MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus pneumoniae P1031

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7480521 7480522 SPP_0001 SPP_0002 dnaA dnaN TRUE 0.669 159.000 0.328 1.000 Y NA
 7480522 7480523 SPP_0002 SPP_0003 dnaN   TRUE 0.593 65.000 0.009 NA   NA
 7480523 7480524 SPP_0003 SPP_0004   ychF TRUE 0.575 84.000 0.064 NA   NA
 7480524 7480525 SPP_0004 SPP_0005 ychF pth TRUE 0.896 71.000 0.184 1.000 Y NA
 7480525 7480526 SPP_0005 SPP_0006 pth mfd TRUE 0.987 1.000 0.137 1.000 N NA
 7480526 7480527 SPP_0006 SPP_0007 mfd   TRUE 0.736 58.000 0.024 1.000 N NA
 7480527 7480528 SPP_0007 SPP_0008     TRUE 0.979 -7.000 0.053 1.000 N NA
 7480528 7480529 SPP_0008 SPP_0009     TRUE 0.939 5.000 0.009 NA   NA
 7480529 7480530 SPP_0009 SPP_0010     TRUE 0.981 -7.000 0.105 NA   NA
 7480530 7480531 SPP_0010 SPP_0011     TRUE 0.972 -3.000 0.014 NA N NA
 7480531 7480532 SPP_0011 SPP_0012   hpt TRUE 0.975 4.000 0.067 0.065 N NA
 7480532 7480533 SPP_0012 SPP_0013 hpt hflB TRUE 0.975 16.000 0.192 1.000 N NA
 7480533 7480534 SPP_0013 SPP_0014 hflB   FALSE 0.243 122.000 0.006 1.000   NA
 7480534 7480535 SPP_0014 SPP_0015     FALSE 0.187 95.000 0.000 NA   NA
 7480535 7480536 SPP_0015 SPP_0016   rrs1 FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 7480536 7480537 SPP_0016 SPP_0017 rrs1   FALSE 0.092 138.000 0.000 NA   NA
 7480537 7480538 SPP_0017 SPP_0019   rrl1 FALSE 0.121 121.000 0.000 NA   NA
 7480538 7480539 SPP_0019 SPP_0020 rrl1 rrf1 FALSE 0.273 77.000 0.000 NA   NA
 7480539 7480540 SPP_0020 SPP_0021 rrf1   TRUE 0.855 6.000 0.000 NA   NA
 7480540 7480541 SPP_0021 SPP_0022     FALSE 0.154 105.000 0.000 NA   NA
 7480541 7480542 SPP_0022 SPP_0023     FALSE 0.013 427.000 0.000 NA   NA
 7480543 7480544 SPP_0024 SPP_0025     TRUE 0.515 48.000 0.000 NA   NA
 7480545 7480546 SPP_0026 SPP_0027   purA FALSE 0.049 189.000 0.000 NA   NA
 7480547 7480548 SPP_0028 SPP_0029     FALSE 0.055 175.000 0.000 NA   NA
 7480548 7480549 SPP_0029 SPP_0030     TRUE 0.598 38.000 0.000 NA   NA
 7480549 7480550 SPP_0030 SPP_0031     FALSE 0.284 76.000 0.000 NA   NA
 7480550 7480551 SPP_0031 SPP_0032     TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 7480551 7480552 SPP_0032 SPP_0033     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7480552 7480553 SPP_0033 SPP_0034     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7480554 7480555 SPP_0035 SPP_0036     FALSE 0.014 411.000 0.000 NA   NA
 7480555 7480556 SPP_0036 SPP_0037     TRUE 0.797 17.000 0.000 NA   NA
 7480558 7480559 SPP_0039 SPP_0040     TRUE 0.985 13.000 0.400 NA   NA
 7480559 7480560 SPP_0040 SPP_0041     FALSE 0.213 86.000 0.000 NA   NA
 7480560 7480561 SPP_0041 SPP_0042     TRUE 0.807 16.000 0.000 NA   NA
 7480561 7480562 SPP_0042 SPP_0043     TRUE 0.857 -16.000 0.000 NA   NA
 7480562 7480563 SPP_0043 SPP_0044     TRUE 0.879 -12.000 0.000 NA   NA
 7480563 7480564 SPP_0044 SPP_0045     FALSE 0.115 123.000 0.000 NA   NA
 7480564 7480565 SPP_0045 SPP_0046     TRUE 0.813 15.000 0.000 NA   NA
 7480565 7480566 SPP_0046 SPP_0047     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7480566 7480567 SPP_0047 SPP_0048     FALSE 0.107 127.000 0.000 NA   NA
 7480567 7480568 SPP_0048 SPP_0049     FALSE 0.059 168.000 0.000 NA   NA
 7480568 7480569 SPP_0049 SPP_0050     TRUE 0.886 -10.000 0.000 NA   NA
 7480569 7480570 SPP_0050 SPP_0051     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7480570 7480571 SPP_0051 SPP_0053     TRUE 0.575 42.000 0.000 NA   NA
 7480571 7480572 SPP_0053 SPP_0054     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7480572 7480573 SPP_0054 SPP_0055     TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7480573 7480574 SPP_0055 SPP_0056     FALSE 0.009 802.000 0.000 NA   NA
 7480574 7480575 SPP_0056 SPP_0057     FALSE 0.063 164.000 0.000 NA   NA
 7480575 7480576 SPP_0057 SPP_0058     FALSE 0.123 120.000 0.000 NA   NA
 7480576 7480577 SPP_0058 SPP_0059     FALSE 0.092 138.000 0.000 NA   NA
 7480577 7480578 SPP_0059 SPP_0060     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 7480578 7480579 SPP_0060 SPP_0061     TRUE 0.847 8.000 0.000 NA   NA
 7480579 7480580 SPP_0061 SPP_0062     TRUE 0.785 18.000 0.000 NA   NA
 7480580 7480581 SPP_0062 SPP_0063     TRUE 0.990 -16.000 0.538 NA   NA
 7480581 7480582 SPP_0063 SPP_0064     TRUE 0.991 -3.000 0.273 NA   NA
 7480582 7480583 SPP_0064 SPP_0065     TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7480583 7480584 SPP_0065 SPP_0066     TRUE 0.986 3.000 0.250 NA   NA
 7480584 7480585 SPP_0066 SPP_0067     TRUE 0.871 -13.000 0.000 NA   NA
 7480585 7480586 SPP_0067 SPP_0068     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7480586 7480587 SPP_0068 SPP_0069     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7480587 7480588 SPP_0069 SPP_0070     TRUE 0.971 12.000 0.148 NA   NA
 7480588 7480589 SPP_0070 SPP_0071     TRUE 0.967 12.000 0.111 NA   NA
 7480589 7480590 SPP_0071 SPP_0072     FALSE 0.024 278.000 0.000 NA   NA
 7480590 7480591 SPP_0072 SPP_0073     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7480591 7480592 SPP_0073 SPP_0074     TRUE 0.905 1.000 0.000 NA   NA
 7480592 7480593 SPP_0074 SPP_0075     TRUE 0.530 46.000 0.000 NA   NA
 7480593 7480594 SPP_0075 SPP_0076     FALSE 0.078 149.000 0.000 NA   NA
 7480594 7480595 SPP_0076 SPP_0077     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7480595 7480596 SPP_0077 SPP_0078     TRUE 0.844 -19.000 0.000 NA   NA
 7480596 7480597 SPP_0078 SPP_0079     TRUE 0.995 3.000 1.000 NA   NA
 7480597 7480598 SPP_0079 SPP_0080     TRUE 0.807 -48.000 0.000 NA   NA
 7480598 7480599 SPP_0080 SPP_0081     TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 7480599 7480600 SPP_0081 SPP_0082     TRUE 0.868 4.000 0.000 NA   NA
 7480600 7480601 SPP_0082 SPP_0083     TRUE 0.993 0.000 0.400 NA   NA
 7480603 7480604 SPP_0085 SPP_2297   srpB TRUE 0.617 36.000 0.000 NA   NA
 7480604 7480605 SPP_2297 SPP_0086 srpB   TRUE 0.389 61.000 0.000 NA   NA
 7480605 7480606 SPP_0086 SPP_0087     TRUE 0.922 -40.000 0.005 NA N NA
 7480606 7480607 SPP_0087 SPP_0088   radA FALSE 0.290 113.000 0.003 NA N NA
 7480607 7480608 SPP_0088 SPP_0089 radA   TRUE 0.573 73.000 0.009 1.000 N NA
 7480608 7480609 SPP_0089 SPP_0090     TRUE 0.932 25.000 0.111 NA   NA
 7480609 7480610 SPP_0090 SPP_0091     TRUE 0.850 -18.000 0.000 NA   NA
 7480610 7480611 SPP_0091 SPP_0092     FALSE 0.082 145.000 0.000 NA   NA
 7480612 7480613 SPP_0093 SPP_0094     FALSE 0.018 324.000 0.000 NA   NA
 7480614 7480615 SPP_0095 SPP_0096     TRUE 0.387 85.000 0.005 NA   NA
 7480615 7480616 SPP_0096 SPP_0097     TRUE 0.581 41.000 0.000 NA   NA
 7480618 7480619 SPP_0099 SPP_0100   recO TRUE 0.972 -3.000 0.012 1.000 N NA
 7480619 7480620 SPP_0100 SPP_0101 recO plsX TRUE 0.971 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7480620 7480621 SPP_0101 SPP_0102 plsX   TRUE 0.981 6.000 0.017 0.009 Y NA
 7480621 7480622 SPP_0102 SPP_0103     TRUE 0.623 43.000 0.000 NA N NA
 7480622 7480623 SPP_0103 SPP_0104     FALSE 0.044 203.000 0.000 NA   NA
 7480623 7480624 SPP_0104 SPP_0105     TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 7480626 7480627 SPP_0107 SPP_0108     TRUE 0.987 13.000 0.444 0.067   NA
 7480627 7480628 SPP_0108 SPP_0109   purC FALSE 0.119 170.000 0.004 1.000   NA
 7480628 7480629 SPP_0109 SPP_0110 purC   FALSE 0.323 202.000 0.043 1.000 Y NA
 7480629 7480630 SPP_0110 SPP_0111   purF TRUE 0.681 93.000 0.024 1.000 Y NA
 7480630 7480631 SPP_0111 SPP_0112 purF purM TRUE 0.973 37.000 0.248 1.000 Y NA
 7480631 7480632 SPP_0112 SPP_0113 purM purN TRUE 0.996 -3.000 0.238 0.003 Y NA
 7480632 7480633 SPP_0113 SPP_0114 purN   TRUE 0.423 84.000 0.003 NA N NA
 7480633 7480634 SPP_0114 SPP_0115   purH TRUE 0.843 25.000 0.002 NA N NA
 7480634 7480635 SPP_0115 SPP_0116 purH purD TRUE 0.755 122.000 0.238 1.000 Y NA
 7480635 7480636 SPP_0116 SPP_0117 purD   FALSE 0.028 257.000 0.000 NA   NA
 7480636 7480637 SPP_0117 SPP_0118   purE TRUE 0.651 30.000 0.000 NA   NA
 7480637 7480638 SPP_0118 SPP_0119 purE purK TRUE 0.982 -13.000 0.008 0.001 Y NA
 7480638 7480639 SPP_0119 SPP_0120 purK   TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 7480639 7480640 SPP_0120 SPP_0121   purB TRUE 0.530 63.000 0.002 NA   NA
 7480641 7480642 SPP_0122 SPP_0123     FALSE 0.024 316.000 0.000 1.000 N NA
 7480643 7480644 SPP_0124 SPP_0125     TRUE 0.995 -3.000 0.190 1.000 Y NA
 7480644 7480645 SPP_0125 SPP_0126     TRUE 0.992 28.000 0.810 0.037 Y NA
 7480645 7480646 SPP_0126 SPP_0127     TRUE 0.965 -13.000 0.000 0.037 Y NA
 7480646 7480647 SPP_0127 SPP_0128     TRUE 0.959 7.000 0.000 0.037 Y NA
 7480647 7480648 SPP_0128 SPP_0129     FALSE 0.074 299.000 0.022 1.000 N NA
 7480648 7480649 SPP_0129 SPP_0130     FALSE 0.182 116.000 0.000 0.029 N NA
 7480649 7480650 SPP_0130 SPP_0131     FALSE 0.042 207.000 0.000 NA   NA
 7480650 7480651 SPP_0131 SPP_0132     FALSE 0.034 232.000 0.000 NA   NA
 7480652 7480653 SPP_0133 SPP_0134     TRUE 0.450 54.000 0.000 NA   NA
 7480653 7480654 SPP_0134 SPP_0135     TRUE 0.886 -10.000 0.000 NA   NA
 7480655 7480656 SPP_0136 SPP_0137     FALSE 0.028 256.000 0.000 NA   NA
 7480656 7480657 SPP_0137 SPP_0138     FALSE 0.058 169.000 0.000 NA   NA
 7480657 7480658 SPP_0138 SPP_0139     TRUE 0.994 14.000 0.490 0.005 Y NA
 7480658 7480659 SPP_0139 SPP_0140     FALSE 0.096 135.000 0.000 NA   NA
 7480659 7480660 SPP_0140 SPP_0141     TRUE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 7480660 7480661 SPP_0141 SPP_0144     FALSE 0.130 116.000 0.000 NA   NA
 7480661 7480662 SPP_0144 SPP_0145     TRUE 0.437 167.000 0.333 1.000   NA
 7480662 7480663 SPP_0145 SPP_0146     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7480663 7480664 SPP_0146 SPP_0147   rpsD FALSE 0.103 195.000 0.002 1.000 N NA
 7480664 7480665 SPP_0147 SPP_0148 rpsD   FALSE 0.051 185.000 0.000 NA   NA
 7480665 7480666 SPP_0148 SPP_0149     FALSE 0.012 469.000 0.000 NA   NA
 7480666 7480667 SPP_0149 SPP_0150     TRUE 0.810 -46.000 0.000 NA   NA
 7480667 7480668 SPP_0150 SPP_0151     FALSE 0.018 336.000 0.000 NA   NA
 7480668 7480669 SPP_0151 SPP_0152     TRUE 0.997 14.000 0.917 0.048 Y NA
 7480669 7480670 SPP_0152 SPP_0153     TRUE 0.881 84.000 0.250 0.048 Y NA
 7480670 7480671 SPP_0153 SPP_0154     FALSE 0.026 272.000 0.000 NA   NA
 7480671 7480672 SPP_0154 SPP_0155     FALSE 0.118 122.000 0.000 NA   NA
 7480673 7480674 SPP_0156 SPP_0157     TRUE 0.906 63.000 0.500 NA   NA
 7480674 7480675 SPP_0157 SPP_0158     TRUE 0.985 -7.000 0.150 NA   NA
 7480675 7480676 SPP_0158 SPP_0159     TRUE 0.985 -13.000 0.250 NA   NA
 7480676 7480677 SPP_0159 SPP_0160     TRUE 0.391 139.000 0.100 NA N NA
 7480678 7480679 SPP_0161 SPP_0162     TRUE 0.650 68.000 0.000 NA Y NA
 7480680 7480681 SPP_0163 SPP_0164     TRUE 0.501 50.000 0.000 NA   NA
 7480681 7480682 SPP_0164 SPP_0165   sdaAA TRUE 0.906 22.000 0.033 1.000   NA
 7480682 7480683 SPP_0165 SPP_0166 sdaAA sdaAB TRUE 0.992 9.000 0.221 0.001 Y NA
 7480684 7480685 SPP_0167 SPP_0168     FALSE 0.009 797.000 0.000 NA   NA
 7480685 7480686 SPP_0168 SPP_0169     TRUE 0.908 55.000 0.353 NA   NA
 7480686 7480687 SPP_0169 SPP_0170     TRUE 0.994 -3.000 0.520 NA   NA
 7480687 7480688 SPP_0170 SPP_0171     FALSE 0.056 207.000 0.000 1.000 N NA
 7480688 7480689 SPP_0171 SPP_0172   argG TRUE 0.887 17.000 0.002 1.000   NA
 7480691 7480692 SPP_0174 SPP_0175     FALSE 0.016 374.000 0.000 NA   NA
 7480692 7480693 SPP_0175 SPP_0176     FALSE 0.018 315.000 0.000 NA   NA
 7480693 7480694 SPP_0176 SPP_0177     TRUE 0.907 -6.000 0.000 NA   NA
 7480694 7480695 SPP_0177 SPP_0178     FALSE 0.015 377.000 0.000 NA   NA
 7480695 7480696 SPP_0178 SPP_0179     TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 7480696 7480697 SPP_0179 SPP_0180     TRUE 0.769 19.000 0.000 NA   NA
 7480697 7480698 SPP_0180 SPP_0181     TRUE 0.436 56.000 0.000 NA   NA
 7480698 7480699 SPP_0181 SPP_0182     TRUE 0.822 -33.000 0.000 NA   NA
 7480699 7480700 SPP_0182 SPP_0183     FALSE 0.009 1228.000 0.000 NA   NA
 7480700 7480701 SPP_0183 SPP_0184     FALSE 0.179 97.000 0.000 NA   NA
 7480701 7480702 SPP_0184 SPP_0185     FALSE 0.022 286.000 0.000 NA   NA
 7480702 7480703 SPP_0185 SPP_0186   trmU FALSE 0.014 401.000 0.000 NA   NA
 7480703 7480704 SPP_0186 SPP_0187 trmU   FALSE 0.198 141.000 0.003 1.000 N NA
 7480704 7480705 SPP_0187 SPP_0188   gidA TRUE 0.933 10.000 0.005 1.000 N NA
 7480705 7480706 SPP_0188 SPP_0189 gidA   FALSE 0.043 204.000 0.000 NA   NA
 7480707 7480708 SPP_0190 SPP_0191     TRUE 0.993 2.000 0.576 NA   NA
 7480710 7480711 SPP_0193 SPP_0194     TRUE 0.992 2.000 0.500 NA   NA
 7480712 7480713 SPP_0195 SPP_0196   rimI TRUE 0.989 -3.000 0.209 1.000   NA
 7480713 7480714 SPP_0196 SPP_0197 rimI   TRUE 0.965 -10.000 0.030 1.000   NA
 7480715 7480716 SPP_0198 SPP_0199     TRUE 0.893 -9.000 0.000 NA   NA
 7480716 7480717 SPP_0199 SPP_0200     FALSE 0.010 660.000 0.000 NA   NA
 7480718 7480719 SPP_0201 SPP_0204     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 7480719 7480720 SPP_0204 SPP_0205     FALSE 0.160 103.000 0.000 NA   NA
 7480720 7480721 SPP_0205 SPP_0206     FALSE 0.009 931.000 0.000 NA   NA
 7480721 7480722 SPP_0206 SPP_0207     TRUE 0.834 -22.000 0.000 NA   NA
 7480722 7480723 SPP_0207 SPP_0208     TRUE 0.598 38.000 0.000 NA   NA
 7480723 7480724 SPP_0208 SPP_0209     TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7480724 7480725 SPP_0209 SPP_0210     TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 7480725 7480726 SPP_0210 SPP_0211     FALSE 0.015 395.000 0.000 1.000   NA
 7480726 7480727 SPP_0211 SPP_0212     FALSE 0.022 286.000 0.000 NA   NA
 7480727 7480728 SPP_0212 SPP_0213     TRUE 0.728 22.000 0.000 NA   NA
 7480728 7480729 SPP_0213 SPP_0214     TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7480729 7480730 SPP_0214 SPP_0215     FALSE 0.306 72.000 0.000 NA   NA
 7480730 7480731 SPP_0215 SPP_0216     FALSE 0.013 454.000 0.000 NA   NA
 7480731 7480732 SPP_0216 SPP_0217     TRUE 0.409 104.000 0.000 NA Y NA
 7480732 7480733 SPP_0217 SPP_0218     FALSE 0.091 154.000 0.000 NA N NA
 7480733 7480734 SPP_0218 SPP_0219     TRUE 0.788 100.000 0.500 NA N NA
 7480734 7480735 SPP_0219 SPP_0220     TRUE 0.976 -7.000 0.042 1.000 N NA
 7480735 7480736 SPP_0220 SPP_0221     TRUE 0.998 2.000 0.938 1.000 Y NA
 7480738 7480739 SPP_0223 SPP_0224     TRUE 0.954 50.000 0.667 NA   NA
 7480739 7480740 SPP_0224 SPP_0225     TRUE 0.992 12.000 0.227 0.014 Y NA
 7480740 7480741 SPP_0225 SPP_0226     TRUE 0.826 52.000 0.091 NA   NA
 7480741 7480742 SPP_0226 SPP_0227     TRUE 0.794 78.000 0.286 NA   NA
 7480743 7480744 SPP_0228 SPP_0229     FALSE 0.019 310.000 0.000 NA   NA
 7480744 7480745 SPP_0229 SPP_0230     TRUE 0.993 -3.000 0.392 NA   NA
 7480747 7480748 SPP_0232 SPP_0233 ribH   TRUE 0.991 1.000 0.054 0.003 Y NA
 7480748 7480749 SPP_0233 SPP_0234   ribE TRUE 0.971 20.000 0.051 1.000 Y NA
 7480749 7480750 SPP_0234 SPP_0235 ribE ribD TRUE 0.995 -15.000 0.456 1.000 Y NA
 7480751 7480752 SPP_0236 SPP_0237 ruvA   TRUE 0.974 10.000 0.012 1.000 Y NA
 7480752 7480753 SPP_0237 SPP_0238     TRUE 0.957 -3.000 0.004 NA   NA
 7480754 7480755 SPP_0239 SPP_0240     FALSE 0.028 255.000 0.000 NA   NA
 7480755 7480756 SPP_0240 SPP_0241     TRUE 0.959 12.000 0.072 NA   NA
 7480757 7480758 SPP_0242 SPP_0243 uvrA   TRUE 0.965 -7.000 0.008 1.000 N NA
 7480758 7480759 SPP_0243 SPP_0244     FALSE 0.127 132.000 0.000 1.000 N NA
 7480759 7480760 SPP_0244 SPP_0245     TRUE 0.850 66.000 0.267 NA   NA
 7480760 7480761 SPP_0245 SPP_0246     TRUE 0.437 87.000 0.016 NA   NA
 7480761 7480762 SPP_0246 SPP_0247     TRUE 0.991 4.000 0.537 NA   NA
 7480762 7480763 SPP_0247 SPP_0248     TRUE 0.988 16.000 0.651 NA   NA
 7480763 7480764 SPP_0248 SPP_0249     FALSE 0.056 306.000 0.019 NA   NA
 7480764 7480765 SPP_0249 SPP_0250     TRUE 0.988 -3.000 0.200 NA   NA
 7480765 7480766 SPP_0250 SPP_0251     FALSE 0.080 146.000 0.000 NA   NA
 7480766 7480767 SPP_0251 SPP_0252     FALSE 0.263 78.000 0.000 NA   NA
 7480767 7480768 SPP_0252 SPP_0253     TRUE 0.894 37.000 0.095 NA   NA
 7480768 7480769 SPP_0253 SPP_0254   nrdD TRUE 0.407 114.000 0.057 NA   NA
 7480769 7480770 SPP_0254 SPP_0255 nrdD   TRUE 0.957 12.000 0.062 NA   NA
 7480770 7480771 SPP_0255 SPP_0256     TRUE 0.930 44.000 0.292 NA   NA
 7480771 7480772 SPP_0256 SPP_0257   nrdG TRUE 0.986 -7.000 0.159 1.000   NA
 7480772 7480773 SPP_0257 SPP_0258 nrdG   TRUE 0.977 -3.000 0.029 1.000 N NA
 7480773 7480774 SPP_0258 SPP_0259   rpsJ FALSE 0.038 255.000 0.000 1.000 N NA
 7480774 7480775 SPP_0259 SPP_0260 rpsJ rplC TRUE 0.595 217.000 0.467 0.037 Y NA
 7480775 7480776 SPP_0260 SPP_0261 rplC rplD TRUE 0.990 25.000 0.544 0.028 Y NA
 7480776 7480777 SPP_0261 SPP_0262 rplD rplW TRUE 0.997 0.000 0.307 0.028 Y NA
 7480777 7480778 SPP_0262 SPP_0263 rplW rplB TRUE 0.996 18.000 0.849 0.033 Y NA
 7480778 7480779 SPP_0263 SPP_0264 rplB rpsS TRUE 0.919 104.000 0.820 0.037 Y NA
 7480779 7480780 SPP_0264 SPP_0265 rpsS rplV TRUE 0.996 12.000 0.769 0.037 Y NA
 7480780 7480781 SPP_0265 SPP_0266 rplV rpsC TRUE 0.996 13.000 0.719 0.037 Y NA
 7480781 7480782 SPP_0266 SPP_0267 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.037 Y NA
 7480782 7480783 SPP_0267 SPP_0268 rplP rpmC TRUE 0.997 10.000 0.802 0.028 Y NA
 7480783 7480784 SPP_0268 SPP_0269 rpmC rpsQ TRUE 0.993 25.000 0.828 0.028 Y NA
 7480784 7480785 SPP_0269 SPP_0270 rpsQ rplN TRUE 0.992 26.000 0.791 0.037 Y NA
 7480785 7480786 SPP_0270 SPP_0271 rplN rplX TRUE 0.955 78.000 0.810 0.037 Y NA
 7480786 7480787 SPP_0271 SPP_0272 rplX   TRUE 0.993 24.000 0.758 0.028 Y NA
 7480787 7480788 SPP_0272 SPP_0273     TRUE 0.991 18.000 0.309 0.028 Y NA
 7480788 7480789 SPP_0273 SPP_0274   rpsH TRUE 0.393 285.000 0.295 0.028 Y NA
 7480789 7480790 SPP_0274 SPP_0275 rpsH   TRUE 0.749 192.000 0.808 0.028 Y NA
 7480790 7480791 SPP_0275 SPP_0276   rplR TRUE 0.947 84.000 0.815 0.028 Y NA
 7480791 7480792 SPP_0276 SPP_0277 rplR rpsE TRUE 0.995 18.000 0.814 0.037 Y NA
 7480792 7480793 SPP_0277 SPP_0278 rpsE rpmD TRUE 0.996 14.000 0.789 0.037 Y NA
 7480793 7480794 SPP_0278 SPP_0279 rpmD rplO TRUE 0.819 145.000 0.653 0.005 Y NA
 7480794 7480795 SPP_0279 SPP_0280 rplO   TRUE 0.992 13.000 0.730 1.000 N NA
 7480795 7480796 SPP_0280 SPP_0281     TRUE 0.479 151.000 0.241 1.000 N NA
 7480796 7480797 SPP_0281 SPP_0282   infA TRUE 0.436 117.000 0.059 1.000 N NA
 7480797 7480798 SPP_0282 SPP_0283 infA rpmJ TRUE 0.965 25.000 0.067 1.000 Y NA
 7480798 7480799 SPP_0283 SPP_0284 rpmJ rpsM TRUE 0.981 18.000 0.086 0.028 Y NA
 7480799 7480800 SPP_0284 SPP_0285 rpsM rpsK TRUE 0.995 18.000 0.810 0.028 Y NA
 7480800 7480801 SPP_0285 SPP_0286 rpsK rpoA TRUE 0.944 43.000 0.308 1.000 N NA
 7480801 7480802 SPP_0286 SPP_0287 rpoA rplQ TRUE 0.994 12.000 0.873 1.000 N NA
 7480802 7480803 SPP_0287 SPP_0288 rplQ   FALSE 0.061 265.000 0.002 1.000 N NA
 7480803 7480804 SPP_0288 SPP_0289     TRUE 0.989 10.000 0.569 NA   NA
 7480804 7480805 SPP_0289 SPP_0290     FALSE 0.074 244.000 0.008 NA   NA
 7480806 7480807 SPP_0291 SPP_0293     TRUE 0.886 -10.000 0.000 NA   NA
 7480807 7480808 SPP_0293 SPP_0295     TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 7480808 7480809 SPP_0295 SPP_0297     FALSE 0.011 586.000 0.000 NA   NA
 7480810 7480811 SPP_0298 SPP_0299     TRUE 0.990 13.000 0.188 0.037 Y NA
 7480811 7480812 SPP_0299 SPP_0300     FALSE 0.233 195.000 0.091 1.000 N NA
 7480812 7480813 SPP_0300 SPP_0301     TRUE 0.987 46.000 0.889 0.023 Y NA
 7480813 7480814 SPP_0301 SPP_0302     TRUE 0.996 17.000 0.889 0.023 Y NA
 7480814 7480815 SPP_0302 SPP_0303     TRUE 0.385 151.000 0.132 1.000 N NA
 7480815 7480816 SPP_0303 SPP_0304     TRUE 0.980 19.000 0.368 1.000 N NA
 7480816 7480817 SPP_0304 SPP_0305     TRUE 0.974 18.000 0.211 1.000 N NA
 7480817 7480818 SPP_0305 SPP_0306   leuS FALSE 0.017 455.000 0.000 1.000 N NA
 7480818 7480819 SPP_0306 SPP_0307 leuS   FALSE 0.159 194.000 0.000 1.000 Y NA
 7480819 7480820 SPP_0307 SPP_0308     TRUE 0.953 12.000 0.037 0.014   NA
 7480820 7480821 SPP_0308 SPP_0309   ruvB FALSE 0.009 1041.000 0.000 1.000   NA
 7480821 7480822 SPP_0309 SPP_0310 ruvB   TRUE 0.921 -19.000 0.004 NA   NA
 7480822 7480823 SPP_0310 SPP_0311   uppS FALSE 0.034 231.000 0.000 NA   NA
 7480823 7480824 SPP_0311 SPP_0312 uppS cdsA TRUE 0.988 9.000 0.113 1.000 Y NA
 7480824 7480825 SPP_0312 SPP_0313 cdsA rseP TRUE 0.923 22.000 0.040 1.000 N NA
 7480825 7480826 SPP_0313 SPP_0314 rseP proS TRUE 0.968 13.000 0.095 1.000 N NA
 7480826 7480827 SPP_0314 SPP_0315 proS   FALSE 0.342 99.000 0.002 1.000 N NA
 7480827 7480828 SPP_0315 SPP_0316   glmS FALSE 0.115 193.000 0.003 1.000 N NA
 7480832 7480833 SPP_0320 SPP_0321 rpsL rpsG TRUE 0.986 20.000 0.224 0.005 Y NA
 7480833 7480834 SPP_0321 SPP_0322 rpsG fusA FALSE 0.367 425.000 0.579 1.000 Y NA
 7480834 7480835 SPP_0322 SPP_0323 fusA polC FALSE 0.325 104.000 0.003 1.000 N NA
 7480835 7480836 SPP_0323 SPP_0324 polC   TRUE 0.421 102.000 0.000 NA Y NA
 7480836 7480837 SPP_0324 SPP_0325     TRUE 0.992 -7.000 0.400 NA   NA
 7480837 7480838 SPP_0325 SPP_0326     TRUE 0.742 21.000 0.000 NA   NA
 7480838 7480839 SPP_0326 SPP_0327     TRUE 0.936 22.000 0.095 NA   NA
 7480839 7480840 SPP_0327 SPP_0328     TRUE 0.975 10.000 0.190 1.000   NA
 7480840 7480841 SPP_0328 SPP_0329     FALSE 0.037 223.000 0.000 1.000   NA
 7480841 7480842 SPP_0329 SPP_0330     FALSE 0.150 217.000 0.041 1.000 N NA
 7480843 7480844 SPP_0331 SPP_0332     TRUE 0.993 24.000 0.812 0.035 Y NA
 7480844 7480845 SPP_0332 SPP_0333     TRUE 0.993 28.000 0.943 0.035 Y NA
 7480845 7480846 SPP_0333 SPP_0334     FALSE 0.035 233.000 0.000 1.000   NA
 7480846 7480847 SPP_0334 SPP_0335     FALSE 0.148 109.000 0.000 NA   NA
 7480847 7480848 SPP_0335 SPP_0336     FALSE 0.227 84.000 0.000 NA   NA
 7480849 7480850 SPP_0337 SPP_0338     TRUE 0.752 53.000 0.034 NA   NA
 7480850 7480851 SPP_0338 SPP_0339   folP FALSE 0.183 96.000 0.000 NA   NA
 7480851 7480852 SPP_0339 SPP_0340 folP   TRUE 0.984 2.000 0.006 0.005 Y NA
 7480852 7480853 SPP_0340 SPP_0341   folE TRUE 0.980 -19.000 0.024 1.000 Y NA
 7480853 7480854 SPP_0341 SPP_0342 folE   TRUE 0.897 43.000 0.005 1.000 Y NA
 7480856 7480857 SPP_0344 SPP_0345 rplM rpsI TRUE 0.994 19.000 0.601 0.028 Y NA
 7480859 7480860 SPP_0347 SPP_0348     FALSE 0.014 402.000 0.000 NA   NA
 7480862 7480863 SPP_0350 SPP_0351     FALSE 0.014 414.000 0.000 NA   NA
 7480864 7480865 SPP_0352 SPP_0353     TRUE 0.989 10.000 0.167 1.000 Y NA
 7480865 7480866 SPP_0353 SPP_0354     TRUE 0.961 31.000 0.094 1.000 Y NA
 7480866 7480867 SPP_0354 SPP_0355     TRUE 0.969 19.000 0.197 1.000 N NA
 7480868 7480869 SPP_0356 SPP_0357     TRUE 0.974 12.000 0.160 1.000   NA
 7480869 7480870 SPP_0357 SPP_0358     TRUE 0.981 11.000 0.267 1.000   NA
 7480870 7480871 SPP_0358 SPP_0359     TRUE 0.997 15.000 0.933 0.035 Y NA
 7480871 7480872 SPP_0359 SPP_0360     TRUE 0.998 -13.000 0.933 0.035 Y NA
 7480872 7480873 SPP_0360 SPP_0361     TRUE 0.794 36.000 0.002 NA N NA
 7480873 7480874 SPP_0361 SPP_0362     TRUE 0.861 22.000 0.006 NA   NA
 7480874 7480875 SPP_0362 SPP_0363     TRUE 0.921 60.000 0.562 NA   NA
 7480876 7480877 SPP_0364 SPP_0365     TRUE 0.828 11.000 0.000 NA   NA
 7480877 7480878 SPP_0365 SPP_0366     TRUE 0.828 11.000 0.000 NA   NA
 7480878 7480879 SPP_0366 SPP_0367     TRUE 0.960 16.000 0.105 NA   NA
 7480880 7480881 SPP_0368 SPP_0369 mraW ftsL TRUE 0.966 12.000 0.077 1.000 N NA
 7480881 7480882 SPP_0369 SPP_0370 ftsL   TRUE 0.991 4.000 0.456 1.000 N NA
 7480882 7480883 SPP_0370 SPP_0371   mraY TRUE 0.988 2.000 0.038 1.000 Y NA
 7480883 7480884 SPP_0371 SPP_0372 mraY   FALSE 0.040 212.000 0.000 NA   NA
 7480884 7480885 SPP_0372 SPP_0373     FALSE 0.024 281.000 0.000 NA   NA
 7480885 7480886 SPP_0373 SPP_0374     FALSE 0.013 438.000 0.000 NA   NA
 7480886 7480887 SPP_0374 SPP_2303     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7480888 7480889 SPP_0375 SPP_0376 luxS   FALSE 0.353 95.000 0.006 NA   NA
 7480890 7480891 SPP_0377 SPP_0378     FALSE 0.067 159.000 0.000 NA   NA
 7480892 7480893 SPP_0379 SPP_0380     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7480896 7480897 SPP_0383 SPP_0384     TRUE 0.994 2.000 0.583 1.000 N NA
 7480897 7480898 SPP_0384 SPP_0385     TRUE 0.996 9.000 0.636 1.000 Y NA
 7480898 7480899 SPP_0385 SPP_0386     TRUE 0.993 10.000 0.800 1.000 N NA
 7480899 7480900 SPP_0386 SPP_0387     FALSE 0.113 141.000 0.000 1.000 N NA
 7480900 7480901 SPP_0387 SPP_0388     TRUE 0.961 -7.000 0.011 1.000   NA
 7480901 7480902 SPP_0388 SPP_0389     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 7480902 7480903 SPP_0389 SPP_0390     FALSE 0.127 117.000 0.000 NA   NA
 7480903 7480904 SPP_0390 SPP_0391     FALSE 0.229 186.000 0.100 NA   NA
 7480904 7480905 SPP_0391 SPP_0392     FALSE 0.343 68.000 0.000 1.000   NA
 7480905 7480906 SPP_0392 SPP_0393     TRUE 0.880 29.000 0.000 1.000 Y NA
 7480906 7480907 SPP_0393 SPP_0394     FALSE 0.038 216.000 0.000 NA   NA
 7480908 7480909 SPP_0395 SPP_0396     FALSE 0.219 85.000 0.000 NA   NA
 7480909 7480910 SPP_0396 SPP_0397     TRUE 0.811 -45.000 0.000 NA   NA
 7480911 7480912 SPP_0398 SPP_0399 rfbA   TRUE 0.994 1.000 0.149 1.000 Y NA
 7480912 7480913 SPP_0399 SPP_0400   rfbB TRUE 0.993 10.000 0.350 1.000 Y NA
 7480913 7480914 SPP_0400 SPP_0401 rfbB   FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 7480914 7480915 SPP_0401 SPP_0403     FALSE 0.284 76.000 0.000 NA   NA
 7480915 7480916 SPP_0403 SPP_0404     FALSE 0.302 73.000 0.000 NA   NA
 7480916 7480917 SPP_0404 SPP_0405     FALSE 0.015 396.000 0.000 NA   NA
 7480917 7480918 SPP_0405 SPP_0406     FALSE 0.021 301.000 0.000 1.000   NA
 7480919 7480920 SPP_0407 SPP_0408   recU TRUE 0.992 -3.000 0.319 1.000   NA
 7480921 7480922 SPP_0409 SPP_0410     TRUE 0.895 70.000 0.579 NA   NA
 7480922 7480923 SPP_0410 SPP_2304     TRUE 0.417 58.000 0.000 NA   NA
 7480923 7480924 SPP_2304 SPP_0411     FALSE 0.203 90.000 0.000 NA   NA
 7480924 7480925 SPP_0411 SPP_0412     TRUE 0.941 13.000 0.029 NA   NA
 7480925 7480926 SPP_0412 SPP_0413   gnd TRUE 0.469 76.000 0.005 NA   NA
 7480926 7480927 SPP_0413 SPP_0414 gnd   TRUE 0.941 12.000 0.012 1.000 N NA
 7480927 7480928 SPP_0414 SPP_0415     FALSE 0.176 98.000 0.000 NA   NA
 7480929 7480930 SPP_0416 SPP_0417     FALSE 0.066 160.000 0.000 NA   NA
 7480931 7480932 SPP_0418 SPP_0419   mvk FALSE 0.118 122.000 0.000 NA   NA
 7480932 7480933 SPP_0419 SPP_0420 mvk mvaD TRUE 0.994 -18.000 0.281 0.005 Y NA
 7480933 7480934 SPP_0420 SPP_0421 mvaD   TRUE 0.995 -13.000 0.312 0.005 Y NA
 7480934 7480935 SPP_0421 SPP_0422   fni TRUE 0.975 -16.000 0.097 1.000 N NA
 7480935 7480936 SPP_0422 SPP_0423 fni   TRUE 0.462 77.000 0.005 NA   NA
 7480936 7480937 SPP_0423 SPP_0424     TRUE 0.995 -3.000 0.679 NA   NA
 7480937 7480938 SPP_0424 SPP_0425     TRUE 0.997 14.000 0.853 0.013 Y NA
 7480938 7480939 SPP_0425 SPP_0426     TRUE 0.905 1.000 0.000 NA   NA
 7480939 7480940 SPP_0426 SPP_0427     TRUE 0.850 -18.000 0.000 NA   NA
 7480940 7480941 SPP_0427 SPP_0428     FALSE 0.134 115.000 0.000 NA   NA
 7480941 7480942 SPP_0428 SPP_0429     FALSE 0.077 150.000 0.000 NA   NA
 7480942 7480943 SPP_0429 SPP_0430     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7480943 7480944 SPP_0430 SPP_0431     FALSE 0.021 299.000 0.000 1.000   NA
 7480944 7480945 SPP_0431 SPP_0432   tig FALSE 0.068 161.000 0.000 1.000   NA
 7480946 7480947 SPP_0433 SPP_0434   lepB TRUE 0.436 128.000 0.099 1.000 N NA
 7480947 7480948 SPP_0434 SPP_0435 lepB rnhC TRUE 0.967 12.000 0.080 1.000 N NA
 7480949 7480950 SPP_0436 SPP_0437   cvpA TRUE 0.970 -3.000 0.019 NA   NA
 7480950 7480951 SPP_0437 SPP_0438 cvpA   TRUE 0.476 104.000 0.070 1.000   NA
 7480951 7480952 SPP_0438 SPP_0439     FALSE 0.023 343.000 0.000 1.000 N NA
 7480952 7480953 SPP_0439 SPP_0440     FALSE 0.037 218.000 0.000 NA   NA
 7480953 7480954 SPP_0440 SPP_0441     FALSE 0.146 110.000 0.000 NA   NA
 7480955 7480956 SPP_0442 SPP_0443 serS   FALSE 0.076 214.000 0.003 NA   NA
 7480956 7480957 SPP_0443 SPP_0444     TRUE 0.948 3.000 0.010 NA   NA
 7480957 7480958 SPP_0444 SPP_0445     FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 7480959 7480960 SPP_0446 SPP_0447     TRUE 0.605 94.000 0.098 1.000 N NA
 7480960 7480961 SPP_0447 SPP_0448     TRUE 0.983 0.000 0.070 1.000 N NA
 7480961 7480962 SPP_0448 SPP_0449     TRUE 0.771 60.000 0.065 0.008   NA
 7480962 7480963 SPP_0449 SPP_0450     TRUE 0.561 119.000 0.216 1.000   NA
 7480963 7480964 SPP_0450 SPP_0451   fabD TRUE 0.981 -7.000 0.099 1.000   NA
 7480964 7480965 SPP_0451 SPP_0452 fabD fabG TRUE 0.984 34.000 0.432 0.008 Y NA
 7480965 7480966 SPP_0452 SPP_0453 fabG fabF TRUE 0.968 22.000 0.056 1.000 Y NA
 7480966 7480967 SPP_0453 SPP_0454 fabF accB TRUE 0.989 3.000 0.074 1.000 Y NA
 7480967 7480968 SPP_0454 SPP_0455 accB fabZ TRUE 0.992 -3.000 0.047 0.008 Y NA
 7480968 7480969 SPP_0455 SPP_0456 fabZ accC TRUE 0.981 12.000 0.045 1.000 Y NA
 7480969 7480970 SPP_0456 SPP_0457 accC accD TRUE 0.958 37.000 0.090 0.003 Y NA
 7480970 7480971 SPP_0457 SPP_0458 accD accA TRUE 0.996 -3.000 0.234 0.002 Y NA
 7480971 7480972 SPP_0458 SPP_0459 accA   FALSE 0.129 159.000 0.003 NA   NA
 7480972 7480973 SPP_0459 SPP_0460     TRUE 0.958 57.000 1.000 NA   NA
 7480974 7480975 SPP_0461 SPP_0462   nusB TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 7480975 7480976 SPP_0462 SPP_0463 nusB   TRUE 0.989 -7.000 0.265 NA   NA
 7480976 7480977 SPP_0463 SPP_0464   efp TRUE 0.903 22.000 0.031 NA   NA
 7480979 7480980 SPP_0466 SPP_0467     FALSE 0.144 124.000 0.000 1.000 N NA
 7480980 7480981 SPP_0467 SPP_0468     TRUE 0.998 0.000 0.492 0.002 Y NA
 7480981 7480982 SPP_0468 SPP_0469   gatC TRUE 0.998 0.000 0.643 0.002 Y NA
 7480983 7480984 SPP_0470 SPP_0471 prfC   FALSE 0.027 269.000 0.000 1.000   NA
 7480984 7480985 SPP_0471 SPP_0472   rpmB FALSE 0.136 116.000 0.000 1.000   NA
 7480985 7480986 SPP_0472 SPP_0473 rpmB   FALSE 0.226 157.000 0.044 NA   NA
 7480986 7480987 SPP_0473 SPP_0474     TRUE 0.992 3.000 0.567 NA   NA
 7480987 7480988 SPP_0474 SPP_0475   ilvB FALSE 0.095 201.000 0.004 1.000   NA
 7480988 7480989 SPP_0475 SPP_0476 ilvB ilvN TRUE 0.996 -7.000 0.249 0.001 Y NA
 7480989 7480990 SPP_0476 SPP_0477 ilvN ilvC TRUE 0.905 66.000 0.130 0.003 Y NA
 7480990 7480991 SPP_0477 SPP_0478 ilvC   FALSE 0.151 107.000 0.000 NA   NA
 7480991 7480992 SPP_0478 SPP_0479     FALSE 0.032 238.000 0.000 NA   NA
 7480992 7480993 SPP_0479 SPP_0480   ilvA TRUE 0.501 50.000 0.000 NA   NA
 7480993 7480994 SPP_0480 SPP_0481 ilvA   FALSE 0.085 142.000 0.000 NA   NA
 7480994 7480995 SPP_0481 SPP_0482     FALSE 0.011 541.000 0.000 NA   NA
 7480996 7480997 SPP_0483 SPP_0484 gltL   TRUE 0.998 0.000 0.758 1.000 Y NA
 7480999 7481000 SPP_0485 SPP_0487     FALSE 0.097 134.000 0.000 NA   NA
 7481000 7481001 SPP_0487 SPP_0488     FALSE 0.046 198.000 0.000 NA   NA
 7481002 7481003 SPP_0489 SPP_0490     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 7481004 7481005 SPP_0491 SPP_0492     TRUE 0.537 45.000 0.000 NA   NA
 7481007 7481008 SPP_0494 SPP_0495     FALSE 0.018 327.000 0.000 NA   NA
 7481010 7481011 SPP_0497 SPP_0498     FALSE 0.022 288.000 0.000 NA   NA
 7481012 7481013 SPP_0499 SPP_0500     TRUE 0.988 2.000 0.250 NA   NA
 7481013 7481014 SPP_0500 SPP_0501     FALSE 0.059 168.000 0.000 NA   NA
 7481014 7481015 SPP_0501 SPP_0502   lacG1 TRUE 0.950 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7481015 7481016 SPP_0502 SPP_0503 lacG1   TRUE 0.641 70.000 0.000 1.000 Y NA
 7481017 7481018 SPP_0504 SPP_0505     TRUE 0.983 4.000 0.017 0.005 Y NA
 7481019 7481020 SPP_0506 SPP_0507     TRUE 0.954 15.000 0.068 NA   NA
 7481020 7481021 SPP_0507 SPP_0508     TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 7481021 7481022 SPP_0508 SPP_0509     FALSE 0.163 102.000 0.000 NA   NA
 7481022 7481023 SPP_0509 SPP_0510     TRUE 0.991 -15.000 0.530 1.000   NA
 7481023 7481024 SPP_0510 SPP_0511   cspR FALSE 0.120 193.000 0.005 1.000 N NA
 7481024 7481025 SPP_0511 SPP_0512 cspR   FALSE 0.013 453.000 0.000 NA   NA
 7481025 7481026 SPP_0512 SPP_0513     TRUE 0.988 14.000 0.600 NA   NA
 7481026 7481027 SPP_0513 SPP_0514     TRUE 0.922 28.000 0.105 1.000   NA
 7481027 7481028 SPP_0514 SPP_0515     TRUE 0.865 5.000 0.000 1.000   NA
 7481028 7481029 SPP_0515 SPP_0516   rpoE FALSE 0.136 128.000 0.000 1.000 N NA
 7481029 7481030 SPP_0516 SPP_0517 rpoE   FALSE 0.095 136.000 0.000 NA   NA
 7481030 7481031 SPP_0517 SPP_0518   pyrG FALSE 0.104 129.000 0.000 NA   NA
 7481033 7481034 SPP_0520 SPP_0521   pgk TRUE 0.597 90.000 0.002 1.000 Y NA
 7481034 7481035 SPP_0521 SPP_0522 pgk   FALSE 0.165 136.000 0.002 NA   NA
 7481035 7481036 SPP_0522 SPP_0523     TRUE 0.730 77.000 0.154 NA   NA
 7481036 7481037 SPP_0523 SPP_0524   glnA TRUE 0.933 37.000 0.179 1.000 N NA
 7481039 7481040 SPP_0526 SPP_0527     FALSE 0.057 171.000 0.000 NA   NA
 7481040 7481041 SPP_0527 SPP_0528     TRUE 0.521 57.000 0.000 0.068 N NA
 7481041 7481042 SPP_0528 SPP_0530     TRUE 0.847 11.000 0.000 0.068   NA
 7481043 7481044 SPP_0529 SPP_0531     TRUE 0.990 0.000 0.023 0.068 Y NA
 7481044 7481045 SPP_0531 SPP_0532     TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 7481045 7481046 SPP_0532 SPP_0534     FALSE 0.017 351.000 0.000 NA   NA
 7481047 7481048 SPP_0535 SPP_0536   hrcA FALSE 0.122 164.000 0.003 NA   NA
 7481048 7481049 SPP_0536 SPP_0537 hrcA grpE TRUE 0.910 27.000 0.051 1.000 N NA
 7481049 7481050 SPP_0537 SPP_0538 grpE dnaK FALSE 0.107 480.000 0.026 0.006 Y NA
 7481050 7481051 SPP_0538 SPP_0539 dnaK   TRUE 0.833 13.000 0.000 1.000   NA
 7481051 7481052 SPP_0539 SPP_0540   dnaJ FALSE 0.045 205.000 0.000 1.000   NA
 7481053 7481054 SPP_0541 SPP_0542     FALSE 0.064 162.000 0.000 NA   NA
 7481054 7481055 SPP_0542 SPP_0543     TRUE 0.957 10.000 0.063 NA   NA
 7481056 7481057 SPP_0544 SPP_0545     TRUE 0.989 -3.000 0.167 NA N NA
 7481059 7481060 SPP_0547 SPP_0548     TRUE 0.990 5.000 0.500 NA   NA
 7481060 7481061 SPP_0548 SPP_0549     TRUE 0.994 14.000 0.444 NA Y NA
 7481062 7481063 SPP_0550 SPP_0551     TRUE 0.883 57.000 0.250 1.000   NA
 7481063 7481064 SPP_0551 SPP_0552     TRUE 0.985 11.000 0.375 0.060   NA
 7481065 7481066 SPP_0553 SPP_0554     TRUE 0.983 16.000 0.400 NA   NA
 7481066 7481067 SPP_0554 SPP_0555     FALSE 0.031 244.000 0.000 NA   NA
 7481067 7481068 SPP_0555 SPP_0556     TRUE 0.850 -18.000 0.000 NA   NA
 7481068 7481069 SPP_0556 SPP_0557     TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 7481069 7481070 SPP_0557 SPP_0558     FALSE 0.139 113.000 0.000 NA   NA
 7481070 7481071 SPP_0558 SPP_0559     FALSE 0.332 68.000 0.000 NA   NA
 7481071 7481072 SPP_0559 SPP_0560     TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 7481072 7481073 SPP_0560 SPP_0561     FALSE 0.054 178.000 0.000 NA   NA
 7481073 7481074 SPP_0561 SPP_0562     TRUE 0.635 32.000 0.000 NA   NA
 7481074 7481075 SPP_0562 SPP_0563     TRUE 0.766 100.000 0.500 NA   NA
 7481075 7481076 SPP_0563 SPP_0564     TRUE 0.473 52.000 0.000 NA   NA
 7481076 7481077 SPP_0564 SPP_0565     TRUE 0.575 42.000 0.000 NA   NA
 7481077 7481078 SPP_0565 SPP_0566     FALSE 0.076 151.000 0.000 NA   NA
 7481078 7481079 SPP_0566 SPP_0567     FALSE 0.065 161.000 0.000 NA   NA
 7481079 7481080 SPP_0567 SPP_0568   trmB TRUE 0.987 -3.000 0.154 NA   NA
 7481080 7481081 SPP_0568 SPP_0569 trmB   FALSE 0.211 126.000 0.004 NA   NA
 7481081 7481082 SPP_0569 SPP_0570   nusA TRUE 0.965 44.000 0.759 NA   NA
 7481082 7481083 SPP_0570 SPP_0571 nusA   TRUE 0.986 22.000 0.323 NA Y NA
 7481083 7481084 SPP_0571 SPP_0572     TRUE 0.993 -7.000 0.408 NA N NA
 7481084 7481085 SPP_0572 SPP_0573     TRUE 0.988 17.000 0.223 NA Y NA
 7481085 7481086 SPP_0573 SPP_0574   rbfA TRUE 0.546 251.000 0.530 1.000 Y NA
 7481086 7481087 SPP_0574 SPP_0575 rbfA   FALSE 0.024 279.000 0.000 NA   NA
 7481087 7481088 SPP_0575 SPP_0576     TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 7481090 7481091 SPP_0578 SPP_0579     TRUE 0.990 0.000 0.229 NA   NA
 7481091 7481092 SPP_0579 SPP_0580     TRUE 0.968 10.000 0.114 NA   NA
 7481092 7481093 SPP_0580 SPP_0581     TRUE 0.602 96.000 0.143 NA   NA
 7481093 7481094 SPP_0581 SPP_0582     FALSE 0.014 413.000 0.000 1.000   NA
 7481094 7481095 SPP_0582 SPP_0583     TRUE 0.980 -13.000 0.150 1.000   NA
 7481095 7481096 SPP_0583 SPP_0584     TRUE 0.978 0.000 0.053 NA   NA
 7481096 7481097 SPP_0584 SPP_0585   valS TRUE 0.958 -7.000 0.008 NA   NA
 7481097 7481098 SPP_0585 SPP_0586 valS   FALSE 0.317 70.000 0.000 NA   NA
 7481098 7481099 SPP_0586 SPP_0587     FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 7481100 7481101 SPP_0588 SPP_0589     FALSE 0.041 209.000 0.000 NA   NA
 7481102 7481103 SPP_0590 SPP_0592     FALSE 0.020 301.000 0.000 NA   NA
 7481103 7481104 SPP_0592 SPP_0593     TRUE 0.974 18.000 0.259 1.000   NA
 7481104 7481105 SPP_0593 SPP_0594     TRUE 0.992 13.000 0.318 1.000 Y NA
 7481105 7481106 SPP_0594 SPP_0595   pheS FALSE 0.015 550.000 0.000 1.000 N NA
 7481106 7481107 SPP_0595 SPP_0596 pheS   TRUE 0.965 0.000 0.009 1.000   NA
 7481107 7481108 SPP_0596 SPP_0597   pheT TRUE 0.486 77.000 0.007 1.000   NA
 7481110 7481111 SPP_0599 SPP_0600     TRUE 0.752 20.000 0.000 NA   NA
 7481111 7481112 SPP_0600 SPP_0601     FALSE 0.115 123.000 0.000 NA   NA
 7481112 7481113 SPP_0601 SPP_0602   metE FALSE 0.029 260.000 0.000 1.000   NA
 7481113 7481114 SPP_0602 SPP_0603 metE metF TRUE 0.873 64.000 0.050 0.002 Y NA
 7481114 7481115 SPP_0603 SPP_0604 metF   FALSE 0.011 559.000 0.000 NA   NA
 7481115 7481116 SPP_0604 SPP_0606   cysE TRUE 0.807 16.000 0.000 NA   NA
 7481116 7481117 SPP_0606 SPP_0607 cysE   TRUE 0.938 12.000 0.017 1.000   NA
 7481117 7481118 SPP_0607 SPP_0608   cysS TRUE 0.383 82.000 0.002 1.000   NA
 7481118 7481119 SPP_0608 SPP_0609 cysS   TRUE 0.983 -7.000 0.129 1.000   NA
 7481119 7481120 SPP_0609 SPP_0610     TRUE 0.951 4.000 0.017 NA   NA
 7481120 7481121 SPP_0610 SPP_0611     TRUE 0.515 48.000 0.000 NA   NA
 7481121 7481122 SPP_0611 SPP_0612     FALSE 0.042 207.000 0.000 NA   NA
 7481122 7481123 SPP_0612 SPP_0613     FALSE 0.080 146.000 0.000 NA   NA
 7481123 7481124 SPP_0613 SPP_2306     FALSE 0.040 213.000 0.000 NA   NA
 7481124 7481125 SPP_2306 SPP_0614     FALSE 0.306 72.000 0.000 NA   NA
 7481125 7481126 SPP_0614 SPP_0615     TRUE 0.997 13.000 0.917 1.000 Y NA
 7481126 7481127 SPP_0615 SPP_0616     TRUE 0.973 52.000 0.542 1.000 Y NA
 7481127 7481128 SPP_0616 SPP_0617     FALSE 0.237 313.000 0.409 1.000 N NA
 7481128 7481129 SPP_0617 SPP_0618     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7481129 7481130 SPP_0618 SPP_0619   fba FALSE 0.113 141.000 0.000 1.000 N NA
 7481131 7481132 SPP_0620 SPP_0622     FALSE 0.030 249.000 0.000 NA   NA
 7481132 7481133 SPP_0622 SPP_0623     TRUE 0.997 10.000 0.947 0.011 Y NA
 7481133 7481134 SPP_0623 SPP_0624     TRUE 0.994 13.000 0.400 0.042 Y NA
 7481134 7481135 SPP_0624 SPP_0625     TRUE 0.989 11.000 0.185 1.000 Y NA
 7481136 7481137 SPP_0626 SPP_0627 recJ   FALSE 0.057 175.000 0.000 1.000   NA
 7481137 7481138 SPP_0627 SPP_0628     TRUE 0.764 69.000 0.143 NA   NA
 7481138 7481139 SPP_0628 SPP_0629     TRUE 0.480 112.000 0.100 NA   NA
 7481139 7481140 SPP_0629 SPP_0630     TRUE 0.996 5.000 0.467 0.008 Y NA
 7481140 7481141 SPP_0630 SPP_0631     TRUE 0.679 79.000 0.087 1.000 N NA
 7481141 7481142 SPP_0631 SPP_0632   uvrC TRUE 0.771 40.000 0.002 1.000 N NA
 7481142 7481143 SPP_0632 SPP_0633 uvrC   TRUE 0.891 -10.000 0.000 1.000   NA
 7481145 7481146 SPP_0635 SPP_0636     TRUE 0.871 -13.000 0.000 NA   NA
 7481146 7481147 SPP_0636 SPP_0637   pepV TRUE 0.959 13.000 0.051 1.000 N NA
 7481147 7481148 SPP_0637 SPP_0638 pepV   TRUE 0.769 54.000 0.031 NA N NA
 7481148 7481149 SPP_0638 SPP_0639     FALSE 0.066 160.000 0.000 NA   NA
 7481149 7481150 SPP_0639 SPP_0640     TRUE 0.807 16.000 0.000 NA   NA
 7481150 7481151 SPP_0640 SPP_0641   brnQ FALSE 0.057 171.000 0.000 NA   NA
 7481151 7481152 SPP_0641 SPP_0642 brnQ   FALSE 0.223 98.000 0.000 1.000 N NA
 7481152 7481153 SPP_0642 SPP_0643     TRUE 0.983 2.000 0.007 1.000 Y NA
 7481153 7481154 SPP_0643 SPP_0644     TRUE 0.847 8.000 0.000 NA   NA
 7481154 7481155 SPP_0644 SPP_0645     TRUE 0.797 17.000 0.000 NA   NA
 7481155 7481156 SPP_0645 SPP_0646     FALSE 0.295 81.000 0.000 NA N NA
 7481158 7481159 SPP_0648 SPP_0649 rplK rplA TRUE 0.730 208.000 0.838 0.034 Y NA
 7481159 7481160 SPP_0649 SPP_2307 rplA   FALSE 0.012 536.000 0.000 NA   NA
 7481162 7481163 SPP_0651 SPP_0652     TRUE 0.978 2.000 0.098 NA   NA
 7481163 7481164 SPP_0652 SPP_0653     TRUE 0.976 2.000 0.083 NA   NA
 7481164 7481165 SPP_0653 SPP_0654     TRUE 0.590 39.000 0.000 NA   NA
 7481169 7481170 SPP_0659 SPP_0660     FALSE 0.302 73.000 0.000 NA   NA
 7481170 7481171 SPP_0660 SPP_0661     FALSE 0.010 689.000 0.000 NA   NA
 7481171 7481172 SPP_0661 SPP_0662     TRUE 0.861 38.000 0.000 0.021 Y NA
 7481172 7481173 SPP_0662 SPP_0663     TRUE 0.814 48.000 0.000 0.032 Y NA
 7481173 7481174 SPP_0663 SPP_0664     TRUE 0.680 26.000 0.000 NA   NA
 7481174 7481175 SPP_0664 SPP_0665     FALSE 0.207 88.000 0.000 NA   NA
 7481176 7481177 SPP_0666 SPP_0667     TRUE 0.879 -12.000 0.000 NA   NA
 7481177 7481178 SPP_0667 SPP_0668     FALSE 0.040 211.000 0.000 NA   NA
 7481179 7481180 SPP_0669 SPP_0672     TRUE 0.834 -22.000 0.000 NA   NA
 7481180 7481181 SPP_0672 SPP_0674     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 7481181 7481182 SPP_0674 SPP_0675     TRUE 0.970 12.000 0.136 NA   NA
 7481184 7481185 SPP_0677 SPP_0678     FALSE 0.038 219.000 0.000 1.000   NA
 7481185 7481186 SPP_0678 SPP_0679     TRUE 0.986 20.000 0.250 1.000 Y NA
 7481186 7481187 SPP_0679 SPP_0680     TRUE 0.997 11.000 0.875 1.000 Y NA
 7481187 7481188 SPP_0680 SPP_0681     FALSE 0.157 313.000 0.240 1.000   NA
 7481188 7481189 SPP_0681 SPP_0682     TRUE 0.994 -3.000 0.480 0.012   NA
 7481189 7481190 SPP_0682 SPP_0683     FALSE 0.316 116.000 0.020 NA   NA
 7481190 7481191 SPP_0683 SPP_0684   zmpB1 TRUE 0.728 22.000 0.000 NA   NA
 7481191 7481192 SPP_0684 SPP_0685 zmpB1   TRUE 0.400 61.000 0.000 1.000   NA
 7481192 7481193 SPP_0685 SPP_0686     TRUE 0.957 1.000 0.006 NA   NA
 7481193 7481194 SPP_0686 SPP_0688     TRUE 0.501 50.000 0.000 NA   NA
 7481194 7481195 SPP_0688 SPP_0689     FALSE 0.107 127.000 0.000 NA   NA
 7481195 7481196 SPP_0689 SPP_0690   thyA TRUE 0.383 97.000 0.006 1.000 N NA
 7481198 7481199 SPP_0692 SPP_0693 miaA hflX TRUE 0.969 -7.000 0.027 1.000   NA
 7481199 7481200 SPP_0693 SPP_0694 hflX   TRUE 0.963 -7.000 0.014 NA   NA
 7481200 7481201 SPP_0694 SPP_0695   rnz TRUE 0.932 15.000 0.022 NA   NA
 7481201 7481202 SPP_0695 SPP_0696 rnz   TRUE 0.935 21.000 0.074 1.000   NA
 7481204 7481205 SPP_0698 SPP_0699     TRUE 0.974 0.000 0.035 NA   NA
 7481205 7481206 SPP_0699 SPP_0700     FALSE 0.205 89.000 0.000 NA   NA
 7481208 7481209 SPP_0702 SPP_0703 typA   TRUE 0.897 20.000 0.015 NA   NA
 7481209 7481210 SPP_0703 SPP_0704     FALSE 0.016 366.000 0.000 NA   NA
 7481210 7481211 SPP_0704 SPP_0705     FALSE 0.032 238.000 0.000 NA   NA
 7481211 7481212 SPP_0705 SPP_0706     TRUE 0.996 2.000 1.000 NA   NA
 7481212 7481213 SPP_0706 SPP_0707   murD FALSE 0.199 104.000 0.000 1.000 N NA
 7481213 7481214 SPP_0707 SPP_0708 murD   TRUE 0.990 2.000 0.060 1.000 Y NA
 7481214 7481215 SPP_0708 SPP_0709     TRUE 0.984 10.000 0.072 NA Y NA
 7481215 7481216 SPP_0709 SPP_0710   pyrF FALSE 0.042 233.000 0.000 NA N NA
 7481216 7481217 SPP_0710 SPP_0711 pyrF pyrE TRUE 0.919 34.000 0.006 1.000 Y NA
 7481217 7481218 SPP_0711 SPP_0712 pyrE   FALSE 0.012 461.000 0.000 NA   NA
 7481218 7481219 SPP_0712 SPP_0713     TRUE 0.821 96.000 0.667 NA   NA
 7481219 7481220 SPP_0713 SPP_0714     TRUE 0.995 0.000 0.667 NA   NA
 7481220 7481221 SPP_0714 SPP_0715     TRUE 0.995 4.000 1.000 NA   NA
 7481221 7481222 SPP_0715 SPP_0716     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 7481223 7481224 SPP_0717 SPP_0718     TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7481224 7481225 SPP_0718 SPP_0720     TRUE 0.905 1.000 0.000 NA   NA
 7481225 7481226 SPP_0720 SPP_0722     TRUE 0.815 -40.000 0.000 NA   NA
 7481227 7481228 SPP_0723 SPP_0724   lysS FALSE 0.110 128.000 0.000 1.000   NA
 7481228 7481229 SPP_0724 SPP_0725 lysS lctO FALSE 0.014 625.000 0.000 1.000 N NA
 7481229 7481230 SPP_0725 SPP_0726 lctO   FALSE 0.011 557.000 0.000 NA   NA
 7481232 7481233 SPP_0728 SPP_0729 thiM thiE1 TRUE 0.990 2.000 0.061 0.005 Y NA
 7481233 7481234 SPP_0729 SPP_0730 thiE1   FALSE 0.011 559.000 0.000 NA   NA
 7481234 7481235 SPP_0730 SPP_0731     TRUE 0.905 1.000 0.000 NA   NA
 7481235 7481236 SPP_0731 SPP_0732     TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 7481236 7481237 SPP_0732 SPP_0733     TRUE 0.951 11.000 0.050 NA   NA
 7481237 7481238 SPP_0733 SPP_0734   thiW TRUE 0.962 5.000 0.052 NA   NA
 7481238 7481239 SPP_0734 SPP_0735 thiW   TRUE 0.979 0.000 0.059 NA   NA
 7481239 7481240 SPP_0735 SPP_0736   thiE2 TRUE 0.995 -7.000 0.190 0.005 Y NA
 7481242 7481243 SPP_0738 SPP_0739     TRUE 0.979 11.000 0.250 NA   NA
 7481243 7481244 SPP_0739 SPP_0740     TRUE 0.974 10.000 0.167 NA   NA
 7481244 7481245 SPP_0740 SPP_0741   spxB FALSE 0.056 207.000 0.000 1.000 N NA
 7481245 7481246 SPP_0741 SPP_0742 spxB   TRUE 0.461 111.000 0.083 NA   NA
 7481247 7481248 SPP_0743 SPP_0744     TRUE 0.907 -6.000 0.000 NA   NA
 7481248 7481249 SPP_0744 SPP_0745     TRUE 0.806 -49.000 0.000 NA   NA
 7481250 7481251 SPP_0746 SPP_0748   manA FALSE 0.115 132.000 0.000 0.024   NA
 7481254 7481255 SPP_0751 SPP_0752     TRUE 0.470 53.000 0.000 1.000   NA
 7481255 7481256 SPP_0752 SPP_0753     TRUE 0.650 59.000 0.012 NA   NA
 7481257 7481258 SPP_0754 SPP_0755     TRUE 0.817 19.000 0.000 1.000 N NA
 7481258 7481259 SPP_0755 SPP_0756   upp TRUE 0.847 66.000 0.041 1.000 Y NA
 7481259 7481260 SPP_0756 SPP_0757 upp clpP FALSE 0.156 174.000 0.010 1.000 N NA
 7481260 7481261 SPP_0757 SPP_0758 clpP   TRUE 0.613 79.000 0.065 NA   NA
 7481261 7481262 SPP_0758 SPP_0759     TRUE 0.538 101.000 0.109 NA   NA
 7481264 7481265 SPP_0761 SPP_0762     TRUE 0.995 4.000 0.363 0.041 Y NA
 7481265 7481266 SPP_0762 SPP_0763     TRUE 0.997 0.000 0.349 1.000 Y NA
 7481266 7481267 SPP_0763 SPP_0764     TRUE 0.994 0.000 0.128 0.034 Y NA
 7481267 7481268 SPP_0764 SPP_0765     FALSE 0.147 308.000 0.214 1.000   NA
 7481268 7481269 SPP_0765 SPP_0766   prfB FALSE 0.041 214.000 0.000 1.000   NA
 7481269 7481270 SPP_0766 SPP_0767 prfB ftsE TRUE 0.949 18.000 0.053 1.000 N NA
 7481270 7481271 SPP_0767 SPP_0768 ftsE   TRUE 0.997 -7.000 0.431 1.000 Y NA
 7481271 7481272 SPP_0768 SPP_0769     FALSE 0.032 286.000 0.000 0.077 N NA
 7481272 7481273 SPP_0769 SPP_0770     TRUE 0.946 52.000 0.610 NA   NA
 7481273 7481274 SPP_0770 SPP_0771     FALSE 0.089 140.000 0.000 NA   NA
 7481274 7481275 SPP_0771 SPP_0772   metK FALSE 0.021 377.000 0.000 1.000 N NA
 7481275 7481276 SPP_0772 SPP_0773 metK   FALSE 0.015 553.000 0.000 1.000 N NA
 7481276 7481277 SPP_0773 SPP_0774   holA TRUE 0.800 34.000 0.002 1.000 N NA
 7481277 7481278 SPP_0774 SPP_0775 holA   FALSE 0.165 173.000 0.012 1.000 N NA
 7481278 7481279 SPP_0775 SPP_0776     FALSE 0.192 156.000 0.021 NA   NA
 7481279 7481280 SPP_0776 SPP_0777     TRUE 0.893 21.000 0.016 NA   NA
 7481280 7481281 SPP_0777 SPP_0778     TRUE 0.966 0.000 0.012 NA   NA
 7481281 7481282 SPP_0778 SPP_0779     TRUE 0.964 2.000 0.027 NA   NA
 7481283 7481284 SPP_0780 SPP_0781     FALSE 0.235 83.000 0.000 NA   NA
 7481284 7481285 SPP_0781 SPP_0782     FALSE 0.012 479.000 0.000 NA   NA
 7481286 7481287 SPP_0783 SPP_0784 rpsP   TRUE 0.976 20.000 0.385 1.000   NA
 7481287 7481288 SPP_0784 SPP_0785     FALSE 0.011 577.000 0.000 NA   NA
 7481288 7481289 SPP_0785 SPP_0786   rimM TRUE 0.644 31.000 0.000 NA   NA
 7481289 7481290 SPP_0786 SPP_0787 rimM trmD TRUE 0.997 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 7481290 7481291 SPP_0787 SPP_0788 trmD   TRUE 0.907 12.000 0.002 1.000   NA
 7481294 7481295 SPP_0790 SPP_0792     FALSE 0.374 63.000 0.000 NA   NA
 7481295 7481296 SPP_0792 SPP_0793   gor FALSE 0.046 196.000 0.000 NA   NA
 7481297 7481298 SPP_0794 SPP_0795     TRUE 0.995 -16.000 0.923 1.000 N NA
 7481298 7481299 SPP_0795 SPP_0796     TRUE 0.998 2.000 0.923 1.000 Y NA
 7481299 7481300 SPP_0796 SPP_0797   metG FALSE 0.248 124.000 0.003 1.000 N NA
 7481300 7481301 SPP_0797 SPP_0798 metG   FALSE 0.017 421.000 0.000 NA N NA
 7481301 7481302 SPP_0798 SPP_0799     TRUE 0.989 4.000 0.429 NA   NA
 7481302 7481303 SPP_0799 SPP_0800     FALSE 0.291 75.000 0.000 NA   NA
 7481303 7481304 SPP_0800 SPP_0801     FALSE 0.335 100.000 0.008 NA   NA
 7481304 7481305 SPP_0801 SPP_0802     TRUE 0.995 -7.000 0.710 NA   NA
 7481305 7481306 SPP_0802 SPP_0803     TRUE 0.964 11.000 0.067 1.000 N NA
 7481306 7481307 SPP_0803 SPP_0804     TRUE 0.840 -22.000 0.000 1.000   NA
 7481307 7481308 SPP_0804 SPP_0805     TRUE 0.827 -25.000 0.000 NA   NA
 7481308 7481309 SPP_0805 SPP_0806     FALSE 0.115 123.000 0.000 NA   NA
 7481309 7481310 SPP_0806 SPP_0807     TRUE 0.482 109.000 0.061 1.000 N NA
 7481310 7481311 SPP_0807 SPP_0808     TRUE 0.997 -10.000 0.606 1.000 Y NA
 7481313 7481314 SPP_0810 SPP_0811     FALSE 0.059 200.000 0.000 1.000 N NA
 7481314 7481315 SPP_0811 SPP_0812     TRUE 0.947 10.000 0.019 1.000 N NA
 7481315 7481316 SPP_0812 SPP_0813     TRUE 0.923 11.000 0.008 NA   NA
 7481316 7481317 SPP_0813 SPP_0814     FALSE 0.284 76.000 0.000 NA   NA
 7481317 7481318 SPP_0814 SPP_0815   gyrB TRUE 0.926 15.000 0.013 1.000   NA
 7481318 7481319 SPP_0815 SPP_0816 gyrB ezrA TRUE 0.505 82.000 0.011 1.000 N NA
 7481320 7481321 SPP_0817 SPP_0818     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7481322 7481323 SPP_0819 SPP_0820     FALSE 0.085 142.000 0.000 NA   NA
 7481325 7481326 SPP_0822 SPP_0823     FALSE 0.035 226.000 0.000 NA   NA
 7481326 7481327 SPP_0823 SPP_0824     TRUE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 7481328 7481329 SPP_0825 SPP_0826     FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 7481331 7481332 SPP_0828 SPP_0829     FALSE 0.035 229.000 0.000 NA   NA
 7481333 7481334 SPP_0830 SPP_0831     TRUE 0.998 0.000 0.640 1.000 Y NA
 7481334 7481335 SPP_0831 SPP_0832     FALSE 0.279 133.000 0.017 1.000 N NA
 7481335 7481336 SPP_0832 SPP_0833     FALSE 0.273 142.000 0.030 NA N NA
 7481336 7481337 SPP_0833 SPP_0834   rpiA FALSE 0.082 282.000 0.000 NA Y NA
 7481337 7481338 SPP_0834 SPP_0835 rpiA deoB TRUE 0.974 14.000 0.018 1.000 Y NA
 7481338 7481339 SPP_0835 SPP_0836 deoB   TRUE 0.981 2.000 0.120 NA   NA
 7481339 7481340 SPP_0836 SPP_0837     FALSE 0.349 148.000 0.125 NA   NA
 7481340 7481341 SPP_0837 SPP_0838     FALSE 0.013 476.000 0.000 1.000   NA
 7481341 7481342 SPP_0838 SPP_0839     TRUE 0.541 46.000 0.000 1.000   NA
 7481342 7481343 SPP_0839 SPP_0840     TRUE 0.704 25.000 0.000 1.000   NA
 7481343 7481344 SPP_0840 SPP_0841     FALSE 0.153 106.000 0.000 NA   NA
 7481344 7481345 SPP_0841 SPP_0842   deoD FALSE 0.013 439.000 0.000 NA   NA
 7481346 7481347 SPP_0843 SPP_0844   rpsT TRUE 0.673 53.000 0.002 1.000 N NA
 7481347 7481348 SPP_0844 SPP_0845 rpsT coaA TRUE 0.631 68.000 0.014 1.000 N NA
 7481349 7481350 SPP_0846 SPP_0847     FALSE 0.038 216.000 0.000 NA   NA
 7481350 7481351 SPP_0847 SPP_0848     TRUE 0.980 -3.000 0.044 1.000 N NA
 7481351 7481352 SPP_0848 SPP_0849   deoC TRUE 0.982 18.000 0.106 1.000 Y NA
 7481352 7481353 SPP_0849 SPP_0850 deoC cdd1 TRUE 0.986 -13.000 0.051 1.000 Y NA
 7481353 7481354 SPP_0850 SPP_0851 cdd1   TRUE 0.675 91.000 0.200 1.000   NA
 7481354 7481355 SPP_0851 SPP_0852     FALSE 0.231 144.000 0.024 1.000   NA
 7481355 7481356 SPP_0852 SPP_0853     TRUE 0.993 -7.000 0.438 1.000   NA
 7481356 7481357 SPP_0853 SPP_0854     TRUE 0.994 3.000 0.720 0.040   NA
 7481357 7481358 SPP_0854 SPP_0855     FALSE 0.219 85.000 0.000 NA   NA
 7481358 7481359 SPP_0855 SPP_0856     FALSE 0.095 136.000 0.000 NA   NA
 7481359 7481360 SPP_0856 SPP_0857     TRUE 0.785 18.000 0.000 NA   NA
 7481360 7481361 SPP_0857 SPP_0858     TRUE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 7481363 7481364 SPP_0860 SPP_0861 parE   FALSE 0.121 121.000 0.000 NA   NA
 7481364 7481365 SPP_0861 SPP_0862   parC FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 7481365 7481366 SPP_0862 SPP_0863 parC ilvE TRUE 0.402 132.000 0.086 1.000 N NA
 7481366 7481367 SPP_0863 SPP_0864 ilvE   TRUE 0.436 56.000 0.000 NA   NA
 7481367 7481368 SPP_0864 SPP_0865     FALSE 0.363 65.000 0.000 NA   NA
 7481368 7481369 SPP_0865 SPP_0866     TRUE 0.997 -3.000 0.939 NA   NA
 7481369 7481370 SPP_0866 SPP_0867   pcp1 TRUE 0.980 15.000 0.300 NA   NA
 7481370 7481371 SPP_0867 SPP_0868 pcp1   FALSE 0.059 168.000 0.000 NA   NA
 7481371 7481372 SPP_0868 SPP_0869     TRUE 0.501 50.000 0.000 NA   NA
 7481372 7481373 SPP_0869 SPP_0870     TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 7481373 7481374 SPP_0870 SPP_0871     FALSE 0.067 159.000 0.000 NA   NA
 7481374 7481375 SPP_0871 SPP_0872     TRUE 0.420 86.000 0.005 NA N NA
 7481375 7481376 SPP_0872 SPP_0873     TRUE 0.977 0.000 0.030 NA N NA
 7481376 7481377 SPP_0873 SPP_0874     TRUE 0.808 52.000 0.067 NA   NA
 7481377 7481378 SPP_0874 SPP_0875   sufC FALSE 0.145 150.000 0.003 NA   NA
 7481378 7481379 SPP_0875 SPP_0876 sufC sufD TRUE 0.971 28.000 0.139 1.000 Y NA
 7481379 7481380 SPP_0876 SPP_0877 sufD   TRUE 0.991 11.000 0.606 1.000 N NA
 7481380 7481381 SPP_0877 SPP_0878     TRUE 0.989 -13.000 0.292 1.000 N NA
 7481381 7481382 SPP_0878 SPP_0879   sufB TRUE 0.882 54.000 0.152 0.002 N NA
 7481384 7481385 SPP_0881 SPP_2298     FALSE 0.010 646.000 0.000 NA   NA
 7481387 7481388 SPP_0883 SPP_0884   pfkB TRUE 0.998 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 7481388 7481389 SPP_0884 SPP_0885 pfkB   TRUE 0.998 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 7481389 7481390 SPP_0885 SPP_0886     TRUE 0.481 86.000 0.010 0.055 N NA
 7481392 7481393 SPP_0888 SPP_0889   thiI TRUE 0.987 9.000 0.349 1.000 N NA
 7481393 7481394 SPP_0889 SPP_0890 thiI   FALSE 0.190 135.000 0.005 NA   NA
 7481394 7481395 SPP_0890 SPP_0891     TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 7481395 7481396 SPP_0891 SPP_0892     FALSE 0.028 260.000 0.000 NA   NA
 7481396 7481397 SPP_0892 SPP_0893     FALSE 0.115 123.000 0.000 NA   NA
 7481397 7481398 SPP_0893 SPP_0894     TRUE 0.986 13.000 0.092 0.062 Y NA
 7481398 7481399 SPP_0894 SPP_0895     TRUE 0.394 60.000 0.000 NA   NA
 7481399 7481400 SPP_0895 SPP_0896     TRUE 0.964 -3.000 0.009 NA   NA
 7481400 7481401 SPP_0896 SPP_0897     FALSE 0.130 118.000 0.000 1.000   NA
 7481401 7481402 SPP_0897 SPP_0898     TRUE 0.841 -34.000 0.000 0.062   NA
 7481402 7481403 SPP_0898 SPP_0899     TRUE 0.893 30.000 0.048 0.007   NA
 7481403 7481404 SPP_0899 SPP_0900     FALSE 0.026 271.000 0.000 NA   NA
 7481405 7481406 SPP_0901 SPP_0902     TRUE 0.805 17.000 0.000 1.000   NA
 7481407 7481408 SPP_0903 SPP_0904   pfkA TRUE 0.668 83.000 0.098 1.000 N NA
 7481408 7481409 SPP_0904 SPP_0905 pfkA pyk TRUE 0.947 59.000 0.261 0.005 Y NA
 7481412 7481413 SPP_0908 SPP_0909     TRUE 0.905 1.000 0.000 NA   NA
 7481414 7481415 SPP_0910 SPP_0911     TRUE 0.620 35.000 0.000 NA   NA
 7481416 7481417 SPP_0912 SPP_0913     TRUE 0.996 -3.000 0.841 NA   NA
 7481417 7481418 SPP_0913 SPP_0914     TRUE 0.980 1.000 0.091 NA   NA
 7481419 7481420 SPP_0915 SPP_0916     TRUE 0.973 -58.000 0.215 NA   NA
 7481420 7481421 SPP_0916 SPP_0917     TRUE 0.736 59.000 0.051 NA   NA
 7481421 7481422 SPP_0917 SPP_0918     FALSE 0.011 973.000 0.000 NA N NA
 7481422 7481423 SPP_0918 SPP_0919     TRUE 0.995 2.000 0.855 1.000   NA
 7481424 7481425 SPP_0920 SPP_0921     TRUE 0.680 26.000 0.000 NA   NA
 7481425 7481426 SPP_0921 SPP_0922     FALSE 0.033 233.000 0.000 NA   NA
 7481428 7481429 SPP_0923 SPP_0925     TRUE 0.807 -48.000 0.000 NA   NA
 7481430 7481431 SPP_0926 SPP_0927 speE lys TRUE 0.990 -3.000 0.036 1.000 Y NA
 7481431 7481432 SPP_0927 SPP_0928 lys nspC TRUE 0.997 0.000 0.444 1.000 Y NA
 7481432 7481433 SPP_0928 SPP_0929 nspC aguA TRUE 0.990 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 7481433 7481434 SPP_0929 SPP_0930 aguA aguB TRUE 0.963 10.000 0.084 1.000   NA
 7481438 7481439 SPP_0934 SPP_0935   lspA TRUE 0.987 -3.000 0.119 1.000 N NA
 7481439 7481440 SPP_0935 SPP_0936 lspA   TRUE 0.979 -10.000 0.082 1.000 N NA
 7481440 7481441 SPP_0936 SPP_0937     TRUE 0.881 3.000 0.000 1.000   NA
 7481441 7481442 SPP_0937 SPP_0938   proB FALSE 0.172 101.000 0.000 1.000   NA
 7481442 7481443 SPP_0938 SPP_0939 proB proA TRUE 0.993 10.000 0.281 0.002 Y NA
 7481443 7481444 SPP_0939 SPP_0940 proA proC TRUE 0.965 4.000 0.000 0.002 Y NA
 7481444 7481445 SPP_0940 SPP_0941 proC tmk FALSE 0.047 220.000 0.000 1.000 N NA
 7481445 7481446 SPP_0941 SPP_0942 tmk   TRUE 0.992 -3.000 0.254 1.000 N NA
 7481446 7481447 SPP_0942 SPP_0943     TRUE 0.839 40.000 0.038 NA   NA
 7481447 7481448 SPP_0943 SPP_0944     TRUE 0.965 3.000 0.043 NA   NA
 7481448 7481449 SPP_0944 SPP_0945     FALSE 0.035 227.000 0.000 NA   NA
 7481449 7481450 SPP_0945 SPP_0947     FALSE 0.148 109.000 0.000 NA   NA
 7481451 7481452 SPP_0946 SPP_0948     TRUE 0.797 17.000 0.000 NA   NA
 7481452 7481453 SPP_0948 SPP_0949     FALSE 0.332 68.000 0.000 NA   NA
 7481454 7481455 SPP_0950 SPP_0951 trmFO pyrH TRUE 0.419 84.000 0.002 1.000 N NA
 7481455 7481456 SPP_0951 SPP_0952 pyrH frr TRUE 0.992 9.000 0.626 1.000 N NA
 7481456 7481457 SPP_0952 SPP_0953 frr   TRUE 0.884 21.000 0.012 NA   NA
 7481457 7481458 SPP_0953 SPP_0954     TRUE 0.936 9.000 0.013 NA   NA
 7481458 7481459 SPP_0954 SPP_0955     TRUE 0.411 86.000 0.010 NA   NA
 7481459 7481460 SPP_0955 SPP_0956     FALSE 0.055 180.000 0.000 1.000   NA
 7481460 7481461 SPP_0956 SPP_0957     TRUE 0.970 3.000 0.065 NA   NA
 7481463 7481464 SPP_0960 SPP_0961     TRUE 0.787 68.000 0.125 1.000 N NA
 7481464 7481465 SPP_0961 SPP_0962     TRUE 0.924 -16.000 0.002 1.000   NA
 7481465 7481466 SPP_0962 SPP_0963     FALSE 0.015 400.000 0.000 1.000   NA
 7481466 7481467 SPP_0963 SPP_0964     TRUE 0.991 4.000 0.500 NA   NA
 7481467 7481468 SPP_0964 SPP_0965   infC FALSE 0.022 286.000 0.000 NA   NA
 7481468 7481469 SPP_0965 SPP_0966 infC rpmI TRUE 0.988 33.000 0.652 1.000 Y NA
 7481469 7481470 SPP_0966 SPP_0967 rpmI rplT TRUE 0.984 52.000 0.928 0.024 Y NA
 7481470 7481471 SPP_0967 SPP_0968 rplT   TRUE 0.650 58.000 0.003 1.000 N NA
 7481471 7481472 SPP_0968 SPP_0969     FALSE 0.039 250.000 0.000 1.000 N NA
 7481472 7481473 SPP_0969 SPP_0970     TRUE 0.991 11.000 0.592 1.000 N NA
 7481473 7481474 SPP_0970 SPP_0971     FALSE 0.324 99.000 0.005 1.000   NA
 7481476 7481477 SPP_0973 SPP_0974     TRUE 0.951 -19.000 0.035 NA   NA
 7481477 7481478 SPP_0974 SPP_0975   era TRUE 0.949 17.000 0.063 1.000   NA
 7481478 7481479 SPP_0975 SPP_0976 era mutM TRUE 0.700 49.000 0.004 1.000   NA
 7481479 7481480 SPP_0976 SPP_0977 mutM coaE TRUE 0.983 0.000 0.066 1.000 N NA
 7481480 7481481 SPP_0977 SPP_0978 coaE   TRUE 0.953 -13.000 0.007 1.000 N NA
 7481481 7481482 SPP_0978 SPP_0979   rpmG1 TRUE 0.972 0.000 0.012 1.000 N NA
 7481482 7481483 SPP_0979 SPP_0980 rpmG1 secG TRUE 0.821 40.000 0.012 1.000 N NA
 7481483 7481484 SPP_0980 SPP_0981 secG rnr TRUE 0.515 102.000 0.064 1.000 N NA
 7481484 7481485 SPP_0981 SPP_0982 rnr smpB TRUE 0.975 -37.000 0.143 0.028 N NA
 7481485 7481486 SPP_0982 SPP_0983 smpB tehB TRUE 0.910 16.000 0.002 1.000 N NA
 7481486 7481487 SPP_0983 SPP_0984 tehB   FALSE 0.302 73.000 0.000 NA   NA
 7481487 7481488 SPP_0984 SPP_0985   pepF1 TRUE 0.965 19.000 0.204 NA   NA
 7481488 7481489 SPP_0985 SPP_0986 pepF1   TRUE 0.831 38.000 0.024 1.000   NA
 7481489 7481490 SPP_0986 SPP_0987     TRUE 0.613 67.000 0.016 1.000   NA
 7481491 7481492 SPP_0988 SPP_0989     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7481492 7481493 SPP_0989 SPP_0990     FALSE 0.011 570.000 0.000 NA   NA
 7481493 7481494 SPP_0990 SPP_0991     TRUE 0.969 0.000 0.018 NA   NA
 7481494 7481495 SPP_0991 SPP_0992     TRUE 0.966 0.000 0.012 NA   NA
 7481495 7481496 SPP_0992 SPP_0993     TRUE 0.511 95.000 0.062 NA   NA
 7481497 7481498 SPP_0994 SPP_0995 glmU   TRUE 0.945 10.000 0.015 1.000 N NA
 7481498 7481499 SPP_0995 SPP_0996     TRUE 0.942 12.000 0.025 NA   NA
 7481499 7481500 SPP_0996 SPP_0997   mtnN TRUE 0.937 17.000 0.041 NA   NA
 7481500 7481501 SPP_0997 SPP_0998 mtnN   TRUE 0.478 77.000 0.006 1.000   NA
 7481501 7481502 SPP_0998 SPP_0999     TRUE 0.725 74.000 0.105 0.036   NA
 7481502 7481503 SPP_0999 SPP_1000     TRUE 0.973 9.000 0.105 1.000 N NA
 7481503 7481504 SPP_1000 SPP_1001     FALSE 0.050 214.000 0.000 NA N NA
 7481504 7481505 SPP_1001 SPP_1002     FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 7481505 7481506 SPP_1002 SPP_1003     FALSE 0.065 161.000 0.000 NA   NA
 7481506 7481507 SPP_1003 SPP_1004     TRUE 0.575 42.000 0.000 NA   NA
 7481507 7481508 SPP_1004 SPP_1005     FALSE 0.034 231.000 0.000 NA   NA
 7481508 7481509 SPP_1005 SPP_1006     TRUE 0.995 11.000 0.500 1.000 Y NA
 7481509 7481510 SPP_1006 SPP_1007     FALSE 0.021 375.000 0.000 1.000 N NA
 7481510 7481511 SPP_1007 SPP_1008     FALSE 0.109 143.000 0.000 1.000 N NA
 7481511 7481512 SPP_1008 SPP_1009     TRUE 0.989 8.000 0.500 NA   NA
 7481512 7481513 SPP_1009 SPP_1010     FALSE 0.040 211.000 0.000 NA   NA
 7481513 7481514 SPP_1010 SPP_1011     FALSE 0.009 830.000 0.000 NA   NA
 7481514 7481515 SPP_1011 SPP_1012     FALSE 0.021 295.000 0.000 NA   NA
 7481518 7481519 SPP_1016 SPP_1017 mscL   TRUE 0.427 82.000 0.003 0.054   NA
 7481520 7481521 SPP_1018 SPP_1019     FALSE 0.168 100.000 0.000 NA   NA
 7481521 7481522 SPP_1019 SPP_1020   asd FALSE 0.018 339.000 0.000 NA   NA
 7481522 7481523 SPP_1020 SPP_1021 asd dapA TRUE 0.902 56.000 0.063 1.000 Y NA
 7481524 7481525 SPP_1022 SPP_1023 trmE   FALSE 0.178 137.000 0.003 1.000   NA
 7481526 7481527 SPP_1024 SPP_1025 tdk   TRUE 0.945 -10.000 0.004 1.000   NA
 7481527 7481528 SPP_1025 SPP_1026   prfA TRUE 0.906 10.000 0.002 1.000   NA
 7481528 7481529 SPP_1026 SPP_1027 prfA hemK TRUE 0.993 0.000 0.084 1.000 Y NA
 7481529 7481530 SPP_1027 SPP_1028 hemK   TRUE 0.982 -16.000 0.029 NA Y NA
 7481530 7481531 SPP_1028 SPP_1029     TRUE 0.957 2.000 0.012 NA   NA
 7481531 7481532 SPP_1029 SPP_1030   glyA TRUE 0.734 62.000 0.056 1.000   NA
 7481532 7481533 SPP_1030 SPP_1031 glyA   TRUE 0.969 8.000 0.103 NA   NA
 7481533 7481534 SPP_1031 SPP_1032     TRUE 0.985 0.000 0.128 NA   NA
 7481534 7481535 SPP_1032 SPP_1033     TRUE 0.561 74.000 0.019 NA   NA
 7481535 7481536 SPP_1033 SPP_1034   rumA1 TRUE 0.561 74.000 0.019 NA   NA
 7481536 7481537 SPP_1034 SPP_1035 rumA1   FALSE 0.013 738.000 0.000 1.000 N NA
 7481537 7481538 SPP_1035 SPP_1036     FALSE 0.020 393.000 0.000 1.000 N NA
 7481538 7481539 SPP_1036 SPP_1037     TRUE 0.998 -10.000 0.778 1.000 Y NA
 7481539 7481540 SPP_1037 SPP_1038     TRUE 0.998 0.000 0.800 0.038 Y NA
 7481540 7481541 SPP_1038 SPP_1039     TRUE 0.996 0.000 0.250 1.000 Y NA
 7481541 7481542 SPP_1039 SPP_1040     FALSE 0.009 926.000 0.000 NA   NA
 7481542 7481543 SPP_1040 SPP_1041     FALSE 0.010 684.000 0.000 NA   NA
 7481543 7481544 SPP_1041 SPP_1042     FALSE 0.195 92.000 0.000 NA   NA
 7481544 7481545 SPP_1042 SPP_1044     FALSE 0.026 268.000 0.000 NA   NA
 7481545 7481546 SPP_1044 SPP_1045     FALSE 0.018 323.000 0.000 NA   NA
 7481546 7481547 SPP_1045 SPP_1046     TRUE 0.796 62.000 0.125 NA   NA
 7481547 7481548 SPP_1046 SPP_1047     TRUE 0.417 58.000 0.000 NA   NA
 7481548 7481549 SPP_1047 SPP_1048     TRUE 0.481 112.000 0.077 NA N NA
 7481549 7481550 SPP_1048 SPP_1049     FALSE 0.063 163.000 0.000 NA   NA
 7481550 7481551 SPP_1049 SPP_1051     FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 7481551 7481552 SPP_1051 SPP_1052     FALSE 0.089 140.000 0.000 NA   NA
 7481552 7481553 SPP_1052 SPP_1053     FALSE 0.049 190.000 0.000 NA   NA
 7481553 7481554 SPP_1053 SPP_1054     TRUE 0.916 0.000 0.000 1.000   NA
 7481554 7481555 SPP_1054 SPP_1055     TRUE 0.666 28.000 0.000 NA   NA
 7481555 7481556 SPP_1055 SPP_1056     FALSE 0.009 819.000 0.000 NA   NA
 7481556 7481557 SPP_1056 SPP_1057     FALSE 0.049 189.000 0.000 NA   NA
 7481557 7481558 SPP_1057 SPP_1058     TRUE 0.871 -13.000 0.000 NA   NA
 7481558 7481559 SPP_1058 SPP_1059     FALSE 0.043 204.000 0.000 NA   NA
 7481561 7481562 SPP_1062 SPP_1063     TRUE 0.871 -13.000 0.000 NA   NA
 7481562 7481563 SPP_1063 SPP_1064     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7481563 7481564 SPP_1064 SPP_1065     TRUE 0.868 4.000 0.000 NA   NA
 7481564 7481565 SPP_1065 SPP_1066     TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 7481565 7481566 SPP_1066 SPP_1067   galE1 TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 7481566 7481567 SPP_1067 SPP_1068 galE1   TRUE 0.718 24.000 0.000 1.000   NA
 7481567 7481568 SPP_1068 SPP_1069     TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 7481568 7481569 SPP_1069 SPP_1071     FALSE 0.010 680.000 0.000 NA   NA
 7481569 7481570 SPP_1071 SPP_1072     FALSE 0.013 448.000 0.000 NA   NA
 7481570 7481571 SPP_1072 SPP_1073     FALSE 0.027 264.000 0.000 NA   NA
 7481571 7481572 SPP_1073 SPP_1074   ppc TRUE 0.925 20.000 0.028 1.000 N NA
 7481572 7481573 SPP_1074 SPP_1075 ppc   FALSE 0.014 413.000 0.000 NA   NA
 7481573 7481574 SPP_1075 SPP_1076     TRUE 0.861 69.000 0.368 NA   NA
 7481574 7481575 SPP_1076 SPP_1077     TRUE 0.997 -3.000 0.895 1.000   NA
 7481575 7481576 SPP_1077 SPP_1078   dnaG FALSE 0.342 90.000 0.002 1.000   NA
 7481576 7481577 SPP_1078 SPP_1079 dnaG   TRUE 0.986 3.000 0.209 1.000 N NA
 7481577 7481578 SPP_1079 SPP_1080     TRUE 0.946 14.000 0.044 NA   NA
 7481578 7481579 SPP_1080 SPP_1081     FALSE 0.319 115.000 0.019 NA   NA
 7481579 7481580 SPP_1081 SPP_1082     TRUE 0.993 16.000 0.413 0.011 Y NA
 7481580 7481581 SPP_1082 SPP_1083     TRUE 0.862 31.000 0.016 NA N NA
 7481581 7481582 SPP_1083 SPP_1084     TRUE 0.836 59.000 0.167 NA   NA
 7481582 7481583 SPP_1084 SPP_1085     TRUE 0.551 70.000 0.011 NA   NA
 7481583 7481584 SPP_1085 SPP_1086     TRUE 0.926 10.000 0.009 NA   NA
 7481584 7481585 SPP_1086 SPP_1087   murA1 FALSE 0.009 1050.000 0.000 NA   NA
 7481585 7481586 SPP_1087 SPP_1088 murA1   TRUE 0.954 16.000 0.052 1.000 N NA
 7481586 7481587 SPP_1088 SPP_1089     TRUE 0.992 -7.000 0.342 1.000 N NA
 7481587 7481588 SPP_1089 SPP_1090   map TRUE 0.979 16.000 0.235 1.000 N NA
 7481588 7481589 SPP_1090 SPP_1091 map   FALSE 0.015 380.000 0.000 NA   NA
 7481589 7481590 SPP_1091 SPP_1092     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7481590 7481591 SPP_1092 SPP_1093   pcrA FALSE 0.172 191.000 0.000 0.059 Y NA
 7481591 7481592 SPP_1093 SPP_1095 pcrA   TRUE 0.902 43.000 0.005 0.015 Y NA
 7481593 7481594 SPP_1094 SPP_1096     TRUE 0.988 18.000 0.714 1.000   NA
 7481594 7481595 SPP_1096 SPP_1097     TRUE 0.675 83.000 0.143 NA   NA
 7481595 7481596 SPP_1097 SPP_1098     TRUE 0.960 8.000 0.056 NA   NA
 7481596 7481597 SPP_1098 SPP_1099     TRUE 0.979 5.000 0.166 NA   NA
 7481597 7481598 SPP_1099 SPP_1100     TRUE 0.985 10.000 0.089 1.000 Y NA
 7481598 7481599 SPP_1100 SPP_1101     TRUE 0.530 113.000 0.145 1.000   NA
 7481600 7481601 SPP_1102 SPP_1103     TRUE 0.993 -16.000 0.725 1.000   NA
 7481601 7481602 SPP_1103 SPP_1104     TRUE 0.989 -3.000 0.150 1.000 N NA
 7481602 7481603 SPP_1104 SPP_1105   pta TRUE 0.871 44.000 0.067 1.000 N NA
 7481604 7481605 SPP_1106 SPP_1107     FALSE 0.056 173.000 0.000 NA   NA
 7481605 7481606 SPP_1107 SPP_1108     FALSE 0.036 219.000 0.000 NA   NA
 7481607 7481608 SPP_1109 SPP_1110   rplU FALSE 0.037 218.000 0.000 NA   NA
 7481608 7481609 SPP_1110 SPP_1111 rplU   TRUE 0.988 16.000 0.208 NA Y NA
 7481609 7481610 SPP_1111 SPP_1112   rpmA TRUE 0.987 17.000 0.203 NA Y NA
 7481611 7481612 SPP_1113 SPP_1114     TRUE 0.825 -28.000 0.000 NA   NA
 7481615 7481616 SPP_1117 SPP_1118     TRUE 0.494 107.000 0.098 NA   NA
 7481616 7481617 SPP_1118 SPP_1119     FALSE 0.014 427.000 0.000 1.000   NA
 7481617 7481618 SPP_1119 SPP_1120     TRUE 0.957 3.000 0.019 1.000   NA
 7481618 7481619 SPP_1120 SPP_1121     TRUE 0.863 80.000 0.600 NA   NA
 7481619 7481620 SPP_1121 SPP_1122   ligA FALSE 0.318 93.000 0.002 NA   NA
 7481620 7481621 SPP_1122 SPP_1123 ligA pulA FALSE 0.286 112.000 0.002 1.000 N NA
 7481623 7481624 SPP_1125 SPP_1126   glgB FALSE 0.016 483.000 0.000 1.000 N NA
 7481624 7481625 SPP_1126 SPP_1127 glgB glgC TRUE 0.996 -10.000 0.317 0.002 Y NA
 7481625 7481626 SPP_1127 SPP_1128 glgC glgD TRUE 0.998 -10.000 0.810 0.001 Y NA
 7481626 7481627 SPP_1128 SPP_1129 glgD   TRUE 0.997 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 7481627 7481628 SPP_1129 SPP_1130     TRUE 0.404 59.000 0.000 NA   NA
 7481628 7481629 SPP_1130 SPP_1132     FALSE 0.023 283.000 0.000 NA   NA
 7481635 7481636 SPP_1137 SPP_1138 rexB addA TRUE 0.993 -3.000 0.070 0.059 Y NA
 7481636 7481637 SPP_1138 SPP_1139 addA   FALSE 0.094 215.000 0.010 NA   NA
 7481637 7481638 SPP_1139 SPP_1140     FALSE 0.041 209.000 0.000 NA   NA
 7481638 7481639 SPP_1140 SPP_1141   zmpB2 TRUE 0.599 44.000 0.000 0.002   NA
 7481641 7481642 SPP_1143 SPP_1144     TRUE 0.992 -3.000 0.333 NA   NA
 7481642 7481643 SPP_1144 SPP_1145     TRUE 0.713 99.000 0.333 NA   NA
 7481643 7481644 SPP_1145 SPP_1146     TRUE 0.995 -16.000 1.000 NA   NA
 7481644 7481645 SPP_1146 SPP_1147     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 7481645 7481646 SPP_1147 SPP_1148     TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 7481646 7481647 SPP_1148 SPP_1149     FALSE 0.083 144.000 0.000 NA   NA
 7481648 7481649 SPP_1150 SPP_1151     FALSE 0.240 82.000 0.000 NA   NA
 7481649 7481650 SPP_1151 SPP_1152     FALSE 0.010 688.000 0.000 NA   NA
 7481651 7481652 SPP_1153 SPP_1154     FALSE 0.017 356.000 0.000 NA   NA
 7481653 7481654 SPP_1155 SPP_1156     TRUE 0.986 16.000 0.545 NA   NA
 7481654 7481655 SPP_1156 SPP_1157     FALSE 0.031 245.000 0.000 NA   NA
 7481655 7481656 SPP_1157 SPP_1158     TRUE 0.813 15.000 0.000 NA   NA
 7481656 7481657 SPP_1158 SPP_1159     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7481657 7481658 SPP_1159 SPP_1160     TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 7481658 7481659 SPP_1160 SPP_1161     TRUE 0.857 -16.000 0.000 NA   NA
 7481659 7481660 SPP_1161 SPP_1162     TRUE 0.827 -25.000 0.000 NA   NA
 7481660 7481661 SPP_1162 SPP_1163     FALSE 0.127 117.000 0.000 NA   NA
 7481661 7481662 SPP_1163 SPP_1164     TRUE 0.563 43.000 0.000 NA   NA
 7481662 7481663 SPP_1164 SPP_1165     FALSE 0.056 178.000 0.000 1.000   NA
 7481663 7481664 SPP_1165 SPP_1166     TRUE 0.657 29.000 0.000 NA   NA
 7481664 7481665 SPP_1166 SPP_1167     TRUE 0.769 19.000 0.000 NA   NA
 7481665 7481666 SPP_1167 SPP_1168     TRUE 0.715 23.000 0.000 NA   NA
 7481667 7481668 SPP_1169 SPP_1170     TRUE 0.886 -10.000 0.000 NA   NA
 7481668 7481669 SPP_1170 SPP_1171     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7481669 7481670 SPP_1171 SPP_1172     TRUE 0.742 21.000 0.000 NA   NA
 7481670 7481671 SPP_1172 SPP_1173     TRUE 0.797 17.000 0.000 NA   NA
 7481671 7481672 SPP_1173 SPP_1174     TRUE 0.450 54.000 0.000 NA   NA
 7481672 7481673 SPP_1174 SPP_1175     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 7481673 7481674 SPP_1175 SPP_1176     TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7481674 7481675 SPP_1176 SPP_1177     FALSE 0.032 238.000 0.000 NA   NA
 7481675 7481676 SPP_1177 SPP_1178     FALSE 0.074 152.000 0.000 NA   NA
 7481676 7481677 SPP_1178 SPP_1179     TRUE 0.515 48.000 0.000 NA   NA
 7481677 7481678 SPP_1179 SPP_1180     TRUE 0.894 75.000 0.667 NA   NA
 7481678 7481679 SPP_1180 SPP_1181     TRUE 0.993 14.000 1.000 NA   NA
 7481681 7481682 SPP_1183 SPP_1184     TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 7481682 7481683 SPP_1184 SPP_1185     TRUE 0.489 51.000 0.000 NA   NA
 7481683 7481684 SPP_1185 SPP_1186     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7481684 7481685 SPP_1186 SPP_1187     TRUE 0.598 38.000 0.000 NA   NA
 7481685 7481686 SPP_1187 SPP_1188     FALSE 0.317 70.000 0.000 NA   NA
 7481686 7481687 SPP_1188 SPP_1189     TRUE 0.983 0.000 0.095 1.000   NA
 7481687 7481688 SPP_1189 SPP_1190     FALSE 0.036 228.000 0.000 1.000   NA
 7481688 7481689 SPP_1190 SPP_1191     TRUE 0.904 3.000 0.000 1.000 N NA
 7481689 7481690 SPP_1191 SPP_1192     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7481690 7481691 SPP_1192 SPP_1193     TRUE 0.886 -10.000 0.000 NA   NA
 7481691 7481692 SPP_1193 SPP_1194     FALSE 0.021 296.000 0.000 NA   NA
 7481692 7481693 SPP_1194 SPP_1195     FALSE 0.084 143.000 0.000 NA   NA
 7481693 7481694 SPP_1195 SPP_1196     TRUE 0.871 -13.000 0.000 NA   NA
 7481694 7481695 SPP_1196 SPP_1197     FALSE 0.156 104.000 0.000 NA   NA
 7481695 7481696 SPP_1197 SPP_1198     FALSE 0.011 588.000 0.000 1.000   NA
 7481696 7481697 SPP_1198 SPP_1199     FALSE 0.248 82.000 0.000 1.000   NA
 7481697 7481698 SPP_1199 SPP_1200     TRUE 0.980 -13.000 0.148 1.000   NA
 7481698 7481699 SPP_1200 SPP_1201     TRUE 0.911 16.000 0.002 1.000 N NA
 7481699 7481700 SPP_1201 SPP_1202     FALSE 0.016 494.000 0.000 1.000 N NA
 7481701 7481702 SPP_1203 SPP_1204   lpdA TRUE 0.849 64.000 0.200 1.000 N NA
 7481702 7481703 SPP_1204 SPP_1205 lpdA   TRUE 0.962 46.000 0.227 1.000 Y NA
 7481703 7481704 SPP_1205 SPP_1206     FALSE 0.368 218.000 0.103 0.042 Y NA
 7481704 7481705 SPP_1206 SPP_1207     TRUE 0.996 16.000 0.769 0.001 Y NA
 7481705 7481706 SPP_1207 SPP_1208     FALSE 0.094 154.000 0.000 1.000 N NA
 7481706 7481707 SPP_1208 SPP_1209     FALSE 0.030 285.000 0.000 1.000 N NA
 7481707 7481708 SPP_1209 SPP_1210     TRUE 0.931 13.000 0.005 1.000 N NA
 7481708 7481709 SPP_1210 SPP_1211   ung TRUE 0.981 10.000 0.043 1.000 Y NA
 7481709 7481710 SPP_1211 SPP_1212 ung   FALSE 0.092 138.000 0.000 NA   NA
 7481710 7481711 SPP_1212 SPP_1213     TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 7481711 7481712 SPP_1213 SPP_1214     FALSE 0.030 253.000 0.000 1.000   NA
 7481712 7481713 SPP_1214 SPP_1215     FALSE 0.011 567.000 0.000 NA   NA
 7481713 7481714 SPP_1215 SPP_1217     FALSE 0.013 422.000 0.000 NA   NA
 7481714 7481715 SPP_1217 SPP_1218     FALSE 0.069 158.000 0.000 NA   NA
 7481717 7481718 SPP_1219 SPP_1221 ptsP   TRUE 0.993 6.000 0.240 0.018 Y NA
 7481719 7481720 SPP_1222 SPP_1223     TRUE 0.871 81.000 0.562 1.000 N NA
 7481720 7481721 SPP_1223 SPP_1224     TRUE 0.684 188.000 0.500 0.001 Y NA
 7481721 7481722 SPP_1224 SPP_1225     FALSE 0.219 182.000 0.056 1.000 N NA
 7481723 7481724 SPP_1226 SPP_1227   lacG2 TRUE 0.677 123.000 0.500 NA   NA
 7481724 7481725 SPP_1227 SPP_1228 lacG2   TRUE 0.445 215.000 0.200 1.000 Y NA
 7481725 7481726 SPP_1228 SPP_1229     TRUE 0.998 0.000 0.600 0.018 Y NA
 7481726 7481727 SPP_1229 SPP_1230     TRUE 0.964 36.000 0.500 1.000   NA
 7481727 7481728 SPP_1230 SPP_1231   lacD FALSE 0.034 234.000 0.000 1.000   NA
 7481728 7481729 SPP_1231 SPP_1232 lacD lacC TRUE 0.998 2.000 0.800 0.001 Y NA
 7481729 7481730 SPP_1232 SPP_1233 lacC lacB TRUE 0.995 11.000 0.500 1.000 Y NA
 7481730 7481731 SPP_1233 SPP_1234 lacB lacA TRUE 0.982 31.000 0.333 0.001 Y NA
 7481731 7481732 SPP_1234 SPP_1235 lacA   FALSE 0.072 158.000 0.000 1.000   NA
 7481732 7481733 SPP_1235 SPP_1236     FALSE 0.061 169.000 0.000 1.000   NA
 7481733 7481734 SPP_1236 SPP_1237     TRUE 0.797 17.000 0.000 NA   NA
 7481734 7481735 SPP_1237 SPP_1238     TRUE 0.847 8.000 0.000 NA   NA
 7481735 7481736 SPP_1238 SPP_1239     TRUE 0.861 38.000 0.000 0.018 Y NA
 7481738 7481739 SPP_1241 SPP_1242 lepA   TRUE 0.401 79.000 0.002 1.000   NA
 7481739 7481740 SPP_1242 SPP_1243   recN TRUE 0.950 2.000 0.005 1.000   NA
 7481740 7481741 SPP_1243 SPP_1244 recN   TRUE 0.962 7.000 0.037 1.000 N NA
 7481741 7481742 SPP_1244 SPP_1245   tylA TRUE 0.977 -7.000 0.048 1.000 N NA
 7481742 7481743 SPP_1245 SPP_1246 tylA   TRUE 0.979 -7.000 0.058 1.000 N NA
 7481743 7481744 SPP_1246 SPP_1247   xseB TRUE 0.986 -3.000 0.100 1.000 N NA
 7481744 7481745 SPP_1247 SPP_1248 xseB xseA TRUE 0.995 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 7481745 7481746 SPP_1248 SPP_1249 xseA udk FALSE 0.227 128.000 0.002 1.000 N NA
 7481746 7481747 SPP_1249 SPP_1250 udk   FALSE 0.149 108.000 0.000 NA   NA
 7481747 7481748 SPP_1250 SPP_1251   truB FALSE 0.032 241.000 0.000 NA   NA
 7481748 7481749 SPP_1251 SPP_1252 truB   TRUE 0.933 10.000 0.014 NA   NA
 7481749 7481750 SPP_1252 SPP_1253     FALSE 0.183 96.000 0.000 NA   NA
 7481750 7481751 SPP_1253 SPP_1255     FALSE 0.078 148.000 0.000 NA   NA
 7481751 7481752 SPP_1255 SPP_1256     FALSE 0.040 244.000 0.000 NA N NA
 7481752 7481753 SPP_1256 SPP_1257   gyrA TRUE 0.972 0.000 0.013 NA N NA
 7481755 7481756 SPP_1259 SPP_1260     TRUE 0.523 47.000 0.000 NA   NA
 7481756 7481757 SPP_1260 SPP_1261     TRUE 0.991 2.000 0.400 NA   NA
 7481757 7481758 SPP_1261 SPP_1262     FALSE 0.199 91.000 0.000 NA   NA
 7481758 7481759 SPP_1262 SPP_1263     TRUE 0.969 2.000 0.038 1.000   NA
 7481759 7481760 SPP_1263 SPP_1264     TRUE 0.998 -7.000 0.597 0.011 Y NA
 7481760 7481761 SPP_1264 SPP_1265   mutY TRUE 0.656 56.000 0.002 1.000 N NA
 7481764 7481765 SPP_1268 SPP_1269 coaB coaC TRUE 0.934 12.000 0.013 1.000   NA
 7481765 7481766 SPP_1269 SPP_1270 coaC   TRUE 0.948 -16.000 0.019 NA   NA
 7481766 7481767 SPP_1270 SPP_1271     FALSE 0.073 282.000 0.026 NA   NA
 7481767 7481768 SPP_1271 SPP_1273     TRUE 0.966 12.000 0.107 NA   NA
 7481769 7481770 SPP_1272 SPP_1274     TRUE 0.574 74.000 0.021 1.000   NA
 7481770 7481771 SPP_1274 SPP_1275     TRUE 0.936 -34.000 0.014 0.011   NA
 7481771 7481772 SPP_1275 SPP_1276   uvrB TRUE 0.921 10.000 0.002 1.000 N NA
 7481772 7481773 SPP_1276 SPP_1277 uvrB   TRUE 0.417 77.000 0.002 NA   NA
 7481774 7481775 SPP_1278 SPP_1279     TRUE 0.997 0.000 0.326 1.000 Y NA
 7481775 7481776 SPP_1279 SPP_1280   zwf FALSE 0.241 149.000 0.021 1.000 N NA
 7481777 7481778 SPP_1281 SPP_1282     TRUE 0.883 4.000 0.000 0.069   NA
 7481778 7481779 SPP_1282 SPP_1283     TRUE 0.926 0.000 0.000 0.016   NA
 7481779 7481780 SPP_1283 SPP_1284   smc TRUE 0.962 -3.000 0.006 1.000   NA
 7481780 7481781 SPP_1284 SPP_1285 smc rnc TRUE 0.984 -9.000 0.120 1.000 N NA
 7481781 7481782 SPP_1285 SPP_1286 rnc   FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 7481782 7481783 SPP_1286 SPP_1287   guaC FALSE 0.374 63.000 0.000 NA   NA
 7481783 7481784 SPP_1287 SPP_1288 guaC   FALSE 0.070 175.000 0.000 NA N NA
 7481784 7481785 SPP_1288 SPP_1289     TRUE 0.996 -13.000 0.467 NA Y NA
 7481785 7481786 SPP_1289 SPP_1290     FALSE 0.063 163.000 0.000 NA   NA
 7481786 7481787 SPP_1290 SPP_1291     TRUE 0.886 -10.000 0.000 NA   NA
 7481787 7481788 SPP_1291 SPP_1292     FALSE 0.168 100.000 0.000 NA   NA
 7481788 7481789 SPP_1292 SPP_1293     FALSE 0.036 219.000 0.000 NA   NA
 7481789 7481790 SPP_1293 SPP_1294     TRUE 0.868 4.000 0.000 NA   NA
 7481790 7481791 SPP_1294 SPP_1295   leuB TRUE 0.962 -3.000 0.007 NA   NA
 7481791 7481792 SPP_1295 SPP_1296 leuB   TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7481792 7481793 SPP_1296 SPP_1298     TRUE 0.769 19.000 0.000 NA   NA
 7481793 7481794 SPP_1298 SPP_1299     TRUE 0.820 44.000 0.040 NA   NA
 7481794 7481795 SPP_1299 SPP_1300     TRUE 0.409 93.000 0.015 NA   NA
 7481795 7481796 SPP_1300 SPP_1301   topA FALSE 0.153 106.000 0.000 NA   NA
 7481796 7481797 SPP_1301 SPP_1302 topA   FALSE 0.060 167.000 0.000 NA   NA
 7481799 7481800 SPP_1304 SPP_1305 dprA   FALSE 0.345 98.000 0.002 1.000 N NA
 7481800 7481801 SPP_1305 SPP_1306     TRUE 0.970 12.000 0.133 1.000   NA
 7481801 7481802 SPP_1306 SPP_1307     TRUE 0.994 -10.000 0.667 NA   NA
 7481802 7481803 SPP_1307 SPP_1308     TRUE 0.957 17.000 0.074 NA N NA
 7481803 7481804 SPP_1308 SPP_1309     TRUE 0.989 5.000 0.367 1.000 N NA
 7481805 7481806 SPP_1310 SPP_1311     TRUE 0.988 10.000 0.500 NA   NA
 7481806 7481807 SPP_1311 SPP_1312     TRUE 0.998 2.000 1.000 NA Y NA
 7481808 7481809 SPP_1313 SPP_1314 carB carA FALSE 0.243 313.000 0.117 0.001 Y NA
 7481809 7481810 SPP_1314 SPP_1315 carA pyrB TRUE 0.889 50.000 0.014 1.000 Y NA
 7481810 7481811 SPP_1315 SPP_1316 pyrB   TRUE 0.987 19.000 0.247 1.000 Y NA
 7481811 7481812 SPP_1316 SPP_1317   nth FALSE 0.053 211.000 0.000 1.000 N NA
 7481812 7481813 SPP_1317 SPP_1318 nth   TRUE 0.953 0.000 0.002 NA   NA
 7481814 7481815 SPP_1319 SPP_1320     TRUE 0.489 51.000 0.000 NA   NA
 7481815 7481816 SPP_1320 SPP_1321     FALSE 0.032 239.000 0.000 NA   NA
 7481817 7481818 SPP_1322 SPP_1323     TRUE 0.986 2.000 0.222 NA   NA
 7481819 7481820 SPP_1324 SPP_1325 gidB   FALSE 0.038 254.000 0.000 1.000 N NA
 7481821 7481822 SPP_1326 SPP_1327 ffh   TRUE 0.973 12.000 0.151 1.000   NA
 7481822 7481823 SPP_1327 SPP_1328     TRUE 0.388 91.000 0.009 NA   NA
 7481824 7481825 SPP_1329 SPP_1330     TRUE 0.946 13.000 0.035 1.000   NA
 7481825 7481826 SPP_1330 SPP_1331     TRUE 0.574 43.000 0.000 1.000   NA
 7481827 7481828 SPP_1332 SPP_1333   rplS TRUE 0.575 42.000 0.000 NA   NA
 7481828 7481829 SPP_1333 SPP_1334 rplS   FALSE 0.274 119.000 0.004 1.000 N NA
 7481829 7481830 SPP_1334 SPP_1335     TRUE 0.995 -6.000 0.160 0.068 Y NA
 7481830 7481831 SPP_1335 SPP_1336     TRUE 0.976 -3.000 0.023 1.000 N NA
 7481831 7481832 SPP_1336 SPP_1337     FALSE 0.167 116.000 0.000 1.000 N NA
 7481833 7481834 SPP_1338 SPP_1339   rpmE TRUE 0.415 96.000 0.020 1.000   NA
 7481835 7481836 SPP_1340 SPP_1341     TRUE 0.847 8.000 0.000 NA   NA
 7481836 7481837 SPP_1341 SPP_1342     FALSE 0.115 123.000 0.000 NA   NA
 7481837 7481838 SPP_1342 SPP_1343     TRUE 0.473 52.000 0.000 NA   NA
 7481840 7481841 SPP_1345 SPP_1346     TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 7481841 7481842 SPP_1346 SPP_1347     FALSE 0.011 599.000 0.000 1.000   NA
 7481844 7481845 SPP_1349 SPP_1350     TRUE 0.785 18.000 0.000 NA   NA
 7481845 7481846 SPP_1350 SPP_1351   cdd2 TRUE 0.700 32.000 0.000 1.000 N NA
 7481846 7481847 SPP_1351 SPP_1352 cdd2 pgpA FALSE 0.029 288.000 0.000 1.000 N NA
 7481847 7481848 SPP_1352 SPP_1353 pgpA   TRUE 0.860 5.000 0.000 NA   NA
 7481848 7481849 SPP_1353 SPP_1354   gsiA TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 7481849 7481850 SPP_1354 SPP_1355 gsiA   TRUE 0.833 13.000 0.000 1.000   NA
 7481850 7481851 SPP_1355 SPP_1356     TRUE 0.983 17.000 0.091 0.036 Y NA
 7481851 7481852 SPP_1356 SPP_1357     TRUE 0.712 109.000 0.091 0.036 Y NA
 7481852 7481853 SPP_1357 SPP_1358     FALSE 0.240 82.000 0.000 NA   NA
 7481853 7481854 SPP_1358 SPP_1359     TRUE 0.708 24.000 0.000 NA   NA
 7481854 7481855 SPP_1359 SPP_1360     TRUE 0.585 47.000 0.000 NA N NA
 7481855 7481856 SPP_1360 SPP_1361     FALSE 0.011 583.000 0.000 NA   NA
 7481856 7481857 SPP_1361 SPP_1362     FALSE 0.023 283.000 0.000 NA   NA
 7481857 7481858 SPP_1362 SPP_1363     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7481858 7481859 SPP_1363 SPP_1364     FALSE 0.102 130.000 0.000 NA   NA
 7481859 7481860 SPP_1364 SPP_1365     TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 7481860 7481861 SPP_1365 SPP_1366     TRUE 0.883 91.000 1.000 NA   NA
 7481861 7481862 SPP_1366 SPP_1367     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 7481862 7481863 SPP_1367 SPP_1368     TRUE 0.857 -16.000 0.000 NA   NA
 7481863 7481864 SPP_1368 SPP_1371     FALSE 0.172 99.000 0.000 NA   NA
 7481864 7481865 SPP_1371 SPP_1372     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7481865 7481866 SPP_1372 SPP_1373   rplL FALSE 0.090 187.000 0.002 NA   NA
 7481866 7481867 SPP_1373 SPP_1374 rplL   TRUE 0.964 76.000 0.884 0.022 Y NA
 7481867 7481868 SPP_1374 SPP_1375     FALSE 0.039 250.000 0.000 1.000 N NA
 7481868 7481869 SPP_1375 SPP_1376     FALSE 0.236 95.000 0.000 1.000 N NA
 7481869 7481870 SPP_1376 SPP_1377     TRUE 0.998 2.000 0.895 0.007 Y NA
 7481870 7481871 SPP_1377 SPP_1378     TRUE 0.756 58.000 0.035 1.000 N NA
 7481871 7481872 SPP_1378 SPP_1379     TRUE 0.657 29.000 0.000 NA   NA
 7481872 7481873 SPP_1379 SPP_1380   thrB TRUE 0.807 16.000 0.000 NA   NA
 7481873 7481874 SPP_1380 SPP_1381 thrB   TRUE 0.988 2.000 0.036 1.000 Y NA
 7481874 7481875 SPP_1381 SPP_1382     FALSE 0.273 151.000 0.044 NA N NA
 7481875 7481876 SPP_1382 SPP_1383     FALSE 0.045 200.000 0.000 NA   NA
 7481876 7481877 SPP_1383 SPP_1384     TRUE 0.958 29.000 0.333 NA   NA
 7481877 7481878 SPP_1384 SPP_1385     TRUE 0.974 16.000 0.222 NA   NA
 7481878 7481879 SPP_1385 SPP_1386     TRUE 0.895 2.000 0.000 1.000   NA
 7481879 7481880 SPP_1386 SPP_1387     TRUE 0.971 -7.000 0.000 NA Y NA
 7481880 7481881 SPP_1387 SPP_1388     FALSE 0.030 279.000 0.000 NA N NA
 7481881 7481882 SPP_1388 SPP_1389     TRUE 0.976 -3.000 0.025 NA N NA
 7481882 7481883 SPP_1389 SPP_1390   aroK TRUE 0.990 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 7481883 7481884 SPP_1390 SPP_1391 aroK aroA TRUE 0.986 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 7481884 7481885 SPP_1391 SPP_1392 aroA   FALSE 0.334 92.000 0.003 NA   NA
 7481885 7481886 SPP_1392 SPP_1393     TRUE 0.955 11.000 0.058 NA   NA
 7481886 7481887 SPP_1393 SPP_1394   aroC TRUE 0.974 10.000 0.010 1.000 Y NA
 7481887 7481888 SPP_1394 SPP_1395 aroC aroB TRUE 0.988 10.000 0.110 0.003 Y NA
 7481888 7481889 SPP_1395 SPP_1396 aroB aroE TRUE 0.961 19.000 0.010 1.000 Y NA
 7481889 7481890 SPP_1396 SPP_1397 aroE aroD TRUE 0.997 -10.000 0.500 1.000 Y NA
 7481890 7481891 SPP_1397 SPP_1398 aroD   TRUE 0.985 -3.000 0.125 NA   NA
 7481891 7481892 SPP_1398 SPP_1399     FALSE 0.010 687.000 0.000 NA   NA
 7481892 7481893 SPP_1399 SPP_1400     TRUE 0.985 -19.000 0.341 NA   NA
 7481895 7481896 SPP_1402 SPP_1403 alaS   TRUE 0.863 22.000 0.006 NA   NA
 7481896 7481897 SPP_1403 SPP_1404     FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 7481897 7481898 SPP_1404 SPP_1405     FALSE 0.027 261.000 0.000 NA   NA
 7481898 7481899 SPP_1405 SPP_1406     TRUE 0.996 -3.000 0.253 0.035 Y NA
 7481899 7481900 SPP_1406 SPP_1407     TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.035 Y NA
 7481900 7481901 SPP_1407 SPP_1408     TRUE 0.997 -19.000 0.928 0.035 Y NA
 7481901 7481902 SPP_1408 SPP_1409   murB FALSE 0.243 160.000 0.041 1.000 N NA
 7481902 7481903 SPP_1409 SPP_1410 murB   FALSE 0.266 112.000 0.005 NA   NA
 7481903 7481904 SPP_1410 SPP_1411   budA TRUE 0.949 10.000 0.042 NA   NA
 7481906 7481907 SPP_1413 SPP_1414   phoU1 FALSE 0.026 297.000 0.000 NA N NA
 7481907 7481908 SPP_1414 SPP_1415 phoU1 pstB1 TRUE 0.994 12.000 0.413 NA Y NA
 7481908 7481909 SPP_1415 SPP_1416 pstB1 pstB2 TRUE 0.995 13.000 0.542 0.002 Y NA
 7481909 7481910 SPP_1416 SPP_1417 pstB2 pstA1 TRUE 0.995 11.000 0.490 0.004 Y NA
 7481910 7481911 SPP_1417 SPP_1418 pstA1 pstC1 TRUE 0.998 -10.000 0.907 0.004 Y NA
 7481911 7481912 SPP_1418 SPP_1419 pstC1   TRUE 0.995 0.000 0.206 1.000 Y NA
 7481914 7481915 SPP_1421 SPP_1422     TRUE 0.990 1.000 0.229 NA N NA
 7481915 7481916 SPP_1422 SPP_1423     TRUE 0.989 -10.000 0.337 NA   NA
 7481916 7481917 SPP_1423 SPP_1424     TRUE 0.988 0.000 0.169 NA   NA
 7481917 7481918 SPP_1424 SPP_1425     FALSE 0.041 210.000 0.000 NA   NA
 7481918 7481919 SPP_1425 SPP_1426     TRUE 0.989 -10.000 0.330 NA   NA
 7481919 7481920 SPP_1426 SPP_1427     TRUE 0.961 11.000 0.055 1.000 N NA
 7481920 7481921 SPP_1427 SPP_1428     TRUE 0.970 5.000 0.060 1.000 N NA
 7481921 7481922 SPP_1428 SPP_1429     TRUE 0.478 84.000 0.021 NA   NA
 7481922 7481923 SPP_1429 SPP_1430     TRUE 0.972 16.000 0.206 NA   NA
 7481923 7481924 SPP_1430 SPP_1431   lgt TRUE 0.979 1.000 0.079 NA   NA
 7481924 7481925 SPP_1431 SPP_1432 lgt hprK TRUE 0.994 -7.000 0.494 1.000 N NA
 7481925 7481926 SPP_1432 SPP_1433 hprK rpsU FALSE 0.235 130.000 0.011 1.000   NA
 7481926 7481927 SPP_1433 SPP_1434 rpsU   FALSE 0.209 140.000 0.011 1.000   NA
 7481929 7481930 SPP_1436 SPP_1437     FALSE 0.009 1460.000 0.000 NA   NA
 7481930 7481931 SPP_1437 SPP_1438   nadE FALSE 0.049 350.000 0.007 1.000 N NA
 7481931 7481932 SPP_1438 SPP_1439 nadE pncB TRUE 0.996 -3.000 0.194 0.003 Y NA
 7481932 7481933 SPP_1439 SPP_1440 pncB   FALSE 0.320 116.000 0.021 NA   NA
 7481933 7481934 SPP_1440 SPP_1441     TRUE 0.978 -10.000 0.103 NA   NA
 7481934 7481935 SPP_1441 SPP_1442     FALSE 0.012 465.000 0.000 NA   NA
 7481935 7481936 SPP_1442 SPP_1444     TRUE 0.807 16.000 0.000 NA   NA
 7481936 7481937 SPP_1444 SPP_1445     FALSE 0.071 156.000 0.000 NA   NA
 7481937 7481938 SPP_1445 SPP_1446     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 7481938 7481939 SPP_1446 SPP_1448     FALSE 0.030 249.000 0.000 NA   NA
 7481939 7481940 SPP_1448 SPP_1449     TRUE 0.917 15.000 0.008 1.000   NA
 7481941 7481942 SPP_1450 SPP_1452     TRUE 0.847 8.000 0.000 NA   NA
 7481942 7481943 SPP_1452 SPP_1453     FALSE 0.030 247.000 0.000 NA   NA
 7481945 7481946 SPP_1455 SPP_1456     TRUE 0.994 -16.000 0.294 0.007 Y NA
 7481946 7481947 SPP_1456 SPP_1457     TRUE 0.828 11.000 0.000 NA   NA
 7481947 7481948 SPP_1457 SPP_1458     TRUE 0.997 0.000 1.000 NA   NA
 7481948 7481949 SPP_1458 SPP_1459     TRUE 0.989 -12.000 0.357 1.000   NA
 7481950 7481951 SPP_1460 SPP_1461     FALSE 0.020 299.000 0.000 NA   NA
 7481951 7481952 SPP_1461 SPP_1462     TRUE 0.769 19.000 0.000 NA   NA
 7481952 7481953 SPP_1462 SPP_1463     TRUE 0.804 -97.000 0.000 NA   NA
 7481953 7481954 SPP_1463 SPP_1464     FALSE 0.023 284.000 0.000 NA   NA
 7481954 7481955 SPP_1464 SPP_1465     TRUE 0.844 -19.000 0.000 NA   NA
 7481955 7481956 SPP_1465 SPP_1466     FALSE 0.020 304.000 0.000 NA   NA
 7481958 7481959 SPP_1468 SPP_1469     TRUE 0.956 9.000 0.047 1.000   NA
 7481959 7481960 SPP_1469 SPP_1470     TRUE 0.992 -3.000 0.326 NA   NA
 7481960 7481961 SPP_1470 SPP_1471     FALSE 0.227 84.000 0.000 NA   NA
 7481961 7481962 SPP_1471 SPP_1472     TRUE 0.983 2.000 0.143 1.000   NA
 7481962 7481963 SPP_1472 SPP_1473     TRUE 0.728 22.000 0.000 NA   NA
 7481964 7481965 SPP_1476 SPP_1477 def1   TRUE 0.873 45.000 0.002 1.000 Y NA
 7481966 7481967 SPP_1478 SPP_1479 trxB   TRUE 0.771 66.000 0.117 NA   NA
 7481967 7481968 SPP_1479 SPP_1480     TRUE 0.819 78.000 0.364 NA   NA
 7481968 7481969 SPP_1480 SPP_1481     TRUE 0.996 0.000 0.310 1.000 Y NA
 7481969 7481970 SPP_1481 SPP_1482     FALSE 0.190 158.000 0.010 1.000 N NA
 7481970 7481971 SPP_1482 SPP_1483     TRUE 0.958 13.000 0.050 1.000 N NA
 7481971 7481972 SPP_1483 SPP_1484     TRUE 0.970 0.000 0.019 1.000   NA
 7481973 7481974 SPP_1485 SPP_1486     TRUE 0.987 -3.000 0.146 1.000   NA
 7481975 7481976 SPP_1487 SPP_1488     TRUE 0.997 1.000 0.488 NA Y NA
 7481976 7481977 SPP_1488 SPP_1489     FALSE 0.156 152.000 0.005 1.000   NA
 7481978 7481979 SPP_1490 SPP_1491     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7481979 7481980 SPP_1491 SPP_1492     TRUE 0.862 60.000 0.243 NA   NA
 7481980 7481981 SPP_1492 SPP_1493     TRUE 0.984 19.000 0.588 NA   NA
 7481982 7481983 SPP_1494 SPP_1495   glyS TRUE 0.807 42.000 0.020 NA   NA
 7481983 7481984 SPP_1495 SPP_1496 glyS glyQ TRUE 0.590 260.000 0.651 0.001 Y NA
 7481984 7481985 SPP_1496 SPP_1497 glyQ   FALSE 0.033 369.000 0.003 NA   NA
 7481985 7481986 SPP_1497 SPP_1498     TRUE 0.822 -33.000 0.000 NA   NA
 7481986 7481987 SPP_1498 SPP_1499     FALSE 0.025 273.000 0.000 NA   NA
 7481987 7481988 SPP_1499 SPP_1500     FALSE 0.142 114.000 0.000 1.000   NA
 7481988 7481989 SPP_1500 SPP_1501     FALSE 0.021 289.000 0.000 NA   NA
 7481990 7481991 SPP_1502 SPP_1503     TRUE 0.989 -3.000 0.200 1.000   NA
 7481992 7481993 SPP_1504 SPP_1505     TRUE 0.802 -112.000 0.000 NA   NA
 7481993 7481994 SPP_1505 SPP_1506     FALSE 0.121 121.000 0.000 NA   NA
 7481994 7481995 SPP_1506 SPP_1507   tuf FALSE 0.015 384.000 0.000 NA   NA
 7481995 7481996 SPP_1507 SPP_1508 tuf   FALSE 0.017 343.000 0.000 NA   NA
 7481996 7481997 SPP_1508 SPP_1509     FALSE 0.014 411.000 0.000 NA   NA
 7481997 7481998 SPP_1509 SPP_1510     TRUE 0.695 25.000 0.000 NA   NA
 7481998 7481999 SPP_1510 SPP_1511     FALSE 0.284 76.000 0.000 NA   NA
 7481999 7482000 SPP_1511 SPP_1512     TRUE 0.812 -42.000 0.000 NA   NA
 7482000 7482001 SPP_1512 SPP_1513     FALSE 0.105 128.000 0.000 NA   NA
 7482001 7482002 SPP_1513 SPP_1514     TRUE 0.834 -22.000 0.000 NA   NA
 7482002 7482003 SPP_1514 SPP_1515     FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 7482003 7482004 SPP_1515 SPP_1516     TRUE 0.871 -13.000 0.000 NA   NA
 7482004 7482005 SPP_1516 SPP_1517     TRUE 0.515 48.000 0.000 NA   NA
 7482006 7482007 SPP_1518 SPP_1519     TRUE 0.404 111.000 0.049 NA   NA
 7482008 7482009 SPP_1520 SPP_1521     TRUE 0.988 13.000 0.154 1.000 Y NA
 7482009 7482010 SPP_1521 SPP_1522     TRUE 0.988 10.000 0.130 1.000 Y NA
 7482010 7482011 SPP_1522 SPP_1523     FALSE 0.200 146.000 0.013 1.000   NA
 7482011 7482012 SPP_1523 SPP_1524     TRUE 0.989 -10.000 0.324 NA   NA
 7482014 7482015 SPP_1526 SPP_1527 atpC atpD TRUE 0.997 11.000 0.837 0.004 Y NA
 7482015 7482016 SPP_1527 SPP_1528 atpD atpG TRUE 0.938 86.000 0.724 0.004 Y NA
 7482016 7482017 SPP_1528 SPP_1529 atpG atpA TRUE 0.996 16.000 0.846 0.004 Y NA
 7482017 7482018 SPP_1529 SPP_1530 atpA atpH TRUE 0.997 15.000 0.864 0.004 Y NA
 7482018 7482019 SPP_1530 SPP_1531 atpH atpF TRUE 0.996 0.000 0.222 0.004 Y NA
 7482019 7482020 SPP_1531 SPP_1532 atpF atpB TRUE 0.979 14.000 0.032 0.004 Y NA
 7482020 7482021 SPP_1532 SPP_1533 atpB   TRUE 0.987 35.000 0.557 0.004 Y NA
 7482021 7482022 SPP_1533 SPP_1534     FALSE 0.355 75.000 0.000 1.000 N NA
 7482022 7482023 SPP_1534 SPP_1535     FALSE 0.013 445.000 0.000 NA   NA
 7482025 7482026 SPP_1537 SPP_1538     TRUE 0.689 71.000 0.079 NA   NA
 7482026 7482027 SPP_1538 SPP_1539     TRUE 0.670 81.000 0.120 NA   NA
 7482027 7482028 SPP_1539 SPP_1540     TRUE 0.977 -3.000 0.037 0.010   NA
 7482028 7482029 SPP_1540 SPP_1541   murC TRUE 0.935 10.000 0.014 1.000   NA
 7482029 7482030 SPP_1541 SPP_1542 murC   TRUE 0.930 11.000 0.013 NA   NA
 7482030 7482031 SPP_1542 SPP_1543     TRUE 0.883 48.000 0.151 NA   NA
 7482031 7482032 SPP_1543 SPP_1544     FALSE 0.242 93.000 0.000 1.000 N NA
 7482032 7482033 SPP_1544 SPP_1545     TRUE 0.987 8.000 0.082 0.009 Y NA
 7482033 7482034 SPP_1545 SPP_1546     FALSE 0.072 158.000 0.000 1.000   NA
 7482036 7482037 SPP_1548 SPP_1550     FALSE 0.057 172.000 0.000 NA   NA
 7482037 7482038 SPP_1550 SPP_1551     FALSE 0.046 203.000 0.000 1.000   NA
 7482040 7482041 SPP_1553 SPP_1554     TRUE 0.647 101.000 0.231 NA   NA
 7482041 7482042 SPP_1554 SPP_1555     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7482042 7482043 SPP_1555 SPP_1556     TRUE 0.929 37.000 0.208 NA   NA
 7482043 7482044 SPP_1556 SPP_1557     TRUE 0.382 86.000 0.005 NA   NA
 7482044 7482045 SPP_1557 SPP_1558     TRUE 0.559 71.000 0.005 1.000 N NA
 7482045 7482046 SPP_1558 SPP_1559     TRUE 0.986 -10.000 0.209 1.000   NA
 7482046 7482047 SPP_1559 SPP_1560     TRUE 0.667 54.000 0.006 1.000   NA
 7482047 7482048 SPP_1560 SPP_1561     TRUE 0.972 -25.000 0.151 1.000   NA
 7482048 7482049 SPP_1561 SPP_1562   rpsR FALSE 0.022 295.000 0.000 1.000   NA
 7482049 7482050 SPP_1562 SPP_1563 rpsR   TRUE 0.852 32.000 0.012 1.000 N NA
 7482050 7482051 SPP_1563 SPP_1564   rpsF TRUE 0.941 12.000 0.012 1.000 N NA
 7482051 7482052 SPP_1564 SPP_1565 rpsF asnS FALSE 0.232 153.000 0.000 1.000 Y NA
 7482052 7482053 SPP_1565 SPP_1566 asnS   TRUE 0.902 19.000 0.013 NA   NA
 7482053 7482054 SPP_1566 SPP_1567     TRUE 0.972 -7.000 0.042 NA   NA
 7482054 7482055 SPP_1567 SPP_1568     TRUE 0.989 -3.000 0.205 NA   NA
 7482055 7482056 SPP_1568 SPP_1569     FALSE 0.345 67.000 0.000 NA   NA
 7482058 7482059 SPP_1571 SPP_1572     TRUE 0.427 79.000 0.004 NA   NA
 7482059 7482060 SPP_1572 SPP_1573     TRUE 0.643 67.000 0.030 NA   NA
 7482060 7482061 SPP_1573 SPP_1574   def2 TRUE 0.943 12.000 0.028 NA   NA
 7482061 7482062 SPP_1574 SPP_1575 def2   FALSE 0.161 116.000 0.000 NA N NA
 7482062 7482063 SPP_1575 SPP_1576     TRUE 0.859 13.000 0.000 NA N NA
 7482065 7482066 SPP_1578 SPP_1579     TRUE 0.979 -3.000 0.056 1.000   NA
 7482066 7482067 SPP_1579 SPP_1580   dapB TRUE 0.945 12.000 0.015 1.000 N NA
 7482067 7482068 SPP_1580 SPP_1581 dapB   FALSE 0.051 277.000 0.004 NA   NA
 7482068 7482069 SPP_1581 SPP_1582     TRUE 0.982 2.000 0.139 NA   NA
 7482069 7482070 SPP_1582 SPP_1583   glmM TRUE 0.469 74.000 0.003 1.000   NA
 7482070 7482071 SPP_1583 SPP_1584 glmM   TRUE 0.945 24.000 0.150 NA   NA
 7482071 7482072 SPP_1584 SPP_1585     TRUE 0.991 -13.000 0.502 NA   NA
 7482074 7482075 SPP_1587 SPP_1588     TRUE 0.994 -3.000 0.470 NA   NA
 7482075 7482076 SPP_1588 SPP_1589     TRUE 0.989 -3.000 0.214 NA   NA
 7482076 7482077 SPP_1589 SPP_1590     TRUE 0.785 52.000 0.051 NA   NA
 7482077 7482078 SPP_1590 SPP_1591     TRUE 0.906 11.000 0.002 NA   NA
 7482078 7482079 SPP_1591 SPP_1592   clpX TRUE 0.955 9.000 0.043 1.000   NA
 7482079 7482080 SPP_1592 SPP_1593 clpX   TRUE 0.824 32.000 0.012 NA   NA
 7482080 7482081 SPP_1593 SPP_1594   folA TRUE 0.973 0.000 0.030 NA   NA
 7482081 7482082 SPP_1594 SPP_1595 folA   FALSE 0.240 130.000 0.005 1.000 N NA
 7482082 7482083 SPP_1595 SPP_1596     FALSE 0.012 497.000 0.000 1.000   NA
 7482083 7482084 SPP_1596 SPP_1597   tpiA TRUE 0.530 71.000 0.007 1.000   NA
 7482084 7482085 SPP_1597 SPP_1598 tpiA   TRUE 0.383 98.000 0.007 NA N NA
 7482085 7482086 SPP_1598 SPP_1599   metA TRUE 0.952 9.000 0.021 NA N NA
 7482086 7482087 SPP_1599 SPP_1600 metA apt FALSE 0.144 182.000 0.009 1.000 N NA
 7482087 7482088 SPP_1600 SPP_1601 apt   TRUE 0.398 87.000 0.002 1.000 N NA
 7482090 7482091 SPP_1603 SPP_1604     FALSE 0.024 279.000 0.000 NA   NA
 7482091 7482092 SPP_1604 SPP_1605     FALSE 0.245 81.000 0.000 NA   NA
 7482092 7482093 SPP_1605 SPP_1606   codY TRUE 0.984 0.000 0.083 1.000 N NA
 7482093 7482094 SPP_1606 SPP_1607 codY   FALSE 0.095 265.000 0.000 1.000 Y NA
 7482094 7482095 SPP_1607 SPP_1608     FALSE 0.058 199.000 0.000 NA N NA
 7482096 7482097 SPP_1609 SPP_1610     TRUE 0.396 99.000 0.010 1.000 N NA
 7482097 7482098 SPP_1610 SPP_1611     TRUE 0.996 0.000 0.796 1.000   NA
 7482098 7482099 SPP_1611 SPP_1612     FALSE 0.113 126.000 0.000 1.000   NA
 7482099 7482100 SPP_1612 SPP_1613     TRUE 0.905 -7.000 0.000 1.000   NA
 7482101 7482102 SPP_1614 SPP_1615     FALSE 0.015 391.000 0.000 NA   NA
 7482104 7482105 SPP_1616 SPP_1618     TRUE 0.981 -22.000 0.276 NA   NA
 7482105 7482106 SPP_1618 SPP_1619   truA TRUE 0.976 -10.000 0.058 1.000 N NA
 7482106 7482107 SPP_1619 SPP_1620 truA   FALSE 0.046 318.000 0.009 1.000   NA
 7482109 7482110 SPP_1622 SPP_1623   phnA TRUE 0.949 3.000 0.011 NA   NA
 7482110 7482111 SPP_1623 SPP_1624 phnA cmk FALSE 0.216 131.000 0.002 1.000 N NA
 7482111 7482112 SPP_1624 SPP_1625 cmk   TRUE 0.935 9.000 0.012 NA   NA
 7482114 7482115 SPP_1627 SPP_1628   galE2 TRUE 0.987 2.000 0.030 NA Y NA
 7482115 7482116 SPP_1628 SPP_1629 galE2   FALSE 0.160 103.000 0.000 NA   NA
 7482116 7482117 SPP_1629 SPP_1630     TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 7482117 7482118 SPP_1630 SPP_1631     TRUE 0.925 17.000 0.021 NA   NA
 7482118 7482119 SPP_1631 SPP_1632     TRUE 0.986 -13.000 0.283 NA   NA
 7482121 7482122 SPP_1634 SPP_1635     TRUE 0.695 25.000 0.000 NA   NA
 7482122 7482123 SPP_1635 SPP_1636     FALSE 0.130 116.000 0.000 NA   NA
 7482123 7482124 SPP_1636 SPP_1637   tkt1 FALSE 0.021 373.000 0.000 1.000 N NA
 7482124 7482125 SPP_1637 SPP_1638 tkt1   TRUE 0.857 37.000 0.000 1.000 Y NA
 7482125 7482126 SPP_1638 SPP_1639     TRUE 0.992 11.000 0.273 1.000 Y NA
 7482126 7482127 SPP_1639 SPP_1640     TRUE 0.680 26.000 0.000 NA   NA
 7482127 7482128 SPP_1640 SPP_1641     TRUE 0.666 28.000 0.000 NA   NA
 7482128 7482129 SPP_1641 SPP_1642     TRUE 0.978 -22.000 0.015 0.017 Y NA
 7482129 7482130 SPP_1642 SPP_1643     TRUE 0.976 -7.000 0.029 0.017 N NA
 7482130 7482131 SPP_1643 SPP_1644     FALSE 0.015 529.000 0.000 1.000 N NA
 7482133 7482134 SPP_1646 SPP_1647   rpsO FALSE 0.012 816.000 0.000 NA N NA
 7482134 7482135 SPP_1647 SPP_1648 rpsO   FALSE 0.091 141.000 0.000 1.000   NA
 7482136 7482137 SPP_1649 SPP_1650   thrS TRUE 0.681 58.000 0.018 NA   NA
 7482138 7482139 SPP_1651 SPP_1652     TRUE 0.998 -7.000 0.812 1.000 Y NA
 7482141 7482142 SPP_1654 SPP_1655     FALSE 0.332 68.000 0.000 NA   NA
 7482142 7482143 SPP_1655 SPP_1656     TRUE 0.891 76.000 0.667 NA   NA
 7482144 7482145 SPP_1657 SPP_1658     TRUE 0.844 -19.000 0.000 NA   NA
 7482145 7482146 SPP_1658 SPP_1659     TRUE 0.680 26.000 0.000 NA   NA
 7482146 7482147 SPP_1659 SPP_1660     FALSE 0.100 131.000 0.000 NA   NA
 7482147 7482148 SPP_1660 SPP_1661     TRUE 0.769 19.000 0.000 NA   NA
 7482148 7482149 SPP_1661 SPP_1662     FALSE 0.345 67.000 0.000 NA   NA
 7482150 7482151 SPP_1663 SPP_1664 dtd spoT TRUE 0.943 30.000 0.177 1.000 N NA
 7482154 7482155 SPP_1667 SPP_1668     TRUE 0.991 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 7482155 7482156 SPP_1668 SPP_1669     TRUE 0.946 32.000 0.038 1.000 Y NA
 7482156 7482157 SPP_1669 SPP_1670     FALSE 0.276 123.000 0.007 1.000 N NA
 7482158 7482159 SPP_1671 SPP_1672     TRUE 0.993 2.000 0.438 1.000 N NA
 7482159 7482160 SPP_1672 SPP_1673     FALSE 0.031 250.000 0.000 1.000   NA
 7482160 7482161 SPP_1673 SPP_1674     TRUE 0.671 53.000 0.006 1.000   NA
 7482161 7482162 SPP_1674 SPP_1675     TRUE 0.489 51.000 0.000 NA   NA
 7482162 7482163 SPP_1675 SPP_1676     FALSE 0.047 194.000 0.000 NA   NA
 7482163 7482164 SPP_1676 SPP_1677   ileS FALSE 0.014 403.000 0.000 NA   NA
 7482164 7482165 SPP_1677 SPP_1678 ileS   FALSE 0.029 253.000 0.000 NA   NA
 7482165 7482166 SPP_1678 SPP_1679     TRUE 0.839 -21.000 0.000 NA   NA
 7482166 7482167 SPP_1679 SPP_1680     TRUE 0.990 9.000 0.579 NA   NA
 7482167 7482168 SPP_1680 SPP_1681     TRUE 0.992 -3.000 0.287 1.000   NA
 7482168 7482169 SPP_1681 SPP_1682     TRUE 0.993 0.000 0.370 NA   NA
 7482169 7482170 SPP_1682 SPP_1683     TRUE 0.975 10.000 0.194 NA   NA
 7482170 7482171 SPP_1683 SPP_1684   ftsZ TRUE 0.954 5.000 0.030 NA   NA
 7482171 7482172 SPP_1684 SPP_1685 ftsZ ftsA TRUE 0.993 17.000 0.460 1.000 Y NA
 7482172 7482173 SPP_1685 SPP_1686 ftsA   FALSE 0.036 219.000 0.000 NA   NA
 7482173 7482174 SPP_1686 SPP_1687     TRUE 0.420 91.000 0.016 NA   NA
 7482174 7482175 SPP_1687 SPP_1688     TRUE 0.960 -13.000 0.016 1.000 N NA
 7482175 7482176 SPP_1688 SPP_1689     TRUE 0.770 84.000 0.046 0.006 Y NA
 7482176 7482177 SPP_1689 SPP_1690   recR FALSE 0.134 195.000 0.010 1.000 N NA
 7482177 7482178 SPP_1690 SPP_1691 recR   TRUE 0.942 11.000 0.013 1.000 N NA
 7482180 7482181 SPP_1693 SPP_1694     TRUE 0.949 18.000 0.054 1.000 N NA
 7482181 7482182 SPP_1694 SPP_1695     TRUE 0.424 169.000 0.333 NA   NA
 7482184 7482185 SPP_1697 SPP_1698     FALSE 0.381 272.000 0.250 NA Y NA
 7482185 7482186 SPP_1698 SPP_1699     TRUE 0.997 16.000 1.000 0.033 Y NA
 7482186 7482187 SPP_1699 SPP_1700     FALSE 0.126 232.000 0.000 0.033 Y NA
 7482187 7482188 SPP_1700 SPP_1701     FALSE 0.323 125.000 0.000 1.000 Y NA
 7482188 7482189 SPP_1701 SPP_1702     TRUE 0.982 19.000 0.132 1.000 Y NA
 7482189 7482190 SPP_1702 SPP_1703     FALSE 0.059 173.000 0.000 1.000   NA
 7482190 7482191 SPP_1703 SPP_1704     TRUE 0.981 12.000 0.273 1.000   NA
 7482191 7482192 SPP_1704 SPP_1705     TRUE 0.934 18.000 0.000 1.000 Y NA
 7482192 7482193 SPP_1705 SPP_1706     TRUE 0.997 0.000 0.300 0.033 Y NA
 7482193 7482194 SPP_1706 SPP_1707     TRUE 0.873 79.000 0.180 0.033 Y NA
 7482194 7482195 SPP_1707 SPP_1708     TRUE 0.974 19.000 0.060 NA Y NA
 7482195 7482196 SPP_1708 SPP_1709     FALSE 0.032 1013.000 0.000 NA Y NA
 7482196 7482197 SPP_1709 SPP_1710     FALSE 0.017 357.000 0.000 NA   NA
 7482199 7482200 SPP_1712 SPP_1713   recG FALSE 0.024 316.000 0.000 1.000 N NA
 7482200 7482201 SPP_1713 SPP_1714 recG alr TRUE 0.951 19.000 0.078 1.000 N NA
 7482201 7482202 SPP_1714 SPP_1715 alr acpS TRUE 0.980 -10.000 0.093 1.000 N NA
 7482202 7482203 SPP_1715 SPP_1716 acpS   TRUE 0.773 45.000 0.007 1.000 N NA
 7482203 7482204 SPP_1716 SPP_1717     TRUE 0.998 2.000 0.750 0.001 Y NA
 7482204 7482205 SPP_1717 SPP_1718   secA TRUE 0.563 81.000 0.025 1.000 N NA
 7482205 7482206 SPP_1718 SPP_1719 secA   FALSE 0.205 146.000 0.017 NA   NA
 7482206 7482207 SPP_1719 SPP_1720     FALSE 0.043 204.000 0.000 NA   NA
 7482207 7482208 SPP_1720 SPP_1721     TRUE 0.868 4.000 0.000 NA   NA
 7482208 7482209 SPP_1721 SPP_1722     TRUE 0.404 59.000 0.000 NA   NA
 7482209 7482210 SPP_1722 SPP_1723     FALSE 0.051 185.000 0.000 NA   NA
 7482210 7482211 SPP_1723 SPP_1724     FALSE 0.089 140.000 0.000 NA   NA
 7482211 7482212 SPP_1724 SPP_1725   engA FALSE 0.336 88.000 0.002 NA   NA
 7482212 7482213 SPP_1725 SPP_1726 engA   TRUE 0.913 14.000 0.005 1.000   NA
 7482213 7482214 SPP_1726 SPP_1727     TRUE 0.980 -3.000 0.048 1.000 N NA
 7482214 7482215 SPP_1727 SPP_1728     TRUE 0.998 1.000 0.817 NA Y NA
 7482215 7482216 SPP_1728 SPP_1729   nrdR TRUE 0.985 1.000 0.109 NA N NA
 7482217 7482218 SPP_1730 SPP_1731     TRUE 0.990 5.000 0.412 1.000 N NA
 7482218 7482219 SPP_1731 SPP_1732     TRUE 0.984 17.000 0.471 NA   NA
 7482220 7482221 SPP_1733 SPP_1734     TRUE 0.979 -3.000 0.059 NA   NA
 7482222 7482223 SPP_1735 SPP_1736     FALSE 0.009 996.000 0.000 NA   NA
 7482224 7482225 SPP_1737 SPP_1738     TRUE 0.657 149.000 0.235 1.000 Y NA
 7482225 7482226 SPP_1738 SPP_1739     FALSE 0.109 126.000 0.000 NA   NA
 7482227 7482228 SPP_1740 SPP_1741     TRUE 0.991 -19.000 0.571 1.000 N NA
 7482229 7482230 SPP_1742 SPP_1744     TRUE 0.913 0.000 0.000 NA   NA
 7482230 7482231 SPP_1744 SPP_1745     FALSE 0.151 107.000 0.000 NA   NA
 7482231 7482232 SPP_1745 SPP_1746     FALSE 0.332 68.000 0.000 NA   NA
 7482232 7482233 SPP_1746 SPP_1747     TRUE 0.797 17.000 0.000 NA   NA
 7482233 7482234 SPP_1747 SPP_1748     FALSE 0.363 65.000 0.000 NA   NA
 7482234 7482235 SPP_1748 SPP_1749     TRUE 0.991 2.000 0.400 NA   NA
 7482235 7482236 SPP_1749 SPP_1750     FALSE 0.284 115.000 0.010 NA   NA
 7482236 7482237 SPP_1750 SPP_1751     TRUE 0.998 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 7482237 7482238 SPP_1751 SPP_1752   sun TRUE 0.962 15.000 0.074 1.000 N NA
 7482238 7482239 SPP_1752 SPP_1753 sun fmt TRUE 0.996 -7.000 0.305 1.000 Y NA
 7482239 7482240 SPP_1753 SPP_1754 fmt   TRUE 0.959 13.000 0.052 1.000 N NA
 7482240 7482241 SPP_1754 SPP_1755     TRUE 0.712 66.000 0.032 0.052 N NA
 7482241 7482242 SPP_1755 SPP_1756   gmk TRUE 0.972 28.000 0.471 1.000 N NA
 7482242 7482243 SPP_1756 SPP_1757 gmk   FALSE 0.232 130.000 0.010 1.000   NA
 7482243 7482244 SPP_1757 SPP_1758     FALSE 0.017 343.000 0.000 NA   NA
 7482244 7482245 SPP_1758 SPP_1759     FALSE 0.017 347.000 0.000 NA   NA
 7482245 7482246 SPP_1759 SPP_1760     TRUE 0.964 10.000 0.094 NA   NA
 7482246 7482247 SPP_1760 SPP_1761     TRUE 0.496 103.000 0.085 NA   NA
 7482247 7482248 SPP_1761 SPP_1762     TRUE 0.921 13.000 0.008 NA   NA
 7482248 7482249 SPP_1762 SPP_1763     TRUE 0.974 1.000 0.024 1.000 N NA
 7482249 7482250 SPP_1763 SPP_1764   nadD TRUE 0.995 0.000 0.199 1.000 Y NA
 7482250 7482251 SPP_1764 SPP_1765 nadD   TRUE 0.879 52.000 0.150 NA N NA
 7482251 7482252 SPP_1765 SPP_1766     FALSE 0.161 214.000 0.068 NA   NA
 7482252 7482253 SPP_1766 SPP_1767   yqeG TRUE 0.992 3.000 0.555 NA   NA
 7482253 7482254 SPP_1767 SPP_1768 yqeG   TRUE 0.926 15.000 0.015 NA   NA
 7482254 7482255 SPP_1768 SPP_1769     TRUE 0.783 57.000 0.059 0.062   NA
 7482256 7482257 SPP_1770 SPP_1772     FALSE 0.332 68.000 0.000 NA   NA
 7482257 7482258 SPP_1772 SPP_1773     FALSE 0.084 143.000 0.000 NA   NA
 7482258 7482259 SPP_1773 SPP_1774     TRUE 0.585 99.000 0.143 NA   NA
 7482259 7482260 SPP_1774 SPP_1775   trx TRUE 0.980 17.000 0.364 NA   NA
 7482260 7482261 SPP_1775 SPP_1776 trx   FALSE 0.020 305.000 0.000 1.000   NA
 7482262 7482263 SPP_1777 SPP_1778     FALSE 0.304 111.000 0.010 NA   NA
 7482263 7482264 SPP_1778 SPP_1779     FALSE 0.013 424.000 0.000 NA   NA
 7482264 7482265 SPP_1779 SPP_1780     TRUE 0.979 -7.000 0.084 1.000   NA
 7482267 7482268 SPP_1782 SPP_1783 pepF2   TRUE 0.913 11.000 0.004 NA   NA
 7482268 7482269 SPP_1783 SPP_1784   prmA TRUE 0.987 2.000 0.227 NA   NA
 7482269 7482270 SPP_1784 SPP_1785 prmA   FALSE 0.186 138.000 0.004 1.000   NA
 7482270 7482271 SPP_1785 SPP_1786     TRUE 0.850 -19.000 0.000 1.000   NA
 7482271 7482272 SPP_1786 SPP_1787     TRUE 0.769 19.000 0.000 NA   NA
 7482272 7482273 SPP_1787 SPP_1788     FALSE 0.021 291.000 0.000 NA   NA
 7482273 7482274 SPP_1788 SPP_1789     FALSE 0.017 352.000 0.000 NA   NA
 7482274 7482275 SPP_1789 SPP_1790     FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 7482276 7482277 SPP_1791 SPP_1792     FALSE 0.027 264.000 0.000 NA   NA
 7482278 7482279 SPP_1793 SPP_1794     TRUE 0.992 10.000 0.273 1.000 Y NA
 7482279 7482280 SPP_1794 SPP_1795     TRUE 0.998 2.000 0.917 0.033 Y NA
 7482280 7482281 SPP_1795 SPP_1796     TRUE 0.939 96.000 0.917 0.033 Y NA
 7482281 7482282 SPP_1796 SPP_1797     TRUE 0.639 127.000 0.364 1.000 N NA
 7482282 7482283 SPP_1797 SPP_1798     FALSE 0.016 362.000 0.000 NA   NA
 7482284 7482285 SPP_1799 SPP_1800     TRUE 0.718 84.000 0.214 NA   NA
 7482285 7482286 SPP_1800 SPP_1801     TRUE 0.971 12.000 0.143 NA   NA
 7482286 7482287 SPP_1801 SPP_1802     TRUE 0.839 39.000 0.036 NA   NA
 7482287 7482288 SPP_1802 SPP_1803     TRUE 0.982 31.000 1.000 NA   NA
 7482289 7482290 SPP_1804 SPP_1805     FALSE 0.037 218.000 0.000 NA   NA
 7482290 7482291 SPP_1805 SPP_1806     FALSE 0.263 78.000 0.000 NA   NA
 7482291 7482292 SPP_1806 SPP_1807     FALSE 0.213 86.000 0.000 NA   NA
 7482292 7482293 SPP_1807 SPP_1808     TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 7482293 7482294 SPP_1808 SPP_1810     TRUE 0.797 17.000 0.000 NA   NA
 7482294 7482295 SPP_1810 SPP_1811     TRUE 0.820 15.000 0.000 1.000   NA
 7482295 7482296 SPP_1811 SPP_1812     TRUE 0.881 3.000 0.000 1.000   NA
 7482300 7482301 SPP_1816 SPP_1817     TRUE 0.971 15.000 0.182 NA   NA
 7482301 7482302 SPP_1817 SPP_1818     TRUE 0.609 37.000 0.000 NA   NA
 7482302 7482303 SPP_1818 SPP_1819   trpA FALSE 0.020 302.000 0.000 NA   NA
 7482303 7482304 SPP_1819 SPP_1820 trpA trpB TRUE 0.996 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 7482304 7482305 SPP_1820 SPP_1821 trpB trpF TRUE 0.994 -22.000 0.375 0.002 Y NA
 7482305 7482306 SPP_1821 SPP_1822 trpF trpC TRUE 0.995 -13.000 0.264 0.002 Y NA
 7482306 7482307 SPP_1822 SPP_1823 trpC trpD TRUE 0.996 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 7482307 7482308 SPP_1823 SPP_1824 trpD   TRUE 0.976 11.000 0.018 1.000 Y NA
 7482308 7482309 SPP_1824 SPP_1825   trpE TRUE 0.997 -3.000 0.321 0.001 Y NA
 7482309 7482310 SPP_1825 SPP_1826 trpE   FALSE 0.016 372.000 0.000 NA   NA
 7482310 7482311 SPP_1826 SPP_1827     FALSE 0.010 608.000 0.000 NA   NA
 7482311 7482312 SPP_1827 SPP_1828     FALSE 0.011 572.000 0.000 1.000   NA
 7482312 7482313 SPP_1828 SPP_1829     TRUE 0.891 3.000 0.000 0.062   NA
 7482313 7482314 SPP_1829 SPP_1830     TRUE 0.991 12.000 0.545 0.033 N NA
 7482314 7482315 SPP_1830 SPP_1831     TRUE 0.749 103.000 0.364 0.033 N NA
 7482315 7482316 SPP_1831 SPP_1832     TRUE 0.704 25.000 0.000 1.000   NA
 7482316 7482317 SPP_1832 SPP_1833     FALSE 0.110 125.000 0.000 NA   NA
 7482317 7482318 SPP_1833 SPP_1834     FALSE 0.010 781.000 0.000 NA   NA
 7482318 7482319 SPP_1834 SPP_1835     FALSE 0.032 1163.000 0.000 1.000 Y NA
 7482319 7482320 SPP_1835 SPP_1836     TRUE 0.976 43.000 0.382 NA Y NA
 7482320 7482321 SPP_1836 SPP_1837     FALSE 0.158 186.000 0.018 NA N NA
 7482321 7482322 SPP_1837 SPP_1838     TRUE 0.998 -10.000 0.911 0.007 Y NA
 7482324 7482325 SPP_1840 SPP_1841     FALSE 0.073 153.000 0.000 NA   NA
 7482325 7482326 SPP_1841 SPP_1842     TRUE 0.810 -46.000 0.000 NA   NA
 7482327 7482328 SPP_1843 SPP_1844 xth   TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7482328 7482329 SPP_1844 SPP_1846   xpt FALSE 0.009 878.000 0.000 NA   NA
 7482329 7482330 SPP_1846 SPP_1847 xpt   TRUE 0.991 0.000 0.046 1.000 Y NA
 7482331 7482332 SPP_1848 SPP_1849     TRUE 0.989 -13.000 0.347 0.051   NA
 7482332 7482333 SPP_1849 SPP_1850     TRUE 0.964 26.000 0.058 0.003 Y NA
 7482333 7482334 SPP_1850 SPP_1851     FALSE 0.203 157.000 0.015 NA N NA
 7482334 7482335 SPP_1851 SPP_1852   galT TRUE 0.637 70.000 0.024 NA N NA
 7482335 7482336 SPP_1852 SPP_1853 galT galK TRUE 0.982 19.000 0.107 0.002 Y NA
 7482338 7482339 SPP_1855 SPP_1856     TRUE 0.927 1.000 0.000 1.000 N NA
 7482339 7482340 SPP_1856 SPP_1857     FALSE 0.041 244.000 0.000 1.000 N NA
 7482342 7482343 SPP_1859 SPP_1860     FALSE 0.012 524.000 0.000 1.000   NA
 7482343 7482344 SPP_1860 SPP_1861     FALSE 0.054 183.000 0.000 1.000   NA
 7482344 7482345 SPP_1861 SPP_1862     TRUE 0.993 -7.000 0.382 1.000 N NA
 7482345 7482346 SPP_1862 SPP_1863     TRUE 0.938 15.000 0.031 NA   NA
 7482346 7482347 SPP_1863 SPP_1864     TRUE 0.983 4.000 0.222 NA   NA
 7482347 7482348 SPP_1864 SPP_1865     FALSE 0.010 682.000 0.000 NA   NA
 7482348 7482349 SPP_1865 SPP_1866   pepA TRUE 0.938 22.000 0.100 NA   NA
 7482349 7482350 SPP_1866 SPP_1867 pepA   FALSE 0.071 156.000 0.000 NA   NA
 7482351 7482352 SPP_1868 SPP_1869     FALSE 0.061 165.000 0.000 NA   NA
 7482352 7482353 SPP_1869 SPP_1870     TRUE 0.998 -10.000 0.870 0.032 Y NA
 7482353 7482354 SPP_1870 SPP_1871     TRUE 0.998 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 7482354 7482355 SPP_1871 SPP_1872     TRUE 0.715 96.000 0.055 1.000 Y NA
 7482356 7482357 SPP_1873 SPP_1874   rluB TRUE 0.968 0.000 0.014 NA   NA
 7482357 7482358 SPP_1874 SPP_1875 rluB scpB TRUE 0.986 -13.000 0.224 NA N NA
 7482358 7482359 SPP_1875 SPP_1876 scpB   TRUE 0.984 19.000 0.570 NA   NA
 7482359 7482360 SPP_1876 SPP_1877     TRUE 0.969 0.000 0.017 NA   NA
 7482360 7482361 SPP_1877 SPP_1878     TRUE 0.981 -9.000 0.111 1.000   NA
 7482361 7482362 SPP_1878 SPP_1879     TRUE 0.980 -3.000 0.065 NA   NA
 7482362 7482363 SPP_1879 SPP_1880     TRUE 0.961 -24.000 0.085 NA   NA
 7482363 7482364 SPP_1880 SPP_1881   murI TRUE 0.978 -3.000 0.034 1.000 N NA
 7482364 7482365 SPP_1881 SPP_1882 murI   FALSE 0.111 207.000 0.014 NA   NA
 7482365 7482366 SPP_1882 SPP_1883   treC FALSE 0.085 142.000 0.000 NA   NA
 7482366 7482367 SPP_1883 SPP_1884 treC treP TRUE 0.726 178.000 0.650 1.000 Y NA
 7482369 7482370 SPP_1886 SPP_1887     TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 7482370 7482371 SPP_1887 SPP_1889     TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7482373 7482374 SPP_1892 SPP_1893     TRUE 0.993 11.000 0.333 0.001 Y NA
 7482374 7482375 SPP_1893 SPP_1894     TRUE 0.996 9.000 0.650 1.000 Y NA
 7482375 7482376 SPP_1894 SPP_1895     TRUE 0.992 0.000 0.278 0.032   NA
 7482376 7482377 SPP_1895 SPP_1896     TRUE 0.915 67.000 0.600 0.032   NA
 7482379 7482380 SPP_1898 SPP_1899     FALSE 0.115 138.000 0.000 NA N NA
 7482380 7482381 SPP_1899 SPP_1900     FALSE 0.051 184.000 0.000 NA   NA
 7482381 7482382 SPP_1900 SPP_1901     TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 7482382 7482383 SPP_1901 SPP_1902     TRUE 0.997 14.000 0.925 0.032 Y NA
 7482383 7482384 SPP_1902 SPP_1903     TRUE 0.992 14.000 0.275 0.032 Y NA
 7482384 7482385 SPP_1903 SPP_1904     TRUE 0.863 92.000 0.286 1.000 Y NA
 7482386 7482387 SPP_1905 SPP_1906     TRUE 0.933 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7482388 7482389 SPP_1907 SPP_1908     TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 7482389 7482390 SPP_1908 SPP_1909     TRUE 0.635 32.000 0.000 NA   NA
 7482390 7482391 SPP_1909 SPP_1910     TRUE 0.797 17.000 0.000 NA   NA
 7482391 7482392 SPP_1910 SPP_1911     TRUE 0.905 1.000 0.000 NA   NA
 7482392 7482393 SPP_1911 SPP_1912     TRUE 0.847 8.000 0.000 NA   NA
 7482393 7482394 SPP_1912 SPP_1913     TRUE 0.847 8.000 0.000 NA   NA
 7482394 7482395 SPP_1913 SPP_1914     TRUE 0.831 10.000 0.000 NA   NA
 7482395 7482396 SPP_1914 SPP_1915     TRUE 0.905 1.000 0.000 NA   NA
 7482396 7482397 SPP_1915 SPP_1916     TRUE 0.831 12.000 0.000 NA   NA
 7482397 7482398 SPP_1916 SPP_1917     TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 7482398 7482399 SPP_1917 SPP_1918     TRUE 0.860 5.000 0.000 NA   NA
 7482399 7482400 SPP_1918 SPP_1919     TRUE 0.752 20.000 0.000 NA   NA
 7482400 7482401 SPP_1919 SPP_1920     TRUE 0.813 15.000 0.000 NA   NA
 7482401 7482402 SPP_1920 SPP_1921     TRUE 0.891 2.000 0.000 NA   NA
 7482402 7482403 SPP_1921 SPP_1922     TRUE 0.695 25.000 0.000 NA   NA
 7482403 7482404 SPP_1922 SPP_2299     TRUE 0.876 3.000 0.000 NA   NA
 7482404 7482405 SPP_2299 SPP_1923   rrf2 TRUE 0.860 5.000 0.000 NA   NA
 7482405 7482406 SPP_1923 SPP_1924 rrf2 rrl2 FALSE 0.273 77.000 0.000 NA   NA
 7482406 7482407 SPP_1924 SPP_1926 rrl2   FALSE 0.121 121.000 0.000 NA   NA
 7482407 7482408 SPP_1926 SPP_1927   rrs2 FALSE 0.092 138.000 0.000 NA   NA
 7482408 7482409 SPP_1927 SPP_1928 rrs2   FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 7482409 7482410 SPP_1928 SPP_1929   rumA2 TRUE 0.382 62.000 0.000 NA   NA
 7482411 7482412 SPP_1930 SPP_1931     TRUE 0.913 10.000 0.003 1.000   NA
 7482412 7482413 SPP_1931 SPP_1932     TRUE 0.458 89.000 0.025 NA   NA
 7482414 7482415 SPP_1933 SPP_1935   groL FALSE 0.020 303.000 0.000 NA   NA
 7482415 7482416 SPP_1935 SPP_1936 groL groS TRUE 0.987 16.000 0.160 1.000 Y NA
 7482416 7482417 SPP_1936 SPP_1937 groS   FALSE 0.138 270.000 0.083 1.000 N NA
 7482417 7482418 SPP_1937 SPP_1938     FALSE 0.272 78.000 0.000 1.000   NA
 7482418 7482419 SPP_1938 SPP_1939     TRUE 0.843 33.000 0.020 1.000   NA
 7482419 7482420 SPP_1939 SPP_1940     TRUE 0.976 16.000 0.239 1.000   NA
 7482420 7482421 SPP_1940 SPP_1941     TRUE 0.986 -3.000 0.140 NA   NA
 7482421 7482422 SPP_1941 SPP_1942     FALSE 0.022 285.000 0.000 NA   NA
 7482422 7482423 SPP_1942 SPP_1943     FALSE 0.065 161.000 0.000 NA   NA
 7482423 7482424 SPP_1943 SPP_1944     TRUE 0.993 5.000 0.714 NA   NA
 7482424 7482425 SPP_1944 SPP_1945     TRUE 0.399 114.000 0.053 NA   NA
 7482425 7482426 SPP_1945 SPP_1946     TRUE 0.913 -3.000 0.000 NA   NA
 7482426 7482427 SPP_1946 SPP_1947     FALSE 0.355 66.000 0.000 NA   NA
 7482427 7482428 SPP_1947 SPP_1948     TRUE 0.852 7.000 0.000 NA   NA
 7482428 7482429 SPP_1948 SPP_1951     TRUE 0.797 17.000