MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus pneumoniae JJA

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7478286 7478287 SPJ_0001 SPJ_0002 dnaA dnaN TRUE 0.662 159.000 0.328 1.000 Y NA
 7478287 7478288 SPJ_0002 SPJ_0003 dnaN   TRUE 0.555 65.000 0.009 NA   NA
 7478288 7478289 SPJ_0003 SPJ_0004   ychF TRUE 0.481 84.000 0.064 NA   NA
 7478289 7478290 SPJ_0004 SPJ_0005 ychF pth TRUE 0.888 72.000 0.184 1.000 Y NA
 7478290 7478291 SPJ_0005 SPJ_0006 pth mfd TRUE 0.979 1.000 0.137 1.000 N NA
 7478291 7478292 SPJ_0006 SPJ_0007 mfd   TRUE 0.765 58.000 0.024 1.000 N NA
 7478292 7478293 SPJ_0007 SPJ_0008     TRUE 0.975 -7.000 0.053 1.000 N NA
 7478293 7478294 SPJ_0008 SPJ_0009     TRUE 0.893 5.000 0.009 NA   NA
 7478294 7478295 SPJ_0009 SPJ_0010     TRUE 0.978 -7.000 0.105 NA   NA
 7478295 7478296 SPJ_0010 SPJ_0011     TRUE 0.959 -3.000 0.014 NA N NA
 7478296 7478297 SPJ_0011 SPJ_0012   hpt TRUE 0.970 4.000 0.067 0.066 N NA
 7478297 7478298 SPJ_0012 SPJ_0013 hpt   TRUE 0.968 16.000 0.192 1.000 N NA
 7478298 7478299 SPJ_0013 SPJ_0014     FALSE 0.162 122.000 0.006 1.000   NA
 7478299 7478300 SPJ_0014 SPJ_0015     FALSE 0.118 95.000 0.000 NA   NA
 7478300 7478301 SPJ_0015 SPJ_0016   rrs1 FALSE 0.033 262.000 0.000 NA   NA
 7478301 7478302 SPJ_0016 SPJ_0017 rrs1   FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 7478302 7478303 SPJ_0017 SPJ_0019   rrl1 FALSE 0.078 121.000 0.000 NA   NA
 7478303 7478304 SPJ_0019 SPJ_0020 rrl1 rrf1 FALSE 0.220 77.000 0.000 NA   NA
 7478304 7478305 SPJ_0020 SPJ_0021 rrf1   TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 7478305 7478306 SPJ_0021 SPJ_0022     FALSE 0.095 105.000 0.000 NA   NA
 7478306 7478307 SPJ_0022 SPJ_0024     FALSE 0.020 427.000 0.000 NA   NA
 7478308 7478309 SPJ_0023 SPJ_0025     FALSE 0.063 143.000 0.000 NA   NA
 7478309 7478310 SPJ_0025 SPJ_0026     TRUE 0.570 48.000 0.000 NA   NA
 7478311 7478312 SPJ_0027 SPJ_0028   purA FALSE 0.049 189.000 0.000 NA   NA
 7478312 7478313 SPJ_0028 SPJ_0029 purA   FALSE 0.201 201.000 0.000 1.000 Y NA
 7478314 7478315 SPJ_0030 SPJ_0031     FALSE 0.255 72.000 0.000 NA   NA
 7478315 7478316 SPJ_0031 SPJ_0032     TRUE 0.497 55.000 0.000 NA   NA
 7478316 7478317 SPJ_0032 SPJ_0033     TRUE 0.769 17.000 0.000 NA   NA
 7478317 7478318 SPJ_0033 SPJ_0034     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7478318 7478319 SPJ_0034 SPJ_0035     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 7478319 7478320 SPJ_0035 SPJ_0036     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 7478321 7478322 SPJ_0037 SPJ_0038     FALSE 0.063 143.000 0.000 NA   NA
 7478322 7478323 SPJ_0038 SPJ_0039     TRUE 0.735 23.000 0.000 NA   NA
 7478323 7478324 SPJ_0039 SPJ_0041     TRUE 0.769 15.000 0.000 NA   NA
 7478326 7478327 SPJ_0042 SPJ_0044     FALSE 0.139 90.000 0.000 NA   NA
 7478329 7478330 SPJ_0045 SPJ_0046     TRUE 0.904 -40.000 0.005 NA N NA
 7478330 7478331 SPJ_0046 SPJ_0047   radA FALSE 0.157 113.000 0.003 NA N NA
 7478331 7478332 SPJ_0047 SPJ_0048 radA   TRUE 0.475 73.000 0.009 1.000 N NA
 7478332 7478333 SPJ_0048 SPJ_0049     TRUE 0.939 25.000 0.111 NA   NA
 7478333 7478334 SPJ_0049 SPJ_0050     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7478334 7478335 SPJ_0050 SPJ_0051     FALSE 0.063 145.000 0.000 NA   NA
 7478336 7478337 SPJ_0052 SPJ_0053     FALSE 0.072 127.000 0.000 NA   NA
 7478337 7478338 SPJ_0053 SPJ_0054     TRUE 0.816 -42.000 0.000 NA   NA
 7478338 7478339 SPJ_0054 SPJ_0055     TRUE 0.641 40.000 0.000 NA   NA
 7478340 7478341 SPJ_0056 SPJ_0057     FALSE 0.266 85.000 0.005 NA   NA
 7478343 7478344 SPJ_0059 SPJ_0060   recO TRUE 0.962 -3.000 0.012 1.000 N NA
 7478344 7478345 SPJ_0060 SPJ_0061 recO plsX TRUE 0.961 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7478345 7478346 SPJ_0061 SPJ_0062 plsX   TRUE 0.981 6.000 0.017 0.009 Y NA
 7478346 7478347 SPJ_0062 SPJ_0063     TRUE 0.677 43.000 0.000 1.000 N NA
 7478347 7478348 SPJ_0063 SPJ_0064     FALSE 0.046 203.000 0.000 NA   NA
 7478348 7478349 SPJ_0064 SPJ_0065     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7478349 7478350 SPJ_0065 SPJ_0066     FALSE 0.021 408.000 0.000 NA   NA
 7478350 7478351 SPJ_0066 SPJ_0067     TRUE 0.745 21.000 0.000 NA   NA
 7478351 7478352 SPJ_0067 SPJ_0068     FALSE 0.018 543.000 0.000 NA   NA
 7478352 7478353 SPJ_0068 SPJ_0069     TRUE 0.979 7.000 0.500 NA   NA
 7478353 7478354 SPJ_0069 SPJ_0070     TRUE 0.438 237.000 0.800 NA   NA
 7478354 7478355 SPJ_0070 SPJ_0071     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7478355 7478356 SPJ_0071 SPJ_0072     TRUE 0.842 -19.000 0.000 NA   NA
 7478356 7478357 SPJ_0072 SPJ_0073     FALSE 0.023 380.000 0.000 NA   NA
 7478357 7478358 SPJ_0073 SPJ_0074     TRUE 0.983 13.000 0.444 0.068   NA
 7478358 7478359 SPJ_0074 SPJ_0075   purC FALSE 0.108 170.000 0.004 1.000   NA
 7478359 7478360 SPJ_0075 SPJ_0076 purC   TRUE 0.891 11.000 0.000 0.001   NA
 7478360 7478361 SPJ_0076 SPJ_0077     TRUE 0.529 57.000 0.000 1.000   NA
 7478361 7478362 SPJ_0077 SPJ_0078   purF TRUE 0.616 93.000 0.024 1.000 Y NA
 7478362 7478363 SPJ_0078 SPJ_0079 purF purM TRUE 0.982 37.000 0.248 1.000 Y NA
 7478363 7478364 SPJ_0079 SPJ_0080 purM purN TRUE 0.997 -3.000 0.238 0.003 Y NA
 7478364 7478365 SPJ_0080 SPJ_0081 purN   FALSE 0.280 84.000 0.003 NA N NA
 7478365 7478366 SPJ_0081 SPJ_0082   purH TRUE 0.827 25.000 0.002 NA N NA
 7478366 7478367 SPJ_0082 SPJ_0083 purH purD TRUE 0.693 122.000 0.238 1.000 Y NA
 7478367 7478368 SPJ_0083 SPJ_0084 purD purE FALSE 0.222 403.000 0.044 1.000 Y NA
 7478368 7478369 SPJ_0084 SPJ_0085 purE purK TRUE 0.989 -13.000 0.008 0.001 Y NA
 7478369 7478370 SPJ_0085 SPJ_0086 purK   TRUE 0.771 23.000 0.000 1.000   NA
 7478370 7478371 SPJ_0086 SPJ_0087   purB FALSE 0.063 173.000 0.000 1.000   NA
 7478372 7478373 SPJ_0088 SPJ_0089     FALSE 0.035 315.000 0.000 1.000 N NA
 7478374 7478375 SPJ_0090 SPJ_0091     TRUE 0.995 -3.000 0.190 1.000 Y NA
 7478375 7478376 SPJ_0091 SPJ_0092     TRUE 0.995 28.000 0.810 0.036 Y NA
 7478376 7478377 SPJ_0092 SPJ_0093     TRUE 0.979 -13.000 0.000 0.036 Y NA
 7478377 7478378 SPJ_0093 SPJ_0094     TRUE 0.961 7.000 0.000 0.036 Y NA
 7478378 7478379 SPJ_0094 SPJ_0095     FALSE 0.119 253.000 0.022 1.000 N NA
 7478379 7478380 SPJ_0095 SPJ_0096     FALSE 0.176 116.000 0.000 0.029 N NA
 7478380 7478381 SPJ_0096 SPJ_0097     FALSE 0.045 207.000 0.000 NA   NA
 7478381 7478382 SPJ_0097 SPJ_0098     FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 7478383 7478384 SPJ_0099 SPJ_0100     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7478387 7478388 SPJ_0103 SPJ_0104     TRUE 0.995 14.000 0.490 0.005 Y NA
 7478388 7478389 SPJ_0104 SPJ_0105     FALSE 0.068 135.000 0.000 NA   NA
 7478389 7478390 SPJ_0105 SPJ_0106     TRUE 0.398 62.000 0.000 NA   NA
 7478390 7478391 SPJ_0106 SPJ_0108     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 7478391 7478392 SPJ_0108 SPJ_0109     TRUE 0.411 167.000 0.333 1.000   NA
 7478392 7478393 SPJ_0109 SPJ_0110     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7478393 7478394 SPJ_0110 SPJ_0111   rpsD FALSE 0.091 195.000 0.002 1.000 N NA
 7478394 7478395 SPJ_0111 SPJ_0112 rpsD   FALSE 0.049 186.000 0.000 NA   NA
 7478395 7478396 SPJ_0112 SPJ_0113     FALSE 0.020 423.000 0.000 NA   NA
 7478396 7478397 SPJ_0113 SPJ_0114     TRUE 0.813 -46.000 0.000 NA   NA
 7478397 7478398 SPJ_0114 SPJ_0115     FALSE 0.026 319.000 0.000 NA   NA
 7478398 7478399 SPJ_0115 SPJ_0116     TRUE 0.996 14.000 0.917 0.048 Y NA
 7478399 7478400 SPJ_0116 SPJ_0117     TRUE 0.569 258.000 0.250 0.048 Y NA
 7478400 7478401 SPJ_0117 SPJ_0118     FALSE 0.032 272.000 0.000 NA   NA
 7478401 7478402 SPJ_0118 SPJ_0119     FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 7478403 7478404 SPJ_0120 SPJ_0121     TRUE 0.897 63.000 0.500 NA   NA
 7478404 7478405 SPJ_0121 SPJ_0122     TRUE 0.981 -7.000 0.150 NA   NA
 7478405 7478406 SPJ_0122 SPJ_0123     TRUE 0.983 -13.000 0.250 NA   NA
 7478406 7478407 SPJ_0123 SPJ_0124     FALSE 0.291 139.000 0.100 NA N NA
 7478408 7478409 SPJ_0125 SPJ_0126     TRUE 0.886 42.000 0.000 NA Y NA
 7478410 7478411 SPJ_0127 SPJ_0128   sdaAA TRUE 0.918 22.000 0.033 1.000   NA
 7478411 7478412 SPJ_0128 SPJ_0129 sdaAA sdaAB TRUE 0.992 9.000 0.221 0.001 Y NA
 7478415 7478416 SPJ_0132 SPJ_0133     TRUE 0.432 142.000 0.353 NA   NA
 7478416 7478417 SPJ_0133 SPJ_0134     TRUE 0.992 -3.000 0.520 NA   NA
 7478417 7478418 SPJ_0134 SPJ_0135     FALSE 0.060 207.000 0.000 1.000 N NA
 7478418 7478419 SPJ_0135 SPJ_0136     TRUE 0.769 17.000 0.000 NA   NA
 7478419 7478420 SPJ_0136 SPJ_0138   argH TRUE 0.706 29.000 0.000 NA   NA
 7478422 7478423 SPJ_0140 SPJ_0141     TRUE 0.983 -7.000 0.176 NA   NA
 7478423 7478424 SPJ_0141 SPJ_0142     TRUE 0.988 -3.000 0.286 NA   NA
 7478424 7478425 SPJ_0142 SPJ_0143     FALSE 0.063 145.000 0.000 NA   NA
 7478425 7478426 SPJ_0143 SPJ_0144     TRUE 0.757 9.000 0.000 NA   NA
 7478426 7478427 SPJ_0144 SPJ_0145     TRUE 0.489 56.000 0.000 NA   NA
 7478427 7478428 SPJ_0145 SPJ_0146     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7478428 7478429 SPJ_0146 SPJ_0147     FALSE 0.015 1135.000 0.000 NA   NA
 7478429 7478430 SPJ_0147 SPJ_0148     FALSE 0.030 286.000 0.000 NA   NA
 7478430 7478431 SPJ_0148 SPJ_0150     FALSE 0.035 253.000 0.000 NA   NA
 7478431 7478432 SPJ_0150 SPJ_0151   trmU TRUE 0.735 23.000 0.000 NA   NA
 7478432 7478433 SPJ_0151 SPJ_0152 trmU   FALSE 0.133 141.000 0.003 1.000 N NA
 7478433 7478434 SPJ_0152 SPJ_0153   gidA TRUE 0.881 10.000 0.005 1.000 N NA
 7478435 7478436 SPJ_0154 SPJ_0155     FALSE 0.255 72.000 0.000 NA   NA
 7478436 7478437 SPJ_0155 SPJ_0156     TRUE 0.988 2.000 0.576 NA   NA
 7478437 7478438 SPJ_0156 SPJ_0157     FALSE 0.015 818.000 0.000 NA   NA
 7478438 7478439 SPJ_0157 SPJ_0158     TRUE 0.987 2.000 0.500 NA   NA
 7478440 7478441 SPJ_0159 SPJ_0160   rimI TRUE 0.987 -3.000 0.209 1.000   NA
 7478441 7478442 SPJ_0160 SPJ_0161 rimI   TRUE 0.964 -10.000 0.030 1.000   NA
 7478443 7478444 SPJ_0162 SPJ_0163     TRUE 0.880 -9.000 0.000 NA   NA
 7478445 7478446 SPJ_0164 SPJ_0166     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7478446 7478447 SPJ_0166 SPJ_0167     TRUE 0.771 10.000 0.000 NA N NA
 7478447 7478448 SPJ_0167 SPJ_0168     FALSE 0.018 553.000 0.000 NA   NA
 7478448 7478449 SPJ_0168 SPJ_0169     TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7478449 7478450 SPJ_0169 SPJ_0170     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7478450 7478451 SPJ_0170 SPJ_0171     FALSE 0.027 396.000 0.000 1.000   NA
 7478451 7478452 SPJ_0171 SPJ_0172     FALSE 0.030 286.000 0.000 NA   NA
 7478452 7478453 SPJ_0172 SPJ_0173     FALSE 0.317 67.000 0.000 NA   NA
 7478453 7478454 SPJ_0173 SPJ_0174     FALSE 0.255 72.000 0.000 NA   NA
 7478454 7478455 SPJ_0174 SPJ_0175     FALSE 0.020 453.000 0.000 NA   NA
 7478455 7478456 SPJ_0175 SPJ_0176     TRUE 0.987 -10.000 0.338 NA   NA
 7478456 7478457 SPJ_0176 SPJ_0177     FALSE 0.097 218.000 0.013 NA   NA
 7478457 7478458 SPJ_0177 SPJ_0178     FALSE 0.067 154.000 0.000 NA N NA
 7478458 7478459 SPJ_0178 SPJ_0179     TRUE 0.631 100.000 0.500 NA N NA
 7478459 7478460 SPJ_0179 SPJ_0180     TRUE 0.972 -7.000 0.042 1.000 N NA
 7478460 7478461 SPJ_0180 SPJ_0181     TRUE 0.997 2.000 0.938 1.000 Y NA
 7478463 7478464 SPJ_0183 SPJ_0184     TRUE 0.956 50.000 0.667 NA   NA
 7478464 7478465 SPJ_0184 SPJ_0185     TRUE 0.991 12.000 0.227 0.014 Y NA
 7478465 7478466 SPJ_0185 SPJ_0186     TRUE 0.853 52.000 0.091 NA   NA
 7478466 7478467 SPJ_0186 SPJ_0187     TRUE 0.725 78.000 0.286 NA   NA
 7478468 7478469 SPJ_0188 SPJ_0189     FALSE 0.027 310.000 0.000 NA   NA
 7478469 7478470 SPJ_0189 SPJ_0190     TRUE 0.990 -3.000 0.392 NA   NA
 7478472 7478473 SPJ_0192 SPJ_0193 ribH   TRUE 0.993 1.000 0.054 0.003 Y NA
 7478473 7478474 SPJ_0193 SPJ_0194   ribE TRUE 0.976 20.000 0.051 1.000 Y NA
 7478474 7478475 SPJ_0194 SPJ_0195 ribE ribD TRUE 0.996 -15.000 0.456 1.000 Y NA
 7478476 7478477 SPJ_0196 SPJ_0197 ruvA   TRUE 0.965 10.000 0.012 1.000 Y NA
 7478477 7478478 SPJ_0197 SPJ_0198     TRUE 0.940 -3.000 0.004 NA   NA
 7478479 7478480 SPJ_0199 SPJ_0200     FALSE 0.035 255.000 0.000 NA   NA
 7478480 7478481 SPJ_0200 SPJ_0201     TRUE 0.934 12.000 0.072 NA   NA
 7478482 7478483 SPJ_0202 SPJ_0203 uvrA   TRUE 0.955 -7.000 0.008 1.000 N NA
 7478483 7478484 SPJ_0203 SPJ_0204     FALSE 0.090 132.000 0.000 1.000 N NA
 7478484 7478485 SPJ_0204 SPJ_0205     TRUE 0.829 66.000 0.267 NA   NA
 7478485 7478486 SPJ_0205 SPJ_0206     FALSE 0.320 87.000 0.016 NA   NA
 7478486 7478487 SPJ_0206 SPJ_0207     TRUE 0.984 4.000 0.537 NA   NA
 7478487 7478488 SPJ_0207 SPJ_0208     TRUE 0.983 16.000 0.651 NA   NA
 7478488 7478489 SPJ_0208 SPJ_0209     FALSE 0.093 258.000 0.019 NA   NA
 7478489 7478490 SPJ_0209 SPJ_0210     TRUE 0.985 -3.000 0.200 NA   NA
 7478490 7478491 SPJ_0210 SPJ_0211     FALSE 0.062 146.000 0.000 NA   NA
 7478491 7478492 SPJ_0211 SPJ_0212     FALSE 0.034 258.000 0.000 NA   NA
 7478492 7478493 SPJ_0212 SPJ_0213   nrdD FALSE 0.271 120.000 0.057 NA   NA
 7478493 7478494 SPJ_0213 SPJ_0214 nrdD   TRUE 0.931 12.000 0.062 NA   NA
 7478494 7478495 SPJ_0214 SPJ_0215     TRUE 0.936 44.000 0.292 NA   NA
 7478495 7478496 SPJ_0215 SPJ_0216   nrdG TRUE 0.984 -7.000 0.159 1.000   NA
 7478496 7478497 SPJ_0216 SPJ_0217 nrdG   TRUE 0.928 8.000 0.029 1.000 N NA
 7478497 7478498 SPJ_0217 SPJ_0218   rpsJ FALSE 0.043 266.000 0.000 1.000 N NA
 7478498 7478499 SPJ_0218 SPJ_0219 rpsJ rplC TRUE 0.694 217.000 0.467 0.038 Y NA
 7478499 7478500 SPJ_0219 SPJ_0220 rplC rplD TRUE 0.994 25.000 0.544 0.028 Y NA
 7478500 7478501 SPJ_0220 SPJ_0221 rplD rplW TRUE 0.997 0.000 0.307 0.028 Y NA
 7478501 7478502 SPJ_0221 SPJ_0222 rplW rplB TRUE 0.996 18.000 0.849 0.033 Y NA
 7478502 7478503 SPJ_0222 SPJ_0223 rplB rpsS TRUE 0.893 104.000 0.820 0.038 Y NA
 7478503 7478504 SPJ_0223 SPJ_0224 rpsS rplV TRUE 0.995 12.000 0.769 0.038 Y NA
 7478504 7478505 SPJ_0224 SPJ_0225 rplV rpsC TRUE 0.995 13.000 0.719 0.038 Y NA
 7478505 7478506 SPJ_0225 SPJ_0226 rpsC rplP TRUE 0.997 4.000 0.828 0.038 Y NA
 7478506 7478507 SPJ_0226 SPJ_0227 rplP rpmC TRUE 0.996 10.000 0.802 0.028 Y NA
 7478507 7478508 SPJ_0227 SPJ_0228 rpmC rpsQ TRUE 0.995 25.000 0.828 0.028 Y NA
 7478508 7478509 SPJ_0228 SPJ_0229 rpsQ rplN TRUE 0.995 26.000 0.791 0.038 Y NA
 7478509 7478510 SPJ_0229 SPJ_0230 rplN rplX TRUE 0.953 78.000 0.810 0.038 Y NA
 7478510 7478511 SPJ_0230 SPJ_0231 rplX   TRUE 0.995 24.000 0.758 0.028 Y NA
 7478511 7478512 SPJ_0231 SPJ_0232     TRUE 0.993 18.000 0.309 0.028 Y NA
 7478512 7478513 SPJ_0232 SPJ_0233   rpsH TRUE 0.567 285.000 0.295 0.028 Y NA
 7478513 7478514 SPJ_0233 SPJ_0234 rpsH   TRUE 0.799 192.000 0.808 0.028 Y NA
 7478514 7478515 SPJ_0234 SPJ_0235   rplR TRUE 0.942 84.000 0.815 0.028 Y NA
 7478515 7478516 SPJ_0235 SPJ_0236 rplR rpsE TRUE 0.996 18.000 0.814 0.038 Y NA
 7478516 7478517 SPJ_0236 SPJ_0237 rpsE rpmD TRUE 0.996 14.000 0.789 0.038 Y NA
 7478517 7478518 SPJ_0237 SPJ_0238 rpmD rplO TRUE 0.834 145.000 0.653 0.005 Y NA
 7478518 7478519 SPJ_0238 SPJ_0239 rplO   TRUE 0.985 13.000 0.730 1.000 N NA
 7478519 7478520 SPJ_0239 SPJ_0240     TRUE 0.408 151.000 0.241 1.000 N NA
 7478520 7478521 SPJ_0240 SPJ_0241   infA FALSE 0.319 117.000 0.059 1.000 N NA
 7478521 7478522 SPJ_0241 SPJ_0242 infA rpmJ TRUE 0.976 25.000 0.067 1.000 Y NA
 7478522 7478523 SPJ_0242 SPJ_0243 rpmJ rpsM TRUE 0.987 18.000 0.086 0.028 Y NA
 7478523 7478524 SPJ_0243 SPJ_0244 rpsM rpsK TRUE 0.996 18.000 0.810 0.028 Y NA
 7478524 7478525 SPJ_0244 SPJ_0245 rpsK rpoA TRUE 0.949 43.000 0.308 1.000 N NA
 7478525 7478526 SPJ_0245 SPJ_0246 rpoA rplQ TRUE 0.987 12.000 0.873 1.000 N NA
 7478526 7478527 SPJ_0246 SPJ_0247 rplQ   FALSE 0.064 265.000 0.002 1.000 N NA
 7478527 7478528 SPJ_0247 SPJ_0248     TRUE 0.979 10.000 0.569 NA   NA
 7478528 7478529 SPJ_0248 SPJ_0249     FALSE 0.102 187.000 0.008 NA   NA
 7478530 7478531 SPJ_0250 SPJ_0252     FALSE 0.110 97.000 0.000 NA   NA
 7478531 7478532 SPJ_0252 SPJ_0253     FALSE 0.036 248.000 0.000 NA   NA
 7478532 7478533 SPJ_0253 SPJ_0254     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7478533 7478534 SPJ_0254 SPJ_0256     FALSE 0.039 232.000 0.000 NA   NA
 7478534 7478535 SPJ_0256 SPJ_0257     FALSE 0.273 75.000 0.000 1.000   NA
 7478536 7478537 SPJ_0258 SPJ_0259     TRUE 0.989 13.000 0.188 0.039 Y NA
 7478537 7478538 SPJ_0259 SPJ_0260     FALSE 0.234 195.000 0.091 1.000 N NA
 7478538 7478539 SPJ_0260 SPJ_0261     TRUE 0.992 46.000 0.889 0.022 Y NA
 7478539 7478540 SPJ_0261 SPJ_0262     TRUE 0.997 17.000 0.889 0.022 Y NA
 7478540 7478541 SPJ_0262 SPJ_0263     FALSE 0.325 151.000 0.132 1.000 N NA
 7478541 7478542 SPJ_0263 SPJ_0264     TRUE 0.976 19.000 0.368 1.000 N NA
 7478542 7478543 SPJ_0264 SPJ_0265     TRUE 0.968 18.000 0.211 1.000 N NA
 7478543 7478544 SPJ_0265 SPJ_0266   leuS FALSE 0.026 455.000 0.000 1.000 N NA
 7478544 7478545 SPJ_0266 SPJ_0267 leuS   FALSE 0.205 194.000 0.000 1.000 Y NA
 7478545 7478546 SPJ_0267 SPJ_0268     TRUE 0.950 12.000 0.037 0.015   NA
 7478546 7478547 SPJ_0268 SPJ_0269   ruvB FALSE 0.018 1041.000 0.000 1.000   NA
 7478547 7478548 SPJ_0269 SPJ_0270 ruvB   TRUE 0.908 -19.000 0.004 NA   NA
 7478548 7478549 SPJ_0270 SPJ_0271   uppS FALSE 0.039 231.000 0.000 NA   NA
 7478549 7478550 SPJ_0271 SPJ_0272 uppS cdsA TRUE 0.983 9.000 0.113 1.000 Y NA
 7478550 7478551 SPJ_0272 SPJ_0273 cdsA rseP TRUE 0.927 22.000 0.040 1.000 N NA
 7478551 7478552 SPJ_0273 SPJ_0274 rseP proS TRUE 0.950 13.000 0.095 1.000 N NA
 7478552 7478553 SPJ_0274 SPJ_0275 proS   FALSE 0.134 100.000 0.000 1.000 N NA
 7478553 7478554 SPJ_0275 SPJ_0276   glmS FALSE 0.063 192.000 0.000 1.000 N NA
 7478554 7478555 SPJ_0276 SPJ_0277 glmS   FALSE 0.088 119.000 0.000 NA N NA
 7478557 7478558 SPJ_0279 SPJ_0280 rpsL rpsG TRUE 0.992 20.000 0.224 0.005 Y NA
 7478558 7478559 SPJ_0280 SPJ_0281 rpsG fusA TRUE 0.487 424.000 0.579 1.000 Y NA
 7478559 7478560 SPJ_0281 SPJ_0282 fusA polC FALSE 0.192 104.000 0.003 1.000 N NA
 7478560 7478561 SPJ_0282 SPJ_0283 polC   FALSE 0.340 102.000 0.000 NA Y NA
 7478561 7478562 SPJ_0283 SPJ_0284     TRUE 0.990 -7.000 0.400 NA   NA
 7478562 7478563 SPJ_0284 SPJ_0285     TRUE 0.745 21.000 0.000 NA   NA
 7478563 7478564 SPJ_0285 SPJ_0286     TRUE 0.938 22.000 0.095 NA   NA
 7478564 7478565 SPJ_0286 SPJ_0287     TRUE 0.962 10.000 0.190 1.000   NA
 7478565 7478566 SPJ_0287 SPJ_0288     FALSE 0.032 313.000 0.000 1.000   NA
 7478566 7478567 SPJ_0288 SPJ_0289     FALSE 0.164 217.000 0.041 1.000 N NA
 7478568 7478569 SPJ_0290 SPJ_0291     TRUE 0.995 24.000 0.812 0.034 Y NA
 7478569 7478570 SPJ_0291 SPJ_0292     TRUE 0.996 28.000 0.943 0.034 Y NA
 7478570 7478571 SPJ_0292 SPJ_0293     FALSE 0.047 233.000 0.000 1.000   NA
 7478571 7478572 SPJ_0293 SPJ_0294     FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 7478572 7478573 SPJ_0294 SPJ_0295     FALSE 0.110 97.000 0.000 NA   NA
 7478574 7478575 SPJ_0296 SPJ_0297     TRUE 0.787 53.000 0.034 NA   NA
 7478575 7478576 SPJ_0297 SPJ_0298   folP FALSE 0.046 200.000 0.000 NA   NA
 7478576 7478577 SPJ_0298 SPJ_0299 folP   TRUE 0.986 2.000 0.006 0.005 Y NA
 7478577 7478578 SPJ_0299 SPJ_0300   folE TRUE 0.983 -19.000 0.024 1.000 Y NA
 7478578 7478579 SPJ_0300 SPJ_0301 folE   TRUE 0.924 43.000 0.005 1.000 Y NA
 7478581 7478582 SPJ_0303 SPJ_0304   rplM FALSE 0.059 209.000 0.000 1.000 N NA
 7478582 7478583 SPJ_0304 SPJ_0305 rplM rpsI TRUE 0.995 19.000 0.601 0.028 Y NA
 7478585 7478586 SPJ_0307 SPJ_0308     FALSE 0.021 402.000 0.000 NA   NA
 7478588 7478589 SPJ_0310 SPJ_0311     FALSE 0.025 415.000 0.000 1.000   NA
 7478590 7478591 SPJ_0312 SPJ_0313     TRUE 0.985 10.000 0.167 1.000 Y NA
 7478591 7478592 SPJ_0313 SPJ_0314     TRUE 0.975 31.000 0.094 1.000 Y NA
 7478592 7478593 SPJ_0314 SPJ_0315     TRUE 0.965 19.000 0.197 1.000 N NA
 7478594 7478595 SPJ_0316 SPJ_0317     TRUE 0.959 12.000 0.160 1.000   NA
 7478595 7478596 SPJ_0317 SPJ_0318     TRUE 0.970 11.000 0.267 1.000   NA
 7478596 7478597 SPJ_0318 SPJ_0319     TRUE 0.997 15.000 0.933 0.034 Y NA
 7478597 7478598 SPJ_0319 SPJ_0320     TRUE 0.998 -13.000 0.933 0.034 Y NA
 7478598 7478599 SPJ_0320 SPJ_0321     TRUE 0.824 27.000 0.002 NA N NA
 7478599 7478600 SPJ_0321 SPJ_0322     TRUE 0.851 22.000 0.006 NA   NA
 7478600 7478601 SPJ_0322 SPJ_0323     TRUE 0.919 60.000 0.562 NA   NA
 7478602 7478603 SPJ_0324 SPJ_0325     TRUE 0.751 11.000 0.000 NA   NA
 7478603 7478604 SPJ_0325 SPJ_0326     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 7478605 7478606 SPJ_0327 SPJ_0328 mraW ftsL TRUE 0.945 12.000 0.077 1.000 N NA
 7478606 7478607 SPJ_0328 SPJ_0329 ftsL   TRUE 0.985 4.000 0.456 1.000 N NA
 7478607 7478608 SPJ_0329 SPJ_0330   mraY TRUE 0.985 2.000 0.038 1.000 Y NA
 7478608 7478609 SPJ_0330 SPJ_0331 mraY   FALSE 0.023 564.000 0.000 1.000 N NA
 7478610 7478611 SPJ_0332 SPJ_0333 luxS   FALSE 0.215 95.000 0.006 NA   NA
 7478612 7478613 SPJ_0334 SPJ_0335     FALSE 0.020 1066.000 0.000 1.000 N NA
 7478613 7478614 SPJ_0335 SPJ_0336     TRUE 0.990 2.000 0.583 1.000 N NA
 7478614 7478615 SPJ_0336 SPJ_0337     TRUE 0.993 9.000 0.636 1.000 Y NA
 7478615 7478616 SPJ_0337 SPJ_0338     TRUE 0.986 10.000 0.800 1.000 N NA
 7478616 7478617 SPJ_0338 SPJ_0339     TRUE 0.944 16.000 0.067 NA N NA
 7478617 7478618 SPJ_0339 SPJ_0340     TRUE 0.925 4.000 0.020 NA   NA
 7478618 7478619 SPJ_0340 SPJ_0341     TRUE 0.967 0.000 0.048 NA   NA
 7478619 7478620 SPJ_0341 SPJ_0342     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7478620 7478621 SPJ_0342 SPJ_0343     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7478621 7478622 SPJ_0343 SPJ_0344     TRUE 0.938 15.000 0.062 NA   NA
 7478622 7478623 SPJ_0344 SPJ_0345     TRUE 0.647 88.000 0.333 NA   NA
 7478623 7478624 SPJ_0345 SPJ_0346     TRUE 0.979 -7.000 0.118 NA   NA
 7478624 7478625 SPJ_0346 SPJ_0348     TRUE 0.852 -16.000 0.000 NA   NA
 7478625 7478626 SPJ_0348 SPJ_0350     FALSE 0.023 379.000 0.000 NA   NA
 7478627 7478628 SPJ_0349 SPJ_0351     FALSE 0.276 70.000 0.000 NA   NA
 7478628 7478629 SPJ_0351 SPJ_0352     TRUE 0.943 -3.000 0.000 0.079   NA
 7478630 7478631 SPJ_0353 SPJ_0354     FALSE 0.034 301.000 0.000 1.000   NA
 7478632 7478633 SPJ_0355 SPJ_0356   recU TRUE 0.990 -3.000 0.319 1.000   NA
 7478634 7478635 SPJ_0357 SPJ_0358     TRUE 0.857 70.000 0.579 NA   NA
 7478635 7478636 SPJ_0358 SPJ_0359     FALSE 0.019 486.000 0.000 NA   NA
 7478636 7478637 SPJ_0359 SPJ_0360     TRUE 0.909 13.000 0.029 NA   NA
 7478637 7478638 SPJ_0360 SPJ_0361   gnd TRUE 0.364 76.000 0.005 NA   NA
 7478638 7478639 SPJ_0361 SPJ_0362 gnd   TRUE 0.897 12.000 0.012 1.000 N NA
 7478639 7478640 SPJ_0362 SPJ_0363     FALSE 0.107 98.000 0.000 NA   NA
 7478640 7478641 SPJ_0363 SPJ_0364     TRUE 0.755 19.000 0.000 NA   NA
 7478642 7478643 SPJ_0365 SPJ_0366     TRUE 0.609 43.000 0.000 NA   NA
 7478644 7478645 SPJ_0367 SPJ_0368   mvk FALSE 0.077 122.000 0.000 NA   NA
 7478645 7478646 SPJ_0368 SPJ_0369 mvk mvaD TRUE 0.996 -18.000 0.281 0.005 Y NA
 7478646 7478647 SPJ_0369 SPJ_0370 mvaD   TRUE 0.997 -13.000 0.312 0.005 Y NA
 7478647 7478648 SPJ_0370 SPJ_0371   fni TRUE 0.973 -16.000 0.097 1.000 N NA
 7478648 7478649 SPJ_0371 SPJ_0372 fni   TRUE 0.356 77.000 0.005 NA   NA
 7478649 7478650 SPJ_0372 SPJ_0373     TRUE 0.993 -3.000 0.679 NA   NA
 7478650 7478651 SPJ_0373 SPJ_0374     TRUE 0.997 14.000 0.853 0.013 Y NA
 7478651 7478652 SPJ_0374 SPJ_0375     FALSE 0.043 214.000 0.000 NA   NA
 7478652 7478653 SPJ_0375 SPJ_0376     FALSE 0.223 115.000 0.024 NA   NA
 7478653 7478654 SPJ_0376 SPJ_0377     FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 7478654 7478655 SPJ_0377 SPJ_0378     FALSE 0.185 81.000 0.000 NA   NA
 7478655 7478656 SPJ_0378 SPJ_0379     TRUE 0.755 19.000 0.000 NA   NA
 7478657 7478658 SPJ_0380 SPJ_0381     FALSE 0.025 343.000 0.000 NA   NA
 7478658 7478659 SPJ_0381 SPJ_0382     FALSE 0.067 136.000 0.000 NA   NA
 7478660 7478661 SPJ_0383 SPJ_0384     TRUE 0.980 24.000 0.336 0.021 N NA
 7478661 7478662 SPJ_0384 SPJ_0385     TRUE 0.983 2.000 0.131 0.021 N NA
 7478662 7478663 SPJ_0385 SPJ_0386     TRUE 0.907 62.000 0.062 1.000 Y NA
 7478663 7478664 SPJ_0386 SPJ_0387     FALSE 0.022 389.000 0.000 NA   NA
 7478664 7478665 SPJ_0387 SPJ_0388   tig FALSE 0.027 313.000 0.000 NA   NA
 7478666 7478667 SPJ_0389 SPJ_0390   lepB FALSE 0.205 234.000 0.099 1.000 N NA
 7478667 7478668 SPJ_0390 SPJ_0391 lepB rnhC TRUE 0.961 4.000 0.080 1.000 N NA
 7478669 7478670 SPJ_0392 SPJ_0393   cvpA TRUE 0.961 -3.000 0.019 NA   NA
 7478670 7478671 SPJ_0393 SPJ_0394 cvpA   TRUE 0.361 104.000 0.070 1.000   NA
 7478671 7478672 SPJ_0394 SPJ_0395     FALSE 0.033 343.000 0.000 1.000 N NA
 7478672 7478673 SPJ_0395 SPJ_0396     FALSE 0.041 218.000 0.000 NA   NA
 7478673 7478674 SPJ_0396 SPJ_0397     FALSE 0.091 110.000 0.000 NA   NA
 7478675 7478676 SPJ_0398 SPJ_0399 serS   FALSE 0.071 214.000 0.003 NA   NA
 7478676 7478677 SPJ_0399 SPJ_0400     TRUE 0.915 3.000 0.010 NA   NA
 7478678 7478679 SPJ_0401 SPJ_0402     TRUE 0.472 94.000 0.098 1.000 N NA
 7478679 7478680 SPJ_0402 SPJ_0403     TRUE 0.977 0.000 0.070 1.000 N NA
 7478680 7478681 SPJ_0403 SPJ_0404     TRUE 0.859 60.000 0.065 0.008   NA
 7478681 7478682 SPJ_0404 SPJ_0405     TRUE 0.445 119.000 0.216 1.000   NA
 7478682 7478683 SPJ_0405 SPJ_0406   fabD TRUE 0.979 -7.000 0.099 1.000   NA
 7478683 7478684 SPJ_0406 SPJ_0407 fabD fabG TRUE 0.992 34.000 0.432 0.008 Y NA
 7478684 7478685 SPJ_0407 SPJ_0408 fabG fabF TRUE 0.976 22.000 0.056 1.000 Y NA
 7478685 7478686 SPJ_0408 SPJ_0409 fabF accB TRUE 0.986 3.000 0.074 1.000 Y NA
 7478686 7478687 SPJ_0409 SPJ_0410 accB fabZ TRUE 0.994 -3.000 0.047 0.008 Y NA
 7478687 7478688 SPJ_0410 SPJ_0411 fabZ accC TRUE 0.975 12.000 0.045 1.000 Y NA
 7478688 7478689 SPJ_0411 SPJ_0412 accC accD TRUE 0.981 37.000 0.090 0.003 Y NA
 7478689 7478690 SPJ_0412 SPJ_0413 accD accA TRUE 0.997 -3.000 0.234 0.002 Y NA
 7478690 7478691 SPJ_0413 SPJ_0414 accA   FALSE 0.099 159.000 0.003 NA   NA
 7478691 7478692 SPJ_0414 SPJ_0415     TRUE 0.381 341.000 1.000 NA   NA
 7478693 7478694 SPJ_0416 SPJ_0417   nusB TRUE 0.751 10.000 0.000 NA   NA
 7478694 7478695 SPJ_0417 SPJ_0418 nusB   TRUE 0.987 -7.000 0.265 NA   NA
 7478695 7478696 SPJ_0418 SPJ_0419   efp TRUE 0.907 22.000 0.031 NA   NA
 7478696 7478697 SPJ_0419 SPJ_0420 efp   FALSE 0.283 129.000 0.000 1.000 Y NA
 7478697 7478698 SPJ_0420 SPJ_0421     TRUE 0.998 0.000 0.492 0.002 Y NA
 7478698 7478699 SPJ_0421 SPJ_0422   gatC TRUE 0.998 0.000 0.643 0.002 Y NA
 7478700 7478701 SPJ_0423 SPJ_0424 prfC   FALSE 0.039 269.000 0.000 1.000   NA
 7478701 7478702 SPJ_0424 SPJ_0425   rpmB FALSE 0.099 116.000 0.000 1.000   NA
 7478702 7478703 SPJ_0425 SPJ_0426 rpmB   FALSE 0.196 157.000 0.044 NA   NA
 7478703 7478704 SPJ_0426 SPJ_0427     TRUE 0.986 3.000 0.567 NA   NA
 7478704 7478705 SPJ_0427 SPJ_0428   ilvB FALSE 0.095 200.000 0.004 1.000   NA
 7478705 7478706 SPJ_0428 SPJ_0429 ilvB ilvN TRUE 0.997 -7.000 0.249 0.001 Y NA
 7478706 7478707 SPJ_0429 SPJ_0430 ilvN ilvC TRUE 0.939 66.000 0.130 0.003 Y NA
 7478707 7478708 SPJ_0430 SPJ_0431 ilvC   FALSE 0.046 203.000 0.000 NA   NA
 7478708 7478709 SPJ_0431 SPJ_0432     FALSE 0.038 238.000 0.000 NA   NA
 7478709 7478710 SPJ_0432 SPJ_0433   ilvA TRUE 0.556 50.000 0.000 NA   NA
 7478710 7478711 SPJ_0433 SPJ_0434 ilvA   FALSE 0.064 142.000 0.000 NA   NA
 7478711 7478712 SPJ_0434 SPJ_0435     FALSE 0.018 541.000 0.000 NA   NA
 7478713 7478714 SPJ_0436 SPJ_0437 gltL   TRUE 0.998 0.000 0.758 1.000 Y NA
 7478716 7478717 SPJ_0438 SPJ_0440     TRUE 0.690 32.000 0.000 NA   NA
 7478718 7478719 SPJ_0441 SPJ_0442     TRUE 0.697 31.000 0.000 NA   NA
 7478722 7478723 SPJ_0445 SPJ_0446     FALSE 0.026 327.000 0.000 NA   NA
 7478723 7478724 SPJ_0446 SPJ_0447     FALSE 0.017 612.000 0.000 NA   NA
 7478726 7478727 SPJ_0450 SPJ_0451     TRUE 0.985 4.000 0.017 0.005 Y NA
 7478728 7478729 SPJ_0452 SPJ_0453     TRUE 0.940 15.000 0.068 NA   NA
 7478729 7478730 SPJ_0453 SPJ_0454     TRUE 0.771 7.000 0.000 NA   NA
 7478730 7478731 SPJ_0454 SPJ_0455     FALSE 0.100 102.000 0.000 NA   NA
 7478731 7478732 SPJ_0455 SPJ_0456     TRUE 0.990 -15.000 0.530 1.000   NA
 7478732 7478733 SPJ_0456 SPJ_0457   cspR FALSE 0.106 193.000 0.005 1.000 N NA
 7478733 7478734 SPJ_0457 SPJ_0458 cspR   FALSE 0.020 453.000 0.000 NA   NA
 7478734 7478735 SPJ_0458 SPJ_0459     TRUE 0.981 14.000 0.600 NA   NA
 7478735 7478736 SPJ_0459 SPJ_0460     TRUE 0.940 28.000 0.105 1.000   NA
 7478736 7478737 SPJ_0460 SPJ_0461     TRUE 0.820 5.000 0.000 1.000   NA
 7478737 7478738 SPJ_0461 SPJ_0462   rpoE FALSE 0.094 128.000 0.000 1.000 N NA
 7478742 7478743 SPJ_0467 SPJ_0468   pgk TRUE 0.525 90.000 0.002 1.000 Y NA
 7478743 7478744 SPJ_0468 SPJ_0469 pgk   FALSE 0.103 136.000 0.002 NA   NA
 7478744 7478745 SPJ_0469 SPJ_0470     TRUE 0.662 77.000 0.154 NA   NA
 7478745 7478746 SPJ_0470 SPJ_0471   glnA TRUE 0.945 37.000 0.179 1.000 N NA
 7478748 7478749 SPJ_0473 SPJ_0474     FALSE 0.019 468.000 0.000 NA   NA
 7478750 7478751 SPJ_0475 SPJ_0476     TRUE 0.661 57.000 0.000 0.077 N NA
 7478751 7478752 SPJ_0476 SPJ_0477     TRUE 0.992 0.000 0.045 0.077 Y NA
 7478752 7478753 SPJ_0477 SPJ_0478     TRUE 0.994 13.000 0.564 0.077 Y NA
 7478754 7478755 SPJ_0479 SPJ_0480     TRUE 0.676 35.000 0.000 NA   NA
 7478755 7478756 SPJ_0480 SPJ_0481   hrcA FALSE 0.096 164.000 0.003 NA   NA
 7478756 7478757 SPJ_0481 SPJ_0482 hrcA grpE TRUE 0.926 27.000 0.051 1.000 N NA
 7478757 7478758 SPJ_0482 SPJ_0483 grpE dnaK FALSE 0.251 480.000 0.026 0.006 Y NA
 7478758 7478759 SPJ_0483 SPJ_0484 dnaK dnaJ TRUE 0.366 760.000 0.196 0.003 Y NA
 7478760 7478761 SPJ_0485 SPJ_0486     FALSE 0.057 162.000 0.000 NA   NA
 7478761 7478762 SPJ_0486 SPJ_0487     TRUE 0.932 10.000 0.063 NA   NA
 7478763 7478764 SPJ_0488 SPJ_0489     TRUE 0.985 -3.000 0.167 NA N NA
 7478766 7478767 SPJ_0491 SPJ_0492     TRUE 0.981 5.000 0.500 NA   NA
 7478767 7478768 SPJ_0492 SPJ_0493     TRUE 0.991 14.000 0.444 NA Y NA
 7478769 7478770 SPJ_0494 SPJ_0495     TRUE 0.905 57.000 0.250 1.000   NA
 7478770 7478771 SPJ_0495 SPJ_0496     TRUE 0.751 11.000 0.000 NA   NA
 7478772 7478773 SPJ_0498 SPJ_0499     TRUE 0.976 16.000 0.400 NA   NA
 7478773 7478774 SPJ_0499 SPJ_0500     FALSE 0.037 244.000 0.000 NA   NA
 7478774 7478775 SPJ_0500 SPJ_0501     TRUE 0.847 -18.000 0.000 NA   NA
 7478775 7478776 SPJ_0501 SPJ_0502     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7478776 7478777 SPJ_0502 SPJ_0503     FALSE 0.028 298.000 0.000 NA   NA
 7478777 7478778 SPJ_0503 SPJ_0504     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7478778 7478779 SPJ_0504 SPJ_0505     FALSE 0.051 178.000 0.000 NA   NA
 7478779 7478780 SPJ_0505 SPJ_0506     FALSE 0.032 272.000 0.000 NA   NA
 7478780 7478781 SPJ_0506 SPJ_0507     TRUE 0.525 52.000 0.000 NA   NA
 7478781 7478782 SPJ_0507 SPJ_0508     TRUE 0.626 42.000 0.000 NA   NA
 7478782 7478783 SPJ_0508 SPJ_0509     TRUE 0.702 30.000 0.000 NA   NA
 7478783 7478784 SPJ_0509 SPJ_0510     FALSE 0.058 161.000 0.000 NA   NA
 7478784 7478785 SPJ_0510 SPJ_0511   trmB TRUE 0.983 -3.000 0.154 NA   NA
 7478785 7478786 SPJ_0511 SPJ_0512 trmB   FALSE 0.129 126.000 0.004 NA   NA
 7478786 7478787 SPJ_0512 SPJ_0513   nusA TRUE 0.965 44.000 0.759 NA   NA
 7478787 7478788 SPJ_0513 SPJ_0514 nusA   TRUE 0.988 22.000 0.323 NA Y NA
 7478788 7478789 SPJ_0514 SPJ_0515     TRUE 0.990 -7.000 0.408 NA N NA
 7478789 7478790 SPJ_0515 SPJ_0516     TRUE 0.987 17.000 0.223 NA Y NA
 7478790 7478791 SPJ_0516 SPJ_0517   rbfA TRUE 0.614 251.000 0.530 1.000 Y NA
 7478791 7478792 SPJ_0517 SPJ_0518 rbfA   FALSE 0.031 279.000 0.000 NA   NA
 7478792 7478793 SPJ_0518 SPJ_0519     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7478795 7478796 SPJ_0521 SPJ_0522     TRUE 0.985 0.000 0.229 NA   NA
 7478796 7478797 SPJ_0522 SPJ_0523     TRUE 0.947 10.000 0.114 NA   NA
 7478797 7478798 SPJ_0523 SPJ_0524     TRUE 0.455 96.000 0.143 NA   NA
 7478798 7478799 SPJ_0524 SPJ_0525     FALSE 0.021 412.000 0.000 NA   NA
 7478799 7478800 SPJ_0525 SPJ_0526     TRUE 0.852 -16.000 0.000 NA   NA
 7478800 7478801 SPJ_0526 SPJ_0527     TRUE 0.979 -13.000 0.150 1.000   NA
 7478801 7478802 SPJ_0527 SPJ_0528     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7478802 7478803 SPJ_0528 SPJ_0529   valS TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7478803 7478804 SPJ_0529 SPJ_0530 valS   FALSE 0.276 70.000 0.000 NA   NA
 7478804 7478805 SPJ_0530 SPJ_0531     FALSE 0.030 285.000 0.000 NA   NA
 7478805 7478806 SPJ_0531 SPJ_0532     FALSE 0.043 269.000 0.000 1.000 N NA
 7478806 7478807 SPJ_0532 SPJ_0533     FALSE 0.353 191.000 0.333 NA   NA
 7478807 7478808 SPJ_0533 SPJ_0534   pheS FALSE 0.023 369.000 0.000 NA   NA
 7478808 7478809 SPJ_0534 SPJ_0535 pheS   TRUE 0.950 0.000 0.009 1.000   NA
 7478809 7478810 SPJ_0535 SPJ_0536   pheT TRUE 0.410 77.000 0.007 1.000   NA
 7478812 7478813 SPJ_0538 SPJ_0539     FALSE 0.201 79.000 0.000 NA   NA
 7478813 7478814 SPJ_0539 SPJ_0540   metE FALSE 0.041 261.000 0.000 1.000   NA
 7478814 7478815 SPJ_0540 SPJ_0541 metE metF TRUE 0.927 64.000 0.050 0.002 Y NA
 7478815 7478816 SPJ_0541 SPJ_0542 metF   FALSE 0.021 685.000 0.000 1.000 N NA
 7478816 7478817 SPJ_0542 SPJ_0543   cysE TRUE 0.894 16.000 0.006 1.000 N NA
 7478817 7478818 SPJ_0543 SPJ_0544 cysE   TRUE 0.904 12.000 0.017 1.000   NA
 7478818 7478819 SPJ_0544 SPJ_0545   cysS FALSE 0.246 87.000 0.002 1.000   NA
 7478819 7478820 SPJ_0545 SPJ_0546 cysS   TRUE 0.982 -7.000 0.129 1.000   NA
 7478820 7478821 SPJ_0546 SPJ_0547     TRUE 0.921 4.000 0.017 NA   NA
 7478823 7478824 SPJ_0549 SPJ_0550     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7478824 7478825 SPJ_0550 SPJ_0551     FALSE 0.062 146.000 0.000 NA   NA
 7478825 7478826 SPJ_0551 SPJ_0552     FALSE 0.024 354.000 0.000 NA   NA
 7478826 7478827 SPJ_0552 SPJ_0553     TRUE 0.995 13.000 0.917 1.000 Y NA
 7478827 7478828 SPJ_0553 SPJ_0554     TRUE 0.980 52.000 0.542 1.000 Y NA
 7478828 7478829 SPJ_0554 SPJ_0555     FALSE 0.284 312.000 0.409 1.000 N NA
 7478829 7478830 SPJ_0555 SPJ_0556     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7478830 7478831 SPJ_0556 SPJ_0557   fba FALSE 0.084 141.000 0.000 1.000 N NA
 7478832 7478833 SPJ_0558 SPJ_0559     FALSE 0.060 296.000 0.000 0.061 N NA
 7478833 7478834 SPJ_0559 SPJ_0560     TRUE 0.997 10.000 0.947 0.013 Y NA
 7478834 7478835 SPJ_0560 SPJ_0561     TRUE 0.993 13.000 0.400 0.043 Y NA
 7478835 7478836 SPJ_0561 SPJ_0562     TRUE 0.976 40.000 0.185 1.000 Y NA
 7478837 7478838 SPJ_0563 SPJ_0564 recJ   FALSE 0.063 175.000 0.000 1.000   NA
 7478838 7478839 SPJ_0564 SPJ_0565     TRUE 0.723 69.000 0.143 NA   NA
 7478839 7478840 SPJ_0565 SPJ_0566     FALSE 0.347 112.000 0.100 NA   NA
 7478840 7478841 SPJ_0566 SPJ_0567     TRUE 0.995 5.000 0.467 0.008 Y NA
 7478841 7478842 SPJ_0567 SPJ_0568     TRUE 0.606 79.000 0.087 1.000 N NA
 7478842 7478843 SPJ_0568 SPJ_0569   uvrC TRUE 0.787 40.000 0.002 1.000 N NA
 7478843 7478844 SPJ_0569 SPJ_0570 uvrC   TRUE 0.556 50.000 0.000 NA   NA
 7478846 7478847 SPJ_0573 SPJ_0574   pepV TRUE 0.937 13.000 0.051 1.000 N NA
 7478847 7478848 SPJ_0574 SPJ_0575 pepV   TRUE 0.788 54.000 0.031 NA N NA
 7478848 7478849 SPJ_0575 SPJ_0576     FALSE 0.058 160.000 0.000 NA   NA
 7478849 7478850 SPJ_0576 SPJ_0577     TRUE 0.863 1.000 0.000 NA   NA
 7478850 7478851 SPJ_0577 SPJ_0578   brnQ FALSE 0.053 171.000 0.000 NA   NA
 7478851 7478852 SPJ_0578 SPJ_0579 brnQ   FALSE 0.139 98.000 0.000 1.000 N NA
 7478852 7478853 SPJ_0579 SPJ_0580     TRUE 0.978 2.000 0.007 1.000 Y NA
 7478853 7478854 SPJ_0580 SPJ_0581     TRUE 0.893 18.000 0.007 1.000 N NA
 7478854 7478855 SPJ_0581 SPJ_0582   rplK FALSE 0.107 117.000 0.000 1.000 N NA
 7478855 7478856 SPJ_0582 SPJ_0583 rplK rplA TRUE 0.790 208.000 0.838 0.035 Y NA
 7478857 7478858 SPJ_0584 SPJ_0585     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7478858 7478859 SPJ_0585 SPJ_0586     FALSE 0.017 564.000 0.000 NA   NA
 7478860 7478861 SPJ_0587 SPJ_0588     FALSE 0.018 1045.000 0.000 1.000   NA
 7478861 7478862 SPJ_0588 SPJ_0589     TRUE 0.967 2.000 0.098 NA   NA
 7478862 7478863 SPJ_0589 SPJ_0590     TRUE 0.965 2.000 0.083 NA   NA
 7478863 7478864 SPJ_0590 SPJ_0591     TRUE 0.651 39.000 0.000 NA   NA
 7478864 7478865 SPJ_0591 SPJ_0592     FALSE 0.016 693.000 0.000 NA   NA
 7478865 7478866 SPJ_0592 SPJ_0593     FALSE 0.020 626.000 0.000 1.000   NA
 7478866 7478867 SPJ_0593 SPJ_0594     TRUE 0.938 38.000 0.000 0.020 Y NA
 7478867 7478868 SPJ_0594 SPJ_0595     TRUE 0.909 48.000 0.000 0.032 Y NA
 7478868 7478869 SPJ_0595 SPJ_0596     FALSE 0.115 350.000 0.000 1.000 Y NA
 7478870 7478871 SPJ_0597 SPJ_0598     TRUE 0.868 -12.000 0.000 NA   NA
 7478874 7478875 SPJ_0601 SPJ_0603     TRUE 0.852 -16.000 0.000 NA   NA
 7478875 7478876 SPJ_0603 SPJ_0604     TRUE 0.977 -7.000 0.100 NA   NA
 7478876 7478877 SPJ_0604 SPJ_0605     TRUE 0.950 12.000 0.136 NA   NA
 7478877 7478878 SPJ_0605 SPJ_0606     FALSE 0.190 179.000 0.044 1.000   NA
 7478878 7478879 SPJ_0606 SPJ_0607     FALSE 0.052 211.000 0.000 1.000   NA
 7478879 7478880 SPJ_0607 SPJ_0608     TRUE 0.988 20.000 0.250 1.000 Y NA
 7478880 7478881 SPJ_0608 SPJ_0609     TRUE 0.995 11.000 0.875 1.000 Y NA
 7478881 7478882 SPJ_0609 SPJ_0610     FALSE 0.196 358.000 0.240 1.000   NA
 7478882 7478883 SPJ_0610 SPJ_0611     TRUE 0.995 -3.000 0.480 0.013   NA
 7478883 7478884 SPJ_0611 SPJ_0612     FALSE 0.210 116.000 0.020 NA   NA
 7478884 7478885 SPJ_0612 SPJ_0613     TRUE 0.740 22.000 0.000 NA   NA
 7478885 7478886 SPJ_0613 SPJ_0615     TRUE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 7478886 7478887 SPJ_0615 SPJ_0616     FALSE 0.079 120.000 0.000 NA   NA
 7478889 7478890 SPJ_0618 SPJ_0619     FALSE 0.118 191.000 0.015 NA   NA
 7478890 7478891 SPJ_0619 SPJ_0620   thyA FALSE 0.235 97.000 0.006 1.000 N NA
 7478893 7478894 SPJ_0622 SPJ_0623 miaA hflX TRUE 0.966 -7.000 0.027 1.000   NA
 7478894 7478895 SPJ_0623 SPJ_0624 hflX   TRUE 0.953 -7.000 0.014 NA   NA
 7478895 7478896 SPJ_0624 SPJ_0625   rnz TRUE 0.910 15.000 0.022 NA   NA
 7478896 7478897 SPJ_0625 SPJ_0626 rnz   TRUE 0.941 21.000 0.074 1.000   NA
 7478899 7478900 SPJ_0628 SPJ_0629     TRUE 0.963 0.000 0.035 NA   NA
 7478902 7478903 SPJ_0631 SPJ_0632 typA   TRUE 0.887 20.000 0.015 NA   NA
 7478903 7478904 SPJ_0632 SPJ_0633     FALSE 0.026 317.000 0.000 NA   NA
 7478904 7478905 SPJ_0633 SPJ_0636     FALSE 0.028 299.000 0.000 NA   NA
 7478905 7478906 SPJ_0636 SPJ_0637     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7478906 7478907 SPJ_0637 SPJ_0638   murD FALSE 0.125 104.000 0.000 1.000 N NA
 7478907 7478908 SPJ_0638 SPJ_0639 murD   TRUE 0.984 4.000 0.060 1.000 Y NA
 7478908 7478909 SPJ_0639 SPJ_0640     TRUE 0.977 10.000 0.072 NA Y NA
 7478909 7478910 SPJ_0640 SPJ_0641   pyrF FALSE 0.043 233.000 0.000 NA N NA
 7478910 7478911 SPJ_0641 SPJ_0642 pyrF pyrE TRUE 0.945 34.000 0.006 1.000 Y NA
 7478911 7478912 SPJ_0642 SPJ_0643 pyrE   FALSE 0.019 461.000 0.000 NA   NA
 7478912 7478913 SPJ_0643 SPJ_0644     TRUE 0.689 96.000 0.667 NA   NA
 7478913 7478914 SPJ_0644 SPJ_0645     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 7478914 7478915 SPJ_0645 SPJ_0646     TRUE 0.990 4.000 1.000 NA   NA
 7478915 7478916 SPJ_0646 SPJ_0647     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 7478917 7478918 SPJ_0648 SPJ_0649     TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7478918 7478919 SPJ_0649 SPJ_0650     TRUE 0.997 1.000 0.773 1.000 Y NA
 7478919 7478920 SPJ_0650 SPJ_0651     TRUE 0.997 -40.000 0.841 0.013 Y NA
 7478920 7478921 SPJ_0651 SPJ_0652     FALSE 0.072 127.000 0.000 NA   NA
 7478922 7478923 SPJ_0653 SPJ_0654   lysS FALSE 0.086 128.000 0.000 1.000   NA
 7478923 7478924 SPJ_0654 SPJ_0655 lysS lctO FALSE 0.022 625.000 0.000 1.000 N NA
 7478924 7478925 SPJ_0655 SPJ_0656 lctO   FALSE 0.020 557.000 0.000 NA N NA
 7478925 7478926 SPJ_0656 SPJ_0657   thiM FALSE 0.042 237.000 0.000 NA N NA
 7478926 7478927 SPJ_0657 SPJ_0658 thiM thiE1 TRUE 0.992 2.000 0.061 0.005 Y NA
 7478927 7478928 SPJ_0658 SPJ_0659 thiE1   FALSE 0.018 559.000 0.000 NA   NA
 7478928 7478929 SPJ_0659 SPJ_0660     TRUE 0.863 1.000 0.000 NA   NA
 7478929 7478930 SPJ_0660 SPJ_0661     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7478930 7478931 SPJ_0661 SPJ_0662     TRUE 0.924 11.000 0.050 NA   NA
 7478931 7478932 SPJ_0662 SPJ_0663   thiW TRUE 0.940 5.000 0.052 NA   NA
 7478932 7478933 SPJ_0663 SPJ_0664 thiW   TRUE 0.970 0.000 0.059 NA   NA
 7478933 7478934 SPJ_0664 SPJ_0665   thiE2 TRUE 0.996 -7.000 0.190 0.005 Y NA
 7478936 7478937 SPJ_0667 SPJ_0668     TRUE 0.966 11.000 0.250 NA   NA
 7478937 7478938 SPJ_0668 SPJ_0669     TRUE 0.956 10.000 0.167 NA   NA
 7478938 7478939 SPJ_0669 SPJ_0670   spxB FALSE 0.060 207.000 0.000 1.000 N NA
 7478939 7478940 SPJ_0670 SPJ_0671 spxB   FALSE 0.332 111.000 0.083 NA   NA
 7478941 7478942 SPJ_0672 SPJ_0673     FALSE 0.023 380.000 0.000 NA   NA
 7478943 7478944 SPJ_0674 SPJ_0675   manA FALSE 0.068 132.000 0.000 NA   NA
 7478946 7478947 SPJ_0677 SPJ_0678     TRUE 0.863 1.000 0.000 NA   NA
 7478948 7478949 SPJ_0679 SPJ_0680     TRUE 0.491 59.000 0.000 1.000   NA
 7478949 7478950 SPJ_0680 SPJ_0681     TRUE 0.662 59.000 0.012 NA   NA
 7478951 7478952 SPJ_0682 SPJ_0683     TRUE 0.806 19.000 0.000 1.000 N NA
 7478952 7478953 SPJ_0683 SPJ_0684   upp TRUE 0.844 68.000 0.041 1.000 Y NA
 7478953 7478954 SPJ_0684 SPJ_0685 upp clpP FALSE 0.134 174.000 0.010 1.000 N NA
 7478954 7478955 SPJ_0685 SPJ_0686 clpP   TRUE 0.538 79.000 0.065 NA   NA
 7478955 7478956 SPJ_0686 SPJ_0687     TRUE 0.395 101.000 0.109 NA   NA
 7478956 7478957 SPJ_0687 SPJ_0688     TRUE 0.412 268.000 0.150 1.000 Y NA
 7478957 7478958 SPJ_0688 SPJ_0689     TRUE 0.995 4.000 0.363 0.042 Y NA
 7478958 7478959 SPJ_0689 SPJ_0690     TRUE 0.996 0.000 0.349 1.000 Y NA
 7478959 7478960 SPJ_0690 SPJ_0691     TRUE 0.995 0.000 0.128 0.035 Y NA
 7478960 7478961 SPJ_0691 SPJ_0692     FALSE 0.163 414.000 0.214 1.000   NA
 7478961 7478962 SPJ_0692 SPJ_0693   prfB FALSE 0.052 214.000 0.000 1.000   NA
 7478962 7478963 SPJ_0693 SPJ_0694 prfB ftsE TRUE 0.942 18.000 0.053 1.000 N NA
 7478963 7478964 SPJ_0694 SPJ_0695 ftsE   TRUE 0.997 -7.000 0.431 1.000 Y NA
 7478964 7478965 SPJ_0695 SPJ_0696     FALSE 0.061 286.000 0.000 0.079 N NA
 7478965 7478966 SPJ_0696 SPJ_0697     TRUE 0.948 52.000 0.610 NA   NA
 7478966 7478967 SPJ_0697 SPJ_0698     FALSE 0.065 140.000 0.000 NA   NA
 7478967 7478968 SPJ_0698 SPJ_0699   metK FALSE 0.056 216.000 0.000 1.000 N NA
 7478970 7478971 SPJ_0701 SPJ_0702   holA TRUE 0.816 34.000 0.002 1.000 N NA
 7478971 7478972 SPJ_0702 SPJ_0703 holA   FALSE 0.143 173.000 0.012 1.000 N NA
 7478972 7478973 SPJ_0703 SPJ_0704     FALSE 0.159 157.000 0.021 NA   NA
 7478973 7478974 SPJ_0704 SPJ_0705     TRUE 0.887 21.000 0.016 NA   NA
 7478974 7478975 SPJ_0705 SPJ_0706     TRUE 0.948 0.000 0.012 NA   NA
 7478975 7478976 SPJ_0706 SPJ_0707     TRUE 0.946 2.000 0.027 NA   NA
 7478977 7478978 SPJ_0708 SPJ_0709     FALSE 0.168 84.000 0.000 NA   NA
 7478978 7478979 SPJ_0709 SPJ_0710     TRUE 0.811 -48.000 0.000 NA   NA
 7478979 7478980 SPJ_0710 SPJ_0711     FALSE 0.024 361.000 0.000 NA   NA
 7478981 7478982 SPJ_0712 SPJ_0713 rpsP   TRUE 0.975 20.000 0.385 1.000   NA
 7478982 7478983 SPJ_0713 SPJ_0714     FALSE 0.017 577.000 0.000 NA   NA
 7478983 7478984 SPJ_0714 SPJ_0715   rimM TRUE 0.697 31.000 0.000 NA   NA
 7478984 7478985 SPJ_0715 SPJ_0716 rimM trmD TRUE 0.997 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 7478985 7478986 SPJ_0716 SPJ_0717 trmD   TRUE 0.849 12.000 0.002 1.000   NA
 7478989 7478990 SPJ_0719 SPJ_0721     TRUE 0.382 63.000 0.000 NA   NA
 7478991 7478992 SPJ_0722 SPJ_0723     TRUE 0.891 66.000 0.600 NA   NA
 7478992 7478993 SPJ_0723 SPJ_0724     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 7478993 7478994 SPJ_0724 SPJ_0725     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 7478996 7478997 SPJ_0727 SPJ_0728     TRUE 0.993 -16.000 0.923 1.000 N NA
 7478997 7478998 SPJ_0728 SPJ_0729     TRUE 0.997 2.000 0.923 1.000 Y NA
 7478998 7478999 SPJ_0729 SPJ_0730   metG FALSE 0.155 124.000 0.003 1.000 N NA
 7478999 7479000 SPJ_0730 SPJ_0731 metG   TRUE 0.556 50.000 0.000 NA   NA
 7479000 7479001 SPJ_0731 SPJ_0732     FALSE 0.066 138.000 0.000 NA   NA
 7479001 7479002 SPJ_0732 SPJ_0733     TRUE 0.981 4.000 0.429 NA   NA
 7479002 7479003 SPJ_0733 SPJ_0734     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7479003 7479004 SPJ_0734 SPJ_0735     TRUE 0.829 -28.000 0.000 NA   NA
 7479004 7479005 SPJ_0735 SPJ_0736     FALSE 0.219 96.000 0.008 NA   NA
 7479005 7479006 SPJ_0736 SPJ_0737     TRUE 0.993 -7.000 0.710 NA   NA
 7479006 7479007 SPJ_0737 SPJ_0738     TRUE 0.944 11.000 0.067 1.000 N NA
 7479007 7479008 SPJ_0738 SPJ_0739     TRUE 0.952 8.000 0.091 1.000 N NA
 7479008 7479009 SPJ_0739 SPJ_0740     TRUE 0.671 42.000 0.000 1.000   NA
 7479009 7479010 SPJ_0740 SPJ_0741     TRUE 0.831 -25.000 0.000 NA   NA
 7479010 7479011 SPJ_0741 SPJ_0742     FALSE 0.076 123.000 0.000 NA   NA
 7479013 7479014 SPJ_0744 SPJ_0745     TRUE 0.997 -10.000 0.606 1.000 Y NA
 7479016 7479017 SPJ_0747 SPJ_0748     FALSE 0.062 200.000 0.000 1.000 N NA
 7479017 7479018 SPJ_0748 SPJ_0749     TRUE 0.874 37.000 0.019 1.000 N NA
 7479018 7479019 SPJ_0749 SPJ_0750     TRUE 0.868 11.000 0.008 NA   NA
 7479019 7479020 SPJ_0750 SPJ_0751     FALSE 0.158 85.000 0.000 NA   NA
 7479020 7479021 SPJ_0751 SPJ_0752   gyrB TRUE 0.906 15.000 0.013 1.000   NA
 7479021 7479022 SPJ_0752 SPJ_0753 gyrB ezrA TRUE 0.390 82.000 0.011 1.000 N NA
 7479023 7479024 SPJ_0754 SPJ_0755     FALSE 0.034 261.000 0.000 NA   NA
 7479024 7479025 SPJ_0755 SPJ_0756     FALSE 0.056 165.000 0.000 NA   NA
 7479026 7479027 SPJ_0757 SPJ_0758     FALSE 0.025 335.000 0.000 NA   NA
 7479028 7479029 SPJ_0759 SPJ_0760     FALSE 0.040 229.000 0.000 NA   NA
 7479030 7479031 SPJ_0761 SPJ_0762     TRUE 0.997 0.000 0.640 1.000 Y NA
 7479031 7479032 SPJ_0762 SPJ_0763     FALSE 0.197 133.000 0.017 1.000 N NA
 7479032 7479033 SPJ_0763 SPJ_0764     FALSE 0.136 137.000 0.009 NA   NA
 7479033 7479034 SPJ_0764 SPJ_0765     TRUE 0.890 14.000 0.013 NA   NA
 7479034 7479035 SPJ_0765 SPJ_0766   rpiA FALSE 0.119 298.000 0.000 NA Y NA
 7479035 7479036 SPJ_0766 SPJ_0767 rpiA deoB TRUE 0.970 14.000 0.018 1.000 Y NA
 7479036 7479037 SPJ_0767 SPJ_0768 deoB   TRUE 0.970 2.000 0.120 NA   NA
 7479037 7479038 SPJ_0768 SPJ_0769     FALSE 0.289 147.000 0.125 NA   NA
 7479038 7479039 SPJ_0769 SPJ_0770     FALSE 0.023 476.000 0.000 1.000   NA
 7479039 7479040 SPJ_0770 SPJ_0771     TRUE 0.786 10.000 0.000 1.000   NA
 7479040 7479041 SPJ_0771 SPJ_0772     TRUE 0.763 25.000 0.000 1.000   NA
 7479041 7479042 SPJ_0772 SPJ_0773   deoD FALSE 0.020 658.000 0.000 1.000   NA
 7479043 7479044 SPJ_0774 SPJ_0775   rpsT TRUE 0.688 53.000 0.002 1.000 N NA
 7479044 7479045 SPJ_0775 SPJ_0776 rpsT coaA TRUE 0.573 68.000 0.014 1.000 N NA
 7479046 7479047 SPJ_0777 SPJ_0778     FALSE 0.022 383.000 0.000 NA   NA
 7479047 7479048 SPJ_0778 SPJ_0779     TRUE 0.975 -3.000 0.044 1.000 N NA
 7479048 7479049 SPJ_0779 SPJ_0780   deoC TRUE 0.983 18.000 0.106 1.000 Y NA
 7479049 7479050 SPJ_0780 SPJ_0781 deoC cdd TRUE 0.989 -13.000 0.051 1.000 Y NA
 7479050 7479051 SPJ_0781 SPJ_0782 cdd   TRUE 0.576 91.000 0.200 1.000   NA
 7479051 7479052 SPJ_0782 SPJ_0783     FALSE 0.192 144.000 0.024 1.000   NA
 7479052 7479053 SPJ_0783 SPJ_0784     TRUE 0.991 -7.000 0.438 1.000   NA
 7479053 7479054 SPJ_0784 SPJ_0785     TRUE 0.992 3.000 0.720 0.041   NA
 7479054 7479055 SPJ_0785 SPJ_0786     FALSE 0.158 85.000 0.000 NA   NA
 7479055 7479056 SPJ_0786 SPJ_0787     FALSE 0.066 137.000 0.000 NA   NA
 7479056 7479057 SPJ_0787 SPJ_0788     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 7479059 7479060 SPJ_0790 SPJ_0791 parE   FALSE 0.078 121.000 0.000 NA   NA
 7479060 7479061 SPJ_0791 SPJ_0792   parC FALSE 0.056 165.000 0.000 NA   NA
 7479061 7479062 SPJ_0792 SPJ_0793 parC ilvE FALSE 0.309 132.000 0.086 1.000 N NA
 7479062 7479063 SPJ_0793 SPJ_0794 ilvE   TRUE 0.489 56.000 0.000 NA   NA
 7479063 7479064 SPJ_0794 SPJ_0795     FALSE 0.354 65.000 0.000 NA   NA
 7479064 7479065 SPJ_0795 SPJ_0796     TRUE 0.995 -3.000 0.939 NA   NA
 7479065 7479066 SPJ_0796 SPJ_0797   pcp1 TRUE 0.971 15.000 0.300 NA   NA
 7479066 7479067 SPJ_0797 SPJ_0798 pcp1   FALSE 0.055 168.000 0.000 NA   NA
 7479067 7479068 SPJ_0798 SPJ_0799     TRUE 0.556 50.000 0.000 NA   NA
 7479068 7479069 SPJ_0799 SPJ_0800     TRUE 0.771 7.000 0.000 NA   NA
 7479069 7479070 SPJ_0800 SPJ_0801     FALSE 0.059 159.000 0.000 NA   NA
 7479071 7479072 SPJ_0802 SPJ_0803     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7479072 7479073 SPJ_0803 SPJ_0804     TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.071   NA
 7479074 7479075 SPJ_0805 SPJ_0806     TRUE 0.964 0.000 0.030 NA N NA
 7479075 7479076 SPJ_0806 SPJ_0807     TRUE 0.921 28.000 0.067 NA   NA
 7479076 7479077 SPJ_0807 SPJ_0808   sufC FALSE 0.102 150.000 0.003 NA   NA
 7479077 7479078 SPJ_0808 SPJ_0809 sufC sufD TRUE 0.980 28.000 0.139 1.000 Y NA
 7479078 7479079 SPJ_0809 SPJ_0810 sufD   TRUE 0.983 11.000 0.606 1.000 N NA
 7479079 7479080 SPJ_0810 SPJ_0811     TRUE 0.987 -13.000 0.292 1.000 N NA
 7479080 7479081 SPJ_0811 SPJ_0812   sufB TRUE 0.931 54.000 0.152 0.002 N NA
 7479085 7479086 SPJ_0816 SPJ_0817   pfkB TRUE 0.998 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 7479086 7479087 SPJ_0817 SPJ_0818 pfkB   TRUE 0.998 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 7479087 7479088 SPJ_0818 SPJ_0819     TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7479088 7479089 SPJ_0819 SPJ_0820     TRUE 0.891 -6.000 0.000 NA   NA
 7479091 7479092 SPJ_0822 SPJ_0823   thiI TRUE 0.976 9.000 0.349 1.000 N NA
 7479092 7479093 SPJ_0823 SPJ_0824 thiI   FALSE 0.120 135.000 0.005 NA   NA
 7479093 7479094 SPJ_0824 SPJ_0825     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7479094 7479095 SPJ_0825 SPJ_0826     FALSE 0.025 508.000 0.000 1.000 N NA
 7479095 7479096 SPJ_0826 SPJ_0827     TRUE 0.985 13.000 0.092 0.071 Y NA
 7479096 7479097 SPJ_0827 SPJ_0828     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.009   NA
 7479097 7479098 SPJ_0828 SPJ_0829     TRUE 0.425 60.000 0.000 NA   NA
 7479098 7479099 SPJ_0829 SPJ_0830     TRUE 0.950 -3.000 0.009 NA   NA
 7479099 7479100 SPJ_0830 SPJ_0831     FALSE 0.096 118.000 0.000 1.000   NA
 7479100 7479101 SPJ_0831 SPJ_0832     TRUE 0.903 -34.000 0.000 0.071   NA
 7479101 7479102 SPJ_0832 SPJ_0833     TRUE 0.944 30.000 0.048 0.009   NA
 7479103 7479104 SPJ_0834 SPJ_0835     TRUE 0.802 17.000 0.000 1.000   NA
 7479105 7479106 SPJ_0836 SPJ_0837   pfkA TRUE 0.580 83.000 0.098 1.000 N NA
 7479106 7479107 SPJ_0837 SPJ_0838 pfkA pyk TRUE 0.972 59.000 0.261 0.005 Y NA
 7479107 7479108 SPJ_0838 SPJ_0839 pyk   FALSE 0.014 1864.000 0.000 NA   NA
 7479110 7479111 SPJ_0841 SPJ_0842     FALSE 0.058 161.000 0.000 NA   NA
 7479112 7479113 SPJ_0843 SPJ_0844     TRUE 0.994 -3.000 0.841 NA   NA
 7479113 7479114 SPJ_0844 SPJ_0845     TRUE 0.970 1.000 0.091 NA   NA
 7479114 7479115 SPJ_0845 SPJ_0846     FALSE 0.086 114.000 0.000 NA   NA
 7479116 7479117 SPJ_0847 SPJ_0848     TRUE 0.981 -13.000 0.215 NA   NA
 7479117 7479118 SPJ_0848 SPJ_0849     TRUE 0.356 95.000 0.051 NA   NA
 7479120 7479121 SPJ_0851 SPJ_0852     TRUE 0.992 2.000 0.855 1.000   NA
 7479122 7479123 SPJ_0853 SPJ_0854     FALSE 0.192 80.000 0.000 NA   NA
 7479123 7479124 SPJ_0854 SPJ_0855     FALSE 0.039 233.000 0.000 NA   NA
 7479126 7479127 SPJ_0856 SPJ_0858     FALSE 0.076 123.000 0.000 NA   NA
 7479128 7479129 SPJ_0859 SPJ_0860 speE lys TRUE 0.990 -3.000 0.036 1.000 Y NA
 7479129 7479130 SPJ_0860 SPJ_0861 lys nspC TRUE 0.996 0.000 0.444 1.000 Y NA
 7479130 7479131 SPJ_0861 SPJ_0862 nspC aguA TRUE 0.990 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 7479131 7479132 SPJ_0862 SPJ_0863 aguA aguB TRUE 0.945 10.000 0.084 1.000   NA
 7479134 7479135 SPJ_0865 SPJ_0866     TRUE 0.505 54.000 0.000 NA   NA
 7479135 7479136 SPJ_0866 SPJ_0867     FALSE 0.037 242.000 0.000 NA   NA
 7479136 7479137 SPJ_0867 SPJ_0868   lspA TRUE 0.984 -3.000 0.119 1.000 N NA
 7479137 7479138 SPJ_0868 SPJ_0869 lspA   TRUE 0.976 -10.000 0.082 1.000 N NA
 7479138 7479139 SPJ_0869 SPJ_0870     TRUE 0.850 3.000 0.000 1.000   NA
 7479139 7479140 SPJ_0870 SPJ_0871   proB FALSE 0.121 101.000 0.000 1.000   NA
 7479140 7479141 SPJ_0871 SPJ_0872 proB proA TRUE 0.993 10.000 0.281 0.002 Y NA
 7479141 7479142 SPJ_0872 SPJ_0873 proA proC TRUE 0.983 4.000 0.009 0.002 Y NA
 7479142 7479143 SPJ_0873 SPJ_0874 proC tmk FALSE 0.054 220.000 0.000 1.000 N NA
 7479143 7479144 SPJ_0874 SPJ_0875 tmk   TRUE 0.989 -3.000 0.254 1.000 N NA
 7479144 7479145 SPJ_0875 SPJ_0876     TRUE 0.867 40.000 0.038 NA   NA
 7479145 7479146 SPJ_0876 SPJ_0877     TRUE 0.947 3.000 0.043 NA   NA
 7479146 7479147 SPJ_0877 SPJ_0878     FALSE 0.040 227.000 0.000 NA   NA
 7479147 7479148 SPJ_0878 SPJ_0880     FALSE 0.092 109.000 0.000 NA   NA
 7479149 7479150 SPJ_0879 SPJ_0881     TRUE 0.769 17.000 0.000 NA   NA
 7479151 7479152 SPJ_0882 SPJ_0883 trmFO pyrH FALSE 0.299 84.000 0.002 1.000 N NA
 7479152 7479153 SPJ_0883 SPJ_0884 pyrH frr TRUE 0.984 9.000 0.626 1.000 N NA
 7479153 7479154 SPJ_0884 SPJ_0885 frr   TRUE 0.638 60.000 0.012 NA   NA
 7479154 7479155 SPJ_0885 SPJ_0886     TRUE 0.886 9.000 0.013 NA   NA
 7479155 7479156 SPJ_0886 SPJ_0888     FALSE 0.290 86.000 0.010 NA   NA
 7479158 7479159 SPJ_0889 SPJ_0890     TRUE 0.955 3.000 0.065 NA   NA
 7479161 7479162 SPJ_0894 SPJ_0895     TRUE 0.754 68.000 0.125 1.000 N NA
 7479162 7479163 SPJ_0895 SPJ_0896     TRUE 0.918 -16.000 0.002 1.000   NA
 7479163 7479164 SPJ_0896 SPJ_0897     FALSE 0.026 400.000 0.000 1.000   NA
 7479164 7479165 SPJ_0897 SPJ_0898     TRUE 0.983 4.000 0.500 NA   NA
 7479167 7479168 SPJ_0900 SPJ_0901 infC rpmI TRUE 0.991 33.000 0.652 1.000 Y NA
 7479168 7479169 SPJ_0901 SPJ_0902 rpmI rplT TRUE 0.990 52.000 0.928 0.024 Y NA
 7479169 7479170 SPJ_0902 SPJ_0903 rplT   TRUE 0.659 58.000 0.003 1.000 N NA
 7479170 7479171 SPJ_0903 SPJ_0904     FALSE 0.048 250.000 0.000 1.000 N NA
 7479171 7479172 SPJ_0904 SPJ_0905     TRUE 0.982 11.000 0.592 1.000 N NA
 7479172 7479173 SPJ_0905 SPJ_0906     FALSE 0.205 99.000 0.005 1.000   NA
 7479175 7479176 SPJ_0908 SPJ_0909     TRUE 0.950 -19.000 0.035 NA   NA
 7479176 7479177 SPJ_0909 SPJ_0910   era TRUE 0.944 17.000 0.063 1.000   NA
 7479177 7479178 SPJ_0910 SPJ_0911 era mutM TRUE 0.738 49.000 0.004 1.000   NA
 7479178 7479179 SPJ_0911 SPJ_0912 mutM coaE TRUE 0.976 0.000 0.066 1.000 N NA
 7479179 7479180 SPJ_0912 SPJ_0913 coaE   TRUE 0.943 -13.000 0.007 1.000 N NA
 7479180 7479181 SPJ_0913 SPJ_0914   rpmG1 TRUE 0.957 0.000 0.012 1.000 N NA
 7479181 7479182 SPJ_0914 SPJ_0915 rpmG1 secG TRUE 0.840 40.000 0.012 1.000 N NA
 7479182 7479183 SPJ_0915 SPJ_0916 secG rnr TRUE 0.377 102.000 0.064 1.000 N NA
 7479183 7479184 SPJ_0916 SPJ_0917 rnr smpB TRUE 0.981 -37.000 0.143 0.028 N NA
 7479184 7479185 SPJ_0917 SPJ_0918 smpB tehB TRUE 0.876 16.000 0.002 1.000 N NA
 7479185 7479186 SPJ_0918 SPJ_0919 tehB   FALSE 0.246 73.000 0.000 NA   NA
 7479186 7479187 SPJ_0919 SPJ_0920   pepF1 TRUE 0.961 19.000 0.204 NA   NA
 7479187 7479188 SPJ_0920 SPJ_0921 pepF1   TRUE 0.871 38.000 0.024 1.000   NA
 7479188 7479189 SPJ_0921 SPJ_0922     TRUE 0.589 67.000 0.016 1.000   NA
 7479190 7479191 SPJ_0923 SPJ_0924     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 7479191 7479192 SPJ_0924 SPJ_0925     FALSE 0.016 653.000 0.000 NA   NA
 7479192 7479193 SPJ_0925 SPJ_0926     TRUE 0.953 0.000 0.018 NA   NA
 7479193 7479194 SPJ_0926 SPJ_0927     TRUE 0.947 0.000 0.012 NA   NA
 7479194 7479195 SPJ_0927 SPJ_0928     TRUE 0.378 95.000 0.062 NA   NA
 7479196 7479197 SPJ_0929 SPJ_0930 glmU   TRUE 0.907 10.000 0.015 1.000 N NA
 7479197 7479198 SPJ_0930 SPJ_0931     TRUE 0.904 12.000 0.025 NA   NA
 7479198 7479199 SPJ_0931 SPJ_0932   mtnN TRUE 0.926 17.000 0.041 NA   NA
 7479199 7479200 SPJ_0932 SPJ_0933 mtnN   FALSE 0.142 89.000 0.000 NA   NA
 7479200 7479201 SPJ_0933 SPJ_0934     FALSE 0.344 98.000 0.057 NA   NA
 7479201 7479202 SPJ_0934 SPJ_0935     TRUE 0.954 9.000 0.105 1.000 N NA
 7479202 7479203 SPJ_0935 SPJ_0936     FALSE 0.048 214.000 0.000 NA N NA
 7479203 7479204 SPJ_0936 SPJ_0937     FALSE 0.051 179.000 0.000 NA   NA
 7479204 7479205 SPJ_0937 SPJ_0938     FALSE 0.058 161.000 0.000 NA   NA
 7479205 7479206 SPJ_0938 SPJ_0939     TRUE 0.626 42.000 0.000 NA   NA
 7479206 7479207 SPJ_0939 SPJ_0940     FALSE 0.039 231.000 0.000 NA   NA
 7479207 7479208 SPJ_0940 SPJ_0941     TRUE 0.992 11.000 0.500 1.000 Y NA
 7479208 7479209 SPJ_0941 SPJ_0942     FALSE 0.031 374.000 0.000 1.000 N NA
 7479209 7479210 SPJ_0942 SPJ_0943     FALSE 0.084 143.000 0.000 1.000 N NA
 7479210 7479211 SPJ_0943 SPJ_0944     TRUE 0.979 8.000 0.500 NA   NA
 7479211 7479212 SPJ_0944 SPJ_0945     FALSE 0.044 210.000 0.000 NA   NA
 7479212 7479213 SPJ_0945 SPJ_0946     FALSE 0.014 1161.000 0.000 NA   NA
 7479213 7479214 SPJ_0946 SPJ_0947     FALSE 0.029 295.000 0.000 NA   NA
 7479217 7479218 SPJ_0950 SPJ_0951 mscL   TRUE 0.411 82.000 0.003 0.055   NA
 7479219 7479220 SPJ_0952 SPJ_0953     FALSE 0.103 100.000 0.000 NA   NA
 7479220 7479221 SPJ_0953 SPJ_0954   asd FALSE 0.017 628.000 0.000 NA   NA
 7479221 7479222 SPJ_0954 SPJ_0955 asd dapA TRUE 0.935 56.000 0.063 1.000 Y NA
 7479223 7479224 SPJ_0956 SPJ_0957 trmE   FALSE 0.126 136.000 0.003 1.000   NA
 7479225 7479226 SPJ_0958 SPJ_0959 tdk prfA TRUE 0.978 -3.000 0.062 1.000 N NA
 7479226 7479227 SPJ_0959 SPJ_0960 prfA hemK TRUE 0.992 0.000 0.084 1.000 Y NA
 7479227 7479228 SPJ_0960 SPJ_0961 hemK   TRUE 0.984 -16.000 0.029 NA Y NA
 7479228 7479229 SPJ_0961 SPJ_0962     TRUE 0.930 2.000 0.012 NA   NA
 7479229 7479230 SPJ_0962 SPJ_0963   glyA TRUE 0.762 62.000 0.056 1.000   NA
 7479230 7479231 SPJ_0963 SPJ_0964 glyA   TRUE 0.948 8.000 0.103 NA   NA
 7479231 7479232 SPJ_0964 SPJ_0965     TRUE 0.978 0.000 0.128 NA   NA
 7479232 7479233 SPJ_0965 SPJ_0966     TRUE 0.477 74.000 0.019 NA   NA
 7479233 7479234 SPJ_0966 SPJ_0967   rumA1 TRUE 0.475 74.000 0.019 NA   NA
 7479234 7479235 SPJ_0967 SPJ_0968 rumA1   FALSE 0.021 738.000 0.000 1.000 N NA
 7479235 7479236 SPJ_0968 SPJ_0969     FALSE 0.029 393.000 0.000 1.000 N NA
 7479236 7479237 SPJ_0969 SPJ_0970     TRUE 0.997 -10.000 0.778 1.000 Y NA
 7479237 7479238 SPJ_0970 SPJ_0971     TRUE 0.998 0.000 0.800 0.039 Y NA
 7479238 7479239 SPJ_0971 SPJ_0972     TRUE 0.995 0.000 0.250 1.000 Y NA
 7479239 7479240 SPJ_0972 SPJ_0973     FALSE 0.021 568.000 0.000 1.000   NA
 7479240 7479241 SPJ_0973 SPJ_0974     FALSE 0.062 149.000 0.000 NA   NA
 7479241 7479242 SPJ_0974 SPJ_0975     FALSE 0.016 684.000 0.000 NA   NA
 7479242 7479243 SPJ_0975 SPJ_0976     FALSE 0.131 92.000 0.000 NA   NA
 7479243 7479244 SPJ_0976 SPJ_0978     FALSE 0.032 268.000 0.000 NA   NA
 7479244 7479245 SPJ_0978 SPJ_0979     FALSE 0.026 322.000 0.000 NA   NA
 7479245 7479246 SPJ_0979 SPJ_0980     TRUE 0.802 62.000 0.125 NA   NA
 7479246 7479247 SPJ_0980 SPJ_0981     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 7479247 7479248 SPJ_0981 SPJ_0982     FALSE 0.333 112.000 0.077 NA N NA
 7479248 7479249 SPJ_0982 SPJ_0983     FALSE 0.075 163.000 0.000 1.000 N NA
 7479249 7479250 SPJ_0983 SPJ_0984     FALSE 0.329 86.000 0.016 NA   NA
 7479250 7479251 SPJ_0984 SPJ_0985     FALSE 0.045 205.000 0.000 NA   NA
 7479251 7479252 SPJ_0985 SPJ_0986     FALSE 0.065 140.000 0.000 NA   NA
 7479252 7479253 SPJ_0986 SPJ_0987     FALSE 0.022 387.000 0.000 NA   NA
 7479253 7479254 SPJ_0987 SPJ_0988     TRUE 0.900 0.000 0.000 1.000   NA
 7479254 7479255 SPJ_0988 SPJ_0989     TRUE 0.712 28.000 0.000 NA   NA
 7479255 7479256 SPJ_0989 SPJ_0990     TRUE 0.809 -72.000 0.000 NA   NA
 7479256 7479257 SPJ_0990 SPJ_0991     FALSE 0.015 832.000 0.000 NA   NA
 7479257 7479258 SPJ_0991 SPJ_0992     TRUE 0.751 10.000 0.000 NA   NA
 7479258 7479259 SPJ_0992 SPJ_0993     TRUE 0.735 23.000 0.000 NA   NA
 7479259 7479260 SPJ_0993 SPJ_0995     FALSE 0.126 93.000 0.000 NA   NA
 7479262 7479263 SPJ_0997 SPJ_0998     TRUE 0.992 -7.000 0.625 NA   NA
 7479263 7479264 SPJ_0998 SPJ_0999     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7479264 7479265 SPJ_0999 SPJ_1000     TRUE 0.681 34.000 0.000 NA   NA
 7479265 7479266 SPJ_1000 SPJ_1001     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7479266 7479267 SPJ_1001 SPJ_1002     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7479267 7479268 SPJ_1002 SPJ_1004     FALSE 0.018 542.000 0.000 NA   NA
 7479270 7479271 SPJ_1005 SPJ_1006   ppc TRUE 0.922 20.000 0.028 1.000 N NA
 7479271 7479272 SPJ_1006 SPJ_1007 ppc   FALSE 0.021 413.000 0.000 NA   NA
 7479272 7479273 SPJ_1007 SPJ_1008     TRUE 0.822 69.000 0.368 NA   NA
 7479273 7479274 SPJ_1008 SPJ_1009     TRUE 0.995 -3.000 0.895 1.000   NA
 7479274 7479275 SPJ_1009 SPJ_1010   dnaG FALSE 0.241 90.000 0.002 1.000   NA
 7479275 7479276 SPJ_1010 SPJ_1011 dnaG   TRUE 0.978 3.000 0.209 1.000 N NA
 7479276 7479277 SPJ_1011 SPJ_1012     TRUE 0.926 14.000 0.044 NA   NA
 7479277 7479278 SPJ_1012 SPJ_1013     FALSE 0.209 115.000 0.019 NA   NA
 7479278 7479279 SPJ_1013 SPJ_1014     TRUE 0.995 16.000 0.413 0.010 Y NA
 7479279 7479280 SPJ_1014 SPJ_1015     TRUE 0.870 31.000 0.016 NA N NA
 7479280 7479281 SPJ_1015 SPJ_1016     TRUE 0.851 59.000 0.167 NA   NA
 7479281 7479282 SPJ_1016 SPJ_1017     TRUE 0.580 64.000 0.011 NA   NA
 7479282 7479283 SPJ_1017 SPJ_1018     TRUE 0.871 10.000 0.009 NA   NA
 7479283 7479284 SPJ_1018 SPJ_1019   murA1 FALSE 0.015 1087.000 0.000 NA   NA
 7479284 7479285 SPJ_1019 SPJ_1020 murA1   TRUE 0.944 16.000 0.052 1.000 N NA
 7479285 7479286 SPJ_1020 SPJ_1021     TRUE 0.990 -7.000 0.342 1.000 N NA
 7479286 7479287 SPJ_1021 SPJ_1022   map TRUE 0.972 16.000 0.235 1.000 N NA
 7479287 7479288 SPJ_1022 SPJ_1023 map   FALSE 0.105 99.000 0.000 NA   NA
 7479288 7479289 SPJ_1023 SPJ_1024     FALSE 0.060 153.000 0.000 NA   NA
 7479289 7479290 SPJ_1024 SPJ_1025   pcrA FALSE 0.265 191.000 0.000 0.068 Y NA
 7479290 7479291 SPJ_1025 SPJ_1027 pcrA   TRUE 0.947 43.000 0.005 0.016 Y NA
 7479292 7479293 SPJ_1026 SPJ_1028     TRUE 0.985 18.000 0.714 1.000   NA
 7479293 7479294 SPJ_1028 SPJ_1029     TRUE 0.584 83.000 0.143 NA   NA
 7479294 7479295 SPJ_1029 SPJ_1030     TRUE 0.933 8.000 0.056 NA   NA
 7479295 7479296 SPJ_1030 SPJ_1031     TRUE 0.964 5.000 0.166 NA   NA
 7479296 7479297 SPJ_1031 SPJ_1032     TRUE 0.980 10.000 0.089 1.000 Y NA
 7479297 7479298 SPJ_1032 SPJ_1033     TRUE 0.411 113.000 0.145 1.000   NA
 7479299 7479300 SPJ_1034 SPJ_1035     TRUE 0.991 -16.000 0.725 1.000   NA
 7479300 7479301 SPJ_1035 SPJ_1036     TRUE 0.985 -3.000 0.150 1.000 N NA
 7479301 7479302 SPJ_1036 SPJ_1037   pta TRUE 0.891 44.000 0.067 1.000 N NA
 7479303 7479304 SPJ_1038 SPJ_1039     FALSE 0.066 138.000 0.000 NA   NA
 7479304 7479305 SPJ_1039 SPJ_1040     TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.067   NA
 7479305 7479306 SPJ_1040 SPJ_1041     FALSE 0.025 329.000 0.000 NA   NA
 7479307 7479308 SPJ_1042 SPJ_1043   rplU FALSE 0.050 182.000 0.000 NA   NA
 7479308 7479309 SPJ_1043 SPJ_1044 rplU   TRUE 0.987 16.000 0.208 NA Y NA
 7479309 7479310 SPJ_1044 SPJ_1045   rpmA TRUE 0.987 17.000 0.203 NA Y NA
 7479311 7479312 SPJ_1046 SPJ_1047     TRUE 0.829 -28.000 0.000 NA   NA
 7479315 7479316 SPJ_1050 SPJ_1051     TRUE 0.358 107.000 0.098 NA   NA
 7479316 7479317 SPJ_1051 SPJ_1052     FALSE 0.024 430.000 0.000 1.000   NA
 7479317 7479318 SPJ_1052 SPJ_1053     TRUE 0.938 3.000 0.019 1.000   NA
 7479318 7479319 SPJ_1053 SPJ_1054     TRUE 0.793 80.000 0.600 NA   NA
 7479319 7479320 SPJ_1054 SPJ_1055   ligA FALSE 0.193 93.000 0.002 NA   NA
 7479320 7479321 SPJ_1055 SPJ_1056 ligA pulA FALSE 0.168 112.000 0.002 1.000 N NA
 7479321 7479322 SPJ_1056 SPJ_1057 pulA   FALSE 0.024 545.000 0.000 1.000 N NA
 7479322 7479323 SPJ_1057 SPJ_1058   glgB FALSE 0.025 483.000 0.000 1.000 N NA
 7479323 7479324 SPJ_1058 SPJ_1059 glgB glgC TRUE 0.997 -10.000 0.317 0.002 Y NA
 7479324 7479325 SPJ_1059 SPJ_1060 glgC glgD TRUE 0.998 -10.000 0.810 0.001 Y NA
 7479325 7479326 SPJ_1060 SPJ_1061 glgD   TRUE 0.997 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 7479326 7479327 SPJ_1061 SPJ_1062     TRUE 0.442 59.000 0.000 NA   NA
 7479327 7479328 SPJ_1062 SPJ_1065     TRUE 0.757 9.000 0.000 NA   NA
 7479331 7479332 SPJ_1067 SPJ_1068     TRUE 0.825 -34.000 0.000 NA   NA
 7479332 7479333 SPJ_1068 SPJ_1069     FALSE 0.028 301.000 0.000 NA   NA
 7479334 7479335 SPJ_1070 SPJ_1071 rexB addA TRUE 0.994 -3.000 0.070 0.067 Y NA
 7479335 7479336 SPJ_1071 SPJ_1072 addA   FALSE 0.093 215.000 0.010 NA   NA
 7479336 7479337 SPJ_1072 SPJ_1073     FALSE 0.044 209.000 0.000 NA   NA
 7479337 7479338 SPJ_1073 SPJ_1074   zmpB3 TRUE 0.795 44.000 0.000 0.002   NA
 7479338 7479339 SPJ_1074 SPJ_1075 zmpB3   FALSE 0.042 254.000 0.000 1.000   NA
 7479339 7479340 SPJ_1075 SPJ_1076     TRUE 0.979 -13.000 0.148 1.000   NA
 7479340 7479341 SPJ_1076 SPJ_1077     TRUE 0.878 16.000 0.002 1.000 N NA
 7479341 7479342 SPJ_1077 SPJ_1078     FALSE 0.023 584.000 0.000 1.000 N NA
 7479343 7479344 SPJ_1079 SPJ_1080   lpdA TRUE 0.844 64.000 0.200 1.000 N NA
 7479344 7479345 SPJ_1080 SPJ_1081 lpdA   TRUE 0.973 46.000 0.227 1.000 Y NA
 7479345 7479346 SPJ_1081 SPJ_1082     TRUE 0.507 218.000 0.103 0.044 Y NA
 7479346 7479347 SPJ_1082 SPJ_1083     TRUE 0.997 16.000 0.769 0.001 Y NA
 7479347 7479348 SPJ_1083 SPJ_1084     FALSE 0.079 154.000 0.000 1.000 N NA
 7479348 7479349 SPJ_1084 SPJ_1085     FALSE 0.040 285.000 0.000 1.000 N NA
 7479349 7479350 SPJ_1085 SPJ_1086     TRUE 0.882 13.000 0.005 1.000 N NA
 7479350 7479351 SPJ_1086 SPJ_1087   ung TRUE 0.975 10.000 0.043 1.000 Y NA
 7479351 7479352 SPJ_1087 SPJ_1088 ung   FALSE 0.066 138.000 0.000 NA   NA
 7479352 7479353 SPJ_1088 SPJ_1089     TRUE 0.771 7.000 0.000 NA   NA
 7479353 7479354 SPJ_1089 SPJ_1090     TRUE 0.463 58.000 0.000 NA   NA
 7479354 7479355 SPJ_1090 SPJ_1091     FALSE 0.019 458.000 0.000 NA   NA
 7479355 7479356 SPJ_1091 SPJ_1093     FALSE 0.021 417.000 0.000 NA   NA
 7479358 7479359 SPJ_1094 SPJ_1096 ptsP   TRUE 0.993 6.000 0.240 0.018 Y NA
 7479360 7479361 SPJ_1097 SPJ_1098     TRUE 0.801 81.000 0.562 1.000 N NA
 7479361 7479362 SPJ_1098 SPJ_1099     TRUE 0.771 188.000 0.500 0.001 Y NA
 7479362 7479363 SPJ_1099 SPJ_1100     FALSE 0.134 288.000 0.056 1.000 N NA
 7479364 7479365 SPJ_1101 SPJ_1102   lacG TRUE 0.537 123.000 0.500 NA   NA
 7479365 7479366 SPJ_1102 SPJ_1103 lacG   TRUE 0.515 215.000 0.200 1.000 Y NA
 7479366 7479367 SPJ_1103 SPJ_1104     TRUE 0.997 2.000 0.600 0.018 Y NA
 7479367 7479368 SPJ_1104 SPJ_1105     TRUE 0.970 36.000 0.500 1.000   NA
 7479368 7479369 SPJ_1105 SPJ_1106   lacD FALSE 0.046 234.000 0.000 1.000   NA
 7479369 7479370 SPJ_1106 SPJ_1107 lacD lacC TRUE 0.998 2.000 0.800 0.001 Y NA
 7479370 7479371 SPJ_1107 SPJ_1108 lacC lacB TRUE 0.992 11.000 0.500 1.000 Y NA
 7479371 7479372 SPJ_1108 SPJ_1109 lacB lacA TRUE 0.992 31.000 0.333 0.001 Y NA
 7479372 7479373 SPJ_1109 SPJ_1110 lacA   FALSE 0.071 157.000 0.000 1.000   NA
 7479373 7479374 SPJ_1110 SPJ_1111     FALSE 0.066 169.000 0.000 1.000   NA
 7479374 7479375 SPJ_1111 SPJ_1112     TRUE 0.809 -69.000 0.000 NA   NA
 7479375 7479376 SPJ_1112 SPJ_1113     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 7479376 7479377 SPJ_1113 SPJ_1114     TRUE 0.764 8.000 0.000 NA   NA
 7479377 7479378 SPJ_1114 SPJ_1115     TRUE 0.975 38.000 0.429 0.018   NA
 7479378 7479379 SPJ_1115 SPJ_1116     TRUE 0.944 0.000 0.000 0.018   NA
 7479381 7479382 SPJ_1118 SPJ_1119 lepA   FALSE 0.320 79.000 0.002 1.000   NA
 7479382 7479383 SPJ_1119 SPJ_1120   recN TRUE 0.923 2.000 0.005 1.000   NA
 7479383 7479384 SPJ_1120 SPJ_1121 recN   TRUE 0.935 7.000 0.037 1.000 N NA
 7479384 7479385 SPJ_1121 SPJ_1122   tylA TRUE 0.974 -7.000 0.048 1.000 N NA
 7479385 7479386 SPJ_1122 SPJ_1123 tylA   TRUE 0.976 -7.000 0.058 1.000 N NA
 7479386 7479387 SPJ_1123 SPJ_1124   xseB TRUE 0.982 -3.000 0.100 1.000 N NA
 7479387 7479388 SPJ_1124 SPJ_1125 xseB xseA TRUE 0.997 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 7479388 7479389 SPJ_1125 SPJ_1126 xseA udk FALSE 0.142 128.000 0.002 1.000 N NA
 7479389 7479390 SPJ_1126 SPJ_1127 udk   FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 7479390 7479391 SPJ_1127 SPJ_1128   truB FALSE 0.037 241.000 0.000 NA   NA
 7479391 7479392 SPJ_1128 SPJ_1129 truB   TRUE 0.888 10.000 0.014 NA   NA
 7479392 7479393 SPJ_1129 SPJ_1130     FALSE 0.053 171.000 0.000 NA   NA
 7479393 7479394 SPJ_1130 SPJ_1132     FALSE 0.062 148.000 0.000 NA   NA
 7479394 7479395 SPJ_1132 SPJ_1133     FALSE 0.041 244.000 0.000 NA N NA
 7479395 7479396 SPJ_1133 SPJ_1134   gyrA TRUE 0.952 0.000 0.013 NA N NA
 7479398 7479399 SPJ_1136 SPJ_1137     TRUE 0.576 47.000 0.000 NA   NA
 7479399 7479400 SPJ_1137 SPJ_1138     TRUE 0.985 2.000 0.400 NA   NA
 7479400 7479401 SPJ_1138 SPJ_1139     FALSE 0.135 91.000 0.000 NA   NA
 7479401 7479402 SPJ_1139 SPJ_1140     TRUE 0.957 2.000 0.038 1.000   NA
 7479402 7479403 SPJ_1140 SPJ_1141     TRUE 0.998 -7.000 0.597 0.011 Y NA
 7479403 7479404 SPJ_1141 SPJ_1142   mutY TRUE 0.678 55.000 0.002 1.000 N NA
 7479404 7479405 SPJ_1142 SPJ_1143 mutY fhs FALSE 0.034 328.000 0.000 1.000 N NA
 7479406 7479407 SPJ_1144 SPJ_1145 coaB coaC TRUE 0.897 12.000 0.013 1.000   NA
 7479407 7479408 SPJ_1145 SPJ_1146 coaC   TRUE 0.943 -16.000 0.019 NA   NA
 7479408 7479409 SPJ_1146 SPJ_1147     FALSE 0.093 278.000 0.026 NA   NA
 7479409 7479410 SPJ_1147 SPJ_1149     TRUE 0.945 12.000 0.107 NA   NA
 7479411 7479412 SPJ_1148 SPJ_1150     TRUE 0.516 74.000 0.021 1.000   NA
 7479412 7479413 SPJ_1150 SPJ_1151     TRUE 0.959 -34.000 0.014 0.012   NA
 7479413 7479414 SPJ_1151 SPJ_1152   uvrB TRUE 0.861 10.000 0.002 1.000 N NA
 7479414 7479415 SPJ_1152 SPJ_1153 uvrB   FALSE 0.314 77.000 0.002 NA   NA
 7479416 7479417 SPJ_1154 SPJ_1155     TRUE 0.996 0.000 0.326 1.000 Y NA
 7479417 7479418 SPJ_1155 SPJ_1156   zwf FALSE 0.193 149.000 0.021 1.000 N NA
 7479419 7479420 SPJ_1157 SPJ_1158     TRUE 0.933 4.000 0.005 0.072   NA
 7479420 7479421 SPJ_1158 SPJ_1159     TRUE 0.986 0.000 0.103 0.018   NA
 7479421 7479422 SPJ_1159 SPJ_1160   smc TRUE 0.952 -3.000 0.006 1.000   NA
 7479422 7479423 SPJ_1160 SPJ_1161 smc rnc TRUE 0.981 -9.000 0.120 1.000 N NA
 7479423 7479424 SPJ_1161 SPJ_1162 rnc   FALSE 0.051 179.000 0.000 NA   NA
 7479424 7479425 SPJ_1162 SPJ_1163   guaC TRUE 0.382 63.000 0.000 NA   NA
 7479425 7479426 SPJ_1163 SPJ_1164 guaC   FALSE 0.057 176.000 0.000 NA N NA
 7479426 7479427 SPJ_1164 SPJ_1165     TRUE 0.996 -13.000 0.467 NA Y NA
 7479427 7479428 SPJ_1165 SPJ_1166     FALSE 0.056 166.000 0.000 NA   NA
 7479428 7479429 SPJ_1166 SPJ_1167     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7479429 7479430 SPJ_1167 SPJ_1168     TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 7479430 7479431 SPJ_1168 SPJ_1169     FALSE 0.041 219.000 0.000 NA   NA
 7479431 7479432 SPJ_1169 SPJ_1170     TRUE 0.808 4.000 0.000 NA   NA
 7479432 7479433 SPJ_1170 SPJ_1171   leuB TRUE 0.948 -3.000 0.007 NA   NA
 7479433 7479434 SPJ_1171 SPJ_1172 leuB   TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7479434 7479435 SPJ_1172 SPJ_1174     TRUE 0.755 19.000 0.000 NA   NA
 7479435 7479436 SPJ_1174 SPJ_1175     TRUE 0.844 44.000 0.040 NA   NA
 7479436 7479437 SPJ_1175 SPJ_1176     FALSE 0.279 93.000 0.015 NA   NA
 7479437 7479438 SPJ_1176 SPJ_1177   topA FALSE 0.094 106.000 0.000 NA   NA
 7479438 7479439 SPJ_1177 SPJ_1178 topA   FALSE 0.055 167.000 0.000 NA   NA
 7479441 7479442 SPJ_1180 SPJ_1181 dprA   FALSE 0.213 96.000 0.002 1.000 N NA
 7479442 7479443 SPJ_1181 SPJ_1182     TRUE 0.954 12.000 0.133 1.000   NA
 7479443 7479444 SPJ_1182 SPJ_1183     TRUE 0.992 -10.000 0.667 NA   NA
 7479444 7479445 SPJ_1183 SPJ_1184     TRUE 0.945 17.000 0.074 NA N NA
 7479445 7479446 SPJ_1184 SPJ_1185     TRUE 0.980 5.000 0.367 1.000 N NA
 7479447 7479448 SPJ_1186 SPJ_1187     TRUE 0.977 10.000 0.500 NA   NA
 7479448 7479449 SPJ_1187 SPJ_1188     TRUE 0.997 2.000 1.000 NA Y NA
 7479450 7479451 SPJ_1189 SPJ_1190 carB carA TRUE 0.458 312.000 0.117 0.001 Y NA
 7479451 7479452 SPJ_1190 SPJ_1191 carA pyrB TRUE 0.923 50.000 0.014 1.000 Y NA
 7479452 7479453 SPJ_1191 SPJ_1192 pyrB   TRUE 0.988 19.000 0.247 1.000 Y NA
 7479453 7479454 SPJ_1192 SPJ_1193   nth FALSE 0.058 211.000 0.000 1.000 N NA
 7479454 7479455 SPJ_1193 SPJ_1194 nth   TRUE 0.924 0.000 0.002 NA   NA
 7479456 7479457 SPJ_1195 SPJ_1196     FALSE 0.020 425.000 0.000 NA   NA
 7479457 7479458 SPJ_1196 SPJ_1197     FALSE 0.037 282.000 0.000 1.000   NA
 7479459 7479460 SPJ_1198 SPJ_1199     TRUE 0.978 2.000 0.222 NA   NA
 7479461 7479462 SPJ_1200 SPJ_1201 gidB   FALSE 0.032 352.000 0.000 1.000 N NA
 7479463 7479464 SPJ_1202 SPJ_1203 ffh   TRUE 0.957 12.000 0.151 1.000   NA
 7479464 7479465 SPJ_1203 SPJ_1204     FALSE 0.260 91.000 0.009 NA   NA
 7479466 7479467 SPJ_1205 SPJ_1206     TRUE 0.924 13.000 0.035 1.000   NA
 7479467 7479468 SPJ_1206 SPJ_1207     TRUE 0.655 43.000 0.000 1.000   NA
 7479469 7479470 SPJ_1208 SPJ_1209   rplS TRUE 0.626 42.000 0.000 NA   NA
 7479470 7479471 SPJ_1209 SPJ_1210 rplS   FALSE 0.167 119.000 0.004 1.000 N NA
 7479471 7479472 SPJ_1210 SPJ_1211     TRUE 0.996 -6.000 0.160 0.071 Y NA
 7479472 7479473 SPJ_1211 SPJ_1212     TRUE 0.969 -3.000 0.023 1.000 N NA
 7479473 7479474 SPJ_1212 SPJ_1213     TRUE 0.433 116.000 0.167 1.000 N NA
 7479475 7479476 SPJ_1214 SPJ_1215   rpmE FALSE 0.297 96.000 0.020 1.000   NA
 7479477 7479478 SPJ_1216 SPJ_1217     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7479478 7479479 SPJ_1217 SPJ_1218     FALSE 0.061 150.000 0.000 NA   NA
 7479481 7479482 SPJ_1220 SPJ_1221     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7479482 7479483 SPJ_1221 SPJ_1222     FALSE 0.058 190.000 0.000 1.000   NA
 7479483 7479484 SPJ_1222 SPJ_1223     TRUE 0.769 17.000 0.000 NA   NA
 7479484 7479485 SPJ_1223 SPJ_1224     FALSE 0.118 95.000 0.000 NA   NA
 7479485 7479486 SPJ_1224 SPJ_1225     FALSE 0.126 93.000 0.000 NA   NA
 7479486 7479487 SPJ_1225 SPJ_1226     FALSE 0.033 263.000 0.000 NA   NA
 7479487 7479488 SPJ_1226 SPJ_1227     FALSE 0.057 162.000 0.000 NA   NA
 7479490 7479491 SPJ_1229 SPJ_1230     TRUE 0.842 -19.000 0.000 NA   NA
 7479491 7479492 SPJ_1230 SPJ_1231     FALSE 0.031 273.000 0.000 NA   NA
 7479492 7479493 SPJ_1231 SPJ_1232     TRUE 0.991 23.000 0.238 0.007 Y NA
 7479493 7479494 SPJ_1232 SPJ_1233     TRUE 0.998 1.000 0.776 0.007 Y NA
 7479494 7479495 SPJ_1233 SPJ_1234     TRUE 0.973 63.000 0.462 0.007 Y NA
 7479495 7479496 SPJ_1234 SPJ_1235     TRUE 0.998 -10.000 0.487 0.007 Y NA
 7479496 7479497 SPJ_1235 SPJ_1236     TRUE 0.837 65.000 0.097 0.009   NA
 7479497 7479498 SPJ_1236 SPJ_1237     TRUE 0.938 34.000 0.045 0.009   NA
 7479498 7479499 SPJ_1237 SPJ_1238     TRUE 0.992 16.000 0.848 0.009   NA
 7479499 7479500 SPJ_1238 SPJ_1239     TRUE 0.959 -10.000 0.029 NA   NA
 7479500 7479501 SPJ_1239 SPJ_1240     TRUE 0.966 25.000 0.333 NA   NA
 7479501 7479502 SPJ_1240 SPJ_1241     TRUE 0.523 157.000 0.667 NA   NA
 7479502 7479503 SPJ_1241 SPJ_1242     TRUE 0.685 40.000 0.000 1.000   NA
 7479503 7479504 SPJ_1242 SPJ_1243     TRUE 0.961 2.000 0.000 NA Y NA
 7479504 7479505 SPJ_1243 SPJ_1244     TRUE 0.922 19.000 0.037 NA N NA
 7479505 7479506 SPJ_1244 SPJ_1245     TRUE 0.968 28.000 0.037 1.000 Y NA
 7479506 7479507 SPJ_1245 SPJ_1246     TRUE 0.986 25.000 1.000 1.000 N NA
 7479507 7479508 SPJ_1246 SPJ_1247     TRUE 0.943 5.000 0.040 1.000 N NA
 7479508 7479509 SPJ_1247 SPJ_1248     FALSE 0.022 399.000 0.000 NA   NA
 7479509 7479510 SPJ_1248 SPJ_1249     FALSE 0.126 93.000 0.000 NA   NA
 7479510 7479511 SPJ_1249 SPJ_1250     TRUE 0.667 37.000 0.000 NA   NA
 7479511 7479512 SPJ_1250 SPJ_1251     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7479512 7479513 SPJ_1251 SPJ_1252     FALSE 0.192 80.000 0.000 NA   NA
 7479513 7479514 SPJ_1252 SPJ_1253     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 7479514 7479515 SPJ_1253 SPJ_1254   rplL FALSE 0.076 187.000 0.002 NA   NA
 7479515 7479516 SPJ_1254 SPJ_1255 rplL   TRUE 0.964 76.000 0.884 0.023 Y NA
 7479516 7479517 SPJ_1255 SPJ_1256     FALSE 0.048 250.000 0.000 1.000 N NA
 7479517 7479518 SPJ_1256 SPJ_1257     FALSE 0.153 95.000 0.000 1.000 N NA
 7479518 7479519 SPJ_1257 SPJ_1258     TRUE 0.998 2.000 0.895 0.008 Y NA
 7479519 7479520 SPJ_1258 SPJ_1259     TRUE 0.786 58.000 0.035 1.000 N NA
 7479520 7479521 SPJ_1259 SPJ_1260   thrB FALSE 0.027 430.000 0.000 1.000 N NA
 7479521 7479522 SPJ_1260 SPJ_1261 thrB   TRUE 0.985 2.000 0.036 1.000 Y NA
 7479522 7479523 SPJ_1261 SPJ_1262     FALSE 0.213 151.000 0.044 NA N NA
 7479523 7479524 SPJ_1262 SPJ_1263     FALSE 0.046 200.000 0.000 NA   NA
 7479524 7479525 SPJ_1263 SPJ_1264     TRUE 0.963 29.000 0.333 NA   NA
 7479525 7479526 SPJ_1264 SPJ_1265     TRUE 0.967 16.000 0.222 NA   NA
 7479526 7479527 SPJ_1265 SPJ_1266     TRUE 0.993 2.000 0.250 1.000 Y NA
 7479527 7479528 SPJ_1266 SPJ_1267     TRUE 0.997 -7.000 0.667 NA Y NA
 7479528 7479529 SPJ_1267 SPJ_1268     FALSE 0.034 279.000 0.000 NA N NA
 7479529 7479530 SPJ_1268 SPJ_1269     TRUE 0.967 -3.000 0.025 NA N NA
 7479530 7479531 SPJ_1269 SPJ_1270   aroK TRUE 0.990 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 7479531 7479532 SPJ_1270 SPJ_1271 aroK aroA TRUE 0.986 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 7479532 7479533 SPJ_1271 SPJ_1272 aroA   FALSE 0.210 92.000 0.003 NA   NA
 7479533 7479534 SPJ_1272 SPJ_1273     TRUE 0.930 11.000 0.058 NA   NA
 7479534 7479535 SPJ_1273 SPJ_1274   aroC TRUE 0.964 10.000 0.010 1.000 Y NA
 7479535 7479536 SPJ_1274 SPJ_1275 aroC aroB TRUE 0.989 10.000 0.110 0.003 Y NA
 7479536 7479537 SPJ_1275 SPJ_1276 aroB aroE TRUE 0.964 19.000 0.010 1.000 Y NA
 7479537 7479538 SPJ_1276 SPJ_1277 aroE aroD TRUE 0.973 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 7479538 7479539 SPJ_1277 SPJ_1278 aroD   TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7479539 7479540 SPJ_1278 SPJ_1279     FALSE 0.016 685.000 0.000 NA   NA
 7479540 7479541 SPJ_1279 SPJ_1280     TRUE 0.983 -19.000 0.341 NA   NA
 7479543 7479544 SPJ_1282 SPJ_1283 alaS   TRUE 0.853 22.000 0.006 NA   NA
 7479544 7479545 SPJ_1283 SPJ_1284     FALSE 0.031 275.000 0.000 NA   NA
 7479545 7479546 SPJ_1284 SPJ_1285     FALSE 0.034 261.000 0.000 NA   NA
 7479546 7479547 SPJ_1285 SPJ_1286     TRUE 0.997 -3.000 0.253 0.037 Y NA
 7479547 7479548 SPJ_1286 SPJ_1287     TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.037 Y NA
 7479548 7479549 SPJ_1287 SPJ_1288     TRUE 0.998 -19.000 0.928 0.037 Y NA
 7479549 7479550 SPJ_1288 SPJ_1289   murB FALSE 0.217 160.000 0.041 1.000 N NA
 7479550 7479551 SPJ_1289 SPJ_1290 murB   FALSE 0.154 112.000 0.005 NA   NA
 7479551 7479552 SPJ_1290 SPJ_1291   budA TRUE 0.919 10.000 0.042 NA   NA
 7479554 7479555 SPJ_1293 SPJ_1294   phoU1 FALSE 0.032 297.000 0.000 NA N NA
 7479555 7479556 SPJ_1294 SPJ_1295 phoU1 pstB1 TRUE 0.990 12.000 0.413 NA Y NA
 7479556 7479557 SPJ_1295 SPJ_1296 pstB1 pstB2 TRUE 0.995 13.000 0.542 0.002 Y NA
 7479557 7479558 SPJ_1296 SPJ_1297 pstB2 pstA1 TRUE 0.995 11.000 0.490 0.004 Y NA
 7479558 7479559 SPJ_1297 SPJ_1298 pstA1 pstC1 TRUE 0.999 -10.000 0.907 0.004 Y NA
 7479559 7479560 SPJ_1298 SPJ_1299 pstC1   TRUE 0.994 0.000 0.206 1.000 Y NA
 7479562 7479563 SPJ_1301 SPJ_1302     TRUE 0.983 1.000 0.229 NA N NA
 7479563 7479564 SPJ_1302 SPJ_1303     TRUE 0.987 -10.000 0.337 NA   NA
 7479564 7479565 SPJ_1303 SPJ_1304     TRUE 0.982 0.000 0.169 NA   NA
 7479565 7479566 SPJ_1304 SPJ_1305     FALSE 0.044 210.000 0.000 NA   NA
 7479566 7479567 SPJ_1305 SPJ_1306     TRUE 0.987 -10.000 0.330 NA   NA
 7479567 7479568 SPJ_1306 SPJ_1307     TRUE 0.939 11.000 0.055 1.000 N NA
 7479568 7479569 SPJ_1307 SPJ_1308     TRUE 0.952 5.000 0.060 1.000 N NA
 7479569 7479570 SPJ_1308 SPJ_1309     TRUE 0.376 84.000 0.021 NA   NA
 7479570 7479571 SPJ_1309 SPJ_1310     TRUE 0.965 16.000 0.206 NA   NA
 7479571 7479572 SPJ_1310 SPJ_1311   lgt TRUE 0.969 1.000 0.079 NA   NA
 7479572 7479573 SPJ_1311 SPJ_1312 lgt hprK TRUE 0.992 -7.000 0.494 1.000 N NA
 7479573 7479574 SPJ_1312 SPJ_1313 hprK rpsU FALSE 0.168 130.000 0.011 1.000   NA
 7479574 7479575 SPJ_1313 SPJ_1314 rpsU   FALSE 0.157 140.000 0.011 1.000   NA
 7479577 7479578 SPJ_1316 SPJ_1317     FALSE 0.014 1461.000 0.000 NA   NA
 7479578 7479579 SPJ_1317 SPJ_1318   nadE FALSE 0.061 350.000 0.007 1.000 N NA
 7479579 7479580 SPJ_1318 SPJ_1319 nadE pncB TRUE 0.997 -3.000 0.194 0.003 Y NA
 7479580 7479581 SPJ_1319 SPJ_1320 pncB   FALSE 0.214 116.000 0.021 NA   NA
 7479581 7479582 SPJ_1320 SPJ_1321     TRUE 0.975 -10.000 0.103 NA   NA
 7479582 7479583 SPJ_1321 SPJ_1322     FALSE 0.022 386.000 0.000 NA   NA
 7479583 7479584 SPJ_1322 SPJ_1323     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 7479584 7479585 SPJ_1323 SPJ_1325     FALSE 0.018 505.000 0.000 NA   NA
 7479585 7479586 SPJ_1325 SPJ_1326     FALSE 0.078 263.000 0.008 1.000   NA
 7479586 7479587 SPJ_1326 SPJ_1327     TRUE 0.892 15.000 0.008 1.000   NA
 7479588 7479589 SPJ_1328 SPJ_1330     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7479589 7479590 SPJ_1330 SPJ_1331     FALSE 0.037 247.000 0.000 NA   NA
 7479592 7479593 SPJ_1333 SPJ_1334     TRUE 0.996 -16.000 0.294 0.008 Y NA
 7479593 7479594 SPJ_1334 SPJ_1335     TRUE 0.751 11.000 0.000 NA   NA
 7479594 7479595 SPJ_1335 SPJ_1336     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 7479595 7479596 SPJ_1336 SPJ_1337     TRUE 0.988 -12.000 0.357 1.000   NA
 7479597 7479598 SPJ_1338 SPJ_1339     FALSE 0.246 73.000 0.000 NA   NA
 7479598 7479599 SPJ_1339 SPJ_1340     TRUE 0.757 9.000 0.000 NA   NA
 7479599 7479600 SPJ_1340 SPJ_1341     TRUE 0.808 -76.000 0.000 NA   NA
 7479600 7479601 SPJ_1341 SPJ_1342     FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 7479601 7479602 SPJ_1342 SPJ_1343     FALSE 0.152 86.000 0.000 NA   NA
 7479602 7479603 SPJ_1343 SPJ_1344     FALSE 0.036 250.000 0.000 NA   NA
 7479605 7479606 SPJ_1346 SPJ_1347     TRUE 0.933 9.000 0.047 1.000   NA
 7479606 7479607 SPJ_1347 SPJ_1348     TRUE 0.989 -3.000 0.326 NA   NA
 7479607 7479608 SPJ_1348 SPJ_1349     FALSE 0.168 84.000 0.000 NA   NA
 7479608 7479609 SPJ_1349 SPJ_1350     TRUE 0.975 2.000 0.143 1.000   NA
 7479609 7479610 SPJ_1350 SPJ_1351     TRUE 0.740 22.000 0.000 NA   NA
 7479613 7479614 SPJ_1355 SPJ_1356 def1   TRUE 0.907 45.000 0.002 1.000 Y NA
 7479615 7479616 SPJ_1357 SPJ_1358 trxB   TRUE 0.751 66.000 0.117 NA   NA
 7479616 7479617 SPJ_1358 SPJ_1359     TRUE 0.751 78.000 0.364 NA   NA
 7479617 7479618 SPJ_1359 SPJ_1360     TRUE 0.996 0.000 0.310 1.000 Y NA
 7479618 7479619 SPJ_1360 SPJ_1361     FALSE 0.152 158.000 0.010 1.000 N NA
 7479619 7479620 SPJ_1361 SPJ_1362     TRUE 0.936 13.000 0.050 1.000 N NA
 7479620 7479621 SPJ_1362 SPJ_1363     TRUE 0.960 0.000 0.019 1.000   NA
 7479622 7479623 SPJ_1364 SPJ_1365     TRUE 0.984 -3.000 0.146 1.000   NA
 7479624 7479625 SPJ_1366 SPJ_1367     TRUE 0.996 1.000 0.488 NA Y NA
 7479625 7479626 SPJ_1367 SPJ_1368     FALSE 0.125 152.000 0.005 1.000   NA
 7479627 7479628 SPJ_1369 SPJ_1370     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7479628 7479629 SPJ_1370 SPJ_1371     TRUE 0.871 60.000 0.243 NA   NA
 7479629 7479630 SPJ_1371 SPJ_1372     TRUE 0.980 19.000 0.588 NA   NA
 7479631 7479632 SPJ_1373 SPJ_1374   glyS TRUE 0.832 42.000 0.020 NA   NA
 7479632 7479633 SPJ_1374 SPJ_1375 glyS glyQ TRUE 0.733 260.000 0.651 0.001 Y NA
 7479633 7479634 SPJ_1375 SPJ_1376 glyQ   TRUE 0.847 19.000 0.003 NA   NA
 7479634 7479635 SPJ_1376 SPJ_1377     FALSE 0.031 273.000 0.000 NA   NA
 7479635 7479636 SPJ_1377 SPJ_1378     FALSE 0.101 115.000 0.000 1.000   NA
 7479636 7479637 SPJ_1378 SPJ_1379     FALSE 0.029 289.000 0.000 NA   NA
 7479638 7479639 SPJ_1380 SPJ_1381     TRUE 0.987 -3.000 0.200 1.000   NA
 7479640 7479641 SPJ_1382 SPJ_1383     FALSE 0.023 380.000 0.000 NA   NA
 7479641 7479642 SPJ_1383 SPJ_1384     TRUE 0.813 -46.000 0.000 NA   NA
 7479643 7479644 SPJ_1385 SPJ_1386     TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.063   NA
 7479644 7479645 SPJ_1386 SPJ_1387     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7479646 7479647 SPJ_1388 SPJ_1389 tuf   FALSE 0.075 164.000 0.000 1.000 N NA
 7479647 7479648 SPJ_1389 SPJ_1390     FALSE 0.019 471.000 0.000 NA   NA
 7479648 7479649 SPJ_1390 SPJ_1391     FALSE 0.019 457.000 0.000 NA   NA
 7479649 7479650 SPJ_1391 SPJ_1392     FALSE 0.049 224.000 0.000 1.000   NA
 7479650 7479651 SPJ_1392 SPJ_1393     TRUE 0.816 -42.000 0.000 NA   NA
 7479651 7479652 SPJ_1393 SPJ_1394     TRUE 0.868 -12.000 0.000 NA   NA
 7479652 7479653 SPJ_1394 SPJ_1395     FALSE 0.090 111.000 0.000 NA   NA
 7479653 7479654 SPJ_1395 SPJ_1396     FALSE 0.024 358.000 0.000 NA   NA
 7479654 7479655 SPJ_1396 SPJ_1397     TRUE 0.863 -13.000 0.000 NA   NA
 7479655 7479656 SPJ_1397 SPJ_1398     TRUE 0.570 48.000 0.000 NA   NA
 7479657 7479658 SPJ_1399 SPJ_1400     FALSE 0.284 111.000 0.049 NA   NA
 7479659 7479660 SPJ_1401 SPJ_1402     TRUE 0.985 13.000 0.154 1.000 Y NA
 7479660 7479661 SPJ_1402 SPJ_1403     TRUE 0.983 10.000 0.130 1.000 Y NA
 7479661 7479662 SPJ_1403 SPJ_1404     FALSE 0.162 146.000 0.013 1.000   NA
 7479662 7479663 SPJ_1404 SPJ_1405     TRUE 0.987 -10.000 0.324 NA   NA
 7479664 7479665 SPJ_1406 SPJ_1407     FALSE 0.078 140.000 0.000 1.000   NA
 7479665 7479666 SPJ_1407 SPJ_1408     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7479667 7479668 SPJ_1409 SPJ_1410 atpC atpD TRUE 0.996 11.000 0.837 0.007 Y NA
 7479668 7479669 SPJ_1410 SPJ_1411 atpD atpG TRUE 0.934 86.000 0.724 0.007 Y NA
 7479669 7479670 SPJ_1411 SPJ_1412 atpG atpA TRUE 0.997 16.000 0.846 0.007 Y NA
 7479670 7479671 SPJ_1412 SPJ_1413 atpA atpH TRUE 0.997 15.000 0.864 0.007 Y NA
 7479671 7479672 SPJ_1413 SPJ_1414 atpH atpF TRUE 0.996 0.000 0.222 0.007 Y NA
 7479672 7479673 SPJ_1414 SPJ_1415 atpF atpB TRUE 0.983 14.000 0.032 0.009 Y NA
 7479673 7479674 SPJ_1415 SPJ_1416 atpB   TRUE 0.993 35.000 0.557 0.009 Y NA
 7479674 7479675 SPJ_1416 SPJ_1417     FALSE 0.294 75.000 0.000 1.000 N NA
 7479675 7479676 SPJ_1417 SPJ_1418     FALSE 0.026 445.000 0.000 1.000 N NA
 7479676 7479677 SPJ_1418 SPJ_1419     FALSE 0.025 508.000 0.000 1.000 N NA
 7479677 7479678 SPJ_1419 SPJ_1420     FALSE 0.265 71.000 0.000 NA   NA
 7479678 7479679 SPJ_1420 SPJ_1422     FALSE 0.185 81.000 0.000 NA   NA
 7479679 7479680 SPJ_1422 SPJ_1423     TRUE 0.982 -3.000 0.037 0.012   NA
 7479680 7479681 SPJ_1423 SPJ_1424   murC TRUE 0.899 10.000 0.014 1.000   NA
 7479681 7479682 SPJ_1424 SPJ_1425 murC   TRUE 0.883 11.000 0.013 NA   NA
 7479682 7479683 SPJ_1425 SPJ_1426     TRUE 0.570 48.000 0.000 NA   NA
 7479683 7479684 SPJ_1426 SPJ_1428     FALSE 0.126 93.000 0.000 NA   NA
 7479684 7479685 SPJ_1428 SPJ_1429     TRUE 0.987 8.000 0.082 0.009 Y NA
 7479685 7479686 SPJ_1429 SPJ_1430     FALSE 0.059 158.000 0.000 NA   NA
 7479686 7479687 SPJ_1430 SPJ_1432     FALSE 0.053 172.000 0.000 NA   NA
 7479687 7479688 SPJ_1432 SPJ_1433     FALSE 0.055 204.000 0.000 1.000   NA
 7479690 7479691 SPJ_1435 SPJ_1436     TRUE 0.498 101.000 0.231 NA   NA
 7479691 7479692 SPJ_1436 SPJ_1437     TRUE 0.942 37.000 0.208 NA   NA
 7479692 7479693 SPJ_1437 SPJ_1438     FALSE 0.259 86.000 0.005 NA   NA
 7479693 7479694 SPJ_1438 SPJ_1439     TRUE 0.468 71.000 0.005 1.000 N NA
 7479694 7479695 SPJ_1439 SPJ_1440     TRUE 0.984 -10.000 0.209 1.000   NA
 7479695 7479696 SPJ_1440 SPJ_1441     TRUE 0.707 54.000 0.006 1.000   NA
 7479696 7479697 SPJ_1441 SPJ_1442     TRUE 0.974 -25.000 0.151 1.000   NA
 7479697 7479698 SPJ_1442 SPJ_1443   rpsR FALSE 0.035 295.000 0.000 1.000   NA
 7479698 7479699 SPJ_1443 SPJ_1444 rpsR   TRUE 0.869 32.000 0.012 1.000 N NA
 7479699 7479700 SPJ_1444 SPJ_1445   rpsF TRUE 0.897 12.000 0.012 1.000 N NA
 7479700 7479701 SPJ_1445 SPJ_1446 rpsF asnS FALSE 0.250 153.000 0.000 1.000 Y NA
 7479701 7479702 SPJ_1446 SPJ_1447 asnS   TRUE 0.886 19.000 0.013 NA   NA
 7479702 7479703 SPJ_1447 SPJ_1448     TRUE 0.967 -7.000 0.042 NA   NA
 7479703 7479704 SPJ_1448 SPJ_1449     TRUE 0.985 -3.000 0.205 NA   NA
 7479704 7479705 SPJ_1449 SPJ_1450     FALSE 0.317 67.000 0.000 NA   NA
 7479709 7479710 SPJ_1454 SPJ_1455     FALSE 0.319 79.000 0.004 NA   NA
 7479710 7479711 SPJ_1455 SPJ_1456     FALSE 0.152 179.000 0.030 NA   NA
 7479711 7479712 SPJ_1456 SPJ_1457   def2 TRUE 0.907 12.000 0.028 NA   NA
 7479712 7479713 SPJ_1457 SPJ_1458 def2   FALSE 0.092 116.000 0.000 NA N NA
 7479713 7479714 SPJ_1458 SPJ_1459     TRUE 0.773 13.000 0.000 NA N NA
 7479716 7479717 SPJ_1461 SPJ_1462     TRUE 0.976 -3.000 0.056 1.000   NA
 7479717 7479718 SPJ_1462 SPJ_1463   dapB TRUE 0.906 12.000 0.015 1.000 N NA
 7479718 7479719 SPJ_1463 SPJ_1464 dapB   FALSE 0.056 277.000 0.004 NA   NA
 7479719 7479720 SPJ_1464 SPJ_1465     TRUE 0.972 2.000 0.139 NA   NA
 7479720 7479721 SPJ_1465 SPJ_1466   glmM TRUE 0.389 74.000 0.003 1.000   NA
 7479721 7479722 SPJ_1466 SPJ_1467 glmM   TRUE 0.948 24.000 0.150 NA   NA
 7479722 7479723 SPJ_1467 SPJ_1468     TRUE 0.989 -13.000 0.502 NA   NA
 7479725 7479726 SPJ_1470 SPJ_1471     TRUE 0.991 -3.000 0.470 NA   NA
 7479726 7479727 SPJ_1471 SPJ_1472     TRUE 0.986 -3.000 0.214 NA   NA
 7479727 7479728 SPJ_1472 SPJ_1473     TRUE 0.819 52.000 0.051 NA   NA
 7479728 7479729 SPJ_1473 SPJ_1474     TRUE 0.836 11.000 0.002 NA   NA
 7479729 7479730 SPJ_1474 SPJ_1475   clpX TRUE 0.931 9.000 0.043 1.000   NA
 7479730 7479731 SPJ_1475 SPJ_1476 clpX   TRUE 0.844 32.000 0.012 NA   NA
 7479731 7479732 SPJ_1476 SPJ_1477   folA TRUE 0.961 0.000 0.030 NA   NA
 7479732 7479733 SPJ_1477 SPJ_1478 folA   FALSE 0.154 130.000 0.005 1.000 N NA
 7479733 7479734 SPJ_1478 SPJ_1479     FALSE 0.022 498.000 0.000 1.000   NA
 7479734 7479735 SPJ_1479 SPJ_1480   tpiA FALSE 0.305 71.000 0.000 1.000   NA
 7479735 7479736 SPJ_1480 SPJ_1481 tpiA   FALSE 0.217 98.000 0.007 NA N NA
 7479736 7479737 SPJ_1481 SPJ_1482   metA TRUE 0.910 9.000 0.021 NA N NA
 7479739 7479740 SPJ_1483 SPJ_1485 apt   TRUE 0.450 70.000 0.002 1.000 N NA
 7479742 7479743 SPJ_1487 SPJ_1488     FALSE 0.031 279.000 0.000 NA   NA
 7479743 7479744 SPJ_1488 SPJ_1489     FALSE 0.185 81.000 0.000 NA   NA
 7479744 7479745 SPJ_1489 SPJ_1490   codY TRUE 0.978 0.000 0.083 1.000 N NA
 7479745 7479746 SPJ_1490 SPJ_1491 codY   FALSE 0.149 265.000 0.000 1.000 Y NA
 7479746 7479747 SPJ_1491 SPJ_1492     FALSE 0.052 199.000 0.000 NA N NA
 7479748 7479749 SPJ_1493 SPJ_1494     FALSE 0.248 99.000 0.010 1.000 N NA
 7479749 7479750 SPJ_1494 SPJ_1495     TRUE 0.994 0.000 0.796 1.000   NA
 7479750 7479751 SPJ_1495 SPJ_1496     FALSE 0.088 126.000 0.000 1.000   NA
 7479751 7479752 SPJ_1496 SPJ_1497     TRUE 0.604 50.000 0.000 1.000   NA
 7479753 7479754 SPJ_1498 SPJ_1499     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7479754 7479755 SPJ_1499 SPJ_1500     FALSE 0.067 136.000 0.000 NA   NA
 7479755 7479756 SPJ_1500 SPJ_1501     FALSE 0.040 227.000 0.000 NA   NA
 7479756 7479757 SPJ_1501 SPJ_1502     TRUE 0.980 -22.000 0.276 NA   NA
 7479757 7479758 SPJ_1502 SPJ_1503   truA TRUE 0.973 -10.000 0.058 1.000 N NA
 7479762 7479763 SPJ_1507 SPJ_1508   phnA TRUE 0.917 3.000 0.011 NA   NA
 7479763 7479764 SPJ_1508 SPJ_1509 phnA cmk FALSE 0.137 131.000 0.002 1.000 N NA
 7479764 7479765 SPJ_1509 SPJ_1510 cmk   TRUE 0.883 9.000 0.012 NA   NA
 7479767 7479768 SPJ_1512 SPJ_1513   galE1 TRUE 0.983 2.000 0.030 NA Y NA
 7479768 7479769 SPJ_1513 SPJ_1514 galE1   FALSE 0.098 103.000 0.000 NA   NA
 7479769 7479770 SPJ_1514 SPJ_1515     FALSE 0.276 70.000 0.000 NA   NA
 7479770 7479771 SPJ_1515 SPJ_1516     TRUE 0.909 17.000 0.021 NA   NA
 7479771 7479772 SPJ_1516 SPJ_1517     TRUE 0.984 -13.000 0.283 NA   NA
 7479772 7479773 SPJ_1517 SPJ_1518     FALSE 0.100 102.000 0.000 NA   NA
 7479775 7479776 SPJ_1520 SPJ_1521   rpsO FALSE 0.017 815.000 0.000 NA N NA
 7479776 7479777 SPJ_1521 SPJ_1522 rpsO   FALSE 0.077 141.000 0.000 1.000   NA
 7479778 7479779 SPJ_1523 SPJ_1524   thrS TRUE 0.707 58.000 0.018 NA   NA
 7479780 7479781 SPJ_1525 SPJ_1526     TRUE 0.998 -7.000 0.812 1.000 Y NA
 7479783 7479784 SPJ_1528 SPJ_1529     FALSE 0.298 68.000 0.000 NA   NA
 7479784 7479785 SPJ_1529 SPJ_1530     TRUE 0.839 76.000 0.667 NA   NA
 7479786 7479787 SPJ_1531 SPJ_1532     TRUE 0.842 -19.000 0.000 NA   NA
 7479787 7479788 SPJ_1532 SPJ_1533     FALSE 0.044 209.000 0.000 NA   NA
 7479788 7479789 SPJ_1533 SPJ_1534     FALSE 0.069 131.000 0.000 NA   NA
 7479791 7479792 SPJ_1536 SPJ_1537     FALSE 0.065 140.000 0.000 NA   NA
 7479793 7479794 SPJ_1538 SPJ_1539 dtd spoT TRUE 0.953 30.000 0.177 1.000 N NA
 7479795 7479796 SPJ_1540 SPJ_1541     FALSE 0.025 340.000 0.000 NA   NA
 7479798 7479799 SPJ_1543 SPJ_1544     TRUE 0.991 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 7479799 7479800 SPJ_1544 SPJ_1545     TRUE 0.965 32.000 0.038 1.000 Y NA
 7479800 7479801 SPJ_1545 SPJ_1546     FALSE 0.175 123.000 0.007 1.000 N NA
 7479801 7479802 SPJ_1546 SPJ_1547     TRUE 0.541 51.000 0.000 NA   NA
 7479803 7479804 SPJ_1548 SPJ_1549     TRUE 0.988 2.000 0.438 1.000 N NA
 7479804 7479805 SPJ_1549 SPJ_1550     FALSE 0.083 131.000 0.000 1.000   NA
 7479805 7479806 SPJ_1550 SPJ_1551     TRUE 0.710 53.000 0.006 1.000   NA
 7479806 7479807 SPJ_1551 SPJ_1552     TRUE 0.541 51.000 0.000 NA   NA
 7479807 7479808 SPJ_1552 SPJ_1553     FALSE 0.029 296.000 0.000 NA   NA
 7479808 7479809 SPJ_1553 SPJ_1554   ileS FALSE 0.026 410.000 0.000 1.000   NA
 7479809 7479810 SPJ_1554 SPJ_1555 ileS   FALSE 0.035 253.000 0.000 NA   NA
 7479810 7479811 SPJ_1555 SPJ_1556     TRUE 0.837 -21.000 0.000 NA   NA
 7479811 7479812 SPJ_1556 SPJ_1557     TRUE 0.980 9.000 0.579 NA   NA
 7479812 7479813 SPJ_1557 SPJ_1558     TRUE 0.989 -3.000 0.287 1.000   NA
 7479813 7479814 SPJ_1558 SPJ_1559     TRUE 0.988 0.000 0.370 NA   NA
 7479814 7479815 SPJ_1559 SPJ_1560     TRUE 0.959 10.000 0.194 NA   NA
 7479815 7479816 SPJ_1560 SPJ_1561   ftsZ TRUE 0.926 5.000 0.030 NA   NA
 7479816 7479817 SPJ_1561 SPJ_1562 ftsZ ftsA TRUE 0.992 17.000 0.460 1.000 Y NA
 7479817 7479818 SPJ_1562 SPJ_1563 ftsA   FALSE 0.041 219.000 0.000 NA   NA
 7479818 7479819 SPJ_1563 SPJ_1564     FALSE 0.296 91.000 0.016 NA   NA
 7479819 7479820 SPJ_1564 SPJ_1565     TRUE 0.954 -13.000 0.016 1.000 N NA
 7479820 7479821 SPJ_1565 SPJ_1566     TRUE 0.804 84.000 0.046 0.007 Y NA
 7479821 7479822 SPJ_1566 SPJ_1567   recR FALSE 0.136 176.000 0.010 1.000 N NA
 7479822 7479823 SPJ_1567 SPJ_1568 recR   TRUE 0.902 11.000 0.013 1.000 N NA
 7479825 7479826 SPJ_1570 SPJ_1571     TRUE 0.942 18.000 0.054 1.000 N NA
 7479826 7479827 SPJ_1571 SPJ_1572     TRUE 0.384 169.000 0.333 NA   NA
 7479827 7479828 SPJ_1572 SPJ_1573     FALSE 0.030 287.000 0.000 NA   NA
 7479828 7479829 SPJ_1573 SPJ_1574     FALSE 0.027 307.000 0.000 NA   NA
 7479829 7479830 SPJ_1574 SPJ_1575     TRUE 0.456 272.000 0.250 NA Y NA
 7479830 7479831 SPJ_1575 SPJ_1576     TRUE 0.997 16.000 1.000 0.035 Y NA
 7479831 7479832 SPJ_1576 SPJ_1577     FALSE 0.234 231.000 0.000 0.035 Y NA
 7479832 7479833 SPJ_1577 SPJ_1578     FALSE 0.294 125.000 0.000 1.000 Y NA
 7479833 7479834 SPJ_1578 SPJ_1579     TRUE 0.984 19.000 0.132 1.000 Y NA
 7479834 7479835 SPJ_1579 SPJ_1580     FALSE 0.063 174.000 0.000 1.000   NA
 7479835 7479836 SPJ_1580 SPJ_1581     TRUE 0.969 12.000 0.273 1.000   NA
 7479836 7479837 SPJ_1581 SPJ_1582     TRUE 0.943 18.000 0.000 1.000 Y NA
 7479837 7479838 SPJ_1582 SPJ_1583     TRUE 0.997 0.000 0.300 0.035 Y NA
 7479838 7479839 SPJ_1583 SPJ_1584     TRUE 0.886 79.000 0.180 0.035 Y NA
 7479839 7479840 SPJ_1584 SPJ_1585     TRUE 0.976 19.000 0.060 NA Y NA
 7479840 7479841 SPJ_1585 SPJ_1586     FALSE 0.066 1014.000 0.000 NA Y NA
 7479841 7479842 SPJ_1586 SPJ_1587     FALSE 0.024 357.000 0.000 NA   NA
 7479844 7479845 SPJ_1589 SPJ_1590   recG FALSE 0.035 317.000 0.000 1.000 N NA
 7479845 7479846 SPJ_1590 SPJ_1591 recG alr TRUE 0.947 19.000 0.078 1.000 N NA
 7479846 7479847 SPJ_1591 SPJ_1592 alr acpS TRUE 0.978 -10.000 0.093 1.000 N NA
 7479847 7479848 SPJ_1592 SPJ_1593 acpS   TRUE 0.783 45.000 0.007 1.000 N NA
 7479848 7479849 SPJ_1593 SPJ_1594     TRUE 0.998 2.000 0.750 0.001 Y NA
 7479849 7479850 SPJ_1594 SPJ_1595   secA TRUE 0.465 81.000 0.025 1.000 N NA
 7479850 7479851 SPJ_1595 SPJ_1596 secA   FALSE 0.155 146.000 0.017 NA   NA
 7479851 7479852 SPJ_1596 SPJ_1597     TRUE 0.712 28.000 0.000 NA   NA
 7479852 7479853 SPJ_1597 SPJ_1598     TRUE 0.808 4.000 0.000 NA   NA
 7479853 7479854 SPJ_1598 SPJ_1599     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7479854 7479855 SPJ_1599 SPJ_1600     TRUE 0.980 22.000 0.667 NA   NA
 7479857 7479858 SPJ_1602 SPJ_1603     FALSE 0.065 140.000 0.000 NA   NA
 7479858 7479859 SPJ_1603 SPJ_1604   engA FALSE 0.218 88.000 0.002 NA   NA
 7479859 7479860 SPJ_1604 SPJ_1605 engA   TRUE 0.878 14.000 0.005 1.000   NA
 7479860 7479861 SPJ_1605 SPJ_1606     TRUE 0.976 -3.000 0.048 1.000 N NA
 7479861 7479862 SPJ_1606 SPJ_1607     TRUE 0.997 1.000 0.817 NA Y NA
 7479862 7479863 SPJ_1607 SPJ_1608   nrdR TRUE 0.975 1.000 0.109 NA N NA
 7479864 7479865 SPJ_1609 SPJ_1610     TRUE 0.982 5.000 0.412 1.000 N NA
 7479865 7479866 SPJ_1610 SPJ_1611     TRUE 0.978 17.000 0.471 NA   NA
 7479867 7479868 SPJ_1612 SPJ_1613     TRUE 0.974 -3.000 0.059 NA   NA
 7479869 7479870 SPJ_1614 SPJ_1615     FALSE 0.015 996.000 0.000 NA   NA
 7479871 7479872 SPJ_1616 SPJ_1617     TRUE 0.639 149.000 0.235 1.000 Y NA
 7479872 7479873 SPJ_1617 SPJ_1618     FALSE 0.072 127.000 0.000 NA   NA
 7479874 7479875 SPJ_1619 SPJ_1620     TRUE 0.990 -19.000 0.571 1.000 N NA
 7479876 7479877 SPJ_1621 SPJ_1622     TRUE 0.994 0.000 0.183 1.000 Y NA
 7479877 7479878 SPJ_1622 SPJ_1623     FALSE 0.093 107.000 0.000 NA   NA
 7479878 7479879 SPJ_1623 SPJ_1624     FALSE 0.298 68.000 0.000 NA   NA
 7479879 7479880 SPJ_1624 SPJ_1625     TRUE 0.810 -52.000 0.000 NA   NA
 7479880 7479881 SPJ_1625 SPJ_1626     FALSE 0.059 159.000 0.000 NA   NA
 7479881 7479882 SPJ_1626 SPJ_1627     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7479882 7479883 SPJ_1627 SPJ_1628     FALSE 0.085 115.000 0.000 NA   NA
 7479883 7479884 SPJ_1628 SPJ_1629     TRUE 0.998 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 7479884 7479885 SPJ_1629 SPJ_1630   sun TRUE 0.950 15.000 0.074 1.000 N NA
 7479885 7479886 SPJ_1630 SPJ_1631 sun fmt TRUE 0.996 -7.000 0.305 1.000 Y NA
 7479886 7479887 SPJ_1631 SPJ_1632 fmt   TRUE 0.938 13.000 0.052 1.000 N NA
 7479887 7479888 SPJ_1632 SPJ_1633   rpoZ TRUE 0.746 66.000 0.032 0.060 N NA
 7479888 7479889 SPJ_1633 SPJ_1634 rpoZ gmk TRUE 0.975 28.000 0.471 1.000 N NA
 7479889 7479890 SPJ_1634 SPJ_1635 gmk   FALSE 0.165 130.000 0.010 1.000   NA
 7479890 7479891 SPJ_1635 SPJ_1636     FALSE 0.048 191.000 0.000 NA   NA
 7479891 7479892 SPJ_1636 SPJ_1637     TRUE 0.986 4.000 0.615 NA   NA
 7479892 7479893 SPJ_1637 SPJ_1638     FALSE 0.038 238.000 0.000 NA   NA
 7479893 7479894 SPJ_1638 SPJ_1639     TRUE 0.941 10.000 0.094 NA   NA
 7479894 7479895 SPJ_1639 SPJ_1640     TRUE 0.357 103.000 0.085 NA   NA
 7479895 7479896 SPJ_1640 SPJ_1641     TRUE 0.868 13.000 0.008 NA   NA
 7479896 7479897 SPJ_1641 SPJ_1642     TRUE 0.960 1.000 0.024 1.000 N NA
 7479897 7479898 SPJ_1642 SPJ_1643   nadD TRUE 0.994 0.000 0.199 1.000 Y NA
 7479898 7479899 SPJ_1643 SPJ_1644 nadD   TRUE 0.888 52.000 0.150 NA N NA
 7479899 7479900 SPJ_1644 SPJ_1645     FALSE 0.174 215.000 0.068 NA   NA
 7479900 7479901 SPJ_1645 SPJ_1646   yqeG TRUE 0.986 3.000 0.555 NA   NA
 7479901 7479902 SPJ_1646 SPJ_1647 yqeG   TRUE 0.898 15.000 0.015 NA   NA
 7479902 7479903 SPJ_1647 SPJ_1648     TRUE 0.863 57.000 0.059 0.065   NA
 7479904 7479905 SPJ_1649 SPJ_1651     FALSE 0.298 68.000 0.000 NA   NA
 7479906 7479907 SPJ_1652 SPJ_1653     TRUE 0.989 5.000 1.000 NA   NA
 7479907 7479908 SPJ_1653 SPJ_1654     TRUE 0.985 2.000 0.400 NA   NA
 7479908 7479909 SPJ_1654 SPJ_1655     TRUE 0.990 -7.000 0.400 NA   NA
 7479909 7479910 SPJ_1655 SPJ_1656     TRUE 0.978 12.000 0.429 1.000 N NA
 7479910 7479911 SPJ_1656 SPJ_1657     TRUE 0.992 -7.000 0.571 NA   NA
 7479911 7479912 SPJ_1657 SPJ_1658     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 7479912 7479913 SPJ_1658 SPJ_1659     TRUE 0.989 -16.000 0.571 NA   NA
 7479913 7479914 SPJ_1659 SPJ_1660     TRUE 0.863 10.000 0.007 NA   NA
 7479914 7479915 SPJ_1660 SPJ_1661     TRUE 0.618 57.000 0.002 NA N NA
 7479915 7479916 SPJ_1661 SPJ_1662     TRUE 0.996 0.000 0.500 NA Y NA
 7479916 7479917 SPJ_1662 SPJ_1663     TRUE 0.996 9.000 0.750 0.004 Y NA
 7479917 7479918 SPJ_1663 SPJ_1664     TRUE 0.952 31.000 0.000 0.004 Y NA
 7479918 7479919 SPJ_1664 SPJ_1665     TRUE 0.954 10.000 0.154 NA   NA
 7479919 7479920 SPJ_1665 SPJ_1666     TRUE 0.706 29.000 0.000 NA   NA
 7479920 7479921 SPJ_1666 SPJ_1667     TRUE 0.789 5.000 0.000 NA   NA
 7479921 7479922 SPJ_1667 SPJ_1668     FALSE 0.195 307.000 0.000 0.004 Y NA
 7479922 7479923 SPJ_1668 SPJ_1669     TRUE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 7479923 7479924 SPJ_1669 SPJ_1670     FALSE 0.024 361.000 0.000 NA   NA
 7479925 7479926 SPJ_1671 SPJ_1672     TRUE 0.434 99.000 0.143 NA   NA
 7479926 7479927 SPJ_1672 SPJ_1673   trx TRUE 0.974 17.000 0.364 NA   NA
 7479927 7479928 SPJ_1673 SPJ_1674 trx   FALSE 0.034 306.000 0.000 1.000   NA
 7479928 7479929 SPJ_1674 SPJ_1675     TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7479930 7479931 SPJ_1676 SPJ_1677     FALSE 0.185 111.000 0.010 NA   NA
 7479931 7479932 SPJ_1677 SPJ_1678     FALSE 0.298 68.000 0.000 NA   NA
 7479932 7479933 SPJ_1678 SPJ_1679   pepF2 TRUE 0.735 23.000 0.000 NA   NA
 7479933 7479934 SPJ_1679 SPJ_1680 pepF2   TRUE 0.848 11.000 0.004 NA   NA
 7479934 7479935 SPJ_1680 SPJ_1681   prmA TRUE 0.979 2.000 0.227 NA   NA
 7479935 7479936 SPJ_1681 SPJ_1682 prmA   TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7479936 7479937 SPJ_1682 SPJ_1683     TRUE 0.541 51.000 0.000 NA   NA
 7479937 7479938 SPJ_1683 SPJ_1684     TRUE 0.865 62.000 0.231 1.000   NA
 7479938 7479939 SPJ_1684 SPJ_1685     FALSE 0.109 110.000 0.000 1.000   NA
 7479939 7479940 SPJ_1685 SPJ_1686     TRUE 0.867 -19.000 0.000 1.000   NA
 7479940 7479941 SPJ_1686 SPJ_1687     TRUE 0.755 19.000 0.000 NA   NA
 7479941 7479942 SPJ_1687 SPJ_1688     FALSE 0.029 291.000 0.000 NA   NA
 7479942 7479943 SPJ_1688 SPJ_1689     TRUE 0.954 37.000 0.308 NA   NA
 7479943 7479944 SPJ_1689 SPJ_1690     FALSE 0.066 137.000 0.000 NA   NA
 7479945 7479946 SPJ_1691 SPJ_1692     FALSE 0.033 264.000 0.000 NA   NA
 7479947 7479948 SPJ_1693 SPJ_1694     TRUE 0.986 10.000 0.182 1.000 Y NA
 7479948 7479949 SPJ_1694 SPJ_1695     TRUE 0.994 29.000 0.733 0.034 Y NA
 7479949 7479950 SPJ_1695 SPJ_1696     TRUE 0.996 11.000 0.933 0.034 Y NA
 7479950 7479951 SPJ_1696 SPJ_1697     TRUE 0.389 149.000 0.214 1.000 N NA
 7479951 7479952 SPJ_1697 SPJ_1698     FALSE 0.023 362.000 0.000 NA   NA
 7479953 7479954 SPJ_1699 SPJ_1700     TRUE 0.625 84.000 0.214 NA   NA
 7479954 7479955 SPJ_1700 SPJ_1701     TRUE 0.951 12.000 0.143 NA   NA
 7479955 7479956 SPJ_1701 SPJ_1702     TRUE 0.869 39.000 0.036 NA   NA
 7479956 7479957 SPJ_1702 SPJ_1703     TRUE 0.982 31.000 1.000 NA   NA
 7479957 7479958 SPJ_1703 SPJ_1704     FALSE 0.017 586.000 0.000 NA   NA
 7479959 7479960 SPJ_1705 SPJ_1706     FALSE 0.041 219.000 0.000 NA   NA
 7479960 7479961 SPJ_1706 SPJ_1707     TRUE 0.769 15.000 0.000 NA   NA
 7479961 7479962 SPJ_1707 SPJ_1708     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7479962 7479963 SPJ_1708 SPJ_1709     FALSE 0.034 323.000 0.000 1.000 N NA
 7479963 7479964 SPJ_1709 SPJ_1710     TRUE 0.994 10.000 0.500 0.016 Y NA
 7479964 7479965 SPJ_1710 SPJ_1711     TRUE 0.994 17.000 0.429 0.016 Y NA
 7479965 7479966 SPJ_1711 SPJ_1712     TRUE 0.802 15.000 0.000 1.000   NA
 7479966 7479967 SPJ_1712 SPJ_1713     TRUE 0.850 3.000 0.000 1.000   NA
 7479971 7479972 SPJ_1717 SPJ_1718     TRUE 0.961 15.000 0.182 NA   NA
 7479972 7479973 SPJ_1718 SPJ_1719   trpA FALSE 0.028 302.000 0.000 NA   NA
 7479973 7479974 SPJ_1719 SPJ_1720 trpA trpB TRUE 0.997 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 7479974 7479975 SPJ_1720 SPJ_1721 trpB trpF TRUE 0.996 -22.000 0.375 0.002 Y NA
 7479975 7479976 SPJ_1721 SPJ_1722 trpF trpC TRUE 0.996 -13.000 0.264 0.002 Y NA
 7479976 7479977 SPJ_1722 SPJ_1723 trpC trpD TRUE 0.995 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 7479977 7479978 SPJ_1723 SPJ_1724 trpD   TRUE 0.968 11.000 0.018 1.000 Y NA
 7479978 7479979 SPJ_1724 SPJ_1725   trpE TRUE 0.998 -3.000 0.321 0.001 Y NA
 7479979 7479980 SPJ_1725 SPJ_1726 trpE   FALSE 0.021 409.000 0.000 NA   NA
 7479980 7479981 SPJ_1726 SPJ_1727     FALSE 0.017 608.000 0.000 NA   NA
 7479981 7479982 SPJ_1727 SPJ_1728     FALSE 0.093 108.000 0.000 NA   NA
 7479982 7479983 SPJ_1728 SPJ_1729     FALSE 0.113 96.000 0.000 NA   NA
 7479983 7479984 SPJ_1729 SPJ_1730     TRUE 0.903 3.000 0.000 0.064   NA
 7479984 7479985 SPJ_1730 SPJ_1731     TRUE 0.986 12.000 0.545 0.034 N NA
 7479985 7479986 SPJ_1731 SPJ_1732     TRUE 0.665 103.000 0.364 0.034 N NA
 7479986 7479987 SPJ_1732 SPJ_1733     TRUE 0.763 25.000 0.000 1.000   NA
 7479987 7479988 SPJ_1733 SPJ_1734     FALSE 0.071 128.000 0.000 NA   NA
 7479988 7479989 SPJ_1734 SPJ_1735   galE2 TRUE 0.828 -31.000 0.000 NA   NA
 7479989 7479990 SPJ_1735 SPJ_1736 galE2 galT1 TRUE 0.895 13.000 0.000 0.003 N NA
 7479990 7479991 SPJ_1736 SPJ_1737 galT1   TRUE 0.773 13.000 0.000 NA N NA
 7479991 7479992 SPJ_1737 SPJ_1738     TRUE 0.463 58.000 0.000 NA   NA
 7479992 7479993 SPJ_1738 SPJ_1739     FALSE 0.060 154.000 0.000 NA   NA
 7479993 7479994 SPJ_1739 SPJ_1740     TRUE 0.852 -16.000 0.000 NA   NA
 7479996 7479997 SPJ_1742 SPJ_1743     TRUE 0.980 43.000 0.382 NA Y NA
 7479997 7479998 SPJ_1743 SPJ_1744     FALSE 0.145 173.000 0.018 NA N NA
 7479998 7479999 SPJ_1744 SPJ_1745     TRUE 0.998 -10.000 0.911 0.008 Y NA
 7479999 7480000 SPJ_1745 SPJ_1746     FALSE 0.117 206.000 0.018 NA   NA
 7480000 7480001 SPJ_1746 SPJ_1747     FALSE 0.255 72.000 0.000 NA   NA
 7480001 7480002 SPJ_1747 SPJ_1748     TRUE 0.813 -46.000 0.000 NA   NA
 7480003 7480004 SPJ_1749 SPJ_1750 xth   TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7480004 7480005 SPJ_1750 SPJ_1752   xpt FALSE 0.015 878.000 0.000 NA   NA
 7480005 7480006 SPJ_1752 SPJ_1753 xpt   TRUE 0.990 0.000 0.046 1.000 Y NA
 7480007 7480008 SPJ_1754 SPJ_1755     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7480008 7480009 SPJ_1755 SPJ_1756     FALSE 0.050 181.000 0.000 NA   NA
 7480009 7480010 SPJ_1756 SPJ_1757   galT2 TRUE 0.558 70.000 0.024 NA N NA
 7480010 7480011 SPJ_1757 SPJ_1758 galT2 galK TRUE 0.989 19.000 0.107 0.003 Y NA
 7480013 7480014 SPJ_1760 SPJ_1761     TRUE 0.895 1.000 0.000 1.000 N NA
 7480014 7480015 SPJ_1761 SPJ_1762     FALSE 0.049 244.000 0.000 1.000 N NA
 7480017 7480018 SPJ_1764 SPJ_1765     FALSE 0.053 171.000 0.000 NA   NA
 7480018 7480019 SPJ_1765 SPJ_1766     TRUE 0.463 58.000 0.000 NA   NA
 7480019 7480020 SPJ_1766 SPJ_1767     TRUE 0.991 -7.000 0.382 1.000 N NA
 7480020 7480021 SPJ_1767 SPJ_1768     TRUE 0.919 15.000 0.031 NA   NA
 7480021 7480022 SPJ_1768 SPJ_1769     TRUE 0.973 4.000 0.222 NA   NA
 7480022 7480023 SPJ_1769 SPJ_1770     FALSE 0.016 682.000 0.000 NA   NA
 7480023 7480024 SPJ_1770 SPJ_1771   pepA TRUE 0.940 22.000 0.100 NA   NA
 7480025 7480026 SPJ_1772 SPJ_1773     FALSE 0.059 159.000 0.000 NA   NA
 7480026 7480027 SPJ_1773 SPJ_1774     FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 7480027 7480028 SPJ_1774 SPJ_1775     TRUE 0.998 -10.000 0.870 0.033 Y NA
 7480028 7480029 SPJ_1775 SPJ_1776     TRUE 0.998 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 7480029 7480030 SPJ_1776 SPJ_1777     TRUE 0.643 96.000 0.055 1.000 Y NA
 7480031 7480032 SPJ_1778 SPJ_1779   rluB TRUE 0.951 0.000 0.014 NA   NA
 7480032 7480033 SPJ_1779 SPJ_1780 rluB scpB TRUE 0.983 -13.000 0.224 NA N NA
 7480033 7480034 SPJ_1780 SPJ_1781 scpB   TRUE 0.979 19.000 0.570 NA   NA
 7480034 7480035 SPJ_1781 SPJ_1782     TRUE 0.927 0.000 0.003 NA   NA
 7480035 7480036 SPJ_1782 SPJ_1783     TRUE 0.958 -9.000 0.017 1.000   NA
 7480036 7480037 SPJ_1783 SPJ_1784     TRUE 0.975 -3.000 0.065 NA   NA
 7480037 7480038 SPJ_1784 SPJ_1785     TRUE 0.962 -24.000 0.085 NA   NA
 7480038 7480039 SPJ_1785 SPJ_1786   murI TRUE 0.973 -3.000 0.034 1.000 N NA
 7480039 7480040 SPJ_1786 SPJ_1787 murI   FALSE 0.109 207.000 0.014 NA   NA
 7480040 7480041 SPJ_1787 SPJ_1788   treC FALSE 0.035 256.000 0.000 NA   NA
 7480041 7480042 SPJ_1788 SPJ_1789 treC treP TRUE 0.725 178.000 0.650 1.000 Y NA
 7480044 7480045 SPJ_1791 SPJ_1792     TRUE 0.957 13.000 0.143 1.000   NA
 7480045 7480046 SPJ_1792 SPJ_1793     TRUE 0.962 12.000 0.222 NA   NA
 7480048 7480049 SPJ_1795 SPJ_1796     FALSE 0.335 66.000 0.000 NA   NA
 7480049 7480050 SPJ_1796 SPJ_1797     TRUE 0.994 11.000 0.333 0.001 Y NA
 7480050 7480051 SPJ_1797 SPJ_1798     TRUE 0.993 9.000 0.650 1.000 Y NA
 7480051 7480052 SPJ_1798 SPJ_1799     TRUE 0.991 0.000 0.278 0.033   NA
 7480052 7480053 SPJ_1799 SPJ_1800     TRUE 0.920 67.000 0.600 0.033   NA
 7480053 7480054 SPJ_1800 SPJ_1801     FALSE 0.018 686.000 0.000 NA N NA
 7480054 7480055 SPJ_1801 SPJ_1802     FALSE 0.073 138.000 0.000 NA N NA
 7480055 7480056 SPJ_1802 SPJ_1803     FALSE 0.050 184.000 0.000 NA   NA
 7480056 7480057 SPJ_1803 SPJ_1804     TRUE 0.771 7.000 0.000 NA   NA
 7480057 7480058 SPJ_1804 SPJ_1805     TRUE 0.997 14.000 0.925 0.033 Y NA
 7480058 7480059 SPJ_1805 SPJ_1806     TRUE 0.992 14.000 0.275 0.033 Y NA
 7480059 7480060 SPJ_1806 SPJ_1807     TRUE 0.817 92.000 0.286 1.000 Y NA
 7480061 7480062 SPJ_1808 SPJ_1809     TRUE 0.919 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7480062 7480063 SPJ_1809 SPJ_1810     FALSE 0.043 251.000 0.000 1.000   NA
 7480063 7480064 SPJ_1810 SPJ_1811     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7480065 7480066 SPJ_1812 SPJ_1813     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7480066 7480067 SPJ_1813 SPJ_1814     TRUE 0.690 32.000 0.000 NA   NA
 7480067 7480068 SPJ_1814 SPJ_1815     TRUE 0.769 17.000 0.000 NA   NA
 7480068 7480069 SPJ_1815 SPJ_1816     TRUE 0.863 1.000 0.000 NA   NA
 7480069 7480070 SPJ_1816 SPJ_1817     TRUE 0.751 11.000 0.000 NA   NA
 7480070 7480071 SPJ_1817 SPJ_1818     TRUE 0.764 8.000 0.000 NA   NA
 7480071 7480072 SPJ_1818 SPJ_1819     TRUE 0.751 10.000 0.000 NA   NA
 7480072 7480073 SPJ_1819 SPJ_1820     TRUE 0.863 1.000 0.000 NA   NA
 7480073 7480074 SPJ_1820 SPJ_1821     TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7480074 7480075 SPJ_1821 SPJ_1822     TRUE 0.771 7.000 0.000 NA   NA
 7480075 7480076 SPJ_1822 SPJ_1823     TRUE 0.789 5.000 0.000 NA   NA
 7480076 7480077 SPJ_1823 SPJ_1824     TRUE 0.748 20.000 0.000 NA   NA
 7480077 7480078 SPJ_1824 SPJ_1825     TRUE 0.769 15.000 0.000 NA   NA
 7480078 7480079 SPJ_1825 SPJ_1826     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7480079 7480080 SPJ_1826 SPJ_1827     TRUE 0.725 25.000 0.000 NA   NA
 7480080 7480081 SPJ_1827 SPJ_2273     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7480081 7480082 SPJ_2273 SPJ_1828   rrf2 TRUE 0.789 5.000 0.000 NA   NA
 7480082 7480083 SPJ_1828 SPJ_1829 rrf2 rrl2 FALSE 0.220 77.000 0.000 NA   NA
 7480083 7480084 SPJ_1829 SPJ_1831 rrl2   FALSE 0.078 121.000 0.000 NA   NA
 7480084 7480085 SPJ_1831 SPJ_1832   rrs2 FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 7480085 7480086 SPJ_1832 SPJ_1833 rrs2   FALSE 0.033 262.000 0.000 NA   NA
 7480086 7480087 SPJ_1833 SPJ_1834   rumA2 TRUE 0.398 62.000 0.000 NA   NA
 7480088 7480089 SPJ_1835 SPJ_1836     FALSE 0.344 89.000 0.025 NA   NA
 7480091 7480092 SPJ_1838 SPJ_1839     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7480093 7480094 SPJ_1840 SPJ_1841 groL groS TRUE 0.987 16.000 0.160 1.000 Y NA
 7480094 7480095 SPJ_1841 SPJ_1842 groS   FALSE 0.275 156.000 0.083 1.000 N NA
 7480095 7480096 SPJ_1842 SPJ_1843     TRUE 0.718 27.000 0.000 NA   NA
 7480096 7480097 SPJ_1843 SPJ_1844     FALSE 0.039 232.000 0.000 NA   NA
 7480097 7480098 SPJ_1844 SPJ_1845     TRUE 0.977 6.000 0.400 NA   NA
 7480098 7480099 SPJ_1845 SPJ_1846     TRUE 0.808 4.000 0.000 NA   NA
 7480099 7480100 SPJ_1846 SPJ_1847     TRUE 0.751 10.000 0.000 NA   NA
 7480100 7480101 SPJ_1847 SPJ_1848     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7480101 7480102 SPJ_1848 SPJ_1849     TRUE 0.842 -19.000 0.000 NA   NA
 7480102 7480103 SPJ_1849 SPJ_1850     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7480103 7480104 SPJ_1850 SPJ_1851     TRUE 0.789 5.000 0.000 NA   NA
 7480104 7480105 SPJ_1851 SPJ_1852     TRUE 0.757 9.000 0.000 NA   NA
 7480105 7480106 SPJ_1852 SPJ_1853     TRUE 0.863 -13.000 0.000 NA   NA
 7480106 7480107 SPJ_1853 SPJ_1854     TRUE 0.963 39.000 0.500 NA   NA
 7480107 7480108 SPJ_1854 SPJ_1855     TRUE 0.987 5.000 0.800 NA   NA
 7480108 7480109 SPJ_1855 SPJ_1856     TRUE 0.982 3.000 0.400 NA   NA
 7480109 7480110 SPJ_1856 SPJ_1857     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7480110 7480111 SPJ_1857 SPJ_1858     FALSE 0.057 164.000 0.000 NA   NA
 7480111 7480112 SPJ_1858 SPJ_1859     TRUE 0.769 17.000 0.000 NA   NA
 7480112 7480113 SPJ_1859 SPJ_1860     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7480113 7480114 SPJ_1860 SPJ_1861     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7480114 7480115 SPJ_1861 SPJ_1862     TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7480115 7480116 SPJ_1862 SPJ_1863     TRUE 0.960 6.000 0.154 NA   NA
 7480116 7480117 SPJ_1863 SPJ_1864     FALSE 0.042 217.000 0.000 NA   NA
 7480117 7480118 SPJ_1864 SPJ_1865     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7480118 7480119 SPJ_1865 SPJ_1866     TRUE 0.609 43.000 0.000 NA   NA
 7480119 7480120 SPJ_1866 SPJ_1867     TRUE 0.965 -3.000 0.027 NA   NA
 7480120 7480121 SPJ_1867 SPJ_1868     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7480121 7480122 SPJ_1868 SPJ_1869     TRUE 0.975 -37.000 0.222 NA   NA
 7480122 7480123 SPJ_1869 SPJ_1870     FALSE 0.050 180.000 0.000 NA   NA
 7480123 7480124 SPJ_1870 SPJ_1871     TRUE 0.932 -22.000 0.000 0.001   NA
 7480124 7480125 SPJ_1871 SPJ_1872     FALSE 0.037 245.000 0.000 NA   NA
 7480125 7480126 SPJ_1872 SPJ_1873     FALSE 0.192 80.000 0.000 NA   NA
 7480126 7480127 SPJ_1873 SPJ_1874     FALSE 0.020 441.000 0.000 NA   NA
 7480127 7480128 SPJ_1874 SPJ_1875     TRUE 0.748 12.000 0.000 NA   NA
 7480128 7480129 SPJ_1875 SPJ_1876     FALSE 0.035 254.000 0.000 NA   NA
 7480129 7480130 SPJ_1876 SPJ_1877     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 7480130 7480131 SPJ_1877 SPJ_1878     TRUE 0.843 2.000 0.000 NA   NA
 7480131 7480132 SPJ_1878 SPJ_1879     FALSE 0.041 223.000 0.000 NA   NA
 7480132 7480133 SPJ_1879 SPJ_1880     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7480133 7480134 SPJ_1880 SPJ_1881     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7480134 7480135 SPJ_1881 SPJ_1882     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7480135 7480136 SPJ_1882 SPJ_1883     FALSE 0.027 310.000 0.000 NA   NA
 7480136 7480137 SPJ_1883 SPJ_1884     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7480137 7480138 SPJ_1884 SPJ_1885   bet TRUE 0.943 10.000 0.100 NA   NA
 7480138 7480139 SPJ_1885 SPJ_1886 bet   TRUE 0.667 37.000 0.000 NA   NA
 7480139 7480140 SPJ_1886 SPJ_1887     FALSE 0.081 117.000 0.000 NA   NA
 7480140 7480141 SPJ_1887 SPJ_1888     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7480141 7480142 SPJ_1888 SPJ_1889     TRUE 0.863 1.000 0.000 NA   NA
 7480142 7480143 SPJ_1889 SPJ_1890     TRUE 0.880 0.000 0.000 NA   NA
 7480143 7480144 SPJ_1890 SPJ_1891     TRUE 0.762 18.000 0.000 NA   NA
 7480144 7480145 SPJ_1891 SPJ_1892     FALSE 0.317 67.000 0.000 NA   NA
 7480147 7480148 SPJ_1893 SPJ_1895     FALSE 0.049 185.000 0.000 NA   NA
 7480148 7480149 SPJ_1895 SPJ_1896     FALSE 0.066 167.000 0.000 1.000   NA
 7480150 7480151 SPJ_1897 SPJ_1899     FALSE 0.022 401.000 0.000 NA   NA
 7480152 7480153 SPJ_1898 SPJ_1900     FALSE 0.090 111.000 0.000 NA   NA
 7480157 7480158 SPJ_1904 SPJ_1905     TRUE 0.849 42.000 0.020 1.000   NA
 7480158 7480159 SPJ_1905 SPJ_1906     TRUE 0.971 16.000 0.239 1.000   NA
 7480159 7480160 SPJ_1906 SPJ_1907     TRUE 0.982 -3.000 0.140 NA   NA
 7480160 7480161 SPJ_1907 SPJ_1908     FALSE 0.029 294.000 0.000 NA   NA
 7480161 7480162 SPJ_1908 SPJ_1909     FALSE 0.044 209.000 0.000 NA   NA
 7480162 7480163 SPJ_1909 SPJ_1910     TRUE 0.984 6.000 0.714 NA   NA
 7480163 7480164 SPJ_1910 SPJ_1911     FALSE 0.283 114.000 0.053 NA   NA
 7480164 7480165 SPJ_1911 SPJ_1912     TRUE 0.894 -3.000 0.000 NA   NA
 7480165 7480166 SPJ_1912 SPJ_1913     FALSE 0.335 66.000 0.000 NA   NA
 7480166 7480167 SPJ_1913 SPJ_1915     TRUE 0.771 7.000 0.000 NA   NA
 7480167 7480168 SPJ_1915 SPJ_1917     TRUE 0.651 39.000 0.000 NA   NA
 7480168 7480169 SPJ_1917 SPJ_1919     FALSE 0.075 124.000 0.000 NA   NA
 7480169 7480170 SPJ_1919 SPJ_1920     FALSE 0.015 881.000 0.000 NA   NA
 7480170 7480171 SPJ_1920 SPJ_1921     TRUE 0.751 11.000 0.000 NA   NA
 7480171 7480172 SPJ_1921 SPJ_1922     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7480172 7480173 SPJ_1922 SPJ_1923     TRUE 0.753 13.000 0.000 NA   NA
 7480174 7480175 SPJ_1924 SPJ_1925     TRUE 0.789 5.000 0.000 NA   NA
 7480176 7480177 SPJ_1926 SPJ_1927     TRUE 0.442 59.000 0.000 NA   NA
 7480177 7480178 SPJ_1927 SPJ_1928     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA