MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus pneumoniae Hungary19A-6

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
5694857	5694858	SPH_0001	SPH_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.753	159.000	0.328	1.000	Y	NA
5694858	5694859	SPH_0002	SPH_0003	dnaN		TRUE	0.565	65.000	0.009	NA		NA
5694859	5694860	SPH_0003	SPH_0004		ychF	TRUE	0.508	84.000	0.064	NA		NA
5694860	5694861	SPH_0004	SPH_0005	ychF	pth	TRUE	0.901	71.000	0.184	1.000	Y	NA
5694861	5694862	SPH_0005	SPH_0006	pth	mfd	TRUE	0.982	1.000	0.137	1.000	N	NA
5694862	5694863	SPH_0006	SPH_0007	mfd		TRUE	0.706	58.000	0.024	1.000	N	NA
5694863	5694864	SPH_0007	SPH_0008			TRUE	0.966	-7.000	0.053	1.000	N	NA
5694864	5694865	SPH_0008	SPH_0009			TRUE	0.937	5.000	0.009	NA		NA
5694865	5694866	SPH_0009	SPH_0010			TRUE	0.974	-7.000	0.105	NA		NA
5694866	5694867	SPH_0010	SPH_0011			TRUE	0.961	-3.000	0.014	NA	N	NA
5694867	5694868	SPH_0011	SPH_0012		hpt	TRUE	0.962	4.000	0.067	0.062	N	NA
5694868	5694869	SPH_0012	SPH_0013	hpt	hflB	TRUE	0.976	16.000	0.192	1.000	N	NA
5694869	5694870	SPH_0013	SPH_0014	hflB		FALSE	0.206	122.000	0.006	1.000		NA
5694870	5694871	SPH_0014	SPH_0015			FALSE	0.163	94.000	0.000	NA		NA
5694871	5694872	SPH_0015	SPH_0016		rrs1	FALSE	0.042	275.000	0.000	NA		NA
5694872	5694873	SPH_0016	SPH_0017	rrs1		FALSE	0.099	138.000	0.000	NA		NA
5694873	5694874	SPH_0017	SPH_0019		rrl1	FALSE	0.117	121.000	0.000	NA		NA
5694874	5694875	SPH_0019	SPH_0020	rrl1	rrf	FALSE	0.252	77.000	0.000	NA		NA
5694875	5694876	SPH_0020	SPH_0021	rrf		TRUE	0.865	6.000	0.000	NA		NA
5694877	5694878	SPH_0022	SPH_0023			TRUE	0.575	48.000	0.000	NA		NA
5694879	5694880	SPH_0024	SPH_0025		purA	FALSE	0.069	189.000	0.000	NA		NA
5694881	5694882	SPH_0026	SPH_0028			FALSE	0.077	171.000	0.000	NA		NA
5694882	5694883	SPH_0028	SPH_0029			FALSE	0.111	127.000	0.000	NA		NA
5694884	5694885	SPH_0030	SPH_0031			FALSE	0.297	71.000	0.000	NA		NA
5694885	5694886	SPH_0031	SPH_0033			TRUE	0.858	12.000	0.000	NA		NA
5694888	5694889	SPH_0034	SPH_0035			TRUE	0.987	13.000	0.400	NA		NA
5694889	5694890	SPH_0035	SPH_0036			FALSE	0.189	86.000	0.000	NA		NA
5694890	5694891	SPH_0036	SPH_0037			TRUE	0.847	16.000	0.000	NA		NA
5694891	5694892	SPH_0037	SPH_0038			TRUE	0.813	-16.000	0.000	NA		NA
5694892	5694893	SPH_0038	SPH_0039			TRUE	0.845	-12.000	0.000	NA		NA
5694893	5694894	SPH_0039	SPH_0040			TRUE	0.888	-6.000	0.000	NA		NA
5694894	5694895	SPH_0040	SPH_0041			TRUE	0.849	15.000	0.000	NA		NA
5694895	5694896	SPH_0041	SPH_0042			TRUE	0.906	0.000	0.000	NA		NA
5694896	5694897	SPH_0042	SPH_0043			FALSE	0.071	185.000	0.000	NA		NA
5694897	5694898	SPH_0043	SPH_0044			TRUE	0.856	-10.000	0.000	NA		NA
5694898	5694899	SPH_0044	SPH_0045			TRUE	0.666	40.000	0.000	NA		NA
5694899	5694900	SPH_0045	SPH_0046			FALSE	0.132	109.000	0.000	NA		NA
5694900	5694901	SPH_0046	SPH_0047			FALSE	0.024	430.000	0.000	1.000		NA
5694901	5694902	SPH_0047	SPH_0048			TRUE	0.697	143.000	0.667	NA		NA
5694902	5694903	SPH_0048	SPH_0049			TRUE	0.986	-7.000	0.286	NA		NA
5694903	5694904	SPH_0049	SPH_0050			TRUE	0.456	225.000	0.429	NA		NA
5694904	5694905	SPH_0050	SPH_0051			TRUE	0.949	47.000	0.400	NA		NA
5694905	5694906	SPH_0051	SPH_0052			TRUE	0.995	15.000	1.000	NA		NA
5694906	5694907	SPH_0052	SPH_0053			TRUE	0.991	26.000	1.000	NA		NA
5694907	5694908	SPH_0053	SPH_0054			TRUE	0.997	-3.000	1.000	NA		NA
5694908	5694909	SPH_0054	SPH_0055			TRUE	0.997	0.000	1.000	NA		NA
5694909	5694910	SPH_0055	SPH_0056			TRUE	0.995	-13.000	1.000	NA		NA
5694910	5694911	SPH_0056	SPH_0057			TRUE	0.995	14.000	1.000	NA		NA
5694911	5694912	SPH_0057	SPH_0058			TRUE	0.997	2.000	1.000	NA		NA
5694912	5694913	SPH_0058	SPH_0059			TRUE	0.987	39.000	1.000	NA		NA
5694913	5694914	SPH_0059	SPH_0060			TRUE	0.822	20.000	0.000	NA		NA
5694914	5694915	SPH_0060	SPH_0061			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5694915	5694916	SPH_0061	SPH_0062			TRUE	0.901	1.000	0.000	NA		NA
5694916	5694917	SPH_0062	SPH_0063			FALSE	0.163	94.000	0.000	NA		NA
5694917	5694918	SPH_0063	SPH_0064			TRUE	0.996	3.000	1.000	NA		NA
5694918	5694919	SPH_0064	SPH_0065			TRUE	0.854	10.000	0.000	NA		NA
5694919	5694920	SPH_0065	SPH_0066			TRUE	0.873	4.000	0.000	NA		NA
5694920	5694921	SPH_0066	SPH_0067			TRUE	0.989	4.000	0.400	NA		NA
5694923	5694924	SPH_0069	SPH_2440		srpB	TRUE	0.658	41.000	0.000	NA		NA
5694925	5694926	SPH_0070	SPH_0071			FALSE	0.111	119.000	0.000	1.000		NA
5694926	5694927	SPH_0071	SPH_0072			TRUE	0.851	14.000	0.000	NA		NA
5694927	5694928	SPH_0072	SPH_0073			TRUE	0.799	22.000	0.000	NA		NA
5694929	5694930	SPH_0074	SPH_0075			TRUE	0.880	2.000	0.000	1.000		NA
5694930	5694931	SPH_0075	SPH_0076			FALSE	0.071	186.000	0.000	NA		NA
5694931	5694932	SPH_0076	SPH_0077			FALSE	0.088	157.000	0.000	NA		NA
5694932	5694933	SPH_0077	SPH_0078			FALSE	0.203	84.000	0.000	NA		NA
5694933	5694934	SPH_0078	SPH_0079			TRUE	0.865	6.000	0.000	NA		NA
5694934	5694935	SPH_0079	SPH_0080			TRUE	0.970	3.000	0.085	NA		NA
5694935	5694936	SPH_0080	SPH_0081			TRUE	0.799	22.000	0.000	NA		NA
5694936	5694937	SPH_0081	SPH_0082			TRUE	0.856	-10.000	0.000	NA		NA
5694937	5694938	SPH_0082	SPH_0083			TRUE	0.742	26.000	0.000	1.000		NA
5694938	5694939	SPH_0083	SPH_0084			TRUE	0.787	5.000	0.000	0.002		NA
5694939	5694940	SPH_0084	SPH_0085			TRUE	0.702	35.000	0.000	NA		NA
5694940	5694941	SPH_0085	SPH_0086			TRUE	0.501	54.000	0.000	NA		NA
5694941	5694942	SPH_0086	SPH_0087			TRUE	0.995	2.000	0.708	NA		NA
5694942	5694943	SPH_0087	SPH_0088			TRUE	0.844	17.000	0.000	NA		NA
5694943	5694944	SPH_0088	SPH_0089			FALSE	0.048	254.000	0.000	NA		NA
5694944	5694945	SPH_0089	SPH_0090			TRUE	0.889	2.000	0.000	NA		NA
5694945	5694946	SPH_0090	SPH_0091			TRUE	0.558	50.000	0.000	NA		NA
5694946	5694947	SPH_0091	SPH_0092			TRUE	0.889	2.000	0.000	NA		NA
5694947	5694948	SPH_0092	SPH_0093			TRUE	0.906	0.000	0.000	NA		NA
5694948	5694949	SPH_0093	SPH_0094			TRUE	0.906	0.000	0.000	NA		NA
5694949	5694950	SPH_0094	SPH_0095			FALSE	0.288	72.000	0.000	NA		NA
5694950	5694951	SPH_0095	SPH_0097			TRUE	0.800	-19.000	0.000	NA		NA
5694953	5694954	SPH_0098	SPH_0099			TRUE	0.856	-10.000	0.000	NA		NA
5694954	5694955	SPH_0099	SPH_0100			TRUE	0.982	13.000	0.267	NA		NA
5694955	5694956	SPH_0100	SPH_0101			TRUE	0.834	-13.000	0.000	NA		NA
5694956	5694957	SPH_0101	SPH_0102			TRUE	0.629	43.000	0.000	NA		NA
5694957	5694958	SPH_0102	SPH_0103			FALSE	0.056	139.000	0.000	0.001		NA
5694958	5694959	SPH_0103	SPH_0104			TRUE	0.839	18.000	0.000	NA		NA
5694959	5694960	SPH_0104	SPH_0105			TRUE	0.854	11.000	0.000	NA		NA
5694960	5694961	SPH_0105	SPH_0106			TRUE	0.629	43.000	0.000	NA		NA
5694961	5694962	SPH_0106	SPH_0107			TRUE	0.985	-10.000	0.333	NA		NA
5694962	5694963	SPH_0107	SPH_0108			TRUE	0.993	0.000	0.438	NA		NA
5694963	5694964	SPH_0108	SPH_0109			TRUE	0.985	0.000	0.188	NA		NA
5694964	5694965	SPH_0109	SPH_0110			TRUE	0.997	-3.000	1.000	NA		NA
5694965	5694966	SPH_0110	SPH_0111			TRUE	0.954	65.000	1.000	NA		NA
5694966	5694967	SPH_0111	SPH_0112			TRUE	0.973	13.000	0.150	NA		NA
5694967	5694968	SPH_0112	SPH_0113			TRUE	0.879	-7.000	0.000	NA		NA
5694968	5694969	SPH_0113	SPH_0114			TRUE	0.730	30.000	0.000	NA		NA
5694969	5694970	SPH_0114	SPH_0115			TRUE	0.992	2.000	0.500	NA		NA
5694970	5694971	SPH_0115	SPH_0116			TRUE	0.977	11.000	0.200	NA		NA
5694971	5694972	SPH_0116	SPH_0117			TRUE	0.416	60.000	0.000	NA		NA
5694972	5694973	SPH_0117	SPH_0118			TRUE	0.854	10.000	0.000	NA		NA
5694973	5694974	SPH_0118	SPH_0119			TRUE	0.873	4.000	0.000	NA		NA
5694974	5694975	SPH_0119	SPH_0121			TRUE	0.873	4.000	0.000	NA		NA
5694975	5694976	SPH_0121	SPH_0122			FALSE	0.040	283.000	0.000	NA		NA
5694976	5694977	SPH_0122	SPH_0123			TRUE	0.880	-40.000	0.005	NA	N	NA
5694977	5694978	SPH_0123	SPH_0124		radA	FALSE	0.240	113.000	0.003	NA	N	NA
5694978	5694979	SPH_0124	SPH_0125	radA		TRUE	0.483	73.000	0.009	1.000	N	NA
5694979	5694980	SPH_0125	SPH_0126			TRUE	0.958	21.000	0.111	NA		NA
5694980	5694981	SPH_0126	SPH_0127			FALSE	0.094	145.000	0.000	NA		NA
5694982	5694983	SPH_0128	SPH_0129			TRUE	0.879	-7.000	0.000	NA		NA
5694983	5694984	SPH_0129	SPH_0130			FALSE	0.059	215.000	0.000	NA		NA
5694985	5694986	SPH_0131	SPH_0132			TRUE	0.330	85.000	0.005	NA		NA
5694986	5694987	SPH_0132	SPH_0133			TRUE	0.658	41.000	0.000	NA		NA
5694989	5694990	SPH_0135	SPH_0136		recO	TRUE	0.957	-3.000	0.012	1.000	N	NA
5694990	5694991	SPH_0136	SPH_0137	recO	plsX	TRUE	0.957	-3.000	0.011	1.000	N	NA
5694991	5694992	SPH_0137	SPH_0138	plsX		TRUE	0.980	6.000	0.017	0.008	Y	NA
5694992	5694993	SPH_0138	SPH_0139			TRUE	0.662	43.000	0.000	NA	N	NA
5694993	5694994	SPH_0139	SPH_0140			FALSE	0.064	203.000	0.000	NA		NA
5694994	5694995	SPH_0140	SPH_0141			TRUE	0.877	3.000	0.000	NA		NA
5694995	5694996	SPH_0141	SPH_0142			FALSE	0.021	623.000	0.000	NA		NA
5694996	5694997	SPH_0142	SPH_0143			FALSE	0.022	543.000	0.000	NA		NA
5694997	5694998	SPH_0143	SPH_0144			TRUE	0.990	7.000	0.500	NA		NA
5694998	5694999	SPH_0144	SPH_0145			TRUE	0.593	237.000	0.800	NA		NA
5694999	5695000	SPH_0145	SPH_0146			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5695000	5695001	SPH_0146	SPH_0147			TRUE	0.800	-19.000	0.000	NA		NA
5695001	5695002	SPH_0147	SPH_0148			FALSE	0.029	380.000	0.000	NA		NA
5695002	5695003	SPH_0148	SPH_0149			TRUE	0.987	13.000	0.444	0.066		NA
5695003	5695004	SPH_0149	SPH_0150		purC	FALSE	0.134	169.000	0.004	1.000		NA
5695004	5695005	SPH_0150	SPH_0151	purC		TRUE	0.763	11.000	0.000	0.001		NA
5695005	5695006	SPH_0151	SPH_0152			TRUE	0.446	57.000	0.000	1.000		NA
5695006	5695007	SPH_0152	SPH_0153		purF	TRUE	0.666	93.000	0.024	1.000	Y	NA
5695007	5695008	SPH_0153	SPH_0154	purF	purM	TRUE	0.983	37.000	0.248	1.000	Y	NA
5695008	5695009	SPH_0154	SPH_0155	purM	purN	TRUE	0.995	-3.000	0.238	0.003	Y	NA
5695009	5695010	SPH_0155	SPH_0156	purN		TRUE	0.351	84.000	0.003	NA	N	NA
5695010	5695011	SPH_0156	SPH_0157		purH	TRUE	0.871	25.000	0.002	NA	N	NA
5695011	5695012	SPH_0157	SPH_0158	purH	purD	TRUE	0.772	122.000	0.238	1.000	Y	NA
5695012	5695013	SPH_0158	SPH_0159	purD		FALSE	0.047	257.000	0.000	NA		NA
5695013	5695014	SPH_0159	SPH_0160		purE	TRUE	0.730	30.000	0.000	NA		NA
5695014	5695015	SPH_0160	SPH_0161	purE	purK	TRUE	0.970	-13.000	0.008	0.001	Y	NA
5695015	5695016	SPH_0161	SPH_0162	purK		TRUE	0.854	10.000	0.000	NA		NA
5695016	5695017	SPH_0162	SPH_0163		purB	TRUE	0.517	63.000	0.002	NA		NA
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5695029	5695030	SPH_0175	SPH_0176			FALSE	0.032	340.000	0.000	NA		NA
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5695032	5695033	SPH_0178	SPH_0179			FALSE	0.078	169.000	0.000	NA		NA
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5695036	5695037	SPH_0182	SPH_0184			FALSE	0.123	116.000	0.000	NA		NA
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5695156	5695157	SPH_0303	SPH_0304			FALSE	0.017	1207.000	0.000	NA		NA
5695157	5695158	SPH_0304	SPH_0305		uvrA	FALSE	0.021	489.000	0.000	1.000		NA
5695158	5695159	SPH_0305	SPH_0306	uvrA		TRUE	0.944	-7.000	0.008	1.000	N	NA
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5695160	5695161	SPH_0307	SPH_0308			TRUE	0.834	66.000	0.267	NA		NA
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5695200	5695201	SPH_0347	SPH_0348	rpsM	rpsK	TRUE	0.997	18.000	0.810	0.026	Y	NA
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5695311	5695312	SPH_0462	SPH_0463			TRUE	0.901	1.000	0.000	NA		NA
5695312	5695313	SPH_0463	SPH_0464			TRUE	0.949	28.000	0.154	NA		NA
5695313	5695314	SPH_0464	SPH_0465			TRUE	0.774	65.000	0.154	1.000		NA
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5695448	5695449	SPH_0602	SPH_0603		rpoE	FALSE	0.116	128.000	0.000	1.000	N	NA
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5695454	5695455	SPH_0608	SPH_0609	pgk		FALSE	0.165	136.000	0.002	NA		NA
5695455	5695456	SPH_0609	SPH_0610			TRUE	0.681	77.000	0.154	NA		NA
5695456	5695457	SPH_0610	SPH_0611		glnA	TRUE	0.940	37.000	0.179	1.000	N	NA
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5695466	5695467	SPH_0620	SPH_0621			FALSE	0.134	107.000	0.000	NA		NA
5695467	5695468	SPH_0621	SPH_0622		hrcA	FALSE	0.145	164.000	0.003	NA		NA
5695468	5695469	SPH_0622	SPH_0623	hrcA	grpE	TRUE	0.919	27.000	0.051	1.000	N	NA
5695469	5695470	SPH_0623	SPH_0624	grpE	dnaK	FALSE	0.166	480.000	0.026	0.006	Y	NA
5695470	5695471	SPH_0624	SPH_0625	dnaK	dnaJ	FALSE	0.251	760.000	0.196	0.003	Y	NA
5695472	5695473	SPH_0626	SPH_0627			TRUE	0.959	10.000	0.063	NA		NA
5695474	5695475	SPH_0628	SPH_0629			TRUE	0.985	-3.000	0.167	NA	N	NA
5695477	5695478	SPH_0631	SPH_0632			TRUE	0.991	5.000	0.500	NA		NA
5695478	5695479	SPH_0632	SPH_0633			TRUE	0.996	14.000	0.444	NA	Y	NA
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5695960	5695961	SPH_1123	SPH_1124	prfA	hemK	TRUE	0.993	0.000	0.084	1.000	Y	NA
5695961	5695962	SPH_1124	SPH_1125	hemK		TRUE	0.979	-16.000	0.029	NA	Y	NA
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5695964	5695965	SPH_1127	SPH_1128	glyA		TRUE	0.969	8.000	0.103	NA		NA
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5695967	5695968	SPH_1130	SPH_1131		rumA	TRUE	0.506	74.000	0.019	NA		NA
5695968	5695969	SPH_1131	SPH_1132	rumA		FALSE	0.020	749.000	0.000	1.000	N	NA
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5695973	5695974	SPH_1136	SPH_1137			TRUE	0.996	0.000	0.250	1.000	Y	NA
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5696033	5696034	SPH_1198	SPH_1199		rpmA	TRUE	0.992	17.000	0.203	NA	Y	NA
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5696041	5696042	SPH_1207	SPH_1208			TRUE	0.947	3.000	0.019	1.000		NA
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5696043	5696044	SPH_1209	SPH_1210		ligA	FALSE	0.264	93.000	0.002	NA		NA
5696044	5696045	SPH_1210	SPH_1211	ligA	pulA	FALSE	0.219	112.000	0.002	1.000	N	NA
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5696091	5696092	SPH_1259	SPH_1260			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
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5696094	5696095	SPH_1262	SPH_1263			TRUE	0.898	0.000	0.000	1.000		NA
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5696096	5696097	SPH_1264	SPH_1265			FALSE	0.052	239.000	0.000	NA		NA
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5696100	5696101	SPH_1269	SPH_1270			FALSE	0.068	177.000	0.000	1.000		NA
5696101	5696102	SPH_1270	SPH_1271			FALSE	0.119	120.000	0.000	NA		NA
5696102	5696103	SPH_1271	SPH_1272			TRUE	0.945	4.000	0.015	NA		NA
5696103	5696104	SPH_1272	SPH_1273			FALSE	0.033	329.000	0.000	NA		NA
5696104	5696105	SPH_1273	SPH_1274			TRUE	0.966	-13.000	0.148	1.000		NA
5696105	5696106	SPH_1274	SPH_1275			TRUE	0.914	16.000	0.002	1.000	N	NA
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5696108	5696109	SPH_1278	SPH_1279			FALSE	0.274	162.000	0.000	0.062	Y	NA
5696110	5696111	SPH_1280	SPH_1281			FALSE	0.041	285.000	0.000	1.000	N	NA
5696111	5696112	SPH_1281	SPH_1282			TRUE	0.928	13.000	0.005	1.000	N	NA
5696112	5696113	SPH_1282	SPH_1283		ung	TRUE	0.985	10.000	0.043	1.000	Y	NA
5696113	5696114	SPH_1283	SPH_1284	ung		TRUE	0.630	62.000	0.024	1.000		NA
5696114	5696115	SPH_1284	SPH_1285			FALSE	0.113	125.000	0.000	NA		NA
5696115	5696116	SPH_1285	SPH_1286			FALSE	0.031	351.000	0.000	NA		NA
5696116	5696117	SPH_1286	SPH_1287			TRUE	0.950	22.000	0.000	1.000	Y	NA
5696117	5696118	SPH_1287	SPH_1288			FALSE	0.103	135.000	0.000	NA		NA
5696118	5696119	SPH_1288	SPH_1289			FALSE	0.076	172.000	0.000	NA		NA
5696119	5696120	SPH_1289	SPH_1290			FALSE	0.019	582.000	0.000	1.000		NA
5696120	5696121	SPH_1290	SPH_1291			TRUE	0.986	0.000	0.211	1.000		NA
5696121	5696122	SPH_1291	SPH_1292		dhaK1	TRUE	0.990	22.000	0.316	0.002	Y	NA
5696123	5696124	SPH_1293	SPH_1294		dhaK2	TRUE	0.994	-3.000	0.625	1.000		NA
5696125	5696126	SPH_1295	SPH_1296			TRUE	0.693	58.000	0.022	NA		NA
5696126	5696127	SPH_1296	SPH_1297		ptsP	FALSE	0.243	134.000	0.022	NA		NA
5696127	5696128	SPH_1297	SPH_1298	ptsP		TRUE	0.992	15.000	0.240	0.019	Y	NA
5696129	5696130	SPH_1299	SPH_1300			TRUE	0.843	81.000	0.562	1.000	N	NA
5696130	5696131	SPH_1300	SPH_1301			TRUE	0.747	188.000	0.500	0.001	Y	NA
5696131	5696132	SPH_1301	SPH_1302			FALSE	0.232	182.000	0.056	1.000	N	NA
5696133	5696134	SPH_1303	SPH_1304		lacG2	TRUE	0.965	43.000	0.500	NA		NA
5696134	5696135	SPH_1304	SPH_1305	lacG2		TRUE	0.588	215.000	0.200	1.000	Y	NA
5696135	5696136	SPH_1305	SPH_1306			TRUE	0.998	0.000	0.600	0.019	Y	NA
5696136	5696137	SPH_1306	SPH_1307			TRUE	0.973	36.000	0.500	1.000		NA
5696137	5696138	SPH_1307	SPH_1308		lacD	FALSE	0.049	234.000	0.000	1.000		NA
5696138	5696139	SPH_1308	SPH_1309	lacD	lacC	TRUE	0.998	2.000	0.800	0.001	Y	NA
5696139	5696140	SPH_1309	SPH_1310	lacC	lacB	TRUE	0.996	11.000	0.500	1.000	Y	NA
5696140	5696141	SPH_1310	SPH_1311	lacB	lacA	TRUE	0.986	31.000	0.333	0.001	Y	NA
5696141	5696142	SPH_1311	SPH_1312	lacA		FALSE	0.081	157.000	0.000	1.000		NA
5696142	5696143	SPH_1312	SPH_1313			FALSE	0.072	169.000	0.000	1.000		NA
5696143	5696144	SPH_1313	SPH_1314			FALSE	0.095	142.000	0.000	NA		NA
5696144	5696145	SPH_1314	SPH_1315			TRUE	0.862	8.000	0.000	NA		NA
5696145	5696146	SPH_1315	SPH_1316			TRUE	0.683	38.000	0.000	NA		NA
5696148	5696149	SPH_1318	SPH_1319	lepA		TRUE	0.333	79.000	0.002	1.000		NA
5696149	5696150	SPH_1319	SPH_1320		recN	TRUE	0.938	2.000	0.005	1.000		NA
5696150	5696151	SPH_1320	SPH_1321	recN		TRUE	0.954	7.000	0.037	1.000	N	NA
5696151	5696152	SPH_1321	SPH_1322		tylA	TRUE	0.964	-7.000	0.048	1.000	N	NA
5696152	5696153	SPH_1322	SPH_1323	tylA		TRUE	0.967	-7.000	0.058	1.000	N	NA
5696153	5696154	SPH_1323	SPH_1324		xseB	TRUE	0.979	-3.000	0.100	1.000	N	NA
5696154	5696155	SPH_1324	SPH_1325	xseB	xseA	TRUE	0.992	-22.000	0.412	0.001	Y	NA
5696155	5696156	SPH_1325	SPH_1326	xseA	udk	FALSE	0.193	128.000	0.002	1.000	N	NA
5696156	5696157	SPH_1326	SPH_1327	udk		FALSE	0.133	108.000	0.000	NA		NA
5696157	5696158	SPH_1327	SPH_1328		truB	FALSE	0.051	241.000	0.000	NA		NA
5696158	5696159	SPH_1328	SPH_1329	truB		TRUE	0.936	10.000	0.014	NA		NA
5696159	5696160	SPH_1329	SPH_1330			FALSE	0.157	96.000	0.000	NA		NA
5696160	5696161	SPH_1330	SPH_1332			FALSE	0.093	148.000	0.000	NA		NA
5696161	5696162	SPH_1332	SPH_1333			FALSE	0.058	244.000	0.000	NA	N	NA
5696162	5696163	SPH_1333	SPH_1334		gyrA	TRUE	0.963	0.000	0.013	NA	N	NA
5696165	5696166	SPH_1336	SPH_1337			TRUE	0.587	47.000	0.000	NA		NA
5696166	5696167	SPH_1337	SPH_1338			TRUE	0.991	2.000	0.400	NA		NA
5696167	5696168	SPH_1338	SPH_1339			FALSE	0.172	91.000	0.000	NA		NA
5696168	5696169	SPH_1339	SPH_1340			TRUE	0.961	2.000	0.038	1.000		NA
5696169	5696170	SPH_1340	SPH_1341			TRUE	0.997	-7.000	0.597	0.010	Y	NA
5696170	5696171	SPH_1341	SPH_1342		mutY	TRUE	0.648	55.000	0.002	1.000	N	NA
5696171	5696172	SPH_1342	SPH_1343	mutY		FALSE	0.203	84.000	0.000	NA		NA
5696172	5696173	SPH_1343	SPH_1344		fhs	TRUE	0.854	11.000	0.000	NA		NA
5696174	5696175	SPH_1345	SPH_1346	coaB	coaC	TRUE	0.933	12.000	0.013	1.000		NA
5696175	5696176	SPH_1346	SPH_1347	coaC		TRUE	0.921	-16.000	0.019	NA		NA
5696176	5696177	SPH_1347	SPH_1348			FALSE	0.120	264.000	0.026	NA		NA
5696177	5696178	SPH_1348	SPH_1350			TRUE	0.969	12.000	0.107	NA		NA
5696179	5696180	SPH_1349	SPH_1351			TRUE	0.498	74.000	0.021	1.000		NA
5696180	5696181	SPH_1351	SPH_1352			TRUE	0.860	-34.000	0.014	0.010		NA
5696181	5696182	SPH_1352	SPH_1353		uvrB	TRUE	0.915	10.000	0.002	1.000	N	NA
5696182	5696183	SPH_1353	SPH_1355	uvrB		FALSE	0.252	77.000	0.000	NA		NA
5696184	5696185	SPH_1356	SPH_1357			TRUE	0.997	0.000	0.326	1.000	Y	NA
5696185	5696186	SPH_1357	SPH_1358		zwf	FALSE	0.225	149.000	0.021	1.000	N	NA
5696187	5696188	SPH_1359	SPH_1360			TRUE	0.918	4.000	0.005	0.069		NA
5696188	5696189	SPH_1360	SPH_1361			TRUE	0.974	0.000	0.103	0.016		NA
5696189	5696190	SPH_1361	SPH_1362		smc	TRUE	0.947	-3.000	0.006	1.000		NA
5696190	5696191	SPH_1362	SPH_1363	smc	rnc	TRUE	0.974	-9.000	0.120	1.000	N	NA
5696191	5696192	SPH_1363	SPH_1364	rnc		FALSE	0.072	179.000	0.000	NA		NA
5696192	5696193	SPH_1364	SPH_1365		guaC	TRUE	0.380	63.000	0.000	NA		NA
5696193	5696194	SPH_1365	SPH_1366	guaC		FALSE	0.159	103.000	0.000	NA	N	NA
5696194	5696195	SPH_1366	SPH_1367			TRUE	0.996	-13.000	0.467	NA	Y	NA
5696195	5696196	SPH_1367	SPH_1368			FALSE	0.081	165.000	0.000	NA		NA
5696196	5696197	SPH_1368	SPH_1369			TRUE	0.856	-10.000	0.000	NA		NA
5696197	5696198	SPH_1369	SPH_1370			FALSE	0.146	100.000	0.000	NA		NA
5696198	5696199	SPH_1370	SPH_1371			FALSE	0.058	219.000	0.000	NA		NA
5696199	5696200	SPH_1371	SPH_1372			TRUE	0.873	4.000	0.000	NA		NA
5696200	5696201	SPH_1372	SPH_1373		leuB	TRUE	0.952	-3.000	0.007	NA		NA
5696201	5696202	SPH_1373	SPH_1374	leuB		TRUE	0.950	12.000	0.041	1.000		NA
5696202	5696203	SPH_1374	SPH_1375			TRUE	0.832	19.000	0.000	NA		NA
5696203	5696204	SPH_1375	SPH_1376			TRUE	0.838	44.000	0.040	NA		NA
5696204	5696205	SPH_1376	SPH_1377			TRUE	0.336	93.000	0.015	NA		NA
5696205	5696206	SPH_1377	SPH_1378		topA	FALSE	0.136	106.000	0.000	NA		NA
5696206	5696207	SPH_1378	SPH_1379	topA		FALSE	0.080	167.000	0.000	NA		NA
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5696208	5696209	SPH_1380	SPH_1381			FALSE	0.243	78.000	0.000	NA		NA
5696209	5696210	SPH_1381	SPH_1382		dprA	FALSE	0.020	652.000	0.000	NA		NA
5696210	5696211	SPH_1382	SPH_1383	dprA		FALSE	0.231	106.000	0.002	1.000	N	NA
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5696212	5696213	SPH_1384	SPH_1385			TRUE	0.992	-10.000	0.667	NA		NA
5696213	5696214	SPH_1385	SPH_1386			TRUE	0.962	17.000	0.074	NA	N	NA
5696214	5696215	SPH_1386	SPH_1387			TRUE	0.988	5.000	0.367	1.000	N	NA
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5696217	5696218	SPH_1389	SPH_1390			TRUE	0.889	2.000	0.000	NA		NA
5696219	5696220	SPH_1391	SPH_1392	carB	carA	TRUE	0.332	313.000	0.117	0.001	Y	NA
5696220	5696221	SPH_1392	SPH_1393	carA	pyrB	TRUE	0.919	50.000	0.014	1.000	Y	NA
5696221	5696222	SPH_1393	SPH_1394	pyrB		TRUE	0.992	19.000	0.247	1.000	Y	NA
5696222	5696223	SPH_1394	SPH_1395		nth	FALSE	0.066	211.000	0.000	1.000	N	NA
5696223	5696224	SPH_1395	SPH_1396	nth		TRUE	0.945	0.000	0.002	NA		NA
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5696227	5696228	SPH_1399	SPH_1400			TRUE	0.984	2.000	0.222	NA		NA
5696230	5696231	SPH_1402	SPH_1403			FALSE	0.216	82.000	0.000	NA		NA
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5696238	5696239	SPH_1410	SPH_1411			FALSE	0.050	245.000	0.000	NA		NA
5696239	5696240	SPH_1411	SPH_1412			TRUE	0.849	15.000	0.000	NA		NA
5696240	5696241	SPH_1412	SPH_1413			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
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5696242	5696243	SPH_1414	SPH_1415			TRUE	0.813	-16.000	0.000	NA		NA
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5696244	5696245	SPH_1416	SPH_1417			FALSE	0.122	117.000	0.000	NA		NA
5696247	5696248	SPH_1419	SPH_1420			TRUE	0.754	-55.000	0.000	NA		NA
5696248	5696249	SPH_1420	SPH_1421			FALSE	0.047	257.000	0.000	NA		NA
5696249	5696250	SPH_1421	SPH_1422			TRUE	0.785	23.000	0.000	NA		NA
5696250	5696251	SPH_1422	SPH_1423			FALSE	0.067	178.000	0.000	1.000		NA
5696251	5696252	SPH_1423	SPH_1424			TRUE	0.737	29.000	0.000	NA		NA
5696252	5696253	SPH_1424	SPH_1425			TRUE	0.832	19.000	0.000	NA		NA
5696253	5696254	SPH_1425	SPH_1426			TRUE	0.785	23.000	0.000	NA		NA
5696256	5696257	SPH_1428	SPH_1429	ffh		TRUE	0.973	12.000	0.151	1.000		NA
5696257	5696258	SPH_1429	SPH_1430			TRUE	0.321	91.000	0.009	NA		NA
5696259	5696260	SPH_1431	SPH_1432			TRUE	0.946	13.000	0.035	1.000		NA
5696260	5696261	SPH_1432	SPH_1433			TRUE	0.608	43.000	0.000	1.000		NA
5696262	5696263	SPH_1434	SPH_1435		rplS	TRUE	0.647	42.000	0.000	NA		NA
5696263	5696264	SPH_1435	SPH_1436	rplS		FALSE	0.219	119.000	0.004	1.000	N	NA
5696264	5696265	SPH_1436	SPH_1437			TRUE	0.993	-6.000	0.160	0.068	Y	NA
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5696266	5696267	SPH_1438	SPH_1439			FALSE	0.130	116.000	0.000	1.000	N	NA
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5696336	5696337	SPH_1508	SPH_1509	aroE	aroD	TRUE	0.966	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
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5696338	5696339	SPH_1510	SPH_1511			FALSE	0.019	685.000	0.000	NA		NA
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5696342	5696343	SPH_1514	SPH_1515	alaS		TRUE	0.895	22.000	0.006	NA		NA
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5696346	5696347	SPH_1518	SPH_1519			TRUE	0.997	-19.000	0.928	0.036	Y	NA
5696347	5696348	SPH_1519	SPH_1520		murB	FALSE	0.240	161.000	0.041	1.000	N	NA
5696348	5696349	SPH_1520	SPH_1521	murB		FALSE	0.229	112.000	0.005	NA		NA
5696349	5696350	SPH_1521	SPH_1522			TRUE	0.788	-22.000	0.000	NA		NA
5696350	5696351	SPH_1522	SPH_1523		budA	TRUE	0.951	10.000	0.042	NA		NA
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5696354	5696355	SPH_1526	SPH_1527	phoU1	pstB1	TRUE	0.996	12.000	0.413	NA	Y	NA
5696355	5696356	SPH_1527	SPH_1528	pstB1	pstB2	TRUE	0.996	13.000	0.542	0.001	Y	NA
5696356	5696357	SPH_1528	SPH_1529	pstB2	pstA1	TRUE	0.995	11.000	0.490	0.003	Y	NA
5696357	5696358	SPH_1529	SPH_1530	pstA1	pstC1	TRUE	0.998	-10.000	0.907	0.003	Y	NA
5696358	5696359	SPH_1530	SPH_1531	pstC1		TRUE	0.995	0.000	0.206	1.000	Y	NA
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5696371	5696372	SPH_1543	SPH_1544	lgt	hprK	TRUE	0.992	-7.000	0.494	1.000	N	NA
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5696377	5696378	SPH_1549	SPH_1550		nadE	FALSE	0.062	398.000	0.007	1.000	N	NA
5696378	5696379	SPH_1550	SPH_1551	nadE	pncB	TRUE	0.994	-3.000	0.194	0.003	Y	NA
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5696380	5696381	SPH_1552	SPH_1553			TRUE	0.968	-10.000	0.103	NA		NA
5696381	5696382	SPH_1553	SPH_1554			FALSE	0.028	386.000	0.000	NA		NA
5696382	5696383	SPH_1554	SPH_1555			TRUE	0.972	16.000	0.154	NA		NA
5696383	5696384	SPH_1555	SPH_1556			FALSE	0.021	507.000	0.000	1.000		NA
5696387	5696388	SPH_1560	SPH_1561			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
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5696393	5696394	SPH_1566	SPH_1567			FALSE	0.203	84.000	0.000	NA		NA
5696394	5696395	SPH_1567	SPH_1568			TRUE	0.978	2.000	0.143	1.000		NA
5696395	5696396	SPH_1568	SPH_1569			FALSE	0.138	104.000	0.000	NA		NA
5696396	5696397	SPH_1569	SPH_1570			TRUE	0.901	1.000	0.000	NA		NA
5696398	5696399	SPH_1571	SPH_1572		def1	FALSE	0.033	324.000	0.000	NA		NA
5696399	5696400	SPH_1572	SPH_1573	def1		TRUE	0.914	45.000	0.002	1.000	Y	NA
5696401	5696402	SPH_1574	SPH_1575	trxB		TRUE	0.743	66.000	0.117	NA		NA
5696402	5696403	SPH_1575	SPH_1576			TRUE	0.793	78.000	0.364	NA		NA
5696403	5696404	SPH_1576	SPH_1577			TRUE	0.997	0.000	0.310	1.000	Y	NA
5696404	5696405	SPH_1577	SPH_1578			FALSE	0.186	158.000	0.010	1.000	N	NA
5696405	5696406	SPH_1578	SPH_1579			TRUE	0.956	13.000	0.050	1.000	N	NA
5696406	5696407	SPH_1579	SPH_1580			TRUE	0.960	0.000	0.019	1.000		NA
5696408	5696409	SPH_1581	SPH_1582			TRUE	0.981	-3.000	0.146	1.000		NA
5696410	5696411	SPH_1583	SPH_1584			TRUE	0.998	1.000	0.488	NA	Y	NA
5696411	5696412	SPH_1584	SPH_1585			FALSE	0.159	152.000	0.005	1.000		NA
5696413	5696414	SPH_1586	SPH_1587			TRUE	0.859	60.000	0.243	NA		NA
5696414	5696415	SPH_1587	SPH_1588			TRUE	0.990	19.000	0.588	NA		NA
5696416	5696417	SPH_1589	SPH_1590		glyS	TRUE	0.832	42.000	0.020	NA		NA
5696417	5696418	SPH_1590	SPH_1591	glyS	glyQ	TRUE	0.767	212.000	0.651	0.001	Y	NA
5696418	5696419	SPH_1591	SPH_1592	glyQ		FALSE	0.122	194.000	0.003	NA		NA
5696419	5696420	SPH_1592	SPH_1593			FALSE	0.042	273.000	0.000	NA		NA
5696420	5696421	SPH_1593	SPH_1594			FALSE	0.117	114.000	0.000	1.000		NA
5696421	5696422	SPH_1594	SPH_1595			FALSE	0.038	289.000	0.000	NA		NA
5696423	5696424	SPH_1596	SPH_1597			TRUE	0.984	-3.000	0.200	1.000		NA
5696425	5696426	SPH_1598	SPH_1599			TRUE	0.752	-112.000	0.000	NA		NA
5696426	5696427	SPH_1599	SPH_1600			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5696427	5696428	SPH_1600	SPH_1601		tuf	FALSE	0.029	384.000	0.000	NA		NA
5696428	5696429	SPH_1601	SPH_1602	tuf		FALSE	0.031	343.000	0.000	NA		NA
5696429	5696430	SPH_1602	SPH_1603			FALSE	0.025	446.000	0.000	NA		NA
5696430	5696431	SPH_1603	SPH_1604			FALSE	0.052	224.000	0.000	1.000		NA
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5696440	5696441	SPH_1613	SPH_1614			TRUE	0.990	10.000	0.130	1.000	Y	NA
5696441	5696442	SPH_1614	SPH_1615			FALSE	0.192	146.000	0.013	1.000		NA
5696442	5696443	SPH_1615	SPH_1616			TRUE	0.984	-10.000	0.324	NA		NA
5696445	5696446	SPH_1618	SPH_1619	atpC	atpD	TRUE	0.998	11.000	0.837	0.006	Y	NA
5696446	5696447	SPH_1619	SPH_1620	atpD	atpG	TRUE	0.932	86.000	0.724	0.006	Y	NA
5696447	5696448	SPH_1620	SPH_1621	atpG	atpA	TRUE	0.997	16.000	0.846	0.006	Y	NA
5696448	5696449	SPH_1621	SPH_1622	atpA	atpH	TRUE	0.998	15.000	0.864	0.006	Y	NA
5696449	5696450	SPH_1622	SPH_1623	atpH	atpF	TRUE	0.995	0.000	0.222	0.006	Y	NA
5696450	5696451	SPH_1623	SPH_1624	atpF	atpB	TRUE	0.981	14.000	0.032	0.008	Y	NA
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5696459	5696460	SPH_1632	SPH_1633		murC	TRUE	0.932	10.000	0.014	1.000		NA
5696460	5696461	SPH_1633	SPH_1634	murC		TRUE	0.934	11.000	0.013	NA		NA
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5696474	5696475	SPH_1649	SPH_1650			TRUE	0.977	-10.000	0.209	1.000		NA
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5696476	5696477	SPH_1651	SPH_1652			TRUE	0.954	-25.000	0.151	1.000		NA
5696477	5696478	SPH_1652	SPH_1653		rpsR	FALSE	0.034	294.000	0.000	1.000		NA
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5696495	5696496	SPH_1670	SPH_1671		dapB	TRUE	0.941	12.000	0.015	1.000	N	NA
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5696507	5696508	SPH_1682	SPH_1683		clpX	TRUE	0.951	9.000	0.043	1.000		NA
5696508	5696509	SPH_1683	SPH_1684	clpX		TRUE	0.618	61.000	0.012	NA		NA
5696509	5696510	SPH_1684	SPH_1685		folA	TRUE	0.966	0.000	0.030	NA		NA
5696510	5696511	SPH_1685	SPH_1686	folA		FALSE	0.206	130.000	0.005	1.000	N	NA
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5696512	5696513	SPH_1687	SPH_1688		tpiA	FALSE	0.279	71.000	0.000	1.000		NA
5696513	5696514	SPH_1688	SPH_1689	tpiA		FALSE	0.304	98.000	0.007	NA	N	NA
5696514	5696515	SPH_1689	SPH_1690		metA	TRUE	0.949	9.000	0.021	NA	N	NA
5696515	5696516	SPH_1690	SPH_1691	metA	apt	FALSE	0.153	182.000	0.009	1.000	N	NA
5696516	5696517	SPH_1691	SPH_1692	apt		FALSE	0.305	87.000	0.002	1.000	N	NA
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5696520	5696521	SPH_1695	SPH_1696			FALSE	0.221	81.000	0.000	NA		NA
5696521	5696522	SPH_1696	SPH_1697		codY	TRUE	0.978	0.000	0.083	1.000	N	NA
5696522	5696523	SPH_1697	SPH_1698	codY		FALSE	0.182	265.000	0.000	1.000	Y	NA
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5696734	5696735	SPH_1911	SPH_1912			TRUE	0.938	96.000	0.917	0.034	Y	NA
5696735	5696736	SPH_1912	SPH_1913			TRUE	0.606	127.000	0.364	1.000	N	NA
5696736	5696737	SPH_1913	SPH_1914			FALSE	0.030	362.000	0.000	NA		NA
5696738	5696739	SPH_1915	SPH_1916			FALSE	0.203	84.000	0.000	NA		NA
5696739	5696740	SPH_1916	SPH_1917			TRUE	0.973	12.000	0.143	NA		NA
5696740	5696741	SPH_1917	SPH_1918			TRUE	0.868	39.000	0.036	NA		NA
5696741	5696742	SPH_1918	SPH_1919			TRUE	0.990	31.000	1.000	NA		NA
5696743	5696744	SPH_1920	SPH_1921			FALSE	0.024	464.000	0.000	NA		NA
5696744	5696745	SPH_1921	SPH_1922			FALSE	0.065	201.000	0.000	NA		NA
5696745	5696746	SPH_1922	SPH_1923			TRUE	0.849	15.000	0.000	NA		NA
5696746	5696747	SPH_1923	SPH_1924			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5696747	5696748	SPH_1924	SPH_1925			FALSE	0.035	323.000	0.000	1.000	N	NA
5696748	5696749	SPH_1925	SPH_1926			TRUE	0.996	10.000	0.500	0.017	Y	NA
5696749	5696750	SPH_1926	SPH_1927			TRUE	0.995	17.000	0.429	0.017	Y	NA
5696750	5696751	SPH_1927	SPH_1928			TRUE	0.838	15.000	0.000	1.000		NA
5696751	5696752	SPH_1928	SPH_1929			TRUE	0.867	3.000	0.000	1.000		NA
5696756	5696757	SPH_1932	SPH_1934	trpA	trpB	TRUE	0.994	-7.000	0.248	0.001	Y	NA
5696757	5696758	SPH_1934	SPH_1935	trpB	trpF	TRUE	0.991	-22.000	0.375	0.002	Y	NA
5696758	5696759	SPH_1935	SPH_1936	trpF	trpC	TRUE	0.991	-13.000	0.264	0.002	Y	NA
5696759	5696760	SPH_1936	SPH_1937	trpC	trpD	TRUE	0.995	-3.000	0.216	1.000	Y	NA
5696760	5696761	SPH_1937	SPH_1938	trpD		TRUE	0.982	11.000	0.018	1.000	Y	NA
5696761	5696762	SPH_1938	SPH_1939		trpE	TRUE	0.996	-3.000	0.321	0.001	Y	NA
5696762	5696763	SPH_1939	SPH_1940	trpE		FALSE	0.030	372.000	0.000	NA		NA
5696763	5696764	SPH_1940	SPH_1941			FALSE	0.021	608.000	0.000	NA		NA
5696764	5696765	SPH_1941	SPH_1942			FALSE	0.039	285.000	0.000	NA		NA
5696765	5696766	SPH_1942	SPH_1943			FALSE	0.157	96.000	0.000	NA		NA
5696766	5696767	SPH_1943	SPH_1944			TRUE	0.833	3.000	0.000	0.061		NA
5696767	5696768	SPH_1944	SPH_1945			TRUE	0.990	12.000	0.545	0.033	N	NA
5696768	5696769	SPH_1945	SPH_1946			TRUE	0.634	103.000	0.364	0.033	N	NA
5696769	5696770	SPH_1946	SPH_1947			TRUE	0.752	25.000	0.000	1.000		NA
5696770	5696771	SPH_1947	SPH_1948			FALSE	0.110	128.000	0.000	NA		NA
5696771	5696772	SPH_1948	SPH_1949			FALSE	0.023	503.000	0.000	NA		NA
5696772	5696773	SPH_1949	SPH_1950			TRUE	0.813	-16.000	0.000	NA		NA
5696773	5696774	SPH_1950	SPH_1951			FALSE	0.018	754.000	0.000	NA		NA
5696774	5696775	SPH_1951	SPH_1952			FALSE	0.039	284.000	0.000	NA		NA
5696775	5696776	SPH_1952	SPH_1953			TRUE	0.985	43.000	0.382	NA	Y	NA
5696776	5696777	SPH_1953	SPH_1954			FALSE	0.192	173.000	0.018	NA	N	NA
5696777	5696778	SPH_1954	SPH_1955			TRUE	0.998	-10.000	0.911	0.005	Y	NA
5696778	5696779	SPH_1955	SPH_1956			FALSE	0.152	206.000	0.018	NA		NA
5696779	5696780	SPH_1956	SPH_1957			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5696780	5696781	SPH_1957	SPH_1958			TRUE	0.765	-40.000	0.000	NA		NA
5696782	5696783	SPH_1959	SPH_1960	xth		TRUE	0.858	12.000	0.000	NA		NA
5696783	5696784	SPH_1960	SPH_1961			TRUE	0.863	7.000	0.000	NA		NA
5696784	5696785	SPH_1961	SPH_1962		xpt	FALSE	0.017	878.000	0.000	NA		NA
5696785	5696786	SPH_1962	SPH_1963	xpt		TRUE	0.991	0.000	0.046	1.000	Y	NA
5696787	5696788	SPH_1964	SPH_1965			TRUE	0.980	-13.000	0.347	0.055		NA
5696788	5696789	SPH_1965	SPH_1966			TRUE	0.971	26.000	0.058	0.005	Y	NA
5696789	5696790	SPH_1966	SPH_1967			FALSE	0.211	157.000	0.015	NA	N	NA
5696790	5696791	SPH_1967	SPH_1968		galT	TRUE	0.580	70.000	0.024	NA	N	NA
5696791	5696792	SPH_1968	SPH_1969	galT	galK	TRUE	0.985	19.000	0.107	0.001	Y	NA
5696794	5696795	SPH_1971	SPH_1972			TRUE	0.907	1.000	0.000	1.000	N	NA
5696795	5696796	SPH_1972	SPH_1973			FALSE	0.053	244.000	0.000	1.000	N	NA
5696798	5696799	SPH_1975	SPH_1976			FALSE	0.077	171.000	0.000	NA		NA
5696799	5696800	SPH_1976	SPH_1977			TRUE	0.449	58.000	0.000	NA		NA
5696800	5696801	SPH_1977	SPH_1978			TRUE	0.990	-7.000	0.382	1.000	N	NA
5696801	5696802	SPH_1978	SPH_1979			TRUE	0.945	15.000	0.031	NA		NA
5696802	5696803	SPH_1979	SPH_1980			TRUE	0.982	4.000	0.222	NA		NA
5696803	5696804	SPH_1980	SPH_1981			FALSE	0.020	677.000	0.000	NA		NA
5696804	5696805	SPH_1981	SPH_1982		pepA	TRUE	0.799	22.000	0.000	NA		NA
5696806	5696807	SPH_1983	SPH_1984			FALSE	0.086	159.000	0.000	NA		NA
5696807	5696808	SPH_1984	SPH_1985			FALSE	0.026	423.000	0.000	NA		NA
5696808	5696809	SPH_1985	SPH_1986			TRUE	0.998	-10.000	0.870	0.033	Y	NA
5696809	5696810	SPH_1986	SPH_1987			TRUE	0.999	-3.000	0.870	1.000	Y	NA
5696810	5696811	SPH_1987	SPH_1988			TRUE	0.700	96.000	0.055	1.000	Y	NA
5696812	5696813	SPH_1989	SPH_1990		rluB	TRUE	0.960	0.000	0.014	NA		NA
5696813	5696814	SPH_1990	SPH_1991	rluB	scpB	TRUE	0.978	-13.000	0.224	NA	N	NA
5696814	5696815	SPH_1991	SPH_1992	scpB		TRUE	0.989	19.000	0.570	NA		NA
5696815	5696816	SPH_1992	SPH_1993			TRUE	0.947	0.000	0.003	NA		NA
5696816	5696817	SPH_1993	SPH_1994			TRUE	0.941	-9.000	0.017	1.000		NA
5696817	5696818	SPH_1994	SPH_1995			TRUE	0.973	-3.000	0.065	NA		NA
5696818	5696819	SPH_1995	SPH_1996			TRUE	0.943	-24.000	0.085	NA		NA
5696819	5696820	SPH_1996	SPH_1997		murI	TRUE	0.967	-3.000	0.034	1.000	N	NA
5696820	5696821	SPH_1997	SPH_1998	murI		FALSE	0.145	207.000	0.014	NA		NA
5696821	5696822	SPH_1998	SPH_1999		treC	FALSE	0.047	256.000	0.000	NA		NA
5696822	5696823	SPH_1999	SPH_2000	treC	treP	TRUE	0.830	178.000	0.650	1.000	Y	NA
5696824	5696825	SPH_2001	SPH_2002	treR		FALSE	0.089	155.000	0.000	NA		NA
5696825	5696826	SPH_2002	SPH_2003			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5696826	5696827	SPH_2003	SPH_2004			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5696828	5696829	SPH_2005	SPH_2006			TRUE	0.994	11.000	0.333	0.001	Y	NA
5696829	5696830	SPH_2006	SPH_2007			TRUE	0.997	9.000	0.650	1.000	Y	NA
5696830	5696831	SPH_2007	SPH_2008			TRUE	0.987	0.000	0.278	0.033		NA
5696831	5696832	SPH_2008	SPH_2009			TRUE	0.893	67.000	0.600	0.033		NA
5696832	5696833	SPH_2009	SPH_2010			FALSE	0.021	829.000	0.000	NA	N	NA
5696833	5696834	SPH_2010	SPH_2011			FALSE	0.112	138.000	0.000	NA	N	NA
5696834	5696835	SPH_2011	SPH_2012			FALSE	0.304	311.000	0.050	1.000	Y	NA
5696835	5696836	SPH_2012	SPH_2013			TRUE	0.998	14.000	0.925	0.033	Y	NA
5696836	5696837	SPH_2013	SPH_2014			TRUE	0.993	14.000	0.275	0.033	Y	NA
5696837	5696838	SPH_2014	SPH_2015			TRUE	0.858	92.000	0.286	1.000	Y	NA
5696839	5696840	SPH_2016	SPH_2017			TRUE	0.905	-3.000	0.000	1.000	N	NA
5696840	5696841	SPH_2017	SPH_2018			FALSE	0.049	251.000	0.000	NA		NA
5696841	5696842	SPH_2018	SPH_2019			TRUE	0.867	-9.000	0.000	NA		NA
5696843	5696844	SPH_2020	SPH_2021			TRUE	0.889	2.000	0.000	NA		NA
5696844	5696845	SPH_2021	SPH_2022			TRUE	0.719	32.000	0.000	NA		NA
5696845	5696846	SPH_2022	SPH_2023			TRUE	0.844	17.000	0.000	NA		NA
5696846	5696847	SPH_2023	SPH_2024			TRUE	0.901	1.000	0.000	NA		NA
5696847	5696848	SPH_2024	SPH_2025			TRUE	0.854	11.000	0.000	NA		NA
5696848	5696849	SPH_2025	SPH_2026			TRUE	0.863	7.000	0.000	NA		NA
5696849	5696850	SPH_2026	SPH_2027			TRUE	0.859	9.000	0.000	NA		NA
5696850	5696851	SPH_2027	SPH_2028			TRUE	0.901	1.000	0.000	NA		NA
5696851	5696852	SPH_2028	SPH_2029			TRUE	0.858	12.000	0.000	NA		NA
5696852	5696853	SPH_2029	SPH_2030			TRUE	0.863	7.000	0.000	NA		NA
5696853	5696854	SPH_2030	SPH_2031			TRUE	0.868	5.000	0.000	NA		NA
5696854	5696855	SPH_2031	SPH_2032			TRUE	0.822	20.000	0.000	NA		NA
5696855	5696856	SPH_2032	SPH_2033			TRUE	0.849	15.000	0.000	NA		NA
5696856	5696857	SPH_2033	SPH_2034			TRUE	0.889	2.000	0.000	NA		NA
5696857	5696858	SPH_2034	SPH_2035			TRUE	0.799	22.000	0.000	NA		NA
5696858	5696859	SPH_2035	SPH_2036		rrf	TRUE	0.868	5.000	0.000	NA		NA
5696859	5696860	SPH_2036	SPH_2037	rrf	rrl2	FALSE	0.252	77.000	0.000	NA		NA
5696860	5696861	SPH_2037	SPH_2039	rrl2		FALSE	0.117	121.000	0.000	NA		NA
5696861	5696862	SPH_2039	SPH_2040		rrs2	FALSE	0.099	138.000	0.000	NA		NA
5696862	5696863	SPH_2040	SPH_2041	rrs2		FALSE	0.042	275.000	0.000	NA		NA
5696863	5696864	SPH_2041	SPH_2042			TRUE	0.558	50.000	0.000	NA		NA
5696865	5696866	SPH_2044	SPH_2045			TRUE	0.385	89.000	0.025	NA		NA
5696868	5696869	SPH_2047	SPH_2048			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5696869	5696870	SPH_2048	SPH_2049			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5696871	5696872	SPH_2050	SPH_2051	groL	groS	TRUE	0.990	16.000	0.160	0.096	Y	NA
5696872	5696873	SPH_2051	SPH_2052	groS		FALSE	0.173	270.000	0.083	1.000	N	NA
5696873	5696874	SPH_2052	SPH_2053			FALSE	0.236	77.000	0.000	1.000		NA
5696874	5696875	SPH_2053	SPH_2054			TRUE	0.864	33.000	0.020	1.000		NA
5696875	5696876	SPH_2054	SPH_2055			TRUE	0.978	16.000	0.239	1.000		NA
5696876	5696877	SPH_2055	SPH_2056			TRUE	0.981	-3.000	0.140	NA		NA
5696877	5696878	SPH_2056	SPH_2057			FALSE	0.019	682.000	0.000	NA		NA
5696878	5696879	SPH_2057	SPH_2058			TRUE	0.993	6.000	0.714	NA		NA
5696879	5696880	SPH_2058	SPH_2059			TRUE	0.348	114.000	0.053	NA		NA
5696880	5696881	SPH_2059	SPH_2060			TRUE	0.900	-3.000	0.000	NA		NA
5696881	5696882	SPH_2060	SPH_2061			TRUE	0.350	66.000	0.000	NA		NA
5696882	5696883	SPH_2061	SPH_2062			TRUE	0.863	7.000	0.000	NA		NA
5696883	5696884	SPH_2062	SPH_2063			TRUE	0.844	17.000	0.000	NA		NA
5696884	5696885	SPH_2063	SPH_2064			FALSE	0.190	124.000	0.002	NA		NA
5696885	5696886	SPH_2064	SPH_2065			FALSE	0.017	881.000	0.000	NA		NA
5696886	5696887	SPH_2065	SPH_2066			TRUE	0.854	11.000	0.000	NA		NA
5696887	5696888	SPH_2066	SPH_2067			FALSE	0.297	71.000	0.000	NA		NA
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5696909	5696910	SPH_2088	SPH_2089		recA	FALSE	0.038	307.000	0.000	1.000	N	NA
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5696930	5696931	SPH_2109	SPH_2110			FALSE	0.172	91.000	0.000	NA		NA
5696931	5696932	SPH_2110	SPH_2111		coaD	TRUE	0.899	-16.000	0.003	1.000	N	NA
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5696933	5696934	SPH_2112	SPH_2113		asnA	TRUE	0.562	65.000	0.006	1.000	N	NA
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5696940	5696941	SPH_2119	SPH_2120		purR	TRUE	0.558	67.000	0.012	1.000	N	NA
5696941	5696942	SPH_2120	SPH_2121	purR		FALSE	0.136	267.000	0.052	1.000		NA
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5696944	5696945	SPH_2123	SPH_2124		rpe	TRUE	0.958	-37.000	0.166	1.000	N	NA
5696945	5696946	SPH_2124	SPH_2125	rpe	rsgA	TRUE	0.977	11.000	0.213	1.000		NA
5696946	5696947	SPH_2125	SPH_2126	rsgA	ksgA	TRUE	0.933	2.000	0.003	1.000		NA
5696947	5696948	SPH_2126	SPH_2127	ksgA		FALSE	0.106	131.000	0.000	NA		NA
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5696951	5696952	SPH_2130	SPH_2131			FALSE	0.034	314.000	0.000	NA		NA
5696952	5696953	SPH_2131	SPH_2132			FALSE	0.270	72.000	0.000	1.000		NA
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5696962	5696963	SPH_2140	SPH_2142		ccpA	TRUE	0.373	64.000	0.000	NA		NA
5696963	5696964	SPH_2142	SPH_2143	ccpA		FALSE	0.096	425.000	0.000	0.025	Y	NA
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5696975	5696976	SPH_2154	SPH_2155			TRUE	0.889	2.000	0.000	NA		NA
5696976	5696977	SPH_2155	SPH_2156			TRUE	0.799	22.000	0.000	NA		NA
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5696978	5696979	SPH_2157	SPH_2158	rrf	rrl3	FALSE	0.252	77.000	0.000	NA		NA
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5696980	5696981	SPH_2160	SPH_2161		rrs3	FALSE	0.099	138.000	0.000	NA		NA
5696981	5696982	SPH_2161	SPH_2162	rrs3		FALSE	0.042	275.000	0.000	NA		NA
5696982	5696983	SPH_2162	SPH_2163			FALSE	0.163	94.000	0.000	NA		NA
5696983	5696984	SPH_2163	SPH_2164		nusG	FALSE	0.149	122.000	0.002	0.034		NA
5696984	5696985	SPH_2164	SPH_2165	nusG	secE	TRUE	0.966	55.000	0.843	1.000	N	NA
5696985	5696986	SPH_2165	SPH_2166	secE		FALSE	0.063	215.000	0.000	1.000	N	NA
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5696989	5696990	SPH_2169	SPH_2170			FALSE	0.019	720.000	0.000	NA		NA
5696990	5696991	SPH_2170	SPH_2171		nadC	FALSE	0.121	131.000	0.000	NA	N	NA
5696993	5696994	SPH_2173	SPH_2174			FALSE	0.021	522.000	0.000	1.000		NA
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5696999	5697000	SPH_2179	SPH_2180			FALSE	0.036	301.000	0.000	NA		NA
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5697002	5697003	SPH_2182	SPH_2183	yajC2	tkt2	FALSE	0.138	117.000	0.000	NA	N	NA
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5697011	5697012	SPH_2191	SPH_2192			FALSE	0.279	131.000	0.039	NA		NA
5697012	5697013	SPH_2192	SPH_2193			TRUE	0.724	51.000	0.008	NA		NA
5697013	5697014	SPH_2193	SPH_2194			TRUE	0.960	19.000	0.106	1.000		NA
5697014	5697015	SPH_2194	SPH_2195		rnpA	TRUE	0.928	-31.000	0.052	1.000	N	NA
5697015	5697016	SPH_2195	SPH_2196	rnpA		TRUE	0.844	17.000	0.000	NA		NA
5697016	5697017	SPH_2196	SPH_2197		ackA	TRUE	0.901	1.000	0.000	NA		NA
5697017	5697018	SPH_2197	SPH_2198	ackA		TRUE	0.873	51.000	0.130	1.000	N	NA
5697018	5697019	SPH_2198	SPH_2199			TRUE	0.405	61.000	0.000	NA		NA
5697019	5697020	SPH_2199	SPH_2200			TRUE	0.719	32.000	0.000	NA		NA
5697020	5697021	SPH_2200	SPH_2201			FALSE	0.100	137.000	0.000	NA		NA
5697021	5697022	SPH_2201	SPH_2202			TRUE	0.969	-22.000	0.232	NA		NA
5697022	5697023	SPH_2202	SPH_2203			TRUE	0.967	-37.000	0.250	NA		NA
5697023	5697024	SPH_2203	SPH_2204			TRUE	0.994	5.000	0.786	NA		NA
5697024	5697025	SPH_2204	SPH_2205			TRUE	0.968	11.000	0.110	NA		NA
5697025	5697026	SPH_2205	SPH_2206			TRUE	0.998	2.000	0.861	0.001	Y	NA
5697026	5697027	SPH_2206	SPH_2207			TRUE	0.896	116.000	0.639	1.000	Y	NA
5697027	5697028	SPH_2207	SPH_2208			TRUE	0.616	76.000	0.083	NA		NA
5697030	5697031	SPH_2210	SPH_2211		nagA	FALSE	0.219	163.000	0.030	1.000	N	NA
5697031	5697032	SPH_2211	SPH_2212	nagA		FALSE	0.095	152.000	0.000	1.000	N	NA
5697032	5697033	SPH_2212	SPH_2213		tgt	FALSE	0.249	101.000	0.003	1.000	N	NA
5697035	5697036	SPH_2215	SPH_2216			FALSE	0.047	257.000	0.000	NA		NA
5697036	5697037	SPH_2216	SPH_2217			TRUE	0.854	11.000	0.000	NA		NA
5697037	5697038	SPH_2217	SPH_2218			FALSE	0.100	137.000	0.000	NA		NA
5697038	5697039	SPH_2218	SPH_2219			FALSE	0.062	210.000	0.000	NA		NA
5697039	5697040	SPH_2219	SPH_2220			TRUE	0.320	166.000	0.133	1.000		NA
5697040	5697041	SPH_2220	SPH_2221			TRUE	0.987	4.000	0.364	1.000		NA
5697041	5697042	SPH_2221	SPH_2222		thrC	TRUE	0.603	61.000	0.006	1.000	N	NA
5697042	5697043	SPH_2222	SPH_2223	thrC		TRUE	0.436	76.000	0.003	NA	N	NA
5697043	5697044	SPH_2223	SPH_2224			FALSE	0.037	292.000	0.000	NA		NA
5697045	5697046	SPH_2225	SPH_2226			TRUE	0.800	-19.000	0.000	NA		NA
5697046	5697047	SPH_2226	SPH_2227			TRUE	0.449	58.000	0.000	NA		NA
5697047	5697048	SPH_2227	SPH_2228			FALSE	0.040	266.000	0.000	1.000		NA
5697048	5697049	SPH_2228	SPH_2229			FALSE	0.176	90.000	0.000	NA		NA
5697049	5697050	SPH_2229	SPH_2230			TRUE	0.708	34.000	0.000	NA		NA
5697050	5697051	SPH_2230	SPH_2231			FALSE	0.080	167.000	0.000	NA		NA
5697051	5697052	SPH_2231	SPH_2232			FALSE	0.062	210.000	0.000	NA		NA
5697052	5697053	SPH_2232	SPH_2233			TRUE	0.987	17.000	0.429	NA		NA
5697053	5697054	SPH_2233	SPH_2234			TRUE	0.994	4.000	0.714	NA		NA
5697054	5697055	SPH_2234	SPH_2235			TRUE	0.848	41.000	0.027	NA		NA
5697055	5697056	SPH_2235	SPH_2236			FALSE	0.059	215.000	0.000	NA		NA
5697056	5697057	SPH_2236	SPH_2237			TRUE	0.869	-7.000	0.000	1.000		NA
5697058	5697059	SPH_2238	SPH_2239			FALSE	0.053	234.000	0.000	NA		NA
5697059	5697060	SPH_2239	SPH_2240			TRUE	0.868	5.000	0.000	NA		NA
5697060	5697061	SPH_2240	SPH_2241			TRUE	0.859	9.000	0.000	NA		NA
5697061	5697062	SPH_2241	SPH_2242			TRUE	0.854	10.000	0.000	NA		NA
5697062	5697063	SPH_2242	SPH_2243			TRUE	0.859	9.000	0.000	NA		NA
5697063	5697064	SPH_2243	SPH_2244			TRUE	0.901	1.000	0.000	NA		NA
5697064	5697065	SPH_2244	SPH_2245			TRUE	0.854	11.000	0.000	NA		NA
5697065	5697066	SPH_2245	SPH_2246			FALSE	0.234	79.000	0.000	NA		NA
5697066	5697067	SPH_2246	SPH_2247			TRUE	0.730	30.000	0.000	NA		NA
5697067	5697068	SPH_2247	SPH_2248			TRUE	0.889	2.000	0.000	NA		NA
5697068	5697069	SPH_2248	SPH_2249		rrf	TRUE	0.868	5.000	0.000	NA		NA
5697069	5697070	SPH_2249	SPH_2250	rrf	rrl4	FALSE	0.252	77.000	0.000	NA		NA
5697070	5697071	SPH_2250	SPH_2252	rrl4		FALSE	0.117	121.000	0.000	NA		NA
5697071	5697072	SPH_2252	SPH_2253		rrs4	FALSE	0.099	138.000	0.000	NA		NA
5697072	5697073	SPH_2253	SPH_2254	rrs4		FALSE	0.042	275.000	0.000	NA		NA
5697073	5697074	SPH_2254	SPH_2255			FALSE	0.117	121.000	0.000	NA		NA
5697074	5697075	SPH_2255	SPH_2256		gltX	TRUE	0.931	14.000	0.008	1.000	N	NA
5697075	5697076	SPH_2256	SPH_2257	gltX	pgi	FALSE	0.212	124.000	0.005	1.000	N	NA
5697076	5697077	SPH_2257	SPH_2258	pgi		TRUE	0.834	-13.000	0.000	NA		NA
5697077	5697078	SPH_2258	SPH_2259			TRUE	0.873	4.000	0.000	NA		NA
5697078	5697079	SPH_2259	SPH_2260			FALSE	0.274	139.000	0.053	1.000		NA
5697079	5697080	SPH_2260	SPH_2261			FALSE	0.184	87.000	0.000	NA		NA
5697082	5697083	SPH_2263	SPH_2264		mutS	FALSE	0.145	147.000	0.003	0.092	N	NA
5697083	5697084	SPH_2264	SPH_2265	mutS	argR	TRUE	0.732	51.000	0.008	1.000	N	NA
5697087	5697088	SPH_2268	SPH_2269			TRUE	0.427	84.000	0.027	NA		NA
5697088	5697089	SPH_2269	SPH_2270			TRUE	0.995	1.000	0.164	1.000	Y	NA
5697089	5697090	SPH_2270	SPH_2271			TRUE	0.367	167.000	0.176	NA		NA
5697090	5697091	SPH_2271	SPH_2272		pstC2	FALSE	0.231	118.000	0.007	NA		NA
5697091	5697092	SPH_2272	SPH_2273	pstC2	pstA2	TRUE	0.993	-7.000	0.219	0.003	Y	NA
5697092	5697093	SPH_2273	SPH_2274	pstA2	pstB3	TRUE	0.996	2.000	0.428	0.003	Y	NA
5697093	5697094	SPH_2274	SPH_2275	pstB3	phoU2	TRUE	0.992	15.000	0.182	NA	Y	NA
5697094	5697095	SPH_2275	SPH_2276	phoU2		FALSE	0.265	76.000	0.000	NA		NA
5697097	5697098	SPH_2278	SPH_2279		galU	TRUE	0.927	22.000	0.032	1.000	N	NA
5697098	5697099	SPH_2279	SPH_2280	galU		FALSE	0.027	418.000	0.000	NA		NA
5697100	5697101	SPH_2281	SPH_2282			TRUE	0.851	14.000	0.000	NA		NA
5697101	5697102	SPH_2282	SPH_2283			TRUE	0.929	-16.000	0.037	1.000		NA
5697102	5697103	SPH_2283	SPH_2284			TRUE	0.923	12.000	0.006	1.000		NA
5697103	5697104	SPH_2284	SPH_2285			TRUE	0.850	68.000	0.372	1.000		NA
5697104	5697105	SPH_2285	SPH_2286			FALSE	0.050	230.000	0.000	1.000		NA
5697105	5697106	SPH_2286	SPH_2287			TRUE	0.343	65.000	0.000	1.000		NA
5697108	5697109	SPH_2289	SPH_2290			TRUE	0.989	2.000	0.363	NA		NA
5697110	5697111	SPH_2291	SPH_2292			TRUE	0.745	28.000	0.000	NA		NA
5697111	5697112	SPH_2292	SPH_2293			FALSE	0.020	673.000	0.000	NA		NA
5697113	5697114	SPH_2294	SPH_2295			FALSE	0.019	717.000	0.000	NA		NA
5697114	5697115	SPH_2295	SPH_2296		malQ	TRUE	0.977	26.000	0.105	0.018	Y	NA
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5697117	5697118	SPH_2298	SPH_2299			TRUE	0.998	2.000	0.714	0.031	Y	NA
5697118	5697119	SPH_2299	SPH_2300			FALSE	0.258	262.000	0.200	NA		NA
5697119	5697120	SPH_2300	SPH_2301			TRUE	0.986	10.000	0.364	NA		NA
5697121	5697122	SPH_2302	SPH_2303		aspS	TRUE	0.906	-22.000	0.016	NA		NA
5697122	5697123	SPH_2303	SPH_2304	aspS		FALSE	0.091	151.000	0.000	NA		NA
5697123	5697124	SPH_2304	SPH_2305			FALSE	0.136	105.000	0.000	NA		NA
5697124	5697125	SPH_2305	SPH_2306			TRUE	0.986	18.000	0.400	NA		NA
5697125	5697126	SPH_2306	SPH_2307			TRUE	0.858	12.000	0.000	NA		NA
5697126	5697127	SPH_2307	SPH_2308			TRUE	0.968	3.000	0.077	NA		NA
5697127	5697128	SPH_2308	SPH_2309			TRUE	0.906	0.000	0.000	NA		NA
5697128	5697129	SPH_2309	SPH_2310			TRUE	0.854	10.000	0.000	NA		NA
5697129	5697130	SPH_2310	SPH_2311			FALSE	0.089	153.000	0.000	NA		NA
5697130	5697131	SPH_2311	SPH_2312		hisS	TRUE	0.416	60.000	0.000	NA		NA
5697131	5697132	SPH_2312	SPH_2313	hisS		TRUE	0.378	78.000	0.003	NA		NA
5697132	5697133	SPH_2313	SPH_2314			FALSE	0.069	191.000	0.000	NA		NA
5697133	5697134	SPH_2314	SPH_2315			TRUE	0.779	-25.000	0.000	NA		NA
5697135	5697136	SPH_2316	SPH_2317			TRUE	0.373	64.000	0.000	NA		NA
5697137	5697138	SPH_2318	SPH_2319	ilvD		FALSE	0.213	233.000	0.000	1.000	Y	NA
5697138	5697139	SPH_2319	SPH_2320			TRUE	0.998	-3.000	0.742	0.002	Y	NA
5697139	5697140	SPH_2320	SPH_2321			TRUE	0.986	4.000	0.333	1.000		NA
5697140	5697141	SPH_2321	SPH_2322			TRUE	0.970	13.000	0.182	0.024		NA
5697141	5697142	SPH_2322	SPH_2323			TRUE	0.974	4.000	0.156	0.016	N	NA
5697143	5697144	SPH_2324	SPH_2325			TRUE	0.992	3.000	0.549	1.000		NA
5697144	5697145	SPH_2325	SPH_2326		rpmF	FALSE	0.083	152.000	0.000	1.000		NA
5697145	5697146	SPH_2326	SPH_2327	rpmF	rpmG2	TRUE	0.976	16.000	0.012	0.023	Y	NA
5697148	5697149	SPH_2329	SPH_2330			TRUE	0.760	-43.000	0.000	NA		NA
5697149	5697150	SPH_2330	SPH_2331			TRUE	0.697	36.000	0.000	NA		NA
5697151	5697152	SPH_2332	SPH_2333			TRUE	0.350	66.000	0.000	NA		NA
5697152	5697153	SPH_2333	SPH_2334			FALSE	0.072	180.000	0.000	NA		NA
5697153	5697154	SPH_2334	SPH_2335			TRUE	0.992	-6.000	0.500	NA		NA
5697154	5697155	SPH_2335	SPH_2336			TRUE	0.878	84.000	0.250	NA	Y	NA
5697155	5697156	SPH_2336	SPH_2337			FALSE	0.181	218.000	0.056	1.000		NA
5697159	5697160	SPH_2340	SPH_2341	arcA	argF	TRUE	0.939	58.000	0.146	1.000	Y	NA
5697160	5697161	SPH_2341	SPH_2342	argF	arcC	TRUE	0.624	165.000	0.146	1.000	Y	NA
5697161	5697162	SPH_2342	SPH_2343	arcC		FALSE	0.063	209.000	0.000	NA		NA
5697162	5697163	SPH_2343	SPH_2344			TRUE	0.959	22.000	0.140	NA		NA
5697163	5697164	SPH_2344	SPH_2345			FALSE	0.226	80.000	0.000	NA		NA
5697165	5697166	SPH_2346	SPH_2347			TRUE	0.775	-28.000	0.000	NA		NA
5697166	5697167	SPH_2347	SPH_2348			TRUE	0.845	-12.000	0.000	NA		NA
5697169	5697170	SPH_2350	SPH_2351			FALSE	0.114	130.000	0.000	1.000	N	NA
5697170	5697171	SPH_2351	SPH_2352		fucI	FALSE	0.099	146.000	0.000	1.000	N	NA
5697171	5697172	SPH_2352	SPH_2353	fucI		TRUE	0.446	57.000	0.000	1.000		NA
5697172	5697173	SPH_2353	SPH_2354			TRUE	0.842	10.000	0.000	1.000		NA
5697173	5697174	SPH_2354	SPH_2355			TRUE	0.408	59.000	0.000	1.000		NA
5697174	5697175	SPH_2355	SPH_2356			TRUE	0.998	-3.000	0.714	0.024	Y	NA
5697175	5697176	SPH_2356	SPH_2357			TRUE	0.998	14.000	0.833	0.024	Y	NA
5697176	5697177	SPH_2357	SPH_2358			TRUE	0.994	-9.000	0.286	0.016	Y	NA
5697177	5697178	SPH_2358	SPH_2359			TRUE	0.950	-19.000	0.000	1.000	Y	NA
5697178	5697179	SPH_2359	SPH_2360			TRUE	0.967	12.000	0.000	1.000	Y	NA
5697179	5697180	SPH_2360	SPH_2361			TRUE	0.407	115.000	0.000	1.000	Y	NA
5697182	5697183	SPH_2363	SPH_2364			FALSE	0.018	846.000	0.000	NA		NA
5697183	5697184	SPH_2364	SPH_2365			TRUE	0.990	10.000	0.111	1.000	Y	NA
5697184	5697185	SPH_2365	SPH_2366			TRUE	0.998	-7.000	0.673	0.091	Y	NA
5697185	5697186	SPH_2366	SPH_2367			TRUE	0.986	0.000	0.192	1.000	N	NA
5697188	5697189	SPH_2369	SPH_2370		dltC	TRUE	0.990	-7.000	0.409	NA		NA
5697189	5697190	SPH_2370	SPH_2371	dltC		TRUE	0.986	14.000	0.387	NA		NA
5697190	5697191	SPH_2371	SPH_2372		dltA	TRUE	0.993	-3.000	0.435	NA	N	NA
5697191	5697192	SPH_2372	SPH_2373	dltA		TRUE	0.987	21.000	0.549	NA		NA
5697192	5697193	SPH_2373	SPH_2374			FALSE	0.034	314.000	0.000	NA		NA
5697193	5697194	SPH_2374	SPH_2375			FALSE	0.019	726.000	0.000	NA		NA
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