MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus anthracis str. A0465

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6053249 6053250 BAM_3064 BAM_3065     FALSE 0.044 276.000 0.000 NA   NA
 6053250 6053251 BAM_3065 BAM_3066     FALSE 0.431 203.000 0.000 1.000 N NA
 6053252 6053253 BAM_3067 BAM_3068     TRUE 0.848 11.000 0.636 NA   NA
 6053254 6053255 BAM_3069 BAM_3070     TRUE 0.732 107.000 0.286 NA   NA
 6053255 6053256 BAM_3070 BAM_3071     TRUE 0.716 -3.000 0.364 NA   NA
 6053256 6053257 BAM_3071 BAM_3072     FALSE 0.599 90.000 0.273 NA   NA
 6053257 6053258 BAM_3072 BAM_3073     TRUE 0.957 96.000 0.375 NA Y NA
 6053258 6053259 BAM_3073 BAM_3074     TRUE 0.748 163.000 0.133 1.000 N NA
 6053259 6053260 BAM_3074 BAM_3075     TRUE 0.923 0.000 0.533 1.000 N NA
 6053260 6053261 BAM_3075 BAM_3076     TRUE 0.886 15.000 0.333 1.000 N NA
 6053262 6053263 BAM_3077 BAM_3078     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6053264 6053265 BAM_3079 BAM_3080     FALSE 0.370 41.000 0.000 NA   NA
 6053265 6053266 BAM_3080 BAM_3081     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6053267 6053268 BAM_3082 BAM_3083     TRUE 0.837 -3.000 0.700 NA   NA
 6053268 6053269 BAM_3083 BAM_3084     FALSE 0.166 202.000 0.000 NA   NA
 6053271 6053272 BAM_3086 BAM_3087     TRUE 0.705 84.000 0.500 NA   NA
 6053273 6053274 BAM_3088 BAM_3089     FALSE 0.006 616.000 0.000 NA   NA
 6053274 6053275 BAM_3089 BAM_3090     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6053275 6053276 BAM_3090 BAM_3091     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6053276 6053277 BAM_3091 BAM_3092     FALSE 0.068 250.000 0.000 NA   NA
 6053277 6053278 BAM_3092 BAM_3093     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 6053280 6053281 BAM_3095 BAM_3096     TRUE 0.705 114.000 0.162 NA   NA
 6053281 6053282 BAM_3096 BAM_3097   adP2 FALSE 0.055 370.000 0.000 1.000 N NA
 6053282 6053283 BAM_3097 BAM_3098 adP2   FALSE 0.059 259.000 0.000 NA   NA
 6053283 6053284 BAM_3098 BAM_3099     FALSE 0.589 94.000 0.222 NA   NA
 6053284 6053285 BAM_3099 BAM_3100     FALSE 0.326 -19.000 0.000 NA   NA
 6053285 6053286 BAM_3100 BAM_3101     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6053286 6053287 BAM_3101 BAM_3102     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6053287 6053288 BAM_3102 BAM_3103     TRUE 0.841 -3.000 0.714 NA   NA
 6053288 6053289 BAM_3103 BAM_3104     TRUE 0.654 148.000 0.176 1.000   NA
 6053289 6053290 BAM_3104 BAM_3105     TRUE 0.738 39.000 0.588 0.030   NA
 6053290 6053291 BAM_3105 BAM_3106     TRUE 0.933 19.000 0.882 1.000 N NA
 6053293 6053294 BAM_3108 BAM_3109     FALSE 0.568 22.000 0.087 NA   NA
 6053294 6053295 BAM_3109 BAM_3110     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6053297 6053298 BAM_3112 BAM_3113     FALSE 0.583 30.000 0.286 NA   NA
 6053298 6053299 BAM_3113 BAM_3114     TRUE 0.729 -12.000 0.714 NA   NA
 6053299 6053300 BAM_3114 BAM_3115     TRUE 0.864 -12.000 0.750 1.000 N NA
 6053302 6053303 BAM_3117 BAM_3118     FALSE 0.572 186.000 0.182 1.000 N NA
 6053303 6053304 BAM_3118 BAM_3119     TRUE 0.761 0.000 0.364 NA   NA
 6053304 6053305 BAM_3119 BAM_3120     TRUE 0.869 6.000 0.667 NA   NA
 6053305 6053306 BAM_3120 BAM_3121     FALSE 0.579 66.000 0.500 NA   NA
 6053306 6053307 BAM_3121 BAM_3122     FALSE 0.146 207.000 0.000 NA   NA
 6053307 6053308 BAM_3122 BAM_3123     TRUE 0.816 25.000 0.096 1.000 N NA
 6053308 6053309 BAM_3123 BAM_3124     TRUE 0.695 49.000 0.082 1.000 N NA
 6053309 6053310 BAM_3124 BAM_3125     FALSE 0.619 18.000 0.194 NA   NA
 6053313 6053314 BAM_3128 BAM_3129     FALSE 0.457 82.000 0.015 NA   NA
 6053317 6053318 BAM_3132 BAM_3133     TRUE 0.969 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 6053318 6053319 BAM_3133 BAM_3134     FALSE 0.611 35.000 0.421 NA   NA
 6053319 6053320 BAM_3134 BAM_3135     TRUE 0.676 100.000 0.263 NA   NA
 6053320 6053321 BAM_3135 BAM_3136     TRUE 0.718 129.000 0.172 NA   NA
 6053321 6053322 BAM_3136 BAM_3137     FALSE 0.185 214.000 0.114 1.000   NA
 6053322 6053323 BAM_3137 BAM_3138     TRUE 0.644 14.000 0.159 NA   NA
 6053323 6053324 BAM_3138 BAM_3139     FALSE 0.607 15.000 0.047 NA   NA
 6053327 6053328 BAM_3142 BAM_3143 lysP   TRUE 0.781 114.000 0.333 NA   NA
 6053328 6053329 BAM_3143 BAM_3144     FALSE 0.440 34.000 0.057 NA   NA
 6053332 6053333 BAM_3147 BAM_3148     FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6053333 6053334 BAM_3148 BAM_3149     FALSE 0.342 69.000 0.000 NA   NA
 6053336 6053337 BAM_3151 BAM_3152 lepB   TRUE 0.895 83.000 0.778 1.000 N NA
 6053339 6053340 BAM_3154 BAM_3155   pcp FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6053340 6053341 BAM_3155 BAM_3156 pcp   FALSE 0.393 -12.000 0.000 NA   NA
 6053341 6053342 BAM_3156 BAM_3157     FALSE 0.071 248.000 0.000 NA   NA
 6053342 6053343 BAM_3157 BAM_3158     TRUE 0.683 121.000 0.000 NA   NA
 6053343 6053344 BAM_3158 BAM_3159     TRUE 0.903 2.000 0.939 NA   NA
 6053344 6053345 BAM_3159 BAM_3160     FALSE 0.614 15.000 0.064 NA   NA
 6053345 6053346 BAM_3160 BAM_3161     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6053346 6053347 BAM_3161 BAM_3162     FALSE 0.314 -21.000 0.000 NA   NA
 6053347 6053348 BAM_3162 BAM_3163     FALSE 0.430 -9.000 0.000 NA   NA
 6053348 6053349 BAM_3163 BAM_3164     TRUE 0.875 15.000 0.267 1.000 N NA
 6053349 6053350 BAM_3164 BAM_3165   sipU FALSE 0.220 259.000 0.231 1.000 N NA
 6053350 6053351 BAM_3165 BAM_3166 sipU   TRUE 0.812 24.000 0.038 1.000 N NA
 6053351 6053352 BAM_3166 BAM_3167     FALSE 0.026 315.000 0.000 NA   NA
 6053352 6053353 BAM_3167 BAM_3168     FALSE 0.161 204.000 0.028 NA   NA
 6053355 6053356 BAM_3170 BAM_3171     FALSE 0.531 153.000 0.083 NA   NA
 6053356 6053357 BAM_3171 BAM_3172     FALSE 0.022 331.000 0.000 NA   NA
 6053359 6053360 BAM_3174 BAM_3175     TRUE 0.704 114.000 0.125 NA   NA
 6053360 6053361 BAM_3175 BAM_3176     TRUE 0.677 4.000 0.083 NA   NA
 6053361 6053362 BAM_3176 BAM_3177     FALSE 0.516 161.000 0.033 1.000   NA
 6053362 6053363 BAM_3177 BAM_3178     FALSE 0.468 162.000 0.154 NA   NA
 6053366 6053367 BAM_3181 BAM_3182     FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6053368 6053369 BAM_3183 BAM_3184     FALSE 0.593 -10.000 0.383 NA   NA
 6053369 6053370 BAM_3184 BAM_3185   cotF FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 6053370 6053371 BAM_3185 BAM_3186 cotF   FALSE 0.581 148.000 0.105 NA   NA
 6053372 6053373 BAM_3187 BAM_3188     FALSE 0.612 92.000 0.273 NA   NA
 6053374 6053375 BAM_3189 BAM_3190     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6053375 6053376 BAM_3190 BAM_3191     FALSE 0.107 221.000 0.000 NA   NA
 6053376 6053377 BAM_3191 BAM_3192     FALSE 0.196 195.000 0.000 NA   NA
 6053379 6053380 BAM_3194 BAM_3195   sasP2 FALSE 0.042 295.000 0.143 NA   NA
 6053384 6053385 BAM_3199 BAM_3200 aspA3 ansA2 TRUE 0.892 54.000 0.037 1.000 Y NA
 6053386 6053387 BAM_3201 BAM_3202 ansR   FALSE 0.026 314.000 0.000 NA   NA
 6053388 6053389 BAM_3203 BAM_3204     FALSE 0.626 167.000 0.429 1.000   NA
 6053389 6053390 BAM_3204 BAM_3205   brnQ5 FALSE 0.457 274.000 0.000 0.072 Y NA
 6053390 6053391 BAM_3205 BAM_3206 brnQ5 proC2 TRUE 0.780 198.000 0.000 1.000 Y NA
 6053391 6053392 BAM_3206 BAM_3207 proC2   FALSE 0.025 316.000 0.000 NA   NA
 6053392 6053393 BAM_3207 BAM_3208     FALSE 0.478 165.000 0.250 NA   NA
 6053393 6053394 BAM_3208 BAM_3209     TRUE 0.760 108.000 0.333 NA   NA
 6053394 6053395 BAM_3209 BAM_3210   gerAC FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 6053395 6053396 BAM_3210 BAM_3211 gerAC   FALSE 0.221 -1043.000 0.000 NA   NA
 6053396 6053397 BAM_3211 BAM_3212   gerAB FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053397 6053398 BAM_3212 BAM_3213 gerAB gerAA FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6053398 6053399 BAM_3213 BAM_3214 gerAA   FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6053399 6053400 BAM_3214 BAM_3215     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6053400 6053401 BAM_3215 BAM_3216     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053401 6053402 BAM_3216 BAM_3217     FALSE 0.007 545.000 0.000 NA   NA
 6053402 6053403 BAM_3217 BAM_3218     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6053403 6053404 BAM_3218 BAM_3219     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6053404 6053405 BAM_3219 BAM_3220   glsA2 FALSE 0.008 488.000 0.000 NA   NA
 6053405 6053406 BAM_3220 BAM_3221 glsA2   TRUE 0.973 125.000 0.095 1.000 Y NA
 6053409 6053410 BAM_3224 BAM_3225     FALSE 0.559 24.000 0.100 NA   NA
 6053411 6053412 BAM_3226 BAM_3227     FALSE 0.107 221.000 0.000 NA   NA
 6053412 6053413 BAM_3227 BAM_3228     FALSE 0.020 686.000 0.000 1.000 N NA
 6053413 6053414 BAM_3228 BAM_3229     TRUE 0.725 114.000 0.000 1.000   NA
 6053415 6053416 BAM_3230 BAM_3231     TRUE 0.900 174.000 0.235 0.089 Y NA
 6053416 6053417 BAM_3231 BAM_3232     TRUE 0.681 -3.000 0.206 1.000   NA
 6053417 6053418 BAM_3232 BAM_3233     TRUE 0.684 14.000 0.059 1.000   NA
 6053419 6053420 BAM_3234 BAM_3235     FALSE 0.008 491.000 0.000 NA   NA
 6053420 6053421 BAM_3235 BAM_3236     FALSE 0.009 443.000 0.000 NA   NA
 6053421 6053422 BAM_3236 BAM_3237     FALSE 0.029 306.000 0.000 NA   NA
 6053422 6053423 BAM_3237 BAM_3238     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 6053427 6053428 BAM_3242 BAM_3243     TRUE 0.724 104.000 0.200 1.000   NA
 6053428 6053429 BAM_3243 BAM_3244     TRUE 0.882 113.000 0.010 1.000 N NA
 6053429 6053430 BAM_3244 BAM_3245     TRUE 0.717 165.000 0.004 1.000 N NA
 6053430 6053431 BAM_3245 BAM_3246     FALSE 0.503 81.000 0.136 NA   NA
 6053431 6053432 BAM_3246 BAM_3247     TRUE 0.735 0.000 0.303 NA   NA
 6053432 6053433 BAM_3247 BAM_3248     FALSE 0.005 643.000 0.000 NA   NA
 6053435 6053436 BAM_3250 BAM_3251     FALSE 0.191 196.000 0.000 NA   NA
 6053438 6053439 BAM_3253 BAM_3254 mntA   TRUE 0.957 18.000 0.173 1.000 Y NA
 6053439 6053440 BAM_3254 BAM_3255     TRUE 0.957 -3.000 0.196 1.000 Y NA
 6053440 6053441 BAM_3255 BAM_3256     FALSE 0.014 373.000 0.000 NA   NA
 6053441 6053442 BAM_3256 BAM_3257     FALSE 0.337 56.000 0.014 NA   NA
 6053444 6053445 BAM_3259 BAM_3260   arsC TRUE 0.749 154.000 0.556 NA   NA
 6053445 6053446 BAM_3260 BAM_3261 arsC acr3 TRUE 0.886 26.000 0.556 1.000 N NA
 6053446 6053447 BAM_3261 BAM_3262 acr3   TRUE 0.847 19.000 0.208 1.000 N NA
 6053447 6053448 BAM_3262 BAM_3263   arsR TRUE 0.682 60.000 0.126 1.000 N NA
 6053448 6053449 BAM_3263 BAM_3264 arsR   FALSE 0.009 447.000 0.000 NA   NA
 6053449 6053450 BAM_3264 BAM_3265     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6053450 6053451 BAM_3265 BAM_3266   hscC TRUE 0.689 0.000 0.000 1.000   NA
 6053451 6053452 BAM_3266 BAM_3267 hscC   FALSE 0.007 508.000 0.000 NA   NA
 6053452 6053453 BAM_3267 BAM_3268     FALSE 0.030 305.000 0.000 NA   NA
 6053455 6053456 BAM_3270 BAM_3271     FALSE 0.052 266.000 0.000 NA   NA
 6053456 6053457 BAM_3271 BAM_3272     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6053458 6053459 BAM_3273 BAM_3274     TRUE 0.688 136.000 0.167 NA   NA
 6053460 6053461 BAM_3275 BAM_3276     FALSE 0.636 140.000 0.056 NA   NA
 6053461 6053462 BAM_3276 BAM_3277     FALSE 0.055 264.000 0.000 NA   NA
 6053462 6053463 BAM_3277 BAM_3278     TRUE 0.754 -16.000 0.375 1.000 N NA
 6053463 6053464 BAM_3278 BAM_3279     FALSE 0.039 416.000 0.000 1.000 N NA
 6053464 6053465 BAM_3279 BAM_3280     FALSE 0.025 316.000 0.000 NA   NA
 6053466 6053467 BAM_3281 BAM_3282     FALSE 0.230 -99.000 0.000 NA   NA
 6053468 6053469 BAM_3283 BAM_3284     FALSE 0.125 218.000 0.065 NA   NA
 6053469 6053470 BAM_3284 BAM_3285     FALSE 0.056 325.000 0.455 NA   NA
 6053470 6053471 BAM_3285 BAM_3286   cypD FALSE 0.140 283.000 0.000 1.000 N NA
 6053471 6053472 BAM_3286 BAM_3287 cypD   FALSE 0.370 41.000 0.000 NA   NA
 6053472 6053473 BAM_3287 BAM_3288     FALSE 0.014 375.000 0.000 NA   NA
 6053475 6053476 BAM_3290 BAM_3291     FALSE 0.018 346.000 0.000 NA   NA
 6053476 6053477 BAM_3291 BAM_3292     TRUE 0.817 3.000 0.455 NA   NA
 6053478 6053479 BAM_3293 BAM_3294     TRUE 0.968 -3.000 0.492 1.000 Y NA
 6053480 6053481 BAM_3295 BAM_3296     FALSE 0.023 325.000 0.000 NA   NA
 6053481 6053482 BAM_3296 BAM_3297     FALSE 0.005 961.000 0.000 NA   NA
 6053484 6053485 BAM_3299 BAM_3300     FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 6053485 6053486 BAM_3300 BAM_3301     FALSE 0.335 55.000 0.000 NA   NA
 6053486 6053487 BAM_3301 BAM_3302     FALSE 0.185 197.000 0.000 NA   NA
 6053487 6053488 BAM_3302 BAM_3303     FALSE 0.488 -6.000 0.000 NA   NA
 6053488 6053489 BAM_3303 BAM_3304     FALSE 0.006 634.000 0.000 NA   NA
 6053489 6053490 BAM_3304 BAM_3305     TRUE 0.869 6.000 0.667 NA   NA
 6053490 6053491 BAM_3305 BAM_3306     FALSE 0.019 341.000 0.000 NA   NA
 6053491 6053492 BAM_3306 BAM_3307     FALSE 0.613 -3.000 0.162 NA   NA
 6053492 6053493 BAM_3307 BAM_3308     TRUE 0.724 -7.000 0.550 NA   NA
 6053493 6053494 BAM_3308 BAM_3309     TRUE 0.692 -3.000 0.233 1.000   NA
 6053494 6053495 BAM_3309 BAM_3310     FALSE 0.409 77.000 0.000 NA   NA
 6053495 6053496 BAM_3310 BAM_3311     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6053496 6053497 BAM_3311 BAM_3312     FALSE 0.031 432.000 0.000 NA N NA
 6053498 6053499 BAM_3313 BAM_3314     FALSE 0.519 150.000 0.000 NA   NA
 6053500 6053501 BAM_3315 BAM_3316     TRUE 0.889 0.000 0.852 NA   NA
 6053502 6053503 BAM_3317 BAM_3318     FALSE 0.393 69.000 0.156 NA   NA
 6053504 6053505 BAM_3319 BAM_3320     TRUE 0.984 2.000 0.833 1.000 Y NA
 6053505 6053506 BAM_3320 BAM_3321     FALSE 0.503 81.000 0.139 NA   NA
 6053507 6053508 BAM_3322 BAM_3323     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6053508 6053509 BAM_3323 BAM_3324     FALSE 0.248 -42.000 0.000 NA   NA
 6053509 6053510 BAM_3324 BAM_3325   paiB1 FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6053511 6053512 BAM_3326 BAM_3327     FALSE 0.009 449.000 0.000 NA   NA
 6053512 6053513 BAM_3327 BAM_3328     FALSE 0.427 38.000 0.103 NA   NA
 6053513 6053514 BAM_3328 BAM_3329     TRUE 0.802 2.000 0.138 0.002   NA
 6053514 6053515 BAM_3329 BAM_3330     TRUE 0.975 -3.000 0.800 NA Y NA
 6053519 6053520 BAM_3334 BAM_3335     FALSE 0.058 260.000 0.000 NA   NA
 6053520 6053521 BAM_3335 BAM_3336     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6053521 6053522 BAM_3336 BAM_3337     FALSE 0.006 568.000 0.000 NA   NA
 6053522 6053523 BAM_3337 BAM_3338     FALSE 0.008 471.000 0.000 NA   NA
 6053523 6053524 BAM_3338 BAM_3339     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 6053524 6053525 BAM_3339 BAM_3340     TRUE 0.800 18.000 0.471 1.000   NA
 6053525 6053526 BAM_3340 BAM_3341     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6053526 6053527 BAM_3341 BAM_3342     FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 6053528 6053529 BAM_3343 BAM_3344     FALSE 0.110 237.000 0.000 1.000   NA
 6053529 6053530 BAM_3344 BAM_3345     TRUE 0.898 0.000 1.000 NA   NA
 6053531 6053532 BAM_3346 BAM_3347     FALSE 0.023 326.000 0.000 NA   NA
 6053533 6053534 BAM_3348 BAM_3349     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053534 6053535 BAM_3349 BAM_3350     FALSE 0.362 44.000 0.000 NA   NA
 6053536 6053537 BAM_3351 BAM_3352     FALSE 0.005 713.000 0.000 NA   NA
 6053538 6053539 BAM_3353 BAM_3354     FALSE 0.012 387.000 0.000 NA   NA
 6053540 6053541 BAM_3355 BAM_3356     FALSE 0.005 697.000 0.000 NA   NA
 6053541 6053542 BAM_3356 BAM_3357     FALSE 0.046 273.000 0.000 NA   NA
 6053542 6053543 BAM_3357 BAM_3358     FALSE 0.047 271.000 0.000 NA   NA
 6053543 6053544 BAM_3358 BAM_3359     FALSE 0.191 196.000 0.000 NA   NA
 6053544 6053545 BAM_3359 BAM_3360     TRUE 0.638 110.000 0.000 NA   NA
 6053545 6053546 BAM_3360 BAM_3361     FALSE 0.126 213.000 0.000 NA   NA
 6053548 6053549 BAM_3363 BAM_3364     FALSE 0.630 108.000 0.000 NA   NA
 6053549 6053550 BAM_3364 BAM_3365     FALSE 0.053 355.000 0.000 NA N NA
 6053550 6053551 BAM_3365 BAM_3366   sdaAA1 FALSE 0.336 294.000 0.000 NA Y NA
 6053551 6053552 BAM_3366 BAM_3367 sdaAA1 sdaAB1 FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6053552 6053553 BAM_3367 BAM_3368 sdaAB1   FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6053553 6053554 BAM_3368 BAM_3369     FALSE 0.005 710.000 0.000 NA   NA
 6053554 6053555 BAM_3369 BAM_3370     FALSE 0.174 200.000 0.000 NA   NA
 6053555 6053556 BAM_3370 BAM_3371     FALSE 0.453 82.000 0.000 NA   NA
 6053556 6053557 BAM_3371 BAM_3372   hypF TRUE 0.749 79.000 0.000 1.000 N NA
 6053557 6053558 BAM_3372 BAM_3373 hypF   TRUE 0.935 30.000 0.079 1.000 Y NA
 6053558 6053559 BAM_3373 BAM_3374     FALSE 0.457 83.000 0.000 NA   NA
 6053559 6053560 BAM_3374 BAM_3375     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6053560 6053561 BAM_3375 BAM_3376     FALSE 0.156 204.000 0.000 NA   NA
 6053563 6053564 BAM_3378 BAM_3379     FALSE 0.583 144.000 0.010 NA   NA
 6053564 6053565 BAM_3379 BAM_3380     TRUE 0.639 14.000 0.109 NA   NA
 6053565 6053566 BAM_3380 BAM_3381   serC TRUE 0.963 13.000 0.238 1.000 Y NA
 6053566 6053567 BAM_3381 BAM_3382 serC   FALSE 0.037 289.000 0.000 NA   NA
 6053567 6053568 BAM_3382 BAM_3383     FALSE 0.337 -18.000 0.000 NA   NA
 6053568 6053569 BAM_3383 BAM_3384     TRUE 0.750 -10.000 0.733 NA   NA
 6053569 6053570 BAM_3384 BAM_3385     FALSE 0.029 306.000 0.000 NA   NA
 6053570 6053571 BAM_3385 BAM_3386     FALSE 0.532 90.000 0.097 NA   NA
 6053571 6053572 BAM_3386 BAM_3387     FALSE 0.407 76.000 0.023 NA   NA
 6053572 6053573 BAM_3387 BAM_3388     FALSE 0.143 282.000 0.000 1.000 N NA
 6053575 6053576 BAM_3390 BAM_3391     FALSE 0.440 80.000 0.000 NA   NA
 6053576 6053577 BAM_3391 BAM_3392     FALSE 0.035 291.000 0.000 NA   NA
 6053577 6053578 BAM_3392 BAM_3393     FALSE 0.132 211.000 0.000 NA   NA
 6053584 6053585 BAM_3399 BAM_3400     FALSE 0.399 -16.000 0.154 NA   NA
 6053585 6053586 BAM_3400 BAM_3401     FALSE 0.614 141.000 0.025 NA   NA
 6053587 6053588 BAM_3402 BAM_3403     TRUE 0.843 16.000 0.225 NA N NA
 6053588 6053589 BAM_3403 BAM_3404     TRUE 0.884 101.000 0.412 NA N NA
 6053590 6053591 BAM_3405 BAM_3406     FALSE 0.308 181.000 0.095 NA   NA
 6053591 6053592 BAM_3406 BAM_3407     FALSE 0.572 -7.000 0.275 NA   NA
 6053592 6053593 BAM_3407 BAM_3408     FALSE 0.613 -3.000 0.157 NA   NA
 6053594 6053595 BAM_3409 BAM_3410     FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6053596 6053597 BAM_3411 BAM_3412     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053597 6053598 BAM_3412 BAM_3413     TRUE 0.860 15.000 0.098 1.000 N NA
 6053598 6053599 BAM_3413 BAM_3414   alo FALSE 0.029 332.000 0.000 1.000   NA
 6053601 6053602 BAM_3416 BAM_3417     TRUE 0.711 -3.000 0.350 NA   NA
 6053602 6053603 BAM_3417 BAM_3418     TRUE 0.718 24.000 0.350 1.000   NA
 6053603 6053604 BAM_3418 BAM_3419     FALSE 0.066 252.000 0.000 NA   NA
 6053606 6053607 BAM_3421 BAM_3422     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6053607 6053608 BAM_3422 BAM_3423     FALSE 0.246 184.000 0.000 NA   NA
 6053608 6053609 BAM_3423 BAM_3424     FALSE 0.524 66.000 0.412 NA   NA
 6053609 6053610 BAM_3424 BAM_3425     TRUE 0.676 -21.000 0.673 1.000   NA
 6053610 6053611 BAM_3425 BAM_3426     FALSE 0.576 23.000 0.145 NA   NA
 6053611 6053612 BAM_3426 BAM_3427     FALSE 0.495 57.000 0.364 NA   NA
 6053612 6053613 BAM_3427 BAM_3428     FALSE 0.020 337.000 0.000 NA   NA
 6053613 6053614 BAM_3428 BAM_3429     FALSE 0.019 339.000 0.000 NA   NA
 6053616 6053617 BAM_3431 BAM_3432     FALSE 0.010 428.000 0.000 NA   NA
 6053617 6053618 BAM_3432 BAM_3433     FALSE 0.166 202.000 0.000 NA   NA
 6053618 6053619 BAM_3433 BAM_3434     TRUE 0.854 11.000 0.133 NA N NA
 6053619 6053620 BAM_3434 BAM_3435     FALSE 0.026 341.000 0.000 1.000   NA
 6053620 6053621 BAM_3435 BAM_3436     FALSE 0.008 620.000 0.000 1.000   NA
 6053622 6053623 BAM_3437 BAM_3438 hisS1   FALSE 0.023 327.000 0.008 NA   NA
 6053623 6053624 BAM_3438 BAM_3439     FALSE 0.052 266.000 0.000 NA   NA
 6053626 6053627 BAM_3441 BAM_3442     FALSE 0.541 154.000 0.125 NA   NA
 6053628 6053629 BAM_3443 BAM_3444 pykA1   FALSE 0.521 93.000 0.028 NA   NA
 6053629 6053630 BAM_3444 BAM_3445     TRUE 0.659 103.000 0.200 NA   NA
 6053630 6053631 BAM_3445 BAM_3446     TRUE 0.704 113.000 0.200 NA   NA
 6053631 6053632 BAM_3446 BAM_3447     FALSE 0.382 57.000 0.130 NA   NA
 6053632 6053633 BAM_3447 BAM_3448     TRUE 0.662 -7.000 0.426 NA   NA
 6053633 6053634 BAM_3448 BAM_3449     FALSE 0.526 87.000 0.159 NA   NA
 6053635 6053636 BAM_3450 BAM_3451     FALSE 0.498 -12.000 0.269 NA   NA
 6053637 6053638 BAM_3452 BAM_3453     FALSE 0.337 174.000 0.067 NA   NA
 6053640 6053641 BAM_3455 BAM_3456     FALSE 0.390 180.000 0.136 1.000   NA
 6053642 6053643 BAM_3457 BAM_3458     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6053644 6053645 BAM_3459 BAM_3460     FALSE 0.203 195.000 0.030 NA   NA
 6053645 6053646 BAM_3460 BAM_3461     FALSE 0.631 62.000 0.050 NA N NA
 6053646 6053647 BAM_3461 BAM_3462     TRUE 0.971 123.000 0.200 NA Y NA
 6053647 6053648 BAM_3462 BAM_3463   maa FALSE 0.345 57.000 0.038 NA   NA
 6053648 6053649 BAM_3463 BAM_3464 maa   FALSE 0.029 307.000 0.000 NA   NA
 6053649 6053650 BAM_3464 BAM_3465     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053650 6053651 BAM_3465 BAM_3466     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6053651 6053652 BAM_3466 BAM_3467     FALSE 0.409 77.000 0.000 NA   NA
 6053654 6053655 BAM_3469 BAM_3470     FALSE 0.379 64.000 0.179 NA   NA
 6053656 6053657 BAM_3471 BAM_3472     FALSE 0.043 278.000 0.000 NA   NA
 6053658 6053659 BAM_3473 BAM_3474     FALSE 0.509 41.000 0.312 NA   NA
 6053662 6053663 BAM_3477 BAM_3478     TRUE 0.712 77.000 0.636 NA   NA
 6053664 6053665 BAM_3479 BAM_3480     FALSE 0.181 200.000 0.030 NA   NA
 6053665 6053666 BAM_3480 BAM_3481     FALSE 0.426 53.000 0.039 1.000   NA
 6053666 6053667 BAM_3481 BAM_3482     TRUE 0.791 120.000 0.235 1.000   NA
 6053671 6053672 BAM_3486 BAM_3487   gntK TRUE 0.977 122.000 0.316 1.000 Y NA
 6053672 6053673 BAM_3487 BAM_3488 gntK gntP2 TRUE 0.902 56.000 0.263 1.000 Y NA
 6053673 6053674 BAM_3488 BAM_3489 gntP2   FALSE 0.163 390.000 0.000 1.000 Y NA
 6053674 6053675 BAM_3489 BAM_3490     TRUE 0.931 52.000 0.545 1.000 Y NA
 6053675 6053676 BAM_3490 BAM_3491   tkt1 TRUE 0.979 105.000 0.636 1.000 Y NA
 6053676 6053677 BAM_3491 BAM_3492 tkt1 zwf TRUE 0.939 40.000 0.545 1.000 Y NA
 6053677 6053678 BAM_3492 BAM_3493 zwf   FALSE 0.034 351.000 0.000 0.001   NA
 6053678 6053679 BAM_3493 BAM_3494     FALSE 0.597 90.000 0.083 1.000   NA
 6053679 6053680 BAM_3494 BAM_3495     TRUE 0.957 14.000 0.111 NA Y NA
 6053680 6053681 BAM_3495 BAM_3496     TRUE 0.717 126.000 0.094 NA   NA
 6053683 6053684 BAM_3498 BAM_3499     FALSE 0.420 42.000 0.167 NA   NA
 6053684 6053685 BAM_3499 BAM_3500     FALSE 0.024 588.000 0.000 1.000 N NA
 6053685 6053686 BAM_3500 BAM_3501     FALSE 0.548 156.000 0.000 1.000   NA
 6053686 6053687 BAM_3501 BAM_3502     FALSE 0.025 343.000 0.000 1.000   NA
 6053687 6053688 BAM_3502 BAM_3503     FALSE 0.017 383.000 0.000 1.000   NA
 6053688 6053689 BAM_3503 BAM_3504     FALSE 0.014 412.000 0.000 1.000   NA
 6053689 6053690 BAM_3504 BAM_3505     TRUE 0.835 17.000 0.571 1.000   NA
 6053690 6053691 BAM_3505 BAM_3506     FALSE 0.009 580.000 0.000 1.000   NA
 6053691 6053692 BAM_3506 BAM_3507     FALSE 0.419 43.000 0.190 NA   NA
 6053694 6053695 BAM_3509 BAM_3510     FALSE 0.005 1153.000 0.000 NA   NA
 6053695 6053696 BAM_3510 BAM_3511     TRUE 0.711 131.000 0.154 NA   NA
 6053696 6053697 BAM_3511 BAM_3512     FALSE 0.450 164.000 0.128 NA   NA
 6053697 6053698 BAM_3512 BAM_3513     TRUE 0.741 110.000 0.286 NA   NA
 6053698 6053699 BAM_3513 BAM_3515     TRUE 0.738 12.000 0.333 NA   NA
 6053701 6053702 BAM_3517 BAM_3518     FALSE 0.551 33.000 0.130 1.000   NA
 6053702 6053703 BAM_3518 BAM_3519   cfa FALSE 0.149 218.000 0.000 1.000   NA
 6053703 6053704 BAM_3519 BAM_3520 cfa   FALSE 0.075 323.000 0.000 NA N NA
 6053704 6053705 BAM_3520 BAM_3521     TRUE 0.877 191.000 0.667 NA Y NA
 6053706 6053707 BAM_3522 BAM_3523     FALSE 0.532 79.000 0.262 NA   NA
 6053708 6053709 BAM_3524 BAM_3525     FALSE 0.591 26.000 0.250 NA   NA
 6053709 6053710 BAM_3525 BAM_3526     FALSE 0.572 28.000 0.250 NA   NA
 6053712 6053713 BAM_3528 BAM_3529     TRUE 0.704 12.000 0.093 1.000   NA
 6053713 6053714 BAM_3529 BAM_3530     TRUE 0.772 -3.000 0.300 0.084   NA
 6053714 6053715 BAM_3530 BAM_3531     TRUE 0.741 -3.000 0.238 0.084   NA
 6053715 6053716 BAM_3531 BAM_3532     TRUE 0.855 146.000 0.000 0.084 N NA
 6053716 6053717 BAM_3532 BAM_3533     TRUE 0.645 135.000 0.000 NA   NA
 6053717 6053718 BAM_3533 BAM_3534     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 6053720 6053721 BAM_3536 BAM_3537     FALSE 0.393 -12.000 0.000 NA   NA
 6053723 6053724 BAM_3539 BAM_3540     FALSE 0.088 232.000 0.000 NA   NA
 6053724 6053725 BAM_3540 BAM_3541     FALSE 0.356 47.000 0.000 NA   NA
 6053725 6053726 BAM_3541 BAM_3542     FALSE 0.292 178.000 0.000 NA   NA
 6053726 6053727 BAM_3542 BAM_3543   sigI TRUE 0.746 -7.000 0.605 NA   NA
 6053727 6053728 BAM_3543 BAM_3544 sigI   FALSE 0.006 570.000 0.000 NA   NA
 6053728 6053729 BAM_3544 BAM_3545     FALSE 0.366 43.000 0.000 NA   NA
 6053729 6053730 BAM_3545 BAM_3546     FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 6053732 6053733 BAM_3548 BAM_3549     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6053735 6053736 BAM_3551 BAM_3552     FALSE 0.067 269.000 0.000 1.000   NA
 6053736 6053737 BAM_3552 BAM_3553     TRUE 0.949 1.000 0.860 1.000 N NA
 6053737 6053738 BAM_3553 BAM_3554     FALSE 0.534 155.000 0.186 NA   NA
 6053738 6053739 BAM_3554 BAM_3555     FALSE 0.523 76.000 0.289 NA   NA
 6053739 6053740 BAM_3555 BAM_3556     FALSE 0.035 291.000 0.000 NA   NA
 6053740 6053741 BAM_3556 BAM_3557     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6053742 6053743 BAM_3558 BAM_3559     FALSE 0.056 261.000 0.000 NA   NA
 6053744 6053745 BAM_3560 BAM_3561 bla2   TRUE 0.706 139.000 0.045 1.000   NA
 6053745 6053746 BAM_3561 BAM_3562     FALSE 0.461 35.000 0.130 NA   NA
 6053749 6053750 BAM_3565 BAM_3566     TRUE 0.720 111.000 0.250 NA   NA
 6053751 6053752 BAM_3567 BAM_3568     FALSE 0.043 278.000 0.000 NA   NA
 6053752 6053753 BAM_3568 BAM_3569     FALSE 0.353 171.000 0.056 NA   NA
 6053753 6053754 BAM_3569 BAM_3570     FALSE 0.628 14.000 0.085 NA   NA
 6053755 6053756 BAM_3571 BAM_3572     TRUE 0.752 14.000 0.386 NA   NA
 6053756 6053757 BAM_3572 BAM_3573     FALSE 0.619 105.000 0.000 NA   NA
 6053757 6053758 BAM_3573 BAM_3574     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6053761 6053762 BAM_3577 BAM_3578     FALSE 0.026 630.000 0.000 0.068 N NA
 6053764 6053765 BAM_3580 BAM_3581     TRUE 0.663 162.000 0.500 NA   NA
 6053765 6053766 BAM_3581 BAM_3582     FALSE 0.479 58.000 0.333 NA   NA
 6053769 6053770 BAM_2534 BAM_2535   gpm TRUE 0.693 168.000 0.023 1.000 N NA
 6053772 6053773 BAM_2537 BAM_2538     TRUE 0.822 113.000 0.444 NA   NA
 6053773 6053774 BAM_2538 BAM_2539     FALSE 0.497 77.000 0.250 NA   NA
 6053775 6053776 BAM_2540 BAM_2541     FALSE 0.014 373.000 0.000 NA   NA
 6053779 6053780 BAM_2544 BAM_2545   pepD FALSE 0.631 144.000 0.125 NA   NA
 6053781 6053782 BAM_2546 BAM_2547     FALSE 0.022 329.000 0.000 NA   NA
 6053783 6053784 BAM_2548 BAM_2549     FALSE 0.314 222.000 0.000 1.000 N NA
 6053784 6053785 BAM_2549 BAM_2550     TRUE 0.716 -10.000 0.636 NA   NA
 6053787 6053788 BAM_2552 BAM_2553     FALSE 0.497 77.000 0.250 NA   NA
 6053788 6053789 BAM_2553 BAM_2554   bla1 FALSE 0.083 327.000 0.000 1.000 N NA
 6053792 6053793 BAM_2557 BAM_2558 csbX   FALSE 0.244 -46.000 0.000 NA   NA
 6053794 6053795 BAM_2559 BAM_2560     TRUE 0.668 100.000 0.042 1.000   NA
 6053795 6053796 BAM_2560 BAM_2561   mmsA2 TRUE 0.842 39.000 0.667 1.000 N NA
 6053796 6053797 BAM_2561 BAM_2562 mmsA2   FALSE 0.239 -49.000 0.000 NA   NA
 6053797 6053798 BAM_2562 BAM_2563     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6053798 6053799 BAM_2563 BAM_2564     TRUE 0.896 123.000 0.000 1.000 N NA
 6053799 6053800 BAM_2564 BAM_2565   fba1 TRUE 0.970 129.000 0.000 1.000 Y NA
 6053800 6053801 BAM_2565 BAM_2566 fba1   FALSE 0.624 106.000 0.000 NA   NA
 6053801 6053802 BAM_2566 BAM_2567     FALSE 0.466 85.000 0.000 NA   NA
 6053804 6053805 BAM_2569 BAM_2570     FALSE 0.029 307.000 0.000 NA   NA
 6053806 6053807 BAM_2571 BAM_2572     TRUE 0.818 0.000 0.500 NA   NA
 6053808 6053809 BAM_2573 BAM_2574     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6053813 6053814 BAM_2578 BAM_2579     FALSE 0.030 305.000 0.000 NA   NA
 6053814 6053815 BAM_2579 BAM_2580     TRUE 0.672 129.000 0.000 NA   NA
 6053815 6053816 BAM_2580 BAM_2581     FALSE 0.007 531.000 0.000 NA   NA
 6053817 6053818 BAM_2582 BAM_2583     FALSE 0.012 394.000 0.000 NA   NA
 6053819 6053820 BAM_2584 BAM_2585     FALSE 0.034 445.000 0.000 1.000 N NA
 6053820 6053821 BAM_2585 BAM_2586     FALSE 0.571 145.000 0.000 NA   NA
 6053823 6053824 BAM_2588 BAM_2589     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6053824 6053825 BAM_2589 BAM_2590     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6053825 6053826 BAM_2590 BAM_2591     TRUE 0.665 111.000 0.059 NA   NA
 6053826 6053827 BAM_2591 BAM_2592     FALSE 0.137 210.000 0.000 NA   NA
 6053827 6053828 BAM_2592 BAM_2593     FALSE 0.081 245.000 0.069 NA   NA
 6053828 6053829 BAM_2593 BAM_2594     TRUE 0.923 -3.000 0.713 1.000 N NA
 6053829 6053830 BAM_2594 BAM_2596     TRUE 0.809 25.000 0.049 1.000 N NA
 6053831 6053832 BAM_2595 BAM_2597     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6053833 6053834 BAM_2598 BAM_2599     FALSE 0.116 217.000 0.000 NA   NA
 6053834 6053835 BAM_2599 BAM_2600     TRUE 0.958 16.000 0.067 1.000 Y NA
 6053835 6053836 BAM_2600 BAM_2601     TRUE 0.782 27.000 0.553 1.000   NA
 6053836 6053837 BAM_2601 BAM_2602   mvaB TRUE 0.856 22.000 0.778 1.000   NA
 6053837 6053838 BAM_2602 BAM_2603 mvaB   TRUE 0.949 5.000 0.690 0.082 N NA
 6053838 6053839 BAM_2603 BAM_2604     TRUE 0.975 3.000 0.426 1.000 Y NA
 6053839 6053840 BAM_2604 BAM_2605     TRUE 0.902 50.000 0.167 1.000 Y NA
 6053840 6053841 BAM_2605 BAM_2606     FALSE 0.360 170.000 0.045 NA   NA
 6053841 6053842 BAM_2606 BAM_2607     TRUE 0.737 121.000 0.219 NA   NA
 6053842 6053843 BAM_2607 BAM_2608     TRUE 0.704 49.000 0.188 1.000 N NA
 6053843 6053844 BAM_2608 BAM_2609     FALSE 0.528 -7.000 0.222 NA   NA
 6053844 6053845 BAM_2609 BAM_2610     TRUE 0.697 3.000 0.214 NA   NA
 6053846 6053847 BAM_2611 BAM_2612     FALSE 0.609 182.000 0.143 1.000 N NA
 6053847 6053848 BAM_2612 BAM_2613     TRUE 0.967 -10.000 0.932 0.022 Y NA
 6053849 6053850 BAM_2614 BAM_2615     FALSE 0.050 269.000 0.000 NA   NA
 6053850 6053851 BAM_2615 BAM_2616     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053851 6053852 BAM_2616 BAM_2617     TRUE 0.879 17.000 0.333 1.000 N NA
 6053852 6053853 BAM_2617 BAM_2618     FALSE 0.629 94.000 0.091 1.000   NA
 6053853 6053854 BAM_2618 BAM_2619     TRUE 0.679 108.000 0.152 NA   NA
 6053854 6053855 BAM_2619 BAM_2620     FALSE 0.343 170.000 0.000 NA   NA
 6053855 6053856 BAM_2620 BAM_2621     FALSE 0.355 71.000 0.000 NA   NA
 6053856 6053857 BAM_2621 BAM_2622     FALSE 0.016 355.000 0.000 NA   NA
 6053857 6053858 BAM_2622 BAM_2623     TRUE 0.683 137.000 0.167 NA   NA
 6053858 6053859 BAM_2623 BAM_2624     FALSE 0.491 88.000 0.036 NA   NA
 6053859 6053860 BAM_2624 BAM_2625     FALSE 0.465 80.000 0.060 NA   NA
 6053860 6053861 BAM_2625 BAM_2626     FALSE 0.013 382.000 0.000 NA   NA
 6053861 6053862 BAM_2626 BAM_2627     TRUE 0.763 -3.000 0.462 NA   NA
 6053862 6053863 BAM_2627 BAM_2628     FALSE 0.543 35.000 0.304 NA   NA
 6053863 6053864 BAM_2628 BAM_2629     TRUE 0.906 122.000 0.208 1.000 N NA
 6053866 6053867 BAM_2631 BAM_2632     FALSE 0.262 182.000 0.000 NA   NA
 6053867 6053868 BAM_2632 BAM_2633     FALSE 0.348 50.000 0.000 NA   NA
 6053872 6053873 BAM_2637 BAM_2638     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6053873 6053874 BAM_2638 BAM_2639     FALSE 0.355 71.000 0.000 NA   NA
 6053874 6053875 BAM_2639 BAM_2640     TRUE 0.683 137.000 0.125 NA   NA
 6053876 6053877 BAM_2641 BAM_2642     FALSE 0.233 -70.000 0.000 NA   NA
 6053878 6053879 BAM_2643 BAM_2644     FALSE 0.111 219.000 0.000 NA   NA
 6053879 6053880 BAM_2644 BAM_2645     FALSE 0.013 376.000 0.000 NA   NA
 6053880 6053881 BAM_2645 BAM_2646     FALSE 0.045 274.000 0.000 NA   NA
 6053881 6053882 BAM_2646 BAM_2647     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6053886 6053887 BAM_2651 BAM_2652     FALSE 0.417 34.000 0.000 NA   NA
 6053887 6053888 BAM_2652 BAM_2653     TRUE 0.904 126.000 0.156 1.000 N NA
 6053888 6053889 BAM_2653 BAM_2654     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6053889 6053890 BAM_2654 BAM_2655     FALSE 0.227 -106.000 0.000 NA   NA
 6053892 6053893 BAM_2657 BAM_2658     TRUE 0.792 10.000 0.350 1.000   NA
 6053893 6053894 BAM_2658 BAM_2659     FALSE 0.013 385.000 0.000 NA   NA
 6053894 6053895 BAM_2659 BAM_2660     FALSE 0.026 314.000 0.000 NA   NA
 6053895 6053896 BAM_2660 BAM_2661     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6053896 6053897 BAM_2661 BAM_2662     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053897 6053898 BAM_2662 BAM_2663     FALSE 0.338 68.000 0.000 NA   NA
 6053900 6053901 BAM_2665 BAM_2666     FALSE 0.477 88.000 0.000 NA   NA
 6053901 6053902 BAM_2666 BAM_2667     TRUE 0.972 122.000 0.038 1.000 Y NA
 6053902 6053903 BAM_2667 BAM_2668   ddlB TRUE 0.877 5.000 0.005 1.000 N NA
 6053903 6053904 BAM_2668 BAM_2669 ddlB tenA FALSE 0.154 275.000 0.000 1.000 N NA
 6053904 6053905 BAM_2669 BAM_2670 tenA   FALSE 0.199 194.000 0.000 NA   NA
 6053905 6053906 BAM_2670 BAM_2671     FALSE 0.383 -39.000 0.333 NA   NA
 6053906 6053907 BAM_2671 BAM_2672     FALSE 0.013 378.000 0.000 NA   NA
 6053907 6053908 BAM_2672 BAM_2673     FALSE 0.462 84.000 0.000 NA   NA
 6053910 6053911 BAM_2675 BAM_2676     TRUE 0.666 116.000 0.000 NA   NA
 6053912 6053913 BAM_2677 BAM_2678     FALSE 0.634 109.000 0.000 NA   NA
 6053914 6053915 BAM_2679 BAM_2680     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6053915 6053916 BAM_2680 BAM_2681     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053916 6053917 BAM_2681 BAM_2682     TRUE 0.681 127.000 0.000 NA   NA
 6053917 6053918 BAM_2682 BAM_2683     TRUE 0.827 141.000 0.556 NA   NA
 6053920 6053921 BAM_2685 BAM_2686     FALSE 0.601 147.000 0.136 NA   NA
 6053921 6053922 BAM_2686 BAM_2687   cypA FALSE 0.493 160.000 0.188 NA   NA
 6053922 6053923 BAM_2687 BAM_2688 cypA   FALSE 0.050 269.000 0.000 NA   NA
 6053923 6053924 BAM_2688 BAM_2689     FALSE 0.435 -10.000 0.056 NA   NA
 6053924 6053925 BAM_2689 BAM_2690     FALSE 0.373 71.000 0.048 NA   NA
 6053927 6053928 BAM_2692 BAM_2693     TRUE 0.866 113.000 0.412 0.010   NA
 6053928 6053929 BAM_2693 BAM_2694     FALSE 0.528 178.000 0.412 1.000   NA
 6053929 6053930 BAM_2694 BAM_2695     FALSE 0.008 477.000 0.000 NA   NA
 6053930 6053931 BAM_2695 BAM_2696     FALSE 0.490 90.000 0.000 NA   NA
 6053931 6053932 BAM_2696 BAM_2697     FALSE 0.102 223.000 0.000 NA   NA
 6053932 6053933 BAM_2697 BAM_2698     FALSE 0.075 336.000 0.000 1.000 N NA
 6053935 6053936 BAM_2700 BAM_2701     TRUE 0.788 11.000 0.435 NA   NA
 6053936 6053937 BAM_2701 BAM_2702     TRUE 0.751 -7.000 0.530 1.000   NA
 6053937 6053938 BAM_2702 BAM_2703     FALSE 0.525 91.000 0.065 NA   NA
 6053939 6053940 BAM_2704 BAM_2705 kinB2   FALSE 0.610 88.000 0.222 1.000   NA
 6053941 6053942 BAM_2706 BAM_2707     FALSE 0.356 171.000 0.062 NA   NA
 6053942 6053943 BAM_2707 BAM_2708     FALSE 0.028 335.000 0.000 1.000   NA
 6053943 6053944 BAM_2708 BAM_2709     FALSE 0.007 535.000 0.000 NA   NA
 6053944 6053945 BAM_2709 BAM_2710     TRUE 0.671 112.000 0.063 NA   NA
 6053945 6053946 BAM_2710 BAM_2711     TRUE 0.725 5.000 0.048 1.000   NA
 6053946 6053947 BAM_2711 BAM_2712     FALSE 0.174 200.000 0.000 NA   NA
 6053947 6053948 BAM_2712 BAM_2713     FALSE 0.207 200.000 0.125 NA   NA
 6053949 6053950 BAM_2714 BAM_2715     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6053951 6053952 BAM_2716 BAM_2717     FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 6053952 6053953 BAM_2717 BAM_2718     FALSE 0.440 75.000 0.127 NA   NA
 6053953 6053954 BAM_2718 BAM_2719     FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 6053956 6053957 BAM_2721 BAM_2722   adP1 FALSE 0.513 151.000 0.000 NA   NA
 6053957 6053958 BAM_2722 BAM_2723 adP1   FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 6053958 6053959 BAM_2723 BAM_2724     FALSE 0.209 192.000 0.000 NA   NA
 6053959 6053960 BAM_2724 BAM_2725     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6053961 6053962 BAM_2726 BAM_2727     FALSE 0.534 178.000 0.500 NA   NA
 6053963 6053964 BAM_2728 BAM_2729     TRUE 0.746 46.000 0.778 1.000   NA
 6053967 6053968 BAM_2732 BAM_2733     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6053969 6053970 BAM_2734 BAM_2735     FALSE 0.509 25.000 0.000 NA   NA
 6053970 6053971 BAM_2735 BAM_2736     FALSE 0.623 139.000 0.000 NA   NA
 6053971 6053972 BAM_2736 BAM_2737     FALSE 0.605 141.000 0.000 NA   NA
 6053972 6053973 BAM_2737 BAM_2738     FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6053973 6053974 BAM_2738 BAM_2739     FALSE 0.601 23.000 0.000 1.000   NA
 6053974 6053975 BAM_2739 BAM_2740     FALSE 0.293 203.000 0.400 NA   NA
 6053975 6053976 BAM_2740 BAM_2741     TRUE 0.680 102.000 0.250 NA   NA
 6053976 6053977 BAM_2741 BAM_2742     FALSE 0.439 32.000 0.000 NA   NA
 6053977 6053978 BAM_2742 BAM_2743     FALSE 0.039 285.000 0.000 NA   NA
 6053978 6053979 BAM_2743 BAM_2744     FALSE 0.136 274.000 0.000 NA N NA
 6053979 6053980 BAM_2744 BAM_2745     FALSE 0.018 634.000 0.000 NA N NA
 6053980 6053981 BAM_2745 BAM_2746   dnaN2 TRUE 0.926 32.000 0.007 1.000 Y NA
 6053981 6053982 BAM_2746 BAM_2747 dnaN2   TRUE 0.946 23.000 0.004 1.000 Y NA
 6053982 6053983 BAM_2747 BAM_2748     FALSE 0.567 98.000 0.021 NA   NA
 6053983 6053984 BAM_2748 BAM_2749     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6053986 6053987 BAM_2751 BAM_2752     TRUE 0.718 136.000 0.250 NA   NA
 6053987 6053988 BAM_2752 BAM_2753     TRUE 0.720 119.000 0.111 NA   NA
 6053989 6053990 BAM_2754 BAM_2755     FALSE 0.466 79.000 0.082 NA   NA
 6053990 6053991 BAM_2755 BAM_2756     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6053991 6053992 BAM_2756 BAM_2757     FALSE 0.483 89.000 0.000 NA   NA
 6053992 6053993 BAM_2757 BAM_2758     FALSE 0.052 266.000 0.000 NA   NA
 6053993 6053994 BAM_2758 BAM_2759     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6053996 6053997 BAM_2761 BAM_2762     TRUE 0.678 2.000 0.108 NA   NA
 6053997 6053998 BAM_2762 BAM_2763     FALSE 0.619 17.000 0.108 NA   NA
 6053998 6053999 BAM_2763 BAM_2764     TRUE 0.647 64.000 0.171 NA N NA
 6053999 6054000 BAM_2764 BAM_2765     TRUE 0.783 83.000 0.280 NA N NA
 6054002 6054003 BAM_2767 BAM_2768     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6054003 6054004 BAM_2768 BAM_2769     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6054004 6054005 BAM_2769 BAM_2770     FALSE 0.320 181.000 0.179 NA   NA
 6054006 6054007 BAM_2771 BAM_2772     TRUE 0.886 140.000 0.833 NA   NA
 6054008 6054009 BAM_2773 BAM_2774     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054009 6054010 BAM_2774 BAM_2775     FALSE 0.519 150.000 0.000 NA   NA
 6054010 6054011 BAM_2775 BAM_2776     FALSE 0.623 139.000 0.000 NA   NA
 6054011 6054012 BAM_2776 BAM_2777     FALSE 0.272 -31.000 0.000 NA   NA
 6054012 6054013 BAM_2777 BAM_2778     TRUE 0.719 126.000 0.099 NA   NA
 6054013 6054014 BAM_2778 BAM_2779     FALSE 0.588 148.000 0.167 NA   NA
 6054014 6054015 BAM_2779 BAM_2780     TRUE 0.662 139.000 0.097 NA   NA
 6054015 6054016 BAM_2780 BAM_2781     TRUE 0.665 109.000 0.081 NA   NA
 6054016 6054017 BAM_2781 BAM_2782     TRUE 0.669 137.000 0.088 NA   NA
 6054018 6054019 BAM_2783 BAM_2784     FALSE 0.222 202.000 0.250 NA   NA
 6054019 6054020 BAM_2784 BAM_2785     FALSE 0.005 967.000 0.000 NA   NA
 6054021 6054022 BAM_2786 BAM_2787     TRUE 0.686 56.000 0.143 1.000 N NA
 6054022 6054023 BAM_2787 BAM_2788     FALSE 0.606 33.000 0.286 1.000   NA
 6054023 6054024 BAM_2788 BAM_2789     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6054024 6054025 BAM_2789 BAM_2790     FALSE 0.005 662.000 0.000 NA   NA
 6054027 6054028 BAM_2792 BAM_2793     FALSE 0.009 460.000 0.000 NA   NA
 6054028 6054029 BAM_2793 BAM_2794     TRUE 0.719 1.000 0.265 NA   NA
 6054029 6054030 BAM_2794 BAM_2795     FALSE 0.194 251.000 0.000 NA N NA
 6054032 6054033 BAM_2797 BAM_2798     TRUE 0.693 135.000 0.143 NA   NA
 6054034 6054035 BAM_2799 BAM_2800     FALSE 0.021 360.000 0.000 1.000   NA
 6054035 6054036 BAM_2800 BAM_2802     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6054037 6054038 BAM_2801 BAM_2803     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6054040 6054041 BAM_2805 BAM_2806     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6054041 6054042 BAM_2806 BAM_2807     FALSE 0.333 56.000 0.000 NA   NA
 6054042 6054043 BAM_2807 BAM_2808     FALSE 0.630 108.000 0.000 NA   NA
 6054043 6054044 BAM_2808 BAM_2809     FALSE 0.616 26.000 0.280 NA   NA
 6054044 6054045 BAM_2809 BAM_2810     TRUE 0.701 113.000 0.143 NA   NA
 6054045 6054046 BAM_2810 BAM_2811   ypeB FALSE 0.541 27.000 0.105 NA   NA
 6054046 6054047 BAM_2811 BAM_2812 ypeB sleB TRUE 0.754 16.000 0.408 NA   NA
 6054049 6054050 BAM_2814 BAM_2815   kynA TRUE 0.894 117.000 0.066 1.000 N NA
 6054050 6054051 BAM_2815 BAM_2816 kynA kynB FALSE 0.540 34.000 0.165 1.000   NA
 6054051 6054052 BAM_2816 BAM_2817 kynB kynU TRUE 0.819 3.000 0.382 1.000   NA
 6054056 6054057 BAM_2821 BAM_2822     TRUE 0.677 152.000 0.385 NA   NA
 6054057 6054058 BAM_2822 BAM_2823     TRUE 0.884 137.000 0.750 NA   NA
 6054058 6054059 BAM_2823 BAM_2824     TRUE 0.724 112.000 0.250 NA   NA
 6054059 6054060 BAM_2824 BAM_2825     TRUE 0.735 125.000 0.208 NA   NA
 6054060 6054061 BAM_2825 BAM_2826     TRUE 0.782 18.000 0.500 NA   NA
 6054061 6054062 BAM_2826 BAM_2827     TRUE 0.670 151.000 0.350 NA   NA
 6054062 6054063 BAM_2827 BAM_2828     TRUE 0.892 13.000 0.350 1.000 N NA
 6054065 6054066 BAM_2830 BAM_2831     FALSE 0.513 33.000 0.022 1.000   NA
 6054066 6054067 BAM_2831 BAM_2832     TRUE 0.825 94.000 0.111 1.000 N NA
 6054067 6054068 BAM_2832 BAM_2833     FALSE 0.331 58.000 0.000 NA   NA
 6054068 6054069 BAM_2833 BAM_2834     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6054071 6054072 BAM_2836 BAM_2837 acoL acoC TRUE 0.964 16.000 0.294 1.000 Y NA
 6054072 6054073 BAM_2837 BAM_2838 acoC acoB TRUE 0.953 28.000 0.295 0.079 Y NA
 6054073 6054074 BAM_2838 BAM_2839 acoB acoA TRUE 0.981 18.000 0.804 0.001 Y NA
 6054074 6054075 BAM_2839 BAM_2840 acoA   FALSE 0.360 -16.000 0.033 NA   NA
 6054075 6054076 BAM_2840 BAM_2841     FALSE 0.505 31.000 0.150 NA   NA
 6054077 6054078 BAM_2842 BAM_2843     FALSE 0.420 42.000 0.143 NA   NA
 6054079 6054080 BAM_2844 BAM_2845     TRUE 0.737 20.000 0.429 NA   NA
 6054080 6054081 BAM_2845 BAM_2846     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6054081 6054082 BAM_2846 BAM_2847     FALSE 0.511 93.000 0.000 NA   NA
 6054082 6054083 BAM_2847 BAM_2848     FALSE 0.342 69.000 0.000 NA   NA
 6054083 6054084 BAM_2848 BAM_2849     TRUE 0.662 115.000 0.000 NA   NA
 6054084 6054085 BAM_2849 BAM_2850     FALSE 0.008 477.000 0.000 NA   NA
 6054085 6054086 BAM_2850 BAM_2851   proV2 TRUE 0.941 -7.000 0.094 0.096 Y NA
 6054088 6054089 BAM_2853 BAM_2854 clpP1   TRUE 0.906 22.000 0.647 1.000 N NA
 6054090 6054091 BAM_2855 BAM_2856   rpiA TRUE 0.878 5.000 0.011 1.000 N NA
 6054091 6054092 BAM_2856 BAM_2857 rpiA   TRUE 0.702 108.000 0.011 1.000   NA
 6054093 6054094 BAM_2858 BAM_2859     FALSE 0.012 438.000 0.000 1.000   NA
 6054094 6054095 BAM_2859 BAM_2860     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054095 6054096 BAM_2860 BAM_2861     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6054096 6054097 BAM_2861 BAM_2862     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054097 6054098 BAM_2862 BAM_2863     FALSE 0.351 66.000 0.055 NA   NA
 6054098 6054099 BAM_2863 BAM_2864     FALSE 0.604 19.000 0.115 NA   NA
 6054099 6054100 BAM_2864 BAM_2865     FALSE 0.624 106.000 0.000 NA   NA
 6054100 6054101 BAM_2865 BAM_2866     FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6054101 6054102 BAM_2866 BAM_2867     TRUE 0.649 13.000 0.135 NA   NA
 6054103 6054104 BAM_2868 BAM_2869     TRUE 0.706 3.000 0.231 NA   NA
 6054105 6054106 BAM_2870 BAM_2871     FALSE 0.190 207.000 0.000 1.000   NA
 6054106 6054107 BAM_2871 BAM_2872     TRUE 0.833 27.000 0.875 NA   NA
 6054107 6054108 BAM_2872 BAM_2873     TRUE 0.780 -3.000 0.500 NA   NA
 6054108 6054109 BAM_2873 BAM_2874     FALSE 0.585 145.000 0.035 NA   NA
 6054109 6054110 BAM_2874 BAM_2875     FALSE 0.427 35.000 0.049 NA   NA
 6054110 6054111 BAM_2875 BAM_2876     FALSE 0.476 -13.000 0.262 NA   NA
 6054111 6054112 BAM_2876 BAM_2877     FALSE 0.350 170.000 0.021 NA   NA
 6054112 6054113 BAM_2877 BAM_2878     FALSE 0.331 63.000 0.011 NA   NA
 6054115 6054116 BAM_2880 BAM_2881     FALSE 0.281 185.000 0.156 NA   NA
 6054116 6054117 BAM_2881 BAM_2882   recQ2 FALSE 0.524 26.000 0.050 NA   NA
 6054118 6054119 BAM_2883 BAM_2884     FALSE 0.006 618.000 0.000 NA   NA
 6054120 6054121 BAM_2885 BAM_2886     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6054123 6054124 BAM_2888 BAM_2889     FALSE 0.242 -48.000 0.000 NA   NA
 6054124 6054125 BAM_2889 BAM_2890   ppaC FALSE 0.624 106.000 0.000 NA   NA
 6054125 6054126 BAM_2890 BAM_2891 ppaC   FALSE 0.498 162.000 0.018 1.000   NA
 6054126 6054127 BAM_2891 BAM_2892     FALSE 0.132 225.000 0.014 1.000   NA
 6054127 6054128 BAM_2892 BAM_2893     FALSE 0.149 218.000 0.000 1.000   NA
 6054128 6054129 BAM_2893 BAM_2894     TRUE 0.719 103.000 0.206 1.000   NA
 6054129 6054130 BAM_2894 BAM_2895     TRUE 0.906 108.000 0.368 1.000 N NA
 6054130 6054131 BAM_2895 BAM_2896   dapA1 TRUE 0.893 19.000 0.474 1.000 N NA
 6054131 6054132 BAM_2896 BAM_2897 dapA1   TRUE 0.963 23.000 0.474 1.000 Y NA
 6054132 6054133 BAM_2897 BAM_2898     TRUE 0.980 -3.000 0.750 0.001 Y NA
 6054133 6054134 BAM_2898 BAM_2899     TRUE 0.960 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 6054135 6054136 BAM_2900 BAM_2901     FALSE 0.166 202.000 0.000 NA   NA
 6054136 6054137 BAM_2901 BAM_2902     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054137 6054138 BAM_2902 BAM_2903   gidA1 FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054139 6054140 BAM_2904 BAM_2905     TRUE 0.730 -12.000 0.722 NA   NA
 6054141 6054142 BAM_2906 BAM_2907     FALSE 0.086 235.000 0.000 NA   NA
 6054145 6054146 BAM_2910 BAM_2911 dltD2   FALSE 0.175 267.000 0.000 1.000 N NA
 6054146 6054147 BAM_2911 BAM_2912     TRUE 0.936 118.000 0.500 1.000 N NA
 6054147 6054148 BAM_2912 BAM_2913     TRUE 0.841 21.000 0.308 NA N NA
 6054148 6054149 BAM_2913 BAM_2914     TRUE 0.902 40.000 0.147 NA Y NA
 6054149 6054150 BAM_2914 BAM_2915     FALSE 0.503 152.000 0.000 NA   NA
 6054150 6054151 BAM_2915 BAM_2916   divIC2 FALSE 0.058 260.000 0.000 NA   NA
 6054151 6054152 BAM_2916 BAM_2917 divIC2   FALSE 0.007 500.000 0.000 NA   NA
 6054154 6054155 BAM_2919 BAM_2920     FALSE 0.027 312.000 0.000 NA   NA
 6054155 6054156 BAM_2920 BAM_2921     FALSE 0.166 202.000 0.000 NA   NA
 6054158 6054159 BAM_2923 BAM_2924     FALSE 0.232 201.000 0.051 1.000   NA
 6054159 6054160 BAM_2924 BAM_2925     TRUE 0.940 -7.000 0.256 1.000 Y NA
 6054162 6054163 BAM_2927 BAM_2928     FALSE 0.050 269.000 0.000 NA   NA
 6054163 6054164 BAM_2928 BAM_2929     FALSE 0.340 53.000 0.000 NA   NA
 6054164 6054165 BAM_2929 BAM_2930     FALSE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 6054165 6054166 BAM_2930 BAM_2931     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054166 6054167 BAM_2931 BAM_2932     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054167 6054168 BAM_2932 BAM_2933     FALSE 0.383 38.000 0.000 NA   NA
 6054168 6054169 BAM_2933 BAM_2934     FALSE 0.146 207.000 0.000 NA   NA
 6054169 6054170 BAM_2934 BAM_2935     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054171 6054172 BAM_2936 BAM_2937     FALSE 0.074 244.000 0.000 NA   NA
 6054175 6054176 BAM_2940 BAM_2941     TRUE 0.714 25.000 0.438 NA   NA
 6054176 6054177 BAM_2941 BAM_2942     TRUE 0.825 19.000 0.667 NA   NA
 6054177 6054178 BAM_2942 BAM_2943     TRUE 0.825 14.000 0.577 NA   NA
 6054178 6054179 BAM_2943 BAM_2944     FALSE 0.534 161.000 0.269 NA   NA
 6054181 6054182 BAM_2946 BAM_2947     FALSE 0.572 28.000 0.250 NA   NA
 6054182 6054183 BAM_2947 BAM_2948     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6054183 6054184 BAM_2948 BAM_2949     FALSE 0.305 -22.000 0.000 NA   NA
 6054184 6054185 BAM_2949 BAM_2950     TRUE 0.703 78.000 0.583 NA   NA
 6054185 6054186 BAM_2950 BAM_2951     FALSE 0.601 174.000 0.500 1.000   NA
 6054186 6054187 BAM_2951 BAM_2952     TRUE 0.768 78.000 0.778 NA   NA
 6054187 6054188 BAM_2952 BAM_2953     FALSE 0.431 79.000 0.000 NA   NA
 6054188 6054189 BAM_2953 BAM_2954     FALSE 0.191 196.000 0.000 NA   NA
 6054189 6054190 BAM_2954 BAM_2955     TRUE 0.816 152.000 0.750 NA   NA
 6054191 6054192 BAM_2956 BAM_2957     FALSE 0.568 51.000 0.455 NA   NA
 6054192 6054193 BAM_2957 BAM_2958     FALSE 0.054 265.000 0.000 NA   NA
 6054193 6054194 BAM_2958 BAM_2959     FALSE 0.503 152.000 0.000 NA   NA
 6054194 6054195 BAM_2959 BAM_2960     FALSE 0.259 -34.000 0.000 NA   NA
 6054195 6054196 BAM_2960 BAM_2961     FALSE 0.332 171.000 0.000 NA   NA
 6054196 6054197 BAM_2961 BAM_2962     FALSE 0.302 181.000 0.080 NA   NA
 6054197 6054198 BAM_2962 BAM_2963     TRUE 0.650 57.000 0.120 NA N NA
 6054198 6054199 BAM_2963 BAM_2964   coaA TRUE 0.788 93.000 0.072 NA N NA
 6054200 6054201 BAM_2965 BAM_2966     FALSE 0.222 188.000 0.000 NA   NA
 6054201 6054202 BAM_2966 BAM_2967     FALSE 0.329 60.000 0.000 NA   NA
 6054202 6054203 BAM_2967 BAM_2968     FALSE 0.428 33.000 0.000 NA   NA
 6054203 6054204 BAM_2968 BAM_2969     TRUE 0.820 -3.000 0.636 NA   NA
 6054204 6054205 BAM_2969 BAM_2970     FALSE 0.612 104.000 0.000 NA   NA
 6054205 6054206 BAM_2970 BAM_2971     TRUE 0.685 124.000 0.000 NA   NA
 6054207 6054208 BAM_2972 BAM_2973     FALSE 0.599 165.000 0.429 NA   NA
 6054208 6054209 BAM_2973 BAM_2974     TRUE 0.836 28.000 1.000 NA   NA
 6054209 6054210 BAM_2974 BAM_2975     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6054210 6054211 BAM_2975 BAM_2976     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6054211 6054212 BAM_2976 BAM_2977     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6054212 6054213 BAM_2977 BAM_2978     FALSE 0.571 26.000 0.222 NA   NA
 6054216 6054217 BAM_2981 BAM_2982   ssuD FALSE 0.600 144.000 0.051 NA   NA
 6054217 6054218 BAM_2982 BAM_2983 ssuD   TRUE 0.737 77.000 0.034 1.000 N NA
 6054218 6054219 BAM_2983 BAM_2984     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6054219 6054220 BAM_2984 BAM_2985     FALSE 0.581 100.000 0.000 NA   NA
 6054220 6054221 BAM_2985 BAM_2986     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6054221 6054222 BAM_2986 BAM_2987     FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 6054222 6054223 BAM_2987 BAM_2988     FALSE 0.356 47.000 0.000 NA   NA
 6054223 6054224 BAM_2988 BAM_2989     FALSE 0.137 210.000 0.000 NA   NA
 6054224 6054225 BAM_2989 BAM_2990     TRUE 0.692 104.000 0.250 NA   NA
 6054225 6054226 BAM_2990 BAM_2991     FALSE 0.549 -7.000 0.250 NA   NA
 6054226 6054227 BAM_2991 BAM_2992     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054227 6054228 BAM_2992 BAM_2993     TRUE 0.684 124.000 0.002 NA   NA
 6054228 6054229 BAM_2993 BAM_2994   aacC7 FALSE 0.583 16.000 0.008 NA   NA
 6054231 6054232 BAM_2996 BAM_2997     TRUE 0.846 21.000 0.800 NA   NA
 6054232 6054233 BAM_2997 BAM_2998     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054233 6054234 BAM_2998 BAM_2999     FALSE 0.252 -37.000 0.000 NA   NA
 6054234 6054235 BAM_2999 BAM_3000     FALSE 0.599 57.000 0.538 NA   NA
 6054235 6054236 BAM_3000 BAM_3001     FALSE 0.498 70.000 0.333 NA   NA
 6054236 6054237 BAM_3001 BAM_3002     TRUE 0.780 16.000 0.467 NA   NA
 6054237 6054238 BAM_3002 BAM_3003     TRUE 0.950 35.000 0.500 0.022 Y NA
 6054238 6054239 BAM_3003 BAM_3004     TRUE 0.695 16.000 0.179 1.000   NA
 6054239 6054240 BAM_3004 BAM_3005     FALSE 0.625 17.000 0.179 NA   NA
 6054240 6054241 BAM_3005 BAM_3006     FALSE 0.015 366.000 0.000 NA   NA
 6054241 6054242 BAM_3006 BAM_3007     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6054243 6054244 BAM_3008 BAM_3009     FALSE 0.496 160.000 0.200 NA   NA
 6054244 6054245 BAM_3009 BAM_3010     TRUE 0.668 111.000 0.067 NA   NA
 6054246 6054247 BAM_3011 BAM_3012     FALSE 0.010 517.000 0.000 1.000   NA
 6054247 6054248 BAM_3012 BAM_3013     FALSE 0.013 378.000 0.000 NA   NA
 6054248 6054249 BAM_3013 BAM_3014     FALSE 0.038 287.000 0.000 NA   NA
 6054249 6054250 BAM_3014 BAM_3015     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6054250 6054251 BAM_3015 BAM_3016     FALSE 0.064 254.000 0.000 NA   NA
 6054251 6054252 BAM_3016 BAM_3017     FALSE 0.065 270.000 0.000 1.000   NA
 6054252 6054253 BAM_3017 BAM_3018   aroA FALSE 0.295 186.000 0.005 1.000   NA
 6054253 6054254 BAM_3018 BAM_3019 aroA tyrA TRUE 0.957 17.000 0.069 1.000 Y NA
 6054254 6054255 BAM_3019 BAM_3020 tyrA hisC2 TRUE 0.934 -7.000 0.062 1.000 Y NA
 6054255 6054256 BAM_3020 BAM_3021 hisC2 aroC2 TRUE 0.952 19.000 0.007 1.000 Y NA
 6054256 6054257 BAM_3021 BAM_3022 aroC2   TRUE 0.685 123.000 0.000 NA   NA
 6054257 6054258 BAM_3022 BAM_3023     FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 6054258 6054259 BAM_3023 BAM_3024     FALSE 0.007 541.000 0.000 NA   NA
 6054259 6054260 BAM_3024 BAM_3025     FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 6054262 6054263 BAM_3027 BAM_3028     TRUE 0.876 17.000 0.231 0.076 N NA
 6054263 6054264 BAM_3028 BAM_3029     FALSE 0.618 20.000 0.231 NA   NA
 6054266 6054267 BAM_3031 BAM_3032     FALSE 0.227 187.000 0.000 NA   NA
 6054267 6054268 BAM_3032 BAM_3033     FALSE 0.362 44.000 0.000 NA   NA
 6054268 6054269 BAM_3033 BAM_3034     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6054269 6054270 BAM_3034 BAM_3035     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6054271 6054272 BAM_3036 BAM_3037     TRUE 0.684 125.000 0.000 NA   NA
 6054275 6054276 BAM_3040 BAM_3041     TRUE 0.976 -3.000 0.844 NA Y NA
 6054278 6054279 BAM_3042 BAM_3044     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054280 6054281 BAM_3045 BAM_3046     TRUE 0.883 0.000 0.250 1.000 N NA
 6054281 6054282 BAM_3046 BAM_3047     TRUE 0.944 26.000 0.062 1.000 Y NA
 6054282 6054283 BAM_3047 BAM_3048     TRUE 0.965 7.000 0.031 1.000 Y NA
 6054284 6054285 BAM_3049 BAM_3050     FALSE 0.027 337.000 0.000 1.000   NA
 6054285 6054286 BAM_3050 BAM_3051     FALSE 0.525 83.000 0.222 NA   NA
 6054286 6054287 BAM_3051 BAM_3052     FALSE 0.581 97.000 0.071 NA   NA
 6054287 6054288 BAM_3052 BAM_3053     FALSE 0.612 97.000 0.214 NA   NA
 6054288 6054289 BAM_3053 BAM_3054     FALSE 0.637 52.000 0.600 NA   NA
 6054290 6054291 BAM_3055 BAM_3056     FALSE 0.156 204.000 0.000 NA   NA
 6054292 6054293 BAM_3057 BAM_3058 proA proB TRUE 0.950 30.000 0.281 0.002 Y NA
 6054293 6054294 BAM_3058 BAM_3059 proB   FALSE 0.008 494.000 0.000 NA   NA
 6054296 6054297 BAM_3061 BAM_3062 rocB   FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6054298 6054299 BAM_4878 BAM_4879   gap1 FALSE 0.515 85.000 0.111 NA   NA
 6054299 6054300 BAM_4879 BAM_4880 gap1   TRUE 0.876 110.000 0.020 1.000 N NA
 6054300 6054301 BAM_4880 BAM_4881     FALSE 0.356 52.000 0.038 NA   NA
 6054301 6054302 BAM_4881 BAM_4882   mutM FALSE 0.389 73.000 0.050 NA   NA
 6054302 6054303 BAM_4882 BAM_4883 mutM polA TRUE 0.962 13.000 0.101 1.000 Y NA
 6054303 6054304 BAM_4883 BAM_4884 polA phoR FALSE 0.135 287.000 0.006 1.000 N NA
 6054304 6054305 BAM_4884 BAM_4885 phoR phoP TRUE 0.942 -7.000 0.159 0.082 Y NA
 6054305 6054306 BAM_4885 BAM_4886 phoP   FALSE 0.535 148.000 0.000 NA   NA
 6054308 6054309 BAM_4888 BAM_4889   mdh FALSE 0.345 217.000 0.022 1.000 N NA
 6054309 6054310 BAM_4889 BAM_4890 mdh citC TRUE 0.954 20.000 0.115 1.000 Y NA
 6054310 6054311 BAM_4890 BAM_4891 citC citZ TRUE 0.928 161.000 0.140 1.000 Y NA
 6054311 6054312 BAM_4891 BAM_4892 citZ   FALSE 0.013 388.000 0.039 NA   NA
 6054314 6054315 BAM_4894 BAM_4895   pyk FALSE 0.245 200.000 0.082 1.000   NA
 6054315 6054316 BAM_4895 BAM_4896 pyk pfkA TRUE 0.915 54.000 0.261 0.004 Y NA
 6054316 6054317 BAM_4896 BAM_4897 pfkA accA TRUE 0.894 129.000 0.047 1.000 N NA
 6054317 6054318 BAM_4897 BAM_4898 accA accD TRUE 0.932 -12.000 0.234 0.001 Y NA
 6054318 6054319 BAM_4898 BAM_4899 accD   FALSE 0.552 186.000 0.032 1.000 N NA
 6054319 6054320 BAM_4899 BAM_4900     TRUE 0.913 15.000 0.514 1.000 N NA
 6054320 6054321 BAM_4900 BAM_4901   dnaE TRUE 0.873 104.000 0.127 1.000 N NA
 6054322 6054323 BAM_4902 BAM_4903     TRUE 0.769 -3.000 0.481 NA   NA
 6054324 6054325 BAM_4904 BAM_4905     FALSE 0.526 93.000 0.038 NA   NA
 6054327 6054328 BAM_4907 BAM_4908     FALSE 0.274 181.000 0.000 NA   NA
 6054328 6054329 BAM_4908 BAM_4909     FALSE 0.235 194.000 0.120 NA   NA
 6054333 6054334 BAM_4913 BAM_4914     TRUE 0.666 21.000 0.300 NA   NA
 6054336 6054337 BAM_4916 BAM_4917     FALSE 0.012 392.000 0.000 NA   NA
 6054337 6054338 BAM_4917 BAM_4918     FALSE 0.422 73.000 0.160 NA   NA
 6054338 6054339 BAM_4918 BAM_4919     TRUE 0.739 3.000 0.280 NA   NA
 6054339 6054340 BAM_4919 BAM_4920     TRUE 0.718 -3.000 0.368 NA   NA
 6054340 6054341 BAM_4920 BAM_4921     FALSE 0.499 45.000 0.316 NA   NA
 6054342 6054343 BAM_4922 BAM_4923     TRUE 0.812 -3.000 0.600 NA   NA
 6054344 6054345 BAM_4924 BAM_4925 ald2   FALSE 0.357 214.000 0.000 1.000 N NA
 6054349 6054350 BAM_4929 BAM_4930   argH2 FALSE 0.571 99.000 0.006 NA   NA
 6054350 6054351 BAM_4930 BAM_4931 argH2 argG TRUE 0.960 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 6054352 6054353 BAM_4932 BAM_4933     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054355 6054356 BAM_4935 BAM_4936     FALSE 0.006 632.000 0.000 NA   NA
 6054358 6054359 BAM_4938 BAM_4939     FALSE 0.412 72.000 0.125 NA   NA
 6054360 6054361 BAM_4940 BAM_4941 ackA   FALSE 0.128 299.000 0.217 1.000 N NA
 6054361 6054362 BAM_4941 BAM_4942     FALSE 0.472 200.000 0.089 1.000 N NA
 6054362 6054363 BAM_4942 BAM_4943     TRUE 0.650 135.000 0.018 NA   NA
 6054363 6054364 BAM_4943 BAM_4944     TRUE 0.875 13.000 0.800 NA   NA
 6054366 6054367 BAM_4946 BAM_4947     FALSE 0.399 70.000 0.146 NA   NA
 6054367 6054368 BAM_4947 BAM_4948     TRUE 0.655 103.000 0.156 NA   NA
 6054368 6054369 BAM_4948 BAM_4949   sspB FALSE 0.067 278.000 0.111 1.000   NA
 6054369 6054370 BAM_4949 BAM_4950 sspB thiI FALSE 0.532 81.000 0.018 1.000   NA
 6054370 6054371 BAM_4950 BAM_4951 thiI   TRUE 0.904 7.000 0.349 1.000 N NA
 6054371 6054372 BAM_4951 BAM_4952   ezrA TRUE 0.706 169.000 0.201 1.000 N NA
 6054376 6054377 BAM_4956 BAM_4957     FALSE 0.362 72.000 0.000 NA   NA
 6054379 6054380 BAM_4959 BAM_4960 megL   FALSE 0.048 270.000 0.000 NA   NA
 6054384 6054385 BAM_4964 BAM_4965 tyrS1   FALSE 0.013 377.000 0.000 NA   NA
 6054385 6054386 BAM_4965 BAM_4966     FALSE 0.347 -19.000 0.059 NA   NA
 6054386 6054387 BAM_4966 BAM_4967     FALSE 0.347 -19.000 0.059 NA   NA
 6054387 6054388 BAM_4967 BAM_4968   acsA FALSE 0.043 278.000 0.000 NA   NA
 6054389 6054390 BAM_4969 BAM_4970 acuA acuB TRUE 0.731 18.000 0.143 0.075   NA
 6054390 6054391 BAM_4970 BAM_4971 acuB acuC TRUE 0.843 -3.000 0.075 1.000 N NA
 6054392 6054393 BAM_4972 BAM_4973     FALSE 0.145 215.000 0.150 NA   NA
 6054393 6054394 BAM_4973 BAM_4974     TRUE 0.982 2.000 0.725 1.000 Y NA
 6054395 6054396 BAM_4975 BAM_4976     FALSE 0.460 80.000 0.049 NA   NA
 6054396 6054397 BAM_4976 BAM_4977   mscL TRUE 0.740 129.000 0.012 1.000   NA
 6054399 6054400 BAM_4979 BAM_4980     TRUE 0.805 82.000 0.857 NA   NA
 6054400 6054401 BAM_4980 BAM_4981     TRUE 0.850 2.000 0.583 NA   NA
 6054402 6054403 BAM_4982 BAM_4983 ccpA   FALSE 0.007 529.000 0.000 NA   NA
 6054403 6054404 BAM_4983 BAM_4984     TRUE 0.702 118.000 0.069 NA   NA
 6054404 6054405 BAM_4984 BAM_4985     TRUE 0.649 0.000 0.079 NA   NA
 6054407 6054408 BAM_4987 BAM_4988     TRUE 0.764 16.000 0.429 NA   NA
 6054408 6054409 BAM_4988 BAM_4989     TRUE 0.758 -3.000 0.444 NA   NA
 6054409 6054410 BAM_4989 BAM_4990     FALSE 0.545 92.000 0.097 NA   NA
 6054410 6054411 BAM_4990 BAM_4991   murC FALSE 0.472 197.000 0.005 1.000 N NA
 6054411 6054412 BAM_4991 BAM_4992 murC   FALSE 0.215 253.000 0.002 1.000 N NA
 6054412 6054413 BAM_4992 BAM_4993     TRUE 0.674 62.000 0.084 1.000 N NA
 6054413 6054414 BAM_4993 BAM_4994     FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 6054414 6054415 BAM_4994 BAM_4995     FALSE 0.028 312.000 0.034 NA   NA
 6054415 6054416 BAM_4995 BAM_4996     TRUE 0.790 -3.000 0.511 NA   NA
 6054416 6054417 BAM_4996 BAM_4997     FALSE 0.578 59.000 0.500 NA   NA
 6054417 6054418 BAM_4997 BAM_4998     FALSE 0.487 84.000 0.062 NA   NA
 6054418 6054419 BAM_4998 BAM_4999     FALSE 0.087 242.000 0.084 NA   NA
 6054421 6054422 BAM_5001 BAM_5002   trmB FALSE 0.465 70.000 0.117 1.000   NA
 6054424 6054425 BAM_5004 BAM_5005     FALSE 0.264 230.000 0.078 NA N NA
 6054425 6054426 BAM_5005 BAM_5006     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6054426 6054427 BAM_5006 BAM_5007     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6054427 6054428 BAM_5007 BAM_5008     TRUE 0.873 104.000 0.138 1.000 N NA
 6054430 6054431 BAM_5010 BAM_5011     FALSE 0.473 42.000 0.082 1.000   NA
 6054432 6054433 BAM_5012 BAM_5013     FALSE 0.326 -19.000 0.000 NA   NA
 6054433 6054434 BAM_5013 BAM_5014     FALSE 0.233 -70.000 0.000 NA   NA
 6054435 6054436 BAM_5015 BAM_5016     TRUE 0.792 1.000 0.413 NA   NA
 6054438 6054439 BAM_5018 BAM_5019     TRUE 0.719 2.000 0.258 NA   NA
 6054440 6054441 BAM_5020 BAM_5021     FALSE 0.224 -440.000 0.000 NA   NA
 6054442 6054443 BAM_5022 BAM_5023 gdH glcU TRUE 0.931 14.000 0.700 1.000 N NA
 6054443 6054444 BAM_5023 BAM_5024 glcU   TRUE 0.766 37.000 0.875 NA   NA
 6054444 6054445 BAM_5024 BAM_5025   moaD3 FALSE 0.526 94.000 0.014 NA   NA
 6054445 6054446 BAM_5025 BAM_5026 moaD3 moaE3 TRUE 0.981 3.000 0.501 0.005 Y NA
 6054446 6054447 BAM_5026 BAM_5027 moaE3 mobB TRUE 0.960 -3.000 0.040 0.005 Y NA
 6054447 6054448 BAM_5027 BAM_5028 mobB moeA3 TRUE 0.884 -30.000 0.200 0.005 Y NA
 6054450 6054451 BAM_5030 BAM_5031     TRUE 0.978 17.000 0.778 1.000 Y NA
 6054451 6054452 BAM_5031 BAM_5032     FALSE 0.376 175.000 0.000 1.000   NA
 6054452 6054453 BAM_5032 BAM_5033     FALSE 0.312 174.000 0.000 NA   NA
 6054453 6054454 BAM_5033 BAM_5034     TRUE 0.871 15.000 0.800 NA   NA
 6054454 6054455 BAM_5034 BAM_5035     FALSE 0.599 78.000 0.381 NA   NA
 6054458 6054459 BAM_5040 BAM_5041   gerHB TRUE 0.829 18.000 0.450 0.008   NA
 6054459 6054460 BAM_5041 BAM_5042 gerHB gerHC TRUE 0.733 -24.000 0.800 0.008   NA
 6054460 6054461 BAM_5042 BAM_5043 gerHC   TRUE 0.824 91.000 0.800 NA   NA
 6054461 6054462 BAM_5043 BAM_5044     FALSE 0.253 190.000 0.121 NA   NA
 6054465 6054466 BAM_5047 BAM_5048 leuS   FALSE 0.027 475.000 0.000 NA N NA
 6054466 6054467 BAM_5048 BAM_5049     FALSE 0.174 370.000 0.000 NA Y NA
 6054467 6054468 BAM_5049 BAM_5050     TRUE 0.985 4.000 0.875 1.000 Y NA
 6054468 6054469 BAM_5050 BAM_5051     TRUE 0.742 35.000 0.636 1.000   NA
 6054469 6054470 BAM_5051 BAM_5052     FALSE 0.023 350.000 0.000 1.000   NA
 6054470 6054471 BAM_5052 BAM_5053     TRUE 0.742 19.000 0.333 1.000   NA
 6054471 6054472 BAM_5053 BAM_5054     FALSE 0.019 339.000 0.000 NA   NA
 6054472 6054473 BAM_5054 BAM_5055     TRUE 0.764 137.000 0.333 NA   NA
 6054473 6054474 BAM_5055 BAM_5056     TRUE 0.819 16.000 0.583 NA   NA
 6054475 6054476 BAM_5057 BAM_5058     TRUE 0.774 -3.000 0.408 1.000   NA
 6054476 6054477 BAM_5058 BAM_5059     FALSE 0.240 198.000 0.031 1.000   NA
 6054477 6054478 BAM_5059 BAM_5060     FALSE 0.614 19.000 0.208 NA   NA
 6054478 6054479 BAM_5060 BAM_5061     FALSE 0.597 25.000 0.250 NA   NA
 6054479 6054480 BAM_5061 BAM_5062     FALSE 0.630 156.000 0.263 1.000   NA
 6054481 6054482 BAM_5063 BAM_5064     FALSE 0.360 62.000 0.080 NA   NA
 6054485 6054486 BAM_5067 BAM_5068     TRUE 0.651 145.000 0.019 1.000   NA
 6054486 6054487 BAM_5068 BAM_5069     TRUE 0.890 13.000 0.333 1.000 N NA
 6054488 6054489 BAM_5070 BAM_5071     TRUE 0.960 -3.000 0.056 0.005 Y NA
 6054490 6054491 BAM_5072 BAM_5073     TRUE 0.775 7.000 0.375 NA   NA
 6054493 6054494 BAM_5075 BAM_5076   pckA TRUE 0.641 3.000 0.005 NA   NA
 6054494 6054495 BAM_5076 BAM_5077 pckA   FALSE 0.036 290.000 0.000 NA   NA
 6054498 6054499 BAM_5080 BAM_5081     FALSE 0.032 299.000 0.000 NA   NA
 6054500 6054501 BAM_5082 BAM_5083     FALSE 0.513 25.000 0.013 NA   NA
 6054502 6054503 BAM_5084 BAM_5085     TRUE 0.973 -3.000 0.500 0.012 Y NA
 6054505 6054506 BAM_5087 BAM_5088     FALSE 0.226 -156.000 0.000 NA   NA
 6054506 6054507 BAM_5088 BAM_5089     FALSE 0.116 217.000 0.000 NA   NA
 6054507 6054508 BAM_5089 BAM_5090     TRUE 0.886 12.000 0.875 NA   NA
 6054509 6054510 BAM_5091 BAM_5092     TRUE 0.972 12.000 0.528 NA Y NA
 6054510 6054511 BAM_5092 BAM_5093     TRUE 0.968 -7.000 0.876 1.000 Y NA
 6054512 6054513 BAM_5094 BAM_5095     FALSE 0.083 237.000 0.000 NA   NA
 6054515 6054516 BAM_5097 BAM_5098   mutTA TRUE 0.688 112.000 0.101 NA   NA
 6054516 6054517 BAM_5098 BAM_5099 mutTA   FALSE 0.592 85.000 0.292 NA   NA
 6054518 6054519 BAM_5100 BAM_5101     FALSE 0.161 203.000 0.000 NA   NA
 6054523 6054524 BAM_5105 BAM_5106 cydA2 cydB2 TRUE 0.967 -10.000 0.939 0.034 Y NA
 6054525 6054526 BAM_5107 BAM_5108     TRUE 0.653 15.000 0.222 NA   NA
 6054526 6054527 BAM_5108 BAM_5109     FALSE 0.320 -31.000 0.200 NA   NA
 6054528 6054529 BAM_5110 BAM_5111     FALSE 0.304 193.000 0.300 NA   NA
 6054530 6054531 BAM_5112 BAM_5113     TRUE 0.657 98.000 0.263 NA   NA
 6054531 6054532 BAM_5113 BAM_5114     TRUE 0.725 13.000 0.316 NA   NA
 6054532 6054533 BAM_5114 BAM_5115     TRUE 0.655 22.000 0.294 NA   NA
 6054533 6054534 BAM_5115 BAM_5116     TRUE 0.769 81.000 0.706 NA   NA
 6054536 6054537 BAM_5118 BAM_5119   feoB TRUE 0.798 17.000 0.517 NA   NA
 6054537 6054538 BAM_5119 BAM_5120 feoB   TRUE 0.961 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 6054540 6054541 BAM_5122 BAM_5123     TRUE 0.978 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 6054541 6054542 BAM_5123 BAM_5124     TRUE 0.855 40.000 0.875 NA N NA
 6054542 6054543 BAM_5124 BAM_5125     TRUE 0.831 90.000 0.875 NA   NA
 6054543 6054544 BAM_5125 BAM_5126     FALSE 0.297 177.000 0.000 NA   NA
 6054544 6054545 BAM_5126 BAM_5127     FALSE 0.246 184.000 0.000 NA   NA
 6054546 6054547 BAM_5128 BAM_5129 hpt2   FALSE 0.198 259.000 0.015 1.000 N NA
 6054550 6054551 BAM_5132 BAM_5133     TRUE 0.660 18.000 0.262 NA   NA
 6054551 6054552 BAM_5133 BAM_5134     FALSE 0.007 535.000 0.000 NA   NA
 6054552 6054553 BAM_5134 BAM_5135     TRUE 0.705 75.000 0.667 NA   NA
 6054553 6054554 BAM_5135 BAM_5136     FALSE 0.033 297.000 0.000 NA   NA
 6054554 6054555 BAM_5136 BAM_5137     TRUE 0.859 0.000 0.667 NA   NA
 6054555 6054556 BAM_5137 BAM_5138     TRUE 0.826 143.000 0.500 1.000   NA
 6054556 6054557 BAM_5138 BAM_5139     TRUE 0.740 -13.000 0.700 1.000   NA
 6054558 6054559 BAM_5140 BAM_5141     FALSE 0.270 202.000 0.000 0.040   NA
 6054559 6054560 BAM_5141 BAM_5142     TRUE 0.982 3.000 0.727 1.000 Y NA
 6054560 6054561 BAM_5142 BAM_5143     TRUE 0.861 95.000 0.800 1.000   NA
 6054561 6054562 BAM_5143 BAM_5144     TRUE 0.774 75.000 0.700 0.090   NA
 6054562 6054563 BAM_5144 BAM_5145     TRUE 0.845 21.000 0.700 1.000   NA
 6054563 6054564 BAM_5145 BAM_5146     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054564 6054565 BAM_5146 BAM_5147     FALSE 0.619 105.000 0.000 NA   NA
 6054566 6054567 BAM_5148 BAM_5149   gntP3 TRUE 0.673 169.000 0.667 NA   NA
 6054567 6054568 BAM_5149 BAM_5150 gntP3   TRUE 0.734 49.000 0.292 1.000 N NA
 6054568 6054569 BAM_5150 BAM_5151     TRUE 0.898 0.000 0.333 1.000 N NA
 6054569 6054570 BAM_5151 BAM_5152     FALSE 0.577 -7.000 0.283 NA   NA
 6054570 6054571 BAM_5152 BAM_5153     TRUE 0.872 2.000 0.679 NA   NA
 6054571 6054572 BAM_5153 BAM_5154     TRUE 0.690 -22.000 0.750 1.000   NA
 6054572 6054573 BAM_5154 BAM_5155     FALSE 0.020 336.000 0.000 NA   NA
 6054573 6054574 BAM_5155 BAM_5156     TRUE 0.731 21.000 0.429 NA   NA
 6054574 6054575 BAM_5156 BAM_5157     FALSE 0.007 534.000 0.000 NA   NA
 6054575 6054576 BAM_5157 BAM_5158     TRUE 0.895 83.000 0.778 1.000 N NA
 6054576 6054577 BAM_5158 BAM_5159     TRUE 0.970 -7.000 0.778 0.019 Y NA
 6054577 6054578 BAM_5159 BAM_5160     FALSE 0.221 256.000 0.143 1.000 N NA
 6054578 6054579 BAM_5160 BAM_5161     TRUE 0.872 1.000 0.029 1.000 N NA
 6054579 6054580 BAM_5161 BAM_5162   menB FALSE 0.503 204.000 0.193 0.002 N NA
 6054580 6054581 BAM_5162 BAM_5163 menB   FALSE 0.517 70.000 0.280 1.000   NA
 6054581 6054582 BAM_5163 BAM_5164   menD TRUE 0.755 -3.000 0.355 1.000   NA
 6054582 6054583 BAM_5164 BAM_5165 menD menF TRUE 0.956 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 6054584 6054585 BAM_5166 BAM_5167     TRUE 0.892 110.000 0.250 1.000 N NA
 6054587 6054588 BAM_5169 BAM_5170     FALSE 0.393 165.000 0.010 NA   NA
 6054588 6054589 BAM_5170 BAM_5171     FALSE 0.542 77.000 0.300 NA   NA
 6054590 6054591 BAM_5172 BAM_5173 glgP glgA TRUE 0.961 19.000 0.314 1.000 Y NA
 6054591 6054592 BAM_5173 BAM_5174 glgA glgD TRUE 0.940 47.000 0.630 1.000 Y NA
 6054592 6054593 BAM_5174 BAM_5175 glgD glgC TRUE 0.962 19.000 0.210 0.001 Y NA
 6054593 6054594 BAM_5175 BAM_5176 glgC glgB TRUE 0.903 -25.000 0.296 0.001 Y NA
 6054596 6054597 BAM_5178 BAM_5179 ldh2   FALSE 0.005 654.000 0.000 NA   NA
 6054597 6054598 BAM_5179 BAM_5180     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6054598 6054599 BAM_5180 BAM_5181     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6054599 6054600 BAM_5181 BAM_5182     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6054600 6054601 BAM_5182 BAM_5183     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6054601 6054602 BAM_5183 BAM_5184     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054602 6054603 BAM_5184 BAM_5185     FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6054603 6054604 BAM_5185 BAM_5186     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6054604 6054605 BAM_5186 BAM_5187     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054605 6054606 BAM_5187 BAM_5188     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6054606 6054607 BAM_5188 BAM_5189     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6054607 6054608 BAM_5189 BAM_5190     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6054608 6054609 BAM_5190 BAM_5191     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6054609 6054610 BAM_5191 BAM_5192     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054610 6054611 BAM_5192 BAM_5193     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6054611 6054612 BAM_5193 BAM_5194     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6054612 6054613 BAM_5194 BAM_5195     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6054613 6054614 BAM_5195 BAM_5196     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054614 6054615 BAM_5196 BAM_5197     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6054615 6054616 BAM_5197 BAM_5198     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6054616 6054617 BAM_5198 BAM_5199     FALSE 0.619 9.000 0.000 NA   NA
 6054617 6054618 BAM_5199 BAM_5200     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6054618 6054619 BAM_5200 BAM_5201   rrfK TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6054621 6054622 BAM_5203 BAM_5204 rrsK   FALSE 0.488 -6.000 0.000 NA   NA
 6054622 6054623 BAM_5204 BAM_5205     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6054624 6054625 BAM_5206 BAM_5208 sapB   TRUE 0.665 96.000 0.212 1.000   NA
 6054626 6054627 BAM_5207 BAM_5209   pgi TRUE 0.639 108.000 0.027 NA   NA
 6054629 6054630 BAM_5211 BAM_5212 yugI   FALSE 0.215 254.000 0.033 1.000 N NA
 6054630 6054631 BAM_5212 BAM_5213     TRUE 0.936 -3.000 0.894 1.000 N NA
 6054632 6054633 BAM_5214 BAM_5215     TRUE 0.741 110.000 0.117 1.000   NA
 6054636 6054637 BAM_5218 BAM_5219 sodC   FALSE 0.405 48.000 0.163 NA   NA
 6054642 6054643 BAM_5224 BAM_5225     FALSE 0.340 171.000 0.024 NA   NA
 6054643 6054644 BAM_5225 BAM_5226   glyS FALSE 0.357 46.000 0.004 NA   NA
 6054646 6054647 BAM_5228 BAM_5229     FALSE 0.479 51.000 0.308 NA   NA
 6054647 6054648 BAM_5229 BAM_5230     FALSE 0.568 148.000 0.077 NA   NA
 6054649 6054650 BAM_5231 BAM_5232 gtaB   TRUE 0.875 109.000 0.037 1.000 N NA
 6054652 6054653 BAM_5234 BAM_5235 pepA   TRUE 0.661 147.000 0.111 1.000   NA
 6054653 6054654 BAM_5235 BAM_5236     FALSE 0.499 54.000 0.361 NA   NA
 6054654 6054655 BAM_5236 BAM_5237     TRUE 0.646 -3.000 0.250 NA   NA
 6054655 6054656 BAM_5237 BAM_5238     TRUE 0.906 124.000 0.208 1.000 N NA
 6054659 6054660 BAM_5241 BAM_5242     FALSE 0.316 176.000 0.043 NA   NA
 6054663 6054664 BAM_5245 BAM_5246     FALSE 0.627 107.000 0.000 NA   NA
 6054666 6054667 BAM_5248 BAM_5249   dapF FALSE 0.375 42.000 0.020 NA   NA
 6054667 6054668 BAM_5249 BAM_5250 dapF   FALSE 0.074 244.000 0.002 NA   NA
 6054669 6054670 BAM_5251 BAM_5252     FALSE 0.101 231.000 0.075 NA   NA
 6054670 6054671 BAM_5252 BAM_5253     FALSE 0.358 55.000 0.062 NA   NA
 6054671 6054672 BAM_5253 BAM_5254     FALSE 0.368 -16.000 0.053 NA   NA
 6054673 6054674 BAM_5255 BAM_5256 phnA   FALSE 0.085 236.000 0.000 NA   NA
 6054674 6054675 BAM_5256 BAM_5257     FALSE 0.028 308.000 0.000 NA   NA
 6054676 6054677 BAM_5258 BAM_5259     TRUE 0.768 25.000 0.571 NA   NA
 6054678 6054679 BAM_5260 BAM_5261     TRUE 0.818 114.000 0.429 NA   NA
 6054679 6054680 BAM_5261 BAM_5262     TRUE 0.741 99.000 0.400 NA   NA
 6054680 6054681 BAM_5262 BAM_5263     FALSE 0.390 53.000 0.127 NA   NA
 6054682 6054683 BAM_5264 BAM_5265     FALSE 0.010 435.000 0.019 NA   NA
 6054688 6054689 BAM_5270 BAM_5271     TRUE 0.879 110.000 0.059 1.000 N NA
 6054689 6054690 BAM_5271 BAM_5272     FALSE 0.392 72.000 0.074 NA   NA
 6054691 6054692 BAM_5273 BAM_5274 fbp1   TRUE 0.732 18.000 0.394 NA   NA
 6054692 6054693 BAM_5274 BAM_5275     FALSE 0.014 373.000 0.000 NA   NA
 6054699 6054700 BAM_5281 BAM_5282     FALSE 0.484 75.000 0.259 NA   NA
 6054703 6054704 BAM_5285 BAM_5286     FALSE 0.396 55.000 0.221 NA   NA
 6054704 6054705 BAM_5286 BAM_5287     FALSE 0.406 66.000 0.241 NA   NA
 6054706 6054707 BAM_5288 BAM_5289     FALSE 0.055 264.000 0.000 NA   NA
 6054707 6054708 BAM_5289 BAM_5290     TRUE 0.750 0.000 0.333 NA   NA
 6054709 6054710 BAM_5291 BAM_5292 sufB sufA TRUE 0.750 49.000 0.152 0.001 N NA
 6054710 6054711 BAM_5292 BAM_5293 sufA sufS TRUE 0.783 -10.000 0.292 1.000 N NA
 6054711 6054712 BAM_5293 BAM_5294 sufS sufD TRUE 0.930 0.000 0.606 1.000 N NA
 6054712 6054713 BAM_5294 BAM_5295 sufD sufC TRUE 0.960 16.000 0.139 1.000 Y NA
 6054713 6054714 BAM_5295 BAM_5296 sufC   FALSE 0.222 240.000 0.000 NA N NA
 6054714 6054715 BAM_5296 BAM_5297     TRUE 0.945 73.000 0.750 NA Y NA
 6054715 6054716 BAM_5297 BAM_5298     TRUE 0.941 24.000 0.074 NA Y NA
 6054716 6054717 BAM_5298 BAM_5299     TRUE 0.960 -7.000 0.642 1.000 Y NA
 6054719 6054720 BAM_5301 BAM_5302     FALSE 0.600 155.000 0.131 1.000   NA
 6054720 6054721 BAM_5302 BAM_5303     TRUE 0.842 4.000 0.443 1.000   NA
 6054723 6054724 BAM_5305 BAM_5306 gcvH   FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 6054724 6054725 BAM_5306 BAM_5307     FALSE 0.296 -24.000 0.000 NA   NA
 6054725 6054726 BAM_5307 BAM_5308     FALSE 0.007 531.000 0.000 NA   NA
 6054726 6054727 BAM_5308 BAM_5309     TRUE 0.771 11.000 0.400 NA   NA
 6054727 6054728 BAM_5309 BAM_5310     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6054728 6054729 BAM_5310 BAM_5311     FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 6054729 6054730 BAM_5311 BAM_5312     FALSE 0.448 81.000 0.000 NA   NA
 6054730 6054731 BAM_5312 BAM_5313     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6054731 6054732 BAM_5313 BAM_5314     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6054732 6054733 BAM_5314 BAM_5315     FALSE 0.340 53.000 0.000 NA   NA
 6054735 6054736 BAM_5317 BAM_5318   ldh3 TRUE 0.670 23.000 0.333 NA   NA
 6054736 6054737 BAM_5318 BAM_5319 ldh3   FALSE 0.072 246.000 0.000 NA   NA
 6054737 6054738 BAM_5319 BAM_5320     TRUE 0.876 14.000 0.828 NA   NA
 6054738 6054739 BAM_5320 BAM_5321     FALSE 0.602 147.000 0.185 NA   NA
 6054739 6054740 BAM_5321 BAM_5322     FALSE 0.006 588.000 0.000 NA   NA
 6054740 6054741 BAM_5322 BAM_5323     TRUE 0.791 4.000 0.289 1.000   NA
 6054741 6054742 BAM_5323 BAM_5324     TRUE 0.730 139.000 0.156 1.000   NA
 6054742 6054743 BAM_5324 BAM_5325     FALSE 0.520 153.000 0.061 NA   NA
 6054743 6054744 BAM_5325 BAM_5326     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6054744 6054745 BAM_5326 BAM_5327     TRUE 0.968 22.000 0.588 1.000 Y NA
 6054745 6054746 BAM_5327 BAM_5328     FALSE 0.560 98.000 0.000 NA   NA
 6054747 6054748 BAM_5329 BAM_5330     FALSE 0.477 88.000 0.000 NA   NA
 6054749 6054750 BAM_5331 BAM_5332     FALSE 0.028 310.000 0.000 NA   NA
 6054750 6054751 BAM_5332 BAM_5333     FALSE 0.358 49.000 0.021 NA   NA
 6054751 6054752 BAM_5333 BAM_5334     FALSE 0.430 78.000 0.024 NA   NA
 6054754 6054755 BAM_5336 BAM_5337     FALSE 0.061 256.000 0.000 NA   NA
 6054755 6054756 BAM_5337 BAM_5338     FALSE 0.499 80.000 0.200 NA   NA
 6054756 6054757 BAM_5338 BAM_5339     TRUE 0.907 120.000 0.233 1.000 N NA
 6054757 6054758 BAM_5339 BAM_5340     FALSE 0.008 596.000 0.000 1.000   NA
 6054758 6054759 BAM_5340 BAM_5341   spoIIIJ1 TRUE 0.733 130.000 0.003 1.000   NA
 6054759 6054760 BAM_5341 BAM_5342 spoIIIJ1   TRUE 0.824 29.000 0.889 NA   NA
 6054761 6054762 BAM_5343 BAM_5344     FALSE 0.021 332.000 0.000 NA   NA
 6054763 6054764 BAM_5345 BAM_5346     FALSE 0.603 97.000 0.167 NA   NA
 6054764 6054765 BAM_5346 BAM_5347     TRUE 0.757 13.000 0.389 NA   NA
 6054765 6054766 BAM_5347 BAM_5348     FALSE 0.467 -10.000 0.149 NA   NA
 6054769 6054770 BAM_5351 BAM_5352     TRUE 0.777 31.000 0.727 NA   NA
 6054770 6054771 BAM_5352 BAM_5353     FALSE 0.015 365.000 0.000 NA   NA
 6054771 6054772 BAM_5353 BAM_5354     TRUE 0.921 -22.000 0.571 1.000 Y NA
 6054772 6054773 BAM_5354 BAM_5355     TRUE 0.862 140.000 0.500 0.087   NA
 6054775 6054776 BAM_5357 BAM_5358     FALSE 0.014 414.000 0.000 1.000   NA
 6054776 6054777 BAM_5358 BAM_5359     TRUE 0.721 118.000 0.167 NA   NA
 6054778 6054779 BAM_5360 BAM_5361 nprB   FALSE 0.533 156.000 0.214 NA   NA
 6054779 6054780 BAM_5361 BAM_5362     FALSE 0.458 52.000 0.286 NA   NA
 6054780 6054781 BAM_5362 BAM_5363     TRUE 0.788 113.000 0.364 NA   NA
 6054781 6054782 BAM_5363 BAM_5364     TRUE 0.673 164.000 0.556 NA   NA
 6054782 6054783 BAM_5364 BAM_5365     TRUE 0.958 -12.000 0.875 1.000 Y NA
 6054783 6054784 BAM_5365 BAM_5366     FALSE 0.637 57.000 0.625 NA   NA
 6054785 6054786 BAM_5367 BAM_5368     FALSE 0.363 213.000 0.000 1.000 N NA
 6054786 6054787 BAM_5368 BAM_5369     FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 6054788 6054789 BAM_5370 BAM_5371     FALSE 0.315 -34.000 0.222 NA   NA
 6054789 6054790 BAM_5371 BAM_5372     FALSE 0.465 30.000 0.010 NA   NA
 6054791 6054792 BAM_5373 BAM_5374     FALSE 0.347 54.000 0.029 NA   NA
 6054792 6054793 BAM_5374 BAM_5375     FALSE 0.535 148.000 0.000 NA   NA
 6054793 6054794 BAM_5375 BAM_5376     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6054797 6054798 BAM_1532 BAM_1533   recQ1 FALSE 0.457 -10.000 0.103 NA   NA
 6054798 6054799 BAM_1533 BAM_1534 recQ1   TRUE 0.669 0.000 0.192 NA   NA
 6054799 6054800 BAM_1534 BAM_1535     TRUE 0.662 23.000 0.320 NA   NA
 6054800 6054801 BAM_1535 BAM_1536     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6054801 6054802 BAM_1536 BAM_1537     FALSE 0.266 -33.000 0.000 NA   NA
 6054802 6054803 BAM_1537 BAM_1538     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6054803 6054804 BAM_1538 BAM_1539     TRUE 0.796 78.000 0.417 NA N NA
 6054804 6054805 BAM_1539 BAM_1540   gudB FALSE 0.170 268.000 0.222 NA N NA
 6054805 6054806 BAM_1540 BAM_1541 gudB   FALSE 0.506 79.000 0.233 NA   NA
 6054806 6054807 BAM_1541 BAM_1542     TRUE 0.808 93.000 0.700 NA   NA
 6054807 6054808 BAM_1542 BAM_1543     FALSE 0.440 80.000 0.000 NA   NA
 6054808 6054809 BAM_1543 BAM_1544     FALSE 0.343 170.000 0.000 NA   NA
 6054811 6054812 BAM_1546 BAM_1547   cmk TRUE 0.672 130.000 0.016 NA   NA
 6054812 6054813 BAM_1547 BAM_1548 cmk rpsA FALSE 0.080 334.000 0.047 1.000 N NA
 6054813 6054814 BAM_1548 BAM_1549 rpsA   TRUE 0.860 13.000 0.061 1.000 N NA
 6054816 6054817 BAM_1551 BAM_1552     TRUE 0.729 -7.000 0.567 NA   NA
 6054817 6054818 BAM_1552 BAM_1553     TRUE 0.819 -3.000 0.633 NA   NA
 6054818 6054819 BAM_1553 BAM_1554     TRUE 0.688 125.000 0.014 NA   NA
 6054819 6054820 BAM_1554 BAM_1555   gpsA TRUE 0.652 19.000 0.068 1.000   NA
 6054820 6054821 BAM_1555 BAM_1556 gpsA   TRUE 0.684 117.000 0.039 NA   NA
 6054821 6054822 BAM_1556 BAM_1557     FALSE 0.051 267.000 0.000 NA   NA
 6054822 6054823 BAM_1557 BAM_1558     TRUE 0.688 65.000 0.771 NA   NA
 6054823 6054824 BAM_1558 BAM_1559   spoIVA FALSE 0.085 243.000 0.081 NA   NA
 6054824 6054825 BAM_1559 BAM_1560 spoIVA hup1 FALSE 0.032 299.000 0.000 NA   NA
 6054825 6054826 BAM_1560 BAM_1561 hup1 mtrA TRUE 0.904 121.000 0.154 1.000 N NA
 6054826 6054827 BAM_1561 BAM_1562 mtrA   FALSE 0.093 258.000 0.114 1.000   NA
 6054827 6054828 BAM_1562 BAM_1563   menG TRUE 0.804 30.000 0.708 1.000   NA
 6054828 6054829 BAM_1563 BAM_1564 menG hepT TRUE 0.949 32.000 0.476 1.000 Y NA
 6054829 6054830 BAM_1564 BAM_1565 hepT   TRUE 0.899 125.000 0.054 1.000 N NA
 6054830 6054831 BAM_1565 BAM_1566   aroC1 FALSE 0.164 271.000 0.002 1.000 N NA
 6054831 6054832 BAM_1566 BAM_1567 aroC1 aroB TRUE 0.970 0.000 0.110 0.001 Y NA
 6054832 6054833 BAM_1567 BAM_1568 aroB hisC1 TRUE 0.969 132.000 0.009 1.000 Y NA
 6054833 6054834 BAM_1568 BAM_1569 hisC1   FALSE 0.036 313.000 0.000 1.000   NA
 6054834 6054835 BAM_1569 BAM_1570     FALSE 0.553 74.000 0.375 NA   NA
 6054835 6054836 BAM_1570 BAM_1571     TRUE 0.756 154.000 0.583 NA   NA
 6054836 6054837 BAM_1571 BAM_1572   qcrA TRUE 0.807 144.000 0.540 NA   NA
 6054837 6054838 BAM_1572 BAM_1573 qcrA qcrB TRUE 0.860 1.000 0.447 0.032   NA
 6054838 6054839 BAM_1573 BAM_1574 qcrB qcrC FALSE 0.541 44.000 0.095 0.032   NA
 6054839 6054840 BAM_1574 BAM_1575 qcrC   FALSE 0.366 43.000 0.005 NA   NA
 6054840 6054841 BAM_1575 BAM_1576     FALSE 0.309 -24.000 0.036 NA   NA
 6054841 6054842 BAM_1576 BAM_1577     FALSE 0.549 26.000 0.104 NA   NA
 6054842 6054843 BAM_1577 BAM_1578     TRUE 0.671 108.000 0.104 NA   NA
 6054843 6054844 BAM_1578 BAM_1579     FALSE 0.323 -22.000 0.050 NA   NA
 6054844 6054845 BAM_1579 BAM_1580     FALSE 0.604 102.000 0.020 NA   NA
 6054847 6054848 BAM_1582 BAM_1583   dapB FALSE 0.634 0.000 0.044 NA   NA
 6054848 6054849 BAM_1583 BAM_1584 dapB mgsA TRUE 0.874 15.000 0.044 0.036 N NA
 6054849 6054850 BAM_1584 BAM_1585 mgsA   FALSE 0.636 12.000 0.081 NA   NA
 6054850 6054851 BAM_1585 BAM_1586     FALSE 0.620 -3.000 0.210 NA   NA
 6054851 6054852 BAM_1586 BAM_1587     TRUE 0.726 -13.000 0.126 1.000 N NA
 6054852 6054853 BAM_1587 BAM_1588   birA TRUE 0.714 -15.000 0.134 1.000 N NA
 6054855 6054856 BAM_1590 BAM_1591 panB panC TRUE 0.970 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 6054856 6054857 BAM_1591 BAM_1592 panC panD TRUE 0.968 13.000 0.342 1.000 Y NA
 6054857 6054858 BAM_1592 BAM_1593 panD   TRUE 0.672 129.000 0.000 NA   NA
 6054858 6054859 BAM_1593 BAM_1594     FALSE 0.252 -37.000 0.000 NA   NA
 6054859 6054860 BAM_1594 BAM_1595     FALSE 0.067 251.000 0.000 NA   NA
 6054860 6054861 BAM_1595 BAM_1596     TRUE 0.732 8.000 0.289 NA   NA
 6054861 6054862 BAM_1596 BAM_1597   aspB TRUE 0.712 19.000 0.367 NA   NA
 6054862 6054863 BAM_1597 BAM_1598 aspB dnaD TRUE 0.885 122.000 0.072 NA N NA
 6054863 6054864 BAM_1598 BAM_1599 dnaD nth TRUE 0.954 16.000 0.075 NA Y NA
 6054864 6054865 BAM_1599 BAM_1600 nth   TRUE 0.657 4.000 0.034 NA   NA
 6054866 6054867 BAM_1601 BAM_1602   recU FALSE 0.422 66.000 0.056 1.000   NA
 6054868 6054869 BAM_1603 BAM_1605     FALSE 0.068 250.000 0.000 NA   NA
 6054871 6054872 BAM_1606 BAM_1607     FALSE 0.633 16.000 0.148 NA   NA
 6054874 6054875 BAM_1609 BAM_1610     FALSE 0.620 155.000 0.318 NA   NA
 6054875 6054876 BAM_1610 BAM_1611     FALSE 0.361 57.000 0.074 NA   NA
 6054876 6054877 BAM_1611 BAM_1612     TRUE 0.804 98.000 0.579 NA   NA
 6054877 6054878 BAM_1612 BAM_5813     TRUE 0.684 122.000 0.000 NA   NA
 6054878 6054879 BAM_5813 BAM_1613     FALSE 0.234 186.000 0.000 NA   NA
 6054879 6054880 BAM_1613 BAM_1614     FALSE 0.332 62.000 0.014 NA   NA
 6054880 6054881 BAM_1614 BAM_1615     TRUE 0.707 138.000 0.250 NA   NA
 6054881 6054882 BAM_1615 BAM_1616     TRUE 0.879 106.000 0.118 1.000 N NA
 6054882 6054883 BAM_1616 BAM_1617     FALSE 0.433 46.000 0.000 1.000   NA
 6054885 6054886 BAM_1619 BAM_1620 maP2   FALSE 0.214 198.000 0.115 NA   NA
 6054886 6054887 BAM_1620 BAM_1621   xpt FALSE 0.593 15.000 0.014 NA   NA
 6054887 6054888 BAM_1621 BAM_1622 xpt pbuX TRUE 0.968 4.000 0.056 1.000 Y NA
 6054889 6054890 BAM_1623 BAM_1624     FALSE 0.397 164.000 0.000 NA   NA
 6054891 6054892 BAM_1625 BAM_1626     FALSE 0.196 195.000 0.000 NA   NA
 6054894 6054895 BAM_1628 BAM_1629     FALSE 0.560 22.000 0.069 NA   NA
 6054895 6054896 BAM_1629 BAM_1630     TRUE 0.658 3.000 0.046 NA   NA
 6054898 6054899 BAM_1632 BAM_1633     FALSE 0.477 88.000 0.000 NA   NA
 6054899 6054900 BAM_1633 BAM_1634     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054900 6054901 BAM_1634 BAM_1635     FALSE 0.005 693.000 0.000 NA   NA
 6054901 6054902 BAM_1635 BAM_1636     TRUE 0.764 131.000 0.157 1.000   NA
 6054902 6054903 BAM_1636 BAM_1637     FALSE 0.017 357.000 0.039 NA   NA
 6054903 6054904 BAM_1637 BAM_1638     FALSE 0.020 337.000 0.000 NA   NA
 6054904 6054905 BAM_1638 BAM_1639     TRUE 0.943 1.000 0.750 1.000 N NA
 6054905 6054906 BAM_1639 BAM_1640     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6054906 6054907 BAM_1640 BAM_1641     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6054907 6054908 BAM_1641 BAM_1642     FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6054908 6054909 BAM_1642 BAM_1643     TRUE 0.670 43.000 0.625 NA   NA
 6054909 6054910 BAM_1643 BAM_1644     TRUE 0.835 4.000 0.500 NA   NA
 6054910 6054911 BAM_1644 BAM_1645     FALSE 0.304 -25.000 0.046 NA   NA
 6054911 6054912 BAM_1645 BAM_1646     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054912 6054913 BAM_1646 BAM_1647     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054913 6054914 BAM_1647 BAM_1648     FALSE 0.430 -9.000 0.000 NA   NA
 6054914 6054915 BAM_1648 BAM_1649     FALSE 0.511 93.000 0.000 NA   NA
 6054920 6054921 BAM_1653 BAM_1655     FALSE 0.222 -906.000 0.000 NA   NA
 6054921 6054922 BAM_1655 BAM_1656   rnhA FALSE 0.623 8.000 0.000 NA   NA
 6054922 6054923 BAM_1656 BAM_1657 rnhA   FALSE 0.428 33.000 0.000 NA   NA
 6054924 6054925 BAM_1658 BAM_1659     FALSE 0.636 144.000 0.200 NA   NA
 6054925 6054926 BAM_1659 BAM_1660     TRUE 0.853 13.000 0.680 NA   NA
 6054927 6054928 BAM_1661 BAM_1662   cspB1 TRUE 0.882 120.000 0.619 NA   NA
 6054929 6054930 BAM_1663 BAM_1664     FALSE 0.482 70.000 0.308 NA   NA
 6054930 6054931 BAM_1664 BAM_1665     TRUE 0.769 20.000 0.500 NA   NA
 6054931 6054932 BAM_1665 BAM_1666     FALSE 0.539 80.000 0.259 NA   NA
 6054932 6054933 BAM_1666 BAM_1667     FALSE 0.101 224.000 0.000 NA   NA
 6054933 6054934 BAM_1667 BAM_1668     TRUE 0.817 3.000 0.455 NA   NA
 6054934 6054935 BAM_1668 BAM_1669     FALSE 0.417 187.000 0.364 1.000   NA
 6054935 6054936 BAM_1669 BAM_1670     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6054936 6054937 BAM_1670 BAM_1671     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6054939 6054940 BAM_1673 BAM_1674     TRUE 0.677 98.000 0.188 1.000   NA
 6054940 6054941 BAM_1674 BAM_1675     TRUE 0.886 139.000 0.250 1.000 N NA
 6054943 6054944 BAM_1677 BAM_1678     FALSE 0.264 -79.000 0.100 NA   NA
 6054944 6054945 BAM_1678 BAM_1679     TRUE 0.686 146.000 0.300 NA   NA
 6054945 6054946 BAM_1679 BAM_1680     FALSE 0.055 274.000 0.143 NA   NA
 6054946 6054947 BAM_1680 BAM_1681     FALSE 0.398 51.000 0.190 NA   NA
 6054948 6054949 BAM_1682 BAM_1683     TRUE 0.694 125.000 0.031 NA   NA
 6054949 6054950 BAM_1683 BAM_1684     TRUE 0.691 20.000 0.333 NA   NA
 6054950 6054951 BAM_1684 BAM_1685     TRUE 0.717 129.000 0.118 NA   NA
 6054951 6054952 BAM_1685 BAM_1686     TRUE 0.673 8.000 0.147 NA   NA
 6054952 6054953 BAM_1686 BAM_1687     FALSE 0.591 167.000 0.444 NA   NA
 6054954 6054955 BAM_1688 BAM_1689   hfq1 TRUE 0.699 54.000 0.778 NA   NA
 6054957 6054958 BAM_1691 BAM_1692     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6054958 6054959 BAM_1692 BAM_1693     TRUE 0.821 151.000 0.143 1.000 N NA
 6054959 6054960 BAM_1693 BAM_1694     TRUE 0.667 130.000 0.000 NA   NA
 6054960 6054961 BAM_1694 BAM_1695     FALSE 0.277 -30.000 0.000 NA   NA
 6054961 6054962 BAM_1695 BAM_1696     FALSE 0.312 174.000 0.000 NA   NA
 6054962 6054963 BAM_1696 BAM_1697     FALSE 0.462 30.000 0.000 NA   NA
 6054963 6054964 BAM_1697 BAM_1698     TRUE 0.830 28.000 0.889 NA   NA
 6054965 6054966 BAM_1699 BAM_1700 cheR   FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6054967 6054968 BAM_1701 BAM_1702     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6054968 6054969 BAM_1702 BAM_1703     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6054969 6054970 BAM_1703 BAM_1704     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6054970 6054971 BAM_1704 BAM_1705     FALSE 0.152 205.000 0.000 NA   NA
 6054971 6054972 BAM_1705 BAM_1706     FALSE 0.348 50.000 0.000 NA   NA
 6054972 6054973 BAM_1706 BAM_1707     FALSE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 6054973 6054974 BAM_1707 BAM_1708     TRUE 0.954 23.000 0.000 0.001 Y NA
 6054974 6054975 BAM_1708 BAM_1709     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6054975 6054976 BAM_1709 BAM_1710   flgB FALSE 0.014 370.000 0.000 NA   NA
 6054976 6054977 BAM_1710 BAM_1711 flgB flgC TRUE 0.979 21.000 0.804 0.002 Y NA
 6054977 6054978 BAM_1711 BAM_1712 flgC   TRUE 0.963 17.000 0.068 0.002 Y NA
 6054978 6054979 BAM_1712 BAM_1713     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6054979 6054980 BAM_1713 BAM_1714     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 6054980 6054981 BAM_1714 BAM_1715   fliG FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6054981 6054982 BAM_1715 BAM_1716 fliG   FALSE 0.609 -13.000 0.471 NA   NA
 6054982 6054983 BAM_1716 BAM_1717     FALSE 0.613 -3.000 0.129 NA   NA
 6054983 6054984 BAM_1717 BAM_1718     TRUE 0.693 117.000 0.061 NA   NA
 6054984 6054985 BAM_1718 BAM_1719     FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6054985 6054986 BAM_1719 BAM_1720     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6054986 6054987 BAM_1720 BAM_1721     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6054987 6054988 BAM_1721 BAM_1722     FALSE 0.581 22.000 0.117 NA   NA
 6054988 6054989 BAM_1722 BAM_1723     FALSE 0.402 50.000 0.195 NA   NA
 6054989 6054990 BAM_1723 BAM_1724     FALSE 0.028 308.000 0.000 NA   NA
 6054990 6054991 BAM_1724 BAM_1725     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054991 6054992 BAM_1725 BAM_1726     TRUE 0.684 125.000 0.000 NA   NA
 6054992 6054993 BAM_1726 BAM_1727     FALSE 0.006 637.000 0.000 NA   NA
 6054993 6054994 BAM_1727 BAM_1728     FALSE 0.005 1082.000 0.000 NA   NA
 6054994 6054995 BAM_1728 BAM_1729     FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6054995 6054996 BAM_1729 BAM_1730     FALSE 0.326 -19.000 0.000 NA   NA
 6054996 6054997 BAM_1730 BAM_1731     FALSE 0.235 -63.000 0.000 NA   NA
 6054997 6054998 BAM_1731 BAM_1732     FALSE 0.488 154.000 0.000 NA   NA
 6054998 6054999 BAM_1732 BAM_1733     TRUE 0.678 128.000 0.000 NA   NA
 6054999 6055000 BAM_1733 BAM_1734     FALSE 0.087 233.000 0.000 NA   NA
 6055000 6055001 BAM_1734 BAM_1735     FALSE 0.005 1252.000 0.000 NA   NA
 6055001 6055002 BAM_1735 BAM_1736     FALSE 0.006 607.000 0.000 NA   NA
 6055002 6055003 BAM_1736 BAM_1737     FALSE 0.027 311.000 0.000 NA   NA
 6055003 6055004 BAM_1737 BAM_1738     FALSE 0.185 197.000 0.000 NA   NA
 6055004 6055005 BAM_1738 BAM_1739     FALSE 0.589 101.000 0.000 NA   NA
 6055005 6055006 BAM_1739 BAM_1740     FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6055006 6055007 BAM_1740 BAM_1741     FALSE 0.222 188.000 0.000 NA   NA
 6055009 6055010 BAM_1743 BAM_1744     TRUE 0.651 134.000 0.000 NA   NA
 6055010 6055011 BAM_1744 BAM_1745     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6055011 6055012 BAM_1745 BAM_1746     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6055012 6055013 BAM_1746 BAM_1747     FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6055013 6055014 BAM_1747 BAM_1748     TRUE 0.762 13.000 0.400 NA   NA
 6055014 6055015 BAM_1748 BAM_1749     FALSE 0.592 -3.000 0.073 NA   NA
 6055015 6055016 BAM_1749 BAM_1750     TRUE 0.935 34.000 0.162 0.003 Y NA
 6055016 6055017 BAM_1750 BAM_1751   fliR FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6055017 6055018 BAM_1751 BAM_1752 fliR   FALSE 0.330 59.000 0.000 NA   NA
 6055018 6055019 BAM_1752 BAM_1753     FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6055019 6055020 BAM_1753 BAM_1754   flhA TRUE 0.955 24.000 0.207 0.003 Y NA
 6055020 6055021 BAM_1754 BAM_1755 flhA   TRUE 0.973 15.000 0.440 0.084 Y NA
 6055021 6055022 BAM_1755 BAM_1756     TRUE 0.904 43.000 0.045 1.000 Y NA
 6055022 6055023 BAM_1756 BAM_1757     TRUE 0.725 118.000 0.200 NA   NA
 6055023 6055024 BAM_1757 BAM_1758     TRUE 0.814 18.000 0.600 NA   NA
 6055024 6055025 BAM_1758 BAM_1759     TRUE 0.761 -7.000 0.133 NA N NA
 6055025 6055026 BAM_1759 BAM_1760     FALSE 0.590 -9.000 0.338 NA   NA
 6055026 6055027 BAM_1760 BAM_1761     FALSE 0.345 63.000 0.044 NA   NA
 6055027 6055028 BAM_1761 BAM_1762     FALSE 0.609 88.000 0.300 NA   NA
 6055028 6055029 BAM_1762 BAM_1763     TRUE 0.703 -7.000 0.500 NA   NA
 6055030 6055031 BAM_1764 BAM_1765     TRUE 0.724 3.000 0.051 1.000   NA
 6055031 6055032 BAM_1765 BAM_1766     FALSE 0.286 189.000 0.034 1.000   NA
 6055032 6055033 BAM_1766 BAM_1767     FALSE 0.467 67.000 0.231 1.000   NA
 6055034 6055035 BAM_1768 BAM_1769     TRUE 0.841 106.000 0.571 NA   NA
 6055036 6055037 BAM_1770 BAM_1771     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6055038 6055039 BAM_1772 BAM_1773     TRUE 0.760 -22.000 0.419 0.029 N NA
 6055039 6055040 BAM_1773 BAM_1774     TRUE 0.982 13.000 0.750 0.029 Y NA
 6055040 6055041 BAM_1774 BAM_1775     TRUE 0.889 0.000 0.278 1.000 N NA
 6055041 6055042 BAM_1775 BAM_1776     FALSE 0.617 21.000 0.241 NA   NA
 6055044 6055045 BAM_1778 BAM_1779     FALSE 0.613 160.000 0.375 NA   NA
 6055045 6055046 BAM_1779 BAM_1780     TRUE 0.831 102.000 0.500 1.000   NA
 6055046 6055047 BAM_1780 BAM_1781     FALSE 0.396 51.000 0.143 NA   NA
 6055047 6055048 BAM_1781 BAM_1782     FALSE 0.501 159.000 0.143 NA   NA
 6055048 6055049 BAM_1782 BAM_1783     TRUE 0.657 90.000 0.368 NA   NA
 6055050 6055051 BAM_1784 BAM_1785     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6055051 6055052 BAM_1785 BAM_1786     FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6055052 6055053 BAM_1786 BAM_1787     FALSE 0.259 -34.000 0.000 NA   NA
 6055056 6055057 BAM_1790 BAM_1791     TRUE 0.822 -3.000 0.643 NA   NA
 6055059 6055060 BAM_1793 BAM_1794     FALSE 0.213 194.000 0.049 NA   NA
 6055061 6055062 BAM_1795 BAM_1796     TRUE 0.855 17.000 0.194 1.000 N NA
 6055062 6055063 BAM_1796 BAM_1797     FALSE 0.286 183.000 0.097 NA   NA
 6055064 6055065 BAM_1798 BAM_1799     TRUE 0.864 14.000 0.750 NA   NA
 6055065 6055066 BAM_1799 BAM_1800     TRUE 0.700 113.000 0.125 NA   NA
 6055066 6055067 BAM_1800 BAM_1801     FALSE 0.521 94.000 0.000 NA   NA
 6055067 6055068 BAM_1801 BAM_1802   nhaC2 FALSE 0.598 102.000 0.000 NA   NA
 6055068 6055069 BAM_1802 BAM_1803 nhaC2 fumC FALSE 0.508 256.000 0.003 1.000 Y NA
 6055071 6055072 BAM_1805 BAM_1806     FALSE 0.015 364.000 0.000 NA   NA
 6055072 6055073 BAM_1806 BAM_1807     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6055073 6055074 BAM_1807 BAM_1808     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6055074 6055075 BAM_1808 BAM_1810     FALSE 0.253 -36.000 0.000 NA   NA
 6055077 6055078 BAM_1811 BAM_1812     TRUE 0.678 108.000 0.125 NA   NA
 6055078 6055079 BAM_1812 BAM_1813     TRUE 0.879 5.000 0.250 NA N NA
 6055079 6055080 BAM_1813 BAM_1814   ccdA1 TRUE 0.887 54.000 0.171 NA Y NA
 6055080 6055081 BAM_1814 BAM_1815 ccdA1   TRUE 0.957 19.000 0.241 1.000 Y NA
 6055081 6055082 BAM_1815 BAM_1816     TRUE 0.642 18.000 0.011 1.000   NA
 6055084 6055085 BAM_1818 BAM_1819     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6055085 6055086 BAM_1819 BAM_1820   dsdA FALSE 0.203 193.000 0.000 NA   NA
 6055086 6055087 BAM_1820 BAM_1821 dsdA   FALSE 0.588 146.000 0.065 NA   NA
 6055088 6055089 BAM_1822 BAM_1823     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055089 6055090 BAM_1823 BAM_1824     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055090 6055091 BAM_1824 BAM_1825     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055092 6055093 BAM_1826 BAM_1827     TRUE 0.986 5.000 0.857 0.018 Y NA
 6055093 6055094 BAM_1827 BAM_1828     TRUE 0.954 118.000 0.667 0.092 N NA
 6055094 6055095 BAM_1828 BAM_1829     TRUE 0.715 38.000 0.250 NA N NA
 6055095 6055096 BAM_1829 BAM_1830     TRUE 0.965 2.000 0.227 NA Y NA
 6055096 6055097 BAM_1830 BAM_1831     TRUE 0.684 125.000 0.000 NA   NA
 6055099 6055100 BAM_1833 BAM_1834   aspA2 TRUE 0.905 25.000 0.700 1.000 N NA
 6055100 6055101 BAM_1834 BAM_1835 aspA2 malS TRUE 0.839 76.000 0.583 1.000 N NA
 6055101 6055102 BAM_1835 BAM_1836 malS   TRUE 0.677 75.000 0.500 1.000   NA
 6055102 6055103 BAM_1836 BAM_1837     TRUE 0.876 3.000 0.600 1.000   NA
 6055103 6055104 BAM_1837 BAM_1838     TRUE 0.973 118.000 0.113 1.000 Y NA
 6055105 6055106 BAM_1839 BAM_1840     FALSE 0.007 523.000 0.000 NA   NA
 6055107 6055108 BAM_1841 BAM_1842 asnA   FALSE 0.597 142.000 0.000 NA   NA
 6055108 6055109 BAM_1842 BAM_1843     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6055110 6055111 BAM_1844 BAM_1845   dapG1 FALSE 0.017 350.000 0.000 NA   NA
 6055111 6055112 BAM_1845 BAM_1846 dapG1   TRUE 0.683 121.000 0.005 NA   NA
 6055113 6055114 BAM_1847 BAM_1848     TRUE 0.664 131.000 0.000 NA   NA
 6055114 6055115 BAM_1848 BAM_1849     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6055115 6055116 BAM_1849 BAM_1850     TRUE 0.791 6.000 0.400 NA   NA
 6055117 6055118 BAM_1851 BAM_1852     FALSE 0.407 35.000 0.000 NA   NA
 6055119 6055120 BAM_1853 BAM_1854     FALSE 0.250 254.000 0.000 0.004 N NA
 6055120 6055121 BAM_1854 BAM_1855     TRUE 0.810 196.000 0.333 NA Y NA
 6055121 6055122 BAM_1855 BAM_1856     FALSE 0.337 -28.000 0.222 NA   NA
 6055124 6055125 BAM_1858 BAM_1859     FALSE 0.483 89.000 0.000 NA   NA
 6055125 6055126 BAM_1859 BAM_1860     TRUE 0.684 125.000 0.000 NA   NA
 6055126 6055127 BAM_1860 BAM_1861     FALSE 0.366 43.000 0.000 NA   NA
 6055129 6055130 BAM_1863 BAM_1864     FALSE 0.011 484.000 0.000 1.000   NA
 6055131 6055132 BAM_1865 BAM_1866     FALSE 0.253 183.000 0.000 NA   NA
 6055133 6055134 BAM_1867 BAM_1869 fsR cysK2 FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6055134 6055135 BAM_1869 BAM_1870 cysK2   FALSE 0.532 77.000 0.143 1.000   NA
 6055135 6055136 BAM_1870 BAM_1871     TRUE 0.827 93.000 0.778 NA   NA
 6055140 6055141 BAM_1875 BAM_1876     FALSE 0.457 181.000 0.412 NA   NA
 6055141 6055142 BAM_1876 BAM_1877     TRUE 0.727 11.000 0.300 NA   NA
 6055142 6055143 BAM_1877 BAM_1878     FALSE 0.400 -16.000 0.188 NA   NA
 6055143 6055144 BAM_1878 BAM_1879     FALSE 0.009 464.000 0.000 NA   NA
 6055146 6055147 BAM_1881 BAM_1882     TRUE 0.685 123.000 0.000 NA   NA
 6055147 6055148 BAM_1882 BAM_1883     TRUE 0.773 31.000 0.714 NA   NA
 6055149 6055150 BAM_1884 BAM_1885 msrA1   TRUE 0.817 92.000 0.194 1.000 N NA
 6055151 6055152 BAM_1886 BAM_1887 ilvE2 ilvB2 TRUE 0.946 23.000 0.017 1.000 Y NA
 6055152 6055153 BAM_1887 BAM_1888 ilvB2   FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055153 6055154 BAM_1888 BAM_1889   ilvC2 FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6055154 6055155 BAM_1889 BAM_1890 ilvC2 ilvD TRUE 0.913 47.000 0.022 0.002 Y NA
 6055155 6055156 BAM_1890 BAM_1891 ilvD ilvA TRUE 0.926 32.000 0.012 1.000 Y NA
 6055157 6055158 BAM_1892 BAM_1893     FALSE 0.314 -21.000 0.000 NA   NA
 6055159 6055160 BAM_1894 BAM_1895     FALSE 0.322 173.000 0.000 NA   NA
 6055160 6055161 BAM_1895 BAM_1896     FALSE 0.593 16.000 0.032 NA   NA
 6055161 6055162 BAM_1896 BAM_1897     FALSE 0.360 168.000 0.000 NA   NA
 6055162 6055163 BAM_1897 BAM_1898     FALSE 0.314 -21.000 0.000 NA   NA
 6055165 6055166 BAM_1900 BAM_1901     FALSE 0.010 425.000 0.000 NA   NA
 6055166 6055167 BAM_1901 BAM_1902     TRUE 0.874 128.000 0.588 NA   NA
 6055167 6055168 BAM_1902 BAM_1903     FALSE 0.173 211.000 0.000 1.000   NA
 6055168 6055169 BAM_1903 BAM_1904     FALSE 0.543 28.000 0.207 NA   NA
 6055169 6055170 BAM_1904 BAM_1905     FALSE 0.389 72.000 0.069 NA   NA
 6055171 6055172 BAM_1906 BAM_1907     FALSE 0.035 340.000 0.333 NA   NA
 6055173 6055174 BAM_1908 BAM_1909     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055174 6055175 BAM_1909 BAM_1910     FALSE 0.007 514.000 0.000 NA   NA
 6055175 6055176 BAM_1910 BAM_1911     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6055176 6055177 BAM_1911 BAM_1912     FALSE 0.532 95.000 0.000 NA   NA
 6055177 6055178 BAM_1912 BAM_1913     FALSE 0.440 80.000 0.000 NA   NA
 6055178 6055179 BAM_1913 BAM_1914     TRUE 0.772 135.000 0.333 NA   NA
 6055179 6055180 BAM_1914 BAM_1915     FALSE 0.371 67.000 0.095 NA   NA
 6055180 6055181 BAM_1915 BAM_1916     FALSE 0.066 288.000 0.000 0.067   NA
 6055183 6055184 BAM_1918 BAM_1919     TRUE 0.890 -34.000 0.455 1.000 Y NA
 6055184 6055185 BAM_1919 BAM_1920     FALSE 0.580 83.000 0.174 1.000   NA
 6055191 6055192 BAM_1926 BAM_1927     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6055192 6055193 BAM_1927 BAM_1928     FALSE 0.006 594.000 0.000 NA   NA
 6055193 6055194 BAM_1928 BAM_1929     TRUE 0.767 32.000 0.500 0.003   NA
 6055194 6055195 BAM_1929 BAM_1930     FALSE 0.630 108.000 0.000 NA   NA
 6055195 6055196 BAM_1930 BAM_1931     FALSE 0.011 396.000 0.000 NA   NA
 6055196 6055197 BAM_1931 BAM_1932     FALSE 0.061 358.000 0.000 1.000 N NA
 6055197 6055198 BAM_1932 BAM_1933   dra FALSE 0.112 306.000 0.077 1.000 N NA
 6055198 6055199 BAM_1933 BAM_1934 dra   TRUE 0.961 103.000 0.026 1.000 Y NA
 6055199 6055200 BAM_1934 BAM_1935     FALSE 0.366 43.000 0.000 NA   NA
 6055202 6055203 BAM_1937 BAM_1938     TRUE 0.724 52.000 0.750 1.000   NA
 6055204 6055205 BAM_1939 BAM_1940     TRUE 0.893 118.000 0.027 1.000 N NA
 6055205 6055206 BAM_1940 BAM_1941     FALSE 0.023 606.000 0.000 1.000 N NA
 6055208 6055209 BAM_1943 BAM_1944 topB2   FALSE 0.054 270.000 0.065 NA   NA
 6055211 6055212 BAM_1946 BAM_1947     FALSE 0.079 240.000 0.000 NA   NA
 6055212 6055213 BAM_1947 BAM_1948   brnQ FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6055213 6055214 BAM_1948 BAM_1949 brnQ   FALSE 0.462 84.000 0.000 NA   NA
 6055214 6055215 BAM_1949 BAM_1950     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6055215 6055216 BAM_1950 BAM_1951     TRUE 0.648 112.000 0.000 NA   NA
 6055216 6055217 BAM_1951 BAM_1952     TRUE 0.864 113.000 0.600 NA   NA
 6055218 6055219 BAM_1953 BAM_1954     FALSE 0.306 182.000 0.158 NA   NA
 6055220 6055221 BAM_1956 BAM_1957     TRUE 0.976 121.000 0.389 NA Y NA
 6055221 6055222 BAM_1957 BAM_1958     TRUE 0.679 72.000 0.158 NA N NA
 6055222 6055223 BAM_1958 BAM_1960     FALSE 0.515 58.000 0.123 0.030   NA
 6055225 6055226 BAM_1961 BAM_1962     TRUE 0.695 112.000 0.128 NA   NA
 6055226 6055227 BAM_1962 BAM_1963     FALSE 0.332 179.000 0.128 NA   NA
 6055229 6055230 BAM_1965 BAM_1966     TRUE 0.710 104.000 0.273 NA   NA
 6055232 6055233 BAM_1968 BAM_1969     TRUE 0.859 13.000 0.052 1.000 N NA
 6055233 6055234 BAM_1969 BAM_1970     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6055234 6055235 BAM_1970 BAM_1971     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6055235 6055236 BAM_1971 BAM_1972     FALSE 0.555 182.000 0.054 NA N NA
 6055236 6055237 BAM_1972 BAM_1973     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6055237 6055238 BAM_1973 BAM_1974     FALSE 0.272 -31.000 0.000 NA   NA
 6055238 6055239 BAM_1974 BAM_1975     TRUE 0.939 -22.000 0.708 0.024 Y NA
 6055239 6055240 BAM_1975 BAM_1976     TRUE 0.973 22.000 0.746 1.000 Y NA
 6055240 6055241 BAM_1976 BAM_1977     TRUE 0.948 50.000 0.687 0.028 Y NA
 6055243 6055244 BAM_1979 BAM_1980     FALSE 0.439 37.000 0.111 NA   NA
 6055244 6055245 BAM_1980 BAM_1981     TRUE 0.881 2.000 0.647 1.000   NA
 6055245 6055246 BAM_1981 BAM_1982     TRUE 0.692 94.000 0.286 1.000   NA
 6055246 6055247 BAM_1982 BAM_1983     TRUE 0.896 118.000 0.259 NA N NA
 6055247 6055248 BAM_1983 BAM_1984   cydA1 FALSE 0.076 618.000 0.000 NA Y NA
 6055248 6055249 BAM_1984 BAM_1985 cydA1 cydB1 TRUE 0.918 -13.000 0.051 0.030 Y NA
 6055249 6055250 BAM_1985 BAM_1986 cydB1   TRUE 0.965 0.000 0.151 1.000 Y NA
 6055250 6055251 BAM_1986 BAM_1987     TRUE 0.973 3.000 0.168 0.004 Y NA
 6055251 6055252 BAM_1987 BAM_1988     FALSE 0.036 290.000 0.000 NA   NA
 6055252 6055253 BAM_1988 BAM_1989     TRUE 0.658 91.000 0.353 NA   NA
 6055255 6055256 BAM_1991 BAM_1992     FALSE 0.097 245.000 0.000 1.000   NA
 6055256 6055257 BAM_1992 BAM_1993     FALSE 0.005 916.000 0.000 NA   NA
 6055259 6055260 BAM_1995 BAM_1996     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6055260 6055261 BAM_1996 BAM_1997     FALSE 0.483 89.000 0.000 NA   NA
 6055261 6055262 BAM_1997 BAM_1998     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055262 6055263 BAM_1998 BAM_1999     FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 6055265 6055266 BAM_2001 BAM_2002     TRUE 0.671 117.000 0.000 NA   NA
 6055266 6055267 BAM_2002 BAM_2003     FALSE 0.605 141.000 0.000 NA   NA
 6055267 6055268 BAM_2003 BAM_2004     TRUE 0.722 118.000 0.136 NA   NA
 6055268 6055269 BAM_2004 BAM_2005     FALSE 0.342 69.000 0.000 NA   NA
 6055269 6055270 BAM_2005 BAM_2006     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6055272 6055273 BAM_2008 BAM_2009   hom1 FALSE 0.007 964.000 0.000 1.000   NA
 6055273 6055274 BAM_2009 BAM_2010 hom1 thrC TRUE 0.932 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 6055274 6055275 BAM_2010 BAM_2011 thrC thrB TRUE 0.957 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 6055275 6055276 BAM_2011 BAM_2012 thrB   TRUE 0.683 120.000 0.011 NA   NA
 6055276 6055277 BAM_2012 BAM_2013     FALSE 0.116 217.000 0.000 NA   NA
 6055277 6055278 BAM_2013 BAM_2014     FALSE 0.152 205.000 0.000 NA   NA
 6055278 6055279 BAM_2014 BAM_2015     FALSE 0.506 160.000 0.222 NA   NA
 6055279 6055280 BAM_2015 BAM_2016     FALSE 0.608 14.000 0.038 NA   NA
 6055280 6055281 BAM_2016 BAM_2017     TRUE 0.915 -21.000 0.472 1.000 Y NA
 6055281 6055282 BAM_2017 BAM_2018     TRUE 0.862 101.000 0.129 1.000 N NA
 6055282 6055283 BAM_2018 BAM_2019     FALSE 0.636 15.000 0.111 NA   NA
 6055283 6055284 BAM_2019 BAM_2020     FALSE 0.487 160.000 0.111 NA   NA
 6055284 6055285 BAM_2020 BAM_2021     TRUE 0.650 98.000 0.049 1.000   NA
 6055285 6055286 BAM_2021 BAM_2022   asbA FALSE 0.053 284.000 0.000 1.000   NA
 6055286 6055287 BAM_2022 BAM_2023 asbA asbB TRUE 0.909 65.000 0.163 0.001 Y NA
 6055287 6055288 BAM_2023 BAM_2024 asbB asbC TRUE 0.922 -13.000 0.310 1.000 Y NA
 6055288 6055289 BAM_2024 BAM_2025 asbC asbD FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055289 6055290 BAM_2025 BAM_2026 asbD asbE FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6055290 6055291 BAM_2026 BAM_2027 asbE asbF FALSE 0.581 38.000 0.412 NA   NA
 6055291 6055292 BAM_2027 BAM_2028 asbF   TRUE 0.728 126.000 0.137 NA   NA
 6055292 6055293 BAM_2028 BAM_2029     FALSE 0.480 168.000 0.167 1.000   NA
 6055295 6055296 BAM_2031 BAM_2032     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6055297 6055298 BAM_2033 BAM_2034     TRUE 0.804 91.000 0.714 NA   NA
 6055299 6055300 BAM_2035 BAM_2036     TRUE 0.722 146.000 0.375 NA   NA
 6055300 6055301 BAM_2036 BAM_2037     FALSE 0.612 104.000 0.000 NA   NA
 6055301 6055302 BAM_2037 BAM_2038     FALSE 0.439 32.000 0.000 NA   NA
 6055304 6055305 BAM_2040 BAM_2041     FALSE 0.605 103.000 0.000 NA   NA
 6055305 6055306 BAM_2041 BAM_2042     TRUE 0.768 117.000 0.286 NA   NA
 6055306 6055307 BAM_2042 BAM_2043     FALSE 0.134 275.000 0.000 NA N NA
 6055309 6055310 BAM_2045 BAM_2046     FALSE 0.161 203.000 0.000 NA   NA
 6055310 6055311 BAM_2046 BAM_2047     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6055312 6055313 BAM_2048 BAM_2049     TRUE 0.820 85.000 0.889 NA   NA
 6055314 6055315 BAM_2050 BAM_2051     FALSE 0.313 180.000 0.091 NA   NA
 6055315 6055316 BAM_2051 BAM_2052     FALSE 0.197 205.000 0.000 1.000   NA
 6055316 6055317 BAM_2052 BAM_2053     FALSE 0.403 205.000 0.667 NA   NA
 6055317 6055318 BAM_2053 BAM_2054     FALSE 0.050 269.000 0.000 NA   NA
 6055320 6055321 BAM_2056 BAM_2057 dpS   TRUE 0.672 107.000 0.111 NA   NA
 6055321 6055322 BAM_2057 BAM_2058     FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 6055323 6055324 BAM_2059 BAM_2060     TRUE 0.809 106.000 0.467 NA   NA
 6055325 6055326 BAM_2061 BAM_2062     TRUE 0.880 85.000 0.636 1.000 N NA
 6055330 6055331 BAM_2066 BAM_2068     FALSE 0.250 -40.000 0.000 NA   NA
 6055332 6055333 BAM_2067 BAM_2069     FALSE 0.332 171.000 0.000 NA   NA
 6055333 6055334 BAM_2069 BAM_2070     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6055335 6055336 BAM_2071 BAM_2072     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 6055336 6055337 BAM_2072 BAM_2073     FALSE 0.069 249.000 0.000 NA   NA
 6055337 6055338 BAM_2073 BAM_2074     FALSE 0.005 2229.000 0.000 NA   NA
 6055342 6055343 BAM_2078 BAM_2079     TRUE 0.822 116.000 0.333 1.000   NA
 6055345 6055346 BAM_2081 BAM_2082 ogt1   FALSE 0.554 95.000 0.054 NA   NA
 6055346 6055347 BAM_2082 BAM_2083     FALSE 0.540 77.000 0.296 NA   NA
 6055347 6055348 BAM_2083 BAM_2084   fosB1 TRUE 0.884 59.000 0.129 NA Y NA
 6055348 6055349 BAM_2084 BAM_2085 fosB1   FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6055349 6055350 BAM_2085 BAM_2086     TRUE 0.671 13.000 0.000 1.000   NA
 6055352 6055353 BAM_2088 BAM_2089 cotH   TRUE 0.854 106.000 0.062 NA N NA
 6055353 6055354 BAM_2089 BAM_2090     TRUE 0.643 105.000 0.062 NA   NA
 6055354 6055355 BAM_2090 BAM_2091     TRUE 0.805 102.000 0.500 NA   NA
 6055355 6055356 BAM_2091 BAM_2092     FALSE 0.311 185.000 0.033 1.000   NA
 6055356 6055357 BAM_2092 BAM_2093     FALSE 0.191 199.000 0.053 NA   NA
 6055357 6055358 BAM_2093 BAM_2094     TRUE 0.899 4.000 0.841 NA   NA
 6055358 6055359 BAM_2094 BAM_2095     FALSE 0.228 196.000 0.195 NA   NA
 6055359 6055360 BAM_2095 BAM_2096     FALSE 0.182 374.000 0.000 1.000 Y NA
 6055360 6055361 BAM_2096 BAM_2097     FALSE 0.439 32.000 0.000 NA   NA
 6055361 6055362 BAM_2097 BAM_2098     FALSE 0.417 34.000 0.000 NA   NA
 6055362 6055363 BAM_2098 BAM_2099     FALSE 0.227 187.000 0.000 NA   NA
 6055363 6055364 BAM_2099 BAM_2100     TRUE 0.656 101.000 0.227 NA   NA
 6055365 6055366 BAM_2101 BAM_2102     TRUE 0.647 2.000 0.034 NA   NA
 6055366 6055367 BAM_2102 BAM_2103     FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 6055367 6055368 BAM_2103 BAM_2104     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6055369 6055370 BAM_2105 BAM_2106   brnQ4 FALSE 0.010 424.000 0.000 NA   NA
 6055370 6055371 BAM_2106 BAM_2107 brnQ4 csaA FALSE 0.417 67.000 0.032 1.000   NA
 6055371 6055372 BAM_2107 BAM_2109 csaA   FALSE 0.576 18.000 0.032 NA   NA
 6055373 6055374 BAM_2108 BAM_2110     TRUE 0.695 5.000 0.200 NA   NA
 6055375 6055376 BAM_2111 BAM_2112 spoIIP   FALSE 0.159 224.000 0.214 1.000   NA
 6055376 6055377 BAM_2112 BAM_2113     TRUE 0.922 12.000 0.571 1.000 N NA
 6055377 6055378 BAM_2113 BAM_2114     TRUE 0.759 24.000 0.444 1.000   NA
 6055378 6055379 BAM_2114 BAM_2115     FALSE 0.394 185.000 0.286 1.000   NA
 6055381 6055382 BAM_2117 BAM_2118     TRUE 0.967 3.000 0.259 NA Y NA
 6055382 6055383 BAM_2118 BAM_2119     TRUE 0.871 107.000 0.021 1.000 N NA
 6055383 6055384 BAM_2119 BAM_2120     TRUE 0.807 7.000 0.368 1.000   NA
 6055387 6055388 BAM_2123 BAM_2124     FALSE 0.584 -7.000 0.185 1.000   NA
 6055388 6055389 BAM_2124 BAM_2125     FALSE 0.583 24.000 0.222 NA   NA
 6055390 6055391 BAM_2126 BAM_2127     TRUE 0.694 168.000 0.700 NA   NA
 6055393 6055394 BAM_2129 BAM_2130     FALSE 0.535 148.000 0.000 NA   NA
 6055394 6055395 BAM_2130 BAM_2131     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055397 6055398 BAM_2133 BAM_2134     FALSE 0.314 -21.000 0.000 NA   NA
 6055398 6055399 BAM_2134 BAM_2135     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055399 6055400 BAM_2135 BAM_2136     FALSE 0.634 13.000 0.090 NA   NA
 6055400 6055401 BAM_2136 BAM_2137     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6055401 6055402 BAM_2137 BAM_2138     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6055402 6055403 BAM_2138 BAM_2139     FALSE 0.409 77.000 0.000 NA   NA
 6055403 6055404 BAM_2139 BAM_2140     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6055404 6055405 BAM_2140 BAM_2141     FALSE 0.597 142.000 0.000 NA   NA
 6055406 6055407 BAM_2142 BAM_2143     FALSE 0.404 163.000 0.000 NA   NA
 6055407 6055408 BAM_2143 BAM_2144     FALSE 0.046 272.000 0.000 NA   NA
 6055409 6055410 BAM_2145 BAM_2146     FALSE 0.491 161.000 0.216 NA   NA
 6055410 6055411 BAM_2146 BAM_2147     FALSE 0.402 52.000 0.216 NA   NA
 6055411 6055412 BAM_2147 BAM_2148     TRUE 0.736 70.000 0.889 NA   NA
 6055414 6055415 BAM_2150 BAM_2151   fhs TRUE 0.684 64.000 0.200 1.000 N NA
 6055415 6055416 BAM_2151 BAM_2152 fhs   TRUE 0.658 91.000 0.355 NA   NA
 6055416 6055417 BAM_2152 BAM_2153     FALSE 0.575 20.000 0.070 NA   NA
 6055417 6055418 BAM_2153 BAM_2154     FALSE 0.599 143.000 0.026 NA   NA
 6055418 6055419 BAM_2154 BAM_2155     FALSE 0.391 56.000 0.211 NA   NA
 6055420 6055421 BAM_2156 BAM_2157     FALSE 0.538 30.000 0.233 NA   NA
 6055422 6055423 BAM_2158 BAM_2159     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6055423 6055424 BAM_2159 BAM_2160     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055425 6055426 BAM_2161 BAM_2162     FALSE 0.495 86.000 0.064 NA   NA
 6055426 6055427 BAM_2162 BAM_2163     FALSE 0.586 98.000 0.064 NA   NA
 6055429 6055430 BAM_2165 BAM_2166     FALSE 0.084 318.000 0.642 NA   NA
 6055430 6055431 BAM_2166 BAM_2167     TRUE 0.870 0.000 0.714 NA   NA
 6055431 6055432 BAM_2167 BAM_2168     FALSE 0.012 389.000 0.000 NA   NA
 6055432 6055433 BAM_2168 BAM_2169     TRUE 0.766 93.000 0.556 NA   NA
 6055434 6055435 BAM_2170 BAM_2171 narG narH TRUE 0.950 -10.000 0.429 0.000 Y NA
 6055435 6055436 BAM_2171 BAM_2172 narH narJ TRUE 0.978 20.000 0.750 0.001 Y NA
 6055436 6055437 BAM_2172 BAM_2173 narJ narI TRUE 0.967 18.000 0.294 0.001 Y NA
 6055437 6055438 BAM_2173 BAM_2174 narI   FALSE 0.079 332.000 0.000 1.000 N NA
 6055438 6055439 BAM_2174 BAM_2175     TRUE 0.857 -3.000 0.250 1.000 N NA
 6055439 6055440 BAM_2175 BAM_2176     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6055442 6055443 BAM_2178 BAM_2179 narA1   TRUE 0.977 18.000 0.778 1.000 Y NA
 6055443 6055444 BAM_2179 BAM_2180   moeA1 TRUE 0.934 43.000 0.500 1.000 Y NA
 6055444 6055445 BAM_2180 BAM_2181 moeA1 moaE1 TRUE 0.913 45.000 0.006 0.004 Y NA
 6055445 6055446 BAM_2181 BAM_2182 moaE1 moaD1 TRUE 0.974 -3.000 0.501 0.004 Y NA
 6055446 6055447 BAM_2182 BAM_2183 moaD1 narK TRUE 0.734 81.000 0.021 NA N NA
 6055447 6055448 BAM_2183 BAM_2184 narK   FALSE 0.017 352.000 0.000 NA   NA
 6055448 6055449 BAM_2184 BAM_2186     FALSE 0.008 480.000 0.000 NA   NA
 6055450 6055451 BAM_2185 BAM_2187     TRUE 0.685 116.000 0.054 NA   NA
 6055451 6055452 BAM_2187 BAM_2188     FALSE 0.583 -7.000 0.143 1.000   NA
 6055452 6055453 BAM_2188 BAM_2189     TRUE 0.764 -3.000 0.381 1.000   NA
 6055453 6055454 BAM_2189 BAM_2190   nirD TRUE 0.669 63.000 0.061 1.000 N NA
 6055454 6055455 BAM_2190 BAM_2191 nirD nirB TRUE 0.884 16.000 0.091 0.000 N NA
 6055455 6055456 BAM_2191 BAM_2192 nirB scdA FALSE 0.331 212.000 0.000 NA N NA
 6055459 6055460 BAM_2195 BAM_2196     FALSE 0.247 216.000 0.444 NA   NA
 6055462 6055463 BAM_2198 BAM_2199     FALSE 0.329 61.000 0.000 NA   NA
 6055463 6055464 BAM_2199 BAM_2200   spoVS1 FALSE 0.009 430.000 0.000 NA   NA
 6055465 6055466 BAM_2201 BAM_2202     FALSE 0.025 317.000 0.000 NA   NA
 6055467 6055468 BAM_2203 BAM_2204     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6055469 6055470 BAM_2205 BAM_2206     FALSE 0.142 208.000 0.000 NA   NA
 6055471 6055472 BAM_2207 BAM_2208     FALSE 0.568 -3.000 0.020 NA   NA
 6055472 6055473 BAM_2208 BAM_2209     TRUE 0.645 -3.000 0.031 1.000   NA
 6055473 6055474 BAM_2209 BAM_2210     FALSE 0.406 76.000 0.022 NA   NA
 6055474 6055475 BAM_2210 BAM_2211     TRUE 0.643 106.000 0.049 NA   NA
 6055475 6055476 BAM_2211 BAM_2212   ssb2 TRUE 0.765 159.000 0.700 NA   NA
 6055477 6055478 BAM_2213 BAM_2214     FALSE 0.598 102.000 0.000 NA   NA
 6055478 6055479 BAM_2214 BAM_2215     FALSE 0.038 286.000 0.000 NA   NA
 6055480 6055481 BAM_2216 BAM_2217     TRUE 0.655 4.000 0.028 NA   NA
 6055481 6055482 BAM_2217 BAM_2218     FALSE 0.473 84.000 0.028 NA   NA
 6055482 6055483 BAM_2218 BAM_2219     FALSE 0.381 50.000 0.081 NA   NA
 6055483 6055484 BAM_2219 BAM_2220   argS1 FALSE 0.031 301.000 0.000 NA   NA
 6055484 6055485 BAM_2220 BAM_2221 argS1   FALSE 0.121 217.000 0.032 NA   NA
 6055485 6055486 BAM_2221 BAM_2222     FALSE 0.551 30.000 0.250 NA   NA
 6055486 6055487 BAM_2222 BAM_2223     TRUE 0.682 137.000 0.118 NA   NA
 6055487 6055488 BAM_2223 BAM_2224     FALSE 0.014 370.000 0.000 NA   NA
 6055488 6055489 BAM_2224 BAM_2225     FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6055489 6055490 BAM_2225 BAM_2227   ileS1 FALSE 0.012 393.000 0.000 NA   NA
 6055494 6055495 BAM_2230 BAM_2231   aspS1 FALSE 0.110 220.000 0.000 NA   NA
 6055495 6055496 BAM_2231 BAM_2232 aspS1   FALSE 0.170 201.000 0.000 NA   NA
 6055496 6055497 BAM_2232 BAM_2233     TRUE 0.658 13.000 0.214 NA   NA
 6055497 6055498 BAM_2233 BAM_2234     TRUE 0.645 29.000 0.375 NA   NA
 6055498 6055499 BAM_2234 BAM_2235     FALSE 0.462 32.000 0.057 NA   NA
 6055499 6055500 BAM_2235 BAM_2236     TRUE 0.706 128.000 0.075 NA   NA
 6055500 6055501 BAM_2236 BAM_2237     FALSE 0.555 85.000 0.250 NA   NA
 6055501 6055502 BAM_2237 BAM_2238     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6055502 6055503 BAM_2238 BAM_2239     FALSE 0.430 -9.000 0.000 NA   NA
 6055503 6055504 BAM_2239 BAM_2240     FALSE 0.490 90.000 0.000 NA   NA
 6055504 6055505 BAM_2240 BAM_2241     FALSE 0.355 71.000 0.000 NA   NA
 6055505 6055506 BAM_2241 BAM_2242     FALSE 0.083 237.000 0.000 NA   NA
 6055506 6055507 BAM_2242 BAM_2243     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6055507 6055508 BAM_2243 BAM_2244     FALSE 0.009 461.000 0.000 NA   NA
 6055508 6055509 BAM_2244 BAM_2245     TRUE 0.713 -15.000 0.750 NA   NA
 6055509 6055510 BAM_2245 BAM_2246     FALSE 0.447 159.000 0.000 NA   NA
 6055510 6055511 BAM_2246 BAM_2247     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055511 6055512 BAM_2247 BAM_2248     FALSE 0.059 258.000 0.000 NA   NA
 6055512 6055513 BAM_2248 BAM_2249     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6055513 6055514 BAM_2249 BAM_2250     FALSE 0.006 560.000 0.000 NA   NA
 6055514 6055515 BAM_2250 BAM_2251     FALSE 0.407 35.000 0.000 NA   NA
 6055515 6055516 BAM_2251 BAM_2252     FALSE 0.007 513.000 0.000 NA   NA
 6055516 6055517 BAM_2252 BAM_2253     FALSE 0.351 49.000 0.000 NA   NA
 6055517 6055518 BAM_2253 BAM_2254     FALSE 0.007 547.000 0.000 NA   NA
 6055518 6055519 BAM_2254 BAM_2255     TRUE 0.855 -3.000 0.240 1.000 N NA
 6055519 6055520 BAM_2255 BAM_2256     TRUE 0.891 129.000 0.015 1.000 N NA
 6055520 6055521 BAM_2256 BAM_2257     TRUE 0.968 4.000 0.100 1.000 Y NA
 6055521 6055522 BAM_2257 BAM_2258     TRUE 0.663 20.000 0.133 1.000   NA
 6055522 6055523 BAM_2258 BAM_2259     TRUE 0.903 109.000 0.667 0.004   NA
 6055523 6055524 BAM_2259 BAM_2260     FALSE 0.010 495.000 0.000 1.000   NA
 6055524 6055525 BAM_2260 BAM_2261     FALSE 0.496 41.000 0.206 1.000   NA
 6055526 6055527 BAM_2262 BAM_2263     FALSE 0.472 87.000 0.000 NA   NA
 6055528 6055529 BAM_2264 BAM_2265     FALSE 0.179 210.000 0.000 1.000   NA
 6055529 6055530 BAM_2265 BAM_2266     TRUE 0.802 53.000 0.583 1.000 N NA
 6055530 6055531 BAM_2266 BAM_2267     TRUE 0.823 148.000 0.032 1.000 N NA
 6055531 6055532 BAM_2267 BAM_2268     FALSE 0.399 75.000 0.032 NA   NA
 6055532 6055533 BAM_2268 BAM_2269     FALSE 0.610 -3.000 0.113 NA   NA
 6055534 6055535 BAM_2270 BAM_2271     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6055535 6055536 BAM_2271 BAM_2272     FALSE 0.462 30.000 0.000 NA   NA
 6055537 6055538 BAM_2273 BAM_2274     FALSE 0.598 -7.000 0.308 NA   NA
 6055538 6055539 BAM_2274 BAM_2275     FALSE 0.039 283.000 0.000 NA   NA
 6055539 6055540 BAM_2275 BAM_2276     TRUE 0.642 106.000 0.045 NA   NA
 6055540 6055541 BAM_2276 BAM_2277     FALSE 0.455 80.000 0.038 NA   NA
 6055541 6055542 BAM_2277 BAM_2278     FALSE 0.633 13.000 0.085 NA   NA
 6055543 6055544 BAM_2279 BAM_2280     TRUE 0.767 128.000 0.094 1.000   NA
 6055545 6055546 BAM_2281 BAM_2282 thyA dfrA TRUE 0.861 20.000 0.295 1.000 N NA
 6055546 6055547 BAM_2282 BAM_2283 dfrA pbpC TRUE 0.779 156.000 0.015 1.000 N NA
 6055547 6055548 BAM_2283 BAM_2284 pbpC   FALSE 0.076 242.000 0.000 NA   NA
 6055550 6055551 BAM_1480 BAM_1479     FALSE 0.014 419.000 0.000 1.000   NA
 6055551 6055552 BAM_1479 BAM_1478     FALSE 0.503 -25.000 0.375 1.000   NA
 6055552 6055553 BAM_1478 BAM_1477   cysG TRUE 0.779 2.000 0.281 1.000   NA
 6055553 6055554 BAM_1477 BAM_1476 cysG   FALSE 0.588 87.000 0.281 NA   NA
 6055554 6055555 BAM_1476 BAM_1475     TRUE 0.850 11.000 0.647 NA   NA
 6055555 6055556 BAM_1475 BAM_1474   cysC TRUE 0.962 12.000 0.067 1.000 Y NA
 6055556 6055557 BAM_1474 BAM_1473 cysC sat TRUE 0.968 13.000 0.101 0.000 Y NA
 6055557 6055558 BAM_1473 BAM_1472 sat cysH TRUE 0.716 39.000 0.065 1.000 N NA
 6055558 6055559 BAM_1472 BAM_1471 cysH   FALSE 0.475 87.000 0.011 NA   NA
 6055559 6055560 BAM_1471 BAM_1470   lysA FALSE 0.033 297.000 0.000 NA   NA
 6055560 6055561 BAM_1470 BAM_1469 lysA   FALSE 0.009 457.000 0.000 NA   NA
 6055562 6055563 BAM_1468 BAM_1467     FALSE 0.586 182.000 0.011 1.000 N NA
 6055564 6055565 BAM_1466 BAM_1465     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6055565 6055566 BAM_1465 BAM_1464     FALSE 0.338 68.000 0.000 NA   NA
 6055566 6055567 BAM_1464 BAM_1463   hisI FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6055567 6055568 BAM_1463 BAM_1462 hisI hisE FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6055568 6055569 BAM_1462 BAM_1461 hisE hisF FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055569 6055570 BAM_1461 BAM_1460 hisF hisA TRUE 0.962 -6.000 0.433 0.003 Y NA
 6055570 6055571 BAM_1460 BAM_1459 hisA hisH TRUE 0.887 -27.000 0.124 0.003 Y NA
 6055571 6055572 BAM_1459 BAM_1458 hisH hisB TRUE 0.971 1.000 0.125 0.003 Y NA
 6055572 6055573 BAM_1458 BAM_1457 hisB hisD TRUE 0.969 0.000 0.096 0.003 Y NA
 6055573 6055574 BAM_1457 BAM_1456 hisD hisG TRUE 0.970 12.000 0.254 0.003 Y NA
 6055574 6055575 BAM_1456 BAM_1455 hisG hisZ TRUE 0.897 -24.000 0.239 0.003 Y NA
 6055575 6055576 BAM_1455 BAM_1454 hisZ leuD FALSE 0.309 311.000 0.000 1.000 Y NA
 6055576 6055577 BAM_1454 BAM_1453 leuD leuC TRUE 0.925 -22.000 0.477 0.000 Y NA
 6055577 6055578 BAM_1453 BAM_1452 leuC leuB TRUE 0.970 0.000 0.080 0.001 Y NA
 6055578 6055579 BAM_1452 BAM_1451 leuB leuA TRUE 0.934 78.000 0.041 0.001 Y NA
 6055579 6055580 BAM_1451 BAM_1450 leuA ilvC1 TRUE 0.967 2.000 0.103 1.000 Y NA
 6055580 6055581 BAM_1450 BAM_1449 ilvC1 ilvN TRUE 0.952 27.000 0.130 0.001 Y NA
 6055581 6055582 BAM_1449 BAM_1448 ilvN ilvB TRUE 0.964 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 6055582 6055583 BAM_1448 BAM_1447 ilvB ilvE1 FALSE 0.320 307.000 0.000 1.000 Y NA
 6055583 6055584 BAM_1447 BAM_1446 ilvE1   TRUE 0.726 120.000 0.150 NA   NA
 6055585 6055586 BAM_1445 BAM_1444     TRUE 0.729 127.000 0.195 NA   NA
 6055587 6055588 BAM_1443 BAM_1442     TRUE 0.792 85.000 0.750 NA   NA
 6055592 6055593 BAM_1438 BAM_1437     FALSE 0.635 137.000 0.000 NA   NA
 6055594 6055595 BAM_1436 BAM_1435     FALSE 0.341 67.000 0.022 NA   NA
 6055599 6055600 BAM_1431 BAM_1430     TRUE 0.825 19.000 0.667 NA   NA
 6055603 6055604 BAM_1427 BAM_1426     TRUE 0.730 100.000 0.357 NA   NA
 6055604 6055605 BAM_1426 BAM_1425     TRUE 0.704 25.000 0.421 NA   NA
 6055605 6055606 BAM_1425 BAM_1424     FALSE 0.602 -7.000 0.316 NA   NA
 6055606 6055607 BAM_1424 BAM_1423   amaA FALSE 0.097 227.000 0.000 NA   NA
 6055608 6055609 BAM_1422 BAM_1421   dltA TRUE 0.821 13.000 0.549 NA   NA
 6055609 6055610 BAM_1421 BAM_1420 dltA dltB TRUE 0.876 -3.000 0.435 NA N NA
 6055610 6055611 BAM_1420 BAM_1419 dltB dltC FALSE 0.520 69.000 0.387 NA   NA
 6055611 6055612 BAM_1419 BAM_1418 dltC dltD TRUE 0.656 -3.000 0.064 1.000   NA
 6055615 6055616 BAM_1415 BAM_1414     FALSE 0.526 87.000 0.127 NA   NA
 6055616 6055617 BAM_1414 BAM_1413     FALSE 0.517 -7.000 0.194 NA   NA
 6055618 6055619 BAM_1412 BAM_1411     TRUE 0.679 101.000 0.258 NA   NA
 6055620 6055621 BAM_1410 BAM_1409     FALSE 0.170 203.000 0.040 NA   NA
 6055621 6055622 BAM_1409 BAM_1408     TRUE 0.805 0.000 0.471 NA   NA
 6055622 6055623 BAM_1408 BAM_1407     TRUE 0.858 15.000 0.727 NA   NA
 6055623 6055624 BAM_1407 BAM_1406     TRUE 0.854 -3.000 0.778 NA   NA
 6055624 6055625 BAM_1406 BAM_1405     TRUE 0.864 -3.000 0.280 1.000 N NA
 6055625 6055626 BAM_1405 BAM_1404   nrdF FALSE 0.342 217.000 0.000 1.000 N NA
 6055626 6055627 BAM_1404 BAM_1403 nrdF nrdE TRUE 0.973 94.000 0.625 0.001 Y NA
 6055627 6055628 BAM_1403 BAM_1402 nrdE   FALSE 0.609 95.000 0.000 1.000   NA
 6055628 6055629 BAM_1402 BAM_1401     FALSE 0.103 241.000 0.000 1.000   NA
 6055629 6055630 BAM_1401 BAM_1400   nrdI FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6055630 6055631 BAM_1400 BAM_1399 nrdI   FALSE 0.008 477.000 0.000 NA   NA
 6055631 6055632 BAM_1399 BAM_1398     FALSE 0.566 27.000 0.229 NA   NA
 6055634 6055635 BAM_1396 BAM_1395     FALSE 0.537 89.000 0.140 NA   NA
 6055637 6055638 BAM_1393 BAM_1392     TRUE 0.664 19.000 0.101 1.000   NA
 6055638 6055639 BAM_1392 BAM_1391     TRUE 0.809 -7.000 0.280 1.000 N NA
 6055639 6055640 BAM_1391 BAM_1390     TRUE 0.706 0.000 0.062 1.000   NA
 6055642 6055643 BAM_1388 BAM_1387     FALSE 0.605 103.000 0.000 NA   NA
 6055643 6055644 BAM_1387 BAM_1386     TRUE 0.669 139.000 0.114 NA   NA
 6055644 6055645 BAM_1386 BAM_1385     TRUE 0.736 161.000 0.129 NA N NA
 6055649 6055650 BAM_1381 BAM_1380     TRUE 0.683 126.000 0.000 NA   NA
 6055650 6055651 BAM_1380 BAM_1379     FALSE 0.488 -6.000 0.000 NA   NA
 6055651 6055652 BAM_1379 BAM_1378     FALSE 0.071 248.000 0.000 NA   NA
 6055652 6055653 BAM_1378 BAM_1377     FALSE 0.326 -19.000 0.000 NA   NA
 6055653 6055654 BAM_1377 BAM_1376     FALSE 0.619 9.000 0.000 NA   NA
 6055654 6055655 BAM_1376 BAM_1375     FALSE 0.390 165.000 0.000 NA   NA
 6055655 6055656 BAM_1375 BAM_1374     FALSE 0.427 161.000 0.000 NA   NA
 6055656 6055657 BAM_1374 BAM_1373     FALSE 0.370 41.000 0.000 NA   NA
 6055657 6055658 BAM_1373 BAM_1372     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6055658 6055659 BAM_1372 BAM_1371     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055659 6055660 BAM_1371 BAM_1370   phnX TRUE 0.793 16.000 0.315 0.063   NA
 6055660 6055661 BAM_1370 BAM_1369 phnX   FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6055661 6055662 BAM_1369 BAM_1368     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6055662 6055663 BAM_1368 BAM_1367     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6055663 6055664 BAM_1367 BAM_1366     FALSE 0.478 155.000 0.000 NA   NA
 6055664 6055665 BAM_1366 BAM_1365     FALSE 0.093 229.000 0.000 NA   NA
 6055667 6055668 BAM_1363 BAM_1362     TRUE 0.819 24.000 0.096 1.000 N NA
 6055668 6055669 BAM_1362 BAM_1361   phaC TRUE 0.836 96.000 0.113 1.000 N NA
 6055669 6055670 BAM_1361 BAM_1360 phaC phbB TRUE 0.946 83.000 0.161 0.000 Y NA
 6055670 6055671 BAM_1360 BAM_1359 phbB   TRUE 0.728 150.000 0.450 NA   NA
 6055672 6055673 BAM_1358 BAM_1357     FALSE 0.472 43.000 0.273 NA   NA
 6055673 6055674 BAM_1357 BAM_1356     TRUE 0.838 102.000 0.615 NA   NA
 6055674 6055675 BAM_1356 BAM_1355     TRUE 0.825 148.000 0.615 1.000   NA
 6055675 6055676 BAM_1355 BAM_1354     FALSE 0.327 172.000 0.000 NA   NA
 6055676 6055677 BAM_1354 BAM_1353     FALSE 0.428 33.000 0.000 NA   NA
 6055677 6055678 BAM_1353 BAM_1352     FALSE 0.034 295.000 0.000 NA   NA
 6055678 6055679 BAM_1352 BAM_1351     TRUE 0.747 204.000 0.000 1.000 Y NA
 6055680 6055681 BAM_1350 BAM_1349   comC FALSE 0.589 15.000 0.005 NA   NA
 6055681 6055682 BAM_1349 BAM_1348 comC   TRUE 0.726 113.000 0.022 1.000   NA
 6055682 6055683 BAM_1348 BAM_1347     TRUE 0.875 0.000 0.500 0.001   NA
 6055683 6055684 BAM_1347 BAM_1346     TRUE 0.978 17.000 0.947 NA Y NA
 6055684 6055685 BAM_1346 BAM_1345     TRUE 0.743 168.000 0.395 NA N NA
 6055685 6055686 BAM_1345 BAM_1344     FALSE 0.191 261.000 0.000 1.000 N NA
 6055686 6055687 BAM_1344 BAM_1343     TRUE 0.981 4.000 0.621 1.000 Y NA
 6055687 6055688 BAM_1343 BAM_1342     TRUE 0.721 -7.000 0.543 NA   NA
 6055689 6055690 BAM_1341 BAM_1340   glcD TRUE 0.906 118.000 0.247 1.000 N NA
 6055690 6055691 BAM_1340 BAM_1339 glcD   TRUE 0.963 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 6055691 6055692 BAM_1339 BAM_1338     FALSE 0.008 466.000 0.000 NA   NA
 6055693 6055694 BAM_1337 BAM_1336     FALSE 0.542 92.000 0.089 NA   NA
 6055694 6055695 BAM_1336 BAM_1335     FALSE 0.607 99.000 0.089 NA   NA
 6055695 6055696 BAM_1335 BAM_1334     TRUE 0.727 101.000 0.333 NA   NA
 6055696 6055697 BAM_1334 BAM_1333     TRUE 0.806 111.000 0.333 1.000   NA
 6055697 6055698 BAM_1333 BAM_1332   potD TRUE 0.705 60.000 0.267 1.000 N NA
 6055698 6055699 BAM_1332 BAM_1331 potD potC FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 6055699 6055700 BAM_1331 BAM_1330 potC potB FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6055700 6055701 BAM_1330 BAM_1329 potB potA TRUE 0.980 -3.000 0.789 0.026 Y NA
 6055701 6055702 BAM_1329 BAM_1328 potA   FALSE 0.297 227.000 0.000 1.000 N NA
 6055702 6055703 BAM_1328 BAM_1327     FALSE 0.423 172.000 0.069 1.000   NA
 6055704 6055705 BAM_1326 BAM_1325   sinR TRUE 0.724 80.000 0.389 0.004   NA
 6055706 6055707 BAM_1324 BAM_1323 calY   FALSE 0.011 398.000 0.000 NA   NA
 6055707 6055708 BAM_1323 BAM_1322     TRUE 0.764 162.000 0.778 NA   NA
 6055708 6055709 BAM_1322 BAM_1321   sipW FALSE 0.467 63.000 0.320 NA   NA
 6055709 6055710 BAM_1321 BAM_1320 sipW   FALSE 0.409 195.000 0.320 0.025   NA
 6055710 6055711 BAM_1320 BAM_1319     TRUE 0.781 156.000 0.700 NA   NA
 6055712 6055713 BAM_1318 BAM_1317     FALSE 0.343 170.000 0.000 NA   NA
 6055713 6055714 BAM_1317 BAM_1316     FALSE 0.051 278.000 0.103 NA   NA
 6055714 6055715 BAM_1316 BAM_1315     FALSE 0.218 189.000 0.000 NA   NA
 6055716 6055717 BAM_1314 BAM_1313     FALSE 0.366 43.000 0.000 NA   NA
 6055717 6055718 BAM_1313 BAM_1312     FALSE 0.383 38.000 0.000 NA   NA
 6055718 6055719 BAM_1312 BAM_1311     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6055719 6055720 BAM_1311 BAM_1310     TRUE 0.645 135.000 0.000 NA   NA
 6055720 6055721 BAM_1310 BAM_1309     FALSE 0.495 153.000 0.000 NA   NA
 6055721 6055722 BAM_1309 BAM_1308     FALSE 0.331 58.000 0.000 NA   NA
 6055722 6055723 BAM_1308 BAM_1307     TRUE 0.873 135.000 0.667 NA   NA
 6055723 6055724 BAM_1307 BAM_1306     TRUE 0.772 29.000 0.667 NA   NA
 6055724 6055725 BAM_1306 BAM_1305     TRUE 0.901 3.000 0.875 NA   NA
 6055726 6055727 BAM_1304 BAM_1303 odhA odhB TRUE 0.981 136.000 0.667 1.000 Y NA
 6055727 6055728 BAM_1303 BAM_1302 odhB   TRUE 0.688 125.000 0.014 NA   NA
 6055728 6055729 BAM_1302 BAM_1301     TRUE 0.845 -3.000 0.733 NA   NA
 6055729 6055730 BAM_1301 BAM_1300     TRUE 0.861 17.000 0.786 NA   NA
 6055731 6055732 BAM_1299 BAM_1298     FALSE 0.630 145.000 0.208 NA   NA
 6055732 6055733 BAM_1298 BAM_1297     TRUE 0.701 102.000 0.098 1.000   NA
 6055733 6055734 BAM_1297 BAM_1296     TRUE 0.647 2.000 0.033 NA   NA
 6055734 6055735 BAM_1296 BAM_1295     FALSE 0.431 79.000 0.000 NA   NA
 6055737 6055738 BAM_1294 BAM_1292     FALSE 0.011 398.000 0.000 NA   NA
 6055740 6055741 BAM_1290 BAM_1289     FALSE 0.564 93.000 0.167 NA   NA
 6055741 6055742 BAM_1289 BAM_1288     TRUE 0.707 115.000 0.119 NA   NA
 6055742 6055743 BAM_1288 BAM_1287   trpA FALSE 0.350 51.000 0.015 NA   NA
 6055743 6055744 BAM_1287 BAM_1286 trpA trpB TRUE 0.975 4.000 0.248 0.000 Y NA
 6055744 6055745 BAM_1286 BAM_1285 trpB trpF TRUE 0.969 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 6055745 6055746 BAM_1285 BAM_1284 trpF   TRUE 0.965 -3.000 0.264 0.001 Y NA
 6055746 6055747 BAM_1284 BAM_1283   trpD TRUE 0.968 2.000 0.216 1.000 Y NA
 6055747 6055748 BAM_1283 BAM_1282 trpD   TRUE 0.955 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 6055748 6055749 BAM_1282 BAM_1281   trpE TRUE 0.967 -3.000 0.293 0.001 Y NA
 6055749 6055750 BAM_1281 BAM_1280 trpE   FALSE 0.014 370.000 0.000 NA   NA
 6055750 6055751 BAM_1280 BAM_1279     FALSE 0.391 -103.000 0.400 NA   NA
 6055752 6055753 BAM_1278 BAM_1277     FALSE 0.058 271.000 0.130 NA   NA
 6055754 6055755 BAM_1276 BAM_1275     FALSE 0.629 149.000 0.267 NA   NA
 6055756 6055757 BAM_1274 BAM_1273     TRUE 0.821 93.000 0.287 NA N NA
 6055757 6055758 BAM_1273 BAM_1272     TRUE 0.746 2.000 0.213 1.000   NA
 6055758 6055759 BAM_1272 BAM_1271     TRUE 0.704 100.000 0.222 1.000   NA
 6055759 6055760 BAM_1271 BAM_1270   cotZ2 TRUE 0.852 143.000 0.700 NA   NA
 6055760 6055761 BAM_1270 BAM_1269 cotZ2   FALSE 0.360 168.000 0.000 NA   NA
 6055762 6055763 BAM_1268 BAM_1267     TRUE 0.643 111.000 0.000 NA   NA
 6055765 6055766 BAM_1265 BAM_1264   fabI FALSE 0.468 162.000 0.129 NA   NA
 6055766 6055767 BAM_1264 BAM_1263 fabI rfbD TRUE 0.879 109.000 0.082 1.000 N NA
 6055767 6055768 BAM_1263 BAM_1262 rfbD   FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6055768 6055769 BAM_1262 BAM_1261   rfbB FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055769 6055770 BAM_1261 BAM_1260 rfbB rfbC FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6055770 6055771 BAM_1260 BAM_1259 rfbC   TRUE 0.965 9.000 0.096 1.000 Y NA
 6055771 6055772 BAM_1259 BAM_1258     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6055772 6055773 BAM_1258 BAM_1257     FALSE 0.448 81.000 0.000 NA   NA
 6055773 6055774 BAM_1257 BAM_1256     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6055774 6055775 BAM_1256 BAM_1255     TRUE 0.758 -3.000 0.444 NA   NA
 6055775 6055776 BAM_1255 BAM_1254     FALSE 0.044 276.000 0.000 NA   NA
 6055777 6055778 BAM_1253 BAM_1252     TRUE 0.780 123.000 0.154 1.000   NA
 6055778 6055779 BAM_1252 BAM_1251     TRUE 0.780 128.000 0.212 1.000   NA
 6055779 6055780 BAM_1251 BAM_1250     TRUE 0.701 7.000 0.242 NA   NA
 6055780 6055781 BAM_1250 BAM_1249     FALSE 0.589 143.000 0.000 NA   NA
 6055781 6055782 BAM_1249 BAM_1248     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055782 6055783 BAM_1248 BAM_1247     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 6055783 6055784 BAM_1247 BAM_1246     TRUE 0.682 141.000 0.017 1.000   NA
 6055785 6055786 BAM_1245 BAM_1244     TRUE 0.904 16.000 0.480 1.000 N NA
 6055786 6055787 BAM_1244 BAM_1243     TRUE 0.859 19.000 0.725 1.000   NA
 6055787 6055788 BAM_1243 BAM_1242     FALSE 0.568 31.000 0.283 NA   NA
 6055789 6055790 BAM_1241 BAM_1240     FALSE 0.361 181.000 0.063 1.000   NA
 6055790 6055791 BAM_1240 BAM_1239     TRUE 0.667 0.000 0.138 NA   NA
 6055791 6055792 BAM_1239 BAM_1238     FALSE 0.091 230.000 0.000 NA   NA
 6055793 6055794 BAM_1237 BAM_1236 pepF1   FALSE 0.528 51.000 0.398 NA   NA
 6055794 6055795 BAM_1236 BAM_1235   cls2 FALSE 0.508 82.000 0.189 NA   NA
 6055795 6055796 BAM_1235 BAM_1234 cls2 mecA TRUE 0.729 73.000 0.314 NA N NA
 6055796 6055797 BAM_1234 BAM_1233 mecA   FALSE 0.285 -33.000 0.059 NA   NA
 6055799 6055800 BAM_1231 BAM_1230     FALSE 0.008 478.000 0.000 NA   NA
 6055804 6055805 BAM_1226 BAM_1225     TRUE 0.736 -7.000 0.375 0.003   NA
 6055805 6055806 BAM_1225 BAM_1224     TRUE 0.975 19.000 0.706 1.000 Y NA
 6055806 6055807 BAM_1224 BAM_1223     TRUE 0.961 -3.000 0.165 0.026 Y NA
 6055807 6055808 BAM_1223 BAM_1222     TRUE 0.975 128.000 0.031 0.026 Y NA
 6055809 6055810 BAM_1221 BAM_1220   trpS FALSE 0.011 398.000 0.000 NA   NA
 6055811 6055812 BAM_1219 BAM_1218     TRUE 0.714 144.000 0.321 NA   NA
 6055812 6055813 BAM_1218 BAM_1217   fabF TRUE 0.853 107.000 0.039 NA N NA
 6055813 6055814 BAM_1217 BAM_1216 fabF fabH TRUE 0.939 32.000 0.076 0.001 Y NA
 6055814 6055815 BAM_1216 BAM_1215 fabH   TRUE 0.671 117.000 0.000 NA   NA
 6055815 6055816 BAM_1215 BAM_1214     FALSE 0.322 173.000 0.000 NA   NA
 6055816 6055817 BAM_1214 BAM_1213     TRUE 0.662 6.000 0.065 NA   NA
 6055817 6055818 BAM_1213 BAM_1212     FALSE 0.379 48.000 0.065 NA   NA
 6055823 6055824 BAM_1207 BAM_1206     TRUE 0.795 106.000 0.429 NA   NA
 6055824 6055825 BAM_1206 BAM_1205     TRUE 0.891 1.000 0.826 NA   NA
 6055827 6055828 BAM_1203 BAM_1202   prsA2 TRUE 0.840 129.000 0.467 NA   NA
 6055829 6055830 BAM_1201 BAM_1200     FALSE 0.309 184.000 0.000 1.000   NA
 6055832 6055833 BAM_1197 BAM_1196     FALSE 0.067 251.000 0.000 NA   NA
 6055834 6055835 BAM_2531 BAM_2530     TRUE 0.681 120.000 0.000 NA   NA
 6055835 6055836 BAM_2530 BAM_2529     TRUE 0.853 99.000 0.182 1.000 N NA
 6055836 6055837 BAM_2529 BAM_2528     TRUE 0.902 12.000 0.412 1.000 N NA
 6055837 6055838 BAM_2528 BAM_2527     TRUE 0.861 139.000 0.167 NA N NA
 6055838 6055839 BAM_2527 BAM_2526     TRUE 0.687 63.000 0.300 NA N NA
 6055839 6055840 BAM_2526 BAM_2525     TRUE 0.687 110.000 0.143 NA   NA
 6055842 6055843 BAM_2523 BAM_2522     FALSE 0.288 182.000 0.075 NA   NA
 6055843 6055844 BAM_2522 BAM_2521     FALSE 0.431 74.000 0.150 NA   NA
 6055847 6055848 BAM_2518 BAM_2517     FALSE 0.040 282.000 0.000 NA   NA
 6055848 6055849 BAM_2517 BAM_2516     FALSE 0.019 341.000 0.000 NA   NA
 6055850 6055851 BAM_2515 BAM_2514 tdcB   TRUE 0.943 87.000 0.017 0.014 Y NA
 6055851 6055852 BAM_2514 BAM_2513     FALSE 0.440 71.000 0.250 NA   NA
 6055852 6055853 BAM_2513 BAM_2512     TRUE 0.750 112.000 0.286 NA   NA
 6055853 6055854 BAM_2512 BAM_2511     TRUE 0.796 21.000 0.004 NA N NA
 6055854 6055855 BAM_2511 BAM_2510     FALSE 0.527 23.000 0.015 NA   NA
 6055855 6055856 BAM_2510 BAM_2509     FALSE 0.571 80.000 0.296 NA   NA
 6055856 6055857 BAM_2509 BAM_2508     TRUE 0.981 12.000 0.667 0.004 Y NA
 6055857 6055858 BAM_2508 BAM_2507     FALSE 0.561 146.000 0.000 NA   NA
 6055860 6055861 BAM_2505 BAM_2504     TRUE 0.768 25.000 0.571 NA   NA
 6055861 6055862 BAM_2504 BAM_2503     FALSE 0.026 314.000 0.000 NA   NA
 6055863 6055864 BAM_2502 BAM_2501     FALSE 0.203 193.000 0.000 NA   NA
 6055865 6055866 BAM_2500 BAM_2499     TRUE 0.658 -22.000 0.145 1.000 N NA
 6055866 6055867 BAM_2499 BAM_2498     FALSE 0.585 95.000 0.127 NA   NA
 6055875 6055876 BAM_2490 BAM_2489     TRUE 0.946 -7.000 0.240 0.004 Y NA
 6055876 6055877 BAM_2489 BAM_2488     FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 6055877 6055878 BAM_2488 BAM_2487     FALSE 0.460 34.000 0.100 NA   NA
 6055878 6055879 BAM_2487 BAM_2486     FALSE 0.075 262.000 0.000 1.000   NA
 6055881 6055882 BAM_2484 BAM_2483     FALSE 0.453 54.000 0.286 NA   NA
 6055882 6055883 BAM_2483 BAM_2482   asd1 FALSE 0.478 166.000 0.058 1.000   NA
 6055884 6055885 BAM_2481 BAM_2480     FALSE 0.010 423.000 0.000 NA   NA
 6055885 6055886 BAM_2480 BAM_2479     FALSE 0.006 595.000 0.000 NA   NA
 6055888 6055889 BAM_2477 BAM_2476     FALSE 0.011 408.000 0.000 NA   NA
 6055890 6055891 BAM_2475 BAM_2474     FALSE 0.009 440.000 0.000 NA   NA
 6055891 6055892 BAM_2474 BAM_2473     FALSE 0.613 98.000 0.143 NA   NA
 6055894 6055895 BAM_2471 BAM_2470     FALSE 0.297 -36.000 0.188 NA   NA
 6055896 6055897 BAM_2469 BAM_2468 cspA2   FALSE 0.624 87.000 0.333 NA   NA
 6055900 6055901 BAM_2465 BAM_2464 hemY2   FALSE 0.577 61.000 0.500 NA   NA
 6055901 6055902 BAM_2464 BAM_2463     TRUE 0.828 115.000 0.444 NA   NA
 6055902 6055903 BAM_2463 BAM_2462     TRUE 0.676 158.000 0.455 NA   NA
 6055903 6055904 BAM_2462 BAM_2461     FALSE 0.471 34.000 0.179 NA   NA
 6055906 6055907 BAM_2459 BAM_2458     TRUE 0.717 148.000 0.171 0.017   NA
 6055907 6055908 BAM_2458 BAM_2457     TRUE 0.654 56.000 0.462 0.017   NA
 6055908 6055909 BAM_2457 BAM_2456     FALSE 0.186 208.000 0.000 1.000   NA
 6055913 6055914 BAM_2452 BAM_2451     FALSE 0.552 67.000 0.368 1.000   NA
 6055917 6055918 BAM_2448 BAM_2447     FALSE 0.471 34.000 0.137 NA   NA
 6055919 6055920 BAM_2446 BAM_2445     FALSE 0.355 71.000 0.000 NA   NA
 6055920 6055921 BAM_2445 BAM_2444     FALSE 0.561 146.000 0.000 NA   NA
 6055921 6055922 BAM_2444 BAM_2443     FALSE 0.364 49.000 0.036 NA   NA
 6055924 6055925 BAM_2441 BAM_2440     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6055925 6055926 BAM_2440 BAM_2439     FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6055926 6055927 BAM_2439 BAM_2438     FALSE 0.335 55.000 0.000 NA   NA
 6055927 6055928 BAM_2438 BAM_2437     FALSE 0.107 221.000 0.000 NA   NA
 6055928 6055929 BAM_2437 BAM_2436     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6055929 6055930 BAM_2436 BAM_2435     TRUE 0.685 124.000 0.000 NA   NA
 6055930 6055931 BAM_2435 BAM_2434     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6055931 6055932 BAM_2434 BAM_2433     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6055932 6055933 BAM_2433 BAM_2432   thrS1 FALSE 0.064 254.000 0.000 NA   NA
 6055935 6055936 BAM_2430 BAM_2429     FALSE 0.333 186.000 0.148 1.000   NA
 6055936 6055937 BAM_2429 BAM_2428     FALSE 0.225 205.000 0.286 NA   NA
 6055938 6055939 BAM_2427 BAM_2426     FALSE 0.009 445.000 0.000 NA   NA
 6055939 6055940 BAM_2426 BAM_2425     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055940 6055941 BAM_2425 BAM_2424     FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 6055942 6055943 BAM_2423 BAM_2422     TRUE 0.651 15.000 0.219 NA   NA
 6055945 6055946 BAM_2420 BAM_2419     FALSE 0.409 36.000 0.025 NA   NA
 6055946 6055947 BAM_2419 BAM_2418     TRUE 0.765 34.000 0.229 1.000 N NA
 6055947 6055948 BAM_2418 BAM_2417     TRUE 0.777 0.000 0.400 NA   NA
 6055948 6055949 BAM_2417 BAM_2416     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055949 6055950 BAM_2416 BAM_2415   bacF FALSE 0.329 63.000 0.000 NA   NA
 6055950 6055951 BAM_2415 BAM_2414 bacF bacB FALSE 0.439 32.000 0.000 NA   NA
 6055951 6055952 BAM_2414 BAM_2413 bacB bacE TRUE 0.954 32.000 0.581 1.000 Y NA
 6055952 6055953 BAM_2413 BAM_2412 bacE bacC TRUE 0.974 13.000 0.511 1.000 Y NA
 6055953 6055954 BAM_2412 BAM_2411 bacC bacA TRUE 0.944 27.000 0.210 1.000 Y NA
 6055954 6055955 BAM_2411 BAM_2410 bacA   FALSE 0.020 584.000 0.000 NA N NA
 6055955 6055956 BAM_2410 BAM_2409     TRUE 0.861 -3.000 0.833 NA   NA
 6055956 6055957 BAM_2409 BAM_2408     FALSE 0.288 199.000 0.333 NA   NA
 6055960 6055961 BAM_2405 BAM_2404     FALSE 0.011 400.000 0.000 NA   NA
 6055962 6055963 BAM_2403 BAM_2402     TRUE 0.972 -3.000 0.669 NA Y NA
 6055963 6055964 BAM_2402 BAM_2401     FALSE 0.586 16.000 0.016 NA   NA
 6055964 6055965 BAM_2401 BAM_2400     FALSE 0.318 184.000 0.250 NA   NA
 6055966 6055967 BAM_2399 BAM_2398     FALSE 0.588 184.000 0.167 1.000 N NA
 6055968 6055969 BAM_2397 BAM_2396 mmsA1   TRUE 0.855 37.000 0.545 0.001 N NA
 6055969 6055970 BAM_2396 BAM_2395     TRUE 0.970 17.000 0.500 1.000 Y NA
 6055972 6055973 BAM_2393 BAM_2392 prpB mmgE TRUE 0.679 19.000 0.218 1.000   NA
 6055973 6055974 BAM_2392 BAM_2391 mmgE mmgD TRUE 0.692 99.000 0.216 1.000   NA
 6055974 6055975 BAM_2391 BAM_2390 mmgD   FALSE 0.011 400.000 0.000 NA   NA
 6055975 6055976 BAM_2390 BAM_2389     TRUE 0.665 16.000 0.250 NA   NA
 6055976 6055977 BAM_2389 BAM_2388     FALSE 0.023 615.000 0.000 1.000 N NA
 6055979 6055980 BAM_2386 BAM_2385     FALSE 0.033 296.000 0.000 NA   NA
 6055982 6055983 BAM_2383 BAM_2382     FALSE 0.009 430.000 0.000 NA   NA
 6055983 6055984 BAM_2382 BAM_2381     FALSE 0.240 185.000 0.000 NA   NA
 6055984 6055985 BAM_2381 BAM_2380   prsA3 FALSE 0.007 505.000 0.000 NA   NA
 6055987 6055988 BAM_2378 BAM_2377     TRUE 0.856 120.000 0.500 NA   NA
 6055988 6055989 BAM_2377 BAM_2376     FALSE 0.024 322.000 0.000 NA   NA
 6055991 6055992 BAM_2374 BAM_2373     FALSE 0.012 393.000 0.000 NA   NA
 6055992 6055993 BAM_2373 BAM_2372     FALSE 0.008 468.000 0.000 NA   NA
 6055996 6055997 BAM_2369 BAM_2368     FALSE 0.005 821.000 0.000 NA   NA
 6055998 6055999 BAM_2367 BAM_2366     TRUE 0.775 32.000 0.667 1.000   NA
 6055999 6056000 BAM_2366 BAM_2365     TRUE 0.889 119.000 0.667 NA   NA
 6056000 6056001 BAM_2365 BAM_2364     TRUE 0.780 -3.000 0.500 NA   NA
 6056002 6056003 BAM_2363 BAM_2362     FALSE 0.468 37.000 0.000 1.000   NA
 6056005 6056006 BAM_2360 BAM_2359     FALSE 0.262 182.000 0.000 NA   NA
 6056006 6056007 BAM_2359 BAM_2358     FALSE 0.617 22.000 0.250 NA   NA
 6056007 6056008 BAM_2358 BAM_2357     FALSE 0.253 183.000 0.000 NA   NA
 6056008 6056009 BAM_2357 BAM_2356     FALSE 0.194 206.000 0.000 1.000   NA
 6056009 6056010 BAM_2356 BAM_2354     FALSE 0.056 280.000 0.000 1.000   NA
 6056011 6056012 BAM_2355 BAM_2353     FALSE 0.403 57.000 0.233 NA   NA
 6056012 6056013 BAM_2353 BAM_2352     FALSE 0.409 -18.000 0.237 NA   NA
 6056013 6056014 BAM_2352 BAM_2351     TRUE 0.667 0.000 0.158 NA   NA
 6056014 6056015 BAM_2351 BAM_2350     TRUE 0.745 111.000 0.286 NA   NA
 6056017 6056018 BAM_2348 BAM_2347     FALSE 0.228 190.000 0.045 NA   NA
 6056018 6056019 BAM_2347 BAM_2346     FALSE 0.413 73.000 0.102 NA   NA
 6056019 6056020 BAM_2346 BAM_2345   kamA FALSE 0.612 -3.000 0.124 NA   NA
 6056020 6056021 BAM_2345 BAM_2344 kamA rocR2 FALSE 0.376 211.000 0.000 1.000 N NA
 6056021 6056022 BAM_2344 BAM_2343 rocR2   TRUE 0.869 106.000 0.013 1.000 N NA
 6056022 6056023 BAM_2343 BAM_2342     TRUE 0.955 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 6056023 6056024 BAM_2342 BAM_2341     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6056024 6056025 BAM_2341 BAM_2340   atoD FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6056025 6056026 BAM_2340 BAM_2339 atoD   FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6056026 6056027 BAM_2339 BAM_2338     FALSE 0.404 163.000 0.000 NA   NA
 6056031 6056032 BAM_2334 BAM_2333     TRUE 0.843 134.000 0.333 0.060   NA
 6056034 6056035 BAM_2331 BAM_2330     FALSE 0.043 277.000 0.000 NA   NA
 6056035 6056036 BAM_2330 BAM_2329     FALSE 0.603 -10.000 0.400 NA   NA
 6056036 6056037 BAM_2329 BAM_2328     TRUE 0.782 106.000 0.400 NA   NA
 6056037 6056038 BAM_2328 BAM_2327   arcD TRUE 0.674 77.000 0.533 NA   NA
 6056038 6056039 BAM_2327 BAM_2326 arcD   FALSE 0.357 214.000 0.000 1.000 N NA
 6056039 6056040 BAM_2326 BAM_2325   proV1 TRUE 0.905 4.000 0.218 0.073 N NA
 6056040 6056041 BAM_2325 BAM_2324 proV1   TRUE 0.701 103.000 0.269 NA   NA
 6056041 6056042 BAM_2324 BAM_2323     TRUE 0.726 121.000 0.117 NA   NA
 6056042 6056043 BAM_2323 BAM_2322     TRUE 0.740 2.000 0.150 1.000   NA
 6056043 6056044 BAM_2322 BAM_2321     FALSE 0.561 146.000 0.000 NA   NA
 6056044 6056045 BAM_2321 BAM_2320     FALSE 0.407 35.000 0.000 NA   NA
 6056045 6056046 BAM_2320 BAM_2319     FALSE 0.503 152.000 0.000 NA   NA
 6056046 6056047 BAM_2319 BAM_2318     FALSE 0.366 43.000 0.000 NA   NA
 6056047 6056048 BAM_2318 BAM_2317     FALSE 0.008 493.000 0.000 NA   NA
 6056048 6056049 BAM_2317 BAM_2316     FALSE 0.488 154.000 0.000 NA   NA
 6056049 6056050 BAM_2316 BAM_2315     FALSE 0.488 154.000 0.000 NA   NA
 6056051 6056052 BAM_2314 BAM_2313     TRUE 0.972 -3.000 0.500 0.025 Y NA
 6056053 6056054 BAM_2312 BAM_2311     FALSE 0.037 289.000 0.000 NA   NA
 6056054 6056055 BAM_2311 BAM_2310     FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6056055 6056056 BAM_2310 BAM_2309     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6056056 6056057 BAM_2309 BAM_2308     TRUE 0.968 14.000 0.250 0.016 Y NA
 6056057 6056058 BAM_2308 BAM_2307     TRUE 0.863 151.000 0.400 1.000 N NA
 6056058 6056059 BAM_2307 BAM_2306     FALSE 0.099 299.000 0.000 NA N NA
 6056061 6056062 BAM_2304 BAM_2303     FALSE 0.017 351.000 0.000 NA   NA
 6056062 6056063 BAM_2303 BAM_2302     TRUE 0.761 128.000 0.263 NA   NA
 6056063 6056064 BAM_2302 BAM_2301     FALSE 0.058 260.000 0.000 NA   NA
 6056064 6056065 BAM_2301 BAM_2300   dat1 TRUE 0.853 99.000 0.175 1.000 N NA
 6056065 6056066 BAM_2300 BAM_2299 dat1   TRUE 0.952 132.000 0.778 1.000 N NA
 6056066 6056067 BAM_2299 BAM_2298     FALSE 0.561 146.000 0.000 NA   NA
 6056067 6056068 BAM_2298 BAM_2297     FALSE 0.404 163.000 0.000 NA   NA
 6056068 6056069 BAM_2297 BAM_2296     TRUE 0.685 43.000 0.667 NA   NA
 6056069 6056070 BAM_2296 BAM_2295   asnO3 FALSE 0.636 94.000 0.108 1.000   NA
 6056074 6056075 BAM_2291 BAM_2290     TRUE 0.862 132.000 0.577 NA   NA
 6056075 6056076 BAM_2290 BAM_2289     FALSE 0.386 -16.000 0.095 NA   NA
 6056076 6056077 BAM_2289 BAM_2288     FALSE 0.083 237.000 0.000 NA   NA
 6056077 6056078 BAM_2288 BAM_2287     TRUE 0.927 43.000 0.500 NA Y NA
 6056081 6056082 BAM_4456 BAM_4455 recN spoIVB TRUE 0.678 128.000 0.000 NA   NA
 6056082 6056083 BAM_4455 BAM_4454 spoIVB spo0A FALSE 0.292 252.000 0.393 1.000 N NA
 6056083 6056084 BAM_4454 BAM_4453 spo0A   FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 6056088 6056089 BAM_4449 BAM_4448   yqiS FALSE 0.562 196.000 0.333 1.000 N NA
 6056089 6056090 BAM_4448 BAM_4447 yqiS   TRUE 0.813 35.000 0.431 1.000 N NA
 6056090 6056091 BAM_4447 BAM_4446   buk TRUE 0.861 88.000 0.490 1.000 N NA
 6056091 6056092 BAM_4446 BAM_4445 buk bfmbC TRUE 0.972 5.000 0.172 0.031 Y NA
 6056092 6056093 BAM_4445 BAM_4444 bfmbC bfmbAa TRUE 0.954 28.000 0.414 1.000 Y NA
 6056093 6056094 BAM_4444 BAM_4443 bfmbAa bfmbAb TRUE 0.984 14.000 0.897 0.000 Y NA
 6056094 6056095 BAM_4443 BAM_4442 bfmbAb bfmbB TRUE 0.982 16.000 0.882 0.060 Y NA
 6056095 6056096 BAM_4442 BAM_4441 bfmbB   FALSE 0.070 342.000 0.000 1.000 N NA
 6056096 6056097 BAM_4441 BAM_4440     TRUE 0.700 167.000 0.000 1.000 N NA
 6056097 6056098 BAM_4440 BAM_4439     FALSE 0.461 35.000 0.182 NA   NA
 6056098 6056099 BAM_4439 BAM_4438     TRUE 0.712 122.000 0.078 NA   NA
 6056099 6056100 BAM_4438 BAM_4437     FALSE 0.498 89.000 0.039 NA   NA
 6056100 6056101 BAM_4437 BAM_4436     TRUE 0.654 12.000 0.148 NA   NA
 6056101 6056102 BAM_4436 BAM_4435     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6056102 6056103 BAM_4435 BAM_4434     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6056103 6056104 BAM_4434 BAM_4433     FALSE 0.598 97.000 0.110 NA   NA
 6056104 6056105 BAM_4433 BAM_4432     TRUE 0.657 17.000 0.250 NA   NA
 6056105 6056106 BAM_4432 BAM_4431     FALSE 0.433 67.000 0.267 NA   NA
 6056108 6056109 BAM_4429 BAM_4428     TRUE 0.897 128.000 0.062 1.000 N NA
 6056113 6056114 BAM_4424 BAM_4423 rnz   FALSE 0.007 551.000 0.000 NA   NA
 6056114 6056115 BAM_4423 BAM_4422   sdaAB2 FALSE 0.433 38.000 0.118 NA   NA
 6056115 6056116 BAM_4422 BAM_4421 sdaAB2 sdaAA2 TRUE 0.968 19.000 0.353 0.001 Y NA
 6056118 6056119 BAM_4419 BAM_4418     TRUE 0.724 10.000 0.188 1.000   NA
 6056121 6056122 BAM_4416 BAM_4415 argC argJ TRUE 0.972 12.000 0.303 0.001 Y NA
 6056122 6056123 BAM_4415 BAM_4414 argJ argB TRUE 0.968 12.000 0.067 0.001 Y NA
 6056123 6056124 BAM_4414 BAM_4413 argB argD TRUE 0.962 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 6056124 6056125 BAM_4413 BAM_4412 argD argF TRUE 0.960 13.000 0.037 1.000 Y NA
 6056125 6056126 BAM_4412 BAM_4411 argF   FALSE 0.282 180.000 0.008 NA   NA
 6056126 6056127 BAM_4411 BAM_4410     FALSE 0.625 59.000 0.600 NA   NA
 6056128 6056129 BAM_4409 BAM_4408     TRUE 0.784 73.000 0.421 1.000 N NA
 6056131 6056132 BAM_4406 BAM_4405 nhaC3   FALSE 0.071 248.000 0.000 NA   NA
 6056133 6056134 BAM_4403 BAM_4404     FALSE 0.225 -350.000 0.000 NA   NA
 6056134 6056135 BAM_4404 BAM_4402   bioA FALSE 0.503 152.000 0.000 NA   NA
 6056135 6056136 BAM_4402 BAM_4401 bioA bioD TRUE 0.969 0.000 0.053 0.001 Y NA
 6056136 6056137 BAM_4401 BAM_4400 bioD bioF TRUE 0.876 -34.000 0.107 0.001 Y NA
 6056137 6056138 BAM_4400 BAM_4399 bioF   FALSE 0.613 -3.000 0.128 NA   NA
 6056138 6056139 BAM_4399 BAM_4398     FALSE 0.303 -34.000 0.163 NA   NA
 6056139 6056140 BAM_4398 BAM_4397   bioB TRUE 0.899 2.000 0.022 0.001 N NA
 6056140 6056141 BAM_4397 BAM_4395 bioB   FALSE 0.255 183.000 0.010 NA   NA
 6056142 6056143 BAM_4396 BAM_4394 ribH ribBA TRUE 0.960 19.000 0.034 0.001 Y NA
 6056143 6056144 BAM_4394 BAM_4393 ribBA ribE TRUE 0.960 13.000 0.040 1.000 Y NA
 6056144 6056145 BAM_4393 BAM_4392 ribE ribD TRUE 0.922 -18.000 0.456 1.000 Y NA
 6056145 6056146 BAM_4392 BAM_4391 ribD   FALSE 0.005 645.000 0.000 NA   NA
 6056149 6056150 BAM_4388 BAM_4387     TRUE 0.676 100.000 0.068 1.000   NA
 6056151 6056152 BAM_4386 BAM_4385     TRUE 0.743 132.000 0.059 1.000   NA
 6056155 6056156 BAM_4382 BAM_4381     FALSE 0.524 70.000 0.381 NA   NA
 6056156 6056157 BAM_4381 BAM_4380     TRUE 0.834 129.000 0.444 NA   NA
 6056158 6056159 BAM_4379 BAM_4378 lolS   FALSE 0.387 54.000 0.140 NA   NA
 6056162 6056163 BAM_4375 BAM_4374 spoIIM   TRUE 0.763 107.000 0.341 NA   NA
 6056163 6056164 BAM_4374 BAM_4373     TRUE 0.717 104.000 0.284 NA   NA
 6056164 6056165 BAM_4373 BAM_4372     TRUE 0.815 7.000 0.476 NA   NA
 6056165 6056166 BAM_4372 BAM_4371     FALSE 0.632 144.000 0.167 NA   NA
 6056166 6056167 BAM_4371 BAM_4370   deoB FALSE 0.011 406.000 0.000 NA   NA
 6056167 6056168 BAM_4370 BAM_4369 deoB   TRUE 0.925 13.000 0.609 1.000 N NA
 6056168 6056169 BAM_4369 BAM_4368   pyn2 TRUE 0.965 8.000 0.084 1.000 Y NA
 6056169 6056170 BAM_4368 BAM_4367 pyn2 corA TRUE 0.718 75.000 0.031 1.000 N NA
 6056171 6056172 BAM_4366 BAM_4365     TRUE 0.667 135.000 0.058 NA   NA
 6056176 6056177 BAM_4361 BAM_4360     FALSE 0.467 -10.000 0.133 NA   NA
 6056177 6056178 BAM_4360 BAM_4359     FALSE 0.605 -34.000 0.149 1.000 N NA
 6056179 6056180 BAM_4358 BAM_4357 dacF spoIIAA TRUE 0.711 171.000 0.276 1.000 N NA
 6056180 6056181 BAM_4357 BAM_4356 spoIIAA spoIIAB TRUE 0.983 1.000 0.669 0.001 Y NA
 6056181 6056182 BAM_4356 BAM_4355 spoIIAB sigF TRUE 0.941 13.000 0.842 1.000 N NA
 6056182 6056183 BAM_4355 BAM_4354 sigF   TRUE 0.718 138.000 0.067 1.000   NA
 6056183 6056184 BAM_4354 BAM_4353     FALSE 0.296 -24.000 0.000 NA   NA
 6056184 6056185 BAM_4353 BAM_4352   spoVAA TRUE 0.666 116.000 0.000 NA   NA
 6056185 6056186 BAM_4352 BAM_4351 spoVAA spoVAB TRUE 0.820 -7.000 0.923 NA   NA
 6056186 6056187 BAM_4351 BAM_4350 spoVAB   TRUE 0.682 15.000 0.260 NA   NA
 6056187 6056188 BAM_4350 BAM_4349     TRUE 0.836 14.000 0.615 NA   NA
 6056188 6056189 BAM_4349 BAM_4348   spoVAE TRUE 0.897 4.000 0.808 NA   NA
 6056189 6056190 BAM_4348 BAM_4347 spoVAE   TRUE 0.697 24.000 0.400 NA   NA
 6056190 6056191 BAM_4347 BAM_4346   spoVAF TRUE 0.688 -13.000 0.650 NA   NA
 6056191 6056192 BAM_4346 BAM_4345 spoVAF   TRUE 0.676 97.000 0.219 1.000   NA
 6056194 6056195 BAM_4343 BAM_4342     FALSE 0.086 236.000 0.015 NA   NA
 6056195 6056196 BAM_4342 BAM_4341   ribT FALSE 0.361 69.000 0.051 NA   NA
 6056197 6056198 BAM_4340 BAM_4339     FALSE 0.579 99.000 0.024 NA   NA
 6056199 6056200 BAM_4338 BAM_4336 scpA scpB TRUE 0.719 159.000 0.570 NA   NA
 6056200 6056201 BAM_4336 BAM_4335 scpB   FALSE 0.434 79.000 0.012 NA   NA
 6056201 6056202 BAM_4335 BAM_4334   nagA FALSE 0.188 209.000 0.028 1.000   NA
 6056202 6056203 BAM_4334 BAM_4333 nagA nagB TRUE 0.974 5.000 0.194 0.000 Y NA
 6056203 6056204 BAM_4333 BAM_4332 nagB   TRUE 0.873 104.000 0.128 1.000 N NA
 6056206 6056207 BAM_4330 BAM_4329 glcT ptsG FALSE 0.027 339.000 0.000 1.000   NA
 6056207 6056208 BAM_4329 BAM_4328 ptsG ptsH1 TRUE 0.972 135.000 0.054 0.005 Y NA
 6056208 6056209 BAM_4328 BAM_4327 ptsH1 ptsI TRUE 0.970 0.000 0.132 0.005 Y NA
 6056210 6056211 BAM_4326 BAM_4325     FALSE 0.517 197.000 0.800 NA   NA
 6056211 6056212 BAM_4325 BAM_4324     FALSE 0.038 287.000 0.000 NA   NA
 6056213 6056214 BAM_4323 BAM_4322     FALSE 0.329 61.000 0.000 NA   NA
 6056214 6056215 BAM_4322 BAM_4321     FALSE 0.055 263.000 0.000 NA   NA
 6056215 6056216 BAM_4321 BAM_4320     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6056216 6056217 BAM_4320 BAM_4319     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6056218 6056219 BAM_4318 BAM_4317     FALSE 0.029 307.000 0.000 NA   NA
 6056219 6056220 BAM_4317 BAM_4316     FALSE 0.405 -22.000 0.087 1.000   NA
 6056220 6056221 BAM_4316 BAM_4315   mtnX TRUE 0.859 -3.000 0.253 1.000 N NA
 6056221 6056222 BAM_4315 BAM_4314 mtnX mtnW TRUE 0.894 -3.000 0.304 0.000 N NA
 6056222 6056223 BAM_4314 BAM_4313 mtnW   FALSE 0.269 237.000 0.043 1.000 N NA
 6056224 6056225 BAM_4312 BAM_4311     FALSE 0.040 305.000 0.000 1.000   NA
 6056225 6056226 BAM_4311 BAM_4310     TRUE 0.670 -3.000 0.104 1.000   NA
 6056226 6056227 BAM_4310 BAM_4309     FALSE 0.390 75.000 0.011 NA   NA
 6056229 6056230 BAM_4307 BAM_4306     TRUE 0.668 0.000 0.185 NA   NA
 6056230 6056231 BAM_4306 BAM_4305     TRUE 0.731 17.000 0.375 NA   NA
 6056231 6056232 BAM_4305 BAM_4304     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6056232 6056233 BAM_4304 BAM_4303     TRUE 0.637 81.000 0.400 NA   NA
 6056235 6056236 BAM_4301 BAM_4300     TRUE 0.804 110.000 0.429 NA   NA
 6056236 6056237 BAM_4300 BAM_4299     TRUE 0.874 140.000 0.171 1.000 N NA
 6056239 6056240 BAM_4297 BAM_4295     FALSE 0.451 36.000 0.125 NA   NA
 6056242 6056243 BAM_4294 BAM_4293     FALSE 0.390 178.000 0.273 NA   NA
 6056243 6056244 BAM_4293 BAM_4292     FALSE 0.547 65.000 0.444 NA   NA
 6056248 6056249 BAM_4288 BAM_4287   malC TRUE 0.944 65.000 0.815 1.000 Y NA
 6056249 6056250 BAM_4287 BAM_4286 malC malD TRUE 0.986 1.000 0.885 0.025 Y NA
 6056250 6056251 BAM_4286 BAM_4285 malD   TRUE 0.675 4.000 0.077 NA   NA
 6056251 6056252 BAM_4285 BAM_4284   malR FALSE 0.415 164.000 0.045 NA   NA
 6056253 6056254 BAM_4283 BAM_4282     TRUE 0.730 123.000 0.184 NA   NA
 6056257 6056258 BAM_4279 BAM_4278   comI FALSE 0.465 76.000 0.222 NA   NA
 6056258 6056259 BAM_4278 BAM_4277 comI comJ TRUE 0.641 37.000 0.500 NA   NA
 6056260 6056261 BAM_4276 BAM_4275 metE   FALSE 0.019 618.000 0.000 NA N NA
 6056261 6056262 BAM_4275 BAM_4274     TRUE 0.863 92.000 0.500 NA N NA
 6056265 6056266 BAM_4271 BAM_4270     FALSE 0.008 467.000 0.000 NA   NA
 6056266 6056267 BAM_4270 BAM_4269     FALSE 0.329 60.000 0.000 NA   NA
 6056269 6056270 BAM_4267 BAM_4266   ppk FALSE 0.634 109.000 0.000 NA   NA
 6056271 6056272 BAM_4264 BAM_4263     TRUE 0.723 98.000 0.381 NA   NA
 6056273 6056274 BAM_4262 BAM_4261     FALSE 0.183 256.000 0.043 NA N NA
 6056274 6056275 BAM_4261 BAM_4260     TRUE 0.667 0.000 0.139 NA   NA
 6056275 6056276 BAM_4260 BAM_4259     TRUE 0.764 16.000 0.429 NA   NA
 6056278 6056279 BAM_4257 BAM_4256     FALSE 0.129 212.000 0.000 NA   NA
 6056279 6056280 BAM_4256 BAM_4255     FALSE 0.418 75.000 0.074 NA   NA
 6056280 6056281 BAM_4255 BAM_4254     TRUE 0.683 109.000 0.176 NA   NA
 6056281 6056282 BAM_4254 BAM_4253     FALSE 0.392 170.000 0.120 NA   NA
 6056282 6056283 BAM_4253 BAM_4252     TRUE 0.959 142.000 0.214 NA Y NA
 6056283 6056284 BAM_4252 BAM_4251     TRUE 0.712 72.000 0.121 1.000 N NA
 6056284 6056285 BAM_4251 BAM_4250     FALSE 0.548 62.000 0.372 1.000   NA
 6056285 6056286 BAM_4250 BAM_4249     FALSE 0.062 255.000 0.000 NA   NA
 6056286 6056287 BAM_4249 BAM_4248     FALSE 0.516 84.000 0.163 NA   NA
 6056288 6056289 BAM_4247 BAM_4246     TRUE 0.853 5.000 0.576 NA   NA
 6056291 6056292 BAM_4244 BAM_4243 def2   FALSE 0.571 147.000 0.059 NA   NA
 6056293 6056294 BAM_4242 BAM_4241 pdhA pdhB TRUE 0.981 4.000 0.484 0.001 Y NA
 6056294 6056295 BAM_4241 BAM_4240 pdhB pdhC TRUE 0.977 93.000 0.883 0.058 Y NA
 6056295 6056296 BAM_4240 BAM_4239 pdhC pdhD TRUE 0.985 6.000 0.948 1.000 Y NA
 6056296 6056297 BAM_4239 BAM_4238 pdhD   FALSE 0.080 238.000 0.000 NA   NA
 6056299 6056300 BAM_4236 BAM_4235     FALSE 0.362 196.000 0.438 NA   NA
 6056300 6056301 BAM_4235 BAM_4233     TRUE 0.843 1.000 0.571 NA   NA
 6056301 6056302 BAM_4233 BAM_4232     TRUE 0.758 36.000 0.800 NA   NA
 6056303 6056304 BAM_4231 BAM_4230   speA FALSE 0.379 74.000 0.000 NA   NA
 6056307 6056308 BAM_4457 BAM_4458   dxs TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6056308 6056309 BAM_4458 BAM_4459 dxs ispA FALSE 0.338 302.000 0.024 1.000 Y NA
 6056309 6056310 BAM_4459 BAM_4460 ispA xseB TRUE 0.873 0.000 0.100 1.000 N NA
 6056310 6056311 BAM_4460 BAM_4461 xseB xseA TRUE 0.949 -10.000 0.412 0.000 Y NA
 6056311 6056312 BAM_4461 BAM_4462 xseA folD TRUE 0.801 27.000 0.058 1.000 N NA
 6056312 6056313 BAM_4462 BAM_4463 folD nusB TRUE 0.814 24.000 0.056 1.000 N NA
 6056313 6056314 BAM_4463 BAM_4464 nusB   FALSE 0.018 347.000 0.023 NA   NA
 6056314 6056315 BAM_4464 BAM_4465   accC TRUE 0.688 23.000 0.373 NA   NA
 6056315 6056316 BAM_4465 BAM_4466 accC accB TRUE 0.964 17.000 0.086 0.001 Y NA
 6056316 6056317 BAM_4466 BAM_4467 accB   FALSE 0.005 758.000 0.020 NA   NA
 6056317 6056318 BAM_4467 BAM_4468   spoIIIAG TRUE 0.803 16.000 0.509 NA   NA
 6056318 6056319 BAM_4468 BAM_4469 spoIIIAG spoIIIAF TRUE 0.789 -10.000 0.907 NA   NA
 6056319 6056320 BAM_4469 BAM_4470 spoIIIAF spoIIIAE TRUE 0.888 13.000 0.918 NA   NA
 6056320 6056321 BAM_4470 BAM_4471 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.887 11.000 0.864 NA   NA
 6056321 6056322 BAM_4471 BAM_4472 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.905 111.000 0.895 NA   NA
 6056322 6056323 BAM_4472 BAM_4473 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.885 15.000 0.926 NA   NA
 6056323 6056324 BAM_4473 BAM_4474 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.767 -6.000 0.604 NA   NA
 6056324 6056325 BAM_4474 BAM_4475 spoIIIAA   FALSE 0.527 29.000 0.148 NA   NA
 6056326 6056327 BAM_4476 BAM_4477     FALSE 0.612 -19.000 0.583 NA   NA
 6056328 6056329 BAM_4478 BAM_4479 efp pepQ1 TRUE 0.827 23.000 0.160 1.000 N NA
 6056329 6056330 BAM_4479 BAM_4480 pepQ1 aroQ TRUE 0.969 5.000 0.168 1.000 Y NA
 6056330 6056331 BAM_4480 BAM_4481 aroQ   FALSE 0.356 53.000 0.044 NA   NA
 6056332 6056333 BAM_4482 BAM_4484     FALSE 0.495 80.000 0.140 NA   NA
 6056334 6056335 BAM_4483 BAM_4485     FALSE 0.432 54.000 0.064 1.000   NA
 6056335 6056336 BAM_4485 BAM_4486   splB TRUE 0.852 145.000 0.110 1.000 N NA
 6056336 6056337 BAM_4486 BAM_4487 splB   FALSE 0.441 79.000 0.027 NA   NA
 6056340 6056341 BAM_4490 BAM_4491     FALSE 0.197 250.000 0.000 NA N NA
 6056341 6056342 BAM_4491 BAM_4492     TRUE 0.969 103.000 0.258 0.045 Y NA
 6056342 6056343 BAM_4492 BAM_4493   sugE1 TRUE 0.730 72.000 0.258 1.000 N NA
 6056343 6056344 BAM_4493 BAM_4494 sugE1 sugE2 TRUE 0.984 2.000 0.727 0.047 Y NA
 6056344 6056345 BAM_4494 BAM_4495 sugE2   TRUE 0.858 16.000 0.750 NA   NA
 6056346 6056347 BAM_4496 BAM_4497     FALSE 0.069 249.000 0.000 NA   NA
 6056347 6056348 BAM_4497 BAM_4498     TRUE 0.718 14.000 0.308 NA   NA
 6056348 6056349 BAM_4498 BAM_4499     TRUE 0.716 33.000 0.600 NA   NA
 6056349 6056350 BAM_4499 BAM_4500     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6056350 6056351 BAM_4500 BAM_4501     FALSE 0.326 -19.000 0.000 NA   NA
 6056351 6056352 BAM_4501 BAM_4502     TRUE 0.903 4.000 0.292 1.000 N NA
 6056352 6056353 BAM_4502 BAM_4503     TRUE 0.903 117.000 0.778 NA   NA
 6056353 6056354 BAM_4503 BAM_4504     TRUE 0.742 71.000 0.889 NA   NA
 6056354 6056355 BAM_4504 BAM_4505   yqhK FALSE 0.034 293.000 0.000 NA   NA
 6056355 6056356 BAM_4505 BAM_4506 yqhK yqhJ TRUE 0.968 -3.000 0.316 0.000 Y NA
 6056356 6056357 BAM_4506 BAM_4507 yqhJ gcvT TRUE 0.959 21.000 0.092 0.001 Y NA
 6056358 6056359 BAM_4508 BAM_4509     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6056360 6056361 BAM_4510 BAM_4511     TRUE 0.645 98.000 0.250 NA   NA
 6056362 6056363 BAM_4512 BAM_4513     TRUE 0.779 130.000 0.312 NA   NA
 6056364 6056365 BAM_4514 BAM_4515   aroK FALSE 0.552 39.000 0.375 NA   NA
 6056367 6056368 BAM_4516 BAM_4518     FALSE 0.093 229.000 0.000 NA   NA
 6056368 6056369 BAM_4518 BAM_4519     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6056369 6056370 BAM_4519 BAM_4520     TRUE 0.685 90.000 0.417 NA   NA
 6056370 6056371 BAM_4520 BAM_4521   comGD FALSE 0.508 -7.000 0.109 NA   NA
 6056371 6056372 BAM_4521 BAM_4522 comGD comGC TRUE 0.696 -3.000 0.320 NA   NA
 6056372 6056373 BAM_4522 BAM_4523 comGC comGB TRUE 0.984 12.000 0.861 0.001 Y NA
 6056373 6056374 BAM_4523 BAM_4524 comGB comGA TRUE 0.960 -7.000 0.639 1.000 Y NA
 6056375 6056376 BAM_4525 BAM_4526     TRUE 0.837 126.000 0.432 NA   NA
 6056376 6056377 BAM_4526 BAM_4527     TRUE 0.647 108.000 0.045 NA   NA
 6056378 6056379 BAM_4528 BAM_4529     TRUE 0.799 88.000 0.750 NA   NA
 6056381 6056382 BAM_4531 BAM_4532     FALSE 0.495 80.000 0.175 NA   NA
 6056382 6056383 BAM_4532 BAM_4533     FALSE 0.594 96.000 0.175 NA   NA
 6056383 6056384 BAM_4533 BAM_4534   murG2 FALSE 0.543 96.000 0.010 NA   NA
 6056384 6056385 BAM_4534 BAM_4535 murG2 metH FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6056385 6056386 BAM_4535 BAM_4536 metH   FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6056386 6056387 BAM_4536 BAM_4537     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6056388 6056389 BAM_4538 BAM_4539 metI   TRUE 0.976 -3.000 0.600 0.004 Y NA
 6056389 6056390 BAM_4539 BAM_4540     TRUE 0.892 130.000 0.055 1.000 N NA
 6056390 6056391 BAM_4540 BAM_4541     FALSE 0.036 433.000 0.000 1.000 N NA
 6056392 6056393 BAM_4542 BAM_4543     FALSE 0.621 10.000 0.021 NA   NA
 6056395 6056396 BAM_4545 BAM_4546 glcK   TRUE 0.761 20.000 0.496 NA   NA
 6056396 6056397 BAM_4546 BAM_4547     FALSE 0.614 104.000 0.010 NA   NA
 6056397 6056398 BAM_4547 BAM_4548   rpmG2 TRUE 0.869 105.000 0.045 1.000 N NA
 6056398 6056399 BAM_4548 BAM_4549 rpmG2   TRUE 0.679 70.000 0.009 1.000 N NA
 6056399 6056400 BAM_4549 BAM_4550     FALSE 0.044 376.000 0.000 NA N NA
 6056400 6056401 BAM_4550 BAM_4551   pstB TRUE 0.931 156.000 0.118 NA Y NA
 6056401 6056402 BAM_4551 BAM_4552 pstB pstA TRUE 0.947 29.000 0.125 0.002 Y NA
 6056402 6056403 BAM_4552 BAM_4553 pstA pstC TRUE 0.980 2.000 0.485 0.002 Y NA
 6056403 6056404 BAM_4553 BAM_4554 pstC phoX TRUE 0.940 28.000 0.077 1.000 Y NA
 6056404 6056405 BAM_4554 BAM_4555 phoX   FALSE 0.079 332.000 0.000 1.000 N NA
 6056405 6056406 BAM_4555 BAM_4556     TRUE 0.686 110.000 0.157 NA   NA
 6056406 6056407 BAM_4556 BAM_4557   sodA1 TRUE 0.712 116.000 0.157 NA   NA
 6056407 6056408 BAM_4557 BAM_4558 sodA1   FALSE 0.113 218.000 0.000 NA   NA
 6056409 6056410 BAM_4559 BAM_4560     FALSE 0.416 72.000 0.195 NA   NA
 6056410 6056411 BAM_4560 BAM_4561   gcpE FALSE 0.477 156.000 0.022 NA   NA
 6056412 6056413 BAM_4562 BAM_4563     TRUE 0.975 9.000 0.480 1.000 Y NA
 6056413 6056414 BAM_4563 BAM_4564     TRUE 0.974 0.000 0.389 0.078 Y NA
 6056414 6056415 BAM_4564 BAM_4565     FALSE 0.166 242.000 0.440 NA   NA
 6056417 6056418 BAM_4567 BAM_4568 nfo   FALSE 0.626 231.000 0.104 1.000 Y NA
 6056421 6056422 BAM_4570 BAM_4572   lytB FALSE 0.371 167.000 0.000 NA   NA
 6056423 6056424 BAM_4573 BAM_4574     FALSE 0.614 -3.000 0.138 NA   NA
 6056424 6056425 BAM_4574 BAM_4575   cccA FALSE 0.404 166.000 0.057 NA   NA
 6056425 6056426 BAM_4575 BAM_4576 cccA sigA FALSE 0.017 386.000 0.009 1.000   NA
 6056426 6056427 BAM_4576 BAM_4577 sigA dnaG FALSE 0.329 60.000 0.000 NA   NA
 6056429 6056430 BAM_4578 BAM_4580     FALSE 0.218 189.000 0.000 NA   NA
 6056430 6056431 BAM_4580 BAM_4581     FALSE 0.373 48.000 0.050 NA   NA
 6056431 6056432 BAM_4581 BAM_4582     TRUE 0.751 30.000 0.621 NA   NA
 6056432 6056433 BAM_4582 BAM_4583   recO TRUE 0.703 108.000 0.013 1.000   NA
 6056433 6056434 BAM_4583 BAM_4584 recO   FALSE 0.424 34.000 0.020 NA   NA
 6056434 6056435 BAM_4584 BAM_4585   era FALSE 0.311 177.000 0.040 NA   NA
 6056435 6056436 BAM_4585 BAM_4586 era cdd2 FALSE 0.573 -7.000 0.098 1.000   NA
 6056436 6056437 BAM_4586 BAM_4587 cdd2 dgkA TRUE 0.858 100.000 0.179 1.000 N NA
 6056437 6056438 BAM_4587 BAM_4588 dgkA   FALSE 0.612 -3.000 0.123 NA   NA
 6056438 6056439 BAM_4588 BAM_4589     FALSE 0.614 -3.000 0.182 NA   NA
 6056439 6056440 BAM_4589 BAM_4590     FALSE 0.290 194.000 0.172 1.000   NA
 6056440 6056441 BAM_4590 BAM_4591     TRUE 0.690 4.000 0.114 NA   NA
 6056441 6056442 BAM_4591 BAM_4592     FALSE 0.419 -10.000 0.018 NA   NA
 6056442 6056443 BAM_4592 BAM_4593   yqfC FALSE 0.415 77.000 0.019 NA   NA
 6056443 6056444 BAM_4593 BAM_4594 yqfC   TRUE 0.644 109.000 0.029 NA   NA
 6056444 6056445 BAM_4594 BAM_4595   rpsU TRUE 0.755 16.000 0.150 0.010   NA
 6056445 6056446 BAM_4595 BAM_4596 rpsU   FALSE 0.030 331.000 0.016 1.000   NA
 6056446 6056447 BAM_4596 BAM_4597     TRUE 0.678 7.000 0.163 NA   NA
 6056447 6056448 BAM_4597 BAM_4598   prmA FALSE 0.630 146.000 0.227 NA   NA
 6056448 6056449 BAM_4598 BAM_4599 prmA dnaJ TRUE 0.797 29.000 0.133 1.000 N NA
 6056449 6056450 BAM_4599 BAM_4600 dnaJ dnaK TRUE 0.786 205.000 0.196 0.001 Y NA
 6056450 6056451 BAM_4600 BAM_4601 dnaK grpE TRUE 0.952 27.000 0.224 0.003 Y NA
 6056451 6056452 BAM_4601 BAM_4602 grpE hrcA TRUE 0.907 115.000 0.286 1.000 N NA
 6056452 6056453 BAM_4602 BAM_4603 hrcA hemN TRUE 0.887 134.000 0.082 1.000 N NA
 6056453 6056454 BAM_4603 BAM_4604 hemN   TRUE 0.643 56.000 0.084 NA N NA
 6056454 6056455 BAM_4604 BAM_4605   lepA TRUE 0.867 132.000 0.007 NA N NA
 6056455 6056456 BAM_4605 BAM_4606 lepA   FALSE 0.133 211.000 0.008 NA   NA
 6056456 6056457 BAM_4606 BAM_4607   gpr TRUE 0.710 0.000 0.265 NA   NA
 6056461 6056462 BAM_4611 BAM_4612   comEC FALSE 0.503 152.000 0.000 NA   NA
 6056462 6056463 BAM_4612 BAM_4613 comEC comEB FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6056463 6056464 BAM_4613 BAM_4614 comEB comEA TRUE 0.676 63.000 0.095 1.000 N NA
 6056466 6056467 BAM_4616 BAM_4617     FALSE 0.597 -3.000 0.085 NA   NA
 6056467 6056468 BAM_4617 BAM_4618     FALSE 0.613 -3.000 0.149 NA   NA
 6056468 6056469 BAM_4618 BAM_4619   nadD TRUE 0.924 -10.000 0.199 1.000 Y NA
 6056469 6056470 BAM_4619 BAM_4620 nadD   FALSE 0.233 -70.000 0.000 NA   NA
 6056470 6056471 BAM_4620 BAM_4621     FALSE 0.589 101.000 0.000 NA   NA
 6056471 6056472 BAM_4621 BAM_4622   aroE TRUE 0.864 6.000 0.089 NA N NA
 6056472 6056473 BAM_4622 BAM_4623 aroE   TRUE 0.766 16.000 0.336 1.000   NA
 6056473 6056474 BAM_4623 BAM_4624     TRUE 0.849 4.000 0.555 NA   NA
 6056476 6056477 BAM_4626 BAM_4627 psd sigK FALSE 0.125 292.000 0.000 1.000 N NA
 6056479 6056480 BAM_4629 BAM_4630   rpmG3 FALSE 0.356 71.000 0.007 NA   NA
 6056480 6056481 BAM_4630 BAM_4631 rpmG3   TRUE 0.840 145.000 0.006 1.000 N NA
 6056482 6056483 BAM_4632 BAM_4633     FALSE 0.322 173.000 0.000 NA   NA
 6056484 6056485 BAM_4634 BAM_4635     FALSE 0.455 55.000 0.292 NA   NA
 6056486 6056487 BAM_4636 BAM_4637     TRUE 0.840 16.000 0.667 NA   NA
 6056488 6056489 BAM_4638 BAM_4639     FALSE 0.054 265.000 0.000 NA   NA
 6056489 6056490 BAM_4639 BAM_4640     TRUE 0.729 19.000 0.400 NA   NA
 6056491 6056492 BAM_4641 BAM_4642     TRUE 0.706 71.000 0.750 NA   NA
 6056494 6056495 BAM_4644 BAM_4645 vpr   TRUE 0.815 125.000 0.375 NA   NA
 6056495 6056496 BAM_4645 BAM_4646     FALSE 0.589 143.000 0.000 NA   NA
 6056496 6056497 BAM_4646 BAM_4647     FALSE 0.126 213.000 0.000 NA   NA
 6056497 6056498 BAM_4647 BAM_4648     TRUE 0.664 -19.000 0.044 1.000 N NA
 6056499 6056500 BAM_4649 BAM_4650     FALSE 0.557 22.000 0.064 NA   NA
 6056502 6056503 BAM_4652 BAM_4653     TRUE 0.867 112.000 0.438 0.057   NA
 6056503 6056504 BAM_4653 BAM_4654     FALSE 0.501 57.000 0.081 0.057   NA
 6056504 6056505 BAM_4654 BAM_4655     FALSE 0.029 306.000 0.000 NA   NA
 6056505 6056506 BAM_4655 BAM_4656     FALSE 0.382 -33.000 0.300 NA   NA
 6056506 6056507 BAM_4656 BAM_4657     TRUE 0.926 -13.000 0.360 1.000 Y NA
 6056507 6056508 BAM_4657 BAM_4658     TRUE 0.984 6.000 0.889 1.000 Y NA
 6056508 6056509 BAM_4658 BAM_4659     FALSE 0.529 157.000 0.222 NA   NA
 6056509 6056510 BAM_4659 BAM_4660     TRUE 0.833 127.000 0.429 NA   NA
 6056510 6056511 BAM_4660 BAM_4661     FALSE 0.195 260.000 0.000 1.000 N NA
 6056511 6056512 BAM_4661 BAM_4662   cysM TRUE 0.984 4.000 0.690 0.013 Y NA
 6056512 6056513 BAM_4662 BAM_4663 cysM   TRUE 0.775 83.000 0.048 1.000 N NA
 6056513 6056514 BAM_4663 BAM_4664     TRUE 0.855 15.000 0.057 1.000 N NA
 6056516 6056517 BAM_4666 BAM_4667     TRUE 0.715 117.000 0.119 NA   NA
 6056517 6056518 BAM_4667 BAM_4668   greA TRUE 0.813 93.000 0.070 1.000 N NA
 6056518 6056519 BAM_4668 BAM_4669 greA udk FALSE 0.156 279.000 0.095 1.000 N NA
 6056519 6056520 BAM_4669 BAM_4670 udk   TRUE 0.847 18.000 0.100 1.000 N NA
 6056520 6056521 BAM_4670 BAM_4671     TRUE 0.962 19.000 0.156 0.002 Y NA
 6056521 6056522 BAM_4671 BAM_4672     TRUE 0.731 8.000 0.142 1.000   NA
 6056522 6056523 BAM_4672 BAM_4673     FALSE 0.161 203.000 0.000 NA   NA
 6056524 6056525 BAM_1065 BAM_1064     FALSE 0.560 98.000 0.000 NA   NA
 6056525 6056526 BAM_1064 BAM_1063     FALSE 0.277 -30.000 0.000 NA   NA
 6056526 6056527 BAM_1063 BAM_1062     FALSE 0.015 360.000 0.000 NA   NA
 6056527 6056528 BAM_1062 BAM_1061     FALSE 0.360 174.000 0.167 NA   NA
 6056528 6056529 BAM_1061 BAM_1060     TRUE 0.718 141.000 0.292 NA   NA
 6056529 6056530 BAM_1060 BAM_1059     FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 6056530 6056531 BAM_1059 BAM_1058     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6056531 6056532 BAM_1058 BAM_1057     FALSE 0.101 224.000 0.000 NA   NA
 6056532 6056533 BAM_1057 BAM_1056     FALSE 0.531 44.000 0.368 NA   NA
 6056533 6056534 BAM_1056 BAM_1055     FALSE 0.010 419.000 0.000 NA   NA
 6056534 6056535 BAM_1055 BAM_1054     TRUE 0.649 58.000 0.133 NA N NA
 6056535 6056536 BAM_1054 BAM_1053     FALSE 0.367 177.000 0.000 1.000   NA
 6056536 6056537 BAM_1053 BAM_1052     FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 6056537 6056538 BAM_1052 BAM_1051     FALSE 0.360 168.000 0.000 NA   NA
 6056538 6056539 BAM_1051 BAM_1050     FALSE 0.005 639.000 0.000 NA   NA
 6056539 6056540 BAM_1050 BAM_1049     TRUE 0.698 -3.000 0.330 NA   NA
 6056543 6056544 BAM_1046 BAM_1045     TRUE 0.672 129.000 0.000 NA   NA
 6056544 6056545 BAM_1045 BAM_1044     TRUE 0.701 118.000 0.068 NA   NA
 6056546 6056547 BAM_1043 BAM_1042     FALSE 0.021 334.000 0.000 NA   NA
 6056547 6056548 BAM_1042 BAM_1041     FALSE 0.589 143.000 0.000 NA   NA
 6056548 6056549 BAM_1041 BAM_1040     FALSE 0.623 61.000 0.600 NA   NA
 6056549 6056550 BAM_1040 BAM_1039     TRUE 0.667 40.000 0.600 NA   NA
 6056551 6056552 BAM_1038 BAM_1037     FALSE 0.194 206.000 0.000 1.000   NA
 6056552 6056553 BAM_1037 BAM_1036     TRUE 0.958 17.000 0.169 1.000 Y NA
 6056554 6056555 BAM_1035 BAM_1034     FALSE 0.635 176.000 0.032 1.000 N NA
 6056555 6056556 BAM_1034 BAM_1033   sigB TRUE 0.684 70.000 0.038 1.000 N NA
 6056556 6056557 BAM_1033 BAM_1032 sigB rsbW TRUE 0.789 -34.000 0.838 1.000 N NA
 6056557 6056558 BAM_1032 BAM_1031 rsbW rsbV TRUE 0.981 7.000 0.714 1.000 Y NA
 6056560 6056561 BAM_1029 BAM_1028     TRUE 0.648 76.000 0.500 NA   NA
 6056561 6056562 BAM_1028 BAM_1027     TRUE 0.729 51.000 0.875 NA   NA
 6056563 6056564 BAM_1026 BAM_1025     FALSE 0.088 232.000 0.000 NA   NA
 6056565 6056566 BAM_1024 BAM_1023     TRUE 0.793 14.000 0.486 NA   NA
 6056566 6056567 BAM_1023 BAM_1022     TRUE 0.653 141.000 0.114 NA   NA
 6056567 6056568 BAM_1022 BAM_1021     FALSE 0.029 307.000 0.000 NA   NA
 6056572 6056573 BAM_1017 BAM_1016     FALSE 0.007 555.000 0.000 NA   NA
 6056573 6056574 BAM_1016 BAM_1015     FALSE 0.010 412.000 0.000 NA   NA
 6056575 6056576 BAM_1014 BAM_1013     FALSE 0.132 211.000 0.000 NA   NA
 6056576 6056577 BAM_1013 BAM_1012     TRUE 0.653 113.000 0.000 NA   NA
 6056578 6056579 BAM_1011 BAM_1010     FALSE 0.156 204.000 0.000 NA   NA
 6056582 6056583 BAM_1007 BAM_1006     TRUE 0.909 20.000 0.625 1.000 N NA
 6056584 6056585 BAM_1005 BAM_1004     FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 6056585 6056586 BAM_1004 BAM_1003     FALSE 0.035 292.000 0.000 NA   NA
 6056586 6056587 BAM_1003 BAM_1002   pssA FALSE 0.596 24.000 0.013 1.000   NA
 6056587 6056588 BAM_1002 BAM_1001 pssA   TRUE 0.692 44.000 0.000 1.000 N NA
 6056588 6056589 BAM_1001 BAM_1000     FALSE 0.046 272.000 0.000 NA   NA
 6056590 6056591 BAM_0999 BAM_0998     FALSE 0.010 418.000 0.000 NA   NA
 6056591 6056592 BAM_0998 BAM_0997     FALSE 0.331 58.000 0.000 NA   NA
 6056592 6056593 BAM_0997 BAM_0996     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6056594 6056595 BAM_0995 BAM_0994     TRUE 0.717 118.000 0.109 NA   NA
 6056596 6056597 BAM_0993 BAM_0992     FALSE 0.434 181.000 0.375 NA   NA
 6056599 6056600 BAM_0990 BAM_0989     FALSE 0.170 201.000 0.000 NA   NA
 6056600 6056601 BAM_0989 BAM_0988     FALSE 0.469 -7.000 0.023 NA   NA
 6056601 6056602 BAM_0988 BAM_0987     FALSE 0.572 -3.000 0.030 NA   NA
 6056609 6056610 BAM_0980 BAM_0979     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6056610 6056611 BAM_0979 BAM_0978     TRUE 0.681 127.000 0.000 NA   NA
 6056611 6056612 BAM_0978 BAM_0977     FALSE 0.428 33.000 0.000 NA   NA
 6056612 6056613 BAM_0977 BAM_0976     FALSE 0.577 -3.000 0.041 NA   NA
 6056613 6056614 BAM_0976 BAM_0975     FALSE 0.177 207.000 0.200 NA   NA
 6056614 6056615 BAM_0975 BAM_0974     FALSE 0.437 54.000 0.267 NA   NA
 6056615 6056616 BAM_0974 BAM_0973     TRUE 0.802 9.000 0.455 NA   NA
 6056616 6056617 BAM_0973 BAM_0972     TRUE 0.898 4.000 0.833 NA   NA
 6056619 6056620 BAM_0970 BAM_0969     FALSE 0.615 -25.000 0.684 NA   NA
 6056620 6056621 BAM_0969 BAM_0968     TRUE 0.848 100.000 0.026 1.000 N NA
 6056621 6056622 BAM_0968 BAM_0967     FALSE 0.141 221.000 0.000 1.000   NA
 6056622 6056623 BAM_0967 BAM_0966     TRUE 0.839 -3.000 0.611 1.000   NA
 6056623 6056624 BAM_0966 BAM_0965     TRUE 0.979 19.000 0.833 0.061 Y NA
 6056625 6056626 BAM_0964 BAM_0963     FALSE 0.025 316.000 0.000 NA   NA
 6056627 6056628 BAM_0962 BAM_0961     TRUE 0.729 19.000 0.400 NA   NA
 6056628 6056629 BAM_0961 BAM_0960     FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6056629 6056630 BAM_0960 BAM_0959     FALSE 0.566 37.000 0.375 NA   NA
 6056630 6056631 BAM_0959 BAM_0958     FALSE 0.343 170.000 0.000 NA   NA
 6056631 6056632 BAM_0958 BAM_0957     FALSE 0.343 170.000 0.000 NA   NA
 6056632 6056633 BAM_0957 BAM_0956     FALSE 0.107 221.000 0.000 NA   NA
 6056633 6056634 BAM_0956 BAM_0955     FALSE 0.382 -15.000 0.051 NA   NA
 6056634 6056635 BAM_0955 BAM_0954     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6056635 6056636 BAM_0954 BAM_0953     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6056636 6056637 BAM_0953 BAM_0952     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6056637 6056638 BAM_0952 BAM_0951     TRUE 0.985 7.000 0.786 0.024 Y NA
 6056638 6056639 BAM_0951 BAM_0950     TRUE 0.943 60.000 0.688 0.024 Y NA
 6056641 6056642 BAM_0948 BAM_0947     FALSE 0.458 52.000 0.286 NA   NA
 6056642 6056643 BAM_0947 BAM_0946     FALSE 0.010 411.000 0.000 NA   NA
 6056643 6056644 BAM_0946 BAM_0945     FALSE 0.005 739.000 0.000 NA   NA
 6056644 6056645 BAM_0945 BAM_0944     FALSE 0.012 386.000 0.000 NA   NA
 6056645 6056646 BAM_0944 BAM_0943     TRUE 0.953 20.000 0.109 1.000 Y NA
 6056648 6056649 BAM_0941 BAM_0940     TRUE 0.897 133.000 0.318 NA N NA
 6056649 6056650 BAM_0940 BAM_0939     FALSE 0.252 240.000 0.000 1.000 N NA
 6056650 6056651 BAM_0939 BAM_0937     FALSE 0.022 329.000 0.000 NA   NA
 6056651 6056652 BAM_0937 BAM_0935     TRUE 0.812 15.000 0.538 NA   NA
 6056652 6056653 BAM_0935 BAM_0934     TRUE 0.712 102.000 0.292 NA   NA
 6056655 6056656 BAM_0933 BAM_0931     FALSE 0.340 53.000 0.000 NA   NA
 6056656 6056657 BAM_0931 BAM_0930     TRUE 0.748 10.000 0.333 NA   NA
 6056658 6056659 BAM_0929 BAM_0928     TRUE 0.691 25.000 0.400 NA   NA
 6056660 6056661 BAM_0927 BAM_0926 eag sap FALSE 0.005 722.000 0.000 NA   NA
 6056661 6056662 BAM_0926 BAM_0925 sap csaB FALSE 0.005 676.000 0.000 NA   NA
 6056662 6056663 BAM_0925 BAM_0924 csaB   FALSE 0.612 142.000 0.040 NA   NA
 6056664 6056665 BAM_0923 BAM_0922 secA1   TRUE 0.809 15.000 0.519 NA   NA
 6056666 6056667 BAM_0921 BAM_0920     FALSE 0.016 359.000 0.000 NA   NA
 6056667 6056668 BAM_0920 BAM_0919     FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 6056670 6056671 BAM_0917 BAM_0916     FALSE 0.110 315.000 0.000 0.056 N NA
 6056672 6056673 BAM_0915 BAM_0914     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6056674 6056675 BAM_0913 BAM_0912     FALSE 0.008 494.000 0.000 NA   NA
 6056676 6056677 BAM_0911 BAM_0910     FALSE 0.531 22.000 0.005 NA   NA
 6056678 6056679 BAM_0909 BAM_0908 alsD alsS TRUE 0.878 17.000 0.323 1.000 N NA
 6056680 6056681 BAM_0907 BAM_0906     TRUE 0.775 22.000 0.545 NA   NA
 6056682 6056683 BAM_0905 BAM_0904     TRUE 0.727 142.000 0.321 NA   NA
 6056684 6056685 BAM_0903 BAM_0902     TRUE 0.792 21.000 0.583 NA   NA
 6056688 6056689 BAM_0899 BAM_0898     TRUE 0.955 29.000 0.481 1.000 Y NA
 6056689 6056690 BAM_0898 BAM_0897     TRUE 0.931 -22.000 0.594 0.024 Y NA
 6056690 6056691 BAM_0897 BAM_0896     FALSE 0.045 274.000 0.000 NA   NA
 6056691 6056692 BAM_0896 BAM_0895     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6056692 6056693 BAM_0895 BAM_0894     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6056693 6056694 BAM_0894 BAM_0893     FALSE 0.075 243.000 0.000 NA   NA
 6056696 6056697 BAM_0891 BAM_0890   racE1 TRUE 0.654 113.000 0.005 NA   NA
 6056698 6056699 BAM_0889 BAM_0888     TRUE 0.693 61.000 0.320 NA N NA
 6056699 6056700 BAM_0888 BAM_0887     FALSE 0.489 193.000 0.160 NA N NA
 6056700 6056701 BAM_0887 BAM_0886     FALSE 0.636 24.000 0.176 1.000   NA
 6056701 6056702 BAM_0886 BAM_0885     FALSE 0.080 238.000 0.000 NA   NA
 6056705 6056706 BAM_0882 BAM_0881     TRUE 0.647 20.000 0.267 NA   NA
 6056708 6056709 BAM_0879 BAM_0878 blT   FALSE 0.441 202.000 0.000 1.000 N NA
 6056709 6056710 BAM_0878 BAM_0877     TRUE 0.934 133.000 0.538 1.000 N NA
 6056710 6056711 BAM_0877 BAM_0876     TRUE 0.986 3.000 0.846 0.045 Y NA
 6056711 6056712 BAM_0876 BAM_0875     FALSE 0.016 359.000 0.000 NA   NA
 6056713 6056714 BAM_0284 BAM_0283     TRUE 0.968 32.000 0.800 0.015 Y NA
 6056714 6056715 BAM_0283 BAM_0282     TRUE 0.686 145.000 0.146 1.000   NA
 6056715 6056716 BAM_0282 BAM_0281   guaA FALSE 0.017 385.000 0.000 1.000   NA
 6056716 6056717 BAM_0281 BAM_0280 guaA groL FALSE 0.050 399.000 0.000 0.076 N NA
 6056717 6056718 BAM_0280 BAM_0279 groL groES TRUE 0.953 39.000 0.674 0.076 Y NA
 6056719 6056720 BAM_0278 BAM_0277     FALSE 0.594 -3.000 0.080 NA   NA
 6056723 6056724 BAM_0274 BAM_0273   rimI TRUE 0.715 0.000 0.090 1.000   NA
 6056724 6056725 BAM_0273 BAM_0272 rimI   TRUE 0.705 14.000 0.127 1.000   NA
 6056725 6056726 BAM_0272 BAM_0271     FALSE 0.385 -19.000 0.217 NA   NA
 6056726 6056727 BAM_0271 BAM_0270     FALSE 0.312 174.000 0.000 NA   NA
 6056727 6056728 BAM_0270 BAM_0269     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6056728 6056729 BAM_0269 BAM_0268   rrfE FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6056729 6056730 BAM_0268 BAM_0267 rrfE rrlE FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6056732 6056733 BAM_0265 BAM_0264 rrsE   FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6056733 6056734 BAM_0264 BAM_0263     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6056734 6056735 BAM_0263 BAM_0262     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6056735 6056736 BAM_0262 BAM_0261     FALSE 0.541 96.000 0.000 NA   NA
 6056736 6056737 BAM_0261 BAM_0260     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6056737 6056738 BAM_0260 BAM_0259     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6056738 6056739 BAM_0259 BAM_0258     FALSE 0.477 88.000 0.000 NA   NA
 6056739 6056740 BAM_0258 BAM_0257     FALSE 0.357 46.000 0.000 NA   NA
 6056740 6056741 BAM_0257 BAM_0256     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6056741 6056742 BAM_0256 BAM_0255     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6056742 6056743 BAM_0255 BAM_0254     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6056743 6056744 BAM_0254 BAM_0253     TRUE 0.658 114.000 0.000 NA   NA
 6056746 6056747 BAM_0251 BAM_0250     TRUE 0.676 68.000 0.045 1.000 N NA
 6056747 6056748 BAM_0250 BAM_0249     TRUE 0.882 5.000 0.260 NA N NA
 6056748 6056749 BAM_0249 BAM_0248   dal1 FALSE 0.095 310.000 0.108 NA N NA
 6056749 6056750 BAM_0248 BAM_0247 dal1   TRUE 0.970 119.000 0.194 NA Y NA
 6056750 6056751 BAM_0247 BAM_0246   acpS TRUE 0.790 94.000 0.038 NA N NA
 6056753 6056754 BAM_0245 BAM_0243     TRUE 0.952 97.000 0.013 1.000 Y NA
 6056754 6056755 BAM_0243 BAM_0242   murF FALSE 0.126 304.000 0.004 0.075 N NA
 6056755 6056756 BAM_0242 BAM_0241 murF   FALSE 0.505 61.000 0.044 0.003   NA
 6056756 6056757 BAM_0241 BAM_0240     FALSE 0.021 335.000 0.000 NA   NA
 6056757 6056758 BAM_0240 BAM_0239     FALSE 0.013 383.000 0.000 NA   NA
 6056758 6056759 BAM_0239 BAM_0238     TRUE 0.643 111.000 0.000 NA   NA
 6056759 6056760 BAM_0238 BAM_0237     FALSE 0.601 13.000 0.013 NA   NA
 6056760 6056761 BAM_0237 BAM_0236     TRUE 0.855 -34.000 0.101 1.000 Y NA
 6056761 6056762 BAM_0236 BAM_0235   hppD TRUE 0.681 64.000 0.118 1.000 N NA
 6056762 6056763 BAM_0235 BAM_0234 hppD   FALSE 0.027 311.000 0.000 NA   NA
 6056763 6056764 BAM_0234 BAM_0233     FALSE 0.417 34.000 0.000 NA   NA
 6056764 6056765 BAM_0233 BAM_0232     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 6056765 6056766 BAM_0232 BAM_0231     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 6056766 6056767 BAM_0231 BAM_0230     FALSE 0.526 149.000 0.000 NA   NA
 6056768 6056769 BAM_0229 BAM_0228     FALSE 0.239 -49.000 0.000 NA   NA
 6056770 6056771 BAM_0227 BAM_0226     TRUE 0.973 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 6056771 6056772 BAM_0226 BAM_0225     TRUE 0.980 11.000 0.750 1.000 Y NA
 6056772 6056773 BAM_0225 BAM_0224     TRUE 0.983 13.000 0.850 0.023 Y NA
 6056773 6056774 BAM_0224 BAM_0223     TRUE 0.966 94.000 0.444 0.023 Y NA
 6056774 6056775 BAM_0223 BAM_0222     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 6056779 6056780 BAM_0218 BAM_0217     FALSE 0.023 327.000 0.000 NA   NA
 6056781 6056782 BAM_0216 BAM_0215     TRUE 0.645 135.000 0.000 NA   NA
 6056785 6056786 BAM_0212 BAM_0211     FALSE 0.336 59.000 0.019 NA   NA
 6056786 6056787 BAM_0211 BAM_0210     FALSE 0.006 572.000 0.000 NA   NA
 6056787 6056788 BAM_0210 BAM_0209     TRUE 0.865 138.000 0.667 NA   NA
 6056788 6056789 BAM_0209 BAM_0208     TRUE 0.906 119.000 0.778 NA   NA
 6056789 6056790 BAM_0208 BAM_0207     TRUE 0.835 149.000 0.778 NA   NA
 6056790 6056791 BAM_0207 BAM_0206     FALSE 0.222 188.000 0.000 NA   NA
 6056791 6056792 BAM_0206 BAM_0205     FALSE 0.447 159.000 0.000 NA   NA
 6056794 6056795 BAM_0203 BAM_0202     TRUE 0.779 22.000 0.556 NA   NA
 6056796 6056797 BAM_0201 BAM_0200     TRUE 0.647 142.000 0.167 NA   NA
 6056797 6056798 BAM_0200 BAM_0199     TRUE 0.849 13.000 0.667 NA   NA
 6056800 6056801 BAM_0196 BAM_0194 modA modB TRUE 0.979 6.000 0.430 0.000 Y NA
 6056801 6056802 BAM_0194 BAM_0193 modB   FALSE 0.129 302.000 0.000 0.045 N NA
 6056803 6056804 BAM_0192 BAM_0191     FALSE 0.581 -7.000 0.286 NA   NA
 6056805 6056806 BAM_0190 BAM_0189     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6056806 6056807 BAM_0189 BAM_0188     FALSE 0.016 392.000 0.000 1.000   NA
 6056807 6056808 BAM_0188 BAM_0187     FALSE 0.184 388.000 0.000 0.023 Y NA
 6056809 6056810 BAM_0186 BAM_0185     FALSE 0.617 -3.000 0.200 NA   NA
 6056810 6056811 BAM_0185 BAM_0184     FALSE 0.415 73.000 0.105 NA   NA
 6056813 6056814 BAM_0182 BAM_0181     TRUE 0.965 14.000 0.292 1.000 Y NA
 6056814 6056815 BAM_0181 BAM_0180     TRUE 0.964 -3.000 0.233 0.002 Y NA
 6056815 6056816 BAM_0180 BAM_0179     TRUE 0.853 -43.000 0.233 1.000 Y NA
 6056816 6056817 BAM_0179 BAM_0178     TRUE 0.982 17.000 0.909 0.023 Y NA
 6056819 6056820 BAM_0176 BAM_0175     FALSE 0.067 251.000 0.000 NA   NA
 6056820 6056821 BAM_0175 BAM_0174     FALSE 0.300 182.000 0.104 NA   NA
 6056821 6056822 BAM_0174 BAM_0173     FALSE 0.441 79.000 0.026 NA   NA
 6056822 6056823 BAM_0173 BAM_0172     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6056823 6056824 BAM_0172 BAM_0171     FALSE 0.451 31.000 0.000 NA   NA
 6056824 6056825 BAM_0171 BAM_0170     TRUE 0.648 112.000 0.000 NA   NA
 6056826 6056827 BAM_0169 BAM_0168     FALSE 0.126 280.000 0.000 NA N NA
 6056827 6056828 BAM_0168 BAM_0167     TRUE 0.980 13.000 0.880 NA Y NA
 6056828 6056829 BAM_0167 BAM_0166     TRUE 0.934 -25.000 0.846 1.000 Y NA
 6056830 6056831 BAM_0165 BAM_0164     FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 6056832 6056833 BAM_0163 BAM_0162     TRUE 0.810 141.000 0.500 NA   NA
 6056833 6056834 BAM_0162 BAM_0161     TRUE 0.876 0.000 0.750 NA   NA
 6056834 6056835 BAM_0161 BAM_0160     FALSE 0.077 241.000 0.000 NA   NA
 6056836 6056837 BAM_0159 BAM_0158     TRUE 0.716 119.000 0.100 NA   NA
 6056837 6056838 BAM_0158 BAM_0157   yqjI FALSE 0.071 343.000 0.047 1.000 N NA
 6056838 6056839 BAM_0157 BAM_0156 yqjI gntP1 FALSE 0.475 265.000 0.000 1.000 Y NA
 6056839 6056840 BAM_0156 BAM_0155 gntP1   TRUE 0.985 120.000 0.696 1.000 Y NA
 6056840 6056841 BAM_0155 BAM_0154   gntR TRUE 0.885 -7.000 0.680 1.000 N NA
 6056841 6056842 BAM_0154 BAM_0153 gntR   FALSE 0.011 407.000 0.000 NA   NA
 6056842 6056843 BAM_0153 BAM_0152   glmS FALSE 0.015 364.000 0.000 NA   NA
 6056843 6056844 BAM_0152 BAM_0151 glmS   FALSE 0.599 13.000 0.008 NA   NA
 6056846 6056847 BAM_0150 BAM_0149 glmM   FALSE 0.514 -7.000 0.150 NA   NA
 6056847 6056848 BAM_0149 BAM_0148     TRUE 0.714 -7.000 0.502 NA   NA
 6056848 6056849 BAM_0148 BAM_0147   rocF FALSE 0.069 249.000 0.000 NA   NA
 6056849 6056850 BAM_0147 BAM_0146 rocF   FALSE 0.137 210.000 0.000 NA   NA
 6056850 6056851 BAM_0146 BAM_0145     FALSE 0.239 -49.000 0.000 NA   NA
 6056851 6056852 BAM_0145 BAM_0144     TRUE 0.648 112.000 0.000 NA   NA
 6056852 6056853 BAM_0144 BAM_0143     FALSE 0.623 8.000 0.000 NA   NA
 6056853 6056854 BAM_0143 BAM_0142     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6056854 6056855 BAM_0142 BAM_0141     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6056855 6056856 BAM_0141 BAM_0140     FALSE 0.331 66.000 0.000 NA   NA
 6056856 6056857 BAM_0140 BAM_0139     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6056857 6056858 BAM_0139 BAM_0138     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6056858 6056859 BAM_0138 BAM_0137     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6056859 6056860 BAM_0137 BAM_0136     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6056860 6056861 BAM_0136 BAM_0135   rrfD FALSE 0.619 9.000 0.000 NA   NA
 6056863 6056864 BAM_3919 BAM_3920     FALSE 0.541 96.000 0.000 NA   NA
 6056864 6056865 BAM_3920 BAM_3921     FALSE 0.222 188.000 0.000 NA   NA
 6056865 6056866 BAM_3921 BAM_3922     FALSE 0.035 292.000 0.000 NA   NA
 6056866 6056867 BAM_3922 BAM_3923     FALSE 0.021 332.000 0.000 NA   NA
 6056867 6056868 BAM_3923 BAM_3924     TRUE 0.814 17.000 0.583 NA   NA
 6056868 6056869 BAM_3924 BAM_3925     TRUE 0.974 15.000 0.545 1.000 Y NA
 6056869 6056870 BAM_3925 BAM_3926     TRUE 0.972 -7.000 0.909 0.023 Y NA
 6056870 6056871 BAM_3926 BAM_3927     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6056871 6056872 BAM_3927 BAM_3928     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6056872 6056873 BAM_3928 BAM_3929   exoA FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 6056873 6056874 BAM_3929 BAM_3930 exoA xth FALSE 0.259 -34.000 0.000 NA   NA
 6056875 6056876 BAM_3931 BAM_3932 adaA ogt2 TRUE 0.747 -19.000 0.265 0.001 N NA
 6056876 6056877 BAM_3932 BAM_3933 ogt2 alkA TRUE 0.960 -3.000 0.269 1.000 Y NA
 6056880 6056881 BAM_3936 BAM_3937     FALSE 0.023 324.000 0.000 NA   NA
 6056881 6056882 BAM_3937 BAM_3938     FALSE 0.451 31.000 0.000 NA   NA
 6056882 6056883 BAM_3938 BAM_3939     FALSE 0.239 -49.000 0.000 NA   NA
 6056883 6056884 BAM_3939 BAM_3940     FALSE 0.227 187.000 0.000 NA   NA
 6056885 6056886 BAM_3941 BAM_3943     FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 6056888 6056889 BAM_3944 BAM_3945     FALSE 0.475 -25.000 0.412 NA   NA
 6056890 6056891 BAM_3946 BAM_3947     TRUE 0.858 16.000 0.750 NA   NA
 6056891 6056892 BAM_3947 BAM_3948     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6056892 6056893 BAM_3948 BAM_3949     FALSE 0.417 34.000 0.000 NA   NA
 6056893 6056894 BAM_3949 BAM_3950     FALSE 0.533 69.000 0.308 1.000   NA
 6056894 6056895 BAM_3950 BAM_3951     FALSE 0.566 24.000 0.114 NA   NA
 6056895 6056896 BAM_3951 BAM_3952     FALSE 0.378 44.000 0.042 NA   NA
 6056896 6056897 BAM_3952 BAM_3953     FALSE 0.126 213.000 0.000 NA   NA
 6056897 6056898 BAM_3953 BAM_3954     FALSE 0.589 53.000 0.500 NA   NA
 6056901 6056902 BAM_3957 BAM_3958     FALSE 0.055 264.000 0.000 NA   NA
 6056902 6056903 BAM_3958 BAM_3959     FALSE 0.012 391.000 0.000 NA   NA
 6056906 6056907 BAM_3962 BAM_3963     FALSE 0.350 215.000 0.000 1.000 N NA
 6056907 6056908 BAM_3963 BAM_3964     TRUE 0.953 -12.000 0.741 1.000 Y NA
 6056908 6056909 BAM_3964 BAM_3965     FALSE 0.530 42.000 0.352 NA   NA
 6056909 6056910 BAM_3965 BAM_3966     TRUE 0.821 2.000 0.490 NA   NA
 6056910 6056911 BAM_3966 BAM_3967     TRUE 0.693 4.000 0.163 NA   NA
 6056911 6056912 BAM_3967 BAM_3968   mutL FALSE 0.287 239.000 0.000 0.074 N NA
 6056912 6056913 BAM_3968 BAM_3969 mutL mutS TRUE 0.971 9.000 0.220 0.001 Y NA
 6056913 6056914 BAM_3969 BAM_3970 mutS cotE FALSE 0.271 182.000 0.027 NA   NA
 6056914 6056915 BAM_3970 BAM_3971 cotE   TRUE 0.734 126.000 0.209 NA   NA
 6056915 6056916 BAM_3971 BAM_3972     TRUE 0.660 4.000 0.041 NA   NA
 6056916 6056917 BAM_3972 BAM_3973     FALSE 0.037 428.000 0.004 1.000 N NA
 6056917 6056918 BAM_3973 BAM_3974     TRUE 0.943 -13.000 0.437 0.000 Y NA
 6056918 6056919 BAM_3974 BAM_3975     FALSE 0.299 228.000 0.041 1.000 N NA
 6056919 6056920 BAM_3975 BAM_3976   spoVS2 FALSE 0.407 60.000 0.247 NA   NA
 6056920 6056921 BAM_3976 BAM_3977 spoVS2   FALSE 0.573 150.000 0.139 NA   NA
 6056921 6056922 BAM_3977 BAM_3978     FALSE 0.462 166.000 0.245 NA   NA
 6056922 6056923 BAM_3978 BAM_3979     FALSE 0.011 483.000 0.018 1.000   NA
 6056923 6056924 BAM_3979 BAM_3980   recA FALSE 0.057 307.000 0.007 0.001   NA
 6056924 6056925 BAM_3980 BAM_3981 recA cinA TRUE 0.663 146.000 0.083 1.000   NA
 6056925 6056926 BAM_3981 BAM_3982 cinA pgsA TRUE 0.656 21.000 0.151 1.000   NA
 6056926 6056927 BAM_3982 BAM_3983 pgsA   FALSE 0.429 64.000 0.077 1.000   NA
 6056927 6056928 BAM_3983 BAM_3984     TRUE 0.736 22.000 0.371 1.000   NA
 6056928 6056929 BAM_3984 BAM_3985     TRUE 0.768 140.000 0.388 NA   NA
 6056929 6056930 BAM_3985 BAM_3986     FALSE 0.579 76.000 0.386 NA   NA
 6056930 6056931 BAM_3986 BAM_3987     TRUE 0.804 104.000 0.397 1.000   NA
 6056931 6056932 BAM_3987 BAM_3988     TRUE 0.922 1.000 0.872 0.005   NA
 6056932 6056933 BAM_3988 BAM_3989     FALSE 0.249 199.000 0.077 1.000   NA
 6056933 6056934 BAM_3989 BAM_3990     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6056934 6056935 BAM_3990 BAM_3991     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6056935 6056936 BAM_3991 BAM_3992     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6056936 6056937 BAM_3992 BAM_3993     TRUE 0.715 109.000 0.042 1.000   NA
 6056937 6056938 BAM_3993 BAM_3994     FALSE 0.603 90.000 0.100 1.000   NA
 6056938 6056939 BAM_3994 BAM_3995     FALSE 0.029 538.000 0.115 1.000 N NA
 6056939 6056940 BAM_3995 BAM_3996     FALSE 0.129 212.000 0.000 NA   NA
 6056940 6056941 BAM_3996 BAM_3997   clpP FALSE 0.563 -3.000 0.009 NA   NA
 6056941 6056942 BAM_3997 BAM_3998 clpP   TRUE 0.685 104.000 0.009 1.000   NA
 6056944 6056945 BAM_4000 BAM_4001 dapA2 dapG2 TRUE 0.962 12.000 0.085 1.000 Y NA
 6056945 6056946 BAM_4001 BAM_4002 dapG2 asd2 TRUE 0.946 24.000 0.065 1.000 Y NA
 6056946 6056947 BAM_4002 BAM_4003 asd2 spoVFB FALSE 0.598 151.000 0.025 1.000   NA
 6056947 6056948 BAM_4003 BAM_4004 spoVFB spoVFA TRUE 0.792 -3.000 0.450 1.000   NA
 6056950 6056951 BAM_4006 BAM_4007     TRUE 0.720 127.000 0.104 NA   NA
 6056951 6056952 BAM_4007 BAM_4008     FALSE 0.594 87.000 0.127 1.000   NA
 6056952 6056953 BAM_4008 BAM_4009   pnp TRUE 0.806 152.000 0.048 1.000 N NA
 6056953 6056954 BAM_4009 BAM_4010 pnp rpsO TRUE 0.938 161.000 0.335 1.000 Y NA
 6056954 6056955 BAM_4010 BAM_4011 rpsO ribF TRUE 0.862 101.000 0.119 1.000 N NA
 6056955 6056956 BAM_4011 BAM_4012 ribF truB TRUE 0.750 44.000 0.308 1.000 N NA
 6056956 6056957 BAM_4012 BAM_4013 truB rbfA TRUE 0.938 87.000 0.111 1.000 Y NA
 6056957 6056958 BAM_4013 BAM_4014 rbfA   FALSE 0.630 16.000 0.113 NA   NA
 6056958 6056959 BAM_4014 BAM_4015   infB FALSE 0.605 -3.000 0.102 NA   NA
 6056959 6056960 BAM_4015 BAM_4016 infB   TRUE 0.969 5.000 0.223 1.000 Y NA
 6056960 6056961 BAM_4016 BAM_4017     TRUE 0.899 1.000 0.408 NA N NA
 6056961 6056962 BAM_4017 BAM_4018   nusA TRUE 0.964 12.000 0.323 NA Y NA
 6056962 6056963 BAM_4018 BAM_4019 nusA   TRUE 0.852 18.000 0.759 NA   NA
 6056963 6056964 BAM_4019 BAM_4020   polC FALSE 0.023 333.000 0.059 NA   NA
 6056966 6056967 BAM_4021 BAM_4023 proS2   TRUE 0.882 110.000 0.095 1.000 N NA
 6056967 6056968 BAM_4023 BAM_4024   dxr2 TRUE 0.912 17.000 0.568 1.000 N NA
 6056968 6056969 BAM_4024 BAM_4025 dxr2 cdsA TRUE 0.946 24.000 0.071 1.000 Y NA
 6056969 6056970 BAM_4025 BAM_4026 cdsA uppS TRUE 0.957 18.000 0.113 1.000 Y NA
 6056970 6056971 BAM_4026 BAM_4027 uppS frr TRUE 0.843 86.000 0.409 1.000 N NA
 6056971 6056972 BAM_4027 BAM_4028 frr pyrH2 TRUE 0.937 3.000 0.626 1.000 N NA
 6056972 6056973 BAM_4028 BAM_4029 pyrH2 tsf TRUE 0.754 67.000 0.416 1.000 N NA
 6056973 6056974 BAM_4029 BAM_4030 tsf rpsB FALSE 0.612 104.000 0.000 NA   NA
 6056975 6056976 BAM_5538 BAM_5537   thiC FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 6056977 6056978 BAM_5536 BAM_5535     FALSE 0.045 391.000 0.000 1.000 N NA
 6056978 6056979 BAM_5535 BAM_5534   cydA3 TRUE 0.972 -7.000 0.880 0.025 Y NA
 6056980 6056981 BAM_5533 BAM_5532     FALSE 0.191 196.000 0.000 NA   NA
 6056981 6056982 BAM_5532 BAM_5531     FALSE 0.071 248.000 0.000 NA   NA
 6056985 6056986 BAM_5528 BAM_5527     FALSE 0.530 43.000 0.269 1.000   NA
 6056986 6056987 BAM_5527 BAM_5526     TRUE 0.647 149.000 0.192 1.000   NA
 6056988 6056989 BAM_5525 BAM_5524 celA3 celB3 TRUE 0.980 15.000 0.700 0.004 Y NA
 6056989 6056990 BAM_5524 BAM_5523 celB3 celC3 TRUE 0.967 10.000 0.000 0.004 Y NA
 6056991 6056992 BAM_5522 BAM_5521 speD2   FALSE 0.574 28.000 0.039 1.000   NA
 6056993 6056994 BAM_5520 BAM_5519 celA2 celB2 TRUE 0.961 17.000 0.000 0.004 Y NA
 6056994 6056995 BAM_5519 BAM_5518 celB2 celC2 TRUE 0.913 184.000 0.615 0.004 Y NA
 6056995 6056996 BAM_5518 BAM_5517 celC2 celF TRUE 0.975 4.000 0.400 1.000 Y NA
 6056996 6056997 BAM_5517 BAM_5516 celF   FALSE 0.622 50.000 0.350 0.008   NA
 6057000 6057001 BAM_5513 BAM_5512     TRUE 0.910 105.000 0.421 1.000 N NA
 6057001 6057002 BAM_5512 BAM_5511     FALSE 0.498 201.000 0.263 1.000 N NA
 6057003 6057004 BAM_5510 BAM_5509 ugd   TRUE 0.910 75.000 0.000 1.000 Y NA
 6057005 6057006 BAM_5508 BAM_5507     FALSE 0.402 75.000 0.039 NA   NA
 6057007 6057008 BAM_5506 BAM_5505     FALSE 0.340 -19.000 0.040 NA   NA
 6057008 6057009 BAM_5505 BAM_5504     FALSE 0.364 71.000 0.024 NA   NA
 6057009 6057010 BAM_5504 BAM_5503     FALSE 0.191 252.000 0.010 NA N NA
 6057010 6057011 BAM_5503 BAM_5502   comFA TRUE 0.877 128.000 0.014 NA N NA
 6057011 6057012 BAM_5502 BAM_5501 comFA comFC TRUE 0.725 0.000 0.130 1.000   NA
 6057012 6057013 BAM_5501 BAM_5500 comFC cspC TRUE 0.748 121.000 0.008 1.000   NA
 6057015 6057016 BAM_5498 BAM_5497 yfiA secA2 FALSE 0.135 277.000 0.041 NA N NA
 6057016 6057017 BAM_5497 BAM_5496 secA2 prfB FALSE 0.581 100.000 0.000 NA   NA
 6057017 6057018 BAM_5496 BAM_5494 prfB   FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6057018 6057019 BAM_5494 BAM_5493   cccB FALSE 0.062 255.000 0.000 NA   NA
 6057019 6057020 BAM_5493 BAM_5492 cccB ftsE FALSE 0.134 287.000 0.000 1.000 N NA
 6057020 6057021 BAM_5492 BAM_5491 ftsE ftsX TRUE 0.941 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 6057021 6057022 BAM_5491 BAM_5490 ftsX   TRUE 0.894 119.000 0.021 1.000 N NA
 6057022 6057023 BAM_5490 BAM_5489     TRUE 0.805 110.000 0.224 0.006   NA
 6057023 6057024 BAM_5489 BAM_5488     FALSE 0.036 313.000 0.000 1.000   NA
 6057024 6057025 BAM_5488 BAM_5487     FALSE 0.359 65.000 0.075 NA   NA
 6057026 6057027 BAM_5486 BAM_5485     FALSE 0.074 266.000 0.042 1.000   NA
 6057027 6057028 BAM_5485 BAM_5484     TRUE 0.823 5.000 0.389 1.000   NA
 6057028 6057029 BAM_5484 BAM_5483     TRUE 0.910 52.000 0.125 0.042 Y NA
 6057030 6057031 BAM_5482 BAM_5481     FALSE 0.021 335.000 0.023 NA   NA
 6057031 6057032 BAM_5481 BAM_5480     TRUE 0.680 13.000 0.250 NA   NA
 6057032 6057033 BAM_5480 BAM_5479     TRUE 0.858 -3.000 0.800 NA   NA
 6057033 6057034 BAM_5479 BAM_5478     TRUE 0.653 113.000 0.000 NA   NA
 6057034 6057035 BAM_5478 BAM_5477     FALSE 0.581 100.000 0.000 NA   NA
 6057035 6057036 BAM_5477 BAM_5476     TRUE 0.682 -3.000 0.294 NA   NA
 6057036 6057037 BAM_5476 BAM_5475     TRUE 0.647 94.000 0.294 NA   NA
 6057037 6057038 BAM_5475 BAM_5474     FALSE 0.010 418.000 0.000 NA   NA
 6057038 6057039 BAM_5474 BAM_5473   uvrB TRUE 0.915 161.000 0.000 NA Y NA
 6057039 6057040 BAM_5473 BAM_5472 uvrB uvrA TRUE 0.973 6.000 0.154 0.001 Y NA
 6057040 6057041 BAM_5472 BAM_5471 uvrA   FALSE 0.330 60.000 0.006 NA   NA
 6057041 6057042 BAM_5471 BAM_5470     TRUE 0.701 115.000 0.103 NA   NA
 6057042 6057043 BAM_5470 BAM_5469   hprK FALSE 0.623 -3.000 0.215 NA   NA
 6057043 6057044 BAM_5469 BAM_5468 hprK lgT TRUE 0.876 25.000 0.494 1.000 N NA
 6057044 6057045 BAM_5468 BAM_5467 lgT   FALSE 0.456 68.000 0.169 1.000   NA
 6057045 6057046 BAM_5467 BAM_5466     TRUE 0.746 24.000 0.417 1.000   NA
 6057046 6057047 BAM_5466 BAM_5465     TRUE 0.723 140.000 0.169 1.000   NA
 6057047 6057048 BAM_5465 BAM_5464   trxB FALSE 0.589 85.000 0.183 1.000   NA
 6057048 6057049 BAM_5464 BAM_5463 trxB   FALSE 0.431 163.000 0.067 NA   NA
 6057049 6057050 BAM_5463 BAM_5462     FALSE 0.093 229.000 0.000 NA   NA
 6057050 6057051 BAM_5462 BAM_5461     FALSE 0.637 21.000 0.263 NA   NA
 6057051 6057052 BAM_5461 BAM_5460     TRUE 0.701 4.000 0.214 NA   NA
 6057052 6057053 BAM_5460 BAM_5459     TRUE 0.711 90.000 0.470 NA   NA
 6057053 6057054 BAM_5459 BAM_5458   ptsH2 FALSE 0.560 24.000 0.101 NA   NA
 6057055 6057056 BAM_5457 BAM_5456 clpP2   FALSE 0.076 242.000 0.000 NA   NA
 6057056 6057057 BAM_5456 BAM_5455     TRUE 0.716 21.000 0.400 NA   NA
 6057057 6057058 BAM_5455 BAM_5454     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6057058 6057059 BAM_5454 BAM_5453     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057059 6057060 BAM_5453 BAM_5452     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6057060 6057061 BAM_5452 BAM_5451     TRUE 0.695 31.000 0.500 NA   NA
 6057061 6057062 BAM_5451 BAM_5450     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6057063 6057064 BAM_5449 BAM_5448   sigL FALSE 0.062 255.000 0.000 NA   NA
 6057064 6057065 BAM_5448 BAM_5447 sigL   TRUE 0.723 10.000 0.145 1.000   NA
 6057065 6057066 BAM_5447 BAM_5446   cggR TRUE 0.734 137.000 0.101 1.000   NA
 6057066 6057067 BAM_5446 BAM_5445 cggR gap2 TRUE 0.844 27.000 0.348 1.000 N NA
 6057067 6057068 BAM_5445 BAM_5444 gap2 pgk TRUE 0.968 140.000 0.063 0.003 Y NA
 6057068 6057069 BAM_5444 BAM_5443 pgk tpi TRUE 0.928 33.000 0.141 1.000 Y NA
 6057069 6057070 BAM_5443 BAM_5442 tpi gpmI TRUE 0.956 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 6057070 6057071 BAM_5442 BAM_5441 gpmI eno TRUE 0.934 31.000 0.136 1.000 Y NA
 6057071 6057072 BAM_5441 BAM_5440 eno   TRUE 0.845 144.000 0.003 1.000 N NA
 6057072 6057073 BAM_5440 BAM_5439     TRUE 0.685 123.000 0.000 NA   NA
 6057074 6057075 BAM_5438 BAM_5437     FALSE 0.472 87.000 0.000 NA   NA
 6057075 6057076 BAM_5437 BAM_5436     FALSE 0.325 -28.000 0.167 NA   NA
 6057076 6057077 BAM_5436 BAM_5435     FALSE 0.010 417.000 0.000 NA   NA
 6057077 6057078 BAM_5435 BAM_5434     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6057078 6057079 BAM_5434 BAM_5433     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6057079 6057080 BAM_5433 BAM_5432     FALSE 0.246 184.000 0.000 NA   NA
 6057080 6057081 BAM_5432 BAM_5431     FALSE 0.010 411.000 0.000 NA   NA
 6057081 6057082 BAM_5431 BAM_5430     FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6057083 6057084 BAM_5429 BAM_5428     TRUE 0.643 111.000 0.000 NA   NA
 6057084 6057085 BAM_5428 BAM_5427     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6057085 6057086 BAM_5427 BAM_5426     FALSE 0.329 60.000 0.000 NA   NA
 6057088 6057089 BAM_5424 BAM_5423     FALSE 0.282 -27.000 0.000 NA   NA
 6057091 6057092 BAM_1194 BAM_1193 katB hemH2 TRUE 0.661 60.000 0.013 1.000 N NA
 6057092 6057093 BAM_1193 BAM_1192 hemH2 asnO1 FALSE 0.526 189.000 0.011 1.000 N NA
 6057096 6057097 BAM_1189 BAM_1188 rocD   FALSE 0.632 106.000 0.023 NA   NA
 6057099 6057100 BAM_1186 BAM_1185   gerPA FALSE 0.550 97.000 0.000 NA   NA
 6057100 6057101 BAM_1185 BAM_1184 gerPA gerPB TRUE 0.882 15.000 0.889 NA   NA
 6057101 6057102 BAM_1184 BAM_1183 gerPB gerPC FALSE 0.333 67.000 0.003 NA   NA
 6057102 6057103 BAM_1183 BAM_1182 gerPC gerPD FALSE 0.629 7.000 0.003 NA   NA
 6057103 6057104 BAM_1182 BAM_1181 gerPD gerPE TRUE 0.702 16.000 0.296 NA   NA
 6057104 6057105 BAM_1181 BAM_1180 gerPE gerPF1 FALSE 0.431 43.000 0.222 NA   NA
 6057106 6057107 BAM_1179 BAM_1178   addA TRUE 0.742 13.000 0.035 0.029   NA
 6057107 6057108 BAM_1178 BAM_1177 addA addB TRUE 0.970 -3.000 0.408 0.002 Y NA
 6057108 6057109 BAM_1177 BAM_1176 addB sipT TRUE 0.896 117.000 0.086 1.000 N NA
 6057109 6057110 BAM_1176 BAM_1175 sipT   FALSE 0.409 57.000 0.246 NA   NA
 6057110 6057111 BAM_1175 BAM_1174     FALSE 0.047 274.000 0.033 NA   NA
 6057113 6057114 BAM_1172 BAM_1171   cspA1 FALSE 0.598 102.000 0.000 NA   NA
 6057116 6057117 BAM_1169 BAM_1168 aceA aceB TRUE 0.947 24.000 0.084 1.000 Y NA
 6057117 6057118 BAM_1168 BAM_1167 aceB   FALSE 0.259 184.000 0.044 NA   NA
 6057118 6057119 BAM_1167 BAM_1166     FALSE 0.019 340.000 0.000 NA   NA
 6057121 6057122 BAM_1164 BAM_1163     TRUE 0.669 78.000 0.500 NA   NA
 6057122 6057123 BAM_1163 BAM_1162     FALSE 0.208 213.000 0.000 0.065   NA
 6057123 6057124 BAM_1162 BAM_1161     TRUE 0.891 137.000 0.022 0.065 N NA
 6057124 6057125 BAM_1161 BAM_1160     TRUE 0.647 135.000 0.009 NA   NA
 6057125 6057126 BAM_1160 BAM_1159     TRUE 0.766 12.000 0.400 NA   NA
 6057126 6057127 BAM_1159 BAM_1158     FALSE 0.614 140.000 0.000 NA   NA
 6057127 6057128 BAM_1158 BAM_1157     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6057129 6057130 BAM_1156 BAM_1155     TRUE 0.976 10.000 0.533 1.000 Y NA
 6057131 6057132 BAM_1154 BAM_1153     FALSE 0.441 183.000 0.429 NA   NA
 6057132 6057133 BAM_1153 BAM_1152     FALSE 0.452 60.000 0.294 NA   NA
 6057134 6057135 BAM_1151 BAM_1150     TRUE 0.765 6.000 0.333 NA   NA
 6057136 6057137 BAM_1149 BAM_1148     FALSE 0.118 216.000 0.000 NA   NA
 6057137 6057138 BAM_1148 BAM_1147     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6057138 6057139 BAM_1147 BAM_1146     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6057141 6057142 BAM_1144 BAM_1143     FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6057142 6057143 BAM_1143 BAM_1142     FALSE 0.087 234.000 0.000 NA   NA
 6057143 6057144 BAM_1142 BAM_1141     FALSE 0.342 69.000 0.000 NA   NA
 6057144 6057145 BAM_1141 BAM_1140     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6057145 6057146 BAM_1140 BAM_1139     FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6057146 6057147 BAM_1139 BAM_1138     FALSE 0.023 327.000 0.000 NA   NA
 6057147 6057148 BAM_1138 BAM_1137     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 6057148 6057149 BAM_1137 BAM_1136     TRUE 0.763 -7.000 0.667 NA   NA
 6057149 6057150 BAM_1136 BAM_1135     FALSE 0.231 -81.000 0.000 NA   NA
 6057150 6057151 BAM_1135 BAM_1134     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6057151 6057152 BAM_1134 BAM_1133     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6057152 6057153 BAM_1133 BAM_1132     FALSE 0.623 8.000 0.000 NA   NA
 6057153 6057154 BAM_1132 BAM_1131     FALSE 0.023 326.000 0.000 NA   NA
 6057154 6057155 BAM_1131 BAM_1130     FALSE 0.355 71.000 0.000 NA   NA
 6057155 6057156 BAM_1130 BAM_1129     FALSE 0.227 -106.000 0.000 NA   NA
 6057156 6057157 BAM_1129 BAM_1128     TRUE 0.712 113.000 0.222 NA   NA
 6057157 6057158 BAM_1128 BAM_1127     TRUE 0.764 162.000 0.778 NA   NA
 6057158 6057159 BAM_1127 BAM_1126     FALSE 0.073 255.000 0.098 NA   NA
 6057159 6057160 BAM_1126 BAM_1125     TRUE 0.726 10.000 0.200 1.000   NA
 6057162 6057163 BAM_1123 BAM_1122     FALSE 0.080 238.000 0.000 NA   NA
 6057165 6057166 BAM_1120 BAM_1119     TRUE 0.745 37.000 0.778 NA   NA
 6057166 6057167 BAM_1119 BAM_1118     TRUE 0.703 144.000 0.300 NA   NA
 6057167 6057168 BAM_1118 BAM_1117     FALSE 0.120 215.000 0.000 NA   NA
 6057168 6057169 BAM_1117 BAM_1116     TRUE 0.669 214.000 0.000 NA Y NA
 6057169 6057170 BAM_1116 BAM_1115   blaI TRUE 0.976 -3.000 0.833 NA Y NA
 6057172 6057173 BAM_1114 BAM_1112     FALSE 0.503 152.000 0.000 NA   NA
 6057175 6057176 BAM_1110 BAM_1109 hemY1 hemH1 TRUE 0.952 20.000 0.069 1.000 Y NA
 6057176 6057177 BAM_1109 BAM_1108 hemH1 hemE TRUE 0.961 15.000 0.131 1.000 Y NA
 6057177 6057178 BAM_1108 BAM_1107 hemE pbpF FALSE 0.609 180.000 0.020 1.000 N NA
 6057180 6057181 BAM_1105 BAM_1104     TRUE 0.709 50.000 0.778 NA   NA
 6057181 6057182 BAM_1104 BAM_1103     FALSE 0.531 74.000 0.333 NA   NA
 6057182 6057183 BAM_1103 BAM_1102     FALSE 0.030 303.000 0.000 NA   NA
 6057185 6057186 BAM_1100 BAM_1099     FALSE 0.005 693.000 0.000 NA   NA
 6057186 6057187 BAM_1099 BAM_1098     FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 6057187 6057188 BAM_1098 BAM_1097     FALSE 0.009 453.000 0.000 NA   NA
 6057188 6057189 BAM_1097 BAM_1096     TRUE 0.665 10.000 0.150 NA   NA
 6057189 6057190 BAM_1096 BAM_1095     FALSE 0.619 105.000 0.000 NA   NA
 6057190 6057191 BAM_1095 BAM_1094     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6057191 6057192 BAM_1094 BAM_1093     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6057192 6057193 BAM_1093 BAM_1092     TRUE 0.782 80.000 0.778 NA   NA
 6057193 6057194 BAM_1092 BAM_1091     TRUE 0.891 3.000 0.778 NA   NA
 6057196 6057197 BAM_1089 BAM_1088 ecsC ecsB TRUE 0.708 14.000 0.292 NA   NA
 6057197 6057198 BAM_1088 BAM_1087 ecsB ecsA TRUE 0.783 -7.000 0.271 NA N NA
 6057199 6057200 BAM_1086 BAM_1085     FALSE 0.339 178.000 0.137 NA   NA
 6057200 6057201 BAM_1085 BAM_1084   hpr FALSE 0.035 299.000 0.063 NA   NA
 6057205 6057206 BAM_1080 BAM_1079 prsA1   FALSE 0.018 378.000 0.000 1.000   NA
 6057206 6057207 BAM_1079 BAM_1078     TRUE 0.717 88.000 0.500 NA   NA
 6057208 6057209 BAM_1077 BAM_1076     TRUE 0.879 23.000 0.333 0.003 N NA
 6057209 6057210 BAM_1076 BAM_1075     FALSE 0.568 162.000 0.333 NA   NA
 6057214 6057215 BAM_5630 BAM_5631     FALSE 0.090 231.000 0.000 NA   NA
 6057215 6057216 BAM_5631 BAM_5632     FALSE 0.493 78.000 0.230 NA   NA
 6057216 6057217 BAM_5632 BAM_5633     TRUE 0.864 108.000 0.133 NA N NA
 6057217 6057218 BAM_5633 BAM_5634     FALSE 0.399 50.000 0.158 NA   NA
 6057218 6057219 BAM_5634 BAM_5635   hemK TRUE 0.662 104.000 0.178 NA   NA
 6057219 6057220 BAM_5635 BAM_5636 hemK prfA TRUE 0.968 0.000 0.084 0.027 Y NA
 6057220 6057221 BAM_5636 BAM_5637 prfA tdk FALSE 0.196 262.000 0.062 1.000 N NA
 6057221 6057222 BAM_5637 BAM_5638 tdk rpmE TRUE 0.874 109.000 0.028 1.000 N NA
 6057222 6057223 BAM_5638 BAM_5639 rpmE rho FALSE 0.043 404.000 0.049 1.000 N NA
 6057223 6057224 BAM_5639 BAM_5640 rho fbp2 FALSE 0.068 343.000 0.005 1.000 N NA
 6057224 6057225 BAM_5640 BAM_5641 fbp2   FALSE 0.607 16.000 0.065 NA   NA
 6057225 6057226 BAM_5641 BAM_5642   murA2 FALSE 0.632 1.000 0.013 NA   NA
 6057226 6057227 BAM_5642 BAM_5643 murA2 fba2 FALSE 0.079 332.000 0.000 1.000 N NA
 6057227 6057228 BAM_5643 BAM_5644 fba2 spo0F FALSE 0.200 211.000 0.170 1.000   NA
 6057230 6057231 BAM_5646 BAM_5647 pyrG rpoE FALSE 0.203 258.000 0.029 1.000 N NA
 6057231 6057232 BAM_5647 BAM_5648 rpoE   TRUE 0.938 155.000 0.068 1.000 Y NA
 6057232 6057233 BAM_5648 BAM_5649     TRUE 0.757 65.000 0.432 1.000 N NA
 6057233 6057234 BAM_5649 BAM_5650     TRUE 0.961 22.000 0.270 0.001 Y NA
 6057234 6057235 BAM_5650 BAM_5651     TRUE 0.912 74.000 0.110 1.000 Y NA
 6057235 6057236 BAM_5651 BAM_5652     TRUE 0.901 50.000 0.118 1.000 Y NA
 6057236 6057237 BAM_5652 BAM_5653     TRUE 0.888 111.000 0.205 1.000 N NA
 6057238 6057239 BAM_5654 BAM_5655     TRUE 0.849 33.000 0.545 1.000 N NA
 6057239 6057240 BAM_5655 BAM_5656     FALSE 0.030 600.000 0.308 1.000 N NA
 6057241 6057242 BAM_5657 BAM_5658 papR   FALSE 0.490 90.000 0.000 NA   NA
 6057242 6057243 BAM_5658 BAM_5659     FALSE 0.342 52.000 0.000 NA   NA
 6057245 6057246 BAM_5661 BAM_5662     TRUE 0.981 -3.000 0.867 0.014 Y NA
 6057246 6057247 BAM_5662 BAM_5663     TRUE 0.940 1.000 0.800 NA N NA
 6057247 6057248 BAM_5663 BAM_5664     TRUE 0.952 -3.000 0.136 NA Y NA
 6057249 6057250 BAM_5665 BAM_5666 maP3   FALSE 0.005 828.000 0.000 NA   NA
 6057250 6057251 BAM_5666 BAM_5667     FALSE 0.612 104.000 0.000 NA   NA
 6057253 6057254 BAM_5669 BAM_5670     TRUE 0.817 149.000 0.700 NA   NA
 6057255 6057256 BAM_5671 BAM_5672     TRUE 0.728 -16.000 0.857 NA   NA
 6057256 6057257 BAM_5672 BAM_5673     FALSE 0.627 -13.000 0.500 NA   NA
 6057257 6057258 BAM_5673 BAM_5674   argS2 FALSE 0.043 397.000 0.000 1.000 N NA
 6057258 6057259 BAM_5674 BAM_5675 argS2   TRUE 0.649 0.000 0.079 NA   NA
 6057263 6057264 BAM_5679 BAM_5680     FALSE 0.395 -12.000 0.010 NA   NA
 6057264 6057265 BAM_5680 BAM_5681   speE TRUE 0.687 218.000 0.141 1.000 Y NA
 6057265 6057266 BAM_5681 BAM_5682 speE   FALSE 0.556 187.000 0.096 1.000 N NA
 6057266 6057267 BAM_5682 BAM_5683     TRUE 0.886 6.000 0.205 1.000 N NA
 6057267 6057268 BAM_5683 BAM_5684     FALSE 0.497 32.000 0.200 NA   NA
 6057269 6057270 BAM_5685 BAM_5686     TRUE 0.850 100.000 0.051 1.000 N NA
 6057271 6057272 BAM_5687 BAM_5688     FALSE 0.521 26.000 0.044 NA   NA
 6057274 6057275 BAM_5690 BAM_5691     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6057275 6057276 BAM_5691 BAM_5692     FALSE 0.209 192.000 0.000 NA   NA
 6057276 6057277 BAM_5692 BAM_5693     TRUE 0.975 16.000 0.609 1.000 Y NA
 6057277 6057278 BAM_5693 BAM_5694     TRUE 0.962 -3.000 0.130 0.022 Y NA
 6057278 6057279 BAM_5694 BAM_5695     FALSE 0.027 312.000 0.000 NA   NA
 6057284 6057285 BAM_5700 BAM_5701     FALSE 0.166 202.000 0.000 NA   NA
 6057285 6057286 BAM_5701 BAM_5702   cwlJ2 FALSE 0.407 174.000 0.069 1.000   NA
 6057286 6057287 BAM_5702 BAM_5703 cwlJ2 gerQ TRUE 0.796 28.000 0.722 NA   NA
 6057288 6057289 BAM_5704 BAM_5705     FALSE 0.345 65.000 0.042 NA   NA
 6057289 6057290 BAM_5705 BAM_5706     TRUE 0.782 7.000 0.391 NA   NA
 6057291 6057292 BAM_5707 BAM_5708     FALSE 0.486 173.000 0.062 0.030   NA
 6057292 6057293 BAM_5708 BAM_5709     FALSE 0.137 210.000 0.000 NA   NA
 6057294 6057295 BAM_5710 BAM_5711 ung   FALSE 0.583 20.000 0.088 NA   NA
 6057295 6057296 BAM_5711 BAM_5712     TRUE 0.799 -7.000 0.791 NA   NA
 6057296 6057297 BAM_5712 BAM_5713     TRUE 0.933 -3.000 0.850 1.000 N NA
 6057297 6057298 BAM_5713 BAM_5714     TRUE 0.786 83.000 0.175 1.000 N NA
 6057300 6057301 BAM_5716 BAM_5717 hom2 metA TRUE 0.960 142.000 0.021 1.000 Y NA
 6057301 6057302 BAM_5717 BAM_5718 metA   TRUE 0.898 -16.000 0.051 1.000 Y NA
 6057306 6057307 BAM_5722 BAM_5723     TRUE 0.638 192.000 0.471 1.000 N NA
 6057307 6057308 BAM_5723 BAM_5724     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6057308 6057309 BAM_5724 BAM_5725     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6057311 6057312 BAM_5727 BAM_5728     FALSE 0.600 147.000 0.171 NA   NA
 6057312 6057313 BAM_5728 BAM_5729   cstA FALSE 0.532 -7.000 0.229 NA   NA
 6057313 6057314 BAM_5729 BAM_5730 cstA   TRUE 0.980 122.000 0.421 1.000 Y NA
 6057314 6057315 BAM_5730 BAM_5731     FALSE 0.137 210.000 0.000 NA   NA
 6057316 6057317 BAM_4770 BAM_4771     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6057317 6057318 BAM_4771 BAM_4772   rph TRUE 0.880 12.000 0.262 1.000 N NA
 6057318 6057319 BAM_4772 BAM_4773 rph gerM TRUE 0.687 129.000 0.040 NA   NA
 6057319 6057320 BAM_4773 BAM_4774 gerM racE2 TRUE 0.673 131.000 0.026 NA   NA
 6057320 6057321 BAM_4774 BAM_4775 racE2   FALSE 0.376 211.000 0.000 1.000 N NA
 6057322 6057323 BAM_4776 BAM_4777     FALSE 0.178 199.000 0.000 NA   NA
 6057324 6057325 BAM_4778 BAM_4779     FALSE 0.481 161.000 0.154 NA   NA
 6057325 6057326 BAM_4779 BAM_4780     FALSE 0.532 155.000 0.154 NA   NA
 6057326 6057327 BAM_4780 BAM_4781   gerE FALSE 0.341 174.000 0.075 NA   NA
 6057327 6057328 BAM_4781 BAM_4782 gerE   TRUE 0.730 166.000 0.175 1.000 N NA
 6057328 6057329 BAM_4782 BAM_4783     TRUE 0.801 31.000 0.065 0.064 N NA
 6057329 6057330 BAM_4783 BAM_4784     TRUE 0.812 93.000 0.065 1.000 N NA
 6057330 6057331 BAM_4784 BAM_4785     TRUE 0.965 14.000 0.286 1.000 Y NA
 6057331 6057332 BAM_4785 BAM_4786     TRUE 0.934 110.000 0.600 1.000 N NA
 6057333 6057334 BAM_4787 BAM_4788     TRUE 0.981 16.000 0.765 0.022 Y NA
 6057334 6057335 BAM_4788 BAM_4789     TRUE 0.962 15.000 0.245 1.000 Y NA
 6057335 6057336 BAM_4789 BAM_4790     TRUE 0.974 2.000 0.265 0.002 Y NA
 6057336 6057337 BAM_4790 BAM_4791     FALSE 0.348 70.000 0.000 NA   NA
 6057337 6057338 BAM_4791 BAM_4792     FALSE 0.071 248.000 0.000 NA   NA
 6057338 6057339 BAM_4792 BAM_4793     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6057339 6057340 BAM_4793 BAM_4794     FALSE 0.337 -18.000 0.000 NA   NA
 6057340 6057341 BAM_4794 BAM_4795     FALSE 0.091 230.000 0.000 NA   NA
 6057343 6057344 BAM_4797 BAM_4798     FALSE 0.594 144.000 0.035 NA   NA
 6057345 6057346 BAM_4799 BAM_4800     TRUE 0.945 119.000 0.700 NA N NA
 6057346 6057347 BAM_4800 BAM_4801     TRUE 0.903 3.000 0.889 NA   NA
 6057349 6057350 BAM_4803 BAM_4804     FALSE 0.393 -12.000 0.000 NA   NA
 6057350 6057351 BAM_4804 BAM_4805     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6057353 6057354 BAM_4807 BAM_4808   sdhB FALSE 0.627 102.000 0.072 NA   NA
 6057354 6057355 BAM_4808 BAM_4809 sdhB sdhA TRUE 0.947 -7.000 0.231 0.001 Y NA
 6057355 6057356 BAM_4809 BAM_4810 sdhA sdhC TRUE 0.968 14.000 0.184 0.001 Y NA
 6057358 6057359 BAM_4812 BAM_4813 uvrC trx TRUE 0.817 149.000 0.023 1.000 N NA
 6057359 6057360 BAM_4813 BAM_4814 trx etfA TRUE 0.737 212.000 0.055 0.005 Y NA
 6057360 6057361 BAM_4814 BAM_4815 etfA etfB TRUE 0.939 37.000 0.373 0.005 Y NA
 6057361 6057362 BAM_4815 BAM_4816 etfB   TRUE 0.789 79.000 0.275 1.000 N NA
 6057362 6057363 BAM_4816 BAM_4817     TRUE 0.886 12.000 0.294 1.000 N NA
 6057363 6057364 BAM_4817 BAM_4818   fadD TRUE 0.910 107.000 0.406 1.000 N NA
 6057364 6057365 BAM_4818 BAM_4819 fadD   TRUE 0.764 127.000 0.071 1.000   NA
 6057365 6057366 BAM_4819 BAM_4820     TRUE 0.679 119.000 0.000 NA   NA
 6057367 6057368 BAM_4821 BAM_4822     FALSE 0.623 8.000 0.000 NA   NA
 6057368 6057369 BAM_4822 BAM_4823     TRUE 0.674 112.000 0.069 NA   NA
 6057369 6057370 BAM_4823 BAM_4824     TRUE 0.685 137.000 0.190 NA   NA
 6057371 6057372 BAM_4825 BAM_4826     TRUE 0.689 27.000 0.417 NA   NA
 6057372 6057373 BAM_4826 BAM_4827     FALSE 0.584 38.000 0.417 NA   NA
 6057373 6057374 BAM_4827 BAM_4828     TRUE 0.740 35.000 0.714 NA   NA
 6057374 6057375 BAM_4828 BAM_4829     FALSE 0.470 38.000 0.250 NA   NA
 6057375 6057376 BAM_4829 BAM_4830     TRUE 0.957 126.000 0.680 0.071 N NA
 6057376 6057377 BAM_4830 BAM_4831     TRUE 0.984 2.000 0.750 0.014 Y NA
 6057378 6057379 BAM_4832 BAM_4833     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6057380 6057381 BAM_4834 BAM_4835     FALSE 0.574 90.000 0.020 1.000   NA
 6057383 6057384 BAM_4837 BAM_4838     FALSE 0.611 32.000 0.373 NA   NA
 6057384 6057385 BAM_4838 BAM_4839     TRUE 0.953 -10.000 0.657 1.000 Y NA
 6057385 6057386 BAM_4839 BAM_4840     TRUE 0.971 28.000 0.877 1.000 Y NA
 6057386 6057387 BAM_4840 BAM_4841     FALSE 0.348 70.000 0.000 NA   NA
 6057387 6057388 BAM_4841 BAM_4842     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6057388 6057389 BAM_4842 BAM_4843     FALSE 0.509 25.000 0.000 NA   NA
 6057389 6057390 BAM_4843 BAM_4844     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6057390 6057391 BAM_4844 BAM_4845   brnQ6 FALSE 0.008 488.000 0.000 NA   NA
 6057391 6057392 BAM_4845 BAM_4846 brnQ6   FALSE 0.031 477.000 0.000 1.000 N NA
 6057392 6057393 BAM_4846 BAM_4847     FALSE 0.473 73.000 0.267 NA   NA
 6057393 6057394 BAM_4847 BAM_4848     FALSE 0.454 31.000 0.010 NA   NA
 6057394 6057395 BAM_4848 BAM_4849     TRUE 0.954 20.000 0.114 1.000 Y NA
 6057395 6057396 BAM_4849 BAM_4850     FALSE 0.436 53.000 0.066 1.000   NA
 6057396 6057397 BAM_4850 BAM_4851     TRUE 0.670 2.000 0.091 NA   NA
 6057398 6057399 BAM_4852 BAM_4853 rnh   TRUE 0.672 132.000 0.034 NA   NA
 6057399 6057400 BAM_4853 BAM_4854     TRUE 0.828 -3.000 0.667 NA   NA
 6057401 6057402 BAM_4855 BAM_4856   asnS FALSE 0.521 94.000 0.000 NA   NA
 6057402 6057403 BAM_4856 BAM_4857 asnS pheT FALSE 0.120 499.000 0.000 0.071 Y NA
 6057403 6057404 BAM_4857 BAM_4858 pheT pheS TRUE 0.975 19.000 0.574 0.000 Y NA
 6057404 6057405 BAM_4858 BAM_4859 pheS   FALSE 0.283 321.000 0.006 1.000 Y NA
 6057406 6057407 BAM_4860 BAM_4861 sspI   FALSE 0.468 162.000 0.175 NA   NA
 6057407 6057408 BAM_4861 BAM_4862     TRUE 0.664 140.000 0.147 NA   NA
 6057408 6057409 BAM_4862 BAM_4863     FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 6057409 6057410 BAM_4863 BAM_4864     FALSE 0.447 159.000 0.000 NA   NA
 6057410 6057411 BAM_4864 BAM_4865     TRUE 0.720 38.000 0.714 NA   NA
 6057412 6057413 BAM_4866 BAM_4867     TRUE 0.814 13.000 0.441 1.000   NA
 6057415 6057416 BAM_4869 BAM_4870     FALSE 0.575 70.000 0.463 NA   NA
 6057416 6057417 BAM_4870 BAM_4871   rplT FALSE 0.008 471.000 0.000 NA   NA
 6057417 6057418 BAM_4871 BAM_4872 rplT rpmI FALSE 0.383 38.000 0.000 NA   NA
 6057419 6057420 BAM_0378 BAM_0377     FALSE 0.083 237.000 0.000 NA   NA
 6057421 6057422 BAM_0376 BAM_0375     TRUE 0.695 170.000 0.133 1.000 N NA
 6057422 6057423 BAM_0375 BAM_0374     TRUE 0.978 122.000 0.348 1.000 Y NA
 6057423 6057424 BAM_0374 BAM_0373     TRUE 0.957 95.000 0.130 0.030 Y NA
 6057426 6057427 BAM_0371 BAM_0370     TRUE 0.850 144.000 0.053 1.000 N NA
 6057428 6057429 BAM_0369 BAM_0368     TRUE 0.709 123.000 0.068 NA   NA
 6057431 6057432 BAM_0366 BAM_0365     FALSE 0.101 224.000 0.000 NA   NA
 6057432 6057433 BAM_0365 BAM_0364     FALSE 0.329 62.000 0.000 NA   NA
 6057433 6057434 BAM_0364 BAM_0363     FALSE 0.040 282.000 0.000 NA   NA
 6057434 6057435 BAM_0363 BAM_0362     FALSE 0.083 237.000 0.000 NA   NA
 6057435 6057436 BAM_0362 BAM_0361     FALSE 0.515 -7.000 0.133 NA   NA
 6057436 6057437 BAM_0361 BAM_0360     FALSE 0.329 63.000 0.000 NA   NA
 6057437 6057438 BAM_0360 BAM_0359     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6057438 6057439 BAM_0359 BAM_0358     FALSE 0.085 236.000 0.000 NA   NA
 6057442 6057443 BAM_0355 BAM_0354     TRUE 0.928 49.000 0.487 1.000 Y NA
 6057443 6057444 BAM_0354 BAM_0353     TRUE 0.980 -3.000 0.857 0.063 Y NA
 6057445 6057446 BAM_0352 BAM_0351     TRUE 0.667 55.000 0.017 1.000 N NA
 6057446 6057447 BAM_0351 BAM_0350     TRUE 0.698 10.000 0.042 1.000   NA
 6057448 6057449 BAM_0349 BAM_0348 ahpC ahpF TRUE 0.974 15.000 0.551 1.000 Y NA
 6057450 6057451 BAM_0347 BAM_0346   amhX FALSE 0.605 152.000 0.263 NA   NA
 6057454 6057455 BAM_0343 BAM_0342     TRUE 0.642 15.000 0.189 NA   NA
 6057456 6057457 BAM_0341 BAM_0340     FALSE 0.549 95.000 0.043 NA   NA
 6057457 6057458 BAM_0340 BAM_0339     FALSE 0.046 273.000 0.000 NA   NA
 6057458 6057459 BAM_0339 BAM_0338     FALSE 0.056 261.000 0.000 NA   NA
 6057459 6057460 BAM_0338 BAM_0337     TRUE 0.952 97.000 0.008 1.000 Y NA
 6057461 6057462 BAM_0336 BAM_0335     FALSE 0.252 240.000 0.000 1.000 N NA
 6057462 6057463 BAM_0335 BAM_0334     TRUE 0.958 152.000 0.300 0.004 Y NA
 6057463 6057464 BAM_0334 BAM_0333   ampS TRUE 0.907 117.000 0.258 1.000 N NA
 6057465 6057466 BAM_0332 BAM_0331   gabD TRUE 0.705 48.000 0.157 1.000 N NA
 6057466 6057467 BAM_0331 BAM_0330 gabD   TRUE 0.871 -7.000 0.583 1.000 N NA
 6057467 6057468 BAM_0330 BAM_0329   gabT TRUE 0.919 113.000 0.409 1.000 N NA
 6057468 6057469 BAM_0329 BAM_0328 gabT   FALSE 0.551 83.000 0.045 1.000   NA
 6057469 6057470 BAM_0328 BAM_0327     TRUE 0.694 140.000 0.028 1.000   NA
 6057470 6057471 BAM_0327 BAM_0326   gatB FALSE 0.033 471.000 0.034 1.000 N NA
 6057471 6057472 BAM_0326 BAM_0325 gatB gatA TRUE 0.976 15.000 0.492 0.001 Y NA
 6057472 6057473 BAM_0325 BAM_0324 gatA gatC TRUE 0.979 16.000 0.643 0.001 Y NA
 6057473 6057474 BAM_0324 BAM_0323 gatC   FALSE 0.185 197.000 0.000 NA   NA
 6057475 6057476 BAM_0322 BAM_0321     FALSE 0.409 77.000 0.000 NA   NA
 6057476 6057477 BAM_0321 BAM_0320     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6057477 6057478 BAM_0320 BAM_0319     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6057478 6057479 BAM_0319 BAM_0318     TRUE 0.683 59.000 0.750 NA   NA
 6057480 6057481 BAM_0317 BAM_0316     TRUE 0.947 22.000 0.233 NA Y NA
 6057481 6057482 BAM_0316 BAM_0315     TRUE 0.926 -10.000 0.233 1.000 Y NA
 6057484 6057485 BAM_0313 BAM_0312     FALSE 0.249 186.000 0.051 NA   NA
 6057485 6057486 BAM_0312 BAM_0311     FALSE 0.614 154.000 0.205 1.000   NA
 6057486 6057487 BAM_0311 BAM_0310     TRUE 0.847 96.000 0.800 NA   NA
 6057487 6057488 BAM_0310 BAM_0309   ligA FALSE 0.574 17.000 0.009 NA   NA
 6057488 6057489 BAM_0309 BAM_0308 ligA pcrA TRUE 0.964 16.000 0.103 0.007 Y NA
 6057489 6057490 BAM_0308 BAM_0307 pcrA   TRUE 0.647 1.000 0.049 NA   NA
 6057491 6057492 BAM_0306 BAM_0305     FALSE 0.137 210.000 0.000 NA   NA
 6057492 6057493 BAM_0305 BAM_0304     TRUE 0.830 17.000 0.549 1.000   NA
 6057494 6057495 BAM_0303 BAM_0302 purD purH TRUE 0.975 122.000 0.238 1.000 Y NA
 6057495 6057496 BAM_0302 BAM_0301 purH purN TRUE 0.948 25.000 0.225 1.000 Y NA
 6057496 6057497 BAM_0301 BAM_0300 purN purM TRUE 0.964 -3.000 0.238 0.001 Y NA
 6057497 6057498 BAM_0300 BAM_0299 purM purF TRUE 0.968 107.000 0.248 1.000 Y NA
 6057498 6057499 BAM_0299 BAM_0298 purF purL TRUE 0.909 -15.000 0.223 1.000 Y NA
 6057499 6057500 BAM_0298 BAM_0297 purL purQ TRUE 0.928 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 6057500 6057501 BAM_0297 BAM_0296 purQ   TRUE 0.977 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 6057501 6057502 BAM_0296 BAM_0295   purC TRUE 0.952 -7.000 0.460 1.000 Y NA
 6057502 6057503 BAM_0295 BAM_0294 purC purB TRUE 0.939 89.000 0.072 1.000 Y NA
 6057503 6057504 BAM_0294 BAM_0293 purB purK TRUE 0.954 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 6057504 6057505 BAM_0293 BAM_0292 purK purE TRUE 0.962 -3.000 0.038 0.000 Y NA
 6057505 6057506 BAM_0292 BAM_0291 purE rrfH FALSE 0.005 700.000 0.000 NA   NA
 6057507 6057508 BAM_3656 BAM_3657     FALSE 0.472 87.000 0.000 NA   NA
 6057508 6057509 BAM_3657 BAM_3658     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057513 6057514 BAM_3662 BAM_3663   argH1 FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6057514 6057515 BAM_3663 BAM_3664 argH1   FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6057515 6057516 BAM_3664 BAM_3665     FALSE 0.598 102.000 0.000 NA   NA
 6057516 6057517 BAM_3665 BAM_3666     TRUE 0.924 147.000 0.889 NA N NA
 6057517 6057518 BAM_3666 BAM_3667     TRUE 0.919 108.000 0.471 1.000 N NA
 6057518 6057519 BAM_3667 BAM_3668     TRUE 0.693 4.000 0.170 NA   NA
 6057523 6057524 BAM_3672 BAM_3673     FALSE 0.596 100.000 0.040 NA   NA
 6057524 6057525 BAM_3673 BAM_3674     FALSE 0.449 80.000 0.023 NA   NA
 6057525 6057526 BAM_3674 BAM_3675     FALSE 0.506 91.000 0.023 NA   NA
 6057526 6057527 BAM_3675 BAM_3676     FALSE 0.360 169.000 0.022 NA   NA
 6057527 6057528 BAM_3676 BAM_3677     FALSE 0.574 43.000 0.429 NA   NA
 6057528 6057529 BAM_3677 BAM_3678     TRUE 0.764 16.000 0.429 NA   NA
 6057529 6057530 BAM_3678 BAM_3679   moaD2 TRUE 0.665 67.000 0.010 1.000 N NA
 6057530 6057531 BAM_3679 BAM_3680 moaD2 moaE2 TRUE 0.981 5.000 0.501 0.003 Y NA
 6057531 6057532 BAM_3680 BAM_3681 moaE2 moeA2 TRUE 0.900 -19.000 0.008 0.003 Y NA
 6057532 6057533 BAM_3681 BAM_3682 moeA2   TRUE 0.978 19.000 0.900 1.000 Y NA
 6057533 6057534 BAM_3682 BAM_3683     TRUE 0.867 25.000 0.429 1.000 N NA
 6057534 6057535 BAM_3683 BAM_3684     FALSE 0.430 -13.000 0.143 NA   NA
 6057535 6057536 BAM_3684 BAM_3685   narA2 FALSE 0.584 96.000 0.100 NA   NA
 6057536 6057537 BAM_3685 BAM_3686 narA2 fdhD2 TRUE 0.874 21.000 0.400 1.000 N NA
 6057537 6057538 BAM_3686 BAM_3687 fdhD2   TRUE 0.803 17.000 0.545 NA   NA
 6057538 6057539 BAM_3687 BAM_3688     TRUE 0.823 116.000 0.429 NA   NA
 6057539 6057540 BAM_3688 BAM_3689     TRUE 0.891 12.000 0.929 NA   NA
 6057540 6057541 BAM_3689 BAM_3690     FALSE 0.317 -31.000 0.143 NA   NA
 6057542 6057543 BAM_3691 BAM_3692 gerSA gerSB TRUE 0.751 -3.000 0.231 0.006   NA
 6057543 6057544 BAM_3692 BAM_3693 gerSB gerSC FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6057544 6057545 BAM_3693 BAM_3694 gerSC   FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057546 6057547 BAM_3695 BAM_3696     FALSE 0.544 58.000 0.438 NA   NA
 6057547 6057548 BAM_3696 BAM_3697     FALSE 0.629 74.000 0.500 NA   NA
 6057548 6057549 BAM_3697 BAM_3698     FALSE 0.067 251.000 0.000 NA   NA
 6057549 6057550 BAM_3698 BAM_3699     TRUE 0.646 -3.000 0.250 NA   NA
 6057552 6057553 BAM_3701 BAM_3702     TRUE 0.883 113.000 0.026 1.000 N NA
 6057553 6057554 BAM_3702 BAM_3703     FALSE 0.422 286.000 0.000 0.022 Y NA
 6057554 6057555 BAM_3703 BAM_3704     FALSE 0.076 335.000 0.000 1.000 N NA
 6057555 6057556 BAM_3704 BAM_3705     FALSE 0.415 201.000 0.037 NA N NA
 6057556 6057557 BAM_3705 BAM_3706     TRUE 0.864 16.000 0.778 NA   NA
 6057557 6057558 BAM_3706 BAM_3707     TRUE 0.872 13.000 0.778 NA   NA
 6057558 6057559 BAM_3707 BAM_3708     TRUE 0.678 128.000 0.000 NA   NA
 6057559 6057560 BAM_3708 BAM_3709     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6057560 6057561 BAM_3709 BAM_3710     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6057561 6057562 BAM_3710 BAM_3711     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6057562 6057563 BAM_3711 BAM_3712     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6057565 6057566 BAM_3714 BAM_3715   parC FALSE 0.428 170.000 0.035 1.000   NA
 6057566 6057567 BAM_3715 BAM_3716 parC parE TRUE 0.982 2.000 0.552 0.001 Y NA
 6057567 6057568 BAM_3716 BAM_3717 parE   FALSE 0.149 206.000 0.000 NA   NA
 6057568 6057569 BAM_3717 BAM_3718     FALSE 0.332 57.000 0.000 NA   NA
 6057569 6057570 BAM_3718 BAM_3719   htrA FALSE 0.445 80.000 0.015 NA   NA
 6057570 6057571 BAM_3719 BAM_3720 htrA   FALSE 0.463 203.000 0.222 1.000 N NA
 6057571 6057572 BAM_3720 BAM_3721     FALSE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 6057572 6057573 BAM_3721 BAM_3722     FALSE 0.314 -21.000 0.000 NA   NA
 6057573 6057574 BAM_3722 BAM_3723     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057575 6057576 BAM_3724 BAM_3725     TRUE 0.652 109.000 0.048 NA   NA
 6057579 6057580 BAM_3728 BAM_3729 tlp sspN TRUE 0.794 100.000 0.500 NA   NA
 6057580 6057581 BAM_3729 BAM_3730 sspN   TRUE 0.718 44.000 0.773 NA   NA
 6057581 6057582 BAM_3730 BAM_3731     TRUE 0.771 133.000 0.316 NA   NA
 6057586 6057587 BAM_3735 BAM_3736   acnA TRUE 0.890 117.000 0.013 1.000 N NA
 6057589 6057590 BAM_3738 BAM_3739     FALSE 0.532 47.000 0.381 NA   NA
 6057592 6057593 BAM_3741 BAM_3742     FALSE 0.525 58.000 0.412 NA   NA
 6057597 6057598 BAM_3746 BAM_3747     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6057598 6057599 BAM_3747 BAM_3748     FALSE 0.331 66.000 0.000 NA   NA
 6057601 6057602 BAM_0641 BAM_0640 aspA1   FALSE 0.530 84.000 0.222 NA   NA
 6057602 6057603 BAM_0640 BAM_0639     FALSE 0.632 108.000 0.010 NA   NA
 6057604 6057605 BAM_0638 BAM_0637     FALSE 0.220 261.000 0.333 NA N NA
 6057605 6057606 BAM_0637 BAM_0636     FALSE 0.240 235.000 0.000 NA N NA
 6057607 6057608 BAM_0635 BAM_0634     TRUE 0.855 16.000 0.727 NA   NA
 6057610 6057611 BAM_0632 BAM_0631     FALSE 0.478 167.000 0.273 NA   NA
 6057611 6057612 BAM_0631 BAM_0630     TRUE 0.706 3.000 0.231 NA   NA
 6057614 6057615 BAM_0628 BAM_0627     TRUE 0.821 25.000 0.203 1.000 N NA
 6057615 6057616 BAM_0627 BAM_0626     FALSE 0.175 267.000 0.000 1.000 N NA
 6057616 6057617 BAM_0626 BAM_0625   ald1 TRUE 0.983 104.000 0.889 1.000 Y NA
 6057617 6057618 BAM_0625 BAM_0624 ald1   FALSE 0.056 368.000 0.000 1.000 N NA
 6057618 6057619 BAM_0624 BAM_0623     FALSE 0.461 157.000 0.000 NA   NA
 6057619 6057620 BAM_0623 BAM_0622     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6057620 6057621 BAM_0622 BAM_0621     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6057622 6057623 BAM_0620 BAM_0619 fdhD1   FALSE 0.288 229.000 0.000 1.000 N NA
 6057625 6057626 BAM_0617 BAM_0616     TRUE 0.939 66.000 0.727 1.000 Y NA
 6057626 6057627 BAM_0616 BAM_0615     TRUE 0.835 147.000 0.636 1.000   NA
 6057629 6057630 BAM_0613 BAM_0612     TRUE 0.823 116.000 0.429 NA   NA
 6057631 6057632 BAM_0611 BAM_0610     TRUE 0.917 60.000 0.432 1.000 Y NA
 6057632 6057633 BAM_0610 BAM_0609     TRUE 0.909 123.000 0.243 1.000 N NA
 6057633 6057634 BAM_0609 BAM_0608     TRUE 0.962 -3.000 0.229 0.055 Y NA
 6057634 6057635 BAM_0608 BAM_0607     TRUE 0.974 125.000 0.229 1.000 Y NA
 6057635 6057636 BAM_0607 BAM_0606     FALSE 0.064 254.000 0.000 NA   NA
 6057636 6057637 BAM_0606 BAM_0605     TRUE 0.657 44.000 0.600 NA   NA
 6057637 6057638 BAM_0605 BAM_0604     FALSE 0.146 207.000 0.000 NA   NA
 6057638 6057639 BAM_0604 BAM_0603     TRUE 0.973 -3.000 0.606 1.000 Y NA
 6057639 6057640 BAM_0603 BAM_0602     FALSE 0.627 150.000 0.091 1.000   NA
 6057640 6057641 BAM_0602 BAM_0601     FALSE 0.014 416.000 0.000 1.000   NA
 6057641 6057642 BAM_0601 BAM_0600     TRUE 0.975 22.000 0.708 0.022 Y NA
 6057642 6057643 BAM_0600 BAM_0599     TRUE 0.980 -3.000 0.848 0.022 Y NA
 6057643 6057644 BAM_0599 BAM_0598     TRUE 0.975 0.000 0.391 0.022 Y NA
 6057644 6057645 BAM_0598 BAM_0597     TRUE 0.860 -3.000 0.262 1.000 N NA
 6057645 6057646 BAM_0597 BAM_0596     FALSE 0.006 559.000 0.000 NA   NA
 6057646 6057647 BAM_0596 BAM_0595     FALSE 0.036 290.000 0.000 NA   NA
 6057647 6057648 BAM_0595 BAM_0594     TRUE 0.693 135.000 0.125 NA   NA
 6057650 6057651 BAM_0592 BAM_0591     TRUE 0.984 0.000 0.818 0.055 Y NA
 6057651 6057652 BAM_0591 BAM_0590     TRUE 0.963 158.000 0.600 0.010 Y NA
 6057652 6057653 BAM_0590 BAM_0589     FALSE 0.083 237.000 0.000 NA   NA
 6057653 6057654 BAM_0589 BAM_0588     TRUE 0.790 13.000 0.464 NA   NA
 6057654 6057655 BAM_0588 BAM_0587     FALSE 0.067 251.000 0.000 NA   NA
 6057657 6057658 BAM_0585 BAM_0584     TRUE 0.753 155.000 0.500 1.000   NA
 6057658 6057659 BAM_0584 BAM_0583     TRUE 0.672 130.000 0.018 NA   NA
 6057659 6057660 BAM_0583 BAM_0582     FALSE 0.034 446.000 0.683 NA   NA
 6057662 6057663 BAM_0580 BAM_0579     TRUE 0.894 128.000 0.016 1.000 N NA
 6057663 6057664 BAM_0579 BAM_0578     FALSE 0.369 59.000 0.097 NA   NA
 6057664 6057665 BAM_0578 BAM_0577     FALSE 0.411 45.000 0.174 NA   NA
 6057665 6057666 BAM_0577 BAM_0576     FALSE 0.178 199.000 0.000 NA   NA
 6057666 6057667 BAM_0576 BAM_0575     TRUE 0.662 115.000 0.000 NA   NA
 6057667 6057668 BAM_0575 BAM_0574     FALSE 0.222 188.000 0.000 NA   NA
 6057670 6057671 BAM_0552 BAM_0551 rrsI   FALSE 0.488 -6.000 0.000 NA   NA
 6057673 6057674 BAM_0549 BAM_0548   bcP FALSE 0.115 299.000 0.005 1.000 N NA
 6057674 6057675 BAM_0548 BAM_0547 bcP   FALSE 0.364 45.000 0.015 NA   NA
 6057675 6057676 BAM_0547 BAM_0546     FALSE 0.423 73.000 0.188 NA   NA
 6057676 6057677 BAM_0546 BAM_0545     TRUE 0.834 5.000 0.500 NA   NA
 6057677 6057678 BAM_0545 BAM_0544     TRUE 0.691 -7.000 0.488 NA   NA
 6057679 6057680 BAM_0543 BAM_0542 hemL1   FALSE 0.461 200.000 0.036 1.000 N NA
 6057680 6057681 BAM_0542 BAM_0541     FALSE 0.063 261.000 0.066 NA   NA
 6057682 6057683 BAM_0540 BAM_0539     TRUE 0.643 55.000 0.077 NA N NA
 6057692 6057693 BAM_0530 BAM_0529 sspK   FALSE 0.597 44.000 0.480 NA   NA
 6057694 6057695 BAM_0528 BAM_0527     FALSE 0.632 10.000 0.045 NA   NA
 6057696 6057697 BAM_0526 BAM_0525     FALSE 0.605 141.000 0.000 NA   NA
 6057697 6057698 BAM_0525 BAM_0524     FALSE 0.216 242.000 0.000 NA N NA
 6057698 6057699 BAM_0524 BAM_0523     TRUE 0.833 111.000 0.500 NA   NA
 6057700 6057701 BAM_0522 BAM_0521   pflA FALSE 0.039 413.000 0.000 1.000 N NA
 6057701 6057702 BAM_0521 BAM_0520 pflA pfl TRUE 0.700 70.000 0.135 1.000 N NA
 6057702 6057703 BAM_0520 BAM_0519 pfl   FALSE 0.019 340.000 0.000 NA   NA
 6057703 6057704 BAM_0519 BAM_0518     FALSE 0.480 -7.000 0.050 NA   NA
 6057704 6057705 BAM_0518 BAM_0516     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057705 6057706 BAM_0516 BAM_0515     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6057706 6057707 BAM_0515 BAM_0514     TRUE 0.646 -19.000 0.667 NA   NA
 6057707 6057708 BAM_0514 BAM_0513     TRUE 0.842 17.000 0.692 NA   NA
 6057708 6057709 BAM_0513 BAM_0512     TRUE 0.664 154.000 0.385 NA   NA
 6057709 6057710 BAM_0512 BAM_0511     FALSE 0.208 255.000 0.000 1.000 N NA
 6057710 6057711 BAM_0511 BAM_0510     FALSE 0.608 142.000 0.032 NA   NA
 6057712 6057713 BAM_0509 BAM_0508 glsA1   FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6057713 6057714 BAM_0508 BAM_0507     FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 6057715 6057716 BAM_0506 BAM_0505     TRUE 0.662 115.000 0.000 NA   NA
 6057718 6057719 BAM_0503 BAM_0502     TRUE 0.956 96.000 0.259 1.000 Y NA
 6057719 6057720 BAM_0502 BAM_0501     TRUE 0.853 105.000 0.636 NA   NA
 6057721 6057722 BAM_0500 BAM_0499     FALSE 0.598 84.000 0.304 NA   NA
 6057725 6057726 BAM_0496 BAM_0495     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6057726 6057727 BAM_0495 BAM_0494     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6057727 6057728 BAM_0494 BAM_0493     FALSE 0.532 95.000 0.000 NA   NA
 6057728 6057729 BAM_0493 BAM_0492     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6057729 6057730 BAM_0492 BAM_0491     FALSE 0.342 69.000 0.000 NA   NA
 6057730 6057731 BAM_0491 BAM_0490     FALSE 0.331 66.000 0.000 NA   NA
 6057731 6057732 BAM_0490 BAM_0489     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6057732 6057733 BAM_0489 BAM_0488     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057733 6057734 BAM_0488 BAM_0487     FALSE 0.259 -34.000 0.000 NA   NA
 6057734 6057735 BAM_0487 BAM_0486     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6057735 6057736 BAM_0486 BAM_0485     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6057736 6057737 BAM_0485 BAM_0484     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6057737 6057738 BAM_0484 BAM_0483     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057738 6057739 BAM_0483 BAM_0482     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6057739 6057740 BAM_0482 BAM_0481     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057740 6057741 BAM_0481 BAM_0480     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057741 6057742 BAM_0480 BAM_0479     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6057742 6057743 BAM_0479 BAM_0478     FALSE 0.574 19.000 0.048 NA   NA
 6057743 6057744 BAM_0478 BAM_0477     FALSE 0.246 -43.000 0.000 NA   NA
 6057744 6057745 BAM_0477 BAM_0476     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6057745 6057746 BAM_0476 BAM_0475     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057746 6057747 BAM_0475 BAM_0474     FALSE 0.589 101.000 0.000 NA   NA
 6057747 6057748 BAM_0474 BAM_0473     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057748 6057749 BAM_0473 BAM_0472     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057751 6057752 BAM_0470 BAM_0469     TRUE 0.655 133.000 0.000 NA   NA
 6057752 6057753 BAM_0469 BAM_0468     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6057753 6057754 BAM_0468 BAM_0467     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6057754 6057755 BAM_0467 BAM_0466     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6057755 6057756 BAM_0466 BAM_0465     TRUE 0.666 116.000 0.000 NA   NA
 6057756 6057757 BAM_0465 BAM_0464     FALSE 0.107 221.000 0.000 NA   NA
 6057757 6057758 BAM_0464 BAM_0463     FALSE 0.624 106.000 0.000 NA   NA
 6057758 6057759 BAM_0463 BAM_0462     FALSE 0.439 32.000 0.000 NA   NA
 6057759 6057760 BAM_0462 BAM_0461     FALSE 0.370 41.000 0.000 NA   NA
 6057760 6057761 BAM_0461 BAM_0460     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6057761 6057762 BAM_0460 BAM_0459     FALSE 0.362 44.000 0.000 NA   NA
 6057762 6057763 BAM_0459 BAM_0458     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6057763 6057764 BAM_0458 BAM_0457     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6057764 6057765 BAM_0457 BAM_0456     FALSE 0.383 38.000 0.000 NA   NA
 6057765 6057766 BAM_0456 BAM_0455     FALSE 0.174 200.000 0.000 NA   NA
 6057766 6057767 BAM_0455 BAM_0454     FALSE 0.351 49.000 0.000 NA   NA
 6057767 6057768 BAM_0454 BAM_0453     FALSE 0.383 38.000 0.000 NA   NA
 6057768 6057769 BAM_0453 BAM_0452     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6057769 6057770 BAM_0452 BAM_0451     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6057770 6057771 BAM_0451 BAM_0450     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6057771 6057772 BAM_0450 BAM_0449     FALSE 0.509 25.000 0.000 NA   NA
 6057772 6057773 BAM_0449 BAM_0448     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6057773 6057774 BAM_0448 BAM_0447     FALSE 0.317 -31.000 0.182 NA   NA
 6057774 6057775 BAM_0447 BAM_0446     FALSE 0.614 -3.000 0.182 NA   NA
 6057775 6057776 BAM_0446 BAM_0445     FALSE 0.462 30.000 0.000 NA   NA
 6057776 6057777 BAM_0445 BAM_0444     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057778 6057779 BAM_4691 BAM_4692 aspS hisS2 FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6057779 6057780 BAM_4692 BAM_4693 hisS2   FALSE 0.191 196.000 0.000 NA   NA
 6057780 6057781 BAM_4693 BAM_4694     FALSE 0.497 39.000 0.286 NA   NA
 6057781 6057782 BAM_4694 BAM_4695   dtD FALSE 0.342 52.000 0.003 NA   NA
 6057782 6057783 BAM_4695 BAM_4696 dtD relA TRUE 0.850 18.000 0.177 1.000 N NA
 6057783 6057784 BAM_4696 BAM_4697 relA apt1 FALSE 0.388 211.000 0.068 1.000 N NA
 6057784 6057785 BAM_4697 BAM_4698 apt1 recJ TRUE 0.705 48.000 0.128 1.000 N NA
 6057785 6057786 BAM_4698 BAM_4699 recJ   FALSE 0.107 221.000 0.000 NA   NA
 6057786 6057787 BAM_4699 BAM_4700   secDF FALSE 0.513 151.000 0.000 NA   NA
 6057787 6057788 BAM_4700 BAM_4701 secDF   FALSE 0.059 271.000 0.185 NA   NA
 6057792 6057793 BAM_4705 BAM_4706 yajC tgt TRUE 0.813 28.000 0.325 NA N NA
 6057793 6057794 BAM_4706 BAM_4707 tgt queA TRUE 0.973 13.000 0.360 0.000 Y NA
 6057794 6057795 BAM_4707 BAM_4708 queA   FALSE 0.561 20.000 0.039 NA   NA
 6057795 6057796 BAM_4708 BAM_4709   ruvB FALSE 0.576 -3.000 0.040 NA   NA
 6057796 6057797 BAM_4709 BAM_4710 ruvB ruvA TRUE 0.982 6.000 0.549 0.001 Y NA
 6057799 6057800 BAM_4712 BAM_4713     TRUE 0.683 121.000 0.000 NA   NA
 6057800 6057801 BAM_4713 BAM_4714     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6057801 6057802 BAM_4714 BAM_4715     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6057804 6057805 BAM_4717 BAM_4718   safA FALSE 0.417 179.000 0.320 NA   NA
 6057805 6057806 BAM_4718 BAM_4719 safA nadA FALSE 0.019 375.000 0.000 1.000   NA
 6057806 6057807 BAM_4719 BAM_4720 nadA nadC TRUE 0.943 31.000 0.198 0.002 Y NA
 6057807 6057808 BAM_4720 BAM_4721 nadC nadB TRUE 0.958 20.000 0.014 0.002 Y NA
 6057809 6057810 BAM_4722 BAM_4723     TRUE 0.762 3.000 0.243 1.000   NA
 6057810 6057811 BAM_4723 BAM_4724     FALSE 0.550 82.000 0.057 1.000   NA
 6057812 6057813 BAM_4725 BAM_4726 pheA   FALSE 0.634 97.000 0.025 1.000   NA
 6057813 6057814 BAM_4726 BAM_4727     TRUE 0.787 50.000 0.889 0.061   NA
 6057814 6057815 BAM_4727 BAM_4728     TRUE 0.708 -25.000 0.889 1.000   NA
 6057815 6057816 BAM_4728 BAM_4729     FALSE 0.521 94.000 0.000 NA   NA
 6057816 6057817 BAM_4729 BAM_4730     FALSE 0.430 -9.000 0.000 NA   NA
 6057817 6057818 BAM_4730 BAM_4731     FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6057818 6057819 BAM_4731 BAM_4732   obg TRUE 0.687 140.000 0.008 1.000   NA
 6057819 6057820 BAM_4732 BAM_4733 obg   FALSE 0.624 0.000 0.021 NA   NA
 6057820 6057821 BAM_4733 BAM_4734   rpmA FALSE 0.333 64.000 0.013 NA   NA
 6057821 6057822 BAM_4734 BAM_4735 rpmA   TRUE 0.966 4.000 0.203 NA Y NA
 6057822 6057823 BAM_4735 BAM_4736   rplU TRUE 0.957 12.000 0.036 NA Y NA
 6057823 6057824 BAM_4736 BAM_4737 rplU   TRUE 0.911 166.000 0.076 1.000 Y NA
 6057824 6057825 BAM_4737 BAM_4738   spoIVFB FALSE 0.471 68.000 0.229 1.000   NA
 6057825 6057826 BAM_4738 BAM_4739 spoIVFB spoIVFA FALSE 0.526 -7.000 0.219 NA   NA
 6057826 6057827 BAM_4739 BAM_4740 spoIVFA minD TRUE 0.868 134.000 0.060 NA N NA
 6057827 6057828 BAM_4740 BAM_4741 minD minC TRUE 0.974 3.000 0.368 1.000 Y NA
 6057828 6057829 BAM_4741 BAM_4742 minC mreD TRUE 0.741 36.000 0.106 1.000 N NA
 6057829 6057830 BAM_4742 BAM_4743 mreD mreC TRUE 0.978 15.000 0.550 0.001 Y NA
 6057830 6057831 BAM_4743 BAM_4744 mreC mreB TRUE 0.841 42.000 0.689 1.000 N NA
 6057831 6057832 BAM_4744 BAM_4745 mreB radC TRUE 0.762 159.000 0.011 1.000 N NA
 6057832 6057833 BAM_4745 BAM_4746 radC maF TRUE 0.653 47.000 0.023 NA N NA
 6057833 6057834 BAM_4746 BAM_4747 maF   FALSE 0.110 221.000 0.020 NA   NA
 6057834 6057835 BAM_4747 BAM_4748   folC FALSE 0.434 166.000 0.159 NA   NA
 6057835 6057836 BAM_4748 BAM_4749 folC valS TRUE 0.839 94.000 0.041 0.068 N NA
 6057836 6057837 BAM_4749 BAM_4750 valS ysxE FALSE 0.011 396.000 0.000 NA   NA
 6057837 6057838 BAM_4750 BAM_4751 ysxE   FALSE 0.576 63.000 0.500 NA   NA
 6057838 6057839 BAM_4751 BAM_4752   hemL2 TRUE 0.786 110.000 0.288 1.000   NA
 6057839 6057840 BAM_4752 BAM_4753 hemL2 hemB TRUE 0.970 0.000 0.126 0.001 Y NA
 6057840 6057841 BAM_4753 BAM_4754 hemB hemD TRUE 0.958 21.000 0.061 0.001 Y NA
 6057841 6057842 BAM_4754 BAM_4755 hemD hemC TRUE 0.971 2.000 0.028 0.001 Y NA
 6057842 6057843 BAM_4755 BAM_4756 hemC   TRUE 0.849 16.000 0.040 1.000 N NA
 6057843 6057844 BAM_4756 BAM_4757   hemA TRUE 0.914 18.000 0.613 1.000 N NA
 6057845 6057846 BAM_4758 BAM_4759     TRUE 0.914 3.000 0.400 1.000 N NA
 6057847 6057848 BAM_4760 BAM_4761   loN TRUE 0.654 -3.000 0.055 1.000   NA
 6057848 6057849 BAM_4761 BAM_4762 loN lonB TRUE 0.897 184.000 0.435 0.001 Y NA
 6057849 6057850 BAM_4762 BAM_4763 lonB clpX TRUE 0.968 104.000 0.042 0.001 Y NA
 6057850 6057851 BAM_4763 BAM_4764 clpX tig FALSE 0.519 265.000 0.033 0.002 Y NA
 6057851 6057852 BAM_4764 BAM_4765 tig   FALSE 0.038 310.000 0.011 1.000   NA
 6057852 6057853 BAM_4765 BAM_4766     FALSE 0.215 198.000 0.125 NA   NA
 6057853 6057854 BAM_4766 BAM_4767     FALSE 0.037 288.000 0.000 NA   NA
 6057858 6057859 BAM_4124 BAM_4125     FALSE 0.439 32.000 0.000 NA   NA
 6057859 6057860 BAM_4125 BAM_4126     TRUE 0.666 116.000 0.000 NA   NA
 6057860 6057861 BAM_4126 BAM_4127     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6057862 6057863 BAM_4128 BAM_4129     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6057863 6057864 BAM_4129 BAM_4130     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6057865 6057866 BAM_4131 BAM_4132     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6057866 6057867 BAM_4132 BAM_4133     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6057867 6057868 BAM_4133 BAM_4134     FALSE 0.469 156.000 0.000 NA   NA
 6057868 6057869 BAM_4134 BAM_4135     FALSE 0.509 25.000 0.000 NA   NA
 6057869 6057870 BAM_4135 BAM_4136     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6057870 6057871 BAM_4136 BAM_4137     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6057871 6057872 BAM_4137 BAM_4138     FALSE 0.397 164.000 0.000 NA   NA
 6057872 6057873 BAM_4138 BAM_4139     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6057873 6057874 BAM_4139 BAM_4140     FALSE 0.331 66.000 0.000 NA   NA
 6057874 6057875 BAM_4140 BAM_4141     FALSE 0.619 105.000 0.000 NA   NA
 6057875 6057876 BAM_4141 BAM_4142     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6057876 6057877 BAM_4142 BAM_4143     FALSE 0.329 60.000 0.000 NA   NA
 6057877 6057878 BAM_4143 BAM_4144     TRUE 0.888 14.000 1.000 NA   NA
 6057878 6057879 BAM_4144 BAM_4145     TRUE 0.874 -3.000 1.000 NA   NA
 6057879 6057880 BAM_4145 BAM_4146     FALSE 0.422 -12.000 0.071 NA   NA
 6057880 6057881 BAM_4146 BAM_4147     FALSE 0.423 -13.000 0.107 NA   NA
 6057881 6057882 BAM_4147 BAM_4148     FALSE 0.619 9.000 0.000 NA   NA
 6057882 6057883 BAM_4148 BAM_4149     FALSE 0.409 77.000 0.000 NA   NA
 6057883 6057884 BAM_4149 BAM_4150     TRUE 0.863 -3.000 0.846 NA   NA
 6057884 6057885 BAM_4150 BAM_4151     TRUE 0.885 11.000 0.846 NA   NA
 6057885 6057886 BAM_4151 BAM_4152     TRUE 0.660 61.000 0.692 NA   NA
 6057886 6057887 BAM_4152 BAM_4153     FALSE 0.379 -19.000 0.200 NA   NA
 6057887 6057888 BAM_4153 BAM_4154     TRUE 0.663 162.000 0.500 NA   NA
 6057888 6057889 BAM_4154 BAM_4155     FALSE 0.614 140.000 0.000 NA   NA
 6057889 6057890 BAM_4155 BAM_4156     FALSE 0.012 388.000 0.000 NA   NA
 6057890 6057891 BAM_4156 BAM_4157     FALSE 0.045 274.000 0.000 NA   NA
 6057891 6057892 BAM_4157 BAM_4158     FALSE 0.637 -3.000 0.000 1.000   NA
 6057892 6057893 BAM_4158 BAM_4159     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6057893 6057894 BAM_4159 BAM_4160     TRUE 0.662 115.000 0.000 NA   NA
 6057894 6057895 BAM_4160 BAM_4161     TRUE 0.787 27.000 0.667 NA   NA
 6057895 6057896 BAM_4161 BAM_4162     FALSE 0.498 91.000 0.000 NA   NA
 6057896 6057897 BAM_4162 BAM_4163     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6057897 6057898 BAM_4163 BAM_4164     TRUE 0.681 120.000 0.000 NA   NA
 6057898 6057899 BAM_4164 BAM_4165     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6057899 6057900 BAM_4165 BAM_4166     FALSE 0.005 745.000 0.000 NA   NA
 6057902 6057903 BAM_4168 BAM_4169     FALSE 0.371 167.000 0.000 NA   NA
 6057903 6057904 BAM_4169 BAM_4170   dut FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6057904 6057905 BAM_4170 BAM_4171 dut   FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6057905 6057906 BAM_4171 BAM_4172     FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6057906 6057907 BAM_4172 BAM_4173     FALSE 0.619 9.000 0.000 NA   NA
 6057907 6057908 BAM_4173 BAM_4174     FALSE 0.434 39.000 0.200 NA   NA
 6057908 6057909 BAM_4174 BAM_4175     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6057909 6057910 BAM_4175 BAM_4176     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6057910 6057911 BAM_4176 BAM_4177     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6057911 6057912 BAM_4177 BAM_4178     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6057912 6057913 BAM_4178 BAM_4179     FALSE 0.326 -19.000 0.000 NA   NA
 6057913 6057914 BAM_4179 BAM_4180     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6057914 6057915 BAM_4180 BAM_4181     TRUE 0.764 30.000 0.667 NA   NA
 6057915 6057916 BAM_4181 BAM_4182     FALSE 0.490 90.000 0.000 NA   NA
 6057916 6057917 BAM_4182 BAM_4183     FALSE 0.491 52.000 0.333 NA   NA
 6057919 6057920 BAM_4185 BAM_4186     TRUE 0.890 102.000 1.000 NA   NA
 6057920 6057921 BAM_4186 BAM_4187     TRUE 0.762 13.000 0.400 NA   NA
 6057923 6057924 BAM_4189 BAM_4190     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6057924 6057925 BAM_4190 BAM_4191     TRUE 0.758 22.000 0.500 NA   NA
 6057926 6057927 BAM_4192 BAM_4193     FALSE 0.206 193.000 0.014 NA   NA
 6057928 6057929 BAM_4194 BAM_4195     FALSE 0.572 -7.000 0.095 1.000   NA
 6057931 6057932 BAM_4196 BAM_4198 coaD   TRUE 0.835 -3.000 0.009 1.000 N NA
 6057933 6057934 BAM_4199 BAM_4200     FALSE 0.337 -18.000 0.000 NA   NA
 6057935 6057936 BAM_4201 BAM_4202   ylbF FALSE 0.161 253.000 0.500 NA   NA
 6057936 6057937 BAM_4202 BAM_4203 ylbF   TRUE 0.700 117.000 0.078 NA   NA
 6057937 6057938 BAM_4203 BAM_4204     FALSE 0.442 77.000 0.078 NA   NA
 6057938 6057939 BAM_4204 BAM_4205     TRUE 0.883 12.000 0.852 NA   NA
 6057939 6057940 BAM_4205 BAM_4206     TRUE 0.667 146.000 0.276 NA   NA
 6057942 6057943 BAM_4208 BAM_4209     FALSE 0.097 227.000 0.000 NA   NA
 6057943 6057944 BAM_4209 BAM_4210   ctaF TRUE 0.784 86.000 0.707 NA   NA
 6057944 6057945 BAM_4210 BAM_4211 ctaF ctaE TRUE 0.987 4.000 0.950 0.001 Y NA
 6057945 6057946 BAM_4211 BAM_4212 ctaE ctaD TRUE 0.986 0.000 0.925 0.001 Y NA
 6057946 6057947 BAM_4212 BAM_4213 ctaD ctaC TRUE 0.965 34.000 0.755 0.001 Y NA
 6057947 6057948 BAM_4213 BAM_4214 ctaC   TRUE 0.845 94.000 0.084 0.040 N NA
 6057950 6057951 BAM_4216 BAM_4217 pyc   FALSE 0.087 323.000 0.000 1.000 N NA
 6057951 6057952 BAM_4217 BAM_4218     TRUE 0.728 126.000 0.133 NA   NA
 6057954 6057955 BAM_4220 BAM_4221     FALSE 0.098 248.000 0.025 1.000   NA
 6057957 6057958 BAM_4223 BAM_4224     TRUE 0.770 15.000 0.429 NA   NA
 6057958 6057959 BAM_4224 BAM_4225   typA FALSE 0.482 156.000 0.032 NA   NA
 6057962 6057963 BAM_4056 BAM_4057   rpe TRUE 0.878 139.000 0.166 1.000 N NA
 6057963 6057964 BAM_4057 BAM_4058 rpe   TRUE 0.751 3.000 0.213 1.000   NA
 6057964 6057965 BAM_4058 BAM_4059     FALSE 0.080 269.000 0.196 1.000   NA
 6057965 6057966 BAM_4059 BAM_4060     TRUE 0.980 9.000 0.704 1.000 Y NA
 6057966 6057967 BAM_4060 BAM_4061     TRUE 0.742 5.000 0.105 1.000   NA
 6057967 6057968 BAM_4061 BAM_4062   sun TRUE 0.748 5.000 0.135 1.000   NA
 6057968 6057969 BAM_4062 BAM_4063 sun fmt TRUE 0.961 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 6057969 6057970 BAM_4063 BAM_4064 fmt def1 TRUE 0.952 24.000 0.031 0.008 Y NA
 6057970 6057971 BAM_4064 BAM_4065 def1 priA TRUE 0.860 12.000 0.029 1.000 N NA
 6057971 6057972 BAM_4065 BAM_4066 priA coaBC TRUE 0.845 -3.000 0.099 1.000 N NA
 6057972 6057973 BAM_4066 BAM_4067 coaBC rpoZ TRUE 0.675 173.000 0.192 1.000 N NA
 6057973 6057974 BAM_4067 BAM_4068 rpoZ   TRUE 0.923 3.000 0.471 1.000 N NA
 6057974 6057975 BAM_4068 BAM_4069     TRUE 0.645 14.000 0.143 NA   NA
 6057975 6057976 BAM_4069 BAM_4070     FALSE 0.390 68.000 0.189 NA   NA
 6057976 6057977 BAM_4070 BAM_4071     FALSE 0.603 101.000 0.037 NA   NA
 6057978 6057979 BAM_4072 BAM_4074     FALSE 0.014 371.000 0.000 NA   NA
 6057980 6057981 BAM_4073 BAM_4075     TRUE 0.704 -3.000 0.333 NA   NA
 6057981 6057982 BAM_4075 BAM_4076     TRUE 0.824 16.000 0.600 NA   NA
 6057983 6057984 BAM_4077 BAM_4078     FALSE 0.413 167.000 0.100 NA   NA
 6057984 6057985 BAM_4078 BAM_4079     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6057986 6057987 BAM_4080 BAM_4081 pyrE pyrF TRUE 0.956 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 6057987 6057988 BAM_4081 BAM_4082 pyrF pyrD TRUE 0.921 -15.000 0.154 0.001 Y NA
 6057988 6057989 BAM_4082 BAM_4083 pyrD pyrK TRUE 0.910 -3.000 0.592 1.000 N NA
 6057989 6057990 BAM_4083 BAM_4084 pyrK carB TRUE 0.848 -3.000 0.147 1.000 N NA
 6057990 6057991 BAM_4084 BAM_4085 carB   TRUE 0.921 -15.000 0.117 0.000 Y NA
 6057991 6057992 BAM_4085 BAM_4086   pyrC TRUE 0.956 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 6057992 6057993 BAM_4086 BAM_4087 pyrC pyrB TRUE 0.925 -16.000 0.452 1.000 Y NA
 6057993 6057994 BAM_4087 BAM_4088 pyrB uraA TRUE 0.948 149.000 0.064 1.000 Y NA
 6057994 6057995 BAM_4088 BAM_4089 uraA pyrR TRUE 0.954 147.000 0.140 1.000 Y NA
 6057995 6057996 BAM_4089 BAM_4090 pyrR   FALSE 0.440 203.000 0.048 1.000 N NA
 6057996 6057997 BAM_4090 BAM_4091   lspA TRUE 0.879 5.000 0.022 1.000 N NA
 6057997 6057998 BAM_4091 BAM_4092 lspA   TRUE 0.757 125.000 0.038 1.000   NA
 6057998 6057999 BAM_4092 BAM_4093   ileS2 FALSE 0.631 156.000 0.010 0.011   NA
 6057999 6058000 BAM_4093 BAM_4094 ileS2 divIVA FALSE 0.056 348.000 0.012 NA N NA
 6058000 6058001 BAM_4094 BAM_4095 divIVA   TRUE 0.756 90.000 0.579 NA   NA
 6058001 6058002 BAM_4095 BAM_4096     TRUE 0.695 16.000 0.138 1.000   NA
 6058002 6058003 BAM_4096 BAM_4097     TRUE 0.678 7.000 0.158 NA   NA
 6058003 6058004 BAM_4097 BAM_4098     FALSE 0.601 20.000 0.194 NA   NA
 6058004 6058005 BAM_4098 BAM_4099     FALSE 0.586 -3.000 0.061 NA   NA
 6058005 6058006 BAM_4099 BAM_4100     TRUE 0.685 117.000 0.039 NA   NA
 6058006 6058007 BAM_4100 BAM_4101   sigG FALSE 0.461 169.000 0.276 NA   NA
 6058007 6058008 BAM_4101 BAM_4102 sigG sigE TRUE 0.963 158.000 0.602 0.007 Y NA
 6058008 6058009 BAM_4102 BAM_4103 sigE spoIIGA TRUE 0.873 20.000 0.856 1.000   NA
 6058009 6058010 BAM_4103 BAM_4104 spoIIGA ftsZ FALSE 0.074 265.000 0.024 1.000   NA
 6058010 6058011 BAM_4104 BAM_4105 ftsZ ftsA TRUE 0.933 40.000 0.460 1.000 Y NA
 6058011 6058012 BAM_4105 BAM_4106 ftsA   FALSE 0.053 401.000 0.389 NA N NA
 6058012 6058013 BAM_4106 BAM_4107   murB1 TRUE 0.952 99.000 0.070 NA Y NA
 6058013 6058014 BAM_4107 BAM_4108 murB1 murG1 TRUE 0.890 62.000 0.061 1.000 Y NA
 6058014 6058015 BAM_4108 BAM_4109 murG1 spoVE TRUE 0.702 49.000 0.120 1.000 N NA
 6058015 6058016 BAM_4109 BAM_4110 spoVE murD TRUE 0.837 91.000 0.067 0.003 N NA
 6058016 6058017 BAM_4110 BAM_4111 murD mraY TRUE 0.982 1.000 0.647 0.003 Y NA
 6058017 6058018 BAM_4111 BAM_4112 mraY murE TRUE 0.954 23.000 0.025 0.003 Y NA
 6058018 6058019 BAM_4112 BAM_4113 murE   TRUE 0.737 209.000 0.181 1.000 Y NA
 6058019 6058020 BAM_4113 BAM_4114     TRUE 0.942 82.000 0.096 0.002 Y NA
 6058020 6058021 BAM_4114 BAM_4115   ftsL TRUE 0.829 22.000 0.101 1.000 N NA
 6058021 6058022 BAM_4115 BAM_4116 ftsL mraW TRUE 0.854 16.000 0.077 1.000 N NA
 6058022 6058023 BAM_4116 BAM_4117 mraW   FALSE 0.014 371.000 0.003 NA   NA
 6058023 6058024 BAM_4117 BAM_4118   panE2 FALSE 0.462 80.000 0.053 NA   NA
 6058026 6058027 BAM_4120 BAM_4121   rpmF TRUE 0.734 130.000 0.007 1.000   NA
 6058027 6058028 BAM_4121 BAM_4122 rpmF   FALSE 0.329 62.000 0.000 NA   NA
 6058029 6058030 BAM_0079 BAM_0078 lysS   TRUE 0.926 160.000 0.021 1.000 Y NA
 6058030 6058031 BAM_0078 BAM_0077     TRUE 0.809 24.000 0.016 1.000 N NA
 6058031 6058032 BAM_0077 BAM_0076   folK FALSE 0.562 -48.000 0.027 1.000 N NA
 6058032 6058033 BAM_0076 BAM_0075 folK folB TRUE 0.956 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 6058033 6058034 BAM_0075 BAM_0074 folB folP TRUE 0.967 1.000 0.176 1.000 Y NA
 6058034 6058035 BAM_0074 BAM_0073 folP pabC TRUE 0.978 2.000 0.519 1.000 Y NA
 6058035 6058036 BAM_0073 BAM_0072 pabC pabA TRUE 0.960 -6.000 0.532 1.000 Y NA
 6058036 6058037 BAM_0072 BAM_0071 pabA pabB TRUE 0.979 6.000 0.452 0.009 Y NA
 6058037 6058038 BAM_0071 BAM_0070 pabB cysK1 TRUE 0.671 221.000 0.107 1.000 Y NA
 6058038 6058039 BAM_0070 BAM_0069 cysK1 hslO TRUE 0.870 105.000 0.053 1.000 N NA
 6058039 6058040 BAM_0069 BAM_0068 hslO   TRUE 0.875 7.000 0.060 1.000 N NA
 6058040 6058041 BAM_0068 BAM_0067   ftsH FALSE 0.306 225.000 0.029 1.000 N NA
 6058041 6058042 BAM_0067 BAM_0066 ftsH hpt FALSE 0.469 86.000 0.000 NA   NA
 6058042 6058043 BAM_0066 BAM_0065 hpt tilS FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058043 6058044 BAM_0065 BAM_0064 tilS spoIIE FALSE 0.278 234.000 0.041 1.000 N NA
 6058044 6058045 BAM_0064 BAM_0063 spoIIE   FALSE 0.060 257.000 0.000 NA   NA
 6058045 6058046 BAM_0063 BAM_0062     FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6058046 6058047 BAM_0062 BAM_0061     FALSE 0.438 160.000 0.000 NA   NA
 6058047 6058048 BAM_0061 BAM_0060   divIC1 TRUE 0.800 88.000 0.134 1.000 N NA
 6058048 6058049 BAM_0060 BAM_0059 divIC1 yabQ FALSE 0.592 -3.000 0.074 NA   NA
 6058049 6058050 BAM_0059 BAM_0058 yabQ yabP TRUE 0.851 -3.000 0.774 NA   NA
 6058050 6058051 BAM_0058 BAM_0057 yabP   FALSE 0.374 59.000 0.108 NA   NA
 6058051 6058052 BAM_0057 BAM_0056     TRUE 0.679 15.000 0.054 1.000   NA
 6058052 6058053 BAM_0056 BAM_0055     TRUE 0.688 13.000 0.058 1.000   NA
 6058053 6058054 BAM_0055 BAM_0054   spoVT FALSE 0.109 231.000 0.147 NA   NA
 6058054 6058055 BAM_0054 BAM_0053 spoVT mfd TRUE 0.962 137.000 0.026 NA Y NA
 6058055 6058056 BAM_0053 BAM_0052 mfd   TRUE 0.637 106.000 0.035 NA   NA
 6058056 6058057 BAM_0052 BAM_0051   spoVC FALSE 0.367 71.000 0.033 NA   NA
 6058057 6058058 BAM_0051 BAM_0050 spoVC prsA TRUE 0.863 10.000 0.010 1.000 N NA
 6058058 6058059 BAM_0050 BAM_0049 prsA gcaD TRUE 0.838 19.000 0.069 1.000 N NA
 6058059 6058060 BAM_0049 BAM_0048 gcaD spoVG FALSE 0.279 323.000 0.014 1.000 Y NA
 6058060 6058061 BAM_0048 BAM_0047 spoVG   TRUE 0.832 153.000 0.377 NA N NA
 6058061 6058062 BAM_0047 BAM_0046     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6058062 6058063 BAM_0046 BAM_0045   purR FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6058063 6058064 BAM_0045 BAM_0044 purR ispE TRUE 0.675 55.000 0.062 1.000 N NA
 6058064 6058065 BAM_0044 BAM_0043 ispE sspF FALSE 0.243 197.000 0.024 1.000   NA
 6058065 6058066 BAM_0043 BAM_0042 sspF   FALSE 0.557 92.000 0.163 NA   NA
 6058066 6058067 BAM_0042 BAM_0041     FALSE 0.096 239.000 0.116 NA   NA
 6058067 6058068 BAM_0041 BAM_0040   ksgA TRUE 0.650 111.000 0.022 NA   NA
 6058068 6058069 BAM_0040 BAM_0039 ksgA   TRUE 0.844 -3.000 0.093 1.000 N NA
 6058069 6058070 BAM_0039 BAM_0038     TRUE 0.669 215.000 0.058 NA Y NA
 6058070 6058071 BAM_0038 BAM_0037   metS TRUE 0.703 166.000 0.221 NA N NA
 6058073 6058074 BAM_0035 BAM_0034     FALSE 0.272 -31.000 0.000 NA   NA
 6058074 6058075 BAM_0034 BAM_0033     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6058075 6058076 BAM_0033 BAM_0032     TRUE 0.780 121.000 0.193 1.000   NA
 6058076 6058077 BAM_0032 BAM_0031     TRUE 0.641 15.000 0.183 NA   NA
 6058077 6058078 BAM_0031 BAM_0030   holB TRUE 0.779 6.000 0.372 NA   NA
 6058078 6058079 BAM_0030 BAM_0029 holB tmk TRUE 0.756 36.000 0.009 0.066 N NA
 6058079 6058080 BAM_0029 BAM_0028 tmk   TRUE 0.873 2.000 0.009 1.000 N NA
 6058080 6058081 BAM_0028 BAM_0027     FALSE 0.559 73.000 0.400 NA   NA
 6058081 6058082 BAM_0027 BAM_0026   rrfB FALSE 0.213 191.000 0.000 NA   NA
 6058082 6058083 BAM_0026 BAM_0025 rrfB rrlB FALSE 0.351 49.000 0.000 NA   NA
 6058085 6058086 BAM_0023 BAM_0022     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6058086 6058087 BAM_0022 BAM_0021   rrsB FALSE 0.519 150.000 0.000 NA   NA
 6058087 6058088 BAM_0021 BAM_0020 rrsB bofA FALSE 0.074 244.000 0.000 NA   NA
 6058088 6058089 BAM_0020 BAM_0019 bofA   FALSE 0.236 215.000 0.417 NA   NA
 6058089 6058090 BAM_0019 BAM_0018   recR FALSE 0.618 15.000 0.071 NA   NA
 6058090 6058091 BAM_0018 BAM_0017 recR   TRUE 0.832 15.000 0.604 NA   NA
 6058091 6058092 BAM_0017 BAM_0016   dnaX FALSE 0.553 23.000 0.071 NA   NA
 6058092 6058093 BAM_0016 BAM_5816 dnaX srpB FALSE 0.262 182.000 0.000 NA   NA
 6058093 6058094 BAM_5816 BAM_0015 srpB   FALSE 0.203 193.000 0.000 NA   NA
 6058094 6058095 BAM_0015 BAM_0014     FALSE 0.413 -10.000 0.004 NA   NA
 6058096 6058097 BAM_0013 BAM_0012     TRUE 0.899 126.000 0.058 1.000 N NA
 6058097 6058098 BAM_0012 BAM_0011     TRUE 0.975 3.000 0.255 0.001 Y NA
 6058099 6058100 BAM_0010 BAM_0009     FALSE 0.371 167.000 0.000 NA   NA
 6058100 6058101 BAM_0009 BAM_0008   serS FALSE 0.461 157.000 0.000 NA   NA
 6058101 6058102 BAM_0008 BAM_0007 serS   FALSE 0.071 328.000 0.010 NA N NA
 6058102 6058103 BAM_0007 BAM_0006     TRUE 0.964 19.000 0.488 NA Y NA
 6058103 6058104 BAM_0006 BAM_0005   dacA TRUE 0.748 161.000 0.017 1.000 N NA
 6058104 6058105 BAM_0005 BAM_0004 dacA guaB TRUE 0.895 105.000 0.304 1.000 N NA
 6058107 6058108 BAM_0002 BAM_0001 rrfA rrlA FALSE 0.351 49.000 0.000 NA   NA
 6058111 6058112 BAM_0441 BAM_0440     FALSE 0.360 168.000 0.000 NA   NA
 6058112 6058113 BAM_0440 BAM_0439     FALSE 0.370 41.000 0.000 NA   NA
 6058114 6058115 BAM_0438 BAM_0437     FALSE 0.005 716.000 0.000 NA   NA
 6058116 6058117 BAM_0436 BAM_0435     FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6058117 6058118 BAM_0435 BAM_0434     FALSE 0.417 34.000 0.000 NA   NA
 6058118 6058119 BAM_0434 BAM_0433     FALSE 0.329 60.000 0.000 NA   NA
 6058119 6058120 BAM_0433 BAM_0432   fumA TRUE 0.904 127.000 0.185 1.000 N NA
 6058120 6058121 BAM_0432 BAM_0431 fumA   FALSE 0.167 207.000 0.093 NA   NA
 6058123 6058124 BAM_0429 BAM_0428   cax FALSE 0.515 82.000 0.212 NA   NA
 6058125 6058126 BAM_0427 BAM_0426     FALSE 0.537 154.000 0.111 NA   NA
 6058126 6058127 BAM_0426 BAM_0425     TRUE 0.676 107.000 0.129 NA   NA
 6058130 6058131 BAM_0422 BAM_0421 sipS1   FALSE 0.116 233.000 0.000 1.000   NA
 6058131 6058132 BAM_0421 BAM_0420     TRUE 0.758 123.000 0.039 1.000   NA
 6058134 6058135 BAM_0418 BAM_0417 yihY   FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 6058135 6058136 BAM_0417 BAM_0416     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6058137 6058138 BAM_0415 BAM_0414     FALSE 0.246 192.000 0.125 NA   NA
 6058139 6058140 BAM_0413 BAM_0412     TRUE 0.840 19.000 0.727 NA   NA
 6058140 6058141 BAM_0412 BAM_0411     TRUE 0.721 110.000 0.256 NA   NA
 6058141 6058142 BAM_0411 BAM_0410     TRUE 0.762 74.000 0.308 1.000 N NA
 6058142 6058143 BAM_0410 BAM_0409     TRUE 0.962 81.000 0.571 0.002 Y NA
 6058143 6058144 BAM_0409 BAM_0408     TRUE 0.963 24.000 0.364 0.002 Y NA
 6058144 6058145 BAM_0408 BAM_0407     TRUE 0.900 129.000 0.145 1.000 N NA
 6058147 6058148 BAM_0405 BAM_0404 proS1   FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 6058149 6058150 BAM_0403 BAM_0402     TRUE 0.660 109.000 0.068 NA   NA
 6058151 6058152 BAM_0401 BAM_0400     TRUE 0.649 13.000 0.143 NA   NA
 6058152 6058153 BAM_0400 BAM_0399     TRUE 0.781 114.000 0.333 NA   NA
 6058153 6058154 BAM_0399 BAM_0398     TRUE 0.675 67.000 0.714 NA   NA
 6058154 6058155 BAM_0398 BAM_0397     FALSE 0.039 283.000 0.000 NA   NA
 6058155 6058156 BAM_0397 BAM_0396     FALSE 0.607 14.000 0.037 NA   NA
 6058156 6058157 BAM_0396 BAM_0395     FALSE 0.635 11.000 0.065 NA   NA
 6058158 6058159 BAM_0394 BAM_0393     FALSE 0.509 25.000 0.000 NA   NA
 6058160 6058161 BAM_0392 BAM_0391     FALSE 0.023 388.000 0.000 0.017   NA
 6058161 6058162 BAM_0391 BAM_0390     TRUE 0.968 -3.000 0.554 NA Y NA
 6058162 6058163 BAM_0390 BAM_0389     TRUE 0.969 -3.000 0.584 NA Y NA
 6058163 6058164 BAM_0389 BAM_0388     FALSE 0.425 -31.000 0.364 NA   NA
 6058164 6058165 BAM_0388 BAM_0387     FALSE 0.055 264.000 0.000 NA   NA
 6058167 6058168 BAM_0385 BAM_0384 thiE thiM TRUE 0.963 17.000 0.061 0.003 Y NA
 6058170 6058171 BAM_0382 BAM_0381     TRUE 0.660 132.000 0.000 NA   NA
 6058171 6058172 BAM_0381 BAM_0380     FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6058172 6058173 BAM_0380 BAM_0379     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6058176 6058177 BAM_0702 BAM_0701   inhA FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 6058177 6058178 BAM_0701 BAM_0700 inhA   FALSE 0.034 317.000 0.000 1.000   NA
 6058178 6058179 BAM_0700 BAM_0699   rbsB TRUE 0.909 35.000 0.032 NA Y NA
 6058179 6058180 BAM_0699 BAM_0698 rbsB rbsC TRUE 0.978 15.000 0.847 NA Y NA
 6058180 6058181 BAM_0698 BAM_0697 rbsC rbsA TRUE 0.977 3.000 0.358 0.001 Y NA
 6058181 6058182 BAM_0697 BAM_0696 rbsA rbsD TRUE 0.957 19.000 0.243 1.000 Y NA
 6058182 6058183 BAM_0696 BAM_0695 rbsD rbsK TRUE 0.956 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 6058183 6058184 BAM_0695 BAM_0694 rbsK rbsR TRUE 0.863 14.000 0.109 1.000 N NA
 6058184 6058185 BAM_0694 BAM_0693 rbsR   FALSE 0.629 138.000 0.000 NA   NA
 6058185 6058186 BAM_0693 BAM_0692     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058186 6058187 BAM_0692 BAM_0691     FALSE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 6058188 6058189 BAM_0690 BAM_0689 glpT   FALSE 0.138 285.000 0.000 1.000 N NA
 6058189 6058190 BAM_0689 BAM_0688     TRUE 0.709 -13.000 0.477 0.002   NA
 6058190 6058191 BAM_0688 BAM_0687     TRUE 0.875 15.000 0.727 1.000   NA
 6058191 6058192 BAM_0687 BAM_0686     TRUE 0.978 19.000 0.727 0.020 Y NA
 6058192 6058193 BAM_0686 BAM_0685     TRUE 0.966 15.000 0.195 0.020 Y NA
 6058194 6058195 BAM_0684 BAM_0683     FALSE 0.113 218.000 0.000 NA   NA
 6058195 6058196 BAM_0683 BAM_0682     TRUE 0.804 66.000 0.615 1.000 N NA
 6058196 6058197 BAM_0682 BAM_0681     TRUE 0.792 158.000 0.778 NA   NA
 6058198 6058199 BAM_0680 BAM_0679     TRUE 0.975 12.000 0.538 1.000 Y NA
 6058202 6058203 BAM_0676 BAM_0675     FALSE 0.259 -34.000 0.000 NA   NA
 6058203 6058204 BAM_0675 BAM_0674     TRUE 0.640 177.000 0.079 1.000 N NA
 6058204 6058205 BAM_0674 BAM_0673     TRUE 0.680 62.000 0.111 1.000 N NA
 6058205 6058206 BAM_0673 BAM_0672     TRUE 0.652 -25.000 0.242 1.000 N NA
 6058206 6058207 BAM_0672 BAM_0671     TRUE 0.764 205.000 0.000 0.039 Y NA
 6058207 6058208 BAM_0671 BAM_0670     TRUE 0.986 1.000 0.947 0.004 Y NA
 6058208 6058209 BAM_0670 BAM_0669     TRUE 0.912 63.000 0.280 0.028 Y NA
 6058209 6058210 BAM_0669 BAM_0668     TRUE 0.969 13.000 0.389 1.000 Y NA
 6058210 6058211 BAM_0668 BAM_0667     TRUE 0.963 11.000 0.093 1.000 Y NA
 6058211 6058212 BAM_0667 BAM_0666     TRUE 0.678 158.000 0.462 NA   NA
 6058212 6058213 BAM_0666 BAM_0665     TRUE 0.688 24.000 0.385 NA   NA
 6058214 6058215 BAM_0664 BAM_0663 gerKA gerKB FALSE 0.625 -19.000 0.412 0.006   NA
 6058215 6058216 BAM_0663 BAM_0662 gerKB gerKC TRUE 0.764 -19.000 0.833 0.006   NA
 6058217 6058218 BAM_0661 BAM_0660 treC treB TRUE 0.977 14.000 0.650 1.000 Y NA
 6058218 6058219 BAM_0660 BAM_0659 treB treR TRUE 0.880 138.000 0.115 1.000 N NA
 6058221 6058222 BAM_0657 BAM_0656     FALSE 0.016 359.000 0.000 NA   NA
 6058222 6058223 BAM_0656 BAM_0655     FALSE 0.451 31.000 0.000 NA   NA
 6058224 6058225 BAM_0654 BAM_0653 cls1   TRUE 0.775 128.000 0.156 1.000   NA
 6058225 6058226 BAM_0653 BAM_0652     TRUE 0.898 4.000 0.822 NA   NA
 6058227 6058228 BAM_0651 BAM_0650     TRUE 0.669 55.000 0.025 1.000 N NA
 6058228 6058229 BAM_0650 BAM_0649     TRUE 0.710 45.000 0.165 1.000 N NA
 6058231 6058232 BAM_0647 BAM_0646     TRUE 0.965 13.000 0.273 1.000 Y NA
 6058232 6058233 BAM_0646 BAM_0645     TRUE 0.964 -3.000 0.273 0.020 Y NA
 6058234 6058235 BAM_0644 BAM_0643     FALSE 0.013 382.000 0.000 NA   NA
 6058236 6058237 BAM_3655 BAM_3654     FALSE 0.526 149.000 0.000 NA   NA
 6058237 6058238 BAM_3654 BAM_3653     TRUE 0.685 32.000 0.500 NA   NA
 6058239 6058240 BAM_3652 BAM_3651     TRUE 0.718 117.000 0.182 NA   NA
 6058241 6058242 BAM_3650 BAM_3649     FALSE 0.398 175.000 0.263 NA   NA
 6058246 6058247 BAM_3645 BAM_3644     FALSE 0.027 339.000 0.000 1.000   NA
 6058247 6058248 BAM_3644 BAM_3643     TRUE 0.850 154.000 0.750 0.048   NA
 6058248 6058249 BAM_3643 BAM_3642     FALSE 0.628 20.000 0.021 1.000   NA
 6058249 6058250 BAM_3642 BAM_3641     TRUE 0.936 -7.000 0.144 1.000 Y NA
 6058250 6058251 BAM_3641 BAM_3640     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6058251 6058252 BAM_3640 BAM_3639     FALSE 0.040 282.000 0.000 NA   NA
 6058252 6058253 BAM_3639 BAM_3638     FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 6058253 6058254 BAM_3638 BAM_3637     FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 6058254 6058255 BAM_3637 BAM_3636     FALSE 0.510 170.000 0.368 NA   NA
 6058255 6058256 BAM_3636 BAM_3635     TRUE 0.733 5.000 0.074 1.000   NA
 6058256 6058257 BAM_3635 BAM_3634     FALSE 0.617 13.000 0.049 NA   NA
 6058257 6058258 BAM_3634 BAM_3633     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6058258 6058259 BAM_3633 BAM_3632     TRUE 0.671 117.000 0.000 NA   NA
 6058259 6058260 BAM_3632 BAM_3631   paiB2 TRUE 0.645 135.000 0.000 NA   NA
 6058261 6058262 BAM_3630 BAM_3629     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058262 6058263 BAM_3629 BAM_3628     FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6058263 6058264 BAM_3628 BAM_3627     FALSE 0.061 256.000 0.000 NA   NA
 6058264 6058265 BAM_3627 BAM_3626     FALSE 0.290 179.000 0.017 NA   NA
 6058265 6058266 BAM_3626 BAM_3625     TRUE 0.860 19.000 0.276 1.000 N NA
 6058267 6058268 BAM_3624 BAM_3623     FALSE 0.006 616.000 0.000 NA   NA
 6058268 6058269 BAM_3623 BAM_3622     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6058269 6058270 BAM_3622 BAM_3621     FALSE 0.223 -494.000 0.000 NA   NA
 6058270 6058271 BAM_3621 BAM_3620     FALSE 0.007 539.000 0.000 NA   NA
 6058272 6058273 BAM_3619 BAM_3618     FALSE 0.528 94.000 0.020 NA   NA
 6058273 6058274 BAM_3618 BAM_3617     TRUE 0.641 -7.000 0.389 NA   NA
 6058275 6058276 BAM_3616 BAM_3615     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6058279 6058280 BAM_3612 BAM_3611 pepF2   TRUE 0.898 117.000 0.113 1.000 N NA
 6058281 6058282 BAM_3610 BAM_3609   amyS FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6058284 6058285 BAM_3607 BAM_3606     FALSE 0.011 399.000 0.000 NA   NA
 6058285 6058286 BAM_3606 BAM_3605     TRUE 0.736 7.000 0.137 1.000   NA
 6058286 6058287 BAM_3605 BAM_3604     TRUE 0.675 163.000 0.467 1.000   NA
 6058289 6058290 BAM_3602 BAM_3601     FALSE 0.031 302.000 0.000 NA   NA
 6058290 6058291 BAM_3601 BAM_3600     TRUE 0.798 18.000 0.545 NA   NA
 6058293 6058294 BAM_3598 BAM_3597     FALSE 0.047 271.000 0.000 NA   NA
 6058294 6058295 BAM_3597 BAM_3596     FALSE 0.069 249.000 0.000 NA   NA
 6058297 6058298 BAM_3594 BAM_3593     TRUE 0.986 1.000 0.909 0.020 Y NA
 6058298 6058299 BAM_3593 BAM_3592     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6058299 6058300 BAM_3592 BAM_3591     FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6058300 6058301 BAM_3591 BAM_3590     FALSE 0.111 219.000 0.000 NA   NA
 6058303 6058304 BAM_3588 BAM_3587     FALSE 0.005 1146.000 0.000 NA   NA
 6058306 6058307 BAM_3585 BAM_3584     FALSE 0.633 16.000 0.178 NA   NA
 6058307 6058308 BAM_3584 BAM_3583     FALSE 0.013 379.000 0.000 NA   NA
 6058309 6058310 BAM_0749 BAM_0750     FALSE 0.623 8.000 0.000 NA   NA
 6058310 6058311 BAM_0750 BAM_0751     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6058311 6058312 BAM_0751 BAM_0752     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6058312 6058313 BAM_0752 BAM_0753     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6058313 6058314 BAM_0753 BAM_0754     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6058314 6058315 BAM_0754 BAM_0755     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6058315 6058316 BAM_0755 BAM_0756     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6058316 6058317 BAM_0756 BAM_0757     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6058317 6058318 BAM_0757 BAM_0758     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6058318 6058319 BAM_0758 BAM_0759     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6058319 6058320 BAM_0759 BAM_0760     FALSE 0.335 55.000 0.000 NA   NA
 6058320 6058321 BAM_0760 BAM_0761     FALSE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 6058321 6058322 BAM_0761 BAM_0762     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6058322 6058323 BAM_0762 BAM_0763     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6058323 6058324 BAM_0763 BAM_0764     FALSE 0.623 8.000 0.000 NA   NA
 6058324 6058325 BAM_0764 BAM_0765     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6058325 6058326 BAM_0765 BAM_0766     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6058326 6058327 BAM_0766 BAM_0768     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6058327 6058328 BAM_0768 BAM_0769     FALSE 0.623 139.000 0.000 NA   NA
 6058328 6058329 BAM_0769 BAM_0770     FALSE 0.034 295.000 0.000 NA   NA
 6058330 6058331 BAM_0771 BAM_0772     TRUE 0.799 15.000 0.500 NA   NA
 6058331 6058332 BAM_0772 BAM_0773     TRUE 0.885 6.000 0.750 NA   NA
 6058333 6058334 BAM_0774 BAM_0775     FALSE 0.620 -31.000 0.145 1.000 N NA
 6058334 6058335 BAM_0775 BAM_0776     TRUE 0.982 0.000 0.826 1.000 Y NA
 6058335 6058336 BAM_0776 BAM_0777     TRUE 0.962 -3.000 0.135 0.020 Y NA
 6058336 6058337 BAM_0777 BAM_0778   tenI TRUE 0.865 11.000 0.054 1.000 N NA
 6058337 6058338 BAM_0778 BAM_0779 tenI thiO TRUE 0.789 -7.000 0.194 1.000 N NA
 6058338 6058339 BAM_0779 BAM_0780 thiO thiS TRUE 0.865 16.000 0.239 1.000 N NA
 6058339 6058340 BAM_0780 BAM_0781 thiS thiG TRUE 0.967 3.000 0.054 1.000 Y NA
 6058340 6058341 BAM_0781 BAM_0782 thiG   TRUE 0.940 -7.000 0.012 0.016 Y NA
 6058341 6058342 BAM_0782 BAM_0783   thiD1 TRUE 0.960 16.000 0.195 1.000 Y NA
 6058342 6058343 BAM_0783 BAM_0784 thiD1   FALSE 0.009 442.000 0.000 NA   NA
 6058343 6058344 BAM_0784 BAM_0785     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6058344 6058345 BAM_0785 BAM_0786     FALSE 0.583 30.000 0.286 NA   NA
 6058345 6058346 BAM_0786 BAM_0787     FALSE 0.018 347.000 0.000 NA   NA
 6058346 6058347 BAM_0787 BAM_0788   kdpA TRUE 0.666 97.000 0.286 NA   NA
 6058347 6058348 BAM_0788 BAM_0789 kdpA kdpB TRUE 0.968 11.000 0.035 0.001 Y NA
 6058348 6058349 BAM_0789 BAM_0790 kdpB kdpC TRUE 0.983 17.000 0.877 0.001 Y NA
 6058349 6058350 BAM_0790 BAM_0791 kdpC kdpD FALSE 0.492 63.000 0.066 0.058   NA
 6058352 6058353 BAM_0793 BAM_0794     TRUE 0.872 129.000 0.500 1.000   NA
 6058353 6058354 BAM_0794 BAM_0795     FALSE 0.504 170.000 0.357 NA   NA
 6058356 6058357 BAM_0797 BAM_0798     FALSE 0.547 67.000 0.438 NA   NA
 6058357 6058358 BAM_0798 BAM_0799     FALSE 0.619 105.000 0.000 NA   NA
 6058359 6058360 BAM_0800 BAM_0801 scrK scrB TRUE 0.956 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 6058360 6058361 BAM_0801 BAM_0802 scrB scrA TRUE 0.956 18.000 0.100 1.000 Y NA
 6058361 6058362 BAM_0802 BAM_0803 scrA scrR TRUE 0.899 129.000 0.113 1.000 N NA
 6058362 6058363 BAM_0803 BAM_0804 scrR   TRUE 0.696 118.000 0.056 NA   NA
 6058363 6058364 BAM_0804 BAM_0805     FALSE 0.422 73.000 0.148 NA   NA
 6058364 6058365 BAM_0805 BAM_0806     TRUE 0.762 13.000 0.073 0.003   NA
 6058365 6058366 BAM_0806 BAM_0807     FALSE 0.434 166.000 0.127 NA   NA
 6058366 6058367 BAM_0807 BAM_0808     TRUE 0.804 118.000 0.364 NA   NA
 6058367 6058368 BAM_0808 BAM_0809     FALSE 0.357 46.000 0.000 NA   NA
 6058368 6058369 BAM_0809 BAM_0810     TRUE 0.681 120.000 0.000 NA   NA
 6058369 6058370 BAM_0810 BAM_0811   gerYC FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6058370 6058371 BAM_0811 BAM_0812 gerYC gerYA TRUE 0.857 84.000 0.867 0.005   NA
 6058371 6058372 BAM_0812 BAM_0813 gerYA   TRUE 0.846 125.000 0.462 NA   NA
 6058373 6058374 BAM_0814 BAM_0815   spoVR TRUE 0.672 116.000 0.019 NA   NA
 6058374 6058375 BAM_0815 BAM_0816 spoVR   FALSE 0.461 -7.000 0.007 NA   NA
 6058375 6058376 BAM_0816 BAM_0817     FALSE 0.305 -22.000 0.000 NA   NA
 6058378 6058379 BAM_0819 BAM_0820     TRUE 0.898 134.000 0.800 NA   NA
 6058379 6058380 BAM_0820 BAM_0821     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6058380 6058381 BAM_0821 BAM_0822     FALSE 0.598 102.000 0.000 NA   NA
 6058381 6058382 BAM_0822 BAM_0823     FALSE 0.275 186.000 0.143 NA   NA
 6058382 6058383 BAM_0823 BAM_0824     FALSE 0.536 89.000 0.127 NA   NA
 6058383 6058384 BAM_0824 BAM_0825     FALSE 0.555 39.000 0.286 1.000   NA
 6058384 6058385 BAM_0825 BAM_0826     FALSE 0.526 36.000 0.207 1.000   NA
 6058385 6058386 BAM_0826 BAM_0827     FALSE 0.409 77.000 0.000 NA   NA
 6058386 6058387 BAM_0827 BAM_0828     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6058387 6058388 BAM_0828 BAM_0829     FALSE 0.329 61.000 0.000 NA   NA
 6058388 6058389 BAM_0829 BAM_0830     FALSE 0.417 34.000 0.000 NA   NA
 6058390 6058391 BAM_0831 BAM_0832     TRUE 0.828 146.000 0.667 NA   NA
 6058394 6058395 BAM_5783 BAM_5782 purA   FALSE 0.623 139.000 0.000 NA   NA
 6058395 6058396 BAM_5782 BAM_5781     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6058396 6058397 BAM_5781 BAM_5780     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6058397 6058398 BAM_5780 BAM_5779     FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 6058398 6058399 BAM_5779 BAM_5778   yycF FALSE 0.011 400.000 0.000 NA   NA
 6058399 6058400 BAM_5778 BAM_5777 yycF yycG TRUE 0.982 4.000 0.597 0.013 Y NA
 6058400 6058401 BAM_5777 BAM_5776 yycG   TRUE 0.804 -3.000 0.575 NA   NA
 6058401 6058402 BAM_5776 BAM_5775     TRUE 0.718 -19.000 0.890 NA   NA
 6058402 6058403 BAM_5775 BAM_5774     FALSE 0.399 -16.000 0.176 NA   NA
 6058403 6058404 BAM_5774 BAM_5773     FALSE 0.422 64.000 0.060 1.000   NA
 6058404 6058405 BAM_5773 BAM_5772     FALSE 0.558 54.000 0.452 NA   NA
 6058405 6058406 BAM_5772 BAM_5771     FALSE 0.338 60.000 0.025 NA   NA
 6058406 6058407 BAM_5771 BAM_5770     FALSE 0.262 182.000 0.004 NA   NA
 6058408 6058409 BAM_5769 BAM_5768   guaC TRUE 0.882 135.000 0.049 1.000 N NA
 6058410 6058411 BAM_5767 BAM_5766     FALSE 0.297 187.000 0.037 1.000   NA
 6058413 6058414 BAM_5764 BAM_5763   galE2 FALSE 0.131 225.000 0.000 1.000   NA
 6058416 6058417 BAM_5761 BAM_5760     TRUE 0.725 109.000 0.073 1.000   NA
 6058419 6058420 BAM_5758 BAM_5757     FALSE 0.058 363.000 0.000 1.000 N NA
 6058422 6058423 BAM_5755 BAM_5754     TRUE 0.928 -22.000 0.538 0.013 Y NA
 6058423 6058424 BAM_5754 BAM_5753     TRUE 0.757 133.000 0.178 1.000   NA
 6058424 6058425 BAM_5753 BAM_5752     TRUE 0.799 35.000 0.869 1.000   NA
 6058425 6058426 BAM_5752 BAM_5751     FALSE 0.023 327.000 0.000 NA   NA
 6058426 6058427 BAM_5751 BAM_5750     FALSE 0.272 -31.000 0.000 NA   NA
 6058427 6058428 BAM_5750 BAM_5749   msrAB FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6058431 6058432 BAM_5746 BAM_5745     FALSE 0.500 37.000 0.091 1.000   NA
 6058434 6058435 BAM_5743 BAM_5742     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6058435 6058436 BAM_5742 BAM_5741     FALSE 0.503 92.000 0.000 NA   NA
 6058436 6058437 BAM_5741 BAM_5740     FALSE 0.200 196.000 0.038 NA   NA
 6058437 6058438 BAM_5740 BAM_5739     FALSE 0.487 29.000 0.038 NA   NA
 6058438 6058439 BAM_5739 BAM_5738     FALSE 0.013 385.000 0.000 NA   NA
 6058441 6058442 BAM_5736 BAM_5735     TRUE 0.759 130.000 0.276 NA   NA
 6058443 6058444 BAM_5734 BAM_5733     FALSE 0.463 79.000 0.075 NA   NA
 6058444 6058445 BAM_5733 BAM_5732     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6058446 6058447 BAM_1482 BAM_1483     FALSE 0.338 68.000 0.000 NA   NA
 6058447 6058448 BAM_1483 BAM_1484     FALSE 0.024 322.000 0.000 NA   NA
 6058448 6058449 BAM_1484 BAM_1485     FALSE 0.099 229.000 0.046 NA   NA
 6058449 6058450 BAM_1485 BAM_1486     FALSE 0.608 51.000 0.514 NA   NA
 6058450 6058451 BAM_1486 BAM_1487     TRUE 0.677 107.000 0.135 NA   NA
 6058451 6058452 BAM_1487 BAM_1488     TRUE 0.649 0.000 0.080 NA   NA
 6058452 6058453 BAM_1488 BAM_1489     TRUE 0.981 -3.000 0.853 0.013 Y NA
 6058453 6058454 BAM_1489 BAM_1490     TRUE 0.684 133.000 0.075 NA   NA
 6058460 6058461 BAM_1496 BAM_1497     TRUE 0.696 115.000 0.092 NA   NA
 6058461 6058462 BAM_1497 BAM_1498   hmp FALSE 0.458 160.000 0.049 NA   NA
 6058465 6058466 BAM_1501 BAM_1502     TRUE 0.774 118.000 0.136 1.000   NA
 6058466 6058467 BAM_1502 BAM_1503     TRUE 0.959 12.000 0.100 NA Y NA
 6058469 6058470 BAM_1505 BAM_1506     FALSE 0.252 196.000 0.250 NA   NA
 6058470 6058471 BAM_1506 BAM_1507     FALSE 0.215 190.000 0.000 NA   NA
 6058471 6058472 BAM_1507 BAM_1508     FALSE 0.430 -9.000 0.000 NA   NA
 6058474 6058475 BAM_1510 BAM_1511     TRUE 0.856 120.000 0.500 NA   NA
 6058475 6058476 BAM_1511 BAM_1512     TRUE 0.814 108.000 0.389 1.000   NA
 6058476 6058477 BAM_1512 BAM_1513   deoD TRUE 0.777 157.000 0.040 1.000 N NA
 6058478 6058479 BAM_1514 BAM_1515     FALSE 0.012 393.000 0.000 NA   NA
 6058481 6058482 BAM_1517 BAM_1518     TRUE 0.729 22.000 0.435 NA   NA
 6058482 6058483 BAM_1518 BAM_1519     TRUE 0.665 106.000 0.101 NA   NA
 6058483 6058484 BAM_1519 BAM_1520     TRUE 0.653 113.000 0.000 NA   NA
 6058484 6058485 BAM_1520 BAM_1521   spmA FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6058485 6058486 BAM_1521 BAM_1522 spmA   TRUE 0.823 -3.000 0.655 NA   NA
 6058486 6058487 BAM_1522 BAM_1523   rluB FALSE 0.040 290.000 0.063 NA   NA
 6058487 6058488 BAM_1523 BAM_1524 rluB resA TRUE 0.826 95.000 0.069 1.000 N NA
 6058488 6058489 BAM_1524 BAM_1525 resA resB TRUE 0.974 122.000 0.306 NA Y NA
 6058489 6058490 BAM_1525 BAM_1526 resB resC TRUE 0.960 15.000 0.278 NA Y NA
 6058490 6058491 BAM_1526 BAM_1527 resC resD FALSE 0.194 266.000 0.178 1.000 N NA
 6058491 6058492 BAM_1527 BAM_1528 resD resE TRUE 0.976 0.000 0.511 1.000 Y NA
 6058492 6058493 BAM_1528 BAM_1529 resE   TRUE 0.769 137.000 0.046 0.064   NA
 6058493 6058494 BAM_1529 BAM_1531     FALSE 0.466 85.000 0.000 NA   NA
 6058496 6058497 BAM_3856 BAM_3857     FALSE 0.342 69.000 0.000 NA   NA
 6058497 6058498 BAM_3857 BAM_3858     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6058498 6058499 BAM_3858 BAM_3859     FALSE 0.526 149.000 0.000 NA   NA
 6058499 6058500 BAM_3859 BAM_3860     FALSE 0.006 580.000 0.000 NA   NA
 6058500 6058501 BAM_3860 BAM_3861     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6058501 6058502 BAM_3861 BAM_3862     FALSE 0.017 354.000 0.000 NA   NA
 6058502 6058503 BAM_3862 BAM_3863     FALSE 0.262 182.000 0.000 NA   NA
 6058503 6058504 BAM_3863 BAM_3864     FALSE 0.040 282.000 0.000 NA   NA
 6058504 6058505 BAM_3864 BAM_3865     FALSE 0.329 62.000 0.000 NA   NA
 6058505 6058506 BAM_3865 BAM_3866     FALSE 0.132 211.000 0.000 NA   NA
 6058506 6058507 BAM_3866 BAM_3867     FALSE 0.628 32.000 0.400 NA   NA
 6058509 6058510 BAM_3869 BAM_3870     FALSE 0.277 232.000 0.000 1.000 N NA
 6058510 6058511 BAM_3870 BAM_3871     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6058511 6058512 BAM_3871 BAM_3872     FALSE 0.532 95.000 0.000 NA   NA
 6058512 6058513 BAM_3872 BAM_3873     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6058513 6058514 BAM_3873 BAM_3874     TRUE 0.780 -3.000 0.500 NA   NA
 6058514 6058515 BAM_3874 BAM_3875     TRUE 0.830 18.000 0.667 NA   NA
 6058515 6058516 BAM_3875 BAM_3876     FALSE 0.407 47.000 0.158 NA   NA
 6058516 6058517 BAM_3876 BAM_3877     FALSE 0.613 -3.000 0.158 NA   NA
 6058517 6058518 BAM_3877 BAM_3878     TRUE 0.676 14.000 0.250 NA   NA
 6058518 6058519 BAM_3878 BAM_3879     TRUE 0.646 -3.000 0.250 NA   NA
 6058519 6058520 BAM_3879 BAM_3880     TRUE 0.640 15.000 0.143 NA   NA
 6058520 6058521 BAM_3880 BAM_3881     TRUE 0.675 71.000 0.667 NA   NA
 6058521 6058522 BAM_3881 BAM_3882     TRUE 0.793 -10.000 1.000 NA   NA
 6058522 6058523 BAM_3882 BAM_3883     TRUE 0.845 0.000 0.600 NA   NA
 6058523 6058524 BAM_3883 BAM_3884     FALSE 0.634 109.000 0.000 NA   NA
 6058524 6058525 BAM_3884 BAM_3885     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058526 6058527 BAM_3886 BAM_3887     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6058527 6058528 BAM_3887 BAM_3888     TRUE 0.840 16.000 0.667 NA   NA
 6058528 6058529 BAM_3888 BAM_3889     FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 6058529 6058530 BAM_3889 BAM_3890     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6058531 6058532 BAM_3891 BAM_3892 glnA glnR TRUE 0.785 49.000 0.481 1.000 N NA
 6058532 6058533 BAM_3892 BAM_3893 glnR   TRUE 0.654 176.000 0.138 1.000 N NA
 6058533 6058534 BAM_3893 BAM_3894     FALSE 0.561 -7.000 0.065 1.000   NA
 6058535 6058536 BAM_3895 BAM_3896     FALSE 0.607 100.000 0.065 NA   NA
 6058538 6058539 BAM_3898 BAM_3899     TRUE 0.709 114.000 0.200 NA   NA
 6058540 6058541 BAM_3900 BAM_3901 hfq2 miaA TRUE 0.651 22.000 0.192 1.000   NA
 6058543 6058544 BAM_3903 BAM_3904     FALSE 0.065 348.000 0.000 1.000 N NA
 6058544 6058545 BAM_3904 BAM_3905   fruB TRUE 0.980 14.000 0.816 1.000 Y NA
 6058545 6058546 BAM_3905 BAM_3906 fruB   TRUE 0.975 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 6058546 6058547 BAM_3906 BAM_3907     FALSE 0.438 160.000 0.000 NA   NA
 6058547 6058548 BAM_3907 BAM_3908     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058548 6058549 BAM_3908 BAM_3909     TRUE 0.671 117.000 0.000 NA   NA
 6058549 6058550 BAM_3909 BAM_3910     FALSE 0.312 179.000 0.072 NA   NA
 6058550 6058551 BAM_3910 BAM_3911     TRUE 0.829 20.000 0.700 NA   NA
 6058551 6058552 BAM_3911 BAM_3912   gabP TRUE 0.799 112.000 0.400 NA   NA
 6058553 6058554 BAM_3913 BAM_3914 chi36   FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 6058555 6058556 BAM_3915 BAM_3916     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6058560 6058561 BAM_5578 BAM_5579     TRUE 0.972 16.000 0.429 0.063 Y NA
 6058561 6058562 BAM_5579 BAM_5580     TRUE 0.956 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 6058562 6058563 BAM_5580 BAM_5581     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 6058563 6058564 BAM_5581 BAM_5582     FALSE 0.488 154.000 0.000 NA   NA
 6058564 6058565 BAM_5582 BAM_5583     FALSE 0.348 50.000 0.000 NA   NA
 6058565 6058566 BAM_5583 BAM_5584     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058566 6058567 BAM_5584 BAM_5585     FALSE 0.065 253.000 0.000 NA   NA
 6058567 6058568 BAM_5585 BAM_5586     TRUE 0.861 -49.000 0.171 0.008 Y NA
 6058568 6058569 BAM_5586 BAM_5587   mbl FALSE 0.122 294.000 0.000 1.000 N NA
 6058569 6058570 BAM_5587 BAM_5588 mbl spoIIID FALSE 0.532 162.000 0.284 NA   NA
 6058570 6058571 BAM_5588 BAM_5589 spoIIID   FALSE 0.042 279.000 0.000 NA   NA
 6058571 6058572 BAM_5589 BAM_5590     FALSE 0.469 156.000 0.000 NA   NA
 6058572 6058573 BAM_5590 BAM_5591     FALSE 0.597 142.000 0.000 NA   NA
 6058573 6058574 BAM_5591 BAM_5592     FALSE 0.415 162.000 0.000 NA   NA
 6058574 6058575 BAM_5592 BAM_5593     TRUE 0.852 0.000 0.636 NA   NA
 6058575 6058576 BAM_5593 BAM_5594     FALSE 0.262 182.000 0.000 NA   NA
 6058576 6058577 BAM_5594 BAM_5595     FALSE 0.466 85.000 0.000 NA   NA
 6058577 6058578 BAM_5595 BAM_5596   spoIID TRUE 0.678 128.000 0.000 NA   NA
 6058578 6058579 BAM_5596 BAM_5597 spoIID murA1 FALSE 0.434 208.000 0.243 1.000 N NA
 6058579 6058580 BAM_5597 BAM_5598 murA1   FALSE 0.533 40.000 0.346 NA   NA
 6058580 6058581 BAM_5598 BAM_5599     FALSE 0.409 52.000 0.228 NA   NA
 6058581 6058582 BAM_5599 BAM_5600   nuoN FALSE 0.016 366.000 0.047 NA   NA
 6058582 6058583 BAM_5600 BAM_5601 nuoN nuoM TRUE 0.973 2.000 0.128 0.001 Y NA
 6058583 6058584 BAM_5601 BAM_5602 nuoM nuoL TRUE 0.961 -3.000 0.041 0.001 Y NA
 6058584 6058585 BAM_5602 BAM_5603 nuoL nuoK TRUE 0.948 30.000 0.253 0.002 Y NA
 6058585 6058586 BAM_5603 BAM_5604 nuoK nuoJ TRUE 0.962 -7.000 0.506 0.001 Y NA
 6058586 6058587 BAM_5604 BAM_5605 nuoJ nuoI TRUE 0.963 -3.000 0.223 0.002 Y NA
 6058587 6058588 BAM_5605 BAM_5606 nuoI nuoH TRUE 0.951 26.000 0.035 0.002 Y NA
 6058588 6058589 BAM_5606 BAM_5607 nuoH nuoD TRUE 0.972 0.000 0.258 0.002 Y NA
 6058589 6058590 BAM_5607 BAM_5608 nuoD   TRUE 0.972 5.000 0.030 0.002 Y NA
 6058590 6058591 BAM_5608 BAM_5609   nuoB TRUE 0.962 -3.000 0.095 0.001 Y NA
 6058591 6058592 BAM_5609 BAM_5610 nuoB nuoA TRUE 0.938 -9.000 0.091 0.001 Y NA
 6058594 6058595 BAM_5612 BAM_5613     FALSE 0.622 48.000 0.538 NA   NA
 6058595 6058596 BAM_5613 BAM_5614     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6058596 6058597 BAM_5614 BAM_5615     FALSE 0.478 155.000 0.000 NA   NA
 6058600 6058601 BAM_5379 BAM_5380     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6058601 6058602 BAM_5380 BAM_5381     FALSE 0.246 -43.000 0.000 NA   NA
 6058602 6058603 BAM_5381 BAM_5382     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6058603 6058604 BAM_5382 BAM_5383     FALSE 0.010 429.000 0.000 NA   NA
 6058604 6058605 BAM_5383 BAM_5384     TRUE 0.716 110.000 0.250 NA   NA
 6058605 6058606 BAM_5384 BAM_5385     TRUE 0.712 17.000 0.250 1.000   NA
 6058607 6058608 BAM_5386 BAM_5387     FALSE 0.009 436.000 0.000 NA   NA
 6058608 6058609 BAM_5387 BAM_5388     FALSE 0.497 45.000 0.310 NA   NA
 6058610 6058611 BAM_5389 BAM_5390 tyrS2 murB2 FALSE 0.057 365.000 0.000 1.000 N NA
 6058611 6058612 BAM_5390 BAM_5391 murB2   FALSE 0.017 389.000 0.000 1.000   NA
 6058612 6058613 BAM_5391 BAM_5392     FALSE 0.486 167.000 0.107 1.000   NA
 6058613 6058614 BAM_5392 BAM_5393     FALSE 0.539 26.000 0.083 NA   NA
 6058615 6058616 BAM_5394 BAM_5395     TRUE 0.962 -3.000 0.229 0.057 Y NA
 6058617 6058618 BAM_5396 BAM_5397     TRUE 0.741 79.000 0.667 NA   NA
 6058618 6058619 BAM_5397 BAM_5398   speG FALSE 0.465 158.000 0.027 NA   NA
 6058619 6058620 BAM_5398 BAM_5399 speG   TRUE 0.665 144.000 0.034 1.000   NA
 6058620 6058621 BAM_5399 BAM_5400     FALSE 0.525 50.000 0.385 NA   NA
 6058623 6058624 BAM_5402 BAM_5403     TRUE 0.978 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 6058624 6058625 BAM_5403 BAM_5404     TRUE 0.981 -3.000 0.870 0.020 Y NA
 6058625 6058626 BAM_5404 BAM_5405     TRUE 0.954 20.000 0.150 1.000 Y NA
 6058626 6058627 BAM_5405 BAM_5406     FALSE 0.039 415.000 0.000 1.000 N NA
 6058627 6058628 BAM_5406 BAM_5815   ssrA FALSE 0.011 408.000 0.000 NA   NA
 6058628 6058629 BAM_5815 BAM_5408 ssrA smpB TRUE 0.681 127.000 0.000 NA   NA
 6058631 6058632 BAM_5410 BAM_5411 vacB estA TRUE 0.680 143.000 0.060 1.000   NA
 6058632 6058633 BAM_5411 BAM_5412 estA secG FALSE 0.536 159.000 0.032 1.000   NA
 6058633 6058634 BAM_5412 BAM_5413 secG   FALSE 0.532 95.000 0.000 NA   NA
 6058634 6058635 BAM_5413 BAM_5414     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058637 6058638 BAM_5416 BAM_5417     FALSE 0.248 -42.000 0.000 NA   NA
 6058638 6058639 BAM_5417 BAM_5418     FALSE 0.455 158.000 0.000 NA   NA
 6058639 6058640 BAM_5418 BAM_5419     TRUE 0.643 111.000 0.000 NA   NA
 6058640 6058641 BAM_5419 BAM_5420     FALSE 0.229 -105.000 0.000 NA   NA
 6058641 6058642 BAM_5420 BAM_5421     FALSE 0.279 -28.000 0.000 NA   NA
 6058642 6058643 BAM_5421 BAM_5422     FALSE 0.322 173.000 0.000 NA   NA
 6058646 6058647 BAM_5541 BAM_5542 dat2   FALSE 0.132 211.000 0.000 NA   NA
 6058647 6058648 BAM_5542 BAM_5544     FALSE 0.018 346.000 0.000 NA   NA
 6058648 6058649 BAM_5544 BAM_5545     FALSE 0.007 530.000 0.000 NA   NA
 6058649 6058650 BAM_5545 BAM_5546     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058651 6058652 BAM_5547 BAM_5548   opuD2 FALSE 0.077 241.000 0.000 NA   NA
 6058653 6058654 BAM_5549 BAM_5550     TRUE 0.804 80.000 0.889 NA   NA
 6058655 6058656 BAM_5551 BAM_5552     TRUE 0.861 14.000 0.727 NA   NA
 6058656 6058657 BAM_5552 BAM_5553     TRUE 0.885 6.000 0.750 NA   NA
 6058658 6058659 BAM_5554 BAM_5555     FALSE 0.618 -16.000 0.458 1.000   NA
 6058661 6058662 BAM_5557 BAM_5558     FALSE 0.495 56.000 0.361 NA   NA
 6058665 6058666 BAM_5561 BAM_5562     FALSE 0.111 219.000 0.000 NA   NA
 6058666 6058667 BAM_5562 BAM_5563     TRUE 0.894 114.000 0.750 NA   NA
 6058667 6058668 BAM_5563 BAM_5564     TRUE 0.929 -12.000 0.333 1.000 Y NA
 6058668 6058669 BAM_5564 BAM_5565     TRUE 0.900 -3.000 0.500 1.000 N NA
 6058670 6058671 BAM_5566 BAM_5567     TRUE 0.684 1.000 0.211 NA   NA
 6058672 6058673 BAM_5568 BAM_5569     TRUE 0.836 20.000 0.273 NA N NA
 6058673 6058674 BAM_5569 BAM_5570     TRUE 0.860 -3.000 0.818 NA   NA
 6058674 6058675 BAM_5570 BAM_5571     FALSE 0.628 67.000 0.600 NA   NA
 6058675 6058676 BAM_5571 BAM_5572     TRUE 0.976 12.000 0.600 1.000 Y NA
 6058676 6058677 BAM_5572 BAM_5573   galE1 TRUE 0.945 128.000 0.600 1.000 N NA
 6058677 6058678 BAM_5573 BAM_5574 galE1 lytR FALSE 0.609 178.000 0.200 NA N NA
 6058678 6058679 BAM_5574 BAM_5575 lytR   FALSE 0.005 948.000 0.000 NA   NA
 6058681 6058682 BAM_0719 BAM_0720     FALSE 0.306 182.000 0.171 NA   NA
 6058683 6058684 BAM_0721 BAM_0722     TRUE 0.908 132.000 0.750 1.000   NA
 6058684 6058685 BAM_0722 BAM_0723     TRUE 0.786 5.000 0.375 NA   NA
 6058686 6058687 BAM_0724 BAM_0725     TRUE 0.639 15.000 0.125 NA   NA
 6058687 6058688 BAM_0725 BAM_0726     FALSE 0.516 90.000 0.062 NA   NA
 6058688 6058689 BAM_0726 BAM_0727   qoxD FALSE 0.353 222.000 0.000 0.038 N NA
 6058689 6058690 BAM_0727 BAM_0728 qoxD qoxC TRUE 0.984 1.000 0.959 1.000 Y NA
 6058690 6058691 BAM_0728 BAM_0729 qoxC qoxB TRUE 0.984 14.000 0.957 0.021 Y NA
 6058691 6058692 BAM_0729 BAM_0730 qoxB qoxA TRUE 0.936 34.000 0.234 0.004 Y NA
 6058692 6058693 BAM_0730 BAM_0731 qoxA   FALSE 0.040 282.000 0.000 NA   NA
 6058694 6058695 BAM_0732 BAM_0733     TRUE 0.889 133.000 0.727 NA   NA
 6058695 6058696 BAM_0733 BAM_0734     TRUE 0.739 2.000 0.286 NA   NA
 6058696 6058697 BAM_0734 BAM_0735     TRUE 0.780 -3.000 0.500 NA   NA
 6058697 6058698 BAM_0735 BAM_0736   gerLA TRUE 0.815 112.000 0.353 1.000   NA
 6058698 6058699 BAM_0736 BAM_0737 gerLA gerLB TRUE 0.907 1.000 0.706 0.005   NA
 6058699 6058700 BAM_0737 BAM_0738 gerLB gerLC FALSE 0.562 -16.000 0.235 0.005   NA
 6058700 6058701 BAM_0738 BAM_0739 gerLC   TRUE 0.809 12.000 0.500 NA   NA
 6058702 6058703 BAM_0740 BAM_0741     TRUE 0.673 -22.000 0.556 0.002   NA
 6058703 6058704 BAM_0741 BAM_0742     TRUE 0.702 -3.000 0.250 1.000   NA
 6058705 6058706 BAM_0743 BAM_0744     TRUE 0.898 68.000 0.206 1.000 Y NA
 6058706 6058707 BAM_0744 BAM_0745     TRUE 0.987 3.000 0.907 0.001 Y NA
 6058707 6058708 BAM_0745 BAM_0746     FALSE 0.248 186.000 0.048 NA   NA
 6058711 6058712 BAM_5784 BAM_5785   rplI TRUE 0.795 28.000 0.064 1.000 N NA
 6058712 6058713 BAM_5785 BAM_5786 rplI   TRUE 0.836 -3.000 0.020 1.000 N NA
 6058713 6058714 BAM_5786 BAM_5787     FALSE 0.482 79.000 0.116 NA   NA
 6058714 6058715 BAM_5787 BAM_5788   rpsR FALSE 0.450 78.000 0.069 NA   NA
 6058715 6058716 BAM_5788 BAM_5789 rpsR ssb1 TRUE 0.689 46.000 0.015 1.000 N NA
 6058716 6058717 BAM_5789 BAM_5790 ssb1 rpsF TRUE 0.837 18.000 0.015 1.000 N NA
 6058717 6058718 BAM_5790 BAM_5791 rpsF ychF TRUE 0.811 192.000 0.029 1.000 Y NA
 6058718 6058719 BAM_5791 BAM_5792 ychF   TRUE 0.690 116.000 0.064 NA   NA
 6058719 6058720 BAM_5792 BAM_5793     FALSE 0.591 21.000 0.171 NA   NA
 6058722 6058723 BAM_5795 BAM_5796 spo0J soj TRUE 0.901 -7.000 0.827 1.000 N NA
 6058723 6058724 BAM_5796 BAM_5797 soj   FALSE 0.530 191.000 0.069 1.000 N NA
 6058724 6058725 BAM_5797 BAM_5798   gidB TRUE 0.873 105.000 0.089 1.000 N NA
 6058725 6058726 BAM_5798 BAM_5799 gidB gidA2 TRUE 0.882 22.000 0.466 1.000 N NA
 6058726 6058727 BAM_5799 BAM_5800 gidA2 trmE FALSE 0.518 47.000 0.266 1.000   NA
 6058727 6058728 BAM_5800 BAM_5801 trmE jag FALSE 0.148 227.000 0.116 1.000   NA
 6058728 6058729 BAM_5801 BAM_5802 jag spoIIIJ2 TRUE 0.660 -3.000 0.071 1.000   NA
 6058729 6058730 BAM_5802 BAM_5803 spoIIIJ2 rnpA TRUE 0.705 40.000 0.025 1.000 N NA
 6058730 6058731 BAM_5803 BAM_5804 rnpA rpmH TRUE 0.788 77.000 0.787 1.000   NA
 6058732 6058733 BAM_5805 BAM_5806 dnaA dnaN1 TRUE 0.888 179.000 0.328 1.000 Y NA
 6058733 6058734 BAM_5806 BAM_5807 dnaN1   TRUE 0.770 128.000 0.103 1.000   NA
 6058734 6058735 BAM_5807 BAM_5808   recF TRUE 0.714 13.000 0.209 1.000   NA
 6058735 6058736 BAM_5808 BAM_5809 recF gyrB TRUE 0.927 39.000 0.249 0.002 Y NA
 6058736 6058737 BAM_5809 BAM_5810 gyrB gyrA TRUE 0.956 89.000 0.306 0.001 Y NA
 6058737 6058738 BAM_5810 BAM_5811 gyrA rrsA FALSE 0.050 269.000 0.000 NA   NA
 6058741 6058742 BAM_3775 BAM_3776     TRUE 0.704 -3.000 0.333 NA   NA
 6058742 6058743 BAM_3776 BAM_3777     FALSE 0.364 -58.000 0.333 NA   NA
 6058744 6058745 BAM_3778 BAM_3779     TRUE 0.669 104.000 0.211 NA   NA
 6058748 6058749 BAM_3782 BAM_3783     FALSE 0.142 208.000 0.000 NA   NA
 6058751 6058752 BAM_3785 BAM_3786   ccdA2 TRUE 0.939 91.000 0.200 NA Y NA
 6058752 6058753 BAM_3786 BAM_3787 ccdA2   FALSE 0.156 204.000 0.000 NA   NA
 6058753 6058754 BAM_3787 BAM_3788     FALSE 0.033 297.000 0.000 NA   NA
 6058755 6058756 BAM_3789 BAM_3790     TRUE 0.878 -3.000 0.840 1.000   NA
 6058757 6058758 BAM_3791 BAM_3792     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058760 6058761 BAM_3794 BAM_3795     FALSE 0.393 -12.000 0.000 NA   NA
 6058761 6058762 BAM_3795 BAM_3796     FALSE 0.329 61.000 0.000 NA   NA
 6058762 6058763 BAM_3796 BAM_3797     FALSE 0.543 165.000 0.333 NA   NA
 6058763 6058764 BAM_3797 BAM_3798     FALSE 0.247 192.000 0.154 NA   NA
 6058764 6058765 BAM_3798 BAM_3799     FALSE 0.528 70.000 0.389 NA   NA
 6058765 6058766 BAM_3799 BAM_3800     TRUE 0.688 119.000 0.028 NA   NA
 6058766 6058767 BAM_3800 BAM_3801     TRUE 0.986 0.000 0.911 0.003 Y NA
 6058767 6058768 BAM_3801 BAM_3802     TRUE 0.685 124.000 0.000 NA   NA
 6058769 6058770 BAM_3826 BAM_3827     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6058770 6058771 BAM_3827 BAM_3828     TRUE 0.648 112.000 0.000 NA   NA
 6058771 6058772 BAM_3828 BAM_3829     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6058772 6058773 BAM_3829 BAM_3830     FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 6058773 6058774 BAM_3830 BAM_3831     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058774 6058775 BAM_3831 BAM_3832     FALSE 0.329 63.000 0.000 NA   NA
 6058775 6058776 BAM_3832 BAM_3833     FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 6058776 6058777 BAM_3833 BAM_3834     FALSE 0.052 266.000 0.000 NA   NA
 6058777 6058778 BAM_3834 BAM_3835     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6058778 6058779 BAM_3835 BAM_3836     TRUE 0.688 5.000 0.111 NA   NA
 6058779 6058780 BAM_3836 BAM_3837     TRUE 0.673 1.000 0.111 NA   NA
 6058780 6058781 BAM_3837 BAM_3838     TRUE 0.874 -3.000 1.000 NA   NA
 6058781 6058782 BAM_3838 BAM_3839     TRUE 0.823 -7.000 1.000 NA   NA
 6058782 6058783 BAM_3839 BAM_3840     TRUE 0.874 -3.000 1.000 NA   NA
 6058783 6058784 BAM_3840 BAM_3841     TRUE 0.907 3.000 1.000 NA   NA
 6058784 6058785 BAM_3841 BAM_3842     TRUE 0.778 37.000 1.000 NA   NA
 6058785 6058786 BAM_3842 BAM_3843     FALSE 0.623 14.000 0.071 NA   NA
 6058786 6058787 BAM_3843 BAM_3844     FALSE 0.283 -34.000 0.071 NA   NA
 6058787 6058788 BAM_3844 BAM_3845     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6058788 6058789 BAM_3845 BAM_3846     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6058789 6058790 BAM_3846 BAM_3847     TRUE 0.771 166.000 1.000 NA   NA
 6058791 6058792 BAM_3848 BAM_3849     FALSE 0.046 272.000 0.000 NA   NA
 6058793 6058794 BAM_3850 BAM_3851     TRUE 0.683 121.000 0.000 NA   NA
 6058794 6058795 BAM_3851 BAM_3852     FALSE 0.619 -31.000 0.750 NA   NA
 6058795 6058796 BAM_3852 BAM_3853     FALSE 0.011 403.000 0.000 NA   NA
 6058796 6058797 BAM_3853 BAM_3854     TRUE 0.662 115.000 0.000 NA   NA
 6058798 6058799 BAM_3772 BAM_3771   hutH FALSE 0.619 105.000 0.000 NA   NA
 6058799 6058800 BAM_3771 BAM_3770 hutH hutU TRUE 0.961 24.000 0.315 0.001 Y NA
 6058800 6058801 BAM_3770 BAM_3769 hutU hutI TRUE 0.865 13.000 0.110 1.000 N NA
 6058801 6058802 BAM_3769 BAM_3768 hutI hutG TRUE 0.667 -21.000 0.171 1.000 N NA
 6058802 6058803 BAM_3768 BAM_3767 hutG   FALSE 0.235 247.000 0.000 1.000 N NA
 6058803 6058804 BAM_3767 BAM_3766     FALSE 0.024 582.000 0.000 1.000 N NA
 6058804 6058805 BAM_3766 BAM_3765     TRUE 0.757 68.000 0.412 1.000 N NA
 6058805 6058806 BAM_3765 BAM_3764     FALSE 0.382 288.000 0.000 1.000 Y NA
 6058806 6058807 BAM_3764 BAM_3763     FALSE 0.233 342.000 0.000 1.000 Y NA
 6058807 6058808 BAM_3763 BAM_3762     FALSE 0.630 25.000 0.175 1.000   NA
 6058812 6058813 BAM_3758 BAM_3757     TRUE 0.741 16.000 0.286 1.000   NA
 6058813 6058814 BAM_3757 BAM_3756     FALSE 0.595 18.000 0.073 NA   NA
 6058817 6058818 BAM_3753 BAM_3752     FALSE 0.531 172.000 0.429 NA   NA
 6058819 6058820 BAM_3751 BAM_3750     TRUE 0.662 115.000 0.000 NA   NA
 6058820 6058821 BAM_3750 BAM_3749   alkK FALSE 0.013 381.000 0.000 NA   NA
 6058822 6058823 BAM_0100 BAM_0099 rplK nusG TRUE 0.836 168.000 0.681 1.000 N NA
 6058823 6058824 BAM_0099 BAM_0098 nusG secE TRUE 0.939 143.000 0.843 1.000 N NA
 6058824 6058825 BAM_0098 BAM_0097 secE rpmG1 FALSE 0.534 33.000 0.080 1.000   NA
 6058825 6058826 BAM_0097 BAM_0096 rpmG1 sigH TRUE 0.798 132.000 0.282 1.000   NA
 6058826 6058827 BAM_0096 BAM_0095 sigH   FALSE 0.500 68.000 0.361 NA   NA
 6058827 6058828 BAM_0095 BAM_0094     TRUE 0.688 4.000 0.109 NA   NA
 6058828 6058829 BAM_0094 BAM_0093     TRUE 0.748 -3.000 0.150 0.002   NA
 6058829 6058830 BAM_0093 BAM_0092   cysS TRUE 0.745 3.000 0.129 1.000   NA
 6058830 6058831 BAM_0092 BAM_0091 cysS cysE TRUE 0.703 -19.000 0.039 0.023 N NA
 6058831 6058832 BAM_0091 BAM_0090 cysE gltX FALSE 0.036 433.000 0.008 1.000 N NA
 6058832 6058833 BAM_0090 BAM_0089 gltX ispF TRUE 0.704 72.000 0.076 1.000 N NA
 6058833 6058834 BAM_0089 BAM_0088 ispF ispD TRUE 0.977 115.000 0.419 1.000 Y NA
 6058834 6058835 BAM_0088 BAM_0087 ispD   FALSE 0.619 17.000 0.108 NA   NA
 6058835 6058836 BAM_0087 BAM_0086     FALSE 0.465 161.000 0.088 NA   NA
 6058836 6058837 BAM_0086 BAM_0085   radA TRUE 0.692 4.000 0.126 NA   NA
 6058837 6058838 BAM_0085 BAM_0084 radA   TRUE 0.959 97.000 0.062 0.006 Y NA
 6058838 6058839 BAM_0084 BAM_0083     TRUE 0.872 23.000 0.425 1.000 N NA
 6058839 6058840 BAM_0083 BAM_0082     TRUE 0.911 5.000 0.848 1.000   NA
 6058840 6058841 BAM_0082 BAM_0081   ctsR TRUE 0.640 174.000 0.681 NA   NA
 6058841 6058842 BAM_0081 BAM_0080 ctsR rrfC FALSE 0.146 207.000 0.000 NA   NA
 6058844 6058845 BAM_0836 BAM_0837     FALSE 0.491 73.000 0.149 1.000   NA
 6058845 6058846 BAM_0837 BAM_0838   celC1 TRUE 0.909 112.000 0.149 0.003 N NA
 6058846 6058847 BAM_0838 BAM_0839 celC1 celA1 TRUE 0.985 2.000 0.778 0.003 Y NA
 6058847 6058848 BAM_0839 BAM_0840 celA1 celB1 TRUE 0.963 83.000 0.583 0.003 Y NA
 6058848 6058849 BAM_0840 BAM_0841 celB1   FALSE 0.579 -24.000 0.583 NA   NA
 6058849 6058850 BAM_0841 BAM_0842     TRUE 0.739 -10.000 0.700 NA   NA
 6058851 6058852 BAM_0843 BAM_0844     FALSE 0.024 571.000 0.000 1.000 N NA
 6058852 6058853 BAM_0844 BAM_0845     TRUE 0.959 -12.000 0.889 1.000 Y NA
 6058853 6058854 BAM_0845 BAM_0846     TRUE 0.935 -3.000 0.889 1.000 N NA
 6058855 6058856 BAM_0847 BAM_0848     TRUE 0.666 116.000 0.000 NA   NA
 6058856 6058857 BAM_0848 BAM_0849     FALSE 0.462 30.000 0.000 NA   NA
 6058857 6058858 BAM_0849 BAM_0850     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6058860 6058861 BAM_0874 BAM_0873     FALSE 0.351 49.000 0.000 NA   NA
 6058861 6058862 BAM_0873 BAM_0872     TRUE 0.711 25.000 0.344 1.000   NA
 6058862 6058863 BAM_0872 BAM_0871     TRUE 0.678 156.000 0.156 0.001   NA
 6058863 6058864 BAM_0871 BAM_0870     FALSE 0.561 30.000 0.259 NA   NA
 6058864 6058865 BAM_0870 BAM_0869     TRUE 0.908 126.000 0.778 NA   NA
 6058867 6058868 BAM_0867 BAM_0866     TRUE 0.823 13.000 0.556 NA   NA
 6058868 6058869 BAM_0866 BAM_0865     FALSE 0.630 80.000 0.400 NA   NA
 6058869 6058870 BAM_0865 BAM_0864     FALSE 0.037 289.000 0.000 NA   NA
 6058870 6058871 BAM_0864 BAM_0863     FALSE 0.226 -162.000 0.000 NA   NA
 6058871 6058872 BAM_0863 BAM_0862     FALSE 0.348 70.000 0.000 NA   NA
 6058872 6058873 BAM_0862 BAM_0861     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6058873 6058874 BAM_0861 BAM_0860     TRUE 0.815 21.000 0.667 NA   NA
 6058874 6058875 BAM_0860 BAM_0859     TRUE 0.819 105.000 0.500 NA   NA
 6058875 6058876 BAM_0859 BAM_0858     TRUE 0.757 11.000 0.368 NA   NA
 6058878 6058879 BAM_0856 BAM_0855     TRUE 0.680 15.000 0.259 NA   NA
 6058880 6058881 BAM_0854 BAM_0853 cotJA cotJB TRUE 0.828 9.000 0.516 NA   NA
 6058881 6058882 BAM_0853 BAM_0852 cotJB cotJC FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6058883 6058884 BAM_3803 BAM_3804     FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 6058884 6058885 BAM_3804 BAM_3805     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6058885 6058886 BAM_3805 BAM_3806     TRUE 0.654 6.000 0.044 NA   NA
 6058886 6058887 BAM_3806 BAM_3807     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6058887 6058888 BAM_3807 BAM_3808     FALSE 0.469 86.000 0.000 NA   NA
 6058888 6058889 BAM_3808 BAM_3809     TRUE 0.952 84.000 0.308 0.001 Y NA
 6058890 6058891 BAM_3810 BAM_3811     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6058892 6058893 BAM_3812 BAM_3813     FALSE 0.389 46.000 0.078 NA   NA
 6058895 6058896 BAM_3815 BAM_3816     TRUE 0.864 1.000 0.667 NA   NA
 6058896 6058897 BAM_3816 BAM_3817     TRUE 0.763 -7.000 0.667 NA   NA
 6058897 6058898 BAM_3817 BAM_3818     TRUE 0.681 120.000 0.000 NA   NA
 6058898 6058899 BAM_3818 BAM_3819     FALSE 0.008 483.000 0.000 NA   NA
 6058899 6058900 BAM_3819 BAM_3820     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6058900 6058901 BAM_3820 BAM_3821     FALSE 0.021 365.000 0.000 1.000   NA
 6058901 6058902 BAM_3821 BAM_3822     FALSE 0.007 506.000 0.000 NA   NA
 6058904 6058905 BAM_3824 BAM_3825     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6058906 6058907 BAM_4674 BAM_4675     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6058907 6058908 BAM_4675 BAM_4676     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6058908 6058909 BAM_4676 BAM_4677   alaS FALSE 0.457 77.000 0.110 NA   NA
 6058913 6058914 BAM_4681 BAM_4682     FALSE 0.607 19.000 0.125 NA   NA
 6058914 6058915 BAM_4682 BAM_4683     TRUE 0.718 128.000 0.107 NA   NA
 6058915 6058916 BAM_4683 BAM_4684     TRUE 0.704 96.000 0.281 1.000   NA
 6058916 6058917 BAM_4684 BAM_4685   trmU TRUE 0.722 111.000 0.038 1.000   NA
 6058917 6058918 BAM_4685 BAM_4686 trmU   TRUE 0.859 14.000 0.072 1.000 N NA
 6058918 6058919 BAM_4686 BAM_4687     TRUE 0.715 36.000 0.201 NA N NA
 6058920 6058921 BAM_4688 BAM_4689     FALSE 0.569 38.000 0.106 0.025   NA
 6058923 6058924 BAM_4044 BAM_4045 ffh   FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6058924 6058925 BAM_4045 BAM_4046   ftsY TRUE 0.742 134.000 0.081 1.000   NA
 6058925 6058926 BAM_4046 BAM_4047 ftsY smc TRUE 0.881 16.000 0.165 0.006 N NA
 6058926 6058927 BAM_4047 BAM_4048 smc rncS TRUE 0.841 147.000 0.120 1.000 N NA
 6058927 6058928 BAM_4048 BAM_4049 rncS acpP TRUE 0.672 59.000 0.068 1.000 N NA
 6058928 6058929 BAM_4049 BAM_4050 acpP fabG TRUE 0.914 70.000 0.100 0.002 Y NA
 6058929 6058930 BAM_4050 BAM_4051 fabG fabD TRUE 0.970 0.000 0.149 0.002 Y NA
 6058930 6058931 BAM_4051 BAM_4052 fabD plsX TRUE 0.966 15.000 0.106 0.002 Y NA
 6058931 6058932 BAM_4052 BAM_4053 plsX   TRUE 0.815 -3.000 0.035 NA N NA
 6058932 6058933 BAM_4053 BAM_4054   recG TRUE 0.783 89.000 0.225 NA N NA
 6058933 6058934 BAM_4054 BAM_4055 recG   FALSE 0.036 290.000 0.000 NA   NA
 6058935 6058936 BAM_4031 BAM_4032 codY hslU FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6058936 6058937 BAM_4032 BAM_4033 hslU hslV TRUE 0.973 23.000 0.752 1.000 Y NA
 6058937 6058938 BAM_4033 BAM_4034 hslV xerC TRUE 0.714 43.000 0.113 1.000 N NA
 6058938 6058939 BAM_4034 BAM_4035 xerC gid TRUE 0.680 66.000 0.105 1.000 N NA
 6058939 6058940 BAM_4035 BAM_4036 gid topA TRUE 0.697 51.000 0.137 1.000 N NA
 6058940 6058941 BAM_4036 BAM_4037 topA smf FALSE 0.017 348.000 0.000 NA   NA
 6058941 6058942 BAM_4037 BAM_4038 smf sucD FALSE 0.477 88.000 0.000 NA   NA
 6058942 6058943 BAM_4038 BAM_4039 sucD sucC TRUE 0.960 21.000 0.173 0.000 Y NA
 6058943 6058944 BAM_4039 BAM_4040 sucC rnhB FALSE 0.493 195.000 0.015 1.000 N NA
 6058944 6058945 BAM_4040 BAM_4041 rnhB   FALSE 0.460 52.000 0.148 1.000   NA
 6058945 6058946 BAM_4041 BAM_4042   sipS2 FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6058946 6058947 BAM_4042 BAM_4043 sipS2 rplS FALSE 0.598 102.000 0.000 NA   NA
 6058949 6058950 BAM_0716 BAM_0715     TRUE 0.831 117.000 0.438 NA   NA
 6058950 6058951 BAM_0715 BAM_0714     TRUE 0.703 -7.000 0.500 NA   NA
 6058951 6058952 BAM_0714 BAM_0713     TRUE 0.896 113.000 0.233 1.000 N NA
 6058953 6058954 BAM_0712 BAM_0711     TRUE 0.905 133.000 0.085 0.055 N NA
 6058957 6058958 BAM_0708 BAM_0707     TRUE 0.816 -12.000 0.571 NA N NA
 6058958 6058959 BAM_0707 BAM_0706   sph FALSE 0.630 108.000 0.000 NA   NA
 6058959 6058960 BAM_0706 BAM_0705 sph plc FALSE 0.456 74.000 0.000 1.000   NA
 6058961 6058962 BAM_0118 BAM_0119 rpsK rpoA FALSE 0.274 181.000 0.000 NA   NA
 6058962 6058963 BAM_0119 BAM_0120 rpoA rplQ TRUE 0.880 36.000 0.873 1.000 N NA
 6058963 6058964 BAM_0120 BAM_0121 rplQ   TRUE 0.868 104.000 0.074 1.000 N NA
 6058964 6058965 BAM_0121 BAM_0122     TRUE 0.937 -24.000 0.713 0.016 Y NA
 6058965 6058966 BAM_0122 BAM_0123     TRUE 0.917 -12.000 0.139 1.000 Y NA
 6058966 6058967 BAM_0123 BAM_0124   truA1 TRUE 0.876 0.000 0.170 1.000 N NA
 6058967 6058968 BAM_0124 BAM_0125 truA1 rplM TRUE 0.942 153.000 0.052 1.000 Y NA
 6058968 6058969 BAM_0125 BAM_0126 rplM rpsI TRUE 0.973 22.000 0.601 0.005 Y NA
 6058969 6058970 BAM_0126 BAM_0127 rpsI   FALSE 0.411 163.000 0.021 NA   NA
 6058970 6058971 BAM_0127 BAM_0128   cwlD FALSE 0.391 67.000 0.211 NA   NA
 6058971 6058972 BAM_0128 BAM_0129 cwlD   TRUE 0.855 145.000 0.211 1.000 N NA
 6058976 6058977 BAM_0133 BAM_0134     FALSE 0.455 158.000 0.000 NA   NA
 6058978 6058979 BAM_5616 BAM_5617 atpC atpD FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6058979 6058980 BAM_5617 BAM_5618 atpD atpG TRUE 0.987 120.000 0.724 0.001 Y NA
 6058980 6058981 BAM_5618 BAM_5619 atpG atpA FALSE 0.455 336.000 0.846 0.001 Y NA
 6058981 6058982 BAM_5619 BAM_5620 atpA atpH TRUE 0.984 12.000 0.864 0.001 Y NA
 6058982 6058983 BAM_5620 BAM_5621 atpH atpF TRUE 0.964 -3.000 0.222 0.001 Y NA
 6058983 6058984 BAM_5621 BAM_5622 atpF atpE TRUE 0.881 129.000 0.402 0.001   NA
 6058984 6058985 BAM_5622 BAM_5623 atpE atpB FALSE 0.543 57.000 0.189 0.001   NA
 6058985 6058986 BAM_5623 BAM_5624 atpB atpI TRUE 0.789 8.000 0.330 1.000   NA
 6058986 6058987 BAM_5624 BAM_5625 atpI   TRUE 0.668 0.000 0.187 NA   NA
 6058987 6058988 BAM_5625 BAM_5626     FALSE 0.506 27.000 0.030 NA   NA
 6058988 6058989 BAM_5626 BAM_5627   upp FALSE 0.014 372.000 0.000 NA   NA
 6058989 6058990 BAM_5627 BAM_5628 upp glyA FALSE 0.046 272.000 0.000 NA   NA
 6058991 6058992 BAM_0105 BAM_0104 rpoC rpoB TRUE 0.962 38.000 0.851 0.001 Y NA
 6058992 6058993 BAM_0104 BAM_0103 rpoB   FALSE 0.124 293.000 0.008 1.000 N NA
 6058993 6058994 BAM_0103 BAM_0102   rplL TRUE 0.912 75.000 0.050 1.000 Y NA
 6058994 6058995 BAM_0102 BAM_0101 rplL   FALSE 0.338 68.000 0.000 NA   NA
 6058997 6058998 BAM_0286 BAM_0287 bacA1   TRUE 0.640 18.000 0.240 NA   NA
 6058998 6058999 BAM_0287 BAM_0288     TRUE 0.648 -7.000 0.400 NA   NA
 6058999 6059000 BAM_0288 BAM_0289     TRUE 0.820 69.000 0.556 0.061 N NA
 6059000 6059001 BAM_0289 BAM_0290     TRUE 0.947 -10.000 0.538 1.000 Y NA
 6059002 6059003 BAM_4873 BAM_4874 thrS2   FALSE 0.029 307.000 0.000 NA   NA
 6059003 6059004 BAM_4874 BAM_4875   dnaI FALSE 0.044 282.000 0.048 NA   NA
 6059004 6059005 BAM_4875 BAM_4876 dnaI dnaB TRUE 0.957 34.000 0.817 NA Y NA
 6059005 6059006 BAM_4876 BAM_4877 dnaB   TRUE 0.678 128.000 0.000 NA   NA
 6059007 6059008 BAM_0117 BAM_0116 map adk FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6059008 6059009 BAM_0116 BAM_0115 adk secY1 TRUE 0.696 57.000 0.241 1.000 N NA
 6059009 6059010 BAM_0115 BAM_0114 secY1 rplO TRUE 0.939 0.000 0.730 1.000 N NA
 6059010 6059011 BAM_0114 BAM_0113 rplO rpmD TRUE 0.960 34.000 0.653 0.001 Y NA
 6059011 6059012 BAM_0113 BAM_0112 rpmD rpsE TRUE 0.982 14.000 0.789 0.005 Y NA
 6059012 6059013 BAM_0112 BAM_0111 rpsE rplR TRUE 0.978 22.000 0.814 0.005 Y NA
 6059013 6059014 BAM_0111 BAM_0110 rplR rplF TRUE 0.968 32.000 0.815 0.005 Y NA
 6059014 6059015 BAM_0110 BAM_0109 rplF rpsH TRUE 0.967 33.000 0.808 0.005 Y NA
 6059015 6059016 BAM_0109 BAM_0108 rpsH rpsN TRUE 0.959 30.000 0.473 0.005 Y NA
 6059016 6059017 BAM_0108 BAM_0107 rpsN rplE TRUE 0.952 34.000 0.496 0.005 Y NA
 6059017 6059018 BAM_0107 BAM_0106 rplE   FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6059019 6059020 BAM_0573 BAM_0572     FALSE 0.514 151.000 0.008 NA   NA
 6059022 6059023 BAM_0570 BAM_0569     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6059023 6059024 BAM_0569 BAM_0568     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6059024 6059025 BAM_0568 BAM_0567     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6059025 6059026 BAM_0567 BAM_0566     FALSE 0.329 63.000 0.000 NA   NA
 6059026 6059027 BAM_0566 BAM_0565     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6059027 6059028 BAM_0565 BAM_0564     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6059028 6059029 BAM_0564 BAM_0563     FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6059029 6059030 BAM_0563 BAM_0562     FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6059030 6059031 BAM_0562 BAM_0561     FALSE 0.619 9.000 0.000 NA   NA
 6059031 6059032 BAM_0561 BAM_0560     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6059032 6059033 BAM_0560 BAM_0558     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6059033 6059034 BAM_0558 BAM_0557     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6059034 6059035 BAM_0557 BAM_0556     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6059035 6059036 BAM_0556 BAM_0555     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6059036 6059037 BAM_0555 BAM_0554   rrfI FALSE 0.623 8.000 0.000 NA   NA
 6059040 6059041 BAM_1068 BAM_1069     FALSE 0.523 -6.000 0.080 NA   NA
 6059041 6059042 BAM_1069 BAM_1070     FALSE 0.543 154.000 0.182 NA   NA
 6059042 6059043 BAM_1070 BAM_1071     TRUE 0.977 5.000 0.533 NA Y NA
 6059043 6059044 BAM_1071 BAM_1072     FALSE 0.623 8.000 0.000 NA   NA
 6059045 6059046 BAM_A0001 BAM_A0002     FALSE 0.461 157.000 0.000 NA   NA
 6059046 6059047 BAM_A0002 BAM_A0003     TRUE 0.819 17.000 0.600 NA   NA
 6059047 6059048 BAM_A0003 BAM_A0004     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059048 6059049 BAM_A0004 BAM_A0005     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6059049 6059050 BAM_A0005 BAM_A0006     FALSE 0.451 31.000 0.000 NA   NA
 6059050 6059051 BAM_A0006 BAM_A0007     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6059051 6059052 BAM_A0007 BAM_A0008     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6059052 6059053 BAM_A0008 BAM_A0009     TRUE 0.686 67.000 0.750 NA   NA
 6059057 6059058 BAM_A0013 BAM_A0014     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6059058 6059059 BAM_A0014 BAM_A0015     FALSE 0.373 40.000 0.000 NA   NA
 6059059 6059060 BAM_A0015 BAM_A0016     FALSE 0.042 279.000 0.000 NA   NA
 6059060 6059061 BAM_A0016 BAM_A0017     FALSE 0.007 528.000 0.000 NA   NA
 6059061 6059062 BAM_A0017 BAM_A0018     FALSE 0.457 83.000 0.000 NA   NA
 6059062 6059063 BAM_A0018 BAM_A0019     TRUE 0.780 -3.000 0.500 NA   NA
 6059063 6059064 BAM_A0019 BAM_A0020     FALSE 0.110 220.000 0.000 NA   NA
 6059064 6059065 BAM_A0020 BAM_A0021     FALSE 0.451 31.000 0.000 NA   NA
 6059065 6059066 BAM_A0021 BAM_A0022     FALSE 0.506 71.000 0.333 NA   NA
 6059066 6059067 BAM_A0022 BAM_A0023     FALSE 0.591 69.000 0.500 NA   NA
 6059067 6059068 BAM_A0023 BAM_A0024     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6059068 6059069 BAM_A0024 BAM_A0025     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6059069 6059070 BAM_A0025 BAM_A0026     FALSE 0.366 43.000 0.000 NA   NA
 6059070 6059071 BAM_A0026 BAM_A0027     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6059071 6059072 BAM_A0027 BAM_A0028     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6059072 6059073 BAM_A0028 BAM_A0029     TRUE 0.788 -7.000 0.750 NA   NA
 6059073 6059074 BAM_A0029 BAM_A0030     TRUE 0.929 17.000 0.750 1.000 N NA
 6059074 6059075 BAM_A0030 BAM_A0031   cpaB FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6059077 6059078 BAM_A0033 BAM_A0034     TRUE 0.868 132.000 0.600 NA   NA
 6059078 6059079 BAM_A0034 BAM_A0035     TRUE 0.756 155.000 0.600 NA   NA
 6059079 6059080 BAM_A0035 BAM_A0036     FALSE 0.101 224.000 0.000 NA   NA
 6059080 6059081 BAM_A0036 BAM_A0037     TRUE 0.816 26.000 0.750 NA   NA
 6059081 6059082 BAM_A0037 BAM_A0038     TRUE 0.854 17.000 0.750 NA   NA
 6059082 6059083 BAM_A0038 BAM_A0039     TRUE 0.840 20.000 0.750 NA   NA
 6059083 6059084 BAM_A0039 BAM_A0040     FALSE 0.006 572.000 0.000 NA   NA
 6059084 6059085 BAM_A0040 BAM_A0041     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6059086 6059087 BAM_A0042 BAM_A0043     FALSE 0.009 447.000 0.000 NA   NA
 6059087 6059088 BAM_A0043 BAM_A0044     FALSE 0.490 90.000 0.000 NA   NA
 6059089 6059090 BAM_A0045 BAM_A0046     FALSE 0.209 192.000 0.000 NA   NA
 6059091 6059092 BAM_A0047 BAM_A0048     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6059092 6059093 BAM_A0048 BAM_A0049     FALSE 0.009 437.000 0.000 NA   NA
 6059093 6059094 BAM_A0049 BAM_A0050     TRUE 0.824 107.000 0.500 NA   NA
 6059094 6059095 BAM_A0050 BAM_A0051     TRUE 0.850 18.000 0.750 NA   NA
 6059095 6059096 BAM_A0051 BAM_A0052     FALSE 0.383 38.000 0.000 NA   NA
 6059097 6059098 BAM_A0053 BAM_A0054     TRUE 0.685 123.000 0.000 NA   NA
 6059098 6059099 BAM_A0054 BAM_A0055     TRUE 0.678 27.000 0.400 NA   NA
 6059099 6059100 BAM_A0055 BAM_A0056     FALSE 0.503 152.000 0.000 NA   NA
 6059101 6059102 BAM_A0057 BAM_A0058     FALSE 0.503 92.000 0.000 NA   NA
 6059102 6059103 BAM_A0058 BAM_A0059     TRUE 0.684 122.000 0.000 NA   NA
 6059104 6059105 BAM_A0060 BAM_A0061     FALSE 0.295 186.000 0.000 1.000   NA
 6059106 6059107 BAM_A0062 BAM_A0063     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6059107 6059108 BAM_A0063 BAM_A0064     FALSE 0.011 410.000 0.000 NA   NA
 6059109 6059110 BAM_A0065 BAM_A0066     FALSE 0.451 31.000 0.000 NA   NA
 6059111 6059112 BAM_A0067 BAM_A0068     TRUE 0.698 16.000 0.200 1.000   NA
 6059112 6059113 BAM_A0068 BAM_A0069     FALSE 0.016 356.000 0.000 NA   NA
 6059113 6059114 BAM_A0069 BAM_A0070     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6059114 6059115 BAM_A0070 BAM_A0071     FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6059119 6059120 BAM_A0075 BAM_A0076     FALSE 0.016 359.000 0.000 NA   NA
 6059120 6059121 BAM_A0076 BAM_A0077     FALSE 0.110 220.000 0.000 NA   NA
 6059121 6059122 BAM_A0077 BAM_A0078     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6059122 6059123 BAM_A0078 BAM_A0079     FALSE 0.541 96.000 0.000 NA   NA
 6059123 6059124 BAM_A0079 BAM_A0080     FALSE 0.461 197.000 0.667 NA   NA
 6059126 6059127 BAM_A0082 BAM_A0083     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059127 6059128 BAM_A0083 BAM_A0084     FALSE 0.561 146.000 0.000 NA   NA
 6059128 6059129 BAM_A0084 BAM_A0085     TRUE 0.685 124.000 0.000 NA   NA
 6059129 6059130 BAM_A0085 BAM_A0086     FALSE 0.362 72.000 0.000 NA   NA
 6059130 6059131 BAM_A0086 BAM_A0087     TRUE 0.681 120.000 0.000 NA   NA
 6059133 6059134 BAM_A0089 BAM_A0090     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059135 6059136 BAM_A0091 BAM_A0092     FALSE 0.605 141.000 0.000 NA   NA
 6059136 6059137 BAM_A0092 BAM_A0093     FALSE 0.006 594.000 0.000 NA   NA
 6059137 6059138 BAM_A0093 BAM_A0094     FALSE 0.635 137.000 0.000 NA   NA
 6059138 6059139 BAM_A0094 BAM_A0095     FALSE 0.006 608.000 0.000 NA   NA
 6059140 6059141 BAM_A0096 BAM_A0097     FALSE 0.447 159.000 0.000 NA   NA
 6059141 6059142 BAM_A0097 BAM_A0098     FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 6059142 6059143 BAM_A0098 BAM_A0099     TRUE 0.658 114.000 0.000 NA   NA
 6059145 6059146 BAM_A0101 BAM_A0102     FALSE 0.008 488.000 0.000 NA   NA
 6059146 6059147 BAM_A0102 BAM_A0103     TRUE 0.810 22.000 0.667 NA   NA
 6059147 6059148 BAM_A0103 BAM_A0104     TRUE 0.686 103.000 0.250 NA   NA
 6059148 6059149 BAM_A0104 BAM_A0105     TRUE 0.665 16.000 0.250 NA   NA
 6059149 6059150 BAM_A0105 BAM_A0106     TRUE 0.801 24.000 0.667 NA   NA
 6059150 6059151 BAM_A0106 BAM_A0107     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6059151 6059152 BAM_A0107 BAM_A0108     FALSE 0.007 505.000 0.000 NA   NA
 6059152 6059153 BAM_A0108 BAM_A0109     FALSE 0.619 105.000 0.000 NA   NA
 6059153 6059154 BAM_A0109 BAM_A0110     TRUE 0.671 117.000 0.000 NA   NA
 6059154 6059155 BAM_A0110 BAM_A0111     TRUE 0.835 17.000 0.667 NA   NA
 6059155 6059156 BAM_A0111 BAM_A0112     FALSE 0.020 336.000 0.000 NA   NA
 6059156 6059157 BAM_A0112 BAM_A0113     TRUE 0.876 0.000 0.750 NA   NA
 6059158 6059159 BAM_A0114 BAM_A0115     TRUE 0.668 -16.000 0.667 NA   NA
 6059160 6059161 BAM_A0116 BAM_A0117     TRUE 0.819 17.000 0.600 NA   NA
 6059161 6059162 BAM_A0117 BAM_A0118     TRUE 0.814 18.000 0.600 NA   NA
 6059163 6059164 BAM_A0119 BAM_A0120     TRUE 0.638 110.000 0.000 NA   NA
 6059164 6059165 BAM_A0120 BAM_A0121     FALSE 0.342 52.000 0.000 NA   NA
 6059166 6059167 BAM_A0122 BAM_A0123     FALSE 0.605 141.000 0.000 NA   NA
 6059167 6059168 BAM_A0123 BAM_A0124     FALSE 0.018 344.000 0.000 NA   NA
 6059168 6059169 BAM_A0124 BAM_A0125     FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 6059169 6059170 BAM_A0125 BAM_A0126   topX FALSE 0.237 -54.000 0.000 NA   NA
 6059170 6059171 BAM_A0126 BAM_A0128 topX   FALSE 0.305 175.000 0.000 NA   NA
 6059171 6059172 BAM_A0128 BAM_A0129     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6059172 6059173 BAM_A0129 BAM_A0130     TRUE 0.662 52.000 0.667 NA   NA
 6059173 6059174 BAM_A0130 BAM_A0131     FALSE 0.629 74.000 0.500 NA   NA
 6059174 6059175 BAM_A0131 BAM_A0132     FALSE 0.362 44.000 0.000 NA   NA
 6059175 6059176 BAM_A0132 BAM_A0133     FALSE 0.477 88.000 0.000 NA   NA
 6059177 6059178 BAM_A0134 BAM_A0135 hfq   FALSE 0.415 193.000 0.500 NA   NA
 6059178 6059179 BAM_A0135 BAM_A0136     TRUE 0.704 -3.000 0.333 NA   NA
 6059180 6059181 BAM_A0137 BAM_A0138     FALSE 0.451 31.000 0.000 NA   NA
 6059181 6059182 BAM_A0138 BAM_A0139     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6059182 6059183 BAM_A0139 BAM_A0140     FALSE 0.597 142.000 0.000 NA   NA
 6059184 6059185 BAM_A0141 BAM_A0142     FALSE 0.099 244.000 0.000 1.000   NA
 6059187 6059188 BAM_A0143 BAM_A0145     FALSE 0.051 267.000 0.000 NA   NA
 6059188 6059189 BAM_A0145 BAM_A0146     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 6059189 6059190 BAM_A0146 BAM_A0147     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6059190 6059191 BAM_A0147 BAM_A0148     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6059191 6059192 BAM_A0148 BAM_A0150     FALSE 0.329 63.000 0.000 NA   NA
 6059192 6059193 BAM_A0150 BAM_A0151     FALSE 0.266 -33.000 0.000 NA   NA
 6059194 6059195 BAM_A0152 BAM_A0153     TRUE 0.687 21.000 0.000 0.024   NA
 6059196 6059197 BAM_A0154 BAM_A0155     TRUE 0.805 13.000 0.500 NA   NA
 6059197 6059198 BAM_A0155 BAM_A0156     TRUE 0.651 134.000 0.000 NA   NA
 6059198 6059199 BAM_A0156 BAM_A0157     FALSE 0.123 214.000 0.000 NA   NA
 6059199 6059200 BAM_A0157 BAM_A0158     FALSE 0.005 735.000 0.000 NA   NA
 6059202 6059203 BAM_A0160 BAM_A0161     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6059203 6059204 BAM_A0161 BAM_A0162     TRUE 0.683 126.000 0.000 NA   NA
 6059207 6059208 BAM_A0165 BAM_A0166     FALSE 0.451 31.000 0.000 NA   NA
 6059209 6059210 BAM_A0167 BAM_A0168     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059210 6059211 BAM_A0168 BAM_A0169     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6059211 6059212 BAM_A0169 BAM_A0170     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059212 6059213 BAM_A0170 BAM_A0171     FALSE 0.008 469.000 0.000 NA   NA
 6059213 6059214 BAM_A0171 BAM_A0172     FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6059214 6059215 BAM_A0172 BAM_A0173     FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6059216 6059217 BAM_A0174 BAM_A0175 lef   FALSE 0.571 145.000 0.000 NA   NA
 6059218 6059219 BAM_A0176 BAM_A0177     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6059219 6059220 BAM_A0177 BAM_A0178     FALSE 0.244 -46.000 0.000 NA   NA
 6059222 6059223 BAM_A0179 BAM_A0181   pagR FALSE 0.007 518.000 0.000 NA   NA
 6059223 6059224 BAM_A0181 BAM_A0182 pagR   FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 6059224 6059225 BAM_A0182 BAM_A0183   pagA FALSE 0.007 500.000 0.000 NA   NA
 6059225 6059226 BAM_A0183 BAM_A0184 pagA   FALSE 0.016 359.000 0.000 NA   NA
 6059226 6059227 BAM_A0184 BAM_A0185     FALSE 0.031 302.000 0.000 NA   NA
 6059227 6059228 BAM_A0185 BAM_A0186     FALSE 0.005 743.000 0.000 NA   NA
 6059230 6059231 BAM_A0189 BAM_A0190     FALSE 0.282 -27.000 0.000 NA   NA
 6059231 6059232 BAM_A0190 BAM_A0191   gerXC TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6059232 6059233 BAM_A0191 BAM_A0192 gerXC gerXA TRUE 0.716 -13.000 0.500 0.005   NA
 6059233 6059234 BAM_A0192 BAM_A0193 gerXA gerXB TRUE 0.777 44.000 0.750 0.005   NA
 6059234 6059235 BAM_A0193 BAM_A0194 gerXB   FALSE 0.030 329.000 0.000 1.000   NA
 6059237 6059238 BAM_A0196 BAM_A0197     FALSE 0.161 203.000 0.000 NA   NA
 6059238 6059239 BAM_A0197 BAM_A0198     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6059239 6059240 BAM_A0198 BAM_A0199     FALSE 0.237 -54.000 0.000 NA   NA
 6059240 6059241 BAM_A0199 BAM_A0200     FALSE 0.007 551.000 0.000 NA   NA
 6059243 6059244 BAM_A0203 BAM_A0204     FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6059245 6059246 BAM_A0205 BAM_A0206   atxA TRUE 0.662 115.000 0.000 NA   NA
 6059246 6059247 BAM_A0206 BAM_A0207 atxA   FALSE 0.010 420.000 0.000 NA   NA
 6059247 6059248 BAM_A0207 BAM_A0208     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6059248 6059249 BAM_A0208 BAM_A0209     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 6059249 6059250 BAM_A0209 BAM_A0210     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6059250 6059251 BAM_A0210 BAM_A0211     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6059252 6059253 BAM_A0212 BAM_A0213 apt2 cya FALSE 0.038 287.000 0.000 NA   NA
 6059253 6059254 BAM_A0213 BAM_A0214 cya   FALSE 0.006 562.000 0.000 NA   NA
 6059254 6059255 BAM_A0214 BAM_A0215     FALSE 0.026 313.000 0.000 NA   NA
 6059256 6059257 BAM_A0216 BAM_A0217     TRUE 0.657 54.000 0.667 NA   NA
 6059257 6059258 BAM_A0217 BAM_A0218     TRUE 0.883 130.000 0.667 NA   NA
 6059258 6059259 BAM_A0218 BAM_A0219     FALSE 0.005 822.000 0.000 NA   NA
 6059259 6059260 BAM_A0219 BAM_A0220     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6059260 6059261 BAM_A0220 BAM_A0221     FALSE 0.550 97.000 0.000 NA   NA
 6059261 6059262 BAM_A0221 BAM_A0222     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6059263 6059264 BAM_A0224 BAM_A0225     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6059266 6059267 BAM_A0228 BAM_A0230     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6059267 6059268 BAM_A0230 BAM_A0231     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6059268 6059269 BAM_A0231 BAM_A0232     FALSE 0.012 395.000 0.000 NA   NA
 6059269 6059270 BAM_A0232 BAM_A0233     FALSE 0.005 685.000 0.000 NA   NA
 6059270 6059271 BAM_A0233 BAM_A0234     TRUE 0.945 27.000 0.222 1.000 Y NA
 6059271 6059272 BAM_A0234 BAM_A0235     FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 6059272 6059273 BAM_A0235 BAM_A0236     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059274 6059275 BAM_A0237 BAM_A0238     FALSE 0.006 622.000 0.000 NA   NA
 6059276 6059277 BAM_A0239 BAM_A0240     FALSE 0.048 270.000 0.000 NA   NA
 6059277 6059278 BAM_A0240 BAM_A0241     FALSE 0.015 369.000 0.000 NA   NA
 6059278 6059279 BAM_A0241 BAM_A0242     FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6059280 6059281 BAM_A0243 BAM_A0245     FALSE 0.338 68.000 0.000 NA   NA
 6059281 6059282 BAM_A0245 BAM_A0246     FALSE 0.006 565.000 0.000 NA   NA
 6059282 6059283 BAM_A0246 BAM_A0247     FALSE 0.440 80.000 0.000 NA   NA
 6059285 6059286 BAM_A0249 BAM_A0250     TRUE 0.667 40.000 0.600 NA   NA
 6059287 6059288 BAM_A0251 BAM_A0252     FALSE 0.589 101.000 0.000 NA   NA
 6059288 6059289 BAM_A0252 BAM_A0253     FALSE 0.456 76.000 0.200 NA   NA
 6059289 6059290 BAM_A0253 BAM_A0254     TRUE 0.812 130.000 0.400 NA   NA
 6059290 6059291 BAM_A0254 BAM_A0255     TRUE 0.740 -9.000 0.667 NA   NA
 6059293 6059294 BAM_B0002 BAM_B0005     TRUE 0.643 111.000 0.000 NA   NA
 6059294 6059295 BAM_B0005 BAM_B0006     FALSE 0.036 290.000 0.000 NA   NA
 6059297 6059298 BAM_B0008 BAM_B0009     FALSE 0.005 642.000 0.000 NA   NA
 6059298 6059299 BAM_B0009 BAM_B0010     FALSE 0.007 530.000 0.000 NA   NA
 6059299 6059300 BAM_B0010 BAM_B0011   acpA FALSE 0.083 237.000 0.000 NA   NA
 6059300 6059301 BAM_B0011 BAM_B0012 acpA   FALSE 0.007 515.000 0.000 NA   NA
 6059303 6059304 BAM_B0014 BAM_B0015     FALSE 0.009 448.000 0.000 NA   NA
 6059304 6059305 BAM_B0015 BAM_B0016     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059306 6059307 BAM_B0017 BAM_B0018     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6059309 6059310 BAM_B0019 BAM_B0021     FALSE 0.014 371.000 0.000 NA   NA
 6059311 6059312 BAM_B0022 BAM_B0023     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059312 6059313 BAM_B0023 BAM_B0024     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6059314 6059315 BAM_B0025 BAM_B0026     FALSE 0.415 162.000 0.000 NA   NA
 6059315 6059316 BAM_B0026 BAM_B0027     TRUE 0.648 112.000 0.000 NA   NA
 6059317 6059318 BAM_B0028 BAM_B0029     FALSE 0.025 316.000 0.000 NA   NA
 6059318 6059319 BAM_B0029 BAM_B0030     FALSE 0.362 72.000 0.000 NA   NA
 6059320 6059321 BAM_B0031 BAM_B0032     FALSE 0.146 207.000 0.000 NA   NA
 6059321 6059322 BAM_B0032 BAM_B0033   topB FALSE 0.462 30.000 0.000 NA   NA
 6059322 6059323 BAM_B0033 BAM_B0034 topB   FALSE 0.123 214.000 0.000 NA   NA
 6059324 6059325 BAM_B0035 BAM_B0037     FALSE 0.634 109.000 0.000 NA   NA
 6059326 6059327 BAM_B0036 BAM_B0038     FALSE 0.469 86.000 0.000 NA   NA
 6059327 6059328 BAM_B0038 BAM_B0039     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6059328 6059329 BAM_B0039 BAM_B0040     FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 6059329 6059330 BAM_B0040 BAM_B0041     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059330 6059331 BAM_B0041 BAM_B0042     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6059331 6059332 BAM_B0042 BAM_B0043     FALSE 0.362 44.000 0.000 NA   NA
 6059332 6059333 BAM_B0043 BAM_B0044     FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6059333 6059334 BAM_B0044 BAM_B0045     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059334 6059335 BAM_B0045 BAM_B0046     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6059335 6059336 BAM_B0046 BAM_B0047     FALSE 0.123 214.000 0.000 NA   NA
 6059336 6059337 BAM_B0047 BAM_B0048     FALSE 0.305 -22.000 0.000 NA   NA
 6059337 6059338 BAM_B0048 BAM_B0049     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059338 6059339 BAM_B0049 BAM_B0050     FALSE 0.483 89.000 0.000 NA   NA
 6059339 6059340 BAM_B0050 BAM_B0051     FALSE 0.509 25.000 0.000 NA   NA
 6059340 6059341 BAM_B0051 BAM_B0052     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6059341 6059342 BAM_B0052 BAM_B0053     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6059342 6059343 BAM_B0053 BAM_B0054     TRUE 0.819 17.000 0.600 NA   NA
 6059343 6059344 BAM_B0054 BAM_B0055     FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 6059344 6059345 BAM_B0055 BAM_B0056     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6059345 6059346 BAM_B0056 BAM_B0057     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6059346 6059347 BAM_B0057 BAM_B0058     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6059347 6059348 BAM_B0058 BAM_B0059     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6059348 6059349 BAM_B0059 BAM_B0060     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6059349 6059350 BAM_B0060 BAM_B0061     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6059350 6059351 BAM_B0061 BAM_B0062     FALSE 0.469 86.000 0.000 NA   NA
 6059351 6059352 BAM_B0062 BAM_B0063     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6059352 6059353 BAM_B0063 BAM_B0064     FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6059353 6059354 BAM_B0064 BAM_B0065     FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6059354 6059355 BAM_B0065 BAM_B0066     TRUE 0.737 40.000 0.800 NA   NA
 6059355 6059356 BAM_B0066 BAM_B0067     TRUE 0.858 -3.000 0.800 NA   NA
 6059356 6059357 BAM_B0067 BAM_B0068     FALSE 0.566 33.000 0.308 NA   NA
 6059357 6059358 BAM_B0068 BAM_B0069     TRUE 0.700 17.000 0.308 NA   NA
 6059358 6059359 BAM_B0069 BAM_B0070     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6059359 6059360 BAM_B0070 BAM_B0071     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 6059360 6059361 BAM_B0071 BAM_B0072     FALSE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 6059361 6059362 BAM_B0072 BAM_B0073     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059362 6059363 BAM_B0073 BAM_B0074     TRUE 0.660 132.000 0.000 NA   NA
 6059363 6059364 BAM_B0074 BAM_B0075     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6059366 6059367 BAM_B0077 BAM_B0078     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6059367 6059368 BAM_B0078 BAM_B0079     FALSE 0.550 97.000 0.000 NA   NA
 6059368 6059369 BAM_B0079 BAM_B0080     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6059369 6059370 BAM_B0080 BAM_B0081     FALSE 0.007 507.000 0.000 NA   NA
 6059370 6059371 BAM_B0081 BAM_B0082     FALSE 0.005 878.000 0.000 NA   NA
 6059371 6059372 BAM_B0082 BAM_B0083     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059372 6059373 BAM_B0083 BAM_B0084     FALSE 0.061 256.000 0.000 NA   NA
 6059373 6059374 BAM_B0084 BAM_B0085     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6059374 6059375 BAM_B0085 BAM_B0086     FALSE 0.161 203.000 0.000 NA   NA
 6059375 6059376 BAM_B0086 BAM_B0087     FALSE 0.007 555.000 0.000 NA   NA
 6059377 6059378 BAM_B0088 BAM_B0089     TRUE 0.703 -7.000 0.500 NA   NA
 6059378 6059379 BAM_B0089 BAM_B0090     FALSE 0.102 223.000 0.000 NA   NA
 6059379 6059380 BAM_B0090 BAM_B0091     FALSE 0.024 320.000 0.000 NA   NA
 6059380 6059381 BAM_B0091 BAM_B0092     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6059384 6059385 BAM_B0095 BAM_B0096     FALSE 0.223 -558.000 0.000 NA   NA
 6059385 6059386 BAM_B0096 BAM_B0097     FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6059386 6059387 BAM_B0097 BAM_B0098     FALSE 0.015 366.000 0.000 NA   NA
 6059387 6059388 BAM_B0098 BAM_B0100     FALSE 0.337 -18.000 0.000 NA   NA
 6059388 6059389 BAM_B0100 BAM_B0101     TRUE 0.845 19.000 0.750 NA   NA
 6059389 6059390 BAM_B0101 BAM_B0102     FALSE 0.244 -46.000 0.000 NA   NA
 6059392 6059393 BAM_B0104 BAM_B0105     FALSE 0.601 49.000 0.500 NA   NA
 6059394 6059395 BAM_B0106 BAM_B0107     FALSE 0.013 377.000 0.000 NA   NA
 6059395 6059396 BAM_B0107 BAM_B0108     FALSE 0.009 437.000 0.000 NA   NA
 6059396 6059397 BAM_B0108 BAM_B0109     FALSE 0.430 -9.000 0.000 NA   NA
 6059398 6059399 BAM_B0110 BAM_B0111     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6059399 6059400 BAM_B0111 BAM_B0112     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6059400 6059401 BAM_B0112 BAM_B0113     TRUE 0.671 117.000 0.000 NA   NA
 6059401 6059402 BAM_B0113 BAM_B0114     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6059402 6059403 BAM_B0114 BAM_B0115   acpB FALSE 0.005 1038.000 0.000 NA   NA
 6059405 6059406 BAM_B0117 BAM_B0118 capE capD FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6059406 6059407 BAM_B0118 BAM_B0119 capD capA TRUE 0.884 -3.000 0.400 1.000 N NA
 6059407 6059408 BAM_B0119 BAM_B0120 capA capC TRUE 0.676 12.000 0.000 1.000   NA
 6059408 6059409 BAM_B0120 BAM_B0121 capC capB TRUE 0.753 15.000 0.000 0.000   NA
 6059409 6059410 BAM_B0121 BAM_B0122 capB   FALSE 0.024 321.000 0.000 NA   NA
 6059410 6059411 BAM_B0122 BAM_B0123     FALSE 0.005 679.000 0.000 NA   NA
 6059413 6059414 BAM_B0125 BAM_B0126     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 6059414 6059415 BAM_B0126 BAM_B0127     FALSE 0.014 373.000 0.000 NA   NA
 6059415 6059416 BAM_B0127 BAM_B0128     FALSE 0.025 317.000 0.000 NA   NA
 6059416 6059417 BAM_B0128 BAM_B0129     FALSE 0.513 151.000 0.000 NA   NA
 6059417 6059418 BAM_B0129 BAM_B0130     FALSE 0.017 352.000 0.000 NA   NA
 6059418 6059419 BAM_B0130 BAM_B0131     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA