MicrobesOnline Operon Predictions for Bacillus anthracis str. A0465

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6053249 6053250 BAM_3064 BAM_3065     FALSE 0.044 276.000 0.000 NA   NA
 6053250 6053251 BAM_3065 BAM_3066     FALSE 0.431 203.000 0.000 1.000 N NA
 6053252 6053253 BAM_3067 BAM_3068     TRUE 0.848 11.000 0.636 NA   NA
 6053254 6053255 BAM_3069 BAM_3070     TRUE 0.732 107.000 0.286 NA   NA
 6053255 6053256 BAM_3070 BAM_3071     TRUE 0.716 -3.000 0.364 NA   NA
 6053256 6053257 BAM_3071 BAM_3072     FALSE 0.599 90.000 0.273 NA   NA
 6053257 6053258 BAM_3072 BAM_3073     TRUE 0.957 96.000 0.375 NA Y NA
 6053258 6053259 BAM_3073 BAM_3074     TRUE 0.748 163.000 0.133 1.000 N NA
 6053259 6053260 BAM_3074 BAM_3075     TRUE 0.923 0.000 0.533 1.000 N NA
 6053260 6053261 BAM_3075 BAM_3076     TRUE 0.886 15.000 0.333 1.000 N NA
 6053262 6053263 BAM_3077 BAM_3078     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6053264 6053265 BAM_3079 BAM_3080     FALSE 0.370 41.000 0.000 NA   NA
 6053265 6053266 BAM_3080 BAM_3081     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6053267 6053268 BAM_3082 BAM_3083     TRUE 0.837 -3.000 0.700 NA   NA
 6053268 6053269 BAM_3083 BAM_3084     FALSE 0.166 202.000 0.000 NA   NA
 6053271 6053272 BAM_3086 BAM_3087     TRUE 0.705 84.000 0.500 NA   NA
 6053273 6053274 BAM_3088 BAM_3089     FALSE 0.006 616.000 0.000 NA   NA
 6053274 6053275 BAM_3089 BAM_3090     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6053275 6053276 BAM_3090 BAM_3091     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6053276 6053277 BAM_3091 BAM_3092     FALSE 0.068 250.000 0.000 NA   NA
 6053277 6053278 BAM_3092 BAM_3093     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 6053280 6053281 BAM_3095 BAM_3096     TRUE 0.705 114.000 0.162 NA   NA
 6053281 6053282 BAM_3096 BAM_3097   adP2 FALSE 0.055 370.000 0.000 1.000 N NA
 6053282 6053283 BAM_3097 BAM_3098 adP2   FALSE 0.059 259.000 0.000 NA   NA
 6053283 6053284 BAM_3098 BAM_3099     FALSE 0.589 94.000 0.222 NA   NA
 6053284 6053285 BAM_3099 BAM_3100     FALSE 0.326 -19.000 0.000 NA   NA
 6053285 6053286 BAM_3100 BAM_3101     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6053286 6053287 BAM_3101 BAM_3102     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6053287 6053288 BAM_3102 BAM_3103     TRUE 0.841 -3.000 0.714 NA   NA
 6053288 6053289 BAM_3103 BAM_3104     TRUE 0.654 148.000 0.176 1.000   NA
 6053289 6053290 BAM_3104 BAM_3105     TRUE 0.738 39.000 0.588 0.030   NA
 6053290 6053291 BAM_3105 BAM_3106     TRUE 0.933 19.000 0.882 1.000 N NA
 6053293 6053294 BAM_3108 BAM_3109     FALSE 0.568 22.000 0.087 NA   NA
 6053294 6053295 BAM_3109 BAM_3110     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6053297 6053298 BAM_3112 BAM_3113     FALSE 0.583 30.000 0.286 NA   NA
 6053298 6053299 BAM_3113 BAM_3114     TRUE 0.729 -12.000 0.714 NA   NA
 6053299 6053300 BAM_3114 BAM_3115     TRUE 0.864 -12.000 0.750 1.000 N NA
 6053302 6053303 BAM_3117 BAM_3118     FALSE 0.572 186.000 0.182 1.000 N NA
 6053303 6053304 BAM_3118 BAM_3119     TRUE 0.761 0.000 0.364 NA   NA
 6053304 6053305 BAM_3119 BAM_3120     TRUE 0.869 6.000 0.667 NA   NA
 6053305 6053306 BAM_3120 BAM_3121     FALSE 0.579 66.000 0.500 NA   NA
 6053306 6053307 BAM_3121 BAM_3122     FALSE 0.146 207.000 0.000 NA   NA
 6053307 6053308 BAM_3122 BAM_3123     TRUE 0.816 25.000 0.096 1.000 N NA
 6053308 6053309 BAM_3123 BAM_3124     TRUE 0.695 49.000 0.082 1.000 N NA
 6053309 6053310 BAM_3124 BAM_3125     FALSE 0.619 18.000 0.194 NA   NA
 6053313 6053314 BAM_3128 BAM_3129     FALSE 0.457 82.000 0.015 NA   NA
 6053317 6053318 BAM_3132 BAM_3133     TRUE 0.969 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 6053318 6053319 BAM_3133 BAM_3134     FALSE 0.611 35.000 0.421 NA   NA
 6053319 6053320 BAM_3134 BAM_3135     TRUE 0.676 100.000 0.263 NA   NA
 6053320 6053321 BAM_3135 BAM_3136     TRUE 0.718 129.000 0.172 NA   NA
 6053321 6053322 BAM_3136 BAM_3137     FALSE 0.185 214.000 0.114 1.000   NA
 6053322 6053323 BAM_3137 BAM_3138     TRUE 0.644 14.000 0.159 NA   NA
 6053323 6053324 BAM_3138 BAM_3139     FALSE 0.607 15.000 0.047 NA   NA
 6053327 6053328 BAM_3142 BAM_3143 lysP   TRUE 0.781 114.000 0.333 NA   NA
 6053328 6053329 BAM_3143 BAM_3144     FALSE 0.440 34.000 0.057 NA   NA
 6053332 6053333 BAM_3147 BAM_3148     FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6053333 6053334 BAM_3148 BAM_3149     FALSE 0.342 69.000 0.000 NA   NA
 6053336 6053337 BAM_3151 BAM_3152 lepB   TRUE 0.895 83.000 0.778 1.000 N NA
 6053339 6053340 BAM_3154 BAM_3155   pcp FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6053340 6053341 BAM_3155 BAM_3156 pcp   FALSE 0.393 -12.000 0.000 NA   NA
 6053341 6053342 BAM_3156 BAM_3157     FALSE 0.071 248.000 0.000 NA   NA
 6053342 6053343 BAM_3157 BAM_3158     TRUE 0.683 121.000 0.000 NA   NA
 6053343 6053344 BAM_3158 BAM_3159     TRUE 0.903 2.000 0.939 NA   NA
 6053344 6053345 BAM_3159 BAM_3160     FALSE 0.614 15.000 0.064 NA   NA
 6053345 6053346 BAM_3160 BAM_3161     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6053346 6053347 BAM_3161 BAM_3162     FALSE 0.314 -21.000 0.000 NA   NA
 6053347 6053348 BAM_3162 BAM_3163     FALSE 0.430 -9.000 0.000 NA   NA
 6053348 6053349 BAM_3163 BAM_3164     TRUE 0.875 15.000 0.267 1.000 N NA
 6053349 6053350 BAM_3164 BAM_3165   sipU FALSE 0.220 259.000 0.231 1.000 N NA
 6053350 6053351 BAM_3165 BAM_3166 sipU   TRUE 0.812 24.000 0.038 1.000 N NA
 6053351 6053352 BAM_3166 BAM_3167     FALSE 0.026 315.000 0.000 NA   NA
 6053352 6053353 BAM_3167 BAM_3168     FALSE 0.161 204.000 0.028 NA   NA
 6053355 6053356 BAM_3170 BAM_3171     FALSE 0.531 153.000 0.083 NA   NA
 6053356 6053357 BAM_3171 BAM_3172     FALSE 0.022 331.000 0.000 NA   NA
 6053359 6053360 BAM_3174 BAM_3175     TRUE 0.704 114.000 0.125 NA   NA
 6053360 6053361 BAM_3175 BAM_3176     TRUE 0.677 4.000 0.083 NA   NA
 6053361 6053362 BAM_3176 BAM_3177     FALSE 0.516 161.000 0.033 1.000   NA
 6053362 6053363 BAM_3177 BAM_3178     FALSE 0.468 162.000 0.154 NA   NA
 6053366 6053367 BAM_3181 BAM_3182     FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6053368 6053369 BAM_3183 BAM_3184     FALSE 0.593 -10.000 0.383 NA   NA
 6053369 6053370 BAM_3184 BAM_3185   cotF FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 6053370 6053371 BAM_3185 BAM_3186 cotF   FALSE 0.581 148.000 0.105 NA   NA
 6053372 6053373 BAM_3187 BAM_3188     FALSE 0.612 92.000 0.273 NA   NA
 6053374 6053375 BAM_3189 BAM_3190     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6053375 6053376 BAM_3190 BAM_3191     FALSE 0.107 221.000 0.000 NA   NA
 6053376 6053377 BAM_3191 BAM_3192     FALSE 0.196 195.000 0.000 NA   NA
 6053379 6053380 BAM_3194 BAM_3195   sasP2 FALSE 0.042 295.000 0.143 NA   NA
 6053384 6053385 BAM_3199 BAM_3200 aspA3 ansA2 TRUE 0.892 54.000 0.037 1.000 Y NA
 6053386 6053387 BAM_3201 BAM_3202 ansR   FALSE 0.026 314.000 0.000 NA   NA
 6053388 6053389 BAM_3203 BAM_3204     FALSE 0.626 167.000 0.429 1.000   NA
 6053389 6053390 BAM_3204 BAM_3205   brnQ5 FALSE 0.457 274.000 0.000 0.072 Y NA
 6053390 6053391 BAM_3205 BAM_3206 brnQ5 proC2 TRUE 0.780 198.000 0.000 1.000 Y NA
 6053391 6053392 BAM_3206 BAM_3207 proC2   FALSE 0.025 316.000 0.000 NA   NA
 6053392 6053393 BAM_3207 BAM_3208     FALSE 0.478 165.000 0.250 NA   NA
 6053393 6053394 BAM_3208 BAM_3209     TRUE 0.760 108.000 0.333 NA   NA
 6053394 6053395 BAM_3209 BAM_3210   gerAC FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 6053395 6053396 BAM_3210 BAM_3211 gerAC   FALSE 0.221 -1043.000 0.000 NA   NA
 6053396 6053397 BAM_3211 BAM_3212   gerAB FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053397 6053398 BAM_3212 BAM_3213 gerAB gerAA FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6053398 6053399 BAM_3213 BAM_3214 gerAA   FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6053399 6053400 BAM_3214 BAM_3215     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6053400 6053401 BAM_3215 BAM_3216     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053401 6053402 BAM_3216 BAM_3217     FALSE 0.007 545.000 0.000 NA   NA
 6053402 6053403 BAM_3217 BAM_3218     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6053403 6053404 BAM_3218 BAM_3219     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6053404 6053405 BAM_3219 BAM_3220   glsA2 FALSE 0.008 488.000 0.000 NA   NA
 6053405 6053406 BAM_3220 BAM_3221 glsA2   TRUE 0.973 125.000 0.095 1.000 Y NA
 6053409 6053410 BAM_3224 BAM_3225     FALSE 0.559 24.000 0.100 NA   NA
 6053411 6053412 BAM_3226 BAM_3227     FALSE 0.107 221.000 0.000 NA   NA
 6053412 6053413 BAM_3227 BAM_3228     FALSE 0.020 686.000 0.000 1.000 N NA
 6053413 6053414 BAM_3228 BAM_3229     TRUE 0.725 114.000 0.000 1.000   NA
 6053415 6053416 BAM_3230 BAM_3231     TRUE 0.900 174.000 0.235 0.089 Y NA
 6053416 6053417 BAM_3231 BAM_3232     TRUE 0.681 -3.000 0.206 1.000   NA
 6053417 6053418 BAM_3232 BAM_3233     TRUE 0.684 14.000 0.059 1.000   NA
 6053419 6053420 BAM_3234 BAM_3235     FALSE 0.008 491.000 0.000 NA   NA
 6053420 6053421 BAM_3235 BAM_3236     FALSE 0.009 443.000 0.000 NA   NA
 6053421 6053422 BAM_3236 BAM_3237     FALSE 0.029 306.000 0.000 NA   NA
 6053422 6053423 BAM_3237 BAM_3238     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 6053427 6053428 BAM_3242 BAM_3243     TRUE 0.724 104.000 0.200 1.000   NA
 6053428 6053429 BAM_3243 BAM_3244     TRUE 0.882 113.000 0.010 1.000 N NA
 6053429 6053430 BAM_3244 BAM_3245     TRUE 0.717 165.000 0.004 1.000 N NA
 6053430 6053431 BAM_3245 BAM_3246     FALSE 0.503 81.000 0.136 NA   NA
 6053431 6053432 BAM_3246 BAM_3247     TRUE 0.735 0.000 0.303 NA   NA
 6053432 6053433 BAM_3247 BAM_3248     FALSE 0.005 643.000 0.000 NA   NA
 6053435 6053436 BAM_3250 BAM_3251     FALSE 0.191 196.000 0.000 NA   NA
 6053438 6053439 BAM_3253 BAM_3254 mntA   TRUE 0.957 18.000 0.173 1.000 Y NA
 6053439 6053440 BAM_3254 BAM_3255     TRUE 0.957 -3.000 0.196 1.000 Y NA
 6053440 6053441 BAM_3255 BAM_3256     FALSE 0.014 373.000 0.000 NA   NA
 6053441 6053442 BAM_3256 BAM_3257     FALSE 0.337 56.000 0.014 NA   NA
 6053444 6053445 BAM_3259 BAM_3260   arsC TRUE 0.749 154.000 0.556 NA   NA
 6053445 6053446 BAM_3260 BAM_3261 arsC acr3 TRUE 0.886 26.000 0.556 1.000 N NA
 6053446 6053447 BAM_3261 BAM_3262 acr3   TRUE 0.847 19.000 0.208 1.000 N NA
 6053447 6053448 BAM_3262 BAM_3263   arsR TRUE 0.682 60.000 0.126 1.000 N NA
 6053448 6053449 BAM_3263 BAM_3264 arsR   FALSE 0.009 447.000 0.000 NA   NA
 6053449 6053450 BAM_3264 BAM_3265     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6053450 6053451 BAM_3265 BAM_3266   hscC TRUE 0.689 0.000 0.000 1.000   NA
 6053451 6053452 BAM_3266 BAM_3267 hscC   FALSE 0.007 508.000 0.000 NA   NA
 6053452 6053453 BAM_3267 BAM_3268     FALSE 0.030 305.000 0.000 NA   NA
 6053455 6053456 BAM_3270 BAM_3271     FALSE 0.052 266.000 0.000 NA   NA
 6053456 6053457 BAM_3271 BAM_3272     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6053458 6053459 BAM_3273 BAM_3274     TRUE 0.688 136.000 0.167 NA   NA
 6053460 6053461 BAM_3275 BAM_3276     FALSE 0.636 140.000 0.056 NA   NA
 6053461 6053462 BAM_3276 BAM_3277     FALSE 0.055 264.000 0.000 NA   NA
 6053462 6053463 BAM_3277 BAM_3278     TRUE 0.754 -16.000 0.375 1.000 N NA
 6053463 6053464 BAM_3278 BAM_3279     FALSE 0.039 416.000 0.000 1.000 N NA
 6053464 6053465 BAM_3279 BAM_3280     FALSE 0.025 316.000 0.000 NA   NA
 6053466 6053467 BAM_3281 BAM_3282     FALSE 0.230 -99.000 0.000 NA   NA
 6053468 6053469 BAM_3283 BAM_3284     FALSE 0.125 218.000 0.065 NA   NA
 6053469 6053470 BAM_3284 BAM_3285     FALSE 0.056 325.000 0.455 NA   NA
 6053470 6053471 BAM_3285 BAM_3286   cypD FALSE 0.140 283.000 0.000 1.000 N NA
 6053471 6053472 BAM_3286 BAM_3287 cypD   FALSE 0.370 41.000 0.000 NA   NA
 6053472 6053473 BAM_3287 BAM_3288     FALSE 0.014 375.000 0.000 NA   NA
 6053475 6053476 BAM_3290 BAM_3291     FALSE 0.018 346.000 0.000 NA   NA
 6053476 6053477 BAM_3291 BAM_3292     TRUE 0.817 3.000 0.455 NA   NA
 6053478 6053479 BAM_3293 BAM_3294     TRUE 0.968 -3.000 0.492 1.000 Y NA
 6053480 6053481 BAM_3295 BAM_3296     FALSE 0.023 325.000 0.000 NA   NA
 6053481 6053482 BAM_3296 BAM_3297     FALSE 0.005 961.000 0.000 NA   NA
 6053484 6053485 BAM_3299 BAM_3300     FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 6053485 6053486 BAM_3300 BAM_3301     FALSE 0.335 55.000 0.000 NA   NA
 6053486 6053487 BAM_3301 BAM_3302     FALSE 0.185 197.000 0.000 NA   NA
 6053487 6053488 BAM_3302 BAM_3303     FALSE 0.488 -6.000 0.000 NA   NA
 6053488 6053489 BAM_3303 BAM_3304     FALSE 0.006 634.000 0.000 NA   NA
 6053489 6053490 BAM_3304 BAM_3305     TRUE 0.869 6.000 0.667 NA   NA
 6053490 6053491 BAM_3305 BAM_3306     FALSE 0.019 341.000 0.000 NA   NA
 6053491 6053492 BAM_3306 BAM_3307     FALSE 0.613 -3.000 0.162 NA   NA
 6053492 6053493 BAM_3307 BAM_3308     TRUE 0.724 -7.000 0.550 NA   NA
 6053493 6053494 BAM_3308 BAM_3309     TRUE 0.692 -3.000 0.233 1.000   NA
 6053494 6053495 BAM_3309 BAM_3310     FALSE 0.409 77.000 0.000 NA   NA
 6053495 6053496 BAM_3310 BAM_3311     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6053496 6053497 BAM_3311 BAM_3312     FALSE 0.031 432.000 0.000 NA N NA
 6053498 6053499 BAM_3313 BAM_3314     FALSE 0.519 150.000 0.000 NA   NA
 6053500 6053501 BAM_3315 BAM_3316     TRUE 0.889 0.000 0.852 NA   NA
 6053502 6053503 BAM_3317 BAM_3318     FALSE 0.393 69.000 0.156 NA   NA
 6053504 6053505 BAM_3319 BAM_3320     TRUE 0.984 2.000 0.833 1.000 Y NA
 6053505 6053506 BAM_3320 BAM_3321     FALSE 0.503 81.000 0.139 NA   NA
 6053507 6053508 BAM_3322 BAM_3323     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6053508 6053509 BAM_3323 BAM_3324     FALSE 0.248 -42.000 0.000 NA   NA
 6053509 6053510 BAM_3324 BAM_3325   paiB1 FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6053511 6053512 BAM_3326 BAM_3327     FALSE 0.009 449.000 0.000 NA   NA
 6053512 6053513 BAM_3327 BAM_3328     FALSE 0.427 38.000 0.103 NA   NA
 6053513 6053514 BAM_3328 BAM_3329     TRUE 0.802 2.000 0.138 0.002   NA
 6053514 6053515 BAM_3329 BAM_3330     TRUE 0.975 -3.000 0.800 NA Y NA
 6053519 6053520 BAM_3334 BAM_3335     FALSE 0.058 260.000 0.000 NA   NA
 6053520 6053521 BAM_3335 BAM_3336     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6053521 6053522 BAM_3336 BAM_3337     FALSE 0.006 568.000 0.000 NA   NA
 6053522 6053523 BAM_3337 BAM_3338     FALSE 0.008 471.000 0.000 NA   NA
 6053523 6053524 BAM_3338 BAM_3339     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 6053524 6053525 BAM_3339 BAM_3340     TRUE 0.800 18.000 0.471 1.000   NA
 6053525 6053526 BAM_3340 BAM_3341     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6053526 6053527 BAM_3341 BAM_3342     FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 6053528 6053529 BAM_3343 BAM_3344     FALSE 0.110 237.000 0.000 1.000   NA
 6053529 6053530 BAM_3344 BAM_3345     TRUE 0.898 0.000 1.000 NA   NA
 6053531 6053532 BAM_3346 BAM_3347     FALSE 0.023 326.000 0.000 NA   NA
 6053533 6053534 BAM_3348 BAM_3349     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053534 6053535 BAM_3349 BAM_3350     FALSE 0.362 44.000 0.000 NA   NA
 6053536 6053537 BAM_3351 BAM_3352     FALSE 0.005 713.000 0.000 NA   NA
 6053538 6053539 BAM_3353 BAM_3354     FALSE 0.012 387.000 0.000 NA   NA
 6053540 6053541 BAM_3355 BAM_3356     FALSE 0.005 697.000 0.000 NA   NA
 6053541 6053542 BAM_3356 BAM_3357     FALSE 0.046 273.000 0.000 NA   NA
 6053542 6053543 BAM_3357 BAM_3358     FALSE 0.047 271.000 0.000 NA   NA
 6053543 6053544 BAM_3358 BAM_3359     FALSE 0.191 196.000 0.000 NA   NA
 6053544 6053545 BAM_3359 BAM_3360     TRUE 0.638 110.000 0.000 NA   NA
 6053545 6053546 BAM_3360 BAM_3361     FALSE 0.126 213.000 0.000 NA   NA
 6053548 6053549 BAM_3363 BAM_3364     FALSE 0.630 108.000 0.000 NA   NA
 6053549 6053550 BAM_3364 BAM_3365     FALSE 0.053 355.000 0.000 NA N NA
 6053550 6053551 BAM_3365 BAM_3366   sdaAA1 FALSE 0.336 294.000 0.000 NA Y NA
 6053551 6053552 BAM_3366 BAM_3367 sdaAA1 sdaAB1 FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6053552 6053553 BAM_3367 BAM_3368 sdaAB1   FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6053553 6053554 BAM_3368 BAM_3369     FALSE 0.005 710.000 0.000 NA   NA
 6053554 6053555 BAM_3369 BAM_3370     FALSE 0.174 200.000 0.000 NA   NA
 6053555 6053556 BAM_3370 BAM_3371     FALSE 0.453 82.000 0.000 NA   NA
 6053556 6053557 BAM_3371 BAM_3372   hypF TRUE 0.749 79.000 0.000 1.000 N NA
 6053557 6053558 BAM_3372 BAM_3373 hypF   TRUE 0.935 30.000 0.079 1.000 Y NA
 6053558 6053559 BAM_3373 BAM_3374     FALSE 0.457 83.000 0.000 NA   NA
 6053559 6053560 BAM_3374 BAM_3375     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6053560 6053561 BAM_3375 BAM_3376     FALSE 0.156 204.000 0.000 NA   NA
 6053563 6053564 BAM_3378 BAM_3379     FALSE 0.583 144.000 0.010 NA   NA
 6053564 6053565 BAM_3379 BAM_3380     TRUE 0.639 14.000 0.109 NA   NA
 6053565 6053566 BAM_3380 BAM_3381   serC TRUE 0.963 13.000 0.238 1.000 Y NA
 6053566 6053567 BAM_3381 BAM_3382 serC   FALSE 0.037 289.000 0.000 NA   NA
 6053567 6053568 BAM_3382 BAM_3383     FALSE 0.337 -18.000 0.000 NA   NA
 6053568 6053569 BAM_3383 BAM_3384     TRUE 0.750 -10.000 0.733 NA   NA
 6053569 6053570 BAM_3384 BAM_3385     FALSE 0.029 306.000 0.000 NA   NA
 6053570 6053571 BAM_3385 BAM_3386     FALSE 0.532 90.000 0.097 NA   NA
 6053571 6053572 BAM_3386 BAM_3387     FALSE 0.407 76.000 0.023 NA   NA
 6053572 6053573 BAM_3387 BAM_3388     FALSE 0.143 282.000 0.000 1.000 N NA
 6053575 6053576 BAM_3390 BAM_3391     FALSE 0.440 80.000 0.000 NA   NA
 6053576 6053577 BAM_3391 BAM_3392     FALSE 0.035 291.000 0.000 NA   NA
 6053577 6053578 BAM_3392 BAM_3393     FALSE 0.132 211.000 0.000 NA   NA
 6053584 6053585 BAM_3399 BAM_3400     FALSE 0.399 -16.000 0.154 NA   NA
 6053585 6053586 BAM_3400 BAM_3401     FALSE 0.614 141.000 0.025 NA   NA
 6053587 6053588 BAM_3402 BAM_3403     TRUE 0.843 16.000 0.225 NA N NA
 6053588 6053589 BAM_3403 BAM_3404     TRUE 0.884 101.000 0.412 NA N NA
 6053590 6053591 BAM_3405 BAM_3406     FALSE 0.308 181.000 0.095 NA   NA
 6053591 6053592 BAM_3406 BAM_3407     FALSE 0.572 -7.000 0.275 NA   NA
 6053592 6053593 BAM_3407 BAM_3408     FALSE 0.613 -3.000 0.157 NA   NA
 6053594 6053595 BAM_3409 BAM_3410     FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6053596 6053597 BAM_3411 BAM_3412     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053597 6053598 BAM_3412 BAM_3413     TRUE 0.860 15.000 0.098 1.000 N NA
 6053598 6053599 BAM_3413 BAM_3414   alo FALSE 0.029 332.000 0.000 1.000   NA
 6053601 6053602 BAM_3416 BAM_3417     TRUE 0.711 -3.000 0.350 NA   NA
 6053602 6053603 BAM_3417 BAM_3418     TRUE 0.718 24.000 0.350 1.000   NA
 6053603 6053604 BAM_3418 BAM_3419     FALSE 0.066 252.000 0.000 NA   NA
 6053606 6053607 BAM_3421 BAM_3422     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6053607 6053608 BAM_3422 BAM_3423     FALSE 0.246 184.000 0.000 NA   NA
 6053608 6053609 BAM_3423 BAM_3424     FALSE 0.524 66.000 0.412 NA   NA
 6053609 6053610 BAM_3424 BAM_3425     TRUE 0.676 -21.000 0.673 1.000   NA
 6053610 6053611 BAM_3425 BAM_3426     FALSE 0.576 23.000 0.145 NA   NA
 6053611 6053612 BAM_3426 BAM_3427     FALSE 0.495 57.000 0.364 NA   NA
 6053612 6053613 BAM_3427 BAM_3428     FALSE 0.020 337.000 0.000 NA   NA
 6053613 6053614 BAM_3428 BAM_3429     FALSE 0.019 339.000 0.000 NA   NA
 6053616 6053617 BAM_3431 BAM_3432     FALSE 0.010 428.000 0.000 NA   NA
 6053617 6053618 BAM_3432 BAM_3433     FALSE 0.166 202.000 0.000 NA   NA
 6053618 6053619 BAM_3433 BAM_3434     TRUE 0.854 11.000 0.133 NA N NA
 6053619 6053620 BAM_3434 BAM_3435     FALSE 0.026 341.000 0.000 1.000   NA
 6053620 6053621 BAM_3435 BAM_3436     FALSE 0.008 620.000 0.000 1.000   NA
 6053622 6053623 BAM_3437 BAM_3438 hisS1   FALSE 0.023 327.000 0.008 NA   NA
 6053623 6053624 BAM_3438 BAM_3439     FALSE 0.052 266.000 0.000 NA   NA
 6053626 6053627 BAM_3441 BAM_3442     FALSE 0.541 154.000 0.125 NA   NA
 6053628 6053629 BAM_3443 BAM_3444 pykA1   FALSE 0.521 93.000 0.028 NA   NA
 6053629 6053630 BAM_3444 BAM_3445     TRUE 0.659 103.000 0.200 NA   NA
 6053630 6053631 BAM_3445 BAM_3446     TRUE 0.704 113.000 0.200 NA   NA
 6053631 6053632 BAM_3446 BAM_3447     FALSE 0.382 57.000 0.130 NA   NA
 6053632 6053633 BAM_3447 BAM_3448     TRUE 0.662 -7.000 0.426 NA   NA
 6053633 6053634 BAM_3448 BAM_3449     FALSE 0.526 87.000 0.159 NA   NA
 6053635 6053636 BAM_3450 BAM_3451     FALSE 0.498 -12.000 0.269 NA   NA
 6053637 6053638 BAM_3452 BAM_3453     FALSE 0.337 174.000 0.067 NA   NA
 6053640 6053641 BAM_3455 BAM_3456     FALSE 0.390 180.000 0.136 1.000   NA
 6053642 6053643 BAM_3457 BAM_3458     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6053644 6053645 BAM_3459 BAM_3460     FALSE 0.203 195.000 0.030 NA   NA
 6053645 6053646 BAM_3460 BAM_3461     FALSE 0.631 62.000 0.050 NA N NA
 6053646 6053647 BAM_3461 BAM_3462     TRUE 0.971 123.000 0.200 NA Y NA
 6053647 6053648 BAM_3462 BAM_3463   maa FALSE 0.345 57.000 0.038 NA   NA
 6053648 6053649 BAM_3463 BAM_3464 maa   FALSE 0.029 307.000 0.000 NA   NA
 6053649 6053650 BAM_3464 BAM_3465     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053650 6053651 BAM_3465 BAM_3466     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6053651 6053652 BAM_3466 BAM_3467     FALSE 0.409 77.000 0.000 NA   NA
 6053654 6053655 BAM_3469 BAM_3470     FALSE 0.379 64.000 0.179 NA   NA
 6053656 6053657 BAM_3471 BAM_3472     FALSE 0.043 278.000 0.000 NA   NA
 6053658 6053659 BAM_3473 BAM_3474     FALSE 0.509 41.000 0.312 NA   NA
 6053662 6053663 BAM_3477 BAM_3478     TRUE 0.712 77.000 0.636 NA   NA
 6053664 6053665 BAM_3479 BAM_3480     FALSE 0.181 200.000 0.030 NA   NA
 6053665 6053666 BAM_3480 BAM_3481     FALSE 0.426 53.000 0.039 1.000   NA
 6053666 6053667 BAM_3481 BAM_3482     TRUE 0.791 120.000 0.235 1.000   NA
 6053671 6053672 BAM_3486 BAM_3487   gntK TRUE 0.977 122.000 0.316 1.000 Y NA
 6053672 6053673 BAM_3487 BAM_3488 gntK gntP2 TRUE 0.902 56.000 0.263 1.000 Y NA
 6053673 6053674 BAM_3488 BAM_3489 gntP2   FALSE 0.163 390.000 0.000 1.000 Y NA
 6053674 6053675 BAM_3489 BAM_3490     TRUE 0.931 52.000 0.545 1.000 Y NA
 6053675 6053676 BAM_3490 BAM_3491   tkt1 TRUE 0.979 105.000 0.636 1.000 Y NA
 6053676 6053677 BAM_3491 BAM_3492 tkt1 zwf TRUE 0.939 40.000 0.545 1.000 Y NA
 6053677 6053678 BAM_3492 BAM_3493 zwf   FALSE 0.034 351.000 0.000 0.001   NA
 6053678 6053679 BAM_3493 BAM_3494     FALSE 0.597 90.000 0.083 1.000   NA
 6053679 6053680 BAM_3494 BAM_3495     TRUE 0.957 14.000 0.111 NA Y NA
 6053680 6053681 BAM_3495 BAM_3496     TRUE 0.717 126.000 0.094 NA   NA
 6053683 6053684 BAM_3498 BAM_3499     FALSE 0.420 42.000 0.167 NA   NA
 6053684 6053685 BAM_3499 BAM_3500     FALSE 0.024 588.000 0.000 1.000 N NA
 6053685 6053686 BAM_3500 BAM_3501     FALSE 0.548 156.000 0.000 1.000   NA
 6053686 6053687 BAM_3501 BAM_3502     FALSE 0.025 343.000 0.000 1.000   NA
 6053687 6053688 BAM_3502 BAM_3503     FALSE 0.017 383.000 0.000 1.000   NA
 6053688 6053689 BAM_3503 BAM_3504     FALSE 0.014 412.000 0.000 1.000   NA
 6053689 6053690 BAM_3504 BAM_3505     TRUE 0.835 17.000 0.571 1.000   NA
 6053690 6053691 BAM_3505 BAM_3506     FALSE 0.009 580.000 0.000 1.000   NA
 6053691 6053692 BAM_3506 BAM_3507     FALSE 0.419 43.000 0.190 NA   NA
 6053694 6053695 BAM_3509 BAM_3510     FALSE 0.005 1153.000 0.000 NA   NA
 6053695 6053696 BAM_3510 BAM_3511     TRUE 0.711 131.000 0.154 NA   NA
 6053696 6053697 BAM_3511 BAM_3512     FALSE 0.450 164.000 0.128 NA   NA
 6053697 6053698 BAM_3512 BAM_3513     TRUE 0.741 110.000 0.286 NA   NA
 6053698 6053699 BAM_3513 BAM_3515     TRUE 0.738 12.000 0.333 NA   NA
 6053701 6053702 BAM_3517 BAM_3518     FALSE 0.551 33.000 0.130 1.000   NA
 6053702 6053703 BAM_3518 BAM_3519   cfa FALSE 0.149 218.000 0.000 1.000   NA
 6053703 6053704 BAM_3519 BAM_3520 cfa   FALSE 0.075 323.000 0.000 NA N NA
 6053704 6053705 BAM_3520 BAM_3521     TRUE 0.877 191.000 0.667 NA Y NA
 6053706 6053707 BAM_3522 BAM_3523     FALSE 0.532 79.000 0.262 NA   NA
 6053708 6053709 BAM_3524 BAM_3525     FALSE 0.591 26.000 0.250 NA   NA
 6053709 6053710 BAM_3525 BAM_3526     FALSE 0.572 28.000 0.250 NA   NA
 6053712 6053713 BAM_3528 BAM_3529     TRUE 0.704 12.000 0.093 1.000   NA
 6053713 6053714 BAM_3529 BAM_3530     TRUE 0.772 -3.000 0.300 0.084   NA
 6053714 6053715 BAM_3530 BAM_3531     TRUE 0.741 -3.000 0.238 0.084   NA
 6053715 6053716 BAM_3531 BAM_3532     TRUE 0.855 146.000 0.000 0.084 N NA
 6053716 6053717 BAM_3532 BAM_3533     TRUE 0.645 135.000 0.000 NA   NA
 6053717 6053718 BAM_3533 BAM_3534     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 6053720 6053721 BAM_3536 BAM_3537     FALSE 0.393 -12.000 0.000 NA   NA
 6053723 6053724 BAM_3539 BAM_3540     FALSE 0.088 232.000 0.000 NA   NA
 6053724 6053725 BAM_3540 BAM_3541     FALSE 0.356 47.000 0.000 NA   NA
 6053725 6053726 BAM_3541 BAM_3542     FALSE 0.292 178.000 0.000 NA   NA
 6053726 6053727 BAM_3542 BAM_3543   sigI TRUE 0.746 -7.000 0.605 NA   NA
 6053727 6053728 BAM_3543 BAM_3544 sigI   FALSE 0.006 570.000 0.000 NA   NA
 6053728 6053729 BAM_3544 BAM_3545     FALSE 0.366 43.000 0.000 NA   NA
 6053729 6053730 BAM_3545 BAM_3546     FALSE 0.018 343.000 0.000 NA   NA
 6053732 6053733 BAM_3548 BAM_3549     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6053735 6053736 BAM_3551 BAM_3552     FALSE 0.067 269.000 0.000 1.000   NA
 6053736 6053737 BAM_3552 BAM_3553     TRUE 0.949 1.000 0.860 1.000 N NA
 6053737 6053738 BAM_3553 BAM_3554     FALSE 0.534 155.000 0.186 NA   NA
 6053738 6053739 BAM_3554 BAM_3555     FALSE 0.523 76.000 0.289 NA   NA
 6053739 6053740 BAM_3555 BAM_3556     FALSE 0.035 291.000 0.000 NA   NA
 6053740 6053741 BAM_3556 BAM_3557     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6053742 6053743 BAM_3558 BAM_3559     FALSE 0.056 261.000 0.000 NA   NA
 6053744 6053745 BAM_3560 BAM_3561 bla2   TRUE 0.706 139.000 0.045 1.000   NA
 6053745 6053746 BAM_3561 BAM_3562     FALSE 0.461 35.000 0.130 NA   NA
 6053749 6053750 BAM_3565 BAM_3566     TRUE 0.720 111.000 0.250 NA   NA
 6053751 6053752 BAM_3567 BAM_3568     FALSE 0.043 278.000 0.000 NA   NA
 6053752 6053753 BAM_3568 BAM_3569     FALSE 0.353 171.000 0.056 NA   NA
 6053753 6053754 BAM_3569 BAM_3570     FALSE 0.628 14.000 0.085 NA   NA
 6053755 6053756 BAM_3571 BAM_3572     TRUE 0.752 14.000 0.386 NA   NA
 6053756 6053757 BAM_3572 BAM_3573     FALSE 0.619 105.000 0.000 NA   NA
 6053757 6053758 BAM_3573 BAM_3574     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6053761 6053762 BAM_3577 BAM_3578     FALSE 0.026 630.000 0.000 0.068 N NA
 6053764 6053765 BAM_3580 BAM_3581     TRUE 0.663 162.000 0.500 NA   NA
 6053765 6053766 BAM_3581 BAM_3582     FALSE 0.479 58.000 0.333 NA   NA
 6053769 6053770 BAM_2534 BAM_2535   gpm TRUE 0.693 168.000 0.023 1.000 N NA
 6053772 6053773 BAM_2537 BAM_2538     TRUE 0.822 113.000 0.444 NA   NA
 6053773 6053774 BAM_2538 BAM_2539     FALSE 0.497 77.000 0.250 NA   NA
 6053775 6053776 BAM_2540 BAM_2541     FALSE 0.014 373.000 0.000 NA   NA
 6053779 6053780 BAM_2544 BAM_2545   pepD FALSE 0.631 144.000 0.125 NA   NA
 6053781 6053782 BAM_2546 BAM_2547     FALSE 0.022 329.000 0.000 NA   NA
 6053783 6053784 BAM_2548 BAM_2549     FALSE 0.314 222.000 0.000 1.000 N NA
 6053784 6053785 BAM_2549 BAM_2550     TRUE 0.716 -10.000 0.636 NA   NA
 6053787 6053788 BAM_2552 BAM_2553     FALSE 0.497 77.000 0.250 NA   NA
 6053788 6053789 BAM_2553 BAM_2554   bla1 FALSE 0.083 327.000 0.000 1.000 N NA
 6053792 6053793 BAM_2557 BAM_2558 csbX   FALSE 0.244 -46.000 0.000 NA   NA
 6053794 6053795 BAM_2559 BAM_2560     TRUE 0.668 100.000 0.042 1.000   NA
 6053795 6053796 BAM_2560 BAM_2561   mmsA2 TRUE 0.842 39.000 0.667 1.000 N NA
 6053796 6053797 BAM_2561 BAM_2562 mmsA2   FALSE 0.239 -49.000 0.000 NA   NA
 6053797 6053798 BAM_2562 BAM_2563     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6053798 6053799 BAM_2563 BAM_2564     TRUE 0.896 123.000 0.000 1.000 N NA
 6053799 6053800 BAM_2564 BAM_2565   fba1 TRUE 0.970 129.000 0.000 1.000 Y NA
 6053800 6053801 BAM_2565 BAM_2566 fba1   FALSE 0.624 106.000 0.000 NA   NA
 6053801 6053802 BAM_2566 BAM_2567     FALSE 0.466 85.000 0.000 NA   NA
 6053804 6053805 BAM_2569 BAM_2570     FALSE 0.029 307.000 0.000 NA   NA
 6053806 6053807 BAM_2571 BAM_2572     TRUE 0.818 0.000 0.500 NA   NA
 6053808 6053809 BAM_2573 BAM_2574     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6053813 6053814 BAM_2578 BAM_2579     FALSE 0.030 305.000 0.000 NA   NA
 6053814 6053815 BAM_2579 BAM_2580     TRUE 0.672 129.000 0.000 NA   NA
 6053815 6053816 BAM_2580 BAM_2581     FALSE 0.007 531.000 0.000 NA   NA
 6053817 6053818 BAM_2582 BAM_2583     FALSE 0.012 394.000 0.000 NA   NA
 6053819 6053820 BAM_2584 BAM_2585     FALSE 0.034 445.000 0.000 1.000 N NA
 6053820 6053821 BAM_2585 BAM_2586     FALSE 0.571 145.000 0.000 NA   NA
 6053823 6053824 BAM_2588 BAM_2589     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6053824 6053825 BAM_2589 BAM_2590     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6053825 6053826 BAM_2590 BAM_2591     TRUE 0.665 111.000 0.059 NA   NA
 6053826 6053827 BAM_2591 BAM_2592     FALSE 0.137 210.000 0.000 NA   NA
 6053827 6053828 BAM_2592 BAM_2593     FALSE 0.081 245.000 0.069 NA   NA
 6053828 6053829 BAM_2593 BAM_2594     TRUE 0.923 -3.000 0.713 1.000 N NA
 6053829 6053830 BAM_2594 BAM_2596     TRUE 0.809 25.000 0.049 1.000 N NA
 6053831 6053832 BAM_2595 BAM_2597     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6053833 6053834 BAM_2598 BAM_2599     FALSE 0.116 217.000 0.000 NA   NA
 6053834 6053835 BAM_2599 BAM_2600     TRUE 0.958 16.000 0.067 1.000 Y NA
 6053835 6053836 BAM_2600 BAM_2601     TRUE 0.782 27.000 0.553 1.000   NA
 6053836 6053837 BAM_2601 BAM_2602   mvaB TRUE 0.856 22.000 0.778 1.000   NA
 6053837 6053838 BAM_2602 BAM_2603 mvaB   TRUE 0.949 5.000 0.690 0.082 N NA
 6053838 6053839 BAM_2603 BAM_2604     TRUE 0.975 3.000 0.426 1.000 Y NA
 6053839 6053840 BAM_2604 BAM_2605     TRUE 0.902 50.000 0.167 1.000 Y NA
 6053840 6053841 BAM_2605 BAM_2606     FALSE 0.360 170.000 0.045 NA   NA
 6053841 6053842 BAM_2606 BAM_2607     TRUE 0.737 121.000 0.219 NA   NA
 6053842 6053843 BAM_2607 BAM_2608     TRUE 0.704 49.000 0.188 1.000 N NA
 6053843 6053844 BAM_2608 BAM_2609     FALSE 0.528 -7.000 0.222 NA   NA
 6053844 6053845 BAM_2609 BAM_2610     TRUE 0.697 3.000 0.214 NA   NA
 6053846 6053847 BAM_2611 BAM_2612     FALSE 0.609 182.000 0.143 1.000 N NA
 6053847 6053848 BAM_2612 BAM_2613     TRUE 0.967 -10.000 0.932 0.022 Y NA
 6053849 6053850 BAM_2614 BAM_2615     FALSE 0.050 269.000 0.000 NA   NA
 6053850 6053851 BAM_2615 BAM_2616     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053851 6053852 BAM_2616 BAM_2617     TRUE 0.879 17.000 0.333 1.000 N NA
 6053852 6053853 BAM_2617 BAM_2618     FALSE 0.629 94.000 0.091 1.000   NA
 6053853 6053854 BAM_2618 BAM_2619     TRUE 0.679 108.000 0.152 NA   NA
 6053854 6053855 BAM_2619 BAM_2620     FALSE 0.343 170.000 0.000 NA   NA
 6053855 6053856 BAM_2620 BAM_2621     FALSE 0.355 71.000 0.000 NA   NA
 6053856 6053857 BAM_2621 BAM_2622     FALSE 0.016 355.000 0.000 NA   NA
 6053857 6053858 BAM_2622 BAM_2623     TRUE 0.683 137.000 0.167 NA   NA
 6053858 6053859 BAM_2623 BAM_2624     FALSE 0.491 88.000 0.036 NA   NA
 6053859 6053860 BAM_2624 BAM_2625     FALSE 0.465 80.000 0.060 NA   NA
 6053860 6053861 BAM_2625 BAM_2626     FALSE 0.013 382.000 0.000 NA   NA
 6053861 6053862 BAM_2626 BAM_2627     TRUE 0.763 -3.000 0.462 NA   NA
 6053862 6053863 BAM_2627 BAM_2628     FALSE 0.543 35.000 0.304 NA   NA
 6053863 6053864 BAM_2628 BAM_2629     TRUE 0.906 122.000 0.208 1.000 N NA
 6053866 6053867 BAM_2631 BAM_2632     FALSE 0.262 182.000 0.000 NA   NA
 6053867 6053868 BAM_2632 BAM_2633     FALSE 0.348 50.000 0.000 NA   NA
 6053872 6053873 BAM_2637 BAM_2638     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6053873 6053874 BAM_2638 BAM_2639     FALSE 0.355 71.000 0.000 NA   NA
 6053874 6053875 BAM_2639 BAM_2640     TRUE 0.683 137.000 0.125 NA   NA
 6053876 6053877 BAM_2641 BAM_2642     FALSE 0.233 -70.000 0.000 NA   NA
 6053878 6053879 BAM_2643 BAM_2644     FALSE 0.111 219.000 0.000 NA   NA
 6053879 6053880 BAM_2644 BAM_2645     FALSE 0.013 376.000 0.000 NA   NA
 6053880 6053881 BAM_2645 BAM_2646     FALSE 0.045 274.000 0.000 NA   NA
 6053881 6053882 BAM_2646 BAM_2647     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6053886 6053887 BAM_2651 BAM_2652     FALSE 0.417 34.000 0.000 NA   NA
 6053887 6053888 BAM_2652 BAM_2653     TRUE 0.904 126.000 0.156 1.000 N NA
 6053888 6053889 BAM_2653 BAM_2654     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6053889 6053890 BAM_2654 BAM_2655     FALSE 0.227 -106.000 0.000 NA   NA
 6053892 6053893 BAM_2657 BAM_2658     TRUE 0.792 10.000 0.350 1.000   NA
 6053893 6053894 BAM_2658 BAM_2659     FALSE 0.013 385.000 0.000 NA   NA
 6053894 6053895 BAM_2659 BAM_2660     FALSE 0.026 314.000 0.000 NA   NA
 6053895 6053896 BAM_2660 BAM_2661     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6053896 6053897 BAM_2661 BAM_2662     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053897 6053898 BAM_2662 BAM_2663     FALSE 0.338 68.000 0.000 NA   NA
 6053900 6053901 BAM_2665 BAM_2666     FALSE 0.477 88.000 0.000 NA   NA
 6053901 6053902 BAM_2666 BAM_2667     TRUE 0.972 122.000 0.038 1.000 Y NA
 6053902 6053903 BAM_2667 BAM_2668   ddlB TRUE 0.877 5.000 0.005 1.000 N NA
 6053903 6053904 BAM_2668 BAM_2669 ddlB tenA FALSE 0.154 275.000 0.000 1.000 N NA
 6053904 6053905 BAM_2669 BAM_2670 tenA   FALSE 0.199 194.000 0.000 NA   NA
 6053905 6053906 BAM_2670 BAM_2671     FALSE 0.383 -39.000 0.333 NA   NA
 6053906 6053907 BAM_2671 BAM_2672     FALSE 0.013 378.000 0.000 NA   NA
 6053907 6053908 BAM_2672 BAM_2673     FALSE 0.462 84.000 0.000 NA   NA
 6053910 6053911 BAM_2675 BAM_2676     TRUE 0.666 116.000 0.000 NA   NA
 6053912 6053913 BAM_2677 BAM_2678     FALSE 0.634 109.000 0.000 NA   NA
 6053914 6053915 BAM_2679 BAM_2680     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6053915 6053916 BAM_2680 BAM_2681     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6053916 6053917 BAM_2681 BAM_2682     TRUE 0.681 127.000 0.000 NA   NA
 6053917 6053918 BAM_2682 BAM_2683     TRUE 0.827 141.000 0.556 NA   NA
 6053920 6053921 BAM_2685 BAM_2686     FALSE 0.601 147.000 0.136 NA   NA
 6053921 6053922 BAM_2686 BAM_2687   cypA FALSE 0.493 160.000 0.188 NA   NA
 6053922 6053923 BAM_2687 BAM_2688 cypA   FALSE 0.050 269.000 0.000 NA   NA
 6053923 6053924 BAM_2688 BAM_2689     FALSE 0.435 -10.000 0.056 NA   NA
 6053924 6053925 BAM_2689 BAM_2690     FALSE 0.373 71.000 0.048 NA   NA
 6053927 6053928 BAM_2692 BAM_2693     TRUE 0.866 113.000 0.412 0.010   NA
 6053928 6053929 BAM_2693 BAM_2694     FALSE 0.528 178.000 0.412 1.000   NA
 6053929 6053930 BAM_2694 BAM_2695     FALSE 0.008 477.000 0.000 NA   NA
 6053930 6053931 BAM_2695 BAM_2696     FALSE 0.490 90.000 0.000 NA   NA
 6053931 6053932 BAM_2696 BAM_2697     FALSE 0.102 223.000 0.000 NA   NA
 6053932 6053933 BAM_2697 BAM_2698     FALSE 0.075 336.000 0.000 1.000 N NA
 6053935 6053936 BAM_2700 BAM_2701     TRUE 0.788 11.000 0.435 NA   NA
 6053936 6053937 BAM_2701 BAM_2702     TRUE 0.751 -7.000 0.530 1.000   NA
 6053937 6053938 BAM_2702 BAM_2703     FALSE 0.525 91.000 0.065 NA   NA
 6053939 6053940 BAM_2704 BAM_2705 kinB2   FALSE 0.610 88.000 0.222 1.000   NA
 6053941 6053942 BAM_2706 BAM_2707     FALSE 0.356 171.000 0.062 NA   NA
 6053942 6053943 BAM_2707 BAM_2708     FALSE 0.028 335.000 0.000 1.000   NA
 6053943 6053944 BAM_2708 BAM_2709     FALSE 0.007 535.000 0.000 NA   NA
 6053944 6053945 BAM_2709 BAM_2710     TRUE 0.671 112.000 0.063 NA   NA
 6053945 6053946 BAM_2710 BAM_2711     TRUE 0.725 5.000 0.048 1.000   NA
 6053946 6053947 BAM_2711 BAM_2712     FALSE 0.174 200.000 0.000 NA   NA
 6053947 6053948 BAM_2712 BAM_2713     FALSE 0.207 200.000 0.125 NA   NA
 6053949 6053950 BAM_2714 BAM_2715     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6053951 6053952 BAM_2716 BAM_2717     FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 6053952 6053953 BAM_2717 BAM_2718     FALSE 0.440 75.000 0.127 NA   NA
 6053953 6053954 BAM_2718 BAM_2719     FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 6053956 6053957 BAM_2721 BAM_2722   adP1 FALSE 0.513 151.000 0.000 NA   NA
 6053957 6053958 BAM_2722 BAM_2723 adP1   FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 6053958 6053959 BAM_2723 BAM_2724     FALSE 0.209 192.000 0.000 NA   NA
 6053959 6053960 BAM_2724 BAM_2725     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6053961 6053962 BAM_2726 BAM_2727     FALSE 0.534 178.000 0.500 NA   NA
 6053963 6053964 BAM_2728 BAM_2729     TRUE 0.746 46.000 0.778 1.000   NA
 6053967 6053968 BAM_2732 BAM_2733     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6053969 6053970 BAM_2734 BAM_2735     FALSE 0.509 25.000 0.000 NA   NA
 6053970 6053971 BAM_2735 BAM_2736     FALSE 0.623 139.000 0.000 NA   NA
 6053971 6053972 BAM_2736 BAM_2737     FALSE 0.605 141.000 0.000 NA   NA
 6053972 6053973 BAM_2737 BAM_2738     FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6053973 6053974 BAM_2738 BAM_2739     FALSE 0.601 23.000 0.000 1.000   NA
 6053974 6053975 BAM_2739 BAM_2740     FALSE 0.293 203.000 0.400 NA   NA
 6053975 6053976 BAM_2740 BAM_2741     TRUE 0.680 102.000 0.250 NA   NA
 6053976 6053977 BAM_2741 BAM_2742     FALSE 0.439 32.000 0.000 NA   NA
 6053977 6053978 BAM_2742 BAM_2743     FALSE 0.039 285.000 0.000 NA   NA
 6053978 6053979 BAM_2743 BAM_2744     FALSE 0.136 274.000 0.000 NA N NA
 6053979 6053980 BAM_2744 BAM_2745     FALSE 0.018 634.000 0.000 NA N NA
 6053980 6053981 BAM_2745 BAM_2746   dnaN2 TRUE 0.926 32.000 0.007 1.000 Y NA
 6053981 6053982 BAM_2746 BAM_2747 dnaN2   TRUE 0.946 23.000 0.004 1.000 Y NA
 6053982 6053983 BAM_2747 BAM_2748     FALSE 0.567 98.000 0.021 NA   NA
 6053983 6053984 BAM_2748 BAM_2749     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6053986 6053987 BAM_2751 BAM_2752     TRUE 0.718 136.000 0.250 NA   NA
 6053987 6053988 BAM_2752 BAM_2753     TRUE 0.720 119.000 0.111 NA   NA
 6053989 6053990 BAM_2754 BAM_2755     FALSE 0.466 79.000 0.082 NA   NA
 6053990 6053991 BAM_2755 BAM_2756     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6053991 6053992 BAM_2756 BAM_2757     FALSE 0.483 89.000 0.000 NA   NA
 6053992 6053993 BAM_2757 BAM_2758     FALSE 0.052 266.000 0.000 NA   NA
 6053993 6053994 BAM_2758 BAM_2759     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6053996 6053997 BAM_2761 BAM_2762     TRUE 0.678 2.000 0.108 NA   NA
 6053997 6053998 BAM_2762 BAM_2763     FALSE 0.619 17.000 0.108 NA   NA
 6053998 6053999 BAM_2763 BAM_2764     TRUE 0.647 64.000 0.171 NA N NA
 6053999 6054000 BAM_2764 BAM_2765     TRUE 0.783 83.000 0.280 NA N NA
 6054002 6054003 BAM_2767 BAM_2768     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6054003 6054004 BAM_2768 BAM_2769     FALSE 0.483 28.000 0.000 NA   NA
 6054004 6054005 BAM_2769 BAM_2770     FALSE 0.320 181.000 0.179 NA   NA
 6054006 6054007 BAM_2771 BAM_2772     TRUE 0.886 140.000 0.833 NA   NA
 6054008 6054009 BAM_2773 BAM_2774     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054009 6054010 BAM_2774 BAM_2775     FALSE 0.519 150.000 0.000 NA   NA
 6054010 6054011 BAM_2775 BAM_2776     FALSE 0.623 139.000 0.000 NA   NA
 6054011 6054012 BAM_2776 BAM_2777     FALSE 0.272 -31.000 0.000 NA   NA
 6054012 6054013 BAM_2777 BAM_2778     TRUE 0.719 126.000 0.099 NA   NA
 6054013 6054014 BAM_2778 BAM_2779     FALSE 0.588 148.000 0.167 NA   NA
 6054014 6054015 BAM_2779 BAM_2780     TRUE 0.662 139.000 0.097 NA   NA
 6054015 6054016 BAM_2780 BAM_2781     TRUE 0.665 109.000 0.081 NA   NA
 6054016 6054017 BAM_2781 BAM_2782     TRUE 0.669 137.000 0.088 NA   NA
 6054018 6054019 BAM_2783 BAM_2784     FALSE 0.222 202.000 0.250 NA   NA
 6054019 6054020 BAM_2784 BAM_2785     FALSE 0.005 967.000 0.000 NA   NA
 6054021 6054022 BAM_2786 BAM_2787     TRUE 0.686 56.000 0.143 1.000 N NA
 6054022 6054023 BAM_2787 BAM_2788     FALSE 0.606 33.000 0.286 1.000   NA
 6054023 6054024 BAM_2788 BAM_2789     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6054024 6054025 BAM_2789 BAM_2790     FALSE 0.005 662.000 0.000 NA   NA
 6054027 6054028 BAM_2792 BAM_2793     FALSE 0.009 460.000 0.000 NA   NA
 6054028 6054029 BAM_2793 BAM_2794     TRUE 0.719 1.000 0.265 NA   NA
 6054029 6054030 BAM_2794 BAM_2795     FALSE 0.194 251.000 0.000 NA N NA
 6054032 6054033 BAM_2797 BAM_2798     TRUE 0.693 135.000 0.143 NA   NA
 6054034 6054035 BAM_2799 BAM_2800     FALSE 0.021 360.000 0.000 1.000   NA
 6054035 6054036 BAM_2800 BAM_2802     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6054037 6054038 BAM_2801 BAM_2803     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6054040 6054041 BAM_2805 BAM_2806     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6054041 6054042 BAM_2806 BAM_2807     FALSE 0.333 56.000 0.000 NA   NA
 6054042 6054043 BAM_2807 BAM_2808     FALSE 0.630 108.000 0.000 NA   NA
 6054043 6054044 BAM_2808 BAM_2809     FALSE 0.616 26.000 0.280 NA   NA
 6054044 6054045 BAM_2809 BAM_2810     TRUE 0.701 113.000 0.143 NA   NA
 6054045 6054046 BAM_2810 BAM_2811   ypeB FALSE 0.541 27.000 0.105 NA   NA
 6054046 6054047 BAM_2811 BAM_2812 ypeB sleB TRUE 0.754 16.000 0.408 NA   NA
 6054049 6054050 BAM_2814 BAM_2815   kynA TRUE 0.894 117.000 0.066 1.000 N NA
 6054050 6054051 BAM_2815 BAM_2816 kynA kynB FALSE 0.540 34.000 0.165 1.000   NA
 6054051 6054052 BAM_2816 BAM_2817 kynB kynU TRUE 0.819 3.000 0.382 1.000   NA
 6054056 6054057 BAM_2821 BAM_2822     TRUE 0.677 152.000 0.385 NA   NA
 6054057 6054058 BAM_2822 BAM_2823     TRUE 0.884 137.000 0.750 NA   NA
 6054058 6054059 BAM_2823 BAM_2824     TRUE 0.724 112.000 0.250 NA   NA
 6054059 6054060 BAM_2824 BAM_2825     TRUE 0.735 125.000 0.208 NA   NA
 6054060 6054061 BAM_2825 BAM_2826     TRUE 0.782 18.000 0.500 NA   NA
 6054061 6054062 BAM_2826 BAM_2827     TRUE 0.670 151.000 0.350 NA   NA
 6054062 6054063 BAM_2827 BAM_2828     TRUE 0.892 13.000 0.350 1.000 N NA
 6054065 6054066 BAM_2830 BAM_2831     FALSE 0.513 33.000 0.022 1.000   NA
 6054066 6054067 BAM_2831 BAM_2832     TRUE 0.825 94.000 0.111 1.000 N NA
 6054067 6054068 BAM_2832 BAM_2833     FALSE 0.331 58.000 0.000 NA   NA
 6054068 6054069 BAM_2833 BAM_2834     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6054071 6054072 BAM_2836 BAM_2837 acoL acoC TRUE 0.964 16.000 0.294 1.000 Y NA
 6054072 6054073 BAM_2837 BAM_2838 acoC acoB TRUE 0.953 28.000 0.295 0.079 Y NA
 6054073 6054074 BAM_2838 BAM_2839 acoB acoA TRUE 0.981 18.000 0.804 0.001 Y NA
 6054074 6054075 BAM_2839 BAM_2840 acoA   FALSE 0.360 -16.000 0.033 NA   NA
 6054075 6054076 BAM_2840 BAM_2841     FALSE 0.505 31.000 0.150 NA   NA
 6054077 6054078 BAM_2842 BAM_2843     FALSE 0.420 42.000 0.143 NA   NA
 6054079 6054080 BAM_2844 BAM_2845     TRUE 0.737 20.000 0.429 NA   NA
 6054080 6054081 BAM_2845 BAM_2846     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6054081 6054082 BAM_2846 BAM_2847     FALSE 0.511 93.000 0.000 NA   NA
 6054082 6054083 BAM_2847 BAM_2848     FALSE 0.342 69.000 0.000 NA   NA
 6054083 6054084 BAM_2848 BAM_2849     TRUE 0.662 115.000 0.000 NA   NA
 6054084 6054085 BAM_2849 BAM_2850     FALSE 0.008 477.000 0.000 NA   NA
 6054085 6054086 BAM_2850 BAM_2851   proV2 TRUE 0.941 -7.000 0.094 0.096 Y NA
 6054088 6054089 BAM_2853 BAM_2854 clpP1   TRUE 0.906 22.000 0.647 1.000 N NA
 6054090 6054091 BAM_2855 BAM_2856   rpiA TRUE 0.878 5.000 0.011 1.000 N NA
 6054091 6054092 BAM_2856 BAM_2857 rpiA   TRUE 0.702 108.000 0.011 1.000   NA
 6054093 6054094 BAM_2858 BAM_2859     FALSE 0.012 438.000 0.000 1.000   NA
 6054094 6054095 BAM_2859 BAM_2860     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054095 6054096 BAM_2860 BAM_2861     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6054096 6054097 BAM_2861 BAM_2862     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054097 6054098 BAM_2862 BAM_2863     FALSE 0.351 66.000 0.055 NA   NA
 6054098 6054099 BAM_2863 BAM_2864     FALSE 0.604 19.000 0.115 NA   NA
 6054099 6054100 BAM_2864 BAM_2865     FALSE 0.624 106.000 0.000 NA   NA
 6054100 6054101 BAM_2865 BAM_2866     FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6054101 6054102 BAM_2866 BAM_2867     TRUE 0.649 13.000 0.135 NA   NA
 6054103 6054104 BAM_2868 BAM_2869     TRUE 0.706 3.000 0.231 NA   NA
 6054105 6054106 BAM_2870 BAM_2871     FALSE 0.190 207.000 0.000 1.000   NA
 6054106 6054107 BAM_2871 BAM_2872     TRUE 0.833 27.000 0.875 NA   NA
 6054107 6054108 BAM_2872 BAM_2873     TRUE 0.780 -3.000 0.500 NA   NA
 6054108 6054109 BAM_2873 BAM_2874     FALSE 0.585 145.000 0.035 NA   NA
 6054109 6054110 BAM_2874 BAM_2875     FALSE 0.427 35.000 0.049 NA   NA
 6054110 6054111 BAM_2875 BAM_2876     FALSE 0.476 -13.000 0.262 NA   NA
 6054111 6054112 BAM_2876 BAM_2877     FALSE 0.350 170.000 0.021 NA   NA
 6054112 6054113 BAM_2877 BAM_2878     FALSE 0.331 63.000 0.011 NA   NA
 6054115 6054116 BAM_2880 BAM_2881     FALSE 0.281 185.000 0.156 NA   NA
 6054116 6054117 BAM_2881 BAM_2882   recQ2 FALSE 0.524 26.000 0.050 NA   NA
 6054118 6054119 BAM_2883 BAM_2884     FALSE 0.006 618.000 0.000 NA   NA
 6054120 6054121 BAM_2885 BAM_2886     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6054123 6054124 BAM_2888 BAM_2889     FALSE 0.242 -48.000 0.000 NA   NA
 6054124 6054125 BAM_2889 BAM_2890   ppaC FALSE 0.624 106.000 0.000 NA   NA
 6054125 6054126 BAM_2890 BAM_2891 ppaC   FALSE 0.498 162.000 0.018 1.000   NA
 6054126 6054127 BAM_2891 BAM_2892     FALSE 0.132 225.000 0.014 1.000   NA
 6054127 6054128 BAM_2892 BAM_2893     FALSE 0.149 218.000 0.000 1.000   NA
 6054128 6054129 BAM_2893 BAM_2894     TRUE 0.719 103.000 0.206 1.000   NA
 6054129 6054130 BAM_2894 BAM_2895     TRUE 0.906 108.000 0.368 1.000 N NA
 6054130 6054131 BAM_2895 BAM_2896   dapA1 TRUE 0.893 19.000 0.474 1.000 N NA
 6054131 6054132 BAM_2896 BAM_2897 dapA1   TRUE 0.963 23.000 0.474 1.000 Y NA
 6054132 6054133 BAM_2897 BAM_2898     TRUE 0.980 -3.000 0.750 0.001 Y NA
 6054133 6054134 BAM_2898 BAM_2899     TRUE 0.960 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 6054135 6054136 BAM_2900 BAM_2901     FALSE 0.166 202.000 0.000 NA   NA
 6054136 6054137 BAM_2901 BAM_2902     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054137 6054138 BAM_2902 BAM_2903   gidA1 FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054139 6054140 BAM_2904 BAM_2905     TRUE 0.730 -12.000 0.722 NA   NA
 6054141 6054142 BAM_2906 BAM_2907     FALSE 0.086 235.000 0.000 NA   NA
 6054145 6054146 BAM_2910 BAM_2911 dltD2   FALSE 0.175 267.000 0.000 1.000 N NA
 6054146 6054147 BAM_2911 BAM_2912     TRUE 0.936 118.000 0.500 1.000 N NA
 6054147 6054148 BAM_2912 BAM_2913     TRUE 0.841 21.000 0.308 NA N NA
 6054148 6054149 BAM_2913 BAM_2914     TRUE 0.902 40.000 0.147 NA Y NA
 6054149 6054150 BAM_2914 BAM_2915     FALSE 0.503 152.000 0.000 NA   NA
 6054150 6054151 BAM_2915 BAM_2916   divIC2 FALSE 0.058 260.000 0.000 NA   NA
 6054151 6054152 BAM_2916 BAM_2917 divIC2   FALSE 0.007 500.000 0.000 NA   NA
 6054154 6054155 BAM_2919 BAM_2920     FALSE 0.027 312.000 0.000 NA   NA
 6054155 6054156 BAM_2920 BAM_2921     FALSE 0.166 202.000 0.000 NA   NA
 6054158 6054159 BAM_2923 BAM_2924     FALSE 0.232 201.000 0.051 1.000   NA
 6054159 6054160 BAM_2924 BAM_2925     TRUE 0.940 -7.000 0.256 1.000 Y NA
 6054162 6054163 BAM_2927 BAM_2928     FALSE 0.050 269.000 0.000 NA   NA
 6054163 6054164 BAM_2928 BAM_2929     FALSE 0.340 53.000 0.000 NA   NA
 6054164 6054165 BAM_2929 BAM_2930     FALSE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 6054165 6054166 BAM_2930 BAM_2931     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054166 6054167 BAM_2931 BAM_2932     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054167 6054168 BAM_2932 BAM_2933     FALSE 0.383 38.000 0.000 NA   NA
 6054168 6054169 BAM_2933 BAM_2934     FALSE 0.146 207.000 0.000 NA   NA
 6054169 6054170 BAM_2934 BAM_2935     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054171 6054172 BAM_2936 BAM_2937     FALSE 0.074 244.000 0.000 NA   NA
 6054175 6054176 BAM_2940 BAM_2941     TRUE 0.714 25.000 0.438 NA   NA
 6054176 6054177 BAM_2941 BAM_2942     TRUE 0.825 19.000 0.667 NA   NA
 6054177 6054178 BAM_2942 BAM_2943     TRUE 0.825 14.000 0.577 NA   NA
 6054178 6054179 BAM_2943 BAM_2944     FALSE 0.534 161.000 0.269 NA   NA
 6054181 6054182 BAM_2946 BAM_2947     FALSE 0.572 28.000 0.250 NA   NA
 6054182 6054183 BAM_2947 BAM_2948     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6054183 6054184 BAM_2948 BAM_2949     FALSE 0.305 -22.000 0.000 NA   NA
 6054184 6054185 BAM_2949 BAM_2950     TRUE 0.703 78.000 0.583 NA   NA
 6054185 6054186 BAM_2950 BAM_2951     FALSE 0.601 174.000 0.500 1.000   NA
 6054186 6054187 BAM_2951 BAM_2952     TRUE 0.768 78.000 0.778 NA   NA
 6054187 6054188 BAM_2952 BAM_2953     FALSE 0.431 79.000 0.000 NA   NA
 6054188 6054189 BAM_2953 BAM_2954     FALSE 0.191 196.000 0.000 NA   NA
 6054189 6054190 BAM_2954 BAM_2955     TRUE 0.816 152.000 0.750 NA   NA
 6054191 6054192 BAM_2956 BAM_2957     FALSE 0.568 51.000 0.455 NA   NA
 6054192 6054193 BAM_2957 BAM_2958     FALSE 0.054 265.000 0.000 NA   NA
 6054193 6054194 BAM_2958 BAM_2959     FALSE 0.503 152.000 0.000 NA   NA
 6054194 6054195 BAM_2959 BAM_2960     FALSE 0.259 -34.000 0.000 NA   NA
 6054195 6054196 BAM_2960 BAM_2961     FALSE 0.332 171.000 0.000 NA   NA
 6054196 6054197 BAM_2961 BAM_2962     FALSE 0.302 181.000 0.080 NA   NA
 6054197 6054198 BAM_2962 BAM_2963     TRUE 0.650 57.000 0.120 NA N NA
 6054198 6054199 BAM_2963 BAM_2964   coaA TRUE 0.788 93.000 0.072 NA N NA
 6054200 6054201 BAM_2965 BAM_2966     FALSE 0.222 188.000 0.000 NA   NA
 6054201 6054202 BAM_2966 BAM_2967     FALSE 0.329 60.000 0.000 NA   NA
 6054202 6054203 BAM_2967 BAM_2968     FALSE 0.428 33.000 0.000 NA   NA
 6054203 6054204 BAM_2968 BAM_2969     TRUE 0.820 -3.000 0.636 NA   NA
 6054204 6054205 BAM_2969 BAM_2970     FALSE 0.612 104.000 0.000 NA   NA
 6054205 6054206 BAM_2970 BAM_2971     TRUE 0.685 124.000 0.000 NA   NA
 6054207 6054208 BAM_2972 BAM_2973     FALSE 0.599 165.000 0.429 NA   NA
 6054208 6054209 BAM_2973 BAM_2974     TRUE 0.836 28.000 1.000 NA   NA
 6054209 6054210 BAM_2974 BAM_2975     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6054210 6054211 BAM_2975 BAM_2976     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6054211 6054212 BAM_2976 BAM_2977     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6054212 6054213 BAM_2977 BAM_2978     FALSE 0.571 26.000 0.222 NA   NA
 6054216 6054217 BAM_2981 BAM_2982   ssuD FALSE 0.600 144.000 0.051 NA   NA
 6054217 6054218 BAM_2982 BAM_2983 ssuD   TRUE 0.737 77.000 0.034 1.000 N NA
 6054218 6054219 BAM_2983 BAM_2984     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6054219 6054220 BAM_2984 BAM_2985     FALSE 0.581 100.000 0.000 NA   NA
 6054220 6054221 BAM_2985 BAM_2986     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6054221 6054222 BAM_2986 BAM_2987     FALSE 0.095 228.000 0.000 NA   NA
 6054222 6054223 BAM_2987 BAM_2988     FALSE 0.356 47.000 0.000 NA   NA
 6054223 6054224 BAM_2988 BAM_2989     FALSE 0.137 210.000 0.000 NA   NA
 6054224 6054225 BAM_2989 BAM_2990     TRUE 0.692 104.000 0.250 NA   NA
 6054225 6054226 BAM_2990 BAM_2991     FALSE 0.549 -7.000 0.250 NA   NA
 6054226 6054227 BAM_2991 BAM_2992     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054227 6054228 BAM_2992 BAM_2993     TRUE 0.684 124.000 0.002 NA   NA
 6054228 6054229 BAM_2993 BAM_2994   aacC7 FALSE 0.583 16.000 0.008 NA   NA
 6054231 6054232 BAM_2996 BAM_2997     TRUE 0.846 21.000 0.800 NA   NA
 6054232 6054233 BAM_2997 BAM_2998     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054233 6054234 BAM_2998 BAM_2999     FALSE 0.252 -37.000 0.000 NA   NA
 6054234 6054235 BAM_2999 BAM_3000     FALSE 0.599 57.000 0.538 NA   NA
 6054235 6054236 BAM_3000 BAM_3001     FALSE 0.498 70.000 0.333 NA   NA
 6054236 6054237 BAM_3001 BAM_3002     TRUE 0.780 16.000 0.467 NA   NA
 6054237 6054238 BAM_3002 BAM_3003     TRUE 0.950 35.000 0.500 0.022 Y NA
 6054238 6054239 BAM_3003 BAM_3004     TRUE 0.695 16.000 0.179 1.000   NA
 6054239 6054240 BAM_3004 BAM_3005     FALSE 0.625 17.000 0.179 NA   NA
 6054240 6054241 BAM_3005 BAM_3006     FALSE 0.015 366.000 0.000 NA   NA
 6054241 6054242 BAM_3006 BAM_3007     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6054243 6054244 BAM_3008 BAM_3009     FALSE 0.496 160.000 0.200 NA   NA
 6054244 6054245 BAM_3009 BAM_3010     TRUE 0.668 111.000 0.067 NA   NA
 6054246 6054247 BAM_3011 BAM_3012     FALSE 0.010 517.000 0.000 1.000   NA
 6054247 6054248 BAM_3012 BAM_3013     FALSE 0.013 378.000 0.000 NA   NA
 6054248 6054249 BAM_3013 BAM_3014     FALSE 0.038 287.000 0.000 NA   NA
 6054249 6054250 BAM_3014 BAM_3015     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6054250 6054251 BAM_3015 BAM_3016     FALSE 0.064 254.000 0.000 NA   NA
 6054251 6054252 BAM_3016 BAM_3017     FALSE 0.065 270.000 0.000 1.000   NA
 6054252 6054253 BAM_3017 BAM_3018   aroA FALSE 0.295 186.000 0.005 1.000   NA
 6054253 6054254 BAM_3018 BAM_3019 aroA tyrA TRUE 0.957 17.000 0.069 1.000 Y NA
 6054254 6054255 BAM_3019 BAM_3020 tyrA hisC2 TRUE 0.934 -7.000 0.062 1.000 Y NA
 6054255 6054256 BAM_3020 BAM_3021 hisC2 aroC2 TRUE 0.952 19.000 0.007 1.000 Y NA
 6054256 6054257 BAM_3021 BAM_3022 aroC2   TRUE 0.685 123.000 0.000 NA   NA
 6054257 6054258 BAM_3022 BAM_3023     FALSE 0.329 64.000 0.000 NA   NA
 6054258 6054259 BAM_3023 BAM_3024     FALSE 0.007 541.000 0.000 NA   NA
 6054259 6054260 BAM_3024 BAM_3025     FALSE 0.354 48.000 0.000 NA   NA
 6054262 6054263 BAM_3027 BAM_3028     TRUE 0.876 17.000 0.231 0.076 N NA
 6054263 6054264 BAM_3028 BAM_3029     FALSE 0.618 20.000 0.231 NA   NA
 6054266 6054267 BAM_3031 BAM_3032     FALSE 0.227 187.000 0.000 NA   NA
 6054267 6054268 BAM_3032 BAM_3033     FALSE 0.362 44.000 0.000 NA   NA
 6054268 6054269 BAM_3033 BAM_3034     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6054269 6054270 BAM_3034 BAM_3035     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6054271 6054272 BAM_3036 BAM_3037     TRUE 0.684 125.000 0.000 NA   NA
 6054275 6054276 BAM_3040 BAM_3041     TRUE 0.976 -3.000 0.844 NA Y NA
 6054278 6054279 BAM_3042 BAM_3044     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054280 6054281 BAM_3045 BAM_3046     TRUE 0.883 0.000 0.250 1.000 N NA
 6054281 6054282 BAM_3046 BAM_3047     TRUE 0.944 26.000 0.062 1.000 Y NA
 6054282 6054283 BAM_3047 BAM_3048     TRUE 0.965 7.000 0.031 1.000 Y NA
 6054284 6054285 BAM_3049 BAM_3050     FALSE 0.027 337.000 0.000 1.000   NA
 6054285 6054286 BAM_3050 BAM_3051     FALSE 0.525 83.000 0.222 NA   NA
 6054286 6054287 BAM_3051 BAM_3052     FALSE 0.581 97.000 0.071 NA   NA
 6054287 6054288 BAM_3052 BAM_3053     FALSE 0.612 97.000 0.214 NA   NA
 6054288 6054289 BAM_3053 BAM_3054     FALSE 0.637 52.000 0.600 NA   NA
 6054290 6054291 BAM_3055 BAM_3056     FALSE 0.156 204.000 0.000 NA   NA
 6054292 6054293 BAM_3057 BAM_3058 proA proB TRUE 0.950 30.000 0.281 0.002 Y NA
 6054293 6054294 BAM_3058 BAM_3059 proB   FALSE 0.008 494.000 0.000 NA   NA
 6054296 6054297 BAM_3061 BAM_3062 rocB   FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6054298 6054299 BAM_4878 BAM_4879   gap1 FALSE 0.515 85.000 0.111 NA   NA
 6054299 6054300 BAM_4879 BAM_4880 gap1   TRUE 0.876 110.000 0.020 1.000 N NA
 6054300 6054301 BAM_4880 BAM_4881     FALSE 0.356 52.000 0.038 NA   NA
 6054301 6054302 BAM_4881 BAM_4882   mutM FALSE 0.389 73.000 0.050 NA   NA
 6054302 6054303 BAM_4882 BAM_4883 mutM polA TRUE 0.962 13.000 0.101 1.000 Y NA
 6054303 6054304 BAM_4883 BAM_4884 polA phoR FALSE 0.135 287.000 0.006 1.000 N NA
 6054304 6054305 BAM_4884 BAM_4885 phoR phoP TRUE 0.942 -7.000 0.159 0.082 Y NA
 6054305 6054306 BAM_4885 BAM_4886 phoP   FALSE 0.535 148.000 0.000 NA   NA
 6054308 6054309 BAM_4888 BAM_4889   mdh FALSE 0.345 217.000 0.022 1.000 N NA
 6054309 6054310 BAM_4889 BAM_4890 mdh citC TRUE 0.954 20.000 0.115 1.000 Y NA
 6054310 6054311 BAM_4890 BAM_4891 citC citZ TRUE 0.928 161.000 0.140 1.000 Y NA
 6054311 6054312 BAM_4891 BAM_4892 citZ   FALSE 0.013 388.000 0.039 NA   NA
 6054314 6054315 BAM_4894 BAM_4895   pyk FALSE 0.245 200.000 0.082 1.000   NA
 6054315 6054316 BAM_4895 BAM_4896 pyk pfkA TRUE 0.915 54.000 0.261 0.004 Y NA
 6054316 6054317 BAM_4896 BAM_4897 pfkA accA TRUE 0.894 129.000 0.047 1.000 N NA
 6054317 6054318 BAM_4897 BAM_4898 accA accD TRUE 0.932 -12.000 0.234 0.001 Y NA
 6054318 6054319 BAM_4898 BAM_4899 accD   FALSE 0.552 186.000 0.032 1.000 N NA
 6054319 6054320 BAM_4899 BAM_4900     TRUE 0.913 15.000 0.514 1.000 N NA
 6054320 6054321 BAM_4900 BAM_4901   dnaE TRUE 0.873 104.000 0.127 1.000 N NA
 6054322 6054323 BAM_4902 BAM_4903     TRUE 0.769 -3.000 0.481 NA   NA
 6054324 6054325 BAM_4904 BAM_4905     FALSE 0.526 93.000 0.038 NA   NA
 6054327 6054328 BAM_4907 BAM_4908     FALSE 0.274 181.000 0.000 NA   NA
 6054328 6054329 BAM_4908 BAM_4909     FALSE 0.235 194.000 0.120 NA   NA
 6054333 6054334 BAM_4913 BAM_4914     TRUE 0.666 21.000 0.300 NA   NA
 6054336 6054337 BAM_4916 BAM_4917     FALSE 0.012 392.000 0.000 NA   NA
 6054337 6054338 BAM_4917 BAM_4918     FALSE 0.422 73.000 0.160 NA   NA
 6054338 6054339 BAM_4918 BAM_4919     TRUE 0.739 3.000 0.280 NA   NA
 6054339 6054340 BAM_4919 BAM_4920     TRUE 0.718 -3.000 0.368 NA   NA
 6054340 6054341 BAM_4920 BAM_4921     FALSE 0.499 45.000 0.316 NA   NA
 6054342 6054343 BAM_4922 BAM_4923     TRUE 0.812 -3.000 0.600 NA   NA
 6054344 6054345 BAM_4924 BAM_4925 ald2   FALSE 0.357 214.000 0.000 1.000 N NA
 6054349 6054350 BAM_4929 BAM_4930   argH2 FALSE 0.571 99.000 0.006 NA   NA
 6054350 6054351 BAM_4930 BAM_4931 argH2 argG TRUE 0.960 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 6054352 6054353 BAM_4932 BAM_4933     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054355 6054356 BAM_4935 BAM_4936     FALSE 0.006 632.000 0.000 NA   NA
 6054358 6054359 BAM_4938 BAM_4939     FALSE 0.412 72.000 0.125 NA   NA
 6054360 6054361 BAM_4940 BAM_4941 ackA   FALSE 0.128 299.000 0.217 1.000 N NA
 6054361 6054362 BAM_4941 BAM_4942     FALSE 0.472 200.000 0.089 1.000 N NA
 6054362 6054363 BAM_4942 BAM_4943     TRUE 0.650 135.000 0.018 NA   NA
 6054363 6054364 BAM_4943 BAM_4944     TRUE 0.875 13.000 0.800 NA   NA
 6054366 6054367 BAM_4946 BAM_4947     FALSE 0.399 70.000 0.146 NA   NA
 6054367 6054368 BAM_4947 BAM_4948     TRUE 0.655 103.000 0.156 NA   NA
 6054368 6054369 BAM_4948 BAM_4949   sspB FALSE 0.067 278.000 0.111 1.000   NA
 6054369 6054370 BAM_4949 BAM_4950 sspB thiI FALSE 0.532 81.000 0.018 1.000   NA
 6054370 6054371 BAM_4950 BAM_4951 thiI   TRUE 0.904 7.000 0.349 1.000 N NA
 6054371 6054372 BAM_4951 BAM_4952   ezrA TRUE 0.706 169.000 0.201 1.000 N NA
 6054376 6054377 BAM_4956 BAM_4957     FALSE 0.362 72.000 0.000 NA   NA
 6054379 6054380 BAM_4959 BAM_4960 megL   FALSE 0.048 270.000 0.000 NA   NA
 6054384 6054385 BAM_4964 BAM_4965 tyrS1   FALSE 0.013 377.000 0.000 NA   NA
 6054385 6054386 BAM_4965 BAM_4966     FALSE 0.347 -19.000 0.059 NA   NA
 6054386 6054387 BAM_4966 BAM_4967     FALSE 0.347 -19.000 0.059 NA   NA
 6054387 6054388 BAM_4967 BAM_4968   acsA FALSE 0.043 278.000 0.000 NA   NA
 6054389 6054390 BAM_4969 BAM_4970 acuA acuB TRUE 0.731 18.000 0.143 0.075   NA
 6054390 6054391 BAM_4970 BAM_4971 acuB acuC TRUE 0.843 -3.000 0.075 1.000 N NA
 6054392 6054393 BAM_4972 BAM_4973     FALSE 0.145 215.000 0.150 NA   NA
 6054393 6054394 BAM_4973 BAM_4974     TRUE 0.982 2.000 0.725 1.000 Y NA
 6054395 6054396 BAM_4975 BAM_4976     FALSE 0.460 80.000 0.049 NA   NA
 6054396 6054397 BAM_4976 BAM_4977   mscL TRUE 0.740 129.000 0.012 1.000   NA
 6054399 6054400 BAM_4979 BAM_4980     TRUE 0.805 82.000 0.857 NA   NA
 6054400 6054401 BAM_4980 BAM_4981     TRUE 0.850 2.000 0.583 NA   NA
 6054402 6054403 BAM_4982 BAM_4983 ccpA   FALSE 0.007 529.000 0.000 NA   NA
 6054403 6054404 BAM_4983 BAM_4984     TRUE 0.702 118.000 0.069 NA   NA
 6054404 6054405 BAM_4984 BAM_4985     TRUE 0.649 0.000 0.079 NA   NA
 6054407 6054408 BAM_4987 BAM_4988     TRUE 0.764 16.000 0.429 NA   NA
 6054408 6054409 BAM_4988 BAM_4989     TRUE 0.758 -3.000 0.444 NA   NA
 6054409 6054410 BAM_4989 BAM_4990     FALSE 0.545 92.000 0.097 NA   NA
 6054410 6054411 BAM_4990 BAM_4991   murC FALSE 0.472 197.000 0.005 1.000 N NA
 6054411 6054412 BAM_4991 BAM_4992 murC   FALSE 0.215 253.000 0.002 1.000 N NA
 6054412 6054413 BAM_4992 BAM_4993     TRUE 0.674 62.000 0.084 1.000 N NA
 6054413 6054414 BAM_4993 BAM_4994     FALSE 0.104 222.000 0.000 NA   NA
 6054414 6054415 BAM_4994 BAM_4995     FALSE 0.028 312.000 0.034 NA   NA
 6054415 6054416 BAM_4995 BAM_4996     TRUE 0.790 -3.000 0.511 NA   NA
 6054416 6054417 BAM_4996 BAM_4997     FALSE 0.578 59.000 0.500 NA   NA
 6054417 6054418 BAM_4997 BAM_4998     FALSE 0.487 84.000 0.062 NA   NA
 6054418 6054419 BAM_4998 BAM_4999     FALSE 0.087 242.000 0.084 NA   NA
 6054421 6054422 BAM_5001 BAM_5002   trmB FALSE 0.465 70.000 0.117 1.000   NA
 6054424 6054425 BAM_5004 BAM_5005     FALSE 0.264 230.000 0.078 NA N NA
 6054425 6054426 BAM_5005 BAM_5006     FALSE 0.288 -25.000 0.000 NA   NA
 6054426 6054427 BAM_5006 BAM_5007     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6054427 6054428 BAM_5007 BAM_5008     TRUE 0.873 104.000 0.138 1.000 N NA
 6054430 6054431 BAM_5010 BAM_5011     FALSE 0.473 42.000 0.082 1.000   NA
 6054432 6054433 BAM_5012 BAM_5013     FALSE 0.326 -19.000 0.000 NA   NA
 6054433 6054434 BAM_5013 BAM_5014     FALSE 0.233 -70.000 0.000 NA   NA
 6054435 6054436 BAM_5015 BAM_5016     TRUE 0.792 1.000 0.413 NA   NA
 6054438 6054439 BAM_5018 BAM_5019     TRUE 0.719 2.000 0.258 NA   NA
 6054440 6054441 BAM_5020 BAM_5021     FALSE 0.224 -440.000 0.000 NA   NA
 6054442 6054443 BAM_5022 BAM_5023 gdH glcU TRUE 0.931 14.000 0.700 1.000 N NA
 6054443 6054444 BAM_5023 BAM_5024 glcU   TRUE 0.766 37.000 0.875 NA   NA
 6054444 6054445 BAM_5024 BAM_5025   moaD3 FALSE 0.526 94.000 0.014 NA   NA
 6054445 6054446 BAM_5025 BAM_5026 moaD3 moaE3 TRUE 0.981 3.000 0.501 0.005 Y NA
 6054446 6054447 BAM_5026 BAM_5027 moaE3 mobB TRUE 0.960 -3.000 0.040 0.005 Y NA
 6054447 6054448 BAM_5027 BAM_5028 mobB moeA3 TRUE 0.884 -30.000 0.200 0.005 Y NA
 6054450 6054451 BAM_5030 BAM_5031     TRUE 0.978 17.000 0.778 1.000 Y NA
 6054451 6054452 BAM_5031 BAM_5032     FALSE 0.376 175.000 0.000 1.000   NA
 6054452 6054453 BAM_5032 BAM_5033     FALSE 0.312 174.000 0.000 NA   NA
 6054453 6054454 BAM_5033 BAM_5034     TRUE 0.871 15.000 0.800 NA   NA
 6054454 6054455 BAM_5034 BAM_5035     FALSE 0.599 78.000 0.381 NA   NA
 6054458 6054459 BAM_5040 BAM_5041   gerHB TRUE 0.829 18.000 0.450 0.008   NA
 6054459 6054460 BAM_5041 BAM_5042 gerHB gerHC TRUE 0.733 -24.000 0.800 0.008   NA
 6054460 6054461 BAM_5042 BAM_5043 gerHC   TRUE 0.824 91.000 0.800 NA   NA
 6054461 6054462 BAM_5043 BAM_5044     FALSE 0.253 190.000 0.121 NA   NA
 6054465 6054466 BAM_5047 BAM_5048 leuS   FALSE 0.027 475.000 0.000 NA N NA
 6054466 6054467 BAM_5048 BAM_5049     FALSE 0.174 370.000 0.000 NA Y NA
 6054467 6054468 BAM_5049 BAM_5050     TRUE 0.985 4.000 0.875 1.000 Y NA
 6054468 6054469 BAM_5050 BAM_5051     TRUE 0.742 35.000 0.636 1.000   NA
 6054469 6054470 BAM_5051 BAM_5052     FALSE 0.023 350.000 0.000 1.000   NA
 6054470 6054471 BAM_5052 BAM_5053     TRUE 0.742 19.000 0.333 1.000   NA
 6054471 6054472 BAM_5053 BAM_5054     FALSE 0.019 339.000 0.000 NA   NA
 6054472 6054473 BAM_5054 BAM_5055     TRUE 0.764 137.000 0.333 NA   NA
 6054473 6054474 BAM_5055 BAM_5056     TRUE 0.819 16.000 0.583 NA   NA
 6054475 6054476 BAM_5057 BAM_5058     TRUE 0.774 -3.000 0.408 1.000   NA
 6054476 6054477 BAM_5058 BAM_5059     FALSE 0.240 198.000 0.031 1.000   NA
 6054477 6054478 BAM_5059 BAM_5060     FALSE 0.614 19.000 0.208 NA   NA
 6054478 6054479 BAM_5060 BAM_5061     FALSE 0.597 25.000 0.250 NA   NA
 6054479 6054480 BAM_5061 BAM_5062     FALSE 0.630 156.000 0.263 1.000   NA
 6054481 6054482 BAM_5063 BAM_5064     FALSE 0.360 62.000 0.080 NA   NA
 6054485 6054486 BAM_5067 BAM_5068     TRUE 0.651 145.000 0.019 1.000   NA
 6054486 6054487 BAM_5068 BAM_5069     TRUE 0.890 13.000 0.333 1.000 N NA
 6054488 6054489 BAM_5070 BAM_5071     TRUE 0.960 -3.000 0.056 0.005 Y NA
 6054490 6054491 BAM_5072 BAM_5073     TRUE 0.775 7.000 0.375 NA   NA
 6054493 6054494 BAM_5075 BAM_5076   pckA TRUE 0.641 3.000 0.005 NA   NA
 6054494 6054495 BAM_5076 BAM_5077 pckA   FALSE 0.036 290.000 0.000 NA   NA
 6054498 6054499 BAM_5080 BAM_5081     FALSE 0.032 299.000 0.000 NA   NA
 6054500 6054501 BAM_5082 BAM_5083     FALSE 0.513 25.000 0.013 NA   NA
 6054502 6054503 BAM_5084 BAM_5085     TRUE 0.973 -3.000 0.500 0.012 Y NA
 6054505 6054506 BAM_5087 BAM_5088     FALSE 0.226 -156.000 0.000 NA   NA
 6054506 6054507 BAM_5088 BAM_5089     FALSE 0.116 217.000 0.000 NA   NA
 6054507 6054508 BAM_5089 BAM_5090     TRUE 0.886 12.000 0.875 NA   NA
 6054509 6054510 BAM_5091 BAM_5092     TRUE 0.972 12.000 0.528 NA Y NA
 6054510 6054511 BAM_5092 BAM_5093     TRUE 0.968 -7.000 0.876 1.000 Y NA
 6054512 6054513 BAM_5094 BAM_5095     FALSE 0.083 237.000 0.000 NA   NA
 6054515 6054516 BAM_5097 BAM_5098   mutTA TRUE 0.688 112.000 0.101 NA   NA
 6054516 6054517 BAM_5098 BAM_5099 mutTA   FALSE 0.592 85.000 0.292 NA   NA
 6054518 6054519 BAM_5100 BAM_5101     FALSE 0.161 203.000 0.000 NA   NA
 6054523 6054524 BAM_5105 BAM_5106 cydA2 cydB2 TRUE 0.967 -10.000 0.939 0.034 Y NA
 6054525 6054526 BAM_5107 BAM_5108     TRUE 0.653 15.000 0.222 NA   NA
 6054526 6054527 BAM_5108 BAM_5109     FALSE 0.320 -31.000 0.200 NA   NA
 6054528 6054529 BAM_5110 BAM_5111     FALSE 0.304 193.000 0.300 NA   NA
 6054530 6054531 BAM_5112 BAM_5113     TRUE 0.657 98.000 0.263 NA   NA
 6054531 6054532 BAM_5113 BAM_5114     TRUE 0.725 13.000 0.316 NA   NA
 6054532 6054533 BAM_5114 BAM_5115     TRUE 0.655 22.000 0.294 NA   NA
 6054533 6054534 BAM_5115 BAM_5116     TRUE 0.769 81.000 0.706 NA   NA
 6054536 6054537 BAM_5118 BAM_5119   feoB TRUE 0.798 17.000 0.517 NA   NA
 6054537 6054538 BAM_5119 BAM_5120 feoB   TRUE 0.961 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 6054540 6054541 BAM_5122 BAM_5123     TRUE 0.978 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 6054541 6054542 BAM_5123 BAM_5124     TRUE 0.855 40.000 0.875 NA N NA
 6054542 6054543 BAM_5124 BAM_5125     TRUE 0.831 90.000 0.875 NA   NA
 6054543 6054544 BAM_5125 BAM_5126     FALSE 0.297 177.000 0.000 NA   NA
 6054544 6054545 BAM_5126 BAM_5127     FALSE 0.246 184.000 0.000 NA   NA
 6054546 6054547 BAM_5128 BAM_5129 hpt2   FALSE 0.198 259.000 0.015 1.000 N NA
 6054550 6054551 BAM_5132 BAM_5133     TRUE 0.660 18.000 0.262 NA   NA
 6054551 6054552 BAM_5133 BAM_5134     FALSE 0.007 535.000 0.000 NA   NA
 6054552 6054553 BAM_5134 BAM_5135     TRUE 0.705 75.000 0.667 NA   NA
 6054553 6054554 BAM_5135 BAM_5136     FALSE 0.033 297.000 0.000 NA   NA
 6054554 6054555 BAM_5136 BAM_5137     TRUE 0.859 0.000 0.667 NA   NA
 6054555 6054556 BAM_5137 BAM_5138     TRUE 0.826 143.000 0.500 1.000   NA
 6054556 6054557 BAM_5138 BAM_5139     TRUE 0.740 -13.000 0.700 1.000   NA
 6054558 6054559 BAM_5140 BAM_5141     FALSE 0.270 202.000 0.000 0.040   NA
 6054559 6054560 BAM_5141 BAM_5142     TRUE 0.982 3.000 0.727 1.000 Y NA
 6054560 6054561 BAM_5142 BAM_5143     TRUE 0.861 95.000 0.800 1.000   NA
 6054561 6054562 BAM_5143 BAM_5144     TRUE 0.774 75.000 0.700 0.090   NA
 6054562 6054563 BAM_5144 BAM_5145     TRUE 0.845 21.000 0.700 1.000   NA
 6054563 6054564 BAM_5145 BAM_5146     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054564 6054565 BAM_5146 BAM_5147     FALSE 0.619 105.000 0.000 NA   NA
 6054566 6054567 BAM_5148 BAM_5149   gntP3 TRUE 0.673 169.000 0.667 NA   NA
 6054567 6054568 BAM_5149 BAM_5150 gntP3   TRUE 0.734 49.000 0.292 1.000 N NA
 6054568 6054569 BAM_5150 BAM_5151     TRUE 0.898 0.000 0.333 1.000 N NA
 6054569 6054570 BAM_5151 BAM_5152     FALSE 0.577 -7.000 0.283 NA   NA
 6054570 6054571 BAM_5152 BAM_5153     TRUE 0.872 2.000 0.679 NA   NA
 6054571 6054572 BAM_5153 BAM_5154     TRUE 0.690 -22.000 0.750 1.000   NA
 6054572 6054573 BAM_5154 BAM_5155     FALSE 0.020 336.000 0.000 NA   NA
 6054573 6054574 BAM_5155 BAM_5156     TRUE 0.731 21.000 0.429 NA   NA
 6054574 6054575 BAM_5156 BAM_5157     FALSE 0.007 534.000 0.000 NA   NA
 6054575 6054576 BAM_5157 BAM_5158     TRUE 0.895 83.000 0.778 1.000 N NA
 6054576 6054577 BAM_5158 BAM_5159     TRUE 0.970 -7.000 0.778 0.019 Y NA
 6054577 6054578 BAM_5159 BAM_5160     FALSE 0.221 256.000 0.143 1.000 N NA
 6054578 6054579 BAM_5160 BAM_5161     TRUE 0.872 1.000 0.029 1.000 N NA
 6054579 6054580 BAM_5161 BAM_5162   menB FALSE 0.503 204.000 0.193 0.002 N NA
 6054580 6054581 BAM_5162 BAM_5163 menB   FALSE 0.517 70.000 0.280 1.000   NA
 6054581 6054582 BAM_5163 BAM_5164   menD TRUE 0.755 -3.000 0.355 1.000   NA
 6054582 6054583 BAM_5164 BAM_5165 menD menF TRUE 0.956 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 6054584 6054585 BAM_5166 BAM_5167     TRUE 0.892 110.000 0.250 1.000 N NA
 6054587 6054588 BAM_5169 BAM_5170     FALSE 0.393 165.000 0.010 NA   NA
 6054588 6054589 BAM_5170 BAM_5171     FALSE 0.542 77.000 0.300 NA   NA
 6054590 6054591 BAM_5172 BAM_5173 glgP glgA TRUE 0.961 19.000 0.314 1.000 Y NA
 6054591 6054592 BAM_5173 BAM_5174 glgA glgD TRUE 0.940 47.000 0.630 1.000 Y NA
 6054592 6054593 BAM_5174 BAM_5175 glgD glgC TRUE 0.962 19.000 0.210 0.001 Y NA
 6054593 6054594 BAM_5175 BAM_5176 glgC glgB TRUE 0.903 -25.000 0.296 0.001 Y NA
 6054596 6054597 BAM_5178 BAM_5179 ldh2   FALSE 0.005 654.000 0.000 NA   NA
 6054597 6054598 BAM_5179 BAM_5180     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6054598 6054599 BAM_5180 BAM_5181     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6054599 6054600 BAM_5181 BAM_5182     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6054600 6054601 BAM_5182 BAM_5183     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6054601 6054602 BAM_5183 BAM_5184     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054602 6054603 BAM_5184 BAM_5185     FALSE 0.615 10.000 0.000 NA   NA
 6054603 6054604 BAM_5185 BAM_5186     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6054604 6054605 BAM_5186 BAM_5187     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6054605 6054606 BAM_5187 BAM_5188     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6054606 6054607 BAM_5188 BAM_5189     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6054607 6054608 BAM_5189 BAM_5190     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6054608 6054609 BAM_5190 BAM_5191     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6054609 6054610 BAM_5191 BAM_5192     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054610 6054611 BAM_5192 BAM_5193     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6054611 6054612 BAM_5193 BAM_5194     FALSE 0.629 7.000 0.000 NA   NA
 6054612 6054613 BAM_5194 BAM_5195     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6054613 6054614 BAM_5195 BAM_5196     FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6054614 6054615 BAM_5196 BAM_5197     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6054615 6054616 BAM_5197 BAM_5198     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6054616 6054617 BAM_5198 BAM_5199     FALSE 0.619 9.000 0.000 NA   NA
 6054617 6054618 BAM_5199 BAM_5200     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6054618 6054619 BAM_5200 BAM_5201   rrfK TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6054621 6054622 BAM_5203 BAM_5204 rrsK   FALSE 0.488 -6.000 0.000 NA   NA
 6054622 6054623 BAM_5204 BAM_5205     FALSE 0.391 37.000 0.000 NA   NA
 6054624 6054625 BAM_5206 BAM_5208 sapB   TRUE 0.665 96.000 0.212 1.000   NA
 6054626 6054627 BAM_5207 BAM_5209   pgi TRUE 0.639 108.000 0.027 NA   NA
 6054629 6054630 BAM_5211 BAM_5212 yugI   FALSE 0.215 254.000 0.033 1.000 N NA
 6054630 6054631 BAM_5212 BAM_5213     TRUE 0.936 -3.000 0.894 1.000 N NA
 6054632 6054633 BAM_5214 BAM_5215     TRUE 0.741 110.000 0.117 1.000   NA
 6054636 6054637 BAM_5218 BAM_5219 sodC   FALSE 0.405 48.000 0.163 NA   NA
 6054642 6054643 BAM_5224 BAM_5225     FALSE 0.340 171.000 0.024 NA   NA
 6054643 6054644 BAM_5225 BAM_5226   glyS FALSE 0.357 46.000 0.004 NA   NA
 6054646 6054647 BAM_5228 BAM_5229     FALSE 0.479 51.000 0.308 NA   NA
 6054647 6054648 BAM_5229 BAM_5230     FALSE 0.568 148.000 0.077 NA   NA
 6054649 6054650 BAM_5231 BAM_5232 gtaB   TRUE 0.875 109.000 0.037 1.000 N NA
 6054652 6054653 BAM_5234 BAM_5235 pepA   TRUE 0.661 147.000 0.111 1.000   NA
 6054653 6054654 BAM_5235 BAM_5236     FALSE 0.499 54.000 0.361 NA   NA
 6054654 6054655 BAM_5236 BAM_5237     TRUE 0.646 -3.000 0.250 NA   NA
 6054655 6054656 BAM_5237 BAM_5238     TRUE 0.906 124.000 0.208 1.000 N NA
 6054659 6054660 BAM_5241 BAM_5242     FALSE 0.316 176.000 0.043 NA   NA
 6054663 6054664 BAM_5245 BAM_5246     FALSE 0.627 107.000 0.000 NA   NA
 6054666 6054667 BAM_5248 BAM_5249   dapF FALSE 0.375 42.000 0.020 NA   NA
 6054667 6054668 BAM_5249 BAM_5250 dapF   FALSE 0.074 244.000 0.002 NA   NA
 6054669 6054670 BAM_5251 BAM_5252     FALSE 0.101 231.000 0.075 NA   NA
 6054670 6054671 BAM_5252 BAM_5253     FALSE 0.358 55.000 0.062 NA   NA
 6054671 6054672 BAM_5253 BAM_5254     FALSE 0.368 -16.000 0.053 NA   NA
 6054673 6054674 BAM_5255 BAM_5256 phnA   FALSE 0.085 236.000 0.000 NA   NA
 6054674 6054675 BAM_5256 BAM_5257     FALSE 0.028 308.000 0.000 NA   NA
 6054676 6054677 BAM_5258 BAM_5259     TRUE 0.768 25.000 0.571 NA   NA
 6054678 6054679 BAM_5260 BAM_5261     TRUE 0.818 114.000 0.429 NA   NA
 6054679 6054680 BAM_5261 BAM_5262     TRUE 0.741 99.000 0.400 NA   NA
 6054680 6054681 BAM_5262 BAM_5263     FALSE 0.390 53.000 0.127 NA   NA
 6054682 6054683 BAM_5264 BAM_5265     FALSE 0.010 435.000 0.019 NA   NA
 6054688 6054689 BAM_5270 BAM_5271     TRUE 0.879 110.000 0.059 1.000 N NA
 6054689 6054690 BAM_5271 BAM_5272     FALSE 0.392 72.000 0.074 NA   NA
 6054691 6054692 BAM_5273 BAM_5274 fbp1   TRUE 0.732 18.000 0.394 NA   NA
 6054692 6054693 BAM_5274 BAM_5275     FALSE 0.014 373.000 0.000 NA   NA
 6054699 6054700 BAM_5281 BAM_5282     FALSE 0.484 75.000 0.259 NA   NA
 6054703 6054704 BAM_5285 BAM_5286     FALSE 0.396 55.000 0.221 NA   NA
 6054704 6054705 BAM_5286 BAM_5287     FALSE 0.406 66.000 0.241 NA   NA
 6054706 6054707 BAM_5288 BAM_5289     FALSE 0.055 264.000 0.000 NA   NA
 6054707 6054708 BAM_5289 BAM_5290     TRUE 0.750 0.000 0.333 NA   NA
 6054709 6054710 BAM_5291 BAM_5292 sufB sufA TRUE 0.750 49.000 0.152 0.001 N NA
 6054710 6054711 BAM_5292 BAM_5293 sufA sufS TRUE 0.783 -10.000 0.292 1.000 N NA
 6054711 6054712 BAM_5293 BAM_5294 sufS sufD TRUE 0.930 0.000 0.606 1.000 N NA
 6054712 6054713 BAM_5294 BAM_5295 sufD sufC TRUE 0.960 16.000 0.139 1.000 Y NA
 6054713 6054714 BAM_5295 BAM_5296 sufC   FALSE 0.222 240.000 0.000 NA N NA
 6054714 6054715 BAM_5296 BAM_5297     TRUE 0.945 73.000 0.750 NA Y NA
 6054715 6054716 BAM_5297 BAM_5298     TRUE 0.941 24.000 0.074 NA Y NA
 6054716 6054717 BAM_5298 BAM_5299     TRUE 0.960 -7.000 0.642 1.000 Y NA
 6054719 6054720 BAM_5301 BAM_5302     FALSE 0.600 155.000 0.131 1.000   NA
 6054720 6054721 BAM_5302 BAM_5303     TRUE 0.842 4.000 0.443 1.000   NA
 6054723 6054724 BAM_5305 BAM_5306 gcvH   FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 6054724 6054725 BAM_5306 BAM_5307     FALSE 0.296 -24.000 0.000 NA   NA
 6054725 6054726 BAM_5307 BAM_5308     FALSE 0.007 531.000 0.000 NA   NA
 6054726 6054727 BAM_5308 BAM_5309     TRUE 0.771 11.000 0.400 NA   NA
 6054727 6054728 BAM_5309 BAM_5310     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6054728 6054729 BAM_5310 BAM_5311     FALSE 0.368 42.000 0.000 NA   NA
 6054729 6054730 BAM_5311 BAM_5312     FALSE 0.448 81.000 0.000 NA   NA
 6054730 6054731 BAM_5312 BAM_5313     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6054731 6054732 BAM_5313 BAM_5314     FALSE 0.603 12.000 0.000 NA   NA
 6054732 6054733 BAM_5314 BAM_5315     FALSE 0.340 53.000 0.000 NA   NA
 6054735 6054736 BAM_5317 BAM_5318   ldh3 TRUE 0.670 23.000 0.333 NA   NA
 6054736 6054737 BAM_5318 BAM_5319 ldh3   FALSE 0.072 246.000 0.000 NA   NA
 6054737 6054738 BAM_5319 BAM_5320     TRUE 0.876 14.000 0.828 NA   NA
 6054738 6054739 BAM_5320 BAM_5321     FALSE 0.602 147.000 0.185 NA   NA
 6054739 6054740 BAM_5321 BAM_5322     FALSE 0.006 588.000 0.000 NA   NA
 6054740 6054741 BAM_5322 BAM_5323     TRUE 0.791 4.000 0.289 1.000   NA
 6054741 6054742 BAM_5323 BAM_5324     TRUE 0.730 139.000 0.156 1.000   NA
 6054742 6054743 BAM_5324 BAM_5325     FALSE 0.520 153.000 0.061 NA   NA
 6054743 6054744 BAM_5325 BAM_5326     TRUE 0.637 6.000 0.000 NA   NA
 6054744 6054745 BAM_5326 BAM_5327     TRUE 0.968 22.000 0.588 1.000 Y NA
 6054745 6054746 BAM_5327 BAM_5328     FALSE 0.560 98.000 0.000 NA   NA
 6054747 6054748 BAM_5329 BAM_5330     FALSE 0.477 88.000 0.000 NA   NA
 6054749 6054750 BAM_5331 BAM_5332     FALSE 0.028 310.000 0.000 NA   NA
 6054750 6054751 BAM_5332 BAM_5333     FALSE 0.358 49.000 0.021 NA   NA
 6054751 6054752 BAM_5333 BAM_5334     FALSE 0.430 78.000 0.024 NA   NA
 6054754 6054755 BAM_5336 BAM_5337     FALSE 0.061 256.000 0.000 NA   NA
 6054755 6054756 BAM_5337 BAM_5338     FALSE 0.499 80.000 0.200 NA   NA
 6054756 6054757 BAM_5338 BAM_5339     TRUE 0.907 120.000 0.233 1.000 N NA
 6054757 6054758 BAM_5339 BAM_5340     FALSE 0.008 596.000 0.000 1.000   NA
 6054758 6054759 BAM_5340 BAM_5341   spoIIIJ1 TRUE 0.733 130.000 0.003 1.000   NA
 6054759 6054760 BAM_5341 BAM_5342 spoIIIJ1   TRUE 0.824 29.000 0.889 NA   NA
 6054761 6054762 BAM_5343 BAM_5344     FALSE 0.021 332.000 0.000 NA   NA
 6054763 6054764 BAM_5345 BAM_5346     FALSE 0.603 97.000 0.167 NA   NA
 6054764 6054765 BAM_5346 BAM_5347     TRUE 0.757 13.000 0.389 NA   NA
 6054765 6054766 BAM_5347 BAM_5348     FALSE 0.467 -10.000 0.149 NA   NA
 6054769 6054770 BAM_5351 BAM_5352     TRUE 0.777 31.000 0.727 NA   NA
 6054770 6054771 BAM_5352 BAM_5353     FALSE 0.015 365.000 0.000 NA   NA
 6054771 6054772 BAM_5353 BAM_5354     TRUE 0.921 -22.000 0.571 1.000 Y NA
 6054772 6054773 BAM_5354 BAM_5355     TRUE 0.862 140.000 0.500 0.087   NA
 6054775 6054776 BAM_5357 BAM_5358     FALSE 0.014 414.000 0.000 1.000   NA
 6054776 6054777 BAM_5358 BAM_5359     TRUE 0.721 118.000 0.167 NA   NA
 6054778 6054779 BAM_5360 BAM_5361 nprB   FALSE 0.533 156.000 0.214 NA   NA
 6054779 6054780 BAM_5361 BAM_5362     FALSE 0.458 52.000 0.286 NA   NA
 6054780 6054781 BAM_5362 BAM_5363     TRUE 0.788 113.000 0.364 NA   NA
 6054781 6054782 BAM_5363 BAM_5364     TRUE 0.673 164.000 0.556 NA   NA
 6054782 6054783 BAM_5364 BAM_5365     TRUE 0.958 -12.000 0.875 1.000 Y NA
 6054783 6054784 BAM_5365 BAM_5366     FALSE 0.637 57.000 0.625 NA   NA
 6054785 6054786 BAM_5367 BAM_5368     FALSE 0.363 213.000 0.000 1.000 N NA
 6054786 6054787 BAM_5368 BAM_5369     FALSE 0.024 319.000 0.000 NA   NA
 6054788 6054789 BAM_5370 BAM_5371     FALSE 0.315 -34.000 0.222 NA   NA
 6054789 6054790 BAM_5371 BAM_5372     FALSE 0.465 30.000 0.010 NA   NA
 6054791 6054792 BAM_5373 BAM_5374     FALSE 0.347 54.000 0.029 NA   NA
 6054792 6054793 BAM_5374 BAM_5375     FALSE 0.535 148.000 0.000 NA   NA
 6054793 6054794 BAM_5375 BAM_5376     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6054797 6054798 BAM_1532 BAM_1533   recQ1 FALSE 0.457 -10.000 0.103 NA   NA
 6054798 6054799 BAM_1533 BAM_1534 recQ1   TRUE 0.669 0.000 0.192 NA   NA
 6054799 6054800 BAM_1534 BAM_1535     TRUE 0.662 23.000 0.320 NA   NA
 6054800 6054801 BAM_1535 BAM_1536     FALSE 0.334 67.000 0.000 NA   NA
 6054801 6054802 BAM_1536 BAM_1537     FALSE 0.266 -33.000 0.000 NA   NA
 6054802 6054803 BAM_1537 BAM_1538     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6054803 6054804 BAM_1538 BAM_1539     TRUE 0.796 78.000 0.417 NA N NA
 6054804 6054805 BAM_1539 BAM_1540   gudB FALSE 0.170 268.000 0.222 NA N NA
 6054805 6054806 BAM_1540 BAM_1541 gudB   FALSE 0.506 79.000 0.233 NA   NA
 6054806 6054807 BAM_1541 BAM_1542     TRUE 0.808 93.000 0.700 NA   NA
 6054807 6054808 BAM_1542 BAM_1543     FALSE 0.440 80.000 0.000 NA   NA
 6054808 6054809 BAM_1543 BAM_1544     FALSE 0.343 170.000 0.000 NA   NA
 6054811 6054812 BAM_1546 BAM_1547   cmk TRUE 0.672 130.000 0.016 NA   NA
 6054812 6054813 BAM_1547 BAM_1548 cmk rpsA FALSE 0.080 334.000 0.047 1.000 N NA
 6054813 6054814 BAM_1548 BAM_1549 rpsA   TRUE 0.860 13.000 0.061 1.000 N NA
 6054816 6054817 BAM_1551 BAM_1552     TRUE 0.729 -7.000 0.567 NA   NA
 6054817 6054818 BAM_1552 BAM_1553     TRUE 0.819 -3.000 0.633 NA   NA
 6054818 6054819 BAM_1553 BAM_1554     TRUE 0.688 125.000 0.014 NA   NA
 6054819 6054820 BAM_1554 BAM_1555   gpsA TRUE 0.652 19.000 0.068 1.000   NA
 6054820 6054821 BAM_1555 BAM_1556 gpsA   TRUE 0.684 117.000 0.039 NA   NA
 6054821 6054822 BAM_1556 BAM_1557     FALSE 0.051 267.000 0.000 NA   NA
 6054822 6054823 BAM_1557 BAM_1558     TRUE 0.688 65.000 0.771 NA   NA
 6054823 6054824 BAM_1558 BAM_1559   spoIVA FALSE 0.085 243.000 0.081 NA   NA
 6054824 6054825 BAM_1559 BAM_1560 spoIVA hup1 FALSE 0.032 299.000 0.000 NA   NA
 6054825 6054826 BAM_1560 BAM_1561 hup1 mtrA TRUE 0.904 121.000 0.154 1.000 N NA
 6054826 6054827 BAM_1561 BAM_1562 mtrA   FALSE 0.093 258.000 0.114 1.000   NA
 6054827 6054828 BAM_1562 BAM_1563   menG TRUE 0.804 30.000 0.708 1.000   NA
 6054828 6054829 BAM_1563 BAM_1564 menG hepT TRUE 0.949 32.000 0.476 1.000 Y NA
 6054829 6054830 BAM_1564 BAM_1565 hepT   TRUE 0.899 125.000 0.054 1.000 N NA
 6054830 6054831 BAM_1565 BAM_1566   aroC1 FALSE 0.164 271.000 0.002 1.000 N NA
 6054831 6054832 BAM_1566 BAM_1567 aroC1 aroB TRUE 0.970 0.000 0.110 0.001 Y NA
 6054832 6054833 BAM_1567 BAM_1568 aroB hisC1 TRUE 0.969 132.000 0.009 1.000 Y NA
 6054833 6054834 BAM_1568 BAM_1569 hisC1   FALSE 0.036 313.000 0.000 1.000   NA
 6054834 6054835 BAM_1569 BAM_1570     FALSE 0.553 74.000 0.375 NA   NA
 6054835 6054836 BAM_1570 BAM_1571     TRUE 0.756 154.000 0.583 NA   NA
 6054836 6054837 BAM_1571 BAM_1572   qcrA TRUE 0.807 144.000 0.540 NA   NA
 6054837 6054838 BAM_1572 BAM_1573 qcrA qcrB TRUE 0.860 1.000 0.447 0.032   NA
 6054838 6054839 BAM_1573 BAM_1574 qcrB qcrC FALSE 0.541 44.000 0.095 0.032   NA
 6054839 6054840 BAM_1574 BAM_1575 qcrC   FALSE 0.366 43.000 0.005 NA   NA
 6054840 6054841 BAM_1575 BAM_1576     FALSE 0.309 -24.000 0.036 NA   NA
 6054841 6054842 BAM_1576 BAM_1577     FALSE 0.549 26.000 0.104 NA   NA
 6054842 6054843 BAM_1577 BAM_1578     TRUE 0.671 108.000 0.104 NA   NA
 6054843 6054844 BAM_1578 BAM_1579     FALSE 0.323 -22.000 0.050 NA   NA
 6054844 6054845 BAM_1579 BAM_1580     FALSE 0.604 102.000 0.020 NA   NA
 6054847 6054848 BAM_1582 BAM_1583   dapB FALSE 0.634 0.000 0.044 NA   NA
 6054848 6054849 BAM_1583 BAM_1584 dapB mgsA TRUE 0.874 15.000 0.044 0.036 N NA
 6054849 6054850 BAM_1584 BAM_1585 mgsA   FALSE 0.636 12.000 0.081 NA   NA
 6054850 6054851 BAM_1585 BAM_1586     FALSE 0.620 -3.000 0.210 NA   NA
 6054851 6054852 BAM_1586 BAM_1587     TRUE 0.726 -13.000 0.126 1.000 N NA
 6054852 6054853 BAM_1587 BAM_1588   birA TRUE 0.714 -15.000 0.134 1.000 N NA
 6054855 6054856 BAM_1590 BAM_1591 panB panC TRUE 0.970 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 6054856 6054857 BAM_1591 BAM_1592 panC panD TRUE 0.968 13.000 0.342 1.000 Y NA
 6054857 6054858 BAM_1592 BAM_1593 panD   TRUE 0.672 129.000 0.000 NA   NA
 6054858 6054859 BAM_1593 BAM_1594     FALSE 0.252 -37.000 0.000 NA   NA
 6054859 6054860 BAM_1594 BAM_1595     FALSE 0.067 251.000 0.000 NA   NA
 6054860 6054861 BAM_1595 BAM_1596     TRUE 0.732 8.000 0.289 NA   NA
 6054861 6054862 BAM_1596 BAM_1597   aspB TRUE 0.712 19.000 0.367 NA   NA
 6054862 6054863 BAM_1597 BAM_1598 aspB dnaD TRUE 0.885 122.000 0.072 NA N NA
 6054863 6054864 BAM_1598 BAM_1599 dnaD nth TRUE 0.954 16.000 0.075 NA Y NA
 6054864 6054865 BAM_1599 BAM_1600 nth   TRUE 0.657 4.000 0.034 NA   NA
 6054866 6054867 BAM_1601 BAM_1602   recU FALSE 0.422 66.000 0.056 1.000   NA
 6054868 6054869 BAM_1603 BAM_1605     FALSE 0.068 250.000 0.000 NA   NA
 6054871 6054872 BAM_1606 BAM_1607     FALSE 0.633 16.000 0.148 NA   NA
 6054874 6054875 BAM_1609 BAM_1610     FALSE 0.620 155.000 0.318 NA   NA
 6054875 6054876 BAM_1610 BAM_1611     FALSE 0.361 57.000 0.074 NA   NA
 6054876 6054877 BAM_1611 BAM_1612     TRUE 0.804 98.000 0.579 NA   NA
 6054877 6054878 BAM_1612 BAM_5813     TRUE 0.684 122.000 0.000 NA   NA
 6054878 6054879 BAM_5813 BAM_1613     FALSE 0.234 186.000 0.000 NA   NA
 6054879 6054880 BAM_1613 BAM_1614     FALSE 0.332 62.000 0.014 NA   NA
 6054880 6054881 BAM_1614 BAM_1615     TRUE 0.707 138.000 0.250 NA   NA
 6054881 6054882 BAM_1615 BAM_1616     TRUE 0.879 106.000 0.118 1.000 N NA
 6054882 6054883 BAM_1616 BAM_1617     FALSE 0.433 46.000 0.000 1.000   NA
 6054885 6054886 BAM_1619 BAM_1620 maP2   FALSE 0.214 198.000 0.115 NA   NA
 6054886 6054887 BAM_1620 BAM_1621   xpt FALSE 0.593 15.000 0.014 NA   NA
 6054887 6054888 BAM_1621 BAM_1622 xpt pbuX TRUE 0.968 4.000 0.056 1.000 Y NA
 6054889 6054890 BAM_1623 BAM_1624     FALSE 0.397 164.000 0.000 NA   NA
 6054891 6054892 BAM_1625 BAM_1626     FALSE 0.196 195.000 0.000 NA   NA
 6054894 6054895 BAM_1628 BAM_1629     FALSE 0.560 22.000 0.069 NA   NA
 6054895 6054896 BAM_1629 BAM_1630     TRUE 0.658 3.000 0.046 NA   NA
 6054898 6054899 BAM_1632 BAM_1633     FALSE 0.477 88.000 0.000 NA   NA
 6054899 6054900 BAM_1633 BAM_1634     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054900 6054901 BAM_1634 BAM_1635     FALSE 0.005 693.000 0.000 NA   NA
 6054901 6054902 BAM_1635 BAM_1636     TRUE 0.764 131.000 0.157 1.000   NA
 6054902 6054903 BAM_1636 BAM_1637     FALSE 0.017 357.000 0.039 NA   NA
 6054903 6054904 BAM_1637 BAM_1638     FALSE 0.020 337.000 0.000 NA   NA
 6054904 6054905 BAM_1638 BAM_1639     TRUE 0.943 1.000 0.750 1.000 N NA
 6054905 6054906 BAM_1639 BAM_1640     FALSE 0.460 -7.000 0.000 NA   NA
 6054906 6054907 BAM_1640 BAM_1641     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6054907 6054908 BAM_1641 BAM_1642     FALSE 0.555 19.000 0.000 NA   NA
 6054908 6054909 BAM_1642 BAM_1643     TRUE 0.670 43.000 0.625 NA   NA
 6054909 6054910 BAM_1643 BAM_1644     TRUE 0.835 4.000 0.500 NA   NA
 6054910 6054911 BAM_1644 BAM_1645     FALSE 0.304 -25.000 0.046 NA   NA
 6054911 6054912 BAM_1645 BAM_1646     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054912 6054913 BAM_1646 BAM_1647     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054913 6054914 BAM_1647 BAM_1648     FALSE 0.430 -9.000 0.000 NA   NA
 6054914 6054915 BAM_1648 BAM_1649     FALSE 0.511 93.000 0.000 NA   NA
 6054920 6054921 BAM_1653 BAM_1655     FALSE 0.222 -906.000 0.000 NA   NA
 6054921 6054922 BAM_1655 BAM_1656   rnhA FALSE 0.623 8.000 0.000 NA   NA
 6054922 6054923 BAM_1656 BAM_1657 rnhA   FALSE 0.428 33.000 0.000 NA   NA
 6054924 6054925 BAM_1658 BAM_1659     FALSE 0.636 144.000 0.200 NA   NA
 6054925 6054926 BAM_1659 BAM_1660     TRUE 0.853 13.000 0.680 NA   NA
 6054927 6054928 BAM_1661 BAM_1662   cspB1 TRUE 0.882 120.000 0.619 NA   NA
 6054929 6054930 BAM_1663 BAM_1664     FALSE 0.482 70.000 0.308 NA   NA
 6054930 6054931 BAM_1664 BAM_1665     TRUE 0.769 20.000 0.500 NA   NA
 6054931 6054932 BAM_1665 BAM_1666     FALSE 0.539 80.000 0.259 NA   NA
 6054932 6054933 BAM_1666 BAM_1667     FALSE 0.101 224.000 0.000 NA   NA
 6054933 6054934 BAM_1667 BAM_1668     TRUE 0.817 3.000 0.455 NA   NA
 6054934 6054935 BAM_1668 BAM_1669     FALSE 0.417 187.000 0.364 1.000   NA
 6054935 6054936 BAM_1669 BAM_1670     FALSE 0.617 0.000 0.000 NA   NA
 6054936 6054937 BAM_1670 BAM_1671     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6054939 6054940 BAM_1673 BAM_1674     TRUE 0.677 98.000 0.188 1.000   NA
 6054940 6054941 BAM_1674 BAM_1675     TRUE 0.886 139.000 0.250 1.000 N NA
 6054943 6054944 BAM_1677 BAM_1678     FALSE 0.264 -79.000 0.100 NA   NA
 6054944 6054945 BAM_1678 BAM_1679     TRUE 0.686 146.000 0.300 NA   NA
 6054945 6054946 BAM_1679 BAM_1680     FALSE 0.055 274.000 0.143 NA   NA
 6054946 6054947 BAM_1680 BAM_1681     FALSE 0.398 51.000 0.190 NA   NA
 6054948 6054949 BAM_1682 BAM_1683     TRUE 0.694 125.000 0.031 NA   NA
 6054949 6054950 BAM_1683 BAM_1684     TRUE 0.691 20.000 0.333 NA   NA
 6054950 6054951 BAM_1684 BAM_1685     TRUE 0.717 129.000 0.118 NA   NA
 6054951 6054952 BAM_1685 BAM_1686     TRUE 0.673 8.000 0.147 NA   NA
 6054952 6054953 BAM_1686 BAM_1687     FALSE 0.591 167.000 0.444 NA   NA
 6054954 6054955 BAM_1688 BAM_1689   hfq1 TRUE 0.699 54.000 0.778 NA   NA
 6054957 6054958 BAM_1691 BAM_1692     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6054958 6054959 BAM_1692 BAM_1693     TRUE 0.821 151.000 0.143 1.000 N NA
 6054959 6054960 BAM_1693 BAM_1694     TRUE 0.667 130.000 0.000 NA   NA
 6054960 6054961 BAM_1694 BAM_1695     FALSE 0.277 -30.000 0.000 NA   NA
 6054961 6054962 BAM_1695 BAM_1696     FALSE 0.312 174.000 0.000 NA   NA
 6054962 6054963 BAM_1696 BAM_1697     FALSE 0.462 30.000 0.000 NA   NA
 6054963 6054964 BAM_1697 BAM_1698     TRUE 0.830 28.000 0.889 NA   NA
 6054965 6054966 BAM_1699 BAM_1700 cheR   FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 6054967 6054968 BAM_1701 BAM_1702     FALSE 0.573 17.000 0.000 NA   NA
 6054968 6054969 BAM_1702 BAM_1703     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6054969 6054970 BAM_1703 BAM_1704     FALSE 0.564 18.000 0.000 NA   NA
 6054970 6054971 BAM_1704 BAM_1705     FALSE 0.152 205.000 0.000 NA   NA
 6054971 6054972 BAM_1705 BAM_1706     FALSE 0.348 50.000 0.000 NA   NA
 6054972 6054973 BAM_1706 BAM_1707     FALSE 0.546 20.000 0.000 NA   NA
 6054973 6054974 BAM_1707 BAM_1708     TRUE 0.954 23.000 0.000 0.001 Y NA
 6054974 6054975 BAM_1708 BAM_1709     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6054975 6054976 BAM_1709 BAM_1710   flgB FALSE 0.014 370.000 0.000 NA   NA
 6054976 6054977 BAM_1710 BAM_1711 flgB flgC TRUE 0.979 21.000 0.804 0.002 Y NA
 6054977 6054978 BAM_1711 BAM_1712 flgC   TRUE 0.963 17.000 0.068 0.002 Y NA
 6054978 6054979 BAM_1712 BAM_1713     FALSE 0.523 23.000 0.000 NA   NA
 6054979 6054980 BAM_1713 BAM_1714     FALSE 0.399 36.000 0.000 NA   NA
 6054980 6054981 BAM_1714 BAM_1715   fliG FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6054981 6054982 BAM_1715 BAM_1716 fliG   FALSE 0.609 -13.000 0.471 NA   NA
 6054982 6054983 BAM_1716 BAM_1717     FALSE 0.613 -3.000 0.129 NA   NA
 6054983 6054984 BAM_1717 BAM_1718     TRUE 0.693 117.000 0.061 NA   NA
 6054984 6054985 BAM_1718 BAM_1719     FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6054985 6054986 BAM_1719 BAM_1720     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6054986 6054987 BAM_1720 BAM_1721     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6054987 6054988 BAM_1721 BAM_1722     FALSE 0.581 22.000 0.117 NA   NA
 6054988 6054989 BAM_1722 BAM_1723     FALSE 0.402 50.000 0.195 NA   NA
 6054989 6054990 BAM_1723 BAM_1724     FALSE 0.028 308.000 0.000 NA   NA
 6054990 6054991 BAM_1724 BAM_1725     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6054991 6054992 BAM_1725 BAM_1726     TRUE 0.684 125.000 0.000 NA   NA
 6054992 6054993 BAM_1726 BAM_1727     FALSE 0.006 637.000 0.000 NA   NA
 6054993 6054994 BAM_1727 BAM_1728     FALSE 0.005 1082.000 0.000 NA   NA
 6054994 6054995 BAM_1728 BAM_1729     FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6054995 6054996 BAM_1729 BAM_1730     FALSE 0.326 -19.000 0.000 NA   NA
 6054996 6054997 BAM_1730 BAM_1731     FALSE 0.235 -63.000 0.000 NA   NA
 6054997 6054998 BAM_1731 BAM_1732     FALSE 0.488 154.000 0.000 NA   NA
 6054998 6054999 BAM_1732 BAM_1733     TRUE 0.678 128.000 0.000 NA   NA
 6054999 6055000 BAM_1733 BAM_1734     FALSE 0.087 233.000 0.000 NA   NA
 6055000 6055001 BAM_1734 BAM_1735     FALSE 0.005 1252.000 0.000 NA   NA
 6055001 6055002 BAM_1735 BAM_1736     FALSE 0.006 607.000 0.000 NA   NA
 6055002 6055003 BAM_1736 BAM_1737     FALSE 0.027 311.000 0.000 NA   NA
 6055003 6055004 BAM_1737 BAM_1738     FALSE 0.185 197.000 0.000 NA   NA
 6055004 6055005 BAM_1738 BAM_1739     FALSE 0.589 101.000 0.000 NA   NA
 6055005 6055006 BAM_1739 BAM_1740     FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6055006 6055007 BAM_1740 BAM_1741     FALSE 0.222 188.000 0.000 NA   NA
 6055009 6055010 BAM_1743 BAM_1744     TRUE 0.651 134.000 0.000 NA   NA
 6055010 6055011 BAM_1744 BAM_1745     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6055011 6055012 BAM_1745 BAM_1746     FALSE 0.503 26.000 0.000 NA   NA
 6055012 6055013 BAM_1746 BAM_1747     FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6055013 6055014 BAM_1747 BAM_1748     TRUE 0.762 13.000 0.400 NA   NA
 6055014 6055015 BAM_1748 BAM_1749     FALSE 0.592 -3.000 0.073 NA   NA
 6055015 6055016 BAM_1749 BAM_1750     TRUE 0.935 34.000 0.162 0.003 Y NA
 6055016 6055017 BAM_1750 BAM_1751   fliR FALSE 0.581 16.000 0.000 NA   NA
 6055017 6055018 BAM_1751 BAM_1752 fliR   FALSE 0.330 59.000 0.000 NA   NA
 6055018 6055019 BAM_1752 BAM_1753     FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6055019 6055020 BAM_1753 BAM_1754   flhA TRUE 0.955 24.000 0.207 0.003 Y NA
 6055020 6055021 BAM_1754 BAM_1755 flhA   TRUE 0.973 15.000 0.440 0.084 Y NA
 6055021 6055022 BAM_1755 BAM_1756     TRUE 0.904 43.000 0.045 1.000 Y NA
 6055022 6055023 BAM_1756 BAM_1757     TRUE 0.725 118.000 0.200 NA   NA
 6055023 6055024 BAM_1757 BAM_1758     TRUE 0.814 18.000 0.600 NA   NA
 6055024 6055025 BAM_1758 BAM_1759     TRUE 0.761 -7.000 0.133 NA N NA
 6055025 6055026 BAM_1759 BAM_1760     FALSE 0.590 -9.000 0.338 NA   NA
 6055026 6055027 BAM_1760 BAM_1761     FALSE 0.345 63.000 0.044 NA   NA
 6055027 6055028 BAM_1761 BAM_1762     FALSE 0.609 88.000 0.300 NA   NA
 6055028 6055029 BAM_1762 BAM_1763     TRUE 0.703 -7.000 0.500 NA   NA
 6055030 6055031 BAM_1764 BAM_1765     TRUE 0.724 3.000 0.051 1.000   NA
 6055031 6055032 BAM_1765 BAM_1766     FALSE 0.286 189.000 0.034 1.000   NA
 6055032 6055033 BAM_1766 BAM_1767     FALSE 0.467 67.000 0.231 1.000   NA
 6055034 6055035 BAM_1768 BAM_1769     TRUE 0.841 106.000 0.571 NA   NA
 6055036 6055037 BAM_1770 BAM_1771     FALSE 0.473 29.000 0.000 NA   NA
 6055038 6055039 BAM_1772 BAM_1773     TRUE 0.760 -22.000 0.419 0.029 N NA
 6055039 6055040 BAM_1773 BAM_1774     TRUE 0.982 13.000 0.750 0.029 Y NA
 6055040 6055041 BAM_1774 BAM_1775     TRUE 0.889 0.000 0.278 1.000 N NA
 6055041 6055042 BAM_1775 BAM_1776     FALSE 0.617 21.000 0.241 NA   NA
 6055044 6055045 BAM_1778 BAM_1779     FALSE 0.613 160.000 0.375 NA   NA
 6055045 6055046 BAM_1779 BAM_1780     TRUE 0.831 102.000 0.500 1.000   NA
 6055046 6055047 BAM_1780 BAM_1781     FALSE 0.396 51.000 0.143 NA   NA
 6055047 6055048 BAM_1781 BAM_1782     FALSE 0.501 159.000 0.143 NA   NA
 6055048 6055049 BAM_1782 BAM_1783     TRUE 0.657 90.000 0.368 NA   NA
 6055050 6055051 BAM_1784 BAM_1785     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6055051 6055052 BAM_1785 BAM_1786     FALSE 0.348 -16.000 0.000 NA   NA
 6055052 6055053 BAM_1786 BAM_1787     FALSE 0.259 -34.000 0.000 NA   NA
 6055056 6055057 BAM_1790 BAM_1791     TRUE 0.822 -3.000 0.643 NA   NA
 6055059 6055060 BAM_1793 BAM_1794     FALSE 0.213 194.000 0.049 NA   NA
 6055061 6055062 BAM_1795 BAM_1796     TRUE 0.855 17.000 0.194 1.000 N NA
 6055062 6055063 BAM_1796 BAM_1797     FALSE 0.286 183.000 0.097 NA   NA
 6055064 6055065 BAM_1798 BAM_1799     TRUE 0.864 14.000 0.750 NA   NA
 6055065 6055066 BAM_1799 BAM_1800     TRUE 0.700 113.000 0.125 NA   NA
 6055066 6055067 BAM_1800 BAM_1801     FALSE 0.521 94.000 0.000 NA   NA
 6055067 6055068 BAM_1801 BAM_1802   nhaC2 FALSE 0.598 102.000 0.000 NA   NA
 6055068 6055069 BAM_1802 BAM_1803 nhaC2 fumC FALSE 0.508 256.000 0.003 1.000 Y NA
 6055071 6055072 BAM_1805 BAM_1806     FALSE 0.015 364.000 0.000 NA   NA
 6055072 6055073 BAM_1806 BAM_1807     FALSE 0.570 99.000 0.000 NA   NA
 6055073 6055074 BAM_1807 BAM_1808     FALSE 0.494 27.000 0.000 NA   NA
 6055074 6055075 BAM_1808 BAM_1810     FALSE 0.253 -36.000 0.000 NA   NA
 6055077 6055078 BAM_1811 BAM_1812     TRUE 0.678 108.000 0.125 NA   NA
 6055078 6055079 BAM_1812 BAM_1813     TRUE 0.879 5.000 0.250 NA N NA
 6055079 6055080 BAM_1813 BAM_1814   ccdA1 TRUE 0.887 54.000 0.171 NA Y NA
 6055080 6055081 BAM_1814 BAM_1815 ccdA1   TRUE 0.957 19.000 0.241 1.000 Y NA
 6055081 6055082 BAM_1815 BAM_1816     TRUE 0.642 18.000 0.011 1.000   NA
 6055084 6055085 BAM_1818 BAM_1819     TRUE 0.641 3.000 0.000 NA   NA
 6055085 6055086 BAM_1819 BAM_1820   dsdA FALSE 0.203 193.000 0.000 NA   NA
 6055086 6055087 BAM_1820 BAM_1821 dsdA   FALSE 0.588 146.000 0.065 NA   NA
 6055088 6055089 BAM_1822 BAM_1823     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055089 6055090 BAM_1823 BAM_1824     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055090 6055091 BAM_1824 BAM_1825     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055092 6055093 BAM_1826 BAM_1827     TRUE 0.986 5.000 0.857 0.018 Y NA
 6055093 6055094 BAM_1827 BAM_1828     TRUE 0.954 118.000 0.667 0.092 N NA
 6055094 6055095 BAM_1828 BAM_1829     TRUE 0.715 38.000 0.250 NA N NA
 6055095 6055096 BAM_1829 BAM_1830     TRUE 0.965 2.000 0.227 NA Y NA
 6055096 6055097 BAM_1830 BAM_1831     TRUE 0.684 125.000 0.000 NA   NA
 6055099 6055100 BAM_1833 BAM_1834   aspA2 TRUE 0.905 25.000 0.700 1.000 N NA
 6055100 6055101 BAM_1834 BAM_1835 aspA2 malS TRUE 0.839 76.000 0.583 1.000 N NA
 6055101 6055102 BAM_1835 BAM_1836 malS   TRUE 0.677 75.000 0.500 1.000   NA
 6055102 6055103 BAM_1836 BAM_1837     TRUE 0.876 3.000 0.600 1.000   NA
 6055103 6055104 BAM_1837 BAM_1838     TRUE 0.973 118.000 0.113 1.000 Y NA
 6055105 6055106 BAM_1839 BAM_1840     FALSE 0.007 523.000 0.000 NA   NA
 6055107 6055108 BAM_1841 BAM_1842 asnA   FALSE 0.597 142.000 0.000 NA   NA
 6055108 6055109 BAM_1842 BAM_1843     FALSE 0.421 78.000 0.000 NA   NA
 6055110 6055111 BAM_1844 BAM_1845   dapG1 FALSE 0.017 350.000 0.000 NA   NA
 6055111 6055112 BAM_1845 BAM_1846 dapG1   TRUE 0.683 121.000 0.005 NA   NA
 6055113 6055114 BAM_1847 BAM_1848     TRUE 0.664 131.000 0.000 NA   NA
 6055114 6055115 BAM_1848 BAM_1849     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6055115 6055116 BAM_1849 BAM_1850     TRUE 0.791 6.000 0.400 NA   NA
 6055117 6055118 BAM_1851 BAM_1852     FALSE 0.407 35.000 0.000 NA   NA
 6055119 6055120 BAM_1853 BAM_1854     FALSE 0.250 254.000 0.000 0.004 N NA
 6055120 6055121 BAM_1854 BAM_1855     TRUE 0.810 196.000 0.333 NA Y NA
 6055121 6055122 BAM_1855 BAM_1856     FALSE 0.337 -28.000 0.222 NA   NA
 6055124 6055125 BAM_1858 BAM_1859     FALSE 0.483 89.000 0.000 NA   NA
 6055125 6055126 BAM_1859 BAM_1860     TRUE 0.684 125.000 0.000 NA   NA
 6055126 6055127 BAM_1860 BAM_1861     FALSE 0.366 43.000 0.000 NA   NA
 6055129 6055130 BAM_1863 BAM_1864     FALSE 0.011 484.000 0.000 1.000   NA
 6055131 6055132 BAM_1865 BAM_1866     FALSE 0.253 183.000 0.000 NA   NA
 6055133 6055134 BAM_1867 BAM_1869 fsR cysK2 FALSE 0.609 11.000 0.000 NA   NA
 6055134 6055135 BAM_1869 BAM_1870 cysK2   FALSE 0.532 77.000 0.143 1.000   NA
 6055135 6055136 BAM_1870 BAM_1871     TRUE 0.827 93.000 0.778 NA   NA
 6055140 6055141 BAM_1875 BAM_1876     FALSE 0.457 181.000 0.412 NA   NA
 6055141 6055142 BAM_1876 BAM_1877     TRUE 0.727 11.000 0.300 NA   NA
 6055142 6055143 BAM_1877 BAM_1878     FALSE 0.400 -16.000 0.188 NA   NA
 6055143 6055144 BAM_1878 BAM_1879     FALSE 0.009 464.000 0.000 NA   NA
 6055146 6055147 BAM_1881 BAM_1882     TRUE 0.685 123.000 0.000 NA   NA
 6055147 6055148 BAM_1882 BAM_1883     TRUE 0.773 31.000 0.714 NA   NA
 6055149 6055150 BAM_1884 BAM_1885 msrA1   TRUE 0.817 92.000 0.194 1.000 N NA
 6055151 6055152 BAM_1886 BAM_1887 ilvE2 ilvB2 TRUE 0.946 23.000 0.017 1.000 Y NA
 6055152 6055153 BAM_1887 BAM_1888 ilvB2   FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055153 6055154 BAM_1888 BAM_1889   ilvC2 FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6055154 6055155 BAM_1889 BAM_1890 ilvC2 ilvD TRUE 0.913 47.000 0.022 0.002 Y NA
 6055155 6055156 BAM_1890 BAM_1891 ilvD ilvA TRUE 0.926 32.000 0.012 1.000 Y NA
 6055157 6055158 BAM_1892 BAM_1893     FALSE 0.314 -21.000 0.000 NA   NA
 6055159 6055160 BAM_1894 BAM_1895     FALSE 0.322 173.000 0.000 NA   NA
 6055160 6055161 BAM_1895 BAM_1896     FALSE 0.593 16.000 0.032 NA   NA
 6055161 6055162 BAM_1896 BAM_1897     FALSE 0.360 168.000 0.000 NA   NA
 6055162 6055163 BAM_1897 BAM_1898     FALSE 0.314 -21.000 0.000 NA   NA
 6055165 6055166 BAM_1900 BAM_1901     FALSE 0.010 425.000 0.000 NA   NA
 6055166 6055167 BAM_1901 BAM_1902     TRUE 0.874 128.000 0.588 NA   NA
 6055167 6055168 BAM_1902 BAM_1903     FALSE 0.173 211.000 0.000 1.000   NA
 6055168 6055169 BAM_1903 BAM_1904     FALSE 0.543 28.000 0.207 NA   NA
 6055169 6055170 BAM_1904 BAM_1905     FALSE 0.389 72.000 0.069 NA   NA
 6055171 6055172 BAM_1906 BAM_1907     FALSE 0.035 340.000 0.333 NA   NA
 6055173 6055174 BAM_1908 BAM_1909     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055174 6055175 BAM_1909 BAM_1910     FALSE 0.007 514.000 0.000 NA   NA
 6055175 6055176 BAM_1910 BAM_1911     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6055176 6055177 BAM_1911 BAM_1912     FALSE 0.532 95.000 0.000 NA   NA
 6055177 6055178 BAM_1912 BAM_1913     FALSE 0.440 80.000 0.000 NA   NA
 6055178 6055179 BAM_1913 BAM_1914     TRUE 0.772 135.000 0.333 NA   NA
 6055179 6055180 BAM_1914 BAM_1915     FALSE 0.371 67.000 0.095 NA   NA
 6055180 6055181 BAM_1915 BAM_1916     FALSE 0.066 288.000 0.000 0.067   NA
 6055183 6055184 BAM_1918 BAM_1919     TRUE 0.890 -34.000 0.455 1.000 Y NA
 6055184 6055185 BAM_1919 BAM_1920     FALSE 0.580 83.000 0.174 1.000   NA
 6055191 6055192 BAM_1926 BAM_1927     FALSE 0.370 73.000 0.000 NA   NA
 6055192 6055193 BAM_1927 BAM_1928     FALSE 0.006 594.000 0.000 NA   NA
 6055193 6055194 BAM_1928 BAM_1929     TRUE 0.767 32.000 0.500 0.003   NA
 6055194 6055195 BAM_1929 BAM_1930     FALSE 0.630 108.000 0.000 NA   NA
 6055195 6055196 BAM_1930 BAM_1931     FALSE 0.011 396.000 0.000 NA   NA
 6055196 6055197 BAM_1931 BAM_1932     FALSE 0.061 358.000 0.000 1.000 N NA
 6055197 6055198 BAM_1932 BAM_1933   dra FALSE 0.112 306.000 0.077 1.000 N NA
 6055198 6055199 BAM_1933 BAM_1934 dra   TRUE 0.961 103.000 0.026 1.000 Y NA
 6055199 6055200 BAM_1934 BAM_1935     FALSE 0.366 43.000 0.000 NA   NA
 6055202 6055203 BAM_1937 BAM_1938     TRUE 0.724 52.000 0.750 1.000   NA
 6055204 6055205 BAM_1939 BAM_1940     TRUE 0.893 118.000 0.027 1.000 N NA
 6055205 6055206 BAM_1940 BAM_1941     FALSE 0.023 606.000 0.000 1.000 N NA
 6055208 6055209 BAM_1943 BAM_1944 topB2   FALSE 0.054 270.000 0.065 NA   NA
 6055211 6055212 BAM_1946 BAM_1947     FALSE 0.079 240.000 0.000 NA   NA
 6055212 6055213 BAM_1947 BAM_1948   brnQ FALSE 0.363 -15.000 0.000 NA   NA
 6055213 6055214 BAM_1948 BAM_1949 brnQ   FALSE 0.462 84.000 0.000 NA   NA
 6055214 6055215 BAM_1949 BAM_1950     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6055215 6055216 BAM_1950 BAM_1951     TRUE 0.648 112.000 0.000 NA   NA
 6055216 6055217 BAM_1951 BAM_1952     TRUE 0.864 113.000 0.600 NA   NA
 6055218 6055219 BAM_1953 BAM_1954     FALSE 0.306 182.000 0.158 NA   NA
 6055220 6055221 BAM_1956 BAM_1957     TRUE 0.976 121.000 0.389 NA Y NA
 6055221 6055222 BAM_1957 BAM_1958     TRUE 0.679 72.000 0.158 NA N NA
 6055222 6055223 BAM_1958 BAM_1960     FALSE 0.515 58.000 0.123 0.030   NA
 6055225 6055226 BAM_1961 BAM_1962     TRUE 0.695 112.000 0.128 NA   NA
 6055226 6055227 BAM_1962 BAM_1963     FALSE 0.332 179.000 0.128 NA   NA
 6055229 6055230 BAM_1965 BAM_1966     TRUE 0.710 104.000 0.273 NA   NA
 6055232 6055233 BAM_1968 BAM_1969     TRUE 0.859 13.000 0.052 1.000 N NA
 6055233 6055234 BAM_1969 BAM_1970     TRUE 0.644 5.000 0.000 NA   NA
 6055234 6055235 BAM_1970 BAM_1971     FALSE 0.589 15.000 0.000 NA   NA
 6055235 6055236 BAM_1971 BAM_1972     FALSE 0.555 182.000 0.054 NA N NA
 6055236 6055237 BAM_1972 BAM_1973     FALSE 0.593 14.000 0.000 NA   NA
 6055237 6055238 BAM_1973 BAM_1974     FALSE 0.272 -31.000 0.000 NA   NA
 6055238 6055239 BAM_1974 BAM_1975     TRUE 0.939 -22.000 0.708 0.024 Y NA
 6055239 6055240 BAM_1975 BAM_1976     TRUE 0.973 22.000 0.746 1.000 Y NA
 6055240 6055241 BAM_1976 BAM_1977     TRUE 0.948 50.000 0.687 0.028 Y NA
 6055243 6055244 BAM_1979 BAM_1980     FALSE 0.439 37.000 0.111 NA   NA
 6055244 6055245 BAM_1980 BAM_1981     TRUE 0.881 2.000 0.647 1.000   NA
 6055245 6055246 BAM_1981 BAM_1982     TRUE 0.692 94.000 0.286 1.000   NA
 6055246 6055247 BAM_1982 BAM_1983     TRUE 0.896 118.000 0.259 NA N NA
 6055247 6055248 BAM_1983 BAM_1984   cydA1 FALSE 0.076 618.000 0.000 NA Y NA
 6055248 6055249 BAM_1984 BAM_1985 cydA1 cydB1 TRUE 0.918 -13.000 0.051 0.030 Y NA
 6055249 6055250 BAM_1985 BAM_1986 cydB1   TRUE 0.965 0.000 0.151 1.000 Y NA
 6055250 6055251 BAM_1986 BAM_1987     TRUE 0.973 3.000 0.168 0.004 Y NA
 6055251 6055252 BAM_1987 BAM_1988     FALSE 0.036 290.000 0.000 NA   NA
 6055252 6055253 BAM_1988 BAM_1989     TRUE 0.658 91.000 0.353 NA   NA
 6055255 6055256 BAM_1991 BAM_1992     FALSE 0.097 245.000 0.000 1.000   NA
 6055256 6055257 BAM_1992 BAM_1993     FALSE 0.005 916.000 0.000 NA   NA
 6055259 6055260 BAM_1995 BAM_1996     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 6055260 6055261 BAM_1996 BAM_1997     FALSE 0.483 89.000 0.000 NA   NA
 6055261 6055262 BAM_1997 BAM_1998     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055262 6055263 BAM_1998 BAM_1999     FALSE 0.377 39.000 0.000 NA   NA
 6055265 6055266 BAM_2001 BAM_2002     TRUE 0.671 117.000 0.000 NA   NA
 6055266 6055267 BAM_2002 BAM_2003     FALSE 0.605 141.000 0.000 NA   NA
 6055267 6055268 BAM_2003 BAM_2004     TRUE 0.722 118.000 0.136 NA   NA
 6055268 6055269 BAM_2004 BAM_2005     FALSE 0.342 69.000 0.000 NA   NA
 6055269 6055270 BAM_2005 BAM_2006     TRUE 0.645 4.000 0.000 NA   NA
 6055272 6055273 BAM_2008 BAM_2009   hom1 FALSE 0.007 964.000 0.000 1.000   NA
 6055273 6055274 BAM_2009 BAM_2010 hom1 thrC TRUE 0.932 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 6055274 6055275 BAM_2010 BAM_2011 thrC thrB TRUE 0.957 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 6055275 6055276 BAM_2011 BAM_2012 thrB   TRUE 0.683 120.000 0.011 NA   NA
 6055276 6055277 BAM_2012 BAM_2013     FALSE 0.116 217.000 0.000 NA   NA
 6055277 6055278 BAM_2013 BAM_2014     FALSE 0.152 205.000 0.000 NA   NA
 6055278 6055279 BAM_2014 BAM_2015     FALSE 0.506 160.000 0.222 NA   NA
 6055279 6055280 BAM_2015 BAM_2016     FALSE 0.608 14.000 0.038 NA   NA
 6055280 6055281 BAM_2016 BAM_2017     TRUE 0.915 -21.000 0.472 1.000 Y NA
 6055281 6055282 BAM_2017 BAM_2018     TRUE 0.862 101.000 0.129 1.000 N NA
 6055282 6055283 BAM_2018 BAM_2019     FALSE 0.636 15.000 0.111 NA   NA
 6055283 6055284 BAM_2019 BAM_2020     FALSE 0.487 160.000 0.111 NA   NA
 6055284 6055285 BAM_2020 BAM_2021     TRUE 0.650 98.000 0.049 1.000   NA
 6055285 6055286 BAM_2021 BAM_2022   asbA FALSE 0.053 284.000 0.000 1.000   NA
 6055286 6055287 BAM_2022 BAM_2023 asbA asbB TRUE 0.909 65.000 0.163 0.001 Y NA
 6055287 6055288 BAM_2023 BAM_2024 asbB asbC TRUE 0.922 -13.000 0.310 1.000 Y NA
 6055288 6055289 BAM_2024 BAM_2025 asbC asbD FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055289 6055290 BAM_2025 BAM_2026 asbD asbE FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 6055290 6055291 BAM_2026 BAM_2027 asbE asbF FALSE 0.581 38.000 0.412 NA   NA
 6055291 6055292 BAM_2027 BAM_2028 asbF   TRUE 0.728 126.000 0.137 NA   NA
 6055292 6055293 BAM_2028 BAM_2029     FALSE 0.480 168.000 0.167 1.000   NA
 6055295 6055296 BAM_2031 BAM_2032     FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6055297 6055298 BAM_2033 BAM_2034     TRUE 0.804 91.000 0.714 NA   NA
 6055299 6055300 BAM_2035 BAM_2036     TRUE 0.722 146.000 0.375 NA   NA
 6055300 6055301 BAM_2036 BAM_2037     FALSE 0.612 104.000 0.000 NA   NA
 6055301 6055302 BAM_2037 BAM_2038     FALSE 0.439 32.000 0.000 NA   NA
 6055304 6055305 BAM_2040 BAM_2041     FALSE 0.605 103.000 0.000 NA   NA
 6055305 6055306 BAM_2041 BAM_2042     TRUE 0.768 117.000 0.286 NA   NA
 6055306 6055307 BAM_2042 BAM_2043     FALSE 0.134 275.000 0.000 NA N NA
 6055309 6055310 BAM_2045 BAM_2046     FALSE 0.161 203.000 0.000 NA   NA
 6055310 6055311 BAM_2046 BAM_2047     FALSE 0.377 -13.000 0.000 NA   NA
 6055312 6055313 BAM_2048 BAM_2049     TRUE 0.820 85.000 0.889 NA   NA
 6055314 6055315 BAM_2050 BAM_2051     FALSE 0.313 180.000 0.091 NA   NA
 6055315 6055316 BAM_2051 BAM_2052     FALSE 0.197 205.000 0.000 1.000   NA
 6055316 6055317 BAM_2052 BAM_2053     FALSE 0.403 205.000 0.667 NA   NA
 6055317 6055318 BAM_2053 BAM_2054     FALSE 0.050 269.000 0.000 NA   NA
 6055320 6055321 BAM_2056 BAM_2057 dpS   TRUE 0.672 107.000 0.111 NA   NA
 6055321 6055322 BAM_2057 BAM_2058     FALSE 0.099 225.000 0.000 NA   NA
 6055323 6055324 BAM_2059 BAM_2060     TRUE 0.809 106.000 0.467 NA   NA
 6055325 6055326 BAM_2061 BAM_2062     TRUE 0.880 85.000 0.636 1.000 N NA
 6055330 6055331 BAM_2066 BAM_2068     FALSE 0.250 -40.000 0.000 NA   NA
 6055332 6055333 BAM_2067 BAM_2069     FALSE 0.332 171.000 0.000 NA   NA
 6055333 6055334 BAM_2069 BAM_2070     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6055335 6055336 BAM_2071 BAM_2072     FALSE 0.387 75.000 0.000 NA   NA
 6055336 6055337 BAM_2072 BAM_2073     FALSE 0.069 249.000 0.000 NA   NA
 6055337 6055338 BAM_2073 BAM_2074     FALSE 0.005 2229.000 0.000 NA   NA
 6055342 6055343 BAM_2078 BAM_2079     TRUE 0.822 116.000 0.333 1.000   NA
 6055345 6055346 BAM_2081 BAM_2082 ogt1   FALSE 0.554 95.000 0.054 NA   NA
 6055346 6055347 BAM_2082 BAM_2083     FALSE 0.540 77.000 0.296 NA   NA
 6055347 6055348 BAM_2083 BAM_2084   fosB1 TRUE 0.884 59.000 0.129 NA Y NA
 6055348 6055349 BAM_2084 BAM_2085 fosB1   FALSE 0.598 13.000 0.000 NA   NA
 6055349 6055350 BAM_2085 BAM_2086     TRUE 0.671 13.000 0.000 1.000   NA
 6055352 6055353 BAM_2088 BAM_2089 cotH   TRUE 0.854 106.000 0.062 NA N NA
 6055353 6055354 BAM_2089 BAM_2090     TRUE 0.643 105.000 0.062 NA   NA
 6055354 6055355 BAM_2090 BAM_2091     TRUE 0.805 102.000 0.500 NA   NA
 6055355 6055356 BAM_2091 BAM_2092     FALSE 0.311 185.000 0.033 1.000   NA
 6055356 6055357 BAM_2092 BAM_2093     FALSE 0.191 199.000 0.053 NA   NA
 6055357 6055358 BAM_2093 BAM_2094     TRUE 0.899 4.000 0.841 NA   NA
 6055358 6055359 BAM_2094 BAM_2095     FALSE 0.228 196.000 0.195 NA   NA
 6055359 6055360 BAM_2095 BAM_2096     FALSE 0.182 374.000 0.000 1.000 Y NA
 6055360 6055361 BAM_2096 BAM_2097     FALSE 0.439 32.000 0.000 NA   NA
 6055361 6055362 BAM_2097 BAM_2098     FALSE 0.417 34.000 0.000 NA   NA
 6055362 6055363 BAM_2098 BAM_2099     FALSE 0.227 187.000 0.000 NA   NA
 6055363 6055364 BAM_2099 BAM_2100     TRUE 0.656 101.000 0.227 NA   NA
 6055365 6055366 BAM_2101 BAM_2102     TRUE 0.647 2.000 0.034 NA   NA
 6055366 6055367 BAM_2102 BAM_2103     FALSE 0.140 209.000 0.000 NA   NA
 6055367 6055368 BAM_2103 BAM_2104     FALSE 0.547 147.000 0.000 NA   NA
 6055369 6055370 BAM_2105 BAM_2106   brnQ4 FALSE 0.010 424.000 0.000 NA   NA
 6055370 6055371 BAM_2106 BAM_2107 brnQ4 csaA FALSE 0.417 67.000 0.032 1.000   NA
 6055371 6055372 BAM_2107 BAM_2109 csaA   FALSE 0.576 18.000 0.032 NA   NA
 6055373 6055374 BAM_2108 BAM_2110     TRUE 0.695 5.000 0.200 NA   NA
 6055375 6055376 BAM_2111 BAM_2112 spoIIP   FALSE 0.159 224.000 0.214 1.000   NA
 6055376 6055377 BAM_2112 BAM_2113     TRUE 0.922 12.000 0.571 1.000 N NA
 6055377 6055378 BAM_2113 BAM_2114     TRUE 0.759 24.000 0.444 1.000   NA
 6055378 6055379 BAM_2114 BAM_2115     FALSE 0.394 185.000 0.286 1.000   NA
 6055381 6055382 BAM_2117 BAM_2118     TRUE 0.967 3.000 0.259 NA Y NA
 6055382 6055383 BAM_2118 BAM_2119     TRUE 0.871 107.000 0.021 1.000 N NA
 6055383 6055384 BAM_2119 BAM_2120     TRUE 0.807 7.000 0.368 1.000   NA
 6055387 6055388 BAM_2123 BAM_2124     FALSE 0.584 -7.000 0.185 1.000   NA
 6055388 6055389 BAM_2124 BAM_2125     FALSE 0.583 24.000 0.222 NA   NA
 6055390 6055391 BAM_2126 BAM_2127     TRUE 0.694 168.000 0.700 NA   NA
 6055393 6055394 BAM_2129 BAM_2130     FALSE 0.535 148.000 0.000 NA   NA
 6055394 6055395 BAM_2130 BAM_2131     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055397 6055398 BAM_2133 BAM_2134     FALSE 0.314 -21.000 0.000 NA   NA
 6055398 6055399 BAM_2134 BAM_2135     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055399 6055400 BAM_2135 BAM_2136     FALSE 0.634 13.000 0.090 NA   NA
 6055400 6055401 BAM_2136 BAM_2137     FALSE 0.538 21.000 0.000 NA   NA
 6055401 6055402 BAM_2137 BAM_2138     FALSE 0.628 1.000 0.000 NA   NA
 6055402 6055403 BAM_2138 BAM_2139     FALSE 0.409 77.000 0.000 NA   NA
 6055403 6055404 BAM_2139 BAM_2140     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 6055404 6055405 BAM_2140 BAM_2141     FALSE 0.597 142.000 0.000 NA   NA
 6055406 6055407 BAM_2142 BAM_2143     FALSE 0.404 163.000 0.000 NA   NA
 6055407 6055408 BAM_2143 BAM_2144     FALSE 0.046 272.000 0.000 NA   NA
 6055409 6055410 BAM_2145 BAM_2146     FALSE 0.491 161.000 0.216 NA   NA
 6055410 6055411 BAM_2146 BAM_2147     FALSE 0.402 52.000 0.216 NA   NA
 6055411 6055412 BAM_2147 BAM_2148     TRUE 0.736 70.000 0.889 NA   NA
 6055414 6055415 BAM_2150 BAM_2151   fhs TRUE 0.684 64.000 0.200 1.000 N NA
 6055415 6055416 BAM_2151 BAM_2152 fhs   TRUE 0.658 91.000 0.355 NA   NA
 6055416 6055417 BAM_2152 BAM_2153     FALSE 0.575 20.000 0.070 NA   NA
 6055417 6055418 BAM_2153 BAM_2154     FALSE 0.599 143.000 0.026 NA   NA
 6055418 6055419 BAM_2154 BAM_2155     FALSE 0.391 56.000 0.211 NA   NA
 6055420 6055421 BAM_2156 BAM_2157     FALSE 0.538 30.000 0.233 NA   NA
 6055422 6055423 BAM_2158 BAM_2159     FALSE 0.337 54.000 0.000 NA   NA
 6055423 6055424 BAM_2159 BAM_2160     FALSE 0.561 -3.000 0.000 NA   NA
 6055425 6055426 BAM_2161 BAM_2162     FALSE 0.495 86.000 0.064 NA   NA
 6055426 6055427 BAM_2162 BAM_2163     FALSE 0.586 98.000 0.064 NA   NA
 6055429 6055430 BAM_2165 BAM_2166     FALSE 0.084 318.000 0.642 NA   NA
 6055430 6055431 BAM_2166 BAM_2167     TRUE 0.870 0.000 0.714 NA   NA
 6055431 6055432 BAM_2167 BAM_2168     FALSE 0.012 389.000 0.000 NA   NA
 6055432 6055433 BAM_2168 BAM_2169     TRUE 0.766 93.000 0.556 NA   NA
 6055434 6055435 BAM_2170 BAM_2171 narG narH TRUE 0.950 -10.000 0.429 0.000 Y NA
 6055435 6055436 BAM_2171 BAM_2172 narH narJ TRUE 0.978 20.000 0.750 0.001 Y NA
 6055436 6055437 BAM_2172 BAM_2173 narJ narI TRUE 0.967 18.000 0.294 0.001 Y NA
 6055437 6055438 BAM_2173 BAM_2174 narI   FALSE 0.079 332.000 0.000 1.000 N NA
 6055438 6055439 BAM_2174 BAM_2175     TRUE 0.857 -3.000 0.250 1.000 N NA
 6055439 6055440 BAM_2175 BAM_2176     FALSE 0.413 -10.000 0.000 NA   NA
 6055442 6055443 BAM_2178 BAM_2179 narA1   TRUE 0.977 18.000 0.778 1.000 Y NA
 6055443 6055444 BAM_2179 BAM_2180   moeA1 TRUE 0.934 43.000 0.500 1.000 Y NA
 6055444 6055445 BAM_2180 BAM_2181 moeA1 moaE1 TRUE 0.913 45.000 0.006 0.004 Y NA
 6055445 6055446 BAM_2181 BAM_2182 moaE1 moaD1 TRUE 0.974 -3.000 0.501 0.004 Y NA
 6055446 6055447 BAM_2182 BAM_2183 moaD1 narK TRUE 0.734 81.000 0.021 NA N NA
 6055447 6055448 BAM_2183 BAM_2184 narK   FALSE 0.017 352.000 0.000 NA   NA
 6055448 6055449 BAM_2184 BAM_2186     FALSE 0.008 480.000 0.000 NA   NA
 6055450 6055451 BAM_2185 BAM_2187     TRUE 0.685 116.000 0.054 NA   NA
 6055451 6055452 BAM_2187 BAM_2188     FALSE 0.583 -7.000 0.143 1.000   NA
 6055452 6055453 BAM_2188 BAM_2189     TRUE 0.764 -3.000 0.381 1.000   NA
 6055453 6055454 BAM_2189 BAM_2190   nirD TRUE 0.669 63.000 0.061 1.000 N NA
 6055454 6055455 BAM_2190 BAM_2191 nirD nirB TRUE 0.884 16.000 0.091 0.000 N NA
 6055455 6055456 BAM_2191 BAM_2192 nirB scdA FALSE 0.331 212.000 0.000 NA N NA
 6055459 6055460 BAM_2195 BAM_2196     FALSE 0.247 216.000 0.444 NA   NA
 6055462 6055463 BAM_2198 BAM_2199     FALSE 0.329 61.000 0.000 NA   NA
 6055463 6055464 BAM_2199 BAM_2200   spoVS1 FALSE 0.009 430.000 0.000 NA   NA
 6055465 6055466 BAM_2201 BAM_2202     FALSE 0.025 317.000 0.000 NA   NA
 6055467 6055468 BAM_2203 BAM_2204     FALSE 0.635 2.000 0.000 NA   NA
 6055469 6055470 BAM_2205 BAM_2206     FALSE 0.142 208.000 0.000 NA   NA
 6055471 6055472 BAM_2207 BAM_2208     FALSE 0.568 -3.000 0.020 NA   NA
 6055472 6055473 BAM_2208 BAM_2209     TRUE 0.645 -3.000 0.031 1.000   NA
 6055473 6055474 BAM_2209 BAM_2210     FALSE 0.406 76.000 0.022 NA   NA
 6055474 6055475 BAM_2210 BAM_2211     TRUE 0.643 106.000 0.049 NA   NA
 6055475 6055476 BAM_2211 BAM_2212   ssb2 TRUE 0.765 159.000 0.700 NA   NA
 6055477 6055478 BAM_2213 BAM_2214     FALSE 0.598 102.000 0.000 NA   NA
 6055478 6055479 BAM_2214 BAM_2215     FALSE 0.038 286.000 0.000 NA   NA
 6055480 6055481 BAM_2216 BAM_2217     TRUE 0.655 4.000 0.028 NA   NA
 6055481 6055482 BAM_2217 BAM_2218     FALSE 0.473 84.000 0.028 NA   NA
 6055482 6055483 BAM_2218 BAM_2219     FALSE 0.381 50.000 0.081 NA   NA
 6055483 6055484 BAM_2219 BAM_2220   argS1 FALSE 0.031 301.000 0.000 NA   NA
 6055484 6055485 BAM_2220 BAM_2221 argS1   FALSE 0.121 217.000 0.032 NA   NA
 6055485 6055486 BAM_2221 BAM_2222     FALSE 0.551 30.000 0.250 NA   NA
 6055486 6055487 BAM_2222 BAM_2223     TRUE 0.682 137.000 0.118 NA   NA
 6055487 6055488 BAM_2223 BAM_2224     FALSE 0.014 370.000 0.000 NA   NA
 6055488 6055489 BAM_2224 BAM_2225     FALSE 0.398 76.000 0.000 NA   NA
 6055489 6055490 BAM_2225 BAM_2227   ileS1 FALSE 0.012 393.000 0.000 NA   NA
 6055494 6055495 BAM_2230 BAM_2231   aspS1 FALSE 0.110 220.000 0.000 NA   NA
 6055495 6055496 BAM_2231 BAM_2232 aspS1   FALSE 0.170 201.000 0.000 NA   NA
 6055496 6055497 BAM_2232 BAM_2233     TRUE 0.658 13.000 0.214 NA   NA
 6055497 6055498 BAM_2233 BAM_2234     TRUE 0.645 29.000 0.375 NA   NA
 6055498 6055499 BAM_2234 BAM_2235