MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus dysgalactiae subsp. equisimilis GGS_124

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7471588 7471589 SDEG_0001 SDEG_0002 dnaA dnaN TRUE 0.773 154.000 0.328 1.000 Y NA
 7471589 7471590 SDEG_0002 SDEG_0003 dnaN   FALSE 0.287 74.000 0.009 NA   NA
 7471590 7471591 SDEG_0003 SDEG_0004     FALSE 0.044 257.000 0.000 NA   NA
 7471591 7471592 SDEG_0004 SDEG_0005     FALSE 0.191 124.000 0.002 NA   NA
 7471592 7471593 SDEG_0005 SDEG_0006   pth TRUE 0.826 71.000 0.184 1.000 Y NA
 7471593 7471594 SDEG_0006 SDEG_0007 pth trcF TRUE 0.931 3.000 0.137 1.000 N NA
 7471594 7471595 SDEG_0007 SDEG_0008 trcF   TRUE 0.923 -52.000 0.033 1.000   NA
 7471595 7471596 SDEG_0008 SDEG_0009     TRUE 0.712 35.000 0.034 1.000   NA
 7471596 7471597 SDEG_0009 SDEG_0010   divIC TRUE 0.936 -13.000 0.053 1.000 N NA
 7471597 7471598 SDEG_0010 SDEG_0011 divIC   TRUE 0.898 0.000 0.011 NA   NA
 7471598 7471599 SDEG_0011 SDEG_0012     TRUE 0.920 13.000 0.132 NA   NA
 7471599 7471600 SDEG_0012 SDEG_0013   tilS TRUE 0.910 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7471600 7471601 SDEG_0013 SDEG_0014 tilS hpt TRUE 0.966 5.000 0.067 0.057 N NA
 7471601 7471602 SDEG_0014 SDEG_0015 hpt ftsH TRUE 0.894 22.000 0.192 1.000 N NA
 7471602 7471603 SDEG_0015 SDEG_0016 ftsH   FALSE 0.190 128.000 0.009 1.000 N NA
 7471603 7471604 SDEG_0016 SDEG_0017     FALSE 0.010 1597.000 0.000 NA   NA
 7471604 7471605 SDEG_0017 SDEG_0018     TRUE 0.410 51.000 0.000 NA   NA
 7471605 7471606 SDEG_0018 SDEG_0019     FALSE 0.026 307.000 0.000 NA   NA
 7471606 7471607 SDEG_0019 SDEG_0020     FALSE 0.185 95.000 0.000 NA   NA
 7471607 7471608 SDEG_0020 SDEG_0021     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 7471608 7471609 SDEG_0021 SDEG_0022     TRUE 0.738 19.000 0.000 NA   NA
 7471609 7471610 SDEG_0022 SDEG_0023     TRUE 0.616 32.000 0.000 NA   NA
 7471610 7471611 SDEG_0023 SDEG_0024     TRUE 0.818 6.000 0.000 NA   NA
 7471611 7471612 SDEG_0024 SDEG_0025     TRUE 0.802 11.000 0.000 NA   NA
 7471612 7471613 SDEG_0025 SDEG_0026     TRUE 0.802 11.000 0.000 NA   NA
 7471613 7471614 SDEG_0026 SDEG_0027     TRUE 0.809 9.000 0.000 NA   NA
 7471614 7471615 SDEG_0027 SDEG_0028     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 7471615 7471616 SDEG_0028 SDEG_0029     TRUE 0.818 6.000 0.000 NA   NA
 7471616 7471617 SDEG_0029 SDEG_0030     TRUE 0.828 4.000 0.000 NA   NA
 7471617 7471618 SDEG_0030 SDEG_0031     TRUE 0.730 20.000 0.000 NA   NA
 7471618 7471619 SDEG_0031 SDEG_0032     TRUE 0.800 13.000 0.000 NA   NA
 7471619 7471620 SDEG_0032 SDEG_0033     TRUE 0.809 9.000 0.000 NA   NA
 7471620 7471621 SDEG_0033 SDEG_0034     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 7471621 7471622 SDEG_0034 SDEG_0035     TRUE 0.809 9.000 0.000 NA   NA
 7471622 7471623 SDEG_0035 SDEG_0036     TRUE 0.678 26.000 0.000 NA   NA
 7471623 7471624 SDEG_0036 SDEG_0037     TRUE 0.818 6.000 0.000 NA   NA
 7471624 7471625 SDEG_0037 SDEG_0038   sibA FALSE 0.010 1092.000 0.000 NA   NA
 7471625 7471626 SDEG_0038 SDEG_0039 sibA prs1 FALSE 0.297 154.000 0.107 NA   NA
 7471626 7471627 SDEG_0039 SDEG_0040 prs1 recO FALSE 0.052 225.000 0.000 1.000 N NA
 7471627 7471628 SDEG_0040 SDEG_0041 recO plsX FALSE 0.215 107.000 0.011 1.000 N NA
 7471628 7471629 SDEG_0041 SDEG_0042 plsX acpP.1 TRUE 0.996 -7.000 0.017 0.008 Y NA
 7471629 7471630 SDEG_0042 SDEG_0043 acpP.1 purC FALSE 0.163 165.000 0.017 1.000 N NA
 7471630 7471631 SDEG_0043 SDEG_0044 purC   TRUE 0.426 209.000 0.043 1.000 Y NA
 7471631 7471632 SDEG_0044 SDEG_0045   purF TRUE 0.640 119.000 0.024 1.000 Y NA
 7471632 7471633 SDEG_0045 SDEG_0046 purF   TRUE 0.752 150.000 0.248 1.000 Y NA
 7471633 7471634 SDEG_0046 SDEG_0047   purN TRUE 0.998 -7.000 0.238 0.003 Y NA
 7471634 7471635 SDEG_0047 SDEG_0048 purN   FALSE 0.190 98.000 0.003 NA N NA
 7471635 7471636 SDEG_0048 SDEG_0049     TRUE 0.743 19.000 0.002 NA N NA
 7471638 7471639 SDEG_0051 SDEG_0052 purD   FALSE 0.097 639.000 0.044 1.000 Y NA
 7471639 7471640 SDEG_0052 SDEG_0053     TRUE 0.996 -13.000 0.008 0.001 Y NA
 7471640 7471641 SDEG_0053 SDEG_0054     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 7471641 7471642 SDEG_0054 SDEG_0055   purB FALSE 0.047 251.000 0.000 NA   NA
 7471642 7471643 SDEG_0055 SDEG_0056 purB   FALSE 0.181 142.000 0.005 1.000   NA
 7471643 7471644 SDEG_0056 SDEG_0057   ruvB FALSE 0.077 217.000 0.002 1.000   NA
 7471644 7471645 SDEG_0057 SDEG_0058 ruvB   FALSE 0.172 135.000 0.005 1.000 N NA
 7471645 7471646 SDEG_0058 SDEG_0059     TRUE 0.744 29.000 0.019 NA   NA
 7471646 7471647 SDEG_0059 SDEG_0060     TRUE 0.979 -3.000 0.351 NA   NA
 7471647 7471648 SDEG_0060 SDEG_0061   adh2 FALSE 0.021 321.000 0.000 1.000 N NA
 7471648 7471649 SDEG_0061 SDEG_0062 adh2 adhA FALSE 0.224 293.000 0.012 0.001   NA
 7471649 7471650 SDEG_0062 SDEG_0063 adhA thnsl FALSE 0.106 192.000 0.003 1.000   NA
 7471650 7471651 SDEG_0063 SDEG_0064 thnsl   TRUE 0.475 40.000 0.000 1.000 N NA
 7471652 7471653 SDEG_0065 SDEG_0066     TRUE 0.867 -171.000 0.000 NA   NA
 7471654 7471655 SDEG_0067 SDEG_0068 rpsJ rplC TRUE 0.935 106.000 0.467 0.038 Y NA
 7471655 7471656 SDEG_0068 SDEG_0069 rplC rplD TRUE 0.995 24.000 0.544 0.029 Y NA
 7471656 7471657 SDEG_0069 SDEG_0070 rplD rplW TRUE 0.997 0.000 0.307 0.029 Y NA
 7471657 7471658 SDEG_0070 SDEG_0071 rplW rplB TRUE 0.997 18.000 0.849 0.033 Y NA
 7471658 7471659 SDEG_0071 SDEG_0072 rplB rpsS TRUE 0.961 91.000 0.820 0.038 Y NA
 7471659 7471660 SDEG_0072 SDEG_0073 rpsS rplV TRUE 0.997 16.000 0.769 0.038 Y NA
 7471660 7471661 SDEG_0073 SDEG_0074 rplV   TRUE 0.997 13.000 0.719 0.038 Y NA
 7471661 7471662 SDEG_0074 SDEG_0075     TRUE 0.998 4.000 0.828 0.038 Y NA
 7471662 7471663 SDEG_0075 SDEG_0076     TRUE 0.998 10.000 0.802 0.029 Y NA
 7471663 7471664 SDEG_0076 SDEG_0077     TRUE 0.996 28.000 0.828 0.029 Y NA
 7471664 7471665 SDEG_0077 SDEG_0078   rplN TRUE 0.995 25.000 0.791 0.038 Y NA
 7471667 7471668 SDEG_0080 SDEG_0081 rplX rplE TRUE 0.996 24.000 0.758 0.029 Y NA
 7471668 7471669 SDEG_0081 SDEG_0082 rplE rpsN TRUE 0.996 16.000 0.496 0.029 Y NA
 7471669 7471670 SDEG_0082 SDEG_0083 rpsN rpsH TRUE 0.854 208.000 0.473 0.029 Y NA
 7471670 7471671 SDEG_0083 SDEG_0084 rpsH rplF TRUE 0.911 202.000 0.808 0.029 Y NA
 7471671 7471672 SDEG_0084 SDEG_0085 rplF rplR TRUE 0.962 96.000 0.815 0.029 Y NA
 7471676 7471677 SDEG_0089 SDEG_0090 rpmD rplO TRUE 0.897 215.000 0.653 0.005 Y NA
 7471677 7471678 SDEG_0090 SDEG_0091 rplO secY TRUE 0.988 -22.000 0.730 1.000 N NA
 7471678 7471679 SDEG_0091 SDEG_0092 secY adk TRUE 0.419 147.000 0.241 1.000 N NA
 7471679 7471680 SDEG_0092 SDEG_0093 adk infA FALSE 0.301 64.000 0.007 1.000 N NA
 7471680 7471681 SDEG_0093 SDEG_0094 infA rpmJ TRUE 0.946 26.000 0.020 1.000 Y NA
 7471681 7471682 SDEG_0094 SDEG_0095 rpmJ rpsM TRUE 0.990 18.000 0.086 0.028 Y NA
 7471682 7471683 SDEG_0095 SDEG_0096 rpsM rpsK TRUE 0.997 18.000 0.810 0.028 Y NA
 7471683 7471684 SDEG_0096 SDEG_0097 rpsK rpoA TRUE 0.800 46.000 0.308 1.000 N NA
 7471684 7471685 SDEG_0097 SDEG_0098 rpoA rplQ TRUE 0.979 15.000 0.873 1.000 N NA
 7471685 7471686 SDEG_0098 SDEG_0099 rplQ   FALSE 0.012 480.000 0.000 1.000 N NA
 7471686 7471687 SDEG_0099 SDEG_0100     TRUE 0.815 88.000 0.000 0.030 Y NA
 7471687 7471688 SDEG_0100 SDEG_0101     FALSE 0.019 360.000 0.000 NA   NA
 7471688 7471689 SDEG_0101 SDEG_0102     TRUE 0.410 51.000 0.000 NA   NA
 7471689 7471690 SDEG_0102 SDEG_0103     FALSE 0.026 307.000 0.000 NA   NA
 7471690 7471691 SDEG_0103 SDEG_0104     FALSE 0.185 95.000 0.000 NA   NA
 7471691 7471692 SDEG_0104 SDEG_0105     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 7471692 7471693 SDEG_0105 SDEG_0106     TRUE 0.823 5.000 0.000 NA   NA
 7471693 7471694 SDEG_0106 SDEG_0107     TRUE 0.668 27.000 0.000 NA   NA
 7471694 7471695 SDEG_0107 SDEG_0108     TRUE 0.786 15.000 0.000 NA   NA
 7471695 7471696 SDEG_0108 SDEG_0109     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 7471696 7471697 SDEG_0109 SDEG_0110     TRUE 0.809 9.000 0.000 NA   NA
 7471697 7471698 SDEG_0110 SDEG_0111     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 7471698 7471699 SDEG_0111 SDEG_0112     TRUE 0.738 19.000 0.000 NA   NA
 7471699 7471700 SDEG_0112 SDEG_0113     TRUE 0.815 7.000 0.000 NA   NA
 7471700 7471701 SDEG_0113 SDEG_0114     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 7471701 7471702 SDEG_0114 SDEG_0115     TRUE 0.815 7.000 0.000 NA   NA
 7471702 7471703 SDEG_0115 SDEG_0116     TRUE 0.738 19.000 0.000 NA   NA
 7471703 7471704 SDEG_0116 SDEG_0117     FALSE 0.056 231.000 0.000 NA   NA
 7471704 7471705 SDEG_0117 SDEG_0118     FALSE 0.142 135.000 0.000 1.000 N NA
 7471705 7471706 SDEG_0118 SDEG_0119     TRUE 0.971 -3.000 0.261 1.000 N NA
 7471706 7471707 SDEG_0119 SDEG_0120   cydA TRUE 0.764 110.000 0.174 1.000 Y NA
 7471707 7471708 SDEG_0120 SDEG_0121 cydA cydB TRUE 0.999 1.000 0.950 0.017 Y NA
 7471708 7471709 SDEG_0121 SDEG_0122 cydB   TRUE 0.985 0.000 0.061 1.000 Y NA
 7471709 7471710 SDEG_0122 SDEG_0123     TRUE 0.997 -3.000 0.168 0.017 Y NA
 7471712 7471713 SDEG_0125 SDEG_0126 ispE adcR FALSE 0.276 69.000 0.008 1.000 N NA
 7471713 7471714 SDEG_0126 SDEG_0127 adcR adcC TRUE 0.943 4.000 0.192 1.000 N NA
 7471714 7471715 SDEG_0127 SDEG_0128 adcC adcB TRUE 0.996 -46.000 0.673 1.000 Y NA
 7471717 7471718 SDEG_0130 SDEG_0131   rpoB FALSE 0.036 264.000 0.000 1.000 N NA
 7471718 7471719 SDEG_0131 SDEG_0132 rpoB rpoC TRUE 0.974 96.000 0.851 0.002 Y NA
 7471719 7471720 SDEG_0132 SDEG_0133 rpoC   FALSE 0.105 203.000 0.007 NA   NA
 7471720 7471721 SDEG_0133 SDEG_0134     TRUE 0.387 81.000 0.083 NA   NA
 7471721 7471722 SDEG_0134 SDEG_0135     TRUE 0.996 -124.000 0.639 1.000 Y NA
 7471722 7471723 SDEG_0135 SDEG_0136     TRUE 0.999 2.000 0.861 0.001 Y NA
 7471723 7471724 SDEG_0136 SDEG_0137     TRUE 0.950 -40.000 0.110 NA   NA
 7471724 7471725 SDEG_0137 SDEG_0138     TRUE 0.988 -43.000 0.786 NA   NA
 7471725 7471726 SDEG_0138 SDEG_0139   comYD TRUE 0.973 -19.000 0.250 NA   NA
 7471726 7471727 SDEG_0139 SDEG_0140 comYD   TRUE 0.971 -22.000 0.232 NA   NA
 7471727 7471728 SDEG_0140 SDEG_0141     TRUE 0.489 63.000 0.087 NA   NA
 7471728 7471729 SDEG_0141 SDEG_0142   ackA TRUE 0.557 59.000 0.130 1.000 N NA
 7471729 7471730 SDEG_0142 SDEG_0143 ackA   FALSE 0.057 307.000 0.094 1.000 N NA
 7471730 7471731 SDEG_0143 SDEG_0144     FALSE 0.183 103.000 0.000 NA   NA
 7471731 7471732 SDEG_0144 SDEG_0145     TRUE 0.951 18.000 0.400 NA   NA
 7471733 7471734 SDEG_0146 SDEG_0147 proC pepA TRUE 0.570 47.000 0.041 1.000 N NA
 7471734 7471735 SDEG_0147 SDEG_0148 pepA   FALSE 0.247 175.000 0.100 NA   NA
 7471736 7471737 SDEG_0149 SDEG_0150   trxA TRUE 0.959 -3.000 0.140 NA   NA
 7471737 7471738 SDEG_0150 SDEG_0151 trxA   TRUE 0.930 18.000 0.239 1.000   NA
 7471738 7471739 SDEG_0151 SDEG_0152     FALSE 0.225 152.000 0.034 1.000   NA
 7471740 7471741 SDEG_0153 SDEG_0154     TRUE 0.891 -28.000 0.005 1.000 N NA
 7471741 7471742 SDEG_0154 SDEG_0155   hslO TRUE 0.913 -100.000 0.034 1.000 N NA
 7471742 7471743 SDEG_0155 SDEG_0156 hslO rofA FALSE 0.175 147.000 0.003 NA   NA
 7471744 7471745 SDEG_0157 SDEG_0158 fszF fszE FALSE 0.208 83.000 0.000 NA   NA
 7471745 7471746 SDEG_0158 SDEG_0159 fszE   TRUE 0.823 5.000 0.000 NA   NA
 7471746 7471747 SDEG_0159 SDEG_0160     TRUE 0.998 -16.000 1.000 NA Y NA
 7471747 7471748 SDEG_0160 SDEG_0161     FALSE 0.307 61.000 0.000 NA   NA
 7471750 7471751 SDEG_0163 SDEG_0164     TRUE 0.739 26.000 0.016 NA N NA
 7471752 7471753 SDEG_0165 SDEG_0166     TRUE 0.980 13.000 0.818 NA   NA
 7471754 7471755 SDEG_0167 SDEG_0168 purA   FALSE 0.024 326.000 0.000 1.000   NA
 7471757 7471758 SDEG_0170 SDEG_0171     TRUE 0.981 16.000 0.188 1.000 Y NA
 7471758 7471759 SDEG_0171 SDEG_0172     FALSE 0.074 280.000 0.091 1.000 N NA
 7471759 7471760 SDEG_0172 SDEG_0173     TRUE 0.996 28.000 0.889 0.017 Y NA
 7471760 7471761 SDEG_0173 SDEG_0174     TRUE 0.998 10.000 0.889 0.017 Y NA
 7471761 7471762 SDEG_0174 SDEG_0175     FALSE 0.173 211.000 0.132 1.000 N NA
 7471762 7471763 SDEG_0175 SDEG_0176   mipB TRUE 0.957 13.000 0.368 1.000 N NA
 7471763 7471764 SDEG_0176 SDEG_0177 mipB gldA TRUE 0.785 42.000 0.211 1.000 N NA
 7471764 7471765 SDEG_0177 SDEG_0178 gldA   FALSE 0.097 188.000 0.000 NA   NA
 7471767 7471768 SDEG_0180 SDEG_0181     FALSE 0.183 107.000 0.000 NA   NA
 7471771 7471772 SDEG_0184 SDEG_0185     FALSE 0.012 584.000 0.000 NA   NA
 7471772 7471773 SDEG_0185 SDEG_0186     FALSE 0.154 143.000 0.000 NA   NA
 7471773 7471774 SDEG_0186 SDEG_0187     FALSE 0.036 273.000 0.000 NA   NA
 7471775 7471776 SDEG_0188 SDEG_0189     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 7471779 7471780 SDEG_0192 SDEG_0193 flaR   TRUE 0.533 55.000 0.062 1.000   NA
 7471781 7471782 SDEG_0194 SDEG_0195     FALSE 0.162 133.000 0.000 1.000   NA
 7471782 7471783 SDEG_0195 SDEG_0196     FALSE 0.247 69.000 0.000 1.000   NA
 7471783 7471784 SDEG_0196 SDEG_0197     TRUE 0.730 20.000 0.000 NA   NA
 7471784 7471785 SDEG_0197 SDEG_0198     FALSE 0.051 240.000 0.000 NA   NA
 7471785 7471786 SDEG_0198 SDEG_0199     TRUE 0.705 23.000 0.000 NA   NA
 7471786 7471787 SDEG_0199 SDEG_0200     FALSE 0.010 1103.000 0.000 NA   NA
 7471787 7471788 SDEG_0200 SDEG_0201     FALSE 0.218 79.000 0.000 NA   NA
 7471788 7471789 SDEG_0201 SDEG_0202     TRUE 0.366 54.000 0.000 NA   NA
 7471789 7471790 SDEG_0202 SDEG_0203     FALSE 0.016 431.000 0.000 NA   NA
 7471790 7471791 SDEG_0203 SDEG_0204     FALSE 0.015 446.000 0.000 NA   NA
 7471792 7471793 SDEG_0205 SDEG_0206     TRUE 0.929 36.000 0.667 1.000   NA
 7471793 7471794 SDEG_0206 SDEG_0207     FALSE 0.062 223.000 0.000 1.000   NA
 7471794 7471795 SDEG_0207 SDEG_0208     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7471795 7471796 SDEG_0208 SDEG_0209     FALSE 0.285 63.000 0.000 NA   NA
 7471797 7471798 SDEG_0210 SDEG_0211     TRUE 0.738 27.000 0.012 1.000   NA
 7471798 7471799 SDEG_0211 SDEG_0212     FALSE 0.167 127.000 0.000 1.000   NA
 7471800 7471801 SDEG_0213 SDEG_0215   cshA FALSE 0.041 265.000 0.000 NA   NA
 7471801 7471802 SDEG_0215 SDEG_0216 cshA   TRUE 0.706 33.000 0.035 1.000 N NA
 7471802 7471803 SDEG_0216 SDEG_0217     TRUE 0.919 33.000 0.009 1.000 Y NA
 7471804 7471805 SDEG_0218 SDEG_0219     FALSE 0.312 71.000 0.013 NA   NA
 7471805 7471806 SDEG_0219 SDEG_0220     TRUE 0.965 0.000 0.227 NA   NA
 7471806 7471807 SDEG_0220 SDEG_0221     FALSE 0.180 152.000 0.008 NA   NA
 7471807 7471808 SDEG_0221 SDEG_0222     FALSE 0.063 270.000 0.048 1.000 N NA
 7471808 7471809 SDEG_0222 SDEG_0223   rgfB TRUE 0.720 79.000 0.610 NA   NA
 7471810 7471811 SDEG_0224 SDEG_0225     TRUE 0.778 24.000 0.018 NA   NA
 7471811 7471812 SDEG_0225 SDEG_0226     TRUE 0.813 8.000 0.000 NA   NA
 7471812 7471813 SDEG_0226 SDEG_0227     TRUE 0.958 4.000 0.262 NA   NA
 7471813 7471814 SDEG_0227 SDEG_0228   nrdI FALSE 0.185 281.000 0.000 NA Y NA
 7471815 7471816 SDEG_0229 SDEG_0230 mgg stg480.0 FALSE 0.037 271.000 0.000 NA   NA
 7471816 7471817 SDEG_0230 SDEG_0231 stg480.0   FALSE 0.013 541.000 0.000 1.000   NA
 7471817 7471818 SDEG_0231 SDEG_0232     TRUE 0.925 14.000 0.177 1.000 N NA
 7471820 7471821 SDEG_0234 SDEG_0235     FALSE 0.057 298.000 0.071 NA N NA
 7471821 7471822 SDEG_0235 SDEG_0236     TRUE 0.807 76.000 0.171 1.000 Y NA
 7471822 7471823 SDEG_0236 SDEG_0237     TRUE 0.812 166.000 0.049 0.014 Y NA
 7471825 7471826 SDEG_0239 SDEG_0240   yajC FALSE 0.199 107.000 0.006 NA N NA
 7471826 7471827 SDEG_0240 SDEG_0241 yajC   FALSE 0.067 228.000 0.007 NA N NA
 7471827 7471828 SDEG_0241 SDEG_0242     TRUE 0.979 13.000 0.113 1.000 Y NA
 7471828 7471829 SDEG_0242 SDEG_0243     FALSE 0.287 98.000 0.040 1.000   NA
 7471829 7471830 SDEG_0243 SDEG_0244     TRUE 0.980 -126.000 0.009 0.005   NA
 7471830 7471831 SDEG_0244 SDEG_0245     FALSE 0.186 191.000 0.095 1.000 N NA
 7471831 7471832 SDEG_0245 SDEG_0246     TRUE 0.426 53.000 0.004 NA   NA
 7471832 7471833 SDEG_0246 SDEG_0247     FALSE 0.215 117.000 0.007 NA   NA
 7471833 7471834 SDEG_0247 SDEG_0248     FALSE 0.166 166.000 0.020 1.000 N NA
 7471834 7471835 SDEG_0248 SDEG_0249     TRUE 0.625 86.000 0.414 1.000   NA
 7471836 7471837 SDEG_0250 SDEG_0251 def   FALSE 0.043 300.000 0.034 NA N NA
 7471838 7471839 SDEG_0252 SDEG_0253   rpsO FALSE 0.153 148.000 0.003 1.000 N NA
 7471839 7471840 SDEG_0253 SDEG_0254 rpsO   TRUE 0.903 -16.000 0.002 NA   NA
 7471840 7471841 SDEG_0254 SDEG_0255     TRUE 0.367 136.000 0.143 NA   NA
 7471841 7471842 SDEG_0255 SDEG_0256     TRUE 0.982 -28.000 0.048 0.016 N NA
 7471842 7471843 SDEG_0256 SDEG_0257   ulaA TRUE 0.964 27.000 0.241 0.029   NA
 7471843 7471844 SDEG_0257 SDEG_0258 ulaA   TRUE 0.890 10.000 0.056 1.000   NA
 7471844 7471845 SDEG_0258 SDEG_0259     FALSE 0.030 280.000 0.000 1.000 N NA
 7471845 7471846 SDEG_0259 SDEG_0260     TRUE 0.918 -7.000 0.009 NA   NA
 7471846 7471847 SDEG_0260 SDEG_0261     TRUE 0.914 9.000 0.097 NA   NA
 7471847 7471848 SDEG_0261 SDEG_0262     FALSE 0.047 251.000 0.000 NA   NA
 7471848 7471849 SDEG_0262 SDEG_0263   cysS TRUE 0.689 28.000 0.002 NA   NA
 7471849 7471850 SDEG_0263 SDEG_0264 cysS   TRUE 0.959 -7.000 0.129 1.000   NA
 7471850 7471851 SDEG_0264 SDEG_0265     FALSE 0.177 117.000 0.000 NA   NA
 7471851 7471852 SDEG_0265 SDEG_0266     FALSE 0.091 192.000 0.000 NA   NA
 7471852 7471853 SDEG_0266 SDEG_0267     FALSE 0.017 411.000 0.000 NA   NA
 7471853 7471854 SDEG_0267 SDEG_0268     FALSE 0.211 107.000 0.003 NA   NA
 7471854 7471855 SDEG_0268 SDEG_0269     TRUE 0.927 4.000 0.109 NA   NA
 7471855 7471856 SDEG_0269 SDEG_0270     FALSE 0.315 84.000 0.036 NA   NA
 7471856 7471857 SDEG_0270 SDEG_0271     FALSE 0.246 135.000 0.031 NA   NA
 7471857 7471858 SDEG_0271 SDEG_0272     TRUE 0.930 -3.000 0.031 NA   NA
 7471858 7471859 SDEG_0272 SDEG_0273     FALSE 0.165 132.000 0.000 NA   NA
 7471859 7471860 SDEG_0273 SDEG_0274     FALSE 0.230 74.000 0.000 NA   NA
 7471860 7471861 SDEG_0274 SDEG_0275     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7471861 7471862 SDEG_0275 SDEG_0276     FALSE 0.195 89.000 0.000 NA   NA
 7471862 7471863 SDEG_0276 SDEG_0277     FALSE 0.164 131.000 0.000 1.000   NA
 7471863 7471864 SDEG_0277 SDEG_0278   rpsI TRUE 0.996 21.000 0.601 0.027 Y NA
 7471865 7471866 SDEG_0279 SDEG_0280     FALSE 0.273 64.000 0.000 1.000   NA
 7471867 7471868 SDEG_0281 SDEG_0282     TRUE 0.594 137.000 0.500 NA   NA
 7471868 7471869 SDEG_0282 SDEG_0283     TRUE 0.969 11.000 0.500 NA   NA
 7471869 7471870 SDEG_0283 SDEG_0284     TRUE 0.984 13.000 1.000 NA   NA
 7471870 7471871 SDEG_0284 SDEG_0285     TRUE 0.980 4.000 0.667 NA   NA
 7471871 10750671 SDEG_0285 SDEG_0286     FALSE 0.093 190.000 0.000 NA   NA
 10750671 7471872 SDEG_0286 SDEG_0287     TRUE 0.565 36.000 0.000 NA   NA
 7471872 7471873 SDEG_0287 SDEG_0288     FALSE 0.025 316.000 0.000 NA   NA
 7471873 7471874 SDEG_0288 SDEG_0289     TRUE 0.679 168.000 1.000 NA   NA
 7471875 7471876 SDEG_0290 SDEG_0291     TRUE 0.985 -10.000 0.500 NA   NA
 7471876 7471877 SDEG_0291 SDEG_0292   int FALSE 0.017 404.000 0.000 NA   NA
 7471877 7471878 SDEG_0292 SDEG_0293 int   TRUE 0.842 33.000 0.000 0.099   NA
 7471878 7471879 SDEG_0293 SDEG_0294     TRUE 0.395 52.000 0.000 NA   NA
 7471880 7471881 SDEG_0295 SDEG_0296 labC labT TRUE 0.965 30.000 1.000 NA   NA
 7471881 7471882 SDEG_0296 SDEG_0297 labT   FALSE 0.325 59.000 0.000 NA   NA
 7471882 7471883 SDEG_0297 SDEG_0298     FALSE 0.210 82.000 0.000 NA   NA
 7471885 7471886 SDEG_0300 SDEG_0301     TRUE 0.802 12.000 0.000 NA   NA
 7471886 10750672 SDEG_0301 SDEG_0302     FALSE 0.230 74.000 0.000 NA   NA
 10750672 7471887 SDEG_0302 SDEG_0303     FALSE 0.097 188.000 0.000 NA   NA
 7471887 7471888 SDEG_0303 SDEG_0304     FALSE 0.011 778.000 0.000 NA   NA
 7471888 7471889 SDEG_0304 SDEG_0305     TRUE 0.978 2.000 0.071 0.016 N NA
 7471889 7471890 SDEG_0305 SDEG_0306     TRUE 0.996 10.000 0.333 0.029 Y NA
 7471890 7471891 SDEG_0306 SDEG_0307     TRUE 0.998 -3.000 0.444 0.029 Y NA
 7471891 7471892 SDEG_0307 SDEG_0308     TRUE 0.992 2.000 0.364 1.000 Y NA
 7471892 7471893 SDEG_0308 SDEG_0309     TRUE 0.976 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7471893 7471894 SDEG_0309 SDEG_0310     TRUE 0.802 12.000 0.000 NA   NA
 7471894 7471895 SDEG_0310 SDEG_0311     FALSE 0.049 248.000 0.000 NA   NA
 7471895 7471896 SDEG_0311 SDEG_0312     FALSE 0.029 297.000 0.000 NA   NA
 7471896 7471897 SDEG_0312 SDEG_0313     TRUE 0.410 51.000 0.000 NA   NA
 7471897 7471898 SDEG_0313 SDEG_0314     FALSE 0.026 307.000 0.000 NA   NA
 7471898 7471899 SDEG_0314 SDEG_0315     FALSE 0.185 95.000 0.000 NA   NA
 7471899 7471900 SDEG_0315 SDEG_0316     TRUE 0.818 6.000 0.000 NA   NA
 7471900 7471901 SDEG_0316 SDEG_0317     FALSE 0.206 84.000 0.000 NA   NA
 7471901 7471902 SDEG_0317 SDEG_0318   comX.2 FALSE 0.188 93.000 0.000 NA   NA
 7471904 7471905 SDEG_0320 SDEG_0321 truA   TRUE 0.939 -10.000 0.058 1.000 N NA
 7471905 7471906 SDEG_0321 SDEG_0322     TRUE 0.975 -16.000 0.276 NA   NA
 7471906 7471907 SDEG_0322 SDEG_0323     TRUE 0.927 11.000 0.149 NA   NA
 7471909 7471910 SDEG_0325 SDEG_0326 amyE amyE FALSE 0.319 223.000 0.000 0.002   NA
 7471910 7471911 SDEG_0326 SDEG_0327 amyE ropA FALSE 0.152 121.000 0.000 1.000 N NA
 7471911 7471912 SDEG_0327 SDEG_0328 ropA   FALSE 0.076 214.000 0.005 1.000 N NA
 7471912 7471913 SDEG_0328 SDEG_0329   pyrG FALSE 0.048 283.000 0.029 1.000 N NA
 7471913 7471914 SDEG_0329 SDEG_0330 pyrG lytS FALSE 0.199 76.000 0.000 1.000 N NA
 7471914 7471915 SDEG_0330 SDEG_0331 lytS lytR TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.015 Y NA
 7471915 7471916 SDEG_0331 SDEG_0332 lytR lrgA TRUE 0.440 96.000 0.178 1.000   NA
 7471916 7471917 SDEG_0332 SDEG_0333 lrgA lrgB TRUE 0.976 18.000 0.869 1.000   NA
 7471917 7471918 SDEG_0333 SDEG_0334 lrgB   FALSE 0.132 160.000 0.000 1.000   NA
 7471918 7471919 SDEG_0334 SDEG_0335     TRUE 0.366 54.000 0.000 NA   NA
 7471919 7471920 SDEG_0335 SDEG_0336     FALSE 0.080 206.000 0.000 NA   NA
 7471920 7471921 SDEG_0336 SDEG_0337     FALSE 0.014 524.000 0.000 NA   NA
 7471921 7471922 SDEG_0337 SDEG_0338     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7471922 7471923 SDEG_0338 SDEG_0339   rpmB FALSE 0.103 171.000 0.000 1.000 N NA
 7471923 7471924 SDEG_0339 SDEG_0340 rpmB   FALSE 0.232 154.000 0.044 NA   NA
 7471924 7471925 SDEG_0340 SDEG_0341     TRUE 0.982 0.000 0.567 NA   NA
 7471925 7471926 SDEG_0341 SDEG_0342     FALSE 0.066 236.000 0.006 1.000   NA
 7471927 7471928 SDEG_0343 SDEG_0344     TRUE 0.996 -76.000 0.758 1.000 Y NA
 7471929 7471930 SDEG_0345 SDEG_0346   bacA TRUE 0.490 66.000 0.118 NA   NA
 7471930 7471931 SDEG_0346 SDEG_0347 bacA mecA FALSE 0.332 138.000 0.132 NA N NA
 7471931 7471932 SDEG_0347 SDEG_0348 mecA   TRUE 0.951 7.000 0.267 NA N NA
 7471932 7471933 SDEG_0348 SDEG_0349   sufC FALSE 0.220 113.000 0.013 1.000 N NA
 7471933 7471934 SDEG_0349 SDEG_0350 sufC sufD TRUE 0.744 96.000 0.139 1.000 Y NA
 7471934 7471935 SDEG_0350 SDEG_0351 sufD sufS TRUE 0.936 31.000 0.606 1.000 N NA
 7471935 7471936 SDEG_0351 SDEG_0352 sufS iscU TRUE 0.975 -13.000 0.292 1.000 N NA
 7471936 7471937 SDEG_0352 SDEG_0353 iscU   TRUE 0.992 -7.000 0.152 0.002 N NA
 7471938 7471939 SDEG_0354 SDEG_0355   dacA TRUE 0.916 144.000 0.231 0.004 Y NA
 7471940 7471941 SDEG_0356 SDEG_0357 oppA oppB TRUE 0.963 54.000 0.273 0.040 Y NA
 7471941 7471942 SDEG_0357 SDEG_0358 oppB oppC TRUE 0.998 0.000 0.556 0.040 Y NA
 7471942 7471943 SDEG_0358 SDEG_0359 oppC oppD TRUE 0.993 9.000 0.650 1.000 Y NA
 7471943 7471944 SDEG_0359 SDEG_0360 oppD oppF TRUE 0.997 -7.000 0.095 0.003 Y NA
 7471944 7471945 SDEG_0360 SDEG_0361 oppF   FALSE 0.010 1372.000 0.000 NA   NA
 7471945 7471946 SDEG_0361 SDEG_0362     TRUE 0.410 51.000 0.000 NA   NA
 7471946 7471947 SDEG_0362 SDEG_0363     FALSE 0.026 307.000 0.000 NA   NA
 7471947 7471948 SDEG_0363 SDEG_0364     FALSE 0.185 95.000 0.000 NA   NA
 7471948 7471949 SDEG_0364 SDEG_0365     TRUE 0.818 6.000 0.000 NA   NA
 7471949 7471950 SDEG_0365 SDEG_0366     FALSE 0.206 84.000 0.000 NA   NA
 7471950 7471951 SDEG_0366 SDEG_0367     FALSE 0.010 1849.000 0.000 NA   NA
 7471951 7471952 SDEG_0367 SDEG_0368     TRUE 0.982 0.000 0.555 1.000   NA
 7471952 7471953 SDEG_0368 SDEG_0369     TRUE 0.938 -55.000 0.068 NA   NA
 7471953 7471954 SDEG_0369 SDEG_0370   nadD TRUE 0.491 69.000 0.150 NA N NA
 7471954 7471955 SDEG_0370 SDEG_0371 nadD   TRUE 0.992 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 7471955 7471956 SDEG_0371 SDEG_0372     TRUE 0.909 -24.000 0.008 1.000   NA
 7471956 7471957 SDEG_0372 SDEG_0373     TRUE 0.907 -10.000 0.002 NA   NA
 7471957 7471958 SDEG_0373 SDEG_0374     TRUE 0.757 36.000 0.085 NA   NA
 7471958 7471959 SDEG_0374 SDEG_0375     TRUE 0.421 75.000 0.094 NA   NA
 7471959 7471960 SDEG_0375 SDEG_0376     FALSE 0.263 103.000 0.023 NA   NA
 7471960 7471961 SDEG_0376 SDEG_0377     FALSE 0.012 611.000 0.000 NA   NA
 7471961 7471962 SDEG_0377 SDEG_0378     TRUE 0.382 53.000 0.000 NA   NA
 7471962 7471963 SDEG_0378 SDEG_0379   bioB FALSE 0.128 164.000 0.000 NA   NA
 7471963 7471964 SDEG_0379 SDEG_0380 bioB   FALSE 0.122 169.000 0.000 NA   NA
 7471964 7471965 SDEG_0380 SDEG_0381     FALSE 0.076 208.000 0.000 NA   NA
 7471965 7471966 SDEG_0381 SDEG_0382     TRUE 0.386 155.000 0.222 NA N NA
 7471966 7471967 SDEG_0382 SDEG_0383     TRUE 0.439 178.000 0.000 NA Y NA
 7471967 7471968 SDEG_0383 SDEG_0384   dapE TRUE 0.603 75.000 0.333 NA N NA
 7471968 7471969 SDEG_0384 SDEG_0385 dapE   TRUE 0.951 -7.000 0.104 1.000 N NA
 7471969 7471970 SDEG_0385 SDEG_0386     TRUE 0.997 1.000 0.938 1.000 Y NA
 7471973 7471974 SDEG_0389 SDEG_0390 ktrA ktrB TRUE 0.997 10.000 0.490 0.003 Y NA
 7471974 7471975 SDEG_0390 SDEG_0391 ktrB gidB FALSE 0.223 84.000 0.006 1.000 N NA
 7471976 7471977 SDEG_0392 SDEG_0393 lemA   TRUE 0.770 47.000 0.222 NA   NA
 7471977 7471978 SDEG_0393 SDEG_0394     FALSE 0.049 264.000 0.002 NA   NA
 7471978 7471979 SDEG_0394 SDEG_0395   covR FALSE 0.054 270.000 0.014 NA   NA
 7471979 7471980 SDEG_0395 SDEG_0396 covR covS TRUE 0.992 6.000 0.438 1.000 Y NA
 7471980 7471981 SDEG_0396 SDEG_0397 covS nrdR FALSE 0.089 206.000 0.007 NA N NA
 7471981 7471982 SDEG_0397 SDEG_0398 nrdR dnaB TRUE 0.951 -16.000 0.109 NA N NA
 7471982 7471983 SDEG_0398 SDEG_0399 dnaB dnaI TRUE 0.996 1.000 0.817 NA Y NA
 7471983 7471984 SDEG_0399 SDEG_0400 dnaI engA FALSE 0.341 63.000 0.008 1.000   NA
 7471984 7471985 SDEG_0400 SDEG_0401 engA snf FALSE 0.081 217.000 0.004 1.000   NA
 7471985 7471986 SDEG_0401 SDEG_0402 snf   FALSE 0.144 241.000 0.151 NA   NA
 7471986 7471987 SDEG_0402 SDEG_0403   murC TRUE 0.561 44.000 0.013 NA   NA
 7471987 7471988 SDEG_0403 SDEG_0404 murC   TRUE 0.564 44.000 0.014 1.000   NA
 7471988 7471989 SDEG_0404 SDEG_0405     TRUE 0.377 112.000 0.120 1.000   NA
 7471989 7471990 SDEG_0405 SDEG_0406   greA TRUE 0.412 73.000 0.079 1.000   NA
 7471991 7471992 SDEG_0407 SDEG_0408     TRUE 0.436 83.000 0.154 1.000 N NA
 7471993 7471994 SDEG_0409 SDEG_0410     TRUE 0.665 39.000 0.043 1.000   NA
 7471994 7471995 SDEG_0410 SDEG_0411     TRUE 0.911 15.000 0.123 NA   NA
 7471995 7471996 SDEG_0411 SDEG_0412     FALSE 0.013 528.000 0.000 NA   NA
 7471996 7471997 SDEG_0412 SDEG_0413   glr FALSE 0.155 177.000 0.014 NA   NA
 7471997 7471998 SDEG_0413 SDEG_0414 glr   TRUE 0.919 -42.000 0.034 1.000 N NA
 7471998 7471999 SDEG_0414 SDEG_0415     TRUE 0.949 -21.000 0.085 NA   NA
 7471999 7472000 SDEG_0415 SDEG_0416     TRUE 0.944 -3.000 0.065 NA   NA
 7472000 7472001 SDEG_0416 SDEG_0417     TRUE 0.954 -3.000 0.111 1.000   NA
 7472001 7472002 SDEG_0417 SDEG_0418   scpA TRUE 0.907 0.000 0.017 NA   NA
 7472002 7472003 SDEG_0418 SDEG_0419 scpA scpB TRUE 0.985 -3.000 0.570 NA   NA
 7472003 7472004 SDEG_0419 SDEG_0420 scpB   TRUE 0.469 109.000 0.224 NA N NA
 7472004 7472005 SDEG_0420 SDEG_0421     TRUE 0.920 -3.000 0.014 NA   NA
 7472005 7472006 SDEG_0421 SDEG_0422     FALSE 0.178 141.000 0.002 NA   NA
 7472006 7472007 SDEG_0422 SDEG_0423     FALSE 0.012 555.000 0.000 NA   NA
 7472007 7472008 SDEG_0423 SDEG_0424     TRUE 0.977 5.000 0.600 NA   NA
 7472008 7472009 SDEG_0424 SDEG_0425     FALSE 0.193 177.000 0.050 1.000   NA
 7472009 7472010 SDEG_0425 SDEG_0426     TRUE 0.940 23.000 0.408 NA   NA
 7472010 7472011 SDEG_0426 SDEG_0427     FALSE 0.252 120.000 0.023 NA   NA
 7472011 7472012 SDEG_0427 SDEG_0428     TRUE 0.881 6.000 0.028 NA   NA
 7472012 7472013 SDEG_0428 SDEG_0429     FALSE 0.221 130.000 0.023 1.000 N NA
 7472013 7472014 SDEG_0429 SDEG_0430     TRUE 0.905 0.000 0.015 NA   NA
 7472015 7472016 SDEG_0431 SDEG_0432 fhuG fhuB TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.040 Y NA
 7472016 7472017 SDEG_0432 SDEG_0433 fhuB fhuD TRUE 0.992 -7.000 0.179 1.000 Y NA
 7472017 7472018 SDEG_0433 SDEG_0434 fhuD fhuA TRUE 0.991 25.000 0.889 1.000 Y NA
 7472018 7472019 SDEG_0434 SDEG_0435 fhuA murE FALSE 0.087 249.000 0.062 1.000 N NA
 7472022 7472023 SDEG_0438 SDEG_0439 upp clpP FALSE 0.074 222.000 0.010 1.000 N NA
 7472023 7472024 SDEG_0439 SDEG_0440 clpP   FALSE 0.018 386.000 0.000 NA   NA
 7472024 7472025 SDEG_0440 SDEG_0441     FALSE 0.227 75.000 0.000 NA   NA
 7472025 7472026 SDEG_0441 SDEG_0442     TRUE 0.984 -24.000 0.500 NA   NA
 7472026 7472027 SDEG_0442 SDEG_0443   livK FALSE 0.191 204.000 0.109 NA   NA
 7472027 7472028 SDEG_0443 SDEG_0444 livK livH TRUE 0.588 189.000 0.150 1.000 Y NA
 7472028 7472029 SDEG_0444 SDEG_0445 livH livM TRUE 0.996 4.000 0.363 0.040 Y NA
 7472029 7472030 SDEG_0445 SDEG_0446 livM livG TRUE 0.992 1.000 0.349 1.000 Y NA
 7472030 7472031 SDEG_0446 SDEG_0447 livG livF TRUE 0.995 0.000 0.128 0.035 Y NA
 7472031 7472032 SDEG_0447 SDEG_0448 livF   TRUE 0.761 45.000 0.214 1.000 N NA
 7472032 7472033 SDEG_0448 SDEG_0449   tmk FALSE 0.214 87.000 0.006 1.000 N NA
 7472033 7472034 SDEG_0449 SDEG_0450 tmk   TRUE 0.936 16.000 0.254 1.000 N NA
 7472034 7472035 SDEG_0450 SDEG_0451   yabA TRUE 0.979 -3.000 0.372 NA   NA
 7472035 7472036 SDEG_0451 SDEG_0452 yabA   TRUE 0.968 -7.000 0.183 NA   NA
 7472036 7472037 SDEG_0452 SDEG_0453     TRUE 0.896 5.000 0.043 NA   NA
 7472037 7472038 SDEG_0453 SDEG_0454     TRUE 0.713 27.000 0.005 NA   NA
 7472040 7472041 SDEG_0456 SDEG_0457     TRUE 0.909 26.000 0.012 0.058   NA
 7472041 7472042 SDEG_0457 SDEG_0458   ogt TRUE 0.405 61.000 0.019 1.000   NA
 7472042 7472043 SDEG_0458 SDEG_0459 ogt   TRUE 0.931 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7472044 7472045 SDEG_0460 SDEG_0461     TRUE 0.976 2.000 0.500 NA   NA
 7472045 7472046 SDEG_0461 SDEG_0462     FALSE 0.183 98.000 0.000 NA   NA
 7472046 7472047 SDEG_0462 SDEG_0463     TRUE 0.968 -3.000 0.200 1.000   NA
 7472047 7472048 SDEG_0463 SDEG_0464   exoA FALSE 0.165 129.000 0.000 1.000   NA
 7472049 7472050 SDEG_0465 SDEG_0466   lctP FALSE 0.028 299.000 0.000 NA   NA
 7472050 7472051 SDEG_0466 SDEG_0467 lctP   TRUE 0.539 142.000 0.000 1.000 Y NA
 7472051 7472052 SDEG_0467 SDEG_0468   cepA FALSE 0.045 252.000 0.000 1.000   NA
 7472052 7472053 SDEG_0468 SDEG_0469 cepA cepA TRUE 0.995 -49.000 0.500 0.002   NA
 7472053 7472054 SDEG_0469 SDEG_0470 cepA cepA FALSE 0.237 71.000 0.000 1.000   NA
 7472054 7472055 SDEG_0470 SDEG_0471 cepA   FALSE 0.072 213.000 0.000 NA   NA
 7472055 7472056 SDEG_0471 SDEG_0472     FALSE 0.032 285.000 0.000 NA   NA
 7472056 7472057 SDEG_0472 SDEG_0473   metS FALSE 0.041 265.000 0.000 NA   NA
 7472057 7472058 SDEG_0473 SDEG_0474 metS nrdF1 FALSE 0.011 533.000 0.000 1.000 N NA
 7472058 7472059 SDEG_0474 SDEG_0475 nrdF1 nrdI TRUE 0.994 4.000 0.643 NA Y NA
 7472059 7472060 SDEG_0475 SDEG_0476 nrdI nrdE1 TRUE 0.998 -16.000 1.000 NA Y NA
 7472060 7472061 SDEG_0476 SDEG_0477 nrdE1 brnQ-1 FALSE 0.025 298.000 0.000 1.000 N NA
 7472063 7472064 SDEG_0479 SDEG_0480     TRUE 0.989 -7.000 0.710 NA   NA
 7472064 7472065 SDEG_0480 SDEG_0481     FALSE 0.069 257.000 0.022 NA   NA
 7472065 7472066 SDEG_0481 SDEG_0482     TRUE 0.907 2.000 0.043 NA   NA
 7472066 7472067 SDEG_0482 SDEG_0483     FALSE 0.022 334.000 0.000 NA   NA
 7472067 7472068 SDEG_0483 SDEG_0484   gcaD FALSE 0.120 172.000 0.002 NA N NA
 7472068 7472069 SDEG_0484 SDEG_0485 gcaD   TRUE 0.690 31.000 0.015 1.000 N NA
 7472069 7472070 SDEG_0485 SDEG_0486   mtnN FALSE 0.033 270.000 0.000 1.000 N NA
 7472072 7472073 SDEG_0488 SDEG_0489 mtsA mtsB TRUE 0.823 65.000 0.135 1.000 Y NA
 7472073 7472074 SDEG_0489 SDEG_0490 mtsB mtsC TRUE 0.986 1.000 0.130 1.000 Y NA
 7472077 7472078 SDEG_0493 SDEG_0494     FALSE 0.138 156.000 0.000 NA   NA
 7472079 7472080 SDEG_0495 SDEG_0496 rplK rplA TRUE 0.961 106.000 0.838 0.034 Y NA
 7472080 7472081 SDEG_0496 SDEG_0497 rplA pyrH FALSE 0.010 907.000 0.002 1.000 N NA
 7472081 7472082 SDEG_0497 SDEG_0498 pyrH frr TRUE 0.942 29.000 0.626 1.000 N NA
 7472082 7472083 SDEG_0498 SDEG_0499 frr   FALSE 0.236 109.000 0.012 NA   NA
 7472083 7472084 SDEG_0499 SDEG_0500   msrA FALSE 0.313 73.000 0.016 NA   NA
 7472084 7472085 SDEG_0500 SDEG_0501 msrA   TRUE 0.948 -3.000 0.080 1.000   NA
 7472085 7472086 SDEG_0501 SDEG_0502     FALSE 0.198 159.000 0.023 1.000   NA
 7472086 7472087 SDEG_0502 SDEG_0503     FALSE 0.061 224.000 0.000 NA   NA
 7472087 7472088 SDEG_0503 SDEG_0504   phoH FALSE 0.153 161.000 0.004 NA   NA
 7472088 7472089 SDEG_0504 SDEG_0505 phoH   TRUE 0.467 47.000 0.005 NA N NA
 7472089 7472090 SDEG_0505 SDEG_0506     FALSE 0.211 108.000 0.003 NA   NA
 7472090 7472091 SDEG_0506 SDEG_0507   dgk TRUE 0.933 -19.000 0.035 NA   NA
 7472091 7472092 SDEG_0507 SDEG_0508 dgk era FALSE 0.305 121.000 0.063 1.000   NA
 7472092 7472093 SDEG_0508 SDEG_0509 era   FALSE 0.122 187.000 0.007 1.000   NA
 7472095 7472096 SDEG_0511 SDEG_0512     TRUE 0.883 37.000 0.400 NA   NA
 7472096 7472097 SDEG_0512 SDEG_0513   blpM FALSE 0.017 408.000 0.000 NA   NA
 7472097 7472098 SDEG_0513 SDEG_0514 blpM blp FALSE 0.158 138.000 0.000 NA   NA
 7472098 7472099 SDEG_0514 SDEG_0515 blp fasA FALSE 0.013 545.000 0.000 NA   NA
 7472099 7472100 SDEG_0515 SDEG_0516 fasA   TRUE 0.990 1.000 0.222 NA Y NA
 7472101 7472102 SDEG_0517 SDEG_0518   silD TRUE 0.516 91.000 0.250 1.000   NA
 7472102 7472103 SDEG_0518 SDEG_0519 silD   TRUE 0.979 11.000 0.250 0.062   NA
 7472104 7472105 SDEG_0520 SDEG_0521     FALSE 0.034 281.000 0.000 NA   NA
 7472105 7472106 SDEG_0521 SDEG_0522     FALSE 0.030 295.000 0.000 NA   NA
 7472106 7472107 SDEG_0522 SDEG_0523     TRUE 0.881 50.000 0.667 NA   NA
 7472107 7472108 SDEG_0523 SDEG_0524     FALSE 0.069 216.000 0.000 NA   NA
 7472110 7472111 SDEG_0526 SDEG_0527     FALSE 0.017 399.000 0.000 NA   NA
 7472113 7472114 SDEG_0529 SDEG_0530 mutR fpg FALSE 0.122 182.000 0.004 1.000   NA
 7472114 7472115 SDEG_0530 SDEG_0531 fpg   TRUE 0.935 -30.000 0.066 1.000 N NA
 7472115 7472116 SDEG_0531 SDEG_0532     FALSE 0.013 461.000 0.000 1.000 N NA
 7472116 7472117 SDEG_0532 SDEG_0533     TRUE 0.981 -10.000 0.385 NA   NA
 7472117 7472118 SDEG_0533 SDEG_0534     FALSE 0.183 110.000 0.000 NA   NA
 7472118 7472119 SDEG_0534 SDEG_0535     FALSE 0.055 260.000 0.007 1.000   NA
 7472119 7472120 SDEG_0535 SDEG_0536     TRUE 0.907 -3.000 0.012 1.000 N NA
 7472120 7472121 SDEG_0536 SDEG_0537   secG TRUE 0.503 46.000 0.012 1.000 N NA
 7472121 7472122 SDEG_0537 SDEG_0538 secG   FALSE 0.299 112.000 0.064 1.000 N NA
 7472122 7472123 SDEG_0538 SDEG_0539   smpB TRUE 0.979 3.000 0.143 0.029 N NA
 7472124 7472125 SDEG_0540 SDEG_0541   sdzD FALSE 0.159 137.000 0.000 NA   NA
 7472125 7472126 SDEG_0541 SDEG_0542 sdzD gloA FALSE 0.020 346.000 0.000 1.000   NA
 7472126 7472127 SDEG_0542 SDEG_0543 gloA   TRUE 0.849 10.000 0.019 1.000 N NA
 7472127 7472128 SDEG_0543 SDEG_0544     TRUE 0.612 44.000 0.053 1.000 N NA
 7472129 7472130 SDEG_0545 SDEG_0546 ccpA amyS FALSE 0.211 154.000 0.041 1.000 N NA
 7472130 7472131 SDEG_0546 SDEG_0547 amyS   FALSE 0.314 77.000 0.037 1.000 N NA
 7472131 7472132 SDEG_0547 SDEG_0548     TRUE 0.998 2.000 0.413 0.011 Y NA
 7472132 7472133 SDEG_0548 SDEG_0549   thrS FALSE 0.014 424.000 0.000 1.000 N NA
 7472133 7472134 SDEG_0549 SDEG_0550 thrS   FALSE 0.216 130.000 0.012 1.000   NA
 7472134 7472135 SDEG_0550 SDEG_0551     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 7472135 7472136 SDEG_0551 SDEG_0552     TRUE 0.893 -12.000 0.000 NA   NA
 7472136 7472137 SDEG_0552 SDEG_0553     TRUE 0.906 2.000 0.042 NA   NA
 7472138 7472139 SDEG_0554 SDEG_0555     TRUE 0.970 15.000 0.625 1.000 N NA
 7472140 7472141 SDEG_0556 SDEG_0557     TRUE 0.997 11.000 0.316 0.002 Y NA
 7472141 7472142 SDEG_0557 SDEG_0558     TRUE 0.942 0.000 0.099 1.000   NA
 7472142 7472143 SDEG_0558 SDEG_0559     TRUE 0.989 18.000 0.857 0.065   NA
 7472143 7472144 SDEG_0559 SDEG_0560     TRUE 0.566 134.000 0.429 NA   NA
 7472144 7472145 SDEG_0560 SDEG_0561     TRUE 0.937 -37.000 0.058 NA   NA
 7472145 7472146 SDEG_0561 SDEG_0562     TRUE 0.996 -10.000 0.576 1.000 Y NA
 7472146 7472147 SDEG_0562 SDEG_0563     FALSE 0.324 77.000 0.030 NA   NA
 7472148 7472149 SDEG_0564 SDEG_0565   glnP TRUE 0.970 -21.000 0.000 0.039   NA
 7472149 7472150 SDEG_0565 SDEG_0566 glnP   TRUE 0.994 15.000 0.947 0.012   NA
 7472150 7472151 SDEG_0566 SDEG_0567     TRUE 0.996 14.000 0.400 0.039 Y NA
 7472151 7472152 SDEG_0567 SDEG_0568     TRUE 0.992 -6.000 0.185 1.000 Y NA
 7472153 7472154 SDEG_0569 SDEG_0570 vicR vicK TRUE 0.998 -7.000 0.597 0.055 Y NA
 7472154 7472155 SDEG_0570 SDEG_0571 vicK vicX TRUE 0.896 4.000 0.038 1.000   NA
 7472155 7472156 SDEG_0571 SDEG_0572 vicX mc FALSE 0.013 758.000 0.002 1.000   NA
 7472156 7472157 SDEG_0572 SDEG_0573 mc smc TRUE 0.934 1.000 0.120 1.000 N NA
 7472157 7472158 SDEG_0573 SDEG_0574 smc cspA FALSE 0.021 340.000 0.000 1.000   NA
 7472158 7472159 SDEG_0574 SDEG_0575 cspA   FALSE 0.051 240.000 0.000 1.000   NA
 7472159 7472160 SDEG_0575 SDEG_0576     FALSE 0.051 240.000 0.000 1.000   NA
 7472160 7472161 SDEG_0576 SDEG_0577     TRUE 0.472 44.000 0.000 NA   NA
 7472161 7472162 SDEG_0577 SDEG_0578     TRUE 0.967 4.000 0.375 NA   NA
 7472162 7472163 SDEG_0578 SDEG_0579   ftzY TRUE 0.965 0.000 0.007 0.082   NA
 7472164 7472165 SDEG_0580 SDEG_0581     TRUE 0.869 -124.000 0.000 NA   NA
 7472166 7472167 SDEG_0582 SDEG_0583     TRUE 0.961 2.000 0.259 1.000   NA
 7472167 7472168 SDEG_0583 SDEG_0584   bglA TRUE 0.983 19.000 0.318 1.000 Y NA
 7472169 7472170 SDEG_0585 SDEG_0586     TRUE 0.990 -24.000 0.841 NA   NA
 7472170 7472171 SDEG_0586 SDEG_0587     FALSE 0.320 147.000 0.114 NA   NA
 7472172 7472173 SDEG_0588 SDEG_0589   phoP FALSE 0.289 87.000 0.027 NA   NA
 7472173 7472174 SDEG_0589 SDEG_0590 phoP pnpS TRUE 0.988 1.000 0.164 1.000 Y NA
 7472174 7472175 SDEG_0590 SDEG_0591 pnpS   TRUE 0.354 158.000 0.176 NA   NA
 7472175 7472176 SDEG_0591 SDEG_0592     FALSE 0.215 118.000 0.007 NA   NA
 7472176 7472177 SDEG_0592 SDEG_0593     TRUE 0.998 -7.000 0.219 0.004 Y NA
 7472177 7472178 SDEG_0593 SDEG_0594     TRUE 0.998 2.000 0.428 0.004 Y NA
 7472178 7472179 SDEG_0594 SDEG_0595     TRUE 0.978 18.000 0.182 NA Y NA
 7472179 7472180 SDEG_0595 SDEG_0596     FALSE 0.010 800.000 0.000 NA N NA
 7472180 7472181 SDEG_0596 SDEG_0597     TRUE 0.966 -58.000 0.215 NA   NA
 7472181 7472182 SDEG_0597 SDEG_0598     TRUE 0.424 64.000 0.051 NA   NA
 7472182 7472183 SDEG_0598 SDEG_0599   ptsK TRUE 0.362 220.000 0.017 NA Y NA
 7472183 7472184 SDEG_0599 SDEG_0600 ptsK lgt TRUE 0.982 -3.000 0.494 1.000 N NA
 7472184 7472185 SDEG_0600 SDEG_0601 lgt   TRUE 0.850 22.000 0.079 NA   NA
 7472185 7472186 SDEG_0601 SDEG_0602     TRUE 0.969 -3.000 0.206 NA   NA
 7472188 7472189 SDEG_0604 SDEG_0605     TRUE 0.920 102.000 0.156 0.003 Y NA
 7472189 7472190 SDEG_0605 SDEG_0606     FALSE 0.081 205.000 0.000 NA   NA
 7472191 7472192 SDEG_0607 SDEG_0608     TRUE 0.435 49.000 0.000 NA   NA
 7472196 7472197 SDEG_0612 SDEG_0613     TRUE 0.863 13.000 0.021 NA   NA
 7472197 7472198 SDEG_0613 SDEG_0614     TRUE 0.922 -3.000 0.016 NA   NA
 7472198 7472199 SDEG_0614 SDEG_0615     FALSE 0.255 86.000 0.010 NA   NA
 7472199 7472200 SDEG_0615 SDEG_0616     FALSE 0.070 249.000 0.016 NA   NA
 7472201 7472202 SDEG_0617 SDEG_0618     TRUE 0.980 -16.000 0.375 NA   NA
 7472203 7472204 SDEG_0619 SDEG_0620   pepF TRUE 0.929 -52.000 0.059 1.000 N NA
 7472205 7472206 SDEG_0621 SDEG_0622 ppc ftsW FALSE 0.136 188.000 0.028 1.000 N NA
 7472206 7472207 SDEG_0622 SDEG_0623 ftsW   FALSE 0.351 71.000 0.049 1.000 N NA
 7472207 7472208 SDEG_0623 SDEG_0624     TRUE 0.978 -16.000 0.333 NA   NA
 7472208 7472209 SDEG_0624 SDEG_0625     FALSE 0.206 108.000 0.002 NA   NA
 7472209 7472210 SDEG_0625 SDEG_0626     FALSE 0.025 311.000 0.000 NA   NA
 7472210 7472211 SDEG_0626 SDEG_0627     FALSE 0.256 164.000 0.083 NA   NA
 7472211 7472212 SDEG_0627 SDEG_0628     TRUE 0.886 -22.000 0.000 NA   NA
 7472212 7472213 SDEG_0628 SDEG_0629   tpiA FALSE 0.109 166.000 0.000 1.000 N NA
 7472214 7472215 SDEG_0630 SDEG_0631     TRUE 0.955 26.000 0.667 NA   NA
 7472215 7472216 SDEG_0631 SDEG_0632     TRUE 0.668 27.000 0.000 NA   NA
 7472216 7472217 SDEG_0632 SDEG_0633     FALSE 0.070 215.000 0.000 NA   NA
 7472217 7472218 SDEG_0633 SDEG_0634     TRUE 0.951 36.000 0.000 0.092 Y NA
 7472218 7472219 SDEG_0634 SDEG_0635     TRUE 0.379 53.000 0.000 1.000   NA
 7472219 7472220 SDEG_0635 SDEG_0636     FALSE 0.169 124.000 0.000 1.000   NA
 7472220 7472221 SDEG_0636 SDEG_0637   murM TRUE 0.997 0.000 0.200 0.010 Y NA
 7472221 7472222 SDEG_0637 SDEG_0638 murM   TRUE 0.984 -15.000 0.500 1.000   NA
 7472222 7472223 SDEG_0638 SDEG_0639     FALSE 0.025 481.000 0.035 1.000   NA
 7472224 7472225 SDEG_0640 SDEG_0641   pacL FALSE 0.023 328.000 0.000 NA   NA
 7472226 7472227 SDEG_0642 SDEG_0643 regR   TRUE 0.823 55.000 0.562 NA   NA
 7472227 7472228 SDEG_0643 SDEG_0644   agaD TRUE 0.668 69.000 0.375 NA   NA
 7472228 7472229 SDEG_0644 SDEG_0645 agaD   TRUE 0.999 -73.000 0.933 0.027 Y NA
 7472229 7472230 SDEG_0645 SDEG_0646   agaV TRUE 0.997 19.000 0.933 0.027 Y NA
 7472230 7472231 SDEG_0646 SDEG_0647 agaV   TRUE 0.832 36.000 0.200 1.000   NA
 7472231 7472232 SDEG_0647 SDEG_0648     TRUE 0.946 0.000 0.120 1.000   NA
 7472233 7472234 SDEG_0649 SDEG_0650   idnO FALSE 0.028 301.000 0.000 NA   NA
 7472234 7472235 SDEG_0650 SDEG_0651 idnO   TRUE 0.884 25.000 0.197 1.000 N NA
 7472235 7472236 SDEG_0651 SDEG_0652     TRUE 0.989 -10.000 0.094 1.000 Y NA
 7472236 7472237 SDEG_0652 SDEG_0653   kgdA TRUE 0.985 5.000 0.167 1.000 Y NA
 7472237 7472238 SDEG_0653 SDEG_0654 kgdA hylB TRUE 0.841 25.000 0.091 1.000   NA
 7472239 7472240 SDEG_0655 SDEG_0656     FALSE 0.344 91.000 0.071 NA   NA
 7472240 7472241 SDEG_0656 SDEG_0657     FALSE 0.119 170.000 0.000 1.000   NA
 7472241 7472242 SDEG_0657 SDEG_0658     TRUE 0.679 258.000 0.333 0.092 Y NA
 7472243 7472244 SDEG_0659 SDEG_0660     FALSE 0.056 231.000 0.000 1.000   NA
 7472244 7472245 SDEG_0660 SDEG_0661     FALSE 0.102 208.000 0.018 1.000 N NA
 7472245 7472246 SDEG_0661 SDEG_0662   prfB FALSE 0.086 207.000 0.006 1.000 N NA
 7472246 7472247 SDEG_0662 SDEG_0663 prfB ftsE TRUE 0.612 44.000 0.053 1.000 N NA
 7472247 7472248 SDEG_0663 SDEG_0664 ftsE ftsX TRUE 0.995 -7.000 0.431 1.000 Y NA
 7472250 7472251 SDEG_0666 SDEG_0667 dinG aspC FALSE 0.029 282.000 0.000 1.000 N NA
 7472251 7472252 SDEG_0667 SDEG_0668 aspC asnC TRUE 0.690 38.000 0.068 1.000 N NA
 7472252 7472253 SDEG_0668 SDEG_0669 asnC   FALSE 0.031 291.000 0.000 NA   NA
 7472253 7472254 SDEG_0669 SDEG_0670     FALSE 0.247 133.000 0.030 NA   NA
 7472254 7472255 SDEG_0670 SDEG_0671     TRUE 0.970 -3.000 0.214 NA   NA
 7472255 7472256 SDEG_0671 SDEG_0672     TRUE 0.982 -3.000 0.470 NA   NA
 7472256 7472257 SDEG_0672 SDEG_0673   pepD FALSE 0.225 133.000 0.015 NA   NA
 7472257 7472258 SDEG_0673 SDEG_0674 pepD znuA TRUE 0.413 151.000 0.250 1.000 N NA
 7472258 7472259 SDEG_0674 SDEG_0675 znuA   FALSE 0.275 149.000 0.091 1.000 N NA
 7472259 7472260 SDEG_0675 SDEG_0676   agaS TRUE 0.897 20.000 0.178 1.000 N NA
 7472260 7472261 SDEG_0676 SDEG_0677 agaS lacD.1 TRUE 0.863 10.000 0.033 1.000 N NA
 7472263 7472264 SDEG_0679 SDEG_0680 bga   TRUE 0.990 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 7472264 7472265 SDEG_0680 SDEG_0681     TRUE 0.991 43.000 0.810 0.027 Y NA
 7472265 7472266 SDEG_0681 SDEG_0682     TRUE 0.997 -13.000 0.176 0.027 Y NA
 7472266 7472267 SDEG_0682 SDEG_0683     TRUE 0.996 0.000 0.136 0.027 Y NA
 7472269 7472270 SDEG_0685 SDEG_0686     TRUE 0.811 8.000 0.000 1.000   NA
 7472270 7472271 SDEG_0686 SDEG_0687     TRUE 0.533 70.000 0.000 0.091   NA
 7472271 7472272 SDEG_0687 SDEG_0688     TRUE 0.443 103.000 0.000 0.091   NA
 7472273 7472274 SDEG_0689 SDEG_0690     TRUE 0.885 6.000 0.033 1.000   NA
 7472274 7472275 SDEG_0690 SDEG_0691     FALSE 0.202 85.000 0.000 1.000   NA
 7472276 7472277 SDEG_0692 SDEG_0693 add   FALSE 0.345 68.000 0.034 1.000 N NA
 7472277 7472278 SDEG_0693 SDEG_0694   cm FALSE 0.284 176.000 0.167 1.000 N NA
 7472278 7472279 SDEG_0694 SDEG_0695 cm   TRUE 0.949 -7.000 0.094 1.000 N NA
 7472279 7472280 SDEG_0695 SDEG_0696   rplS FALSE 0.193 115.000 0.006 1.000 N NA
 7472280 7472281 SDEG_0696 SDEG_0697 rplS   FALSE 0.023 330.000 0.000 NA   NA
 7472281 7472282 SDEG_0697 SDEG_0698   ftsW FALSE 0.064 221.000 0.000 NA   NA
 7472282 7472283 SDEG_0698 SDEG_0699 ftsW   TRUE 0.587 93.000 0.385 1.000   NA
 7472283 7472284 SDEG_0699 SDEG_0700   gyrB TRUE 0.890 1.000 0.013 1.000   NA
 7472284 7472285 SDEG_0700 SDEG_0701 gyrB   FALSE 0.024 350.000 0.011 1.000 N NA
 7472285 7472286 SDEG_0701 SDEG_0702   serB FALSE 0.186 133.000 0.009 1.000 N NA
 7472288 7472289 SDEG_0704 SDEG_0705 eno sagA FALSE 0.011 700.000 0.000 NA   NA
 7472289 7472290 SDEG_0705 SDEG_0706 sagA sagB FALSE 0.067 219.000 0.000 NA   NA
 7472290 7472291 SDEG_0706 SDEG_0707 sagB sagC TRUE 0.968 -3.000 0.200 NA   NA
 7472291 7472292 SDEG_0707 SDEG_0708 sagC sagD TRUE 0.955 13.000 0.318 NA   NA
 7472292 7472293 SDEG_0708 SDEG_0709 sagD sagE TRUE 0.957 -25.000 0.136 NA   NA
 7472293 7472294 SDEG_0709 SDEG_0710 sagE sagF TRUE 0.989 -3.000 0.750 NA   NA
 7472294 7472295 SDEG_0710 SDEG_0711 sagF sagG TRUE 0.967 21.000 0.750 NA   NA
 7472295 7472296 SDEG_0711 SDEG_0712 sagG sagH TRUE 0.968 9.000 0.500 1.000 N NA
 7472296 7472297 SDEG_0712 SDEG_0713 sagH sagI TRUE 0.997 -3.000 0.160 0.015 Y NA
 7472297 7472298 SDEG_0713 SDEG_0714 sagI   FALSE 0.019 355.000 0.000 1.000   NA
 7472298 7472299 SDEG_0714 SDEG_0715     FALSE 0.023 331.000 0.000 NA   NA
 7472299 7472300 SDEG_0715 SDEG_0716   lig FALSE 0.192 147.000 0.010 NA   NA
 7472300 7472301 SDEG_0716 SDEG_0717 lig   TRUE 0.835 13.000 0.013 1.000 N NA
 7472301 7472302 SDEG_0717 SDEG_0718   pulA TRUE 0.908 6.000 0.088 1.000 N NA
 7472302 7472303 SDEG_0718 SDEG_0719 pulA glgB TRUE 0.882 107.000 0.067 0.013 Y NA
 7472303 7472304 SDEG_0719 SDEG_0720 glgB glgC TRUE 0.935 139.000 0.317 0.002 Y NA
 7472304 7472305 SDEG_0720 SDEG_0721 glgC glgC TRUE 0.999 -10.000 0.810 0.001 Y NA
 7472305 7472306 SDEG_0721 SDEG_0722 glgC glgA TRUE 0.995 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 7472306 7472307 SDEG_0722 SDEG_0723 glgA atpE FALSE 0.041 265.000 0.000 1.000   NA
 7472307 7472308 SDEG_0723 SDEG_0724 atpE atpB TRUE 0.955 35.000 0.189 0.005   NA
 7472308 7472309 SDEG_0724 SDEG_0725 atpB atpF TRUE 0.990 18.000 0.032 0.005 Y NA
 7472309 7472310 SDEG_0725 SDEG_0726 atpF atpH TRUE 0.997 0.000 0.222 0.004 Y NA
 7472310 7472311 SDEG_0726 SDEG_0727 atpH atpA TRUE 0.998 16.000 0.864 0.004 Y NA
 7472311 7472312 SDEG_0727 SDEG_0728 atpA atpG TRUE 0.998 19.000 0.846 0.004 Y NA
 7472312 7472313 SDEG_0728 SDEG_0729 atpG atpD TRUE 0.952 163.000 0.724 0.004 Y NA
 7472313 7472314 SDEG_0729 SDEG_0730 atpD atpC TRUE 0.998 13.000 0.837 0.004 Y NA
 7472314 7472315 SDEG_0730 SDEG_0731 atpC murA FALSE 0.010 630.000 0.000 1.000 N NA
 7472315 7472316 SDEG_0731 SDEG_0732 murA endA FALSE 0.058 228.000 0.000 1.000   NA
 7472316 7472317 SDEG_0732 SDEG_0733 endA pheS FALSE 0.033 283.000 0.000 1.000   NA
 7472317 7472318 SDEG_0733 SDEG_0734 pheS pheT TRUE 0.925 195.000 0.574 0.001 Y NA
 7472318 7472319 SDEG_0734 SDEG_0735 pheT   FALSE 0.232 74.000 0.002 1.000 N NA
 7472319 7472320 SDEG_0735 SDEG_0736     TRUE 0.913 -7.000 0.006 NA   NA
 7472320 7472321 SDEG_0736 SDEG_0737     TRUE 0.887 -21.000 0.000 NA   NA
 7472321 7472322 SDEG_0737 SDEG_0738     TRUE 0.433 73.000 0.095 NA   NA
 7472322 7472323 SDEG_0738 SDEG_0739     TRUE 0.966 7.000 0.444 1.000 N NA
 7472325 7472326 SDEG_0741 SDEG_0742 rexB rexA TRUE 0.997 -3.000 0.070 0.002 Y NA
 7472326 7472327 SDEG_0742 SDEG_0743 rexA aspC FALSE 0.160 157.000 0.010 1.000 N NA
 7472327 7472328 SDEG_0743 SDEG_0744 aspC   TRUE 0.724 122.000 0.133 1.000 Y NA
 7472328 7472329 SDEG_0744 SDEG_0745   rpsU FALSE 0.279 90.000 0.027 1.000   NA
 7472331 7472332 SDEG_0747 SDEG_0748 dnaG rpoD TRUE 0.939 9.000 0.209 1.000 N NA
 7472332 7472333 SDEG_0748 SDEG_0749 rpoD   FALSE 0.044 325.000 0.044 NA   NA
 7472333 7472334 SDEG_0749 SDEG_0750     TRUE 0.384 133.000 0.152 NA   NA
 7472334 7472335 SDEG_0750 SDEG_0751   rgpAc TRUE 0.776 119.000 0.212 NA Y NA
 7472335 7472336 SDEG_0751 SDEG_0752 rgpAc rgpBc TRUE 0.977 -10.000 0.289 NA   NA
 7472336 7472337 SDEG_0752 SDEG_0753 rgpBc rgpC TRUE 0.962 3.000 0.289 NA   NA
 7472337 7472338 SDEG_0753 SDEG_0754 rgpC   TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000   NA
 7472338 7472339 SDEG_0754 SDEG_0755     TRUE 0.800 13.000 0.000 NA   NA
 7472339 7472340 SDEG_0755 SDEG_0756   wbbX TRUE 0.911 15.000 0.125 NA   NA
 7472340 7472341 SDEG_0756 SDEG_0757 wbbX   TRUE 0.931 -7.000 0.023 NA   NA
 7472341 7472342 SDEG_0757 SDEG_0758     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 7472342 7472343 SDEG_0758 SDEG_0759     TRUE 0.460 45.000 0.000 NA   NA
 7472343 7472344 SDEG_0759 SDEG_0760     TRUE 0.942 -3.000 0.061 NA   NA
 7472344 7472345 SDEG_0760 SDEG_0761     TRUE 0.958 1.000 0.212 NA   NA
 7472345 7472346 SDEG_0761 SDEG_0762     FALSE 0.285 63.000 0.000 NA   NA
 7472346 7472347 SDEG_0762 SDEG_0763   galE TRUE 0.573 183.000 0.111 1.000 Y NA
 7472347 7472348 SDEG_0763 SDEG_0764 galE amrA FALSE 0.171 121.000 0.000 1.000   NA
 7472348 7472349 SDEG_0764 SDEG_0765 amrA pepT FALSE 0.105 180.000 0.000 1.000   NA
 7472349 7472350 SDEG_0765 SDEG_0766 pepT ebsA TRUE 0.633 44.000 0.051 NA   NA
 7472352 7472353 SDEG_0768 SDEG_0769   cmk TRUE 0.835 15.000 0.012 1.000   NA
 7472353 7472354 SDEG_0769 SDEG_0770 cmk infC FALSE 0.151 162.000 0.010 1.000 N NA
 7472354 7472355 SDEG_0770 SDEG_0771 infC rpmI TRUE 0.973 41.000 0.652 1.000 Y NA
 7472355 7472356 SDEG_0771 SDEG_0772 rpmI rplT TRUE 0.985 59.000 0.928 0.025 Y NA
 7472358 7472359 SDEG_0774 SDEG_0775   aroD TRUE 0.956 -3.000 0.125 NA   NA
 7472359 7472360 SDEG_0775 SDEG_0776 aroD aroF TRUE 0.862 98.000 0.004 0.003 Y NA
 7472360 7472361 SDEG_0776 SDEG_0777 aroF   FALSE 0.340 62.000 0.005 NA   NA
 7472361 7472362 SDEG_0777 SDEG_0778   gor FALSE 0.094 213.000 0.010 NA   NA
 7472363 7472364 SDEG_0779 SDEG_0780     TRUE 0.806 48.000 0.308 NA   NA
 7472365 7472366 SDEG_0781 SDEG_0782 nifS1 thiI TRUE 0.966 2.000 0.349 1.000 N NA
 7472366 7472367 SDEG_0782 SDEG_0783 thiI capA FALSE 0.134 179.000 0.014 1.000 N NA
 7472367 7472368 SDEG_0783 SDEG_0784 capA   FALSE 0.159 114.000 0.000 1.000 N NA
 7472370 7472371 SDEG_0786 SDEG_0787 rplU   TRUE 0.985 12.000 0.208 NA Y NA
 7472371 7472372 SDEG_0787 SDEG_0788   rpmA TRUE 0.969 28.000 0.203 NA Y NA
 7472372 7472373 SDEG_0788 SDEG_0789 rpmA   FALSE 0.042 248.000 0.000 1.000 N NA
 7472373 7472374 SDEG_0789 SDEG_0790   lsp TRUE 0.951 -3.000 0.119 1.000 N NA
 7472374 7472375 SDEG_0790 SDEG_0791 lsp   TRUE 0.947 -10.000 0.082 1.000 N NA
 7472377 7472378 SDEG_0793 SDEG_0794 pyrR pyrP TRUE 0.978 16.000 0.140 1.000 Y NA
 7472378 7472379 SDEG_0794 SDEG_0795 pyrP pyrB TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 7472379 7472380 SDEG_0795 SDEG_0796 pyrB carA TRUE 0.588 35.000 0.000 NA   NA
 7472380 7472381 SDEG_0796 SDEG_0797 carA carB TRUE 0.706 252.000 0.117 0.001 Y NA
 7472381 7472382 SDEG_0797 SDEG_0798 carB   FALSE 0.084 222.000 0.017 1.000 N NA
 7472382 7472383 SDEG_0798 SDEG_0799     TRUE 0.988 0.000 0.923 1.000 N NA
 7472383 7472384 SDEG_0799 SDEG_0800     TRUE 0.995 12.000 0.923 1.000 Y NA
 7472384 7472385 SDEG_0800 SDEG_0801     TRUE 0.978 -7.000 0.308 NA   NA
 7472385 7472386 SDEG_0801 SDEG_0802     FALSE 0.349 75.000 0.041 NA   NA
 7472386 7472387 SDEG_0802 SDEG_0803   rpsP FALSE 0.181 118.000 0.003 1.000 N NA
 7472387 7472388 SDEG_0803 SDEG_0804 rpsP   TRUE 0.962 10.000 0.385 1.000   NA
 7472388 7472389 SDEG_0804 SDEG_0805     FALSE 0.040 266.000 0.000 1.000   NA
 7472389 7472390 SDEG_0805 SDEG_0806   rimM FALSE 0.018 369.000 0.000 1.000   NA
 7472390 7472391 SDEG_0806 SDEG_0807 rimM trmD TRUE 0.997 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 7472391 7472392 SDEG_0807 SDEG_0808 trmD trxB TRUE 0.879 0.000 0.007 1.000 N NA
 7472392 7472393 SDEG_0808 SDEG_0809 trxB   FALSE 0.178 189.000 0.059 NA   NA
 7472393 7472394 SDEG_0809 SDEG_0810   apbA TRUE 0.957 13.000 0.333 NA   NA
 7472394 7472395 SDEG_0810 SDEG_0811 apbA   FALSE 0.047 235.000 0.000 1.000 N NA
 7472395 7472396 SDEG_0811 SDEG_0812   fruB TRUE 0.997 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 7472396 7472397 SDEG_0812 SDEG_0813 fruB fruA TRUE 0.997 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 7472397 7472398 SDEG_0813 SDEG_0814 fruA mur1-1 FALSE 0.274 82.000 0.022 1.000 N NA
 7472398 7472399 SDEG_0814 SDEG_0815 mur1-1 mur1-2 TRUE 0.917 160.000 0.333 0.005 Y NA
 7472399 7472400 SDEG_0815 SDEG_0816 mur1-2   TRUE 0.794 51.000 0.333 NA   NA
 7472400 7472401 SDEG_0816 SDEG_0817     TRUE 0.718 39.000 0.083 NA   NA
 7472401 7472402 SDEG_0817 SDEG_0818     TRUE 0.950 0.000 0.139 NA   NA
 7472402 7472403 SDEG_0818 SDEG_0819   papS FALSE 0.218 120.000 0.009 NA   NA
 7472403 7472404 SDEG_0819 SDEG_0820 papS   TRUE 0.940 -3.000 0.056 1.000   NA
 7472404 7472405 SDEG_0820 SDEG_0821     FALSE 0.227 108.000 0.008 1.000   NA
 7472405 7472406 SDEG_0821 SDEG_0822     TRUE 0.999 0.000 0.846 0.015 Y NA
 7472406 7472407 SDEG_0822 SDEG_0823   gdh FALSE 0.160 190.000 0.059 1.000 N NA
 7472407 7472408 SDEG_0823 SDEG_0824 gdh fms FALSE 0.270 125.000 0.056 1.000 N NA
 7472410 7472411 SDEG_0826 SDEG_0827     TRUE 0.972 3.000 0.000 0.002   NA
 7472411 7472412 SDEG_0827 SDEG_0828   sptR TRUE 0.983 3.000 0.800 1.000   NA
 7472412 7472413 SDEG_0828 SDEG_0829 sptR sptS TRUE 0.996 -18.000 0.533 1.000 Y NA
 7472413 7472414 SDEG_0829 SDEG_0830 sptS   FALSE 0.032 289.000 0.000 NA   NA
 7472414 7472415 SDEG_0830 SDEG_0831     FALSE 0.063 222.000 0.000 NA   NA
 7472415 7472416 SDEG_0831 SDEG_0832     TRUE 0.999 2.000 0.844 0.015 Y NA
 7472416 7472417 SDEG_0832 SDEG_0833   mvaK1 FALSE 0.071 205.000 0.000 1.000 N NA
 7472417 7472418 SDEG_0833 SDEG_0834 mvaK1 mvaD TRUE 0.998 -18.000 0.281 0.003 Y NA
 7472418 7472419 SDEG_0834 SDEG_0835 mvaD mvaK2 TRUE 0.998 -55.000 0.312 0.005 Y NA
 7472419 7472420 SDEG_0835 SDEG_0836 mvaK2   TRUE 0.950 -13.000 0.097 1.000 N NA
 7472422 7472423 SDEG_0838 SDEG_0839     FALSE 0.169 125.000 0.000 NA   NA
 7472423 7472424 SDEG_0839 SDEG_0840     FALSE 0.091 192.000 0.000 NA   NA
 7472425 7472426 SDEG_0841 SDEG_0842   mvaS1 FALSE 0.131 161.000 0.000 NA   NA
 7472426 7472427 SDEG_0842 SDEG_0843 mvaS1 mvaS2 TRUE 0.992 -19.000 0.183 1.000 Y NA
 7472427 7472428 SDEG_0843 SDEG_0844 mvaS2   FALSE 0.085 188.000 0.000 1.000 N NA
 7472429 7472430 SDEG_0845 SDEG_0846 thyA dyr TRUE 0.559 81.000 0.295 1.000 N NA
 7472430 7472431 SDEG_0846 SDEG_0847 dyr   TRUE 0.818 20.000 0.030 NA   NA
 7472431 7472432 SDEG_0847 SDEG_0848   clpX FALSE 0.235 114.000 0.012 NA   NA
 7472432 7472433 SDEG_0848 SDEG_0849 clpX   TRUE 0.882 10.000 0.043 1.000   NA
 7472433 7472434 SDEG_0849 SDEG_0850     FALSE 0.178 144.000 0.004 NA   NA
 7472435 7472436 SDEG_0851 SDEG_0852 clpL   FALSE 0.036 273.000 0.000 1.000   NA
 7472439 7472440 SDEG_0855 SDEG_0856 rplL   FALSE 0.045 240.000 0.000 1.000 N NA
 7472442 7472443 SDEG_0858 SDEG_0859   thrB TRUE 0.979 2.000 0.036 1.000 Y NA
 7472443 7472444 SDEG_0859 SDEG_0860 thrB folC1 FALSE 0.339 60.000 0.006 1.000 N NA
 7472444 7472445 SDEG_0860 SDEG_0861 folC1 folE TRUE 0.911 40.000 0.057 1.000 Y NA
 7472445 7472446 SDEG_0861 SDEG_0862 folE folP TRUE 0.977 10.000 0.073 1.000 Y NA
 7472446 7472447 SDEG_0862 SDEG_0863 folP folQ TRUE 0.980 8.000 0.094 1.000 Y NA
 7472447 7472448 SDEG_0863 SDEG_0864 folQ folK TRUE 0.990 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 7472448 7472449 SDEG_0864 SDEG_0865 folK murB FALSE 0.171 149.000 0.010 1.000 N NA
 7472449 7472450 SDEG_0865 SDEG_0866 murB potA TRUE 0.558 49.000 0.041 1.000 N NA
 7472450 7472451 SDEG_0866 SDEG_0867 potA potB TRUE 0.999 -37.000 0.928 0.037 Y NA
 7472451 7472452 SDEG_0867 SDEG_0868 potB potC TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.037 Y NA
 7472452 7472453 SDEG_0868 SDEG_0869 potC potD TRUE 0.997 -7.000 0.253 0.037 Y NA
 7472454 7472455 SDEG_0870 SDEG_0871 dpiA dpiB TRUE 0.962 -19.000 0.154 NA   NA
 7472456 7472457 SDEG_0872 SDEG_0873 malP   TRUE 0.978 31.000 0.432 1.000 Y NA
 7472457 7472458 SDEG_0873 SDEG_0874     FALSE 0.145 132.000 0.000 1.000 N NA
 7472460 7472461 SDEG_0876 SDEG_0877     FALSE 0.217 177.000 0.071 NA   NA
 7472461 7472462 SDEG_0877 SDEG_0878   radC TRUE 0.599 48.000 0.046 NA   NA
 7472463 7472464 SDEG_0879 SDEG_0880   rex TRUE 0.979 9.000 0.714 1.000   NA
 7472464 7472465 SDEG_0880 SDEG_0881 rex   FALSE 0.332 178.000 0.214 NA   NA
 7472465 7472466 SDEG_0881 SDEG_0882     TRUE 0.444 68.000 0.083 NA   NA
 7472466 7472467 SDEG_0882 SDEG_0883   nifS2 TRUE 0.966 -10.000 0.166 NA   NA
 7472467 7472468 SDEG_0883 SDEG_0884 nifS2   TRUE 0.989 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 7472468 7472469 SDEG_0884 SDEG_0885     TRUE 0.381 129.000 0.145 1.000   NA
 7472470 7472471 SDEG_0886 SDEG_0887   ppnK TRUE 0.988 -28.000 0.725 1.000   NA
 7472471 7472472 SDEG_0887 SDEG_0888 ppnK   TRUE 0.958 -3.000 0.150 1.000 N NA
 7472472 7472473 SDEG_0888 SDEG_0889   pta TRUE 0.904 4.000 0.067 1.000 N NA
 7472473 7472474 SDEG_0889 SDEG_0890 pta   TRUE 0.549 109.000 0.031 0.054   NA
 7472476 7472477 SDEG_0892 SDEG_0893     TRUE 0.980 -7.000 0.382 1.000 N NA
 7472477 7472478 SDEG_0893 SDEG_0894   guaC FALSE 0.030 278.000 0.000 1.000 N NA
 7472478 7472479 SDEG_0894 SDEG_0895 guaC xpt FALSE 0.174 305.000 0.009 1.000 Y NA
 7472479 7472480 SDEG_0895 SDEG_0896 xpt   TRUE 0.984 0.000 0.046 1.000 Y NA
 7472481 7472482 SDEG_0897 SDEG_0898 apbE   TRUE 0.694 53.000 0.189 1.000   NA
 7472483 7472484 SDEG_0899 SDEG_0900 tdk prfA TRUE 0.819 23.000 0.062 1.000 N NA
 7472484 7472485 SDEG_0900 SDEG_0901 prfA hemK TRUE 0.986 0.000 0.084 1.000 Y NA
 7472485 7472486 SDEG_0901 SDEG_0902 hemK   TRUE 0.984 -52.000 0.029 NA Y NA
 7472486 7472487 SDEG_0902 SDEG_0903     TRUE 0.852 11.000 0.012 NA   NA
 7472487 7472488 SDEG_0903 SDEG_0904   glyA TRUE 0.890 11.000 0.056 1.000   NA
 7472488 7472489 SDEG_0904 SDEG_0905 glyA   TRUE 0.918 7.000 0.103 NA   NA
 7472489 7472490 SDEG_0905 SDEG_0906     TRUE 0.850 1.000 0.000 NA   NA
 7472490 7472491 SDEG_0906 SDEG_0907     TRUE 0.878 10.000 0.035 NA   NA
 7472491 7472492 SDEG_0907 SDEG_0908     TRUE 0.999 -3.000 0.895 0.014 Y NA
 7472492 7472493 SDEG_0908 SDEG_0909   nox FALSE 0.051 240.000 0.000 1.000   NA
 7472493 7472494 SDEG_0909 SDEG_0910 nox   TRUE 0.383 69.000 0.047 1.000   NA
 7472496 7472497 SDEG_0912 SDEG_0913 gyrA   TRUE 0.843 9.000 0.013 NA N NA
 7472497 7472498 SDEG_0913 SDEG_0914     FALSE 0.299 83.000 0.039 NA N NA
 7472498 7472499 SDEG_0914 SDEG_0915   lmb FALSE 0.144 151.000 0.000 NA   NA
 7472499 7472500 SDEG_0915 SDEG_0916 lmb lmb TRUE 0.823 5.000 0.000 NA   NA
 7472500 7472501 SDEG_0916 SDEG_0917 lmb lmb TRUE 0.976 -114.000 0.000 0.007   NA
 7472501 7472502 SDEG_0917 SDEG_0918 lmb htpA TRUE 0.992 -3.000 1.000 NA   NA
 7472502 7472503 SDEG_0918 SDEG_0919 htpA   FALSE 0.036 273.000 0.000 NA   NA
 7472504 7472505 SDEG_0920 SDEG_0921     TRUE 0.893 -7.000 0.000 NA   NA
 7472505 7472506 SDEG_0921 SDEG_0922     TRUE 0.929 54.000 0.667 0.089   NA
 7472507 7472508 SDEG_0923 SDEG_0924     FALSE 0.085 415.000 0.333 NA   NA
 7472508 7472509 SDEG_0924 SDEG_0925     TRUE 0.980 -13.000 0.385 NA N NA
 7472509 7472510 SDEG_0925 SDEG_0926     TRUE 0.991 13.000 0.467 1.000 Y NA
 7472510 7472511 SDEG_0926 SDEG_0927   irr TRUE 0.501 94.000 0.267 1.000 N NA
 7472511 7472512 SDEG_0927 SDEG_0928 irr ihk TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7472512 7472513 SDEG_0928 SDEG_0929 ihk isp TRUE 0.460 102.000 0.200 1.000   NA
 7472513 7472514 SDEG_0929 SDEG_0930 isp   TRUE 0.811 78.000 1.000 NA   NA
 7472514 7472515 SDEG_0930 SDEG_0931     FALSE 0.023 332.000 0.000 NA   NA
 7472515 7472516 SDEG_0931 SDEG_0932   sic1-01 FALSE 0.038 270.000 0.000 NA   NA
 7472516 7472517 SDEG_0932 SDEG_0933 sic1-01 scpB FALSE 0.016 422.000 0.000 NA   NA
 7472517 7472518 SDEG_0933 SDEG_0934 scpB   TRUE 0.896 45.000 0.667 NA   NA
 7472518 7472519 SDEG_0934 SDEG_0935   lmb FALSE 0.191 91.000 0.000 NA   NA
 7472519 7472520 SDEG_0935 SDEG_0936 lmb   TRUE 0.979 13.000 0.800 NA   NA
 7472523 7472524 SDEG_0939 SDEG_0940 dppE dppD TRUE 0.999 -16.000 0.750 0.033 Y NA
 7472524 7472525 SDEG_0940 SDEG_0941 dppD dppC TRUE 0.989 12.000 0.333 1.000 Y NA
 7472525 7472526 SDEG_0941 SDEG_0942 dppC dppB TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.037 Y NA
 7472526 7472527 SDEG_0942 SDEG_0943 dppB dppA TRUE 0.483 113.000 0.000 0.037   NA
 7472527 7472528 SDEG_0943 SDEG_0944 dppA dppA TRUE 0.972 -6.000 0.000 0.037   NA
 7472529 7472530 SDEG_0945 SDEG_0946     TRUE 0.659 28.000 0.000 NA   NA
 7472530 7472531 SDEG_0946 SDEG_0947     FALSE 0.158 115.000 0.000 1.000 N NA
 7472533 7472534 SDEG_0949 SDEG_0950 tra   TRUE 0.828 4.000 0.000 NA   NA
 7472534 7472535 SDEG_0950 SDEG_0951     TRUE 0.874 -55.000 0.000 NA   NA
 7472535 7472536 SDEG_0951 SDEG_0952     FALSE 0.095 299.000 0.000 0.088   NA
 7472536 7472537 SDEG_0952 SDEG_0953     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.088   NA
 7472537 7472538 SDEG_0953 SDEG_0954     TRUE 0.813 7.000 0.000 1.000   NA
 7472539 7472540 SDEG_0955 SDEG_0956   guaA FALSE 0.142 135.000 0.000 1.000 N NA
 7472541 7472542 SDEG_0957 SDEG_0958     TRUE 0.356 80.000 0.057 NA   NA
 7472542 7472543 SDEG_0958 SDEG_0959   ylxM TRUE 0.563 101.000 0.032 0.038   NA
 7472543 7472544 SDEG_0959 SDEG_0960 ylxM ffh TRUE 0.930 9.000 0.151 1.000   NA
 7472544 7472545 SDEG_0960 SDEG_0961 ffh   FALSE 0.015 432.000 0.000 1.000   NA
 7472545 7472546 SDEG_0961 SDEG_0962     TRUE 0.700 73.000 0.000 0.001   NA
 7472548 7472549 SDEG_0964 SDEG_0965     FALSE 0.156 140.000 0.000 1.000   NA
 7472549 7472550 SDEG_0965 SDEG_0966     TRUE 0.996 -16.000 0.500 1.000 Y NA
 7472550 7472551 SDEG_0966 SDEG_0967     FALSE 0.149 125.000 0.000 1.000 N NA
 7472552 7472553 SDEG_0968 SDEG_0969 murO murO TRUE 0.988 9.000 0.333 0.009   NA
 7472554 7472555 SDEG_0970 SDEG_0971 xerS   FALSE 0.222 77.000 0.000 NA   NA
 7472556 7472557 SDEG_0972 SDEG_0973     TRUE 0.992 -10.000 1.000 1.000   NA
 7472559 7472560 SDEG_0975 SDEG_0976 bceS bceR TRUE 0.997 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 7472560 7472561 SDEG_0976 SDEG_0977 bceR bceB TRUE 0.686 44.000 0.094 1.000   NA
 7472561 7472562 SDEG_0977 SDEG_0978 bceB   TRUE 0.986 2.000 0.855 1.000   NA
 7472562 7472563 SDEG_0978 SDEG_0979     TRUE 0.669 37.000 0.033 1.000   NA
 7472564 7472565 SDEG_0980 SDEG_0981   citC FALSE 0.040 267.000 0.000 NA   NA
 7472568 7472569 SDEG_0984 SDEG_0985 citX citF TRUE 0.948 -103.000 0.138 1.000 N NA
 7472569 7472570 SDEG_0985 SDEG_0986 citF citE TRUE 0.985 3.000 0.119 0.001 N NA
 7472570 7472571 SDEG_0986 SDEG_0987 citE citD TRUE 0.994 -12.000 0.284 0.002 N NA
 7472571 7472572 SDEG_0987 SDEG_0988 citD   TRUE 0.828 36.000 0.192 1.000   NA
 7472572 7472573 SDEG_0988 SDEG_0989   oadB TRUE 0.984 18.000 0.273 0.002   NA
 7472573 7472574 SDEG_0989 SDEG_0990 oadB   TRUE 0.663 45.000 0.103 1.000 N NA
 7472574 7472575 SDEG_0990 SDEG_0991     TRUE 0.489 62.000 0.077 NA   NA
 7472576 7472577 SDEG_0992 SDEG_0993   citG TRUE 0.483 158.000 0.400 1.000 N NA
 7472577 7472578 SDEG_0993 SDEG_0994 citG   TRUE 0.988 -7.000 0.700 1.000 N NA
 7472579 7472580 SDEG_0995 SDEG_0996     FALSE 0.103 182.000 0.000 NA   NA
 7472580 7472581 SDEG_0996 SDEG_0997     TRUE 0.885 10.000 0.062 1.000 N NA
 7472581 7472582 SDEG_0997 SDEG_0998     TRUE 0.980 0.000 0.500 NA   NA
 7472582 7472583 SDEG_0998 SDEG_0999   oadA2 TRUE 0.811 43.000 0.250 NA   NA
 7472583 7472584 SDEG_0999 SDEG_1000 oadA2 gid FALSE 0.119 177.000 0.005 1.000 N NA
 7472584 7472585 SDEG_1000 SDEG_1001 gid satE FALSE 0.225 103.000 0.008 NA   NA
 7472585 7472586 SDEG_1001 SDEG_1002 satE satD TRUE 0.974 -7.000 0.250 NA   NA
 7472586 7472587 SDEG_1002 SDEG_1003 satD ddh FALSE 0.309 107.000 0.056 NA   NA
 7472587 7472588 SDEG_1003 SDEG_1004 ddh   TRUE 0.371 144.000 0.158 NA   NA
 7472589 7472590 SDEG_1005 SDEG_1006     TRUE 0.703 23.000 0.000 1.000   NA
 7472590 7472591 SDEG_1006 SDEG_1007     FALSE 0.182 111.000 0.000 NA   NA
 7472592 7472593 SDEG_1008 SDEG_1009   smf TRUE 0.796 101.000 0.238 1.000 Y NA
 7472593 7472594 SDEG_1009 SDEG_1010 smf rnhB TRUE 0.669 107.000 0.037 1.000 Y NA
 7472594 7472595 SDEG_1010 SDEG_1011 rnhB   TRUE 0.963 -10.000 0.148 1.000   NA
 7472595 7472596 SDEG_1011 SDEG_1012     FALSE 0.011 723.000 0.000 NA   NA
 7472596 7472597 SDEG_1012 SDEG_1013     FALSE 0.067 219.000 0.000 NA   NA
 7472598 7472599 SDEG_1014 SDEG_1015     TRUE 0.961 -3.000 0.146 NA   NA
 7472599 7472600 SDEG_1015 SDEG_1016     TRUE 0.383 118.000 0.135 1.000   NA
 7472601 7472602 SDEG_1017 SDEG_1018     FALSE 0.159 137.000 0.000 NA   NA
 7472602 7472603 SDEG_1018 SDEG_1019     FALSE 0.023 329.000 0.000 NA   NA
 7472603 7472604 SDEG_1019 SDEG_1020   skc TRUE 0.393 52.000 0.000 1.000   NA
 7472604 7472605 SDEG_1020 SDEG_1021 skc   FALSE 0.020 350.000 0.000 NA   NA
 7472605 7472606 SDEG_1021 SDEG_1022   pdxK TRUE 0.959 -3.000 0.142 NA   NA
 7472608 7472609 SDEG_1024 SDEG_1025   asd FALSE 0.245 123.000 0.020 NA   NA
 7472609 7472610 SDEG_1025 SDEG_1026 asd   FALSE 0.028 288.000 0.000 1.000 N NA
 7472610 7472611 SDEG_1026 SDEG_1027   scp FALSE 0.018 370.000 0.000 1.000   NA
 7472611 7472612 SDEG_1027 SDEG_1028 scp   FALSE 0.216 79.000 0.000 1.000   NA
 7472612 7472613 SDEG_1028 SDEG_1029     FALSE 0.176 118.000 0.000 NA   NA
 7472613 7472614 SDEG_1029 SDEG_1030     FALSE 0.249 69.000 0.000 NA   NA
 7472614 7472615 SDEG_1030 SDEG_1031     FALSE 0.169 126.000 0.000 NA   NA
 7472615 7472616 SDEG_1031 SDEG_1032   tnpA TRUE 0.903 53.000 0.000 0.087 Y NA
 7472616 7472617 SDEG_1032 SDEG_1033 tnpA fhs1 FALSE 0.010 637.000 0.000 1.000 N NA
 7472617 7472618 SDEG_1033 SDEG_1034 fhs1 lplA TRUE 0.416 127.000 0.200 1.000 N NA
 7472618 7472619 SDEG_1034 SDEG_1035 lplA   TRUE 0.939 15.000 0.250 NA N NA
 7472619 7472620 SDEG_1035 SDEG_1036     TRUE 0.976 -13.000 0.286 NA   NA
 7472620 7472621 SDEG_1036 SDEG_1037     TRUE 0.956 -7.000 0.107 NA   NA
 7472621 7472622 SDEG_1037 SDEG_1038   yqiG FALSE 0.048 232.000 0.000 1.000 N NA
 7472622 7472623 SDEG_1038 SDEG_1039 yqiG   TRUE 0.899 0.000 0.019 1.000 N NA
 7472624 7472625 SDEG_1040 SDEG_1041 dpfB coaC TRUE 0.905 -7.000 0.002 1.000   NA
 7472625 7472626 SDEG_1041 SDEG_1042 coaC   TRUE 0.459 55.000 0.019 NA   NA
 7472626 7472627 SDEG_1042 SDEG_1043   pgmA FALSE 0.270 163.000 0.098 NA   NA
 7472628 7472629 SDEG_1044 SDEG_1045     TRUE 0.996 -10.000 0.720 0.036   NA
 7472629 7472630 SDEG_1045 SDEG_1046     TRUE 0.983 -7.000 0.438 1.000   NA
 7472630 7472631 SDEG_1046 SDEG_1047     FALSE 0.280 114.000 0.036 1.000   NA
 7472631 7472632 SDEG_1047 SDEG_1048   cdd TRUE 0.539 94.000 0.300 1.000   NA
 7472632 7472633 SDEG_1048 SDEG_1049 cdd deoC TRUE 0.987 -13.000 0.051 1.000 Y NA
 7472633 7472634 SDEG_1049 SDEG_1050 deoC pdp TRUE 0.975 16.000 0.106 1.000 Y NA
 7472634 7472635 SDEG_1050 SDEG_1051 pdp   TRUE 0.933 -13.000 0.044 1.000 N NA
 7472636 7472637 SDEG_1052 SDEG_1053 coaA rpsT TRUE 0.426 54.000 0.014 1.000 N NA
 7472638 7472639 SDEG_1054 SDEG_1055     TRUE 0.996 -7.000 0.606 1.000 Y NA
 7472639 7472640 SDEG_1055 SDEG_1056   pepN FALSE 0.144 204.000 0.061 1.000 N NA
 7472640 7472641 SDEG_1056 SDEG_1057 pepN phoU FALSE 0.198 177.000 0.067 NA N NA
 7472641 7472642 SDEG_1057 SDEG_1058 phoU pstB TRUE 0.876 78.000 0.413 NA Y NA
 7472642 7472643 SDEG_1058 SDEG_1059 pstB pstB2 TRUE 0.998 10.000 0.542 0.002 Y NA
 7472643 7472644 SDEG_1059 SDEG_1060 pstB2 pstA TRUE 0.997 16.000 0.490 0.004 Y NA
 7472644 7472645 SDEG_1060 SDEG_1061 pstA pstC TRUE 0.999 -10.000 0.907 0.004 Y NA
 7472645 7472646 SDEG_1061 SDEG_1062 pstC pstS TRUE 0.985 11.000 0.206 1.000 Y NA
 7472646 7472647 SDEG_1062 SDEG_1063 pstS   TRUE 0.472 140.000 0.303 NA N NA
 7472647 7472648 SDEG_1063 SDEG_1064     TRUE 0.931 16.000 0.229 NA N NA
 7472648 7472649 SDEG_1064 SDEG_1065     TRUE 0.979 -10.000 0.337 NA   NA
 7472649 7472650 SDEG_1065 SDEG_1066   spxA TRUE 0.947 2.000 0.169 NA   NA
 7472650 7472651 SDEG_1066 SDEG_1067 spxA ribC TRUE 0.560 43.000 0.017 1.000 N NA
 7472651 7472652 SDEG_1067 SDEG_1068 ribC paaB TRUE 0.528 38.000 0.000 1.000   NA
 7472652 7472653 SDEG_1068 SDEG_1069 paaB   FALSE 0.337 57.000 0.000 NA   NA
 7472653 7472654 SDEG_1069 SDEG_1070   truB FALSE 0.185 95.000 0.000 NA   NA
 7472654 7472655 SDEG_1070 SDEG_1071 truB   FALSE 0.241 116.000 0.014 NA   NA
 7472655 7472656 SDEG_1071 SDEG_1072     FALSE 0.296 106.000 0.045 NA   NA
 7472656 7472657 SDEG_1072 SDEG_1073     TRUE 0.884 11.000 0.045 NA   NA
 7472657 7472658 SDEG_1073 SDEG_1074     TRUE 0.421 82.000 0.121 1.000   NA
 7472658 7472659 SDEG_1074 SDEG_1075     TRUE 0.991 10.000 0.438 1.000 Y NA
 7472661 7472662 SDEG_1077 SDEG_1078     TRUE 0.401 160.000 0.238 NA   NA
 7472662 7472663 SDEG_1078 SDEG_1079     FALSE 0.040 266.000 0.000 NA   NA
 7472663 7472664 SDEG_1079 SDEG_1080     TRUE 0.826 24.000 0.060 NA   NA
 7472664 7472665 SDEG_1080 SDEG_1081     TRUE 0.925 11.000 0.143 NA   NA
 7472665 7472666 SDEG_1081 SDEG_1082     TRUE 0.721 61.000 0.357 NA   NA
 7472666 7472667 SDEG_1082 SDEG_1083     FALSE 0.018 370.000 0.000 1.000   NA
 7472668 7472669 SDEG_1084 SDEG_1085   czcD TRUE 0.556 106.000 0.060 0.076 N NA
 7472670 7472671 SDEG_1086 SDEG_1087     TRUE 0.967 -157.000 0.000 0.030   NA
 7472671 7472672 SDEG_1087 SDEG_1088     FALSE 0.048 232.000 0.000 1.000 N NA
 7472672 7472673 SDEG_1088 SDEG_1089     TRUE 0.982 13.000 0.154 1.000 Y NA
 7472673 7472674 SDEG_1089 SDEG_1090   hisM TRUE 0.981 10.000 0.130 1.000 Y NA
 7472674 7472675 SDEG_1090 SDEG_1091 hisM   FALSE 0.234 107.000 0.018 1.000 N NA
 7472675 7472676 SDEG_1091 SDEG_1092   glmS FALSE 0.097 198.000 0.008 1.000 N NA
 7472676 7472677 SDEG_1092 SDEG_1093 glmS sipC FALSE 0.120 184.000 0.011 1.000 N NA
 7472677 7472678 SDEG_1093 SDEG_1094 sipC pyk FALSE 0.223 166.000 0.072 1.000 N NA
 7472678 7472679 SDEG_1094 SDEG_1095 pyk pfkA TRUE 0.961 63.000 0.261 0.006 Y NA
 7472679 7472680 SDEG_1095 SDEG_1096 pfkA dnaE TRUE 0.385 80.000 0.098 1.000 N NA
 7472681 7472682 SDEG_1097 SDEG_1098     TRUE 0.975 0.000 0.412 1.000 N NA
 7472682 7472683 SDEG_1098 SDEG_1099     TRUE 0.967 10.000 0.471 NA   NA
 7472688 7472689 SDEG_1104 SDEG_1105     FALSE 0.095 189.000 0.000 NA   NA
 7472689 7472690 SDEG_1105 SDEG_1106     FALSE 0.017 397.000 0.000 NA   NA
 7472690 7472691 SDEG_1106 SDEG_1107     TRUE 0.893 -12.000 0.000 NA   NA
 7472691 7472692 SDEG_1107 SDEG_1108     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 7472692 7472693 SDEG_1108 SDEG_1109     TRUE 0.833 3.000 0.000 NA   NA
 7472693 7472694 SDEG_1109 SDEG_1110     TRUE 0.833 3.000 0.000 NA   NA
 7472694 7472695 SDEG_1110 SDEG_1111     TRUE 0.803 10.000 0.000 NA   NA
 7472695 7472696 SDEG_1111 SDEG_1112     TRUE 0.809 9.000 0.000 NA   NA
 7472696 7472697 SDEG_1112 SDEG_1113     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 7472697 7472698 SDEG_1113 SDEG_1114     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7472698 7472699 SDEG_1114 SDEG_1115     FALSE 0.337 57.000 0.000 NA   NA
 7472699 7472700 SDEG_1115 SDEG_1116     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 7472700 7472701 SDEG_1116 SDEG_1117     TRUE 0.966 -3.000 0.188 NA   NA
 7472701 7472702 SDEG_1117 SDEG_1118     FALSE 0.122 169.000 0.000 NA   NA
 7472702 7472703 SDEG_1118 SDEG_1119     FALSE 0.199 87.000 0.000 NA   NA
 7472703 7472704 SDEG_1119 SDEG_1120     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 7472704 7472705 SDEG_1120 SDEG_1121     FALSE 0.032 289.000 0.000 NA   NA
 7472705 7472706 SDEG_1121 SDEG_1122     TRUE 0.967 9.000 0.444 NA   NA
 7472706 7472707 SDEG_1122 SDEG_1123     TRUE 0.985 1.000 0.750 NA   NA
 7472707 7472708 SDEG_1123 SDEG_1124     TRUE 0.983 -16.000 0.467 NA   NA
 7472708 7472709 SDEG_1124 SDEG_1125     TRUE 0.987 -37.000 0.667 NA   NA
 7472709 7472710 SDEG_1125 SDEG_1126     TRUE 0.721 21.000 0.000 NA   NA
 7472710 7472711 SDEG_1126 SDEG_1127     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 7472711 7472712 SDEG_1127 SDEG_1128     TRUE 0.953 18.000 0.417 NA   NA
 7472712 7472713 SDEG_1128 SDEG_1129     TRUE 0.970 -67.000 0.263 NA   NA
 7472713 7472714 SDEG_1129 SDEG_1130     TRUE 0.435 49.000 0.000 NA   NA
 7472714 7472715 SDEG_1130 SDEG_1131     FALSE 0.296 62.000 0.000 NA   NA
 7472715 7472716 SDEG_1131 SDEG_1132     TRUE 0.956 0.000 0.167 NA   NA
 7472716 7472717 SDEG_1132 SDEG_1133     TRUE 0.980 -7.000 0.353 NA   NA
 7472717 7472718 SDEG_1133 SDEG_1134     TRUE 0.955 -3.000 0.118 NA   NA
 7472718 7472719 SDEG_1134 SDEG_1135     TRUE 0.441 148.000 0.250 NA   NA
 7472719 7472720 SDEG_1135 SDEG_1136     TRUE 0.504 108.000 0.250 NA   NA
 7472720 7472721 SDEG_1136 SDEG_1137     TRUE 0.815 76.000 1.000 NA   NA
 7472721 7472722 SDEG_1137 SDEG_1138     TRUE 0.794 14.000 0.000 NA   NA
 7472722 7472723 SDEG_1138 SDEG_1139     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 7472723 7472724 SDEG_1139 SDEG_1140     TRUE 0.907 -13.000 0.002 NA   NA
 7472724 7472725 SDEG_1140 SDEG_1141     TRUE 0.902 -3.000 0.002 NA   NA
 7472725 7472726 SDEG_1141 SDEG_1142     FALSE 0.114 175.000 0.000 NA   NA
 7472726 7472727 SDEG_1142 SDEG_1143     TRUE 0.976 10.000 0.667 NA   NA
 7472727 7472728 SDEG_1143 SDEG_1144     TRUE 0.893 -7.000 0.000 NA   NA
 7472728 7472729 SDEG_1144 SDEG_1145     TRUE 0.988 -3.000 0.667 NA   NA
 7472729 7472730 SDEG_1145 SDEG_1146     FALSE 0.131 161.000 0.000 NA   NA
 7472730 7472731 SDEG_1146 SDEG_1147     TRUE 0.809 9.000 0.000 NA   NA
 7472731 7472732 SDEG_1147 SDEG_1148     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7472732 7472733 SDEG_1148 SDEG_1149     TRUE 0.888 -19.000 0.000 NA   NA
 7472733 7472734 SDEG_1149 SDEG_1150     FALSE 0.158 139.000 0.000 NA   NA
 7472734 7472735 SDEG_1150 SDEG_1151     FALSE 0.183 100.000 0.000 NA   NA
 7472735 7472736 SDEG_1151 SDEG_1152     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 7472736 7472737 SDEG_1152 SDEG_1153     FALSE 0.031 290.000 0.000 NA   NA
 7472740 7472741 SDEG_1156 SDEG_1157     TRUE 0.833 3.000 0.000 NA   NA
 7472741 7472742 SDEG_1157 SDEG_1158     TRUE 0.802 11.000 0.000 NA   NA
 7472742 7472743 SDEG_1158 SDEG_1159     TRUE 0.986 6.000 1.000 NA   NA
 7472743 7472744 SDEG_1159 SDEG_1160   int FALSE 0.170 124.000 0.000 NA   NA
 7472744 7472745 SDEG_1160 SDEG_1161 int   FALSE 0.019 357.000 0.000 NA   NA
 7472746 7472747 SDEG_1162 SDEG_1163     TRUE 0.867 -172.000 0.000 NA   NA
 7472747 7472748 SDEG_1163 SDEG_1164     FALSE 0.163 133.000 0.000 NA   NA
 7472748 7472749 SDEG_1164 SDEG_1165   rpsA FALSE 0.183 102.000 0.000 NA   NA
 7472749 7472750 SDEG_1165 SDEG_1167 rpsA   FALSE 0.169 125.000 0.000 NA   NA
 7472750 7472751 SDEG_1167 SDEG_1168     TRUE 0.435 49.000 0.000 NA   NA
 7472751 7472752 SDEG_1168 SDEG_1169     FALSE 0.307 61.000 0.000 NA   NA
 7472752 7472753 SDEG_1169 SDEG_1170   bcaT TRUE 0.485 64.000 0.095 NA   NA
 7472755 7472756 SDEG_1172 SDEG_1173 parC   FALSE 0.127 197.000 0.018 NA   NA
 7472756 7472757 SDEG_1173 SDEG_1174   parE TRUE 0.358 67.000 0.025 NA   NA
 7472759 7472760 SDEG_1176 SDEG_1177 pyrC ung FALSE 0.189 132.000 0.009 1.000 N NA
 7472760 7472761 SDEG_1177 SDEG_1178 ung   FALSE 0.220 133.000 0.025 1.000 N NA
 7472761 7472762 SDEG_1178 SDEG_1179     TRUE 0.983 29.000 0.125 0.035 Y NA
 7472762 7472763 SDEG_1179 SDEG_1180   amiC TRUE 0.467 82.000 0.182 1.000 N NA
 7472763 7472764 SDEG_1180 SDEG_1181 amiC   FALSE 0.094 179.000 0.000 1.000 N NA
 7472764 7472765 SDEG_1181 SDEG_1182     TRUE 0.990 36.000 0.667 0.084 Y NA
 7472765 7472766 SDEG_1182 SDEG_1183     FALSE 0.351 55.000 0.000 1.000   NA
 7472766 7472767 SDEG_1183 SDEG_1184   pyrE TRUE 0.586 41.000 0.012 1.000   NA
 7472767 7472768 SDEG_1184 SDEG_1185 pyrE pyrF TRUE 0.848 61.000 0.133 1.000 Y NA
 7472768 7472769 SDEG_1185 SDEG_1186 pyrF   FALSE 0.073 212.000 0.000 NA   NA
 7472771 7472772 SDEG_1188 SDEG_1189 cpsX deoD2 TRUE 0.955 -13.000 0.107 NA   NA
 7472772 7472773 SDEG_1189 SDEG_1190 deoD2 punA FALSE 0.328 553.000 0.040 0.001 Y NA
 7472773 7472774 SDEG_1190 SDEG_1191 punA arsC TRUE 0.951 -16.000 0.108 1.000 N NA
 7472774 7472775 SDEG_1191 SDEG_1192 arsC deoB TRUE 0.905 13.000 0.108 1.000 N NA
 7472775 7472776 SDEG_1192 SDEG_1193 deoB rpiA TRUE 0.694 79.000 0.018 1.000 Y NA
 7472778 7472779 SDEG_1195 SDEG_1196     FALSE 0.284 178.000 0.179 1.000 N NA
 7472780 7472781 SDEG_1197 SDEG_1198     TRUE 0.979 -175.000 0.000 0.002   NA
 7472781 7472782 SDEG_1198 SDEG_1199     TRUE 0.486 171.000 0.000 0.002   NA
 7472783 7472784 SDEG_1200 SDEG_1201 uvrC ybjI FALSE 0.186 130.000 0.002 NA   NA
 7472784 7472785 SDEG_1201 SDEG_1202 ybjI gabD TRUE 0.535 56.000 0.069 NA   NA
 7472785 7472786 SDEG_1202 SDEG_1203 gabD   TRUE 0.636 74.000 0.044 0.051   NA
 7472787 7472788 SDEG_1204 SDEG_1205     TRUE 0.538 62.000 0.124 NA   NA
 7472788 7472789 SDEG_1205 SDEG_1206     TRUE 0.800 13.000 0.000 NA   NA
 10750673 7472790 SDEG_1207 SDEG_1208     FALSE 0.133 160.000 0.000 NA   NA
 7472790 7472791 SDEG_1208 SDEG_1209     FALSE 0.184 96.000 0.000 NA   NA
 7472791 7472792 SDEG_1209 SDEG_1210   yesN TRUE 0.986 -13.000 0.571 1.000   NA
 7472792 7472793 SDEG_1210 SDEG_1211 yesN yesM TRUE 0.992 4.000 0.500 0.013   NA
 7472793 7472794 SDEG_1211 SDEG_1212 yesM ptsD TRUE 0.646 146.000 0.222 0.059 N NA
 7472794 7472795 SDEG_1212 SDEG_1213 ptsD ptsC TRUE 0.999 -3.000 0.778 0.024 Y NA
 7472795 7472796 SDEG_1213 SDEG_1214 ptsC ptsB TRUE 0.997 16.000 0.778 0.024 Y NA
 7472796 7472797 SDEG_1214 SDEG_1215 ptsB   TRUE 0.997 19.000 0.786 0.016 Y NA
 7472797 7472798 SDEG_1215 SDEG_1216     FALSE 0.078 207.000 0.000 NA   NA
 7472798 7472799 SDEG_1216 SDEG_1217     FALSE 0.182 111.000 0.000 NA   NA
 7472799 7472800 SDEG_1217 SDEG_1218   spiA FALSE 0.093 190.000 0.000 NA   NA
 7472800 7472801 SDEG_1218 SDEG_1219 spiA   TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 7472801 7472802 SDEG_1219 SDEG_1220     FALSE 0.132 160.000 0.000 1.000   NA
 7472802 7472803 SDEG_1220 SDEG_1221   msrB TRUE 0.843 13.000 0.010 1.000   NA
 7472803 7472804 SDEG_1221 SDEG_1222 msrB lepA FALSE 0.113 176.000 0.002 1.000 N NA
 7472804 7472805 SDEG_1222 SDEG_1223 lepA ndk FALSE 0.249 70.000 0.003 1.000 N NA
 7472806 7472807 SDEG_1224 SDEG_1225     TRUE 0.869 -124.000 0.000 NA   NA
 11477561 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2652.000 0.000 NA   NA
 11619924 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2652.000 0.000 NA   NA
 11762316 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2652.000 0.000 NA   NA
 11477562 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2688.000 0.000 NA   NA
 11619925 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2688.000 0.000 NA   NA
 11762317 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2688.000 0.000 NA   NA
 7472807 7472808 SDEG_1225 SDEG_1226     FALSE 0.169 126.000 0.000 NA   NA
 11477563 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2718.000 0.000 NA   NA
 11619926 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2718.000 0.000 NA   NA
 11762318 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2718.000 0.000 NA   NA
 11477564 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2754.000 0.000 NA   NA
 11619927 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2754.000 0.000 NA   NA
 11762319 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2754.000 0.000 NA   NA
 11477565 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2784.000 0.000 NA   NA
 11619928 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2784.000 0.000 NA   NA
 11762320 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2784.000 0.000 NA   NA
 11477566 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2820.000 0.000 NA   NA
 11619929 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2820.000 0.000 NA   NA
 11762321 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2820.000 0.000 NA   NA
 11477567 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2850.000 0.000 NA   NA
 11619930 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2850.000 0.000 NA   NA
 11762322 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2850.000 0.000 NA   NA
 11477568 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2886.000 0.000 NA   NA
 11619931 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2886.000 0.000 NA   NA
 11762323 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2886.000 0.000 NA   NA
 11477569 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2916.000 0.000 NA   NA
 11619932 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2916.000 0.000 NA   NA
 11762324 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2916.000 0.000 NA   NA
 11477570 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2952.000 0.000 NA   NA
 11619933 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2952.000 0.000 NA   NA
 11762325 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2952.000 0.000 NA   NA
 11477571 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2982.000 0.000 NA   NA
 11619934 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2982.000 0.000 NA   NA
 11762326 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 2982.000 0.000 NA   NA
 11477572 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3018.000 0.000 NA   NA
 11619935 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3018.000 0.000 NA   NA
 11762327 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3018.000 0.000 NA   NA
 7472808 7472809 SDEG_1226 SDEG_1227     FALSE 0.243 70.000 0.000 NA   NA
 11477573 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3048.000 0.000 NA   NA
 11619936 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3048.000 0.000 NA   NA
 11762328 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3048.000 0.000 NA   NA
 11477574 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3084.000 0.000 NA   NA
 11619937 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3084.000 0.000 NA   NA
 11762329 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3084.000 0.000 NA   NA
 11477575 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3116.000 0.000 NA   NA
 11619938 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3116.000 0.000 NA   NA
 11762330 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3116.000 0.000 NA   NA
 11477576 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3152.000 0.000 NA   NA
 11619939 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3152.000 0.000 NA   NA
 11762331 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3152.000 0.000 NA   NA
 11477577 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3182.000 0.000 NA   NA
 11619940 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3182.000 0.000 NA   NA
 11762332 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3182.000 0.000 NA   NA
 11477578 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3218.000 0.000 NA   NA
 11619941 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3218.000 0.000 NA   NA
 11762333 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3218.000 0.000 NA   NA
 11477579 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3248.000 0.000 NA   NA
 11619942 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3248.000 0.000 NA   NA
 11762334 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3248.000 0.000 NA   NA
 11477580 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3284.000 0.000 NA   NA
 11619943 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3284.000 0.000 NA   NA
 11762335 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3284.000 0.000 NA   NA
 11477581 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3314.000 0.000 NA   NA
 11619944 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3314.000 0.000 NA   NA
 11762336 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3314.000 0.000 NA   NA
 11477582 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3350.000 0.000 NA   NA
 11619945 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3350.000 0.000 NA   NA
 11762337 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3350.000 0.000 NA   NA
 11477583 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3380.000 0.000 NA   NA
 11619946 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3380.000 0.000 NA   NA
 11762338 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3380.000 0.000 NA   NA
 11477584 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3416.000 0.000 NA   NA
 11619947 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3416.000 0.000 NA   NA
 11762339 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3416.000 0.000 NA   NA
 11477585 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3446.000 0.000 NA   NA
 11619948 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3446.000 0.000 NA   NA
 11762340 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3446.000 0.000 NA   NA
 11477586 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3482.000 0.000 NA   NA
 11619949 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3482.000 0.000 NA   NA
 11762341 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3482.000 0.000 NA   NA
 11477587 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3512.000 0.000 NA   NA
 11619950 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3512.000 0.000 NA   NA
 11762342 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3512.000 0.000 NA   NA
 11477588 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3548.000 0.000 NA   NA
 11619951 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3548.000 0.000 NA   NA
 11762343 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3548.000 0.000 NA   NA
 11477589 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3578.000 0.000 NA   NA
 11619952 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3578.000 0.000 NA   NA
 11762344 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3578.000 0.000 NA   NA
 11477590 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3614.000 0.000 NA   NA
 11619953 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3614.000 0.000 NA   NA
 11762345 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3614.000 0.000 NA   NA
 11477591 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3644.000 0.000 NA   NA
 11619954 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3644.000 0.000 NA   NA
 11762346 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3644.000 0.000 NA   NA
 11477592 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3680.000 0.000 NA   NA
 11619955 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3680.000 0.000 NA   NA
 11762347 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3680.000 0.000 NA   NA
 11477593 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3710.000 0.000 NA   NA
 11619956 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3710.000 0.000 NA   NA
 11762348 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3710.000 0.000 NA   NA
 11477594 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3746.000 0.000 NA   NA
 11619957 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3746.000 0.000 NA   NA
 11762349 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3746.000 0.000 NA   NA
 11477595 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3776.000 0.000 NA   NA
 11619958 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3776.000 0.000 NA   NA
 11762350 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3776.000 0.000 NA   NA
 11477596 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3812.000 0.000 NA   NA
 11619959 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3812.000 0.000 NA   NA
 11762351 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3812.000 0.000 NA   NA
 11477597 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3842.000 0.000 NA   NA
 11619960 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3842.000 0.000 NA   NA
 11762352 7472803   SDEG_1221   msrB FALSE NA 3842.000 0.000 NA   NA
 7472810 7472811 SDEG_1228 SDEG_1229     TRUE 0.969 -76.000 0.253 NA   NA
 7472811 7472812 SDEG_1229 SDEG_1230     TRUE 0.991 -3.000 0.876 NA   NA
 7472812 7472813 SDEG_1230 SDEG_1231     TRUE 0.982 0.000 0.546 NA   NA
 7472813 7472814 SDEG_1231 SDEG_1232     TRUE 0.794 24.000 0.030 NA   NA
 7472814 7472815 SDEG_1232 SDEG_1233     FALSE 0.022 336.000 0.000 NA   NA
 7472815 7472816 SDEG_1233 SDEG_1234     TRUE 0.978 -12.000 0.330 NA   NA
 7472816 7472817 SDEG_1234 SDEG_1235     TRUE 0.920 0.000 0.055 1.000 N NA
 7472817 7472818 SDEG_1235 SDEG_1236   hemN TRUE 0.884 10.000 0.060 1.000 N NA
 7472818 7472819 SDEG_1236 SDEG_1237 hemN   TRUE 0.400 62.000 0.021 NA   NA
 7472819 7472820 SDEG_1237 SDEG_1238   femD FALSE 0.195 124.000 0.003 NA   NA
 7472820 7472821 SDEG_1238 SDEG_1239 femD   TRUE 0.645 54.000 0.150 NA   NA
 7472821 7472822 SDEG_1239 SDEG_1240     TRUE 0.985 -3.000 0.502 NA   NA
 7472823 7472824 SDEG_1241 SDEG_1242     TRUE 0.987 0.000 0.796 1.000   NA
 7472825 7472826 SDEG_1243 SDEG_1244 lplB   FALSE 0.208 83.000 0.000 NA   NA
 7472826 7472827 SDEG_1244 SDEG_1245     TRUE 0.875 -54.000 0.000 NA   NA
 7472827 7472828 SDEG_1245 SDEG_1246   acoL FALSE 0.050 230.000 0.000 NA N NA
 7472830 7472831 SDEG_1248 SDEG_1249 acoC acoB TRUE 0.752 180.000 0.077 0.048 Y NA
 7472831 7472832 SDEG_1249 SDEG_1250 acoB acoA TRUE 0.988 56.000 0.769 0.001 Y NA
 7472832 7472833 SDEG_1250 SDEG_1251 acoA   FALSE 0.036 273.000 0.000 1.000   NA
 7472833 7472834 SDEG_1251 SDEG_1252     FALSE 0.315 79.000 0.029 NA   NA
 7472834 7472835 SDEG_1252 SDEG_1253   estA TRUE 0.849 30.000 0.150 NA   NA
 7472835 7472836 SDEG_1253 SDEG_1254 estA   TRUE 0.373 133.000 0.143 NA   NA
 7472836 7472837 SDEG_1254 SDEG_1255     FALSE 0.112 212.000 0.026 1.000   NA
 7472837 7472838 SDEG_1255 SDEG_1256     TRUE 0.991 -3.000 0.895 1.000   NA
 7472838 7472839 SDEG_1256 SDEG_1257     TRUE 0.948 18.000 0.368 NA   NA
 7472839 7472840 SDEG_1257 SDEG_1258     FALSE 0.015 463.000 0.000 NA   NA
 7472840 7472841 SDEG_1258 SDEG_1259     FALSE 0.010 2009.000 0.000 NA   NA
 7472841 7472842 SDEG_1259 SDEG_1260     FALSE 0.242 120.000 0.017 NA   NA
 7472846 7472847 SDEG_1264 SDEG_1265     TRUE 0.934 -28.000 0.048 NA   NA
 7472847 7472848 SDEG_1265 SDEG_1266     TRUE 0.635 49.000 0.074 NA   NA
 7472850 7472851 SDEG_1268 SDEG_1269   cpsFQ FALSE 0.015 451.000 0.000 NA   NA
 7472851 7472852 SDEG_1269 SDEG_1270 cpsFQ cpsFP TRUE 0.558 235.000 0.350 1.000 Y NA
 7472852 7472853 SDEG_1270 SDEG_1271 cpsFP cpsFO TRUE 0.989 0.000 0.149 1.000 Y NA
 7472853 7472854 SDEG_1271 SDEG_1272 cpsFO   TRUE 0.481 58.000 0.059 1.000 N NA
 7472854 7472855 SDEG_1272 SDEG_1273     TRUE 0.847 10.000 0.018 1.000 N NA
 7472855 7472856 SDEG_1273 SDEG_1274     TRUE 0.806 18.000 0.011 NA   NA
 7472856 7472857 SDEG_1274 SDEG_1275     TRUE 0.976 -10.000 0.283 NA   NA
 7472857 7472858 SDEG_1275 SDEG_1276   nth FALSE 0.255 81.000 0.006 NA   NA
 7472858 7472859 SDEG_1276 SDEG_1277 nth dnaD TRUE 0.984 -15.000 0.007 NA Y NA
 7472859 7472860 SDEG_1277 SDEG_1278 dnaD apt FALSE 0.073 218.000 0.005 NA N NA
 7472860 7472861 SDEG_1278 SDEG_1279 apt recJ FALSE 0.309 148.000 0.128 1.000 N NA
 7472861 7472862 SDEG_1279 SDEG_1280 recJ   TRUE 0.921 -3.000 0.016 1.000   NA
 7472862 7472863 SDEG_1280 SDEG_1281   elaC TRUE 0.935 0.000 0.074 1.000   NA
 7472863 7472864 SDEG_1281 SDEG_1282 elaC   TRUE 0.854 15.000 0.022 NA   NA
 7472864 7472865 SDEG_1282 SDEG_1283   hflX TRUE 0.924 -7.000 0.014 NA   NA
 7472865 7472866 SDEG_1283 SDEG_1284 hflX miaA FALSE 0.319 76.000 0.027 1.000   NA
 7472868 7472869 SDEG_1286 SDEG_1287     FALSE 0.219 159.000 0.056 1.000 N NA
 7472869 7472870 SDEG_1287 SDEG_1288     FALSE 0.216 79.000 0.000 1.000   NA
 7472870 7472871 SDEG_1288 SDEG_1289     FALSE 0.065 220.000 0.000 NA   NA
 7472873 7472874 SDEG_1291 SDEG_1292   glgP FALSE 0.053 237.000 0.000 1.000   NA
 7472874 7472875 SDEG_1292 SDEG_1293 glgP malQ TRUE 0.990 31.000 0.289 0.021 Y NA
 7472875 7472876 SDEG_1293 SDEG_1294 malQ malR TRUE 0.620 119.000 0.538 1.000 N NA
 7472877 7472878 SDEG_1295 SDEG_1296   malE FALSE 0.122 156.000 0.000 NA N NA
 7472878 7472879 SDEG_1296 SDEG_1297 malE malF TRUE 0.574 281.000 0.690 NA Y NA
 7472879 7472880 SDEG_1297 SDEG_1298 malF malG TRUE 0.999 0.000 0.793 0.032 Y NA
 7472880 7472881 SDEG_1298 SDEG_1299 malG   FALSE 0.221 173.000 0.069 1.000   NA
 7472882 7472883 SDEG_1300 SDEG_1301 malA malD TRUE 0.905 22.000 0.200 NA   NA
 7472883 7472884 SDEG_1301 SDEG_1302 malD malC TRUE 0.986 0.000 0.714 NA   NA
 7472884 7472885 SDEG_1302 SDEG_1303 malC malC FALSE 0.183 104.000 0.000 NA   NA
 7472885 7472886 SDEG_1303 SDEG_1304 malC amyB TRUE 0.570 123.000 0.000 1.000 Y NA
 7472886 7472887 SDEG_1304 SDEG_1305 amyB malX TRUE 0.595 165.000 0.065 1.000 Y NA
 7472887 7472888 SDEG_1305 SDEG_1306 malX dltD FALSE 0.015 404.000 0.000 NA N NA
 7472888 7472889 SDEG_1306 SDEG_1307 dltD dltC TRUE 0.982 -7.000 0.409 NA   NA
 7472889 7472890 SDEG_1307 SDEG_1308 dltC dltB TRUE 0.950 18.000 0.387 NA   NA
 7472890 7472891 SDEG_1308 SDEG_1309 dltB dltA TRUE 0.981 -3.000 0.435 NA N NA
 7472891 7472892 SDEG_1309 SDEG_1310 dltA   TRUE 0.971 12.000 0.549 NA   NA
 7472892 7472893 SDEG_1310 SDEG_1311   uvrB FALSE 0.045 253.000 0.000 NA   NA
 7472894 7472895 SDEG_1312 SDEG_1313 glnH glnQ.2 TRUE 0.993 0.000 0.326 1.000 Y NA
 7472895 7472896 SDEG_1313 SDEG_1314 glnQ.2   FALSE 0.024 302.000 0.000 1.000 N NA
 7472897 7472898 SDEG_1315 SDEG_1316 obg   TRUE 0.428 55.000 0.011 NA   NA
 7472899 7472900 SDEG_1317 SDEG_1318 pepS   TRUE 0.422 60.000 0.035 1.000 N NA
 7472905 7472906 SDEG_1323 SDEG_1324     TRUE 0.957 -3.000 0.127 NA   NA
 7472906 7472907 SDEG_1324 SDEG_1325     FALSE 0.082 204.000 0.000 NA   NA
 7472907 7472908 SDEG_1325 SDEG_1326     FALSE 0.188 82.000 0.000 NA N NA
 7472908 7472909 SDEG_1326 SDEG_1327     FALSE 0.133 147.000 0.000 NA N NA
 7472910 7472911 SDEG_1328 SDEG_1329     TRUE 0.968 36.000 0.667 0.077   NA
 7472912 7472913 SDEG_1330 SDEG_1331     TRUE 0.897 30.000 0.000 0.028   NA
 7472913 7472914 SDEG_1331 SDEG_1332     TRUE 0.664 24.000 0.000 1.000 N NA
 7472914 7472915 SDEG_1332 SDEG_1333     TRUE 0.601 98.000 0.429 NA   NA
 7472918 7472919 SDEG_1336 SDEG_1337     TRUE 0.904 53.000 0.000 0.077 Y NA
 7472920 7472921 SDEG_1338 SDEG_1339     TRUE 0.653 75.000 0.400 NA   NA
 7472921 7472922 SDEG_1339 SDEG_1340     FALSE 0.188 93.000 0.000 NA   NA
 7472922 7472923 SDEG_1340 SDEG_1341     FALSE 0.135 158.000 0.000 1.000   NA
 7472923 7472924 SDEG_1341 SDEG_1342     TRUE 0.683 79.000 0.500 NA   NA
 7472924 7472925 SDEG_1342 SDEG_1343     TRUE 0.840 43.000 0.333 NA   NA
 7472925 7472926 SDEG_1343 SDEG_1344     FALSE 0.234 73.000 0.000 NA   NA
 7472926 7472927 SDEG_1344 SDEG_1345     FALSE 0.214 80.000 0.000 NA   NA
 7472927 7472928 SDEG_1345 SDEG_1346     TRUE 0.410 51.000 0.000 NA   NA
 7472928 7472929 SDEG_1346 SDEG_1347     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7472929 7472930 SDEG_1347 SDEG_1348     TRUE 0.992 -3.000 1.000 NA   NA
 7472930 7472931 SDEG_1348 SDEG_1349     TRUE 0.990 -3.000 0.833 NA   NA
 7472931 7472932 SDEG_1349 SDEG_1350     FALSE 0.013 531.000 0.000 NA   NA
 7472932 7472933 SDEG_1350 SDEG_1351     TRUE 0.361 86.000 0.093 NA N NA
 7472933 7472934 SDEG_1351 SDEG_1352   aroK FALSE 0.127 231.000 0.111 NA N NA
 7472934 7472935 SDEG_1352 SDEG_1353 aroK   TRUE 0.985 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 7472935 7472936 SDEG_1353 SDEG_1354     FALSE 0.208 98.000 0.003 1.000   NA
 7472936 7472937 SDEG_1354 SDEG_1355   map TRUE 0.969 2.000 0.373 1.000   NA
 7472937 7472938 SDEG_1355 SDEG_1356 map   TRUE 0.927 17.000 0.235 1.000 N NA
 7472938 7472939 SDEG_1356 SDEG_1357     TRUE 0.977 -19.000 0.342 1.000 N NA
 7472939 7472940 SDEG_1357 SDEG_1358   spg FALSE 0.047 249.000 0.000 1.000   NA
 7472940 7472941 SDEG_1358 SDEG_1359 spg   FALSE 0.014 482.000 0.000 1.000   NA
 7472941 7472942 SDEG_1359 SDEG_1360     FALSE 0.230 116.000 0.012 1.000   NA
 7472942 7472943 SDEG_1360 SDEG_1361     FALSE 0.183 269.000 0.035 0.047   NA
 7472943 7472944 SDEG_1361 SDEG_1362     TRUE 0.953 15.000 0.364 1.000 N NA
 7472944 7472945 SDEG_1362 SDEG_1363     TRUE 0.966 89.000 0.533 0.001 Y NA
 7472945 7472946 SDEG_1363 SDEG_1364     TRUE 0.631 109.000 0.000 0.001   NA
 7472946 7472947 SDEG_1364 SDEG_1365     TRUE 0.832 3.000 0.000 1.000   NA
 7472947 7472948 SDEG_1365 SDEG_1366     TRUE 0.626 128.000 0.583 1.000 N NA
 7472948 7472949 SDEG_1366 SDEG_1367     TRUE 0.836 42.000 0.333 1.000 N NA
 7472949 7472950 SDEG_1367 SDEG_1368     TRUE 0.977 23.000 0.238 1.000 Y NA
 7472950 7472951 SDEG_1368 SDEG_1369     TRUE 0.846 153.000 0.600 NA Y NA
 7472951 7472952 SDEG_1369 SDEG_1370   murZ FALSE 0.018 344.000 0.000 NA N NA
 7472952 7472953 SDEG_1370 SDEG_1371 murZ metK2 FALSE 0.132 189.000 0.026 1.000 N NA
 7472953 7472954 SDEG_1371 SDEG_1372 metK2 inlA FALSE 0.014 495.000 0.000 1.000   NA
 7472956 7472957 SDEG_1374 SDEG_1375     FALSE 0.219 174.000 0.067 NA   NA
 7472957 7472958 SDEG_1375 SDEG_1376     TRUE 0.907 0.000 0.030 NA N NA
 7472960 7472961 SDEG_1378 SDEG_1379   udk TRUE 0.374 61.000 0.010 NA   NA
 7472962 7472963 SDEG_1380 SDEG_1381 deaD   FALSE 0.205 268.000 0.000 1.000 Y NA
 7472963 7472964 SDEG_1381 SDEG_1382     TRUE 0.550 69.000 0.000 0.076   NA
 7472964 7472965 SDEG_1382 SDEG_1383     TRUE 0.919 25.000 0.000 0.022   NA
 7472966 7472967 SDEG_1384 SDEG_1385     FALSE 0.197 88.000 0.000 NA   NA
 7472967 7472968 SDEG_1385 SDEG_1386     FALSE 0.116 173.000 0.000 NA   NA
 7472968 7472969 SDEG_1386 SDEG_1387     TRUE 0.640 79.000 0.000 1.000 Y NA
 7472969 7472970 SDEG_1387 SDEG_1388     TRUE 0.996 18.000 0.500 0.022 Y NA
 7472970 7472971 SDEG_1388 SDEG_1389     TRUE 0.998 10.000 0.667 0.022 Y NA
 7472971 7472972 SDEG_1389 SDEG_1390     FALSE 0.162 134.000 0.000 NA   NA
 7472972 7472973 SDEG_1390 SDEG_1391     TRUE 0.395 52.000 0.000 NA   NA
 7472973 7472974 SDEG_1391 SDEG_1392     TRUE 0.773 56.000 0.000 0.004   NA
 7472974 7472975 SDEG_1392 SDEG_1393     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.004   NA
 7472975 7472976 SDEG_1393 SDEG_1394     FALSE 0.181 102.000 0.000 1.000   NA
 7472976 7472977 SDEG_1394 SDEG_1395     TRUE 0.890 -16.000 0.000 1.000   NA
 7472977 7472978 SDEG_1395 SDEG_1396     FALSE 0.196 88.000 0.000 1.000   NA
 7472978 7472979 SDEG_1396 SDEG_1397     TRUE 0.520 70.000 0.167 1.000   NA
 7472979 7472980 SDEG_1397 SDEG_1398     TRUE 0.949 34.000 0.842 NA   NA
 7472980 7472981 SDEG_1398 SDEG_1399     TRUE 0.919 19.000 0.211 NA   NA
 7472981 7472982 SDEG_1399 SDEG_1400   bglG TRUE 0.984 0.000 0.085 0.012 N NA
 7472982 7472983 SDEG_1400 SDEG_1401 bglG   TRUE 0.904 44.000 0.128 0.012 N NA
 7472983 7472984 SDEG_1401 SDEG_1402     FALSE 0.012 521.000 0.000 1.000 N NA
 7472984 7472985 SDEG_1402 SDEG_1403     TRUE 0.952 36.000 0.000 0.076 Y NA
 7472985 7472986 SDEG_1403 SDEG_1404     FALSE 0.015 435.000 0.000 NA   NA
 7472986 7472987 SDEG_1404 SDEG_1405   tnp1191 FALSE 0.061 224.000 0.000 NA   NA
 7472987 7472988 SDEG_1405 SDEG_1406 tnp1191   FALSE 0.051 240.000 0.000 NA   NA
 7472988 7472989 SDEG_1406 SDEG_1407   bgl TRUE 0.873 17.000 0.066 NA   NA
 7472989 7472990 SDEG_1407 SDEG_1408 bgl   FALSE 0.181 102.000 0.000 1.000   NA
 7472992 7472993 SDEG_1410 SDEG_1411     TRUE 0.802 11.000 0.000 NA   NA
 7472993 7472994 SDEG_1411 SDEG_1412   bglA FALSE 0.012 576.000 0.000 1.000   NA
 7472996 7472997 SDEG_1414 SDEG_1415     FALSE 0.052 239.000 0.000 1.000   NA
 7472997 7472998 SDEG_1415 SDEG_1416     FALSE 0.177 116.000 0.000 1.000   NA
 7473000 7473001 SDEG_1418 SDEG_1419   gapN FALSE 0.270 86.000 0.028 1.000 N NA
 7473001 7473002 SDEG_1419 SDEG_1420 gapN pstI FALSE 0.181 167.000 0.035 1.000 N NA
 7473002 7473003 SDEG_1420 SDEG_1421 pstI ptsH TRUE 0.996 5.000 0.240 0.012 Y NA
 7473004 7473005 SDEG_1422 SDEG_1423   nrdE.2 TRUE 0.955 20.000 0.562 1.000 N NA
 7473005 7473006 SDEG_1423 SDEG_1424 nrdE.2 nrdF TRUE 0.708 333.000 0.500 0.002 Y NA
 7473006 7473007 SDEG_1424 SDEG_1425 nrdF   TRUE 0.943 -22.000 0.083 1.000 N NA
 7473008 7473009 SDEG_1426 SDEG_1427     TRUE 0.865 19.000 0.077 NA   NA
 7473009 7473010 SDEG_1427 SDEG_1428     TRUE 0.979 -3.000 0.362 NA   NA
 7473010 7473011 SDEG_1428 SDEG_1429     TRUE 0.914 0.000 0.029 NA   NA
 7473011 7473012 SDEG_1429 SDEG_1430   alaS FALSE 0.133 160.000 0.000 NA   NA
 7473012 7473013 SDEG_1430 SDEG_1431 alaS   TRUE 0.810 16.000 0.006 NA   NA
 7473013 7473014 SDEG_1431 SDEG_1432   prsA FALSE 0.045 255.000 0.000 NA   NA
 7473014 7473015 SDEG_1432 SDEG_1433 prsA   TRUE 0.356 63.000 0.012 1.000   NA
 7473015 7473016 SDEG_1433 SDEG_1434     TRUE 0.477 52.000 0.012 NA   NA
 7473016 7473017 SDEG_1434 SDEG_1435     FALSE 0.022 334.000 0.000 NA   NA
 7473017 7473018 SDEG_1435 SDEG_1436     TRUE 0.988 0.000 0.273 0.046   NA
 7473018 7473019 SDEG_1436 SDEG_1437     FALSE 0.165 130.000 0.000 1.000   NA
 7473019 7473020 SDEG_1437 SDEG_1438   pepB FALSE 0.104 181.000 0.000 1.000   NA
 7473020 7473021 SDEG_1438 SDEG_1439 pepB   TRUE 0.940 11.000 0.204 NA   NA
 7473021 7473022 SDEG_1439 SDEG_1440     FALSE 0.304 115.000 0.056 NA   NA
 7473022 7473023 SDEG_1440 SDEG_1441     TRUE 0.893 -9.000 0.000 NA   NA
 7473023 7473024 SDEG_1441 SDEG_1442     FALSE 0.268 92.000 0.020 NA   NA
 7473024 7473025 SDEG_1442 SDEG_1443   nagB FALSE 0.280 104.000 0.051 1.000 N NA
 7473026 7473027 SDEG_1444 SDEG_1445 queA   TRUE 0.848 5.000 0.004 NA   NA
 7473028 7473029 SDEG_1446 SDEG_1447   sodA FALSE 0.122 167.000 0.000 1.000   NA
 7473029 7473030 SDEG_1447 SDEG_1448 sodA holA FALSE 0.219 97.000 0.012 1.000 N NA
 7473030 7473031 SDEG_1448 SDEG_1449 holA comEC TRUE 0.471 81.000 0.163 1.000   NA
 7473031 7473032 SDEG_1449 SDEG_1450 comEC comEA TRUE 0.958 -19.000 0.130 1.000   NA
 7473032 7473033 SDEG_1450 SDEG_1451 comEA   FALSE 0.022 397.000 0.014 1.000 N NA
 7473034 7473035 SDEG_1452 SDEG_1453     TRUE 0.971 -10.000 0.209 1.000   NA
 7473036 7473037 SDEG_1454 SDEG_1455   deaD FALSE 0.187 128.000 0.007 1.000 N NA
 7473037 7473038 SDEG_1455 SDEG_1456 deaD   FALSE 0.051 229.000 0.000 NA N NA
 7473038 7473039 SDEG_1456 SDEG_1457     TRUE 0.982 24.000 0.400 NA Y NA
 7473039 7473040 SDEG_1457 SDEG_1458     TRUE 0.988 -7.000 0.067 1.000 Y NA
 7473040 7473041 SDEG_1458 SDEG_1459     FALSE 0.076 208.000 0.000 NA   NA
 7473041 7473042 SDEG_1459 SDEG_1460   prfC FALSE 0.193 128.000 0.003 NA   NA
 7473042 7473043 SDEG_1460 SDEG_1461 prfC   FALSE 0.058 248.000 0.003 NA   NA
 7473043 7473044 SDEG_1461 SDEG_1462   murF FALSE 0.339 98.000 0.078 NA   NA
 7473044 7473045 SDEG_1462 SDEG_1463 murF ddl TRUE 0.737 206.000 0.046 0.008 Y NA
 7473045 7473046 SDEG_1463 SDEG_1464 ddl recR FALSE 0.137 172.000 0.010 1.000 N NA
 7473046 7473047 SDEG_1464 SDEG_1465 recR ftsI TRUE 0.835 12.000 0.013 1.000 N NA
 7473047 7473048 SDEG_1465 SDEG_1466 ftsI   FALSE 0.260 107.000 0.034 1.000 N NA
 7473048 7473049 SDEG_1466 SDEG_1467     TRUE 0.365 100.000 0.105 NA   NA
 7473049 7473050 SDEG_1467 SDEG_1468     TRUE 0.367 102.000 0.107 NA   NA
 7473050 7473051 SDEG_1468 SDEG_1469     FALSE 0.236 110.000 0.012 1.000   NA
 7473051 7473052 SDEG_1469 SDEG_1470     FALSE 0.065 210.000 0.000 1.000 N NA
 7473054 7473055 SDEG_1472 SDEG_1473     FALSE 0.322 72.000 0.018 NA   NA
 7473056 7473057 SDEG_1474 SDEG_1475     TRUE 0.745 70.000 0.600 NA   NA
 7473058 7473059 SDEG_1476 SDEG_1477     TRUE 0.422 99.000 0.156 NA   NA
 7473059 7473060 SDEG_1477 SDEG_1478     TRUE 0.990 -22.000 0.828 NA   NA
 7473060 7473061 SDEG_1478 SDEG_1479     TRUE 0.966 -37.000 0.203 NA   NA
 7473061 7473062 SDEG_1479 SDEG_1480     FALSE 0.058 229.000 0.000 NA   NA
 7473062 7473063 SDEG_1480 SDEG_1481   recN FALSE 0.078 207.000 0.000 NA   NA
 7473063 7473064 SDEG_1481 SDEG_1482 recN argR1 TRUE 0.844 16.000 0.037 1.000 N NA
 7473064 7473065 SDEG_1482 SDEG_1483 argR1   TRUE 0.924 -46.000 0.048 1.000 N NA
 7473065 7473066 SDEG_1483 SDEG_1484   fps TRUE 0.939 -7.000 0.058 1.000 N NA
 7473066 7473067 SDEG_1484 SDEG_1485 fps xseB TRUE 0.937 0.000 0.100 1.000 N NA
 7473067 7473068 SDEG_1485 SDEG_1486 xseB xseA TRUE 0.999 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 7473068 7473069 SDEG_1486 SDEG_1487 xseA   FALSE 0.155 151.000 0.005 NA N NA
 7473069 7473070 SDEG_1487 SDEG_1488     TRUE 0.922 -3.000 0.030 NA N NA
 7473070 7473071 SDEG_1488 SDEG_1489     FALSE 0.142 173.000 0.013 1.000 N NA
 7473071 7473072 SDEG_1489 SDEG_1490   phr FALSE 0.149 153.000 0.004 1.000 N NA
 7473072 7473073 SDEG_1490 SDEG_1491 phr   FALSE 0.090 193.000 0.000 NA   NA
 7473073 7473074 SDEG_1491 SDEG_1492   feoB TRUE 0.929 0.000 0.057 NA   NA
 7473074 7473075 SDEG_1492 SDEG_1493 feoB feoA TRUE 0.997 -3.000 0.871 1.000 Y NA
 7473075 7473076 SDEG_1493 SDEG_1494 feoA artP FALSE 0.118 198.000 0.022 1.000 N NA
 7473076 7473077 SDEG_1494 SDEG_1495 artP artQ TRUE 0.995 0.000 0.640 1.000 Y NA
 7473078 7473079 SDEG_1496 SDEG_1497 clpE mutT FALSE 0.308 118.000 0.079 1.000 N NA
 7473079 7473080 SDEG_1497 SDEG_1498 mutT   TRUE 0.663 50.000 0.114 NA   NA
 7473081 7473082 SDEG_1499 SDEG_1500 ileS divIVAS FALSE 0.050 266.000 0.012 NA N NA
 7473082 7473083 SDEG_1500 SDEG_1501 divIVAS   TRUE 0.973 10.000 0.579 NA   NA
 7473083 7473084 SDEG_1501 SDEG_1502     TRUE 0.970 0.000 0.287 1.000   NA
 7473084 7473085 SDEG_1502 SDEG_1503     TRUE 0.964 6.000 0.370 NA   NA
 7473085 7473086 SDEG_1503 SDEG_1504     TRUE 0.955 1.000 0.194 NA   NA
 7473086 7473087 SDEG_1504 SDEG_1505   ftsZ TRUE 0.893 3.000 0.030 NA   NA
 7473087 7473088 SDEG_1505 SDEG_1506 ftsZ ftsA TRUE 0.984 24.000 0.460 1.000 Y NA
 7473088 7473089 SDEG_1506 SDEG_1507 ftsA ftsQ FALSE 0.318 211.000 0.389 NA N NA
 7473089 7473090 SDEG_1507 SDEG_1508 ftsQ ftsQ TRUE 0.866 -187.000 0.000 NA   NA
 7473090 7473091 SDEG_1508 SDEG_1509 ftsQ murG TRUE 0.850 1.000 0.000 NA   NA
 7473091 7473092 SDEG_1509 SDEG_1510 murG murD TRUE 0.985 0.000 0.060 1.000 Y NA
 7473092 7473093 SDEG_1510 SDEG_1511 murD   FALSE 0.054 235.000 0.000 NA   NA
 7473093 7473094 SDEG_1511 SDEG_1512     FALSE 0.045 253.000 0.000 NA   NA
 7473094 7473095 SDEG_1512 SDEG_1513   typA FALSE 0.247 99.000 0.015 NA   NA
 7473095 7473096 SDEG_1513 SDEG_1514 typA   FALSE 0.108 182.000 0.003 NA N NA
 7473096 7473097 SDEG_1514 SDEG_1515   glcK TRUE 0.887 10.000 0.064 NA N NA
 7473097 7473098 SDEG_1515 SDEG_1516 glcK   TRUE 0.972 5.000 0.496 NA   NA
 7473098 7473099 SDEG_1516 SDEG_1517     FALSE 0.296 124.000 0.058 NA   NA
 7473101 7473102 SDEG_1519 SDEG_1520     TRUE 0.999 -19.000 0.857 0.012 Y NA
 7473102 7473103 SDEG_1520 SDEG_1521     TRUE 0.980 0.000 0.500 NA   NA
 7473103 7473104 SDEG_1521 SDEG_1522     TRUE 0.934 4.000 0.136 NA   NA
 7473104 7473105 SDEG_1522 SDEG_1523     TRUE 0.545 139.000 0.000 1.000 Y NA
 7473105 7473106 SDEG_1523 SDEG_1524     TRUE 0.991 -13.000 0.911 1.000   NA
 7473106 7473107 SDEG_1524 SDEG_1525     TRUE 0.357 65.000 0.018 1.000   NA
 7473107 7473108 SDEG_1525 SDEG_1526     TRUE 0.679 95.000 0.045 NA Y NA
 7473108 7473109 SDEG_1526 SDEG_1527     TRUE 0.867 5.000 0.012 NA   NA
 7473109 7473110 SDEG_1527 SDEG_1528     TRUE 0.877 4.000 0.016 NA   NA
 7473110 7473111 SDEG_1528 SDEG_1529     FALSE 0.044 259.000 0.000 NA   NA
 7473111 7473112 SDEG_1529 SDEG_1530     TRUE 0.786 15.000 0.000 NA   NA
 7473113 7473114 SDEG_1531 SDEG_1532     TRUE 0.645 65.000 0.000 0.026   NA
 7473115 7473116 SDEG_1533 SDEG_1534 rbsB rbsA TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7473116 7473117 SDEG_1534 SDEG_1535 rbsA rbsD TRUE 0.937 16.000 0.243 1.000   NA
 7473117 7473118 SDEG_1535 SDEG_1536 rbsD rbsK TRUE 0.991 -25.000 0.183 1.000 Y NA
 7473118 7473119 SDEG_1536 SDEG_1537 rbsK   TRUE 0.974 -7.000 0.281 1.000 N NA
 7473119 7473120 SDEG_1537 SDEG_1538     FALSE 0.029 281.000 0.000 1.000 N NA
 7473120 7473121 SDEG_1538 SDEG_1539   coaD TRUE 0.936 -13.000 0.052 1.000 N NA
 7473121 7473122 SDEG_1539 SDEG_1540 coaD   TRUE 0.979 -10.000 0.367 1.000 N NA
 7473122 7473123 SDEG_1540 SDEG_1541   asnA FALSE 0.110 185.000 0.006 1.000 N NA
 7473123 7473124 SDEG_1541 SDEG_1542 asnA arcC FALSE 0.134 327.000 0.000 1.000 Y NA
 7473126 7473127 SDEG_1544 SDEG_1545     TRUE 0.905 17.000 0.140 NA   NA
 7473127 7473128 SDEG_1545 SDEG_1546   arcB TRUE 0.361 113.000 0.104 NA   NA
 7473128 7473129 SDEG_1546 SDEG_1547 arcB   FALSE 0.343 124.000 0.104 1.000   NA
 7473129 7473130 SDEG_1547 SDEG_1548   arcA FALSE 0.309 100.000 0.056 1.000   NA
 7473130 7473131 SDEG_1548 SDEG_1549 arcA   FALSE 0.031 276.000 0.000 1.000 N NA
 7473133 7473134 SDEG_1551 SDEG_1552     TRUE 0.838 14.000 0.009 NA   NA
 7473134 7473135 SDEG_1552 SDEG_1553   yesM FALSE 0.283 73.000 0.007 NA   NA
 7473135 7473136 SDEG_1553 SDEG_1554 yesM yesN TRUE 0.995 -3.000 0.480 0.012   NA
 7473136 7473137 SDEG_1554 SDEG_1555 yesN msrA TRUE 0.518 88.000 0.240 1.000   NA
 7473137 7473138 SDEG_1555 SDEG_1556 msrA tipA TRUE 0.978 43.000 0.875 1.000 Y NA
 7473138 7473139 SDEG_1556 SDEG_1557 tipA ccdA TRUE 0.966 42.000 0.500 1.000 Y NA
 7473139 7473140 SDEG_1557 SDEG_1558 ccdA corA FALSE 0.196 220.000 0.000 0.066 N NA
 7473140 7473141 SDEG_1558 SDEG_1559 corA   TRUE 0.585 92.000 0.375 1.000   NA
 7473142 7473143 SDEG_1560 SDEG_1561     FALSE 0.156 141.000 0.000 NA   NA
 7473144 7473145 SDEG_1562 SDEG_1563 valS   TRUE 0.874 2.000 0.008 NA   NA
 7473145 7473146 SDEG_1563 SDEG_1564     TRUE 0.930 -24.000 0.033 NA   NA
 7473146 7473147 SDEG_1564 SDEG_1565     TRUE 0.770 14.000 0.000 NA N NA
 7473147 7473148 SDEG_1565 SDEG_1566     FALSE 0.019 355.000 0.000 NA   NA
 7473148 7473149 SDEG_1566 SDEG_1567     TRUE 0.913 21.000 0.214 NA   NA
 7473150 7473151 SDEG_1568 SDEG_1569   norM2 TRUE 0.900 14.000 0.103 1.000 N NA
 7473151 7473152 SDEG_1569 SDEG_1570 norM2   FALSE 0.184 96.000 0.000 NA   NA
 7473152 7473153 SDEG_1570 SDEG_1571   aroA.2 FALSE 0.014 506.000 0.000 NA   NA
 7473153 7473154 SDEG_1571 SDEG_1572 aroA.2 aroB TRUE 0.955 50.000 0.003 0.002 Y NA
 7473157 7473158 SDEG_1575 SDEG_1576   aroE FALSE 0.155 142.000 0.000 NA   NA
 7473158 7473159 SDEG_1576 SDEG_1577 aroE lacZ FALSE 0.297 99.000 0.061 1.000 N NA
 7473159 7473160 SDEG_1577 SDEG_1578 lacZ yesN TRUE 0.955 -70.000 0.167 1.000 N NA
 7473160 7473161 SDEG_1578 SDEG_1579 yesN yesM TRUE 0.997 0.000 0.167 0.012 Y NA
 7473161 7473162 SDEG_1579 SDEG_1580 yesM   TRUE 0.988 -13.000 0.667 NA   NA
 7473162 7473163 SDEG_1580 SDEG_1581     FALSE 0.026 308.000 0.000 NA   NA
 7473163 7473164 SDEG_1581 SDEG_1582     TRUE 0.938 80.000 0.333 0.031 Y NA
 7473164 7473165 SDEG_1582 SDEG_1583     TRUE 0.998 10.000 0.917 0.031 Y NA
 7473166 7473167 SDEG_1584 SDEG_1585     TRUE 0.987 4.000 0.200 1.000 Y NA
 7473168 7473169 SDEG_1586 SDEG_1587     FALSE 0.018 373.000 0.000 NA   NA
 7473169 7473170 SDEG_1587 SDEG_1588   hyl TRUE 0.887 25.000 0.182 1.000   NA
 7473170 7473171 SDEG_1588 SDEG_1589 hyl   TRUE 0.774 51.000 0.286 1.000   NA
 7473172 7473173 SDEG_1590 SDEG_1591     TRUE 0.932 15.000 0.194 1.000   NA
 7473174 7473175 SDEG_1592 SDEG_1593   pat TRUE 0.887 -19.000 0.000 1.000   NA
 7473175 7473176 SDEG_1593 SDEG_1594 pat   FALSE 0.009 842.000 0.000 NA N NA
 7473176 7473177 SDEG_1594 SDEG_1595     FALSE 0.106 170.000 0.000 NA N NA
 7473177 7473178 SDEG_1595 SDEG_1596     FALSE 0.335 57.000 0.000 1.000   NA
 7473178 7473179 SDEG_1596 SDEG_1597     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7473179 7473180 SDEG_1597 SDEG_1598     TRUE 0.974 38.000 0.588 NA Y NA
 7473181 7473182 SDEG_1599 SDEG_1600     FALSE 0.197 88.000 0.000 NA   NA
 7473183 7473184 SDEG_1601 SDEG_1602     TRUE 0.840 2.000 0.000 NA   NA
 7473184 7473185 SDEG_1602 SDEG_1603     FALSE 0.024 323.000 0.000 NA   NA
 7473185 7473186 SDEG_1603 SDEG_1604     TRUE 0.892 -6.000 0.000 NA   NA
 7473186 7473187 SDEG_1604 SDEG_1605     FALSE 0.134 190.000 0.016 NA   NA
 7473188 7473189 SDEG_1606 SDEG_1607     TRUE 0.866 0.000 0.000 NA   NA
 7473189 7473190 SDEG_1607 SDEG_1608     TRUE 0.881 -28.000 0.000 1.000   NA
 7473191 7473192 SDEG_1609 SDEG_1610     TRUE 0.839 2.000 0.000 1.000   NA
 7473192 7473193 SDEG_1610 SDEG_1611     TRUE 0.985 0.000 0.667 NA   NA
 7473193 7473194 SDEG_1611 SDEG_1612     TRUE 0.976 13.000 0.667 NA   NA
 7473194 7473195 SDEG_1612 SDEG_1613     TRUE 0.991 -28.000 1.000 NA   NA
 7473195 7473196 SDEG_1613 SDEG_1614     TRUE 0.946 16.000 0.300 NA   NA
 7473196 7473197 SDEG_1614 SDEG_1615     TRUE 0.939 11.000 0.200 NA   NA
 7473197 7473198 SDEG_1615 SDEG_1616     TRUE 0.978 1.000 0.500 NA   NA
 7473198 7473199 SDEG_1616 SDEG_1617     TRUE 0.940 1.000 0.125 NA   NA
 7473199 7473200 SDEG_1617 SDEG_1618     FALSE 0.067 219.000 0.000 NA   NA
 7473200 7473201 SDEG_1618 SDEG_1619     FALSE 0.261 66.000 0.000 NA   NA
 7473201 7473202 SDEG_1619 SDEG_1620     TRUE 0.893 -7.000 0.000 NA   NA
 7473202 7473203 SDEG_1620 SDEG_1621     TRUE 0.991 -27.000 0.929 NA   NA
 7473203 7473204 SDEG_1621 SDEG_1622     TRUE 0.922 12.000 0.134 NA   NA
 7473204 7473205 SDEG_1622 SDEG_1623     TRUE 0.887 12.000 0.052 NA   NA
 7473205 7473206 SDEG_1623 SDEG_1624     TRUE 0.984 2.000 0.800 NA   NA
 7473206 7473207 SDEG_1624 SDEG_1625     TRUE 0.992 -3.000 1.000 NA   NA
 7473207 7473208 SDEG_1625 SDEG_1626     TRUE 0.975 -3.000 0.286 NA   NA
 7473208 7473209 SDEG_1626 SDEG_1627     TRUE 0.819 14.000 0.002 NA   NA
 7473209 7473210 SDEG_1627 SDEG_1628     TRUE 0.825 12.000 0.002 NA   NA
 7473210 7473211 SDEG_1628 SDEG_1629     TRUE 0.951 18.000 0.400 NA   NA
 7473211 7473212 SDEG_1629 SDEG_1630     FALSE 0.085 201.000 0.000 NA   NA
 7473212 7473213 SDEG_1630 SDEG_1631     TRUE 0.971 7.000 0.500 NA   NA
 7473213 7473214 SDEG_1631 SDEG_1632     TRUE 0.968 -31.000 0.214 NA   NA
 7473214 7473215 SDEG_1632 SDEG_1633     TRUE 0.946 0.000 0.118 NA   NA
 7473215 7473216 SDEG_1633 SDEG_1634     TRUE 0.958 -10.000 0.118 NA   NA
 7473218 7473219 SDEG_1636 SDEG_1637     TRUE 0.513 40.000 0.000 NA   NA
 7473219 7473220 SDEG_1637 SDEG_1638     FALSE 0.062 223.000 0.000 NA   NA
 7473220 7473221 SDEG_1638 SDEG_1639     TRUE 0.893 -10.000 0.000 NA   NA
 7473221 7473222 SDEG_1639 SDEG_1640     TRUE 0.828 4.000 0.000 NA   NA
 7473222 7473223 SDEG_1640 SDEG_1641     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7473223 7473224 SDEG_1641 SDEG_1642   orf80 TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7473224 7473225 SDEG_1642 SDEG_1643 orf80   TRUE 0.424 50.000 0.000 NA   NA
 7473225 7473226 SDEG_1643 SDEG_1644     TRUE 0.893 -7.000 0.000 NA   NA
 7473226 7473227 SDEG_1644 SDEG_1645     TRUE 0.887 -3.000 0.000 NA   NA
 7473227 7473228 SDEG_1645 SDEG_1646     TRUE 0.992 -3.000 1.000 NA   NA
 7473228 7473229 SDEG_1646 SDEG_1647     TRUE 0.924 -3.000 0.018 NA   NA
 7473229 7473230 SDEG_1647 SDEG_1648     TRUE 0.909 0.000 0.018 NA   NA
 7473230 7473231 SDEG_1648 SDEG_1649   ssb TRUE 0.818 6.000 0.000 NA   NA
 7473231 7473232 SDEG_1649 SDEG_1650 ssb ssb1 TRUE 0.959 -7.000 0.125 NA   NA
 7473232 7473233 SDEG_1650 SDEG_1651 ssb1   TRUE 0.940 1.000 0.125 NA   NA
 7473233 7473234 SDEG_1651 SDEG_1652     TRUE 0.928 21.000 0.286 NA   NA
 7473234 7473235 SDEG_1652 SDEG_1653     TRUE 0.988 -13.000 0.667 NA   NA
 7473235 7473236 SDEG_1653 SDEG_1654     TRUE 0.976 10.000 0.667 NA   NA
 7473236 7473237 SDEG_1654 SDEG_1655     TRUE 0.988 -9.000 0.667 NA   NA
 7473237 7473238 SDEG_1655 SDEG_1656     TRUE 0.988 -13.000 0.667 NA   NA
 7473238 7473239 SDEG_1656 SDEG_1657     TRUE 0.850 1.000 0.000 NA   NA
 7473239 7473240 SDEG_1657 SDEG_1658     TRUE 0.984 -19.000 0.500 NA   NA
 7473240 7473241 SDEG_1658 SDEG_1659     TRUE 0.945 31.000 0.667 NA   NA
 7473241 7473242 SDEG_1659 SDEG_1660     FALSE 0.165 130.000 0.000 1.000   NA
 7473243 7473244 SDEG_1661 SDEG_1662     TRUE 0.978 -16.000 0.333 NA   NA
 7473244 7473245 SDEG_1662 SDEG_1663     TRUE 0.809 9.000 0.000 NA   NA
 7473245 7473246 SDEG_1663 SDEG_1664     TRUE 0.923 37.000 0.667 NA   NA
 7473246 7473247 SDEG_1664 SDEG_1665   int TRUE 0.978 -73.000 0.400 NA   NA
 7473247 7473248 SDEG_1665 SDEG_1666 int recX FALSE 0.170 148.000 0.003 1.000   NA
 7473248 7473249 SDEG_1666 SDEG_1667 recX   FALSE 0.301 82.000 0.025 NA   NA
 7473249 7473250 SDEG_1667 SDEG_1668     TRUE 0.527 54.000 0.051 NA   NA
 7473251 7473252 SDEG_1669 SDEG_1670     TRUE 0.786 15.000 0.000 NA   NA
 7473252 7473253 SDEG_1670 SDEG_1671     TRUE 0.542 37.000 0.000 NA   NA
 7473253 7473254 SDEG_1671 SDEG_1672     TRUE 0.802 11.000 0.000 NA   NA
 7473254 7473255 SDEG_1672 SDEG_1673     TRUE 0.818 6.000 0.000 NA   NA
 7473255 7473256 SDEG_1673 SDEG_1674     TRUE 0.616 32.000 0.000 NA   NA
 7473256 7473257 SDEG_1674 SDEG_1675     TRUE 0.738 19.000 0.000 NA   NA
 7473257 7473258 SDEG_1675 SDEG_1676     TRUE 0.772 16.000 0.000 NA   NA
 7473258 7473259 SDEG_1676 SDEG_1677     FALSE 0.185 95.000 0.000 NA   NA
 7473259 7473260 SDEG_1677 SDEG_1678     FALSE 0.026 307.000 0.000 NA   NA
 7473260 7473261 SDEG_1678 SDEG_1679     TRUE 0.410 51.000 0.000 NA   NA
 7473261 7473262 SDEG_1679 SDEG_1680     FALSE 0.028 302.000 0.000 NA   NA
 7473262 7473263 SDEG_1680 SDEG_1681     FALSE 0.151 124.000 0.000 NA N NA
 7473263 7473264 SDEG_1681 SDEG_1682   comFC TRUE 0.387 80.000 0.080 NA   NA
 7473264 7473265 SDEG_1682 SDEG_1683 comFC comFA TRUE 0.955 -28.000 0.130 NA   NA
 7473266 7473267 SDEG_1684 SDEG_1685   cysM FALSE 0.279 104.000 0.033 NA   NA
 7473268 7473269 SDEG_1686 SDEG_1687     TRUE 0.953 0.000 0.151 1.000   NA
 7473269 7473270 SDEG_1687 SDEG_1688   yvqC TRUE 0.879 25.000 0.164 1.000   NA
 7473270 7473271 SDEG_1688 SDEG_1689 yvqC yvqE TRUE 0.999 -13.000 0.853 0.011 Y NA
 7473271 7473272 SDEG_1689 SDEG_1690 yvqE yvqF TRUE 0.988 -3.000 0.679 NA   NA
 7473272 7473273 SDEG_1690 SDEG_1691 yvqF stk1 FALSE 0.268 127.000 0.039 NA   NA
 7473273 7473274 SDEG_1691 SDEG_1692 stk1 pppL TRUE 0.997 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 7473274 7473275 SDEG_1692 SDEG_1693 pppL sunL TRUE 0.697 38.000 0.074 1.000 N NA
 7473275 7473276 SDEG_1693 SDEG_1694 sunL fmt TRUE 0.993 -46.000 0.305 1.000 Y NA
 7473276 7473277 SDEG_1694 SDEG_1695 fmt priA TRUE 0.391 65.000 0.052 1.000 N NA
 7473277 7473278 SDEG_1695 SDEG_1696 priA   TRUE 0.650 64.000 0.032 0.072 N NA
 7473278 7473279 SDEG_1696 SDEG_1697   gmk TRUE 0.958 16.000 0.471 1.000 N NA
 7473279 7473280 SDEG_1697 SDEG_1698 gmk   FALSE 0.230 110.000 0.010 1.000   NA
 7473280 7473281 SDEG_1698 SDEG_1699     FALSE 0.198 130.000 0.006 1.000   NA
 7473282 7473283 SDEG_1700 SDEG_1701 atoB atoD.1 TRUE 0.777 84.000 0.150 1.000 Y NA
 7473283 7473284 SDEG_1701 SDEG_1702 atoD.1 atoA TRUE 0.935 110.000 0.200 0.001 Y NA
 7473284 7473285 SDEG_1702 SDEG_1703 atoA   TRUE 0.961 33.000 0.000 0.044 Y NA
 7473285 7473286 SDEG_1703 SDEG_1704     TRUE 0.963 3.000 0.333 1.000 N NA
 7473286 7473287 SDEG_1704 SDEG_1705   luxS FALSE 0.021 367.000 0.006 1.000 N NA
 7473288 7473289 SDEG_1706 SDEG_1707     TRUE 0.864 14.000 0.029 NA   NA
 7473289 7473290 SDEG_1707 SDEG_1708     FALSE 0.015 445.000 0.000 NA   NA
 7473290 7473291 SDEG_1708 SDEG_1709     TRUE 0.648 122.000 0.579 NA   NA
 7473292 7473293 SDEG_1710 SDEG_1711 recU pbp1A TRUE 0.978 -13.000 0.319 1.000   NA
 7473294 7473295 SDEG_1712 SDEG_1713 pepC nadE FALSE 0.135 181.000 0.017 1.000 N NA
 7473295 7473296 SDEG_1713 SDEG_1714 nadE   TRUE 0.998 -40.000 0.194 0.002 Y NA
 7473296 7473297 SDEG_1714 SDEG_1715     FALSE 0.172 170.000 0.032 1.000 N NA
 7473297 7473298 SDEG_1715 SDEG_1716     FALSE 0.209 150.000 0.033 1.000 N NA
 7473298 7473299 SDEG_1716 SDEG_1717     TRUE 0.518 63.000 0.117 NA   NA
 7473299 7473300 SDEG_1717 SDEG_1718     TRUE 0.570 104.000 0.364 NA   NA
 7473300 7473301 SDEG_1718 SDEG_1719     TRUE 0.994 -3.000 0.310 1.000 Y NA
 7473301 7473302 SDEG_1719 SDEG_1720     TRUE 0.862 144.000 0.143 0.030 Y NA
 7473302 7473303 SDEG_1720 SDEG_1721     FALSE 0.132 197.000 0.036 1.000 N NA
 7473305 7473306 SDEG_1723 SDEG_1724 mraY ftsI TRUE 0.979 2.000 0.038 1.000 Y NA
 7473306 7473307 SDEG_1724 SDEG_1725 ftsI ftsL TRUE 0.969 4.000 0.456 1.000 N NA
 7473307 7473308 SDEG_1725 SDEG_1726 ftsL mraW TRUE 0.940 -25.000 0.077 1.000 N NA
 7473308 7473309 SDEG_1726 SDEG_1727 mraW   TRUE 0.382 53.000 0.000 NA   NA
 7473309 7473310 SDEG_1727 SDEG_1728     FALSE 0.183 100.000 0.000 NA   NA
 7473310 7473311 SDEG_1728 SDEG_1729     TRUE 0.876 -49.000 0.000 NA   NA
 7473311 7473312 SDEG_1729 SDEG_1730   proA TRUE 0.884 -25.000 0.000 NA   NA
 7473312 7473313 SDEG_1730 SDEG_1731 proA   TRUE 0.998 -7.000 0.281 0.001 Y NA
 7473313 7473314 SDEG_1731 SDEG_1732   proB TRUE 0.377 59.000 0.006 NA   NA
 7473314 7473315 SDEG_1732 SDEG_1733 proB   TRUE 0.977 -37.000 0.341 NA   NA
 7473315 7473316 SDEG_1733 SDEG_1734     TRUE 0.817 33.000 0.136 NA   NA
 7473316 7473317 SDEG_1734 SDEG_1735   tkt FALSE 0.336 193.000 0.300 NA   NA
 7473317 7473318 SDEG_1735 SDEG_1736 tkt   TRUE 0.961 14.000 0.000 1.000 Y NA
 7473320 7473321 SDEG_1738 SDEG_1739     TRUE 0.981 -28.000 0.462 NA   NA
 7473321 7473322 SDEG_1739 SDEG_1740   glpF TRUE 0.569 105.000 0.364 1.000   NA
 7473322 7473323