MicrobesOnline Operon Predictions for Klebsiella pneumoniae NTUH-K2044

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7444171 7444172 KP1_0001 KP1_0002 mioC asnC FALSE 0.333 100.000 0.165 1.000 N NA
 7444174 7444175 KP1_0004 KP1_0005   yieN TRUE 0.969 -3.000 0.443 NA   NA
 7444176 7444177 KP1_0006 KP1_0007 kup rbsD FALSE 0.019 186.000 0.025 1.000 N NA
 7444177 7444178 KP1_0007 KP1_0008 rbsD rbsA TRUE 0.988 11.000 0.337 1.000 Y NA
 7444178 7444179 KP1_0008 KP1_0009 rbsA rbsC TRUE 0.994 6.000 0.504 1.000 Y NA
 7444179 7444180 KP1_0009 KP1_0010 rbsC rbsB TRUE 0.982 28.000 0.847 NA Y NA
 7444180 7444181 KP1_0010 KP1_0011 rbsB rbsK TRUE 0.802 104.000 0.347 NA Y NA
 7444181 7444182 KP1_0011 KP1_0012 rbsK rbsR TRUE 0.962 13.000 0.500 1.000 N NA
 7444183 7444184 KP1_0013 KP1_0014 yieO yieP TRUE 0.854 13.000 0.133 1.000   NA
 7444185 7444186 KP1_6001 KP1_6002 rrsA   FALSE 0.073 86.000 0.000 NA   NA
 7444186 7444187 KP1_6002 KP1_6003   rrlA FALSE 0.011 179.000 0.000 NA   NA
 7444187 7444188 KP1_6003 KP1_6004 rrlA rrfA FALSE 0.008 194.000 0.000 NA   NA
 7444189 7444190 KP1_0016 KP1_0017 mobB mobA TRUE 0.984 -3.000 0.002 0.003 Y NA
 7444191 7444192 KP1_0018 KP1_0019     FALSE 0.293 76.000 0.106 NA   NA
 7444192 7444193 KP1_0019 KP1_0022   dsbA TRUE 0.578 28.000 0.111 NA   NA
 7444197 7444198 KP1_0026 KP1_0027   hemN FALSE 0.041 189.000 0.107 NA   NA
 7444199 7444200 KP1_0028 KP1_0029 glnG glnL TRUE 0.994 9.000 0.587 1.000 Y NA
 7444200 7444201 KP1_0029 KP1_0030 glnL glnA FALSE 0.027 189.000 0.053 1.000 N NA
 7444202 7444203 KP1_0031 KP1_0032 bipA yihX FALSE 0.044 136.000 0.002 1.000   NA
 7444203 7444204 KP1_0032 KP1_0033 yihX rbn TRUE 0.635 -6.000 0.011 1.000   NA
 7444204 7444205 KP1_0033 KP1_0034 rbn dtd TRUE 0.837 -3.000 0.069 1.000   NA
 7444205 7444206 KP1_0034 KP1_0035 dtd yiiD TRUE 0.831 -3.000 0.065 1.000   NA
 7444208 7444209 KP1_0037 KP1_0038 yiiF ygiX TRUE 0.893 0.000 0.120 NA   NA
 7444210 7444211 KP1_0039 KP1_0040 fdhE fdoI TRUE 0.914 -3.000 0.182 NA N NA
 7444211 7444212 KP1_0040 KP1_0041 fdoI fdoH TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.002 Y NA
 7444212 7444213 KP1_0041 KP1_0043 fdoH fdoG TRUE 0.998 13.000 0.833 0.002 Y NA
 7444214 7444215 KP1_0046 KP1_0047 fdhD   FALSE 0.317 129.000 0.280 NA   NA
 7444215 7444216 KP1_0047 KP1_0048     FALSE 0.154 42.000 0.000 NA   NA
 7444216 7444217 KP1_0048 KP1_0049     TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7444217 7444218 KP1_0049 KP1_0050     TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7444218 7444219 KP1_0050 KP1_0051     TRUE 0.983 15.000 0.385 1.000 Y NA
 7444219 7444220 KP1_0051 KP1_0052     TRUE 0.988 -7.000 0.667 0.024   NA
 7444220 7444221 KP1_0052 KP1_0053     TRUE 0.885 -13.000 0.222 1.000   NA
 7444221 7444222 KP1_0053 KP1_0054     TRUE 0.911 23.000 0.500 NA   NA
 7444222 7444223 KP1_0054 KP1_0055     TRUE 0.795 10.000 0.066 NA   NA
 7444223 7444224 KP1_0055 KP1_0056     TRUE 0.768 -3.000 0.049 NA   NA
 7444225 7444226 KP1_0057 KP1_0058     TRUE 0.985 0.000 0.675 NA   NA
 7444227 7444228 KP1_0059 KP1_0061     TRUE 0.800 88.000 0.070 0.031 Y NA
 7444228 7444229 KP1_0061 KP1_0062     TRUE 0.605 116.000 0.538 1.000 N NA
 7444229 7444230 KP1_0062 KP1_0063     TRUE 0.927 -78.000 0.583 1.000 N NA
 7444231 7444232 KP1_0064 KP1_0065 yiiL   TRUE 0.801 -3.000 0.063 NA   NA
 7444232 7444233 KP1_0065 KP1_0066   rhaQ FALSE 0.200 90.000 0.061 1.000 N NA
 7444233 7444234 KP1_0066 KP1_0067 rhaQ rhaP TRUE 0.996 -3.000 0.515 0.081 Y NA
 7444234 7444235 KP1_0067 KP1_0068 rhaP   TRUE 0.996 -3.000 0.794 1.000 Y NA
 7444235 7444236 KP1_0068 KP1_0069   rhaS TRUE 0.666 146.000 0.446 NA Y NA
 7444236 7444237 KP1_0069 KP1_0070 rhaS rhaD TRUE 0.595 82.000 0.018 NA Y NA
 7444237 7444238 KP1_0070 KP1_0071 rhaD rhaA FALSE 0.518 150.000 0.247 1.000 Y NA
 7444238 7444239 KP1_0071 KP1_0072 rhaA rhaB TRUE 0.985 -9.000 0.387 1.000 Y NA
 7444240 7444241 KP1_0073 KP1_0074 rhaS rhaR TRUE 0.971 74.000 0.800 0.031 Y NA
 7444243 7444244 KP1_0076 KP1_0077 sodA   FALSE 0.378 73.000 0.129 1.000   NA
 7444245 7444246 KP1_0078 KP1_0079 cpxA cpxR TRUE 0.996 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 7444247 7444248 KP1_0080 KP1_0081 cpxP fieF FALSE 0.526 105.000 0.031 NA Y NA
 7444248 7444249 KP1_0081 KP1_0082 fieF pfkA FALSE 0.019 197.000 0.040 1.000 N NA
 7444250 7444251 KP1_0084 KP1_0085 menG menA TRUE 0.715 93.000 0.158 NA Y NA
 7444251 7444252 KP1_0085 KP1_0086 menA hslU FALSE 0.243 64.000 0.051 1.000 N NA
 7444252 7444253 KP1_0086 KP1_0088 hslU hslV TRUE 0.996 10.000 0.752 1.000 Y NA
 7444253 7444254 KP1_0088 KP1_0090 hslV ftsN FALSE 0.269 92.000 0.122 NA N NA
 7444254 7444255 KP1_0090 KP1_0091 ftsN cytR FALSE 0.437 94.000 0.245 NA N NA
 7444255 7444256 KP1_0091 KP1_0092 cytR priA FALSE 0.031 151.000 0.013 1.000 N NA
 7444259 7444260 KP1_0095 KP1_0096 metB metL TRUE 0.993 3.000 0.428 1.000 Y NA
 7444264 7444265 KP1_0101 KP1_0102   metF FALSE 0.008 229.000 0.000 1.000 N NA
 7444265 7444266 KP1_0102 KP1_0103 metF   FALSE 0.038 124.000 0.000 NA   NA
 7444267 7444268 KP1_0104 KP1_0105 gldA talC FALSE 0.151 55.000 0.000 1.000 N NA
 7444268 7444269 KP1_0105 KP1_0106 talC yijO FALSE 0.010 206.000 0.000 1.000 N NA
 7444271 7444272 KP1_0108 KP1_0109 ppc argE FALSE 0.012 259.000 0.053 1.000 N NA
 7444273 7444274 KP1_0110 KP1_0111 argC argB TRUE 0.991 7.000 0.097 0.002 Y NA
 7444274 7444275 KP1_0111 KP1_0112 argB argH FALSE 0.551 100.000 0.017 1.000 Y NA
 7444275 7444276 KP1_0112 KP1_6005 argH oxyS FALSE 0.127 50.000 0.000 NA   NA
 7444276 7444277 KP1_6005 KP1_0115 oxyS oxyR FALSE 0.158 41.000 0.000 NA   NA
 7444279 7444280 KP1_0117 KP1_0118 yijC   TRUE 0.947 16.000 0.508 NA   NA
 7444282 7444283 KP1_0120 KP1_0121   btuB FALSE 0.149 43.000 0.000 NA   NA
 7444283 7444284 KP1_0121 KP1_0122 btuB   FALSE 0.442 -55.000 0.025 1.000 N NA
 7444284 7444285 KP1_0122 KP1_6006   rrsB FALSE 0.002 397.000 0.000 NA   NA
 7444285 7444286 KP1_6006 KP1_6007 rrsB   FALSE 0.089 72.000 0.000 NA   NA
 7444286 7444287 KP1_6007 KP1_6008     FALSE 0.173 37.000 0.000 NA   NA
 7444287 7444288 KP1_6008 KP1_6009   rrlB FALSE 0.012 178.000 0.000 NA   NA
 7444288 7444289 KP1_6009 KP1_6010 rrlB rrfB FALSE 0.065 95.000 0.000 NA   NA
 7444289 7444290 KP1_6010 KP1_6011 rrfB   FALSE 0.111 56.000 0.000 NA   NA
 7444290 7444291 KP1_6011 KP1_6012     FALSE 0.116 54.000 0.000 NA   NA
 7444297 7444298 KP1_0129 KP1_0130 ilvG ilvM TRUE 0.995 -3.000 0.943 0.002   NA
 7444298 7444299 KP1_0130 KP1_0131 ilvM ilvE TRUE 0.855 17.000 0.205 1.000   NA
 7444299 7444300 KP1_0131 KP1_0132 ilvE ilvD TRUE 0.747 61.000 0.075 1.000 Y NA
 7444300 7444301 KP1_0132 KP1_0133 ilvD ilvA TRUE 0.980 3.000 0.106 1.000 Y NA
 7444304 7444305 KP1_0136 KP1_0137 ppiC ppiC TRUE 0.584 52.000 0.000 0.003   NA
 7444307 7444308 KP1_0139 KP1_0140     FALSE 0.099 63.000 0.000 NA   NA
 7444308 7444309 KP1_0140 KP1_0141     FALSE 0.047 131.000 0.000 1.000   NA
 7444309 7444310 KP1_0141 KP1_0142   gppA FALSE 0.397 20.000 0.000 1.000 N NA
 7444310 7444311 KP1_0142 KP1_0143 gppA rhlB FALSE 0.502 119.000 0.406 1.000 N NA
 7444312 7444313 KP1_0144 KP1_0145 trxA rho FALSE 0.017 259.000 0.087 1.000 N NA
 7444313 7444314 KP1_0145 KP1_0146 rho wecA FALSE 0.007 241.000 0.000 1.000 N NA
 7444314 7444315 KP1_0146 KP1_0147 wecA wzz TRUE 0.997 14.000 0.735 0.003 Y NA
 7444315 7444316 KP1_0147 KP1_0148 wzz wecB TRUE 0.977 57.000 0.677 0.003 Y NA
 7444316 7444317 KP1_0148 KP1_0149 wecB wecC TRUE 0.990 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 7444317 7444318 KP1_0149 KP1_0150 wecC rmlB TRUE 0.987 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 7444318 7444319 KP1_0150 KP1_0151 rmlB rmlA TRUE 0.995 19.000 0.739 0.002 Y NA
 7444319 7444320 KP1_0151 KP1_0152 rmlA wecD TRUE 0.798 -22.000 0.145 1.000   NA
 7444320 7444321 KP1_0152 KP1_0153 wecD wecE TRUE 0.949 6.000 0.248 1.000   NA
 7444321 7444322 KP1_0153 KP1_0154 wecE wzx TRUE 0.946 2.000 0.218 1.000   NA
 7444322 7444323 KP1_0154 KP1_0155 wzx wecF TRUE 0.981 -3.000 0.605 1.000   NA
 7444323 7444324 KP1_0155 KP1_0156 wecF wzy TRUE 0.984 -3.000 0.684 1.000   NA
 7444324 7444325 KP1_0156 KP1_0157 wzy wecG TRUE 0.863 12.000 0.126 1.000   NA
 7444325 7444326 KP1_0157 KP1_0158 wecG yifK FALSE 0.013 206.000 0.019 1.000 N NA
 7444326 7444327 KP1_0158 KP1_6013 yifK   FALSE 0.057 103.000 0.000 NA   NA
 7444327 7444328 KP1_6013 KP1_6014     FALSE 0.111 56.000 0.000 NA   NA
 7444328 7444329 KP1_6014 KP1_6015     FALSE 0.268 24.000 0.000 NA   NA
 7444329 7444330 KP1_6015 KP1_6016     FALSE 0.149 43.000 0.000 NA   NA
 7444331 7444332 KP1_0159 KP1_0160     TRUE 0.592 7.000 0.000 NA   NA
 7444332 7444333 KP1_0160 KP1_0161   hemX TRUE 0.982 4.000 0.144 1.000 Y NA
 7444333 7444334 KP1_0161 KP1_0162 hemX hemD TRUE 0.982 22.000 0.600 1.000 Y NA
 7444334 7444335 KP1_0162 KP1_0163 hemD hemC TRUE 0.993 -3.000 0.205 0.002 Y NA
 7444338 7444339 KP1_0167 KP1_0168   dapF FALSE 0.240 33.000 0.021 NA N NA
 7444339 7444340 KP1_0168 KP1_0169 dapF   TRUE 0.913 -3.000 0.175 NA   NA
 7444340 7444341 KP1_0169 KP1_0170   xerC TRUE 0.984 -3.000 0.714 NA   NA
 7444341 7444342 KP1_0170 KP1_0171 xerC yigB TRUE 0.970 0.000 0.367 1.000   NA
 7444342 7444343 KP1_0171 KP1_0172 yigB uvrD FALSE 0.430 58.000 0.128 1.000   NA
 7444343 7444344 KP1_0172 KP1_0173 uvrD corA FALSE 0.004 341.000 0.021 1.000 N NA
 7444345 7444346 KP1_0174 KP1_0176 rarD   FALSE 0.391 49.000 0.099 NA   NA
 7444347 7444348 KP1_0177 KP1_0178 pldA recQ FALSE 0.246 68.000 0.057 1.000 N NA
 7444348 7444349 KP1_0178 KP1_0179 recQ rhtC FALSE 0.228 62.000 0.043 1.000 N NA
 7444350 7444351 KP1_0180 KP1_0181   rhtB FALSE 0.043 163.000 0.062 NA   NA
 7444352 7444353 KP1_0182 KP1_0183 pldB   TRUE 0.835 45.000 0.524 1.000   NA
 7444353 7444354 KP1_0183 KP1_0184   yigM FALSE 0.218 89.000 0.067 1.000   NA
 7444355 7444356 KP1_0185 KP1_0186 metR   FALSE 0.089 86.000 0.012 NA   NA
 7444359 7444360 KP1_0189 KP1_0190 udp yigN FALSE 0.059 136.000 0.041 NA   NA
 7444360 7444361 KP1_0190 KP1_0191 yigN ubiE FALSE 0.188 71.000 0.047 NA   NA
 7444361 7444362 KP1_0191 KP1_0193 ubiE   TRUE 0.851 14.000 0.145 1.000   NA
 7444362 7444363 KP1_0193 KP1_0194   ubiB TRUE 0.971 -3.000 0.432 1.000   NA
 7444363 7444364 KP1_0194 KP1_0195 ubiB tatA FALSE 0.188 82.000 0.044 1.000   NA
 7444364 7444365 KP1_0195 KP1_0196 tatA tatB TRUE 0.988 4.000 0.246 1.000 Y NA
 7444365 7444366 KP1_0196 KP1_0197 tatB tatC TRUE 0.990 3.000 0.333 NA Y NA
 7444366 7444367 KP1_0197 KP1_0198 tatC tatD FALSE 0.454 45.000 0.121 NA N NA
 7444369 7444370 KP1_0200 KP1_0201 ubiD fre TRUE 0.789 50.000 0.090 NA Y NA
 7444371 7444372 KP1_0202 KP1_0203 fadA fadB TRUE 0.994 10.000 0.607 1.000 Y NA
 7444373 7444374 KP1_0204 KP1_0205 pepQ yigZ TRUE 0.911 0.000 0.127 1.000   NA
 7444374 7444375 KP1_0205 KP1_0206 yigZ trkH TRUE 0.665 39.000 0.202 1.000   NA
 7444375 7444376 KP1_0206 KP1_0207 trkH hemG TRUE 0.962 12.000 0.455 1.000 N NA
 7444376 7444377 KP1_0207 KP1_6017 hemG rrsC FALSE 0.002 388.000 0.000 NA   NA
 7444377 7444378 KP1_6017 KP1_6018 rrsC   FALSE 0.089 72.000 0.000 NA   NA
 7444378 7444379 KP1_6018 KP1_6019     FALSE 0.055 106.000 0.000 NA   NA
 7444379 7444380 KP1_6019 KP1_6020   rrlC FALSE 0.014 170.000 0.000 NA   NA
 7444380 7444381 KP1_6020 KP1_6021 rrlC rrfC FALSE 0.008 195.000 0.000 NA   NA
 7444381 7444382 KP1_6021 KP1_0209 rrfC murB FALSE 0.002 416.000 0.000 NA   NA
 7444382 7444383 KP1_0209 KP1_0210 murB birA TRUE 0.933 -3.000 0.211 1.000 N NA
 7444385 7444386 KP1_6022 KP1_6023     FALSE 0.531 11.000 0.000 NA   NA
 7444386 7444387 KP1_6023 KP1_6024     FALSE 0.047 116.000 0.000 NA   NA
 7444387 7444388 KP1_6024 KP1_6025     TRUE 0.597 6.000 0.000 NA   NA
 7444388 7444389 KP1_6025 KP1_0213   tufB FALSE 0.047 116.000 0.000 NA   NA
 7444389 7444390 KP1_0213 KP1_0214 tufB secE FALSE 0.003 337.000 0.002 1.000 N NA
 7444390 7444391 KP1_0214 KP1_0215 secE nusG TRUE 0.798 2.000 0.037 1.000 N NA
 7444391 7444392 KP1_0215 KP1_0217 nusG rplK FALSE 0.433 157.000 0.681 1.000 N NA
 7444392 7444393 KP1_0217 KP1_0218 rplK rplA TRUE 0.998 4.000 0.838 0.015 Y NA
 7444393 7444394 KP1_0218 KP1_0219 rplA rplJ FALSE 0.185 414.000 0.302 0.015 Y NA
 7444394 7444395 KP1_0219 KP1_0220 rplJ rplL TRUE 0.978 67.000 0.884 0.011 Y NA
 7444395 7444396 KP1_0220 KP1_0222 rplL rpoB FALSE 0.034 292.000 0.223 1.000   NA
 7444396 7444397 KP1_0222 KP1_0223 rpoB rpoC TRUE 0.932 77.000 0.851 0.001   NA
 7444397 7444398 KP1_0223 KP1_0224 rpoC dcuB FALSE 0.003 401.000 0.000 1.000   NA
 7444399 7444400 KP1_0225 KP1_0226 celC   TRUE 0.998 4.000 0.667 0.017 Y NA
 7444400 7444401 KP1_0226 KP1_0227     FALSE 0.018 173.000 0.000 1.000 N NA
 7444401 7444402 KP1_0227 KP1_0228     FALSE 0.017 156.000 0.000 NA   NA
 7444402 7444403 KP1_0228 KP1_0229   thiH FALSE 0.142 45.000 0.000 NA   NA
 7444403 7444404 KP1_0229 KP1_0230 thiH thiG TRUE 0.994 -3.000 0.277 0.004 Y NA
 7444404 7444405 KP1_0230 KP1_0231 thiG thiS TRUE 0.978 2.000 0.087 1.000 Y NA
 7444405 7444406 KP1_0231 KP1_0232 thiS thiF TRUE 0.987 -16.000 0.548 1.000 Y NA
 7444406 7444407 KP1_0232 KP1_0233 thiF thiE TRUE 0.980 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 7444407 7444408 KP1_0233 KP1_0234 thiE thiC TRUE 0.990 0.000 0.063 0.004 Y NA
 7444408 7444409 KP1_0234 KP1_0235 thiC rsd FALSE 0.005 263.000 0.000 1.000 N NA
 7444410 7444411 KP1_0236 KP1_0237 nudC hemE FALSE 0.319 41.000 0.040 1.000 N NA
 7444411 7444412 KP1_0237 KP1_0238 hemE nfi TRUE 0.652 13.000 0.028 1.000 N NA
 7444412 7444413 KP1_0238 KP1_0239 nfi   FALSE 0.397 43.000 0.086 NA   NA
 7444413 7444414 KP1_0239 KP1_0241     FALSE 0.145 187.000 0.355 NA   NA
 7444414 7444415 KP1_0241 KP1_0242     TRUE 0.964 7.000 0.375 NA   NA
 7444416 7444417 KP1_0243 KP1_0244 zraP   FALSE 0.019 151.000 0.000 NA   NA
 7444418 7444419 KP1_0245 KP1_0246 zraS zraR TRUE 0.925 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 7444420 7444421 KP1_0247 KP1_0248 purD purH TRUE 0.971 16.000 0.238 1.000 Y NA
 7444422 7444423 KP1_6026 KP1_6027 rrsD   FALSE 0.073 86.000 0.000 NA   NA
 7444423 7444424 KP1_6027 KP1_6028   rrlD FALSE 0.011 183.000 0.000 NA   NA
 7444424 7444425 KP1_6028 KP1_6029 rrlD rrfD FALSE 0.008 194.000 0.000 NA   NA
 7444429 7444430 KP1_0253 KP1_0254 aceB aceA TRUE 0.701 65.000 0.043 1.000 Y NA
 7444430 7444431 KP1_0254 KP1_0255 aceA aceK FALSE 0.078 103.000 0.000 1.000 N NA
 7444433 7444434 KP1_0257 KP1_0258 metH yjbB FALSE 0.050 130.000 0.006 1.000 N NA
 7444437 7444438 KP1_0261 KP1_0262   pstA FALSE 0.046 117.000 0.000 NA   NA
 7444438 7444439 KP1_0262 KP1_0263 pstA lysC FALSE 0.136 139.000 0.120 1.000   NA
 7444441 7444442 KP1_0265 KP1_0267 lpxD rimI TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 7444442 7444443 KP1_0267 KP1_0268 rimI   FALSE 0.142 45.000 0.000 NA   NA
 7444443 7444444 KP1_0268 KP1_0269     FALSE 0.453 21.000 0.033 NA   NA
 7444444 7444445 KP1_0269 KP1_0270   ygaZ TRUE 0.631 -7.000 0.033 NA   NA
 7444445 7444446 KP1_0270 KP1_0271 ygaZ   FALSE 0.122 83.000 0.029 NA   NA
 7444448 7444449 KP1_0273 KP1_0274 malG malF TRUE 0.996 15.000 0.814 0.080 Y NA
 7444449 7444450 KP1_0274 KP1_0275 malF malE FALSE 0.456 118.000 0.000 1.000 Y NA
 7444451 7444452 KP1_0276 KP1_0277 malK lamB TRUE 0.825 84.000 0.133 0.096 Y NA
 7444452 7444453 KP1_0277 KP1_0278 lamB malM FALSE 0.297 115.000 0.171 1.000   NA
 7444453 7444454 KP1_0278 KP1_0279 malM ubiC FALSE 0.230 41.000 0.025 NA   NA
 7444454 7444455 KP1_0279 KP1_0280 ubiC ubiA TRUE 0.978 13.000 0.248 NA Y NA
 7444457 7444458 KP1_0282 KP1_0283 dgkA lexA FALSE 0.215 123.000 0.141 1.000 N NA
 7444458 7444459 KP1_0283 KP1_0284 lexA dinF FALSE 0.366 31.000 0.033 1.000 N NA
 7444463 7444464 KP1_0288 KP1_0289   khe FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 7444464 7444465 KP1_0289 KP1_0290 khe yjbN FALSE 0.063 104.000 0.006 NA   NA
 7444465 7444466 KP1_0290 KP1_0292 yjbN   FALSE 0.149 110.000 0.070 NA   NA
 7444468 7444469 KP1_0294 KP1_0295 dnaB alr TRUE 0.798 32.000 0.317 1.000 N NA
 7444469 7444470 KP1_0295 KP1_0296 alr tyrB FALSE 0.210 135.000 0.181 1.000 N NA
 7444470 7444471 KP1_0296 KP1_0297 tyrB aphA FALSE 0.029 170.000 0.026 1.000   NA
 7444471 7444472 KP1_0297 KP1_0299 aphA   FALSE 0.038 131.000 0.009 NA   NA
 7444472 7444473 KP1_0299 KP1_0300     TRUE 0.686 4.000 0.018 NA   NA
 7444477 7444478 KP1_0304 KP1_0306   fepA FALSE 0.016 160.000 0.000 NA   NA
 7444479 7444480 KP1_0307 KP1_0308     TRUE 0.932 4.000 0.000 0.013   NA
 7444480 7444481 KP1_0308 KP1_0309     FALSE 0.249 34.000 0.000 1.000   NA
 7444481 7444482 KP1_0309 KP1_0311     FALSE 0.002 374.000 0.000 NA   NA
 7444483 7444484 KP1_0312 KP1_0313     FALSE 0.004 255.000 0.000 NA   NA
 7444485 7444486 KP1_0314 KP1_0315     TRUE 0.914 -10.000 0.273 1.000 N NA
 7444486 7444487 KP1_0315 KP1_0316     TRUE 0.950 -3.000 0.273 1.000   NA
 7444488 7444489 KP1_0317 KP1_0319 potA   TRUE 0.905 -81.000 0.273 0.079   NA
 7444489 7444490 KP1_0319 KP1_0320     TRUE 0.688 61.000 0.190 0.079   NA
 7444490 7444491 KP1_0320 KP1_0321     TRUE 0.996 -3.000 0.560 0.079 Y NA
 7444493 7444494 KP1_0323 KP1_0324     FALSE 0.013 173.000 0.000 NA   NA
 7444496 7444497 KP1_0326 KP1_0327 soxR   FALSE 0.006 260.000 0.028 NA N NA
 7444497 7444498 KP1_0327 KP1_0328     FALSE 0.002 389.000 0.000 NA   NA
 7444498 7444499 KP1_0328 KP1_0329   yjcE FALSE 0.121 148.000 0.130 1.000   NA
 7444501 7444502 KP1_0331 KP1_0332     TRUE 0.987 -3.000 0.840 NA   NA
 7444502 7444503 KP1_0332 KP1_0334     FALSE 0.001 511.000 0.000 NA N NA
 7444503 7444504 KP1_0334 KP1_0335     TRUE 0.965 61.000 1.000 1.000 Y NA
 7444504 7444505 KP1_0335 KP1_0336     TRUE 0.986 -46.000 0.750 1.000 Y NA
 7444505 7444506 KP1_0336 KP1_0337     TRUE 0.993 -9.000 0.750 1.000 Y NA
 7444506 7444507 KP1_0337 KP1_0338     TRUE 0.974 -61.000 0.667 0.006   NA
 7444508 7444509 KP1_0340 KP1_0341 actP   TRUE 0.984 -3.000 0.733 NA   NA
 7444509 7444510 KP1_0341 KP1_0342   acs FALSE 0.062 184.000 0.147 NA   NA
 7444511 7444512 KP1_0343 KP1_0344   gltP FALSE 0.063 97.000 0.000 NA   NA
 7444513 7444514 KP1_0345 KP1_0346   fdhF FALSE 0.028 230.000 0.105 1.000   NA
 7444516 7444517 KP1_0349 KP1_0351   rbsB TRUE 0.603 75.000 0.000 NA Y NA
 7444517 7444518 KP1_0351 KP1_0352 rbsB rbsC TRUE 0.736 31.000 0.238 NA   NA
 7444518 7444519 KP1_0352 KP1_0353 rbsC rbsA TRUE 0.869 -3.000 0.095 1.000   NA
 7444520 7444521 KP1_0354 KP1_0355     FALSE 0.090 71.000 0.000 NA   NA
 7444522 7444523 KP1_0356 KP1_0357 phnP phnN FALSE 0.392 16.000 0.000 NA   NA
 7444523 7444524 KP1_0357 KP1_0358 phnN phnM TRUE 0.964 0.000 0.000 NA Y NA
 7444524 7444525 KP1_0358 KP1_0359 phnM phnL TRUE 0.989 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 7444525 7444526 KP1_0359 KP1_0360 phnL phnK TRUE 0.957 108.000 0.859 0.027 Y NA
 7444526 7444527 KP1_0360 KP1_0362 phnK phnJ TRUE 0.990 -33.000 0.883 1.000 Y NA
 7444527 7444528 KP1_0362 KP1_0363 phnJ phnI TRUE 0.995 -7.000 0.880 1.000 Y NA
 7444528 7444529 KP1_0363 KP1_0364 phnI phnH TRUE 0.999 1.000 0.960 0.002 Y NA
 7444529 7444530 KP1_0364 KP1_0365 phnH phnG TRUE 0.999 -3.000 0.967 0.002 Y NA
 7444530 7444531 KP1_0365 KP1_0366 phnG phnF TRUE 0.987 1.000 0.691 1.000 N NA
 7444531 7444532 KP1_0366 KP1_0367 phnF   FALSE 0.027 150.000 0.018 NA   NA
 7444532 7444533 KP1_0367 KP1_0368   phnA FALSE 0.007 229.000 0.013 NA   NA
 7444536 7444537 KP1_0371 KP1_0372 melA melB TRUE 0.768 94.000 0.214 1.000 Y NA
 7444537 7444538 KP1_0372 KP1_0373 melB stbA FALSE 0.003 276.000 0.000 NA   NA
 7444538 7444539 KP1_0373 KP1_0374 stbA stbB TRUE 0.563 10.000 0.000 NA   NA
 7444540 7444541 KP1_0375 KP1_0376   cbpA TRUE 0.948 -15.000 0.512 NA   NA
 7444541 7444542 KP1_0376 KP1_0378 cbpA   FALSE 0.031 146.000 0.000 1.000 N NA
 7444544 7444545 KP1_0380 KP1_0381 hmsS   TRUE 0.901 -3.000 0.154 NA   NA
 7444545 7444546 KP1_0381 KP1_0382     TRUE 0.800 -7.000 0.087 1.000 N NA
 7444546 7444547 KP1_0382 KP1_0383     TRUE 0.987 3.000 0.696 1.000   NA
 7444548 7444549 KP1_0384 KP1_0385     FALSE 0.002 391.000 0.000 NA   NA
 7444550 7444551 KP1_0386 KP1_0387     FALSE 0.368 17.000 0.000 NA   NA
 7444551 7444552 KP1_0387 KP1_0388     FALSE 0.368 17.000 0.000 NA   NA
 7444552 7444553 KP1_0388 KP1_0389     FALSE 0.368 17.000 0.000 NA   NA
 7444553 7444554 KP1_0389 KP1_6030     FALSE 0.002 443.000 0.000 NA   NA
 7444554 7444555 KP1_6030 KP1_0390     FALSE 0.047 116.000 0.000 NA   NA
 7444555 7444556 KP1_0390 KP1_0391   yjdC FALSE 0.298 50.000 0.062 NA   NA
 7444556 7444557 KP1_0391 KP1_0392 yjdC dsbD TRUE 0.886 -12.000 0.217 1.000   NA
 7444557 7444558 KP1_0392 KP1_0393 dsbD cutA TRUE 0.709 -24.000 0.092 1.000 N NA
 7444558 7444559 KP1_0393 KP1_0394 cutA dcuA FALSE 0.145 83.000 0.024 1.000   NA
 7444559 7444560 KP1_0394 KP1_0395 dcuA aspA FALSE 0.317 116.000 0.195 1.000   NA
 7444563 7444564 KP1_0399 KP1_0400 groES groEL TRUE 0.966 38.000 0.631 1.000 Y NA
 7444564 7444565 KP1_0400 KP1_0401 groEL   FALSE 0.013 249.000 0.062 NA   NA
 7444566 7444567 KP1_0402 KP1_0403     FALSE 0.502 12.000 0.000 NA   NA
 7444567 7444568 KP1_0403 KP1_0404     TRUE 0.577 -7.000 0.000 1.000   NA
 7444568 7444569 KP1_0404 KP1_0406     FALSE 0.013 171.000 0.000 NA   NA
 7444569 7444570 KP1_0406 KP1_0408     FALSE 0.078 81.000 0.000 NA   NA
 7444570 7444571 KP1_0408 KP1_0409     FALSE 0.075 85.000 0.000 NA   NA
 7444571 7444572 KP1_0409 KP1_0410     FALSE 0.341 -102.000 0.000 1.000   NA
 7444572 7444573 KP1_0410 KP1_0411     TRUE 0.826 30.000 0.000 1.000 Y NA
 7444573 7444574 KP1_0411 KP1_0412   fimA TRUE 0.892 -34.000 0.000 1.000 Y NA
 7444575 7444576 KP1_0413 KP1_0415     FALSE 0.004 265.000 0.000 NA   NA
 7444576 7444577 KP1_0415 KP1_0416   efp FALSE 0.027 138.000 0.000 NA   NA
 7444577 7444578 KP1_0416 KP1_0418 efp ecnA FALSE 0.133 74.000 0.007 1.000   NA
 7444578 7444579 KP1_0418 KP1_0419 ecnA ecnB FALSE 0.356 160.000 0.212 0.001   NA
 7444579 7444580 KP1_0419 KP1_0420 ecnB sugE FALSE 0.088 144.000 0.074 1.000   NA
 7444581 7444582 KP1_0421 KP1_0422 blc frdD FALSE 0.066 114.000 0.000 1.000 N NA
 7444582 7444583 KP1_0422 KP1_0423 frdD frdC TRUE 0.996 -19.000 0.787 0.002 Y NA
 7444583 7444584 KP1_0423 KP1_0424 frdC frdB TRUE 0.996 11.000 0.454 0.002 Y NA
 7444584 7444585 KP1_0424 KP1_0425 frdB frdA TRUE 0.995 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 7444586 7444587 KP1_0426 KP1_0427 yjeA yjeM FALSE 0.014 184.000 0.000 1.000 N NA
 7444588 7444589 KP1_0428 KP1_0429 yjeP psd TRUE 0.695 24.000 0.148 NA N NA
 7444589 7444590 KP1_0429 KP1_0430 psd yjeQ FALSE 0.071 161.000 0.095 1.000   NA
 7444593 7444594 KP1_0433 KP1_6031     FALSE 0.091 70.000 0.000 NA   NA
 7444594 7444595 KP1_6031 KP1_6032     FALSE 0.092 69.000 0.000 NA   NA
 7444595 7444596 KP1_6032 KP1_6033     FALSE 0.088 73.000 0.000 NA   NA
 7444598 7444599 KP1_0435 KP1_0436 yjeF yjeE TRUE 0.822 -7.000 0.118 NA   NA
 7444599 7444600 KP1_0436 KP1_0437 yjeE amiB TRUE 0.732 17.000 0.109 NA   NA
 7444600 7444601 KP1_0437 KP1_0438 amiB mutL TRUE 0.837 11.000 0.092 1.000 N NA
 7444601 7444602 KP1_0438 KP1_0439 mutL miaA TRUE 0.894 -7.000 0.188 1.000 N NA
 7444602 7444603 KP1_0439 KP1_0441 miaA hfq TRUE 0.690 93.000 0.531 1.000   NA
 7444603 7444604 KP1_0441 KP1_0442 hfq hflX FALSE 0.381 76.000 0.141 1.000   NA
 7444604 7444605 KP1_0442 KP1_0443 hflX hflK TRUE 0.658 66.000 0.184 0.089   NA
 7444605 7444606 KP1_0443 KP1_0444 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.010 Y NA
 7444608 7444609 KP1_0446 KP1_0448   purA FALSE 0.132 103.000 0.051 NA   NA
 7444609 7444610 KP1_0448 KP1_0449 purA yjeB FALSE 0.021 151.000 0.010 NA N NA
 7444610 7444611 KP1_0449 KP1_0450 yjeB rnr TRUE 0.804 37.000 0.038 NA Y NA
 7444611 7444612 KP1_0450 KP1_0451 rnr yjfH TRUE 0.615 82.000 0.147 0.016 N NA
 7444612 7444613 KP1_0451 KP1_0452 yjfH aidB FALSE 0.079 107.000 0.005 1.000 N NA
 7444614 7444615 KP1_0453 KP1_0454     TRUE 0.802 57.000 0.588 NA   NA
 7444617 7444618 KP1_0457 KP1_0458 yjfQ yjfR FALSE 0.076 108.000 0.000 1.000   NA
 7444619 7444620 KP1_0460 KP1_0461 ulaA sgaB TRUE 0.967 13.000 0.286 0.024   NA
 7444620 7444621 KP1_0461 KP1_0462 sgaB ptxA TRUE 0.988 10.000 0.115 0.017 Y NA
 7444621 7444622 KP1_0462 KP1_0463 ptxA sgaH TRUE 0.982 14.000 0.328 1.000 Y NA
 7444622 7444623 KP1_0463 KP1_0464 sgaH sgaU TRUE 0.986 10.000 0.250 1.000 Y NA
 7444623 7444624 KP1_0464 KP1_0465 sgaU sgaE TRUE 0.986 0.000 0.200 1.000 Y NA
 7444625 7444626 KP1_0466 KP1_0467     FALSE 0.022 147.000 0.000 NA   NA
 7444627 7444628 KP1_0468 KP1_0469 rpsF priB FALSE 0.089 153.000 0.122 NA   NA
 7444628 7444629 KP1_0469 KP1_0470 priB rpsR TRUE 0.893 5.000 0.128 NA   NA
 7444629 7444630 KP1_0470 KP1_0472 rpsR rplI TRUE 0.974 42.000 0.499 0.011 Y NA
 7444632 7444633 KP1_0474 KP1_0475 fklB cycA FALSE 0.004 305.000 0.000 1.000 N NA
 7444634 7444635 KP1_0477 KP1_0478 ytfE ytfF FALSE 0.341 83.000 0.150 NA N NA
 7444635 7444636 KP1_0478 KP1_0479 ytfF   TRUE 0.641 58.000 0.316 NA N NA
 7444636 7444637 KP1_0479 KP1_0481   ytfG FALSE 0.184 78.000 0.042 1.000 N NA
 7444643 7444644 KP1_0487 KP1_0488   ytfL FALSE 0.060 100.000 0.000 NA   NA
 7444644 7444645 KP1_0488 KP1_0489 ytfL msrA FALSE 0.023 181.000 0.042 NA   NA
 7444646 7444647 KP1_0490 KP1_0491 ytfM   TRUE 0.978 -3.000 0.575 NA   NA
 7444647 7444648 KP1_0491 KP1_0492     TRUE 0.920 3.000 0.167 NA   NA
 7444649 7444650 KP1_0493 KP1_0494   ppa FALSE 0.085 75.000 0.000 NA   NA
 7444651 7444652 KP1_0495 KP1_0496 ytfQ ytfR TRUE 0.876 124.000 0.804 NA Y NA
 7444652 7444653 KP1_0496 KP1_0497 ytfR ytfT TRUE 0.992 11.000 0.506 1.000 Y NA
 7444653 7444654 KP1_0497 KP1_0498 ytfT yjfF TRUE 0.996 -13.000 0.865 0.078 Y NA
 7444655 7444656 KP1_0499 KP1_0500 fbp   FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 7444657 7444658 KP1_0501 KP1_0502 mpl yjdJ FALSE 0.134 66.000 0.000 1.000   NA
 7444659 7444660 KP1_0503 KP1_0504 trxC   FALSE 0.001 1141.000 0.000 NA   NA
 7444661 7444662 KP1_0505 KP1_0506 pmbA cybC FALSE 0.260 37.000 0.028 NA   NA
 7444662 7444663 KP1_0506 KP1_0509 cybC   FALSE 0.004 257.000 0.000 NA   NA
 7444663 7444664 KP1_0509 KP1_0510     TRUE 0.984 11.000 0.821 NA   NA
 7444664 7444665 KP1_0510 KP1_0511     TRUE 0.990 3.000 0.893 NA   NA
 7444665 7444666 KP1_0511 KP1_0512     TRUE 0.962 22.000 0.897 NA   NA
 7444666 7444667 KP1_0512 KP1_0513     TRUE 0.981 14.000 0.966 NA   NA
 7444667 7444668 KP1_0513 KP1_0514     TRUE 0.590 106.000 0.475 NA   NA
 7444668 7444669 KP1_0514 KP1_0515     TRUE 0.969 -16.000 0.750 1.000   NA
 7444671 7444672 KP1_0517 KP1_0518   ybhE FALSE 0.369 67.000 0.132 NA   NA
 7444672 7444673 KP1_0518 KP1_0519 ybhE frvR TRUE 0.778 23.000 0.207 NA N NA
 7444673 7444674 KP1_0519 KP1_0520 frvR relB FALSE 0.394 78.000 0.172 NA N NA
 7444674 7444675 KP1_0520 KP1_0521 relB relE TRUE 0.978 -10.000 0.875 NA N NA
 7444676 7444677 KP1_0523 KP1_0525 nrdG nrdD FALSE 0.061 329.000 0.464 1.000 N NA
 7444677 7444678 KP1_0525 KP1_0526 nrdD   FALSE 0.003 357.000 0.000 1.000 N NA
 7444679 7444680 KP1_0527 KP1_0528   celF TRUE 0.571 91.000 0.000 1.000 Y NA
 7444680 7444681 KP1_0528 KP1_0529 celF   TRUE 0.979 27.000 0.667 1.000 Y NA
 7444682 7444683 KP1_0530 KP1_0531 treC treB TRUE 0.952 52.000 0.650 1.000 Y NA
 7444683 7444684 KP1_0531 KP1_0532 treB treR FALSE 0.213 131.000 0.168 1.000 N NA
 7444686 7444687 KP1_0534 KP1_0535 yjgF pyrI FALSE 0.063 153.000 0.084 NA N NA
 7444687 7444688 KP1_0535 KP1_0536 pyrI pyrB TRUE 0.989 14.000 0.197 0.001 Y NA
 7444691 7444692 KP1_0540 KP1_0542 yjgD miaE FALSE 0.287 59.000 0.078 NA   NA
 7444693 7444694 KP1_0543 KP1_0544 yjgM valS FALSE 0.506 109.000 0.008 1.000 Y NA
 7444694 7444695 KP1_0544 KP1_0545 valS holC TRUE 0.879 0.000 0.089 1.000 N NA
 7444695 7444696 KP1_0545 KP1_0546 holC pepA TRUE 0.680 87.000 0.494 1.000 N NA
 7444697 7444698 KP1_0548 KP1_0549 yjgP yjgQ TRUE 0.991 0.000 0.631 0.088   NA
 7444699 7444700 KP1_0550 KP1_0551 yjgR   FALSE 0.062 99.000 0.000 NA   NA
 7444701 7444702 KP1_0552 KP1_0553     TRUE 0.621 19.000 0.058 1.000 N NA
 7444703 7444704 KP1_0557 KP1_0558   iolB FALSE 0.043 152.000 0.036 1.000 N NA
 7444705 7444706 KP1_0559 KP1_0560 iolD   FALSE 0.516 47.000 0.140 1.000   NA
 7444706 7444707 KP1_0560 KP1_0562     FALSE 0.416 42.000 0.089 NA   NA
 7444707 7444708 KP1_0562 KP1_0564   iolE TRUE 0.962 24.000 0.357 NA Y NA
 7444709 7444710 KP1_0565 KP1_0566     TRUE 0.662 140.000 0.188 0.078 Y NA
 7444710 7444711 KP1_0566 KP1_0567     TRUE 0.843 -45.000 0.250 1.000   NA
 7444711 7444712 KP1_0567 KP1_0568     TRUE 0.897 11.000 0.158 1.000   NA
 7444712 7444713 KP1_0568 KP1_0569     TRUE 0.996 -10.000 0.816 0.078 Y NA
 7444713 7444714 KP1_0569 KP1_0570   yjgB FALSE 0.072 131.000 0.032 1.000   NA
 7444714 7444715 KP1_0570 KP1_0571 yjgB   FALSE 0.073 112.000 0.000 1.000   NA
 7444715 7444716 KP1_0571 KP1_0572   yadF TRUE 0.996 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 7444717 7444718 KP1_6034 KP1_0573   int FALSE 0.006 221.000 0.000 NA   NA
 7444718 7444719 KP1_0573 KP1_0574 int   FALSE 0.012 441.000 0.000 0.060   NA
 7444719 7444720 KP1_0574 KP1_0575     FALSE 0.068 92.000 0.000 NA   NA
 7444721 7444722 KP1_0576 KP1_0577     FALSE 0.002 400.000 0.000 NA   NA
 7444722 7444723 KP1_0577 KP1_0578     TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7444723 7444724 KP1_0578 KP1_0580     TRUE 0.621 0.000 0.000 NA   NA
 7444724 7444725 KP1_0580 KP1_0581     FALSE 0.002 421.000 0.000 NA   NA
 7444725 7444726 KP1_0581 KP1_0583     FALSE 0.001 855.000 0.000 NA   NA
 7444726 7444727 KP1_0583 KP1_0585     FALSE 0.006 221.000 0.000 NA   NA
 7444727 7444728 KP1_0585 KP1_0586     FALSE 0.075 84.000 0.000 NA   NA
 7444729 7444730 KP1_0587 KP1_0588     FALSE 0.408 -13.000 0.000 NA   NA
 7444731 7444732 KP1_0589 KP1_0590     FALSE 0.095 66.000 0.000 NA   NA
 7444732 7444733 KP1_0590 KP1_0591     TRUE 0.886 -31.000 0.333 NA   NA
 7444735 7444736 KP1_0593 KP1_0594     FALSE 0.420 15.000 0.000 NA   NA
 7444736 7444737 KP1_0594 KP1_0595     TRUE 0.738 -60.000 0.167 NA   NA
 7444738 7444739 KP1_0596 KP1_0597     FALSE 0.003 369.000 0.000 1.000 N NA
 7444739 7444740 KP1_0597 KP1_0598     FALSE 0.518 104.000 0.000 1.000 Y NA
 7444740 7444741 KP1_0598 KP1_0600     TRUE 0.958 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7444741 7444742 KP1_0600 KP1_0601     TRUE 0.967 1.000 0.000 1.000 Y NA
 7444742 7444743 KP1_0601 KP1_0602     FALSE 0.118 53.000 0.000 NA   NA
 7444744 7444745 KP1_0604 KP1_0605     TRUE 0.826 11.000 0.081 1.000   NA
 7444745 7444746 KP1_0605 KP1_0607     TRUE 0.998 -3.000 0.833 0.016 Y NA
 7444746 7444747 KP1_0607 KP1_0608     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.016 Y NA
 7444747 7444748 KP1_0608 KP1_0609     FALSE 0.531 113.000 0.400 1.000 N NA
 7444749 7444750 KP1_0611 KP1_0612     FALSE 0.396 83.000 0.000 0.030   NA
 7444751 7444752 KP1_0613 KP1_0614     FALSE 0.002 488.000 0.000 1.000   NA
 7444752 7444753 KP1_0614 KP1_0615     TRUE 0.954 -3.000 0.312 NA   NA
 7444753 7444754 KP1_0615 KP1_0616     TRUE 0.989 -3.000 1.000 NA   NA
 7444754 7444755 KP1_0616 KP1_0617     TRUE 0.943 -3.000 0.263 NA   NA
 7444755 7444756 KP1_0617 KP1_0618     TRUE 0.821 -66.000 0.263 NA   NA
 7444756 7444757 KP1_0618 KP1_0619     FALSE 0.339 -27.000 0.000 NA   NA
 7444757 7444758 KP1_0619 KP1_0620     TRUE 0.620 2.000 0.000 NA   NA
 7444758 7444759 KP1_0620 KP1_0621     TRUE 0.988 10.000 1.000 NA   NA
 7444759 7444760 KP1_0621 KP1_0622     FALSE 0.001 661.000 0.000 NA   NA
 7444760 7444761 KP1_0622 KP1_0623     TRUE 0.961 -37.000 0.833 NA   NA
 7444761 7444762 KP1_0623 KP1_0625     FALSE 0.001 603.000 0.000 NA   NA
 7444762 7444763 KP1_0625 KP1_0626     TRUE 0.965 -3.000 0.400 NA   NA
 7444763 7444764 KP1_0626 KP1_0627     TRUE 0.965 -3.000 0.400 NA   NA
 7444764 7444765 KP1_0627 KP1_0628     TRUE 0.958 -21.000 0.667 NA   NA
 7444765 7444766 KP1_0628 KP1_0629     TRUE 0.984 4.000 0.667 NA   NA
 7444766 7444767 KP1_0629 KP1_0630     FALSE 0.098 64.000 0.000 NA   NA
 7444767 7444768 KP1_0630 KP1_0631     FALSE 0.090 71.000 0.000 NA   NA
 7444769 7444770 KP1_0632 KP1_0633     FALSE 0.015 162.000 0.000 NA   NA
 7444771 7444772 KP1_0634 KP1_0635     TRUE 0.834 22.000 0.000 0.001   NA
 7444772 7444773 KP1_0635 KP1_0636     FALSE 0.008 192.000 0.000 NA   NA
 7444773 7444774 KP1_0636 KP1_0637     FALSE 0.333 -28.000 0.000 NA   NA
 7444774 7444775 KP1_0637 KP1_0638     FALSE 0.016 160.000 0.000 NA   NA
 7444775 7444776 KP1_0638 KP1_0639     FALSE 0.438 -10.000 0.000 NA   NA
 7444776 7444777 KP1_0639 KP1_0640     TRUE 0.962 -16.000 0.667 NA   NA
 7444777 7444778 KP1_0640 KP1_0641     TRUE 0.577 -7.000 0.000 1.000   NA
 7444778 7444779 KP1_0641 KP1_0642     TRUE 0.560 133.000 0.667 NA   NA
 7444780 7444781 KP1_0644 KP1_0645     FALSE 0.002 463.000 0.000 NA   NA
 7444781 7444782 KP1_0645 KP1_0646     TRUE 0.861 48.000 0.029 0.060 Y NA
 7444782 7444783 KP1_0646 KP1_0647   hisG TRUE 0.781 -3.000 0.040 1.000   NA
 7444783 7444784 KP1_0647 KP1_0649 hisG   TRUE 0.621 51.000 0.045 0.011   NA
 7444784 7444785 KP1_0649 KP1_0650     TRUE 0.988 3.000 0.821 NA   NA
 7444785 7444786 KP1_0650 KP1_0651     FALSE 0.480 -7.000 0.000 NA   NA
 7444786 7444787 KP1_0651 KP1_0653     FALSE 0.001 613.000 0.000 NA   NA
 7444788 7444789 KP1_0654 KP1_0655     FALSE 0.022 146.000 0.000 NA   NA
 7444789 7444790 KP1_0655 KP1_0656     FALSE 0.438 -10.000 0.000 NA   NA
 7444790 7444791 KP1_0656 KP1_0658     FALSE 0.002 430.000 0.000 NA   NA
 7444792 7444793 KP1_0660 KP1_0661     FALSE 0.016 347.000 0.000 0.060   NA
 7444798 7444799 KP1_0667 KP1_0668 xynB   TRUE 0.812 59.000 0.154 1.000 Y NA
 7444800 7444801 KP1_0669 KP1_0670     FALSE 0.059 272.000 0.000 1.000 Y NA
 7444802 7444803 KP1_0672 KP1_0673     TRUE 0.646 -3.000 0.016 NA   NA
 7444803 7444804 KP1_0673 KP1_0674     TRUE 0.964 -3.000 0.395 NA   NA
 7444804 7444805 KP1_0674 KP1_0675     TRUE 0.964 -3.000 0.387 NA   NA
 7444805 7444806 KP1_0675 KP1_0677     TRUE 0.978 -3.000 0.588 NA   NA
 7444806 7444807 KP1_0677 KP1_0678     TRUE 0.953 -3.000 0.311 NA   NA
 7444807 7444808 KP1_0678 KP1_0679     TRUE 0.944 -64.000 0.722 NA   NA
 7444808 7444809 KP1_0679 KP1_0680     TRUE 0.971 -3.000 0.217 0.040   NA
 7444809 7444810 KP1_0680 KP1_0681     TRUE 0.977 -3.000 0.533 1.000   NA
 7444814 7444815 KP1_0685 KP1_0686     FALSE 0.088 73.000 0.000 NA   NA
 7444815 7444816 KP1_0686 KP1_0687     TRUE 0.582 12.000 0.000 1.000 N NA
 7444816 7444817 KP1_0687 KP1_0688     FALSE 0.102 61.000 0.000 NA   NA
 7444817 7444818 KP1_0688 KP1_0689     TRUE 0.934 18.000 0.500 NA   NA
 7444819 7444820 KP1_0690 KP1_0691     TRUE 0.994 -22.000 0.600 0.002 Y NA
 7444820 7444821 KP1_0691 KP1_0692     FALSE 0.083 103.000 0.000 1.000   NA
 7444821 7444822 KP1_0692 KP1_0693     FALSE 0.424 -28.000 0.000 1.000   NA
 7444824 7444825 KP1_6035 KP1_6036 rrsE   FALSE 0.073 86.000 0.000 NA   NA
 7444825 7444826 KP1_6036 KP1_6037   rrlE FALSE 0.011 183.000 0.000 NA   NA
 7444826 7444827 KP1_6037 KP1_6038 rrlE rrfE FALSE 0.062 99.000 0.000 NA   NA
 7444827 7444828 KP1_6038 KP1_0696 rrfE   FALSE 0.137 47.000 0.000 NA   NA
 7444828 7444829 KP1_0696 KP1_0697     FALSE 0.003 290.000 0.000 NA   NA
 7444830 7444831 KP1_0698 KP1_0699 yhhJ yhiH TRUE 0.959 -84.000 0.500 0.006   NA
 7444831 7444832 KP1_0699 KP1_0700 yhiH   TRUE 0.802 -3.000 0.049 1.000   NA
 7444832 7444833 KP1_0700 KP1_0701   trpS FALSE 0.004 307.000 0.000 1.000 N NA
 7444834 7444835 KP1_0702 KP1_0703     TRUE 0.942 51.000 0.571 NA Y NA
 7444835 7444836 KP1_0703 KP1_0704     TRUE 0.993 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 7444836 7444837 KP1_0704 KP1_0705     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.077 Y NA
 7444839 7444840 KP1_0707 KP1_0708     FALSE 0.481 -6.000 0.000 NA N NA
 7444842 7444843 KP1_0710 KP1_0711     FALSE 0.139 111.000 0.065 NA   NA
 7444843 7444844 KP1_0711 KP1_0713     TRUE 0.980 10.000 0.621 1.000 N NA
 7444844 7444845 KP1_0713 KP1_0714     TRUE 0.976 -10.000 0.818 NA   NA
 7444846 7444847 KP1_0715 KP1_0716     TRUE 0.825 -3.000 0.078 NA   NA
 7444847 7444848 KP1_0716 KP1_0717   yjiM TRUE 0.811 10.000 0.078 NA N NA
 7444848 7444849 KP1_0717 KP1_0718 yjiM   FALSE 0.085 98.000 0.018 NA   NA
 7444849 7444850 KP1_0718 KP1_0719   yjiO FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 7444850 7444851 KP1_0719 KP1_0720 yjiO yjiN FALSE 0.150 57.000 0.020 NA   NA
 7444851 7444852 KP1_0720 KP1_0721 yjiN   TRUE 0.602 5.000 0.000 NA   NA
 7444852 7444853 KP1_0721 KP1_0722     TRUE 0.702 48.000 0.300 1.000 N NA
 7444854 7444855 KP1_0723 KP1_0725     FALSE 0.016 159.000 0.000 NA   NA
 7444856 7444857 KP1_0726 KP1_0728   yjiA FALSE 0.002 392.000 0.000 NA   NA
 7444857 7444858 KP1_0728 KP1_0729 yjiA   TRUE 0.905 12.000 0.212 NA   NA
 7444858 7444859 KP1_0729 KP1_0730   yjiY TRUE 0.612 110.000 0.531 NA   NA
 7444860 7444861 KP1_0731 KP1_0732     FALSE 0.368 17.000 0.000 NA   NA
 7444862 7444863 KP1_0733 KP1_0734 hpaC hpaB TRUE 0.945 20.000 0.226 0.001   NA
 7444863 7444864 KP1_0734 KP1_0735 hpaB hpaA FALSE 0.027 226.000 0.100 1.000 N NA
 7444864 7444865 KP1_0735 KP1_0736 hpaA hpaX TRUE 0.844 10.000 0.100 NA N NA
 7444865 7444866 KP1_0736 KP1_0737 hpaX hpaI TRUE 0.965 10.000 0.053 NA Y NA
 7444866 7444867 KP1_0737 KP1_0738 hpaI hpaH TRUE 0.965 11.000 0.439 1.000 N NA
 7444867 7444868 KP1_0738 KP1_0739 hpaH hpaF FALSE 0.439 109.000 0.282 1.000 N NA
 7444868 7444869 KP1_0739 KP1_0740 hpaF hpaD TRUE 0.957 10.000 0.330 1.000   NA
 7444869 7444870 KP1_0740 KP1_0741 hpaD hpaE TRUE 0.971 2.000 0.378 1.000   NA
 7444870 7444871 KP1_0741 KP1_0742 hpaE hpaG2 TRUE 0.986 -3.000 0.510 0.074 N NA
 7444871 7444872 KP1_0742 KP1_0743 hpaG2 hpaG1 TRUE 0.998 -3.000 0.618 0.001 Y NA
 7444873 7444874 KP1_0744 KP1_0745   hpaR FALSE 0.116 54.000 0.000 NA   NA
 7444874 7444875 KP1_0745 KP1_0748 hpaR   FALSE 0.042 120.000 0.000 NA   NA
 7444875 7444876 KP1_0748 KP1_0749     FALSE 0.173 37.000 0.000 NA   NA
 7444878 7444879 KP1_0751 KP1_0752     TRUE 0.977 11.000 0.654 NA N NA
 7444879 7444880 KP1_0752 KP1_0753     FALSE 0.038 186.000 0.095 NA N NA
 7444880 7444881 KP1_0753 KP1_0754     TRUE 0.650 10.000 0.024 NA N NA
 7444881 7444882 KP1_0754 KP1_0755     TRUE 0.993 -16.000 1.000 NA Y NA
 7444883 7444884 KP1_0756 KP1_0757     FALSE 0.129 70.000 0.000 1.000   NA
 7444885 7444886 KP1_0758 KP1_0759     FALSE 0.085 101.000 0.000 1.000   NA
 7444886 7444887 KP1_0759 KP1_0760     TRUE 0.843 101.000 0.667 0.023 N NA
 7444887 7444888 KP1_0760 KP1_0761     TRUE 0.982 15.000 0.143 0.016 Y NA
 7444888 7444889 KP1_0761 KP1_0762     TRUE 0.995 17.000 0.800 0.023 Y NA
 7444889 7444890 KP1_0762 KP1_0763     TRUE 0.968 -10.000 0.000 0.023 Y NA
 7444890 7444891 KP1_0763 KP1_0764     TRUE 0.570 13.000 0.000 1.000   NA
 7444891 7444892 KP1_0764 KP1_0765     TRUE 0.927 18.000 0.167 0.005   NA
 7444892 7444893 KP1_0765 KP1_0766     FALSE 0.026 140.000 0.000 NA   NA
 7444894 7444895 KP1_0767 KP1_0769 mdoB yjjA FALSE 0.004 257.000 0.000 NA   NA
 7444895 7444896 KP1_0769 KP1_0770 yjjA dnaC TRUE 0.708 54.000 0.368 NA   NA
 7444896 7444897 KP1_0770 KP1_0771 dnaC dnaT TRUE 0.987 3.000 0.778 NA   NA
 7444897 7444898 KP1_0771 KP1_0772 dnaT yjjB FALSE 0.123 103.000 0.046 NA   NA
 7444898 7444899 KP1_0772 KP1_0773 yjjB yjjP TRUE 0.959 -24.000 0.704 NA   NA
 7444900 7444901 KP1_0774 KP1_0775     FALSE 0.292 28.000 0.020 NA   NA
 7444901 7444902 KP1_0775 KP1_0776     FALSE 0.519 -10.000 0.000 1.000 N NA
 7444902 7444903 KP1_0776 KP1_0777     FALSE 0.126 266.000 0.000 0.030 Y NA
 7444903 7444904 KP1_0777 KP1_0778     TRUE 0.995 -39.000 0.889 0.030 Y NA
 7444907 7444908 KP1_0781 KP1_0782 fhuF ycdT FALSE 0.209 107.000 0.108 NA   NA
 7444910 7444911 KP1_6039 KP1_6040     FALSE 0.194 32.000 0.000 NA   NA
 7444911 7444912 KP1_6040 KP1_6041     FALSE 0.216 29.000 0.000 NA   NA
 7444912 7444913 KP1_6041 KP1_0785   rsmC FALSE 0.013 172.000 0.000 NA   NA
 7444914 7444915 KP1_0786 KP1_0787 holD rimI TRUE 0.737 -31.000 0.121 1.000   NA
 7444915 7444916 KP1_0787 KP1_0788 rimI yjjG TRUE 0.578 15.000 0.018 1.000   NA
 7444916 7444917 KP1_0788 KP1_0789 yjjG prfC FALSE 0.114 91.000 0.012 1.000   NA
 7444917 7444918 KP1_0789 KP1_0790 prfC osmY FALSE 0.006 220.000 0.000 NA   NA
 7444918 7444919 KP1_0790 KP1_0791 osmY ybaT FALSE 0.094 67.000 0.000 NA   NA
 7444919 7444920 KP1_0791 KP1_0792 ybaT yjjU FALSE 0.147 154.000 0.211 NA   NA
 7444920 7444921 KP1_0792 KP1_0793 yjjU yjjV TRUE 0.789 -3.000 0.057 NA   NA
 7444921 7444922 KP1_0793 KP1_0794 yjjV   FALSE 0.049 131.000 0.027 NA N NA
 7444922 7444923 KP1_0794 KP1_0795   deoC FALSE 0.032 396.000 0.000 1.000 Y NA
 7444923 7444924 KP1_0795 KP1_0797 deoC deoA TRUE 0.908 45.000 0.286 1.000 Y NA
 7444924 7444925 KP1_0797 KP1_0799 deoA deoB TRUE 0.740 53.000 0.398 1.000 N NA
 7444925 7444926 KP1_0799 KP1_0801 deoB   TRUE 0.580 103.000 0.414 1.000 N NA
 7444927 7444928 KP1_0802 KP1_0803 lplA smp TRUE 0.833 0.000 0.066 NA   NA
 7444929 7444930 KP1_0804 KP1_0805 serB sms TRUE 0.716 10.000 0.024 1.000 N NA
 7444930 7444931 KP1_0805 KP1_0806 sms nadR FALSE 0.436 22.000 0.021 1.000 N NA
 7444933 7444934 KP1_0809 KP1_0810 slt trpR FALSE 0.379 89.000 0.167 1.000 N NA
 7444938 7444939 KP1_0814 KP1_0815   creB TRUE 0.643 13.000 0.038 NA   NA
 7444939 7444940 KP1_0815 KP1_0816 creB creC TRUE 0.997 0.000 0.776 1.000 Y NA
 7444940 7444941 KP1_0816 KP1_0817 creC creD TRUE 0.627 61.000 0.311 NA N NA
 7444943 7444944 KP1_0819 KP1_0820 lasT thrA FALSE 0.004 321.000 0.000 1.000 N NA
 7444944 7444945 KP1_0820 KP1_0822 thrA thrB TRUE 0.982 2.000 0.133 1.000 Y NA
 7444945 7444946 KP1_0822 KP1_0823 thrB thrC TRUE 0.988 4.000 0.233 1.000 Y NA
 7444946 7444947 KP1_0823 KP1_0824 thrC   FALSE 0.003 315.000 0.000 NA   NA
 7444948 7444949 KP1_0825 KP1_0826   yaaJ FALSE 0.129 78.000 0.028 NA   NA
 7444950 7444951 KP1_0827 KP1_0829 talB mogA FALSE 0.173 85.000 0.042 1.000 N NA
 7444951 7444952 KP1_0829 KP1_0830 mogA   FALSE 0.099 120.000 0.039 1.000 N NA
 7444953 7444954 KP1_0831 KP1_0832 yaaH   FALSE 0.141 89.000 0.043 NA   NA
 7444954 7444955 KP1_0832 KP1_0833     TRUE 0.884 28.000 0.500 NA   NA
 7444956 7444957 KP1_0835 KP1_0836 dnaK dnaJ TRUE 0.901 88.000 0.236 0.003 Y NA
 7444957 7444958 KP1_0836 KP1_0837 dnaJ nhaA FALSE 0.027 166.000 0.022 1.000 N NA
 7444958 7444959 KP1_0837 KP1_0838 nhaA nhaR TRUE 0.655 55.000 0.292 1.000 N NA
 7444961 7444962 KP1_0841 KP1_0842   ileS TRUE 0.685 44.000 0.254 1.000 N NA
 7444962 7444963 KP1_0842 KP1_0843 ileS lspA TRUE 0.816 0.000 0.045 1.000 N NA
 7444963 7444964 KP1_0843 KP1_0844 lspA fkpB FALSE 0.264 116.000 0.154 1.000 N NA
 7444964 7444965 KP1_0844 KP1_0845 fkpB ispH TRUE 0.943 -43.000 0.626 1.000 N NA
 7444965 7444966 KP1_0845 KP1_0846 ispH rihC FALSE 0.141 67.000 0.028 NA N NA
 7444966 7444967 KP1_0846 KP1_0847 rihC   TRUE 0.645 31.000 0.167 NA   NA
 7444969 7444970 KP1_0849 KP1_0850   dapB FALSE 0.003 295.000 0.003 NA   NA
 7444970 7444971 KP1_0850 KP1_0853 dapB carA FALSE 0.034 431.000 0.034 1.000 Y NA
 7444971 7444972 KP1_0853 KP1_0854 carA carB TRUE 0.990 18.000 0.345 0.001 Y NA
 7444972 7444973 KP1_0854 KP1_0855 carB   FALSE 0.015 170.000 0.003 NA   NA
 7444973 7444974 KP1_0855 KP1_0856   yabF FALSE 0.183 132.000 0.160 NA   NA
 7444974 7444975 KP1_0856 KP1_0857 yabF kefC TRUE 0.968 -7.000 0.560 1.000   NA
 7444975 7444976 KP1_0857 KP1_0858 kefC folA FALSE 0.021 174.000 0.012 1.000 N NA
 7444977 7444978 KP1_0859 KP1_0860 apaH apaG TRUE 0.948 5.000 0.267 NA N NA
 7444978 7444979 KP1_0860 KP1_0861 apaG ksgA TRUE 0.842 3.000 0.078 NA N NA
 7444979 7444980 KP1_0861 KP1_0862 ksgA pdxA TRUE 0.928 -3.000 0.197 1.000 N NA
 7444980 7444981 KP1_0862 KP1_0863 pdxA surA TRUE 0.980 6.000 0.561 1.000 N NA
 7444981 7444982 KP1_0863 KP1_0864 surA imp FALSE 0.527 55.000 0.182 1.000 N NA
 7444984 7444985 KP1_0866 KP1_0867 citZ citY TRUE 0.994 -13.000 1.000 1.000 Y NA
 7444986 7444987 KP1_0868 KP1_0869 citW citX FALSE 0.043 132.000 0.000 1.000 N NA
 7444988 7444989 KP1_0870 KP1_0871 rluA hepA TRUE 0.931 13.000 0.294 1.000 N NA
 7444989 7444990 KP1_0871 KP1_0872 hepA polB FALSE 0.344 188.000 0.098 0.059 Y NA
 7444990 7444991 KP1_0872 KP1_0873 polB araD FALSE 0.017 176.000 0.000 1.000 N NA
 7444991 7444992 KP1_0873 KP1_0874 araD araA FALSE 0.332 138.000 0.000 1.000 Y NA
 7444992 7444993 KP1_0874 KP1_0875 araA araB TRUE 0.881 11.000 0.138 1.000 N NA
 7444994 7444995 KP1_0876 KP1_0877 araC yabI FALSE 0.204 129.000 0.167 NA   NA
 7444996 7444997 KP1_0878 KP1_0879 thiQ thiP TRUE 0.975 -16.000 0.522 0.017 N NA
 7444997 7444998 KP1_0879 KP1_0880 thiP tbpA TRUE 0.976 -24.000 0.697 0.091 N NA
 7444998 7444999 KP1_0880 KP1_0881 tbpA yabN FALSE 0.019 290.000 0.000 0.091   NA
 7445000 7445001 KP1_0882 KP1_0883   setA FALSE 0.061 268.000 0.357 NA   NA
 7445004 7445005 KP1_0888 KP1_0889 aroD ydiM FALSE 0.491 19.000 0.019 1.000   NA
 7445005 7445006 KP1_0889 KP1_0890 ydiM aroE TRUE 0.827 11.000 0.082 1.000   NA
 7445006 7445007 KP1_0890 KP1_0891 aroE   TRUE 0.821 -3.000 0.061 1.000 N NA
 7445007 7445008 KP1_0891 KP1_0892   leuD FALSE 0.003 396.000 0.000 1.000 N NA
 7445008 7445009 KP1_0892 KP1_0894 leuD leuC TRUE 0.995 11.000 0.309 0.001 Y NA
 7445009 7445010 KP1_0894 KP1_0895 leuC leuB TRUE 0.996 3.000 0.275 0.001 Y NA
 7445010 7445011 KP1_0895 KP1_0896 leuB leuA TRUE 0.993 0.000 0.126 0.001 Y NA
 7445012 7445013 KP1_0897 KP1_0898 leuO ilvI FALSE 0.003 395.000 0.000 1.000 N NA
 7445013 7445014 KP1_0898 KP1_0899 ilvI ilvH TRUE 0.989 -27.000 0.371 0.002 Y NA
 7445014 7445015 KP1_0899 KP1_0900 ilvH fruR FALSE 0.037 180.000 0.063 1.000 N NA
 7445015 7445016 KP1_0900 KP1_0903 fruR   FALSE 0.001 605.000 0.000 NA   NA
 7445016 7445017 KP1_0903 KP1_0904   mraW TRUE 0.984 3.000 0.635 NA   NA
 7445017 7445018 KP1_0904 KP1_0905 mraW ftsL TRUE 0.939 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7445018 7445019 KP1_0905 KP1_0906 ftsL ftsI TRUE 0.792 16.000 0.124 1.000 N NA
 7445019 7445020 KP1_0906 KP1_0907 ftsI murE TRUE 0.943 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 7445020 7445021 KP1_0907 KP1_0908 murE murF TRUE 0.997 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 7445021 7445022 KP1_0908 KP1_0909 murF mraY TRUE 0.993 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 7445022 7445023 KP1_0909 KP1_0910 mraY murD TRUE 0.998 3.000 0.647 0.004 Y NA
 7445023 7445024 KP1_0910 KP1_0911 murD ftsW TRUE 0.985 0.000 0.297 0.003 N NA
 7445024 7445025 KP1_0911 KP1_0912 ftsW murG TRUE 0.982 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7445025 7445026 KP1_0912 KP1_0913 murG murC TRUE 0.901 48.000 0.283 1.000 Y NA
 7445026 7445027 KP1_0913 KP1_0914 murC ddl TRUE 0.987 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 7445027 7445028 KP1_0914 KP1_0915 ddl ftsQ TRUE 0.992 2.000 0.372 NA Y NA
 7445028 7445029 KP1_0915 KP1_0916 ftsQ ftsA TRUE 0.963 -3.000 0.389 NA N NA
 7445029 7445030 KP1_0916 KP1_0917 ftsA ftsZ TRUE 0.914 63.000 0.460 1.000 Y NA
 7445030 7445031 KP1_0917 KP1_0918 ftsZ lpxC FALSE 0.287 101.000 0.134 1.000 N NA
 7445031 7445032 KP1_0918 KP1_0921 lpxC secM FALSE 0.003 392.000 0.000 1.000   NA
 7445032 7445033 KP1_0921 KP1_0922 secM secA FALSE 0.285 63.000 0.065 1.000   NA
 7445033 7445034 KP1_0922 KP1_0923 secA mutT FALSE 0.485 59.000 0.168 1.000 N NA
 7445035 7445036 KP1_0924 KP1_0925 yacG   TRUE 0.958 10.000 0.356 NA   NA
 7445036 7445037 KP1_0925 KP1_0926   coaE TRUE 0.886 0.000 0.110 NA   NA
 7445038 7445039 KP1_0927 KP1_0928   guaC FALSE 0.109 57.000 0.000 NA   NA
 7445040 7445041 KP1_0929 KP1_0930 hofC hofB TRUE 0.990 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 7445041 7445042 KP1_0930 KP1_0931 hofB ppdD TRUE 0.993 11.000 0.556 1.000 Y NA
 7445042 7445043 KP1_0931 KP1_0932 ppdD nadC FALSE 0.018 182.000 0.015 1.000 N NA
 7445044 7445045 KP1_0933 KP1_0934 ampD ampE TRUE 0.986 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 7445046 7445047 KP1_0935 KP1_0936     TRUE 0.967 0.000 0.333 1.000   NA
 7445047 7445048 KP1_0936 KP1_0938   aroP FALSE 0.107 185.000 0.238 1.000 N NA
 7445049 7445050 KP1_0939 KP1_0940   pdhR FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 7445050 7445051 KP1_0940 KP1_0941 pdhR aceE FALSE 0.284 137.000 0.276 1.000 N NA
 7445051 7445052 KP1_0941 KP1_0943 aceE aceF TRUE 0.972 15.000 0.220 1.000 Y NA
 7445052 7445053 KP1_0943 KP1_0944 aceF lpdA FALSE 0.412 204.000 0.463 1.000 Y NA
 7445053 7445054 KP1_0944 KP1_0945 lpdA   FALSE 0.015 165.000 0.000 NA   NA
 7445055 7445056 KP1_0946 KP1_0947     TRUE 0.973 3.000 0.429 NA   NA
 7445057 7445058 KP1_0948 KP1_0949   acnB FALSE 0.010 184.000 0.000 NA   NA
 7445058 7445059 KP1_0949 KP1_0950 acnB   FALSE 0.029 187.000 0.068 NA   NA
 7445060 7445061 KP1_0951 KP1_0952 speD speE TRUE 0.929 25.000 0.162 1.000 Y NA
 7445061 7445062 KP1_0952 KP1_0953 speE   FALSE 0.027 150.000 0.000 1.000 N NA
 7445062 7445063 KP1_0953 KP1_0954     TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7445063 7445064 KP1_0954 KP1_0956     FALSE 0.004 248.000 0.000 NA   NA
 7445069 7445070 KP1_0962 KP1_0963 yadG yadH TRUE 0.997 -3.000 0.688 0.096 Y NA
 7445070 7445071 KP1_0963 KP1_0964 yadH yadI FALSE 0.090 123.000 0.037 1.000 N NA
 7445071 7445072 KP1_0964 KP1_0965 yadI   TRUE 0.839 65.000 0.222 1.000 Y NA
 7445073 7445074 KP1_0966 KP1_0967 panD panC TRUE 0.837 93.000 0.342 1.000 Y NA
 7445074 7445075 KP1_0967 KP1_0968 panC panB TRUE 0.995 12.000 0.395 0.001 Y NA
 7445075 7445076 KP1_0968 KP1_0969 panB folK TRUE 0.574 121.000 0.117 1.000 Y NA
 7445076 7445077 KP1_0969 KP1_0971 folK pcnB TRUE 0.941 -3.000 0.234 1.000 N NA
 7445077 7445078 KP1_0971 KP1_0972 pcnB yadB TRUE 0.698 96.000 0.131 1.000 Y NA
 7445078 7445079 KP1_0972 KP1_0973 yadB dksA TRUE 0.572 60.000 0.231 1.000 N NA
 7445079 7445080 KP1_0973 KP1_0974 dksA sfsA FALSE 0.133 145.000 0.151 NA   NA
 7445080 7445081 KP1_0974 KP1_0975 sfsA ligT TRUE 0.785 0.000 0.045 NA   NA
 7445083 7445084 KP1_0977 KP1_0978 pulO pulN TRUE 0.717 -3.000 0.017 1.000   NA
 7445084 7445085 KP1_0978 KP1_0979 pulN pulM TRUE 0.970 -10.000 0.649 1.000   NA
 7445085 7445086 KP1_0979 KP1_0980 pulM pulL TRUE 0.994 -7.000 0.811 1.000 Y NA
 7445086 7445087 KP1_0980 KP1_0982 pulL pulK TRUE 0.992 -13.000 0.537 0.086 Y NA
 7445087 7445088 KP1_0982 KP1_0983 pulK pulJ TRUE 0.962 30.000 0.461 1.000 Y NA
 7445088 7445089 KP1_0983 KP1_0985 pulJ pulI TRUE 0.991 -3.000 0.569 0.003   NA
 7445089 7445090 KP1_0985 KP1_0986 pulI pulH TRUE 0.985 15.000 0.605 0.003   NA
 7445090 7445091 KP1_0986 KP1_0987 pulH pulG TRUE 0.990 0.000 0.425 0.003   NA
 7445091 7445092 KP1_0987 KP1_0988 pulG pulF TRUE 0.997 9.000 0.599 0.003 Y NA
 7445092 7445093 KP1_0988 KP1_0989 pulF pulE TRUE 0.998 2.000 0.653 0.003 Y NA
 7445093 7445094 KP1_0989 KP1_0990 pulE pulD TRUE 0.998 -3.000 0.776 0.003 Y NA
 7445094 7445095 KP1_0990 KP1_0991 pulD pulC TRUE 0.997 10.000 0.575 0.003 Y NA
 7445096 7445097 KP1_0994 KP1_0995 pulA   FALSE 0.009 210.000 0.000 1.000 N NA
 7445097 7445098 KP1_0995 KP1_0996     TRUE 0.937 57.000 0.571 1.000 Y NA
 7445098 7445099 KP1_0996 KP1_0997   pulB FALSE 0.051 111.000 0.000 NA   NA
 7445101 7445102 KP1_1000 KP1_1001   mrcB FALSE 0.008 194.000 0.000 NA   NA
 7445102 7445103 KP1_1001 KP1_1002 mrcB fhuA FALSE 0.007 235.000 0.000 1.000 N NA
 7445103 7445104 KP1_1002 KP1_1003 fhuA fhuC TRUE 0.859 46.000 0.156 1.000 Y NA
 7445104 7445105 KP1_1003 KP1_1004 fhuC fhuD TRUE 0.961 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7445105 7445106 KP1_1004 KP1_1005 fhuD fhuB TRUE 0.961 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7445108 7445109 KP1_1007 KP1_1009 yadQ   FALSE 0.129 82.000 0.031 NA   NA
 7445110 7445111 KP1_1010 KP1_1011   yadT TRUE 0.665 37.000 0.213 NA   NA
 7445111 7445112 KP1_1011 KP1_1012 yadT mtnN TRUE 0.778 -7.000 0.073 1.000 N NA
 7445113 7445114 KP1_1013 KP1_1014 dgt degP FALSE 0.132 135.000 0.101 1.000 N NA
 7445114 7445115 KP1_1014 KP1_1016 degP cdaR FALSE 0.046 167.000 0.080 NA N NA
 7445116 7445117 KP1_1017 KP1_1018 yaeH dapD FALSE 0.097 108.000 0.035 NA   NA
 7445117 7445118 KP1_1018 KP1_1019 dapD glnD FALSE 0.548 31.000 0.097 1.000 N NA
 7445118 7445119 KP1_1019 KP1_1020 glnD map TRUE 0.591 58.000 0.243 1.000 N NA
 7445120 7445121 KP1_1021 KP1_1022 rpsB tsf TRUE 0.883 120.000 0.748 1.000 Y NA
 7445121 7445122 KP1_1022 KP1_1024 tsf pyrH FALSE 0.309 151.000 0.416 1.000 N NA
 7445122 7445123 KP1_1024 KP1_1026 pyrH frr FALSE 0.433 151.000 0.626 1.000 N NA
 7445123 7445124 KP1_1026 KP1_1027 frr ispC FALSE 0.012 229.000 0.032 1.000 N NA
 7445124 7445125 KP1_1027 KP1_1028 ispC uppS FALSE 0.090 238.000 0.025 1.000 Y NA
 7445125 7445126 KP1_1028 KP1_1030 uppS cdsA TRUE 0.987 13.000 0.400 1.000 Y NA
 7445126 7445127 KP1_1030 KP1_1031 cdsA yaeL TRUE 0.801 12.000 0.080 1.000 N NA
 7445127 7445128 KP1_1031 KP1_1032 yaeL yaeT TRUE 0.916 32.000 0.204 1.000 Y NA
 7445128 7445129 KP1_1032 KP1_1033 yaeT hlpA TRUE 0.758 122.000 0.354 1.000 Y NA
 7445129 7445130 KP1_1033 KP1_1034 hlpA lpxD TRUE 0.997 4.000 0.814 1.000 Y NA
 7445130 7445131 KP1_1034 KP1_1036 lpxD fabZ TRUE 0.923 34.000 0.796 1.000 N NA
 7445131 7445132 KP1_1036 KP1_1038 fabZ lpxA TRUE 0.989 4.000 0.850 1.000 N NA
 7445132 7445133 KP1_1038 KP1_1039 lpxA lpxB TRUE 0.990 0.000 0.289 1.000 Y NA
 7445133 7445134 KP1_1039 KP1_1040 lpxB rnhB TRUE 0.925 -3.000 0.186 1.000 N NA
 7445134 7445135 KP1_1040 KP1_1041 rnhB dnaE TRUE 0.941 18.000 0.104 1.000 Y NA
 7445135 7445136 KP1_1041 KP1_1042 dnaE accA TRUE 0.840 13.000 0.122 1.000 N NA
 7445136 7445137 KP1_1042 KP1_1043 accA ldcC FALSE 0.075 114.000 0.010 1.000 N NA
 7445137 7445138 KP1_1043 KP1_1045 ldcC yaeR TRUE 0.757 47.000 0.039 NA Y NA
 7445138 7445139 KP1_1045 KP1_1046 yaeR tilS FALSE 0.113 66.000 0.015 NA N NA
 7445140 7445141 KP1_1047 KP1_1048 rof   TRUE 0.844 -13.000 0.179 NA   NA
 7445142 7445143 KP1_1049 KP1_1050     TRUE 0.767 -3.000 0.034 1.000   NA
 7445143 7445144 KP1_1050 KP1_1051   cutF FALSE 0.404 22.000 0.027 NA   NA
 7445145 7445146 KP1_1052 KP1_1053 yaeF proS FALSE 0.110 60.000 0.002 NA   NA
 7445146 7445147 KP1_1053 KP1_1054 proS   FALSE 0.111 113.000 0.048 NA   NA
 7445147 7445148 KP1_1054 KP1_1055   rcsF TRUE 0.939 -3.000 0.247 NA   NA
 7445148 7445149 KP1_1055 KP1_1056 rcsF metQ TRUE 0.597 108.000 0.500 NA   NA
 7445149 7445150 KP1_1056 KP1_1057 metQ metI TRUE 0.961 44.000 0.411 0.075 Y NA
 7445150 7445151 KP1_1057 KP1_1059 metI metN TRUE 0.992 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 7445152 7445153 KP1_1060 KP1_1061     FALSE 0.047 116.000 0.000 NA   NA
 7445153 7445154 KP1_1061 KP1_6042   rrsF FALSE 0.002 369.000 0.000 NA   NA
 7445154 7445155 KP1_6042 KP1_6043 rrsF   FALSE 0.092 69.000 0.000 NA   NA
 7445155 7445156 KP1_6043 KP1_6044     FALSE 0.173 37.000 0.000 NA   NA
 7445156 7445157 KP1_6044 KP1_6045   rrlF FALSE 0.014 166.000 0.000 NA   NA
 7445157 7445158 KP1_6045 KP1_6046 rrlF rrfF FALSE 0.065 95.000 0.000 NA   NA
 7445158 7445159 KP1_6046 KP1_6047 rrfF   FALSE 0.111 56.000 0.000 NA   NA
 7445159 7445160 KP1_6047 KP1_1065   dkgB FALSE 0.015 165.000 0.000 NA   NA
 7445162 7445163 KP1_1067 KP1_1068     FALSE 0.108 94.000 0.029 NA   NA
 7445163 7445164 KP1_1068 KP1_1069   yafE FALSE 0.182 92.000 0.066 NA   NA
 7445165 7445166 KP1_1070 KP1_1071 mltD gloB FALSE 0.536 72.000 0.233 1.000   NA
 7445169 7445170 KP1_1074 KP1_6048 dnaQ   FALSE 0.030 134.000 0.000 NA   NA
 7445173 7445174 KP1_1077 KP1_1078 yafV fadE FALSE 0.027 179.000 0.033 1.000   NA
 7445175 7445176 KP1_1080 KP1_1081 lpcA yafJ FALSE 0.518 75.000 0.229 1.000   NA
 7445178 7445179 KP1_1083 KP1_1084     TRUE 0.999 4.000 0.854 0.002 Y NA
 7445179 7445180 KP1_1084 KP1_1085   nqr3 TRUE 0.996 -7.000 0.603 0.002 Y NA
 7445180 7445181 KP1_1085 KP1_1087 nqr3   TRUE 0.993 -7.000 0.312 0.002 Y NA
 7445181 7445182 KP1_1087 KP1_1088     TRUE 0.993 7.000 0.188 0.002 Y NA
 7445182 7445183 KP1_1088 KP1_1089     TRUE 0.996 13.000 0.551 0.002 Y NA
 7445183 7445184 KP1_1089 KP1_1090     TRUE 0.779 3.000 0.043 NA   NA
 7445186 7445187 KP1_1093 KP1_1094 dinB yafP TRUE 0.732 3.000 0.011 1.000   NA
 7445189 7445190 KP1_1096 KP1_1097 gpt   FALSE 0.055 106.000 0.000 NA   NA
 7445190 7445191 KP1_1097 KP1_1098   crl FALSE 0.106 58.000 0.000 NA   NA
 7445192 7445193 KP1_1099 KP1_1100 ygaE gabP TRUE 0.862 46.000 0.625 1.000 N NA
 7445193 7445194 KP1_1100 KP1_1101 gabP gabT FALSE 0.488 136.000 0.121 1.000 Y NA
 7445194 7445195 KP1_1101 KP1_1102 gabT gabD FALSE 0.554 13.000 0.000 1.000 N NA
 7445195 7445196 KP1_1102 KP1_1103 gabD   FALSE 0.324 26.000 0.000 1.000   NA
 7445196 7445197 KP1_1103 KP1_1104     FALSE 0.224 28.000 0.000 NA   NA
 7445198 7445199 KP1_1105 KP1_1106 xdhC   FALSE 0.289 58.000 0.077 NA   NA
 7445200 7445201 KP1_1107 KP1_1108     FALSE 0.006 218.000 0.000 NA N NA
 7445201 7445202 KP1_1108 KP1_1109     FALSE 0.289 89.000 0.111 1.000 N NA
 7445202 7445203 KP1_1109 KP1_1110   fabG TRUE 0.940 17.000 0.273 0.072 N NA
 7445203 7445204 KP1_1110 KP1_1111 fabG lyx TRUE 0.903 -33.000 0.375 1.000 N NA
 7445204 7445205 KP1_1111 KP1_1112 lyx   TRUE 0.747 -6.000 0.050 1.000 N NA
 7445205 7445206 KP1_1112 KP1_1114     TRUE 0.623 15.000 0.033 1.000 N NA
 7445206 7445207 KP1_1114 KP1_1115     FALSE 0.001 489.000 0.000 NA   NA
 7445207 7445208 KP1_1115 KP1_1116   acoD FALSE 0.012 177.000 0.000 NA   NA
 7445208 7445209 KP1_1116 KP1_1117 acoD acoC TRUE 0.961 -10.000 0.121 1.000 Y NA
 7445209 7445210 KP1_1117 KP1_1118 acoC acoB TRUE 0.984 4.000 0.033 0.072 Y NA
 7445210 7445211 KP1_1118 KP1_1119 acoB acoA TRUE 0.999 3.000 0.804 0.001 Y NA
 7445213 7445214 KP1_1123 KP1_1124     FALSE 0.007 212.000 0.000 NA   NA
 7445214 7445215 KP1_1124 KP1_1126     FALSE 0.158 141.000 0.000 0.058   NA
 7445217 7445218 KP1_1128 KP1_1129     FALSE 0.003 285.000 0.000 NA   NA
 7445218 7445219 KP1_1129 KP1_1130     FALSE 0.254 25.000 0.000 NA   NA
 7445219 7445220 KP1_1130 KP1_1131   int FALSE 0.005 246.000 0.000 NA   NA
 7445220 7445221 KP1_1131 KP1_6049 int   FALSE 0.015 164.000 0.000 NA   NA
 7445221 7445222 KP1_6049 KP1_1132   proA FALSE 0.049 114.000 0.000 NA   NA
 7445222 7445223 KP1_1132 KP1_1133 proA proB TRUE 0.985 11.000 0.026 0.001 Y NA
 7445223 7445224 KP1_1133 KP1_1134 proB   FALSE 0.018 155.000 0.000 NA   NA
 7445227 7445228 KP1_1137 KP1_1138     FALSE 0.065 95.000 0.000 NA   NA
 7445229 7445230 KP1_1139 KP1_1140 yeiE   FALSE 0.007 208.000 0.000 NA   NA
 7445230 7445231 KP1_1140 KP1_1141     TRUE 0.997 -3.000 0.491 0.001 Y NA
 7445231 7445232 KP1_1141 KP1_1142   phnD TRUE 0.992 22.000 0.568 0.001 Y NA
 7445232 7445233 KP1_1142 KP1_1143 phnD phnC TRUE 0.985 35.000 0.589 0.002 Y NA
 7445233 7445234 KP1_1143 KP1_1144 phnC   TRUE 0.621 0.000 0.000 NA   NA
 7445235 7445236 KP1_1145 KP1_1146 ykgK   TRUE 0.652 75.000 0.400 NA   NA
 7445236 7445237 KP1_1146 KP1_1147     TRUE 0.694 59.000 0.385 NA   NA
 7445237 7445238 KP1_1147 KP1_1148   yagX FALSE 0.245 26.000 0.000 NA   NA
 7445238 7445239 KP1_1148 KP1_1149 yagX yagW FALSE 0.438 -10.000 0.000 NA   NA
 7445239 7445240 KP1_1149 KP1_1150 yagW   FALSE 0.280 -61.000 0.000 NA   NA
 7445241 7445242 KP1_1151 KP1_1152 yhdY gltJ TRUE 0.996 -10.000 0.692 0.016 Y NA
 7445242 7445243 KP1_1152 KP1_1153 gltJ gltL TRUE 0.985 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 7445243 7445244 KP1_1153 KP1_1154 gltL   TRUE 0.984 2.000 0.158 1.000 Y NA
 7445244 7445245 KP1_1154 KP1_1156   livF FALSE 0.024 581.000 0.000 1.000 Y NA
 7445245 7445246 KP1_1156 KP1_1157 livF livG TRUE 0.993 -7.000 0.381 0.025 Y NA
 7445246 7445247 KP1_1157 KP1_1159 livG livM TRUE 0.968 -13.000 0.200 1.000 Y NA
 7445247 7445248 KP1_1159 KP1_1160 livM livH TRUE 0.998 0.000 0.771 0.075 Y NA
 7445248 7445249 KP1_1160 KP1_1161 livH livK TRUE 0.928 20.000 0.102 NA Y NA
 7445249 7445250 KP1_1161 KP1_1163 livK eutC FALSE 0.023 546.000 0.000 NA Y NA
 7445250 7445251 KP1_1163 KP1_1164 eutC eutB TRUE 0.999 -3.000 0.859 0.001 Y NA
 7445251 7445252 KP1_1164 KP1_1165 eutB yhfM TRUE 0.991 10.000 0.407 1.000 Y NA
 7445253 7445254 KP1_1166 KP1_1167   ykfD FALSE 0.076 83.000 0.000 NA   NA
 7445254 7445255 KP1_1167 KP1_1168 ykfD mmuM TRUE 0.961 -13.000 0.147 1.000 Y NA
 7445255 7445256 KP1_1168 KP1_1169 mmuM tauA FALSE 0.007 240.000 0.000 1.000 N NA
 7445256 7445257 KP1_1169 KP1_1171 tauA tauB TRUE 0.958 12.000 0.047 1.000 Y NA
 7445257 7445258 KP1_1171 KP1_1172 tauB tauC TRUE 0.996 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 7445258 7445259 KP1_1172 KP1_1173 tauC tauD TRUE 0.934 -3.000 0.214 1.000 N NA
 7445260 7445261 KP1_1174 KP1_1175   hemB FALSE 0.003 454.000 0.014 1.000   NA
 7445261 7445262 KP1_1175 KP1_1176 hemB ampH FALSE 0.073 107.000 0.000 1.000 N NA
 7445263 7445264 KP1_1177 KP1_1178   sbmA FALSE 0.133 118.000 0.059 1.000 N NA
 7445264 7445265 KP1_1178 KP1_1179 sbmA   TRUE 0.701 19.000 0.091 1.000   NA
 7445269 7445270 KP1_1183 KP1_1184     FALSE 0.052 170.000 0.090 NA   NA
 7445270 7445271 KP1_1184 KP1_1185     FALSE 0.019 300.000 0.154 NA   NA
 7445271 7445272 KP1_1185 KP1_1186   phoA FALSE 0.156 67.000 0.032 NA   NA
 7445272 7445273 KP1_1186 KP1_1187 phoA   TRUE 0.669 11.000 0.032 NA   NA
 7445276 7445277 KP1_1190 KP1_1191     FALSE 0.073 86.000 0.000 NA   NA
 7445278 7445279 KP1_1192 KP1_1193 aroL   FALSE 0.089 72.000 0.000 NA   NA
 7445279 7445280 KP1_1193 KP1_1194   aroM FALSE 0.004 251.000 0.000 NA   NA
 7445280 7445281 KP1_1194 KP1_1195 aroM   FALSE 0.173 78.000 0.049 NA   NA
 7445284 7445285 KP1_1198 KP1_1199 sbcC sbcD TRUE 0.987 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 7445286 7445287 KP1_1200 KP1_1201 phoB phoR TRUE 0.988 22.000 0.453 0.013 Y NA
 7445287 7445288 KP1_1201 KP1_1203 phoR brnQ FALSE 0.002 414.000 0.000 1.000 N NA
 7445288 7445289 KP1_1203 KP1_1204 brnQ proY TRUE 0.905 87.000 0.348 0.084 Y NA
 7445289 7445290 KP1_1204 KP1_1205 proY malZ FALSE 0.086 161.000 0.123 1.000 N NA
 7445292 7445293 KP1_1207 KP1_1209     FALSE 0.052 187.000 0.118 1.000   NA
 7445293 7445294 KP1_1209 KP1_1210     TRUE 0.750 25.000 0.180 1.000   NA
 7445295 7445296 KP1_1211 KP1_1212     TRUE 0.857 24.000 0.000 NA Y NA
 7445296 7445297 KP1_1212 KP1_1213     FALSE 0.104 60.000 0.000 NA   NA
 7445297 7445298 KP1_1213 KP1_1214     TRUE 0.927 21.000 0.241 0.022   NA
 7445298 7445299 KP1_1214 KP1_1215     TRUE 0.986 6.000 0.048 0.016 Y NA
 7445299 7445300 KP1_1215 KP1_1217     FALSE 0.021 149.000 0.000 NA   NA
 7445300 7445301 KP1_1217 KP1_1218     FALSE 0.071 88.000 0.000 NA   NA
 7445301 7445302 KP1_1218 KP1_1219   yajB FALSE 0.061 128.000 0.014 1.000   NA
 7445303 7445304 KP1_1220 KP1_1221   queA FALSE 0.096 65.000 0.000 NA   NA
 7445304 7445305 KP1_1221 KP1_1222 queA tgt TRUE 0.917 109.000 0.360 0.000 Y NA
 7445305 7445306 KP1_1222 KP1_1223 tgt yajC TRUE 0.934 -7.000 0.325 NA N NA
 7445306 7445307 KP1_1223 KP1_1225 yajC secD TRUE 0.862 27.000 0.045 NA Y NA
 7445307 7445308 KP1_1225 KP1_1226 secD secF TRUE 0.993 11.000 0.206 0.001 Y NA
 7445308 7445309 KP1_1226 KP1_1227 secF   FALSE 0.036 137.000 0.015 NA   NA
 7445309 7445310 KP1_1227 KP1_1228     TRUE 0.896 24.000 0.452 NA   NA
 7445311 7445312 KP1_1229 KP1_1230 tsx yajI FALSE 0.003 299.000 0.000 NA   NA
 7445313 7445314 KP1_1231 KP1_1232   ribD TRUE 0.952 4.000 0.277 NA N NA
 7445314 7445315 KP1_1232 KP1_1233 ribD ribH TRUE 0.819 88.000 0.034 0.001 Y NA
 7445315 7445316 KP1_1233 KP1_1234 ribH nusB TRUE 0.897 20.000 0.347 1.000 N NA
 7445316 7445317 KP1_1234 KP1_1235 nusB thiL FALSE 0.520 72.000 0.225 1.000 N NA
 7445317 7445318 KP1_1235 KP1_1236 thiL pgpA TRUE 0.902 -7.000 0.206 1.000 N NA
 7445319 7445320 KP1_1237 KP1_1238 yajO dxs FALSE 0.136 61.000 0.000 1.000 N NA
 7445320 7445321 KP1_1238 KP1_1239 dxs ispA TRUE 0.924 19.000 0.060 1.000 Y NA
 7445321 7445322 KP1_1239 KP1_1240 ispA xseB TRUE 0.792 1.000 0.035 1.000 N NA
 7445324 7445325 KP1_1243 KP1_1244   thiJ FALSE 0.123 51.000 0.000 NA   NA
 7445325 7445326 KP1_1244 KP1_1245 thiJ apbA TRUE 0.742 -43.000 0.155 NA   NA
 7445328 7445329 KP1_1247 KP1_1248 yajR   FALSE 0.016 160.000 0.000 NA   NA
 7445329 7445330 KP1_1248 KP1_1250   pcaK FALSE 0.004 332.000 0.000 1.000   NA
 7445330 7445331 KP1_1250 KP1_1251 pcaK   TRUE 0.920 -34.000 0.086 NA Y NA
 7445331 7445332 KP1_1251 KP1_1252     FALSE 0.416 58.000 0.143 NA N NA
 7445332 7445333 KP1_1252 KP1_1253     TRUE 0.943 11.000 0.308 NA   NA
 7445333 7445334 KP1_1253 KP1_1254     TRUE 0.894 14.000 0.227 NA   NA
 7445334 7445335 KP1_1254 KP1_1255     TRUE 0.949 -3.000 0.273 1.000 N NA
 7445337 7445338 KP1_1257 KP1_1258   cyoE FALSE 0.004 249.000 0.000 NA   NA
 7445338 7445339 KP1_1258 KP1_1259 cyoE cyoD TRUE 0.858 -33.000 0.118 0.084 N NA
 7445339 7445340 KP1_1259 KP1_1260 cyoD cyoC TRUE 0.997 0.000 0.485 0.044 Y NA
 7445340 7445341 KP1_1260 KP1_1261 cyoC cyoB TRUE 0.996 -10.000 0.697 0.044 Y NA
 7445341 7445342 KP1_1261 KP1_1262 cyoB cyoA TRUE 0.971 20.000 0.102 0.003 Y NA
 7445342 7445343 KP1_1262 KP1_1263 cyoA ampG FALSE 0.002 480.000 0.000 NA   NA
 7445343 7445344 KP1_1263 KP1_1264 ampG   TRUE 0.668 44.000 0.256 NA   NA
 7445345 7445346 KP1_1266 KP1_1267   bolA FALSE 0.003 282.000 0.000 NA   NA
 7445348 7445349 KP1_1269 KP1_1270 tig clpP FALSE 0.166 310.000 0.351 1.000 Y NA
 7445349 7445350 KP1_1270 KP1_1271 clpP clpX FALSE 0.239 251.000 0.352 1.000 Y NA
 7445350 7445351 KP1_1271 KP1_1272 clpX lon TRUE 0.873 76.000 0.201 0.094 Y NA
 7445351 7445352 KP1_1272 KP1_1273 lon hupB FALSE 0.009 210.000 0.000 1.000 N NA
 7445352 7445353 KP1_1273 KP1_1274 hupB ppiD FALSE 0.009 215.000 0.000 1.000 N NA
 7445353 7445354 KP1_1274 KP1_1275 ppiD   FALSE 0.045 149.000 0.033 1.000 N NA
 7445354 7445355 KP1_1275 KP1_1276     FALSE 0.102 112.000 0.027 1.000   NA
 7445356 7445357 KP1_1277 KP1_1278 ybaX ybaE FALSE 0.166 67.000 0.019 1.000   NA
 7445360 7445361 KP1_1281 KP1_1282 ybaO mdlA TRUE 0.593 44.000 0.179 1.000 N NA
 7445361 7445362 KP1_1282 KP1_1283 mdlA mdlB TRUE 0.994 -160.000 0.911 0.006 Y NA
 7445362 7445363 KP1_1283 KP1_1285 mdlB glnK FALSE 0.010 244.000 0.028 1.000 N NA
 7445363 7445364 KP1_1285 KP1_1286 glnK amtB TRUE 0.627 34.000 0.156 1.000 N NA
 7445367 7445368 KP1_1289 KP1_1290 ybaZ   FALSE 0.275 47.000 0.049 NA   NA
 7445369 7445370 KP1_1292 KP1_1293     TRUE 0.979 -3.000 0.600 NA   NA
 7445375 7445376 KP1_1299 KP1_1300     FALSE 0.005 234.000 0.000 NA N NA
 7445377 7445378 KP1_1301 KP1_1302     FALSE 0.502 12.000 0.000 NA   NA
 7445378 7445379 KP1_1302 KP1_1303   yvfL TRUE 0.955 63.000 0.815 1.000 Y NA
 7445379 7445380 KP1_1303 KP1_1304 yvfL   TRUE 0.998 11.000 0.885 0.074 Y NA
 7445380 7445381 KP1_1304 KP1_1305     TRUE 0.990 5.000 0.308 1.000 Y NA
 7445381 7445382 KP1_1305 KP1_1306     TRUE 0.959 32.000 0.190 0.006 Y NA
 7445382 7445383 KP1_1306 KP1_1307   ptsG TRUE 0.790 65.000 0.143 1.000 Y NA
 7445385 7445386 KP1_1309 KP1_1310   rpmE2 FALSE 0.063 116.000 0.000 1.000 N NA
 7445386 7445387 KP1_1310 KP1_1311 rpmE2 rpmJ2 TRUE 0.960 0.000 0.083 0.010   NA
 7445390 7445391 KP1_1314 KP1_1316   maa FALSE 0.123 133.000 0.101 NA   NA
 7445391 7445392 KP1_1316 KP1_1317 maa hha FALSE 0.054 159.000 0.076 NA   NA
 7445392 7445393 KP1_1317 KP1_1318 hha   FALSE 0.235 27.000 0.000 NA   NA
 7445393 7445394 KP1_1318 KP1_1319   acrB FALSE 0.001 486.000 0.000 NA   NA
 7445394 7445395 KP1_1319 KP1_1320 acrB acrA TRUE 0.909 23.000 0.458 1.000 N NA
 7445396 7445397 KP1_1321 KP1_1322 acrR kefA FALSE 0.230 130.000 0.200 NA N NA
 7445398 7445399 KP1_1323 KP1_1324     FALSE 0.168 68.000 0.037 NA   NA
 7445399 7445400 KP1_1324 KP1_1325   priC TRUE 0.957 13.000 0.474 NA   NA
 7445401 7445402 KP1_1326 KP1_1327   apt FALSE 0.092 118.000 0.043 NA   NA
 7445402 7445403 KP1_1327 KP1_1328 apt dnaX FALSE 0.239 93.000 0.088 1.000 N NA
 7445403 7445404 KP1_1328 KP1_1329 dnaX   TRUE 0.715 58.000 0.411 NA   NA
 7445404 7445405 KP1_1329 KP1_1330   recR TRUE 0.983 0.000 0.604 NA   NA
 7445405 7445406 KP1_1330 KP1_1331 recR htpG FALSE 0.138 88.000 0.028 1.000 N NA
 7445406 7445407 KP1_1331 KP1_1334 htpG adk FALSE 0.042 223.000 0.035 0.094 N NA
 7445407 7445408 KP1_1334 KP1_1335 adk hemH FALSE 0.056 129.000 0.013 1.000 N NA
 7445408 7445409 KP1_1335 KP1_1336 hemH gsk FALSE 0.141 64.000 0.005 1.000 N NA
 7445410 7445411 KP1_1337 KP1_1338 ybaL fsr FALSE 0.005 226.000 0.000 NA N NA
 7445413 7445414 KP1_1341 KP1_1342   ybaP FALSE 0.011 203.000 0.022 NA   NA
 7445414 7445415 KP1_1342 KP1_1343 ybaP ybaR FALSE 0.044 131.000 0.018 NA   NA
 7445417 7445418 KP1_1345 KP1_1346   ybbK TRUE 0.988 -3.000 0.313 NA Y NA
 7445419 7445420 KP1_1347 KP1_1348 ybbL ybbM TRUE 0.791 -13.000 0.127 NA   NA
 7445421 7445422 KP1_1349 KP1_1350 ybbN ybbO FALSE 0.402 59.000 0.118 1.000   NA
 7445422 7445423 KP1_1350 KP1_1352 ybbO tesA TRUE 0.751 -10.000 0.072 1.000   NA
 7445424 7445425 KP1_1353 KP1_1354 ybbA ybbP TRUE 0.993 -3.000 0.535 NA Y NA
 7445425 7445426 KP1_1354 KP1_1355 ybbP   FALSE 0.019 182.000 0.034 NA N NA
 7445427 7445428 KP1_1356 KP1_1357 ybbB allS FALSE 0.091 85.000 0.012 NA   NA
 7445429 7445430 KP1_1359 KP1_1360 allA allR TRUE 0.738 92.000 0.625 1.000 N NA
 7445430 7445431 KP1_1360 KP1_1361 allR gcl FALSE 0.197 88.000 0.054 1.000   NA
 7445431 7445432 KP1_1361 KP1_1362 gcl hyi TRUE 0.743 14.000 0.065 1.000   NA
 7445432 7445433 KP1_1362 KP1_1363 hyi glxR FALSE 0.245 120.000 0.154 1.000 N NA
 7445433 7445434 KP1_1363 KP1_1364 glxR   FALSE 0.235 55.000 0.051 NA N NA
 7445434 7445435 KP1_1364 KP1_1365   ybbW FALSE 0.499 78.000 0.250 NA N NA
 7445435 7445436 KP1_1365 KP1_1367 ybbW allB TRUE 0.569 130.000 0.161 1.000 Y NA
 7445436 7445437 KP1_1367 KP1_1368 allB ybbY FALSE 0.272 186.000 0.161 1.000 Y NA
 7445437 7445438 KP1_1368 KP1_1369 ybbY glxK TRUE 0.774 18.000 0.133 1.000 N NA
 7445439 7445440 KP1_1371 KP1_1372   allC TRUE 0.761 11.000 0.059 NA   NA
 7445440 7445441 KP1_1372 KP1_1373 allC ylbC TRUE 0.776 22.000 0.174 1.000 N NA
 7445442 7445443 KP1_1375 KP1_1376 fdrA ylbE TRUE 0.965 10.000 0.412 NA   NA
 7445443 7445444 KP1_1376 KP1_1377 ylbE ylbF TRUE 0.944 9.000 0.265 NA   NA
 7445444 7445445 KP1_1377 KP1_1378 ylbF arcC TRUE 0.963 9.000 0.375 NA   NA
 7445446 7445447 KP1_1379 KP1_1380 purK purE TRUE 0.992 -3.000 0.136 0.000 Y NA
 7445447 7445448 KP1_1380 KP1_1381 purE   FALSE 0.067 97.000 0.002 NA   NA
 7445448 7445449 KP1_1381 KP1_1382   ybbF FALSE 0.059 108.000 0.005 NA   NA
 7445449 7445450 KP1_1382 KP1_1383 ybbF ppiB TRUE 0.950 4.000 0.237 1.000   NA
 7445452 7445453 KP1_1385 KP1_1386     TRUE 0.793 -3.000 0.059 NA   NA
 7445453 7445454 KP1_1386 KP1_1387   ybcI TRUE 0.830 10.000 0.087 NA   NA
 7445454 7445455 KP1_1387 KP1_1389 ybcI   FALSE 0.052 119.000 0.011 NA   NA
 7445455 7445456 KP1_1389 KP1_1391   folD TRUE 0.841 2.000 0.055 1.000   NA
 7445457 7445458 KP1_1392 KP1_6050     FALSE 0.358 -22.000 0.000 NA   NA
 7445458 7445459 KP1_6050 KP1_1393     FALSE 0.509 -5.000 0.000 NA   NA
 7445459 7445460 KP1_1393 KP1_1394     FALSE 0.002 358.000 0.000 NA   NA
 7445460 7445461 KP1_1394 KP1_1395     FALSE 0.002 375.000 0.000 NA   NA
 7445463 7445464 KP1_1397 KP1_1398     FALSE 0.139 46.000 0.000 NA   NA
 7445465 7445466 KP1_1399 KP1_1400     FALSE 0.358 -22.000 0.000 NA   NA
 7445467 7445468 KP1_1401 KP1_1402     TRUE 0.876 -58.000 0.000 1.000 Y NA
 7445468 7445469 KP1_1402 KP1_1403     TRUE 0.953 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7445469 7445470 KP1_1403 KP1_1404     TRUE 0.967 2.000 0.000 1.000 Y NA
 7445472 7445473 KP1_1406 KP1_1407     FALSE 0.059 101.000 0.000 NA   NA
 7445473 7445474 KP1_1407 KP1_1408   cadC FALSE 0.003 293.000 0.000 NA   NA
 7445474 7445475 KP1_1408 KP1_1409 cadC cadB FALSE 0.003 366.000 0.000 1.000 N NA
 7445475 7445476 KP1_1409 KP1_1410 cadB cadA TRUE 0.616 77.000 0.000 1.000 Y NA
 7445476 7445477 KP1_1410 KP1_1412 cadA yjdL TRUE 0.906 60.000 0.400 1.000 Y NA
 7445477 7445478 KP1_1412 KP1_1414 yjdL lysS FALSE 0.003 332.000 0.000 1.000 N NA
 7445479 7445480 KP1_1415 KP1_1416     FALSE 0.006 214.000 0.000 NA   NA
 7445481 7445482 KP1_1417 KP1_1418     TRUE 0.669 -3.000 0.000 1.000   NA
 7445482 7445483 KP1_1418 KP1_1419     TRUE 0.910 10.000 0.000 0.038   NA
 7445485 7445486 KP1_1421 KP1_1422   mocB FALSE 0.026 436.000 0.000 NA Y NA
 7445486 7445487 KP1_1422 KP1_1423 mocB   TRUE 0.966 33.000 0.600 NA Y NA
 7445487 7445488 KP1_1423 KP1_1424     TRUE 0.973 11.000 0.121 1.000 Y NA
 7445488 7445489 KP1_1424 KP1_1426     FALSE 0.029 136.000 0.000 NA   NA
 7445490 7445491 KP1_1428 KP1_1429     TRUE 0.934 -15.000 0.400 1.000 N NA
 7445491 7445492 KP1_1429 KP1_1431     TRUE 0.994 0.000 0.475 1.000 Y NA
 7445492 7445493 KP1_1431 KP1_1432     TRUE 0.872 105.000 0.275 0.018 Y NA
 7445493 7445494 KP1_1432 KP1_1433     FALSE 0.210 30.000 0.000 NA   NA
 7445494 7445495 KP1_1433 KP1_1434     FALSE 0.224 28.000 0.000 NA   NA
 7445496 7445497 KP1_1435 KP1_1436     FALSE 0.090 71.000 0.000 NA   NA
 7445497 7445498 KP1_1436 KP1_1437     FALSE 0.029 136.000 0.000 NA   NA
 7445498 7445499 KP1_1437 KP1_1438     TRUE 0.872 0.000 0.095 NA   NA
 7445500 7445501 KP1_1439 KP1_1440     TRUE 0.996 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 7445501 7445502 KP1_1440 KP1_1441   yiuA TRUE 0.974 7.000 0.070 1.000 Y NA
 7445502 7445503 KP1_1441 KP1_1442 yiuA   FALSE 0.378 -18.000 0.000 NA   NA
 7445504 7445505 KP1_1443 KP1_1444     FALSE 0.011 180.000 0.000 NA   NA
 7445505 7445506 KP1_1444 KP1_1445     TRUE 0.621 1.000 0.000 NA   NA
 7445506 7445507 KP1_1445 KP1_1447     FALSE 0.142 45.000 0.000 NA   NA
 7445507 7445508 KP1_1447 KP1_1448     FALSE 0.006 216.000 0.000 NA   NA
 7445508 7445509 KP1_1448 KP1_1449     FALSE 0.413 20.000 0.000 1.000   NA
 7445509 7445510 KP1_1449 KP1_1450     FALSE 0.047 129.000 0.000 1.000 N NA
 7445511 7445512 KP1_1451 KP1_1452     TRUE 0.762 -25.000 0.143 NA   NA
 7445512 7445513 KP1_1452 KP1_1453     FALSE 0.354 82.000 0.000 0.071 N NA
 7445513 7445514 KP1_1453 KP1_1454     TRUE 0.762 45.000 0.182 0.071   NA
 7445515 7445516 KP1_1455 KP1_1456 moaR moaG FALSE 0.120 49.000 0.000 NA N NA
 7445516 7445517 KP1_1456 KP1_1457 moaG   TRUE 0.925 -3.000 0.208 NA N NA
 7445518 7445519 KP1_1458 KP1_1459     TRUE 0.970 -22.000 0.864 NA   NA
 7445519 7445520 KP1_1459 KP1_1461     FALSE 0.007 373.000 0.083 NA   NA
 7445520 7445521 KP1_1461 KP1_1462     TRUE 0.811 14.000 0.125 NA   NA
 7445522 7445523 KP1_1463 KP1_1465     FALSE 0.002 372.000 0.000 NA   NA
 7445523 7445524 KP1_1465 KP1_1466     FALSE 0.467 27.000 0.060 NA   NA
 7445524 7445525 KP1_1466 KP1_1467     FALSE 0.236 75.000 0.060 1.000 N NA
 7445525 7445526 KP1_1467 KP1_1469   nupG FALSE 0.106 152.000 0.000 0.083   NA
 7445526 7445527 KP1_1469 KP1_1471 nupG   TRUE 0.728 17.000 0.107 NA   NA
 7445527 7445528 KP1_1471 KP1_1472     TRUE 0.678 -46.000 0.120 NA   NA
 7445531 7445532 KP1_1475 KP1_1476 ybdG   FALSE 0.469 17.000 0.023 NA   NA
 7445533 7445534 KP1_1477 KP1_1478     FALSE 0.004 699.000 0.074 NA   NA
 7445534 7445535 KP1_1478 KP1_1479     FALSE 0.063 97.000 0.000 NA   NA
 7445536 7445537 KP1_1480 KP1_1481     TRUE 0.781 65.000 0.250 0.005   NA
 7445537 7445538 KP1_1481 KP1_1482     TRUE 0.735 36.000 0.250 1.000   NA
 7445538 7445539 KP1_1482 KP1_1483     TRUE 0.998 3.000 0.857 0.022 Y NA
 7445539 7445540 KP1_1483 KP1_1484     TRUE 0.995 15.000 0.625 0.022 Y NA
 7445540 7445541 KP1_1484 KP1_1485     TRUE 0.989 -7.000 0.222 0.015 Y NA
 7445541 7445542 KP1_1485 KP1_1487   nfnB FALSE 0.006 248.000 0.000 1.000 N NA
 7445542 7445543 KP1_1487 KP1_1488 nfnB ybdF FALSE 0.042 120.000 0.000 NA   NA
 7445543 7445544 KP1_1488 KP1_1490 ybdF   TRUE 0.857 0.000 0.083 NA   NA
 7445545 7445546 KP1_1491 KP1_1492     TRUE 0.690 31.000 0.200 NA   NA
 7445547 7445548 KP1_1493 KP1_1494 ybdJ   FALSE 0.192 190.000 0.500 NA   NA
 7445549 7445550 KP1_1495 KP1_1497     FALSE 0.156 53.000 0.000 1.000 N NA
 7445550 7445551 KP1_1497 KP1_1498     TRUE 0.979 14.000 0.842 1.000 N NA
 7445552 7445553 KP1_1499 KP1_1500     FALSE 0.133 48.000 0.000 NA   NA
 7445554 7445555 KP1_1501 KP1_1502     TRUE 0.991 19.000 0.593 0.073 Y NA
 7445555 7445556 KP1_1502 KP1_1503     TRUE 0.998 3.000 0.871 0.073 Y NA
 7445556 7445557 KP1_1503 KP1_1505     TRUE 0.996 4.000 0.742 1.000 Y NA
 7445557 7445558 KP1_1505 KP1_1507     TRUE 0.996 -10.000 0.677 0.002 Y NA
 7445558 7445559 KP1_1507 KP1_1508     FALSE 0.545 98.000 0.000 1.000 Y NA
 7445563 7445564 KP1_1512 KP1_1513     TRUE 0.964 48.000 0.500 0.088 Y NA
 7445564 7445565 KP1_1513 KP1_1514     TRUE 0.985 15.000 0.200 0.016 Y NA
 7445565 7445566 KP1_1514 KP1_1515     TRUE 0.992 -7.000 0.600 1.000 Y NA
 7445569 7445570 KP1_1519 KP1_1520 yeiE   FALSE 0.077 82.000 0.000 NA   NA
 7445570 7445571 KP1_1520 KP1_1521     TRUE 0.937 57.000 0.571 1.000 Y NA
 7445571 7445572 KP1_1521 KP1_1522   yddO FALSE 0.028 149.000 0.000 1.000 N NA
 7445572 7445573 KP1_1522 KP1_1523 yddO yddP TRUE 0.994 -13.000 0.550 0.025 Y NA
 7445573 7445574 KP1_1523 KP1_1524 yddP yddQ TRUE 0.968 -37.000 0.324 1.000 Y NA
 7445574 7445575 KP1_1524 KP1_1525 yddQ yddR TRUE 0.996 0.000 0.441 0.073 Y NA
 7445575 7445576 KP1_1525 KP1_1526 yddR   TRUE 0.915 90.000 0.400 0.073 Y NA
 7445578 7445579 KP1_1528 KP1_1529 betA betB TRUE 0.950 -31.000 0.634 1.000 N NA
 7445579 7445580 KP1_1529 KP1_1530 betB betI TRUE 0.954 14.000 0.459 1.000 N NA
 7445586 7445587 KP1_1536 KP1_1537     TRUE 0.939 48.000 0.240 0.038 Y NA
 7445587 7445588 KP1_1537 KP1_1538     FALSE 0.427 61.000 0.138 1.000 N NA
 7445588 7445589 KP1_1538 KP1_1539     TRUE 0.966 18.000 0.241 1.000 Y NA
 7445589 7445590 KP1_1539 KP1_1540     TRUE 0.916 -16.000 0.350 NA   NA
 7445590 7445591 KP1_1540 KP1_1541     TRUE 0.941 11.000 0.300 NA   NA
 7445591 7445592 KP1_1541 KP1_1542     FALSE 0.031 160.000 0.040 NA N NA
 7445592 7445593 KP1_1542 KP1_1543     FALSE 0.038 256.000 0.200 1.000 N NA
 7445594 7445595 KP1_1544 KP1_1545     TRUE 0.998 -7.000 0.860 0.002 Y NA
 7445596 7445597 KP1_1546 KP1_1547 entD fepA TRUE 0.825 67.000 0.700 1.000 N NA
 7445598 7445599 KP1_1548 KP1_1549 fes ychP TRUE 0.817 28.000 0.320 NA   NA
 7445599 7445600 KP1_1549 KP1_1550 ychP entF TRUE 0.798 11.000 0.080 NA   NA
 7445601 7445602 KP1_1551 KP1_1552 fepC fepG TRUE 0.970 -3.000 0.058 1.000 Y NA
 7445602 7445603 KP1_1552 KP1_1553 fepG fepD TRUE 0.993 -3.000 0.300 0.073 Y NA
 7445603 7445604 KP1_1553 KP1_1554 fepD   FALSE 0.111 56.000 0.000 NA   NA
 7445607 7445608 KP1_1557 KP1_1558 entC entE TRUE 0.993 10.000 0.500 1.000 Y NA
 7445608 7445609 KP1_1558 KP1_1559 entE entB TRUE 0.935 14.000 0.000 1.000 Y NA
 7445609 7445610 KP1_1559 KP1_1560 entB entA TRUE 0.897 -30.000 0.000 1.000 Y NA
 7445610 7445611 KP1_1560 KP1_1562 entA   TRUE 0.974 1.000 0.065 NA Y NA
 7445611 7445612 KP1_1562 KP1_1563   cstA FALSE 0.002 357.000 0.000 NA N NA
 7445612 7445613 KP1_1563 KP1_1564 cstA   FALSE 0.489 105.000 0.333 NA   NA
 7445614 7445615 KP1_1565 KP1_1566     FALSE 0.344 -25.000 0.000 NA   NA
 7445615 7445616 KP1_1566 KP1_1567     FALSE 0.016 157.000 0.000 NA N NA
 7445616 7445617 KP1_1567 KP1_1568   ybdH TRUE 0.941 58.000 1.000 0.037 N NA
 7445618 7445619 KP1_1570 KP1_1571     TRUE 0.997 -3.000 0.952 1.000 Y NA
 7445619 7445620 KP1_1571 KP1_1573     TRUE 0.969 21.000 0.355 NA Y NA
 7445620 7445621 KP1_1573 KP1_1574     TRUE 0.784 -33.000 0.177 NA   NA
 7445624 7445625 KP1_1578 KP1_1579     FALSE 0.216 29.000 0.000 NA   NA
 7445625 7445626 KP1_1579 KP1_1580     TRUE 0.593 111.000 0.100 NA Y NA
 7445626 7445627 KP1_1580 KP1_1581     FALSE 0.207 92.000 0.067 1.000 N NA
 7445627 7445628 KP1_1581 KP1_1582     FALSE 0.397 -31.000 0.000 1.000 N NA
 7445628 7445629 KP1_1582 KP1_1583     TRUE 0.849 -3.000 0.081 1.000 N NA
 7445629 7445630 KP1_1583 KP1_1584   codB FALSE 0.521 45.000 0.140 1.000 N NA
 7445631 7445632 KP1_1585 KP1_1586 mtnB   TRUE 0.942 13.000 0.000 1.000 Y NA
 7445632 7445633 KP1_1586 KP1_1587     TRUE 0.949 -54.000 0.714 1.000 N NA
 7445634 7445635 KP1_1588 KP1_1589     TRUE 0.969 12.000 0.130 NA Y NA
 7445635 7445636 KP1_1589 KP1_1590     TRUE 0.994 -3.000 1.000 0.073   NA
 7445636 7445637 KP1_1590 KP1_1591     TRUE 0.990 -3.000 1.000 1.000   NA
 7445637 7445638 KP1_1591 KP1_1592     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA Y NA
 7445640 7445641 KP1_1594 KP1_1595 mtnD mtnC TRUE 0.942 -3.000 0.231 1.000   NA
 7445643 7445644 KP1_1597 KP1_1598     TRUE 0.950 -15.000 0.500 1.000   NA
 7445644 7445645 KP1_1598 KP1_1599   ybdO FALSE 0.489 111.000 0.333 1.000   NA
 7445645 7445646 KP1_1599 KP1_1600 ybdO dsbG FALSE 0.032 181.000 0.067 NA N NA
 7445646 7445647 KP1_1600 KP1_1601 dsbG   FALSE 0.008 195.000 0.000 NA   NA
 7445648 7445649 KP1_1602 KP1_1603 ahpC ahpF FALSE 0.524 188.000 0.551 1.000 Y NA
 7445650 7445651 KP1_1605 KP1_1606 ybdQ rnk FALSE 0.013 187.000 0.000 1.000 N NA
 7445651 7445652 KP1_1606 KP1_1607 rnk   FALSE 0.020 179.000 0.018 1.000 N NA
 7445652 7445653 KP1_1607 KP1_1608   dcuC FALSE 0.123 93.000 0.024 1.000 N NA
 7445654 7445655 KP1_1610 KP1_1611 crcA cspE FALSE 0.489 111.000 0.333 1.000   NA
 7445657 7445658 KP1_1613 KP1_1614 ybeM tatE FALSE 0.043 243.000 0.196 1.000   NA
 7445659 7445660 KP1_1615 KP1_1616 lipA ybeF FALSE 0.016 181.000 0.005 1.000 N NA
 7445660 7445661 KP1_1616 KP1_1617 ybeF lipB FALSE 0.147 56.000 0.000 1.000 N NA
 7445661 7445662 KP1_1617 KP1_1618 lipB   FALSE 0.366 105.000 0.219 NA   NA
 7445662 7445663 KP1_1618 KP1_1619   dacA FALSE 0.157 113.000 0.081 NA   NA
 7445663 7445664 KP1_1619 KP1_1620 dacA rlpA TRUE 0.714 139.000 0.475 NA Y NA
 7445664 7445665 KP1_1620 KP1_1621 rlpA mrdB TRUE 0.645 12.000 0.035 NA N NA
 7445665 7445666 KP1_1621 KP1_1622 mrdB mrdA TRUE 0.818 0.000 0.046 1.000 N NA
 7445666 7445667 KP1_1622 KP1_1623 mrdA   FALSE 0.337 28.000 0.031 NA   NA
 7445667 7445668 KP1_1623 KP1_1624     TRUE 0.958 4.000 0.307 NA   NA
 7445668 7445669 KP1_1624 KP1_1625   phpB FALSE 0.006 223.000 0.000 NA   NA
 7445669 7445670 KP1_1625 KP1_1626 phpB nadD FALSE 0.234 73.000 0.057 1.000 N NA
 7445670 7445671 KP1_1626 KP1_1627 nadD holA TRUE 0.677 -10.000 0.045 1.000 N NA
 7445671 7445672 KP1_1627 KP1_1628 holA rlpB TRUE 0.933 0.000 0.199 NA N NA
 7445672 7445673 KP1_1628 KP1_1630 rlpB leuS TRUE 0.851 15.000 0.182 NA N NA
 7445675 7445676 KP1_1632 KP1_1633     FALSE 0.095 66.000 0.000 NA   NA
 7445676 7445677 KP1_1633 KP1_1635   gltL FALSE 0.002 335.000 0.000 NA N NA
 7445677 7445678 KP1_1635 KP1_1636 gltL gltK TRUE 0.992 0.000 0.379 1.000 Y NA
 7445678 7445679 KP1_1636 KP1_1637 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.016 Y NA
 7445679 7445680 KP1_1637 KP1_1638 gltJ gltI FALSE 0.387 165.000 0.050 0.072 Y NA
 7445680 7445681 KP1_1638 KP1_1639 gltI lnt FALSE 0.005 280.000 0.000 1.000 N NA
 7445681 7445682 KP1_1639 KP1_1640 lnt ybeX FALSE 0.553 126.000 0.557 1.000 N NA
 7445682 7445683 KP1_1640 KP1_1641 ybeX   FALSE 0.122 148.000 0.150 NA   NA
 7445683 7445684 KP1_1641 KP1_1642   ybeZ TRUE 0.970 -3.000 0.457 NA   NA
 7445684 7445685 KP1_1642 KP1_1643 ybeZ miaB FALSE 0.165 154.000 0.220 1.000 N NA
 7445687 7445688 KP1_6051 KP1_6052     FALSE 0.083 76.000 0.000 NA   NA
 7445688 7445689 KP1_6052 KP1_6053     FALSE 0.133 48.000 0.000 NA   NA
 7445689 7445690 KP1_6053 KP1_6054     FALSE 0.268 24.000 0.000 NA   NA
 7445690 7445691 KP1_6054 KP1_6055     FALSE 0.173 37.000 0.000 NA   NA
 7445691 7445692 KP1_6055 KP1_6056     FALSE 0.268 24.000 0.000 NA   NA
 7445692 7445693 KP1_6056 KP1_6057     TRUE 0.580 9.000 0.000 NA   NA
 7445693 7445694 KP1_6057 KP1_1645   asnB FALSE 0.005 238.000 0.000 NA   NA
 7445694 7445695 KP1_1645 KP1_1646 asnB nagD FALSE 0.018 174.000 0.000 1.000 N NA
 7445695 7445696 KP1_1646 KP1_1647 nagD nagC FALSE 0.517 117.000 0.047 1.000 Y NA
 7445696 7445697 KP1_1647 KP1_1648 nagC nagA TRUE 0.994 9.000 0.571 1.000 Y NA
 7445697 7445698 KP1_1648 KP1_1650 nagA nagB TRUE 0.937 114.000 0.557 0.001 Y NA
 7445699 7445700 KP1_1651 KP1_1653 nagE glnS FALSE 0.017 179.000 0.006 1.000 N NA
 7445702 7445703 KP1_1655 KP1_1656     TRUE 0.840 -42.000 0.000 0.001   NA
 7445703 7445704 KP1_1656 KP1_1657     FALSE 0.133 48.000 0.000 NA   NA
 7445705 7445706 KP1_1658 KP1_1659 citA fur FALSE 0.177 50.000 0.000 1.000   NA
 7445706 7445707 KP1_1659 KP1_1660 fur fldA FALSE 0.023 292.000 0.156 1.000 N NA
 7445707 7445708 KP1_1660 KP1_1661 fldA   TRUE 0.687 83.000 0.473 1.000   NA
 7445708 7445709 KP1_1661 KP1_1662   ybfF TRUE 0.578 65.000 0.276 NA   NA
 7445710 7445711 KP1_1663 KP1_1664   pgm TRUE 0.879 12.000 0.151 1.000 N NA
 7445711 7445712 KP1_1664 KP1_1665 pgm ydgI FALSE 0.114 55.000 0.000 NA   NA
 7445713 7445714 KP1_1666 KP1_1667 kdpE kdpD TRUE 0.991 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 7445714 7445715 KP1_1667 KP1_1668 kdpD kdpC TRUE 0.889 1.000 0.100 1.000 N NA
 7445715 7445716 KP1_1668 KP1_1669 kdpC kdpB TRUE 0.998 11.000 0.877 0.001 Y NA
 7445716 7445717 KP1_1669 KP1_1670 kdpB kdpA TRUE 0.981 21.000 0.201 0.001 Y NA
 7445718 7445719 KP1_1671 KP1_1672   phrB FALSE 0.011 184.000 0.004 NA   NA
 7445721 7445722 KP1_1674 KP1_1675   ybgJ TRUE 0.640 15.000 0.050 NA   NA
 7445722 7445723 KP1_1675 KP1_1676 ybgJ ybgK TRUE 0.987 -6.000 0.379 NA Y NA
 7445723 7445724 KP1_1676 KP1_1677 ybgK   TRUE 0.880 -10.000 0.211 NA   NA
 7445724 7445725 KP1_1677 KP1_1678     FALSE 0.388 82.000 0.173 NA   NA
 7445725 7445726 KP1_1678 KP1_1679     TRUE 0.988 -3.000 0.939 NA   NA
 7445726 7445727 KP1_1679 KP1_1680     TRUE 0.948 10.000 0.300 NA   NA
 7445727 7445728 KP1_1680 KP1_1681   nei TRUE 0.595 16.000 0.033 1.000 N NA
 7445730 7445731 KP1_1683 KP1_1684 sdhC sdhD TRUE 0.996 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 7445731 7445732 KP1_1684 KP1_1685 sdhD sdhA TRUE 0.998 0.000 0.705 0.002 Y NA
 7445732 7445733 KP1_1685 KP1_1686 sdhA sdhB TRUE 0.995 16.000 0.604 0.002 Y NA
 7445733 7445734 KP1_1686 KP1_1687 sdhB sucA FALSE 0.047 382.000 0.067 1.000 Y NA
 7445734 7445735 KP1_1687 KP1_1688 sucA sucB TRUE 0.991 15.000 0.667 1.000 Y NA
 7445735 7445736 KP1_1688 KP1_1689 sucB sucC TRUE 0.673 104.000 0.136 1.000 Y NA
 7445736 7445737 KP1_1689 KP1_1690 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.000 Y NA
 7445739 7445740 KP1_1693 KP1_1694 cydA cydB TRUE 0.981 16.000 0.174 0.043 Y NA
 7445740 7445741 KP1_1694 KP1_1695 cydB ybgT TRUE 0.805 16.000 0.149 NA   NA
 7445741 7445742 KP1_1695 KP1_1696 ybgT   TRUE 0.961 0.000 0.310 NA   NA
 7445742 7445743 KP1_1696 KP1_1697     FALSE 0.077 150.000 0.095 NA   NA
 7445743 7445744 KP1_1697 KP1_1699   tolQ TRUE 0.980 -3.000 0.593 1.000   NA
 7445744 7445745 KP1_1699 KP1_1700 tolQ tolR TRUE 0.997 4.000 0.556 0.087 Y NA
 7445745 7445746 KP1_1700 KP1_1701 tolR tolA FALSE 0.085 100.000 0.020 NA   NA
 7445746 7445747 KP1_1701 KP1_1702 tolA tolB FALSE 0.042 127.000 0.010 NA   NA
 7445747 7445748 KP1_1702 KP1_1704 tolB pal TRUE 0.976 11.000 0.592 1.000 N NA
 7445748 7445749 KP1_1704 KP1_1705 pal ybgF TRUE 0.854 10.000 0.088 1.000   NA
 7445749 7445750 KP1_1705 KP1_6058 ybgF   FALSE 0.015 162.000 0.000 NA   NA
 7445750 7445751 KP1_6058 KP1_6059     FALSE 0.037 126.000 0.000 NA   NA
 7445751 7445752 KP1_6059 KP1_6060     TRUE 0.617 3.000 0.000 NA   NA
 7445752 7445753 KP1_6060 KP1_6061     FALSE 0.020 150.000 0.000 NA   NA
 7445753 7445754 KP1_6061 KP1_6062     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 7445754 7445755 KP1_6062 KP1_6063     FALSE 0.022 147.000 0.000 NA   NA
 7445755 7445756 KP1_6063 KP1_6064     FALSE 0.030 135.000 0.000 NA   NA
 7445756 7445757 KP1_6064 KP1_1706   nadA FALSE 0.001 549.000 0.000 NA   NA
 7445757 7445758 KP1_1706 KP1_1707 nadA pnuC TRUE 0.810 36.000 0.023 1.000 Y NA
 7445759 7445760 KP1_1708 KP1_1709 ybgR ybgS FALSE 0.113 118.000 0.057 NA   NA
 7445762 7445763 KP1_1712 KP1_1714 gpmA galM FALSE 0.054 292.000 0.009 1.000 Y NA
 7445763 7445764 KP1_1714 KP1_1715 galM galK TRUE 0.987 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 7445764 7445765 KP1_1715 KP1_1716 galK galT TRUE 0.989 3.000 0.370 0.001 N NA
 7445765 7445766 KP1_1716 KP1_1717 galT galE TRUE 0.953 10.000 0.053 0.001 N NA
 7445766 7445767 KP1_1717 KP1_1718 galE modF FALSE 0.015 198.000 0.023 1.000   NA
 7445767 7445768 KP1_1718 KP1_1719 modF modE FALSE 0.444 56.000 0.009 0.092   NA
 7445769 7445770 KP1_1720 KP1_1721   modA FALSE 0.075 143.000 0.072 NA   NA
 7445770 7445771 KP1_1721 KP1_1722 modA modB TRUE 0.998 0.000 0.627 0.001 Y NA
 7445771 7445772 KP1_1722 KP1_1723 modB modC TRUE 0.998 3.000 0.537 0.001 Y NA
 7445775 7445776 KP1_1726 KP1_1727     TRUE 0.824 52.000 0.600 NA   NA
 7445776 7445777 KP1_1727 KP1_1728     FALSE 0.425 128.000 0.400 NA   NA
 7445778 7445779 KP1_1729 KP1_1730     FALSE 0.237 156.000 0.333 1.000 N NA
 7445780 7445781 KP1_1731 KP1_1732     FALSE 0.077 82.000 0.000 NA   NA
 7445783 7445784 KP1_1734 KP1_1735     TRUE 0.874 -3.000 0.120 NA   NA
 7445784 7445785 KP1_1735 KP1_1737     TRUE 0.929 1.000 0.185 NA N NA
 7445785 7445786 KP1_1737 KP1_1738     FALSE 0.298 55.000 0.074 NA   NA
 7445787 7445788 KP1_1739 KP1_1740 uspG   TRUE 0.748 52.000 0.400 1.000 N NA
 7445790 7445791 KP1_1742 KP1_1743 hutI hutG TRUE 0.919 -3.000 0.171 1.000 N NA
 7445791 7445792 KP1_1743 KP1_1744 hutG hutC FALSE 0.277 62.000 0.062 1.000 N NA
 7445792 7445793 KP1_1744 KP1_1745 hutC   FALSE 0.056 143.000 0.037 1.000 N NA
 7445793 7445794 KP1_1745 KP1_1746   hutH TRUE 0.996 -3.000 0.315 0.001 Y NA
 7445794 7445795 KP1_1746 KP1_1747 hutH proY FALSE 0.549 99.000 0.008 1.000 Y NA
 7445796 7445797 KP1_1748 KP1_1749 ybhB bioA FALSE 0.090 71.000 0.000 NA   NA
 7445798 7445799 KP1_1750 KP1_1751 bioB bioF TRUE 0.992 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 7445799 7445800 KP1_1751 KP1_1752 bioF bioC TRUE 0.898 -52.000 0.133 0.002 N NA
 7445800 7445801 KP1_1752 KP1_1753 bioC bioD TRUE 0.931 -7.000 0.054 0.002 N NA
 7445802 7445803 KP1_1754 KP1_1755 elsA   FALSE 0.072 87.000 0.000 NA   NA
 7445805 7445806 KP1_1759 KP1_1760     TRUE 0.978 4.000 0.095 1.000 Y NA
 7445806 7445807 KP1_1760 KP1_1761     TRUE 0.888 0.000 0.095 1.000   NA
 7445807 7445808 KP1_1761 KP1_1762   ybhK FALSE 0.070 96.000 0.004 NA   NA
 7445808 7445809 KP1_1762 KP1_1763 ybhK   FALSE 0.358 -22.000 0.000 NA   NA
 7445810 7445811 KP1_1764 KP1_1765 moaA moaB TRUE 0.964 24.000 0.108 0.003 Y NA
 7445811 7445812 KP1_1765 KP1_1766 moaB moaC TRUE 0.991 4.000 0.109 0.003 Y NA
 7445812 7445813 KP1_1766 KP1_1767 moaC moaD TRUE 0.989 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 7445813 7445814 KP1_1767 KP1_1768 moaD moaE TRUE 0.997 2.000 0.501 0.003 Y NA
 7445814 7445815 KP1_1768 KP1_1769 moaE ybhL FALSE 0.204 46.000 0.025 NA   NA
 7445816 7445817 KP1_1770 KP1_1771 ybhN ybhO TRUE 0.864 -3.000 0.107 NA   NA
 7445817 7445818 KP1_1771 KP1_1772 ybhO ybhP TRUE 0.941 -3.000 0.250 NA   NA
 7445820 7445821 KP1_1774 KP1_1775 ybhR ybhS TRUE 0.745 130.000 0.609 0.006 N NA
 7445821 7445822 KP1_1775 KP1_1776 ybhS ybhF TRUE 0.977 -10.000 0.547 0.091   NA
 7445822 7445823 KP1_1776 KP1_1777 ybhF   TRUE 0.967 -7.000 0.545 1.000   NA
 7445823 7445824 KP1_1777 KP1_1778   ybiH TRUE 0.951 0.000 0.236 1.000 N NA
 7445824 7445825 KP1_1778 KP1_1779 ybiH   TRUE 0.805 74.000 0.061 0.080 Y NA
 7445826 7445827 KP1_1780 KP1_1781     FALSE 0.003 288.000 0.000 NA   NA
 7445827 7445828 KP1_1781 KP1_1782     FALSE 0.314 51.000 0.075 NA N NA
 7445828 7445829 KP1_1782 KP1_1783     TRUE 0.918 14.000 0.275 1.000 N NA
 7445829 7445830 KP1_1783 KP1_1784     TRUE 0.999 0.000 0.812 0.002 Y NA
 7445830 7445831 KP1_1784 KP1_1785   rhlE FALSE 0.009 215.000 0.000 1.000 N NA
 7445831 7445832 KP1_1785 KP1_1786 rhlE dinG FALSE 0.277 188.000 0.029 0.056 Y NA
 7445832 7445833 KP1_1786 KP1_1787 dinG   FALSE 0.402 30.000 0.041 1.000 N NA
 7445834 7445835 KP1_1788 KP1_1789   ybiI FALSE 0.005 286.000 0.027 NA   NA
 7445835 7445836 KP1_1789 KP1_1790 ybiI   FALSE 0.479 21.000 0.040 NA   NA
 7445836 7445837 KP1_1790 KP1_1791     FALSE 0.118 110.000 0.050 NA   NA
 7445837 7445838 KP1_1791 KP1_1792     FALSE 0.045 118.000 0.000 NA   NA
 7445840 7445841 KP1_1794 KP1_1795 ybiO glnQ FALSE 0.093 112.000 0.039 NA N NA
 7445841 7445842 KP1_1795 KP1_1796 glnQ glnP TRUE 0.965 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 7445842 7445843 KP1_1796 KP1_1797 glnP glnH TRUE 0.610 126.000 0.051 0.086 Y NA
 7445843 7445844 KP1_1797 KP1_1799 glnH dps FALSE 0.002 409.000 0.000 1.000 N NA
 7445844 7445845 KP1_1799 KP1_1800 dps ybiF FALSE 0.011 238.000 0.044 NA   NA
 7445847 7445848 KP1_1802 KP1_1803 ybiP   FALSE 0.004 260.000 0.000 NA   NA
 7445849 7445850 KP1_1804 KP1_1805 mntR ybiR TRUE 0.699 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7445850 7445851 KP1_1805 KP1_1806 ybiR   FALSE 0.041 143.000 0.014 1.000 N NA
 7445851 7445852 KP1_1806 KP1_1807     TRUE 0.624 51.000 0.235 1.000 N NA
 7445853 7445854 KP1_1808 KP1_1809     FALSE 0.165 39.000 0.000 NA   NA
 7445856 7445857 KP1_1811 KP1_1812   exuT2 TRUE 0.979 16.000 0.341 1.000 Y NA
 7445859 7445860 KP1_1814 KP1_1815   ybiV FALSE 0.057 104.000 0.000 NA   NA
 7445860 7445861 KP1_1815 KP1_1816 ybiV ybiW FALSE 0.018 177.000 0.000 1.000   NA
 7445861 7445862 KP1_1816 KP1_1817 ybiW ybiY TRUE 0.985 5.000 0.316 0.002 N NA
 7445862 7445863 KP1_1817 KP1_1818 ybiY moeB FALSE 0.024 155.000 0.000 1.000 N NA
 7445863 7445864 KP1_1818 KP1_1819 moeB moeA TRUE 0.985 -45.000 0.323 0.003 Y NA
 7445865 7445866 KP1_1820 KP1_1821 ybiK yliA TRUE 0.592 18.000 0.042 1.000   NA
 7445866 7445867 KP1_1821 KP1_1822 yliA yliB FALSE 0.355 33.000 0.033 1.000   NA
 7445867 7445868 KP1_1822 KP1_1823 yliB yliC TRUE 0.981 47.000 0.803 0.072 Y NA
 7445868 7445869 KP1_1823 KP1_1824 yliC yliD TRUE 0.998 2.000 0.689 0.072 Y NA
 7445870 7445871 KP1_1825 KP1_1826   fruP FALSE 0.007 233.000 0.000 1.000 N NA
 7445872 7445873 KP1_1827 KP1_1828 yliH yliI FALSE 0.102 116.000 0.047 NA   NA
 7445874 7445875 KP1_1829 KP1_1830 yliJ   FALSE 0.002 340.000 0.000 NA   NA
 7445875 7445876 KP1_1830 KP1_1831     FALSE 0.001 1616.000 0.000 NA   NA
 7445878 7445879 KP1_1833 KP1_1835 deoR ybjG FALSE 0.427 102.000 0.235 1.000   NA
 7445881 7445882 KP1_1837 KP1_1838 ybjI ybjJ TRUE 0.621 0.000 0.000 NA   NA
 7445887 7445888 KP1_1844 KP1_1845   nfsA TRUE 0.813 -16.000 0.159 NA   NA
 7445888 7445889 KP1_1845 KP1_1846 nfsA rimK FALSE 0.065 115.000 0.000 1.000 N NA
 7445889 7445890 KP1_1846 KP1_1847 rimK ybjN FALSE 0.070 89.000 0.000 NA   NA
 7445890 7445891 KP1_1847 KP1_1848 ybjN potF FALSE 0.002 331.000 0.000 NA   NA
 7445891 7445892 KP1_1848 KP1_1849 potF potG TRUE 0.884 116.000 0.679 1.000 Y NA
 7445892 7445893 KP1_1849 KP1_1850 potG potH TRUE 0.996 11.000 0.857 1.000 Y NA
 7445893 7445894 KP1_1850 KP1_1852 potH potI TRUE 0.988 -45.000 0.528 0.071 Y NA
 7445894 7445895 KP1_1852 KP1_1853 potI   TRUE 0.593 58.000 0.264 NA   NA
 7445895 7445896 KP1_1853 KP1_1854   ybjF TRUE 0.653 42.000 0.226 NA   NA
 7445896 7445897 KP1_1854 KP1_1855 ybjF   FALSE 0.153 79.000 0.028 1.000 N NA
 7445897 7445898 KP1_1855 KP1_1856     TRUE 0.994 -3.000 0.566 1.000 Y NA
 7445899 7445900 KP1_1858 KP1_1859 artJ artM FALSE 0.398 184.000 0.143 0.071 Y NA
 7445900 7445901 KP1_1859 KP1_1860 artM artQ TRUE 0.998 0.000 0.714 0.016 Y NA
 7445901 7445902 KP1_1860 KP1_1861 artQ artI TRUE 0.993 7.000 0.260 0.071 Y NA
 7445902 7445903 KP1_1861 KP1_1862 artI artP TRUE 0.991 0.000 0.323 1.000 Y NA
 7445903 7445904 KP1_1862 KP1_1863 artP ybjP FALSE 0.020 227.000 0.081 NA   NA
 7445905 7445906 KP1_1864 KP1_1865   ybjR FALSE 0.250 32.000 0.000 1.000 N NA
 7445907 7445908 KP1_1866 KP1_1867 ybjS ybjT TRUE 0.766 88.000 0.000 0.009 Y NA
 7445908 7445909 KP1_1867 KP1_1868 ybjT ltaE TRUE 0.811 11.000 0.074 1.000 N NA
 7445909 7445910 KP1_1868 KP1_1869 ltaE poxB TRUE 0.811 39.000 0.041 1.000 Y NA
 7445912 7445913 KP1_1872 KP1_1873 hcr hcp TRUE 0.984 11.000 0.059 0.010 Y NA
 7445913 7445914 KP1_1873 KP1_1874 hcp ybjE FALSE 0.050 144.000 0.043 NA   NA
 7445914 7445915 KP1_1874 KP1_1875 ybjE aqpZ FALSE 0.071 116.000 0.025 NA   NA
 7445915 7445916 KP1_1875 KP1_1876 aqpZ   FALSE 0.005 234.000 0.000 NA   NA
 7445917 7445918 KP1_1877 KP1_1879 ybjD macA FALSE 0.061 147.000 0.066 NA N NA
 7445918 7445919 KP1_1879 KP1_1880 macA ybjZ TRUE 0.986 -3.000 0.789 1.000 N NA
 7445921 7445922 KP1_1882 KP1_1883 clpS clpA TRUE 0.956 16.000 0.596 NA   NA
 7445923 7445924 KP1_1884 KP1_1885 infA aat FALSE 0.004 354.000 0.020 1.000 N NA
 7445924 7445925 KP1_1885 KP1_1886 aat cydC TRUE 0.791 45.000 0.049 1.000 Y NA
 7445925 7445926 KP1_1886 KP1_1888 cydC cydD TRUE 0.998 1.000 0.631 0.006 Y NA
 7445926 7445927 KP1_1888 KP1_1889 cydD trxB FALSE 0.532 115.000 0.049 1.000 Y NA
 7445928 7445929 KP1_1890 KP1_1891 lrp ftsK FALSE 0.353 136.000 0.345 1.000 N NA
 7445929 7445930 KP1_1891 KP1_1892 ftsK lolA FALSE 0.391 123.000 0.305 1.000 N NA
 7445930 7445931 KP1_1892 KP1_1893 lolA ycaJ TRUE 0.917 9.000 0.167 1.000 N NA
 7445931 7445932 KP1_1893 KP1_1894 ycaJ serS FALSE 0.428 91.000 0.078 0.091 N NA
 7445932 7445933 KP1_1894 KP1_1895 serS dmsA FALSE 0.010 201.000 0.000 1.000 N NA
 7445933 7445934 KP1_1895 KP1_1897 dmsA dmsB TRUE 0.983 11.000 0.069 0.042 Y NA
 7445934 7445935 KP1_1897 KP1_1898 dmsB dmsC TRUE 0.706 2.000 0.000 1.000   NA
 7445935 7445936 KP1_1898 KP1_1899 dmsC ycaD FALSE 0.003 275.000 0.000 NA   NA
 7445937 7445938 KP1_1900 KP1_1902 pflA pflB FALSE 0.037 192.000 0.092 1.000 N NA
 7445938 7445939 KP1_1902 KP1_1903 pflB focA TRUE 0.713 52.000 0.345 1.000 N NA
 7445939 7445940 KP1_1903 KP1_1904 focA   FALSE 0.002 386.000 0.000 NA   NA
 7445941 7445942 KP1_1905 KP1_1906   serC FALSE 0.012 189.000 0.014 NA   NA
 7445942 7445943 KP1_1906 KP1_1907 serC aroA TRUE 0.661 74.000 0.033 1.000 Y NA
 7445943 7445944 KP1_1907 KP1_1909 aroA cmk FALSE 0.114 175.000 0.209 1.000 N NA
 7445944 7445945 KP1_1909 KP1_1910 cmk rpsA FALSE 0.306 134.000 0.281 1.000 N NA
 7445945 7445946 KP1_1910 KP1_1912 rpsA himD FALSE 0.219 152.000 0.292 1.000 N NA
 7445946 7445947 KP1_1912 KP1_1913 himD ycaI FALSE 0.198 47.000 0.003 1.000   NA
 7445947 7445948 KP1_1913 KP1_1914 ycaI msbA TRUE 0.685 37.000 0.075 0.081   NA
 7445948 7445949 KP1_1914 KP1_1915 msbA lpxK TRUE 0.931 -3.000 0.205 1.000 N NA
 7445949 7445950 KP1_1915 KP1_1916 lpxK   FALSE 0.147 55.000 0.017 NA   NA
 7445950 7445951 KP1_1916 KP1_1917     FALSE 0.126 64.000 0.016 NA   NA
 7445951 7445952 KP1_1917 KP1_1918   kdsB TRUE 0.944 -3.000 0.265 NA   NA
 7445952 7445953 KP1_1918 KP1_1919 kdsB   FALSE 0.041 137.000 0.023 NA   NA
 7445955 7445956 KP1_1921 KP1_1922 smtA mukF TRUE 0.955 -3.000 0.325 NA N NA
 7445956 7445957 KP1_1922 KP1_1923 mukF mukE TRUE 0.872 -46.000 0.000 NA Y NA
 7445957 7445958 KP1_1923 KP1_1924 mukE mukB TRUE 0.989 0.000 0.000 0.000 Y NA
 7445958 7445959 KP1_1924 KP1_1925 mukB ycbB FALSE 0.029 201.000 0.075 1.000   NA
 7445959 7445960 KP1_1925 KP1_1926 ycbB   FALSE 0.053 294.000 0.372 NA   NA
 7445960 7445961 KP1_1926 KP1_1927   ycbL TRUE 0.759 14.000 0.089 NA   NA
 7445962 7445963 KP1_1928 KP1_1929 aspC ompF FALSE 0.030 188.000 0.060 1.000 N NA
 7445965 7445966 KP1_1931 KP1_1932 asnS   FALSE 0.018 176.000 0.005 1.000 N NA
 7445967 7445968 KP1_1933 KP1_1934   sdaC FALSE 0.404 123.000 0.000 NA Y NA
 7445968 7445969 KP1_1934 KP1_1935 sdaC   TRUE 0.848 25.000 0.000 NA Y NA
 7445969 7445970 KP1_1935 KP1_1936     TRUE 0.961 19.000 0.360 0.004   NA
 7445972 7445973 KP1_1938 KP1_1939   pepN FALSE 0.006 215.000 0.000 NA   NA
 7445974 7445975 KP1_1940 KP1_1941 ssuB ssuC TRUE 0.993 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 7445975 7445976 KP1_1941 KP1_1942 ssuC ssuD TRUE 0.927 11.000 0.226 1.000 N NA
 7445976 7445977 KP1_1942 KP1_1943 ssuD ssuA TRUE 0.961 -3.000 0.341 1.000 N NA
 7445977 7445978 KP1_1943 KP1_1944 ssuA ssuE TRUE 0.885 -7.000 0.169 1.000   NA
 7445979 7445980 KP1_1946 KP1_1947 pyrD   FALSE 0.047 170.000 0.081 NA   NA
 7445982 7445983 KP1_1949 KP1_1950 ycbY uup TRUE 0.758 13.000 0.061 1.000   NA
 7445983 7445984 KP1_1950 KP1_1951 uup pqiA TRUE 0.656 15.000 0.054 NA   NA
 7445984 7445985 KP1_1951 KP1_1952 pqiA pqiB TRUE 0.951 -70.000 0.819 NA   NA
 7445985 7445986 KP1_1952 KP1_1953 pqiB   TRUE 0.979 0.000 0.531 NA   NA
 7445987 7445988 KP1_1955 KP1_1956 fabA ycbZ TRUE 0.955 7.000 0.290 1.000 N NA
 7445994 7445995 KP1_1962 KP1_1963 yccS   TRUE 0.681 18.000 0.090 NA   NA
 7445999 7446000 KP1_1967 KP1_1968 yccV yccW FALSE 0.322 60.000 0.094 NA   NA
 7446001 7446002 KP1_1969 KP1_1970     TRUE 0.918 27.000 0.625 NA   NA
 7446002 7446003 KP1_1970 KP1_1971   yccX FALSE 0.187 49.000 0.007 1.000 N NA
 7446004 7446005 KP1_1972 KP1_1973 yccK yccA FALSE 0.311 89.000 0.140 NA   NA
 7446006 7446007 KP1_1974 KP1_1975     FALSE 0.438 -10.000 0.000 NA   NA
 7446007 7446008 KP1_1975 KP1_6065     FALSE 0.445 14.000 0.000 NA   NA
 7446008 7446009 KP1_6065 KP1_1976     FALSE 0.003 304.000 0.000 NA   NA
 7446009 7446010 KP1_1976 KP1_1977     FALSE 0.383 -37.000 0.000 1.000 N NA
 7446011 7446012 KP1_1978 KP1_1979     FALSE 0.037 126.000 0.000 NA   NA
 7446013 7446014 KP1_1980 KP1_1981 sfuA sfuB TRUE 0.993 22.000 0.824 0.071 Y NA
 7446014 7446015 KP1_1981 KP1_1982 sfuB sfuC TRUE 0.978 2.000 0.275 0.071 N NA
 7446015 7446016 KP1_1982 KP1_1983 sfuC   FALSE 0.006 244.000 0.000 1.000 N NA
 7446018 7446019 KP1_1985 KP1_1986     FALSE 0.531 11.000 0.000 NA   NA
 7446020 7446021 KP1_1987 KP1_1988 frwD pflC TRUE 0.828 16.000 0.156 1.000 N NA
 7446021 7446022 KP1_1988 KP1_1989 pflC pflD TRUE 0.953 -34.000 0.312 0.002 N NA
 7446022 7446023 KP1_1989 KP1_1991 pflD frwB TRUE 0.671 50.000 0.280 1.000 N NA
 7446023 7446024 KP1_1991 KP1_1992 frwB frwC TRUE 0.987 21.000 0.400 0.016 Y NA
 7446026 7446027 KP1_1994 KP1_1995     TRUE 0.766 58.000 0.087 1.000 Y NA
 7446027 7446028 KP1_1995 KP1_1996     FALSE 0.411 19.000 0.000 1.000 N NA
 7446028 7446029 KP1_1996 KP1_1997   yeaV TRUE 0.623 37.000 0.167 1.000 N NA
 7446029 7446030 KP1_1997 KP1_1998 yeaV   FALSE 0.023 621.000 0.333 1.000 N NA
 7446032 7446033 KP1_2001 KP1_2002     TRUE 0.989 3.000 0.500 0.036 N NA
 7446033 7446034 KP1_2002 KP1_2003     FALSE 0.286 -55.000 0.000 NA   NA
 7446034 7446035 KP1_2003 KP1_2004     FALSE 0.005 236.000 0.000 NA   NA
 7446035 7446036 KP1_2004 KP1_2005     FALSE 0.480 26.000 0.046 1.000   NA
 7446037 7446038 KP1_2006 KP1_2007   ycjJ FALSE 0.049 300.000 0.000 1.000 Y NA
 7446041 7446042 KP1_2010 KP1_2012     FALSE 0.231 116.000 0.143 NA   NA
 7446044 7446045 KP1_2014 KP1_2015   wrbA TRUE 0.859 21.000 0.290 NA   NA
 7446048 7446049 KP1_2018 KP1_2019     FALSE 0.202 31.000 0.000 NA   NA
 7446050 7446051 KP1_2020 KP1_2021 ycdG ycdH TRUE 0.929 22.000 0.533 1.000   NA
 7446051 7446052 KP1_2021 KP1_2022 ycdH   TRUE 0.976 -25.000 0.625 0.036   NA
 7446052 7446053 KP1_2022 KP1_2023   ycdJ TRUE 0.942 -3.000 0.256 NA   NA
 7446053 7446054 KP1_2023 KP1_2024 ycdJ   TRUE 0.968 0.000 0.365 NA   NA
 7446054 7446055 KP1_2024 KP1_2025   ycdL TRUE 0.954 -7.000 0.442 NA N NA
 7446055 7446056 KP1_2025 KP1_2027 ycdL ycdM TRUE 0.983 0.000 0.621 NA N NA
 7446058 7446059 KP1_2029 KP1_2030   putA FALSE 0.039 186.000 0.094 NA   NA
 7446060 7446061 KP1_2031 KP1_2033 putP betA FALSE 0.071 135.000 0.051 NA   NA
 7446063 7446064 KP1_2035 KP1_2036     TRUE 0.905 52.000 0.356 NA Y NA
 7446064 7446065 KP1_2036 KP1_2037     TRUE 0.991 5.000 0.378 NA Y NA
 7446065 7446066 KP1_2037 KP1_2038     FALSE 0.005 235.000 0.000 NA N NA
 7446066 7446067 KP1_2038 KP1_2039     FALSE 0.010 214.000 0.000 1.000   NA
 7446068 7446069 KP1_6066 KP1_2040     FALSE 0.022 146.000 0.000 NA   NA
 7446069 7446070 KP1_2040 KP1_2041     FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 7446073 7446074 KP1_2043 KP1_2044 ycdW   TRUE 0.751 89.000 0.169 1.000 Y NA
 7446074 7446075 KP1_2044 KP1_2045   ycdY TRUE 0.900 23.000 0.417 1.000   NA
 7446075 7446076 KP1_2045 KP1_2046 ycdY ycdZ FALSE 0.274 104.000 0.145 NA   NA
 7446076 7446077 KP1_2046 KP1_2047 ycdZ   FALSE 0.031 132.000 0.000 NA   NA
 7446077 7446078 KP1_2047 KP1_2048     FALSE 0.094 67.000 0.000 NA   NA
 7446080 7446081 KP1_2050 KP1_2051 mdoG mdoH TRUE 0.957 -7.000 0.469 NA N NA
 7446081 7446082 KP1_2051 KP1_2052 mdoH   FALSE 0.374 67.000 0.135 NA   NA
 7446083 7446084 KP1_2053 KP1_2054   yceE FALSE 0.068 92.000 0.000 NA   NA
 7446084 7446085 KP1_2054 KP1_2055 yceE htrB TRUE 0.578 172.000 0.857 0.080 N NA
 7446087 7446088 KP1_2058 KP1_2059   solA FALSE 0.548 72.000 0.269 NA   NA
 7446088 7446089 KP1_2059 KP1_2060 solA   FALSE 0.453 126.000 0.423 NA   NA
 7446089 7446090 KP1_2060 KP1_2061   dinI FALSE 0.003 300.000 0.000 NA   NA
 7446090 7446091 KP1_2061 KP1_2062 dinI pyrC FALSE 0.531 16.000 0.031 NA   NA
 7446091 7446092 KP1_2062 KP1_2064 pyrC   FALSE 0.053 126.000 0.022 NA   NA
 7446092 7446093 KP1_2064 KP1_2065   yceL FALSE 0.304 114.000 0.196 NA   NA
 7446094 7446095 KP1_2067 KP1_2068 rimJ   TRUE 0.863 10.000 0.116 NA   NA
 7446095 7446096 KP1_2068 KP1_2069   mviM TRUE 0.874 4.000 0.103 NA   NA
 7446096 7446097 KP1_2069 KP1_2070 mviM mviN FALSE 0.161 73.000 0.022 1.000   NA
 7446103 7446104 KP1_2077 KP1_2078   rpmF TRUE 0.952 17.000 0.599 NA   NA
 7446104 7446105 KP1_2078 KP1_2079 rpmF plsX FALSE 0.143 204.000 0.418 1.000 N NA
 7446105 7446106 KP1_2079 KP1_2080 plsX fabH TRUE 0.959 54.000 0.380 0.003 Y NA
 7446106 7446107 KP1_2080 KP1_2081 fabH fabD TRUE 0.984 16.000 0.182 0.003 Y NA
 7446107 7446108 KP1_2081 KP1_2082 fabD fabG TRUE 0.995 13.000 0.432 0.003 Y NA
 7446108 7446109 KP1_2082 KP1_2083 fabG acpP FALSE 0.505 211.000 0.321 0.003 Y NA
 7446109 7446110 KP1_2083 KP1_2084 acpP fabF TRUE 0.844 90.000 0.346 1.000 Y NA
 7446110 7446111 KP1_2084 KP1_2085 fabF pabC FALSE 0.255 126.000 0.187 1.000 N NA
 7446111 7446112 KP1_2085 KP1_2086 pabC yceG TRUE 0.937 2.000 0.204 NA   NA
 7446112 7446113 KP1_2086 KP1_2087 yceG tmk TRUE 0.878 -10.000 0.209 NA   NA
 7446113 7446114 KP1_2087 KP1_2088 tmk holB TRUE 0.933 -3.000 0.211 1.000 N NA
 7446114 7446115 KP1_2088 KP1_2089 holB ycfH TRUE 0.970 11.000 0.110 NA Y NA
 7446115 7446116 KP1_2089 KP1_2090 ycfH ptsG FALSE 0.003 297.000 0.004 NA N NA
 7446116 7446117 KP1_2090 KP1_2092 ptsG   FALSE 0.066 262.000 0.005 1.000 Y NA
 7446117 7446118 KP1_2092 KP1_2093     TRUE 0.792 5.000 0.051 NA   NA
 7446118 7446119 KP1_2093 KP1_2094   ycfM TRUE 0.961 13.000 0.516 NA   NA
 7446119 7446120 KP1_2094 KP1_2095 ycfM ycfN TRUE 0.898 -19.000 0.310 NA   NA
 7446120 7446121 KP1_2095 KP1_2096 ycfN nagZ TRUE 0.786 12.000 0.069 1.000 N NA
 7446121 7446122 KP1_2096 KP1_2097 nagZ   TRUE 0.600 -66.000 0.091 NA   NA
 7446122 7446123 KP1_2097 KP1_2098   ndh FALSE 0.012 246.000 0.057 NA   NA
 7446123 7446124 KP1_2098 KP1_2100 ndh   FALSE 0.064 156.000 0.071 1.000   NA
 7446125 7446126 KP1_2101 KP1_2102   ycfQ FALSE 0.008 223.000 0.000 1.000 N NA
 7446126 7446127 KP1_2102 KP1_2103 ycfQ   TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7446129 7446130 KP1_2105 KP1_2106 ycfS mfd FALSE 0.024 164.000 0.006 1.000   NA
 7446131 7446132 KP1_2107 KP1_2108 ycfU ycfV TRUE 0.942 -7.000 0.175 0.084 N NA
 7446132 7446133 KP1_2108 KP1_2109 ycfV ycfW TRUE 0.957 0.000 0.125 0.084 N NA
 7446133 7446134 KP1_2109 KP1_2110 ycfW ycfX TRUE 0.625 49.000 0.225 1.000 N NA
 7446134 7446135 KP1_2110 KP1_2111 ycfX cobB TRUE 0.958 15.000 0.119 1.000 Y NA
 7446135 7446136 KP1_2111 KP1_2112 cobB   FALSE 0.098 64.000 0.000 NA   NA
 7446137 7446138 KP1_2113 KP1_2114     FALSE 0.414 36.000 0.058 1.000 N NA
 7446139 7446140 KP1_2115 KP1_2116     TRUE 0.673 36.000 0.196 1.000   NA
 7446140 7446141 KP1_2116 KP1_2117     TRUE 0.851 93.000 0.700 0.079   NA
 7446141 7446142 KP1_2117 KP1_2118     TRUE 0.976 2.000 0.444 1.000   NA
 7446142 7446143 KP1_2118 KP1_2121     TRUE 0.966 29.000 0.500 1.000 Y NA
 7446143 7446144 KP1_2121 KP1_2122   talA TRUE 0.983 31.000 0.500 0.003 Y NA
 7446144 7446145 KP1_2122 KP1_2123 talA tktA TRUE 0.975 20.000 0.400 1.000 Y NA
 7446145 7446146 KP1_2123 KP1_2124 tktA   FALSE 0.146 142.000 0.000 0.068 N NA
 7446146 7446147 KP1_2124 KP1_2125     TRUE 0.981 -3.000 0.375 0.068 N NA
 7446148 7446149 KP1_2127 KP1_2128 potD potC TRUE 0.980 -3.000 0.013 0.070 Y NA
 7446149 7446150 KP1_2128 KP1_2129 potC potB TRUE 0.993 -3.000 0.286 0.070 Y NA
 7446150 7446151 KP1_2129 KP1_2130 potB potA TRUE 0.991 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 7446152 7446153 KP1_2131 KP1_2132 pepT   FALSE 0.004 284.000 0.000 1.000 N NA
 7446153 7446154 KP1_2132 KP1_2133     TRUE 0.937 57.000 0.571 1.000 Y NA
 7446154 7446155 KP1_2133 KP1_2134   yafM TRUE 0.749 85.000 0.000 0.054 Y NA
 7446156 7446157 KP1_2135 KP1_2136 ycfD phoQ TRUE 0.624 86.000 0.408 NA   NA
 7446157 7446158 KP1_2136 KP1_2137 phoQ phoP TRUE 0.997 0.000 0.940 1.000 Y NA
 7446159 7446160 KP1_2138 KP1_2139     TRUE 0.824 12.000 0.094 1.000 N NA
 7446161 7446162 KP1_2140 KP1_2141 purB   TRUE 0.864 4.000 0.093 NA   NA
 7446162 7446163 KP1_2141 KP1_2143   trmU FALSE 0.501 55.000 0.180 NA   NA
 7446163 7446164 KP1_2143 KP1_2144 trmU ymfB TRUE 0.912 -3.000 0.158 1.000 N NA
 7446164 7446165 KP1_2144 KP1_2145 ymfB ymfC TRUE 0.836 17.000 0.182 1.000 N NA
 7446167 7446168 KP1_2147 KP1_2148     TRUE 0.988 -10.000 0.714 0.007   NA
 7446168 7446169 KP1_2148 KP1_2149     FALSE 0.003 299.000 0.000 NA   NA
 7446169 7446170 KP1_2149 KP1_2150     FALSE 0.473 13.000 0.000 NA   NA
 7446170 7446171 KP1_2150 KP1_2152     FALSE 0.035 128.000 0.000 NA   NA
 7446171 7446172 KP1_2152 KP1_2154     FALSE 0.008 193.000 0.000 NA   NA
 7446172 7446173 KP1_2154 KP1_2156     FALSE 0.003 459.000 0.039 NA   NA
 7446173 7446174 KP1_2156 KP1_2157     TRUE 0.630 47.000 0.233 NA   NA
 7446177 7446178 KP1_2160 KP1_2161     FALSE 0.006 228.000 0.000 NA   NA
 7446178 7446179 KP1_2161 KP1_2163     FALSE 0.002 342.000 0.000 NA   NA
 7446179 7446180 KP1_2163 KP1_2164     TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7446180 7446181 KP1_2164 KP1_2165     TRUE 0.967 -12.000 0.667 NA   NA
 7446181 7446182 KP1_2165 KP1_2166     TRUE 0.918 -7.000 0.000 0.001   NA
 7446182 7446183 KP1_2166 KP1_2167     TRUE 0.669 -3.000 0.000 1.000   NA
 7446183 7446184 KP1_2167 KP1_2168     TRUE 0.669 -3.000 0.000 1.000   NA
 7446184 7446185 KP1_2168 KP1_2169     FALSE 0.378 -18.000 0.000 NA   NA
 7446185 7446186 KP1_2169 KP1_2170     TRUE 0.610 4.000 0.000 NA   NA
 7446186 7446187 KP1_2170 KP1_2171     FALSE 0.336 19.000 0.000 NA   NA
 7446189 7446190 KP1_2173 KP1_2175     FALSE 0.001 507.000 0.000 NA   NA
 7446190 7446191 KP1_2175 KP1_2176     TRUE 0.945 -10.000 0.429 NA   NA
 7446191 7446192 KP1_2176 KP1_2177     TRUE 0.621 0.000 0.000 NA   NA
 7446192 7446193 KP1_2177 KP1_2178     TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7446193 7446194 KP1_2178 KP1_2180     FALSE 0.031 132.000 0.000 NA   NA
 7446198 7446199 KP1_2185 KP1_2186   yeaS FALSE 0.094 90.000 0.000 1.000 N NA
 7446199 7446200 KP1_2186 KP1_2187 yeaS   FALSE 0.032 131.000 0.000 NA   NA
 7446201 7446202 KP1_2188 KP1_2189     FALSE 0.309 21.000 0.000 NA   NA
 7446202 7446203 KP1_2189 KP1_2190     FALSE 0.102 61.000 0.000 NA   NA
 7446203 7446204 KP1_2190 KP1_2191     TRUE 0.807 22.000 0.222 NA   NA
 7446206 7446207 KP1_2193 KP1_2194     FALSE 0.433 -16.000 0.010 NA   NA
 7446209 7446210 KP1_2196 KP1_2197   yeaN FALSE 0.358 -22.000 0.000 NA   NA
 7446212 7446213 KP1_2199 KP1_2200     FALSE 0.061 118.000 0.018 NA   NA
 7446213 7446214 KP1_2200 KP1_2201     FALSE 0.069 91.000 0.000 NA   NA
 7446217 7446218 KP1_2205 KP1_2206 umuD umuC TRUE 0.975 3.000 0.429 1.000 N NA
 7446227 7446228 KP1_2215 KP1_2216     TRUE 0.768 86.000 0.683 NA   NA
 7446229 7446230 KP1_2218 KP1_2219 mipA yeaE FALSE 0.258 62.000 0.067 NA   NA
 7446231 7446232 KP1_2220 KP1_2222   gapA TRUE 0.775 75.000 0.154 1.000 Y NA
 7446233 7446234 KP1_2223 KP1_2224 yeaA   TRUE 0.620 44.000 0.216 NA   NA
 7446235 7446236 KP1_2225 KP1_2226     FALSE 0.031 161.000 0.023 1.000   NA
 7446236 7446237 KP1_2226 KP1_2227   pncA FALSE 0.043 135.000 0.000 1.000   NA
 7446237 7446238 KP1_2227 KP1_2228 pncA pncA TRUE 0.857 -9.000 0.005 0.067   NA
 7446238 7446239 KP1_2228 KP1_2229 pncA ansA TRUE 0.762 10.000 0.040 1.000 N NA
 7446239 7446240 KP1_2229 KP1_2230 ansA sppA FALSE 0.127 139.000 0.113 1.000 N NA
 7446243 7446244 KP1_2233 KP1_2236 selD topB TRUE 0.794 5.000 0.041 1.000 N NA
 7446244 7446245 KP1_2236 KP1_2237 topB   FALSE 0.015 180.000 0.000 1.000 N NA
 7446246 7446247 KP1_2238 KP1_2239 gdhA nudG FALSE 0.015 183.000 0.000 1.000 N NA
 7446249 7446250 KP1_2242 KP1_2243 ynjE ynjD FALSE 0.047 190.000 0.111 1.000   NA
 7446250 7446251 KP1_2243 KP1_2244 ynjD ynjC TRUE 0.984 0.000 0.602 1.000   NA
 7446251 7446252 KP1_2244 KP1_2245 ynjC   TRUE 0.974 -27.000 0.627 0.069   NA
 7446252 7446253 KP1_2245 KP1_2246     TRUE 0.741 3.000 0.032 NA   NA
 7446253 7446254 KP1_2246 KP1_2247     TRUE 0.838 -3.000 0.087 NA   NA
 7446254 7446255 KP1_2247 KP1_2248     TRUE 0.787 -13.000 0.125 NA   NA
 7446255 7446256 KP1_2248 KP1_2250   xthA FALSE 0.009 214.000 0.016 NA   NA
 7446257 7446258 KP1_2251 KP1_2252 argD astA TRUE 0.961 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7446258 7446259 KP1_2252 KP1_2253 astA astD TRUE 0.654 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7446259 7446260 KP1_2253 KP1_2254 astD astB TRUE 0.955 -3.000 0.306 1.000 N NA
 7446260 7446261 KP1_2254 KP1_2256 astB astE TRUE 0.958 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7446261 7446262 KP1_2256 KP1_2258 astE spy FALSE 0.002 347.000 0.000 NA N NA
 7446263 7446264 KP1_2259 KP1_2260 ydjQ nadE FALSE 0.096 101.000 0.010 1.000   NA
 7446265 7446266 KP1_2261 KP1_2262 osmE celA FALSE 0.005 279.000 0.000 1.000   NA
 7446266 7446267 KP1_2262 KP1_2264 celA celB FALSE 0.467 148.000 0.000 0.015 Y NA
 7446267 7446268 KP1_2264 KP1_2265 celB celC TRUE 0.981 54.000 0.833 0.015 Y NA
 7446268 7446269 KP1_2265 KP1_2266 celC celD TRUE 0.887 13.000 0.182 1.000 N NA
 7446269 7446270 KP1_2266 KP1_2267 celD celF FALSE 0.437 111.000 0.286 1.000 N NA
 7446270 7446271 KP1_2267 KP1_2268 celF   TRUE 0.979 13.000 0.444 0.024   NA
 7446272 7446273 KP1_2269 KP1_2270 katE katE TRUE 0.804 -198.000 0.000 0.001   NA
 7446275 7446276 KP1_2272 KP1_2273 ydjN ydjM FALSE 0.117 136.000 0.102 NA   NA
 7446276 7446277 KP1_2273 KP1_2274 ydjM kduD FALSE 0.105 92.000 0.026 NA   NA
 7446277 7446278 KP1_2274 KP1_2275 kduD yniC FALSE 0.160 150.000 0.048 0.067   NA
 7446280 7446281 KP1_2277 KP1_2278 yciA iroN FALSE 0.080 100.000 0.020 NA N NA
 7446281 7446282 KP1_2278 KP1_2279 iroN ispZ FALSE 0.009 209.000 0.000 1.000 N NA
 7446282 7446283 KP1_2279 KP1_2280 ispZ   FALSE 0.270 55.000 0.061 NA   NA
 7446283 7446284 KP1_2280 KP1_2281   ykgJ TRUE 0.706 26.000 0.169 NA   NA
 7446286 7446287 KP1_2283 KP1_2284 ybiX ybiL TRUE 0.556 49.000 0.171 1.000   NA
 7446287 7446288 KP1_2284 KP1_2285 ybiL   FALSE 0.004 310.000 0.000 1.000 N NA
 7446293 7446294 KP1_2291 KP1_2292     TRUE 0.603 15.000 0.043 NA N NA
 7446294 7446295 KP1_2292 KP1_2293     TRUE 0.910 3.000 0.130 1.000 N NA
 7446296 7446297 KP1_2294 KP1_2295 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.000 Y NA
 7446297 7446298 KP1_2295 KP1_2296 trpB trpC TRUE 0.994 10.000 0.221 0.001 Y NA
 7446298 7446299 KP1_2296 KP1_2297 trpC trpD TRUE 0.990 4.000 0.293 1.000 Y NA
 7446299 7446300 KP1_2297 KP1_2298 trpD trpE TRUE 0.989 0.000 0.010 0.001 Y NA
 7446301 7446302 KP1_2299 KP1_2300 trpH   TRUE 0.884 17.000 0.281 NA   NA
 7446304 7446305 KP1_2302 KP1_2303   yciL FALSE 0.004 282.000 0.000 1.000 N NA
 7446306 7446307 KP1_2304 KP1_2305 btuR yciK TRUE 0.798 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7446308 7446309 KP1_2306 KP1_2307   sohB FALSE 0.142 45.000 0.000 NA   NA
 7446311 7446312 KP1_2310 KP1_2311   topA FALSE 0.004 257.000 0.000 NA   NA
 7446312 7446313 KP1_2311 KP1_2312 topA cysB FALSE 0.004 346.000 0.008 1.000 N NA
 7446313 7446314 KP1_2312 KP1_2314 cysB   FALSE 0.005 246.000 0.000 NA   NA
 7446314 7446315 KP1_2314 KP1_2315   acnA FALSE 0.002 389.000 0.000 NA   NA
 7446317 7446318 KP1_2317 KP1_2318 pgpB   FALSE 0.154 136.000 0.143 NA   NA
 7446318 7446319 KP1_2318 KP1_2319   yciM TRUE 0.979 7.000 0.576 NA   NA
 7446319 7446320 KP1_2319 KP1_2320 yciM pyrF FALSE 0.049 192.000 0.125 1.000 N NA
 7446320 7446321 KP1_2320 KP1_2321 pyrF   TRUE 0.816 0.000 0.045 1.000 N NA
 7446322 7446323 KP1_2322 KP1_2323 osmB yciT FALSE 0.003 276.000 0.000 NA   NA
 7446323 7446324 KP1_2323 KP1_2324 yciT   FALSE 0.381 72.000 0.146 NA   NA
 7446324 7446325 KP1_2324 KP1_2325   rnb FALSE 0.016 159.000 0.000 NA   NA
 7446325 7446326 KP1_2325 KP1_2326 rnb yciW FALSE 0.275 82.000 0.105 NA   NA
 7446326 7446327 KP1_2326 KP1_2327 yciW fabI FALSE 0.023 191.000 0.057 NA   NA
 7446327 7446328 KP1_2327 KP1_2329 fabI   FALSE 0.008 199.000 0.000 NA   NA
 7446330 7446331 KP1_2331 KP1_2332 sapF sapD TRUE 0.998 2.000 0.684 0.023 Y NA
 7446331 7446332 KP1_2332 KP1_2333 sapD sapC TRUE 0.996 0.000 0.667 1.000 Y NA
 7446332 7446333 KP1_2333 KP1_2334 sapC sapB TRUE 0.986 -13.000 0.284 0.069 Y NA
 7446333 7446334 KP1_2334 KP1_2335 sapB sapA TRUE 0.974 -3.000 0.264 0.069 N NA
 7446334 7446335 KP1_2335 KP1_2336 sapA   FALSE 0.003 334.000 0.000 1.000 N NA
 7446338 7446339 KP1_2339 KP1_2340     TRUE 0.882 41.000 0.667 NA   NA
 7446341 7446342 KP1_2342 KP1_2343 pspA pspB TRUE 0.850 56.000 0.739 NA   NA
 7446342 7446343 KP1_2343 KP1_2344 pspB pspC TRUE 0.990 0.000 0.913 NA   NA
 7446343 7446344 KP1_2344 KP1_2345 pspC pspD TRUE 0.664 29.000 0.167 NA   NA
 7446344 7446345 KP1_2345 KP1_2346 pspD ycjX FALSE 0.134 103.000 0.052 NA   NA
 7446345 7446346 KP1_2346 KP1_2347 ycjX   TRUE 0.986 -3.000 0.791 NA   NA
 7446348 7446349 KP1_2349 KP1_2350   tyrR FALSE 0.018 173.000 0.000 1.000 N NA
 7446349 7446350 KP1_2350 KP1_2351 tyrR   FALSE 0.072 102.000 0.013 NA   NA
 7446354 7446355 KP1_2355 KP1_2356   mppA TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7446356 7446357 KP1_2357 KP1_2358     TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7446358 7446359 KP1_2359 KP1_2360     FALSE 0.305 -40.000 0.000 NA   NA
 7446359 7446360 KP1_2360 KP1_2361     FALSE 0.293 22.000 0.000 NA   NA
 7446360 7446361 KP1_2361 KP1_2362     FALSE 0.008 192.000 0.000 NA   NA
 7446363 7446364 KP1_2364 KP1_2365     FALSE 0.056 105.000 0.000 NA   NA
 7446364 7446365 KP1_2365 KP1_2366     FALSE 0.050 113.000 0.000 NA   NA
 7446365 7446366 KP1_2366 KP1_2367     TRUE 0.620 2.000 0.000 NA   NA
 7446366 7446367 KP1_2367 KP1_2369     FALSE 0.002 384.000 0.000 NA   NA
 7446367 7446368 KP1_2369 KP1_2370     TRUE 0.621 0.000 0.000 NA   NA
 7446370 7446371 KP1_2372 KP1_2373     FALSE 0.247 52.000 0.049 NA   NA
 7446371 7446372 KP1_2373 KP1_2374     FALSE 0.079 79.000 0.000 NA   NA
 7446373 7446374 KP1_2375 KP1_2376     TRUE 0.966 -10.000 0.600 1.000 N NA
 7446374 7446375 KP1_2376 KP1_2377     TRUE 0.918 3.000 0.143 1.000   NA
 7446375 7446376 KP1_2377 KP1_2378     TRUE 0.893 -3.000 0.143 NA   NA
 7446376 7446377 KP1_2378 KP1_2379     TRUE 0.976 -15.000 0.909 NA   NA
 7446377 7446378 KP1_2379 KP1_2380     TRUE 0.929 -60.000 0.588 NA   NA
 7446378 7446379 KP1_2380 KP1_2381     TRUE 0.960 -36.000 0.824 NA   NA
 7446380 7446381 KP1_2382 KP1_2383     TRUE 0.739 11.000 0.051 NA   NA
 7446381 7446382 KP1_2383 KP1_2384     TRUE 0.957 9.000 0.333 NA   NA
 7446382 7446383 KP1_2384 KP1_2385     TRUE 0.973 -31.000 0.200 0.095 Y NA
 7446383 7446384 KP1_2385 KP1_2386     TRUE 0.987 -19.000 0.600 1.000 Y NA
 7446386 7446387 KP1_2388 KP1_2389     FALSE 0.009 217.000 0.000 1.000   NA
 7446389 7446390 KP1_2392 KP1_2393     TRUE 0.809 37.000 0.400 NA   NA
 7446390 7446391 KP1_2393 KP1_2395     FALSE 0.473 13.000 0.000 NA   NA
 7446391 7446392 KP1_2395 KP1_2396     TRUE 0.985 -3.000 0.750 NA   NA
 7446392 7446393 KP1_2396 KP1_2397     TRUE 0.973 -3.000 0.500 NA   NA
 7446393 7446394 KP1_2397 KP1_2398     TRUE 0.981 5.000 0.600 NA   NA
 7446394 7446395 KP1_2398 KP1_2399     FALSE 0.020 264.000 0.125 NA   NA
 7446395 7446396 KP1_2399 KP1_2400     TRUE 0.728 -28.000 0.125 NA   NA
 7446396 7446397 KP1_2400 KP1_2401     TRUE 0.916 -3.000 0.182 NA   NA
 7446397 7446398 KP1_2401 KP1_2402     FALSE 0.350 18.000 0.000 NA   NA
 7446398 7446399 KP1_2402 KP1_2403     TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7446399 7446400 KP1_2403 KP1_2404     FALSE 0.004 260.000 0.000 NA   NA
 7446400 7446401 KP1_2404 KP1_2405   trp1400A TRUE 0.826 -28.000 0.000 0.007   NA
 7446401 7446402 KP1_2405 KP1_2406 trp1400A   FALSE 0.411 75.000 0.000 0.053   NA
 7446402 7446403 KP1_2406 KP1_2407     FALSE 0.505 -13.000 0.000 1.000   NA
 7446403 7446404 KP1_2407 KP1_2408     TRUE 0.578 -3.000 0.000 NA   NA
 7446404 7446405 KP1_2408 KP1_2409     FALSE 0.283 -58.000 0.000 NA   NA
 7446405 7446406 KP1_2409 KP1_2411     FALSE 0.010 184.000 0.000 NA   NA
 7446406 7446407 KP1_2411 KP1_2412     FALSE 0.002 415.000 0.000 NA   NA
 7446407 7446408 KP1_2412 KP1_2413     TRUE 0.936 -51.000 0.625 NA   NA
 7446408 7446409 KP1_2413 KP1_2414     TRUE 0.893 0.000 0.120 NA   NA
 7446409 7446410 KP1_2414 KP1_2415     FALSE 0.342 31.000 0.040 NA   NA
 7446410 7446411 KP1_2415 KP1_2418     TRUE 0.948 -3.000 0.286 NA   NA
 7446411 7446412 KP1_2418 KP1_2419     FALSE 0.082 77.000 0.000 NA   NA
 7446412 7446413 KP1_2419 KP1_2420     TRUE 0.955 -36.000 0.750 NA   NA
 7446413 7446414 KP1_2420 KP1_2421     TRUE 0.963 -22.000 0.750 NA   NA
 7446414 7446415 KP1_2421 KP1_2422     FALSE 0.036 127.000 0.000 NA   NA
 7446420 7446421 KP1_2427 KP1_2428     FALSE 0.323 20.000 0.000 NA   NA
 7446424 7446425 KP1_2431 KP1_2432     TRUE 0.577 -7.000 0.000 1.000   NA
 7446429 7446430 KP1_2436 KP1_2437     TRUE 0.967 -3.000 0.051 NA Y NA
 7446430 7446431 KP1_2437 KP1_2438     TRUE 0.989 -7.000 0.487 1.000 Y NA
 7446432 7446433 KP1_2440 KP1_2442     TRUE 0.557 39.000 0.146 NA   NA
 7446433 7446434 KP1_2442 KP1_2443     FALSE 0.009 252.000 0.045 NA   NA
 7446435 7446436 KP1_2444 KP1_2445 aroP   FALSE 0.004 251.000 0.000 NA   NA
 7446437 7446438 KP1_2446 KP1_2447     FALSE 0.005 237.000 0.000 NA   NA
 7446438 7446439 KP1_2447 KP1_2448     TRUE 0.689 -64.000 0.120 1.000   NA
 7446440 7446441 KP1_2449 KP1_2450 ydaN dbpA FALSE 0.002 526.000 0.000 1.000 N NA