MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter jejuni subsp. jejuni CG8421

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5989068 5989069 Cj8421_0433 Cj8421_0434 pgm fabG FALSE 0.339 72.000 0.018 1.000 N NA
 5989069 5989070 Cj8421_0434 Cj8421_0435 fabG   TRUE 0.778 7.000 0.005 1.000   NA
 5989070 5989071 Cj8421_0435 Cj8421_0436   sdhA FALSE 0.047 396.000 0.000 1.000   NA
 5989071 5989072 Cj8421_0436 Cj8421_0437 sdhA sdhB TRUE 0.986 -3.000 0.279 0.006 Y NA
 5989072 5989073 Cj8421_0437 Cj8421_0438 sdhB sdhC TRUE 0.995 4.000 0.175 0.006 Y NA
 5989075 5989076 Cj8421_0441 Cj8421_0442 fabF accA TRUE 0.965 2.000 0.046 1.000 Y NA
 5989076 5989077 Cj8421_0442 Cj8421_0445 accA   FALSE 0.044 2293.000 0.000 1.000   NA
 5989078 5989079 Cj8421_0448 Cj8421_0449   rpmB FALSE 0.065 185.000 0.004 NA   NA
 5989080 5989081 Cj8421_0450 Cj8421_0451 rep dnaQ TRUE 0.759 66.000 0.279 1.000 N NA
 5989081 5989082 Cj8421_0451 Cj8421_0452 dnaQ thiC FALSE 0.105 175.000 0.007 1.000 N NA
 5989083 5989084 Cj8421_0453 Cj8421_0454     TRUE 0.985 -61.000 0.448 NA   NA
 5989084 5989085 Cj8421_0454 Cj8421_0455     TRUE 0.966 -3.000 1.000 NA   NA
 5989085 5989086 Cj8421_0455 Cj8421_0456     TRUE 0.984 2.000 0.462 NA   NA
 5989086 5989087 Cj8421_0456 Cj8421_0457     TRUE 0.903 -37.000 0.029 NA   NA
 5989087 5989088 Cj8421_0457 Cj8421_0458     TRUE 0.616 39.000 0.033 NA   NA
 5989093 5989094 Cj8421_0467 Cj8421_0468     TRUE 0.795 15.000 0.048 NA N NA
 5989094 5989095 Cj8421_0468 Cj8421_0469     TRUE 0.995 -7.000 0.841 0.016 Y NA
 5989095 5989096 Cj8421_0469 Cj8421_0470     TRUE 0.994 2.000 0.773 1.000 Y NA
 5989096 5989097 Cj8421_0470 Cj8421_0471   tuf FALSE 0.303 656.000 0.000 0.010 N NA
 5989097 5989098 Cj8421_0471 Cj8421_0472 tuf rpmG TRUE 0.798 53.000 0.099 1.000 Y NA
 5989098 5989099 Cj8421_0472 Cj8421_0474 rpmG nusG FALSE 0.052 296.000 0.000 1.000 N NA
 5989099 5989100 Cj8421_0474 Cj8421_0475 nusG rplK TRUE 0.947 26.000 0.681 1.000 N NA
 5989100 5989101 Cj8421_0475 Cj8421_0476 rplK rplA TRUE 0.981 55.000 0.838 0.044 Y NA
 5989101 5989102 Cj8421_0476 Cj8421_0477 rplA rplJ TRUE 0.836 152.000 0.302 0.044 Y NA
 5989102 5989103 Cj8421_0477 Cj8421_0478 rplJ rplL TRUE 0.994 21.000 0.884 0.032 Y NA
 5989103 5989104 Cj8421_0478 Cj8421_0479 rplL rpoB TRUE 0.539 109.000 0.223 1.000   NA
 5989104 5989105 Cj8421_0479 Cj8421_0480 rpoB rpoC TRUE 0.998 -37.000 0.851 0.002   NA
 5989105 5989106 Cj8421_0480 Cj8421_0492 rpoC rpsL FALSE 0.418 120.000 0.122 1.000 N NA
 5989106 5989107 Cj8421_0492 Cj8421_0493 rpsL rpsG TRUE 0.975 69.000 0.620 0.007 Y NA
 5989107 5989108 Cj8421_0493 Cj8421_0494 rpsG fusA TRUE 0.802 118.000 0.579 1.000 Y NA
 5989108 5989109 Cj8421_0494 Cj8421_0496 fusA   FALSE 0.049 278.000 0.000 1.000   NA
 5989109 5989110 Cj8421_0496 Cj8421_0497     TRUE 0.847 -10.000 0.064 NA   NA
 5989110 5989111 Cj8421_0497 Cj8421_0498     TRUE 0.959 -27.000 0.228 NA   NA
 5989111 5989112 Cj8421_0498 Cj8421_0499   trpC TRUE 0.759 -3.000 0.044 1.000   NA
 5989112 5989113 Cj8421_0499 Cj8421_0500 trpC   TRUE 0.856 10.000 0.026 1.000 N NA
 5989113 5989114 Cj8421_0500 Cj8421_0501     TRUE 0.786 -10.000 0.030 NA   NA
 5989115 5989116 Cj8421_0504 Cj8421_0505 hemH   TRUE 0.520 21.000 0.005 1.000   NA
 5989116 5989117 Cj8421_0505 Cj8421_0506     TRUE 0.952 5.000 0.117 1.000   NA
 5989118 5989119 Cj8421_0507 Cj8421_0508 alaS maf TRUE 0.802 0.000 0.015 NA N NA
 5989119 5989120 Cj8421_0508 Cj8421_0509 maf pbpA TRUE 0.673 -3.000 0.026 NA N NA
 5989121 5989122 Cj8421_0510 Cj8421_0511 clpB   FALSE 0.390 112.000 0.108 NA   NA
 5989123 5989124 Cj8421_0512 Cj8421_0513   purC TRUE 0.937 2.000 0.045 1.000 N NA
 5989124 5989125 Cj8421_0513 Cj8421_0514 purC   TRUE 0.987 9.000 0.460 1.000 Y NA
 5989125 5989126 Cj8421_0514 Cj8421_0515   purQ TRUE 0.999 2.000 0.656 0.002 Y NA
 5989126 5989127 Cj8421_0515 Cj8421_0516 purQ   FALSE 0.217 151.000 0.038 NA   NA
 5989127 5989128 Cj8421_0516 Cj8421_0517   plsC TRUE 0.985 -19.000 0.846 NA   NA
 5989128 5989129 Cj8421_0517 Cj8421_0518 plsC crcB TRUE 0.571 51.000 0.038 NA N NA
 5989129 5989130 Cj8421_0518 Cj8421_0519 crcB htpG FALSE 0.207 73.000 0.007 NA N NA
 5989130 5989131 Cj8421_0519 Cj8421_0520 htpG   TRUE 0.501 -3.000 0.007 NA N NA
 5989131 5989132 Cj8421_0520 Cj8421_0521     TRUE 0.970 0.000 0.400 NA   NA
 5989132 5989133 Cj8421_0521 Cj8421_0524     FALSE 0.422 142.000 0.200 NA   NA
 5989134 5989135 Cj8421_0525 Cj8421_0526 pbpB fliE TRUE 0.972 7.000 0.303 1.000 N NA
 5989135 5989136 Cj8421_0526 Cj8421_0527 fliE flgC TRUE 0.995 7.000 0.271 0.008 Y NA
 5989136 5989137 Cj8421_0527 Cj8421_0528 flgC flgB TRUE 0.990 10.000 0.804 1.000 Y NA
 5989137 5989138 Cj8421_0528 Cj8421_0529 flgB   FALSE 0.178 81.000 0.005 1.000   NA
 5989139 5989140 Cj8421_0530 Cj8421_0531   icd FALSE 0.132 117.000 0.011 NA   NA
 5989140 5989141 Cj8421_0531 Cj8421_0532 icd mdh TRUE 0.816 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 5989141 5989142 Cj8421_0532 Cj8421_0533 mdh sucC TRUE 0.945 1.000 0.022 1.000 Y NA
 5989142 5989143 Cj8421_0533 Cj8421_0534 sucC sucD TRUE 0.994 10.000 0.169 0.002 Y NA
 5989143 5989144 Cj8421_0534 Cj8421_0535 sucD oorD TRUE 0.924 14.000 0.097 1.000 Y NA
 5989144 5989145 Cj8421_0535 Cj8421_0536 oorD oorA TRUE 0.996 9.000 0.316 0.004 Y NA
 5989145 5989146 Cj8421_0536 Cj8421_0537 oorA oorB TRUE 0.999 1.000 0.771 0.003 Y NA
 5989146 5989147 Cj8421_0537 Cj8421_0538 oorB oorC TRUE 0.988 -3.000 0.324 0.004 Y NA
 5989147 5989148 Cj8421_0538 Cj8421_0539 oorC   FALSE 0.287 158.000 0.083 NA   NA
 5989148 5989149 Cj8421_0539 Cj8421_0540     TRUE 0.986 3.000 0.514 NA   NA
 5989149 5989150 Cj8421_0540 Cj8421_0541     FALSE 0.329 80.000 0.030 NA   NA
 5989150 5989151 Cj8421_0541 Cj8421_0542   hemA TRUE 0.947 0.000 0.051 1.000 Y NA
 5989151 5989152 Cj8421_0542 Cj8421_0543 hemA proS TRUE 0.960 -16.000 0.040 0.063 N NA
 5989152 5989153 Cj8421_0543 Cj8421_0544 proS   TRUE 0.667 -3.000 0.022 1.000   NA
 5989153 5989154 Cj8421_0544 Cj8421_0545   hemC TRUE 0.595 -3.000 0.013 1.000   NA
 5989154 5989155 Cj8421_0545 Cj8421_0546 hemC   TRUE 0.723 -3.000 0.009 NA Y NA
 5989155 5989156 Cj8421_0546 Cj8421_0547   flaG FALSE 0.140 157.000 0.018 NA N NA
 5989156 5989157 Cj8421_0547 Cj8421_0550 flaG fliS FALSE 0.106 1942.000 0.000 NA Y NA
 5989157 5989158 Cj8421_0550 Cj8421_0552 fliS efp FALSE 0.048 688.000 0.000 1.000 N NA
 5989158 5989159 Cj8421_0552 Cj8421_0553 efp   FALSE 0.059 160.000 0.002 NA   NA
 5989159 5989160 Cj8421_0553 Cj8421_0554     TRUE 0.982 -13.000 0.939 NA   NA
 5989160 5989161 Cj8421_0554 Cj8421_0555     TRUE 0.945 10.000 0.202 NA   NA
 5989161 5989162 Cj8421_0555 Cj8421_0556     FALSE 0.149 119.000 0.014 NA   NA
 5989162 5989163 Cj8421_0556 Cj8421_0557     TRUE 0.807 11.000 0.029 NA   NA
 5989164 5989165 Cj8421_0558 Cj8421_0559   proA FALSE 0.166 72.000 0.003 NA   NA
 5989166 5989167 Cj8421_0560 Cj8421_0561     FALSE 0.119 181.000 0.011 1.000 N NA
 5989169 5989170 Cj8421_0563 Cj8421_0564 dnaB   FALSE 0.155 105.000 0.012 NA   NA
 5989170 5989171 Cj8421_0564 Cj8421_0565     FALSE 0.035 621.000 0.000 NA   NA
 5989171 5989172 Cj8421_0565 Cj8421_0566     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 5989172 5989173 Cj8421_0566 Cj8421_0567     FALSE 0.403 14.000 0.000 NA   NA
 5989173 5989174 Cj8421_0567 Cj8421_0571     TRUE 0.964 9.000 0.273 NA   NA
 5989174 5989175 Cj8421_0571 Cj8421_0572     FALSE 0.326 188.000 0.133 NA   NA
 5989175 5989176 Cj8421_0572 Cj8421_0573   ribA FALSE 0.052 299.000 0.000 1.000 N NA
 5989176 5989177 Cj8421_0573 Cj8421_0574 ribA   TRUE 0.609 12.000 0.004 1.000   NA
 5989177 5989178 Cj8421_0574 Cj8421_0577   ilvH FALSE 0.044 1716.000 0.000 1.000   NA
 5989178 5989179 Cj8421_0577 Cj8421_0578 ilvH lpxD TRUE 0.778 -3.000 0.052 1.000 N NA
 5989180 5989181 Cj8421_0579 Cj8421_0580 queA mttB TRUE 0.769 -7.000 0.036 NA N NA
 5989181 5989182 Cj8421_0580 Cj8421_0581 mttB   TRUE 0.991 1.000 0.535 NA Y NA
 5989182 5989183 Cj8421_0581 Cj8421_0582     FALSE 0.353 59.000 0.011 1.000 N NA
 5989184 5989185 Cj8421_0583 Cj8421_0584   lysC TRUE 0.940 2.000 0.051 1.000 N NA
 5989185 5989186 Cj8421_0584 Cj8421_0585 lysC   TRUE 0.924 1.000 0.050 NA   NA
 5989186 5989187 Cj8421_0585 Cj8421_0586     TRUE 0.540 60.000 0.053 NA   NA
 5989187 5989188 Cj8421_0586 Cj8421_0587   folP TRUE 0.940 2.000 0.054 1.000   NA
 5989188 5989189 Cj8421_0587 Cj8421_0588 folP ligA TRUE 0.825 1.000 0.006 1.000 N NA
 5989189 5989190 Cj8421_0588 Cj8421_0589 ligA   TRUE 0.732 -34.000 0.003 NA   NA
 5989190 5989191 Cj8421_0589 Cj8421_0590   tlyA TRUE 0.774 4.000 0.005 NA   NA
 5989191 5989192 Cj8421_0590 Cj8421_0591 tlyA ribF TRUE 0.898 -34.000 0.029 NA N NA
 5989192 5989193 Cj8421_0591 Cj8421_0592 ribF   TRUE 0.928 -13.000 0.051 1.000 Y NA
 5989194 5989195 Cj8421_0593 Cj8421_0594     TRUE 0.935 -3.000 0.500 NA   NA
 5989195 5989196 Cj8421_0594 Cj8421_0595     FALSE 0.367 58.000 0.017 NA   NA
 5989196 5989197 Cj8421_0595 Cj8421_0596     TRUE 0.822 11.000 0.033 NA   NA
 5989197 5989198 Cj8421_0596 Cj8421_0597   nth TRUE 0.898 -3.000 0.004 0.004 N NA
 5989199 5989200 Cj8421_0598 Cj8421_0599 peb4cbf2 fba TRUE 0.892 0.000 0.036 1.000 N NA
 5989200 5989201 Cj8421_0599 Cj8421_0600 fba   FALSE 0.282 95.000 0.027 1.000   NA
 5989201 5989202 Cj8421_0600 Cj8421_0601     FALSE 0.447 184.000 0.250 1.000   NA
 5989202 5989203 Cj8421_0601 Cj8421_0602     TRUE 0.884 -13.000 0.060 1.000 N NA
 5989204 5989205 Cj8421_0603 Cj8421_0604     TRUE 0.765 51.000 0.160 1.000   NA
 5989205 5989206 Cj8421_0604 Cj8421_0605   dsbD TRUE 0.877 -3.000 0.185 1.000   NA
 5989207 5989208 Cj8421_0606 Cj8421_0607     TRUE 0.666 9.000 0.000 1.000   NA
 5989208 5989209 Cj8421_0607 Cj8421_0608     TRUE 0.593 79.000 0.158 1.000   NA
 5989209 5989210 Cj8421_0608 Cj8421_0609     TRUE 0.962 0.000 0.258 1.000 N NA
 5989210 5989211 Cj8421_0609 Cj8421_0610     TRUE 0.967 2.000 0.152 1.000 N NA
 5989212 5989213 Cj8421_0611 Cj8421_0612     TRUE 0.951 -13.000 0.280 1.000   NA
 5989213 5989214 Cj8421_0612 Cj8421_0613     TRUE 0.969 1.000 0.244 NA   NA
 5989214 5989215 Cj8421_0613 Cj8421_0614   cft TRUE 0.633 43.000 0.047 NA N NA
 5989216 5989217 Cj8421_0615 Cj8421_0616 pstS pstC TRUE 0.587 85.000 0.079 NA Y NA
 5989217 5989218 Cj8421_0616 Cj8421_0617 pstC pstA TRUE 0.991 -3.000 0.485 0.004 Y NA
 5989218 5989219 Cj8421_0617 Cj8421_0618 pstA pstB TRUE 0.974 63.000 0.402 0.004 Y NA
 5989219 5989220 Cj8421_0618 Cj8421_0619 pstB   FALSE 0.153 62.000 0.000 NA   NA
 5989220 5989221 Cj8421_0619 Cj8421_0620     TRUE 0.618 8.000 0.000 NA   NA
 5989221 5989222 Cj8421_0620 Cj8421_0621     FALSE 0.116 202.000 0.017 NA   NA
 5989222 5989223 Cj8421_0621 Cj8421_0622     TRUE 0.946 -39.000 0.085 NA   NA
 5989223 5989224 Cj8421_0622 Cj8421_0623     TRUE 0.808 42.000 0.211 NA   NA
 5989224 5989225 Cj8421_0623 Cj8421_0624   hypF TRUE 0.806 -19.000 0.018 NA   NA
 5989225 5989226 Cj8421_0624 Cj8421_0625 hypF hypB TRUE 0.621 78.000 0.064 1.000 Y NA
 5989226 5989227 Cj8421_0625 Cj8421_0626 hypB hypC TRUE 0.984 0.000 0.463 NA Y NA
 5989227 5989228 Cj8421_0626 Cj8421_0627 hypC hypD TRUE 0.956 -16.000 0.123 NA Y NA
 5989228 5989229 Cj8421_0627 Cj8421_0628 hypD hypE TRUE 0.794 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 5989229 5989230 Cj8421_0628 Cj8421_0629 hypE hypA TRUE 0.924 0.000 0.080 1.000   NA
 5989230 5989231 Cj8421_0629 Cj8421_0630 hypA   FALSE 0.095 95.000 0.000 1.000   NA
 5989231 5989232 Cj8421_0630 Cj8421_0631     TRUE 0.984 -19.000 0.200 0.043   NA
 5989233 5989234 Cj8421_0632 Cj8421_0633     TRUE 0.739 -7.000 0.024 1.000 N NA
 5989235 5989236 Cj8421_0634 Cj8421_0635 ilvC   TRUE 0.863 4.000 0.013 1.000   NA
 5989236 5989237 Cj8421_0635 Cj8421_0636     TRUE 0.762 -10.000 0.022 1.000   NA
 5989237 5989238 Cj8421_0636 Cj8421_0637     TRUE 0.823 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 5989238 5989239 Cj8421_0637 Cj8421_0638     FALSE 0.454 29.000 0.008 NA N NA
 5989240 5989241 Cj8421_0639 Cj8421_0640 mrsA ppa FALSE 0.409 42.000 0.006 1.000 N NA
 5989241 5989242 Cj8421_0640 Cj8421_0641 ppa adk TRUE 0.805 10.000 0.015 1.000 N NA
 5989242 5989243 Cj8421_0641 Cj8421_0642 adk aspS TRUE 0.696 -3.000 0.025 1.000 N NA
 5989244 5989245 Cj8421_0643 Cj8421_0644   recN TRUE 0.919 0.000 0.066 1.000 N NA
 5989245 5989246 Cj8421_0644 Cj8421_0645 recN   FALSE 0.481 106.000 0.141 1.000 N NA
 5989246 5989247 Cj8421_0645 Cj8421_0646     TRUE 0.656 -9.000 0.013 NA N NA
 5989247 5989248 Cj8421_0646 Cj8421_0647     TRUE 0.860 0.000 0.028 NA N NA
 5989248 5989249 Cj8421_0647 Cj8421_0648     TRUE 0.975 -40.000 0.115 NA Y NA
 5989249 5989250 Cj8421_0648 Cj8421_0649     TRUE 0.853 6.000 0.020 NA   NA
 5989250 5989251 Cj8421_0649 Cj8421_0650     TRUE 0.723 -9.000 0.023 NA   NA
 5989251 5989252 Cj8421_0650 Cj8421_0651     TRUE 0.768 -18.000 0.013 NA   NA
 5989252 5989253 Cj8421_0651 Cj8421_0652     TRUE 0.729 -3.000 0.041 NA   NA
 5989253 5989254 Cj8421_0652 Cj8421_0653     FALSE 0.491 -3.000 0.007 NA   NA
 5989254 5989255 Cj8421_0653 Cj8421_0654   pbpC TRUE 0.919 1.000 0.043 NA   NA
 5989256 5989257 Cj8421_0655 Cj8421_0656     TRUE 0.886 16.000 0.051 1.000 Y NA
 5989257 5989258 Cj8421_0656 Cj8421_0657     FALSE 0.209 329.000 0.062 NA   NA
 5989258 5989259 Cj8421_0657 Cj8421_0658     TRUE 0.735 27.000 0.062 NA   NA
 5989259 5989260 Cj8421_0658 Cj8421_0659     TRUE 0.936 39.000 0.062 0.003   NA
 5989260 5989261 Cj8421_0659 Cj8421_0660     TRUE 0.848 12.000 0.062 NA   NA
 5989261 5989262 Cj8421_0660 Cj8421_0661     FALSE 0.230 198.000 0.062 NA   NA
 5989262 5989263 Cj8421_0661 Cj8421_0662     TRUE 0.958 -7.000 0.667 NA   NA
 5989263 5989264 Cj8421_0662 Cj8421_0663   era TRUE 0.732 -13.000 0.015 NA   NA
 5989264 5989265 Cj8421_0663 Cj8421_0664 era hslU FALSE 0.275 135.000 0.051 1.000   NA
 5989265 5989266 Cj8421_0664 Cj8421_0665 hslU hslV TRUE 0.974 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 5989266 5989267 Cj8421_0665 Cj8421_0666 hslV rplI TRUE 0.890 0.000 0.034 1.000 N NA
 5989267 5989268 Cj8421_0666 Cj8421_0667 rplI argG TRUE 0.661 13.000 0.009 1.000 N NA
 5989269 5989270 Cj8421_0668 Cj8421_0669     TRUE 0.536 -3.000 0.011 NA   NA
 5989270 5989271 Cj8421_0669 Cj8421_0670     TRUE 0.903 -31.000 0.039 NA   NA
 5989271 5989272 Cj8421_0670 Cj8421_0671   rpoN TRUE 0.898 0.000 0.044 1.000   NA
 5989272 5989273 Cj8421_0671 Cj8421_0672 rpoN dcuB FALSE 0.215 164.000 0.033 1.000   NA
 5989273 5989274 Cj8421_0672 Cj8421_0677 dcuB kdpD FALSE 0.043 4709.000 0.000 1.000   NA
 5989276 5989277 Cj8421_0679 Cj8421_0680     TRUE 0.969 -10.000 0.714 NA   NA
 5989277 5989278 Cj8421_0680 Cj8421_0681     TRUE 0.904 -3.000 0.316 NA   NA
 5989278 5989279 Cj8421_0681 Cj8421_0682   priA TRUE 0.792 -18.000 0.016 NA N NA
 5989283 5989284 Cj8421_0686 Cj8421_0687 pta ackA TRUE 0.926 14.000 0.103 1.000 Y NA
 5989287 5989288 Cj8421_0690 Cj8421_0691     TRUE 0.868 0.000 0.031 NA   NA
 5989289 5989290 Cj8421_0692 Cj8421_0693   ftsA FALSE 0.393 186.000 0.184 1.000   NA
 5989290 5989291 Cj8421_0693 Cj8421_0694 ftsA ftsZ TRUE 0.920 16.000 0.114 1.000 Y NA
 5989291 5989292 Cj8421_0694 Cj8421_0695 ftsZ flgG2 FALSE 0.080 156.000 0.002 1.000 N NA
 5989292 5989293 Cj8421_0695 Cj8421_0696 flgG2 flgG TRUE 0.984 29.000 0.377 0.010 Y NA
 5989295 5989296 Cj8421_0698 Cj8421_0699     TRUE 0.783 -3.000 0.068 NA   NA
 5989296 5989297 Cj8421_0699 Cj8421_0700   purE TRUE 0.885 1.000 0.018 1.000 N NA
 5989297 5989298 Cj8421_0700 Cj8421_0701 purE   TRUE 0.800 10.000 0.019 NA   NA
 5989298 5989299 Cj8421_0701 Cj8421_0702   glyQ TRUE 0.659 12.000 0.011 NA   NA
 5989299 5989300 Cj8421_0702 Cj8421_0703 glyQ   TRUE 0.845 -13.000 0.041 NA   NA
 5989300 5989301 Cj8421_0703 Cj8421_0704     TRUE 0.962 10.000 0.342 NA   NA
 5989301 5989302 Cj8421_0704 Cj8421_0705   kdtA TRUE 0.832 -3.000 0.122 NA   NA
 5989302 5989303 Cj8421_0705 Cj8421_0706 kdtA   FALSE 0.325 274.000 0.133 1.000   NA
 5989303 5989304 Cj8421_0706 Cj8421_0707   ffh FALSE 0.105 365.000 0.013 1.000   NA
 5989304 5989305 Cj8421_0707 Cj8421_0708 ffh rpsP TRUE 0.682 89.000 0.361 1.000 N NA
 5989305 5989306 Cj8421_0708 Cj8421_0709 rpsP   TRUE 0.983 3.000 0.385 1.000   NA
 5989306 5989307 Cj8421_0709 Cj8421_0710   rimM TRUE 0.545 134.000 0.324 1.000   NA
 5989307 5989308 Cj8421_0710 Cj8421_0711 rimM trmD TRUE 0.972 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 5989308 5989309 Cj8421_0711 Cj8421_0712 trmD rplS TRUE 0.847 88.000 0.567 1.000 Y NA
 5989309 5989310 Cj8421_0712 Cj8421_0713 rplS   FALSE 0.091 133.000 0.003 1.000   NA
 5989310 5989311 Cj8421_0713 Cj8421_0714     TRUE 0.619 24.000 0.018 1.000   NA
 5989311 5989312 Cj8421_0714 Cj8421_0715     TRUE 0.613 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5989312 5989313 Cj8421_0715 Cj8421_0716   dnaE FALSE 0.062 448.000 0.002 1.000 N NA
 5989314 5989315 Cj8421_0717 Cj8421_0718   flaC FALSE 0.427 36.000 0.009 NA   NA
 5989315 5989316 Cj8421_0718 Cj8421_0719 flaC   TRUE 0.800 39.000 0.172 NA   NA
 5989316 5989317 Cj8421_0719 Cj8421_0720     FALSE 0.204 151.000 0.033 NA   NA
 5989317 5989318 Cj8421_0720 Cj8421_0721     TRUE 0.823 18.000 0.068 1.000 N NA
 5989318 5989319 Cj8421_0721 Cj8421_0723   mog FALSE 0.048 680.000 0.000 1.000 N NA
 5989319 5989320 Cj8421_0723 Cj8421_0724 mog corA TRUE 0.598 21.000 0.011 1.000 N NA
 5989321 5989322 Cj8421_0725 Cj8421_0726     TRUE 0.874 11.000 0.073 NA   NA
 5989322 5989323 Cj8421_0726 Cj8421_0727     TRUE 0.777 -3.000 0.065 NA   NA
 5989323 5989324 Cj8421_0727 Cj8421_0728     TRUE 0.908 -3.000 0.290 1.000   NA
 5989324 5989325 Cj8421_0728 Cj8421_0729     TRUE 0.996 1.000 0.774 0.041   NA
 5989325 5989326 Cj8421_0729 Cj8421_0730     TRUE 0.996 4.000 0.360 0.041 Y NA
 5989326 5989327 Cj8421_0730 Cj8421_0731     TRUE 0.903 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 5989329 5989330 Cj8421_0733 Cj8421_0736     FALSE 0.034 1863.000 0.000 NA   NA
 5989330 5989331 Cj8421_0736 Cj8421_0743     FALSE 0.034 2660.000 0.000 NA   NA
 5989333 5989334 Cj8421_1618 Cj8421_1619 pflA nuoN TRUE 0.653 22.000 0.020 1.000   NA
 5989334 5989335 Cj8421_1619 Cj8421_1620 nuoN nuoM TRUE 0.976 -10.000 0.024 0.003 Y NA
 5989335 5989336 Cj8421_1620 Cj8421_1621 nuoM nuoL TRUE 0.994 2.000 0.056 0.003 Y NA
 5989336 5989337 Cj8421_1621 Cj8421_1622 nuoL nuoK TRUE 0.992 2.000 0.056 0.014 Y NA
 5989337 5989338 Cj8421_1622 Cj8421_1623 nuoK nuoJ TRUE 0.970 -3.000 0.064 0.006 Y NA
 5989338 5989339 Cj8421_1623 Cj8421_1624 nuoJ nuoI TRUE 0.988 -3.000 0.442 0.014 Y NA
 5989339 5989340 Cj8421_1624 Cj8421_1625 nuoI nuoH TRUE 0.996 10.000 0.500 0.014 Y NA
 5989340 5989341 Cj8421_1625 Cj8421_1626 nuoH nuoG TRUE 0.973 -7.000 0.065 0.014 Y NA
 5989341 5989342 Cj8421_1626 Cj8421_1627 nuoG   TRUE 0.981 -3.000 0.444 0.014   NA
 5989342 5989343 Cj8421_1627 Cj8421_1628     TRUE 0.982 -3.000 0.464 0.014   NA
 5989343 5989344 Cj8421_1628 Cj8421_1629   nuoD TRUE 0.986 -3.000 0.650 0.014   NA
 5989344 5989345 Cj8421_1629 Cj8421_1630 nuoD nuoC TRUE 0.998 2.000 0.650 0.014 Y NA
 5989345 5989346 Cj8421_1630 Cj8421_1631 nuoC nuoB TRUE 0.927 220.000 0.703 0.006 Y NA
 5989346 5989347 Cj8421_1631 Cj8421_1632 nuoB nuoA TRUE 0.997 -18.000 0.571 0.006 Y NA
 5989347 5989348 Cj8421_1632 Cj8421_1633 nuoA   FALSE 0.330 112.000 0.053 1.000 N NA
 5989348 5989349 Cj8421_1633 Cj8421_1634     TRUE 0.965 -7.000 0.039 0.024 Y NA
 5989349 5989350 Cj8421_1634 Cj8421_1635     TRUE 0.744 92.000 0.278 1.000 Y NA
 5989350 5989351 Cj8421_1635 Cj8421_1636     TRUE 0.995 -13.000 0.647 0.041 Y NA
 5989351 5989352 Cj8421_1636 Cj8421_1637     TRUE 0.995 0.000 0.412 0.041 Y NA
 5989352 5989353 Cj8421_1637 Cj8421_1638     FALSE 0.421 285.000 0.250 1.000 N NA
 5989355 5989356 Cj8421_1640 Cj8421_1641     TRUE 0.879 37.000 0.043 0.051 N NA
 5989357 5989358 Cj8421_1644 Cj8421_1645 infA rpmJ FALSE 0.325 172.000 0.104 1.000   NA
 5989358 5989359 Cj8421_1645 Cj8421_1646 rpmJ rpsM TRUE 0.992 3.000 0.194 0.030   NA
 5989359 5989360 Cj8421_1646 Cj8421_1647 rpsM rpsK TRUE 0.954 101.000 0.810 0.030 Y NA
 5989360 5989361 Cj8421_1647 Cj8421_1648 rpsK rpsD TRUE 0.985 28.000 0.509 0.041 Y NA
 5989361 5989362 Cj8421_1648 Cj8421_1649 rpsD rpoA TRUE 0.964 13.000 0.549 1.000 N NA
 5989362 5989363 Cj8421_1649 Cj8421_1650 rpoA rplQ TRUE 0.992 4.000 0.873 1.000 N NA
 5989363 5989364 Cj8421_1650 Cj8421_1651 rplQ hisG FALSE 0.085 173.000 0.004 1.000 N NA
 5989364 5989365 Cj8421_1651 Cj8421_1652 hisG hisD TRUE 0.994 8.000 0.171 0.009 Y NA
 5989365 5989366 Cj8421_1652 Cj8421_1653 hisD hisB TRUE 0.935 -3.000 0.010 0.009 Y NA
 5989366 5989367 Cj8421_1653 Cj8421_1654 hisB hisH TRUE 0.976 -3.000 0.128 0.009 Y NA
 5989367 5989368 Cj8421_1654 Cj8421_1655 hisH hisA TRUE 0.982 -3.000 0.210 0.009 Y NA
 5989368 5989369 Cj8421_1655 Cj8421_1656 hisA   TRUE 0.637 -15.000 0.004 NA   NA
 5989369 5989370 Cj8421_1656 Cj8421_1657   hisF TRUE 0.744 1.000 0.003 NA   NA
 5989370 5989371 Cj8421_1657 Cj8421_1658 hisF hisI TRUE 0.998 2.000 0.430 0.009 Y NA
 5989372 5989373 Cj8421_1659 Cj8421_1660 dapD mrp TRUE 0.716 26.000 0.036 1.000 N NA
 5989374 5989375 Cj8421_1661 Cj8421_1662     TRUE 0.709 -3.000 0.027 1.000 N NA
 5989375 5989376 Cj8421_1662 Cj8421_1663     TRUE 0.866 -22.000 0.025 1.000 N NA
 5989376 5989377 Cj8421_1663 Cj8421_1664   pgpA TRUE 0.929 5.000 0.052 1.000 N NA
 5989377 5989378 Cj8421_1664 Cj8421_1665 pgpA rpsT FALSE 0.180 79.000 0.004 1.000 N NA
 5989378 5989379 Cj8421_1665 Cj8421_1666 rpsT prfA TRUE 0.845 19.000 0.029 1.000 Y NA
 5989381 5989382 Cj8421_1668 Cj8421_1669 chuA chuB TRUE 0.995 -40.000 0.250 0.041 Y NA
 5989382 5989383 Cj8421_1669 Cj8421_1670 chuB chuC TRUE 0.975 0.000 0.226 1.000 Y NA
 5989383 5989384 Cj8421_1670 Cj8421_1671 chuC chuD TRUE 0.916 17.000 0.113 1.000 Y NA
 5989388 5989389 Cj8421_1675 Cj8421_1676   ribD FALSE 0.035 680.000 0.000 NA   NA
 5989389 5989390 Cj8421_1676 Cj8421_1677 ribD   TRUE 0.685 -19.000 0.005 NA   NA
 5989391 5989392 Cj8421_1678 Cj8421_1679 sdaA sdaC TRUE 0.926 15.000 0.133 NA Y NA
 5989392 5989393 Cj8421_1679 Cj8421_1680 sdaC   FALSE 0.039 259.000 0.000 NA   NA
 5989393 5989394 Cj8421_1680 Cj8421_1681     TRUE 0.802 64.000 0.400 NA   NA
 5989395 5989396 Cj8421_1682 Cj8421_1683 exbB2 exbD2 TRUE 0.997 -28.000 0.815 0.051 Y NA
 5989398 5989399 Cj8421_1686 Cj8421_1687     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 5989400 5989401 Cj8421_1688 Cj8421_1689 aroC rnc FALSE 0.359 81.000 0.030 1.000 N NA
 5989401 5989402 Cj8421_1689 Cj8421_1692 rnc   FALSE 0.047 410.000 0.000 1.000   NA
 5989403 5989404 Cj8421_1693 Cj8421_1694 dnaG   FALSE 0.226 82.000 0.011 1.000 N NA
 5989404 5989405 Cj8421_1694 Cj8421_1695     TRUE 0.701 50.000 0.107 NA   NA
 5989405 5989406 Cj8421_1695 Cj8421_1696   murE TRUE 0.947 -85.000 0.057 NA   NA
 5989406 5989407 Cj8421_1696 Cj8421_1697 murE   TRUE 0.785 4.000 0.006 NA   NA
 5989407 5989408 Cj8421_1697 Cj8421_1698     TRUE 0.524 -3.000 0.010 NA   NA
 5989408 5989409 Cj8421_1698 Cj8421_1699   ispA TRUE 0.547 90.000 0.167 1.000   NA
 5989409 5989410 Cj8421_1699 Cj8421_1700 ispA tkt TRUE 0.968 10.000 0.375 1.000 N NA
 5989410 5989411 Cj8421_1700 Cj8421_1701 tkt iamB TRUE 0.961 2.000 0.132 NA N NA
 5989411 5989412 Cj8421_1701 Cj8421_1702 iamB iamA TRUE 0.879 96.000 0.912 NA Y NA
 5989412 5989413 Cj8421_1702 Cj8421_1703 iamA   TRUE 0.995 3.000 0.912 NA Y NA
 5989413 5989414 Cj8421_1703 Cj8421_1704     FALSE 0.317 176.000 0.120 NA   NA
 5989414 5989415 Cj8421_1704 Cj8421_1705     FALSE 0.466 56.000 0.027 NA   NA
 5989416 5989417 Cj8421_1706 Cj8421_1707 map murI TRUE 0.825 2.000 0.005 1.000 N NA
 5989417 5989418 Cj8421_1707 Cj8421_1708 murI   FALSE 0.164 194.000 0.005 NA Y NA
 5989418 5989419 Cj8421_1708 Cj8421_1709   nhaA2 TRUE 0.958 9.000 0.211 NA N NA
 5989419 5989420 Cj8421_1709 Cj8421_1710 nhaA2 nhaA1 TRUE 0.993 -3.000 0.571 0.003 Y NA
 5989420 5989421 Cj8421_1710 Cj8421_1711 nhaA1   TRUE 0.645 143.000 0.600 NA   NA
 5989422 5989423 Cj8421_1714 Cj8421_1715 p19   TRUE 0.692 83.000 0.386 NA   NA
 5989423 5989424 Cj8421_1715 Cj8421_1716     TRUE 0.593 256.000 0.625 NA   NA
 5989424 5989425 Cj8421_1716 Cj8421_1717     TRUE 0.977 -10.000 0.878 NA N NA
 5989425 5989426 Cj8421_1717 Cj8421_1718     TRUE 0.865 -3.000 0.175 NA N NA
 5989426 5989427 Cj8421_1718 Cj8421_1719     TRUE 0.812 -3.000 0.078 1.000   NA
 5989427 5989428 Cj8421_1719 Cj8421_1720     TRUE 0.993 -39.000 0.147 0.004   NA
 5989429 5989430 Cj8421_1721 Cj8421_1722     TRUE 0.588 91.000 0.250 NA   NA
 5989430 5989431 Cj8421_1722 Cj8421_1723     FALSE 0.136 66.000 0.000 NA   NA
 5989431 5989432 Cj8421_1723 Cj8421_1724     FALSE 0.034 1490.000 0.000 NA   NA
 5989432 5989433 Cj8421_1724 Cj8421_1725     FALSE 0.034 1077.000 0.000 NA   NA
 5989433 5989434 Cj8421_1725 Cj8421_1726     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 5989434 5989435 Cj8421_1726 Cj8421_1727     FALSE 0.194 51.000 0.000 NA   NA
 5989435 5989436 Cj8421_1727 Cj8421_1728     FALSE 0.037 304.000 0.000 NA   NA
 5989436 5989437 Cj8421_1728 Cj8421_1729     FALSE 0.043 186.000 0.000 NA   NA
 5989437 5989438 Cj8421_1729 Cj8421_1730     FALSE 0.037 343.000 0.000 NA   NA
 5989438 5989439 Cj8421_1730 Cj8421_1731     FALSE 0.037 308.000 0.000 NA   NA
 5989439 5989440 Cj8421_1731 Cj8421_1732     TRUE 0.687 -40.000 0.000 NA   NA
 5989440 5989441 Cj8421_1732 Cj8421_1733     FALSE 0.295 779.000 0.000 0.010   NA
 5989441 5989442 Cj8421_1733 Cj8421_1734     TRUE 0.849 0.000 0.026 NA   NA
 5989442 5989443 Cj8421_1734 Cj8421_1735     TRUE 0.972 -10.000 0.788 NA   NA
 5989443 5989444 Cj8421_1735 Cj8421_1736   eno TRUE 0.560 66.000 0.080 NA   NA
 5989444 5989445 Cj8421_1736 Cj8421_1737 eno recA TRUE 0.890 0.000 0.033 1.000 N NA
 5989446 5989447 Cj8421_1738 Cj8421_1739   fliQ TRUE 0.857 12.000 0.068 NA   NA
 5989447 5989448 Cj8421_1739 Cj8421_1740 fliQ murB TRUE 0.802 -3.000 0.066 1.000 N NA
 5989449 5989450 Cj8421_1744 Cj8421_1745   cysQ TRUE 0.620 40.000 0.039 NA   NA
 5989450 5989451 Cj8421_1745 Cj8421_1746 cysQ gltA FALSE 0.306 81.000 0.022 1.000 N NA
 5989451 5989452 Cj8421_1746 Cj8421_1747 gltA   FALSE 0.207 116.000 0.019 1.000 N NA
 5989452 5989453 Cj8421_1747 Cj8421_1748   bioB FALSE 0.138 197.000 0.017 1.000 N NA
 5989453 5989454 Cj8421_1748 Cj8421_1749 bioB topA TRUE 0.854 2.000 0.009 1.000 N NA
 5989456 5989457 Cj8421_1751 Cj8421_1752 secY rplO TRUE 0.984 0.000 0.730 1.000 N NA
 5989457 5989458 Cj8421_1752 Cj8421_1753 rplO rpsE TRUE 0.992 5.000 0.148 0.040 Y NA
 5989458 5989459 Cj8421_1753 Cj8421_1754 rpsE rplR TRUE 0.997 -16.000 0.814 0.040 Y NA
 5989459 5989460 Cj8421_1754 Cj8421_1755 rplR rplF TRUE 0.997 10.000 0.815 0.029 Y NA
 5989460 5989461 Cj8421_1755 Cj8421_1756 rplF rpsH TRUE 0.968 79.000 0.808 0.029 Y NA
 5989461 5989462 Cj8421_1756 Cj8421_1757 rpsH rpsN TRUE 0.995 10.000 0.473 0.029 Y NA
 5989462 5989463 Cj8421_1757 Cj8421_1758 rpsN rplE TRUE 0.996 -25.000 0.496 0.029 Y NA
 5989463 5989464 Cj8421_1758 Cj8421_1759 rplE rplX TRUE 0.998 4.000 0.758 0.029 Y NA
 5989464 5989465 Cj8421_1759 Cj8421_1760 rplX rplN TRUE 0.997 0.000 0.810 0.040 Y NA
 5989465 5989466 Cj8421_1760 Cj8421_1761 rplN rpsQ TRUE 0.997 0.000 0.791 0.040 Y NA
 5989466 5989467 Cj8421_1761 Cj8421_1762 rpsQ rpmC TRUE 0.995 10.000 0.828 0.029   NA
 5989467 5989468 Cj8421_1762 Cj8421_1763 rpmC rplP TRUE 0.997 -34.000 0.802 0.029   NA
 5989468 5989469 Cj8421_1763 Cj8421_1764 rplP rpsC TRUE 0.998 3.000 0.828 0.040 Y NA
 5989469 5989470 Cj8421_1764 Cj8421_1765 rpsC rplV TRUE 0.997 0.000 0.719 0.040 Y NA
 5989470 5989471 Cj8421_1765 Cj8421_1766 rplV rpsS TRUE 0.995 11.000 0.769 0.040 Y NA
 5989471 5989472 Cj8421_1766 Cj8421_1767 rpsS rplB TRUE 0.998 2.000 0.820 0.040 Y NA
 5989472 5989473 Cj8421_1767 Cj8421_1768 rplB rplW TRUE 0.995 2.000 0.849 1.000 Y NA
 5989473 5989474 Cj8421_1768 Cj8421_1769 rplW rplD TRUE 0.992 3.000 0.513 1.000 Y NA
 5989474 5989475 Cj8421_1769 Cj8421_1770 rplD rplC TRUE 0.985 -3.000 0.361 0.029 Y NA
 5989475 5989476 Cj8421_1770 Cj8421_1771 rplC rpsJ TRUE 0.995 10.000 0.467 0.040 Y NA
 5989476 5989477 Cj8421_1771 Cj8421_1772 rpsJ   FALSE 0.165 199.000 0.003 1.000 Y NA
 5989477 5989478 Cj8421_1772 Cj8421_1773     TRUE 0.789 36.000 0.118 1.000   NA
 5989478 5989479 Cj8421_1773 Cj8421_1774   ksgA TRUE 0.895 -31.000 0.028 1.000   NA
 5989480 5989481 Cj8421_1775 Cj8421_1776     TRUE 0.562 87.000 0.011 0.035   NA
 5989481 5989482 Cj8421_1776 Cj8421_1777     FALSE 0.393 -3.000 0.002 NA   NA
 5989482 5989483 Cj8421_1777 Cj8421_1778     FALSE 0.035 541.000 0.000 NA   NA
 5989484 5989485 Cj8421_1779 Cj8421_1780 leuD leuC TRUE 0.998 2.000 0.309 0.002 Y NA
 5989485 5989486 Cj8421_1780 Cj8421_1781 leuC leuB TRUE 0.990 -7.000 0.275 0.003 Y NA
 5989486 5989487 Cj8421_1781 Cj8421_1782 leuB leuA TRUE 0.981 -3.000 0.126 0.003 Y NA
 5989489 5989490 Cj8421_1784 Cj8421_1787     FALSE 0.102 138.000 0.005 1.000   NA
 5989492 5989493 Cj8421_1789 Cj8421_1790 metA metY TRUE 0.529 84.000 0.037 1.000 Y NA
 5989493 5989494 Cj8421_1790 Cj8421_1792 metY flgE2 FALSE 0.046 425.000 0.000 1.000   NA
 5989494 5989495 Cj8421_1792 Cj8421_1793 flgE2 ruvC FALSE 0.070 193.000 0.002 1.000   NA
 5989496 5989497 Cj8421_0001 Cj8421_0002 dnaA dnaN TRUE 0.645 160.000 0.328 1.000 Y NA
 5989497 5989498 Cj8421_0002 Cj8421_0003 dnaN gyrB TRUE 0.881 29.000 0.114 1.000 Y NA
 5989499 5989500 Cj8421_0004c Cj8421_0005c     TRUE 0.987 -34.000 0.180 0.049   NA
 5989501 5989502 Cj8421_0006 Cj8421_0007   gltB FALSE 0.205 134.000 0.025 1.000   NA
 5989502 5989503 Cj8421_0007 Cj8421_0008 gltB   TRUE 0.548 10.000 0.000 NA   NA
 5989503 5989504 Cj8421_0008 Cj8421_0009   gltD TRUE 0.696 3.000 0.000 NA   NA
 5989505 5989506 Cj8421_0010c Cj8421_0011c rnhB   FALSE 0.087 129.000 0.002 1.000   NA
 5989506 5989507 Cj8421_0011c Cj8421_0012c     FALSE 0.242 64.000 0.004 1.000   NA
 5989511 5989512 Cj8421_0018c Cj8421_0019c     FALSE 0.221 285.000 0.000 0.100 N NA
 5989512 5989513 Cj8421_0019c Cj8421_0020c     TRUE 0.975 -10.000 0.800 1.000 N NA
 5989513 5989514 Cj8421_0020c Cj8421_0021c     FALSE 0.469 64.000 0.028 1.000 N NA
 5989514 5989515 Cj8421_0021c Cj8421_0022c     FALSE 0.304 113.000 0.042 1.000 N NA
 5989515 5989516 Cj8421_0022c Cj8421_0023     FALSE 0.423 13.000 0.000 NA   NA
 5989517 5989518 Cj8421_0024 Cj8421_0025c purB nrdA TRUE 0.808 15.000 0.012 1.000 Y NA
 5989519 5989520 Cj8421_0026c Cj8421_0027     FALSE 0.140 120.000 0.009 1.000   NA
 5989521 5989522 Cj8421_0028 Cj8421_0029 pyrG recJ TRUE 0.827 -13.000 0.026 1.000 N NA
 5989522 5989523 Cj8421_0029 Cj8421_0030 recJ ansA FALSE 0.135 96.000 0.004 1.000 N NA
 5989524 5989525 Cj8421_1033 Cj8421_1034     TRUE 0.980 1.000 0.400 NA   NA
 5989525 5989526 Cj8421_1034 Cj8421_1035   livF TRUE 0.917 18.000 0.280 1.000 N NA
 5989526 5989527 Cj8421_1035 Cj8421_1036 livF livG TRUE 0.993 -13.000 0.381 0.023 Y NA
 5989527 5989528 Cj8421_1036 Cj8421_1037 livG livM TRUE 0.929 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 5989528 5989529 Cj8421_1037 Cj8421_1038 livM livH TRUE 0.997 0.000 0.771 0.040 Y NA
 5989529 5989530 Cj8421_1038 Cj8421_1039 livH livK TRUE 0.889 19.000 0.085 NA Y NA
 5989530 5989531 Cj8421_1039 Cj8421_1040 livK livJ TRUE 0.979 22.000 1.000 NA Y NA
 5989531 5989532 Cj8421_1040 Cj8421_1041 livJ   TRUE 0.878 31.000 0.312 NA N NA
 5989532 5989533 Cj8421_1041 Cj8421_1042     TRUE 0.961 9.000 0.250 NA   NA
 5989533 5989534 Cj8421_1042 Cj8421_1043     TRUE 0.592 54.000 0.062 NA   NA
 5989534 5989535 Cj8421_1043 Cj8421_1044   asd TRUE 0.858 9.000 0.025 NA   NA
 5989535 5989536 Cj8421_1044 Cj8421_1047 asd   FALSE 0.034 1359.000 0.000 NA   NA
 5989536 5989537 Cj8421_1047 Cj8421_1048     TRUE 0.987 -24.000 0.900 NA   NA
 5989537 5989538 Cj8421_1048 Cj8421_1051     FALSE 0.034 2697.000 0.000 NA   NA
 5989538 5989539 Cj8421_1051 Cj8421_1052   mapA TRUE 0.852 -3.000 0.152 NA   NA
 5989539 5989540 Cj8421_1052 Cj8421_1053 mapA lepA FALSE 0.137 77.000 0.003 NA   NA
 5989541 5989542 Cj8421_1054 Cj8421_1055     TRUE 0.887 -3.000 0.207 1.000 N NA
 5989542 5989543 Cj8421_1055 Cj8421_1056     TRUE 0.995 3.000 0.844 NA Y NA
 5989544 5989545 Cj8421_1057 Cj8421_1058     TRUE 0.891 1.000 0.022 1.000   NA
 5989545 5989546 Cj8421_1058 Cj8421_1059     TRUE 0.802 0.000 0.016 NA   NA
 5989546 5989547 Cj8421_1059 Cj8421_1060   pycA TRUE 0.852 51.000 0.400 NA   NA
 5989548 5989549 Cj8421_1061 Cj8421_1062   murG TRUE 0.952 -3.000 0.647 1.000 N NA
 5989550 5989551 Cj8421_1063 Cj8421_1064     TRUE 0.960 8.000 0.214 NA   NA
 5989551 5989552 Cj8421_1064 Cj8421_1065     TRUE 0.884 33.000 0.357 NA   NA
 5989552 5989553 Cj8421_1065 Cj8421_1066     TRUE 0.731 -3.000 0.031 1.000 N NA
 5989553 5989554 Cj8421_1066 Cj8421_1067   thiH TRUE 0.987 -10.000 0.128 0.005 Y NA
 5989554 5989555 Cj8421_1067 Cj8421_1068 thiH thiG TRUE 0.997 3.000 0.277 0.005 Y NA
 5989555 5989556 Cj8421_1068 Cj8421_1069 thiG moeB TRUE 0.984 3.000 0.054 0.035   NA
 5989556 5989557 Cj8421_1069 Cj8421_1070 moeB   TRUE 0.918 -3.000 0.346 1.000   NA
 5989557 5989558 Cj8421_1070 Cj8421_1071   dapE TRUE 0.727 10.000 0.005 1.000 N NA
 5989558 5989559 Cj8421_1071 Cj8421_1072 dapE   TRUE 0.932 5.000 0.018 1.000 Y NA
 5989559 5989560 Cj8421_1072 Cj8421_1073     TRUE 0.965 -13.000 0.417 1.000 N NA
 5989560 5989561 Cj8421_1073 Cj8421_1077   mutS FALSE 0.157 4146.000 0.029 1.000 N NA
 5989561 5989562 Cj8421_1077 Cj8421_1078 mutS   TRUE 0.920 -10.000 0.217 NA   NA
 5989562 5989563 Cj8421_1078 Cj8421_1079   murC FALSE 0.191 90.000 0.014 NA   NA
 5989563 5989564 Cj8421_1079 Cj8421_1080 murC   FALSE 0.430 64.000 0.002 1.000 Y NA
 5989564 5989565 Cj8421_1080 Cj8421_1081     FALSE 0.202 392.000 0.049 1.000   NA
 5989565 5989566 Cj8421_1081 Cj8421_1083   guaB FALSE 0.240 163.000 0.045 1.000   NA
 5989566 5989567 Cj8421_1083 Cj8421_1084 guaB gatA TRUE 0.873 10.000 0.032 1.000 N NA
 5989567 5989568 Cj8421_1084 Cj8421_1085 gatA   FALSE 0.145 64.000 0.000 NA   NA
 5989568 5989569 Cj8421_1085 Cj8421_1086   ileS FALSE 0.356 -6.000 0.000 NA   NA
 5989570 5989571 Cj8421_1087 Cj8421_1088     TRUE 0.885 12.000 0.111 NA   NA
 5989571 5989572 Cj8421_1088 Cj8421_1092   pgsA FALSE 0.044 1415.000 0.000 1.000   NA
 5989572 5989573 Cj8421_1092 Cj8421_1093 pgsA   TRUE 0.883 -3.000 0.023 0.063 N NA
 5989573 5989574 Cj8421_1093 Cj8421_1094     FALSE 0.182 65.000 0.002 NA   NA
 5989574 5989575 Cj8421_1094 Cj8421_1095   rpsF FALSE 0.106 87.000 0.002 NA   NA
 5989575 5989576 Cj8421_1095 Cj8421_1096 rpsF ssb TRUE 0.900 9.000 0.033 1.000 N NA
 5989578 5989579 Cj8421_1101 Cj8421_1102   proC TRUE 0.914 0.000 0.075 NA   NA
 5989579 5989580 Cj8421_1102 Cj8421_1103 proC   TRUE 0.792 -3.000 0.075 NA   NA
 5989580 5989581 Cj8421_1103 Cj8421_1104     TRUE 0.957 -3.000 0.800 NA   NA
 5989581 5989582 Cj8421_1104 Cj8421_1105     TRUE 0.920 57.000 1.000 NA   NA
 5989583 5989584 Cj8421_1106 Cj8421_1107   thiE TRUE 0.938 -22.000 0.032 1.000 Y NA
 5989584 5989585 Cj8421_1107 Cj8421_1108 thiE thiD TRUE 0.984 -10.000 0.079 0.005 Y NA
 5989585 5989586 Cj8421_1108 Cj8421_1109 thiD   TRUE 0.853 -30.000 0.016 1.000 N NA
 5989586 5989587 Cj8421_1109 Cj8421_1110     TRUE 0.609 -3.000 0.018 NA   NA
 5989587 5989588 Cj8421_1110 Cj8421_1111   mfd FALSE 0.064 558.000 0.006 NA   NA
 5989588 5989589 Cj8421_1111 Cj8421_1112 mfd   TRUE 0.842 0.000 0.023 NA N NA
 5989589 5989590 Cj8421_1112 Cj8421_1113     TRUE 0.970 -63.000 0.178 NA   NA
 5989590 5989591 Cj8421_1113 Cj8421_1118     FALSE 0.034 2749.000 0.000 NA   NA
 5989591 5989592 Cj8421_1118 Cj8421_1121   secF FALSE 0.034 2437.000 0.000 NA   NA
 5989592 5989593 Cj8421_1121 Cj8421_1122 secF secD TRUE 0.997 0.000 0.436 0.002 Y NA
 5989596 5989597 Cj8421_1126 Cj8421_1127   pyrB TRUE 0.726 10.000 0.005 1.000 N NA
 5989597 5989598 Cj8421_1127 Cj8421_1128 pyrB   TRUE 0.816 4.000 0.005 1.000 N NA
 5989598 5989599 Cj8421_1128 Cj8421_1129     TRUE 0.844 -6.000 0.115 NA   NA
 5989599 5989600 Cj8421_1129 Cj8421_1130     TRUE 0.671 -3.000 0.026 NA   NA
 5989600 5989601 Cj8421_1130 Cj8421_1131   truB FALSE 0.203 308.000 0.046 1.000   NA
 5989601 5989602 Cj8421_1131 Cj8421_1132 truB csrA TRUE 0.938 -6.000 0.046 0.026   NA
 5989602 5989603 Cj8421_1132 Cj8421_1133 csrA   TRUE 0.750 -3.000 0.036 1.000 N NA
 5989603 5989604 Cj8421_1133 Cj8421_1134   smpB TRUE 0.719 -3.000 0.028 1.000 N NA
 5989604 5989605 Cj8421_1134 Cj8421_1135 smpB   TRUE 0.663 11.000 0.009 NA   NA
 5989605 5989606 Cj8421_1135 Cj8421_1136     TRUE 0.839 0.000 0.024 NA   NA
 5989606 5989607 Cj8421_1136 Cj8421_1137   clpA TRUE 0.944 -3.000 0.596 NA   NA
 5989607 5989608 Cj8421_1137 Cj8421_1138 clpA aat TRUE 0.962 -25.000 0.087 1.000 Y NA
 5989609 5989610 Cj8421_1139 Cj8421_1140     TRUE 0.657 81.000 0.286 NA N NA
 5989612 5989613 Cj8421_1143 Cj8421_1144 pssA   TRUE 0.984 10.000 0.466 1.000 Y NA
 5989613 5989614 Cj8421_1144 Cj8421_1145   ftsH TRUE 0.762 -3.000 0.043 1.000 N NA
 5989614 5989615 Cj8421_1145 Cj8421_1146 ftsH prmA TRUE 0.971 4.000 0.217 1.000 N NA
 5989615 5989616 Cj8421_1146 Cj8421_1147 prmA cheY TRUE 0.854 23.000 0.146 1.000 N NA
 5989616 5989617 Cj8421_1147 Cj8421_1148 cheY wlaM FALSE 0.286 146.000 0.062 1.000   NA
 5989617 5989618 Cj8421_1148 Cj8421_1149 wlaM wlaL TRUE 0.959 0.000 0.242 1.000   NA
 5989618 5989619 Cj8421_1149 Cj8421_1150 wlaL wlaK FALSE 0.449 358.000 0.133 1.000 Y NA
 5989619 5989620 Cj8421_1150 Cj8421_1152 wlaK wlaI FALSE 0.396 98.000 0.070 1.000   NA
 5989620 5989621 Cj8421_1152 Cj8421_1153 wlaI wlaH TRUE 0.935 -34.000 0.074 NA   NA
 5989621 5989622 Cj8421_1153 Cj8421_1154 wlaH wlaG TRUE 0.921 -7.000 0.128 NA Y NA
 5989622 5989623 Cj8421_1154 Cj8421_1155 wlaG wlaF TRUE 0.888 10.000 0.045 1.000   NA
 5989623 5989624 Cj8421_1155 Cj8421_1156 wlaF wlaE TRUE 0.980 4.000 0.375 1.000   NA
 5989624 5989625 Cj8421_1156 Cj8421_1157 wlaE wlaD TRUE 0.957 -12.000 0.208 NA Y NA
 5989625 5989626 Cj8421_1157 Cj8421_1158 wlaD wlaC TRUE 0.948 -7.000 0.267 NA Y NA
 5989626 5989627 Cj8421_1158 Cj8421_1161 wlaC galE FALSE 0.120 1684.000 0.000 1.000 Y NA
 5989627 5989628 Cj8421_1161 Cj8421_1162 galE   TRUE 0.675 53.000 0.086 1.000 N NA
 5989629 5989630 Cj8421_1163 Cj8421_1164 waaC htrB TRUE 0.979 -28.000 0.231 1.000 Y NA
 5989630 5989631 Cj8421_1164 Cj8421_1165 htrB   TRUE 0.852 -3.000 0.050 NA Y NA
 5989631 5989632 Cj8421_1165 Cj8421_1166   rmlA TRUE 0.638 34.000 0.007 NA Y NA
 5989632 5989633 Cj8421_1166 Cj8421_1167 rmlA rmlB TRUE 0.986 0.000 0.040 0.007 Y NA
 5989633 5989634 Cj8421_1167 Cj8421_1168 rmlB   TRUE 0.977 3.000 0.286 NA   NA
 5989634 5989635 Cj8421_1168 Cj8421_1169     TRUE 0.807 22.000 0.097 NA   NA
 5989635 5989636 Cj8421_1169 Cj8421_1170     TRUE 0.685 -10.000 0.015 NA   NA
 5989636 5989637 Cj8421_1170 Cj8421_1171     FALSE 0.373 16.000 0.000 NA   NA
 5989637 5989638 Cj8421_1171 Cj8421_1172     FALSE 0.038 297.000 0.000 NA   NA
 5989638 5989639 Cj8421_1172 Cj8421_1173     TRUE 0.818 66.000 0.250 NA Y NA
 5989639 5989640 Cj8421_1173 Cj8421_1174     TRUE 0.909 -31.000 0.012 NA Y NA
 5989641 5989642 Cj8421_1175 Cj8421_1176     TRUE 0.948 -3.000 0.667 NA   NA
 5989643 5989644 Cj8421_1178 Cj8421_1179     TRUE 0.894 -7.000 0.200 NA   NA
 5989644 5989645 Cj8421_1179 Cj8421_1180     TRUE 0.870 -3.000 0.200 NA   NA
 5989648 5989649 Cj8421_1183 Cj8421_1186 gmhA waaD FALSE 0.176 1372.000 0.009 1.000 Y NA
 5989649 5989650 Cj8421_1186 Cj8421_1187 waaD   TRUE 0.952 1.000 0.093 1.000 N NA
 5989652 5989653 Cj8421_1189 Cj8421_1190     TRUE 0.971 -3.000 0.713 NA Y NA
 5989654 5989655 Cj8421_1191 Cj8421_1192 rho dnaX TRUE 0.847 4.000 0.009 1.000 N NA
 5989656 5989657 Cj8421_1193 Cj8421_1196     FALSE 0.428 72.000 0.042 NA   NA
 5989657 5989658 Cj8421_1196 Cj8421_1197     TRUE 0.985 0.000 0.067 0.003   NA
 5989658 5989659 Cj8421_1197 Cj8421_1198     TRUE 0.892 -16.000 0.053 1.000   NA
 5989659 5989660 Cj8421_1198 Cj8421_1199     TRUE 0.602 52.000 0.059 NA   NA
 5989660 5989661 Cj8421_1199 Cj8421_1200     FALSE 0.433 70.000 0.037 NA   NA
 5989661 5989662 Cj8421_1200 Cj8421_1201     TRUE 0.799 -3.000 0.083 NA   NA
 5989664 5989665 Cj8421_1203 Cj8421_1204     FALSE 0.366 81.000 0.043 NA   NA
 5989665 5989666 Cj8421_1204 Cj8421_1205     TRUE 0.872 11.000 0.070 NA   NA
 5989666 5989667 Cj8421_1205 Cj8421_1206   ppi FALSE 0.294 69.000 0.015 NA   NA
 5989667 5989668 Cj8421_1206 Cj8421_1207 ppi   TRUE 0.734 10.000 0.010 NA   NA
 5989669 5989670 Cj8421_1208 Cj8421_1209     TRUE 0.997 0.000 0.869 0.061 Y NA
 5989671 5989672 Cj8421_1212 Cj8421_1213   gmk TRUE 0.721 -13.000 0.009 1.000 N NA
 5989672 5989673 Cj8421_1213 Cj8421_1214 gmk   FALSE 0.416 -3.000 0.003 NA   NA
 5989674 5989675 Cj8421_0428 Cj8421_0427     TRUE 0.905 -7.000 0.237 NA   NA
 5989677 5989678 Cj8421_0425 Cj8421_0424     TRUE 0.870 77.000 1.000 NA   NA
 5989678 5989679 Cj8421_0424 Cj8421_0423     TRUE 0.635 -10.000 0.010 NA   NA
 5989679 5989680 Cj8421_0423 Cj8421_0422     FALSE 0.104 123.000 0.007 NA   NA
 5989680 5989681 Cj8421_0422 Cj8421_0421     TRUE 0.988 0.000 1.000 NA   NA
 5989681 5989682 Cj8421_0421 Cj8421_0420     FALSE 0.269 31.000 0.000 NA   NA
 5989683 5989684 Cj8421_0419 Cj8421_0415     TRUE 0.786 61.000 0.333 NA   NA
 5989685 5989686 Cj8421_0414 Cj8421_0413     FALSE 0.274 74.000 0.017 NA   NA
 5989688 5989689 Cj8421_0410 Cj8421_0409     FALSE 0.039 273.000 0.000 NA   NA
 5989689 5989690 Cj8421_0409 Cj8421_0408     TRUE 0.997 2.000 0.500 0.002   NA
 5989690 5989691 Cj8421_0408 Cj8421_0407     FALSE 0.441 136.000 0.182 1.000   NA
 5989691 5989692 Cj8421_0407 Cj8421_0402   frdB FALSE 0.043 4032.000 0.000 1.000   NA
 5989692 5989693 Cj8421_0402 Cj8421_0401 frdB frdA TRUE 0.985 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 5989693 5989694 Cj8421_0401 Cj8421_0400 frdA frdC TRUE 0.994 -28.000 0.128 0.005 Y NA
 5989694 5989695 Cj8421_0400 Cj8421_0399 frdC lgt TRUE 0.524 27.000 0.010 1.000 N NA
 5989697 5989698 Cj8421_0397 Cj8421_0396 aroE   TRUE 0.625 -3.000 0.020 NA   NA
 5989698 5989699 Cj8421_0396 Cj8421_0395     TRUE 0.982 -49.000 0.387 NA   NA
 5989699 5989700 Cj8421_0395 Cj8421_0394   glyA TRUE 0.964 9.000 0.271 NA   NA
 5989700 5989701 Cj8421_0394 Cj8421_0393 glyA lysS TRUE 0.764 -3.000 0.044 1.000 N NA
 5989701 5989702 Cj8421_0393 Cj8421_0392 lysS fur TRUE 0.895 1.000 0.022 1.000 N NA
 5989702 5989703 Cj8421_0392 Cj8421_0391 fur   TRUE 0.905 2.000 0.023 1.000   NA
 5989703 5989704 Cj8421_0391 Cj8421_0390   gatC FALSE 0.212 67.000 0.003 1.000   NA
 5989705 5989706 Cj8421_0389 Cj8421_0388     TRUE 0.762 -3.000 0.057 NA   NA
 5989706 5989707 Cj8421_0388 Cj8421_0387     TRUE 0.948 -3.000 0.667 NA   NA
 5989707 5989708 Cj8421_0387 Cj8421_0386     TRUE 0.577 -13.000 0.003 NA   NA
 5989708 5989709 Cj8421_0386 Cj8421_0385     FALSE 0.131 118.000 0.007 1.000   NA
 5989709 5989710 Cj8421_0385 Cj8421_0384   pyk TRUE 0.686 49.000 0.073 1.000   NA
 5989710 5989711 Cj8421_0384 Cj8421_0383 pyk   FALSE 0.293 98.000 0.037 NA   NA
 5989712 5989713 Cj8421_0382 Cj8421_0381   serS TRUE 0.792 10.000 0.014 1.000   NA
 5989713 5989714 Cj8421_0381 Cj8421_0380 serS trpS FALSE 0.427 456.000 0.010 0.055 Y NA
 5989714 5989715 Cj8421_0380 Cj8421_0379 trpS aroK FALSE 0.464 -3.000 0.002 1.000 N NA
 5989715 5989716 Cj8421_0379 Cj8421_0378 aroK   TRUE 0.618 -13.000 0.002 1.000   NA
 5989717 5989718 Cj8421_0377 Cj8421_0376   kdsA TRUE 0.511 -3.000 0.005 1.000   NA
 5989718 5989719 Cj8421_0376 Cj8421_0375 kdsA ribH TRUE 0.710 -3.000 0.027 1.000 N NA
 5989719 5989720 Cj8421_0375 Cj8421_0374 ribH nusB TRUE 0.901 0.000 0.045 1.000 N NA
 5989720 5989721 Cj8421_0374 Cj8421_0373 nusB pyrF TRUE 0.682 -3.000 0.023 1.000 N NA
 5989721 5989722 Cj8421_0373 Cj8421_0372 pyrF   FALSE 0.066 201.000 0.005 NA   NA
 5989722 5989723 Cj8421_0372 Cj8421_0371     FALSE 0.346 56.000 0.013 NA   NA
 5989723 5989724 Cj8421_0371 Cj8421_0370     TRUE 0.995 0.000 0.790 0.046   NA
 5989725 5989726 Cj8421_0367 Cj8421_0366     FALSE 0.411 137.000 0.176 NA   NA
 5989726 5989727 Cj8421_0366 Cj8421_0365     FALSE 0.175 93.000 0.012 NA   NA
 5989727 5989728 Cj8421_0365 Cj8421_0364     TRUE 0.734 -10.000 0.021 NA   NA
 5989728 5989729 Cj8421_0364 Cj8421_0363     TRUE 0.963 3.000 0.118 1.000 N NA
 5989729 5989730 Cj8421_0363 Cj8421_0362     TRUE 0.981 10.000 0.763 NA   NA
 5989730 5989731 Cj8421_0362 Cj8421_0361   rpsU FALSE 0.135 120.000 0.012 NA   NA
 5989732 5989733 Cj8421_0360 Cj8421_0359     TRUE 0.981 -13.000 0.818 1.000   NA
 5989733 5989734 Cj8421_0359 Cj8421_0358     TRUE 0.510 94.000 0.145 1.000   NA
 5989734 5989735 Cj8421_0358 Cj8421_0357     TRUE 0.988 0.000 0.945 1.000 N NA
 5989735 5989736 Cj8421_0357 Cj8421_0356     TRUE 0.973 -7.000 0.241 0.038 N NA
 5989739 5989740 Cj8421_0353 Cj8421_0352   lspA TRUE 0.801 -16.000 0.020 NA   NA
 5989740 5989741 Cj8421_0352 Cj8421_0351 lspA   TRUE 0.800 -7.000 0.042 1.000 N NA
 5989741 5989742 Cj8421_0351 Cj8421_0350     FALSE 0.141 94.000 0.004 1.000 N NA
 5989743 5989744 Cj8421_0349 Cj8421_0348     TRUE 0.872 -15.000 0.040 1.000   NA
 5989744 5989745 Cj8421_0348 Cj8421_0347     FALSE 0.416 79.000 0.043 1.000 N NA
 5989745 5989746 Cj8421_0347 Cj8421_0346   fdxB FALSE 0.489 110.000 0.200 NA   NA
 5989746 5989747 Cj8421_0346 Cj8421_0345 fdxB   TRUE 0.984 0.000 0.806 NA   NA
 5989748 5989749 Cj8421_0344 Cj8421_0343   fliN TRUE 0.984 1.000 0.531 NA   NA
 5989749 5989750 Cj8421_0343 Cj8421_0342 fliN   TRUE 0.980 0.000 0.625 NA   NA
 5989750 5989751 Cj8421_0342 Cj8421_0341   trpA FALSE 0.307 70.000 0.017 NA   NA
 5989751 5989752 Cj8421_0341 Cj8421_0340 trpA trpB TRUE 0.990 -7.000 0.248 0.002 Y NA
 5989752 5989753 Cj8421_0340 Cj8421_0339 trpB trpF TRUE 0.990 -3.000 0.375 0.003 Y NA
 5989753 5989754 Cj8421_0339 Cj8421_0338 trpF trpD TRUE 0.793 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 5989754 5989755 Cj8421_0338 Cj8421_0336 trpD   FALSE 0.125 164.000 0.016 NA   NA
 5989756 5989757 Cj8421_0335 Cj8421_0334   uvrA FALSE 0.182 73.000 0.003 1.000   NA
 5989757 5989758 Cj8421_0334 Cj8421_0331 uvrA   TRUE 0.741 2.000 0.002 NA   NA
 5989758 5989759 Cj8421_0331 Cj8421_0333     TRUE 0.942 44.000 1.000 NA   NA
 5989759 5989760 Cj8421_0333 Cj8421_0332     TRUE 0.987 -19.000 1.000 NA   NA
 5989760 5989761 Cj8421_0332 Cj8421_0330     TRUE 0.734 0.000 0.008 NA   NA
 5989762 5989763 Cj8421_0329 Cj8421_0327     FALSE 0.290 176.000 0.097 NA   NA
 5989764 5989765 Cj8421_0326 Cj8421_0325 polA motA TRUE 0.580 16.000 0.006 1.000 N NA
 5989765 5989766 Cj8421_0325 Cj8421_0324 motA motB TRUE 0.979 3.000 0.119 1.000 Y NA
 5989767 5989768 Cj8421_0323 Cj8421_0322 flhB ahpC FALSE 0.130 119.000 0.006 1.000 N NA
 5989769 5989770 Cj8421_0321 Cj8421_0320 fdxA ndk FALSE 0.158 113.000 0.015 NA   NA
 5989770 5989771 Cj8421_0320 Cj8421_0319 ndk   TRUE 0.910 1.000 0.033 NA   NA
 5989771 5989772 Cj8421_0319 Cj8421_0318   rpmF TRUE 0.681 24.000 0.032 NA   NA
 5989772 5989773 Cj8421_0318 Cj8421_0317 rpmF plsX TRUE 0.979 6.000 0.418 1.000   NA
 5989773 5989774 Cj8421_0317 Cj8421_0316 plsX fabH TRUE 0.989 -25.000 0.058 0.007 Y NA
 5989775 5989776 Cj8421_0315 Cj8421_0314   serC FALSE 0.444 -3.000 0.004 NA N NA
 5989776 5989777 Cj8421_0314 Cj8421_0313 serC xseA TRUE 0.770 10.000 0.010 1.000 N NA
 5989777 5989778 Cj8421_0313 Cj8421_0312 xseA ubiE TRUE 0.630 -3.000 0.016 1.000 N NA
 5989778 5989779 Cj8421_0312 Cj8421_0311 ubiE   TRUE 0.824 3.000 0.008 NA   NA
 5989779 5989780 Cj8421_0311 Cj8421_0310   perR TRUE 0.572 46.000 0.033 NA   NA
 5989780 5989781 Cj8421_0310 Cj8421_0309 perR dxs FALSE 0.254 86.000 0.017 1.000 N NA
 5989781 5989782 Cj8421_0309 Cj8421_0308 dxs fliH TRUE 0.797 -7.000 0.052 NA N NA
 5989782 5989783 Cj8421_0308 Cj8421_0307 fliH fliG TRUE 0.982 8.000 0.308 NA Y NA
 5989783 5989784 Cj8421_0307 Cj8421_0306 fliG fliF TRUE 0.996 0.000 0.477 0.012 Y NA
 5989784 5989785 Cj8421_0306 Cj8421_0305 fliF hisC TRUE 0.681 52.000 0.084 1.000 N NA
 5989785 5989786 Cj8421_0305 Cj8421_0304 hisC pheA TRUE 0.884 -10.000 0.028 1.000 Y NA
 5989786 5989787 Cj8421_0304 Cj8421_0303 pheA   TRUE 0.787 -12.000 0.021 1.000 N NA
 5989787 5989788 Cj8421_0303 Cj8421_0302   lysA TRUE 0.882 2.000 0.015 1.000 N NA
 5989788 5989789 Cj8421_0302 Cj8421_0301 lysA   TRUE 0.525 44.000 0.021 1.000   NA
 5989789 5989790 Cj8421_0301 Cj8421_0300   pth TRUE 0.923 2.000 0.031 1.000   NA
 5989790 5989791 Cj8421_0300 Cj8421_0299 pth   TRUE 0.986 -3.000 0.496 0.046 Y NA
 5989792 5989793 Cj8421_0298 Cj8421_0297     TRUE 0.996 4.000 0.444 0.059 Y NA
 5989793 5989794 Cj8421_0297 Cj8421_0296   bioD TRUE 0.870 10.000 0.030 1.000 N NA
 5989796 5989797 Cj8421_0294 Cj8421_0293 bioF   TRUE 0.919 -3.000 0.389 NA   NA
 5989797 5989798 Cj8421_0293 Cj8421_0292   bioC TRUE 0.634 51.000 0.065 NA   NA
 5989798 5989799 Cj8421_0292 Cj8421_0291 bioC modA FALSE 0.094 153.000 0.008 NA   NA
 5989799 5989800 Cj8421_0291 Cj8421_0290 modA   FALSE 0.462 93.000 0.098 1.000 N NA
 5989800 5989801 Cj8421_0290 Cj8421_0289   modB TRUE 0.876 -7.000 0.122 1.000 N NA
 5989801 5989802 Cj8421_0289 Cj8421_0288 modB modC TRUE 0.977 10.000 0.286 1.000 Y NA
 5989802 5989803 Cj8421_0288 Cj8421_0286 modC panB FALSE 0.082 154.000 0.002 1.000 N NA
 5989803 5989804 Cj8421_0286 Cj8421_0285 panB panC TRUE 0.995 11.000 0.395 0.002 Y NA
 5989804 5989805 Cj8421_0285 Cj8421_0284 panC panD TRUE 0.950 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 5989806 5989807 Cj8421_0283 Cj8421_0282     TRUE 0.732 -16.000 0.007 1.000   NA
 5989807 5989808 Cj8421_0282 Cj8421_0280     FALSE 0.436 -10.000 0.000 NA   NA
 5989808 5989809 Cj8421_0280 Cj8421_0281   surE TRUE 0.624 -30.000 0.000 NA   NA
 5989810 5989811 Cj8421_0279 Cj8421_0278     FALSE 0.475 11.000 0.000 NA   NA
 5989811 5989812 Cj8421_0278 Cj8421_0277   peb3 FALSE 0.039 264.000 0.000 NA   NA
 5989812 5989813 Cj8421_0277 Cj8421_0276 peb3 lpxB FALSE 0.068 277.000 0.003 1.000   NA
 5989813 5989814 Cj8421_0276 Cj8421_0275 lpxB greA TRUE 0.840 12.000 0.042 1.000 N NA
 5989814 5989815 Cj8421_0275 Cj8421_0274 greA   FALSE 0.127 133.000 0.012 NA   NA
 5989815 5989816 Cj8421_0274 Cj8421_0273   cheV FALSE 0.260 160.000 0.065 NA   NA
 5989816 5989817 Cj8421_0273 Cj8421_0272 cheV cheA TRUE 0.995 4.000 0.147 0.009 Y NA
 5989817 5989818 Cj8421_0272 Cj8421_0271 cheA cheW TRUE 0.993 5.000 0.137 0.012 Y NA
 5989818 5989819 Cj8421_0271 Cj8421_0270 cheW serB TRUE 0.823 0.000 0.015 1.000 N NA
 5989819 5989820 Cj8421_0270 Cj8421_0269 serB tal TRUE 0.879 0.000 0.029 1.000 N NA
 5989821 5989822 Cj8421_0268 Cj8421_0267   carB TRUE 0.595 -3.000 0.016 NA N NA
 5989822 5989823 Cj8421_0267 Cj8421_0266 carB   FALSE 0.130 243.000 0.016 1.000 N NA
 5989823 5989824 Cj8421_0266 Cj8421_0265   mreB TRUE 0.972 -10.000 0.689 1.000 N NA
 5989824 5989825 Cj8421_0265 Cj8421_0264 mreB clpX TRUE 0.828 12.000 0.034 1.000 N NA
 5989825 5989826 Cj8421_0264 Cj8421_0263 clpX lpxA TRUE 0.752 -7.000 0.027 1.000 N NA
 5989826 5989827 Cj8421_0263 Cj8421_0262 lpxA fabZ TRUE 0.963 0.000 0.264 1.000 N NA
 5989827 5989828 Cj8421_0262 Cj8421_0260 fabZ   FALSE 0.160 529.000 0.035 NA   NA
 5989828 5989829 Cj8421_0260 Cj8421_0259     TRUE 0.712 0.000 0.006 NA   NA
 5989829 5989830 Cj8421_0259 Cj8421_0258     TRUE 0.547 -3.000 0.008 1.000   NA
 5989831 5989832 Cj8421_0257 Cj8421_0256 ilvE   TRUE 0.882 13.000 0.098 1.000 N NA
 5989832 5989833 Cj8421_0256 Cj8421_0255     TRUE 0.509 72.000 0.075 NA   NA
 5989833 5989834 Cj8421_0255 Cj8421_0254     TRUE 0.986 0.000 0.867 NA   NA
 5989835 5989836 Cj8421_1533 Cj8421_1532   ccoN FALSE 0.317 125.000 0.062 1.000 N NA
 5989836 5989837 Cj8421_1532 Cj8421_1531 ccoN ccoO TRUE 0.987 13.000 0.283 0.003 N NA
 5989837 5989838 Cj8421_1531 Cj8421_1530 ccoO ccoQ TRUE 0.998 2.000 0.738 0.003 N NA
 5989838 5989839 Cj8421_1530 Cj8421_1529 ccoQ ccoP TRUE 0.993 0.000 0.286 0.003 N NA
 5989839 5989840 Cj8421_1529 Cj8421_1528 ccoP   TRUE 0.945 21.000 0.579 NA   NA
 5989840 5989841 Cj8421_1528 Cj8421_1527     TRUE 0.714 95.000 0.526 NA   NA
 5989841 5989842 Cj8421_1527 Cj8421_1524     FALSE 0.034 2359.000 0.000 NA   NA
 5989842 5989843 Cj8421_1524 Cj8421_1523   rplM FALSE 0.200 85.000 0.009 1.000 N NA
 5989843 5989844 Cj8421_1523 Cj8421_1522 rplM rpsI TRUE 0.996 3.000 0.231 0.027 Y NA
 5989844 5989845 Cj8421_1522 Cj8421_1521 rpsI cadF FALSE 0.215 125.000 0.024 1.000 N NA
 5989845 5989846 Cj8421_1521 Cj8421_1520 cadF   TRUE 0.918 0.000 0.068 1.000   NA
 5989846 5989847 Cj8421_1520 Cj8421_1519     FALSE 0.375 94.000 0.056 1.000   NA
 5989847 5989848 Cj8421_1519 Cj8421_1518     TRUE 0.683 24.000 0.032 NA   NA
 5989848 5989849 Cj8421_1518 Cj8421_1517     TRUE 0.945 -22.000 0.167 NA   NA
 5989849 5989850 Cj8421_1517 Cj8421_1516     TRUE 0.893 -7.000 0.167 1.000   NA
 5989850 5989851 Cj8421_1516 Cj8421_1515     TRUE 0.622 275.000 0.667 1.000   NA
 5989851 5989852 Cj8421_1515 Cj8421_1512     FALSE 0.044 1545.000 0.000 1.000   NA
 5989853 5989854 Cj8421_1511 Cj8421_1510     TRUE 0.922 4.000 0.035 1.000   NA
 5989854 5989855 Cj8421_1510 Cj8421_1509   flgK TRUE 0.838 17.000 0.084 1.000   NA
 5989855 5989856 Cj8421_1509 Cj8421_1508 flgK   TRUE 0.995 10.000 0.558 0.003   NA
 5989856 5989857 Cj8421_1508 Cj8421_1507     TRUE 0.982 43.000 0.677 0.005   NA
 5989857 5989858 Cj8421_1507 Cj8421_1506     TRUE 0.831 63.000 0.469 NA   NA
 5989858 5989859 Cj8421_1506 Cj8421_1505   flgI TRUE 0.978 0.000 0.569 NA   NA
 5989859 5989860 Cj8421_1505 Cj8421_1504 flgI   FALSE 0.170 59.000 0.000 NA N NA
 5989860 5989861 Cj8421_1504 Cj8421_1503     FALSE 0.436 -10.000 0.000 NA   NA
 5989861 5989862 Cj8421_1503 Cj8421_1502     TRUE 0.847 -3.000 0.143 NA   NA
 5989863 5989864 Cj8421_1501 Cj8421_1500 thiL   TRUE 0.879 -31.000 0.022 1.000   NA
 5989866 5989867 Cj8421_1497 Cj8421_1495     TRUE 0.756 -10.000 0.019 1.000 N NA
 5989868 5989869 Cj8421_1494 Cj8421_1493   dut FALSE 0.427 92.000 0.092 NA   NA
 5989869 5989870 Cj8421_1493 Cj8421_1492 dut   TRUE 0.768 38.000 0.120 NA   NA
 5989871 5989872 Cj8421_1491 Cj8421_1490   kpsM FALSE 0.473 72.000 0.048 1.000   NA
 5989872 5989873 Cj8421_1490 Cj8421_1489 kpsM kpsT TRUE 0.946 -3.000 0.306 1.000 Y NA
 5989873 5989874 Cj8421_1489 Cj8421_1488 kpsT kpsE TRUE 0.977 0.000 0.257 1.000 Y NA
 5989874 5989875 Cj8421_1488 Cj8421_1487 kpsE kpsD TRUE 0.993 2.000 0.200 0.091 Y NA
 5989875 5989876 Cj8421_1487 Cj8421_1486 kpsD kpsF TRUE 0.943 10.000 0.056 1.000 Y NA
 5989876 5989877 Cj8421_1486 Cj8421_1485 kpsF   TRUE 0.951 6.000 0.033 1.000 Y NA
 5989877 5989878 Cj8421_1485 Cj8421_1484     TRUE 0.846 -7.000 0.100 NA   NA
 5989878 5989879 Cj8421_1484 Cj8421_1483     TRUE 0.989 -46.000 0.667 NA   NA
 5989879 5989880 Cj8421_1483 Cj8421_1482     TRUE 0.994 6.000 1.000 NA Y NA
 5989880 5989881 Cj8421_1482 Cj8421_1481     TRUE 0.994 6.000 1.000 NA Y NA
 5989881 5989882 Cj8421_1481 Cj8421_1480     TRUE 0.961 25.000 1.000 NA   NA
 5989882 5989883 Cj8421_1480 Cj8421_1479     TRUE 0.976 0.000 0.500 NA   NA
 5989883 5989884 Cj8421_1479 Cj8421_1478     TRUE 0.985 3.000 0.500 NA   NA
 5989884 5989885 Cj8421_1478 Cj8421_1477     TRUE 0.989 -28.000 1.000 NA   NA
 5989885 5989886 Cj8421_1477 Cj8421_1476   fcl TRUE 0.980 7.000 0.500 NA   NA
 5989886 5989887 Cj8421_1476 Cj8421_1475 fcl dmhA TRUE 0.992 -33.000 0.067 0.006 Y NA
 5989887 5989888 Cj8421_1475 Cj8421_1474 dmhA   TRUE 0.967 24.000 0.067 0.006 Y NA
 5989888 5989889 Cj8421_1474 Cj8421_1473   hddA FALSE 0.446 75.000 0.050 1.000   NA
 5989889 5989890 Cj8421_1473 Cj8421_1472 hddA gmhA2 TRUE 0.919 -12.000 0.148 1.000   NA
 5989890 5989891 Cj8421_1472 Cj8421_1471 gmhA2 hddC TRUE 0.713 60.000 0.154 1.000   NA
 5989891 5989892 Cj8421_1471 Cj8421_1470 hddC   FALSE 0.423 13.000 0.000 NA   NA
 5989892 5989893 Cj8421_1470 Cj8421_1469     TRUE 0.773 52.000 0.222 NA   NA
 5989893 5989894 Cj8421_1469 Cj8421_1468     TRUE 0.875 53.000 0.263 1.000 Y NA
 5989894 5989895 Cj8421_1468 Cj8421_1467     TRUE 0.923 15.000 0.261 1.000 N NA
 5989895 5989896 Cj8421_1467 Cj8421_1466     TRUE 0.966 -9.000 0.667 1.000   NA
 5989896 5989897 Cj8421_1466 Cj8421_1465     TRUE 0.989 2.000 0.679 1.000   NA
 5989897 5989898 Cj8421_1465 Cj8421_1464   cysC TRUE 0.830 -10.000 0.039 1.000 N NA
 5989898 5989899 Cj8421_1464 Cj8421_1463 cysC kpsC FALSE 0.254 138.000 0.039 1.000 N NA
 5989899 5989900 Cj8421_1463 Cj8421_1462 kpsC   TRUE 0.784 184.000 0.056 0.002 Y NA
 5989900 5989901 Cj8421_1462 Cj8421_1461     FALSE 0.426 73.000 0.046 NA   NA
 5989901 5989902 Cj8421_1461 Cj8421_1460     TRUE 0.839 -3.000 0.132 NA   NA
 5989902 5989903 Cj8421_1460 Cj8421_1459     TRUE 0.944 -3.000 0.600 NA   NA
 5989904 5989905 Cj8421_1458 Cj8421_1457 acpS fliL TRUE 0.903 0.000 0.047 1.000 N NA
 5989906 5989907 Cj8421_1456 Cj8421_1455     FALSE 0.333 47.000 0.007 NA   NA
 5989908 5989909 Cj8421_1454 Cj8421_1453     TRUE 0.855 28.000 0.221 NA   NA
 5989910 5989911 Cj8421_1452 Cj8421_1451 gapA pgk TRUE 0.989 3.000 0.020 0.006 Y NA
 5989911 5989912 Cj8421_1451 Cj8421_1450 pgk tpiA TRUE 0.806 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 5989912 5989913 Cj8421_1450 Cj8421_1449 tpiA fabI TRUE 0.985 4.000 0.071 0.039 N NA
 5989913 5989914 Cj8421_1449 Cj8421_1448 fabI hydA2 TRUE 0.952 4.000 0.088 1.000 N NA
 5989915 5989916 Cj8421_1447 Cj8421_1446 feoB   TRUE 0.886 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 5989916 5989917 Cj8421_1446 Cj8421_1445     FALSE 0.261 567.000 0.094 1.000   NA
 5989917 5989918 Cj8421_1445 Cj8421_1444     FALSE 0.045 648.000 0.000 1.000   NA
 5989918 5989919 Cj8421_1444 Cj8421_1442   metC TRUE 0.921 10.000 0.000 0.032   NA
 5989919 5989920 Cj8421_1442 Cj8421_1440 metC metC FALSE 0.416 155.000 0.000 0.005   NA
 5989920 5989921 Cj8421_1440 Cj8421_1437 metC   FALSE 0.034 1457.000 0.000 NA   NA
 5989923 5989924 Cj8421_1435 Cj8421_1434   katA TRUE 0.628 57.000 0.091 NA   NA
 5989925 5989926 Cj8421_1433 Cj8421_1432     TRUE 0.953 3.000 0.094 NA   NA
 5989926 5989927 Cj8421_1432 Cj8421_1431   fldA TRUE 0.970 0.000 0.391 NA   NA
 5989928 5989929 Cj8421_1430 Cj8421_1429     TRUE 0.937 6.000 0.091 NA   NA
 5989929 5989930 Cj8421_1429 Cj8421_1426   selA FALSE 0.047 1850.000 0.000 1.000 N NA
 5989931 5989932 Cj8421_1425 Cj8421_1424     FALSE 0.065 110.000 0.000 NA   NA
 5989935 5989936 Cj8421_1421 Cj8421_1420     TRUE 0.958 0.000 0.263 NA   NA
 5989936 5989937 Cj8421_1420 Cj8421_1419     TRUE 0.980 10.000 0.684 NA N NA
 5989937 5989938 Cj8421_1419 Cj8421_1418     FALSE 0.135 183.000 0.016 1.000   NA
 5989938 5989939 Cj8421_1418 Cj8421_1417     TRUE 0.819 14.000 0.048 1.000   NA
 5989939 5989940 Cj8421_1417 Cj8421_1416     TRUE 0.896 10.000 0.053 1.000   NA
 5989941 5989942 Cj8421_1415 Cj8421_1414   glmS FALSE 0.465 265.000 0.312 1.000 N NA
 5989942 5989943 Cj8421_1414 Cj8421_1413 glmS   TRUE 0.935 3.000 0.042 1.000   NA
 5989943 5989944 Cj8421_1413 Cj8421_1412   fumC FALSE 0.273 56.000 0.003 1.000   NA
 5989945 5989946 Cj8421_1411 Cj8421_1410 amaA ruvB FALSE 0.191 109.000 0.019 NA   NA
 5989947 5989948 Cj8421_1409 Cj8421_1408     FALSE 0.035 563.000 0.000 NA   NA
 5989948 5989949 Cj8421_1408 Cj8421_1407     TRUE 0.703 -49.000 0.000 NA   NA
 5989953 5989954 Cj8421_1403 Cj8421_1402     TRUE 0.966 15.000 0.043 0.002 N NA
 5989954 5989955 Cj8421_1402 Cj8421_1401     TRUE 0.549 136.000 0.375 NA   NA
 5989956 5989957 Cj8421_1217 Cj8421_1218 fliR   TRUE 0.850 -13.000 0.032 1.000 N NA
 5989957 5989958 Cj8421_1218 Cj8421_1219   tsf TRUE 0.743 13.000 0.019 1.000 N NA
 5989958 5989959 Cj8421_1219 Cj8421_1220 tsf rpsB TRUE 0.990 0.000 0.748 1.000 Y NA
 5989959 5989960 Cj8421_1220 Cj8421_1221 rpsB cfa FALSE 0.113 116.000 0.003 1.000 N NA
 5989960 5989961 Cj8421_1221 Cj8421_1222 cfa petC FALSE 0.358 128.000 0.087 1.000 N NA
 5989961 5989962 Cj8421_1222 Cj8421_1223 petC petB TRUE 0.981 -3.000 0.103 0.002 Y NA
 5989962 5989963 Cj8421_1223 Cj8421_1224 petB petA TRUE 0.996 2.000 0.093 0.002 Y NA
 5989963 5989964 Cj8421_1224 Cj8421_1227 petA gidA FALSE 0.063 1379.000 0.003 1.000 N NA
 5989964 5989965 Cj8421_1227 Cj8421_1228 gidA   FALSE 0.150 88.000 0.004 1.000   NA
 5989965 5989966 Cj8421_1228 Cj8421_1229     TRUE 0.987 18.000 0.556 0.008   NA
 5989966 5989967 Cj8421_1229 Cj8421_1230     TRUE 0.879 120.000 0.444 0.008   NA
 5989971 5989972 Cj8421_1234 Cj8421_1235 pyrC2 gpsA TRUE 0.744 10.000 0.007 1.000 N NA
 5989972 5989973 Cj8421_1235 Cj8421_1236 gpsA gatB TRUE 0.794 0.000 0.011 1.000 N NA
 5989974 5989975 Cj8421_1237 Cj8421_1238     FALSE 0.290 311.000 0.000 0.022   NA
 5989975 5989976 Cj8421_1238 Cj8421_1239     TRUE 0.839 11.000 0.043 NA   NA
 5989976 5989977 Cj8421_1239 Cj8421_1240   metE TRUE 0.604 12.000 0.006 NA N NA
 5989977 5989978 Cj8421_1240 Cj8421_1241 metE metF TRUE 0.989 10.000 0.050 0.002 Y NA
 5989979 5989980 Cj8421_1242 Cj8421_1243 atpB radA FALSE 0.224 69.000 0.003 1.000 N NA
 5989980 5989981 Cj8421_1243 Cj8421_1244 radA ftsY TRUE 0.961 0.000 0.015 0.017 N NA
 5989981 5989982 Cj8421_1244 Cj8421_1245 ftsY   TRUE 0.712 0.000 0.003 1.000 N NA
 5989983 5989984 Cj8421_1246 Cj8421_1247     TRUE 0.953 -79.000 0.059 1.000   NA
 5989984 5989985 Cj8421_1247 Cj8421_1248     TRUE 0.774 9.000 0.010 NA   NA
 5989985 5989986 Cj8421_1248 Cj8421_1249     TRUE 0.707 0.000 0.005 NA   NA
 5989987 5989988 Cj8421_1252 Cj8421_1253     TRUE 0.983 3.000 0.404 NA   NA
 5989990 5989991 Cj8421_1255 Cj8421_1256   ribA TRUE 0.819 -36.000 0.011 NA   NA
 5989991 5989992 Cj8421_1256 Cj8421_1257 ribA   TRUE 0.708 9.000 0.004 NA   NA
 5989993 5989994 Cj8421_1258 Cj8421_1259 groES groEL TRUE 0.950 22.000 0.356 1.000 Y NA
 5989995 5989996 Cj8421_1260 Cj8421_1261     TRUE 0.982 -7.000 0.846 1.000 Y NA
 5989997 5989998 Cj8421_1262 Cj8421_1263     TRUE 0.833 11.000 0.031 1.000   NA
 5989999 5990000 Cj8421_1266 Cj8421_1267   htrA TRUE 0.708 76.000 0.294 1.000 N NA
 5990001 5990002 Cj8421_1268 Cj8421_1269 cbpA hspR TRUE 0.923 16.000 0.282 1.000 N NA
 5990002 5990003 Cj8421_1269 Cj8421_1270 hspR kefB TRUE 0.897 7.000 0.028 1.000 N NA
 5990003 5990004 Cj8421_1270 Cj8421_1271 kefB   TRUE 0.952 10.000 0.250 NA   NA
 5990004 5990005 Cj8421_1271 Cj8421_1272     TRUE 0.913 -3.000 0.364 NA   NA
 5990005 5990006 Cj8421_1272 Cj8421_1273   glyS FALSE 0.320 55.000 0.006 1.000   NA
 5990006 5990007 Cj8421_1273 Cj8421_1274 glyS   TRUE 0.553 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5990007 5990008 Cj8421_1274 Cj8421_1275     TRUE 0.543 -3.000 0.012 NA   NA
 5990010 5990011 Cj8421_1277 Cj8421_1278 pdxJ pdxA TRUE 0.975 -3.000 0.048 0.001 Y NA
 5990013 5990014 Cj8421_1280 Cj8421_1281     TRUE 0.830 56.000 0.400 NA   NA
 5990014 5990015 Cj8421_1281 Cj8421_1282   hemE FALSE 0.064 184.000 0.004 NA   NA
 5990015 5990016 Cj8421_1282 Cj8421_1283 hemE   TRUE 0.642 -3.000 0.017 1.000 N NA
 5990017 5990018 Cj8421_1284 Cj8421_1285   uvrC FALSE 0.114 104.000 0.005 NA   NA
 5990018 5990019 Cj8421_1285 Cj8421_1286 uvrC   FALSE 0.124 185.000 0.018 NA   NA
 5990020 5990021 Cj8421_1287 Cj8421_1288 guaA   FALSE 0.107 86.000 0.002 NA   NA
 5990021 5990022 Cj8421_1288 Cj8421_1289   purD FALSE 0.040 240.000 0.000 NA   NA
 5990022 5990023 Cj8421_1289 Cj8421_1290 purD   TRUE 0.596 -3.000 0.017 NA   NA
 5990023 5990024 Cj8421_1290 Cj8421_1291     TRUE 0.901 -10.000 0.149 NA   NA
 5990024 5990025 Cj8421_1291 Cj8421_1292   pnp FALSE 0.257 70.000 0.007 1.000 N NA
 5990025 5990026 Cj8421_1292 Cj8421_1293 pnp   FALSE 0.411 -3.000 0.002 NA N NA
 5990027 5990028 Cj8421_1295 Cj8421_1296     TRUE 0.934 18.000 0.429 NA   NA
 5990029 5990030 Cj8421_1297 Cj8421_1298   porA FALSE 0.039 251.000 0.000 NA   NA
 5990032 5990033 Cj8421_1300 Cj8421_1301 racR racS TRUE 0.960 -3.000 0.448 1.000 Y NA
 5990033 5990034 Cj8421_1301 Cj8421_1302 racS recR TRUE 0.802 0.000 0.011 1.000 N NA
 5990035 5990036 Cj8421_1303 Cj8421_1304 hydD hydC TRUE 0.926 30.000 0.277 1.000 Y NA
 5990036 5990037 Cj8421_1304 Cj8421_1305 hydC hydB TRUE 0.989 -13.000 0.270 0.043 Y NA
 5990037 5990038 Cj8421_1305 Cj8421_1306 hydB hydA TRUE 0.999 3.000 0.951 0.002 Y NA
 5990038 5990039 Cj8421_1306 Cj8421_1309 hydA amiA FALSE 0.047 1958.000 0.000 1.000 N NA
 5990039 5990040 Cj8421_1309 Cj8421_1310 amiA   TRUE 0.903 0.000 0.050 1.000   NA
 5990040 5990041 Cj8421_1310 Cj8421_1311   tyrS TRUE 0.757 -3.000 0.043 1.000   NA
 5990041 5990042 Cj8421_1311 Cj8421_1312 tyrS spoT TRUE 0.844 12.000 0.045 1.000 N NA
 5990042 5990043 Cj8421_1312 Cj8421_1313 spoT rpoZ FALSE 0.226 422.000 0.018 1.000 Y NA
 5990043 5990044 Cj8421_1313 Cj8421_1314 rpoZ pyrH TRUE 0.853 -88.000 0.004 1.000 N NA
 5990044 5990045 Cj8421_1314 Cj8421_1315 pyrH   FALSE 0.284 52.000 0.002 1.000 N NA
 5990045 5990046 Cj8421_1315 Cj8421_1316     FALSE 0.389 -3.000 0.000 1.000   NA
 5990046 5990047 Cj8421_1316 Cj8421_1317     TRUE 0.814 -13.000 0.024 1.000   NA
 5990047 5990048 Cj8421_1317 Cj8421_1318     FALSE 0.480 70.000 0.044 1.000   NA
 5990048 5990049 Cj8421_1318 Cj8421_1319     TRUE 0.901 0.000 0.060 NA   NA
 5990049 5990050 Cj8421_1319 Cj8421_1320     TRUE 0.922 -55.000 0.031 NA   NA
 5990051 5990052 Cj8421_1321 Cj8421_1322 mrdB ktrB FALSE 0.223 628.000 0.000 0.056 N NA
 5990052 5990053 Cj8421_1322 Cj8421_1323 ktrB ktrA TRUE 0.996 11.000 0.647 0.005 Y NA
 5990054 5990055 Cj8421_1324 Cj8421_1325   upp FALSE 0.074 170.000 0.005 NA   NA
 5990055 5990056 Cj8421_1325 Cj8421_1326 upp   TRUE 0.559 -3.000 0.008 1.000 N NA
 5990056 5990057 Cj8421_1326 Cj8421_1327   gltX2 TRUE 0.903 2.000 0.021 1.000 N NA
 5990059 5990060 Cj8421_1329 Cj8421_1330 accC accB TRUE 0.972 2.000 0.071 1.000 Y NA
 5990061 5990062 Cj8421_1331 Cj8421_1332 dcd   FALSE 0.446 49.000 0.014 1.000   NA
 5990062 5990063 Cj8421_1332 Cj8421_1333     TRUE 0.989 2.000 0.678 1.000   NA
 5990063 5990064 Cj8421_1333 Cj8421_1338     FALSE 0.047 1301.000 0.000 1.000 N NA
 5990064 5990065 Cj8421_1338 Cj8421_1339   acpP2 TRUE 0.576 0.000 0.000 NA   NA
 5990065 5990066 Cj8421_1339 Cj8421_1342 acpP2   FALSE 0.035 882.000 0.000 NA   NA
 5990066 5990067 Cj8421_1342 Cj8421_1343     FALSE 0.450 -3.000 0.005 NA   NA
 5990067 5990068 Cj8421_1343 Cj8421_1344   fabH2 TRUE 0.928 -10.000 0.250 NA N NA
 5990068 5990069 Cj8421_1344 Cj8421_1345 fabH2 acpP3 TRUE 0.952 0.000 0.188 1.000   NA
 5990071 5990072 Cj8421_0829 Cj8421_0830   glnH FALSE 0.076 94.000 0.000 NA   NA
 5990074 5990075 Cj8421_0834 Cj8421_0835 dfp   TRUE 0.654 -3.000 0.024 NA   NA
 5990075 5990076 Cj8421_0835 Cj8421_0836   uppS TRUE 0.832 4.000 0.012 NA   NA
 5990076 5990077 Cj8421_0836 Cj8421_0837 uppS   FALSE 0.067 197.000 0.002 1.000   NA
 5990077 5990078 Cj8421_0837 Cj8421_0838     TRUE 0.775 0.000 0.009 1.000   NA
 5990079 5990080 Cj8421_0841 Cj8421_0842 ilvA   FALSE 0.158 291.000 0.030 NA   NA
 5990082 5990083 Cj8421_0844 Cj8421_0845 trmA   TRUE 0.764 -3.000 0.056 NA N NA
 5990083 5990084 Cj8421_0845 Cj8421_0846     TRUE 0.742 -3.000 0.047 NA   NA
 5990084 5990085 Cj8421_0846 Cj8421_0847     TRUE 0.638 -3.000 0.018 1.000   NA
 5990085 5990086 Cj8421_0847 Cj8421_0848   acnB FALSE 0.166 102.000 0.010 1.000   NA
 5990088 5990089 Cj8421_0852 Cj8421_0853 metS   TRUE 0.824 10.000 0.024 NA   NA
 5990089 5990090 Cj8421_0853 Cj8421_0854   fbp TRUE 0.964 -7.000 0.778 NA   NA
 5990090 5990091 Cj8421_0854 Cj8421_0855 fbp   TRUE 0.770 -28.000 0.005 1.000 N NA
 5990093 5990094 Cj8421_0857 Cj8421_0858     FALSE 0.230 438.000 0.080 NA   NA
 5990094 5990095 Cj8421_0858 Cj8421_0859   gltX TRUE 0.956 3.000 0.088 1.000   NA
 5990096 5990097 Cj8421_0860 Cj8421_0861   psd TRUE 0.711 -3.000 0.028 1.000   NA
 5990098 5990099 Cj8421_0862 Cj8421_0863     TRUE 0.753 -3.000 0.042 1.000   NA
 5990099 5990100 Cj8421_0863 Cj8421_0864     TRUE 0.853 -7.000 0.091 1.000   NA
 5990100 5990101 Cj8421_0864 Cj8421_0865     TRUE 0.964 -22.000 0.318 NA   NA
 5990101 5990102 Cj8421_0865 Cj8421_0866     TRUE 0.959 0.000 0.269 NA   NA
 5990102 5990103 Cj8421_0866 Cj8421_0867   hemL TRUE 0.930 -3.000 0.462 NA   NA
 5990103 5990104 Cj8421_0867 Cj8421_0868 hemL   TRUE 0.886 -3.000 0.212 1.000   NA
 5990105 5990106 Cj8421_0869 Cj8421_0870 folD lepP TRUE 0.931 10.000 0.117 1.000 N NA
 5990107 5990108 Cj8421_0871 Cj8421_0872 moeA murA TRUE 0.690 -3.000 0.024 1.000 N NA
 5990108 5990109 Cj8421_0872 Cj8421_0873 murA fspA1 FALSE 0.203 66.000 0.004 NA   NA
 5990111 5990112 Cj8421_0875 Cj8421_0876 pabA pabB FALSE 0.373 290.000 0.009 0.015   NA
 5990112 5990113 Cj8421_0876 Cj8421_0877 pabB xerD FALSE 0.134 128.000 0.009 1.000 N NA
 5990114 5990115 Cj8421_0878 Cj8421_0879   dsbB TRUE 0.932 14.000 0.333 NA   NA
 5990115 5990116 Cj8421_0879 Cj8421_0880 dsbB   FALSE 0.035 681.000 0.000 NA   NA
 5990116 5990117 Cj8421_0880 Cj8421_0882   dsbA FALSE 0.062 114.000 0.000 NA   NA
 5990118 5990119 Cj8421_0883 Cj8421_0885     FALSE 0.040 232.000 0.000 NA   NA
 5990119 5990120 Cj8421_0885 Cj8421_0888     FALSE 0.037 333.000 0.000 NA   NA
 5990120 5990121 Cj8421_0888 Cj8421_0890     FALSE 0.040 223.000 0.000 NA   NA
 5990121 5990122 Cj8421_0890 Cj8421_0891   flhA TRUE 0.941 9.000 0.106 1.000   NA
 5990122 5990123 Cj8421_0891 Cj8421_0892 flhA   TRUE 0.866 -13.000 0.053 NA N NA
 5990125 5990126 Cj8421_0896 Cj8421_0897 flaD   FALSE 0.047 381.000 0.000 1.000   NA
 5990126 5990127 Cj8421_0897 Cj8421_0898     TRUE 0.951 4.000 0.007 0.099   NA
 5990127 5990128 Cj8421_0898 Cj8421_0899     TRUE 0.942 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 5990128 5990129 Cj8421_0899 Cj8421_0900   serA TRUE 0.697 -13.000 0.006 1.000 N NA
 5990129 5990130 Cj8421_0900 Cj8421_0901 serA   FALSE 0.217 110.000 0.025 NA   NA
 5990130 5990131 Cj8421_0901 Cj8421_0902   rpsA TRUE 0.966 0.000 0.343 NA   NA
 5990131 5990132 Cj8421_0902 Cj8421_0903 rpsA lytB FALSE 0.393 132.000 0.118 1.000 N NA
 5990132 5990133 Cj8421_0903 Cj8421_0904 lytB aroA TRUE 0.816 -10.000 0.032 1.000 N NA
 5990133 5990134 Cj8421_0904 Cj8421_0905 aroA pheT TRUE 0.715 -3.000 0.028 1.000 N NA
 5990134 5990135 Cj8421_0905 Cj8421_0906 pheT pheS TRUE 0.994 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 5990137 5990138 Cj8421_0908 Cj8421_0909 thiJ   TRUE 0.552 -3.000 0.012 NA   NA
 5990139 5990140 Cj8421_0910 Cj8421_0911   glnQ TRUE 0.916 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 5990141 5990142 Cj8421_0912 Cj8421_0913     FALSE 0.168 104.000 0.009 1.000 N NA
 5990142 5990143 Cj8421_0913 Cj8421_0914   alr TRUE 0.829 3.000 0.005 1.000 N NA
 5990143 5990144 Cj8421_0914 Cj8421_0915 alr   TRUE 0.874 1.000 0.021 NA   NA
 5990145 5990146 Cj8421_0916 Cj8421_0917     FALSE 0.343 86.000 0.042 NA   NA
 5990146 5990147 Cj8421_0917 Cj8421_0918     TRUE 0.938 4.000 0.069 NA   NA
 5990147 5990148 Cj8421_0918 Cj8421_0919     TRUE 0.868 -3.000 0.192 NA   NA
 5990149 5990150 Cj8421_0920 Cj8421_0921 cysM hupB FALSE 0.209 127.000 0.024 1.000 N NA
 5990152 5990153 Cj8421_0926 Cj8421_0927   cstA TRUE 0.955 -22.000 0.229 NA   NA
 5990153 5990154 Cj8421_0927 Cj8421_0928 cstA prsA FALSE 0.137 167.000 0.014 1.000 N NA
 5990154 5990155 Cj8421_0928 Cj8421_0929 prsA   FALSE 0.423 108.000 0.029 1.000 Y NA
 5990155 5990156 Cj8421_0929 Cj8421_0930     TRUE 0.997 11.000 0.947 0.013 Y NA
 5990156 5990157 Cj8421_0930 Cj8421_0931   peb1A TRUE 0.996 2.000 0.400 0.043 Y NA
 5990157 5990158 Cj8421_0931 Cj8421_0932 peb1A pebC TRUE 0.968 22.000 0.594 1.000 Y NA
 5990158 5990159 Cj8421_0932 Cj8421_0933 pebC cheR FALSE 0.340 274.000 0.143 1.000 N NA
 5990159 5990160 Cj8421_0933 Cj8421_0934 cheR cheB TRUE 0.888 16.000 0.154 1.000   NA
 5990161 5990162 Cj8421_0935 Cj8421_0936 rpiB   TRUE 0.925 0.000 0.103 NA   NA
 5990162 5990163 Cj8421_0936 Cj8421_0937   apt TRUE 0.682 -3.000 0.028 NA   NA
 5990163 5990164 Cj8421_0937 Cj8421_0938 apt   TRUE 0.682 19.000 0.026 NA   NA
 5990164 5990165 Cj8421_0938 Cj8421_0939   pepA TRUE 0.888 -3.000 0.250 NA   NA
 5990165 5990166 Cj8421_0939 Cj8421_0940 pepA   TRUE 0.704 -3.000 0.026 1.000 N NA
 5990167 5990168 Cj8421_0941 Cj8421_0942 argH pckA TRUE 0.740 10.000 0.006 1.000 N NA
 5990168 5990169 Cj8421_0942 Cj8421_0943 pckA pycB TRUE 0.844 13.000 0.016 1.000 Y NA
 5990169 5990170 Cj8421_0943 Cj8421_0946 pycB   FALSE 0.044 1383.000 0.000 1.000   NA
 5990171 5990172 Cj8421_0947 Cj8421_0948 atpE   FALSE 0.229 318.000 0.000 0.055   NA
 5990173 5990174 Cj8421_0949 Cj8421_0950 aas   FALSE 0.389 45.000 0.011 NA   NA
 5990175 5990176 Cj8421_0033 Cj8421_0035     TRUE 0.965 0.000 0.333 NA   NA
 5990176 5990177 Cj8421_0035 Cj8421_0037     FALSE 0.035 706.000 0.000 NA   NA
 5990178 5990179 Cj8421_0038 Cj8421_0039     TRUE 0.620 -3.000 0.019 NA   NA
 5990181 5990182 Cj8421_0041 Cj8421_0042     FALSE 0.377 178.000 0.182 NA   NA
 5990182 5990183 Cj8421_0042 Cj8421_0043   typA TRUE 0.709 0.000 0.006 NA   NA
 5990184 5990185 Cj8421_0044 Cj8421_0047   flgE FALSE 0.034 1864.000 0.000 NA   NA
 5990185 5990186 Cj8421_0047 Cj8421_0048 flgE   TRUE 0.986 4.000 0.341 NA Y NA
 5990187 5990188 Cj8421_0049 Cj8421_0050     TRUE 0.988 1.000 0.714 NA   NA
 5990188 5990189 Cj8421_0050 Cj8421_0051   trmU FALSE 0.047 1937.000 0.000 1.000 N NA
 5990189 5990190 Cj8421_0051 Cj8421_0052 trmU   TRUE 0.775 0.000 0.012 NA   NA
 5990190 5990191 Cj8421_0052 Cj8421_0053     FALSE 0.058 121.000 0.000 NA   NA
 5990191 5990192 Cj8421_0053 Cj8421_0055     FALSE 0.125 70.000 0.000 NA   NA
 5990194 5990195 Cj8421_0059 Cj8421_0060 fliY fliM TRUE 0.982 -3.000 0.142 0.003 Y NA
 5990195 5990196 Cj8421_0060 Cj8421_0061 fliM fliA TRUE 0.939 0.000 0.118 1.000 N NA
 5990196 5990197 Cj8421_0061 Cj8421_0062 fliA   TRUE 0.956 -43.000 0.112 NA   NA
 5990197 5990198 Cj8421_0062 Cj8421_0063     TRUE 0.865 19.000 0.159 NA   NA
 5990198 5990199 Cj8421_0063 Cj8421_0064   flhF TRUE 0.940 -7.000 0.382 1.000 N NA
 5990199 5990200 Cj8421_0064 Cj8421_0065 flhF folK TRUE 0.879 10.000 0.035 1.000 N NA
 5990200 5990201 Cj8421_0065 Cj8421_0066 folK aroQ TRUE 0.859 3.000 0.009 1.000 N NA
 5990202 5990203 Cj8421_0069 Cj8421_0070 pspA   FALSE 0.186 79.000 0.009 NA   NA
 5990204 5990205 Cj8421_0071 Cj8421_0073     FALSE 0.036 445.000 0.000 NA   NA
 5990205 5990206 Cj8421_0073 Cj8421_0074     TRUE 0.982 -7.000 0.209 0.002   NA
 5990206 5990207 Cj8421_0074 Cj8421_0075     TRUE 0.971 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 5990207 5990208 Cj8421_0075 Cj8421_0076   lctP FALSE 0.489 124.000 0.075 1.000 Y NA
 5990208 5990209 Cj8421_0076 Cj8421_0077 lctP cdtC FALSE 0.303 358.000 0.125 1.000   NA
 5990209 5990210 Cj8421_0077 Cj8421_0078 cdtC cdtB TRUE 0.994 11.000 0.500 0.002   NA
 5990210 5990211 Cj8421_0078 Cj8421_0079 cdtB cdtA TRUE 0.997 -63.000 0.421 0.002   NA
 5990212 5990213 Cj8421_0080 Cj8421_0081   cydA TRUE 0.991 1.000 0.887 NA   NA
 5990213 5990214 Cj8421_0081 Cj8421_0082 cydA cydB TRUE 0.997 0.000 0.962 0.041 Y NA
 5990215 5990216 Cj8421_0083 Cj8421_0084   ung FALSE 0.152 120.000 0.011 1.000 N NA
 5990217 5990218 Cj8421_0085 Cj8421_0086 aspA dcuA TRUE 0.873 16.000 0.127 1.000   NA
 5990218 5990219 Cj8421_0086 Cj8421_0087 dcuA   FALSE 0.234 106.000 0.027 NA   NA
 5990219 5990220 Cj8421_0087 Cj8421_0088     TRUE 0.964 10.000 0.372 NA   NA
 5990220 5990221 Cj8421_0088 Cj8421_0089     TRUE 0.928 25.000 0.516 NA   NA
 5990221 5990222 Cj8421_0089 Cj8421_0090     FALSE 0.452 83.000 0.087 NA   NA
 5990222 5990223 Cj8421_0090 Cj8421_0091     TRUE 0.968 10.000 0.414 NA   NA
 5990223 5990224 Cj8421_0091 Cj8421_0092   rplU FALSE 0.079 159.000 0.005 NA   NA
 5990224 5990225 Cj8421_0092 Cj8421_0094 rplU   FALSE 0.047 372.000 0.000 1.000   NA
 5990225 5990226 Cj8421_0094 Cj8421_0095   proB FALSE 0.487 123.000 0.206 1.000   NA
 5990226 5990227 Cj8421_0095 Cj8421_0096 proB fmt FALSE 0.287 74.000 0.014 1.000 N NA
 5990227 5990228 Cj8421_0096 Cj8421_0097 fmt birA TRUE 0.915 -37.000 0.029 1.000 N NA
 5990228 5990229 Cj8421_0097 Cj8421_0098 birA   TRUE 0.756 -3.000 0.040 1.000 N NA
 5990229 5990230 Cj8421_0098 Cj8421_0101   atpF FALSE 0.048 902.000 0.000 1.000 N NA
 5990230 5990231 Cj8421_0101 Cj8421_0102 atpF atpF TRUE 0.987 11.000 0.110 0.006 Y NA
 5990231 5990232 Cj8421_0102 Cj8421_0103 atpF atpH TRUE 0.995 3.000 0.132 0.006 Y NA
 5990232 5990233 Cj8421_0103 Cj8421_0104 atpH atpA TRUE 0.996 14.000 0.864 0.006 Y NA
 5990233 5990234 Cj8421_0104 Cj8421_0105 atpA atpG TRUE 0.998 9.000 0.846 0.006 Y NA
 5990234 5990235 Cj8421_0105 Cj8421_0106 atpG atpD TRUE 0.992 26.000 0.724 0.006 Y NA
 5990235 5990236 Cj8421_0106 Cj8421_0107 atpD atpC TRUE 0.999 4.000 0.837 0.006 Y NA
 5990236 5990237 Cj8421_0107 Cj8421_0108 atpC exbB3 TRUE 0.893 0.000 0.036 1.000 N NA
 5990237 5990238 Cj8421_0108 Cj8421_0109 exbB3 exbD3 TRUE 0.998 9.000 0.944 0.042 Y NA
 5990238 5990239 Cj8421_0109 Cj8421_0110 exbD3   TRUE 0.979 3.000 0.343 NA   NA
 5990239 5990240 Cj8421_0110 Cj8421_0111     TRUE 0.946 10.000 0.213 NA   NA
 5990240 5990241 Cj8421_0111 Cj8421_0112   pal TRUE 0.835 77.000 0.702 1.000 N NA
 5990241 5990242 Cj8421_0112 Cj8421_0113 pal   TRUE 0.990 4.000 0.794 1.000   NA
 5990242 5990243 Cj8421_0113 Cj8421_0114   slyD TRUE 0.957 15.000 0.543 1.000   NA
 5990243 5990244 Cj8421_0114 Cj8421_0115 slyD fabD TRUE 0.812 0.000 0.013 1.000 N NA
 5990244 5990245 Cj8421_0115 Cj8421_0116 fabD pfs TRUE 0.751 -3.000 0.037 1.000 N NA
 5990245 5990246 Cj8421_0116 Cj8421_0117 pfs   TRUE 0.737 -3.000 0.042 NA N NA
 5990246 5990247 Cj8421_0117 Cj8421_0118     TRUE 0.804 5.000 0.009 NA N NA
 5990247 5990248 Cj8421_0118 Cj8421_0119     TRUE 0.730 0.000 0.007 NA   NA
 5990248 5990249 Cj8421_0119 Cj8421_0120     FALSE 0.411 -3.000 0.003 NA   NA
 5990250 5990251 Cj8421_0123 Cj8421_0124     TRUE 0.631 -3.000 0.021 NA   NA
 5990251 5990252 Cj8421_0124 Cj8421_0125     TRUE 0.960 -10.000 0.523 NA   NA
 5990252 5990253 Cj8421_0125 Cj8421_0126     TRUE 0.789 12.000 0.029 NA   NA
 5990253 5990254 Cj8421_0126 Cj8421_0127   accD TRUE 0.801 -10.000 0.035 NA   NA
 5990254 5990255 Cj8421_0127 Cj8421_0128 accD   TRUE 0.843 9.000 0.016 1.000 N NA
 5990255 5990256 Cj8421_0128 Cj8421_0129     TRUE 0.774 0.000 0.008 1.000 N NA
 5990257 5990258 Cj8421_0130 Cj8421_0131 tyrA   FALSE 0.252 80.000 0.013 1.000 N NA
 5990258 5990259 Cj8421_0131 Cj8421_0132   lpxC TRUE 0.921 0.000 0.022 1.000 Y NA
 5990259 5990260 Cj8421_0132 Cj8421_0133 lpxC   TRUE 0.659 39.000 0.035 1.000 N NA
 5990260 5990261 Cj8421_0133 Cj8421_0134   thrB FALSE 0.183 323.000 0.032 1.000 N NA
 5990261 5990262 Cj8421_0134 Cj8421_0136 thrB infB FALSE 0.047 1216.000 0.000 1.000 N NA
 5990262 5990263 Cj8421_0136 Cj8421_0137 infB   TRUE 0.966 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 5990263 5990264 Cj8421_0137 Cj8421_0138     TRUE 0.795 -10.000 0.033 NA   NA
 5990264 5990265 Cj8421_0138 Cj8421_0139     FALSE 0.208 57.000 0.002 NA   NA
 5990265 5990266 Cj8421_0139 Cj8421_0140     TRUE 0.972 -3.000 0.759 NA Y NA
 5990267 5990268 Cj8421_0141 Cj8421_0144     FALSE 0.122 859.000 0.000 1.000 Y NA
 5990269 5990270 Cj8421_0247 Cj8421_0245 pyrC dgkA FALSE 0.055 232.000 0.000 1.000 N NA
 5990270 5990271 Cj8421_0245 Cj8421_0244 dgkA   TRUE 0.855 -3.000 0.136 1.000   NA
 5990273 5990274 Cj8421_0242 Cj8421_0240   moaC FALSE 0.039 255.000 0.000 NA   NA
 5990276 5990277 Cj8421_0237 Cj8421_0236     TRUE 0.881 31.000 0.333 NA   NA
 5990280 5990281 Cj8421_0231 Cj8421_0230     TRUE 0.589 134.000 0.429 NA   NA
 5990281 5990282 Cj8421_0230 Cj8421_0229     FALSE 0.233 211.000 0.052 1.000 N NA
 5990282 5990283 Cj8421_0229 Cj8421_0228     TRUE 0.900 10.000 0.056 1.000 N NA
 5990284 5990285 Cj8421_0227 Cj8421_0226   cynT TRUE 0.838 -3.000 0.105 1.000 N NA
 5990286 5990287 Cj8421_0225 Cj8421_0224   secG FALSE 0.130 104.000 0.007 NA   NA
 5990287 5990288 Cj8421_0224 Cj8421_0223 secG frr TRUE 0.818 10.000 0.017 1.000 N NA
 5990288 5990289 Cj8421_0223 Cj8421_0222 frr pyrE TRUE 0.918 3.000 0.026 1.000 N NA
 5990289 5990290 Cj8421_0222 Cj8421_0221 pyrE   TRUE 0.889 1.000 0.025 NA   NA
 5990290 5990291 Cj8421_0221 Cj8421_0220   nrdB TRUE 0.695 14.000 0.019 NA   NA
 5990291 5990292 Cj8421_0220 Cj8421_0219 nrdB   TRUE 0.842 -10.000 0.048 1.000 N NA
 5990295 5990296 Cj8421_0216 Cj8421_0215 argD argB TRUE 0.955 4.000 0.030 1.000 Y NA
 5990296 5990297 Cj8421_0215 Cj8421_0214 argB   TRUE 0.822 4.000 0.006 1.000   NA
 5990297 5990298 Cj8421_0214 Cj8421_0213   argC TRUE 0.821 10.000 0.019 1.000   NA
 5990298 5990299 Cj8421_0213 Cj8421_0209 argC   FALSE 0.046 3570.000 0.000 1.000 N NA
 5990299 5990300 Cj8421_0209 Cj8421_0208   infC FALSE 0.388 39.000 0.004 1.000 N NA
 5990300 5990301 Cj8421_0208 Cj8421_0207 infC thrS FALSE 0.427 141.000 0.060 1.000 Y NA
 5990301 5990302 Cj8421_0207 Cj8421_0206 thrS bacA FALSE 0.231 405.000 0.063 1.000 N NA
 5990302 5990303 Cj8421_0206 Cj8421_0205 bacA   FALSE 0.409 74.000 0.043 NA   NA
 5990303 5990304 Cj8421_0205 Cj8421_0204     FALSE 0.170 184.000 0.029 NA   NA
 5990305 5990306 Cj8421_0202 Cj8421_0201     FALSE 0.321 143.000 0.100 NA   NA
 5990306 5990307 Cj8421_0201 Cj8421_0200     TRUE 0.698 135.000 0.750 NA   NA
 5990307 5990308 Cj8421_0200 Cj8421_0199     TRUE 0.693 0.000 0.005 NA   NA
 5990308 5990309 Cj8421_0199 Cj8421_0198   dapB FALSE 0.252 63.000 0.003 1.000 N NA
 5990309 5990310 Cj8421_0198 Cj8421_0197 dapB purF TRUE 0.906 2.000 0.022 1.000 N NA
 5990312 5990313 Cj8421_0193 Cj8421_0192 tig clpP TRUE 0.982 0.000 0.351 1.000 Y NA
 5990313 5990314 Cj8421_0192 Cj8421_0191 clpP def TRUE 0.651 36.000 0.030 1.000 N NA
 5990314 5990315 Cj8421_0191 Cj8421_0190 def   TRUE 0.782 -3.000 0.054 1.000 N NA
 5990315 5990316 Cj8421_0190 Cj8421_0189     TRUE 0.704 2.000 0.000 NA N NA
 5990316 5990317 Cj8421_0189 Cj8421_0187   purN FALSE 0.427 -9.000 0.000 NA N NA
 5990317 5990318 Cj8421_0187 Cj8421_0186 purN   FALSE 0.260 72.000 0.009 1.000 N NA
 5990318 5990319 Cj8421_0186 Cj8421_0184     FALSE 0.046 416.000 0.000 1.000   NA
 5990320 5990321 Cj8421_0183 Cj8421_0182     FALSE 0.326 171.000 0.103 1.000   NA
 5990321 5990322 Cj8421_0182 Cj8421_0181   tonB1 TRUE 0.776 51.000 0.174 1.000 N NA
 5990322 5990323 Cj8421_0181 Cj8421_0180 tonB1 exbD1 TRUE 0.990 2.000 0.217 0.084 N NA
 5990323 5990324 Cj8421_0180 Cj8421_0179 exbD1 exbB1 TRUE 0.999 -61.000 1.000 0.041 Y NA
 5990324 5990325 Cj8421_0179 Cj8421_0178 exbB1   TRUE 0.985 35.000 1.000 0.041 N NA
 5990325 5990326 Cj8421_0178 Cj8421_0177     TRUE 0.672 -3.000 0.027 NA   NA
 5990327 5990328 Cj8421_0175 Cj8421_0174     TRUE 0.996 0.000 0.618 0.034 Y NA
 5990328 5990329 Cj8421_0174 Cj8421_0173     TRUE 0.976 -16.000 0.529 1.000 N NA
 5990329 5990330 Cj8421_0173 Cj8421_0172     TRUE 0.704 36.000 0.014 1.000 Y NA
 5990331 5990332 Cj8421_0171 Cj8421_0170     TRUE 0.723 110.000 0.667 NA   NA
 5990332 5990333 Cj8421_0170 Cj8421_0169   sodB FALSE 0.196 69.000 0.004 NA   NA
 5990336 5990337 Cj8421_0165 Cj8421_0164 ubiA   TRUE 0.862 -9.000 0.100 NA   NA
 5990337 5990338 Cj8421_0164 Cj8421_0163     TRUE 0.932 -3.000 0.476 NA   NA
 5990338 5990339 Cj8421_0163 Cj8421_0162   moaA TRUE 0.823 13.000 0.042 1.000   NA
 5990339 5990340 Cj8421_0162 Cj8421_0161 moaA   FALSE 0.407 72.000 0.028 1.000 N NA
 5990340 5990341 Cj8421_0161 Cj8421_0160     TRUE 0.860 -3.000 0.139 1.000 N NA
 5990341 5990342 Cj8421_0160 Cj8421_0159     TRUE 0.795 0.000 0.011 1.000   NA
 5990342 5990343 Cj8421_0159 Cj8421_0158     TRUE 0.962 0.000 0.300 NA   NA
 5990343 5990344 Cj8421_0158 Cj8421_0157     TRUE 0.943 2.000 0.070 NA   NA
 5990344 5990345 Cj8421_0157 Cj8421_0156   rpmE FALSE 0.288 79.000 0.023 NA   NA
 5990345 5990346 Cj8421_0156 Cj8421_0155 rpmE   TRUE 0.926 3.000 0.031 1.000   NA
 5990346 5990347 Cj8421_0155 Cj8421_0154     FALSE 0.183 240.000 0.031 1.000   NA
 5990347 5990348 Cj8421_0154 Cj8421_0153     TRUE 0.753 -7.000 0.033 NA   NA
 5990348 5990349 Cj8421_0153 Cj8421_0152     TRUE 0.967 -6.000 0.882 NA   NA
 5990349 5990350 Cj8421_0152 Cj8421_0151     TRUE 0.878 12.000 0.098 NA   NA
 5990350 5990351 Cj8421_0151 Cj8421_0150   hom TRUE 0.923 4.000 0.009 1.000 Y NA
 5990351 5990352 Cj8421_0150 Cj8421_0149 hom   TRUE 0.711 0.000 0.003 1.000 N NA
 5990352 5990353 Cj8421_0149 Cj8421_0148   trxA FALSE 0.495 57.000 0.027 1.000 N NA
 5990353 5990354 Cj8421_0148 Cj8421_0147 trxA trxB FALSE 0.390 134.000 0.035 1.000 Y NA
 5990357 5990358 Cj8421_1614 Cj8421_1613     TRUE 0.867 -6.000 0.125 1.000 N NA
 5990358 5990359 Cj8421_1613 Cj8421_1612     TRUE 0.745 -3.000 0.034 1.000 N NA
 5990359 5990360 Cj8421_1612 Cj8421_1610     TRUE 0.889 10.000 0.057 NA   NA
 5990360 5990361 Cj8421_1610 Cj8421_1609     TRUE 0.726 -76.000 0.000 NA   NA
 5990362 5990363 Cj8421_1607 Cj8421_1606     FALSE 0.036 389.000 0.000 NA   NA
 5990363 5990364 Cj8421_1606 Cj8421_1605     FALSE 0.346 333.000 0.200 NA   NA
 5990364 5990365 Cj8421_1605 Cj8421_1604     FALSE 0.462 106.000 0.150 NA   NA
 5990366 5990367 Cj8421_1602 Cj8421_1601     TRUE 0.597 65.000 0.083 1.000   NA
 5990367 5990368 Cj8421_1601 Cj8421_1600     FALSE 0.325 120.000 0.062 1.000   NA
 5990368 5990369 Cj8421_1600 Cj8421_1599     FALSE 0.321 22.000 0.000 NA   NA
 5990369 5990370 Cj8421_1599 Cj8421_1598     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 5990370 5990371 Cj8421_1598 Cj8421_1597     FALSE 0.034 1211.000 0.000 NA   NA
 5990371 5990372 Cj8421_1597 Cj8421_1596     TRUE 0.666 1.000 0.000 NA   NA
 5990373 5990374 Cj8421_1595 Cj8421_1594     FALSE 0.407 75.000 0.034 1.000   NA
 5990375 5990376 Cj8421_1593 Cj8421_1592     TRUE 0.980 -76.000 0.122 NA Y NA
 5990376 5990377 Cj8421_1592 Cj8421_1591     TRUE 0.895 10.000 0.053 1.000   NA
 5990377 5990378 Cj8421_1591 Cj8421_1590     FALSE 0.107 142.000 0.010 NA   NA
 5990379 5990380 Cj8421_1589 Cj8421_1588     TRUE 0.983 2.000 0.389 1.000 N NA
 5990380 5990381 Cj8421_1588 Cj8421_1587   acs FALSE 0.237 139.000 0.032 1.000 N NA
 5990381 5990382 Cj8421_1587 Cj8421_1586 acs galU FALSE 0.364 82.000 0.032 1.000 N NA
 5990382 5990383 Cj8421_1586 Cj8421_1585 galU pgi TRUE 0.711 -6.000 0.023 1.000 N NA
 5990383 5990384 Cj8421_1585 Cj8421_1584 pgi   FALSE 0.149 127.000 0.011 1.000 N NA
 5990384 5990385 Cj8421_1584 Cj8421_1583     FALSE 0.445 64.000 0.030 NA   NA
 5990386 5990387 Cj8421_1582 Cj8421_1581   dapF FALSE 0.161 108.000 0.010 1.000   NA
 5990387 5990388 Cj8421_1581 Cj8421_1580 dapF   FALSE 0.134 198.000 0.016 1.000 N NA
 5990389 5990390 Cj8421_1579 Cj8421_1577 purM   FALSE 0.041 211.000 0.000 NA   NA
 5990390 5990391 Cj8421_1577 Cj8421_1576     FALSE 0.034 1890.000 0.000 NA   NA
 5990391 5990392 Cj8421_1576 Cj8421_1575     TRUE 0.940 -3.000 0.546 NA   NA
 5990392 5990393 Cj8421_1575 Cj8421_1574     TRUE 0.970 -7.000 0.876 NA   NA
 11468085 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 144.000 0.000 NA   NA
 11610448 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 144.000 0.000 NA   NA
 11752840 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 144.000 0.000 NA   NA
 11468086 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 173.000 0.000 NA   NA
 11610449 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 173.000 0.000 NA   NA
 11752841 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 173.000 0.000 NA   NA
 11468087 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 210.000 0.000 NA   NA
 11610450 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 210.000 0.000 NA   NA
 11752842 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 210.000 0.000 NA   NA
 11468088 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 239.000 0.000 NA   NA
 11610451 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 239.000 0.000 NA   NA
 11752843 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 239.000 0.000 NA   NA
 11468089 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11610452 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 11752844 5990393   Cj8421_1574     FALSE NA 276.000 0.000 NA   NA
 5990394 5990395 Cj8421_1572 Cj8421_1571 moeA2 moaE TRUE 0.988 4.000 0.018 0.005 Y NA
 5990395 5990396 Cj8421_1571 Cj8421_1569 moaE   FALSE 0.055 224.000 0.000 1.000 N NA
 5990397 5990398 Cj8421_1568 Cj8421_1567     FALSE 0.048 305.000 0.000 1.000   NA
 5990398 5990399 Cj8421_1567 Cj8421_1563   fdhB FALSE 0.043 2967.000 0.000 1.000   NA
 5990399 5990400 Cj8421_1563 Cj8421_1562 fdhB fdhC TRUE 0.996 -36.000 0.200 0.003 Y NA
 5990400 5990401 Cj8421_1562 Cj8421_1561 fdhC fdhD TRUE 0.842 167.000 0.138 0.003 Y NA
 5990401 5990402 Cj8421_1561 Cj8421_1560 fdhD   TRUE 0.885 -7.000 0.172 NA   NA
 5990402 5990403 Cj8421_1560 Cj8421_1559     FALSE 0.346 113.000 0.077 NA   NA
 5990403 5990404 Cj8421_1559 Cj8421_1558     FALSE 0.190 111.000 0.015 1.000 N NA
 5990404 5990405 Cj8421_1558 Cj8421_1557   selD FALSE 0.435 106.000 0.104 1.000 N NA
 5990405 5990406 Cj8421_1557 Cj8421_1556 selD putA FALSE 0.143 131.000 0.011 1.000 N NA
 5990406 5990407 Cj8421_1556 Cj8421_1555 putA putP TRUE 0.946 0.000 0.141 1.000 N NA
 5990409 5990410 Cj8421_1552 Cj8421_1551 purA   TRUE 0.572 -3.000 0.014 NA   NA
 5990410 5990411 Cj8421_1551 Cj8421_1550     TRUE 0.964 -46.000 0.147 NA   NA
 5990411 5990412 Cj8421_1550 Cj8421_1549     FALSE 0.460 93.000 0.120 NA   NA
 5990412 5990413 Cj8421_1549 Cj8421_1548   carA TRUE 0.882 0.000 0.041 NA   NA
 5990413 5990414 Cj8421_1548 Cj8421_1547 carA   FALSE 0.290 63.000 0.011 NA   NA
 5990414 5990415 Cj8421_1547 Cj8421_1546     TRUE 0.534 -3.000 0.011 NA   NA
 5990416 5990417 Cj8421_0952 Cj8421_0953 glnP   TRUE 0.601 23.000 0.015 1.000 N NA
 5990417 5990418 Cj8421_0953 Cj8421_0954   secA TRUE 0.838 75.000 0.201 0.081 N NA
 5990420 5990421 Cj8421_0956 Cj8421_0957     TRUE 0.974 10.000 0.529 NA   NA
 5990421 5990422 Cj8421_0957 Cj8421_0960     FALSE 0.044 1406.000 0.000 1.000   NA
 5990422 5990423 Cj8421_0960 Cj8421_0961     TRUE 0.656 -3.000 0.020 1.000   NA
 5990423 5990424 Cj8421_0961 Cj8421_0962     TRUE 0.672 -3.000 0.025 NA N NA
 5990424 5990425 Cj8421_0962 Cj8421_0963     FALSE 0.250 99.000 0.026 NA N NA
 5990425 5990426 Cj8421_0963 Cj8421_0964     TRUE 0.628 151.000 0.556 NA   NA
 5990426 5990427 Cj8421_0964 Cj8421_0965     FALSE 0.035 511.000 0.000 NA   NA
 5990427 5990428 Cj8421_0965 Cj8421_0966   purH FALSE 0.080 92.000 0.000 NA   NA
 5990428 5990429 Cj8421_0966 Cj8421_0967 purH   TRUE 0.838 3.000 0.005 1.000 N NA
 5990429 5990430 Cj8421_0967 Cj8421_0970   thdF FALSE 0.044 2193.000 0.000 1.000   NA
 5990430 5990431 Cj8421_0970 Cj8421_0971 thdF   TRUE 0.786 -7.000 0.049 NA   NA
 5990431 5990432 Cj8421_0971 Cj8421_0972     TRUE 0.767 -3.000 0.061 NA   NA
 5990432 5990433 Cj8421_0972 Cj8421_0973     TRUE 0.502 407.000 0.461 NA   NA
 5990433 5990434 Cj8421_0973 Cj8421_0974   rnpA TRUE 0.983 -33.000 0.540 NA   NA
 5990435 5990436 Cj8421_0976 Cj8421_0978     FALSE 0.327 -3.000 0.000 NA   NA
 5990436 5990437 Cj8421_0978 Cj8421_0984     FALSE 0.034 3479.000 0.000 NA   NA
 5990437 5990438 Cj8421_0984 Cj8421_0985     TRUE 0.696 3.000 0.000 NA   NA
 5990438 5990439 Cj8421_0985 Cj8421_0986     TRUE 0.688 2.000 0.000 NA   NA
 5990439 5990440 Cj8421_0986 Cj8421_0987     FALSE 0.057 124.000 0.000 NA   NA
 5990440 5990441 Cj8421_0987 Cj8421_0988     FALSE 0.282 28.000 0.000 NA   NA
 5990441 5990442 Cj8421_0988 Cj8421_0993     FALSE 0.034 1850.000 0.000 NA   NA
 5990442 5990443 Cj8421_0993 Cj8421_0994     FALSE 0.453 73.000 0.053 NA N NA
 5990444 5990445 Cj8421_0995 Cj8421_0996     TRUE 0.971 9.000 0.375 NA   NA
 5990445 5990446 Cj8421_0996 Cj8421_0999     FALSE 0.047 1318.000 0.000 1.000 N NA
 5990446 5990447 Cj8421_0999 Cj8421_1000     TRUE 0.888 41.000 0.049 0.032 N NA
 5990448 5990449 Cj8421_1001 Cj8421_1002     FALSE 0.152 93.000 0.009 NA   NA
 5990450 5990451 Cj8421_1003 Cj8421_1005 hipO   TRUE 0.978 2.000 0.333 NA   NA
 5990453 5990454 Cj8421_1010 Cj8421_1011   hemN TRUE 0.996 2.000 0.419 0.019 N NA
 5990454 5990455 Cj8421_1011 Cj8421_1012 hemN   TRUE 0.962 -13.000 0.419 NA   NA
 5990455 5990456 Cj8421_1012 Cj8421_1013   argF TRUE 0.662 -3.000 0.025 NA   NA
 5990456 5990457 Cj8421_1013 Cj8421_1014 argF hemB TRUE 0.663 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5990458 5990459 Cj8421_1015 Cj8421_1016 ribA   TRUE 0.878 1.000 0.017 1.000 N NA
 5990460 5990461 Cj8421_1017 Cj8421_1018     FALSE 0.219 94.000 0.020 NA   NA
 5990462 5990463 Cj8421_1019 Cj8421_1020   rpoD TRUE 0.658 109.000 0.006 0.009 Y NA
 5990464 5990465 Cj8421_1021 Cj8421_1022     FALSE 0.226 140.000 0.040 NA   NA
 5990467 5990468 Cj8421_1024 Cj8421_1025     TRUE 0.945 4.000 0.067 1.000 N NA
 5990468 5990469 Cj8421_1025 Cj8421_1026     FALSE 0.269 183.000 0.063 1.000 N NA
 5990469 5990470 Cj8421_1026 Cj8421_1027   aroB TRUE 0.758 -3.000 0.041 1.000 N NA
 5990470 5990471 Cj8421_1027 Cj8421_1028 aroB   TRUE 0.592 46.000 0.031 1.000   NA
 5990472 5990473 Cj8421_1029 Cj8421_1030 tgt   TRUE 0.985 2.000 0.444 1.000 N NA
 5990476 5990477 Cj8421_0750 Cj8421_0751 cfrA hrcA FALSE 0.040 301.000 0.000 NA N NA
 5990477 5990478 Cj8421_0751 Cj8421_0752 hrcA grpE TRUE 0.730 -3.000 0.038 NA N NA
 5990478 5990479 Cj8421_0752 Cj8421_0753 grpE dnaK TRUE 0.955 22.000 0.029 0.009 Y NA
 5990479 5990480 Cj8421_0753 Cj8421_0754 dnaK   FALSE 0.039 260.000 0.000 NA   NA
 5990480 5990481 Cj8421_0754 Cj8421_0755     FALSE 0.453 70.000 0.045 NA   NA
 5990482 5990483 Cj8421_0756 Cj8421_0757 aspB cysE FALSE 0.463 172.000 0.102 1.000 Y NA
 5990483 5990484 Cj8421_0757 Cj8421_0760 cysE hisS FALSE 0.222 1832.000 0.000 0.047 N NA
 5990484 5990485 Cj8421_0760 Cj8421_0761 hisS tmk TRUE 0.866 -3.000 0.018 0.091 N NA
 5990485 5990486 Cj8421_0761 Cj8421_0762 tmk kdtB TRUE 0.805 -9.000 0.034 1.000 N NA
 5990486 5990487 Cj8421_0762 Cj8421_0763 kdtB   TRUE 0.767 40.000 0.032 1.000 Y NA
 5990487 5990488 Cj8421_0763 Cj8421_0764     TRUE 0.870 -3.000 0.191 NA N NA
 5990488 5990489 Cj8421_0764 Cj8421_0765     FALSE 0.146 353.000 0.028 NA   NA
 5990489 5990490 Cj8421_0765 Cj8421_0766     TRUE 0.742 159.000 1.000 NA   NA
 5990490 5990491 Cj8421_0766 Cj8421_0767     TRUE 0.951 49.000 0.800 NA Y NA
 5990491 5990492 Cj8421_0767 Cj8421_0768     FALSE 0.487 192.000 0.154 NA Y NA
 5990492 5990493 Cj8421_0768 Cj8421_0769     TRUE 0.986 -18.000 0.511 1.000 Y NA
 5990493 5990494 Cj8421_0769 Cj8421_0770   valS FALSE 0.294 236.000 0.007 0.091 N NA
 5990494 5990495 Cj8421_0770 Cj8421_0771 valS   FALSE 0.439 23.000 0.005 NA   NA
 5990496 5990497 Cj8421_0772 Cj8421_0773   peb2 FALSE 0.093 259.000 0.012 NA   NA
 5990497 5990498 Cj8421_0773 Cj8421_0774 peb2 tpx FALSE 0.112 99.000 0.004 NA   NA
 5990498 5990499 Cj8421_0774 Cj8421_0775 tpx napA FALSE 0.054 247.000 0.000 1.000 N NA
 5990499 5990500 Cj8421_0775 Cj8421_0776 napA napG TRUE 0.982 18.000 0.270 0.003   NA
 5990500 5990501 Cj8421_0776 Cj8421_0777 napG napH TRUE 0.997 0.000 0.795 0.003   NA
 5990501 5990502 Cj8421_0777 Cj8421_0778 napH napB TRUE 0.997 0.000 0.385 0.003 Y NA
 5990502 5990503 Cj8421_0778 Cj8421_0779 napB   TRUE 0.951 5.000 0.132 NA   NA
 5990503 5990504 Cj8421_0779 Cj8421_0780   napD TRUE 0.872 -7.000 0.139 NA   NA
 5990504 5990505 Cj8421_0780 Cj8421_0781 napD   TRUE 0.920 10.000 0.111 NA   NA
 5990505 5990506 Cj8421_0781 Cj8421_0782     TRUE 0.689 102.000 0.500 NA   NA
 5990506 5990507 Cj8421_0782 Cj8421_0783     TRUE 0.842 -3.000 0.133 NA   NA
 5990507 5990508 Cj8421_0783 Cj8421_0784     TRUE 0.496 155.000 0.325 NA   NA
 5990508 5990509 Cj8421_0784 Cj8421_0785   purU TRUE 0.799 -3.000 0.064 1.000 N NA
 5990511 5990512 Cj8421_0787 Cj8421_0788     TRUE 0.973 4.000 0.250 1.000   NA
 5990512 5990513 Cj8421_0788 Cj8421_0789     FALSE 0.073 97.000 0.000 NA   NA
 5990515 5990516 Cj8421_0792 Cj8421_0793 murF   TRUE 0.955 1.000 0.129 NA   NA
 5990516 5990517 Cj8421_0793 Cj8421_0794     TRUE 0.932 2.000 0.052 NA   NA
 5990517 5990518 Cj8421_0794 Cj8421_0795   ddlA FALSE 0.368 60.000 0.018 NA   NA
 5990518 5990519 Cj8421_0795 Cj8421_0796 ddlA ruvA TRUE 0.936 10.000 0.014 0.090 N NA
 5990519 5990520 Cj8421_0796 Cj8421_0797 ruvA   TRUE 0.699 -24.000 0.004 NA   NA
 5990521 5990522 Cj8421_0800 Cj8421_0801 cysS msbA TRUE 0.877 -7.000 0.013 0.090 N NA
 5990522 5990523 Cj8421_0801 Cj8421_0802 msbA pyrD TRUE 0.572 32.000 0.017 1.000 N NA
 5990523 5990524 Cj8421_0802 Cj8421_0803 pyrD   TRUE 0.766 -3.000 0.048 1.000   NA
 5990524 5990525 Cj8421_0803 Cj8421_0804   dapA TRUE 0.908 -7.000 0.217 1.000   NA
 5990525 5990526 Cj8421_0804 Cj8421_0805 dapA   TRUE 0.960 0.000 0.238 1.000 N NA
 5990527 5990528 Cj8421_0806 Cj8421_0807     TRUE 0.808 12.000 0.035 NA   NA
 5990529 5990530 Cj8421_0808 Cj8421_0809 nadE lpxK TRUE 0.902 4.000 0.024 1.000 N NA
 5990530 5990531 Cj8421_0809 Cj8421_0810 lpxK thrC TRUE 0.569 -3.000 0.009 1.000 N NA
 5990531 5990532 Cj8421_0810 Cj8421_0811 thrC kdsB TRUE 0.640 -3.000 0.017 1.000 N NA
 5990532 5990533 Cj8421_0811 Cj8421_0812 kdsB   TRUE 0.543 11.000 0.000 1.000   NA
 5990533 5990534 Cj8421_0812 Cj8421_0813     FALSE 0.423 13.000 0.000 NA   NA
 5990534 5990535 Cj8421_0813 Cj8421_0814     FALSE 0.057 124.000 0.000 NA   NA
 5990535 5990536 Cj8421_0814 Cj8421_0815     FALSE 0.041 198.000 0.000 NA   NA
 5990536 5990537 Cj8421_0815 Cj8421_0816     TRUE 0.895 -39.000 0.025 NA   NA
 5990537 5990538 Cj8421_0816 Cj8421_0817     FALSE 0.185 52.000 0.000 NA   NA
 5990538 5990539 Cj8421_0817 Cj8421_0818     FALSE 0.036 367.000 0.000 NA   NA
 5990539 5990540 Cj8421_0818 Cj8421_0820     FALSE 0.035 615.000 0.000 NA   NA
 5990540 5990541 Cj8421_0820 Cj8421_0821     FALSE 0.038 295.000 0.000 NA   NA
 5990542 5990543 Cj8421_0822 Cj8421_0823     TRUE 0.972 -13.000 0.333 NA Y NA
 5990545 5990546 Cj8421_1399 Cj8421_1398 ceuD ceuC TRUE 0.979 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 5990546 5990547 Cj8421_1398 Cj8421_1397 ceuC ceuB TRUE 0.937 155.000 0.870 0.032 Y NA
 5990547 5990548 Cj8421_1397 Cj8421_1396 ceuB pldA FALSE 0.420 146.000 0.019 0.078 N NA
 5990548 5990549 Cj8421_1396 Cj8421_1395 pldA mobA TRUE 0.580 -3.000 0.014 NA N NA
 5990550 5990551 Cj8421_1394 Cj8421_1393     TRUE 0.905 2.000 0.028 NA   NA
 5990551 5990552 Cj8421_1393 Cj8421_1392   cdsA TRUE 0.746 9.000 0.007 NA   NA
 5990552 5990553 Cj8421_1392 Cj8421_1391 cdsA dxr TRUE 0.953 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 5990553 5990554 Cj8421_1391 Cj8421_1390 dxr   TRUE 0.802 2.000 0.006 NA   NA
 5990554 5990555 Cj8421_1390 Cj8421_1389     TRUE 0.496 -3.000 0.008 NA   NA
 5990555 5990556 Cj8421_1389 Cj8421_1388     TRUE 0.805 1.000 0.005 1.000   NA
 5990556 5990557 Cj8421_1388 Cj8421_1387     TRUE 0.979 0.000 0.600 NA   NA
 5990558 5990559 Cj8421_1375 Cj8421_1374   ptmA TRUE 0.834 -12.000 0.043 NA   NA
 5990559 5990560 Cj8421_1374 Cj8421_1373 ptmA ptmB TRUE 0.943 0.000 0.131 1.000 N NA
 5990560 5990561 Cj8421_1373 Cj8421_1372 ptmB   TRUE 0.885 -7.000 0.144 1.000   NA
 5990561 5990562 Cj8421_1372 Cj8421_1371     TRUE 0.822 -3.000 0.088 1.000   NA
 5990562 5990563 Cj8421_1371 Cj8421_1370   neuC2 TRUE 0.970 9.000 0.131 1.000 Y NA
 5990563 5990564 Cj8421_1370 Cj8421_1369 neuC2 neuB2 TRUE 0.994 -64.000 0.549 1.000 Y NA
 5990564 5990565 Cj8421_1369 Cj8421_1368 neuB2   FALSE 0.232 40.000 0.000 NA   NA
 5990565 5990566 Cj8421_1368 Cj8421_1367     FALSE 0.240 39.000 0.000 NA   NA
 5990566 5990567 Cj8421_1367 Cj8421_1366     FALSE 0.213 45.000 0.000 NA   NA
 5990567 5990568 Cj8421_1366 Cj8421_1364     FALSE 0.065 118.000 0.000 NA N NA
 5990568 5990569 Cj8421_1364 Cj8421_1363     FALSE 0.142 73.000 0.000 1.000   NA
 5990569 5990570 Cj8421_1363 Cj8421_1362     FALSE 0.053 205.000 0.000 1.000   NA
 5990570 5990571 Cj8421_1362 Cj8421_1361     TRUE 0.966 -7.000 0.418 1.000 Y NA
 5990572 5990573 Cj8421_1353 Cj8421_1354 neuA2   TRUE 0.977 -16.000 0.355 NA Y NA
 5990573 5990574 Cj8421_1354 Cj8421_1355     TRUE 0.510 87.000 0.137 NA N NA
 5990575 5990576 Cj8421_1356 Cj8421_1357     TRUE 0.984 1.000 0.011 0.007 Y NA
 5990576 5990577 Cj8421_1357 Cj8421_1358     TRUE 0.947 -3.000 0.625 NA N NA
 5990579 5990580 Cj8421_1376 Cj8421_1377 pseD maf3 TRUE 0.972 -24.000 0.400 NA   NA
 5990582 5990583 Cj8421_1351 Cj8421_1352     TRUE 0.919 22.000 0.400 NA   NA
 5990584 5990585 Cj8421_1381 Cj8421_1382 flaA   TRUE 0.624 269.000 0.667 1.000   NA