MicrobesOnline Operon Predictions for Streptomyces griseus subsp. griseus NBRC 13350

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5652558 5652559 SGR_1t SGR_2t     FALSE 0.001 610.000 0.000 NA   NA
 5652560 5652561 SGR_3t SGR_4t     FALSE 0.108 88.000 0.000 NA   NA
 5652561 5652562 SGR_4t SGR_5t     TRUE 0.926 -3.000 0.222 NA   NA
 5652562 5652563 SGR_5t SGR_6t     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5652563 5652564 SGR_6t SGR_7t     FALSE 0.001 1057.000 0.000 NA   NA
 5652564 5652565 SGR_7t SGR_8t     FALSE 0.113 80.000 0.000 NA   NA
 5652565 5652566 SGR_8t SGR_9t     FALSE 0.423 152.000 0.375 NA   NA
 5652566 5652567 SGR_9t SGR_10t     FALSE 0.001 507.000 0.000 NA   NA
 5652567 5652568 SGR_10t SGR_11t     FALSE 0.224 28.000 0.000 NA   NA
 5652569 5652570 SGR_12t SGR_13t     FALSE 0.001 499.000 0.000 NA   NA
 5652570 5652571 SGR_13t SGR_14t     FALSE 0.230 27.000 0.000 NA   NA
 5652572 5652573 SGR_15t SGR_16t     FALSE 0.112 83.000 0.000 NA   NA
 5652573 5652574 SGR_16t SGR_17t     FALSE 0.078 134.000 0.000 NA   NA
 5652575 5652576 SGR_18t SGR_19t     FALSE 0.073 139.000 0.000 NA   NA
 5652576 5652577 SGR_19t SGR_20t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652578 5652579 SGR_21t SGR_22t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652579 5652580 SGR_22t SGR_23t     FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 5652582 5652583 SGR_25t SGR_26t     FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 5652583 5652584 SGR_26t SGR_27t     TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.055 Y NA
 5652585 5652586 SGR_28t SGR_29t     FALSE 0.090 108.000 0.000 NA   NA
 5652586 5652587 SGR_29t SGR_30t     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 5652587 5652588 SGR_30t SGR_31t     TRUE 0.564 -232.000 0.000 NA   NA
 5652589 5652590 SGR_32t SGR_33t     FALSE 0.032 189.000 0.000 NA   NA
 5652590 5652591 SGR_33t SGR_34t     FALSE 0.414 10.000 0.000 NA   NA
 5652591 5652592 SGR_34t SGR_35t     FALSE 0.139 56.000 0.000 NA   NA
 5652594 5652595 SGR_37t SGR_38t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652595 5652596 SGR_38t SGR_39t     FALSE 0.122 69.000 0.000 NA   NA
 5652596 5652597 SGR_39t SGR_40t     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 5652597 5652598 SGR_40t SGR_41t     FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 5652598 5652599 SGR_41t SGR_42t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652603 5652604 SGR_46t SGR_47t     FALSE 0.172 41.000 0.000 NA   NA
 5652604 5652605 SGR_47t SGR_48t     TRUE 0.605 37.000 0.222 NA   NA
 5652609 5652610 SGR_52t SGR_53t     FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 5652611 5652612 SGR_54t SGR_55t crtY2 crtT2 TRUE 0.981 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 5652612 5652613 SGR_55t SGR_56t crtT2 crtU2 TRUE 0.944 -3.000 0.265 1.000   NA
 5652614 5652615 SGR_57t SGR_58t crtV2 crtB2 TRUE 0.889 -3.000 0.027 NA N NA
 5652615 5652616 SGR_58t SGR_59t crtB2 crtI2 TRUE 0.960 -3.000 0.332 1.000 N NA
 5652616 5652617 SGR_59t SGR_60t crtI2 crtE2 TRUE 0.936 -3.000 0.138 1.000 N NA
 5652619 5652620 SGR_62t SGR_63t     FALSE 0.083 117.000 0.000 NA   NA
 5652624 5652625 SGR_67t SGR_68t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652625 5652626 SGR_68t SGR_69t     FALSE 0.003 462.000 0.000 1.000   NA
 5652626 5652627 SGR_69t SGR_70t     FALSE 0.013 238.000 0.000 NA   NA
 5652627 5652628 SGR_70t SGR_71t     FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 5652629 5652630 SGR_72t SGR_73t     FALSE 0.082 122.000 0.000 NA   NA
 5652631 5652632 SGR_74t SGR_75t     FALSE 0.170 42.000 0.000 NA   NA
 5652634 5652635 SGR_77t SGR_78t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652636 5652637 SGR_79t SGR_80t     TRUE 0.906 -3.000 0.000 0.066   NA
 5652637 5652638 SGR_80t SGR_81t     FALSE 0.001 832.000 0.000 NA   NA
 5652639 5652640 SGR_82t SGR_83t     FALSE 0.028 198.000 0.000 NA   NA
 5652640 5652641 SGR_83t SGR_84t     FALSE 0.118 73.000 0.000 NA   NA
 5652641 5652642 SGR_84t SGR_85t     FALSE 0.032 188.000 0.000 NA   NA
 5652642 5652643 SGR_85t SGR_86t     FALSE 0.099 97.000 0.000 NA   NA
 5652643 5652644 SGR_86t SGR_87t     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5652650 5652651 SGR_93t SGR_94t     FALSE 0.461 93.000 0.250 NA   NA
 5652653 5652654 SGR_96t SGR_97t     FALSE 0.004 330.000 0.000 NA   NA
 5652654 5652655 SGR_97t SGR_98t     TRUE 0.924 0.000 0.286 NA   NA
 5652656 5652657 SGR_99t SGR_100t     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5652657 5652658 SGR_100t SGR_101t     FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5652658 5652659 SGR_101t SGR_102t     FALSE 0.111 85.000 0.000 NA   NA
 5652659 5652660 SGR_102t SGR_103t     TRUE 0.903 9.000 0.444 NA   NA
 5652660 5652661 SGR_103t SGR_104t     TRUE 0.712 117.000 0.750 1.000   NA
 5652661 5652662 SGR_104t SGR_105t     FALSE 0.018 218.000 0.000 NA   NA
 5652662 5652663 SGR_105t SGR_106t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652663 5652664 SGR_106t SGR_107t     TRUE 0.593 -6.000 0.000 NA   NA
 5652664 5652665 SGR_107t SGR_108t     FALSE 0.015 228.000 0.000 NA   NA
 5652667 5652668 SGR_110t SGR_111t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652668 5652669 SGR_111t SGR_112t     FALSE 0.283 20.000 0.000 NA   NA
 5652669 5652670 SGR_112t SGR_113t     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 5652671 5652672 SGR_114t SGR_115t     TRUE 0.668 32.000 0.273 NA   NA
 5652672 5652673 SGR_115t SGR_116t     TRUE 0.933 -3.000 0.256 NA   NA
 5652673 5652674 SGR_116t SGR_117t     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 5652675 5652676 SGR_118t SGR_119t     FALSE 0.001 660.000 0.000 NA   NA
 5652677 5652678 SGR_120t SGR_121t     FALSE 0.001 527.000 0.000 NA   NA
 5652678 5652679 SGR_121t SGR_122t     FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 5652679 5652680 SGR_122t SGR_123t     FALSE 0.067 147.000 0.000 NA   NA
 5652680 5652681 SGR_123t SGR_124t     TRUE 0.870 25.000 0.667 NA   NA
 5652681 5652682 SGR_124t SGR_125t     TRUE 0.858 48.000 1.000 NA   NA
 5652682 5652683 SGR_125t SGR_126t     FALSE 0.020 213.000 0.000 NA   NA
 5652685 5652686 SGR_128 SGR_129     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652687 5652688 SGR_130 SGR_131     FALSE 0.001 510.000 0.000 NA   NA
 5652689 5652690 SGR_132 SGR_133     FALSE 0.127 65.000 0.000 NA   NA
 5652691 5652692 SGR_134 SGR_135     FALSE 0.005 308.000 0.000 NA   NA
 5652693 5652694 SGR_136 SGR_137     FALSE 0.117 74.000 0.000 NA   NA
 5652695 5652696 SGR_138 SGR_139     FALSE 0.006 1286.000 0.000 0.025   NA
 5652696 5652697 SGR_139 SGR_140     FALSE 0.002 445.000 0.000 NA   NA
 5652697 5652698 SGR_140 SGR_141     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652699 5652700 SGR_142 SGR_143     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 5652700 5652701 SGR_143 SGR_144     FALSE 0.350 14.000 0.000 NA   NA
 5652701 5652702 SGR_144 SGR_145     FALSE 0.206 112.000 0.000 1.000 N NA
 5652702 5652703 SGR_145 SGR_146     FALSE 0.197 120.000 0.000 1.000 N NA
 5652703 5652704 SGR_146 SGR_147     TRUE 0.790 52.000 0.010 1.000 Y NA
 5652704 5652705 SGR_147 SGR_148     TRUE 0.993 0.000 1.000 NA Y NA
 5652705 5652706 SGR_148 SGR_149     FALSE 0.364 179.000 0.000 NA Y NA
 5652706 5652707 SGR_149 SGR_150     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5652707 5652708 SGR_150 SGR_151     FALSE 0.004 480.000 0.000 1.000 N NA
 5652708 5652709 SGR_151 SGR_152     FALSE 0.027 251.000 0.000 1.000 N NA
 5652709 5652710 SGR_152 SGR_153     FALSE 0.139 56.000 0.000 NA   NA
 5652711 5652712 SGR_154 SGR_155     FALSE 0.002 448.000 0.000 NA   NA
 5652712 5652713 SGR_155 SGR_156     FALSE 0.127 65.000 0.000 NA   NA
 5652713 5652714 SGR_156 SGR_157     FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 5652714 5652715 SGR_157 SGR_158     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5652715 5652716 SGR_158 SGR_159     FALSE 0.333 15.000 0.000 NA   NA
 5652716 5652717 SGR_159 SGR_160     FALSE 0.414 10.000 0.000 NA   NA
 5652717 5652718 SGR_160 SGR_161     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5652718 5652719 SGR_161 SGR_162     TRUE 0.704 6.000 0.000 1.000 N NA
 5652719 5652720 SGR_162 SGR_163     FALSE 0.011 244.000 0.000 NA   NA
 5652720 5652721 SGR_163 SGR_164     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652723 5652724 SGR_166 SGR_167     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 5652725 5652726 SGR_168 SGR_169     FALSE 0.414 10.000 0.000 NA   NA
 5652726 5652727 SGR_169 SGR_170     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652727 5652728 SGR_170 SGR_171     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652732 5652733 SGR_175 SGR_176     FALSE 0.238 26.000 0.000 NA   NA
 5652733 5652734 SGR_176 SGR_177     FALSE 0.065 150.000 0.000 NA   NA
 5652736 5652737 SGR_179 SGR_180     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652737 5652738 SGR_180 SGR_181     FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 5652738 5652739 SGR_181 SGR_182     FALSE 0.179 38.000 0.000 NA   NA
 5652739 5652740 SGR_182 SGR_183     FALSE 0.321 16.000 0.000 NA   NA
 5652741 5652742 SGR_184 SGR_185     FALSE 0.159 47.000 0.000 NA   NA
 5652742 5652743 SGR_185 SGR_186     FALSE 0.002 2875.000 0.000 1.000   NA
 5652744 5652745 SGR_187 SGR_188     TRUE 0.638 86.000 0.000 NA Y NA
 5652745 5652746 SGR_188 SGR_189     FALSE 0.015 1289.000 0.000 1.000 Y NA
 5652746 5652747 SGR_189 SGR_190     FALSE 0.111 85.000 0.000 NA   NA
 5652747 5652748 SGR_190 SGR_191     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652748 5652749 SGR_191 SGR_192     FALSE 0.002 457.000 0.000 NA   NA
 5652750 5652751 SGR_193 SGR_194     FALSE 0.263 22.000 0.000 NA   NA
 5652755 5652756 SGR_198 SGR_199     FALSE 0.001 838.000 0.000 NA   NA
 5652756 5652757 SGR_199 SGR_200     FALSE 0.003 477.000 0.000 1.000   NA
 5652757 5652758 SGR_200 SGR_201     FALSE 0.003 355.000 0.000 NA   NA
 5652761 5652762 SGR_204 SGR_205     TRUE 0.991 3.000 0.500 0.032 Y NA
 5652762 5652763 SGR_205 SGR_206     TRUE 0.963 -3.000 0.429 1.000   NA
 5652764 5652765 SGR_207 SGR_208     TRUE 0.959 -3.000 0.316 1.000 N NA
 5652765 5652766 SGR_208 SGR_209     TRUE 0.992 -3.000 0.368 0.099 Y NA
 5652766 5652767 SGR_209 SGR_210     TRUE 0.594 200.000 0.455 1.000 Y NA
 5652767 5652768 SGR_210 SGR_211     TRUE 0.991 -3.000 0.294 0.052 Y NA
 5652768 5652769 SGR_211 SGR_212     TRUE 0.918 -3.000 0.118 1.000   NA
 5652769 5652770 SGR_212 SGR_213     TRUE 0.967 -3.000 0.545 NA   NA
 5652770 5652771 SGR_213 SGR_214     TRUE 0.950 -3.000 0.364 NA   NA
 5652771 5652772 SGR_214 SGR_215     TRUE 0.980 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 5652772 5652773 SGR_215 SGR_216     FALSE 0.354 182.000 0.000 NA Y NA
 5652774 5652775 SGR_217 SGR_218     FALSE 0.007 334.000 0.000 NA N NA
 5652777 5652778 SGR_220 SGR_221     TRUE 0.592 125.000 0.000 1.000 Y NA
 5652778 5652779 SGR_221 SGR_222     TRUE 0.973 6.000 0.300 1.000 Y NA
 5652780 5652781 SGR_223 SGR_224     TRUE 0.626 97.000 0.381 1.000 N NA
 5652781 5652782 SGR_224 SGR_225     TRUE 0.581 110.000 0.000 NA Y NA
 5652782 5652783 SGR_225 SGR_226     TRUE 0.613 111.000 0.565 NA   NA
 5652783 5652784 SGR_226 SGR_227     TRUE 0.972 -3.000 0.565 1.000   NA
 5652784 5652785 SGR_227 SGR_228     FALSE 0.007 376.000 0.000 1.000 N NA
 5652785 5652786 SGR_228 SGR_229     FALSE 0.001 546.000 0.000 NA   NA
 5652787 5652788 SGR_230 SGR_231     FALSE 0.093 104.000 0.000 NA   NA
 5652788 5652789 SGR_231 SGR_232     FALSE 0.001 523.000 0.000 NA   NA
 5652789 5652790 SGR_232 SGR_233   ureD3 FALSE 0.111 85.000 0.000 NA   NA
 5652790 5652791 SGR_233 SGR_234 ureD3 ureG3 TRUE 0.990 -3.000 0.115 0.004 Y NA
 5652791 5652792 SGR_234 SGR_235 ureG3 ureF3 TRUE 0.992 -7.000 0.439 0.004 Y NA
 5652792 5652793 SGR_235 SGR_236 ureF3 ureC3 TRUE 0.957 0.000 0.061 0.004 N NA
 5652793 5652794 SGR_236 SGR_237 ureC3 ureB3 TRUE 0.992 2.000 0.486 0.002 Y NA
 5652794 5652795 SGR_237 SGR_238 ureB3 ureA3 TRUE 0.988 -3.000 0.014 0.002 Y NA
 5652796 5652797 SGR_239 SGR_240     TRUE 0.928 11.000 0.500 1.000 N NA
 5652797 5652798 SGR_240 SGR_241     FALSE 0.130 62.000 0.000 NA   NA
 5652800 5652801 SGR_243 SGR_244     FALSE 0.062 182.000 0.000 1.000   NA
 5652802 5652803 SGR_245 SGR_246     FALSE 0.109 87.000 0.000 NA   NA
 5652803 5652804 SGR_246 SGR_247     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5652804 5652805 SGR_247 SGR_248     FALSE 0.169 91.000 0.000 1.000   NA
 5652807 5652808 SGR_250 SGR_251     FALSE 0.078 175.000 0.000 NA N NA
 5652808 5652809 SGR_251 SGR_252     FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 5652810 5652811 SGR_253 SGR_254     FALSE 0.091 107.000 0.000 NA   NA
 5652811 5652812 SGR_254 SGR_255     FALSE 0.183 78.000 0.000 1.000   NA
 5652812 5652813 SGR_255 SGR_256     FALSE 0.179 38.000 0.000 NA   NA
 5652813 5652814 SGR_256 SGR_257     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5652816 5652817 SGR_259 SGR_260     FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 5652817 5652818 SGR_260 SGR_261     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 5652818 5652819 SGR_261 SGR_262     FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5652820 5652821 SGR_263 SGR_264     TRUE 0.937 -3.000 0.000 0.012 N NA
 5652821 5652822 SGR_264 SGR_265     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 5652823 5652824 SGR_266 SGR_267     TRUE 0.582 73.000 0.304 1.000   NA
 5652827 5652828 SGR_270 SGR_271     TRUE 0.977 17.000 0.800 1.000 Y NA
 5652828 5652829 SGR_271 SGR_272     TRUE 0.993 0.000 0.833 1.000 Y NA
 5652829 5652830 SGR_272 SGR_273     FALSE 0.004 323.000 0.000 NA   NA
 5652831 5652832 SGR_274 SGR_275     TRUE 0.993 -7.000 0.812 1.000 Y NA
 5652832 5652833 SGR_275 SGR_276     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5652835 5652836 SGR_278 SGR_279     FALSE 0.100 96.000 0.000 NA   NA
 5652836 5652837 SGR_279 SGR_280     TRUE 0.977 0.000 0.857 NA   NA
 5652837 5652838 SGR_280 SGR_281     TRUE 0.969 -3.000 0.571 NA   NA
 5652838 5652839 SGR_281 SGR_282     TRUE 0.647 83.000 0.500 NA   NA
 5652839 5652840 SGR_282 SGR_283     TRUE 0.932 -3.000 0.250 NA   NA
 5652840 5652841 SGR_283 SGR_284     FALSE 0.031 190.000 0.000 NA   NA
 5652841 5652842 SGR_284 SGR_285     TRUE 0.624 50.000 0.190 1.000 N NA
 5652843 5652844 SGR_286 SGR_287     TRUE 0.968 -3.000 0.429 1.000 N NA
 5652844 5652845 SGR_287 SGR_288     TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.051 Y NA
 5652845 5652846 SGR_288 SGR_289     FALSE 0.288 291.000 0.333 0.051 Y NA
 5652846 5652847 SGR_289 SGR_290     FALSE 0.044 224.000 0.000 1.000 N NA
 5652851 5652852 SGR_294 SGR_295     FALSE 0.217 29.000 0.000 NA   NA
 5652852 5652853 SGR_295 SGR_296     FALSE 0.447 7.000 0.000 NA   NA
 5652854 5652855 SGR_297 SGR_298     TRUE 0.845 -7.000 0.053 NA   NA
 5652857 5652858 SGR_300 SGR_301     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5652858 5652859 SGR_301 SGR_302     FALSE 0.081 126.000 0.000 NA   NA
 5652859 5652860 SGR_302 SGR_303     FALSE 0.116 75.000 0.000 NA   NA
 5652860 5652861 SGR_303 SGR_304     FALSE 0.083 117.000 0.000 NA   NA
 5652862 5652863 SGR_305 SGR_306     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5652863 5652864 SGR_306 SGR_307     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 5652867 5652868 SGR_309 SGR_310     FALSE 0.090 108.000 0.000 NA   NA
 5652868 5652869 SGR_310 SGR_311     TRUE 0.840 56.000 0.250 NA Y NA
 5652869 5652870 SGR_311 SGR_312     FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 5652870 5652871 SGR_312 SGR_313     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 5652871 5652872 SGR_313 SGR_314     FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 5652873 5652874 SGR_315 SGR_316     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 5652876 5652877 SGR_318 SGR_319     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5652877 5652878 SGR_319 SGR_320     TRUE 0.886 -3.000 0.071 NA   NA
 5652879 5652880 SGR_321 SGR_322     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5652880 5652881 SGR_322 SGR_323     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652881 5652882 SGR_323 SGR_324     TRUE 0.968 5.000 1.000 NA   NA
 5652882 5652883 SGR_324 SGR_325     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 5652885 5652886 SGR_327 SGR_328     FALSE 0.126 66.000 0.000 NA   NA
 5652891 5652892 SGR_333 SGR_334     FALSE 0.174 40.000 0.000 NA   NA
 5652892 5652893 SGR_334 SGR_335     TRUE 0.730 110.000 0.833 NA   NA
 5652896 5652897 SGR_338 SGR_339     TRUE 0.624 59.000 0.250 1.000 N NA
 5652897 5652898 SGR_339 SGR_340     FALSE 0.390 90.000 0.000 0.053   NA
 5652898 5652899 SGR_340 SGR_341     FALSE 0.026 229.000 0.000 1.000   NA
 5652899 5652900 SGR_341 SGR_342     FALSE 0.211 59.000 0.000 1.000   NA
 5652903 5652904 SGR_345 SGR_346     TRUE 0.957 -3.000 0.429 NA   NA
 5652905 5652906 SGR_347 SGR_348     TRUE 0.976 -3.000 0.700 NA   NA
 5652906 5652907 SGR_348 SGR_349     FALSE 0.002 390.000 0.000 NA   NA
 5652907 5652908 SGR_349 SGR_350     FALSE 0.375 109.000 0.121 1.000   NA
 5652908 5652909 SGR_350 SGR_351     FALSE 0.348 172.000 0.333 1.000   NA
 5652911 5652912 SGR_353 SGR_354     FALSE 0.003 608.000 0.000 1.000 N NA
 5652912 5652913 SGR_354 SGR_355     FALSE 0.193 128.000 0.000 1.000 N NA
 5652913 5652914 SGR_355 SGR_356     FALSE 0.348 45.000 0.000 1.000 N NA
 5652914 5652915 SGR_356 SGR_357     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5652915 5652916 SGR_357 SGR_358     TRUE 0.935 14.000 0.000 0.051 Y NA
 5652916 5652917 SGR_358 SGR_359     TRUE 0.945 20.000 0.097 0.051 Y NA
 5652917 5652918 SGR_359 SGR_360     FALSE 0.045 361.000 0.000 1.000 Y NA
 5652918 5652919 SGR_360 SGR_361     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 5652919 5652920 SGR_361 SGR_362     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5652920 5652921 SGR_362 SGR_363     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5652921 5652922 SGR_363 SGR_364     TRUE 0.534 149.000 0.000 1.000 Y NA
 5652922 5652923 SGR_364 SGR_365     FALSE 0.081 124.000 0.000 NA   NA
 5652923 5652924 SGR_365 SGR_366     TRUE 0.594 0.000 0.000 NA   NA
 5652926 5652927 SGR_368 SGR_369     TRUE 0.979 -3.000 0.800 NA   NA
 5652927 5652928 SGR_369 SGR_370   sprA FALSE 0.001 943.000 0.000 NA   NA
 5652934 5652935 SGR_376 SGR_377     TRUE 0.587 -7.000 0.000 NA   NA
 5652935 5652936 SGR_377 SGR_378     FALSE 0.111 84.000 0.000 NA   NA
 5652936 5652937 SGR_378 SGR_379     FALSE 0.043 175.000 0.000 NA   NA
 5652940 5652941 SGR_382 SGR_383     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 5652941 5652942 SGR_383 SGR_384     FALSE 0.271 21.000 0.000 NA   NA
 5652942 5652943 SGR_384 SGR_385     FALSE 0.064 151.000 0.000 NA   NA
 5652944 5652945 SGR_386 SGR_387     FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   NA
 5652945 5652946 SGR_387 SGR_388     FALSE 0.003 359.000 0.000 NA   NA
 5652948 5652949 SGR_390 SGR_391     FALSE 0.035 184.000 0.000 NA   NA
 5652950 5652951 SGR_392 SGR_393     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 5652951 5652952 SGR_393 SGR_394     FALSE 0.465 6.000 0.000 NA   NA
 5652953 5652954 SGR_395 SGR_396     FALSE 0.121 70.000 0.000 NA   NA
 5652956 5652957 SGR_398 SGR_399     FALSE 0.079 191.000 0.000 1.000 N NA
 5652957 5652958 SGR_399 SGR_400     FALSE 0.003 607.000 0.000 1.000 N NA
 5652958 5652959 SGR_400 SGR_401     FALSE 0.026 252.000 0.000 1.000 N NA
 5652960 5652961 SGR_402 SGR_403     TRUE 0.708 95.000 0.040 NA Y NA
 5652961 5652962 SGR_403 SGR_404     FALSE 0.199 116.000 0.000 1.000 N NA
 5652963 5652964 SGR_405 SGR_406     FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 5652966 5652967 SGR_408 SGR_409     FALSE 0.168 43.000 0.000 NA   NA
 5652967 5652968 SGR_409 SGR_410     FALSE 0.010 252.000 0.000 NA   NA
 5652968 5652969 SGR_410 SGR_411     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 5652969 5652970 SGR_411 SGR_412     FALSE 0.079 132.000 0.000 NA   NA
 5652970 5652971 SGR_412 SGR_413     TRUE 0.556 77.000 0.333 NA   NA
 5652971 5652972 SGR_413 SGR_414     FALSE 0.238 26.000 0.000 NA   NA
 5652973 5652974 SGR_415 SGR_416     FALSE 0.179 38.000 0.000 NA   NA
 5652975 5652976 SGR_417 SGR_418     TRUE 0.960 8.000 0.750 1.000 N NA
 5652978 5652979 SGR_420 SGR_421     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 5652979 5652980 SGR_421 SGR_422     FALSE 0.049 168.000 0.000 NA   NA
 5652980 5652981 SGR_422 SGR_423     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5652981 5652982 SGR_423 SGR_424     FALSE 0.108 88.000 0.000 NA   NA
 5652985 5652986 SGR_427 SGR_428     TRUE 0.874 -3.000 0.050 NA   NA
 5652987 5652988 SGR_429 SGR_430     FALSE 0.442 105.000 0.127 1.000 N NA
 5652990 5652991 SGR_432 SGR_433     FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5652991 5652992 SGR_433 SGR_434     FALSE 0.079 132.000 0.000 NA   NA
 5652992 5652993 SGR_434 SGR_435     FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   NA
 5652993 5652994 SGR_435 SGR_436     TRUE 0.755 148.000 0.333 1.000 Y NA
 5652994 5652995 SGR_436 SGR_437     TRUE 0.989 -3.000 0.157 0.051 Y NA
 5652995 5652996 SGR_437 SGR_438     TRUE 0.997 -3.000 0.918 0.051 Y NA
 5652996 5652997 SGR_438 SGR_439     TRUE 0.926 -3.000 0.073 1.000 N NA
 5652997 5652998 SGR_439 SGR_440     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5652999 5653000 SGR_441 SGR_442     FALSE 0.230 27.000 0.000 NA   NA
 5653000 5653001 SGR_442 SGR_443     FALSE 0.057 159.000 0.000 NA   NA
 5653001 5653002 SGR_443 SGR_444     TRUE 0.996 -7.000 1.000 0.012 Y NA
 5653002 5653003 SGR_444 SGR_445     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653003 5653004 SGR_445 SGR_446     FALSE 0.424 9.000 0.000 NA   NA
 5653006 5653007 SGR_448 SGR_449     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 5653007 5653008 SGR_449 SGR_450     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.006 Y NA
 5653008 5653009 SGR_450 SGR_451     FALSE 0.218 223.000 0.000 1.000 Y NA
 5653009 5653010 SGR_451 SGR_452     FALSE 0.132 60.000 0.000 NA   NA
 5653010 5653011 SGR_452 SGR_453     FALSE 0.052 165.000 0.000 NA   NA
 5653011 5653012 SGR_453 SGR_454     TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.051 Y NA
 5653012 5653013 SGR_454 SGR_455     FALSE 0.072 301.000 0.000 NA Y NA
 5653014 5653015 SGR_456 SGR_457     TRUE 0.739 44.000 0.000 NA Y NA
 5653016 5653017 SGR_458 SGR_459     FALSE 0.149 106.000 0.000 1.000   NA
 5653017 5653018 SGR_459 SGR_460     FALSE 0.208 31.000 0.000 NA   NA
 5653020 5653021 SGR_462 SGR_463     FALSE 0.014 234.000 0.000 NA   NA
 5653021 5653022 SGR_463 SGR_464     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 5653022 5653023 SGR_464 SGR_465     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653023 5653024 SGR_465 SGR_466     TRUE 0.558 2.000 0.000 NA   NA
 5653024 5653025 SGR_466 SGR_467     FALSE 0.094 103.000 0.000 NA   NA
 5653025 5653026 SGR_467 SGR_468     FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 5653026 5653027 SGR_468 SGR_469     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5653027 5653028 SGR_469 SGR_470   srsC FALSE 0.149 156.000 0.000 1.000 N NA
 5653028 5653029 SGR_470 SGR_471 srsC srsB TRUE 0.929 -3.000 0.176 1.000   NA
 5653029 5653030 SGR_471 SGR_472 srsB srsA TRUE 0.730 14.000 0.059 1.000   NA
 5653031 5653032 SGR_473 SGR_474     FALSE 0.087 165.000 0.000 1.000   NA
 5653032 5653033 SGR_474 SGR_475     FALSE 0.135 119.000 0.000 1.000   NA
 5653033 5653034 SGR_475 SGR_476     TRUE 0.940 -3.000 0.294 NA   NA
 5653035 5653036 SGR_477 SGR_478     FALSE 0.087 165.000 0.000 1.000   NA
 5653038 5653039 SGR_480 SGR_481     FALSE 0.159 47.000 0.000 NA   NA
 5653040 5653041 SGR_482 SGR_483     FALSE 0.159 98.000 0.000 1.000   NA
 5653043 5653044 SGR_485 SGR_486     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653045 5653046 SGR_487 SGR_488     FALSE 0.202 32.000 0.000 NA   NA
 5653048 5653049 SGR_490 SGR_491     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 5653049 5653050 SGR_491 SGR_492     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5653050 5653051 SGR_492 SGR_493     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 5653051 5653052 SGR_493 SGR_494     FALSE 0.019 217.000 0.000 NA   NA
 5653052 5653053 SGR_494 SGR_495     TRUE 0.954 -7.000 0.094 0.030 N NA
 5653053 5653054 SGR_495 SGR_496     TRUE 0.987 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 5653054 5653055 SGR_496 SGR_497     TRUE 0.994 -7.000 0.667 0.050 Y NA
 5653055 5653056 SGR_497 SGR_498     TRUE 0.996 -3.000 0.733 0.050 Y NA
 5653056 5653057 SGR_498 SGR_499     FALSE 0.063 153.000 0.000 NA   NA
 5653057 5653058 SGR_499 SGR_500     FALSE 0.166 44.000 0.000 NA   NA
 5653058 5653059 SGR_500 SGR_501     TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.008 Y NA
 5653059 5653060 SGR_501 SGR_502     TRUE 0.956 -3.000 0.286 1.000 N NA
 5653060 5653061 SGR_502 SGR_503     FALSE 0.192 129.000 0.000 1.000 N NA
 5653061 5653062 SGR_503 SGR_504     FALSE 0.087 111.000 0.000 NA   NA
 5653065 5653066 SGR_507 SGR_508     FALSE 0.074 174.000 0.000 1.000   NA
 5653069 5653070 SGR_511 SGR_512     TRUE 0.989 -3.000 0.750 0.050 N NA
 5653070 5653071 SGR_512 SGR_513     TRUE 0.982 26.000 1.000 0.050 Y NA
 5653072 5653073 SGR_514 SGR_515     FALSE 0.017 223.000 0.000 NA   NA
 5653073 5653074 SGR_515 SGR_516     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653074 5653075 SGR_516 SGR_517     FALSE 0.200 115.000 0.000 1.000 N NA
 5653075 5653076 SGR_517 SGR_518     FALSE 0.012 320.000 0.000 1.000 N NA
 5653076 5653077 SGR_518 SGR_519     TRUE 0.977 -3.000 0.068 NA Y NA
 5653077 5653078 SGR_519 SGR_520     TRUE 0.964 3.000 0.068 NA Y NA
 5653078 5653079 SGR_520 SGR_521     TRUE 0.918 -3.000 0.188 NA   NA
 5653079 5653080 SGR_521 SGR_522     TRUE 0.703 -10.000 0.000 1.000   NA
 5653080 5653081 SGR_522 SGR_523     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5653081 5653082 SGR_523 SGR_524     TRUE 0.935 -3.000 0.267 NA   NA
 5653082 5653083 SGR_524 SGR_525     TRUE 0.912 -3.000 0.160 NA   NA
 5653083 5653084 SGR_525 SGR_526   chpG FALSE 0.072 140.000 0.000 NA   NA
 5653085 5653086 SGR_527 SGR_528 melC2-1 melC1-1 FALSE 0.407 20.000 0.000 1.000   NA
 5653087 5653088 SGR_529 SGR_530     FALSE 0.134 123.000 0.000 1.000   NA
 5653088 5653089 SGR_530 SGR_531     FALSE 0.032 217.000 0.000 1.000   NA
 5653090 5653091 SGR_532 SGR_533     TRUE 0.990 -3.000 0.149 0.012 Y NA
 5653091 5653092 SGR_533 SGR_534     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653092 5653093 SGR_534 SGR_535     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653093 5653094 SGR_535 SGR_536     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5653094 5653095 SGR_536 SGR_537     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653095 5653096 SGR_537 SGR_538     FALSE 0.019 216.000 0.000 NA   NA
 5653096 5653097 SGR_538 SGR_539     TRUE 0.760 59.000 0.667 NA   NA
 5653097 5653098 SGR_539 SGR_540     TRUE 0.905 86.000 0.667 1.000 Y NA
 5653098 5653099 SGR_540 SGR_541     TRUE 0.980 -3.000 0.000 0.050 Y NA
 5653099 5653100 SGR_541 SGR_542     TRUE 0.984 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 5653102 5653103 SGR_544 SGR_545     TRUE 0.983 0.000 0.010 0.011 Y NA
 5653104 5653105 SGR_546 SGR_547     TRUE 0.852 62.000 0.009 0.011 Y NA
 5653105 5653106 SGR_547 SGR_548     TRUE 0.841 -3.000 0.014 NA   NA
 5653106 5653107 SGR_548 SGR_549     FALSE 0.242 86.000 0.006 NA   NA
 5653107 5653108 SGR_549 SGR_550     FALSE 0.185 90.000 0.000 NA N NA
 5653110 5653111 SGR_552 SGR_553     TRUE 0.980 9.000 0.577 1.000 Y NA
 5653111 5653112 SGR_553 SGR_554     TRUE 0.984 3.000 0.448 1.000 Y NA
 5653113 5653114 SGR_555 SGR_556     FALSE 0.115 77.000 0.000 NA   NA
 5653114 5653115 SGR_556 SGR_557     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653115 5653116 SGR_557 SGR_558     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5653116 5653117 SGR_558 SGR_559     FALSE 0.366 86.000 0.100 NA   NA
 5653117 5653118 SGR_559 SGR_560     TRUE 0.817 -13.000 0.031 NA   NA
 5653118 5653119 SGR_560 SGR_561     TRUE 0.911 -3.000 0.031 1.000 N NA
 5653119 5653120 SGR_561 SGR_562     TRUE 0.938 -3.000 0.150 1.000 N NA
 5653120 5653121 SGR_562 SGR_563     TRUE 0.970 -3.000 0.600 NA   NA
 5653121 5653122 SGR_563 SGR_564     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653122 5653123 SGR_564 SGR_565     TRUE 0.938 -3.000 0.150 1.000 N NA
 5653124 5653125 SGR_566 SGR_567     FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5653128 5653129 SGR_570 SGR_571     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653129 5653130 SGR_571 SGR_572     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653130 5653131 SGR_572 SGR_573     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 5653132 5653133 SGR_574 SGR_575     TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5653133 5653134 SGR_575 SGR_576     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653134 5653135 SGR_576 SGR_577     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653135 5653136 SGR_577 SGR_578     FALSE 0.465 6.000 0.000 NA   NA
 5653136 5653137 SGR_578 SGR_579     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653137 5653138 SGR_579 SGR_580     TRUE 0.903 -7.000 0.000 0.011   NA
 5653138 5653139 SGR_580 SGR_581     TRUE 0.863 33.000 0.000 0.096 Y NA
 5653139 5653140 SGR_581 SGR_582     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5653140 5653141 SGR_582 SGR_583     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5653141 5653142 SGR_583 SGR_584     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.011 Y NA
 5653142 5653143 SGR_584 SGR_585     TRUE 0.920 -3.000 0.000 0.096 N NA
 5653144 5653145 SGR_586 SGR_587     FALSE 0.028 197.000 0.000 NA   NA
 5653145 5653146 SGR_587 SGR_588     FALSE 0.333 15.000 0.000 NA   NA
 5653146 5653147 SGR_588 SGR_589     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653147 5653148 SGR_589 SGR_590     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653148 5653149 SGR_590 SGR_591     TRUE 0.908 -3.000 0.000 0.053   NA
 5653149 5653150 SGR_591 SGR_592     FALSE 0.172 41.000 0.000 NA   NA
 5653150 5653151 SGR_592 SGR_593     FALSE 0.267 111.000 0.051 NA   NA
 5653151 5653152 SGR_593 SGR_594     FALSE 0.001 748.000 0.000 NA   NA
 5653152 5653153 SGR_594 SGR_595     FALSE 0.414 10.000 0.000 NA   NA
 5653153 5653154 SGR_595 SGR_596     FALSE 0.147 52.000 0.000 NA   NA
 5653154 5653155 SGR_596 SGR_597     FALSE 0.136 58.000 0.000 NA   NA
 5653155 5653156 SGR_597 SGR_598     FALSE 0.075 136.000 0.000 NA   NA
 5653158 5653159 SGR_600 SGR_601     TRUE 0.981 -3.000 0.833 NA   NA
 5653162 5653163 SGR_604 SGR_605 tebC unbL1 FALSE 0.062 154.000 0.000 NA   NA
 5653163 5653164 SGR_605 SGR_606 unbL1 unbL2 TRUE 0.628 92.000 0.500 NA   NA
 5653164 5653165 SGR_606 SGR_607 unbL2 unbV TRUE 0.812 13.000 0.250 NA   NA
 5653165 5653166 SGR_607 SGR_608 unbV unbU TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5653166 5653167 SGR_608 SGR_609 unbU pksE TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5653167 5653168 SGR_609 SGR_610 pksE   TRUE 0.908 -3.000 0.000 0.053   NA
 5653168 5653169 SGR_610 SGR_611     TRUE 0.985 -3.000 0.667 0.054   NA
 5653169 5653170 SGR_611 SGR_612     FALSE 0.003 359.000 0.000 NA   NA
 5653171 5653172 SGR_613 SGR_614     FALSE 0.230 27.000 0.000 NA   NA
 5653173 5653174 SGR_615 SGR_616     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5653175 5653176 SGR_617 SGR_618     FALSE 0.054 163.000 0.000 NA   NA
 5653176 5653177 SGR_618 SGR_619     FALSE 0.081 125.000 0.000 NA   NA
 5653179 5653180 SGR_621 SGR_622     TRUE 0.954 -3.000 0.333 1.000   NA
 5653180 5653181 SGR_622 SGR_623     FALSE 0.110 86.000 0.000 NA   NA
 5653182 5653183 SGR_624 SGR_625     TRUE 0.844 35.000 0.667 1.000   NA
 5653183 5653184 SGR_625 SGR_626     FALSE 0.184 77.000 0.000 1.000   NA
 5653184 5653185 SGR_626 SGR_627     FALSE 0.092 239.000 0.000 0.014 N NA
 5653186 5653187 SGR_628 SGR_629     FALSE 0.028 247.000 0.000 1.000 N NA
 5653187 5653188 SGR_629 SGR_630     FALSE 0.206 62.000 0.000 1.000   NA
 5653188 5653189 SGR_630 SGR_631     FALSE 0.378 62.000 0.024 1.000   NA
 5653189 5653190 SGR_631 SGR_632     FALSE 0.519 20.000 0.000 1.000 N NA
 5653190 5653191 SGR_632 SGR_633     FALSE 0.046 171.000 0.000 NA   NA
 5653191 5653192 SGR_633 SGR_634     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 5653193 5653194 SGR_635 SGR_636     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653194 5653195 SGR_636 SGR_637     FALSE 0.031 433.000 0.000 1.000 Y NA
 5653195 5653196 SGR_637 SGR_638     TRUE 0.774 152.000 0.080 0.003 Y NA
 5653198 5653199 SGR_640 SGR_641     FALSE 0.023 206.000 0.000 NA   NA
 5653201 5653202 SGR_643 SGR_644     FALSE 0.048 169.000 0.000 NA   NA
 5653202 5653203 SGR_644 SGR_645     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 5653207 5653208 SGR_649 SGR_650     FALSE 0.335 99.000 0.100 NA   NA
 5653208 5653209 SGR_650 SGR_651     TRUE 0.972 -3.000 0.556 1.000   NA
 5653209 5653210 SGR_651 SGR_652     FALSE 0.002 586.000 0.000 1.000   NA
 5653210 5653211 SGR_652 SGR_653     FALSE 0.003 871.000 0.000 1.000 N NA
 5653211 5653212 SGR_653 SGR_654     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653212 5653213 SGR_654 SGR_655     TRUE 0.649 68.000 0.462 NA   NA
 5653213 5653214 SGR_655 SGR_656     TRUE 0.978 -3.000 0.615 1.000 N NA
 5653216 5653217 SGR_658 SGR_659     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5653218 5653219 SGR_660 SGR_661     FALSE 0.397 34.000 0.000 1.000 N NA
 5653219 5653220 SGR_661 SGR_662     FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 5653220 5653221 SGR_662 SGR_663     TRUE 0.681 64.000 0.500 NA   NA
 5653223 5653224 SGR_665 SGR_666     TRUE 0.912 -3.000 0.094 1.000   NA
 5653224 5653225 SGR_666 SGR_667     FALSE 0.101 155.000 0.000 1.000   NA
 5653227 5653228 SGR_669 SGR_670     FALSE 0.002 715.000 0.000 1.000   NA
 5653229 5653230 SGR_671 SGR_672     FALSE 0.304 18.000 0.000 NA   NA
 5653232 5653233 SGR_674 SGR_675     TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5653233 5653234 SGR_675 SGR_676     FALSE 0.002 408.000 0.000 NA   NA
 5653234 5653235 SGR_676 SGR_677     TRUE 0.963 2.000 0.667 NA   NA
 5653235 5653236 SGR_677 SGR_678     TRUE 0.540 74.000 0.250 1.000   NA
 5653236 5653237 SGR_678 SGR_679     TRUE 0.958 -3.000 0.375 1.000   NA
 5653238 5653239 SGR_680 SGR_681     FALSE 0.073 139.000 0.000 NA   NA
 5653239 5653240 SGR_681 SGR_682     FALSE 0.082 122.000 0.000 NA   NA
 5653242 5653243 SGR_684 SGR_685     FALSE 0.002 477.000 0.000 NA   NA
 5653243 5653244 SGR_685 SGR_686     FALSE 0.001 740.000 0.000 NA   NA
 5653244 5653245 SGR_686 SGR_687     FALSE 0.044 174.000 0.000 NA   NA
 5653249 5653250 SGR_691 SGR_692     FALSE 0.283 20.000 0.000 NA   NA
 5653253 5653254 SGR_695 SGR_696     TRUE 0.948 -3.000 0.337 NA   NA
 5653254 5653255 SGR_696 SGR_697     TRUE 0.962 0.000 0.597 NA   NA
 5653255 5653256 SGR_697 SGR_698     TRUE 0.944 -3.000 0.316 NA   NA
 5653257 5653258 SGR_699 SGR_700     TRUE 0.940 -3.000 0.286 NA   NA
 5653258 5653259 SGR_700 SGR_701     FALSE 0.017 223.000 0.000 NA   NA
 5653259 5653260 SGR_701 SGR_702     FALSE 0.002 419.000 0.000 NA   NA
 5653261 5653262 SGR_703 SGR_704     FALSE 0.049 200.000 0.000 NA N NA
 5653263 5653264 SGR_705 SGR_706     TRUE 0.995 -3.000 0.470 0.001 Y NA
 5653264 5653265 SGR_706 SGR_707     TRUE 0.981 2.000 0.598 0.001   NA
 5653267 5653268 SGR_709 SGR_710     TRUE 0.956 -3.000 0.417 NA   NA
 5653269 5653270 SGR_711 SGR_712     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 5653276 5653277 SGR_718 SGR_719     FALSE 0.191 243.000 0.667 NA   NA
 5653278 5653279 SGR_720 SGR_721     TRUE 0.942 -3.000 0.250 1.000   NA
 5653279 5653280 SGR_721 SGR_722     TRUE 0.961 -3.000 0.486 NA   NA
 5653280 5653281 SGR_722 SGR_723     FALSE 0.486 63.000 0.200 NA   NA
 5653281 5653282 SGR_723 SGR_724     FALSE 0.264 153.000 0.024 1.000 N NA
 5653282 5653283 SGR_724 SGR_725     FALSE 0.183 37.000 0.000 NA   NA
 5653283 5653284 SGR_725 SGR_726     FALSE 0.087 111.000 0.000 NA   NA
 5653284 5653285 SGR_726 SGR_727     FALSE 0.081 127.000 0.000 NA   NA
 5653286 5653287 SGR_728 SGR_729     TRUE 0.883 -3.000 0.067 NA   NA
 5653287 5653288 SGR_729 SGR_730     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5653289 5653290 SGR_731 SGR_732     FALSE 0.003 359.000 0.000 NA   NA
 5653291 5653292 SGR_733 SGR_734     FALSE 0.369 185.000 0.000 1.000 Y NA
 5653292 5653293 SGR_734 SGR_735     TRUE 0.989 2.000 0.636 1.000 Y NA
 5653293 5653294 SGR_735 SGR_736     TRUE 0.985 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5653294 5653295 SGR_736 SGR_737     TRUE 0.729 49.000 0.500 NA   NA
 5653299 5653300 SGR_741 SGR_742     FALSE 0.053 214.000 0.000 1.000 N NA
 5653304 5653305 SGR_746 SGR_747     FALSE 0.275 38.000 0.000 1.000   NA
 5653307 5653308 SGR_749 SGR_750     TRUE 0.980 12.000 0.450 0.049 Y NA
 5653308 5653309 SGR_750 SGR_751     TRUE 0.965 47.000 0.818 0.049 Y NA
 5653309 5653310 SGR_751 SGR_752     TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000 Y NA
 5653310 5653311 SGR_752 SGR_753     FALSE 0.007 329.000 0.000 1.000   NA
 5653311 5653312 SGR_753 SGR_754     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5653312 5653313 SGR_754 SGR_755     FALSE 0.029 196.000 0.000 NA   NA
 5653314 5653315 SGR_756 SGR_757     FALSE 0.104 153.000 0.000 1.000   NA
 5653315 5653316 SGR_757 SGR_758     FALSE 0.415 123.000 0.273 NA   NA
 5653316 5653317 SGR_758 SGR_759   sprF FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 5653318 5653319 SGR_760 SGR_761     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5653321 5653322 SGR_763 SGR_764     FALSE 0.048 169.000 0.000 NA   NA
 5653324 5653325 SGR_766 SGR_767     FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5653325 5653326 SGR_767 SGR_768     FALSE 0.003 360.000 0.000 NA   NA
 5653326 5653327 SGR_768 SGR_769     FALSE 0.081 124.000 0.000 NA   NA
 5653327 5653328 SGR_769 SGR_770     FALSE 0.147 157.000 0.000 1.000 N NA
 5653328 5653329 SGR_770 SGR_771     FALSE 0.016 265.000 0.000 NA N NA
 5653329 5653330 SGR_771 SGR_772     TRUE 0.920 0.000 0.267 NA   NA
 5653330 5653331 SGR_772 SGR_773     FALSE 0.104 92.000 0.000 NA   NA
 5653332 5653333 SGR_774 SGR_775     FALSE 0.206 62.000 0.000 1.000   NA
 5653334 5653335 SGR_776 SGR_777     TRUE 0.833 64.000 0.000 0.001 Y NA
 5653336 5653337 SGR_778 SGR_779     FALSE 0.001 748.000 0.000 NA   NA
 5653337 5653338 SGR_779 SGR_780     FALSE 0.083 119.000 0.000 NA   NA
 5653338 5653339 SGR_780 SGR_781     TRUE 0.955 -3.000 0.333 NA N NA
 5653340 5653341 SGR_782 SGR_783     FALSE 0.002 446.000 0.000 NA   NA
 5653341 5653342 SGR_783 SGR_784     FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 5653343 5653344 SGR_785 SGR_786 nuoN3 nuoM3 TRUE 0.979 26.000 0.706 0.003 Y NA
 5653344 5653345 SGR_786 SGR_787 nuoM3 nuoL3 TRUE 0.993 5.000 0.765 0.003 Y NA
 5653345 5653346 SGR_787 SGR_788 nuoL3 nuoK3 TRUE 0.979 4.000 0.049 0.007 Y NA
 5653346 5653347 SGR_788 SGR_789 nuoK3 nuoJ3 TRUE 0.957 -3.000 0.039 0.003   NA
 5653347 5653348 SGR_789 SGR_790 nuoJ3 nuoH3 TRUE 0.909 -3.000 0.078 1.000   NA
 5653348 5653349 SGR_790 SGR_791 nuoH3   TRUE 0.879 -3.000 0.059 NA   NA
 5653349 5653350 SGR_791 SGR_792   nuoA3 FALSE 0.438 39.000 0.043 NA   NA
 5653353 5653354 SGR_795 SGR_796     TRUE 0.988 -3.000 0.403 NA Y NA
 5653354 5653355 SGR_796 SGR_797     TRUE 0.981 -3.000 0.387 0.001   NA
 5653355 5653356 SGR_797 SGR_798     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 5653359 5653360 SGR_801 SGR_802     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5653363 5653364 SGR_805 SGR_806     FALSE 0.076 194.000 0.000 1.000 N NA
 5653364 5653365 SGR_806 SGR_807     TRUE 0.994 0.000 0.667 0.049 Y NA
 5653365 5653366 SGR_807 SGR_808     TRUE 0.995 -3.000 0.600 0.049 Y NA
 5653366 5653367 SGR_808 SGR_809     TRUE 0.585 49.000 0.118 1.000 N NA
 5653368 5653369 SGR_810 SGR_811     FALSE 0.355 88.000 0.039 1.000   NA
 5653369 5653370 SGR_811 SGR_812     TRUE 0.949 -3.000 0.059 0.052   NA
 5653370 5653371 SGR_812 SGR_813     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA Y NA
 5653371 5653372 SGR_813 SGR_814     TRUE 0.990 -10.000 0.667 NA Y NA
 5653372 5653373 SGR_814 SGR_815     TRUE 0.678 87.000 0.500 NA N NA
 5653378 5653379 SGR_820 SGR_821     FALSE 0.197 119.000 0.000 1.000 N NA
 5653379 5653380 SGR_821 SGR_822     FALSE 0.183 184.000 0.118 1.000   NA
 5653381 5653382 SGR_823 SGR_824     TRUE 0.594 0.000 0.000 NA   NA
 5653383 5653384 SGR_825 SGR_826     TRUE 0.571 82.000 0.298 NA N NA
 5653385 5653386 SGR_827 SGR_828     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653387 5653388 SGR_829 SGR_830     FALSE 0.039 207.000 0.000 1.000   NA
 5653388 5653389 SGR_830 SGR_831     FALSE 0.211 68.000 0.000 NA N NA
 5653389 5653390 SGR_831 SGR_832     TRUE 0.939 -3.000 0.220 NA N NA
 5653390 5653391 SGR_832 SGR_833     FALSE 0.259 80.000 0.000 1.000 N NA
 5653391 5653392 SGR_833 SGR_834     FALSE 0.093 104.000 0.000 NA   NA
 5653392 5653393 SGR_834 SGR_835     FALSE 0.001 515.000 0.000 NA   NA
 5653393 5653394 SGR_835 SGR_836     FALSE 0.156 152.000 0.000 1.000 N NA
 5653396 5653397 SGR_838 SGR_839     TRUE 0.990 0.000 0.357 0.049 Y NA
 5653397 5653398 SGR_839 SGR_840     TRUE 0.805 60.000 0.000 0.049 Y NA
 5653398 5653399 SGR_840 SGR_841     FALSE 0.045 172.000 0.000 NA   NA
 5653400 5653401 SGR_842 SGR_843   ureD2 FALSE 0.256 82.000 0.000 1.000 N NA
 5653401 5653402 SGR_843 SGR_844 ureD2 ureG2 TRUE 0.985 2.000 0.095 0.004 Y NA
 5653402 5653403 SGR_844 SGR_845 ureG2 ureF2 TRUE 0.987 2.000 0.188 0.004 Y NA
 5653403 5653404 SGR_845 SGR_846 ureF2 ureC2 TRUE 0.954 4.000 0.200 0.004 N NA
 5653404 5653405 SGR_846 SGR_847 ureC2 ureB2 TRUE 0.988 0.000 0.150 0.002 Y NA
 5653405 5653406 SGR_847 SGR_848 ureB2   TRUE 0.957 -3.000 0.429 NA   NA
 5653406 5653407 SGR_848 SGR_849   ureA2 TRUE 0.946 4.000 0.571 NA   NA
 5653407 5653408 SGR_849 SGR_850 ureA2   TRUE 0.784 65.000 0.048 1.000 Y NA
 5653409 5653410 SGR_851 SGR_852     TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.081 Y NA
 5653410 5653411 SGR_852 SGR_853     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 5653413 5653414 SGR_855 SGR_856     FALSE 0.395 89.000 0.000 0.051   NA
 5653414 5653415 SGR_856 SGR_857     FALSE 0.029 299.000 0.000 0.051   NA
 5653415 5653416 SGR_857 SGR_858     FALSE 0.408 73.000 0.065 1.000   NA
 5653416 5653417 SGR_858 SGR_859     FALSE 0.040 205.000 0.000 1.000   NA
 5653418 5653419 SGR_860 SGR_861     TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5653422 5653423 SGR_864 SGR_865     FALSE 0.014 302.000 0.000 1.000 N NA
 5653424 5653425 SGR_866 SGR_867     FALSE 0.103 93.000 0.000 NA   NA
 5653426 5653427 SGR_868 SGR_869     FALSE 0.072 140.000 0.000 NA   NA
 5653427 5653428 SGR_869 SGR_870     FALSE 0.163 45.000 0.000 NA   NA
 5653429 5653430 SGR_871 SGR_872     TRUE 0.594 0.000 0.000 NA   NA
 5653432 5653433 SGR_874 SGR_875     TRUE 0.950 44.000 0.500 0.030 Y NA
 5653433 5653434 SGR_875 SGR_876     FALSE 0.449 27.000 0.000 1.000 N NA
 5653434 5653435 SGR_876 SGR_877     TRUE 0.981 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 5653435 5653436 SGR_877 SGR_tRNA02     FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 5653436 5653437 SGR_tRNA02 SGR_878     FALSE 0.153 50.000 0.000 NA   NA
 5653438 5653439 SGR_879 SGR_880     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5653443 5653444 SGR_884 SGR_885     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.030 Y NA
 5653444 5653445 SGR_885 SGR_886     FALSE 0.128 64.000 0.000 NA   NA
 5653446 5653447 SGR_887 SGR_888     FALSE 0.105 91.000 0.000 NA   NA
 5653449 5653450 SGR_890 SGR_891     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5653450 5653451 SGR_891 SGR_892     TRUE 0.827 4.000 0.095 NA   NA
 5653451 5653452 SGR_892 SGR_893     TRUE 0.907 -3.000 0.143 NA   NA
 5653452 5653453 SGR_893 SGR_894     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5653453 5653454 SGR_894 SGR_895     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 5653454 5653455 SGR_895 SGR_896     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653455 5653456 SGR_896 SGR_897     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653456 5653457 SGR_897 SGR_898     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653457 5653458 SGR_898 SGR_899     TRUE 0.924 -6.000 0.286 NA   NA
 5653458 5653459 SGR_899 SGR_900     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5653461 5653462 SGR_902 SGR_903     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653463 5653464 SGR_904 SGR_905     TRUE 0.852 4.000 0.087 1.000   NA
 5653464 5653465 SGR_905 SGR_906     TRUE 0.911 -3.000 0.087 1.000   NA
 5653465 5653466 SGR_906 SGR_907     TRUE 0.687 2.000 0.000 1.000   NA
 5653466 5653467 SGR_907 SGR_908     TRUE 0.911 -3.000 0.031 1.000 N NA
 5653467 5653468 SGR_908 SGR_909     TRUE 0.642 14.000 0.031 NA   NA
 5653468 5653469 SGR_909 SGR_910     TRUE 0.679 38.000 0.333 NA   NA
 5653471 5653472 SGR_912 SGR_913     FALSE 0.044 174.000 0.000 NA   NA
 5653475 5653476 SGR_916 SGR_917     FALSE 0.019 216.000 0.000 NA   NA
 5653476 5653477 SGR_917 SGR_918     FALSE 0.062 154.000 0.000 NA   NA
 5653477 5653478 SGR_918 SGR_919     FALSE 0.063 153.000 0.000 NA   NA
 5653481 5653482 SGR_921 SGR_922     TRUE 0.891 80.000 0.200 0.001 Y NA
 5653484 5653485 SGR_924 SGR_925     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5653485 5653486 SGR_925 SGR_926     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 5653487 5653488 SGR_927 SGR_928     TRUE 0.987 -3.000 0.385 NA Y NA
 5653488 5653489 SGR_928 SGR_929     TRUE 0.922 28.000 0.357 NA Y NA
 5653491 5653492 SGR_931 SGR_932     TRUE 0.981 -3.000 0.833 NA   NA
 5653492 5653493 SGR_932 SGR_933     TRUE 0.977 -22.000 1.000 NA   NA
 5653493 5653494 SGR_933 SGR_934     TRUE 0.971 3.000 0.857 NA   NA
 5653494 5653495 SGR_934 SGR_935     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653497 5653498 SGR_937 SGR_938     FALSE 0.111 85.000 0.000 NA   NA
 5653498 5653499 SGR_938 SGR_939     FALSE 0.153 102.000 0.000 1.000   NA
 5653499 5653500 SGR_939 SGR_940     FALSE 0.072 140.000 0.000 NA   NA
 5653502 5653503 SGR_942 SGR_943     FALSE 0.016 227.000 0.000 NA   NA
 5653503 5653504 SGR_943 SGR_944     FALSE 0.092 105.000 0.000 NA   NA
 5653506 5653507 SGR_946 SGR_947     TRUE 0.697 86.000 0.625 NA   NA
 5653508 5653509 SGR_948 SGR_949     FALSE 0.465 6.000 0.000 NA   NA
 5653509 5653510 SGR_949 SGR_950     TRUE 0.587 -7.000 0.000 NA   NA
 5653510 5653511 SGR_950 SGR_951     FALSE 0.444 44.000 0.061 NA   NA
 5653511 5653512 SGR_951 SGR_952     TRUE 0.927 -3.000 0.167 1.000   NA
 5653512 5653513 SGR_952 SGR_953     TRUE 0.936 8.000 0.633 NA   NA
 5653514 5653515 SGR_954 SGR_955     FALSE 0.100 156.000 0.000 1.000   NA
 5653517 5653518 SGR_957 SGR_958     FALSE 0.469 64.000 0.182 NA   NA
 5653518 5653519 SGR_958 SGR_959     FALSE 0.470 84.000 0.088 1.000 N NA
 5653519 5653520 SGR_959 SGR_960     FALSE 0.379 58.000 0.016 1.000   NA
 5653520 5653521 SGR_960 SGR_961     TRUE 0.952 -3.000 0.065 0.044   NA
 5653521 5653522 SGR_961 SGR_962   hopA TRUE 0.921 0.000 0.136 1.000 N NA
 5653522 5653523 SGR_962 SGR_963 hopA hopB FALSE 0.409 108.000 0.085 1.000 N NA
 5653523 5653524 SGR_963 SGR_964 hopB hopC TRUE 0.896 -3.000 0.046 1.000   NA
 5653524 5653525 SGR_964 SGR_965 hopC hopD FALSE 0.360 119.000 0.130 1.000   NA
 5653525 5653526 SGR_965 SGR_966 hopD hopE TRUE 0.992 -3.000 0.216 0.000 Y NA
 5653526 5653527 SGR_966 SGR_967 hopE   FALSE 0.006 414.000 0.000 1.000 N NA
 5653527 5653528 SGR_967 SGR_968     TRUE 0.988 -7.000 0.500 1.000 Y NA
 5653528 5653529 SGR_968 SGR_969     TRUE 0.753 102.000 0.857 NA   NA
 5653529 5653530 SGR_969 SGR_970     TRUE 0.957 -3.000 0.429 NA   NA
 5653530 5653531 SGR_970 SGR_971     FALSE 0.368 74.000 0.035 1.000   NA
 5653531 5653532 SGR_971 SGR_972     TRUE 0.910 -12.000 0.111 1.000 N NA
 5653532 5653533 SGR_972 SGR_973     TRUE 0.941 -3.000 0.171 1.000 N NA
 5653534 5653535 SGR_974 SGR_975     FALSE 0.237 181.000 0.133 1.000 N NA
 5653535 5653536 SGR_975 SGR_976     FALSE 0.034 237.000 0.000 1.000 N NA
 5653536 5653537 SGR_976 SGR_977     FALSE 0.162 148.000 0.000 1.000 N NA
 5653538 5653539 SGR_978 SGR_979     FALSE 0.067 147.000 0.000 NA   NA
 5653541 5653542 SGR_981 SGR_982     TRUE 0.765 44.000 0.556 NA   NA
 5653543 5653544 SGR_983 SGR_984     FALSE 0.104 92.000 0.000 NA   NA
 5653547 5653548 SGR_987 SGR_988     TRUE 0.772 65.000 0.667 1.000   NA
 5653550 5653551 SGR_990 SGR_991     FALSE 0.090 108.000 0.000 NA   NA
 5653553 5653554 SGR_993 SGR_994     TRUE 0.844 44.000 0.087 1.000 Y NA
 5653554 5653555 SGR_994 SGR_995     TRUE 0.843 45.000 0.091 1.000 Y NA
 5653555 5653556 SGR_995 SGR_996     TRUE 0.840 9.000 0.091 1.000 N NA
 5653559 5653560 SGR_999 SGR_1000     FALSE 0.115 77.000 0.000 NA   NA
 5653560 5653561 SGR_1000 SGR_1001     FALSE 0.003 350.000 0.000 NA   NA
 5653561 5653562 SGR_1001 SGR_1002     FALSE 0.046 171.000 0.000 NA   NA
 5653562 5653563 SGR_1002 SGR_1003     FALSE 0.055 162.000 0.000 NA   NA
 5653563 5653564 SGR_1003 SGR_1004   ssgD FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5653564 5653565 SGR_1004 SGR_1005 ssgD   FALSE 0.020 213.000 0.000 NA   NA
 5653567 5653568 SGR_1007 SGR_1008     FALSE 0.037 209.000 0.000 1.000   NA
 5653569 5653570 SGR_1009 SGR_1010 whmD   FALSE 0.341 110.000 0.143 NA   NA
 5653570 5653571 SGR_1010 SGR_1011     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 5653571 5653572 SGR_1011 SGR_1012     TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5653572 5653573 SGR_1012 SGR_1013     TRUE 0.956 1.000 0.000 1.000 Y NA
 5653573 5653574 SGR_1013 SGR_1014     TRUE 0.991 -3.000 0.538 1.000 Y NA
 5653574 5653575 SGR_1014 SGR_1015     TRUE 0.991 -3.000 0.273 0.048 Y NA
 5653575 5653576 SGR_1015 SGR_1016     TRUE 0.914 18.000 0.091 NA Y NA
 5653577 5653578 SGR_1017 SGR_1018     FALSE 0.491 161.000 0.000 1.000 Y NA
 5653580 5653581 SGR_1020 SGR_1021     TRUE 0.979 -3.000 0.700 1.000   NA
 5653582 5653583 SGR_1022 SGR_1023     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653584 5653585 SGR_1024 SGR_1025     FALSE 0.239 50.000 0.000 1.000   NA
 5653588 5653589 SGR_1028 SGR_1029     TRUE 0.906 27.000 1.000 NA   NA
 5653589 5653590 SGR_1029 SGR_1030     TRUE 0.685 62.000 0.500 NA   NA
 5653590 5653591 SGR_1030 SGR_1031     TRUE 0.689 60.000 0.500 NA   NA
 5653591 5653592 SGR_1031 SGR_1032     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5653592 5653593 SGR_1032 SGR_1033     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5653593 5653594 SGR_1033 SGR_1034     TRUE 0.996 -3.000 0.600 0.002 Y NA
 5653594 5653595 SGR_1034 SGR_1035     TRUE 0.996 -3.000 0.600 0.002 Y NA
 5653595 5653596 SGR_1035 SGR_1036     TRUE 0.995 2.000 0.750 0.002 Y NA
 5653596 5653597 SGR_1036 SGR_1037     TRUE 0.994 -3.000 0.375 0.002 Y NA
 5653597 5653598 SGR_1037 SGR_1038     TRUE 0.995 -3.000 0.500 0.002 Y NA
 5653598 5653599 SGR_1038 SGR_1039     TRUE 0.987 0.000 0.500 NA Y NA
 5653599 5653600 SGR_1039 SGR_1040     TRUE 0.985 4.000 0.600 NA Y NA
 5653600 5653601 SGR_1040 SGR_1041     TRUE 0.975 -3.000 0.038 NA Y NA
 5653601 5653602 SGR_1041 SGR_1042     FALSE 0.001 619.000 0.000 NA   NA
 5653602 5653603 SGR_1042 SGR_1043     FALSE 0.002 451.000 0.000 NA   NA
 5653603 5653604 SGR_1043 SGR_1044     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 5653605 5653606 SGR_1045 SGR_1046     FALSE 0.017 223.000 0.000 NA   NA
 5653606 5653607 SGR_1046 SGR_1047     FALSE 0.081 127.000 0.000 NA   NA
 5653607 5653608 SGR_1047 SGR_1048     TRUE 0.846 5.000 0.100 1.000   NA
 5653608 5653609 SGR_1048 SGR_1049     FALSE 0.001 669.000 0.000 NA   NA
 5653609 5653610 SGR_1049 SGR_1050     FALSE 0.051 166.000 0.000 NA   NA
 5653610 5653611 SGR_1050 SGR_1051     FALSE 0.071 142.000 0.000 NA   NA
 5653612 5653613 SGR_1052 SGR_1053     FALSE 0.217 29.000 0.000 NA   NA
 5653613 5653614 SGR_1053 SGR_1054     TRUE 0.692 45.000 0.400 NA   NA
 5653614 5653615 SGR_1054 SGR_1055     TRUE 0.955 0.000 0.500 NA   NA
 5653616 5653617 SGR_1056 SGR_1057     TRUE 0.593 -6.000 0.000 NA   NA
 5653618 5653619 SGR_1058 SGR_1059   rarE FALSE 0.191 131.000 0.000 1.000 N NA
 5653619 5653620 SGR_1059 SGR_1060 rarE rarD TRUE 0.573 172.000 0.778 1.000   NA
 5653620 5653621 SGR_1060 SGR_1061 rarD rarC TRUE 0.976 -19.000 0.889 NA   NA
 5653621 5653622 SGR_1061 SGR_1062 rarC rarB TRUE 0.982 -3.000 0.889 NA   NA
 5653622 5653623 SGR_1062 SGR_1063 rarB rarA TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5653623 5653624 SGR_1063 SGR_1064 rarA   FALSE 0.003 462.000 0.000 NA N NA
 5653624 5653625 SGR_1064 SGR_1065     TRUE 0.943 -3.000 0.312 NA   NA
 5653626 5653627 SGR_1066 SGR_1067     FALSE 0.081 125.000 0.000 NA   NA
 5653627 5653628 SGR_1067 SGR_1068     TRUE 0.908 -3.000 0.148 NA   NA
 5653628 5653629 SGR_1068 SGR_1069     FALSE 0.074 137.000 0.000 NA   NA
 5653632 5653633 SGR_1072 SGR_1073     TRUE 0.584 7.000 0.000 1.000   NA
 5653634 5653635 SGR_1074 SGR_1075     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5653635 5653636 SGR_1075 SGR_1076     TRUE 0.974 0.000 0.778 NA   NA
 5653636 5653637 SGR_1076 SGR_1077     FALSE 0.096 100.000 0.000 NA   NA
 5653637 5653638 SGR_1077 SGR_1078     FALSE 0.122 69.000 0.000 NA   NA
 5653638 5653639 SGR_1078 SGR_1079     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5653640 5653641 SGR_1080 SGR_1081     TRUE 0.993 2.000 0.600 0.048 Y NA
 5653641 5653642 SGR_1081 SGR_1082     TRUE 0.988 0.000 0.273 0.079 Y NA
 5653642 5653643 SGR_1082 SGR_1083     TRUE 0.990 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 5653643 5653644 SGR_1083 SGR_1084     TRUE 0.673 101.000 0.500 1.000 N NA
 5653644 5653645 SGR_1084 SGR_1085     FALSE 0.005 427.000 0.000 1.000 N NA
 5653645 5653646 SGR_1085 SGR_1086     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.009 Y NA
 5653647 5653648 SGR_1087 SGR_1088     TRUE 0.986 -10.000 0.417 1.000 Y NA
 5653648 5653649 SGR_1088 SGR_1089     FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5653649 5653650 SGR_1089 SGR_1090     FALSE 0.003 377.000 0.000 NA   NA
 5653650 5653651 SGR_1090 SGR_1091     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 5653651 5653652 SGR_1091 SGR_1092     FALSE 0.032 216.000 0.000 1.000   NA
 5653653 5653654 SGR_1093 SGR_1094     TRUE 0.978 -3.000 0.035 1.000 Y NA
 5653654 5653655 SGR_1094 SGR_1095     TRUE 0.835 63.000 0.217 1.000 Y NA
 5653655 5653656 SGR_1095 SGR_1096     TRUE 0.986 -10.000 0.435 1.000 Y NA
 5653656 5653657 SGR_1096 SGR_1097     TRUE 0.973 -3.000 0.500 1.000 N NA
 5653657 5653658 SGR_1097 SGR_1098     FALSE 0.017 338.000 0.000 0.099   NA
 5653660 5653661 SGR_1100 SGR_1101     TRUE 0.909 -3.000 0.151 NA   NA
 5653662 5653663 SGR_1102 SGR_1103     FALSE 0.010 297.000 0.000 1.000   NA
 5653666 5653667 SGR_1105 SGR_1106     FALSE 0.397 68.000 0.045 1.000   NA
 5653667 5653668 SGR_1106 SGR_1107     TRUE 0.888 -3.000 0.076 NA   NA
 5653668 5653669 SGR_1107 SGR_1108     TRUE 0.729 8.000 0.039 NA   NA
 5653669 5653670 SGR_1108 SGR_1109     TRUE 0.879 0.000 0.119 NA   NA
 5653670 5653671 SGR_1109 SGR_1110     TRUE 0.879 -6.000 0.119 NA   NA
 5653671 5653672 SGR_1110 SGR_1111     TRUE 0.858 -3.000 0.030 NA   NA
 5653672 5653673 SGR_1111 SGR_1112     TRUE 0.898 -3.000 0.051 1.000   NA
 5653673 5653674 SGR_1112 SGR_1113     FALSE 0.350 99.000 0.013 1.000 N NA
 5653674 5653675 SGR_1113 SGR_1114     FALSE 0.061 322.000 0.000 NA Y NA
 5653675 5653676 SGR_1114 SGR_1115     TRUE 0.832 14.000 0.320 NA   NA
 5653676 5653677 SGR_1115 SGR_1116     TRUE 0.555 72.000 0.326 NA   NA
 5653677 5653678 SGR_1116 SGR_1117     TRUE 0.852 67.000 0.348 NA Y NA
 5653678 5653679 SGR_1117 SGR_1118     TRUE 0.989 -3.000 0.390 1.000 Y NA
 5653679 5653680 SGR_1118 SGR_1119     FALSE 0.277 226.000 0.073 NA Y NA
 5653680 5653681 SGR_1119 SGR_1120   fabH2 FALSE 0.084 171.000 0.000 NA N NA
 5653683 5653684 SGR_1122 SGR_1123     FALSE 0.265 41.000 0.000 1.000   NA
 5653685 5653686 SGR_1124 SGR_1125     FALSE 0.005 457.000 0.000 1.000 N NA
 5653686 5653687 SGR_1125 SGR_1126     TRUE 0.559 142.000 0.500 1.000   NA
 5653687 5653688 SGR_1126 SGR_1127     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 5653689 5653690 SGR_1128 SGR_1129     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653691 5653692 SGR_1130 SGR_1131     FALSE 0.148 115.000 0.000 NA N NA
 5653695 5653696 SGR_1134 SGR_1135     FALSE 0.186 36.000 0.000 NA   NA
 5653696 5653697 SGR_1135 SGR_1136     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653697 5653698 SGR_1136 SGR_1137     FALSE 0.002 737.000 0.000 1.000   NA
 5653699 5653700 SGR_1138 SGR_1139     TRUE 0.529 92.000 0.333 NA   NA
 5653700 5653701 SGR_1139 SGR_1140     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 5653703 5653704 SGR_1142 SGR_1143     TRUE 0.969 -3.000 0.571 NA   NA
 5653706 5653707 SGR_1145 SGR_1146     FALSE 0.394 126.000 0.104 1.000 N NA
 5653707 5653708 SGR_1146 SGR_1147     FALSE 0.333 69.000 0.042 NA   NA
 5653709 5653710 SGR_1148 SGR_1149     FALSE 0.161 97.000 0.000 1.000   NA
 5653710 5653711 SGR_1149 SGR_1150     FALSE 0.114 79.000 0.000 NA   NA
 5653711 5653712 SGR_1150 SGR_1151     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 5653712 5653713 SGR_1151 SGR_1152     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 5653713 5653714 SGR_1152 SGR_1153     TRUE 0.898 -3.000 0.041 NA N NA
 5653714 5653715 SGR_1153 SGR_1154     TRUE 0.896 43.000 0.054 0.030 Y NA
 5653715 5653716 SGR_1154 SGR_1155     TRUE 0.991 -7.000 0.727 NA Y NA
 5653717 5653718 SGR_1156 SGR_1157     FALSE 0.083 119.000 0.000 NA   NA
 5653721 5653722 SGR_1160 SGR_1161     FALSE 0.035 268.000 0.091 NA   NA
 5653722 5653723 SGR_1161 SGR_1162     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 5653724 5653725 SGR_1163 SGR_1164     FALSE 0.151 157.000 0.013 NA   NA
 5653727 5653728 SGR_1166 SGR_1167     TRUE 0.659 92.000 0.500 1.000   NA
 5653730 5653731 SGR_1169 SGR_1170     FALSE 0.005 356.000 0.000 1.000   NA
 5653731 5653732 SGR_1170 SGR_1171     TRUE 0.814 10.000 0.051 1.000 N NA
 5653732 5653733 SGR_1171 SGR_1172     TRUE 0.922 -3.000 0.061 1.000 N NA
 5653733 5653734 SGR_1172 SGR_1173     TRUE 0.916 3.000 0.206 1.000 N NA
 5653734 5653735 SGR_1173 SGR_1174     TRUE 0.871 50.000 0.258 1.000 Y NA
 5653735 5653736 SGR_1174 SGR_1175     FALSE 0.464 181.000 0.013 1.000 Y NA
 5653736 5653737 SGR_1175 SGR_1176     TRUE 0.782 68.000 0.055 1.000 Y NA
 5653738 5653739 SGR_1177 SGR_1178     TRUE 0.890 -15.000 0.182 NA   NA
 5653739 5653740 SGR_1178 SGR_1179     TRUE 0.788 12.000 0.182 NA   NA
 5653741 5653742 SGR_1180 SGR_1181     FALSE 0.139 56.000 0.000 NA   NA
 5653743 5653744 SGR_1182 SGR_1183     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5653744 5653745 SGR_1183 SGR_1184     TRUE 0.975 -7.000 0.000 0.048 Y NA
 5653745 5653746 SGR_1184 SGR_1185     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5653746 5653747 SGR_1185 SGR_1186     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.028 Y NA
 5653752 5653753 SGR_1191 SGR_1192     TRUE 0.994 2.000 0.571 0.000 Y NA
 5653753 5653754 SGR_1192 SGR_1193     FALSE 0.009 346.000 0.000 1.000 N NA
 5653754 5653755 SGR_1193 SGR_1194     FALSE 0.282 134.000 0.044 1.000   NA
 5653755 5653756 SGR_1194 SGR_1195     FALSE 0.062 182.000 0.000 1.000   NA
 5653756 5653757 SGR_1195 SGR_1196     FALSE 0.186 183.000 0.048 1.000 N NA
 5653757 5653758 SGR_1196 SGR_1197     FALSE 0.516 90.000 0.241 NA N NA
 5653761 5653762 SGR_1200 SGR_1201     TRUE 0.941 13.000 0.093 1.000 Y NA
 5653762 5653763 SGR_1201 SGR_1202     FALSE 0.079 131.000 0.000 NA   NA
 5653763 5653764 SGR_1202 SGR_1203     FALSE 0.383 46.000 0.028 NA   NA
 5653764 5653765 SGR_1203 SGR_1204     TRUE 0.621 94.000 0.364 1.000 N NA
 5653767 5653768 SGR_1206 SGR_1207     FALSE 0.157 48.000 0.000 NA   NA
 5653769 5653770 SGR_1208 SGR_1209     TRUE 0.959 76.000 0.877 0.006 Y NA
 5653771 5653772 SGR_1210 SGR_1211     FALSE 0.205 71.000 0.000 NA N NA
 5653772 5653773 SGR_1211 SGR_1212     FALSE 0.035 400.000 0.000 1.000 Y NA
 5653776 5653777 SGR_1215 SGR_1216     TRUE 0.944 -3.000 0.197 1.000 N NA
 5653777 5653778 SGR_1216 SGR_1217     TRUE 0.987 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 5653778 5653779 SGR_1217 SGR_1218     TRUE 0.981 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 5653779 5653780 SGR_1218 SGR_1219     TRUE 0.989 -3.000 0.417 1.000 Y NA
 5653780 5653781 SGR_1219 SGR_1220     FALSE 0.028 247.000 0.000 1.000 N NA
 5653781 5653782 SGR_1220 SGR_1221     FALSE 0.172 41.000 0.000 NA   NA
 5653782 5653783 SGR_1221 SGR_1222     FALSE 0.112 82.000 0.000 NA   NA
 5653784 5653785 SGR_1223 SGR_1224     FALSE 0.152 103.000 0.000 1.000   NA
 5653787 5653788 SGR_1226 SGR_1227     FALSE 0.044 174.000 0.000 NA   NA
 5653790 5653791 SGR_1229 SGR_1230     FALSE 0.287 154.000 0.103 NA N NA
 5653791 5653792 SGR_1230 SGR_1231     TRUE 0.782 12.000 0.087 NA N NA
 5653792 5653793 SGR_1231 SGR_1232     FALSE 0.373 100.000 0.031 1.000 N NA
 5653793 5653794 SGR_1232 SGR_1233     TRUE 0.947 -3.000 0.286 1.000   NA
 5653794 5653795 SGR_1233 SGR_1234     FALSE 0.008 267.000 0.000 NA   NA
 5653795 5653796 SGR_1234 SGR_1235     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5653796 5653797 SGR_1235 SGR_1236     FALSE 0.211 59.000 0.000 1.000   NA
 5653799 5653800 SGR_1238 SGR_1239     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5653801 5653802 SGR_1240 SGR_1241   sprT FALSE 0.010 296.000 0.000 1.000   NA
 5653803 5653804 SGR_1242 SGR_1243     TRUE 0.972 -3.000 0.636 NA   NA
 5653804 5653805 SGR_1243 SGR_1244     FALSE 0.097 158.000 0.000 1.000   NA
 5653806 5653807 SGR_1245 SGR_1246     FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 5653807 5653808 SGR_1246 SGR_1247     FALSE 0.052 165.000 0.000 NA   NA
 5653809 5653810 SGR_1248 SGR_1249     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.005 Y NA
 5653810 5653811 SGR_1249 SGR_1250     TRUE 0.984 17.000 0.750 0.048 Y NA
 5653811 5653812 SGR_1250 SGR_1251     TRUE 0.982 13.000 0.800 1.000 Y NA
 5653812 5653813 SGR_1251 SGR_1252     TRUE 0.538 137.000 0.500 NA   NA
 5653815 5653816 SGR_1254 SGR_1255 clpX   FALSE 0.178 84.000 0.000 1.000   NA
 5653816 5653817 SGR_1255 SGR_1256     FALSE 0.461 43.000 0.029 1.000   NA
 5653817 5653818 SGR_1256 SGR_1257     TRUE 0.918 13.000 0.571 1.000   NA
 5653818 5653819 SGR_1257 SGR_1258     FALSE 0.015 229.000 0.000 NA   NA
 5653819 5653820 SGR_1258 SGR_1259     TRUE 0.577 -10.000 0.000 NA   NA
 5653821 5653822 SGR_1260 SGR_1261     FALSE 0.306 56.000 0.000 1.000 N NA
 5653824 5653825 SGR_1263 SGR_1264     FALSE 0.471 51.000 0.125 NA   NA
 5653825 5653826 SGR_1264 SGR_1265     FALSE 0.471 51.000 0.125 NA   NA
 5653826 5653827 SGR_1265 SGR_1266     TRUE 0.993 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5653828 5653829 SGR_1267 SGR_1268     FALSE 0.054 189.000 0.000 1.000   NA
 5653829 5653830 SGR_1268 SGR_1269     TRUE 0.664 34.000 0.222 1.000   NA
 5653830 5653831 SGR_1269 SGR_1270     TRUE 0.536 90.000 0.333 NA   NA
 5653831 5653832 SGR_1270 SGR_1271     FALSE 0.001 494.000 0.000 NA   NA
 5653832 5653833 SGR_1271 SGR_1272     TRUE 0.575 74.000 0.353 NA   NA
 5653833 5653834 SGR_1272 SGR_1273     FALSE 0.417 134.000 0.235 1.000   NA
 5653834 5653835 SGR_1273 SGR_1274     TRUE 0.962 -3.000 0.417 1.000   NA
 5653835 5653836 SGR_1274 SGR_1275     TRUE 0.988 -3.000 0.417 NA Y NA
 5653836 5653837 SGR_1275 SGR_1276     FALSE 0.016 265.000 0.000 NA N NA
 5653839 5653840 SGR_1278 SGR_1279     TRUE 0.805 71.000 0.000 0.009 Y NA
 5653840 5653841 SGR_1279 SGR_1280     TRUE 0.735 37.000 0.300 1.000 N NA
 5653841 5653842 SGR_1280 SGR_1281     TRUE 0.873 152.000 0.538 0.029 Y NA
 5653845 5653846 SGR_1284 SGR_1285     FALSE 0.133 124.000 0.000 1.000   NA
 5653846 5653847 SGR_1285 SGR_1286     FALSE 0.294 142.000 0.000 0.050   NA
 5653848 5653849 SGR_1287 SGR_1288     FALSE 0.089 164.000 0.000 1.000   NA
 5653849 5653850 SGR_1288 SGR_1289     TRUE 0.740 101.000 0.082 1.000 Y NA
 5653852 5653853 SGR_1291 SGR_1292     TRUE 0.942 -3.000 0.174 1.000 N NA
 5653854 5653855 SGR_1293 SGR_1294     TRUE 0.991 -3.000 0.238 0.029 Y NA
 5653857 5653858 SGR_1296 SGR_1297   aceB FALSE 0.057 267.000 0.188 1.000   NA
 5653859 5653860 SGR_1298 SGR_1299     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653860 5653861 SGR_1299 SGR_1300     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653861 5653862 SGR_1300 SGR_1301     FALSE 0.103 93.000 0.000 NA   NA
 5653863 5653864 SGR_1302 SGR_1303     FALSE 0.051 166.000 0.000 NA   NA
 5653865 5653866 SGR_1304 SGR_1305     FALSE 0.170 42.000 0.000 NA   NA
 5653866 5653867 SGR_1305 SGR_1306     FALSE 0.105 91.000 0.000 NA   NA
 5653867 5653868 SGR_1306 SGR_1307     FALSE 0.060 331.000 0.000 1.000 Y NA
 5653868 5653869 SGR_1307 SGR_1308     TRUE 0.840 46.000 0.083 1.000 Y NA
 5653869 5653870 SGR_1308 SGR_1309     FALSE 0.417 69.000 0.016 1.000 N NA
 5653870 5653871 SGR_1309 SGR_1310     TRUE 0.783 8.000 0.047 1.000   NA
 5653871 5653872 SGR_1310 SGR_1311     TRUE 0.932 -3.000 0.250 NA   NA
 5653872 5653873 SGR_1311 SGR_1312     FALSE 0.413 166.000 0.462 NA   NA
 5653873 5653874 SGR_1312 SGR_1313     TRUE 0.849 -3.000 0.021 NA   NA
 5653874 5653875 SGR_1313 SGR_1314     FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 5653875 5653876 SGR_1314 SGR_1315     FALSE 0.136 135.000 0.000 NA N NA
 5653877 5653878 SGR_1316 SGR_1317     TRUE 0.963 45.000 0.750 0.047 Y NA
 5653878 5653879 SGR_1317 SGR_1318     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.047 Y NA
 5653879 5653880 SGR_1318 SGR_1319     TRUE 0.853 60.000 0.273 1.000 Y NA
 5653880 5653881 SGR_1319 SGR_1320     TRUE 0.658 102.000 0.273 0.020   NA
 5653881 5653882 SGR_1320 SGR_1321     FALSE 0.032 217.000 0.000 1.000   NA
 5653882 5653883 SGR_1321 SGR_1322     TRUE 0.850 47.000 0.714 1.000 N NA
 5653883 5653884 SGR_1322 SGR_1323     FALSE 0.053 213.000 0.000 1.000 N NA
 5653885 5653886 SGR_1324 SGR_1325     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653886 5653887 SGR_1325 SGR_1326     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653887 5653888 SGR_1326 SGR_1327     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 5653888 5653889 SGR_1327 SGR_1328     TRUE 0.573 -13.000 0.000 NA   NA
 5653889 5653890 SGR_1328 SGR_1329     FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 5653891 5653892 SGR_1330 SGR_1331     FALSE 0.061 155.000 0.000 NA   NA
 5653892 5653893 SGR_1331 SGR_1332     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5653894 5653895 SGR_1333 SGR_1334     TRUE 0.990 -3.000 0.270 0.090 Y NA
 5653899 5653900 SGR_1338 SGR_1339     TRUE 0.891 -3.000 0.030 NA N NA
 5653901 5653902 SGR_1340 SGR_1341   choII FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 5653902 5653903 SGR_1341 SGR_1342 choII   FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 5653904 5653905 SGR_1343 SGR_1344     FALSE 0.256 23.000 0.000 NA   NA
 5653905 5653906 SGR_1344 SGR_1345     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5653907 5653908 SGR_1346 SGR_1347     FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 5653908 5653909 SGR_1347 SGR_1348     FALSE 0.027 250.000 0.000 1.000 N NA
 5653910 5653911 SGR_1349 SGR_1350     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5653911 5653912 SGR_1350 SGR_1351     FALSE 0.084 115.000 0.000 NA   NA
 5653912 5653913 SGR_1351 SGR_1352     TRUE 0.580 36.000 0.182 NA   NA
 5653913 5653914 SGR_1352 SGR_1353     FALSE 0.026 336.000 0.182 1.000   NA
 5653914 5653915 SGR_1353 SGR_1354     TRUE 0.991 -3.000 0.267 0.051 Y NA
 5653915 5653916 SGR_1354 SGR_1355     TRUE 0.994 3.000 0.765 0.051 Y NA
 5653917 5653918 SGR_1356 SGR_1357     FALSE 0.247 159.000 0.150 NA   NA
 5653920 5653921 SGR_1359 SGR_1360     FALSE 0.186 193.000 0.250 NA   NA
 5653924 5653925 SGR_1363 SGR_1364     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5653925 5653926 SGR_1364 SGR_1365     FALSE 0.354 113.000 0.172 NA   NA
 5653927 5653928 SGR_1366 SGR_1367     FALSE 0.274 81.000 0.017 NA   NA
 5653929 5653930 SGR_1368 SGR_1369     FALSE 0.455 66.000 0.100 1.000   NA
 5653932 5653933 SGR_1371 SGR_1372     FALSE 0.079 132.000 0.000 NA   NA
 5653933 5653934 SGR_1372 SGR_1373   rdlB FALSE 0.032 189.000 0.000 NA   NA
 5653934 5653935 SGR_1373 SGR_1374 rdlB   FALSE 0.121 70.000 0.000 NA   NA
 5653935 5653936 SGR_1374 SGR_1375   chpD FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 5653936 5653937 SGR_1375 SGR_1376 chpD rdlA FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 5653938 5653939 SGR_1377 SGR_1378     FALSE 0.129 63.000 0.000 NA   NA
 5653939 5653940 SGR_1378 SGR_1379     FALSE 0.084 188.000 0.000 1.000 N NA
 5653941 5653942 SGR_1380 SGR_1381     FALSE 0.416 109.000 0.100 1.000 N NA
 5653943 5653944 SGR_1382 SGR_1383     TRUE 0.991 -3.000 0.130 0.000 Y NA
 5653944 5653945 SGR_1383 SGR_1384     TRUE 0.845 114.000 0.500 1.000 Y NA
 5653945 5653946 SGR_1384 SGR_1385     FALSE 0.129 63.000 0.000 NA   NA
 5653947 5653948 SGR_1386 SGR_1387     TRUE 0.676 25.000 0.200 NA   NA
 5653949 5653950 SGR_1388 SGR_1389     FALSE 0.035 213.000 0.000 1.000   NA
 5653950 5653951 SGR_1389 SGR_1390     FALSE 0.378 64.000 0.027 1.000   NA
 5653951 5653952 SGR_1390 SGR_1391     FALSE 0.004 389.000 0.000 1.000   NA
 5653952 5653953 SGR_1391 SGR_1392     TRUE 0.890 -3.000 0.035 1.000   NA
 5653953 5653954 SGR_1392 SGR_1393     TRUE 0.869 -3.000 0.010 1.000   NA
 5653954 5653955 SGR_1393 SGR_1394     TRUE 0.886 0.000 0.022 1.000 N NA
 5653955 5653956 SGR_1394 SGR_1395     TRUE 0.927 -3.000 0.078 1.000 N NA
 5653956 5653957 SGR_1395 SGR_1396     TRUE 0.815 163.000 0.925 0.000 N NA
 5653957 5653958 SGR_1396 SGR_1397     FALSE 0.297 231.000 0.125 1.000 Y NA
 5653958 5653959 SGR_1397 SGR_1398     TRUE 0.906 49.000 0.438 1.000 Y NA
 5653959 5653960 SGR_1398 SGR_1399     TRUE 0.985 -13.000 0.393 1.000 Y NA
 5653960 5653961 SGR_1399 SGR_1400     TRUE 0.827 9.000 0.143 1.000   NA
 5653961 5653962 SGR_1400 SGR_1401     FALSE 0.127 134.000 0.000 1.000   NA
 5653962 5653963 SGR_1401 SGR_1402     FALSE 0.009 258.000 0.000 NA   NA
 5653964 5653965 SGR_1403 SGR_1404     TRUE 0.990 4.000 0.800 1.000 Y NA
 5653965 5653966 SGR_1404 SGR_1405     TRUE 0.995 -3.000 0.600 0.047 Y NA
 5653966 5653967 SGR_1405 SGR_1406     TRUE 0.641 98.000 0.000 1.000 Y NA
 5653967 5653968 SGR_1406 SGR_1407     TRUE 0.612 81.000 0.300 1.000 N NA
 5653968 5653969 SGR_1407 SGR_1408     TRUE 0.997 -3.000 0.800 0.011 Y NA
 5653969 5653970 SGR_1408 SGR_1409     FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 5653970 5653971 SGR_1409 SGR_1410     FALSE 0.350 14.000 0.000 NA   NA
 5653971 5653972 SGR_1410 SGR_1411     FALSE 0.071 142.000 0.000 NA   NA
 5653972 5653973 SGR_1411 SGR_1412     FALSE 0.004 567.000 0.000 1.000 N NA
 5653973 5653974 SGR_1412 SGR_1413     TRUE 0.725 56.000 0.000 1.000 Y NA
 5653974 5653975 SGR_1413 SGR_1414     TRUE 0.990 0.000 0.320 0.047 Y NA
 5653975 5653976 SGR_1414 SGR_1415     TRUE 0.991 -3.000 0.280 0.047 Y NA
 5653977 5653978 SGR_1416 SGR_1417     FALSE 0.157 48.000 0.000 NA   NA
 5653978 5653979 SGR_1417 SGR_1418     FALSE 0.381 12.000 0.000 NA   NA
 5653979 5653980 SGR_1418 SGR_1419     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5653980 5653981 SGR_1419 SGR_1420     FALSE 0.131 61.000 0.000 NA   NA
 5653981 5653982 SGR_1420 SGR_1421     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 5653983 5653984 SGR_1422 SGR_1423 dnaQ2   FALSE 0.200 122.000 0.012 NA   NA
 5653985 5653986 SGR_1424 SGR_1425     TRUE 0.837 80.000 0.015 0.009 Y NA
 5653987 5653988 SGR_1426 SGR_1427     FALSE 0.016 225.000 0.000 NA   NA
 5653989 5653990 SGR_1428 SGR_1429     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 5653991 5653992 SGR_1430 SGR_1431     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.009 Y NA
 5653993 5653994 SGR_1432 SGR_1433     FALSE 0.238 93.000 0.000 1.000 N NA
 5653995 5653996 SGR_1434 SGR_1435     FALSE 0.085 187.000 0.000 1.000 N NA
 5653998 5653999 SGR_1437 SGR_1438     TRUE 0.995 -12.000 0.750 0.029 Y NA
 5654000 5654001 SGR_1439 SGR_1440     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5654001 5654002 SGR_1440 SGR_1441     FALSE 0.108 88.000 0.000 NA   NA
 5654003 5654004 SGR_1442 SGR_1443     FALSE 0.501 49.000 0.026 1.000 N NA
 5654004 5654005 SGR_1443 SGR_1444     TRUE 0.739 75.000 0.547 1.000 N NA
 5654005 5654006 SGR_1444 SGR_1445     FALSE 0.052 346.000 0.000 1.000 Y NA
 5654006 5654007 SGR_1445 SGR_1446     TRUE 0.975 2.000 0.000 0.005 Y NA
 5654007 5654008 SGR_1446 SGR_1447     FALSE 0.414 10.000 0.000 NA   NA
 5654010 5654011 SGR_1449 SGR_1450     FALSE 0.433 8.000 0.000 NA   NA
 5654011 5654012 SGR_1450 SGR_1451     FALSE 0.023 206.000 0.000 NA   NA
 5654012 5654013 SGR_1451 SGR_1452     FALSE 0.003 377.000 0.000 NA   NA
 5654014 5654015 SGR_1453 SGR_1454     FALSE 0.156 49.000 0.000 NA   NA
 5654016 5654017 SGR_1455 SGR_1456     FALSE 0.454 51.000 0.006 1.000 N NA
 5654017 5654018 SGR_1456 SGR_1457     FALSE 0.264 70.000 0.006 NA   NA
 5654018 5654019 SGR_1457 SGR_1458     FALSE 0.270 144.000 0.118 NA   NA
 5654020 5654021 SGR_1459 SGR_1460     FALSE 0.104 92.000 0.000 NA   NA
 5654021 5654022 SGR_1460 SGR_1461     FALSE 0.119 140.000 0.000 1.000   NA
 5654022 5654023 SGR_1461 SGR_1462     FALSE 0.024 233.000 0.000 1.000   NA
 5654024 5654025 SGR_1463 SGR_1464     FALSE 0.113 80.000 0.000 NA   NA
 5654026 5654027 SGR_1465 SGR_1466     FALSE 0.274 77.000 0.015 NA   NA
 5654027 5654028 SGR_1466 SGR_1467     TRUE 0.796 6.000 0.087 NA   NA
 5654028 5654029 SGR_1467 SGR_1468     FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5654030 5654031 SGR_1469 SGR_1470     TRUE 0.841 5.000 0.158 NA   NA
 5654032 5654033 SGR_1471 SGR_1472     FALSE 0.330 68.000 0.038 NA   NA
 5654035 5654036 SGR_1474 SGR_1475     FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 5654036 5654037 SGR_1475 SGR_1476     FALSE 0.486 115.000 0.017 0.058 N NA
 5654037 5654038 SGR_1476 SGR_1477     FALSE 0.028 288.000 0.032 NA N NA
 5654038 5654039 SGR_1477 SGR_1478     TRUE 0.994 -3.000 0.812 NA Y NA
 5654040 5654041 SGR_1479 SGR_1480     FALSE 0.239 50.000 0.000 1.000   NA
 5654041 5654042 SGR_1480 SGR_1481     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5654042 5654043 SGR_1481 SGR_1482     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5654043 5654044 SGR_1482 SGR_1483     FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 5654044 5654045 SGR_1483 SGR_1484     FALSE 0.011 243.000 0.000 NA   NA
 5654046 5654047 SGR_1485 SGR_1486     FALSE 0.511 40.000 0.118 NA   NA
 5654047 5654048 SGR_1486 SGR_1487     FALSE 0.001 580.000 0.000 NA   NA
 5654048 5654049 SGR_1487 SGR_1488     FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 5654049 5654050 SGR_1488 SGR_1489     FALSE 0.082 122.000 0.000 NA   NA
 5654050 5654051 SGR_1489 SGR_1490     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654051 5654052 SGR_1490 SGR_1491     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5654052 5654053 SGR_1491 SGR_1492     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654053 5654054 SGR_1492 SGR_1493     TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5654055 5654056 SGR_1494 SGR_1495   dxs FALSE 0.360 190.000 0.455 1.000 N NA
 5654056 5654057 SGR_1495 SGR_1496 dxs   FALSE 0.425 165.000 0.333 1.000 N NA
 5654057 5654058 SGR_1496 SGR_1497     TRUE 0.977 -3.000 0.667 1.000   NA
 5654058 5654059 SGR_1497 SGR_1498     FALSE 0.005 301.000 0.000 NA   NA
 5654059 5654060 SGR_1498 SGR_1499     TRUE 0.682 121.000 0.080 NA Y NA
 5654060 5654061 SGR_1499 SGR_1500     FALSE 0.253 213.000 0.000 1.000 Y NA
 5654061 5654062 SGR_1500 SGR_1501     TRUE 0.991 0.000 0.415 0.047 Y NA
 5654062 5654063 SGR_1501 SGR_1502     TRUE 0.919 50.000 0.293 0.047 Y NA
 5654067 5654068 SGR_1506 SGR_1507     FALSE 0.001 543.000 0.000 NA   NA
 5654068 5654069 SGR_1507 SGR_1508     FALSE 0.028 197.000 0.000 NA   NA
 5654070 5654071 SGR_1509 SGR_1510     FALSE 0.027 230.000 0.000 NA N NA
 5654071 5654072 SGR_1510 SGR_1511     FALSE 0.001 838.000 0.000 NA   NA
 5654072 5654073 SGR_1511 SGR_1512     FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 5654073 5654074 SGR_1512 SGR_1513     FALSE 0.119 71.000 0.000 NA   NA
 5654074 5654075 SGR_1513 SGR_1514     FALSE 0.136 58.000 0.000 NA   NA
 5654075 5654076 SGR_1514 SGR_1515     FALSE 0.002 435.000 0.000 NA   NA
 5654076 5654077 SGR_1515 SGR_1516     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5654077 5654078 SGR_1516 SGR_1517     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654078 5654079 SGR_1517 SGR_1518     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5654085 5654086 SGR_1524 SGR_1525     FALSE 0.002 557.000 0.000 NA N NA
 5654086 5654087 SGR_1525 SGR_1526     TRUE 0.969 -3.000 0.571 NA   NA
 5654087 5654088 SGR_1526 SGR_1527     TRUE 0.699 105.000 0.714 NA   NA
 5654088 5654089 SGR_1527 SGR_1528     TRUE 0.978 2.000 0.286 NA Y NA
 5654089 5654090 SGR_1528 SGR_1529     TRUE 0.990 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5654090 5654091 SGR_1529 SGR_1530     TRUE 0.981 11.000 0.375 0.027 Y NA
 5654092 5654093 SGR_1531 SGR_1532     FALSE 0.235 56.000 0.000 NA N NA
 5654094 5654095 SGR_1533 SGR_1534     TRUE 0.984 -3.000 0.800 1.000 N NA
 5654095 5654096 SGR_1534 SGR_1535     TRUE 0.935 60.000 0.800 1.000 Y NA
 5654096 5654097 SGR_1535 SGR_1536     FALSE 0.286 40.000 0.000 NA N NA
 5654097 5654098 SGR_1536 SGR_1537     FALSE 0.286 40.000 0.000 NA N NA
 5654098 5654099 SGR_1537 SGR_1538     FALSE 0.107 150.000 0.000 1.000   NA
 5654099 5654100 SGR_1538 SGR_1539     FALSE 0.472 85.000 0.000 0.004   NA
 5654100 5654101 SGR_1539 SGR_1540     FALSE 0.002 419.000 0.000 NA   NA
 5654103 5654104 SGR_1542 SGR_1543     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654104 5654105 SGR_1543 SGR_1544     FALSE 0.170 42.000 0.000 NA   NA
 5654105 5654106 SGR_1544 SGR_1545     TRUE 0.587 -7.000 0.000 NA   NA
 5654106 5654107 SGR_1545 SGR_1546     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654110 5654111 SGR_1549 SGR_1550     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654111 5654112 SGR_1550 SGR_1551     TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5654114 5654115 SGR_1553 SGR_1554     FALSE 0.219 56.000 0.000 1.000   NA
 5654115 5654116 SGR_1554 SGR_1555     FALSE 0.112 146.000 0.000 1.000   NA
 5654116 5654117 SGR_1555 SGR_1556     TRUE 0.986 -3.000 0.277 1.000 Y NA
 5654117 5654118 SGR_1556 SGR_1557     TRUE 0.985 -3.000 0.287 NA Y NA
 5654118 5654119 SGR_1557 SGR_1558     TRUE 0.994 -3.000 0.913 NA Y NA
 5654119 5654120 SGR_1558 SGR_1559     TRUE 0.997 -3.000 0.870 0.007 Y NA
 5654120 5654121 SGR_1559 SGR_1560     TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.007 Y NA
 5654121 5654122 SGR_1560 SGR_1561     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 5654122 5654123 SGR_1561 SGR_1562     FALSE 0.115 77.000 0.000 NA   NA
 5654123 5654124 SGR_1562 SGR_1563     TRUE 0.904 -3.000 0.054 NA N NA
 5654125 5654126 SGR_1564 SGR_1565     TRUE 0.690 19.000 0.061 NA N NA
 5654126 5654127 SGR_1565 SGR_1566     FALSE 0.139 56.000 0.000 NA   NA
 5654127 5654128 SGR_1566 SGR_1567     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654129 5654130 SGR_1568 SGR_1569     TRUE 0.875 3.000 0.048 1.000 N NA
 5654132 5654133 SGR_1571 SGR_1572     FALSE 0.304 222.000 0.050 1.000 Y NA
 5654133 5654134 SGR_1572 SGR_1573     TRUE 0.719 130.000 0.133 1.000 Y NA
 5654134 5654135 SGR_1573 SGR_1574     FALSE 0.180 81.000 0.000 1.000   NA
 5654135 5654136 SGR_1574 SGR_1575     TRUE 0.975 -3.000 0.618 1.000   NA
 5654136 5654137 SGR_1575 SGR_1576     FALSE 0.305 108.000 0.036 1.000   NA
 5654137 5654138 SGR_1576 SGR_1577     FALSE 0.423 91.000 0.111 NA N NA
 5654138 5654139 SGR_1577 SGR_1578     FALSE 0.115 230.000 0.300 NA   NA
 5654139 5654140 SGR_1578 SGR_1579     FALSE 0.214 125.000 0.022 NA   NA
 5654140 5654141 SGR_1579 SGR_1580     FALSE 0.018 219.000 0.000 NA   NA
 5654141 5654142 SGR_1580 SGR_1581     FALSE 0.021 210.000 0.000 NA   NA
 5654143 5654144 SGR_1582 SGR_1583     FALSE 0.333 15.000 0.000 NA   NA
 5654146 5654147 SGR_1585 SGR_1586     TRUE 0.996 -3.000 0.686 0.011 Y NA
 5654147 5654148 SGR_1586 SGR_1587     FALSE 0.018 246.000 0.000 1.000   NA
 5654148 5654149 SGR_1587 SGR_1588     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 5654150 5654151 SGR_1589 SGR_1590     TRUE 0.996 -3.000 0.818 0.046 Y NA
 5654151 5654152 SGR_1590 SGR_1591     TRUE 0.890 51.000 0.364 1.000 Y NA
 5654152 5654153 SGR_1591 SGR_1592     FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 5654156 5654157 SGR_1595 SGR_1596     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5654158 5654159 SGR_1597 SGR_1598     TRUE 0.934 -3.000 0.200 1.000   NA
 5654159 5654160 SGR_1598 SGR_1599     TRUE 0.950 -3.000 0.357 NA   NA
 5654161 5654162 SGR_1600 SGR_1601     TRUE 0.924 -3.000 0.150 1.000   NA
 5654164 5654165 SGR_1603 SGR_1604     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654165 5654166 SGR_1604 SGR_1605     FALSE 0.035 184.000 0.000 NA   NA
 5654166 5654167 SGR_1605 SGR_1606     FALSE 0.083 119.000 0.000 NA   NA
 5654167 5654168 SGR_1606 SGR_1607     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5654168 5654169 SGR_1607 SGR_1608     FALSE 0.043 175.000 0.000 NA   NA
 5654169 5654170 SGR_1608 SGR_1609     FALSE 0.263 22.000 0.000 NA   NA
 5654170 5654171 SGR_1609 SGR_1610     FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 5654171 5654172 SGR_1610 SGR_1611     TRUE 0.907 0.000 0.216 NA   NA
 5654175 5654176 SGR_1614 SGR_1615     FALSE 0.048 169.000 0.000 NA   NA
 5654176 5654177 SGR_1615 SGR_1616     FALSE 0.004 393.000 0.000 1.000   NA
 5654177 5654178 SGR_1616 SGR_1617     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.004 Y NA
 5654178 5654179 SGR_1617 SGR_1618     TRUE 0.980 2.000 0.286 1.000 Y NA
 5654179 5654180 SGR_1618 SGR_1619     TRUE 0.995 -3.000 0.571 0.046 Y NA
 5654180 5654181 SGR_1619 SGR_1620     TRUE 0.983 21.000 0.857 0.046 Y NA
 5654182 5654183 SGR_1621 SGR_1622     FALSE 0.235 95.000 0.000 1.000 N NA
 5654184 5654185 SGR_1623 SGR_1624     TRUE 0.984 -3.000 0.273 NA Y NA
 5654185 5654186 SGR_1624 SGR_1625     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5654186 5654187 SGR_1625 SGR_1626     TRUE 0.969 2.000 0.044 1.000 Y NA
 5654187 5654188 SGR_1626 SGR_1627     TRUE 0.848 10.000 0.133 1.000 N NA
 5654188 5654189 SGR_1627 SGR_1628     TRUE 0.916 -7.000 0.200 1.000   NA
 5654189 5654190 SGR_1628 SGR_1629     TRUE 0.952 -3.000 0.324 1.000   NA
 5654192 5654193 SGR_1631 SGR_1632     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5654194 5654195 SGR_1633 SGR_1634     TRUE 0.707 112.000 0.000 0.095 Y NA
 5654195 5654196 SGR_1634 SGR_1635     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654196 5654197 SGR_1635 SGR_1636     FALSE 0.137 57.000 0.000 NA   NA
 5654197 5654198 SGR_1636 SGR_1637     FALSE 0.080 129.000 0.000 NA   NA
 5654200 5654201 SGR_1639 SGR_1640     TRUE 0.571 -16.000 0.000 NA   NA
 5654202 5654203 SGR_1641 SGR_1642     FALSE 0.194 34.000 0.000 NA   NA
 5654204 5654205 SGR_1643 SGR_1644   aceB2 TRUE 0.711 96.000 0.012 1.000 Y NA
 5654205 5654206 SGR_1644 SGR_1645 aceB2   TRUE 0.983 -3.000 0.750 1.000 N NA
 5654206 5654207 SGR_1645 SGR_1646     FALSE 0.003 431.000 0.000 1.000   NA
 5654209 5654210 SGR_1648 SGR_1649     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654210 5654211 SGR_1649 SGR_1650     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5654211 5654212 SGR_1650 SGR_1651     TRUE 0.971 -3.000 0.541 1.000   NA
 5654212 5654213 SGR_1651 SGR_1652     TRUE 0.961 -3.000 0.486 NA   NA
 5654213 5654214 SGR_1652 SGR_1653     FALSE 0.172 41.000 0.000 NA   NA
 5654215 5654216 SGR_1654 SGR_1655     FALSE 0.060 257.000 0.082 1.000 N NA
 5654217 5654218 SGR_1656 SGR_1657     TRUE 0.988 0.000 0.132 0.002 Y NA
 5654219 5654220 SGR_1658 SGR_1659     TRUE 0.915 4.000 0.364 NA   NA
 5654220 5654221 SGR_1659 SGR_1660     FALSE 0.493 43.000 0.109 NA   NA
 5654221 5654222 SGR_1660 SGR_1661     TRUE 0.911 122.000 1.000 1.000 Y NA
 5654222 5654223 SGR_1661 SGR_1662     FALSE 0.245 179.000 0.143 1.000 N NA
 5654223 5654224 SGR_1662 SGR_1663     FALSE 0.270 91.000 0.024 NA   NA
 5654224 5654225 SGR_1663 SGR_1664     TRUE 0.846 2.000 0.078 NA   NA
 5654225 5654226 SGR_1664 SGR_1665     TRUE 0.837 -3.000 0.012 NA   NA
 5654228 5654229 SGR_1667 SGR_1668     TRUE 0.831 14.000 0.316 NA   NA
 5654229 5654230 SGR_1668 SGR_1669     FALSE 0.002 406.000 0.000 NA   NA
 5654230 5654231 SGR_1669 SGR_1670     TRUE 0.987 6.000 0.727 1.000 Y NA
 5654233 5654234 SGR_1672 SGR_1673     TRUE 0.590 30.000 0.022 1.000 N NA
 5654235 5654236 SGR_1674 SGR_1675     FALSE 0.484 53.000 0.071 NA N NA
 5654241 5654242 SGR_1680 SGR_1681     FALSE 0.446 47.000 0.030 1.000   NA
 5654242 5654243 SGR_1681 SGR_1682     TRUE 0.911 0.000 0.224 NA   NA
 5654243 5654244 SGR_1682 SGR_1683     TRUE 0.626 62.000 0.393 NA   NA
 5654246 5654247 SGR_1685 SGR_1686     FALSE 0.285 178.000 0.214 1.000 N NA
 5654247 5654248 SGR_1686 SGR_1687     FALSE 0.015 407.000 0.000 0.005   NA
 5654248 5654249 SGR_1687 SGR_1688     TRUE 0.990 -3.000 0.810 0.005   NA
 5654251 5654252 SGR_1690 SGR_1691     FALSE 0.256 23.000 0.000 NA   NA
 5654255 5654256 SGR_1694 SGR_1695     TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000 Y NA
 5654257 5654258 SGR_1696 SGR_1697     TRUE 0.936 -3.000 0.273 NA   NA
 5654258 5654259 SGR_1697 SGR_1698   parE FALSE 0.043 175.000 0.000 NA   NA
 5654261 5654262 SGR_1700 SGR_1701 sprV hrdB FALSE 0.341 134.000 0.049 1.000 N NA
 5654262 5654263 SGR_1701 SGR_1702 hrdB whiH FALSE 0.083 338.000 0.000 0.095 Y NA
 5654263 5654264 SGR_1702 SGR_1703 whiH   FALSE 0.459 161.000 0.364 1.000 N NA
 5654264 5654265 SGR_1703 SGR_1704     TRUE 0.564 145.000 0.455 1.000 N NA
 5654265 5654266 SGR_1704 SGR_1705     FALSE 0.258 173.000 0.250 NA   NA
 5654266 5654267 SGR_1705 SGR_1706     FALSE 0.017 300.000 0.023 NA   NA
 5654269 5654270 SGR_1708 SGR_1709     FALSE 0.270 63.000 0.004 NA   NA
 5654270 5654271 SGR_1709 SGR_1710     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 5654271 5654272 SGR_1710 SGR_1711     FALSE 0.002 472.000 0.000 NA   NA
 5654272 5654273 SGR_1711 SGR_1712     TRUE 0.780 13.000 0.105 NA N NA
 5654273 5654274 SGR_1712 SGR_1713     FALSE 0.136 58.000 0.000 NA   NA
 5654276 5654277 SGR_1715 SGR_1716     FALSE 0.169 175.000 0.032 NA N NA
 5654279 5654280 SGR_1718 SGR_1719     TRUE 0.527 39.000 0.017 1.000 N NA
 5654280 5654281 SGR_1719 SGR_1720     FALSE 0.292 61.000 0.000 1.000 N NA
 5654281 5654282 SGR_1720 SGR_1721     FALSE 0.513 86.000 0.163 1.000 N NA
 5654282 5654283 SGR_1721 SGR_1722     TRUE 0.651 29.000 0.070 1.000 N NA
 5654285 5654286 SGR_1724 SGR_1725     FALSE 0.226 132.000 0.005 1.000   NA
 5654286 5654287 SGR_1725 SGR_1726   relA2 FALSE 0.318 182.000 0.364 1.000   NA
 5654287 5654288 SGR_1726 SGR_1727 relA2   FALSE 0.176 172.000 0.002 1.000 N NA
 5654288 5654289 SGR_1727 SGR_1728     FALSE 0.253 75.000 0.006 NA   NA
 5654289 5654290 SGR_1728 SGR_1729   miaA FALSE 0.230 102.000 0.013 NA   NA
 5654292 5654293 SGR_1731 SGR_1732     FALSE 0.064 215.000 0.005 1.000   NA
 5654295 5654296 SGR_1734 SGR_1735     TRUE 0.972 20.000 0.733 1.000 Y NA
 5654297 5654298 SGR_1736 SGR_1737     TRUE 0.907 33.000 0.286 1.000 Y NA
 5654298 5654299 SGR_1737 SGR_1738     TRUE 0.659 191.000 0.286 0.046 Y NA
 5654299 5654300 SGR_1738 SGR_1739     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.005 Y NA
 5654300 5654301 SGR_1739 SGR_1740     FALSE 0.103 177.000 0.000 1.000 N NA
 5654301 5654302 SGR_1740 SGR_1741     FALSE 0.029 222.000 0.000 1.000   NA
 5654302 5654303 SGR_1741 SGR_1742     TRUE 0.901 -3.000 0.119 NA   NA
 5654303 5654304 SGR_1742 SGR_1743     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 5654305 5654306 SGR_1744 SGR_1745   recA TRUE 0.913 4.000 0.296 1.000   NA
 5654306 5654307 SGR_1745 SGR_1746 recA   FALSE 0.002 390.000 0.000 NA   NA
 5654308 5654309 SGR_1747 SGR_1748     TRUE 0.976 -3.000 0.571 1.000 N NA
 5654309 5654310 SGR_1748 SGR_1749     TRUE 0.730 -7.000 0.000 NA N NA
 5654310 5654311 SGR_1749 SGR_1750     FALSE 0.110 155.000 0.000 NA N NA
 5654312 5654313 SGR_1751 SGR_1752     FALSE 0.163 45.000 0.000 NA   NA
 5654315 5654316 SGR_1754 SGR_1755     FALSE 0.060 219.000 0.038 NA   NA
 5654318 5654319 SGR_1757 SGR_1758     TRUE 0.976 -3.000 0.675 NA   NA
 5654319 5654320 SGR_1758 SGR_1759     FALSE 0.409 96.000 0.111 NA N NA
 5654321 5654322 SGR_1760 SGR_1761     FALSE 0.203 211.000 0.352 1.000   NA
 5654322 5654323 SGR_1761 SGR_1762     TRUE 0.553 37.000 0.029 1.000 N NA
 5654324 5654325 SGR_1763 SGR_1764     FALSE 0.018 219.000 0.000 NA   NA
 5654325 5654326 SGR_1764 SGR_1765     TRUE 0.587 -7.000 0.000 NA   NA
 5654326 5654327 SGR_1765 SGR_1766     FALSE 0.014 265.000 0.000 1.000   NA
 5654327 5654328 SGR_1766 SGR_1767     FALSE 0.338 77.000 0.057 NA   NA
 5654328 5654329 SGR_1767 SGR_1768     TRUE 0.909 -3.000 0.151 NA   NA
 5654329 5654330 SGR_1768 SGR_1769     TRUE 0.935 -3.000 0.132 1.000 N NA
 5654330 5654331 SGR_1769 SGR_1770     FALSE 0.166 175.000 0.037 1.000   NA
 5654331 5654332 SGR_1770 SGR_1771     FALSE 0.050 304.000 0.051 0.048   NA
 5654332 5654333 SGR_1771 SGR_1772     FALSE 0.236 151.000 0.039 1.000   NA
 5654333 5654334 SGR_1772 SGR_1773     FALSE 0.065 245.000 0.000 0.020   NA
 5654336 5654337 SGR_tRNA05 SGR_5SrRNA1   rrnA3 FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 5654337 5654338 SGR_5SrRNA1 SGR_23SrRNA1 rrnA3 rrnA2 FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 5654338 5654339 SGR_23SrRNA1 SGR_16SrRNA1 rrnA2 rrnA1 FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5654339 5654340 SGR_16SrRNA1 SGR_1775 rrnA1   FALSE 0.001 652.000 0.000 NA   NA
 5654340 5654341 SGR_1775 SGR_1776     FALSE 0.459 147.000 0.350 1.000   NA
 5654341 5654342 SGR_1776 SGR_1777     FALSE 0.249 153.000 0.012 1.000 N NA
 5654343 5654344 SGR_1778 SGR_1779     TRUE 0.758 95.000 0.833 NA   NA
 5654345 5654346 SGR_1780 SGR_1781     TRUE 0.534 11.000 0.000 1.000   NA
 5654346 5654347 SGR_1781 SGR_1782     FALSE 0.497 36.000 0.032 1.000   NA
 5654347 5654348 SGR_1782 SGR_1783     TRUE 0.928 -3.000 0.171 1.000   NA
 5654348 5654349 SGR_1783 SGR_1784     FALSE 0.122 288.000 0.011 1.000 Y NA
 5654349 5654350 SGR_1784 SGR_1785     FALSE 0.008 344.000 0.002 NA   NA
 5654352 5654353 SGR_1787 SGR_1788     TRUE 0.765 37.000 0.500 NA   NA
 5654353 5654354 SGR_1788 SGR_1789     TRUE 0.763 73.000 0.750 NA   NA
 5654354 5654355 SGR_1789 SGR_1790     TRUE 0.810 41.000 0.667 NA   NA
 5654355 5654356 SGR_1790 SGR_1791     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5654356 5654357 SGR_1791 SGR_1792     FALSE 0.054 163.000 0.000 NA   NA
 5654357 5654358 SGR_1792 SGR_1793     TRUE 0.875 14.000 0.455 NA   NA
 5654359 5654360 SGR_1794 SGR_1795     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5654360 5654361 SGR_1795 SGR_1796   bldB FALSE 0.404 81.000 0.143 NA   NA
 5654361 5654362 SGR_1796 SGR_1797 bldB   FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 5654362 5654363 SGR_1797 SGR_1798     FALSE 0.047 220.000 0.000 1.000 N NA
 5654363 5654364 SGR_1798 SGR_1799     TRUE 0.987 4.000 0.357 0.046 Y NA
 5654364 5654365 SGR_1799 SGR_1800     TRUE 0.996 -3.000 0.714 0.046 Y NA
 5654365 5654366 SGR_1800 SGR_1801     TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5654366 5654367 SGR_1801 SGR_1802     TRUE 0.994 -3.000 0.444 0.004 Y NA
 5654367 5654368 SGR_1802 SGR_1803     FALSE 0.067 201.000 0.000 1.000 N NA
 5654368 5654369 SGR_1803 SGR_1804     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654370 5654371 SGR_1805 SGR_1806     FALSE 0.256 50.000 0.000 NA N NA
 5654371 5654372 SGR_1806 SGR_1807     FALSE 0.415 44.000 0.008 1.000   NA
 5654372 5654373 SGR_1807 SGR_1808   truB FALSE 0.015 262.000 0.000 1.000   NA
 5654373 5654374 SGR_1808 SGR_1809 truB   TRUE 0.987 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 5654374 5654375 SGR_1809 SGR_1810     TRUE 0.527 36.000 0.113 NA   NA
 5654375 5654376 SGR_1810 SGR_1811     FALSE 0.113 200.000 0.102 NA   NA
 5654376 5654377 SGR_1811 SGR_1812     FALSE 0.337 150.000 0.171 NA N NA
 5654377 5654378 SGR_1812 SGR_1813     TRUE 0.777 114.000 0.323 NA Y NA
 5654378 5654379 SGR_1813 SGR_1814     TRUE 0.966 3.000 0.759 NA   NA
 5654380 5654381 SGR_1815 SGR_1816     TRUE 0.887 -3.000 0.073 NA   NA
 5654381 5654382 SGR_1816 SGR_1817     FALSE 0.492 50.000 0.073 1.000   NA
 5654383 5654384 SGR_1818 SGR_1819 proS   FALSE 0.324 70.000 0.006 1.000   NA
 5654384 5654385 SGR_1819 SGR_1820     TRUE 0.645 70.000 0.114 0.016   NA
 5654385 5654386 SGR_1820 SGR_1821   gcpE FALSE 0.110 187.000 0.009 1.000   NA
 5654386 5654387 SGR_1821 SGR_1822 gcpE   FALSE 0.247 171.000 0.072 1.000 N NA
 5654387 5654388 SGR_1822 SGR_1823     TRUE 0.928 -3.000 0.088 1.000 N NA
 5654388 5654389 SGR_1823 SGR_1824     FALSE 0.024 258.000 0.000 1.000 N NA
 5654389 5654390 SGR_1824 SGR_1825     FALSE 0.261 77.000 0.000 1.000 N NA
 5654390 5654391 SGR_1825 SGR_1826     FALSE 0.029 245.000 0.000 1.000 N NA
 5654391 5654392 SGR_1826 SGR_1827     FALSE 0.031 223.000 0.000 NA N NA
 5654392 5654393 SGR_1827 SGR_1828     FALSE 0.370 186.000 0.571 NA   NA
 5654394 5654395 SGR_1829 SGR_1830     FALSE 0.279 149.000 0.083 1.000   NA
 5654396 5654397 SGR_1831 SGR_1832     FALSE 0.348 90.000 0.086 NA   NA
 5654397 5654398 SGR_1832 SGR_1833     FALSE 0.233 148.000 0.074 NA   NA
 5654398 5654399 SGR_1833 SGR_1834     TRUE 0.958 15.000 0.353 1.000 Y NA
 5654399 5654400 SGR_1834 SGR_1835     TRUE 0.995 0.000 0.738 0.046 Y NA
 5654400 5654401 SGR_1835 SGR_1836     TRUE 0.986 -3.000 0.262 1.000 Y NA
 5654401 5654402 SGR_1836 SGR_1837     TRUE 0.858 104.000 0.500 1.000 Y NA
 5654402 5654403 SGR_1837 SGR_1838     TRUE 0.676 63.000 0.350 1.000 N NA
 5654406 5654407 SGR_1841 SGR_1842     TRUE 0.728 23.000 0.125 1.000 N NA
 5654407 5654408 SGR_1842 SGR_1843     FALSE 0.112 83.000 0.000 NA   NA
 5654409 5654410 SGR_1844 SGR_1845     FALSE 0.477 152.000 0.333 1.000 N NA
 5654411 5654412 SGR_1846 SGR_1847     TRUE 0.963 3.000 0.590 1.000 N NA
 5654412 5654413 SGR_1847 SGR_1848     FALSE 0.050 216.000 0.000 1.000 N NA
 5654413 5654414 SGR_1848 SGR_1849     TRUE 0.749 42.000 0.500 NA   NA
 5654415 5654416 SGR_1850 SGR_1851     FALSE 0.082 120.000 0.000 NA   NA
 5654416 5654417 SGR_1851 SGR_1852     TRUE 0.921 -3.000 0.200 NA   NA
 5654418 5654419 SGR_1853 SGR_1854     TRUE 0.991 -6.000 0.333 0.028 Y NA
 5654420 5654421 SGR_1855 SGR_1856     TRUE 0.925 6.000 0.112 0.045 N NA
 5654421 5654422 SGR_1856 SGR_1857     TRUE 0.854 81.000 0.697 0.045 N NA
 5654422 5654423 SGR_1857 SGR_1858     FALSE 0.007 330.000 0.000 1.000   NA
 5654423 5654424 SGR_1858 SGR_1859     FALSE 0.297 110.000 0.033 1.000   NA
 5654424 5654425 SGR_1859 SGR_1860     TRUE 0.909 0.000 0.076 1.000 N NA
 5654425 5654426 SGR_1860 SGR_1861     TRUE 0.691 120.000 0.626 1.000 N NA
 5654426 5654427 SGR_1861 SGR_1862     FALSE 0.483 162.000 0.416 1.000 N NA
 5654427 5654428 SGR_1862 SGR_1863     TRUE 0.903 100.000 0.748 1.000 Y NA
 5654430 5654431 SGR_1865 SGR_1866   whiG FALSE 0.424 124.000 0.025 0.094   NA
 5654431 5654432 SGR_1866 SGR_1867 whiG   FALSE 0.042 255.000 0.003 1.000 N NA
 5654432 5654433 SGR_1867 SGR_1868     TRUE 0.906 -3.000 0.021 1.000 N NA
 5654434 5654435 SGR_1869 SGR_1870     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654435 5654436 SGR_1870 SGR_1871     TRUE 0.960 -3.000 0.455 NA   NA
 5654436 5654437 SGR_1871 SGR_1872     TRUE 0.971 -3.000 0.300 0.047   NA
 5654439 5654440 SGR_1874 SGR_1875     FALSE 0.034 186.000 0.000 NA   NA
 5654441 5654442 SGR_1876 SGR_1877     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654442 5654443 SGR_1877 SGR_1878     FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 5654443 5654444 SGR_1878 SGR_1879     FALSE 0.173 159.000 0.036 NA   NA
 5654444 5654445 SGR_1879 SGR_1880     FALSE 0.312 66.000 0.024 NA   NA
 5654445 5654446 SGR_1880 SGR_1881     TRUE 0.908 -3.000 0.077 1.000   NA
 5654446 5654447 SGR_1881 SGR_1882     TRUE 0.753 51.000 0.167 0.001   NA
 5654447 5654448 SGR_1882 SGR_1883     TRUE 0.991 -97.000 0.333 0.001 Y NA
 5654448 5654449 SGR_1883 SGR_1884     TRUE 0.996 -7.000 0.833 0.001 Y NA
 5654449 5654450 SGR_1884 SGR_1885     FALSE 0.398 67.000 0.005 1.000 N NA
 5654450 5654451 SGR_1885 SGR_1886     TRUE 0.850 130.000 0.567 1.000 Y NA
 5654451 5654452 SGR_1886 SGR_1887     TRUE 0.992 0.000 0.672 1.000 Y NA
 5654452 5654453 SGR_1887 SGR_1888     FALSE 0.480 133.000 0.324 1.000   NA
 5654453 5654454 SGR_1888 SGR_1889     TRUE 0.937 3.000 0.385 1.000   NA
 5654454 5654455 SGR_1889 SGR_1890     FALSE 0.130 158.000 0.002 NA   NA
 5654457 5654458 SGR_1892 SGR_1893     FALSE 0.293 133.000 0.010 1.000 N NA
 5654458 5654459 SGR_1893 SGR_1894     TRUE 0.592 30.000 0.024 1.000 N NA
 5654459 5654460 SGR_1894 SGR_1895     TRUE 0.977 -3.000 0.600 1.000 N NA
 5654460 5654461 SGR_1895 SGR_1896     FALSE 0.016 413.000 0.200 1.000   NA
 5654465 5654466 SGR_1900 SGR_1901 glkP   FALSE 0.073 206.000 0.003 1.000   NA
 5654466 5654467 SGR_1901 SGR_1902     FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 5654467 5654468 SGR_1902 SGR_1903     FALSE 0.002 438.000 0.000 NA   NA
 5654472 5654473 SGR_1907 SGR_1908     FALSE 0.373 122.000 0.068 1.000 N NA
 5654473 5654474 SGR_1908 SGR_1909     TRUE 0.704 20.000 0.044 1.000 N NA
 5654474 5654475 SGR_1909 SGR_1910     TRUE 0.952 3.000 0.599 NA   NA
 5654475 5654476 SGR_1910 SGR_1911     FALSE 0.145 161.000 0.014 NA   NA
 5654476 5654477 SGR_1911 SGR_1912     FALSE 0.260 117.000 0.055 NA   NA
 5654477 5654478 SGR_1912 SGR_1913     TRUE 0.814 27.000 0.367 1.000 N NA
 5654478 5654479 SGR_1913 SGR_1914     FALSE 0.262 225.000 0.008 1.000 Y NA
 5654479 5654480 SGR_1914 SGR_1915     FALSE 0.452 50.000 0.040 1.000   NA
 5654482 5654483 SGR_1917 SGR_1918     TRUE 0.969 9.000 0.010 0.003 Y NA
 5654484 5654485 SGR_1919 SGR_1920     TRUE 0.776 21.000 0.329 NA   NA
 5654486 5654487 SGR_1921 SGR_1922     TRUE 0.624 35.000 0.088 1.000 N NA
 5654487 5654488 SGR_1922 SGR_1923     TRUE 0.965 -3.000 0.380 1.000 N NA
 5654489 5654490 SGR_1924 SGR_1925     TRUE 0.730 11.000 0.064 NA   NA
 5654491 5654492 SGR_1926 SGR_1927     FALSE 0.255 143.000 0.091 NA   NA
 5654492 5654493 SGR_1927 SGR_1928     FALSE 0.250 105.000 0.029 NA   NA
 5654493 5654494 SGR_1928 SGR_1929     TRUE 0.992 3.000 0.477 0.000 Y NA
 5654496 5654497 SGR_tRNA06 SGR_tRNA07     FALSE 0.271 21.000 0.000 NA   NA
 5654497 5654498 SGR_tRNA07 SGR_tRNA08     FALSE 0.366 13.000 0.000 NA   NA
 5654498 5654499 SGR_tRNA08 SGR_tRNA09     FALSE 0.129 63.000 0.000 NA   NA
 5654499 5654500 SGR_tRNA09 SGR_tRNA10     FALSE 0.177 39.000 0.000 NA   NA
 5654500 5654501 SGR_tRNA10 SGR_1931     FALSE 0.108 89.000 0.000 NA   NA
 5654501 5654502 SGR_1931 SGR_1932   gltS FALSE 0.319 100.000 0.035 1.000   NA
 5654502 5654503 SGR_1932 SGR_1933 gltS   TRUE 0.905 -7.000 0.070 1.000 N NA
 5654503 5654504 SGR_1933 SGR_1934     FALSE 0.256 94.000 0.020 NA   NA
 5654505 5654506 SGR_1935 SGR_1936     TRUE 0.573 1.000 0.000 NA   NA
 5654506 5654507 SGR_1936 SGR_1937     FALSE 0.075 136.000 0.000 NA   NA
 5654507 5654508 SGR_1937 SGR_1938     FALSE 0.179 38.000 0.000 NA   NA
 5654508 5654509 SGR_1938 SGR_1939     FALSE 0.005 362.000 0.000 1.000   NA
 5654509 5654510 SGR_1939 SGR_1940     FALSE 0.398 11.000 0.000 NA   NA
 5654510 5654511 SGR_1940 SGR_1941     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5654511 5654512 SGR_1941 SGR_1942     FALSE 0.179 38.000 0.000 NA   NA
 5654513 5654514 SGR_1943 SGR_1944     TRUE 0.814 71.000 1.000 NA   NA
 5654514 5654515 SGR_1944 SGR_1945     FALSE 0.008 265.000 0.000 NA   NA
 5654516 5654517 SGR_1946 SGR_1947     FALSE 0.035 184.000 0.000 NA   NA
 5654520 5654521 SGR_1950 SGR_1951     TRUE 0.678 79.000 0.000 1.000 Y NA
 5654521 5654522 SGR_1951 SGR_1952     TRUE 0.989 2.000 0.600 1.000 Y NA
 5654522 5654523 SGR_1952 SGR_1953     TRUE 0.987 -3.000 0.044 0.045 Y NA
 5654524 5654525 SGR_1954 SGR_1955     FALSE 0.032 188.000 0.000 NA   NA
 5654528 5654529 SGR_1958 SGR_1959     FALSE 0.104 153.000 0.000 1.000   NA
 5654531 5654532 SGR_1961 SGR_1962     FALSE 0.009 259.000 0.000 NA   NA
 5654532 5654533 SGR_1962 SGR_1963     FALSE 0.011 246.000 0.000 NA   NA
 5654533 5654534 SGR_1963 SGR_1964     FALSE 0.165 94.000 0.000 1.000   NA
 5654536 5654537 SGR_1966 SGR_1967     FALSE 0.111 84.000 0.000 NA   NA
 5654538 5654539 SGR_1968 SGR_1969     FALSE 0.083 119.000 0.000 NA   NA
 5654540 5654541 SGR_1970 SGR_1971     FALSE 0.024 204.000 0.000 NA   NA
 5654541 5654542 SGR_1971 SGR_1972     FALSE 0.003 355.000 0.000 NA   NA
 5654542 5654543 SGR_1972 SGR_1973     TRUE 0.783 36.000 0.400 1.000 N NA
 5654543 5654544 SGR_1973 SGR_1974     TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5654544 5654545 SGR_1974 SGR_1975     TRUE 0.938 63.000 0.571 0.045 Y NA
 5654545 5654546 SGR_1975 SGR_1976     TRUE 0.993 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 5654546 5654547 SGR_1976 SGR_1977     TRUE 0.960 29.000 0.727 1.000 Y NA
 5654547 5654548 SGR_1977 SGR_1978     TRUE 0.679 89.000 0.455 1.000 N NA
 5654548 5654549 SGR_1978 SGR_1979     FALSE 0.015 301.000 0.000 1.000 N NA
 5654549 5654550 SGR_1979 SGR_1980     FALSE 0.013 309.000 0.000 1.000 N NA
 5654550 5654551 SGR_1980 SGR_1981     TRUE 0.969 -3.000 0.444 1.000 N NA
 5654551 5654552 SGR_1981 SGR_1982     FALSE 0.401 178.000 0.000 1.000 Y NA
 5654552 5654553 SGR_1982 SGR_1983     FALSE 0.199 257.000 0.083 1.000 Y NA
 5654553 5654554 SGR_1983 SGR_1984     FALSE 0.221 111.000 0.016 NA   NA
 5654554 5654555 SGR_1984 SGR_1985     FALSE 0.004 322.000 0.000 NA   NA
 5654555 5654556 SGR_1985 SGR_1986   sprE FALSE 0.020 243.000 0.000 1.000   NA
 5654558 5654559 SGR_1988 SGR_1989     TRUE 0.532 80.000 0.181 1.000 N NA
 5654561 5654562 SGR_1991 SGR_1992     FALSE 0.112 83.000 0.000 NA   NA
 5654562 5654563 SGR_1992 SGR_1993     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654564 5654565 SGR_1994 SGR_1995     FALSE 0.350 14.000 0.000 NA   NA
 5654566 5654567 SGR_1996 SGR_1997     FALSE 0.002 386.000 0.000 NA   NA
 5654567 5654568 SGR_1997 SGR_1998     FALSE 0.107 299.000 0.006 1.000 Y NA
 5654568 5654569 SGR_1998 SGR_1999     TRUE 0.833 111.000 0.071 0.001 Y NA
 5654569 5654570 SGR_1999 SGR_2000     TRUE 0.969 23.000 0.380 0.001 Y NA
 5654570 5654571 SGR_2000 SGR_2001     FALSE 0.045 223.000 0.000 1.000 N NA
 5654571 5654572 SGR_2001 SGR_2002     FALSE 0.005 446.000 0.000 1.000 N NA
 5654573 5654574 SGR_2003 SGR_2004     FALSE 0.087 111.000 0.000 NA   NA
 5654576 5654577 SGR_2006 SGR_2007     FALSE 0.015 412.000 0.086 1.000 N NA
 5654577 5654578 SGR_2007 SGR_2008     TRUE 0.719 18.000 0.171 NA   NA
 5654579 5654580 SGR_2009 SGR_2010     TRUE 0.925 3.000 0.375 NA   NA
 5654580 5654581 SGR_2010 SGR_2011     FALSE 0.156 204.000 0.250 NA   NA
 5654581 5654582 SGR_2011 SGR_2012     FALSE 0.180 214.000 0.375 NA   NA
 5654582 5654583 SGR_2012 SGR_2013     TRUE 0.956 -22.000 0.500 1.000   NA
 5654583 5654584 SGR_2013 SGR_2014     FALSE 0.064 181.000 0.000 1.000   NA
 5654584 5654585 SGR_2014 SGR_2015     FALSE 0.185 135.000 0.000 1.000 N NA
 5654585 5654586 SGR_2015 SGR_2016   gatB FALSE 0.175 140.000 0.000 1.000 N NA
 5654586 5654587 SGR_2016 SGR_2017 gatB   TRUE 0.543 17.000 0.006 NA   NA
 5654587 5654588 SGR_2017 SGR_2018   gatA TRUE 0.827 -3.000 0.006 NA   NA
 5654588 5654589 SGR_2018 SGR_2019 gatA gatC TRUE 0.992 6.000 0.643 0.001 Y NA
 5654589 5654590 SGR_2019 SGR_2020 gatC   FALSE 0.028 289.000 0.003 1.000 N NA
 5654590 5654591 SGR_2020 SGR_2021     FALSE 0.030 287.000 0.006 1.000 N NA
 5654591 5654592 SGR_2021 SGR_2022     FALSE 0.497 33.000 0.020 1.000   NA
 5654592 5654593 SGR_2022 SGR_2023     FALSE 0.505 47.000 0.074 1.000   NA
 5654593 5654594 SGR_2023 SGR_2024     FALSE 0.037 259.000 0.078 NA   NA
 5654595 5654596 SGR_2025 SGR_2026     FALSE 0.116 75.000 0.000 NA   NA
 5654599 5654600 SGR_2029 SGR_2030     FALSE 0.034 186.000 0.000 NA   NA
 5654600 5654601 SGR_2030 SGR_2031     FALSE 0.113 80.000 0.000 NA   NA
 5654602 5654603 SGR_2032 SGR_2033     FALSE 0.153 112.000 0.000 NA N NA
 5654603 5654604 SGR_2033 SGR_2034     TRUE 0.664 23.000 0.080 NA N NA
 5654605 5654606 SGR_2035 SGR_2036     FALSE 0.354 67.000 0.053 NA   NA
 5654606 5654607 SGR_2036 SGR_2037     FALSE 0.295 19.000 0.000 NA   NA
 5654607 5654608 SGR_2037 SGR_2038     TRUE 0.995 -3.000 0.542 0.003 Y NA
 5654608 5654609 SGR_2038 SGR_2039     TRUE 0.956 7.000 0.077 1.000 Y NA
 5654609 5654610 SGR_2039 SGR_2040     TRUE 0.994 2.000 0.779 0.045 Y NA
 5654610 5654611 SGR_2040 SGR_2041     TRUE 0.903 38.000 0.072 0.045 Y NA
 5654611 5654612 SGR_2041 SGR_2042     FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 5654612 5654613 SGR_2042 SGR_2043     FALSE 0.167 261.000 0.714 NA   NA
 5654613 5654614 SGR_2043 SGR_2044     FALSE 0.119 71.000 0.000 NA   NA
 5654615 5654616 SGR_2045 SGR_2046     TRUE 0.818 122.000 0.056 0.001 Y NA
 5654616 5654617 SGR_2046 SGR_2047     TRUE 0.925 20.000 0.162 1.000 Y NA
 5654617 5654618 SGR_2047 SGR_2048     FALSE 0.305 238.000 0.217 1.000 Y NA
 5654620 5654621 SGR_2050 SGR_2051     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5654621 5654622 SGR_2051 SGR_2052     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654622 5654623 SGR_2052 SGR_2053     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654623 5654624 SGR_2053 SGR_2054     TRUE 0.711 -7.000 0.000 1.000   NA
 5654625 5654626 SGR_2055 SGR_2056     TRUE 0.896 -3.000 0.100 NA   NA
 5654626 5654627 SGR_2056 SGR_2057     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5654627 5654628 SGR_2057 SGR_2058     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 5654628 5654629 SGR_2058 SGR_2059     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 5654629 5654630 SGR_2059 SGR_2060     FALSE 0.033 187.000 0.000 NA   NA
 5654630 5654631 SGR_2060 SGR_2061     FALSE 0.060 156.000 0.000 NA   NA
 5654631 5654632 SGR_2061 SGR_2062     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5654635 5654636 SGR_2065 SGR_2066     FALSE 0.001 707.000 0.000 NA   NA
 5654636 5654637 SGR_2066 SGR_2067     TRUE 0.827 63.000 1.000 NA   NA
 5654637 5654638 SGR_2067 SGR_2068     TRUE 0.947 -3.000 0.333 NA   NA
 5654638 5654639 SGR_2068 SGR_2069     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5654639 5654640 SGR_2069 SGR_2070     TRUE 0.932 5.000 0.500 NA   NA
 5654640 5654641 SGR_2070 SGR_2071     TRUE 0.604 85.000 0.429 NA   NA
 5654641 5654642 SGR_2071 SGR_2072     TRUE 0.563 59.000 0.286 NA   NA
 5654642 5654643 SGR_2072 SGR_2073     TRUE 0.947 -3.000 0.333 NA   NA
 5654643 5654644 SGR_2073 SGR_2074     FALSE 0.343 106.000 0.133 NA   NA
 5654644 5654645 SGR_2074 SGR_2075     TRUE 0.905 -3.000 0.133 NA   NA
 5654645 5654646 SGR_2075 SGR_2076     TRUE 0.916 0.000 0.250 NA   NA
 5654646 5654647 SGR_2076 SGR_2077     TRUE 0.932 -3.000 0.250 NA   NA
 5654647 5654648 SGR_2077 SGR_2078     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5654648 5654649 SGR_2078 SGR_2079     FALSE 0.002 405.000 0.000 NA   NA
 5654649 5654650 SGR_2079 SGR_2080     FALSE 0.013 273.000 0.000 1.000   NA
 5654650 5654651 SGR_2080 SGR_2081     FALSE 0.262 42.000 0.000 1.000   NA
 5654652 5654653 SGR_2082 SGR_2083     FALSE 0.248 89.000 0.000 1.000 N NA
 5654653 5654654 SGR_2083 SGR_2084   cabB FALSE 0.126 135.000 0.000 1.000   NA
 5654654 5654655 SGR_2084 SGR_2085 cabB   FALSE 0.271 39.000 0.000 1.000   NA
 5654655 5654656 SGR_2085 SGR_2086     FALSE 0.002 451.000 0.000 NA   NA
 5654656 5654657 SGR_2086 SGR_2087     FALSE 0.023 287.000 0.043 NA   NA
 5654657 5654658 SGR_2087 SGR_2088     FALSE 0.366 94.000 0.128 NA   NA
 5654658 5654659 SGR_2088 SGR_2089     FALSE 0.299 197.000 0.500 NA   NA
 5654660 5654661 SGR_2090 SGR_2091     FALSE 0.120 207.000 0.041 1.000 N NA
 5654661 5654662 SGR_2091 SGR_2092     TRUE 0.993 -3.000 0.378 0.010 Y NA
 5654664 5654665 SGR_2094 SGR_2095   sgmA FALSE 0.004 385.000 0.000 1.000   NA
 5654666 5654667 SGR_2096 SGR_2097   glgP FALSE 0.024 232.000 0.000 1.000   NA
 5654668 5654669 SGR_2098 SGR_2099   treS TRUE 0.995 -3.000 0.544 0.009 Y NA
 5654669 5654670 SGR_2099 SGR_2100 treS   FALSE 0.221 231.000 0.013 NA Y NA
 5654670 5654671 SGR_2100 SGR_2101   glgB TRUE 0.718 81.000 0.019 NA Y NA
 5654672 5654673 SGR_2102 SGR_2103     FALSE 0.135 118.000 0.000 1.000   NA
 5654673 5654674 SGR_2103 SGR_2104     TRUE 0.964 -3.000 0.450 1.000   NA
 5654674 5654675 SGR_2104 SGR_2105     FALSE 0.078 134.000 0.000 NA   NA
 5654675 5654676 SGR_2105 SGR_2106     FALSE 0.011 244.000 0.000 NA   NA
 5654677 5654678 SGR_2107 SGR_2108     TRUE 0.988 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5654678 5654679 SGR_2108 SGR_2109     FALSE 0.062 182.000 0.000 1.000   NA
 5654681 5654682 SGR_2111 SGR_2112     TRUE 0.550 54.000 0.185 1.000   NA
 5654682 5654683 SGR_2112 SGR_2113     FALSE 0.480 75.000 0.086 1.000 N NA
 5654684 5654685 SGR_2114 SGR_2115     TRUE 0.958 -10.000 0.571 NA   NA
 5654685 5654686 SGR_2115 SGR_2116     TRUE 0.694 97.000 0.667 NA   NA
 5654690 5654691 SGR_2120 SGR_2121     FALSE 0.310 98.000 0.066 NA   NA
 5654691 5654692 SGR_2121 SGR_2122     FALSE 0.353 68.000 0.055 NA   NA
 5654692 5654693 SGR_2122 SGR_2123     TRUE 0.706 11.000 0.043 NA   NA
 5654694 5654695 SGR_2124 SGR_2125     FALSE 0.053 190.000 0.000 1.000   NA
 5654696 5654697 SGR_2126 SGR_2127     TRUE 0.955 4.000 0.667 NA   NA
 5654697 5654698 SGR_2127 SGR_2128     FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5654698 5654699 SGR_2128 SGR_2129     TRUE 0.846 -3.000 0.018 NA   NA
 5654700 5654701 SGR_2130 SGR_2131     TRUE 0.979 0.000 1.000 NA   NA
 5654701 5654702 SGR_2131 SGR_2132     TRUE 0.979 -3.000 0.800 NA   NA
 5654702 5654703 SGR_2132 SGR_2133     FALSE 0.443 150.000 0.400 NA   NA
 5654704 5654705 SGR_2134 SGR_2135     TRUE 0.995 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 5654707 5654708 SGR_2137 SGR_2138     FALSE 0.516 71.000 0.131 1.000 N NA
 5654709 5654710 SGR_2139 SGR_2140     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5654710 5654711 SGR_2140 SGR_2141     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 5654711 5654712 SGR_2141 SGR_2142     FALSE 0.409 84.000 0.154 NA   NA
 5654712 5654713 SGR_2142 SGR_2143     TRUE 0.981 -3.000 0.833 NA   NA
 5654713 5654714 SGR_2143 SGR_2144     FALSE 0.506 165.000 0.625 NA   NA
 5654714 5654715 SGR_2144 SGR_2145     TRUE 0.972 -3.000 0.625 NA   NA
 5654720 5654721 SGR_2150 SGR_2151     FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5654721 5654722 SGR_2151 SGR_2152     FALSE 0.032 291.000 0.028 1.000 N NA
 5654722 5654723 SGR_2152 SGR_2153     FALSE 0.359 150.000 0.143 1.000 N NA
 5654724 5654725 SGR_2154 SGR_2155     TRUE 0.987 8.000 0.833 1.000 Y NA
 5654725 5654726 SGR_2155 SGR_2156     TRUE 0.669 14.000 0.013 1.000   NA
 5654728 5654729 SGR_2158 SGR_2159     TRUE 0.996 -3.000 0.684 0.028 Y NA
 5654729 5654730 SGR_2159 SGR_2160     FALSE 0.423 154.000 0.263 1.000 N NA
 5654731 5654732 SGR_2161 SGR_2162     FALSE 0.253 128.000 0.054 NA   NA
 5654732 5654733 SGR_2162 SGR_2163     TRUE 0.946 110.000 0.837 0.002 Y NA
 5654733 5654734 SGR_2163 SGR_2164     TRUE 0.996 0.000 0.724 0.002 Y NA
 5654734 5654735 SGR_2164 SGR_2165     TRUE 0.995 4.000 0.846 0.002 Y NA
 5654735 5654736 SGR_2165 SGR_2166     TRUE 0.939 136.000 0.864 0.002 Y NA
 5654736 5654737 SGR_2166 SGR_2167     TRUE 0.989 -3.000 0.067 0.002 Y NA
 5654737 5654738 SGR_2167 SGR_2168     TRUE 0.935 5.000 0.121 0.002   NA
 5654738 5654739 SGR_2168 SGR_2169     TRUE 0.825 95.000 0.628 0.002   NA
 5654739 5654740 SGR_2169 SGR_2170     FALSE 0.018 219.000 0.000 NA   NA
 5654740 5654741 SGR_2170 SGR_2171     FALSE 0.025 268.000 0.026 NA   NA
 5654741 5654742 SGR_2171 SGR_2172     FALSE 0.185 192.000 0.105 1.000 N NA
 5654742 5654743 SGR_2172 SGR_2173     FALSE 0.399 152.000 0.217 1.000 N NA
 5654743 5654744 SGR_2173 SGR_2174     TRUE 0.918 -3.000 0.103 NA N NA
 5654744 5654745 SGR_2174 SGR_2175     TRUE 0.911 53.000 0.583 NA Y NA
 5654745 5654746 SGR_2175 SGR_2176     TRUE 0.834 47.000 0.069 1.000 Y NA
 5654746 5654747 SGR_2176 SGR_2177     TRUE 0.641 157.000 0.110 1.000 Y NA
 5654747 5654748 SGR_2177 SGR_2178     FALSE 0.177 163.000 0.009 NA N NA
 5654748 5654749 SGR_2178 SGR_2179     FALSE 0.018 557.000 0.000 NA Y NA
 5654749 5654750 SGR_2179 SGR_2180     FALSE 0.006 392.000 0.000 1.000 N NA
 5654750 5654751 SGR_2180 SGR_2181     FALSE 0.077 389.000 0.221 1.000 Y NA
 5654751 5654752 SGR_2181 SGR_2182     TRUE 0.964 7.000 0.194 1.000 Y NA
 5654752 5654753 SGR_2182 SGR_2183     FALSE 0.195 257.000 0.071 1.000 Y NA
 5654753 5654754 SGR_2183 SGR_2184   argS1 TRUE 0.560 34.000 0.071 1.000   NA
 5654754 5654755 SGR_2184 SGR_2185 argS1   FALSE 0.166 160.000 0.003 1.000   NA
 5654756 5654757 SGR_tRNA11 SGR_2186     FALSE 0.003 344.000 0.000 NA   NA
 5654758 5654759 SGR_2187 SGR_2188     FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 5654761 5654762 SGR_2190 SGR_2191     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654763 5654764 SGR_2192 SGR_2193     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 5654765 5654766 SGR_2194 SGR_2195     FALSE 0.019 244.000 0.000 1.000   NA
 5654767 5654768 SGR_2196 SGR_2197     FALSE 0.028 224.000 0.000 1.000   NA
 5654768 5654769 SGR_2197 SGR_2198     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654769 5654770 SGR_2198 SGR_2199     FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 5654770 5654771 SGR_2199 SGR_2200     TRUE 0.979 -3.000 0.800 NA   NA
 5654771 5654772 SGR_2200 SGR_2201     FALSE 0.143 54.000 0.000 NA   NA
 5654772 5654773 SGR_2201 SGR_2202     FALSE 0.063 152.000 0.000 NA   NA
 5654773 5654774 SGR_2202 SGR_2203     TRUE 0.910 -3.000 0.029 1.000 N NA
 5654774 5654775 SGR_2203 SGR_2204     FALSE 0.331 50.000 0.000 1.000 N NA
 5654776 5654777 SGR_2205 SGR_2206     FALSE 0.114 79.000 0.000 NA   NA
 5654777 5654778 SGR_2206 SGR_2207     FALSE 0.137 57.000 0.000 NA   NA
 5654779 5654780 SGR_2208 SGR_2209     TRUE 0.566 74.000 0.286 1.000   NA
 5654780 5654781 SGR_2209 SGR_2210     TRUE 0.963 5.000 0.833 NA   NA
 5654781 5654782 SGR_2210 SGR_2211     FALSE 0.093 104.000 0.000 NA   NA
 5654782 5654783 SGR_2211 SGR_2212     FALSE 0.055 192.000 0.000 NA N NA
 5654784 5654785 SGR_2213 SGR_2214     TRUE 0.593 47.000 0.200 1.000   NA
 5654785 5654786 SGR_2214 SGR_2215     TRUE 0.931 -19.000 0.353 NA   NA
 5654786 5654787 SGR_2215 SGR_2216     TRUE 0.979 -3.000 0.800 NA   NA
 5654787 5654788 SGR_2216 SGR_2217     TRUE 0.760 75.000 0.750 NA   NA
 5654791 5654792 SGR_2220 SGR_2221     FALSE 0.431 164.000 0.333 1.000 N NA
 5654794 5654795 SGR_2223 SGR_2224     FALSE 0.100 235.000 0.152 1.000 N NA
 5654795 5654796 SGR_2224 SGR_2225     TRUE 0.995 -3.000 0.842 1.000 Y NA
 5654796 5654797 SGR_2225 SGR_2226     FALSE 0.018 282.000 0.000 1.000 N NA
 5654797 5654798 SGR_2226 SGR_2227     FALSE 0.219 134.000 0.031 NA   NA
 5654800 5654801 SGR_2229 SGR_2230     TRUE 0.856 2.000 0.101 NA   NA
 5654802 5654803 SGR_2231 SGR_2232     TRUE 0.717 0.000 0.000 1.000   NA
 5654803 5654804 SGR_2232 SGR_2233     FALSE 0.305 32.000 0.000 1.000   NA
 5654804 5654805 SGR_2233 SGR_2234     TRUE 0.782 -22.000 0.000 1.000 N NA
 5654805 5654806 SGR_2234 SGR_2235     FALSE 0.211 59.000 0.000 1.000   NA
 5654806 5654807 SGR_2235 SGR_2236     FALSE 0.175 185.000 0.109 1.000   NA
 5654808 5654809 SGR_2237 SGR_2238     TRUE 0.944 29.000 0.273 0.044 Y NA
 5654809 5654810 SGR_2238 SGR_2239     TRUE 0.986 -3.000 0.273 1.000 Y NA
 5654811 5654812 SGR_2240 SGR_2241     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654812 5654813 SGR_2241 SGR_2242     FALSE 0.048 219.000 0.000 1.000 N NA
 5654816 5654817 SGR_2245 SGR_2246     FALSE 0.057 159.000 0.000 NA   NA
 5654817 5654818 SGR_2246 SGR_2247     FALSE 0.002 390.000 0.000 NA   NA
 5654818 5654819 SGR_2247 SGR_2248     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654819 5654820 SGR_2248 SGR_2249     TRUE 0.779 95.000 0.833 1.000   NA
 5654820 5654821 SGR_2249 SGR_2250     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.027 Y NA
 5654821 5654822 SGR_2250 SGR_2251     FALSE 0.166 44.000 0.000 NA   NA
 5654822 5654823 SGR_2251 SGR_2252     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654824 5654825 SGR_2253 SGR_2254     FALSE 0.304 18.000 0.000 NA   NA
 5654825 5654826 SGR_2254 SGR_2255     FALSE 0.194 34.000 0.000 NA   NA
 5654826 5654827 SGR_2255 SGR_2256     FALSE 0.369 185.000 0.000 1.000 Y NA
 5654827 5654828 SGR_2256 SGR_2257     FALSE 0.125 167.000 0.000 1.000 N NA
 5654830 5654831 SGR_2259 SGR_2260     TRUE 0.868 3.000 0.167 NA   NA
 5654831 5654832 SGR_2260 SGR_2261     FALSE 0.015 228.000 0.000 NA   NA
 5654832 5654833 SGR_2261 SGR_2262     FALSE 0.145 53.000 0.000 NA   NA
 5654833 5654834 SGR_2262 SGR_2263     FALSE 0.171 90.000 0.000 1.000   NA
 5654834 5654835 SGR_2263 SGR_2264     TRUE 0.742 89.000 0.667 NA N NA
 5654836 5654837 SGR_2265 SGR_2266     FALSE 0.518 133.000 0.367 NA N NA
 5654837 5654838 SGR_2266 SGR_2267     FALSE 0.320 52.000 0.000 1.000 N NA
 5654840 5654841 SGR_2269 SGR_2270   rshA FALSE 0.014 233.000 0.000 NA   NA
 5654841 5654842 SGR_2270 SGR_2271 rshA sigH TRUE 0.955 -3.000 0.400 NA   NA
 5654844 5654845 SGR_2273 SGR_2274   wblE FALSE 0.008 320.000 0.000 1.000   NA
 5654846 5654847 SGR_2275 SGR_2276     FALSE 0.008 356.000 0.000 1.000 N NA
 5654849 5654850 SGR_2278 SGR_2279   dasC TRUE 0.979 10.000 0.571 1.000 Y NA
 5654850 5654851 SGR_2279 SGR_2280 dasC dasB TRUE 0.994 -3.000 0.538 0.044 Y NA
 5654851 5654852 SGR_2280 SGR_2281 dasB dasA TRUE 0.872 116.000 0.385 0.044 Y NA
 5654854 5654855 SGR_2283 SGR_2284     FALSE 0.313 17.000 0.000 NA   NA
 5654855 5654856 SGR_2284 SGR_2285     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654856 5654857 SGR_2285 SGR_2286     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654857 5654858 SGR_2286 SGR_2287     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654858 5654859 SGR_2287 SGR_2288     FALSE 0.346 29.000 0.000 NA N NA
 5654859 5654860 SGR_2288 SGR_2289     TRUE 0.681 18.000 0.010 1.000 N NA
 5654860 5654861 SGR_2289 SGR_2290     TRUE 0.919 -12.000 0.158 1.000 N NA
 5654861 5654862 SGR_2290 SGR_2291     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654862 5654863 SGR_2291 SGR_2292     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654863 5654864 SGR_2292 SGR_2293     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654865 5654866 SGR_2294 SGR_2295     FALSE 0.010 292.000 0.000 1.000   NA
 5654866 5654867 SGR_2295 SGR_2296     TRUE 0.924 -3.000 0.213 NA   NA
 5654867 5654868 SGR_2296 SGR_2297     FALSE 0.078 134.000 0.000 NA   NA
 5654868 5654869 SGR_2297 SGR_2298     FALSE 0.183 37.000 0.000 NA   NA
 5654869 5654870 SGR_2298 SGR_2299     FALSE 0.007 325.000 0.000 1.000   NA
 5654870 5654871 SGR_2299 SGR_2300     TRUE 0.997 0.000 0.917 0.000 Y NA
 5654871 5654872 SGR_2300 SGR_2301     FALSE 0.012 320.000 0.000 1.000 N NA
 5654873 5654874 SGR_2302 SGR_2303     FALSE 0.121 169.000 0.000 1.000 N NA
 5654874 5654875 SGR_2303 SGR_2304     TRUE 0.626 121.000 0.556 1.000   NA
 5654875 5654876 SGR_2304 SGR_2305     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 5654876 5654877 SGR_2305 SGR_2306     TRUE 0.980 -3.000 0.808 NA   NA
 5654877 5654878 SGR_2306 SGR_2307     FALSE 0.013 325.000 0.020 NA   NA
 5654878 5654879 SGR_2307 SGR_2308     TRUE 0.554 26.000 0.059 NA   NA
 5654880 5654881 SGR_2309 SGR_2310     FALSE 0.208 105.000 0.006 NA   NA
 5654881 5654882 SGR_2310 SGR_2311     TRUE 0.841 4.000 0.063 1.000   NA
 5654882 5654883 SGR_2311 SGR_2312     FALSE 0.179 158.000 0.007 1.000   NA
 5654885 5654886 SGR_2314 SGR_2315     FALSE 0.138 199.000 0.096 1.000   NA
 5654889 5654890 SGR_tRNA12 SGR_2318     FALSE 0.116 75.000 0.000 NA   NA
 5654890 5654891 SGR_2318 SGR_tRNA13     FALSE 0.016 226.000 0.000 NA   NA
 5654891 5654892 SGR_tRNA13 SGR_2319     FALSE 0.168 43.000 0.000 NA   NA
 5654894 5654895 SGR_2321 SGR_2322     TRUE 0.601 103.000 0.500 NA   NA
 5654895 5654896 SGR_2322 SGR_2323     FALSE 0.184 127.000 0.006 NA   NA
 5654896 5654897 SGR_2323 SGR_2324     FALSE 0.352 98.000 0.013 1.000 N NA
 5654898 5654899 SGR_2325 SGR_2326     TRUE 0.880 -3.000 0.060 NA   NA
 5654900 5654901 SGR_2327 SGR_2328     TRUE 0.777 20.000 0.300 NA   NA
 5654901 5654902 SGR_2328 SGR_2329     TRUE 0.844 12.000 0.300 NA   NA
 5654902 5654903 SGR_2329 SGR_2330     FALSE 0.200 121.000 0.011 NA   NA
 5654904 5654905 SGR_2331 SGR_2332     TRUE 0.695 66.000 0.535 NA   NA
 5654906 5654907 SGR_2333 SGR_2334     FALSE 0.094 102.000 0.000 NA   NA
 5654907 5654908 SGR_2334 SGR_2335   wblC TRUE 0.901 -3.000 0.120 NA   NA
 5654908 5654909 SGR_2335 SGR_2336 wblC   FALSE 0.173 177.000 0.120 NA   NA
 5654909 5654910 SGR_2336 SGR_2337     FALSE 0.323 90.000 0.059 NA   NA
 5654912 5654913 SGR_2339 SGR_2340     FALSE 0.362 108.000 0.036 1.000 N NA
 5654913 5654914 SGR_2340 SGR_2341     TRUE 0.797 11.000 0.041 1.000 N NA
 5654914 5654915 SGR_2341 SGR_2342     TRUE 0.890 136.000 0.493 0.003 Y NA
 5654915 5654916 SGR_2342 SGR_2343     FALSE 0.434 228.000 0.102 0.009 Y NA
 5654917 5654918 SGR_2344 SGR_2345     FALSE 0.345 98.000 0.111 NA   NA
 5654918 5654919 SGR_2345 SGR_2346     FALSE 0.173 223.000 0.429 NA   NA
 5654920 5654921 SGR_2347 SGR_2348     FALSE 0.338 100.000 0.109 NA   NA
 5654921 5654922 SGR_2348 SGR_2349     TRUE 0.970 -3.000 0.600 NA   NA
 5654922 5654923 SGR_2349 SGR_2350     FALSE 0.094 242.000 0.300 NA   NA
 5654923 5654924 SGR_2350 SGR_2351     FALSE 0.027 356.000 0.308 NA   NA
 5654924 5654925 SGR_2351 SGR_2352     FALSE 0.008 265.000 0.000 NA   NA
 5654925 5654926 SGR_2352 SGR_2353     FALSE 0.036 183.000 0.000 NA   NA
 5654927 5654928 SGR_2354 SGR_2355     FALSE 0.049 168.000 0.000 NA   NA
 5654928 5654929 SGR_2355 SGR_2356     TRUE 0.664 84.000 0.518 NA   NA
 5654929 5654930 SGR_2356 SGR_2357     FALSE 0.086 200.000 0.036 NA   NA
 5654932 5654933 SGR_2359 SGR_2360     FALSE 0.096 203.000 0.068 NA   NA
 5654936 5654937 SGR_2363 SGR_2364     FALSE 0.129 178.000 0.043 NA   NA
 5654937 5654938 SGR_2364 SGR_2365     FALSE 0.138 163.000 0.012 NA   NA
 5654941 5654942 SGR_2368 SGR_2369     TRUE 0.681 26.000 0.222 NA   NA
 5654944 5654945 SGR_2371 SGR_2372     TRUE 0.973 -10.000 0.806 NA   NA
 5654945 5654946 SGR_2372 SGR_2373     TRUE 0.690 44.000 0.389 NA   NA
 5654947 5654948 SGR_2374 SGR_2375   tatB FALSE 0.280 126.000 0.081 NA   NA
 5654948 5654949 SGR_2375 SGR_2376 tatB   FALSE 0.371 120.000 0.065 1.000 N NA
 5654949 5654950 SGR_2376 SGR_2377     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5654950 5654951 SGR_2377 SGR_2378     TRUE 0.888 -3.000 0.075 NA   NA
 5654955 5654956 SGR_2382 SGR_2383     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654958 5654959 SGR_2385 SGR_2386     FALSE 0.360 108.000 0.166 NA   NA
 5654960 5654961 SGR_2387 SGR_2388     FALSE 0.003 357.000 0.000 NA   NA
 5654962 5654963 SGR_2389 SGR_2390     FALSE 0.057 209.000 0.000 1.000 N NA
 5654964 5654965 SGR_2391 SGR_2392     TRUE 0.692 10.000 0.026 NA   NA
 5654965 5654966 SGR_2392 SGR_2393   amfR FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5654967 5654968 SGR_2394 SGR_2395 amfA amfB TRUE 0.997 -3.000 0.900 0.010 Y NA
 5654968 5654969 SGR_2395 SGR_2396 amfB amfS FALSE 0.455 76.000 0.200 NA   NA
 5654969 5654970 SGR_2396 SGR_2397 amfS amfT TRUE 0.632 45.000 0.300 NA   NA
 5654970 5654971 SGR_2397 SGR_2398 amfT   FALSE 0.045 363.000 0.000 1.000 Y NA
 5654972 5654973 SGR_2399 SGR_2400     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5654976 5654977 SGR_2403 SGR_2404     FALSE 0.228 176.000 0.222 NA   NA
 5654977 5654978 SGR_2404 SGR_2405   mshB TRUE 0.947 -3.000 0.333 NA   NA
 5654978 5654979 SGR_2405 SGR_2406 mshB   TRUE 0.728 76.000 0.667 NA   NA
 5654981 5654982 SGR_2408 SGR_2409     FALSE 0.108 89.000 0.000 NA   NA
 5654982 5654983 SGR_2409 SGR_2410     TRUE 0.993 -10.000 0.500 0.003 Y NA
 5654983 5654984 SGR_2410 SGR_2411     TRUE 0.944 14.000 0.162 1.000 Y NA
 5654984 5654985 SGR_2411 SGR_2412     TRUE 0.900 50.000 0.162 0.044 Y NA
 5654985 5654986 SGR_2412 SGR_2413     TRUE 0.769 210.000 0.833 0.044 Y NA
 5654986 5654987 SGR_2413 SGR_2414     FALSE 0.467 166.000 0.000 1.000 Y NA
 5654987 5654988 SGR_2414 SGR_2415     TRUE 0.984 17.000 0.667 0.003 Y NA
 5654988 5654989 SGR_2415 SGR_2416     TRUE 0.946 60.000 1.000 1.000 Y NA
 5654989 5654990 SGR_2416 SGR_2417     TRUE 0.996 -7.000 1.000 0.044 Y NA
 5654990 5654991 SGR_2417 SGR_2418     TRUE 0.938 129.000 1.000 0.044 Y NA
 5654991 5654992 SGR_2418 SGR_2419     FALSE 0.003 655.000 0.000 1.000 N NA
 5654992 5654993 SGR_2419 SGR_2420     FALSE 0.012 378.000 0.002 1.000 N NA
 5654996 5654997 SGR_2423 SGR_2424     TRUE 0.992 3.000 0.660 0.044 Y NA
 5654997 5654998 SGR_2424 SGR_2425     TRUE 0.990 -3.000 0.240 0.044 Y NA
 5654998 5654999 SGR_2425 SGR_2426     TRUE 0.802 95.000 0.241 1.000 Y NA
 5654999 5655000 SGR_2426 SGR_2427     FALSE 0.001 500.000 0.000 NA   NA
 5655000 5655001 SGR_2427 SGR_2428     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 5655001 5655002 SGR_2428 SGR_2429     FALSE 0.174 40.000 0.000 NA   NA
 5655005 5655006 SGR_2432 SGR_2433     FALSE 0.008 267.000 0.000 NA   NA
 5655006 5655007 SGR_2433 SGR_2434     FALSE 0.224 28.000 0.000 NA   NA
 5655007 5655008 SGR_2434 SGR_2435     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5655008 5655009 SGR_2435 SGR_2436     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655010 5655011 SGR_2437 SGR_2438     FALSE 0.036 183.000 0.000 NA   NA
 5655011 5655012 SGR_2438 SGR_2439     FALSE 0.157 48.000 0.000 NA   NA
 5655014 5655015 SGR_2441 SGR_2442     FALSE 0.023 337.000 0.000 0.083 N NA
 5655017 5655018 SGR_2444 SGR_2445     FALSE 0.011 243.000 0.000 NA   NA
 5655018 5655019 SGR_2445 SGR_2446   melC1-2 FALSE 0.006 336.000 0.000 1.000   NA
 5655019 5655020 SGR_2446 SGR_2447 melC1-2 melC2-2 TRUE 0.941 18.000 1.000 1.000   NA
 5655021 5655022 SGR_2448 SGR_2449     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655023 5655024 SGR_2450 SGR_2451     TRUE 0.661 15.000 0.056 NA   NA
 5655024 5655025 SGR_2451 SGR_2452     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5655026 5655027 SGR_2453 SGR_2454     FALSE 0.329 161.000 0.286 NA   NA
 5655027 5655028 SGR_2454 SGR_2455     FALSE 0.014 234.000 0.000 NA   NA
 5655028 5655029 SGR_2455 SGR_2456     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5655029 5655030 SGR_2456 SGR_2457     FALSE 0.011 244.000 0.000 NA   NA
 5655033 5655034 SGR_2460 SGR_2461     FALSE 0.066 202.000 0.000 1.000 N NA
 5655034 5655035 SGR_2461 SGR_2462     FALSE 0.081 125.000 0.000 NA   NA
 5655035 5655036 SGR_2462 SGR_2463     FALSE 0.115 76.000 0.000 NA   NA
 5655036 5655037 SGR_2463 SGR_2464     TRUE 0.587 -7.000 0.000 NA   NA
 5655037 5655038 SGR_2464 SGR_2465     FALSE 0.108 89.000 0.000 NA   NA
 5655038 5655039 SGR_2465 SGR_2466     FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 5655040 5655041 SGR_2467 SGR_2468     TRUE 0.886 35.000 0.259 NA Y NA
 5655041 5655042 SGR_2468 SGR_2469     FALSE 0.004 395.000 0.000 NA N NA
 5655044 5655045 SGR_2471 SGR_2472     TRUE 0.578 39.000 0.057 1.000 N NA
 5655046 5655047 SGR_2473 SGR_2474     FALSE 0.288 121.000 0.002 1.000 N NA
 5655047 5655048 SGR_2474 SGR_2475     TRUE 0.899 115.000 0.412 0.000 Y NA
 5655048 5655049 SGR_2475 SGR_2476     FALSE 0.058 234.000 0.002 1.000 N NA
 5655052 5655053 SGR_2479 SGR_2480 wblI   FALSE 0.304 185.000 0.429 NA   NA
 5655056 5655057 SGR_2483 SGR_2484   pks5 FALSE 0.159 47.000 0.000 NA   NA
 5655057 5655058 SGR_2484 SGR_2485 pks5   TRUE 0.939 -3.000 0.000 0.007 N NA
 5655058 5655059 SGR_2485 SGR_2486     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5655059 5655060 SGR_2486 SGR_2487     FALSE 0.306 56.000 0.000 1.000 N NA
 5655060 5655061 SGR_2487 SGR_2488     TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5655061 5655062 SGR_2488 SGR_2489     TRUE 0.930 38.000 0.300 0.083 Y NA
 5655064 5655065 SGR_2491 SGR_2492     FALSE 0.304 78.000 0.034 NA   NA
 5655065 5655066 SGR_2492 SGR_2493     FALSE 0.002 385.000 0.000 NA   NA
 5655068 5655069 SGR_2495 SGR_2496     TRUE 0.971 -3.000 0.549 1.000   NA
 5655069 5655070 SGR_2496 SGR_2497     FALSE 0.290 89.000 0.034 NA   NA
 5655070 5655071 SGR_2497 SGR_2498     TRUE 0.975 -3.000 0.609 NA N NA
 5655071 5655072 SGR_2498 SGR_2499     TRUE 0.981 -3.000 0.688 1.000 N NA
 5655074 5655075 SGR_2501 SGR_2502     TRUE 0.767 13.000 0.095 1.000   NA
 5655076 5655077 SGR_2503 SGR_2504     TRUE 0.530 165.000 0.667 NA   NA
 5655077 5655078 SGR_2504 SGR_2505     FALSE 0.005 371.000 0.000 1.000   NA
 5655078 5655079 SGR_2505 SGR_2506     FALSE 0.015 389.000 0.058 1.000 N NA
 5655081 5655082 SGR_2508 SGR_2509     FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   NA
 5655082 5655083 SGR_2509 SGR_2510     FALSE 0.180 81.000 0.000 1.000   NA
 5655085 5655086 SGR_2512 SGR_2513     FALSE 0.189 35.000 0.000 NA   NA
 5655087 5655088 SGR_2514 SGR_2515     FALSE 0.159 47.000 0.000 NA   NA
 5655088 5655089 SGR_2515 SGR_2516     FALSE 0.127 65.000 0.000 NA   NA
 5655090 5655091 SGR_2517 SGR_2518     FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 5655091 5655092 SGR_2518 SGR_2519     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 5655092 5655093 SGR_2519 SGR_2520     TRUE 0.957 -3.000 0.429 NA   NA
 5655093 5655094 SGR_2520 SGR_2521     TRUE 0.793 35.000 0.556 NA   NA
 5655094 5655095 SGR_2521 SGR_2522     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655095 5655096 SGR_2522 SGR_2523     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 5655096 5655097 SGR_2523 SGR_2524     TRUE 0.995 -3.000 0.571 0.027 Y NA
 5655097 5655098 SGR_2524 SGR_2525     FALSE 0.408 114.000 0.250 NA   NA
 5655098 5655099 SGR_2525 SGR_2526     TRUE 0.793 31.000 0.500 NA   NA
 5655099 5655100 SGR_2526 SGR_2527     TRUE 0.967 11.000 0.400 NA Y NA
 5655100 5655101 SGR_2527 SGR_2528     FALSE 0.358 104.000 0.150 NA   NA
 5655101 5655102 SGR_2528 SGR_2529     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5655102 5655103 SGR_2529 SGR_2530     TRUE 0.885 4.000 0.250 NA   NA
 5655103 5655104 SGR_2530 SGR_2531     TRUE 0.936 8.000 0.556 NA N NA
 5655104 5655105 SGR_2531 SGR_2532     FALSE 0.069 296.000 0.444 NA   NA
 5655106 5655107 SGR_2533 SGR_2534     FALSE 0.027 227.000 0.000 1.000   NA
 5655107 5655108 SGR_2534 SGR_2535     TRUE 0.903 -487.000 0.000 0.004   NA
 5655109 5655110 SGR_2536 SGR_2537     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5655110 5655111 SGR_2537 SGR_2538     TRUE 0.978 -3.000 0.625 1.000 N NA
 5655115 5655116 SGR_2542 SGR_2543     FALSE 0.262 165.000 0.125 NA N NA
 5655116 5655117 SGR_2543 SGR_2544     TRUE 0.908 7.000 0.348 NA N NA
 5655117 5655118 SGR_2544 SGR_2545     TRUE 0.935 -3.000 0.130 1.000 N NA
 5655119 5655120 SGR_2546 SGR_2547     TRUE 0.553 52.000 0.163 NA N NA
 5655123 5655124 SGR_2550 SGR_2551     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 5655124 5655125 SGR_2551 SGR_2552     FALSE 0.077 135.000 0.000 NA   NA
 5655126 5655127 SGR_2553 SGR_2554 natA   FALSE 0.009 348.000 0.000 1.000 N NA
 5655127 5655128 SGR_2554 SGR_2555     FALSE 0.059 209.000 0.013 NA   NA
 5655132 5655133 SGR_2559 SGR_2560     FALSE 0.033 187.000 0.000 NA   NA
 5655134 5655135 SGR_2561 SGR_2562     TRUE 0.587 -7.000 0.000 NA   NA
 5655136 5655137 SGR_2563 SGR_2564     FALSE 0.081 214.000 0.077 NA   NA
 5655138 5655139 SGR_2565 SGR_2566     FALSE 0.224 28.000 0.000 NA   NA
 5655139 5655140 SGR_2566 SGR_2567     TRUE 0.984 -3.000 0.778 1.000 N NA
 5655140 5655141 SGR_2567 SGR_2568     FALSE 0.249 150.000 0.009 1.000 N NA
 5655142 5655143 SGR_2569 SGR_2570     FALSE 0.132 137.000 0.000 NA N NA
 5655143 5655144 SGR_2570 SGR_2571     TRUE 0.987 -3.000 0.361 NA Y NA
 5655144 5655145 SGR_2571 SGR_2572     TRUE 0.989 -3.000 0.454 NA Y NA
 5655145 5655146 SGR_2572 SGR_2573     TRUE 0.972 -12.000 0.125 NA Y NA
 5655146 5655147 SGR_2573 SGR_2574     TRUE 0.982 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 5655147 5655148 SGR_2574 SGR_2575     TRUE 0.985 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 5655148 5655149 SGR_2575 SGR_2576     FALSE 0.209 60.000 0.000 1.000   NA
 5655149 5655150 SGR_2576 SGR_2577     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5655150 5655151 SGR_2577 SGR_2578     FALSE 0.127 65.000 0.000 NA   NA
 5655155 5655156 SGR_2582 SGR_2583     FALSE 0.232 97.000 0.000 1.000 N NA
 5655157 5655158 SGR_2584 SGR_2585     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655160 5655161 SGR_2587 SGR_2588     TRUE 0.920 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5655161 5655162 SGR_2588 SGR_2589     FALSE 0.166 288.000 0.000 0.005 Y NA
 5655162 5655163 SGR_2589 SGR_2590     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655163 5655164 SGR_2590 SGR_2591     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655164 5655165 SGR_2591 SGR_2592     TRUE 0.677 115.000 0.061 NA Y NA
 5655165 5655166 SGR_2592 SGR_2593     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.016 Y NA
 5655166 5655167 SGR_2593 SGR_2594     FALSE 0.162 148.000 0.000 1.000 N NA
 5655167 5655168 SGR_2594 SGR_2595     FALSE 0.248 89.000 0.000 1.000 N NA
 5655168 5655169 SGR_2595 SGR_2596     FALSE 0.162 148.000 0.000 1.000 N NA
 5655169 5655170 SGR_2596 SGR_2597     TRUE 0.793 7.000 0.048 1.000   NA
 5655170 5655171 SGR_2597 SGR_2598     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5655171 5655172 SGR_2598 SGR_2599     FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 5655176 5655177 SGR_2603 SGR_2604     FALSE 0.005 377.000 0.000 1.000   NA
 5655177 5655178 SGR_2604 SGR_2605     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 5655180 5655181 SGR_2607 SGR_2608     FALSE 0.002 416.000 0.000 NA   NA
 5655181 5655182 SGR_2608 SGR_2609     FALSE 0.010 251.000 0.000 NA   NA
 5655184 5655185 SGR_2611 SGR_2612 hutH   FALSE 0.327 108.000 0.011 1.000 N NA
 5655185 5655186 SGR_2612 SGR_2613     FALSE 0.386 155.000 0.211 1.000 N NA
 5655186 5655187 SGR_2613 SGR_2614   cyaA FALSE 0.117 171.000 0.000 1.000 N NA
 5655187 5655188 SGR_2614 SGR_2615 cyaA   FALSE 0.163 180.000 0.011 1.000 N NA
 5655189 5655190 SGR_2616 SGR_2617     TRUE 0.580 42.000 0.219 NA   NA
 5655190 5655191 SGR_2617 SGR_2618     TRUE 0.594 90.000 0.429 NA   NA
 5655191 5655192 SGR_2618 SGR_2619     FALSE 0.345 43.000 0.006 NA   NA
 5655194 5655195 SGR_2621 SGR_2622     FALSE 0.093 161.000 0.000 1.000   NA
 5655196 5655197 SGR_2623 SGR_2624     FALSE 0.036 234.000 0.000 1.000 N NA
 5655198 5655199 SGR_2625 SGR_2626     FALSE 0.281 117.000 0.075 NA   NA
 5655199 5655200 SGR_2626 SGR_2627     FALSE 0.109 242.000 0.235 1.000 N NA
 5655202 5655203 SGR_2629 SGR_2630     TRUE 0.909 6.000 0.277 1.000 N NA
 5655203 5655204 SGR_2630 SGR_2631     TRUE 0.923 -7.000 0.024 0.082   NA
 5655208 5655209 SGR_2635 SGR_2636     TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 5655209 5655210 SGR_2636 SGR_2637     TRUE 0.981 -3.000 0.833 NA   NA
 5655210 5655211 SGR_2637 SGR_2638     TRUE 0.781 97.000 1.000 NA   NA
 5655211 5655212 SGR_2638 SGR_2639     FALSE 0.418 95.000 0.200 NA   NA
 5655213 5655214 SGR_2640 SGR_2641     FALSE 0.210 135.000 0.027 NA   NA
 5655217 5655218 SGR_2644 SGR_2645     FALSE 0.101 155.000 0.000 1.000   NA
 5655218 5655219 SGR_2645 SGR_2646     FALSE 0.068 177.000 0.000 1.000   NA
 5655222 5655223 SGR_2649 SGR_2650     TRUE 0.758 116.000 0.221 1.000 Y NA
 5655223 5655224 SGR_2650 SGR_2651     TRUE 0.896 -3.000 0.046 1.000   NA
 5655224 5655225 SGR_2651 SGR_2652     TRUE 0.987 -3.000 0.720 0.043   NA
 5655225 5655226 SGR_2652 SGR_2653     TRUE 0.901 -3.000 0.058 1.000   NA
 5655226 5655227 SGR_2653 SGR_2654     FALSE 0.004 411.000 0.000 1.000   NA
 5655227 5655228 SGR_2654 SGR_2655     FALSE 0.072 175.000 0.000 1.000   NA
 5655229 5655230 SGR_2656 SGR_2657     FALSE 0.166 44.000 0.000 NA   NA
 5655231 5655232 SGR_2658 SGR_2659     TRUE 0.754 11.000 0.097 NA   NA
 5655232 5655233 SGR_2659 SGR_2660     TRUE 0.957 13.000 0.274 1.000 Y NA
 5655233 5655234 SGR_2660 SGR_2661     TRUE 0.898 -3.000 0.107 NA   NA
 5655235 5655236 SGR_2662 SGR_2663     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655237 5655238 SGR_2664 SGR_2665     FALSE 0.295 34.000 0.000 1.000   NA
 5655238 5655239 SGR_2665 SGR_2666     TRUE 0.923 -3.000 0.000 0.011   NA
 5655239 5655240 SGR_2666 SGR_2667     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5655240 5655241 SGR_2667 SGR_2668     FALSE 0.136 58.000 0.000 NA   NA
 5655245 5655246 SGR_2672 SGR_2673     TRUE 0.963 0.000 0.600 NA   NA
 5655247 5655248 SGR_2674 SGR_2675     TRUE 0.896 -3.000 0.100 NA   NA
 5655248 5655249 SGR_2675 SGR_2676     FALSE 0.002 444.000 0.000 NA   NA
 5655250 5655251 SGR_2677 SGR_2678     TRUE 0.994 7.000 0.877 0.001 Y NA
 5655251 5655252 SGR_2678 SGR_2679     TRUE 0.990 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 5655252 5655253 SGR_2679 SGR_2680     FALSE 0.006 401.000 0.000 1.000 N NA
 5655253 5655254 SGR_2680 SGR_2681     TRUE 0.822 -3.000 0.005 NA   NA
 5655256 5655257 SGR_2683 SGR_2684     FALSE 0.055 161.000 0.000 NA   NA
 5655257 5655258 SGR_2684 SGR_2685     FALSE 0.063 280.000 0.333 NA   NA
 5655259 5655260 SGR_2686 SGR_2687     FALSE 0.159 167.000 0.042 NA   NA
 5655260 5655261 SGR_2687 SGR_2688     TRUE 0.981 6.000 0.157 0.001 Y NA
 5655261 5655262 SGR_2688 SGR_2689     TRUE 0.976 31.000 0.705 0.001 Y NA
 5655262 5655263 SGR_2689 SGR_2690     TRUE 0.995 0.000 0.604 0.001 Y NA
 5655263 5655264 SGR_2690 SGR_2691     FALSE 0.071 142.000 0.000 NA   NA
 5655264 5655265 SGR_2691 SGR_2692     FALSE 0.081 124.000 0.000 NA   NA
 5655265 5655266 SGR_2692 SGR_2693     TRUE 0.929 -3.000 0.238 NA   NA
 5655266 5655267 SGR_2693 SGR_2694     TRUE 0.735 11.000 0.069 NA   NA
 5655268 5655269 SGR_2695 SGR_2696     FALSE 0.013 273.000 0.000 1.000   NA
 5655272 5655273 SGR_2699 SGR_2700     TRUE 0.686 70.000 0.242 0.045   NA
 5655274 5655275 SGR_2701 SGR_2702   trpS1 TRUE 0.688 125.000 0.047 1.000 Y NA
 5655277 5655278 SGR_2704 SGR_2705     TRUE 0.819 6.000 0.133 NA   NA
 5655278 5655279 SGR_2705 SGR_2706     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5655281 5655282 SGR_2708 SGR_2709     TRUE 0.938 4.000 0.500 NA   NA
 5655282 5655283 SGR_2709 SGR_2710     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5655283 5655284 SGR_2710 SGR_2711     FALSE 0.018 219.000 0.000 NA   NA
 5655284 5655285 SGR_2711 SGR_2712     FALSE 0.022 237.000 0.000 1.000   NA
 5655285 5655286 SGR_2712 SGR_2713     FALSE 0.001 523.000 0.000 NA   NA
 5655286 5655287 SGR_2713 SGR_2714     TRUE 0.571 23.000 0.053 NA   NA
 5655289 5655290 SGR_2716 SGR_2717     FALSE 0.066 148.000 0.000 NA   NA
 5655290 5655291 SGR_2717 SGR_2718     TRUE 0.979 -13.000 0.225 1.000 Y NA
 5655295 5655296 SGR_2722 SGR_2723     TRUE 0.952 22.000 0.088 0.000 Y NA
 5655296 5655297 SGR_2723 SGR_2724     FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 5655297 5655298 SGR_2724 SGR_2725     TRUE 0.968 -3.000 0.569 NA   NA
 5655298 5655299 SGR_2725 SGR_2726     TRUE 0.972 -3.000 0.633 NA   NA
 5655299 5655300 SGR_2726 SGR_2727     FALSE 0.044 173.000 0.000 NA   NA
 5655301 5655302 SGR_2728 SGR_2729     FALSE 0.180 177.000 0.135 NA   NA
 5655304 5655305 SGR_2731 SGR_2732     FALSE 0.042 203.000 0.000 1.000   NA
 5655309 5655310 SGR_2736 SGR_2737     FALSE 0.170 42.000 0.000 NA   NA
 5655311 5655312 SGR_2738 SGR_2739     TRUE 0.994 -3.000 0.797 NA Y NA
 5655314 5655315 SGR_2741 SGR_2742     TRUE 0.592 132.000 0.571 NA   NA
 5655315 5655316 SGR_2742 SGR_2743     FALSE 0.028 269.000 0.047 NA   NA
 5655316 5655317 SGR_2743 SGR_2744     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5655317 5655318 SGR_2744 SGR_2745     FALSE 0.037 182.000 0.000 NA   NA
 5655320 5655321 SGR_2747 SGR_2748     FALSE 0.094 103.000 0.000 NA   NA
 5655321 5655322 SGR_2748 SGR_2749     TRUE 0.591 62.000 0.212 1.000 N NA
 5655322 5655323 SGR_2749 SGR_2750     FALSE 0.020 272.000 0.000 1.000 N NA
 5655323 5655324 SGR_2750 SGR_2751     FALSE 0.099 230.000 0.000 0.003   NA
 5655324 5655325 SGR_2751 SGR_2752     FALSE 0.381 169.000 0.053 0.005   NA
 5655325 5655326 SGR_2752 SGR_2753     FALSE 0.031 319.000 0.083 1.000 N NA
 5655327 5655328 SGR_2754 SGR_2755     FALSE 0.238 26.000 0.000 NA   NA
 5655329 5655330 SGR_2756 SGR_2757     TRUE 0.582 105.000 0.056 0.001   NA
 5655330 5655331 SGR_2757 SGR_2758     FALSE 0.269 140.000 0.006 1.000 N NA
 5655331 5655332 SGR_2758 SGR_2759   bldM FALSE 0.158 276.000 0.000 0.088 Y NA
 5655335 5655336 SGR_2762 SGR_2763     TRUE 0.793 11.000 0.100 1.000   NA
 5655336 5655337 SGR_2763 SGR_2764     FALSE 0.140 113.000 0.000 1.000   NA
 5655337 5655338 SGR_2764 SGR_2765     FALSE 0.138 161.000 0.000 1.000 N NA
 5655338 5655339 SGR_2765 SGR_2766     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.043 Y NA
 5655339 5655340 SGR_2766 SGR_2767     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.043 Y NA
 5655340 5655341 SGR_2767 SGR_2768     TRUE 0.801 34.000 0.429 1.000 N NA
 5655342 5655343 SGR_2769 SGR_2770 groEL1 groES TRUE 0.881 98.000 0.592 1.000 Y NA
 5655347 5655348 SGR_2774 SGR_2775     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5655348 5655349 SGR_2775 SGR_2776     FALSE 0.083 119.000 0.000 NA   NA
 5655351 5655352 SGR_2778 SGR_2779     TRUE 0.822 -3.000 0.005 NA   NA
 5655352 5655353 SGR_2779 SGR_2780     TRUE 0.901 -3.000 0.056 1.000   NA
 5655353 5655354 SGR_2780 SGR_2781     TRUE 0.579 30.000 0.062 1.000   NA
 5655356 5655357 SGR_2783 SGR_2784     FALSE 0.167 136.000 0.003 NA   NA
 5655357 5655358 SGR_2784 SGR_2785     FALSE 0.282 62.000 0.007 NA   NA
 5655358 5655359 SGR_2785 SGR_2786     TRUE 0.890 -3.000 0.027 NA N NA
 5655359 5655360 SGR_2786 SGR_2787     FALSE 0.131 61.000 0.000 NA   NA
 5655360 5655361 SGR_2787 SGR_2788     FALSE 0.163 45.000 0.000 NA   NA
 5655361 5655362 SGR_2788 SGR_2789     FALSE 0.208 171.000 0.066 NA N NA
 5655362 5655363 SGR_2789 SGR_2790     TRUE 0.541 46.000 0.048 1.000 N NA
 5655363 5655364 SGR_2790 SGR_2791   scpD FALSE 0.160 149.000 0.000 1.000 N NA
 5655364 5655365 SGR_2791 SGR_2792 scpD   FALSE 0.021 270.000 0.000 1.000 N NA
 5655365 5655366 SGR_2792 SGR_2793     TRUE 0.956 6.000 0.778 NA   NA
 5655366 5655367 SGR_2793 SGR_2794     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 5655368 5655369 SGR_2795 SGR_2796     TRUE 0.903 -12.000 0.222 NA   NA
 5655369 5655370 SGR_2796 SGR_2797     FALSE 0.055 162.000 0.000 NA   NA
 5655370 5655371 SGR_2797 SGR_2798     FALSE 0.366 47.000 0.020 NA   NA
 5655371 5655372 SGR_2798 SGR_2799     FALSE 0.043 175.000 0.000 NA   NA
 5655373 5655374 SGR_2800 SGR_2801     FALSE 0.018 371.000 0.068 1.000 N NA
 5655374 5655375 SGR_2801 SGR_2802     TRUE 0.958 45.000 0.601 0.009 Y NA
 5655375 5655376 SGR_2802 SGR_2803     FALSE 0.006 349.000 0.000 1.000   NA
 5655378 5655379 SGR_2805 SGR_2806     TRUE 0.767 91.000 0.102 1.000 Y NA
 5655379 5655380 SGR_2806 SGR_2807   rpoA TRUE 0.594 182.000 0.873 1.000 N NA
 5655380 5655381 SGR_2807 SGR_2808 rpoA   FALSE 0.501 138.000 0.308 1.000 N NA
 5655381 5655382 SGR_2808 SGR_2809     TRUE 0.943 105.000 0.810 0.009 Y NA
 5655382 5655383 SGR_2809 SGR_2810     FALSE 0.325 195.000 0.194 0.009   NA
 5655383 5655384 SGR_2810 SGR_2811     TRUE 0.580 60.000 0.257 1.000   NA
 5655384 5655385 SGR_2811 SGR_2812     FALSE 0.497 174.000 0.008 1.000 Y NA
 5655385 5655386 SGR_2812 SGR_2813     FALSE 0.338 133.000 0.043 1.000 N NA
 5655386 5655387 SGR_2813 SGR_2814   secY TRUE 0.939 0.000 0.241 1.000 N NA
 5655387 5655388 SGR_2814 SGR_2815 secY   FALSE 0.072 383.000 0.730 1.000 N NA
 5655388 5655389 SGR_2815 SGR_2816     TRUE 0.994 2.000 0.653 0.001 Y NA
 5655389 5655390 SGR_2816 SGR_2817     TRUE 0.996 0.000 0.789 0.011 Y NA
 5655390 5655391 SGR_2817 SGR_2818     TRUE 0.968 48.000 0.814 0.011 Y NA
 5655391 5655392 SGR_2818 SGR_2819     TRUE 0.995 3.000 0.815 0.009 Y NA
 5655392 5655393 SGR_2819 SGR_2820     TRUE 0.983 22.000 0.808 0.009 Y NA
 5655393 5655394 SGR_2820 SGR_2821     TRUE 0.605 225.000 0.473 0.009 Y NA
 5655394 5655395 SGR_2821 SGR_2822     TRUE 0.991 3.000 0.496 0.009 Y NA
 5655395 5655396 SGR_2822 SGR_2823     TRUE 0.995 0.000 0.758 0.009 Y NA
 5655396 5655397 SGR_2823 SGR_2824     TRUE 0.995 3.000 0.810 0.011 Y NA
 5655397 5655398 SGR_2824 SGR_2825     TRUE 0.938 108.000 0.791 0.011 Y NA
 5655398 5655399 SGR_2825 SGR_2826     TRUE 0.996 0.000 0.828 0.009 Y NA
 5655399 5655400 SGR_2826 SGR_2827     TRUE 0.996 0.000 0.802 0.009 Y NA
 5655400 5655401 SGR_2827 SGR_2828     TRUE 0.993 6.000 0.828 0.011 Y NA
 5655401 5655402 SGR_2828 SGR_2829     TRUE 0.995 0.000 0.719 0.011 Y NA
 5655402 5655403 SGR_2829 SGR_2830     TRUE 0.983 20.000 0.769 0.011 Y NA
 5655403 5655404 SGR_2830 SGR_2831     TRUE 0.989 13.000 0.820 0.011 Y NA
 5655404 5655405 SGR_2831 SGR_2832     TRUE 0.973 40.000 0.849 0.009 Y NA
 5655405 5655406 SGR_2832 SGR_2833     TRUE 0.994 0.000 0.513 0.009 Y NA
 5655406 5655407 SGR_2833 SGR_2834     TRUE 0.987 5.000 0.361 0.009 Y NA
 5655407 5655408 SGR_2834 SGR_2835     TRUE 0.979 15.000 0.467 0.011 Y NA
 5655409 5655410 SGR_2836 SGR_2837   sprX FALSE 0.027 199.000 0.000 NA   NA
 5655411 5655412 SGR_2838 SGR_2839     TRUE 0.567 -31.000 0.000 NA   NA
 5655412 5655413 SGR_2839 SGR_2840     FALSE 0.060 156.000 0.000 NA   NA
 5655413 5655414 SGR_2840 SGR_2841     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5655416 5655417 SGR_2843 SGR_2844     TRUE 0.853 158.000 0.400 0.001 Y NA
 5655417 5655418 SGR_2844 SGR_2845     TRUE 0.935 39.000 0.579 1.000 Y NA
 5655418 5655419 SGR_2845 SGR_2846     TRUE 0.993 3.000 0.620 0.001 Y NA
 5655419 5655420 SGR_2846 SGR_2847     FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 5655420 5655421 SGR_2847 SGR_2848     FALSE 0.100 96.000 0.000 NA   NA
 5655422 5655423 SGR_2849 SGR_2850     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655425 5655426 SGR_2852 SGR_2853     FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5655426 5655427 SGR_2853 SGR_2854     FALSE 0.174 40.000 0.000 NA   NA
 5655427 5655428 SGR_2854 SGR_2855     FALSE 0.126 66.000 0.000 NA   NA
 5655430 5655431 SGR_2857 SGR_2858     FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 5655431 5655432 SGR_2858 SGR_2859     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655432 5655433 SGR_2859 SGR_2860     FALSE 0.168 43.000 0.000 NA   NA
 5655433 5655434 SGR_2860 SGR_2861     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5655434 5655435 SGR_2861 SGR_2862     FALSE 0.424 9.000 0.000 NA   NA
 5655435 5655436 SGR_2862 SGR_2863     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5655436 5655437 SGR_2863 SGR_2864     FALSE 0.081 127.000 0.000 NA   NA
 5655437 5655438 SGR_2864 SGR_2865     FALSE 0.081 127.000 0.000 NA   NA
 5655438 5655439 SGR_2865 SGR_2866     FALSE 0.283 20.000 0.000 NA   NA
 5655439 5655440 SGR_2866 SGR_2867     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655441 5655442 SGR_2868 SGR_2869 rpoC rpoB TRUE 0.953 99.000 0.851 0.001 Y NA
 5655442 5655443 SGR_2869 SGR_2870 rpoB   FALSE 0.012 594.000 0.223 1.000 N NA
 5655443 5655444 SGR_2870 SGR_2871     TRUE 0.957 85.000 0.884 0.009 Y NA
 5655444 5655445 SGR_2871 SGR_2872     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 5655445 5655446 SGR_2872 SGR_2873     FALSE 0.105 171.000 0.002 NA   NA
 5655446 5655447 SGR_2873 SGR_2874     TRUE 0.955 81.000 0.838 0.011 Y NA
 5655447 5655448 SGR_2874 SGR_2875   nusG TRUE 0.544 177.000 0.681 1.000 N NA
 5655448 5655449 SGR_2875 SGR_2876 nusG secE TRUE 0.830 74.000 0.843 1.000 N NA
 5655449 5655450 SGR_2876 SGR_tRNA14 secE   FALSE 0.091 107.000 0.000 NA   NA
 5655451 5655452 SGR_2877 SGR_2878     FALSE 0.403 123.000 0.116 1.000 N NA
 5655455 5655456 SGR_2881 SGR_2882     FALSE 0.183 178.000 0.028 1.000 N NA
 5655456 5655457 SGR_2882 SGR_2883     TRUE 0.991 0.000 0.370 0.045 Y NA
 5655457 5655458 SGR_2883 SGR_2884     FALSE 0.428 125.000 0.159 1.000 N NA
 5655458 5655459 SGR_2884 SGR_tRNA15     FALSE 0.108 89.000 0.000 NA   NA
 5655459 5655460 SGR_tRNA15 SGR_tRNA16     FALSE 0.161 46.000 0.000 NA   NA
 5655461 5655462 SGR_2885 SGR_2886     TRUE 0.565 35.000 0.086 1.000   NA
 5655462 5655463 SGR_2886 SGR_2887     FALSE 0.003 346.000 0.000 NA   NA
 5655463 5655464 SGR_2887 SGR_2888     FALSE 0.083 117.000 0.000 NA   NA
 5655466 5655467 SGR_2890 SGR_2891     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655467 5655468 SGR_2891 SGR_2892     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655468 5655469 SGR_2892 SGR_2893     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655469 5655470 SGR_2893 SGR_2894     TRUE 0.594 0.000 0.000 NA   NA
 5655470 5655471 SGR_2894 SGR_2895     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655471 5655472 SGR_2895 SGR_2896     FALSE 0.333 15.000 0.000 NA   NA
 5655472 5655473 SGR_2896 SGR_2897     FALSE 0.304 18.000 0.000 NA   NA
 5655473 5655474 SGR_2897 SGR_2898     FALSE 0.113 81.000 0.000 NA   NA
 5655474 5655475 SGR_2898 SGR_2899     FALSE 0.113 80.000 0.000 NA   NA
 5655475 5655476 SGR_2899 SGR_2900     FALSE 0.104 153.000 0.000 1.000   NA
 5655476 5655477 SGR_2900 SGR_2901     TRUE 0.580 -9.000 0.000 NA   NA
 5655477 5655478 SGR_2901 SGR_2902     FALSE 0.381 12.000 0.000 NA   NA
 5655478 5655479 SGR_2902 SGR_2903     FALSE 0.109 87.000 0.000 NA   NA
 5655479 5655480 SGR_2903 SGR_2904     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655480 5655481 SGR_2904 SGR_2905     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655481 5655482 SGR_2905 SGR_2906     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655482 5655483 SGR_2906 SGR_2907     FALSE 0.024 204.000 0.000 NA   NA
 5655483 5655484 SGR_2907 SGR_2908     TRUE 0.679 62.000 0.429 1.000   NA
 5655486 5655487 SGR_2909 SGR_2910     FALSE 0.027 199.000 0.000 NA   NA
 5655487 5655488 SGR_2910 SGR_2911     TRUE 0.920 7.000 0.000 NA Y NA
 5655489 5655490 SGR_2912 SGR_2913     FALSE 0.163 146.000 0.009 NA   NA
 5655490 5655491 SGR_2913 SGR_2914     TRUE 0.849 -3.000 0.021 NA   NA
 5655491 5655492 SGR_2914 SGR_2915     FALSE 0.060 255.000 0.000 0.069 N NA
 5655492 5655493 SGR_2915 SGR_2916   nuoN2 FALSE 0.200 115.000 0.000 1.000 N NA
 5655493 5655494 SGR_2916 SGR_2917 nuoN2 nuoM2 TRUE 0.996 -3.000 0.625 0.002 Y NA
 5655494 5655495 SGR_2917 SGR_2918 nuoM2 nuoL2 TRUE 0.988 -3.000 0.026 0.002 Y NA
 5655495 5655496 SGR_2918 SGR_2919 nuoL2 nuoK2 TRUE 0.992 -3.000 0.253 0.006 Y NA
 5655496 5655497 SGR_2919 SGR_2920 nuoK2 nuoJ2 TRUE 0.994 0.000 0.506 0.003 Y NA
 5655497 5655498 SGR_2920 SGR_2921 nuoJ2 nuoI2 TRUE 0.991 -3.000 0.223 0.006 Y NA
 5655498 5655499 SGR_2921 SGR_2922 nuoI2 nuoH2 TRUE 0.988 0.000 0.166 0.006 Y NA
 5655499 5655500 SGR_2922 SGR_2923 nuoH2   TRUE 0.989 -3.000 0.091 0.006 Y NA
 5655500 5655501 SGR_2923 SGR_2924   nuoB2 TRUE 0.994 -3.000 0.406 0.003 Y NA
 5655501 5655502 SGR_2924 SGR_2925 nuoB2 nuoA2 TRUE 0.985 -9.000 0.058 0.003 Y NA
 5655503 5655504 SGR_2926 SGR_2927     TRUE 0.555 228.000 0.375 0.009 Y NA
 5655504 5655505 SGR_2927 SGR_2928     FALSE 0.041 500.000 0.000 0.026 Y NA
 5655505 5655506 SGR_2928 SGR_2929     FALSE 0.004 491.000 0.000 1.000 N NA
 5655506 5655507 SGR_2929 SGR_2930     TRUE 0.996 -7.000 0.832 0.000 Y NA
 5655509 5655510 SGR_2932 SGR_2933     FALSE 0.198 157.000 0.017 1.000   NA
 5655510 5655511 SGR_2933 SGR_2934     FALSE 0.182 79.000 0.000 1.000   NA
 5655511 5655512 SGR_2934 SGR_2935     FALSE 0.433 8.000 0.000 NA   NA
 5655512 5655513 SGR_2935 SGR_2936     FALSE 0.119 71.000 0.000 NA   NA
 5655516 5655517 SGR_2939 SGR_2940     FALSE 0.017 223.000 0.000 NA   NA
 5655517 5655518 SGR_2940 SGR_2941     FALSE 0.055 161.000 0.000 NA   NA
 5655518 5655519 SGR_2941 SGR_2942     FALSE 0.447 7.000 0.000 NA   NA
 5655519 5655520 SGR_2942 SGR_2943     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655521 5655522 SGR_2944 SGR_2945     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655523 5655524 SGR_2946 SGR_2947     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5655524 5655525 SGR_2947 SGR_2948     TRUE 0.954 -3.000 0.333 1.000   NA
 5655526 5655527 SGR_2949 SGR_2950     TRUE 0.996 -3.000 0.667 0.026 Y NA
 5655528 5655529 SGR_2951 SGR_2952   sprH FALSE 0.103 93.000 0.000 NA   NA
 5655530 5655531 SGR_2953 SGR_2954     FALSE 0.472 71.000 0.066 1.000 N NA
 5655531 5655532 SGR_2954 SGR_2955     FALSE 0.109 148.000 0.000 1.000   NA
 5655532 5655533 SGR_2955 SGR_2956     FALSE 0.027 226.000 0.000 1.000   NA
 5655533 5655534 SGR_2956 SGR_2957     FALSE 0.076 172.000 0.000 1.000   NA
 5655535 5655536 SGR_2958 SGR_2959     FALSE 0.150 51.000 0.000 NA   NA
 5655536 5655537 SGR_2959 SGR_2960     FALSE 0.039 385.000 0.000 1.000 Y NA
 5655537 5655538 SGR_2960 SGR_2961     FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 5655538 5655539 SGR_2961 SGR_2962     TRUE 0.713 113.000 0.810 NA   NA
 5655539 5655540 SGR_2962 SGR_2963     TRUE 0.580 127.000 0.471 NA N NA
 5655540 5655541 SGR_2963 SGR_2964     FALSE 0.051 199.000 0.000 NA N NA
 5655542 5655543 SGR_2965 SGR_2966     TRUE 0.683 38.000 0.286 1.000   NA
 5655543 5655544 SGR_2966 SGR_2967     FALSE 0.133 124.000 0.000 1.000   NA
 5655544 5655545 SGR_2967 SGR_2968     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655545 5655546 SGR_2968 SGR_2969     FALSE 0.086 112.000 0.000 NA   NA
 5655547 5655548 SGR_2970 SGR_2971   nuoN1 FALSE 0.087 186.000 0.000 1.000 N NA
 5655548 5655549 SGR_2971 SGR_2972 nuoN1 nuoM1 TRUE 0.992 -3.000 0.257 0.002 Y NA
 5655549 5655550 SGR_2972 SGR_2973 nuoM1 nuoL1 TRUE 0.988 5.000 0.373 0.002 Y NA
 5655550 5655551 SGR_2973 SGR_2974 nuoL1 nuoK1 TRUE 0.989 13.000 0.790 0.006 Y NA
 5655551 5655552 SGR_2974 SGR_2975 nuoK1 nuoJ1 TRUE 0.993 -3.000 0.306 0.003 Y NA
 5655552 5655553 SGR_2975 SGR_2976 nuoJ1 nuoI1 TRUE 0.991 -3.000 0.210 0.006 Y NA
 5655553 5655554 SGR_2976 SGR_2977 nuoI1 nuoH1 TRUE 0.989 -7.000 0.221 0.006 Y NA
 5655554 5655555 SGR_2977 SGR_2978 nuoH1 nuoG1 TRUE 0.990 -3.000 0.151 0.006 Y NA
 5655555 5655556 SGR_2978 SGR_2979 nuoG1 nuoF1 TRUE 0.996 -3.000 0.753 0.006 Y NA
 5655556 5655557 SGR_2979 SGR_2980 nuoF1 nuoE1 TRUE 0.990 -3.000 0.163 0.005 Y NA
 5655557 5655558 SGR_2980 SGR_2981 nuoE1 nuoD1 TRUE 0.990 -3.000 0.161 0.005 Y NA
 5655558 5655559 SGR_2981 SGR_2982 nuoD1 nuoC1 TRUE 0.990 0.000 0.299 0.006 Y NA
 5655559 5655560 SGR_2982 SGR_2983 nuoC1 nuoB1 TRUE 0.996 -3.000 0.691 0.003 Y NA
 5655560 5655561 SGR_2983 SGR_2984 nuoB1 nuoA1 TRUE 0.977 19.000 0.498 0.003 Y NA
 5655563 5655564 SGR_2986 SGR_2987     FALSE 0.002 427.000 0.000 NA   NA
 5655564 5655565 SGR_2987 SGR_2988     FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 5655567 5655568 SGR_2990 SGR_2991     FALSE 0.418 31.000 0.000 1.000 N NA
 5655568 5655569 SGR_2991 SGR_2992     TRUE 0.925 -3.000 0.071 1.000 N NA
 5655569 5655570 SGR_2992 SGR_2993     TRUE 0.914 53.000 0.536 1.000 Y NA
 5655570 5655571 SGR_2993 SGR_2994     TRUE 0.906 52.000 0.223 0.042 Y NA
 5655572 5655573 SGR_2995 SGR_2996     FALSE 0.414 10.000 0.000 NA   NA
 5655573 5655574 SGR_2996 SGR_2997     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655575 5655576 SGR_2998 SGR_2999     TRUE 0.728 11.000 0.023 1.000   NA
 5655576 5655577 SGR_2999 SGR_3000     FALSE 0.397 73.000 0.011 1.000 N NA
 5655577 5655578 SGR_3000 SGR_3001     FALSE 0.013 321.000 0.015 NA   NA
 5655580 5655581 SGR_3003 SGR_3004     TRUE 0.997 -3.000 0.750 0.003 Y NA
 5655581 5655582 SGR_3004 SGR_3005     TRUE 0.986 7.000 0.750 1.000 Y NA
 5655582 5655583 SGR_3005 SGR_3006     TRUE 0.995 -3.000 0.600 0.042 Y NA
 5655583 5655584 SGR_3006 SGR_3007     TRUE 0.992 6.000 0.800 0.042 Y NA
 5655584 5655585 SGR_3007 SGR_3008     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5655586 5655587 SGR_3009 SGR_3010     TRUE 0.830 47.000 0.000 0.087 Y NA
 5655589 5655590 SGR_3012 SGR_3013 afsR-g   FALSE 0.024 204.000 0.000 NA   NA
 5655592 5655593 SGR_3015 SGR_3016     TRUE 0.956 5.000 0.714 NA   NA
 5655593 5655594 SGR_3016 SGR_3017     TRUE 0.966 4.000 0.833 NA   NA
 5655597 5655598 SGR_3020 SGR_3021 afsK-g   FALSE 0.007 277.000 0.000 NA   NA
 5655600 5655601 SGR_3023 SGR_3024     TRUE 0.955 0.000 0.500 NA   NA
 5655602 5655603 SGR_3025 SGR_3026     FALSE 0.520 59.000 0.154 NA N NA
 5655603 5655604 SGR_3026 SGR_3027     FALSE 0.187 134.000 0.000 1.000 N NA
 5655604 5655605 SGR_3027 SGR_3028     TRUE 0.600 22.000 0.070 NA   NA
 5655606 5655607 SGR_3029 SGR_3030     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5655610 5655611 SGR_3033 SGR_3034     FALSE 0.083 119.000 0.000 NA   NA
 5655614 5655615 SGR_3037 SGR_3038     FALSE 0.122 69.000 0.000 NA   NA
 5655615 5655616 SGR_3038 SGR_tRNA18     FALSE 0.061 155.000 0.000 NA   NA
 5655617 5655618 SGR_3039 SGR_3040     TRUE 0.975 -9.000 0.455 0.080 N NA
 5655618 5655619 SGR_3040 SGR_3041     FALSE 0.035 184.000 0.000 NA   NA
 5655619 5655620 SGR_3041 SGR_3042     FALSE 0.055 162.000 0.000 NA   NA
 5655621 5655622 SGR_3043 SGR_3044     FALSE 0.061 155.000 0.000 NA   NA
 5655622 5655623 SGR_3044 SGR_3045     FALSE 0.028 198.000 0.000 NA   NA
 5655627 5655628 SGR_3049 SGR_3050     TRUE 0.928 -3.000 0.086 1.000 N NA
 5655628 5655629 SGR_3050 SGR_3051     TRUE 0.856 41.000 0.114 1.000 Y NA
 5655631 5655632 SGR_3053 SGR_3054     FALSE 0.002 408.000 0.000 NA   NA
 5655632 5655633 SGR_3054 SGR_3055     TRUE 0.980 8.000 1.000 0.007   NA
 5655633 5655634 SGR_3055 SGR_3056     TRUE 0.921 13.000 0.600 1.000   NA
 5655636 5655637 SGR_3058 SGR_3059     TRUE 0.610 85.000 0.375 1.000   NA
 5655638 5655639 SGR_3060 SGR_3061     FALSE 0.035 432.000 0.625 NA   NA
 5655639 5655640 SGR_3061 SGR_3062     FALSE 0.122 69.000 0.000 NA   NA
 5655641 5655642 SGR_3063 SGR_3064     TRUE 0.838 29.000 0.625 NA   NA
 5655644 5655645 SGR_3066 SGR_3067     FALSE 0.186 188.000 0.222 NA   NA
 5655646 5655647 SGR_3068 SGR_3069     FALSE 0.299 84.000 0.034 NA   NA
 5655647 5655648 SGR_3069 SGR_3070     TRUE 0.906 -3.000 0.136 NA   NA
 5655649 5655650 SGR_3071 SGR_3072     FALSE 0.003 585.000 0.000 1.000 N NA
 5655652 5655653 SGR_3074 SGR_3075     FALSE 0.004 567.000 0.000 1.000 N NA
 5655654 5655655 SGR_3076 SGR_3077     FALSE 0.157 99.000 0.000 1.000   NA
 5655660 5655661 SGR_3082 SGR_3083     FALSE 0.163 45.000 0.000 NA   NA
 5655661 5655662 SGR_3083 SGR_3084     FALSE 0.057 159.000 0.000 NA   NA
 5655662 5655663 SGR_3084 SGR_3085     FALSE 0.032 189.000 0.000 NA   NA
 5655664 5655665 SGR_3086 SGR_3087     FALSE 0.161 46.000 0.000 NA   NA
 5655665 5655666 SGR_3087 SGR_3088     FALSE 0.119 71.000 0.000 NA   NA
 5655667 5655668 SGR_3089 SGR_3090     TRUE 0.929 -3.000 0.095 1.000 N NA
 5655668 5655669 SGR_3090 SGR_3091     TRUE 0.987 -3.000 0.068 0.080 Y NA
 5655669 5655670 SGR_3091 SGR_3092     FALSE 0.353 218.000 0.125 1.000 Y NA
 5655670 5655671 SGR_3092 SGR_3093     TRUE 0.994 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 5655671 5655672 SGR_3093 SGR_3094     TRUE 0.993 9.000 0.875 0.005 Y NA
 5655672 5655673 SGR_3094 SGR_3095     TRUE 0.932 -3.000 0.250 NA   NA
 5655673 5655674 SGR_3095 SGR_3096     TRUE 0.958 -3.000 0.438 NA   NA
 5655681 5655682 SGR_3103 SGR_3104     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5655682 5655683 SGR_3104 SGR_3105     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5655683 5655684 SGR_3105 SGR_3106     TRUE 0.936 -19.000 0.385 NA   NA
 5655684 5655685 SGR_3106 SGR_3107     TRUE 0.951 -3.000 0.308 1.000   NA
 5655685 5655686 SGR_3107 SGR_3108     TRUE 0.997 -3.000 0.800 0.007 Y NA
 5655686 5655687 SGR_3108 SGR_3109     FALSE 0.244 164.000 0.036 1.000 N NA
 5655688 5655689 SGR_3110 SGR_3111     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5655689 5655690 SGR_3111 SGR_3112     FALSE 0.005 301.000 0.000 NA   NA
 5655690 5655691 SGR_3112 SGR_3113     FALSE 0.403 75.000 0.000 0.080   NA
 5655692 5655693 SGR_3114 SGR_3115     FALSE 0.074 137.000 0.000 NA   NA
 5655694 5655695 SGR_3116 SGR_3117     FALSE 0.267 73.000 0.000 1.000 N NA
 5655695 5655696 SGR_3117 SGR_3118     TRUE 0.976 -3.000 0.571 1.000 N NA
 5655697 5655698 SGR_3119 SGR_3120     FALSE 0.305 32.000 0.000 1.000   NA
 5655702 5655703 SGR_3124 SGR_3125     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655706 5655707 SGR_3128 SGR_3129     FALSE 0.090 108.000 0.000 NA   NA
 5655707 5655708 SGR_3129 SGR_3130     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5655709 5655710 SGR_3131 SGR_3132     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655710 5655711 SGR_3132 SGR_3133     TRUE 0.954 -3.000 0.333 1.000   NA
 5655711 5655712 SGR_3133 SGR_3134     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5655714 5655715 SGR_3136 SGR_3137     FALSE 0.051 166.000 0.000 NA   NA
 5655715 5655716 SGR_3137 SGR_3138     FALSE 0.030 191.000 0.000 NA   NA
 5655716 5655717 SGR_3138 SGR_3139     FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 5655718 5655719 SGR_3140 SGR_3141     FALSE 0.127 65.000 0.000 NA   NA
 5655719 5655720 SGR_3141 SGR_3142     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655720 5655721 SGR_3142 SGR_3143     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655721 5655722 SGR_3143 SGR_3144     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 5655723 5655724 SGR_3145 SGR_3146     TRUE 0.558 2.000 0.000 NA   NA
 5655724 5655725 SGR_3146 SGR_3147     FALSE 0.111 85.000 0.000 NA   NA
 5655727 5655728 SGR_3149 SGR_3150     FALSE 0.194 126.000 0.000 1.000 N NA
 5655734 5655735 SGR_3156 SGR_3157     TRUE 0.943 0.000 0.333 1.000   NA
 5655735 5655736 SGR_3157 SGR_3158     TRUE 0.687 2.000 0.000 1.000   NA
 5655737 5655738 SGR_3159 SGR_3160     FALSE 0.001 608.000 0.000 NA   NA
 5655738 5655739 SGR_3160 SGR_3161     FALSE 0.041 204.000 0.000 1.000   NA
 5655739 5655740 SGR_3161 SGR_3162     FALSE 0.122 168.000 0.009 NA   NA
 5655740 5655741 SGR_3162 SGR_3163     FALSE 0.326 136.000 0.094 NA N NA
 5655744 5655745 SGR_3166 SGR_3167     FALSE 0.140 181.000 0.068 NA   NA
 5655746 5655747 SGR_3168 SGR_3169     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 5655747 5655748 SGR_3169 SGR_3170     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 5655748 5655749 SGR_3170 SGR_3171     FALSE 0.014 399.000 0.195 NA   NA
 5655750 5655751 SGR_3172 SGR_3173     TRUE 0.581 28.000 0.108 NA   NA
 5655751 5655752 SGR_3173 SGR_3174     FALSE 0.422 54.000 0.080 NA   NA
 5655752 5655753 SGR_3174 SGR_3175     TRUE 0.910 -22.000 0.257 NA   NA
 5655757 5655758 SGR_3179 SGR_3180     TRUE 0.988 -3.000 0.089 0.041 Y NA
 5655758 5655759 SGR_3180 SGR_3181     TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5655759 5655760 SGR_3181 SGR_3182     TRUE 0.980 2.000 0.286 1.000 Y NA
 5655762 5655763 SGR_3184 SGR_3185     FALSE 0.113 81.000 0.000 NA   NA
 5655763 5655764 SGR_3185 SGR_3186     FALSE 0.105 91.000 0.000 NA   NA
 5655769 5655770 SGR_3191 SGR_3192     TRUE 0.991 -3.000 0.551 NA Y NA
 5655770 5655771 SGR_3192 SGR_3193     TRUE 0.956 -3.000 0.350 1.000   NA
 5655772 5655773 SGR_3194 SGR_3195     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5655773 5655774 SGR_3195 SGR_3196     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5655775 5655776 SGR_3197 SGR_3198     TRUE 0.944 -3.000 0.316 NA   NA
 5655777 5655778 SGR_3199 SGR_3200     TRUE 0.701 57.000 0.103 0.002   NA
 5655778 5655779 SGR_3200 SGR_3201     FALSE 0.460 51.000 0.052 1.000   NA
 5655779 5655780 SGR_3201 SGR_3202     FALSE 0.014 266.000 0.000 1.000   NA
 5655782 5655783 SGR_3204 SGR_3205     TRUE 0.987 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 5655786 5655787 SGR_3208 SGR_3209     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5655790 5655791 SGR_3212 SGR_3213     TRUE 0.713 122.000 0.000 0.041 Y NA
 5655791 5655792 SGR_3213 SGR_3214     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 5655792 5655793 SGR_3214 SGR_3215     TRUE 0.706 64.000 0.000 1.000 Y NA
 5655793 5655794 SGR_3215 SGR_3216     FALSE 0.001 943.000 0.000 NA   NA
 5655796 5655797 SGR_3218 SGR_3219     FALSE 0.092 105.000 0.000 NA   NA
 5655797 5655798 SGR_3219 SGR_3220     FALSE 0.080 129.000 0.000 NA   NA
 5655799 5655800 SGR_3221 SGR_3222     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 5655800 5655801 SGR_3222 SGR_3223     FALSE 0.350 14.000 0.000 NA   NA
 5655801 5655802 SGR_3223 SGR_3224     FALSE 0.178 138.000 0.000 1.000 N NA
 5655802 5655803 SGR_3224 SGR_3225   groEL2 FALSE 0.014 306.000 0.000 1.000 N NA
 5655803 5655804 SGR_3225 SGR_3226 groEL2   FALSE 0.008 367.000 0.000 1.000 N NA
 5655804 5655805 SGR_3226 SGR_3227     FALSE 0.005 443.000 0.000 1.000 N NA
 5655805 5655806 SGR_3227 SGR_3228     TRUE 0.619 36.000 0.090 1.000 N NA
 5655807 5655808 SGR_3229 SGR_3230     FALSE 0.361 48.000 0.019 NA   NA
 5655809 5655810 SGR_3231 SGR_3232     FALSE 0.149 156.000 0.000 1.000 N NA
 5655810 5655811 SGR_3232 SGR_3233     TRUE 0.970 -6.000 0.571 1.000 N NA
 5655812 5655813 SGR_3234 SGR_3235     TRUE 0.988 0.000 0.222 0.026 Y NA
 5655813 5655814 SGR_3235 SGR_3236     FALSE 0.187 134.000 0.000 1.000 N NA
 5655814 5655815 SGR_3236 SGR_3237     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5655815 5655816 SGR_3237 SGR_3238     TRUE 0.689 46.000 0.400 NA   NA
 5655817 5655818 SGR_3239 SGR_3240     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655818 5655819 SGR_3240 SGR_3241     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655819 5655820 SGR_3241 SGR_3242     FALSE 0.294 60.000 0.000 1.000 N NA
 5655820 5655821 SGR_3242 SGR_3243     TRUE 0.798 34.000 0.000 1.000 Y NA
 5655821 5655822 SGR_3243 SGR_3244     FALSE 0.352 44.000 0.000 1.000 N NA
 5655822 5655823 SGR_3244 SGR_3245     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5655823 5655824 SGR_3245 SGR_3246     TRUE 0.990 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5655824 5655825 SGR_3246 SGR_3247     TRUE 0.977 -3.000 0.071 NA Y NA
 5655825 5655826 SGR_3247 SGR_3248     TRUE 0.886 -3.000 0.071 NA   NA
 5655826 5655827 SGR_3248 SGR_3249     TRUE 0.896 -3.000 0.100 NA   NA
 5655827 5655828 SGR_3249 SGR_3250     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655828 5655829 SGR_3250 SGR_3251     FALSE 0.372 54.000 0.040 NA   NA
 5655829 5655830 SGR_3251 SGR_3252     TRUE 0.866 -3.000 0.039 NA   NA
 5655830 5655831 SGR_3252 SGR_3253     TRUE 0.951 -3.000 0.039 0.021   NA
 5655831 5655832 SGR_3253 SGR_3254     TRUE 0.994 -3.000 0.500 0.021 Y NA
 5655832 5655833 SGR_3254 SGR_3255     TRUE 0.743 51.000 0.000 1.000 Y NA
 5655833 5655834 SGR_3255 SGR_3256     FALSE 0.091 106.000 0.000 NA   NA
 5655837 5655838 SGR_3259 SGR_3260     FALSE 0.058 185.000 0.000 1.000   NA
 5655838 5655839 SGR_3260 SGR_3261     TRUE 0.907 84.000 0.667 1.000 Y NA
 5655840 5655841 SGR_3262 SGR_3263     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 5655841 5655842 SGR_3263 SGR_3264     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 5655842 5655843 SGR_3264 SGR_3265     TRUE 0.979 0.000 0.000 0.005 Y NA
 5655843 5655844 SGR_3265 SGR_3266     TRUE 0.979 0.000 0.000 0.005 Y NA
 5655844 5655845 SGR_3266 SGR_3267     FALSE 0.047 357.000 0.000 1.000 Y NA
 5655845 5655846 SGR_3267 SGR_3268     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.044 Y NA
 5655846 5655847 SGR_3268 SGR_3269     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655849 5655850 SGR_3271 SGR_3272     FALSE 0.030 221.000 0.000 1.000   NA
 5655850 5655851 SGR_3272 SGR_3273     TRUE 0.938 0.000 0.235 1.000 N NA
 5655855 5655856 SGR_3277 SGR_3278     FALSE 0.026 200.000 0.000 NA   NA
 5655856 5655857 SGR_3278 SGR_3279     TRUE 0.558 2.000 0.000 NA   NA
 5655857 5655858 SGR_3279 SGR_3280     FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 5655858 5655859 SGR_3280 SGR_3281     FALSE 0.381 12.000 0.000 NA   NA
 5655859 5655860 SGR_3281 SGR_3282     FALSE 0.004 471.000 0.000 1.000 N NA
 5655860 5655861 SGR_3282 SGR_3283     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5655861 5655862 SGR_3283 SGR_3284     FALSE 0.056 187.000 0.000 1.000   NA
 5655862 5655863 SGR_3284 SGR_3285     FALSE 0.395 100.000 0.000 0.030   NA
 5655864 5655865 SGR_3286 SGR_3287     TRUE 0.984 0.000 1.000 1.000 N NA
 5655865 5655866 SGR_3287 SGR_3288     TRUE 0.703 17.000 0.133 NA   NA
 5655869 5655870 SGR_3291 SGR_3292     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 5655873 5655874 SGR_3295 SGR_3296     TRUE 0.947 -3.000 0.333 NA   NA
 5655874 5655875 SGR_3296 SGR_3297     FALSE 0.083 119.000 0.000 NA   NA
 5655876 5655877 SGR_tRNA19 SGR_3298     FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5655877 5655878 SGR_3298 SGR_3299     FALSE 0.397 79.000 0.130 NA   NA
 5655878 5655879 SGR_3299 SGR_3300     FALSE 0.011 327.000 0.000 1.000 N NA
 5655879 5655880 SGR_3300 SGR_3301     FALSE 0.066 202.000 0.000 1.000 N NA
 5655880 5655881 SGR_3301 SGR_3302     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5655881 5655882 SGR_3302 SGR_3303     FALSE 0.006 469.000 0.043 NA   NA
 5655882 5655883 SGR_3303 SGR_3304     TRUE 0.581 28.000 0.109 NA   NA
 5655883 5655884 SGR_3304 SGR_3305     FALSE 0.006 427.000 0.020 NA   NA
 5655884 5655885 SGR_3305 SGR_3306     FALSE 0.002 567.000 0.000 NA N NA
 5655885 5655886 SGR_3306 SGR_3307     TRUE 0.643 200.000 0.650 NA Y NA
 5655888 5655889 SGR_3309 SGR_3310     FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   NA
 5655890 5655891 SGR_3311 SGR_3312     TRUE 0.984 -3.000 0.500 0.003   NA
 5655891 5655892 SGR_3312 SGR_3313     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5655892 5655893 SGR_3313 SGR_3314     FALSE 0.003 348.000 0.000 NA   NA
 5655893 5655894 SGR_3314 SGR_3315     TRUE 0.820 26.000 0.500 NA   NA
 5655895 5655896 SGR_3316 SGR_3317     TRUE 0.952 -10.000 0.500 NA   NA
 5655896 5655897 SGR_3317 SGR_3318     FALSE 0.001 805.000 0.000 NA   NA
 5655897 5655898 SGR_3318 SGR_3319     TRUE 0.944 -3.000 0.323 NA   NA
 5655898 5655899 SGR_3319 SGR_3320     TRUE 0.992 -3.000 0.659 NA Y NA
 5655899 5655900 SGR_3320 SGR_3321     TRUE 0.983 -3.000 0.776 1.000 N NA
 5655905 5655906 SGR_3326 SGR_3327     FALSE 0.095 231.000 0.095 1.000 N NA
 5655906 5655907 SGR_3327 SGR_3328     TRUE 0.576 41.000 0.207 NA   NA
 5655907 5655908 SGR_3328 SGR_3329     TRUE 0.961 -3.000 0.494 NA   NA
 5655909 5655910 SGR_3330 SGR_3331     TRUE 0.588 92.000 0.367 1.000   NA
 5655910 5655911 SGR_3331 SGR_3332     FALSE 0.316 95.000 0.025 1.000   NA
 5655913 5655914 SGR_3334 SGR_3335     TRUE 0.961 -3.000 0.123 0.015   NA
 5655914 5655915 SGR_3335 SGR_3336     FALSE 0.022 328.000 0.150 NA   NA
 5655915 5655916 SGR_3336 SGR_3337     TRUE 0.936 0.000 0.340 NA   NA
 5655917 5655918 SGR_3338 SGR_3339     TRUE 0.996 -3.000 0.709 0.001 Y NA
 5655922 5655923 SGR_3343 SGR_3344     FALSE 0.204 134.000 0.021 NA   NA
 5655923 5655924 SGR_3344 SGR_tRNA20     FALSE 0.217 29.000 0.000 NA   NA
 5655925 5655926 SGR_3345 SGR_3346     FALSE 0.021 212.000 0.000 NA   NA
 5655926 5655927 SGR_3346 SGR_3347     FALSE 0.016 227.000 0.000 NA   NA
 5655927 5655928 SGR_3347 SGR_3348     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655928 5655929 SGR_3348 SGR_3349     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5655929 5655930 SGR_3349 SGR_3350     FALSE 0.103 93.000 0.000 NA   NA
 5655930 5655931 SGR_3350 SGR_3351     FALSE 0.321 16.000 0.000 NA   NA
 5655931 5655932 SGR_3351 SGR_3352     FALSE 0.271 21.000 0.000 NA   NA
 5655932 5655933 SGR_3352 SGR_3353     FALSE 0.112 82.000 0.000 NA   NA
 5655933 5655934 SGR_3353 SGR_3354     FALSE 0.174 88.000 0.000 1.000   NA
 5655934 5655935 SGR_3354 SGR_3355     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5655936 5655937 SGR_3356 SGR_3357     TRUE 0.852 23.000 0.500 1.000   NA
 5655939 5655940 SGR_3359 SGR_3360     FALSE 0.001 1108.000 0.000 NA   NA
 5655940 5655941 SGR_3360 SGR_3361     FALSE 0.029 194.000 0.000 NA   NA
 5655941 5655942 SGR_3361 SGR_3362     FALSE 0.112 82.000 0.000 NA   NA
 5655945 5655946 SGR_3365 SGR_3366     FALSE 0.447 7.000 0.000 NA   NA
 5655947 5655948 SGR_3367 SGR_3368     FALSE 0.486 52.000 0.152 NA   NA
 5655949 5655950 SGR_3369 SGR_3370     TRUE 0.917 -3.000 0.182 NA   NA
 5655950 5655951 SGR_3370 SGR_3371   asd FALSE 0.008 360.000 0.000 1.000 N NA
 5655951 5655952 SGR_3371 SGR_3372 asd ask TRUE 0.981 -3.000 0.119 1.000 Y NA
 5655952 5655953 SGR_3372 SGR_3373 ask   FALSE 0.005 317.000 0.000 NA   NA
 5655953 5655954 SGR_3373 SGR_3374     FALSE 0.002 408.000 0.000 NA   NA
 5655956 5655957 SGR_3376 SGR_3377     FALSE 0.210 126.000 0.019 NA   NA
 5655957 5655958 SGR_3377 SGR_3378     TRUE 0.649 105.000 0.604 NA   NA
 5655960 5655961 SGR_3380 SGR_3381     TRUE 0.530 61.000 0.250 NA   NA
 5655961 5655962 SGR_3381 SGR_3382     FALSE 0.234 208.000 0.333 1.000 N NA
 5655963 5655964 SGR_3383 SGR_3384     TRUE 0.900 -3.000 0.114 NA   NA
 5655964 5655965 SGR_3384 SGR_3385     FALSE 0.131 322.000 0.200 1.000 Y NA
 5655967 5655968 SGR_3387 SGR_3388     FALSE 0.392 81.000 0.000 0.084   NA
 5655969 5655970 SGR_3389 SGR_3390     TRUE 0.769 195.000 0.625 0.042 Y NA
 5655978 5655979 SGR_3398 SGR_3399     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5655979 5655980 SGR_3399 SGR_3400   chiC FALSE 0.005 303.000 0.000 NA   NA
 5655980 5655981 SGR_3400 SGR_3401 chiC   FALSE 0.040 301.000 0.000 0.002   NA
 5655981 5655982 SGR_3401 SGR_3402     FALSE 0.013 269.000 0.000 1.000   NA
 5655985 5655986 SGR_3405 SGR_3406     FALSE 0.194 34.000 0.000 NA   NA
 5655986 5655987 SGR_3406 SGR_3407     FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 5655988 5655989 SGR_3408 SGR_3409     FALSE 0.280 154.000 0.040 1.000 N NA
 5655989 5655990 SGR_3409 SGR_3410     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.025 Y NA
 5655990 5655991 SGR_3410 SGR_3411     FALSE 0.153 154.000 0.000 1.000 N NA
 5655991 5655992 SGR_3411 SGR_3412     FALSE 0.216 106.000 0.000 1.000 N NA
 5655992 5655993 SGR_3412 SGR_3413     FALSE 0.328 123.000 0.028 1.000 N NA
 5655993 5655994 SGR_3413 SGR_3414     TRUE 0.973 -7.000 0.056 1.000 Y NA
 5655994 5655995 SGR_3414 SGR_3415     FALSE 0.215 145.000 0.047 NA   NA
 5655995 5655996 SGR_3415 SGR_3416     FALSE 0.215 157.000 0.078 NA   NA
 5655996 5655997 SGR_3416 SGR_3417     FALSE 0.279 124.000 0.033 1.000   NA
 5655997 5655998 SGR_3417 SGR_3418     FALSE 0.351 92.000 0.005 1.000 N NA
 5655998 5655999 SGR_3418 SGR_3419     FALSE 0.238 158.000 0.014 1.000 N NA
 5655999 5656000 SGR_3419 SGR_3420     FALSE 0.486 49.000 0.016 1.000 N NA
 5656000 5656001 SGR_3420 SGR_3421     FALSE 0.479 72.000 0.222 NA   NA
 5656001 5656002 SGR_3421 SGR_3422     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5656002 5656003 SGR_3422 SGR_3423     FALSE 0.359 68.000 0.058 NA   NA
 5656005 5656006 SGR_3425 SGR_3426     FALSE 0.112 170.000 0.005 NA   NA
 5656009 5656010 SGR_3429 SGR_3430     FALSE 0.048 169.000 0.000 NA   NA
 5656011 5656012 SGR_3431 SGR_3432   dnaJ TRUE 0.871 2.000 0.074 1.000   NA
 5656012 5656013 SGR_3432 SGR_3433 dnaJ   TRUE 0.845 97.000 0.068 0.003 Y NA
 5656013 5656014 SGR_3433 SGR_3434   dnaK TRUE 0.989 -3.000 0.074 0.003 Y NA
 5656015 5656016 SGR_3435 SGR_3436     FALSE 0.175 96.000 0.000 NA N NA
 5656016 5656017 SGR_3436 SGR_3437     FALSE 0.002 447.000 0.000 NA   NA
 5656017 5656018 SGR_3437 SGR_3438     FALSE 0.083 119.000 0.000 NA   NA
 5656019 5656020 SGR_3439 SGR_3440     TRUE 0.757 7.000 0.015 1.000   NA
 5656020 5656021 SGR_3440 SGR_3441     FALSE 0.058 205.000 0.005 NA   NA
 5656024 5656025 SGR_3443 SGR_3444     FALSE 0.002 416.000 0.000 NA   NA
 5656025 5656026 SGR_3444 SGR_3445     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656027 5656028 SGR_3446 SGR_3447     FALSE 0.003 467.000 0.000 1.000   NA
 5656029 5656030 SGR_3448 SGR_3449     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5656030 5656031 SGR_3449 SGR_3450     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5656031 5656032 SGR_3450 SGR_3451     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5656032 5656033 SGR_3451 SGR_3452     FALSE 0.001 594.000 0.000 NA   NA
 5656033 5656034 SGR_3452 SGR_3453     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5656035 5656036 SGR_3454 SGR_3455     TRUE 0.558 2.000 0.000 NA   NA
 5656037 5656038 SGR_3456 SGR_3457     FALSE 0.194 34.000 0.000 NA   NA
 5656038 5656039 SGR_3457 SGR_3458     FALSE 0.017 221.000 0.000 NA   NA
 5656039 5656040 SGR_3458 SGR_3459     FALSE 0.381 12.000 0.000 NA   NA
 5656043 5656044 SGR_3462 SGR_3463     FALSE 0.163 45.000 0.000 NA   NA
 5656044 5656045 SGR_3463 SGR_3464     FALSE 0.050 167.000 0.000 NA   NA
 5656047 5656048 SGR_3466 SGR_3467     FALSE 0.011 288.000 0.000 1.000   NA
 5656048 5656049 SGR_3467 SGR_3468     TRUE 0.981 17.000 1.000 1.000 Y NA
 5656049 5656050 SGR_3468 SGR_3469     FALSE 0.170 42.000 0.000 NA   NA
 5656050 5656051 SGR_3469 SGR_3470     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 5656052 5656053 SGR_3471 SGR_3472     FALSE 0.117 149.000 0.000 NA N NA
 5656053 5656054 SGR_3472 SGR_3473     FALSE 0.003 356.000 0.000 NA   NA
 5656054 5656055 SGR_3473 SGR_3474     TRUE 0.687 2.000 0.000 1.000   NA
 5656057 5656058 SGR_3476 SGR_3477     FALSE 0.002 415.000 0.000 NA   NA
 5656058 5656059 SGR_3477 SGR_3478     TRUE 0.558 2.000 0.000 NA   NA
 5656059 5656060 SGR_3478 SGR_3479     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5656060 5656061 SGR_3479 SGR_3480     TRUE 0.977 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 5656061 5656062 SGR_3480 SGR_3481     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5656062 5656063 SGR_3481 SGR_3482     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5656063 5656064 SGR_3482 SGR_3483     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5656064 5656065 SGR_3483 SGR_3484     FALSE 0.345 46.000 0.000 1.000 N NA
 5656065 5656066 SGR_3484 SGR_3485     FALSE 0.121 138.000 0.000 1.000   NA
 5656066 5656067 SGR_3485 SGR_3486     FALSE 0.082 120.000 0.000 NA   NA
 5656067 5656068 SGR_3486 SGR_3487     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5656070 5656071 SGR_3489 SGR_3490     FALSE 0.007 325.000 0.000 1.000   NA
 5656071 5656072 SGR_3490 SGR_3491     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5656072 5656073 SGR_3491 SGR_3492     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5656073 5656074 SGR_3492 SGR_3493     TRUE 0.977 -25.000 1.000 NA   NA
 5656074 5656075 SGR_3493 SGR_3494     TRUE 0.808 66.000 0.800 1.000   NA
 5656075 5656076 SGR_3494 SGR_3495     FALSE 0.397 34.000 0.000 1.000 N NA
 5656076 5656077 SGR_3495 SGR_3496     FALSE 0.112 82.000 0.000 NA   NA
 5656079 5656080 SGR_3498 SGR_3499     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 5656080 5656081 SGR_3499 SGR_3500     TRUE 0.804 39.000 0.118 0.000 N NA
 5656081 5656082 SGR_3500 SGR_3501     FALSE 0.475 121.000 0.000 0.000 N NA
 5656082 5656083 SGR_3501 SGR_3502     FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 5656085 5656086 SGR_3504 SGR_3505     TRUE 0.977 2.000 0.800 1.000 N NA
 5656088 5656089 SGR_3507 SGR_3508     FALSE 0.234 51.000 0.000 1.000   NA
 5656090 5656091 SGR_3509 SGR_3510     FALSE 0.147 52.000 0.000 NA   NA
 5656091 5656092 SGR_3510 SGR_3511     TRUE 0.557 98.000 0.400 NA   NA
 5656092 5656093 SGR_3511 SGR_3512     FALSE 0.150 246.000 0.000 1.000 Y NA
 5656093 5656094 SGR_3512 SGR_3513     FALSE 0.006 339.000 0.000 1.000   NA
 5656095 5656096 SGR_3514 SGR_3515     TRUE 0.847 11.000 0.286 NA   NA
 5656096 5656097 SGR_3515 SGR_3516     FALSE 0.126 66.000 0.000 NA   NA
 5656097 5656098 SGR_3516 SGR_3517     TRUE 0.932 -3.000 0.250 NA   NA
 5656100 5656101 SGR_3519 SGR_3520     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5656102 5656103 SGR_3521 SGR_3522     FALSE 0.321 16.000 0.000 NA   NA
 5656104 5656105 SGR_3523 SGR_3524     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5656105 5656106 SGR_3524 SGR_3525     FALSE 0.082 122.000 0.000 NA   NA
 5656106 5656107 SGR_3525 SGR_3526     FALSE 0.057 159.000 0.000 NA   NA
 5656108 5656109 SGR_3527 SGR_3528     TRUE 0.989 -3.000 0.065 0.006 Y NA
 5656110 5656111 SGR_3529 SGR_3530     FALSE 0.256 23.000 0.000 NA   NA
 5656111 5656112 SGR_3530 SGR_3531     FALSE 0.006 348.000 0.000 1.000   NA
 5656112 5656113 SGR_3531 SGR_3532     FALSE 0.019 245.000 0.000 1.000   NA
 5656113 5656114 SGR_3532 SGR_3533     FALSE 0.003 341.000 0.000 NA   NA
 5656114 5656115 SGR_3533 SGR_3534     FALSE 0.125 194.000 0.102 NA   NA
 5656117 5656118 SGR_3536 SGR_3537     FALSE 0.100 188.000 0.031 NA   NA
 5656118 5656119 SGR_3537 SGR_tRNA22     FALSE 0.105 91.000 0.000 NA   NA
 11450181 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6418.000 0.000 NA   NA
 11592544 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6418.000 0.000 NA   NA
 11734936 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6418.000 0.000 NA   NA
 11450182 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6447.000 0.000 NA   NA
 11592545 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6447.000 0.000 NA   NA
 11734937 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6447.000 0.000 NA   NA
 11450183 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6479.000 0.000 NA   NA
 11592546 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6479.000 0.000 NA   NA
 11734938 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6479.000 0.000 NA   NA
 11450184 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6508.000 0.000 NA   NA
 11592547 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6508.000 0.000 NA   NA
 11734939 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6508.000 0.000 NA   NA
 11450185 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6540.000 0.000 NA   NA
 11592548 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6540.000 0.000 NA   NA
 11734940 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6540.000 0.000 NA   NA
 11450186 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6569.000 0.000 NA   NA
 11592549 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6569.000 0.000 NA   NA
 11734941 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6569.000 0.000 NA   NA
 11450187 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6601.000 0.000 NA   NA
 11592550 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6601.000 0.000 NA   NA
 11734942 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6601.000 0.000 NA   NA
 11450188 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6630.000 0.000 NA   NA
 11592551 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6630.000 0.000 NA   NA
 11734943 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6630.000 0.000 NA   NA
 11450189 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6662.000 0.000 NA   NA
 11592552 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6662.000 0.000 NA   NA
 11734944 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6662.000 0.000 NA   NA
 11450190 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6691.000 0.000 NA   NA
 11592553 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6691.000 0.000 NA   NA
 11734945 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6691.000 0.000 NA   NA
 11450191 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6723.000 0.000 NA   NA
 11592554 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6723.000 0.000 NA   NA
 11734946 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6723.000 0.000 NA   NA
 11450192 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6752.000 0.000 NA   NA
 11592555 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6752.000 0.000 NA   NA
 11734947 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6752.000 0.000 NA   NA
 11450193 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6784.000 0.000 NA   NA
 11592556 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6784.000 0.000 NA   NA
 11734948 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6784.000 0.000 NA   NA
 11450194 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6813.000 0.000 NA   NA
 11592557 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6813.000 0.000 NA   NA
 11734949 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6813.000 0.000 NA   NA
 11450195 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6845.000 0.000 NA   NA
 11592558 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6845.000 0.000 NA   NA
 11734950 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6845.000 0.000 NA   NA
 11450196 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6874.000 0.000 NA   NA
 11592559 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6874.000 0.000 NA   NA
 11734951 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6874.000 0.000 NA   NA
 11450197 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6906.000 0.000 NA   NA
 11592560 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6906.000 0.000 NA   NA
 11734952 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6906.000 0.000 NA   NA
 11450198 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6935.000 0.000 NA   NA
 11592561 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6935.000 0.000 NA   NA
 11734953 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6935.000 0.000 NA   NA
 11450199 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6967.000 0.000 NA   NA
 11592562 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6967.000 0.000 NA   NA
 11734954 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6967.000 0.000 NA   NA
 11450200 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6996.000 0.000 NA   NA
 11592563 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6996.000 0.000 NA   NA
 11734955 5656112   SGR_3531     FALSE NA 6996.000 0.000 NA   NA
 11450201 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7028.000 0.000 NA   NA
 11592564 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7028.000 0.000 NA   NA
 11734956 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7028.000 0.000 NA   NA
 11450202 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7057.000 0.000 NA   NA
 11592565 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7057.000 0.000 NA   NA
 11734957 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7057.000 0.000 NA   NA
 11450203 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7089.000 0.000 NA   NA
 11592566 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7089.000 0.000 NA   NA
 11734958 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7089.000 0.000 NA   NA
 11450204 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7118.000 0.000 NA   NA
 11592567 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7118.000 0.000 NA   NA
 11734959 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7118.000 0.000 NA   NA
 11450205 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7150.000 0.000 NA   NA
 11592568 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7150.000 0.000 NA   NA
 11734960 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7150.000 0.000 NA   NA
 11450206 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7179.000 0.000 NA   NA
 11592569 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7179.000 0.000 NA   NA
 11734961 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7179.000 0.000 NA   NA
 11450207 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7211.000 0.000 NA   NA
 11592570 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7211.000 0.000 NA   NA
 11734962 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7211.000 0.000 NA   NA
 11450208 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7240.000 0.000 NA   NA
 11592571 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7240.000 0.000 NA   NA
 11734963 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7240.000 0.000 NA   NA
 11450209 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7272.000 0.000 NA   NA
 11592572 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7272.000 0.000 NA   NA
 11734964 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7272.000 0.000 NA   NA
 11450210 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7301.000 0.000 NA   NA
 11592573 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7301.000 0.000 NA   NA
 11734965 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7301.000 0.000 NA   NA
 11450211 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7333.000 0.000 NA   NA
 11592574 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7333.000 0.000 NA   NA
 11734966 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7333.000 0.000 NA   NA
 11450212 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7362.000 0.000 NA   NA
 11592575 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7362.000 0.000 NA   NA
 11734967 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7362.000 0.000 NA   NA
 11450213 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7394.000 0.000 NA   NA
 11592576 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7394.000 0.000 NA   NA
 11734968 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7394.000 0.000 NA   NA
 11450214 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7423.000 0.000 NA   NA
 11592577 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7423.000 0.000 NA   NA
 11734969 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7423.000 0.000 NA   NA
 11450215 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7455.000 0.000 NA   NA
 11592578 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7455.000 0.000 NA   NA
 11734970 5656112   SGR_3531     FALSE NA 7455.000 0.000 NA   NA
 5656121 5656122 SGR_3539 SGR_3540     FALSE 0.128 64.000 0.000 NA   NA
 5656122 5656123 SGR_3540 SGR_3541     FALSE 0.009 260.000 0.000 NA   NA
 5656123 5656124 SGR_3541 SGR_3542     FALSE 0.001 1433.000 0.000 NA   NA
 11450216 5656123   SGR_3541     FALSE NA 231.000 0.000 NA   NA
 11592579 5656123   SGR_3541     FALSE NA 231.000 0.000 NA   NA
 11734971 5656123   SGR_3541     FALSE NA 231.000 0.000 NA   NA
 11450217 5656123   SGR_3541     FALSE NA 260.000 0.000 NA   NA
 11592580 5656123   SGR_3541     FALSE NA 260.000 0.000 NA   NA
 11734972 5656123   SGR_3541     FALSE NA 260.000 0.000 NA   NA
 11450218 5656123   SGR_3541     FALSE NA 292.000 0.000 NA   NA
 11592581 5656123   SGR_3541     FALSE NA 292.000 0.000 NA   NA
 11734973 5656123   SGR_3541     FALSE NA 292.000 0.000 NA   NA
 11450219 5656123   SGR_3541     FALSE NA 321.000 0.000 NA   NA
 11592582 5656123   SGR_3541     FALSE NA 321.000 0.000 NA   NA
 11734974 5656123   SGR_3541     FALSE NA 321.000 0.000 NA   NA
 11450220 5656123   SGR_3541     FALSE NA 353.000 0.000 NA   NA
 11592583 5656123   SGR_3541     FALSE NA 353.000 0.000 NA   NA
 11734975 5656123   SGR_3541     FALSE NA 353.000 0.000 NA   NA
 11450221 5656123   SGR_3541     FALSE NA 382.000 0.000 NA   NA
 11592584 5656123   SGR_3541     FALSE NA 382.000 0.000 NA   NA
 11734976 5656123   SGR_3541     FALSE NA 382.000 0.000 NA   NA
 11450222 5656123   SGR_3541     FALSE NA 418.000 0.000 NA   NA
 11592585 5656123   SGR_3541     FALSE NA 418.000 0.000 NA   NA
 11734977 5656123   SGR_3541     FALSE NA 418.000 0.000 NA   NA
 11450223 5656123   SGR_3541     FALSE NA 447.000 0.000 NA   NA
 11592586 5656123   SGR_3541     FALSE NA 447.000 0.000 NA   NA
 11734978 5656123   SGR_3541     FALSE NA 447.000 0.000 NA   NA
 11450224 5656123   SGR_3541     FALSE NA 479.000 0.000 NA   NA
 11592587 5656123   SGR_3541     FALSE NA 479.000 0.000 NA   NA
 11734979 5656123   SGR_3541     FALSE NA 479.000 0.000 NA   NA
 11450225 5656123   SGR_3541     FALSE NA 508.000 0.000 NA   NA
 11592588 5656123   SGR_3541     FALSE NA 508.000 0.000 NA   NA
 11734980 5656123   SGR_3541     FALSE NA 508.000 0.000 NA   NA
 11450226 5656123   SGR_3541     FALSE NA 540.000 0.000 NA   NA
 11592589 5656123   SGR_3541     FALSE NA 540.000 0.000 NA   NA
 11734981 5656123   SGR_3541     FALSE NA 540.000 0.000 NA   NA
 11450227 5656123   SGR_3541     FALSE NA 569.000 0.000 NA   NA
 11592590 5656123   SGR_3541     FALSE NA 569.000 0.000 NA   NA
 11734982 5656123   SGR_3541     FALSE NA 569.000 0.000 NA   NA
 11450228 5656123   SGR_3541     FALSE NA 601.000 0.000 NA   NA
 11592591 5656123   SGR_3541     FALSE NA 601.000 0.000 NA   NA
 11734983 5656123   SGR_3541     FALSE NA 601.000 0.000 NA   NA
 11450229 5656123   SGR_3541     FALSE NA 630.000 0.000 NA   NA
 11592592 5656123   SGR_3541     FALSE NA 630.000 0.000 NA   NA
 11734984 5656123   SGR_3541     FALSE NA 630.000 0.000 NA   NA
 11450230 5656123   SGR_3541     FALSE NA 662.000 0.000 NA   NA
 11592593 5656123   SGR_3541     FALSE NA 662.000 0.000 NA   NA
 11734985 5656123   SGR_3541     FALSE NA 662.000 0.000 NA   NA
 11450231 5656123   SGR_3541     FALSE NA 691.000 0.000 NA   NA
 11592594 5656123   SGR_3541     FALSE NA 691.000 0.000 NA   NA
 11734986 5656123   SGR_3541     FALSE NA 691.000 0.000 NA   NA
 11450232 5656123   SGR_3541     FALSE NA 723.000 0.000 NA   NA
 11592595 5656123   SGR_3541     FALSE NA 723.000 0.000 NA   NA
 11734987 5656123   SGR_3541     FALSE NA 723.000 0.000 NA   NA
 11450233 5656123   SGR_3541     FALSE NA 752.000 0.000 NA   NA
 11592596 5656123   SGR_3541     FALSE NA 752.000 0.000 NA   NA
 11734988 5656123   SGR_3541     FALSE NA 752.000 0.000 NA   NA
 11450234 5656123   SGR_3541     FALSE NA 784.000 0.000 NA   NA
 11592597 5656123   SGR_3541     FALSE NA 784.000 0.000 NA   NA
 11734989 5656123   SGR_3541     FALSE NA 784.000 0.000 NA   NA
 11450235 5656123   SGR_3541     FALSE NA 813.000 0.000 NA   NA
 11592598 5656123   SGR_3541     FALSE NA 813.000 0.000 NA   NA
 11734990 5656123   SGR_3541     FALSE NA 813.000 0.000 NA   NA
 11450236 5656123   SGR_3541     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11592599 5656123   SGR_3541     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11734991 5656123   SGR_3541     FALSE NA 843.000 0.000 NA   NA
 11450237 5656123   SGR_3541     FALSE NA 872.000 0.000 NA   NA
 11592600 5656123   SGR_3541     FALSE NA 872.000 0.000 NA   NA
 11734992 5656123   SGR_3541     FALSE NA 872.000 0.000 NA   NA
 11450238 5656123   SGR_3541     FALSE NA 904.000 0.000 NA   NA
 11592601 5656123   SGR_3541     FALSE NA 904.000 0.000 NA   NA
 11734993 5656123   SGR_3541     FALSE NA 904.000 0.000 NA   NA
 11450239 5656123   SGR_3541     FALSE NA 933.000 0.000 NA   NA
 11592602 5656123   SGR_3541     FALSE NA 933.000 0.000 NA   NA
 11734994 5656123   SGR_3541     FALSE NA 933.000 0.000 NA   NA
 11450240 5656123   SGR_3541     FALSE NA 965.000 0.000 NA   NA
 11592603 5656123   SGR_3541     FALSE NA 965.000 0.000 NA   NA
 11734995 5656123   SGR_3541     FALSE NA 965.000 0.000 NA   NA
 11450241 5656123   SGR_3541     FALSE NA 994.000 0.000 NA   NA
 11592604 5656123   SGR_3541     FALSE NA 994.000 0.000 NA   NA
 11734996 5656123   SGR_3541     FALSE NA 994.000 0.000 NA   NA
 11450242 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1026.000 0.000 NA   NA
 11592605 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1026.000 0.000 NA   NA
 11734997 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1026.000 0.000 NA   NA
 11450243 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1055.000 0.000 NA   NA
 11592606 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1055.000 0.000 NA   NA
 11734998 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1055.000 0.000 NA   NA
 11450244 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1087.000 0.000 NA   NA
 11592607 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1087.000 0.000 NA   NA
 11734999 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1087.000 0.000 NA   NA
 11450245 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1116.000 0.000 NA   NA
 11592608 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1116.000 0.000 NA   NA
 11735000 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1116.000 0.000 NA   NA
 11450246 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1148.000 0.000 NA   NA
 11592609 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1148.000 0.000 NA   NA
 11735001 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1148.000 0.000 NA   NA
 11450247 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
 11592610 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
 11735002 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1177.000 0.000 NA   NA
 11450248 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1209.000 0.000 NA   NA
 11592611 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1209.000 0.000 NA   NA
 11735003 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1209.000 0.000 NA   NA
 11450249 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1238.000 0.000 NA   NA
 11592612 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1238.000 0.000 NA   NA
 11735004 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1238.000 0.000 NA   NA
 11450250 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1270.000 0.000 NA   NA
 11592613 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1270.000 0.000 NA   NA
 11735005 5656123   SGR_3541     FALSE NA 1270.000 0.000 NA   NA
 5656124 5656125 SGR_3542 SGR_3543     TRUE 0.920 -3.000 0.198 NA   NA
 5656125 5656126 SGR_3543 SGR_3544     FALSE 0.375 119.000 0.216 NA   NA
 5656126 5656127 SGR_3544 SGR_3545     TRUE 0.944 -3.000 0.318 NA   NA
 5656127 5656128 SGR_3545 SGR_3546     TRUE 0.949 0.000 0.444 NA   NA
 5656128 5656129 SGR_3546 SGR_3547     TRUE 0.969 -3.000 0.589 NA   NA
 5656129 5656130 SGR_3547 SGR_3548     TRUE 0.966 -3.000 0.509 NA   NA
 5656130 5656131 SGR_3548 SGR_3549     FALSE 0.001 2009.000 0.000 NA   NA
 11450251 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1459.000 0.000 NA   NA
 11592614 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1459.000 0.000 NA   NA
 11735006 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1459.000 0.000 NA   NA
 11450252 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11592615 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11735007 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1487.000 0.000 NA   NA
 11450253 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1520.000 0.000 NA   NA
 11592616 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1520.000 0.000 NA   NA
 11735008 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1520.000 0.000 NA   NA
 11450254 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1548.000 0.000 NA   NA
 11592617 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1548.000 0.000 NA   NA
 11735009 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1548.000 0.000 NA   NA
 11450255 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1581.000 0.000 NA   NA
 11592618 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1581.000 0.000 NA   NA
 11735010 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1581.000 0.000 NA   NA
 11450256 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1609.000 0.000 NA   NA
 11592619 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1609.000 0.000 NA   NA
 11735011 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1609.000 0.000 NA   NA
 11450257 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1642.000 0.000 NA   NA
 11592620 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1642.000 0.000 NA   NA
 11735012 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1642.000 0.000 NA   NA
 11450258 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1670.000 0.000 NA   NA
 11592621 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1670.000 0.000 NA   NA
 11735013 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1670.000 0.000 NA   NA
 11450259 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1703.000 0.000 NA   NA
 11592622 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1703.000 0.000 NA   NA
 11735014 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1703.000 0.000 NA   NA
 11450260 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1731.000 0.000 NA   NA
 11592623 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1731.000 0.000 NA   NA
 11735015 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1731.000 0.000 NA   NA
 11450261 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1764.000 0.000 NA   NA
 11592624 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1764.000 0.000 NA   NA
 11735016 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1764.000 0.000 NA   NA
 11450262 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1792.000 0.000 NA   NA
 11592625 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1792.000 0.000 NA   NA
 11735017 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1792.000 0.000 NA   NA
 11450263 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1825.000 0.000 NA   NA
 11592626 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1825.000 0.000 NA   NA
 11735018 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1825.000 0.000 NA   NA
 11450264 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1853.000 0.000 NA   NA
 11592627 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1853.000 0.000 NA   NA
 11735019 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1853.000 0.000 NA   NA
 11450265 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1886.000 0.000 NA   NA
 11592628 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1886.000 0.000 NA   NA
 11735020 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1886.000 0.000 NA   NA
 11450266 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1914.000 0.000 NA   NA
 11592629 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1914.000 0.000 NA   NA
 11735021 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1914.000 0.000 NA   NA
 11450267 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1947.000 0.000 NA   NA
 11592630 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1947.000 0.000 NA   NA
 11735022 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1947.000 0.000 NA   NA
 11450268 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1975.000 0.000 NA   NA
 11592631 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1975.000 0.000 NA   NA
 11735023 5656128   SGR_3546     FALSE NA 1975.000 0.000 NA   NA
 11450269 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2008.000 0.000 NA   NA
 11592632 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2008.000 0.000 NA   NA
 11735024 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2008.000 0.000 NA   NA
 11450270 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2036.000 0.000 NA   NA
 11592633 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2036.000 0.000 NA   NA
 11735025 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2036.000 0.000 NA   NA
 11450271 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2069.000 0.000 NA   NA
 11592634 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2069.000 0.000 NA   NA
 11735026 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2069.000 0.000 NA   NA
 11450272 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2097.000 0.000 NA   NA
 11592635 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2097.000 0.000 NA   NA
 11735027 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2097.000 0.000 NA   NA
 11450273 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2130.000 0.000 NA   NA
 11592636 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2130.000 0.000 NA   NA
 11735028 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2130.000 0.000 NA   NA
 11450274 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2158.000 0.000 NA   NA
 11592637 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2158.000 0.000 NA   NA
 11735029 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2158.000 0.000 NA   NA
 11450275 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2191.000 0.000 NA   NA
 11592638 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2191.000 0.000 NA   NA
 11735030 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2191.000 0.000 NA   NA
 11450276 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2219.000 0.000 NA   NA
 11592639 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2219.000 0.000 NA   NA
 11735031 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2219.000 0.000 NA   NA
 11450277 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2251.000 0.000 NA   NA
 11592640 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2251.000 0.000 NA   NA
 11735032 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2251.000 0.000 NA   NA
 11450278 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2279.000 0.000 NA   NA
 11592641 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2279.000 0.000 NA   NA
 11735033 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2279.000 0.000 NA   NA
 11450279 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2312.000 0.000 NA   NA
 11592642 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2312.000 0.000 NA   NA
 11735034 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2312.000 0.000 NA   NA
 11450280 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2340.000 0.000 NA   NA
 11592643 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2340.000 0.000 NA   NA
 11735035 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2340.000 0.000 NA   NA
 11450281 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2373.000 0.000 NA   NA
 11592644 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2373.000 0.000 NA   NA
 11735036 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2373.000 0.000 NA   NA
 11450282 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2401.000 0.000 NA   NA
 11592645 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2401.000 0.000 NA   NA
 11735037 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2401.000 0.000 NA   NA
 11450283 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2434.000 0.000 NA   NA
 11592646 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2434.000 0.000 NA   NA
 11735038 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2434.000 0.000 NA   NA
 11450284 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2462.000 0.000 NA   NA
 11592647 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2462.000 0.000 NA   NA
 11735039 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2462.000 0.000 NA   NA
 11450285 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2495.000 0.000 NA   NA
 11592648 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2495.000 0.000 NA   NA
 11735040 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2495.000 0.000 NA   NA
 11450286 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2523.000 0.000 NA   NA
 11592649 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2523.000 0.000 NA   NA
 11735041 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2523.000 0.000 NA   NA
 11450287 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2556.000 0.000 NA   NA
 11592650 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2556.000 0.000 NA   NA
 11735042 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2556.000 0.000 NA   NA
 11450288 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2585.000 0.000 NA   NA
 11592651 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2585.000 0.000 NA   NA
 11735043 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2585.000 0.000 NA   NA
 11450289 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2615.000 0.000 NA   NA
 11592652 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2615.000 0.000 NA   NA
 11735044 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2615.000 0.000 NA   NA
 11450290 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2644.000 0.000 NA   NA
 11592653 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2644.000 0.000 NA   NA
 11735045 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2644.000 0.000 NA   NA
 11450291 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2677.000 0.000 NA   NA
 11592654 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2677.000 0.000 NA   NA
 11735046 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2677.000 0.000 NA   NA
 11450292 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2706.000 0.000 NA   NA
 11592655 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2706.000 0.000 NA   NA
 11735047 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2706.000 0.000 NA   NA
 11450293 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2738.000 0.000 NA   NA
 11592656 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2738.000 0.000 NA   NA
 11735048 5656128   SGR_3546     FALSE NA 2738.000 0.000 NA   NA
 5656131 5656132 SGR_3549 SGR_3550     TRUE 0.906 11.000 0.500 NA   NA
 5656132 5656133 SGR_3550 SGR_3551   sigF FALSE 0.168 200.000 0.250 NA   NA
 5656133 5656134 SGR_3551 SGR_3552 sigF sigL FALSE 0.287 235.000 0.000 0.012 Y NA
 5656134 5656135 SGR_3552 SGR_3553 sigL   TRUE 0.690 84.000 0.600 NA   NA
 5656137 5656138 SGR_3555 SGR_3556     TRUE 0.750 32.000 0.286 1.000 N NA
 5656138 5656139 SGR_3556 SGR_3557     FALSE 0.075 250.000 0.000 0.001   NA
 5656139 5656140 SGR_3557 SGR_3558     FALSE 0.480 59.000 0.111 1.000   NA
 5656140 5656141 SGR_3558 SGR_3559     FALSE 0.024 233.000 0.000 1.000   NA
 5656142 5656143 SGR_3560 SGR_3561     FALSE 0.136 116.000 0.000 1.000   NA
 5656144 5656145 SGR_3562 SGR_3563     FALSE 0.130 62.000 0.000 NA   NA
 5656146 5656147 SGR_3564 SGR_3565     TRUE 0.981 -3.000 0.121 1.000 Y NA
 5656147 5656148 SGR_3565 SGR_3566     TRUE 0.737 26.000 0.182 1.000 N NA
 5656148 5656149 SGR_3566 SGR_3567     TRUE 0.992 -7.000 0.742 1.000 Y NA
 5656149 5656150 SGR_3567 SGR_3568     FALSE 0.330 92.000 0.029 1.000   NA
 5656150 5656151 SGR_3568 SGR_3569     FALSE 0.495 24.000 0.015 NA   NA
 5656151 5656152 SGR_3569 SGR_3570     FALSE 0.132 60.000 0.000 NA   NA
 5656153 5656154 SGR_3571 SGR_3572     TRUE 0.729 93.000 0.600 1.000 N NA
 5656156 5656157 SGR_3574 SGR_3575     FALSE 0.143 54.000 0.000 NA   NA
 5656157 5656158 SGR_3575 SGR_3576     FALSE 0.003 343.000 0.000 NA   NA
 5656160 5656161 SGR_3578 SGR_3579     TRUE 0.836 13.000 0.300 NA   NA
 5656162 5656163 SGR_3580 SGR_3581     FALSE 0.046 171.000 0.000 NA   NA
 5656164 5656165 SGR_3582 SGR_3583     FALSE 0.036 398.000 0.000 1.000 Y NA
 5656165 5656166 SGR_3583 SGR_3584     TRUE 0.859 -3.000 0.002 1.000   NA
 5656167 5656168 SGR_3585 SGR_3586     FALSE 0.013 235.000 0.000 NA   NA
 5656168 5656169 SGR_3586 SGR_3587     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5656170 5656171 SGR_3588 SGR_3589     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5656171 5656172 SGR_3589 SGR_3590     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656172 5656173 SGR_3590 SGR_3591     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5656173 5656174 SGR_3591 SGR_3592     TRUE 0.968 0.000 0.667 NA   NA
 5656174 5656175 SGR_3592 SGR_3593     TRUE 0.594 0.000 0.000 NA   NA
 5656175 5656176 SGR_3593 SGR_3594     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 5656176 5656177 SGR_3594 SGR_3595     FALSE 0.103 93.000 0.000 NA   NA
 5656177 5656178 SGR_3595 SGR_3596     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656178 5656179 SGR_3596 SGR_3597     TRUE 0.943 3.000 0.500 NA   NA
 5656179 5656180 SGR_3597 SGR_3598     FALSE 0.003 349.000 0.000 NA   NA
 5656180 5656181 SGR_3598 SGR_3599     TRUE 0.895 0.000 0.000 0.040   NA
 5656182 5656183 SGR_tRNA23 SGR_tRNA24     FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 5656184 5656185 SGR_3600 SGR_3601     FALSE 0.044 305.000 0.250 1.000   NA
 5656186 5656187 SGR_3602 SGR_3603     FALSE 0.453 127.000 0.200 1.000 N NA
 5656187 5656188 SGR_3603 SGR_3604     FALSE 0.084 171.000 0.000 NA N NA
 5656188 5656189 SGR_3604 SGR_3605     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5656189 5656190 SGR_3605 SGR_3606     TRUE 0.968 -3.000 0.500 1.000   NA
 5656190 5656191 SGR_3606 SGR_3607     TRUE 0.936 2.000 0.400 NA   NA
 5656191 5656192 SGR_3607 SGR_3608     FALSE 0.014 231.000 0.000 NA   NA
 5656192 5656193 SGR_3608 SGR_3609     FALSE 0.008 265.000 0.000 NA   NA
 5656197 5656198 SGR_3613 SGR_tRNA25     TRUE 0.567 -24.000 0.000 NA   NA
 5656198 5656199 SGR_tRNA25 SGR_3614   sprI FALSE 0.110 86.000 0.000 NA   NA
 5656200 5656201 SGR_3615 SGR_3616     FALSE 0.334 74.000 0.013 1.000   NA
 5656201 5656202 SGR_3616 SGR_3617     FALSE 0.064 151.000 0.000 NA   NA
 5656203 5656204 SGR_3618 SGR_3619     TRUE 0.674 106.000 0.667 NA   NA
 5656205 5656206 SGR_3620 SGR_3621     FALSE 0.160 275.000 0.714 1.000   NA
 5656208 5656209 SGR_3623 SGR_3624     FALSE 0.431 149.000 0.375 NA   NA
 5656209 5656210 SGR_3624 SGR_3625     TRUE 0.679 45.000 0.375 NA   NA
 5656210 5656211 SGR_3625 SGR_3626     TRUE 0.976 -3.000 0.700 NA   NA
 5656211 5656212 SGR_3626 SGR_3627     TRUE 0.928 13.000 0.700 NA   NA
 5656212 5656213 SGR_3627 SGR_3628     TRUE 0.985 6.000 0.714 NA Y NA
 5656213 5656214 SGR_3628 SGR_3629     FALSE 0.026 285.000 0.016 NA N NA
 5656214 5656215 SGR_3629 SGR_3630   serS FALSE 0.005 733.000 0.013 1.000 N NA
 5656215 5656216 SGR_3630 SGR_3631 serS   TRUE 0.886 -3.000 0.030 1.000   NA
 5656217 5656218 SGR_3632 SGR_3633     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 5656218 5656219 SGR_3633 SGR_3634     FALSE 0.208 31.000 0.000 NA   NA
 5656219 5656220 SGR_3634 SGR_3635     TRUE 0.982 -3.000 0.875 NA   NA
 5656220 5656221 SGR_3635 SGR_3636     TRUE 0.977 -10.000 0.917 NA   NA
 5656222 5656223 SGR_3637 SGR_3638     TRUE 0.979 -3.000 0.700 1.000   NA
 5656223 5656224 SGR_3638 SGR_3639     TRUE 0.915 -3.000 0.105 1.000   NA
 5656224 5656225 SGR_3639 SGR_3640     FALSE 0.035 213.000 0.000 1.000   NA
 5656228 5656229 SGR_3643 SGR_3644     FALSE 0.054 269.000 0.000 0.039 N NA
 5656229 5656230 SGR_3644 SGR_3645     TRUE 0.787 88.000 0.151 1.000 Y NA
 5656230 5656231 SGR_3645 SGR_3646     TRUE 0.987 17.000 0.925 0.041 Y NA
 5656231 5656232 SGR_3646 SGR_3647     FALSE 0.045 265.000 0.030 1.000 N NA
 5656233 5656234 SGR_3648 SGR_3649     FALSE 0.277 160.000 0.136 1.000   NA
 5656234 5656235 SGR_3649 SGR_3650     FALSE 0.132 203.000 0.182 NA   NA
 5656236 5656237 SGR_3651 SGR_3652     FALSE 0.024 232.000 0.000 1.000   NA
 5656237 5656238 SGR_3652 SGR_3653     FALSE 0.409 60.000 0.003 1.000 N NA
 5656240 5656241 SGR_3655 SGR_3656 ssgA ssfR TRUE 0.559 129.000 0.500 NA   NA
 5656241 5656242 SGR_3656 SGR_3657 ssfR   FALSE 0.217 198.000 0.333 NA   NA
 5656242 5656243 SGR_3657 SGR_3658     FALSE 0.193 137.000 0.017 NA   NA
 5656244 5656245 SGR_3659 SGR_3660     FALSE 0.318 58.000 0.017 NA   NA
 5656245 5656246 SGR_3660 SGR_3661     FALSE 0.345 46.000 0.000 1.000 N NA
 5656246 5656247 SGR_3661 SGR_3662     FALSE 0.091 107.000 0.000 NA   NA
 5656247 5656248 SGR_3662 SGR_3663     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5656250 5656251 SGR_3665 SGR_3666     FALSE 0.364 126.000 0.061 1.000 N NA
 5656252 5656253 SGR_3667 SGR_3668     FALSE 0.249 88.000 0.000 1.000 N NA
 5656253 5656254 SGR_3668 SGR_3669     FALSE 0.189 184.000 0.000 0.093 N NA
 5656256 5656257 SGR_3671 SGR_3672     TRUE 0.976 19.000 0.499 0.008 Y NA
 5656257 5656258 SGR_3672 SGR_3673     TRUE 0.529 43.000 0.030 1.000 N NA
 5656258 5656259 SGR_3673 SGR_3674     FALSE 0.421 75.000 0.029 1.000 N NA
 5656260 5656261 SGR_3675 SGR_3676     FALSE 0.327 173.000 0.364 NA   NA
 5656261 5656262 SGR_3676 SGR_3677     FALSE 0.400 92.000 0.167 NA   NA
 5656263 5656264 SGR_3678 SGR_3679     FALSE 0.460 174.000 0.625 NA   NA
 5656265 5656266 SGR_3680 SGR_3681     TRUE 0.764 60.000 0.608 NA N NA
 5656266 5656267 SGR_3681 SGR_3682     FALSE 0.323 126.000 0.147 NA   NA
 5656269 5656270 SGR_3684 SGR_3685     FALSE 0.457 51.000 0.107 NA   NA
 5656270 5656271 SGR_3685 SGR_3686     FALSE 0.460 130.000 0.286 1.000   NA
 5656271 5656272 SGR_3686 SGR_3687     FALSE 0.111 211.000 0.102 1.000   NA
 5656272 5656273 SGR_3687 SGR_3688     TRUE 0.923 -3.000 0.204 NA   NA
 5656273 5656274 SGR_3688 SGR_3689     FALSE 0.199 127.000 0.012 NA   NA
 5656274 5656275 SGR_3689 SGR_3690     TRUE 0.802 47.000 0.006 1.000 Y NA
 5656276 5656277 SGR_3691 SGR_3692     FALSE 0.019 305.000 0.013 1.000   NA
 5656277 5656278 SGR_3692 SGR_3693   parA1 TRUE 0.985 -3.000 0.827 1.000 N NA
 5656278 5656279 SGR_3693 SGR_3694 parA1   FALSE 0.054 328.000 0.339 1.000 N NA
 5656279 5656280 SGR_3694 SGR_3695     FALSE 0.394 86.000 0.070 1.000   NA
 5656280 5656281 SGR_3695 SGR_3696     TRUE 0.709 15.000 0.053 1.000   NA
 5656281 5656282 SGR_3696 SGR_3697     TRUE 0.765 4.000 0.024 NA   NA
 5656282 5656283 SGR_3697 SGR_3698     TRUE 0.967 -3.000 0.540 NA   NA
 5656283 5656284 SGR_3698 SGR_3699     TRUE 0.919 20.000 0.787 1.000   NA
 5656285 5656286 SGR_3700 SGR_3701 dnaA dnaN FALSE 0.039 1006.000 0.328 1.000 Y NA
 5656286 5656287 SGR_3701 SGR_3702 dnaN   FALSE 0.208 162.000 0.003 1.000 N NA
 5656287 5656288 SGR_3702 SGR_3703   recF FALSE 0.405 67.000 0.008 1.000 N NA
 5656288 5656289 SGR_3703 SGR_3704 recF   FALSE 0.109 201.000 0.099 NA   NA
 5656289 5656290 SGR_3704 SGR_3705   gyrB FALSE 0.005 460.000 0.022 NA   NA
 5656290 5656291 SGR_3705 SGR_3706 gyrB gyrA TRUE 0.875 120.000 0.306 0.001 Y NA
 5656291 5656292 SGR_3706 SGR_3707 gyrA   FALSE 0.304 94.000 0.053 NA   NA
 5656292 5656293 SGR_3707 SGR_tRNA26     FALSE 0.114 79.000 0.000 NA   NA
 5656294 5656295 SGR_3708 SGR_3709     FALSE 0.127 65.000 0.000 NA   NA
 5656296 5656297 SGR_3710 SGR_3711     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 5656298 5656299 SGR_3712 SGR_3713     TRUE 0.618 137.000 0.600 1.000   NA
 5656300 5656301 SGR_tRNA27 SGR_3714     FALSE 0.063 152.000 0.000 NA   NA
 5656303 5656304 SGR_3716 SGR_3717     FALSE 0.056 244.000 0.068 1.000   NA
 5656306 5656307 SGR_3719 SGR_3720     TRUE 0.550 31.000 0.098 NA   NA
 5656307 5656308 SGR_3720 SGR_3721     FALSE 0.444 88.000 0.208 NA   NA
 5656308 5656309 SGR_3721 SGR_3722     TRUE 0.893 -3.000 0.092 NA   NA
 5656309 5656310 SGR_3722 SGR_3723     TRUE 0.890 -3.000 0.029 NA N NA
 5656310 5656311 SGR_3723 SGR_3724     TRUE 0.967 26.000 0.857 NA Y NA
 5656312 5656313 SGR_3725 SGR_3726   pbpA FALSE 0.419 172.000 0.122 0.002   NA
 5656313 5656314 SGR_3726 SGR_3727 pbpA   TRUE 0.910 -3.000 0.029 1.000 N NA
 5656314 5656315 SGR_3727 SGR_3728     TRUE 0.694 23.000 0.064 1.000 N NA
 5656315 5656316 SGR_3728 SGR_3729     TRUE 0.667 136.000 0.095 NA Y NA
 5656316 5656317 SGR_3729 SGR_3730     TRUE 0.977 11.000 0.629 NA Y NA
 5656318 5656319 SGR_tRNA28 SGR_3731   arpA FALSE 0.001 627.000 0.000 NA   NA
 5656319 5656320 SGR_3731 SGR_3732 arpA   FALSE 0.452 162.000 0.000 NA Y NA
 5656320 5656321 SGR_3732 SGR_3733     FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 5656321 5656322 SGR_3733 SGR_3734     FALSE 0.017 370.000 0.188 NA   NA
 5656322 5656323 SGR_3734 SGR_3735     FALSE 0.432 131.000 0.300 NA   NA
 5656324 5656325 SGR_3736 SGR_3737     TRUE 0.561 135.000 0.143 0.041 N NA
 5656325 5656326 SGR_3737 SGR_3738     TRUE 0.833 1.000 0.048 NA   NA
 5656326 5656327 SGR_3738 SGR_3739     TRUE 0.983 -3.000 0.919 NA   NA
 5656327 5656328 SGR_3739 SGR_3740     TRUE 0.983 -3.000 0.943 NA   NA
 5656328 5656329 SGR_3740 SGR_3741     TRUE 0.983 -3.000 0.920 NA   NA
 5656330 5656331 SGR_3742 SGR_3743     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5656331 5656332 SGR_3743 SGR_3744     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656336 5656337 SGR_3748 SGR_3749 bkdA2 bkdB2 TRUE 0.994 -3.000 0.357 0.001 Y NA
 5656337 5656338 SGR_3749 SGR_3750 bkdB2 bkdC2 TRUE 0.989 0.000 0.321 0.072 Y NA
 5656338 5656339 SGR_3750 SGR_3751 bkdC2   FALSE 0.013 278.000 0.000 NA N NA
 5656339 5656340 SGR_3751 SGR_3752     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5656340 5656341 SGR_3752 SGR_3753     TRUE 0.918 -3.000 0.047 1.000 N NA
 5656341 5656342 SGR_3753 SGR_3754     TRUE 0.597 32.000 0.039 1.000 N NA
 5656343 5656344 SGR_3755 SGR_3756     FALSE 0.087 111.000 0.000 NA   NA
 5656344 5656345 SGR_3756 SGR_3757     TRUE 0.994 -3.000 0.773 1.000 Y NA
 5656345 5656346 SGR_3757 SGR_3758     TRUE 0.741 107.000 0.760 NA N NA
 5656346 5656347 SGR_3758 SGR_3759     FALSE 0.102 94.000 0.000 NA   NA
 5656347 5656348 SGR_3759 SGR_3760     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 5656350 5656351 SGR_3762 SGR_3763     FALSE 0.216 105.000 0.010 NA   NA
 5656351 5656352 SGR_3763 SGR_3764     TRUE 0.679 81.000 0.500 1.000   NA
 5656353 5656354 SGR_3765 SGR_3766 bkdA1 bkdB1 TRUE 0.996 3.000 0.917 0.001 Y NA
 5656354 5656355 SGR_3766 SGR_3767 bkdB1 bkdC1 TRUE 0.990 12.000 0.860 0.072 Y NA
 5656356 5656357 SGR_3768 SGR_3769     FALSE 0.335 49.000 0.000 1.000 N NA
 5656357 5656358 SGR_3769 SGR_3770     TRUE 0.925 0.000 0.160 1.000 N NA
 5656358 5656359 SGR_3770 SGR_3771     FALSE 0.094 102.000 0.000 NA   NA
 5656360 5656361 SGR_3772 SGR_3773     TRUE 0.925 -3.000 0.140 NA N NA
 5656363 5656364 SGR_3775 SGR_3776     FALSE 0.132 60.000 0.000 NA   NA
 5656369 5656370 SGR_3781 SGR_3782     FALSE 0.034 186.000 0.000 NA   NA
 5656370 5656371 SGR_3782 SGR_3783     FALSE 0.093 104.000 0.000 NA   NA
 5656371 5656372 SGR_3783 SGR_3784     FALSE 0.067 147.000 0.000 NA   NA
 5656372 5656373 SGR_3784 SGR_3785     FALSE 0.145 53.000 0.000 NA   NA
 5656374 5656375 SGR_3786 SGR_3787     FALSE 0.072 199.000 0.011 NA   NA
 5656375 5656376 SGR_3787 SGR_3788     FALSE 0.126 66.000 0.000 NA   NA
 5656378 5656379 SGR_3790 SGR_3791 aspS   FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5656381 5656382 SGR_3793 SGR_3794     TRUE 0.995 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5656384 5656385 SGR_3796 SGR_3797     FALSE 0.110 86.000 0.000 NA   NA
 5656386 5656387 SGR_3798 SGR_3799     FALSE 0.132 60.000 0.000 NA   NA
 5656388 5656389 SGR_3800 SGR_3801     FALSE 0.021 211.000 0.000 NA   NA
 5656389 5656390 SGR_3801 SGR_3802     TRUE 0.733 59.000 0.600 NA   NA
 5656390 5656391 SGR_3802 SGR_3803     TRUE 0.989 -3.000 0.800 0.092 N NA
 5656391 5656392 SGR_3803 SGR_3804     FALSE 0.194 127.000 0.000 1.000 N NA
 5656393 5656394 SGR_3805 SGR_3806     FALSE 0.118 141.000 0.000 1.000   NA
 5656394 5656395 SGR_3806 SGR_3807     FALSE 0.112 146.000 0.000 1.000   NA
 5656395 5656396 SGR_3807 SGR_3808     TRUE 0.919 6.000 0.462 NA   NA
 5656398 5656399 SGR_3810 SGR_3811     FALSE 0.169 91.000 0.000 1.000   NA
 5656399 5656400 SGR_3811 SGR_3812     FALSE 0.076 336.000 0.711 NA   NA
 5656400 5656401 SGR_3812 SGR_3813     FALSE 0.271 216.000 0.644 NA   NA
 5656403 5656404 SGR_3815 SGR_3816     FALSE 0.409 171.000 0.000 NA Y NA
 5656404 5656405 SGR_3816 SGR_3817     TRUE 0.985 3.000 0.500 1.000 Y NA
 5656405 5656406 SGR_3817 SGR_3818     FALSE 0.162 96.000 0.000 1.000   NA
 5656410 5656411 SGR_3822 SGR_3823     TRUE 0.983 3.000 0.096 0.005 Y NA
 5656411 5656412 SGR_3823 SGR_3824     TRUE 0.646 57.000 0.273 1.000 N NA
 5656413 5656414 SGR_3825 SGR_3826     FALSE 0.117 74.000 0.000 NA   NA
 5656414 5656415 SGR_3826 SGR_3827     FALSE 0.110 86.000 0.000 NA   NA
 5656415 5656416 SGR_3827 SGR_3828     FALSE 0.433 8.000 0.000 NA   NA
 5656416 5656417 SGR_3828 SGR_3829     FALSE 0.038 180.000 0.000 NA   NA
 5656418 5656419 SGR_3830 SGR_3831     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656419 5656420 SGR_3831 SGR_3832     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656420 5656421 SGR_3832 SGR_3833     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5656421 5656422 SGR_3833 SGR_3834     TRUE 0.729 135.000 1.000 NA   NA
 5656422 5656423 SGR_3834 SGR_3835     FALSE 0.048 169.000 0.000 NA   NA
 5656423 5656424 SGR_3835 SGR_3836     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656424 5656425 SGR_3836 SGR_3837     TRUE 0.587 -7.000 0.000 NA   NA
 5656425 5656426 SGR_3837 SGR_3838     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5656426 5656427 SGR_3838 SGR_3839     FALSE 0.451 16.000 0.000 1.000   NA
 5656427 5656428 SGR_3839 SGR_3840     FALSE 0.003 422.000 0.000 1.000   NA
 5656428 5656429 SGR_3840 SGR_3841     FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000   NA
 5656429 5656430 SGR_3841 SGR_3842     FALSE 0.044 173.000 0.000 NA   NA
 5656431 5656432 SGR_3843 SGR_3844     FALSE 0.246 25.000 0.000 NA   NA
 5656433 5656434 SGR_3845 SGR_3846     TRUE 0.679 90.000 0.600 NA   NA
 5656434 5656435 SGR_3846 SGR_3847     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5656435 5656436 SGR_3847 SGR_3848     TRUE 0.585 87.000 0.400 NA   NA
 5656436 5656437 SGR_3848 SGR_3849     TRUE 0.609 56.000 0.333 NA   NA
 5656437 5656438 SGR_3849 SGR_3850     FALSE 0.018 218.000 0.000 NA   NA
 5656438 5656439 SGR_3850 SGR_3851     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656440 5656441 SGR_3852 SGR_3853     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5656441 5656442 SGR_3853 SGR_3854     FALSE 0.082 120.000 0.000 NA   NA
 5656442 5656443 SGR_3854 SGR_3855     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5656443 5656444 SGR_3855 SGR_3856     FALSE 0.099 97.000 0.000 NA   NA
 5656445 5656446 SGR_3857 SGR_tRNA29     FALSE 0.044 174.000 0.000 NA   NA
 5656447 5656448 SGR_RNA01 SGR_3858     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5656448 5656449 SGR_3858 SGR_3859     FALSE 0.419 137.000 0.005 0.092 N NA
 5656449 5656450 SGR_3859 SGR_3860     FALSE 0.002 459.000 0.000 NA   NA
 5656450 5656451 SGR_3860 SGR_3861     FALSE 0.015 418.000 0.250 NA   NA
 5656451 5656452 SGR_3861 SGR_3862     FALSE 0.098 178.000 0.008 NA   NA
 5656453 5656454 SGR_tRNA30 SGR_3863     FALSE 0.251 24.000 0.000 NA   NA
 5656454 5656455 SGR_3863 SGR_3864     TRUE 0.992 -3.000 0.294 0.023 Y NA
 5656455 5656456 SGR_3864 SGR_3865     TRUE 0.972 2.000 0.471 0.092 N NA
 5656456 5656457 SGR_3865 SGR_3866     TRUE 0.991 -3.000 0.321 0.092 Y NA
 5656457 5656458 SGR_3866 SGR_3867     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656458 5656459 SGR_3867 SGR_tRNA31     TRUE 0.566 -57.000 0.000 NA   NA
 5656459 5656460 SGR_tRNA31 SGR_3868     FALSE 0.002 485.000 0.000 NA   NA
 5656461 5656462 SGR_3869 SGR_3870     TRUE 0.996 -3.000 0.656 0.000 Y NA
 5656462 5656463 SGR_3870 SGR_3871     TRUE 0.994 -3.000 0.346 0.000 Y NA
 5656463 5656464 SGR_3871 SGR_3872     FALSE 0.134 123.000 0.000 1.000   NA
 5656464 5656465 SGR_3872 SGR_3873     FALSE 0.280 37.000 0.000 1.000   NA
 5656465 5656466 SGR_3873 SGR_3874     FALSE 0.168 43.000 0.000 NA   NA
 5656466 5656467 SGR_3874 SGR_3875     FALSE 0.462 62.000 0.167 NA   NA
 5656469 5656470 SGR_3877 SGR_3878     TRUE 0.845 61.000 0.248 1.000 Y NA
 5656471 5656472 SGR_3879 SGR_3880     FALSE 0.019 290.000 0.024 NA   NA
 5656473 5656474 SGR_3881 SGR_3882   bldC FALSE 0.005 678.000 0.103 NA   NA
 5656475 5656476 SGR_3883 SGR_tRNA32     FALSE 0.043 175.000 0.000 NA   NA
 5656476 5656477 SGR_tRNA32 SGR_3884     FALSE 0.080 129.000 0.000 NA   NA
 5656478 5656479 SGR_3885 SGR_3886     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5656480 5656481 SGR_tRNA33 SGR_tRNA34     FALSE 0.263 22.000 0.000 NA   NA
 5656481 5656482 SGR_tRNA34 SGR_tRNA35     FALSE 0.177 39.000 0.000 NA   NA
 5656482 5656483 SGR_tRNA35 SGR_3887     FALSE 0.113 81.000 0.000 NA   NA
 5656484 5656485 SGR_3888 SGR_3889     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656485 5656486 SGR_3889 SGR_3890     TRUE 0.991 -3.000 0.286 0.061 Y NA
 5656486 5656487 SGR_3890 SGR_3891     FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 5656487 5656488 SGR_3891 SGR_3892     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 5656488 5656489 SGR_3892 SGR_3893     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 5656489 5656490 SGR_3893 SGR_tRNA36     FALSE 0.079 131.000 0.000 NA   NA
 5656492 5656493 SGR_tRNA37 SGR_3895     FALSE 0.030 191.000 0.000 NA   NA
 5656493 5656494 SGR_3895 SGR_3896     TRUE 0.555 142.000 0.000 1.000 Y NA
 5656494 5656495 SGR_3896 SGR_3897     FALSE 0.005 464.000 0.000 1.000 N NA
 5656495 5656496 SGR_3897 SGR_3898     FALSE 0.254 164.000 0.047 1.000 N NA
 5656497 5656498 SGR_3899 SGR_3900     FALSE 0.166 146.000 0.010 NA   NA
 5656498 5656499 SGR_3900 SGR_3901     TRUE 0.828 -7.000 0.004 1.000   NA
 5656499 5656500 SGR_3901 SGR_3902     FALSE 0.092 238.000 0.214 1.000   NA
 5656502 5656503 SGR_3904 SGR_3905   atrA-g FALSE 0.011 408.000 0.000 0.077   NA
 5656504 5656505 SGR_3906 SGR_3907     FALSE 0.013 439.000 0.091 1.000 N NA
 5656507 5656508 SGR_3909 SGR_16SrRNA2   rrnB1 FALSE 0.001 735.000 0.000 NA   NA
 5656508 5656509 SGR_16SrRNA2 SGR_23SrRNA2 rrnB1 rrnB2 FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 5656509 5656510 SGR_23SrRNA2 SGR_5SrRNA2 rrnB2 rrnB3 FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 5656511 5656512 SGR_3910 SGR_3911     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.023 Y NA
 5656512 5656513 SGR_3911 SGR_3912     FALSE 0.295 19.000 0.000 NA   NA
 5656513 5656514 SGR_3912 SGR_3913     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656516 5656517 SGR_3915 SGR_3916     TRUE 0.948 2.000 0.500 NA   NA
 5656517 5656518 SGR_3916 SGR_3917     FALSE 0.452 187.000 0.750 NA   NA
 5656518 5656519 SGR_3917 SGR_3918     TRUE 0.979 -3.000 0.778 NA   NA
 5656519 5656520 SGR_3918 SGR_3919     TRUE 0.777 62.000 0.727 NA   NA
 5656520 5656521 SGR_3919 SGR_3920     FALSE 0.286 182.000 0.364 NA   NA
 5656522 5656523 SGR_3921 SGR_3922     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656523 5656524 SGR_3922 SGR_3923     FALSE 0.074 137.000 0.000 NA   NA
 5656524 5656525 SGR_3923 SGR_3924     FALSE 0.002 456.000 0.000 NA   NA
 5656525 5656526 SGR_3924 SGR_3925     FALSE 0.001 771.000 0.000 NA   NA
 5656526 5656527 SGR_3925 SGR_3926     FALSE 0.064 288.000 0.375 NA   NA
 5656529 5656530 SGR_3928 SGR_3929   pitH TRUE 0.956 6.000 0.100 NA Y NA
 5656531 5656532 SGR_3930 SGR_3931 pstB pstA TRUE 0.949 40.000 0.373 0.001 Y NA
 5656532 5656533 SGR_3931 SGR_3932 pstA pstC TRUE 0.991 -3.000 0.172 0.001 Y NA
 5656533 5656534 SGR_3932 SGR_3933 pstC pstS TRUE 0.611 200.000 0.137 0.001 Y NA
 5656534 5656535 SGR_3933 SGR_3934 pstS   FALSE 0.007 385.000 0.000 1.000 N NA
 5656535 5656536 SGR_3934 SGR_3935     TRUE 0.892 -3.000 0.090 NA   NA
 5656536 5656537 SGR_3935 SGR_3936     TRUE 0.793 -13.000 0.013 NA   NA
 5656537 5656538 SGR_3936 SGR_3937     FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 5656538 5656539 SGR_3937 SGR_3938     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656539 5656540 SGR_3938 SGR_3939     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5656540 5656541 SGR_3939 SGR_3940     FALSE 0.176 86.000 0.000 1.000   NA
 5656543 5656544 SGR_3942 SGR_3943     FALSE 0.065 248.000 0.000 0.071 N NA
 5656546 5656547 SGR_3945 SGR_3946     FALSE 0.183 37.000 0.000 NA   NA
 5656547 5656548 SGR_3946 SGR_3947     FALSE 0.002 389.000 0.000 NA   NA
 5656549 5656550 SGR_3948 SGR_3949     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5656550 5656551 SGR_3949 SGR_3950     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 5656553 5656554 SGR_3952 SGR_3953     FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 5656557 5656558 SGR_3956 SGR_3957     TRUE 0.994 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 5656558 5656559 SGR_3957 SGR_3958     FALSE 0.456 78.000 0.062 1.000 N NA
 5656559 5656560 SGR_3958 SGR_3959     FALSE 0.365 126.000 0.062 1.000 N NA
 5656560 5656561 SGR_3959 SGR_3960     TRUE 0.937 25.000 0.158 0.095 Y NA
 5656562 5656563 SGR_3961 SGR_3962     FALSE 0.353 75.000 0.068 NA   NA
 5656563 5656564 SGR_3962 SGR_3963     TRUE 0.733 11.000 0.068 NA   NA
 5656564 5656565 SGR_3963 SGR_3964     FALSE 0.164 201.000 0.250 NA   NA
 5656565 5656566 SGR_3964 SGR_3965     FALSE 0.001 526.000 0.000 NA   NA
 5656566 5656567 SGR_3965 SGR_3966     TRUE 0.764 52.000 0.557 1.000   NA
 5656567 5656568 SGR_3966 SGR_3967     FALSE 0.350 101.000 0.130 NA   NA
 5656570 5656571 SGR_3969 SGR_3970     FALSE 0.446 65.000 0.154 NA   NA
 5656571 5656572 SGR_3970 SGR_3971     FALSE 0.431 110.000 0.267 NA   NA
 5656572 5656573 SGR_3971 SGR_3972     TRUE 0.757 10.000 0.036 1.000   NA
 5656575 5656576 SGR_3974 SGR_3975 amfC   TRUE 0.529 51.000 0.200 NA   NA
 5656576 5656577 SGR_3975 SGR_3976     TRUE 0.575 25.000 0.067 NA   NA
 5656578 5656579 SGR_3977 SGR_3978     TRUE 0.926 95.000 0.667 0.091 Y NA
 5656580 5656581 SGR_3979 SGR_3980     TRUE 0.715 20.000 0.000 0.018   NA
 5656582 5656583 SGR_3981 SGR_3982     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656583 5656584 SGR_3982 SGR_3983     FALSE 0.031 290.000 0.000 0.071   NA
 5656584 5656585 SGR_3983 SGR_3984     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656585 5656586 SGR_3984 SGR_3985     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 5656586 5656587 SGR_3985 SGR_3986     FALSE 0.074 137.000 0.000 NA   NA
 5656588 5656589 SGR_3987 SGR_3988     FALSE 0.186 36.000 0.000 NA   NA
 5656589 5656590 SGR_3988 SGR_3989     FALSE 0.277 143.000 0.127 NA   NA
 5656591 5656592 SGR_3990 SGR_3991     FALSE 0.004 325.000 0.000 NA   NA
 5656592 5656593 SGR_3991 SGR_3992     FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 5656594 5656595 SGR_3993 SGR_3994     TRUE 0.764 43.000 0.541 NA   NA
 5656598 5656599 SGR_3997 SGR_3998     FALSE 0.157 48.000 0.000 NA   NA
 5656599 5656600 SGR_3998 SGR_3999     FALSE 0.073 138.000 0.000 NA   NA
 5656600 5656601 SGR_3999 SGR_4000     FALSE 0.166 44.000 0.000 NA   NA
 5656602 5656603 SGR_4001 SGR_4002     FALSE 0.145 53.000 0.000 NA   NA
 5656604 5656605 SGR_4003 SGR_4004     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5656605 5656606 SGR_4004 SGR_4005     FALSE 0.002 446.000 0.000 NA   NA
 5656609 5656610 SGR_4008 SGR_4009 phoR phoP TRUE 0.990 -3.000 0.437 1.000 Y NA
 5656612 5656613 SGR_4011 SGR_4012     FALSE 0.017 379.000 0.068 1.000 N NA
 5656613 5656614 SGR_4012 SGR_4013     TRUE 0.986 -10.000 0.419 1.000 Y NA
 5656614 5656615 SGR_4013 SGR_4014     FALSE 0.194 69.000 0.000 1.000   NA
 5656615 5656616 SGR_4014 SGR_4015     TRUE 0.602 31.000 0.098 1.000   NA
 5656616 5656617 SGR_4015 SGR_4016     TRUE 0.986 5.000 0.353 0.037 Y NA
 5656617 5656618 SGR_4016 SGR_4017     TRUE 0.937 -3.000 0.208 NA N NA
 5656618 5656619 SGR_4017 SGR_4018     FALSE 0.448 51.000 0.095 NA   NA
 5656619 5656620 SGR_4018 SGR_4019   cysS1 FALSE 0.216 136.000 0.004 1.000   NA
 5656620 5656621 SGR_4019 SGR_4020 cysS1   TRUE 0.753 96.000 0.088 1.000 Y NA
 5656621 5656622 SGR_4020 SGR_4021     FALSE 0.050 212.000 0.004 NA   NA
 5656623 5656624 SGR_4022 SGR_4023     TRUE 0.728 55.000 0.556 NA   NA
 5656624 5656625 SGR_4023 SGR_4024     FALSE 0.015 230.000 0.000 NA   NA
 5656625 5656626 SGR_4024 SGR_4025     FALSE 0.007 332.000 0.000 NA N NA
 5656629 5656630 SGR_4027 SGR_4028     FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5656630 5656631 SGR_4028 SGR_4029     FALSE 0.377 112.000 0.200 NA   NA
 5656631 5656632 SGR_4029 SGR_4030     TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.091 Y NA
 5656632 5656633 SGR_4030 SGR_4031     FALSE 0.002 512.000 0.000 1.000   NA
 5656633 5656634 SGR_4031 SGR_4032     TRUE 0.937 10.000 0.625 1.000   NA
 5656639 5656640 SGR_4037 SGR_4038     FALSE 0.160 227.000 0.036 0.039 N NA
 5656644 5656645 SGR_4042 SGR_4043     TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.023 Y NA
 5656646 5656647 SGR_4044 SGR_4045     FALSE 0.411 82.000 0.154 NA   NA
 5656647 5656648 SGR_4045 SGR_4046     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656648 5656649 SGR_4046 SGR_4047     FALSE 0.066 148.000 0.000 NA   NA
 5656650 5656651 SGR_4048 SGR_4049     FALSE 0.010 334.000 0.000 1.000 N NA
 5656654 5656655 SGR_4052 SGR_4053     FALSE 0.513 144.000 0.429 1.000   NA
 5656656 5656657 SGR_4054 SGR_4055     TRUE 0.675 147.000 0.125 1.000 Y NA
 5656657 5656658 SGR_4055 SGR_4056     TRUE 0.980 0.000 0.214 1.000 Y NA
 5656659 5656660 SGR_4057 SGR_4058     TRUE 0.933 15.000 0.833 NA   NA
 5656662 5656663 SGR_4060 SGR_4061 sprC   FALSE 0.401 117.000 0.000 0.003   NA
 5656663 5656664 SGR_4061 SGR_4062     FALSE 0.054 212.000 0.000 1.000 N NA
 5656664 5656665 SGR_4062 SGR_4063     TRUE 0.688 85.000 0.600 NA   NA
 5656667 5656668 SGR_4065 SGR_4066     FALSE 0.183 37.000 0.000 NA   NA
 5656672 5656673 SGR_4070 SGR_4071     TRUE 0.636 59.000 0.333 1.000   NA
 5656675 5656676 SGR_4073 SGR_4074     FALSE 0.383 25.000 0.000 NA N NA
 5656676 5656677 SGR_4074 SGR_4075     TRUE 0.737 78.000 0.625 NA N NA
 5656677 5656678 SGR_4075 SGR_4076     TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.090 Y NA
 5656679 5656680 SGR_4077 SGR_4078     FALSE 0.209 60.000 0.000 1.000   NA
 5656680 5656681 SGR_4078 SGR_4079     FALSE 0.130 131.000 0.000 1.000   NA
 5656681 5656682 SGR_4079 SGR_4080     FALSE 0.010 254.000 0.000 NA   NA
 5656684 5656685 SGR_4082 SGR_4083     FALSE 0.079 192.000 0.011 NA   NA
 5656686 5656687 SGR_4084 SGR_4085     TRUE 0.715 52.000 0.500 NA   NA
 5656687 5656688 SGR_4085 SGR_4086     FALSE 0.098 198.000 0.050 NA   NA
 5656688 5656689 SGR_4086 SGR_4087     TRUE 0.672 84.000 0.137 0.017 N NA
 5656689 5656690 SGR_4087 SGR_4088   ftsH FALSE 0.250 183.000 0.180 1.000 N NA
 5656690 5656691 SGR_4088 SGR_4089 ftsH   FALSE 0.374 158.000 0.212 1.000 N NA
 5656692 5656693 SGR_4090 SGR_4091     FALSE 0.366 75.000 0.081 NA   NA
 5656693 5656694 SGR_4091 SGR_4092     TRUE 0.980 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 5656694 5656695 SGR_4092 SGR_4093     FALSE 0.030 191.000 0.000 NA   NA
 5656695 5656696 SGR_4093 SGR_4094     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656696 5656697 SGR_4094 SGR_4095     FALSE 0.371 62.000 0.057 NA   NA
 5656700 5656701 SGR_4098 SGR_4099     TRUE 0.967 4.000 0.000 0.037 Y NA
 5656701 5656702 SGR_4099 SGR_4100     TRUE 0.522 63.000 0.000 0.037 N NA
 5656702 5656703 SGR_4100 SGR_4101     FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 5656704 5656705 SGR_4102 SGR_4103 nuoD2   TRUE 0.856 -3.000 0.028 NA   NA
 5656706 5656707 SGR_4104 SGR_4105     TRUE 0.919 117.000 0.667 0.023 Y NA
 5656709 5656710 SGR_4107 SGR_4108     TRUE 0.905 -3.000 0.067 1.000   NA
 5656710 5656711 SGR_4108 SGR_4109     TRUE 0.976 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 5656711 5656712 SGR_4109 SGR_4110     TRUE 0.750 175.000 0.223 0.001 Y NA
 5656712 5656713 SGR_4110 SGR_4111     TRUE 0.890 0.000 0.030 1.000 N NA
 5656713 5656714 SGR_4111 SGR_4112     FALSE 0.173 133.000 0.003 NA   NA
 5656714 5656715 SGR_4112 SGR_4113     TRUE 0.803 83.000 1.000 NA   NA
 5656715 5656716 SGR_4113 SGR_4114     TRUE 0.554 168.000 0.750 NA   NA
 5656716 5656717 SGR_4114 SGR_4115     TRUE 0.794 10.000 0.027 1.000 N NA
 5656717 5656718 SGR_4115 SGR_4116     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5656721 5656722 SGR_4119 SGR_4120     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656724 5656725 SGR_4122 SGR_4123     TRUE 0.912 110.000 0.875 1.000 Y NA
 5656725 5656726 SGR_4123 SGR_4124     TRUE 0.812 65.000 0.875 NA   NA
 5656726 5656727 SGR_4124 SGR_4125     FALSE 0.224 228.000 0.625 NA   NA
 5656727 5656728 SGR_4125 SGR_4126     FALSE 0.025 255.000 0.000 1.000 N NA
 5656730 5656731 SGR_4128 SGR_4129     FALSE 0.393 80.000 0.126 NA   NA
 5656734 5656735 SGR_4132 SGR_4133     FALSE 0.299 156.000 0.136 NA N NA
 5656735 5656736 SGR_4133 SGR_4134     TRUE 0.906 -3.000 0.059 NA N NA
 5656736 5656737 SGR_4134 SGR_4135     FALSE 0.258 146.000 0.008 1.000 N NA
 5656739 5656740 SGR_4137 SGR_4138     FALSE 0.163 45.000 0.000 NA   NA
 5656740 5656741 SGR_4138 SGR_4139     FALSE 0.016 224.000 0.000 NA   NA
 5656741 5656742 SGR_4139 SGR_4140     TRUE 0.996 -3.000 0.713 0.090 Y NA
 5656742 5656743 SGR_4140 SGR_4141     FALSE 0.466 61.000 0.037 1.000 N NA
 5656743 5656744 SGR_4141 SGR_16SrRNA3   rrnC1 FALSE 0.001 745.000 0.000 NA   NA
 5656744 5656745 SGR_16SrRNA3 SGR_23SrRNA3 rrnC1 rrnC2 FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5656745 5656746 SGR_23SrRNA3 SGR_5SrRNA3 rrnC2 rrnC3 FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 5656746 5656747 SGR_5SrRNA3 SGR_4142 rrnC3   FALSE 0.131 61.000 0.000 NA   NA
 5656747 5656748 SGR_4142 SGR_4143     TRUE 0.719 43.000 0.444 NA   NA
 5656748 5656749 SGR_4143 SGR_4144     TRUE 0.843 -10.000 0.056 NA   NA
 5656749 5656750 SGR_4144 SGR_4145     FALSE 0.322 100.000 0.084 NA   NA
 5656750 5656751 SGR_4145 SGR_4146     FALSE 0.491 96.000 0.296 NA   NA
 5656751 5656752 SGR_4146 SGR_4147     FALSE 0.363 111.000 0.178 NA   NA
 5656752 5656753 SGR_4147 SGR_4148     FALSE 0.372 162.000 0.356 NA   NA
 5656753 5656754 SGR_4148 SGR_4149     TRUE 0.940 16.000 0.796 1.000 N NA
 5656755 5656756 SGR_4150 SGR_4151   adsA FALSE 0.100 203.000 0.080 NA   NA
 5656756 5656757 SGR_4151 SGR_4152 adsA   FALSE 0.006 396.000 0.000 1.000 N NA
 5656758 5656759 SGR_4153 SGR_4154     FALSE 0.033 258.000 0.054 NA   NA
 5656759 5656760 SGR_4154 SGR_4155   hemA TRUE 0.953 -3.000 0.048 0.017   NA
 5656760 5656761 SGR_4155 SGR_4156 hemA   TRUE 0.991 -3.000 0.178 0.001 Y NA
 5656761 5656762 SGR_4156 SGR_4157     TRUE 0.978 -3.000 0.044 1.000 Y NA
 5656762 5656763 SGR_4157 SGR_4158     TRUE 0.714 171.000 0.429 1.000 Y NA
 5656764 5656765 SGR_4159 SGR_4160     FALSE 0.447 7.000 0.000 NA   NA
 5656765 5656766 SGR_4160 SGR_4161     FALSE 0.156 49.000 0.000 NA   NA
 5656766 5656767 SGR_4161 SGR_4162     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656767 5656768 SGR_4162 SGR_4163     FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 5656768 5656769 SGR_4163 SGR_4164     TRUE 0.905 -3.000 0.133 NA   NA
 5656769 5656770 SGR_4164 SGR_4165     FALSE 0.225 214.000 0.000 NA Y NA
 5656770 5656771 SGR_4165 SGR_4166     TRUE 0.564 138.000 0.000 1.000 Y NA
 5656772 5656773 SGR_4167 SGR_4168     FALSE 0.202 32.000 0.000 NA   NA
 5656773 5656774 SGR_4168 SGR_4169     FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5656777 5656778 SGR_4172 SGR_4173     TRUE 0.914 -3.000 0.000 0.039   NA
 5656779 5656780 SGR_4174 SGR_4175     FALSE 0.009 351.000 0.000 1.000 N NA
 5656780 5656781 SGR_4175 SGR_4176     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5656781 5656782 SGR_4176 SGR_4177     FALSE 0.023 206.000 0.000 NA   NA
 5656785 5656786 SGR_4180 SGR_4181     FALSE 0.119 71.000 0.000 NA   NA
 5656786 5656787 SGR_4181 SGR_4182     FALSE 0.398 11.000 0.000 NA   NA
 5656787 5656788 SGR_4182 SGR_4183     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 5656788 5656789 SGR_4183 SGR_4184     FALSE 0.466 191.000 0.833 NA   NA
 5656791 5656792 SGR_4186 SGR_4187     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 5656792 5656793 SGR_4187 SGR_4188     FALSE 0.028 198.000 0.000 NA   NA
 5656795 5656796 SGR_4190 SGR_4191     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5656797 5656798 SGR_4192 SGR_4193     TRUE 0.937 -3.000 0.204 NA N NA
 5656798 5656799 SGR_4193 SGR_4194     FALSE 0.008 330.000 0.000 NA N NA
 5656799 5656800 SGR_4194 SGR_4195     FALSE 0.001 517.000 0.000 NA   NA
 5656800 5656801 SGR_4195 SGR_4196     TRUE 0.822 68.000 0.857 1.000   NA
 5656801 5656802 SGR_4196 SGR_4197     TRUE 0.974 5.000 0.286 1.000 Y NA
 5656802 5656803 SGR_4197 SGR_4198     TRUE 0.969 5.000 0.262 NA Y NA
 5656803 5656804 SGR_4198 SGR_4199     TRUE 0.981 -3.000 0.180 NA Y NA
 5656806 5656807 SGR_4201 SGR_4202     TRUE 0.981 -3.000 0.177 NA Y NA
 5656809 5656810 SGR_4204 SGR_4205     FALSE 0.039 276.000 0.031 1.000 N NA
 5656810 5656811 SGR_4205 SGR_4206     FALSE 0.506 50.000 0.032 1.000 N NA
 5656811 5656812 SGR_4206 SGR_4207     FALSE 0.438 119.000 0.027 0.070   NA
 5656812 5656813 SGR_4207 SGR_4208     FALSE 0.073 138.000 0.000 NA   NA
 5656813 5656814 SGR_4208 SGR_4209     FALSE 0.002 440.000 0.000 NA   NA
 5656816 5656817 SGR_4211 SGR_4212     FALSE 0.029 195.000 0.000 NA   NA
 5656818 5656819 SGR_4213 SGR_4214     TRUE 0.951 6.000 0.412 0.070   NA
 5656820 5656821 SGR_4215 SGR_4216     FALSE 0.414 176.000 0.000 1.000 Y NA
 5656822 5656823 SGR_4217 SGR_4218     FALSE 0.057 159.000 0.000 NA   NA
 5656824 5656825 SGR_4219 SGR_4220     FALSE 0.100 156.000 0.000 1.000   NA
 5656827 5656828 SGR_4222 SGR_4223     TRUE 0.960 -3.000 0.375 NA N NA
 5656828 5656829 SGR_4223 SGR_4224     TRUE 0.569 141.000 0.500 NA N NA
 5656829 5656830 SGR_4224 SGR_4225     FALSE 0.033 221.000 0.000 NA N NA
 5656830 5656831 SGR_4225 SGR_4226     TRUE 0.968 -3.000 0.429 1.000 N NA
 5656831 5656832 SGR_4226 SGR_4227     FALSE 0.041 228.000 0.000 1.000 N NA
 5656836 5656837 SGR_4231 SGR_4232     FALSE 0.049 200.000 0.000 NA N NA
 5656837 5656838 SGR_4232 SGR_4233     FALSE 0.047 170.000 0.000 NA   NA
 5656844 5656845 SGR_4239 SGR_4240 griS griR FALSE 0.259 43.000 0.000 1.000   NA
 5656845 5656846 SGR_4240 SGR_4241 griR griA FALSE 0.039 230.000 0.000 1.000 N NA
 5656846 5656847 SGR_4241 SGR_4242 griA griB FALSE 0.210 109.000 0.000 1.000 N NA
 5656847 5656848 SGR_4242 SGR_4243 griB griC FALSE 0.065 179.000 0.000 1.000   NA
 5656848 5656849 SGR_4243 SGR_4244 griC griD TRUE 0.855 0.000 0.022 1.000   NA
 5656849 5656850 SGR_4244 SGR_4245 griD griE FALSE 0.227 53.000 0.000 1.000   NA
 5656850 5656851 SGR_4245 SGR_4246 griE griF FALSE 0.268 40.000 0.000 1.000   NA
 5656851 5656852 SGR_4246 SGR_4247 griF griG FALSE 0.131 130.000 0.000 1.000   NA
 5656853 5656854 SGR_4248 SGR_4249 griH griI FALSE 0.402 76.000 0.055 NA N NA
 5656854 5656855 SGR_4249 SGR_4250 griI griJ FALSE 0.423 57.000 0.005 1.000 N NA
 5656856 5656857 SGR_4251 SGR_4252     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 5656858 5656859 SGR_4253 SGR_4254     FALSE 0.004 524.000 0.000 1.000 N NA
 5656861 5656862 SGR_4256 SGR_4257     FALSE 0.129 221.000 0.286 NA   NA
 5656862 5656863 SGR_4257 SGR_4258     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 5656864 5656865 SGR_4259 SGR_4260     FALSE 0.011 243.000 0.000 NA   NA
 5656870 5656871 SGR_tRNA39 SGR_4265     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 5656871 5656872 SGR_4265 SGR_4266     FALSE 0.110 86.000 0.000 NA   NA
 5656873 5656874 SGR_4267 SGR_4268     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656874 5656875 SGR_4268 SGR_4269     FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 5656877 5656878 SGR_4271 SGR_4272     FALSE 0.507 158.000 0.500 1.000   NA
 5656885 5656886 SGR_4279 SGR_4280     FALSE 0.010 253.000 0.000 NA   NA
 5656889 5656890 SGR_4283 SGR_4284     TRUE 0.898 -3.000 0.108 NA   NA
 5656890 5656891 SGR_4284 SGR_4285     TRUE 0.728 7.000 0.031 NA   NA
 5656891 5656892 SGR_4285 SGR_4286     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5656892 5656893 SGR_4286 SGR_4287     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656893 5656894 SGR_4287 SGR_4288     FALSE 0.130 62.000 0.000 NA   NA
 5656895 5656896 SGR_4289 SGR_4290     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 5656896 5656897 SGR_4290 SGR_4291     FALSE 0.228 103.000 0.013 NA   NA
 5656897 5656898 SGR_4291 SGR_4292     FALSE 0.300 67.000 0.018 NA   NA
 5656898 5656899 SGR_4292 SGR_4293     FALSE 0.004 336.000 0.000 NA   NA
 5656902 5656903 SGR_4296 SGR_4297     TRUE 0.752 26.000 0.214 1.000 N NA
 5656903 5656904 SGR_4297 SGR_4298     TRUE 0.864 70.000 0.025 0.001 Y NA
 5656904 5656905 SGR_4298 SGR_4299     TRUE 0.988 -3.000 0.029 0.001 Y NA
 5656905 5656906 SGR_4299 SGR_4300     TRUE 0.802 18.000 0.195 1.000 N NA
 5656906 5656907 SGR_4300 SGR_4301     FALSE 0.163 158.000 0.024 NA   NA
 5656907 5656908 SGR_4301 SGR_tRNA40     FALSE 0.097 99.000 0.000 NA   NA
 5656908 5656909 SGR_tRNA40 SGR_4302     FALSE 0.008 270.000 0.000 NA   NA
 5656910 5656911 SGR_4303 SGR_4304     FALSE 0.433 8.000 0.000 NA   NA
 5656914 5656915 SGR_4307 SGR_4308     FALSE 0.248 47.000 0.000 1.000   NA
 5656919 5656920 SGR_4312 SGR_4313     TRUE 0.978 -3.000 0.667 NA N NA
 5656920 5656921 SGR_4313 SGR_4314     TRUE 0.979 -3.000 0.800 NA   NA
 5656921 5656922 SGR_4314 SGR_4315     FALSE 0.350 14.000 0.000 NA   NA
 5656924 5656925 SGR_4317 SGR_4318     TRUE 0.737 121.000 0.833 1.000   NA
 5656926 5656927 SGR_4319 SGR_4320   ssgE FALSE 0.006 289.000 0.000 NA   NA
 5656928 5656929 SGR_4321 SGR_4322     TRUE 0.988 2.000 0.236 0.005 Y NA
 5656929 5656930 SGR_4322 SGR_4323     TRUE 0.993 -12.000 0.489 0.001 Y NA
 5656930 5656931 SGR_4323 SGR_4324     FALSE 0.028 248.000 0.000 1.000 N NA
 5656931 5656932 SGR_4324 SGR_4325     TRUE 0.956 -3.000 0.286 1.000 N NA
 5656932 5656933 SGR_4325 SGR_4326     FALSE 0.420 69.000 0.000 0.069   NA
 5656935 5656936 SGR_4328 SGR_4329     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 5656937 5656938 SGR_4330 SGR_4331     FALSE 0.119 71.000 0.000 NA   NA
 5656938 5656939 SGR_4331 SGR_4332     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 5656940 5656941 SGR_4333 SGR_4334     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656942 5656943 SGR_4335 SGR_4336     TRUE 0.845 -3.000 0.017 NA   NA
 5656943 5656944 SGR_4336 SGR_4337     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 5656945 5656946 SGR_4338 SGR_4339     FALSE 0.202 32.000 0.000 NA   NA
 5656947 5656948 SGR_4340 SGR_4341     FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 5656949 5656950 SGR_4342 SGR_4343     FALSE 0.056 160.000 0.000 NA   NA
 5656951 5656952 SGR_4344 SGR_4345     FALSE 0.168 43.000 0.000 NA   NA
 5656952 5656953 SGR_4345 SGR_4346     FALSE 0.016 227.000 0.000 NA   NA
 5656955 5656956 SGR_4348 SGR_4349     TRUE 0.887 -3.000 0.073 NA   NA
 5656956 5656957 SGR_4349 SGR_4350     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656957 5656958 SGR_4350 SGR_4351     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5656958 5656959 SGR_4351 SGR_4352     TRUE 0.931 11.000 0.667 NA   NA
 5656960 5656961 SGR_4353 SGR_4354     FALSE 0.098 204.000 0.080 NA   NA
 5656961 5656962 SGR_4354 SGR_4355     FALSE 0.113 200.000 0.100 NA   NA
 5656962 5656963 SGR_4355 SGR_4356     TRUE 0.865 -3.000 0.006 1.000   NA
 5656963 5656964 SGR_4356 SGR_4357     TRUE 0.924 -3.000 0.068 1.000 N NA
 5656964 5656965 SGR_4357 SGR_4358     FALSE 0.297 85.000 0.004 1.000   NA
 5656966 5656967 SGR_4359 SGR_4360     TRUE 0.978 -9.000 1.000 NA   NA
 5656967 5656968 SGR_4360 SGR_4361     FALSE 0.109 87.000 0.000 NA   NA
 5656969 5656970 SGR_4362 SGR_4363     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 5656970 5656971 SGR_4363 SGR_4364     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 5656971 5656972 SGR_4364 SGR_4365     FALSE 0.110 86.000 0.000 NA   NA
 5656972 5656973 SGR_4365 SGR_4366     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 5656974 5656975 SGR_4367 SGR_4368     TRUE 0.891 16.000 0.588 NA   NA
 5656976 5656977 SGR_4369 SGR_4370     TRUE 0.964 -3.000 0.030 0.001 N NA
 5656977 5656978 SGR_4370 SGR_4371     TRUE 0.967 -3.000 0.051 0.001 N NA
 5656983 5656984 SGR_4376 SGR_4377     FALSE 0.154 101.000 0.000 1.000   NA
 5656984 5656985 SGR_4377 SGR_4378     TRUE 0.938 -3.000 0.152 1.000 N NA
 5656987 5656988 SGR_4380 SGR_4381   pth FALSE 0.184 128.000 0.006 NA   NA
 5656988 5656989 SGR_4381 SGR_4382 pth   TRUE 0.915 92.000 0.496 0.012 Y NA
 5656989 5656990 SGR_4382 SGR_4383     FALSE 0.095 207.000 0.004 1.000 N NA
 5656990 5656991 SGR_4383 SGR_4384     FALSE 0.312 121.000 0.014 1.000 N NA
 5656991 5656992 SGR_4384 SGR_tRNA41     FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 5656994 5656995 SGR_4386 SGR_4387     TRUE 0.951 11.000 0.857 NA   NA
 5656996 5656997 SGR_4388 SGR_4389     TRUE 0.936 -3.000 0.273 NA   NA
 5656997 5656998 SGR_4389 SGR_4390     FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 5656998 5656999 SGR_4390 SGR_4391     FALSE 0.081 126.000 0.000 NA   NA
 5657000 5657001 SGR_4392 SGR_4393     TRUE 0.968 -3.000 0.500 1.000   NA
 5657001 5657002 SGR_4393 SGR_4394     TRUE 0.977 -19.000 1.000 NA   NA
 5657002 5657003 SGR_4394 SGR_4395     TRUE 0.939 -3.000 0.286 NA   NA
 5657003 5657004 SGR_4395 SGR_4396     TRUE 0.571 115.000 0.500 NA   NA
 5657004 5657005 SGR_4396 SGR_4397     FALSE 0.001 747.000 0.000 NA   NA
 5657005 5657006 SGR_4397 SGR_4398     TRUE 0.950 -124.000 0.500 NA   NA
 5657008 5657009 SGR_4400 SGR_4401     FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   NA
 5657009 5657010 SGR_4401 SGR_4402     TRUE 0.949 -3.000 0.286 NA N NA
 5657013 5657014 SGR_4405 SGR_4406     TRUE 0.986 -3.000 0.857 1.000 N NA
 5657014 5657015 SGR_4406 SGR_4407     FALSE 0.003 341.000 0.000 NA   NA
 5657015 5657016 SGR_4407 SGR_4408     FALSE 0.065 150.000 0.000 NA   NA
 5657016 5657017 SGR_4408 SGR_4409     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5657017 5657018 SGR_4409 SGR_4410     TRUE 0.940 -10.000 0.400 NA   NA
 5657018 5657019 SGR_4410 SGR_4411     TRUE 0.830 -3.000 0.008 NA   NA
 5657019 5657020 SGR_4411 SGR_4412     TRUE 0.562 15.000 0.006 NA   NA
 5657020 5657021 SGR_4412 SGR_4413     TRUE 0.921 0.000 0.273 NA   NA
 5657021 5657022 SGR_4413 SGR_4414     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657022 5657023 SGR_4414 SGR_4415     TRUE 0.687 2.000 0.000 1.000   NA
 5657023 5657024 SGR_4415 SGR_4416     TRUE 0.909 60.000 0.344 0.088 Y NA
 5657024 5657025 SGR_4416 SGR_4417     TRUE 0.886 -3.000 0.071 NA   NA
 5657027 5657028 SGR_4419 SGR_4420     TRUE 0.955 -3.000 0.400 NA   NA
 5657032 5657033 SGR_4424 SGR_4425     FALSE 0.086 112.000 0.000 NA   NA
 5657035 5657036 SGR_4427 SGR_4428     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657038 5657039 SGR_4430 SGR_4431     FALSE 0.096 100.000 0.000 NA   NA
 5657039 5657040 SGR_4431 SGR_4432     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657040 5657041 SGR_4432 SGR_4433     FALSE 0.039 206.000 0.000 1.000   NA
 5657041 5657042 SGR_4433 SGR_4434     FALSE 0.269 107.000 0.011 1.000   NA
 5657042 5657043 SGR_4434 SGR_4435     FALSE 0.262 42.000 0.000 1.000   NA
 5657043 5657044 SGR_4435 SGR_4436     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5657044 5657045 SGR_4436 SGR_4437     FALSE 0.365 176.000 0.400 1.000   NA
 5657045 5657046 SGR_4437 SGR_4438     FALSE 0.012 478.000 0.000 0.001   NA
 5657046 5657047 SGR_4438 SGR_4439     FALSE 0.008 323.000 0.000 1.000   NA
 5657047 5657048 SGR_4439 SGR_4440     FALSE 0.389 70.000 0.043 1.000   NA
 5657048 5657049 SGR_4440 SGR_4441     FALSE 0.487 85.000 0.252 NA   NA
 5657049 5657050 SGR_4441 SGR_4442     TRUE 0.930 -3.000 0.243 NA   NA
 5657050 5657051 SGR_4442 SGR_4443     FALSE 0.004 443.000 0.000 NA N NA
 5657051 5657052 SGR_4443 SGR_4444     FALSE 0.010 338.000 0.000 1.000 N NA
 5657053 5657054 SGR_4445 SGR_4446     TRUE 0.706 122.000 0.667 1.000 N NA
 5657055 5657056 SGR_tRNA42 SGR_4447     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 5657056 5657057 SGR_4447 SGR_4448     FALSE 0.164 152.000 0.014 NA   NA
 5657058 5657059 SGR_4449 SGR_4450     FALSE 0.003 352.000 0.000 NA   NA
 5657059 5657060 SGR_4450 SGR_4451     FALSE 0.230 178.000 0.100 1.000 N NA
 5657062 5657063 SGR_4453 SGR_4454     FALSE 0.017 221.000 0.000 NA   NA
 5657064 5657065 SGR_4455 SGR_4456     FALSE 0.002 998.000 0.000 1.000   NA
 5657066 5657067 SGR_4457 SGR_4458     FALSE 0.401 142.000 0.300 NA   NA
 5657067 5657068 SGR_4458 SGR_4459     TRUE 0.955 -3.000 0.400 NA   NA
 5657068 5657069 SGR_4459 SGR_4460     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5657069 5657070 SGR_4460 SGR_4461     FALSE 0.057 159.000 0.000 NA   NA
 5657071 5657072 SGR_4462 SGR_4463     TRUE 0.981 0.000 0.237 1.000 Y NA
 5657072 5657073 SGR_4463 SGR_4464     TRUE 0.921 -9.000 0.160 1.000 N NA
 5657073 5657074 SGR_4464 SGR_4465     FALSE 0.424 147.000 0.233 1.000 N NA
 5657076 5657077 SGR_4467 SGR_4468     FALSE 0.293 203.000 0.000 1.000 Y NA
 5657077 5657078 SGR_4468 SGR_4469     FALSE 0.003 383.000 0.000 NA   NA
 5657078 5657079 SGR_4469 SGR_4470     FALSE 0.147 52.000 0.000 NA   NA
 5657079 5657080 SGR_4470 SGR_4471     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657080 5657081 SGR_4471 SGR_4472     TRUE 0.924 15.000 0.750 NA   NA
 5657083 5657084 SGR_4474 SGR_4475     TRUE 0.943 56.000 0.848 1.000 Y NA
 5657086 5657087 SGR_4477 SGR_4478     TRUE 0.991 -3.000 0.141 0.000 Y NA
 5657087 5657088 SGR_4478 SGR_4479     TRUE 0.743 12.000 0.006 1.000 N NA
 5657088 5657089 SGR_4479 SGR_4480     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5657095 5657096 SGR_4486 SGR_4487     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 5657101 5657102 SGR_4492 SGR_4493     FALSE 0.078 293.000 0.000 NA Y NA
 5657102 5657103 SGR_4493 SGR_4494     FALSE 0.021 480.000 0.000 NA Y NA
 5657103 5657104 SGR_4494 SGR_4495     FALSE 0.190 178.000 0.167 NA   NA
 5657105 5657106 SGR_4496 SGR_4497     FALSE 0.377 80.000 0.048 1.000   NA
 5657106 5657107 SGR_4497 SGR_4498     FALSE 0.455 92.000 0.095 1.000 N NA
 5657108 5657109 SGR_4499 SGR_4500     FALSE 0.169 91.000 0.000 1.000   NA
 5657109 5657110 SGR_4500 SGR_4501     TRUE 0.588 72.000 0.371 NA   NA
 5657110 5657111 SGR_4501 SGR_4502     TRUE 0.669 14.000 0.048 NA   NA
 5657112 5657113 SGR_4503 SGR_4504 whiB   FALSE 0.004 693.000 0.036 NA   NA
 5657113 5657114 SGR_4504 SGR_4505     TRUE 0.936 -3.000 0.273 NA   NA
 5657116 5657117 SGR_4507 SGR_4508     TRUE 0.642 70.000 0.460 NA   NA
 5657117 5657118 SGR_4508 SGR_4509     FALSE 0.025 283.000 0.050 NA   NA
 5657118 5657119 SGR_4509 SGR_4510     FALSE 0.110 177.000 0.016 NA   NA
 5657119 5657120 SGR_4510 SGR_4511     FALSE 0.010 464.000 0.198 NA   NA
 5657120 5657121 SGR_4511 SGR_4512     FALSE 0.501 87.000 0.150 1.000 N NA
 5657121 5657122 SGR_4512 SGR_4513     FALSE 0.019 277.000 0.000 1.000 N NA
 5657122 5657123 SGR_4513 SGR_4514     FALSE 0.104 176.000 0.010 NA   NA
 5657125 5657126 SGR_4516 SGR_16SrRNA4   rrnD1 FALSE 0.001 729.000 0.000 NA   NA
 5657126 5657127 SGR_16SrRNA4 SGR_23SrRNA4 rrnD1 rrnD2 FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5657127 5657128 SGR_23SrRNA4 SGR_5SrRNA4 rrnD2 rrnD3 FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 5657129 5657130 SGR_4517 SGR_4518     TRUE 0.948 5.000 0.648 NA   NA
 5657130 5657131 SGR_4518 SGR_4519     TRUE 0.942 -3.000 0.302 NA   NA
 5657131 5657132 SGR_4519 SGR_4520     TRUE 0.981 -3.000 0.841 NA   NA
 5657132 5657133 SGR_4520 SGR_4521     TRUE 0.833 5.000 0.140 NA   NA
 5657134 5657135 SGR_4522 SGR_4523     TRUE 0.824 5.000 0.011 1.000 N NA
 5657135 5657136 SGR_4523 SGR_4524     TRUE 0.991 2.000 0.772 1.000 Y NA
 5657136 5657137 SGR_4524 SGR_4525     FALSE 0.469 29.000 0.025 NA   NA
 5657137 5657138 SGR_4525 SGR_4526     FALSE 0.157 48.000 0.000 NA   NA
 5657138 5657139 SGR_4526 SGR_4527     FALSE 0.017 327.000 0.072 NA   NA
 5657139 5657140 SGR_4527 SGR_4528     FALSE 0.133 184.000 0.019 NA N NA
 5657141 5657142 SGR_4529 SGR_4530     FALSE 0.326 63.000 0.029 NA   NA
 5657145 5657146 SGR_4533 SGR_4534     TRUE 0.555 36.000 0.151 NA   NA
 5657149 5657150 SGR_4537 SGR_4538     TRUE 0.973 -7.000 0.000 0.088 Y NA
 5657152 5657153 SGR_4540 SGR_4541     FALSE 0.112 83.000 0.000 NA   NA
 5657154 5657155 SGR_4542 SGR_4543     FALSE 0.126 135.000 0.000 1.000   NA
 5657155 5657156 SGR_4543 SGR_4544     TRUE 0.643 12.000 0.015 NA   NA
 5657156 5657157 SGR_4544 SGR_4545     FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 5657157 5657158 SGR_4545 SGR_4546     TRUE 0.992 -3.000 0.222 0.001 Y NA
 5657158 5657159 SGR_4546 SGR_4547     TRUE 0.995 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 5657160 5657161 SGR_4548 SGR_4549     FALSE 0.463 190.000 0.429 0.059 N NA
 5657161 5657162 SGR_4549 SGR_4550     TRUE 0.955 -3.000 0.080 0.036   NA
 5657162 5657163 SGR_4550 SGR_4551     TRUE 0.536 107.000 0.080 0.036   NA
 5657163 5657164 SGR_4551 SGR_4552     FALSE 0.013 271.000 0.000 1.000   NA
 5657165 5657166 SGR_4553 SGR_4554     TRUE 0.784 183.000 0.444 0.002 Y NA
 5657166 5657167 SGR_4554 SGR_4555     FALSE 0.298 116.000 0.005 1.000 N NA
 5657167 5657168 SGR_4555 SGR_4556     FALSE 0.004 335.000 0.000 NA   NA
 5657170 5657171 SGR_4558 SGR_4559 ftsE   TRUE 0.895 55.000 0.431 1.000 Y NA
 5657171 5657172 SGR_4559 SGR_4560     FALSE 0.409 69.000 0.012 1.000 N NA
 5657172 5657173 SGR_4560 SGR_4561     TRUE 0.663 19.000 0.006 1.000 N NA
 5657173 5657174 SGR_4561 SGR_RNA02   srn1 FALSE 0.096 100.000 0.000 NA   NA
 5657175 5657176 SGR_4562 SGR_4563     TRUE 0.997 -3.000 0.800 0.008 Y NA
 5657177 5657178 SGR_4564 SGR_4565     TRUE 0.674 141.000 0.667 1.000 N NA
 5657178 5657179 SGR_4565 SGR_4566     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5657179 5657180 SGR_4566 SGR_4567     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5657180 5657181 SGR_4567 SGR_4568     TRUE 0.991 -3.000 0.250 0.036 Y NA
 5657181 5657182 SGR_4568 SGR_4569     TRUE 0.981 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 5657184 5657185 SGR_4571 SGR_4572     TRUE 0.567 140.000 0.571 NA   NA
 5657185 5657186 SGR_4572 SGR_4573     TRUE 0.965 1.000 0.667 NA   NA
 5657186 5657187 SGR_4573 SGR_4574     TRUE 0.985 -3.000 0.833 1.000 N NA
 5657187 5657188 SGR_4574 SGR_4575     FALSE 0.149 156.000 0.000 1.000 N NA
 5657188 5657189 SGR_4575 SGR_4576     FALSE 0.221 169.000 0.032 1.000 N NA
 5657189 5657190 SGR_4576 SGR_4577     FALSE 0.348 45.000 0.000 1.000 N NA
 5657192 5657193 SGR_4579 SGR_4580     FALSE 0.310 108.000 0.091 NA   NA
 5657193 5657194 SGR_4580 SGR_4581     FALSE 0.003 461.000 0.000 1.000   NA
 5657194 5657195 SGR_4581 SGR_4582     FALSE 0.007 378.000 0.000 1.000 N NA
 5657199 5657200 SGR_4586 SGR_4587     FALSE 0.230 113.000 0.027 NA   NA
 5657200 5657201 SGR_4587 SGR_4588     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 5657201 5657202 SGR_4588 SGR_4589     TRUE 0.993 3.000 0.692 0.036 Y NA
 5657202 5657203 SGR_4589 SGR_4590     TRUE 0.997 -3.000 0.900 0.036 Y NA
 5657203 5657204 SGR_4590 SGR_4591     TRUE 0.987 5.000 0.667 1.000 Y NA
 5657204 5657205 SGR_4591 SGR_4592     FALSE 0.023 261.000 0.000 1.000 N NA
 5657205 5657206 SGR_4592 SGR_4593     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 5657206 5657207 SGR_4593 SGR_4594     TRUE 0.677 185.000 0.250 0.038 Y NA
 5657207 5657208 SGR_4594 SGR_4595     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5657208 5657209 SGR_4595 SGR_4596     TRUE 0.923 21.000 1.000 NA   NA
 5657209 5657210 SGR_4596 SGR_4597     FALSE 0.295 19.000 0.000 NA   NA
 5657210 5657211 SGR_4597 SGR_4598     FALSE 0.036 183.000 0.000 NA   NA
 5657211 5657212 SGR_4598 SGR_4599     FALSE 0.091 107.000 0.000 NA   NA
 5657214 5657215 SGR_4600 SGR_4601     FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 5657215 5657216 SGR_4601 SGR_4602     FALSE 0.036 468.000 0.017 1.000 Y NA
 5657216 5657217 SGR_4602 SGR_4603     FALSE 0.238 152.000 0.043 1.000   NA
 5657218 5657219 SGR_4604 SGR_4605     FALSE 0.238 26.000 0.000 NA   NA
 5657219 5657220 SGR_4605 SGR_4606     FALSE 0.159 47.000 0.000 NA   NA
 5657220 5657221 SGR_4606 SGR_4607     FALSE 0.377 77.000 0.045 1.000   NA
 5657221 5657222 SGR_4607 SGR_4608     TRUE 0.972 -3.000 0.229 0.036 N NA
 5657222 5657223 SGR_4608 SGR_4609     TRUE 0.988 -3.000 0.115 0.058 Y NA
 5657223 5657224 SGR_4609 SGR_4610     TRUE 0.985 -7.000 0.138 0.058 Y NA
 5657224 5657225 SGR_4610 SGR_4611     TRUE 0.537 42.000 0.032 1.000 N NA
 5657230 5657231 SGR_4616 SGR_4617     FALSE 0.031 347.000 0.333 NA   NA
 5657233 5657234 SGR_4619 SGR_4620     FALSE 0.447 125.000 0.316 NA   NA
 5657235 5657236 SGR_4621 SGR_4622     FALSE 0.079 234.000 0.053 1.000 N NA
 5657237 5657238 SGR_4623 SGR_4624     TRUE 0.777 78.000 0.823 NA   NA
 5657238 5657239 SGR_4624 SGR_4625     FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 5657239 5657240 SGR_4625 SGR_4626     FALSE 0.213 137.000 0.033 NA   NA
 5657240 5657241 SGR_4626 SGR_4627     FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 5657241 5657242 SGR_4627 SGR_4628     TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5657242 5657243 SGR_4628 SGR_4629     TRUE 0.880 125.000 0.700 1.000 Y NA
 5657243 5657244 SGR_4629 SGR_4630     FALSE 0.263 22.000 0.000 NA   NA
 5657244 5657245 SGR_4630 SGR_4631     FALSE 0.324 113.000 0.130 NA   NA
 5657245 5657246 SGR_4631 SGR_4632     TRUE 0.907 0.000 0.068 1.000 N NA
 5657249 5657250 SGR_4635 SGR_4636     FALSE 0.191 280.000 0.000 0.001 Y NA
 5657251 5657252 SGR_4637 SGR_4638     FALSE 0.085 216.000 0.008 1.000 N NA
 5657252 5657253 SGR_4638 SGR_4639     FALSE 0.195 124.000 0.010 NA   NA
 5657253 5657254 SGR_4639 SGR_4640     FALSE 0.142 154.000 0.005 NA   NA
 5657255 5657256 SGR_tRNA44 SGR_4641     FALSE 0.366 13.000 0.000 NA   NA
 5657256 5657257 SGR_4641 SGR_4642     TRUE 0.933 -3.000 0.000 0.002   NA
 5657257 5657258 SGR_4642 SGR_4643     FALSE 0.072 175.000 0.000 1.000   NA
 5657258 5657259 SGR_4643 SGR_4644     FALSE 0.119 179.000 0.004 1.000   NA
 5657260 5657261 SGR_4645 SGR_4646   groES2 FALSE 0.428 88.000 0.188 NA   NA
 5657263 5657264 SGR_4648 SGR_4649     TRUE 0.977 -7.000 0.886 NA   NA
 5657264 5657265 SGR_4649 SGR_4650     TRUE 0.667 85.000 0.545 NA   NA
 5657265 5657266 SGR_4650 SGR_4651     FALSE 0.343 85.000 0.069 NA   NA
 5657270 5657271 SGR_4655 SGR_4656     FALSE 0.126 66.000 0.000 NA   NA
 5657271 5657272 SGR_4656 SGR_4657     FALSE 0.097 99.000 0.000 NA   NA
 5657274 5657275 SGR_4659 SGR_4660     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657275 5657276 SGR_4660 SGR_4661     FALSE 0.016 227.000 0.000 NA   NA
 5657278 5657279 SGR_4663 SGR_4664     TRUE 0.681 26.000 0.222 NA   NA
 5657282 5657283 SGR_4667 SGR_4668     TRUE 0.774 81.000 0.821 NA   NA
 5657283 5657284 SGR_4668 SGR_4669     TRUE 0.944 -3.000 0.045 0.087   NA
 5657284 5657285 SGR_4669 SGR_4670     TRUE 0.887 -15.000 0.000 0.037   NA
 5657285 5657286 SGR_4670 SGR_4671     FALSE 0.108 149.000 0.000 1.000   NA
 5657287 5657288 SGR_4672 SGR_4673     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5657288 5657289 SGR_4673 SGR_4674     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5657290 5657291 SGR_4675 SGR_4676     TRUE 0.837 61.000 0.000 0.001 Y NA
 5657291 5657292 SGR_4676 SGR_4677     TRUE 0.986 -3.000 0.016 0.037 Y NA
 5657292 5657293 SGR_4677 SGR_4678     TRUE 0.719 8.000 0.032 NA   NA
 5657293 5657294 SGR_4678 SGR_4679     FALSE 0.381 47.000 0.028 NA   NA
 5657294 5657295 SGR_4679 SGR_4680     FALSE 0.014 233.000 0.000 NA   NA
 5657296 5657297 SGR_4681 SGR_4682     FALSE 0.174 40.000 0.000 NA   NA
 5657297 5657298 SGR_4682 SGR_4683     TRUE 0.957 -3.000 0.429 NA   NA
 5657298 5657299 SGR_4683 SGR_4684     FALSE 0.424 9.000 0.000 NA   NA
 5657299 5657300 SGR_4684 SGR_4685     FALSE 0.215 202.000 0.368 NA   NA
 5657300 5657301 SGR_4685 SGR_4686     FALSE 0.467 138.000 0.263 1.000 N NA
 5657302 5657303 SGR_4687 SGR_4688     TRUE 0.953 -3.000 0.385 NA   NA
 5657304 5657305 SGR_4689 SGR_4690     FALSE 0.013 235.000 0.000 NA   NA
 5657305 5657306 SGR_4690 SGR_4691     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5657306 5657307 SGR_4691 SGR_4692     FALSE 0.248 157.000 0.019 1.000 N NA
 5657307 5657308 SGR_4692 SGR_4693     TRUE 0.860 6.000 0.170 1.000   NA
 5657308 5657309 SGR_4693 SGR_4694     TRUE 0.872 -3.000 0.012 1.000   NA
 5657309 5657310 SGR_4694 SGR_4695     TRUE 0.973 -3.000 0.250 0.035 N NA
 5657310 5657311 SGR_4695 SGR_4696     TRUE 0.974 -7.000 0.375 0.035 N NA
 5657311 5657312 SGR_4696 SGR_4697     TRUE 0.649 33.000 0.000 0.035 N NA
 5657312 5657313 SGR_4697 SGR_4698     FALSE 0.017 251.000 0.000 1.000   NA
 5657313 5657314 SGR_4698 SGR_4699     FALSE 0.459 75.000 0.000 0.013   NA
 5657314 5657315 SGR_4699 SGR_4700     FALSE 0.075 136.000 0.000 NA   NA
 5657315 5657316 SGR_4700 SGR_4701     TRUE 0.558 2.000 0.000 NA   NA
 5657316 5657317 SGR_4701 SGR_4702     FALSE 0.003 351.000 0.000 NA   NA
 5657318 5657319 SGR_4703 SGR_4704     TRUE 0.977 -3.000 0.714 NA   NA
 5657319 5657320 SGR_4704 SGR_tRNA45     FALSE 0.001 557.000 0.000 NA   NA
 5657321 5657322 SGR_4705 SGR_4706     TRUE 0.858 -3.000 0.030 NA   NA
 5657322 5657323 SGR_4706 SGR_4707     FALSE 0.034 243.000 0.018 NA   NA
 5657323 5657324 SGR_4707 SGR_4708     FALSE 0.341 27.000 0.000 1.000   NA
 5657325 5657326 SGR_tRNA46 SGR_4709     FALSE 0.081 126.000 0.000 NA   NA
 5657326 5657327 SGR_4709 SGR_4710     FALSE 0.243 168.000 0.052 1.000 N NA
 5657327 5657328 SGR_4710 SGR_4711     TRUE 0.791 92.000 0.190 1.000 Y NA
 5657328 5657329 SGR_4711 SGR_4712     TRUE 0.996 -3.000 0.609 0.004 Y NA
 5657329 5657330 SGR_4712 SGR_4713     TRUE 0.977 19.000 0.522 0.035 Y NA
 5657330 5657331 SGR_4713 SGR_4714     FALSE 0.008 371.000 0.000 1.000 N NA
 5657332 5657333 SGR_4715 SGR_4716     FALSE 0.409 134.000 0.211 NA N NA
 5657336 5657337 SGR_tRNA47 SGR_4719     TRUE 0.580 -9.000 0.000 NA   NA
 5657337 5657338 SGR_4719 SGR_4720     FALSE 0.057 327.000 0.500 NA   NA
 5657338 5657339 SGR_4720 SGR_4721     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 5657339 5657340 SGR_4721 SGR_4722     TRUE 0.861 29.000 0.700 NA   NA
 5657340 5657341 SGR_4722 SGR_4723     TRUE 0.971 -9.000 0.750 NA   NA
 5657341 5657342 SGR_4723 SGR_4724     FALSE 0.436 107.000 0.263 NA   NA
 5657345 5657346 SGR_4727 SGR_4728     TRUE 0.784 76.000 0.833 NA   NA
 5657348 5657349 SGR_4730 SGR_4731     TRUE 0.995 -3.000 0.846 1.000 Y NA
 5657350 5657351 SGR_4732 SGR_4733     TRUE 0.869 12.000 0.321 1.000   NA
 5657351 5657352 SGR_4733 SGR_4734     TRUE 0.906 2.000 0.000 0.002   NA
 5657353 5657354 SGR_4735 SGR_4736     TRUE 0.900 169.000 1.000 0.035 Y NA
 5657354 5657355 SGR_4736 SGR_4737     TRUE 0.934 15.000 0.000 0.035 Y NA
 5657355 5657356 SGR_4737 SGR_4738     TRUE 0.700 67.000 0.000 1.000 Y NA
 5657356 5657357 SGR_4738 SGR_4739     FALSE 0.098 180.000 0.000 1.000 N NA
 5657357 5657358 SGR_4739 SGR_4740     FALSE 0.008 314.000 0.000 1.000   NA
 5657359 5657360 SGR_tRNA48 SGR_4741   ornA FALSE 0.082 121.000 0.000 NA   NA
 5657360 5657361 SGR_4741 SGR_4742 ornA adpA TRUE 0.877 11.000 0.016 0.044 N NA
 5657363 5657364 SGR_4744 SGR_4745     FALSE 0.281 73.000 0.016 NA   NA
 5657364 5657365 SGR_4745 SGR_4746     TRUE 0.542 87.000 0.333 NA   NA
 5657365 5657366 SGR_4746 SGR_4747   alcC FALSE 0.088 110.000 0.000 NA   NA
 5657366 5657367 SGR_4747 SGR_4748 alcC alcB TRUE 0.967 -3.000 0.542 NA   NA
 5657367 5657368 SGR_4748 SGR_4749 alcB alcA TRUE 0.939 -3.000 0.286 NA   NA
 5657368 5657369 SGR_4749 SGR_4750 alcA   TRUE 0.969 -16.000 0.667 NA N NA
 5657369 5657370 SGR_4750 SGR_4751     FALSE 0.283 156.000 0.108 NA N NA
 5657370 5657371 SGR_4751 SGR_4752     FALSE 0.058 189.000 0.000 NA N NA
 5657372 5657373 SGR_4753 SGR_4754     FALSE 0.011 244.000 0.000 NA   NA
 5657373 5657374 SGR_4754 SGR_4755     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 5657375 5657376 SGR_4756 SGR_4757     TRUE 0.922 -3.000 0.061 1.000 N NA
 5657376 5657377 SGR_4757 SGR_4758     TRUE 0.969 -3.000 0.224 0.067 N NA
 5657377 5657378 SGR_4758 SGR_4759     TRUE 0.982 -3.000 0.136 1.000 Y NA
 5657379 5657380 SGR_4760 SGR_4761     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5657383 5657384 SGR_4764 SGR_4765     TRUE 0.759 24.000 0.200 1.000 N NA
 5657386 5657387 SGR_4767 SGR_4768     FALSE 0.488 76.000 0.100 1.000 N NA
 5657387 5657388 SGR_4768 SGR_4769     TRUE 0.939 19.000 0.250 1.000 Y NA
 5657389 5657390 SGR_4770 SGR_4771     FALSE 0.112 82.000 0.000 NA   NA
 5657390 5657391 SGR_4771 SGR_4772     TRUE 0.836 11.000 0.261 NA   NA
 5657391 5657392 SGR_4772 SGR_4773     FALSE 0.050 167.000 0.000 NA   NA
 5657393 5657394 SGR_4774 SGR_4775     TRUE 0.964 -58.000 0.667 NA   NA
 5657395 5657396 SGR_4776 SGR_4777     FALSE 0.246 25.000 0.000 NA   NA
 5657397 5657398 SGR_4778 SGR_4779     FALSE 0.080 130.000 0.000 NA   NA
 5657404 5657405 SGR_4785 SGR_4786     FALSE 0.131 61.000 0.000 NA   NA
 5657406 5657407 SGR_4787 SGR_4788     TRUE 0.729 132.000 0.167 1.000 Y NA
 5657407 5657408 SGR_4788 SGR_4789     TRUE 0.988 -3.000 0.367 1.000 Y NA
 5657410 5657411 SGR_4791 SGR_4792     FALSE 0.249 165.000 0.182 NA   NA
 5657411 5657412 SGR_4792 SGR_4793     FALSE 0.078 133.000 0.000 NA   NA
 5657413 5657414 SGR_4794 SGR_4795     TRUE 0.563 126.000 0.500 NA   NA
 5657414 5657415 SGR_4795 SGR_4796     FALSE 0.205 220.000 0.000 NA Y NA
 5657415 5657416 SGR_4796 SGR_4797     FALSE 0.081 124.000 0.000 NA   NA
 5657416 5657417 SGR_4797 SGR_4798     FALSE 0.112 83.000 0.000 NA   NA
 5657417 5657418 SGR_4798 SGR_4799     FALSE 0.137 115.000 0.000 1.000   NA
 5657418 5657419 SGR_4799 SGR_4800     FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 5657419 5657420 SGR_4800 SGR_4801     TRUE 0.862 -3.000 0.034 NA   NA
 5657420 5657421 SGR_4801 SGR_4802     TRUE 0.862 -3.000 0.034 NA   NA
 5657422 5657423 SGR_4803 SGR_4804     FALSE 0.347 165.000 0.333 NA   NA
 5657423 5657424 SGR_4804 SGR_4805     FALSE 0.398 11.000 0.000 NA   NA
 5657425 5657426 SGR_4806 SGR_4807     FALSE 0.033 282.000 0.000 0.090   NA
 5657426 5657427 SGR_4807 SGR_4808     FALSE 0.424 80.000 0.167 NA   NA
 5657427 5657428 SGR_4808 SGR_4809     FALSE 0.424 126.000 0.286 NA   NA
 5657429 5657430 SGR_4810 SGR_4811     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657432 5657433 SGR_4813 SGR_4814     TRUE 0.563 41.000 0.125 1.000   NA
 5657433 5657434 SGR_4814 SGR_4815     TRUE 0.961 -3.000 0.476 NA   NA
 5657434 5657435 SGR_4815 SGR_4816     FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 5657437 5657438 SGR_4818 SGR_4819     FALSE 0.520 67.000 0.000 0.002   NA
 5657441 5657442 SGR_4822 SGR_4823     FALSE 0.161 46.000 0.000 NA   NA
 5657443 5657444 SGR_4824 SGR_4825     FALSE 0.227 99.000 0.000 1.000 N NA
 5657444 5657445 SGR_4825 SGR_4826     FALSE 0.100 215.000 0.030 1.000 N NA
 5657446 5657447 SGR_4827 SGR_4828 copA copZ TRUE 0.890 102.000 0.667 1.000 Y NA
 5657447 5657448 SGR_4828 SGR_4829 copZ   FALSE 0.344 167.000 0.222 1.000 N NA
 5657449 5657450 SGR_4830 SGR_4831     FALSE 0.025 230.000 0.000 1.000   NA
 5657451 5657452 SGR_4832 SGR_4833     FALSE 0.026 229.000 0.000 1.000   NA
 5657453 5657454 SGR_4834 SGR_4835     TRUE 0.929 -3.000 0.179 1.000   NA
 5657454 5657455 SGR_4835 SGR_4836     TRUE 0.920 -3.000 0.128 1.000   NA
 5657455 5657456 SGR_4836 SGR_4837     TRUE 0.912 -3.000 0.032 1.000 N NA
 5657456 5657457 SGR_4837 SGR_4838     TRUE 0.668 58.000 0.316 1.000 N NA
 5657457 5657458 SGR_4838 SGR_4839     FALSE 0.087 111.000 0.000 NA   NA
 5657458 5657459 SGR_4839 SGR_4840     FALSE 0.159 47.000 0.000 NA   NA
 5657459 5657460 SGR_4840 SGR_4841     TRUE 0.990 8.000 0.667 0.022 Y NA
 5657462 5657463 SGR_4843 SGR_4844     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5657463 5657464 SGR_4844 SGR_4845     FALSE 0.259 139.000 0.083 NA   NA
 5657464 5657465 SGR_4845 SGR_4846     FALSE 0.077 135.000 0.000 NA   NA
 5657466 5657467 SGR_4847 SGR_4848     FALSE 0.058 185.000 0.000 1.000   NA
 5657467 5657468 SGR_4848 SGR_tRNA49     FALSE 0.001 590.000 0.000 NA   NA
 5657469 5657470 SGR_4849 SGR_4850     TRUE 0.968 -12.000 0.706 NA   NA
 5657470 5657471 SGR_4850 SGR_4851     FALSE 0.269 136.000 0.089 NA   NA
 5657471 5657472 SGR_4851 SGR_4852     FALSE 0.046 199.000 0.000 1.000   NA
 5657472 5657473 SGR_4852 SGR_4853     FALSE 0.194 147.000 0.004 1.000   NA
 5657473 5657474 SGR_4853 SGR_4854     TRUE 0.742 6.000 0.031 NA   NA
 5657474 5657475 SGR_4854 SGR_4855     TRUE 0.918 -3.000 0.186 NA   NA
 5657476 5657477 SGR_4856 SGR_4857     FALSE 0.062 154.000 0.000 NA   NA
 5657477 5657478 SGR_4857 SGR_4858     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5657478 5657479 SGR_4858 SGR_4859     TRUE 0.942 2.000 0.167 0.058   NA
 5657479 5657480 SGR_4859 SGR_4860     FALSE 0.029 223.000 0.000 1.000   NA
 5657482 5657483 SGR_4862 SGR_4863     FALSE 0.521 132.000 0.444 NA   NA
 5657483 5657484 SGR_4863 SGR_4864     TRUE 0.688 99.000 0.667 NA   NA
 5657484 5657485 SGR_4864 SGR_4865     TRUE 0.979 3.000 0.294 1.000 Y NA
 5657485 5657486 SGR_4865 SGR_4866     TRUE 0.950 -3.000 0.364 NA   NA
 5657486 5657487 SGR_4866 SGR_4867     FALSE 0.391 111.000 0.216 NA   NA
 5657487 5657488 SGR_4867 SGR_4868     TRUE 0.982 -3.000 0.895 NA   NA
 5657488 5657489 SGR_4868 SGR_4869     FALSE 0.003 340.000 0.000 NA   NA
 5657489 5657490 SGR_4869 SGR_4870     TRUE 0.989 -3.000 0.478 NA Y NA
 5657490 5657491 SGR_4870 SGR_4871     TRUE 0.983 2.000 0.348 1.000 Y NA
 5657491 5657492 SGR_4871 SGR_4872     TRUE 0.993 4.000 0.692 0.035 Y NA
 5657492 5657493 SGR_4872 SGR_4873     TRUE 0.989 7.000 0.615 0.035 Y NA
 5657493 5657494 SGR_4873 SGR_4874     TRUE 0.880 60.000 0.385 1.000 Y NA
 5657494 5657495 SGR_4874 SGR_4875     FALSE 0.050 216.000 0.000 1.000 N NA
 5657498 5657499 SGR_4878 SGR_4879     TRUE 0.975 1.000 0.857 NA   NA
 5657499 5657500 SGR_4879 SGR_4880     TRUE 0.863 21.000 0.571 NA   NA
 5657500 5657501 SGR_4880 SGR_4881     FALSE 0.082 122.000 0.000 NA   NA
 5657501 5657502 SGR_4881 SGR_4882     FALSE 0.282 66.000 0.000 1.000 N NA
 5657507 5657508 SGR_4887 SGR_4888 asd2   FALSE 0.021 270.000 0.000 1.000 N NA
 5657508 5657509 SGR_4888 SGR_4889     FALSE 0.002 454.000 0.000 NA   NA
 5657509 5657510 SGR_4889 SGR_4890     FALSE 0.266 136.000 0.083 NA   NA
 5657511 5657512 SGR_4891 SGR_4892     FALSE 0.104 153.000 0.000 1.000   NA
 5657512 5657513 SGR_4892 SGR_4893     FALSE 0.121 70.000 0.000 NA   NA
 5657517 5657518 SGR_4897 SGR_4898     FALSE 0.015 229.000 0.000 NA   NA
 5657518 5657519 SGR_4898 SGR_4899     FALSE 0.350 14.000 0.000 NA   NA
 5657519 5657520 SGR_4899 SGR_4900     TRUE 0.558 2.000 0.000 NA   NA
 5657520 5657521 SGR_4900 SGR_4901     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657524 5657525 SGR_4904 SGR_4905   srnR TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657525 5657526 SGR_4905 SGR_4906 srnR sodF FALSE 0.140 160.000 0.000 1.000 N NA
 5657528 5657529 SGR_4908 SGR_4909     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 5657529 5657530 SGR_4909 SGR_4910     FALSE 0.057 209.000 0.000 1.000 N NA
 5657530 5657531 SGR_4910 SGR_4911     TRUE 0.888 121.000 0.400 0.003 Y NA
 5657533 5657534 SGR_4913 SGR_4914     FALSE 0.203 113.000 0.000 1.000 N NA
 5657535 5657536 SGR_4915 SGR_4916     TRUE 0.637 94.000 0.398 1.000 N NA
 5657536 5657537 SGR_4916 SGR_4917     FALSE 0.305 132.000 0.062 1.000   NA
 5657543 5657544 SGR_tRNA51 SGR_4922     FALSE 0.062 154.000 0.000 NA   NA
 5657544 5657545 SGR_4922 SGR_4923     FALSE 0.107 299.000 0.007 1.000 Y NA
 5657545 5657546 SGR_4923 SGR_4924     TRUE 0.937 83.000 0.512 0.000 Y NA
 5657546 5657547 SGR_4924 SGR_4925     TRUE 0.604 157.000 0.039 1.000 Y NA
 5657549 5657550 SGR_4927 SGR_4928 valS   FALSE 0.175 237.000 0.208 0.086 N NA
 5657550 5657551 SGR_4928 SGR_4929     TRUE 0.810 8.000 0.156 NA   NA
 5657551 5657552 SGR_4929 SGR_4930     FALSE 0.020 288.000 0.024 NA   NA
 5657552 5657553 SGR_4930 SGR_4931   mreB FALSE 0.068 268.000 0.004 0.086 N NA
 5657553 5657554 SGR_4931 SGR_4932 mreB mreC TRUE 0.567 174.000 0.689 1.000 N NA
 5657554 5657555 SGR_4932 SGR_4933 mreC mreD TRUE 0.959 12.000 0.550 0.001   NA
 5657555 5657556 SGR_4933 SGR_4934 mreD   FALSE 0.488 62.000 0.133 1.000   NA
 5657556 5657557 SGR_4934 SGR_4935     TRUE 0.926 0.000 0.161 1.000 N NA
 5657557 5657558 SGR_4935 SGR_4936     FALSE 0.480 31.000 0.006 1.000   NA
 5657558 5657559 SGR_4936 SGR_4937     FALSE 0.400 53.000 0.018 1.000   NA
 5657559 5657560 SGR_4937 SGR_4938     FALSE 0.121 70.000 0.000 NA   NA
 5657560 5657561 SGR_4938 SGR_4939     FALSE 0.226 123.000 0.030 NA   NA
 5657561 5657562 SGR_4939 SGR_4940     FALSE 0.066 229.000 0.098 NA   NA
 5657562 5657563 SGR_4940 SGR_4941     FALSE 0.009 348.000 0.000 1.000 N NA
 5657563 5657564 SGR_4941 SGR_4942     TRUE 0.920 -3.000 0.131 1.000   NA
 5657564 5657565 SGR_4942 SGR_4943     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657565 5657566 SGR_4943 SGR_4944     TRUE 0.808 5.000 0.083 NA   NA
 5657566 5657567 SGR_4944 SGR_4945     TRUE 0.949 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5657568 5657569 SGR_4946 SGR_4947     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657569 5657570 SGR_4947 SGR_4948     FALSE 0.467 166.000 0.000 1.000 Y NA
 5657570 5657571 SGR_4948 SGR_4949     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5657571 5657572 SGR_4949 SGR_4950     FALSE 0.243 91.000 0.000 1.000 N NA
 5657572 5657573 SGR_4950 SGR_4951     FALSE 0.182 79.000 0.000 1.000   NA
 5657573 5657574 SGR_4951 SGR_4952     FALSE 0.006 285.000 0.000 NA   NA
 5657575 5657576 SGR_4953 SGR_4954     TRUE 0.986 15.000 0.667 0.007 Y NA
 5657576 5657577 SGR_4954 SGR_4955   obg FALSE 0.467 143.000 0.335 1.000   NA
 5657577 5657578 SGR_4955 SGR_4956 obg   FALSE 0.008 319.000 0.000 1.000   NA
 5657578 5657579 SGR_4956 SGR_4957     FALSE 0.216 136.000 0.033 NA   NA
 5657579 5657580 SGR_4957 SGR_4958     FALSE 0.028 198.000 0.000 NA   NA
 5657580 5657581 SGR_4958 SGR_4959     FALSE 0.349 183.000 0.000 NA Y NA
 5657581 5657582 SGR_4959 SGR_4960     FALSE 0.113 173.000 0.000 1.000 N NA
 5657582 5657583 SGR_4960 SGR_4961     FALSE 0.185 129.000 0.006 NA   NA
 5657583 5657584 SGR_4961 SGR_4962     FALSE 0.220 99.000 0.007 NA   NA
 5657584 5657585 SGR_4962 SGR_4963     FALSE 0.074 193.000 0.007 NA   NA
 5657585 5657586 SGR_4963 SGR_4964     FALSE 0.322 207.000 0.667 NA   NA
 5657588 5657589 SGR_4966 SGR_4967     TRUE 0.589 85.000 0.400 NA   NA
 5657589 5657590 SGR_4967 SGR_4968     FALSE 0.356 39.000 0.006 NA   NA
 5657590 5657591 SGR_4968 SGR_4969     TRUE 0.605 20.000 0.010 NA N NA
 5657591 5657592 SGR_4969 SGR_4970     FALSE 0.103 177.000 0.010 NA   NA
 5657592 5657593 SGR_4970 SGR_4971     TRUE 0.870 -3.000 0.045 NA   NA
 5657593 5657594 SGR_4971 SGR_tRNA52     FALSE 0.080 130.000 0.000 NA   NA
 5657594 5657595 SGR_tRNA52 SGR_4972     FALSE 0.004 325.000 0.000 NA   NA
 5657595 5657596 SGR_4972 SGR_tRNA53     FALSE 0.078 133.000 0.000 NA   NA
 5657596 5657597 SGR_tRNA53 SGR_4973   leuS FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 5657597 5657598 SGR_4973 SGR_4974 leuS   FALSE 0.146 150.000 0.004 NA   NA
 5657598 5657599 SGR_4974 SGR_4975     FALSE 0.357 122.000 0.192 NA   NA
 5657599 5657600 SGR_4975 SGR_4976     FALSE 0.009 447.000 0.115 NA   NA
 5657600 5657601 SGR_4976 SGR_4977     TRUE 0.863 -3.000 0.005 1.000   NA
 5657603 5657604 SGR_4979 SGR_4980     FALSE 0.005 356.000 0.000 1.000   NA
 5657608 5657609 SGR_4984 SGR_4985     FALSE 0.046 221.000 0.000 1.000 N NA
 5657611 5657612 SGR_4987 SGR_4988     FALSE 0.065 150.000 0.000 NA   NA
 5657612 5657613 SGR_4988 SGR_4989     FALSE 0.062 232.000 0.005 1.000 N NA
 5657614 5657615 SGR_4990 SGR_4991     FALSE 0.056 160.000 0.000 NA   NA
 5657615 5657616 SGR_4991 SGR_4992     FALSE 0.227 154.000 0.085 NA   NA
 5657617 5657618 SGR_4993 SGR_4994   dnaJ2 TRUE 0.896 1.000 0.059 1.000 N NA
 5657618 5657619 SGR_4994 SGR_4995 dnaJ2   FALSE 0.232 134.000 0.009 1.000   NA
 5657619 5657620 SGR_4995 SGR_4996     TRUE 0.838 -3.000 0.012 NA   NA
 5657620 5657621 SGR_4996 SGR_4997     FALSE 0.317 70.000 0.034 NA   NA
 5657621 5657622 SGR_4997 SGR_4998     TRUE 0.645 15.000 0.010 1.000   NA
 5657622 5657623 SGR_4998 SGR_4999     FALSE 0.489 30.000 0.007 1.000   NA
 5657625 5657626 SGR_5001 SGR_5002     FALSE 0.188 155.000 0.004 NA N NA
 5657626 5657627 SGR_5002 SGR_5003     TRUE 0.883 13.000 0.457 NA   NA
 5657627 5657628 SGR_5003 SGR_5004     TRUE 0.926 -3.000 0.222 NA   NA
 5657628 5657629 SGR_5004 SGR_5005     TRUE 0.841 -3.000 0.014 NA   NA
 5657629 5657630 SGR_5005 SGR_5006     TRUE 0.549 34.000 0.125 NA   NA
 5657630 5657631 SGR_5006 SGR_5007     FALSE 0.007 277.000 0.000 NA   NA
 5657631 5657632 SGR_5007 SGR_5008     TRUE 0.680 103.000 0.667 NA   NA
 5657632 5657633 SGR_5008 SGR_5009     FALSE 0.131 61.000 0.000 NA   NA
 5657634 5657635 SGR_5010 SGR_5011     FALSE 0.330 80.000 0.054 NA   NA
 5657636 5657637 SGR_5012 SGR_5013     FALSE 0.073 206.000 0.032 NA   NA
 5657637 5657638 SGR_5013 SGR_5014     FALSE 0.288 55.000 0.003 NA   NA
 5657638 5657639 SGR_5014 SGR_5015     FALSE 0.463 83.000 0.076 1.000 N NA
 5657640 5657641 SGR_5016 SGR_5017     TRUE 0.791 105.000 0.256 1.000 Y NA
 5657641 5657642 SGR_5017 SGR_5018     TRUE 0.995 0.000 0.742 0.085 Y NA
 5657642 5657643 SGR_5018 SGR_5019     TRUE 0.987 -3.000 0.290 1.000 Y NA
 5657644 5657645 SGR_5020 SGR_5021 glyS   FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 5657645 5657646 SGR_5021 SGR_5022     FALSE 0.009 258.000 0.000 NA   NA
 5657647 5657648 SGR_5023 SGR_5024     FALSE 0.414 10.000 0.000 NA   NA
 5657648 5657649 SGR_5024 SGR_5025     FALSE 0.271 21.000 0.000 NA   NA
 5657649 5657650 SGR_5025 SGR_5026     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657651 5657652 SGR_5027 SGR_5028     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657653 5657654 SGR_5029 SGR_5030     FALSE 0.223 101.000 0.000 1.000 N NA
 5657655 5657656 SGR_5031 SGR_5032     FALSE 0.062 154.000 0.000 NA   NA
 5657656 5657657 SGR_5032 SGR_5033     FALSE 0.099 97.000 0.000 NA   NA
 5657657 5657658 SGR_5033 SGR_5034     FALSE 0.321 16.000 0.000 NA   NA
 5657659 5657660 SGR_5035 SGR_5036   sprW FALSE 0.029 194.000 0.000 NA   NA
 5657663 5657664 SGR_5039 SGR_5040     FALSE 0.086 112.000 0.000 NA   NA
 5657665 5657666 SGR_5041 SGR_5042     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5657666 5657667 SGR_5042 SGR_5043     FALSE 0.300 58.000 0.000 1.000 N NA
 5657670 5657671 SGR_5046 SGR_5047     FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 5657671 5657672 SGR_5047 SGR_5048     FALSE 0.003 594.000 0.000 1.000 N NA
 5657672 5657673 SGR_5048 SGR_5049     FALSE 0.002 717.000 0.000 1.000   NA
 5657673 5657674 SGR_5049 SGR_5050     FALSE 0.081 124.000 0.000 NA   NA
 5657675 5657676 SGR_5051 SGR_5052     FALSE 0.061 155.000 0.000 NA   NA
 5657676 5657677 SGR_5052 SGR_5053     TRUE 0.964 0.000 0.102 0.000 N NA
 5657679 5657680 SGR_5055 SGR_5056     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 5657680 5657681 SGR_5056 SGR_5057     FALSE 0.002 474.000 0.000 NA   NA
 5657681 5657682 SGR_5057 SGR_5058     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657683 5657684 SGR_5059 SGR_5060     FALSE 0.118 72.000 0.000 NA   NA
 5657684 5657685 SGR_5060 SGR_5061     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657687 5657688 SGR_5063 SGR_5064     FALSE 0.005 672.000 0.028 1.000   NA
 5657688 5657689 SGR_5064 SGR_5065     FALSE 0.252 137.000 0.028 1.000   NA
 5657689 5657690 SGR_5065 SGR_5066     FALSE 0.282 94.000 0.006 1.000   NA
 5657690 5657691 SGR_5066 SGR_5067   hrdA FALSE 0.173 210.000 0.209 1.000 N NA
 5657692 5657693 SGR_5068 SGR_5069     TRUE 0.996 0.000 0.833 0.008 Y NA
 5657693 5657694 SGR_5069 SGR_5070     FALSE 0.383 139.000 0.133 1.000 N NA
 5657694 5657695 SGR_5070 SGR_5071     FALSE 0.264 141.000 0.100 NA   NA
 5657696 5657697 SGR_tRNA54 SGR_tRNA55     FALSE 0.465 6.000 0.000 NA   NA
 5657697 5657698 SGR_tRNA55 SGR_tRNA56     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 5657698 5657699 SGR_tRNA56 SGR_5072     FALSE 0.002 434.000 0.000 NA   NA
 5657699 5657700 SGR_5072 SGR_5073     FALSE 0.381 12.000 0.000 NA   NA
 5657700 5657701 SGR_5073 SGR_5074     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5657701 5657702 SGR_5074 SGR_5075     TRUE 0.981 -7.000 1.000 1.000   NA
 5657703 5657704 SGR_5076 SGR_5077     TRUE 0.907 2.000 0.188 NA N NA
 5657704 5657705 SGR_5077 SGR_5078     TRUE 0.996 -3.000 0.632 0.001 Y NA
 5657706 5657707 SGR_5079 SGR_5080     TRUE 0.982 -3.000 0.131 1.000 Y NA
 5657707 5657708 SGR_5080 SGR_5081     TRUE 0.920 -3.000 0.131 1.000   NA
 5657709 5657710 SGR_5082 SGR_5083     FALSE 0.010 337.000 0.000 1.000 N NA
 5657714 5657715 SGR_5087 SGR_5088     TRUE 0.978 -10.000 0.176 1.000 Y NA
 5657716 5657717 SGR_5089 SGR_5090     TRUE 0.928 -3.000 0.000 0.005   NA
 5657720 5657721 SGR_5093 SGR_5094   mreB2 TRUE 0.730 50.000 0.375 1.000 N NA
 5657721 5657722 SGR_5094 SGR_5095 mreB2   FALSE 0.077 135.000 0.000 NA   NA
 5657725 5657726 SGR_5098 SGR_5099     FALSE 0.387 102.000 0.115 1.000   NA
 5657726 5657727 SGR_5099 SGR_5100     FALSE 0.380 85.000 0.011 1.000 N NA
 5657727 5657728 SGR_5100 SGR_5101     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5657729 5657730 SGR_5102 SGR_5103     TRUE 0.803 12.000 0.150 1.000   NA
 5657732 5657733 SGR_5105 SGR_5106 fabB fabC TRUE 0.769 77.000 0.058 1.000 Y NA
 5657733 5657734 SGR_5106 SGR_5107 fabC fabH TRUE 0.920 64.000 0.307 0.001 Y NA
 5657734 5657735 SGR_5107 SGR_5108 fabH fabD TRUE 0.966 10.000 0.294 1.000 Y NA
 5657735 5657736 SGR_5108 SGR_5109 fabD   TRUE 0.640 90.000 0.441 NA N NA
 5657738 5657739 SGR_5111 SGR_5112     FALSE 0.007 281.000 0.000 NA   NA
 5657739 5657740 SGR_5112 SGR_5113     FALSE 0.217 29.000 0.000 NA   NA
 5657740 5657741 SGR_5113 SGR_5114     FALSE 0.003 359.000 0.000 NA   NA
 5657741 5657742 SGR_5114 SGR_5115     FALSE 0.004 536.000 0.000 1.000 N NA
 5657742 5657743 SGR_5115 SGR_5116     TRUE 0.950 -3.000 0.240 1.000 N NA
 5657743 5657744 SGR_5116 SGR_5117     FALSE 0.235 195.000 0.231 1.000 N NA
 5657744 5657745 SGR_5117 SGR_5118     TRUE 0.983 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 5657746 5657747 SGR_5119 SGR_5120     TRUE 0.974 0.000 0.636 1.000 N NA
 5657748 5657749 SGR_5121 SGR_5122     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5657749 5657750 SGR_5122 SGR_5123     FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 5657750 5657751 SGR_5123 SGR_5124     TRUE 0.992 -3.000 0.333 0.021 Y NA
 5657751 5657752 SGR_5124 SGR_5125     FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 5657752 5657753 SGR_5125 SGR_5126     FALSE 0.109 87.000 0.000 NA   NA
 5657753 5657754 SGR_5126 SGR_5127     FALSE 0.083 119.000 0.000 NA   NA
 5657755 5657756 SGR_5128 SGR_5129     FALSE 0.221 197.000 0.333 NA   NA
 5657758 5657759 SGR_5131 SGR_5132     FALSE 0.318 200.000 0.575 NA   NA
 5657759 5657760 SGR_5132 SGR_5133     FALSE 0.328 149.000 0.082 1.000 N NA
 5657760 5657761 SGR_5133 SGR_5134     TRUE 0.850 191.000 0.857 0.004 Y NA
 5657761 5657762 SGR_5134 SGR_5135     TRUE 0.691 130.000 0.714 1.000   NA
 5657762 5657763 SGR_5135 SGR_5136     TRUE 0.588 129.000 0.556 NA   NA
 5657765 5657766 SGR_5138 SGR_5139     TRUE 0.888 11.000 0.420 NA   NA
 5657766 5657767 SGR_5139 SGR_5140     TRUE 0.908 3.000 0.296 NA   NA
 5657767 5657768 SGR_5140 SGR_5141     FALSE 0.367 42.000 0.013 NA   NA
 5657769 5657770 SGR_5142 SGR_5143     FALSE 0.474 53.000 0.143 NA   NA
 5657770 5657771 SGR_5143 SGR_5144     FALSE 0.263 222.000 0.667 NA   NA
 5657775 5657776 SGR_5147 SGR_5148     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 5657776 5657777 SGR_5148 SGR_5149     FALSE 0.156 49.000 0.000 NA   NA
 5657778 5657779 SGR_5150 SGR_5151     FALSE 0.139 56.000 0.000 NA   NA
 5657781 5657782 SGR_5153 SGR_5154     FALSE 0.016 227.000 0.000 NA   NA
 5657782 5657783 SGR_5154 SGR_5155     FALSE 0.078 134.000 0.000 NA   NA
 5657783 5657784 SGR_5155 SGR_5156     FALSE 0.110 86.000 0.000 NA   NA
 5657787 5657788 SGR_5159 SGR_5160     FALSE 0.111 85.000 0.000 NA   NA
 5657788 5657789 SGR_5160 SGR_5161     FALSE 0.278 127.000 0.080 NA   NA
 5657791 5657792 SGR_5163 SGR_5164     FALSE 0.071 231.000 0.000 0.066   NA
 5657795 5657796 SGR_5167 SGR_5168     FALSE 0.066 148.000 0.000 NA   NA
 5657799 5657800 SGR_5171 SGR_5172     TRUE 0.961 -3.000 0.486 NA   NA
 5657800 5657801 SGR_5172 SGR_5173     TRUE 0.971 -3.000 0.541 1.000   NA
 5657801 5657802 SGR_5173 SGR_5174     TRUE 0.937 -3.000 0.276 NA   NA
 5657802 5657803 SGR_5174 SGR_5175     TRUE 0.926 -3.000 0.222 NA   NA
 5657803 5657804 SGR_5175 SGR_5176     FALSE 0.012 280.000 0.000 1.000   NA
 5657805 5657806 SGR_5177 SGR_5178     TRUE 0.977 -3.000 0.667 1.000   NA
 5657807 5657808 SGR_5179 SGR_5180     TRUE 0.577 -10.000 0.000 NA   NA
 5657808 5657809 SGR_5180 SGR_5181     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657809 5657810 SGR_5181 SGR_5182     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5657811 5657812 SGR_5183 SGR_5184     FALSE 0.143 151.000 0.002 NA   NA
 5657812 5657813 SGR_5184 SGR_5185     FALSE 0.398 11.000 0.000 NA   NA
 5657815 5657816 SGR_5187 SGR_5188     TRUE 0.797 71.000 0.700 1.000 N NA
 5657816 5657817 SGR_5188 SGR_5189     TRUE 0.971 -3.000 0.543 1.000   NA
 5657818 5657819 SGR_5190 SGR_5191     FALSE 0.010 250.000 0.000 NA   NA
 5657821 5657822 SGR_5193 SGR_5194     FALSE 0.416 121.000 0.273 NA   NA
 5657822 5657823 SGR_5194 SGR_5195     FALSE 0.155 168.000 0.041 NA   NA
 5657823 5657824 SGR_5195 SGR_5196     FALSE 0.430 36.000 0.031 NA   NA
 5657824 5657825 SGR_5196 SGR_5197     FALSE 0.091 106.000 0.000 NA   NA
 5657825 5657826 SGR_5197 SGR_5198     TRUE 0.918 -3.000 0.047 1.000 N NA
 5657826 5657827 SGR_5198 SGR_5199     TRUE 0.894 0.000 0.167 NA   NA
 5657828 5657829 SGR_5200 SGR_5201     FALSE 0.492 56.000 0.043 1.000 N NA
 5657831 5657832 SGR_5203 SGR_5204     TRUE 0.910 55.000 0.600 NA Y NA
 5657834 5657835 SGR_5206 SGR_5207     FALSE 0.018 249.000 0.000 1.000   NA
 5657835 5657836 SGR_5207 SGR_5208     TRUE 0.761 50.000 0.455 1.000 N NA
 5657836 5657837 SGR_5208 SGR_5209     TRUE 0.804 35.000 0.455 1.000 N NA
 5657839 5657840 SGR_5211 SGR_5212     FALSE 0.038 180.000 0.000 NA   NA
 5657840 5657841 SGR_5212 SGR_5213     TRUE 0.960 -3.000 0.468 NA   NA
 5657841 5657842 SGR_5213 SGR_5214     TRUE 0.946 0.000 0.422 NA   NA
 5657842 5657843 SGR_5214 SGR_5215     FALSE 0.451 16.000 0.000 1.000   NA
 5657844 5657845 SGR_5216 SGR_5217     FALSE 0.259 76.000 0.009 NA   NA
 5657845 5657846 SGR_5217 SGR_5218     FALSE 0.051 166.000 0.000 NA   NA
 5657846 5657847 SGR_5218 SGR_5219     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657849 5657850 SGR_5221 SGR_5222     FALSE 0.014 232.000 0.000 NA   NA
 5657851 5657852 SGR_5223 SGR_5224     FALSE 0.121 70.000 0.000 NA   NA
 5657853 5657854 SGR_5225 SGR_5226     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 5657854 5657855 SGR_5226 SGR_5227     FALSE 0.168 151.000 0.016 NA   NA
 5657862 5657863 SGR_5234 SGR_5235     FALSE 0.139 199.000 0.167 NA   NA
 5657864 5657865 SGR_5236 SGR_5237     FALSE 0.081 127.000 0.000 NA   NA
 5657865 5657866 SGR_5237 SGR_5238     TRUE 0.987 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 5657866 5657867 SGR_5238 SGR_5239     TRUE 0.995 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 5657868 5657869 SGR_5240 SGR_5241     FALSE 0.105 91.000 0.000 NA   NA
 5657869 5657870 SGR_5241 SGR_5242     FALSE 0.083 117.000 0.000 NA   NA
 5657871 5657872 SGR_5243 SGR_5244     FALSE 0.121 207.000 0.042 1.000 N NA
 5657875 5657876 SGR_5247 SGR_5248     FALSE 0.108 89.000 0.000 NA   NA
 5657879 5657880 SGR_5251 SGR_5252     TRUE 0.990 -3.000 0.857 0.084 N NA
 5657880 5657881 SGR_5252 SGR_5253     FALSE 0.185 170.000 0.004 1.000 N NA
 5657882 5657883 SGR_5254 SGR_5255     FALSE 0.100 248.000 0.308 1.000   NA
 5657883 5657884 SGR_5255 SGR_5256     FALSE 0.244 188.000 0.333 NA   NA
 5657884 5657885 SGR_5256 SGR_5257     FALSE 0.077 262.000 0.333 NA   NA
 5657886 5657887 SGR_5258 SGR_5259     FALSE 0.305 125.000 0.011 1.000 N NA
 5657887 5657888 SGR_5259 SGR_5260     FALSE 0.083 118.000 0.000 NA   NA
 5657888 5657889 SGR_5260 SGR_5261     FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 5657889 5657890 SGR_5261 SGR_5262     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 5657890 5657891 SGR_5262 SGR_5263     FALSE 0.278 120.000 0.074 NA   NA
 5657893 5657894 SGR_5265 SGR_5266     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 5657894 5657895 SGR_5266 SGR_5267     FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 5657898 5657899 SGR_5270 SGR_5271     FALSE 0.011 284.000 0.000 1.000   NA
 5657899 5657900 SGR_5271 SGR_5272     FALSE 0.082 189.000 0.000 1.000 N NA
 5657901 5657902 SGR_5273 SGR_5274     FALSE 0.186 233.000 0.556 NA   NA
 5657903 5657904 SGR_5275 SGR_5276     TRUE 0.976 20.000 0.552 0.034 Y NA
 5657904 5657905 SGR_5276 SGR_5277     TRUE 0.995 -3.000 0.516 0.034 Y NA
 5657905 5657906 SGR_5277 SGR_5278     TRUE 0.735 112.000 0.129 1.000 Y NA
 5657906 5657907 SGR_5278 SGR_5279     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5657907 5657908 SGR_5279 SGR_5280     FALSE 0.004 468.000 0.000 1.000 N NA
 5657908 5657909 SGR_5280 SGR_5281     TRUE 0.578 197.000 0.056 0.005 Y NA
 5657909 5657910 SGR_5281 SGR_5282     FALSE 0.066 178.000 0.000 1.000   NA
 5657910 5657911 SGR_5282 SGR_5283     FALSE 0.080 129.000 0.000 NA   NA
 5657914 5657915 SGR_5286 SGR_5287     FALSE 0.099 97.000 0.000 NA   NA
 5657915 5657916 SGR_5287 SGR_5288     FALSE 0.105 91.000 0.000 NA   NA
 5657916 5657917 SGR_5288 SGR_5289     FALSE 0.129 63.000 0.000 NA   NA
 5657917 5657918 SGR_5289 SGR_5290     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5657918 5657919 SGR_5290 SGR_5291     FALSE 0.488 58.000 0.118 1.000   NA
 5657919 5657920 SGR_5291 SGR_5292     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5657920 5657921 SGR_5292 SGR_5293     TRUE 0.977 -3.000 0.061 NA Y NA
 5657921 5657922 SGR_5293 SGR_5294     TRUE 0.888 -12.000 0.091 NA N NA
 5657922 5657923 SGR_5294 SGR_5295     TRUE 0.569 51.000 0.111 1.000 N NA
 5657923 5657924 SGR_5295 SGR_5296     FALSE 0.045 223.000 0.000 1.000 N NA
 5657924 5657925 SGR_5296 SGR_5297     TRUE 0.938 4.000 0.500 NA   NA
 5657927 5657928 SGR_5299 SGR_5300     TRUE 0.995 -15.000 0.750 0.021 Y NA
 5657928 5657929 SGR_5300 SGR_5301     FALSE 0.029 317.000 0.000 0.021   NA
 5657929 5657930 SGR_5301 SGR_5302     FALSE 0.005 364.000 0.000 1.000   NA
 5657930 5657931 SGR_5302 SGR_5303     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5657931 5657932 SGR_5303 SGR_5304     TRUE 0.946 14.000 1.000 NA   NA
 5657937 5657938 SGR_5309 SGR_5310     FALSE 0.075 136.000 0.000 NA   NA
 5657938 5657939 SGR_5310 SGR_5311     FALSE 0.081 127.000 0.000 NA   NA
 5657941 5657942 SGR_5313 SGR_5314     FALSE 0.286 64.000 0.000 1.000 N NA
 5657945 5657946 SGR_5317 SGR_5318     FALSE 0.371 69.000 0.071 NA   NA
 5657946 5657947 SGR_5318 SGR_5319     FALSE 0.008 268.000 0.000 NA   NA
 5657947 5657948 SGR_5319 SGR_5320     FALSE 0.358 281.000 0.319 0.000 Y NA
 5657950 5657951 SGR_5322 SGR_5323     FALSE 0.026 229.000 0.000 1.000   NA
 5657953 5657954 SGR_5325 SGR_5326     TRUE 0.565 63.000 0.300 NA   NA
 5657954 5657955 SGR_5326 SGR_5327     TRUE 0.583 124.000 0.400 1.000 N NA
 5657955 5657956 SGR_5327 SGR_5328     FALSE 0.021 268.000 0.000 1.000 N NA
 5657956 5657957 SGR_5328 SGR_5329     FALSE 0.272 149.000 0.023 1.000 N NA
 5657957 5657958 SGR_5329 SGR_5330     TRUE 0.876 63.000 0.379 1.000 Y NA
 5657958 5657959 SGR_5330 SGR_5331     FALSE 0.046 352.000 0.095 0.016 N NA
 5657959 5657960 SGR_5331 SGR_5332     FALSE 0.087 213.000 0.005 1.000 N NA
 5657962 5657963 SGR_5334 SGR_5335     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5657963 5657964 SGR_5335 SGR_5336     FALSE 0.348 189.000 0.000 1.000 Y NA
 5657966 5657967 SGR_5338 SGR_5339 sprJ   FALSE 0.331 80.000 0.016 1.000   NA
 5657967 5657968 SGR_5339 SGR_5340     FALSE 0.236 129.000 0.040 NA   NA
 5657969 5657970 SGR_5341 SGR_5342     TRUE 0.912 11.000 0.509 NA   NA
 5657970 5657971 SGR_5342 SGR_5343     FALSE 0.239 159.000 0.133 NA   NA
 5657971 5657972 SGR_5343 SGR_5344     TRUE 0.996 -3.000 0.667 0.021 Y NA
 5657972 5657973 SGR_5344 SGR_5345     FALSE 0.395 188.000 0.500 1.000 N NA
 5657976 5657977 SGR_5348 SGR_5349     TRUE 0.725 50.000 0.500 NA   NA
 5657980 5657981 SGR_5352 SGR_5353     TRUE 0.990 -3.000 0.075 0.001 Y NA
 5657981 5657982 SGR_5353 SGR_5354     TRUE 0.883 -3.000 0.066 NA   NA
 5657982 5657983 SGR_5354 SGR_5355     FALSE 0.239 142.000 0.066 NA   NA
 5657985 5657986 SGR_5357 SGR_5358     TRUE 0.881 56.000 0.105 0.037 Y NA
 5657986 5657987 SGR_5358 SGR_5359     TRUE 0.978 -3.000 0.351 0.037 N NA
 5657987 5657988 SGR_5359 SGR_5360     TRUE 0.968 -3.000 0.171 0.037 N NA
 5657988 5657989 SGR_5360 SGR_5361     FALSE 0.295 124.000 0.006 1.000 N NA
 5657989 5657990 SGR_5361 SGR_5362     FALSE 0.037 392.000 0.000 1.000 Y NA
 5657991 5657992 SGR_5363 SGR_5364     TRUE 0.863 -3.000 0.036 NA   NA
 5657993 5657994 SGR_5365 SGR_5366     TRUE 0.627 39.000 0.269 NA   NA
 5657994 5657995 SGR_5366 SGR_5367     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 5657995 5657996 SGR_5367 SGR_5368     FALSE 0.118 256.000 0.000 NA Y NA
 5657996 5657997 SGR_5368 SGR_5369     FALSE 0.104 92.000 0.000 NA   NA
 5658001 5658002 SGR_5373 SGR_5374     FALSE 0.431 63.000 0.130 NA   NA
 5658002 5658003 SGR_5374 SGR_5375     TRUE 0.907 6.000 0.395 NA   NA
 5658003 5658004 SGR_5375 SGR_5376     TRUE 0.532 84.000 0.312 NA   NA
 5658004 5658005 SGR_5376 SGR_5377   glkA FALSE 0.493 120.000 0.375 NA   NA
 5658005 5658006 SGR_5377 SGR_5378 glkA   FALSE 0.365 71.000 0.071 NA   NA
 5658007 5658008 SGR_5379 SGR_5380     TRUE 0.883 -7.000 0.143 NA   NA
 5658009 5658010 SGR_5381 SGR_5382     TRUE 0.713 34.000 0.233 1.000 N NA
 5658010 5658011 SGR_5382 SGR_5383     TRUE 0.997 -3.000 0.906 0.021 Y NA
 5658011 5658012 SGR_5383 SGR_5384     FALSE 0.388 74.000 0.008 1.000 N NA
 5658014 5658015 SGR_5386 SGR_5387     FALSE 0.113 153.000 0.000 NA N NA
 5658018 5658019 SGR_5390 SGR_5391     TRUE 0.957 7.000 0.096 1.000 Y NA
 5658019 5658020 SGR_5391 SGR_5392     FALSE 0.186 175.000 0.015 1.000 N NA
 5658020 5658021 SGR_5392 SGR_5393     TRUE 0.970 3.000 0.104 1.000 Y NA
 5658021 5658022 SGR_5393 SGR_5394     TRUE 0.978 -3.000 0.625 1.000 N NA
 5658023 5658024 SGR_5395 SGR_5396     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 5658024 5658025 SGR_5396 SGR_5397     FALSE 0.376 84.000 0.109 NA   NA
 5658025 5658026 SGR_5397 SGR_5398     FALSE 0.467 44.000 0.082 NA   NA
 5658026 5658027 SGR_5398 SGR_5399     FALSE 0.371 126.000 0.068 1.000 N NA
 5658027 5658028 SGR_5399 SGR_5400     FALSE 0.457 50.000 0.098 NA   NA
 5658029 5658030 SGR_5401 SGR_5402     FALSE 0.463 32.000 0.034 NA   NA
 5658030 5658031 SGR_5402 SGR_5403     FALSE 0.003 384.000 0.000 NA   NA
 5658031 5658032 SGR_5403 SGR_5404     TRUE 0.617 54.000 0.333 NA   NA
 5658032 5658033 SGR_5404 SGR_5405     TRUE 0.558 2.000 0.000 NA   NA
 5658034 5658035 SGR_5406 SGR_5407     FALSE 0.328 106.000 0.111 NA   NA
 5658035 5658036 SGR_5407 SGR_5408     FALSE 0.033 248.000 0.027 NA   NA
 5658037 5658038 SGR_5409 SGR_5410     TRUE 0.981 -3.000 0.837 NA   NA
 5658038 5658039 SGR_5410 SGR_5411     TRUE 0.982 -3.000 0.867 NA   NA
 5658039 5658040 SGR_5411 SGR_5412     FALSE 0.017 251.000 0.000 1.000   NA
 5658041 5658042 SGR_5413 SGR_5414     FALSE 0.429 38.000 0.005 1.000   NA
 5658042 5658043 SGR_5414 SGR_5415     FALSE 0.059 221.000 0.006 1.000   NA
 5658043 5658044 SGR_5415 SGR_5416     TRUE 0.900 41.000 0.333 1.000 Y NA
 5658044 5658045 SGR_5416 SGR_5417     TRUE 0.988 5.000 0.367 0.001 Y NA
 5658045 5658046 SGR_5417 SGR_5418     TRUE 0.989 -3.000 0.071 0.002 Y NA
 5658046 5658047 SGR_5418 SGR_5419     TRUE 0.996 -3.000 0.647 0.002 Y NA
 5658047 5658048 SGR_5419 SGR_5420     TRUE 0.706 66.000 0.081 0.002 N NA
 5658048 5658049 SGR_5420 SGR_5421     TRUE 0.875 7.000 0.167 1.000 N NA
 5658049 5658050 SGR_5421 SGR_5422     TRUE 0.777 63.000 0.072 NA Y NA
 5658050 5658051 SGR_5422 SGR_5423   ftsZ FALSE 0.037 277.000 0.067 NA N NA
 5658051 5658052 SGR_5423 SGR_5424 ftsZ   TRUE 0.890 -3.000 0.082 NA   NA
 5658052 5658053 SGR_5424 SGR_5425     TRUE 0.667 7.000 0.003 NA   NA
 5658053 5658054 SGR_5425 SGR_5426     FALSE 0.177 126.000 0.002 NA   NA
 5658054 5658055 SGR_5426 SGR_5427     FALSE 0.401 91.000 0.165 NA   NA
 5658055 5658056 SGR_5427 SGR_5428     FALSE 0.469 50.000 0.114 NA   NA
 5658058 5658059 SGR_5430 SGR_5431     TRUE 0.525 59.000 0.092 1.000 N NA
 5658059 5658060 SGR_5431 SGR_5432     TRUE 0.574 44.000 0.073 1.000 N NA
 5658060 5658061 SGR_5432 SGR_5433     TRUE 0.862 -3.000 0.005 1.000   NA
 5658061 5658062 SGR_5433 SGR_5434     FALSE 0.401 129.000 0.200 1.000   NA
 5658065 5658066 SGR_5437 SGR_5438     TRUE 0.749 65.000 0.667 NA   NA
 5658066 5658067 SGR_5438 SGR_5439     FALSE 0.359 87.000 0.093 NA   NA
 5658070 5658071 SGR_5442 SGR_5443     FALSE 0.290 125.000 0.095 NA   NA
 5658071 5658072 SGR_5443 SGR_5444     FALSE 0.368 98.000 0.143 NA   NA
 5658072 5658073 SGR_5444 SGR_5445     FALSE 0.137 57.000 0.000 NA   NA
 5658074 5658075 SGR_5446 SGR_5447     TRUE 0.642 17.000 0.018 1.000   NA
 5658075 5658076 SGR_5447 SGR_5448     TRUE 0.710 6.000 0.012 NA   NA
 5658076 5658077 SGR_5448 SGR_5449     FALSE 0.181 220.000 0.429 NA   NA
 5658078 5658079 SGR_5450 SGR_5451     TRUE 0.990 -3.000 0.112 0.001 Y NA
 5658079 5658080 SGR_5451 SGR_5452     TRUE 0.994 -3.000 0.341 0.001 Y NA
 5658080 5658081 SGR_5452 SGR_5453     TRUE 0.821 -3.000 0.004 NA   NA
 5658081 5658082 SGR_5453 SGR_5454     TRUE 0.680 14.000 0.057 NA   NA
 5658082 5658083 SGR_5454 SGR_5455     TRUE 0.993 0.000 0.491 0.001 Y NA
 5658083 5658084 SGR_5455 SGR_5456     TRUE 0.927 -3.000 0.152 NA N NA
 5658084 5658085 SGR_5456 SGR_5457     TRUE 0.877 -3.000 0.011 NA N NA
 5658085 5658086 SGR_5457 SGR_5458     FALSE 0.056 210.000 0.000 1.000 N NA
 5658086 5658087 SGR_5458 SGR_5459     FALSE 0.168 145.000 0.000 1.000 N NA
 5658087 5658088 SGR_5459 SGR_5460     FALSE 0.332 186.000 0.000 NA Y NA
 5658088 5658089 SGR_5460 SGR_5461     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 5658089 5658090 SGR_5461 SGR_5462     FALSE 0.143 54.000 0.000 NA   NA
 5658092 5658093 SGR_5464 SGR_5465     TRUE 0.939 12.000 0.050 1.000 Y NA
 5658093 5658094 SGR_5465 SGR_5466     TRUE 0.916 15.000 0.690 NA   NA
 5658094 5658095 SGR_5466 SGR_5467     FALSE 0.240 112.000 0.031 NA   NA
 5658095 5658096 SGR_5467 SGR_5468     FALSE 0.100 96.000 0.000 NA   NA
 5658096 5658097 SGR_5468 SGR_5469     FALSE 0.389 136.000 0.267 NA   NA
 5658097 5658098 SGR_5469 SGR_5470     TRUE 0.736 18.000 0.200 NA   NA
 5658098 5658099 SGR_5470 SGR_5471     FALSE 0.198 140.000 0.025 NA   NA
 5658099 5658100 SGR_5471 SGR_5472     TRUE 0.991 -3.000 0.153 0.000 Y NA
 5658100 5658101 SGR_5472 SGR_5473     TRUE 0.587 28.000 0.011 1.000 N NA
 5658101 5658102 SGR_5473 SGR_5474     TRUE 0.819 98.000 1.000 1.000 N NA
 5658103 5658104 SGR_5475 SGR_5476     TRUE 0.985 -3.000 0.826 1.000 N NA
 5658104 5658105 SGR_5476 SGR_5477     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5658105 5658106 SGR_5477 SGR_5478     TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5658106 5658107 SGR_5478 SGR_5479     TRUE 0.988 -3.000 0.417 NA Y NA
 5658107 5658108 SGR_5479 SGR_5480     TRUE 0.987 -73.000 0.571 NA Y NA
 5658108 5658109 SGR_5480 SGR_5481     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5658110 5658111 SGR_5482 SGR_5483     FALSE 0.002 483.000 0.000 NA   NA
 5658111 5658112 SGR_5483 SGR_5484     TRUE 0.985 -7.000 0.024 0.000 Y NA
 5658114 5658115 SGR_5486 SGR_5487     TRUE 0.855 -3.000 0.028 NA   NA
 5658115 5658116 SGR_5487 SGR_5488     FALSE 0.083 116.000 0.000 NA   NA
 5658116 5658117 SGR_5488 SGR_5489     FALSE 0.124 136.000 0.000 1.000   NA
 5658118 5658119 SGR_5490 SGR_5491     TRUE 0.996 0.000 0.879 0.005 Y NA
 5658120 5658121 SGR_5492 SGR_5493     TRUE 0.707 55.000 0.371 1.000 N NA
 5658121 5658122 SGR_5493 SGR_5494     TRUE 0.718 43.000 0.308 1.000 N NA
 5658122 5658123 SGR_5494 SGR_5495     FALSE 0.019 277.000 0.000 1.000 N NA
 5658123 5658124 SGR_5495 SGR_5496     FALSE 0.319 198.000 0.000 1.000 Y NA
 5658125 5658126 SGR_5497 SGR_5498     TRUE 0.965 0.000 0.561 1.000   NA
 5658126 5658127 SGR_5498 SGR_5499     TRUE 0.997 -3.000 0.912 0.000 Y NA
 5658127 5658128 SGR_5499 SGR_5500     TRUE 0.961 36.000 0.647 0.064 Y NA
 5658129 5658130 SGR_5501 SGR_5502     FALSE 0.085 166.000 0.000 1.000   NA
 5658130 5658131 SGR_5502 SGR_5503     FALSE 0.224 54.000 0.000 1.000   NA
 5658132 5658133 SGR_5504 SGR_5505     FALSE 0.208 31.000 0.000 NA   NA
 5658136 5658137 SGR_5508 SGR_5509     FALSE 0.284 65.000 0.000 1.000 N NA
 5658137 5658138 SGR_5509 SGR_5510     FALSE 0.203 244.000 0.019 1.000 Y NA
 5658140 5658141 SGR_5512 SGR_5513     TRUE 0.986 -3.000 1.000 NA N NA
 5658143 5658144 SGR_5515 SGR_5516     FALSE 0.299 121.000 0.105 NA   NA
 5658145 5658146 SGR_5517 SGR_tRNA58     FALSE 0.113 80.000 0.000 NA   NA
 5658148 5658149 SGR_5519 SGR_5520     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.020 Y NA
 5658149 5658150 SGR_5520 SGR_5521     TRUE 0.939 5.000 0.000 1.000 Y NA
 5658150 5658151 SGR_5521 SGR_5522     TRUE 0.995 -3.000 0.508 0.034 Y NA
 5658151 5658152 SGR_5522 SGR_5523     TRUE 0.742 115.000 0.230 NA Y NA
 5658152 5658153 SGR_5523 SGR_5524     FALSE 0.002 651.000 0.000 NA N NA
 5658153 5658154 SGR_5524 SGR_5525     FALSE 0.016 224.000 0.000 NA   NA
 5658154 5658155 SGR_5525 SGR_5526     FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 5658158 5658159 SGR_5529 SGR_5530     FALSE 0.062 154.000 0.000 NA   NA
 5658159 5658160 SGR_5530 SGR_5531     TRUE 0.808 28.000 0.500 NA   NA
 5658161 5658162 SGR_5532 SGR_5533     FALSE 0.385 87.000 0.015 1.000 N NA
 5658165 5658166 SGR_5536 SGR_5537     FALSE 0.466 32.000 0.005 1.000   NA
 5658166 5658167 SGR_5537 SGR_5538     FALSE 0.283 90.000 0.002 1.000   NA
 5658171 5658172 SGR_5542 SGR_5543     FALSE 0.127 166.000 0.000 1.000 N NA
 5658172 5658173 SGR_5543 SGR_5544     TRUE 0.985 -3.000 1.000 1.000   NA
 5658173 5658174 SGR_5544 SGR_5545     FALSE 0.078 134.000 0.000 NA   NA
 5658174 5658175 SGR_5545 SGR_5546     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 5658175 5658176 SGR_5546 SGR_5547     TRUE 0.972 -3.000 0.636 NA   NA
 5658178 5658179 SGR_5549 SGR_5550     FALSE 0.118 72.000 0.000 NA   NA
 5658180 5658181 SGR_5551 SGR_5552     TRUE 0.900 -3.000 0.046 NA N NA
 5658183 5658184 SGR_5554 SGR_5555     FALSE 0.030 225.000 0.000 NA N NA
 5658184 5658185 SGR_5555 SGR_5556     FALSE 0.516 70.000 0.125 1.000 N NA
 5658186 5658187 SGR_5557 SGR_5558     FALSE 0.433 40.000 0.005 NA N NA
 5658187 5658188 SGR_5558 SGR_5559     FALSE 0.052 242.000 0.004 1.000 N NA
 5658188 5658189 SGR_5559 SGR_5560     TRUE 0.620 169.000 0.500 0.004   NA
 5658189 5658190 SGR_5560 SGR_5561     FALSE 0.020 243.000 0.000 1.000   NA
 5658191 5658192 SGR_5562 SGR_5563     TRUE 0.831 11.000 0.188 1.000   NA
 5658193 5658194 SGR_5564 SGR_5565     FALSE 0.021 268.000 0.000 1.000 N NA
 5658196 5658197 SGR_5567 SGR_5568     TRUE 0.932 5.000 0.500 NA   NA
 5658197 5658198 SGR_5568 SGR_5569     FALSE 0.078 133.000 0.000 NA   NA
 5658198 5658199 SGR_5569 SGR_5570     TRUE 0.887 -3.000 0.073 NA   NA
 5658199 5658200 SGR_5570 SGR_5571     TRUE 0.934 -3.000 0.259 NA   NA
 5658200 5658201 SGR_5571 SGR_5572   whiA TRUE 0.948 -9.000 0.470 NA   NA
 5658201 5658202 SGR_5572 SGR_5573 whiA   FALSE 0.042 240.000 0.040 NA   NA
 5658202 5658203 SGR_5573 SGR_5574     TRUE 0.813 116.000 0.055 0.003 Y NA
 5658203 5658204 SGR_5574 SGR_5575     TRUE 0.956 7.000 0.075 1.000 Y NA
 5658204 5658205 SGR_5575 SGR_5576   secG FALSE 0.318 117.000 0.064 1.000   NA
 5658205 5658206 SGR_5576 SGR_5577 secG   FALSE 0.244 106.000 0.027 NA   NA
 5658206 5658207 SGR_5577 SGR_5578     FALSE 0.114 179.000 0.027 NA   NA
 5658207 5658208 SGR_5578 SGR_5579     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5658208 5658209 SGR_5579 SGR_5580     TRUE 0.923 -3.000 0.208 NA   NA
 5658209 5658210 SGR_5580 SGR_5581     FALSE 0.136 58.000 0.000 NA   NA
 5658213 5658214 SGR_5584 SGR_5585     TRUE 0.976 -3.000 0.047 NA Y NA
 5658214 5658215 SGR_5585 SGR_5586     TRUE 0.974 -3.000 0.031 NA Y NA
 5658215 5658216 SGR_5586 SGR_5587     TRUE 0.955 6.000 0.037 1.000 Y NA
 5658216 5658217 SGR_5587 SGR_5588     TRUE 0.883 26.000 0.038 1.000 Y NA
 5658218 5658219 SGR_5589 SGR_5590     FALSE 0.252 94.000 0.017 NA   NA
 5658220 5658221 SGR_5591 SGR_5592     TRUE 0.621 89.000 0.106 0.055 N NA
 5658221 5658222 SGR_5592 SGR_5593     TRUE 0.996 -3.000 0.743 0.083 Y NA
 5658223 5658224 SGR_5594 SGR_5595     TRUE 0.931 -3.000 0.100 1.000 N NA
 5658224 5658225 SGR_5595 SGR_5596     TRUE 0.883 105.000 0.266 0.000 Y NA
 5658225 5658226 SGR_5596 SGR_5597     TRUE 0.887 0.000 0.063 NA N NA
 5658226 5658227 SGR_5597 SGR_5598     TRUE 0.790 8.000 0.046 NA N NA
 5658227 5658228 SGR_5598 SGR_5599     TRUE 0.929 -3.000 0.093 1.000 N NA
 5658228 5658229 SGR_5599 SGR_5600     TRUE 0.875 11.000 0.249 1.000 N NA
 5658229 5658230 SGR_5600 SGR_5601     TRUE 0.910 -3.000 0.152 NA   NA
 5658230 5658231 SGR_5601 SGR_5602     FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 5658233 5658234 SGR_5604 SGR_5605     TRUE 0.946 0.000 0.357 1.000   NA
 5658234 5658235 SGR_5605 SGR_5606     FALSE 0.016 332.000 0.028 1.000   NA
 5658239 5658240 SGR_5610 SGR_5611     FALSE 0.081 126.000 0.000 NA   NA
 5658240 5658241 SGR_5611 SGR_5612     FALSE 0.002 390.000 0.000 NA   NA
 5658241 5658242 SGR_5612 SGR_5613     FALSE 0.110 86.000 0.000 NA   NA
 5658243 5658244 SGR_5614 SGR_5615     FALSE 0.365 76.000 0.081 NA   NA
 5658244 5658245 SGR_5615 SGR_5616     FALSE 0.114 78.000 0.000 NA   NA
 5658246 5658247 SGR_5617 SGR_5618     TRUE 0.936 -3.000 0.273 NA   NA
 5658248 5658249 SGR_5619 SGR_5620     FALSE 0.030 193.000 0.000 NA   NA
 5658249 5658250 SGR_5620 SGR_5621     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 5658250 5658251 SGR_5621 SGR_5622     FALSE 0.284 65.000 0.000 1.000 N NA
 5658251 5658252 SGR_5622 SGR_5623     TRUE 0.533 19.000 0.000 1.000 N NA
 5658252 5658253 SGR_5623 SGR_5624     TRUE 0.952 0.000 0.333 1.000 N NA
 5658254 5658255 SGR_5625 SGR_5626     TRUE 0.913 -3.000 0.167 NA   NA
 5658255 5658256 SGR_5626 SGR_5627     FALSE 0.128 184.000 0.059 NA   NA
 5658256 5658257 SGR_5627 SGR_5628     FALSE 0.452 91.000 0.085 1.000 N NA
 5658260 5658261 SGR_5631 SGR_5632   ectD FALSE 0.102 94.000 0.000 NA   NA
 5658261 5658262 SGR_5632 SGR_5633 ectD ectC TRUE 0.826 7.000 0.105 1.000   NA
 5658262 5658263 SGR_5633 SGR_5634 ectC ectB TRUE 0.708 85.000 0.572 1.000   NA
 5658263 5658264 SGR_5634 SGR_5635 ectB ectA TRUE 0.780 158.000 0.793 0.000   NA
 5658264 5658265 SGR_5635 SGR_5636 ectA   FALSE 0.009 309.000 0.000 1.000   NA
 5658266 5658267 SGR_5637 SGR_5638     FALSE 0.017 250.000 0.000 1.000   NA
 5658270 5658271 SGR_5641 SGR_5642     TRUE 0.987 -6.000 0.114 0.005 Y NA
 5658271 5658272 SGR_5642 SGR_5643     TRUE 0.981 0.000 0.024 0.082 Y NA
 5658272 5658273 SGR_5643 SGR_5644     TRUE 0.975 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 5658273 5658274 SGR_5644 SGR_5645     TRUE 0.989 -3.000 0.060 0.005 Y NA
 5658274 5658275 SGR_5645 SGR_5646     FALSE 0.002 420.000 0.000 NA   NA
 5658275 5658276 SGR_5646 SGR_5647     TRUE 0.945 13.000 0.875 NA   NA
 5658277 5658278 SGR_5648 SGR_5649     FALSE 0.449 68.000 0.083 NA N NA
 5658278 5658279 SGR_5649 SGR_5650     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 5658280 5658281 SGR_5651 SGR_5652     FALSE 0.080 128.000 0.000 NA   NA
 5658282 5658283 SGR_5653 SGR_5654     FALSE 0.021 342.000 0.191 NA   NA
 5658283 5658284 SGR_5654 SGR_5655     FALSE 0.283 146.000 0.150 NA   NA
 5658286 5658287 SGR_5657 SGR_5658     FALSE 0.147 52.000 0.000 NA   NA
 5658287 5658288 SGR_5658 SGR_5659     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658288 5658289 SGR_5659 SGR_5660     TRUE 0.924 -3.000 0.214 NA   NA
 5658289 5658290 SGR_5660 SGR_5661     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5658291 5658292 SGR_5662 SGR_5663     TRUE 0.870 5.000 0.088 1.000 N NA
 5658292 5658293 SGR_5663 SGR_5664     FALSE 0.498 69.000 0.235 NA   NA
 5658293 5658294 SGR_5664 SGR_5665     FALSE 0.393 79.000 0.125 NA   NA
 5658294 5658295 SGR_5665 SGR_5666     FALSE 0.341 64.000 0.039 NA   NA
 5658295 5658296 SGR_5666 SGR_5667     FALSE 0.141 112.000 0.000 1.000   NA
 5658297 5658298 SGR_5668 SGR_5669     TRUE 0.874 -3.000 0.050 NA   NA
 5658298 5658299 SGR_5669 SGR_5670     TRUE 0.583 22.000 0.017 1.000   NA
 5658301 5658302 SGR_5672 SGR_5673     TRUE 0.967 -3.000 0.533 NA   NA
 5658302 5658303 SGR_5673 SGR_5674     FALSE 0.107 203.000 0.048 1.000   NA
 5658304 5658305 SGR_5675 SGR_5676     FALSE 0.011 243.000 0.000 NA   NA
 5658307 5658308 SGR_5678 SGR_5679 tyrS   FALSE 0.383 52.000 0.042 NA   NA
 5658308 5658309 SGR_5679 SGR_5680     TRUE 0.982 -3.000 0.914 NA   NA
 5658310 5658311 SGR_5681 SGR_5682     TRUE 0.959 6.000 0.078 1.000 Y NA
 5658311 5658312 SGR_5682 SGR_5683     FALSE 0.135 185.000 0.079 NA   NA
 5658314 5658315 SGR_5685 SGR_5686     TRUE 0.976 -6.000 0.833 NA   NA
 5658315 5658316 SGR_5686 SGR_5687     TRUE 0.564 157.000 0.667 NA   NA
 5658316 5658317 SGR_5687 SGR_5688     TRUE 0.569 93.000 0.400 NA   NA
 5658320 5658321 SGR_5691 SGR_5692   queA FALSE 0.007 274.000 0.000 NA   NA
 5658321 5658322 SGR_5692 SGR_5693 queA   TRUE 0.906 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5658323 5658324 SGR_5694 SGR_5695     TRUE 0.993 -7.000 0.500 0.021 Y NA
 5658324 5658325 SGR_5695 SGR_5696   chpE FALSE 0.416 145.000 0.333 NA   NA
 5658327 5658328 SGR_5698 SGR_5699     FALSE 0.244 151.000 0.038 NA N NA
 5658328 5658329 SGR_5699 SGR_5700     TRUE 0.641 166.000 0.259 NA Y NA
 5658329 5658330 SGR_5700 SGR_5701     FALSE 0.362 79.000 0.035 1.000   NA
 5658331 5658332 SGR_5702 SGR_5703     TRUE 0.594 139.000 0.625 NA   NA
 5658332 5658333 SGR_5703 SGR_5704     TRUE 0.698 57.000 0.500 NA   NA
 5658334 5658335 SGR_5705 SGR_16SrRNA5   rrnE1 FALSE 0.001 688.000 0.000 NA   NA
 5658335 5658336 SGR_16SrRNA5 SGR_23SrRNA5 rrnE1 rrnE2 FALSE 0.005 302.000 0.000 NA   NA
 5658336 5658337 SGR_23SrRNA5 SGR_5SrRNA5 rrnE2 rrnE3 FALSE 0.096 100.000 0.000 NA   NA
 5658337 5658338 SGR_5SrRNA5 SGR_5706 rrnE3   FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 5658338 5658339 SGR_5706 SGR_5707     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5658341 5658342 SGR_5709 SGR_5710     FALSE 0.027 251.000 0.000 1.000 N NA
 5658344 5658345 SGR_5712 SGR_5713     TRUE 0.693 8.000 0.016 NA   NA
 5658345 5658346 SGR_5713 SGR_5714     TRUE 0.849 9.000 0.120 1.000 N NA
 5658346 5658347 SGR_5714 SGR_5715     FALSE 0.392 119.000 0.094 1.000 N NA
 5658347 5658348 SGR_5715 SGR_5716     FALSE 0.034 238.000 0.000 1.000 N NA
 5658349 5658350 SGR_5717 SGR_5718     TRUE 0.669 141.000 0.000 0.069 Y NA
 5658353 5658354 SGR_5721 SGR_5722     FALSE 0.432 89.000 0.055 1.000 N NA
 5658354 5658355 SGR_5722 SGR_5723     FALSE 0.160 165.000 0.006 1.000   NA
 5658355 5658356 SGR_5723 SGR_5724     FALSE 0.442 144.000 0.312 1.000   NA
 5658356 5658357 SGR_5724 SGR_5725   parA2 FALSE 0.005 450.000 0.000 1.000 N NA
 5658357 5658358 SGR_5725 SGR_5726 parA2   TRUE 0.911 -3.000 0.158 NA   NA
 5658358 5658359 SGR_5726 SGR_5727     FALSE 0.003 714.000 0.014 NA   NA
 5658359 5658360 SGR_5727 SGR_5728     TRUE 0.968 -3.000 0.570 NA   NA
 5658360 5658361 SGR_5728 SGR_5729     TRUE 0.940 -3.000 0.224 NA N NA
 5658361 5658362 SGR_5729 SGR_5730     FALSE 0.212 108.000 0.000 1.000 N NA
 5658362 5658363 SGR_5730 SGR_5731     TRUE 0.985 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 5658363 5658364 SGR_5731 SGR_5732     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5658364 5658365 SGR_5732 SGR_5733     TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5658365 5658366 SGR_5733 SGR_5734     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658367 5658368 SGR_5735 SGR_5736     FALSE 0.460 55.000 0.133 NA   NA
 5658369 5658370 SGR_5737 SGR_5738     TRUE 0.976 -3.000 0.016 1.000 Y NA
 5658370 5658371 SGR_5738 SGR_5739     FALSE 0.293 145.000 0.032 1.000 N NA
 5658371 5658372 SGR_5739 SGR_5740     TRUE 0.911 -3.000 0.030 1.000 N NA
 5658372 5658373 SGR_5740 SGR_5741     FALSE 0.341 78.000 0.021 1.000   NA
 5658374 5658375 SGR_5742 SGR_5743     TRUE 0.769 90.000 0.833 NA   NA
 5658376 5658377 SGR_5744 SGR_5745     TRUE 0.979 -3.000 0.800 NA   NA
 5658377 5658378 SGR_5745 SGR_5746     FALSE 0.311 176.000 0.364 NA   NA
 5658378 5658379 SGR_5746 SGR_5747     FALSE 0.002 391.000 0.000 NA   NA
 5658381 5658382 SGR_5749 SGR_5750     TRUE 0.556 79.000 0.214 1.000 N NA
 5658386 5658387 SGR_5754 SGR_5755     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658387 5658388 SGR_5755 SGR_5756     FALSE 0.402 58.000 0.073 NA   NA
 5658388 5658389 SGR_5756 SGR_5757     TRUE 0.980 -3.000 0.073 1.000 Y NA
 5658389 5658390 SGR_5757 SGR_5758     TRUE 0.882 40.000 0.231 1.000 Y NA
 5658390 5658391 SGR_5758 SGR_5759     FALSE 0.314 167.000 0.231 NA N NA
 5658391 5658392 SGR_5759 SGR_5760     TRUE 0.988 -3.000 0.429 NA Y NA
 5658392 5658393 SGR_5760 SGR_5761     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5658393 5658394 SGR_5761 SGR_5762   sprB FALSE 0.014 231.000 0.000 NA   NA
 5658394 5658395 SGR_5762 SGR_5763 sprB   FALSE 0.025 202.000 0.000 NA   NA
 5658397 5658398 SGR_5765 SGR_5766     FALSE 0.001 554.000 0.000 NA   NA
 5658398 5658399 SGR_5766 SGR_5767     FALSE 0.186 75.000 0.000 1.000   NA
 5658399 5658400 SGR_5767 SGR_5768     TRUE 0.990 -3.000 0.750 0.001   NA
 5658405 5658406 SGR_5773 SGR_5774     FALSE 0.093 161.000 0.000 1.000   NA
 5658407 5658408 SGR_5775 SGR_5776     TRUE 0.978 -3.000 0.762 NA   NA
 5658408 5658409 SGR_5776 SGR_5777     TRUE 0.970 4.000 0.944 NA   NA
 5658409 5658410 SGR_5777 SGR_5778     FALSE 0.350 14.000 0.000 NA   NA
 5658411 5658412 SGR_5779 SGR_5780     TRUE 0.751 32.000 0.417 NA   NA
 5658415 5658416 SGR_5783 SGR_5784     FALSE 0.008 267.000 0.000 NA   NA
 5658417 5658418 SGR_5785 SGR_5786     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5658418 5658419 SGR_5786 SGR_5787     TRUE 0.694 72.000 0.571 NA   NA
 5658419 5658420 SGR_5787 SGR_5788     TRUE 0.620 32.000 0.060 1.000 N NA
 5658421 5658422 SGR_5789 SGR_5790     FALSE 0.039 283.000 0.048 1.000 N NA
 5658422 5658423 SGR_5790 SGR_5791     TRUE 0.687 136.000 0.079 1.000 Y NA
 5658423 5658424 SGR_5791 SGR_5792     TRUE 0.902 0.000 0.116 NA N NA
 5658426 5658427 SGR_5794 SGR_5795     TRUE 0.957 34.000 0.500 0.035 Y NA
 5658428 5658429 SGR_5796 SGR_5797     FALSE 0.134 122.000 0.000 1.000   NA
 5658429 5658430 SGR_5797 SGR_5798     FALSE 0.504 55.000 0.051 1.000 N NA
 5658431 5658432 SGR_5799 SGR_5800     FALSE 0.288 108.000 0.065 NA   NA
 5658432 5658433 SGR_5800 SGR_5801     FALSE 0.334 87.000 0.065 NA   NA
 5658436 5658437 SGR_5804 SGR_5805     FALSE 0.002 447.000 0.000 NA   NA
 5658438 5658439 SGR_5806 SGR_5807     FALSE 0.025 553.000 0.333 0.063   NA
 5658439 5658440 SGR_5807 SGR_5808     TRUE 0.650 50.000 0.231 1.000 N NA
 5658440 5658441 SGR_5808 SGR_5809     FALSE 0.008 318.000 0.000 1.000   NA
 5658442 5658443 SGR_5810 SGR_5811     TRUE 0.887 7.000 0.333 NA   NA
 5658444 5658445 SGR_5812 SGR_5813     FALSE 0.249 88.000 0.000 1.000 N NA
 5658446 5658447 SGR_5814 SGR_5815     TRUE 0.939 -3.000 0.286 NA   NA
 5658447 5658448 SGR_5815 SGR_5816     FALSE 0.289 108.000 0.066 NA   NA
 5658451 5658452 SGR_5819 SGR_5820     TRUE 0.580 47.000 0.182 1.000   NA
 5658453 5658454 SGR_5821 SGR_5822     TRUE 0.965 12.000 0.353 1.000 Y NA
 5658455 5658456 SGR_5823 SGR_5824     FALSE 0.268 72.000 0.000 1.000 N NA
 5658456 5658457 SGR_5824 SGR_5825     TRUE 0.948 0.000 0.375 1.000   NA
 5658458 5658459 SGR_5826 SGR_tRNA59     FALSE 0.126 66.000 0.000 NA   NA
 5658460 5658461 SGR_5827 SGR_5828   chpH FALSE 0.389 154.000 0.333 NA   NA
 5658461 5658462 SGR_5828 SGR_5829 chpH   FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5658465 5658466 SGR_5832 SGR_5833     TRUE 0.936 -3.000 0.200 NA N NA
 5658467 5658468 SGR_5834 SGR_5835     FALSE 0.014 232.000 0.000 NA   NA
 5658470 5658471 SGR_5837 SGR_5838     TRUE 0.711 71.000 0.608 NA   NA
 5658471 5658472 SGR_5838 SGR_5839     TRUE 0.980 -3.000 0.810 NA   NA
 5658472 5658473 SGR_5839 SGR_5840   cysS2 FALSE 0.436 123.000 0.247 1.000   NA
 5658474 5658475 SGR_5841 SGR_5842     FALSE 0.141 168.000 0.026 NA   NA
 5658475 5658476 SGR_5842 SGR_5843     TRUE 0.688 144.000 0.200 NA Y NA
 5658476 5658477 SGR_5843 SGR_5844     TRUE 0.985 15.000 0.600 0.001 Y NA
 5658477 5658478 SGR_5844 SGR_5845     TRUE 0.562 40.000 0.047 1.000 N NA
 5658478 5658479 SGR_5845 SGR_5846     FALSE 0.005 436.000 0.000 1.000 N NA
 5658480 5658481 SGR_5847 SGR_5848     FALSE 0.214 145.000 0.011 1.000   NA
 5658481 5658482 SGR_5848 SGR_5849     FALSE 0.008 324.000 0.000 1.000   NA
 5658483 5658484 SGR_5850 SGR_5851     TRUE 0.846 10.000 0.125 1.000 N NA
 5658485 5658486 SGR_5852 SGR_5853     TRUE 0.540 61.000 0.201 1.000   NA
 5658486 5658487 SGR_5853 SGR_5854     FALSE 0.083 196.000 0.021 NA   NA
 5658489 5658490 SGR_5856 SGR_5857     FALSE 0.132 238.000 0.416 NA   NA
 5658490 5658491 SGR_5857 SGR_5858     TRUE 0.659 131.000 0.706 NA   NA
 5658491 5658492 SGR_5858 SGR_5859     FALSE 0.077 303.000 0.512 NA   NA
 5658492 5658493 SGR_5859 SGR_5860     TRUE 0.969 50.000 0.797 0.000 Y NA
 5658495 5658496 SGR_5862 SGR_5863     TRUE 0.749 10.000 0.071 NA   NA
 5658496 5658497 SGR_5863 SGR_5864     FALSE 0.236 149.000 0.082 NA   NA
 5658497 5658498 SGR_5864 SGR_5865     TRUE 0.746 45.000 0.095 0.001   NA
 5658498 5658499 SGR_5865 SGR_5866     FALSE 0.234 163.000 0.145 NA   NA
 5658499 5658500 SGR_5866 SGR_5867     TRUE 0.975 16.000 0.767 NA Y NA
 5658500 5658501 SGR_5867 SGR_5868     TRUE 0.604 23.000 0.082 NA   NA
 5658501 5658502 SGR_5868 SGR_5869     TRUE 0.619 96.000 0.500 NA   NA
 5658502 5658503 SGR_5869 SGR_5870   tatA FALSE 0.018 219.000 0.000 NA   NA
 5658503 5658504 SGR_5870 SGR_5871 tatA tatC TRUE 0.786 50.000 0.023 NA Y NA
 5658504 5658505 SGR_5871 SGR_5872 tatC   TRUE 0.697 19.000 0.070 NA N NA
 5658505 5658506 SGR_5872 SGR_5873     TRUE 0.629 46.000 0.174 1.000 N NA
 5658507 5658508 SGR_5874 SGR_5875     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5658508 5658509 SGR_5875 SGR_5876     FALSE 0.143 127.000 0.000 NA N NA
 5658510 5658511 SGR_5877 SGR_5878     TRUE 0.977 -3.000 0.722 NA   NA
 5658511 5658512 SGR_5878 SGR_5879     TRUE 0.883 -3.000 0.067 NA   NA
 5658512 5658513 SGR_5879 SGR_5880     TRUE 0.990 -3.000 0.097 0.001 Y NA
 5658513 5658514 SGR_5880 SGR_5881     TRUE 0.897 -3.000 0.048 1.000   NA
 5658515 5658516 SGR_5882 SGR_5883     FALSE 0.353 38.000 0.004 NA   NA
 5658516 5658517 SGR_5883 SGR_5884     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658517 5658518 SGR_5884 SGR_5885     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5658518 5658519 SGR_5885 SGR_5886     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658521 5658522 SGR_5888 SGR_5889     FALSE 0.492 53.000 0.081 NA N NA
 5658523 5658524 SGR_5890 SGR_5891     TRUE 0.906 -7.000 0.000 0.054 N NA
 5658524 5658525 SGR_5891 SGR_5892     FALSE 0.090 163.000 0.000 1.000   NA
 5658525 5658526 SGR_5892 SGR_5893     FALSE 0.203 147.000 0.040 NA   NA
 5658528 5658529 SGR_5895 SGR_5896     FALSE 0.136 58.000 0.000 NA   NA
 5658531 5658532 SGR_5898 SGR_5899     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5658534 5658535 SGR_5901 SGR_5902     FALSE 0.115 77.000 0.000 NA   NA
 5658535 5658536 SGR_5902 SGR_5903     FALSE 0.379 70.000 0.083 NA   NA
 5658538 5658539 SGR_5905 SGR_5906     TRUE 0.868 122.000 0.652 1.000 Y NA
 5658539 5658540 SGR_5906 SGR_5907     TRUE 0.948 108.000 0.928 0.007 Y NA
 5658540 5658541 SGR_5907 SGR_5908     TRUE 0.775 144.000 0.057 0.007 Y NA
 5658541 5658542 SGR_5908 SGR_5909     FALSE 0.277 173.000 0.150 1.000 N NA
 5658542 5658543 SGR_5909 SGR_5910   pheS FALSE 0.467 116.000 0.011 0.081 N NA
 5658543 5658544 SGR_5910 SGR_5911 pheS pheT TRUE 0.995 0.000 0.574 0.000 Y NA
 5658544 5658545 SGR_5911 SGR_5912 pheT   FALSE 0.004 416.000 0.000 1.000   NA
 5658545 5658546 SGR_5912 SGR_5913     TRUE 0.722 87.000 0.625 1.000   NA
 5658548 5658549 SGR_5915 SGR_5916 strV strW TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.008 Y NA
 5658549 5658550 SGR_5916 SGR_5917 strW stsG FALSE 0.270 71.000 0.000 1.000 N NA
 5658550 5658551 SGR_5917 SGR_5918 stsG stsF FALSE 0.128 64.000 0.000 NA   NA
 5658551 5658552 SGR_5918 SGR_5919 stsF stsE TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658552 5658553 SGR_5919 SGR_5920 stsE stsD TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658555 5658556 SGR_5922 SGR_5923 stsB stsA FALSE 0.232 57.000 0.000 NA N NA
 5658558 5658559 SGR_5925 SGR_5926 strN strB2 TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658559 5658560 SGR_5926 SGR_5927 strB2 strM FALSE 0.278 43.000 0.000 NA N NA
 5658561 5658562 SGR_5928 SGR_5929 strL strE TRUE 0.887 57.000 0.062 0.002 Y NA
 5658562 5658563 SGR_5929 SGR_5930 strE strD TRUE 0.667 87.000 0.000 1.000 Y NA
 5658564 5658565 SGR_5931 SGR_5932 strR aphD FALSE 0.023 235.000 0.000 1.000   NA
 5658565 5658566 SGR_5932 SGR_5933 aphD strB1 FALSE 0.004 491.000 0.000 1.000 N NA
 5658566 5658567 SGR_5933 SGR_5934 strB1 strF FALSE 0.166 44.000 0.000 NA   NA
 5658567 5658568 SGR_5934 SGR_5935 strF strG FALSE 0.414 10.000 0.000 NA   NA
 5658568 5658569 SGR_5935 SGR_5936 strG strH FALSE 0.055 162.000 0.000 NA   NA
 5658569 5658570 SGR_5936 SGR_5937 strH strI FALSE 0.253 45.000 0.000 1.000   NA
 5658570 5658571 SGR_5937 SGR_5938 strI strK TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5658571 5658572 SGR_5938 SGR_5939 strK strS FALSE 0.418 113.000 0.000 0.030 N NA
 5658572 5658573 SGR_5939 SGR_5940 strS strT FALSE 0.214 107.000 0.000 1.000 N NA
 5658573 5658574 SGR_5940 SGR_5941 strT   FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 5658577 5658578 SGR_5944 SGR_5945     TRUE 0.524 48.000 0.174 NA   NA
 5658580 5658581 SGR_5947 SGR_5948     FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 5658582 5658583 SGR_5949 SGR_5950     FALSE 0.015 268.000 0.000 NA N NA
 5658583 5658584 SGR_5950 SGR_5951     FALSE 0.055 162.000 0.000 NA   NA
 5658586 5658587 SGR_5953 SGR_5954     FALSE 0.014 234.000 0.000 NA   NA
 5658588 5658589 SGR_5955 SGR_5956     TRUE 0.642 4.000 0.000 1.000   NA
 5658589 5658590 SGR_5956 SGR_5957     FALSE 0.139 56.000 0.000 NA   NA
 5658591 5658592 SGR_5958 SGR_5959     FALSE 0.001 491.000 0.000 NA   NA
 5658592 5658593 SGR_5959 SGR_5960     FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 5658593 5658594 SGR_5960 SGR_5961     TRUE 0.993 -3.000 0.303 0.001 Y NA
 5658594 5658595 SGR_5961 SGR_5962     TRUE 0.992 -3.000 0.239 0.001 Y NA
 5658595 5658596 SGR_5962 SGR_5963     TRUE 0.981 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 5658596 5658597 SGR_5963 SGR_5964     TRUE 0.670 26.000 0.062 1.000 N NA
 5658599 5658600 SGR_5966 SGR_5967     TRUE 0.780 115.000 0.278 1.000 Y NA
 5658600 5658601 SGR_5967 SGR_5968     FALSE 0.492 40.000 0.004 1.000 N NA
 5658603 5658604 SGR_5970 SGR_5971     TRUE 0.982 -3.000 0.800 1.000   NA
 5658606 5658607 SGR_5973 SGR_5974     FALSE 0.278 161.000 0.063 1.000 N NA
 5658607 5658608 SGR_5974 SGR_5975     TRUE 0.951 -3.000 0.312 1.000   NA
 5658609 5658610 SGR_5976 SGR_5977     TRUE 0.953 2.000 0.548 NA   NA
 5658611 5658612 SGR_5978 SGR_5979     TRUE 0.987 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 5658612 5658613 SGR_5979 SGR_5980     TRUE 0.899 81.000 0.667 NA Y NA
 5658613 5658614 SGR_5980 SGR_5981     FALSE 0.472 141.000 0.333 NA N NA
 5658614 5658615 SGR_5981 SGR_5982     TRUE 0.627 109.000 0.444 1.000 N NA
 5658615 5658616 SGR_5982 SGR_5983     FALSE 0.105 335.000 0.000 0.005 Y NA
 5658616 5658617 SGR_5983 SGR_5984     FALSE 0.164 301.000 0.244 1.000 Y NA
 5658617 5658618 SGR_5984 SGR_5985     FALSE 0.454 70.000 0.046 1.000 N NA
 5658620 5658621 SGR_5987 SGR_5988     FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5658621 5658622 SGR_5988 SGR_5989     TRUE 0.599 66.000 0.360 NA   NA
 5658623 5658624 SGR_tRNA60 SGR_tRNA61     FALSE 0.251 24.000 0.000 NA   NA
 5658624 5658625 SGR_tRNA61 SGR_tRNA62     FALSE 0.183 37.000 0.000 NA   NA
 5658625 5658626 SGR_tRNA62 SGR_tRNA63     FALSE 0.486 5.000 0.000 NA   NA
 5658626 5658627 SGR_tRNA63 SGR_tRNA64     FALSE 0.177 39.000 0.000 NA   NA
 5658628 5658629 SGR_5990 SGR_5991     TRUE 0.973 0.000 0.039 1.000 Y NA
 5658629 5658630 SGR_5991 SGR_5992     TRUE 0.623 59.000 0.081 0.063   NA
 5658632 5658633 SGR_5994 SGR_5995     FALSE 0.358 182.000 0.500 NA   NA
 5658634 5658635 SGR_5996 SGR_5997   ssgB FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 5658636 5658637 SGR_5998 SGR_tRNA65     FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 5658641 5658642 SGR_6001 SGR_6002     TRUE 0.971 0.000 0.714 NA   NA
 5658642 5658643 SGR_6002 SGR_6003   thrS FALSE 0.261 99.000 0.030 NA   NA
 5658646 5658647 SGR_6006 SGR_6007     FALSE 0.063 153.000 0.000 NA   NA
 5658648 5658649 SGR_6008 SGR_6009     TRUE 0.982 -3.000 0.737 1.000 N NA
 5658649 5658650 SGR_6009 SGR_6010     TRUE 0.994 -3.000 0.831 1.000 Y NA
 5658650 5658651 SGR_6010 SGR_6011     TRUE 0.614 34.000 0.211 NA   NA
 5658651 5658652 SGR_6011 SGR_6012     FALSE 0.067 205.000 0.017 NA   NA
 5658652 5658653 SGR_6012 SGR_6013     TRUE 0.976 7.000 0.488 NA Y NA
 5658653 5658654 SGR_6013 SGR_6014     FALSE 0.368 62.000 0.055 NA   NA
 5658654 5658655 SGR_6014 SGR_6015     FALSE 0.313 164.000 0.277 NA   NA
 5658655 5658656 SGR_6015 SGR_6016     TRUE 0.994 -3.000 0.451 0.004 Y NA
 5658656 5658657 SGR_6016 SGR_6017     TRUE 0.969 31.000 0.549 0.001 Y NA
 5658657 5658658 SGR_6017 SGR_6018     FALSE 0.216 168.000 0.063 NA N NA
 5658658 5658659 SGR_6018 SGR_6019   secD FALSE 0.183 253.000 0.062 NA Y NA
 5658659 5658660 SGR_6019 SGR_6020 secD secF TRUE 0.991 2.000 0.336 0.000 Y NA
 5658660 5658661 SGR_6020 SGR_6021 secF   TRUE 0.862 4.000 0.044 1.000 N NA
 5658661 5658662 SGR_6021 SGR_6022   relA1 FALSE 0.104 218.000 0.051 1.000 N NA
 5658663 5658664 SGR_6023 SGR_6024     FALSE 0.070 227.000 0.103 NA   NA
 5658665 5658666 SGR_6025 SGR_6026   hisS TRUE 0.678 18.000 0.051 1.000   NA
 5658666 5658667 SGR_6026 SGR_6027 hisS   FALSE 0.011 324.000 0.003 NA   NA
 5658667 5658668 SGR_6027 SGR_6028     FALSE 0.242 88.000 0.007 NA   NA
 5658672 5658673 SGR_6032 SGR_6033     TRUE 0.558 53.000 0.250 NA   NA
 5658673 5658674 SGR_6033 SGR_6034   alaS1 TRUE 0.885 0.000 0.138 NA   NA
 5658674 5658675 SGR_6034 SGR_6035 alaS1   TRUE 0.931 -3.000 0.103 1.000 N NA
 5658675 5658676 SGR_6035 SGR_6036     FALSE 0.225 101.000 0.011 NA   NA
 5658676 5658677 SGR_6036 SGR_6037     TRUE 0.810 -7.000 0.018 NA   NA
 5658677 5658678 SGR_6037 SGR_6038     TRUE 0.624 146.000 0.021 1.000 Y NA
 5658678 5658679 SGR_6038 SGR_6039     TRUE 0.990 -3.000 0.110 0.001 Y NA
 5658679 5658680 SGR_6039 SGR_6040     TRUE 0.989 -3.000 0.052 0.001 Y NA
 5658680 5658681 SGR_6040 SGR_6041     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 5658681 5658682 SGR_6041 SGR_6042     FALSE 0.186 130.000 0.008 NA   NA
 5658682 5658683 SGR_6042 SGR_6043     TRUE 0.598 51.000 0.160 1.000 N NA
 5658683 5658684 SGR_6043 SGR_6044     TRUE 0.887 3.000 0.078 1.000 N NA
 5658686 5658687 SGR_6046 SGR_6047     TRUE 0.802 95.000 0.247 1.000 Y NA
 5658687 5658688 SGR_6047 SGR_6048     TRUE 0.984 3.000 0.452 1.000 Y NA
 5658688 5658689 SGR_6048 SGR_6049     TRUE 0.878 -3.000 0.057 NA   NA
 5658689 5658690 SGR_6049 SGR_6050     TRUE 0.874 -3.000 0.050 NA   NA
 5658690 5658691 SGR_6050 SGR_6051     TRUE 0.992 -7.000 0.345 0.000 Y NA
 5658691 5658692 SGR_6051 SGR_6052     TRUE 0.718 93.000 0.013 1.000 Y NA
 5658692 5658693 SGR_6052 SGR_6053     TRUE 0.988 -3.000 0.020 0.001 Y NA
 5658693 5658694 SGR_6053 SGR_6054     FALSE 0.036 245.000 0.004 1.000   NA
 5658694 5658695 SGR_6054 SGR_6055     FALSE 0.451 39.000 0.014 1.000   NA
 5658695 5658696 SGR_6055 SGR_6056     TRUE 0.729 62.000 0.471 1.000 N NA
 5658696 5658697 SGR_6056 SGR_6057     FALSE 0.436 134.000 0.192 1.000 N NA
 5658697 5658698 SGR_6057 SGR_6058     FALSE 0.411 200.000 0.059 1.000 Y NA
 5658698 5658699 SGR_6058 SGR_6059     FALSE 0.315 134.000 0.068 NA N NA
 5658701 5658702 SGR_6061 SGR_6062 fmt   TRUE 0.786 122.000 0.305 1.000 Y NA
 5658702 5658703 SGR_6062 SGR_6063     FALSE 0.307 149.000 0.056 1.000 N NA
 5658703 5658704 SGR_6063 SGR_6064     FALSE 0.458 80.000 0.067 1.000 N NA
 5658706 5658707 SGR_6066 SGR_6067     FALSE 0.260 167.000 0.000 0.063 N NA
 5658707 5658708 SGR_6067 SGR_6068     FALSE 0.173 141.000 0.000 1.000 N NA
 5658708 5658709 SGR_6068 SGR_6069     FALSE 0.155 185.000 0.065 1.000   NA
 5658709 5658710 SGR_6069 SGR_6070     TRUE 0.672 47.000 0.323 1.000   NA
 5658710 5658711 SGR_6070 SGR_6071     FALSE 0.003 1056.000 0.000 1.000 N NA
 5658711 5658712 SGR_6071 SGR_6072     FALSE 0.047 264.000 0.000 0.041   NA
 5658712 5658713 SGR_6072 SGR_6073   pks1-1 FALSE 0.002 638.000 0.000 1.000   NA
 5658713 5658714 SGR_6073 SGR_6074 pks1-1 pks1-2 TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 5658714 5658715 SGR_6074 SGR_6075 pks1-2 pks1-3 TRUE 0.899 29.000 0.000 0.004 Y NA
 5658715 5658716 SGR_6075 SGR_6076 pks1-3 pks1-4 TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 5658716 5658717 SGR_6076 SGR_6077 pks1-4 pks1-5 TRUE 0.805 77.000 0.000 0.004 Y NA
 5658717 5658718 SGR_6077 SGR_6078 pks1-5 pks1-6 TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 5658718 5658719 SGR_6078 SGR_6079 pks1-6   FALSE 0.464 197.000 0.000 0.017 Y NA
 5658719 5658720 SGR_6079 SGR_6080     FALSE 0.111 84.000 0.000 NA   NA
 5658722 5658723 SGR_6082 SGR_6083   pks1-7 FALSE 0.011 328.000 0.000 1.000 N NA
 5658724 5658725 SGR_6084 SGR_6085     FALSE 0.028 229.000 0.000 NA N NA
 5658727 5658728 SGR_6087 SGR_6088     FALSE 0.155 244.000 0.000 1.000 Y NA
 5658729 5658730 SGR_6089 SGR_6090     TRUE 0.986 1.000 0.456 1.000 Y NA
 5658730 5658731 SGR_6090 SGR_6091     TRUE 0.976 -3.000 0.013 1.000 Y NA
 5658731 5658732 SGR_6091 SGR_6092     TRUE 0.982 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 5658732 5658733 SGR_6092 SGR_6093     TRUE 0.923 33.000 0.041 0.001 Y NA
 5658733 5658734 SGR_6093 SGR_6094     TRUE 0.567 36.000 0.034 1.000 N NA
 5658734 5658735 SGR_6094 SGR_6095     TRUE 0.860 92.000 0.081 0.001 Y NA
 5658735 5658736 SGR_6095 SGR_6096     FALSE 0.385 40.000 0.017 NA   NA
 5658736 5658737 SGR_6096 SGR_6097     FALSE 0.015 230.000 0.000 NA   NA
 5658737 5658738 SGR_6097 SGR_6098     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5658739 5658740 SGR_6099 SGR_6100     FALSE 0.003 358.000 0.000 NA   NA
 5658747 5658748 SGR_6107 SGR_6108     FALSE 0.467 67.000 0.122 1.000   NA
 5658748 5658749 SGR_6108 SGR_6109     FALSE 0.003 596.000 0.014 NA   NA
 5658749 5658750 SGR_6109 SGR_6110     FALSE 0.243 114.000 0.037 NA   NA
 5658751 5658752 SGR_6111 SGR_6112     FALSE 0.021 267.000 0.009 NA   NA
 5658752 5658753 SGR_6112 SGR_6113     FALSE 0.417 47.000 0.050 NA   NA
 5658753 5658754 SGR_6113 SGR_6114     TRUE 0.886 -3.000 0.071 NA   NA
 5658756 5658757 SGR_6116 SGR_6117     TRUE 0.876 38.000 1.000 NA   NA
 5658758 5658759 SGR_6118 SGR_6119     FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 5658759 5658760 SGR_6119 SGR_6120     FALSE 0.108 89.000 0.000 NA   NA
 5658760 5658761 SGR_6120 SGR_6121     FALSE 0.117 74.000 0.000 NA   NA
 5658761 5658762 SGR_6121 SGR_6122     FALSE 0.161 46.000 0.000 NA   NA
 5658762 5658763 SGR_6122 SGR_6123     TRUE 0.616 128.000 0.615 NA   NA
 5658763 5658764 SGR_6123 SGR_6124     TRUE 0.728 61.000 0.600 NA   NA
 5658766 5658767 SGR_6126 SGR_6127     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5658767 5658768 SGR_6127 SGR_6128     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 5658768 5658769 SGR_6128 SGR_6129     TRUE 0.974 -19.000 0.833 NA   NA
 5658770 5658771 SGR_6130 SGR_6131     TRUE 0.981 -3.000 0.850 NA   NA
 5658771 5658772 SGR_6131 SGR_6132     FALSE 0.111 85.000 0.000 NA   NA
 5658772 5658773 SGR_6132 SGR_6133     FALSE 0.206 132.000 0.019 NA   NA
 5658776 5658777 SGR_6136 SGR_6137     TRUE 0.657 75.000 0.500 NA   NA
 5658778 5658779 SGR_6138 SGR_6139     TRUE 0.885 79.000 0.158 0.001 Y NA
 5658780 5658781 SGR_16SrRNA6 SGR_23SrRNA6 rrnF1 rrnF2 FALSE 0.006 298.000 0.000 NA   NA
 5658781 5658782 SGR_23SrRNA6 SGR_5SrRNA6 rrnF2 rrnF3 FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 5658782 5658783 SGR_5SrRNA6 SGR_6140 rrnF3   FALSE 0.060 156.000 0.000 NA   NA
 5658783 5658784 SGR_6140 SGR_6141     FALSE 0.377 113.000 0.061 1.000 N NA
 5658784 5658785 SGR_6141 SGR_6142     FALSE 0.337 89.000 0.070 NA   NA
 5658785 5658786 SGR_6142 SGR_6143     TRUE 0.956 -3.000 0.409 NA   NA
 5658786 5658787 SGR_6143 SGR_6144     TRUE 0.956 -3.000 0.409 NA   NA
 5658787 5658788 SGR_6144 SGR_6145     FALSE 0.163 191.000 0.192 NA   NA
 5658788 5658789 SGR_6145 SGR_6146     TRUE 0.699 103.000 0.707 NA   NA
 5658789 5658790 SGR_6146 SGR_6147     FALSE 0.462 54.000 0.133 NA   NA
 5658790 5658791 SGR_6147 SGR_6148     FALSE 0.154 169.000 0.043 NA   NA
 5658791 5658792 SGR_6148 SGR_6149     FALSE 0.358 113.000 0.042 1.000 N NA
 5658795 5658796 SGR_6152 SGR_6153     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 5658802 5658803 SGR_6159 SGR_6160     FALSE 0.002 480.000 0.000 NA   NA
 5658805 5658806 SGR_6162 SGR_6163     FALSE 0.075 136.000 0.000 NA   NA
 5658806 5658807 SGR_6163 SGR_6164     TRUE 0.683 28.000 0.250 NA   NA
 5658809 5658810 SGR_6166 SGR_6167     FALSE 0.113 80.000 0.000 NA   NA
 5658811 5658812 SGR_6168 SGR_6169     FALSE 0.246 110.000 0.004 1.000   NA
 5658812 5658813 SGR_6169 SGR_6170     FALSE 0.336 112.000 0.000 0.054   NA
 5658819 5658820 SGR_6176 SGR_6177     FALSE 0.003 618.000 0.000 1.000 N NA
 5658820 5658821 SGR_6177 SGR_6178     FALSE 0.009 343.000 0.000 1.000 N NA
 5658821 5658822 SGR_6178 SGR_6179   pks2-1 FALSE 0.091 344.000 0.000 0.017 Y NA
 5658822 5658823 SGR_6179 SGR_6180 pks2-1 pks2-2 TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 5658823 5658824 SGR_6180 SGR_6181 pks2-2 pks2-3 TRUE 0.922 21.000 0.000 0.004 Y NA
 5658824 5658825 SGR_6181 SGR_6182 pks2-3 pks2-4 TRUE 0.761 107.000 0.000 0.004 Y NA
 5658825 5658826 SGR_6182 SGR_6183 pks2-4 pks2-5 TRUE 0.835 57.000 0.000 0.004 Y NA
 5658827 5658828 SGR_6184 SGR_6185     FALSE 0.054 212.000 0.000 1.000 N NA
 5658829 5658830 SGR_6186 SGR_6187     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658830 5658831 SGR_6187 SGR_6188     FALSE 0.130 132.000 0.000 1.000   NA
 5658831 5658832 SGR_6188 SGR_6189     TRUE 0.885 0.000 0.000 0.062   NA
 5658833 5658834 SGR_6190 SGR_6191     FALSE 0.154 111.000 0.000 NA N NA
 5658836 5658837 SGR_6193 SGR_6194     FALSE 0.051 166.000 0.000 NA   NA
 5658837 5658838 SGR_6194 SGR_6195     FALSE 0.450 90.000 0.222 NA   NA
 5658838 5658839 SGR_6195 SGR_6196     FALSE 0.055 188.000 0.000 1.000   NA
 5658840 5658841 SGR_6197 SGR_6198     TRUE 0.996 1.000 1.000 0.034 Y NA
 5658841 5658842 SGR_6198 SGR_6199     FALSE 0.002 572.000 0.000 NA N NA
 5658842 5658843 SGR_6199 SGR_6200     FALSE 0.001 1006.000 0.000 NA   NA
 5658845 5658846 SGR_6202 SGR_6203     FALSE 0.350 14.000 0.000 NA   NA
 5658847 5658848 SGR_6204 SGR_6205     FALSE 0.392 21.000 0.000 1.000   NA
 5658849 5658850 SGR_6206 SGR_6207     FALSE 0.503 158.000 0.000 1.000 Y NA
 5658851 5658852 SGR_6208 SGR_6209     TRUE 0.984 9.000 0.714 1.000 Y NA
 5658852 5658853 SGR_6209 SGR_6210     FALSE 0.001 1157.000 0.000 NA   NA
 5658854 5658855 SGR_6211 SGR_6212     TRUE 0.937 -3.000 0.275 NA   NA
 5658855 5658856 SGR_6212 SGR_6213     TRUE 0.984 2.000 0.385 1.000 Y NA
 5658856 5658857 SGR_6213 SGR_6214     FALSE 0.014 233.000 0.000 NA   NA
 5658857 5658858 SGR_6214 SGR_6215     TRUE 0.893 -3.000 0.090 NA   NA
 5658858 5658859 SGR_6215 SGR_6216     FALSE 0.057 221.000 0.034 NA   NA
 5658859 5658860 SGR_6216 SGR_6217     TRUE 0.964 21.000 0.286 0.002 Y NA
 5658860 5658861 SGR_6217 SGR_6218     FALSE 0.132 211.000 0.091 1.000 N NA
 5658861 5658862 SGR_6218 SGR_6219     FALSE 0.484 86.000 0.116 1.000 N NA
 5658862 5658863 SGR_6219 SGR_6220     TRUE 0.559 34.000 0.070 1.000   NA
 5658866 5658867 SGR_6223 SGR_6224     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 5658867 5658868 SGR_6224 SGR_6225     FALSE 0.074 137.000 0.000 NA   NA
 5658868 5658869 SGR_6225 SGR_6226     FALSE 0.134 123.000 0.000 1.000   NA
 5658870 5658871 SGR_6227 SGR_6228     FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 5658872 5658873 SGR_6229 SGR_6230     TRUE 0.792 11.000 0.167 NA   NA
 5658873 5658874 SGR_6230 SGR_6231     TRUE 0.939 -3.000 0.154 1.000 N NA
 5658874 5658875 SGR_6231 SGR_6232     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5658876 5658877 SGR_6233 SGR_6234     FALSE 0.392 21.000 0.000 1.000   NA
 5658878 5658879 SGR_6235 SGR_6236     FALSE 0.047 170.000 0.000 NA   NA
 5658880 5658881 SGR_6237 SGR_6238     FALSE 0.010 301.000 0.000 NA N NA
 5658881 5658882 SGR_6238 SGR_6239     FALSE 0.315 72.000 0.005 1.000   NA
 5658886 5658887 SGR_6243 SGR_6244     FALSE 0.212 169.000 0.073 1.000   NA
 5658887 5658888 SGR_6244 SGR_6245     FALSE 0.484 45.000 0.109 NA   NA
 5658889 5658890 SGR_6246 SGR_6247     FALSE 0.127 65.000 0.000 NA   NA
 5658891 5658892 SGR_6248 SGR_6249     FALSE 0.024 276.000 0.004 1.000   NA
 5658892 5658893 SGR_6249 SGR_6250     TRUE 0.993 -3.000 0.669 NA Y NA
 5658896 5658897 SGR_6253 SGR_6254     FALSE 0.208 31.000 0.000 NA   NA
 5658897 5658898 SGR_6254 SGR_6255     FALSE 0.279 137.000 0.111 NA   NA
 5658900 5658901 SGR_6257 SGR_6258     FALSE 0.407 99.000 0.200 NA   NA
 5658901 5658902 SGR_6258 SGR_6259     TRUE 0.959 -3.000 0.450 NA   NA
 5658902 5658903 SGR_6259 SGR_6260     FALSE 0.349 53.000 0.025 NA   NA
 5658903 5658904 SGR_6260 SGR_6261     FALSE 0.305 129.000 0.051 NA N NA
 5658907 5658908 SGR_6264 SGR_6265     FALSE 0.146 285.000 0.000 0.067 Y NA
 5658909 5658910 SGR_6266 SGR_6267     TRUE 0.880 101.000 0.375 0.083 Y NA
 5658910 5658911 SGR_6267 SGR_6268     TRUE 0.991 -28.000 0.400 0.020 Y NA
 5658912 5658913 SGR_6269 SGR_6270     TRUE 0.952 -3.000 0.375 NA   NA
 5658914 5658915 SGR_6271 SGR_6272     TRUE 0.592 20.000 0.006 NA N NA
 5658915 5658916 SGR_6272 SGR_6273     FALSE 0.323 101.000 0.003 1.000 N NA
 5658916 5658917 SGR_6273 SGR_6274     TRUE 0.691 44.000 0.333 1.000   NA
 5658917 5658918 SGR_6274 SGR_6275     TRUE 0.982 -3.000 0.857 NA   NA
 5658918 5658919 SGR_6275 SGR_6276     FALSE 0.013 327.000 0.020 NA   NA
 5658920 5658921 SGR_6277 SGR_6278     TRUE 0.575 30.000 0.121 NA   NA
 5658922 5658923 SGR_6279 SGR_6280     TRUE 0.667 126.000 0.018 1.000 Y NA
 5658923 5658924 SGR_6280 SGR_6281     TRUE 0.976 7.000 0.053 0.000 Y NA
 5658924 5658925 SGR_6281 SGR_6282     TRUE 0.989 -7.000 0.176 0.000 Y NA
 5658927 5658928 SGR_6284 SGR_6285     TRUE 0.942 10.000 0.714 NA   NA
 5658932 5658933 SGR_6289 SGR_6290     FALSE 0.001 543.000 0.000 NA   NA
 5658933 5658934 SGR_6290 SGR_6291     TRUE 0.864 36.000 0.833 NA   NA
 5658937 5658938 SGR_6294 SGR_6295   ureA1 FALSE 0.178 138.000 0.000 1.000 N NA
 5658938 5658939 SGR_6295 SGR_6296 ureA1 ureB1 TRUE 0.975 14.000 0.259 0.001 Y NA
 5658939 5658940 SGR_6296 SGR_6297 ureB1 ureC1 TRUE 0.996 -7.000 0.875 0.001 Y NA
 5658940 5658941 SGR_6297 SGR_6298 ureC1 ureF1 TRUE 0.891 13.000 0.032 0.003 N NA
 5658941 5658942 SGR_6298 SGR_6299 ureF1 ureG1 TRUE 0.994 -3.000 0.439 0.003 Y NA
 5658942 5658943 SGR_6299 SGR_6300 ureG1 ureD1 TRUE 0.990 -3.000 0.115 0.003 Y NA
 5658943 5658944 SGR_6300 SGR_6301 ureD1   FALSE 0.046 226.000 0.018 NA   NA
 5658945 5658946 SGR_6302 SGR_6303     TRUE 0.592 65.000 0.222 1.000 N NA
 5658946 5658947 SGR_6303 SGR_6304     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 5658947 5658948 SGR_6304 SGR_6305     TRUE 0.745 67.000 0.667 NA   NA
 5658948 5658949 SGR_6305 SGR_6306     TRUE 0.725 136.000 1.000 NA   NA
 5658949 5658950 SGR_6306 SGR_6307     FALSE 0.147 176.000 0.020 1.000   NA
 5658950 5658951 SGR_6307 SGR_6308     TRUE 0.870 35.000 0.796 1.000   NA
 5658955 5658956 SGR_6312 SGR_6313     FALSE 0.234 51.000 0.000 1.000   NA
 5658956 5658957 SGR_6313 SGR_6314     FALSE 0.003 379.000 0.000 NA   NA
 5658957 5658958 SGR_6314 SGR_6315     FALSE 0.251 24.000 0.000 NA   NA
 5658960 5658961 SGR_6317 SGR_6318     FALSE 0.507 35.000 0.035 1.000   NA
 5658962 5658963 SGR_6319 SGR_6320     FALSE 0.137 57.000 0.000 NA   NA
 5658966 5658967 SGR_6323 SGR_6324     TRUE 0.994 -3.000 0.467 0.008 Y NA
 5658967 5658968 SGR_6324 SGR_6325     FALSE 0.099 157.000 0.000 1.000   NA
 5658968 5658969 SGR_6325 SGR_6326     FALSE 0.049 263.000 0.000 0.034   NA
 5658969 5658970 SGR_6326 SGR_6327     TRUE 0.644 34.000 0.111 1.000 N NA
 5658971 5658972 SGR_6328 SGR_6329     FALSE 0.174 40.000 0.000 NA   NA
 5658975 5658976 SGR_6332 SGR_6333     FALSE 0.452 64.000 0.032 1.000 N NA
 5658976 5658977 SGR_6333 SGR_6334     TRUE 0.959 -3.000 0.308 1.000 N NA
 5658977 5658978 SGR_6334 SGR_6335     TRUE 0.987 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 5658978 5658979 SGR_6335 SGR_6336     TRUE 0.984 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 5658980 5658981 SGR_6337 SGR_6338     FALSE 0.121 70.000 0.000 NA   NA
 5658981 5658982 SGR_6338 SGR_6339     TRUE 0.569 -19.000 0.000 NA   NA
 5658982 5658983 SGR_6339 SGR_6340     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5658983 5658984 SGR_6340 SGR_6341     TRUE 0.558 2.000 0.000 NA   NA
 5658984 5658985 SGR_6341 SGR_6342     FALSE 0.001 602.000 0.000 NA   NA
 5658986 5658987 SGR_6343 SGR_6344     TRUE 0.845 53.000 1.000 NA   NA
 5658987 5658988 SGR_6344 SGR_6345     FALSE 0.003 377.000 0.000 NA   NA
 5658989 5658990 SGR_6346 SGR_6347     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5658990 5658991 SGR_6347 SGR_6348     FALSE 0.069 144.000 0.000 NA   NA
 5658991 5658992 SGR_6348 SGR_6349     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5658994 5658995 SGR_6351 SGR_6352     FALSE 0.111 84.000 0.000 NA   NA
 5658995 5658996 SGR_6352 SGR_6353     FALSE 0.002 464.000 0.000 NA   NA
 5658996 5658997 SGR_6353 SGR_6354     FALSE 0.104 92.000 0.000 NA   NA
 5658997 5658998 SGR_6354 SGR_6355     FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 5658998 5658999 SGR_6355 SGR_6356     FALSE 0.143 54.000 0.000 NA   NA
 5658999 5659000 SGR_6356 SGR_6357     FALSE 0.070 143.000 0.000 NA   NA
 5659000 5659001 SGR_6357 SGR_6358     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5659001 5659002 SGR_6358 SGR_6359     FALSE 0.084 115.000 0.000 NA   NA
 5659003 5659004 SGR_6360 SGR_6361     TRUE 0.906 -3.000 0.136 NA   NA
 5659004 5659005 SGR_6361 SGR_6362     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5659005 5659006 SGR_6362 SGR_6363     TRUE 0.711 -7.000 0.000 1.000   NA
 5659006 5659007 SGR_6363 SGR_6364     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659007 5659008 SGR_6364 SGR_6365     TRUE 0.577 -10.000 0.000 NA   NA
 5659009 5659010 SGR_6366 SGR_6367     FALSE 0.064 181.000 0.000 1.000   NA
 5659010 5659011 SGR_6367 SGR_6368     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5659011 5659012 SGR_6368 SGR_6369     FALSE 0.002 445.000 0.000 NA   NA
 5659013 5659014 SGR_6370 SGR_6371 pks3-4 pks3-3 TRUE 0.968 28.000 0.500 0.004 Y NA
 5659014 5659015 SGR_6371 SGR_6372 pks3-3 pks3-2 TRUE 0.988 7.000 0.500 0.004 Y NA
 5659015 5659016 SGR_6372 SGR_6373 pks3-2 pks3-1 TRUE 0.941 15.000 0.000 0.004 Y NA
 5659016 5659017 SGR_6373 SGR_6374 pks3-1   FALSE 0.137 57.000 0.000 NA   NA
 5659017 5659018 SGR_6374 SGR_6375     TRUE 0.934 0.000 0.333 NA   NA
 5659020 5659021 SGR_6377 SGR_6378     FALSE 0.333 15.000 0.000 NA   NA
 5659022 5659023 SGR_6379 SGR_6380     FALSE 0.079 191.000 0.000 1.000 N NA
 5659023 5659024 SGR_6380 SGR_6381     FALSE 0.494 109.000 0.222 1.000 N NA
 5659026 5659027 SGR_6383 SGR_6384     FALSE 0.004 408.000 0.000 NA N NA
 5659027 5659028 SGR_6384 SGR_6385     FALSE 0.121 146.000 0.000 NA N NA
 5659028 5659029 SGR_6385 SGR_6386     FALSE 0.013 310.000 0.000 1.000 N NA
 5659034 5659035 SGR_6391 SGR_6392     TRUE 0.995 -3.000 0.500 0.008 Y NA
 5659036 5659037 SGR_6393 SGR_6394     TRUE 0.970 9.000 0.333 1.000 Y NA
 5659037 5659038 SGR_6394 SGR_6395     TRUE 0.990 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 5659038 5659039 SGR_6395 SGR_6396     FALSE 0.012 241.000 0.000 NA   NA
 5659039 5659040 SGR_6396 SGR_6397     FALSE 0.018 220.000 0.000 NA   NA
 5659041 5659042 SGR_6398 SGR_6399     FALSE 0.238 26.000 0.000 NA   NA
 5659042 5659043 SGR_6399 SGR_6400     FALSE 0.166 44.000 0.000 NA   NA
 5659043 5659044 SGR_6400 SGR_6401     FALSE 0.147 242.000 0.429 NA N NA
 5659044 5659045 SGR_6401 SGR_6402     TRUE 0.990 3.000 0.444 0.034 Y NA
 5659045 5659046 SGR_6402 SGR_6403     TRUE 0.949 -3.000 0.061 0.062   NA
 5659048 5659049 SGR_6405 SGR_6406     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5659053 5659054 SGR_6410 SGR_6411     TRUE 0.954 0.000 0.000 NA Y NA
 5659055 5659056 SGR_6412 SGR_6413     FALSE 0.241 92.000 0.000 1.000 N NA
 5659056 5659057 SGR_6413 SGR_6414     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.032 Y NA
 5659057 5659058 SGR_6414 SGR_6415     FALSE 0.256 82.000 0.000 1.000 N NA
 5659058 5659059 SGR_6415 SGR_6416     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5659060 5659061 SGR_6417 SGR_6418     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 5659061 5659062 SGR_6418 SGR_6419     FALSE 0.168 43.000 0.000 NA   NA
 5659062 5659063 SGR_6419 SGR_6420     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5659063 5659064 SGR_6420 SGR_6421     TRUE 0.770 28.000 0.283 1.000 N NA
 5659064 5659065 SGR_6421 SGR_6422     FALSE 0.032 241.000 0.000 1.000 N NA
 5659065 5659066 SGR_6422 SGR_6423     TRUE 0.989 -3.000 0.421 1.000 Y NA
 5659066 5659067 SGR_6423 SGR_6424     TRUE 0.994 -3.000 0.400 0.002 Y NA
 5659067 5659068 SGR_6424 SGR_6425     TRUE 0.987 2.000 0.299 0.053 Y NA
 5659068 5659069 SGR_6425 SGR_6426     TRUE 0.837 140.000 0.299 0.032 Y NA
 5659070 5659071 SGR_6427 SGR_6428     FALSE 0.138 161.000 0.000 1.000 N NA
 5659071 5659072 SGR_6428 SGR_6429     FALSE 0.200 66.000 0.000 1.000   NA
 5659074 5659075 SGR_6431 SGR_6432     TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5659075 5659076 SGR_6432 SGR_6433     TRUE 0.994 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 5659077 5659078 SGR_6434 SGR_6435     FALSE 0.091 106.000 0.000 NA   NA
 5659079 5659080 SGR_6436 SGR_6437     TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.035 Y NA
 5659080 5659081 SGR_6437 SGR_6438     TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 5659081 5659082 SGR_6438 SGR_6439     TRUE 0.967 -7.000 0.600 NA N NA
 5659086 5659087 SGR_6443 SGR_6444     TRUE 0.702 14.000 0.079 NA   NA
 5659087 5659088 SGR_6444 SGR_6445     TRUE 0.796 26.000 0.436 NA   NA
 5659089 5659090 SGR_6446 SGR_6447     FALSE 0.010 254.000 0.000 NA   NA
 5659090 5659091 SGR_6447 SGR_6448     FALSE 0.143 54.000 0.000 NA   NA
 5659091 5659092 SGR_6448 SGR_6449     FALSE 0.009 263.000 0.000 NA   NA
 5659093 5659094 SGR_6450 SGR_6451     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 5659094 5659095 SGR_6451 SGR_6452     FALSE 0.142 129.000 0.000 NA N NA
 5659095 5659096 SGR_6452 SGR_6453     FALSE 0.215 66.000 0.000 NA N NA
 5659096 5659097 SGR_6453 SGR_6454     FALSE 0.225 100.000 0.000 1.000 N NA
 5659097 5659098 SGR_6454 SGR_6455     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5659099 5659100 SGR_6456 SGR_6457     FALSE 0.171 143.000 0.000 1.000 N NA
 5659100 5659101 SGR_6457 SGR_6458     FALSE 0.207 111.000 0.000 1.000 N NA
 5659101 5659102 SGR_6458 SGR_6459     TRUE 0.833 57.000 0.400 0.003 N NA
 5659102 5659103 SGR_6459 SGR_6460     FALSE 0.024 259.000 0.000 1.000 N NA
 5659103 5659104 SGR_6460 SGR_6461     FALSE 0.150 51.000 0.000 NA   NA
 5659104 5659105 SGR_6461 SGR_6462     TRUE 0.824 -3.000 0.005 NA   NA
 5659105 5659106 SGR_6462 SGR_6463     FALSE 0.226 93.000 0.005 NA   NA
 5659106 5659107 SGR_6463 SGR_6464     TRUE 0.932 5.000 0.500 NA   NA
 5659107 5659108 SGR_6464 SGR_6465     TRUE 0.947 -3.000 0.333 NA   NA
 5659108 5659109 SGR_6465 SGR_6466     TRUE 0.594 0.000 0.000 NA   NA
 5659109 5659110 SGR_6466 SGR_6467     TRUE 0.902 -3.000 0.125 NA   NA
 5659110 5659111 SGR_6467 SGR_6468     TRUE 0.946 -3.000 0.274 1.000   NA
 5659111 5659112 SGR_6468 SGR_6469     FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 5659114 5659115 SGR_6471 SGR_6472     TRUE 0.981 6.000 0.839 0.034 N NA
 5659115 5659116 SGR_6472 SGR_6473     TRUE 0.674 32.000 0.145 1.000 N NA
 5659117 5659118 SGR_6474 SGR_6475     FALSE 0.183 177.000 0.023 1.000 N NA
 5659118 5659119 SGR_6475 SGR_6476     FALSE 0.291 106.000 0.023 1.000   NA
 5659120 5659121 SGR_6477 SGR_6478     TRUE 0.649 118.000 0.667 NA   NA
 5659121 5659122 SGR_6478 SGR_6479     TRUE 0.816 69.000 0.000 0.004 Y NA
 5659123 5659124 SGR_6480 SGR_6481     TRUE 0.971 3.000 0.714 1.000 N NA
 5659124 5659125 SGR_6481 SGR_6482     FALSE 0.007 325.000 0.000 1.000   NA
 5659125 5659126 SGR_6482 SGR_6483     TRUE 0.990 -3.000 0.889 0.029   NA
 5659127 5659128 SGR_6484 SGR_6485     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 5659128 5659129 SGR_6485 SGR_6486     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 5659132 5659133 SGR_6489 SGR_6490     TRUE 0.625 165.000 0.500 0.013   NA
 5659133 5659134 SGR_6490 SGR_6491     FALSE 0.143 111.000 0.000 1.000   NA
 5659135 5659136 SGR_6492 SGR_6493     FALSE 0.033 215.000 0.000 1.000   NA
 5659136 5659137 SGR_6493 SGR_6494     TRUE 0.785 38.000 0.500 1.000   NA
 5659140 5659141 SGR_6497 SGR_6498     FALSE 0.119 140.000 0.000 1.000   NA
 5659142 5659143 SGR_6499 SGR_6500     FALSE 0.227 165.000 0.143 NA   NA
 5659143 5659144 SGR_6500 SGR_6501     TRUE 0.902 -3.000 0.050 NA N NA
 5659144 5659145 SGR_6501 SGR_6502     FALSE 0.442 45.000 0.062 NA   NA
 5659146 5659147 SGR_6503 SGR_6504     FALSE 0.113 81.000 0.000 NA   NA
 5659147 5659148 SGR_6504 SGR_6505     FALSE 0.084 114.000 0.000 NA   NA
 5659149 5659150 SGR_6506 SGR_6507     FALSE 0.108 88.000 0.000 NA   NA
 5659152 5659153 SGR_6509 SGR_6510     FALSE 0.128 64.000 0.000 NA   NA
 5659153 5659154 SGR_6510 SGR_6511     TRUE 0.956 -6.000 0.167 0.012   NA
 5659154 5659155 SGR_6511 SGR_6512     TRUE 0.531 140.000 0.217 0.053   NA
 5659155 5659156 SGR_6512 SGR_6513     TRUE 0.750 99.000 0.833 NA   NA
 5659159 5659160 SGR_6516 SGR_6517     TRUE 0.974 -3.000 0.667 NA   NA
 5659160 5659161 SGR_6517 SGR_6518     TRUE 0.889 -3.000 0.034 1.000   NA
 5659161 5659162 SGR_6518 SGR_6519     FALSE 0.214 112.000 0.014 NA   NA
 5659164 5659165 SGR_6521 SGR_6522     FALSE 0.157 198.000 0.143 1.000   NA
 5659165 5659166 SGR_6522 SGR_6523     FALSE 0.137 201.000 0.000 0.034   NA
 5659166 5659167 SGR_6523 SGR_6524     TRUE 0.960 76.000 0.877 0.004 Y NA
 5659167 5659168 SGR_6524 SGR_6525     FALSE 0.212 161.000 0.041 1.000   NA
 5659169 5659170 SGR_6526 SGR_6527     FALSE 0.002 453.000 0.000 NA   NA
 5659173 5659174 SGR_6530 SGR_6531     FALSE 0.076 195.000 0.000 1.000 N NA
 5659175 5659176 SGR_6532 SGR_6533     FALSE 0.491 51.000 0.080 1.000   NA
 5659180 5659181 SGR_6537 SGR_6538     FALSE 0.198 33.000 0.000 NA   NA
 5659181 5659182 SGR_6538 SGR_6539     FALSE 0.128 64.000 0.000 NA   NA
 5659184 5659185 SGR_6541 SGR_6542     TRUE 0.749 11.000 0.089 NA   NA
 5659185 5659186 SGR_6542 SGR_6543     FALSE 0.013 273.000 0.000 1.000   NA
 5659186 5659187 SGR_6543 SGR_6544     FALSE 0.009 257.000 0.000 NA   NA
 5659189 5659190 SGR_6546 SGR_6547     FALSE 0.130 62.000 0.000 NA   NA
 5659190 5659191 SGR_6547 SGR_6548     FALSE 0.094 103.000 0.000 NA   NA
 5659191 5659192 SGR_6548 SGR_6549     FALSE 0.053 164.000 0.000 NA   NA
 5659192 5659193 SGR_6549 SGR_6550     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 5659195 5659196 SGR_6552 SGR_6553     FALSE 0.429 168.000 0.500 NA   NA
 5659196 5659197 SGR_6553 SGR_6554     FALSE 0.306 66.000 0.021 NA   NA
 5659197 5659198 SGR_6554 SGR_6555     FALSE 0.236 132.000 0.042 NA   NA
 5659198 5659199 SGR_6555 SGR_6556     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 5659199 5659200 SGR_6556 SGR_6557     FALSE 0.090 108.000 0.000 NA   NA
 5659200 5659201 SGR_6557 SGR_6558     TRUE 0.651 37.000 0.286 NA   NA
 5659201 5659202 SGR_6558 SGR_6559     FALSE 0.079 132.000 0.000 NA   NA
 5659203 5659204 SGR_6560 SGR_6561     TRUE 0.971 -58.000 0.062 1.000 Y NA
 5659204 5659205 SGR_6561 SGR_6562     FALSE 0.008 367.000 0.000 1.000 N NA
 5659205 5659206 SGR_6562 SGR_6563     TRUE 0.674 82.000 0.000 1.000 Y NA
 5659206 5659207 SGR_6563 SGR_6564     FALSE 0.113 145.000 0.000 1.000   NA
 5659209 5659210 SGR_6566 SGR_6567     FALSE 0.198 106.000 0.002 NA   NA
 5659210 5659211 SGR_6567 SGR_6568     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 5659211 5659212 SGR_6568 SGR_6569     FALSE 0.402 114.000 0.100 1.000 N NA
 5659214 5659215 SGR_6571 SGR_6572     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 5659215 5659216 SGR_6572 SGR_6573     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5659216 5659217 SGR_6573 SGR_6574     FALSE 0.283 20.000 0.000 NA   NA
 5659217 5659218 SGR_6574 SGR_6575     FALSE 0.112 82.000 0.000 NA   NA
 5659218 5659219 SGR_6575 SGR_6576     FALSE 0.065 149.000 0.000 NA   NA
 5659221 5659222 SGR_6578 SGR_6579     TRUE 0.978 -7.000 0.000 0.008 Y NA
 5659223 5659224 SGR_6580 SGR_6581     TRUE 0.944 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5659224 5659225 SGR_6581 SGR_6582     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5659225 5659226 SGR_6582 SGR_6583     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.032 Y NA
 5659228 5659229 SGR_6585 SGR_6586     TRUE 0.681 76.000 0.000 1.000 Y NA
 5659229 5659230 SGR_6586 SGR_6587     FALSE 0.008 317.000 0.000 1.000   NA
 5659233 5659234 SGR_6590 SGR_6591     FALSE 0.288 63.000 0.000 1.000 N NA
 5659236 5659237 SGR_6593 SGR_6594     FALSE 0.207 61.000 0.000 1.000   NA
 5659237 5659238 SGR_6594 SGR_6595   wblE2 FALSE 0.130 132.000 0.000 1.000   NA
 5659238 5659239 SGR_6595 SGR_6596 wblE2   FALSE 0.109 87.000 0.000 NA   NA
 5659241 5659242 SGR_6598 SGR_6599     FALSE 0.007 274.000 0.000 NA   NA
 5659243 5659244 SGR_6600 SGR_6601     FALSE 0.048 197.000 0.000 1.000   NA
 5659245 5659246 SGR_6602 SGR_6603     TRUE 0.876 94.000 0.600 NA Y NA
 5659246 5659247 SGR_6603 SGR_6604     TRUE 0.992 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 5659247 5659248 SGR_6604 SGR_6605     TRUE 0.989 -3.000 0.778 0.032   NA
 5659248 5659249 SGR_6605 SGR_6606     TRUE 0.548 99.000 0.333 1.000   NA
 5659249 5659250 SGR_6606 SGR_6607     TRUE 0.526 121.000 0.300 1.000 N NA
 5659250 5659251 SGR_6607 SGR_6608     FALSE 0.229 98.000 0.000 1.000 N NA
 5659253 5659254 SGR_6610 SGR_6611     FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 5659254 5659255 SGR_6611 SGR_6612     FALSE 0.036 216.000 0.000 NA N NA
 5659257 5659258 SGR_6614 SGR_6615     FALSE 0.067 201.000 0.000 1.000 N NA
 5659258 5659259 SGR_6615 SGR_6616     TRUE 0.994 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 5659259 5659260 SGR_6616 SGR_6617     TRUE 0.996 -3.000 0.800 0.032 Y NA
 5659260 5659261 SGR_6617 SGR_6618     TRUE 0.987 -3.000 0.325 1.000 Y NA
 5659261 5659262 SGR_6618 SGR_6619   p450-mel FALSE 0.162 148.000 0.000 1.000 N NA
 5659262 5659263 SGR_6619 SGR_6620 p450-mel rppA TRUE 0.886 35.000 0.200 1.000 Y NA
 5659263 5659264 SGR_6620 SGR_6621 rppA   FALSE 0.223 101.000 0.000 1.000 N NA
 5659264 5659265 SGR_6621 SGR_6622     FALSE 0.017 251.000 0.000 1.000   NA
 5659265 5659266 SGR_6622 SGR_6623     FALSE 0.381 126.000 0.167 1.000   NA
 5659266 5659267 SGR_6623 SGR_6624     FALSE 0.163 45.000 0.000 NA   NA
 5659267 5659268 SGR_6624 SGR_6625     FALSE 0.067 147.000 0.000 NA   NA
 5659274 5659275 SGR_6631 SGR_6632     FALSE 0.103 93.000 0.000 NA   NA
 5659275 5659276 SGR_6632 SGR_6633     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000   NA
 5659276 5659277 SGR_6633 SGR_6634     TRUE 0.698 -16.000 0.000 1.000   NA
 5659277 5659278 SGR_6634 SGR_6635   fabH3 FALSE 0.095 182.000 0.000 1.000 N NA
 5659278 5659279 SGR_6635 SGR_6636 fabH3   TRUE 0.956 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 5659279 5659280 SGR_6636 SGR_6637     TRUE 0.684 74.000 0.000 1.000 Y NA
 5659280 5659281 SGR_6637 SGR_6638     FALSE 0.148 107.000 0.000 1.000   NA
 5659281 5659282 SGR_6638 SGR_6639     TRUE 0.961 -3.000 0.400 1.000   NA
 5659282 5659283 SGR_6639 SGR_6640     FALSE 0.005 422.000 0.000 1.000 N NA
 5659283 5659284 SGR_6640 SGR_6641     TRUE 0.989 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 5659284 5659285 SGR_6641 SGR_6642     TRUE 0.989 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 5659288 5659289 SGR_6645 SGR_6646     FALSE 0.404 59.000 0.034 1.000   NA
 5659289 5659290 SGR_6646 SGR_6647     TRUE 0.982 -3.000 0.136 1.000 Y NA
 5659290 5659291 SGR_6647 SGR_6648     FALSE 0.012 240.000 0.000 NA   NA
 5659291 5659292 SGR_6648 SGR_6649     TRUE 0.957 -3.000 0.419 NA   NA
 5659292 5659293 SGR_6649 SGR_6650     TRUE 0.709 91.000 0.608 1.000   NA
 5659293 5659294 SGR_6650 SGR_6651     FALSE 0.053 190.000 0.000 1.000   NA
 5659294 5659295 SGR_6651 SGR_6652   crtS TRUE 0.665 143.000 0.000 0.066 Y NA
 5659296 5659297 SGR_6653 SGR_6654     FALSE 0.009 303.000 0.000 1.000   NA
 5659297 5659298 SGR_6654 SGR_6655     TRUE 0.593 123.000 0.000 1.000 Y NA
 5659298 5659299 SGR_6655 SGR_6656     TRUE 0.921 -3.000 0.056 1.000 N NA
 5659299 5659300 SGR_6656 SGR_6657     TRUE 0.569 89.000 0.056 0.034   NA
 5659300 5659301 SGR_6657 SGR_6658     FALSE 0.003 435.000 0.000 1.000   NA
 5659302 5659303 SGR_6659 SGR_6660     FALSE 0.198 67.000 0.000 1.000   NA
 5659303 5659304 SGR_6660 SGR_6661     TRUE 0.964 -3.000 0.442 1.000   NA
 5659304 5659305 SGR_6661 SGR_6662     TRUE 0.867 112.000 0.242 0.001 Y NA
 5659306 5659307 SGR_6663 SGR_6664     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659309 5659310 SGR_6666 SGR_6667     FALSE 0.001 1844.000 0.000 NA   NA
 5659311 5659312 SGR_6668 SGR_6669     FALSE 0.096 100.000 0.000 NA   NA
 5659313 5659314 SGR_6670 SGR_6671     TRUE 0.569 51.000 0.111 1.000 N NA
 5659314 5659315 SGR_6671 SGR_6672     FALSE 0.001 661.000 0.000 NA   NA
 5659315 5659316 SGR_6672 SGR_6673     FALSE 0.168 43.000 0.000 NA   NA
 5659316 5659317 SGR_6673 SGR_6674     FALSE 0.011 360.000 0.044 NA   NA
 5659317 5659318 SGR_6674 SGR_6675     FALSE 0.127 65.000 0.000 NA   NA
 5659318 5659319 SGR_6675 SGR_6676     FALSE 0.420 91.000 0.000 0.029   NA
 5659319 5659320 SGR_6676 SGR_6677     FALSE 0.159 47.000 0.000 NA   NA
 5659320 5659321 SGR_6677 SGR_6678     FALSE 0.002 477.000 0.000 NA   NA
 5659322 5659323 SGR_6679 SGR_6680     FALSE 0.509 4.000 0.000 NA   NA
 5659326 5659327 SGR_6683 SGR_6684     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5659328 5659329 SGR_6685 SGR_6686     FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 5659329 5659330 SGR_6686 SGR_6687     FALSE 0.411 68.000 0.118 NA   NA
 5659331 5659332 SGR_6688 SGR_6689     FALSE 0.046 171.000 0.000 NA   NA
 5659332 5659333 SGR_6689 SGR_6690     FALSE 0.392 21.000 0.000 1.000   NA
 5659333 5659334 SGR_6690 SGR_6691     FALSE 0.040 559.000 0.000 0.004 Y NA
 5659334 5659335 SGR_6691 SGR_6692     TRUE 0.984 -3.000 0.217 1.000 Y NA
 5659335 5659336 SGR_6692 SGR_6693     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659336 5659337 SGR_6693 SGR_6694     FALSE 0.111 85.000 0.000 NA   NA
 5659337 5659338 SGR_6694 SGR_6695     FALSE 0.117 74.000 0.000 NA   NA
 5659340 5659341 SGR_6697 SGR_6698     TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5659343 5659344 SGR_6700 SGR_6701     TRUE 0.947 -3.000 0.333 NA   NA
 5659345 5659346 SGR_6702 SGR_6703     TRUE 0.890 -3.000 0.083 NA   NA
 5659346 5659347 SGR_6703 SGR_6704     TRUE 0.898 -3.000 0.109 NA   NA
 5659347 5659348 SGR_6704 SGR_6705     FALSE 0.029 515.000 0.032 NA Y NA
 5659348 5659349 SGR_6705 SGR_6706     FALSE 0.108 88.000 0.000 NA   NA
 5659350 5659351 SGR_6707 SGR_6708     FALSE 0.081 127.000 0.000 NA   NA
 5659353 5659354 SGR_6710 SGR_6711     TRUE 0.585 104.000 0.400 NA N NA
 5659354 5659355 SGR_6711 SGR_6712     TRUE 0.996 -3.000 0.750 0.032 Y NA
 5659355 5659356 SGR_6712 SGR_6713     TRUE 0.944 38.000 0.667 1.000 Y NA
 5659356 5659357 SGR_6713 SGR_6714     TRUE 0.782 146.000 0.400 1.000 Y NA
 5659357 5659358 SGR_6714 SGR_6715     TRUE 0.630 50.000 0.200 1.000 N NA
 5659358 5659359 SGR_6715 SGR_6716     TRUE 0.547 60.000 0.133 1.000 N NA
 5659359 5659360 SGR_6716 SGR_6717     TRUE 0.873 6.000 0.133 1.000 N NA
 5659370 5659371 SGR_6727 SGR_6728     FALSE 0.235 218.000 0.000 1.000 Y NA
 5659372 5659373 SGR_6729 SGR_6730     FALSE 0.007 385.000 0.000 1.000 N NA
 5659373 5659374 SGR_6730 SGR_6731     TRUE 0.981 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 5659374 5659375 SGR_6731 SGR_6732     TRUE 0.948 30.000 0.581 1.000 Y NA
 5659375 5659376 SGR_6732 SGR_6733     TRUE 0.991 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 5659376 5659377 SGR_6733 SGR_6734     TRUE 0.807 86.000 0.210 1.000 Y NA
 5659378 5659379 SGR_6735 SGR_6736     TRUE 0.877 15.000 0.000 NA Y NA
 5659380 5659381 SGR_6737 SGR_6738     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659381 5659382 SGR_6738 SGR_6739     FALSE 0.465 6.000 0.000 NA   NA
 5659385 5659386 SGR_6742 SGR_6743     FALSE 0.216 57.000 0.000 1.000   NA
 5659387 5659388 SGR_6744 SGR_6745     TRUE 0.894 13.000 0.366 1.000 N NA
 5659388 5659389 SGR_6745 SGR_6746     TRUE 0.992 -3.000 0.220 0.001 Y NA
 5659390 5659391 SGR_6747 SGR_6748     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 5659392 5659393 SGR_6749 SGR_6750     TRUE 0.904 -3.000 0.130 NA   NA
 5659394 5659395 SGR_6751 SGR_6752     FALSE 0.208 31.000 0.000 NA   NA
 5659398 5659399 SGR_6755 SGR_6756     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 5659400 5659401 SGR_6757 SGR_6758     FALSE 0.131 61.000 0.000 NA   NA
 5659401 5659402 SGR_6758 SGR_6759     TRUE 0.989 -3.000 0.154 0.034 Y NA
 5659402 5659403 SGR_6759 SGR_6760     TRUE 0.801 152.000 0.154 0.001 Y NA
 5659403 5659404 SGR_6760 SGR_6761     FALSE 0.038 208.000 0.000 1.000   NA
 5659404 5659405 SGR_6761 SGR_6762     FALSE 0.095 159.000 0.000 1.000   NA
 5659405 5659406 SGR_6762 SGR_6763     FALSE 0.335 49.000 0.000 1.000 N NA
 5659406 5659407 SGR_6763 SGR_6764     FALSE 0.251 87.000 0.000 1.000 N NA
 5659409 5659410 SGR_6766 SGR_6767     FALSE 0.136 58.000 0.000 NA   NA
 5659410 5659411 SGR_6767 SGR_6768     FALSE 0.398 11.000 0.000 NA   NA
 5659412 5659413 SGR_6769 SGR_6770     FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 5659413 5659414 SGR_6770 SGR_6771     FALSE 0.177 39.000 0.000 NA   NA
 5659414 5659415 SGR_6771 SGR_6772     FALSE 0.003 375.000 0.000 NA   NA
 5659416 5659417 SGR_6773 SGR_6774     FALSE 0.080 130.000 0.000 NA   NA
 5659417 5659418 SGR_6774 SGR_6775     FALSE 0.220 103.000 0.000 1.000 N NA
 5659418 5659419 SGR_6775 SGR_6776   pks4-1 FALSE 0.003 967.000 0.000 1.000 N NA
 5659419 5659420 SGR_6776 SGR_6777 pks4-1 pks4-2 TRUE 0.912 24.000 0.000 0.007 Y NA
 5659420 5659421 SGR_6777 SGR_6778 pks4-2 pks4-3 TRUE 0.978 -7.000 0.000 0.005 Y NA
 5659421 5659422 SGR_6778 SGR_6779 pks4-3   TRUE 0.777 -3.000 0.000 NA N NA
 5659422 5659423 SGR_6779 SGR_6780     TRUE 0.954 0.000 0.000 NA Y NA
 5659425 5659426 SGR_6782 SGR_6783     TRUE 0.642 4.000 0.000 1.000   NA
 5659426 5659427 SGR_6783 SGR_6784     TRUE 0.728 17.000 0.105 1.000   NA
 5659427 5659428 SGR_6784 SGR_6785   pks4-4 TRUE 0.920 -3.000 0.053 1.000 N NA
 5659428 5659429 SGR_6785 SGR_6786 pks4-4   TRUE 0.833 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5659431 5659432 SGR_6788 SGR_6789     TRUE 0.667 87.000 0.000 1.000 Y NA
 5659432 5659433 SGR_6789 SGR_6790     FALSE 0.220 103.000 0.000 1.000 N NA
 5659433 5659434 SGR_6790 SGR_6791     FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 5659434 5659435 SGR_6791 SGR_6792     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 5659435 5659436 SGR_6792 SGR_6793     TRUE 0.796 47.000 0.667 NA   NA
 5659436 5659437 SGR_6793 SGR_6794     FALSE 0.150 199.000 0.055 1.000 N NA
 5659438 5659439 SGR_6795 SGR_6796     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659439 5659440 SGR_6796 SGR_6797     FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 5659441 5659442 SGR_6798 SGR_6799     TRUE 0.920 -3.000 0.130 1.000   NA
 5659442 5659443 SGR_6799 SGR_6800     FALSE 0.039 206.000 0.000 1.000   NA
 5659443 5659444 SGR_6800 SGR_6801     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5659444 5659445 SGR_6801 SGR_6802     FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 5659445 5659446 SGR_6802 SGR_6803     FALSE 0.011 329.000 0.000 1.000 N NA
 5659446 5659447 SGR_6803 SGR_6804     FALSE 0.066 148.000 0.000 NA   NA
 5659448 5659449 SGR_6805 SGR_6806     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659450 5659451 SGR_6807 SGR_6808     FALSE 0.123 68.000 0.000 NA   NA
 5659454 5659455 SGR_6811 SGR_6812     TRUE 0.993 -3.000 0.696 1.000 Y NA
 5659455 5659456 SGR_6812 SGR_6813     TRUE 0.994 -3.000 0.481 0.032 Y NA
 5659456 5659457 SGR_6813 SGR_6814     FALSE 0.207 111.000 0.000 1.000 N NA
 5659458 5659459 SGR_6815 SGR_6816     FALSE 0.134 59.000 0.000 NA   NA
 5659461 5659462 SGR_6818 SGR_6819     FALSE 0.208 265.000 0.000 0.005 Y NA
 5659462 5659463 SGR_6819 SGR_6820     TRUE 0.980 -3.000 0.727 1.000   NA
 5659463 5659464 SGR_6820 SGR_6821     TRUE 0.976 -3.000 0.692 NA   NA
 5659464 5659465 SGR_6821 SGR_6822     TRUE 0.559 50.000 0.154 NA N NA
 5659467 5659468 SGR_6824 SGR_6825 crtY crtT TRUE 0.930 -3.000 0.098 1.000 N NA
 5659468 5659469 SGR_6825 SGR_6826 crtT crtU TRUE 0.944 -3.000 0.265 1.000   NA
 5659470 5659471 SGR_6827 SGR_6828 crtV crtB TRUE 0.889 -3.000 0.027 NA N NA
 5659471 5659472 SGR_6828 SGR_6829 crtB crtI TRUE 0.960 -3.000 0.332 1.000 N NA
 5659472 5659473 SGR_6829 SGR_6830 crtI crtE TRUE 0.936 -3.000 0.138 1.000 N NA
 5659473 5659474 SGR_6830 SGR_6831 crtE   FALSE 0.003 923.000 0.000 1.000 N NA
 5659475 5659476 SGR_6832 SGR_6833     FALSE 0.432 62.000 0.129 NA   NA
 5659476 5659477 SGR_6833 SGR_6834     TRUE 0.976 1.000 0.880 NA   NA
 5659477 5659478 SGR_6834 SGR_6835     TRUE 0.993 -7.000 0.880 NA Y NA
 5659478 5659479 SGR_6835 SGR_6836     FALSE 0.115 77.000 0.000 NA   NA
 5659479 5659480 SGR_6836 SGR_6837     FALSE 0.052 165.000 0.000 NA   NA
 5659480 5659481 SGR_6837 SGR_6838     TRUE 0.949 8.000 0.750 NA   NA
 5659482 5659483 SGR_6839 SGR_6840 geoA   FALSE 0.039 178.000 0.000 NA   NA
 5659483 5659484 SGR_6840 SGR_6841     FALSE 0.001 589.000 0.000 NA   NA
 5659486 5659487 SGR_6843 SGR_6844     FALSE 0.024 257.000 0.000 1.000 N NA
 5659488 5659489 SGR_6845 SGR_6846     TRUE 0.856 61.000 0.009 0.007 Y NA
 5659490 5659491 SGR_6847 SGR_6848     FALSE 0.043 175.000 0.000 NA   NA
 5659492 5659493 SGR_6849 SGR_6850     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5659495 5659496 SGR_6852 SGR_6853     TRUE 0.577 68.000 0.333 NA   NA
 5659496 5659497 SGR_6853 SGR_6854     FALSE 0.078 133.000 0.000 NA   NA
 5659497 5659498 SGR_6854 SGR_6855     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 5659498 5659499 SGR_6855 SGR_6856     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 5659499 5659500 SGR_6856 SGR_6857     TRUE 0.871 7.000 0.286 NA   NA
 5659500 5659501 SGR_6857 SGR_6858     FALSE 0.061 155.000 0.000 NA   NA
 5659501 5659502 SGR_6858 SGR_6859     FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 5659502 5659503 SGR_6859 SGR_6860     FALSE 0.082 123.000 0.000 NA   NA
 5659503 5659504 SGR_6860 SGR_6861     FALSE 0.208 31.000 0.000 NA   NA
 5659505 5659506 SGR_6862 SGR_6863   ptsH2 FALSE 0.259 43.000 0.000 1.000   NA
 5659506 5659507 SGR_6863 SGR_6864 ptsH2 fruA TRUE 0.894 51.000 0.036 0.001 Y NA
 5659507 5659508 SGR_6864 SGR_6865 fruA fruB TRUE 0.666 149.000 0.112 1.000 Y NA
 5659508 5659509 SGR_6865 SGR_6866 fruB   TRUE 0.980 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 5659509 5659510 SGR_6866 SGR_6867     FALSE 0.022 208.000 0.000 NA   NA
 5659512 5659513 SGR_6869 SGR_6870     FALSE 0.196 121.000 0.000 1.000 N NA
 5659513 5659514 SGR_6870 SGR_6871     FALSE 0.189 133.000 0.000 1.000 N NA
 5659515 5659516 SGR_6872 SGR_6873     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659516 5659517 SGR_6873 SGR_6874     FALSE 0.092 105.000 0.000 NA   NA
 5659517 5659518 SGR_6874 SGR_6875     FALSE 0.044 173.000 0.000 NA   NA
 5659518 5659519 SGR_6875 SGR_6876     FALSE 0.001 760.000 0.000 NA   NA
 5659519 5659520 SGR_6876 SGR_6877     TRUE 0.993 8.000 1.000 0.032 Y NA
 5659520 5659521 SGR_6877 SGR_6878     TRUE 0.984 18.000 0.750 0.032 Y NA
 5659521 5659522 SGR_6878 SGR_6879     TRUE 0.722 165.000 0.375 1.000 Y NA
 5659522 5659523 SGR_6879 SGR_6880     FALSE 0.012 279.000 0.000 1.000   NA
 5659526 5659527 SGR_6883 SGR_6884     FALSE 0.141 55.000 0.000 NA   NA
 5659527 5659528 SGR_6884 SGR_6885     TRUE 0.981 0.000 0.222 1.000 Y NA
 5659528 5659529 SGR_6885 SGR_6886     FALSE 0.178 84.000 0.000 1.000   NA
 5659529 5659530 SGR_6886 SGR_6887     FALSE 0.146 108.000 0.000 1.000   NA
 5659531 5659532 SGR_6888 SGR_6889   afsA FALSE 0.002 409.000 0.000 NA   NA
 5659532 5659533 SGR_6889 SGR_6890 afsA   TRUE 0.922 13.000 0.667 NA   NA
 5659537 5659538 SGR_6894 SGR_6895     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 5659538 5659539 SGR_6895 SGR_6896     FALSE 0.125 67.000 0.000 NA   NA
 5659540 5659541 SGR_6897 SGR_6898     FALSE 0.106 90.000 0.000 NA   NA
 5659541 5659542 SGR_6898 SGR_6899     FALSE 0.138 114.000 0.000 1.000   NA
 5659542 5659543 SGR_6899 SGR_6900     TRUE 0.912 16.000 0.625 NA N NA
 5659543 5659544 SGR_6900 SGR_6901     TRUE 0.982 -3.000 0.200 NA Y NA
 5659544 5659545 SGR_6901 SGR_6902     TRUE 0.687 2.000 0.000 1.000   NA
 5659545 5659546 SGR_6902 SGR_6903     FALSE 0.157 48.000 0.000 NA   NA
 5659546 5659547 SGR_6903 SGR_6904     TRUE 0.844 44.000 0.828 NA   NA
 5659547 5659548 SGR_6904 SGR_6905     TRUE 0.588 77.000 0.379 NA   NA
 5659548 5659549 SGR_6905 SGR_6906     TRUE 0.793 77.000 0.562 0.081   NA
 5659549 5659550 SGR_6906 SGR_6907     FALSE 0.093 104.000 0.000 NA   NA
 5659550 5659551 SGR_6907 SGR_6908     FALSE 0.001 594.000 0.000 NA   NA
 5659551 5659552 SGR_6908 SGR_6909     TRUE 0.990 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 5659562 5659563 SGR_6919 SGR_6920     FALSE 0.522 91.000 0.270 1.000   NA
 5659564 5659565 SGR_6921 SGR_6922     FALSE 0.057 159.000 0.000 NA   NA
 5659572 5659573 SGR_6929 SGR_6930     FALSE 0.075 136.000 0.000 NA   NA
 5659573 5659574 SGR_6930 SGR_6931     TRUE 0.699 70.000 0.571 NA   NA
 5659574 5659575 SGR_6931 SGR_6932     FALSE 0.004 493.000 0.000 1.000 N NA
 5659575 5659576 SGR_6932 SGR_6933     TRUE 0.952 8.000 0.800 NA   NA
 5659576 5659577 SGR_6933 SGR_6934     FALSE 0.078 134.000 0.000 NA   NA
 5659578 5659579 SGR_6935 SGR_6936     FALSE 0.208 31.000 0.000 NA   NA
 5659583 5659584 SGR_6940 SGR_6941     FALSE 0.094 103.000 0.000 NA   NA
 5659585 5659586 SGR_6942 SGR_6943     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 5659586 5659587 SGR_6943 SGR_6944     FALSE 0.024 204.000 0.000 NA   NA
 5659588 5659589 SGR_6945 SGR_6946     TRUE 0.994 1.000 0.611 0.019 Y NA
 5659589 5659590 SGR_6946 SGR_6947     FALSE 0.009 351.000 0.000 1.000 N NA
 5659591 5659592 SGR_6948 SGR_6949     FALSE 0.252 86.000 0.000 1.000 N NA
 5659597 5659598 SGR_6954 SGR_6955     FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 5659599 5659600 SGR_6956 SGR_6957     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 5659602 5659603 SGR_6959 SGR_6960     TRUE 0.903 7.000 0.400 NA   NA
 5659603 5659604 SGR_6960 SGR_6961     TRUE 0.947 -3.000 0.333 NA   NA
 5659604 5659605 SGR_6961 SGR_6962     FALSE 0.002 1460.000 0.000 1.000   NA
 5659607 5659608 SGR_6964 SGR_6965     FALSE 0.077 135.000 0.000 NA   NA
 5659609 5659610 SGR_6966 SGR_6967     FALSE 0.001 761.000 0.000 NA   NA
 5659611 5659612 SGR_6968 SGR_6969     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5659613 5659614 SGR_6970 SGR_6971     TRUE 0.906 -129.000 0.000 0.003   NA
 5659614 5659615 SGR_6971 SGR_6972     FALSE 0.097 99.000 0.000 NA   NA
 5659617 5659618 SGR_6974 SGR_6975     FALSE 0.183 37.000 0.000 NA   NA
 5659619 5659620 SGR_6976 SGR_6977     FALSE 0.022 209.000 0.000 NA   NA
 5659620 5659621 SGR_6977 SGR_6978     TRUE 0.968 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5659621 5659622 SGR_6978 SGR_6979     FALSE 0.090 108.000 0.000 NA   NA
 5659622 5659623 SGR_6979 SGR_6980     FALSE 0.085 113.000 0.000 NA   NA
 5659623 5659624 SGR_6980 SGR_6981     FALSE 0.238 93.000 0.000 1.000 N NA
 5659624 5659625 SGR_6981 SGR_6982     FALSE 0.003 448.000 0.000 1.000   NA
 5659626 5659627 SGR_6983 SGR_6984     FALSE 0.122 238.000 0.375 NA   NA
 5659627 5659628 SGR_6984 SGR_6985     FALSE 0.381 12.000 0.000 NA   NA
 5659629 5659630 SGR_6986 SGR_6987     FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 5659632 5659633 SGR_6989 SGR_6990     FALSE 0.170 42.000 0.000 NA   NA
 5659634 5659635 SGR_6991 SGR_6992     FALSE 0.157 48.000 0.000 NA   NA
 5659636 5659637 SGR_6993 SGR_6994     TRUE 0.964 -3.000 0.500 NA   NA
 5659638 5659639 SGR_6995 SGR_6996     FALSE 0.084 115.000 0.000 NA   NA
 5659639 5659640 SGR_6996 SGR_6997     FALSE 0.119 71.000 0.000 NA   NA
 5659640 5659641 SGR_6997 SGR_6998     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.019 Y NA
 5659641 5659642 SGR_6998 SGR_6999     FALSE 0.043 225.000 0.000 1.000 N NA
 5659642 5659643 SGR_6999 SGR_7000     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 5659643 5659644 SGR_7000 SGR_7001     FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 5659645 5659646 SGR_7002 SGR_7003     FALSE 0.033 187.000 0.000 NA   NA
 5659649 5659650 SGR_7006 SGR_7007     FALSE 0.136 58.000 0.000 NA   NA
 5659650 5659651 SGR_7007 SGR_7008     FALSE 0.002 396.000 0.000 NA   NA
 5659653 5659654 SGR_7010 SGR_7011     FALSE 0.047 170.000 0.000 NA   NA
 5659654 5659655 SGR_7011 SGR_7012     FALSE 0.067 147.000 0.000 NA   NA
 5659655 5659656 SGR_7012 SGR_7013t     FALSE 0.008 323.000 0.000 1.000   NA
 5659656 5659657 SGR_7013t SGR_7014t     FALSE 0.020 213.000 0.000 NA   NA
 5659657 5659658 SGR_7014t SGR_7015t     TRUE 0.858 48.000 1.000 NA   NA
 5659658 5659659 SGR_7015t SGR_7016t     TRUE 0.870 25.000 0.667 NA   NA
 5659659 5659660 SGR_7016t SGR_7017t     FALSE 0.067 147.000 0.000 NA   NA
 5659660 5659661 SGR_7017t SGR_7018t     FALSE 0.101 95.000 0.000 NA   NA
 5659661 5659662 SGR_7018t SGR_7019t     FALSE 0.001 527.000 0.000 NA   NA
 5659663 5659664 SGR_7020t SGR_7021t     FALSE 0.001 660.000 0.000 NA   NA
 5659665 5659666 SGR_7022t SGR_7023t     FALSE 0.024 205.000 0.000 NA   NA
 5659666 5659667 SGR_7023t SGR_7024t     TRUE 0.933 -3.000 0.256 NA   NA
 5659667 5659668 SGR_7024t SGR_7025t     TRUE 0.668 32.000 0.273 NA   NA
 5659669 5659670 SGR_7026t SGR_7027t     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 5659670 5659671 SGR_7027t SGR_7028t     FALSE 0.283 20.000 0.000 NA   NA
 5659671 5659672 SGR_7028t SGR_7029t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659674 5659675 SGR_7031t SGR_7032t     FALSE 0.015 228.000 0.000 NA   NA
 5659675 5659676 SGR_7032t SGR_7033t     TRUE 0.593 -6.000 0.000 NA   NA
 5659676 5659677 SGR_7033t SGR_7034t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659677 5659678 SGR_7034t SGR_7035t     FALSE 0.018 218.000 0.000 NA   NA
 5659678 5659679 SGR_7035t SGR_7036t     TRUE 0.712 117.000 0.750 1.000   NA
 5659679 5659680 SGR_7036t SGR_7037t     TRUE 0.903 9.000 0.444 NA   NA
 5659680 5659681 SGR_7037t SGR_7038t     FALSE 0.111 85.000 0.000 NA   NA
 5659681 5659682 SGR_7038t SGR_7039t     FALSE 0.068 146.000 0.000 NA   NA
 5659682 5659683 SGR_7039t SGR_7040t     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 5659684 5659685 SGR_7041t SGR_7042t     TRUE 0.924 0.000 0.286 NA   NA
 5659685 5659686 SGR_7042t SGR_7043t     FALSE 0.004 330.000 0.000 NA   NA
 5659688 5659689 SGR_7045t SGR_7046t     FALSE 0.461 93.000 0.250 NA   NA
 5659695 5659696 SGR_7052t SGR_7053t     TRUE 0.963 -3.000 0.000 NA Y NA
 5659696 5659697 SGR_7053t SGR_7054t     FALSE 0.099 97.000 0.000 NA   NA
 5659697 5659698 SGR_7054t SGR_7055t     FALSE 0.032 188.000 0.000 NA   NA
 5659698 5659699 SGR_7055t SGR_7056t     FALSE 0.118 73.000 0.000 NA   NA
 5659699 5659700 SGR_7056t SGR_7057t     FALSE 0.028 198.000 0.000 NA   NA
 5659701 5659702 SGR_7058t SGR_7059t     FALSE 0.001 832.000 0.000 NA   NA
 5659702 5659703 SGR_7059t SGR_7060t     TRUE 0.914 -3.000 0.000 0.039   NA
 5659704 5659705 SGR_7061t SGR_7062t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659707 5659708 SGR_7064t SGR_7065t     FALSE 0.170 42.000 0.000 NA   NA
 5659709 5659710 SGR_7066t SGR_7067t     FALSE 0.082 122.000 0.000 NA   NA
 5659711 5659712 SGR_7068t SGR_7069t     FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 5659712 5659713 SGR_7069t SGR_7070t     FALSE 0.013 238.000 0.000 NA   NA
 5659713 5659714 SGR_7070t SGR_7071t     FALSE 0.003 462.000 0.000 1.000   NA
 5659714 5659715 SGR_7071t SGR_7072t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659719 5659720 SGR_7076t SGR_7077t     FALSE 0.083 117.000 0.000 NA   NA
 5659722 5659723 SGR_7079t SGR_7080t crtE3 crtI3 TRUE 0.936 -3.000 0.138 1.000 N NA
 5659723 5659724 SGR_7080t SGR_7081t crtI3 crtB3 TRUE 0.960 -3.000 0.332 1.000 N NA
 5659724 5659725 SGR_7081t SGR_7082t crtB3 crtV3 TRUE 0.889 -3.000 0.027 NA N NA
 5659726 5659727 SGR_7083t SGR_7084t crtU3 crtT3 TRUE 0.944 -3.000 0.265 1.000   NA
 5659727 5659728 SGR_7084t SGR_7085t crtT3 crtY3 TRUE 0.981 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 5659729 5659730 SGR_7086t SGR_7087t     FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 5659734 5659735 SGR_7091t SGR_7092t     TRUE 0.605 37.000 0.222 NA   NA
 5659735 5659736 SGR_7092t SGR_7093t     FALSE 0.172 41.000 0.000 NA   NA
 5659740 5659741 SGR_7097t SGR_7098t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659741 5659742 SGR_7098t SGR_7099t     FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 5659742 5659743 SGR_7099t SGR_7100t     FALSE 0.098 98.000 0.000 NA   NA
 5659743 5659744 SGR_7100t SGR_7101t     FALSE 0.122 69.000 0.000 NA   NA
 5659744 5659745 SGR_7101t SGR_7102t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659747 5659748 SGR_7104t SGR_7105t     FALSE 0.139 56.000 0.000 NA   NA
 5659748 5659749 SGR_7105t SGR_7106t     FALSE 0.414 10.000 0.000 NA   NA
 5659749 5659750 SGR_7106t SGR_7107t     FALSE 0.032 189.000 0.000 NA   NA
 5659751 5659752 SGR_7108t SGR_7109t     TRUE 0.564 -232.000 0.000 NA   NA
 5659752 5659753 SGR_7109t SGR_7110t     FALSE 0.005 305.000 0.000 NA   NA
 5659753 5659754 SGR_7110t SGR_7111t     FALSE 0.090 108.000 0.000 NA   NA
 5659755 5659756 SGR_7112t SGR_7113t     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.032 Y NA
 5659756 5659757 SGR_7113t SGR_7114t     FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 5659759 5659760 SGR_7116t SGR_7117t     FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 5659760 5659761 SGR_7117t SGR_7118t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659762 5659763 SGR_7119t SGR_7120t     TRUE 0.647 -3.000 0.000 NA   NA
 5659763 5659764 SGR_7120t SGR_7121t     FALSE 0.073 139.000 0.000 NA   NA
 5659765 5659766 SGR_7122t SGR_7123t     FALSE 0.078 134.000 0.000 NA   NA
 5659766 5659767 SGR_7123t SGR_7124t     FALSE 0.112 83.000 0.000 NA   NA
 5659768 5659769 SGR_7125t SGR_7126t     FALSE 0.230 27.000 0.000 NA   NA
 5659769 5659770 SGR_7126t SGR_7127t     FALSE 0.001 499.000 0.000 NA   NA
 5659771 5659772 SGR_7128t SGR_7129t     FALSE 0.224 28.000 0.000 NA   NA
 5659772 5659773 SGR_7129t SGR_7130t     FALSE 0.001 507.000 0.000 NA   NA
 5659773 5659774 SGR_7130t SGR_7131t     FALSE 0.423 152.000 0.375 NA   NA
 5659774 5659775 SGR_7131t SGR_7132t     FALSE 0.113 80.000 0.000 NA   NA
 5659775 5659776 SGR_7132t SGR_7133t     FALSE 0.001 1057.000 0.000 NA   NA
 5659776 5659777 SGR_7133t SGR_7134t     TRUE 0.533 3.000 0.000 NA   NA
 5659777 5659778 SGR_7134t SGR_7135t     TRUE 0.926 -3.000 0.222 NA   NA
 5659778 5659779 SGR_7135t SGR_7136t     FALSE 0.108 88.000 0.000 NA   NA
 5659780 5659781 SGR_7137t SGR_7138t     FALSE 0.001 610.000 0.000 NA   NA