MicrobesOnline Operon Predictions for Microcystis aeruginosa NIES-843

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3767116 3767117 MAE_00020 MAE_00030     FALSE 0.207 102.000 0.000 NA   NA
 3767119 3767120 MAE_00050 MAE_00060     TRUE 0.570 20.000 0.000 NA   NA
 3767120 3767121 MAE_00060 MAE_00070     FALSE 0.211 87.000 0.000 NA   NA
 3767121 3767122 MAE_00070 MAE_00080   purE TRUE 0.773 43.000 0.003 1.000 N NA
 3767122 3767123 MAE_00080 MAE_00090 purE   TRUE 0.470 25.000 0.000 NA   NA
 3767124 3767125 MAE_00100 MAE_00110     TRUE 0.639 16.000 0.000 NA   NA
 3767125 3767126 MAE_00110 MAE_00120     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3767126 3767127 MAE_00120 MAE_00130     FALSE 0.157 155.000 0.000 NA   NA
 3767127 3767128 MAE_00130 MAE_00140     TRUE 0.998 -16.000 0.080 NA   NA
 3767129 3767130 MAE_00150 MAE_00160 lspA bioY TRUE 0.984 12.000 0.554 NA   NA
 3767130 3767131 MAE_00160 MAE_00170 bioY bioB TRUE 0.998 -28.000 0.016 NA   NA
 3767132 3767133 MAE_00180 MAE_00190 rfbC rfbD TRUE 0.992 6.000 0.131 1.000 Y NA
 3767133 3767134 MAE_00190 MAE_00200 rfbD rfbA TRUE 0.993 5.000 0.164 1.000 Y NA
 3767134 3767135 MAE_00200 MAE_00210 rfbA leuB FALSE 0.082 271.000 0.000 1.000 N NA
 3767135 3767136 MAE_00210 MAE_00220 leuB   TRUE 0.779 81.000 0.037 NA   NA
 3767136 3767137 MAE_00220 MAE_00230   uvrC FALSE 0.083 281.000 0.000 NA   NA
 3767139 3767140 MAE_00250 MAE_00260     FALSE 0.096 247.000 0.000 NA   NA
 3767140 3767141 MAE_00260 MAE_00270     FALSE 0.158 154.000 0.000 NA   NA
 3767141 3767142 MAE_00270 MAE_00280   ptpA TRUE 0.246 48.000 0.000 NA   NA
 3767144 3767145 MAE_00300 MAE_00310 natC natA TRUE 0.780 282.000 0.361 1.000 Y NA
 3767147 3767148 MAE_00330 MAE_00340     FALSE 0.171 139.000 0.000 NA   NA
 3767148 3767149 MAE_00340 MAE_00350     FALSE 0.100 236.000 0.000 NA   NA
 3767149 3767150 MAE_00350 MAE_00360     TRUE 0.604 18.000 0.000 NA   NA
 3767150 3767151 MAE_00360 MAE_00370     FALSE 0.213 84.000 0.000 NA   NA
 3767151 3767152 MAE_00370 MAE_00380     FALSE 0.155 157.000 0.000 NA   NA
 3767153 3767154 MAE_00390 MAE_00400     TRUE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 3767154 3767155 MAE_00400 MAE_00410     FALSE 0.161 150.000 0.000 NA   NA
 3767156 3767157 MAE_00420 MAE_00430     FALSE 0.108 216.000 0.000 NA   NA
 3767157 3767158 MAE_00430 MAE_00440     FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3767158 3767159 MAE_00440 MAE_00450     TRUE 0.996 0.000 0.667 NA   NA
 3767160 3767161 MAE_00460 MAE_00470     TRUE 0.639 16.000 0.000 NA   NA
 3767162 3767163 MAE_00480 MAE_00490     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA   NA
 3767163 3767164 MAE_00490 MAE_00500     TRUE 0.337 34.000 0.000 NA   NA
 3767164 3767165 MAE_00500 MAE_00510     FALSE 0.215 80.000 0.000 NA   NA
 3767165 3767166 MAE_00510 MAE_00520     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3767166 3767167 MAE_00520 MAE_00530     TRUE 0.268 43.000 0.000 NA   NA
 3767167 3767168 MAE_00530 MAE_00540     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3767168 3767169 MAE_00540 MAE_00550     TRUE 0.358 32.000 0.000 NA   NA
 3767170 3767171 MAE_00560 MAE_00570     FALSE 0.091 287.000 0.000 0.077   NA
 3767172 3767173 MAE_00580 MAE_00590     FALSE 0.047 435.000 0.000 NA   NA
 3767173 3767174 MAE_00590 MAE_00600     TRUE 0.470 25.000 0.000 NA   NA
 3767174 3767175 MAE_00600 MAE_00610     FALSE 0.092 259.000 0.000 NA   NA
 3767175 3767176 MAE_00610 MAE_00620     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3767176 3767177 MAE_00620 MAE_00630     FALSE 0.112 210.000 0.000 NA   NA
 3767177 3767178 MAE_00630 MAE_00640     TRUE 0.345 33.000 0.000 NA   NA
 3767178 3767179 MAE_00640 MAE_00650     TRUE 0.843 129.000 0.600 NA   NA
 3767179 3767180 MAE_00650 MAE_00660     FALSE 0.185 124.000 0.000 NA   NA
 3767180 3767181 MAE_00660 MAE_00670     FALSE 0.166 145.000 0.000 NA   NA
 3767183 3767184 MAE_00690 MAE_00700     FALSE 0.197 135.000 0.000 0.005   NA
 3767184 3767185 MAE_00700 MAE_00710     FALSE 0.085 291.000 0.000 1.000   NA
 3767185 3767186 MAE_00710 MAE_00720     TRUE 0.914 0.000 0.000 NA   NA
 3767186 3767187 MAE_00720 MAE_00730     FALSE 0.227 60.000 0.000 NA   NA
 3767187 3767188 MAE_00730 MAE_00740     FALSE 0.064 347.000 0.000 NA   NA
 3767188 3767189 MAE_00740 MAE_00750     TRUE 0.326 195.000 0.000 NA Y NA
 3767190 3767191 MAE_00760 MAE_00770     FALSE 0.041 494.000 0.000 NA   NA
 3767192 3767193 MAE_00780 MAE_00790     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3767195 3767196 MAE_00810 MAE_00820 engA   TRUE 0.986 4.000 0.029 1.000   NA
 3767196 3767197 MAE_00820 MAE_00830     FALSE 0.041 491.000 0.000 NA   NA
 3767197 3767198 MAE_00830 MAE_00840     FALSE 0.225 65.000 0.000 NA   NA
 3767199 3767200 MAE_00850 MAE_00860     FALSE 0.225 65.000 0.000 NA   NA
 3767201 3767202 MAE_00870 MAE_00880     FALSE 0.029 840.000 0.000 NA   NA
 3767202 3767203 MAE_00880 MAE_00890   recQ FALSE 0.193 116.000 0.000 NA   NA
 3767205 3767206 MAE_00910 MAE_00920   atpB FALSE 0.090 264.000 0.000 NA   NA
 3767206 3767207 MAE_00920 MAE_00930 atpB atpE TRUE 0.930 76.000 0.837 0.003 Y NA
 3767209 3767210 MAE_00950 MAE_00960 mutT   FALSE 0.051 402.000 0.000 NA   NA
 3767210 3767211 MAE_00960 MAE_00970     TRUE 0.805 46.000 0.027 NA   NA
 3767214 3767215 MAE_01000 MAE_01010     FALSE 0.035 579.000 0.000 NA   NA
 3767215 3767216 MAE_01010 MAE_01020     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3767216 3767217 MAE_01020 MAE_01030     FALSE 0.174 136.000 0.000 NA   NA
 3767217 3767218 MAE_01030 MAE_01040     FALSE 0.230 54.000 0.000 NA   NA
 3767218 3767219 MAE_01040 MAE_01050     FALSE 0.157 155.000 0.000 NA   NA
 3767219 3767220 MAE_01050 MAE_01060     TRUE 0.998 -3.000 0.800 NA   NA
 3767220 3767221 MAE_01060 MAE_01070     FALSE 0.082 284.000 0.000 NA   NA
 3767222 3767223 MAE_01080 MAE_01090 hoxE hoxF TRUE 0.970 29.000 0.667 0.006 Y NA
 3767224 3767225 MAE_01100 MAE_01110     TRUE 0.748 161.000 0.130 NA   NA
 3767226 3767227 MAE_01120 MAE_01130     FALSE 0.161 149.000 0.000 NA   NA
 3767227 3767228 MAE_01130 MAE_01140     FALSE 0.216 74.000 0.000 NA   NA
 3767228 3767229 MAE_01140 MAE_01150     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3767229 3767230 MAE_01150 MAE_01160     FALSE 0.094 253.000 0.000 NA   NA
 3767230 3767231 MAE_01160 MAE_01170     FALSE 0.168 142.000 0.000 NA   NA
 3767231 3767232 MAE_01170 MAE_01180     TRUE 0.988 5.000 0.176 NA   NA
 3767232 3767233 MAE_01180 MAE_01190     TRUE 0.239 50.000 0.000 NA   NA
 3767234 3767235 MAE_01200 MAE_01210     FALSE 0.087 272.000 0.000 NA   NA
 3767235 3767236 MAE_01210 MAE_01220     FALSE 0.126 190.000 0.000 NA   NA
 3767240 3767241 MAE_01260 MAE_01270     TRUE 0.256 49.000 0.000 1.000   NA
 3767242 3767243 MAE_01280 MAE_01290     TRUE 0.999 -22.000 0.400 NA   NA
 3767243 3767244 MAE_01290 MAE_01300   ppk FALSE 0.059 364.000 0.000 NA   NA
 3767245 3767246 MAE_01310 MAE_01320     FALSE 0.065 339.000 0.000 NA   NA
 3767246 3767247 MAE_01320 MAE_01330     FALSE 0.098 244.000 0.000 NA   NA
 3767249 3767250 MAE_01350 MAE_01360     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3767250 3767251 MAE_01360 MAE_01370     FALSE 0.214 82.000 0.000 NA   NA
 3767251 3767252 MAE_01370 MAE_01380     TRUE 0.792 7.000 0.000 NA   NA
 3767253 3767254 MAE_01390 MAE_01400     FALSE 0.204 107.000 0.000 NA   NA
 3767254 3767255 MAE_01400 MAE_01410     FALSE 0.183 126.000 0.000 NA   NA
 3767255 3767256 MAE_01410 MAE_01420     FALSE 0.192 117.000 0.000 NA   NA
 3767256 3767257 MAE_01420 MAE_01430     FALSE 0.098 242.000 0.000 NA   NA
 3767257 3767258 MAE_01430 MAE_01440     FALSE 0.115 205.000 0.000 NA   NA
 3767258 3767259 MAE_01440 MAE_01450     FALSE 0.179 129.000 0.000 NA   NA
 3767259 3767260 MAE_01450 MAE_01460     FALSE 0.157 155.000 0.000 NA   NA
 3767262 3767263 MAE_01480 MAE_01490     FALSE 0.095 250.000 0.000 NA   NA
 3767263 3767264 MAE_01490 MAE_01500     FALSE 0.208 96.000 0.000 NA   NA
 3767264 3767265 MAE_01500 MAE_01510     FALSE 0.120 198.000 0.000 NA   NA
 3767265 3767266 MAE_01510 MAE_01520     TRUE 0.268 43.000 0.000 NA   NA
 3767269 3767270 MAE_01550 MAE_01560     FALSE 0.044 463.000 0.000 NA   NA
 3767271 3767272 MAE_01570 MAE_01580     FALSE 0.216 77.000 0.000 NA   NA
 3767272 3767273 MAE_01580 MAE_01590     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3767274 3767275 MAE_01600 MAE_01610     FALSE 0.030 766.000 0.000 NA   NA
 3767275 3767276 MAE_01610 MAE_01620     FALSE 0.033 616.000 0.000 NA   NA
 3767277 3767278 MAE_01630 MAE_01640     FALSE 0.043 472.000 0.000 NA   NA
 3767278 3767279 MAE_01640 MAE_01650     FALSE 0.215 81.000 0.000 NA   NA
 3767282 3767283 MAE_01680 MAE_01690     TRUE 0.999 -28.000 0.222 NA   NA
 3767283 3767284 MAE_01690 MAE_01700     FALSE 0.141 173.000 0.000 NA   NA
 3767285 3767286 MAE_01710 MAE_01720     FALSE 0.166 145.000 0.000 NA   NA
 3767287 3767288 MAE_01730 MAE_01740   hisS TRUE 0.811 42.000 0.018 NA   NA
 3767288 3767289 MAE_01740 MAE_01750 hisS   TRUE 0.529 21.000 0.000 1.000 N NA
 3767290 3767291 MAE_01760 MAE_01770     FALSE 0.148 166.000 0.000 NA   NA
 3767291 3767292 MAE_01770 MAE_01780     FALSE 0.173 137.000 0.000 NA   NA
 3767292 3767293 MAE_01780 MAE_01790     FALSE 0.209 93.000 0.000 NA   NA
 3767293 3767294 MAE_01790 MAE_01800     FALSE 0.190 118.000 0.000 NA   NA
 3767294 3767295 MAE_01800 MAE_01810     FALSE 0.073 311.000 0.000 NA   NA
 3767297 3767298 MAE_01830 MAE_01840 ntcA   TRUE 0.989 8.000 0.612 NA   NA
 3767299 3767300 MAE_01850 MAE_01860     FALSE 0.215 81.000 0.000 NA   NA
 3767300 3767301 MAE_01860 MAE_01870     TRUE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 3767301 3767302 MAE_01870 MAE_01880     FALSE 0.086 287.000 0.000 1.000   NA
 3767302 3767303 MAE_01880 MAE_01890     FALSE 0.107 207.000 0.000 1.000 N NA
 3767303 3767304 MAE_01890 MAE_01900   ccsA FALSE 0.082 270.000 0.000 1.000 N NA
 3767306 3767307 MAE_01920 MAE_01930     TRUE 0.972 -16.000 0.000 NA   NA
 3767308 3767309 MAE_01940 MAE_01950     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3767312 3767313 MAE_01980 MAE_01990     TRUE 0.374 31.000 0.000 NA   NA
 3767313 3767314 MAE_01990 MAE_02000     TRUE 0.848 47.000 0.138 NA   NA
 3767314 3767315 MAE_02000 MAE_02010     TRUE 0.945 25.000 0.241 NA   NA
 3767315 3767316 MAE_02010 MAE_02020     FALSE 0.078 299.000 0.000 NA   NA
 3767318 3767319 MAE_02040 MAE_02050     TRUE 0.900 1.000 0.000 NA   NA
 3767319 3767320 MAE_02050 MAE_02060     FALSE 0.186 123.000 0.000 NA   NA
 3767320 3767321 MAE_02060 MAE_02070     FALSE 0.161 150.000 0.000 NA   NA
 3767321 3767322 MAE_02070 MAE_02080     TRUE 0.993 3.000 0.333 NA   NA
 3767322 3767323 MAE_02080 MAE_02090   argG FALSE 0.044 488.000 0.000 1.000   NA
 3767323 3767324 MAE_02090 MAE_02100 argG   FALSE 0.142 163.000 0.000 1.000 N NA
 3767324 3767325 MAE_02100 MAE_02110     FALSE 0.055 384.000 0.000 NA   NA
 3767327 3767328 MAE_02130 MAE_02140 purK   TRUE 0.994 -3.000 0.007 NA   NA
 3767329 3767330 MAE_02150 MAE_02160     FALSE 0.227 62.000 0.000 NA   NA
 3767330 3767331 MAE_02160 MAE_02170     FALSE 0.107 208.000 0.000 1.000 N NA
 3767334 3767335 MAE_02200 MAE_02210     FALSE 0.037 545.000 0.000 NA   NA
 3767338 3767339 MAE_02240 MAE_02250     FALSE 0.166 145.000 0.000 NA   NA
 3767340 3767341 MAE_02260 MAE_02270     FALSE 0.121 197.000 0.000 NA   NA
 3767341 3767342 MAE_02270 MAE_02280     FALSE 0.225 65.000 0.000 NA   NA
 3767343 3767344 MAE_02290 MAE_02300     FALSE 0.228 55.000 0.000 NA   NA
 3767344 3767345 MAE_02300 MAE_02310     FALSE 0.160 151.000 0.000 NA   NA
 3767345 3767346 MAE_02310 MAE_02320     FALSE 0.232 52.000 0.000 NA   NA
 3767346 3767347 MAE_02320 MAE_02330     FALSE 0.209 92.000 0.000 NA   NA
 3767352 3767353 MAE_02380 MAE_02390     TRUE 0.977 -43.000 0.000 NA   NA
 3767354 3767355 MAE_02400 MAE_02410     FALSE 0.097 245.000 0.000 NA   NA
 3767355 3767356 MAE_02410 MAE_02420     FALSE 0.213 85.000 0.000 NA   NA
 3767357 3767358 MAE_02430 MAE_02440     TRUE 0.999 -13.000 0.400 NA   NA
 3767358 3767359 MAE_02440 MAE_02450     FALSE 0.203 108.000 0.000 NA   NA
 3767359 3767360 MAE_02450 MAE_02460     FALSE 0.096 248.000 0.000 NA   NA
 3767360 3767361 MAE_02460 MAE_02470     FALSE 0.097 246.000 0.000 NA   NA
 3767363 3767364 MAE_02490 MAE_02500   rpiA FALSE 0.030 777.000 0.000 NA   NA
 3767364 3767365 MAE_02500 MAE_02510 rpiA   TRUE 0.743 73.000 0.006 1.000   NA
 3767366 3767367 MAE_02520 MAE_02530 nblA   FALSE 0.045 449.000 0.000 NA   NA
 3767368 3767369 MAE_02540 MAE_02550 arsC   TRUE 0.957 24.000 0.438 NA   NA
 3767369 3767370 MAE_02550 MAE_02560     TRUE 0.983 10.000 0.214 NA   NA
 3767370 3767371 MAE_02560 MAE_02570     TRUE 0.755 126.000 0.057 1.000 N NA
 3767372 3767373 MAE_02580 MAE_02590     FALSE 0.088 283.000 0.000 1.000   NA
 3767373 3767374 MAE_02590 MAE_02600     TRUE 0.683 208.000 0.113 0.009   NA
 3767374 3767375 MAE_02600 MAE_02610     FALSE 0.216 74.000 0.000 NA   NA
 3767375 3767376 MAE_02610 MAE_02620     FALSE 0.062 351.000 0.000 NA   NA
 3767376 3767377 MAE_02620 MAE_02630     FALSE 0.048 456.000 0.000 1.000   NA
 3767377 3767378 MAE_02630 MAE_02640     FALSE 0.136 175.000 0.000 NA   NA
 3767378 3767379 MAE_02640 MAE_02650     FALSE 0.033 628.000 0.000 NA   NA
 3767379 3767380 MAE_02650 MAE_02660     FALSE 0.127 189.000 0.000 NA   NA
 3767380 3767381 MAE_02660 MAE_02670     FALSE 0.088 270.000 0.000 NA   NA
 3767383 3767384 MAE_02690 MAE_02700     FALSE 0.130 183.000 0.000 NA   NA
 3767384 3767385 MAE_02700 MAE_02710     FALSE 0.227 58.000 0.000 NA   NA
 3767385 3767386 MAE_02710 MAE_02720   nirA FALSE 0.032 645.000 0.000 NA   NA
 3767386 3767387 MAE_02720 MAE_02730 nirA cobH TRUE 0.994 2.000 0.273 1.000   NA
 3767387 3767388 MAE_02730 MAE_02740 cobH cobI TRUE 0.998 -3.000 0.191 0.012 Y NA
 3767388 3767389 MAE_02740 MAE_02750 cobI   FALSE 0.066 338.000 0.000 NA   NA
 3767389 3767390 MAE_02750 MAE_02760     FALSE 0.069 328.000 0.000 NA   NA
 3767390 3767391 MAE_02760 MAE_02770     FALSE 0.090 265.000 0.000 NA   NA
 3767391 3767392 MAE_02770 MAE_02780     FALSE 0.040 499.000 0.000 NA   NA
 3767395 3767396 MAE_02810 MAE_02820     TRUE 0.759 114.000 0.037 NA   NA
 3767396 3767397 MAE_02820 MAE_02830     TRUE 0.358 32.000 0.000 NA   NA
 3767397 3767398 MAE_02830 MAE_02840     TRUE 0.254 46.000 0.000 NA   NA
 3767398 3767399 MAE_02840 MAE_02850     FALSE 0.077 302.000 0.000 NA   NA
 3767400 3767401 MAE_02860 MAE_02870     TRUE 0.992 0.000 0.018 1.000 N NA
 3767401 3767402 MAE_02870 MAE_02880     FALSE 0.165 157.000 0.000 1.000   NA
 3767405 3767406 MAE_02910 MAE_02920     FALSE 0.082 284.000 0.000 NA   NA
 3767406 3767407 MAE_02920 MAE_02930     TRUE 0.690 13.000 0.000 NA   NA
 3767408 3767409 MAE_02940 MAE_02950     FALSE 0.216 79.000 0.000 NA   NA
 3767409 3767410 MAE_02950 MAE_02960     TRUE 0.639 16.000 0.000 NA   NA
 3767411 3767412 MAE_02970 MAE_02980     FALSE 0.040 505.000 0.000 NA   NA
 3767414 3767415 MAE_03000 MAE_03010     FALSE 0.192 117.000 0.000 NA   NA
 3767415 3767416 MAE_03010 MAE_03020     FALSE 0.225 65.000 0.000 NA   NA
 3767418 3767419 MAE_03040 MAE_03050     FALSE 0.172 148.000 0.000 1.000   NA
 3767419 3767420 MAE_03050 MAE_03060     TRUE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 3767421 3767422 MAE_03070 MAE_03080     TRUE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 3767423 3767424 MAE_03090 MAE_03100     TRUE 0.997 -3.000 0.286 NA   NA
 3767424 3767425 MAE_03100 MAE_03110     TRUE 0.808 6.000 0.000 NA   NA
 3767425 3767426 MAE_03110 MAE_03120     FALSE 0.222 88.000 0.000 1.000   NA
 3767426 3767427 MAE_03120 MAE_03130     TRUE 0.424 28.000 0.000 NA   NA
 3767427 3767428 MAE_03130 MAE_03140     TRUE 0.690 30.000 0.000 NA Y NA
 3767428 3767429 MAE_03140 MAE_03150     TRUE 0.682 14.000 0.000 1.000   NA
 3767429 3767430 MAE_03150 MAE_03160     TRUE 0.361 33.000 0.000 1.000   NA
 3767430 3767431 MAE_03160 MAE_03170     TRUE 0.983 15.000 0.148 NA Y NA
 3767433 3767434 MAE_03190 MAE_03200     FALSE 0.205 73.000 0.000 1.000 N NA
 3767434 3767435 MAE_03200 MAE_03210     FALSE 0.198 93.000 0.000 1.000 N NA
 3767436 3767437 MAE_03220 MAE_03230     FALSE 0.103 228.000 0.000 NA   NA
 3767437 3767438 MAE_03230 MAE_03240     TRUE 0.883 86.000 1.000 0.003   NA
 3767438 3767439 MAE_03240 MAE_03250     FALSE 0.059 365.000 0.000 NA   NA
 3767439 3767440 MAE_03250 MAE_03260     TRUE 0.424 28.000 0.000 NA   NA
 3767440 3767441 MAE_03260 MAE_03270     FALSE 0.182 138.000 0.000 1.000   NA
 3767441 3767442 MAE_03270 MAE_03280     FALSE 0.034 677.000 0.000 1.000   NA
 3767442 3767443 MAE_03280 MAE_03290     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 3767443 3767444 MAE_03290 MAE_03300     TRUE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 3767444 3767445 MAE_03300 MAE_03310     TRUE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 3767445 3767446 MAE_03310 MAE_03320     FALSE 0.227 59.000 0.000 NA   NA
 3767446 3767447 MAE_03320 MAE_03330     FALSE 0.161 150.000 0.000 NA   NA
 3767448 3767449 MAE_03340 MAE_03350     TRUE 0.900 1.000 0.000 NA   NA
 3767450 3767451 MAE_03360 MAE_03370     TRUE 0.317 200.000 0.000 NA Y NA
 3767451 3767452 MAE_03370 MAE_03380     TRUE 0.979 14.000 0.436 1.000   NA
 3767452 3767453 MAE_03380 MAE_03390     TRUE 0.543 22.000 0.000 1.000   NA
 3767455 3767456 MAE_03410 MAE_03420 groEL2   FALSE 0.133 191.000 0.000 1.000   NA
 3767457 3767458 MAE_03430 MAE_03440     FALSE 0.088 268.000 0.000 NA   NA
 3767460 3767461 MAE_03460 MAE_03470     FALSE 0.165 146.000 0.000 NA   NA
 3767462 3767463 MAE_03480 MAE_03490     FALSE 0.207 99.000 0.000 NA   NA
 3767464 3767465 MAE_03500 MAE_03510     FALSE 0.101 233.000 0.000 NA   NA
 3767466 3767467 MAE_03520 MAE_03530   dnaJ FALSE 0.052 401.000 0.000 NA   NA
 3767467 3767468 MAE_03530 MAE_03540 dnaJ   FALSE 0.216 74.000 0.000 NA   NA
 3767468 3767469 MAE_03540 MAE_03550   ycf20 TRUE 0.988 9.000 0.538 NA   NA
 3767469 3767470 MAE_03550 MAE_03560 ycf20   FALSE 0.033 640.000 0.000 NA   NA
 3767470 3767471 MAE_03560 MAE_03570     TRUE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 3767472 3767473 MAE_03580 MAE_03590     TRUE 0.999 -13.000 0.400 NA   NA
 3767473 3767474 MAE_03590 MAE_03600     FALSE 0.107 218.000 0.000 NA   NA
 3767474 3767475 MAE_03600 MAE_03610     TRUE 0.392 30.000 0.000 NA   NA
 3767475 3767476 MAE_03610 MAE_03620     FALSE 0.106 222.000 0.000 NA   NA
 3767476 3767477 MAE_03620 MAE_03630     FALSE 0.151 163.000 0.000 NA   NA
 3767477 3767478 MAE_03630 MAE_03640     FALSE 0.177 144.000 0.000 1.000   NA
 3767481 3767482 MAE_03670 MAE_03680     TRUE 0.972 -16.000 0.000 NA   NA
 3767483 3767484 MAE_03690 MAE_03700     FALSE 0.135 176.000 0.000 NA   NA
 3767484 3767485 MAE_03700 MAE_03710     TRUE 0.997 -3.000 0.286 NA   NA
 3767485 3767486 MAE_03710 MAE_03720     FALSE 0.098 243.000 0.000 NA   NA
 3767486 3767487 MAE_03720 MAE_03730     TRUE 0.767 9.000 0.000 NA   NA
 3767489 3767490 MAE_03750 MAE_03760     TRUE 0.979 12.000 0.208 NA   NA
 3767492 3767493 MAE_03780 MAE_03790     FALSE 0.224 66.000 0.000 NA   NA
 3767493 3767494 MAE_03790 MAE_03800     TRUE 0.977 16.000 0.500 NA   NA
 3767494 3767495 MAE_03800 MAE_03810     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3767496 3767497 MAE_03820 MAE_03830 ftsH   FALSE 0.235 51.000 0.000 NA   NA
 3767497 3767498 MAE_03830 MAE_03840     FALSE 0.065 342.000 0.000 NA   NA
 3767499 3767500 MAE_03850 MAE_03860     TRUE 0.690 13.000 0.000 NA   NA
 3767500 3767501 MAE_03860 MAE_03870     TRUE 0.974 19.000 0.800 NA   NA
 3767502 3767503 MAE_03880 MAE_03890     FALSE 0.221 68.000 0.000 NA   NA
 3767503 3767504 MAE_03890 MAE_03900     FALSE 0.211 88.000 0.000 NA   NA
 3767510 3767511 MAE_03960 MAE_03970     FALSE 0.103 228.000 0.000 NA   NA
 3767511 3767512 MAE_03970 MAE_03980     FALSE 0.078 300.000 0.000 NA   NA
 3767512 3767513 MAE_03980 MAE_03990     FALSE 0.152 161.000 0.000 NA   NA
 3767513 3767514 MAE_03990 MAE_04000     TRUE 0.976 12.000 0.111 NA   NA
 3767515 3767516 MAE_04010 MAE_04020   oxaA TRUE 0.995 0.000 0.254 1.000   NA
 3767516 3767517 MAE_04020 MAE_04030 oxaA   TRUE 0.783 85.000 0.043 NA   NA
 3767517 3767518 MAE_04030 MAE_04040   rnpA TRUE 0.997 -10.000 0.041 NA   NA
 3767518 3767519 MAE_04040 MAE_04050 rnpA rpl34 TRUE 0.955 27.000 0.787 1.000   NA
 3767520 3767521 MAE_04060 MAE_04070     FALSE 0.067 348.000 0.000 1.000   NA
 3767523 3767524 MAE_04090 MAE_04100 pilB pilT TRUE 0.868 146.000 0.178 0.019 Y NA
 3767524 3767525 MAE_04100 MAE_04110 pilT pilC TRUE 0.855 167.000 0.218 1.000 Y NA
 3767525 3767526 MAE_04110 MAE_04120 pilC   FALSE 0.208 96.000 0.000 NA   NA
 3767526 3767527 MAE_04120 MAE_04130     FALSE 0.204 106.000 0.000 NA   NA
 3767529 3767530 MAE_04150 MAE_04160     FALSE 0.077 302.000 0.000 NA   NA
 3767530 3767531 MAE_04160 MAE_04170     FALSE 0.145 168.000 0.000 NA   NA
 3767531 3767532 MAE_04170 MAE_04180     TRUE 0.998 -10.000 0.217 NA   NA
 3767532 3767533 MAE_04180 MAE_04190     FALSE 0.044 461.000 0.000 NA   NA
 3767533 3767534 MAE_04190 MAE_04200     TRUE 0.998 -7.000 0.588 NA   NA
 3767534 3767535 MAE_04200 MAE_04210     FALSE 0.134 178.000 0.000 NA   NA
 3767535 3767536 MAE_04210 MAE_04220     TRUE 0.239 50.000 0.000 NA   NA
 3767536 3767537 MAE_04220 MAE_04230     TRUE 0.654 15.000 0.000 NA   NA
 3767539 3767540 MAE_04250 MAE_04260     FALSE 0.071 319.000 0.000 NA   NA
 3767540 3767541 MAE_04260 MAE_04270     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA   NA
 3767541 3767542 MAE_04270 MAE_04280     FALSE 0.217 72.000 0.000 NA   NA
 3767542 3767543 MAE_04280 MAE_04290     TRUE 0.962 -7.000 0.000 NA   NA
 3767546 3767547 MAE_04320 MAE_04330     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA   NA
 3767547 3767548 MAE_04330 MAE_04340     FALSE 0.118 200.000 0.000 NA   NA
 3767548 3767549 MAE_04340 MAE_04350     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3767549 3767550 MAE_04350 MAE_04360     FALSE 0.038 527.000 0.000 NA   NA
 3767550 3767551 MAE_04360 MAE_04370     TRUE 0.994 -45.000 0.000 1.000 Y NA
 3767551 3767552 MAE_04370 MAE_04380     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 3767553 3767554 MAE_04390 MAE_04400     TRUE 0.958 24.000 0.500 NA   NA
 3767556 3767557 MAE_04420 MAE_04430     FALSE 0.216 77.000 0.000 NA   NA
 3767557 3767558 MAE_04430 MAE_04440     TRUE 0.992 0.000 0.021 NA   NA
 3767560 3767561 MAE_04460 MAE_04470     TRUE 0.570 20.000 0.000 NA   NA
 3767562 3767563 MAE_04480 MAE_04490     TRUE 0.998 -3.000 0.750 NA   NA
 3767564 3767565 MAE_04500 MAE_04510   ureD TRUE 0.914 0.000 0.000 NA   NA
 3767566 3767567 MAE_04520 MAE_04530     TRUE 0.939 18.000 0.007 1.000 N NA
 3767568 3767569 MAE_04540 MAE_04550     TRUE 0.818 146.000 0.023 0.065 Y NA
 3767569 3767570 MAE_04550 MAE_04560     FALSE 0.079 296.000 0.000 NA   NA
 3767570 3767571 MAE_04560 MAE_04570     FALSE 0.187 121.000 0.000 NA   NA
 3767575 3767576 MAE_04600 MAE_04610     TRUE 0.490 24.000 0.000 NA   NA
 3767577 3767578 MAE_04620 MAE_04630     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 3767580 3767581 MAE_04650 MAE_04660     FALSE 0.169 141.000 0.000 NA   NA
 3767581 3767582 MAE_04660 MAE_04670     FALSE 0.066 335.000 0.000 NA   NA
 3767583 3767584 MAE_04680 MAE_04690 ftsY   FALSE 0.197 95.000 0.000 1.000 N NA
 3767584 3767585 MAE_04690 MAE_04700     TRUE 0.284 40.000 0.000 NA   NA
 3767585 3767586 MAE_04700 MAE_04710     TRUE 0.778 199.000 0.762 NA   NA
 3767586 3767587 MAE_04710 MAE_04720     FALSE 0.041 491.000 0.000 NA   NA
 3767587 3767588 MAE_04720 MAE_04730     FALSE 0.091 263.000 0.000 NA   NA
 3767588 3767589 MAE_04730 MAE_04740     FALSE 0.028 1146.000 0.000 NA   NA
 3767591 3767592 MAE_04760 MAE_04770     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3767592 3767593 MAE_04770 MAE_04780     FALSE 0.063 349.000 0.000 NA   NA
 3767595 3767596 MAE_04800 MAE_04810     FALSE 0.134 199.000 0.000 0.042   NA
 3767598 3767599 MAE_04830 MAE_04840     FALSE 0.163 159.000 0.000 1.000   NA
 3767599 3767600 MAE_04840 MAE_04850     FALSE 0.029 1017.000 0.000 NA   NA
 3767601 3767602 MAE_04860 MAE_04870     FALSE 0.080 292.000 0.000 NA   NA
 3767602 3767603 MAE_04870 MAE_04880     FALSE 0.065 341.000 0.000 NA   NA
 3767605 3767606 MAE_04900 MAE_04910     FALSE 0.199 111.000 0.000 NA   NA
 3767606 3767607 MAE_04910 MAE_04920     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3767607 3767608 MAE_04920 MAE_04930     FALSE 0.220 69.000 0.000 NA   NA
 3767608 3767609 MAE_04930 MAE_04940     TRUE 0.792 53.000 0.031 1.000   NA
 3767609 3767610 MAE_04940 MAE_04950     FALSE 0.046 468.000 0.000 1.000   NA
 3767610 3767611 MAE_04950 MAE_04960     TRUE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 3767612 3767613 MAE_04970 MAE_04980     FALSE 0.207 102.000 0.000 NA   NA
 3767615 3767616 MAE_05000 MAE_05010     FALSE 0.127 210.000 0.000 0.008   NA
 3767616 3767617 MAE_05010 MAE_05020     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3767619 3767620 MAE_05040 MAE_05050     FALSE 0.030 735.000 0.000 NA   NA
 3767620 3767621 MAE_05050 MAE_05060     TRUE 0.239 86.000 0.000 0.002   NA
 3767621 3767622 MAE_05060 MAE_05070     FALSE 0.169 151.000 0.000 1.000   NA
 3767623 3767624 MAE_05080 MAE_05090     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 3767624 3767625 MAE_05090 MAE_05100     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3767626 3767627 MAE_05110 MAE_05120     TRUE 0.254 46.000 0.000 NA   NA
 3767627 3767628 MAE_05120 MAE_05130     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 3767630 3767631 MAE_05150 MAE_05160     FALSE 0.235 51.000 0.000 NA   NA
 3767632 3767633 MAE_05170 MAE_05180     FALSE 0.216 76.000 0.000 NA   NA
 3767634 3767635 MAE_05190 MAE_05200     TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3767635 3767636 MAE_05200 MAE_05210     FALSE 0.100 236.000 0.000 NA   NA
 3767636 3767637 MAE_05210 MAE_05220     FALSE 0.094 253.000 0.000 NA   NA
 3767637 3767638 MAE_05220 MAE_05230     FALSE 0.080 289.000 0.000 NA   NA
 3767638 3767639 MAE_05230 MAE_05240     FALSE 0.112 199.000 0.000 1.000 N NA
 3767639 3767640 MAE_05240 MAE_05250     TRUE 0.908 0.000 0.000 1.000 N NA
 3767641 3767642 MAE_05260 MAE_05270     FALSE 0.213 85.000 0.000 NA   NA
 3767642 3767643 MAE_05270 MAE_05280     TRUE 0.998 -3.000 0.600 NA   NA
 3767644 3767645 MAE_05290 MAE_05300     FALSE 0.103 228.000 0.000 NA   NA
 3767645 3767646 MAE_05300 MAE_05310     FALSE 0.168 143.000 0.000 NA   NA
 3767646 3767647 MAE_05310 MAE_05320     FALSE 0.154 158.000 0.000 NA   NA
 3767648 3767649 MAE_05330 MAE_05340     FALSE 0.039 509.000 0.000 NA   NA
 3767651 3767652 MAE_05360 MAE_05370     FALSE 0.034 559.000 0.000 1.000 N NA
 3767654 3767655 MAE_05390 MAE_05400     FALSE 0.117 203.000 0.000 NA   NA
 3767655 3767656 MAE_05400 MAE_05410     TRUE 0.999 -13.000 0.667 NA   NA
 3767657 3767658 MAE_05420 MAE_05430 cbiX folK TRUE 0.967 -9.000 0.000 1.000   NA
 3767658 3767659 MAE_05430 MAE_05440 folK   FALSE 0.136 187.000 0.000 1.000   NA
 3767659 3767660 MAE_05440 MAE_05450     FALSE 0.079 294.000 0.000 NA   NA
 3767660 3767661 MAE_05450 MAE_05460     TRUE 0.509 350.000 0.098 NA   NA
 3767661 3767662 MAE_05460 MAE_05470     TRUE 0.329 35.000 0.000 NA   NA
 3767663 3767664 MAE_05480 MAE_05490     TRUE 0.995 3.000 0.833 1.000   NA
 3767664 3767665 MAE_05490 MAE_05500     FALSE 0.107 218.000 0.000 NA   NA
 3767669 3767670 MAE_05540 MAE_05550   ycf36 TRUE 0.964 23.000 0.810 NA   NA
 3767670 3767671 MAE_05550 MAE_05560 ycf36   TRUE 0.981 6.000 0.033 NA   NA
 3767671 3767672 MAE_05560 MAE_05570     TRUE 0.834 56.000 0.149 NA   NA
 3767672 3767673 MAE_05570 MAE_05580     FALSE 0.227 81.000 0.000 1.000   NA
 3767674 3767675 MAE_05590 MAE_05600     TRUE 0.845 4.000 0.000 NA   NA
 3767675 3767676 MAE_05600 MAE_05610     TRUE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 3767676 3767677 MAE_05610 MAE_05620   acoB TRUE 0.470 25.000 0.000 NA   NA
 3767677 3767678 MAE_05620 MAE_05630 acoB secD TRUE 0.922 27.000 0.091 1.000 N NA
 3767681 3767682 MAE_05660 MAE_05670     FALSE 0.100 235.000 0.000 NA   NA
 3767682 3767683 MAE_05670 MAE_05680     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3767684 3767685 MAE_05690 MAE_05700     TRUE 0.509 23.000 0.000 NA   NA
 3767686 3767687 MAE_05710 MAE_05720     TRUE 0.854 4.000 0.000 1.000   NA
 3767687 3767688 MAE_05720 MAE_05730     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 3767688 3767689 MAE_05730 MAE_05740     FALSE 0.073 312.000 0.000 NA   NA
 3767689 3767690 MAE_05740 MAE_05750     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3767690 3767691 MAE_05750 MAE_05760     FALSE 0.028 1351.000 0.000 NA   NA
 3767692 3767693 MAE_05770 MAE_05780     FALSE 0.111 211.000 0.000 NA   NA
 3767693 3767694 MAE_05780 MAE_05790     TRUE 0.972 -16.000 0.000 NA   NA
 3767694 3767695 MAE_05790 MAE_05800     FALSE 0.091 262.000 0.000 NA   NA
 3767695 3767696 MAE_05800 MAE_05810     FALSE 0.175 134.000 0.000 NA   NA
 3767701 3767702 MAE_05860 MAE_05870 ruvC   TRUE 0.835 4.000 0.000 1.000 N NA
 3767702 3767703 MAE_05870 MAE_05880     TRUE 0.767 9.000 0.000 NA   NA
 3767703 3767704 MAE_05880 MAE_05890     FALSE 0.226 64.000 0.000 NA   NA
 3767704 3767705 MAE_05890 MAE_05900     TRUE 0.938 47.000 0.750 NA Y NA
 3767705 3767706 MAE_05900 MAE_05910     FALSE 0.217 72.000 0.000 NA   NA
 3767709 3767710 MAE_05940 MAE_05950     FALSE 0.227 61.000 0.000 NA   NA
 3767710 3767711 MAE_05950 MAE_05960     TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 3767711 3767712 MAE_05960 MAE_05970     FALSE 0.064 345.000 0.000 NA   NA
 3767712 3767713 MAE_05970 MAE_05980     FALSE 0.200 110.000 0.000 NA   NA
 3767716 3767717 MAE_06010 MAE_06020 ilvB   FALSE 0.107 220.000 0.000 NA   NA
 3767717 3767718 MAE_06020 MAE_06030     FALSE 0.104 225.000 0.000 NA   NA
 3767718 3767719 MAE_06030 MAE_06040     FALSE 0.046 442.000 0.000 NA   NA
 3767719 3767720 MAE_06040 MAE_06050     FALSE 0.103 229.000 0.000 NA   NA
 3767724 3767725 MAE_06090 MAE_06100     FALSE 0.207 100.000 0.000 NA   NA
 3767727 3767728 MAE_06120 MAE_06130 cobB   FALSE 0.036 513.000 0.000 1.000 N NA
 3767729 3767730 MAE_06140 MAE_06150     TRUE 0.604 18.000 0.000 NA   NA
 3767730 3767731 MAE_06150 MAE_06160     FALSE 0.036 555.000 0.000 NA   NA
 3767732 3767733 MAE_06170 MAE_06180     FALSE 0.092 272.000 0.000 1.000   NA
 3767733 3767734 MAE_06180 MAE_06190     TRUE 0.875 39.000 0.126 0.020   NA
 3767734 3767735 MAE_06190 MAE_06200     TRUE 0.806 114.000 0.137 1.000   NA
 3767735 3767736 MAE_06200 MAE_06210     TRUE 0.996 4.000 0.888 0.018 Y NA
 3767736 3767737 MAE_06210 MAE_06220     TRUE 0.882 95.000 0.092 1.000 Y NA
 3767737 3767738 MAE_06220 MAE_06230     FALSE 0.054 407.000 0.000 1.000   NA
 3767738 3767739 MAE_06230 MAE_06240     TRUE 0.820 116.000 0.194 0.063   NA
 3767741 3767742 MAE_06260 MAE_06270 glgA   FALSE 0.035 641.000 0.000 1.000   NA
 3767743 3767744 MAE_06280 MAE_06290 rps15   TRUE 0.919 25.000 0.037 NA   NA
 3767744 3767745 MAE_06290 MAE_06300   ccmA TRUE 0.819 59.000 0.095 NA   NA
 3767745 3767746 MAE_06300 MAE_06310 ccmA   FALSE 0.225 65.000 0.000 NA   NA
 3767746 3767747 MAE_06310 MAE_06320     TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3767747 3767748 MAE_06320 MAE_06330     TRUE 0.490 24.000 0.000 NA   NA
 3767750 3767751 MAE_06350 MAE_06360     FALSE 0.181 149.000 0.000 0.018   NA
 3767751 3767752 MAE_06360 MAE_06370   nbp1 TRUE 0.823 73.000 0.128 1.000   NA
 3767752 3767753 MAE_06370 MAE_06380 nbp1   FALSE 0.171 139.000 0.000 NA   NA
 3767753 3767754 MAE_06380 MAE_06390     TRUE 0.667 14.000 0.000 NA   NA
 3767754 3767755 MAE_06390 MAE_06400     TRUE 0.425 27.000 0.000 1.000 N NA
 3767756 3767757 MAE_06410 MAE_06420     FALSE 0.102 231.000 0.000 NA   NA
 3767757 3767758 MAE_06420 MAE_06430     FALSE 0.227 61.000 0.000 NA   NA
 3767758 3767759 MAE_06430 MAE_06440     TRUE 0.698 136.000 0.014 NA   NA
 3767760 3767761 MAE_06450 MAE_06460     FALSE 0.087 257.000 0.000 1.000 N NA
 3767762 3767763 MAE_06470 MAE_06480     FALSE 0.209 95.000 0.000 NA   NA
 3767763 3767764 MAE_06480 MAE_06490     TRUE 0.651 262.000 0.214 NA   NA
 3767764 3767765 MAE_06490 MAE_06500     FALSE 0.171 139.000 0.000 NA   NA
 3767765 3767766 MAE_06500 MAE_06510     TRUE 0.273 42.000 0.000 NA   NA
 3767768 3767769 MAE_06530 MAE_06540 ndhD1 pcyA FALSE 0.048 452.000 0.000 1.000   NA
 3767771 3767772 MAE_06560 MAE_06570     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA   NA
 3767773 3767774 MAE_06580 MAE_06590     FALSE 0.069 327.000 0.000 NA   NA
 3767776 3767777 MAE_06610 MAE_06620     TRUE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 3767778 3767779 MAE_06630 MAE_06640     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3767783 3767784 MAE_06680 MAE_06690     FALSE 0.064 343.000 0.000 0.100 N NA
 3767784 3767785 MAE_06690 MAE_06700   hemF FALSE 0.201 85.000 0.000 1.000 N NA
 3767785 3767786 MAE_06700 MAE_06710 hemF   FALSE 0.093 269.000 0.000 1.000   NA
 3767786 3767787 MAE_06710 MAE_06720     FALSE 0.227 80.000 0.000 1.000   NA
 3767787 3767788 MAE_06720 MAE_06730     TRUE 0.973 24.000 0.314 1.000 Y NA
 3767788 3767789 MAE_06730 MAE_06740     FALSE 0.202 62.000 0.000 NA N NA
 3767790 3767791 MAE_06750 MAE_06760     FALSE 0.077 302.000 0.000 NA   NA
 3767792 3767793 MAE_06770 MAE_06780   folP TRUE 0.750 49.000 0.003 1.000 N NA
 3767793 3767794 MAE_06780 MAE_06790 folP   FALSE 0.155 157.000 0.000 NA   NA
 3767794 3767795 MAE_06790 MAE_06800     FALSE 0.041 496.000 0.000 NA   NA
 3767795 3767796 MAE_06800 MAE_06810     FALSE 0.117 203.000 0.000 NA   NA
 3767796 3767797 MAE_06810 MAE_06820     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3767797 3767798 MAE_06820 MAE_06830     TRUE 0.337 34.000 0.000 NA   NA
 3767799 3767800 MAE_06840 MAE_06850     FALSE 0.198 91.000 0.000 1.000 N NA
 3767802 3767803 MAE_06870 MAE_06880   pth TRUE 0.748 50.000 0.002 NA   NA
 3767803 3767804 MAE_06880 MAE_06890 pth   FALSE 0.185 135.000 0.000 1.000   NA
 3767805 3767806 MAE_06900 MAE_06910     FALSE 0.116 204.000 0.000 NA   NA
 3767806 3767807 MAE_06910 MAE_06920     FALSE 0.209 93.000 0.000 NA   NA
 3767807 3767808 MAE_06920 MAE_06930     FALSE 0.231 70.000 0.000 1.000   NA
 3767808 3767809 MAE_06930 MAE_06940     FALSE 0.181 127.000 0.000 NA   NA
 3767809 3767810 MAE_06940 MAE_06950     TRUE 0.587 19.000 0.000 NA   NA
 3767814 3767815 MAE_06990 MAE_07000     TRUE 0.445 433.000 0.111 NA   NA
 3767815 3767816 MAE_07000 MAE_07010     FALSE 0.208 97.000 0.000 NA   NA
 3767816 3767817 MAE_07010 MAE_07020     FALSE 0.216 76.000 0.000 NA   NA
 3767817 3767818 MAE_07020 MAE_07030     TRUE 0.730 159.000 0.078 NA   NA
 3767818 3767819 MAE_07030 MAE_07040   clpS TRUE 0.993 3.000 0.255 NA   NA
 3767819 3767820 MAE_07040 MAE_07050 clpS sqdX FALSE 0.227 56.000 0.000 NA   NA
 3767820 3767821 MAE_07050 MAE_07060 sqdX   FALSE 0.197 96.000 0.000 1.000 N NA
 3767824 3767825 MAE_07090 MAE_07100     TRUE 0.900 1.000 0.000 NA   NA
 3767825 3767826 MAE_07100 MAE_07110     FALSE 0.084 279.000 0.000 NA   NA
 3767826 3767827 MAE_07110 MAE_07120     FALSE 0.107 218.000 0.000 NA   NA
 3767830 3767831 MAE_07150 MAE_07160     FALSE 0.032 647.000 0.000 NA   NA
 3767831 3767832 MAE_07160 MAE_07170   trpD TRUE 0.470 25.000 0.000 NA   NA
 3767832 3767833 MAE_07170 MAE_07180 trpD   FALSE 0.215 80.000 0.000 NA   NA
 3767834 3767835 MAE_07190 MAE_07200     FALSE 0.114 208.000 0.000 NA   NA
 3767835 3767836 MAE_07200 MAE_07210     FALSE 0.069 326.000 0.000 NA   NA
 3767837 3767838 MAE_07220 MAE_07230     FALSE 0.038 536.000 0.000 NA   NA
 3767838 3767839 MAE_07230 MAE_07240     FALSE 0.034 601.000 0.000 NA   NA
 3767839 3767840 MAE_07240 MAE_07250     FALSE 0.078 301.000 0.000 NA   NA
 3767840 3767841 MAE_07250 MAE_07260     TRUE 0.998 -7.000 0.625 NA   NA
 3767841 3767842 MAE_07260 MAE_07270   gshB TRUE 0.645 158.000 0.005 NA   NA
 3767842 3767843 MAE_07270 MAE_07280 gshB   TRUE 0.948 16.000 0.010 1.000 N NA
 3767846 3767847 MAE_07310 MAE_07320 rpl9   FALSE 0.219 100.000 0.000 1.000   NA
 3767847 3767848 MAE_07320 MAE_07330     TRUE 0.526 23.000 0.000 1.000   NA
 3767851 3767852 MAE_07360 MAE_07370   crtR FALSE 0.188 120.000 0.000 NA   NA
 3767852 3767853 MAE_07370 MAE_07380 crtR   FALSE 0.134 162.000 0.000 NA N NA
 3767853 3767854 MAE_07380 MAE_07390     TRUE 0.972 -16.000 0.000 NA   NA
 3767855 3767856 MAE_07400 MAE_07410     FALSE 0.215 81.000 0.000 NA   NA
 3767856 3767857 MAE_07410 MAE_07420     TRUE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 3767857 3767858 MAE_07420 MAE_07430     FALSE 0.226 64.000 0.000 NA   NA
 3767859 3767860 MAE_07440 MAE_07450     FALSE 0.088 283.000 0.000 1.000   NA
 3767860 3767861 MAE_07450 MAE_07460     TRUE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 3767861 3767862 MAE_07460 MAE_07470     FALSE 0.151 163.000 0.000 NA   NA
 3767864 3767865 MAE_07490 MAE_07500     TRUE 0.651 262.000 0.214 NA   NA
 3767865 3767866 MAE_07500 MAE_07510     FALSE 0.125 191.000 0.000 NA   NA
 3767866 3767867 MAE_07510 MAE_07520     FALSE 0.228 55.000 0.000 NA   NA
 3767868 3767869 MAE_07530 MAE_07540     TRUE 0.570 20.000 0.000 NA   NA
 3767869 3767870 MAE_07540 MAE_07550     FALSE 0.175 134.000 0.000 NA   NA
 3767870 3767871 MAE_07550 MAE_07560   gltB FALSE 0.112 210.000 0.000 NA   NA
 3767872 3767873 MAE_07570 MAE_07580     TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3767873 3767874 MAE_07580 MAE_07590     TRUE 0.972 -16.000 0.000 NA   NA
 3767875 3767876 MAE_07600 MAE_07610     TRUE 0.998 -7.000 0.500 NA   NA
 3767876 3767877 MAE_07610 MAE_07620     FALSE 0.127 189.000 0.000 NA   NA
 3767877 3767878 MAE_07620 MAE_07630     TRUE 0.995 0.000 0.300 NA   NA
 3767878 3767879 MAE_07630 MAE_07640     FALSE 0.073 312.000 0.000 NA   NA
 3767881 3767882 MAE_07660 MAE_07670     FALSE 0.128 187.000 0.000 NA   NA
 3767882 3767883 MAE_07670 MAE_07680     TRUE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 3767883 3767884 MAE_07680 MAE_07690     FALSE 0.197 113.000 0.000 NA   NA
 3767886 3767887 MAE_07710 MAE_07720     FALSE 0.055 384.000 0.000 NA   NA
 3767889 3767890 MAE_07740 MAE_07750     TRUE 0.780 8.000 0.000 NA   NA
 3767890 3767891 MAE_07750 MAE_07760     TRUE 0.642 238.000 0.120 NA   NA
 3767891 3767892 MAE_07760 MAE_07770     FALSE 0.223 67.000 0.000 NA   NA
 3767894 3767895 MAE_07790 MAE_07800 cytM   FALSE 0.058 385.000 0.000 1.000   NA
 3767895 3767896 MAE_07800 MAE_07810     TRUE 0.850 18.000 0.000 0.026 Y NA
 3767896 3767897 MAE_07810 MAE_07820     TRUE 0.718 13.000 0.000 0.026   NA
 3767897 3767898 MAE_07820 MAE_07830     FALSE 0.212 109.000 0.000 1.000   NA
 3767898 3767899 MAE_07830 MAE_07840     FALSE 0.086 274.000 0.000 NA   NA
 3767901 3767902 MAE_07860 MAE_07870     TRUE 0.882 32.000 0.051 1.000 N NA
 3767902 3767903 MAE_07870 MAE_07880     FALSE 0.104 227.000 0.000 NA   NA
 3767903 3767904 MAE_07880 MAE_07890     FALSE 0.102 231.000 0.000 NA   NA
 3767904 3767905 MAE_07890 MAE_07900     TRUE 0.487 25.000 0.000 1.000   NA
 3767907 3767908 MAE_07920 MAE_07930     FALSE 0.204 106.000 0.000 NA   NA
 3767908 3767909 MAE_07930 MAE_07940     TRUE 0.996 0.000 0.444 NA   NA
 3767909 3767910 MAE_07940 MAE_07950     FALSE 0.123 194.000 0.000 NA   NA
 3767911 3767912 MAE_07960 MAE_07970     FALSE 0.031 682.000 0.000 NA   NA
 3767912 3767913 MAE_07970 MAE_07980     FALSE 0.200 110.000 0.000 NA   NA
 3767913 3767914 MAE_07980 MAE_07990     FALSE 0.131 181.000 0.000 NA   NA
 3767914 3767915 MAE_07990 MAE_08000     TRUE 0.936 28.000 0.237 1.000   NA
 3767916 3767917 MAE_08010 MAE_08020 rpl21 rpl27 TRUE 0.958 35.000 0.667 0.012 Y NA
 3767917 3767918 MAE_08020 MAE_08030 rpl27   FALSE 0.144 148.000 0.000 NA N NA
 3767918 3767919 MAE_08030 MAE_08040     FALSE 0.216 74.000 0.000 NA   NA
 3767920 3767921 MAE_08050 MAE_08060     TRUE 0.967 -10.000 0.000 NA   NA
 3767921 3767922 MAE_08060 MAE_08070   accA FALSE 0.188 131.000 0.000 1.000   NA
 3767924 3767925 MAE_08090 MAE_08100 recJ   FALSE 0.079 277.000 0.000 1.000 N NA
 3767925 3767926 MAE_08100 MAE_08110     TRUE 0.553 20.000 0.000 1.000 N NA
 3767926 3767927 MAE_08110 MAE_08120     FALSE 0.193 116.000 0.000 NA   NA
 3767928 3767929 MAE_08130 MAE_08140   hrcA TRUE 0.684 158.000 0.031 NA N NA
 3767930 3767931 MAE_08150 MAE_08160     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3767933 3767934 MAE_08180 MAE_t002     FALSE 0.147 167.000 0.000 NA   NA
 3767936 3767937 MAE_08200 MAE_08210     FALSE 0.115 206.000 0.000 NA   NA
 3767939 3767940 MAE_08230 MAE_08240     FALSE 0.042 480.000 0.000 NA   NA
 3767941 3767942 MAE_08250 MAE_08260   gdhA FALSE 0.081 304.000 0.000 1.000   NA
 3767942 3767943 MAE_08260 MAE_08270 gdhA   FALSE 0.161 139.000 0.000 1.000 N NA
 3767944 3767945 MAE_08280 MAE_08290 pyrC   FALSE 0.163 137.000 0.000 1.000 N NA
 3767945 3767946 MAE_08290 MAE_08300     FALSE 0.092 261.000 0.000 NA   NA
 3767946 3767947 MAE_08300 MAE_08310     TRUE 0.457 26.000 0.000 NA   NA
 3767948 3767949 MAE_08320 MAE_08330     TRUE 0.249 277.000 0.000 1.000 Y NA
 3767949 3767950 MAE_08330 MAE_08340     FALSE 0.105 223.000 0.000 NA   NA
 3767954 3767955 MAE_08380 MAE_08390     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3767955 3767956 MAE_08390 MAE_08400     TRUE 0.828 67.000 0.143 NA   NA
 3767956 3767957 MAE_08400 MAE_08410     FALSE 0.125 192.000 0.000 NA   NA
 3767957 3767958 MAE_08410 MAE_08420     FALSE 0.036 559.000 0.000 NA   NA
 3767958 3767959 MAE_08420 MAE_08430     TRUE 0.268 43.000 0.000 NA   NA
 3767961 3767962 MAE_08450 MAE_08460     FALSE 0.207 101.000 0.000 NA   NA
 3767962 3767963 MAE_08460 MAE_08470     TRUE 0.239 50.000 0.000 NA   NA
 3767964 3767965 MAE_08480 MAE_08490     FALSE 0.123 205.000 0.000 1.000   NA
 3767965 3767966 MAE_08490 MAE_08500     FALSE 0.113 209.000 0.000 NA   NA
 3767966 3767967 MAE_08500 MAE_08510     TRUE 0.845 4.000 0.000 NA   NA
 3767967 3767968 MAE_08510 MAE_08520     TRUE 0.780 8.000 0.000 NA   NA
 3767969 3767970 MAE_08530 MAE_08540     FALSE 0.083 284.000 0.000 0.028 N NA
 3767970 3767971 MAE_08540 MAE_08550     TRUE 0.986 19.000 0.810 0.028 Y NA
 3767972 3767973 MAE_08560 MAE_08570     TRUE 0.345 33.000 0.000 NA   NA
 3767973 3767974 MAE_08570 MAE_08580     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 3767974 3767975 MAE_08580 MAE_08590     FALSE 0.076 303.000 0.000 NA   NA
 3767976 3767977 MAE_08600 MAE_08610 ccmO   FALSE 0.084 279.000 0.000 NA   NA
 3767977 3767978 MAE_08610 MAE_08620     FALSE 0.216 78.000 0.000 NA   NA
 3767978 3767979 MAE_08620 MAE_08630     FALSE 0.163 148.000 0.000 NA   NA
 3767979 3767980 MAE_08630 MAE_08640     FALSE 0.215 81.000 0.000 NA   NA
 3767982 3767983 MAE_08660 MAE_08670     TRUE 0.310 38.000 0.000 1.000   NA
 3767983 3767984 MAE_08670 MAE_08680     FALSE 0.132 180.000 0.000 NA   NA
 3767984 3767985 MAE_08680 MAE_08690     FALSE 0.228 55.000 0.000 NA   NA
 3767985 3767986 MAE_08690 MAE_08700     TRUE 0.970 -15.000 0.000 NA   NA
 3767987 3767988 MAE_08710 MAE_08720     FALSE 0.112 210.000 0.000 NA   NA
 3767988 3767989 MAE_08720 MAE_08730     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3767990 3767991 MAE_08740 MAE_08750     TRUE 0.998 -10.000 0.250 NA   NA
 3767991 3767992 MAE_08750 MAE_08760     TRUE 0.780 8.000 0.000 NA   NA
 3767992 3767993 MAE_08760 MAE_08770     FALSE 0.118 200.000 0.000 NA   NA
 3767993 3767994 MAE_08770 MAE_08780     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3767997 3767998 MAE_08810 MAE_08820     FALSE 0.161 149.000 0.000 NA   NA
 3767998 3767999 MAE_08820 MAE_08830     TRUE 0.994 1.000 0.200 NA   NA
 3768000 3768001 MAE_08840 MAE_08850     FALSE 0.127 189.000 0.000 NA   NA
 3768001 3768002 MAE_08850 MAE_08860     TRUE 0.988 7.000 0.357 NA   NA
 3768002 3768003 MAE_08860 MAE_08870     FALSE 0.224 66.000 0.000 NA   NA
 3768004 3768005 MAE_08880 MAE_08890     TRUE 0.639 16.000 0.000 NA   NA
 3768007 3768008 MAE_08910 MAE_08920     TRUE 0.999 -45.000 0.137 NA N NA
 3768008 3768009 MAE_08920 MAE_08930     TRUE 0.337 34.000 0.000 NA   NA
 3768009 3768010 MAE_08930 MAE_08940     TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3768011 3768012 MAE_08950 MAE_08960     FALSE 0.064 346.000 0.000 NA   NA
 3768012 3768013 MAE_08960 MAE_08970     FALSE 0.099 239.000 0.000 NA   NA
 3768013 3768014 MAE_08970 MAE_08980     TRUE 0.284 40.000 0.000 NA   NA
 3768015 3768016 MAE_08990 MAE_09000     FALSE 0.215 81.000 0.000 NA   NA
 3768017 3768018 MAE_09010 MAE_09020     FALSE 0.050 419.000 0.000 NA   NA
 3768018 3768019 MAE_09020 MAE_09030     TRUE 0.658 176.000 0.029 NA   NA
 3768020 3768021 MAE_09040 MAE_09050   glnN TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3768022 3768023 MAE_09060 MAE_09070     FALSE 0.103 229.000 0.000 NA   NA
 3768024 3768025 MAE_09080 MAE_09090     TRUE 0.780 8.000 0.000 NA   NA
 3768025 3768026 MAE_09090 MAE_09100     TRUE 0.998 -16.000 0.217 NA   NA
 3768027 3768028 MAE_09110 MAE_09120     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3768028 3768029 MAE_09120 MAE_09130     FALSE 0.221 68.000 0.000 NA   NA
 3768029 3768030 MAE_09130 MAE_09140     TRUE 0.997 -3.000 0.500 NA   NA
 3768030 3768031 MAE_09140 MAE_09150     FALSE 0.216 78.000 0.000 NA   NA
 3768031 3768032 MAE_09150 MAE_09160     FALSE 0.227 58.000 0.000 NA   NA
 3768032 3768033 MAE_09160 MAE_09170     FALSE 0.201 109.000 0.000 NA   NA
 3768033 3768034 MAE_09170 MAE_09180     TRUE 0.914 0.000 0.000 NA   NA
 3768039 3768040 MAE_09230 MAE_09240     TRUE 0.412 142.000 0.000 NA Y NA
 3768040 3768041 MAE_09240 MAE_09250     TRUE 0.497 74.000 0.000 1.000 Y NA
 3768041 3768042 MAE_09250 MAE_09260     TRUE 0.815 140.000 0.016 0.004 Y NA
 3768042 3768043 MAE_09260 MAE_09270     TRUE 0.994 7.000 0.485 0.004 Y NA
 3768043 3768044 MAE_09270 MAE_09280     TRUE 0.960 21.000 0.009 1.000 Y NA
 3768046 3768047 MAE_09300 MAE_09310     TRUE 0.468 108.000 0.000 NA Y NA
 3768049 3768050 MAE_09330 MAE_09340     TRUE 0.961 3.000 0.000 1.000 Y NA
 3768050 3768051 MAE_09340 MAE_09350     FALSE 0.037 512.000 0.000 1.000 N NA
 3768051 3768052 MAE_09350 MAE_09360     FALSE 0.115 196.000 0.000 1.000 N NA
 3768052 3768053 MAE_09360 MAE_09370     FALSE 0.219 70.000 0.000 NA   NA
 3768053 3768054 MAE_09370 MAE_09380     TRUE 0.442 27.000 0.000 NA   NA
 3768056 3768057 MAE_09400 MAE_09410     FALSE 0.176 133.000 0.000 NA   NA
 3768057 3768058 MAE_09410 MAE_09420     FALSE 0.048 434.000 0.000 NA   NA
 3768058 3768059 MAE_09420 MAE_09430     TRUE 0.409 29.000 0.000 NA   NA
 3768059 3768060 MAE_09430 MAE_09440     FALSE 0.084 279.000 0.000 NA   NA
 3768060 3768061 MAE_09440 MAE_09450     FALSE 0.161 149.000 0.000 NA   NA
 3768063 3768064 MAE_09470 MAE_09480     FALSE 0.186 123.000 0.000 NA   NA
 3768065 3768066 MAE_09490 MAE_09500 psaM   TRUE 0.761 163.000 0.184 NA   NA
 3768068 3768069 MAE_09520 MAE_09530     FALSE 0.076 303.000 0.000 NA   NA
 3768070 3768071 MAE_09540 MAE_09550     TRUE 0.907 27.000 0.029 NA   NA
 3768071 3768072 MAE_09550 MAE_09560     FALSE 0.102 231.000 0.000 NA   NA
 3768072 3768073 MAE_09560 MAE_09570   murD FALSE 0.141 179.000 0.000 1.000   NA
 3768082 3768083 MAE_09660 MAE_09670     TRUE 0.786 100.000 0.057 NA   NA
 3768083 3768084 MAE_09670 MAE_09680     FALSE 0.094 253.000 0.000 NA   NA
 3768084 3768085 MAE_09680 MAE_09690     FALSE 0.227 59.000 0.000 NA   NA
 3768087 3768088 MAE_09710 MAE_09720 pilM pilN TRUE 0.988 10.000 0.087 NA Y NA
 3768088 3768089 MAE_09720 MAE_09730 pilN pilO TRUE 0.998 -3.000 0.760 NA   NA
 3768089 3768090 MAE_09730 MAE_09740 pilO pilQ TRUE 0.851 63.000 0.240 NA   NA
 3768090 3768091 MAE_09740 MAE_09750 pilQ   FALSE 0.043 465.000 0.000 NA   NA
 3768091 3768092 MAE_09750 MAE_09760   rbfA TRUE 0.822 42.000 0.030 NA   NA
 3768092 3768093 MAE_09760 MAE_09770 rbfA   TRUE 0.583 221.000 0.025 1.000 N NA
 3768097 3768098 MAE_09810 MAE_09820     FALSE 0.036 555.000 0.000 NA   NA
 3768098 3768099 MAE_09820 MAE_09830     FALSE 0.227 58.000 0.000 NA   NA
 3768099 3768100 MAE_09830 MAE_09840     TRUE 0.914 0.000 0.000 NA   NA
 3768102 3768103 MAE_09860 MAE_09870     FALSE 0.102 230.000 0.000 NA   NA
 3768104 3768105 MAE_09880 MAE_09890     TRUE 0.900 12.000 0.000 1.000 Y NA
 3768108 3768109 MAE_09920 MAE_09930     TRUE 0.992 3.000 0.222 NA   NA
 3768110 3768111 MAE_09940 MAE_09950     TRUE 0.962 -7.000 0.000 NA   NA
 3768111 3768112 MAE_09950 MAE_09960     FALSE 0.210 89.000 0.000 NA   NA
 3768114 3768115 MAE_09980 MAE_09990     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 3768115 3768116 MAE_09990 MAE_10000     TRUE 0.962 -7.000 0.000 NA   NA
 3768116 3768117 MAE_10000 MAE_10010     FALSE 0.133 179.000 0.000 NA   NA
 3768117 3768118 MAE_10010 MAE_10020     FALSE 0.046 446.000 0.000 NA   NA
 3768118 3768119 MAE_10020 MAE_10030     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 3768119 3768120 MAE_10030 MAE_10040     TRUE 0.808 6.000 0.000 NA   NA
 3768120 3768121 MAE_10040 MAE_10050     FALSE 0.098 244.000 0.000 NA   NA
 3768122 3768123 MAE_10060 MAE_10070     TRUE 0.991 6.000 0.744 NA   NA
 3768124 3768125 MAE_10080 MAE_10090     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3768125 3768126 MAE_10090 MAE_10100     FALSE 0.061 358.000 0.000 NA   NA
 3768126 3768127 MAE_10100 MAE_10110     TRUE 0.489 317.000 0.021 0.057   NA
 3768129 3768130 MAE_10130 MAE_10140     FALSE 0.198 112.000 0.000 NA   NA
 3768130 3768131 MAE_10140 MAE_10150     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 3768132 3768133 MAE_10160 MAE_10170     FALSE 0.125 191.000 0.000 NA   NA
 3768133 3768134 MAE_10170 MAE_10180     TRUE 0.735 11.000 0.000 NA   NA
 3768135 3768136 MAE_10190 MAE_10200     FALSE 0.227 63.000 0.000 NA   NA
 3768136 3768137 MAE_10200 MAE_10210     FALSE 0.131 182.000 0.000 NA   NA
 3768137 3768138 MAE_10210 MAE_10220   psbA1 FALSE 0.227 62.000 0.000 NA   NA
 3768142 3768143 MAE_10260 MAE_10270 apcB apcA TRUE 0.885 80.000 0.906 0.003   NA
 3768143 3768144 MAE_10270 MAE_10280 apcA ruvA FALSE 0.074 325.000 0.000 1.000   NA
 3768146 3768147 MAE_10300 MAE_10310     FALSE 0.054 385.000 0.000 NA   NA
 3768148 3768149 MAE_10320 MAE_10330     FALSE 0.216 78.000 0.000 NA   NA
 3768151 3768152 MAE_10350 MAE_10360     TRUE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 3768154 3768155 MAE_10380 MAE_10390 psbA2   FALSE 0.209 93.000 0.000 NA   NA
 3768155 3768156 MAE_10390 MAE_10400     TRUE 0.993 3.000 0.250 NA   NA
 3768156 3768157 MAE_10400 MAE_10410     FALSE 0.193 116.000 0.000 NA   NA
 3768157 3768158 MAE_10410 MAE_10420     FALSE 0.105 224.000 0.000 NA   NA
 3768158 3768159 MAE_10420 MAE_10430     TRUE 0.914 0.000 0.000 NA   NA
 3768161 3768162 MAE_10450 MAE_10460     TRUE 0.994 -45.000 0.000 1.000 Y NA
 3768163 3768164 MAE_10470 MAE_10480     FALSE 0.048 434.000 0.000 NA   NA
 3768164 3768165 MAE_10480 MAE_10490     FALSE 0.093 256.000 0.000 NA   NA
 3768165 3768166 MAE_10490 MAE_10500     FALSE 0.098 242.000 0.000 NA   NA
 3768167 3768168 MAE_10510 MAE_10520 psbA3   FALSE 0.190 118.000 0.000 NA   NA
 3768168 3768169 MAE_10520 MAE_10530     FALSE 0.221 68.000 0.000 NA   NA
 3768169 3768170 MAE_10530 MAE_10540     TRUE 0.994 3.000 0.667 NA   NA
 3768172 3768173 MAE_10560 MAE_10570     TRUE 0.970 18.000 0.357 NA   NA
 3768173 3768174 MAE_10570 MAE_10580     FALSE 0.031 1074.000 0.000 1.000   NA
 3768174 3768175 MAE_10580 MAE_10590     FALSE 0.133 179.000 0.000 NA   NA
 3768175 3768176 MAE_10590 MAE_10600     FALSE 0.157 155.000 0.000 NA   NA
 3768176 3768177 MAE_10600 MAE_10610     TRUE 0.374 171.000 0.000 1.000 Y NA
 3768178 3768179 MAE_10620 MAE_10630     TRUE 0.805 102.000 0.087 0.063   NA
 3768180 3768181 MAE_10640 MAE_10650     TRUE 0.305 37.000 0.000 NA   NA
 3768181 3768182 MAE_10650 MAE_10660     FALSE 0.035 578.000 0.000 NA   NA
 3768182 3768183 MAE_10660 MAE_10670     FALSE 0.064 360.000 0.000 1.000   NA
 3768185 3768186 MAE_10690 MAE_10700     TRUE 0.845 4.000 0.000 NA   NA
 3768188 3768189 MAE_10720 MAE_10730     FALSE 0.089 267.000 0.000 NA   NA
 3768189 3768190 MAE_10730 MAE_10740     FALSE 0.227 58.000 0.000 NA   NA
 3768192 3768193 MAE_10760 MAE_10770     TRUE 0.305 37.000 0.000 NA   NA
 3768194 3768195 MAE_10780 MAE_10790     FALSE 0.228 55.000 0.000 NA   NA
 3768197 3768198 MAE_10810 MAE_10820     FALSE 0.204 107.000 0.000 NA   NA
 3768199 3768200 MAE_10830 MAE_10840 rfbF   FALSE 0.073 312.000 0.000 NA   NA
 3768201 3768202 MAE_10850 MAE_10860     TRUE 0.780 8.000 0.000 NA   NA
 3768202 3768203 MAE_10860 MAE_10870     FALSE 0.071 321.000 0.000 NA   NA
 3768204 3768205 MAE_10880 MAE_10890   rfbG FALSE 0.084 278.000 0.000 NA   NA
 3768205 3768206 MAE_10890 MAE_10900 rfbG   FALSE 0.216 75.000 0.000 NA   NA
 3768206 3768207 MAE_10900 MAE_10910     TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3768207 3768208 MAE_10910 MAE_10920   rfbC TRUE 0.873 87.000 0.053 1.000 Y NA
 3768208 3768209 MAE_10920 MAE_10930 rfbC   TRUE 0.956 25.000 0.040 1.000 Y NA
 3768209 3768210 MAE_10930 MAE_10940     TRUE 0.966 2.000 0.000 NA Y NA
 3768210 3768211 MAE_10940 MAE_10950     FALSE 0.119 199.000 0.000 NA   NA
 3768211 3768212 MAE_10950 MAE_10960     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 3768212 3768213 MAE_10960 MAE_10970     FALSE 0.193 116.000 0.000 NA   NA
 3768213 3768214 MAE_10970 MAE_10980     FALSE 0.192 117.000 0.000 NA   NA
 3768214 3768215 MAE_10980 MAE_10990     TRUE 0.329 35.000 0.000 NA   NA
 3768215 3768216 MAE_10990 MAE_11000     FALSE 0.192 117.000 0.000 NA   NA
 3768216 3768217 MAE_11000 MAE_11010     TRUE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 3768217 3768218 MAE_11010 MAE_11020     FALSE 0.227 62.000 0.000 NA   NA
 3768218 3768219 MAE_11020 MAE_11030     TRUE 0.981 13.000 0.027 1.000 Y NA
 3768219 3768220 MAE_11030 MAE_11040     TRUE 0.998 -3.000 0.040 0.001 Y NA
 3768220 3768221 MAE_11040 MAE_11050     TRUE 0.984 5.000 0.040 1.000   NA
 3768221 3768222 MAE_11050 MAE_11060     TRUE 0.996 -3.000 0.111 NA   NA
 3768222 3768223 MAE_11060 MAE_11070     FALSE 0.062 352.000 0.000 NA   NA
 3768223 3768224 MAE_11070 MAE_11080     FALSE 0.170 140.000 0.000 NA   NA
 3768224 3768225 MAE_11080 MAE_11090     FALSE 0.099 222.000 0.000 1.000 N NA
 3768225 3768226 MAE_11090 MAE_11100     FALSE 0.142 172.000 0.000 NA   NA
 3768226 3768227 MAE_11100 MAE_11110   rpoC1 FALSE 0.164 147.000 0.000 NA   NA
 3768228 3768229 MAE_11120 MAE_11130     TRUE 0.998 -10.000 0.125 NA   NA
 3768229 3768230 MAE_11130 MAE_11140     FALSE 0.085 276.000 0.000 NA   NA
 3768230 3768231 MAE_11140 MAE_11150     TRUE 0.987 11.000 1.000 NA   NA
 3768231 3768232 MAE_11150 MAE_11160   ileS FALSE 0.206 104.000 0.000 NA   NA
 3768233 3768234 MAE_11170 MAE_11180     FALSE 0.115 205.000 0.000 NA   NA
 3768237 3768238 MAE_11210 MAE_11220     FALSE 0.053 393.000 0.000 NA   NA
 3768238 3768239 MAE_11220 MAE_11230     FALSE 0.227 60.000 0.000 NA   NA
 3768239 3768240 MAE_11230 MAE_11240     FALSE 0.068 332.000 0.000 NA   NA
 3768241 3768242 MAE_11250 MAE_11260     FALSE 0.085 246.000 0.000 NA N NA
 3768242 3768243 MAE_11260 MAE_11270     FALSE 0.094 254.000 0.000 NA   NA
 3768249 3768250 MAE_11330 MAE_11340     FALSE 0.090 266.000 0.000 NA   NA
 3768251 3768252 MAE_11350 MAE_11360     FALSE 0.097 245.000 0.000 NA   NA
 3768253 3768254 MAE_11370 MAE_11380     FALSE 0.099 239.000 0.000 NA   NA
 3768254 3768255 MAE_11380 MAE_11390     TRUE 0.254 46.000 0.000 NA   NA
 3768256 3768257 MAE_11400 MAE_11410     FALSE 0.110 213.000 0.000 NA   NA
 3768257 3768258 MAE_11410 MAE_11420     FALSE 0.063 365.000 0.000 1.000   NA
 3768266 3768267 MAE_11500 MAE_11510     FALSE 0.203 108.000 0.000 NA   NA
 3768267 3768268 MAE_11510 MAE_11520     FALSE 0.227 60.000 0.000 NA   NA
 3768269 3768270 MAE_11530 MAE_11540     FALSE 0.145 168.000 0.000 NA   NA
 3768270 3768271 MAE_11540 MAE_11550     FALSE 0.235 51.000 0.000 NA   NA
 3768271 3768272 MAE_11550 MAE_11560     FALSE 0.105 223.000 0.000 NA   NA
 3768272 3768273 MAE_11560 MAE_11570     FALSE 0.188 131.000 0.000 1.000   NA
 3768273 3768274 MAE_11570 MAE_11580     FALSE 0.187 122.000 0.000 NA   NA
 3768274 3768275 MAE_11580 MAE_11590     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3768275 3768276 MAE_11590 MAE_11600     FALSE 0.173 137.000 0.000 NA   NA
 3768276 3768277 MAE_11600 MAE_11610     TRUE 0.961 22.000 0.400 NA   NA
 3768278 3768279 MAE_11620 MAE_11630     FALSE 0.141 190.000 0.000 0.062   NA
 3768279 3768280 MAE_11630 MAE_11640     TRUE 0.424 28.000 0.000 NA   NA
 3768280 3768281 MAE_11640 MAE_11650     FALSE 0.131 181.000 0.000 NA   NA
 3768281 3768282 MAE_11650 MAE_11660     FALSE 0.215 81.000 0.000 NA   NA
 3768282 3768283 MAE_11660 MAE_11670     FALSE 0.188 120.000 0.000 NA   NA
 3768283 3768284 MAE_11670 MAE_11680     FALSE 0.065 357.000 0.000 1.000   NA
 3768284 3768285 MAE_11680 MAE_11690     FALSE 0.054 406.000 0.000 1.000   NA
 3768287 3768288 MAE_11710 MAE_11720     FALSE 0.220 69.000 0.000 NA   NA
 3768288 3768289 MAE_11720 MAE_11730     FALSE 0.125 192.000 0.000 NA   NA
 3768292 3768293 MAE_11760 MAE_11770 ndhC ndhK TRUE 0.932 48.000 0.428 0.003 Y NA
 3768293 3768294 MAE_11770 MAE_11780 ndhK ndhJ TRUE 0.997 1.000 0.406 0.003 Y NA
 3768296 3768297 MAE_11800 MAE_11810     TRUE 0.585 351.000 0.333 NA   NA
 3768298 3768299 MAE_11820 MAE_11830 psbV   TRUE 0.814 129.000 0.273 NA   NA
 3768300 3768301 MAE_11840 MAE_11850     TRUE 0.974 13.000 0.143 NA   NA
 3768301 3768302 MAE_11850 MAE_11860     FALSE 0.070 307.000 0.000 1.000 N NA
 3768302 3768303 MAE_11860 MAE_11870   clpP FALSE 0.215 58.000 0.000 1.000 N NA
 3768303 3768304 MAE_11870 MAE_11880 clpP   FALSE 0.111 212.000 0.000 NA   NA
 3768304 3768305 MAE_11880 MAE_11890   tgt TRUE 0.747 81.000 0.012 NA   NA
 3768305 3768306 MAE_11890 MAE_11900 tgt psbK TRUE 0.800 51.000 0.034 1.000   NA
 3768309 3768310 MAE_11930 MAE_11940     FALSE 0.121 197.000 0.000 NA   NA
 3768312 3768313 MAE_11960 MAE_11970     TRUE 0.996 -3.000 0.047 1.000   NA
 3768313 3768314 MAE_11970 MAE_11980     TRUE 0.239 50.000 0.000 NA   NA
 3768314 3768315 MAE_11980 MAE_11990     FALSE 0.161 150.000 0.000 NA   NA
 3768316 3768317 MAE_12000 MAE_12010     TRUE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 3768317 3768318 MAE_12010 MAE_12020     TRUE 0.273 42.000 0.000 NA   NA
 3768320 3768321 MAE_12040 MAE_12050     FALSE 0.217 104.000 0.000 1.000   NA
 3768324 3768325 MAE_12080 MAE_12090     TRUE 0.254 46.000 0.000 NA   NA
 3768327 3768328 MAE_12110 MAE_12120     FALSE 0.117 201.000 0.000 NA   NA
 3768330 3768331 MAE_12140 MAE_12150     TRUE 0.767 9.000 0.000 NA   NA
 3768331 3768332 MAE_12150 MAE_12160     FALSE 0.045 455.000 0.000 NA   NA
 3768332 3768333 MAE_12160 MAE_12170     TRUE 0.457 26.000 0.000 NA   NA
 3768333 3768334 MAE_12170 MAE_12180     TRUE 0.767 9.000 0.000 NA   NA
 3768334 3768335 MAE_12180 MAE_12190   chlH TRUE 0.785 61.000 0.031 NA   NA
 3768335 3768336 MAE_12190 MAE_12200 chlH   FALSE 0.201 109.000 0.000 NA   NA
 3768337 3768338 MAE_12210 MAE_12220     TRUE 0.989 8.000 0.800 NA   NA
 3768338 3768339 MAE_12220 MAE_12230     TRUE 0.990 7.000 0.667 NA   NA
 3768339 3768340 MAE_12230 MAE_12240     FALSE 0.086 273.000 0.000 NA   NA
 3768341 3768342 MAE_12250 MAE_12260     TRUE 0.829 229.000 0.429 0.008 Y NA
 3768342 3768343 MAE_12260 MAE_12270     TRUE 1.000 -61.000 1.000 0.037 Y NA
 3768343 3768344 MAE_12270 MAE_12280     FALSE 0.053 389.000 0.000 NA   NA
 3768344 3768345 MAE_12280 MAE_12290     TRUE 0.998 -3.000 0.600 NA   NA
 3768345 3768346 MAE_12290 MAE_12300     TRUE 0.570 20.000 0.000 NA   NA
 3768346 3768347 MAE_12300 MAE_12310     FALSE 0.179 130.000 0.000 NA   NA
 3768347 3768348 MAE_12310 MAE_12320     TRUE 0.972 -16.000 0.000 NA   NA
 3768348 3768349 MAE_12320 MAE_12330   cobW FALSE 0.055 383.000 0.000 NA   NA
 3768352 3768353 MAE_12360 MAE_12370 crtH   FALSE 0.109 215.000 0.000 NA   NA
 3768353 3768354 MAE_12370 MAE_12380     FALSE 0.220 69.000 0.000 NA   NA
 3768354 3768355 MAE_12380 MAE_12390     TRUE 0.914 0.000 0.000 NA   NA
 3768355 3768356 MAE_12390 MAE_12400     FALSE 0.207 99.000 0.000 NA   NA
 3768356 3768357 MAE_12400 MAE_12410     FALSE 0.065 341.000 0.000 NA   NA
 3768357 3768358 MAE_12410 MAE_12420     FALSE 0.209 93.000 0.000 NA   NA
 3768358 3768359 MAE_12420 MAE_12430     FALSE 0.102 249.000 0.000 1.000   NA
 3768359 3768360 MAE_12430 MAE_12440     FALSE 0.096 247.000 0.000 NA   NA
 3768361 3768362 MAE_t003 MAE_12450     FALSE 0.228 55.000 0.000 NA   NA
 3768364 3768365 MAE_12470 MAE_12480     FALSE 0.047 462.000 0.000 1.000   NA
 3768367 3768368 MAE_12500 MAE_12510     FALSE 0.058 372.000 0.000 NA   NA
 3768369 3768370 MAE_12520 MAE_12530     FALSE 0.155 157.000 0.000 NA   NA
 3768370 3768371 MAE_12530 MAE_12540     FALSE 0.101 232.000 0.000 NA   NA
 3768371 3768372 MAE_12540 MAE_12550     FALSE 0.105 223.000 0.000 NA   NA
 3768372 3768373 MAE_12550 MAE_12560   cpcD FALSE 0.222 89.000 0.000 1.000   NA
 3768373 3768374 MAE_12560 MAE_12570 cpcD petH FALSE 0.092 289.000 0.000 0.005   NA
 3768374 3768375 MAE_12570 MAE_12580 petH   FALSE 0.114 208.000 0.000 NA   NA
 3768375 3768376 MAE_12580 MAE_12590     FALSE 0.209 93.000 0.000 NA   NA
 3768376 3768377 MAE_12590 MAE_12600     FALSE 0.107 235.000 0.000 1.000   NA
 3768377 3768378 MAE_12600 MAE_12610     FALSE 0.056 377.000 0.000 NA   NA
 3768379 3768380 MAE_12620 MAE_12630     FALSE 0.035 578.000 0.000 NA   NA
 3768380 3768381 MAE_12630 MAE_12640     FALSE 0.083 283.000 0.000 NA   NA
 3768382 3768383 MAE_12650 MAE_12660     FALSE 0.047 436.000 0.000 NA   NA
 3768384 3768385 MAE_12670 MAE_12680     FALSE 0.207 100.000 0.000 NA   NA
 3768385 3768386 MAE_12680 MAE_12690   cysH FALSE 0.226 82.000 0.000 1.000   NA
 3768388 3768389 MAE_12710 MAE_12720     FALSE 0.120 198.000 0.000 NA   NA
 3768389 3768390 MAE_12720 MAE_12730     FALSE 0.032 650.000 0.000 NA   NA
 3768390 3768391 MAE_12730 MAE_12740     TRUE 0.884 52.000 0.667 NA   NA
 3768392 3768393 MAE_12750 MAE_12760     TRUE 0.987 17.000 0.600 0.057 Y NA
 3768397 3768398 MAE_12800 MAE_12810     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 3768398 3768399 MAE_12810 MAE_12820     FALSE 0.235 51.000 0.000 NA   NA
 3768400 3768401 MAE_12830 MAE_12840     TRUE 0.881 50.000 0.500 NA   NA
 3768401 3768402 MAE_12840 MAE_12850     TRUE 0.861 119.000 0.800 1.000   NA
 3768404 3768405 MAE_12870 MAE_12880     TRUE 0.278 41.000 0.000 NA   NA
 3768409 3768410 MAE_12920 MAE_12930 pys pds TRUE 0.870 106.000 0.691 1.000   NA
 3768411 3768412 MAE_12940 MAE_12950     FALSE 0.187 122.000 0.000 NA   NA
 3768412 3768413 MAE_12950 MAE_12960     TRUE 0.944 5.000 0.000 1.000 Y NA
 3768414 3768415 MAE_12970 MAE_12980 ycf37   TRUE 0.654 211.000 0.074 1.000   NA
 3768415 3768416 MAE_12980 MAE_12990     TRUE 0.998 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 3768420 3768421 MAE_13030 MAE_13040     FALSE 0.192 127.000 0.000 1.000   NA
 3768423 3768424 MAE_13060 MAE_13070     TRUE 0.251 50.000 0.000 1.000   NA
 3768424 3768425 MAE_13070 MAE_13080     TRUE 0.358 32.000 0.000 NA   NA
 3768426 3768427 MAE_13090 MAE_13100     FALSE 0.140 165.000 0.000 1.000 N NA
 3768428 3768429 MAE_13110 MAE_13120     TRUE 0.254 46.000 0.000 NA   NA
 3768429 3768430 MAE_13120 MAE_13130     TRUE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 3768431 3768432 MAE_13140 MAE_13150     FALSE 0.211 87.000 0.000 NA   NA
 3768432 3768433 MAE_13150 MAE_13160     FALSE 0.238 88.000 0.000 0.001   NA
 3768435 3768436 MAE_13180 MAE_13190     TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3768436 3768437 MAE_13190 MAE_13200     FALSE 0.174 136.000 0.000 NA   NA
 3768437 3768438 MAE_13200 MAE_13210     TRUE 0.564 21.000 0.000 1.000   NA
 3768438 3768439 MAE_13210 MAE_13220     TRUE 0.998 -3.000 0.200 0.020 Y NA
 3768440 3768441 MAE_13230 MAE_13240     FALSE 0.113 209.000 0.000 NA   NA
 3768442 3768443 MAE_13250 MAE_13260     FALSE 0.113 209.000 0.000 NA   NA
 3768443 3768444 MAE_13260 MAE_13270     TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3768444 3768445 MAE_13270 MAE_13280     TRUE 0.654 15.000 0.000 NA   NA
 3768445 3768446 MAE_13280 MAE_13290     FALSE 0.068 332.000 0.000 NA   NA
 3768446 3768447 MAE_13290 MAE_13300     FALSE 0.041 490.000 0.000 NA   NA
 3768447 3768448 MAE_13300 MAE_13310     FALSE 0.040 502.000 0.000 NA   NA
 3768448 3768449 MAE_13310 MAE_13320     TRUE 0.802 80.000 0.073 NA   NA
 3768449 3768450 MAE_13320 MAE_13330     FALSE 0.136 175.000 0.000 NA   NA
 3768450 3768451 MAE_13330 MAE_13340     FALSE 0.048 433.000 0.000 NA   NA
 3768451 3768452 MAE_13340 MAE_13350     TRUE 0.273 42.000 0.000 NA   NA
 3768452 3768453 MAE_13350 MAE_13360     FALSE 0.031 878.000 0.000 1.000   NA
 3768453 3768454 MAE_13360 MAE_13370     TRUE 0.936 50.000 0.667 0.001 Y NA
 3768454 3768455 MAE_13370 MAE_13380     TRUE 0.978 -58.000 0.000 NA   NA
 3768457 3768458 MAE_13400 MAE_13410     TRUE 0.781 46.000 0.011 1.000 N NA
 3768460 3768461 MAE_13430 MAE_13440     TRUE 0.507 24.000 0.000 1.000   NA
 3768461 3768462 MAE_13440 MAE_13450     FALSE 0.228 77.000 0.000 1.000   NA
 3768462 3768463 MAE_13450 MAE_13460     FALSE 0.207 102.000 0.000 NA   NA
 3768463 3768464 MAE_13460 MAE_13470     TRUE 0.392 30.000 0.000 NA   NA
 3768464 3768465 MAE_13470 MAE_13480     FALSE 0.040 534.000 0.000 1.000   NA
 3768465 3768466 MAE_13480 MAE_13490     FALSE 0.099 257.000 0.000 1.000   NA
 3768467 3768468 MAE_13500 MAE_13510     FALSE 0.217 73.000 0.000 NA   NA
 3768468 3768469 MAE_13510 MAE_13520     FALSE 0.110 213.000 0.000 NA   NA
 3768471 3768472 MAE_13540 MAE_13550     TRUE 0.997 -3.000 0.200 NA   NA
 3768472 3768473 MAE_13550 MAE_13560     FALSE 0.152 161.000 0.000 NA   NA
 3768473 3768474 MAE_13560 MAE_13570     FALSE 0.143 171.000 0.000 NA   NA
 3768476 3768477 MAE_13590 MAE_13600     TRUE 0.289 39.000 0.000 NA   NA
 3768477 3768478 MAE_13600 MAE_13610     FALSE 0.214 82.000 0.000 NA   NA
 3768479 3768480 MAE_13620 MAE_13630 dnaK gltS FALSE 0.057 358.000 0.000 1.000 N NA
 3768481 3768482 MAE_13640 MAE_13650   por TRUE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 3768482 3768483 MAE_13650 MAE_13660 por   FALSE 0.026 825.000 0.000 NA N NA
 3768483 3768484 MAE_13660 MAE_13670     FALSE 0.193 74.000 0.000 NA N NA
 3768485 3768486 MAE_13680 MAE_13690     FALSE 0.152 161.000 0.000 NA   NA
 3768486 3768487 MAE_13690 MAE_13700     FALSE 0.100 235.000 0.000 NA   NA
 3768487 3768488 MAE_13700 MAE_13710     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3768490 3768491 MAE_13730 MAE_13740     FALSE 0.216 78.000 0.000 NA   NA
 3768492 3768493 MAE_13750 MAE_13760     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3768494 3768495 MAE_13770 MAE_13780     FALSE 0.149 165.000 0.000 NA   NA
 3768495 3768496 MAE_13780 MAE_13790     FALSE 0.078 298.000 0.000 NA   NA
 3768496 3768497 MAE_13790 MAE_13800     FALSE 0.065 342.000 0.000 NA   NA
 3768497 3768498 MAE_13800 MAE_13810     FALSE 0.173 137.000 0.000 NA   NA
 3768498 3768499 MAE_13810 MAE_13820     FALSE 0.227 63.000 0.000 NA   NA
 3768499 3768500 MAE_13820 MAE_13830     FALSE 0.111 212.000 0.000 NA   NA
 3768500 3768501 MAE_13830 MAE_13840     TRUE 0.735 11.000 0.000 NA   NA
 3768502 3768503 MAE_13850 MAE_13860     FALSE 0.125 191.000 0.000 NA   NA
 3768504 3768505 MAE_13870 MAE_13880     FALSE 0.156 167.000 0.000 1.000   NA
 3768505 3768506 MAE_13880 MAE_13890     FALSE 0.188 131.000 0.000 1.000   NA
 3768507 3768508 MAE_13900 MAE_13910     TRUE 0.998 -7.000 0.132 NA   NA
 3768508 3768509 MAE_13910 MAE_13920   cysE TRUE 0.837 77.000 0.214 NA   NA
 3768509 3768510 MAE_13920 MAE_13930 cysE cysK TRUE 0.997 -3.000 0.019 0.002 Y NA
 3768510 3768511 MAE_13930 MAE_13940 cysK   FALSE 0.199 111.000 0.000 NA   NA
 3768512 3768513 MAE_13950 MAE_13960     FALSE 0.209 95.000 0.000 NA   NA
 3768513 3768514 MAE_13960 MAE_13970     FALSE 0.158 402.000 0.000 NA Y NA
 3768514 3768515 MAE_13970 MAE_13980     FALSE 0.225 65.000 0.000 NA   NA
 3768517 3768518 MAE_14000 MAE_14010     FALSE 0.199 111.000 0.000 NA   NA
 3768518 3768519 MAE_14010 MAE_14020     TRUE 0.998 -3.000 0.600 NA   NA
 3768519 3768520 MAE_14020 MAE_14030     FALSE 0.149 141.000 0.000 NA N NA
 3768523 3768524 MAE_14060 MAE_14070     FALSE 0.154 159.000 0.000 NA   NA
 3768525 3768526 MAE_14080 MAE_14090     FALSE 0.168 143.000 0.000 NA   NA
 3768529 3768530 MAE_14120 MAE_14130     TRUE 0.962 -7.000 0.000 NA   NA
 3768530 3768531 MAE_14130 MAE_14140     FALSE 0.075 305.000 0.000 NA   NA
 3768531 3768532 MAE_14140 MAE_14150     FALSE 0.216 76.000 0.000 NA   NA
 3768532 3768533 MAE_14150 MAE_14160     FALSE 0.179 130.000 0.000 NA   NA
 3768533 3768534 MAE_14160 MAE_14170     TRUE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 3768535 3768536 MAE_14180 MAE_14190     FALSE 0.201 85.000 0.000 1.000 N NA
 3768536 3768537 MAE_14190 MAE_14200     TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3768539 3768540 MAE_14220 MAE_14230     FALSE 0.041 495.000 0.000 NA   NA
 3768542 3768543 MAE_14250 MAE_14260     FALSE 0.098 243.000 0.000 NA   NA
 3768544 3768545 MAE_14270 MAE_14280   nblB FALSE 0.217 74.000 0.000 0.023 N NA
 3768549 3768550 MAE_14320 MAE_14330   infB TRUE 0.687 132.000 0.007 NA   NA
 3768550 3768551 MAE_14330 MAE_14340 infB   TRUE 0.806 112.000 0.171 NA N NA
 3768551 3768552 MAE_14340 MAE_14350     TRUE 0.998 -3.000 0.323 NA Y NA
 3768552 3768553 MAE_14350 MAE_14360     TRUE 0.591 392.000 0.759 NA   NA
 3768555 3768556 MAE_14380 MAE_14390     TRUE 0.284 40.000 0.000 NA   NA
 3768556 3768557 MAE_14390 MAE_14400     TRUE 0.490 24.000 0.000 NA   NA
 3768558 3768559 MAE_14410 MAE_14420     FALSE 0.119 188.000 0.000 1.000 N NA
 3768559 3768560 MAE_14420 MAE_14430     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3768560 3768561 MAE_14430 MAE_14440     TRUE 0.908 35.000 0.274 NA   NA
 3768561 3768562 MAE_14440 MAE_14450     TRUE 0.278 41.000 0.000 NA   NA
 3768562 3768563 MAE_14450 MAE_14460     FALSE 0.116 194.000 0.000 1.000 N NA
 3768566 3768567 MAE_14490 MAE_14500 petF   FALSE 0.053 392.000 0.000 NA   NA
 3768567 3768568 MAE_14500 MAE_14510     TRUE 0.930 32.000 0.511 NA   NA
 3768570 3768571 MAE_14530 MAE_14540     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 3768572 3768573 MAE_14550 MAE_14560 crtE   TRUE 0.967 18.000 0.214 1.000   NA
 3768573 3768574 MAE_14560 MAE_14570     FALSE 0.082 285.000 0.000 NA   NA
 3768578 3768579 MAE_14610 MAE_14620     TRUE 0.442 27.000 0.000 NA   NA
 3768579 3768580 MAE_14620 MAE_14630     TRUE 0.999 -22.000 0.312 NA   NA
 3768581 3768582 MAE_14640 MAE_14650     FALSE 0.231 70.000 0.000 1.000   NA
 3768582 3768583 MAE_14650 MAE_14660     FALSE 0.202 83.000 0.000 1.000 N NA
 3768584 3768585 MAE_14670 MAE_14680     FALSE 0.030 646.000 0.000 1.000 N NA
 3768586 3768587 MAE_14690 MAE_14700     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3768591 3768592 MAE_14740 MAE_14750   thiG TRUE 0.526 22.000 0.000 NA   NA
 3768594 3768595 MAE_14770 MAE_14780 ntcD ntcC TRUE 0.937 47.000 0.556 0.002 Y NA
 3768595 3768596 MAE_14780 MAE_14790 ntcC ntcB TRUE 0.868 148.000 0.191 0.002 Y NA
 3768596 3768597 MAE_14790 MAE_14800 ntcB   TRUE 0.866 197.000 0.915 NA Y NA
 3768597 3768598 MAE_14800 MAE_14810     TRUE 0.470 25.000 0.000 NA   NA
 3768599 3768600 MAE_14820 MAE_14830     FALSE 0.049 445.000 0.000 1.000   NA
 3768601 3768602 MAE_14840 MAE_14850     FALSE 0.168 143.000 0.000 NA   NA
 3768604 3768605 MAE_14870 MAE_14880     FALSE 0.165 146.000 0.000 NA   NA
 3768606 3768607 MAE_14890 MAE_14900   gltD FALSE 0.059 380.000 0.000 1.000   NA
 3768609 3768610 MAE_14920 MAE_14930   ho1 FALSE 0.205 105.000 0.000 NA   NA
 3768610 3768611 MAE_14930 MAE_14940 ho1   FALSE 0.038 532.000 0.000 NA   NA
 3768611 3768612 MAE_14940 MAE_14950   acpP FALSE 0.187 122.000 0.000 NA   NA
 3768612 3768613 MAE_14950 MAE_14960 acpP   TRUE 0.915 71.000 0.346 1.000 Y NA
 3768613 3768614 MAE_14960 MAE_14970     TRUE 0.793 83.000 0.062 1.000 N NA
 3768614 3768615 MAE_14970 MAE_14980     FALSE 0.214 63.000 0.000 1.000 N NA
 3768615 3768616 MAE_14980 MAE_14990     TRUE 0.974 -19.000 0.000 NA   NA
 3768618 3768619 MAE_15010 MAE_15020     TRUE 0.998 -3.000 0.833 NA   NA
 3768619 3768620 MAE_15020 MAE_15030     TRUE 0.358 32.000 0.000 NA   NA
 3768622 3768623 MAE_15040 MAE_15050     TRUE 0.916 33.000 0.308 NA   NA
 3768623 3768624 MAE_15050 MAE_15060     FALSE 0.228 77.000 0.000 1.000   NA
 3768624 3768625 MAE_15060 MAE_15070     FALSE 0.223 86.000 0.000 1.000   NA
 3768626 3768627 MAE_15080 MAE_15090     TRUE 0.424 28.000 0.000 NA   NA
 3768627 3768628 MAE_15090 MAE_15100     FALSE 0.211 87.000 0.000 NA   NA
 3768629 3768630 MAE_15110 MAE_15120   ndhF3 FALSE 0.237 47.000 0.000 1.000 N NA
 3768630 3768631 MAE_15120 MAE_15130 ndhF3 ecaB TRUE 0.906 82.000 0.238 1.000 Y NA
 3768631 3768632 MAE_15130 MAE_15140 ecaB ndhD3 TRUE 0.841 79.000 0.250 1.000 N NA
 3768634 3768635 MAE_15160 MAE_15170 cupA   FALSE 0.214 83.000 0.000 NA   NA
 3768637 3768638 MAE_15190 MAE_15200   rne FALSE 0.033 709.000 0.000 1.000   NA
 3768638 3768639 MAE_15200 MAE_15210 rne rhnB TRUE 0.995 -3.000 0.033 0.013 N NA
 3768644 3768645 MAE_15260 MAE_15270     TRUE 0.833 184.000 0.188 0.019 Y NA
 3768646 3768647 MAE_15280 MAE_15290     FALSE 0.101 234.000 0.000 NA   NA
 3768648 3768649 MAE_15300 MAE_15310     FALSE 0.172 138.000 0.000 NA   NA
 3768649 3768650 MAE_15310 MAE_15320     FALSE 0.109 215.000 0.000 NA   NA
 3768650 3768651 MAE_15320 MAE_15330     TRUE 0.392 30.000 0.000 NA   NA
 3768651 3768652 MAE_15330 MAE_15340     FALSE 0.094 253.000 0.000 NA   NA
 3768652 3768653 MAE_15340 MAE_15350     FALSE 0.057 373.000 0.000 NA   NA
 3768653 3768654 MAE_15350 MAE_15360     FALSE 0.132 180.000 0.000 NA   NA
 3768655 3768656 MAE_15370 MAE_15380 aroA   FALSE 0.130 196.000 0.000 1.000   NA
 3768657 3768658 MAE_15390 MAE_15400 purF purL TRUE 0.772 268.000 0.223 1.000 Y NA
 3768659 3768660 MAE_15410 MAE_15420     TRUE 0.997 -3.000 0.333 NA   NA
 3768660 3768661 MAE_15420 MAE_15430     FALSE 0.190 118.000 0.000 NA   NA
 3768661 3768662 MAE_15430 MAE_15440     FALSE 0.033 634.000 0.000 NA   NA
 3768663 3768664 MAE_15450 MAE_15460     FALSE 0.206 104.000 0.000 NA   NA
 3768664 3768665 MAE_15460 MAE_15470     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3768665 3768666 MAE_15470 MAE_15480     FALSE 0.098 242.000 0.000 NA   NA
 3768666 3768667 MAE_15480 MAE_15490     TRUE 0.604 18.000 0.000 NA   NA
 3768667 3768668 MAE_15490 MAE_15500     FALSE 0.062 353.000 0.000 NA   NA
 3768668 3768669 MAE_15500 MAE_15510     TRUE 0.982 -136.000 0.000 0.059   NA
 3768672 3768673 MAE_15540 MAE_15550     TRUE 0.250 47.000 0.000 NA   NA
 3768673 3768674 MAE_15550 MAE_15560     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3768674 3768675 MAE_15560 MAE_15570   leuB FALSE 0.075 288.000 0.000 1.000 N NA
 3768675 3768676 MAE_15570 MAE_15580 leuB   FALSE 0.152 161.000 0.000 NA   NA
 3768676 3768677 MAE_15580 MAE_15590     TRUE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 3768677 3768678 MAE_15590 MAE_15600     TRUE 0.713 29.000 0.000 1.000 Y NA
 3768679 3768680 MAE_15610 MAE_15620     TRUE 0.337 34.000 0.000 NA   NA
 3768683 3768684 MAE_15650 MAE_15660     TRUE 0.409 29.000 0.000 NA   NA
 3768684 3768685 MAE_15660 MAE_15670     FALSE 0.165 156.000 0.000 1.000   NA
 3768685 3768686 MAE_15670 MAE_15680     FALSE 0.095 250.000 0.000 NA   NA
 3768687 3768688 MAE_15690 MAE_15700     FALSE 0.049 429.000 0.000 NA   NA
 3768688 3768689 MAE_15700 MAE_15710     FALSE 0.218 102.000 0.000 1.000   NA
 3768689 3768690 MAE_15710 MAE_15720   argD FALSE 0.199 120.000 0.000 1.000   NA
 3768692 3768693 MAE_15740 MAE_15750     TRUE 0.879 39.000 0.182 NA   NA
 3768696 3768697 MAE_15780 MAE_15790 pilT kaiB TRUE 0.854 112.000 0.462 1.000   NA
 3768700 3768701 MAE_15820 MAE_15830     FALSE 0.224 66.000 0.000 NA   NA
 3768701 3768702 MAE_15830 MAE_15840     TRUE 0.916 34.000 0.357 NA   NA
 3768703 3768704 MAE_15850 MAE_15860     FALSE 0.058 372.000 0.000 NA   NA
 3768704 3768705 MAE_15860 MAE_15870     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3768705 3768706 MAE_15870 MAE_15880     FALSE 0.096 247.000 0.000 NA   NA
 3768706 3768707 MAE_15880 MAE_15890     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3768708 3768709 MAE_15900 MAE_15910     TRUE 0.273 42.000 0.000 NA   NA
 3768710 3768711 MAE_15920 MAE_15930     FALSE 0.041 496.000 0.000 NA   NA
 3768711 3768712 MAE_15930 MAE_15940     FALSE 0.192 117.000 0.000 NA   NA
 3768712 3768713 MAE_15940 MAE_15950   dnaK FALSE 0.166 145.000 0.000 NA   NA
 3768713 3768714 MAE_15950 MAE_15960 dnaK dnaJ TRUE 0.851 195.000 0.390 0.004 Y NA
 3768714 3768715 MAE_15960 MAE_15970 dnaJ pyrD FALSE 0.192 107.000 0.000 1.000 N NA
 3768715 3768716 MAE_15970 MAE_15980 pyrD   FALSE 0.135 176.000 0.000 NA   NA
 3768717 3768718 MAE_15990 MAE_16000 folC   FALSE 0.225 305.000 0.000 1.000 Y NA
 3768719 3768720 MAE_16010 MAE_16020   xisH FALSE 0.056 376.000 0.000 NA   NA
 3768720 3768721 MAE_16020 MAE_16030 xisH xisI TRUE 0.999 -12.000 0.800 NA   NA
 3768721 3768722 MAE_16030 MAE_16040 xisI   FALSE 0.142 172.000 0.000 NA   NA
 3768722 3768723 MAE_16040 MAE_16050     FALSE 0.105 223.000 0.000 NA   NA
 3768723 3768724 MAE_16050 MAE_16060     FALSE 0.040 500.000 0.000 NA   NA
 3768724 3768725 MAE_16060 MAE_16070   recA FALSE 0.170 128.000 0.000 1.000 N NA
 3768725 3768726 MAE_16070 MAE_16080 recA   FALSE 0.192 117.000 0.000 NA   NA
 3768726 3768727 MAE_16080 MAE_16090     FALSE 0.046 446.000 0.000 NA   NA
 3768727 3768728 MAE_16090 MAE_16100     FALSE 0.179 129.000 0.000 NA   NA
 3768728 3768729 MAE_16100 MAE_16110     FALSE 0.235 51.000 0.000 NA   NA
 3768729 3768730 MAE_16110 MAE_16120     FALSE 0.213 85.000 0.000 NA   NA
 3768731 3768732 MAE_16130 MAE_16140     TRUE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 3768734 3768735 MAE_16160 MAE_16170     FALSE 0.214 82.000 0.000 NA   NA
 3768736 3768737 MAE_16180 MAE_16190     FALSE 0.209 95.000 0.000 NA   NA
 3768738 3768739 MAE_16200 MAE_16210     FALSE 0.149 165.000 0.000 NA   NA
 3768739 3768740 MAE_16210 MAE_16220     TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 3768741 3768742 MAE_16230 MAE_16240 chlL   TRUE 0.565 239.000 0.022 NA   NA
 3768742 3768743 MAE_16240 MAE_16250   chlN TRUE 0.956 17.000 0.039 NA   NA
 3768743 3768744 MAE_16250 MAE_16260 chlN   FALSE 0.144 169.000 0.000 NA   NA
 3768744 3768745 MAE_16260 MAE_16270     TRUE 0.995 2.000 0.429 NA   NA
 3768745 3768746 MAE_16270 MAE_16280     FALSE 0.198 112.000 0.000 NA   NA
 3768746 3768747 MAE_16280 MAE_16290     FALSE 0.067 334.000 0.000 NA   NA
 3768748 3768749 MAE_16300 MAE_16310     FALSE 0.183 126.000 0.000 NA   NA
 3768749 3768750 MAE_16310 MAE_16320     TRUE 0.967 -10.000 0.000 NA   NA
 3768750 3768751 MAE_16320 MAE_16330     FALSE 0.069 326.000 0.000 NA   NA
 3768751 3768752 MAE_16330 MAE_16340     TRUE 0.982 10.000 0.174 NA   NA
 3768754 3768755 MAE_16360 MAE_16370     FALSE 0.189 119.000 0.000 NA   NA
 3768755 3768756 MAE_16370 MAE_16380     TRUE 0.962 -7.000 0.000 NA   NA
 3768760 3768761 MAE_16420 MAE_16430     FALSE 0.189 119.000 0.000 NA   NA
 3768761 3768762 MAE_16430 MAE_16440     TRUE 0.998 -7.000 0.400 NA   NA
 3768765 3768766 MAE_16470 MAE_16480     FALSE 0.091 275.000 0.000 1.000   NA
 3768766 3768767 MAE_16480 MAE_16490     FALSE 0.227 58.000 0.000 NA   NA
 3768767 3768768 MAE_16490 MAE_16500     FALSE 0.215 81.000 0.000 NA   NA
 3768768 3768769 MAE_16500 MAE_16510     TRUE 0.268 43.000 0.000 NA   NA
 3768774 3768775 MAE_16560 MAE_16570     TRUE 0.287 42.000 0.000 1.000   NA
 3768775 3768776 MAE_16570 MAE_16580     TRUE 0.282 43.000 0.000 1.000   NA
 3768777 3768778 MAE_16590 MAE_16600     FALSE 0.185 114.000 0.000 1.000 N NA
 3768778 3768779 MAE_16600 MAE_16610     FALSE 0.034 595.000 0.000 NA   NA
 3768780 3768781 MAE_16620 MAE_16630     FALSE 0.219 70.000 0.000 NA   NA
 3768781 3768782 MAE_16630 MAE_16640     FALSE 0.190 118.000 0.000 NA   NA
 3768782 3768783 MAE_16640 MAE_16650     FALSE 0.157 155.000 0.000 NA   NA
 3768787 3768788 MAE_16690 MAE_16700 hisD   FALSE 0.206 103.000 0.000 NA   NA
 3768789 3768790 MAE_16710 MAE_16720 accC   TRUE 0.276 44.000 0.000 1.000   NA
 3768790 3768791 MAE_16720 MAE_16730     TRUE 0.337 34.000 0.000 NA   NA
 3768791 3768792 MAE_16730 MAE_16740     TRUE 0.442 27.000 0.000 NA   NA
 3768793 3768794 MAE_16750 MAE_16760     FALSE 0.207 100.000 0.000 NA   NA
 3768796 3768797 MAE_16780 MAE_16790     FALSE 0.100 235.000 0.000 NA   NA
 3768798 3768799 MAE_16800 MAE_16810     FALSE 0.217 72.000 0.000 NA   NA
 3768799 3768800 MAE_16810 MAE_16820     FALSE 0.097 246.000 0.000 NA   NA
 3768804 3768805 MAE_t005 MAE_16860     FALSE 0.096 249.000 0.000 NA   NA
 3768805 3768806 MAE_16860 MAE_16870   ftsW FALSE 0.206 71.000 0.000 1.000 N NA
 3768807 3768808 MAE_16880 MAE_16890     FALSE 0.142 172.000 0.000 NA   NA
 3768814 3768815 MAE_16950 MAE_16960     FALSE 0.042 480.000 0.000 NA   NA
 3768816 3768817 MAE_16970 MAE_16980     FALSE 0.226 64.000 0.000 NA   NA
 3768817 3768818 MAE_16980 MAE_16990     TRUE 0.752 10.000 0.000 NA   NA
 3768818 3768819 MAE_16990 MAE_17000     FALSE 0.064 345.000 0.000 NA   NA
 3768821 3768822 MAE_17020 MAE_17030     FALSE 0.036 569.000 0.000 NA   NA
 3768823 3768824 MAE_17040 MAE_17050     FALSE 0.091 263.000 0.000 NA   NA
 3768824 3768825 MAE_17050 MAE_17060     TRUE 0.824 107.000 0.215 1.000 N NA
 3768825 3768826 MAE_17060 MAE_17070     FALSE 0.034 560.000 0.000 1.000 N NA
 3768826 3768827 MAE_17070 MAE_17080     TRUE 0.950 4.000 0.000 NA Y NA
 3768827 3768828 MAE_17080 MAE_17090     FALSE 0.110 214.000 0.000 NA   NA
 3768829 3768830 MAE_17100 MAE_17110     FALSE 0.072 313.000 0.000 NA   NA
 3768830 3768831 MAE_17110 MAE_17120     TRUE 0.570 20.000 0.000 NA   NA
 3768833 3768834 MAE_17140 MAE_17150   cbiD FALSE 0.203 55.000 0.000 NA N NA
 3768834 3768835 MAE_17150 MAE_17160 cbiD guaA TRUE 0.699 144.000 0.023 1.000 N NA
 3768835 3768836 MAE_17160 MAE_17170 guaA   FALSE 0.210 89.000 0.000 NA   NA
 3768836 3768837 MAE_17170 MAE_17180     TRUE 0.967 14.000 0.071 NA   NA
 3768837 3768838 MAE_17180 MAE_17190     FALSE 0.106 221.000 0.000 NA   NA
 3768839 3768840 MAE_17200 MAE_17210     FALSE 0.226 83.000 0.000 1.000   NA
 3768840 3768841 MAE_17210 MAE_17220     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3768841 3768842 MAE_17220 MAE_17230     FALSE 0.095 252.000 0.000 NA   NA
 3768842 3768843 MAE_17230 MAE_17240     FALSE 0.109 215.000 0.000 NA   NA
 3768843 3768844 MAE_17240 MAE_17250     FALSE 0.179 130.000 0.000 NA   NA
 3768844 3768845 MAE_17250 MAE_17260     FALSE 0.154 159.000 0.000 NA   NA
 3768845 3768846 MAE_17260 MAE_17270     TRUE 0.808 6.000 0.000 NA   NA
 3768846 3768847 MAE_17270 MAE_17280     TRUE 0.994 3.000 0.412 NA   NA
 3768847 3768848 MAE_17280 MAE_17290   sir FALSE 0.134 178.000 0.000 NA   NA
 3768850 3768851 MAE_17310 MAE_17320     FALSE 0.049 425.000 0.000 NA   NA
 3768854 3768855 MAE_17350 MAE_17360     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3768856 3768857 MAE_17370 MAE_17380     TRUE 0.850 76.000 0.292 NA   NA
 3768857 3768858 MAE_17380 MAE_17390     TRUE 0.440 350.000 0.018 1.000   NA
 3768859 3768860 MAE_17400 MAE_17410     TRUE 0.743 149.000 0.068 1.000   NA
 3768861 3768862 MAE_17420 MAE_17430     FALSE 0.225 84.000 0.000 1.000   NA
 3768866 3768867 MAE_17470 MAE_17480     TRUE 0.938 27.000 0.222 NA   NA
 3768867 3768868 MAE_17480 MAE_17490     FALSE 0.205 105.000 0.000 NA   NA
 3768868 3768869 MAE_17490 MAE_17500     FALSE 0.125 179.000 0.000 1.000 N NA
 3768870 3768871 MAE_17510 MAE_17520     FALSE 0.040 497.000 0.000 NA   NA
 3768871 3768872 MAE_17520 MAE_17530     TRUE 0.392 30.000 0.000 NA   NA
 3768872 3768873 MAE_17530 MAE_17540     TRUE 0.997 -3.000 0.487 NA   NA
 3768874 3768875 MAE_17550 MAE_17560     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 3768875 3768876 MAE_17560 MAE_17570     FALSE 0.171 139.000 0.000 NA   NA
 3768876 3768877 MAE_17570 MAE_17580     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3768878 3768879 MAE_17590 MAE_17600     FALSE 0.166 145.000 0.000 NA   NA
 3768880 3768881 MAE_17610 MAE_17620     FALSE 0.116 204.000 0.000 NA   NA
 3768881 3768882 MAE_17620 MAE_17630     FALSE 0.051 403.000 0.000 NA   NA
 3768884 3768885 MAE_17650 MAE_17660 hupE   TRUE 0.620 15.000 0.000 NA N NA
 3768886 3768887 MAE_17670 MAE_17680     FALSE 0.085 276.000 0.000 NA   NA
 3768887 3768888 MAE_17680 MAE_17690     FALSE 0.053 392.000 0.000 NA   NA
 3768893 3768894 MAE_17740 MAE_17750     TRUE 0.948 29.000 0.867 NA   NA
 3768894 3768895 MAE_17750 MAE_17760     TRUE 0.243 49.000 0.000 NA   NA
 3768895 3768896 MAE_17760 MAE_17770     FALSE 0.033 619.000 0.000 NA   NA
 3768896 3768897 MAE_17770 MAE_17780   trpB FALSE 0.040 473.000 0.000 1.000 N NA
 3768897 3768898 MAE_17780 MAE_17790 trpB   FALSE 0.163 137.000 0.000 1.000 N NA
 3768899 3768900 MAE_17800 MAE_17810     TRUE 0.982 11.000 0.227 NA   NA
 3768900 3768901 MAE_17810 MAE_17820     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 3768902 3768903 MAE_17830 MAE_17840     TRUE 0.772 185.000 0.429 NA   NA
 3768903 3768904 MAE_17840 MAE_17850     FALSE 0.102 231.000 0.000 NA   NA
 3768904 3768905 MAE_17850 MAE_17860     TRUE 0.999 -46.000 0.200 NA   NA
 3768905 3768906 MAE_17860 MAE_17870     TRUE 0.979 -91.000 0.000 NA   NA
 3768906 3768907 MAE_17870 MAE_17880     FALSE 0.171 139.000 0.000 NA   NA
 3768907 3768908 MAE_17880 MAE_17890     FALSE 0.118 200.000 0.000 NA   NA
 3768908 3768909 MAE_17890 MAE_17900     TRUE 0.991 3.000 0.111 NA   NA
 3768909 3768910 MAE_17900 MAE_17910     FALSE 0.088 268.000 0.000 NA   NA
 3768910 3768911 MAE_17910 MAE_17920     TRUE 0.899 33.000 0.143 NA   NA
 3768911 3768912 MAE_17920 MAE_17930     FALSE 0.183 137.000 0.000 1.000   NA
 3768912 3768913 MAE_17930 MAE_17940     TRUE 0.440 28.000 0.000 1.000   NA
 3768913 3768914 MAE_17940 MAE_17950     FALSE 0.219 99.000 0.000 1.000   NA
 3768914 3768915 MAE_17950 MAE_17960     TRUE 0.808 6.000 0.000 NA   NA
 3768915 3768916 MAE_17960 MAE_17970     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3768919 3768920 MAE_18000 MAE_18010     FALSE 0.049 426.000 0.000 NA   NA
 3768921 3768922 MAE_18020 MAE_18030     FALSE 0.044 464.000 0.000 NA   NA
 3768922 3768923 MAE_18030 MAE_18040     FALSE 0.076 304.000 0.000 NA   NA
 3768923 3768924 MAE_18040 MAE_18050     TRUE 0.442 27.000 0.000 NA   NA
 3768926 3768927 MAE_18070 MAE_18080     FALSE 0.103 228.000 0.000 NA   NA
 3768927 3768928 MAE_18080 MAE_18090     FALSE 0.052 400.000 0.000 NA   NA
 3768928 3768929 MAE_18090 MAE_18100     TRUE 0.772 173.000 0.300 NA   NA
 3768929 3768930 MAE_18100 MAE_18110   polA TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 3768931 3768932 MAE_18120 MAE_18130     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3768932 3768933 MAE_18130 MAE_18140   rfbB FALSE 0.113 209.000 0.000 NA   NA
 3768933 3768934 MAE_18140 MAE_18150 rfbB   TRUE 0.927 46.000 0.291 1.000 Y NA
 3768934 3768935 MAE_18150 MAE_18160     FALSE 0.087 240.000 0.000 NA N NA
 3768935 3768936 MAE_18160 MAE_18170     FALSE 0.187 351.000 0.000 NA Y NA
 3768936 3768937 MAE_18170 MAE_18180     FALSE 0.073 311.000 0.000 NA   NA
 3768937 3768938 MAE_18180 MAE_18190     TRUE 0.995 2.000 0.500 NA   NA
 3768940 3768941 MAE_18210 MAE_18220     FALSE 0.045 450.000 0.000 NA   NA
 3768941 3768942 MAE_18220 MAE_18230     FALSE 0.210 89.000 0.000 NA   NA
 3768942 3768943 MAE_18230 MAE_18240   cobO FALSE 0.216 75.000 0.000 NA   NA
 3768944 3768945 MAE_18250 MAE_18260     FALSE 0.164 158.000 0.000 1.000   NA
 3768945 3768946 MAE_18260 MAE_18270     FALSE 0.064 345.000 0.000 NA   NA
 3768946 3768947 MAE_18270 MAE_18280     TRUE 0.792 7.000 0.000 NA   NA
 3768947 3768948 MAE_18280 MAE_18290     TRUE 0.991 12.000 0.500 0.003 Y NA
 3768948 3768949 MAE_18290 MAE_18300     TRUE 0.996 5.000 1.000 0.003 Y NA
 3768949 3768950 MAE_18300 MAE_18310     TRUE 0.712 394.000 0.538 0.003 Y NA
 3768950 3768951 MAE_18310 MAE_18320     FALSE 0.049 422.000 0.000 NA   NA
 3768951 3768952 MAE_18320 MAE_18330     FALSE 0.099 239.000 0.000 NA   NA
 3768952 3768953 MAE_18330 MAE_18340   pstB2 FALSE 0.187 121.000 0.000 NA   NA
 3768953 3768954 MAE_18340 MAE_18350 pstB2 pstB TRUE 0.904 92.000 0.222 0.001 Y NA
 3768954 3768955 MAE_18350 MAE_18360 pstB pstA TRUE 0.322 209.000 0.000 0.003 Y NA
 3768955 3768956 MAE_18360 MAE_18370 pstA pstC TRUE 0.757 224.000 0.054 0.003 Y NA
 3768956 3768957 MAE_18370 MAE_18380 pstC pstS TRUE 0.892 95.000 0.135 0.003 Y NA
 3768958 3768959 MAE_18390 MAE_18400 sphX   FALSE 0.216 74.000 0.000 NA   NA
 3768960 3768961 MAE_18410 MAE_18420 nirA   FALSE 0.111 212.000 0.000 NA   NA
 3768962 3768963 MAE_18430 MAE_18440     FALSE 0.108 231.000 0.000 1.000   NA
 3768965 3768966 MAE_18460 MAE_18470     TRUE 0.667 14.000 0.000 NA   NA
 3768967 3768968 MAE_18480 MAE_18490     FALSE 0.050 419.000 0.000 NA   NA
 3768970 3768971 MAE_18510 MAE_18520     FALSE 0.228 55.000 0.000 NA   NA
 3768971 3768972 MAE_18520 MAE_18530     TRUE 0.268 43.000 0.000 NA   NA
 3768973 3768974 MAE_18540 MAE_18550   nadC FALSE 0.217 72.000 0.000 NA   NA
 3768974 3768975 MAE_18550 MAE_18560 nadC   FALSE 0.064 346.000 0.000 NA   NA
 3768975 3768976 MAE_18560 MAE_18570     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3768978 3768979 MAE_18590 MAE_18600     FALSE 0.157 155.000 0.000 NA   NA
 3768979 3768980 MAE_18600 MAE_18610     TRUE 0.998 -7.000 0.353 NA   NA
 3768980 3768981 MAE_18610 MAE_18620     FALSE 0.067 349.000 0.000 1.000   NA
 3768981 3768982 MAE_18620 MAE_18630     FALSE 0.164 147.000 0.000 NA   NA
 3768982 3768983 MAE_18630 MAE_18640   lytB FALSE 0.126 190.000 0.000 NA   NA
 3768984 3768985 MAE_18650 MAE_18660 trkA   TRUE 0.918 103.000 0.469 0.003 Y NA
 3768985 3768986 MAE_18660 MAE_18670     TRUE 0.793 79.000 0.059 1.000 N NA
 3768986 3768987 MAE_18670 MAE_18680     FALSE 0.144 169.000 0.000 NA   NA
 3768988 3768989 MAE_18690 MAE_18700     TRUE 0.907 28.000 0.046 1.000 N NA
 3768989 3768990 MAE_18700 MAE_18710     TRUE 0.526 23.000 0.000 1.000   NA
 3768991 3768992 MAE_18720 MAE_18730     FALSE 0.066 335.000 0.000 NA   NA
 3768993 3768994 MAE_18740 MAE_18750     FALSE 0.141 173.000 0.000 NA   NA
 3768994 3768995 MAE_18750 MAE_18760     TRUE 0.999 -16.000 0.412 NA   NA
 3768995 3768996 MAE_18760 MAE_18770     FALSE 0.163 148.000 0.000 NA   NA
 3768996 3768997 MAE_18770 MAE_18780     TRUE 0.913 37.000 0.512 NA   NA
 3768997 3768998 MAE_18780 MAE_18790   trpE FALSE 0.179 130.000 0.000 NA   NA
 3768998 3768999 MAE_18790 MAE_18800 trpE   FALSE 0.107 219.000 0.000 NA   NA
 3769000 3769001 MAE_18810 MAE_18820     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3769001 3769002 MAE_18820 MAE_18830     FALSE 0.055 382.000 0.000 NA   NA
 3769003 3769004 MAE_18840 MAE_18850     FALSE 0.232 52.000 0.000 NA   NA
 3769004 3769005 MAE_18850 MAE_18860   hypA TRUE 0.639 16.000 0.000 NA   NA
 3769005 3769006 MAE_18860 MAE_18870 hypA hypB TRUE 0.853 59.000 0.215 0.003   NA
 3769006 3769007 MAE_18870 MAE_18880 hypB   TRUE 0.727 152.000 0.062 1.000 N NA
 3769007 3769008 MAE_18880 MAE_18890     TRUE 0.817 206.000 0.204 0.015 Y NA
 3769008 3769009 MAE_18890 MAE_18900     TRUE 0.914 71.000 0.314 1.000 Y NA
 3769009 3769010 MAE_18900 MAE_18910     FALSE 0.082 302.000 0.000 1.000   NA
 3769010 3769011 MAE_18910 MAE_18920     TRUE 0.787 167.000 0.353 NA   NA
 3769011 3769012 MAE_18920 MAE_18930     FALSE 0.145 168.000 0.000 NA   NA
 3769012 3769013 MAE_18930 MAE_18940     FALSE 0.216 74.000 0.000 NA   NA
 3769013 3769014 MAE_18940 MAE_18950     TRUE 0.918 30.000 0.161 NA   NA
 3769015 3769016 MAE_18960 MAE_18970     TRUE 0.962 -7.000 0.000 NA   NA
 3769016 3769017 MAE_18970 MAE_18980     FALSE 0.206 103.000 0.000 NA   NA
 3769020 3769021 MAE_19010 MAE_19020     FALSE 0.054 388.000 0.000 NA   NA
 3769021 3769022 MAE_19020 MAE_19030     TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3769023 3769024 MAE_19040 MAE_19050     FALSE 0.198 112.000 0.000 NA   NA
 3769024 3769025 MAE_19050 MAE_19060     FALSE 0.215 80.000 0.000 NA   NA
 3769025 3769026 MAE_19060 MAE_19070     TRUE 0.730 246.000 0.667 NA   NA
 3769028 3769029 MAE_19090 MAE_19100   aroC TRUE 0.652 14.000 0.000 1.000 N NA
 3769030 3769031 MAE_19110 MAE_19120     FALSE 0.038 528.000 0.000 NA   NA
 3769032 3769033 MAE_19130 MAE_19140     FALSE 0.230 54.000 0.000 NA   NA
 3769033 3769034 MAE_19140 MAE_19150     TRUE 0.764 74.000 0.021 NA   NA
 3769034 3769035 MAE_19150 MAE_19160     TRUE 0.451 429.000 0.117 NA   NA
 3769035 3769036 MAE_19160 MAE_19170     FALSE 0.099 240.000 0.000 NA   NA
 3769036 3769037 MAE_19170 MAE_19180     FALSE 0.088 269.000 0.000 NA   NA
 3769037 3769038 MAE_19180 MAE_19190     FALSE 0.050 421.000 0.000 NA   NA
 3769038 3769039 MAE_19190 MAE_19200     TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 3769039 3769040 MAE_19200 MAE_19210     FALSE 0.169 141.000 0.000 NA   NA
 3769041 3769042 MAE_19220 MAE_19230 petC1 petA TRUE 0.908 44.000 0.881 0.036   NA
 3769042 3769043 MAE_19230 MAE_19240 petA rfbM FALSE 0.186 133.000 0.000 1.000   NA
 3769043 3769044 MAE_19240 MAE_19250 rfbM   TRUE 0.301 761.000 0.046 1.000   NA
 3769045 3769046 MAE_19260 MAE_19270   glnA FALSE 0.062 351.000 0.000 NA   NA
 3769047 3769048 MAE_19280 MAE_19290     FALSE 0.034 603.000 0.000 NA   NA
 3769048 3769049 MAE_19290 MAE_19300   aroH TRUE 0.835 69.000 0.207 1.000 N NA
 3769052 3769053 MAE_19330 MAE_19340     TRUE 0.748 11.000 0.000 1.000   NA
 3769053 3769054 MAE_19340 MAE_19350     FALSE 0.152 161.000 0.000 NA   NA
 3769054 3769055 MAE_19350 MAE_19360     TRUE 0.392 30.000 0.000 NA   NA
 3769057 3769058 MAE_19380 MAE_19390     TRUE 0.271 45.000 0.000 1.000   NA
 3769059 3769060 MAE_19400 MAE_19410     TRUE 0.988 4.000 0.091 NA   NA
 3769062 3769063 MAE_19430 MAE_19440     FALSE 0.141 173.000 0.000 NA   NA
 3769063 3769064 MAE_19440 MAE_19450     FALSE 0.166 145.000 0.000 NA   NA
 3769065 3769066 MAE_19460 MAE_19470 fabD fabH TRUE 0.801 160.000 0.019 0.003 Y NA
 3769066 3769067 MAE_19470 MAE_19480 fabH plsX TRUE 0.853 191.000 0.380 0.003 Y NA
 3769068 3769069 MAE_19490 MAE_19500     TRUE 0.239 50.000 0.000 NA   NA
 3769069 3769070 MAE_19500 MAE_19510     TRUE 0.969 -13.000 0.000 NA   NA
 3769070 3769071 MAE_19510 MAE_19520     FALSE 0.099 239.000 0.000 NA   NA
 3769072 3769073 MAE_19530 MAE_19540 argC   FALSE 0.093 255.000 0.000 NA   NA
 3769073 3769074 MAE_19540 MAE_19550     FALSE 0.186 123.000 0.000 NA   NA
 3769075 3769076 MAE_19560 MAE_19570     FALSE 0.211 87.000 0.000 NA   NA
 3769077 3769078 MAE_19580 MAE_19590     FALSE 0.142 172.000 0.000 NA   NA
 3769078 3769079 MAE_19590 MAE_19600   rpl25 TRUE 0.808 6.000 0.000 NA   NA
 3769079 3769080 MAE_19600 MAE_19610 rpl25 purA TRUE 0.890 28.000 0.017 1.000 N NA
 3769080 3769081 MAE_19610 MAE_19620 purA   FALSE 0.180 128.000 0.000 NA   NA
 3769081 3769082 MAE_19620 MAE_19630   yjgP FALSE 0.227 61.000 0.000 NA   NA
 3769083 3769084 MAE_19640 MAE_19650     TRUE 0.993 3.000 0.258 NA   NA
 3769087 3769088 MAE_19680 MAE_19690 dnaJ   FALSE 0.029 1075.000 0.000 NA   NA
 3769092 3769093 MAE_19730 MAE_19740     TRUE 0.490 24.000 0.000 NA   NA
 3769097 3769098 MAE_19780 MAE_19790     FALSE 0.150 164.000 0.000 NA   NA
 3769099 3769100 MAE_19800 MAE_19810     FALSE 0.046 446.000 0.000 NA   NA
 3769100 3769101 MAE_19810 MAE_19820     TRUE 0.735 11.000 0.000 NA   NA
 3769101 3769102 MAE_19820 MAE_19830     FALSE 0.142 172.000 0.000 NA   NA
 3769102 3769103 MAE_19830 MAE_19840     FALSE 0.106 222.000 0.000 NA   NA
 3769103 3769104 MAE_19840 MAE_19850     FALSE 0.179 130.000 0.000 NA   NA
 3769104 3769105 MAE_19850 MAE_19860     TRUE 0.767 9.000 0.000 NA   NA
 3769105 3769106 MAE_19860 MAE_19870   argH FALSE 0.039 480.000 0.000 1.000 N NA
 3769106 3769107 MAE_19870 MAE_19880 argH   TRUE 0.312 442.000 0.003 1.000 N NA
 3769107 3769108 MAE_19880 MAE_19890     FALSE 0.084 266.000 0.000 1.000 N NA
 3769108 3769109 MAE_19890 MAE_19900     TRUE 0.278 41.000 0.000 NA   NA
 3769109 3769110 MAE_19900 MAE_19910     TRUE 0.969 -13.000 0.000 NA   NA
 3769110 3769111 MAE_19910 MAE_19920     FALSE 0.145 168.000 0.000 NA   NA
 3769111 3769112 MAE_19920 MAE_19930     FALSE 0.097 245.000 0.000 NA   NA
 3769113 3769114 MAE_19940 MAE_19950     FALSE 0.049 427.000 0.000 NA   NA
 3769114 3769115 MAE_19950 MAE_19960     FALSE 0.220 94.000 0.000 1.000   NA
 3769116 3769117 MAE_19970 MAE_19980     FALSE 0.121 197.000 0.000 NA   NA
 3769117 3769118 MAE_19980 MAE_19990     FALSE 0.095 252.000 0.000 NA   NA
 3769118 3769119 MAE_19990 MAE_20000     TRUE 0.919 113.000 0.867 NA Y NA
 3769119 3769120 MAE_20000 MAE_20010     TRUE 0.932 70.000 0.867 0.001 Y NA
 3769120 3769121 MAE_20010 MAE_20020     TRUE 0.926 80.000 0.600 0.001 Y NA
 3769121 3769122 MAE_20020 MAE_20030     FALSE 0.103 229.000 0.000 NA   NA
 3769122 3769123 MAE_20030 MAE_20040     FALSE 0.187 121.000 0.000 NA   NA
 3769124 3769125 MAE_20050 MAE_20060     TRUE 0.983 13.000 0.800 NA   NA
 3769126 3769127 MAE_20070 MAE_20080     TRUE 0.997 -3.000 0.280 NA   NA
 3769127 3769128 MAE_20080 MAE_20090     TRUE 0.271 45.000 0.000 1.000   NA
 3769128 3769129 MAE_20090 MAE_20100     FALSE 0.226 64.000 0.000 NA   NA
 3769131 3769132 MAE_20120 MAE_20130     FALSE 0.045 448.000 0.000 NA   NA
 3769132 3769133 MAE_20130 MAE_20140     TRUE 0.284 40.000 0.000 NA   NA
 3769135 3769136 MAE_20150 MAE_20160     FALSE 0.085 277.000 0.000 NA   NA
 3769136 3769137 MAE_20160 MAE_20170     FALSE 0.035 582.000 0.000 NA   NA
 3769137 3769138 MAE_20170 MAE_20180     FALSE 0.129 186.000 0.000 NA   NA
 3769139 3769140 MAE_20190 MAE_20200     FALSE 0.208 98.000 0.000 NA   NA
 3769140 3769141 MAE_20200 MAE_20210     FALSE 0.156 156.000 0.000 NA   NA
 3769141 3769142 MAE_20210 MAE_20220     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3769142 3769143 MAE_20220 MAE_20230     FALSE 0.217 73.000 0.000 NA   NA
 3769144 3769145 MAE_20240 MAE_20250     FALSE 0.192 117.000 0.000 NA   NA
 3769146 3769147 MAE_20260 MAE_20270     FALSE 0.122 196.000 0.000 NA   NA
 3769147 3769148 MAE_20270 MAE_20280     FALSE 0.118 200.000 0.000 NA   NA
 3769148 3769149 MAE_20280 MAE_20290     FALSE 0.087 271.000 0.000 NA   NA
 3769149 3769150 MAE_20290 MAE_20300     FALSE 0.071 320.000 0.000 NA   NA
 3769151 3769152 MAE_20310 MAE_20320     FALSE 0.221 91.000 0.000 1.000   NA
 3769153 3769154 MAE_20330 MAE_20340     FALSE 0.030 749.000 0.000 NA   NA
 3769154 3769155 MAE_20340 MAE_20350     TRUE 0.958 -6.000 0.000 NA   NA
 3769155 3769156 MAE_20350 MAE_20360     FALSE 0.192 117.000 0.000 NA   NA
 3769156 3769157 MAE_20360 MAE_20370     TRUE 0.845 4.000 0.000 NA   NA
 3769157 3769158 MAE_20370 MAE_20380     FALSE 0.071 320.000 0.000 NA   NA
 3769158 3769159 MAE_20380 MAE_20390     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA   NA
 3769160 3769161 MAE_20400 MAE_20410     FALSE 0.154 159.000 0.000 NA   NA
 3769162 3769163 MAE_20420 MAE_20430     TRUE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 3769163 3769164 MAE_20430 MAE_20440     FALSE 0.052 401.000 0.000 NA   NA
 3769164 3769165 MAE_20440 MAE_20450     FALSE 0.160 151.000 0.000 NA   NA
 3769165 3769166 MAE_20450 MAE_20460     FALSE 0.095 252.000 0.000 NA   NA
 3769166 3769167 MAE_20460 MAE_20470     TRUE 0.243 49.000 0.000 NA   NA
 3769167 3769168 MAE_20470 MAE_20480     TRUE 0.993 3.000 0.379 NA   NA
 3769168 3769169 MAE_20480 MAE_20490     TRUE 0.999 -10.000 0.710 NA   NA
 3769169 3769170 MAE_20490 MAE_20500     FALSE 0.097 245.000 0.000 NA   NA
 3769171 3769172 MAE_20510 MAE_20520     TRUE 0.305 37.000 0.000 NA   NA
 3769173 3769174 MAE_20530 MAE_20540     FALSE 0.114 207.000 0.000 NA   NA
 3769174 3769175 MAE_20540 MAE_20550     FALSE 0.149 165.000 0.000 NA   NA
 3769175 3769176 MAE_20550 MAE_20560     FALSE 0.080 292.000 0.000 NA   NA
 3769176 3769177 MAE_20560 MAE_20570     TRUE 0.999 -49.000 0.375 NA   NA
 3769177 3769178 MAE_20570 MAE_20580     FALSE 0.040 502.000 0.000 NA   NA
 3769180 3769181 MAE_20600 MAE_20610     TRUE 0.994 -45.000 0.000 1.000 Y NA
 3769182 3769183 MAE_20620 MAE_20630     TRUE 0.243 49.000 0.000 NA   NA
 3769183 3769184 MAE_20630 MAE_20640     FALSE 0.082 284.000 0.000 NA   NA
 3769184 3769185 MAE_20640 MAE_20650     FALSE 0.192 117.000 0.000 NA   NA
 3769185 3769186 MAE_20650 MAE_20660     TRUE 0.254 46.000 0.000 NA   NA
 3769187 3769188 MAE_20670 MAE_20680     FALSE 0.097 245.000 0.000 NA   NA
 3769189 3769190 MAE_20690 MAE_20700     FALSE 0.221 68.000 0.000 NA   NA
 3769190 3769191 MAE_20700 MAE_20710     TRUE 0.998 -10.000 0.429 NA   NA
 3769191 3769192 MAE_20710 MAE_20720     FALSE 0.187 122.000 0.000 NA   NA
 3769193 3769194 MAE_20730 MAE_20740     FALSE 0.209 95.000 0.000 NA   NA
 3769194 3769195 MAE_20740 MAE_20750     FALSE 0.035 573.000 0.000 NA   NA
 3769195 3769196 MAE_20750 MAE_20760     FALSE 0.079 297.000 0.000 NA   NA
 3769196 3769197 MAE_20760 MAE_20770     FALSE 0.129 185.000 0.000 NA   NA
 3769197 3769198 MAE_20770 MAE_20780     TRUE 0.861 114.000 0.050 1.000 Y NA
 3769198 3769199 MAE_20780 MAE_20790     TRUE 0.825 5.000 0.000 NA   NA
 3769201 3769202 MAE_t007 MAE_20810     FALSE 0.204 107.000 0.000 NA   NA
 3769202 3769203 MAE_20810 MAE_20820     TRUE 0.919 0.000 0.000 1.000   NA
 3769204 3769205 MAE_20830 MAE_20840     TRUE 0.991 4.000 0.259 0.007   NA
 3769207 3769208 MAE_20850 MAE_20860     FALSE 0.056 375.000 0.000 NA   NA
 3769209 3769210 MAE_20870 MAE_20880     TRUE 0.974 -19.000 0.000 NA   NA
 3769211 3769212 MAE_20890 MAE_20900     TRUE 0.988 5.000 0.167 NA   NA
 3769213 3769214 MAE_20910 MAE_20920     TRUE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 3769214 3769215 MAE_20920 MAE_20930     FALSE 0.227 63.000 0.000 NA   NA
 3769219 3769220 MAE_20970 MAE_20980   trpA FALSE 0.214 82.000 0.000 NA   NA
 3769221 3769222 MAE_20990 MAE_21000     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3769223 3769224 MAE_21010 MAE_21020     FALSE 0.029 834.000 0.000 NA   NA
 3769224 3769225 MAE_21020 MAE_21030     FALSE 0.034 612.000 0.000 NA   NA
 3769225 3769226 MAE_21030 MAE_21040     FALSE 0.221 68.000 0.000 NA   NA
 3769226 3769227 MAE_21040 MAE_21050     FALSE 0.128 187.000 0.000 NA   NA
 3769227 3769228 MAE_21050 MAE_21060     TRUE 0.845 4.000 0.000 NA   NA
 3769229 3769230 MAE_21070 MAE_21080     FALSE 0.085 291.000 0.000 1.000   NA
 3769230 3769231 MAE_21080 MAE_21090     FALSE 0.172 159.000 0.000 0.054   NA
 3769231 3769232 MAE_21090 MAE_21100     FALSE 0.035 587.000 0.000 NA   NA
 3769233 3769234 MAE_21110 MAE_21120     FALSE 0.207 102.000 0.000 NA   NA
 3769235 3769236 MAE_r001 MAE_t009 rrn16S_1   FALSE 0.172 138.000 0.000 NA   NA
 3769236 3769237 MAE_t009 MAE_r002   rrn23S_1 FALSE 0.159 152.000 0.000 NA   NA
 3769237 3769238 MAE_r002 MAE_r003 rrn23S_1 rrn5S_1 FALSE 0.227 59.000 0.000 NA   NA
 3769240 3769241 MAE_21140 MAE_21150     TRUE 0.845 4.000 0.000 NA   NA
 3769241 3769242 MAE_21150 MAE_21160     TRUE 0.962 -7.000 0.000 NA   NA
 3769242 3769243 MAE_21160 MAE_21170     TRUE 0.589 19.000 0.000 0.017 N NA
 3769243 3769244 MAE_21170 MAE_21180     FALSE 0.196 98.000 0.000 1.000 N NA
 3769244 3769245 MAE_21180 MAE_21190     TRUE 0.735 11.000 0.000 NA   NA
 3769245 3769246 MAE_21190 MAE_21200     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3769246 3769247 MAE_21200 MAE_21210     FALSE 0.110 214.000 0.000 NA   NA
 3769247 3769248 MAE_21210 MAE_21220     FALSE 0.158 154.000 0.000 NA   NA
 3769248 3769249 MAE_21220 MAE_21230     TRUE 0.818 261.000 0.571 0.050 Y NA
 3769249 3769250 MAE_21230 MAE_21240     TRUE 0.983 19.000 0.429 1.000 Y NA
 3769250 3769251 MAE_21240 MAE_t010     FALSE 0.227 62.000 0.000 NA   NA
 3769251 3769252 MAE_t010 MAE_21250     TRUE 0.570 20.000 0.000 NA   NA
 3769253 3769254 MAE_21260 MAE_21270     FALSE 0.130 183.000 0.000 NA   NA
 3769254 3769255 MAE_21270 MAE_21280     FALSE 0.231 53.000 0.000 NA   NA
 3769256 3769257 MAE_21290 MAE_21300     FALSE 0.073 312.000 0.000 NA   NA
 3769258 3769259 MAE_21310 MAE_21320     TRUE 0.892 57.000 1.000 0.001   NA
 3769259 3769260 MAE_21320 MAE_21330     FALSE 0.204 106.000 0.000 NA   NA
 3769261 3769262 MAE_21340 MAE_21350     TRUE 0.999 -22.000 1.000 NA   NA
 3769262 3769263 MAE_21350 MAE_21360     FALSE 0.100 237.000 0.000 NA   NA
 3769263 3769264 MAE_21360 MAE_21370     FALSE 0.122 206.000 0.000 1.000   NA
 3769264 3769265 MAE_21370 MAE_21380   metH FALSE 0.100 244.000 0.000 0.002 N NA
 3769266 3769267 MAE_21390 MAE_21400     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3769267 3769268 MAE_21400 MAE_21410     FALSE 0.088 268.000 0.000 NA   NA
 3769268 3769269 MAE_21410 MAE_21420     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3769269 3769270 MAE_21420 MAE_21430     FALSE 0.070 324.000 0.000 NA   NA
 3769270 3769271 MAE_21430 MAE_21440     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3769271 3769272 MAE_21440 MAE_21450     FALSE 0.076 304.000 0.000 NA   NA
 3769274 3769275 MAE_21470 MAE_21480     FALSE 0.123 194.000 0.000 NA   NA
 3769278 3769279 MAE_21510 MAE_21520 aroK   TRUE 0.919 0.000 0.000 1.000   NA
 3769280 3769281 MAE_21530 MAE_21540 hemN   FALSE 0.161 149.000 0.000 NA   NA
 3769281 3769282 MAE_21540 MAE_21550     TRUE 0.289 39.000 0.000 NA   NA
 3769282 3769283 MAE_21550 MAE_21560     FALSE 0.156 156.000 0.000 NA   NA
 3769284 3769285 MAE_21570 MAE_21580     FALSE 0.050 421.000 0.000 NA   NA
 3769285 3769286 MAE_21580 MAE_21590   ycf81 FALSE 0.070 325.000 0.000 NA   NA
 3769288 3769289 MAE_21610 MAE_21620     FALSE 0.227 62.000 0.000 NA   NA
 3769290 3769291 MAE_21630 MAE_21640   apcF FALSE 0.130 196.000 0.000 1.000   NA
 3769291 3769292 MAE_21640 MAE_21650 apcF proB FALSE 0.138 183.000 0.000 1.000   NA
 3769292 3769293 MAE_21650 MAE_21660 proB recJ TRUE 0.407 28.000 0.000 1.000 N NA
 3769293 3769294 MAE_21660 MAE_21670 recJ   FALSE 0.227 59.000 0.000 NA   NA
 3769294 3769295 MAE_21670 MAE_21680     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3769295 3769296 MAE_21680 MAE_21690     FALSE 0.216 75.000 0.000 NA   NA
 3769297 3769298 MAE_21700 MAE_21710     FALSE 0.101 233.000 0.000 NA   NA
 3769298 3769299 MAE_21710 MAE_21720     FALSE 0.046 443.000 0.000 NA   NA
 3769302 3769303 MAE_21750 MAE_21760     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3769303 3769304 MAE_21760 MAE_21770     TRUE 0.466 373.000 0.057 1.000   NA
 3769307 3769308 MAE_21800 MAE_21810     FALSE 0.155 157.000 0.000 NA   NA
 3769308 3769309 MAE_21810 MAE_21820     FALSE 0.205 105.000 0.000 NA   NA
 3769309 3769310 MAE_21820 MAE_21830     FALSE 0.190 118.000 0.000 NA   NA
 3769310 3769311 MAE_21830 MAE_21840     TRUE 0.289 39.000 0.000 NA   NA
 3769312 3769313 MAE_21850 MAE_21860     TRUE 0.968 -12.000 0.000 NA   NA
 3769314 3769315 MAE_r004 MAE_21870 ssaA ndbA FALSE 0.129 185.000 0.000 NA   NA
 3769315 3769316 MAE_21870 MAE_21880 ndbA   FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 3769316 3769317 MAE_21880 MAE_21890     FALSE 0.059 364.000 0.000 NA   NA
 3769317 3769318 MAE_21890 MAE_21900     FALSE 0.032 649.000 0.000 NA   NA
 3769318 3769319 MAE_21900 MAE_21910     TRUE 0.954 15.000 0.013 NA   NA
 3769319 3769320 MAE_21910 MAE_21920     FALSE 0.124 193.000 0.000 NA   NA
 3769324 3769325 MAE_21960 MAE_21970     FALSE 0.104 244.000 0.000 1.000   NA
 3769325 3769326 MAE_21970 MAE_21980     FALSE 0.129 186.000 0.000 NA   NA
 3769327 3769328 MAE_21990 MAE_22000     FALSE 0.139 174.000 0.000 NA   NA
 3769329 3769330 MAE_22010 MAE_22020   chlG TRUE 0.985 7.000 0.190 1.000 N NA
 3769330 3769331 MAE_22020 MAE_22030 chlG   FALSE 0.059 369.000 0.000 NA   NA
 3769331 3769332 MAE_22030 MAE_22040     TRUE 0.812 89.000 0.120 NA   NA
 3769333 3769334 MAE_22050 MAE_22060     FALSE 0.127 188.000 0.000 NA   NA
 3769334 3769335 MAE_22060 MAE_22070     FALSE 0.216 76.000 0.000 NA   NA
 3769337 3769338 MAE_22090 MAE_22100     FALSE 0.048 434.000 0.000 NA   NA
 3769338 3769339 MAE_22100 MAE_22110     TRUE 0.690 13.000 0.000 NA   NA
 3769339 3769340 MAE_22110 MAE_22120     TRUE 0.690 13.000 0.000 NA   NA
 3769340 3769341 MAE_22120 MAE_22130     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 3769341 3769342 MAE_22130 MAE_22140     TRUE 0.690 13.000 0.000 NA   NA
 3769342 3769343 MAE_22140 MAE_22150   radA FALSE 0.107 220.000 0.000 NA   NA
 3769344 3769345 MAE_22160 MAE_22170     TRUE 0.982 10.000 0.195 NA   NA
 3769347 3769348 MAE_22190 MAE_22200     FALSE 0.161 150.000 0.000 NA   NA
 3769349 3769350 MAE_22210 MAE_22220     TRUE 0.254 46.000 0.000 NA   NA
 3769351 3769352 MAE_22230 MAE_22240     FALSE 0.183 137.000 0.000 1.000   NA
 3769352 3769353 MAE_22240 MAE_22250     FALSE 0.100 254.000 0.000 1.000   NA
 3769355 3769356 MAE_22270 MAE_22280     FALSE 0.048 434.000 0.000 NA   NA
 3769356 3769357 MAE_22280 MAE_22290     FALSE 0.101 233.000 0.000 NA   NA
 3769357 3769358 MAE_22290 MAE_22300     FALSE 0.211 87.000 0.000 NA   NA
 3769360 3769361 MAE_22320 MAE_22330     FALSE 0.050 421.000 0.000 NA   NA
 3769361 3769362 MAE_22330 MAE_22340     FALSE 0.174 135.000 0.000 NA   NA
 3769362 3769363 MAE_22340 MAE_22350     TRUE 0.278 41.000 0.000 NA   NA
 3769363 3769364 MAE_22350 MAE_22360     FALSE 0.088 270.000 0.000 NA   NA
 3769364 3769365 MAE_22360 MAE_22370     FALSE 0.125 192.000 0.000 NA   NA
 3769367 3769368 MAE_22390 MAE_22400     FALSE 0.104 227.000 0.000 NA   NA
 3769369 3769370 MAE_22410 MAE_22420     FALSE 0.227 57.000 0.000 NA   NA
 3769370 3769371 MAE_22420 MAE_22430     TRUE 0.316 36.000 0.000 NA   NA
 3769371 3769372 MAE_22430 MAE_22440     FALSE 0.209 92.000 0.000 NA   NA
 3769372 3769373 MAE_22440 MAE_22450     TRUE 0.839 42.000 0.054 NA   NA
 3769373 3769374 MAE_22450 MAE_22460   cdsA TRUE 0.997 -3.000 0.238 1.000   NA
 3769374 3769375 MAE_22460 MAE_22470 cdsA   TRUE 0.999 -25.000 0.179 0.002   NA
 3769375 3769376 MAE_22470 MAE_22480     FALSE 0.030 819.000 0.000 NA   NA
 3769376 3769377 MAE_22480 MAE_22490     TRUE 0.998 -3.000 0.667 NA   NA
 3769377 3769378 MAE_22490 MAE_22500     FALSE 0.208 97.000 0.000 NA   NA
 3769380 3769381 MAE_22520 MAE_22530     TRUE 0.622 17.000 0.000 NA   NA
 3769381 3769382 MAE_22530 MAE_22540     TRUE 0.622 17.000 0.000 NA   NA
 3769382 3769383 MAE_22540 MAE_22550     TRUE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 3769386 3769387 MAE_22580 MAE_22590     FALSE 0.216 75.000 0.000 NA   NA
 3769389 3769390 MAE_22610 MAE_22620     FALSE 0.072 302.000 0.000 1.000 N NA
 3769391 3769392 MAE_22630 MAE_22640     TRUE 0.490 24.000 0.000 NA   NA
 3769392 3769393 MAE_22640 MAE_22650     FALSE 0.217 72.000 0.000 NA   NA
 3769394 3769395 MAE_22660 MAE_22670     TRUE 0.604 18.000 0.000 NA   NA
 3769396 3769397 MAE_22680 MAE_22690     TRUE 0.979 -67.000 0.000 NA   NA
 3769397 3769398 MAE_22690 MAE_22700     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA   NA
 3769400 3769401 MAE_22720 MAE_22730     TRUE 0.958 -6.000 0.000 NA   NA
 3769402 3769403 MAE_22740 MAE_22750     FALSE 0.100 235.000 0.000 NA   NA
 3769403 3769404 MAE_22750 MAE_22760     TRUE 0.622 17.000 0.000 NA   NA
 3769404 3769405 MAE_22760 MAE_22770     FALSE 0.046 445.000 0.000 NA   NA
 3769407 3769408 MAE_22790 MAE_22800     TRUE 0.942 -3.000 0.000 NA   NA
 3769409 3769410 MAE_22810 MAE_22820     FALSE 0.165 146.000 0.000 NA   NA
 3769411 3769412 MAE_22830 MAE_22840     FALSE 0.198 112.000 0.000 NA   NA
 3769413 3769414 MAE_22850 MAE_22860 hemB folE TRUE 0.818 117.000 0.005 1.000 Y NA
 3769418 3769419 MAE_22900 MAE_22910     FALSE 0.216 77.000 0.000 NA   NA
 3769419 3769420 MAE_22910 MAE_22920   ctaA TRUE 0.983 14.000 0.090 1.000 Y NA
 3769421 3769422 MAE_22930 MAE_22940 ctaCI ctaDI TRUE 0.960 30.000 0.263 0.001 Y NA
 3769422 3769423 MAE_22940 MAE_22950 ctaDI ctaEI TRUE 0.844 193.000 0.289 0.001 Y NA
 3769424 3769425 MAE_22960 MAE_22970     TRUE 0.999 -22.000 0.227 1.000 Y NA
 3769426 3769427 MAE_22980 MAE_22990     FALSE 0.059 366.000 0.000 NA   NA
 3769431 3769432 MAE_23030 MAE_23040     FALSE 0.102 230.000 0.000 NA   NA
 3769433 3769434 MAE_23050 MAE_23060   nifS TRUE 0.314 35.000 0.000 1.000 N NA
 3769434 3769435 MAE_23060 MAE_23070 nifS sufD TRUE 0.812 56.000 0.081 1.000 N NA
 3769435 3769436 MAE_23070 MAE_23080 sufD   TRUE 0.855 194.000 0.482 1.000 Y NA
 3769436 3769437 MAE_23080 MAE_23090   sufB TRUE 0.851 198.000 0.466 1.000 Y NA
 3769438 3769439 MAE_23100 MAE_23110 sufR   FALSE 0.104 200.000 0.000 NA N NA
 3769439 3769440 MAE_23110 MAE_23120     FALSE 0.081 286.000 0.000 NA   NA
 3769441 3769442 MAE_23130 MAE_23140     FALSE 0.144 169.000 0.000 NA   NA
 3769442 3769443 MAE_23140 MAE_23150     FALSE 0.098 225.000 0.000 1.000 N NA
 3769443 3769444 MAE_23150 MAE_23160     FALSE 0.059 369.000 0.000 NA   NA
 3769445 3769446 MAE_23170 MAE_23180   murF TRUE 0.275 39.000 0.000 1.000 N NA
 3769446 3769447 MAE_23180 MAE_23190 murF   TRUE 0.547 21.000 0.000 NA   NA
 3769447 3769448 MAE_23190 MAE_23200     FALSE 0.037 545.000 0.000 NA   NA
 3769448 3769449 MAE_23200 MAE_23210     FALSE 0.048 434.000 0.000 NA   NA
 3769449 3769450 MAE_23210 MAE_23220     FALSE 0.055 383.000 0.000 NA   NA
 3769450 3769451 MAE_23220 MAE_23230     TRUE 0.399 156.000 0.000 1.000 Y NA
 3769452 3769453 MAE_23240 MAE_23250     TRUE 0.543 22.000 0.000 1.000   NA
 3769453 3769454 MAE_23250 MAE_23260     FALSE 0.146 157.000 0.000 1.000 N NA
 3769454 3769455 MAE_23260 MAE_23270     FALSE 0.039 516.000 0.000 NA   NA
 3769457 3769458 MAE_23290 MAE_23300 trpE psaD TRUE 0.486 374.000 0.091 1.000   NA
 3769458 3769459 MAE_23300 MAE_23310 psaD   FALSE 0.087 285.000 0.000 1.000   NA
 3769459 3769460 MAE_23310 MAE_23320     FALSE 0.199 111.000 0.000 NA   NA
 3769460 3769461 MAE_23320 MAE_23330   trpG TRUE 0.850 62.000 0.231 NA   NA
 3769461 3769462 MAE_23330 MAE_23340 trpG   FALSE 0.180 128.000 0.000 NA   NA
 3769462 3769463 MAE_23340 MAE_23350     TRUE 0.993 3.000 0.333 NA   NA
 3769464 3769465 MAE_23360 MAE_23370     FALSE 0.164 147.000 0.000 NA   NA
 3769465 3769466 MAE_23370 MAE_23380     TRUE 0.284 40.000 0.000 NA   NA
 3769468 3769469 MAE_23400 MAE_23410     FALSE 0.211 87.000 0.000 NA   NA
 3769469 3769470 MAE_23410 MAE_23420     FALSE 0.235 285.000 0.000 NA Y NA
 3769472 3769473 MAE_23440 MAE_23450     TRUE 0.977 -34.000 0.000 NA   NA
 3769476 3769477 MAE_23480 MAE_23490 mutS psb27 FALSE 0.066 337.000 0.000 NA   NA
 3769477 3769478 MAE_23490 MAE_23500 psb27   FALSE 0.038 528.000 0.000 NA   NA
 3769479 3769480 MAE_23510 MAE_23520     TRUE 0.876 2.000 0.000 NA N NA
 3769480 3769481 MAE_23520 MAE_23530     FALSE 0.143 171.000 0.000 NA   NA
 3769481 3769482 MAE_23530 MAE_23540     TRUE 0.329 35.000 0.000 NA   NA
 3769482 3769483 MAE_23540 MAE_23550     FALSE 0.235 51.000 0.000 NA   NA
 3769483 3769484 MAE_23550 MAE_23560     FALSE 0.208 96.000 0.000 NA   NA
 3769486 3769487 MAE_23580 MAE_23590     FALSE 0.159 153.000 0.000 NA   NA
 3769487 3769488 MAE_23590 MAE_23600     FALSE 0.165 134.000 0.000 1.000 N NA
 3769488 3769489 MAE_23600 MAE_23610     FALSE 0.227 59.000 0.000 NA   NA
 3769489 3769490 MAE_23610 MAE_23620     TRUE 0.305 37.000 0.000 NA   NA
 3769490 3769491 MAE_23620 MAE_23630     FALSE 0.227 63.000 0.000 NA   NA
 3769491 3769492 MAE_23630 MAE_23640     FALSE 0.064 344.000 0.000 NA   NA
 3769493 3769494 MAE_23650 MAE_23660     FALSE 0.184 125.000 0.000 NA   NA
 3769496 3769497 MAE_23680 MAE_23690     TRUE 0.989 8.000 0.643 NA   NA
 3769497 3769498 MAE_23690 MAE_23700     FALSE 0.087 272.000 0.000 NA   NA
 3769498 3769499 MAE_23700 MAE_23710     TRUE 0.998 0.000 0.489 NA Y NA
 3769499 3769500 MAE_23710 MAE_23720     TRUE 0.988 9.000 0.605 NA   NA
 3769500 3769501 MAE_23720 MAE_23730     TRUE 0.998 -3.000 0.605 NA   NA
 3769501 3769502 MAE_23730 MAE_23740     TRUE 0.998 -3.000 0.913 NA   NA
 3769502 3769503 MAE_23740 MAE_23750   ndhD5c TRUE 0.997 -3.000 0.404 NA   NA
 3769503 3769504 MAE_23750 MAE_23760 ndhD5c   TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.007 Y NA
 3769504 3769505 MAE_23760 MAE_23770   ndhD5b TRUE 0.885 144.000 0.306 0.007 Y NA
 3769505 3769506 MAE_23770 MAE_23780 ndhD5b   TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.007 Y NA
 3769506 3769507 MAE_23780 MAE_23790   ndhD5a TRUE 0.885 144.000 0.306 0.007 Y NA
 3769507 3769508 MAE_23790 MAE_23800 ndhD5a   FALSE 0.049 425.000 0.000 NA   NA
 3769509 3769510 MAE_23810 MAE_23820     TRUE 0.808 6.000 0.000 NA   NA
 3769511 3769512 MAE_23830 MAE_23840     FALSE 0.047 436.000 0.000 NA   NA
 3769512 3769513 MAE_23840 MAE_23850     TRUE 0.974 18.000 0.556 NA   NA
 3769513 3769514 MAE_23850 MAE_23860   fbp FALSE 0.099 255.000 0.000 1.000   NA
 3769514 3769515 MAE_23860 MAE_23870 fbp   FALSE 0.134 178.000 0.000 NA   NA
 3769515 3769516 MAE_23870 MAE_23880   zam TRUE 0.992 3.000 0.171 NA   NA
 3769523 3769524 MAE_23950 MAE_23960     TRUE 0.490 24.000 0.000 NA   NA
 3769524 3769525 MAE_23960 MAE_23970     TRUE 0.587 19.000 0.000 NA   NA
 3769527 3769528 MAE_23990 MAE_24000     TRUE 0.239 50.000 0.000 NA   NA
 3769531 3769532 MAE_24030 MAE_24040     TRUE 0.994 2.000 0.348 NA   NA
 3769533 3769534 MAE_24050 MAE_24060     FALSE 0.207 99.000 0.000 NA   NA
 3769534 3769535 MAE_24060 MAE_24070     FALSE 0.101 234.000 0.000 NA   NA
 3769535 3769536 MAE_24070 MAE_24080     TRUE 0.748 147.000 0.074 1.000   NA
 3769537 3769538 MAE_24090 MAE_24100     TRUE 0.933 54.000 1.000 NA Y NA
 3769538 3769539 MAE_24100 MAE_24110     FALSE 0.084 279.000 0.000 NA   NA
 3769539 3769540 MAE_24110 MAE_24120     TRUE 0.273 42.000 0.000 NA   NA
 3769540 3769541 MAE_24120 MAE_24130     TRUE 0.900 1.000 0.000 NA   NA
 3769541 3769542 MAE_24130 MAE_24140   rodA FALSE 0.079 293.000 0.000 NA   NA
 3769542 3769543 MAE_24140 MAE_24150 rodA   TRUE 0.747 219.000 0.041 1.000 Y NA
 3769543 3769544 MAE_24150 MAE_24160     FALSE 0.078 310.000 0.000 1.000   NA
 3769544 3769545 MAE_24160 MAE_24170     TRUE 0.971 -13.000 0.000 1.000   NA
 3769545 3769546 MAE_24170 MAE_24180     TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.017 Y NA
 3769546 3769547 MAE_24180 MAE_24190     TRUE 0.254 43.000 0.000 1.000 N NA
 3769548 3769549 MAE_24200 MAE_24210     FALSE 0.108 194.000 0.000 NA N NA
 3769549 3769550 MAE_24210 MAE_24220     FALSE 0.126 170.000 0.000 NA N NA
 3769551 3769552 MAE_24230 MAE_24240 ureG   FALSE 0.119 176.000 0.000 NA N NA
 3769552 3769553 MAE_24240 MAE_24250     FALSE 0.172 138.000 0.000 NA   NA
 3769553 3769554 MAE_24250 MAE_24260   psbP FALSE 0.086 273.000 0.000 NA   NA
 3769556 3769557 MAE_24280 MAE_24290     FALSE 0.061 356.000 0.000 NA   NA
 3769557 3769558 MAE_24290 MAE_24300     FALSE 0.235 51.000 0.000 NA   NA
 3769558 3769559 MAE_24300 MAE_24310   trpS TRUE 0.667 14.000 0.000 NA   NA
 3769559 3769560 MAE_24310 MAE_24320 trpS   TRUE 0.239 62.000 0.000 1.000   NA
 3769560 3769561 MAE_24320 MAE_24330 &n