MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium butyricum 5521

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 11523917 11666280         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11666280 11808672         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11808672 11523918         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523918 11666281         TRUE NA -45.000 0.000 NA   NA
 11666281 11808673         TRUE NA -45.000 0.000 NA   NA
 11808673 11523919         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523919 11666282         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11666282 11808674         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11808674 11523920         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523920 11666283         TRUE NA -42.000 0.000 NA   NA
 11666283 11808675         TRUE NA -42.000 0.000 NA   NA
 11808675 11523921         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523921 11666284         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11666284 11808676         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11808676 11523922         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523922 11666285         TRUE NA -42.000 0.000 NA   NA
 11666285 11808677         TRUE NA -42.000 0.000 NA   NA
 11808677 11523923         TRUE NA 1.000 0.000 NA   NA
 11523923 11666286         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 11666286 11808678         TRUE NA -16.000 0.000 NA   NA
 5972160 4726349 CBY_4090 CBY_4091     FALSE 0.329 110.000 0.000 1.000 N NA
 4726349 4726350 CBY_4091 CBY_4092     FALSE 0.081 230.000 0.000 0.068   NA
 4726350 5972161 CBY_4092 CBY_4093     FALSE 0.017 377.000 0.000 1.000   NA
 5972161 5972162 CBY_4093 CBY_4094     FALSE 0.418 82.000 0.000 NA   NA
 5972163 5972164 CBY_4095 CBY_4096     FALSE 0.073 243.000 0.000 NA N NA
 5972165 5972166 CBY_4097 CBY_4098     TRUE 0.879 117.000 0.000 1.000 Y NA
 5972166 5972167 CBY_4098 CBY_4099     TRUE 0.844 79.000 0.143 1.000   NA
 5972167 5972168 CBY_4099 CBY_4100     FALSE 0.150 199.000 0.000 NA   NA
 5972168 5972169 CBY_4100 CBY_4101     FALSE 0.306 117.000 0.000 NA   NA
 5972169 5972170 CBY_4101 CBY_4102     FALSE 0.217 172.000 0.000 NA   NA
 5972170 5972171 CBY_4102 CBY_4103     FALSE 0.195 182.000 0.000 NA   NA
 5972172 5972173 CBY_1747 CBY_1748     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5972173 5972174 CBY_1748 CBY_1749     TRUE 0.845 96.000 0.250 NA   NA
 5972174 5972175 CBY_1749 CBY_1750     FALSE 0.014 407.000 0.000 NA   NA
 4726748 4726749 CBY_4080 CBY_4081 glgD glgC TRUE 0.996 25.000 0.309 0.001 Y NA
 4726749 5972176 CBY_4081 CBY_4082 glgC   TRUE 0.927 153.000 0.049 1.000 Y NA
 5972176 5972177 CBY_4082 CBY_4083     FALSE 0.175 190.000 0.000 NA   NA
 5972177 5972178 CBY_4083 CBY_4084     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5972178 5972179 CBY_4084 CBY_4085   glgB TRUE 0.954 100.000 0.050 1.000 Y NA
 5972179 5972180 CBY_4085 CBY_4385 glgB rrf FALSE 0.010 509.000 0.000 NA   NA
 5972180 5972181 CBY_4385 CBY_4386 rrf rrl FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5972182 5972183 CBY_4087 CBY_4088     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972185 5972186 CBY_1186 CBY_1187     FALSE 0.396 88.000 0.000 NA   NA
 5972188 5972189 CBY_1190 CBY_1191     TRUE 0.831 -3.000 0.000 1.000   NA
 5972190 5972191 CBY_1192 CBY_1193     FALSE 0.461 72.000 0.000 NA   NA
 5972192 5972193 CBY_1194 CBY_1195 ilvB   TRUE 0.974 -7.000 0.189 0.003   NA
 5972193 5972194 CBY_1195 CBY_1196     FALSE 0.265 143.000 0.000 NA   NA
 5972195 5972196 CBY_1197 CBY_1198     TRUE 0.998 13.000 0.492 0.024 Y NA
 5972196 5972197 CBY_1198 CBY_1199   gatC TRUE 0.998 16.000 0.643 1.000 Y NA
 5972197 5972198 CBY_1199 CBY_1200 gatC aspS FALSE 0.275 415.000 0.009 1.000 Y NA
 5972198 5972199 CBY_1200 CBY_1201 aspS   FALSE 0.007 747.000 0.000 NA   NA
 5972199 5972200 CBY_1201 CBY_1202     FALSE 0.015 401.000 0.000 NA   NA
 5972200 5972201 CBY_1202 CBY_1203   asd FALSE 0.115 214.000 0.000 NA   NA
 5972203 5972204 CBY_1205 CBY_1206     FALSE 0.025 326.000 0.000 NA   NA
 5972204 5972205 CBY_1206 CBY_1207     FALSE 0.038 285.000 0.000 NA   NA
 5972205 5972206 CBY_1207 CBY_1208     FALSE 0.079 236.000 0.000 NA   NA
 5972208 5972209 CBY_1210 CBY_1211     FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 5972209 5972210 CBY_1211 CBY_1212     FALSE 0.062 252.000 0.000 1.000 N NA
 5972210 5972211 CBY_1212 CBY_1213     FALSE 0.081 236.000 0.000 NA N NA
 5972211 5972212 CBY_1213 CBY_1214     TRUE 0.854 116.000 0.500 NA   NA
 5972212 5972213 CBY_1214 CBY_1215     FALSE 0.123 210.000 0.000 NA   NA
 5972213 5972214 CBY_1215 CBY_1216     TRUE 0.996 -13.000 0.200 1.000 Y NA
 5972215 5972216 CBY_1217 CBY_1218     TRUE 0.979 15.000 0.269 NA N NA
 5972218 5972219 CBY_1220 CBY_1221     TRUE 0.970 15.000 0.125 NA   NA
 5972219 5972220 CBY_1221 CBY_1222     TRUE 0.964 4.000 0.062 NA   NA
 5972220 4726954 CBY_1222 CBY_1223     FALSE 0.268 135.000 0.000 1.000   NA
 5972221 5972222 CBY_1224 CBY_1225 lgt   TRUE 0.653 42.000 0.000 1.000 N NA
 5972222 5972223 CBY_1225 CBY_1226     TRUE 0.890 98.000 0.600 NA N NA
 5972223 5972224 CBY_1226 CBY_1227     FALSE 0.408 85.000 0.000 NA   NA
 5972224 5972225 CBY_1227 CBY_1228     TRUE 0.825 16.000 0.000 NA   NA
 5972225 5972226 CBY_1228 CBY_1229   trx FALSE 0.462 68.000 0.000 0.005   NA
 5972226 5972227 CBY_1229 CBY_1230 trx gidA TRUE 0.783 129.000 0.250 1.000   NA
 5972227 4726960 CBY_1230 CBY_1231 gidA   FALSE 0.057 254.000 0.000 1.000   NA
 5972229 5972230 CBY_0802 CBY_0803     TRUE 0.984 26.000 0.933 NA   NA
 4727118 5972232 CBY_0805 CBY_0806     TRUE 0.783 25.000 0.000 1.000   NA
 5972232 5972233 CBY_0806 CBY_0807     FALSE 0.040 282.000 0.000 1.000 N NA
 5972233 5972234 CBY_0807 CBY_0808     FALSE 0.041 277.000 0.000 NA   NA
 5972236 5972237 CBY_0810 CBY_0811     FALSE 0.017 377.000 0.000 NA   NA
 5972237 5972238 CBY_0811 CBY_0812     TRUE 0.992 23.000 0.025 1.000 Y NA
 5972238 5972239 CBY_0812 CBY_0813     FALSE 0.152 198.000 0.000 NA   NA
 5972239 4727125 CBY_0813 CBY_0814     FALSE 0.077 237.000 0.000 NA   NA
 4727125 5972240 CBY_0814 CBY_0815     FALSE 0.031 301.000 0.000 NA   NA
 5972240 5972241 CBY_0815 CBY_0816   pyc FALSE 0.270 135.000 0.000 NA   NA
 5972241 5972242 CBY_0816 CBY_0817 pyc   FALSE 0.012 449.000 0.000 NA   NA
 5972242 5972243 CBY_0817 CBY_0818     FALSE 0.019 359.000 0.000 NA   NA
 5972243 5972244 CBY_0818 CBY_0819     TRUE 0.728 203.000 0.000 1.000 Y NA
 5972244 5972245 CBY_0819 CBY_0820     TRUE 0.965 45.000 0.000 1.000 Y NA
 5972245 5972246 CBY_0820 CBY_0821     TRUE 0.998 -7.000 0.818 0.041 Y NA
 5972246 5972247 CBY_0821 CBY_0822     TRUE 0.995 32.000 0.273 1.000 Y NA
 5972248 4727142 CBY_0824 CBY_0825     TRUE 0.821 -9.000 0.000 NA   NA
 4727142 5972249 CBY_0825 CBY_0826     TRUE 0.998 5.000 1.000 1.000 Y NA
 5972249 5972250 CBY_0826 CBY_0827     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972250 5972251 CBY_0827 CBY_0828     FALSE 0.229 166.000 0.000 NA   NA
 5972251 5972252 CBY_0828 CBY_0829     TRUE 0.997 29.000 1.000 0.025 Y NA
 5972254 5972255 CBY_1052 CBY_1053     FALSE 0.111 216.000 0.000 NA   NA
 5972255 5972256 CBY_1053 CBY_1054     FALSE 0.017 379.000 0.000 NA   NA
 5972257 5972258 CBY_1055 CBY_1056     FALSE 0.010 546.000 0.000 1.000 N NA
 5972259 5972260 CBY_1057 CBY_1058     FALSE 0.468 198.000 0.061 NA   NA
 5972260 5972261 CBY_1058 CBY_1059     TRUE 0.983 16.000 0.429 NA   NA
 5972261 4727289 CBY_1059 CBY_1060     TRUE 0.922 19.000 0.008 NA   NA
 4727289 5972262 CBY_1060 CBY_1061     FALSE 0.034 291.000 0.000 NA   NA
 5972262 5972263 CBY_1061 CBY_1062     FALSE 0.318 112.000 0.000 NA   NA
 5972264 4727400 CBY_0590 CBY_0591     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 4727400 5972265 CBY_0591 CBY_0592     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5972265 5972266 CBY_0592 CBY_0593     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5972266 5972267 CBY_0593 CBY_0594     TRUE 0.793 23.000 0.000 NA   NA
 5972267 5972268 CBY_0594 CBY_0595     TRUE 0.634 44.000 0.000 NA   NA
 5972268 5972269 CBY_0595 CBY_0596     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5972269 5972270 CBY_0596 CBY_0597     FALSE 0.393 89.000 0.000 NA   NA
 5972270 5972271 CBY_0597 CBY_0598     TRUE 0.804 -30.000 0.000 NA   NA
 5972271 5972272 CBY_0598 CBY_0599     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5972272 5972273 CBY_0599 CBY_0600     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 5972273 5972274 CBY_0600 CBY_0601     TRUE 0.987 14.000 0.667 NA   NA
 5972274 5972275 CBY_0601 CBY_0602     TRUE 0.667 40.000 0.000 NA   NA
 5972275 5972276 CBY_0602 CBY_0603     TRUE 0.807 -22.000 0.000 NA   NA
 5972276 5972277 CBY_0603 CBY_0604     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5972277 5972278 CBY_0604 CBY_0605     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5972279 5972280 CBY_1063 CBY_1064     FALSE 0.241 159.000 0.000 NA   NA
 5972280 5972281 CBY_1064 CBY_1065     TRUE 0.994 -3.000 0.044 0.001 Y NA
 5972281 5972282 CBY_1065 CBY_1066     FALSE 0.008 743.000 0.000 NA N NA
 5972282 5972283 CBY_1066 CBY_1067     TRUE 0.894 106.000 0.000 NA Y NA
 5972283 5972284 CBY_1067 CBY_1068     FALSE 0.096 223.000 0.000 NA   NA
 5972284 5972285 CBY_1068 CBY_1069     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5972285 5972286 CBY_1069 CBY_1070     TRUE 0.866 118.000 0.667 NA   NA
 5972286 5972287 CBY_1070 CBY_1071     FALSE 0.148 200.000 0.000 NA   NA
 5972290 5972291 CBY_1074 CBY_1075     FALSE 0.030 303.000 0.000 NA   NA
 5972292 5972293 CBY_1076 CBY_1077     FALSE 0.185 186.000 0.000 NA   NA
 5972293 4727570 CBY_1077 CBY_1078     FALSE 0.023 334.000 0.000 NA   NA
 5972294 5972295 CBY_1079 CBY_1080     FALSE 0.440 77.000 0.000 NA   NA
 5972296 5972297 CBY_1081 CBY_1082     FALSE 0.312 115.000 0.000 NA   NA
 5972297 5972298 CBY_1082 CBY_1083     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5972298 5972299 CBY_1083 CBY_1084     FALSE 0.036 288.000 0.000 NA   NA
 5972299 5972300 CBY_1084 CBY_1085     FALSE 0.461 72.000 0.000 NA   NA
 5972300 5972301 CBY_1085 CBY_1086     FALSE 0.020 354.000 0.000 NA   NA
 5972301 5972302 CBY_1086 CBY_1087     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5972306 4727686 CBY_0774 CBY_0775     FALSE 0.009 550.000 0.000 1.000   NA
 4727686 5972307 CBY_0775 CBY_0776     FALSE 0.007 854.000 0.000 NA   NA
 5972307 5972308 CBY_0776 CBY_0777     FALSE 0.277 130.000 0.000 NA   NA
 5972308 5972309 CBY_0777 CBY_0778     FALSE 0.344 104.000 0.000 NA   NA
 5972310 5972311 CBY_0548 CBY_0549     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 5972313 5972314 CBY_0551 CBY_0552     FALSE 0.019 369.000 0.000 1.000 N NA
 5972314 5972315 CBY_0552 CBY_0553   argD TRUE 0.634 45.000 0.000 1.000 N NA
 5972315 5972316 CBY_0553 CBY_0554 argD   FALSE 0.024 329.000 0.000 1.000 N NA
 5972316 5972317 CBY_0554 CBY_0555     FALSE 0.012 461.000 0.000 NA   NA
 5972318 5972319 CBY_4228 CBY_0557     FALSE 0.256 152.000 0.000 NA   NA
 5972320 5972321 CBY_0558 CBY_0560 ytxC infC FALSE 0.235 162.000 0.000 NA   NA
 5972322 5972323 CBY_0290 CBY_0291     FALSE 0.072 242.000 0.000 NA   NA
 5972323 5972324 CBY_0291 CBY_0292   recA FALSE 0.119 281.000 0.018 1.000   NA
 5972324 5972325 CBY_0292 CBY_0293 recA   FALSE 0.219 171.000 0.000 NA   NA
 5972326 5972327 CBY_1867 CBY_1868 trpB   TRUE 0.914 211.000 0.375 0.002 Y NA
 5972327 5972328 CBY_1868 CBY_1869   trpC FALSE 0.063 250.000 0.000 NA   NA
 5972328 5972329 CBY_1869 CBY_1870 trpC   FALSE 0.376 93.000 0.000 NA   NA
 5972330 5972331 CBY_0308 CBY_0309     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5972331 5972332 CBY_0309 CBY_0310     FALSE 0.015 395.000 0.000 NA   NA
 5972333 5972334 CBY_3238 CBY_3239   cysT FALSE 0.350 102.000 0.000 NA   NA
 5972334 5972335 CBY_3239 CBY_3240 cysT cysW TRUE 0.966 47.000 0.935 0.001 N NA
 5972335 5972336 CBY_3240 CBY_3241 cysW   TRUE 0.962 0.000 0.060 1.000 N NA
 5972336 5972337 CBY_3241 CBY_3242     TRUE 0.838 91.000 0.194 1.000 N NA
 5972337 5972338 CBY_3242 CBY_3243     TRUE 0.997 -16.000 0.484 0.037 Y NA
 5972338 5972339 CBY_3243 CBY_3244   cysD TRUE 0.965 39.000 0.500 1.000 N NA
 5972339 5972340 CBY_3244 CBY_3245 cysD   TRUE 0.989 2.000 0.933 0.001 N NA
 5972341 5972342 CBY_3246 CBY_3247     FALSE 0.014 414.000 0.000 NA   NA
 5972343 5972344 CBY_3248 CBY_3249     FALSE 0.134 206.000 0.000 NA   NA
 5972344 5972345 CBY_3249 CBY_3250     FALSE 0.020 354.000 0.000 1.000   NA
 5972345 5972346 CBY_3250 CBY_3251     FALSE 0.023 336.000 0.000 NA   NA
 5972346 5972347 CBY_3251 CBY_3252     FALSE 0.221 170.000 0.000 NA   NA
 5972349 5972350 CBY_3254 CBY_3255     TRUE 0.997 21.000 0.429 0.011 Y NA
 5972350 5972351 CBY_3255 CBY_3256     FALSE 0.394 284.000 0.000 1.000 Y NA
 5972351 5972352 CBY_3256 CBY_3257     TRUE 0.947 141.000 0.111 1.000 Y NA
 5972352 4728213 CBY_3257 CBY_3258     FALSE 0.353 248.000 0.182 0.010 N NA
 4728213 4728214 CBY_3258 CBY_3259     FALSE 0.020 355.000 0.000 1.000 N NA
 5972353 5972354 CBY_0540 CBY_0541 trmD rplS FALSE 0.271 134.000 0.000 NA   NA
 5972354 5972355 CBY_0541 CBY_0542 rplS   FALSE 0.094 311.000 0.027 1.000   NA
 5972355 5972356 CBY_0542 CBY_0543     TRUE 0.970 -13.000 0.148 1.000   NA
 5972356 5972357 CBY_0543 CBY_0544     FALSE 0.008 745.000 0.000 1.000 N NA
 5972357 5972358 CBY_0544 CBY_0545     TRUE 0.959 13.000 0.053 1.000 N NA
 5972358 5972359 CBY_0545 CBY_0546   topA TRUE 0.991 45.000 0.238 1.000 Y NA
 5972359 5972360 CBY_0546 CBY_0547 topA   FALSE 0.144 202.000 0.000 NA   NA
 5972363 5972364 CBY_0222 CBY_0223   mgtA FALSE 0.444 76.000 0.000 NA   NA
 5972364 5972365 CBY_0223 CBY_0224 mgtA   FALSE 0.182 187.000 0.000 1.000   NA
 5972365 5972366 CBY_0224 CBY_0225   mgtA TRUE 0.983 17.000 0.444 1.000   NA
 5972368 5972369 CBY_0227 CBY_0228     FALSE 0.069 244.000 0.000 NA   NA
 5972369 5972370 CBY_0228 CBY_0229   hisS FALSE 0.256 152.000 0.000 NA   NA
 5972370 5972371 CBY_0229 CBY_0230 hisS   FALSE 0.022 340.000 0.000 NA   NA
 5972371 5972372 CBY_0230 CBY_0231   aat FALSE 0.024 329.000 0.000 NA   NA
 5972372 5972373 CBY_0231 CBY_0232 aat   TRUE 0.804 21.000 0.000 NA   NA
 5972373 5972374 CBY_0232 CBY_0233   nifJ FALSE 0.008 714.000 0.000 NA   NA
 5972374 5972375 CBY_0233 CBY_0234 nifJ   FALSE 0.036 289.000 0.000 NA   NA
 5972375 5972376 CBY_0234 CBY_0235     FALSE 0.038 285.000 0.000 NA   NA
 5972376 5972377 CBY_0235 CBY_0236   pfkB TRUE 0.975 146.000 0.816 1.000 Y NA
 5972377 5972378 CBY_0236 CBY_0237 pfkB   TRUE 0.998 2.000 0.721 1.000 Y NA
 5972378 5972379 CBY_0237 CBY_0238     TRUE 0.531 146.000 0.016 NA N NA
 5972379 5972380 CBY_0238 CBY_0239     FALSE 0.054 264.000 0.000 NA N NA
 5972380 5972381 CBY_0239 CBY_0240     FALSE 0.319 115.000 0.000 NA N NA
 5972381 5972382 CBY_0240 CBY_0241     TRUE 0.521 185.000 0.057 NA   NA
 5972382 5972383 CBY_0241 CBY_0242     TRUE 0.737 32.000 0.000 1.000   NA
 5972383 5972384 CBY_0242 CBY_0243     FALSE 0.300 118.000 0.000 1.000   NA
 5972386 5972387 CBY_0245 CBY_0246 kduD   TRUE 0.520 62.000 0.000 1.000 N NA
 5972387 5972388 CBY_0246 CBY_0247     TRUE 0.930 141.000 0.046 1.000 Y NA
 5972388 5972389 CBY_0247 CBY_0248     TRUE 0.764 194.000 0.000 1.000 Y NA
 5972389 5972390 CBY_0248 CBY_0249     TRUE 0.997 3.000 0.286 1.000 Y NA
 5972390 5972391 CBY_0249 CBY_0250   uxaC FALSE 0.048 270.000 0.000 NA   NA
 5972393 5972394 CBY_2705 CBY_2706     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972395 5972396 CBY_4330 CBY_2708 rrs gyrA FALSE 0.010 540.000 0.000 NA   NA
 5972396 5972397 CBY_2708 CBY_2709 gyrA gyrB TRUE 0.997 22.000 0.306 0.002 Y NA
 5972397 4728407 CBY_2709 CBY_2710 gyrB   TRUE 0.798 56.000 0.017 NA   NA
 4728407 4728408 CBY_2710 CBY_2711     TRUE 0.944 15.000 0.024 NA   NA
 4728408 5972398 CBY_2711 CBY_2712   yaaA TRUE 0.719 164.000 0.209 1.000   NA
 5972398 5972399 CBY_2712 CBY_2713 yaaA dnaN TRUE 0.929 39.000 0.103 1.000   NA
 5972399 5972400 CBY_2713 CBY_2714 dnaN dnaA TRUE 0.806 263.000 0.328 1.000 Y NA
 5972401 5972402 CBY_2715 CBY_2716 rpmH rnpA TRUE 0.949 59.000 0.787 1.000   NA
 5972402 5972403 CBY_2716 CBY_2717 rnpA   TRUE 0.982 -28.000 0.540 NA   NA
 5972403 5972404 CBY_2717 CBY_2718     TRUE 0.979 24.000 0.461 NA   NA
 5972404 5972405 CBY_2718 CBY_2719     TRUE 0.921 56.000 0.254 1.000   NA
 5972405 5972406 CBY_2719 CBY_2720   trmE TRUE 0.665 163.000 0.116 1.000   NA
 5972406 5972407 CBY_2720 CBY_2721 trmE gidA TRUE 0.980 12.000 0.266 1.000   NA
 5972407 5972408 CBY_2721 CBY_2722 gidA gidB TRUE 0.981 21.000 0.466 1.000 N NA
 5972408 5972409 CBY_2722 CBY_2723 gidB spo0J TRUE 0.731 114.000 0.089 1.000 N NA
 5972409 5972410 CBY_2723 CBY_2724 spo0J   FALSE 0.435 208.000 0.069 1.000 N NA
 5972410 5972411 CBY_2724 CBY_2725     TRUE 0.988 14.000 0.827 1.000 N NA
 5972411 5972412 CBY_2725 CBY_2726     TRUE 0.897 40.000 0.047 NA   NA
 5972413 5972414 CBY_2727 CBY_2728 yyaC   TRUE 0.826 57.000 0.035 NA   NA
 5972414 5972415 CBY_2728 CBY_2729     TRUE 0.986 54.000 0.148 1.000 Y NA
 5972416 5972417 CBY_2730 CBY_2731     TRUE 0.959 24.000 0.105 NA   NA
 5972417 5972418 CBY_2731 CBY_2732     TRUE 0.972 0.000 0.121 NA   NA
 5972418 5972419 CBY_2732 CBY_2733   rpsF TRUE 0.664 102.000 0.028 NA   NA
 5972419 5972420 CBY_2733 CBY_2734 rpsF   TRUE 0.926 14.000 0.003 1.000 N NA
 5972420 5972421 CBY_2734 CBY_2735   rpsR TRUE 0.890 29.000 0.003 1.000 N NA
 5972421 5972422 CBY_2735 CBY_2736 rpsR   FALSE 0.123 274.000 0.015 NA   NA
 5972422 5972423 CBY_2736 CBY_2737     TRUE 0.945 21.000 0.043 NA   NA
 5972423 5972424 CBY_2737 CBY_2738   rplI TRUE 0.973 3.000 0.119 1.000 N NA
 5972424 5972425 CBY_2738 CBY_2739 rplI lonC TRUE 0.948 13.000 0.024 1.000 N NA
 5972425 5972426 CBY_2739 CBY_2740 lonC dnaB TRUE 0.633 134.000 0.053 1.000 N NA
 5972426 5972427 CBY_2740 CBY_2741 dnaB proC FALSE 0.008 623.000 0.000 1.000 N NA
 5972428 5972429 CBY_2742 CBY_2743     TRUE 0.973 -7.000 0.167 NA   NA
 5972429 5972430 CBY_2743 CBY_2744     FALSE 0.090 228.000 0.000 1.000 N NA
 5972432 5972433 CBY_1233 CBY_1234     FALSE 0.039 282.000 0.000 NA   NA
 5972433 5972434 CBY_1234 CBY_1235   dapA FALSE 0.014 417.000 0.000 1.000 N NA
 5972434 5972435 CBY_1235 CBY_1236 dapA   TRUE 0.753 151.000 0.222 NA   NA
 5972435 5972436 CBY_1236 CBY_1237     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5972436 5972437 CBY_1237 CBY_4235   rrf FALSE 0.073 241.000 0.000 NA   NA
 5972437 5972438 CBY_4235 CBY_4236 rrf rrl FALSE 0.262 147.000 0.000 NA   NA
 5972439 5972440 CBY_1239 CBY_1240     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972441 5972442 CBY_0326 CBY_0327     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5972443 5972444 CBY_0328 CBY_0329     TRUE 0.935 16.000 0.015 1.000   NA
 5972444 5972445 CBY_0329 CBY_0330     TRUE 0.712 73.000 0.012 NA   NA
 5972446 5972447 CBY_0332 CBY_0333     FALSE 0.029 307.000 0.000 NA   NA
 5972447 5972448 CBY_0333 CBY_0334     TRUE 0.907 88.000 0.667 NA   NA
 5972448 5972449 CBY_0334 CBY_0335     TRUE 0.506 63.000 0.000 NA   NA
 5972449 5972450 CBY_0335 CBY_0336     FALSE 0.178 189.000 0.000 NA   NA
 5972450 5972451 CBY_0336 CBY_0337     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5972451 5972452 CBY_0337 CBY_0338     TRUE 0.792 178.000 0.667 NA   NA
 5972452 5972453 CBY_0338 CBY_0339   uvdE FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5972453 5972454 CBY_0339 CBY_0340 uvdE   FALSE 0.267 136.000 0.000 1.000   NA
 5972454 5972455 CBY_0340 CBY_0341     FALSE 0.193 182.000 0.000 1.000   NA
 5972455 5972456 CBY_0341 CBY_0342     FALSE 0.019 360.000 0.000 NA   NA
 5972456 5972457 CBY_0342 CBY_0343     TRUE 0.648 221.000 0.000 NA Y NA
 5972457 5972458 CBY_0343 CBY_0344     FALSE 0.110 217.000 0.000 1.000 N NA
 5972458 5972459 CBY_0344 CBY_0345     TRUE 0.530 61.000 0.000 NA N NA
 5972461 5972462 CBY_0347 CBY_0348 valS   FALSE 0.270 142.000 0.000 1.000 N NA
 5972462 5972463 CBY_0348 CBY_0349   folC FALSE 0.028 315.000 0.000 1.000 N NA
 5972463 5972464 CBY_0349 CBY_0350 folC   TRUE 0.873 51.000 0.059 NA   NA
 4728608 5972469 CBY_0180 CBY_0181     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5972469 5972470 CBY_0181 CBY_0182     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5972471 5972472 CBY_3147 CBY_3148     FALSE 0.316 113.000 0.000 NA   NA
 5972472 5972473 CBY_3148 CBY_3149     TRUE 0.937 20.000 0.022 1.000 N NA
 5972473 5972474 CBY_3149 CBY_3150     FALSE 0.059 253.000 0.000 1.000   NA
 5972474 4728665 CBY_3150 CBY_3151   pheS FALSE 0.009 561.000 0.000 1.000   NA
 4728665 5972475 CBY_3151 CBY_3152 pheS pheT TRUE 0.851 254.000 0.574 0.001 Y NA
 5972475 5972476 CBY_3152 CBY_3153 pheT   FALSE 0.025 326.000 0.000 NA   NA
 5972476 5972477 CBY_3153 CBY_3154     FALSE 0.372 95.000 0.000 NA   NA
 5972479 5972480 CBY_3156 CBY_3157     TRUE 0.998 -7.000 0.933 0.009 Y NA
 5972480 5972481 CBY_3157 CBY_3158     FALSE 0.205 177.000 0.000 NA   NA
 5972481 5972482 CBY_3158 CBY_3159     FALSE 0.026 322.000 0.000 NA   NA
 5972482 5972483 CBY_3159 CBY_3160     TRUE 0.985 15.000 0.569 NA   NA
 5972485 5972486 CBY_3162 CBY_3163     FALSE 0.321 111.000 0.000 NA   NA
 4728679 5972488 CBY_3165 CBY_3166     FALSE 0.045 272.000 0.000 0.019 N NA
 5972488 5972489 CBY_3166 CBY_3167   xth TRUE 0.752 31.000 0.000 1.000 N NA
 5972489 5972490 CBY_3167 CBY_3168 xth   FALSE 0.019 362.000 0.000 1.000 N NA
 5972490 5972491 CBY_3168 CBY_3169     TRUE 0.675 133.000 0.080 NA   NA
 5972492 5972493 CBY_3170 CBY_3171     FALSE 0.162 195.000 0.000 NA   NA
 5972494 5972495 CBY_3172 CBY_3173   rnz TRUE 0.828 41.000 0.004 NA   NA
 5972495 5972496 CBY_3173 CBY_3174 rnz   FALSE 0.367 96.000 0.000 NA   NA
 5972496 5972497 CBY_3174 CBY_3175     FALSE 0.021 350.000 0.000 NA   NA
 5972497 5972498 CBY_3175 CBY_3176     TRUE 0.699 196.000 0.435 NA   NA
 5972498 5972499 CBY_3176 CBY_3177     TRUE 0.986 0.000 0.530 1.000   NA
 5972499 5972500 CBY_3177 CBY_3178     FALSE 0.057 257.000 0.000 1.000 N NA
 5972500 5972501 CBY_3178 CBY_3179     FALSE 0.373 96.000 0.000 1.000 N NA
 4728695 5972502 CBY_3181 CBY_3182     TRUE 0.547 57.000 0.000 NA   NA
 5972502 4728696 CBY_3182 CBY_3183     TRUE 0.574 53.000 0.000 NA   NA
 4728696 5972503 CBY_3183 CBY_3184     FALSE 0.298 251.000 0.111 1.000 N NA
 5972503 5972504 CBY_3184 CBY_3185     TRUE 0.984 55.000 0.111 0.039 Y NA
 5972504 5972505 CBY_3185 CBY_3186     TRUE 0.997 0.000 0.222 0.039 Y NA
 5972505 5972506 CBY_3186 CBY_3187     TRUE 0.986 74.000 0.444 0.039 Y NA
 5972506 5972507 CBY_3187 CBY_3188     TRUE 0.734 202.000 0.000 1.000 Y NA
 5972507 5972508 CBY_3188 CBY_3189   pulA TRUE 0.997 2.000 0.250 1.000 Y NA
 5972508 5972509 CBY_3189 CBY_3190 pulA   FALSE 0.277 130.000 0.000 NA   NA
 5972511 5972512 CBY_3192 CBY_3193     TRUE 0.831 122.000 0.405 1.000 N NA
 5972512 5972513 CBY_3193 CBY_3194   folE FALSE 0.251 317.000 0.429 1.000 N NA
 5972513 5972514 CBY_3194 CBY_3195 folE   FALSE 0.039 416.000 0.012 1.000   NA
 5972514 5972515 CBY_3195 CBY_3196     TRUE 0.624 140.000 0.053 1.000   NA
 5972517 5972518 CBY_3198 CBY_3199     FALSE 0.294 124.000 0.000 1.000 N NA
 5972518 5972519 CBY_3199 CBY_3200     TRUE 0.998 -7.000 0.812 0.009 Y NA
 5972520 5972521 CBY_3201 CBY_3202     FALSE 0.031 300.000 0.000 NA   NA
 5972521 5972522 CBY_3202 CBY_3203     FALSE 0.104 219.000 0.000 NA   NA
 5972522 5972523 CBY_3203 CBY_3204     TRUE 0.943 51.000 0.386 NA   NA
 5972526 5972527 CBY_3207 CBY_3208     FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 5972527 5972528 CBY_3208 CBY_3209   scpA TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5972528 5972529 CBY_3209 CBY_3210 scpA scpB TRUE 0.984 -13.000 0.570 NA   NA
 5972530 5972531 CBY_3211 CBY_3212 ytfJ   TRUE 0.977 9.000 0.182 NA   NA
 5972532 5972533 CBY_3213 CBY_3214     FALSE 0.260 149.000 0.000 NA   NA
 5972533 5972534 CBY_3214 CBY_3215     FALSE 0.022 343.000 0.000 NA   NA
 5972536 5972537 CBY_3217 CBY_3218 argF   TRUE 0.864 129.000 0.000 1.000 Y NA
 5972537 5972538 CBY_3218 CBY_3219     TRUE 0.835 55.000 0.037 NA   NA
 5972538 5972539 CBY_3219 CBY_3220     FALSE 0.272 133.000 0.000 NA   NA
 5972539 5972540 CBY_3220 CBY_3222     FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5972541 5972542 CBY_3223 CBY_3224     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5972542 5972543 CBY_3224 CBY_3225     TRUE 0.785 25.000 0.000 NA   NA
 5972543 5972544 CBY_3225 CBY_3226     TRUE 0.998 -3.000 0.933 0.009 Y NA
 5972545 5972546 CBY_3227 CBY_3228     FALSE 0.354 101.000 0.000 NA   NA
 5972546 5972547 CBY_3228 CBY_3229     FALSE 0.058 254.000 0.000 NA   NA
 5972547 5972548 CBY_3229 CBY_3230     TRUE 0.814 132.000 0.400 NA   NA
 5972548 5972549 CBY_3230 CBY_3231     FALSE 0.010 502.000 0.000 NA   NA
 5972549 5972550 CBY_3231 CBY_3232     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5972550 5972551 CBY_3232 CBY_3233     FALSE 0.069 244.000 0.000 NA   NA
 5972551 5972552 CBY_3233 CBY_3234   gidA TRUE 0.982 -3.000 0.381 0.036   NA
 5972554 5972555 CBY_3236 CBY_3237     FALSE 0.019 362.000 0.000 NA   NA
 5972557 5972558 CBY_2445 CBY_2446     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972559 5972560 CBY_4317 CBY_4318 rrf   TRUE 0.842 7.000 0.000 NA   NA
 5972560 5972561 CBY_4318 CBY_4319     FALSE 0.014 409.000 0.000 NA   NA
 5972562 5972563 CBY_2450 CBY_2451     FALSE 0.018 371.000 0.000 1.000   NA
 5972564 5972565 CBY_2452 CBY_4320   rrs FALSE 0.009 577.000 0.000 NA   NA
 5972565 5972566 CBY_4320 CBY_4321 rrs rrl FALSE 0.069 244.000 0.000 NA   NA
 5972567 5972568 CBY_2454 CBY_2455     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972569 5972570 CBY_3378 CBY_3379   cdd TRUE 0.514 62.000 0.000 NA   NA
 5972570 5972571 CBY_3379 CBY_3380 cdd deoB TRUE 0.609 123.000 0.031 1.000 N NA
 5972571 5972572 CBY_3380 CBY_3381 deoB   TRUE 0.970 40.000 0.000 1.000 Y NA
 5972572 5972573 CBY_3381 CBY_3382     TRUE 0.993 -7.000 0.018 0.003 Y NA
 5972573 5972574 CBY_3382 CBY_3383   deoD FALSE 0.355 102.000 0.000 1.000 N NA
 5972574 5972575 CBY_3383 CBY_3384 deoD   TRUE 0.494 66.000 0.000 1.000 N NA
 5972577 5972578 CBY_3386 CBY_3387   deoB TRUE 0.568 189.000 0.093 1.000 N NA
 5972578 5972579 CBY_3387 CBY_3388 deoB   FALSE 0.237 163.000 0.000 1.000 N NA
 5972579 5972580 CBY_3388 CBY_3389     FALSE 0.037 287.000 0.000 NA   NA
 5972580 5972581 CBY_3389 CBY_3391     FALSE 0.309 116.000 0.000 NA   NA
 5972581 5972582 CBY_3391 CBY_3392     FALSE 0.026 322.000 0.000 1.000 N NA
 5972582 5972583 CBY_3392 CBY_3393     FALSE 0.012 463.000 0.000 1.000 N NA
 5972583 5972584 CBY_3393 CBY_3394   cobB TRUE 0.973 63.000 0.039 1.000 Y NA
 5972584 5972585 CBY_3394 CBY_3395 cobB   TRUE 0.992 34.000 0.097 0.013 Y NA
 5972585 5972586 CBY_3395 CBY_3396     FALSE 0.331 108.000 0.000 NA   NA
 5972586 5972587 CBY_3396 CBY_3397   cbiD FALSE 0.059 253.000 0.000 NA   NA
 5972587 5972588 CBY_3397 CBY_3398 cbiD cbiE TRUE 0.996 3.000 0.126 0.013 Y NA
 5972588 5972589 CBY_3398 CBY_3399 cbiE   TRUE 0.911 90.000 0.000 0.001 Y NA
 5972589 5972590 CBY_3399 CBY_3400   cobI TRUE 0.981 41.000 0.010 0.013 Y NA
 5972590 5972591 CBY_3400 CBY_3401 cobI cobM TRUE 0.957 161.000 0.291 0.013 Y NA
 5972591 5972592 CBY_3401 CBY_3402 cobM   TRUE 0.998 0.000 0.397 0.013 Y NA
 5972592 5972593 CBY_3402 CBY_3403   cobJ TRUE 0.995 32.000 0.352 0.013 Y NA
 5972593 5972594 CBY_3403 CBY_3404 cobJ cobK TRUE 0.993 42.000 0.423 0.013 Y NA
 5972594 5972595 CBY_3404 CBY_3405 cobK cobD TRUE 0.844 154.000 0.000 0.013 Y NA
 5972595 5972596 CBY_3405 CBY_3406 cobD   TRUE 0.707 79.000 0.017 0.013 N NA
 5972596 5972597 CBY_3406 CBY_3407   cobQ FALSE 0.396 87.000 0.000 0.013 N NA
 5972597 5972598 CBY_3407 CBY_3408 cobQ   TRUE 0.761 55.000 0.003 NA   NA
 5972598 5972599 CBY_3408 CBY_3409     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5972602 5972603 CBY_3413 CBY_3414     FALSE 0.211 175.000 0.000 NA   NA
 5972603 5972604 CBY_3414 CBY_3415     FALSE 0.009 567.000 0.000 1.000   NA
 5972605 5972606 CBY_3416 CBY_3417 ade   FALSE 0.052 266.000 0.000 NA N NA
 5972608 5972609 CBY_3419 CBY_3420     TRUE 0.766 57.000 0.007 NA   NA
 5972610 5972611 CBY_3421 CBY_3422     TRUE 0.988 2.000 0.750 0.004 N NA
 5972611 5972612 CBY_3422 CBY_3423     TRUE 0.829 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5972612 5972613 CBY_3423 CBY_3424     TRUE 0.955 12.000 0.041 1.000 N NA
 5972613 5972614 CBY_3424 CBY_3425     TRUE 0.845 5.000 0.000 1.000 N NA
 5972614 5972615 CBY_3425 CBY_3426     TRUE 0.981 75.000 0.223 0.039 Y NA
 5972615 5972616 CBY_3426 CBY_3427     TRUE 0.998 15.000 0.536 1.000 Y NA
 5972616 5972617 CBY_3427 CBY_3428     TRUE 0.968 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5972617 5972618 CBY_3428 CBY_3429     TRUE 0.989 63.000 0.429 0.039 Y NA
 5972618 5972619 CBY_3429 CBY_3430     TRUE 0.998 19.000 0.600 1.000 Y NA
 5972619 5972620 CBY_3430 CBY_3431     FALSE 0.369 95.000 0.000 1.000   NA
 5972620 5972621 CBY_3431 CBY_3432     FALSE 0.040 280.000 0.000 NA   NA
 5972621 5972622 CBY_3432 CBY_3433     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5972622 5972623 CBY_3433 CBY_3434     TRUE 0.802 21.000 0.000 1.000   NA
 5972623 5972624 CBY_3434 CBY_3435     FALSE 0.022 339.000 0.000 NA   NA
 5972624 5972625 CBY_3435 CBY_3436     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5972625 5972626 CBY_3436 CBY_3437     FALSE 0.179 190.000 0.000 1.000 N NA
 5972626 5972627 CBY_3437 CBY_3438   hemA FALSE 0.032 299.000 0.000 1.000 N NA
 5972627 5972628 CBY_3438 CBY_3439 hemA   TRUE 0.992 -39.000 0.018 NA Y NA
 5972628 5972629 CBY_3439 CBY_3440   hemC TRUE 0.990 24.000 0.009 NA Y NA
 5972629 5972630 CBY_3440 CBY_3441 hemC   TRUE 0.985 40.000 0.031 1.000 Y NA
 5972630 5972631 CBY_3441 CBY_3442   hemB TRUE 0.970 69.000 0.044 1.000 Y NA
 5972631 5972632 CBY_3442 CBY_3443 hemB hemL TRUE 0.770 223.000 0.026 0.001 Y NA
 5972632 5972633 CBY_3443 CBY_3444 hemL   FALSE 0.021 347.000 0.000 1.000   NA
 5972633 5972634 CBY_3444 CBY_3445     FALSE 0.009 547.000 0.000 1.000   NA
 5972634 5972635 CBY_3445 CBY_3446     FALSE 0.235 162.000 0.000 NA   NA
 5972637 5972638 CBY_3448 CBY_3449     TRUE 0.803 -39.000 0.000 NA   NA
 5972638 5972639 CBY_3449 CBY_3450   thrC FALSE 0.318 112.000 0.000 NA   NA
 5972639 5972640 CBY_3450 CBY_3451 thrC thrB TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5972641 5972642 CBY_4160 CBY_4161     FALSE 0.156 197.000 0.000 NA   NA
 5972642 5972643 CBY_4161 CBY_4162     FALSE 0.094 222.000 0.000 0.073   NA
 5972644 5972645 CBY_4163 CBY_4164     FALSE 0.008 632.000 0.000 NA   NA
 5972645 5972646 CBY_4164 CBY_4165     TRUE 0.842 7.000 0.000 NA   NA
 5972646 5972647 CBY_4165 CBY_4166     TRUE 0.986 24.000 1.000 NA   NA
 5972649 5972650 CBY_4168 CBY_4169     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5972652 5972653 CBY_4171 CBY_4172 galE   FALSE 0.030 304.000 0.000 1.000   NA
 5972653 5972654 CBY_4172 CBY_4173     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5972654 5972655 CBY_4173 CBY_4174     FALSE 0.008 610.000 0.000 NA   NA
 5972655 5972656 CBY_4174 CBY_4175     FALSE 0.289 124.000 0.000 NA   NA
 5972656 5972657 CBY_4175 CBY_4176     TRUE 0.739 32.000 0.000 NA   NA
 5972657 5972658 CBY_4176 CBY_4177     TRUE 0.639 43.000 0.000 NA   NA
 5972658 5972659 CBY_4177 CBY_4178     TRUE 0.989 3.000 0.000 NA Y NA
 5972659 5972660 CBY_4178 CBY_4179     TRUE 0.993 40.000 0.286 NA Y NA
 5972660 5972661 CBY_4179 CBY_4180     TRUE 0.995 -6.000 0.067 NA Y NA
 5972661 5972662 CBY_4180 CBY_4181     TRUE 0.564 241.000 0.000 NA Y NA
 5972662 5972663 CBY_4181 CBY_4182     TRUE 0.726 82.000 0.027 1.000 N NA
 5972663 5972664 CBY_4182 CBY_4183     TRUE 0.982 21.000 0.500 1.000 N NA
 5972664 4728863 CBY_4183 CBY_4184   galU TRUE 0.497 255.000 0.000 1.000 Y NA
 5972665 5972666 CBY_4185 CBY_4186     TRUE 0.747 136.000 0.188 NA   NA
 5972667 5972668 CBY_4187 CBY_4188     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5972668 5972669 CBY_4188 CBY_4189     FALSE 0.385 91.000 0.000 NA   NA
 4728866 5972670 CBY_4190 CBY_4191     TRUE 0.613 48.000 0.000 NA   NA
 5972670 5972671 CBY_4191 CBY_4192     FALSE 0.181 188.000 0.000 NA   NA
 5972671 5972672 CBY_4192 CBY_4193     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5972673 5972674 CBY_4194 CBY_4195     TRUE 0.519 61.000 0.000 0.037 N NA
 5972674 5972675 CBY_4195 CBY_4196     TRUE 0.844 2.000 0.000 1.000 N NA
 5972675 5972676 CBY_4196 CBY_4197     TRUE 0.804 -25.000 0.000 1.000   NA
 5972676 5972677 CBY_4197 CBY_4198     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5972677 5972678 CBY_4198 CBY_4199     TRUE 0.775 27.000 0.000 NA   NA
 5972678 5972679 CBY_4199 CBY_4200     FALSE 0.471 265.000 0.000 NA Y NA
 5972679 5972680 CBY_4200 CBY_4201     TRUE 0.982 28.000 0.000 NA Y NA
 5972680 5972681 CBY_4201 CBY_4202     TRUE 0.824 -7.000 0.000 1.000   NA
 5972681 5972682 CBY_4202 CBY_4203     TRUE 0.739 32.000 0.000 NA   NA
 5972682 5972683 CBY_4203 CBY_4204   rfbB TRUE 0.986 -25.000 0.000 NA Y NA
 5972683 5972684 CBY_4204 CBY_4205 rfbB rfbC TRUE 0.994 27.000 0.106 1.000 Y NA
 5972684 5972685 CBY_4205 CBY_4206 rfbC rfbA TRUE 0.993 32.000 0.115 1.000 Y NA
 5972686 5972687 CBY_4207 CBY_4208     TRUE 0.928 132.000 0.034 NA Y NA
 5972687 5972688 CBY_4208 CBY_4209     FALSE 0.032 298.000 0.000 NA   NA
 5972689 5972690 CBY_4210 CBY_4211     FALSE 0.050 266.000 0.000 NA   NA
 11531823 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11674186 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11816578 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2277.000 0.000 NA   NA
 11531824 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2294.000 0.000 NA   NA
 11674187 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2294.000 0.000 NA   NA
 11816579 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2294.000 0.000 NA   NA
 11531825 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2340.000 0.000 NA   NA
 11674188 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2340.000 0.000 NA   NA
 11816580 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2340.000 0.000 NA   NA
 11531826 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2357.000 0.000 NA   NA
 11674189 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2357.000 0.000 NA   NA
 11816581 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2357.000 0.000 NA   NA
 11531827 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2400.000 0.000 NA   NA
 11674190 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2400.000 0.000 NA   NA
 11816582 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2400.000 0.000 NA   NA
 11531828 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2417.000 0.000 NA   NA
 11674191 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2417.000 0.000 NA   NA
 11816583 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2417.000 0.000 NA   NA
 11531829 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11674192 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 11816584 5972687   CBY_4208     FALSE NA 2460.000 0.000 NA   NA
 5972691 5972692 CBY_4267 CBY_4268 rrs rrf FALSE 0.007 890.000 0.000 NA   NA
 5972692 5972693 CBY_4268 CBY_4269 rrf rrl FALSE 0.341 105.000 0.000 NA   NA
 5972694 5972695 CBY_2062 CBY_2063     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5972696 5972697 CBY_4270 CBY_4271   rrs FALSE 0.266 140.000 0.000 NA   NA
 5972697 5972698 CBY_4271 CBY_2066 rrs   FALSE 0.008 615.000 0.000 NA   NA
 5972698 5972699 CBY_2066 CBY_2068     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972699 5972700 CBY_2068 CBY_2069     FALSE 0.056 257.000 0.000 NA   NA
 5972700 5972701 CBY_2069 CBY_2070     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5972701 5972702 CBY_2070 CBY_2071     TRUE 0.793 23.000 0.000 NA   NA
 5972702 5972703 CBY_2071 CBY_2072     FALSE 0.207 178.000 0.000 1.000 N NA
 5972703 5972704 CBY_2072 CBY_2073     TRUE 0.815 173.000 0.000 0.012 Y NA
 5972704 5972705 CBY_2073 CBY_2074     TRUE 0.938 67.000 0.000 0.012 Y NA
 5972705 5972706 CBY_2074 CBY_2075     FALSE 0.060 254.000 0.000 NA N NA
 5972706 5972707 CBY_2075 CBY_2076     FALSE 0.172 191.000 0.000 NA   NA
 5972707 5972708 CBY_2076 CBY_2077     FALSE 0.128 208.000 0.000 NA   NA
 5972708 5972709 CBY_2077 CBY_2078     FALSE 0.049 268.000 0.000 NA   NA
 5972709 5972710 CBY_2078 CBY_2079   phnA FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5972710 5972711 CBY_2079 CBY_2080 phnA   TRUE 0.672 216.000 0.000 1.000 Y NA
 5972711 5972712 CBY_2080 CBY_2081     TRUE 0.994 -7.000 0.041 NA Y NA
 5972714 5972715 CBY_2083 CBY_2084     FALSE 0.011 481.000 0.000 NA   NA
 5972715 5972716 CBY_2084 CBY_2085     FALSE 0.277 208.000 0.005 NA   NA
 5972716 5972717 CBY_2085 CBY_2086     TRUE 0.764 58.000 0.008 NA   NA
 5972717 5972718 CBY_2086 CBY_2087   murA TRUE 0.942 27.000 0.058 1.000   NA
 5972719 5972720 CBY_2088 CBY_2089     FALSE 0.335 220.000 0.049 NA   NA
 5972720 5972721 CBY_2089 CBY_2090     TRUE 0.749 152.000 0.220 NA   NA
 5972721 5972722 CBY_2090 CBY_2091     TRUE 0.966 17.000 0.097 NA   NA
 5972722 5972723 CBY_2091 CBY_2092     TRUE 0.839 78.000 0.125 NA   NA
 5972723 5972724 CBY_2092 CBY_2093     FALSE 0.131 207.000 0.000 NA   NA
 5972724 5972725 CBY_2093 CBY_2094     TRUE 0.998 -7.000 0.600 NA Y NA
 5972726 5972727 CBY_4272 CBY_4273     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5972727 5972728 CBY_4273 CBY_4274     TRUE 0.590 51.000 0.000 NA   NA
 5972728 5972729 CBY_4274 CBY_4275     TRUE 0.780 26.000 0.000 NA   NA
 5972729 5972730 CBY_4275 CBY_4276     TRUE 0.841 8.000 0.000 NA   NA
 5972730 5972731 CBY_4276 CBY_4277     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5972731 5972732 CBY_4277 CBY_4278     TRUE 0.599 50.000 0.000 NA   NA
 5972732 5972733 CBY_4278 CBY_4279     TRUE 0.780 26.000 0.000 NA   NA
 5972733 5972734 CBY_4279 CBY_4280     TRUE 0.841 8.000 0.000 NA   NA
 5972734 5972735 CBY_4280 CBY_4281     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5972736 5972737 CBY_0951 CBY_0952   glpK FALSE 0.449 75.000 0.000 NA   NA
 5972737 5972738 CBY_0952 CBY_0953 glpK   FALSE 0.384 183.000 0.006 1.000   NA
 5972738 5972739 CBY_0953 CBY_0954     TRUE 0.507 238.000 0.476 0.036   NA
 5972739 5972740 CBY_0954 CBY_0955     TRUE 0.871 98.000 0.417 NA   NA
 5972740 5972741 CBY_0955 CBY_0956     FALSE 0.010 505.000 0.000 NA   NA
 5972741 5972742 CBY_0956 CBY_0957     FALSE 0.046 272.000 0.000 NA   NA
 5972744 5972745 CBY_0959 CBY_0960     FALSE 0.019 357.000 0.000 NA   NA
 5972745 5972746 CBY_0960 CBY_0961   udk FALSE 0.029 305.000 0.000 NA   NA
 5972746 5972747 CBY_0961 CBY_0962 udk   FALSE 0.030 303.000 0.000 NA   NA
 5972747 5972748 CBY_0962 CBY_0963     FALSE 0.214 173.000 0.000 NA   NA
 5972748 5972749 CBY_0963 CBY_0964     FALSE 0.461 72.000 0.000 NA   NA
 5972750 5972751 CBY_0965 CBY_0966 ilvA   FALSE 0.092 225.000 0.000 NA   NA
 5972754 5972755 CBY_0969 CBY_0970     TRUE 0.695 37.000 0.000 NA   NA
 5972757 5972758 CBY_0972 CBY_0973     FALSE 0.316 112.000 0.000 1.000   NA
 5972758 5972759 CBY_0973 CBY_0974     FALSE 0.196 181.000 0.000 NA   NA
 5972759 5972760 CBY_0974 CBY_0975     FALSE 0.025 324.000 0.000 NA   NA
 5972760 5972761 CBY_0975 CBY_0976     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5972761 5972762 CBY_0976 CBY_0977   rluB FALSE 0.081 234.000 0.000 NA   NA
 5972762 5972763 CBY_0977 CBY_0978 rluB   TRUE 0.767 28.000 0.000 1.000   NA
 5972764 5972765 CBY_0979 CBY_0980     FALSE 0.344 104.000 0.000 NA   NA
 5972765 5972766 CBY_0980 CBY_0981     FALSE 0.264 144.000 0.000 NA   NA
 5972767 5972768 CBY_0982 CBY_0983     FALSE 0.316 113.000 0.000 NA   NA
 5972768 5972769 CBY_0983 CBY_0984     FALSE 0.354 101.000 0.000 NA   NA
 5972770 5972771 CBY_0985 CBY_0986     TRUE 0.968 28.000 0.231 NA   NA
 5972772 5972773 CBY_0987 CBY_0988 glyA   FALSE 0.247 159.000 0.000 NA N NA
 5972773 5972774 CBY_0988 CBY_0989     FALSE 0.008 603.000 0.000 NA   NA
 5972776 5972777 CBY_0991 CBY_0992     FALSE 0.225 168.000 0.000 NA   NA
 5972779 5972780 CBY_0994 CBY_0995     FALSE 0.185 185.000 0.000 1.000   NA
 5972780 5972781 CBY_0995 CBY_0996     FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 5972781 5972782 CBY_0996 CBY_0997     TRUE 0.814 -13.000 0.000 NA   NA
 5972782 5972783 CBY_0997 CBY_0998     TRUE 0.809 -19.000 0.000 NA   NA
 5972783 5972784 CBY_0998 CBY_1000     FALSE 0.027 318.000 0.000 NA   NA
 5972786 5972787 CBY_1001 CBY_1002     FALSE 0.205 177.000 0.000 NA   NA
 5972787 5972788 CBY_1002 CBY_1003     FALSE 0.261 148.000 0.000 NA   NA
 5972788 5972789 CBY_1003 CBY_1004     FALSE 0.035 290.000 0.000 1.000   NA
 5972789 5972790 CBY_1004 CBY_1005     FALSE 0.277 133.000 0.000 1.000 N NA
 5972790 5972791 CBY_1005 CBY_1006     FALSE 0.273 136.000 0.000 1.000 N NA
 5972796 5972797 CBY_0780 CBY_0781 hisI   TRUE 0.713 34.000 0.000 NA   NA
 5972797 4729038 CBY_0781 CBY_0782   hisF TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 4729038 5972798 CBY_0782 CBY_0783 hisF hisA TRUE 0.992 50.000 0.433 0.005 Y NA
 5972798 5972799 CBY_0783 CBY_0784 hisA hisH TRUE 0.996 -3.000 0.124 0.005 Y NA
 5972799 5972800 CBY_0784 CBY_0785 hisH hisB TRUE 0.994 28.000 0.125 0.005 Y NA
 5972800 5972801 CBY_0785 CBY_0786 hisB   TRUE 0.997 23.000 0.341 1.000 Y NA
 5972801 5972802 CBY_0786 CBY_0787   hisD TRUE 0.996 -13.000 0.165 1.000 Y NA
 5972802 5972803 CBY_0787 CBY_0788 hisD hisG TRUE 0.943 181.000 0.254 0.005 Y NA
 5972803 5972804 CBY_0788 CBY_0789 hisG hisZ TRUE 0.991 45.000 0.239 0.005 Y NA
 5972806 5972807 CBY_0791 CBY_0792 thiI   TRUE 0.983 0.000 0.349 1.000 N NA
 5972807 5972808 CBY_0792 CBY_0793     FALSE 0.075 240.000 0.000 1.000 N NA
 5972808 5972809 CBY_0793 CBY_0794     TRUE 0.829 16.000 0.000 1.000 N NA
 5972809 5972810 CBY_0794 CBY_0795     FALSE 0.048 269.000 0.000 1.000   NA
 5972810 5972811 CBY_0795 CBY_0796     FALSE 0.396 88.000 0.000 NA   NA
 5972812 4729090 CBY_2746 CBY_2747     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 4729090 5972813 CBY_2747 CBY_2748     FALSE 0.256 152.000 0.000 NA   NA
 5972813 5972814 CBY_2748 CBY_2749   argS FALSE 0.156 197.000 0.000 NA   NA
 5972814 4729094 CBY_2749 CBY_2750 argS   FALSE 0.009 573.000 0.000 1.000   NA
 4729094 5972815 CBY_2750 CBY_2751     FALSE 0.281 128.000 0.000 NA   NA
 5972815 5972816 CBY_2751 CBY_2752     TRUE 0.984 21.000 0.667 NA   NA
 5972818 5972819 CBY_2754 CBY_2755     FALSE 0.026 320.000 0.000 NA   NA
 5972819 4729101 CBY_2755 CBY_2756   asnA FALSE 0.331 108.000 0.000 NA   NA
 4729101 5972820 CBY_2756 CBY_2757 asnA   FALSE 0.026 319.000 0.000 0.046 N NA
 5972821 5972822 CBY_2758 CBY_2759     TRUE 0.672 134.000 0.077 1.000 N NA
 5972823 5972824 CBY_2760 CBY_2761 pflA pflB FALSE 0.334 214.000 0.032 1.000 N NA
 5972824 5972825 CBY_2761 CBY_2762 pflB pyrE FALSE 0.008 672.000 0.000 1.000 N NA
 5972825 5972826 CBY_2762 CBY_2763 pyrE   TRUE 0.989 34.000 0.041 1.000 Y NA
 5972826 5972827 CBY_2763 CBY_2764     TRUE 0.983 21.000 0.592 1.000 N NA
 5972827 5972828 CBY_2764 CBY_2765   pyrF TRUE 0.564 193.000 0.112 0.004 N NA
 5972828 5972829 CBY_2765 CBY_2766 pyrF   TRUE 0.987 42.000 0.064 1.000 Y NA
 5972829 5972830 CBY_2766 CBY_2767     TRUE 0.923 146.000 0.032 NA Y NA
 5972830 5972831 CBY_2767 CBY_2768   pyrB TRUE 0.997 1.000 0.197 NA Y NA
 5972831 5972832 CBY_2768 CBY_2769 pyrB   FALSE 0.018 375.000 0.000 1.000 N NA
 5972832 5972833 CBY_2769 CBY_2770     TRUE 0.700 96.000 0.036 1.000 N NA
 5972833 4729117 CBY_2770 CBY_2771     FALSE 0.014 413.000 0.000 1.000 N NA
 4729117 4729118 CBY_2771 CBY_2772     TRUE 0.869 91.000 0.333 NA   NA
 4729118 5972834 CBY_2772 CBY_2773     TRUE 0.597 132.000 0.035 NA   NA
 5972834 5972835 CBY_2773 CBY_2774   ychF FALSE 0.068 244.000 0.000 1.000   NA
 5972839 5972840 CBY_2778 CBY_2779     TRUE 0.931 34.000 0.071 NA N NA
 5972840 5972841 CBY_2779 CBY_2780     TRUE 0.994 -10.000 0.056 NA Y NA
 5972841 5972842 CBY_2780 CBY_2781     TRUE 0.962 5.000 0.056 NA   NA
 5972842 5972843 CBY_2781 CBY_2782   mviN TRUE 0.908 64.000 0.286 NA   NA
 5972843 5972844 CBY_2782 CBY_2783 mviN   TRUE 0.939 13.000 0.015 1.000   NA
 5972844 5972845 CBY_2783 CBY_2784     TRUE 0.651 92.000 0.015 1.000   NA
 5972845 5972846 CBY_2784 CBY_2785     FALSE 0.467 244.000 0.417 1.000   NA
 5972846 4729134 CBY_2785 CBY_2786     FALSE 0.032 424.000 0.002 1.000 N NA
 4729134 4729135 CBY_2786 CBY_2787     TRUE 0.881 166.000 0.002 0.001 Y NA
 4729135 5972847 CBY_2787 CBY_2788     FALSE 0.032 301.000 0.000 NA N NA
 5972847 5972848 CBY_2788 CBY_2789     TRUE 0.985 -13.000 0.669 NA N NA
 5972848 5972849 CBY_2789 CBY_2790     FALSE 0.051 265.000 0.000 NA   NA
 5972849 5972850 CBY_2790 CBY_2791     FALSE 0.270 135.000 0.000 NA   NA
 5972850 5972851 CBY_2791 CBY_2792     FALSE 0.182 187.000 0.000 1.000   NA
 5972851 5972852 CBY_2792 CBY_2793     FALSE 0.034 292.000 0.000 NA   NA
 5972852 5972853 CBY_2793 CBY_2794     TRUE 0.594 129.000 0.031 NA   NA
 5972853 5972854 CBY_2794 CBY_2795     TRUE 0.863 60.000 0.078 1.000 N NA
 5972854 5972855 CBY_2795 CBY_2796     FALSE 0.268 137.000 0.000 NA   NA
 5972856 5972857 CBY_2797 CBY_2798     TRUE 0.986 19.000 0.796 1.000   NA
 5972859 5972860 CBY_2800 CBY_2801     FALSE 0.376 203.000 0.029 1.000   NA
 5972860 5972861 CBY_2801 CBY_2802     TRUE 0.725 33.000 0.000 1.000   NA
 5972862 5972863 CBY_2803 CBY_2804     FALSE 0.015 394.000 0.000 NA   NA
 5972863 5972864 CBY_2804 CBY_2805     TRUE 0.998 -16.000 0.876 1.000 Y NA
 5972864 5972865 CBY_2805 CBY_2806     TRUE 0.958 44.000 0.528 NA   NA
 5972866 5972867 CBY_2807 CBY_2808     FALSE 0.430 79.000 0.000 NA   NA
 5972868 5972869 CBY_2809 CBY_2810     TRUE 0.599 50.000 0.000 NA   NA
 5972869 5972870 CBY_2810 CBY_2811     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972870 5972871 CBY_2811 CBY_2812     TRUE 0.916 52.000 0.182 NA   NA
 5972871 5972872 CBY_2812 CBY_2813     FALSE 0.012 477.000 0.000 1.000 N NA
 5972872 5972873 CBY_2813 CBY_2814     FALSE 0.079 236.000 0.000 NA   NA
 5972873 5972874 CBY_2814 CBY_2815     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5972874 5972875 CBY_2815 CBY_2816     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972875 5972876 CBY_2816 CBY_2817     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5972876 5972877 CBY_2817 CBY_2818     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5972877 5972878 CBY_2818 CBY_2819     TRUE 0.988 0.000 0.833 NA   NA
 5972878 5972879 CBY_2819 CBY_2820     TRUE 0.976 0.000 0.188 NA   NA
 5972879 5972880 CBY_2820 CBY_2821     TRUE 0.977 2.000 0.188 NA   NA
 5972881 4729147 CBY_0694 CBY_0696   apt FALSE 0.187 185.000 0.000 NA   NA
 4729147 5972882 CBY_0696 CBY_0697 apt   FALSE 0.284 127.000 0.000 NA   NA
 4729264 5972885 CBY_3111 CBY_3112     FALSE 0.012 450.000 0.000 1.000   NA
 5972885 5972886 CBY_3112 CBY_3113     FALSE 0.061 251.000 0.000 NA   NA
 5972886 4729269 CBY_3113 CBY_3114     FALSE 0.041 278.000 0.000 NA   NA
 4729269 5972887 CBY_3114 CBY_3115     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 5972887 5972888 CBY_3115 CBY_3116     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5972888 5972889 CBY_3116 CBY_3117     FALSE 0.266 141.000 0.000 NA   NA
 5972891 5972892 CBY_3119 CBY_3120     TRUE 0.997 -13.000 0.325 0.009 Y NA
 5972892 5972893 CBY_3120 CBY_3121     FALSE 0.319 111.000 0.000 1.000   NA
 5972893 5972894 CBY_3121 CBY_3122   add FALSE 0.019 359.000 0.000 1.000   NA
 5972896 4729281 CBY_3124 CBY_3125     FALSE 0.022 342.000 0.000 NA   NA
 4729281 5972897 CBY_3125 CBY_3126     FALSE 0.312 115.000 0.000 NA   NA
 5972897 5972898 CBY_3126 CBY_3127     FALSE 0.251 154.000 0.000 NA   NA
 5972898 5972899 CBY_3127 CBY_3128     FALSE 0.249 157.000 0.000 1.000 N NA
 5972899 5972900 CBY_3128 CBY_3129     FALSE 0.030 730.000 0.039 1.000 N NA
 5972900 4729287 CBY_3129 CBY_3130     FALSE 0.071 242.000 0.000 1.000   NA
 5972901 5972902 CBY_3132 CBY_3133     TRUE 0.694 173.000 0.197 1.000 N NA
 5972903 5972904 CBY_3134 CBY_3135     FALSE 0.030 306.000 0.000 1.000 N NA
 5972904 5972905 CBY_3135 CBY_3136     FALSE 0.265 142.000 0.000 NA   NA
 5972906 5972907 CBY_3137 CBY_3138     FALSE 0.132 204.000 0.000 0.059   NA
 5972908 5972909 CBY_3139 CBY_3140     FALSE 0.261 148.000 0.000 NA   NA
 5972910 5972911 CBY_3141 CBY_3142     FALSE 0.393 89.000 0.000 NA   NA
 5972913 5972914 CBY_3144 CBY_3145 treR treC TRUE 0.756 169.000 0.336 1.000 N NA
 5972914 5972915 CBY_3145 CBY_3146 treC treP FALSE 0.268 138.000 0.000 NA   NA
 4729311 5972916 CBY_0646 CBY_0647     FALSE 0.274 132.000 0.000 NA   NA
 5972917 5972918 CBY_0317 CBY_0318   eno FALSE 0.134 206.000 0.000 NA   NA
 4729347 5972919 CBY_0319 CBY_0320     FALSE 0.425 80.000 0.000 NA   NA
 5972919 5972920 CBY_0320 CBY_0322   modA TRUE 0.739 32.000 0.000 NA   NA
 5972921 5972922 CBY_0323 CBY_0324     TRUE 0.970 5.000 0.094 NA   NA
 5972922 5972923 CBY_0324 CBY_0325     TRUE 0.954 -3.000 0.043 NA   NA
 5972924 5972925 CBY_0178 CBY_0179     FALSE 0.030 303.000 0.000 NA   NA
 5972926 5972927 CBY_0196 CBY_0197     FALSE 0.111 216.000 0.000 NA   NA
 5972927 5972928 CBY_0197 CBY_0198     FALSE 0.131 207.000 0.000 NA   NA
 5972928 5972929 CBY_0198 CBY_0199   recG FALSE 0.059 253.000 0.000 NA   NA
 5972929 5972930 CBY_0199 CBY_0200 recG   TRUE 0.968 63.000 0.016 1.000 Y NA
 5972930 5972931 CBY_0200 CBY_0201   coaD TRUE 0.983 2.000 0.367 1.000 N NA
 5972931 5972932 CBY_0201 CBY_0202 coaD   TRUE 0.934 12.000 0.008 NA   NA
 5972933 5972934 CBY_0203 CBY_0204 ylbJ   TRUE 0.643 115.000 0.036 NA   NA
 5972935 5972936 CBY_0205 CBY_0206 pta ackA TRUE 0.991 39.000 0.137 1.000 Y NA
 5972936 5972937 CBY_0206 CBY_0207 ackA   TRUE 0.637 144.000 0.061 NA   NA
 5972937 5972938 CBY_0207 CBY_0208   rpmF TRUE 0.987 4.000 0.599 NA   NA
 5972938 5972939 CBY_0208 CBY_0209 rpmF plsX FALSE 0.196 356.000 0.418 1.000 N NA
 5972939 5972940 CBY_0209 CBY_0210 plsX acpP TRUE 0.970 66.000 0.034 0.004 Y NA
 5972940 5972941 CBY_0210 CBY_0211 acpP rnc TRUE 0.742 100.000 0.068 1.000 N NA
 5972941 5972942 CBY_0211 CBY_0212 rnc   TRUE 0.995 -7.000 0.064 1.000 Y NA
 5972942 5972943 CBY_0212 CBY_0213   smc FALSE 0.411 196.000 0.027 1.000 N NA
 5972943 5972944 CBY_0213 CBY_0214 smc ftsY FALSE 0.476 217.000 0.165 0.018 N NA
 5972944 5972945 CBY_0214 CBY_0215 ftsY   FALSE 0.444 209.000 0.081 1.000   NA
 5972945 5972946 CBY_0215 CBY_0216   ffh TRUE 0.973 14.000 0.151 1.000   NA
 5972946 5972947 CBY_0216 CBY_0217 ffh rpsP TRUE 0.952 43.000 0.361 1.000 N NA
 5972947 5972948 CBY_0217 CBY_0218 rpsP   TRUE 0.946 49.000 0.385 1.000   NA
 5972948 5972949 CBY_0218 CBY_0219   rimM FALSE 0.113 215.000 0.000 NA   NA
 5972950 5972951 CBY_0028 CBY_0029     TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5972951 5972952 CBY_0029 CBY_0030     TRUE 0.959 42.000 0.489 0.006   NA
 5972952 5972953 CBY_0030 CBY_0031     TRUE 0.997 13.000 0.258 0.006 Y NA
 5972953 5972954 CBY_0031 CBY_0032     TRUE 0.998 -7.000 0.487 0.006 Y NA
 5972954 5972955 CBY_0032 CBY_0033     TRUE 0.997 18.000 0.462 0.006 Y NA
 5972955 5972956 CBY_0033 CBY_0034     TRUE 0.998 -7.000 0.776 0.006 Y NA
 5972956 5972957 CBY_0034 CBY_0035     TRUE 0.997 4.000 0.238 0.006 Y NA
 4729511 5972959 CBY_0037 CBY_0038     FALSE 0.019 359.000 0.000 1.000   NA
 5972959 5972960 CBY_0038 CBY_0039     TRUE 0.960 -10.000 0.075 0.001   NA
 5972962 5972963 CBY_0041 CBY_0042     FALSE 0.023 332.000 0.000 NA   NA
 5972963 5972964 CBY_0042 CBY_0043     TRUE 0.961 19.000 0.083 NA   NA
 5972964 5972965 CBY_0043 CBY_0044     FALSE 0.007 989.000 0.000 NA   NA
 5972965 5972966 CBY_0044 CBY_0045     TRUE 0.934 19.000 0.018 NA   NA
 5972966 4729521 CBY_0045 CBY_0046     TRUE 0.907 28.000 0.011 1.000 N NA
 5972967 4729524 CBY_0047 CBY_0048     FALSE 0.023 335.000 0.000 NA   NA
 5972969 5972970 CBY_0050 CBY_0051     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5972970 5972971 CBY_0051 CBY_0052     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5972972 5972973 CBY_0698 CBY_0700     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 4729572 5972974 CBY_1139 CBY_1140     FALSE 0.376 93.000 0.000 NA   NA
 5972974 5972975 CBY_1140 CBY_1141     FALSE 0.063 250.000 0.000 NA   NA
 5972975 5972976 CBY_1141 CBY_1142     FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5972976 5972977 CBY_1142 CBY_1143     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5972977 5972978 CBY_1143 CBY_1144     TRUE 0.701 36.000 0.000 NA   NA
 5972978 5972979 CBY_1144 CBY_1145     FALSE 0.344 104.000 0.000 NA   NA
 5972979 5972980 CBY_1145 CBY_1146     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 5972980 4729577 CBY_1146 CBY_1147     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 4729577 4729578 CBY_1147 CBY_1148     TRUE 0.936 0.000 0.011 1.000   NA
 4729578 5972981 CBY_1148 CBY_1149     FALSE 0.251 154.000 0.000 NA   NA
 5972984 4729600 CBY_0767 CBY_0768     FALSE 0.061 251.000 0.000 1.000   NA
 4729600 5972985 CBY_0768 CBY_0769     FALSE 0.265 142.000 0.000 NA   NA
 4729633 5972986 CBY_0606 CBY_0607     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5972986 5972987 CBY_0607 CBY_0608   argR TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5972987 5972988 CBY_0608 CBY_0609 argR recN TRUE 0.962 19.000 0.086 1.000 N NA
 5972988 5972989 CBY_0609 CBY_0610 recN spoIVB FALSE 0.135 314.000 0.079 1.000   NA
 5972989 5972990 CBY_0610 CBY_0611 spoIVB   FALSE 0.081 234.000 0.000 NA   NA
 5972990 5972991 CBY_0611 CBY_0612   spo0A FALSE 0.418 82.000 0.000 NA   NA
 5972991 5972992 CBY_0612 CBY_0613 spo0A   FALSE 0.009 573.000 0.000 NA   NA
 5972992 5972993 CBY_0613 CBY_0614     FALSE 0.007 937.000 0.000 NA   NA
 5972993 5972994 CBY_0614 CBY_0615     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5972994 5972995 CBY_0615 CBY_0616     FALSE 0.457 73.000 0.000 NA   NA
 5972995 4729639 CBY_0616 CBY_0617     TRUE 0.829 -6.000 0.000 NA   NA
 4729639 5972996 CBY_0617 CBY_0618     FALSE 0.008 680.000 0.000 NA   NA
 5972996 5972997 CBY_0618 CBY_0619     FALSE 0.013 418.000 0.000 NA   NA
 5972997 5972998 CBY_0619 CBY_0620     FALSE 0.241 159.000 0.000 NA   NA
 5972998 5972999 CBY_0620 CBY_0621     FALSE 0.198 180.000 0.000 NA   NA
 5972999 5973000 CBY_0621 CBY_0622     FALSE 0.123 210.000 0.000 NA   NA
 5973000 5973001 CBY_0622 CBY_0623     FALSE 0.248 155.000 0.000 NA   NA
 5973001 5973002 CBY_0623 CBY_0624     FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973002 5973003 CBY_0624 CBY_0625     FALSE 0.016 391.000 0.000 NA   NA
 5973003 5973004 CBY_0625 CBY_0626     FALSE 0.022 340.000 0.000 1.000   NA
 5973004 5973005 CBY_0626 CBY_0627     TRUE 0.950 91.000 0.018 1.000 Y NA
 5973005 5973006 CBY_0627 CBY_0628     TRUE 0.997 13.000 0.345 0.036 Y NA
 5973006 5973007 CBY_0628 CBY_0629     TRUE 0.998 3.000 0.349 1.000 Y NA
 5973007 5973008 CBY_0629 CBY_0630     TRUE 0.994 2.000 0.018 0.024 Y NA
 5973008 5973009 CBY_0630 CBY_0631     TRUE 0.974 24.000 0.286 NA   NA
 5973009 5973010 CBY_0631 CBY_0632   spoIIM FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973010 5973011 CBY_0632 CBY_0633 spoIIM   TRUE 0.676 92.000 0.021 NA   NA
 5973011 5973012 CBY_0633 CBY_0634     FALSE 0.159 196.000 0.000 NA   NA
 5973012 5973013 CBY_0634 CBY_0635     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5973013 5973014 CBY_0635 CBY_0636     FALSE 0.230 165.000 0.000 NA   NA
 5973014 5973015 CBY_0636 CBY_0637     FALSE 0.046 272.000 0.000 NA   NA
 5973017 5973018 CBY_0639 CBY_0640     TRUE 0.798 22.000 0.000 NA   NA
 5973018 5973019 CBY_0640 CBY_0641     FALSE 0.356 100.000 0.000 NA   NA
 5973020 5973021 CBY_0648 CBY_0649     FALSE 0.226 167.000 0.000 NA   NA
 5973021 5973022 CBY_0649 CBY_0650     FALSE 0.117 213.000 0.000 NA   NA
 5973022 5973023 CBY_0650 CBY_0651     FALSE 0.120 211.000 0.000 NA   NA
 5973023 5973024 CBY_0651 CBY_0652     FALSE 0.047 271.000 0.000 NA   NA
 5973024 5973025 CBY_0652 CBY_0653     FALSE 0.100 221.000 0.000 NA   NA
 5973027 5973028 CBY_0655 CBY_0656   aguB FALSE 0.205 177.000 0.000 NA   NA
 5973028 5973029 CBY_0656 CBY_0657 aguB   TRUE 0.791 23.000 0.000 1.000   NA
 5973029 5973030 CBY_0657 CBY_0658     FALSE 0.435 191.000 0.027 1.000 N NA
 5973032 5973033 CBY_0660 CBY_0661     FALSE 0.022 347.000 0.000 1.000 N NA
 5973033 5973034 CBY_0661 CBY_0662     FALSE 0.337 108.000 0.000 1.000 N NA
 5973034 5973035 CBY_0662 CBY_0663     TRUE 0.926 17.000 0.007 1.000 N NA
 5973035 5973036 CBY_0663 CBY_0664     TRUE 0.997 1.000 0.286 0.036 Y NA
 5973036 4729746 CBY_0664 CBY_0665     TRUE 0.998 14.000 0.789 1.000 Y NA
 4729746 5973037 CBY_0665 CBY_0666     TRUE 0.911 154.000 0.018 1.000 Y NA
 5973037 5973038 CBY_0666 CBY_0667     TRUE 0.951 138.000 0.133 1.000 Y NA
 5973038 5973039 CBY_0667 CBY_0668     FALSE 0.020 352.000 0.000 NA   NA
 5973041 5973042 CBY_0670 CBY_0671     TRUE 0.998 2.000 0.889 1.000 Y NA
 5973042 5973043 CBY_0671 CBY_0672     TRUE 0.718 34.000 0.000 1.000 N NA
 5973043 5973044 CBY_0672 CBY_0673     TRUE 0.725 33.000 0.000 1.000   NA
 5973044 5973045 CBY_0673 CBY_0674     TRUE 0.687 38.000 0.000 NA   NA
 5973046 5973047 CBY_0675 CBY_0676     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5973047 5973048 CBY_0676 CBY_0677     TRUE 0.985 19.000 0.714 NA   NA
 5973049 5973050 CBY_0678 CBY_0679     TRUE 0.779 27.000 0.000 1.000 N NA
 5973051 5973052 CBY_0680 CBY_0681     TRUE 0.961 28.000 0.160 NA   NA
 5973053 5973054 CBY_0682 CBY_0683 ribH   TRUE 0.940 122.000 0.054 0.001 Y NA
 5973054 5973055 CBY_0683 CBY_0684   ribE TRUE 0.983 49.000 0.051 1.000 Y NA
 5973055 5973056 CBY_0684 CBY_0685 ribE ribD TRUE 0.998 16.000 0.456 1.000 Y NA
 5973056 5973057 CBY_0685 CBY_0686 ribD   FALSE 0.011 480.000 0.000 1.000   NA
 5973060 5973061 CBY_0761 CBY_0762     TRUE 0.815 -7.000 0.000 0.002   NA
 5973061 5973062 CBY_0762 CBY_0763     FALSE 0.266 140.000 0.000 NA   NA
 5973063 5973064 CBY_0797 CBY_0798   tuf FALSE 0.008 652.000 0.000 NA   NA
 5973064 5973065 CBY_0798 CBY_0799 tuf fusA TRUE 0.913 214.000 0.400 0.001 Y NA
 5973065 5973066 CBY_0799 CBY_0800 fusA rpsG TRUE 0.983 92.000 0.579 1.000 Y NA
 5973066 5973067 CBY_0800 CBY_0801 rpsG rpsL FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5973068 5973069 CBY_4139 CBY_4140     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 5973070 5973071 CBY_4141 CBY_4142     TRUE 0.937 190.000 0.267 1.000 Y NA
 5973071 5973072 CBY_4142 CBY_4143     FALSE 0.009 577.000 0.000 NA N NA
 5973072 5973073 CBY_4143 CBY_4144     FALSE 0.011 491.000 0.000 NA   NA
 5973073 5973074 CBY_4144 CBY_4145     FALSE 0.187 185.000 0.000 NA   NA
 5973074 5973075 CBY_4145 CBY_4146     FALSE 0.374 94.000 0.000 NA   NA
 5973075 5973076 CBY_4146 CBY_4147     FALSE 0.013 419.000 0.000 NA   NA
 5973078 5973079 CBY_4149 CBY_4150     TRUE 0.568 54.000 0.000 NA   NA
 5973079 5973080 CBY_4150 CBY_4151   prfC FALSE 0.309 116.000 0.000 NA   NA
 5973080 5973081 CBY_4151 CBY_4152 prfC   FALSE 0.007 1032.000 0.000 NA   NA
 5973081 5973082 CBY_4152 CBY_4153     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 5973082 5973083 CBY_4153 CBY_4154     FALSE 0.008 654.000 0.000 NA   NA
 5973083 5973084 CBY_4154 CBY_4155     FALSE 0.008 590.000 0.000 NA   NA
 5973084 5973085 CBY_4155 CBY_4156     FALSE 0.011 493.000 0.000 NA   NA
 5973085 5973086 CBY_4156 CBY_4157     FALSE 0.010 521.000 0.000 NA   NA
 5973086 4729868 CBY_4157 CBY_4158     TRUE 0.834 15.000 0.000 NA N NA
 4729868 5973087 CBY_4158 CBY_4159     FALSE 0.011 482.000 0.000 NA   NA
 5973089 5973090 CBY_0740 CBY_0741     TRUE 0.488 66.000 0.000 NA   NA
 5973090 5973091 CBY_0741 CBY_0742     TRUE 0.605 50.000 0.000 1.000 N NA
 5973091 5973092 CBY_0742 CBY_0743     FALSE 0.060 252.000 0.000 NA   NA
 5973094 5973095 CBY_0745 CBY_0746     FALSE 0.021 349.000 0.000 NA   NA
 5973095 5973096 CBY_0746 CBY_0747     FALSE 0.227 169.000 0.000 1.000 N NA
 5973096 5973097 CBY_0747 CBY_0748     FALSE 0.091 225.000 0.000 1.000   NA
 5973097 5973098 CBY_0748 CBY_0749     FALSE 0.075 238.000 0.000 1.000   NA
 5973098 5973099 CBY_0749 CBY_0750     TRUE 0.998 3.000 0.465 1.000 Y NA
 5973101 5973102 CBY_0752 CBY_0753 pepT   TRUE 0.608 106.000 0.013 NA N NA
 5973102 5973103 CBY_0753 CBY_0754     FALSE 0.178 189.000 0.000 NA   NA
 5973105 5973106 CBY_0756 CBY_0757     FALSE 0.281 128.000 0.000 NA   NA
 5973106 4729884 CBY_0757 CBY_0758     FALSE 0.050 266.000 0.000 NA   NA
 4729884 5973107 CBY_0758 CBY_0759   feoB TRUE 0.695 37.000 0.000 NA   NA
 5973108 5973109 CBY_0391 CBY_0392     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973109 5973110 CBY_0392 CBY_0393     TRUE 0.747 31.000 0.000 NA   NA
 5973112 5973113 CBY_0395 CBY_0396     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5973113 5973114 CBY_0396 CBY_0397   nagB FALSE 0.211 175.000 0.000 NA   NA
 5973117 5973118 CBY_0400 CBY_0401     FALSE 0.414 80.000 0.000 0.052   NA
 5973119 5973120 CBY_0402 CBY_0403     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5973120 5973121 CBY_0403 CBY_0404     FALSE 0.233 166.000 0.000 1.000 N NA
 5973123 5973124 CBY_0406 CBY_0407 trpA trpB TRUE 0.992 -7.000 0.008 0.001 Y NA
 5973126 5973127 CBY_0409 CBY_0410     TRUE 0.868 99.000 0.400 1.000 N NA
 5973127 5973128 CBY_0410 CBY_0411     TRUE 0.987 1.000 0.667 NA   NA
 5973128 5973129 CBY_0411 CBY_0412     TRUE 0.939 21.000 0.029 NA   NA
 5973129 5973130 CBY_0412 CBY_0413     TRUE 0.988 -3.000 0.869 1.000   NA
 5973130 5973131 CBY_0413 CBY_0414     FALSE 0.013 425.000 0.000 1.000   NA
 5973131 5973132 CBY_0414 CBY_0415     TRUE 0.949 60.000 0.000 1.000 Y NA
 5973132 5973133 CBY_0415 CBY_0416     TRUE 0.845 7.000 0.000 1.000 N NA
 5973133 5973134 CBY_0416 CBY_0417     FALSE 0.032 296.000 0.000 1.000   NA
 5973134 5973135 CBY_0417 CBY_0418     FALSE 0.024 329.000 0.000 1.000   NA
 5973135 5973136 CBY_0418 CBY_0419     TRUE 0.971 -10.000 0.153 NA   NA
 5973136 5973137 CBY_0419 CBY_0420     FALSE 0.026 321.000 0.000 NA   NA
 5973137 5973138 CBY_0420 CBY_0421     FALSE 0.321 111.000 0.000 NA   NA
 5973138 5973139 CBY_0421 CBY_0422     FALSE 0.187 185.000 0.000 NA   NA
 5973139 5973140 CBY_0422 CBY_0423     TRUE 0.935 33.000 0.073 NA   NA
 5973140 5973141 CBY_0423 CBY_0424     FALSE 0.113 215.000 0.000 NA   NA
 5973141 5973142 CBY_0424 CBY_0425     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973144 5973145 CBY_0427 CBY_0428     TRUE 0.998 13.000 0.455 0.023 Y NA
 5973145 5973146 CBY_0428 CBY_0429   nikC TRUE 0.998 0.000 0.364 1.000 Y NA
 5973146 5973147 CBY_0429 CBY_0430 nikC nikB TRUE 0.998 2.000 0.500 0.001 Y NA
 5973147 5973148 CBY_0430 CBY_0431 nikB nikA TRUE 0.978 102.000 0.429 0.049 Y NA
 5973148 5973149 CBY_0431 CBY_0432 nikA   TRUE 0.789 134.000 0.286 1.000 N NA
 5973149 5973150 CBY_0432 CBY_0433     FALSE 0.149 201.000 0.000 1.000 N NA
 5973152 5973153 CBY_0435 CBY_0436     TRUE 0.835 14.000 0.000 1.000 N NA
 5973153 5973154 CBY_0436 CBY_0437     TRUE 0.988 7.000 0.000 0.008 Y NA
 5973154 5973155 CBY_0437 CBY_0438   gufA FALSE 0.066 249.000 0.000 1.000 N NA
 5973156 5973157 CBY_0439 CBY_0440     FALSE 0.014 407.000 0.000 NA   NA
 5973157 5973158 CBY_0440 CBY_0441     TRUE 0.990 4.000 0.957 NA   NA
 5973158 5973159 CBY_0441 CBY_0442     FALSE 0.038 285.000 0.000 NA   NA
 5973160 5973161 CBY_0443 CBY_0445     FALSE 0.018 364.000 0.000 NA   NA
 5973161 5973162 CBY_0445 CBY_0446     TRUE 0.803 -43.000 0.000 NA   NA
 5973162 5973163 CBY_0446 CBY_0447     FALSE 0.009 548.000 0.000 NA   NA
 5973163 5973164 CBY_0447 CBY_0448     TRUE 0.665 40.000 0.000 1.000   NA
 5973164 5973165 CBY_0448 CBY_0449     FALSE 0.246 155.000 0.000 1.000   NA
 5973166 5973167 CBY_0450 CBY_0451     FALSE 0.019 358.000 0.000 NA   NA
 5973168 5973169 CBY_0452 CBY_0453     FALSE 0.165 194.000 0.000 NA   NA
 5973169 5973170 CBY_0453 CBY_0454     FALSE 0.030 304.000 0.000 NA   NA
 5973170 5973171 CBY_0454 CBY_0455     TRUE 0.992 60.000 0.708 0.035 Y NA
 5973171 5973172 CBY_0455 CBY_0456     TRUE 0.998 0.000 0.848 0.035 Y NA
 5973172 5973173 CBY_0456 CBY_0457     TRUE 0.996 -7.000 0.109 0.035 Y NA
 5973173 5973174 CBY_0457 CBY_0458     FALSE 0.016 389.000 0.000 1.000 N NA
 5973174 5973175 CBY_0458 CBY_0459     FALSE 0.362 100.000 0.000 1.000 N NA
 5973177 5973178 CBY_0461 CBY_0462     FALSE 0.209 171.000 0.000 0.008   NA
 5973180 5973181 CBY_0464 CBY_0465 pflA pflB TRUE 0.959 -34.000 0.082 1.000 N NA
 5973181 5973182 CBY_0465 CBY_0466 pflB   FALSE 0.010 546.000 0.000 1.000 N NA
 5973182 5973183 CBY_0466 CBY_0467     FALSE 0.013 418.000 0.000 0.035 N NA
 5973183 5973184 CBY_0467 CBY_0468     TRUE 0.949 180.000 0.333 1.000 Y NA
 5973184 5973185 CBY_0468 CBY_0469     TRUE 0.988 -7.000 1.000 0.008   NA
 5973187 5973188 CBY_0471 CBY_0472     TRUE 0.985 22.000 0.000 1.000 Y NA
 5973188 5973189 CBY_0472 CBY_0473     TRUE 0.802 21.000 0.000 1.000   NA
 5973191 5973192 CBY_0475 CBY_0476     TRUE 0.842 7.000 0.000 NA   NA
 5973192 5973193 CBY_0476 CBY_0477     FALSE 0.226 167.000 0.000 NA   NA
 5973193 5973194 CBY_0477 CBY_0478     FALSE 0.009 607.000 0.000 1.000 N NA
 5973194 5973195 CBY_0478 CBY_0479     TRUE 0.950 21.000 0.053 1.000 N NA
 5973197 5973198 CBY_0481 CBY_0482     TRUE 0.498 64.000 0.000 NA   NA
 5973198 5973199 CBY_0482 CBY_0483     TRUE 0.493 65.000 0.000 NA   NA
 5973199 5973200 CBY_0483 CBY_0484     TRUE 0.804 -34.000 0.000 NA   NA
 5973200 5973201 CBY_0484 CBY_0485     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5973203 5973204 CBY_0487 CBY_0488     FALSE 0.350 102.000 0.000 NA   NA
 5973204 5973205 CBY_0488 CBY_0489     FALSE 0.016 382.000 0.000 NA   NA
 5973205 5973206 CBY_0489 CBY_0490     FALSE 0.022 345.000 0.000 NA   NA
 5973206 5973207 CBY_0490 CBY_0491     FALSE 0.011 487.000 0.000 NA   NA
 5973207 5973208 CBY_0491 CBY_0492     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5973208 5973209 CBY_0492 CBY_0493     FALSE 0.015 403.000 0.000 NA   NA
 5973209 5973210 CBY_0493 CBY_0494     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5973210 5973211 CBY_0494 CBY_0495     TRUE 0.812 -15.000 0.000 NA   NA
 5973211 5973212 CBY_0495 CBY_0496     TRUE 0.996 25.000 0.318 NA Y NA
 5973214 5973215 CBY_0498 CBY_0499   ahpC TRUE 0.931 166.000 0.084 1.000 Y NA
 5973215 5973216 CBY_0499 CBY_0500 ahpC   FALSE 0.063 251.000 0.000 1.000 N NA
 5973216 5973217 CBY_0500 CBY_0501     FALSE 0.218 173.000 0.000 1.000 N NA
 5973217 5973218 CBY_0501 CBY_0502     TRUE 0.960 28.000 0.143 0.004 N NA
 5973218 5973219 CBY_0502 CBY_0503     FALSE 0.029 307.000 0.000 1.000 N NA
 5973219 5973220 CBY_0503 CBY_0504     TRUE 0.988 10.000 0.000 0.021 Y NA
 5973220 5973221 CBY_0504 CBY_0505     FALSE 0.071 240.000 0.000 0.050   NA
 5973221 5973222 CBY_0505 CBY_0506     TRUE 0.971 12.000 0.118 1.000   NA
 5973222 5973223 CBY_0506 CBY_0507   dhaK TRUE 0.996 25.000 0.226 0.001 Y NA
 5973223 5973224 CBY_0507 CBY_0508 dhaK   TRUE 0.960 0.000 0.053 1.000 N NA
 5973224 5973225 CBY_0508 CBY_0509     FALSE 0.253 291.000 0.250 1.000 N NA
 5973225 5973226 CBY_0509 CBY_0510     FALSE 0.223 171.000 0.000 1.000 N NA
 5973226 5973227 CBY_0510 CBY_0511     TRUE 0.984 0.000 0.429 1.000 N NA
 5973227 5973228 CBY_0511 CBY_0512     FALSE 0.171 191.000 0.000 1.000   NA
 5973228 5973229 CBY_0512 CBY_0513     TRUE 0.958 -25.000 0.081 0.001   NA
 5973229 5973230 CBY_0513 CBY_0514     TRUE 0.836 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5973230 5973231 CBY_0514 CBY_0515     TRUE 0.835 14.000 0.000 1.000 N NA
 5973231 5973232 CBY_0515 CBY_0516   nifE TRUE 0.997 15.000 0.342 0.001 Y NA
 5973232 5973233 CBY_0516 CBY_0517 nifE   TRUE 0.943 190.000 0.380 0.001 Y NA
 5973233 5973234 CBY_0517 CBY_0518   nifD TRUE 0.998 3.000 0.902 0.001 Y NA
 5973234 5973235 CBY_0518 CBY_0519 nifD   TRUE 0.978 19.000 0.294 1.000 N NA
 5973235 5973236 CBY_0519 CBY_0520     TRUE 0.998 22.000 0.860 0.003 Y NA
 5973236 5973237 CBY_0520 CBY_0521   nifH TRUE 0.785 25.000 0.000 NA   NA
 5973238 4729927 CBY_1088 CBY_1089     TRUE 0.811 -16.000 0.000 NA   NA
 4729927 5973239 CBY_1089 CBY_1090     TRUE 0.494 178.000 0.031 1.000 N NA
 5973239 5973240 CBY_1090 CBY_1091   clpP FALSE 0.407 203.000 0.042 1.000 N NA
 5973240 5973241 CBY_1091 CBY_1092 clpP   FALSE 0.165 191.000 0.000 0.026   NA
 5973241 5973242 CBY_1092 CBY_1093     FALSE 0.294 121.000 0.000 1.000   NA
 5973242 5973243 CBY_1093 CBY_1094     TRUE 0.752 145.000 0.208 1.000   NA
 5973243 4729933 CBY_1094 CBY_1095     FALSE 0.023 334.000 0.000 1.000   NA
 4729933 4729934 CBY_1095 CBY_1096     TRUE 0.557 55.000 0.000 1.000   NA
 4729934 5973244 CBY_1096 CBY_1097     TRUE 0.844 155.000 0.000 1.000 Y NA
 5973244 5973245 CBY_1097 CBY_1098     TRUE 0.662 174.000 0.148 NA   NA
 5973245 5973246 CBY_1098 CBY_1099     FALSE 0.455 212.000 0.104 NA   NA
 5973246 5973247 CBY_1099 CBY_1100   pnp TRUE 0.626 146.000 0.057 1.000   NA
 5973247 5973248 CBY_1100 CBY_1101 pnp rpsO TRUE 0.976 102.000 0.335 1.000 Y NA
 5973248 5973249 CBY_1101 CBY_1102 rpsO ribF TRUE 0.744 118.000 0.119 1.000 N NA
 5973249 5973250 CBY_1102 CBY_1103 ribF truB TRUE 0.980 16.000 0.308 1.000 N NA
 5973250 5973251 CBY_1103 CBY_1104 truB   TRUE 0.975 17.000 0.221 1.000   NA
 5973251 5973252 CBY_1104 CBY_1105   rbfA TRUE 0.975 0.000 0.173 1.000   NA
 5973252 5973253 CBY_1105 CBY_1106 rbfA infB TRUE 0.998 14.000 0.530 1.000 Y NA
 5973253 5973254 CBY_1106 CBY_1107 infB   TRUE 0.997 16.000 0.223 NA Y NA
 5973254 5973255 CBY_1107 CBY_1108     TRUE 0.983 -7.000 0.408 NA N NA
 5973255 5973256 CBY_1108 CBY_1109   nusA TRUE 0.997 16.000 0.323 NA Y NA
 5973256 5973257 CBY_1109 CBY_1110 nusA   TRUE 0.986 18.000 0.759 NA   NA
 5973257 5973258 CBY_1110 CBY_1111   polC FALSE 0.153 288.000 0.059 NA   NA
 5973258 5973259 CBY_1111 CBY_1112 polC ispG FALSE 0.178 267.000 0.040 1.000 N NA
 5973259 5973260 CBY_1112 CBY_1113 ispG rseP TRUE 0.489 204.000 0.092 1.000 N NA
 5973260 5973261 CBY_1113 CBY_1114 rseP dxr TRUE 0.984 18.000 0.568 1.000 N NA
 5973261 5973262 CBY_1114 CBY_1115 dxr   TRUE 0.902 28.000 0.008 NA   NA
 5973262 5973263 CBY_1115 CBY_1116   cdsA TRUE 0.671 127.000 0.068 NA   NA
 5973263 5973264 CBY_1116 CBY_1117 cdsA uppS TRUE 0.958 14.000 0.055 1.000   NA
 5973264 5973265 CBY_1117 CBY_1118 uppS frr TRUE 0.874 96.000 0.409 1.000 N NA
 5973265 5973266 CBY_1118 CBY_1119 frr pyrH TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5973266 5973267 CBY_1119 CBY_1120 pyrH tsf FALSE 0.019 357.000 0.000 NA   NA
 5973267 5973268 CBY_1120 CBY_1121 tsf   FALSE 0.354 101.000 0.000 NA   NA
 5973269 5973270 CBY_0001 CBY_0002     TRUE 0.939 -13.000 0.025 1.000   NA
 5973270 5973271 CBY_0002 CBY_0003     FALSE 0.095 223.000 0.000 1.000   NA
 5973271 5973272 CBY_0003 CBY_0004     TRUE 0.953 -52.000 0.063 NA   NA
 5973272 5973273 CBY_0004 CBY_0005     FALSE 0.405 250.000 0.300 NA   NA
 5973275 5973276 CBY_0007 CBY_0008     TRUE 0.934 10.000 0.007 1.000   NA
 5973276 5973277 CBY_0008 CBY_0009     TRUE 0.495 130.000 0.005 1.000   NA
 5973277 5973278 CBY_0009 CBY_0010     TRUE 0.952 39.000 0.250 1.000   NA
 5973278 5973279 CBY_0010 CBY_0011     FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5973279 5973280 CBY_0011 CBY_0012     FALSE 0.035 290.000 0.000 NA   NA
 5973280 5973281 CBY_0012 CBY_0013     FALSE 0.263 145.000 0.000 NA   NA
 5973283 5973284 CBY_0015 CBY_0016     FALSE 0.212 174.000 0.000 NA   NA
 5973285 5973286 CBY_0017 CBY_0018     TRUE 0.668 109.000 0.041 NA   NA
 5973287 5973288 CBY_0019 CBY_0020     FALSE 0.041 278.000 0.000 NA   NA
 5973288 5973289 CBY_0020 CBY_0021     TRUE 0.568 54.000 0.000 NA   NA
 5973289 5973290 CBY_0021 CBY_0022     FALSE 0.082 233.000 0.000 NA   NA
 5973290 5973291 CBY_0022 CBY_0023   lon TRUE 0.952 -10.000 0.048 1.000   NA
 5973291 5973292 CBY_0023 CBY_0024 lon lonB TRUE 0.833 218.000 0.072 0.002 Y NA
 5973292 5973293 CBY_0024 CBY_0025 lonB clpX TRUE 0.765 230.000 0.042 0.003 Y NA
 5973293 5973294 CBY_0025 CBY_0026 clpX clpP TRUE 0.978 43.000 0.002 1.000 Y NA
 5973294 5973295 CBY_0026 CBY_0027 clpP tig FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5973296 5973297 CBY_4250 CBY_4251 rrs rrl FALSE 0.070 243.000 0.000 NA   NA
 5973297 5973298 CBY_4251 CBY_4252 rrl rrf FALSE 0.312 115.000 0.000 NA   NA
 5973298 5973299 CBY_4252 CBY_4253 rrf   TRUE 0.841 9.000 0.000 NA   NA
 5973299 5973300 CBY_4253 CBY_4254     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5973300 4729985 CBY_4254 CBY_1477     FALSE 0.268 137.000 0.000 NA   NA
 4729985 5973301 CBY_1477 CBY_1478     TRUE 0.945 13.000 0.021 1.000   NA
 5973301 5973302 CBY_1478 CBY_1479     TRUE 0.978 21.000 0.370 NA   NA
 5973302 5973303 CBY_1479 CBY_1480   serS FALSE 0.013 422.000 0.000 NA   NA
 5973303 5973304 CBY_1480 CBY_4256 serS   FALSE 0.054 260.000 0.000 NA   NA
 5973304 5973305 CBY_4256 CBY_4257     TRUE 0.634 44.000 0.000 NA   NA
 5973305 5973306 CBY_4257 CBY_4258     FALSE 0.023 335.000 0.000 NA   NA
 5973306 5973307 CBY_4258 CBY_4259     TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 5973307 5973308 CBY_4259 CBY_1485     FALSE 0.217 172.000 0.000 NA   NA
 5973308 5973309 CBY_1485 CBY_1486   addB TRUE 0.942 19.000 0.029 1.000 N NA
 5973309 5973310 CBY_1486 CBY_1487 addB addA TRUE 0.991 52.000 0.408 0.004 Y NA
 4730003 5973314 CBY_1871 CBY_1872     TRUE 0.840 3.000 0.000 1.000   NA
 5973316 5973317 CBY_1874 CBY_1875     TRUE 0.545 172.000 0.047 NA   NA
 5973317 5973318 CBY_1875 CBY_1876     FALSE 0.025 328.000 0.000 NA N NA
 5973320 4730012 CBY_1878 CBY_1879     FALSE 0.122 211.000 0.000 1.000 N NA
 4730012 5973321 CBY_1879 CBY_1880     FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5973321 4730013 CBY_1880 CBY_1881     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 4730013 5973322 CBY_1881 CBY_1882     TRUE 0.657 41.000 0.000 NA   NA
 5973322 5973323 CBY_1882 CBY_1883     TRUE 0.807 -22.000 0.000 NA   NA
 5973323 5973324 CBY_1883 CBY_1884     FALSE 0.418 81.000 0.000 1.000   NA
 5973325 5973326 CBY_1885 CBY_1886     FALSE 0.254 152.000 0.000 1.000   NA
 5973327 5973328 CBY_1887 CBY_1888     TRUE 0.997 -18.000 0.312 NA Y NA
 5973328 5973329 CBY_1888 CBY_1889   nifJ FALSE 0.008 688.000 0.000 1.000 N NA
 5973334 5973335 CBY_1895 CBY_1896     FALSE 0.012 442.000 0.000 NA   NA
 5973336 5973337 CBY_1897 CBY_1898     TRUE 0.799 -18.000 0.000 0.003   NA
 5973338 5973339 CBY_1899 CBY_1900     FALSE 0.312 115.000 0.000 NA   NA
 5973341 5973342 CBY_1902 CBY_1903     FALSE 0.027 314.000 0.000 NA   NA
 5973342 5973343 CBY_1903 CBY_1904   xpt FALSE 0.008 720.000 0.000 NA   NA
 5973343 5973344 CBY_1904 CBY_1905 xpt   TRUE 0.952 96.000 0.032 1.000 Y NA
 5973344 5973345 CBY_1905 CBY_1906     FALSE 0.008 630.000 0.000 NA   NA
 5973345 5973346 CBY_1906 CBY_1907     FALSE 0.021 351.000 0.000 NA   NA
 5973346 5973347 CBY_1907 CBY_1908     FALSE 0.020 352.000 0.000 NA   NA
 5973347 5973348 CBY_1908 CBY_1909     FALSE 0.092 227.000 0.000 NA N NA
 5973348 5973349 CBY_1909 CBY_1910     FALSE 0.284 127.000 0.000 NA   NA
 5973349 5973350 CBY_1910 CBY_1911     FALSE 0.272 133.000 0.000 NA   NA
 5973350 5973351 CBY_1911 CBY_1912     FALSE 0.264 144.000 0.000 NA   NA
 5973351 5973352 CBY_1912 CBY_1913     FALSE 0.453 74.000 0.000 NA   NA
 5973352 5973353 CBY_1913 CBY_1914     TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 5973353 5973354 CBY_1914 CBY_1915     FALSE 0.008 607.000 0.000 NA   NA
 5973354 5973355 CBY_1915 CBY_1916     FALSE 0.092 225.000 0.000 NA   NA
 5973357 5973358 CBY_1918 CBY_1919     TRUE 0.621 46.000 0.000 NA   NA
 5973358 5973359 CBY_1919 CBY_1920     FALSE 0.017 376.000 0.000 NA   NA
 5973359 5973360 CBY_1920 CBY_1921     FALSE 0.350 102.000 0.000 NA   NA
 5973360 5973361 CBY_1921 CBY_1922     FALSE 0.175 190.000 0.000 NA   NA
 5973361 5973362 CBY_1922 CBY_1923     FALSE 0.013 435.000 0.000 NA   NA
 5973362 5973363 CBY_1923 CBY_1924     FALSE 0.221 170.000 0.000 NA   NA
 5973363 5973364 CBY_1924 CBY_1925     FALSE 0.067 245.000 0.000 NA   NA
 5973364 5973365 CBY_1925 CBY_1926     FALSE 0.023 331.000 0.000 NA   NA
 5973365 5973366 CBY_1926 CBY_1927     FALSE 0.190 184.000 0.000 NA   NA
 5973366 5973367 CBY_1927 CBY_1928     FALSE 0.033 297.000 0.000 1.000 N NA
 5973367 5973368 CBY_1928 CBY_1929     FALSE 0.039 283.000 0.000 NA   NA
 5973370 5973371 CBY_1931 CBY_1932     TRUE 0.989 10.000 0.833 NA   NA
 5973371 5973372 CBY_1932 CBY_1933     TRUE 0.979 4.000 0.211 NA   NA
 5973372 5973373 CBY_1933 CBY_1934     FALSE 0.185 186.000 0.000 NA   NA
 5973373 5973374 CBY_1934 CBY_1935     TRUE 0.762 29.000 0.000 NA   NA
 5973374 5973375 CBY_1935 CBY_1936     FALSE 0.052 264.000 0.000 NA   NA
 5973375 5973376 CBY_1936 CBY_1937     FALSE 0.341 105.000 0.000 NA   NA
 5973376 5973377 CBY_1937 CBY_1938     TRUE 0.727 33.000 0.000 NA   NA
 5973377 5973378 CBY_1938 CBY_1939     FALSE 0.159 196.000 0.000 NA   NA
 5973378 5973379 CBY_1939 CBY_1940     TRUE 0.672 40.000 0.000 1.000 N NA
 5973379 5973380 CBY_1940 CBY_1941     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973380 5973381 CBY_1941 CBY_1942     TRUE 0.970 38.000 0.667 NA   NA
 5973381 5973382 CBY_1942 CBY_1943     TRUE 0.948 57.000 0.667 NA   NA
 5973383 5973384 CBY_1944 CBY_1945     FALSE 0.060 252.000 0.000 NA   NA
 5973384 5973385 CBY_1945 CBY_1946     FALSE 0.466 71.000 0.000 NA   NA
 5973385 5973386 CBY_1946 CBY_1947     FALSE 0.289 124.000 0.000 NA   NA
 5973386 5973387 CBY_1947 CBY_1948     TRUE 0.739 148.000 0.188 NA   NA
 5973388 5973389 CBY_1949 CBY_1950     TRUE 0.814 -13.000 0.000 NA   NA
 5973389 5973390 CBY_1950 CBY_1951     TRUE 0.574 53.000 0.000 NA   NA
 5973391 5973392 CBY_1952 CBY_1953     FALSE 0.010 532.000 0.000 NA   NA
 5973393 5973394 CBY_1954 CBY_1955     FALSE 0.358 99.000 0.000 NA   NA
 5973394 5973395 CBY_1955 CBY_1956     FALSE 0.066 246.000 0.000 NA   NA
 5973395 5973396 CBY_1956 CBY_1957     FALSE 0.140 203.000 0.000 NA   NA
 5973396 5973397 CBY_1957 CBY_1958     TRUE 0.840 10.000 0.000 NA   NA
 5973397 5973398 CBY_1958 CBY_1959     FALSE 0.140 203.000 0.000 NA   NA
 5973398 5973399 CBY_1959 CBY_1960     FALSE 0.022 336.000 0.000 1.000   NA
 5973399 5973400 CBY_1960 CBY_1961     FALSE 0.026 320.000 0.000 NA   NA
 5973400 5973401 CBY_1961 CBY_1962     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5973401 5973402 CBY_1962 CBY_1963     TRUE 0.841 8.000 0.000 NA   NA
 5973402 5973403 CBY_1963 CBY_1964     FALSE 0.385 91.000 0.000 NA   NA
 5973403 5973404 CBY_1964 CBY_1965     FALSE 0.156 197.000 0.000 NA   NA
 5973404 5973405 CBY_1965 CBY_1966     FALSE 0.335 107.000 0.000 NA   NA
 5973405 5973406 CBY_1966 CBY_1968     FALSE 0.214 173.000 0.000 NA   NA
 5973406 5973407 CBY_1968 CBY_1969     FALSE 0.369 98.000 0.000 NA N NA
 5973407 5973408 CBY_1969 CBY_1970     FALSE 0.265 143.000 0.000 NA   NA
 5973408 5973409 CBY_1970 CBY_1971     FALSE 0.477 68.000 0.000 NA   NA
 5973409 5973410 CBY_1971 CBY_1972     TRUE 0.988 78.000 0.700 1.000 Y NA
 5973410 5973411 CBY_1972 CBY_1973     TRUE 0.928 49.000 0.200 1.000   NA
 5973411 5973412 CBY_1973 CBY_1974     TRUE 0.978 -10.000 0.286 1.000   NA
 5973412 5973413 CBY_1974 CBY_1975     FALSE 0.014 405.000 0.000 NA   NA
 5973415 5973416 CBY_1977 CBY_1978     TRUE 0.933 78.000 1.000 0.004 N NA
 5973416 5973417 CBY_1978 CBY_1979     FALSE 0.018 371.000 0.000 1.000 N NA
 5973417 5973418 CBY_1979 CBY_1980     FALSE 0.124 211.000 0.000 NA N NA
 5973418 5973419 CBY_1980 CBY_1981     FALSE 0.267 139.000 0.000 NA   NA
 5973419 5973420 CBY_1981 CBY_1982     FALSE 0.246 156.000 0.000 NA   NA
 5973420 5973421 CBY_1982 CBY_1983     FALSE 0.258 154.000 0.000 NA N NA
 5973421 5973422 CBY_1983 CBY_1984     FALSE 0.042 277.000 0.000 1.000 N NA
 5973422 5973423 CBY_1984 CBY_1985     FALSE 0.217 171.000 0.000 1.000   NA
 5973423 5973424 CBY_1985 CBY_1986     FALSE 0.217 171.000 0.000 1.000   NA
 5973424 5973425 CBY_1986 CBY_1987     FALSE 0.229 165.000 0.000 1.000   NA
 5973425 5973426 CBY_1987 CBY_1988     TRUE 0.836 12.000 0.000 1.000   NA
 5973428 5973429 CBY_1990 CBY_1991     FALSE 0.483 67.000 0.000 NA   NA
 5973429 5973430 CBY_1991 CBY_1992     TRUE 0.514 62.000 0.000 NA   NA
 5973430 5973431 CBY_1992 CBY_1993     FALSE 0.296 121.000 0.000 NA   NA
 5973431 5973432 CBY_1993 CBY_1994     TRUE 0.519 61.000 0.000 1.000   NA
 5973432 5973433 CBY_1994 CBY_1995     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5973433 5973434 CBY_1995 CBY_1996     FALSE 0.007 773.000 0.000 NA   NA
 5973434 5973435 CBY_1996 CBY_1997     FALSE 0.203 178.000 0.000 NA   NA
 5973435 5973436 CBY_1997 CBY_1998     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5973436 5973437 CBY_1998 CBY_1999     FALSE 0.402 86.000 0.000 1.000   NA
 5973437 5973438 CBY_1999 CBY_2000     FALSE 0.273 136.000 0.000 1.000 N NA
 5973438 5973439 CBY_2000 CBY_2001     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5973439 5973440 CBY_2001 CBY_2002     FALSE 0.084 231.000 0.000 NA   NA
 5973440 5973441 CBY_2002 CBY_2003     FALSE 0.012 450.000 0.000 NA   NA
 5973441 5973442 CBY_2003 CBY_2004     FALSE 0.128 208.000 0.000 NA   NA
 5973442 5973443 CBY_2004 CBY_2005     FALSE 0.021 349.000 0.000 NA   NA
 5973445 5973446 CBY_2007 CBY_2008     FALSE 0.080 235.000 0.000 NA   NA
 5973446 5973447 CBY_2008 CBY_2009     FALSE 0.208 176.000 0.000 NA   NA
 5973447 5973448 CBY_2009 CBY_2010     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5973450 5973451 CBY_2012 CBY_2013     TRUE 0.973 -16.000 0.208 NA   NA
 5973451 5973452 CBY_2013 CBY_2014     FALSE 0.277 133.000 0.000 1.000 N NA
 5973452 5973453 CBY_2014 CBY_2015     TRUE 0.998 -12.000 0.741 0.021 Y NA
 5973453 5973454 CBY_2015 CBY_2016     TRUE 0.961 37.000 0.352 NA   NA
 5973454 5973455 CBY_2016 CBY_2017     TRUE 0.986 4.000 0.490 NA   NA
 5973455 5973456 CBY_2017 CBY_2018     TRUE 0.976 4.000 0.163 NA   NA
 5973458 5973459 CBY_2020 CBY_2021     FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973459 5973460 CBY_2021 CBY_2022     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5973460 5973461 CBY_2022 CBY_2023     FALSE 0.314 114.000 0.000 NA   NA
 5973461 5973462 CBY_2023 CBY_2024     TRUE 0.972 0.000 0.127 NA   NA
 5973462 5973463 CBY_2024 CBY_2025     FALSE 0.264 140.000 0.000 1.000   NA
 5973463 5973464 CBY_2025 CBY_2026     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5973464 5973465 CBY_2026 CBY_2027     TRUE 0.606 49.000 0.000 NA   NA
 5973467 5973468 CBY_2029 CBY_2030     TRUE 0.874 86.000 0.300 NA   NA
 5973468 5973469 CBY_2030 CBY_2031     TRUE 0.982 8.000 0.300 1.000 N NA
 5973469 5973470 CBY_2031 CBY_2032     FALSE 0.020 352.000 0.000 NA   NA
 5973470 5973471 CBY_2032 CBY_2033     TRUE 0.978 -10.000 0.286 NA   NA
 5973471 5973472 CBY_2033 CBY_2034     TRUE 0.998 3.000 0.571 0.031 Y NA
 5973472 5973473 CBY_2034 CBY_2035     TRUE 0.980 106.000 0.611 0.031 Y NA
 5973473 5973474 CBY_2035 CBY_2036     TRUE 0.777 93.000 0.083 1.000 N NA
 5973476 5973477 CBY_2038 CBY_2039     FALSE 0.201 179.000 0.000 NA   NA
 5973477 5973478 CBY_2039 CBY_2040     TRUE 0.953 19.000 0.055 NA   NA
 5973478 5973479 CBY_2040 CBY_2041     TRUE 0.898 63.000 0.209 NA   NA
 5973479 5973480 CBY_2041 CBY_2042     FALSE 0.327 109.000 0.000 NA   NA
 5973480 5973481 CBY_2042 CBY_2043     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5973482 5973483 CBY_2044 CBY_2045     FALSE 0.144 202.000 0.000 NA   NA
 5973484 5973485 CBY_2046 CBY_2047     FALSE 0.012 446.000 0.000 1.000   NA
 5973485 5973486 CBY_2047 CBY_2048     TRUE 0.986 18.000 0.733 0.001   NA
 5973486 5973487 CBY_2048 CBY_2049     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973487 5973488 CBY_2049 CBY_2051     FALSE 0.075 239.000 0.000 NA   NA
 5973489 5973490 CBY_2052 CBY_2053     TRUE 0.986 -7.000 0.614 NA   NA
 5973491 5973492 CBY_2054 CBY_2055     FALSE 0.063 251.000 0.000 1.000 N NA
 5973492 5973493 CBY_2055 CBY_2056     TRUE 0.903 48.000 0.087 1.000 N NA
 5973493 5973494 CBY_2056 CBY_2057     TRUE 0.998 1.000 0.957 1.000 Y NA
 5973494 5973495 CBY_2057 CBY_2058     TRUE 0.994 28.000 0.087 NA Y NA
 5973495 5973496 CBY_2058 CBY_2059     FALSE 0.010 516.000 0.000 NA   NA
 5973497 5973498 CBY_2822 CBY_2823     TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 5973498 5973499 CBY_2823 CBY_2824     TRUE 0.837 12.000 0.000 NA   NA
 5973499 5973500 CBY_2824 CBY_2825     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973500 5973501 CBY_2825 CBY_2826     FALSE 0.401 87.000 0.000 NA   NA
 5973501 5973502 CBY_2826 CBY_2827     TRUE 0.958 49.000 0.667 NA   NA
 5973502 5973503 CBY_2827 CBY_2828     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5973503 5973504 CBY_2828 CBY_2829     TRUE 0.984 5.000 0.375 NA   NA
 5973504 5973505 CBY_2829 CBY_2830     TRUE 0.979 -3.000 0.250 NA   NA
 5973505 5973506 CBY_2830 CBY_2831     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5973506 5973507 CBY_2831 CBY_2832     TRUE 0.839 11.000 0.000 NA   NA
 5973507 5973508 CBY_2832 CBY_2833     TRUE 0.920 46.000 0.133 NA   NA
 5973508 5973509 CBY_2833 CBY_2834     TRUE 0.974 3.000 0.133 NA   NA
 5973509 5973510 CBY_2834 CBY_2835     TRUE 0.970 -22.000 0.167 NA   NA
 5973510 5973511 CBY_2835 CBY_2836     TRUE 0.972 18.000 0.167 NA   NA
 5973511 5973512 CBY_2836 CBY_2837     TRUE 0.987 0.000 0.667 NA   NA
 5973512 5973513 CBY_2837 CBY_2838     FALSE 0.385 91.000 0.000 NA   NA
 5973513 5973514 CBY_2838 CBY_2839     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5973514 5973515 CBY_2839 CBY_2840     FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973515 5973516 CBY_2840 CBY_2841     TRUE 0.842 4.000 0.000 NA   NA
 5973516 5973517 CBY_2841 CBY_2842     FALSE 0.170 192.000 0.000 NA   NA
 5973517 5973518 CBY_2842 CBY_2843     FALSE 0.306 117.000 0.000 NA   NA
 5973518 5973519 CBY_2843 CBY_2844     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5973519 5973520 CBY_2844 CBY_2845     FALSE 0.272 133.000 0.000 NA   NA
 5973520 5973521 CBY_2845 CBY_2846     FALSE 0.265 142.000 0.000 NA   NA
 5973521 5973522 CBY_2846 CBY_2847     TRUE 0.837 0.000 0.000 NA   NA
 5973522 5973523 CBY_2847 CBY_2848     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5973523 5973524 CBY_2848 CBY_2849     TRUE 0.754 30.000 0.000 NA   NA
 5973524 4730057 CBY_2849 CBY_2850     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 4730057 5973525 CBY_2850 CBY_2851     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5973525 5973526 CBY_2851 CBY_2852     TRUE 0.808 20.000 0.000 NA   NA
 5973526 5973527 CBY_2852 CBY_2853     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5973527 5973528 CBY_2853 CBY_2854     TRUE 0.522 61.000 0.000 NA   NA
 5973528 5973529 CBY_2854 CBY_2855     TRUE 0.817 18.000 0.000 NA   NA
 5973529 5973530 CBY_2855 CBY_2856     FALSE 0.327 109.000 0.000 NA   NA
 5973530 5973531 CBY_2856 CBY_2857     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5973531 5973532 CBY_2857 CBY_2858   dnaB TRUE 0.825 16.000 0.000 NA   NA
 5973532 5973533 CBY_2858 CBY_2859 dnaB   TRUE 0.839 1.000 0.000 NA   NA
 5973533 5973534 CBY_2859 CBY_2860     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5973534 5973535 CBY_2860 CBY_2861     TRUE 0.970 -15.000 0.154 1.000 N NA
 5973535 5973536 CBY_2861 CBY_2862     FALSE 0.430 79.000 0.000 NA   NA
 5973536 5973537 CBY_2862 CBY_2863     TRUE 0.829 15.000 0.000 NA   NA
 5973537 5973538 CBY_2863 CBY_2864     TRUE 0.530 60.000 0.000 NA   NA
 5973538 5973539 CBY_2864 CBY_2865     TRUE 0.964 37.000 0.400 NA   NA
 5973539 5973540 CBY_2865 CBY_2866     FALSE 0.216 168.000 0.000 0.027   NA
 5973541 5973542 CBY_2867 CBY_2868     FALSE 0.361 98.000 0.000 NA   NA
 5973542 5973543 CBY_2868 CBY_2869     FALSE 0.339 106.000 0.000 NA   NA
 5973543 5973544 CBY_2869 CBY_2871     FALSE 0.372 95.000 0.000 NA   NA
 5973545 5973546 CBY_2870 CBY_2872     FALSE 0.165 194.000 0.000 NA   NA
 5973546 5973547 CBY_2872 CBY_2873     TRUE 0.626 107.000 0.018 1.000 N NA
 5973547 5973548 CBY_2873 CBY_2874     TRUE 0.944 105.000 0.027 1.000 Y NA
 5973548 5973549 CBY_2874 CBY_2875     TRUE 0.987 -7.000 0.000 0.013 Y NA
 5973549 5973550 CBY_2875 CBY_2876     FALSE 0.008 625.000 0.000 NA   NA
 5973550 5973551 CBY_2876 CBY_2877     TRUE 0.812 19.000 0.000 NA   NA
 5973551 5973552 CBY_2877 CBY_2878     FALSE 0.023 336.000 0.000 NA   NA
 5973552 5973553 CBY_2878 CBY_2879     FALSE 0.274 132.000 0.000 NA   NA
 5973553 5973554 CBY_2879 CBY_2880   pabB TRUE 0.995 12.000 0.050 1.000 Y NA
 5973554 5973555 CBY_2880 CBY_2881 pabB pabA TRUE 0.997 -7.000 0.375 1.000 Y NA
 5973555 5973556 CBY_2881 CBY_2882 pabA   FALSE 0.029 307.000 0.000 1.000 N NA
 5973556 5973557 CBY_2882 CBY_2883     TRUE 0.921 50.000 0.179 NA   NA
 5973557 5973558 CBY_2883 CBY_2884     TRUE 0.971 34.000 0.556 NA   NA
 5973558 5973559 CBY_2884 CBY_2885     TRUE 0.983 -13.000 0.556 NA   NA
 5973559 5973560 CBY_2885 CBY_2886     TRUE 0.989 -6.000 1.000 NA   NA
 5973560 5973561 CBY_2886 CBY_4332     FALSE 0.056 257.000 0.000 NA   NA
 5973561 5973562 CBY_4332 CBY_2888     FALSE 0.302 118.000 0.000 NA   NA
 5973562 5973563 CBY_2888 CBY_2889   coaE TRUE 0.959 15.000 0.058 NA   NA
 5973563 5973564 CBY_2889 CBY_2890 coaE   TRUE 0.655 138.000 0.068 1.000 N NA
 5973566 5973567 CBY_2892 CBY_4333     FALSE 0.048 269.000 0.000 NA   NA
 5973567 5973568 CBY_4333 CBY_2894     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 5973568 5973569 CBY_2894 CBY_2895     FALSE 0.480 153.000 0.008 NA   NA
 5973569 5973570 CBY_2895 CBY_2896     FALSE 0.092 299.000 0.016 NA   NA
 5973570 5973571 CBY_2896 CBY_2897     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5973571 5973572 CBY_2897 CBY_2898     TRUE 0.841 9.000 0.000 NA   NA
 5973575 5973576 CBY_2105 CBY_2106     FALSE 0.044 274.000 0.000 NA   NA
 5973577 5973578 CBY_4283 CBY_4284 rrf rrs FALSE 0.296 121.000 0.000 NA   NA
 5973579 5973580 CBY_0832 CBY_0833     FALSE 0.146 201.000 0.000 NA   NA
 5973582 5973583 CBY_0835 CBY_0836     FALSE 0.075 239.000 0.000 NA   NA
 5973584 5973585 CBY_0837 CBY_0838     TRUE 0.989 61.000 0.380 NA Y NA
 5973585 5973586 CBY_0838 CBY_0839     TRUE 0.931 187.000 0.189 NA Y NA
 5973586 5973587 CBY_0839 CBY_0840     TRUE 0.937 40.000 0.148 NA N NA
 5973587 5973588 CBY_0840 CBY_0841   nanA TRUE 0.899 192.000 0.074 1.000 Y NA
 5973588 5973589 CBY_0841 CBY_0842 nanA   TRUE 0.845 60.000 0.058 1.000 N NA
 5973590 5973591 CBY_0843 CBY_0844     FALSE 0.013 426.000 0.000 1.000 N NA
 5973591 5973592 CBY_0844 CBY_0845     FALSE 0.008 635.000 0.000 1.000 N NA
 5973592 5973593 CBY_0845 CBY_0846     FALSE 0.157 468.000 0.000 0.002 Y NA
 5973593 4730108 CBY_0846 CBY_0847     FALSE 0.122 210.000 0.000 1.000   NA
 4730108 5973594 CBY_0847 CBY_0848     FALSE 0.007 683.000 0.000 0.092   NA
 5973596 5973597 CBY_0850 CBY_0851     FALSE 0.016 385.000 0.000 NA   NA
 5973597 5973598 CBY_0851 CBY_0852   amt TRUE 0.842 61.000 0.061 NA   NA
 5973598 5973599 CBY_0852 CBY_0853 amt   TRUE 0.634 45.000 0.000 1.000 N NA
 5973601 5973602 CBY_0855 CBY_0856     TRUE 0.988 0.000 0.793 0.092 N NA
 5973604 5973605 CBY_0858 CBY_0859     TRUE 0.989 2.000 0.889 NA   NA
 5973605 5973606 CBY_0859 CBY_0860     FALSE 0.421 81.000 0.000 NA   NA
 5973606 5973607 CBY_0860 CBY_0861     FALSE 0.032 298.000 0.000 0.032 N NA
 5973607 5973608 CBY_0861 CBY_0862     FALSE 0.016 387.000 0.000 1.000 N NA
 5973608 5973609 CBY_0862 CBY_0863     TRUE 0.817 172.000 0.000 0.011 Y NA
 5973609 5973610 CBY_0863 CBY_0864     TRUE 0.951 57.000 0.000 0.011 Y NA
 5973610 5973611 CBY_0864 CBY_0865     TRUE 0.919 85.000 0.000 NA Y NA
 5973611 5973612 CBY_0865 CBY_0866     TRUE 0.978 33.000 0.000 NA Y NA
 5973612 5973613 CBY_0866 CBY_0867     FALSE 0.012 451.000 0.000 1.000 N NA
 5973615 5973616 CBY_0870 CBY_0871     TRUE 0.870 122.000 0.000 0.012 Y NA
 5973617 5973618 CBY_0872 CBY_0873     TRUE 0.971 131.000 0.500 0.075 Y NA
 5973619 5973620 CBY_0874 CBY_0875     TRUE 0.910 91.000 0.000 0.011 Y NA
 5973620 5973621 CBY_0875 CBY_0876     FALSE 0.446 270.000 0.000 0.011 Y NA
 5973621 5973622 CBY_0876 CBY_0877     FALSE 0.195 404.000 0.000 NA Y NA
 5973622 5973623 CBY_0877 CBY_0878     TRUE 0.856 143.000 0.000 NA Y NA
 5973623 5973624 CBY_0878 CBY_0879     TRUE 0.998 24.000 0.800 0.033 Y NA
 5973624 5973625 CBY_0879 CBY_0880     FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5973625 5973626 CBY_0880 CBY_0881     FALSE 0.237 161.000 0.000 NA   NA
 5973626 5973627 CBY_0881 CBY_0882     TRUE 0.979 -7.000 0.273 NA   NA
 5973629 5973630 CBY_0884 CBY_0885     TRUE 0.804 -34.000 0.000 NA   NA
 5973630 5973631 CBY_0885 CBY_0886     TRUE 0.989 -3.000 0.875 1.000 N NA
 5973631 5973632 CBY_0886 CBY_0887   phnW TRUE 0.876 48.000 0.049 1.000 N NA
 5973632 5973633 CBY_0887 CBY_0888 phnW phnX TRUE 0.982 3.000 0.315 1.000   NA
 5973633 5973634 CBY_0888 CBY_0889 phnX   TRUE 0.924 -25.000 0.012 1.000   NA
 5973636 5973637 CBY_0891 CBY_0892     FALSE 0.017 378.000 0.000 1.000 N NA
 5973638 5973639 CBY_0893 CBY_0894     TRUE 0.974 -10.000 0.200 NA   NA
 5973640 5973641 CBY_0895 CBY_0896     FALSE 0.165 195.000 0.000 1.000 N NA
 5973641 5973642 CBY_0896 CBY_0897     FALSE 0.220 377.000 0.000 NA Y NA
 5973642 5973643 CBY_0897 CBY_0898     TRUE 0.743 199.000 0.000 NA Y NA
 5973643 5973644 CBY_0898 CBY_0899     FALSE 0.048 269.000 0.000 NA   NA
 5973644 5973645 CBY_0899 CBY_0900     TRUE 0.823 64.000 0.056 NA   NA
 5973645 5973646 CBY_0900 CBY_0901     TRUE 0.842 3.000 0.000 NA   NA
 5973647 5973648 CBY_0902 CBY_0903     FALSE 0.318 112.000 0.000 NA   NA
 5973648 5973649 CBY_0903 CBY_0904     TRUE 0.987 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5973649 5973650 CBY_0904 CBY_0905     FALSE 0.012 466.000 0.000 1.000 N NA
 5973651 5973652 CBY_0906 CBY_0907     FALSE 0.045 274.000 0.000 1.000 N NA
 5973652 5973653 CBY_0907 CBY_0908   pglB TRUE 0.994 15.000 0.033 NA Y NA
 5973653 5973654 CBY_0908 CBY_0909 pglB   FALSE 0.034 292.000 0.000 NA   NA
 5973656 5973657 CBY_0053 CBY_0054   dxs TRUE 0.835 13.000 0.000 NA   NA
 5973657 5973658 CBY_0054 CBY_0055 dxs   TRUE 0.994 17.000 0.048 1.000 Y NA
 5973658 5973659 CBY_0055 CBY_0056   xseB TRUE 0.954 -10.000 0.053 1.000   NA
 5973659 5973660 CBY_0056 CBY_0057 xseB xseA TRUE 0.983 12.000 0.412 0.001   NA
 5973660 5973661 CBY_0057 CBY_0058 xseA   TRUE 0.951 -10.000 0.045 1.000 N NA
 5973661 5973662 CBY_0058 CBY_0059     TRUE 0.842 5.000 0.000 NA   NA
 5973662 5973663 CBY_0059 CBY_0060   nusB FALSE 0.026 319.000 0.000 NA   NA
 5973663 5973664 CBY_0060 CBY_0061 nusB   TRUE 0.784 123.000 0.223 NA   NA
 5973664 5973665 CBY_0061 CBY_0062     TRUE 0.773 102.000 0.108 NA   NA
 5973665 5973666 CBY_0062 CBY_0063   spoIIIAG TRUE 0.958 41.000 0.407 NA   NA
 5973666 5973667 CBY_0063 CBY_0064 spoIIIAG   TRUE 0.989 14.000 0.907 NA   NA
 5973667 5973668 CBY_0064 CBY_0065   spoIIIAE TRUE 0.989 6.000 0.918 NA   NA
 5973668 5973669 CBY_0065 CBY_0066 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.911 94.000 0.864 NA   NA
 5973669 5973670 CBY_0066 CBY_0067 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.989 12.000 0.895 NA   NA
 5973670 5973671 CBY_0067 CBY_0068 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.822 176.000 0.926 NA   NA
 5973671 5973672 CBY_0068 CBY_0069 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.984 -12.000 0.604 NA   NA
 5973672 5973673 CBY_0069 CBY_0070 spoIIIAA   TRUE 0.616 180.000 0.112 NA   NA
 5973673 4730127 CBY_0070 CBY_0071   efp TRUE 0.518 174.000 0.037 NA   NA
 4730127 4730128 CBY_0071 CBY_0072 efp   FALSE 0.396 173.000 0.002 NA   NA
 4730128 5973674 CBY_0072 CBY_0073     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973674 5973675 CBY_0073 CBY_0074     TRUE 0.814 -13.000 0.000 NA   NA
 5973675 4730130 CBY_0074 CBY_0075     TRUE 0.522 61.000 0.000 NA   NA
 4730130 5973676 CBY_0075 CBY_0076     TRUE 0.988 -12.000 1.000 NA   NA
 5973676 5973677 CBY_0076 CBY_0077     TRUE 0.988 -10.000 1.000 NA   NA
 5973677 5973678 CBY_0077 CBY_0078     TRUE 0.727 33.000 0.000 NA   NA
 5973678 5973679 CBY_0078 CBY_0079     TRUE 0.841 2.000 0.000 NA   NA
 5973679 5973680 CBY_0079 CBY_0080     TRUE 0.996 -7.000 0.135 1.000 Y NA
 5973680 5973681 CBY_0080 CBY_0081     FALSE 0.118 212.000 0.000 NA   NA
 5973681 5973682 CBY_0081 CBY_0082   dapF TRUE 0.731 61.000 0.003 NA   NA
 5973684 5973685 CBY_0084 CBY_0085     FALSE 0.147 202.000 0.000 1.000 N NA
 5973685 5973686 CBY_0085 CBY_0086     TRUE 0.930 15.000 0.008 1.000 N NA
 5973686 5973687 CBY_0086 CBY_0087   rluD TRUE 0.938 27.000 0.048 1.000 N NA
 5973687 5973688 CBY_0087 CBY_0088 rluD   FALSE 0.285 203.000 0.002 1.000 N NA
 5973688 5973689 CBY_0088 CBY_0089     TRUE 0.984 17.000 0.579 1.000   NA
 5973689 5973690 CBY_0089 CBY_0090     FALSE 0.123 271.000 0.010 NA   NA
 5973690 5973691 CBY_0090 CBY_0091     TRUE 0.952 12.000 0.032 NA   NA
 5973691 5973692 CBY_0091 CBY_0092     TRUE 0.664 92.000 0.017 NA   NA
 5973692 5973693 CBY_0092 CBY_0093     TRUE 0.964 13.000 0.070 NA   NA
 5973693 5973694 CBY_0093 CBY_0094     TRUE 0.964 12.000 0.070 NA   NA
 5973694 5973695 CBY_0094 CBY_0095     TRUE 0.930 -13.000 0.014 NA   NA
 5973695 5973696 CBY_0095 CBY_0096   ftsW FALSE 0.340 203.000 0.015 NA N NA
 5973696 5973697 CBY_0096 CBY_0097 ftsW mraY TRUE 0.916 25.000 0.014 0.003 N NA
 5973697 5973698 CBY_0097 CBY_0098 mraY   TRUE 0.984 40.000 0.024 0.003 Y NA
 5973698 5973699 CBY_0098 CBY_0099     TRUE 0.988 59.000 0.328 0.002 Y NA
 5973699 5973700 CBY_0099 CBY_0100     TRUE 0.739 282.000 0.265 1.000 Y NA
 5973700 5973701 CBY_0100 CBY_0101     FALSE 0.423 274.000 0.000 0.002 Y NA
 5973701 5973702 CBY_0101 CBY_0102     FALSE 0.425 80.000 0.000 NA   NA
 5973702 5973703 CBY_0102 CBY_0103   mraW TRUE 0.866 40.000 0.017 NA   NA
 5973703 5973704 CBY_0103 CBY_0104 mraW mraZ TRUE 0.987 13.000 0.635 NA   NA
 5973704 5973705 CBY_0104 CBY_0105 mraZ   FALSE 0.140 203.000 0.000 NA   NA
 5973705 5973706 CBY_0105 CBY_0106     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 5973706 5973707 CBY_0106 CBY_0107     TRUE 0.687 38.000 0.000 NA   NA
 5973707 5973708 CBY_0107 CBY_0108     TRUE 0.981 29.000 0.750 NA   NA
 5973708 5973709 CBY_0108 CBY_0109     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973709 5973710 CBY_0109 CBY_0110   gidA FALSE 0.131 207.000 0.000 NA   NA
 5973710 5973711 CBY_0110 CBY_0111 gidA   FALSE 0.042 276.000 0.000 NA   NA
 5973711 5973712 CBY_0111 CBY_0112     FALSE 0.264 144.000 0.000 NA   NA
 5973712 5973713 CBY_0112 CBY_0113     TRUE 0.542 58.000 0.000 NA   NA
 5973713 5973714 CBY_0113 CBY_0114     FALSE 0.230 165.000 0.000 NA   NA
 5973714 5973715 CBY_0114 CBY_0115     FALSE 0.380 92.000 0.000 NA   NA
 5973715 5973716 CBY_0115 CBY_0116     FALSE 0.411 84.000 0.000 NA   NA
 5973716 5973717 CBY_0116 CBY_0117     TRUE 0.807 21.000 0.000 1.000 N NA
 5973720 5973721 CBY_1491 CBY_1492     FALSE 0.134 206.000 0.000 NA   NA
 5973721 5973722 CBY_1492 CBY_1493     TRUE 0.752 30.000 0.000 1.000   NA
 5973722 5973723 CBY_1493 CBY_1494     TRUE 0.825 16.000 0.000 NA   NA
 5973723 4730146 CBY_1494 CBY_1495     TRUE 0.786 26.000 0.000 NA N NA
 4730146 5973724 CBY_1495 CBY_1496     FALSE 0.033 293.000 0.000 NA   NA
 5973724 5973725 CBY_1496 CBY_1497     TRUE 0.893 70.000 0.250 NA   NA
 5973725 5973726 CBY_1497 CBY_1498     TRUE 0.997 21.000 0.375 1.000 Y NA
 5973726 5973727 CBY_1498 CBY_1499     TRUE 0.973 81.000 0.111 1.000 Y NA
 5973727 5973728 CBY_1499 CBY_1500     TRUE 0.982 28.000 0.000 0.010 Y NA
 5973728 5973729 CBY_1500 CBY_1501     TRUE 0.596 50.000 0.000 1.000   NA
 5973729 5973730 CBY_1501 CBY_1502     FALSE 0.015 401.000 0.000 NA   NA
 5973732 5973733 CBY_1504 CBY_1505     FALSE 0.359 98.000 0.000 1.000   NA
 5973733 5973734 CBY_1505 CBY_1506     FALSE 0.131 208.000 0.000 1.000 N NA
 5973734 5973735 CBY_1506 CBY_1507     FALSE 0.084 233.000 0.000 1.000 N NA
 5973735 5973736 CBY_1507 CBY_1508     FALSE 0.171 191.000 0.000 1.000   NA
 5973736 5973737 CBY_1508 CBY_1509     FALSE 0.252 153.000 0.000 1.000   NA
 5973737 5973738 CBY_1509 CBY_1510     FALSE 0.275 131.000 0.000 NA   NA
 5973738 5973739 CBY_1510 CBY_1511     FALSE 0.115 214.000 0.000 NA   NA
 5973739 5973740 CBY_1511 CBY_1512     FALSE 0.029 308.000 0.000 NA   NA
 5973740 5973741 CBY_1512 CBY_1513     FALSE 0.444 76.000 0.000 NA   NA
 5973741 5973742 CBY_1513 CBY_1514   prmA FALSE 0.035 290.000 0.000 NA   NA
 5973742 5973743 CBY_1514 CBY_1515 prmA   FALSE 0.370 97.000 0.000 1.000 N NA
 5973743 5973744 CBY_1515 CBY_1516     TRUE 0.566 55.000 0.000 1.000 N NA
 5973744 5973745 CBY_1516 CBY_1517     FALSE 0.265 143.000 0.000 NA   NA
 5973745 5973746 CBY_1517 CBY_1518     TRUE 0.514 62.000 0.000 NA   NA
 5973746 5973747 CBY_1518 CBY_1519     FALSE 0.407 280.000 0.000 1.000 Y NA
 5973748 5973749 CBY_1520 CBY_1521     FALSE 0.023 333.000 0.000 NA   NA
 5973750 5973751 CBY_1522 CBY_1523     FALSE 0.016 386.000 0.000 NA   NA
 5973751 5973752 CBY_1523 CBY_1524     FALSE 0.288 123.000 0.000 0.031 N NA
 5973752 5973753 CBY_1524 CBY_1525     FALSE 0.102 220.000 0.000 1.000   NA
 5973755 5973756 CBY_1527 CBY_1528     TRUE 0.838 13.000 0.000 1.000 N NA
 5973756 5973757 CBY_1528 CBY_1529     FALSE 0.136 205.000 0.000 NA   NA
 5973757 5973758 CBY_1529 CBY_1530     FALSE 0.259 150.000 0.000 NA   NA
 5973758 5973759 CBY_1530 CBY_1531     FALSE 0.188 184.000 0.000 1.000   NA
 5973759 5973760 CBY_1531 CBY_1532     FALSE 0.254 152.000 0.000 1.000   NA
 5973762 5973763 CBY_1534 CBY_1535     TRUE 0.488 66.000 0.000 NA   NA
 5973763 5973764 CBY_1535 CBY_1536     FALSE 0.020 352.000 0.000 NA   NA
 5973764 5973765 CBY_1536 CBY_1537     FALSE 0.070 243.000 0.000 NA   NA
 5973765 5973766 CBY_1537 CBY_1538     FALSE 0.219 171.000 0.000 NA   NA
 5973766 5973767 CBY_1538 CBY_1539     FALSE 0.042 275.000 0.000 NA   NA
 5973769 5973770 CBY_1541 CBY_1542     FALSE 0.263 145.000 0.000 NA   NA
 5973772 5973773 CBY_1544 CBY_1545     FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5973774 5973775 CBY_4104 CBY_4105     FALSE 0.098 222.000 0.000 NA   NA
 5973776 5973777 CBY_4106 CBY_4107     TRUE 0.991 70.000 1.000 0.032 Y NA
 5973777 5973778 CBY_4107 CBY_4108     TRUE 0.998 19.000 0.800 0.032 Y NA
 5973778 5973779 CBY_4108 CBY_4109     FALSE 0.028 308.000 0.000 0.090 N NA
 5973780 5973781 CBY_4110 CBY_4111     TRUE 0.988 3.000 0.748 NA   NA
 5973781 5973782 CBY_4111 CBY_4112     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973783 5973784 CBY_4113 CBY_4114     FALSE 0.036 288.000 0.000 NA   NA
 5973784 5973785 CBY_4114 CBY_4115     FALSE 0.103 220.000 0.000 NA   NA
 5973785 5973786 CBY_4115 CBY_4116     TRUE 0.974 17.000 0.188 NA   NA
 5973786 5973787 CBY_4116 CBY_4117   speD FALSE 0.009 552.000 0.000 NA   NA
 5973787 5973788 CBY_4117 CBY_4118 speD   TRUE 0.996 13.000 0.091 1.000 Y NA
 5973788 5973789 CBY_4118 CBY_4119   speE TRUE 0.979 83.000 0.237 1.000 Y NA
 5973789 5973790 CBY_4119 CBY_4120 speE lys1 TRUE 0.976 59.000 0.036 1.000 Y NA
 5973790 5973791 CBY_4120 CBY_4121 lys1 nspC TRUE 0.973 120.000 0.444 1.000 Y NA
 5973791 5973792 CBY_4121 CBY_4122 nspC speB TRUE 0.982 48.000 0.035 1.000 Y NA
 5973792 5973793 CBY_4122 CBY_4123 speB   FALSE 0.262 143.000 0.000 1.000   NA
 5973793 5973794 CBY_4123 CBY_4124     TRUE 0.781 24.000 0.000 0.030   NA
 5973794 5973795 CBY_4124 CBY_4125     FALSE 0.268 145.000 0.000 1.000 N NA
 5973795 5973796 CBY_4125 CBY_4126     FALSE 0.068 246.000 0.000 1.000 N NA
 5973796 5973797 CBY_4126 CBY_4127     TRUE 0.963 166.000 0.463 0.032 Y NA
 5973797 5973798 CBY_4127 CBY_4128     TRUE 0.998 -7.000 0.926 0.032 Y NA
 5973798 5973799 CBY_4128 CBY_4129     TRUE 0.926 169.000 0.074 1.000 Y NA
 5973799 5973800 CBY_4129 CBY_4130     FALSE 0.265 148.000 0.000 1.000 N NA
 5973801 5973802 CBY_4131 CBY_4132     TRUE 0.994 32.000 0.222 0.020 Y NA
 5973803 5973804 CBY_4133 CBY_4134     TRUE 0.962 48.000 0.000 0.005 Y NA
 5973805 5973806 CBY_4135 CBY_4136     FALSE 0.367 96.000 0.000 NA   NA
 5973807 5973808 CBY_4137 CBY_4138     FALSE 0.235 162.000 0.000 NA   NA
 5973810 5973811 CBY_0176 CBY_0177     FALSE 0.260 149.000 0.000 NA   NA
 5973812 5973813 CBY_1751 CBY_1752     FALSE 0.243 158.000 0.000 NA   NA
 5973813 5973814 CBY_1752 CBY_1753     FALSE 0.172 191.000 0.000 NA   NA
 5973814 5973815 CBY_1753 CBY_1754     FALSE 0.009 572.000 0.000 NA   NA
 5973817 5973818 CBY_1756 CBY_1757     FALSE 0.013 430.000 0.000 NA   NA
 5973818 5973819 CBY_1757 CBY_1758     FALSE 0.408 85.000 0.000 NA   NA
 5973819 5973820 CBY_1758 CBY_1759     FALSE 0.015 396.000 0.000 NA   NA
 5973822 5973823 CBY_1761 CBY_1762     FALSE 0.014 411.000 0.000 1.000   NA
 5973823 5973824 CBY_1762 CBY_1763     FALSE 0.359 294.000 0.000 NA Y NA
 5973824 5973825 CBY_1763 CBY_1764     FALSE 0.027 320.000 0.000 NA N NA
 5973827 5973828 CBY_1765 CBY_1767     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5973828 5973829 CBY_1767 CBY_1768     FALSE 0.341 105.000 0.000 NA   NA
 5973829 5973830 CBY_1768 CBY_1769     TRUE 0.657 41.000 0.000 NA   NA
 5973830 5973831 CBY_1769 CBY_1770     FALSE 0.008 667.000 0.000 NA   NA
 5973831 5973832 CBY_1770 CBY_1771     FALSE 0.014 412.000 0.000 1.000 N NA
 5973832 5973833 CBY_1771 CBY_1772     FALSE 0.012 453.000 0.000 NA N NA
 5973833 5973834 CBY_1772 CBY_1773     FALSE 0.018 373.000 0.000 NA N NA
 5973834 5973835 CBY_1773 CBY_1774   folP TRUE 0.973 58.000 0.019 0.003 Y NA
 5973835 5973836 CBY_1774 CBY_1775 folP   TRUE 0.870 107.000 0.533 1.000   NA
 5973836 5973837 CBY_1775 CBY_1776   dapA FALSE 0.021 350.000 0.000 1.000   NA
 5973839 5973840 CBY_1778 CBY_1779     FALSE 0.016 390.000 0.000 1.000 N NA
 5973840 5973841 CBY_1779 CBY_1780     TRUE 0.998 -13.000 0.640 1.000 Y NA
 5973841 5973842 CBY_1780 CBY_1781     TRUE 0.625 282.000 0.066 0.032 Y NA
 5973842 5973843 CBY_1781 CBY_1782     FALSE 0.009 548.000 0.000 1.000   NA
 5973843 5973844 CBY_1782 CBY_1783     TRUE 0.847 124.000 0.583 0.012   NA
 5973844 5973845 CBY_1783 CBY_1784     TRUE 0.963 28.000 0.182 NA   NA
 5973845 5973846 CBY_1784 CBY_1785   lepB TRUE 0.674 176.000 0.182 NA   NA
 5973846 5973847 CBY_1785 CBY_1786 lepB lepB TRUE 0.886 109.000 0.000 0.001 Y NA
 5973847 5973848 CBY_1786 CBY_1787 lepB lepB TRUE 0.816 172.000 0.000 0.001 Y NA
 5973848 5973849 CBY_1787 CBY_1788 lepB lysA FALSE 0.011 478.000 0.000 1.000 N NA
 5973849 5973850 CBY_1788 CBY_1789 lysA   FALSE 0.008 668.000 0.000 1.000   NA
 5973850 5973851 CBY_1789 CBY_1790     FALSE 0.015 401.000 0.000 NA   NA
 5973852 5973853 CBY_1791 CBY_1792     TRUE 0.825 -7.000 0.000 NA   NA
 5973854 5973855 CBY_1793 CBY_1794     FALSE 0.232 164.000 0.000 NA   NA
 5973857 5973858 CBY_1796 CBY_1797     TRUE 0.984 53.000 0.088 0.001 Y NA
 5973858 5973859 CBY_1797 CBY_1798     TRUE 0.928 55.000 0.287 NA   NA
 5973859 5973860 CBY_1798 CBY_1799     FALSE 0.042 276.000 0.000 NA   NA
 5973860 5973861 CBY_1799 CBY_1800     FALSE 0.156 478.000 0.000 1.000 Y NA
 5973861 5973862 CBY_1800 CBY_1801     TRUE 0.547 57.000 0.000 NA   NA
 5973862 5973863 CBY_1801 CBY_1802     TRUE 0.832 -3.000 0.000 NA   NA
 5973863 5973864 CBY_1802 CBY_1803     FALSE 0.408 85.000 0.000 NA   NA
 5973864 5973865 CBY_1803 CBY_1804     FALSE 0.389 90.000 0.000 NA   NA
 5973865 5973866 CBY_1804 CBY_1805     FALSE 0.047 271.000 0.000 NA   NA
 5973866 5973867 CBY_1805 CBY_1806     TRUE 0.530 60.000 0.000 NA   NA
 5973867 5973868 CBY_1806 CBY_1807     FALSE 0.028 316.000 0.000 NA N NA
 5973868 5973869 CBY_1807 CBY_1808     TRUE 0.956 29.000 0.125 NA   NA
 5973869 5973870 CBY_1808 CBY_1809     TRUE 0.817 51.000 0.015 NA   NA
 5973870 5973871 CBY_1809 CBY_1810     TRUE 0.824 72.000 0.077 NA   NA
 5973871 5973872 CBY_1810 CBY_1811     TRUE 0.733 110.000 0.083 NA   NA
 5973872 5973873 CBY_1811 CBY_1812     TRUE 0.986 3.000 0.576 0.008 N NA
 5973873 5973874 CBY_1812 CBY_1813     FALSE 0.191 183.000 0.000 1.000   NA
 5973874 5973875 CBY_1813 CBY_1814     TRUE 0.702 75.000 0.011 NA   NA
 5973875 5973876 CBY_1814 CBY_1815     FALSE 0.372 95.000 0.000 NA   NA
 5973876 5973877 CBY_1815 CBY_1816     TRUE 0.981 32.000 1.000 1.000   NA
 5973877 5973878 CBY_1816 CBY_1817     FALSE 0.282 301.000 0.444 1.000   NA
 5973878 5973879 CBY_1817 CBY_1818     TRUE 0.901 210.000 0.233 0.003 Y NA
 5973879 5973880 CBY_1818 CBY_1819     TRUE 0.967 -7.000 0.100 NA   NA
 5973880 5973881 CBY_1819 CBY_1820     FALSE 0.178 189.000 0.000 NA   NA
 5973881 5973882 CBY_1820 CBY_1821     TRUE 0.998 -7.000 0.816 1.000 Y NA
 5973882 5973883 CBY_1821 CBY_1822     FALSE 0.241 159.000 0.000 NA   NA
 5973883 5973884 CBY_1822 CBY_1823     FALSE 0.051 265.000 0.000 NA   NA
 5973884 5973885 CBY_1823 CBY_1824   rumA FALSE 0.031 304.000 0.000 NA N NA
 5973885 5973886 CBY_1824 CBY_1825 rumA pyk FALSE 0.009 551.000 0.000 1.000 N NA
 5973886 5973887 CBY_1825 CBY_1826 pyk pfkA TRUE 0.788 212.000 0.011 0.004 Y NA
 5973887 5973888 CBY_1826 CBY_1827 pfkA   FALSE 0.035 532.000 0.029 1.000   NA
 5973888 5973889 CBY_1827 CBY_1828     FALSE 0.321 110.000 0.000 1.000   NA
 5973889 5973890 CBY_1828 CBY_1829     FALSE 0.009 541.000 0.000 1.000   NA
 5973890 5973891 CBY_1829 CBY_1830     FALSE 0.064 249.000 0.000 NA   NA
 5973891 5973892 CBY_1830 CBY_1831     TRUE 0.811 -16.000 0.000 NA   NA
 5973894 5973895 CBY_1833 CBY_1834     FALSE 0.441 170.000 0.009 NA   NA
 5973895 5973896 CBY_1834 CBY_1835     TRUE 0.980 23.000 0.470 NA   NA
 5973896 5973897 CBY_1835 CBY_1836     TRUE 0.979 -3.000 0.259 NA   NA
 5973897 5973898 CBY_1836 CBY_1837   murB FALSE 0.134 315.000 0.080 NA   NA
 5973898 5973899 CBY_1837 CBY_1838 murB uvrC FALSE 0.239 216.000 0.003 1.000 N NA
 5973899 5973900 CBY_1838 CBY_1839 uvrC   FALSE 0.315 199.000 0.005 1.000 N NA
 5973900 5973901 CBY_1839 CBY_1840     TRUE 0.981 2.000 0.285 1.000 N NA
 5973901 5973902 CBY_1840 CBY_1841     FALSE 0.468 202.000 0.070 NA   NA
 5973902 5973903 CBY_1841 CBY_1842   uvrA TRUE 0.562 103.000 0.002 NA   NA
 5973903 5973904 CBY_1842 CBY_1843 uvrA uvrB TRUE 0.942 166.000 0.154 0.001 Y NA
 5973904 5973905 CBY_1843 CBY_1844 uvrB   FALSE 0.276 215.000 0.013 NA   NA
 5973905 5973906 CBY_1844 CBY_1845     TRUE 0.952 21.000 0.060 NA   NA
 5973906 5973907 CBY_1845 CBY_1846     TRUE 0.528 144.000 0.015 1.000 N NA
 5973907 5973908 CBY_1846 CBY_1847   ftsE TRUE 0.997 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 5973908 5973909 CBY_1847 CBY_1848 ftsE   FALSE 0.284 210.000 0.010 NA   NA
 5973909 5973910 CBY_1848 CBY_1849     FALSE 0.125 365.000 0.167 NA   NA
 5973910 5973911 CBY_1849 CBY_1850     TRUE 0.997 0.000 0.180 0.002 Y NA
 5973911 5973912 CBY_1850 CBY_1851     FALSE 0.432 187.000 0.019 1.000 N NA
 5973912 5973913 CBY_1851 CBY_1852     TRUE 0.946 10.000 0.019 NA   NA
 5973913 5973914 CBY_1852 CBY_1853     FALSE 0.035 290.000 0.000 NA   NA
 5973914 5973915 CBY_1853 CBY_1854     TRUE 0.836 63.000 0.064 NA   NA
 5973915 5973916 CBY_1854 CBY_1855   acpS TRUE 0.945 -3.000 0.020 NA N NA
 5973916 5973917 CBY_1855 CBY_1856 acpS   TRUE 0.750 70.000 0.020 NA   NA
 5973917 5973918 CBY_1856 CBY_1857     FALSE 0.010 536.000 0.000 NA   NA
 5973918 5973919 CBY_1857 CBY_1858     TRUE 0.581 196.000 0.150 1.000   NA
 5973919 5973920 CBY_1858 CBY_1859     FALSE 0.136 205.000 0.000 NA   NA
 5973920 5973921 CBY_1859 CBY_1860     TRUE 0.648 42.000 0.000 NA   NA
 5973921 5973922 CBY_1860 CBY_1861     TRUE 0.819 -10.000 0.000 NA   NA
 5973922 5973923 CBY_1861 CBY_1862     TRUE 0.713 207.000 0.000 NA Y NA
 5973923 5973924 CBY_1862 CBY_1863     FALSE 0.446 75.000 0.000 1.000   NA
 5973924 5973925 CBY_1863 CBY_1864     TRUE 0.745 66.000 0.015 1.000   NA
 5973925 5973926 CBY_1864 CBY_1865     FALSE 0.265 149.000 0.000 1.000 N NA
 5973926 5973927 CBY_1865 CBY_1866     TRUE 0.564 124.000 0.016 NA   NA
 5973929 5973930 CBY_0283 CBY_0284     TRUE 0.832 14.000 0.000 NA   NA
 5973930 5973931 CBY_0284 CBY_0285     TRUE 0.945 17.000 0.031 1.000   NA
 5973933 5973934 CBY_0287 CBY_0288   gshAB FALSE 0.070 244.000 0.000 1.000 N NA
 5973934 5973935 CBY_0288 CBY_0289 gshAB   FALSE 0.281 128.000 0.000 NA   NA
 5973936 5973937 CBY_2456 CBY_2457 cutC   FALSE 0.051 265.000 0.000 NA   NA
 5973937 5973938 CBY_2457 CBY_2458     TRUE 0.925 29.000 0.033 1.000   NA
 5973940 5973941 CBY_2460 CBY_2461     TRUE 0.931 -10.000 0.011 NA N NA
 5973941 5973942 CBY_2461 CBY_2462     FALSE 0.011 495.000 0.000 NA   NA
 5973942 5973943 CBY_2462 CBY_2463     TRUE 0.805 -27.000 0.000 NA   NA
 5973943 5973944 CBY_2463 CBY_2464     TRUE 0.639 43.000 0.000 NA   NA
 5973944 5973945 CBY_2464 CBY_2465     TRUE 0.988 0.000 0.000 0.031 Y NA
 5973945 5973946 CBY_2465 CBY_2466     TRUE 0.991 69.000 1.000 0.031 Y NA
 5973947 5973948 CBY_2467 CBY_2468     TRUE 0.817 -7.000 0.000 0.019   NA
 5973948 5973949 CBY_2468 CBY_2469     FALSE 0.277 129.000 0.000 1.000   NA
 5973950 5973951 CBY_2470 CBY_2471 gltA   TRUE 0.988 3.000 0.667 0.029 N NA
 5973951 5973952 CBY_2471 CBY_2472     TRUE 0.582 153.000 0.039 1.000 N NA
 5973952 5973953 CBY_2472 CBY_2473     FALSE 0.073 242.000 0.000 1.000 N NA
 5973953 5973954 CBY_2473 CBY_2474     FALSE 0.009 542.000 0.000 0.012 N NA
 5973954 5973955 CBY_2474 CBY_2475     FALSE 0.007 826.000 0.000 0.022   NA
 5973955 5973956 CBY_2475 CBY_2476     TRUE 0.631 42.000 0.000 0.001   NA
 5973956 5973957 CBY_2476 CBY_2477     TRUE 0.793 23.000 0.000 NA   NA
 5973957 5973958 CBY_2477 CBY_2478     FALSE 0.008 664.000 0.000 NA   NA
 5973958 5973959 CBY_2478 CBY_2479     TRUE 0.727 33.000 0.000 NA   NA
 5973959 5973960 CBY_2479 CBY_2480     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 5973960 5973961 CBY_2480 CBY_2481     FALSE 0.095 223.000 0.000 1.000   NA
 5973961 5973962 CBY_2481 CBY_2482     FALSE 0.108 217.000 0.000 NA   NA
 5973962 5973963 CBY_2482 CBY_2483     FALSE 0.016 383.000 0.000 NA   NA
 5973963 5973964 CBY_2483 CBY_2484     FALSE 0.010 530.000 0.000 NA   NA
 5973964 5973965 CBY_2484 CBY_2485     FALSE 0.007 1761.000 0.000 NA   NA
 5973965 5973966 CBY_2485 CBY_2486     FALSE 0.007 1261.000 0.000 NA   NA
 5973968 5973969 CBY_2488 CBY_2489     TRUE 0.621 46.000 0.000 NA   NA
 5973971 5973972 CBY_4322 CBY_2491     FALSE 0.258 151.000 0.000 NA   NA
 5973972 5973973 CBY_2491 CBY_2492     TRUE 0.963 90.000 0.067 0.071 Y NA
 5973973 5973974 CBY_2492 CBY_2493     TRUE 0.995 12.000 0.067 1.000 Y NA
 5973974 5973975 CBY_2493 CBY_2494     TRUE 0.725 78.000 0.022 1.000   NA
 5973975 5973976 CBY_2494 CBY_2495   gltA FALSE 0.099 221.000 0.000 1.000   NA
 5973976 5973977 CBY_2495 CBY_2496 gltA   TRUE 0.987 0.000 0.667 0.029 N NA
 5973977 5973978 CBY_2496 CBY_2497     FALSE 0.201 179.000 0.000 NA   NA
 5973978 5973979 CBY_2497 CBY_2498     FALSE 0.066 246.000 0.000 NA   NA
 5973981 5973982 CBY_2500 CBY_2501     FALSE 0.055 258.000 0.000 NA   NA
 5973982 5973983 CBY_2501 CBY_2502   aepY TRUE 0.939 42.000 0.200 1.000   NA
 5973983 5973984 CBY_2502 CBY_2503 aepY   TRUE 0.918 71.000 0.486 1.000   NA
 5973984 5973985 CBY_2503 CBY_2504     TRUE 0.905 43.000 0.077 0.003 N NA
 5973985 5973986 CBY_2504 CBY_2505     FALSE 0.053 262.000 0.000 NA   NA
 5973986 5973987 CBY_2505 CBY_2506     FALSE 0.025 326.000 0.000 NA   NA
 5973987 5973988 CBY_2506 CBY_2507     FALSE 0.265 142.000 0.000 NA   NA
 5973989 5973990 CBY_4367 CBY_3493 rrs   FALSE 0.008 719.000 0.000 NA   NA
 5973990 5973991 CBY_3493 CBY_3494     TRUE 0.841 9.000 0.000 NA   NA
 5973991 5973992 CBY_3494 CBY_3495     FALSE 0.233 163.000 0.000 NA   NA
 5973992 5973993 CBY_3495 CBY_3496     FALSE 0.088 229.000 0.000 1.000 N NA
 5973993 5973994 CBY_3496 CBY_3497     FALSE 0.040 283.000 0.000 1.000 N NA
 5973994 5973995 CBY_3497 CBY_3498   malQ TRUE 0.995 0.000 0.058 0.030 Y NA
 5973995 5973996 CBY_3498 CBY_3499 malQ   TRUE 0.948 32.000 0.111 1.000 N NA
 5973996 5973997 CBY_3499 CBY_3500     FALSE 0.016 387.000 0.000 NA   NA
 5973997 5973998 CBY_3500 CBY_3501     TRUE 0.909 50.000 0.122 NA   NA
 5973998 4730305 CBY_3501 CBY_3502     FALSE 0.023 331.000 0.000 NA   NA
 4730305 5973999 CBY_3502 CBY_4368     FALSE 0.036 288.000 0.000 NA   NA
 5973999 5974000 CBY_4368 CBY_3503     FALSE 0.389 90.000 0.000 NA   NA
 5974000 5974001 CBY_3503 CBY_3504     TRUE 0.728 63.000 0.005 NA   NA
 5974001 5974002 CBY_3504 CBY_3505     TRUE 0.980 13.000 0.283 NA   NA
 5974002 5974003 CBY_3505 CBY_3506     TRUE 0.817 109.000 0.239 1.000   NA
 5974003 5974004 CBY_3506 CBY_3507     TRUE 0.951 37.000 0.209 1.000 N NA
 5974004 5974005 CBY_3507 CBY_3508     FALSE 0.400 210.000 0.056 1.000 N NA
 5974007 5974008 CBY_3510 CBY_3511 ppdK   TRUE 0.621 108.000 0.019 1.000   NA
 5974008 5974009 CBY_3511 CBY_3512     TRUE 0.690 185.000 0.273 NA   NA
 5974009 5974010 CBY_3512 CBY_3513   recO TRUE 0.934 7.000 0.007 NA   NA
 5974010 5974011 CBY_3513 CBY_3514 recO era TRUE 0.971 4.000 0.108 1.000   NA
 5974011 5974012 CBY_3514 CBY_3515 era   FALSE 0.048 366.000 0.007 1.000   NA
 5974012 5974013 CBY_3515 CBY_3516     TRUE 0.678 80.000 0.010 NA   NA
 5974013 5974014 CBY_3516 CBY_3517     TRUE 0.975 -3.000 0.182 NA   NA
 5974014 5974015 CBY_3517 CBY_3518   yqfD TRUE 0.918 31.000 0.032 NA   NA
 5974015 5974016 CBY_3518 CBY_3519 yqfD yqfC TRUE 0.988 -3.000 0.851 NA   NA
 5974016 5974017 CBY_3519 CBY_3520 yqfC   FALSE 0.414 196.000 0.029 NA   NA
 5974017 5974018 CBY_3520 CBY_3521   rpsU TRUE 0.950 33.000 0.150 0.018   NA
 5974018 5974019 CBY_3521 CBY_3522 rpsU   TRUE 0.659 136.000 0.071 1.000   NA
 5974019 5974020 CBY_3522 CBY_3523     TRUE 0.579 162.000 0.051 0.030 N NA
 5974020 5974021 CBY_3523 CBY_3524     TRUE 0.976 5.000 0.163 NA   NA
 5974021 5974022 CBY_3524 CBY_3525   prmA TRUE 0.979 9.000 0.227 NA   NA
 5974022 5974023 CBY_3525 CBY_3526 prmA trmB FALSE 0.401 173.000 0.003 1.000