MicrobesOnline Operon Predictions for Brucella ovis ATCC 25840

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3753952 3753953 BOV_A0001 BOV_A0002 repC   FALSE 0.007 748.000 0.000 NA   NA
 3753954 3753955 BOV_A0003 BOV_A0004 iunH   FALSE 0.273 23.000 0.000 1.000   NA
 3753955 3753956 BOV_A0004 BOV_A0005     TRUE 0.990 -3.000 0.667 0.073   NA
 3753956 3753957 BOV_A0005 BOV_A0006     TRUE 0.927 62.000 0.667 1.000   NA
 3753957 3753958 BOV_A0006 BOV_A0007     TRUE 0.981 3.000 0.500 1.000   NA
 3753960 3753961 BOV_A0008 BOV_A0010   entA TRUE 0.913 -25.000 0.000 0.001 Y NA
 3753961 3753962 BOV_A0010 BOV_A0011 entA entB TRUE 0.924 0.000 0.024 1.000 Y NA
 3753962 3753963 BOV_A0011 BOV_A0012 entB entE TRUE 0.835 52.000 0.138 1.000 Y NA
 3753963 3753964 BOV_A0012 BOV_A0013 entE entC TRUE 0.970 -22.000 0.276 1.000 Y NA
 3753966 3753967 BOV_A0015 BOV_A0016     TRUE 0.993 -3.000 0.920 0.059   NA
 3753967 3753968 BOV_A0016 BOV_A0017     TRUE 0.728 61.000 0.186 NA   NA
 3753969 3753970 BOV_A0018 BOV_A0019     TRUE 0.979 -10.000 0.812 NA   NA
 3753972 3753973 BOV_A0021 BOV_A0022     FALSE 0.109 42.000 0.000 NA   NA
 3753973 3753974 BOV_A0022 BOV_A0023     TRUE 0.443 4.000 0.000 NA   NA
 3753974 3753975 BOV_A0023 BOV_A0024     TRUE 0.993 0.000 0.647 1.000 Y NA
 3753975 3753976 BOV_A0024 BOV_A0025     TRUE 0.976 0.000 0.086 0.034 Y NA
 3753976 3753977 BOV_A0025 BOV_A0026     TRUE 0.543 52.000 0.000 1.000 Y NA
 3753977 3753978 BOV_A0026 BOV_A0027     TRUE 0.692 4.000 0.000 1.000 N NA
 3753978 3753979 BOV_A0027 BOV_A0028     TRUE 0.805 18.000 0.000 0.075 Y NA
 3753979 3753980 BOV_A0028 BOV_A0029     TRUE 0.525 110.000 0.000 0.075 N NA
 3753980 3753981 BOV_A0029 BOV_A0030     FALSE 0.196 19.000 0.000 NA   NA
 3753981 3753982 BOV_A0030 BOV_A0031     FALSE 0.158 101.000 0.000 NA   NA
 3753982 3753983 BOV_A0031 BOV_A0032     FALSE 0.031 280.000 0.000 NA   NA
 3753983 3753984 BOV_A0032 BOV_A0033   mgtA FALSE 0.017 353.000 0.000 NA   NA
 3753984 3753985 BOV_A0033 BOV_A0034 mgtA   FALSE 0.008 566.000 0.000 NA   NA
 3753985 3753986 BOV_A0034 BOV_A0035     TRUE 0.467 2.000 0.000 NA   NA
 3753988 3753989 BOV_A0037 BOV_A0038     TRUE 0.994 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 3753990 3753991 BOV_A0039 BOV_A0040     FALSE 0.138 113.000 0.000 NA   NA
 3753991 3753992 BOV_A0040 BOV_A0041     FALSE 0.132 116.000 0.000 NA   NA
 3753993 3753994 BOV_A0042 BOV_A0043     FALSE 0.218 162.000 0.000 1.000 N NA
 3753995 3753996 BOV_A0044 BOV_A0045     FALSE 0.017 350.000 0.000 NA   NA
 3753997 3753998 BOV_A0046 BOV_A0047     FALSE 0.020 327.000 0.000 NA   NA
 3754000 3754001 BOV_A0049 BOV_A0050 gltB gltD TRUE 0.963 82.000 0.236 0.001 Y NA
 3754002 3754003 BOV_A0051 BOV_A0052     FALSE 0.102 218.000 0.000 1.000   NA
 3754003 3754004 BOV_A0052 BOV_A0053     FALSE 0.076 250.000 0.000 1.000   NA
 3754004 3754005 BOV_A0053 BOV_A0054   virB11 FALSE 0.243 146.000 0.000 1.000 N NA
 3754005 3754006 BOV_A0054 BOV_A0055 virB11   TRUE 0.989 -19.000 0.750 1.000 Y NA
 3754006 3754007 BOV_A0055 BOV_A0056   virB9 TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA Y NA
 3754007 3754008 BOV_A0056 BOV_A0057 virB9   TRUE 0.992 -3.000 0.750 NA Y NA
 3754008 3754009 BOV_A0057 BOV_A0058     FALSE 0.121 340.000 0.000 NA Y NA
 3754009 3754010 BOV_A0058 BOV_A0059   virB5 FALSE 0.430 184.000 0.091 NA   NA
 3754010 3754011 BOV_A0059 BOV_A0060 virB5   TRUE 0.943 5.000 0.222 NA   NA
 3754011 3754012 BOV_A0060 BOV_A0061     TRUE 0.988 0.000 0.444 NA Y NA
 3754012 3754013 BOV_A0061 BOV_A0062     TRUE 0.980 -22.000 1.000 NA   NA
 3754013 3754014 BOV_A0062 BOV_A0063     FALSE 0.011 436.000 0.000 NA   NA
 3754014 3754015 BOV_A0063 BOV_A0064     FALSE 0.009 504.000 0.000 NA   NA
 3754016 3754017 BOV_A0065 BOV_A0066   galU FALSE 0.022 315.000 0.000 NA   NA
 3754020 3754021 BOV_A0069 BOV_A0070     TRUE 0.936 21.000 0.313 NA Y NA
 3754021 3754022 BOV_A0070 BOV_A0071   hemH TRUE 0.588 133.000 0.092 NA N NA
 3754022 3754023 BOV_A0071 BOV_A0072 hemH omp10 FALSE 0.319 138.000 0.033 NA   NA
 3754023 3754024 BOV_A0072 BOV_A0073 omp10   TRUE 0.823 142.000 0.385 NA   NA
 3754024 3754025 BOV_A0073 BOV_A0074     FALSE 0.392 112.000 0.013 1.000 N NA
 3754025 3754026 BOV_A0074 BOV_A0075   pabB TRUE 0.879 54.000 0.219 1.000 Y NA
 3754026 3754027 BOV_A0075 BOV_A0076 pabB pepF TRUE 0.879 10.000 0.027 1.000 Y NA
 3754028 3754029 BOV_A0077 BOV_A0078     FALSE 0.032 275.000 0.000 NA   NA
 3754030 3754031 BOV_A0079 BOV_A0080 eda   FALSE 0.161 159.000 0.013 NA   NA
 3754032 3754033 BOV_A0081 BOV_A0082   modA FALSE 0.030 281.000 0.000 NA   NA
 3754033 3754034 BOV_A0082 BOV_A0083 modA modB TRUE 0.994 11.000 0.627 0.001 Y NA
 3754034 3754035 BOV_A0083 BOV_A0084 modB modC FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754035 3754036 BOV_A0084 BOV_A0085 modC   FALSE 0.160 70.000 0.000 NA   NA
 3754036 3754037 BOV_A0085 BOV_A0086     FALSE 0.337 -13.000 0.000 NA   NA
 3754037 3754038 BOV_A0086 BOV_A0087     FALSE 0.165 92.000 0.000 NA   NA
 3754039 3754040 BOV_A0088 BOV_A0089     TRUE 0.831 21.000 0.226 NA   NA
 3754040 3754041 BOV_A0089 BOV_A0090     FALSE 0.107 40.000 0.000 NA   NA
 3754041 3754042 BOV_A0090 BOV_A0091     TRUE 0.443 4.000 0.000 NA   NA
 3754044 3754045 BOV_A0093 BOV_A0094     FALSE 0.119 126.000 0.000 NA   NA
 3754045 3754046 BOV_A0094 BOV_A0095     TRUE 0.899 -3.000 0.109 NA   NA
 3754046 3754047 BOV_A0095 BOV_A0096     TRUE 0.471 1.000 0.000 NA   NA
 3754048 3754049 BOV_A0097 BOV_A0098     FALSE 0.373 8.000 0.000 NA   NA
 3754049 3754050 BOV_A0098 BOV_A0100     FALSE 0.266 14.000 0.000 NA   NA
 3754053 3754054 BOV_A0102 BOV_A0103     TRUE 0.987 6.000 0.461 1.000 Y NA
 3754054 3754055 BOV_A0103 BOV_A0104     TRUE 0.991 -3.000 0.774 0.072   NA
 3754055 3754056 BOV_A0104 BOV_A0105     TRUE 0.833 173.000 0.301 0.072   NA
 3754058 3754059 BOV_A0107 BOV_A0108     TRUE 0.941 93.000 0.586 1.000 N NA
 3754060 3754061 BOV_A0109 BOV_A0110     FALSE 0.420 247.000 0.000 0.065 Y NA
 3754062 3754063 BOV_A0111 BOV_A0112   flhB TRUE 0.914 111.000 0.595 NA   NA
 3754063 3754064 BOV_A0112 BOV_A0113 flhB fliG TRUE 0.976 17.000 0.571 1.000 Y NA
 3754064 3754065 BOV_A0113 BOV_A0114 fliG   TRUE 0.992 17.000 0.875 0.002 Y NA
 3754065 3754066 BOV_A0114 BOV_A0115     TRUE 0.894 -3.000 0.103 NA   NA
 3754066 3754067 BOV_A0115 BOV_A0116     FALSE 0.321 -19.000 0.000 NA   NA
 3754067 3754068 BOV_A0116 BOV_A0117   motA TRUE 0.467 2.000 0.000 NA   NA
 3754069 3754070 BOV_A0118 BOV_A0119   flgF TRUE 0.963 0.000 0.279 NA   NA
 3754070 3754071 BOV_A0119 BOV_A0120 flgF fliI TRUE 0.990 -3.000 0.529 1.000 Y NA
 3754071 3754072 BOV_A0120 BOV_A0121 fliI   TRUE 0.849 84.000 0.275 NA   NA
 3754074 3754075 BOV_A0123 BOV_A0124     FALSE 0.007 747.000 0.000 NA   NA
 3754075 3754076 BOV_A0124 BOV_A0125     TRUE 0.954 -16.000 0.412 NA   NA
 3754076 3754077 BOV_A0125 BOV_A0126     TRUE 0.635 0.000 0.000 1.000   NA
 3754077 3754078 BOV_A0126 BOV_A0127     FALSE 0.161 201.000 0.000 1.000 N NA
 3754079 3754080 BOV_A0128 BOV_A0129     TRUE 0.609 26.000 0.000 1.000 Y NA
 3754080 3754081 BOV_A0129 BOV_A0130     TRUE 0.818 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 3754081 3754082 BOV_A0130 BOV_A0131     TRUE 0.892 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3754082 3754083 BOV_A0131 BOV_A0132     TRUE 0.878 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3754083 3754084 BOV_A0132 BOV_A0133     TRUE 0.474 0.000 0.000 NA   NA
 3754084 3754085 BOV_A0133 BOV_A0134     TRUE 0.467 2.000 0.000 NA   NA
 3754086 3754087 BOV_A0135 BOV_A0136 flgB flgC TRUE 0.994 3.000 0.804 1.000 Y NA
 3754087 3754088 BOV_A0136 BOV_A0137 flgC fliE TRUE 0.984 0.000 0.115 0.003 Y NA
 3754088 3754089 BOV_A0137 BOV_A0138 fliE flgG TRUE 0.986 86.000 0.771 0.004 Y NA
 3754089 3754090 BOV_A0138 BOV_A0139 flgG flgA TRUE 0.923 12.000 0.252 NA   NA
 3754090 3754091 BOV_A0139 BOV_A0140 flgA flgI FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754091 3754092 BOV_A0140 BOV_A0141 flgI   FALSE 0.248 15.000 0.000 NA   NA
 3754092 3754093 BOV_A0141 BOV_A0142   flgH TRUE 0.980 -3.000 0.592 NA   NA
 3754093 3754094 BOV_A0142 BOV_A0143 flgH   TRUE 0.982 13.000 0.576 0.007   NA
 3754094 3754095 BOV_A0143 BOV_A0144   fliP TRUE 0.983 -3.000 0.605 1.000   NA
 3754095 3754096 BOV_A0144 BOV_A0145 fliP   FALSE 0.008 602.000 0.000 NA   NA
 3754098 3754099 BOV_A0147 BOV_A0148     FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 3754099 3754100 BOV_A0148 BOV_A0149     TRUE 0.908 -6.000 0.167 NA   NA
 3754100 3754101 BOV_A0149 BOV_A0150     FALSE 0.108 33.000 0.000 NA   NA
 3754101 3754102 BOV_A0150 BOV_A0151     FALSE 0.037 265.000 0.000 NA   NA
 3754102 3754103 BOV_A0151 BOV_A0152     FALSE 0.011 1307.000 0.000 1.000   NA
 3754103 3754104 BOV_A0152 BOV_A0153     FALSE 0.278 88.000 0.000 1.000   NA
 3754107 3754108 BOV_A0156 BOV_A0157     TRUE 0.870 122.000 0.100 0.065 Y NA
 3754108 3754109 BOV_A0157 BOV_A0158     FALSE 0.355 95.000 0.000 1.000 N NA
 3754109 3754110 BOV_A0158 BOV_A0159     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754110 3754111 BOV_A0159 BOV_A0160     FALSE 0.082 177.000 0.000 NA   NA
 3754112 3754113 BOV_A0161 BOV_A0162 glcD   FALSE 0.152 67.000 0.000 NA   NA
 3754113 3754114 BOV_A0162 BOV_A0163     FALSE 0.258 -117.000 0.000 NA   NA
 3754115 3754116 BOV_A0164 BOV_A0165     FALSE 0.127 30.000 0.000 NA   NA
 3754117 3754118 BOV_A0166 BOV_A0167     FALSE 0.328 11.000 0.000 NA   NA
 3754118 3754119 BOV_A0167 BOV_A0168     FALSE 0.196 19.000 0.000 NA   NA
 3754119 3754120 BOV_A0168 BOV_A0169   hisS FALSE 0.143 111.000 0.000 NA   NA
 3754120 3754121 BOV_A0169 BOV_A0170 hisS hisZ TRUE 0.950 9.000 0.097 0.001 N NA
 3754121 3754122 BOV_A0170 BOV_A0171 hisZ hisG TRUE 0.980 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 3754123 3754124 BOV_A0172 BOV_A0173     FALSE 0.028 286.000 0.000 NA   NA
 3754124 3754125 BOV_A0173 BOV_A0174   fumC FALSE 0.206 103.000 0.007 NA   NA
 3754125 3754126 BOV_A0174 BOV_A0175 fumC   FALSE 0.160 106.000 0.003 NA   NA
 3754126 3754127 BOV_A0175 BOV_A0176     FALSE 0.008 546.000 0.000 NA   NA
 3754127 3754128 BOV_A0176 BOV_A0177   groEL FALSE 0.127 30.000 0.000 NA   NA
 3754128 3754129 BOV_A0177 BOV_A0178 groEL groES TRUE 0.980 91.000 0.565 0.008 Y NA
 3754130 3754131 BOV_A0179 BOV_A0180   ribF FALSE 0.167 88.000 0.000 NA   NA
 3754131 3754132 BOV_A0180 BOV_A0181 ribF ileS FALSE 0.096 344.000 0.029 1.000 N NA
 3754132 3754133 BOV_A0181 BOV_A0182 ileS   FALSE 0.154 192.000 0.019 NA   NA
 3754133 3754134 BOV_A0182 BOV_A0183     FALSE 0.021 324.000 0.000 NA   NA
 3754136 3754137 BOV_A0185 BOV_A0186     TRUE 0.846 -19.000 0.079 1.000 N NA
 3754137 3754138 BOV_A0186 BOV_A0187     FALSE 0.333 86.000 0.008 1.000   NA
 3754138 3754139 BOV_A0187 BOV_A0188     TRUE 0.992 0.000 0.598 0.007   NA
 3754139 3754140 BOV_A0188 BOV_A0189     TRUE 0.612 -19.000 0.017 1.000   NA
 3754142 3754143 BOV_A0191 BOV_A0192 pmbA   TRUE 0.901 -13.000 0.182 NA   NA
 3754143 3754144 BOV_A0192 BOV_A0193     TRUE 0.866 39.000 0.515 NA   NA
 3754144 3754145 BOV_A0193 BOV_A0194     TRUE 0.749 64.000 0.185 NA   NA
 3754145 3754146 BOV_A0194 BOV_A0195   kdtA TRUE 0.915 -3.000 0.131 NA   NA
 3754146 3754147 BOV_A0195 BOV_A0196 kdtA lpxK TRUE 0.918 3.000 0.024 1.000 Y NA
 3754148 3754149 BOV_A0197 BOV_A0198   mutL FALSE 0.400 17.000 0.019 NA   NA
 3754149 3754150 BOV_A0198 BOV_A0199 mutL mucK FALSE 0.187 184.000 0.000 1.000 N NA
 3754150 3754151 BOV_A0199 BOV_A0200 mucK   FALSE 0.161 98.000 0.000 NA   NA
 3754151 3754152 BOV_A0200 BOV_A0201     FALSE 0.118 57.000 0.000 NA   NA
 3754153 3754154 BOV_A0202 BOV_A0203     FALSE 0.426 5.000 0.000 NA   NA
 3754155 3754156 BOV_A0204 BOV_A0205     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754160 3754161 BOV_A0209 BOV_A0210     TRUE 0.993 0.000 0.657 1.000 Y NA
 3754162 3754163 BOV_A0211 BOV_A0212     FALSE 0.087 168.000 0.000 NA   NA
 3754163 3754164 BOV_A0212 BOV_A0213     FALSE 0.328 11.000 0.000 NA   NA
 3754164 3754165 BOV_A0213 BOV_A0214     FALSE 0.321 -19.000 0.000 NA   NA
 3754166 3754167 BOV_A0215 BOV_A0216     FALSE 0.029 283.000 0.000 NA   NA
 3754168 3754169 BOV_A0217 BOV_A0218     TRUE 0.854 101.000 0.227 1.000 N NA
 3754173 3754174 BOV_A0222 BOV_A0223   norF TRUE 0.929 8.000 0.071 0.002   NA
 3754174 3754175 BOV_A0223 BOV_A0224 norF norC TRUE 0.465 160.000 0.000 0.002   NA
 3754175 3754176 BOV_A0224 BOV_A0225 norC   FALSE 0.145 26.000 0.000 NA   NA
 3754176 3754177 BOV_A0225 BOV_A0226     FALSE 0.165 91.000 0.000 NA   NA
 3754177 3754178 BOV_A0226 BOV_A0227   norD TRUE 0.985 12.000 0.590 0.002   NA
 3754178 3754179 BOV_A0227 BOV_A0228 norD   FALSE 0.142 180.000 0.000 1.000   NA
 3754179 3754180 BOV_A0228 BOV_A0229     TRUE 0.594 117.000 0.095 NA   NA
 3754180 3754181 BOV_A0229 BOV_A0230     TRUE 0.958 -3.000 0.286 NA   NA
 3754181 3754182 BOV_A0230 BOV_A0231     TRUE 0.745 7.000 0.043 NA   NA
 3754182 3754183 BOV_A0231 BOV_A0232     FALSE 0.167 85.000 0.000 NA   NA
 3754183 3754184 BOV_A0232 BOV_A0233     TRUE 0.891 -3.000 0.084 1.000   NA
 3754184 3754185 BOV_A0233 BOV_A0234     TRUE 0.469 26.000 0.024 1.000 N NA
 3754185 3754186 BOV_A0234 BOV_A0235     FALSE 0.167 76.000 0.000 NA   NA
 3754186 3754187 BOV_A0235 BOV_A0236   nirK FALSE 0.115 131.000 0.000 NA   NA
 3754187 3754188 BOV_A0236 BOV_A0237 nirK   TRUE 0.668 71.000 0.100 NA   NA
 3754188 3754189 BOV_A0237 BOV_A0238     TRUE 0.844 101.000 0.280 NA   NA
 3754189 3754190 BOV_A0238 BOV_A0239     TRUE 0.600 83.000 0.000 0.056 N NA
 3754190 3754191 BOV_A0239 BOV_A0240     FALSE 0.132 401.000 0.095 NA N NA
 3754191 3754192 BOV_A0240 BOV_A0241     TRUE 0.595 305.000 0.565 NA   NA
 3754192 3754193 BOV_A0241 BOV_A0242     TRUE 0.982 -3.000 0.565 1.000   NA
 3754193 3754194 BOV_A0242 BOV_A0243     TRUE 0.547 288.000 0.375 1.000   NA
 3754194 3754195 BOV_A0243 BOV_A0244     TRUE 0.938 13.000 0.306 1.000   NA
 3754196 3754197 BOV_A0245 BOV_A0246     TRUE 0.935 -3.000 0.186 NA   NA
 3754197 3754198 BOV_A0246 BOV_A0247     FALSE 0.100 148.000 0.000 NA   NA
 3754198 3754199 BOV_A0247 BOV_A0248     FALSE 0.055 220.000 0.000 NA   NA
 3754200 3754201 BOV_A0250 BOV_A0251   nosZ TRUE 0.674 21.000 0.064 1.000 N NA
 3754201 3754202 BOV_A0251 BOV_A0252 nosZ nosD TRUE 0.966 6.000 0.146 0.004 N NA
 3754202 3754203 BOV_A0252 BOV_A0253 nosD nosF TRUE 0.987 -7.000 0.963 1.000 N NA
 3754203 3754204 BOV_A0253 BOV_A0254 nosF nosY TRUE 0.976 -3.000 0.500 NA   NA
 3754204 3754205 BOV_A0254 BOV_A0255 nosY   TRUE 0.977 -3.000 0.519 NA   NA
 3754205 3754206 BOV_A0255 BOV_A0256     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754206 3754207 BOV_A0256 BOV_A0257   nnrR FALSE 0.134 115.000 0.000 NA   NA
 3754207 3754208 BOV_A0257 BOV_A0258 nnrR   FALSE 0.357 72.000 0.000 1.000 N NA
 3754208 3754209 BOV_A0258 BOV_A0259     FALSE 0.420 51.000 0.041 NA N NA
 3754210 3754211 BOV_A0260 BOV_A0261     FALSE 0.145 26.000 0.000 NA   NA
 3754211 3754212 BOV_A0261 BOV_A0262     TRUE 0.993 -3.000 0.706 1.000 Y NA
 3754213 3754214 BOV_A0263 BOV_A0264     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754215 3754216 BOV_A0265 BOV_A0266     TRUE 0.997 3.000 0.948 0.004 Y NA
 3754216 3754217 BOV_A0266 BOV_A0267     TRUE 0.965 -9.000 0.381 1.000 N NA
 3754218 3754219 BOV_A0268 BOV_A0269 ubiD   TRUE 0.806 -3.000 0.051 NA   NA
 3754220 3754221 BOV_A0270 BOV_A0271     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754221 3754222 BOV_A0271 BOV_A0272   narI FALSE 0.404 6.000 0.000 NA   NA
 3754222 3754223 BOV_A0272 BOV_A0273 narI   TRUE 0.916 11.000 0.000 0.002 Y NA
 3754223 3754224 BOV_A0273 BOV_A0274   narH TRUE 0.953 0.000 0.000 0.002 Y NA
 3754224 3754225 BOV_A0274 BOV_A0275 narH   TRUE 0.994 -3.000 0.405 0.001 Y NA
 3754225 3754226 BOV_A0275 BOV_A0276   narK FALSE 0.158 24.000 0.000 NA   NA
 3754229 3754230 BOV_A0279 BOV_A0280     FALSE 0.167 77.000 0.000 NA   NA
 3754230 3754231 BOV_A0280 BOV_A0281     TRUE 0.457 3.000 0.000 NA   NA
 3754231 3754232 BOV_A0281 BOV_A0282     FALSE 0.386 7.000 0.000 NA   NA
 3754232 3754233 BOV_A0282 BOV_A0283     FALSE 0.136 63.000 0.000 NA   NA
 3754233 3754234 BOV_A0283 BOV_A0284     FALSE 0.358 9.000 0.000 NA   NA
 3754234 3754235 BOV_A0284 BOV_A0285     FALSE 0.046 237.000 0.000 NA   NA
 3754237 3754238 BOV_A0287 BOV_A0288     FALSE 0.337 -13.000 0.000 NA   NA
 3754240 3754241 BOV_A0290 BOV_A0291 nrdH nrdI TRUE 0.948 14.000 0.440 NA N NA
 3754241 3754242 BOV_A0291 BOV_A0292 nrdI   TRUE 0.735 51.000 0.081 NA Y NA
 3754242 3754243 BOV_A0292 BOV_A0293   nrdF TRUE 0.944 15.000 0.071 0.001 Y NA
 3754243 3754244 BOV_A0293 BOV_A0294 nrdF minC FALSE 0.006 866.000 0.000 NA   NA
 3754244 3754245 BOV_A0294 BOV_A0295 minC minD FALSE 0.113 48.000 0.000 NA   NA
 3754245 3754246 BOV_A0295 BOV_A0296 minD minE TRUE 0.991 -3.000 0.618 NA Y NA
 3754246 3754247 BOV_A0296 BOV_A0297 minE   FALSE 0.132 44.000 0.005 NA   NA
 3754248 3754249 BOV_A0298 BOV_A0299     FALSE 0.113 135.000 0.000 NA   NA
 3754250 3754251 BOV_A0300 BOV_A0301     TRUE 0.955 74.000 0.438 1.000 Y NA
 3754251 3754252 BOV_A0301 BOV_A0302     FALSE 0.277 -66.000 0.000 NA   NA
 3754252 3754253 BOV_A0302 BOV_A0303     TRUE 0.457 3.000 0.000 NA   NA
 3754253 3754254 BOV_A0303 BOV_A0304     FALSE 0.012 996.000 0.000 1.000   NA
 3754255 3754256 BOV_A0305 BOV_A0306     FALSE 0.107 34.000 0.000 NA   NA
 3754256 3754257 BOV_A0306 BOV_A0307     TRUE 0.692 4.000 0.000 1.000 N NA
 3754257 3754258 BOV_A0307 BOV_A0308     FALSE 0.073 186.000 0.000 NA   NA
 3754259 3754260 BOV_A0309 BOV_A0310     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 3754260 3754261 BOV_A0310 BOV_A0311     FALSE 0.106 36.000 0.000 NA   NA
 3754261 3754262 BOV_A0311 BOV_A0312   hdeA FALSE 0.100 148.000 0.000 NA   NA
 3754265 3754266 BOV_A0315 BOV_A0316     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754266 3754267 BOV_A0316 BOV_A0317     FALSE 0.126 120.000 0.000 NA   NA
 3754267 3754268 BOV_A0317 BOV_A0318     FALSE 0.399 24.000 0.009 1.000 N NA
 3754270 3754271 BOV_A0320 BOV_A0321   oxyR FALSE 0.258 44.000 0.000 1.000 N NA
 3754272 3754273 BOV_A0322 BOV_A0323 katA   FALSE 0.164 95.000 0.000 NA   NA
 3754273 3754274 BOV_A0323 BOV_A0324     FALSE 0.130 29.000 0.000 NA   NA
 3754274 3754275 BOV_A0324 BOV_A0325     FALSE 0.137 177.000 0.000 NA N NA
 3754275 3754276 BOV_A0325 BOV_A0326     FALSE 0.172 189.000 0.012 NA N NA
 3754276 3754277 BOV_A0326 BOV_A0327     TRUE 0.830 -3.000 0.048 NA N NA
 3754277 3754278 BOV_A0327 BOV_A0328   guaA TRUE 0.652 109.000 0.012 1.000 Y NA
 3754278 3754279 BOV_A0328 BOV_A0329 guaA   FALSE 0.025 383.000 0.000 NA N NA
 3754279 3754280 BOV_A0329 BOV_A0330     TRUE 0.858 28.000 0.386 NA   NA
 3754280 3754281 BOV_A0330 BOV_A0331     TRUE 0.971 13.000 0.775 NA   NA
 3754281 3754282 BOV_A0331 BOV_A0332     TRUE 0.856 21.000 0.233 NA N NA
 3754283 3754284 BOV_A0333 BOV_A0334 xfp ackA TRUE 0.967 21.000 1.000 1.000 N NA
 3754285 3754286 BOV_A0335 BOV_A0336     FALSE 0.113 49.000 0.000 NA   NA
 3754286 3754287 BOV_A0336 BOV_A0337     TRUE 0.983 10.000 0.538 0.069 N NA
 3754287 3754288 BOV_A0337 BOV_A0338     TRUE 0.976 -13.000 0.357 0.032 N NA
 3754288 3754289 BOV_A0338 BOV_A0339   fabG TRUE 0.961 3.000 0.214 1.000 N NA
 3754289 3754290 BOV_A0339 BOV_A0340 fabG   TRUE 0.676 5.000 0.000 1.000 N NA
 3754290 3754291 BOV_A0340 BOV_A0341     FALSE 0.426 5.000 0.000 NA   NA
 3754291 3754292 BOV_A0341 BOV_A0342     FALSE 0.151 25.000 0.000 NA   NA
 3754292 3754293 BOV_A0342 BOV_A0343     FALSE 0.116 55.000 0.000 NA   NA
 3754293 3754294 BOV_A0343 BOV_A0344     FALSE 0.136 63.000 0.000 NA   NA
 3754294 3754295 BOV_A0344 BOV_A0345     FALSE 0.052 286.000 0.000 1.000   NA
 3754295 3754296 BOV_A0345 BOV_A0346     TRUE 0.771 -12.000 0.000 0.038   NA
 3754297 3754298 BOV_A0347 BOV_A0348     TRUE 0.994 -3.000 0.436 0.002 Y NA
 3754298 3754299 BOV_A0348 BOV_A0349     TRUE 0.941 11.000 0.109 1.000 Y NA
 3754299 3754300 BOV_A0349 BOV_A0350     TRUE 0.965 -25.000 0.242 1.000 Y NA
 3754300 3754301 BOV_A0350 BOV_A0351     TRUE 0.992 -34.000 0.778 0.069 Y NA
 3754301 3754302 BOV_A0351 BOV_A0352     TRUE 0.974 100.000 0.533 0.069 Y NA
 3754302 3754303 BOV_A0352 BOV_A0353     TRUE 0.983 -3.000 0.533 1.000 N NA
 3754304 3754305 BOV_A0354 BOV_A0355     FALSE 0.158 24.000 0.000 NA   NA
 3754305 3754306 BOV_A0355 BOV_A0356     FALSE 0.167 83.000 0.000 NA   NA
 3754308 3754309 BOV_A0358 BOV_A0359     TRUE 0.716 37.000 0.150 1.000 N NA
 3754309 3754310 BOV_A0359 BOV_A0360     TRUE 0.956 10.000 0.150 1.000 Y NA
 3754311 3754312 BOV_A0361 BOV_A0362   gmd-1 TRUE 0.966 -16.000 0.100 0.005 Y NA
 3754313 3754314 BOV_A0363 BOV_A0364     TRUE 0.933 18.000 0.100 0.018 Y NA
 3754314 3754315 BOV_A0364 BOV_A0365     TRUE 0.983 -3.000 0.158 0.018 Y NA
 3754316 3754317 BOV_A0366 BOV_A0367 omp31-2   FALSE 0.013 397.000 0.000 NA   NA
 3754317 3754318 BOV_A0367 BOV_A0368     FALSE 0.316 12.000 0.000 NA   NA
 3754318 3754319 BOV_A0368 BOV_A0369     FALSE 0.238 135.000 0.019 NA   NA
 3754319 3754320 BOV_A0369 BOV_A0370     TRUE 0.596 -3.000 0.013 NA   NA
 3754320 3754321 BOV_A0370 BOV_A0371     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754322 3754323 BOV_A0372 BOV_A0374     FALSE 0.229 16.000 0.000 NA   NA
 3754325 3754326 BOV_A0375 BOV_A0376     TRUE 0.715 -100.000 0.039 1.000 N NA
 3754326 3754327 BOV_A0376 BOV_A0377     FALSE 0.316 -21.000 0.000 NA   NA
 3754327 3754328 BOV_A0377 BOV_A0378     FALSE 0.124 121.000 0.000 NA   NA
 3754328 3754329 BOV_A0378 BOV_A0380     TRUE 0.968 0.000 0.320 NA   NA
 3754331 3754332 BOV_A0381 BOV_A0382     TRUE 0.942 3.000 0.162 1.000   NA
 3754332 3754333 BOV_A0382 BOV_A0383     TRUE 0.970 -3.000 0.412 NA   NA
 3754333 3754334 BOV_A0383 BOV_A0385     FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 3754335 3754336 BOV_A0384 BOV_A0386   glpK FALSE 0.297 117.000 0.000 1.000 N NA
 3754336 3754337 BOV_A0386 BOV_A0387 glpK   FALSE 0.119 127.000 0.000 NA   NA
 3754337 3754338 BOV_A0387 BOV_A0388     FALSE 0.363 -7.000 0.000 NA   NA
 3754339 3754340 BOV_A0389 BOV_A0390   msrB FALSE 0.167 85.000 0.000 NA   NA
 3754341 3754342 BOV_A0391 BOV_A0392     TRUE 0.992 0.000 0.529 1.000 Y NA
 3754342 3754343 BOV_A0392 BOV_A0393     TRUE 0.965 69.000 0.575 1.000 Y NA
 3754343 3754344 BOV_A0393 BOV_A0394     FALSE 0.293 13.000 0.000 NA   NA
 3754344 3754345 BOV_A0394 BOV_A0395     FALSE 0.363 -7.000 0.000 NA   NA
 3754346 3754347 BOV_A0396 BOV_A0397     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754347 3754348 BOV_A0397 BOV_A0398     TRUE 0.938 -3.000 0.192 NA   NA
 3754350 3754351 BOV_A0400 BOV_A0401     FALSE 0.008 543.000 0.000 NA   NA
 3754351 3754352 BOV_A0401 BOV_A0402     TRUE 0.845 5.000 0.043 1.000 N NA
 3754352 3754353 BOV_A0402 BOV_A0403     TRUE 0.989 11.000 0.752 1.000 Y NA
 3754353 3754354 BOV_A0403 BOV_A0404     TRUE 0.987 -3.000 0.671 1.000 N NA
 3754354 3754355 BOV_A0404 BOV_A0405     FALSE 0.186 38.000 0.000 1.000   NA
 3754356 3754357 BOV_A0406 BOV_A0407     TRUE 0.989 -7.000 0.607 1.000 Y NA
 3754357 3754358 BOV_A0407 BOV_A0408     TRUE 0.920 46.000 0.435 NA Y NA
 3754359 3754360 BOV_A0409 BOV_A0410     TRUE 0.931 7.000 0.214 NA   NA
 3754360 3754361 BOV_A0410 BOV_A0411     TRUE 0.851 25.000 0.311 NA   NA
 3754362 3754363 BOV_A0412 BOV_A0413     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754364 3754365 BOV_A0414 BOV_A0415     FALSE 0.316 12.000 0.000 NA   NA
 3754365 3754366 BOV_A0415 BOV_A0416     FALSE 0.067 195.000 0.000 NA   NA
 3754367 3754368 BOV_A0417 BOV_A0418     FALSE 0.361 83.000 0.000 1.000 N NA
 3754368 3754369 BOV_A0418 BOV_A0419     FALSE 0.103 255.000 0.000 1.000 N NA
 3754369 3754370 BOV_A0419 BOV_A0420     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754373 3754374 BOV_A0423 BOV_A0424   metA FALSE 0.147 109.000 0.000 NA   NA
 3754375 3754376 BOV_A0425 BOV_A0426     FALSE 0.107 251.000 0.000 1.000 N NA
 3754376 3754377 BOV_A0426 BOV_A0427   bioA TRUE 0.758 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3754377 3754378 BOV_A0427 BOV_A0428 bioA bioD TRUE 0.984 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 3754378 3754379 BOV_A0428 BOV_A0429 bioD bioF TRUE 0.973 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 3754379 3754380 BOV_A0429 BOV_A0430 bioF bioB TRUE 0.904 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 3754380 3754381 BOV_A0430 BOV_A0431 bioB   FALSE 0.016 357.000 0.000 NA   NA
 3754384 3754385 BOV_A0434 BOV_A0435     FALSE 0.011 447.000 0.000 NA   NA
 3754385 3754386 BOV_A0435 BOV_A0436     TRUE 0.979 0.000 0.095 0.009 Y NA
 3754386 3754387 BOV_A0436 BOV_A0437     TRUE 0.997 3.000 0.976 0.009 Y NA
 3754387 3754388 BOV_A0437 BOV_A0438     TRUE 0.995 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 3754388 3754389 BOV_A0438 BOV_A0439     TRUE 0.996 -3.000 0.937 0.069 Y NA
 3754389 3754390 BOV_A0439 BOV_A0440     TRUE 0.995 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 3754390 3754391 BOV_A0440 BOV_A0441     FALSE 0.041 376.000 0.000 1.000 N NA
 3754391 3754392 BOV_A0441 BOV_A0442   cydD TRUE 0.485 108.000 0.025 1.000 N NA
 3754392 3754393 BOV_A0442 BOV_A0443 cydD   TRUE 0.995 -3.000 0.631 0.008 Y NA
 3754393 3754394 BOV_A0443 BOV_A0444   cydA TRUE 0.704 144.000 0.059 1.000 Y NA
 3754394 3754395 BOV_A0444 BOV_A0445 cydA cydB TRUE 0.996 6.000 0.953 0.055 Y NA
 3754395 3754396 BOV_A0445 BOV_A0446 cydB   TRUE 0.914 -22.000 0.230 NA   NA
 3754397 3754398 BOV_A0447 BOV_A0448     TRUE 0.987 -3.000 0.704 1.000 N NA
 3754401 3754402 BOV_A0451 BOV_A0452     TRUE 0.991 13.000 0.708 0.068 Y NA
 3754402 3754403 BOV_A0452 BOV_A0453     TRUE 0.975 -3.000 0.415 1.000   NA
 3754403 3754404 BOV_A0453 BOV_A0454     TRUE 0.891 30.000 0.463 1.000   NA
 3754404 3754405 BOV_A0454 BOV_A0455     FALSE 0.032 433.000 0.000 1.000 N NA
 3754405 3754406 BOV_A0455 BOV_A0456     TRUE 0.981 104.000 0.558 0.001 Y NA
 3754406 3754407 BOV_A0456 BOV_A0457     TRUE 0.987 1.000 0.152 0.001 Y NA
 3754407 3754408 BOV_A0457 BOV_A0459   lpdA-1 TRUE 0.988 5.000 0.457 1.000 Y NA
 3754409 3754410 BOV_A0458 BOV_A0460     FALSE 0.007 694.000 0.000 NA   NA
 3754410 3754411 BOV_A0460 BOV_A0461     FALSE 0.045 295.000 0.000 NA N NA
 3754413 3754414 BOV_A0463 BOV_A0464 alkB   FALSE 0.124 121.000 0.000 NA   NA
 3754414 3754415 BOV_A0464 BOV_A0465     TRUE 0.928 2.000 0.115 1.000   NA
 3754415 3754416 BOV_A0465 BOV_A0466     TRUE 0.993 -34.000 0.870 0.068 Y NA
 3754416 3754417 BOV_A0466 BOV_A0467     TRUE 0.819 217.000 0.192 0.068 Y NA
 3754417 3754418 BOV_A0467 BOV_A0468     TRUE 0.861 110.000 0.071 0.068 Y NA
 3754419 3754420 BOV_A0469 BOV_A0470     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754422 3754423 BOV_A0472 BOV_A0473     FALSE 0.010 460.000 0.000 NA   NA
 3754423 3754424 BOV_A0473 BOV_A0474   galE-1 TRUE 0.993 0.000 0.333 0.005 Y NA
 3754424 3754425 BOV_A0474 BOV_A0475 galE-1   FALSE 0.081 178.000 0.000 NA   NA
 3754425 3754426 BOV_A0475 BOV_A0476   ugd FALSE 0.248 15.000 0.000 NA   NA
 3754426 3754427 BOV_A0476 BOV_A0477 ugd   TRUE 0.953 -10.000 0.375 NA   NA
 3754427 3754428 BOV_A0477 BOV_A0478     TRUE 0.708 50.000 0.190 NA   NA
 3754428 3754429 BOV_A0478 BOV_A0479     TRUE 0.833 119.000 0.333 NA   NA
 3754430 3754431 BOV_A0480 BOV_A0481     FALSE 0.106 143.000 0.000 NA   NA
 3754431 3754432 BOV_A0481 BOV_A0482     FALSE 0.099 366.000 0.000 0.064 N NA
 3754432 3754433 BOV_A0482 BOV_A0483     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754435 3754436 BOV_A0485 BOV_A0486     FALSE 0.095 155.000 0.000 NA   NA
 3754436 3754437 BOV_A0486 BOV_A0487     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754437 3754438 BOV_A0487 BOV_A0488     FALSE 0.008 564.000 0.000 NA   NA
 3754439 3754440 BOV_A0489 BOV_A0490     FALSE 0.118 57.000 0.000 NA   NA
 3754440 3754441 BOV_A0490 BOV_A0491     FALSE 0.163 23.000 0.000 NA   NA
 3754441 3754442 BOV_A0491 BOV_A0492     FALSE 0.132 116.000 0.000 NA   NA
 3754443 3754444 BOV_A0493 BOV_A0494     FALSE 0.103 146.000 0.000 NA   NA
 3754446 3754447 BOV_A0496 BOV_A0497     TRUE 0.983 2.000 0.600 NA   NA
 3754449 3754450 BOV_A0499 BOV_A0500     FALSE 0.106 35.000 0.000 NA   NA
 3754450 3754451 BOV_A0500 BOV_A0501     TRUE 0.979 -7.000 0.375 0.004   NA
 3754451 3754452 BOV_A0501 BOV_A0502     TRUE 0.991 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 3754452 3754453 BOV_A0502 BOV_A0503     TRUE 0.993 5.000 0.500 0.067 Y NA
 3754453 3754454 BOV_A0503 BOV_A0504     TRUE 0.973 94.000 0.500 0.067 Y NA
 3754454 3754455 BOV_A0504 BOV_A0505     TRUE 0.857 143.000 0.429 1.000   NA
 3754458 3754459 BOV_A0508 BOV_A0510     FALSE 0.068 194.000 0.000 NA   NA
 3754460 3754461 BOV_A0509 BOV_A0511     FALSE 0.006 846.000 0.000 NA   NA
 3754463 3754464 BOV_A0512 BOV_A0514     FALSE 0.112 47.000 0.000 NA   NA
 3754464 3754465 BOV_A0514 BOV_A0515     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754465 3754466 BOV_A0515 BOV_A0516     FALSE 0.118 57.000 0.000 NA   NA
 3754467 3754468 BOV_A0517 BOV_A0519     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754469 3754470 BOV_A0518 BOV_A0520     FALSE 0.164 93.000 0.000 NA   NA
 3754470 3754471 BOV_A0520 BOV_A0521     FALSE 0.021 322.000 0.000 NA   NA
 3754471 3754472 BOV_A0521 BOV_A0522     TRUE 0.907 -3.000 0.116 NA   NA
 3754472 3754473 BOV_A0522 BOV_A0523     TRUE 0.942 50.000 0.571 NA Y NA
 3754473 3754474 BOV_A0523 BOV_A0524     TRUE 0.978 -36.000 0.500 NA Y NA
 3754474 3754475 BOV_A0524 BOV_A0525     FALSE 0.167 81.000 0.000 NA   NA
 3754475 3754476 BOV_A0525 BOV_A0526     FALSE 0.006 1297.000 0.000 NA   NA
 3754477 3754478 BOV_A0527 BOV_A0528   rirA FALSE 0.043 246.000 0.000 NA   NA
 3754478 3754479 BOV_A0528 BOV_A0529 rirA   FALSE 0.131 117.000 0.000 NA   NA
 3754479 3754480 BOV_A0529 BOV_A0530   bfr FALSE 0.007 733.000 0.000 NA   NA
 3754480 3754481 BOV_A0530 BOV_A0531 bfr   FALSE 0.222 164.000 0.004 1.000 N NA
 3754483 3754484 BOV_A0533 BOV_A0534     TRUE 0.978 0.000 0.418 1.000   NA
 3754484 3754485 BOV_A0534 BOV_A0535     TRUE 0.992 5.000 0.923 0.066   NA
 3754485 3754486 BOV_A0535 BOV_A0536     TRUE 0.885 83.000 0.318 1.000   NA
 3754487 3754488 BOV_A0537 BOV_A0538     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754489 3754490 BOV_A0539 BOV_A0540     TRUE 0.517 73.000 0.052 NA   NA
 3754492 3754493 BOV_A0542 BOV_A0543     TRUE 0.645 179.000 0.147 1.000 N NA
 3754494 3754495 BOV_A0544 BOV_A0545 mfd   TRUE 0.519 125.000 0.078 NA   NA
 3754497 3754498 BOV_A0547 BOV_A0548 glmS glmU TRUE 0.826 104.000 0.083 1.000 Y NA
 3754498 3754499 BOV_A0548 BOV_A0549 glmU ccdA FALSE 0.307 37.000 0.011 1.000 N NA
 3754500 3754501 BOV_A0550 BOV_A0551     TRUE 0.679 33.000 0.176 NA   NA
 3754502 3754503 BOV_A0552 BOV_A0553     FALSE 0.018 344.000 0.000 NA   NA
 3754504 3754505 BOV_A0554 BOV_A0555   lipB FALSE 0.273 128.000 0.000 1.000 N NA
 3754508 3754509 BOV_A0558 BOV_A0559   gatA FALSE 0.048 234.000 0.000 NA   NA
 3754509 3754510 BOV_A0559 BOV_A0560 gatA gatC TRUE 0.977 59.000 0.643 0.002 Y NA
 3754510 3754511 BOV_A0560 BOV_A0561 gatC   TRUE 0.445 95.000 0.024 1.000   NA
 3754514 3754515 BOV_A0564 BOV_A0565 pyrB pyrC-2 TRUE 0.989 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 3754515 3754516 BOV_A0565 BOV_A0566 pyrC-2   TRUE 0.732 75.000 0.108 1.000   NA
 3754516 3754517 BOV_A0566 BOV_A0567     TRUE 0.874 -3.000 0.070 1.000   NA
 3754519 3754520 BOV_A0569 BOV_A0570 topA rnr TRUE 0.860 4.000 0.045 1.000 N NA
 3754520 3754521 BOV_A0570 BOV_A0571 rnr   TRUE 0.825 0.000 0.050 NA   NA
 3754521 3754522 BOV_A0571 BOV_A0572     TRUE 0.958 9.000 0.406 NA   NA
 3754522 3754523 BOV_A0572 BOV_A0573     TRUE 0.794 75.000 0.159 1.000   NA
 3754523 3754524 BOV_A0573 BOV_A0574   rpmG FALSE 0.367 159.000 0.028 1.000 N NA
 3754525 3754526 BOV_A0575 BOV_A0576 pleD divK TRUE 0.966 121.000 0.461 0.010 Y NA
 3754529 3754530 BOV_A0579 BOV_A0581     FALSE 0.148 176.000 0.000 1.000   NA
 3754534 3754535 BOV_A0584 BOV_A0586     FALSE 0.104 145.000 0.000 NA   NA
 3754537 3754538 BOV_A0587 BOV_A0588     FALSE 0.164 94.000 0.000 NA   NA
 3754541 3754542 BOV_A0591 BOV_A0592     FALSE 0.043 364.000 0.000 1.000 N NA
 3754542 3754543 BOV_A0592 BOV_A0593     TRUE 0.961 89.000 0.500 1.000 Y NA
 3754543 3754544 BOV_A0593 BOV_A0594     TRUE 0.980 156.000 1.000 0.002 Y NA
 3754544 3754545 BOV_A0594 BOV_A0595     FALSE 0.075 185.000 0.000 NA   NA
 3754546 3754547 BOV_A0596 BOV_A0597     FALSE 0.058 280.000 0.000 1.000   NA
 3754548 3754549 BOV_A0598 BOV_A0599 pcaF   FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 3754549 3754550 BOV_A0599 BOV_A0600   pcaI FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754555 3754556 BOV_A0605 BOV_A0606   pcaC TRUE 0.443 4.000 0.000 NA   NA
 3754556 3754557 BOV_A0606 BOV_A0607 pcaC   FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754557 3754558 BOV_A0607 BOV_A0608   pcaG TRUE 0.467 2.000 0.000 NA   NA
 3754558 3754559 BOV_A0608 BOV_A0609 pcaG   TRUE 0.443 4.000 0.000 NA   NA
 3754559 3754560 BOV_A0609 BOV_A0610     FALSE 0.112 136.000 0.000 NA   NA
 3754560 3754561 BOV_A0610 BOV_A0611     FALSE 0.084 173.000 0.000 NA   NA
 3754561 3754562 BOV_A0611 BOV_A0612     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754562 3754563 BOV_A0612 BOV_A0613     TRUE 0.994 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 3754563 3754564 BOV_A0613 BOV_A0614     TRUE 0.996 -3.000 0.824 0.031 Y NA
 3754566 3754567 BOV_A0616 BOV_A0617   ugpB FALSE 0.069 300.000 0.000 1.000 N NA
 3754567 3754568 BOV_A0617 BOV_A0618 ugpB ugpA TRUE 0.983 73.000 0.793 0.066 Y NA
 3754568 3754569 BOV_A0618 BOV_A0619 ugpA ugpE TRUE 0.990 12.000 0.559 0.066 Y NA
 3754569 3754570 BOV_A0619 BOV_A0620 ugpE ugpC TRUE 0.994 0.000 0.464 0.066 Y NA
 3754570 3754571 BOV_A0620 BOV_A0621 ugpC   FALSE 0.143 262.000 0.016 1.000 N NA
 3754572 3754573 BOV_A0622 BOV_A0623     FALSE 0.327 61.000 0.017 1.000   NA
 3754573 3754574 BOV_A0623 BOV_A0624     FALSE 0.011 438.000 0.000 NA   NA
 3754575 3754576 BOV_A0625 BOV_A0626     FALSE 0.127 119.000 0.000 NA   NA
 3754576 3754577 BOV_A0626 BOV_A0627     FALSE 0.229 173.000 0.016 1.000   NA
 3754577 3754578 BOV_A0627 BOV_A0628     FALSE 0.390 72.000 0.016 1.000   NA
 3754578 3754579 BOV_A0628 BOV_A0630     FALSE 0.358 9.000 0.000 NA   NA
 3754581 3754582 BOV_A0631 BOV_A0632     FALSE 0.026 496.000 0.000 1.000 N NA
 3754582 3754583 BOV_A0632 BOV_A0633     TRUE 0.922 57.000 0.356 1.000 Y NA
 3754583 3754584 BOV_A0633 BOV_A0634     TRUE 0.995 -7.000 0.870 0.066 Y NA
 3754584 3754585 BOV_A0634 BOV_A0635     TRUE 0.994 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 3754587 3754588 BOV_A0637 BOV_A0638   fliY FALSE 0.209 286.000 0.000 1.000 Y NA
 3754588 3754589 BOV_A0638 BOV_A0639 fliY   TRUE 0.951 180.000 0.594 0.066 Y NA
 3754589 3754590 BOV_A0639 BOV_A0640     TRUE 0.989 -3.000 0.481 1.000 Y NA
 3754590 3754591 BOV_A0640 BOV_A0641     FALSE 0.116 242.000 0.000 1.000 N NA
 3754591 3754592 BOV_A0641 BOV_A0642     TRUE 0.881 77.000 0.316 NA N NA
 3754595 3754596 BOV_A0645 BOV_A0646     TRUE 0.975 19.000 0.421 0.065 Y NA
 3754596 3754597 BOV_A0646 BOV_A0647     TRUE 0.994 -3.000 0.588 0.065 Y NA
 3754597 3754598 BOV_A0647 BOV_A0648     FALSE 0.149 108.000 0.000 NA   NA
 3754601 3754602 BOV_A0651 BOV_A0652     FALSE 0.108 41.000 0.000 NA   NA
 3754603 3754604 BOV_A0653 BOV_A0654     FALSE 0.081 178.000 0.000 NA   NA
 3754604 3754605 BOV_A0654 BOV_A0655     TRUE 0.913 21.000 0.104 0.065 Y NA
 3754605 3754606 BOV_A0655 BOV_A0656     TRUE 0.952 0.000 0.087 0.065 N NA
 3754606 3754607 BOV_A0656 BOV_A0657     FALSE 0.275 -72.000 0.000 NA   NA
 3754609 3754610 BOV_A0659 BOV_A0660 sodC   FALSE 0.085 277.000 0.000 1.000 N NA
 3754610 3754611 BOV_A0660 BOV_A0661     FALSE 0.123 60.000 0.000 NA   NA
 3754613 3754614 BOV_A0663 BOV_A0664   ahpC FALSE 0.185 20.000 0.000 NA   NA
 3754616 3754617 BOV_A0666 BOV_A0667   idhA TRUE 0.886 98.000 0.400 NA   NA
 3754618 3754619 BOV_A0668 BOV_A0669     FALSE 0.165 92.000 0.000 NA   NA
 3754619 3754620 BOV_A0669 BOV_A0670   iolD FALSE 0.108 33.000 0.000 NA   NA
 3754620 3754621 BOV_A0670 BOV_A0671 iolD iolE TRUE 0.979 4.000 0.438 1.000 N NA
 3754621 3754622 BOV_A0671 BOV_A0672 iolE iolB TRUE 0.929 4.000 0.038 1.000 Y NA
 3754623 3754624 BOV_A0673 BOV_A0674     TRUE 0.919 21.000 0.400 1.000 N NA
 3754624 3754625 BOV_A0674 BOV_A0675     TRUE 0.991 -3.000 0.632 0.065 N NA
 3754625 3754626 BOV_A0675 BOV_A0676     TRUE 0.974 135.000 0.800 0.065 Y NA
 3754626 3754627 BOV_A0676 BOV_A0677     FALSE 0.050 230.000 0.000 NA   NA
 3754629 3754630 BOV_A0679 BOV_A0680 gcvP gcvH TRUE 0.965 5.000 0.130 1.000 Y NA
 3754630 3754631 BOV_A0680 BOV_A0681 gcvH gcvT TRUE 0.986 6.000 0.202 0.002 Y NA
 3754633 3754634 BOV_A0683 BOV_A0684     FALSE 0.239 112.000 0.000 1.000   NA
 3754635 3754636 BOV_A0685 BOV_A0686     TRUE 0.600 64.000 0.000 1.000 Y NA
 3754636 3754637 BOV_A0686 BOV_A0687     TRUE 0.556 101.000 0.036 1.000 N NA
 3754637 3754638 BOV_A0687 BOV_A0688     FALSE 0.077 182.000 0.000 NA   NA
 3754638 3754639 BOV_A0688 BOV_A0689     FALSE 0.010 461.000 0.000 NA   NA
 3754640 3754641 BOV_A0690 BOV_A0691     FALSE 0.113 48.000 0.000 NA   NA
 3754641 3754642 BOV_A0691 BOV_A0692     TRUE 0.849 69.000 0.055 0.098 Y NA
 3754642 3754643 BOV_A0692 BOV_A0693     FALSE 0.009 540.000 0.000 NA   NA
 3754643 3754644 BOV_A0693 BOV_A0694     TRUE 0.637 14.000 0.045 NA   NA
 3754644 3754645 BOV_A0694 BOV_A0695     TRUE 0.818 5.000 0.045 NA N NA
 3754645 3754646 BOV_A0695 BOV_A0696     TRUE 0.932 -28.000 0.231 1.000 N NA
 3754646 3754647 BOV_A0696 BOV_A0697     FALSE 0.426 5.000 0.000 NA   NA
 3754648 3754649 BOV_A0698 BOV_A0699     TRUE 0.961 73.000 0.320 0.065 Y NA
 3754649 3754650 BOV_A0699 BOV_A0700     TRUE 0.992 -3.000 0.429 0.065 Y NA
 3754650 3754651 BOV_A0700 BOV_A0701     TRUE 0.784 13.000 0.071 NA N NA
 3754651 3754652 BOV_A0701 BOV_A0702     TRUE 0.557 27.000 0.077 NA   NA
 3754653 3754654 BOV_A0703 BOV_A0704     TRUE 0.986 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 3754654 3754655 BOV_A0704 BOV_A0705     TRUE 0.969 54.000 0.958 1.000 Y NA
 3754655 3754656 BOV_A0705 BOV_A0706     FALSE 0.023 551.000 0.000 1.000 N NA
 3754656 3754657 BOV_A0706 BOV_A0707     TRUE 0.966 -3.000 0.353 NA   NA
 3754657 3754658 BOV_A0707 BOV_A0708     FALSE 0.139 27.000 0.000 NA   NA
 3754658 3754659 BOV_A0708 BOV_A0709     FALSE 0.109 43.000 0.000 NA   NA
 3754660 3754661 BOV_A0710 BOV_A0711     TRUE 0.628 100.000 0.087 NA   NA
 3754662 3754663 BOV_A0712 BOV_A0713 xseA   FALSE 0.158 69.000 0.000 NA   NA
 3754664 3754665 BOV_A0714 BOV_A0715     FALSE 0.040 252.000 0.000 NA   NA
 3754665 3754666 BOV_A0715 BOV_A0716     FALSE 0.123 60.000 0.000 NA   NA
 3754666 3754667 BOV_A0716 BOV_A0717     FALSE 0.115 54.000 0.000 NA   NA
 3754669 3754670 BOV_A0719 BOV_A0721     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754671 3754672 BOV_A0720 BOV_A0722     FALSE 0.023 310.000 0.000 NA   NA
 3754672 3754673 BOV_A0722 BOV_A0723     FALSE 0.038 259.000 0.000 NA   NA
 3754674 3754675 BOV_A0724 BOV_A0725     TRUE 0.987 -3.000 0.880 NA   NA
 3754675 3754676 BOV_A0725 BOV_A0726     FALSE 0.163 23.000 0.000 NA   NA
 3754678 3754679 BOV_A0728 BOV_A0729 zwf pgl TRUE 0.665 129.000 0.032 1.000 Y NA
 3754679 3754680 BOV_A0729 BOV_A0730 pgl edd TRUE 0.871 131.000 0.202 1.000 Y NA
 3754683 3754684 BOV_A0733 BOV_A0734     FALSE 0.363 -7.000 0.000 NA   NA
 3754684 3754685 BOV_A0734 BOV_A0735     TRUE 0.993 -3.000 0.778 1.000 Y NA
 3754685 3754686 BOV_A0735 BOV_A0736     TRUE 0.995 -3.000 0.727 0.064 Y NA
 3754686 3754687 BOV_A0736 BOV_A0737     FALSE 0.108 33.000 0.000 NA   NA
 3754688 3754689 BOV_A0738 BOV_A0739     FALSE 0.098 149.000 0.000 NA   NA
 3754692 3754693 BOV_A0742 BOV_A0743     TRUE 0.957 1.000 0.185 1.000 N NA
 3754693 3754694 BOV_A0743 BOV_A0744   fadB FALSE 0.119 238.000 0.000 1.000 N NA
 3754694 3754695 BOV_A0744 BOV_A0745 fadB   TRUE 0.976 16.000 0.562 1.000 Y NA
 3754695 3754696 BOV_A0745 BOV_A0746     TRUE 0.915 65.000 0.247 1.000 Y NA
 3754696 3754697 BOV_A0746 BOV_A0747     FALSE 0.307 -25.000 0.000 NA   NA
 3754698 3754699 BOV_A0748 BOV_A0749     FALSE 0.142 218.000 0.000 1.000 N NA
 3754700 3754701 BOV_A0750 BOV_A0751 nikE   FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754701 3754702 BOV_A0751 BOV_A0752   nikC FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754702 3754703 BOV_A0752 BOV_A0753 nikC nikB TRUE 0.996 -3.000 0.629 0.001 Y NA
 3754703 3754704 BOV_A0753 BOV_A0754 nikB nikA TRUE 0.996 2.000 0.833 0.082 Y NA
 3754706 3754707 BOV_A0756 BOV_A0757     FALSE 0.361 78.000 0.000 1.000 N NA
 3754707 3754708 BOV_A0757 BOV_A0758     TRUE 0.994 1.000 0.864 0.064 N NA
 3754708 3754709 BOV_A0758 BOV_A0759     TRUE 0.986 9.000 0.594 0.064 N NA
 3754709 3754710 BOV_A0759 BOV_A0760     TRUE 0.922 78.000 0.562 NA   NA
 3754710 3754711 BOV_A0760 BOV_A0761     FALSE 0.092 160.000 0.000 NA   NA
 3754711 3754712 BOV_A0761 BOV_A0762     FALSE 0.316 12.000 0.000 NA   NA
 3754713 3754714 BOV_A0763 BOV_A0764   uxuA FALSE 0.291 61.000 0.000 1.000 N NA
 3754715 3754716 BOV_A0765 BOV_A0766     FALSE 0.258 23.000 0.000 NA N NA
 3754717 3754718 BOV_A0767 BOV_A0768     TRUE 0.967 -24.000 0.167 0.097 Y NA
 3754718 3754719 BOV_A0768 BOV_A0769     TRUE 0.733 16.000 0.091 NA   NA
 3754721 3754722 BOV_A0771 BOV_A0772     FALSE 0.147 237.000 0.019 1.000   NA
 3754722 3754723 BOV_A0772 BOV_A0773     TRUE 0.768 35.000 0.274 NA   NA
 3754724 3754725 BOV_A0774 BOV_A0775     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754725 3754726 BOV_A0775 BOV_A0776     FALSE 0.342 10.000 0.000 NA   NA
 3754726 3754727 BOV_A0776 BOV_A0777     FALSE 0.163 96.000 0.000 NA   NA
 3754727 3754728 BOV_A0777 BOV_A0778     FALSE 0.065 199.000 0.000 NA   NA
 3754729 3754730 BOV_A0779 BOV_A0780     FALSE 0.012 426.000 0.000 NA   NA
 3754730 3754731 BOV_A0780 BOV_A0781     FALSE 0.008 554.000 0.000 NA   NA
 3754737 3754738 BOV_A0787 BOV_A0788   hsdM TRUE 0.709 -37.000 0.000 0.060   NA
 3754738 3754739 BOV_A0788 BOV_A0789 hsdM hsdS TRUE 0.946 -10.000 0.054 0.060 Y NA
 3754739 3754740 BOV_A0789 BOV_A0790 hsdS hsdR TRUE 0.924 63.000 0.126 0.001 Y NA
 3754740 3754741 BOV_A0790 BOV_A0791 hsdR   TRUE 0.843 -3.000 0.068 NA   NA
 3754741 3754742 BOV_A0791 BOV_A0792     FALSE 0.373 8.000 0.000 NA   NA
 3754742 3754743 BOV_A0792 BOV_A0793     FALSE 0.337 -13.000 0.000 NA   NA
 3754743 3754744 BOV_A0793 BOV_A0794     FALSE 0.009 535.000 0.000 NA   NA
 3754744 3754745 BOV_A0794 BOV_A0795     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754747 3754748 BOV_A0797 BOV_A0798     FALSE 0.143 111.000 0.000 NA   NA
 3754749 3754750 BOV_A0799 BOV_A0800     FALSE 0.328 11.000 0.000 NA   NA
 3754750 3754751 BOV_A0800 BOV_A0801     FALSE 0.113 49.000 0.000 NA   NA
 3754751 3754752 BOV_A0801 BOV_A0802     TRUE 0.686 -28.000 0.033 1.000   NA
 3754752 3754753 BOV_A0802 BOV_A0803     TRUE 0.959 0.000 0.192 1.000 N NA
 3754753 3754754 BOV_A0803 BOV_A0804     FALSE 0.021 623.000 0.000 1.000 N NA
 3754754 3754755 BOV_A0804 BOV_A0805     FALSE 0.104 145.000 0.000 NA   NA
 3754755 3754756 BOV_A0805 BOV_A0806     FALSE 0.088 167.000 0.000 NA   NA
 3754756 3754757 BOV_A0806 BOV_A0807   rbsA-3 FALSE 0.158 24.000 0.000 NA   NA
 3754757 3754758 BOV_A0807 BOV_A0808 rbsA-3   TRUE 0.985 -3.000 0.786 NA   NA
 3754761 3754762 BOV_A0811 BOV_A0812   eryB FALSE 0.293 13.000 0.000 NA   NA
 3754762 3754763 BOV_A0812 BOV_A0813 eryB eryC TRUE 0.957 -7.000 0.389 NA   NA
 3754763 3754764 BOV_A0813 BOV_A0814 eryC   FALSE 0.134 28.000 0.000 NA   NA
 3754764 3754765 BOV_A0814 BOV_A0815     FALSE 0.167 88.000 0.000 NA   NA
 3754765 3754766 BOV_A0815 BOV_A0816   tpiA TRUE 0.953 13.000 0.188 1.000 Y NA
 3754766 3754767 BOV_A0816 BOV_A0817 tpiA   TRUE 0.980 12.000 0.438 1.000 Y NA
 3754768 3754769 BOV_A0818 BOV_A0819 fba fbp TRUE 0.836 31.000 0.125 1.000 Y NA
 3754769 3754770 BOV_A0819 BOV_A0820 fbp   FALSE 0.022 434.000 0.000 1.000   NA
 3754770 3754771 BOV_A0820 BOV_A0821   typA TRUE 0.479 50.000 0.000 0.009   NA
 3754771 3754772 BOV_A0821 BOV_A0822 typA mgtE FALSE 0.114 243.000 0.000 1.000 N NA
 3754774 3754775 BOV_A0824 BOV_A0825     TRUE 0.751 0.000 0.029 NA   NA
 3754775 3754776 BOV_A0825 BOV_A0826     TRUE 0.821 18.000 0.179 NA   NA
 3754777 3754778 BOV_A0827 BOV_A0828 leuD   TRUE 0.685 62.000 0.112 1.000   NA
 3754783 3754784 BOV_A0833 BOV_A0834   leuB FALSE 0.293 141.000 0.007 1.000 N NA
 3754784 3754785 BOV_A0834 BOV_A0835 leuB   FALSE 0.026 300.000 0.000 NA   NA
 3754785 3754786 BOV_A0835 BOV_A0836     TRUE 0.576 177.000 0.148 NA   NA
 3754786 3754787 BOV_A0836 BOV_A0837   trx-2 TRUE 0.812 64.000 0.222 1.000   NA
 3754787 3754788 BOV_A0837 BOV_A0838 trx-2   TRUE 0.561 233.000 0.245 NA   NA
 3754789 3754790 BOV_A0839 BOV_A0840     FALSE 0.035 269.000 0.000 NA   NA
 3754790 3754791 BOV_A0840 BOV_A0841     FALSE 0.089 165.000 0.000 NA   NA
 3754792 3754793 BOV_A0842 BOV_A0843 arcB rocF TRUE 0.845 39.000 0.174 1.000 Y NA
 3754795 3754796 BOV_A0845 BOV_A0846     TRUE 0.793 44.000 0.224 1.000 N NA
 3754798 3754799 BOV_A0848 BOV_A0849     FALSE 0.160 100.000 0.000 NA   NA
 3754800 3754801 BOV_A0850 BOV_A0851     TRUE 0.581 74.000 0.069 NA   NA
 3754802 3754803 BOV_A0852 BOV_A0853 purU   TRUE 0.733 144.000 0.200 1.000   NA
 3754803 3754804 BOV_A0853 BOV_A0854   nagA TRUE 0.902 8.000 0.123 1.000   NA
 3754804 3754805 BOV_A0854 BOV_A0855 nagA nagB TRUE 0.975 -3.000 0.369 1.000 N NA
 3754805 3754806 BOV_A0855 BOV_A0856 nagB   TRUE 0.970 3.000 0.280 1.000 N NA
 3754806 3754807 BOV_A0856 BOV_A0857     TRUE 0.587 145.000 0.100 NA N NA
 3754807 3754808 BOV_A0857 BOV_A0858     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754808 3754809 BOV_A0858 BOV_A0859     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754809 3754810 BOV_A0859 BOV_A0860     FALSE 0.028 286.000 0.000 NA   NA
 3754810 3754811 BOV_A0860 BOV_A0861     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754812 3754813 BOV_A0862 BOV_A0863 lldD   FALSE 0.084 279.000 0.000 1.000 N NA
 3754815 3754816 BOV_A0865 BOV_A0866 alr dadA TRUE 0.877 16.000 0.179 1.000 N NA
 3754819 3754820 BOV_A0869 BOV_A0870 hutC hutF TRUE 0.688 12.000 0.020 1.000 N NA
 3754821 3754822 BOV_A0871 BOV_A0872 hutI hutH TRUE 0.888 25.000 0.192 0.045 N NA
 3754822 3754823 BOV_A0872 BOV_A0873 hutH hutG TRUE 0.949 2.000 0.064 1.000 Y NA
 3754823 3754824 BOV_A0873 BOV_A0874 hutG hutU TRUE 0.925 11.000 0.081 1.000 Y NA
 3754824 3754825 BOV_A0874 BOV_A0875 hutU   TRUE 0.831 7.000 0.077 NA   NA
 3754825 3754826 BOV_A0875 BOV_A0876     FALSE 0.167 88.000 0.000 NA   NA
 3754827 3754828 BOV_A0877 BOV_A0878     TRUE 0.974 39.000 0.680 0.005 Y NA
 3754828 3754829 BOV_A0878 BOV_A0879     TRUE 0.926 145.000 0.500 NA Y NA
 3754829 3754830 BOV_A0879 BOV_A0880     TRUE 0.547 149.000 0.024 NA Y NA
 3754830 3754831 BOV_A0880 BOV_A0881   dgoK TRUE 0.976 -3.000 0.205 1.000 Y NA
 3754831 3754832 BOV_A0881 BOV_A0882 dgoK   TRUE 0.868 15.000 0.057 1.000 Y NA
 3754832 3754833 BOV_A0882 BOV_A0883     TRUE 0.570 97.000 0.051 1.000   NA
 3754833 3754834 BOV_A0883 BOV_A0884     TRUE 0.847 -81.000 0.119 1.000   NA
 3754836 3754837 BOV_A0886 BOV_A0887     FALSE 0.134 115.000 0.000 NA   NA
 3754838 3754839 BOV_A0888 BOV_A0889     FALSE 0.111 45.000 0.000 NA   NA
 3754840 3754841 BOV_A0890 BOV_A0891     TRUE 0.736 104.000 0.032 1.000 Y NA
 3754844 3754845 BOV_A0894 BOV_A0895     TRUE 0.980 13.000 0.548 NA Y NA
 3754845 3754846 BOV_A0895 BOV_A0896     TRUE 0.996 -7.000 1.000 0.029 Y NA
 3754846 3754847 BOV_A0896 BOV_A0897     TRUE 0.988 5.000 0.447 1.000 Y NA
 3754847 3754848 BOV_A0897 BOV_A0898     TRUE 0.467 2.000 0.000 NA   NA
 3754848 3754849 BOV_A0898 BOV_A0899     FALSE 0.140 64.000 0.000 NA   NA
 3754849 3754850 BOV_A0899 BOV_A0900     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754850 3754851 BOV_A0900 BOV_A0901     FALSE 0.127 30.000 0.000 NA   NA
 3754851 3754852 BOV_A0901 BOV_A0902     TRUE 0.552 465.000 0.560 NA Y NA
 3754852 3754853 BOV_A0902 BOV_A0903     TRUE 0.985 -19.000 0.565 1.000 Y NA
 3754854 3754855 BOV_A0904 BOV_A0905     TRUE 0.559 92.000 0.065 NA   NA
 3754855 3754856 BOV_A0905 BOV_A0906   rpsU FALSE 0.131 520.000 0.136 1.000   NA
 3754858 3754859 BOV_A0908 BOV_A0909     TRUE 0.895 75.000 0.222 0.064   NA
 3754861 3754862 BOV_A0911 BOV_A0912 pntB pntAB TRUE 0.917 13.000 0.087 0.001   NA
 3754862 3754863 BOV_A0912 BOV_A0913 pntAB pntA TRUE 0.995 0.000 0.829 0.001   NA
 3754863 3754864 BOV_A0913 BOV_A0914 pntA   FALSE 0.392 38.000 0.038 1.000   NA
 3754864 3754865 BOV_A0914 BOV_A0915     TRUE 0.507 189.000 0.129 NA   NA
 3754865 3754866 BOV_A0915 BOV_A0916     FALSE 0.023 308.000 0.000 NA   NA
 3754866 3754867 BOV_A0916 BOV_A0917     FALSE 0.104 253.000 0.000 1.000 N NA
 3754867 3754868 BOV_A0917 BOV_A0918     FALSE 0.042 366.000 0.000 1.000 N NA
 3754869 3754870 BOV_A0919 BOV_A0920     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754870 3754871 BOV_A0920 BOV_A0921     FALSE 0.224 29.000 0.000 1.000   NA
 3754872 3754873 BOV_A0922 BOV_A0923     FALSE 0.361 80.000 0.000 1.000 N NA
 3754873 3754874 BOV_A0923 BOV_A0924     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3754874 3754875 BOV_A0924 BOV_A0925     FALSE 0.118 57.000 0.000 NA   NA
 3754875 3754876 BOV_A0925 BOV_A0926     FALSE 0.167 86.000 0.000 NA   NA
 3754876 3754877 BOV_A0926 BOV_A0927     FALSE 0.101 147.000 0.000 NA   NA
 3754878 3754879 BOV_A0928 BOV_A0929     TRUE 0.747 236.000 0.565 NA   NA
 3754879 3754880 BOV_A0929 BOV_A0930     TRUE 0.776 119.000 0.231 NA   NA
 3754882 3754883 BOV_A0932 BOV_A0933     TRUE 0.993 2.000 0.790 0.050   NA
 3754884 3754885 BOV_A0934 BOV_A0935     TRUE 0.616 0.000 0.000 NA N NA
 3754885 3754886 BOV_A0935 BOV_A0936     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3754886 3754887 BOV_A0936 BOV_A0937     TRUE 0.474 0.000 0.000 NA   NA
 3754887 3754888 BOV_A0937 BOV_A0938     FALSE 0.358 9.000 0.000 NA   NA
 3754890 3754891 BOV_A0940 BOV_A0941     FALSE 0.087 168.000 0.000 NA   NA
 3754891 3754892 BOV_A0941 BOV_A0942     FALSE 0.162 97.000 0.000 NA   NA
 3754892 3754893 BOV_A0942 BOV_A0943     FALSE 0.096 153.000 0.000 NA   NA
 3754893 3754894 BOV_A0943 BOV_A0944     FALSE 0.188 183.000 0.000 1.000 N NA
 3754894 3754895 BOV_A0944 BOV_A0945     TRUE 0.655 104.000 0.100 NA   NA
 3754895 3754896 BOV_A0945 BOV_A0946     TRUE 0.908 171.000 1.000 NA   NA
 3754896 3754897 BOV_A0946 BOV_A0947     FALSE 0.088 235.000 0.000 1.000   NA
 3754899 3754900 BOV_A0949 BOV_A0950     FALSE 0.123 31.000 0.000 NA   NA
 3754900 3754901 BOV_A0950 BOV_A0951     TRUE 0.980 -3.000 0.267 0.004   NA
 3754901 3754902 BOV_A0951 BOV_A0952     TRUE 0.984 -3.000 0.317 1.000 Y NA
 3754902 3754903 BOV_A0952 BOV_A0953     TRUE 0.996 -3.000 0.829 0.062 Y NA
 3754903 3754904 BOV_A0953 BOV_A0954     TRUE 0.842 98.000 0.038 0.062 Y NA
 3754904 3754905 BOV_A0954 BOV_A0955     TRUE 0.705 62.000 0.105 1.000 N NA
 3754905 3754906 BOV_A0955 BOV_A0956     TRUE 0.900 35.000 0.368 0.064 N NA
 3754906 3754907 BOV_A0956 BOV_A0957     TRUE 0.899 -16.000 0.125 1.000 N NA
 3754908 3754909 BOV_A0958 BOV_A0959     FALSE 0.104 145.000 0.000 NA   NA
 3754909 3754910 BOV_A0959 BOV_A0960     FALSE 0.085 172.000 0.000 NA   NA
 3754912 3754913 BOV_A0962 BOV_A0963 rpmH rnpA TRUE 0.919 38.000 0.787 1.000   NA
 3754913 3754914 BOV_A0963 BOV_A0964 rnpA   TRUE 0.893 -10.000 0.105 1.000 N NA
 3754914 3754915 BOV_A0964 BOV_A0965     TRUE 0.689 42.000 0.082 0.063   NA
 3754915 3754916 BOV_A0965 BOV_A0966   argB FALSE 0.372 171.000 0.046 1.000   NA
 3754916 3754917 BOV_A0966 BOV_A0967 argB   TRUE 0.520 46.000 0.069 1.000   NA
 3754921 3754922 BOV_A0971 BOV_A0972   dapE FALSE 0.107 40.000 0.000 NA   NA
 3754922 3754923 BOV_A0972 BOV_A0973 dapE   TRUE 0.450 63.000 0.050 NA   NA
 3754924 3754925 BOV_A0974 BOV_A0975 truA fmt TRUE 0.948 4.000 0.069 1.000 Y NA
 3754925 3754926 BOV_A0975 BOV_A0976 fmt def TRUE 0.968 0.000 0.050 0.027 Y NA
 3754928 3754929 BOV_A0978 BOV_A0979   lepA FALSE 0.022 561.000 0.000 1.000 N NA
 3754932 3754933 BOV_A0982 BOV_A0983     TRUE 0.922 -37.000 0.213 1.000 N NA
 3754933 3754934 BOV_A0983 BOV_A0984     TRUE 0.884 2.000 0.055 1.000 N NA
 3754934 3754935 BOV_A0984 BOV_A0985   mepA TRUE 0.899 1.000 0.007 1.000 Y NA
 3754935 3754936 BOV_A0985 BOV_A0986 mepA mgsA FALSE 0.409 153.000 0.035 1.000 N NA
 3754936 3754937 BOV_A0986 BOV_A0987 mgsA glk TRUE 0.851 81.000 0.035 0.044 Y NA
 3754937 3754938 BOV_A0987 BOV_A0988 glk   FALSE 0.149 281.000 0.027 1.000 N NA
 3754938 3754939 BOV_A0988 BOV_A0989   dapB TRUE 0.776 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3754939 3754940 BOV_A0989 BOV_A0990 dapB gpm TRUE 0.450 37.000 0.038 1.000 N NA
 3754940 3754941 BOV_A0990 BOV_A0991 gpm   FALSE 0.098 149.000 0.000 NA   NA
 3754941 3754942 BOV_A0991 BOV_A0992     FALSE 0.075 185.000 0.000 NA   NA
 3754942 3754943 BOV_A0992 BOV_A0993     FALSE 0.036 334.000 0.000 1.000   NA
 3754943 3754944 BOV_A0993 BOV_A0994     FALSE 0.166 198.000 0.000 1.000 N NA
 3754944 3754945 BOV_A0994 BOV_A0995     FALSE 0.116 201.000 0.000 1.000   NA
 3754945 3754946 BOV_A0995 BOV_A0996     TRUE 0.970 -10.000 0.500 1.000   NA
 3754946 3754947 BOV_A0996 BOV_A0997     FALSE 0.220 155.000 0.022 NA   NA
 3754952 3754953 BOV_A1001 BOV_A1003 coaBC ubiB FALSE 0.371 31.000 0.025 1.000   NA
 3754953 3754954 BOV_A1003 BOV_A1004 ubiB ubiE TRUE 0.652 49.000 0.115 1.000   NA
 3754955 3754956 BOV_A1005 BOV_A1006 upp   FALSE 0.213 60.000 0.000 1.000   NA
 3754957 3754958 BOV_A1007 BOV_A1008 msrA   FALSE 0.372 23.000 0.026 NA   NA
 3754960 3754961 BOV_A1010 BOV_A1011     TRUE 0.959 -3.000 0.143 0.059   NA
 3754964 3754965 BOV_A1014 BOV_A1015     TRUE 0.959 -3.000 0.143 0.059   NA
 3754966 3754967 BOV_A1016 BOV_A1017   rrfC FALSE 0.157 102.000 0.000 NA   NA
 3754969 3754970 BOV_A1018 BOV_A1020 rrlC   FALSE 0.021 322.000 0.000 NA   NA
 3754970 3754971 BOV_A1020 BOV_A1021     FALSE 0.293 13.000 0.000 NA   NA
 3754971 3754972 BOV_A1021 BOV_A1022   rrsC FALSE 0.025 302.000 0.000 NA   NA
 3754973 3754974 BOV_A1023 BOV_A1024     FALSE 0.054 280.000 0.000 NA N NA
 3754978 3754979 BOV_A1028 BOV_A1029 znuC znuB TRUE 0.987 -46.000 0.755 1.000 Y NA
 3754979 3754980 BOV_A1029 BOV_A1030 znuB   TRUE 0.954 -3.000 0.086 1.000 Y NA
 3754980 3754981 BOV_A1030 BOV_A1032     TRUE 0.493 127.000 0.071 NA   NA
 3754982 3754983 BOV_A1031 BOV_A1033     TRUE 0.735 -3.000 0.031 NA   NA
 3754983 3754984 BOV_A1033 BOV_A1034     FALSE 0.377 76.000 0.025 NA   NA
 3754984 3754985 BOV_A1034 BOV_A1035     TRUE 0.576 26.000 0.080 NA   NA
 3754985 3754986 BOV_A1035 BOV_A1036   fliR FALSE 0.296 -34.000 0.000 NA   NA
 3754986 3754987 BOV_A1036 BOV_A1037 fliR flhA TRUE 0.984 16.000 0.442 0.002 Y NA
 3754987 3754988 BOV_A1037 BOV_A1038 flhA fliQ TRUE 0.945 161.000 0.349 0.002 Y NA
 3754988 3754989 BOV_A1038 BOV_A1039 fliQ flgD TRUE 0.981 12.000 0.509 NA Y NA
 3754989 3754990 BOV_A1039 BOV_A1040 flgD flbT TRUE 0.989 -3.000 0.528 NA Y NA
 3754990 3754991 BOV_A1040 BOV_A1041 flbT flaF TRUE 0.994 2.000 0.829 NA Y NA
 3754991 3754992 BOV_A1041 BOV_A1042 flaF flgL TRUE 0.682 132.000 0.057 NA Y NA
 3754992 3754993 BOV_A1042 BOV_A1043 flgL flgK TRUE 0.996 -3.000 0.667 0.003 Y NA
 3754993 3754994 BOV_A1043 BOV_A1044 flgK flgE TRUE 0.977 125.000 0.667 0.003 Y NA
 3754994 3754995 BOV_A1044 BOV_A1045 flgE   FALSE 0.035 411.000 0.000 1.000 N NA
 3754995 3754996 BOV_A1045 BOV_A1046     FALSE 0.020 328.000 0.000 NA   NA
 3754996 3754997 BOV_A1046 BOV_A1047     FALSE 0.287 -46.000 0.000 NA   NA
 3754997 3754998 BOV_A1047 BOV_A1048     TRUE 0.795 9.000 0.069 NA   NA
 3754998 3754999 BOV_A1048 BOV_A1049     FALSE 0.163 96.000 0.000 NA   NA
 3754999 3755000 BOV_A1049 BOV_A1050     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755000 3755001 BOV_A1050 BOV_A1051   fliF TRUE 0.938 3.000 0.184 NA   NA
 3755001 3755002 BOV_A1051 BOV_A1052 fliF   TRUE 0.967 -3.000 0.053 0.006 Y NA
 3755005 3755006 BOV_A1055 BOV_A1056     FALSE 0.093 159.000 0.000 NA   NA
 3755006 3755007 BOV_A1056 BOV_A1057   xylH FALSE 0.130 29.000 0.000 NA   NA
 3755007 3755008 BOV_A1057 BOV_A1058 xylH   FALSE 0.025 522.000 0.000 1.000 N NA
 3755008 3755009 BOV_A1058 BOV_A1059     FALSE 0.160 100.000 0.000 NA   NA
 3755010 3755011 BOV_A1060 BOV_A1061 hpaI hpaH TRUE 0.563 218.000 0.154 1.000 N NA
 3755011 3755012 BOV_A1061 BOV_A1062 hpaH   TRUE 0.443 4.000 0.000 NA   NA
 3755012 3755013 BOV_A1062 BOV_A1063     TRUE 0.474 0.000 0.000 NA   NA
 3755013 3755014 BOV_A1063 BOV_A1064   hpaE FALSE 0.116 55.000 0.000 NA   NA
 3755014 3755015 BOV_A1064 BOV_A1065 hpaE hpcD TRUE 0.869 70.000 0.252 1.000 N NA
 3755017 3755018 BOV_A1066 BOV_A1068     FALSE 0.426 5.000 0.000 NA   NA
 3755018 3755019 BOV_A1068 BOV_A1069     FALSE 0.117 56.000 0.000 NA   NA
 3755019 3755020 BOV_A1069 BOV_A1070     FALSE 0.293 13.000 0.000 NA   NA
 3755020 3755021 BOV_A1070 BOV_A1071     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755021 3755022 BOV_A1071 BOV_A1072     FALSE 0.160 70.000 0.000 NA   NA
 3755023 3755024 BOV_A1073 BOV_A1074     FALSE 0.164 72.000 0.000 NA   NA
 3755024 3755025 BOV_A1074 BOV_A1075     FALSE 0.165 159.000 0.000 1.000   NA
 3755025 3755026 BOV_A1075 BOV_A1076     FALSE 0.152 67.000 0.000 NA   NA
 3755026 3755027 BOV_A1076 BOV_A1077     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 3755027 3755028 BOV_A1077 BOV_A1078     FALSE 0.337 -13.000 0.000 NA   NA
 3755028 3755029 BOV_A1078 BOV_A1079     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755030 3755031 BOV_A1080 BOV_A1081     TRUE 0.905 15.000 0.280 NA   NA
 3755031 3755032 BOV_A1081 BOV_A1082     FALSE 0.248 15.000 0.000 NA   NA
 3755032 3755033 BOV_A1082 BOV_A1083     FALSE 0.104 145.000 0.000 NA   NA
 3755033 3755034 BOV_A1083 BOV_A1084     FALSE 0.106 35.000 0.000 NA   NA
 3755034 3755035 BOV_A1084 BOV_A1085     TRUE 0.978 11.000 0.222 0.061 Y NA
 3755035 3755036 BOV_A1085 BOV_A1086     TRUE 0.984 -34.000 0.381 0.061 Y NA
 3755036 3755037 BOV_A1086 BOV_A1087     TRUE 0.972 -3.000 0.381 1.000   NA
 3755037 3755038 BOV_A1087 BOV_A1088     FALSE 0.061 275.000 0.000 1.000   NA
 3755038 3755039 BOV_A1088 BOV_A1089     TRUE 0.522 143.000 0.000 1.000 Y NA
 3755039 3755040 BOV_A1089 BOV_A1090     TRUE 0.966 16.000 0.389 1.000 Y NA
 3755040 3755041 BOV_A1090 BOV_A1091     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755041 3755042 BOV_A1091 BOV_A1092     FALSE 0.257 -121.000 0.000 NA   NA
 3755042 3755043 BOV_A1092 BOV_A1093     FALSE 0.103 256.000 0.000 1.000 N NA
 3755044 3755045 BOV_A1094 BOV_A1095     FALSE 0.161 150.000 0.000 NA N NA
 3755045 3755046 BOV_A1095 BOV_A1096     TRUE 0.729 202.000 0.177 NA Y NA
 3755046 3755047 BOV_A1096 BOV_A1097     TRUE 0.991 -3.000 0.359 0.061 Y NA
 3755047 3755048 BOV_A1097 BOV_A1098     TRUE 0.967 -3.000 0.128 1.000 Y NA
 3755048 3755049 BOV_A1098 BOV_A1099     TRUE 0.990 -3.000 0.312 0.028 Y NA
 3755050 3755051 BOV_A1100 BOV_A1101 cadA-1 hemN-1 FALSE 0.082 280.000 0.000 1.000 N NA
 3755054 3755055 BOV_A1104 BOV_A1105 repA   TRUE 0.885 65.000 0.333 1.000 N NA
 3755055 3753952 BOV_A1105 BOV_A0001   repC FALSE 0.015 368.000 0.000 NA   NA
 3755056 3755057 BOV_0001 BOV_0002 dnaA dnaN TRUE 0.815 229.000 0.328 1.000 Y NA
 3755057 3755058 BOV_0002 BOV_0003 dnaN recF TRUE 0.872 182.000 0.318 1.000 Y NA
 3755058 3755059 BOV_0003 BOV_0004 recF moeB FALSE 0.355 38.000 0.019 1.000 N NA
 3755060 3755061 BOV_0005 BOV_0006     TRUE 0.943 -3.000 0.179 1.000   NA
 3755061 3755062 BOV_0006 BOV_0007     TRUE 0.990 -3.000 0.744 0.092   NA
 3755062 3755063 BOV_0007 BOV_0008     TRUE 0.994 0.000 0.882 0.061   NA
 3755063 3755064 BOV_0008 BOV_0009     TRUE 0.957 112.000 0.711 0.061   NA
 3755064 3755065 BOV_0009 BOV_0010     TRUE 0.982 14.000 0.391 0.061 Y NA
 3755065 3755066 BOV_0010 BOV_0011     FALSE 0.007 636.000 0.000 NA   NA
 3755066 3755067 BOV_0011 BOV_0012     FALSE 0.007 655.000 0.000 NA   NA
 3755067 3755068 BOV_0012 BOV_0013     FALSE 0.028 469.000 0.000 1.000 N NA
 3755068 3755069 BOV_0013 BOV_0014   mvaB TRUE 0.974 -3.000 0.218 0.063 N NA
 3755069 3755070 BOV_0014 BOV_0015 mvaB   TRUE 0.966 -7.000 0.229 0.063 N NA
 3755070 3755071 BOV_0015 BOV_0016     TRUE 0.952 12.000 0.158 1.000 Y NA
 3755071 3755072 BOV_0016 BOV_0017   ivd TRUE 0.986 0.000 0.316 1.000 Y NA
 3755072 3755073 BOV_0017 BOV_0018 ivd   TRUE 0.473 177.000 0.007 1.000 Y NA
 3755073 3755074 BOV_0018 BOV_0019     FALSE 0.075 185.000 0.000 NA   NA
 3755074 3755075 BOV_0019 BOV_0020     FALSE 0.082 177.000 0.000 NA   NA
 3755075 3755076 BOV_0020 BOV_0022     FALSE 0.054 221.000 0.000 NA   NA
 3755076 3755077 BOV_0022 BOV_0023     FALSE 0.052 225.000 0.000 NA   NA
 3755078 3755079 BOV_0024 BOV_0025 aroA cmk TRUE 0.957 -3.000 0.209 1.000 N NA
 3755079 3755080 BOV_0025 BOV_0026 cmk rpsA TRUE 0.701 216.000 0.281 1.000 N NA
 3755081 3755082 BOV_0027 BOV_0028     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755082 3755083 BOV_0028 BOV_0029     FALSE 0.035 267.000 0.000 NA   NA
 3755085 3755086 BOV_0031 BOV_0032   recR TRUE 0.542 16.000 0.014 1.000 N NA
 3755086 3755087 BOV_0032 BOV_0033 recR   TRUE 0.886 38.000 0.604 NA   NA
 3755087 3755088 BOV_0033 BOV_0034     TRUE 0.882 25.000 0.411 NA   NA
 3755089 3755090 BOV_0035 BOV_0036     TRUE 0.705 29.000 0.108 1.000 N NA
 3755091 3755092 BOV_0037 BOV_0038 pheA kdsB TRUE 0.709 89.000 0.083 1.000 N NA
 3755094 3755095 BOV_0040 BOV_0041     FALSE 0.107 40.000 0.000 NA   NA
 3755096 3755097 BOV_0042 BOV_0043 cyoA cyoB TRUE 0.861 80.000 0.034 0.008 Y NA
 3755097 3755098 BOV_0043 BOV_0044 cyoB cyoC TRUE 0.957 4.000 0.034 0.049 Y NA
 3755098 3755099 BOV_0044 BOV_0045 cyoC cyoD TRUE 0.963 0.000 0.038 0.049 Y NA
 3755099 3755100 BOV_0045 BOV_0046 cyoD   FALSE 0.011 451.000 0.000 NA   NA
 3755100 3755101 BOV_0046 BOV_0047     FALSE 0.010 485.000 0.000 NA   NA
 3755101 3755102 BOV_0047 BOV_0048     TRUE 0.619 189.000 0.212 NA   NA
 3755102 3755103 BOV_0048 BOV_0049     FALSE 0.104 145.000 0.000 NA   NA
 3755106 3755107 BOV_0051 BOV_0053     FALSE 0.019 337.000 0.000 NA   NA
 3755107 3755108 BOV_0053 BOV_0054     FALSE 0.328 11.000 0.000 NA   NA
 3755108 3755109 BOV_0054 BOV_0055     TRUE 0.913 84.000 0.500 NA   NA
 3755109 3755110 BOV_0055 BOV_0056     FALSE 0.049 232.000 0.000 NA   NA
 3755112 3755113 BOV_0058 BOV_0059 pgm   FALSE 0.241 147.000 0.000 1.000 N NA
 3755114 3755115 BOV_0060 BOV_0061   frcK FALSE 0.277 73.000 0.000 1.000   NA
 3755115 3755116 BOV_0061 BOV_0062 frcK   TRUE 0.649 100.000 0.065 1.000 N NA
 3755116 3755117 BOV_0062 BOV_0063     TRUE 0.594 20.000 0.065 NA   NA
 3755117 3755118 BOV_0063 BOV_0064     TRUE 0.888 62.000 0.500 NA   NA
 3755118 3755119 BOV_0064 BOV_0065     FALSE 0.088 166.000 0.000 NA   NA
 3755119 3755120 BOV_0065 BOV_0066     FALSE 0.248 15.000 0.000 NA   NA
 3755120 3755121 BOV_0066 BOV_0067     FALSE 0.264 182.000 0.039 NA   NA
 3755122 3755123 BOV_0068 BOV_0069     TRUE 0.474 0.000 0.000 NA   NA
 3755123 3755124 BOV_0069 BOV_0070     FALSE 0.145 26.000 0.000 NA   NA
 3755125 3755126 BOV_0071 BOV_0072     TRUE 0.976 -13.000 0.750 NA   NA
 3755129 3755130 BOV_0075 BOV_0076     FALSE 0.152 34.000 0.008 NA   NA
 3755130 3755131 BOV_0076 BOV_0077     FALSE 0.048 260.000 0.006 NA   NA
 3755133 3755134 BOV_0079 BOV_0080   phhB TRUE 0.657 88.000 0.094 NA   NA
 3755136 3755137 BOV_0081 BOV_0083     TRUE 0.495 181.000 0.077 1.000 N NA
 3755138 3755139 BOV_0084 BOV_0085     TRUE 0.994 -3.000 0.626 0.091 Y NA
 3755139 3755140 BOV_0085 BOV_0086     FALSE 0.348 234.000 0.101 NA   NA
 3755140 3755141 BOV_0086 BOV_0087   pat TRUE 0.705 115.000 0.149 NA   NA
 3755142 3755143 BOV_0088 BOV_0089     FALSE 0.008 550.000 0.000 NA   NA
 3755146 3755147 BOV_0092 BOV_0093 ccmA ccmB TRUE 0.995 0.000 0.503 0.003 Y NA
 3755147 3755148 BOV_0093 BOV_0094 ccmB ccmC TRUE 0.971 55.000 0.501 0.001 Y NA
 3755148 3755149 BOV_0094 BOV_0095 ccmC ccmD TRUE 0.980 -3.000 0.501 1.000   NA
 3755149 3755150 BOV_0095 BOV_0096 ccmD cycY TRUE 0.941 -3.000 0.172 1.000   NA
 3755151 3755152 BOV_0097 BOV_0098 ilvD   FALSE 0.013 394.000 0.000 NA   NA
 3755152 3755153 BOV_0098 BOV_0099     TRUE 0.474 0.000 0.000 NA   NA
 3755153 3755154 BOV_0099 BOV_0100     FALSE 0.320 178.000 0.000 0.071   NA
 3755157 3755158 BOV_0103 BOV_0104     FALSE 0.032 278.000 0.000 NA   NA
 3755158 3755159 BOV_0104 BOV_0105   cysT-1 TRUE 0.701 95.000 0.020 0.002   NA
 3755159 3755160 BOV_0105 BOV_0106 cysT-1 cysW-1 TRUE 0.993 -10.000 0.935 0.002 N NA
 3755160 3755161 BOV_0106 BOV_0107 cysW-1   TRUE 0.762 17.000 0.015 1.000 Y NA
 3755161 3755162 BOV_0107 BOV_0108     FALSE 0.037 395.000 0.000 1.000 N NA
 3755162 3755163 BOV_0108 BOV_0109   pncB FALSE 0.405 51.000 0.025 1.000 N NA
 3755164 3755165 BOV_0110 BOV_0111     FALSE 0.132 116.000 0.000 NA   NA
 3755165 3755166 BOV_0111 BOV_0112   cscK FALSE 0.355 23.000 0.000 1.000 N NA
 3755166 3755167 BOV_0112 BOV_0113 cscK   TRUE 0.666 91.000 0.067 1.000 N NA
 3755167 3755168 BOV_0113 BOV_0114     TRUE 0.485 121.000 0.036 1.000 N NA
 3755168 3755169 BOV_0114 BOV_0115     FALSE 0.187 304.000 0.000 1.000 Y NA
 3755169 3755170 BOV_0115 BOV_0116     TRUE 0.451 267.000 0.000 0.002 Y NA
 3755170 3755171 BOV_0116 BOV_0117     FALSE 0.091 232.000 0.000 1.000   NA
 3755171 3755172 BOV_0117 BOV_0118     TRUE 0.456 39.000 0.054 1.000   NA
 3755173 3755174 BOV_0119 BOV_0120 polA   TRUE 0.526 142.000 0.000 1.000 Y NA
 3755175 3755176 BOV_0121 BOV_0122 gyrB fghA FALSE 0.037 330.000 0.000 1.000   NA
 3755176 3755177 BOV_0122 BOV_0123 fghA   TRUE 0.494 88.000 0.046 NA   NA
 3755177 3755178 BOV_0123 BOV_0124     TRUE 0.474 0.000 0.000 NA   NA
 3755178 3755179 BOV_0124 BOV_0125     TRUE 0.474 0.000 0.000 NA   NA
 3755179 3755180 BOV_0125 BOV_0126     FALSE 0.107 34.000 0.000 NA   NA
 3755181 3755182 BOV_0127 BOV_0128 hrpB   TRUE 0.588 95.000 0.042 1.000 N NA
 3755182 3755183 BOV_0128 BOV_0129     FALSE 0.165 92.000 0.000 NA   NA
 3755183 3755184 BOV_0129 BOV_0130     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755184 3755185 BOV_0130 BOV_0131     FALSE 0.021 600.000 0.000 1.000 N NA
 3755188 3755189 BOV_0134 BOV_0135     TRUE 0.762 109.000 0.151 1.000   NA
 3755189 3755190 BOV_0135 BOV_0136   trpS TRUE 0.789 7.000 0.042 1.000   NA
 3755192 3755193 BOV_0137 BOV_0139 mviN glnD TRUE 0.795 -64.000 0.081 1.000   NA
 3755197 3755198 BOV_0143 BOV_0144   lspA FALSE 0.032 275.000 0.000 NA   NA
 3755198 3755199 BOV_0144 BOV_0145 lspA   TRUE 0.711 2.000 0.000 1.000 N NA
 3755199 3755200 BOV_0145 BOV_0146     TRUE 0.944 -3.000 0.213 NA   NA
 3755200 3755201 BOV_0146 BOV_0147     FALSE 0.236 113.000 0.014 NA   NA
 3755201 3755202 BOV_0147 BOV_0148   ihfB TRUE 0.833 10.000 0.095 NA   NA
 3755202 3755203 BOV_0148 BOV_0149 ihfB sppA TRUE 0.717 47.000 0.142 1.000 N NA
 3755204 3755205 BOV_0150 BOV_0151     FALSE 0.298 286.000 0.144 NA   NA
 3755205 3755206 BOV_0151 BOV_0152     TRUE 0.920 81.000 0.543 NA   NA
 3755206 3755207 BOV_0152 BOV_0153   rpoN FALSE 0.049 296.000 0.003 1.000   NA
 3755207 3755208 BOV_0153 BOV_0154 rpoN yfiA FALSE 0.013 655.000 0.000 NA N NA
 3755208 3755209 BOV_0154 BOV_0155 yfiA   TRUE 0.884 103.000 0.353 NA N NA
 3755210 3755211 BOV_0156 BOV_0157     TRUE 0.949 106.000 0.955 NA   NA
 3755211 3755212 BOV_0157 BOV_0158     FALSE 0.059 212.000 0.000 NA   NA
 3755214 3755215 BOV_0160 BOV_0161     FALSE 0.348 -10.000 0.000 NA   NA
 3755217 3755218 BOV_0163 BOV_0164     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755218 3755219 BOV_0164 BOV_0165   grpE FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755219 3755220 BOV_0165 BOV_0166 grpE hrcA TRUE 0.760 106.000 0.120 1.000 N NA
 3755221 3755222 BOV_0167 BOV_0168 rph   FALSE 0.311 129.000 0.019 NA N NA
 3755222 3755223 BOV_0168 BOV_0169   rdgB TRUE 0.700 3.000 0.013 NA N NA
 3755223 3755224 BOV_0169 BOV_0170 rdgB   TRUE 0.958 -3.000 0.218 1.000 N NA
 3755224 3755225 BOV_0170 BOV_0171     FALSE 0.285 66.000 0.006 1.000   NA
 3755225 3755226 BOV_0171 BOV_0172     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755226 3755227 BOV_0172 BOV_0173   cysG FALSE 0.057 217.000 0.000 NA   NA
 3755227 3755228 BOV_0173 BOV_0174 cysG   TRUE 0.829 18.000 0.188 NA   NA
 3755228 3755229 BOV_0174 BOV_0175   cysI TRUE 0.955 21.000 0.919 NA   NA
 3755229 3755230 BOV_0175 BOV_0176 cysI cysH TRUE 0.829 -10.000 0.059 1.000 N NA
 3755230 3755231 BOV_0176 BOV_0177 cysH   TRUE 0.652 53.000 0.139 NA   NA
 3755231 3755232 BOV_0177 BOV_0178     TRUE 0.599 2.000 0.011 NA   NA
 3755236 3755237 BOV_0182 BOV_0183 metH   FALSE 0.147 321.000 0.000 0.047 N NA
 3755237 3755238 BOV_0183 BOV_0184     TRUE 0.526 114.000 0.040 1.000 N NA
 3755238 3755239 BOV_0184 BOV_0185   cysD FALSE 0.107 403.000 0.000 1.000 Y NA
 3755239 3755240 BOV_0185 BOV_0186 cysD cysNC TRUE 0.968 0.000 0.096 0.001 N NA
 3755240 3755241 BOV_0186 BOV_0187 cysNC cysQ TRUE 0.953 3.000 0.076 1.000 Y NA
 3755241 3755242 BOV_0187 BOV_0188 cysQ   FALSE 0.114 133.000 0.000 NA   NA
 3755244 3755245 BOV_0190 BOV_0191     FALSE 0.060 211.000 0.000 NA   NA
 3755245 3755246 BOV_0191 BOV_0192   glpD TRUE 0.733 13.000 0.036 1.000 N NA
 3755246 3755247 BOV_0192 BOV_0193 glpD   TRUE 0.637 -114.000 0.048 NA   NA
 3755247 3755248 BOV_0193 BOV_0194     TRUE 0.785 71.000 0.190 NA   NA
 3755248 3755249 BOV_0194 BOV_0195     FALSE 0.019 481.000 0.000 1.000   NA
 3755249 3755250 BOV_0195 BOV_0196     TRUE 0.524 91.000 0.055 NA   NA
 3755250 3755251 BOV_0196 BOV_0197     FALSE 0.232 62.000 0.014 NA   NA
 3755256 3755257 BOV_0202 BOV_0203     TRUE 0.815 -3.000 0.027 1.000 N NA
 3755257 3755258 BOV_0203 BOV_0204     TRUE 0.944 -3.000 0.189 NA N NA
 3755258 3755259 BOV_0204 BOV_0205   thiE FALSE 0.343 24.000 0.013 NA N NA
 3755259 3755260 BOV_0205 BOV_0206 thiE thiG TRUE 0.981 -3.000 0.118 0.005 Y NA
 3755260 3755261 BOV_0206 BOV_0207 thiG thiS TRUE 0.962 2.000 0.095 1.000 Y NA
 3755261 3755262 BOV_0207 BOV_0208 thiS thiO TRUE 0.953 -3.000 0.192 1.000 N NA
 3755262 3755263 BOV_0208 BOV_0209 thiO thiD TRUE 0.808 0.000 0.019 1.000 N NA
 3755264 3755265 BOV_0210 BOV_0212     TRUE 0.867 99.000 0.250 1.000 N NA
 3755266 3755267 BOV_0211 BOV_0213 cueR   TRUE 0.466 106.000 0.021 1.000 N NA
 3755267 3755268 BOV_0213 BOV_0214     TRUE 0.991 -3.000 0.542 1.000 Y NA
 3755268 3755269 BOV_0214 BOV_0215     TRUE 0.811 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3755269 3755270 BOV_0215 BOV_0216     TRUE 0.740 73.000 0.042 0.059 N NA
 3755270 3755271 BOV_0216 BOV_0217     FALSE 0.108 33.000 0.000 NA   NA
 3755271 3755272 BOV_0217 BOV_0218     FALSE 0.027 290.000 0.000 NA   NA
 3755274 3755275 BOV_0219 BOV_0221     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755276 3755277 BOV_0222 BOV_0223 soxB soxD TRUE 0.845 19.000 0.000 0.002 Y NA
 3755277 3755278 BOV_0223 BOV_0224 soxD   TRUE 0.995 0.000 0.867 0.001   NA
 3755278 3755279 BOV_0224 BOV_0225     FALSE 0.328 11.000 0.000 NA   NA
 3755280 3755281 BOV_0226 BOV_0227     FALSE 0.120 58.000 0.000 NA   NA
 3755282 3755283 BOV_0228 BOV_0229     TRUE 0.937 61.000 0.250 0.059 Y NA
 3755283 3755284 BOV_0229 BOV_0230     TRUE 0.989 3.000 0.250 0.059 Y NA
 3755284 3755285 BOV_0230 BOV_0231     TRUE 0.987 8.000 0.318 0.059 Y NA
 3755285 3755286 BOV_0231 BOV_0232     TRUE 0.961 3.000 0.219 1.000 N NA
 3755286 3755287 BOV_0232 BOV_0233     TRUE 0.919 -3.000 0.140 NA   NA
 3755287 3755288 BOV_0233 BOV_0234     TRUE 0.835 -7.000 0.088 NA   NA
 3755288 3755289 BOV_0234 BOV_0235     TRUE 0.457 3.000 0.000 NA   NA
 3755289 3755290 BOV_0235 BOV_0236     TRUE 0.443 4.000 0.000 NA   NA
 3755290 3755291 BOV_0236 BOV_0237     TRUE 0.952 41.000 0.429 0.061 Y NA
 3755291 3755292 BOV_0237 BOV_0238     TRUE 0.905 -64.000 0.097 0.061 N NA
 3755292 3755293 BOV_0238 BOV_0239     FALSE 0.017 2183.000 0.000 1.000 N NA
 3755293 3755294 BOV_0239 BOV_0240     FALSE 0.016 511.000 0.000 NA N NA
 3755294 3755295 BOV_0240 BOV_0241     FALSE 0.061 207.000 0.000 NA   NA
 3755295 3755296 BOV_0241 BOV_0242     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755296 3755297 BOV_0242 BOV_0243     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755297 3755298 BOV_0243 BOV_0244     TRUE 0.474 0.000 0.000 NA   NA
 3755298 3755299 BOV_0244 BOV_0245     FALSE 0.095 154.000 0.000 NA   NA
 3755299 3755300 BOV_0245 BOV_0246     FALSE 0.023 308.000 0.000 NA   NA
 3755300 3755301 BOV_0246 BOV_0248     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755303 3755304 BOV_0249 BOV_0250     FALSE 0.283 -54.000 0.000 NA   NA
 3755304 3755305 BOV_0250 BOV_0251     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755305 3755306 BOV_0251 BOV_0252     FALSE 0.107 34.000 0.000 NA   NA
 3755306 3755307 BOV_0252 BOV_0253     FALSE 0.010 494.000 0.000 NA   NA
 3755307 3755308 BOV_0253 BOV_0254     TRUE 0.901 -3.000 0.094 1.000   NA
 3755309 3755310 BOV_0255 BOV_0256     FALSE 0.140 64.000 0.000 NA   NA
 3755311 3755312 BOV_0257 BOV_0258     FALSE 0.148 66.000 0.000 NA   NA
 3755312 3755313 BOV_0258 BOV_0259     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755313 3755314 BOV_0259 BOV_0260     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755314 3755315 BOV_0260 BOV_0261     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755315 3755316 BOV_0261 BOV_0262     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755317 3755318 BOV_0263 BOV_0264     FALSE 0.007 719.000 0.000 NA   NA
 3755318 3755319 BOV_0264 BOV_0265     FALSE 0.076 184.000 0.000 NA   NA
 3755319 3755320 BOV_0265 BOV_0266   maf-2 TRUE 0.847 10.000 0.102 NA   NA
 3755320 3755321 BOV_0266 BOV_0267 maf-2 infA TRUE 0.739 34.000 0.207 NA N NA
 3755321 3755322 BOV_0267 BOV_0268 infA   TRUE 0.876 25.000 0.293 1.000 N NA
 3755322 3755323 BOV_0268 BOV_0269     FALSE 0.386 7.000 0.000 NA   NA
 3755323 3755324 BOV_0269 BOV_0270   hisD FALSE 0.386 7.000 0.000 NA   NA
 3755324 3755325 BOV_0270 BOV_0271 hisD   TRUE 0.664 75.000 0.096 NA   NA
 3755325 3755326 BOV_0271 BOV_0272   murA FALSE 0.332 271.000 0.138 NA   NA
 3755326 3755327 BOV_0272 BOV_0273 murA   FALSE 0.156 223.000 0.028 NA   NA
 3755328 3755329 BOV_0275 BOV_0277     FALSE 0.167 79.000 0.000 NA   NA
 3755331 3755332 BOV_0278 BOV_0279     FALSE 0.013 650.000 0.000 NA N NA
 3755332 3755333 BOV_0279 BOV_0280     FALSE 0.015 377.000 0.000 NA   NA
 3755333 3755334 BOV_0280 BOV_0281   ureD-1 FALSE 0.006 3025.000 0.000 NA   NA
 3755334 3755335 BOV_0281 BOV_0282 ureD-1 ureA TRUE 0.946 153.000 0.664 0.006 N NA
 3755335 3755336 BOV_0282 BOV_0283 ureA ureB TRUE 0.965 167.000 0.595 0.003 Y NA
 3755336 3755337 BOV_0283 BOV_0284 ureB ureC TRUE 0.982 19.000 0.486 0.003 Y NA
 3755337 3755338 BOV_0284 BOV_0285 ureC ureE TRUE 0.961 16.000 0.315 0.003 N NA
 3755338 3755339 BOV_0285 BOV_0286 ureE   TRUE 0.984 -40.000 0.330 0.006 Y NA
 3755339 3755340 BOV_0286 BOV_0287   ureG-1 TRUE 0.990 -3.000 0.283 0.006 Y NA
 3755341 3755342 BOV_0288 BOV_0289     FALSE 0.092 160.000 0.000 NA   NA
 3755343 3755344 BOV_0290 BOV_0291     TRUE 0.944 15.000 0.442 NA N NA
 3755345 3755346 BOV_0292 BOV_0293 hydA   TRUE 0.717 52.000 0.137 1.000 N NA
 3755347 3755348 BOV_0294 BOV_0295     TRUE 0.779 -3.000 0.028 1.000   NA
 3755349 3755350 BOV_0296 BOV_0297     TRUE 0.983 4.000 0.301 0.010 N NA
 3755350 3755351 BOV_0297 BOV_0298     FALSE 0.072 188.000 0.000 NA   NA
 3755352 3755353 BOV_0299 BOV_0300 pgi   FALSE 0.303 134.000 0.018 1.000   NA
 3755353 3755354 BOV_0300 BOV_0302     TRUE 0.848 -3.000 0.011 0.060   NA
 3755355 3755356 BOV_0301 BOV_0303   fadD FALSE 0.145 26.000 0.000 NA   NA
 3755356 3755357 BOV_0303 BOV_0304 fadD   FALSE 0.046 351.000 0.000 1.000 N NA
 3755358 3755359 BOV_0305 BOV_0306     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755360 3755361 BOV_0307 BOV_0308     FALSE 0.012 430.000 0.000 NA   NA
 3755361 3755362 BOV_0308 BOV_0309     FALSE 0.045 242.000 0.000 NA   NA
 3755367 3755368 BOV_0314 BOV_0315 argD argF TRUE 0.937 5.000 0.058 1.000 Y NA
 3755368 3755369 BOV_0315 BOV_0316 argF   TRUE 0.467 2.000 0.000 NA   NA
 3755370 3755371 BOV_0317 BOV_0318 apaG metZ FALSE 0.134 336.000 0.066 NA N NA
 3755371 3755372 BOV_0318 BOV_0319 metZ   FALSE 0.321 -19.000 0.000 NA   NA
 3755373 3755374 BOV_0320 BOV_0321     FALSE 0.375 97.000 0.005 1.000 N NA
 3755374 3755375 BOV_0321 BOV_0322     TRUE 0.510 87.000 0.050 NA   NA
 3755375 3755376 BOV_0322 BOV_0323     TRUE 0.842 100.000 0.275 NA   NA
 3755376 3755377 BOV_0323 BOV_0324     FALSE 0.238 175.000 0.030 NA   NA
 3755378 3755379 BOV_0325 BOV_0326 pyrD   TRUE 0.898 -3.000 0.108 NA   NA
 3755379 3755380 BOV_0326 BOV_0327     FALSE 0.139 27.000 0.000 NA   NA
 3755380 3755381 BOV_0327 BOV_0328     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755385 3755386 BOV_0332 BOV_0333     FALSE 0.029 285.000 0.000 NA   NA
 3755388 3755389 BOV_0335 BOV_0336 hemA   FALSE 0.243 146.000 0.000 1.000 N NA
 3755389 3755390 BOV_0336 BOV_0337     TRUE 0.857 9.000 0.071 1.000 N NA
 3755390 3755391 BOV_0337 BOV_0338     TRUE 0.459 130.000 0.048 1.000   NA
 3755391 3755392 BOV_0338 BOV_0339     FALSE 0.165 92.000 0.000 NA   NA
 3755392 3755393 BOV_0339 BOV_0340     TRUE 0.672 43.000 0.167 NA   NA
 3755394 3755395 BOV_0341 BOV_0342     TRUE 0.982 -13.000 0.840 1.000   NA
 3755395 3755396 BOV_0342 BOV_0343     FALSE 0.008 547.000 0.000 NA   NA
 3755396 3755397 BOV_0343 BOV_0344     FALSE 0.165 92.000 0.000 NA   NA
 3755397 3755398 BOV_0344 BOV_0345     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755398 3755399 BOV_0345 BOV_0346   panC FALSE 0.340 104.000 0.000 1.000 N NA
 3755399 3755400 BOV_0346 BOV_0347 panC panB TRUE 0.988 -37.000 0.395 0.001 Y NA
 3755401 3755402 BOV_0348 BOV_0349 fpr   FALSE 0.155 178.000 0.004 1.000   NA
 3755403 3755404 BOV_0350 BOV_0351   nspC FALSE 0.106 39.000 0.000 NA   NA
 3755404 3755405 BOV_0351 BOV_0352 nspC   TRUE 0.902 181.000 0.444 1.000 Y NA
 3755406 3755407 BOV_0353 BOV_0354     FALSE 0.116 55.000 0.000 NA   NA
 3755410 3755411 BOV_0357 BOV_0358     TRUE 0.991 -3.000 0.312 0.011 Y NA
 3755411 3755412 BOV_0358 BOV_0359     FALSE 0.089 288.000 0.020 NA N NA
 3755412 3755413 BOV_0359 BOV_0360     TRUE 0.967 12.000 0.283 NA Y NA
 3755413 3755414 BOV_0360 BOV_0361     TRUE 0.773 129.000 0.083 1.000 Y NA
 3755415 3755416 BOV_0362 BOV_0363     TRUE 0.793 13.000 0.091 NA   NA
 3755417 3755418 BOV_0364 BOV_0365   xdhA TRUE 0.566 6.000 0.000 1.000   NA
 3755418 3755419 BOV_0365 BOV_0366 xdhA   FALSE 0.293 13.000 0.000 NA   NA
 3755419 3755420 BOV_0366 BOV_0367   xdhC FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 3755422 3755423 BOV_0369 BOV_0370   guaD FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755423 3755424 BOV_0370 BOV_0372 guaD   FALSE 0.390 20.000 0.000 1.000 N NA
 3755425 3755426 BOV_0371 BOV_0373 ccoS   FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755426 3755427 BOV_0373 BOV_0374     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755427 3755428 BOV_0374 BOV_0375   ccoG TRUE 0.982 0.000 0.506 NA N NA
 3755428 3755429 BOV_0375 BOV_0376 ccoG ccoP TRUE 0.908 152.000 0.203 0.010 Y NA
 3755429 3755430 BOV_0376 BOV_0377 ccoP ccoQ TRUE 0.923 -7.000 0.058 0.003 N NA
 3755430 3755431 BOV_0377 BOV_0378 ccoQ ccoO TRUE 0.922 15.000 0.114 0.003 N NA
 3755431 3755432 BOV_0378 BOV_0379 ccoO ccoN TRUE 0.943 8.000 0.086 0.003 N NA
 3755432 3755433 BOV_0379 BOV_0380 ccoN   FALSE 0.142 218.000 0.000 1.000 N NA
 3755436 3755437 BOV_0383 BOV_0384 ada   FALSE 0.190 182.000 0.000 1.000 N NA
 3755437 3755438 BOV_0384 BOV_0385     FALSE 0.019 336.000 0.000 NA   NA
 3755438 3755439 BOV_0385 BOV_0386     FALSE 0.098 150.000 0.000 NA   NA
 3755439 3755440 BOV_0386 BOV_0388   bacA TRUE 0.483 222.000 0.068 0.058   NA
 3755442 3755443 BOV_0389 BOV_0390   engA TRUE 0.465 22.000 0.026 1.000   NA
 3755443 3755444 BOV_0390 BOV_0391 engA   FALSE 0.165 159.000 0.000 1.000   NA
 3755444 3755445 BOV_0391 BOV_0392     FALSE 0.011 436.000 0.000 NA   NA
 3755445 3755446 BOV_0392 BOV_0393     FALSE 0.034 271.000 0.000 NA   NA
 3755446 3755447 BOV_0393 BOV_0394   atpB TRUE 0.773 108.000 0.195 NA   NA
 3755447 3755448 BOV_0394 BOV_0395 atpB atpE TRUE 0.964 68.000 0.628 0.004   NA
 3755448 3755449 BOV_0395 BOV_0396 atpE   TRUE 0.856 172.000 0.278 0.004   NA
 3755449 3755450 BOV_0396 BOV_0397   atpF TRUE 0.995 11.000 0.863 0.004 Y NA
 3755451 3755452 BOV_0398 BOV_0399 rnhB   TRUE 0.536 177.000 0.022 1.000 Y NA
 3755454 3755455 BOV_0401 BOV_0402     FALSE 0.106 143.000 0.000 NA   NA
 3755455 3755456 BOV_0402 BOV_0403   ispE FALSE 0.016 359.000 0.000 NA   NA
 3755456 3755457 BOV_0403 BOV_0404 ispE   FALSE 0.138 30.000 0.004 NA   NA
 3755457 3755458 BOV_0404 BOV_0405     FALSE 0.029 431.000 0.019 NA   NA
 3755458 3755459 BOV_0405 BOV_0406   nhaA TRUE 0.526 -79.000 0.004 1.000 N NA
 3755459 3755460 BOV_0406 BOV_0407 nhaA   FALSE 0.107 40.000 0.000 NA   NA
 3755460 3755461 BOV_0407 BOV_0408     FALSE 0.156 68.000 0.000 NA   NA
 3755461 3755462 BOV_0408 BOV_0409     TRUE 0.932 21.000 0.525 1.000   NA
 3755463 3755464 BOV_0410 BOV_0411     FALSE 0.125 304.000 0.028 1.000 N NA
 3755464 3755465 BOV_0411 BOV_0412   glyQ FALSE 0.340 129.000 0.013 1.000 N NA
 3755465 3755466 BOV_0412 BOV_0413 glyQ glyS TRUE 0.996 6.000 0.651 0.001 Y NA
 3755466 3755467 BOV_0413 BOV_0414 glyS   TRUE 0.478 139.000 0.003 NA Y NA
 3755467 3755468 BOV_0414 BOV_0415     TRUE 0.760 26.000 0.158 NA N NA
 3755469 3755470 BOV_0416 BOV_0417     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755472 3755473 BOV_0419 BOV_0420     TRUE 0.985 3.000 0.303 1.000 Y NA
 3755478 3755479 BOV_0425 BOV_0426     TRUE 0.505 145.000 0.087 NA   NA
 3755481 3755482 BOV_0428 BOV_0429 fabI-1   TRUE 0.855 52.000 0.397 NA N NA
 3755482 3755483 BOV_0429 BOV_0430     FALSE 0.065 262.000 0.000 NA N NA
 3755483 3755484 BOV_0430 BOV_0431     FALSE 0.106 143.000 0.000 NA   NA
 3755484 3755485 BOV_0431 BOV_0432     FALSE 0.122 124.000 0.000 NA   NA
 3755485 3755486 BOV_0432 BOV_0433     FALSE 0.167 77.000 0.000 NA   NA
 3755488 3755489 BOV_0435 BOV_0436 aroC ribAB FALSE 0.388 136.000 0.023 1.000 N NA
 3755489 3755490 BOV_0436 BOV_0437 ribAB   FALSE 0.235 216.000 0.023 1.000 N NA
 3755490 3755491 BOV_0437 BOV_0438   xseB TRUE 0.774 5.000 0.019 1.000 N NA
 3755492 3755493 BOV_0439 BOV_0440     TRUE 0.470 167.000 0.091 NA   NA
 3755494 3755495 BOV_0441 BOV_0442     FALSE 0.094 157.000 0.000 NA   NA
 3755495 3755496 BOV_0442 BOV_0443   dxs FALSE 0.106 143.000 0.000 NA   NA
 3755496 3755497 BOV_0443 BOV_0444 dxs tlyA TRUE 0.945 6.000 0.189 1.000 N NA
 3755497 3755498 BOV_0444 BOV_0445 tlyA   TRUE 0.932 -3.000 0.062 NA Y NA
 3755500 3755501 BOV_0447 BOV_0448     FALSE 0.211 186.000 0.029 NA   NA
 3755501 3755502 BOV_0448 BOV_0449     TRUE 0.697 203.000 0.290 1.000   NA
 3755502 3755503 BOV_0449 BOV_0450     TRUE 0.671 105.000 0.075 1.000 N NA
 3755503 3755504 BOV_0450 BOV_0451     TRUE 0.989 5.000 0.466 1.000 Y NA
 3755505 3755506 BOV_0452 BOV_0453   purF TRUE 0.640 42.000 0.100 1.000 N NA
 3755506 3755507 BOV_0453 BOV_0454 purF   FALSE 0.371 243.000 0.101 1.000   NA
 3755507 3755508 BOV_0454 BOV_0455   radA TRUE 0.611 126.000 0.094 1.000   NA
 3755508 3755509 BOV_0455 BOV_0456 radA dnaB TRUE 0.660 28.000 0.010 0.001 N NA
 3755509 3755510 BOV_0456 BOV_0457 dnaB cfa FALSE 0.163 199.000 0.000 1.000 N NA
 3755510 3755511 BOV_0457 BOV_0458 cfa rplI FALSE 0.041 374.000 0.000 1.000 N NA
 3755511 3755512 BOV_0458 BOV_0459 rplI   FALSE 0.400 30.000 0.043 NA   NA
 3755512 3755513 BOV_0459 BOV_0460   rpsR FALSE 0.285 151.000 0.033 NA   NA
 3755513 3755514 BOV_0460 BOV_0461 rpsR rpsF TRUE 0.991 3.000 0.319 0.015 Y NA
 3755515 3755516 BOV_0462 BOV_0463 fabD fabG TRUE 0.973 70.000 0.432 0.005 Y NA
 3755516 3755517 BOV_0463 BOV_0464 fabG acpP TRUE 0.836 274.000 0.321 0.005 Y NA
 3755517 3755518 BOV_0464 BOV_0465 acpP fabF FALSE 0.404 324.000 0.106 1.000 Y NA
 3755518 3755519 BOV_0465 BOV_0466 fabF   TRUE 0.610 147.000 0.134 NA   NA
 3755519 3755520 BOV_0466 BOV_0467     FALSE 0.120 58.000 0.000 NA   NA
 3755520 3755521 BOV_0467 BOV_0468     FALSE 0.261 -112.000 0.000 NA   NA
 3755521 3755522 BOV_0468 BOV_0469   gmk TRUE 0.941 9.000 0.276 NA   NA
 3755523 3755524 BOV_0470 BOV_0471     FALSE 0.328 142.000 0.037 NA   NA
 3755524 3755525 BOV_0471 BOV_0472     FALSE 0.066 198.000 0.000 NA   NA
 3755526 3755527 BOV_0473 BOV_0474   ctaD FALSE 0.111 138.000 0.000 NA   NA
 3755527 3755528 BOV_0474 BOV_0475 ctaD cyoE TRUE 0.641 237.000 0.153 0.058 N NA
 3755528 3755529 BOV_0475 BOV_0476 cyoE   TRUE 0.615 0.000 0.012 NA   NA
 3755529 3755530 BOV_0476 BOV_0477   ctaG FALSE 0.334 20.000 0.017 NA   NA
 3755530 3755531 BOV_0477 BOV_0478 ctaG coxC TRUE 0.826 209.000 0.536 1.000 N NA
 3755531 3755532 BOV_0478 BOV_0479 coxC   TRUE 0.533 -3.000 0.007 NA   NA
 3755532 3755533 BOV_0479 BOV_0480   ispH TRUE 0.605 31.000 0.105 NA   NA
 3755533 3755534 BOV_0480 BOV_0481 ispH thrB TRUE 0.954 6.000 0.251 1.000   NA
 3755534 3755535 BOV_0481 BOV_0482 thrB rnhA TRUE 0.912 -3.000 0.104 1.000   NA
 3755536 3755537 BOV_0483 BOV_0484     TRUE 0.885 180.000 0.357 1.000 Y NA
 3755539 3755540 BOV_0486 BOV_0487     TRUE 0.969 -3.000 0.293 1.000 N NA
 3755540 3755541 BOV_0487 BOV_0488     TRUE 0.888 171.000 0.674 1.000   NA
 3755541 3755542 BOV_0488 BOV_0489   thrC TRUE 0.677 54.000 0.129 1.000   NA
 3755543 3755544 BOV_0490 BOV_0491     FALSE 0.023 314.000 0.000 NA   NA
 3755544 3755545 BOV_0491 BOV_0492     FALSE 0.161 99.000 0.000 NA   NA
 3755546 3755547 BOV_0493 BOV_0494     FALSE 0.100 148.000 0.000 NA   NA
 3755549 3755550 BOV_0496 BOV_0497   mutY TRUE 0.717 -3.000 0.016 1.000   NA
 3755551 3755552 BOV_0498 BOV_0499     TRUE 0.783 154.000 0.333 NA   NA
 3755552 3755553 BOV_0499 BOV_0500   smc TRUE 0.583 79.000 0.039 1.000 N NA
 3755553 3755554 BOV_0500 BOV_0501 smc   FALSE 0.355 23.000 0.000 1.000 N NA
 3755556 3755557 BOV_0503 BOV_0505 ppdK   FALSE 0.372 214.000 0.005 1.000 Y NA
 3755558 3755559 BOV_0504 BOV_0506     FALSE 0.307 -25.000 0.000 NA   NA
 3755562 3755563 BOV_0509 BOV_0510     TRUE 0.649 136.000 0.143 NA   NA
 3755563 3755564 BOV_0510 BOV_0511   uraH TRUE 0.811 12.000 0.074 1.000   NA
 3755564 3755565 BOV_0511 BOV_0512 uraH   FALSE 0.163 71.000 0.000 NA   NA
 3755565 3755566 BOV_0512 BOV_0514     FALSE 0.009 537.000 0.000 NA   NA
 3755568 3755569 BOV_0515 BOV_0516     FALSE 0.061 206.000 0.000 NA   NA
 3755569 3755570 BOV_0516 BOV_0517     FALSE 0.256 -268.000 0.000 NA   NA
 3755570 3755571 BOV_0517 BOV_0518     FALSE 0.118 57.000 0.000 NA   NA
 3755571 3755572 BOV_0518 BOV_0519     FALSE 0.147 109.000 0.000 NA   NA
 3755572 3755573 BOV_0519 BOV_0520     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755574 3755575 BOV_0521 BOV_0522     FALSE 0.139 27.000 0.000 NA   NA
 3755575 3755576 BOV_0522 BOV_0523     FALSE 0.088 167.000 0.000 NA   NA
 3755576 3755577 BOV_0523 BOV_0524     TRUE 0.952 -111.000 0.130 0.095 Y NA
 3755577 3755578 BOV_0524 BOV_0525     TRUE 0.960 0.000 0.087 1.000 Y NA
 3755578 3755579 BOV_0525 BOV_0526   gmd-2 FALSE 0.144 344.000 0.000 1.000 Y NA
 3755580 3755581 BOV_0527 BOV_0528     FALSE 0.268 -81.000 0.000 NA   NA
 3755581 3755582 BOV_0528 BOV_0529     FALSE 0.127 30.000 0.000 NA   NA
 3755582 3755583 BOV_0529 BOV_0530     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755583 3755584 BOV_0530 BOV_0531     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755584 3755585 BOV_0531 BOV_0532     TRUE 0.471 1.000 0.000 NA   NA
 3755585 3755586 BOV_0532 BOV_0533     FALSE 0.115 131.000 0.000 NA   NA
 3755586 3755587 BOV_0533 BOV_0534     FALSE 0.195 58.000 0.000 NA N NA
 3755587 3755588 BOV_0534 BOV_0535     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA Y NA
 3755590 3755591 BOV_0537 BOV_0538     TRUE 0.955 -81.000 0.261 NA Y NA
 3755591 3755592 BOV_0538 BOV_0539     FALSE 0.091 360.000 0.000 0.053   NA
 3755592 3755593 BOV_0539 BOV_0540     FALSE 0.157 166.000 0.000 1.000   NA
 3755593 3755594 BOV_0540 BOV_0541     FALSE 0.334 25.000 0.000 1.000 N NA
 3755594 3755595 BOV_0541 BOV_0542     FALSE 0.108 33.000 0.000 NA   NA
 3755595 3755596 BOV_0542 BOV_0543     FALSE 0.114 50.000 0.000 NA   NA
 3755596 3755597 BOV_0543 BOV_0544   rbsA-1 FALSE 0.007 659.000 0.000 NA   NA
 3755597 3755598 BOV_0544 BOV_0545 rbsA-1 rbsC-1 TRUE 0.967 21.000 0.300 0.005 Y NA
 3755598 3755599 BOV_0545 BOV_0546 rbsC-1 rbsB-1 TRUE 0.906 79.000 0.217 NA Y NA
 3755599 3755600 BOV_0546 BOV_0547 rbsB-1   TRUE 0.664 58.000 0.043 NA Y NA
 3755600 3755601 BOV_0547 BOV_0548     TRUE 0.907 72.000 0.481 NA   NA
 3755602 3755603 BOV_0549 BOV_0550 xylA xylB TRUE 0.782 47.000 0.094 1.000 Y NA
 3755603 3755604 BOV_0550 BOV_0551 xylB   TRUE 0.901 33.000 0.300 1.000 Y NA
 3755604 3755605 BOV_0551 BOV_0552     FALSE 0.231 263.000 0.000 0.044 N NA
 3755605 3755606 BOV_0552 BOV_0553   betB FALSE 0.024 539.000 0.000 1.000 N NA
 3755606 3755607 BOV_0553 BOV_0554 betB betA TRUE 0.876 186.000 0.634 1.000 N NA
 3755607 3755608 BOV_0554 BOV_0555 betA betI TRUE 0.813 3.000 0.024 1.000 N NA
 3755609 3755610 BOV_0556 BOV_0558     FALSE 0.260 45.000 0.000 1.000 N NA
 3755611 3755612 BOV_0557 BOV_0559     TRUE 0.755 -3.000 0.035 NA   NA
 3755612 3755613 BOV_0559 BOV_0560     FALSE 0.425 61.000 0.049 NA   NA
 3755614 3755615 BOV_0561 BOV_0562     TRUE 0.789 132.000 0.250 NA N NA
 3755618 3755619 BOV_0565 BOV_0566   dehII FALSE 0.106 37.000 0.000 NA   NA
 3755621 3755622 BOV_0568 BOV_0569   ptrB FALSE 0.315 67.000 0.020 NA   NA
 3755625 3755626 BOV_0572 BOV_0573     TRUE 0.742 -3.000 0.032 NA   NA
 3755626 3755627 BOV_0573 BOV_0574     FALSE 0.165 91.000 0.000 NA   NA
 3755628 3755629 BOV_0575 BOV_0576     FALSE 0.419 80.000 0.032 NA   NA
 3755630 3755631 BOV_0577 BOV_0578     TRUE 0.923 -73.000 0.267 1.000   NA
 3755631 3755632 BOV_0578 BOV_0579     TRUE 0.724 14.000 0.071 NA   NA
 3755633 3755634 BOV_0580 BOV_0581     FALSE 0.233 198.000 0.039 NA   NA
 3755634 3755635 BOV_0581 BOV_0582     TRUE 0.983 -7.000 0.941 NA   NA
 3755635 3755636 BOV_0582 BOV_0583     TRUE 0.975 7.000 0.582 NA   NA
 3755637 3755638 BOV_0584 BOV_0585     FALSE 0.264 -94.000 0.000 NA   NA
 3755638 3755639 BOV_0585 BOV_0586     FALSE 0.386 7.000 0.000 NA   NA
 3755639 3755640 BOV_0586 BOV_0587     FALSE 0.257 32.000 0.022 NA   NA
 3755640 3755641 BOV_0587 BOV_0588     TRUE 0.786 -3.000 0.044 NA   NA
 3755641 3755642 BOV_0588 BOV_0589     TRUE 0.894 -13.000 0.167 NA   NA
 3755642 3755643 BOV_0589 BOV_0590     FALSE 0.168 22.000 0.000 NA   NA
 3755643 3755644 BOV_0590 BOV_0591     FALSE 0.089 165.000 0.000 NA   NA
 3755644 3755645 BOV_0591 BOV_0592     TRUE 0.821 -3.000 0.058 NA   NA
 3755645 3755646 BOV_0592 BOV_0593     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755646 3755647 BOV_0593 BOV_0594     FALSE 0.289 -40.000 0.000 NA   NA
 3755647 3755648 BOV_0594 BOV_0595     FALSE 0.108 41.000 0.000 NA   NA
 3755648 3755649 BOV_0595 BOV_0596     TRUE 0.457 3.000 0.000 NA   NA
 3755649 3755650 BOV_0596 BOV_0597     FALSE 0.309 195.000 0.062 NA   NA
 3755650 3755651 BOV_0597 BOV_0598     TRUE 0.457 3.000 0.000 NA   NA
 3755651 3755652 BOV_0598 BOV_0599     FALSE 0.151 25.000 0.000 NA   NA
 3755652 3755653 BOV_0599 BOV_0600     TRUE 0.880 4.000 0.091 NA   NA
 3755653 3755654 BOV_0600 BOV_0601     TRUE 0.709 66.000 0.136 NA   NA
 3755654 3755655 BOV_0601 BOV_0602     TRUE 0.592 162.000 0.143 NA   NA
 3755655 3755656 BOV_0602 BOV_0603     TRUE 0.821 79.000 0.223 NA   NA
 3755656 3755657 BOV_0603 BOV_0604     TRUE 0.981 75.000 0.713 0.084 Y NA
 3755657 3755658 BOV_0604 BOV_0605     FALSE 0.354 61.000 0.023 NA N NA
 3755658 3755659 BOV_0605 BOV_0606   ccmI TRUE 0.487 65.000 0.041 NA N NA
 3755659 3755660 BOV_0606 BOV_0607 ccmI ccmE TRUE 0.958 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 3755660 3755661 BOV_0607 BOV_0608 ccmE ccmF TRUE 0.942 20.000 0.125 0.003 Y NA
 3755661 3755662 BOV_0608 BOV_0609 ccmF ccmh TRUE 0.991 -3.000 0.644 NA Y NA
 3755662 3755663 BOV_0609 BOV_0610 ccmh   TRUE 0.843 142.000 0.200 NA Y NA
 3755663 3755664 BOV_0610 BOV_0611     TRUE 0.856 94.000 0.222 1.000 N NA
 3755664 3755665 BOV_0611 BOV_0612     TRUE 0.994 0.000 0.733 1.000 Y NA
 3755665 3755666 BOV_0612 BOV_0613   glnE TRUE 0.778 123.000 0.081 1.000 Y NA
 3755667 3755668 BOV_0614 BOV_0615     FALSE 0.342 103.000 0.000 1.000 N NA
 3755668 3755669 BOV_0615 BOV_0616   pepN FALSE 0.070 391.000 0.025 1.000 N NA
 3755671 3755672 BOV_0618 BOV_0619     FALSE 0.246 162.000 0.007 1.000 N NA
 3755674 3755675 BOV_0621 BOV_0622   amn FALSE 0.301 64.000 0.021 NA   NA
 3755675 3755676 BOV_0622 BOV_0623 amn   FALSE 0.165 41.000 0.011 NA   NA
 3755682 3755683 BOV_0629 BOV_0630     FALSE 0.354 -27.000 0.005 NA   NA
 3755683 3755684 BOV_0630 BOV_0631     FALSE 0.079 282.000 0.000 1.000 N NA
 3755684 3755685 BOV_0631 BOV_0632     FALSE 0.033 274.000 0.000 NA   NA
 3755685 3755686 BOV_0632 BOV_0633     FALSE 0.079 180.000 0.000 NA   NA
 3755687 3755688 BOV_0634 BOV_0635     FALSE 0.105 144.000 0.000 NA   NA
 3755688 3755689 BOV_0635 BOV_0636     FALSE 0.117 56.000 0.000 NA   NA
 3755689 3755690 BOV_0636 BOV_0637     FALSE 0.127 61.000 0.000 NA   NA
 3755692 3755693 BOV_0639 BOV_0640   dapA FALSE 0.014 388.000 0.000 NA   NA
 3755693 3755694 BOV_0640 BOV_0641 dapA smpB TRUE 0.636 97.000 0.058 1.000 N NA
 3755695 3755696 BOV_0642 BOV_0643     FALSE 0.123 31.000 0.000 NA   NA
 3755697 3755698 BOV_0644 BOV_0645     TRUE 0.491 241.000 0.058 1.000 Y NA
 3755698 3755699 BOV_0645 BOV_0646   pyrE TRUE 0.847 8.000 0.062 1.000 N NA
 3755699 3755700 BOV_0646 BOV_0647 pyrE   FALSE 0.261 160.000 0.008 1.000 N NA
 3755700 3755701 BOV_0647 BOV_0648   hemN-2 FALSE 0.040 381.000 0.000 1.000 N NA
 3755703 3755704 BOV_0650 BOV_0651     FALSE 0.159 53.000 0.007 NA   NA
 3755704 3755705 BOV_0651 BOV_0652   acpS TRUE 0.736 -3.000 0.032 NA   NA
 3755705 3755706 BOV_0652 BOV_0653 acpS lepB FALSE 0.421 111.000 0.017 1.000 N NA
 3755706 3755707 BOV_0653 BOV_0654 lepB rnc TRUE 0.591 -67.000 0.012 1.000 N NA
 3755707 3755708 BOV_0654 BOV_0655 rnc   FALSE 0.109 43.000 0.000 NA   NA
 3755708 3755709 BOV_0655 BOV_0656   era TRUE 0.443 4.000 0.000 NA   NA
 3755709 3755710 BOV_0656 BOV_0658 era recO FALSE 0.381 27.000 0.021 1.000   NA
 3755711 3755712 BOV_0657 BOV_0659     TRUE 0.954 -3.000 0.258 NA   NA
 3755712 3755713 BOV_0659 BOV_0660   ygfZ TRUE 0.796 0.000 0.039 NA   NA
 3755717 3755718 BOV_0663 BOV_0665     TRUE 0.833 157.000 0.462 NA   NA
 3755718 3755719 BOV_0665 BOV_0666     TRUE 0.779 128.000 0.259 NA   NA
 3755720 3755721 BOV_0667 BOV_0668     FALSE 0.116 55.000 0.000 NA   NA
 3755721 3755722 BOV_0668 BOV_0669     FALSE 0.111 46.000 0.000 NA   NA
 3755722 3755723 BOV_0669 BOV_0670   cysS FALSE 0.022 319.000 0.000 NA   NA
 3755723 3755724 BOV_0670 BOV_0671 cysS   TRUE 0.704 -18.000 0.021 1.000 N NA
 3755724 3755725 BOV_0671 BOV_0672   rarD FALSE 0.096 304.000 0.026 1.000   NA
 3755725 3755726 BOV_0672 BOV_0673 rarD   FALSE 0.236 125.000 0.006 1.000   NA
 3755727 3755728 BOV_0674 BOV_0675 ksgA pdxA TRUE 0.954 -3.000 0.197 1.000 N NA
 3755728 3755729 BOV_0675 BOV_0676 pdxA   TRUE 0.928 65.000 0.561 1.000 N NA
 3755729 3755730 BOV_0676 BOV_0677     FALSE 0.278 311.000 0.112 1.000 N NA
 3755730 3755731 BOV_0677 BOV_0678     TRUE 0.800 21.000 0.153 1.000   NA
 3755731 3755732 BOV_0678 BOV_0679     TRUE 0.990 -3.000 0.631 0.056   NA
 3755733 3755734 BOV_0680 BOV_0681     TRUE 0.861 72.000 0.230 1.000 N NA
 3755734 3755735 BOV_0681 BOV_0682     TRUE 0.544 0.000 0.006 NA   NA
 3755736 3755737 BOV_0683 BOV_0684     TRUE 0.660 4.000 0.019 NA   NA
 3755739 3755740 BOV_0686 BOV_0687   moaE FALSE 0.101 147.000 0.003 NA   NA
 3755740 3755741 BOV_0687 BOV_0688 moaE moaD TRUE 0.995 2.000 0.501 0.004 Y NA
 3755741 3755742 BOV_0688 BOV_0689 moaD pgsA TRUE 0.900 5.000 0.082 1.000 N NA
 3755742 3755743 BOV_0689 BOV_0690 pgsA uvrC TRUE 0.819 119.000 0.227 1.000 N NA
 3755743 3755744 BOV_0690 BOV_0691 uvrC   TRUE 0.786 0.000 0.014 1.000 N NA
 3755746 3755747 BOV_0693 BOV_0694     TRUE 0.464 55.000 0.036 1.000 N NA
 3755747 3755748 BOV_0694 BOV_0695     FALSE 0.293 13.000 0.000 NA   NA
 3755748 3755749 BOV_0695 BOV_0696     FALSE 0.161 38.000 0.010 NA   NA
 3755750 3755751 BOV_0697 BOV_0698     TRUE 0.585 78.000 0.054 1.000   NA
 3755752 3755753 BOV_0699 BOV_0700   purN FALSE 0.151 131.000 0.007 NA   NA
 3755753 3755754 BOV_0700 BOV_0701 purN purM TRUE 0.989 -3.000 0.230 0.003 Y NA
 3755754 3755755 BOV_0701 BOV_0702 purM   FALSE 0.017 350.000 0.000 NA   NA
 3755756 3755757 BOV_0703 BOV_0704     TRUE 0.816 40.000 0.362 NA   NA
 3755757 3755758 BOV_0704 BOV_0706     TRUE 0.657 -3.000 0.009 NA N NA
 3755759 3755760 BOV_0705 BOV_0707     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 3755760 3755761 BOV_0707 BOV_0708     FALSE 0.090 162.000 0.000 NA   NA
 3755764 3755765 BOV_0711 BOV_0712     FALSE 0.093 159.000 0.000 NA   NA
 3755765 3755766 BOV_0712 BOV_0713     FALSE 0.161 98.000 0.000 NA   NA
 3755766 3755767 BOV_0713 BOV_0714     FALSE 0.014 392.000 0.000 NA   NA
 3755768 3755769 BOV_0715 BOV_0716     FALSE 0.039 325.000 0.000 1.000   NA
 3755769 3755770 BOV_0716 BOV_0717     TRUE 0.601 -3.000 0.000 1.000   NA
 3755770 3755771 BOV_0717 BOV_0718     TRUE 0.766 -58.000 0.067 1.000   NA
 3755771 3755772 BOV_0718 BOV_0719     FALSE 0.006 1103.000 0.000 NA   NA
 3755774 3755775 BOV_0720 BOV_0722     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755776 3755777 BOV_0723 BOV_0724     FALSE 0.030 281.000 0.000 NA   NA
 3755777 3755778 BOV_0724 BOV_0725     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755778 3755779 BOV_0725 BOV_0726     TRUE 0.471 1.000 0.000 NA   NA
 3755779 3755780 BOV_0726 BOV_0727     FALSE 0.006 1019.000 0.000 NA   NA
 3755782 3755783 BOV_0729 BOV_0730     FALSE 0.011 454.000 0.000 NA   NA
 3755783 3755784 BOV_0730 BOV_0731     FALSE 0.348 -10.000 0.000 NA   NA
 3755785 3755786 BOV_0732 BOV_0733     FALSE 0.107 34.000 0.000 NA   NA
 3755786 3755787 BOV_0733 BOV_0734   metC FALSE 0.007 653.000 0.000 NA   NA
 3755788 3755789 BOV_0735 BOV_0736     FALSE 0.020 456.000 0.000 1.000   NA
 3755789 3755790 BOV_0736 BOV_0737     TRUE 0.967 126.000 0.548 0.054 Y NA
 3755790 3755791 BOV_0737 BOV_0738     TRUE 0.994 3.000 0.815 0.010 N NA
 3755791 3755792 BOV_0738 BOV_0739     TRUE 0.971 15.000 0.734 1.000 N NA
 3755793 3755794 BOV_0740 BOV_0741     TRUE 0.919 30.000 0.745 NA   NA
 3755795 3755796 BOV_0742 BOV_0743 ppk   TRUE 0.970 -3.000 0.149 1.000 Y NA
 3755800 3755801 BOV_0747 BOV_0748     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755801 3755802 BOV_0748 BOV_0749   parC TRUE 0.591 63.000 0.000 1.000 Y NA
 3755803 3755804 BOV_0750 BOV_0751     TRUE 0.653 121.000 0.128 NA   NA
 3755804 3755805 BOV_0751 BOV_0752   hemB FALSE 0.386 147.000 0.055 NA   NA
 3755806 3755807 BOV_0753 BOV_0754     TRUE 0.928 14.000 0.347 NA   NA
 3755807 3755808 BOV_0754 BOV_0755     TRUE 0.499 231.000 0.192 NA   NA
 3755810 3755811 BOV_0757 BOV_0758   glyA TRUE 0.447 231.000 0.123 1.000   NA
 3755811 3755812 BOV_0758 BOV_0759 glyA nrdR FALSE 0.238 242.000 0.052 NA N NA
 3755812 3755813 BOV_0759 BOV_0760 nrdR ribD TRUE 0.966 2.000 0.277 NA N NA
 3755813 3755814 BOV_0760 BOV_0761 ribD ribE TRUE 0.990 0.000 0.456 1.000 Y NA
 3755814 3755815 BOV_0761 BOV_0762 ribE ribH TRUE 0.871 95.000 0.030 0.001 Y NA
 3755815 3755816 BOV_0762 BOV_0763 ribH nusB TRUE 0.969 6.000 0.347 1.000 N NA
 3755816 3755817 BOV_0763 BOV_0764 nusB hppA FALSE 0.082 280.000 0.000 1.000 N NA
 3755819 3755820 BOV_0766 BOV_0767     TRUE 0.506 120.000 0.071 NA   NA
 3755820 3755821 BOV_0767 BOV_0768   plsX FALSE 0.411 118.000 0.044 NA   NA
 3755821 3755822 BOV_0768 BOV_0769 plsX fabH TRUE 0.881 248.000 0.380 0.004 Y NA
 3755822 3755823 BOV_0769 BOV_0771 fabH ihfA TRUE 0.787 56.000 0.207 1.000 N NA
 3755826 3755827 BOV_0773 BOV_0774 sugE   FALSE 0.120 58.000 0.000 NA   NA
 3755827 3755828 BOV_0774 BOV_0775     FALSE 0.060 209.000 0.000 NA   NA
 3755828 3755829 BOV_0775 BOV_0776     FALSE 0.111 354.000 0.000 NA Y NA
 3755830 3755831 BOV_0777 BOV_0778     FALSE 0.109 43.000 0.000 NA   NA
 3755833 3755834 BOV_0780 BOV_0781     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755834 3755835 BOV_0781 BOV_0782     FALSE 0.133 226.000 0.000 1.000 N NA
 3755836 3755837 BOV_0783 BOV_0784 argC speB TRUE 0.873 70.000 0.124 1.000 Y NA
 3755839 3755840 BOV_0786 BOV_0787 rpsI rplM TRUE 0.989 3.000 0.231 0.015 Y NA
 3755840 3755841 BOV_0787 BOV_0788 rplM   FALSE 0.128 236.000 0.015 NA N NA
 3755843 3755844 BOV_0789 BOV_0791     FALSE 0.316 12.000 0.000 NA   NA
 3755846 3755847 BOV_0793 BOV_0794     FALSE 0.167 78.000 0.000 NA   NA
 3755850 3755851 BOV_0797 BOV_0798 nuoA nuoB TRUE 0.990 -9.000 0.396 0.003 Y NA
 3755851 3755852 BOV_0798 BOV_0799 nuoB nuoC TRUE 0.953 113.000 0.262 0.003 Y NA
 3755852 3755853 BOV_0799 BOV_0800 nuoC nuoD TRUE 0.982 18.000 0.483 0.007 Y NA
 3755853 3755854 BOV_0800 BOV_0801 nuoD nuoE TRUE 0.993 0.000 0.355 0.007 Y NA
 3755854 3755855 BOV_0801 BOV_0802 nuoE nuoF TRUE 0.992 4.000 0.343 0.007 Y NA
 3755855 3755856 BOV_0802 BOV_0803 nuoF nuoG TRUE 0.956 135.000 0.395 0.007 Y NA
 3755856 3755857 BOV_0803 BOV_0804 nuoG nuoH TRUE 0.983 18.000 0.515 0.007 Y NA
 3755857 3755858 BOV_0804 BOV_0805 nuoH nuoI TRUE 0.989 13.000 0.500 0.007 Y NA
 3755858 3755859 BOV_0805 BOV_0806 nuoI nuoJ TRUE 0.946 174.000 0.442 0.007 Y NA
 3755859 3755860 BOV_0806 BOV_0807 nuoJ nuoK TRUE 0.988 -91.000 0.484 0.003 Y NA
 3755860 3755861 BOV_0807 BOV_0808 nuoK nuoL TRUE 0.992 8.000 0.451 0.007 Y NA
 3755861 3755862 BOV_0808 BOV_0809 nuoL nuoM TRUE 0.991 0.000 0.251 0.002 Y NA
 3755862 3755863 BOV_0809 BOV_0810 nuoM nuoN TRUE 0.978 22.000 0.453 0.002 Y NA
 3755863 3755864 BOV_0810 BOV_0811 nuoN   TRUE 0.893 26.000 0.372 1.000 N NA
 3755864 3755865 BOV_0811 BOV_0812     TRUE 0.726 194.000 0.307 1.000   NA
 3755865 3755866 BOV_0812 BOV_0813   mce TRUE 0.616 40.000 0.105 1.000   NA
 3755866 3755867 BOV_0813 BOV_0814 mce   TRUE 0.935 3.000 0.172 NA   NA
 3755867 3755868 BOV_0814 BOV_0815     FALSE 0.016 358.000 0.000 NA   NA
 3755868 3755869 BOV_0815 BOV_0816   proS FALSE 0.017 350.000 0.000 NA   NA
 3755869 3755870 BOV_0816 BOV_0817 proS   TRUE 0.680 69.000 0.076 1.000 N NA
 3755870 3755871 BOV_0817 BOV_0818   lolD TRUE 0.987 0.000 0.620 1.000 N NA
 3755871 3755872 BOV_0818 BOV_0819 lolD dnaE FALSE 0.021 659.000 0.005 1.000 N NA
 3755872 3755873 BOV_0819 BOV_0820 dnaE   FALSE 0.108 41.000 0.000 NA   NA
 3755874 3755875 BOV_0821 BOV_0822     FALSE 0.033 272.000 0.000 NA   NA
 3755876 3755877 BOV_0823 BOV_0824 rpsD   FALSE 0.016 509.000 0.000 NA N NA
 3755877 3755878 BOV_0824 BOV_0825     TRUE 0.579 -13.000 0.012 NA N NA
 3755879 3755880 BOV_0826 BOV_0827     FALSE 0.421 271.000 0.147 1.000 N NA
 3755880 3755881 BOV_0827 BOV_0828     TRUE 0.773 125.000 0.216 NA N NA
 3755881 3755882 BOV_0828 BOV_0829   purL FALSE 0.285 270.000 0.093 NA N NA
 3755882 3755883 BOV_0829 BOV_0830 purL   FALSE 0.090 187.000 0.006 NA   NA
 3755883 3755884 BOV_0830 BOV_0831     FALSE 0.367 60.000 0.038 NA   NA
 3755884 3755885 BOV_0831 BOV_0832   purQ FALSE 0.377 15.000 0.003 NA N NA
 3755885 3755886 BOV_0832 BOV_0833 purQ purS TRUE 0.985 23.000 0.656 0.001 Y NA
 3755886 3755887 BOV_0833 BOV_0834 purS purC TRUE 0.946 116.000 0.460 1.000 Y NA
 3755890 3755891 BOV_0837 BOV_0838     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755894 3755895 BOV_0841 BOV_0842 purB rpe FALSE 0.354 27.000 0.007 1.000 N NA
 3755895 3755896 BOV_0842 BOV_0843 rpe   FALSE 0.229 158.000 0.003 1.000 N NA
 3755896 3755897 BOV_0843 BOV_0844     TRUE 0.924 14.000 0.248 1.000 N NA
 3755897 3755898 BOV_0844 BOV_0845     TRUE 0.924 82.000 0.453 1.000 N NA
 3755898 3755899 BOV_0845 BOV_0846     TRUE 0.997 2.000 0.784 0.002 Y NA
 3755899 3755900 BOV_0846 BOV_0847     TRUE 0.831 148.000 0.167 1.000 Y NA
 3755900 3755901 BOV_0847 BOV_0848     FALSE 0.064 201.000 0.000 NA   NA
 3755904 3755905 BOV_0851 BOV_0853   phnM TRUE 0.943 4.000 0.205 NA   NA
 3755907 3755908 BOV_0854 BOV_0856     FALSE 0.173 192.000 0.000 1.000 N NA
 3755909 3755910 BOV_0855 BOV_0857     TRUE 0.791 42.000 0.305 NA   NA
 3755910 3755911 BOV_0857 BOV_0858   cobS TRUE 0.615 -16.000 0.028 NA   NA
 3755913 3755914 BOV_0860 BOV_0861     TRUE 0.565 128.000 0.081 NA N NA
 3755914 3755915 BOV_0861 BOV_0862     TRUE 0.752 97.000 0.050 NA Y NA
 3755920 3755921 BOV_0867 BOV_0868 dgt argS FALSE 0.347 222.000 0.062 1.000 N NA
 3755921 3755922 BOV_0868 BOV_0869 argS   FALSE 0.163 212.000 0.027 NA   NA
 3755922 3755923 BOV_0869 BOV_0870     FALSE 0.292 194.000 0.056 NA   NA
 3755923 3755924 BOV_0870 BOV_0871   scpA TRUE 0.612 118.000 0.103 NA   NA
 3755924 3755925 BOV_0871 BOV_0872 scpA scpB TRUE 0.972 -7.000 0.570 NA   NA
 3755925 3755926 BOV_0872 BOV_0873 scpB tatA TRUE 0.508 122.000 0.060 NA N NA
 3755926 3755927 BOV_0873 BOV_0874 tatA tatB TRUE 0.970 81.000 0.353 0.005 Y NA
 3755927 3755928 BOV_0874 BOV_0875 tatB tatC TRUE 0.942 31.000 0.535 NA Y NA
 3755928 3755929 BOV_0875 BOV_0876 tatC serS TRUE 0.761 -49.000 0.065 NA N NA
 3755929 3755930 BOV_0876 BOV_0877 serS surE TRUE 0.531 116.000 0.058 1.000   NA
 3755930 3755931 BOV_0877 BOV_0878 surE pcm TRUE 0.934 -3.000 0.147 1.000   NA
 3755932 3755933 BOV_0879 BOV_0880     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755933 3755934 BOV_0880 BOV_0881     FALSE 0.147 109.000 0.000 NA   NA
 3755934 3755935 BOV_0881 BOV_0882     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755936 3755937 BOV_0883 BOV_0884     FALSE 0.167 81.000 0.000 NA   NA
 3755939 3755940 BOV_0886 BOV_0887 yajC   TRUE 0.836 88.000 0.099 NA Y NA
 3755940 3755941 BOV_0887 BOV_0888     TRUE 0.835 3.000 0.060 NA   NA
 3755941 3755942 BOV_0888 BOV_0889     TRUE 0.918 6.000 0.165 NA   NA
 3755943 3755944 BOV_0890 BOV_0891 trmFO   FALSE 0.038 260.000 0.000 NA   NA
 3755945 3755946 BOV_0892 BOV_0893     TRUE 0.980 -3.000 0.589 NA   NA
 3755946 3755947 BOV_0893 BOV_0894     FALSE 0.048 234.000 0.000 NA   NA
 3755947 3755948 BOV_0894 BOV_0895   tig FALSE 0.140 64.000 0.000 NA   NA
 3755948 3755949 BOV_0895 BOV_0896 tig gatB FALSE 0.266 150.000 0.007 1.000 N NA
 3755949 3755950 BOV_0896 BOV_0897 gatB   TRUE 0.731 0.000 0.014 1.000   NA
 3755950 3755951 BOV_0897 BOV_0898     FALSE 0.251 160.000 0.017 1.000   NA
 3755951 3755952 BOV_0898 BOV_0899     FALSE 0.123 60.000 0.000 NA   NA
 3755952 3755953 BOV_0899 BOV_0900     FALSE 0.358 9.000 0.000 NA   NA
 3755954 3755955 BOV_0901 BOV_0902   accC FALSE 0.404 6.000 0.000 NA   NA
 3755955 3755956 BOV_0902 BOV_0903 accC accB TRUE 0.920 50.000 0.153 0.001 Y NA
 3755956 3755957 BOV_0903 BOV_0904 accB aroQ TRUE 0.713 2.000 0.003 1.000 N NA
 3755957 3755958 BOV_0904 BOV_0905 aroQ   TRUE 0.478 187.000 0.080 1.000 N NA
 3755958 3755959 BOV_0905 BOV_0906     TRUE 0.457 48.000 0.050 1.000   NA
 3755962 3755963 BOV_0909 BOV_0910     FALSE 0.008 551.000 0.000 NA   NA
 3755963 3755964 BOV_0910 BOV_0911     TRUE 0.755 280.000 0.396 1.000 Y NA
 3755964 3755965 BOV_0911 BOV_0912   prfB TRUE 0.469 141.000 0.041 1.000 N NA
 3755965 3755966 BOV_0912 BOV_0913 prfB   FALSE 0.057 216.000 0.000 NA   NA
 3755966 3755967 BOV_0913 BOV_0914     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3755968 3755969 BOV_0915 BOV_0916     FALSE 0.439 -3.000 0.000 NA   NA
 3755969 3755970 BOV_0916 BOV_0917     FALSE 0.085 171.000 0.000 NA   NA
 3755970 3755971 BOV_0917 BOV_0918     FALSE 0.293 13.000 0.000 NA   NA
 3755975 3755976 BOV_0921 BOV_0923 qacH   FALSE 0.295 112.000 0.009 1.000   NA
 3755977 3755978 BOV_0924 BOV_0925   sufB TRUE 0.579 181.000 0.109 1.000 N NA
 3755978 3755979 BOV_0925 BOV_0926 sufB sufC TRUE 0.982 -19.000 0.466 1.000 Y NA
 3755979 3755980 BOV_0926 BOV_0927 sufC sufD TRUE 0.977 14.000 0.482 1.000 Y NA
 3755980 3755981 BOV_0927 BOV_0928 sufD   TRUE 0.841 82.000 0.193 1.000 N NA
 3755981 3755982 BOV_0928 BOV_0929     TRUE 0.961 -3.000 0.309 NA   NA
 3755983 3755984 BOV_0930 BOV_0931     FALSE 0.061 206.000 0.000 NA   NA
 3755985 3755986 BOV_0932 BOV_0933 ppnK   FALSE 0.145 328.000 0.051 1.000 N NA
 3755988 3755989 BOV_0935 BOV_0936     FALSE 0.167 81.000 0.000 NA   NA
 3755989 3755990 BOV_0936 BOV_0937     FALSE 0.053 329.000 0.000 1.000 N NA
 3755990 3755991 BOV_0937 BOV_0938     TRUE 0.456 151.000 0.047 1.000 N NA
 3755991 3755992 BOV_0938 BOV_0939     FALSE 0.111 250.000 0.024 NA   NA
 3755992 3755993 BOV_0939 BOV_0940   valS FALSE 0.093 291.000 0.033 NA   NA
 3755993 3755994 BOV_0940 BOV_0941 valS   FALSE 0.014 391.000 0.000 NA   NA
 3755994 3755995 BOV_0941 BOV_0942     FALSE 0.147 109.000 0.000 NA   NA
 3755996 3755997 BOV_0943 BOV_0944     FALSE 0.309 28.000 0.012 1.000   NA
 3755997 3755998 BOV_0944 BOV_0945     FALSE 0.403 -115.000 0.000 1.000   NA
 3755998 3755999 BOV_0945 BOV_0946   mobB FALSE 0.033 345.000 0.000 1.000   NA
 3755999 3756000 BOV_0946 BOV_0947 mobB mobA TRUE 0.969 -3.000 0.056 0.004 Y NA
 3756000 3756001 BOV_0947 BOV_0948 mobA moaA TRUE 0.653 176.000 0.000 0.004 Y NA
 3756003 3756004 BOV_0950 BOV_0951   fumB FALSE 0.144 344.000 0.000 1.000 Y NA
 3756008 3756009 BOV_0955 BOV_0956     FALSE 0.016 357.000 0.000 NA   NA
 3756010 3756011 BOV_0957 BOV_0958 arsC   FALSE 0.026 377.000 0.000 NA N NA
 3756011 3756012 BOV_0958 BOV_0959     TRUE 0.663 111.000 0.028 NA Y NA
 3756012 3756013 BOV_0959 BOV_0960   tmk TRUE 0.745 82.000 0.099 1.000 N NA
 3756013 3756014 BOV_0960 BOV_0961 tmk   TRUE 0.976 -3.000 0.254 0.089 N NA
 3756014 3756015 BOV_0961 BOV_0962   metG TRUE 0.634 169.000 0.075 0.089 N NA
 3756015 3756016 BOV_0962 BOV_0963 metG   TRUE 0.934 9.000 0.221 NA N NA
 3756016 3756017 BOV_0963 BOV_0964     TRUE 0.923 3.000 0.139 NA   NA
 3756019 3756020 BOV_0966 BOV_0967 rluC   FALSE 0.347 66.000 0.005 1.000 N NA
 3756020 3756021 BOV_0967 BOV_0968     TRUE 0.673 -3.000 0.010 1.000   NA
 3756021 3756022 BOV_0968 BOV_0969     TRUE 0.799 120.000 0.269 NA   NA
 3756023 3756024 BOV_0970 BOV_0971 glnA glnB TRUE 0.817 148.000 0.145 1.000 Y NA
 3756024 3756025 BOV_0971 BOV_0972 glnB   FALSE 0.307 -25.000 0.000 NA   NA
 3756027 3756028 BOV_0974 BOV_0975   gph TRUE 0.724 -3.000 0.029 NA   NA
 3756029 3756030 BOV_0976 BOV_0977 rpiA   TRUE 0.524 26.000 0.065 NA   NA
 3756030 3756031 BOV_0977 BOV_0978   gor TRUE 0.676 154.000 0.200 NA   NA
 3756031 3756032 BOV_0978 BOV_0979 gor   TRUE 0.586 209.000 0.079 0.037 N NA
 3756032 3756033 BOV_0979 BOV_0980   dgkA TRUE 0.614 114.000 0.067 1.000 N NA
 3756033 3756034 BOV_0980 BOV_0981 dgkA nadE TRUE 0.635 92.000 0.057 1.000 N NA
 3756034 3756035 BOV_0981 BOV_0983 nadE gltX-1 TRUE 0.878 6.000 0.028 0.089 N NA
 3756036 3756037 BOV_0982 BOV_0984   maeB FALSE 0.326 144.000 0.038 NA   NA
 3756037 3756038 BOV_0984 BOV_0985 maeB   FALSE 0.307 218.000 0.000 0.054 N NA
 3756039 3756040 BOV_0986 BOV_0987     TRUE 0.927 211.000 0.889 NA Y NA
 3756040 3756041 BOV_0987 BOV_0988     TRUE 0.993 4.000 0.850 NA Y NA
 3756041 3756042 BOV_0988 BOV_0989     TRUE 0.681 24.000 0.109 NA   NA
 3756044 3756045 BOV_0991 BOV_0992     FALSE 0.127 119.000 0.000 NA   NA
 3756045 3756046 BOV_0992 BOV_0993     FALSE 0.186 37.000 0.000 1.000   NA
 3756048 3756049 BOV_0995 BOV_0996 folP folB TRUE 0.873 19.000 0.094 1.000 Y NA
 3756049 3756050 BOV_0996 BOV_0997 folB folK TRUE 0.969 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 3756051 3756052 BOV_0998 BOV_0999     FALSE 0.199 252.000 0.059 NA   NA
 3756052 3756053 BOV_0999 BOV_1000     TRUE 0.985 -3.000 0.791 NA   NA
 3756053 3756054 BOV_1000 BOV_1001     FALSE 0.164 93.000 0.000 NA   NA
 3756057 3756058 BOV_1004 BOV_1005     FALSE 0.329 25.000 0.011 1.000   NA
 3756058 3756059 BOV_1005 BOV_1007     FALSE 0.213 31.000 0.000 1.000   NA
 3756060 3756061 BOV_1006 BOV_1008     FALSE 0.166 90.000 0.000 NA   NA
 3756061 3756062 BOV_1008 BOV_1009     FALSE 0.013 702.000 0.000 1.000   NA
 3756062 3756063 BOV_1009 BOV_1010     FALSE 0.046 241.000 0.000 NA   NA
 3756065 3756066 BOV_1012 BOV_1013     FALSE 0.279 78.000 0.000 1.000   NA
 3756067 3756068 BOV_1014 BOV_1015 wrbA   FALSE 0.100 148.000 0.000 NA   NA
 3756068 3756069 BOV_1015 BOV_1016     FALSE 0.160 70.000 0.000 NA   NA
 3756069 3756070 BOV_1016 BOV_1017     FALSE 0.152 67.000 0.000 NA   NA
 3756070 3756071 BOV_1017 BOV_1018     FALSE 0.250 171.000 0.009 1.000 N NA
 3756071 3756072 BOV_1018 BOV_1019     TRUE 0.896 3.000 0.082 1.000   NA
 3756072 3756073 BOV_1019 BOV_1020     TRUE 0.811 27.000 0.222 1.000   NA
 3756073 3756074 BOV_1020 BOV_1021     TRUE 0.954 2.000 0.200 1.000   NA
 3756075 3756076 BOV_1022 BOV_1023     FALSE 0.022 565.000 0.000 1.000 N NA
 3756076 3756077 BOV_1023 BOV_1024     FALSE 0.096 265.000 0.000 1.000 N NA
 3756077 3756078 BOV_1024 BOV_1025     TRUE 0.474 0.000 0.000 NA   NA
 3756080 3756081 BOV_1027 BOV_1028     FALSE 0.038 259.000 0.000 NA   NA
 3756081 3756082 BOV_1028 BOV_1029     FALSE 0.232 172.000 0.016 1.000   NA
 3756082 3756083 BOV_1029 BOV_1030   galE-2 FALSE 0.301 129.000 0.016 1.000   NA
 3756085 3756086 BOV_1032 BOV_1033     TRUE 0.480 43.000 0.008 0.029   NA
 3756089 3756090 BOV_1036 BOV_1037     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3756091 3756092 BOV_1038 BOV_1039     FALSE 0.150 107.000 0.000 NA   NA
 3756092 3756093 BOV_1039 BOV_1040     TRUE 0.793 2.000 0.041 NA   NA
 3756094 3756095 BOV_1041 BOV_1042 folE hisI TRUE 0.579 83.000 0.038 1.000 N NA
 3756095 3756096 BOV_1042 BOV_1043 hisI   FALSE 0.168 217.000 0.017 1.000   NA
 3756096 3756097 BOV_1043 BOV_1044     FALSE 0.024 304.000 0.000 NA   NA
 3756098 3756099 BOV_1045 BOV_1046     FALSE 0.167 79.000 0.000 NA   NA
 3756101 3756102 BOV_1047 BOV_1049     FALSE 0.108 142.000 0.000 NA   NA
 3756102 3756103 BOV_1049 BOV_1050     FALSE 0.342 10.000 0.000 NA   NA
 3756105 3756106 BOV_1052 BOV_1053 tgt queA TRUE 0.993 -3.000 0.360 0.001 Y NA
 3756106 3756107 BOV_1053 BOV_1054 queA   TRUE 0.458 122.000 0.031 1.000 N NA
 3756107 3756108 BOV_1054 BOV_1055     TRUE 0.969 63.000 0.420 0.002 Y NA
 3756108 3756109 BOV_1055 BOV_1056   coaD FALSE 0.418 123.000 0.024 1.000 N NA
 3756117 3756118 BOV_1064 BOV_1065   lon FALSE 0.386 181.000 0.043 1.000 N NA
 3756120 3756121 BOV_1066 BOV_1068 clpX clpP TRUE 0.562 382.000 0.352 1.000 Y NA
 3756121 3756122 BOV_1068 BOV_1069 clpP hflX FALSE 0.193 48.000 0.002 1.000   NA
 3756122 3756123 BOV_1069 BOV_1070 hflX hfq TRUE 0.648 137.000 0.115 1.000   NA
 3756123 3756124 BOV_1070 BOV_1071 hfq   FALSE 0.050 229.000 0.000 NA   NA
 3756124 3756125 BOV_1071 BOV_1072   trkA FALSE 0.157 102.000 0.000 NA   NA
 3756125 3756126 BOV_1072 BOV_1073 trkA ntrX TRUE 0.690 25.000 0.085 1.000 N NA
 3756126 3756127 BOV_1073 BOV_1074 ntrX ntrY TRUE 0.994 2.000 0.533 0.062 Y NA
 3756127 3756128 BOV_1074 BOV_1075 ntrY ntrC TRUE 0.943 91.000 0.205 0.062 Y NA
 3756128 3756129 BOV_1075 BOV_1076 ntrC ntrB TRUE 0.989 -3.000 0.297 0.088 Y NA
 3756129 3756130 BOV_1076 BOV_1077 ntrB nifR3 TRUE 0.925 0.000 0.094 1.000 N NA
 3756131 3756132 BOV_1078 BOV_1079 ispDF cinA TRUE 0.826 -3.000 0.061 NA   NA
 3756132 3756133 BOV_1079 BOV_1080 cinA   FALSE 0.330 77.000 0.019 NA   NA
 3756134 3756135 BOV_1081 BOV_1082   lipA TRUE 0.869 6.000 0.081 NA N NA
 3756135 3756136 BOV_1082 BOV_1083 lipA   FALSE 0.141 110.000 0.003 NA   NA
 3756136 3756137 BOV_1083 BOV_1084   lpdA-2 FALSE 0.170 119.000 0.007 NA   NA
 3756137 3756138 BOV_1084 BOV_1085 lpdA-2   TRUE 0.930 -73.000 0.121 1.000 Y NA
 3756138 3756139 BOV_1085 BOV_1086   pdhB TRUE 0.945 18.000 0.254 1.000 Y NA
 3756139 3756140 BOV_1086 BOV_1087 pdhB pdhA TRUE 0.969 58.000 0.456 0.001 Y NA
 3756140 3756141 BOV_1087 BOV_1088 pdhA   TRUE 0.656 138.000 0.104 1.000 N NA
 3756141 3756142 BOV_1088 BOV_1089     FALSE 0.062 272.000 0.000 1.000   NA
 3756143 3756144 BOV_1090 BOV_1091     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3756145 3756146 BOV_1092 BOV_1093 eno kdsA FALSE 0.360 187.000 0.041 1.000 N NA
 3756146 3756147 BOV_1093 BOV_1094 kdsA pyrG TRUE 0.779 106.000 0.138 1.000 N NA
 3756147 3756148 BOV_1094 BOV_1095 pyrG   FALSE 0.034 270.000 0.000 NA   NA
 3756148 3756149 BOV_1095 BOV_1096   secG FALSE 0.076 179.000 0.002 NA   NA
 3756149 3756150 BOV_1096 BOV_1097 secG tpiA TRUE 0.824 100.000 0.184 1.000 N NA
 3756151 3756152 BOV_1098 BOV_1099   trpD FALSE 0.430 24.000 0.014 1.000 N NA
 3756152 3756153 BOV_1099 BOV_1100 trpD trpC TRUE 0.953 17.000 0.293 1.000 Y NA
 3756153 3756154 BOV_1100 BOV_1101 trpC moaC TRUE 0.929 -3.000 0.113 1.000 N NA
 3756154 3756155 BOV_1101 BOV_1102 moaC moeA TRUE 0.914 96.000 0.093 0.004 Y NA
 3756155 3756156 BOV_1102 BOV_1104 moeA lexA TRUE 0.583 248.000 0.232 1.000 N NA
 3756158 3756159 BOV_1105 BOV_1106 gltX gltA TRUE 0.532 214.000 0.127 1.000 N NA
 3756160 3756161 BOV_1107 BOV_1108 lpxB   TRUE 0.931 -3.000 0.173 NA   NA
 3756161 3756162 BOV_1108 BOV_1109   lpxA TRUE 0.965 -19.000 0.552 NA   NA
 3756162 3756163 BOV_1109 BOV_1110 lpxA fabZ TRUE 0.953 9.000 0.264 1.000 N NA
 3756163 3756164 BOV_1110 BOV_1111 fabZ lpxD TRUE 0.942 -7.000 0.212 1.000 N NA
 3756164 3756165 BOV_1111 BOV_1112 lpxD yaeT TRUE 0.732 54.000 0.063 1.000 Y NA
 3756165 3756166 BOV_1112 BOV_1113 yaeT rseP TRUE 0.653 270.000 0.204 1.000 Y NA
 3756166 3756167 BOV_1113 BOV_1114 rseP cdsA TRUE 0.678 67.000 0.080 1.000 N NA
 3756167 3756168 BOV_1114 BOV_1115 cdsA uppS TRUE 0.952 81.000 0.400 1.000 Y NA
 3756168 3756169 BOV_1115 BOV_1116 uppS frr TRUE 0.872 45.000 0.409 1.000 N NA
 3756169 3756170 BOV_1116 BOV_1117 frr pyrH TRUE 0.911 36.000 0.626 1.000 N NA
 3756170 3756171 BOV_1117 BOV_1118 pyrH tsf TRUE 0.953 -82.000 0.416 1.000 N NA
 3756171 3756172 BOV_1118 BOV_1119 tsf rpsB TRUE 0.933 190.000 0.748 1.000 Y NA
 3756172 3756173 BOV_1119 BOV_1120 rpsB   FALSE 0.122 124.000 0.000 NA   NA
 3756173 3756174 BOV_1120 BOV_1121     FALSE 0.161 99.000 0.000 NA   NA
 3756175 3756176 BOV_1122 BOV_1123     TRUE 0.987 2.000 0.696 NA N NA
 3756176 3756177 BOV_1123 BOV_1124     TRUE 0.790 55.000 0.280 NA   NA
 3756177 3756178 BOV_1124 BOV_1125     TRUE 0.730 72.000 0.131 NA   NA
 3756179 3756180 BOV_1126 BOV_1127 clpA clpS TRUE 0.976 7.000 0.596 NA   NA
 3756180 3756181 BOV_1127 BOV_1128 clpS   FALSE 0.151 25.000 0.000 NA   NA
 3756182 3756183 BOV_1129 BOV_1130     TRUE 0.520 32.000 0.083 NA   NA
 3756184 3756185 BOV_1131 BOV_1132     FALSE 0.139 27.000 0.000 NA   NA
 3756185 3756186 BOV_1132 BOV_1133     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3756186 3756187 BOV_1133 BOV_1134   sdaA FALSE 0.085 171.000 0.000 NA   NA
 3756187 3756188 BOV_1134 BOV_1135 sdaA   FALSE 0.066 198.000 0.000 NA   NA
 3756188 3756189 BOV_1135 BOV_1136     FALSE 0.141 199.000 0.018 NA   NA
 3756192 3756193 BOV_1139 BOV_1140     FALSE 0.248 15.000 0.000 NA   NA
 3756193 3756194 BOV_1140 BOV_1141     FALSE 0.111 138.000 0.000 NA   NA
 3756194 3756195 BOV_1141 BOV_1142     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3756195 3756196 BOV_1142 BOV_1143     FALSE 0.109 42.000 0.000 NA   NA
 3756196 3756197 BOV_1143 BOV_1144   queF FALSE 0.019 339.000 0.000 NA   NA
 3756197 3756198 BOV_1144 BOV_1145 queF   FALSE 0.138 131.000 0.005 NA   NA
 3756198 3756199 BOV_1145 BOV_1146     FALSE 0.170 140.000 0.011 NA   NA
 3756201 3756202 BOV_1148 BOV_1149   pccA FALSE 0.167 85.000 0.000 NA   NA
 3756202 3756203 BOV_1149 BOV_1150 pccA   FALSE 0.127 61.000 0.000 NA   NA
 3756204 3756205 BOV_1151 BOV_1152     FALSE 0.129 118.000 0.000 NA   NA
 3756206 3756207 BOV_1153 BOV_1154     FALSE 0.114 32.000 0.000 NA   NA
 3756208 3756209 BOV_1155 BOV_1156     FALSE 0.168 22.000 0.000 NA   NA
 3756209 3756210 BOV_1156 BOV_1157   murI FALSE 0.112 206.000 0.000 1.000   NA
 3756210 3756211 BOV_1157 BOV_1158 murI   TRUE 0.806 -3.000 0.025 1.000 N NA
 3756212 3756213 BOV_1159 BOV_1160     TRUE 0.787 89.000 0.188 NA   NA
 3756213 3756214 BOV_1160 BOV_1161     FALSE 0.165 128.000 0.008 NA   NA
 3756217 3756218 BOV_1164 BOV_1165 alaS recA FALSE 0.167 393.000 0.054 0.087 N NA
 3756218 3756219 BOV_1165 BOV_1166 recA   FALSE 0.321 -19.000 0.000 NA   NA