MicrobesOnline Operon Predictions for Lysinibacillus sphaericus C3-41

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5627993 5627994 Bsph_0001 Bsph_0002 dnaA dnaA FALSE 0.558 35.000 0.005 NA   NA
 5627994 5627995 Bsph_0002 Bsph_0003 dnaA dnaA FALSE 0.369 72.000 0.005 NA   NA
 5627995 5627996 Bsph_0003 Bsph_0004 dnaA dnaA TRUE 0.984 -16.000 0.005 0.001   NA
 5627996 5627997 Bsph_0004 Bsph_0005 dnaA dnaN FALSE 0.525 171.000 0.328 1.000   NA
 5627997 5627998 Bsph_0005 Bsph_0006 dnaN   TRUE 0.628 112.000 0.103 1.000   NA
 5627998 5627999 Bsph_0006 Bsph_0007   recF TRUE 0.974 4.000 0.209 1.000   NA
 5627999 5628000 Bsph_0007 Bsph_0008 recF   TRUE 0.956 93.000 0.249 0.004 Y NA
 5628000 5628001 Bsph_0008 Bsph_0009     TRUE 0.989 26.000 0.306 0.001 Y NA
 5628001 5628002 Bsph_0009 Bsph_0010     FALSE 0.434 142.000 0.019 1.000 N NA
 5628002 5628003 Bsph_0010 Bsph_rRNA0116S     FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 5628003 5628004 Bsph_rRNA0116S Bsph_tRNA1     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628004 5628005 Bsph_tRNA1 Bsph_tRNA2     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628007 5628008 Bsph_rRNA0123S Bsph_rRNA015S     FALSE 0.076 189.000 0.000 NA   NA
 5628008 5628009 Bsph_rRNA015S Bsph_0014     FALSE 0.013 277.000 0.000 NA   NA
 5628009 5628010 Bsph_0014 Bsph_rRNA0216S     FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 5628010 5628011 Bsph_rRNA0216S Bsph_tRNA3     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628011 5628012 Bsph_tRNA3 Bsph_tRNA4     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628012 5628013 Bsph_tRNA4 Bsph_rRNA0223S     FALSE 0.027 229.000 0.000 NA   NA
 5628013 5628014 Bsph_rRNA0223S Bsph_rRNA025S     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5628014 5628015 Bsph_rRNA025S Bsph_0017     FALSE 0.010 298.000 0.000 NA   NA
 5628015 5628016 Bsph_0017 Bsph_0018     FALSE 0.521 142.000 0.067 1.000 N NA
 5628016 5628017 Bsph_0018 Bsph_0019     FALSE 0.533 101.000 0.030 1.000 N NA
 5628019 5628020 Bsph_0021 Bsph_0022   pdxT TRUE 0.994 2.000 0.488 NA Y NA
 5628020 5628021 Bsph_0022 Bsph_0023 pdxT   FALSE 0.006 410.000 0.010 NA N NA
 5628023 5628024 Bsph_0025 Bsph_0026 yozA czcD TRUE 0.899 19.000 0.139 1.000 N NA
 5628024 5628025 Bsph_0026 Bsph_0027 czcD   FALSE 0.401 70.000 0.012 NA   NA
 5628025 5628026 Bsph_0027 Bsph_0028   copZ TRUE 0.676 35.000 0.048 NA   NA
 5628026 5628027 Bsph_0028 Bsph_0029 copZ   TRUE 0.954 82.000 0.115 0.001 Y NA
 5628027 5628028 Bsph_0029 Bsph_0030     FALSE 0.376 151.000 0.015 1.000 N NA
 5628028 5628029 Bsph_0030 Bsph_0031     TRUE 0.998 0.000 0.255 0.001 Y NA
 5628029 5628030 Bsph_0031 Bsph_0032     FALSE 0.344 90.000 0.010 NA   NA
 5628030 5628031 Bsph_0032 Bsph_0033   bdlA FALSE 0.423 65.000 0.010 NA   NA
 5628031 5628032 Bsph_0033 Bsph_0034 bdlA   FALSE 0.455 86.000 0.049 NA   NA
 5628033 5628034 Bsph_0035 Bsph_0036 gltT glnL TRUE 0.868 91.000 1.000 1.000 N NA
 5628034 5628035 Bsph_0036 Bsph_tRNA85 glnL   FALSE 0.003 1388.000 0.000 NA   NA
 5628036 5628037 Bsph_0038 Bsph_0039     TRUE 0.776 22.000 0.071 NA   NA
 5628037 5628038 Bsph_0039 Bsph_0040   recR TRUE 0.861 54.000 0.604 NA   NA
 5628038 5628039 Bsph_0040 Bsph_0041 recR   TRUE 0.837 14.000 0.071 NA   NA
 5628039 5628040 Bsph_0041 Bsph_0042     TRUE 0.771 74.000 0.417 NA   NA
 5628040 5628041 Bsph_0042 Bsph_rRNA0316S     FALSE 0.011 291.000 0.000 NA   NA
 5628041 5628042 Bsph_rRNA0316S Bsph_tRNA5     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628042 5628043 Bsph_tRNA5 Bsph_tRNA6     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628043 5628044 Bsph_tRNA6 Bsph_rRNA0323S     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 5628044 5628045 Bsph_rRNA0323S Bsph_rRNA035S     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5628045 5628046 Bsph_rRNA035S Bsph_0046     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 5628046 5628047 Bsph_0046 Bsph_0047     FALSE 0.130 186.000 0.040 NA   NA
 5628047 5628048 Bsph_0047 Bsph_0048     TRUE 0.960 1.000 0.045 1.000 N NA
 5628048 5628049 Bsph_0048 Bsph_0049     FALSE 0.009 370.000 0.038 NA   NA
 5628049 5628050 Bsph_0049 Bsph_0050   yaaR FALSE 0.017 345.000 0.104 NA   NA
 5628050 5628051 Bsph_0050 Bsph_0051 yaaR   FALSE 0.019 297.000 0.059 NA   NA
 5628051 5628052 Bsph_0051 Bsph_0052   yaaT TRUE 0.981 -7.000 0.372 NA   NA
 5628052 5628053 Bsph_0052 Bsph_0053 yaaT yabA TRUE 0.871 19.000 0.183 NA   NA
 5628053 5628054 Bsph_0053 Bsph_0054 yabA   TRUE 0.722 64.000 0.193 NA   NA
 5628054 5628055 Bsph_0054 Bsph_0055     TRUE 0.868 38.000 0.209 1.000   NA
 5628055 5628056 Bsph_0055 Bsph_0056   yabC TRUE 0.962 -3.000 0.041 1.000   NA
 5628058 5628059 Bsph_0058 Bsph_0059     FALSE 0.073 254.000 0.221 NA N NA
 5628059 5628060 Bsph_0059 Bsph_0060     FALSE 0.022 241.000 0.007 NA   NA
 5628060 5628061 Bsph_0060 Bsph_0061     FALSE 0.223 195.000 0.121 1.000   NA
 5628061 5628062 Bsph_0061 Bsph_0062   ksgA TRUE 0.974 -7.000 0.093 1.000 N NA
 5628062 5628063 Bsph_0062 Bsph_0063 ksgA   FALSE 0.253 157.000 0.035 NA   NA
 5628063 5628064 Bsph_0063 Bsph_0064   sspF FALSE 0.552 134.000 0.163 NA   NA
 5628064 5628065 Bsph_0064 Bsph_0065 sspF   FALSE 0.325 160.000 0.024 1.000   NA
 5628065 5628066 Bsph_0065 Bsph_0066     TRUE 0.720 57.000 0.062 1.000 N NA
 5628066 5628067 Bsph_0066 Bsph_0067   yabJ TRUE 0.978 -3.000 0.227 NA N NA
 5628067 5628068 Bsph_0067 Bsph_0068 yabJ spoVG FALSE 0.079 273.000 0.377 NA N NA
 5628068 5628069 Bsph_0068 Bsph_0069 spoVG   FALSE 0.294 104.000 0.000 NA   NA
 5628069 5628070 Bsph_0069 Bsph_0070   glmU TRUE 0.599 27.000 0.000 NA   NA
 5628070 5628071 Bsph_0070 Bsph_0071 glmU   TRUE 0.847 25.000 0.069 1.000 N NA
 5628071 5628072 Bsph_0071 Bsph_0072     FALSE 0.039 264.000 0.027 1.000 N NA
 5628072 5628073 Bsph_0072 Bsph_0073     TRUE 0.958 102.000 0.496 0.025 Y NA
 5628073 5628074 Bsph_0073 Bsph_0074     FALSE 0.073 204.000 0.033 NA   NA
 5628074 5628075 Bsph_0074 Bsph_0075     FALSE 0.314 143.000 0.035 NA   NA
 5628075 5628076 Bsph_0075 Bsph_0076     FALSE 0.139 248.000 0.026 NA Y NA
 5628076 5628077 Bsph_0076 Bsph_0077     FALSE 0.408 160.000 0.147 NA   NA
 5628077 5628078 Bsph_0077 Bsph_0078     TRUE 0.960 1.000 0.058 1.000   NA
 5628078 5628079 Bsph_0078 Bsph_0079     TRUE 0.966 -3.000 0.054 1.000   NA
 5628079 5628080 Bsph_0079 Bsph_0080     FALSE 0.470 140.000 0.108 NA   NA
 5628080 5628081 Bsph_0080 Bsph_0081     TRUE 0.988 -3.000 0.774 NA   NA
 5628081 5628082 Bsph_0081 Bsph_0082     TRUE 0.802 18.000 0.074 NA   NA
 5628082 5628083 Bsph_0082 Bsph_0083     TRUE 0.630 135.000 0.134 1.000 N NA
 5628084 5628085 Bsph_0084 Bsph_tRNA84     FALSE 0.223 145.000 0.000 NA   NA
 5628085 5628086 Bsph_tRNA84 Bsph_tRNA83     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5628086 5628087 Bsph_tRNA83 Bsph_tRNA82     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5628088 5628089 Bsph_0085 Bsph_0086     TRUE 0.770 38.000 0.041 1.000 N NA
 5628089 5628090 Bsph_0086 Bsph_0087     TRUE 0.819 68.000 0.067 0.043 N NA
 5628090 5628091 Bsph_0087 Bsph_0088     FALSE 0.043 330.000 0.192 1.000 N NA
 5628091 5628092 Bsph_0088 Bsph_0089   ytbE FALSE 0.273 163.000 0.006 1.000   NA
 5628092 5628093 Bsph_0089 Bsph_0090 ytbE   FALSE 0.261 164.000 0.003 1.000   NA
 5628093 5628094 Bsph_0090 Bsph_0091     TRUE 0.956 4.000 0.060 1.000 N NA
 5628094 5628095 Bsph_0091 Bsph_0092     TRUE 0.995 -16.000 0.019 0.006 Y NA
 5628095 5628096 Bsph_0092 Bsph_0093     FALSE 0.036 276.000 0.035 1.000 N NA
 5628096 5628097 Bsph_0093 Bsph_0094     TRUE 0.639 181.000 0.107 1.000 Y NA
 5628097 5628098 Bsph_0094 Bsph_0095     TRUE 0.998 -3.000 0.452 0.017 Y NA
 5628098 5628099 Bsph_0095 Bsph_0096     TRUE 0.979 28.000 0.532 1.000 Y NA
 5628099 5628100 Bsph_0096 Bsph_0097     TRUE 0.987 14.000 0.519 1.000 Y NA
 5628100 5628101 Bsph_0097 Bsph_0098     TRUE 0.994 0.000 0.176 1.000 Y NA
 5628101 5628102 Bsph_0098 Bsph_0099     TRUE 0.994 0.000 0.142 1.000 Y NA
 5628102 5628103 Bsph_0099 Bsph_0100     TRUE 0.605 70.000 0.025 1.000 N NA
 5628103 5628104 Bsph_0100 Bsph_0101     FALSE 0.539 179.000 0.004 1.000 Y NA
 5628104 5628105 Bsph_0101 Bsph_0102     FALSE 0.342 192.000 0.500 NA   NA
 5628105 5628106 Bsph_0102 Bsph_rRNA0416S     FALSE 0.003 630.000 0.000 NA   NA
 5628106 5628107 Bsph_rRNA0416S Bsph_tRNA7     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628107 5628108 Bsph_tRNA7 Bsph_tRNA8     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628108 5628109 Bsph_tRNA8 Bsph_rRNA0423S     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 5628109 5628110 Bsph_rRNA0423S Bsph_rRNA045S     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5628111 5628112 Bsph_0105 Bsph_0106     FALSE 0.030 269.000 0.000 1.000 N NA
 5628112 5628113 Bsph_0106 Bsph_0107     TRUE 0.993 -10.000 0.222 0.001   NA
 5628113 5628114 Bsph_0107 Bsph_0108     TRUE 0.988 -3.000 0.750 NA   NA
 5628114 5628115 Bsph_0108 Bsph_0109   yqiR FALSE 0.539 139.000 0.167 NA   NA
 5628116 5628117 Bsph_0110 Bsph_0111     TRUE 0.996 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 5628117 5628118 Bsph_0111 Bsph_0112     TRUE 0.988 13.000 0.750 NA Y NA
 5628118 5628119 Bsph_0112 Bsph_0113     TRUE 0.972 28.000 0.474 NA Y NA
 5628119 5628120 Bsph_0113 Bsph_0114     TRUE 0.988 0.000 0.474 1.000 N NA
 5628121 5628122 Bsph_0115 Bsph_0116     FALSE 0.188 182.000 0.005 1.000 N NA
 5628126 5628127 Bsph_0120 Bsph_0121   dppC TRUE 0.976 14.000 0.125 1.000 Y NA
 5628127 5628128 Bsph_0121 Bsph_0122 dppC   TRUE 0.997 -3.000 0.165 0.040 Y NA
 5628129 5628130 Bsph_tRNA9 Bsph_0123     FALSE 0.004 472.000 0.000 NA   NA
 5628130 5628131 Bsph_0123 Bsph_0124   ydiB FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 5628131 5628132 Bsph_0124 Bsph_0125 ydiB ydiC TRUE 0.947 -3.000 0.002 1.000   NA
 5628132 5628133 Bsph_0125 Bsph_0126 ydiC   TRUE 0.883 20.000 0.127 1.000   NA
 5628133 5628134 Bsph_0126 Bsph_0127     TRUE 0.970 0.000 0.090 1.000   NA
 5628136 5628137 Bsph_0129 Bsph_0130     FALSE 0.534 157.000 0.167 1.000   NA
 5628137 5628138 Bsph_0130 Bsph_0131     TRUE 0.974 18.000 0.357 NA Y NA
 5628140 5628141 Bsph_0133 Bsph_0134   fecD FALSE 0.014 345.000 0.000 1.000 N NA
 5628141 5628142 Bsph_0134 Bsph_0135 fecD fecE TRUE 0.995 5.000 0.750 1.000 Y NA
 5628142 5628143 Bsph_0135 Bsph_0136 fecE   TRUE 0.987 14.000 0.500 1.000 Y NA
 5628144 5628145 Bsph_0137 Bsph_0138     TRUE 0.963 -3.000 0.045 1.000   NA
 5628145 5628146 Bsph_0138 Bsph_0139   tlpC TRUE 0.687 132.000 0.200 1.000 N NA
 5628146 5628147 Bsph_0139 Bsph_0140 tlpC   FALSE 0.003 557.000 0.000 NA   NA
 5628148 5628149 Bsph_0141 Bsph_0142     TRUE 0.969 -7.000 0.154 NA   NA
 5628150 5628151 Bsph_0143 Bsph_0144     TRUE 0.882 14.000 0.130 NA   NA
 5628151 5628152 Bsph_0144 Bsph_0145     FALSE 0.140 169.000 0.000 NA   NA
 5628153 5628154 Bsph_0146 Bsph_0147     FALSE 0.443 106.000 0.059 NA   NA
 5628154 5628155 Bsph_0147 Bsph_0148     FALSE 0.551 108.000 0.118 NA   NA
 5628157 5628158 Bsph_0150 Bsph_0151     TRUE 0.773 50.000 0.158 NA N NA
 5628158 5628159 Bsph_0151 Bsph_0152     FALSE 0.582 69.000 0.069 NA N NA
 5628159 5628160 Bsph_0152 Bsph_0153     TRUE 0.716 35.000 0.069 NA   NA
 5628160 5628161 Bsph_0153 Bsph_0154     FALSE 0.270 130.000 0.000 NA   NA
 5628161 5628162 Bsph_0154 Bsph_0155   srrA TRUE 0.989 8.000 0.231 1.000 Y NA
 5628163 5628164 Bsph_0156 Bsph_0157     FALSE 0.299 117.000 0.000 NA   NA
 5628165 5628166 Bsph_0159 Bsph_0160   fecE TRUE 0.995 6.000 0.857 1.000 Y NA
 5628167 5628168 Bsph_0161 Bsph_0162     TRUE 0.998 0.000 0.846 0.069 Y NA
 5628168 5628169 Bsph_0162 Bsph_0163     TRUE 0.816 72.000 0.333 1.000 N NA
 5628170 5628171 Bsph_0164 Bsph_0165     FALSE 0.432 70.000 0.022 NA   NA
 5628171 5628172 Bsph_0165 Bsph_0166     FALSE 0.352 104.000 0.022 NA   NA
 5628172 5628173 Bsph_0166 Bsph_0167     FALSE 0.003 623.000 0.000 NA   NA
 5628174 5628175 Bsph_0168 Bsph_0169     TRUE 0.959 -12.000 0.111 NA   NA
 5628176 5628177 Bsph_0170 Bsph_0171     TRUE 0.755 54.000 0.182 NA   NA
 5628177 5628178 Bsph_0171 Bsph_0172     FALSE 0.006 630.000 0.000 1.000   NA
 5628178 5628179 Bsph_0172 Bsph_0173     FALSE 0.069 192.000 0.000 NA   NA
 5628179 5628180 Bsph_0173 Bsph_0174     TRUE 0.877 -27.000 0.000 NA   NA
 5628180 5628181 Bsph_0174 Bsph_0175     FALSE 0.120 196.000 0.000 1.000 N NA
 5628181 5628182 Bsph_0175 Bsph_0176     TRUE 0.997 -7.000 0.045 0.001 Y NA
 5628182 5628183 Bsph_0176 Bsph_0177     FALSE 0.478 113.000 0.000 1.000 N NA
 5628183 5628184 Bsph_0177 Bsph_0178     FALSE 0.500 99.000 0.014 1.000 N NA
 5628184 5628185 Bsph_0178 Bsph_0179   desK FALSE 0.036 323.000 0.118 1.000 N NA
 5628185 5628186 Bsph_0179 Bsph_0180 desK   TRUE 0.991 29.000 1.000 0.028 Y NA
 5628187 5628188 Bsph_0181 Bsph_0182   ybbM FALSE 0.364 74.000 0.006 NA   NA
 5628188 5628189 Bsph_0182 Bsph_0183 ybbM pstB TRUE 0.942 -3.000 0.047 NA   NA
 5628191 5628192 Bsph_0185 Bsph_0186     TRUE 0.921 14.000 0.127 1.000 N NA
 5628193 5628194 Bsph_0187 Bsph_0188     TRUE 0.987 19.000 0.194 0.003 Y NA
 5628194 5628195 Bsph_0188 Bsph_0189     FALSE 0.187 158.000 0.007 NA   NA
 5628195 5628196 Bsph_0189 Bsph_0190     FALSE 0.048 207.000 0.000 NA   NA
 5628196 5628197 Bsph_0190 Bsph_0191     TRUE 0.795 36.000 0.143 NA   NA
 5628197 5628198 Bsph_0191 Bsph_0192     TRUE 0.810 39.000 0.188 NA   NA
 5628198 5628199 Bsph_0192 Bsph_0193     TRUE 0.970 0.000 0.179 NA   NA
 5628199 5628200 Bsph_0193 Bsph_0194   srtF TRUE 0.971 -3.000 0.154 NA   NA
 5628200 5628201 Bsph_0194 Bsph_0195 srtF   FALSE 0.303 193.000 0.036 0.033   NA
 5628201 5628202 Bsph_0195 Bsph_0196     TRUE 0.988 -3.000 0.714 NA   NA
 5628202 5628203 Bsph_0196 Bsph_0197     TRUE 0.987 -3.000 0.642 NA   NA
 5628203 5628204 Bsph_0197 Bsph_0198     FALSE 0.019 250.000 0.007 NA   NA
 5628204 5628205 Bsph_0198 Bsph_0199     FALSE 0.418 129.000 0.000 1.000   NA
 5628205 5628206 Bsph_0199 Bsph_0200     FALSE 0.007 476.000 0.000 1.000   NA
 5628206 5628207 Bsph_0200 Bsph_0201     TRUE 0.845 49.000 0.042 0.040   NA
 5628207 5628208 Bsph_0201 Bsph_rRNA0516S     FALSE 0.004 485.000 0.000 NA   NA
 5628208 5628209 Bsph_rRNA0516S Bsph_rRNA0523S     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 5628209 5628210 Bsph_rRNA0523S Bsph_rRNA055S     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5628210 5628211 Bsph_rRNA055S Bsph_0205     FALSE 0.009 316.000 0.000 NA   NA
 5628211 5628212 Bsph_0205 Bsph_0206     FALSE 0.206 150.000 0.000 NA   NA
 5628214 5628215 Bsph_0208 Bsph_0209     TRUE 0.997 -3.000 0.038 0.001 Y NA
 5628215 5628216 Bsph_0209 Bsph_0210     TRUE 0.966 14.000 0.033 1.000 Y NA
 5628216 5628217 Bsph_0210 Bsph_0211     TRUE 0.841 130.000 0.072 1.000 Y NA
 5628217 5628218 Bsph_0211 Bsph_0212   yexA TRUE 0.995 3.000 0.460 1.000 Y NA
 5628218 5628219 Bsph_0212 Bsph_0213 yexA   TRUE 0.998 3.000 0.656 0.001 Y NA
 5628219 5628220 Bsph_0213 Bsph_0214     TRUE 0.998 -13.000 0.346 0.001 Y NA
 5628220 5628221 Bsph_0214 Bsph_0215     TRUE 0.994 -24.000 0.223 1.000 Y NA
 5628221 5628222 Bsph_0215 Bsph_0216     TRUE 0.909 94.000 0.248 1.000 Y NA
 5628222 5628223 Bsph_0216 Bsph_0217     TRUE 0.998 0.000 0.238 0.002 Y NA
 5628223 5628224 Bsph_0217 Bsph_0218   purH TRUE 0.901 106.000 0.225 1.000 Y NA
 5628224 5628225 Bsph_0218 Bsph_0219 purH   TRUE 0.923 74.000 0.238 1.000 Y NA
 5628227 5628228 Bsph_0221 Bsph_0222     TRUE 0.770 53.000 0.200 NA   NA
 5628228 5628229 Bsph_0222 Bsph_0223     TRUE 0.851 16.000 0.106 NA   NA
 5628229 5628230 Bsph_0223 Bsph_0224     FALSE 0.035 233.000 0.031 NA   NA
 5628230 5628231 Bsph_0224 Bsph_0225     TRUE 0.699 33.000 0.054 NA   NA
 5628231 5628232 Bsph_0225 Bsph_0226     TRUE 0.986 15.000 0.103 0.014 Y NA
 5628232 5628233 Bsph_0226 Bsph_0227     FALSE 0.330 86.000 0.004 NA   NA
 5628233 5628234 Bsph_0227 Bsph_0228     FALSE 0.024 233.000 0.000 NA   NA
 5628234 5628235 Bsph_0228 Bsph_0229     TRUE 0.992 25.000 0.643 0.001 Y NA
 5628235 5628236 Bsph_0229 Bsph_0230     TRUE 0.998 2.000 0.492 0.001 Y NA
 5628236 5628237 Bsph_0230 Bsph_0231     FALSE 0.165 161.000 0.002 NA   NA
 5628237 5628238 Bsph_0231 Bsph_0232     TRUE 0.617 34.000 0.022 NA   NA
 5628238 5628239 Bsph_0232 Bsph_0233     FALSE 0.008 317.000 0.000 NA   NA
 5628239 5628240 Bsph_0233 Bsph_0234     TRUE 0.949 12.000 0.400 NA   NA
 5628240 5628241 Bsph_0234 Bsph_0235     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.039 Y NA
 5628241 5628242 Bsph_0235 Bsph_0236     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5628242 5628243 Bsph_0236 Bsph_0237     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628243 5628244 Bsph_0237 Bsph_0238     TRUE 0.818 117.000 0.008 1.000 Y NA
 5628244 5628245 Bsph_0238 Bsph_0239     FALSE 0.132 193.000 0.000 1.000 N NA
 5628245 5628246 Bsph_0239 Bsph_0240     TRUE 0.612 72.000 0.033 1.000 N NA
 5628246 5628247 Bsph_0240 Bsph_0241     FALSE 0.310 163.000 0.013 1.000 N NA
 5628247 5628248 Bsph_0241 Bsph_0242   glpK TRUE 0.809 20.000 0.020 1.000 N NA
 5628248 5628249 Bsph_0242 Bsph_0243 glpK   FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 5628249 5628250 Bsph_0243 Bsph_0244     TRUE 0.843 44.000 0.333 NA   NA
 5628250 5628251 Bsph_0244 Bsph_0245     FALSE 0.016 314.000 0.000 1.000   NA
 5628253 5628254 Bsph_0247 Bsph_0249     FALSE 0.213 148.000 0.000 NA   NA
 5628254 5628255 Bsph_0249 Bsph_0250     FALSE 0.010 302.000 0.000 NA   NA
 5628255 5628256 Bsph_0250 Bsph_0251   tlpC TRUE 0.872 -40.000 0.000 NA   NA
 5628256 5628257 Bsph_0251 Bsph_0252 tlpC   TRUE 0.992 -10.000 1.000 1.000 N NA
 5628257 5628258 Bsph_0252 Bsph_0253     TRUE 0.932 22.000 0.375 1.000 N NA
 5628258 5628259 Bsph_0253 Bsph_0254     FALSE 0.564 146.000 0.250 NA   NA
 5628260 5628261 Bsph_0255 Bsph_0256     FALSE 0.015 265.000 0.000 NA   NA
 5628262 5628263 Bsph_0257 Bsph_0258     FALSE 0.505 177.000 0.683 NA   NA
 5628263 5628264 Bsph_0258 Bsph_0259     TRUE 0.893 46.000 0.761 NA   NA
 5628272 5628273 Bsph_0267 Bsph_0268     FALSE 0.505 43.000 0.000 NA   NA
 5628273 5628274 Bsph_0268 Bsph_0269     TRUE 0.965 13.000 1.000 NA   NA
 5628274 5628275 Bsph_0269 Bsph_0270     FALSE 0.006 361.000 0.000 NA   NA
 5628275 5628276 Bsph_0270 Bsph_0271     FALSE 0.494 45.000 0.000 NA   NA
 5628276 5628277 Bsph_0271 Bsph_0272     FALSE 0.378 68.000 0.000 NA   NA
 5628279 5628280 Bsph_0274 Bsph_0275     FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 5628280 5628281 Bsph_0275 Bsph_0276     TRUE 0.857 58.000 0.667 NA   NA
 5628281 5628282 Bsph_0276 Bsph_0277     TRUE 0.955 -3.000 0.019 1.000   NA
 5628282 5628283 Bsph_0277 Bsph_0278   yfmL FALSE 0.074 219.000 0.000 1.000 N NA
 5628283 5628284 Bsph_0278 Bsph_0279 yfmL   TRUE 0.948 2.000 0.017 1.000 N NA
 5628284 5628285 Bsph_0279 Bsph_0280     TRUE 0.988 12.000 0.400 1.000 Y NA
 5628285 5628286 Bsph_0280 Bsph_0281     FALSE 0.476 110.000 0.000 1.000 N NA
 5628286 5628287 Bsph_0281 Bsph_0282     TRUE 0.996 -3.000 0.669 NA Y NA
 5628289 5628290 Bsph_0284 Bsph_0285     FALSE 0.003 504.000 0.000 NA   NA
 5628290 5628291 Bsph_0285 Bsph_0286     FALSE 0.149 172.000 0.016 NA   NA
 5628293 5628294 Bsph_0288 Bsph_0289   yjcK FALSE 0.128 176.000 0.015 NA   NA
 5628297 5628298 Bsph_0292 Bsph_0293     FALSE 0.244 139.000 0.000 NA   NA
 5628299 5628300 Bsph_0294 Bsph_0295 motA motB TRUE 0.961 41.000 0.257 1.000 Y NA
 5628302 5628303 Bsph_0297 Bsph_0298     TRUE 0.850 23.000 0.159 NA   NA
 5628304 5628305 Bsph_0299 Bsph_0300     FALSE 0.033 260.000 0.000 1.000 N NA
 5628308 5628309 Bsph_0303 Bsph_0304 yfkF   FALSE 0.022 237.000 0.000 NA   NA
 5628310 5628311 Bsph_0305 Bsph_0306     TRUE 0.788 29.000 0.025 1.000 N NA
 5628311 5628312 Bsph_0306 Bsph_0307   yfhF TRUE 0.640 57.000 0.025 1.000   NA
 5628313 5628314 Bsph_0308 Bsph_0309 recX   TRUE 0.941 -3.000 0.045 NA   NA
 5628314 5628315 Bsph_0309 Bsph_0310   yfhJ TRUE 0.958 1.000 0.116 NA   NA
 5628317 5628318 Bsph_0312 Bsph_0313     FALSE 0.468 89.000 0.002 1.000   NA
 5628318 5628319 Bsph_0313 Bsph_0314     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 5628319 5628320 Bsph_0314 Bsph_0315     FALSE 0.117 205.000 0.077 NA N NA
 5628320 5628321 Bsph_0315 Bsph_0316     FALSE 0.021 300.000 0.000 1.000 N NA
 5628321 5628322 Bsph_0316 Bsph_0317     TRUE 0.999 -16.000 1.000 0.005 Y NA
 5628322 5628323 Bsph_0317 Bsph_0318     TRUE 0.939 103.000 0.750 1.000 Y NA
 5628323 5628324 Bsph_0318 Bsph_0319     FALSE 0.486 217.000 0.067 0.039 Y NA
 5628324 5628325 Bsph_0319 Bsph_0320     TRUE 0.994 13.000 0.779 0.039 Y NA
 5628325 5628326 Bsph_0320 Bsph_0321     FALSE 0.031 265.000 0.000 1.000 N NA
 5628326 5628327 Bsph_0321 Bsph_0322     TRUE 0.986 33.000 0.364 0.004 Y NA
 5628327 5628328 Bsph_0322 Bsph_0323     TRUE 0.988 34.000 0.571 0.004 Y NA
 5628328 5628329 Bsph_0323 Bsph_0324     FALSE 0.475 110.000 0.071 NA   NA
 5628329 5628330 Bsph_0324 Bsph_0325     FALSE 0.364 123.000 0.026 NA   NA
 5628330 5628331 Bsph_0325 Bsph_0326     TRUE 0.982 -19.000 0.325 1.000   NA
 5628331 5628332 Bsph_0326 Bsph_0327     TRUE 0.982 -3.000 0.358 NA   NA
 5628332 5628333 Bsph_0327 Bsph_0328     TRUE 0.744 63.000 0.222 NA   NA
 5628333 5628334 Bsph_0328 Bsph_0329     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 5628334 5628335 Bsph_0329 Bsph_0330     TRUE 0.907 38.000 0.727 NA   NA
 5628336 5628337 Bsph_0331 Bsph_0332     FALSE 0.482 133.000 0.102 NA   NA
 5628338 5628339 Bsph_0333 Bsph_0334     TRUE 0.959 -3.000 0.017 1.000 N NA
 5628339 5628340 Bsph_0334 Bsph_0335     TRUE 0.689 113.000 0.146 1.000 N NA
 5628342 5628343 Bsph_0337 Bsph_rRNA0616S     FALSE 0.006 354.000 0.000 NA   NA
 5628343 5628344 Bsph_rRNA0616S Bsph_rRNA0623S     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 5628344 5628345 Bsph_rRNA0623S Bsph_rRNA065S     FALSE 0.299 118.000 0.000 NA   NA
 5628345 5628346 Bsph_rRNA065S Bsph_tRNA10     TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5628346 5628347 Bsph_tRNA10 Bsph_tRNA11     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5628347 5628348 Bsph_tRNA11 Bsph_tRNA12     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5628348 5628349 Bsph_tRNA12 Bsph_tRNA13     TRUE 0.629 20.000 0.000 NA   NA
 5628349 5628350 Bsph_tRNA13 Bsph_tRNA14     TRUE 0.603 26.000 0.000 NA   NA
 5628350 5628351 Bsph_tRNA14 Bsph_tRNA15     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5628351 5628352 Bsph_tRNA15 Bsph_tRNA16     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5628352 5628353 Bsph_tRNA16 Bsph_tRNA17     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 5628353 5628354 Bsph_tRNA17 Bsph_tRNA18     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5628354 5628355 Bsph_tRNA18 Bsph_tRNA19     TRUE 0.611 24.000 0.000 NA   NA
 5628355 5628356 Bsph_tRNA19 Bsph_tRNA20     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628356 5628357 Bsph_tRNA20 Bsph_tRNA21     FALSE 0.494 45.000 0.000 NA   NA
 5628357 5628358 Bsph_tRNA21 Bsph_tRNA22     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628358 5628359 Bsph_tRNA22 Bsph_tRNA23     TRUE 0.816 7.000 0.000 NA   NA
 5628359 5628360 Bsph_tRNA23 Bsph_tRNA24     TRUE 0.797 9.000 0.000 NA   NA
 5628360 5628361 Bsph_tRNA24 Bsph_tRNA25     FALSE 0.476 48.000 0.000 NA   NA
 5628361 5628362 Bsph_tRNA25 Bsph_0340     FALSE 0.010 300.000 0.000 NA   NA
 5628364 5628365 Bsph_0342 Bsph_0343     FALSE 0.004 435.000 0.000 NA   NA
 5628365 5628366 Bsph_0343 Bsph_0344     TRUE 0.986 3.000 1.000 NA   NA
 5628367 5628368 Bsph_0345 Bsph_0346     TRUE 0.925 4.000 0.000 1.000   NA
 5628368 5628369 Bsph_0346 Bsph_0347   qacR TRUE 0.985 1.000 0.400 1.000   NA
 5628370 5628371 Bsph_0348 Bsph_0349     FALSE 0.219 146.000 0.000 NA   NA
 5628373 5628374 Bsph_0351 Bsph_0352   ykfA FALSE 0.013 291.000 0.000 NA N NA
 5628374 5628375 Bsph_0352 Bsph_0353 ykfA   TRUE 0.904 11.000 0.095 NA N NA
 5628376 5628377 Bsph_0354 Bsph_0355     FALSE 0.010 299.000 0.000 NA   NA
 5628377 5628378 Bsph_0355 Bsph_0356     TRUE 0.735 16.000 0.024 NA   NA
 5628379 5628380 Bsph_0357 Bsph_0358     TRUE 0.698 68.000 0.077 1.000 N NA
 5628382 5628383 Bsph_0360 Bsph_0361     FALSE 0.577 85.000 0.111 NA   NA
 5628384 5628385 Bsph_0362 Bsph_0363     TRUE 0.669 55.000 0.022 1.000 N NA
 5628386 5628387 Bsph_0364 Bsph_0365 liaS yhcZ TRUE 0.994 13.000 0.536 0.027 Y NA
 5628389 5628390 Bsph_0367 Bsph_0368 yobV   TRUE 0.604 52.000 0.051 NA   NA
 5628391 5628392 Bsph_0369 Bsph_0370   yhdP FALSE 0.355 194.000 0.667 NA   NA
 5628392 5628393 Bsph_0370 Bsph_0371 yhdP   FALSE 0.298 120.000 0.000 NA   NA
 5628393 5628394 Bsph_0371 Bsph_0372     FALSE 0.023 235.000 0.000 NA   NA
 5628394 5628395 Bsph_0372 Bsph_0373     FALSE 0.485 145.000 0.143 NA   NA
 5628396 5628397 Bsph_0374 Bsph_0375   yheA TRUE 0.910 17.000 0.321 NA   NA
 5628397 5628398 Bsph_0375 Bsph_0376 yheA   FALSE 0.300 131.000 0.015 NA   NA
 5628398 5628399 Bsph_0376 Bsph_0377     FALSE 0.496 119.000 0.080 NA   NA
 5628403 5628404 Bsph_0381 Bsph_0382     TRUE 0.992 1.000 0.081 1.000 Y NA
 5628404 5628405 Bsph_0382 Bsph_0383     FALSE 0.577 73.000 0.031 1.000   NA
 5628405 5628406 Bsph_0383 Bsph_0384     TRUE 0.946 -13.000 0.074 NA   NA
 5628406 5628407 Bsph_0384 Bsph_0385     FALSE 0.135 193.000 0.074 NA   NA
 5628413 5628414 Bsph_0391 Bsph_0392     TRUE 0.978 0.000 0.330 NA   NA
 5628414 5628415 Bsph_0392 Bsph_0393     TRUE 0.980 -3.000 0.291 NA   NA
 5628415 5628416 Bsph_0393 Bsph_0394     FALSE 0.003 535.000 0.000 NA   NA
 5628417 5628418 Bsph_0395 Bsph_0396 prsA   FALSE 0.004 427.000 0.000 NA   NA
 5628418 5628419 Bsph_0396 Bsph_0397     FALSE 0.520 128.000 0.111 NA   NA
 5628419 5628420 Bsph_0397 Bsph_0398     FALSE 0.194 176.000 0.060 NA   NA
 5628420 5628421 Bsph_0398 Bsph_0399     FALSE 0.176 158.000 0.000 NA   NA
 5628421 5628422 Bsph_0399 Bsph_0400     TRUE 0.870 -45.000 0.000 NA   NA
 5628422 5628423 Bsph_0400 Bsph_0401     FALSE 0.296 108.000 0.000 NA   NA
 5628423 5628424 Bsph_0401 Bsph_0402     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5628424 5628425 Bsph_0402 Bsph_0403     FALSE 0.147 173.000 0.017 NA   NA
 5628426 5628427 Bsph_0404 Bsph_0405 ecsA   TRUE 0.898 20.000 0.271 NA N NA
 5628428 5628429 Bsph_0406 Bsph_0407     FALSE 0.198 152.000 0.000 NA   NA
 5628430 5628431 Bsph_0408 Bsph_0409     TRUE 0.826 148.000 0.131 1.000 Y NA
 5628431 5628432 Bsph_0409 Bsph_0410     TRUE 0.969 15.000 0.069 1.000 Y NA
 5628436 5628437 Bsph_0414 Bsph_0415     TRUE 0.986 -3.000 0.543 NA   NA
 5628437 5628438 Bsph_0415 Bsph_0416   resE TRUE 0.997 -3.000 0.621 1.000 Y NA
 5628438 5628439 Bsph_0416 Bsph_0417 resE   TRUE 0.947 4.000 0.108 NA   NA
 5628439 5628440 Bsph_0417 Bsph_0418     FALSE 0.435 121.000 0.054 NA   NA
 5628440 5628441 Bsph_0418 Bsph_0419     FALSE 0.491 130.000 0.100 NA   NA
 5628443 5628444 Bsph_0421 Bsph_0422   yxdJ FALSE 0.566 101.000 0.049 1.000 N NA
 5628444 5628445 Bsph_0422 Bsph_0423 yxdJ   FALSE 0.187 177.000 0.000 1.000   NA
 5628445 5628446 Bsph_0423 Bsph_0424   yxdK TRUE 0.926 -49.000 0.000 1.000   NA
 5628446 5628447 Bsph_0424 Bsph_0425 yxdK   TRUE 0.969 12.000 1.000 NA   NA
 5628447 5628448 Bsph_0425 Bsph_0426   yxdL TRUE 0.950 13.000 0.500 NA   NA
 5628448 5628449 Bsph_0426 Bsph_0427 yxdL   TRUE 0.887 38.000 0.500 NA   NA
 5628449 5628450 Bsph_0427 Bsph_0428     TRUE 0.711 143.000 0.667 NA   NA
 5628450 5628451 Bsph_0428 Bsph_0429     FALSE 0.017 253.000 0.000 NA   NA
 5628451 5628452 Bsph_0429 Bsph_0430     FALSE 0.243 172.000 0.074 NA   NA
 5628454 5628455 Bsph_0432 Bsph_0433     TRUE 0.749 53.000 0.162 NA   NA
 5628455 5628456 Bsph_0433 Bsph_0434     FALSE 0.037 243.000 0.000 1.000   NA
 5628456 5628457 Bsph_0434 Bsph_0435     TRUE 0.902 46.000 0.494 1.000 N NA
 5628457 5628458 Bsph_0435 Bsph_0436     TRUE 0.927 14.000 0.169 1.000   NA
 5628458 5628459 Bsph_0436 Bsph_0437     TRUE 0.976 6.000 0.417 1.000   NA
 5628459 5628460 Bsph_0437 Bsph_0438     FALSE 0.030 266.000 0.012 1.000   NA
 5628460 5628461 Bsph_0438 Bsph_0439     TRUE 0.998 -7.000 0.239 0.004 Y NA
 5628461 5628462 Bsph_0439 Bsph_0440     TRUE 0.984 33.000 0.254 0.004 Y NA
 5628462 5628463 Bsph_0440 Bsph_0441     TRUE 0.995 5.000 0.096 0.004 Y NA
 5628463 5628464 Bsph_0441 Bsph_0442   hisH TRUE 0.997 -3.000 0.125 0.004 Y NA
 5628464 5628465 Bsph_0442 Bsph_0443 hisH hisF TRUE 0.996 -6.000 0.027 0.004 Y NA
 5628465 5628466 Bsph_0443 Bsph_0444 hisF hisIE TRUE 0.998 -3.000 0.430 0.004 Y NA
 5628466 5628467 Bsph_0444 Bsph_0445 hisIE   FALSE 0.426 130.000 0.007 1.000   NA
 5628467 5628468 Bsph_0445 Bsph_0446     FALSE 0.123 232.000 0.183 1.000   NA
 5628468 5628469 Bsph_0446 Bsph_0447     FALSE 0.016 329.000 0.000 1.000 N NA
 5628469 5628470 Bsph_0447 Bsph_0448     TRUE 0.945 10.000 0.263 NA   NA
 5628470 5628471 Bsph_0448 Bsph_0449   yvcK TRUE 0.959 5.000 0.214 NA   NA
 5628471 5628472 Bsph_0449 Bsph_0450 yvcK   TRUE 0.777 76.000 0.470 NA   NA
 5628472 5628473 Bsph_0450 Bsph_0451     FALSE 0.529 114.000 0.101 NA   NA
 5628475 5628476 Bsph_tRNA26 Bsph_0453     FALSE 0.004 499.000 0.000 NA   NA
 5628476 5628477 Bsph_0453 Bsph_0454   yckA TRUE 0.975 30.000 0.107 0.038 Y NA
 5628477 5628478 Bsph_0454 Bsph_0455 yckA glnQ TRUE 0.996 -3.000 0.392 1.000 Y NA
 5628480 5628481 Bsph_0457 Bsph_0459     FALSE 0.322 87.000 0.000 NA   NA
 5628481 5628482 Bsph_0459 Bsph_0460     FALSE 0.301 134.000 0.018 NA   NA
 5628482 5628483 Bsph_0460 Bsph_0461     FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5628483 5628484 Bsph_0461 Bsph_0462     FALSE 0.022 239.000 0.000 NA   NA
 5628484 5628485 Bsph_0462 Bsph_0463     FALSE 0.137 175.000 0.017 NA   NA
 5628485 5628486 Bsph_0463 Bsph_0464     TRUE 0.777 115.000 0.348 1.000 N NA
 5628486 5628487 Bsph_0464 Bsph_0465     FALSE 0.090 549.000 0.063 0.004 Y NA
 5628487 5628488 Bsph_0465 Bsph_0466     TRUE 0.964 27.000 0.141 1.000 Y NA
 5628488 5628489 Bsph_0466 Bsph_0467     TRUE 0.994 -7.000 0.138 1.000 Y NA
 5628489 5628490 Bsph_0467 Bsph_0468     TRUE 0.992 3.000 0.136 1.000 Y NA
 5628490 5628491 Bsph_0468 Bsph_0469     FALSE 0.003 712.000 0.000 NA   NA
 5628491 5628492 Bsph_0469 Bsph_0470     FALSE 0.299 118.000 0.000 NA   NA
 5628493 5628494 Bsph_0471 Bsph_0472     TRUE 0.961 -3.000 0.036 1.000   NA
 5628494 5628495 Bsph_0472 Bsph_0473     TRUE 0.840 49.000 0.387 NA   NA
 5628495 5628496 Bsph_0473 Bsph_0474     TRUE 0.985 -3.000 0.435 NA N NA
 5628496 5628497 Bsph_0474 Bsph_0475     FALSE 0.009 436.000 0.000 1.000 N NA
 5628497 5628498 Bsph_0475 Bsph_0476     FALSE 0.102 179.000 0.000 NA   NA
 5628498 5628499 Bsph_0476 Bsph_0477     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5628500 5628501 Bsph_0478 Bsph_0479     FALSE 0.170 189.000 0.032 1.000   NA
 5628501 5628502 Bsph_0479 Bsph_0480     TRUE 0.833 22.000 0.060 1.000   NA
 5628502 5628503 Bsph_0480 Bsph_0481     TRUE 0.864 72.000 0.143 0.020 N NA
 5628504 5628505 Bsph_0482 Bsph_0483     FALSE 0.446 109.000 0.000 1.000   NA
 5628505 5628506 Bsph_0483 Bsph_0484     TRUE 0.787 17.000 0.000 1.000   NA
 5628508 5628509 Bsph_0486 Bsph_0487     FALSE 0.006 658.000 0.000 1.000   NA
 5628510 5628511 Bsph_0488 Bsph_0489     FALSE 0.004 437.000 0.000 NA   NA
 5628511 5628512 Bsph_0489 Bsph_0490     FALSE 0.289 125.000 0.000 NA   NA
 5628513 5628514 Bsph_0491 Bsph_0492     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5628514 5628515 Bsph_0492 Bsph_0493     TRUE 0.934 17.000 0.543 NA   NA
 5628515 5628516 Bsph_0493 Bsph_0494     TRUE 0.846 13.000 0.065 NA   NA
 5628517 5628518 Bsph_0495 Bsph_0496 sugR   TRUE 0.948 -3.000 0.000 1.000   NA
 5628519 5628520 Bsph_0497 Bsph_0498     FALSE 0.570 102.000 0.136 NA   NA
 5628520 5628521 Bsph_0498 Bsph_0499     FALSE 0.003 704.000 0.000 NA   NA
 5628522 5628523 Bsph_0500 Bsph_0501     FALSE 0.236 142.000 0.000 NA   NA
 5628524 5628525 Bsph_0502 Bsph_0503     FALSE 0.453 96.000 0.000 1.000   NA
 5628528 5628529 Bsph_0505 Bsph_0507     FALSE 0.004 494.000 0.000 NA   NA
 5628530 5628531 Bsph_0508 Bsph_0509     FALSE 0.444 124.000 0.061 NA   NA
 5628532 5628533 Bsph_0510 Bsph_0511     TRUE 0.616 64.000 0.016 1.000 N NA
 5628534 5628535 Bsph_0512 Bsph_0513     FALSE 0.296 108.000 0.000 NA   NA
 5628536 5628537 Bsph_0514 Bsph_0515     TRUE 0.972 4.000 0.333 NA   NA
 5628538 5628539 Bsph_0516 Bsph_0517     FALSE 0.054 227.000 0.000 1.000   NA
 5628542 5628543 Bsph_0520 Bsph_0521     FALSE 0.587 169.000 0.667 NA N NA
 5628545 5628546 Bsph_0523 Bsph_0524     FALSE 0.431 141.000 0.071 NA N NA
 5628546 5628547 Bsph_0524 Bsph_0525     TRUE 0.973 11.000 0.067 NA Y NA
 5628547 5628548 Bsph_0525 Bsph_0526     TRUE 0.922 38.000 0.067 NA Y NA
 5628548 5628549 Bsph_0526 Bsph_0527     TRUE 0.929 23.000 0.667 NA   NA
 5628549 5628550 Bsph_0527 Bsph_0528     TRUE 0.949 5.000 0.143 NA   NA
 5628550 5628551 Bsph_0528 Bsph_0529     FALSE 0.020 295.000 0.000 1.000   NA
 5628551 5628552 Bsph_0529 Bsph_0530     FALSE 0.550 106.000 0.039 1.000 N NA
 5628553 5628554 Bsph_0531 Bsph_0532   ydbP TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5628555 5628556 Bsph_0533 Bsph_0534     TRUE 0.967 49.000 0.588 1.000 Y NA
 5628556 5628557 Bsph_0534 Bsph_0535     FALSE 0.219 257.000 0.124 1.000 Y NA
 5628557 5628558 Bsph_0535 Bsph_0536     TRUE 0.866 49.000 0.060 0.037 N NA
 5628558 5628559 Bsph_0536 Bsph_0537     FALSE 0.265 196.000 0.170 1.000 N NA
 5628559 5628560 Bsph_0537 Bsph_0538     FALSE 0.429 92.000 0.043 NA   NA
 5628560 5628561 Bsph_0538 Bsph_0539     TRUE 0.871 -43.000 0.000 NA   NA
 5628561 5628562 Bsph_0539 Bsph_0540     TRUE 0.931 16.000 0.443 NA   NA
 5628562 5628563 Bsph_0540 Bsph_0541   metN FALSE 0.091 205.000 0.000 1.000   NA
 5628563 5628564 Bsph_0541 Bsph_0542 metN metN TRUE 0.931 -28.000 0.000 1.000   NA
 5628564 5628565 Bsph_0542 Bsph_0543 metN metI TRUE 0.980 29.000 0.642 1.000 Y NA
 5628565 5628566 Bsph_0543 Bsph_0544 metI   TRUE 0.892 67.000 0.128 NA Y NA
 5628566 5628567 Bsph_0544 Bsph_0545   vipA FALSE 0.003 691.000 0.000 NA N NA
 5628567 5628568 Bsph_0545 Bsph_0546 vipA   TRUE 0.860 53.000 0.286 1.000 N NA
 5628568 5628569 Bsph_0546 Bsph_0547     TRUE 0.961 -3.000 0.024 1.000 N NA
 5628569 5628570 Bsph_0547 Bsph_0548     TRUE 0.967 -3.000 0.060 1.000   NA
 5628570 5628571 Bsph_0548 Bsph_0549     TRUE 0.972 14.000 0.250 0.010   NA
 5628573 5628574 Bsph_0551 Bsph_0552     TRUE 0.969 19.000 0.139 1.000 Y NA
 5628574 5628575 Bsph_0552 Bsph_0553     TRUE 0.989 0.000 0.606 1.000 N NA
 5628575 5628576 Bsph_0553 Bsph_0554     TRUE 0.985 -10.000 0.292 1.000 N NA
 5628576 5628577 Bsph_0554 Bsph_0555     TRUE 0.886 81.000 0.152 0.001 N NA
 5628577 5628578 Bsph_0555 Bsph_0556   feuA FALSE 0.147 190.000 0.000 1.000 N NA
 5628578 5628579 Bsph_0556 Bsph_0557 feuA   FALSE 0.320 135.000 0.026 NA   NA
 5628579 5628580 Bsph_0557 Bsph_0558     TRUE 0.978 0.000 0.303 NA   NA
 5628580 5628581 Bsph_0558 Bsph_0559     TRUE 0.913 27.000 0.299 1.000   NA
 5628581 5628582 Bsph_0559 Bsph_0560   rpfG TRUE 0.779 37.000 0.046 1.000 N NA
 5628582 5628583 Bsph_0560 Bsph_0561 rpfG   TRUE 0.738 24.000 0.052 NA   NA
 5628583 5628584 Bsph_0561 Bsph_0562     FALSE 0.340 77.000 0.003 NA   NA
 5628584 5628585 Bsph_0562 Bsph_0563     TRUE 0.620 33.000 0.021 NA   NA
 5628587 5628588 Bsph_0566 Bsph_0567     FALSE 0.509 51.000 0.015 NA   NA
 5628590 5628591 Bsph_0569 Bsph_0570     TRUE 0.977 -3.000 0.237 NA   NA
 5628593 5628594 Bsph_0572 Bsph_0573   yutJ FALSE 0.032 225.000 0.000 NA   NA
 5628599 5628600 Bsph_0578 Bsph_0579     FALSE 0.251 136.000 0.000 NA   NA
 5628601 5628602 Bsph_0580 Bsph_0581     TRUE 0.802 22.000 0.031 1.000   NA
 5628602 5628603 Bsph_0581 Bsph_0582   lytS FALSE 0.219 207.000 0.000 0.015   NA
 5628603 5628604 Bsph_0582 Bsph_0583 lytS lytT TRUE 0.996 7.000 0.538 0.026 Y NA
 5628604 5628605 Bsph_0583 Bsph_0584 lytT   TRUE 0.748 161.000 0.082 1.000 Y NA
 5628605 5628606 Bsph_0584 Bsph_0585     FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5628608 5628609 Bsph_0587 Bsph_0588     FALSE 0.362 135.000 0.044 NA   NA
 5628609 5628610 Bsph_0588 Bsph_0589     FALSE 0.005 396.000 0.000 NA   NA
 5628610 5628611 Bsph_0589 Bsph_0590     TRUE 0.960 13.000 0.438 1.000   NA
 5628611 5628612 Bsph_0590 Bsph_0591     TRUE 0.966 0.000 0.143 NA   NA
 5628612 5628613 Bsph_0591 Bsph_0592     FALSE 0.531 46.000 0.015 NA   NA
 5628613 5628614 Bsph_0592 Bsph_0593     TRUE 0.977 88.000 0.791 0.001 Y NA
 5628615 5628616 Bsph_0594 Bsph_0595 cysA cysW TRUE 0.986 16.000 0.587 1.000 Y NA
 5628616 5628617 Bsph_0595 Bsph_0596 cysW cysT TRUE 0.991 11.000 0.935 0.001 N NA
 5628617 5628618 Bsph_0596 Bsph_0597 cysT   TRUE 0.977 12.000 0.112 0.001 N NA
 5628619 5628620 Bsph_0598 Bsph_0599     TRUE 0.864 13.000 0.011 1.000 N NA
 5628620 5628621 Bsph_0599 Bsph_0600     TRUE 0.850 79.000 0.021 1.000 Y NA
 5628621 5628622 Bsph_0600 Bsph_0601     TRUE 0.997 -3.000 0.101 0.001 Y NA
 5628623 5628624 Bsph_0602 Bsph_0603     TRUE 0.994 -16.000 0.244 1.000 Y NA
 5628624 5628625 Bsph_0603 Bsph_0604     TRUE 0.998 -3.000 0.829 0.065 Y NA
 5628625 5628626 Bsph_0604 Bsph_0605     TRUE 0.995 5.000 0.842 1.000 Y NA
 5628626 5628627 Bsph_0605 Bsph_0606     TRUE 0.998 -7.000 0.368 0.002 Y NA
 5628627 5628628 Bsph_0606 Bsph_0607     TRUE 0.994 0.000 0.341 NA Y NA
 5628628 5628629 Bsph_0607 Bsph_0608   mrpA TRUE 0.995 -13.000 0.439 NA Y NA
 5628632 5628633 Bsph_0611 Bsph_0612     TRUE 0.754 23.000 0.060 NA   NA
 5628634 5628635 Bsph_0613 Bsph_0614   patB FALSE 0.356 112.000 0.022 NA   NA
 5628635 5628636 Bsph_0614 Bsph_0615 patB   TRUE 0.918 -10.000 0.022 NA   NA
 5628639 5628640 Bsph_0618 Bsph_0619 sigY   TRUE 0.965 -7.000 0.125 NA   NA
 5628640 5628641 Bsph_0619 Bsph_0620     FALSE 0.404 85.000 0.027 NA   NA
 5628643 5628644 Bsph_0622 Bsph_0623     FALSE 0.051 242.000 0.023 1.000 N NA
 5628644 5628645 Bsph_0623 Bsph_0624     TRUE 0.835 85.000 0.008 1.000 Y NA
 5628645 5628646 Bsph_0624 Bsph_0625     FALSE 0.103 240.000 0.000 0.038 N NA
 5628647 5628648 Bsph_0626 Bsph_0627     FALSE 0.482 84.000 0.000 1.000   NA
 5628648 5628649 Bsph_0627 Bsph_0628     TRUE 0.812 15.000 0.061 NA   NA
 5628650 5628651 Bsph_rRNA0716S Bsph_rRNA0723S     FALSE 0.008 323.000 0.000 NA   NA
 5628651 5628652 Bsph_rRNA0723S Bsph_rRNA075S     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5628654 5628655 Bsph_0633 Bsph_0634     TRUE 0.845 89.000 0.029 1.000 Y NA
 5628657 5628658 Bsph_0636 Bsph_0637     TRUE 0.905 74.000 0.000 0.065 Y NA
 5628658 5628659 Bsph_0637 Bsph_0638     TRUE 0.851 37.000 0.286 NA   NA
 5628659 5628660 Bsph_0638 Bsph_0639   mtrA FALSE 0.350 74.000 0.000 NA   NA
 5628660 5628661 Bsph_0639 Bsph_0640 mtrA   TRUE 0.984 24.000 0.833 1.000 Y NA
 5628661 5628662 Bsph_0640 Bsph_0641     TRUE 0.678 74.000 0.100 1.000   NA
 5628664 5628665 Bsph_0643 Bsph_0644     FALSE 0.324 86.000 0.000 NA   NA
 5628665 5628666 Bsph_0644 Bsph_0645     FALSE 0.004 427.000 0.000 NA   NA
 5628666 5628667 Bsph_0645 Bsph_0646     FALSE 0.116 175.000 0.000 NA   NA
 5628668 5628669 Bsph_0647 Bsph_0648     TRUE 0.928 -12.000 0.025 NA N NA
 5628669 5628670 Bsph_0648 Bsph_0649     TRUE 0.808 28.000 0.037 1.000 N NA
 5628670 5628671 Bsph_0649 Bsph_0650   fbpC TRUE 0.973 13.000 0.250 0.038 N NA
 5628671 5628672 Bsph_0650 Bsph_0651 fbpC   TRUE 0.921 66.000 0.000 0.038 Y NA
 5628672 5628673 Bsph_0651 Bsph_0652     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 5628673 5628674 Bsph_0652 Bsph_0653     TRUE 0.865 4.000 0.000 NA   NA
 5628675 5628676 Bsph_0654 Bsph_0655     TRUE 0.760 21.000 0.000 1.000   NA
 5628676 5628677 Bsph_0655 Bsph_0656     FALSE 0.042 213.000 0.000 NA   NA
 5628677 5628678 Bsph_0656 Bsph_0657   yxlF TRUE 0.975 -3.000 0.216 NA   NA
 5628678 5628679 Bsph_0657 Bsph_0658 yxlF   TRUE 0.986 -3.000 0.569 NA   NA
 5628680 5628681 Bsph_0659 Bsph_0660     FALSE 0.007 343.000 0.000 NA   NA
 5628686 5628687 Bsph_0665 Bsph_0666     TRUE 0.994 -10.000 0.364 NA Y NA
 5628687 5628688 Bsph_0666 Bsph_0667     TRUE 0.992 4.000 0.273 NA Y NA
 5628688 5628689 Bsph_0667 Bsph_0668     TRUE 0.996 2.000 0.079 0.002 Y NA
 5628689 5628690 Bsph_0668 Bsph_0669     TRUE 0.994 0.000 0.184 1.000 Y NA
 5628690 5628691 Bsph_0669 Bsph_0670   mrpF TRUE 0.944 87.000 0.214 0.065 Y NA
 5628691 5628692 Bsph_0670 Bsph_0671 mrpF   TRUE 0.994 -7.000 0.136 1.000 Y NA
 5628692 5628693 Bsph_0671 Bsph_0672   yqiX FALSE 0.021 298.000 0.000 1.000 N NA
 5628693 5628694 Bsph_0672 Bsph_0673 yqiX yqiY TRUE 0.933 97.000 0.154 0.046 Y NA
 5628694 5628695 Bsph_0673 Bsph_0674 yqiY   TRUE 0.997 -7.000 0.640 1.000 Y NA
 5628695 5628696 Bsph_0674 Bsph_0675     FALSE 0.009 413.000 0.000 1.000   NA
 5628697 5628698 Bsph_0676 Bsph_0677     TRUE 0.988 12.000 0.667 NA Y NA
 5628698 5628699 Bsph_0677 Bsph_0678     TRUE 0.687 43.000 0.000 1.000 N NA
 5628699 5628700 Bsph_0678 Bsph_0679     TRUE 0.955 13.000 0.000 0.001   NA
 5628703 5628704 Bsph_0682 Bsph_0683     FALSE 0.016 256.000 0.000 NA   NA
 5628704 5628705 Bsph_0683 Bsph_0684     TRUE 0.707 14.000 0.000 NA   NA
 5628705 5628706 Bsph_0684 Bsph_0685     TRUE 0.678 39.000 0.000 1.000   NA
 5628706 5628707 Bsph_0685 Bsph_0686     FALSE 0.227 174.000 0.000 1.000 N NA
 5628707 5628708 Bsph_0686 Bsph_0687     TRUE 0.979 -13.000 0.375 NA   NA
 5628708 5628709 Bsph_0687 Bsph_0688     TRUE 0.977 2.000 0.375 NA   NA
 5628710 5628711 Bsph_0689 Bsph_0690   mrsR2 TRUE 0.973 45.000 0.765 1.000 Y NA
 5628712 5628713 Bsph_0691 Bsph_0692     FALSE 0.296 122.000 0.000 NA   NA
 5628713 5628714 Bsph_0692 Bsph_0693     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5628714 5628715 Bsph_0693 Bsph_0694     FALSE 0.144 168.000 0.000 NA   NA
 5628717 5628718 Bsph_0696 Bsph_0697     FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 5628718 5628719 Bsph_0697 Bsph_0698     TRUE 0.647 18.000 0.000 NA   NA
 5628720 5628721 Bsph_0699 Bsph_0700     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 5628721 5628722 Bsph_0700 Bsph_0701   ybbB TRUE 0.983 46.000 0.500 0.008 Y NA
 5628722 5628723 Bsph_0701 Bsph_0702 ybbB ybbB TRUE 0.970 27.000 0.000 0.008 Y NA
 5628723 5628724 Bsph_0702 Bsph_0703 ybbB   TRUE 0.973 98.000 1.000 0.008 Y NA
 5628724 5628725 Bsph_0703 Bsph_0704     FALSE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5628728 5628729 Bsph_0707 Bsph_0708 ybbB   TRUE 0.901 101.000 0.000 0.008 Y NA
 5628730 5628731 Bsph_0709 Bsph_0710     FALSE 0.164 162.000 0.000 NA   NA
 5628734 5628735 Bsph_0713 Bsph_0714 mcpB   FALSE 0.008 429.000 0.000 1.000   NA
 5628735 5628736 Bsph_0714 Bsph_0715   thiC FALSE 0.014 330.000 0.000 1.000   NA
 5628737 5628738 Bsph_0716 Bsph_0717     FALSE 0.021 299.000 0.000 1.000 N NA
 5628739 5628740 Bsph_0718 Bsph_0719     TRUE 0.933 155.000 0.315 0.001 Y NA
 5628740 5628741 Bsph_0719 Bsph_0720     TRUE 0.977 -3.000 0.110 1.000 N NA
 5628741 5628742 Bsph_0720 Bsph_0721     FALSE 0.116 198.000 0.000 1.000 N NA
 5628742 5628743 Bsph_0721 Bsph_0722     TRUE 0.600 84.000 0.047 1.000 N NA
 5628743 5628744 Bsph_0722 Bsph_0723     TRUE 0.946 10.000 0.125 1.000 N NA
 5628744 5628745 Bsph_0723 Bsph_0724     TRUE 0.974 24.000 0.005 0.003 Y NA
 5628745 5628746 Bsph_0724 Bsph_0725     FALSE 0.354 145.000 0.000 1.000   NA
 5628746 5628747 Bsph_0725 Bsph_rRNA0816S     FALSE 0.003 595.000 0.000 NA   NA
 5628747 5628748 Bsph_rRNA0816S Bsph_rRNA0823S     FALSE 0.008 323.000 0.000 NA   NA
 5628748 5628749 Bsph_rRNA0823S Bsph_rRNA085S     FALSE 0.364 71.000 0.000 NA   NA
 5628749 5628750 Bsph_rRNA085S Bsph_tRNA27     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5628750 5628751 Bsph_tRNA27 Bsph_tRNA28     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628751 5628752 Bsph_tRNA28 Bsph_tRNA29     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5628752 5628753 Bsph_tRNA29 Bsph_tRNA30     TRUE 0.807 8.000 0.000 NA   NA
 5628753 5628754 Bsph_tRNA30 Bsph_tRNA31     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628754 5628755 Bsph_tRNA31 Bsph_tRNA32     FALSE 0.499 44.000 0.000 NA   NA
 5628755 5628756 Bsph_tRNA32 Bsph_tRNA33     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5628756 5628757 Bsph_tRNA33 Bsph_tRNA34     TRUE 0.707 14.000 0.000 NA   NA
 5628757 5628758 Bsph_tRNA34 Bsph_tRNA35     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5628758 5628759 Bsph_tRNA35 Bsph_tRNA36     TRUE 0.676 16.000 0.000 NA   NA
 5628759 5628760 Bsph_tRNA36 Bsph_tRNA37     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5628760 5628761 Bsph_tRNA37 Bsph_tRNA38     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5628761 5628762 Bsph_tRNA38 Bsph_tRNA39     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628762 5628763 Bsph_tRNA39 Bsph_tRNA40     TRUE 0.816 7.000 0.000 NA   NA
 5628763 5628764 Bsph_tRNA40 Bsph_tRNA41     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628764 5628765 Bsph_tRNA41 Bsph_tRNA42     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 5628765 5628766 Bsph_tRNA42 Bsph_tRNA43     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5628766 5628767 Bsph_tRNA43 Bsph_0728     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5628767 5628768 Bsph_0728 Bsph_0729     FALSE 0.473 66.000 0.028 NA   NA
 5628770 5628771 Bsph_0731 Bsph_0732     FALSE 0.432 157.000 0.062 1.000 N NA
 5628771 5628772 Bsph_0732 Bsph_0733   resE TRUE 0.997 6.000 0.750 0.026 Y NA
 5628772 5628773 Bsph_0733 Bsph_0734 resE ycbN TRUE 0.832 105.000 0.680 1.000 N NA
 5628773 5628774 Bsph_0734 Bsph_0735 ycbN   TRUE 0.937 5.000 0.100 NA   NA
 5628774 5628775 Bsph_0735 Bsph_0736     FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5628777 5628778 Bsph_0738 Bsph_0739 ykoG ykoH TRUE 0.946 39.000 0.100 1.000 Y NA
 5628778 5628779 Bsph_0739 Bsph_0740 ykoH   TRUE 0.986 -27.000 0.533 1.000   NA
 5628779 5628780 Bsph_0740 Bsph_0741     TRUE 0.895 87.000 0.250 0.001   NA
 5628780 5628781 Bsph_0741 Bsph_0742     FALSE 0.007 483.000 0.000 1.000   NA
 5628781 5628782 Bsph_0742 Bsph_0743     FALSE 0.012 375.000 0.000 1.000 N NA
 5628782 5628783 Bsph_0743 Bsph_0744     TRUE 0.989 0.000 0.014 1.000 Y NA
 5628783 5628784 Bsph_0744 Bsph_0745     FALSE 0.003 519.000 0.000 NA   NA
 5628787 5628788 Bsph_0748 Bsph_0749     FALSE 0.294 106.000 0.000 NA   NA
 5628788 5628789 Bsph_0749 Bsph_0750     FALSE 0.398 145.000 0.080 NA   NA
 5628789 5628790 Bsph_0750 Bsph_0751     TRUE 0.968 -19.000 0.200 NA   NA
 5628791 5628792 Bsph_0752 Bsph_0754     FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5628793 5628794 Bsph_0755 Bsph_0756   ypsA FALSE 0.335 102.000 0.017 NA   NA
 5628794 5628795 Bsph_0756 Bsph_0757 ypsA   FALSE 0.029 227.000 0.000 NA   NA
 5628796 5628797 Bsph_0758 Bsph_0759   yvrG TRUE 0.996 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 5628799 5628800 Bsph_0761 Bsph_0762   yfeW TRUE 0.751 156.000 0.167 0.007 N NA
 5628800 5628801 Bsph_0762 Bsph_0763 yfeW yurO TRUE 0.968 -3.000 0.053 1.000 N NA
 5628801 5628802 Bsph_0763 Bsph_0764 yurO yurN TRUE 0.925 153.000 0.456 0.037 Y NA
 5628804 5628805 Bsph_0765 Bsph_0767 yurM   TRUE 0.948 -13.000 0.077 NA   NA
 5628805 5628806 Bsph_0767 Bsph_0768     TRUE 0.919 6.000 0.080 NA   NA
 5628806 5628807 Bsph_0768 Bsph_0769   ybbH TRUE 0.901 72.000 0.240 0.002   NA
 5628809 5628810 Bsph_0771 Bsph_0772     FALSE 0.004 478.000 0.000 NA   NA
 5628810 5628811 Bsph_0772 Bsph_0773   yjlD TRUE 0.830 46.000 0.310 NA   NA
 5628811 5628812 Bsph_0773 Bsph_0774 yjlD mcpC FALSE 0.521 128.000 0.034 1.000 N NA
 5628817 5628818 Bsph_0779 Bsph_0780   ydeL FALSE 0.466 151.000 0.154 NA   NA
 5628819 5628820 Bsph_0781 Bsph_0782     FALSE 0.467 114.000 0.009 1.000   NA
 5628821 5628822 Bsph_0783 Bsph_0784     TRUE 0.987 -3.000 0.636 NA   NA
 5628822 5628823 Bsph_0784 Bsph_0785     TRUE 0.848 147.000 0.667 0.030   NA
 5628823 5628824 Bsph_0785 Bsph_0786     TRUE 0.838 13.000 0.000 1.000   NA
 5628829 5628830 Bsph_0791 Bsph_0792     FALSE 0.576 142.000 0.000 0.089   NA
 5628830 5628831 Bsph_0792 Bsph_0793     TRUE 0.719 108.000 0.048 0.059   NA
 5628831 5628832 Bsph_0793 Bsph_0794     TRUE 0.768 17.000 0.048 NA   NA
 5628833 5628834 Bsph_0795 Bsph_0796 arsR   TRUE 0.982 0.000 0.413 NA   NA
 5628835 5628836 Bsph_0797 Bsph_0798     FALSE 0.098 207.000 0.000 1.000 N NA
 5628836 5628837 Bsph_0798 Bsph_0799     TRUE 0.771 120.000 0.333 1.000 N NA
 5628837 5628838 Bsph_0799 Bsph_0800     TRUE 0.997 0.000 0.056 0.001 Y NA
 5628838 5628839 Bsph_0800 Bsph_0801     FALSE 0.373 69.000 0.000 NA   NA
 5628839 5628840 Bsph_0801 Bsph_0802     FALSE 0.345 101.000 0.020 NA   NA
 5628842 5628843 Bsph_0804 Bsph_0805   yokL FALSE 0.003 993.000 0.000 NA   NA
 5628843 5628844 Bsph_0805 Bsph_0806 yokL   FALSE 0.006 709.000 0.000 1.000 N NA
 5628845 5628846 Bsph_0807 Bsph_0808     FALSE 0.319 104.000 0.010 NA   NA
 5628848 5628849 Bsph_0810 Bsph_0811 yxdM yxdL TRUE 0.809 65.000 0.444 NA   NA
 5628849 5628850 Bsph_0811 Bsph_0812 yxdL yxdK TRUE 0.840 125.000 0.833 1.000 N NA
 5628850 5628851 Bsph_0812 Bsph_0813 yxdK yxdJ TRUE 0.997 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 5628853 5628854 Bsph_0815 Bsph_0816   yehT FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 5628855 5628856 Bsph_0817 Bsph_0818 yocH   FALSE 0.485 125.000 0.023 1.000   NA
 5628856 5628857 Bsph_0818 Bsph_0819     FALSE 0.011 290.000 0.000 NA   NA
 5628857 5628858 Bsph_0819 Bsph_0820     FALSE 0.296 99.000 0.000 NA   NA
 5628858 5628859 Bsph_0820 Bsph_0821     TRUE 0.713 115.000 0.381 NA   NA
 5628859 5628860 Bsph_0821 Bsph_0822     TRUE 0.977 -3.000 0.237 NA   NA
 5628860 5628861 Bsph_0822 Bsph_0823     FALSE 0.018 249.000 0.000 NA   NA
 5628861 5628862 Bsph_0823 Bsph_0824   amhX FALSE 0.205 192.000 0.154 NA   NA
 5628862 5628863 Bsph_0824 Bsph_0825 amhX   FALSE 0.023 282.000 0.000 1.000   NA
 5628865 5628866 Bsph_0827 Bsph_0828     TRUE 0.923 12.000 0.189 NA   NA
 5628869 5628870 Bsph_0831 Bsph_0832     FALSE 0.385 125.000 0.036 NA   NA
 5628870 5628871 Bsph_0832 Bsph_0833     TRUE 0.782 30.000 0.036 1.000   NA
 5628873 5628874 Bsph_0835 Bsph_0836     FALSE 0.043 211.000 0.000 NA   NA
 5628876 5628877 Bsph_0838 Bsph_0839     FALSE 0.053 201.000 0.000 NA   NA
 5628878 5628879 Bsph_0840 Bsph_0841     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 5628879 5628880 Bsph_0841 Bsph_0842     FALSE 0.257 134.000 0.000 NA   NA
 5628880 5628881 Bsph_0842 Bsph_0843     FALSE 0.048 207.000 0.000 NA   NA
 5628883 5628884 Bsph_0845 Bsph_0846 ywfM   FALSE 0.556 77.000 0.087 NA   NA
 5628884 5628885 Bsph_0846 Bsph_0847     TRUE 0.854 14.000 0.087 NA   NA
 5628885 5628886 Bsph_0847 Bsph_0848     TRUE 0.890 27.000 0.333 NA   NA
 5628888 5628889 Bsph_0850 Bsph_0851     FALSE 0.553 104.000 0.056 1.000   NA
 5628889 5628890 Bsph_0851 Bsph_0852     FALSE 0.023 283.000 0.000 1.000   NA
 5628890 5628891 Bsph_0852 Bsph_0853     FALSE 0.060 224.000 0.000 1.000   NA
 5628893 5628894 Bsph_0855 Bsph_0856     FALSE 0.011 289.000 0.000 NA   NA
 5628894 5628895 Bsph_0856 Bsph_0857     TRUE 0.869 27.000 0.107 1.000 N NA
 5628895 5628896 Bsph_0857 Bsph_0858     TRUE 0.813 22.000 0.027 1.000 N NA
 5628896 5628897 Bsph_0858 Bsph_0859     FALSE 0.394 137.000 0.062 NA   NA
 5628899 5628900 Bsph_0861 Bsph_0862     TRUE 0.837 22.000 0.133 NA   NA
 5628902 5628903 Bsph_0864 Bsph_0865   yfiB FALSE 0.532 173.000 0.667 NA   NA
 5628903 5628904 Bsph_0865 Bsph_0866 yfiB   TRUE 0.997 0.000 0.167 0.004 Y NA
 5628904 5628905 Bsph_0866 Bsph_0867     FALSE 0.038 217.000 0.000 NA   NA
 5628905 5628906 Bsph_0867 Bsph_0868     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5628910 5628911 Bsph_0872 Bsph_0873     FALSE 0.314 96.000 0.006 NA   NA
 5628912 5628913 Bsph_0874 Bsph_0875     FALSE 0.110 283.000 0.000 1.000 Y NA
 5628913 5628914 Bsph_0875 Bsph_0876     FALSE 0.023 290.000 0.000 1.000 N NA
 5628914 5628915 Bsph_0876 Bsph_0877     TRUE 0.994 9.000 0.250 0.037 Y NA
 5628916 5628917 Bsph_0878 Bsph_0879     FALSE 0.131 318.000 0.000 0.063 Y NA
 5628918 5628919 Bsph_0880 Bsph_0881   spxA TRUE 0.916 24.000 0.250 1.000 N NA
 5628919 5628920 Bsph_0881 Bsph_0882 spxA   FALSE 0.009 411.000 0.000 1.000   NA
 5628920 5628921 Bsph_0882 Bsph_0883     TRUE 0.784 35.000 0.125 NA   NA
 5628921 5628922 Bsph_0883 Bsph_0884   neuA FALSE 0.051 203.000 0.000 NA   NA
 5628923 5628924 Bsph_0885 Bsph_0886     FALSE 0.536 120.000 0.043 1.000   NA
 5628924 5628925 Bsph_0886 Bsph_0887     TRUE 0.737 89.000 0.222 1.000   NA
 5628925 5628926 Bsph_0887 Bsph_0888     TRUE 0.970 2.000 0.222 NA   NA
 5628926 5628927 Bsph_0888 Bsph_0889     FALSE 0.400 157.000 0.125 NA   NA
 5628929 5628930 Bsph_0891 Bsph_0892     FALSE 0.006 372.000 0.000 NA   NA
 5628930 5628931 Bsph_0892 Bsph_rRNA0916S     FALSE 0.003 690.000 0.000 NA   NA
 5628931 5628932 Bsph_rRNA0916S Bsph_tRNA44     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5628932 5628933 Bsph_tRNA44 Bsph_tRNA45     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5628933 5628934 Bsph_tRNA45 Bsph_rRNA0923S     FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 5628934 5628935 Bsph_rRNA0923S Bsph_rRNA095S     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5628935 5628936 Bsph_rRNA095S Bsph_0895     FALSE 0.003 1145.000 0.000 NA   NA
 5628936 5628937 Bsph_0895 Bsph_0896     FALSE 0.570 91.000 0.037 1.000 N NA
 5628937 5628938 Bsph_0896 Bsph_0897     TRUE 0.795 148.000 0.074 1.000 Y NA
 5628938 5628939 Bsph_0897 Bsph_0898     TRUE 0.959 16.000 0.237 0.081   NA
 5628939 5628940 Bsph_0898 Bsph_0899     TRUE 0.986 -34.000 0.053 0.001   NA
 5628940 5628941 Bsph_0899 Bsph_0900     TRUE 0.826 65.000 0.553 NA   NA
 5628941 5628942 Bsph_0900 Bsph_0901     TRUE 0.952 15.000 0.778 NA   NA
 5628942 5628943 Bsph_0901 Bsph_0902     TRUE 0.995 -3.000 0.690 0.080 N NA
 5628943 5628944 Bsph_0902 Bsph_0903     TRUE 0.914 130.000 0.426 1.000 Y NA
 5628944 5628945 Bsph_0903 Bsph_0904     FALSE 0.506 71.000 0.037 NA N NA
 5628945 5628946 Bsph_0904 Bsph_0905     FALSE 0.006 355.000 0.000 NA   NA
 5628946 5628947 Bsph_0905 Bsph_0906     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5628947 5628948 Bsph_0906 Bsph_0907     FALSE 0.264 133.000 0.004 NA   NA
 5628948 5628949 Bsph_0907 Bsph_0908     FALSE 0.298 114.000 0.000 NA   NA
 5628949 5628950 Bsph_0908 Bsph_0909     FALSE 0.582 59.000 0.000 1.000   NA
 5628951 5628952 Bsph_0910 Bsph_0911     TRUE 0.993 -3.000 0.074 1.000 Y NA
 5628952 5628953 Bsph_0911 Bsph_0912     TRUE 0.957 15.000 0.500 1.000 N NA
 5628953 5628954 Bsph_0912 Bsph_0913   metI TRUE 0.902 14.000 0.077 1.000 N NA
 5628954 5628955 Bsph_0913 Bsph_0914 metI metN TRUE 0.997 -7.000 0.846 1.000 Y NA
 5628955 5628956 Bsph_0914 Bsph_0915 metN metQ TRUE 0.929 105.000 0.880 NA Y NA
 5628961 5628962 Bsph_0920 Bsph_0921     TRUE 0.950 22.000 0.667 1.000 N NA
 5628962 5628963 Bsph_0921 Bsph_0922     TRUE 0.933 35.000 0.667 1.000 N NA
 5628965 5628966 Bsph_0924 Bsph_0925 tlpA   FALSE 0.013 349.000 0.000 1.000 N NA
 5628967 5628968 Bsph_0926 Bsph_0928     FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 5628969 5628970 Bsph_0929 Bsph_0930     FALSE 0.502 82.000 0.067 NA   NA
 5628970 5628971 Bsph_0930 Bsph_0931   cbiO TRUE 0.805 20.000 0.029 1.000   NA
 5628974 5628975 Bsph_0934 Bsph_0935     TRUE 0.950 14.000 0.644 NA   NA
 5628975 5628976 Bsph_0935 Bsph_0936     FALSE 0.003 538.000 0.000 NA   NA
 5628976 5628977 Bsph_0936 Bsph_0937     FALSE 0.017 252.000 0.000 NA   NA
 5628978 5628979 Bsph_0938 Bsph_0939     FALSE 0.465 76.000 0.044 NA   NA
 5628979 5628980 Bsph_0939 Bsph_0940     TRUE 0.964 0.000 0.130 NA   NA
 5628980 5628981 Bsph_0940 Bsph_0941     TRUE 0.705 28.000 0.042 NA   NA
 5628981 5628982 Bsph_0941 Bsph_0942   yhaA FALSE 0.192 156.000 0.005 NA   NA
 5628983 5628984 Bsph_0943 Bsph_0944 gerQ   TRUE 0.932 23.000 0.722 NA   NA
 5628986 5628987 Bsph_0946 Bsph_0947     TRUE 0.864 5.000 0.009 NA   NA
 5628990 5628991 Bsph_0950 Bsph_0951     FALSE 0.248 159.000 0.039 NA   NA
 5628991 5628992 Bsph_0951 Bsph_0952     FALSE 0.010 374.000 0.000 1.000   NA
 5628993 5628994 Bsph_0953 Bsph_0954 srtA   FALSE 0.157 178.000 0.039 NA   NA
 5628997 5628998 Bsph_0957 Bsph_0958     FALSE 0.164 162.000 0.000 NA   NA
 5628998 5628999 Bsph_0958 Bsph_0959   oxaA TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5628999 5629000 Bsph_0959 Bsph_0960 oxaA   FALSE 0.209 155.000 0.011 NA   NA
 5629000 5629001 Bsph_0960 Bsph_0961     TRUE 0.956 -3.000 0.079 NA   NA
 5629001 5629002 Bsph_0961 Bsph_0962     FALSE 0.132 193.000 0.000 1.000 N NA
 5629002 5629003 Bsph_0962 Bsph_0963     TRUE 0.986 -7.000 0.321 1.000 N NA
 5629003 5629004 Bsph_0963 Bsph_0964     TRUE 0.990 2.000 0.065 1.000 Y NA
 5629004 5629005 Bsph_0964 Bsph_0965     FALSE 0.044 241.000 0.000 1.000 N NA
 5629005 5629006 Bsph_0965 Bsph_0966   hmuU TRUE 0.995 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 5629006 5629007 Bsph_0966 Bsph_0967 hmuU   TRUE 0.996 -3.000 0.373 1.000 Y NA
 5629007 5629008 Bsph_0967 Bsph_0968     TRUE 0.649 83.000 0.092 1.000   NA
 5629008 5629009 Bsph_0968 Bsph_0969     FALSE 0.022 237.000 0.000 NA   NA
 5629009 5629010 Bsph_0969 Bsph_0970     TRUE 0.869 -46.000 0.000 NA   NA
 5629010 5629011 Bsph_0970 Bsph_0971     FALSE 0.339 189.000 0.205 1.000 N NA
 5629011 5629012 Bsph_0971 Bsph_0972     TRUE 0.993 0.000 0.118 1.000 Y NA
 5629012 5629013 Bsph_0972 Bsph_0973     TRUE 0.922 60.000 0.110 1.000 Y NA
 5629013 5629014 Bsph_0973 Bsph_0974     TRUE 0.920 155.000 0.270 0.004 Y NA
 5629014 5629015 Bsph_0974 Bsph_0975     TRUE 0.984 4.000 0.432 1.000 N NA
 5629015 5629016 Bsph_0975 Bsph_0976     TRUE 0.702 93.000 0.146 1.000 N NA
 5629016 5629017 Bsph_0976 Bsph_0977     FALSE 0.216 147.000 0.000 NA   NA
 5629017 5629018 Bsph_0977 Bsph_0978     FALSE 0.228 144.000 0.000 NA   NA
 5629018 5629019 Bsph_0978 Bsph_0979     FALSE 0.011 443.000 0.029 1.000 N NA
 5629021 5629022 Bsph_0981 Bsph_0982     FALSE 0.007 525.000 0.000 1.000 N NA
 5629022 5629023 Bsph_0982 Bsph_0983     TRUE 0.772 151.000 0.061 1.000 Y NA
 5629023 5629024 Bsph_0983 Bsph_0984     TRUE 0.894 13.000 0.049 1.000 N NA
 5629024 5629025 Bsph_0984 Bsph_0985     TRUE 0.714 95.000 0.170 1.000 N NA
 5629025 5629026 Bsph_0985 Bsph_0986     FALSE 0.062 227.000 0.005 1.000 N NA
 5629026 5629027 Bsph_0986 Bsph_0987     FALSE 0.565 32.000 0.002 NA   NA
 5629027 5629028 Bsph_0987 Bsph_0988     TRUE 0.895 -10.000 0.000 NA   NA
 5629028 5629029 Bsph_0988 Bsph_0989     TRUE 0.899 49.000 0.500 1.000 N NA
 5629029 5629030 Bsph_0989 Bsph_0990     TRUE 0.844 43.000 0.150 1.000 N NA
 5629030 5629031 Bsph_0990 Bsph_0991     TRUE 0.936 47.000 0.100 1.000 Y NA
 5629031 5629032 Bsph_0991 Bsph_0992     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.036 Y NA
 5629032 5629033 Bsph_0992 Bsph_0993     TRUE 0.866 93.000 1.000 1.000 N NA
 5629033 5629034 Bsph_0993 Bsph_0994     FALSE 0.007 503.000 0.000 1.000 N NA
 5629034 5629035 Bsph_0994 Bsph_0995     FALSE 0.436 156.000 0.062 1.000 N NA
 5629035 5629036 Bsph_0995 Bsph_0996     TRUE 0.996 -10.000 0.084 0.038 Y NA
 5629036 5629037 Bsph_0996 Bsph_0997   spoIIR TRUE 0.615 118.000 0.178 NA   NA
 5629037 5629038 Bsph_0997 Bsph_0998 spoIIR   FALSE 0.448 102.000 0.062 NA   NA
 5629038 5629039 Bsph_0998 Bsph_0999     FALSE 0.162 167.000 0.008 NA   NA
 5629039 5629040 Bsph_0999 Bsph_1000     FALSE 0.377 73.000 0.008 NA   NA
 5629040 5629041 Bsph_1000 Bsph_1001   mcpA TRUE 0.973 15.000 0.105 1.000 Y NA
 5629041 5629042 Bsph_1001 Bsph_1002 mcpA   FALSE 0.026 394.000 0.150 1.000 N NA
 5629042 5629043 Bsph_1002 Bsph_1003     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5629043 5629044 Bsph_1003 Bsph_1004     TRUE 0.869 -46.000 0.000 NA   NA
 5629044 5629045 Bsph_1004 Bsph_1005     TRUE 0.826 29.000 0.145 NA   NA
 5629045 5629046 Bsph_1005 Bsph_1006     FALSE 0.026 281.000 0.000 1.000 N NA
 5629046 5629047 Bsph_1006 Bsph_1007     FALSE 0.465 125.000 0.002 1.000 N NA
 5629047 5629048 Bsph_1007 Bsph_1008     FALSE 0.249 171.000 0.004 1.000 N NA
 5629048 5629049 Bsph_1008 Bsph_1009     FALSE 0.006 538.000 0.000 1.000   NA
 5629049 5629050 Bsph_1009 Bsph_1010     TRUE 0.893 37.000 0.330 1.000   NA
 5629050 5629051 Bsph_1010 Bsph_1011   atpE TRUE 0.904 64.000 0.189 0.003   NA
 5629051 5629052 Bsph_1011 Bsph_1012 atpE   TRUE 0.731 174.000 0.402 0.003   NA
 5629052 5629053 Bsph_1012 Bsph_1013     TRUE 0.998 -3.000 0.222 0.003 Y NA
 5629053 5629054 Bsph_1013 Bsph_1014     TRUE 0.992 29.000 0.864 0.003 Y NA
 5629054 5629055 Bsph_1014 Bsph_1015     TRUE 0.987 48.000 0.846 0.003 Y NA
 5629055 5629056 Bsph_1015 Bsph_1016     TRUE 0.986 49.000 0.724 0.003 Y NA
 5629056 5629057 Bsph_1016 Bsph_1017     TRUE 0.975 88.000 0.837 0.003 Y NA
 5629057 5629058 Bsph_1017 Bsph_1018     FALSE 0.447 78.000 0.039 NA   NA
 5629058 5629059 Bsph_1018 Bsph_1019     FALSE 0.027 367.000 0.279 NA   NA
 5629059 5629060 Bsph_1019 Bsph_1020     TRUE 0.769 82.000 0.243 1.000 N NA
 5629060 5629061 Bsph_1020 Bsph_1021     TRUE 0.831 32.000 0.090 1.000   NA
 5629061 5629062 Bsph_1021 Bsph_1022     FALSE 0.027 240.000 0.019 NA   NA
 5629062 5629063 Bsph_1022 Bsph_1023     FALSE 0.181 211.000 0.284 NA   NA
 5629063 5629064 Bsph_1023 Bsph_1024   flhO TRUE 0.941 13.000 0.186 1.000 N NA
 5629064 5629065 Bsph_1024 Bsph_1025 flhO flhP TRUE 0.985 31.000 0.248 0.003 Y NA
 5629065 5629066 Bsph_1025 Bsph_1026 flhP   TRUE 0.858 43.000 0.395 NA   NA
 5629066 5629067 Bsph_1026 Bsph_1027     FALSE 0.086 192.000 0.019 NA   NA
 5629067 5629068 Bsph_1027 Bsph_1028     FALSE 0.215 149.000 0.004 NA   NA
 5629068 5629069 Bsph_1028 Bsph_1029     TRUE 0.604 109.000 0.167 NA   NA
 5629072 5629073 Bsph_1032 Bsph_1033     TRUE 0.974 0.000 0.125 1.000   NA
 5629074 5629075 Bsph_1034 Bsph_1035     FALSE 0.258 200.000 0.400 NA   NA
 5629076 5629077 Bsph_1036 Bsph_1037     TRUE 0.978 0.000 0.328 NA   NA
 5629077 5629078 Bsph_1037 Bsph_1038     TRUE 0.744 21.000 0.049 NA   NA
 5629078 5629079 Bsph_1038 Bsph_1039     TRUE 0.953 -3.000 0.015 1.000   NA
 5629079 5629080 Bsph_1039 Bsph_1040     FALSE 0.003 893.000 0.000 NA N NA
 5629081 5629082 Bsph_1041 Bsph_1042     FALSE 0.003 837.000 0.000 NA   NA
 5629083 5629084 Bsph_1043 Bsph_1044     FALSE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 5629084 5629085 Bsph_1044 Bsph_1045     TRUE 0.907 33.000 0.000 NA Y NA
 5629086 5629087 Bsph_1046 Bsph_1047     FALSE 0.003 1127.000 0.000 NA   NA
 5629087 5629088 Bsph_1047 Bsph_1048     FALSE 0.003 1019.000 0.000 NA   NA
 5629088 5629089 Bsph_1048 Bsph_1049     FALSE 0.003 966.000 0.000 NA   NA
 5629089 5629090 Bsph_1049 Bsph_1050     FALSE 0.003 1007.000 0.000 NA   NA
 5629090 5629091 Bsph_1050 Bsph_1051     FALSE 0.037 218.000 0.000 NA   NA
 5629091 5629092 Bsph_1051 Bsph_1052     FALSE 0.006 354.000 0.000 NA   NA
 5629092 5629093 Bsph_1052 Bsph_1053     TRUE 0.890 -13.000 0.000 NA   NA
 5629093 5629094 Bsph_1053 Bsph_1054     TRUE 0.875 3.000 0.000 NA   NA
 5629094 5629095 Bsph_1054 Bsph_1055     TRUE 0.731 13.000 0.000 NA   NA
 5629095 5629096 Bsph_1055 Bsph_1056     FALSE 0.003 689.000 0.000 NA   NA
 5629096 5629097 Bsph_1056 Bsph_1057     FALSE 0.018 250.000 0.000 NA   NA
 5629097 5629098 Bsph_1057 Bsph_1058     TRUE 0.771 11.000 0.000 NA   NA
 5629098 5629099 Bsph_1058 Bsph_1059     TRUE 0.797 9.000 0.000 NA   NA
 5629099 5629100 Bsph_1059 Bsph_1060     FALSE 0.003 757.000 0.000 NA   NA
 5629100 5629101 Bsph_1060 Bsph_1061     FALSE 0.278 128.000 0.000 NA   NA
 5629101 5629102 Bsph_1061 Bsph_1062     FALSE 0.003 768.000 0.000 NA   NA
 5629102 5629103 Bsph_1062 Bsph_1063     FALSE 0.003 679.000 0.000 NA   NA
 5629103 5629104 Bsph_1063 Bsph_1064     FALSE 0.003 669.000 0.000 NA   NA
 5629104 5629105 Bsph_1064 Bsph_1065     TRUE 0.882 -19.000 0.000 NA   NA
 5629105 5629106 Bsph_1065 Bsph_1066     FALSE 0.149 167.000 0.000 NA   NA
 5629106 5629107 Bsph_1066 Bsph_1067     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 5629107 5629108 Bsph_1067 Bsph_1068     FALSE 0.004 459.000 0.000 NA   NA
 5629108 5629109 Bsph_1068 Bsph_1069     FALSE 0.026 231.000 0.000 NA   NA
 5629109 5629110 Bsph_1069 Bsph_1070     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5629112 5629113 Bsph_1072 Bsph_1073     FALSE 0.004 473.000 0.000 NA   NA
 5629113 5629114 Bsph_1073 Bsph_1074     TRUE 0.599 27.000 0.000 NA   NA
 5629114 5629115 Bsph_1074 Bsph_1075     FALSE 0.003 675.000 0.000 NA   NA
 5629116 5629117 Bsph_1076 Bsph_1078     FALSE 0.087 185.000 0.000 NA   NA
 5629117 5629118 Bsph_1078 Bsph_1079   licT FALSE 0.006 674.000 0.000 1.000 N NA
 5629118 5629119 Bsph_1079 Bsph_1080 licT   FALSE 0.005 1242.000 0.000 1.000   NA
 5629120 5629121 Bsph_1081 Bsph_1082     FALSE 0.003 650.000 0.000 NA   NA
 5629121 5629122 Bsph_1082 Bsph_1083     FALSE 0.007 343.000 0.000 NA   NA
 5629122 5629123 Bsph_1083 Bsph_1084     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 5629124 5629125 Bsph_1085 Bsph_1086     FALSE 0.581 30.000 0.000 NA   NA
 5629125 5629126 Bsph_1086 Bsph_1087     FALSE 0.003 807.000 0.000 NA   NA
 5629126 5629127 Bsph_1087 Bsph_1088   gerXC FALSE 0.003 575.000 0.000 NA   NA
 5629127 5629128 Bsph_1088 Bsph_1089 gerXC   TRUE 0.890 72.000 0.286 0.014   NA
 5629128 5629129 Bsph_1089 Bsph_1090     TRUE 0.994 -3.000 0.429 0.014   NA
 5629130 5629131 Bsph_1091 Bsph_1092     TRUE 0.991 6.000 0.000 0.009 Y NA
 5629131 5629132 Bsph_1092 Bsph_1093     TRUE 0.975 18.000 0.000 0.009 Y NA
 5629132 5629133 Bsph_1093 Bsph_1094     TRUE 0.995 0.000 0.000 0.009 Y NA
 5629135 5629136 Bsph_1096 Bsph_1097     FALSE 0.009 311.000 0.000 NA   NA
 5629136 5629137 Bsph_1097 Bsph_1098     TRUE 0.880 -22.000 0.000 NA   NA
 5629139 5629140 Bsph_1100 Bsph_1101     FALSE 0.014 268.000 0.000 NA   NA
 5629140 5629141 Bsph_1101 Bsph_1102     FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 5629141 5629142 Bsph_1102 Bsph_1103     FALSE 0.010 299.000 0.000 NA   NA
 5629144 5629145 Bsph_1105 Bsph_1106     FALSE 0.003 945.000 0.000 NA   NA
 5629145 5629146 Bsph_1106 Bsph_1107     FALSE 0.005 411.000 0.000 NA   NA
 5629146 5629147 Bsph_1107 Bsph_1108   mcpA FALSE 0.006 639.000 0.000 1.000   NA
 5629149 5629150 Bsph_1110 Bsph_1111     FALSE 0.441 55.000 0.000 NA   NA
 5629151 5629152 Bsph_1112 Bsph_1113     FALSE 0.005 384.000 0.000 NA   NA
 5629155 5629156 Bsph_1116 Bsph_1117     FALSE 0.003 820.000 0.000 NA   NA
 5629156 5629157 Bsph_1117 Bsph_1118     FALSE 0.526 114.000 0.100 NA   NA
 5629158 5629159 Bsph_1119 Bsph_1120     TRUE 0.987 -3.000 0.667 NA   NA
 5629160 5629161 Bsph_1121 Bsph_1122     FALSE 0.062 195.000 0.000 NA   NA
 5629161 5629162 Bsph_1122 Bsph_1123     FALSE 0.034 222.000 0.000 NA   NA
 5629162 5629163 Bsph_1123 Bsph_1124   yrvJ FALSE 0.076 291.000 0.000 NA Y NA
 5629164 5629165 Bsph_1125 Bsph_1126   rocA FALSE 0.029 263.000 0.000 1.000   NA
 5629165 5629166 Bsph_1126 Bsph_1127 rocA   TRUE 0.968 9.000 0.000 0.001   NA
 5629166 5629167 Bsph_1127 Bsph_1128     FALSE 0.092 276.000 0.000 0.001   NA
 5629171 5629172 Bsph_1132 Bsph_1133   brnQ FALSE 0.119 193.000 0.000 1.000   NA
 5629172 5629173 Bsph_1133 Bsph_1134 brnQ braB TRUE 0.983 -21.000 0.000 0.001   NA
 5629175 5629176 Bsph_1136 Bsph_1137     FALSE 0.003 506.000 0.000 NA   NA
 5629176 5629177 Bsph_1137 Bsph_1138   secA TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5629179 5629180 Bsph_1140 Bsph_1141   yvyE FALSE 0.031 228.000 0.009 NA   NA
 5629181 5629182 Bsph_1142 Bsph_1143 degS degU TRUE 0.987 31.000 0.519 0.025 Y NA
 5629182 5629183 Bsph_1143 Bsph_1144 degU   FALSE 0.010 296.000 0.000 NA   NA
 5629183 5629184 Bsph_1144 Bsph_1145     FALSE 0.019 245.000 0.000 NA   NA
 5629184 5629185 Bsph_1145 Bsph_1146     TRUE 0.798 46.000 0.214 NA   NA
 5629185 5629186 Bsph_1146 Bsph_1147     TRUE 0.977 -3.000 0.130 1.000   NA
 5629186 5629187 Bsph_1147 Bsph_1148     FALSE 0.457 80.000 0.045 NA   NA
 5629187 5629188 Bsph_1148 Bsph_1149     TRUE 0.633 121.000 0.204 NA   NA
 5629188 5629189 Bsph_1149 Bsph_1150     TRUE 0.969 28.000 0.421 0.002   NA
 5629189 5629190 Bsph_1150 Bsph_1151     TRUE 0.969 17.000 0.233 0.002   NA
 5629190 5629191 Bsph_1151 Bsph_1152     TRUE 0.968 73.000 0.257 0.001 Y NA
 5629191 5629192 Bsph_1152 Bsph_1153     TRUE 0.742 61.000 0.207 NA   NA
 5629192 5629193 Bsph_1153 Bsph_1154     TRUE 0.928 15.000 0.375 NA   NA
 5629193 5629194 Bsph_1154 Bsph_1155     TRUE 0.889 36.000 0.489 NA   NA
 5629194 5629195 Bsph_1155 Bsph_1156     FALSE 0.337 180.000 0.111 1.000 N NA
 5629195 5629196 Bsph_1156 Bsph_1157     FALSE 0.527 88.000 0.083 NA   NA
 5629196 5629197 Bsph_1157 Bsph_1158     TRUE 0.968 3.000 0.231 NA   NA
 5629197 5629198 Bsph_1158 Bsph_1159     TRUE 0.974 2.000 0.286 NA   NA
 5629198 5629199 Bsph_1159 Bsph_1160     TRUE 0.663 25.000 0.020 NA   NA
 5629199 5629200 Bsph_1160 Bsph_1161     TRUE 0.996 -3.000 0.418 1.000 Y NA
 5629200 5629201 Bsph_1161 Bsph_1162     TRUE 0.995 -3.000 0.190 1.000 Y NA
 5629201 5629202 Bsph_1162 Bsph_1163     TRUE 0.997 -3.000 0.549 1.000 Y NA
 5629202 5629203 Bsph_1163 Bsph_1164     TRUE 0.984 -7.000 0.292 1.000   NA
 5629203 5629204 Bsph_1164 Bsph_1165     TRUE 0.966 5.000 0.156 1.000   NA
 5629204 5629205 Bsph_1165 Bsph_1166     TRUE 0.995 -10.000 0.235 1.000 Y NA
 5629205 5629206 Bsph_1166 Bsph_1167     FALSE 0.520 40.000 0.000 NA   NA
 5629206 5629207 Bsph_1167 Bsph_1169     FALSE 0.236 142.000 0.000 NA   NA
 5629207 5629208 Bsph_1169 Bsph_1170     FALSE 0.501 68.000 0.043 NA   NA
 5629208 5629209 Bsph_1170 Bsph_1171   flaG FALSE 0.064 200.000 0.000 NA N NA
 5629209 5629210 Bsph_1171 Bsph_1172 flaG   TRUE 0.969 22.000 0.298 NA Y NA
 5629210 5629211 Bsph_1172 Bsph_1173     TRUE 0.640 29.000 0.019 NA   NA
 5629211 5629212 Bsph_1173 Bsph_1174   fliS FALSE 0.144 211.000 0.174 NA   NA
 5629212 5629213 Bsph_1174 Bsph_1175 fliS   FALSE 0.082 194.000 0.023 NA   NA
 5629213 5629214 Bsph_1175 Bsph_1176     FALSE 0.305 100.000 0.006 NA   NA
 5629214 5629215 Bsph_1176 Bsph_1177     FALSE 0.365 142.000 0.041 NA N NA
 5629215 5629216 Bsph_1177 Bsph_1178   comK FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 5629216 5629217 Bsph_1178 Bsph_1179 comK   FALSE 0.035 220.000 0.000 NA   NA
 5629219 5629220 Bsph_1181 Bsph_1182     FALSE 0.008 326.000 0.000 NA   NA
 5629220 5629221 Bsph_1182 Bsph_1183     TRUE 0.995 8.000 0.154 0.001 Y NA
 5629221 5629222 Bsph_1183 Bsph_1184   yvlB FALSE 0.063 196.000 0.006 NA   NA
 5629222 5629223 Bsph_1184 Bsph_1185 yvlB ftsE FALSE 0.038 217.000 0.000 NA   NA
 5629223 5629224 Bsph_1185 Bsph_1186 ftsE ftsX TRUE 0.957 56.000 0.431 1.000 Y NA
 5629224 5629225 Bsph_1186 Bsph_1187 ftsX   TRUE 0.947 24.000 0.026 1.000 Y NA
 5629225 5629226 Bsph_1187 Bsph_1188     FALSE 0.011 292.000 0.000 NA   NA
 5629226 5629227 Bsph_1188 Bsph_1189     TRUE 0.976 -3.000 0.222 NA   NA
 5629227 5629228 Bsph_1189 Bsph_1190     FALSE 0.040 246.000 0.000 1.000 N NA
 5629228 5629229 Bsph_1190 Bsph_1191     TRUE 0.740 122.000 0.024 0.009   NA
 5629229 5629230 Bsph_1191 Bsph_1192     TRUE 0.956 0.000 0.094 NA   NA
 5629231 5629232 Bsph_1193 Bsph_1194     FALSE 0.060 196.000 0.000 NA   NA
 5629232 5629233 Bsph_1194 Bsph_1195   ygaZ TRUE 0.981 -3.000 0.338 NA   NA
 5629234 5629235 Bsph_1196 Bsph_1197     TRUE 0.821 12.000 0.033 NA   NA
 5629235 5629236 Bsph_1197 Bsph_1198     FALSE 0.012 280.000 0.000 NA   NA
 5629236 5629237 Bsph_1198 Bsph_1199     TRUE 0.998 2.000 0.408 0.002 Y NA
 5629237 5629238 Bsph_1199 Bsph_1200     FALSE 0.330 101.000 0.015 NA   NA
 5629238 5629239 Bsph_1200 Bsph_1201     FALSE 0.448 128.000 0.070 NA   NA
 5629239 5629240 Bsph_1201 Bsph_1202     FALSE 0.225 187.000 0.141 NA   NA
 5629240 5629241 Bsph_1202 Bsph_1203     FALSE 0.236 142.000 0.000 NA   NA
 5629241 5629242 Bsph_1203 Bsph_1204     TRUE 0.873 -34.000 0.000 NA   NA
 5629243 5629244 Bsph_1205 Bsph_1206 yitS yitU FALSE 0.223 145.000 0.000 NA   NA
 5629244 5629245 Bsph_1206 Bsph_1207 yitU   TRUE 0.753 63.000 0.000 0.077   NA
 5629246 5629247 Bsph_1208 Bsph_1209     TRUE 0.867 33.000 0.303 NA   NA
 5629251 5629252 Bsph_1213 Bsph_1214     TRUE 0.992 10.000 0.076 0.001 Y NA
 5629254 5629255 Bsph_1216 Bsph_1217   mecA FALSE 0.009 436.000 0.063 NA N NA
 5629257 5629258 Bsph_1219 Bsph_1220     TRUE 0.828 54.000 0.398 NA   NA
 5629259 5629260 Bsph_1221 Bsph_1222   yjbI TRUE 0.967 -7.000 0.138 NA   NA
 5629260 5629261 Bsph_1222 Bsph_1223 yjbI   FALSE 0.047 220.000 0.024 NA   NA
 5629261 5629262 Bsph_1223 Bsph_1224     TRUE 0.749 56.000 0.188 NA   NA
 5629263 5629264 Bsph_1225 Bsph_1226     TRUE 0.799 54.000 0.283 NA   NA
 5629264 5629265 Bsph_1226 Bsph_1227     TRUE 0.988 3.000 0.725 1.000   NA
 5629265 5629266 Bsph_1227 Bsph_1228     TRUE 0.932 29.000 0.480 1.000 N NA
 5629266 5629267 Bsph_1228 Bsph_1229     FALSE 0.242 140.000 0.000 NA   NA
 5629267 5629268 Bsph_1229 Bsph_1230     TRUE 0.890 -13.000 0.000 NA   NA
 5629268 5629269 Bsph_1230 Bsph_1231     TRUE 0.735 30.000 0.065 NA   NA
 5629271 5629272 Bsph_1233 Bsph_1234     TRUE 0.977 1.000 0.333 NA   NA
 5629272 5629273 Bsph_1234 Bsph_1235     TRUE 0.990 -6.000 1.000 NA   NA
 5629273 5629274 Bsph_1235 Bsph_1236     TRUE 0.952 17.000 1.000 NA   NA
 5629274 5629275 Bsph_1236 Bsph_1237     FALSE 0.387 66.000 0.000 NA   NA
 5629275 5629276 Bsph_1237 Bsph_1238     FALSE 0.249 137.000 0.000 NA   NA
 5629276 5629277 Bsph_1238 Bsph_1239     TRUE 0.930 4.000 0.069 NA   NA
 5629278 5629279 Bsph_1240 Bsph_1241     TRUE 0.940 4.000 0.028 1.000   NA
 5629279 5629280 Bsph_1241 Bsph_1242     TRUE 0.728 82.000 0.287 NA N NA
 5629282 5629283 Bsph_1244 Bsph_1245   yliD TRUE 0.983 13.000 0.833 0.035   NA
 5629283 5629284 Bsph_1245 Bsph_1246 yliD   TRUE 0.994 14.000 0.833 0.035 Y NA
 5629285 5629286 Bsph_1247 Bsph_1248 yliA   FALSE 0.006 563.000 0.000 1.000   NA
 5629286 5629287 Bsph_1248 Bsph_1249     FALSE 0.008 427.000 0.000 1.000   NA
 5629287 5629288 Bsph_1249 Bsph_1250     TRUE 0.928 19.000 0.333 1.000   NA
 5629288 5629289 Bsph_1250 Bsph_1251     TRUE 0.998 -19.000 0.667 0.035 Y NA
 5629289 5629290 Bsph_1251 Bsph_1252   lplA TRUE 0.991 20.000 0.800 0.035 Y NA
 5629290 5629291 Bsph_1252 Bsph_1253 lplA   FALSE 0.469 172.000 0.400 NA   NA
 5629291 5629292 Bsph_1253 Bsph_1254     TRUE 0.931 -3.000 0.028 NA   NA
 5629292 5629293 Bsph_1254 Bsph_1255   yurK TRUE 0.611 70.000 0.028 1.000 N NA
 5629293 5629294 Bsph_1255 Bsph_1256 yurK   TRUE 0.766 72.000 0.182 1.000 N NA
 5629294 5629295 Bsph_1256 Bsph_1257     TRUE 0.996 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 5629295 5629296 Bsph_1257 Bsph_1258     TRUE 0.749 41.000 0.033 1.000 N NA
 5629296 5629297 Bsph_1258 Bsph_1259   glcK TRUE 0.636 67.000 0.033 1.000 N NA
 5629298 5629299 Bsph_1260 Bsph_1261 msmX   TRUE 0.735 83.000 0.321 NA N NA
 5629299 5629300 Bsph_1261 Bsph_1262     FALSE 0.004 487.000 0.000 NA N NA
 5629301 5629302 Bsph_1263 Bsph_1264     FALSE 0.066 193.000 0.000 NA   NA
 5629302 5629303 Bsph_1264 Bsph_1265     TRUE 0.982 2.000 0.515 NA   NA
 5629303 5629304 Bsph_1265 Bsph_1266     TRUE 0.828 66.000 0.000 NA Y NA
 5629304 5629305 Bsph_1266 Bsph_1267     TRUE 0.856 11.000 0.036 NA N NA
 5629305 5629306 Bsph_1267 Bsph_1268   fhuB TRUE 0.946 96.000 0.877 1.000 Y NA
 5629306 5629307 Bsph_1268 Bsph_1269 fhuB fepC TRUE 0.994 6.000 0.657 1.000 Y NA
 5629307 5629308 Bsph_1269 Bsph_1270 fepC   TRUE 0.982 -3.000 0.373 NA   NA
 5629310 5629311 Bsph_1272 Bsph_1273     FALSE 0.480 187.000 1.000 NA   NA
 5629311 5629312 Bsph_1273 Bsph_1274     TRUE 0.718 78.000 0.154 1.000   NA
 5629312 5629313 Bsph_1274 Bsph_1275     TRUE 0.945 -3.000 0.054 NA   NA
 5629313 5629314 Bsph_1275 Bsph_1276     FALSE 0.379 126.000 0.036 NA   NA
 5629314 5629315 Bsph_1276 Bsph_1277     FALSE 0.356 187.000 0.024 0.034 N NA
 5629315 5629316 Bsph_1277 Bsph_1278     FALSE 0.427 140.000 0.024 1.000   NA
 5629318 5629319 Bsph_1280 Bsph_1281     FALSE 0.019 309.000 0.000 1.000 N NA
 5629319 5629320 Bsph_1281 Bsph_1282     TRUE 0.643 135.000 0.003 0.036 N NA
 5629320 5629321 Bsph_1282 Bsph_1283     FALSE 0.078 193.000 0.003 NA N NA
 5629321 5629322 Bsph_1283 Bsph_1284     TRUE 0.656 123.000 0.217 NA N NA
 5629322 5629323 Bsph_1284 Bsph_1285     FALSE 0.008 339.000 0.000 NA N NA
 5629323 5629324 Bsph_1285 Bsph_1286     FALSE 0.349 146.000 0.000 1.000   NA
 5629328 5629329 Bsph_1290 Bsph_1291     TRUE 0.629 121.000 0.087 1.000 N NA
 5629330 5629331 Bsph_1292 Bsph_1293     FALSE 0.373 69.000 0.000 NA   NA
 5629331 5629332 Bsph_1293 Bsph_1294     TRUE 0.800 62.000 0.375 NA   NA
 5629332 5629333 Bsph_1294 Bsph_1295     FALSE 0.463 80.000 0.048 NA   NA
 5629334 5629335 Bsph_1296 Bsph_1297     FALSE 0.446 117.000 0.057 NA   NA
 5629335 5629336 Bsph_1297 Bsph_1298     FALSE 0.013 274.000 0.000 NA   NA
 5629338 5629339 Bsph_1300 Bsph_1301     FALSE 0.043 211.000 0.000 NA   NA
 5629339 5629340 Bsph_1301 Bsph_1302   cheV FALSE 0.574 66.000 0.015 1.000   NA
 5629340 5629341 Bsph_1302 Bsph_1303 cheV   FALSE 0.474 140.000 0.033 1.000 N NA
 5629341 5629342 Bsph_1303 Bsph_1304     TRUE 0.991 -10.000 0.056 1.000 Y NA
 5629342 5629343 Bsph_1304 Bsph_1305     TRUE 0.751 30.000 0.004 1.000 N NA
 5629345 5629346 Bsph_1307 Bsph_1308   mmsA TRUE 0.982 8.000 0.091 0.001 N NA
 5629346 5629347 Bsph_1308 Bsph_1309 mmsA   TRUE 0.696 77.000 0.105 1.000 N NA
 5629347 5629348 Bsph_1309 Bsph_1310     TRUE 0.923 13.000 0.105 1.000 N NA
 5629348 5629349 Bsph_1310 Bsph_1311     TRUE 0.962 17.000 0.286 0.076 N NA
 5629349 5629350 Bsph_1311 Bsph_1312     FALSE 0.585 154.000 0.021 0.035 N NA
 5629350 5629351 Bsph_1312 Bsph_1313     FALSE 0.462 64.000 0.021 NA   NA
 5629351 5629352 Bsph_1313 Bsph_1314     FALSE 0.068 199.000 0.017 NA   NA
 5629352 5629353 Bsph_1314 Bsph_1315   ykuM TRUE 0.712 69.000 0.214 NA   NA
 5629353 5629354 Bsph_1315 Bsph_1316 ykuM   FALSE 0.138 185.000 0.045 NA   NA
 5629354 5629355 Bsph_1316 Bsph_1317   ybhF TRUE 0.959 3.000 0.150 NA   NA
 5629355 5629356 Bsph_1317 Bsph_1318 ybhF   TRUE 0.982 -3.000 0.350 NA   NA
 5629356 5629357 Bsph_1318 Bsph_1319     TRUE 0.926 13.000 0.250 NA   NA
 5629357 5629358 Bsph_1319 Bsph_1320     TRUE 0.938 12.000 0.286 NA   NA
 5629358 5629359 Bsph_1320 Bsph_1321     TRUE 0.983 -3.000 0.412 NA   NA
 5629359 5629360 Bsph_1321 Bsph_1322     TRUE 0.754 12.000 0.000 NA   NA
 5629360 5629361 Bsph_1322 Bsph_1323     TRUE 0.886 -16.000 0.000 NA   NA
 5629361 5629362 Bsph_1323 Bsph_1324     FALSE 0.578 104.000 0.143 NA   NA
 5629363 5629364 Bsph_1325 Bsph_1326     FALSE 0.052 202.000 0.000 NA   NA
 5629364 5629365 Bsph_1326 Bsph_1327     FALSE 0.008 490.000 0.000 1.000 N NA
 5629365 5629366 Bsph_1327 Bsph_1328     TRUE 0.997 -3.000 0.253 0.034 Y NA
 5629366 5629367 Bsph_1328 Bsph_1329   potB TRUE 0.956 105.000 0.492 0.034 Y NA
 5629367 5629368 Bsph_1329 Bsph_1330 potB potA TRUE 0.976 -10.000 0.000 0.042   NA
 5629368 5629369 Bsph_1330 Bsph_1331 potA   FALSE 0.520 173.000 0.000 0.001   NA
 5629369 5629370 Bsph_1331 Bsph_1332     TRUE 0.930 18.000 0.326 1.000   NA
 5629371 5629372 Bsph_1333 Bsph_1334     TRUE 0.679 180.000 0.006 0.035 Y NA
 5629372 5629373 Bsph_1334 Bsph_1335   ykqB FALSE 0.429 151.000 0.041 1.000 N NA
 5629373 5629374 Bsph_1335 Bsph_1336 ykqB   TRUE 0.878 7.000 0.041 NA   NA
 5629374 5629375 Bsph_1336 Bsph_1337     FALSE 0.232 158.000 0.028 NA   NA
 5629375 5629376 Bsph_1337 Bsph_1338     TRUE 0.898 127.000 0.028 0.022 Y NA
 5629376 5629377 Bsph_1338 Bsph_1339   mccF TRUE 0.878 16.000 0.133 NA N NA
 5629378 5629379 Bsph_1340 Bsph_1341 rimL   FALSE 0.571 137.000 0.200 NA   NA
 5629379 5629380 Bsph_1341 Bsph_1342     FALSE 0.316 135.000 0.025 NA   NA
 5629381 5629382 Bsph_1343 Bsph_1344     TRUE 0.998 1.000 1.000 0.083 Y NA
 5629382 5629383 Bsph_1344 Bsph_1345     FALSE 0.079 188.000 0.000 NA   NA
 5629388 5629389 Bsph_1350 Bsph_1351   ykqC FALSE 0.015 322.000 0.000 1.000   NA
 5629389 5629390 Bsph_1351 Bsph_1352 ykqC   TRUE 0.973 6.000 0.576 NA   NA
 5629390 5629391 Bsph_1352 Bsph_1353     FALSE 0.228 144.000 0.000 NA   NA
 5629391 5629392 Bsph_1353 Bsph_1354     TRUE 0.869 -48.000 0.000 NA   NA
 5629395 5629396 Bsph_1357 Bsph_1358 potA fbpB TRUE 0.992 -7.000 0.875 1.000 N NA
 5629396 5629397 Bsph_1358 Bsph_1359 fbpB   TRUE 0.994 -3.000 0.429 0.034 N NA
 5629397 5629398 Bsph_1359 Bsph_1360     TRUE 0.906 14.000 0.086 1.000 N NA
 5629398 5629399 Bsph_1360 Bsph_1361   phnX TRUE 0.984 -10.000 0.315 1.000   NA
 5629401 5629402 Bsph_1363 Bsph_1364     TRUE 0.998 4.000 0.484 0.001 Y NA
 5629402 5629403 Bsph_1364 Bsph_1365     TRUE 0.983 48.000 0.883 0.076 Y NA
 5629403 5629404 Bsph_1365 Bsph_1366     TRUE 0.995 6.000 0.948 1.000 Y NA
 5629404 5629405 Bsph_1366 Bsph_1367     FALSE 0.528 122.000 0.026 1.000 N NA
 5629406 5629407 Bsph_1368 Bsph_1369     TRUE 0.937 18.000 0.667 NA   NA
 5629407 5629408 Bsph_1369 Bsph_1370     TRUE 0.770 95.000 0.600 NA   NA
 5629408 5629409 Bsph_1370 Bsph_1371   citT FALSE 0.584 150.000 0.182 1.000   NA
 5629409 5629410 Bsph_1371 Bsph_1372 citT   TRUE 0.997 -7.000 0.818 1.000 Y NA
 5629411 5629412 Bsph_1373 Bsph_1374     TRUE 0.991 -7.000 0.727 1.000   NA
 5629413 5629414 Bsph_1375 Bsph_1376     FALSE 0.008 451.000 0.000 1.000   NA
 5629415 5629416 Bsph_1377 Bsph_1378     TRUE 0.822 21.000 0.108 NA   NA
 5629418 5629419 Bsph_1380 Bsph_1381     FALSE 0.022 238.000 0.000 NA   NA
 5629421 5629422 Bsph_1383 Bsph_1384 typA ylaH FALSE 0.383 123.000 0.032 NA   NA
 5629422 5629423 Bsph_1384 Bsph_1385 ylaH   FALSE 0.093 191.000 0.023 NA   NA
 5629423 5629424 Bsph_1385 Bsph_1386   nrtD TRUE 0.995 0.000 0.528 NA Y NA
 5629424 5629425 Bsph_1386 Bsph_1387 nrtD ssuC TRUE 0.997 -7.000 0.876 1.000 Y NA
 5629426 5629427 Bsph_1388 Bsph_1389     TRUE 0.919 12.000 0.173 NA   NA
 5629428 5629429 Bsph_1390 Bsph_1391     TRUE 0.775 63.000 0.300 NA   NA
 5629429 5629430 Bsph_1391 Bsph_1392     TRUE 0.893 13.000 0.046 1.000 N NA
 5629430 5629431 Bsph_1392 Bsph_1393     FALSE 0.003 606.000 0.000 NA   NA
 5629433 5629434 Bsph_1395 Bsph_1396 ctaB   FALSE 0.294 101.000 0.000 NA   NA
 5629434 5629435 Bsph_1396 Bsph_1398     FALSE 0.515 41.000 0.000 NA   NA
 5629435 5629436 Bsph_1398 Bsph_1399     TRUE 0.999 0.000 0.925 0.001 Y NA
 5629436 5629437 Bsph_1399 Bsph_1400   ctaF TRUE 0.978 91.000 0.950 0.001 Y NA
 5629437 5629438 Bsph_1400 Bsph_1401 ctaF   FALSE 0.454 184.000 0.707 NA   NA
 5629438 5629439 Bsph_1401 Bsph_1402     TRUE 0.869 41.000 0.415 NA   NA
 5629440 5629441 Bsph_1403 Bsph_1404   ylbA FALSE 0.004 474.000 0.000 NA   NA
 5629442 5629443 Bsph_1405 Bsph_1406     FALSE 0.081 188.000 0.004 NA   NA
 5629449 5629450 Bsph_1412 Bsph_1413     FALSE 0.492 45.000 0.003 NA   NA
 5629450 5629451 Bsph_1413 Bsph_1414     TRUE 0.984 2.000 0.367 1.000 N NA
 5629455 5629456 Bsph_1418 Bsph_1419     TRUE 0.921 25.000 0.599 NA   NA
 5629456 5629457 Bsph_1419 Bsph_1420     FALSE 0.486 125.000 0.010 1.000 N NA
 5629457 5629458 Bsph_1420 Bsph_1421     FALSE 0.543 131.000 0.069 1.000   NA
 5629458 5629459 Bsph_1421 Bsph_1422     FALSE 0.148 188.000 0.008 1.000   NA
 5629459 5629460 Bsph_1422 Bsph_1423     FALSE 0.084 219.000 0.091 NA   NA
 5629460 5629461 Bsph_1423 Bsph_1424     FALSE 0.033 274.000 0.099 NA   NA
 5629461 5629462 Bsph_1424 Bsph_1425     FALSE 0.021 262.000 0.025 NA   NA
 5629462 5629463 Bsph_1425 Bsph_1426     TRUE 0.840 63.000 0.635 NA   NA
 5629463 5629464 Bsph_1426 Bsph_1427     TRUE 0.968 1.000 0.077 1.000 N NA
 5629464 5629465 Bsph_1427 Bsph_1428     TRUE 0.986 -3.000 0.316 1.000 N NA
 5629465 5629466 Bsph_1428 Bsph_1429     TRUE 0.972 58.000 0.157 0.001 Y NA
 5629466 5629467 Bsph_1429 Bsph_1430     FALSE 0.285 126.000 0.000 NA   NA
 5629467 5629468 Bsph_1430 Bsph_1432     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5629468 5629469 Bsph_1432 Bsph_1433     TRUE 0.986 -10.000 0.008 0.001   NA
 5629469 5629470 Bsph_1433 Bsph_1434     TRUE 0.910 41.000 0.067 0.005 N NA
 5629470 5629471 Bsph_1434 Bsph_1435     FALSE 0.357 126.000 0.015 NA N NA
 5629471 5629472 Bsph_1435 Bsph_1436   ylxW TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5629472 5629473 Bsph_1436 Bsph_1437 ylxW ylxX FALSE 0.264 132.000 0.000 NA   NA
 5629473 5629474 Bsph_1437 Bsph_1438 ylxX   TRUE 0.958 4.000 0.165 NA   NA
 5629474 5629475 Bsph_1438 Bsph_1439   ftsA FALSE 0.459 96.000 0.062 NA   NA
 5629475 5629476 Bsph_1439 Bsph_1440 ftsA ftsZ TRUE 0.842 54.000 0.460 NA   NA
 5629476 5629477 Bsph_1440 Bsph_1441 ftsZ ftsZ TRUE 0.880 -34.000 0.006 NA   NA
 5629477 5629478 Bsph_1441 Bsph_1442 ftsZ   FALSE 0.024 296.000 0.024 1.000   NA
 5629478 5629479 Bsph_1442 Bsph_1443     TRUE 0.838 107.000 0.856 1.000   NA
 5629479 5629480 Bsph_1443 Bsph_1444     TRUE 0.965 115.000 0.602 0.009 Y NA
 5629480 5629481 Bsph_1444 Bsph_1445     FALSE 0.540 153.000 0.276 NA   NA
 5629481 5629482 Bsph_1445 Bsph_1446   ylmE FALSE 0.342 78.000 0.004 NA   NA
 5629482 5629483 Bsph_1446 Bsph_1447 ylmE   TRUE 0.971 -10.000 0.194 NA   NA
 5629483 5629484 Bsph_1447 Bsph_1448     TRUE 0.706 108.000 0.370 NA   NA
 5629484 5629485 Bsph_1448 Bsph_1449     FALSE 0.147 233.000 0.287 1.000   NA
 5629485 5629486 Bsph_1449 Bsph_1450   divIVA TRUE 0.765 96.000 0.579 NA   NA
 5629486 5629487 Bsph_1450 Bsph_1451 divIVA   FALSE 0.006 441.000 0.012 NA N NA
 5629489 5629490 Bsph_1453 Bsph_1454     TRUE 0.751 23.000 0.057 NA   NA
 5629490 5629491 Bsph_1454 Bsph_1455     TRUE 0.959 11.000 0.500 NA   NA
 5629491 5629492 Bsph_1455 Bsph_1456   lspA TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5629492 5629493 Bsph_1456 Bsph_1457 lspA   TRUE 0.981 -49.000 0.000 0.001   NA
 5629493 5629494 Bsph_1457 Bsph_1458     TRUE 0.948 -3.000 0.000 1.000   NA
 5629494 5629495 Bsph_1458 Bsph_1459     FALSE 0.138 206.000 0.048 1.000 N NA
 5629495 5629496 Bsph_1459 Bsph_1460     TRUE 0.976 15.000 0.140 1.000 Y NA
 5629496 5629497 Bsph_1460 Bsph_1461     FALSE 0.520 190.000 0.064 1.000 Y NA
 5629497 5629498 Bsph_1461 Bsph_1462     TRUE 0.995 2.000 0.452 1.000 Y NA
 5629498 5629499 Bsph_1462 Bsph_1463     TRUE 0.994 0.000 0.155 1.000 Y NA
 5629499 5629500 Bsph_1463 Bsph_1464     TRUE 0.997 -7.000 0.117 0.001 Y NA
 5629500 5629501 Bsph_1464 Bsph_1465     TRUE 0.975 2.000 0.147 1.000 N NA
 5629501 5629502 Bsph_1465 Bsph_1466     TRUE 0.905 -3.000 0.000 NA   NA
 5629502 5629503 Bsph_1466 Bsph_1468     TRUE 0.896 0.000 0.000 NA   NA
 5629503 5629504 Bsph_1468 Bsph_1469     TRUE 0.993 1.000 0.133 1.000 Y NA
 5629506 5629507 Bsph_1471 Bsph_1472 oppD oppF TRUE 0.995 -3.000 0.477 0.006   NA
 5629507 5629508 Bsph_1472 Bsph_1473 oppF oppB TRUE 0.988 2.000 0.727 1.000   NA
 5629508 5629509 Bsph_1473 Bsph_1474 oppB oppC TRUE 0.987 37.000 0.727 0.034 Y NA
 5629509 5629510 Bsph_1474 Bsph_1475 oppC oppA TRUE 0.983 17.000 0.122 0.034 Y NA
 5629511 5629512 Bsph_1476 Bsph_1477 oppF oppD TRUE 0.990 -7.000 0.125 0.006   NA
 5629512 5629513 Bsph_1477 Bsph_1478 oppD oppC TRUE 0.995 5.000 0.667 1.000 Y NA
 5629513 5629514 Bsph_1478 Bsph_1479 oppC oppB TRUE 0.998 0.000 0.545 0.034 Y NA
 5629514 5629515 Bsph_1479 Bsph_1480 oppB oppA FALSE 0.459 211.000 0.000 0.034 Y NA
 5629515 5629516 Bsph_1480 Bsph_1481 oppA tlpA FALSE 0.006 910.000 0.000 1.000 N NA
 5629516 5629517 Bsph_1481 Bsph_1482 tlpA   FALSE 0.020 253.000 0.000 NA N NA
 5629518 5629519 Bsph_1483 Bsph_1484     TRUE 0.828 44.000 0.276 NA   NA
 5629519 5629520 Bsph_1484 Bsph_1485     TRUE 0.984 4.000 0.471 1.000 N NA
 5629520 5629521 Bsph_1485 Bsph_1486   coaBC TRUE 0.721 89.000 0.192 1.000   NA
 5629521 5629522 Bsph_1486 Bsph_1487 coaBC   TRUE 0.974 -3.000 0.099 1.000   NA
 5629522 5629523 Bsph_1487 Bsph_1488     TRUE 0.688 54.000 0.029 1.000 N NA
 5629523 5629524 Bsph_1488 Bsph_1489     TRUE 0.994 2.000 0.031 0.021 Y NA
 5629524 5629525 Bsph_1489 Bsph_1490     TRUE 0.996 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 5629525 5629526 Bsph_1490 Bsph_1491   yloN TRUE 0.976 0.000 0.135 1.000   NA
 5629526 5629527 Bsph_1491 Bsph_1492 yloN   TRUE 0.963 4.000 0.105 1.000   NA
 5629527 5629528 Bsph_1492 Bsph_1493     TRUE 0.996 3.000 0.704 1.000 Y NA
 5629528 5629529 Bsph_1493 Bsph_1494     TRUE 0.945 12.000 0.196 1.000   NA
 5629529 5629530 Bsph_1494 Bsph_1495     TRUE 0.976 3.000 0.213 1.000   NA
 5629530 5629531 Bsph_1495 Bsph_1496     TRUE 0.954 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5629532 5629533 Bsph_1497 Bsph_1498   kdgR FALSE 0.033 251.000 0.000 1.000   NA
 5629534 5629535 Bsph_1499 Bsph_1500     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5629535 5629536 Bsph_1500 Bsph_1502     FALSE 0.297 111.000 0.000 NA   NA
 5629536 5629537 Bsph_1502 Bsph_1503     TRUE 0.939 38.000 0.062 1.000 Y NA
 5629537 5629538 Bsph_1503 Bsph_1504     FALSE 0.005 383.000 0.000 NA   NA
 5629538 5629539 Bsph_1504 Bsph_1505     TRUE 0.928 19.000 0.567 NA   NA
 5629539 5629540 Bsph_1505 Bsph_1506     FALSE 0.017 353.000 0.045 1.000   NA
 5629540 5629541 Bsph_1506 Bsph_1507     TRUE 0.868 -49.000 0.000 NA   NA
 5629541 5629542 Bsph_1507 Bsph_1508     TRUE 0.691 15.000 0.000 NA   NA
 5629542 5629543 Bsph_1508 Bsph_1509   yofA FALSE 0.341 163.000 0.029 1.000 N NA
 5629543 5629544 Bsph_1509 Bsph_1510 yofA   TRUE 0.682 89.000 0.250 NA   NA
 5629544 5629545 Bsph_1510 Bsph_1511     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5629545 5629546 Bsph_1511 Bsph_1512     TRUE 0.965 13.000 1.000 NA   NA
 5629546 5629547 Bsph_1512 Bsph_1513     TRUE 0.930 34.000 0.667 1.000   NA
 5629547 5629548 Bsph_1513 Bsph_1514     FALSE 0.477 112.000 0.000 1.000 N NA
 5629548 5629549 Bsph_1514 Bsph_1515     TRUE 0.731 124.000 0.225 1.000 N NA
 5629549 5629550 Bsph_1515 Bsph_1516   plsX TRUE 0.952 3.000 0.035 1.000 N NA
 5629550 5629551 Bsph_1516 Bsph_1517 plsX   TRUE 0.984 18.000 0.106 0.005 Y NA
 5629551 5629552 Bsph_1517 Bsph_1518     TRUE 0.948 -7.000 0.008 1.000   NA
 5629552 5629553 Bsph_1518 Bsph_1519   fabG TRUE 0.978 -7.000 0.149 1.000   NA
 5629553 5629554 Bsph_1519 Bsph_1520 fabG   TRUE 0.967 50.000 0.100 0.005 Y NA
 5629554 5629555 Bsph_1520 Bsph_1521     FALSE 0.017 253.000 0.000 NA   NA
 5629555 5629556 Bsph_1521 Bsph_1522     FALSE 0.593 28.000 0.000 NA   NA
 5629556 5629557 Bsph_1522 Bsph_1523     TRUE 0.968 4.000 0.120 1.000 N NA
 5629557 5629558 Bsph_1523 Bsph_1524   ftsY TRUE 0.989 3.000 0.165 0.011 N NA
 5629558 5629559 Bsph_1524 Bsph_1525 ftsY   FALSE 0.027 327.000 0.081 1.000   NA
 5629559 5629560 Bsph_1525 Bsph_1526     TRUE 0.930 13.000 0.151 1.000   NA
 5629560 5629561 Bsph_1526 Bsph_1527     TRUE 0.784 95.000 0.361 1.000 N NA
 5629561 5629562 Bsph_1527 Bsph_1528     TRUE 0.943 16.000 0.385 1.000   NA
 5629562 5629563 Bsph_1528 Bsph_1529   rimM FALSE 0.039 369.000 0.324 1.000   NA
 5629563 5629564 Bsph_1529 Bsph_1530 rimM   TRUE 0.997 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 5629564 5629565 Bsph_1530 Bsph_1531     TRUE 0.933 117.000 0.567 1.000 Y NA
 5629565 5629566 Bsph_1531 Bsph_1532     FALSE 0.511 106.000 0.020 1.000 N NA
 5629566 5629567 Bsph_1532 Bsph_1533     TRUE 0.676 58.000 0.049 1.000   NA
 5629567 5629568 Bsph_1533 Bsph_1534     FALSE 0.529 155.000 0.148 1.000   NA
 5629568 5629569 Bsph_1534 Bsph_1535     TRUE 0.607 33.000 0.016 NA   NA
 5629569 5629570 Bsph_1535 Bsph_1536     TRUE 0.965 -3.000 0.115 NA   NA
 5629570 5629571 Bsph_1536 Bsph_1537     FALSE 0.415 148.000 0.038 1.000   NA
 5629571 5629572 Bsph_1537 Bsph_1538     TRUE 0.989 18.000 0.173 0.001 Y NA
 5629572 5629573 Bsph_1538 Bsph_1539     FALSE 0.328 168.000 0.037 1.000 N NA
 5629573 5629574 Bsph_1539 Bsph_1540     FALSE 0.313 92.000 0.000 NA   NA
 5629574 5629575 Bsph_1540 Bsph_1542     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5629575 5629576 Bsph_1542 Bsph_1543     FALSE 0.049 286.000 0.105 1.000 N NA
 5629576 5629577 Bsph_1543 Bsph_1544     TRUE 0.882 22.000 0.113 1.000 N NA
 5629577 5629578 Bsph_1544 Bsph_1545   hslU TRUE 0.997 0.000 0.752 1.000 Y NA
 5629578 5629579 Bsph_1545 Bsph_1546 hslU   TRUE 0.698 88.000 0.131 1.000 N NA
 5629579 5629580 Bsph_1546 Bsph_1547   flgB FALSE 0.009 581.000 0.037 1.000 N NA
 5629580 5629581 Bsph_1547 Bsph_1548 flgB flgC TRUE 0.998 4.000 0.804 0.003 Y NA
 5629581 5629582 Bsph_1548 Bsph_1549 flgC fliE TRUE 0.974 48.000 0.156 0.003 Y NA
 5629582 5629583 Bsph_1549 Bsph_1550 fliE   TRUE 0.946 118.000 0.164 0.004 Y NA
 5629583 5629584 Bsph_1550 Bsph_1551   fliG TRUE 0.992 16.000 0.477 0.004 Y NA
 5629584 5629585 Bsph_1551 Bsph_1552 fliG fliH TRUE 0.862 65.000 0.048 NA Y NA
 5629585 5629586 Bsph_1552 Bsph_1553 fliH   TRUE 0.986 6.000 0.152 NA Y NA
 5629586 5629587 Bsph_1553 Bsph_1554     TRUE 0.994 1.000 0.241 1.000 Y NA
 5629587 5629588 Bsph_1554 Bsph_1555     TRUE 0.956 5.000 0.095 1.000   NA
 5629588 5629589 Bsph_1555 Bsph_1556     TRUE 0.911 25.000 0.267 1.000   NA
 5629589 5629590 Bsph_1556 Bsph_1557     TRUE 0.992 4.000 0.304 NA Y NA
 5629590 5629591 Bsph_1557 Bsph_1558     TRUE 0.850 16.000 0.105 NA   NA
 5629591 5629592 Bsph_1558 Bsph_1559   flgG TRUE 0.615 87.000 0.148 NA   NA
 5629592 5629593 Bsph_1559 Bsph_1560 flgG   TRUE 0.822 105.000 0.077 NA Y NA
 5629593 5629594 Bsph_1560 Bsph_1561     TRUE 0.988 5.000 0.149 NA Y NA
 5629594 5629595 Bsph_1561 Bsph_1562   fliM TRUE 0.988 32.000 0.323 0.001 Y NA
 5629595 5629596 Bsph_1562 Bsph_1563 fliM fliY TRUE 0.999 -7.000 0.508 0.001 Y NA
 5629596 5629597 Bsph_1563 Bsph_1564 fliY cheY TRUE 0.989 7.000 0.203 1.000 Y NA
 5629597 5629598 Bsph_1564 Bsph_1565 cheY fliZ TRUE 0.961 5.000 0.101 1.000 N NA
 5629598 5629599 Bsph_1565 Bsph_1566 fliZ fliP TRUE 0.996 -3.000 0.386 1.000 Y NA
 5629599 5629600 Bsph_1566 Bsph_1567 fliP fliQ TRUE 0.991 14.000 0.206 0.003 Y NA
 5629600 5629601 Bsph_1567 Bsph_1568 fliQ fliR TRUE 0.998 5.000 0.817 0.002 Y NA
 5629601 5629602 Bsph_1568 Bsph_1569 fliR flhB TRUE 0.996 2.000 0.750 1.000 Y NA
 5629602 5629603 Bsph_1569 Bsph_1570 flhB flhA TRUE 0.986 25.000 0.203 0.003 Y NA
 5629603 5629604 Bsph_1570 Bsph_1571 flhA flhF TRUE 0.996 0.000 0.440 1.000 Y NA
 5629604 5629605 Bsph_1571 Bsph_1572 flhF   TRUE 0.988 -3.000 0.382 1.000 N NA
 5629605 5629606 Bsph_1572 Bsph_1573     TRUE 0.977 1.000 0.153 1.000 N NA
 5629606 5629607 Bsph_1573 Bsph_1574   cheA TRUE 0.991 16.000 0.390 0.016 Y NA
 5629607 5629608 Bsph_1574 Bsph_1575 cheA cheW TRUE 0.983 27.000 0.184 0.016 Y NA
 5629608 5629609 Bsph_1575 Bsph_1576 cheW   TRUE 0.982 10.000 0.180 NA Y NA
 5629609 5629610 Bsph_1576 Bsph_1577     TRUE 0.996 0.000 0.606 NA Y NA
 5629610 5629611 Bsph_1577 Bsph_1578     FALSE 0.162 174.000 0.028 NA   NA
 5629611 5629612 Bsph_1578 Bsph_1579     FALSE 0.003 660.000 0.008 NA   NA
 5629612 5629613 Bsph_1579 Bsph_1580     TRUE 0.655 24.000 0.017 NA   NA
 5629613 5629614 Bsph_1580 Bsph_1581     TRUE 0.785 10.000 0.000 NA   NA
 5629614 5629615 Bsph_1581 Bsph_1582     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5629615 5629616 Bsph_1582 Bsph_1583     FALSE 0.144 172.000 0.012 NA   NA
 5629616 5629617 Bsph_1583 Bsph_1584     TRUE 0.939 103.000 0.748 1.000 Y NA
 5629617 5629618 Bsph_1584 Bsph_1585     FALSE 0.275 215.000 0.416 1.000 N NA
 5629618 5629619 Bsph_1585 Bsph_1586     TRUE 0.990 0.000 0.626 1.000 N NA
 5629619 5629620 Bsph_1586 Bsph_1587     TRUE 0.835 49.000 0.009 0.021   NA
 5629620 5629621 Bsph_1587 Bsph_1588     FALSE 0.067 316.000 0.409 1.000   NA
 5629621 5629622 Bsph_1588 Bsph_1589     TRUE 0.994 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 5629622 5629623 Bsph_1589 Bsph_1590     TRUE 0.905 63.000 0.071 1.000 Y NA
 5629623 5629624 Bsph_1590 Bsph_1591     TRUE 0.907 47.000 0.568 1.000 N NA
 5629624 5629625 Bsph_1591 Bsph_1592     FALSE 0.524 149.000 0.095 1.000 N NA
 5629625 5629626 Bsph_1592 Bsph_1593     FALSE 0.320 198.000 0.070 0.035 N NA
 5629626 5629627 Bsph_1593 Bsph_1594   ylxS FALSE 0.013 341.000 0.059 NA   NA
 5629627 5629628 Bsph_1594 Bsph_1595 ylxS nusA TRUE 0.923 31.000 0.759 NA   NA
 5629628 5629629 Bsph_1595 Bsph_1596 nusA   TRUE 0.866 137.000 0.323 NA Y NA
 5629629 5629630 Bsph_1596 Bsph_1597   ylxQ TRUE 0.984 -3.000 0.408 NA N NA
 5629630 5629631 Bsph_1597 Bsph_1598 ylxQ   TRUE 0.980 15.000 0.223 1.000 Y NA
 5629631 5629632 Bsph_1598 Bsph_1599     TRUE 0.958 0.000 0.102 NA   NA
 5629632 5629633 Bsph_1599 Bsph_1600     TRUE 0.610 73.000 0.113 NA   NA
 5629633 5629634 Bsph_1600 Bsph_1601     TRUE 0.868 126.000 0.111 1.000 Y NA
 5629634 5629635 Bsph_1601 Bsph_1602   ribC TRUE 0.954 13.000 0.308 1.000 N NA
 5629635 5629636 Bsph_1602 Bsph_1603 ribC   FALSE 0.528 154.000 0.119 1.000 N NA
 5629638 5629639 Bsph_1604 Bsph_1606     FALSE 0.008 448.000 0.000 1.000   NA
 5629639 5629640 Bsph_1606 Bsph_1607     FALSE 0.556 123.000 0.057 1.000   NA
 5629642 5629643 Bsph_1609 Bsph_1610     TRUE 0.936 10.000 0.200 NA   NA
 5629643 5629644 Bsph_1610 Bsph_1611     TRUE 0.979 -6.000 0.153 1.000   NA
 5629644 5629645 Bsph_1611 Bsph_1612     FALSE 0.555 83.000 0.034 1.000   NA
 5629645 5629646 Bsph_1612 Bsph_1613     TRUE 0.967 14.000 0.038 1.000 Y NA
 5629646 5629647 Bsph_1613 Bsph_1614     FALSE 0.030 260.000 0.000 1.000   NA
 5629647 5629648 Bsph_1614 Bsph_1615     FALSE 0.360 154.000 0.026 1.000   NA
 5629648 5629649 Bsph_1615 Bsph_1616   ymfC FALSE 0.276 187.000 0.115 1.000   NA
 5629649 5629650 Bsph_1616 Bsph_1617 ymfC   TRUE 0.744 55.000 0.087 1.000   NA
 5629650 5629651 Bsph_1617 Bsph_1618     FALSE 0.013 420.000 0.048 1.000   NA
 5629651 5629652 Bsph_1618 Bsph_1619     TRUE 0.987 0.000 0.438 1.000   NA
 5629652 5629653 Bsph_1619 Bsph_1620     TRUE 0.994 2.000 0.720 0.034   NA
 5629653 5629654 Bsph_1620 Bsph_1621     FALSE 0.314 175.000 0.077 1.000   NA
 5629654 5629655 Bsph_1621 Bsph_1622     TRUE 0.996 -3.000 0.872 0.005   NA
 5629655 5629656 Bsph_1622 Bsph_1623     TRUE 0.986 0.000 0.397 1.000   NA
 5629656 5629657 Bsph_1623 Bsph_1624     TRUE 0.851 45.000 0.386 NA   NA
 5629657 5629658 Bsph_1624 Bsph_1625     FALSE 0.165 224.000 0.388 NA   NA
 5629658 5629659 Bsph_1625 Bsph_1626     TRUE 0.938 17.000 0.371 1.000   NA
 5629659 5629660 Bsph_1626 Bsph_1627     TRUE 0.829 30.000 0.077 1.000   NA
 5629660 5629661 Bsph_1627 Bsph_1628     TRUE 0.900 18.000 0.151 1.000   NA
 5629661 5629662 Bsph_1628 Bsph_1629     FALSE 0.087 231.000 0.083 1.000   NA
 5629662 5629663 Bsph_1629 Bsph_1630   ymdA FALSE 0.007 524.000 0.018 1.000   NA
 5629663 5629664 Bsph_1630 Bsph_1631 ymdA   FALSE 0.348 147.000 0.004 1.000   NA
 5629664 5629665 Bsph_1631 Bsph_1632     FALSE 0.046 209.000 0.000 NA   NA
 5629665 5629666 Bsph_1632 Bsph_1633   ywqC TRUE 0.826 70.000 0.667 NA   NA
 5629666 5629667 Bsph_1633 Bsph_1634 ywqC   TRUE 0.990 0.000 0.667 1.000 N NA
 5629667 5629668 Bsph_1634 Bsph_1635   yveP TRUE 0.912 11.000 0.047 1.000 N NA
 5629668 5629669 Bsph_1635 Bsph_1636 yveP   TRUE 0.887 128.000 0.000 0.014 Y NA
 5629669 5629670 Bsph_1636 Bsph_1637     TRUE 0.777 33.000 0.043 1.000   NA
 5629670 5629671 Bsph_1637 Bsph_1638     TRUE 0.941 0.000 0.056 NA   NA
 5629671 5629672 Bsph_1638 Bsph_1639     FALSE 0.308 119.000 0.005 NA   NA
 5629672 5629673 Bsph_1639 Bsph_1640     FALSE 0.268 179.000 0.139 NA   NA
 5629673 5629674 Bsph_1640 Bsph_1641   korA FALSE 0.016 259.000 0.000 NA   NA
 5629674 5629675 Bsph_1641 Bsph_1642 korA korB TRUE 0.998 0.000 0.437 0.001 Y NA
 5629675 5629676 Bsph_1642 Bsph_1643 korB   FALSE 0.278 128.000 0.000 NA   NA
 5629676 5629677 Bsph_1643 Bsph_1644     FALSE 0.021 240.000 0.000 NA   NA
 5629677 5629678 Bsph_1644 Bsph_1645     TRUE 0.924 -10.000 0.029 NA   NA
 5629678 5629679 Bsph_1645 Bsph_1646     FALSE 0.590 71.000 0.032 1.000   NA
 5629679 5629680 Bsph_1646 Bsph_1647     TRUE 0.995 -3.000 0.774 0.033   NA
 5629680 5629681 Bsph_1647 Bsph_1648   potA TRUE 0.996 -3.000 0.360 1.000 Y NA
 5629681 5629682 Bsph_1648 Bsph_1649 potA   TRUE 0.974 -3.000 0.083 1.000 N NA
 5629682 5629683 Bsph_1649 Bsph_1650     TRUE 0.960 0.000 0.033 1.000 N NA
 5629683 5629684 Bsph_1650 Bsph_1651     FALSE 0.539 78.000 0.022 1.000   NA
 5629684 5629685 Bsph_1651 Bsph_1652   ymcB FALSE 0.369 179.000 0.002 0.028   NA
 5629685 5629686 Bsph_1652 Bsph_1653 ymcB   TRUE 0.928 1.000 0.041 NA   NA
 5629686 5629687 Bsph_1653 Bsph_1654     TRUE 0.596 132.000 0.209 NA   NA
 5629687 5629688 Bsph_1654 Bsph_1655   mutS FALSE 0.351 128.000 0.027 NA   NA
 5629688 5629689 Bsph_1655 Bsph_1656 mutS mutL TRUE 0.985 34.000 0.220 0.001 Y NA
 5629689 5629690 Bsph_1656 Bsph_1657 mutL   TRUE 0.949 0.000 0.002 1.000 N NA
 5629690 5629691 Bsph_1657 Bsph_1658     TRUE 0.997 4.000 0.182 0.001 Y NA
 5629691 5629692 Bsph_1658 Bsph_1659     TRUE 0.729 22.000 0.029 NA N NA
 5629692 5629693 Bsph_1659 Bsph_1660     TRUE 0.927 -13.000 0.025 NA N NA
 5629693 5629694 Bsph_1660 Bsph_1661     FALSE 0.006 388.000 0.000 NA N NA
 5629696 5629697 Bsph_1663 Bsph_1664     FALSE 0.006 559.000 0.000 1.000   NA
 5629699 5629700 Bsph_1666 Bsph_1667   glnR FALSE 0.243 182.000 0.046 1.000 N NA
 5629700 5629701 Bsph_1667 Bsph_1668 glnR glnA TRUE 0.601 55.000 0.000 1.000   NA
 5629701 5629702 Bsph_1668 Bsph_1669 glnA glnA TRUE 0.922 26.000 0.000 0.001   NA
 5629704 5629705 Bsph_1671 Bsph_1672     FALSE 0.045 210.000 0.000 NA   NA
 5629705 5629706 Bsph_1672 Bsph_1674   cbrC TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5629706 5629707 Bsph_1674 Bsph_1675 cbrC cbrD TRUE 0.948 27.000 0.039 1.000 Y NA
 5629707 5629708 Bsph_1675 Bsph_1676 cbrD   FALSE 0.540 105.000 0.111 NA   NA
 5629708 5629709 Bsph_1676 Bsph_1677     FALSE 0.005 395.000 0.000 NA   NA
 5629710 5629711 Bsph_1678 Bsph_1679   icaC FALSE 0.166 183.000 0.062 NA   NA
 5629712 5629713 Bsph_1680 Bsph_1681     FALSE 0.428 82.000 0.034 NA   NA
 5629713 5629714 Bsph_1681 Bsph_1682   comC FALSE 0.015 265.000 0.000 NA   NA
 5629714 5629715 Bsph_1682 Bsph_1683 comC yvdE TRUE 0.769 20.000 0.005 1.000   NA
 5629717 5629718 Bsph_1685 Bsph_1686     TRUE 0.937 -3.000 0.038 NA   NA
 5629719 5629720 Bsph_1687 Bsph_1688     TRUE 0.763 144.000 0.017 1.000 Y NA
 5629721 5629722 Bsph_1689 Bsph_1690     FALSE 0.479 126.000 0.080 NA   NA
 5629723 5629724 Bsph_1691 Bsph_1692     FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 5629724 5629725 Bsph_1692 Bsph_1693   vraS TRUE 0.998 -7.000 0.853 0.023 Y NA
 5629725 5629726 Bsph_1693 Bsph_1694 vraS   TRUE 0.988 -3.000 0.679 NA   NA
 5629726 5629727 Bsph_1694 Bsph_1695     FALSE 0.341 176.000 0.210 NA   NA
 5629727 5629728 Bsph_1695 Bsph_1696     TRUE 0.937 16.000 0.514 NA   NA
 5629729 5629730 Bsph_1697 Bsph_1698     TRUE 0.662 82.000 0.197 NA   NA
 5629730 5629731 Bsph_1698 Bsph_1699   luxS FALSE 0.228 144.000 0.000 NA   NA
 5629733 5629734 Bsph_1701 Bsph_1702     TRUE 0.859 14.000 0.095 NA   NA
 5629734 5629735 Bsph_1702 Bsph_1703     TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5629736 5629737 Bsph_1704 Bsph_1705     FALSE 0.566 54.000 0.040 NA   NA
 5629738 5629739 Bsph_1706 Bsph_1707     FALSE 0.459 53.000 0.004 NA   NA
 5629739 5629740 Bsph_1707 Bsph_1708     FALSE 0.169 172.000 0.027 NA   NA
 5629740 5629741 Bsph_1708 Bsph_1709     FALSE 0.280 172.000 0.027 1.000 N NA
 5629741 5629742 Bsph_1709 Bsph_1710     TRUE 0.799 72.000 0.267 1.000 N NA
 5629742 5629743 Bsph_1710 Bsph_1711     TRUE 0.866 13.000 0.013 1.000 N NA
 5629743 5629744 Bsph_1711 Bsph_1712     FALSE 0.042 243.000 0.000 1.000 N NA
 5629744 5629745 Bsph_1712 Bsph_1713     TRUE 0.998 5.000 0.669 0.002 Y NA
 5629745 5629746 Bsph_1713 Bsph_1714     FALSE 0.358 214.000 0.842 1.000 N NA
 5629746 5629747 Bsph_1714 Bsph_1715     TRUE 0.823 16.000 0.019 1.000   NA
 5629747 5629748 Bsph_1715 Bsph_1716     FALSE 0.113 194.000 0.002 1.000   NA
 5629748 5629749 Bsph_1716 Bsph_1717     FALSE 0.055 200.000 0.003 NA   NA
 5629751 5629752 Bsph_1719 Bsph_1720     TRUE 0.947 14.000 0.570 NA   NA
 5629752 5629753 Bsph_1720 Bsph_1721     FALSE 0.441 76.000 0.021 NA N NA
 5629753 5629754 Bsph_1721 Bsph_1722     FALSE 0.009 452.000 0.010 1.000 N NA
 5629754 5629755 Bsph_1722 Bsph_1723     FALSE 0.026 328.000 0.069 1.000 N NA
 5629755 5629756 Bsph_1723 Bsph_1724     TRUE 0.980 8.000 0.094 NA Y NA
 5629756 5629757 Bsph_1724 Bsph_1725     TRUE 0.992 -3.000 0.120 NA Y NA
 5629757 5629758 Bsph_1725 Bsph_1726   resD TRUE 0.709 110.000 0.178 1.000 N NA
 5629758 5629759 Bsph_1726 Bsph_1727 resD resE TRUE 0.940 83.000 0.511 1.000 Y NA
 5629759 5629760 Bsph_1727 Bsph_1728 resE   TRUE 0.636 92.000 0.078 1.000 N NA
 5629760 5629761 Bsph_1728 Bsph_1729     TRUE 0.989 -3.000 0.917 NA   NA
 5629761 5629762 Bsph_1729 Bsph_1730     FALSE 0.004 492.000 0.000 NA   NA
 5629762 5629763 Bsph_1730 Bsph_1731     FALSE 0.186 163.000 0.016 NA   NA
 5629763 5629764 Bsph_1731 Bsph_1732     FALSE 0.555 168.000 0.333 1.000   NA
 5629764 5629765 Bsph_1732 Bsph_1733     TRUE 0.839 79.000 1.000 NA   NA
 5629765 5629766 Bsph_1733 Bsph_1734     FALSE 0.003 591.000 0.000 NA   NA
 5629766 5629767 Bsph_1734 Bsph_1735     TRUE 0.965 -49.000 0.111 1.000   NA
 5629767 5629768 Bsph_1735 Bsph_1736     TRUE 0.961 10.000 0.000 0.003   NA
 5629770 5629771 Bsph_1738 Bsph_1739     FALSE 0.004 457.000 0.000 NA   NA
 5629773 5629774 Bsph_1741 Bsph_1742   yqgG TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5629774 5629775 Bsph_1742 Bsph_1743 yqgG   FALSE 0.417 60.000 0.000 NA   NA
 5629775 5629776 Bsph_1743 Bsph_1744   ykkC FALSE 0.561 33.000 0.000 NA   NA
 5629776 5629777 Bsph_1744 Bsph_1745 ykkC ykkD TRUE 0.998 0.000 0.560 0.057 Y NA
 5629778 5629779 Bsph_1746 Bsph_1747   opuAB TRUE 0.947 69.000 0.118 0.033 Y NA
 5629779 5629780 Bsph_1747 Bsph_1748 opuAB opuAA TRUE 0.997 -7.000 0.177 0.091 Y NA
 5629780 5629781 Bsph_1748 Bsph_1749 opuAA   FALSE 0.400 159.000 0.052 1.000 N NA
 5629782 5629783 Bsph_1750 Bsph_1751   ribD TRUE 0.995 1.000 0.004 0.002 Y NA
 5629783 5629784 Bsph_1751 Bsph_1752 ribD   TRUE 0.990 -3.000 0.002 1.000 Y NA
 5629784 5629785 Bsph_1752 Bsph_1753     TRUE 0.637 19.000 0.000 NA   NA
 5629786 5629787 Bsph_1754 Bsph_1755     FALSE 0.294 103.000 0.000 NA   NA
 5629787 5629788 Bsph_1755 Bsph_1757     FALSE 0.448 54.000 0.000 NA   NA
 5629788 5629789 Bsph_1757 Bsph_1758     FALSE 0.185 200.000 0.083 1.000 N NA
 5629790 5629791 Bsph_1759 Bsph_1760     FALSE 0.146 187.000 0.044 NA N NA
 5629791 5629792 Bsph_1760 Bsph_1761     TRUE 0.873 13.000 0.095 NA   NA
 5629794 5629795 Bsph_1763 Bsph_1764     FALSE 0.009 306.000 0.000 NA   NA
 5629796 5629797 Bsph_1765 Bsph_1766     TRUE 0.665 47.000 0.071 NA   NA
 5629797 5629798 Bsph_1766 Bsph_1767     TRUE 0.878 19.000 0.208 NA   NA
 5629798 5629799 Bsph_1767 Bsph_1768     TRUE 0.691 160.000 0.017 1.000 Y NA
 5629799 5629800 Bsph_1768 Bsph_1769   yhiH TRUE 0.997 -3.000 0.713 1.000 Y NA
 5629802 5629803 Bsph_1771 Bsph_1772   xkdA FALSE 0.006 359.000 0.000 NA   NA
 5629803 5629804 Bsph_1772 Bsph_1773 xkdA   FALSE 0.577 96.000 0.133 NA   NA
 5629805 5629806 Bsph_1774 Bsph_1775     FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 5629806 5629807 Bsph_1775 Bsph_1776     FALSE 0.012 279.000 0.000 NA   NA
 5629807 5629808 Bsph_1776 Bsph_1777     FALSE 0.003 797.000 0.000 NA   NA
 5629808 5629809 Bsph_1777 Bsph_1778     TRUE 0.882 2.000 0.000 NA   NA
 5629809 5629810 Bsph_1778 Bsph_1779   xkdK TRUE 0.976 2.000 0.333 NA   NA
 5629810 5629811 Bsph_1779 Bsph_1780 xkdK   TRUE 0.918 16.000 0.333 NA   NA
 5629811 5629812 Bsph_1780 Bsph_1781   xkdN1 FALSE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 5629812 5629813 Bsph_1781 Bsph_1782 xkdN1   FALSE 0.005 409.000 0.000 NA   NA
 5629813 5629814 Bsph_1782 Bsph_1783     TRUE 0.635 80.000 0.154 NA   NA
 5629814 5629815 Bsph_1783 Bsph_1784     TRUE 0.934 17.000 0.538 NA   NA
 5629815 5629816 Bsph_1784 Bsph_1785     TRUE 0.977 2.000 0.375 NA   NA
 5629816 5629817 Bsph_1785 Bsph_1786     TRUE 0.978 0.000 0.320 NA   NA
 5629817 5629818 Bsph_1786 Bsph_1787     TRUE 0.987 0.000 0.720 NA   NA
 5629818 5629819 Bsph_1787 Bsph_1788     TRUE 0.987 -7.000 0.708 NA   NA
 5629819 5629820 Bsph_1788 Bsph_1789     TRUE 0.936 0.000 0.047 NA   NA
 5629820 5629821 Bsph_1789 Bsph_1790     TRUE 0.803 14.000 0.047 NA   NA
 5629821 5629822 Bsph_1790 Bsph_1791     FALSE 0.023 235.000 0.000 NA   NA
 5629822 5629823 Bsph_1791 Bsph_1792     TRUE 0.895 13.000 0.133 NA   NA
 5629823 5629824 Bsph_1792 Bsph_1793     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 5629824 5629825 Bsph_1793 Bsph_1794     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 5629825 5629826 Bsph_1794 Bsph_1795     FALSE 0.040 215.000 0.000 NA   NA
 5629826 5629827 Bsph_1795 Bsph_1796     FALSE 0.017 255.000 0.000 NA   NA
 5629827 5629828 Bsph_1796 Bsph_1797     FALSE 0.108 177.000 0.000 NA   NA
 5629828 5629829 Bsph_1797 Bsph_1798     TRUE 0.716 32.000 0.000 1.000   NA
 5629831 5629832 Bsph_1800 Bsph_1801     FALSE 0.487 46.000 0.000 NA   NA
 5629833 5629834 Bsph_1802 Bsph_1803     TRUE 0.763 34.000 0.100 NA   NA
 5629835 5629836 Bsph_1804 Bsph_1805     TRUE 0.959 6.000 0.275 NA   NA
 5629836 5629837 Bsph_1805 Bsph_1806     TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5629838 5629839 Bsph_1807 Bsph_1808     FALSE 0.007 328.000 0.000 NA   NA
 5629839 5629840 Bsph_1808 Bsph_1809     FALSE 0.404 63.000 0.000 NA   NA
 5629841 5629842 Bsph_1810 Bsph_1811     TRUE 0.917 20.000 0.000 0.008 N NA
 5629842 5629843 Bsph_1811 Bsph_1812     TRUE 0.937 55.000 0.000 0.033 Y NA
 5629843 5629844 Bsph_1812 Bsph_1813     FALSE 0.019 311.000 0.000 1.000 N NA
 5629846 5629847 Bsph_1815 Bsph_1816 yxaF   FALSE 0.352 151.000 0.000 1.000 N NA
 5629847 5629848 Bsph_1816 Bsph_1817     FALSE 0.012 365.000 0.000 1.000 N NA
 5629848 5629849 Bsph_1817 Bsph_1818     TRUE 0.944 20.000 0.500 1.000 N NA
 5629850 5629851 Bsph_1819 Bsph_1820 yiaA   FALSE 0.278 128.000 0.000 NA   NA
 5629852 5629853 Bsph_1821 Bsph_1822     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 5629854 5629855 Bsph_1823 Bsph_1824     TRUE 0.806 58.000 0.000 0.013   NA
 5629855 5629856 Bsph_1824 Bsph_1825     TRUE 0.993 -13.000 0.429 0.013   NA
 5629857 5629858 Bsph_1826 Bsph_1827 degU   FALSE 0.005 417.000 0.000 NA   NA
 5629858 5629859 Bsph_1827 Bsph_1828     FALSE 0.007 331.000 0.000 NA   NA
 5629859 5629860 Bsph_1828 Bsph_1829   tlpA TRUE 0.884 -18.000 0.000 NA   NA
 5629860 5629861 Bsph_1829 Bsph_1830 tlpA   FALSE 0.007 468.000 0.000 1.000   NA
 5629861 5629862 Bsph_1830 Bsph_1831     TRUE 0.980 -3.000 0.312 NA   NA
 5629862 5629863 Bsph_1831 Bsph_1832   araC FALSE 0.005 421.000 0.000 NA   NA
 5629863 5629864 Bsph_1832 Bsph_1833 araC   TRUE 0.683 84.000 0.105 1.000 N NA
 5629864 5629865 Bsph_1833 Bsph_1834     TRUE 0.671 28.000 0.016 NA N NA
 5629865 5629866 Bsph_1834 Bsph_1835     FALSE 0.019 247.000 0.000 NA   NA
 5629867 5629868 Bsph_1836 Bsph_1837     FALSE 0.201 151.000 0.000 NA   NA
 5629869 5629870 Bsph_1838 Bsph_1839     FALSE 0.519 80.000 0.071 NA   NA
 5629870 5629871 Bsph_1839 Bsph_1840     FALSE 0.004 451.000 0.000 NA   NA
 5629871 5629872 Bsph_1840 Bsph_1841     FALSE 0.027 804.000 0.000 1.000 Y NA
 5629872 5629873 Bsph_1841 Bsph_1842     TRUE 0.926 -3.000 0.009 NA N NA
 5629873 5629874 Bsph_1842 Bsph_1843     TRUE 0.995 -3.000 0.400 NA Y NA
 5629874 5629875 Bsph_1843 Bsph_1844     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.001 Y NA
 5629875 5629876 Bsph_1844 Bsph_1845     TRUE 0.969 12.000 0.002 1.000 Y NA
 5629876 5629877 Bsph_1845 Bsph_1846     FALSE 0.282 160.000 0.000 1.000   NA
 5629878 5629879 Bsph_1847 Bsph_1848     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 5629881 5629882 Bsph_1850 Bsph_1851     FALSE 0.023 291.000 0.000 1.000 N NA
 5629883 5629884 Bsph_1852 Bsph_1853     FALSE 0.006 1096.000 0.000 1.000 N NA
 5629884 5629885 Bsph_1853 Bsph_1854     FALSE 0.115 277.000 0.000 1.000 Y NA
 5629885 5629886 Bsph_1854 Bsph_1855     FALSE 0.021 240.000 0.000 NA   NA
 5629886 5629887 Bsph_1855 Bsph_1856     FALSE 0.318 131.000 0.021 NA   NA
 5629887 5629888 Bsph_1856 Bsph_1857     FALSE 0.174 198.000 0.077 1.000   NA
 5629888 5629889 Bsph_1857 Bsph_1858     TRUE 0.988 23.000 0.385 0.023 Y NA
 5629889 5629890 Bsph_1858 Bsph_1859     FALSE 0.587 127.000 0.083 1.000   NA
 5629890 5629891 Bsph_1859 Bsph_1860     TRUE 0.652 125.000 0.250 NA   NA
 5629891 5629892 Bsph_1860 Bsph_1861     FALSE 0.032 225.000 0.000 NA   NA
 5629892 5629893 Bsph_1861 Bsph_1862     FALSE 0.413 61.000 0.000 NA   NA
 5629893 5629894 Bsph_1862 Bsph_1863     FALSE 0.455 53.000 0.000 NA   NA
 5629897 5629898 Bsph_1866 Bsph_1867 mcpC yufN TRUE 0.915 51.000 0.857 1.000   NA
 5629900 5629901 Bsph_1869 Bsph_1870     FALSE 0.004 428.000 0.000 NA   NA
 5629901 5629902 Bsph_1870 Bsph_1871     TRUE 0.959 35.000 0.377 0.003   NA
 5629902 5629903 Bsph_1871 Bsph_1872     TRUE 0.997 -3.000 0.065 0.002 Y NA
 5629903 5629904 Bsph_1872 Bsph_1873     FALSE 0.350 74.000 0.000 NA   NA
 5629904 5629905 Bsph_1873 Bsph_1874     FALSE 0.039 216.000 0.000 NA   NA
 5629906 5629907 Bsph_1875 Bsph_1876     FALSE 0.341 84.000 0.006 NA   NA
 5629907 5629908 Bsph_1876 Bsph_1877     FALSE 0.415 93.000 0.038 NA   NA
 5629909 5629910 Bsph_1878 Bsph_1879     TRUE 0.912 12.000 0.148 NA   NA
 5629910 5629911 Bsph_1879 Bsph_1880     FALSE 0.351 135.000 0.039 NA   NA
 5629911 5629912 Bsph_1880 Bsph_1881     TRUE 0.991 0.000 0.849 1.000   NA
 5629912 5629913 Bsph_1881 Bsph_1882     TRUE 0.830 6.000 0.000 NA   NA
 5629913 5629914 Bsph_1882 Bsph_1883     FALSE 0.306 95.000 0.000 NA   NA
 5629914 5629915 Bsph_1883 Bsph_1884     FALSE 0.339 78.000 0.000 NA   NA
 5629916 5629917 Bsph_1885 Bsph_1886     FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 5629917 5629918 Bsph_1886 Bsph_1887     FALSE 0.487 72.000 0.047 NA   NA
 5629918 5629919 Bsph_1887 Bsph_1888     TRUE 0.836 14.000 0.013 1.000   NA
 5629923 5629924 Bsph_1892 Bsph_1893     TRUE 0.981 -18.000 0.464 NA   NA
 5629926 5629927 Bsph_1896 Bsph_1897     FALSE 0.299 118.000 0.000 NA   NA
 5629928 5629929 Bsph_1898 Bsph_1899     TRUE 0.868 16.000 0.065 1.000   NA
 5629930 5629931 Bsph_1900 Bsph_1901 yybF   TRUE 0.607 25.000 0.000 NA   NA
 5629932 5629933 Bsph_1902 Bsph_1903     FALSE 0.257 150.000 0.024 NA   NA
 5629933 5629934 Bsph_1903 Bsph_1904     FALSE 0.264 132.000 0.000 NA   NA
 5629935 5629936 Bsph_1905 Bsph_1906     TRUE 0.983 1.000 0.508 NA   NA
 5629936 5629937 Bsph_1906 Bsph_1907     FALSE 0.583 72.000 0.032 1.000   NA
 5629937 5629938 Bsph_1907 Bsph_1908     FALSE 0.469 147.000 0.067 1.000   NA
 5629938 5629939 Bsph_1908 Bsph_1909     FALSE 0.470 114.000 0.011 1.000   NA
 5629939 5629940 Bsph_1909 Bsph_1910     FALSE 0.322 102.000 0.011 NA   NA
 5629940 5629941 Bsph_1910 Bsph_1911     TRUE 0.940 5.000 0.107 NA   NA
 5629943 5629944 Bsph_1913 Bsph_1914     TRUE 0.602 97.000 0.157 NA   NA
 5629944 5629945 Bsph_1914 Bsph_1915   ypeB TRUE 0.893 31.000 0.408 NA   NA
 5629945 5629946 Bsph_1915 Bsph_1916 ypeB   TRUE 0.660 87.000 0.205 NA   NA
 5629946 5629947 Bsph_1916 Bsph_1917     FALSE 0.363 97.000 0.009 NA N NA
 5629947 5629948 Bsph_1917 Bsph_1918     FALSE 0.561 103.000 0.047 1.000 N NA
 5629948 5629949 Bsph_1918 Bsph_1919   engA FALSE 0.026 293.000 0.032 1.000   NA
 5629949 5629950 Bsph_1919 Bsph_1920 engA engA TRUE 0.981 -19.000 0.006 0.003   NA
 5629950 5629951 Bsph_1920 Bsph_1921 engA   FALSE 0.575 108.000 0.068 1.000   NA
 5629951 5629952 Bsph_1921 Bsph_1922     FALSE 0.026 242.000 0.021 NA   NA
 5629952 5629953 Bsph_1922 Bsph_1923     FALSE 0.344 199.000 0.771 NA   NA
 5629953 5629954 Bsph_1923 Bsph_1924     FALSE 0.310 93.000 0.000 NA   NA
 5629954 5629955 Bsph_1924 Bsph_1925     FALSE 0.296 108.000 0.000 NA   NA
 5629955 5629956 Bsph_1925 Bsph_1926     FALSE 0.309 94.000 0.000 NA   NA
 5629956 5629957 Bsph_1926 Bsph_1929     FALSE 0.072 191.000 0.000 NA   NA
 5629957 5629958 Bsph_1929 Bsph_1930     FALSE 0.166 220.000 0.154 1.000 N NA
 5629958 5629959 Bsph_1930 Bsph_1931   mtrB TRUE 0.753 63.000 0.130 1.000   NA
 5629959 5629960 Bsph_1931 Bsph_1932 mtrB gerCA FALSE 0.109 246.000 0.245 1.000   NA
 5629960 5629961 Bsph_1932 Bsph_1933 gerCA   TRUE 0.825 15.000 0.012 1.000   NA
 5629961 5629962 Bsph_1933 Bsph_1934     TRUE 0.949 20.000 0.020 1.000 Y NA
 5629962 5629963 Bsph_1934 Bsph_1935     TRUE 0.606 87.000 0.054 1.000 N NA
 5629963 5629964 Bsph_1935 Bsph_1936   xerD FALSE 0.479 117.000 0.000 1.000 N NA
 5629964 5629965 Bsph_1936 Bsph_1937 xerD   FALSE 0.294 106.000 0.000 NA   NA
 5629965 5629966 Bsph_1937 Bsph_1938     FALSE 0.003 1173.000 0.000 NA   NA
 5629966 5629967 Bsph_1938 Bsph_1939     FALSE 0.282 127.000 0.000 NA   NA
 5629967 5629968 Bsph_1939 Bsph_1940     FALSE 0.003 587.000 0.000 NA   NA
 5629968 5629969 Bsph_1940 Bsph_1941     TRUE 0.917 31.000 0.667 NA   NA
 5629969 5629970 Bsph_1941 Bsph_1942     FALSE 0.011 288.000 0.000 NA   NA
 5629970 5629971 Bsph_1942 Bsph_1943     FALSE 0.035 221.000 0.000 NA   NA
 5629971 5629972 Bsph_1943 Bsph_1944     TRUE 0.886 -16.000 0.000 NA   NA
 5629972 5629973 Bsph_1944 Bsph_1945     TRUE 0.949 3.000 0.104 NA   NA
 5629973 5629974 Bsph_1945 Bsph_1946     FALSE 0.393 65.000 0.000 NA   NA
 5629974 5629975 Bsph_1946 Bsph_1947     FALSE 0.339 78.000 0.000 NA   NA
 5629975 5629976 Bsph_1947 Bsph_1948     FALSE 0.408 62.000 0.000 NA   NA
 5629976 5629977 Bsph_1948 Bsph_1949     TRUE 0.892 -12.000 0.000 NA   NA
 5629977 5629978 Bsph_1949 Bsph_1950     FALSE 0.023 236.000 0.000 NA   NA
 5629978 5629979 Bsph_1950 Bsph_1951     TRUE 0.902 12.000 0.125 NA   NA
 5629979 5629980 Bsph_1951 Bsph_1952     TRUE 0.620 22.000 0.000 NA   NA
 5629980 5629981 Bsph_1952 Bsph_1953     FALSE 0.299 118.000 0.000 NA   NA
 5629981 5629982 Bsph_1953 Bsph_1954     FALSE 0.026 271.000 0.000 1.000   NA
 5629982 5629983 Bsph_1954 Bsph_1955     TRUE 0.977 15.000 0.167 1.000 Y NA
 5629983 5629984 Bsph_1955 Bsph_1956     TRUE 0.951 70.000 0.182 0.071 Y NA
 5629984 5629985 Bsph_1956 Bsph_1957     TRUE 0.748 118.000 0.500 NA   NA
 5629985 5629986 Bsph_1957 Bsph_1958     FALSE 0.326 85.000 0.000 NA   NA
 5629986 5629987 Bsph_1958 Bsph_1960     FALSE 0.010 294.000 0.000 NA   NA
 5629987 5629988 Bsph_1960 Bsph_1961     TRUE 0.996 4.000 0.110 0.001 Y NA
 5629988 5629989 Bsph_1961 Bsph_1962     TRUE 0.992 -3.000 0.041 1.000 Y NA
 5629989 5629990 Bsph_1962 Bsph_1963     TRUE 0.963 19.000 0.078 1.000 Y NA
 5629990 5629991 Bsph_1963 Bsph_1964     TRUE 0.993 -3.000 0.098 1.000 Y NA
 5629991 5629992 Bsph_1964 Bsph_1965     FALSE 0.466 149.000 0.069 1.000   NA
 5629992 5629993 Bsph_1965 Bsph_1966     TRUE 0.825 72.000 0.017 0.001   NA
 5629993 5629994 Bsph_1966 Bsph_1967     FALSE 0.457 97.000 0.005 1.000   NA
 5629994 5629995 Bsph_1967 Bsph_1968   ypiB TRUE 0.913 9.000 0.104 NA   NA
 5629995 5629996 Bsph_1968 Bsph_1969 ypiB   TRUE 0.698 142.000 0.583 NA   NA
 5629996 5629997 Bsph_1969 Bsph_1970     TRUE 0.660 17.000 0.000 NA   NA
 5629997 5629998 Bsph_1970 Bsph_1971     FALSE 0.136 170.000 0.000 NA   NA
 5629998 5629999 Bsph_1971 Bsph_1972     FALSE 0.108 177.000 0.000 NA   NA
 5629999 5630000 Bsph_1972 Bsph_1973     TRUE 0.917 20.000 0.447 NA   NA
 5630000 5630001 Bsph_1973 Bsph_1974     TRUE 0.897 42.000 0.095 0.031   NA
 5630001 5630002 Bsph_1974 Bsph_1975     FALSE 0.009 427.000 0.069 NA   NA
 5630002 5630003 Bsph_1975 Bsph_1976     TRUE 0.622 61.000 0.083 NA   NA
 5630005 5630006 Bsph_1978 Bsph_1979     TRUE 0.935 0.000 0.044 NA   NA
 5630006 5630007 Bsph_1979 Bsph_1980     TRUE 0.920 20.000 0.044 0.034 N NA
 5630007 5630008 Bsph_1980 Bsph_1981     TRUE 0.740 34.000 0.009 1.000 N NA
 5630008 5630009 Bsph_1981 Bsph_1982     TRUE 0.975 -13.000 0.126 1.000 N NA
 5630009 5630010 Bsph_1982 Bsph_1983   birA FALSE 0.584 146.000 0.134 1.000 N NA
 5630011 5630012 Bsph_1984 Bsph_1985     FALSE 0.082 187.000 0.000 NA   NA
 5630012 5630013 Bsph_1985 Bsph_1986     TRUE 0.901 -7.000 0.000 NA   NA
 5630014 5630015 Bsph_1987 Bsph_1988     TRUE 0.998 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 5630015 5630016 Bsph_1988 Bsph_1989     TRUE 0.988 12.000 0.342 1.000 Y NA
 5630016 5630017 Bsph_1989 Bsph_1990     FALSE 0.026 282.000 0.000 1.000 N NA
 5630017 5630018 Bsph_1990 Bsph_1991     FALSE 0.078 217.000 0.000 1.000 N NA
 5630020 5630021 Bsph_1993 Bsph_1995   yihN TRUE 0.615 23.000 0.000 NA   NA
 5630023 5630024 Bsph_1997 Bsph_1998     FALSE 0.013 276.000 0.000 NA   NA
 5630024 5630025 Bsph_1998 Bsph_1999   adaA FALSE 0.123 173.000 0.000 NA   NA
 5630025 5630026 Bsph_1999 Bsph_2000 adaA   FALSE 0.331 82.000 0.000 NA   NA
 5630026 5630027 Bsph_2000 Bsph_2002     TRUE 0.871 -43.000 0.000 NA   NA
 5630027 5630028 Bsph_2002 Bsph_2003   yuzA FALSE 0.473 56.000 0.014 NA   NA
 5630029 5630030 Bsph_2004 Bsph_2005     TRUE 0.975 13.000 1.000 1.000 N NA
 5630030 5630031 Bsph_2005 Bsph_2006     FALSE 0.583 150.000 0.286 NA N NA
 5630032 5630033 Bsph_2007 Bsph_2008     TRUE 0.697 45.000 0.012 1.000 N NA
 5630033 5630034 Bsph_2008 Bsph_2009     FALSE 0.295 100.000 0.000 NA   NA
 5630034 5630035 Bsph_2009 Bsph_2011     TRUE 0.707 14.000 0.000 NA   NA
 5630035 5630036 Bsph_2011 Bsph_2012     FALSE 0.337 79.000 0.000 NA   NA
 5630036 5630037 Bsph_2012 Bsph_2013     FALSE 0.542 36.000 0.000 NA   NA
 5630037 5630038 Bsph_2013 Bsph_2015     FALSE 0.487 46.000 0.000 NA   NA
 5630040 5630041 Bsph_2018