MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum A str. Hall

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3741468 3741469 CLC_0001 CLC_0002 dnaA dnaN TRUE 0.675 263.000 0.328 1.000 Y NA
 3741469 3741470 CLC_0002 CLC_0003 dnaN   TRUE 0.960 19.000 0.103 1.000   NA
 3741470 3741471 CLC_0003 CLC_0004   recF TRUE 0.853 69.000 0.209 1.000   NA
 3741471 3741472 CLC_0004 CLC_0005 recF   TRUE 0.928 21.000 0.024 NA   NA
 3741472 3741473 CLC_0005 CLC_0006   gyrB TRUE 0.925 18.000 0.017 NA   NA
 3741473 3741474 CLC_0006 CLC_0007 gyrB gyrA TRUE 0.993 26.000 0.306 0.002 Y NA
 3741474 3741475 CLC_0007 CLC_0008 gyrA rrsA FALSE 0.004 415.000 0.000 NA   NA
 3741475 3741476 CLC_0008 CLC_0011 rrsA rrlA FALSE 0.054 221.000 0.000 NA   NA
 3741476 3741477 CLC_0011 CLC_0012 rrlA rrfA FALSE 0.180 92.000 0.000 NA   NA
 3741477 3741478 CLC_0012 CLC_0013 rrfA   TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3741478 3741479 CLC_0013 CLC_0015     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3741479 3741480 CLC_0015 CLC_0017     FALSE 0.121 165.000 0.000 NA   NA
 3741480 3741481 CLC_0017 CLC_0018     TRUE 0.938 16.000 0.029 NA   NA
 3741481 3741482 CLC_0018 CLC_0019     TRUE 0.957 2.000 0.014 1.000   NA
 3741482 3741483 CLC_0019 CLC_0020     TRUE 0.948 5.000 0.011 1.000   NA
 3741483 3741484 CLC_0020 CLC_0021     FALSE 0.558 137.000 0.016 NA   NA
 3741484 3741485 CLC_0021 CLC_0022     TRUE 0.966 25.000 0.214 NA   NA
 3741485 3741486 CLC_0022 CLC_0023     TRUE 0.978 17.000 0.370 NA   NA
 3741486 3741487 CLC_0023 CLC_0024   serS-1 FALSE 0.007 370.000 0.000 NA   NA
 3741487 3741488 CLC_0024 CLC_0025 serS-1   FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3741488 3741489 CLC_0025 CLC_0027     TRUE 0.637 21.000 0.000 NA   NA
 3741489 3741490 CLC_0027 CLC_0029     FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 3741490 3741491 CLC_0029 CLC_0031     TRUE 0.637 21.000 0.000 NA   NA
 3741491 3741492 CLC_0031 CLC_0033     FALSE 0.193 85.000 0.000 NA   NA
 3741493 3741494 CLC_0035 CLC_0036 psd-1   FALSE 0.002 493.000 0.000 NA   NA
 3741495 3741496 CLC_0037 CLC_0038     FALSE 0.230 73.000 0.000 NA   NA
 3741496 3741497 CLC_0038 CLC_0039     TRUE 0.989 9.000 0.667 NA   NA
 3741497 3741498 CLC_0039 CLC_0040     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3741498 3741499 CLC_0040 CLC_0041     TRUE 0.654 17.000 0.000 NA   NA
 3741500 3741501 CLC_0042 CLC_0043 psd-2   FALSE 0.612 103.000 0.026 NA   NA
 3741501 3741502 CLC_0043 CLC_0044     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3741503 3741504 CLC_0045 CLC_0046     FALSE 0.162 134.000 0.000 NA   NA
 3741504 3741505 CLC_0046 CLC_0047   megL TRUE 0.645 160.000 0.034 1.000 N NA
 3741505 3741506 CLC_0047 CLC_0048 megL   FALSE 0.354 124.000 0.000 1.000 N NA
 3741506 3741507 CLC_0048 CLC_0049     FALSE 0.120 166.000 0.000 NA   NA
 3741507 10195466 CLC_0049 CLC_3700   srpB FALSE 0.167 124.000 0.000 NA   NA
 10195466 3741508 CLC_3700 CLC_0051 srpB dnaX FALSE 0.123 164.000 0.000 NA   NA
 3741508 3741509 CLC_0051 CLC_0052 dnaX   TRUE 0.801 65.000 0.100 NA   NA
 3741509 3741510 CLC_0052 CLC_0053   recR TRUE 0.973 33.000 0.604 NA   NA
 3741510 3741511 CLC_0053 CLC_0054 recR   TRUE 0.817 57.000 0.071 NA   NA
 3741511 3741512 CLC_0054 CLC_0055   bofA TRUE 0.820 150.000 0.417 NA   NA
 3741512 3741513 CLC_0055 CLC_0056 bofA sfsA FALSE 0.473 151.000 0.005 NA   NA
 3741513 3741514 CLC_0056 CLC_0057 sfsA   TRUE 0.744 56.000 0.015 NA   NA
 3741514 3741515 CLC_0057 CLC_0058     FALSE 0.239 118.000 0.000 1.000   NA
 3741515 3741516 CLC_0058 CLC_0059     FALSE 0.224 134.000 0.000 1.000   NA
 3741516 3741517 CLC_0059 CLC_0060     TRUE 0.969 19.000 0.222 NA   NA
 3741517 3741518 CLC_0060 CLC_0061     FALSE 0.006 383.000 0.000 NA   NA
 3741518 3741519 CLC_0061 CLC_0062     TRUE 0.682 83.000 0.007 1.000 N NA
 3741519 3741520 CLC_0062 CLC_0063     TRUE 0.942 29.000 0.035 1.000 N NA
 3741520 3741521 CLC_0063 CLC_0064   rrsB FALSE 0.006 387.000 0.000 NA   NA
 3741521 3741522 CLC_0064 CLC_0067 rrsB rrlB FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3741522 3741523 CLC_0067 CLC_0068 rrlB rrfB FALSE 0.169 122.000 0.000 NA   NA
 3741523 3741524 CLC_0068 CLC_0069 rrfB   TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3741526 3741527 CLC_0072 CLC_0075 rrsC rrlC FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3741527 3741528 CLC_0075 CLC_0076 rrlC rrfC FALSE 0.162 133.000 0.000 NA   NA
 3741528 3741529 CLC_0076 CLC_0077 rrfC   TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3741529 3741530 CLC_0077 CLC_0079     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 3741530 3741531 CLC_0079 CLC_0080     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 3741531 3741532 CLC_0080 CLC_0081   rrsE FALSE 0.002 645.000 0.000 NA   NA
 3741532 3741533 CLC_0081 CLC_0084 rrsE rrlE FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3741533 3741534 CLC_0084 CLC_0085 rrlE rrfE FALSE 0.336 53.000 0.000 NA   NA
 3741534 3741535 CLC_0085 CLC_0086 rrfE   TRUE 0.709 8.000 0.000 NA   NA
 3741535 3741536 CLC_0086 CLC_0088     FALSE 0.158 141.000 0.000 NA   NA
 3741536 3741537 CLC_0088 CLC_0089   rrsF FALSE 0.002 522.000 0.000 NA   NA
 3741537 3741538 CLC_0089 CLC_0092 rrsF rrlF FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3741538 3741539 CLC_0092 CLC_0093 rrlF rrfF FALSE 0.173 106.000 0.000 NA   NA
 3741539 3741540 CLC_0093 CLC_0094 rrfF   FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 3741540 3741541 CLC_0094 CLC_0095     FALSE 0.201 82.000 0.000 NA   NA
 3741542 3741543 CLC_0096 CLC_0097     TRUE 0.906 36.000 0.039 NA N NA
 3741546 3741547 CLC_0100 CLC_0101     TRUE 0.987 -21.000 0.120 NA   NA
 3741547 3741548 CLC_0101 CLC_0102     TRUE 0.955 24.000 0.034 1.000 N NA
 3741548 3741549 CLC_0102 CLC_0103     TRUE 0.681 81.000 0.034 NA   NA
 3741549 3741550 CLC_0103 CLC_0104     TRUE 0.925 18.000 0.018 NA   NA
 3741550 3741551 CLC_0104 CLC_0105     TRUE 0.986 2.000 0.372 NA   NA
 3741551 3741552 CLC_0105 CLC_0106     TRUE 0.931 12.000 0.011 NA   NA
 3741552 3741553 CLC_0106 CLC_0107     TRUE 0.860 82.000 0.333 1.000   NA
 3741553 3741554 CLC_0107 CLC_0108     FALSE 0.569 121.000 0.006 1.000   NA
 3741554 3741555 CLC_0108 CLC_0109     TRUE 0.968 20.000 0.078 0.010   NA
 3741555 3741556 CLC_0109 CLC_0110     FALSE 0.433 156.000 0.002 NA   NA
 3741558 3741559 CLC_0112 CLC_0113   arcA-1 FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 3741560 3741561 CLC_0114 CLC_0115 ispF   FALSE 0.586 76.000 0.003 NA   NA
 3741564 3741565 CLC_0118 CLC_0119 spmA   TRUE 0.992 13.000 0.655 0.003   NA
 3741567 3741568 CLC_0121 CLC_0122 udgA   TRUE 0.929 29.000 0.016 1.000 N NA
 3741568 3741569 CLC_0122 CLC_0123   metG FALSE 0.016 382.000 0.000 1.000 N NA
 3741569 3741570 CLC_0123 CLC_0124 metG   FALSE 0.414 165.000 0.003 NA   NA
 3741570 3741571 CLC_0124 CLC_0125     FALSE 0.466 151.000 0.004 NA   NA
 3741571 3741572 CLC_0125 CLC_0126     FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 3741572 3741573 CLC_0126 CLC_0127     TRUE 0.706 73.000 0.020 1.000   NA
 3741573 3741574 CLC_0127 CLC_0128   ksgA TRUE 0.980 2.000 0.093 1.000 N NA
 3741574 3741575 CLC_0128 CLC_0129 ksgA   FALSE 0.610 79.000 0.010 NA   NA
 3741575 3741576 CLC_0129 CLC_0130     TRUE 0.759 157.000 0.278 NA   NA
 3741576 3741577 CLC_0130 CLC_0131     TRUE 0.676 169.000 0.188 NA   NA
 3741577 3741578 CLC_0131 CLC_0132     TRUE 0.665 168.000 0.167 NA   NA
 3741578 3741579 CLC_0132 CLC_0133     TRUE 0.986 11.000 0.350 1.000 N NA
 3741579 3741580 CLC_0133 CLC_0134     TRUE 0.996 -3.000 0.349 NA Y NA
 3741580 3741581 CLC_0134 CLC_0135     TRUE 0.698 82.000 0.019 NA N NA
 3741581 3741582 CLC_0135 CLC_0136     FALSE 0.220 140.000 0.000 1.000   NA
 3741582 3741583 CLC_0136 CLC_0137     FALSE 0.222 75.000 0.000 NA   NA
 3741585 3741586 CLC_0139 CLC_0140     FALSE 0.302 57.000 0.000 NA   NA
 3741586 3741587 CLC_0140 CLC_0141   nrdD FALSE 0.020 290.000 0.000 NA   NA
 3741587 3741588 CLC_0141 CLC_0142 nrdD nrdG TRUE 0.988 17.000 0.315 0.001 N NA
 3741589 3741590 CLC_0143 CLC_0144     FALSE 0.160 138.000 0.000 NA   NA
 3741590 3741591 CLC_0144 CLC_0145     TRUE 0.974 2.000 0.111 NA   NA
 3741591 3741592 CLC_0145 CLC_0146     FALSE 0.170 121.000 0.000 NA   NA
 3741593 3741594 CLC_0147 CLC_0148 ileS   FALSE 0.601 151.000 0.009 1.000 N NA
 3741594 3741595 CLC_0148 CLC_0149     FALSE 0.386 216.000 0.017 1.000 N NA
 3741595 3741596 CLC_0149 CLC_0150     TRUE 0.854 75.000 0.160 1.000 N NA
 3741596 3741597 CLC_0150 CLC_0151     FALSE 0.010 336.000 0.000 NA   NA
 3741597 3741598 CLC_0151 CLC_0152     TRUE 0.964 5.000 0.066 NA   NA
 3741598 3741599 CLC_0152 CLC_0153     TRUE 0.970 20.000 0.210 1.000   NA
 3741599 3741600 CLC_0153 CLC_0154     FALSE 0.073 225.000 0.000 1.000   NA
 3741600 3741601 CLC_0154 CLC_0155     TRUE 0.709 187.000 0.333 1.000   NA
 3741603 3741604 CLC_0157 CLC_0158     TRUE 0.965 15.000 0.143 NA   NA
 3741604 3741605 CLC_0158 CLC_0159     TRUE 0.967 27.000 0.250 NA   NA
 3741605 3741606 CLC_0159 CLC_0160     TRUE 0.989 13.000 0.800 NA   NA
 3741608 3741609 CLC_0162 CLC_0163 cotS   TRUE 0.722 124.000 0.119 NA   NA
 3741609 3741610 CLC_0163 CLC_0164     FALSE 0.530 196.000 0.116 NA   NA
 3741610 3741611 CLC_0164 CLC_0165     TRUE 0.694 104.000 0.082 NA   NA
 3741611 3741612 CLC_0165 CLC_0166     FALSE 0.018 297.000 0.000 NA   NA
 3741612 3741613 CLC_0166 CLC_0167   cphB TRUE 0.856 -30.000 0.000 NA   NA
 3741613 3741614 CLC_0167 CLC_0168 cphB cphA TRUE 0.967 44.000 0.605 1.000 N NA
 3741614 3741615 CLC_0168 CLC_0169 cphA ispE TRUE 0.685 93.000 0.016 1.000 N NA
 3741615 3741616 CLC_0169 CLC_0170 ispE   FALSE 0.425 166.000 0.005 NA   NA
 3741616 3741617 CLC_0170 CLC_0171     TRUE 0.840 60.000 0.133 NA   NA
 3741617 3741618 CLC_0171 CLC_0172     TRUE 0.984 20.000 0.333 0.008   NA
 3741618 3741619 CLC_0172 CLC_0173     TRUE 0.961 50.000 0.500 0.008   NA
 3741619 3741620 CLC_0173 CLC_0174     TRUE 0.786 73.000 0.109 NA   NA
 3741622 3741623 CLC_0176 CLC_0177 ypeB   FALSE 0.552 103.000 0.003 1.000   NA
 3741623 3741624 CLC_0177 CLC_0178     TRUE 0.910 25.000 0.011 NA   NA
 3741624 3741625 CLC_0178 CLC_0179     TRUE 0.626 132.000 0.039 NA   NA
 3741625 3741626 CLC_0179 CLC_0180   pyrG FALSE 0.192 234.000 0.004 NA   NA
 3741626 3741627 CLC_0180 CLC_0181 pyrG   FALSE 0.003 448.000 0.000 NA   NA
 3741627 3741628 CLC_0181 CLC_0182   rho FALSE 0.412 172.000 0.006 NA   NA
 3741630 3741631 CLC_0184 CLC_0185 tdk   TRUE 0.918 17.000 0.010 NA   NA
 3741631 3741632 CLC_0185 CLC_0186   hemK TRUE 0.966 8.000 0.098 NA   NA
 3741632 3741633 CLC_0186 CLC_0187 hemK prfA TRUE 0.902 82.000 0.081 1.000 Y NA
 3741633 3741634 CLC_0187 CLC_0188 prfA   TRUE 0.893 28.000 0.009 NA   NA
 3741634 3741635 CLC_0188 CLC_0189     TRUE 0.831 60.000 0.116 NA   NA
 3741635 3741636 CLC_0189 CLC_0190     TRUE 0.956 21.000 0.052 NA N NA
 3741636 3741637 CLC_0190 CLC_0191     TRUE 0.968 9.000 0.056 NA N NA
 3741637 3741638 CLC_0191 CLC_0192   rpiB TRUE 0.850 60.000 0.065 1.000 N NA
 3741638 3741639 CLC_0192 CLC_0193 rpiB upp TRUE 0.927 30.000 0.019 1.000 N NA
 3741639 3741640 CLC_0193 CLC_0194 upp   FALSE 0.068 507.000 0.041 1.000 Y NA
 3741640 3741641 CLC_0194 CLC_0195   tagO TRUE 0.709 108.000 0.029 1.000 N NA
 3741641 3741642 CLC_0195 CLC_0196 tagO mnaA TRUE 0.993 14.000 0.346 1.000 Y NA
 3741642 3741643 CLC_0196 CLC_0197 mnaA   FALSE 0.004 492.000 0.000 1.000   NA
 3741643 3741644 CLC_0197 CLC_0198   atpB TRUE 0.980 15.000 0.330 1.000   NA
 3741644 3741645 CLC_0198 CLC_0199 atpB atpE TRUE 0.880 40.000 0.009 0.008   NA
 3741645 3741646 CLC_0199 CLC_0200 atpE atpF TRUE 0.839 76.000 0.095 0.008   NA
 3741646 3741647 CLC_0200 CLC_0201 atpF atpH TRUE 0.992 3.000 0.040 0.008 Y NA
 3741647 3741648 CLC_0201 CLC_0202 atpH atpA TRUE 0.998 11.000 0.864 0.008 Y NA
 3741648 3741649 CLC_0202 CLC_0203 atpA atpG TRUE 0.997 22.000 0.846 0.008 Y NA
 3741649 3741650 CLC_0203 CLC_0204 atpG atpD TRUE 0.997 14.000 0.724 0.008 Y NA
 3741650 3741651 CLC_0204 CLC_0205 atpD atpC TRUE 0.997 25.000 0.837 0.008 Y NA
 3741651 3741652 CLC_0205 CLC_0206 atpC   FALSE 0.346 193.000 0.007 NA   NA
 3741652 3741653 CLC_0206 CLC_0207   murA-1 TRUE 0.975 24.000 0.346 NA   NA
 3741653 3741654 CLC_0207 CLC_0208 murA-1 spoIID FALSE 0.415 270.000 0.243 1.000 N NA
 3741654 3741655 CLC_0208 CLC_0209 spoIID   FALSE 0.033 532.000 0.090 1.000 N NA
 3741655 3741656 CLC_0209 CLC_0210   spoIIID TRUE 0.728 108.000 0.093 1.000   NA
 3741656 3741657 CLC_0210 CLC_0211 spoIIID   TRUE 0.825 100.000 0.284 1.000   NA
 3741658 3741659 CLC_0212 CLC_0213     TRUE 0.768 49.000 0.010 NA   NA
 3741660 3741661 CLC_0214 CLC_0215     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3741661 3741662 CLC_0215 CLC_0217     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3741662 3741663 CLC_0217 CLC_0219     TRUE 0.646 18.000 0.000 NA   NA
 3741663 3741664 CLC_0219 CLC_0220     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3741664 3741665 CLC_0220 CLC_0222   metK FALSE 0.013 316.000 0.000 NA   NA
 3741665 3741666 CLC_0222 CLC_0223 metK   FALSE 0.566 191.000 0.052 1.000 N NA
 3741666 3741667 CLC_0223 CLC_0224     TRUE 0.938 26.000 0.051 NA   NA
 3741667 3741668 CLC_0224 CLC_0225     TRUE 0.987 -27.000 0.130 NA   NA
 3741668 3741669 CLC_0225 CLC_0226   yfiA FALSE 0.040 425.000 0.080 NA   NA
 3741669 3741670 CLC_0226 CLC_0227 yfiA secA FALSE 0.379 228.000 0.050 NA N NA
 3741670 3741671 CLC_0227 CLC_0228 secA prfB FALSE 0.089 364.000 0.048 1.000 N NA
 3741673 3741674 CLC_0230 CLC_0231     FALSE 0.021 284.000 0.000 NA   NA
 3741674 3741675 CLC_0231 CLC_0232     FALSE 0.028 411.000 0.016 NA   NA
 3741675 3741676 CLC_0232 CLC_0233     TRUE 0.982 21.000 0.500 NA   NA
 3741676 3741677 CLC_0233 CLC_0234     TRUE 0.960 14.000 0.077 1.000   NA
 3741677 3741678 CLC_0234 CLC_0235     TRUE 0.662 84.000 0.022 1.000   NA
 3741678 3741679 CLC_0235 CLC_0236     TRUE 0.905 40.000 0.109 1.000   NA
 3741681 3741682 CLC_0238 CLC_0239     FALSE 0.146 150.000 0.000 NA   NA
 3741683 3741684 CLC_0240 CLC_0241 leuS   FALSE 0.014 377.000 0.000 NA N NA
 3741686 3741687 CLC_0244 CLC_0245     TRUE 0.959 25.000 0.138 NA   NA
 3741687 3741688 CLC_0245 CLC_0246     FALSE 0.008 360.000 0.000 NA   NA
 3741688 3741689 CLC_0246 CLC_0247     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3741691 3741692 CLC_0249 CLC_0250 fba   FALSE 0.049 226.000 0.000 NA   NA
 3741692 3741693 CLC_0250 CLC_0251     TRUE 0.696 117.000 0.082 NA   NA
 3741694 3741695 CLC_0252 CLC_0253     FALSE 0.543 138.000 0.013 NA   NA
 3741697 3741698 CLC_0255 CLC_0256     TRUE 0.729 106.000 0.094 1.000   NA
 3741698 3741699 CLC_0256 CLC_0257     TRUE 0.856 74.000 0.281 NA   NA
 3741701 3741702 CLC_0259 CLC_0260   sleB FALSE 0.393 230.000 0.041 0.066   NA
 3741702 3741703 CLC_0260 CLC_0261 sleB cysK-1 FALSE 0.011 364.000 0.000 1.000   NA
 3741703 3741704 CLC_0261 CLC_0262 cysK-1 cysE TRUE 0.991 15.000 0.101 0.002 Y NA
 3741704 3741705 CLC_0262 CLC_0263 cysE   TRUE 0.962 22.000 0.064 1.000 N NA
 3741705 3741706 CLC_0263 CLC_0264     TRUE 0.718 148.000 0.064 1.000 N NA
 3741706 3741707 CLC_0264 CLC_0265   nth TRUE 0.667 93.000 0.011 1.000 N NA
 3741707 3741708 CLC_0265 CLC_0266 nth   FALSE 0.028 334.000 0.000 1.000 N NA
 3741709 3741710 CLC_0267 CLC_0268     TRUE 0.907 26.000 0.004 1.000   NA
 3741710 3741711 CLC_0268 CLC_0269     FALSE 0.589 110.000 0.018 NA   NA
 3741712 3741713 CLC_0270 CLC_0271     FALSE 0.450 205.000 0.000 1.000 Y NA
 3741713 3741714 CLC_0271 CLC_0272   splB TRUE 0.671 147.000 0.027 1.000 N NA
 3741714 3741715 CLC_0272 CLC_0273 splB   TRUE 0.636 128.000 0.008 1.000 N NA
 3741715 3741716 CLC_0273 CLC_0274     TRUE 0.933 13.000 0.016 NA   NA
 3741716 3741717 CLC_0274 CLC_0275     FALSE 0.019 294.000 0.000 NA   NA
 3741717 3741718 CLC_0275 CLC_0276     TRUE 0.639 166.000 0.097 1.000   NA
 3741718 3741719 CLC_0276 CLC_0277     TRUE 0.989 2.000 0.438 1.000   NA
 3741719 3741720 CLC_0277 CLC_0278     TRUE 0.996 -7.000 0.720 0.038   NA
 3741720 3741721 CLC_0278 CLC_0279     FALSE 0.579 112.000 0.007 1.000   NA
 3741721 3741722 CLC_0279 CLC_0280   rpoN FALSE 0.171 329.000 0.125 1.000 N NA
 3741722 3741723 CLC_0280 CLC_0281 rpoN cggR FALSE 0.383 288.000 0.034 1.000 Y NA
 3741723 3741724 CLC_0281 CLC_0282 cggR gap-1 TRUE 0.892 78.000 0.348 1.000 N NA
 3741724 3741725 CLC_0282 CLC_0283 gap-1 pgk FALSE 0.472 297.000 0.063 0.004 Y NA
 3741725 3741726 CLC_0283 CLC_0284 pgk tpiA TRUE 0.943 62.000 0.141 1.000 Y NA
 3741726 3741727 CLC_0284 CLC_0285 tpiA gpmI TRUE 0.908 92.000 0.138 1.000 Y NA
 3741727 3741728 CLC_0285 CLC_0286 gpmI eno TRUE 0.921 56.000 0.016 1.000 Y NA
 3741728 3741729 CLC_0286 CLC_0287 eno secG FALSE 0.320 223.000 0.006 1.000 N NA
 3741729 3741730 CLC_0287 CLC_0288 secG rnr FALSE 0.502 209.000 0.064 1.000 N NA
 3741730 3741731 CLC_0288 CLC_0289 rnr surE FALSE 0.007 409.000 0.000 1.000   NA
 3741731 3741732 CLC_0289 CLC_0290 surE smpB FALSE 0.048 257.000 0.000 1.000   NA
 3741734 3741735 CLC_0292 CLC_0293     FALSE 0.001 780.000 0.000 NA   NA
 3741735 3741736 CLC_0293 CLC_0295     FALSE 0.134 157.000 0.000 NA   NA
 3741736 3741737 CLC_0295 CLC_0296     FALSE 0.005 391.000 0.000 NA   NA
 3741738 3741739 CLC_0297 CLC_0298     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3741740 3741741 CLC_0299 CLC_0300     FALSE 0.212 188.000 0.000 1.000 N NA
 3741741 3741742 CLC_0300 CLC_0301     FALSE 0.012 359.000 0.000 1.000   NA
 3741742 3741743 CLC_0301 CLC_0302     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3741743 3741744 CLC_0302 CLC_0303     FALSE 0.010 341.000 0.000 NA   NA
 3741744 3741745 CLC_0303 CLC_0304     FALSE 0.002 502.000 0.000 NA   NA
 3741745 3741746 CLC_0304 CLC_0305   kdgT FALSE 0.091 212.000 0.000 1.000   NA
 3741746 3741747 CLC_0305 CLC_0306 kdgT   FALSE 0.087 214.000 0.000 1.000   NA
 3741747 3741748 CLC_0306 CLC_0307     TRUE 0.999 -22.000 1.000 1.000 Y NA
 3741748 3741749 CLC_0307 CLC_0308   lysP FALSE 0.005 557.000 0.000 1.000 N NA
 3741749 3741750 CLC_0308 CLC_0309 lysP   FALSE 0.003 544.000 0.000 1.000   NA
 3741750 3741751 CLC_0309 CLC_0310     FALSE 0.240 114.000 0.000 1.000   NA
 3741751 3741752 CLC_0310 CLC_0311     TRUE 0.707 26.000 0.000 1.000   NA
 3741752 3741753 CLC_0311 CLC_0312     FALSE 0.185 159.000 0.000 1.000   NA
 3741753 3741754 CLC_0312 CLC_0313     TRUE 0.945 26.000 0.050 1.000   NA
 3741754 3741755 CLC_0313 CLC_0314     TRUE 0.853 63.000 0.095 1.000 N NA
 3741755 3741756 CLC_0314 CLC_0315     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3741758 3741759 CLC_0317 CLC_0318     TRUE 0.998 0.000 0.800 0.042 Y NA
 3741759 3741760 CLC_0318 CLC_0319     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 3741760 3741761 CLC_0319 CLC_0320     FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 3741761 3741762 CLC_0320 CLC_0321     TRUE 0.695 11.000 0.000 NA   NA
 3741762 3741763 CLC_0321 CLC_0322     TRUE 0.637 22.000 0.000 NA   NA
 3741763 3741764 CLC_0322 CLC_0323     TRUE 0.964 25.000 0.091 1.000 N NA
 3741764 3741765 CLC_0323 CLC_0324     TRUE 0.997 -28.000 0.278 1.000 Y NA
 3741767 3741768 CLC_0326 CLC_0327 glvA-1   TRUE 0.901 163.000 0.294 1.000 Y NA
 3741769 3741770 CLC_0328 CLC_0329     TRUE 0.996 16.000 0.500 0.005 Y NA
 3741771 3741772 CLC_0330 CLC_0331     FALSE 0.365 98.000 0.000 1.000 N NA
 3741772 3741773 CLC_0331 CLC_0332     TRUE 0.992 10.000 0.235 1.000 Y NA
 3741773 3741774 CLC_0332 CLC_0333     TRUE 0.867 120.000 0.353 1.000 N NA
 3741774 3741775 CLC_0333 CLC_0334     TRUE 0.977 14.000 0.286 NA   NA
 3741775 3741776 CLC_0334 CLC_0335   alr-1 FALSE 0.040 240.000 0.000 NA   NA
 3741776 3741777 CLC_0335 CLC_0336 alr-1   FALSE 0.006 520.000 0.000 1.000 N NA
 3741777 3741778 CLC_0336 CLC_0337   glvA-2 FALSE 0.125 316.000 0.000 1.000 Y NA
 3741778 3741779 CLC_0337 CLC_0338 glvA-2   FALSE 0.128 314.000 0.000 1.000 Y NA
 3741779 3741780 CLC_0338 CLC_0339     FALSE 0.058 283.000 0.000 1.000 N NA
 3741782 3741783 CLC_0341 CLC_0342     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 3741783 3741784 CLC_0342 CLC_0343     FALSE 0.004 435.000 0.000 NA   NA
 3741784 3741785 CLC_0343 CLC_0344     TRUE 0.752 152.000 0.158 NA N NA
 3741785 3741786 CLC_0344 CLC_0345     TRUE 0.936 27.000 0.035 1.000   NA
 3741786 3741787 CLC_0345 CLC_0346     FALSE 0.005 438.000 0.000 1.000   NA
 3741787 3741788 CLC_0346 CLC_0347     TRUE 0.873 119.000 0.385 1.000 N NA
 3741788 3741789 CLC_0347 CLC_0348   glvA-3 TRUE 0.700 262.000 0.385 1.000 Y NA
 3741789 3741790 CLC_0348 CLC_0349 glvA-3   TRUE 0.993 13.000 0.375 1.000 Y NA
 3741790 3741791 CLC_0349 CLC_0350   ilvD TRUE 0.941 138.000 0.286 0.012 Y NA
 3741791 3741792 CLC_0350 CLC_0351 ilvD eda TRUE 0.961 52.000 0.091 0.065 Y NA
 3741792 3741793 CLC_0351 CLC_0352 eda   TRUE 0.991 2.000 0.091 1.000 Y NA
 3741793 3741794 CLC_0352 CLC_0353   ade FALSE 0.170 206.000 0.000 1.000 N NA
 3741794 3741795 CLC_0353 CLC_0354 ade   FALSE 0.013 402.000 0.000 1.000 N NA
 3741795 3741796 CLC_0354 CLC_0355     TRUE 0.998 0.000 0.889 1.000 Y NA
 3741796 3741797 CLC_0355 CLC_0356     FALSE 0.011 397.000 0.000 NA N NA
 3741797 3741798 CLC_0356 CLC_0357     TRUE 0.842 -16.000 0.000 NA   NA
 3741798 3741799 CLC_0357 CLC_0358     TRUE 0.904 119.000 0.750 1.000   NA
 3741799 3741800 CLC_0358 CLC_0359     FALSE 0.014 341.000 0.000 1.000   NA
 3741800 3741801 CLC_0359 CLC_0360     FALSE 0.077 264.000 0.000 1.000 N NA
 3741801 3741802 CLC_0360 CLC_0361     TRUE 0.993 3.000 0.167 1.000 Y NA
 3741802 3741803 CLC_0361 CLC_0362     TRUE 0.997 2.000 0.750 1.000 Y NA
 3741803 3741804 CLC_0362 CLC_0363     TRUE 0.713 35.000 0.000 1.000 N NA
 3741806 3741807 CLC_0365 CLC_0366     FALSE 0.273 61.000 0.000 NA   NA
 3741809 3741810 CLC_0368 CLC_0369     TRUE 0.942 27.000 0.000 1.000 Y NA
 3741810 3741811 CLC_0369 CLC_0370     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 3741811 3741812 CLC_0370 CLC_0371     TRUE 0.961 11.000 0.000 1.000 Y NA
 3741812 3741813 CLC_0371 CLC_0372     TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3741815 3741816 CLC_0374 CLC_0375   xpt-1 TRUE 0.981 23.000 0.032 1.000 Y NA
 3741816 3741817 CLC_0375 CLC_0376 xpt-1   FALSE 0.009 451.000 0.000 1.000 N NA
 3741817 3741818 CLC_0376 CLC_0377     TRUE 0.997 13.000 1.000 1.000 Y NA
 3741818 3741819 CLC_0377 CLC_0378     TRUE 0.739 176.000 0.222 1.000 N NA
 3741819 3741820 CLC_0378 CLC_0379     TRUE 0.993 15.000 0.333 1.000 Y NA
 3741820 3741821 CLC_0379 CLC_0380     TRUE 0.993 0.000 0.750 NA   NA
 3741821 3741822 CLC_0380 CLC_0381     TRUE 0.985 24.000 0.667 NA   NA
 3741822 3741823 CLC_0381 CLC_0382     FALSE 0.014 314.000 0.000 NA   NA
 3741823 3741824 CLC_0382 CLC_0383     TRUE 0.993 3.000 0.869 NA   NA
 3741824 3741825 CLC_0383 CLC_0384     FALSE 0.018 296.000 0.000 NA   NA
 3741825 3741826 CLC_0384 CLC_0385     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3741826 3741827 CLC_0385 CLC_0386     FALSE 0.516 135.000 0.006 NA   NA
 3741827 3741828 CLC_0386 CLC_0387     FALSE 0.012 324.000 0.000 NA   NA
 3741828 3741829 CLC_0387 CLC_0388     TRUE 0.855 179.000 1.000 NA   NA
 3741829 3741830 CLC_0388 CLC_0389     TRUE 0.993 -7.000 0.556 NA   NA
 3741830 3741831 CLC_0389 CLC_0390     TRUE 0.994 -16.000 0.556 NA   NA
 3741831 3741832 CLC_0390 CLC_0391     TRUE 0.824 72.000 0.179 NA   NA
 3741832 3741833 CLC_0391 CLC_0392     FALSE 0.116 231.000 0.000 1.000 N NA
 3741833 3741834 CLC_0392 CLC_0393     FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 3741834 3741835 CLC_0393 CLC_0394     TRUE 0.983 27.000 0.667 NA   NA
 3741835 3741836 CLC_0394 CLC_0395     FALSE 0.032 259.000 0.000 NA   NA
 3741836 3741837 CLC_0395 CLC_0396     TRUE 0.996 -13.000 1.000 NA   NA
 3741837 3741838 CLC_0396 CLC_0397     TRUE 0.917 95.000 1.000 NA   NA
 3741838 3741839 CLC_0397 CLC_0398     TRUE 0.930 81.000 1.000 NA   NA
 3741839 3741840 CLC_0398 CLC_0399     FALSE 0.090 233.000 0.000 NA N NA
 3741842 3741843 CLC_0401 CLC_0402     TRUE 0.957 119.000 0.667 1.000 Y NA
 3741843 3741844 CLC_0402 CLC_0403   adhE FALSE 0.010 428.000 0.000 1.000 N NA
 3741844 3741845 CLC_0403 CLC_0404 adhE   FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 3741845 3741846 CLC_0404 CLC_0405     TRUE 0.710 63.000 0.019 NA   NA
 3741847 3741848 CLC_0406 CLC_0407     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 3741849 3741850 CLC_0408 CLC_0409     FALSE 0.007 411.000 0.000 1.000   NA
 3741850 3741851 CLC_0409 CLC_0410     TRUE 0.725 108.000 0.038 1.000 N NA
 3741851 3741852 CLC_0410 CLC_0411     TRUE 0.986 10.000 0.038 1.000 Y NA
 3741852 3741853 CLC_0411 CLC_0412     TRUE 0.800 63.000 0.091 NA   NA
 3741853 3741854 CLC_0412 CLC_0413     TRUE 0.873 44.000 0.087 NA   NA
 3741854 3741855 CLC_0413 CLC_0414     TRUE 0.947 26.000 0.087 NA   NA
 3741856 3741857 CLC_0415 CLC_0416     FALSE 0.077 200.000 0.000 NA   NA
 3741858 3741859 CLC_0417 CLC_0418     FALSE 0.124 192.000 0.000 1.000   NA
 3741859 3741860 CLC_0418 CLC_0419     FALSE 0.021 312.000 0.000 1.000   NA
 3741862 3741863 CLC_0421 CLC_0422     FALSE 0.550 131.000 0.013 NA   NA
 3741863 3741864 CLC_0422 CLC_0423     TRUE 0.988 -54.000 0.105 1.000   NA
 3741864 3741865 CLC_0423 CLC_0424     TRUE 0.997 -10.000 0.429 1.000 Y NA
 3741865 3741866 CLC_0424 CLC_0425     FALSE 0.365 108.000 0.000 1.000 N NA
 3741866 3741867 CLC_0425 CLC_0426     FALSE 0.003 1230.000 0.000 1.000 N NA
 3741867 3741868 CLC_0426 CLC_0427     TRUE 0.994 23.000 0.431 0.057 Y NA
 3741868 3741869 CLC_0427 CLC_0428     TRUE 0.998 0.000 0.678 0.057 Y NA
 3741869 3741870 CLC_0428 CLC_0429     TRUE 0.991 11.000 0.091 0.057 Y NA
 3741870 3741871 CLC_0429 CLC_0430     TRUE 0.974 51.000 0.237 0.057 Y NA
 3741871 3741872 CLC_0430 CLC_0431     TRUE 0.993 14.000 0.221 0.057 Y NA
 3741872 3741873 CLC_0431 CLC_0432     FALSE 0.006 380.000 0.000 NA   NA
 3741874 3741875 CLC_0433 CLC_0434     TRUE 0.947 18.000 0.059 NA   NA
 3741875 3741876 CLC_0434 CLC_0435     TRUE 0.793 115.000 0.231 NA   NA
 3741876 3741877 CLC_0435 CLC_0436     FALSE 0.004 848.000 0.000 1.000 N NA
 3741877 3741878 CLC_0436 CLC_0437     FALSE 0.004 677.000 0.000 1.000 N NA
 3741879 3741880 CLC_0438 CLC_0439   rnhA TRUE 0.967 -25.000 0.003 NA   NA
 3741880 3741881 CLC_0439 CLC_0440 rnhA   TRUE 0.643 63.000 0.003 NA   NA
 3741881 3741882 CLC_0440 CLC_0441     FALSE 0.098 181.000 0.000 NA   NA
 3741882 3741883 CLC_0441 CLC_0442     TRUE 0.977 32.000 0.429 0.030   NA
 3741883 3741884 CLC_0442 CLC_0443     FALSE 0.014 314.000 0.000 NA   NA
 3741884 3741885 CLC_0443 CLC_0444     FALSE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 3741885 3741886 CLC_0444 CLC_0445     FALSE 0.130 160.000 0.000 NA   NA
 3741886 3741887 CLC_0445 CLC_0446     FALSE 0.534 31.000 0.000 NA   NA
 3741889 3741890 CLC_0448 CLC_0449   clpB FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 3741892 3741893 CLC_0451 CLC_0452     FALSE 0.002 624.000 0.000 NA   NA
 3741893 3741894 CLC_0452 CLC_0453     FALSE 0.053 438.000 0.000 0.005 Y NA
 3741894 3741895 CLC_0453 CLC_0454     FALSE 0.012 352.000 0.000 1.000   NA
 3741895 3741896 CLC_0454 CLC_0455     TRUE 0.800 45.000 0.008 1.000   NA
 3741897 3741898 CLC_0456 CLC_0457     FALSE 0.175 294.000 0.000 1.000 Y NA
 3741898 3741899 CLC_0457 CLC_0458     TRUE 0.998 0.000 0.455 0.001 Y NA
 3741900 3741901 CLC_0459 CLC_0460     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 3741903 3741904 CLC_0462 CLC_0463     TRUE 0.994 3.000 0.313 NA Y NA
 3741904 3741905 CLC_0463 CLC_0464     FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   NA
 3741905 3741906 CLC_0464 CLC_0465   pepP FALSE 0.055 220.000 0.000 NA   NA
 3741907 3741908 CLC_0466 CLC_0467     TRUE 0.951 58.000 0.796 1.000   NA
 3741909 3741910 CLC_0468 CLC_0469 manA   FALSE 0.009 349.000 0.000 NA   NA
 3741910 3741911 CLC_0469 CLC_0470     TRUE 0.864 108.000 0.500 NA   NA
 3741911 3741912 CLC_0470 CLC_0471   rrsG FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 3741912 3741913 CLC_0471 CLC_0472 rrsG   FALSE 0.155 144.000 0.000 NA   NA
 3741913 3741914 CLC_0472 CLC_0474     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3741914 3741915 CLC_0474 CLC_0477   rrlG FALSE 0.226 74.000 0.000 NA   NA
 3741915 3741916 CLC_0477 CLC_0478 rrlG rrfG FALSE 0.162 133.000 0.000 NA   NA
 3741916 3741917 CLC_0478 CLC_0479 rrfG   TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3741919 3741920 CLC_0482 CLC_0483     FALSE 0.004 745.000 0.000 1.000 N NA
 3741920 3741921 CLC_0483 CLC_0484     TRUE 0.733 144.000 0.027 0.064 N NA
 3741921 3741922 CLC_0484 CLC_0485     TRUE 0.973 36.000 0.054 0.064 Y NA
 3741922 3741923 CLC_0485 CLC_0486     FALSE 0.276 252.000 0.000 1.000 Y NA
 3741923 3741924 CLC_0486 CLC_0487     FALSE 0.006 519.000 0.000 1.000 N NA
 3741925 3741926 CLC_0488 CLC_0489   panD FALSE 0.544 88.000 0.004 NA   NA
 3741926 3741927 CLC_0489 CLC_0490 panD panC TRUE 0.922 149.000 0.342 1.000 Y NA
 3741927 3741928 CLC_0490 CLC_0491 panC panB TRUE 0.980 55.000 0.395 0.001 Y NA
 3741930 3741931 CLC_0493 CLC_0494     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3741931 3741932 CLC_0494 CLC_0495     FALSE 0.503 33.000 0.000 NA   NA
 3741932 3741933 CLC_0495 CLC_0496     TRUE 0.982 8.000 0.333 NA   NA
 3741934 3741935 CLC_0497 CLC_0498     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3741935 3741936 CLC_0498 CLC_0499     FALSE 0.165 126.000 0.000 NA   NA
 3741936 3741937 CLC_0499 CLC_0500     FALSE 0.180 92.000 0.000 NA   NA
 3741937 3741938 CLC_0500 CLC_0501     FALSE 0.062 213.000 0.000 NA   NA
 3741940 3741941 CLC_0503 CLC_0504     TRUE 0.991 3.000 0.667 NA   NA
 3741943 3741944 CLC_0506 CLC_0507 hypB   FALSE 0.436 236.000 0.115 1.000 N NA
 3741944 3741945 CLC_0507 CLC_0508   hypA TRUE 0.917 56.000 0.333 1.000   NA
 3741945 3741946 CLC_0508 CLC_0509 hypA   TRUE 0.925 39.000 0.214 NA   NA
 3741948 3741949 CLC_0511 CLC_0512 addA   TRUE 0.633 140.000 0.010 1.000 N NA
 3741949 3741950 CLC_0512 CLC_0513   pepT TRUE 0.793 77.000 0.056 1.000 N NA
 3741952 3741953 CLC_0515 CLC_0516     FALSE 0.069 206.000 0.000 NA   NA
 3741953 3741954 CLC_0516 CLC_0517     TRUE 0.994 -40.000 0.400 NA   NA
 3741954 3741955 CLC_0517 CLC_0518     FALSE 0.016 304.000 0.000 NA   NA
 3741956 3741957 CLC_0519 CLC_0520     TRUE 0.995 13.000 0.461 0.049 Y NA
 3741959 3741960 CLC_0522 CLC_0523   thiE FALSE 0.058 266.000 0.000 NA N NA
 3741960 3741961 CLC_0523 CLC_0524 thiE thiM-1 TRUE 0.997 -9.000 0.190 0.006 Y NA
 3741961 3741962 CLC_0524 CLC_0525 thiM-1 thiD-1 TRUE 0.669 232.000 0.039 0.006 Y NA
 3741963 3741964 CLC_0526 CLC_0527 ddlB   FALSE 0.560 156.000 0.004 1.000 N NA
 3741964 3741965 CLC_0527 CLC_0528     TRUE 0.993 4.000 0.182 1.000 Y NA
 3741965 3741966 CLC_0528 CLC_0529     TRUE 0.996 1.000 0.241 0.037 Y NA
 3741966 3741967 CLC_0529 CLC_0530     TRUE 0.991 12.000 0.167 1.000 Y NA
 3741967 3741968 CLC_0530 CLC_0531     TRUE 0.992 2.000 0.048 0.037 Y NA
 3741968 3741969 CLC_0531 CLC_0532     TRUE 0.958 29.000 0.222 NA   NA
 3741969 3741970 CLC_0532 CLC_0533     FALSE 0.005 402.000 0.000 NA   NA
 3741970 3741971 CLC_0533 CLC_0534     TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA   NA
 3741971 3741972 CLC_0534 CLC_0535     FALSE 0.157 142.000 0.000 NA   NA
 3741972 3741973 CLC_0535 CLC_0536     TRUE 0.677 61.000 0.007 NA   NA
 3741973 3741974 CLC_0536 CLC_0537     TRUE 0.700 10.000 0.000 NA   NA
 3741974 3741975 CLC_0537 CLC_0538     FALSE 0.002 519.000 0.000 NA   NA
 3741975 3741976 CLC_0538 CLC_0539     FALSE 0.134 274.000 0.010 NA   NA
 3741976 3741977 CLC_0539 CLC_0540     FALSE 0.534 134.000 0.010 NA   NA
 3741977 3741978 CLC_0540 CLC_0541     FALSE 0.524 176.000 0.050 NA   NA
 3741978 3741979 CLC_0541 CLC_0542     TRUE 0.958 2.000 0.025 NA   NA
 3741980 3741981 CLC_0543 CLC_0544     TRUE 0.637 21.000 0.000 NA   NA
 3741982 3741983 CLC_0545 CLC_0546     FALSE 0.006 377.000 0.000 NA   NA
 3741983 3741984 CLC_0546 CLC_0547   sbcC TRUE 0.998 -25.000 0.669 0.004 N NA
 3741984 3741985 CLC_0547 CLC_0548 sbcC   TRUE 0.898 28.000 0.005 1.000   NA
 3741985 3741986 CLC_0548 CLC_0549     FALSE 0.001 811.000 0.000 NA   NA
 3741986 3741987 CLC_0549 CLC_0550     FALSE 0.002 641.000 0.000 NA   NA
 3741987 3741988 CLC_0550 CLC_0551   cadA TRUE 0.750 76.000 0.053 1.000   NA
 3741988 3741989 CLC_0551 CLC_0552 cadA   FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 3741989 3741990 CLC_0552 CLC_0553     FALSE 0.139 154.000 0.000 NA   NA
 3741990 3741991 CLC_0553 CLC_0554     FALSE 0.001 881.000 0.000 NA   NA
 3741993 3741994 CLC_0556 CLC_0557     FALSE 0.001 957.000 0.000 NA   NA
 3741994 3741995 CLC_0557 CLC_0558     FALSE 0.057 268.000 0.000 NA N NA
 3741995 3741996 CLC_0558 CLC_0559     TRUE 0.989 10.000 0.667 NA   NA
 3741996 3741997 CLC_0559 CLC_0560     FALSE 0.012 320.000 0.000 NA   NA
 3741997 3741998 CLC_0560 CLC_0561   sagB TRUE 0.707 165.000 0.222 NA   NA
 3741998 3741999 CLC_0561 CLC_0562 sagB sagC TRUE 0.979 4.000 0.222 NA   NA
 3741999 3742000 CLC_0562 CLC_0563 sagC sagD TRUE 0.977 16.000 0.318 NA   NA
 3742000 3742001 CLC_0563 CLC_0564 sagD   TRUE 0.985 -25.000 0.091 NA   NA
 3742001 3742002 CLC_0564 CLC_0565     TRUE 0.992 8.000 1.000 NA   NA
 3742002 3742003 CLC_0565 CLC_0566   sagG FALSE 0.014 309.000 0.000 NA   NA
 3742003 3742004 CLC_0566 CLC_0567 sagG sagH TRUE 0.988 12.000 0.500 NA N NA
 3742005 3742006 CLC_0568 CLC_0569 sagI   FALSE 0.227 128.000 0.000 1.000   NA
 3742007 3742008 CLC_0570 CLC_0571     TRUE 0.848 118.000 0.409 NA   NA
 3742008 3742009 CLC_0571 CLC_0572     TRUE 0.690 127.000 0.091 NA   NA
 3742010 3742011 CLC_0573 CLC_0574 trmB   FALSE 0.062 213.000 0.000 NA   NA
 3742013 3742014 CLC_0576 CLC_0577 fabG-1   TRUE 0.809 63.000 0.032 1.000 N NA
 3742016 3742017 CLC_0579 CLC_0580     FALSE 0.079 263.000 0.000 1.000 N NA
 3742017 3742018 CLC_0580 CLC_0581     FALSE 0.027 297.000 0.000 1.000   NA
 3742018 3742019 CLC_0581 CLC_0582     TRUE 0.960 36.000 0.400 1.000   NA
 3742019 3742020 CLC_0582 CLC_0583     FALSE 0.450 205.000 0.000 1.000 Y NA
 3742020 3742021 CLC_0583 CLC_0584   serS-2 FALSE 0.007 482.000 0.000 1.000 N NA
 3742021 3742022 CLC_0584 CLC_0585 serS-2   FALSE 0.005 578.000 0.000 1.000 N NA
 3742023 3742024 CLC_0586 CLC_0587     FALSE 0.016 330.000 0.000 1.000   NA
 3742027 3742028 CLC_0590 CLC_0591     FALSE 0.108 175.000 0.000 NA   NA
 3742033 3742034 CLC_0596 CLC_0597     FALSE 0.150 148.000 0.000 NA   NA
 3742036 3742037 CLC_0599 CLC_0600     FALSE 0.004 418.000 0.000 NA   NA
 3742037 3742038 CLC_0600 CLC_0601     TRUE 0.896 -22.000 0.000 1.000   NA
 3742039 3742040 CLC_0602 CLC_0603     FALSE 0.003 472.000 0.000 NA   NA
 3742040 3742041 CLC_0603 CLC_0604     FALSE 0.097 182.000 0.000 NA   NA
 3742041 3742042 CLC_0604 CLC_0605     FALSE 0.251 66.000 0.000 NA   NA
 3742042 3742043 CLC_0605 CLC_0606     FALSE 0.027 268.000 0.000 NA   NA
 3742043 3742044 CLC_0606 CLC_0607     TRUE 0.974 10.000 0.184 NA   NA
 3742044 3742045 CLC_0607 CLC_0608     FALSE 0.003 461.000 0.000 NA   NA
 3742045 3742046 CLC_0608 CLC_0609     FALSE 0.001 920.000 0.000 NA   NA
 3742048 3742049 CLC_0611 CLC_0612 mscL   FALSE 0.007 366.000 0.000 NA   NA
 3742051 3742052 CLC_0614 CLC_0615     FALSE 0.003 488.000 0.000 NA   NA
 3742052 3742053 CLC_0615 CLC_0616     TRUE 0.989 -7.000 0.165 1.000 N NA
 3742053 3742054 CLC_0616 CLC_0617     TRUE 0.968 0.000 0.035 NA   NA
 3742054 3742055 CLC_0617 CLC_0618   potA FALSE 0.001 817.000 0.000 NA   NA
 3742055 3742056 CLC_0618 CLC_0619 potA potB TRUE 0.998 0.000 0.789 1.000 Y NA
 3742056 3742057 CLC_0619 CLC_0620 potB   TRUE 0.990 3.000 0.022 0.037 Y NA
 3742059 3742060 CLC_0622 CLC_0623     FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 3742060 3742061 CLC_0623 CLC_0624     FALSE 0.005 404.000 0.000 NA   NA
 3742061 3742062 CLC_0624 CLC_0625     FALSE 0.027 268.000 0.000 NA   NA
 3742062 3742063 CLC_0625 CLC_0626     FALSE 0.195 84.000 0.000 NA   NA
 3742063 3742064 CLC_0626 CLC_0627     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3742066 3742067 CLC_0629 CLC_0630   lepB-1 FALSE 0.109 174.000 0.000 NA   NA
 3742069 3742070 CLC_0632 CLC_0633     FALSE 0.002 614.000 0.000 NA   NA
 3742070 3742071 CLC_0633 CLC_0634     TRUE 0.973 40.000 1.000 NA   NA
 3742071 3742072 CLC_0634 CLC_0635     FALSE 0.001 694.000 0.000 NA   NA
 3742072 3742073 CLC_0635 CLC_0636     FALSE 0.002 607.000 0.000 NA   NA
 3742073 3742074 CLC_0636 CLC_0637     TRUE 0.981 -7.000 0.080 1.000   NA
 3742074 3742075 CLC_0637 CLC_0638     TRUE 0.976 37.000 1.000 NA   NA
 3742075 3742076 CLC_0638 CLC_0639     TRUE 0.941 35.000 0.222 NA   NA
 3742076 3742077 CLC_0639 CLC_0640     TRUE 0.786 110.000 0.222 NA   NA
 3742077 3742078 CLC_0640 CLC_0641     TRUE 0.978 23.000 0.400 NA   NA
 3742078 3742079 CLC_0641 CLC_0642     TRUE 0.978 -3.000 0.095 NA   NA
 3742079 3742080 CLC_0642 CLC_0643     TRUE 0.979 15.000 0.238 NA N NA
 3742080 3742081 CLC_0643 CLC_0644     FALSE 0.002 569.000 0.000 NA   NA
 3742081 3742082 CLC_0644 CLC_0645     FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 3742082 3742083 CLC_0645 CLC_0646     FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 3742086 3742087 CLC_0649 CLC_0650     FALSE 0.028 335.000 0.000 1.000 N NA
 3742088 3742089 CLC_0651 CLC_0652 asnS   FALSE 0.041 294.000 0.000 NA N NA
 3742089 3742090 CLC_0652 CLC_0653     TRUE 0.985 16.000 0.571 NA   NA
 3742090 3742091 CLC_0653 CLC_0654     FALSE 0.072 203.000 0.000 NA   NA
 3742091 3742092 CLC_0654 CLC_0655     TRUE 0.992 2.000 0.714 NA   NA
 3742092 3742093 CLC_0655 CLC_0656     FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 3742093 3742094 CLC_0656 CLC_0657     FALSE 0.004 429.000 0.000 NA   NA
 3742094 3742095 CLC_0657 CLC_0658     TRUE 0.987 13.000 0.667 NA   NA
 3742095 3742096 CLC_0658 CLC_0659     FALSE 0.004 463.000 0.000 1.000   NA
 3742096 3742097 CLC_0659 CLC_0660     FALSE 0.235 197.000 0.000 0.011   NA
 3742097 3742098 CLC_0660 CLC_0661     FALSE 0.153 175.000 0.000 1.000   NA
 3742098 3742099 CLC_0661 CLC_0662     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3742099 3742100 CLC_0662 CLC_0663     TRUE 0.740 3.000 0.000 NA   NA
 3742100 3742101 CLC_0663 CLC_0664     FALSE 0.170 206.000 0.000 1.000 N NA
 3742101 3742102 CLC_0664 CLC_0665     TRUE 0.965 21.000 0.085 1.000 N NA
 3742102 3742103 CLC_0665 CLC_0666     TRUE 0.999 -10.000 0.932 1.000 Y NA
 3742104 3742105 CLC_0667 CLC_0668     FALSE 0.156 143.000 0.000 NA   NA
 3742105 3742106 CLC_0668 CLC_0669     TRUE 0.977 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3742109 3742110 CLC_0672 CLC_0673     TRUE 0.787 170.000 0.286 1.000 N NA
 3742112 3742113 CLC_0675 CLC_0676     TRUE 0.720 103.000 0.083 1.000   NA
 3742114 3742115 CLC_0677 CLC_0678 csaA   FALSE 0.368 208.000 0.023 1.000   NA
 3742115 3742116 CLC_0678 CLC_0679     FALSE 0.056 297.000 0.000 0.029   NA
 3742117 3742118 CLC_0680 CLC_0681     FALSE 0.164 128.000 0.000 NA   NA
 3742118 3742119 CLC_0681 CLC_0682     FALSE 0.272 383.000 0.667 0.036 N NA
 3742119 3742120 CLC_0682 CLC_0683     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3742122 3742123 CLC_0685 CLC_0686     FALSE 0.239 108.000 0.000 1.000   NA
 3742123 3742124 CLC_0686 CLC_0687     FALSE 0.292 58.000 0.000 NA   NA
 3742125 3742126 CLC_0688 CLC_0689     TRUE 0.919 23.000 0.015 NA   NA
 3742128 3742129 CLC_0691 CLC_0692     FALSE 0.548 139.000 0.006 1.000   NA
 3742130 3742131 CLC_0693 CLC_0694     FALSE 0.239 118.000 0.000 1.000   NA
 3742131 3742132 CLC_0694 CLC_0695   rhlE FALSE 0.047 259.000 0.000 1.000   NA
 3742132 3742133 CLC_0695 CLC_0696 rhlE   FALSE 0.003 576.000 0.000 1.000   NA
 3742133 3742134 CLC_0696 CLC_0697     TRUE 0.745 172.000 0.286 1.000   NA
 3742134 3742135 CLC_0697 CLC_0698     TRUE 0.974 28.000 0.250 1.000 N NA
 3742137 3742138 CLC_0700 CLC_0701     FALSE 0.228 127.000 0.000 1.000   NA
 3742138 3742139 CLC_0701 CLC_0702     FALSE 0.095 184.000 0.000 NA   NA
 3742139 3742140 CLC_0702 CLC_0703     TRUE 0.986 -10.000 0.154 NA   NA
 3742140 3742141 CLC_0703 CLC_0704     FALSE 0.247 67.000 0.000 NA   NA
 3742141 3742142 CLC_0704 CLC_0705     FALSE 0.163 131.000 0.000 NA   NA
 3742144 3742145 CLC_0707 CLC_0708     TRUE 0.691 205.000 0.409 1.000   NA
 3742145 3742146 CLC_0708 CLC_0709     TRUE 0.963 12.000 0.074 1.000   NA
 3742146 3742147 CLC_0709 CLC_0710     FALSE 0.002 627.000 0.000 1.000   NA
 3742147 3742148 CLC_0710 CLC_0711     TRUE 0.771 159.000 0.190 1.000 N NA
 3742148 3742149 CLC_0711 CLC_0712     TRUE 0.853 60.000 0.071 1.000 N NA
 3742149 3742150 CLC_0712 CLC_0713     TRUE 0.947 26.000 0.089 NA   NA
 3742154 3742155 CLC_0717 CLC_0718     TRUE 0.967 7.000 0.100 NA   NA
 3742156 3742157 CLC_0719 CLC_0720     TRUE 0.860 -49.000 0.000 NA   NA
 3742158 3742159 CLC_0721 CLC_0722     FALSE 0.014 342.000 0.000 1.000   NA
 3742159 3742160 CLC_0722 CLC_0723     TRUE 0.989 -37.000 0.118 1.000   NA
 3742160 3742161 CLC_0723 CLC_0724     TRUE 0.983 31.000 1.000 NA   NA
 3742161 3742162 CLC_0724 CLC_0725     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3742162 3742163 CLC_0725 CLC_0726     FALSE 0.001 720.000 0.000 NA   NA
 3742164 3742165 CLC_0727 CLC_0728     TRUE 0.992 -3.000 0.571 NA   NA
 3742166 3742167 CLC_0729 CLC_0730   greA-1 TRUE 0.632 136.000 0.008 1.000 N NA
 3742167 3742168 CLC_0730 CLC_0731 greA-1   FALSE 0.538 161.000 0.031 NA   NA
 3742168 3742169 CLC_0731 CLC_0732     FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 3742169 3742170 CLC_0732 CLC_0733     TRUE 0.894 95.000 0.041 0.060 Y NA
 3742170 3742171 CLC_0733 CLC_0734     FALSE 0.188 88.000 0.000 NA   NA
 3742171 3742172 CLC_0734 CLC_0735     FALSE 0.056 219.000 0.000 NA   NA
 3742172 3742173 CLC_0735 CLC_0736     FALSE 0.155 144.000 0.000 NA   NA
 3742173 3742174 CLC_0736 CLC_0737     TRUE 0.648 58.000 0.000 0.060 N NA
 3742176 3742177 CLC_0739 CLC_0740     FALSE 0.008 470.000 0.000 1.000 N NA
 3742177 3742178 CLC_0740 CLC_0741   fhuB TRUE 0.949 96.000 0.500 1.000 Y NA
 3742178 3742179 CLC_0741 CLC_0742 fhuB fhuG TRUE 0.998 0.000 0.750 0.036 Y NA
 3742179 3742180 CLC_0742 CLC_0743 fhuG fhuC TRUE 0.666 228.000 0.100 1.000 Y NA
 3742180 3742181 CLC_0743 CLC_0744 fhuC nifH TRUE 0.983 30.000 0.150 1.000 Y NA
 3742181 3742182 CLC_0744 CLC_0745 nifH   TRUE 0.994 3.000 0.571 0.055 N NA
 3742182 3742183 CLC_0745 CLC_0746     TRUE 0.992 40.000 1.000 0.039 Y NA
 3742183 3742184 CLC_0746 CLC_0747     FALSE 0.032 323.000 0.000 1.000 N NA
 3742184 3742185 CLC_0747 CLC_0748     FALSE 0.174 97.000 0.000 NA   NA
 3742187 3742188 CLC_0750 CLC_0751 gcvT gcvH TRUE 0.774 125.000 0.000 0.001 Y NA
 3742188 3742189 CLC_0751 CLC_0752 gcvH gcvPA TRUE 0.984 3.000 0.005 1.000 Y NA
 3742189 3742190 CLC_0752 CLC_0753 gcvPA gcvPB TRUE 0.997 0.000 0.316 0.001 Y NA
 3742190 3742191 CLC_0753 CLC_0754 gcvPB   FALSE 0.457 194.000 0.010 1.000 N NA
 3742191 3742192 CLC_0754 CLC_0755     TRUE 0.971 18.000 0.118 1.000 N NA
 3742192 3742193 CLC_0755 CLC_0756     FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 3742193 3742194 CLC_0756 CLC_0757     FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 3742194 3742195 CLC_0757 CLC_0758     TRUE 0.837 94.000 0.375 NA   NA
 3742195 3742196 CLC_0758 CLC_0759     FALSE 0.074 202.000 0.000 NA   NA
 3742196 3742197 CLC_0759 CLC_0760     FALSE 0.001 710.000 0.000 NA   NA
 3742197 3742198 CLC_0760 CLC_0761     FALSE 0.330 54.000 0.000 NA   NA
 3742198 3742199 CLC_0761 CLC_0762     FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 3742199 3742200 CLC_0762 CLC_0763     TRUE 0.935 52.000 0.273 1.000 N NA
 3742200 3742201 CLC_0763 CLC_0764     TRUE 0.985 -13.000 0.094 1.000   NA
 3742201 3742202 CLC_0764 CLC_0765     FALSE 0.096 208.000 0.000 1.000   NA
 3742202 3742203 CLC_0765 CLC_0766     FALSE 0.121 194.000 0.000 1.000   NA
 3742204 3742205 CLC_0767 CLC_0768     TRUE 0.825 83.000 0.250 NA   NA
 3742205 3742206 CLC_0768 CLC_0769     FALSE 0.003 492.000 0.000 NA   NA
 3742207 3742208 CLC_0770 CLC_0771     FALSE 0.002 590.000 0.000 NA   NA
 3742208 3742209 CLC_0771 CLC_0772     TRUE 0.618 26.000 0.000 NA   NA
 3742211 3742212 CLC_0774 CLC_0775     FALSE 0.002 493.000 0.000 NA   NA
 3742214 3742215 CLC_0777 CLC_0778     FALSE 0.174 114.000 0.000 NA   NA
 3742215 3742216 CLC_0778 CLC_0779     FALSE 0.330 54.000 0.000 NA   NA
 3742217 3742218 CLC_0780 CLC_0781   luxS TRUE 0.980 -16.000 0.010 1.000 N NA
 3742218 3742219 CLC_0781 CLC_0782 luxS metC TRUE 0.982 2.000 0.048 0.044 N NA
 3742219 3742220 CLC_0782 CLC_0783 metC   TRUE 0.688 101.000 0.021 1.000 N NA
 3742220 3742221 CLC_0783 CLC_0784     FALSE 0.002 559.000 0.000 NA   NA
 3742222 3742223 CLC_0785 CLC_0786     FALSE 0.019 366.000 0.000 1.000 N NA
 3742224 3742225 CLC_0787 CLC_0788     TRUE 0.697 88.000 0.061 NA   NA
 3742225 3742226 CLC_0788 CLC_0789     FALSE 0.002 534.000 0.000 NA   NA
 3742226 3742227 CLC_0789 CLC_0790     FALSE 0.245 93.000 0.000 1.000   NA
 3742228 3742229 CLC_0791 CLC_0792     FALSE 0.173 102.000 0.000 NA   NA
 3742229 3742230 CLC_0792 CLC_0793     TRUE 0.639 19.000 0.000 NA   NA
 3742230 3742231 CLC_0793 CLC_0794     FALSE 0.191 86.000 0.000 NA   NA
 3742231 3742232 CLC_0794 CLC_0795     FALSE 0.158 141.000 0.000 NA   NA
 3742232 3742233 CLC_0795 CLC_0796     FALSE 0.038 244.000 0.000 NA   NA
 3742233 3742234 CLC_0796 CLC_0797     FALSE 0.041 238.000 0.000 NA   NA
 3742234 3742235 CLC_0797 CLC_0798     TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 3742235 3742236 CLC_0798 CLC_0799     FALSE 0.148 149.000 0.000 NA   NA
 3742238 3742239 CLC_0801 CLC_0802     FALSE 0.534 31.000 0.000 NA   NA
 3742239 3742240 CLC_0802 CLC_0803     FALSE 0.182 91.000 0.000 NA   NA
 3742246 3742247 CLC_0810 CLC_0811 arsR arsD TRUE 0.724 22.000 0.000 1.000   NA
 3742247 3742248 CLC_0811 CLC_0812 arsD arsA TRUE 0.962 19.000 0.116 1.000   NA
 3742248 3742249 CLC_0812 CLC_0813 arsA arsB TRUE 0.889 99.000 0.093 1.000 Y NA
 3742249 3742250 CLC_0813 CLC_0814 arsB   FALSE 0.062 277.000 0.000 1.000 N NA
 3742250 3742251 CLC_0814 CLC_0815     FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 3742251 3742252 CLC_0815 CLC_0816     FALSE 0.002 508.000 0.000 NA   NA
 3742252 3742253 CLC_0816 CLC_0817     TRUE 0.992 10.000 1.000 NA   NA
 3742253 3742254 CLC_0817 CLC_0818     FALSE 0.568 29.000 0.000 NA   NA
 3742254 3742255 CLC_0818 CLC_0819     FALSE 0.034 255.000 0.000 NA   NA
 3742255 3742256 CLC_0819 CLC_0820     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3742256 3742257 CLC_0820 CLC_0821     FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 3742257 3742258 CLC_0821 CLC_0822     TRUE 0.991 -7.000 0.400 NA   NA
 3742258 3742259 CLC_0822 CLC_0823     FALSE 0.001 691.000 0.000 NA   NA
 3742259 3742260 CLC_0823 CLC_0824   thyA TRUE 0.970 -10.000 0.017 NA   NA
 3742260 3742261 CLC_0824 CLC_0825 thyA   TRUE 0.957 12.000 0.017 1.000 N NA
 3742261 3742262 CLC_0825 CLC_0826     TRUE 0.887 46.000 0.047 1.000 N NA
 3742262 3742263 CLC_0826 CLC_0827   thiD-2 TRUE 0.777 78.000 0.043 1.000 N NA
 3742263 3742264 CLC_0827 CLC_0828 thiD-2   FALSE 0.534 172.000 0.043 NA   NA
 3742266 3742267 CLC_0830 CLC_0831     TRUE 0.992 3.000 0.833 NA   NA
 3742267 3742268 CLC_0831 CLC_0832     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3742268 3742269 CLC_0832 CLC_0833     FALSE 0.078 421.000 0.167 1.000 N NA
 3742269 3742270 CLC_0833 CLC_0834     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 3742270 3742271 CLC_0834 CLC_0835     FALSE 0.352 251.000 0.167 NA   NA
 3742271 3742272 CLC_0835 CLC_0836     TRUE 0.910 45.000 0.167 1.000   NA
 3742272 3742273 CLC_0836 CLC_0837     FALSE 0.001 955.000 0.000 NA   NA
 3742273 3742274 CLC_0837 CLC_0838     FALSE 0.023 280.000 0.000 NA   NA
 3742274 3742275 CLC_0838 CLC_0839     FALSE 0.554 184.000 0.100 NA   NA
 3742275 3742276 CLC_0839 CLC_0840     TRUE 0.998 -13.000 0.750 NA Y NA
 3742276 3742277 CLC_0840 CLC_0841     FALSE 0.063 211.000 0.000 NA   NA
 3742277 3742278 CLC_0841 CLC_0842     FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 3742278 3742279 CLC_0842 CLC_0843     TRUE 0.943 154.000 0.636 1.000 Y NA
 3742279 3742280 CLC_0843 CLC_0844     FALSE 0.126 190.000 0.000 1.000   NA
 3742282 3742283 CLC_0846 CLC_0847   dapB-1 FALSE 0.002 666.000 0.000 NA   NA
 3742283 3742284 CLC_0847 CLC_0848 dapB-1   TRUE 0.790 22.000 0.000 NA N NA
 3742285 3742286 CLC_0849 CLC_0850     FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 3742286 3742287 CLC_0850 CLC_0851     FALSE 0.371 46.000 0.000 NA   NA
 3742288 3742289 CLC_0852 CLC_0853     TRUE 0.639 19.000 0.000 NA   NA
 3742289 3742290 CLC_0853 CLC_0854     FALSE 0.019 294.000 0.000 NA   NA
 3742290 3742291 CLC_0854 CLC_0855     FALSE 0.214 77.000 0.000 NA   NA
 3742292 3742293 CLC_0856 CLC_0857   ha70 FALSE 0.242 95.000 0.000 1.000   NA
 3742293 3742294 CLC_0857 CLC_0858 ha70 ha17 TRUE 0.982 14.000 0.429 NA   NA
 3742294 3742295 CLC_0858 CLC_0859 ha17 ha33 TRUE 0.880 63.000 0.286 NA   NA
 3742296 3742297 CLC_0860 CLC_0861 botR ntnH TRUE 0.856 162.000 0.667 1.000   NA
 3742297 3742298 CLC_0861 CLC_0862 ntnH boNT/A1 TRUE 0.721 44.000 0.000 0.001   NA
 3742300 3742301 CLC_0864 CLC_0865     FALSE 0.163 132.000 0.000 NA   NA
 3742301 3742302 CLC_0865 CLC_0866     FALSE 0.093 185.000 0.000 NA   NA
 3742302 3742303 CLC_0866 CLC_0867     FALSE 0.010 336.000 0.000 NA   NA
 3742303 3742304 CLC_0867 CLC_0868   brnQ-1 FALSE 0.005 566.000 0.000 1.000 N NA
 3742304 3742305 CLC_0868 CLC_0869 brnQ-1 brnQ-2 TRUE 0.972 151.000 1.000 0.001 Y NA
 3742307 3742308 CLC_0871 CLC_0873 feoA-1 feoB-1 FALSE 0.154 145.000 0.000 NA   NA
 3742308 3742309 CLC_0873 CLC_0874 feoB-1 cobC FALSE 0.001 715.000 0.000 NA   NA
 3742309 3742310 CLC_0874 CLC_0875 cobC   FALSE 0.332 145.000 0.000 1.000 N NA
 3742310 3742311 CLC_0875 CLC_0876   cobS FALSE 0.069 271.000 0.000 1.000 N NA
 3742311 3742312 CLC_0876 CLC_0877 cobS   FALSE 0.003 458.000 0.000 NA   NA
 3742312 3742313 CLC_0877 CLC_0878     FALSE 0.014 309.000 0.000 NA   NA
 3742313 3742314 CLC_0878 CLC_0879     TRUE 0.649 131.000 0.053 NA   NA
 3742314 3742315 CLC_0879 CLC_0880     TRUE 0.988 18.000 0.828 NA   NA
 3742315 3742316 CLC_0880 CLC_0881     FALSE 0.002 569.000 0.000 NA   NA
 3742316 3742317 CLC_0881 CLC_0882     FALSE 0.026 271.000 0.000 NA   NA
 3742317 3742318 CLC_0882 CLC_0883   folP TRUE 0.821 95.000 0.003 1.000 Y NA
 3742318 3742319 CLC_0883 CLC_0884 folP   FALSE 0.497 132.000 0.003 NA   NA
 3742319 3742320 CLC_0884 CLC_0885   folK FALSE 0.511 100.000 0.003 NA   NA
 3742320 3742321 CLC_0885 CLC_0886 folK   FALSE 0.309 119.000 0.000 NA N NA
 3742321 3742322 CLC_0886 CLC_0887     FALSE 0.026 320.000 0.000 NA N NA
 3742322 3742323 CLC_0887 CLC_0888     TRUE 0.857 55.000 0.039 1.000 N NA
 3742323 3742324 CLC_0888 CLC_0889     TRUE 0.858 142.000 0.012 0.019 Y NA
 3742324 3742325 CLC_0889 CLC_0890     FALSE 0.005 597.000 0.000 1.000 N NA
 3742325 3742326 CLC_0890 CLC_0891     FALSE 0.052 294.000 0.000 1.000 N NA
 3742326 3742327 CLC_0891 CLC_0892     TRUE 0.988 5.000 0.500 NA   NA
 3742329 3742330 CLC_0894 CLC_0895   cadD FALSE 0.017 300.000 0.000 NA   NA
 3742330 3742331 CLC_0895 CLC_0896 cadD   FALSE 0.148 149.000 0.000 NA   NA
 3742332 3742333 CLC_0897 CLC_0898     TRUE 0.967 19.000 0.200 NA   NA
 3742333 3742334 CLC_0898 CLC_0899     TRUE 0.985 -3.000 0.100 1.000 N NA
 3742335 3742336 CLC_0900 CLC_0901     FALSE 0.002 657.000 0.000 NA   NA
 3742336 3742337 CLC_0901 CLC_0902     FALSE 0.153 175.000 0.000 1.000   NA
 3742337 3742338 CLC_0902 CLC_0903     FALSE 0.013 347.000 0.000 1.000   NA
 3742338 3742339 CLC_0903 CLC_0904     FALSE 0.003 523.000 0.000 1.000   NA
 3742339 3742340 CLC_0904 CLC_0905     FALSE 0.292 58.000 0.000 NA   NA
 3742341 3742342 CLC_0906 CLC_0907     TRUE 0.871 18.000 0.000 0.005   NA
 3742342 3742343 CLC_0907 CLC_0908     FALSE 0.238 105.000 0.000 1.000   NA
 3742343 3742344 CLC_0908 CLC_0909     FALSE 0.115 344.000 0.000 0.061 Y NA
 3742345 3742346 CLC_0910 CLC_0911     FALSE 0.069 206.000 0.000 NA   NA
 3742346 3742347 CLC_0911 CLC_0912     FALSE 0.262 63.000 0.000 NA   NA
 3742348 3742349 CLC_0913 CLC_0914     FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 3742350 3742351 CLC_0915 CLC_0916     FALSE 0.011 364.000 0.000 1.000   NA
 3742352 3742353 CLC_0917 CLC_0918 oxdD   FALSE 0.120 166.000 0.000 NA   NA
 3742353 3742354 CLC_0918 CLC_0919     TRUE 0.712 58.000 0.010 NA   NA
 3742355 3742356 CLC_0920 CLC_0921     FALSE 0.038 273.000 0.000 1.000   NA
 3742357 3742358 CLC_0922 CLC_0923     FALSE 0.086 193.000 0.000 NA   NA
 3742362 3742363 CLC_0927 CLC_0928     TRUE 0.989 0.000 0.400 NA   NA
 3742363 3742364 CLC_0928 CLC_0929     FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 3742366 3742367 CLC_0931 CLC_0932     FALSE 0.038 243.000 0.000 NA   NA
 3742368 3742369 CLC_0933 CLC_0934     FALSE 0.229 125.000 0.000 1.000   NA
 3742369 3742370 CLC_0934 CLC_0935     FALSE 0.106 329.000 0.000 1.000 Y NA
 3742370 3742371 CLC_0935 CLC_0936     FALSE 0.164 128.000 0.000 NA   NA
 3742373 3742374 CLC_0938 CLC_0939     FALSE 0.006 424.000 0.000 1.000   NA
 3742374 3742375 CLC_0939 CLC_0940     FALSE 0.038 244.000 0.000 NA   NA
 3742375 3742376 CLC_0940 CLC_0941     FALSE 0.008 353.000 0.000 NA   NA
 3742382 3742383 CLC_0947 CLC_0948     FALSE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 3742383 3742384 CLC_0948 CLC_0949     FALSE 0.008 356.000 0.000 NA   NA
 3742385 3742386 CLC_0950 CLC_0951     FALSE 0.109 174.000 0.000 NA   NA
 3742386 3742387 CLC_0951 CLC_0952     FALSE 0.030 264.000 0.000 NA   NA
 3742387 3742388 CLC_0952 CLC_0953     FALSE 0.173 106.000 0.000 NA   NA
 3742389 3742390 CLC_0954 CLC_0955     FALSE 0.002 539.000 0.000 NA   NA
 3742391 3742392 CLC_0956 CLC_0957     FALSE 0.095 184.000 0.000 NA   NA
 3742393 3742394 CLC_0958 CLC_0959     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3742394 3742395 CLC_0959 CLC_0960     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 3742395 3742396 CLC_0960 CLC_0961     FALSE 0.005 405.000 0.000 NA   NA
 3742396 3742397 CLC_0961 CLC_0962     FALSE 0.014 342.000 0.000 1.000   NA
 3742397 3742398 CLC_0962 CLC_0963     TRUE 0.815 79.000 0.100 1.000 N NA
 3742398 3742399 CLC_0963 CLC_0964   cobU FALSE 0.061 278.000 0.000 1.000 N NA
 3742400 3742401 CLC_0965 CLC_0966 tipA   FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 3742402 3742403 CLC_0967 CLC_0968   cobQ TRUE 0.658 61.000 0.003 NA   NA
 3742403 3742404 CLC_0968 CLC_0969 cobQ cobD TRUE 0.994 2.000 0.092 0.012 Y NA
 3742404 3742405 CLC_0969 CLC_0970 cobD   FALSE 0.400 219.000 0.026 1.000 N NA
 3742405 3742406 CLC_0970 CLC_0971   cbiM FALSE 0.198 274.000 0.013 1.000 N NA
 3742406 3742407 CLC_0971 CLC_0972 cbiM cbiN TRUE 0.998 4.000 0.861 0.012 Y NA
 3742407 3742408 CLC_0972 CLC_0973 cbiN cbiQ TRUE 0.974 116.000 0.804 0.002 Y NA
 3742408 3742409 CLC_0973 CLC_0974 cbiQ   FALSE 0.008 424.000 0.000 NA N NA
 3742409 3742410 CLC_0974 CLC_0975   hemC TRUE 0.992 -31.000 0.009 NA Y NA
 3742410 3742411 CLC_0975 CLC_0976 hemC cobA/hemD TRUE 0.849 136.000 0.031 1.000 Y NA
 3742411 3742412 CLC_0976 CLC_0977 cobA/hemD   FALSE 0.154 145.000 0.000 NA   NA
 3742412 3742413 CLC_0977 CLC_0978   hemB FALSE 0.031 262.000 0.000 NA   NA
 3742413 3742414 CLC_0978 CLC_0979 hemB cobB TRUE 0.819 121.000 0.005 1.000 Y NA
 3742414 3742415 CLC_0979 CLC_0980 cobB cobH TRUE 0.989 25.000 0.097 0.012 Y NA
 3742415 3742416 CLC_0980 CLC_0981 cobH   FALSE 0.084 194.000 0.000 NA   NA
 3742416 3742417 CLC_0981 CLC_0982     FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 3742417 3742418 CLC_0982 CLC_0983     FALSE 0.023 306.000 0.000 1.000   NA
 3742418 3742419 CLC_0983 CLC_0984     FALSE 0.311 56.000 0.000 NA   NA
 3742419 3742420 CLC_0984 CLC_0985     FALSE 0.169 122.000 0.000 NA   NA
 3742420 3742421 CLC_0985 CLC_0986     FALSE 0.290 77.000 0.000 1.000   NA
 3742421 3742422 CLC_0986 CLC_0987     FALSE 0.051 251.000 0.000 1.000   NA
 3742422 3742423 CLC_0987 CLC_0988     TRUE 0.918 30.000 0.032 1.000   NA
 3742423 3742424 CLC_0988 CLC_0989     TRUE 0.726 67.000 0.032 NA   NA
 3742424 3742425 CLC_0989 CLC_0990     TRUE 0.801 108.000 0.250 NA   NA
 3742425 3742426 CLC_0990 CLC_0991   cbiD FALSE 0.226 74.000 0.000 NA   NA
 3742426 3742427 CLC_0991 CLC_0992 cbiD cbiE TRUE 0.871 177.000 0.126 0.012 Y NA
 3742427 3742428 CLC_0992 CLC_0993 cbiE   FALSE 0.049 227.000 0.000 NA   NA
 3742428 3742429 CLC_0993 CLC_0994   cbiT FALSE 0.086 193.000 0.000 NA   NA
 3742429 3742430 CLC_0994 CLC_0995 cbiT   TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3742430 3742431 CLC_0995 CLC_0996     FALSE 0.459 36.000 0.000 NA   NA
 3742433 3742434 CLC_0998 CLC_0999     TRUE 0.942 43.000 0.400 NA   NA
 3742434 3742435 CLC_0999 CLC_1000     FALSE 0.280 60.000 0.000 NA   NA
 3742435 3742436 CLC_1000 CLC_1001     FALSE 0.236 120.000 0.000 1.000   NA
 3742436 3742437 CLC_1001 CLC_1002   cobI FALSE 0.050 295.000 0.000 1.000 N NA
 3742437 3742438 CLC_1002 CLC_1003 cobI cobM TRUE 0.993 19.000 0.291 0.012 Y NA
 3742438 3742439 CLC_1003 CLC_1004 cobM cbiG TRUE 0.666 291.000 0.397 0.012 Y NA
 3742439 3742440 CLC_1004 CLC_1005 cbiG cobJ TRUE 0.934 158.000 0.352 0.012 Y NA
 3742440 3742441 CLC_1005 CLC_1006 cobJ cobK TRUE 0.953 134.000 0.423 0.012 Y NA
 3742441 3742442 CLC_1006 CLC_1007 cobK   FALSE 0.590 80.000 0.006 NA   NA
 3742442 3742443 CLC_1007 CLC_1008   cbiK FALSE 0.534 176.000 0.056 NA   NA
 3742443 3742444 CLC_1008 CLC_1009 cbiK   TRUE 0.964 13.000 0.040 1.000 N NA
 3742444 3742445 CLC_1009 CLC_1010   cobO FALSE 0.326 148.000 0.000 1.000 N NA
 3742445 3742446 CLC_1010 CLC_1011 cobO   FALSE 0.088 253.000 0.000 1.000 N NA
 3742446 3742447 CLC_1011 CLC_1012     TRUE 0.818 90.000 0.152 1.000 N NA
 3742447 3742448 CLC_1012 CLC_1013   asrA TRUE 0.968 20.000 0.174 1.000   NA
 3742448 3742449 CLC_1013 CLC_1014 asrA asrB TRUE 0.997 -13.000 0.750 0.038   NA
 3742449 3742450 CLC_1014 CLC_1015 asrB arsC TRUE 0.997 13.000 0.720 0.038 Y NA
 3742450 3742451 CLC_1015 CLC_1016 arsC   FALSE 0.022 354.000 0.000 1.000 N NA
 3742451 3742452 CLC_1016 CLC_1017     FALSE 0.037 312.000 0.000 1.000 N NA
 3742452 3742453 CLC_1017 CLC_1018     TRUE 0.987 20.000 0.556 1.000 N NA
 3742453 3742454 CLC_1018 CLC_1019     TRUE 0.987 15.000 0.444 1.000 N NA
 3742454 3742455 CLC_1019 CLC_1020     TRUE 0.982 -16.000 0.067 NA   NA
 3742455 3742456 CLC_1020 CLC_1021     FALSE 0.001 831.000 0.000 NA   NA
 3742456 3742457 CLC_1021 CLC_1022     TRUE 0.988 21.000 0.833 NA   NA
 3742457 3742458 CLC_1022 CLC_1023     TRUE 0.992 4.000 0.833 NA   NA
 3742458 3742459 CLC_1023 CLC_1024     FALSE 0.022 645.000 0.154 NA   NA
 3742459 3742460 CLC_1024 CLC_1025     TRUE 0.998 -10.000 0.765 1.000 Y NA
 3742461 3742462 CLC_1026 CLC_1027     TRUE 0.997 1.000 0.625 1.000 Y NA
 3742462 3742463 CLC_1027 CLC_1028     TRUE 0.993 13.000 0.375 1.000 Y NA
 3742463 3742464 CLC_1028 CLC_1029   dhaKL FALSE 0.005 558.000 0.000 1.000 N NA
 3742464 3742465 CLC_1029 CLC_1030 dhaKL dhaD TRUE 0.969 11.000 0.053 1.000 N NA
 3742465 3742466 CLC_1030 CLC_1031 dhaD   FALSE 0.270 312.000 0.250 1.000 N NA
 3742467 3742468 CLC_1032 CLC_1033     FALSE 0.476 35.000 0.000 NA   NA
 3742468 3742469 CLC_1033 CLC_1034     TRUE 0.842 27.000 0.000 0.011   NA
 3742469 3742470 CLC_1034 CLC_1035     FALSE 0.140 153.000 0.000 NA   NA
 3742470 3742471 CLC_1035 CLC_1036     FALSE 0.262 63.000 0.000 NA   NA
 3742471 3742472 CLC_1036 CLC_1037     FALSE 0.173 118.000 0.000 NA   NA
 3742472 3742473 CLC_1037 CLC_1038     TRUE 0.774 101.000 0.200 NA   NA
 3742473 3742474 CLC_1038 CLC_1039     TRUE 0.854 46.000 0.061 NA   NA
 3742474 3742475 CLC_1039 CLC_1040     FALSE 0.064 210.000 0.000 NA   NA
 3742475 3742476 CLC_1040 CLC_1041     TRUE 0.982 17.000 0.486 NA   NA
 3742476 3742477 CLC_1041 CLC_1042     FALSE 0.161 135.000 0.000 NA   NA
 3742479 3742480 CLC_1044 CLC_1045     TRUE 0.987 26.000 0.833 NA   NA
 3742482 3742483 CLC_1047 CLC_1048   recQ FALSE 0.038 244.000 0.000 NA   NA
 3742483 3742484 CLC_1048 CLC_1049 recQ   FALSE 0.259 172.000 0.000 1.000 N NA
 3742486 3742487 CLC_1051 CLC_1052     FALSE 0.240 115.000 0.000 1.000   NA
 3742487 3742488 CLC_1052 CLC_1053     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 3742488 3742489 CLC_1053 CLC_1054     TRUE 0.988 2.000 0.444 NA   NA
 3742489 3742490 CLC_1054 CLC_1055     TRUE 0.981 0.000 0.167 NA   NA
 3742490 3742491 CLC_1055 CLC_1056     TRUE 0.987 14.000 0.077 1.000 Y NA
 3742491 3742492 CLC_1056 CLC_1057     TRUE 0.965 15.000 0.135 NA   NA
 3742492 3742493 CLC_1057 CLC_1058   lctP FALSE 0.003 484.000 0.000 NA   NA
 3742493 3742494 CLC_1058 CLC_1059 lctP   TRUE 0.939 29.000 0.098 NA   NA
 3742494 3742495 CLC_1059 CLC_1060     TRUE 0.882 43.000 0.098 NA   NA
 3742495 3742496 CLC_1060 CLC_1061     TRUE 0.995 32.000 0.875 0.022 Y NA
 3742496 3742497 CLC_1061 CLC_1062     TRUE 0.985 61.000 0.875 0.009 Y NA
 3742497 3742498 CLC_1062 CLC_1063     FALSE 0.027 269.000 0.000 NA   NA
 3742498 3742499 CLC_1063 CLC_1064     FALSE 0.164 128.000 0.000 NA   NA
 3742499 3742500 CLC_1064 CLC_1065     FALSE 0.082 196.000 0.000 NA   NA
 3742500 3742501 CLC_1065 CLC_1066     TRUE 0.966 2.000 0.051 NA   NA
 3742502 3742503 CLC_1067 CLC_1068     FALSE 0.001 929.000 0.000 NA   NA
 3742504 3742505 CLC_1069 CLC_1070     FALSE 0.191 303.000 0.000 0.059 Y NA
 3742505 3742506 CLC_1070 CLC_1071     FALSE 0.059 215.000 0.000 NA   NA
 3742508 3742509 CLC_1073 CLC_1074     FALSE 0.183 160.000 0.000 1.000   NA
 3742509 3742510 CLC_1074 CLC_1075     TRUE 0.842 16.000 0.000 1.000 N NA
 3742514 3742515 CLC_1079 CLC_1080     FALSE 0.162 134.000 0.000 NA   NA
 3742515 3742516 CLC_1080 CLC_1081     FALSE 0.002 554.000 0.000 NA   NA
 3742516 3742517 CLC_1081 CLC_1082   feoB-2 FALSE 0.517 32.000 0.000 NA   NA
 3742517 3742518 CLC_1082 CLC_1083 feoB-2   TRUE 0.940 21.000 0.029 1.000   NA
 3742520 3742521 CLC_1085 CLC_1086     FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3742521 3742522 CLC_1086 CLC_1087   tlp FALSE 0.017 299.000 0.000 NA   NA
 3742522 3742523 CLC_1087 CLC_1088 tlp   FALSE 0.057 218.000 0.000 NA   NA
 3742523 3742524 CLC_1088 CLC_1089     TRUE 0.996 1.000 0.462 1.000 Y NA
 3742524 3742525 CLC_1089 CLC_1090     FALSE 0.006 535.000 0.000 1.000 N NA
 3742527 3742528 CLC_1092 CLC_1093     FALSE 0.027 270.000 0.000 NA   NA
 3742528 3742529 CLC_1093 CLC_1094     TRUE 0.998 0.000 0.833 1.000 Y NA
 3742530 3742531 CLC_1095 CLC_1096     FALSE 0.085 236.000 0.000 NA N NA
 3742532 3742533 CLC_1097 CLC_1098     TRUE 0.999 -10.000 0.870 0.034 Y NA
 3742533 3742534 CLC_1098 CLC_1099     TRUE 0.998 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 3742534 3742535 CLC_1099 CLC_1100     TRUE 0.937 74.000 0.196 1.000 Y NA
 3742535 3742536 CLC_1100 CLC_1101     FALSE 0.179 202.000 0.000 1.000 N NA
 3742536 3742537 CLC_1101 CLC_1102     FALSE 0.006 515.000 0.000 1.000 N NA
 3742537 3742538 CLC_1102 CLC_1103     TRUE 0.997 2.000 0.389 0.007 Y NA
 3742539 3742540 CLC_1104 CLC_1105     TRUE 0.997 3.000 1.000 NA Y NA
 3742540 3742541 CLC_1105 CLC_1106     FALSE 0.188 88.000 0.000 NA   NA
 3742541 3742542 CLC_1106 CLC_1107     FALSE 0.040 239.000 0.000 NA   NA
 3742543 3742544 CLC_1108 CLC_1109     FALSE 0.263 188.000 0.000 0.006   NA
 3742544 3742545 CLC_1109 CLC_1110     FALSE 0.098 181.000 0.000 NA   NA
 3742545 3742546 CLC_1110 CLC_1111     TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA   NA
 3742546 3742547 CLC_1111 CLC_1112     FALSE 0.080 324.000 0.023 NA   NA
 3742547 3742548 CLC_1112 CLC_1113     FALSE 0.499 165.000 0.023 NA   NA
 3742549 3742550 CLC_1114 CLC_1115     FALSE 0.578 116.000 0.015 NA   NA
 3742550 3742551 CLC_1115 CLC_1116     FALSE 0.008 384.000 0.000 1.000   NA
 3742552 3742553 CLC_1117 CLC_1118     FALSE 0.010 375.000 0.000 1.000   NA
 3742553 3742554 CLC_1118 CLC_1119     FALSE 0.083 218.000 0.000 1.000   NA
 3742554 3742555 CLC_1119 CLC_1120     FALSE 0.096 208.000 0.000 1.000   NA
 3742555 3742556 CLC_1120 CLC_1121     TRUE 0.888 57.000 0.107 0.037   NA
 3742556 3742557 CLC_1121 CLC_1122     TRUE 0.989 3.000 0.300 0.037   NA
 3742557 3742558 CLC_1122 CLC_1123   glpT TRUE 0.648 89.000 0.021 1.000   NA
 3742558 3742559 CLC_1123 CLC_1124 glpT argS FALSE 0.005 582.000 0.000 1.000 N NA
 3742559 3742560 CLC_1124 CLC_1125 argS   FALSE 0.009 342.000 0.000 NA   NA
 3742560 3742561 CLC_1125 CLC_1126     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3742561 3742562 CLC_1126 CLC_1127     FALSE 0.221 139.000 0.000 1.000   NA
 3742563 3742564 CLC_1128 CLC_1129   feoB-3 TRUE 0.931 26.000 0.034 NA   NA
 3742564 3742565 CLC_1129 CLC_1130 feoB-3 feoA-2 TRUE 0.992 15.000 0.308 1.000 Y NA
 3742566 3742567 CLC_1131 CLC_1132     FALSE 0.062 213.000 0.000 NA   NA
 3742567 3742568 CLC_1132 CLC_1133     FALSE 0.033 257.000 0.000 NA   NA
 3742568 3742569 CLC_1133 CLC_1134     FALSE 0.268 62.000 0.000 NA   NA
 3742569 3742570 CLC_1134 CLC_1135     FALSE 0.006 412.000 0.000 1.000   NA
 3742570 3742571 CLC_1135 CLC_1136     FALSE 0.018 325.000 0.000 1.000   NA
 3742571 3742572 CLC_1136 CLC_1137     TRUE 0.996 2.000 0.511 1.000 Y NA
 3742572 3742573 CLC_1137 CLC_1138     TRUE 0.952 55.000 0.154 NA Y NA
 3742573 3742574 CLC_1138 CLC_1139     TRUE 0.840 189.000 0.250 NA Y NA
 3742574 3742575 CLC_1139 CLC_1140     FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 3742575 3742576 CLC_1140 CLC_1141     FALSE 0.029 265.000 0.000 NA   NA
 3742576 3742577 CLC_1141 CLC_1142     FALSE 0.087 191.000 0.000 NA   NA
 3742577 3742578 CLC_1142 CLC_1143     FALSE 0.004 506.000 0.000 1.000   NA
 3742578 3742579 CLC_1143 CLC_1144     FALSE 0.037 245.000 0.000 NA   NA
 3742579 3742580 CLC_1144 CLC_1145     FALSE 0.065 209.000 0.000 NA   NA
 3742584 3742585 CLC_1149 CLC_1150     FALSE 0.512 143.000 0.008 NA   NA
 3742585 3742586 CLC_1150 CLC_1151     TRUE 0.748 56.000 0.008 1.000   NA
 3742587 3742588 CLC_1152 CLC_1153     FALSE 0.028 596.000 0.000 0.003 Y NA
 3742589 3742590 CLC_1154 CLC_1155     TRUE 0.982 18.000 0.333 1.000 N NA
 3742590 3742591 CLC_1155 CLC_1156     FALSE 0.006 419.000 0.000 1.000   NA
 3742591 3742592 CLC_1156 CLC_1157     FALSE 0.173 99.000 0.000 NA   NA
 3742592 3742593 CLC_1157 CLC_1158     FALSE 0.001 807.000 0.000 NA   NA
 3742593 3742594 CLC_1158 CLC_1159     TRUE 0.981 2.000 0.217 NA   NA
 3742594 3742595 CLC_1159 CLC_1160     TRUE 0.988 23.000 0.084 0.034 Y NA
 3742595 3742596 CLC_1160 CLC_1161     TRUE 0.988 12.000 0.308 0.034 N NA
 3742596 3742597 CLC_1161 CLC_1162     FALSE 0.016 303.000 0.000 NA   NA
 3742597 3742598 CLC_1162 CLC_1163     FALSE 0.592 104.000 0.020 NA   NA
 3742598 3742599 CLC_1163 CLC_1164     TRUE 0.777 10.000 0.000 1.000   NA
 3742599 3742600 CLC_1164 CLC_1165     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3742600 3742601 CLC_1165 CLC_1166     TRUE 0.968 1.000 0.050 NA   NA
 3742601 3742602 CLC_1166 CLC_1167   maa FALSE 0.020 288.000 0.000 NA   NA
 3742604 3742605 CLC_1169 CLC_1170     FALSE 0.037 275.000 0.000 1.000   NA
 3742605 3742606 CLC_1170 CLC_1171     FALSE 0.536 160.000 0.017 1.000   NA
 3742608 3742609 CLC_1173 CLC_1174   mgtE FALSE 0.002 501.000 0.000 NA   NA
 3742609 3742610 CLC_1174 CLC_1175 mgtE   FALSE 0.005 1003.000 0.000 0.058 N NA
 3742610 3742611 CLC_1175 CLC_1176   serA TRUE 0.721 228.000 0.110 0.058 Y NA
 3742611 3742612 CLC_1176 CLC_1177 serA   TRUE 0.984 -22.000 0.072 NA   NA
 3742612 3742613 CLC_1177 CLC_1178     FALSE 0.002 600.000 0.000 NA   NA
 3742613 3742614 CLC_1178 CLC_1179     TRUE 0.624 159.000 0.056 1.000   NA
 3742616 3742617 CLC_1181 CLC_1182     TRUE 0.751 111.000 0.118 1.000   NA
 3742617 3742618 CLC_1182 CLC_1183     FALSE 0.026 299.000 0.000 1.000   NA
 3742618 3742619 CLC_1183 CLC_1184     FALSE 0.523 158.000 0.004 NA N NA
 3742619 3742620 CLC_1184 CLC_1185     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3742620 3742621 CLC_1185 CLC_1186     FALSE 0.024 277.000 0.000 NA   NA
 3742621 3742622 CLC_1186 CLC_1187     FALSE 0.567 177.000 0.091 NA   NA
 3742622 3742623 CLC_1187 CLC_1188   xpt-2 FALSE 0.570 161.000 0.009 1.000 N NA
 3742623 3742624 CLC_1188 CLC_1189 xpt-2   FALSE 0.018 298.000 0.000 NA   NA
 3742624 3742625 CLC_1189 CLC_1190     FALSE 0.014 309.000 0.000 NA   NA
 3742625 3742626 CLC_1190 CLC_1191     TRUE 0.770 196.000 0.667 NA   NA
 3742626 3742627 CLC_1191 CLC_1192     FALSE 0.008 350.000 0.000 NA   NA
 3742627 3742628 CLC_1192 CLC_1193     FALSE 0.100 180.000 0.000 NA   NA
 3742628 3742629 CLC_1193 CLC_1194     TRUE 0.659 137.000 0.065 NA   NA
 3742629 3742630 CLC_1194 CLC_1195     FALSE 0.001 771.000 0.000 NA   NA
 3742630 3742631 CLC_1195 CLC_1196     TRUE 0.848 182.000 1.000 NA   NA
 3742631 3742632 CLC_1196 CLC_1197     FALSE 0.005 391.000 0.000 NA   NA
 3742632 3742633 CLC_1197 CLC_1198     TRUE 0.998 2.000 0.667 0.034 Y NA
 3742633 3742634 CLC_1198 CLC_1199     TRUE 0.998 -37.000 0.900 0.034 N NA
 3742636 3742637 CLC_1201 CLC_1202   rpsA FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 3742637 3742638 CLC_1202 CLC_1203 rpsA   FALSE 0.412 183.000 0.008 1.000   NA
 3742638 3742639 CLC_1203 CLC_1204     FALSE 0.565 172.000 0.067 NA   NA
 3742639 3742640 CLC_1204 CLC_1205     FALSE 0.001 869.000 0.000 NA   NA
 3742640 3742641 CLC_1205 CLC_1206     TRUE 0.994 0.000 0.857 NA   NA
 3742641 3742642 CLC_1206 CLC_1207     TRUE 0.992 -37.000 0.231 1.000   NA
 3742642 3742643 CLC_1207 CLC_1208     FALSE 0.011 330.000 0.000 NA   NA
 3742643 3742644 CLC_1208 CLC_1209   asdA FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 3742646 3742647 CLC_1211 CLC_1212     TRUE 0.972 -6.000 0.012 NA N NA
 3742647 3742648 CLC_1212 CLC_1213   panE FALSE 0.005 492.000 0.000 NA N NA
 3742648 3742649 CLC_1213 CLC_1214 panE fchA FALSE 0.043 303.000 0.000 1.000 N NA
 3742649 3742650 CLC_1214 CLC_1215 fchA folD TRUE 0.988 0.000 0.082 0.001 N NA
 3742650 3742651 CLC_1215 CLC_1216 folD   FALSE 0.019 320.000 0.000 1.000   NA
 3742653 3742654 CLC_1218 CLC_1219     TRUE 0.813 118.000 0.286 NA   NA
 3742654 3742655 CLC_1219 CLC_1220     FALSE 0.561 120.000 0.012 NA   NA
 3742655 3742656 CLC_1220 CLC_1221     FALSE 0.003 672.000 0.000 NA N NA
 3742656 3742657 CLC_1221 CLC_1222   cysK-2 FALSE 0.135 329.000 0.083 NA N NA
 3742657 3742658 CLC_1222 CLC_1223 cysK-2   TRUE 0.997 -13.000 0.400 1.000 Y NA
 3742658 3742659 CLC_1223 CLC_1224     TRUE 0.989 35.000 0.400 0.034 Y NA
 3742659 3742660 CLC_1224 CLC_1225   iscS-1 TRUE 0.929 101.000 0.286 1.000 Y NA
 3742660 3742661 CLC_1225 CLC_1226 iscS-1   FALSE 0.313 72.000 0.000 1.000   NA
 3742661 3742662 CLC_1226 CLC_1227     FALSE 0.479 155.000 0.008 NA   NA
 3742662 3742663 CLC_1227 CLC_1228   trmU-1 FALSE 0.524 116.000 0.004 NA   NA
 3742663 3742664 CLC_1228 CLC_1229 trmU-1   FALSE 0.026 340.000 0.000 1.000 N NA
 3742664 3742665 CLC_1229 CLC_1230     TRUE 0.998 -3.000 0.875 NA Y NA
 3742665 3742666 CLC_1230 CLC_1231   bcrA FALSE 0.014 373.000 0.000 NA N NA
 3742666 3742667 CLC_1231 CLC_1232 bcrA   TRUE 0.814 -7.000 0.000 NA   NA
 3742667 3742668 CLC_1232 CLC_1233     FALSE 0.002 603.000 0.000 NA   NA
 3742668 3742669 CLC_1233 CLC_1234     FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 3742671 3742672 CLC_1236 CLC_1237     TRUE 0.991 6.000 0.556 1.000 N NA
 3742672 3742673 CLC_1237 CLC_1238     FALSE 0.017 301.000 0.000 NA   NA
 3742673 3742674 CLC_1238 CLC_1239     FALSE 0.002 511.000 0.000 NA   NA
 3742676 3742677 CLC_1241 CLC_1242     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3742677 3742678 CLC_1242 CLC_1243     FALSE 0.426 64.000 0.000 NA N NA
 3742678 3742679 CLC_1243 CLC_1244     TRUE 0.964 3.000 0.000 NA Y NA
 3742679 3742680 CLC_1244 CLC_1245   amyB FALSE 0.006 671.000 0.000 0.005   NA
 3742680 10195468 CLC_1245 CLC_3714 amyB   FALSE 0.162 134.000 0.000 NA   NA
 10195468 3742681 CLC_3714 CLC_1246   tyrS-1 FALSE 0.002 550.000 0.000 NA   NA
 3742681 3742682 CLC_1246 CLC_1247 tyrS-1   FALSE 0.055 287.000 0.000 1.000 N NA
 3742682 3742683 CLC_1247 CLC_1248     TRUE 0.996 -7.000 0.833 1.000 N NA
 3742683 3742684 CLC_1248 CLC_1249     TRUE 0.985 1.000 0.278 NA   NA
 3742686 3742687 CLC_1251 CLC_1252     FALSE 0.089 189.000 0.000 NA   NA
 3742687 3742688 CLC_1252 CLC_1253     FALSE 0.210 78.000 0.000 NA   NA
 3742688 3742689 CLC_1253 CLC_1254     FALSE 0.613 174.000 0.095 1.000   NA
 3742689 3742690 CLC_1254 CLC_1255   sdhB FALSE 0.013 400.000 0.000 1.000 N NA
 3742690 3742691 CLC_1255 CLC_1256 sdhB sdhA TRUE 0.993 13.000 0.146 0.001 Y NA
 3742691 3742692 CLC_1256 CLC_1258 sdhA   FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 3742695 3742696 CLC_1261 CLC_1262     FALSE 0.006 380.000 0.000 NA   NA
 3742696 3742697 CLC_1262 CLC_1263     TRUE 0.752 107.000 0.154 NA   NA
 3742697 3742698 CLC_1263 CLC_1264     TRUE 0.982 2.000 0.231 NA   NA
 3742698 3742699 CLC_1264 CLC_1265     TRUE 0.942 37.000 0.286 NA   NA
 3742699 3742700 CLC_1265 CLC_1266     TRUE 0.651 173.000 0.071 1.000 N NA
 3742700 3742701 CLC_1266 CLC_1267     TRUE 0.997 6.000 0.786 0.033 Y NA
 3742701 3742702 CLC_1267 CLC_1268     TRUE 0.924 199.000 0.688 0.033 Y NA
 3742703 3742704 CLC_1269 CLC_1270   cotJB TRUE 0.927 34.000 0.125 NA   NA
 3742704 3742705 CLC_1270 CLC_1271 cotJB cotJC TRUE 0.913 31.000 0.047 NA   NA
 3742705 3742706 CLC_1271 CLC_1272 cotJC   FALSE 0.094 230.000 0.000 NA N NA
 3742706 3742707 CLC_1272 CLC_1273     TRUE 0.986 17.000 0.667 NA   NA
 3742707 3742708 CLC_1273 CLC_1274     FALSE 0.002 648.000 0.000 NA   NA
 3742711 3742712 CLC_1277 CLC_1278     FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 3742715 3742716 CLC_1281 CLC_1282     FALSE 0.420 39.000 0.000 NA   NA
 3742716 3742717 CLC_1282 CLC_1283     FALSE 0.043 234.000 0.000 NA   NA
 3742719 3742720 CLC_1285 CLC_1286     TRUE 0.991 12.000 1.000 NA   NA
 3742722 3742723 CLC_1288 CLC_1289     FALSE 0.002 662.000 0.000 NA   NA
 3742723 3742724 CLC_1289 CLC_1290     FALSE 0.002 880.000 0.000 1.000   NA
 3742724 3742725 CLC_1290 CLC_1291     FALSE 0.021 284.000 0.000 NA   NA
 3742725 3742726 CLC_1291 CLC_1292     FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 3742727 3742728 CLC_1293 CLC_1294     TRUE 0.870 40.000 0.014 1.000 N NA
 3742729 3742730 CLC_1295 CLC_1296 grdX grdE TRUE 0.850 91.000 0.400 NA   NA
 3742730 3742731 CLC_1296 CLC_1297 grdE grdB TRUE 0.966 33.000 0.222 0.003   NA
 3742731 3742732 CLC_1297 CLC_1298 grdB trxB FALSE 0.200 151.000 0.000 1.000   NA
 3742732 3742733 CLC_1298 CLC_1299 trxB   TRUE 0.982 34.000 0.226 1.000 Y NA
 3742733 3742734 CLC_1299 CLC_1300   grdA FALSE 0.261 86.000 0.000 1.000   NA
 3742734 3742735 CLC_1300 CLC_1301 grdA grdC TRUE 0.780 95.000 0.054 0.003   NA
 3742735 3742736 CLC_1301 CLC_1302 grdC grdD TRUE 0.991 16.000 0.622 0.003   NA
 3742736 3742737 CLC_1302 CLC_1303 grdD   FALSE 0.010 427.000 0.000 1.000 N NA
 3742737 3742738 CLC_1303 CLC_1304     TRUE 0.749 66.000 0.005 0.055   NA
 3742738 3742739 CLC_1304 CLC_1305   mtnK FALSE 0.005 436.000 0.000 1.000   NA
 3742739 3742740 CLC_1305 CLC_1306 mtnK mtnA TRUE 0.717 140.000 0.104 1.000   NA
 3742740 3742741 CLC_1306 CLC_1307 mtnA   TRUE 0.632 24.000 0.000 NA   NA
 3742741 3742742 CLC_1307 CLC_1308     TRUE 0.654 17.000 0.000 NA   NA
 3742742 3742743 CLC_1308 CLC_1309     FALSE 0.384 44.000 0.000 NA   NA
 3742743 3742744 CLC_1309 CLC_1310     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3742744 3742745 CLC_1310 CLC_1311     FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 3742747 3742748 CLC_1313 CLC_1314     FALSE 0.602 162.000 0.074 NA   NA
 3742748 3742749 CLC_1314 CLC_1315     FALSE 0.616 142.000 0.038 NA   NA
 3742749 3742750 CLC_1315 CLC_1316     TRUE 0.982 -3.000 0.135 NA   NA
 3742750 3742751 CLC_1316 CLC_1317     FALSE 0.006 383.000 0.000 NA   NA
 3742751 3742752 CLC_1317 CLC_1318     TRUE 0.772 69.000 0.080 NA   NA
 3742753 3742754 CLC_1319 CLC_1320     FALSE 0.006 381.000 0.000 NA   NA
 3742755 3742756 CLC_1321 CLC_1322     TRUE 0.982 28.000 0.667 NA   NA
 3742756 3742757 CLC_1322 CLC_1323     TRUE 0.876 57.000 0.200 NA   NA
 3742757 3742758 CLC_1323 CLC_1324     TRUE 0.996 14.000 0.500 0.001 Y NA
 3742758 3742759 CLC_1324 CLC_1325     TRUE 0.993 32.000 0.667 0.050 Y NA
 3742759 3742760 CLC_1325 CLC_1326     TRUE 0.780 116.000 0.100 1.000 N NA
 3742760 3742761 CLC_1326 CLC_1327   topB FALSE 0.015 390.000 0.000 1.000 N NA
 3742761 3742762 CLC_1327 CLC_1328 topB   FALSE 0.014 312.000 0.000 NA   NA
 3742762 3742763 CLC_1328 CLC_1329     FALSE 0.251 66.000 0.000 NA   NA
 3742765 3742766 CLC_1331 CLC_1332     FALSE 0.007 399.000 0.000 1.000   NA
 3742766 3742767 CLC_1332 CLC_1333     FALSE 0.023 305.000 0.000 1.000   NA
 3742767 3742768 CLC_1333 CLC_1334     FALSE 0.036 315.000 0.000 1.000 N NA
 3742768 3742769 CLC_1334 CLC_1335     TRUE 0.953 20.000 0.067 1.000   NA
 3742769 3742770 CLC_1335 CLC_1336     TRUE 0.954 6.000 0.033 NA   NA
 3742770 3742771 CLC_1336 CLC_1337     FALSE 0.292 281.000 0.230 NA   NA
 3742771 3742772 CLC_1337 CLC_1338     FALSE 0.004 417.000 0.000 NA   NA
 3742772 3742773 CLC_1338 CLC_1339     FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 3742773 3742774 CLC_1339 CLC_1340     FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 3742774 3742775 CLC_1340 CLC_1341     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3742775 3742776 CLC_1341 CLC_1342     TRUE 0.943 37.000 0.287 NA   NA
 3742776 3742777 CLC_1342 CLC_1343   copZ TRUE 0.892 123.000 0.024 0.001 Y NA
 3742777 3742778 CLC_1343 CLC_1344 copZ   FALSE 0.060 382.000 0.000 1.000 Y NA
 3742778 3742779 CLC_1344 CLC_1345     FALSE 0.007 478.000 0.000 1.000 N NA
 3742779 3742780 CLC_1345 CLC_1346     FALSE 0.010 338.000 0.000 NA   NA
 3742780 3742781 CLC_1346 CLC_1347     FALSE 0.551 164.000 0.040 NA   NA
 3742781 3742782 CLC_1347 CLC_1348     FALSE 0.004 419.000 0.000 NA   NA
 3742784 3742785 CLC_1350 CLC_1351     TRUE 0.931 25.000 0.032 NA   NA
 3742787 3742788 CLC_1353 CLC_1354     FALSE 0.002 592.000 0.000 NA   NA
 3742788 3742789 CLC_1354 CLC_1355   trkA FALSE 0.001 788.000 0.000 NA   NA
 3742789 3742790 CLC_1355 CLC_1356 trkA trkH TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA   NA
 3742790 3742791 CLC_1356 CLC_1357 trkH   FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 3742791 3742792 CLC_1357 CLC_1358     TRUE 0.847 -19.000 0.000 NA   NA
 3742793 3742794 CLC_1359 CLC_1360     TRUE 0.967 15.000 0.158 NA   NA
 3742794 3742795 CLC_1360 CLC_1361     FALSE 0.014 342.000 0.000 1.000   NA
 3742796 3742797 CLC_1362 CLC_1363 rbr   FALSE 0.040 295.000 0.000 NA N NA
 3742801 3742802 CLC_1367 CLC_1368     FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 3742802 3742803 CLC_1368 CLC_1369     TRUE 0.651 209.000 0.312 NA N NA
 3742803 3742804 CLC_1369 CLC_1370     TRUE 0.891 147.000 0.077 0.050 Y NA
 3742804 3742805 CLC_1370 CLC_1371   noxA FALSE 0.609 199.000 0.111 0.050   NA
 3742806 3742807 CLC_1372 CLC_1373     FALSE 0.016 382.000 0.000 1.000 N NA
 3742808 3742809 CLC_1374 CLC_1375     FALSE 0.043 303.000 0.000 1.000 N NA
 3742809 3742810 CLC_1375 CLC_1376     TRUE 0.989 22.000 0.214 1.000 Y NA
 3742810 3742811 CLC_1376 CLC_1377     TRUE 0.994 3.000 0.255 1.000 Y NA
 3742812 3742813 CLC_1378 CLC_1379     TRUE 0.794 75.000 0.133 NA   NA
 3742814 3742815 CLC_1380 CLC_1381     FALSE 0.081 280.000 0.000 0.004   NA
 3742815 3742816 CLC_1381 CLC_1382     TRUE 0.742 113.000 0.107 1.000   NA
 3742816 3742817 CLC_1382 CLC_1383     FALSE 0.047 424.000 0.089 1.000   NA
 3742817 3742818 CLC_1383 CLC_1384     FALSE 0.011 332.000 0.000 NA   NA
 3742818 3742819 CLC_1384 CLC_1385     FALSE 0.022 283.000 0.000 NA   NA
 3742819 3742820 CLC_1385 CLC_1386     FALSE 0.015 306.000 0.000 NA   NA
 3742820 3742821 CLC_1386 CLC_1387     TRUE 0.939 53.000 0.500 NA   NA
 3742821 3742822 CLC_1387 CLC_1388     TRUE 0.985 0.000 0.250 NA   NA
 3742824 3742825 CLC_1390 CLC_1391     FALSE 0.008 458.000 0.000 1.000 N NA
 3742825 3742826 CLC_1391 CLC_1392     TRUE 0.996 -3.000 0.235 0.033 Y NA
 3742826 3742827 CLC_1392 CLC_1393     TRUE 0.995 9.000 0.353 0.033 Y NA
 3742827 3742828 CLC_1393 CLC_1394     TRUE 0.898 99.000 0.118 1.000 Y NA
 3742828 3742829 CLC_1394 CLC_1395     TRUE 0.985 -6.000 0.059 0.032   NA
 3742829 3742830 CLC_1395 CLC_1396     FALSE 0.003 444.000 0.000 NA   NA
 3742831 3742832 CLC_1397 CLC_1398     TRUE 0.995 0.000 0.231 1.000 Y NA
 3742835 3742836 CLC_1401 CLC_1402     TRUE 0.680 135.000 0.025 1.000 N NA
 3742836 3742837 CLC_1402 CLC_1403     FALSE 0.001 913.000 0.000 NA   NA
 3742837 3742838 CLC_1403 CLC_1404     FALSE 0.366 47.000 0.000 NA   NA
 3742838 3742839 CLC_1404 CLC_1405     TRUE 0.998 -28.000 0.646 NA Y NA
 3742839 3742840 CLC_1405 CLC_1406     TRUE 0.920 141.000 0.270 1.000 Y NA
 3742840 3742841 CLC_1406 CLC_1407     FALSE 0.202 279.000 0.000 1.000 Y NA
 3742841 3742842 CLC_1407 CLC_1408     TRUE 0.987 -30.000 0.035 0.057   NA
 3742842 3742843 CLC_1408 CLC_1409     TRUE 0.653 127.000 0.035 1.000   NA
 3742843 3742844 CLC_1409 CLC_1410     FALSE 0.377 45.000 0.000 NA   NA
 3742844 3742845 CLC_1410 CLC_1411   rnz FALSE 0.163 129.000 0.000 NA   NA
 3742845 3742846 CLC_1411 CLC_1412 rnz   FALSE 0.013 346.000 0.000 1.000   NA
 3742846 3742847 CLC_1412 CLC_1413     FALSE 0.154 145.000 0.000 NA   NA
 3742847 3742848 CLC_1413 CLC_1414     TRUE 0.932 13.000 0.015 NA   NA
 3742848 3742849 CLC_1414 CLC_1415     TRUE 0.944 183.000 0.800 0.019 Y NA
 3742849 3742850 CLC_1415 CLC_1416     FALSE 0.281 351.000 0.600 1.000 N NA
 3742850 3742851 CLC_1416 CLC_1417     TRUE 0.965 106.000 1.000 NA Y NA
 3742851 3742852 CLC_1417 CLC_1418     TRUE 0.991 2.000 0.600 NA   NA
 3742852 3742853 CLC_1418 CLC_1419     TRUE 0.982 19.000 0.500 NA   NA
 3742854 3742855 CLC_1420 CLC_1421     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 3742855 3742856 CLC_1421 CLC_1422     TRUE 0.717 168.000 0.250 NA   NA
 3742857 3742858 CLC_1423 CLC_1424 pepD-1   FALSE 0.382 58.000 0.000 1.000   NA
 3742858 3742859 CLC_1424 CLC_1425     FALSE 0.161 135.000 0.000 NA   NA
 3742859 3742860 CLC_1425 CLC_1426   pdxK FALSE 0.005 398.000 0.000 NA   NA
 3742862 3742863 CLC_1428 CLC_1429     TRUE 0.994 -13.000 0.500 1.000   NA
 3742863 3742864 CLC_1429 CLC_1430     TRUE 0.791 173.000 0.500 NA   NA
 3742864 3742865 CLC_1430 CLC_1431     FALSE 0.003 440.000 0.000 NA   NA
 3742865 3742866 CLC_1431 CLC_1432     TRUE 0.998 2.000 1.000 1.000 Y NA
 3742866 3742867 CLC_1432 CLC_1433     TRUE 0.942 59.000 0.500 1.000 N NA
 3742867 3742868 CLC_1433 CLC_1434     TRUE 0.989 -10.000 0.222 1.000   NA
 3742868 3742869 CLC_1434 CLC_1435     FALSE 0.240 69.000 0.000 NA   NA
 3742869 3742870 CLC_1435 CLC_1436     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 3742870 3742871 CLC_1436 CLC_1437     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3742871 3742872 CLC_1437 CLC_1438     TRUE 0.712 88.000 0.000 1.000 Y NA
 3742872 3742873 CLC_1438 CLC_1439     TRUE 0.993 19.000 0.400 1.000 Y NA
 3742873 3742874 CLC_1439 CLC_1440     FALSE 0.006 425.000 0.000 1.000   NA
 3742878 3742879 CLC_1444 CLC_1445     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3742879 3742880 CLC_1445 CLC_1446     TRUE 0.791 173.000 0.500 NA   NA
 3742882 3742883 CLC_1448 CLC_1449     TRUE 0.998 2.000 0.643 0.033 Y NA
 3742883 3742884 CLC_1449 CLC_1450     TRUE 0.633 131.000 0.041 NA   NA
 3742884 3742885 CLC_1450 CLC_1451     FALSE 0.176 95.000 0.000 NA   NA
 3742885 3742886 CLC_1451 CLC_1452     FALSE 0.005 388.000 0.000 NA   NA
 3742886 3742887 CLC_1452 CLC_1453     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3742887 3742888 CLC_1453 CLC_1454     FALSE 0.163 132.000 0.000 NA   NA
 3742888 3742889 CLC_1454 CLC_1455     FALSE 0.174 110.000 0.000 NA   NA
 3742889 3742890 CLC_1455 CLC_1456     FALSE 0.126 162.000 0.000 NA   NA
 3742890 3742891 CLC_1456 CLC_1457     FALSE 0.180 92.000 0.000 NA   NA
 3742891 3742892 CLC_1457 CLC_1458     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3742892 3742893 CLC_1458 CLC_1459   uviB FALSE 0.051 224.000 0.000 NA   NA
 3742893 3742894 CLC_1459 CLC_1460 uviB   TRUE 0.994 -7.000 0.667 NA   NA
 3742894 3742895 CLC_1460 CLC_1461     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3742895 3742896 CLC_1461 CLC_1462     FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 3742896 3742897 CLC_1462 CLC_1463     TRUE 0.992 2.000 0.750 NA   NA
 3742897 3742898 CLC_1463 CLC_1464     FALSE 0.002 659.000 0.000 NA   NA
 3742898 3742899 CLC_1464 CLC_1465     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3742899 3742900 CLC_1465 CLC_1466     FALSE 0.008 351.000 0.000 NA   NA
 3742900 3742901 CLC_1466 CLC_1467     FALSE 0.072 203.000 0.000 NA   NA
 3742901 3742902 CLC_1467 CLC_1468     FALSE 0.551 220.000 0.250 1.000   NA
 3742902 3742903 CLC_1468 CLC_1469     FALSE 0.403 56.000 0.000 1.000   NA
 3742903 3742904 CLC_1469 CLC_1470     FALSE 0.007 480.000 0.000 1.000 N NA
 3742904 3742905 CLC_1470 CLC_1471   spoVB-1 TRUE 0.943 32.000 0.137 1.000   NA
 3742909 3742910 CLC_1475 CLC_1476     FALSE 0.020 361.000 0.000 1.000 N NA
 3742911 3742912 CLC_1477 CLC_1478   npr-1 FALSE 0.115 170.000 0.000 NA   NA
 3742912 3742913 CLC_1478 CLC_1479 npr-1 npr-2 TRUE 0.974 137.000 1.000 0.005 Y NA
 3742913 3742914 CLC_1479 CLC_1480 npr-2 npr-3 TRUE 0.772 116.000 0.000 0.005 Y NA
 3742914 3742915 CLC_1480 CLC_1481 npr-3 npr-4 TRUE 0.976 120.000 1.000 0.005 Y NA
 3742915 3742916 CLC_1481 CLC_1482 npr-4 npr-5 TRUE 0.769 120.000 0.000 0.005 Y NA
 3742916 3742917 CLC_1482 CLC_1483 npr-5 npr-6 TRUE 0.939 34.000 0.000 0.005 Y NA
 3742917 3742918 CLC_1483 CLC_1484 npr-6 nadC FALSE 0.005 603.000 0.000 1.000 N NA
 3742918 3742919 CLC_1484 CLC_1485 nadC nadB TRUE 0.994 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 3742919 3742920 CLC_1485 CLC_1486 nadB nadA TRUE 0.989 3.000 0.042 1.000 Y NA
 3742922 3742923 CLC_1488 CLC_1489 hlyIII ychF TRUE 0.624 121.000 0.002 0.051   NA
 3742924 3742925 CLC_1490 CLC_1491 mraZ mraW TRUE 0.902 80.000 0.635 NA   NA
 3742925 3742926 CLC_1491 CLC_1492 mraW   TRUE 0.625 82.000 0.008 1.000   NA
 3742926 3742927 CLC_1492 CLC_1493     TRUE 0.962 16.000 0.096 1.000   NA
 3742927 3742928 CLC_1493 CLC_1494   murE TRUE 0.747 230.000 0.265 1.000 Y NA
 3742928 3742929 CLC_1494 CLC_1495 murE murF TRUE 0.993 26.000 0.328 0.003 Y NA
 3742929 3742930 CLC_1495 CLC_1496 murF mraY-2 TRUE 0.970 36.000 0.024 0.005 Y NA
 3742930 3742931 CLC_1496 CLC_1497 mraY-2   TRUE 0.793 79.000 0.014 0.005 N NA
 3742931 3742932 CLC_1497 CLC_1498     FALSE 0.101 319.000 0.015 NA N NA
 3742932 3742933 CLC_1498 CLC_1499     TRUE 0.935 11.000 0.014 NA   NA
 3742933 3742934 CLC_1499 CLC_1500   sbp TRUE 0.901 34.000 0.053 NA   NA
 3742934 3742935 CLC_1500 CLC_1501 sbp   TRUE 0.969 1.000 0.053 NA   NA
 3742935 3742936 CLC_1501 CLC_1502     FALSE 0.594 93.000 0.017 NA   NA
 3742936 3742937 CLC_1502 CLC_1503     TRUE 0.934 21.000 0.032 NA   NA
 3742937 3742938 CLC_1503 CLC_1504     TRUE 0.973 17.000 0.246 NA   NA
 3742938 3742939 CLC_1504 CLC_1505     TRUE 0.979 1.000 0.118 1.000   NA
 3742939 3742940 CLC_1505 CLC_1506   divIVA TRUE 0.986 16.000 0.579 1.000   NA
 3742940 3742941 CLC_1506 CLC_1507 divIVA aroB FALSE 0.037 408.000 0.006 1.000 N NA
 3742941 3742942 CLC_1507 CLC_1508 aroB mtnN TRUE 0.964 1.000 0.003 1.000 N NA
 3742942 3742943 CLC_1508 CLC_1509 mtnN aroF TRUE 0.730 121.000 0.046 1.000 N NA
 3742943 3742944 CLC_1509 CLC_1510 aroF aroA TRUE 0.805 134.000 0.003 1.000 Y NA
 3742944 3742945 CLC_1510 CLC_1511 aroA   FALSE 0.144 217.000 0.000 1.000 N NA
 3742945 3742946 CLC_1511 CLC_1512   lspA FALSE 0.060 404.000 0.050 1.000 N NA
 3742946 3742947 CLC_1512 CLC_1513 lspA   TRUE 0.977 4.000 0.082 1.000 N NA
 3742947 3742948 CLC_1513 CLC_1514   pyrR-1 FALSE 0.033 487.000 0.048 1.000 N NA
 3742948 3742949 CLC_1514 CLC_1515 pyrR-1   TRUE 0.965 44.000 0.140 1.000 Y NA
 3742949 3742950 CLC_1515 CLC_1516   xth FALSE 0.005 590.000 0.000 1.000 N NA
 3742950 3742951 CLC_1516 CLC_1517 xth   FALSE 0.369 223.000 0.000 1.000 Y NA
 3742951 3742952 CLC_1517 CLC_1518     FALSE 0.067 231.000 0.000 1.000   NA
 3742952 3742953 CLC_1518 CLC_1519   modA FALSE 0.458 178.000 0.015 1.000   NA
 3742953 3742954 CLC_1519 CLC_1520 modA modB TRUE 0.996 10.000 0.430 0.001 Y NA
 3742954 3742955 CLC_1520 CLC_1521 modB   FALSE 0.440 328.000 0.342 1.000 Y NA
 3742955 3742956 CLC_1521 CLC_1522     TRUE 0.755 54.000 0.013 NA   NA
 3742956 3742957 CLC_1522 CLC_1523     FALSE 0.006 382.000 0.000 NA   NA
 3742957 3742958 CLC_1523 CLC_1524     FALSE 0.017 300.000 0.000 NA   NA
 3742958 3742959 CLC_1524 CLC_1525     FALSE 0.026 273.000 0.000 NA   NA
 3742959 3742960 CLC_1525 CLC_1526     TRUE 0.871 88.000 0.308 1.000 N NA
 3742960 3742961 CLC_1526 CLC_1527     FALSE 0.218 142.000 0.000 1.000   NA
 3742961 3742962 CLC_1527 CLC_1528     TRUE 0.761 90.000 0.147 NA   NA
 3742962 3742963 CLC_1528 CLC_1529     TRUE 0.970 23.000 0.235 NA   NA
 3742963 3742964 CLC_1529 CLC_1530   mtbC TRUE 0.959 26.000 0.118 1.000   NA
 3742964 3742965 CLC_1530 CLC_1531 mtbC   TRUE 0.774 85.000 0.118 1.000   NA
 3742965 3742966 CLC_1531 CLC_1532     FALSE 0.020 946.000 0.000 0.002 Y NA
 3742966 3742967 CLC_1532 CLC_1533     TRUE 0.958 23.000 0.044 1.000 N NA
 3742967 3742968 CLC_1533 CLC_1534     TRUE 0.993 2.000 0.178 1.000 Y NA
 3742968 3742969 CLC_1534 CLC_1535     TRUE 0.932 144.000 0.444 NA Y NA
 3742971 3742972 CLC_1537 CLC_1538   asnA FALSE 0.030 329.000 0.000 1.000 N NA
 3742974 3742975 CLC_1540 CLC_1541     TRUE 0.977 27.000 0.024 1.000 Y NA
 3742975 3742976 CLC_1541 CLC_1542     FALSE 0.019 317.000 0.000 1.000   NA
 3742978 3742979 CLC_1544 CLC_1545     TRUE 0.766 1.000 0.000 NA   NA
 3742979 3742980 CLC_1545 CLC_1546     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3742980 3742981 CLC_1546 CLC_1547     FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 3742981 3742982 CLC_1547 CLC_1548     TRUE 0.949 13.000 0.041 NA   NA
 3742982 3742983 CLC_1548 CLC_1549     TRUE 0.996 -7.000 0.611 0.032 N NA
 3742983 3742984 CLC_1549 CLC_1550     TRUE 0.985 36.000 0.278 0.032 Y NA
 3742984 3742985 CLC_1550 CLC_1551     TRUE 0.970 46.000 0.121 0.032 Y NA
 3742991 3742992 CLC_1557 CLC_1558     FALSE 0.174 108.000 0.000 NA   NA
 3742992 3742993 CLC_1558 CLC_1559     FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 3742993 3742994 CLC_1559 CLC_1560     FALSE 0.170 206.000 0.000 1.000 N NA
 3742994 3742995 CLC_1560 CLC_1561     TRUE 0.944 27.000 0.087 NA   NA
 3742997 3742998 CLC_1563 CLC_1564   ogt TRUE 0.892 29.000 0.014 NA   NA
 3742998 3742999 CLC_1564 CLC_1565 ogt   TRUE 0.917 27.000 0.014 1.000   NA
 3742999 3743000 CLC_1565 CLC_1566     TRUE 0.732 165.000 0.263 NA   NA
 3743000 3743001 CLC_1566 CLC_1567     TRUE 0.962 25.000 0.168 NA   NA
 3743001 3743002 CLC_1567 CLC_1568     FALSE 0.008 390.000 0.000 1.000   NA
 3743002 3743003 CLC_1568 CLC_1569     FALSE 0.431 53.000 0.000 1.000   NA
 3743003 3743004 CLC_1569 CLC_1570     TRUE 0.625 57.000 0.000 0.003   NA
 3743004 3743005 CLC_1570 CLC_1571     FALSE 0.011 486.000 0.000 0.097 N NA
 3743005 3743006 CLC_1571 CLC_1572     FALSE 0.010 436.000 0.000 1.000 N NA
 3743006 3743007 CLC_1572 CLC_1573     FALSE 0.174 98.000 0.000 NA   NA
 3743007 3743008 CLC_1573 CLC_1574     FALSE 0.105 381.000 0.250 NA   NA
 3743008 3743009 CLC_1574 CLC_1576     TRUE 0.618 26.000 0.000 NA   NA
 3743013 3743014 CLC_1580 CLC_1581     FALSE 0.239 118.000 0.000 1.000   NA
 3743015 3743016 CLC_1582 CLC_1583     TRUE 0.669 94.000 0.051 NA   NA
 3743017 3743018 CLC_1584 CLC_1585   hgdC-1 TRUE 0.912 117.000 0.722 NA N NA
 3743018 3743019 CLC_1585 CLC_1586 hgdC-1   TRUE 0.969 18.000 0.135 NA N NA
 3743019 3743020 CLC_1586 CLC_1587     TRUE 0.991 2.000 0.405 1.000 N NA
 3743020 3743021 CLC_1587 CLC_1588   folE TRUE 0.990 4.000 0.429 1.000 N NA
 3743021 3743022 CLC_1588 CLC_1589 folE   FALSE 0.435 184.000 0.015 1.000   NA
 3743022 3743023 CLC_1589 CLC_1590     FALSE 0.567 115.000 0.005 1.000   NA
 3743023 3743024 CLC_1590 CLC_1591     FALSE 0.108 175.000 0.000 NA   NA
 3743024 3743025 CLC_1591 CLC_1592     FALSE 0.012 322.000 0.000 NA   NA
 3743025 3743026 CLC_1592 CLC_1593     TRUE 0.939 22.000 0.040 NA   NA
 3743026 3743027 CLC_1593 CLC_1594   deoC FALSE 0.234 292.000 0.077 1.000 N NA
 3743027 3743028 CLC_1594 CLC_1595 deoC rbsK FALSE 0.093 344.000 0.026 1.000 N NA
 3743028 3743029 CLC_1595 CLC_1596 rbsK   FALSE 0.009 448.000 0.000 1.000 N NA
 3743029 3743030 CLC_1596 CLC_1597   hisG TRUE 0.993 25.000 0.239 0.003 Y NA
 3743030 3743031 CLC_1597 CLC_1598 hisG hisD TRUE 0.957 78.000 0.254 0.003 Y NA
 3743031 3743032 CLC_1598 CLC_1599 hisD hisB TRUE 0.904 150.000 0.096 0.003 Y NA
 3743032 3743033 CLC_1599 CLC_1600 hisB hisH TRUE 0.923 128.000 0.125 0.003 Y NA
 3743033 3743034 CLC_1600 CLC_1601 hisH hisA TRUE 0.996 -3.000 0.124 0.003 Y NA
 3743034 3743035 CLC_1601 CLC_1602 hisA hisC TRUE 0.992 -3.000 0.004 0.003 Y NA
 3743035 3743036 CLC_1602 CLC_1603 hisC hisF TRUE 0.729 197.000 0.002 0.003 Y NA
 3743036 3743037 CLC_1603 CLC_1604 hisF hislE FALSE 0.140 153.000 0.000 NA   NA
 3743037 3743038 CLC_1604 CLC_1605 hislE   FALSE 0.161 136.000 0.000 NA   NA
 3743038 3743039 CLC_1605 CLC_1606     TRUE 0.974 14.000 0.231 NA   NA
 3743039 3743040 CLC_1606 CLC_1607     TRUE 0.973 18.000 0.267 NA   NA
 3743042 3743043 CLC_1609 CLC_1610     TRUE 0.748 81.000 0.070 1.000   NA
 3743043 3743044 CLC_1610 CLC_1611     TRUE 0.627 153.000 0.047 1.000   NA
 3743044 3743045 CLC_1611 CLC_1612     FALSE 0.022 307.000 0.000 1.000   NA
 3743045 3743046 CLC_1612 CLC_1613     TRUE 0.962 3.000 0.041 NA   NA
 3743046 3743047 CLC_1613 CLC_1614     TRUE 0.988 3.000 0.490 NA   NA
 3743047 3743048 CLC_1614 CLC_1615     TRUE 0.829 117.000 0.352 NA   NA
 3743048 3743049 CLC_1615 CLC_1616     TRUE 0.999 -9.000 0.741 0.018 Y NA
 3743049 3743050 CLC_1616 CLC_1617   arcA-2 FALSE 0.005 564.000 0.000 1.000 N NA
 3743050 3743051 CLC_1617 CLC_1618 arcA-2 arcD TRUE 0.843 125.000 0.022 1.000 Y NA
 3743053 3743054 CLC_1620 CLC_1621     FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 3743054 3743055 CLC_1621 CLC_1622     FALSE 0.410 40.000 0.000 NA   NA
 3743057 3743058 CLC_1624 CLC_1625     FALSE 0.524 190.000 0.067 1.000   NA
 3743058 3743059 CLC_1625 CLC_1626     FALSE 0.006 419.000 0.000 1.000   NA
 3743059 3743060 CLC_1626 CLC_1627     FALSE 0.054 247.000 0.000 1.000   NA
 3743060 3743061 CLC_1627 CLC_1628     TRUE 0.807 149.000 0.222 1.000 N NA
 3743061 3743062 CLC_1628 CLC_1629     TRUE 0.998 2.000 0.900 0.006 Y NA
 3743062 3743063 CLC_1629 CLC_1630     FALSE 0.014 392.000 0.000 1.000 N NA
 3743063 3743064 CLC_1630 CLC_1631     FALSE 0.147 304.000 0.000 1.000 Y NA
 3743064 3743065 CLC_1631 CLC_1632     FALSE 0.291 247.000 0.000 1.000 Y NA
 3743065 3743066 CLC_1632 CLC_1633     TRUE 0.969 42.000 0.167 1.000 Y NA
 3743066 3743067 CLC_1633 CLC_1634     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3743067 3743068 CLC_1634 CLC_1635     FALSE 0.050 225.000 0.000 NA   NA
 3743070 3743071 CLC_1637 CLC_1638     TRUE 0.842 158.000 0.600 NA   NA
 3743072 3743073 CLC_1639 CLC_1640     TRUE 0.997 -22.000 0.261 1.000 Y NA
 3743074 3743075 CLC_1641 CLC_1642     FALSE 0.343 52.000 0.000 NA   NA
 3743076 3743077 CLC_1643 CLC_1644     TRUE 0.976 9.000 0.171 1.000   NA
 3743078 3743079 CLC_1645 CLC_1646     TRUE 0.833 190.000 1.000 NA   NA
 3743081 3743082 CLC_1648 CLC_1649 metF   TRUE 0.669 173.000 0.045 0.002   NA
 3743082 3743083 CLC_1649 CLC_1650     TRUE 0.989 -10.000 0.075 0.001   NA
 3743085 3743086 CLC_1652 CLC_1653     TRUE 0.994 -7.000 0.667 NA   NA
 3743086 3743087 CLC_1653 CLC_1654     FALSE 0.008 350.000 0.000 NA   NA
 3743087 3743088 CLC_1654 CLC_1655     FALSE 0.116 169.000 0.000 NA   NA
 3743088 3743089 CLC_1655 CLC_1656   acoA TRUE 0.947 21.000 0.065 NA   NA
 3743089 3743090 CLC_1656 CLC_1657 acoA acoB TRUE 0.993 3.000 0.076 0.001 Y NA
 3743090 3743091 CLC_1657 CLC_1658 acoB acoX TRUE 0.915 53.000 0.162 0.055   NA
 3743091 3743092 CLC_1658 CLC_1659 acoX acoC TRUE 0.932 36.000 0.081 0.055   NA
 3743092 3743093 CLC_1659 CLC_1660 acoC acoL TRUE 0.990 13.000 0.148 1.000 Y NA
 3743093 3743094 CLC_1660 CLC_1661 acoL   TRUE 0.962 25.000 0.074 1.000 N NA
 3743094 3743095 CLC_1661 CLC_1662     FALSE 0.027 339.000 0.000 1.000 N NA
 3743095 3743096 CLC_1662 CLC_1663     TRUE 0.997 -7.000 0.793 0.097 N NA
 3743096 3743097 CLC_1663 CLC_1664   thrC FALSE 0.004 815.000 0.000 1.000 N NA
 3743097 3743098 CLC_1664 CLC_1665 thrC thrB TRUE 0.992 10.000 0.233 1.000 Y NA
 3743098 3743099 CLC_1665 CLC_1666 thrB   TRUE 0.821 127.000 0.008 1.000 Y NA
 3743099 3743100 CLC_1666 CLC_1667   hom-1 TRUE 0.655 223.000 0.010 0.002 Y NA
 3743100 3743101 CLC_1667 CLC_1668 hom-1   FALSE 0.005 587.000 0.000 1.000 N NA
 3743101 3743102 CLC_1668 CLC_1669     FALSE 0.006 509.000 0.000 1.000 N NA
 3743102 3743103 CLC_1669 CLC_1670     FALSE 0.106 329.000 0.000 1.000 Y NA
 3743103 3743104 CLC_1670 CLC_1671   gltA-1 TRUE 0.996 0.000 0.667 0.048 N NA
 3743104 3743105 CLC_1671 CLC_1672 gltA-1   FALSE 0.119 229.000 0.000 1.000 N NA
 3743105 3743106 CLC_1672 CLC_1673     TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3743106 3743107 CLC_1673 CLC_1674     FALSE 0.004 423.000 0.000 NA   NA
 3743107 3743108 CLC_1674 CLC_1675     FALSE 0.174 109.000 0.000 NA   NA
 3743108 3743109 CLC_1675 CLC_1676     FALSE 0.100 180.000 0.000 NA   NA
 3743109 3743110 CLC_1676 CLC_1677     FALSE 0.008 359.000 0.000 NA   NA
 3743110 3743111 CLC_1677 CLC_1678     FALSE 0.020 288.000 0.000 NA   NA
 3743111 3743112 CLC_1678 CLC_1679     FALSE 0.091 186.000 0.000 NA   NA
 3743112 3743113 CLC_1679 CLC_1680     FALSE 0.003 468.000 0.000 NA   NA
 3743113 3743114 CLC_1680 CLC_1681     FALSE 0.136 156.000 0.000 NA   NA
 3743114 3743115 CLC_1681 CLC_1682     FALSE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 3743115 3743116 CLC_1682 CLC_1683     FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 3743116 3743117 CLC_1683 CLC_1684     TRUE 0.961 33.000 0.379 NA   NA
 3743117 3743118 CLC_1684 CLC_1685   alr-2 FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 3743118 3743119 CLC_1685 CLC_1686 alr-2   FALSE 0.011 421.000 0.000 1.000 N NA
 3743119 3743120 CLC_1686 CLC_1687     TRUE 0.704 88.000 0.016 0.096   NA
 3743120 3743121 CLC_1687 CLC_1688     FALSE 0.040 240.000 0.000 NA   NA
 3743123 3743124 CLC_1690 CLC_1691     FALSE 0.001 913.000 0.000 NA   NA
 3743128 3743129 CLC_1695 CLC_1696     TRUE 0.684 137.000 0.027 1.000 N NA
 3743129 3743130 CLC_1696 CLC_1697     TRUE 0.996 14.000 0.667 0.032 Y NA
 3743130 3743131 CLC_1697 CLC_1698     TRUE 0.998 4.000 1.000 0.032 Y NA
 3743131 3743132 CLC_1698 CLC_1699     TRUE 0.962 31.000 0.265 1.000   NA
 3743134 3743135 CLC_1701 CLC_1702     FALSE 0.026 272.000 0.000 NA   NA
 3743137 3743138 CLC_1704 CLC_1705     FALSE 0.609 151.000 0.011 1.000 N NA
 3743138 3743139 CLC_1705 CLC_1706   fruK FALSE 0.185 200.000 0.000 1.000 N NA
 3743141 3743142 CLC_1708 CLC_1709     TRUE 0.861 152.000 0.667 NA   NA
 3743144 3743145 CLC_1711 CLC_1712     FALSE 0.442 37.000 0.000 NA   NA
 3743146 3743147 CLC_1713 CLC_1714 safA   FALSE 0.005 402.000 0.000 NA   NA
 3743148 3743149 CLC_1715 CLC_1716     FALSE 0.017 376.000 0.000 1.000 N NA
 3743151 3743152 CLC_1718 CLC_1719     FALSE 0.002 571.000 0.000 NA   NA
 3743154 3743155 CLC_1721 CLC_1722     FALSE 0.018 323.000 0.000 1.000   NA
 3743155 3743156 CLC_1722 CLC_1723   deaD FALSE 0.421 179.000 0.006 1.000   NA
 3743156 3743157 CLC_1723 CLC_1724 deaD   FALSE 0.544 154.000 0.025 NA   NA
 3743157 3743158 CLC_1724 CLC_1725     FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 3743158 3743159 CLC_1725 CLC_1726     FALSE 0.007 406.000 0.000 1.000   NA
 3743161 3743162 CLC_1728 CLC_1729     FALSE 0.273 61.000 0.000 NA   NA
 3743162 3743163 CLC_1729 CLC_1730   cheX TRUE 0.992 0.000 0.100 NA Y NA
 3743165 3743166 CLC_1732 CLC_1733     FALSE 0.599 61.000 0.000 0.002   NA
 3743171 3743172 CLC_1738 CLC_1739   hfq TRUE 0.703 101.000 0.064 1.000   NA
 3743172 3743173 CLC_1739 CLC_1740 hfq miaA TRUE 0.808 86.000 0.192 1.000   NA
 3743173 3743174 CLC_1740 CLC_1741 miaA   TRUE 0.970 16.000 0.097 1.000 N NA
 3743174 3743175 CLC_1741 CLC_1742   mutS FALSE 0.152 146.000 0.000 NA   NA
 3743175 3743176 CLC_1742 CLC_1743 mutS miaB FALSE 0.205 80.000 0.000 NA   NA
 3743177 3743178 CLC_1744 CLC_1745     TRUE 0.725 85.000 0.087 NA   NA
 3743178 3743179 CLC_1745 CLC_1746   aspB-1 TRUE 0.730 55.000 0.008 NA   NA
 3743180 3743181 CLC_1747 CLC_1748     TRUE 0.894 82.000 0.571 NA   NA
 3743181 3743182 CLC_1748 CLC_1749     FALSE 0.036 248.000 0.000 NA   NA
 3743182 3743183 CLC_1749 CLC_1750   cmk TRUE 0.821 64.000 0.047 1.000 N NA
 3743183 3743184 CLC_1750 CLC_1751 cmk aroH TRUE 0.746 76.000 0.020 1.000 N NA
 3743184 3743185 CLC_1751 CLC_1752 aroH   TRUE 0.967 0.000 0.024 1.000   NA
 3743185 3743186 CLC_1752 CLC_1753   gluD FALSE 0.028 295.000 0.000 1.000   NA
 3743186 3743187 CLC_1753 CLC_1754 gluD   FALSE 0.393 235.000 0.068 1.000 N NA
 3743187 3743188 CLC_1754 CLC_1755   rluB FALSE 0.062 368.000 0.013 1.000 N NA
 3743188 3743189 CLC_1755 CLC_1756 rluB   FALSE 0.003 463.000 0.000 NA   NA
 3743189 3743190 CLC_1756 CLC_1757     FALSE 0.174 98.000 0.000 NA   NA
 3743190 3743191 CLC_1757 CLC_1758     FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 3743192 3743193 CLC_1759 CLC_1760     FALSE 0.010 373.000 0.000 1.000   NA
 3743194 3743195 CLC_1761 CLC_1762     TRUE 0.966 2.000 0.034 1.000   NA
 3743195 3743196 CLC_1762 CLC_1763     TRUE 0.746 115.000 0.111 1.000   NA
 3743196 3743197 CLC_1763 CLC_1764     TRUE 0.707 131.000 0.111 NA   NA
 3743199 3743200 CLC_1766 CLC_1767 pcaC-1   FALSE 0.222 138.000 0.000 1.000   NA
 3743200 3743201 CLC_1767 CLC_1768     FALSE 0.093 185.000 0.000 NA   NA
 3743201 3743202 CLC_1768 CLC_1769     FALSE 0.045 232.000 0.000 NA   NA
 3743202 3743203 CLC_1769 CLC_1770     TRUE 0.974 -19.000 0.019 NA   NA
 3743204 3743205 CLC_1771 CLC_1772     TRUE 0.985 3.000 0.200 0.048   NA
 3743205 3743206 CLC_1772 CLC_1773     TRUE 0.982 -3.000 0.111 1.000   NA
 3743206 3743207 CLC_1773 CLC_1774     TRUE 0.678 135.000 0.056 1.000   NA
 3743208 3743209 CLC_1775 CLC_1776 hypE hypD TRUE 0.902 168.000 0.353 1.000 Y NA
 3743209 3743210 CLC_1776 CLC_1777 hypD   TRUE 0.996 -7.000 0.363 NA Y NA
 3743210 3743211 CLC_1777 CLC_1778   hypF TRUE 0.996 -37.000 0.181 NA Y NA
 3743211 3743212 CLC_1778 CLC_1779 hypF   TRUE 0.972 -16.000 0.008 1.000   NA
 3743212 3743213 CLC_1779 CLC_1780     FALSE 0.049 255.000 0.000 1.000   NA
 3743213 3743214 CLC_1780 CLC_1781     FALSE 0.550 160.000 0.022 1.000   NA
 3743214 3743215 CLC_1781 CLC_1782   hupL TRUE 0.974 33.000 0.079 1.000 Y NA
 3743215 3743216 CLC_1782 CLC_1783 hupL hupS TRUE 0.973 102.000 0.778 0.001 Y NA
 3743219 3743220 CLC_1786 CLC_1787     FALSE 0.069 206.000 0.000 NA   NA
 3743220 3743221 CLC_1787 CLC_1788     FALSE 0.001 891.000 0.000 NA   NA
 3743222 3743223 CLC_1789 CLC_1790     FALSE 0.011 362.000 0.000 1.000   NA
 3743223 3743224 CLC_1790 CLC_1791     TRUE 0.967 20.000 0.048 0.001   NA
 3743224 3743225 CLC_1791 CLC_1792     TRUE 0.993 12.000 0.154 0.001 Y NA
 3743225 3743226 CLC_1792 CLC_1793     FALSE 0.008 476.000 0.000 1.000 N NA
 3743226 3743227 CLC_1793 CLC_1794     FALSE 0.067 259.000 0.000 NA N NA
 3743230 3743231 CLC_1797 CLC_1798   ytfJ FALSE 0.243 68.000 0.000 NA   NA
 3743232 3743233 CLC_1799 CLC_1800 scpB scpA TRUE 0.993 -7.000 0.570 NA   NA
 3743233 3743234 CLC_1800 CLC_1801 scpA   TRUE 0.970 -25.000 0.006 NA   NA
 3743234 3743235 CLC_1801 CLC_1802   dacF FALSE 0.316 213.000 0.021 NA   NA
 3743235 3743236 CLC_1802 CLC_1803 dacF   FALSE 0.579 123.000 0.018 NA   NA
 3743236 3743237 CLC_1803 CLC_1804     FALSE 0.132 159.000 0.000 NA   NA
 3743237 3743238 CLC_1804 CLC_1805     FALSE 0.575 142.000 0.024 NA   NA
 3743238 3743239 CLC_1805 CLC_1806   pdp TRUE 0.675 107.000 0.061 NA   NA
 3743239 3743240 CLC_1806 CLC_1807 pdp punA FALSE 0.186 286.000 0.000 1.000 Y NA
 3743240 3743241 CLC_1807 CLC_1808 punA xerD TRUE 0.861 38.000 0.004 1.000 N NA
 3743241 3743242 CLC_1808 CLC_1809 xerD   TRUE 0.732 52.000 0.004 NA   NA
 3743242 3743243 CLC_1809 CLC_1810     TRUE 0.975 -9.000 0.034 NA   NA
 3743243 3743244 CLC_1810 CLC_1811     FALSE 0.385 205.000 0.033 NA   NA
 3743244 3743245 CLC_1811 CLC_1812     FALSE 0.007 484.000 0.000 1.000 N NA
 3743245 3743246 CLC_1812 CLC_1813     FALSE 0.003 551.000 0.000 1.000   NA
 3743246 3743247 CLC_1813 CLC_1814     FALSE 0.001 1485.000 0.000 NA   NA
 3743247 3743248 CLC_1814 CLC_1815     FALSE 0.161 136.000 0.000 NA   NA
 3743248 3743249 CLC_1815 CLC_1816   spo0A FALSE 0.155 287.000 0.027 1.000   NA
 3743249 3743250 CLC_1816 CLC_1817 spo0A spoIVB FALSE 0.091 430.000 0.393 1.000   NA
 3743250 3743251 CLC_1817 CLC_1818 spoIVB metA FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 3743251 3743252 CLC_1818 CLC_1819 metA hom-2 TRUE 0.972 27.000 0.005 1.000 Y NA
 3743252 3743253 CLC_1819 CLC_1820 hom-2   TRUE 0.947 40.000 0.017 1.000 Y NA
 3743253 3743254 CLC_1820 CLC_1821   recN FALSE 0.046 299.000 0.000 1.000 N NA
 3743254 3743255 CLC_1821 CLC_1822 recN argR TRUE 0.971 13.000 0.086 1.000 N NA
 3743255 3743256 CLC_1822 CLC_1823 argR ppnK TRUE 0.982 2.000 0.117 1.000 N NA
 3743256 3743257 CLC_1823 CLC_1824 ppnK   TRUE 0.985 0.000 0.120 1.000 N NA
 3743257 3743258 CLC_1824 CLC_1825   dxs TRUE 0.975 22.000 0.189 1.000 N NA
 3743258 3743259 CLC_1825 CLC_1826 dxs   TRUE 0.965 1.000 0.037 NA   NA
 3743259 3743260 CLC_1826 CLC_1827   ispA FALSE 0.001 801.000 0.000 NA   NA
 3743260 3743261 CLC_1827 CLC_1828 ispA xseB TRUE 0.733 125.000 0.053 1.000 N NA
 3743261 3743262 CLC_1828 CLC_1829 xseB xseA TRUE 0.958 123.000 0.412 0.001 Y NA
 3743262 3743263 CLC_1829 CLC_1830 xseA nusB TRUE 0.800 71.000 0.043 1.000 N NA
 3743263 3743264 CLC_1830 CLC_1831 nusB asp TRUE 0.772 139.000 0.223 NA   NA
 3743264 3743265 CLC_1831 CLC_1832 asp   TRUE 0.754 82.000 0.108 NA   NA
 3743265 3743266 CLC_1832 CLC_1833     TRUE 0.906 62.000 0.407 NA   NA
 3743266 3743267 CLC_1833 CLC_1834   spoIIIAF TRUE 0.903 138.000 0.907 NA   NA
 3743267 3743268 CLC_1834 CLC_1835 spoIIIAF   TRUE 0.977 36.000 0.918 NA   NA
 3743268 3743269 CLC_1835 CLC_1836     TRUE 0.991 9.000 0.864 NA   NA
 3743269 3743270 CLC_1836 CLC_1837     TRUE 0.987 27.000 0.895 NA   NA
 3743270 3743271 CLC_1837 CLC_1838     TRUE 0.969 43.000 0.926 NA   NA
 3743271 3743272 CLC_1838 CLC_1839     TRUE 0.965 37.000 0.604 NA   NA
 3743272 3743273 CLC_1839 CLC_1840     FALSE 0.532 195.000 0.112 NA   NA
 3743273 3743274 CLC_1840 CLC_1841   efp TRUE 0.851 41.000 0.037 NA   NA
 3743274 3743275 CLC_1841 CLC_1842 efp aroQ TRUE 0.678 89.000 0.010 1.000 N NA
 3743275 3743276 CLC_1842 CLC_1843 aroQ aroK TRUE 0.801 155.000 0.015 1.000 Y NA
 3743276 3743277 CLC_1843 CLC_1844 aroK   FALSE 0.572 134.000 0.020 NA   NA
 3743277 3743278 CLC_1844 CLC_1845     TRUE 0.993 6.000 1.000 NA   NA
 3743278 3743279 CLC_1845 CLC_1846     TRUE 0.977 16.000 0.333 NA   NA
 3743279 3743280 CLC_1846 CLC_1847     TRUE 0.977 28.000 0.500 NA   NA
 3743280 3743281 CLC_1847 CLC_1848     TRUE 0.994 -21.000 0.500 NA   NA
 3743281 3743282 CLC_1848 CLC_1849     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 3743282 3743283 CLC_1849 CLC_1850     TRUE 0.995 -19.000 0.667 NA   NA
 3743283 3743284 CLC_1850 CLC_1851     FALSE 0.084 402.000 0.250 NA   NA
 3743284 3743285 CLC_1851 CLC_1852     TRUE 0.788 186.000 0.109 NA Y NA
 3743285 3743286 CLC_1852 CLC_1853     TRUE 0.890 145.000 0.135 1.000 Y NA
 3743286 3743287 CLC_1853 CLC_1854     FALSE 0.148 149.000 0.000 NA   NA
 3743287 3743288 CLC_1854 CLC_1855     FALSE 0.175 96.000 0.000 NA   NA
 3743288 3743289 CLC_1855 CLC_1856   dapF TRUE 0.766 1.000 0.000 NA   NA
 3743290 3743291 CLC_1857 CLC_1858   truA-1 TRUE 0.699 69.000 0.005 NA N NA
 3743292 3743293 CLC_1859 CLC_1860     FALSE 0.459 36.000 0.000 NA   NA
 3743295 3743296 CLC_1862 CLC_1863     FALSE 0.002 505.000 0.000 NA   NA
 3743296 3743297 CLC_1863 CLC_1864   cloSI FALSE 0.004 470.000 0.000 1.000   NA
 3743298 3743299 CLC_1865 CLC_1866     TRUE 0.986 2.000 0.333 NA   NA
 3743299 3743300 CLC_1866 CLC_1867     TRUE 0.998 -10.000 0.857 1.000 Y NA
 3743303 3743304 CLC_1870 CLC_1871     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3743304 3743305 CLC_1871 CLC_1872     FALSE 0.282 283.000 0.222 NA   NA
 3743305 3743306 CLC_1872 CLC_1873     TRUE 0.795 189.000 0.714 NA   NA
 3743306 3743307 CLC_1873 CLC_1874     TRUE 0.992 0.000 0.625 NA   NA
 3743309 3743310 CLC_1876 CLC_1877     TRUE 0.999 -3.000 0.933 0.006 Y NA
 3743312 3743313 CLC_1879 CLC_1880 moeB moaD TRUE 0.991 2.000 0.571 1.000   NA
 3743313 3743314 CLC_1880 CLC_1881 moaD aor FALSE 0.602 153.000 0.033 1.000   NA
 3743314 3743315 CLC_1881 CLC_1882 aor aorR FALSE 0.012 409.000 0.000 1.000 N NA
 3743315 3743316 CLC_1882 CLC_1883 aorR   TRUE 0.948 50.000 0.500 1.000   NA
 3743316 3743317 CLC_1883 CLC_1884   moaC TRUE 0.951 2.000 0.006 1.000   NA
 3743317 3743318 CLC_1884 CLC_1885 moaC moaA TRUE 0.993 4.000 0.071 0.002 Y NA
 3743318 3743319 CLC_1885 CLC_1886 moaA   TRUE 0.951 59.000 0.053 0.002 Y NA
 3743319 3743320 CLC_1886 CLC_1887   moeA TRUE 0.996 12.000 0.481 0.002 Y NA
 3743320 3743321 CLC_1887 CLC_1888 moeA mog TRUE 0.985 24.000 0.017 0.002 Y NA
 3743321 3743322 CLC_1888 CLC_1889 mog tupC TRUE 0.644 95.000 0.006 1.000 N NA
 3743322 3743323 CLC_1889 CLC_1890 tupC tupB TRUE 0.992 -3.000 0.389 1.000 N NA
 3743323 3743324 CLC_1890 CLC_1891 tupB   TRUE 0.996 9.000 0.524 0.031 Y NA
 3743324 3743325 CLC_1891 CLC_1892     FALSE 0.140 219.000 0.000 1.000 N NA
 3743325 3743326 CLC_1892 CLC_1893     TRUE 0.973 0.000 0.071 NA   NA
 3743326 3743327 CLC_1893 CLC_1894     FALSE 0.039 241.000 0.000 NA   NA
 3743327 3743328 CLC_1894 CLC_1895     FALSE 0.012 322.000 0.000 NA   NA
 3743328 3743329 CLC_1895 CLC_1896     TRUE 0.988 15.000 0.667 1.000   NA
 3743331 3743332 CLC_1898 CLC_1899     TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.006 Y NA
 3743333 3743334 CLC_1900 CLC_1901     FALSE 0.004 419.000 0.000 NA   NA
 3743334 3743335 CLC_1901 CLC_1902     FALSE 0.001 1294.000 0.000 NA   NA
 3743335 3743336 CLC_1902 CLC_1903     TRUE 0.724 22.000 0.000 1.000   NA
 3743337 3743338 CLC_1904 CLC_1905     FALSE 0.016 363.000 0.000 NA N NA
 3743338 3743339 CLC_1905 CLC_1906     TRUE 0.955 13.000 0.028 NA N NA
 3743339 3743340 CLC_1906 CLC_1907     FALSE 0.585 42.000 0.000 NA N NA
 3743340 3743341 CLC_1907 CLC_1908     TRUE 0.990 22.000 0.800 1.000 N NA
 3743342 3743343 CLC_1909 CLC_1910     FALSE 0.459 36.000 0.000 NA   NA
 3743343 3743344 CLC_1910 CLC_1911     FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 3743344 3743345 CLC_1911 CLC_1912     FALSE 0.177 94.000 0.000 NA   NA
 3743346 3743347 CLC_1913 CLC_1914     TRUE 0.999 -10.000 0.750 0.018 Y NA
 3743347 3743348 CLC_1914 CLC_1915     FALSE 0.128 161.000 0.000 NA   NA
 3743348 3743349 CLC_1915 CLC_1916     FALSE 0.060 214.000 0.000 NA   NA
 3743349 3743350 CLC_1916 CLC_1917     TRUE 0.941 26.000 0.061 NA   NA
 3743350 3743351 CLC_1917 CLC_1918     TRUE 0.950 45.000 0.469 1.000   NA
 3743351 3743352 CLC_1918 CLC_1919     TRUE 0.972 3.000 0.103 NA   NA
 3743352 3743353 CLC_1919 CLC_1920     TRUE 0.737 161.000 0.250 NA   NA
 3743354 3743355 CLC_1921 CLC_1922     FALSE 0.471 83.000 0.000 0.006   NA
 3743355 3743356 CLC_1922 CLC_1923     TRUE 0.996 -10.000 0.500 0.006   NA
 3743356 3743357 CLC_1923 CLC_1924     TRUE 0.995 -10.000 0.400 0.006   NA
 3743357 3743358 CLC_1924 CLC_1925     TRUE 0.963 42.000 0.400 0.006   NA
 3743360 3743361 CLC_1927 CLC_1928 pcaC-2   TRUE 0.971 13.000 0.144 1.000   NA
 3743361 3743362 CLC_1928 CLC_1929     FALSE 0.140 181.000 0.000 1.000   NA
 3743363 3743364 CLC_1930 CLC_1931   hsp90 FALSE 0.005 598.000 0.000 1.000 N NA
 3743365 3743366 CLC_1932 CLC_1933   treP FALSE 0.007 482.000 0.000 1.000 N NA
 3743366 3743367 CLC_1933 CLC_1934 treP treC TRUE 0.963 82.000 0.650 1.000 Y NA
 3743367 3743368 CLC_1934 CLC_1935 treC treR TRUE 0.969 33.000 0.336 1.000 N NA
 3743369 3743370 CLC_1936 CLC_1937     FALSE 0.479 273.000 0.015 0.008 Y NA
 3743370 3743371 CLC_1937 CLC_1938     TRUE 0.994 1.000 0.217 1.000 Y NA
 3743371 3743372 CLC_1938 CLC_1939     TRUE 0.993 20.000 0.400 1.000 Y NA
 3743372 3743373 CLC_1939 CLC_1940     TRUE 0.666 200.000 0.222 1.000 N NA
 3743373 3743374 CLC_1940 CLC_1941     FALSE 0.195 84.000 0.000 NA   NA
 3743376 3743377 CLC_1943 CLC_1944     FALSE 0.030 264.000 0.000 NA   NA
 3743379 3743380 CLC_1946 CLC_1947     FALSE 0.163 131.000 0.000 NA   NA
 3743380 3743381 CLC_1947 CLC_1948     TRUE 0.806 -6.000 0.000 NA   NA
 3743381 3743382 CLC_1948 CLC_1949     FALSE 0.254 65.000 0.000 NA   NA
 3743382 3743383 CLC_1949 CLC_1950     FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 3743385 3743386 CLC_1952 CLC_1953     TRUE 0.977 16.000 0.273 1.000   NA
 3743386 3743387 CLC_1953 CLC_1954     FALSE 0.005 443.000 0.000 1.000   NA
 3743387 3743388 CLC_1954 CLC_1955     FALSE 0.043 234.000 0.000 NA   NA
 3743388 3743389 CLC_1955 CLC_1956     FALSE 0.032 260.000 0.000 NA   NA
 3743390 3743391 CLC_1957 CLC_1958     FALSE 0.012 320.000 0.000 NA   NA
 3743394 3743395 CLC_1961 CLC_1962 aspB-2   TRUE 0.985 20.000 0.088 1.000 Y NA
 3743395 3743396 CLC_1962 CLC_1963     TRUE 0.837 -13.000 0.000 NA   NA
 3743396 3743397 CLC_1963 CLC_1964     FALSE 0.191 86.000 0.000 NA   NA
 3743397 3743398 CLC_1964 CLC_1965     FALSE 0.007 365.000 0.000 NA   NA
 3743398 3743399 CLC_1965 CLC_1966   cat-2 FALSE 0.366 113.000 0.000 1.000 N NA
 3743399 3743400 CLC_1966 CLC_1967 cat-2   FALSE 0.002 495.000 0.000 NA   NA
 3743400 3743401 CLC_1967 CLC_1968     FALSE 0.173 100.000 0.000 NA   NA
 3743401 3743402 CLC_1968 CLC_1969     TRUE 0.632 24.000 0.000 NA   NA
 3743402 3743403 CLC_1969 CLC_1970     FALSE 0.160 138.000 0.000 NA   NA
 3743403 3743404 CLC_1970 CLC_1971     FALSE 0.226 74.000 0.000 NA   NA
 3743404 3743405 CLC_1971 CLC_1972     FALSE 0.050 225.000 0.000 NA   NA
 3743405 3743406 CLC_1972 CLC_1973     FALSE 0.096 183.000 0.000 NA   NA
 3743406 3743407 CLC_1973 CLC_1974     FALSE 0.184 90.000 0.000 NA   NA
 3743407 3743408 CLC_1974 CLC_1975     FALSE 0.194 311.000 0.000 0.002 Y NA
 3743409 3743410 CLC_1976 CLC_1977 pepQ pepIP TRUE 0.790 82.000 0.054 0.032   NA
 3743411 3743412 CLC_1978 CLC_1979     TRUE 0.929 17.000 0.019 NA   NA
 3743412 3743413 CLC_1979 CLC_1980     FALSE 0.007 409.000 0.000 1.000   NA
 3743414 3743415 CLC_1981 CLC_1982     TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 3743416 3743417 CLC_1983 CLC_1984     FALSE 0.044 233.000 0.000 NA   NA
 3743417 3743418 CLC_1984 CLC_1985     FALSE 0.003 473.000 0.000 NA   NA
 3743418 3743419 CLC_1985 CLC_1986     FALSE 0.173 105.000 0.000 NA   NA
 3743419 3743420 CLC_1986 CLC_1987     TRUE 0.986 15.000 0.600 NA   NA
 3743420 3743421 CLC_1987 CLC_1988     TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 3743421 3743422 CLC_1988 CLC_1989     TRUE 0.860 122.000 0.500 NA   NA
 3743422 3743423 CLC_1989 CLC_1990     FALSE 0.244 304.000 0.231 1.000   NA
 3743423 3743424 CLC_1990 CLC_1991     FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 3743424 3743425 CLC_1991 CLC_1992     FALSE 0.069 206.000 0.000 NA   NA
 3743425 3743426 CLC_1992 CLC_1993     FALSE 0.157 142.000 0.000 NA   NA
 3743428 3743429 CLC_1995 CLC_1996     TRUE 0.826 44.000 0.027 NA   NA
 3743429 3743430 CLC_1996 CLC_1997     TRUE 0.657 92.000 0.027 1.000   NA
 3743430 3743431 CLC_1997 CLC_1998     FALSE 0.371 46.000 0.000 NA   NA
 3743432 3743433 CLC_1999 CLC_2000   rfbB TRUE 0.961 42.000 0.087 1.000 Y NA
 3743433 3743434 CLC_2000 CLC_2001 rfbB   FALSE 0.024 277.000 0.000 NA   NA
 3743434 3743435 CLC_2001 CLC_2002     FALSE 0.035 251.000 0.000 NA   NA
 3743436 3743437 CLC_2003 CLC_2004     FALSE 0.011 331.000 0.000 NA   NA
 3743437 3743438 CLC_2004 CLC_2005     TRUE 0.814 -7.000 0.000 NA   NA
 3743438 3743439 CLC_2005 CLC_2006     FALSE 0.001 851.000 0.000 NA   NA
 3743439 3743440 CLC_2006 CLC_2007     FALSE 0.035 250.000 0.000 NA   NA
 3743440 3743441 CLC_2007 CLC_2008     FALSE 0.027 268.000 0.000 NA   NA
 3743441 3743442 CLC_2008 CLC_2009     TRUE 0.993 -6.000 0.600 NA   NA
 3743442 3743443 CLC_2009 CLC_2010     TRUE 0.989 0.000 0.250 1.000 N NA
 3743443 3743444 CLC_2010 CLC_2011     FALSE 0.004 628.000 0.000 1.000 N NA
 3743444 3743445 CLC_2011 CLC_2012     TRUE 0.990 -7.000 0.312 NA   NA
 3743445 3743446 CLC_2012 CLC_2013     FALSE 0.036 249.000 0.000 NA   NA
 3743446 3743447 CLC_2013 CLC_2014     FALSE 0.173 119.000 0.000 NA   NA
 3743447 3743448 CLC_2014 CLC_2015   codA TRUE 0.636 23.000 0.000 NA   NA
 3743448 3743449 CLC_2015 CLC_2016 codA   TRUE 0.973 44.000 0.250 1.000 Y NA
 3743449 3743450 CLC_2016 CLC_2017     FALSE 0.009 345.000 0.000 NA   NA
 3743450 3743451 CLC_2017 CLC_2018     FALSE 0.479 167.000 0.018 NA   NA
 3743451 3743452 CLC_2018 CLC_2019     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3743452 3743453 CLC_2019 CLC_2020     FALSE 0.001 765.000 0.000 NA   NA
 3743453 3743454 CLC_2020 CLC_2021     TRUE 0.989 14.000 0.750 1.000   NA
 3743454 3743455 CLC_2021 CLC_2022     TRUE 0.995 -3.000 0.917 NA   NA
 3743457 3743458 CLC_2024 CLC_2025     FALSE 0.003 490.000 0.000 NA   NA
 3743458 3743459 CLC_2025 CLC_2026     FALSE 0.025 274.000 0.000 NA   NA
 3743461 3743462 CLC_2028 CLC_2029     FALSE 0.292 58.000 0.000 NA   NA
 3743462 3743463 CLC_2029 CLC_2030     FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 3743463 3743464 CLC_2030 CLC_2031     FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 3743464 3743465 CLC_2031 CLC_2032     TRUE 0.995 -7.000 0.140 1.000 Y NA
 3743465 3743466 CLC_2032 CLC_2033     FALSE 0.005 406.000 0.000 NA   NA
 3743466 3743467 CLC_2033 CLC_2034     FALSE 0.257 64.000 0.000 NA   NA
 3743467 3743468 CLC_2034 CLC_2035     FALSE 0.033 256.000 0.000 NA   NA
 3743468 3743469 CLC_2035 CLC_2036     FALSE 0.036 248.000 0.000 NA   NA
 3743469 3743470 CLC_2036 CLC_2037     TRUE 0.646 18.000 0.000 NA   NA
 3743470 3743471 CLC_2037 CLC_2038     FALSE 0.013 316.000 0.000 NA   NA
 3743471 3743472 CLC_2038 CLC_2039     FALSE 0.237 70.000 0.000 NA   NA
 3743472 3743473 CLC_2039 CLC_2040     FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 3743473 3743474 CLC_2040 CLC_2041     FALSE 0.455 49.000 0.000 1.000   NA
 3743474 3743475 CLC_2041 CLC_2042     FALSE 0.170 121.000 0.000 NA   NA