MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum A str. Hall

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3741468 3741469 CLC_0001 CLC_0002 dnaA dnaN TRUE 0.675 263.000 0.328 1.000 Y NA
 3741469 3741470 CLC_0002 CLC_0003 dnaN   TRUE 0.960 19.000 0.103 1.000   NA
 3741470 3741471 CLC_0003 CLC_0004   recF TRUE 0.853 69.000 0.209 1.000   NA
 3741471 3741472 CLC_0004 CLC_0005 recF   TRUE 0.928 21.000 0.024 NA   NA
 3741472 3741473 CLC_0005 CLC_0006   gyrB TRUE 0.925 18.000 0.017 NA   NA
 3741473 3741474 CLC_0006 CLC_0007 gyrB gyrA TRUE 0.993 26.000 0.306 0.002 Y NA
 3741474 3741475 CLC_0007 CLC_0008 gyrA rrsA FALSE 0.004 415.000 0.000 NA   NA
 3741475 3741476 CLC_0008 CLC_0011 rrsA rrlA FALSE 0.054 221.000 0.000 NA   NA
 3741476 3741477 CLC_0011 CLC_0012 rrlA rrfA FALSE 0.180 92.000 0.000 NA   NA
 3741477 3741478 CLC_0012 CLC_0013 rrfA   TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3741478 3741479 CLC_0013 CLC_0015     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3741479 3741480 CLC_0015 CLC_0017     FALSE 0.121 165.000 0.000 NA   NA
 3741480 3741481 CLC_0017 CLC_0018     TRUE 0.938 16.000 0.029 NA   NA
 3741481 3741482 CLC_0018 CLC_0019     TRUE 0.957 2.000 0.014 1.000   NA
 3741482 3741483 CLC_0019 CLC_0020     TRUE 0.948 5.000 0.011 1.000   NA
 3741483 3741484 CLC_0020 CLC_0021     FALSE 0.558 137.000 0.016 NA   NA
 3741484 3741485 CLC_0021 CLC_0022     TRUE 0.966 25.000 0.214 NA   NA
 3741485 3741486 CLC_0022 CLC_0023     TRUE 0.978 17.000 0.370 NA   NA
 3741486 3741487 CLC_0023 CLC_0024   serS-1 FALSE 0.007 370.000 0.000 NA   NA
 3741487 3741488 CLC_0024 CLC_0025 serS-1   FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3741488 3741489 CLC_0025 CLC_0027     TRUE 0.637 21.000 0.000 NA   NA
 3741489 3741490 CLC_0027 CLC_0029     FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 3741490 3741491 CLC_0029 CLC_0031     TRUE 0.637 21.000 0.000 NA   NA
 3741491 3741492 CLC_0031 CLC_0033     FALSE 0.193 85.000 0.000 NA   NA
 3741493 3741494 CLC_0035 CLC_0036 psd-1   FALSE 0.002 493.000 0.000 NA   NA
 3741495 3741496 CLC_0037 CLC_0038     FALSE 0.230 73.000 0.000 NA   NA
 3741496 3741497 CLC_0038 CLC_0039     TRUE 0.989 9.000 0.667 NA   NA
 3741497 3741498 CLC_0039 CLC_0040     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3741498 3741499 CLC_0040 CLC_0041     TRUE 0.654 17.000 0.000 NA   NA
 3741500 3741501 CLC_0042 CLC_0043 psd-2   FALSE 0.612 103.000 0.026 NA   NA
 3741501 3741502 CLC_0043 CLC_0044     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3741503 3741504 CLC_0045 CLC_0046     FALSE 0.162 134.000 0.000 NA   NA
 3741504 3741505 CLC_0046 CLC_0047   megL TRUE 0.645 160.000 0.034 1.000 N NA
 3741505 3741506 CLC_0047 CLC_0048 megL   FALSE 0.354 124.000 0.000 1.000 N NA
 3741506 3741507 CLC_0048 CLC_0049     FALSE 0.120 166.000 0.000 NA   NA
 3741507 10195466 CLC_0049 CLC_3700   srpB FALSE 0.167 124.000 0.000 NA   NA
 10195466 3741508 CLC_3700 CLC_0051 srpB dnaX FALSE 0.123 164.000 0.000 NA   NA
 3741508 3741509 CLC_0051 CLC_0052 dnaX   TRUE 0.801 65.000 0.100 NA   NA
 3741509 3741510 CLC_0052 CLC_0053   recR TRUE 0.973 33.000 0.604 NA   NA
 3741510 3741511 CLC_0053 CLC_0054 recR   TRUE 0.817 57.000 0.071 NA   NA
 3741511 3741512 CLC_0054 CLC_0055   bofA TRUE 0.820 150.000 0.417 NA   NA
 3741512 3741513 CLC_0055 CLC_0056 bofA sfsA FALSE 0.473 151.000 0.005 NA   NA
 3741513 3741514 CLC_0056 CLC_0057 sfsA   TRUE 0.744 56.000 0.015 NA   NA
 3741514 3741515 CLC_0057 CLC_0058     FALSE 0.239 118.000 0.000 1.000   NA
 3741515 3741516 CLC_0058 CLC_0059     FALSE 0.224 134.000 0.000 1.000   NA
 3741516 3741517 CLC_0059 CLC_0060     TRUE 0.969 19.000 0.222 NA   NA
 3741517 3741518 CLC_0060 CLC_0061     FALSE 0.006 383.000 0.000 NA   NA
 3741518 3741519 CLC_0061 CLC_0062     TRUE 0.682 83.000 0.007 1.000 N NA
 3741519 3741520 CLC_0062 CLC_0063     TRUE 0.942 29.000 0.035 1.000 N NA
 3741520 3741521 CLC_0063 CLC_0064   rrsB FALSE 0.006 387.000 0.000 NA   NA
 3741521 3741522 CLC_0064 CLC_0067 rrsB rrlB FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3741522 3741523 CLC_0067 CLC_0068 rrlB rrfB FALSE 0.169 122.000 0.000 NA   NA
 3741523 3741524 CLC_0068 CLC_0069 rrfB   TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3741526 3741527 CLC_0072 CLC_0075 rrsC rrlC FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3741527 3741528 CLC_0075 CLC_0076 rrlC rrfC FALSE 0.162 133.000 0.000 NA   NA
 3741528 3741529 CLC_0076 CLC_0077 rrfC   TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3741529 3741530 CLC_0077 CLC_0079     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 3741530 3741531 CLC_0079 CLC_0080     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 3741531 3741532 CLC_0080 CLC_0081   rrsE FALSE 0.002 645.000 0.000 NA   NA
 3741532 3741533 CLC_0081 CLC_0084 rrsE rrlE FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3741533 3741534 CLC_0084 CLC_0085 rrlE rrfE FALSE 0.336 53.000 0.000 NA   NA
 3741534 3741535 CLC_0085 CLC_0086 rrfE   TRUE 0.709 8.000 0.000 NA   NA
 3741535 3741536 CLC_0086 CLC_0088     FALSE 0.158 141.000 0.000 NA   NA
 3741536 3741537 CLC_0088 CLC_0089   rrsF FALSE 0.002 522.000 0.000 NA   NA
 3741537 3741538 CLC_0089 CLC_0092 rrsF rrlF FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3741538 3741539 CLC_0092 CLC_0093 rrlF rrfF FALSE 0.173 106.000 0.000 NA   NA
 3741539 3741540 CLC_0093 CLC_0094 rrfF   FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 3741540 3741541 CLC_0094 CLC_0095     FALSE 0.201 82.000 0.000 NA   NA
 3741542 3741543 CLC_0096 CLC_0097     TRUE 0.906 36.000 0.039 NA N NA
 3741546 3741547 CLC_0100 CLC_0101     TRUE 0.987 -21.000 0.120 NA   NA
 3741547 3741548 CLC_0101 CLC_0102     TRUE 0.955 24.000 0.034 1.000 N NA
 3741548 3741549 CLC_0102 CLC_0103     TRUE 0.681 81.000 0.034 NA   NA
 3741549 3741550 CLC_0103 CLC_0104     TRUE 0.925 18.000 0.018 NA   NA
 3741550 3741551 CLC_0104 CLC_0105     TRUE 0.986 2.000 0.372 NA   NA
 3741551 3741552 CLC_0105 CLC_0106     TRUE 0.931 12.000 0.011 NA   NA
 3741552 3741553 CLC_0106 CLC_0107     TRUE 0.860 82.000 0.333 1.000   NA
 3741553 3741554 CLC_0107 CLC_0108     FALSE 0.569 121.000 0.006 1.000   NA
 3741554 3741555 CLC_0108 CLC_0109     TRUE 0.968 20.000 0.078 0.010   NA
 3741555 3741556 CLC_0109 CLC_0110     FALSE 0.433 156.000 0.002 NA   NA
 3741558 3741559 CLC_0112 CLC_0113   arcA-1 FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 3741560 3741561 CLC_0114 CLC_0115 ispF   FALSE 0.586 76.000 0.003 NA   NA
 3741564 3741565 CLC_0118 CLC_0119 spmA   TRUE 0.992 13.000 0.655 0.003   NA
 3741567 3741568 CLC_0121 CLC_0122 udgA   TRUE 0.929 29.000 0.016 1.000 N NA
 3741568 3741569 CLC_0122 CLC_0123   metG FALSE 0.016 382.000 0.000 1.000 N NA
 3741569 3741570 CLC_0123 CLC_0124 metG   FALSE 0.414 165.000 0.003 NA   NA
 3741570 3741571 CLC_0124 CLC_0125     FALSE 0.466 151.000 0.004 NA   NA
 3741571 3741572 CLC_0125 CLC_0126     FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 3741572 3741573 CLC_0126 CLC_0127     TRUE 0.706 73.000 0.020 1.000   NA
 3741573 3741574 CLC_0127 CLC_0128   ksgA TRUE 0.980 2.000 0.093 1.000 N NA
 3741574 3741575 CLC_0128 CLC_0129 ksgA   FALSE 0.610 79.000 0.010 NA   NA
 3741575 3741576 CLC_0129 CLC_0130     TRUE 0.759 157.000 0.278 NA   NA
 3741576 3741577 CLC_0130 CLC_0131     TRUE 0.676 169.000 0.188 NA   NA
 3741577 3741578 CLC_0131 CLC_0132     TRUE 0.665 168.000 0.167 NA   NA
 3741578 3741579 CLC_0132 CLC_0133     TRUE 0.986 11.000 0.350 1.000 N NA
 3741579 3741580 CLC_0133 CLC_0134     TRUE 0.996 -3.000 0.349 NA Y NA
 3741580 3741581 CLC_0134 CLC_0135     TRUE 0.698 82.000 0.019 NA N NA
 3741581 3741582 CLC_0135 CLC_0136     FALSE 0.220 140.000 0.000 1.000   NA
 3741582 3741583 CLC_0136 CLC_0137     FALSE 0.222 75.000 0.000 NA   NA
 3741585 3741586 CLC_0139 CLC_0140     FALSE 0.302 57.000 0.000 NA   NA
 3741586 3741587 CLC_0140 CLC_0141   nrdD FALSE 0.020 290.000 0.000 NA   NA
 3741587 3741588 CLC_0141 CLC_0142 nrdD nrdG TRUE 0.988 17.000 0.315 0.001 N NA
 3741589 3741590 CLC_0143 CLC_0144     FALSE 0.160 138.000 0.000 NA   NA
 3741590 3741591 CLC_0144 CLC_0145     TRUE 0.974 2.000 0.111 NA   NA
 3741591 3741592 CLC_0145 CLC_0146     FALSE 0.170 121.000 0.000 NA   NA
 3741593 3741594 CLC_0147 CLC_0148 ileS   FALSE 0.601 151.000 0.009 1.000 N NA
 3741594 3741595 CLC_0148 CLC_0149     FALSE 0.386 216.000 0.017 1.000 N NA
 3741595 3741596 CLC_0149 CLC_0150     TRUE 0.854 75.000 0.160 1.000 N NA
 3741596 3741597 CLC_0150 CLC_0151     FALSE 0.010 336.000 0.000 NA   NA
 3741597 3741598 CLC_0151 CLC_0152     TRUE 0.964 5.000 0.066 NA   NA
 3741598 3741599 CLC_0152 CLC_0153     TRUE 0.970 20.000 0.210 1.000   NA
 3741599 3741600 CLC_0153 CLC_0154     FALSE 0.073 225.000 0.000 1.000   NA
 3741600 3741601 CLC_0154 CLC_0155     TRUE 0.709 187.000 0.333 1.000   NA
 3741603 3741604 CLC_0157 CLC_0158     TRUE 0.965 15.000 0.143 NA   NA
 3741604 3741605 CLC_0158 CLC_0159     TRUE 0.967 27.000 0.250 NA   NA
 3741605 3741606 CLC_0159 CLC_0160     TRUE 0.989 13.000 0.800 NA   NA
 3741608 3741609 CLC_0162 CLC_0163 cotS   TRUE 0.722 124.000 0.119 NA   NA
 3741609 3741610 CLC_0163 CLC_0164     FALSE 0.530 196.000 0.116 NA   NA
 3741610 3741611 CLC_0164 CLC_0165     TRUE 0.694 104.000 0.082 NA   NA
 3741611 3741612 CLC_0165 CLC_0166     FALSE 0.018 297.000 0.000 NA   NA
 3741612 3741613 CLC_0166 CLC_0167   cphB TRUE 0.856 -30.000 0.000 NA   NA
 3741613 3741614 CLC_0167 CLC_0168 cphB cphA TRUE 0.967 44.000 0.605 1.000 N NA
 3741614 3741615 CLC_0168 CLC_0169 cphA ispE TRUE 0.685 93.000 0.016 1.000 N NA
 3741615 3741616 CLC_0169 CLC_0170 ispE   FALSE 0.425 166.000 0.005 NA   NA
 3741616 3741617 CLC_0170 CLC_0171     TRUE 0.840 60.000 0.133 NA   NA
 3741617 3741618 CLC_0171 CLC_0172     TRUE 0.984 20.000 0.333 0.008   NA
 3741618 3741619 CLC_0172 CLC_0173     TRUE 0.961 50.000 0.500 0.008   NA
 3741619 3741620 CLC_0173 CLC_0174     TRUE 0.786 73.000 0.109 NA   NA
 3741622 3741623 CLC_0176 CLC_0177 ypeB   FALSE 0.552 103.000 0.003 1.000   NA
 3741623 3741624 CLC_0177 CLC_0178     TRUE 0.910 25.000 0.011 NA   NA
 3741624 3741625 CLC_0178 CLC_0179     TRUE 0.626 132.000 0.039 NA   NA
 3741625 3741626 CLC_0179 CLC_0180   pyrG FALSE 0.192 234.000 0.004 NA   NA
 3741626 3741627 CLC_0180 CLC_0181 pyrG   FALSE 0.003 448.000 0.000 NA   NA
 3741627 3741628 CLC_0181 CLC_0182   rho FALSE 0.412 172.000 0.006 NA   NA
 3741630 3741631 CLC_0184 CLC_0185 tdk   TRUE 0.918 17.000 0.010 NA   NA
 3741631 3741632 CLC_0185 CLC_0186   hemK TRUE 0.966 8.000 0.098 NA   NA
 3741632 3741633 CLC_0186 CLC_0187 hemK prfA TRUE 0.902 82.000 0.081 1.000 Y NA
 3741633 3741634 CLC_0187 CLC_0188 prfA   TRUE 0.893 28.000 0.009 NA   NA
 3741634 3741635 CLC_0188 CLC_0189     TRUE 0.831 60.000 0.116 NA   NA
 3741635 3741636 CLC_0189 CLC_0190     TRUE 0.956 21.000 0.052 NA N NA
 3741636 3741637 CLC_0190 CLC_0191     TRUE 0.968 9.000 0.056 NA N NA
 3741637 3741638 CLC_0191 CLC_0192   rpiB TRUE 0.850 60.000 0.065 1.000 N NA
 3741638 3741639 CLC_0192 CLC_0193 rpiB upp TRUE 0.927 30.000 0.019 1.000 N NA
 3741639 3741640 CLC_0193 CLC_0194 upp   FALSE 0.068 507.000 0.041 1.000 Y NA
 3741640 3741641 CLC_0194 CLC_0195   tagO TRUE 0.709 108.000 0.029 1.000 N NA
 3741641 3741642 CLC_0195 CLC_0196 tagO mnaA TRUE 0.993 14.000 0.346 1.000 Y NA
 3741642 3741643 CLC_0196 CLC_0197 mnaA   FALSE 0.004 492.000 0.000 1.000   NA
 3741643 3741644 CLC_0197 CLC_0198   atpB TRUE 0.980 15.000 0.330 1.000   NA
 3741644 3741645 CLC_0198 CLC_0199 atpB atpE TRUE 0.880 40.000 0.009 0.008   NA
 3741645 3741646 CLC_0199 CLC_0200 atpE atpF TRUE 0.839 76.000 0.095 0.008   NA
 3741646 3741647 CLC_0200 CLC_0201 atpF atpH TRUE 0.992 3.000 0.040 0.008 Y NA
 3741647 3741648 CLC_0201 CLC_0202 atpH atpA TRUE 0.998 11.000 0.864 0.008 Y NA
 3741648 3741649 CLC_0202 CLC_0203 atpA atpG TRUE 0.997 22.000 0.846 0.008 Y NA
 3741649 3741650 CLC_0203 CLC_0204 atpG atpD TRUE 0.997 14.000 0.724 0.008 Y NA
 3741650 3741651 CLC_0204 CLC_0205 atpD atpC TRUE 0.997 25.000 0.837 0.008 Y NA
 3741651 3741652 CLC_0205 CLC_0206 atpC   FALSE 0.346 193.000 0.007 NA   NA
 3741652 3741653 CLC_0206 CLC_0207   murA-1 TRUE 0.975 24.000 0.346 NA   NA
 3741653 3741654 CLC_0207 CLC_0208 murA-1 spoIID FALSE 0.415 270.000 0.243 1.000 N NA
 3741654 3741655 CLC_0208 CLC_0209 spoIID   FALSE 0.033 532.000 0.090 1.000 N NA
 3741655 3741656 CLC_0209 CLC_0210   spoIIID TRUE 0.728 108.000 0.093 1.000   NA
 3741656 3741657 CLC_0210 CLC_0211 spoIIID   TRUE 0.825 100.000 0.284 1.000   NA
 3741658 3741659 CLC_0212 CLC_0213     TRUE 0.768 49.000 0.010 NA   NA
 3741660 3741661 CLC_0214 CLC_0215     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3741661 3741662 CLC_0215 CLC_0217     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3741662 3741663 CLC_0217 CLC_0219     TRUE 0.646 18.000 0.000 NA   NA
 3741663 3741664 CLC_0219 CLC_0220     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3741664 3741665 CLC_0220 CLC_0222   metK FALSE 0.013 316.000 0.000 NA   NA
 3741665 3741666 CLC_0222 CLC_0223 metK   FALSE 0.566 191.000 0.052 1.000 N NA
 3741666 3741667 CLC_0223 CLC_0224     TRUE 0.938 26.000 0.051 NA   NA
 3741667 3741668 CLC_0224 CLC_0225     TRUE 0.987 -27.000 0.130 NA   NA
 3741668 3741669 CLC_0225 CLC_0226   yfiA FALSE 0.040 425.000 0.080 NA   NA
 3741669 3741670 CLC_0226 CLC_0227 yfiA secA FALSE 0.379 228.000 0.050 NA N NA
 3741670 3741671 CLC_0227 CLC_0228 secA prfB FALSE 0.089 364.000 0.048 1.000 N NA
 3741673 3741674 CLC_0230 CLC_0231     FALSE 0.021 284.000 0.000 NA   NA
 3741674 3741675 CLC_0231 CLC_0232     FALSE 0.028 411.000 0.016 NA   NA
 3741675 3741676 CLC_0232 CLC_0233     TRUE 0.982 21.000 0.500 NA   NA
 3741676 3741677 CLC_0233 CLC_0234     TRUE 0.960 14.000 0.077 1.000   NA
 3741677 3741678 CLC_0234 CLC_0235     TRUE 0.662 84.000 0.022 1.000   NA
 3741678 3741679 CLC_0235 CLC_0236     TRUE 0.905 40.000 0.109 1.000   NA
 3741681 3741682 CLC_0238 CLC_0239     FALSE 0.146 150.000 0.000 NA   NA
 3741683 3741684 CLC_0240 CLC_0241 leuS   FALSE 0.014 377.000 0.000 NA N NA
 3741686 3741687 CLC_0244 CLC_0245     TRUE 0.959 25.000 0.138 NA   NA
 3741687 3741688 CLC_0245 CLC_0246     FALSE 0.008 360.000 0.000 NA   NA
 3741688 3741689 CLC_0246 CLC_0247     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3741691 3741692 CLC_0249 CLC_0250 fba   FALSE 0.049 226.000 0.000 NA   NA
 3741692 3741693 CLC_0250 CLC_0251     TRUE 0.696 117.000 0.082 NA   NA
 3741694 3741695 CLC_0252 CLC_0253     FALSE 0.543 138.000 0.013 NA   NA
 3741697 3741698 CLC_0255 CLC_0256     TRUE 0.729 106.000 0.094 1.000   NA
 3741698 3741699 CLC_0256 CLC_0257     TRUE 0.856 74.000 0.281 NA   NA
 3741701 3741702 CLC_0259 CLC_0260   sleB FALSE 0.393 230.000 0.041 0.066   NA
 3741702 3741703 CLC_0260 CLC_0261 sleB cysK-1 FALSE 0.011 364.000 0.000 1.000   NA
 3741703 3741704 CLC_0261 CLC_0262 cysK-1 cysE TRUE 0.991 15.000 0.101 0.002 Y NA
 3741704 3741705 CLC_0262 CLC_0263 cysE   TRUE 0.962 22.000 0.064 1.000 N NA
 3741705 3741706 CLC_0263 CLC_0264     TRUE 0.718 148.000 0.064 1.000 N NA
 3741706 3741707 CLC_0264 CLC_0265   nth TRUE 0.667 93.000 0.011 1.000 N NA
 3741707 3741708 CLC_0265 CLC_0266 nth   FALSE 0.028 334.000 0.000 1.000 N NA
 3741709 3741710 CLC_0267 CLC_0268     TRUE 0.907 26.000 0.004 1.000   NA
 3741710 3741711 CLC_0268 CLC_0269     FALSE 0.589 110.000 0.018 NA   NA
 3741712 3741713 CLC_0270 CLC_0271     FALSE 0.450 205.000 0.000 1.000 Y NA
 3741713 3741714 CLC_0271 CLC_0272   splB TRUE 0.671 147.000 0.027 1.000 N NA
 3741714 3741715 CLC_0272 CLC_0273 splB   TRUE 0.636 128.000 0.008 1.000 N NA
 3741715 3741716 CLC_0273 CLC_0274     TRUE 0.933 13.000 0.016 NA   NA
 3741716 3741717 CLC_0274 CLC_0275     FALSE 0.019 294.000 0.000 NA   NA
 3741717 3741718 CLC_0275 CLC_0276     TRUE 0.639 166.000 0.097 1.000   NA
 3741718 3741719 CLC_0276 CLC_0277     TRUE 0.989 2.000 0.438 1.000   NA
 3741719 3741720 CLC_0277 CLC_0278     TRUE 0.996 -7.000 0.720 0.038   NA
 3741720 3741721 CLC_0278 CLC_0279     FALSE 0.579 112.000 0.007 1.000   NA
 3741721 3741722 CLC_0279 CLC_0280   rpoN FALSE 0.171 329.000 0.125 1.000 N NA
 3741722 3741723 CLC_0280 CLC_0281 rpoN cggR FALSE 0.383 288.000 0.034 1.000 Y NA
 3741723 3741724 CLC_0281 CLC_0282 cggR gap-1 TRUE 0.892 78.000 0.348 1.000 N NA
 3741724 3741725 CLC_0282 CLC_0283 gap-1 pgk FALSE 0.472 297.000 0.063 0.004 Y NA
 3741725 3741726 CLC_0283 CLC_0284 pgk tpiA TRUE 0.943 62.000 0.141 1.000 Y NA
 3741726 3741727 CLC_0284 CLC_0285 tpiA gpmI TRUE 0.908 92.000 0.138 1.000 Y NA
 3741727 3741728 CLC_0285 CLC_0286 gpmI eno TRUE 0.921 56.000 0.016 1.000 Y NA
 3741728 3741729 CLC_0286 CLC_0287 eno secG FALSE 0.320 223.000 0.006 1.000 N NA
 3741729 3741730 CLC_0287 CLC_0288 secG rnr FALSE 0.502 209.000 0.064 1.000 N NA
 3741730 3741731 CLC_0288 CLC_0289 rnr surE FALSE 0.007 409.000 0.000 1.000   NA
 3741731 3741732 CLC_0289 CLC_0290 surE smpB FALSE 0.048 257.000 0.000 1.000   NA
 3741734 3741735 CLC_0292 CLC_0293     FALSE 0.001 780.000 0.000 NA   NA
 3741735 3741736 CLC_0293 CLC_0295     FALSE 0.134 157.000 0.000 NA   NA
 3741736 3741737 CLC_0295 CLC_0296     FALSE 0.005 391.000 0.000 NA   NA
 3741738 3741739 CLC_0297 CLC_0298     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3741740 3741741 CLC_0299 CLC_0300     FALSE 0.212 188.000 0.000 1.000 N NA
 3741741 3741742 CLC_0300 CLC_0301     FALSE 0.012 359.000 0.000 1.000   NA
 3741742 3741743 CLC_0301 CLC_0302     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3741743 3741744 CLC_0302 CLC_0303     FALSE 0.010 341.000 0.000 NA   NA
 3741744 3741745 CLC_0303 CLC_0304     FALSE 0.002 502.000 0.000 NA   NA
 3741745 3741746 CLC_0304 CLC_0305   kdgT FALSE 0.091 212.000 0.000 1.000   NA
 3741746 3741747 CLC_0305 CLC_0306 kdgT   FALSE 0.087 214.000 0.000 1.000   NA
 3741747 3741748 CLC_0306 CLC_0307     TRUE 0.999 -22.000 1.000 1.000 Y NA
 3741748 3741749 CLC_0307 CLC_0308   lysP FALSE 0.005 557.000 0.000 1.000 N NA
 3741749 3741750 CLC_0308 CLC_0309 lysP   FALSE 0.003 544.000 0.000 1.000   NA
 3741750 3741751 CLC_0309 CLC_0310     FALSE 0.240 114.000 0.000 1.000   NA
 3741751 3741752 CLC_0310 CLC_0311     TRUE 0.707 26.000 0.000 1.000   NA
 3741752 3741753 CLC_0311 CLC_0312     FALSE 0.185 159.000 0.000 1.000   NA
 3741753 3741754 CLC_0312 CLC_0313     TRUE 0.945 26.000 0.050 1.000   NA
 3741754 3741755 CLC_0313 CLC_0314     TRUE 0.853 63.000 0.095 1.000 N NA
 3741755 3741756 CLC_0314 CLC_0315     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3741758 3741759 CLC_0317 CLC_0318     TRUE 0.998 0.000 0.800 0.042 Y NA
 3741759 3741760 CLC_0318 CLC_0319     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 3741760 3741761 CLC_0319 CLC_0320     FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 3741761 3741762 CLC_0320 CLC_0321     TRUE 0.695 11.000 0.000 NA   NA
 3741762 3741763 CLC_0321 CLC_0322     TRUE 0.637 22.000 0.000 NA   NA
 3741763 3741764 CLC_0322 CLC_0323     TRUE 0.964 25.000 0.091 1.000 N NA
 3741764 3741765 CLC_0323 CLC_0324     TRUE 0.997 -28.000 0.278 1.000 Y NA
 3741767 3741768 CLC_0326 CLC_0327 glvA-1   TRUE 0.901 163.000 0.294 1.000 Y NA
 3741769 3741770 CLC_0328 CLC_0329     TRUE 0.996 16.000 0.500 0.005 Y NA
 3741771 3741772 CLC_0330 CLC_0331     FALSE 0.365 98.000 0.000 1.000 N NA
 3741772 3741773 CLC_0331 CLC_0332     TRUE 0.992 10.000 0.235 1.000 Y NA
 3741773 3741774 CLC_0332 CLC_0333     TRUE 0.867 120.000 0.353 1.000 N NA
 3741774 3741775 CLC_0333 CLC_0334     TRUE 0.977 14.000 0.286 NA   NA
 3741775 3741776 CLC_0334 CLC_0335   alr-1 FALSE 0.040 240.000 0.000 NA   NA
 3741776 3741777 CLC_0335 CLC_0336 alr-1   FALSE 0.006 520.000 0.000 1.000 N NA
 3741777 3741778 CLC_0336 CLC_0337   glvA-2 FALSE 0.125 316.000 0.000 1.000 Y NA
 3741778 3741779 CLC_0337 CLC_0338 glvA-2   FALSE 0.128 314.000 0.000 1.000 Y NA
 3741779 3741780 CLC_0338 CLC_0339     FALSE 0.058 283.000 0.000 1.000 N NA
 3741782 3741783 CLC_0341 CLC_0342     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 3741783 3741784 CLC_0342 CLC_0343     FALSE 0.004 435.000 0.000 NA   NA
 3741784 3741785 CLC_0343 CLC_0344     TRUE 0.752 152.000 0.158 NA N NA
 3741785 3741786 CLC_0344 CLC_0345     TRUE 0.936 27.000 0.035 1.000   NA
 3741786 3741787 CLC_0345 CLC_0346     FALSE 0.005 438.000 0.000 1.000   NA
 3741787 3741788 CLC_0346 CLC_0347     TRUE 0.873 119.000 0.385 1.000 N NA
 3741788 3741789 CLC_0347 CLC_0348   glvA-3 TRUE 0.700 262.000 0.385 1.000 Y NA
 3741789 3741790 CLC_0348 CLC_0349 glvA-3   TRUE 0.993 13.000 0.375 1.000 Y NA
 3741790 3741791 CLC_0349 CLC_0350   ilvD TRUE 0.941 138.000 0.286 0.012 Y NA
 3741791 3741792 CLC_0350 CLC_0351 ilvD eda TRUE 0.961 52.000 0.091 0.065 Y NA
 3741792 3741793 CLC_0351 CLC_0352 eda   TRUE 0.991 2.000 0.091 1.000 Y NA
 3741793 3741794 CLC_0352 CLC_0353   ade FALSE 0.170 206.000 0.000 1.000 N NA
 3741794 3741795 CLC_0353 CLC_0354 ade   FALSE 0.013 402.000 0.000 1.000 N NA
 3741795 3741796 CLC_0354 CLC_0355     TRUE 0.998 0.000 0.889 1.000 Y NA
 3741796 3741797 CLC_0355 CLC_0356     FALSE 0.011 397.000 0.000 NA N NA
 3741797 3741798 CLC_0356 CLC_0357     TRUE 0.842 -16.000 0.000 NA   NA
 3741798 3741799 CLC_0357 CLC_0358     TRUE 0.904 119.000 0.750 1.000   NA
 3741799 3741800 CLC_0358 CLC_0359     FALSE 0.014 341.000 0.000 1.000   NA
 3741800 3741801 CLC_0359 CLC_0360     FALSE 0.077 264.000 0.000 1.000 N NA
 3741801 3741802 CLC_0360 CLC_0361     TRUE 0.993 3.000 0.167 1.000 Y NA
 3741802 3741803 CLC_0361 CLC_0362     TRUE 0.997 2.000 0.750 1.000 Y NA
 3741803 3741804 CLC_0362 CLC_0363     TRUE 0.713 35.000 0.000 1.000 N NA
 3741806 3741807 CLC_0365 CLC_0366     FALSE 0.273 61.000 0.000 NA   NA
 3741809 3741810 CLC_0368 CLC_0369     TRUE 0.942 27.000 0.000 1.000 Y NA
 3741810 3741811 CLC_0369 CLC_0370     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.038 Y NA
 3741811 3741812 CLC_0370 CLC_0371     TRUE 0.961 11.000 0.000 1.000 Y NA
 3741812 3741813 CLC_0371 CLC_0372     TRUE 0.915 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3741815 3741816 CLC_0374 CLC_0375   xpt-1 TRUE 0.981 23.000 0.032 1.000 Y NA
 3741816 3741817 CLC_0375 CLC_0376 xpt-1   FALSE 0.009 451.000 0.000 1.000 N NA
 3741817 3741818 CLC_0376 CLC_0377     TRUE 0.997 13.000 1.000 1.000 Y NA
 3741818 3741819 CLC_0377 CLC_0378     TRUE 0.739 176.000 0.222 1.000 N NA
 3741819 3741820 CLC_0378 CLC_0379     TRUE 0.993 15.000 0.333 1.000 Y NA
 3741820 3741821 CLC_0379 CLC_0380     TRUE 0.993 0.000 0.750 NA   NA
 3741821 3741822 CLC_0380 CLC_0381     TRUE 0.985 24.000 0.667 NA   NA
 3741822 3741823 CLC_0381 CLC_0382     FALSE 0.014 314.000 0.000 NA   NA
 3741823 3741824 CLC_0382 CLC_0383     TRUE 0.993 3.000 0.869 NA   NA
 3741824 3741825 CLC_0383 CLC_0384     FALSE 0.018 296.000 0.000 NA   NA
 3741825 3741826 CLC_0384 CLC_0385     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3741826 3741827 CLC_0385 CLC_0386     FALSE 0.516 135.000 0.006 NA   NA
 3741827 3741828 CLC_0386 CLC_0387     FALSE 0.012 324.000 0.000 NA   NA
 3741828 3741829 CLC_0387 CLC_0388     TRUE 0.855 179.000 1.000 NA   NA
 3741829 3741830 CLC_0388 CLC_0389     TRUE 0.993 -7.000 0.556 NA   NA
 3741830 3741831 CLC_0389 CLC_0390     TRUE 0.994 -16.000 0.556 NA   NA
 3741831 3741832 CLC_0390 CLC_0391     TRUE 0.824 72.000 0.179 NA   NA
 3741832 3741833 CLC_0391 CLC_0392     FALSE 0.116 231.000 0.000 1.000 N NA
 3741833 3741834 CLC_0392 CLC_0393     FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 3741834 3741835 CLC_0393 CLC_0394     TRUE 0.983 27.000 0.667 NA   NA
 3741835 3741836 CLC_0394 CLC_0395     FALSE 0.032 259.000 0.000 NA   NA
 3741836 3741837 CLC_0395 CLC_0396     TRUE 0.996 -13.000 1.000 NA   NA
 3741837 3741838 CLC_0396 CLC_0397     TRUE 0.917 95.000 1.000 NA   NA
 3741838 3741839 CLC_0397 CLC_0398     TRUE 0.930 81.000 1.000 NA   NA
 3741839 3741840 CLC_0398 CLC_0399     FALSE 0.090 233.000 0.000 NA N NA
 3741842 3741843 CLC_0401 CLC_0402     TRUE 0.957 119.000 0.667 1.000 Y NA
 3741843 3741844 CLC_0402 CLC_0403   adhE FALSE 0.010 428.000 0.000 1.000 N NA
 3741844 3741845 CLC_0403 CLC_0404 adhE   FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 3741845 3741846 CLC_0404 CLC_0405     TRUE 0.710 63.000 0.019 NA   NA
 3741847 3741848 CLC_0406 CLC_0407     FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 3741849 3741850 CLC_0408 CLC_0409     FALSE 0.007 411.000 0.000 1.000   NA
 3741850 3741851 CLC_0409 CLC_0410     TRUE 0.725 108.000 0.038 1.000 N NA
 3741851 3741852 CLC_0410 CLC_0411     TRUE 0.986 10.000 0.038 1.000 Y NA
 3741852 3741853 CLC_0411 CLC_0412     TRUE 0.800 63.000 0.091 NA   NA
 3741853 3741854 CLC_0412 CLC_0413     TRUE 0.873 44.000 0.087 NA   NA
 3741854 3741855 CLC_0413 CLC_0414     TRUE 0.947 26.000 0.087 NA   NA
 3741856 3741857 CLC_0415 CLC_0416     FALSE 0.077 200.000 0.000 NA   NA
 3741858 3741859 CLC_0417 CLC_0418     FALSE 0.124 192.000 0.000 1.000   NA
 3741859 3741860 CLC_0418 CLC_0419     FALSE 0.021 312.000 0.000 1.000   NA
 3741862 3741863 CLC_0421 CLC_0422     FALSE 0.550 131.000 0.013 NA   NA
 3741863 3741864 CLC_0422 CLC_0423     TRUE 0.988 -54.000 0.105 1.000   NA
 3741864 3741865 CLC_0423 CLC_0424     TRUE 0.997 -10.000 0.429 1.000 Y NA
 3741865 3741866 CLC_0424 CLC_0425     FALSE 0.365 108.000 0.000 1.000 N NA
 3741866 3741867 CLC_0425 CLC_0426     FALSE 0.003 1230.000 0.000 1.000 N NA
 3741867 3741868 CLC_0426 CLC_0427     TRUE 0.994 23.000 0.431 0.057 Y NA
 3741868 3741869 CLC_0427 CLC_0428     TRUE 0.998 0.000 0.678 0.057 Y NA
 3741869 3741870 CLC_0428 CLC_0429     TRUE 0.991 11.000 0.091 0.057 Y NA
 3741870 3741871 CLC_0429 CLC_0430     TRUE 0.974 51.000 0.237 0.057 Y NA
 3741871 3741872 CLC_0430 CLC_0431     TRUE 0.993 14.000 0.221 0.057 Y NA
 3741872 3741873 CLC_0431 CLC_0432     FALSE 0.006 380.000 0.000 NA   NA
 3741874 3741875 CLC_0433 CLC_0434     TRUE 0.947 18.000 0.059 NA   NA
 3741875 3741876 CLC_0434 CLC_0435     TRUE 0.793 115.000 0.231 NA   NA
 3741876 3741877 CLC_0435 CLC_0436     FALSE 0.004 848.000 0.000 1.000 N NA
 3741877 3741878 CLC_0436 CLC_0437     FALSE 0.004 677.000 0.000 1.000 N NA
 3741879 3741880 CLC_0438 CLC_0439   rnhA TRUE 0.967 -25.000 0.003 NA   NA
 3741880 3741881 CLC_0439 CLC_0440 rnhA   TRUE 0.643 63.000 0.003 NA   NA
 3741881 3741882 CLC_0440 CLC_0441     FALSE 0.098 181.000 0.000 NA   NA
 3741882 3741883 CLC_0441 CLC_0442     TRUE 0.977 32.000 0.429 0.030   NA
 3741883 3741884 CLC_0442 CLC_0443     FALSE 0.014 314.000 0.000 NA   NA
 3741884 3741885 CLC_0443 CLC_0444     FALSE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 3741885 3741886 CLC_0444 CLC_0445     FALSE 0.130 160.000 0.000 NA   NA
 3741886 3741887 CLC_0445 CLC_0446     FALSE 0.534 31.000 0.000 NA   NA
 3741889 3741890 CLC_0448 CLC_0449   clpB FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 3741892 3741893 CLC_0451 CLC_0452     FALSE 0.002 624.000 0.000 NA   NA
 3741893 3741894 CLC_0452 CLC_0453     FALSE 0.053 438.000 0.000 0.005 Y NA
 3741894 3741895 CLC_0453 CLC_0454     FALSE 0.012 352.000 0.000 1.000   NA
 3741895 3741896 CLC_0454 CLC_0455     TRUE 0.800 45.000 0.008 1.000   NA
 3741897 3741898 CLC_0456 CLC_0457     FALSE 0.175 294.000 0.000 1.000 Y NA
 3741898 3741899 CLC_0457 CLC_0458     TRUE 0.998 0.000 0.455 0.001 Y NA
 3741900 3741901 CLC_0459 CLC_0460     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 3741903 3741904 CLC_0462 CLC_0463     TRUE 0.994 3.000 0.313 NA Y NA
 3741904 3741905 CLC_0463 CLC_0464     FALSE 0.007 363.000 0.000 NA   NA
 3741905 3741906 CLC_0464 CLC_0465   pepP FALSE 0.055 220.000 0.000 NA   NA
 3741907 3741908 CLC_0466 CLC_0467     TRUE 0.951 58.000 0.796 1.000   NA
 3741909 3741910 CLC_0468 CLC_0469 manA   FALSE 0.009 349.000 0.000 NA   NA
 3741910 3741911 CLC_0469 CLC_0470     TRUE 0.864 108.000 0.500 NA   NA
 3741911 3741912 CLC_0470 CLC_0471   rrsG FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 3741912 3741913 CLC_0471 CLC_0472 rrsG   FALSE 0.155 144.000 0.000 NA   NA
 3741913 3741914 CLC_0472 CLC_0474     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3741914 3741915 CLC_0474 CLC_0477   rrlG FALSE 0.226 74.000 0.000 NA   NA
 3741915 3741916 CLC_0477 CLC_0478 rrlG rrfG FALSE 0.162 133.000 0.000 NA   NA
 3741916 3741917 CLC_0478 CLC_0479 rrfG   TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3741919 3741920 CLC_0482 CLC_0483     FALSE 0.004 745.000 0.000 1.000 N NA
 3741920 3741921 CLC_0483 CLC_0484     TRUE 0.733 144.000 0.027 0.064 N NA
 3741921 3741922 CLC_0484 CLC_0485     TRUE 0.973 36.000 0.054 0.064 Y NA
 3741922 3741923 CLC_0485 CLC_0486     FALSE 0.276 252.000 0.000 1.000 Y NA
 3741923 3741924 CLC_0486 CLC_0487     FALSE 0.006 519.000 0.000 1.000 N NA
 3741925 3741926 CLC_0488 CLC_0489   panD FALSE 0.544 88.000 0.004 NA   NA
 3741926 3741927 CLC_0489 CLC_0490 panD panC TRUE 0.922 149.000 0.342 1.000 Y NA
 3741927 3741928 CLC_0490 CLC_0491 panC panB TRUE 0.980 55.000 0.395 0.001 Y NA
 3741930 3741931 CLC_0493 CLC_0494     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3741931 3741932 CLC_0494 CLC_0495     FALSE 0.503 33.000 0.000 NA   NA
 3741932 3741933 CLC_0495 CLC_0496     TRUE 0.982 8.000 0.333 NA   NA
 3741934 3741935 CLC_0497 CLC_0498     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3741935 3741936 CLC_0498 CLC_0499     FALSE 0.165 126.000 0.000 NA   NA
 3741936 3741937 CLC_0499 CLC_0500     FALSE 0.180 92.000 0.000 NA   NA
 3741937 3741938 CLC_0500 CLC_0501     FALSE 0.062 213.000 0.000 NA   NA
 3741940 3741941 CLC_0503 CLC_0504     TRUE 0.991 3.000 0.667 NA   NA
 3741943 3741944 CLC_0506 CLC_0507 hypB   FALSE 0.436 236.000 0.115 1.000 N NA
 3741944 3741945 CLC_0507 CLC_0508   hypA TRUE 0.917 56.000 0.333 1.000   NA
 3741945 3741946 CLC_0508 CLC_0509 hypA   TRUE 0.925 39.000 0.214 NA   NA
 3741948 3741949 CLC_0511 CLC_0512 addA   TRUE 0.633 140.000 0.010 1.000 N NA
 3741949 3741950 CLC_0512 CLC_0513   pepT TRUE 0.793 77.000 0.056 1.000 N NA
 3741952 3741953 CLC_0515 CLC_0516     FALSE 0.069 206.000 0.000 NA   NA
 3741953 3741954 CLC_0516 CLC_0517     TRUE 0.994 -40.000 0.400 NA   NA
 3741954 3741955 CLC_0517 CLC_0518     FALSE 0.016 304.000 0.000 NA   NA
 3741956 3741957 CLC_0519 CLC_0520     TRUE 0.995 13.000 0.461 0.049 Y NA
 3741959 3741960 CLC_0522 CLC_0523   thiE FALSE 0.058 266.000 0.000 NA N NA
 3741960 3741961 CLC_0523 CLC_0524 thiE thiM-1 TRUE 0.997 -9.000 0.190 0.006 Y NA
 3741961 3741962 CLC_0524 CLC_0525 thiM-1 thiD-1 TRUE 0.669 232.000 0.039 0.006 Y NA
 3741963 3741964 CLC_0526 CLC_0527 ddlB   FALSE 0.560 156.000 0.004 1.000 N NA
 3741964 3741965 CLC_0527 CLC_0528     TRUE 0.993 4.000 0.182 1.000 Y NA
 3741965 3741966 CLC_0528 CLC_0529     TRUE 0.996 1.000 0.241 0.037 Y NA
 3741966 3741967 CLC_0529 CLC_0530     TRUE 0.991 12.000 0.167 1.000 Y NA
 3741967 3741968 CLC_0530 CLC_0531     TRUE 0.992 2.000 0.048 0.037 Y NA
 3741968 3741969 CLC_0531 CLC_0532     TRUE 0.958 29.000 0.222 NA   NA
 3741969 3741970 CLC_0532 CLC_0533     FALSE 0.005 402.000 0.000 NA   NA
 3741970 3741971 CLC_0533 CLC_0534     TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA   NA
 3741971 3741972 CLC_0534 CLC_0535     FALSE 0.157 142.000 0.000 NA   NA
 3741972 3741973 CLC_0535 CLC_0536     TRUE 0.677 61.000 0.007 NA   NA
 3741973 3741974 CLC_0536 CLC_0537     TRUE 0.700 10.000 0.000 NA   NA
 3741974 3741975 CLC_0537 CLC_0538     FALSE 0.002 519.000 0.000 NA   NA
 3741975 3741976 CLC_0538 CLC_0539     FALSE 0.134 274.000 0.010 NA   NA
 3741976 3741977 CLC_0539 CLC_0540     FALSE 0.534 134.000 0.010 NA   NA
 3741977 3741978 CLC_0540 CLC_0541     FALSE 0.524 176.000 0.050 NA   NA
 3741978 3741979 CLC_0541 CLC_0542     TRUE 0.958 2.000 0.025 NA   NA
 3741980 3741981 CLC_0543 CLC_0544     TRUE 0.637 21.000 0.000 NA   NA
 3741982 3741983 CLC_0545 CLC_0546     FALSE 0.006 377.000 0.000 NA   NA
 3741983 3741984 CLC_0546 CLC_0547   sbcC TRUE 0.998 -25.000 0.669 0.004 N NA
 3741984 3741985 CLC_0547 CLC_0548 sbcC   TRUE 0.898 28.000 0.005 1.000   NA
 3741985 3741986 CLC_0548 CLC_0549     FALSE 0.001 811.000 0.000 NA   NA
 3741986 3741987 CLC_0549 CLC_0550     FALSE 0.002 641.000 0.000 NA   NA
 3741987 3741988 CLC_0550 CLC_0551   cadA TRUE 0.750 76.000 0.053 1.000   NA
 3741988 3741989 CLC_0551 CLC_0552 cadA   FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 3741989 3741990 CLC_0552 CLC_0553     FALSE 0.139 154.000 0.000 NA   NA
 3741990 3741991 CLC_0553 CLC_0554     FALSE 0.001 881.000 0.000 NA   NA
 3741993 3741994 CLC_0556 CLC_0557     FALSE 0.001 957.000 0.000 NA   NA
 3741994 3741995 CLC_0557 CLC_0558     FALSE 0.057 268.000 0.000 NA N NA
 3741995 3741996 CLC_0558 CLC_0559     TRUE 0.989 10.000 0.667 NA   NA
 3741996 3741997 CLC_0559 CLC_0560     FALSE 0.012 320.000 0.000 NA   NA
 3741997 3741998 CLC_0560 CLC_0561   sagB TRUE 0.707 165.000 0.222 NA   NA
 3741998 3741999 CLC_0561 CLC_0562 sagB sagC TRUE 0.979 4.000 0.222 NA   NA
 3741999 3742000 CLC_0562 CLC_0563 sagC sagD TRUE 0.977 16.000 0.318 NA   NA
 3742000 3742001 CLC_0563 CLC_0564 sagD   TRUE 0.985 -25.000 0.091 NA   NA
 3742001 3742002 CLC_0564 CLC_0565     TRUE 0.992 8.000 1.000 NA   NA
 3742002 3742003 CLC_0565 CLC_0566   sagG FALSE 0.014 309.000 0.000 NA   NA
 3742003 3742004 CLC_0566 CLC_0567 sagG sagH TRUE 0.988 12.000 0.500 NA N NA
 3742005 3742006 CLC_0568 CLC_0569 sagI   FALSE 0.227 128.000 0.000 1.000   NA
 3742007 3742008 CLC_0570 CLC_0571     TRUE 0.848 118.000 0.409 NA   NA
 3742008 3742009 CLC_0571 CLC_0572     TRUE 0.690 127.000 0.091 NA   NA
 3742010 3742011 CLC_0573 CLC_0574 trmB   FALSE 0.062 213.000 0.000 NA   NA
 3742013 3742014 CLC_0576 CLC_0577 fabG-1   TRUE 0.809 63.000 0.032 1.000 N NA
 3742016 3742017 CLC_0579 CLC_0580     FALSE 0.079 263.000 0.000 1.000 N NA
 3742017 3742018 CLC_0580 CLC_0581     FALSE 0.027 297.000 0.000 1.000   NA
 3742018 3742019 CLC_0581 CLC_0582     TRUE 0.960 36.000 0.400 1.000   NA
 3742019 3742020 CLC_0582 CLC_0583     FALSE 0.450 205.000 0.000 1.000 Y NA
 3742020 3742021 CLC_0583 CLC_0584   serS-2 FALSE 0.007 482.000 0.000 1.000 N NA
 3742021 3742022 CLC_0584 CLC_0585 serS-2   FALSE 0.005 578.000 0.000 1.000 N NA
 3742023 3742024 CLC_0586 CLC_0587     FALSE 0.016 330.000 0.000 1.000   NA
 3742027 3742028 CLC_0590 CLC_0591     FALSE 0.108 175.000 0.000 NA   NA
 3742033 3742034 CLC_0596 CLC_0597     FALSE 0.150 148.000 0.000 NA   NA
 3742036 3742037 CLC_0599 CLC_0600     FALSE 0.004 418.000 0.000 NA   NA
 3742037 3742038 CLC_0600 CLC_0601     TRUE 0.896 -22.000 0.000 1.000   NA
 3742039 3742040 CLC_0602 CLC_0603     FALSE 0.003 472.000 0.000 NA   NA
 3742040 3742041 CLC_0603 CLC_0604     FALSE 0.097 182.000 0.000 NA   NA
 3742041 3742042 CLC_0604 CLC_0605     FALSE 0.251 66.000 0.000 NA   NA
 3742042 3742043 CLC_0605 CLC_0606     FALSE 0.027 268.000 0.000 NA   NA
 3742043 3742044 CLC_0606 CLC_0607     TRUE 0.974 10.000 0.184 NA   NA
 3742044 3742045 CLC_0607 CLC_0608     FALSE 0.003 461.000 0.000 NA   NA
 3742045 3742046 CLC_0608 CLC_0609     FALSE 0.001 920.000 0.000 NA   NA
 3742048 3742049 CLC_0611 CLC_0612 mscL   FALSE 0.007 366.000 0.000 NA   NA
 3742051 3742052 CLC_0614 CLC_0615     FALSE 0.003 488.000 0.000 NA   NA
 3742052 3742053 CLC_0615 CLC_0616     TRUE 0.989 -7.000 0.165 1.000 N NA
 3742053 3742054 CLC_0616 CLC_0617     TRUE 0.968 0.000 0.035 NA   NA
 3742054 3742055 CLC_0617 CLC_0618   potA FALSE 0.001 817.000 0.000 NA   NA
 3742055 3742056 CLC_0618 CLC_0619 potA potB TRUE 0.998 0.000 0.789 1.000 Y NA
 3742056 3742057 CLC_0619 CLC_0620 potB   TRUE 0.990 3.000 0.022 0.037 Y NA
 3742059 3742060 CLC_0622 CLC_0623     FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 3742060 3742061 CLC_0623 CLC_0624     FALSE 0.005 404.000 0.000 NA   NA
 3742061 3742062 CLC_0624 CLC_0625     FALSE 0.027 268.000 0.000 NA   NA
 3742062 3742063 CLC_0625 CLC_0626     FALSE 0.195 84.000 0.000 NA   NA
 3742063 3742064 CLC_0626 CLC_0627     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3742066 3742067 CLC_0629 CLC_0630   lepB-1 FALSE 0.109 174.000 0.000 NA   NA
 3742069 3742070 CLC_0632 CLC_0633     FALSE 0.002 614.000 0.000 NA   NA
 3742070 3742071 CLC_0633 CLC_0634     TRUE 0.973 40.000 1.000 NA   NA
 3742071 3742072 CLC_0634 CLC_0635     FALSE 0.001 694.000 0.000 NA   NA
 3742072 3742073 CLC_0635 CLC_0636     FALSE 0.002 607.000 0.000 NA   NA
 3742073 3742074 CLC_0636 CLC_0637     TRUE 0.981 -7.000 0.080 1.000   NA
 3742074 3742075 CLC_0637 CLC_0638     TRUE 0.976 37.000 1.000 NA   NA
 3742075 3742076 CLC_0638 CLC_0639     TRUE 0.941 35.000 0.222 NA   NA
 3742076 3742077 CLC_0639 CLC_0640     TRUE 0.786 110.000 0.222 NA   NA
 3742077 3742078 CLC_0640 CLC_0641     TRUE 0.978 23.000 0.400 NA   NA
 3742078 3742079 CLC_0641 CLC_0642     TRUE 0.978 -3.000 0.095 NA   NA
 3742079 3742080 CLC_0642 CLC_0643     TRUE 0.979 15.000 0.238 NA N NA
 3742080 3742081 CLC_0643 CLC_0644     FALSE 0.002 569.000 0.000 NA   NA
 3742081 3742082 CLC_0644 CLC_0645     FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 3742082 3742083 CLC_0645 CLC_0646     FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 3742086 3742087 CLC_0649 CLC_0650     FALSE 0.028 335.000 0.000 1.000 N NA
 3742088 3742089 CLC_0651 CLC_0652 asnS   FALSE 0.041 294.000 0.000 NA N NA
 3742089 3742090 CLC_0652 CLC_0653     TRUE 0.985 16.000 0.571 NA   NA
 3742090 3742091 CLC_0653 CLC_0654     FALSE 0.072 203.000 0.000 NA   NA
 3742091 3742092 CLC_0654 CLC_0655     TRUE 0.992 2.000 0.714 NA   NA
 3742092 3742093 CLC_0655 CLC_0656     FALSE 0.002 602.000 0.000 NA   NA
 3742093 3742094 CLC_0656 CLC_0657     FALSE 0.004 429.000 0.000 NA   NA
 3742094 3742095 CLC_0657 CLC_0658     TRUE 0.987 13.000 0.667 NA   NA
 3742095 3742096 CLC_0658 CLC_0659     FALSE 0.004 463.000 0.000 1.000   NA
 3742096 3742097 CLC_0659 CLC_0660     FALSE 0.235 197.000 0.000 0.011   NA
 3742097 3742098 CLC_0660 CLC_0661     FALSE 0.153 175.000 0.000 1.000   NA
 3742098 3742099 CLC_0661 CLC_0662     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3742099 3742100 CLC_0662 CLC_0663     TRUE 0.740 3.000 0.000 NA   NA
 3742100 3742101 CLC_0663 CLC_0664     FALSE 0.170 206.000 0.000 1.000 N NA
 3742101 3742102 CLC_0664 CLC_0665     TRUE 0.965 21.000 0.085 1.000 N NA
 3742102 3742103 CLC_0665 CLC_0666     TRUE 0.999 -10.000 0.932 1.000 Y NA
 3742104 3742105 CLC_0667 CLC_0668     FALSE 0.156 143.000 0.000 NA   NA
 3742105 3742106 CLC_0668 CLC_0669     TRUE 0.977 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3742109 3742110 CLC_0672 CLC_0673     TRUE 0.787 170.000 0.286 1.000 N NA
 3742112 3742113 CLC_0675 CLC_0676     TRUE 0.720 103.000 0.083 1.000   NA
 3742114 3742115 CLC_0677 CLC_0678 csaA   FALSE 0.368 208.000 0.023 1.000   NA
 3742115 3742116 CLC_0678 CLC_0679     FALSE 0.056 297.000 0.000 0.029   NA
 3742117 3742118 CLC_0680 CLC_0681     FALSE 0.164 128.000 0.000 NA   NA
 3742118 3742119 CLC_0681 CLC_0682     FALSE 0.272 383.000 0.667 0.036 N NA
 3742119 3742120 CLC_0682 CLC_0683     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3742122 3742123 CLC_0685 CLC_0686     FALSE 0.239 108.000 0.000 1.000   NA
 3742123 3742124 CLC_0686 CLC_0687     FALSE 0.292 58.000 0.000 NA   NA
 3742125 3742126 CLC_0688 CLC_0689     TRUE 0.919 23.000 0.015 NA   NA
 3742128 3742129 CLC_0691 CLC_0692     FALSE 0.548 139.000 0.006 1.000   NA
 3742130 3742131 CLC_0693 CLC_0694     FALSE 0.239 118.000 0.000 1.000   NA
 3742131 3742132 CLC_0694 CLC_0695   rhlE FALSE 0.047 259.000 0.000 1.000   NA
 3742132 3742133 CLC_0695 CLC_0696 rhlE   FALSE 0.003 576.000 0.000 1.000   NA
 3742133 3742134 CLC_0696 CLC_0697     TRUE 0.745 172.000 0.286 1.000   NA
 3742134 3742135 CLC_0697 CLC_0698     TRUE 0.974 28.000 0.250 1.000 N NA
 3742137 3742138 CLC_0700 CLC_0701     FALSE 0.228 127.000 0.000 1.000   NA
 3742138 3742139 CLC_0701 CLC_0702     FALSE 0.095 184.000 0.000 NA   NA
 3742139 3742140 CLC_0702 CLC_0703     TRUE 0.986 -10.000 0.154 NA   NA
 3742140 3742141 CLC_0703 CLC_0704     FALSE 0.247 67.000 0.000 NA   NA
 3742141 3742142 CLC_0704 CLC_0705     FALSE 0.163 131.000 0.000 NA   NA
 3742144 3742145 CLC_0707 CLC_0708     TRUE 0.691 205.000 0.409 1.000   NA
 3742145 3742146 CLC_0708 CLC_0709     TRUE 0.963 12.000 0.074 1.000   NA
 3742146 3742147 CLC_0709 CLC_0710     FALSE 0.002 627.000 0.000 1.000   NA
 3742147 3742148 CLC_0710 CLC_0711     TRUE 0.771 159.000 0.190 1.000 N NA
 3742148 3742149 CLC_0711 CLC_0712     TRUE 0.853 60.000 0.071 1.000 N NA
 3742149 3742150 CLC_0712 CLC_0713     TRUE 0.947 26.000 0.089 NA   NA
 3742154 3742155 CLC_0717 CLC_0718     TRUE 0.967 7.000 0.100 NA   NA
 3742156 3742157 CLC_0719 CLC_0720     TRUE 0.860 -49.000 0.000 NA   NA
 3742158 3742159 CLC_0721 CLC_0722     FALSE 0.014 342.000 0.000 1.000   NA
 3742159 3742160 CLC_0722 CLC_0723     TRUE 0.989 -37.000 0.118 1.000   NA
 3742160 3742161 CLC_0723 CLC_0724     TRUE 0.983 31.000 1.000 NA   NA
 3742161 3742162 CLC_0724 CLC_0725     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3742162 3742163 CLC_0725 CLC_0726     FALSE 0.001 720.000 0.000 NA   NA
 3742164 3742165 CLC_0727 CLC_0728     TRUE 0.992 -3.000 0.571 NA   NA
 3742166 3742167 CLC_0729 CLC_0730   greA-1 TRUE 0.632 136.000 0.008 1.000 N NA
 3742167 3742168 CLC_0730 CLC_0731 greA-1   FALSE 0.538 161.000 0.031 NA   NA
 3742168 3742169 CLC_0731 CLC_0732     FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 3742169 3742170 CLC_0732 CLC_0733     TRUE 0.894 95.000 0.041 0.060 Y NA
 3742170 3742171 CLC_0733 CLC_0734     FALSE 0.188 88.000 0.000 NA   NA
 3742171 3742172 CLC_0734 CLC_0735     FALSE 0.056 219.000 0.000 NA   NA
 3742172 3742173 CLC_0735 CLC_0736     FALSE 0.155 144.000 0.000 NA   NA
 3742173 3742174 CLC_0736 CLC_0737     TRUE 0.648 58.000 0.000 0.060 N NA
 3742176 3742177 CLC_0739 CLC_0740     FALSE 0.008 470.000 0.000 1.000 N NA
 3742177 3742178 CLC_0740 CLC_0741   fhuB TRUE 0.949 96.000 0.500 1.000 Y NA
 3742178 3742179 CLC_0741 CLC_0742 fhuB fhuG TRUE 0.998 0.000 0.750 0.036 Y NA
 3742179 3742180 CLC_0742 CLC_0743 fhuG fhuC TRUE 0.666 228.000 0.100 1.000 Y NA
 3742180 3742181 CLC_0743 CLC_0744 fhuC nifH TRUE 0.983 30.000 0.150 1.000 Y NA
 3742181 3742182 CLC_0744 CLC_0745 nifH   TRUE 0.994 3.000 0.571 0.055 N NA
 3742182 3742183 CLC_0745 CLC_0746     TRUE 0.992 40.000 1.000 0.039 Y NA
 3742183 3742184 CLC_0746 CLC_0747     FALSE 0.032 323.000 0.000 1.000 N NA
 3742184 3742185 CLC_0747 CLC_0748     FALSE 0.174 97.000 0.000 NA   NA
 3742187 3742188 CLC_0750 CLC_0751 gcvT gcvH TRUE 0.774 125.000 0.000 0.001 Y NA
 3742188 3742189 CLC_0751 CLC_0752 gcvH gcvPA TRUE 0.984 3.000 0.005 1.000 Y NA
 3742189 3742190 CLC_0752 CLC_0753 gcvPA gcvPB TRUE 0.997 0.000 0.316 0.001 Y NA
 3742190 3742191 CLC_0753 CLC_0754 gcvPB   FALSE 0.457 194.000 0.010 1.000 N NA
 3742191 3742192 CLC_0754 CLC_0755     TRUE 0.971 18.000 0.118 1.000 N NA
 3742192 3742193 CLC_0755 CLC_0756     FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 3742193 3742194 CLC_0756 CLC_0757     FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 3742194 3742195 CLC_0757 CLC_0758     TRUE 0.837 94.000 0.375 NA   NA
 3742195 3742196 CLC_0758 CLC_0759     FALSE 0.074 202.000 0.000 NA   NA
 3742196 3742197 CLC_0759 CLC_0760     FALSE 0.001 710.000 0.000 NA   NA
 3742197 3742198 CLC_0760 CLC_0761     FALSE 0.330 54.000 0.000 NA   NA
 3742198 3742199 CLC_0761 CLC_0762     FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 3742199 3742200 CLC_0762 CLC_0763     TRUE 0.935 52.000 0.273 1.000 N NA
 3742200 3742201 CLC_0763 CLC_0764     TRUE 0.985 -13.000 0.094 1.000   NA
 3742201 3742202 CLC_0764 CLC_0765     FALSE 0.096 208.000 0.000 1.000   NA
 3742202 3742203 CLC_0765 CLC_0766     FALSE 0.121 194.000 0.000 1.000   NA
 3742204 3742205 CLC_0767 CLC_0768     TRUE 0.825 83.000 0.250 NA   NA
 3742205 3742206 CLC_0768 CLC_0769     FALSE 0.003 492.000 0.000 NA   NA
 3742207 3742208 CLC_0770 CLC_0771     FALSE 0.002 590.000 0.000 NA   NA
 3742208 3742209 CLC_0771 CLC_0772     TRUE 0.618 26.000 0.000 NA   NA
 3742211 3742212 CLC_0774 CLC_0775     FALSE 0.002 493.000 0.000 NA   NA
 3742214 3742215 CLC_0777 CLC_0778     FALSE 0.174 114.000 0.000 NA   NA
 3742215 3742216 CLC_0778 CLC_0779     FALSE 0.330 54.000 0.000 NA   NA
 3742217 3742218 CLC_0780 CLC_0781   luxS TRUE 0.980 -16.000 0.010 1.000 N NA
 3742218 3742219 CLC_0781 CLC_0782 luxS metC TRUE 0.982 2.000 0.048 0.044 N NA
 3742219 3742220 CLC_0782 CLC_0783 metC   TRUE 0.688 101.000 0.021 1.000 N NA
 3742220 3742221 CLC_0783 CLC_0784     FALSE 0.002 559.000 0.000 NA   NA
 3742222 3742223 CLC_0785 CLC_0786     FALSE 0.019 366.000 0.000 1.000 N NA
 3742224 3742225 CLC_0787 CLC_0788     TRUE 0.697 88.000 0.061 NA   NA
 3742225 3742226 CLC_0788 CLC_0789     FALSE 0.002 534.000 0.000 NA   NA
 3742226 3742227 CLC_0789 CLC_0790     FALSE 0.245 93.000 0.000 1.000   NA
 3742228 3742229 CLC_0791 CLC_0792     FALSE 0.173 102.000 0.000 NA   NA
 3742229 3742230 CLC_0792 CLC_0793     TRUE 0.639 19.000 0.000 NA   NA
 3742230 3742231 CLC_0793 CLC_0794     FALSE 0.191 86.000 0.000 NA   NA
 3742231 3742232 CLC_0794 CLC_0795     FALSE 0.158 141.000 0.000 NA   NA
 3742232 3742233 CLC_0795 CLC_0796     FALSE 0.038 244.000 0.000 NA   NA
 3742233 3742234 CLC_0796 CLC_0797     FALSE 0.041 238.000 0.000 NA   NA
 3742234 3742235 CLC_0797 CLC_0798     TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 3742235 3742236 CLC_0798 CLC_0799     FALSE 0.148 149.000 0.000 NA   NA
 3742238 3742239 CLC_0801 CLC_0802     FALSE 0.534 31.000 0.000 NA   NA
 3742239 3742240 CLC_0802 CLC_0803     FALSE 0.182 91.000 0.000 NA   NA
 3742246 3742247 CLC_0810 CLC_0811 arsR arsD TRUE 0.724 22.000 0.000 1.000   NA
 3742247 3742248 CLC_0811 CLC_0812 arsD arsA TRUE 0.962 19.000 0.116 1.000   NA
 3742248 3742249 CLC_0812 CLC_0813 arsA arsB TRUE 0.889 99.000 0.093 1.000 Y NA
 3742249 3742250 CLC_0813 CLC_0814 arsB   FALSE 0.062 277.000 0.000 1.000 N NA
 3742250 3742251 CLC_0814 CLC_0815     FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 3742251 3742252 CLC_0815 CLC_0816     FALSE 0.002 508.000 0.000 NA   NA
 3742252 3742253 CLC_0816 CLC_0817     TRUE 0.992 10.000 1.000 NA   NA
 3742253 3742254 CLC_0817 CLC_0818     FALSE 0.568 29.000 0.000 NA   NA
 3742254 3742255 CLC_0818 CLC_0819     FALSE 0.034 255.000 0.000 NA   NA
 3742255 3742256 CLC_0819 CLC_0820     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3742256 3742257 CLC_0820 CLC_0821     FALSE 0.007 374.000 0.000 NA   NA
 3742257 3742258 CLC_0821 CLC_0822     TRUE 0.991 -7.000 0.400 NA   NA
 3742258 3742259 CLC_0822 CLC_0823     FALSE 0.001 691.000 0.000 NA   NA
 3742259 3742260 CLC_0823 CLC_0824   thyA TRUE 0.970 -10.000 0.017 NA   NA
 3742260 3742261 CLC_0824 CLC_0825 thyA   TRUE 0.957 12.000 0.017 1.000 N NA
 3742261 3742262 CLC_0825 CLC_0826     TRUE 0.887 46.000 0.047 1.000 N NA
 3742262 3742263 CLC_0826 CLC_0827   thiD-2 TRUE 0.777 78.000 0.043 1.000 N NA
 3742263 3742264 CLC_0827 CLC_0828 thiD-2   FALSE 0.534 172.000 0.043 NA   NA
 3742266 3742267 CLC_0830 CLC_0831     TRUE 0.992 3.000 0.833 NA   NA
 3742267 3742268 CLC_0831 CLC_0832     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3742268 3742269 CLC_0832 CLC_0833     FALSE 0.078 421.000 0.167 1.000 N NA
 3742269 3742270 CLC_0833 CLC_0834     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 3742270 3742271 CLC_0834 CLC_0835     FALSE 0.352 251.000 0.167 NA   NA
 3742271 3742272 CLC_0835 CLC_0836     TRUE 0.910 45.000 0.167 1.000   NA
 3742272 3742273 CLC_0836 CLC_0837     FALSE 0.001 955.000 0.000 NA   NA
 3742273 3742274 CLC_0837 CLC_0838     FALSE 0.023 280.000 0.000 NA   NA
 3742274 3742275 CLC_0838 CLC_0839     FALSE 0.554 184.000 0.100 NA   NA
 3742275 3742276 CLC_0839 CLC_0840     TRUE 0.998 -13.000 0.750 NA Y NA
 3742276 3742277 CLC_0840 CLC_0841     FALSE 0.063 211.000 0.000 NA   NA
 3742277 3742278 CLC_0841 CLC_0842     FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 3742278 3742279 CLC_0842 CLC_0843     TRUE 0.943 154.000 0.636 1.000 Y NA
 3742279 3742280 CLC_0843 CLC_0844     FALSE 0.126 190.000 0.000 1.000   NA
 3742282 3742283 CLC_0846 CLC_0847   dapB-1 FALSE 0.002 666.000 0.000 NA   NA
 3742283 3742284 CLC_0847 CLC_0848 dapB-1   TRUE 0.790 22.000 0.000 NA N NA
 3742285 3742286 CLC_0849 CLC_0850     FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 3742286 3742287 CLC_0850 CLC_0851     FALSE 0.371 46.000 0.000 NA   NA
 3742288 3742289 CLC_0852 CLC_0853     TRUE 0.639 19.000 0.000 NA   NA
 3742289 3742290 CLC_0853 CLC_0854     FALSE 0.019 294.000 0.000 NA   NA
 3742290 3742291 CLC_0854 CLC_0855     FALSE 0.214 77.000 0.000 NA   NA
 3742292 3742293 CLC_0856 CLC_0857   ha70 FALSE 0.242 95.000 0.000 1.000   NA
 3742293 3742294 CLC_0857 CLC_0858 ha70 ha17 TRUE 0.982 14.000 0.429 NA   NA
 3742294 3742295 CLC_0858 CLC_0859 ha17 ha33 TRUE 0.880 63.000 0.286 NA   NA
 3742296 3742297 CLC_0860 CLC_0861 botR ntnH TRUE 0.856 162.000 0.667 1.000   NA
 3742297 3742298 CLC_0861 CLC_0862 ntnH boNT/A1 TRUE 0.721 44.000 0.000 0.001   NA
 3742300 3742301 CLC_0864 CLC_0865     FALSE 0.163 132.000 0.000 NA   NA
 3742301 3742302 CLC_0865 CLC_0866     FALSE 0.093 185.000 0.000 NA   NA
 3742302 3742303 CLC_0866 CLC_0867     FALSE 0.010 336.000 0.000 NA   NA
 3742303 3742304 CLC_0867 CLC_0868   brnQ-1 FALSE 0.005 566.000 0.000 1.000 N NA
 3742304 3742305 CLC_0868 CLC_0869 brnQ-1 brnQ-2 TRUE 0.972 151.000 1.000 0.001 Y NA
 3742307 3742308 CLC_0871 CLC_0873 feoA-1 feoB-1 FALSE 0.154 145.000 0.000 NA   NA
 3742308 3742309 CLC_0873 CLC_0874 feoB-1 cobC FALSE 0.001 715.000 0.000 NA   NA
 3742309 3742310 CLC_0874 CLC_0875 cobC   FALSE 0.332 145.000 0.000 1.000 N NA
 3742310 3742311 CLC_0875 CLC_0876   cobS FALSE 0.069 271.000 0.000 1.000 N NA
 3742311 3742312 CLC_0876 CLC_0877 cobS   FALSE 0.003 458.000 0.000 NA   NA
 3742312 3742313 CLC_0877 CLC_0878     FALSE 0.014 309.000 0.000 NA   NA
 3742313 3742314 CLC_0878 CLC_0879     TRUE 0.649 131.000 0.053 NA   NA
 3742314 3742315 CLC_0879 CLC_0880     TRUE 0.988 18.000 0.828 NA   NA
 3742315 3742316 CLC_0880 CLC_0881     FALSE 0.002 569.000 0.000 NA   NA
 3742316 3742317 CLC_0881 CLC_0882     FALSE 0.026 271.000 0.000 NA   NA
 3742317 3742318 CLC_0882 CLC_0883   folP TRUE 0.821 95.000 0.003 1.000 Y NA
 3742318 3742319 CLC_0883 CLC_0884 folP   FALSE 0.497 132.000 0.003 NA   NA
 3742319 3742320 CLC_0884 CLC_0885   folK FALSE 0.511 100.000 0.003 NA   NA
 3742320 3742321 CLC_0885 CLC_0886 folK   FALSE 0.309 119.000 0.000 NA N NA
 3742321 3742322 CLC_0886 CLC_0887     FALSE 0.026 320.000 0.000 NA N NA
 3742322 3742323 CLC_0887 CLC_0888     TRUE 0.857 55.000 0.039 1.000 N NA
 3742323 3742324 CLC_0888 CLC_0889     TRUE 0.858 142.000 0.012 0.019 Y NA
 3742324 3742325 CLC_0889 CLC_0890     FALSE 0.005 597.000 0.000 1.000 N NA
 3742325 3742326 CLC_0890 CLC_0891     FALSE 0.052 294.000 0.000 1.000 N NA
 3742326 3742327 CLC_0891 CLC_0892     TRUE 0.988 5.000 0.500 NA   NA
 3742329 3742330 CLC_0894 CLC_0895   cadD FALSE 0.017 300.000 0.000 NA   NA
 3742330 3742331 CLC_0895 CLC_0896 cadD   FALSE 0.148 149.000 0.000 NA   NA
 3742332 3742333 CLC_0897 CLC_0898     TRUE 0.967 19.000 0.200 NA   NA
 3742333 3742334 CLC_0898 CLC_0899     TRUE 0.985 -3.000 0.100 1.000 N NA
 3742335 3742336 CLC_0900 CLC_0901     FALSE 0.002 657.000 0.000 NA   NA
 3742336 3742337 CLC_0901 CLC_0902     FALSE 0.153 175.000 0.000 1.000   NA
 3742337 3742338 CLC_0902 CLC_0903     FALSE 0.013 347.000 0.000 1.000   NA
 3742338 3742339 CLC_0903 CLC_0904     FALSE 0.003 523.000 0.000 1.000   NA
 3742339 3742340 CLC_0904 CLC_0905     FALSE 0.292 58.000 0.000 NA   NA
 3742341 3742342 CLC_0906 CLC_0907     TRUE 0.871 18.000 0.000 0.005   NA
 3742342 3742343 CLC_0907 CLC_0908     FALSE 0.238 105.000 0.000 1.000   NA
 3742343 3742344 CLC_0908 CLC_0909     FALSE 0.115 344.000 0.000 0.061 Y NA
 3742345 3742346 CLC_0910 CLC_0911     FALSE 0.069 206.000 0.000 NA   NA
 3742346 3742347 CLC_0911 CLC_0912     FALSE 0.262 63.000 0.000 NA   NA
 3742348 3742349 CLC_0913 CLC_0914     FALSE 0.025 275.000 0.000 NA   NA
 3742350 3742351 CLC_0915 CLC_0916     FALSE 0.011 364.000 0.000 1.000   NA
 3742352 3742353 CLC_0917 CLC_0918 oxdD   FALSE 0.120 166.000 0.000 NA   NA
 3742353 3742354 CLC_0918 CLC_0919     TRUE 0.712 58.000 0.010 NA   NA
 3742355 3742356 CLC_0920 CLC_0921     FALSE 0.038 273.000 0.000 1.000   NA
 3742357 3742358 CLC_0922 CLC_0923     FALSE 0.086 193.000 0.000 NA   NA
 3742362 3742363 CLC_0927 CLC_0928     TRUE 0.989 0.000 0.400 NA   NA
 3742363 3742364 CLC_0928 CLC_0929     FALSE 0.002 663.000 0.000 NA   NA
 3742366 3742367 CLC_0931 CLC_0932     FALSE 0.038 243.000 0.000 NA   NA
 3742368 3742369 CLC_0933 CLC_0934     FALSE 0.229 125.000 0.000 1.000   NA
 3742369 3742370 CLC_0934 CLC_0935     FALSE 0.106 329.000 0.000 1.000 Y NA
 3742370 3742371 CLC_0935 CLC_0936     FALSE 0.164 128.000 0.000 NA   NA
 3742373 3742374 CLC_0938 CLC_0939     FALSE 0.006 424.000 0.000 1.000   NA
 3742374 3742375 CLC_0939 CLC_0940     FALSE 0.038 244.000 0.000 NA   NA
 3742375 3742376 CLC_0940 CLC_0941     FALSE 0.008 353.000 0.000 NA   NA
 3742382 3742383 CLC_0947 CLC_0948     FALSE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 3742383 3742384 CLC_0948 CLC_0949     FALSE 0.008 356.000 0.000 NA   NA
 3742385 3742386 CLC_0950 CLC_0951     FALSE 0.109 174.000 0.000 NA   NA
 3742386 3742387 CLC_0951 CLC_0952     FALSE 0.030 264.000 0.000 NA   NA
 3742387 3742388 CLC_0952 CLC_0953     FALSE 0.173 106.000 0.000 NA   NA
 3742389 3742390 CLC_0954 CLC_0955     FALSE 0.002 539.000 0.000 NA   NA
 3742391 3742392 CLC_0956 CLC_0957     FALSE 0.095 184.000 0.000 NA   NA
 3742393 3742394 CLC_0958 CLC_0959     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3742394 3742395 CLC_0959 CLC_0960     FALSE 0.008 352.000 0.000 NA   NA
 3742395 3742396 CLC_0960 CLC_0961     FALSE 0.005 405.000 0.000 NA   NA
 3742396 3742397 CLC_0961 CLC_0962     FALSE 0.014 342.000 0.000 1.000   NA
 3742397 3742398 CLC_0962 CLC_0963     TRUE 0.815 79.000 0.100 1.000 N NA
 3742398 3742399 CLC_0963 CLC_0964   cobU FALSE 0.061 278.000 0.000 1.000 N NA
 3742400 3742401 CLC_0965 CLC_0966 tipA   FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 3742402 3742403 CLC_0967 CLC_0968   cobQ TRUE 0.658 61.000 0.003 NA   NA
 3742403 3742404 CLC_0968 CLC_0969 cobQ cobD TRUE 0.994 2.000 0.092 0.012 Y NA
 3742404 3742405 CLC_0969 CLC_0970 cobD   FALSE 0.400 219.000 0.026 1.000 N NA
 3742405 3742406 CLC_0970 CLC_0971   cbiM FALSE 0.198 274.000 0.013 1.000 N NA
 3742406 3742407 CLC_0971 CLC_0972 cbiM cbiN TRUE 0.998 4.000 0.861 0.012 Y NA
 3742407 3742408 CLC_0972 CLC_0973 cbiN cbiQ TRUE 0.974 116.000 0.804 0.002 Y NA
 3742408 3742409 CLC_0973 CLC_0974 cbiQ   FALSE 0.008 424.000 0.000 NA N NA
 3742409 3742410 CLC_0974 CLC_0975   hemC TRUE 0.992 -31.000 0.009 NA Y NA
 3742410 3742411 CLC_0975 CLC_0976 hemC cobA/hemD TRUE 0.849 136.000 0.031 1.000 Y NA
 3742411 3742412 CLC_0976 CLC_0977 cobA/hemD   FALSE 0.154 145.000 0.000 NA   NA
 3742412 3742413 CLC_0977 CLC_0978   hemB FALSE 0.031 262.000 0.000 NA   NA
 3742413 3742414 CLC_0978 CLC_0979 hemB cobB TRUE 0.819 121.000 0.005 1.000 Y NA
 3742414 3742415 CLC_0979 CLC_0980 cobB cobH TRUE 0.989 25.000 0.097 0.012 Y NA
 3742415 3742416 CLC_0980 CLC_0981 cobH   FALSE 0.084 194.000 0.000 NA   NA
 3742416 3742417 CLC_0981 CLC_0982     FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 3742417 3742418 CLC_0982 CLC_0983     FALSE 0.023 306.000 0.000 1.000   NA
 3742418 3742419 CLC_0983 CLC_0984     FALSE 0.311 56.000 0.000 NA   NA
 3742419 3742420 CLC_0984 CLC_0985     FALSE 0.169 122.000 0.000 NA   NA
 3742420 3742421 CLC_0985 CLC_0986     FALSE 0.290 77.000 0.000 1.000   NA
 3742421 3742422 CLC_0986 CLC_0987     FALSE 0.051 251.000 0.000 1.000   NA
 3742422 3742423 CLC_0987 CLC_0988     TRUE 0.918 30.000 0.032 1.000   NA
 3742423 3742424 CLC_0988 CLC_0989     TRUE 0.726 67.000 0.032 NA   NA
 3742424 3742425 CLC_0989 CLC_0990     TRUE 0.801 108.000 0.250 NA   NA
 3742425 3742426 CLC_0990 CLC_0991   cbiD FALSE 0.226 74.000 0.000 NA   NA
 3742426 3742427 CLC_0991 CLC_0992 cbiD cbiE TRUE 0.871 177.000 0.126 0.012 Y NA
 3742427 3742428 CLC_0992 CLC_0993 cbiE   FALSE 0.049 227.000 0.000 NA   NA
 3742428 3742429 CLC_0993 CLC_0994   cbiT FALSE 0.086 193.000 0.000 NA   NA
 3742429 3742430 CLC_0994 CLC_0995 cbiT   TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3742430 3742431 CLC_0995 CLC_0996     FALSE 0.459 36.000 0.000 NA   NA
 3742433 3742434 CLC_0998 CLC_0999     TRUE 0.942 43.000 0.400 NA   NA
 3742434 3742435 CLC_0999 CLC_1000     FALSE 0.280 60.000 0.000 NA   NA
 3742435 3742436 CLC_1000 CLC_1001     FALSE 0.236 120.000 0.000 1.000   NA
 3742436 3742437 CLC_1001 CLC_1002   cobI FALSE 0.050 295.000 0.000 1.000 N NA
 3742437 3742438 CLC_1002 CLC_1003 cobI cobM TRUE 0.993 19.000 0.291 0.012 Y NA
 3742438 3742439 CLC_1003 CLC_1004 cobM cbiG TRUE 0.666 291.000 0.397 0.012 Y NA
 3742439 3742440 CLC_1004 CLC_1005 cbiG cobJ TRUE 0.934 158.000 0.352 0.012 Y NA
 3742440 3742441 CLC_1005 CLC_1006 cobJ cobK TRUE 0.953 134.000 0.423 0.012 Y NA
 3742441 3742442 CLC_1006 CLC_1007 cobK   FALSE 0.590 80.000 0.006 NA   NA
 3742442 3742443 CLC_1007 CLC_1008   cbiK FALSE 0.534 176.000 0.056 NA   NA
 3742443 3742444 CLC_1008 CLC_1009 cbiK   TRUE 0.964 13.000 0.040 1.000 N NA
 3742444 3742445 CLC_1009 CLC_1010   cobO FALSE 0.326 148.000 0.000 1.000 N NA
 3742445 3742446 CLC_1010 CLC_1011 cobO   FALSE 0.088 253.000 0.000 1.000 N NA
 3742446 3742447 CLC_1011 CLC_1012     TRUE 0.818 90.000 0.152 1.000 N NA
 3742447 3742448 CLC_1012 CLC_1013   asrA TRUE 0.968 20.000 0.174 1.000   NA
 3742448 3742449 CLC_1013 CLC_1014 asrA asrB TRUE 0.997 -13.000 0.750 0.038   NA
 3742449 3742450 CLC_1014 CLC_1015 asrB arsC TRUE 0.997 13.000 0.720 0.038 Y NA
 3742450 3742451 CLC_1015 CLC_1016 arsC   FALSE 0.022 354.000 0.000 1.000 N NA
 3742451 3742452 CLC_1016 CLC_1017     FALSE 0.037 312.000 0.000 1.000 N NA
 3742452 3742453 CLC_1017 CLC_1018     TRUE 0.987 20.000 0.556 1.000 N NA
 3742453 3742454 CLC_1018 CLC_1019     TRUE 0.987 15.000 0.444 1.000 N NA
 3742454 3742455 CLC_1019 CLC_1020     TRUE 0.982 -16.000 0.067 NA   NA
 3742455 3742456 CLC_1020 CLC_1021     FALSE 0.001 831.000 0.000 NA   NA
 3742456 3742457 CLC_1021 CLC_1022     TRUE 0.988 21.000 0.833 NA   NA
 3742457 3742458 CLC_1022 CLC_1023     TRUE 0.992 4.000 0.833 NA   NA
 3742458 3742459 CLC_1023 CLC_1024     FALSE 0.022 645.000 0.154 NA   NA
 3742459 3742460 CLC_1024 CLC_1025     TRUE 0.998 -10.000 0.765 1.000 Y NA
 3742461 3742462 CLC_1026 CLC_1027     TRUE 0.997 1.000 0.625 1.000 Y NA
 3742462 3742463 CLC_1027 CLC_1028     TRUE 0.993 13.000 0.375 1.000 Y NA
 3742463 3742464 CLC_1028 CLC_1029   dhaKL FALSE 0.005 558.000 0.000 1.000 N NA
 3742464 3742465 CLC_1029 CLC_1030 dhaKL dhaD TRUE 0.969 11.000 0.053 1.000 N NA
 3742465 3742466 CLC_1030 CLC_1031 dhaD   FALSE 0.270 312.000 0.250 1.000 N NA
 3742467 3742468 CLC_1032 CLC_1033     FALSE 0.476 35.000 0.000 NA   NA
 3742468 3742469 CLC_1033 CLC_1034     TRUE 0.842 27.000 0.000 0.011   NA
 3742469 3742470 CLC_1034 CLC_1035     FALSE 0.140 153.000 0.000 NA   NA
 3742470 3742471 CLC_1035 CLC_1036     FALSE 0.262 63.000 0.000 NA   NA
 3742471 3742472 CLC_1036 CLC_1037     FALSE 0.173 118.000 0.000 NA   NA
 3742472 3742473 CLC_1037 CLC_1038     TRUE 0.774 101.000 0.200 NA   NA
 3742473 3742474 CLC_1038 CLC_1039     TRUE 0.854 46.000 0.061 NA   NA
 3742474 3742475 CLC_1039 CLC_1040     FALSE 0.064 210.000 0.000 NA   NA
 3742475 3742476 CLC_1040 CLC_1041     TRUE 0.982 17.000 0.486 NA   NA
 3742476 3742477 CLC_1041 CLC_1042     FALSE 0.161 135.000 0.000 NA   NA
 3742479 3742480 CLC_1044 CLC_1045     TRUE 0.987 26.000 0.833 NA   NA
 3742482 3742483 CLC_1047 CLC_1048   recQ FALSE 0.038 244.000 0.000 NA   NA
 3742483 3742484 CLC_1048 CLC_1049 recQ   FALSE 0.259 172.000 0.000 1.000 N NA
 3742486 3742487 CLC_1051 CLC_1052     FALSE 0.240 115.000 0.000 1.000   NA
 3742487 3742488 CLC_1052 CLC_1053     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 3742488 3742489 CLC_1053 CLC_1054     TRUE 0.988 2.000 0.444 NA   NA
 3742489 3742490 CLC_1054 CLC_1055     TRUE 0.981 0.000 0.167 NA   NA
 3742490 3742491 CLC_1055 CLC_1056     TRUE 0.987 14.000 0.077 1.000 Y NA
 3742491 3742492 CLC_1056 CLC_1057     TRUE 0.965 15.000 0.135 NA   NA
 3742492 3742493 CLC_1057 CLC_1058   lctP FALSE 0.003 484.000 0.000 NA   NA
 3742493 3742494 CLC_1058 CLC_1059 lctP   TRUE 0.939 29.000 0.098 NA   NA
 3742494 3742495 CLC_1059 CLC_1060     TRUE 0.882 43.000 0.098 NA   NA
 3742495 3742496 CLC_1060 CLC_1061     TRUE 0.995 32.000 0.875 0.022 Y NA
 3742496 3742497 CLC_1061 CLC_1062     TRUE 0.985 61.000 0.875 0.009 Y NA
 3742497 3742498 CLC_1062 CLC_1063     FALSE 0.027 269.000 0.000 NA   NA
 3742498 3742499 CLC_1063 CLC_1064     FALSE 0.164 128.000 0.000 NA   NA
 3742499 3742500 CLC_1064 CLC_1065     FALSE 0.082 196.000 0.000 NA   NA
 3742500 3742501 CLC_1065 CLC_1066     TRUE 0.966 2.000 0.051 NA   NA
 3742502 3742503 CLC_1067 CLC_1068     FALSE 0.001 929.000 0.000 NA   NA
 3742504 3742505 CLC_1069 CLC_1070     FALSE 0.191 303.000 0.000 0.059 Y NA
 3742505 3742506 CLC_1070 CLC_1071     FALSE 0.059 215.000 0.000 NA   NA
 3742508 3742509 CLC_1073 CLC_1074     FALSE 0.183 160.000 0.000 1.000   NA
 3742509 3742510 CLC_1074 CLC_1075     TRUE 0.842 16.000 0.000 1.000 N NA
 3742514 3742515 CLC_1079 CLC_1080     FALSE 0.162 134.000 0.000 NA   NA
 3742515 3742516 CLC_1080 CLC_1081     FALSE 0.002 554.000 0.000 NA   NA
 3742516 3742517 CLC_1081 CLC_1082   feoB-2 FALSE 0.517 32.000 0.000 NA   NA
 3742517 3742518 CLC_1082 CLC_1083 feoB-2   TRUE 0.940 21.000 0.029 1.000   NA
 3742520 3742521 CLC_1085 CLC_1086     FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3742521 3742522 CLC_1086 CLC_1087   tlp FALSE 0.017 299.000 0.000 NA   NA
 3742522 3742523 CLC_1087 CLC_1088 tlp   FALSE 0.057 218.000 0.000 NA   NA
 3742523 3742524 CLC_1088 CLC_1089     TRUE 0.996 1.000 0.462 1.000 Y NA
 3742524 3742525 CLC_1089 CLC_1090     FALSE 0.006 535.000 0.000 1.000 N NA
 3742527 3742528 CLC_1092 CLC_1093     FALSE 0.027 270.000 0.000 NA   NA
 3742528 3742529 CLC_1093 CLC_1094     TRUE 0.998 0.000 0.833 1.000 Y NA
 3742530 3742531 CLC_1095 CLC_1096     FALSE 0.085 236.000 0.000 NA N NA
 3742532 3742533 CLC_1097 CLC_1098     TRUE 0.999 -10.000 0.870 0.034 Y NA
 3742533 3742534 CLC_1098 CLC_1099     TRUE 0.998 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 3742534 3742535 CLC_1099 CLC_1100     TRUE 0.937 74.000 0.196 1.000 Y NA
 3742535 3742536 CLC_1100 CLC_1101     FALSE 0.179 202.000 0.000 1.000 N NA
 3742536 3742537 CLC_1101 CLC_1102     FALSE 0.006 515.000 0.000 1.000 N NA
 3742537 3742538 CLC_1102 CLC_1103     TRUE 0.997 2.000 0.389 0.007 Y NA
 3742539 3742540 CLC_1104 CLC_1105     TRUE 0.997 3.000 1.000 NA Y NA
 3742540 3742541 CLC_1105 CLC_1106     FALSE 0.188 88.000 0.000 NA   NA
 3742541 3742542 CLC_1106 CLC_1107     FALSE 0.040 239.000 0.000 NA   NA
 3742543 3742544 CLC_1108 CLC_1109     FALSE 0.263 188.000 0.000 0.006   NA
 3742544 3742545 CLC_1109 CLC_1110     FALSE 0.098 181.000 0.000 NA   NA
 3742545 3742546 CLC_1110 CLC_1111     TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA   NA
 3742546 3742547 CLC_1111 CLC_1112     FALSE 0.080 324.000 0.023 NA   NA
 3742547 3742548 CLC_1112 CLC_1113     FALSE 0.499 165.000 0.023 NA   NA
 3742549 3742550 CLC_1114 CLC_1115     FALSE 0.578 116.000 0.015 NA   NA
 3742550 3742551 CLC_1115 CLC_1116     FALSE 0.008 384.000 0.000 1.000   NA
 3742552 3742553 CLC_1117 CLC_1118     FALSE 0.010 375.000 0.000 1.000   NA
 3742553 3742554 CLC_1118 CLC_1119     FALSE 0.083 218.000 0.000 1.000   NA
 3742554 3742555 CLC_1119 CLC_1120     FALSE 0.096 208.000 0.000 1.000   NA
 3742555 3742556 CLC_1120 CLC_1121     TRUE 0.888 57.000 0.107 0.037   NA
 3742556 3742557 CLC_1121 CLC_1122     TRUE 0.989 3.000 0.300 0.037   NA
 3742557 3742558 CLC_1122 CLC_1123   glpT TRUE 0.648 89.000 0.021 1.000   NA
 3742558 3742559 CLC_1123 CLC_1124 glpT argS FALSE 0.005 582.000 0.000 1.000 N NA
 3742559 3742560 CLC_1124 CLC_1125 argS   FALSE 0.009 342.000 0.000 NA   NA
 3742560 3742561 CLC_1125 CLC_1126     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3742561 3742562 CLC_1126 CLC_1127     FALSE 0.221 139.000 0.000 1.000   NA
 3742563 3742564 CLC_1128 CLC_1129   feoB-3 TRUE 0.931 26.000 0.034 NA   NA
 3742564 3742565 CLC_1129 CLC_1130 feoB-3 feoA-2 TRUE 0.992 15.000 0.308 1.000 Y NA
 3742566 3742567 CLC_1131 CLC_1132     FALSE 0.062 213.000 0.000 NA   NA
 3742567 3742568 CLC_1132 CLC_1133     FALSE 0.033 257.000 0.000 NA   NA
 3742568 3742569 CLC_1133 CLC_1134     FALSE 0.268 62.000 0.000 NA   NA
 3742569 3742570 CLC_1134 CLC_1135     FALSE 0.006 412.000 0.000 1.000   NA
 3742570 3742571 CLC_1135 CLC_1136     FALSE 0.018 325.000 0.000 1.000   NA
 3742571 3742572 CLC_1136 CLC_1137     TRUE 0.996 2.000 0.511 1.000 Y NA
 3742572 3742573 CLC_1137 CLC_1138     TRUE 0.952 55.000 0.154 NA Y NA
 3742573 3742574 CLC_1138 CLC_1139     TRUE 0.840 189.000 0.250 NA Y NA
 3742574 3742575 CLC_1139 CLC_1140     FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 3742575 3742576 CLC_1140 CLC_1141     FALSE 0.029 265.000 0.000 NA   NA
 3742576 3742577 CLC_1141 CLC_1142     FALSE 0.087 191.000 0.000 NA   NA
 3742577 3742578 CLC_1142 CLC_1143     FALSE 0.004 506.000 0.000 1.000   NA
 3742578 3742579 CLC_1143 CLC_1144     FALSE 0.037 245.000 0.000 NA   NA
 3742579 3742580 CLC_1144 CLC_1145     FALSE 0.065 209.000 0.000 NA   NA
 3742584 3742585 CLC_1149 CLC_1150     FALSE 0.512 143.000 0.008 NA   NA
 3742585 3742586 CLC_1150 CLC_1151     TRUE 0.748 56.000 0.008 1.000   NA
 3742587 3742588 CLC_1152 CLC_1153     FALSE 0.028 596.000 0.000 0.003 Y NA
 3742589 3742590 CLC_1154 CLC_1155     TRUE 0.982 18.000 0.333 1.000 N NA
 3742590 3742591 CLC_1155 CLC_1156     FALSE 0.006 419.000 0.000 1.000   NA
 3742591 3742592 CLC_1156 CLC_1157     FALSE 0.173 99.000 0.000 NA   NA
 3742592 3742593 CLC_1157 CLC_1158     FALSE 0.001 807.000 0.000 NA   NA
 3742593 3742594 CLC_1158 CLC_1159     TRUE 0.981 2.000 0.217 NA   NA
 3742594 3742595 CLC_1159 CLC_1160     TRUE 0.988 23.000 0.084 0.034 Y NA
 3742595 3742596 CLC_1160 CLC_1161     TRUE 0.988 12.000 0.308 0.034 N NA
 3742596 3742597 CLC_1161 CLC_1162     FALSE 0.016 303.000 0.000 NA   NA
 3742597 3742598 CLC_1162 CLC_1163     FALSE 0.592 104.000 0.020 NA   NA
 3742598 3742599 CLC_1163 CLC_1164     TRUE 0.777 10.000 0.000 1.000   NA
 3742599 3742600 CLC_1164 CLC_1165     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3742600 3742601 CLC_1165 CLC_1166     TRUE 0.968 1.000 0.050 NA   NA
 3742601 3742602 CLC_1166 CLC_1167   maa FALSE 0.020 288.000 0.000 NA   NA
 3742604 3742605 CLC_1169 CLC_1170     FALSE 0.037 275.000 0.000 1.000   NA
 3742605 3742606 CLC_1170 CLC_1171     FALSE 0.536 160.000 0.017 1.000   NA
 3742608 3742609 CLC_1173 CLC_1174   mgtE FALSE 0.002 501.000 0.000 NA   NA
 3742609 3742610 CLC_1174 CLC_1175 mgtE   FALSE 0.005 1003.000 0.000 0.058 N NA
 3742610 3742611 CLC_1175 CLC_1176   serA TRUE 0.721 228.000 0.110 0.058 Y NA
 3742611 3742612 CLC_1176 CLC_1177 serA   TRUE 0.984 -22.000 0.072 NA   NA
 3742612 3742613 CLC_1177 CLC_1178     FALSE 0.002 600.000 0.000 NA   NA
 3742613 3742614 CLC_1178 CLC_1179     TRUE 0.624 159.000 0.056 1.000   NA
 3742616 3742617 CLC_1181 CLC_1182     TRUE 0.751 111.000 0.118 1.000   NA
 3742617 3742618 CLC_1182 CLC_1183     FALSE 0.026 299.000 0.000 1.000   NA
 3742618 3742619 CLC_1183 CLC_1184     FALSE 0.523 158.000 0.004 NA N NA
 3742619 3742620 CLC_1184 CLC_1185     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3742620 3742621 CLC_1185 CLC_1186     FALSE 0.024 277.000 0.000 NA   NA
 3742621 3742622 CLC_1186 CLC_1187     FALSE 0.567 177.000 0.091 NA   NA
 3742622 3742623 CLC_1187 CLC_1188   xpt-2 FALSE 0.570 161.000 0.009 1.000 N NA
 3742623 3742624 CLC_1188 CLC_1189 xpt-2   FALSE 0.018 298.000 0.000 NA   NA
 3742624 3742625 CLC_1189 CLC_1190     FALSE 0.014 309.000 0.000 NA   NA
 3742625 3742626 CLC_1190 CLC_1191     TRUE 0.770 196.000 0.667 NA   NA
 3742626 3742627 CLC_1191 CLC_1192     FALSE 0.008 350.000 0.000 NA   NA
 3742627 3742628 CLC_1192 CLC_1193     FALSE 0.100 180.000 0.000 NA   NA
 3742628 3742629 CLC_1193 CLC_1194     TRUE 0.659 137.000 0.065 NA   NA
 3742629 3742630 CLC_1194 CLC_1195     FALSE 0.001 771.000 0.000 NA   NA
 3742630 3742631 CLC_1195 CLC_1196     TRUE 0.848 182.000 1.000 NA   NA
 3742631 3742632 CLC_1196 CLC_1197     FALSE 0.005 391.000 0.000 NA   NA
 3742632 3742633 CLC_1197 CLC_1198     TRUE 0.998 2.000 0.667 0.034 Y NA
 3742633 3742634 CLC_1198 CLC_1199     TRUE 0.998 -37.000 0.900 0.034 N NA
 3742636 3742637 CLC_1201 CLC_1202   rpsA FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 3742637 3742638 CLC_1202 CLC_1203 rpsA   FALSE 0.412 183.000 0.008 1.000   NA
 3742638 3742639 CLC_1203 CLC_1204     FALSE 0.565 172.000 0.067 NA   NA
 3742639 3742640 CLC_1204 CLC_1205     FALSE 0.001 869.000 0.000 NA   NA
 3742640 3742641 CLC_1205 CLC_1206     TRUE 0.994 0.000 0.857 NA   NA
 3742641 3742642 CLC_1206 CLC_1207     TRUE 0.992 -37.000 0.231 1.000   NA
 3742642 3742643 CLC_1207 CLC_1208     FALSE 0.011 330.000 0.000 NA   NA
 3742643 3742644 CLC_1208 CLC_1209   asdA FALSE 0.004 433.000 0.000 NA   NA
 3742646 3742647 CLC_1211 CLC_1212     TRUE 0.972 -6.000 0.012 NA N NA
 3742647 3742648 CLC_1212 CLC_1213   panE FALSE 0.005 492.000 0.000 NA N NA
 3742648 3742649 CLC_1213 CLC_1214 panE fchA FALSE 0.043 303.000 0.000 1.000 N NA
 3742649 3742650 CLC_1214 CLC_1215 fchA folD TRUE 0.988 0.000 0.082 0.001 N NA
 3742650 3742651 CLC_1215 CLC_1216 folD   FALSE 0.019 320.000 0.000 1.000   NA
 3742653 3742654 CLC_1218 CLC_1219     TRUE 0.813 118.000 0.286 NA   NA
 3742654 3742655 CLC_1219 CLC_1220     FALSE 0.561 120.000 0.012 NA   NA
 3742655 3742656 CLC_1220 CLC_1221     FALSE 0.003 672.000 0.000 NA N NA
 3742656 3742657 CLC_1221 CLC_1222   cysK-2 FALSE 0.135 329.000 0.083 NA N NA
 3742657 3742658 CLC_1222 CLC_1223 cysK-2   TRUE 0.997 -13.000 0.400 1.000 Y NA
 3742658 3742659 CLC_1223 CLC_1224     TRUE 0.989 35.000 0.400 0.034 Y NA
 3742659 3742660 CLC_1224 CLC_1225   iscS-1 TRUE 0.929 101.000 0.286 1.000 Y NA
 3742660 3742661 CLC_1225 CLC_1226 iscS-1   FALSE 0.313 72.000 0.000 1.000   NA
 3742661 3742662 CLC_1226 CLC_1227     FALSE 0.479 155.000 0.008 NA   NA
 3742662 3742663 CLC_1227 CLC_1228   trmU-1 FALSE 0.524 116.000 0.004 NA   NA
 3742663 3742664 CLC_1228 CLC_1229 trmU-1   FALSE 0.026 340.000 0.000 1.000 N NA
 3742664 3742665 CLC_1229 CLC_1230     TRUE 0.998 -3.000 0.875 NA Y NA
 3742665 3742666 CLC_1230 CLC_1231   bcrA FALSE 0.014 373.000 0.000 NA N NA
 3742666 3742667 CLC_1231 CLC_1232 bcrA   TRUE 0.814 -7.000 0.000 NA   NA
 3742667 3742668 CLC_1232 CLC_1233     FALSE 0.002 603.000 0.000 NA   NA
 3742668 3742669 CLC_1233 CLC_1234     FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 3742671 3742672 CLC_1236 CLC_1237     TRUE 0.991 6.000 0.556 1.000 N NA
 3742672 3742673 CLC_1237 CLC_1238     FALSE 0.017 301.000 0.000 NA   NA
 3742673 3742674 CLC_1238 CLC_1239     FALSE 0.002 511.000 0.000 NA   NA
 3742676 3742677 CLC_1241 CLC_1242     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3742677 3742678 CLC_1242 CLC_1243     FALSE 0.426 64.000 0.000 NA N NA
 3742678 3742679 CLC_1243 CLC_1244     TRUE 0.964 3.000 0.000 NA Y NA
 3742679 3742680 CLC_1244 CLC_1245   amyB FALSE 0.006 671.000 0.000 0.005   NA
 3742680 10195468 CLC_1245 CLC_3714 amyB   FALSE 0.162 134.000 0.000 NA   NA
 10195468 3742681 CLC_3714 CLC_1246   tyrS-1 FALSE 0.002 550.000 0.000 NA   NA
 3742681 3742682 CLC_1246 CLC_1247 tyrS-1   FALSE 0.055 287.000 0.000 1.000 N NA
 3742682 3742683 CLC_1247 CLC_1248     TRUE 0.996 -7.000 0.833 1.000 N NA
 3742683 3742684 CLC_1248 CLC_1249     TRUE 0.985 1.000 0.278 NA   NA
 3742686 3742687 CLC_1251 CLC_1252     FALSE 0.089 189.000 0.000 NA   NA
 3742687 3742688 CLC_1252 CLC_1253     FALSE 0.210 78.000 0.000 NA   NA
 3742688 3742689 CLC_1253 CLC_1254     FALSE 0.613 174.000 0.095 1.000   NA
 3742689 3742690 CLC_1254 CLC_1255   sdhB FALSE 0.013 400.000 0.000 1.000 N NA
 3742690 3742691 CLC_1255 CLC_1256 sdhB sdhA TRUE 0.993 13.000 0.146 0.001 Y NA
 3742691 3742692 CLC_1256 CLC_1258 sdhA   FALSE 0.004 424.000 0.000 NA   NA
 3742695 3742696 CLC_1261 CLC_1262     FALSE 0.006 380.000 0.000 NA   NA
 3742696 3742697 CLC_1262 CLC_1263     TRUE 0.752 107.000 0.154 NA   NA
 3742697 3742698 CLC_1263 CLC_1264     TRUE 0.982 2.000 0.231 NA   NA
 3742698 3742699 CLC_1264 CLC_1265     TRUE 0.942 37.000 0.286 NA   NA
 3742699 3742700 CLC_1265 CLC_1266     TRUE 0.651 173.000 0.071 1.000 N NA
 3742700 3742701 CLC_1266 CLC_1267     TRUE 0.997 6.000 0.786 0.033 Y NA
 3742701 3742702 CLC_1267 CLC_1268     TRUE 0.924 199.000 0.688 0.033 Y NA
 3742703 3742704 CLC_1269 CLC_1270   cotJB TRUE 0.927 34.000 0.125 NA   NA
 3742704 3742705 CLC_1270 CLC_1271 cotJB cotJC TRUE 0.913 31.000 0.047 NA   NA
 3742705 3742706 CLC_1271 CLC_1272 cotJC   FALSE 0.094 230.000 0.000 NA N NA
 3742706 3742707 CLC_1272 CLC_1273     TRUE 0.986 17.000 0.667 NA   NA
 3742707 3742708 CLC_1273 CLC_1274     FALSE 0.002 648.000 0.000 NA   NA
 3742711 3742712 CLC_1277 CLC_1278     FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 3742715 3742716 CLC_1281 CLC_1282     FALSE 0.420 39.000 0.000 NA   NA
 3742716 3742717 CLC_1282 CLC_1283     FALSE 0.043 234.000 0.000 NA   NA
 3742719 3742720 CLC_1285 CLC_1286     TRUE 0.991 12.000 1.000 NA   NA
 3742722 3742723 CLC_1288 CLC_1289     FALSE 0.002 662.000 0.000 NA   NA
 3742723 3742724 CLC_1289 CLC_1290     FALSE 0.002 880.000 0.000 1.000   NA
 3742724 3742725 CLC_1290 CLC_1291     FALSE 0.021 284.000 0.000 NA   NA
 3742725 3742726 CLC_1291 CLC_1292     FALSE 0.013 319.000 0.000 NA   NA
 3742727 3742728 CLC_1293 CLC_1294     TRUE 0.870 40.000 0.014 1.000 N NA
 3742729 3742730 CLC_1295 CLC_1296 grdX grdE TRUE 0.850 91.000 0.400 NA   NA
 3742730 3742731 CLC_1296 CLC_1297 grdE grdB TRUE 0.966 33.000 0.222 0.003   NA
 3742731 3742732 CLC_1297 CLC_1298 grdB trxB FALSE 0.200 151.000 0.000 1.000   NA
 3742732 3742733 CLC_1298 CLC_1299 trxB   TRUE 0.982 34.000 0.226 1.000 Y NA
 3742733 3742734 CLC_1299 CLC_1300   grdA FALSE 0.261 86.000 0.000 1.000   NA
 3742734 3742735 CLC_1300 CLC_1301 grdA grdC TRUE 0.780 95.000 0.054 0.003   NA
 3742735 3742736 CLC_1301 CLC_1302 grdC grdD TRUE 0.991 16.000 0.622 0.003   NA
 3742736 3742737 CLC_1302 CLC_1303 grdD   FALSE 0.010 427.000 0.000 1.000 N NA
 3742737 3742738 CLC_1303 CLC_1304     TRUE 0.749 66.000 0.005 0.055   NA
 3742738 3742739 CLC_1304 CLC_1305   mtnK FALSE 0.005 436.000 0.000 1.000   NA
 3742739 3742740 CLC_1305 CLC_1306 mtnK mtnA TRUE 0.717 140.000 0.104 1.000   NA
 3742740 3742741 CLC_1306 CLC_1307 mtnA   TRUE 0.632 24.000 0.000 NA   NA
 3742741 3742742 CLC_1307 CLC_1308     TRUE 0.654 17.000 0.000 NA   NA
 3742742 3742743 CLC_1308 CLC_1309     FALSE 0.384 44.000 0.000 NA   NA
 3742743 3742744 CLC_1309 CLC_1310     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3742744 3742745 CLC_1310 CLC_1311     FALSE 0.015 307.000 0.000 NA   NA
 3742747 3742748 CLC_1313 CLC_1314     FALSE 0.602 162.000 0.074 NA   NA
 3742748 3742749 CLC_1314 CLC_1315     FALSE 0.616 142.000 0.038 NA   NA
 3742749 3742750 CLC_1315 CLC_1316     TRUE 0.982 -3.000 0.135 NA   NA
 3742750 3742751 CLC_1316 CLC_1317     FALSE 0.006 383.000 0.000 NA   NA
 3742751 3742752 CLC_1317 CLC_1318     TRUE 0.772 69.000 0.080 NA   NA
 3742753 3742754 CLC_1319 CLC_1320     FALSE 0.006 381.000 0.000 NA   NA
 3742755 3742756 CLC_1321 CLC_1322     TRUE 0.982 28.000 0.667 NA   NA
 3742756 3742757 CLC_1322 CLC_1323     TRUE 0.876 57.000 0.200 NA   NA
 3742757 3742758 CLC_1323 CLC_1324     TRUE 0.996 14.000 0.500 0.001 Y NA
 3742758 3742759 CLC_1324 CLC_1325     TRUE 0.993 32.000 0.667 0.050 Y NA
 3742759 3742760 CLC_1325 CLC_1326     TRUE 0.780 116.000 0.100 1.000 N NA
 3742760 3742761 CLC_1326 CLC_1327   topB FALSE 0.015 390.000 0.000 1.000 N NA
 3742761 3742762 CLC_1327 CLC_1328 topB   FALSE 0.014 312.000 0.000 NA   NA
 3742762 3742763 CLC_1328 CLC_1329     FALSE 0.251 66.000 0.000 NA   NA
 3742765 3742766 CLC_1331 CLC_1332     FALSE 0.007 399.000 0.000 1.000   NA
 3742766 3742767 CLC_1332 CLC_1333     FALSE 0.023 305.000 0.000 1.000   NA
 3742767 3742768 CLC_1333 CLC_1334     FALSE 0.036 315.000 0.000 1.000 N NA
 3742768 3742769 CLC_1334 CLC_1335     TRUE 0.953 20.000 0.067 1.000   NA
 3742769 3742770 CLC_1335 CLC_1336     TRUE 0.954 6.000 0.033 NA   NA
 3742770 3742771 CLC_1336 CLC_1337     FALSE 0.292 281.000 0.230 NA   NA
 3742771 3742772 CLC_1337 CLC_1338     FALSE 0.004 417.000 0.000 NA   NA
 3742772 3742773 CLC_1338 CLC_1339     FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 3742773 3742774 CLC_1339 CLC_1340     FALSE 0.010 335.000 0.000 NA   NA
 3742774 3742775 CLC_1340 CLC_1341     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3742775 3742776 CLC_1341 CLC_1342     TRUE 0.943 37.000 0.287 NA   NA
 3742776 3742777 CLC_1342 CLC_1343   copZ TRUE 0.892 123.000 0.024 0.001 Y NA
 3742777 3742778 CLC_1343 CLC_1344 copZ   FALSE 0.060 382.000 0.000 1.000 Y NA
 3742778 3742779 CLC_1344 CLC_1345     FALSE 0.007 478.000 0.000 1.000 N NA
 3742779 3742780 CLC_1345 CLC_1346     FALSE 0.010 338.000 0.000 NA   NA
 3742780 3742781 CLC_1346 CLC_1347     FALSE 0.551 164.000 0.040 NA   NA
 3742781 3742782 CLC_1347 CLC_1348     FALSE 0.004 419.000 0.000 NA   NA
 3742784 3742785 CLC_1350 CLC_1351     TRUE 0.931 25.000 0.032 NA   NA
 3742787 3742788 CLC_1353 CLC_1354     FALSE 0.002 592.000 0.000 NA   NA
 3742788 3742789 CLC_1354 CLC_1355   trkA FALSE 0.001 788.000 0.000 NA   NA
 3742789 3742790 CLC_1355 CLC_1356 trkA trkH TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA   NA
 3742790 3742791 CLC_1356 CLC_1357 trkH   FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 3742791 3742792 CLC_1357 CLC_1358     TRUE 0.847 -19.000 0.000 NA   NA
 3742793 3742794 CLC_1359 CLC_1360     TRUE 0.967 15.000 0.158 NA   NA
 3742794 3742795 CLC_1360 CLC_1361     FALSE 0.014 342.000 0.000 1.000   NA
 3742796 3742797 CLC_1362 CLC_1363 rbr   FALSE 0.040 295.000 0.000 NA N NA
 3742801 3742802 CLC_1367 CLC_1368     FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 3742802 3742803 CLC_1368 CLC_1369     TRUE 0.651 209.000 0.312 NA N NA
 3742803 3742804 CLC_1369 CLC_1370     TRUE 0.891 147.000 0.077 0.050 Y NA
 3742804 3742805 CLC_1370 CLC_1371   noxA FALSE 0.609 199.000 0.111 0.050   NA
 3742806 3742807 CLC_1372 CLC_1373     FALSE 0.016 382.000 0.000 1.000 N NA
 3742808 3742809 CLC_1374 CLC_1375     FALSE 0.043 303.000 0.000 1.000 N NA
 3742809 3742810 CLC_1375 CLC_1376     TRUE 0.989 22.000 0.214 1.000 Y NA
 3742810 3742811 CLC_1376 CLC_1377     TRUE 0.994 3.000 0.255 1.000 Y NA
 3742812 3742813 CLC_1378 CLC_1379     TRUE 0.794 75.000 0.133 NA   NA
 3742814 3742815 CLC_1380 CLC_1381     FALSE 0.081 280.000 0.000 0.004   NA
 3742815 3742816 CLC_1381 CLC_1382     TRUE 0.742 113.000 0.107 1.000   NA
 3742816 3742817 CLC_1382 CLC_1383     FALSE 0.047 424.000 0.089 1.000   NA
 3742817 3742818 CLC_1383 CLC_1384     FALSE 0.011 332.000 0.000 NA   NA
 3742818 3742819 CLC_1384 CLC_1385     FALSE 0.022 283.000 0.000 NA   NA
 3742819 3742820 CLC_1385 CLC_1386     FALSE 0.015 306.000 0.000 NA   NA
 3742820 3742821 CLC_1386 CLC_1387     TRUE 0.939 53.000 0.500 NA   NA
 3742821 3742822 CLC_1387 CLC_1388     TRUE 0.985 0.000 0.250 NA   NA
 3742824 3742825 CLC_1390 CLC_1391     FALSE 0.008 458.000 0.000 1.000 N NA
 3742825 3742826 CLC_1391 CLC_1392     TRUE 0.996 -3.000 0.235 0.033 Y NA
 3742826 3742827 CLC_1392 CLC_1393     TRUE 0.995 9.000 0.353 0.033 Y NA
 3742827 3742828 CLC_1393 CLC_1394     TRUE 0.898 99.000 0.118 1.000 Y NA
 3742828 3742829 CLC_1394 CLC_1395     TRUE 0.985 -6.000 0.059 0.032   NA
 3742829 3742830 CLC_1395 CLC_1396     FALSE 0.003 444.000 0.000 NA   NA
 3742831 3742832 CLC_1397 CLC_1398     TRUE 0.995 0.000 0.231 1.000 Y NA
 3742835 3742836 CLC_1401 CLC_1402     TRUE 0.680 135.000 0.025 1.000 N NA
 3742836 3742837 CLC_1402 CLC_1403     FALSE 0.001 913.000 0.000 NA   NA
 3742837 3742838 CLC_1403 CLC_1404     FALSE 0.366 47.000 0.000 NA   NA
 3742838 3742839 CLC_1404 CLC_1405     TRUE 0.998 -28.000 0.646 NA Y NA
 3742839 3742840 CLC_1405 CLC_1406     TRUE 0.920 141.000 0.270 1.000 Y NA
 3742840 3742841 CLC_1406 CLC_1407     FALSE 0.202 279.000 0.000 1.000 Y NA
 3742841 3742842 CLC_1407 CLC_1408     TRUE 0.987 -30.000 0.035 0.057   NA
 3742842 3742843 CLC_1408 CLC_1409     TRUE 0.653 127.000 0.035 1.000   NA
 3742843 3742844 CLC_1409 CLC_1410     FALSE 0.377 45.000 0.000 NA   NA
 3742844 3742845 CLC_1410 CLC_1411   rnz FALSE 0.163 129.000 0.000 NA   NA
 3742845 3742846 CLC_1411 CLC_1412 rnz   FALSE 0.013 346.000 0.000 1.000   NA
 3742846 3742847 CLC_1412 CLC_1413     FALSE 0.154 145.000 0.000 NA   NA
 3742847 3742848 CLC_1413 CLC_1414     TRUE 0.932 13.000 0.015 NA   NA
 3742848 3742849 CLC_1414 CLC_1415     TRUE 0.944 183.000 0.800 0.019 Y NA
 3742849 3742850 CLC_1415 CLC_1416     FALSE 0.281 351.000 0.600 1.000 N NA
 3742850 3742851 CLC_1416 CLC_1417     TRUE 0.965 106.000 1.000 NA Y NA
 3742851 3742852 CLC_1417 CLC_1418     TRUE 0.991 2.000 0.600 NA   NA
 3742852 3742853 CLC_1418 CLC_1419     TRUE 0.982 19.000 0.500 NA   NA
 3742854 3742855 CLC_1420 CLC_1421     FALSE 0.002 558.000 0.000 NA   NA
 3742855 3742856 CLC_1421 CLC_1422     TRUE 0.717 168.000 0.250 NA   NA
 3742857 3742858 CLC_1423 CLC_1424 pepD-1   FALSE 0.382 58.000 0.000 1.000   NA
 3742858 3742859 CLC_1424 CLC_1425     FALSE 0.161 135.000 0.000 NA   NA
 3742859 3742860 CLC_1425 CLC_1426   pdxK FALSE 0.005 398.000 0.000 NA   NA
 3742862 3742863 CLC_1428 CLC_1429     TRUE 0.994 -13.000 0.500 1.000   NA
 3742863 3742864 CLC_1429 CLC_1430     TRUE 0.791 173.000 0.500 NA   NA
 3742864 3742865 CLC_1430 CLC_1431     FALSE 0.003 440.000 0.000 NA   NA
 3742865 3742866 CLC_1431 CLC_1432     TRUE 0.998 2.000 1.000 1.000 Y NA
 3742866 3742867 CLC_1432 CLC_1433     TRUE 0.942 59.000 0.500 1.000 N NA
 3742867 3742868 CLC_1433 CLC_1434     TRUE 0.989 -10.000 0.222 1.000   NA
 3742868 3742869 CLC_1434 CLC_1435     FALSE 0.240 69.000 0.000 NA   NA
 3742869 3742870 CLC_1435 CLC_1436     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 3742870 3742871 CLC_1436 CLC_1437     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3742871 3742872 CLC_1437 CLC_1438     TRUE 0.712 88.000 0.000 1.000 Y NA
 3742872 3742873 CLC_1438 CLC_1439     TRUE 0.993 19.000 0.400 1.000 Y NA
 3742873 3742874 CLC_1439 CLC_1440     FALSE 0.006 425.000 0.000 1.000   NA
 3742878 3742879 CLC_1444 CLC_1445     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3742879 3742880 CLC_1445 CLC_1446     TRUE 0.791 173.000 0.500 NA   NA
 3742882 3742883 CLC_1448 CLC_1449     TRUE 0.998 2.000 0.643 0.033 Y NA
 3742883 3742884 CLC_1449 CLC_1450     TRUE 0.633 131.000 0.041 NA   NA
 3742884 3742885 CLC_1450 CLC_1451     FALSE 0.176 95.000 0.000 NA   NA
 3742885 3742886 CLC_1451 CLC_1452     FALSE 0.005 388.000 0.000 NA   NA
 3742886 3742887 CLC_1452 CLC_1453     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3742887 3742888 CLC_1453 CLC_1454     FALSE 0.163 132.000 0.000 NA   NA
 3742888 3742889 CLC_1454 CLC_1455     FALSE 0.174 110.000 0.000 NA   NA
 3742889 3742890 CLC_1455 CLC_1456     FALSE 0.126 162.000 0.000 NA   NA
 3742890 3742891 CLC_1456 CLC_1457     FALSE 0.180 92.000 0.000 NA   NA
 3742891 3742892 CLC_1457 CLC_1458     FALSE 0.024 276.000 0.000 NA   NA
 3742892 3742893 CLC_1458 CLC_1459   uviB FALSE 0.051 224.000 0.000 NA   NA
 3742893 3742894 CLC_1459 CLC_1460 uviB   TRUE 0.994 -7.000 0.667 NA   NA
 3742894 3742895 CLC_1460 CLC_1461     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3742895 3742896 CLC_1461 CLC_1462     FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 3742896 3742897 CLC_1462 CLC_1463     TRUE 0.992 2.000 0.750 NA   NA
 3742897 3742898 CLC_1463 CLC_1464     FALSE 0.002 659.000 0.000 NA   NA
 3742898 3742899 CLC_1464 CLC_1465     FALSE 0.006 384.000 0.000 NA   NA
 3742899 3742900 CLC_1465 CLC_1466     FALSE 0.008 351.000 0.000 NA   NA
 3742900 3742901 CLC_1466 CLC_1467     FALSE 0.072 203.000 0.000 NA   NA
 3742901 3742902 CLC_1467 CLC_1468     FALSE 0.551 220.000 0.250 1.000   NA
 3742902 3742903 CLC_1468 CLC_1469     FALSE 0.403 56.000 0.000 1.000   NA
 3742903 3742904 CLC_1469 CLC_1470     FALSE 0.007 480.000 0.000 1.000 N NA
 3742904 3742905 CLC_1470 CLC_1471   spoVB-1 TRUE 0.943 32.000 0.137 1.000   NA
 3742909 3742910 CLC_1475 CLC_1476     FALSE 0.020 361.000 0.000 1.000 N NA
 3742911 3742912 CLC_1477 CLC_1478   npr-1 FALSE 0.115 170.000 0.000 NA   NA
 3742912 3742913 CLC_1478 CLC_1479 npr-1 npr-2 TRUE 0.974 137.000 1.000 0.005 Y NA
 3742913 3742914 CLC_1479 CLC_1480 npr-2 npr-3 TRUE 0.772 116.000 0.000 0.005 Y NA
 3742914 3742915 CLC_1480 CLC_1481 npr-3 npr-4 TRUE 0.976 120.000 1.000 0.005 Y NA
 3742915 3742916 CLC_1481 CLC_1482 npr-4 npr-5 TRUE 0.769 120.000 0.000 0.005 Y NA
 3742916 3742917 CLC_1482 CLC_1483 npr-5 npr-6 TRUE 0.939 34.000 0.000 0.005 Y NA
 3742917 3742918 CLC_1483 CLC_1484 npr-6 nadC FALSE 0.005 603.000 0.000 1.000 N NA
 3742918 3742919 CLC_1484 CLC_1485 nadC nadB TRUE 0.994 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 3742919 3742920 CLC_1485 CLC_1486 nadB nadA TRUE 0.989 3.000 0.042 1.000 Y NA
 3742922 3742923 CLC_1488 CLC_1489 hlyIII ychF TRUE 0.624 121.000 0.002 0.051   NA
 3742924 3742925 CLC_1490 CLC_1491 mraZ mraW TRUE 0.902 80.000 0.635 NA   NA
 3742925 3742926 CLC_1491 CLC_1492 mraW   TRUE 0.625 82.000 0.008 1.000   NA
 3742926 3742927 CLC_1492 CLC_1493     TRUE 0.962 16.000 0.096 1.000   NA
 3742927 3742928 CLC_1493 CLC_1494   murE TRUE 0.747 230.000 0.265 1.000 Y NA
 3742928 3742929 CLC_1494 CLC_1495 murE murF TRUE 0.993 26.000 0.328 0.003 Y NA
 3742929 3742930 CLC_1495 CLC_1496 murF mraY-2 TRUE 0.970 36.000 0.024 0.005 Y NA
 3742930 3742931 CLC_1496 CLC_1497 mraY-2   TRUE 0.793 79.000 0.014 0.005 N NA
 3742931 3742932 CLC_1497 CLC_1498     FALSE 0.101 319.000 0.015 NA N NA
 3742932 3742933 CLC_1498 CLC_1499     TRUE 0.935 11.000 0.014 NA   NA
 3742933 3742934 CLC_1499 CLC_1500   sbp TRUE 0.901 34.000 0.053 NA   NA
 3742934 3742935 CLC_1500 CLC_1501 sbp   TRUE 0.969 1.000 0.053 NA   NA
 3742935 3742936 CLC_1501 CLC_1502     FALSE 0.594 93.000 0.017 NA   NA
 3742936 3742937 CLC_1502 CLC_1503     TRUE 0.934 21.000 0.032 NA   NA
 3742937 3742938 CLC_1503 CLC_1504     TRUE 0.973 17.000 0.246 NA   NA
 3742938 3742939 CLC_1504 CLC_1505     TRUE 0.979 1.000 0.118 1.000   NA
 3742939 3742940 CLC_1505 CLC_1506   divIVA TRUE 0.986 16.000 0.579 1.000   NA
 3742940 3742941 CLC_1506 CLC_1507 divIVA aroB FALSE 0.037 408.000 0.006 1.000 N NA
 3742941 3742942 CLC_1507 CLC_1508 aroB mtnN TRUE 0.964 1.000 0.003 1.000 N NA
 3742942 3742943 CLC_1508 CLC_1509 mtnN aroF TRUE 0.730 121.000 0.046 1.000 N NA
 3742943 3742944 CLC_1509 CLC_1510 aroF aroA TRUE 0.805 134.000 0.003 1.000 Y NA
 3742944 3742945 CLC_1510 CLC_1511 aroA   FALSE 0.144 217.000 0.000 1.000 N NA
 3742945 3742946 CLC_1511 CLC_1512   lspA FALSE 0.060 404.000 0.050 1.000 N NA
 3742946 3742947 CLC_1512 CLC_1513 lspA   TRUE 0.977 4.000 0.082 1.000 N NA
 3742947 3742948 CLC_1513 CLC_1514   pyrR-1 FALSE 0.033 487.000 0.048 1.000 N NA
 3742948 3742949 CLC_1514 CLC_1515 pyrR-1   TRUE 0.965 44.000 0.140 1.000 Y NA
 3742949 3742950 CLC_1515 CLC_1516   xth FALSE 0.005 590.000 0.000 1.000 N NA
 3742950 3742951 CLC_1516 CLC_1517 xth   FALSE 0.369 223.000 0.000 1.000 Y NA
 3742951 3742952 CLC_1517 CLC_1518     FALSE 0.067 231.000 0.000 1.000   NA
 3742952 3742953 CLC_1518 CLC_1519   modA FALSE 0.458 178.000 0.015 1.000   NA
 3742953 3742954 CLC_1519 CLC_1520 modA modB TRUE 0.996 10.000 0.430 0.001 Y NA
 3742954 3742955 CLC_1520 CLC_1521 modB   FALSE 0.440 328.000 0.342 1.000 Y NA
 3742955 3742956 CLC_1521 CLC_1522     TRUE 0.755 54.000 0.013 NA   NA
 3742956 3742957 CLC_1522 CLC_1523     FALSE 0.006 382.000 0.000 NA   NA
 3742957 3742958 CLC_1523 CLC_1524     FALSE 0.017 300.000 0.000 NA   NA
 3742958 3742959 CLC_1524 CLC_1525     FALSE 0.026 273.000 0.000 NA   NA
 3742959 3742960 CLC_1525 CLC_1526     TRUE 0.871 88.000 0.308 1.000 N NA
 3742960 3742961 CLC_1526 CLC_1527     FALSE 0.218 142.000 0.000 1.000   NA
 3742961 3742962 CLC_1527 CLC_1528     TRUE 0.761 90.000 0.147 NA   NA
 3742962 3742963 CLC_1528 CLC_1529     TRUE 0.970 23.000 0.235 NA   NA
 3742963 3742964 CLC_1529 CLC_1530   mtbC TRUE 0.959 26.000 0.118 1.000   NA
 3742964 3742965 CLC_1530 CLC_1531 mtbC   TRUE 0.774 85.000 0.118 1.000   NA
 3742965 3742966 CLC_1531 CLC_1532     FALSE 0.020 946.000 0.000 0.002 Y NA
 3742966 3742967 CLC_1532 CLC_1533     TRUE 0.958 23.000 0.044 1.000 N NA
 3742967 3742968 CLC_1533 CLC_1534     TRUE 0.993 2.000 0.178 1.000 Y NA
 3742968 3742969 CLC_1534 CLC_1535     TRUE 0.932 144.000 0.444 NA Y NA
 3742971 3742972 CLC_1537 CLC_1538   asnA FALSE 0.030 329.000 0.000 1.000 N NA
 3742974 3742975 CLC_1540 CLC_1541     TRUE 0.977 27.000 0.024 1.000 Y NA
 3742975 3742976 CLC_1541 CLC_1542     FALSE 0.019 317.000 0.000 1.000   NA
 3742978 3742979 CLC_1544 CLC_1545     TRUE 0.766 1.000 0.000 NA   NA
 3742979 3742980 CLC_1545 CLC_1546     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3742980 3742981 CLC_1546 CLC_1547     FALSE 0.007 362.000 0.000 NA   NA
 3742981 3742982 CLC_1547 CLC_1548     TRUE 0.949 13.000 0.041 NA   NA
 3742982 3742983 CLC_1548 CLC_1549     TRUE 0.996 -7.000 0.611 0.032 N NA
 3742983 3742984 CLC_1549 CLC_1550     TRUE 0.985 36.000 0.278 0.032 Y NA
 3742984 3742985 CLC_1550 CLC_1551     TRUE 0.970 46.000 0.121 0.032 Y NA
 3742991 3742992 CLC_1557 CLC_1558     FALSE 0.174 108.000 0.000 NA   NA
 3742992 3742993 CLC_1558 CLC_1559     FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 3742993 3742994 CLC_1559 CLC_1560     FALSE 0.170 206.000 0.000 1.000 N NA
 3742994 3742995 CLC_1560 CLC_1561     TRUE 0.944 27.000 0.087 NA   NA
 3742997 3742998 CLC_1563 CLC_1564   ogt TRUE 0.892 29.000 0.014 NA   NA
 3742998 3742999 CLC_1564 CLC_1565 ogt   TRUE 0.917 27.000 0.014 1.000   NA
 3742999 3743000 CLC_1565 CLC_1566     TRUE 0.732 165.000 0.263 NA   NA
 3743000 3743001 CLC_1566 CLC_1567     TRUE 0.962 25.000 0.168 NA   NA
 3743001 3743002 CLC_1567 CLC_1568     FALSE 0.008 390.000 0.000 1.000   NA
 3743002 3743003 CLC_1568 CLC_1569     FALSE 0.431 53.000 0.000 1.000   NA
 3743003 3743004 CLC_1569 CLC_1570     TRUE 0.625 57.000 0.000 0.003   NA
 3743004 3743005 CLC_1570 CLC_1571     FALSE 0.011 486.000 0.000 0.097 N NA
 3743005 3743006 CLC_1571 CLC_1572     FALSE 0.010 436.000 0.000 1.000 N NA
 3743006 3743007 CLC_1572 CLC_1573     FALSE 0.174 98.000 0.000 NA   NA
 3743007 3743008 CLC_1573 CLC_1574     FALSE 0.105 381.000 0.250 NA   NA
 3743008 3743009 CLC_1574 CLC_1576     TRUE 0.618 26.000 0.000 NA   NA
 3743013 3743014 CLC_1580 CLC_1581     FALSE 0.239 118.000 0.000 1.000   NA
 3743015 3743016 CLC_1582 CLC_1583     TRUE 0.669 94.000 0.051 NA   NA
 3743017 3743018 CLC_1584 CLC_1585   hgdC-1 TRUE 0.912 117.000 0.722 NA N NA
 3743018 3743019 CLC_1585 CLC_1586 hgdC-1   TRUE 0.969 18.000 0.135 NA N NA
 3743019 3743020 CLC_1586 CLC_1587     TRUE 0.991 2.000 0.405 1.000 N NA
 3743020 3743021 CLC_1587 CLC_1588   folE TRUE 0.990 4.000 0.429 1.000 N NA
 3743021 3743022 CLC_1588 CLC_1589 folE   FALSE 0.435 184.000 0.015 1.000   NA
 3743022 3743023 CLC_1589 CLC_1590     FALSE 0.567 115.000 0.005 1.000   NA
 3743023 3743024 CLC_1590 CLC_1591     FALSE 0.108 175.000 0.000 NA   NA
 3743024 3743025 CLC_1591 CLC_1592     FALSE 0.012 322.000 0.000 NA   NA
 3743025 3743026 CLC_1592 CLC_1593     TRUE 0.939 22.000 0.040 NA   NA
 3743026 3743027 CLC_1593 CLC_1594   deoC FALSE 0.234 292.000 0.077 1.000 N NA
 3743027 3743028 CLC_1594 CLC_1595 deoC rbsK FALSE 0.093 344.000 0.026 1.000 N NA
 3743028 3743029 CLC_1595 CLC_1596 rbsK   FALSE 0.009 448.000 0.000 1.000 N NA
 3743029 3743030 CLC_1596 CLC_1597   hisG TRUE 0.993 25.000 0.239 0.003 Y NA
 3743030 3743031 CLC_1597 CLC_1598 hisG hisD TRUE 0.957 78.000 0.254 0.003 Y NA
 3743031 3743032 CLC_1598 CLC_1599 hisD hisB TRUE 0.904 150.000 0.096 0.003 Y NA
 3743032 3743033 CLC_1599 CLC_1600 hisB hisH TRUE 0.923 128.000 0.125 0.003 Y NA
 3743033 3743034 CLC_1600 CLC_1601 hisH hisA TRUE 0.996 -3.000 0.124 0.003 Y NA
 3743034 3743035 CLC_1601 CLC_1602 hisA hisC TRUE 0.992 -3.000 0.004 0.003 Y NA
 3743035 3743036 CLC_1602 CLC_1603 hisC hisF TRUE 0.729 197.000 0.002 0.003 Y NA
 3743036 3743037 CLC_1603 CLC_1604 hisF hislE FALSE 0.140 153.000 0.000 NA   NA
 3743037 3743038 CLC_1604 CLC_1605 hislE   FALSE 0.161 136.000 0.000 NA   NA
 3743038 3743039 CLC_1605 CLC_1606     TRUE 0.974 14.000 0.231 NA   NA
 3743039 3743040 CLC_1606 CLC_1607     TRUE 0.973 18.000 0.267 NA   NA
 3743042 3743043 CLC_1609 CLC_1610     TRUE 0.748 81.000 0.070 1.000   NA
 3743043 3743044 CLC_1610 CLC_1611     TRUE 0.627 153.000 0.047 1.000   NA
 3743044 3743045 CLC_1611 CLC_1612     FALSE 0.022 307.000 0.000 1.000   NA
 3743045 3743046 CLC_1612 CLC_1613     TRUE 0.962 3.000 0.041 NA   NA
 3743046 3743047 CLC_1613 CLC_1614     TRUE 0.988 3.000 0.490 NA   NA
 3743047 3743048 CLC_1614 CLC_1615     TRUE 0.829 117.000 0.352 NA   NA
 3743048 3743049 CLC_1615 CLC_1616     TRUE 0.999 -9.000 0.741 0.018 Y NA
 3743049 3743050 CLC_1616 CLC_1617   arcA-2 FALSE 0.005 564.000 0.000 1.000 N NA
 3743050 3743051 CLC_1617 CLC_1618 arcA-2 arcD TRUE 0.843 125.000 0.022 1.000 Y NA
 3743053 3743054 CLC_1620 CLC_1621     FALSE 0.007 371.000 0.000 NA   NA
 3743054 3743055 CLC_1621 CLC_1622     FALSE 0.410 40.000 0.000 NA   NA
 3743057 3743058 CLC_1624 CLC_1625     FALSE 0.524 190.000 0.067 1.000   NA
 3743058 3743059 CLC_1625 CLC_1626     FALSE 0.006 419.000 0.000 1.000   NA
 3743059 3743060 CLC_1626 CLC_1627     FALSE 0.054 247.000 0.000 1.000   NA
 3743060 3743061 CLC_1627 CLC_1628     TRUE 0.807 149.000 0.222 1.000 N NA
 3743061 3743062 CLC_1628 CLC_1629     TRUE 0.998 2.000 0.900 0.006 Y NA
 3743062 3743063 CLC_1629 CLC_1630     FALSE 0.014 392.000 0.000 1.000 N NA
 3743063 3743064 CLC_1630 CLC_1631     FALSE 0.147 304.000 0.000 1.000 Y NA
 3743064 3743065 CLC_1631 CLC_1632     FALSE 0.291 247.000 0.000 1.000 Y NA
 3743065 3743066 CLC_1632 CLC_1633     TRUE 0.969 42.000 0.167 1.000 Y NA
 3743066 3743067 CLC_1633 CLC_1634     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3743067 3743068 CLC_1634 CLC_1635     FALSE 0.050 225.000 0.000 NA   NA
 3743070 3743071 CLC_1637 CLC_1638     TRUE 0.842 158.000 0.600 NA   NA
 3743072 3743073 CLC_1639 CLC_1640     TRUE 0.997 -22.000 0.261 1.000 Y NA
 3743074 3743075 CLC_1641 CLC_1642     FALSE 0.343 52.000 0.000 NA   NA
 3743076 3743077 CLC_1643 CLC_1644     TRUE 0.976 9.000 0.171 1.000   NA
 3743078 3743079 CLC_1645 CLC_1646     TRUE 0.833 190.000 1.000 NA   NA
 3743081 3743082 CLC_1648 CLC_1649 metF   TRUE 0.669 173.000 0.045 0.002   NA
 3743082 3743083 CLC_1649 CLC_1650     TRUE 0.989 -10.000 0.075 0.001   NA
 3743085 3743086 CLC_1652 CLC_1653     TRUE 0.994 -7.000 0.667 NA   NA
 3743086 3743087 CLC_1653 CLC_1654     FALSE 0.008 350.000 0.000 NA   NA
 3743087 3743088 CLC_1654 CLC_1655     FALSE 0.116 169.000 0.000 NA   NA
 3743088 3743089 CLC_1655 CLC_1656   acoA TRUE 0.947 21.000 0.065 NA   NA
 3743089 3743090 CLC_1656 CLC_1657 acoA acoB TRUE 0.993 3.000 0.076 0.001 Y NA
 3743090 3743091 CLC_1657 CLC_1658 acoB acoX TRUE 0.915 53.000 0.162 0.055   NA
 3743091 3743092 CLC_1658 CLC_1659 acoX acoC TRUE 0.932 36.000 0.081 0.055   NA
 3743092 3743093 CLC_1659 CLC_1660 acoC acoL TRUE 0.990 13.000 0.148 1.000 Y NA
 3743093 3743094 CLC_1660 CLC_1661 acoL   TRUE 0.962 25.000 0.074 1.000 N NA
 3743094 3743095 CLC_1661 CLC_1662     FALSE 0.027 339.000 0.000 1.000 N NA
 3743095 3743096 CLC_1662 CLC_1663     TRUE 0.997 -7.000 0.793 0.097 N NA
 3743096 3743097 CLC_1663 CLC_1664   thrC FALSE 0.004 815.000 0.000 1.000 N NA
 3743097 3743098 CLC_1664 CLC_1665 thrC thrB TRUE 0.992 10.000 0.233 1.000 Y NA
 3743098 3743099 CLC_1665 CLC_1666 thrB   TRUE 0.821 127.000 0.008 1.000 Y NA
 3743099 3743100 CLC_1666 CLC_1667   hom-1 TRUE 0.655 223.000 0.010 0.002 Y NA
 3743100 3743101 CLC_1667 CLC_1668 hom-1   FALSE 0.005 587.000 0.000 1.000 N NA
 3743101 3743102 CLC_1668 CLC_1669     FALSE 0.006 509.000 0.000 1.000 N NA
 3743102 3743103 CLC_1669 CLC_1670     FALSE 0.106 329.000 0.000 1.000 Y NA
 3743103 3743104 CLC_1670 CLC_1671   gltA-1 TRUE 0.996 0.000 0.667 0.048 N NA
 3743104 3743105 CLC_1671 CLC_1672 gltA-1   FALSE 0.119 229.000 0.000 1.000 N NA
 3743105 3743106 CLC_1672 CLC_1673     TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3743106 3743107 CLC_1673 CLC_1674     FALSE 0.004 423.000 0.000 NA   NA
 3743107 3743108 CLC_1674 CLC_1675     FALSE 0.174 109.000 0.000 NA   NA
 3743108 3743109 CLC_1675 CLC_1676     FALSE 0.100 180.000 0.000 NA   NA
 3743109 3743110 CLC_1676 CLC_1677     FALSE 0.008 359.000 0.000 NA   NA
 3743110 3743111 CLC_1677 CLC_1678     FALSE 0.020 288.000 0.000 NA   NA
 3743111 3743112 CLC_1678 CLC_1679     FALSE 0.091 186.000 0.000 NA   NA
 3743112 3743113 CLC_1679 CLC_1680     FALSE 0.003 468.000 0.000 NA   NA
 3743113 3743114 CLC_1680 CLC_1681     FALSE 0.136 156.000 0.000 NA   NA
 3743114 3743115 CLC_1681 CLC_1682     FALSE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 3743115 3743116 CLC_1682 CLC_1683     FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 3743116 3743117 CLC_1683 CLC_1684     TRUE 0.961 33.000 0.379 NA   NA
 3743117 3743118 CLC_1684 CLC_1685   alr-2 FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 3743118 3743119 CLC_1685 CLC_1686 alr-2   FALSE 0.011 421.000 0.000 1.000 N NA
 3743119 3743120 CLC_1686 CLC_1687     TRUE 0.704 88.000 0.016 0.096   NA
 3743120 3743121 CLC_1687 CLC_1688     FALSE 0.040 240.000 0.000 NA   NA
 3743123 3743124 CLC_1690 CLC_1691     FALSE 0.001 913.000 0.000 NA   NA
 3743128 3743129 CLC_1695 CLC_1696     TRUE 0.684 137.000 0.027 1.000 N NA
 3743129 3743130 CLC_1696 CLC_1697     TRUE 0.996 14.000 0.667 0.032 Y NA
 3743130 3743131 CLC_1697 CLC_1698     TRUE 0.998 4.000 1.000 0.032 Y NA
 3743131 3743132 CLC_1698 CLC_1699     TRUE 0.962 31.000 0.265 1.000   NA
 3743134 3743135 CLC_1701 CLC_1702     FALSE 0.026 272.000 0.000 NA   NA
 3743137 3743138 CLC_1704 CLC_1705     FALSE 0.609 151.000 0.011 1.000 N NA
 3743138 3743139 CLC_1705 CLC_1706   fruK FALSE 0.185 200.000 0.000 1.000 N NA
 3743141 3743142 CLC_1708 CLC_1709     TRUE 0.861 152.000 0.667 NA   NA
 3743144 3743145 CLC_1711 CLC_1712     FALSE 0.442 37.000 0.000 NA   NA
 3743146 3743147 CLC_1713 CLC_1714 safA   FALSE 0.005 402.000 0.000 NA   NA
 3743148 3743149 CLC_1715 CLC_1716     FALSE 0.017 376.000 0.000 1.000 N NA
 3743151 3743152 CLC_1718 CLC_1719     FALSE 0.002 571.000 0.000 NA   NA
 3743154 3743155 CLC_1721 CLC_1722     FALSE 0.018 323.000 0.000 1.000   NA
 3743155 3743156 CLC_1722 CLC_1723   deaD FALSE 0.421 179.000 0.006 1.000   NA
 3743156 3743157 CLC_1723 CLC_1724 deaD   FALSE 0.544 154.000 0.025 NA   NA
 3743157 3743158 CLC_1724 CLC_1725     FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 3743158 3743159 CLC_1725 CLC_1726     FALSE 0.007 406.000 0.000 1.000   NA
 3743161 3743162 CLC_1728 CLC_1729     FALSE 0.273 61.000 0.000 NA   NA
 3743162 3743163 CLC_1729 CLC_1730   cheX TRUE 0.992 0.000 0.100 NA Y NA
 3743165 3743166 CLC_1732 CLC_1733     FALSE 0.599 61.000 0.000 0.002   NA
 3743171 3743172 CLC_1738 CLC_1739   hfq TRUE 0.703 101.000 0.064 1.000   NA
 3743172 3743173 CLC_1739 CLC_1740 hfq miaA TRUE 0.808 86.000 0.192 1.000   NA
 3743173 3743174 CLC_1740 CLC_1741 miaA   TRUE 0.970 16.000 0.097 1.000 N NA
 3743174 3743175 CLC_1741 CLC_1742   mutS FALSE 0.152 146.000 0.000 NA   NA
 3743175 3743176 CLC_1742 CLC_1743 mutS miaB FALSE 0.205 80.000 0.000 NA   NA
 3743177 3743178 CLC_1744 CLC_1745     TRUE 0.725 85.000 0.087 NA   NA
 3743178 3743179 CLC_1745 CLC_1746   aspB-1 TRUE 0.730 55.000 0.008 NA   NA
 3743180 3743181 CLC_1747 CLC_1748     TRUE 0.894 82.000 0.571 NA   NA
 3743181 3743182 CLC_1748 CLC_1749     FALSE 0.036 248.000 0.000 NA   NA
 3743182 3743183 CLC_1749 CLC_1750   cmk TRUE 0.821 64.000 0.047 1.000 N NA
 3743183 3743184 CLC_1750 CLC_1751 cmk aroH TRUE 0.746 76.000 0.020 1.000 N NA
 3743184 3743185 CLC_1751 CLC_1752 aroH   TRUE 0.967 0.000 0.024 1.000   NA
 3743185 3743186 CLC_1752 CLC_1753   gluD FALSE 0.028 295.000 0.000 1.000   NA
 3743186 3743187 CLC_1753 CLC_1754 gluD   FALSE 0.393 235.000 0.068 1.000 N NA
 3743187 3743188 CLC_1754 CLC_1755   rluB FALSE 0.062 368.000 0.013 1.000 N NA
 3743188 3743189 CLC_1755 CLC_1756 rluB   FALSE 0.003 463.000 0.000 NA   NA
 3743189 3743190 CLC_1756 CLC_1757     FALSE 0.174 98.000 0.000 NA   NA
 3743190 3743191 CLC_1757 CLC_1758     FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 3743192 3743193 CLC_1759 CLC_1760     FALSE 0.010 373.000 0.000 1.000   NA
 3743194 3743195 CLC_1761 CLC_1762     TRUE 0.966 2.000 0.034 1.000   NA
 3743195 3743196 CLC_1762 CLC_1763     TRUE 0.746 115.000 0.111 1.000   NA
 3743196 3743197 CLC_1763 CLC_1764     TRUE 0.707 131.000 0.111 NA   NA
 3743199 3743200 CLC_1766 CLC_1767 pcaC-1   FALSE 0.222 138.000 0.000 1.000   NA
 3743200 3743201 CLC_1767 CLC_1768     FALSE 0.093 185.000 0.000 NA   NA
 3743201 3743202 CLC_1768 CLC_1769     FALSE 0.045 232.000 0.000 NA   NA
 3743202 3743203 CLC_1769 CLC_1770     TRUE 0.974 -19.000 0.019 NA   NA
 3743204 3743205 CLC_1771 CLC_1772     TRUE 0.985 3.000 0.200 0.048   NA
 3743205 3743206 CLC_1772 CLC_1773     TRUE 0.982 -3.000 0.111 1.000   NA
 3743206 3743207 CLC_1773 CLC_1774     TRUE 0.678 135.000 0.056 1.000   NA
 3743208 3743209 CLC_1775 CLC_1776 hypE hypD TRUE 0.902 168.000 0.353 1.000 Y NA
 3743209 3743210 CLC_1776 CLC_1777 hypD   TRUE 0.996 -7.000 0.363 NA Y NA
 3743210 3743211 CLC_1777 CLC_1778   hypF TRUE 0.996 -37.000 0.181 NA Y NA
 3743211 3743212 CLC_1778 CLC_1779 hypF   TRUE 0.972 -16.000 0.008 1.000   NA
 3743212 3743213 CLC_1779 CLC_1780     FALSE 0.049 255.000 0.000 1.000   NA
 3743213 3743214 CLC_1780 CLC_1781     FALSE 0.550 160.000 0.022 1.000   NA
 3743214 3743215 CLC_1781 CLC_1782   hupL TRUE 0.974 33.000 0.079 1.000 Y NA
 3743215 3743216 CLC_1782 CLC_1783 hupL hupS TRUE 0.973 102.000 0.778 0.001 Y NA
 3743219 3743220 CLC_1786 CLC_1787     FALSE 0.069 206.000 0.000 NA   NA
 3743220 3743221 CLC_1787 CLC_1788     FALSE 0.001 891.000 0.000 NA   NA
 3743222 3743223 CLC_1789 CLC_1790     FALSE 0.011 362.000 0.000 1.000   NA
 3743223 3743224 CLC_1790 CLC_1791     TRUE 0.967 20.000 0.048 0.001   NA
 3743224 3743225 CLC_1791 CLC_1792     TRUE 0.993 12.000 0.154 0.001 Y NA
 3743225 3743226 CLC_1792 CLC_1793     FALSE 0.008 476.000 0.000 1.000 N NA
 3743226 3743227 CLC_1793 CLC_1794     FALSE 0.067 259.000 0.000 NA N NA
 3743230 3743231 CLC_1797 CLC_1798   ytfJ FALSE 0.243 68.000 0.000 NA   NA
 3743232 3743233 CLC_1799 CLC_1800 scpB scpA TRUE 0.993 -7.000 0.570 NA   NA
 3743233 3743234 CLC_1800 CLC_1801 scpA   TRUE 0.970 -25.000 0.006 NA   NA
 3743234 3743235 CLC_1801 CLC_1802   dacF FALSE 0.316 213.000 0.021 NA   NA
 3743235 3743236 CLC_1802 CLC_1803 dacF   FALSE 0.579 123.000 0.018 NA   NA
 3743236 3743237 CLC_1803 CLC_1804     FALSE 0.132 159.000 0.000 NA   NA
 3743237 3743238 CLC_1804 CLC_1805     FALSE 0.575 142.000 0.024 NA   NA
 3743238 3743239 CLC_1805 CLC_1806   pdp TRUE 0.675 107.000 0.061 NA   NA
 3743239 3743240 CLC_1806 CLC_1807 pdp punA FALSE 0.186 286.000 0.000 1.000 Y NA
 3743240 3743241 CLC_1807 CLC_1808 punA xerD TRUE 0.861 38.000 0.004 1.000 N NA
 3743241 3743242 CLC_1808 CLC_1809 xerD   TRUE 0.732 52.000 0.004 NA   NA
 3743242 3743243 CLC_1809 CLC_1810     TRUE 0.975 -9.000 0.034 NA   NA
 3743243 3743244 CLC_1810 CLC_1811     FALSE 0.385 205.000 0.033 NA   NA
 3743244 3743245 CLC_1811 CLC_1812     FALSE 0.007 484.000 0.000 1.000 N NA
 3743245 3743246 CLC_1812 CLC_1813     FALSE 0.003 551.000 0.000 1.000   NA
 3743246 3743247 CLC_1813 CLC_1814     FALSE 0.001 1485.000 0.000 NA   NA
 3743247 3743248 CLC_1814 CLC_1815     FALSE 0.161 136.000 0.000 NA   NA
 3743248 3743249 CLC_1815 CLC_1816   spo0A FALSE 0.155 287.000 0.027 1.000   NA
 3743249 3743250 CLC_1816 CLC_1817 spo0A spoIVB FALSE 0.091 430.000 0.393 1.000   NA
 3743250 3743251 CLC_1817 CLC_1818 spoIVB metA FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 3743251 3743252 CLC_1818 CLC_1819 metA hom-2 TRUE 0.972 27.000 0.005 1.000 Y NA
 3743252 3743253 CLC_1819 CLC_1820 hom-2   TRUE 0.947 40.000 0.017 1.000 Y NA
 3743253 3743254 CLC_1820 CLC_1821   recN FALSE 0.046 299.000 0.000 1.000 N NA
 3743254 3743255 CLC_1821 CLC_1822 recN argR TRUE 0.971 13.000 0.086 1.000 N NA
 3743255 3743256 CLC_1822 CLC_1823 argR ppnK TRUE 0.982 2.000 0.117 1.000 N NA
 3743256 3743257 CLC_1823 CLC_1824 ppnK   TRUE 0.985 0.000 0.120 1.000 N NA
 3743257 3743258 CLC_1824 CLC_1825   dxs TRUE 0.975 22.000 0.189 1.000 N NA
 3743258 3743259 CLC_1825 CLC_1826 dxs   TRUE 0.965 1.000 0.037 NA   NA
 3743259 3743260 CLC_1826 CLC_1827   ispA FALSE 0.001 801.000 0.000 NA   NA
 3743260 3743261 CLC_1827 CLC_1828 ispA xseB TRUE 0.733 125.000 0.053 1.000 N NA
 3743261 3743262 CLC_1828 CLC_1829 xseB xseA TRUE 0.958 123.000 0.412 0.001 Y NA
 3743262 3743263 CLC_1829 CLC_1830 xseA nusB TRUE 0.800 71.000 0.043 1.000 N NA
 3743263 3743264 CLC_1830 CLC_1831 nusB asp TRUE 0.772 139.000 0.223 NA   NA
 3743264 3743265 CLC_1831 CLC_1832 asp   TRUE 0.754 82.000 0.108 NA   NA
 3743265 3743266 CLC_1832 CLC_1833     TRUE 0.906 62.000 0.407 NA   NA
 3743266 3743267 CLC_1833 CLC_1834   spoIIIAF TRUE 0.903 138.000 0.907 NA   NA
 3743267 3743268 CLC_1834 CLC_1835 spoIIIAF   TRUE 0.977 36.000 0.918 NA   NA
 3743268 3743269 CLC_1835 CLC_1836     TRUE 0.991 9.000 0.864 NA   NA
 3743269 3743270 CLC_1836 CLC_1837     TRUE 0.987 27.000 0.895 NA   NA
 3743270 3743271 CLC_1837 CLC_1838     TRUE 0.969 43.000 0.926 NA   NA
 3743271 3743272 CLC_1838 CLC_1839     TRUE 0.965 37.000 0.604 NA   NA
 3743272 3743273 CLC_1839 CLC_1840     FALSE 0.532 195.000 0.112 NA   NA
 3743273 3743274 CLC_1840 CLC_1841   efp TRUE 0.851 41.000 0.037 NA   NA
 3743274 3743275 CLC_1841 CLC_1842 efp aroQ TRUE 0.678 89.000 0.010 1.000 N NA
 3743275 3743276 CLC_1842 CLC_1843 aroQ aroK TRUE 0.801 155.000 0.015 1.000 Y NA
 3743276 3743277 CLC_1843 CLC_1844 aroK   FALSE 0.572 134.000 0.020 NA   NA
 3743277 3743278 CLC_1844 CLC_1845     TRUE 0.993 6.000 1.000 NA   NA
 3743278 3743279 CLC_1845 CLC_1846     TRUE 0.977 16.000 0.333 NA   NA
 3743279 3743280 CLC_1846 CLC_1847     TRUE 0.977 28.000 0.500 NA   NA
 3743280 3743281 CLC_1847 CLC_1848     TRUE 0.994 -21.000 0.500 NA   NA
 3743281 3743282 CLC_1848 CLC_1849     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 3743282 3743283 CLC_1849 CLC_1850     TRUE 0.995 -19.000 0.667 NA   NA
 3743283 3743284 CLC_1850 CLC_1851     FALSE 0.084 402.000 0.250 NA   NA
 3743284 3743285 CLC_1851 CLC_1852     TRUE 0.788 186.000 0.109 NA Y NA
 3743285 3743286 CLC_1852 CLC_1853     TRUE 0.890 145.000 0.135 1.000 Y NA
 3743286 3743287 CLC_1853 CLC_1854     FALSE 0.148 149.000 0.000 NA   NA
 3743287 3743288 CLC_1854 CLC_1855     FALSE 0.175 96.000 0.000 NA   NA
 3743288 3743289 CLC_1855 CLC_1856   dapF TRUE 0.766 1.000 0.000 NA   NA
 3743290 3743291 CLC_1857 CLC_1858   truA-1 TRUE 0.699 69.000 0.005 NA N NA
 3743292 3743293 CLC_1859 CLC_1860     FALSE 0.459 36.000 0.000 NA   NA
 3743295 3743296 CLC_1862 CLC_1863     FALSE 0.002 505.000 0.000 NA   NA
 3743296 3743297 CLC_1863 CLC_1864   cloSI FALSE 0.004 470.000 0.000 1.000   NA
 3743298 3743299 CLC_1865 CLC_1866     TRUE 0.986 2.000 0.333 NA   NA
 3743299 3743300 CLC_1866 CLC_1867     TRUE 0.998 -10.000 0.857 1.000 Y NA
 3743303 3743304 CLC_1870 CLC_1871     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3743304 3743305 CLC_1871 CLC_1872     FALSE 0.282 283.000 0.222 NA   NA
 3743305 3743306 CLC_1872 CLC_1873     TRUE 0.795 189.000 0.714 NA   NA
 3743306 3743307 CLC_1873 CLC_1874     TRUE 0.992 0.000 0.625 NA   NA
 3743309 3743310 CLC_1876 CLC_1877     TRUE 0.999 -3.000 0.933 0.006 Y NA
 3743312 3743313 CLC_1879 CLC_1880 moeB moaD TRUE 0.991 2.000 0.571 1.000   NA
 3743313 3743314 CLC_1880 CLC_1881 moaD aor FALSE 0.602 153.000 0.033 1.000   NA
 3743314 3743315 CLC_1881 CLC_1882 aor aorR FALSE 0.012 409.000 0.000 1.000 N NA
 3743315 3743316 CLC_1882 CLC_1883 aorR   TRUE 0.948 50.000 0.500 1.000   NA
 3743316 3743317 CLC_1883 CLC_1884   moaC TRUE 0.951 2.000 0.006 1.000   NA
 3743317 3743318 CLC_1884 CLC_1885 moaC moaA TRUE 0.993 4.000 0.071 0.002 Y NA
 3743318 3743319 CLC_1885 CLC_1886 moaA   TRUE 0.951 59.000 0.053 0.002 Y NA
 3743319 3743320 CLC_1886 CLC_1887   moeA TRUE 0.996 12.000 0.481 0.002 Y NA
 3743320 3743321 CLC_1887 CLC_1888 moeA mog TRUE 0.985 24.000 0.017 0.002 Y NA
 3743321 3743322 CLC_1888 CLC_1889 mog tupC TRUE 0.644 95.000 0.006 1.000 N NA
 3743322 3743323 CLC_1889 CLC_1890 tupC tupB TRUE 0.992 -3.000 0.389 1.000 N NA
 3743323 3743324 CLC_1890 CLC_1891 tupB   TRUE 0.996 9.000 0.524 0.031 Y NA
 3743324 3743325 CLC_1891 CLC_1892     FALSE 0.140 219.000 0.000 1.000 N NA
 3743325 3743326 CLC_1892 CLC_1893     TRUE 0.973 0.000 0.071 NA   NA
 3743326 3743327 CLC_1893 CLC_1894     FALSE 0.039 241.000 0.000 NA   NA
 3743327 3743328 CLC_1894 CLC_1895     FALSE 0.012 322.000 0.000 NA   NA
 3743328 3743329 CLC_1895 CLC_1896     TRUE 0.988 15.000 0.667 1.000   NA
 3743331 3743332 CLC_1898 CLC_1899     TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.006 Y NA
 3743333 3743334 CLC_1900 CLC_1901     FALSE 0.004 419.000 0.000 NA   NA
 3743334 3743335 CLC_1901 CLC_1902     FALSE 0.001 1294.000 0.000 NA   NA
 3743335 3743336 CLC_1902 CLC_1903     TRUE 0.724 22.000 0.000 1.000   NA
 3743337 3743338 CLC_1904 CLC_1905     FALSE 0.016 363.000 0.000 NA N NA
 3743338 3743339 CLC_1905 CLC_1906     TRUE 0.955 13.000 0.028 NA N NA
 3743339 3743340 CLC_1906 CLC_1907     FALSE 0.585 42.000 0.000 NA N NA
 3743340 3743341 CLC_1907 CLC_1908     TRUE 0.990 22.000 0.800 1.000 N NA
 3743342 3743343 CLC_1909 CLC_1910     FALSE 0.459 36.000 0.000 NA   NA
 3743343 3743344 CLC_1910 CLC_1911     FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 3743344 3743345 CLC_1911 CLC_1912     FALSE 0.177 94.000 0.000 NA   NA
 3743346 3743347 CLC_1913 CLC_1914     TRUE 0.999 -10.000 0.750 0.018 Y NA
 3743347 3743348 CLC_1914 CLC_1915     FALSE 0.128 161.000 0.000 NA   NA
 3743348 3743349 CLC_1915 CLC_1916     FALSE 0.060 214.000 0.000 NA   NA
 3743349 3743350 CLC_1916 CLC_1917     TRUE 0.941 26.000 0.061 NA   NA
 3743350 3743351 CLC_1917 CLC_1918     TRUE 0.950 45.000 0.469 1.000   NA
 3743351 3743352 CLC_1918 CLC_1919     TRUE 0.972 3.000 0.103 NA   NA
 3743352 3743353 CLC_1919 CLC_1920     TRUE 0.737 161.000 0.250 NA   NA
 3743354 3743355 CLC_1921 CLC_1922     FALSE 0.471 83.000 0.000 0.006   NA
 3743355 3743356 CLC_1922 CLC_1923     TRUE 0.996 -10.000 0.500 0.006   NA
 3743356 3743357 CLC_1923 CLC_1924     TRUE 0.995 -10.000 0.400 0.006   NA
 3743357 3743358 CLC_1924 CLC_1925     TRUE 0.963 42.000 0.400 0.006   NA
 3743360 3743361 CLC_1927 CLC_1928 pcaC-2   TRUE 0.971 13.000 0.144 1.000   NA
 3743361 3743362 CLC_1928 CLC_1929     FALSE 0.140 181.000 0.000 1.000   NA
 3743363 3743364 CLC_1930 CLC_1931   hsp90 FALSE 0.005 598.000 0.000 1.000 N NA
 3743365 3743366 CLC_1932 CLC_1933   treP FALSE 0.007 482.000 0.000 1.000 N NA
 3743366 3743367 CLC_1933 CLC_1934 treP treC TRUE 0.963 82.000 0.650 1.000 Y NA
 3743367 3743368 CLC_1934 CLC_1935 treC treR TRUE 0.969 33.000 0.336 1.000 N NA
 3743369 3743370 CLC_1936 CLC_1937     FALSE 0.479 273.000 0.015 0.008 Y NA
 3743370 3743371 CLC_1937 CLC_1938     TRUE 0.994 1.000 0.217 1.000 Y NA
 3743371 3743372 CLC_1938 CLC_1939     TRUE 0.993 20.000 0.400 1.000 Y NA
 3743372 3743373 CLC_1939 CLC_1940     TRUE 0.666 200.000 0.222 1.000 N NA
 3743373 3743374 CLC_1940 CLC_1941     FALSE 0.195 84.000 0.000 NA   NA
 3743376 3743377 CLC_1943 CLC_1944     FALSE 0.030 264.000 0.000 NA   NA
 3743379 3743380 CLC_1946 CLC_1947     FALSE 0.163 131.000 0.000 NA   NA
 3743380 3743381 CLC_1947 CLC_1948     TRUE 0.806 -6.000 0.000 NA   NA
 3743381 3743382 CLC_1948 CLC_1949     FALSE 0.254 65.000 0.000 NA   NA
 3743382 3743383 CLC_1949 CLC_1950     FALSE 0.008 357.000 0.000 NA   NA
 3743385 3743386 CLC_1952 CLC_1953     TRUE 0.977 16.000 0.273 1.000   NA
 3743386 3743387 CLC_1953 CLC_1954     FALSE 0.005 443.000 0.000 1.000   NA
 3743387 3743388 CLC_1954 CLC_1955     FALSE 0.043 234.000 0.000 NA   NA
 3743388 3743389 CLC_1955 CLC_1956     FALSE 0.032 260.000 0.000 NA   NA
 3743390 3743391 CLC_1957 CLC_1958     FALSE 0.012 320.000 0.000 NA   NA
 3743394 3743395 CLC_1961 CLC_1962 aspB-2   TRUE 0.985 20.000 0.088 1.000 Y NA
 3743395 3743396 CLC_1962 CLC_1963     TRUE 0.837 -13.000 0.000 NA   NA
 3743396 3743397 CLC_1963 CLC_1964     FALSE 0.191 86.000 0.000 NA   NA
 3743397 3743398 CLC_1964 CLC_1965     FALSE 0.007 365.000 0.000 NA   NA
 3743398 3743399 CLC_1965 CLC_1966   cat-2 FALSE 0.366 113.000 0.000 1.000 N NA
 3743399 3743400 CLC_1966 CLC_1967 cat-2   FALSE 0.002 495.000 0.000 NA   NA
 3743400 3743401 CLC_1967 CLC_1968     FALSE 0.173 100.000 0.000 NA   NA
 3743401 3743402 CLC_1968 CLC_1969     TRUE 0.632 24.000 0.000 NA   NA
 3743402 3743403 CLC_1969 CLC_1970     FALSE 0.160 138.000 0.000 NA   NA
 3743403 3743404 CLC_1970 CLC_1971     FALSE 0.226 74.000 0.000 NA   NA
 3743404 3743405 CLC_1971 CLC_1972     FALSE 0.050 225.000 0.000 NA   NA
 3743405 3743406 CLC_1972 CLC_1973     FALSE 0.096 183.000 0.000 NA   NA
 3743406 3743407 CLC_1973 CLC_1974     FALSE 0.184 90.000 0.000 NA   NA
 3743407 3743408 CLC_1974 CLC_1975     FALSE 0.194 311.000 0.000 0.002 Y NA
 3743409 3743410 CLC_1976 CLC_1977 pepQ pepIP TRUE 0.790 82.000 0.054 0.032   NA
 3743411 3743412 CLC_1978 CLC_1979     TRUE 0.929 17.000 0.019 NA   NA
 3743412 3743413 CLC_1979 CLC_1980     FALSE 0.007 409.000 0.000 1.000   NA
 3743414 3743415 CLC_1981 CLC_1982     TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 3743416 3743417 CLC_1983 CLC_1984     FALSE 0.044 233.000 0.000 NA   NA
 3743417 3743418 CLC_1984 CLC_1985     FALSE 0.003 473.000 0.000 NA   NA
 3743418 3743419 CLC_1985 CLC_1986     FALSE 0.173 105.000 0.000 NA   NA
 3743419 3743420 CLC_1986 CLC_1987     TRUE 0.986 15.000 0.600 NA   NA
 3743420 3743421 CLC_1987 CLC_1988     TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 3743421 3743422 CLC_1988 CLC_1989     TRUE 0.860 122.000 0.500 NA   NA
 3743422 3743423 CLC_1989 CLC_1990     FALSE 0.244 304.000 0.231 1.000   NA
 3743423 3743424 CLC_1990 CLC_1991     FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 3743424 3743425 CLC_1991 CLC_1992     FALSE 0.069 206.000 0.000 NA   NA
 3743425 3743426 CLC_1992 CLC_1993     FALSE 0.157 142.000 0.000 NA   NA
 3743428 3743429 CLC_1995 CLC_1996     TRUE 0.826 44.000 0.027 NA   NA
 3743429 3743430 CLC_1996 CLC_1997     TRUE 0.657 92.000 0.027 1.000   NA
 3743430 3743431 CLC_1997 CLC_1998     FALSE 0.371 46.000 0.000 NA   NA
 3743432 3743433 CLC_1999 CLC_2000   rfbB TRUE 0.961 42.000 0.087 1.000 Y NA
 3743433 3743434 CLC_2000 CLC_2001 rfbB   FALSE 0.024 277.000 0.000 NA   NA
 3743434 3743435 CLC_2001 CLC_2002     FALSE 0.035 251.000 0.000 NA   NA
 3743436 3743437 CLC_2003 CLC_2004     FALSE 0.011 331.000 0.000 NA   NA
 3743437 3743438 CLC_2004 CLC_2005     TRUE 0.814 -7.000 0.000 NA   NA
 3743438 3743439 CLC_2005 CLC_2006     FALSE 0.001 851.000 0.000 NA   NA
 3743439 3743440 CLC_2006 CLC_2007     FALSE 0.035 250.000 0.000 NA   NA
 3743440 3743441 CLC_2007 CLC_2008     FALSE 0.027 268.000 0.000 NA   NA
 3743441 3743442 CLC_2008 CLC_2009     TRUE 0.993 -6.000 0.600 NA   NA
 3743442 3743443 CLC_2009 CLC_2010     TRUE 0.989 0.000 0.250 1.000 N NA
 3743443 3743444 CLC_2010 CLC_2011     FALSE 0.004 628.000 0.000 1.000 N NA
 3743444 3743445 CLC_2011 CLC_2012     TRUE 0.990 -7.000 0.312 NA   NA
 3743445 3743446 CLC_2012 CLC_2013     FALSE 0.036 249.000 0.000 NA   NA
 3743446 3743447 CLC_2013 CLC_2014     FALSE 0.173 119.000 0.000 NA   NA
 3743447 3743448 CLC_2014 CLC_2015   codA TRUE 0.636 23.000 0.000 NA   NA
 3743448 3743449 CLC_2015 CLC_2016 codA   TRUE 0.973 44.000 0.250 1.000 Y NA
 3743449 3743450 CLC_2016 CLC_2017     FALSE 0.009 345.000 0.000 NA   NA
 3743450 3743451 CLC_2017 CLC_2018     FALSE 0.479 167.000 0.018 NA   NA
 3743451 3743452 CLC_2018 CLC_2019     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3743452 3743453 CLC_2019 CLC_2020     FALSE 0.001 765.000 0.000 NA   NA
 3743453 3743454 CLC_2020 CLC_2021     TRUE 0.989 14.000 0.750 1.000   NA
 3743454 3743455 CLC_2021 CLC_2022     TRUE 0.995 -3.000 0.917 NA   NA
 3743457 3743458 CLC_2024 CLC_2025     FALSE 0.003 490.000 0.000 NA   NA
 3743458 3743459 CLC_2025 CLC_2026     FALSE 0.025 274.000 0.000 NA   NA
 3743461 3743462 CLC_2028 CLC_2029     FALSE 0.292 58.000 0.000 NA   NA
 3743462 3743463 CLC_2029 CLC_2030     FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 3743463 3743464 CLC_2030 CLC_2031     FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 3743464 3743465 CLC_2031 CLC_2032     TRUE 0.995 -7.000 0.140 1.000 Y NA
 3743465 3743466 CLC_2032 CLC_2033     FALSE 0.005 406.000 0.000 NA   NA
 3743466 3743467 CLC_2033 CLC_2034     FALSE 0.257 64.000 0.000 NA   NA
 3743467 3743468 CLC_2034 CLC_2035     FALSE 0.033 256.000 0.000 NA   NA
 3743468 3743469 CLC_2035 CLC_2036     FALSE 0.036 248.000 0.000 NA   NA
 3743469 3743470 CLC_2036 CLC_2037     TRUE 0.646 18.000 0.000 NA   NA
 3743470 3743471 CLC_2037 CLC_2038     FALSE 0.013 316.000 0.000 NA   NA
 3743471 3743472 CLC_2038 CLC_2039     FALSE 0.237 70.000 0.000 NA   NA
 3743472 3743473 CLC_2039 CLC_2040     FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 3743473 3743474 CLC_2040 CLC_2041     FALSE 0.455 49.000 0.000 1.000   NA
 3743474 3743475 CLC_2041 CLC_2042     FALSE 0.170 121.000 0.000 NA   NA
 3743475 3743476 CLC_2042 CLC_2043     FALSE 0.093 185.000 0.000 NA   NA
 3743477 3743478 CLC_2044 CLC_2045     TRUE 0.942 24.000 0.000 NA Y NA
 3743479 3743480 CLC_2046 CLC_2047     FALSE 0.003 530.000 0.000 1.000   NA
 3743480 3743481 CLC_2047 CLC_2048     FALSE 0.002 548.000 0.000 NA   NA
 3743481 3743482 CLC_2048 CLC_2049     TRUE 0.959 74.000 0.500 NA Y NA
 3743482 3743483 CLC_2049 CLC_2050   eutE TRUE 0.995 0.000 0.769 1.000 N NA
 3743483 3743484 CLC_2050 CLC_2051 eutE   TRUE 0.989 35.000 0.692 NA Y NA
 3743484 3743485 CLC_2051 CLC_2052     TRUE 0.989 21.000 0.750 NA N NA
 3743485 3743486 CLC_2052 CLC_2053     TRUE 0.680 199.000 0.273 NA N NA
 3743486 3743487 CLC_2053 CLC_2054     TRUE 0.990 -3.000 0.389 NA   NA
 3743487 3743488 CLC_2054 CLC_2055     TRUE 0.881 78.000 0.444 NA   NA
 3743488 3743489 CLC_2055 CLC_2056     TRUE 0.998 -18.000 0.615 NA Y NA
 3743489 3743490 CLC_2056 CLC_2057     TRUE 0.992 7.000 0.222 NA Y NA
 3743490 3743491 CLC_2057 CLC_2058     TRUE 0.994 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 3743491 3743492 CLC_2058 CLC_2059     TRUE 0.958 40.000 0.375 1.000 N NA
 3743492 3743493 CLC_2059 CLC_2060     TRUE 0.922 164.000 0.815 0.002 N NA
 3743493 3743494 CLC_2060 CLC_2061     TRUE 0.975 50.000 0.370 1.000 Y NA
 3743494 3743495 CLC_2061 CLC_2062     TRUE 0.958 38.000 0.500 NA   NA
 3743495 3743496 CLC_2062 CLC_2063     TRUE 0.983 24.000 0.571 NA   NA
 3743496 3743497 CLC_2063 CLC_2064     FALSE 0.230 73.000 0.000 NA   NA
 3743497 3743498 CLC_2064 CLC_2065     FALSE 0.207 79.000 0.000 NA   NA
 3743498 3743499 CLC_2065 CLC_2066     TRUE 0.996 -13.000 0.810 NA   NA
 3743499 3743500 CLC_2066 CLC_2067     FALSE 0.004 486.000 0.000 1.000   NA
 3743500 3743501 CLC_2067 CLC_2068     TRUE 0.774 117.000 0.094 1.000 N NA
 3743502 3743503 CLC_2069 CLC_2070     FALSE 0.330 146.000 0.000 1.000 N NA
 3743504 3743505 CLC_2071 CLC_2072     FALSE 0.587 28.000 0.000 NA   NA
 3743505 3743506 CLC_2072 CLC_2073     TRUE 0.840 -15.000 0.000 NA   NA
 3743506 3743507 CLC_2073 CLC_2074     FALSE 0.001 805.000 0.000 NA   NA
 3743507 3743508 CLC_2074 CLC_2075     TRUE 0.952 13.000 0.053 NA   NA
 3743508 3743509 CLC_2075 CLC_2076     FALSE 0.022 282.000 0.000 NA   NA
 3743509 3743510 CLC_2076 CLC_2077     TRUE 0.857 -31.000 0.000 NA   NA
 3743510 3743511 CLC_2077 CLC_2078     FALSE 0.019 317.000 0.000 1.000   NA
 3743511 3743512 CLC_2078 CLC_2079     TRUE 0.998 -3.000 0.700 1.000 Y NA
 3743512 3743513 CLC_2079 CLC_2080     TRUE 0.647 198.000 0.300 NA   NA
 3743513 3743514 CLC_2080 CLC_2081     TRUE 0.993 -7.000 0.500 NA   NA
 3743514 3743515 CLC_2081 CLC_2082     TRUE 0.910 72.000 0.500 1.000   NA
 3743515 3743516 CLC_2082 CLC_2083     FALSE 0.367 60.000 0.000 1.000   NA
 3743516 3743517 CLC_2083 CLC_2084     FALSE 0.022 308.000 0.000 1.000   NA
 3743517 3743518 CLC_2084 CLC_2085     TRUE 0.993 -7.000 0.400 1.000 N NA
 3743518 3743519 CLC_2085 CLC_2086     TRUE 0.978 17.000 0.375 NA   NA
 3743519 3743520 CLC_2086 CLC_2087     FALSE 0.003 452.000 0.000 NA   NA
 3743520 3743521 CLC_2087 CLC_2088     TRUE 0.825 67.000 0.091 NA N NA
 3743521 3743522 CLC_2088 CLC_2089     TRUE 0.840 84.000 0.222 NA N NA
 3743522 3743523 CLC_2089 CLC_2090     FALSE 0.003 566.000 0.000 1.000   NA
 3743523 3743524 CLC_2090 CLC_2091     TRUE 0.993 -10.000 0.429 1.000   NA
 3743524 3743525 CLC_2091 CLC_2092     FALSE 0.001 786.000 0.000 NA   NA
 3743525 3743526 CLC_2092 CLC_2093     FALSE 0.012 326.000 0.000 NA   NA
 3743526 3743527 CLC_2093 CLC_2094     FALSE 0.189 212.000 0.000 0.011   NA
 3743527 3743528 CLC_2094 CLC_2095     TRUE 0.984 13.000 0.241 0.011   NA
 3743528 3743529 CLC_2095 CLC_2096     TRUE 0.987 29.000 0.119 0.008 Y NA
 3743529 3743530 CLC_2096 CLC_2097     TRUE 0.984 24.000 0.081 1.000 Y NA
 3743530 3743531 CLC_2097 CLC_2098     FALSE 0.042 235.000 0.000 NA   NA
 3743531 3743532 CLC_2098 CLC_2099     FALSE 0.010 338.000 0.000 NA   NA
 3743532 3743533 CLC_2099 CLC_2100     FALSE 0.010 340.000 0.000 NA   NA
 3743535 3743536 CLC_2102 CLC_2103     TRUE 0.661 133.000 0.065 NA   NA
 3743537 3743538 CLC_2104 CLC_2105     FALSE 0.226 74.000 0.000 NA   NA
 3743539 3743540 CLC_2106 CLC_2107     TRUE 0.980 7.000 0.222 1.000   NA
 3743542 3743543 CLC_2109 CLC_2110 enr   TRUE 0.701 97.000 0.059 1.000   NA
 3743543 3743544 CLC_2110 CLC_2111     TRUE 0.967 48.000 1.000 NA   NA
 3743544 3743545 CLC_2111 CLC_2112     FALSE 0.086 192.000 0.000 NA   NA
 3743545 3743546 CLC_2112 CLC_2113     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3743546 3743547 CLC_2113 CLC_2114     TRUE 0.963 12.000 0.103 NA   NA
 3743547 3743548 CLC_2114 CLC_2115   cmr4 TRUE 0.935 28.000 0.064 NA   NA
 3743548 3743549 CLC_2115 CLC_2116 cmr4 cmr3 TRUE 0.986 12.000 0.556 NA   NA
 3743549 3743550 CLC_2116 CLC_2117 cmr3 crm2 TRUE 0.971 17.000 0.222 NA   NA
 3743550 3743551 CLC_2117 CLC_2118 crm2   TRUE 0.987 1.000 0.375 NA   NA
 3743551 3743552 CLC_2118 CLC_2119     TRUE 0.976 13.000 0.250 NA   NA
 3743552 3743553 CLC_2119 CLC_2120     FALSE 0.343 52.000 0.000 NA   NA
 3743553 3743554 CLC_2120 CLC_2121   cas6 TRUE 0.637 20.000 0.000 NA   NA
 3743554 3743555 CLC_2121 CLC_2122 cas6   FALSE 0.001 1739.000 0.000 NA   NA
 3743555 3743556 CLC_2122 CLC_2123     FALSE 0.204 81.000 0.000 NA   NA
 3743556 3743557 CLC_2123 CLC_2124     FALSE 0.001 773.000 0.000 NA   NA
 3743557 3743558 CLC_2124 CLC_2125     FALSE 0.005 398.000 0.000 NA   NA
 3743559 3743560 CLC_2126 CLC_2127     FALSE 0.001 925.000 0.000 NA   NA
 3743561 3743562 CLC_2128 CLC_2129     FALSE 0.615 168.000 0.033 1.000 N NA
 3743564 3743565 CLC_2131 CLC_2132     TRUE 0.707 209.000 0.064 1.000 Y NA
 3743566 3743567 CLC_2133 CLC_2134     FALSE 0.010 341.000 0.000 NA   NA
 3743568 3743569 CLC_2135 CLC_2136 hgdC-2   TRUE 0.859 77.000 0.333 NA   NA
 3743569 3743570 CLC_2136 CLC_2137     FALSE 0.017 301.000 0.000 NA   NA
 3743570 3743571 CLC_2137 CLC_2138     TRUE 0.996 19.000 0.750 0.019 Y NA
 3743571 3743572 CLC_2138 CLC_2139     TRUE 0.981 39.000 0.750 0.043 N NA
 3743572 3743573 CLC_2139 CLC_2140     FALSE 0.060 265.000 0.000 NA N NA
 3743573 3743574 CLC_2140 CLC_2141     TRUE 0.997 0.000 0.750 NA Y NA
 3743574 3743575 CLC_2141 CLC_2142     TRUE 0.942 63.000 0.667 NA N NA
 3743575 3743576 CLC_2142 CLC_2143     FALSE 0.006 382.000 0.000 NA   NA
 3743576 3743577 CLC_2143 CLC_2144     TRUE 0.684 96.000 0.068 NA   NA
 3743577 3743578 CLC_2144 CLC_2145     TRUE 0.999 -9.000 0.838 0.004 Y NA
 3743578 3743579 CLC_2145 CLC_2146     TRUE 0.964 25.000 0.193 NA   NA
 3743579 3743580 CLC_2146 CLC_2147     FALSE 0.002 589.000 0.000 NA   NA
 3743580 3743581 CLC_2147 CLC_2148   motB-1 FALSE 0.018 296.000 0.000 NA   NA
 3743581 3743582 CLC_2148 CLC_2149 motB-1 motA-1 TRUE 0.993 18.000 0.257 0.005 Y NA
 3743584 3743585 CLC_2151 CLC_2152     FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 3743585 3743586 CLC_2152 CLC_2153     FALSE 0.023 280.000 0.000 NA   NA
 3743586 3743587 CLC_2153 CLC_2154     TRUE 0.973 6.000 0.153 NA   NA
 3743587 3743588 CLC_2154 CLC_2155   pepD-2 FALSE 0.173 118.000 0.000 NA   NA
 3743588 3743589 CLC_2155 CLC_2156 pepD-2   FALSE 0.021 558.000 0.000 1.000 Y NA
 3743593 3743594 CLC_2160 CLC_2161     TRUE 0.994 14.000 0.448 NA Y NA
 3743594 3743595 CLC_2161 CLC_2162     FALSE 0.005 456.000 0.000 1.000   NA
 3743595 3743596 CLC_2162 CLC_2163     TRUE 0.752 14.000 0.000 1.000   NA
 3743598 3743599 CLC_2165 CLC_2166     FALSE 0.175 96.000 0.000 NA   NA
 3743599 3743600 CLC_2166 CLC_2167     FALSE 0.013 348.000 0.000 1.000   NA
 3743602 3743603 CLC_2169 CLC_2170     FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 3743603 3743604 CLC_2170 CLC_2171     FALSE 0.006 382.000 0.000 NA   NA
 3743605 3743606 CLC_2172 CLC_2173     TRUE 0.639 19.000 0.000 NA   NA
 3743606 3743607 CLC_2173 CLC_2174     TRUE 0.976 3.000 0.148 NA   NA
 3743608 3743609 CLC_2175 CLC_2176   thiM-2 FALSE 0.080 220.000 0.000 1.000   NA
 3743609 3743610 CLC_2176 CLC_2177 thiM-2 thiW TRUE 0.983 -22.000 0.059 NA   NA
 3743610 3743611 CLC_2177 CLC_2178 thiW   FALSE 0.186 89.000 0.000 NA   NA
 3743611 3743612 CLC_2178 CLC_2179     FALSE 0.124 163.000 0.000 NA   NA
 3743612 3743613 CLC_2179 CLC_2180     TRUE 0.717 128.000 0.095 1.000   NA
 3743613 3743614 CLC_2180 CLC_2181     FALSE 0.541 185.000 0.095 NA   NA
 3743614 3743615 CLC_2181 CLC_2182   bioD FALSE 0.021 285.000 0.000 NA   NA
 3743615 3743616 CLC_2182 CLC_2183 bioD bioB TRUE 0.992 3.000 0.025 0.001 Y NA
 3743616 3743617 CLC_2183 CLC_2184 bioB   TRUE 0.968 -7.000 0.018 NA   NA
 3743617 3743618 CLC_2184 CLC_2185     FALSE 0.159 139.000 0.000 NA   NA
 3743618 3743619 CLC_2185 CLC_2186     TRUE 0.990 -12.000 0.247 NA   NA
 3743619 3743620 CLC_2186 CLC_2187     FALSE 0.157 142.000 0.000 NA   NA
 3743621 3743622 CLC_2188 CLC_2189     TRUE 0.966 31.000 0.015 1.000 Y NA
 3743623 3743624 CLC_2190 CLC_2191     FALSE 0.030 264.000 0.000 NA   NA
 3743626 3743627 CLC_2193 CLC_2194     FALSE 0.115 198.000 0.000 1.000   NA
 3743627 3743628 CLC_2194 CLC_2195     FALSE 0.003 455.000 0.000 NA   NA
 3743628 3743629 CLC_2195 CLC_2197     FALSE 0.152 146.000 0.000 NA   NA
 3743629 3743630 CLC_2197 CLC_2198     FALSE 0.292 58.000 0.000 NA   NA
 3743631 3743632 CLC_2199 CLC_2200     FALSE 0.003 442.000 0.000 NA   NA
 3743633 3743634 CLC_2201 CLC_2202     FALSE 0.001 852.000 0.000 NA   NA
 3743634 3743635 CLC_2202 CLC_2203   msrB TRUE 0.667 174.000 0.200 NA   NA
 3743635 3743636 CLC_2203 CLC_2204 msrB sodF FALSE 0.114 232.000 0.000 1.000 N NA
 3743636 3743637 CLC_2204 CLC_2205 sodF   FALSE 0.366 113.000 0.000 1.000 N NA
 3743637 3743638 CLC_2205 CLC_2206     TRUE 0.999 -7.000 0.867 0.006 Y NA
 3743638 3743639 CLC_2206 CLC_2207     FALSE 0.469 280.000 0.462 1.000 N NA
 3743639 3743640 CLC_2207 CLC_2208     FALSE 0.002 507.000 0.000 NA   NA
 3743640 3743641 CLC_2208 CLC_2209     TRUE 0.963 36.000 0.500 NA   NA
 3743641 3743642 CLC_2209 CLC_2210     TRUE 0.985 -7.000 0.167 NA   NA
 3743642 3743643 CLC_2210 CLC_2211     TRUE 0.777 202.000 0.556 1.000 N NA
 3743643 3743644 CLC_2211 CLC_2212     TRUE 0.994 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 3743645 3743646 CLC_2213 CLC_2214     FALSE 0.012 321.000 0.000 NA   NA
 3743647 3743648 CLC_2215 CLC_2216     FALSE 0.600 83.000 0.011 NA   NA
 3743648 3743649 CLC_2216 CLC_2217   def-1 FALSE 0.024 303.000 0.000 1.000   NA
 3743649 3743650 CLC_2217 CLC_2218 def-1   TRUE 0.993 1.000 0.529 1.000 N NA
 3743650 3743651 CLC_2218 CLC_2219     FALSE 0.057 242.000 0.000 1.000   NA
 3743651 3743652 CLC_2219 CLC_2220     TRUE 0.976 -3.000 0.077 NA   NA
 3743656 3743657 CLC_2224 CLC_2225     TRUE 0.985 -7.000 0.179 NA   NA
 3743657 3743658 CLC_2225 CLC_2226     TRUE 0.987 -19.000 0.143 NA   NA
 3743658 3743659 CLC_2226 CLC_2227     TRUE 0.984 -3.000 0.182 NA   NA
 3743659 3743660 CLC_2227 CLC_2228     FALSE 0.005 454.000 0.000 1.000   NA
 3743660 3743661 CLC_2228 CLC_2229     FALSE 0.007 405.000 0.000 1.000   NA
 3743661 3743662 CLC_2229 CLC_2230     FALSE 0.459 70.000 0.000 1.000 N NA
 3743662 3743663 CLC_2230 CLC_2231     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3743663 3743664 CLC_2231 CLC_2232     FALSE 0.104 177.000 0.000 NA   NA
 3743665 3743666 CLC_2233 CLC_2234     FALSE 0.226 74.000 0.000 NA   NA
 3743667 3743668 CLC_2235 CLC_2236     TRUE 0.996 -7.000 0.138 0.086 Y NA
 3743668 3743669 CLC_2236 CLC_2237     TRUE 0.969 -7.000 0.023 NA   NA
 3743669 3743670 CLC_2237 CLC_2238     FALSE 0.146 150.000 0.000 NA   NA
 3743670 3743671 CLC_2238 CLC_2239     FALSE 0.008 358.000 0.000 NA   NA
 3743671 3743672 CLC_2239 CLC_2240     TRUE 0.995 -124.000 0.500 NA   NA
 3743676 3743677 CLC_2244 CLC_2245 ptsH aspB-3 TRUE 0.736 111.000 0.047 1.000 N NA
 3743677 3743678 CLC_2245 CLC_2246 aspB-3   FALSE 0.213 145.000 0.000 1.000   NA
 3743678 3743679 CLC_2246 CLC_2247     TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA   NA
 3743679 3743680 CLC_2247 CLC_2248     TRUE 0.926 19.000 0.020 NA   NA
 3743680 3743681 CLC_2248 CLC_2249   spoVS FALSE 0.499 163.000 0.020 NA   NA
 3743681 3743682 CLC_2249 CLC_2250 spoVS   FALSE 0.556 139.000 0.016 NA   NA
 3743682 3743683 CLC_2250 CLC_2251   recA FALSE 0.257 235.000 0.018 1.000   NA
 3743683 3743684 CLC_2251 CLC_2252 recA pgsA TRUE 0.653 148.000 0.022 1.000 N NA
 3743684 3743685 CLC_2252 CLC_2253 pgsA   TRUE 0.990 -16.000 0.132 1.000 N NA
 3743685 3743686 CLC_2253 CLC_2254   ftsK TRUE 0.716 95.000 0.031 1.000 N NA
 3743686 3743687 CLC_2254 CLC_2255 ftsK clpP-1 FALSE 0.035 481.000 0.047 1.000 N NA
 3743687 3743688 CLC_2255 CLC_2256 clpP-1 dapG FALSE 0.331 248.000 0.045 1.000 N NA
 3743688 3743689 CLC_2256 CLC_2257 dapG   TRUE 0.965 16.000 0.148 NA   NA
 3743689 3743690 CLC_2257 CLC_2258     TRUE 0.766 77.000 0.104 NA   NA
 3743690 3743691 CLC_2258 CLC_2259   pnpA FALSE 0.569 175.000 0.057 1.000   NA
 3743691 3743692 CLC_2259 CLC_2260 pnpA rpsO TRUE 0.675 264.000 0.335 1.000 Y NA
 3743692 3743693 CLC_2260 CLC_2261 rpsO ribF TRUE 0.820 82.000 0.119 1.000 N NA
 3743693 3743694 CLC_2261 CLC_2262 ribF truB TRUE 0.984 13.000 0.308 1.000 N NA
 3743694 3743695 CLC_2262 CLC_2263 truB   TRUE 0.984 1.000 0.221 1.000   NA
 3743695 3743696 CLC_2263 CLC_2264   rbfA TRUE 0.988 -10.000 0.173 1.000   NA
 3743696 3743697 CLC_2264 CLC_2265 rbfA infB TRUE 0.991 31.000 0.530 1.000 Y NA
 3743697 3743698 CLC_2265 CLC_2266 infB   TRUE 0.989 18.000 0.223 NA Y NA
 3743698 3743699 CLC_2266 CLC_2267     TRUE 0.994 -13.000 0.408 NA N NA
 3743699 3743700 CLC_2267 CLC_2268   nusA TRUE 0.959 60.000 0.323 NA Y NA
 3743700 3743701 CLC_2268 CLC_2269 nusA   TRUE 0.988 17.000 0.759 NA   NA
 3743701 3743702 CLC_2269 CLC_2270   polC FALSE 0.135 305.000 0.059 NA   NA
 3743702 3743703 CLC_2270 CLC_2271 polC gcpE FALSE 0.232 279.000 0.040 1.000 N NA
 3743703 3743704 CLC_2271 CLC_2272 gcpE   TRUE 0.752 141.000 0.092 1.000 N NA
 3743704 3743705 CLC_2272 CLC_2273   dxr TRUE 0.964 45.000 0.568 1.000 N NA
 3743705 3743706 CLC_2273 CLC_2274 dxr   TRUE 0.821 37.000 0.008 NA   NA
 3743706 3743707 CLC_2274 CLC_2275     TRUE 0.800 100.000 0.250 NA   NA
 3743707 3743708 CLC_2275 CLC_2276     FALSE 0.286 59.000 0.000 NA   NA
 3743708 3743709 CLC_2276 CLC_2277   cdsA FALSE 0.091 186.000 0.000 NA   NA
 3743709 3743710 CLC_2277 CLC_2278 cdsA uppS TRUE 0.983 25.000 0.055 1.000 Y NA
 3743710 3743711 CLC_2278 CLC_2279 uppS frr TRUE 0.923 66.000 0.409 1.000 N NA
 3743711 3743712 CLC_2279 CLC_2280 frr pyrH TRUE 0.989 16.000 0.626 1.000 N NA
 3743714 3743715 CLC_2282 CLC_2283 tsf rpsB TRUE 0.964 88.000 0.748 1.000 Y NA
 3743715 3743716 CLC_2283 CLC_2284 rpsB codY FALSE 0.268 237.000 0.006 1.000 N NA
 3743716 3743717 CLC_2284 CLC_2285 codY topA FALSE 0.448 207.000 0.025 1.000 N NA
 3743717 3743718 CLC_2285 CLC_2286 topA dprA FALSE 0.276 372.000 0.238 1.000 Y NA
 3743719 3743720 CLC_2287 CLC_2288     TRUE 0.939 16.000 0.003 1.000 N NA
 3743721 3743722 CLC_2289 CLC_2290 rnhB   FALSE 0.225 297.000 0.148 1.000   NA
 3743722 3743723 CLC_2290 CLC_2291   lepB-2 FALSE 0.130 304.000 0.007 0.044   NA
 3743723 3743724 CLC_2291 CLC_2292 lepB-2 rplS TRUE 0.774 59.000 0.006 1.000 N NA
 3743724 3743725 CLC_2292 CLC_2293 rplS trmD TRUE 0.941 151.000 0.567 1.000 Y NA
 3743725 3743726 CLC_2293 CLC_2294 trmD rimM TRUE 0.998 -9.000 0.672 1.000 Y NA
 3743726 3743727 CLC_2294 CLC_2295 rimM   TRUE 0.836 113.000 0.324 1.000   NA
 3743727 3743728 CLC_2295 CLC_2296   rpsP TRUE 0.979 21.000 0.385 1.000   NA
 3743728 3743729 CLC_2296 CLC_2297 rpsP ffh TRUE 0.973 31.000 0.361 1.000 N NA
 3743729 3743730 CLC_2297 CLC_2298 ffh   TRUE 0.971 13.000 0.151 1.000   NA
 3743730 3743731 CLC_2298 CLC_2299   ftsY FALSE 0.393 224.000 0.081 1.000   NA
 3743731 3743732 CLC_2299 CLC_2300 ftsY smc TRUE 0.799 163.000 0.165 0.017 N NA
 3743732 3743733 CLC_2300 CLC_2301 smc   TRUE 0.914 13.000 0.003 NA   NA
 3743733 3743734 CLC_2301 CLC_2302     FALSE 0.569 123.000 0.016 NA   NA
 3743734 3743735 CLC_2302 CLC_2303   rnc TRUE 0.993 -7.000 0.064 1.000 Y NA
 3743735 3743736 CLC_2303 CLC_2304 rnc acpP-1 TRUE 0.756 112.000 0.068 1.000 N NA
 3743736 3743737 CLC_2304 CLC_2305 acpP-1 plsX TRUE 0.919 78.000 0.034 0.004 Y NA
 3743737 3743738 CLC_2305 CLC_2306 plsX rpmF TRUE 0.890 90.000 0.418 1.000 N NA
 3743738 3743739 CLC_2306 CLC_2307 rpmF   TRUE 0.986 14.000 0.599 NA   NA
 3743739 3743740 CLC_2307 CLC_2308   ackA TRUE 0.676 118.000 0.061 NA   NA
 3743740 3743741 CLC_2308 CLC_2309 ackA pta TRUE 0.894 140.000 0.137 1.000 Y NA
 3743741 3743742 CLC_2309 CLC_2310 pta   FALSE 0.015 334.000 0.000 1.000   NA
 3743742 3743743 CLC_2310 CLC_2311     FALSE 0.010 367.000 0.000 1.000   NA
 3743743 3743744 CLC_2311 CLC_2312     FALSE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 3743744 3743745 CLC_2312 CLC_2313     TRUE 0.992 9.000 1.000 NA   NA
 3743745 3743746 CLC_2313 CLC_2314     TRUE 0.981 33.000 1.000 NA   NA
 3743746 3743747 CLC_2314 CLC_2315     TRUE 0.985 22.000 0.667 NA   NA
 3743747 3743748 CLC_2315 CLC_2316     FALSE 0.002 996.000 0.000 1.000   NA
 3743748 3743749 CLC_2316 CLC_2317     FALSE 0.021 312.000 0.000 1.000   NA
 3743749 3743750 CLC_2317 CLC_2318     FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 3743750 3743751 CLC_2318 CLC_2319     FALSE 0.003 452.000 0.000 NA   NA
 3743751 3743752 CLC_2319 CLC_2320     FALSE 0.240 69.000 0.000 NA   NA
 3743752 3743753 CLC_2320 CLC_2321     FALSE 0.058 217.000 0.000 NA   NA
 3743755 3743756 CLC_2323 CLC_2324     FALSE 0.391 43.000 0.000 NA   NA
 3743756 3743757 CLC_2324 CLC_2325     FALSE 0.184 90.000 0.000 NA   NA
 3743757 3743758 CLC_2325 CLC_2326     FALSE 0.143 151.000 0.000 NA   NA
 3743758 3743759 CLC_2326 CLC_2327   prdE TRUE 0.970 14.000 0.154 1.000   NA
 3743759 3743760 CLC_2327 CLC_2328 prdE prdD TRUE 0.994 14.000 1.000 0.002   NA
 3743760 3743761 CLC_2328 CLC_2329 prdD prdB FALSE 0.037 341.000 0.000 0.002   NA
 3743761 3743762 CLC_2329 CLC_2330 prdB   FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3743762 3743763 CLC_2330 CLC_2331   prdA TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3743763 3743764 CLC_2331 CLC_2332 prdA   TRUE 0.989 25.000 1.000 NA   NA
 3743764 3743765 CLC_2332 CLC_2333     TRUE 0.989 22.000 1.000 NA   NA
 3743765 3743766 CLC_2333 CLC_2334     FALSE 0.002 641.000 0.000 NA   NA
 3743766 3743767 CLC_2334 CLC_2335     TRUE 0.973 40.000 1.000 NA   NA
 3743769 3743770 CLC_2337 CLC_2338     FALSE 0.036 248.000 0.000 NA   NA
 3743772 3743773 CLC_2339 CLC_2341     FALSE 0.173 104.000 0.000 NA   NA
 3743773 3743774 CLC_2341 CLC_2342     FALSE 0.230 73.000 0.000 NA   NA
 3743774 3743775 CLC_2342 CLC_2343     TRUE 0.959 31.000 0.286 NA   NA
 3743775 3743776 CLC_2343 CLC_2344     FALSE 0.244 176.000 0.000 1.000 N NA
 3743777 3743778 CLC_2345 CLC_2346     TRUE 0.789 60.000 0.036 1.000   NA
 3743779 3743780 CLC_2347 CLC_2348   coaD TRUE 0.953 13.000 0.055 NA   NA
 3743780 3743781 CLC_2348 CLC_2349 coaD   TRUE 0.990 2.000 0.367 1.000 N NA
 3743781 3743782 CLC_2349 CLC_2350   recG FALSE 0.529 262.000 0.016 0.010 Y NA
 3743782 3743783 CLC_2350 CLC_2351 recG   FALSE 0.082 350.000 0.048 1.000   NA
 3743783 3743784 CLC_2351 CLC_2352     TRUE 0.985 15.000 0.567 NA   NA
 3743786 3743787 CLC_2354 CLC_2355     TRUE 0.872 78.000 0.400 NA   NA
 3743787 3743788 CLC_2355 CLC_2356     FALSE 0.033 378.000 0.005 NA   NA
 3743788 3743789 CLC_2356 CLC_2357   rpe TRUE 0.984 2.000 0.166 1.000 N NA
 3743789 3743790 CLC_2357 CLC_2358 rpe rsgA TRUE 0.987 -6.000 0.213 1.000   NA
 3743790 3743791 CLC_2358 CLC_2359 rsgA   FALSE 0.566 207.000 0.196 1.000   NA
 3743791 3743792 CLC_2359 CLC_2360     TRUE 0.998 -22.000 0.704 1.000 Y NA
 3743792 3743793 CLC_2360 CLC_2361     TRUE 0.960 19.000 0.105 1.000   NA
 3743793 3743794 CLC_2361 CLC_2362   sun TRUE 0.971 12.000 0.135 1.000   NA
 3743794 3743795 CLC_2362 CLC_2363 sun   TRUE 0.954 21.000 0.076 1.000   NA
 3743795 3743796 CLC_2363 CLC_2364   fmt FALSE 0.112 318.000 0.035 1.000   NA
 3743796 3743797 CLC_2364 CLC_2365 fmt def-2 TRUE 0.983 17.000 0.009 0.023 Y NA
 3743797 3743798 CLC_2365 CLC_2366 def-2 priA TRUE 0.929 28.000 0.010 1.000 N NA
 3743798 3743799 CLC_2366 CLC_2367 priA coaBC FALSE 0.144 338.000 0.099 1.000 N NA
 3743799 3743800 CLC_2367 CLC_2368 coaBC rpoZ TRUE 0.967 2.000 0.013 1.000 N NA
 3743800 3743801 CLC_2368 CLC_2369 rpoZ gmk TRUE 0.986 -19.000 0.035 1.000 N NA
 3743801 3743802 CLC_2369 CLC_2370 gmk   TRUE 0.980 0.000 0.143 NA   NA
 3743802 3743803 CLC_2370 CLC_2371     TRUE 0.969 16.000 0.189 NA   NA
 3743803 3743804 CLC_2371 CLC_2372   ansA FALSE 0.353 194.000 0.003 1.000   NA
 3743806 3743807 CLC_2374 CLC_2375 spoIVA   FALSE 0.006 385.000 0.000 NA   NA
 3743809 3743810 CLC_2377 CLC_2378     FALSE 0.598 171.000 0.068 1.000   NA
 3743810 3743811 CLC_2378 CLC_2379     TRUE 0.970 3.000 0.061 1.000   NA
 3743811 3743812 CLC_2379 CLC_2380   phoU FALSE 0.032 452.000 0.028 NA N NA
 3743812 3743813 CLC_2380 CLC_2381 phoU pstB TRUE 0.982 30.000 0.182 NA Y NA
 3743813 3743814 CLC_2381 CLC_2382 pstB pstA TRUE 0.992 13.000 0.112 0.002 Y NA
 3743814 3743815 CLC_2382 CLC_2383 pstA pstC TRUE 0.999 0.000 0.907 0.002 Y NA
 3743815 3743816 CLC_2383 CLC_2384 pstC pstS TRUE 0.787 208.000 0.206 1.000 Y NA
 3743816 3743817 CLC_2384 CLC_2385 pstS   FALSE 0.305 247.000 0.028 1.000 N NA
 3743817 3743818 CLC_2385 CLC_2386     TRUE 0.991 12.000 0.110 0.068 Y NA
 3743818 3743819 CLC_2386 CLC_2387     TRUE 0.939 11.000 0.018 NA   NA
 3743819 3743820 CLC_2387 CLC_2388   nrdR FALSE 0.020 449.000 0.013 NA   NA
 3743820 3743821 CLC_2388 CLC_2389 nrdR   FALSE 0.513 131.000 0.005 NA   NA
 3743821 3743822 CLC_2389 CLC_2390   sigG FALSE 0.574 147.000 0.026 NA   NA
 3743822 3743823 CLC_2390 CLC_2391 sigG sigE TRUE 0.975 75.000 0.602 0.006 Y NA
 3743823 3743824 CLC_2391 CLC_2392 sigE spoIIGA TRUE 0.991 12.000 0.856 1.000   NA
 3743824 3743825 CLC_2392 CLC_2393 spoIIGA ftsZ FALSE 0.104 313.000 0.024 1.000   NA
 3743825 3743826 CLC_2393 CLC_2394 ftsZ ftsA TRUE 0.993 23.000 0.460 1.000 Y NA
 3743826 3743827 CLC_2394 CLC_2395 ftsA   FALSE 0.549 157.000 0.008 NA N NA
 3743829 3743830 CLC_2397 CLC_2398 pilT aroE TRUE 0.972 2.000 0.028 1.000 N NA
 3743830 3743831 CLC_2398 CLC_2399 aroE   FALSE 0.221 139.000 0.000 1.000   NA
 3743831 3743832 CLC_2399 CLC_2400     FALSE 0.343 52.000 0.000 NA   NA
 3743833 3743834 CLC_2401 CLC_2402     FALSE 0.213 200.000 0.000 0.022   NA
 3743834 3743835 CLC_2402 CLC_2403     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3743836 3743837 CLC_2404 CLC_2405     FALSE 0.243 68.000 0.000 NA   NA
 3743837 3743838 CLC_2405 CLC_2406     TRUE 0.852 -22.000 0.000 NA   NA
 3743838 3743839 CLC_2406 CLC_2407     TRUE 0.874 -9.000 0.000 1.000   NA
 3743839 3743840 CLC_2407 CLC_2408     FALSE 0.010 437.000 0.000 1.000 N NA
 3743840 3743841 CLC_2408 CLC_2409     FALSE 0.059 239.000 0.000 1.000   NA
 3743841 3743842 CLC_2409 CLC_2410     FALSE 0.410 40.000 0.000 NA   NA
 3743842 3743843 CLC_2410 CLC_2411     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3743843 3743844 CLC_2411 CLC_2412     FALSE 0.207 79.000 0.000 NA   NA
 3743844 3743845 CLC_2412 CLC_2413     FALSE 0.141 152.000 0.000 NA   NA
 3743845 3743846 CLC_2413 CLC_2414     FALSE 0.051 224.000 0.000 NA   NA
 3743846 3743847 CLC_2414 CLC_2415     FALSE 0.003 485.000 0.000 NA   NA
 3743847 3743848 CLC_2415 CLC_2416     FALSE 0.207 79.000 0.000 NA   NA
 3743848 3743849 CLC_2416 CLC_2417     FALSE 0.165 127.000 0.000 NA   NA
 3743849 3743850 CLC_2417 CLC_2418     FALSE 0.173 119.000 0.000 NA   NA
 3743850 3743851 CLC_2418 CLC_2419     TRUE 0.636 23.000 0.000 NA   NA
 3743851 3743852 CLC_2419 CLC_2420     TRUE 0.695 11.000 0.000 NA   NA
 3743852 3743853 CLC_2420 CLC_2421     TRUE 0.994 -19.000 0.500 NA   NA
 3743854 3743855 CLC_2422 CLC_2423     FALSE 0.098 207.000 0.000 1.000   NA
 3743856 3743857 CLC_2424 CLC_2425   udk TRUE 0.691 86.000 0.012 1.000 N NA
 3743857 3743858 CLC_2425 CLC_2426 udk   TRUE 0.748 148.000 0.100 1.000 N NA
 3743858 3743859 CLC_2426 CLC_2427     TRUE 0.986 -7.000 0.146 1.000   NA
 3743859 3743860 CLC_2427 CLC_2428     TRUE 0.715 83.000 0.067 NA   NA
 3743860 3743861 CLC_2428 CLC_2429   typA TRUE 0.623 78.000 0.012 NA   NA
 3743861 3743862 CLC_2429 CLC_2430 typA   FALSE 0.010 644.000 0.004 1.000   NA
 3743862 3743863 CLC_2430 CLC_2431     TRUE 0.929 48.000 0.289 1.000   NA
 3743863 3743864 CLC_2431 CLC_2432     TRUE 0.773 122.000 0.211 NA   NA
 3743864 3743865 CLC_2432 CLC_2433     TRUE 0.949 14.000 0.047 NA   NA
 3743865 3743866 CLC_2433 CLC_2434     TRUE 0.699 207.000 0.537 NA   NA
 3743866 3743867 CLC_2434 CLC_2435   alaS TRUE 0.722 115.000 0.110 NA   NA
 3743867 3743868 CLC_2435 CLC_2436 alaS   FALSE 0.015 499.000 0.015 NA   NA
 3743868 3743869 CLC_2436 CLC_2437     TRUE 0.972 13.000 0.209 NA   NA
 3743869 3743870 CLC_2437 CLC_2438     FALSE 0.352 50.000 0.000 NA   NA
 3743870 3743871 CLC_2438 CLC_2439     TRUE 0.677 13.000 0.000 NA   NA
 3743871 3743872 CLC_2439 CLC_2440   iscS-2 TRUE 0.974 2.000 0.035 1.000 N NA
 3743872 3743873 CLC_2440 CLC_2441 iscS-2   TRUE 0.987 -7.000 0.125 NA N NA
 3743873 3743874 CLC_2441 CLC_2442     FALSE 0.364 220.000 0.025 NA N NA
 3743874 3743875 CLC_2442 CLC_2443   hisK FALSE 0.062 398.000 0.041 1.000 N NA
 3743875 3743876 CLC_2443 CLC_2444 hisK   FALSE 0.066 367.000 0.041 1.000   NA
 3743876 3743877 CLC_2444 CLC_2445     TRUE 0.746 108.000 0.143 NA   NA
 3743879 3743880 CLC_2447 CLC_2448     FALSE 0.169 122.000 0.000 NA   NA
 3743880 3743881 CLC_2448 CLC_2449     FALSE 0.001 745.000 0.000 NA   NA
 3743883 3743884 CLC_2451 CLC_2452     FALSE 0.007 364.000 0.000 NA   NA
 3743884 3743885 CLC_2452 CLC_2453     FALSE 0.189 199.000 0.000 1.000 N NA
 3743885 3743886 CLC_2453 CLC_2454     TRUE 0.988 -3.000 0.182 1.000 N NA
 3743886 3743887 CLC_2454 CLC_2455     TRUE 0.987 5.000 0.400 1.000   NA
 3743887 3743888 CLC_2455 CLC_2456     TRUE 0.947 6.000 0.011 1.000   NA
 3743888 3743889 CLC_2456 CLC_2457     TRUE 0.976 17.000 0.011 NA Y NA
 3743889 3743890 CLC_2457 CLC_2458     TRUE 0.960 9.000 0.026 NA N NA
 3743890 3743891 CLC_2458 CLC_2459     TRUE 0.975 41.000 0.250 1.000 Y NA
 3743891 3743892 CLC_2459 CLC_2460     TRUE 0.932 41.000 0.143 0.047   NA
 3743892 3743893 CLC_2460 CLC_2461     TRUE 0.977 4.000 0.143 1.000   NA
 3743893 3743894 CLC_2461 CLC_2462     TRUE 0.961 9.000 0.044 1.000   NA
 3743894 3743895 CLC_2462 CLC_2463     TRUE 0.965 -3.000 0.011 1.000   NA
 3743895 3743896 CLC_2463 CLC_2464     TRUE 0.925 19.000 0.011 1.000   NA
 3743896 3743897 CLC_2464 CLC_2465   argF FALSE 0.008 466.000 0.000 1.000 N NA
 3743897 3743898 CLC_2465 CLC_2466 argF arcC TRUE 0.949 95.000 0.500 1.000 Y NA
 3743898 3743899 CLC_2466 CLC_2467 arcC glyA FALSE 0.020 564.000 0.000 1.000 Y NA
 3743900 3743901 CLC_2468 CLC_2469     TRUE 0.983 -3.000 0.154 NA   NA
 3743902 3743903 CLC_2470 CLC_2471     FALSE 0.484 201.000 0.095 NA   NA
 3743903 10195469 CLC_2471 CLC_3726     TRUE 0.862 -158.000 0.000 NA   NA
 3743904 3743905 CLC_2472 CLC_2473     FALSE 0.004 411.000 0.000 NA   NA
 3743905 3743906 CLC_2473 CLC_2474     TRUE 0.857 77.000 0.185 1.000 N NA
 3743906 3743907 CLC_2474 CLC_2475     TRUE 0.666 154.000 0.111 NA   NA
 3743907 3743908 CLC_2475 CLC_2476     FALSE 0.010 339.000 0.000 NA   NA
 3743909 3743910 CLC_2477 CLC_2478     TRUE 0.713 122.000 0.034 1.000 N NA
 3743910 3743911 CLC_2478 CLC_2479     FALSE 0.010 426.000 0.000 1.000 N NA
 3743911 3743912 CLC_2479 CLC_2480   hprK TRUE 0.974 -7.000 0.006 1.000 N NA
 3743912 3743913 CLC_2480 CLC_2481 hprK   TRUE 0.879 32.000 0.018 NA   NA
 3743913 3743914 CLC_2481 CLC_2482     FALSE 0.115 171.000 0.000 NA   NA
 3743914 3743915 CLC_2482 CLC_2483     TRUE 0.988 -34.000 0.130 NA   NA
 3743915 3743916 CLC_2483 CLC_2484     TRUE 0.786 109.000 0.222 NA   NA
 3743916 3743917 CLC_2484 CLC_2485     TRUE 0.970 0.000 0.049 NA   NA
 3743917 3743918 CLC_2485 CLC_2486     TRUE 0.981 -10.000 0.073 NA   NA
 3743918 3743919 CLC_2486 CLC_2487     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3743923 3743924 CLC_2491 CLC_2492     FALSE 0.003 455.000 0.000 NA   NA
 3743924 3743925 CLC_2492 CLC_2493     FALSE 0.002 547.000 0.000 NA   NA
 3743925 3743926 CLC_2493 CLC_2494     FALSE 0.001 1052.000 0.000 NA   NA
 3743926 3743927 CLC_2494 CLC_2495   def-3 TRUE 0.964 18.000 0.065 1.000 N NA
 3743927 3743928 CLC_2495 CLC_2496 def-3   FALSE 0.144 217.000 0.000 1.000 N NA
 3743928 3743929 CLC_2496 CLC_2497     TRUE 0.990 29.000 0.238 0.005 Y NA
 3743929 3743930 CLC_2497 CLC_2498     TRUE 0.999 -7.000 0.776 0.005 Y NA
 3743930 3743931 CLC_2498 CLC_2499     TRUE 0.996 14.000 0.462 0.005 Y NA
 3743931 3743932 CLC_2499 CLC_2500     TRUE 0.998 -7.000 0.487 0.005 Y NA
 3743932 3743933 CLC_2500 CLC_2501     TRUE 0.994 15.000 0.258 0.005 Y NA
 3743933 3743934 CLC_2501 CLC_2502     TRUE 0.970 39.000 0.489 0.005   NA
 3743934 3743935 CLC_2502 CLC_2503     TRUE 0.993 13.000 0.848 0.005   NA
 3743935 3743936 CLC_2503 CLC_2504     TRUE 0.985 -13.000 0.025 0.005   NA
 3743936 3743937 CLC_2504 CLC_2505     FALSE 0.023 306.000 0.000 1.000   NA
 3743937 3743938 CLC_2505 CLC_2506     TRUE 0.966 -25.000 0.002 NA   NA
 3743938 3743939 CLC_2506 CLC_2507     FALSE 0.341 184.000 0.002 NA   NA
 3743939 3743940 CLC_2507 CLC_2508     TRUE 0.637 22.000 0.000 NA   NA
 3743940 3743941 CLC_2508 CLC_2509     FALSE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 3743943 3743944 CLC_2511 CLC_2512     FALSE 0.011 328.000 0.000 NA   NA
 3743944 3743945 CLC_2512 CLC_2513     TRUE 0.961 55.000 0.088 0.004 Y NA
 3743945 3743946 CLC_2513 CLC_2514     TRUE 0.718 66.000 0.027 NA   NA
 3743946 3743947 CLC_2514 CLC_2515     TRUE 0.823 78.000 0.222 NA   NA
 3743947 3743948 CLC_2515 CLC_2516   fliA TRUE 0.921 29.000 0.029 1.000   NA
 3743948 3743949 CLC_2516 CLC_2517 fliA   TRUE 0.963 14.000 0.062 NA N NA
 3743949 3743950 CLC_2517 CLC_2518   flhG TRUE 0.967 15.000 0.094 NA N NA
 3743950 3743951 CLC_2518 CLC_2519 flhG flhF TRUE 0.993 -6.000 0.382 1.000 N NA
 3743951 3743952 CLC_2519 CLC_2520 flhF flhA TRUE 0.997 -3.000 0.440 1.000 Y NA
 3743952 3743953 CLC_2520 CLC_2521 flhA   TRUE 0.991 28.000 0.207 0.002 Y NA
 3743953 3743954 CLC_2521 CLC_2522   fliQ TRUE 0.983 34.000 0.114 0.002 Y NA
 3743954 3743955 CLC_2522 CLC_2523 fliQ fliP TRUE 0.993 12.000 0.162 0.003 Y NA
 3743955 3743956 CLC_2523 CLC_2524 fliP   TRUE 0.997 -16.000 0.386 1.000 Y NA
 3743956 3743957 CLC_2524 CLC_2525   fliL FALSE 0.230 73.000 0.000 NA   NA
 3743957 3743958 CLC_2525 CLC_2526 fliL motB-2 TRUE 0.796 -3.000 0.000 NA   NA
 3743958 3743959 CLC_2526 CLC_2527 motB-2 motA-2 TRUE 0.997 -7.000 0.350 1.000 Y NA
 3743959 3743960 CLC_2527 CLC_2528 motA-2   TRUE 0.996 -3.000 0.301 NA Y NA
 3743960 3743961 CLC_2528 CLC_2529   flgE FALSE 0.597 234.000 0.077 NA Y NA
 3743961 3743962 CLC_2529 CLC_2530 flgE   TRUE 0.749 82.000 0.100 NA   NA
 3743962 3743963 CLC_2530 CLC_2531   flgD TRUE 0.952 15.000 0.064 NA   NA
 3743963 3743964 CLC_2531 CLC_2532 flgD fliK TRUE 0.883 30.000 0.012 NA   NA
 3743964 3743965 CLC_2532 CLC_2533 fliK   TRUE 0.964 6.000 0.006 0.005   NA
 3743965 3743966 CLC_2533 CLC_2534   fliI TRUE 0.942 104.000 0.241 0.007 Y NA
 3743966 3743967 CLC_2534 CLC_2535 fliI fliH TRUE 0.979 40.000 0.379 NA Y NA
 3743967 3743968 CLC_2535 CLC_2536 fliH fliG TRUE 0.997 -16.000 0.308 NA Y NA
 3743968 3743969 CLC_2536 CLC_2537 fliG fliF TRUE 0.997 7.000 0.477 0.005 Y NA
 3743969 3743970 CLC_2537 CLC_2538 fliF fliE TRUE 0.991 16.000 0.112 0.005 Y NA
 3743970 3743971 CLC_2538 CLC_2539 fliE flgC TRUE 0.992 12.000 0.095 0.004 Y NA
 3743971 3743972 CLC_2539 CLC_2540 flgC flgB TRUE 0.973 98.000 0.804 0.004 Y NA
 3743972 3743973 CLC_2540 CLC_2541 flgB   FALSE 0.007 572.000 0.000 0.004   NA
 3743973 3743974 CLC_2541 CLC_2542     TRUE 0.742 144.000 0.182 NA   NA
 3743974 3743975 CLC_2542 CLC_2543   argH FALSE 0.002 540.000 0.000 NA   NA
 3743975 3743976 CLC_2543 CLC_2544 argH argG TRUE 0.991 22.000 0.278 1.000 Y NA
 3743976 3743977 CLC_2544 CLC_2545 argG   FALSE 0.019 295.000 0.000 NA   NA
 3743977 3743978 CLC_2545 CLC_2546     TRUE 0.985 23.000 0.667 NA   NA
 3743978 3743979 CLC_2546 CLC_2547   cls FALSE 0.100 180.000 0.000 NA   NA
 3743981 3743982 CLC_2549 CLC_2550     FALSE 0.022 283.000 0.000 NA   NA
 3743982 3743983 CLC_2550 CLC_2551     FALSE 0.035 251.000 0.000 NA   NA
 3743983 3743984 CLC_2551 CLC_2552     FALSE 0.510 40.000 0.000 1.000   NA
 3743984 3743985 CLC_2552 CLC_2553     TRUE 0.934 29.000 0.000 1.000 Y NA
 3743985 3743986 CLC_2553 CLC_2554     TRUE 0.972 32.000 0.051 1.000 Y NA
 3743986 3743987 CLC_2554 CLC_2555     TRUE 0.957 15.000 0.091 NA   NA
 3743987 3743988 CLC_2555 CLC_2556     FALSE 0.491 34.000 0.000 NA   NA
 3743988 3743989 CLC_2556 CLC_2557     FALSE 0.604 27.000 0.000 NA   NA
 3743989 3743990 CLC_2557 CLC_2558   glf TRUE 0.956 0.000 0.012 NA   NA
 3743990 3743991 CLC_2558 CLC_2559 glf   TRUE 0.822 105.000 0.012 NA Y NA
 3743991 3743992 CLC_2559 CLC_2560     FALSE 0.126 211.000 0.000 NA N NA
 3743992 3743993 CLC_2560 CLC_2561     TRUE 0.829 19.000 0.000 1.000 N NA
 3743993 3743994 CLC_2561 CLC_2562     TRUE 0.982 16.000 0.027 1.000 Y NA
 3743994 3743995 CLC_2562 CLC_2563     TRUE 0.966 35.000 0.400 NA N NA
 3743995 3743996 CLC_2563 CLC_2564     FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 3743996 3743997 CLC_2564 CLC_2565     FALSE 0.146 150.000 0.000 NA   NA
 3743997 3743998 CLC_2565 CLC_2566     TRUE 0.914 121.000 1.000 NA   NA
 3743998 3743999 CLC_2566 CLC_2567     FALSE 0.003 484.000 0.000 NA   NA
 3743999 3744000 CLC_2567 CLC_2568   fliC TRUE 0.852 77.000 0.250 1.000   NA
 3744000 3744001 CLC_2568 CLC_2569 fliC   TRUE 0.662 185.000 0.250 NA   NA
 3744001 3744002 CLC_2569 CLC_2570     FALSE 0.191 86.000 0.000 NA   NA
 3744002 3744003 CLC_2570 CLC_2571     TRUE 0.660 16.000 0.000 NA   NA
 3744003 3744004 CLC_2571 CLC_2572     FALSE 0.174 108.000 0.000 NA   NA
 3744004 3744005 CLC_2572 CLC_2573     FALSE 0.007 497.000 0.000 1.000 N NA
 3744005 3744006 CLC_2573 CLC_2574     FALSE 0.252 90.000 0.000 1.000   NA
 3744006 3744007 CLC_2574 CLC_2575     TRUE 0.738 17.000 0.000 1.000   NA
 3744007 3744008 CLC_2575 CLC_2576     TRUE 0.680 28.000 0.000 1.000   NA
 3744008 3744009 CLC_2576 CLC_2577     FALSE 0.173 105.000 0.000 NA   NA
 3744009 3744010 CLC_2577 CLC_2578     TRUE 0.709 8.000 0.000 NA   NA
 3744010 3744011 CLC_2578 CLC_2579     TRUE 0.707 26.000 0.000 1.000   NA
 3744011 3744012 CLC_2579 CLC_2580     FALSE 0.442 37.000 0.000 NA   NA
 3744012 3744013 CLC_2580 CLC_2581     FALSE 0.371 46.000 0.000 NA   NA
 3744013 3744014 CLC_2581 CLC_2582     FALSE 0.224 134.000 0.000 1.000   NA
 3744014 3744015 CLC_2582 CLC_2583     FALSE 0.251 66.000 0.000 NA   NA
 3744015 3744016 CLC_2583 CLC_2584     TRUE 0.814 -7.000 0.000 NA   NA
 3744016 3744017 CLC_2584 CLC_2585     FALSE 0.259 87.000 0.000 1.000   NA
 3744017 3744018 CLC_2585 CLC_2586     TRUE 0.724 22.000 0.000 1.000   NA
 3744018 3744019 CLC_2586 CLC_2587     TRUE 0.979 -3.000 0.071 1.000   NA
 3744019 3744020 CLC_2587 CLC_2588     TRUE 0.981 -10.000 0.053 1.000   NA
 3744020 3744021 CLC_2588 CLC_2589   rfbC TRUE 0.995 -3.000 0.196 1.000 Y NA
 3744021 3744022 CLC_2589 CLC_2590 rfbC   TRUE 0.990 1.000 0.457 1.000   NA
 3744022 3744023 CLC_2590 CLC_2591     FALSE 0.464 47.000 0.000 1.000   NA
 3744023 3744024 CLC_2591 CLC_2592     TRUE 0.956 2.000 0.013 1.000   NA
 3744024 3744025 CLC_2592 CLC_2593     TRUE 0.639 19.000 0.000 NA   NA
 3744025 3744026 CLC_2593 CLC_2594     FALSE 0.182 91.000 0.000 NA   NA
 3744026 3744027 CLC_2594 CLC_2595     TRUE 0.851 142.000 0.037 1.000 Y NA
 3744027 3744028 CLC_2595 CLC_2596     TRUE 0.699 123.000 0.069 1.000   NA
 3744028 3744029 CLC_2596 CLC_2597     TRUE 0.956 40.000 0.468 1.000   NA
 3744029 3744030 CLC_2597 CLC_2598     FALSE 0.135 221.000 0.000 1.000 N NA
 3744030 3744031 CLC_2598 CLC_2599     TRUE 0.870 120.000 0.267 0.002   NA
 3744031 3744032 CLC_2599 CLC_2600     FALSE 0.500 41.000 0.000 1.000   NA
 3744032 3744033 CLC_2600 CLC_2601     TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3744033 3744034 CLC_2601 CLC_2602     TRUE 0.969 4.000 0.095 NA   NA
 3744034 3744035 CLC_2602 CLC_2603     TRUE 0.627 25.000 0.000 NA   NA
 3744035 3744036 CLC_2603 CLC_2604     FALSE 0.483 223.000 0.105 1.000 N NA
 3744036 3744037 CLC_2604 CLC_2605     TRUE 0.801 214.000 0.133 0.002 Y NA
 3744037 3744038 CLC_2605 CLC_2606     TRUE 0.736 150.000 0.200 NA   NA
 3744038 3744039 CLC_2606 CLC_2607   fliD TRUE 0.932 27.000 0.043 NA   NA
 3744039 3744040 CLC_2607 CLC_2608 fliD fliS TRUE 0.980 54.000 0.370 0.002 Y NA
 3744040 3744041 CLC_2608 CLC_2609 fliS   TRUE 0.900 37.000 0.093 NA   NA
 3744041 3744042 CLC_2609 CLC_2610     TRUE 0.786 55.000 0.028 NA   NA
 3744042 3744043 CLC_2610 CLC_2611   csrA TRUE 0.952 16.000 0.028 NA N NA
 3744043 3744044 CLC_2611 CLC_2612 csrA   TRUE 0.976 0.000 0.096 NA   NA
 3744044 3744045 CLC_2612 CLC_2613   flgL TRUE 0.847 89.000 0.385 NA   NA
 3744045 3744046 CLC_2613 CLC_2614 flgL flgK TRUE 0.990 18.000 0.071 0.001 Y NA
 3744046 3744047 CLC_2614 CLC_2615 flgK   FALSE 0.278 289.000 0.082 0.002   NA
 3744047 3744048 CLC_2615 CLC_2616     TRUE 0.993 0.000 0.421 0.002   NA
 3744048 3744049 CLC_2616 CLC_2617   fliN FALSE 0.004 497.000 0.000 1.000   NA
 3744049 3744050 CLC_2617 CLC_2618 fliN fliM TRUE 0.998 -7.000 0.508 0.001 Y NA
 3744050 3744051 CLC_2618 CLC_2619 fliM   TRUE 0.984 28.000 0.039 0.010 Y NA
 3744051 3744052 CLC_2619 CLC_2620   cheY TRUE 0.943 100.000 0.417 1.000 Y NA
 3744052 3744053 CLC_2620 CLC_2621 cheY cheC TRUE 0.979 28.000 0.082 NA Y NA
 3744053 3744054 CLC_2621 CLC_2622 cheC cheA TRUE 0.986 26.000 0.176 NA Y NA
 3744054 3744055 CLC_2622 CLC_2623 cheA cheR TRUE 0.987 13.000 0.081 1.000 Y NA
 3744055 3744056 CLC_2623 CLC_2624 cheR cheB TRUE 0.988 15.000 0.107 1.000 Y NA
 3744056 3744057 CLC_2624 CLC_2625 cheB cheD TRUE 0.984 23.000 0.070 1.000 Y NA
 3744057 3744058 CLC_2625 CLC_2626 cheD cheW TRUE 0.985 17.000 0.063 1.000 Y NA
 3744058 3744059 CLC_2626 CLC_2627 cheW   TRUE 0.978 16.000 0.231 NA N NA
 3744059 3744060 CLC_2627 CLC_2628     FALSE 0.070 253.000 0.000 NA N NA
 3744060 3744061 CLC_2628 CLC_2629     TRUE 0.845 83.000 0.273 1.000   NA
 3744061 3744062 CLC_2629 CLC_2630     FALSE 0.052 249.000 0.000 1.000   NA
 3744062 3744063 CLC_2630 CLC_2631     TRUE 0.902 127.000 0.082 0.047 Y NA
 3744063 3744064 CLC_2631 CLC_2632     FALSE 0.033 257.000 0.000 NA   NA
 3744064 3744065 CLC_2632 CLC_2633     FALSE 0.031 261.000 0.000 NA   NA
 3744065 3744066 CLC_2633 CLC_2634     FALSE 0.028 266.000 0.000 NA   NA
 3744066 3744067 CLC_2634 CLC_2635   murG FALSE 0.004 630.000 0.000 1.000 N NA
 3744069 3744070 CLC_2637 CLC_2638   recJ FALSE 0.355 123.000 0.000 1.000 N NA
 3744072 3744073 CLC_2640 CLC_2641     FALSE 0.002 995.000 0.000 1.000   NA
 3744074 3744075 CLC_2642 CLC_2643     TRUE 0.681 68.000 0.008 1.000   NA
 3744076 3744077 CLC_2644 CLC_2645 glpP   TRUE 0.851 49.000 0.018 1.000 N NA
 3744077 3744078 CLC_2645 CLC_2646     TRUE 0.975 74.000 0.552 0.001 Y NA
 3744078 3744079 CLC_2646 CLC_2647     FALSE 0.007 367.000 0.000 NA   NA
 3744080 3744081 CLC_2648 CLC_2649     TRUE 0.979 13.000 0.333 NA   NA
 3744081 3744082 CLC_2649 CLC_2650     FALSE 0.003 461.000 0.000 NA   NA
 3744082 3744083 CLC_2650 CLC_2651     TRUE 0.975 20.000 0.333 NA   NA
 3744084 3744085 CLC_2652 CLC_2653   galE FALSE 0.429 38.000 0.000 NA   NA
 3744085 3744086 CLC_2653 CLC_2654 galE   FALSE 0.024 347.000 0.000 1.000 N NA
 3744086 3744087 CLC_2654 CLC_2655     FALSE 0.021 284.000 0.000 NA   NA
 3744087 3744088 CLC_2655 CLC_2656     TRUE 0.850 -21.000 0.000 NA   NA
 3744088 3744089 CLC_2656 CLC_2657     FALSE 0.026 272.000 0.000 NA   NA
 3744089 3744090 CLC_2657 CLC_2658     FALSE 0.004 624.000 0.000 1.000 N NA
 3744092 3744093 CLC_2660 CLC_2661 glpK   FALSE 0.364 264.000 0.131 1.000 N NA
 3744095 3744096 CLC_2663 CLC_2664     TRUE 0.832 132.000 0.400 NA   NA
 3744096 3744097 CLC_2664 CLC_2665     TRUE 0.979 -16.000 0.038 NA   NA
 3744097 3744098 CLC_2665 CLC_2666     TRUE 0.989 6.000 0.419 1.000 N NA
 3744098 3744099 CLC_2666 CLC_2667     FALSE 0.553 174.000 0.027 NA N NA
 3744100 3744101 CLC_2668 CLC_2669     FALSE 0.001 748.000 0.000 NA   NA
 3744101 3744102 CLC_2669 CLC_2670     FALSE 0.016 304.000 0.000 NA   NA
 3744103 3744104 CLC_2671 CLC_2672 gerAC   TRUE 0.958 -46.000 0.000 0.005   NA
 3744104 3744105 CLC_2672 CLC_2673   gerAA TRUE 0.947 -10.000 0.000 0.005   NA
 3744105 3744106 CLC_2673 CLC_2674 gerAA   FALSE 0.032 260.000 0.000 NA   NA
 3744106 3744107 CLC_2674 CLC_2675     FALSE 0.050 225.000 0.000 NA   NA
 3744107 3744108 CLC_2675 CLC_2676     TRUE 0.754 2.000 0.000 NA   NA
 3744108 3744109 CLC_2676 CLC_2677     FALSE 0.021 359.000 0.000 1.000 N NA
 3744109 3744110 CLC_2677 CLC_2678     FALSE 0.137 220.000 0.000 1.000 N NA
 3744110 3744111 CLC_2678 CLC_2679     FALSE 0.587 77.000 0.004 NA   NA
 3744113 3744114 CLC_2681 CLC_2682     FALSE 0.484 197.000 0.000 1.000 Y NA
 3744116 3744117 CLC_2684 CLC_2685     FALSE 0.008 391.000 0.000 1.000   NA
 3744117 3744118 CLC_2685 CLC_2686     FALSE 0.028 267.000 0.000 NA   NA
 3744118 3744119 CLC_2686 CLC_2687     TRUE 0.854 133.000 0.500 NA   NA
 3744119 3744120 CLC_2687 CLC_2688     FALSE 0.002 517.000 0.000 NA   NA
 3744120 3744121 CLC_2688 CLC_2689   nrdB FALSE 0.009 344.000 0.000 NA   NA
 3744121 3744122 CLC_2689 CLC_2690 nrdB nrdA FALSE 0.082 196.000 0.000 NA   NA
 3744122 3744123 CLC_2690 CLC_2691 nrdA   FALSE 0.046 230.000 0.000 NA   NA
 3744124 3744125 CLC_2692 CLC_2693     FALSE 0.391 237.000 0.167 NA   NA
 3744126 3744127 CLC_2694 CLC_2695 dinB   FALSE 0.008 465.000 0.000 1.000 N NA
 3744127 3744128 CLC_2695 CLC_2696     TRUE 0.986 0.000 0.062 0.021 N NA
 3744128 3744129 CLC_2696 CLC_2697   pyrR-2 FALSE 0.009 447.000 0.000 1.000 N NA
 3744129 3744130 CLC_2697 CLC_2698 pyrR-2   FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 3744130 3744131 CLC_2698 CLC_2699     FALSE 0.004 430.000 0.000 NA   NA
 3744131 3744132 CLC_2699 CLC_2700     TRUE 0.988 18.000 0.571 1.000 N NA
 3744134 3744135 CLC_2702 CLC_2703 ligT   FALSE 0.461 185.000 0.034 NA   NA
 3744135 3744136 CLC_2703 CLC_2704     FALSE 0.040 240.000 0.000 NA   NA
 3744139 3744140 CLC_2707 CLC_2708     TRUE 0.888 133.000 0.667 1.000   NA
 3744141 3744142 CLC_2709 CLC_2710   nagB FALSE 0.351 228.000 0.000 1.000 Y NA
 3744142 3744143 CLC_2710 CLC_2711 nagB nagA TRUE 0.966 68.000 0.273 0.001 Y NA
 3744143 3744144 CLC_2711 CLC_2712 nagA   TRUE 0.864 161.000 0.545 1.000 N NA
 3744147 3744148 CLC_2715 CLC_2716 nagE   FALSE 0.007 480.000 0.000 1.000 N NA
 3744149 3744150 CLC_2717 CLC_2718     FALSE 0.110 234.000 0.000 1.000 N NA
 3744150 3744151 CLC_2718 CLC_2719     TRUE 0.958 59.000 0.571 0.041 N NA
 3744151 3744152 CLC_2719 CLC_2720     FALSE 0.022 356.000 0.000 1.000 N NA
 3744153 3744154 CLC_2721 CLC_2722     TRUE 0.815 171.000 0.583 NA   NA
 3744154 3744155 CLC_2722 CLC_2723     FALSE 0.002 538.000 0.000 NA   NA
 3744155 3744156 CLC_2723 CLC_2724     TRUE 0.998 9.000 0.909 0.001 Y NA
 3744157 3744158 CLC_2725 CLC_2726     FALSE 0.082 219.000 0.000 1.000   NA
 3744158 3744159 CLC_2726 CLC_2727     TRUE 0.998 5.000 0.800 0.041 Y NA
 3744159 3744160 CLC_2727 CLC_2728     TRUE 0.998 -3.000 0.800 0.029 Y NA
 3744162 3744163 CLC_2730 CLC_2731     FALSE 0.174 115.000 0.000 NA   NA
 3744163 3744164 CLC_2731 CLC_2732     FALSE 0.002 640.000 0.000 NA   NA
 3744164 3744165 CLC_2732 CLC_2733     FALSE 0.004 420.000 0.000 NA   NA
 3744165 3744166 CLC_2733 CLC_2734     FALSE 0.011 329.000 0.000 NA   NA
 3744166 3744167 CLC_2734 CLC_2735     FALSE 0.458 163.000 0.003 1.000   NA
 3744167 3744168 CLC_2735 CLC_2736     FALSE 0.002 1027.000 0.000 1.000   NA
 3744168 3744169 CLC_2736 CLC_2737     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3744169 3744170 CLC_2737 CLC_2738     TRUE 0.847 -19.000 0.000 NA   NA
 3744170 3744171 CLC_2738 CLC_2739     FALSE 0.001 886.000 0.000 NA   NA
 3744171 3744172 CLC_2739 CLC_2740     FALSE 0.233 72.000 0.000 NA   NA
 3744174 3744175 CLC_2742 CLC_2743     FALSE 0.001 1809.000 0.000 NA   NA
 3744175 3744176 CLC_2743 CLC_2744     TRUE 0.969 17.000 0.083 0.045   NA
 3744176 3744177 CLC_2744 CLC_2745     TRUE 0.960 20.000 0.042 0.045   NA
 3744177 3744178 CLC_2745 CLC_2746     FALSE 0.006 430.000 0.000 1.000   NA
 3744178 3744179 CLC_2746 CLC_2747     FALSE 0.156 143.000 0.000 NA   NA
 3744179 3744180 CLC_2747 CLC_2748     TRUE 0.637 21.000 0.000 NA   NA
 3744180 3744181 CLC_2748 CLC_2749     FALSE 0.163 130.000 0.000 NA   NA
 3744181 3744182 CLC_2749 CLC_2750     TRUE 0.915 102.000 1.000 NA   NA
 3744184 3744185 CLC_2752 CLC_2753     FALSE 0.214 77.000 0.000 NA   NA
 3744185 3744186 CLC_2753 CLC_2754     TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3744186 3744187 CLC_2754 CLC_2755     FALSE 0.338 65.000 0.000 1.000   NA
 3744188 3744189 CLC_2756 CLC_2757     FALSE 0.309 73.000 0.000 1.000   NA
 3744190 3744191 CLC_2758 CLC_2759 rumA-1   FALSE 0.021 287.000 0.000 NA   NA
 3744192 3744193 CLC_2760 CLC_2761     TRUE 0.968 26.000 0.214 1.000   NA
 3744194 3744195 CLC_2762 CLC_2763 ribH ribAB TRUE 0.981 32.000 0.054 0.002 Y NA
 3744195 3744196 CLC_2763 CLC_2764 ribAB ribE FALSE 0.330 308.000 0.051 1.000 Y NA
 3744196 3744197 CLC_2764 CLC_2765 ribE ribD TRUE 0.998 -19.000 0.456 1.000 Y NA
 3744197 3744198 CLC_2765 CLC_2766 ribD pepD-3 FALSE 0.013 404.000 0.000 1.000 N NA
 3744200 3744201 CLC_2768 CLC_2769 mgtA   FALSE 0.001 743.000 0.000 NA   NA
 3744201 3744202 CLC_2769 CLC_2770   purD FALSE 0.011 328.000 0.000 NA   NA
 3744202 3744203 CLC_2770 CLC_2771 purD purH TRUE 0.909 149.000 0.238 1.000 Y NA
 3744203 3744204 CLC_2771 CLC_2772 purH purN TRUE 0.781 214.000 0.225 1.000 Y NA
 3744204 3744205 CLC_2772 CLC_2773 purN purM TRUE 0.942 128.000 0.238 0.001 Y NA
 3744205 3744206 CLC_2773 CLC_2774 purM purF-1 TRUE 0.956 61.000 0.248 1.000 Y NA
 3744206 3744207 CLC_2774 CLC_2775 purF-1 purC TRUE 0.890 92.000 0.082 1.000 Y NA
 3744207 3744208 CLC_2775 CLC_2776 purC purE TRUE 0.991 0.000 0.035 1.000 Y NA
 3744210 3744211 CLC_2778 CLC_2779     FALSE 0.018 375.000 0.000 1.000 N NA
 3744211 3744212 CLC_2779 CLC_2780     TRUE 0.951 26.000 0.033 1.000 N NA
 3744212 3744213 CLC_2780 CLC_2781     TRUE 0.977 31.000 0.443 1.000 N NA
 3744213 3744214 CLC_2781 CLC_2782     TRUE 0.965 36.000 0.049 1.000 Y NA
 3744214 3744215 CLC_2782 CLC_2783   hydA FALSE 0.025 342.000 0.000 1.000 N NA
 3744215 3744216 CLC_2783 CLC_2784 hydA   TRUE 0.930 50.000 0.012 1.000 Y NA
 3744216 3744217 CLC_2784 CLC_2785   dpaL TRUE 0.971 22.000 0.133 1.000 N NA
 3744217 3744218 CLC_2785 CLC_2786 dpaL   FALSE 0.056 285.000 0.000 1.000 N NA
 3744219 3744220 CLC_2787 CLC_2788     TRUE 0.960 15.000 0.104 NA   NA
 3744220 3744221 CLC_2788 CLC_2789     TRUE 0.985 -19.000 0.109 NA   NA
 3744221 3744222 CLC_2789 CLC_2790     TRUE 0.985 -18.000 0.109 NA   NA
 3744222 3744223 CLC_2790 CLC_2791     TRUE 0.945 26.000 0.032 NA N NA
 3744223 3744224 CLC_2791 CLC_2792     TRUE 0.981 -3.000 0.047 1.000 N NA
 3744224 3744225 CLC_2792 CLC_2793     TRUE 0.998 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 3744225 3744226 CLC_2793 CLC_2794     TRUE 0.938 52.000 0.031 1.000 Y NA
 3744226 3744227 CLC_2794 CLC_2795     TRUE 0.852 138.000 0.500 NA   NA
 3744227 3744228 CLC_2795 CLC_2796     TRUE 0.651 128.000 0.053 NA   NA
 3744229 3744230 CLC_2797 CLC_2798     FALSE 0.011 331.000 0.000 NA   NA
 3744230 3744231 CLC_2798 CLC_2799     FALSE 0.006 528.000 0.000 0.081   NA
 3744231 3744232 CLC_2799 CLC_2800     FALSE 0.002 950.000 0.000 1.000   NA
 3744232 3744233 CLC_2800 CLC_2801   trmU-2 FALSE 0.003 507.000 0.000 1.000   NA
 3744235 3744236 CLC_2803 CLC_2804     TRUE 0.962 0.000 0.005 NA N NA
 3744238 3744239 CLC_2806 CLC_2807   thiC TRUE 0.899 19.000 0.003 NA   NA
 3744239 3744240 CLC_2807 CLC_2808 thiC purF-2 FALSE 0.349 211.000 0.003 1.000 N NA
 3744240 3744241 CLC_2808 CLC_2809 purF-2   FALSE 0.030 263.000 0.000 NA   NA
 3744241 3744242 CLC_2809 CLC_2810     TRUE 0.723 56.000 0.008 NA   NA
 3744242 3744243 CLC_2810 CLC_2811     TRUE 0.754 2.000 0.000 NA   NA
 3744243 3744244 CLC_2811 CLC_2812     TRUE 0.965 7.000 0.083 NA   NA
 3744244 3744245 CLC_2812 CLC_2813     TRUE 0.702 207.000 0.375 1.000 N NA
 3744246 3744247 CLC_2814 CLC_2815   ribB FALSE 0.002 590.000 0.000 NA   NA
 3744249 3744250 CLC_2817 CLC_2818     FALSE 0.254 89.000 0.000 1.000   NA
 3744250 3744251 CLC_2818 CLC_2819     TRUE 0.988 23.000 0.917 NA   NA
 3744252 3744253 CLC_2820 CLC_2821     TRUE 0.759 117.000 0.167 NA   NA
 3744253 3744254 CLC_2821 CLC_2822     FALSE 0.015 308.000 0.000 NA   NA
 3744254 3744255 CLC_2822 CLC_2823     FALSE 0.009 379.000 0.000 1.000   NA
 3744257 3744258 CLC_2825 CLC_2826     FALSE 0.064 210.000 0.000 NA   NA
 3744258 3744259 CLC_2826 CLC_2827     FALSE 0.174 98.000 0.000 NA   NA
 10195470 3744261 CLC_3733 CLC_2829     FALSE 0.174 110.000 0.000 NA   NA
 3744261 3744262 CLC_2829 CLC_2830     TRUE 0.812 139.000 0.342 NA   NA
 3744262 3744263 CLC_2830 CLC_2831     TRUE 0.990 -9.000 0.283 NA   NA
 3744263 3744264 CLC_2831 CLC_2832     TRUE 0.685 76.000 0.028 NA   NA
 3744264 3744265 CLC_2832 CLC_2833   rpoD TRUE 0.689 74.000 0.026 NA   NA
 3744265 3744266 CLC_2833 CLC_2834 rpoD dnaG TRUE 0.975 25.000 0.209 1.000 N NA
 3744266 3744267 CLC_2834 CLC_2835 dnaG   FALSE 0.236 284.000 0.056 1.000 N NA
 3744269 3744270 CLC_2837 CLC_2838 ppdK   TRUE 0.670 80.000 0.019 1.000   NA
 3744270 3744271 CLC_2838 CLC_2839     FALSE 0.002 510.000 0.000 NA   NA
 3744271 3744272 CLC_2839 CLC_2840     TRUE 0.740 3.000 0.000 NA   NA
 3744272 3744273 CLC_2840 CLC_2841   era FALSE 0.005 399.000 0.000 NA   NA
 3744273 3744274 CLC_2841 CLC_2842 era cdd TRUE 0.959 16.000 0.077 1.000   NA
 3744274 3744275 CLC_2842 CLC_2843 cdd   TRUE 0.756 84.000 0.040 1.000 N NA
 3744275 3744276 CLC_2843 CLC_2844     TRUE 0.840 39.000 0.023 NA   NA
 3744276 3744277 CLC_2844 CLC_2845     TRUE 0.984 -3.000 0.182 NA   NA
 3744277 3744278 CLC_2845 CLC_2846     TRUE 0.933 23.000 0.032 NA   NA
 3744278 3744279 CLC_2846 CLC_2847   yqfC TRUE 0.996 -10.000 0.851 NA   NA
 3744279 3744280 CLC_2847 CLC_2848 yqfC   TRUE 0.625 114.000 0.029 NA   NA
 3744280 3744281 CLC_2848 CLC_2849   rpsU TRUE 0.933 43.000 0.150 0.022   NA
 3744281 3744282 CLC_2849 CLC_2850 rpsU   TRUE 0.689 137.000 0.071 1.000   NA
 3744282 3744283 CLC_2850 CLC_2851     TRUE 0.889 57.000 0.051 0.033 N NA
 3744283 3744284 CLC_2851 CLC_2852     TRUE 0.981 0.000 0.163 NA   NA
 3744284 3744285 CLC_2852 CLC_2853   prmA TRUE 0.791 98.000 0.227 NA   NA
 3744285 3744286 CLC_2853 CLC_2854 prmA dnaJ TRUE 0.684 178.000 0.133 1.000 N NA
 3744286 3744287 CLC_2854 CLC_2855 dnaJ dnaK TRUE 0.930 143.000 0.196 0.002 Y NA
 3744287 3744288 CLC_2855 CLC_2856 dnaK grpE TRUE 0.973 55.000 0.224 0.004 Y NA
 3744288 3744289 CLC_2856 CLC_2857 grpE hrcA TRUE 0.977 27.000 0.286 1.000 N NA
 3744289 3744290 CLC_2857 CLC_2858 hrcA   FALSE 0.539 201.000 0.062 1.000 N NA
 3744290 3744291 CLC_2858 CLC_2859   lepA TRUE 0.960 27.000 0.083 1.000 N NA
 3744291 3744292 CLC_2859 CLC_2860 lepA   FALSE 0.494 141.000 0.004 NA   NA
 3744292 3744293 CLC_2860 CLC_2861     TRUE 0.765 71.000 0.077 NA   NA
 3744293 3744294 CLC_2861 CLC_2862   gpr TRUE 0.765 185.000 0.521 NA   NA
 3744296 3744297 CLC_2864 CLC_2865 holA   TRUE 0.951 29.000 0.163 NA   NA
 3744297 3744298 CLC_2865 CLC_2866     TRUE 0.915 12.000 0.002 NA   NA
 3744298 3744299 CLC_2866 CLC_2867     TRUE 0.689 105.000 0.077 NA   NA
 3744299 3744300 CLC_2867 CLC_2868     FALSE 0.002 509.000 0.000 NA   NA
 3744301 3744302 CLC_2869 CLC_2871     FALSE 0.001 996.000 0.000 NA   NA
 3744303 3744304 CLC_2872 CLC_2873 selB selA TRUE 0.991 19.000 0.569 0.001 N NA
 3744304 3744305 CLC_2873 CLC_2874 selA selD TRUE 0.917 67.000 0.055 1.000 Y NA
 3744305 3744306 CLC_2874 CLC_2875 selD   FALSE 0.365 106.000 0.000 1.000 N NA
 3744308 3744309 CLC_2877 CLC_2878     FALSE 0.257 326.000 0.047 NA Y NA
 3744309 3744310 CLC_2878 CLC_2879     TRUE 0.978 16.000 0.231 NA N NA
 3744310 3744311 CLC_2879 CLC_2880     TRUE 0.961 11.000 0.033 NA N NA
 3744311 3744312 CLC_2880 CLC_2881   nadD TRUE 0.926 83.000 0.199 1.000 Y NA
 3744312 3744313 CLC_2881 CLC_2882 nadD   FALSE 0.418 243.000 0.150 NA N NA
 3744313 3744314 CLC_2882 CLC_2883   obg TRUE 0.933 27.000 0.046 NA   NA
 3744314 3744315 CLC_2883 CLC_2884 obg rpmA FALSE 0.135 379.000 0.335 1.000   NA
 3744315 3744316 CLC_2884 CLC_2885 rpmA   TRUE 0.993 3.000 0.203 NA Y NA
 3744316 3744317 CLC_2885 CLC_2886   rplU TRUE 0.993 3.000 0.208 NA Y NA
 3744317 3744318 CLC_2886 CLC_2887 rplU   TRUE 0.876 124.000 0.018 0.017 Y NA
 3744318 3744319 CLC_2887 CLC_2888     TRUE 0.704 158.000 0.180 NA   NA
 3744319 3744320 CLC_2888 CLC_2889     TRUE 0.994 -22.000 0.420 NA   NA
 3744320 3744321 CLC_2889 CLC_2890     TRUE 0.735 113.000 0.098 1.000   NA
 3744321 3744322 CLC_2890 CLC_2891     TRUE 0.912 55.000 0.135 0.006   NA
 3744322 3744323 CLC_2891 CLC_2892   rodA-2 FALSE 0.033 320.000 0.000 1.000 N NA
 3744323 3744324 CLC_2892 CLC_2893 rodA-2 minE TRUE 0.814 99.000 0.008 NA Y NA
 3744324 3744325 CLC_2893 CLC_2894 minE minD TRUE 0.992 14.000 0.347 NA Y NA
 3744325 3744326 CLC_2894 CLC_2895 minD minC TRUE 0.992 18.000 0.368 1.000 Y NA
 3744326 3744327 CLC_2895 CLC_2896 minC   FALSE 0.573 175.000 0.060 1.000   NA
 3744327 3744328 CLC_2896 CLC_2897   mreD TRUE 0.956 20.000 0.089 1.000   NA
 3744328 3744329 CLC_2897 CLC_2898 mreD mreC TRUE 0.992 11.000 0.550 0.002   NA
 3744329 3744330 CLC_2898 CLC_2899 mreC   TRUE 0.992 7.000 0.689 1.000 N NA
 3744330 3744331 CLC_2899 CLC_2900     TRUE 0.944 29.000 0.040 1.000 N NA
 3744331 3744332 CLC_2900 CLC_2901   maf TRUE 0.964 15.000 0.074 NA N NA
 3744332 3744333 CLC_2901 CLC_2902 maf   TRUE 0.936 16.000 0.026 NA   NA
 3744333 3744334 CLC_2902 CLC_2903     TRUE 0.831 110.000 0.357 NA   NA
 3744334 3744335 CLC_2903 CLC_2904     FALSE 0.550 226.000 0.364 NA   NA
 3744337 3744338 CLC_2906 CLC_2907 pheB   TRUE 0.751 57.000 0.020 NA   NA
 3744338 10195471 CLC_2907 CLC_3735     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3744340 3744341 CLC_2909 CLC_2910   coaE TRUE 0.877 39.000 0.058 NA   NA
 3744341 3744342 CLC_2910 CLC_2911 coaE polA TRUE 0.970 12.000 0.068 1.000 N NA
 3744342 3744343 CLC_2911 CLC_2912 polA aroC TRUE 0.935 18.000 0.003 1.000 N NA
 3744343 3744344 CLC_2912 CLC_2913 aroC   FALSE 0.588 142.000 0.002 1.000 N NA
 3744344 3744345 CLC_2913 CLC_2914     TRUE 0.902 147.000 1.000 NA   NA
 3744345 3744346 CLC_2914 CLC_2915     TRUE 0.989 19.000 1.000 NA   NA
 3744346 3744347 CLC_2915 CLC_2916     TRUE 0.801 156.000 0.400 NA   NA
 3744347 3744348 CLC_2916 CLC_2917     FALSE 0.226 74.000 0.000 NA   NA
 3744348 3744349 CLC_2917 CLC_2918     FALSE 0.174 97.000 0.000 NA   NA
 3744349 3744350 CLC_2918 CLC_2919     TRUE 0.670 14.000 0.000 NA   NA
 3744350 3744351 CLC_2919 CLC_2920     FALSE 0.174 98.000 0.000 NA   NA
 3744351 3744352 CLC_2920 CLC_2921     TRUE 0.985 12.000 0.500 NA   NA
 3744352 3744353 CLC_2921 CLC_2922     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3744353 3744354 CLC_2922 CLC_2923     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3744354 3744355 CLC_2923 CLC_2924     TRUE 0.986 15.000 0.600 NA   NA
 3744355 3744356 CLC_2924 CLC_2925     TRUE 0.984 23.000 0.600 NA   NA
 3744356 3744357 CLC_2925 CLC_2926     TRUE 0.989 2.000 0.500 NA   NA
 3744357 3744358 CLC_2926 CLC_2927     TRUE 0.984 15.000 0.500 NA   NA
 3744358 3744359 CLC_2927 CLC_2928     TRUE 0.986 13.000 0.600 NA   NA
 3744359 3744360 CLC_2928 CLC_2929     TRUE 0.992 -13.000 0.400 NA   NA
 3744360 3744361 CLC_2929 CLC_2930     TRUE 0.677 13.000 0.000 NA   NA
 3744361 3744362 CLC_2930 CLC_2931     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3744362 3744363 CLC_2931 CLC_2932     TRUE 0.965 35.000 0.500 NA   NA
 3744363 3744364 CLC_2932 CLC_2933     TRUE 0.988 16.000 0.750 NA   NA
 3744364 3744365 CLC_2933 CLC_2934     TRUE 0.991 5.000 0.750 NA   NA
 3744365 3744366 CLC_2934 CLC_2935     TRUE 0.991 6.000 0.750 NA   NA
 3744366 3744367 CLC_2935 CLC_2936     TRUE 0.991 5.000 0.750 NA   NA
 3744367 3744368 CLC_2936 CLC_2937     TRUE 0.991 0.000 0.500 NA   NA
 3744368 3744369 CLC_2937 CLC_2938     FALSE 0.001 687.000 0.000 NA   NA
 3744369 3744370 CLC_2938 CLC_2939     TRUE 0.762 173.000 0.400 NA   NA
 3744370 3744371 CLC_2939 CLC_2940     TRUE 0.957 57.000 1.000 NA   NA
 3744371 3744372 CLC_2940 CLC_2941     TRUE 0.830 -10.000 0.000 NA   NA
 3744372 3744373 CLC_2941 CLC_2942     FALSE 0.173 118.000 0.000 NA   NA
 3744373 3744374 CLC_2942 CLC_2943     TRUE 0.952 62.000 0.667 0.021   NA
 3744375 3744376 CLC_2944 CLC_2945     FALSE 0.017 302.000 0.000 NA   NA
 3744376 3744377 CLC_2945 CLC_2947     FALSE 0.002 564.000 0.000 NA   NA
 3744377 3744378 CLC_2947 CLC_2948     FALSE 0.004 431.000 0.000 NA   NA
 3744378 3744379 CLC_2948 CLC_2949     TRUE 0.972 13.000 0.200 NA   NA
 3744380 3744381 CLC_2950 CLC_2951     TRUE 0.841 185.000 1.000 NA   NA
 3744381 3744382 CLC_2951 CLC_2952     FALSE 0.040 239.000 0.000 NA   NA
 3744382 3744383 CLC_2952 CLC_2953     TRUE 0.917 57.000 0.400 NA   NA
 3744383 3744384 CLC_2953 CLC_2954     TRUE 0.807 141.000 0.333 NA   NA
 3744386 3744387 CLC_2956 CLC_2957 aspS-2 hisS TRUE 0.961 41.000 0.028 0.032 Y NA
 3744387 3744388 CLC_2957 CLC_2958 hisS   TRUE 0.969 19.000 0.111 1.000 N NA
 3744388 3744389 CLC_2958 CLC_2959     TRUE 0.878 38.000 0.035 1.000   NA
 3744389 3744390 CLC_2959 CLC_2960   dtd TRUE 0.796 61.000 0.048 1.000   NA
 3744390 3744391 CLC_2960 CLC_2961 dtd relA TRUE 0.932 43.000 0.177 1.000 N NA
 3744391 3744392 CLC_2961 CLC_2962 relA apt TRUE 0.746 124.000 0.068 1.000 N NA
 3744392 3744393 CLC_2962 CLC_2963 apt   FALSE 0.589 109.000 0.010 1.000   NA
 3744393 3744394 CLC_2963 CLC_2964   secF FALSE 0.302 229.000 0.028 1.000   NA
 3744394 3744395 CLC_2964 CLC_2965 secF secD TRUE 0.998 2.000 0.516 0.001 Y NA
 3744395 3744396 CLC_2965 CLC_2966 secD   TRUE 0.690 94.000 0.048 1.000   NA
 3744396 3744397 CLC_2966 CLC_2967     TRUE 0.833 157.000 0.540 NA   NA
 3744397 3744398 CLC_2967 CLC_2968     TRUE 0.791 90.000 0.212 NA   NA
 3744398 3744399 CLC_2968 CLC_2969   yajC TRUE 0.820 55.000 0.055 NA   NA
 3744399 3744400 CLC_2969 CLC_2970 yajC tgt FALSE 0.550 180.000 0.035 NA N NA
 3744400 3744401 CLC_2970 CLC_2971 tgt queA TRUE 0.944 56.000 0.014 0.001 Y NA
 3744401 3744402 CLC_2971 CLC_2972 queA ruvB TRUE 0.934 34.000 0.069 1.000 N NA
 3744402 3744403 CLC_2972 CLC_2973 ruvB ruvA TRUE 0.996 20.000 0.549 0.002 Y NA
 3744403 3744404 CLC_2973 CLC_2974 ruvA   FALSE 0.375 182.000 0.007 NA   NA
 3744404 3744405 CLC_2974 CLC_2975     FALSE 0.032 377.000 0.003 NA   NA
 3744405 3744406 CLC_2975 CLC_2976     FALSE 0.518 151.000 0.015 NA   NA
 3744406 3744407 CLC_2976 CLC_2977     TRUE 0.744 16.000 0.000 1.000   NA
 3744407 3744408 CLC_2977 CLC_2978     FALSE 0.257 88.000 0.000 1.000   NA
 3744408 3744409 CLC_2978 CLC_2979     FALSE 0.267 286.000 0.176 1.000   NA
 3744409 3744410 CLC_2979 CLC_2980     TRUE 0.639 150.000 0.071 NA   NA
 3744410 3744411 CLC_2980 CLC_2981     FALSE 0.541 173.000 0.051 NA   NA
 3744411 3744412 CLC_2981 CLC_2982     FALSE 0.530 129.000 0.002 1.000   NA
 3744416 3744417 CLC_2986 CLC_2987     TRUE 0.979 16.000 0.386 NA   NA
 3744417 3744418 CLC_2987 CLC_2988     TRUE 0.977 23.000 0.386 NA   NA
 3744418 3744419 CLC_2988 CLC_2989   sigF FALSE 0.459 202.000 0.078 NA   NA
 3744419 3744420 CLC_2989 CLC_2990 sigF spoIIAB TRUE 0.991 19.000 0.842 1.000 N NA
 3744420 3744421 CLC_2990 CLC_2991 spoIIAB spoIIAA TRUE 0.997 17.000 0.669 0.001 Y NA
 3744421 3744422 CLC_2991 CLC_2992 spoIIAA   FALSE 0.025 301.000 0.000 1.000   NA
 3744424 3744425 CLC_2994 CLC_2995     FALSE 0.224 328.000 0.024 NA Y NA
 3744425 3744426 CLC_2995 CLC_2996     TRUE 0.950 21.000 0.079 NA   NA
 3744426 3744427 CLC_2996 CLC_2997   mviN FALSE 0.078 398.000 0.053 0.003   NA
 3744427 3744428 CLC_2997 CLC_2998 mviN   TRUE 0.954 19.000 0.075 1.000   NA
 3744428 3744429 CLC_2998 CLC_2999     TRUE 0.763 110.000 0.000 0.015 Y NA
 3744429 3744430 CLC_2999 CLC_3000     TRUE 0.667 115.000 0.000 NA Y NA
 3744430 3744431 CLC_3000 CLC_3001     TRUE 0.861 78.000 0.016 NA Y NA
 3744431 3744432 CLC_3001 CLC_3002     TRUE 0.988 19.000 0.146 1.000 Y NA
 3744432 3744433 CLC_3002 CLC_3003     TRUE 0.992 0.000 0.077 1.000 Y NA
 3744433 3744434 CLC_3003 CLC_3004     TRUE 0.976 23.000 0.176 0.015   NA
 3744434 3744435 CLC_3004 CLC_3005     TRUE 0.991 -10.000 0.375 NA   NA
 3744435 3744436 CLC_3005 CLC_3006     TRUE 0.665 15.000 0.000 NA   NA
 3744436 3744437 CLC_3006 CLC_3007     FALSE 0.542 37.000 0.000 1.000   NA
 3744437 3744438 CLC_3007 CLC_3008     TRUE 0.631 31.000 0.000 1.000   NA
 3744438 3744439 CLC_3008 CLC_3009     FALSE 0.238 100.000 0.000 1.000   NA
 3744439 3744440 CLC_3009 CLC_3010     TRUE 0.884 63.000 0.154 0.039   NA
 3744440 3744441 CLC_3010 CLC_3011     TRUE 0.855 130.000 0.035 1.000 Y NA
 3744441 3744442 CLC_3011 CLC_3012     TRUE 0.770 181.000 0.037 1.000 Y NA
 3744442 3744443 CLC_3012 CLC_3013     TRUE 0.948 195.000 1.000 0.003 Y NA
 3744443 3744444 CLC_3013 CLC_3014     FALSE 0.240 69.000 0.000 NA   NA
 3744444 3744445 CLC_3014 CLC_3015     TRUE 0.847 -19.000 0.000 NA   NA
 3744445 3744446 CLC_3015 CLC_3016   galU FALSE 0.365 99.000 0.000 1.000 N NA
 3744446 3744447 CLC_3016 CLC_3017 galU   FALSE 0.448 50.000 0.000 1.000   NA
 3744447 3744448 CLC_3017 CLC_3018     FALSE 0.213 145.000 0.000 1.000   NA
 3744448 3744449 CLC_3018 CLC_3019     FALSE 0.009 986.000 0.002 1.000 N NA
 3744451 3744452 CLC_3021 CLC_3022     FALSE 0.080 198.000 0.000 NA   NA
 3744452 3744453 CLC_3022 CLC_3023     FALSE 0.035 444.000 0.000 1.000 Y NA
 3744453 3744454 CLC_3023 CLC_3024     FALSE 0.042 236.000 0.000 NA   NA
 3744454 3744455 CLC_3024 CLC_3025     FALSE 0.440 188.000 0.031 NA   NA
 3744455 3744456 CLC_3025 CLC_3026     TRUE 0.747 133.000 0.078 1.000 N NA
 3744456 3744457 CLC_3026 CLC_3027     FALSE 0.002 574.000 0.000 NA   NA
 3744459 3744460 CLC_3029 CLC_3030     FALSE 0.100 180.000 0.000 NA   NA
 3744462 3744463 CLC_3032 CLC_3033   pheT FALSE 0.396 205.000 0.038 NA   NA
 3744463 3744464 CLC_3033 CLC_3034 pheT pheS TRUE 0.954 161.000 0.574 0.001 Y NA
 3744464 3744465 CLC_3034 CLC_3035 pheS   FALSE 0.165 348.000 0.006 1.000 Y NA
 3744465 3744466 CLC_3035 CLC_3036     TRUE 0.704 91.000 0.022 1.000 N NA
 3744466 3744467 CLC_3036 CLC_3037     TRUE 0.993 11.000 0.137 0.003 Y NA
 3744467 3744468 CLC_3037 CLC_3038   rplT TRUE 0.622 124.000 0.004 1.000 N NA
 3744468 3744469 CLC_3038 CLC_3039 rplT rpmI TRUE 0.996 30.000 0.928 0.013 Y NA
 3744469 3744470 CLC_3039 CLC_3040 rpmI infC TRUE 0.995 22.000 0.652 1.000 Y NA
 3744470 3744471 CLC_3040 CLC_3041 infC thrS FALSE 0.443 255.000 0.007 1.000 Y NA
 3744471 3744472 CLC_3041 CLC_3042 thrS   FALSE 0.009 348.000 0.000 NA   NA
 3744474 3744475 CLC_3044 CLC_3045     TRUE 0.993 2.000 0.952 NA   NA
 3744476 3744477 CLC_3046 CLC_3047     TRUE 0.700 10.000 0.000 NA   NA
 3744477 3744478 CLC_3047 CLC_3049     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3744478 3744479 CLC_3049 CLC_3051     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3744479 3744480 CLC_3051 CLC_3052     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3744481 3744482 CLC_3053 CLC_3054 hsp33   TRUE 0.915 38.000 0.063 1.000 N NA
 3744482 3744483 CLC_3054 CLC_3055     TRUE 0.721 86.000 0.056 1.000   NA
 3744483 3744484 CLC_3055 CLC_3056     FALSE 0.026 299.000 0.000 1.000   NA
 3744484 3744485 CLC_3056 CLC_3057     TRUE 0.998 0.000 0.444 0.001 Y NA
 3744485 3744486 CLC_3057 CLC_3058     TRUE 0.995 14.000 0.571 1.000 Y NA
 3744486 3744487 CLC_3058 CLC_3059     TRUE 0.991 16.000 0.124 0.026 Y NA
 3744487 3744488 CLC_3059 CLC_3060     TRUE 0.927 81.000 0.093 0.026 Y NA
 3744489 3744490 CLC_3061 CLC_3062 asd dapA TRUE 0.981 23.000 0.029 1.000 Y NA
 3744490 3744491 CLC_3062 CLC_3063 dapA dapB-2 FALSE 0.595 223.000 0.022 1.000 Y NA
 3744494 3744495 CLC_3066 CLC_3067     TRUE 0.735 78.000 0.071 NA   NA
 3744495 3744496 CLC_3067 CLC_3068     FALSE 0.413 199.000 0.034 NA   NA
 3744500 3744501 CLC_3072 CLC_3073 folC valS FALSE 0.037 446.000 0.006 0.098 N NA
 3744501 3744502 CLC_3073 CLC_3074 valS   TRUE 0.974 21.000 0.002 1.000 Y NA
 3744502 3744503 CLC_3074 CLC_3075     FALSE 0.009 454.000 0.000 1.000 N NA
 3744503 3744504 CLC_3075 CLC_3076     TRUE 0.993 3.000 1.000 NA   NA
 3744504 3744505 CLC_3076 CLC_3077     FALSE 0.003 458.000 0.000 NA   NA
 3744506 3744507 CLC_3078 CLC_3079     FALSE 0.075 201.000 0.000 NA   NA
 3744509 3744510 CLC_3081 CLC_3082     TRUE 0.998 -3.000 0.876 1.000 Y NA
 3744510 3744511 CLC_3082 CLC_3083     TRUE 0.633 144.000 0.034 1.000   NA
 3744512 3744513 CLC_3084 CLC_3085   recX TRUE 0.912 25.000 0.012 NA   NA
 3744513 3744514 CLC_3085 CLC_3086 recX   TRUE 0.928 22.000 0.015 1.000   NA
 3744515 3744516 CLC_3087 CLC_3088     TRUE 0.855 38.000 0.029 NA   NA
 3744516 3744517 CLC_3088 CLC_3089     TRUE 0.794 57.000 0.029 1.000   NA
 3744518 3744519 CLC_3090 CLC_3091     TRUE 0.799 42.000 0.011 NA   NA
 3744519 3744520 CLC_3091 CLC_3092   proC FALSE 0.542 128.000 0.011 NA   NA
 3744520 3744521 CLC_3092 CLC_3093 proC   TRUE 0.856 112.000 0.286 1.000 N NA
 3744521 3744522 CLC_3093 CLC_3094     TRUE 0.994 7.000 0.583 0.002 N NA
 3744522 3744523 CLC_3094 CLC_3095     TRUE 0.852 64.000 0.167 1.000   NA
 3744523 3744524 CLC_3095 CLC_3096     FALSE 0.002 635.000 0.000 1.000   NA
 3744524 3744525 CLC_3096 CLC_3097     TRUE 0.795 37.000 0.002 NA   NA
 3744525 3744526 CLC_3097 CLC_3098     TRUE 0.972 12.000 0.182 NA   NA
 3744526 3744527 CLC_3098 CLC_3099     TRUE 0.965 23.000 0.182 NA   NA
 3744528 3744529 CLC_3100 CLC_3101     FALSE 0.240 69.000 0.000 NA   NA
 3744531 3744532 CLC_3103 CLC_3104     TRUE 0.990 3.000 0.583 NA   NA
 3744532 3744533 CLC_3104 CLC_3105     TRUE 0.995 -19.000 0.600 NA   NA
 3744534 3744535 CLC_3106 CLC_3107     FALSE 0.021 358.000 0.000 1.000 N NA
 3744535 3744536 CLC_3107 CLC_3108     TRUE 0.997 13.000 0.714 0.017 Y NA
 3744536 3744537 CLC_3108 CLC_3109   bcd TRUE 0.989 12.000 0.364 0.039 N NA
 3744537 3744538 CLC_3109 CLC_3110 bcd   TRUE 0.890 194.000 0.500 1.000 Y NA
 3744538 3744539 CLC_3110 CLC_3111   hbd TRUE 0.983 25.000 0.054 1.000 Y NA
 3744539 3744540 CLC_3111 CLC_3112 hbd crt TRUE 0.990 31.000 0.486 1.000 Y NA
 3744540 3744541 CLC_3112 CLC_3113 crt   FALSE 0.004 416.000 0.000 NA   NA
 3744541 3744542 CLC_3113 CLC_3114     TRUE 0.900 44.000 0.154 NA   NA
 3744542 3744543 CLC_3114 CLC_3115     FALSE 0.036 276.000 0.000 1.000   NA
 3744543 3744544 CLC_3115 CLC_3116     FALSE 0.007 402.000 0.000 1.000   NA
 3744544 3744545 CLC_3116 CLC_3117     TRUE 0.811 68.000 0.100 1.000   NA
 3744545 3744546 CLC_3117 CLC_3118     FALSE 0.121 165.000 0.000 NA   NA
 3744546 3744547 CLC_3118 CLC_3119   lgt FALSE 0.173 102.000 0.000 NA   NA
 3744547 3744548 CLC_3119 CLC_3120 lgt   FALSE 0.094 209.000 0.000 1.000   NA
 3744548 3744549 CLC_3120 CLC_3121     TRUE 0.799 43.000 0.012 NA   NA
 3744551 3744552 CLC_3123 CLC_3124     FALSE 0.582 195.000 0.080 1.000 N NA
 3744552 3744553 CLC_3124 CLC_3125   pflA FALSE 0.004 642.000 0.000 1.000 N NA
 3744553 3744554 CLC_3125 CLC_3126 pflA pfl TRUE 0.696 180.000 0.163 1.000 N NA
 3744554 3744555 CLC_3126 CLC_3127 pfl   FALSE 0.002 512.000 0.000 NA   NA
 3744555 3744556 CLC_3127 CLC_3128     FALSE 0.004 428.000 0.000 NA   NA
 3744556 3744557 CLC_3128 CLC_3129     FALSE 0.400 167.000 0.002 NA   NA
 3744561 3744562 CLC_3133 CLC_3134     FALSE 0.059 215.000 0.000 NA   NA
 3744562 3744563 CLC_3134 CLC_3135     FALSE 0.320 55.000 0.000 NA   NA
 3744563 3744564 CLC_3135 CLC_3136     FALSE 0.343 52.000 0.000 NA   NA
 3744564 3744565 CLC_3136 CLC_3137     FALSE 0.056 219.000 0.000 NA   NA
 3744565 3744566 CLC_3137 CLC_3138     TRUE 0.902 24.000 0.005 NA   NA
 3744566 3744567 CLC_3138 CLC_3139   lon TRUE 0.954 15.000 0.048 1.000   NA
 3744567 3744568 CLC_3139 CLC_3140 lon lonB TRUE 0.909 138.000 0.072 0.001 Y NA
 3744568 3744569 CLC_3140 CLC_3141 lonB clpX TRUE 0.900 128.000 0.042 0.002 Y NA
 3744569 3744570 CLC_3141 CLC_3142 clpX clpP-2 TRUE 0.979 20.000 0.022 1.000 Y NA
 3744570 3744571 CLC_3142 CLC_3143 clpP-2 tig TRUE 0.844 126.000 0.024 1.000 Y NA
 3744571 3744572 CLC_3143 CLC_3144 tig   FALSE 0.460 178.000 0.005 NA N NA
 3744572 3744573 CLC_3144 CLC_3145     TRUE 0.779 107.000 0.211 NA   NA
 3744573 3744574 CLC_3145 CLC_3146   pyrE FALSE 0.060 214.000 0.000 NA   NA
 3744574 3744575 CLC_3146 CLC_3147 pyrE pyrD TRUE 0.971 34.000 0.060 1.000 Y NA
 3744575 3744576 CLC_3147 CLC_3148 pyrD pyrK TRUE 0.994 0.000 0.592 1.000 N NA
 3744576 3744577 CLC_3148 CLC_3149 pyrK pyrF TRUE 0.828 145.000 0.112 0.002 N NA
 3744577 3744578 CLC_3149 CLC_3150 pyrF pyrC TRUE 0.984 24.000 0.064 1.000 Y NA
 3744578 3744579 CLC_3150 CLC_3151 pyrC pyrI TRUE 0.981 22.000 0.032 1.000 Y NA
 3744579 3744580 CLC_3151 CLC_3152 pyrI pyrB TRUE 0.996 2.000 0.197 0.001 Y NA
 3744580 3744581 CLC_3152 CLC_3153 pyrB   FALSE 0.069 255.000 0.000 NA N NA
 3744581 3744582 CLC_3153 CLC_3154     TRUE 0.938 23.000 0.039 NA   NA
 3744582 3744583 CLC_3154 CLC_3155     FALSE 0.008 360.000 0.000 NA   NA
 3744583 3744584 CLC_3155 CLC_3156     TRUE 0.849 129.000 0.041 NA Y NA
 3744584 3744585 CLC_3156 CLC_3157     TRUE 0.667 112.000 0.053 NA   NA
 3744585 3744586 CLC_3157 CLC_3158     TRUE 0.906 37.000 0.105 NA   NA
 3744586 3744587 CLC_3158 CLC_3159     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3744587 3744588 CLC_3159 CLC_3160     TRUE 0.861 -51.000 0.000 NA   NA
 3744588 3744589 CLC_3160 CLC_3161     TRUE 0.940 52.000 0.500 NA   NA
 3744589 3744590 CLC_3161 CLC_3162     TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3744590 3744591 CLC_3162 CLC_3163     TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3744591 3744592 CLC_3163 CLC_3164     TRUE 0.951 28.000 0.105 1.000   NA
 3744592 3744593 CLC_3164 CLC_3165     TRUE 0.973 18.000 0.263 NA   NA
 3744593 3744594 CLC_3165 CLC_3166     TRUE 0.950 16.000 0.056 NA   NA
 3744594 3744595 CLC_3166 CLC_3167     TRUE 0.974 0.000 0.078 NA   NA
 3744596 3744597 CLC_3168 CLC_3169     TRUE 0.618 26.000 0.000 NA   NA
 3744597 3744598 CLC_3169 CLC_3171     FALSE 0.551 30.000 0.000 NA   NA
 3744598 3744599 CLC_3171 CLC_3172     FALSE 0.604 27.000 0.000 NA   NA
 3744599 3744600 CLC_3172 CLC_3174     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3744600 3744601 CLC_3174 CLC_3175     TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3744601 3744602 CLC_3175 CLC_3176     TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3744602 3744603 CLC_3176 CLC_3178     FALSE 0.247 67.000 0.000 NA   NA
 3744603 3744604 CLC_3178 CLC_3180     TRUE 0.660 16.000 0.000 NA   NA
 3744604 3744605 CLC_3180 CLC_3182     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3744605 3744606 CLC_3182 CLC_3184     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3744606 3744607 CLC_3184 CLC_3185     TRUE 0.660 16.000 0.000 NA   NA
 3744607 3744608 CLC_3185 CLC_3187     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3744608 3744609 CLC_3187 CLC_3188     TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3744609 3744610 CLC_3188 CLC_3189     TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3744610 3744611 CLC_3189 CLC_3191     FALSE 0.247 67.000 0.000 NA   NA
 3744611 3744612 CLC_3191 CLC_3193     TRUE 0.660 16.000 0.000 NA   NA
 3744612 3744613 CLC_3193 CLC_3195     TRUE 0.732 4.000 0.000 NA   NA
 3744613 3744614 CLC_3195 CLC_3197     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3744614 3744615 CLC_3197 CLC_3199     TRUE 0.709 8.000 0.000 NA   NA
 3744615 3744616 CLC_3199 CLC_3200     TRUE 0.713 7.000 0.000 NA   NA
 3744616 3744617 CLC_3200 CLC_3202     TRUE 0.709 8.000 0.000 NA   NA
 3744618 3744619 CLC_3203 CLC_3204     TRUE 0.970 17.000 0.085 0.018   NA
 3744620 3744621 CLC_3205 CLC_3206     TRUE 0.817 113.000 0.300 NA   NA
 3744622 3744623 CLC_3207 CLC_3208   gatB FALSE 0.555 154.000 0.002 1.000 N NA
 3744623 3744624 CLC_3208 CLC_3209 gatB gatA TRUE 0.990 36.000 0.492 0.001 Y NA
 3744624 3744625 CLC_3209 CLC_3210 gatA gatC TRUE 0.992 37.000 0.643 0.001 Y NA
 3744625 3744626 CLC_3210 CLC_3211 gatC   FALSE 0.602 135.000 0.002 1.000 N NA
 3744626 3744627 CLC_3211 CLC_3212     FALSE 0.018 297.000 0.000 NA   NA
 3744627 3744628 CLC_3212 CLC_3213   ligA TRUE 0.766 101.000 0.182 NA   NA
 3744628 3744629 CLC_3213 CLC_3214 ligA pcrA TRUE 0.989 12.000 0.039 0.012 Y NA
 3744629 3744630 CLC_3214 CLC_3215 pcrA   TRUE 0.624 127.000 0.025 1.000   NA
 3744630 3744631 CLC_3215 CLC_3216     FALSE 0.026 298.000 0.000 1.000   NA
 3744631 3744632 CLC_3216 CLC_3217     TRUE 0.682 84.000 0.041 NA   NA
 3744632 3744633 CLC_3217 CLC_3218     TRUE 0.957 14.000 0.083 NA   NA
 3744635 3744636 CLC_3220 CLC_3221   pgi TRUE 0.940 11.000 0.018 NA   NA
 3744636 3744637 CLC_3221 CLC_3222 pgi   FALSE 0.561 84.000 0.005 NA   NA
 3744637 3744638 CLC_3222 CLC_3223     FALSE 0.014 309.000 0.000 NA   NA
 3744639 3744640 CLC_3224 CLC_3225   ldhA-1 FALSE 0.002 544.000 0.000 NA   NA
 3744641 3744642 CLC_3226 CLC_3227 ldhA-2   FALSE 0.002 814.000 0.000 1.000   NA
 3744642 3744643 CLC_3227 CLC_3228     FALSE 0.083 218.000 0.000 1.000   NA
 3744643 3744644 CLC_3228 CLC_3229     TRUE 0.995 18.000 0.400 0.016 Y NA
 3744644 3744645 CLC_3229 CLC_3230     TRUE 0.994 13.000 0.800 0.039 N NA
 3744645 3744646 CLC_3230 CLC_3231   fldC TRUE 0.808 167.000 0.400 NA N NA
 3744646 3744647 CLC_3231 CLC_3232 fldC fldB TRUE 0.996 2.000 0.500 NA Y NA
 3744647 3744648 CLC_3232 CLC_3233 fldB fldI TRUE 0.994 5.000 0.875 NA N NA
 3744648 3744649 CLC_3233 CLC_3234 fldI fldA TRUE 0.992 0.000 0.429 NA N NA
 3744649 3744650 CLC_3234 CLC_3235 fldA   TRUE 0.963 54.000 0.500 0.032 N NA
 3744650 3744651 CLC_3235 CLC_3236     FALSE 0.008 466.000 0.000 1.000 N NA
 3744651 3744652 CLC_3236 CLC_3237   guaA FALSE 0.008 459.000 0.000 1.000 N NA
 3744652 3744653 CLC_3237 CLC_3238 guaA guaB TRUE 0.994 13.000 0.190 0.001 Y NA
 3744655 3744656 CLC_3240 CLC_3241 groL groES TRUE 0.995 30.000 0.674 0.004 Y NA
 3744658 3744659 CLC_3242 CLC_3244     FALSE 0.003 453.000 0.000 NA   NA
 3744659 3744660 CLC_3244 CLC_3245     FALSE 0.510 173.000 0.024 1.000   NA
 3744660 3744661 CLC_3245 CLC_3246   gltA-2 TRUE 0.637 150.000 0.018 1.000 N NA
 3744661 3744662 CLC_3246 CLC_3247 gltA-2   TRUE 0.996 0.000 0.667 0.038 N NA
 3744662 3744663 CLC_3247 CLC_3248     FALSE 0.067 231.000 0.000 1.000   NA
 3744665 3744666 CLC_3250 CLC_3251     TRUE 0.997 1.000 0.444 0.014 Y NA
 3744668 3744669 CLC_3253 CLC_3254   pyc FALSE 0.009 381.000 0.000 1.000   NA
 3744669 3744670 CLC_3254 CLC_3255 pyc   FALSE 0.008 460.000 0.000 1.000 N NA
 3744671 3744672 CLC_3256 CLC_3257     FALSE 0.042 236.000 0.000 NA   NA
 3744675 3744676 CLC_3261 CLC_3262     FALSE 0.262 63.000 0.000 NA   NA
 3744676 3744677 CLC_3262 CLC_3263     TRUE 0.660 16.000 0.000 NA   NA
 3744678 3744679 CLC_3264 CLC_3265     FALSE 0.517 138.000 0.007 NA   NA
 3744679 3744680 CLC_3265 CLC_3266     TRUE 0.985 -3.000 0.217 NA   NA
 3744680 3744681 CLC_3266 CLC_3267   rimI TRUE 0.985 -7.000 0.127 1.000   NA
 3744682 3744683 CLC_3268 CLC_3269 tyrS-2   FALSE 0.044 233.000 0.000 NA   NA
 3744683 3744684 CLC_3269 CLC_3270     TRUE 0.657 136.000 0.062 NA   NA
 3744684 3744685 CLC_3270 CLC_3271     FALSE 0.568 148.000 0.025 NA   NA
 3744685 3744686 CLC_3271 CLC_3272     FALSE 0.197 83.000 0.000 NA   NA
 3744690 3744691 CLC_3276 CLC_3277 trpS   FALSE 0.102 179.000 0.000 NA   NA
 3744691 3744692 CLC_3277 CLC_3278     FALSE 0.018 297.000 0.000 NA   NA
 3744694 3744695 CLC_3280 CLC_3281 cgs lysA FALSE 0.193 265.000 0.003 1.000 N NA
 3744695 3744696 CLC_3281 CLC_3282 lysA lysC TRUE 0.980 16.000 0.016 1.000 Y NA
 3744696 3744697 CLC_3282 CLC_3283 lysC   FALSE 0.054 396.000 0.000 1.000 Y NA
 3744698 3744699 CLC_3284 CLC_3285     TRUE 0.688 137.000 0.069 1.000   NA
 3744700 3744701 CLC_3286 CLC_3287   ftsH-1 TRUE 0.988 21.000 0.583 0.096   NA
 3744701 3744702 CLC_3287 CLC_3288 ftsH-1   FALSE 0.019 427.000 0.000 0.015 N NA
 3744702 3744703 CLC_3288 CLC_3289   proS FALSE 0.182 201.000 0.000 1.000 N NA
 3744703 3744704 CLC_3289 CLC_3290 proS   FALSE 0.010 427.000 0.000 1.000 N NA
 3744704 3744705 CLC_3290 CLC_3291     TRUE 0.646 18.000 0.000 NA   NA
 3744705 3744706 CLC_3291 CLC_3292     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 3744706 3744707 CLC_3292 CLC_3293     FALSE 0.149 214.000 0.000 1.000 N NA
 3744707 3744708 CLC_3293 CLC_3294     TRUE 0.996 23.000 1.000 1.000 Y NA
 3744708 3744709 CLC_3294 CLC_3295     FALSE 0.526 265.000 0.667 NA   NA
 3744709 3744710 CLC_3295 CLC_3296     TRUE 0.990 5.000 0.667 NA   NA
 3744712 3744713 CLC_3298 CLC_3299     FALSE 0.007 367.000 0.000 NA   NA
 3744713 3744714 CLC_3299 CLC_3300     FALSE 0.279 307.000 0.400 NA   NA
 3744714 3744715 CLC_3300 CLC_3301     TRUE 0.964 60.000 0.400 NA Y NA
 3744715 3744716 CLC_3301 CLC_3302     FALSE 0.390 242.000 0.000 0.007 Y NA
 3744716 3744717 CLC_3302 CLC_3303     TRUE 0.912 120.000 0.429 0.009 N NA
 3744717 3744718 CLC_3303 CLC_3304     TRUE 0.808 125.000 0.071 0.009 N NA
 3744718 3744719 CLC_3304 CLC_3305     TRUE 0.899 82.000 0.071 1.000 Y NA
 3744719 3744720 CLC_3305 CLC_3306     FALSE 0.022 356.000 0.000 1.000 N NA
 3744722 3744723 CLC_3308 CLC_3309 speD   FALSE 0.139 154.000 0.000 NA   NA
 3744723 3744724 CLC_3309 CLC_3310     FALSE 0.002 522.000 0.000 NA   NA
 3744724 3744725 CLC_3310 CLC_3311     FALSE 0.002 496.000 0.000 NA   NA
 3744725 3744726 CLC_3311 CLC_3312   rumA-2 FALSE 0.003 990.000 0.000 1.000 N NA
 3744726 3744727 CLC_3312 CLC_3313 rumA-2   FALSE 0.044 233.000 0.000 NA   NA
 3744727 3744728 CLC_3313 CLC_3314     FALSE 0.012 327.000 0.000 NA   NA
 3744728 3744729 CLC_3314 CLC_3315   pykA TRUE 0.669 144.000 0.057 1.000   NA
 3744729 3744730 CLC_3315 CLC_3316 pykA pfkA TRUE 0.973 34.000 0.015 0.002 Y NA
 3744730 3744731 CLC_3316 CLC_3317 pfkA dnaE FALSE 0.319 242.000 0.029 1.000 N NA
 3744731 3744732 CLC_3317 CLC_3318 dnaE   FALSE 0.495 163.000 0.010 1.000   NA
 3744732 3744733 CLC_3318 CLC_3319     TRUE 0.986 7.000 0.470 NA   NA
 3744733 3744734 CLC_3319 CLC_3320     TRUE 0.987 -3.000 0.259 NA   NA
 3744734 3744735 CLC_3320 CLC_3321   murB TRUE 0.690 120.000 0.080 NA   NA
 3744735 3744736 CLC_3321 CLC_3322 murB   TRUE 0.740 69.000 0.009 1.000 N NA
 3744736 3744737 CLC_3322 CLC_3323   uvrC TRUE 0.865 49.000 0.004 0.042 N NA
 3744737 3744738 CLC_3323 CLC_3324 uvrC   TRUE 0.916 14.000 0.005 NA   NA
 3744738 3744739 CLC_3324 CLC_3325     FALSE 0.401 187.000 0.017 NA   NA
 3744739 3744740 CLC_3325 CLC_3326     TRUE 0.938 28.000 0.053 1.000   NA
 3744740 3744741 CLC_3326 CLC_3327     TRUE 0.987 5.000 0.285 1.000 N NA
 3744741 3744742 CLC_3327 CLC_3328     TRUE 0.954 11.000 0.047 NA   NA
 3744742 3744743 CLC_3328 CLC_3329   uvrA FALSE 0.529 99.000 0.005 NA   NA
 3744743 3744744 CLC_3329 CLC_3330 uvrA uvrB TRUE 0.992 19.000 0.154 0.001 Y NA
 3744744 3744745 CLC_3330 CLC_3331 uvrB   TRUE 0.957 2.000 0.013 1.000   NA
 3744745 3744746 CLC_3331 CLC_3332     TRUE 0.789 89.000 0.060 0.007   NA
 3744746 3744747 CLC_3332 CLC_3333     FALSE 0.401 210.000 0.015 1.000 N NA
 3744747 3744748 CLC_3333 CLC_3334     TRUE 0.997 -10.000 0.431 1.000 Y NA
 3744748 3744749 CLC_3334 CLC_3335     FALSE 0.482 156.000 0.010 NA   NA
 3744749 3744750 CLC_3335 CLC_3336     TRUE 0.791 93.000 0.222 NA   NA
 3744750 3744751 CLC_3336 CLC_3337     FALSE 0.490 214.000 0.167 NA   NA
 3744751 3744752 CLC_3337 CLC_3338     TRUE 0.996 0.000 0.180 0.001 Y NA
 3744752 3744753 CLC_3338 CLC_3339     FALSE 0.247 263.000 0.019 1.000 N NA
 3744753 3744754 CLC_3339 CLC_3340     TRUE 0.987 -43.000 0.039 1.000 N NA
 3744754 3744755 CLC_3340 CLC_3341   alr-3 TRUE 0.895 139.000 0.571 1.000 N NA
 3744755 3744756 CLC_3341 CLC_3342 alr-3   TRUE 0.979 28.000 0.068 NA Y NA
 3744756 3744757 CLC_3342 CLC_3343     FALSE 0.517 200.000 0.064 NA N NA
 3744757 3744758 CLC_3343 CLC_3344   acpS TRUE 0.973 -3.000 0.020 NA N NA
 3744758 3744759 CLC_3344 CLC_3345 acpS   FALSE 0.596 115.000 0.020 NA   NA
 3744759 3744760 CLC_3345 CLC_3346     TRUE 0.705 9.000 0.000 NA   NA
 3744760 3744761 CLC_3346 CLC_3347     FALSE 0.010 334.000 0.000 NA   NA
 3744761 3744762 CLC_3347 CLC_3348     FALSE 0.023 305.000 0.000 1.000   NA
 3744762 3744763 CLC_3348 CLC_3349     FALSE 0.130 160.000 0.000 NA   NA
 3744763 3744764 CLC_3349 CLC_3350   rpsD-1 FALSE 0.145 253.000 0.002 NA   NA
 3744766 3744767 CLC_3352 CLC_3353     FALSE 0.044 233.000 0.000 NA   NA
 3744769 3744770 CLC_3355 CLC_3356 glmS   FALSE 0.005 603.000 0.000 1.000 N NA
 3744770 3744771 CLC_3356 CLC_3357     TRUE 0.916 19.000 0.005 1.000   NA
 3744771 3744772 CLC_3357 CLC_3358   srlD TRUE 0.959 24.000 0.040 0.043   NA
 3744772 3744773 CLC_3358 CLC_3359 srlD   TRUE 0.964 20.000 0.080 1.000 N NA
 3744773 3744774 CLC_3359 CLC_3360     TRUE 0.788 216.000 0.133 0.007 Y NA
 3744774 3744775 CLC_3360 CLC_3361     TRUE 0.995 13.000 0.349 0.007 Y NA
 3744775 3744776 CLC_3361 CLC_3362   gutM TRUE 0.912 43.000 0.116 NA N NA
 3744776 3744777 CLC_3362 CLC_3363 gutM   TRUE 0.982 14.000 0.333 NA N NA
 3744777 3744778 CLC_3363 CLC_3364     TRUE 0.936 35.000 0.091 1.000 N NA
 3744778 3744779 CLC_3364 CLC_3365   glmM FALSE 0.022 355.000 0.000 1.000 N NA
 3744779 3744780 CLC_3365 CLC_3366 glmM   FALSE 0.161 135.000 0.000 NA   NA
 3744780 3744781 CLC_3366 CLC_3367     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3744781 3744782 CLC_3367 CLC_3368     TRUE 0.973 16.000 0.075 0.001   NA
 3744782 3744783 CLC_3368 CLC_3369     TRUE 0.791 102.000 0.200 1.000   NA
 3744783 3744784 CLC_3369 CLC_3370   buk-1 FALSE 0.341 263.000 0.163 1.000   NA
 3744784 3744785 CLC_3370 CLC_3371 buk-1 ptb TRUE 0.988 29.000 0.275 1.000 Y NA
 3744785 3744786 CLC_3371 CLC_3372 ptb buk-2 TRUE 0.995 -7.000 0.118 1.000 Y NA
 3744786 3744787 CLC_3372 CLC_3373 buk-2   FALSE 0.575 101.000 0.007 1.000   NA
 3744787 3744788 CLC_3373 CLC_3374     TRUE 0.971 2.000 0.083 NA   NA
 3744788 3744789 CLC_3374 CLC_3375     TRUE 0.995 -30.000 0.502 NA   NA
 3744791 3744792 CLC_3377 CLC_3378   trx TRUE 0.909 66.000 0.429 1.000   NA
 3744792 3744793 CLC_3378 CLC_3379 trx iadA TRUE 0.642 109.000 0.025 1.000   NA
 3744793 3744794 CLC_3379 CLC_3380 iadA   TRUE 0.708 75.000 0.025 1.000   NA
 3744794 3744795 CLC_3380 CLC_3381     TRUE 0.969 28.000 0.333 NA   NA
 3744795 3744796 CLC_3381 CLC_3382   ptsI TRUE 0.682 103.000 0.069 NA   NA
 3744798 3744799 CLC_3384 CLC_3385     TRUE 0.664 70.000 0.006 1.000   NA
 3744799 3744800 CLC_3385 CLC_3386     TRUE 0.948 101.000 0.262 0.001 Y NA
 3744800 3744801 CLC_3386 CLC_3387     TRUE 0.679 141.000 0.026 1.000 N NA
 3744801 3744802 CLC_3387 CLC_3388     FALSE 0.073 266.000 0.000 1.000 N NA
 3744802 3744803 CLC_3388 CLC_3389   rpsI FALSE 0.041 306.000 0.000 1.000 N NA
 3744803 3744804 CLC_3389 CLC_3390 rpsI rplM TRUE 0.995 26.000 0.601 0.013 Y NA
 3744804 3744805 CLC_3390 CLC_3391 rplM truA-2 TRUE 0.854 124.000 0.031 1.000 Y NA
 3744805 3744806 CLC_3391 CLC_3392 truA-2   TRUE 0.992 0.000 0.404 1.000 N NA
 3744806 3744807 CLC_3392 CLC_3393     TRUE 0.996 -3.000 0.304 1.000 Y NA
 3744807 3744808 CLC_3393 CLC_3394     TRUE 0.999 -15.000 0.713 0.025 Y NA
 3744808 3744809 CLC_3394 CLC_3395   rplQ TRUE 0.770 91.000 0.074 1.000 N NA
 3744809 3744810 CLC_3395 CLC_3396 rplQ rpoA TRUE 0.975 44.000 0.873 1.000 N NA
 3744810 3744811 CLC_3396 CLC_3397 rpoA rpsD-2 TRUE 0.933 68.000 0.549 1.000 N NA
 3744811 3744812 CLC_3397 CLC_3398 rpsD-2 rpsK TRUE 0.991 35.000 0.509 0.017 Y NA
 3744812 3744813 CLC_3398 CLC_3399 rpsK rpsM TRUE 0.997 18.000 0.810 0.013 Y NA
 3744813 3744814 CLC_3399 CLC_3400 rpsM rpmJ TRUE 0.839 113.000 0.194 0.013   NA
 3744814 3744815 CLC_3400 CLC_3401 rpmJ infA TRUE 0.976 17.000 0.257 1.000   NA
 3744815 3744816 CLC_3401 CLC_3402 infA   TRUE 0.965 8.000 0.090 NA   NA
 3744816 3744817 CLC_3402 CLC_3403   map-1 TRUE 0.969 15.000 0.185 NA   NA
 3744817 3744818 CLC_3403 CLC_3404 map-1 adk TRUE 0.990 0.000 0.290 1.000 N NA
 3744818 3744819 CLC_3404 CLC_3405 adk secY TRUE 0.978 24.000 0.241 1.000 N NA
 3744819 3744820 CLC_3405 CLC_3406 secY rplO TRUE 0.994 1.000 0.730 1.000 N NA
 3744820 3744821 CLC_3406 CLC_3407 rplO rpmD TRUE 0.996 20.000 0.653 0.002 Y NA
 3744821 3744822 CLC_3407 CLC_3408 rpmD rpsE TRUE 0.997 14.000 0.789 0.017 Y NA
 3744822 3744823 CLC_3408 CLC_3409 rpsE rplR TRUE 0.997 18.000 0.814 0.017 Y NA
 3744823 3744824 CLC_3409 CLC_3410 rplR rplF TRUE 0.997 19.000 0.815 0.013 Y NA
 3744824 3744825 CLC_3410 CLC_3411 rplF rpsH TRUE 0.996 24.000 0.808 0.013 Y NA
 3744825 3744826 CLC_3411 CLC_3412 rpsH rpsN TRUE 0.993 30.000 0.473 0.013 Y NA
 3744826 3744827 CLC_3412 CLC_3413 rpsN rplE TRUE 0.995 17.000 0.496 0.013 Y NA
 3744827 3744828 CLC_3413 CLC_3414 rplE rplX TRUE 0.988 23.000 0.057 0.013 Y NA
 3744828 3744829 CLC_3414 CLC_3415 rplX rplN TRUE 0.988 24.000 0.071 0.017 Y NA
 3744829 3744830 CLC_3415 CLC_3416 rplN rpsQ TRUE 0.993 35.000 0.791 0.017 Y NA
 3744830 3744831 CLC_3416 CLC_3417 rpsQ rpmC TRUE 0.997 22.000 0.828 0.013 Y NA
 3744831 3744832 CLC_3417 CLC_3418 rpmC rplP TRUE 0.999 -10.000 0.802 0.013 Y NA
 3744832 3744833 CLC_3418 CLC_3419 rplP rpsC TRUE 0.997 18.000 0.828 0.017 Y NA
 3744833 3744834 CLC_3419 CLC_3420 rpsC rplV TRUE 0.996 18.000 0.719 0.017 Y NA
 3744834 3744835 CLC_3420 CLC_3421 rplV rpsS TRUE 0.996 22.000 0.769 0.017 Y NA
 3744835 3744836 CLC_3421 CLC_3422 rpsS rplB TRUE 0.981 70.000 0.820 0.017 Y NA
 3744836 3744837 CLC_3422 CLC_3423 rplB rplW TRUE 0.988 55.000 0.849 0.017 Y NA
 3744837 3744838 CLC_3423 CLC_3424 rplW rplD TRUE 0.997 0.000 0.307 0.013 Y NA
 3744838 3744839 CLC_3424 CLC_3425 rplD rplC TRUE 0.995 25.000 0.544 0.013 Y NA
 3744839 3744840 CLC_3425 CLC_3426 rplC rpsJ TRUE 0.961 90.000 0.467 0.017 Y NA
 3744840 3744841 CLC_3426 CLC_3427 rpsJ tuf-1 FALSE 0.255 397.000 0.318 1.000 Y NA
 3744841 3744842 CLC_3427 CLC_3428 tuf-1 fusA-1 TRUE 0.987 40.000 0.400 0.001 Y NA
 3744842 3744843 CLC_3428 CLC_3429 fusA-1 rpsG TRUE 0.970 66.000 0.579 1.000 Y NA
 3744843 3744844 CLC_3429 CLC_3430 rpsG rpsL TRUE 0.921 161.000 0.224 0.002 Y NA
 3744844 3744845 CLC_3430 CLC_3431 rpsL   TRUE 0.955 76.000 0.239 0.017 Y NA
 3744845 3744846 CLC_3431 CLC_3432   rpoC TRUE 0.743 125.000 0.065 1.000 N NA
 3744846 3744847 CLC_3432 CLC_3433 rpoC rpoB TRUE 0.997 21.000 0.851 0.001 Y NA
 3744847 3744848 CLC_3433 CLC_3434 rpoB rplL FALSE 0.420 265.000 0.223 1.000 N NA
 3744848 3744849 CLC_3434 CLC_3435 rplL rplJ TRUE 0.987 47.000 0.884 1.000 Y NA
 3744849 3744850 CLC_3435 CLC_3436 rplJ rplA TRUE 0.836 202.000 0.302 1.000 Y NA
 3744850 3744851 CLC_3436 CLC_3437 rplA rplK TRUE 0.986 57.000 0.838 0.017 Y NA
 3744851 3744852 CLC_3437 CLC_3438 rplK nusG TRUE 0.941 71.000 0.681 1.000 N NA
 3744852 3744853 CLC_3438 CLC_3439 nusG secE TRUE 0.972 47.000 0.843 1.000 N NA
 3744853 3744854 CLC_3439 CLC_3440 secE rpmG TRUE 0.901 50.000 0.100 1.000 N NA
 3744854 3744855 CLC_3440 CLC_3441 rpmG tuf-2 TRUE 0.757 202.000 0.099 1.000 Y NA
 3744856 3744857 CLC_3442 CLC_3444     TRUE 0.639 19.000 0.000 NA   NA
 3744858 3744859 CLC_3445 CLC_3446 sigH   TRUE 0.872 74.000 0.361 NA   NA
 3744859 3744860 CLC_3446 CLC_3447     TRUE 0.972 3.000 0.109 NA   NA
 3744860 3744861 CLC_3447 CLC_3448   thyX TRUE 0.971 3.000 0.032 1.000 N NA
 3744861 3744862 CLC_3448 CLC_3449 thyX   TRUE 0.981 -10.000 0.055 1.000   NA
 3744862 3744863 CLC_3449 CLC_3450   cysS TRUE 0.893 49.000 0.129 1.000   NA
 3744863 3744864 CLC_3450 CLC_3451 cysS ilvA TRUE 0.913 29.000 0.003 1.000 N NA
 3744864 3744865 CLC_3451 CLC_3452 ilvA   TRUE 0.713 72.000 0.004 1.000 N NA
 3744865 3744866 CLC_3452 CLC_3453   ispD TRUE 0.625 111.000 0.002 1.000 N NA
 3744866 3744867 CLC_3453 CLC_3454 ispD   TRUE 0.977 2.000 0.134 NA   NA
 3744869 3744870 CLC_3456 CLC_3457   radA TRUE 0.959 19.000 0.126 NA   NA
 3744870 3744871 CLC_3457 CLC_3458 radA clpC TRUE 0.868 120.000 0.009 0.015 Y NA
 3744871 3744872 CLC_3458 CLC_3459 clpC   TRUE 0.983 2.000 0.129 1.000 N NA
 3744872 3744873 CLC_3459 CLC_3460     TRUE 0.993 5.000 0.848 1.000   NA
 3744873 3744874 CLC_3460 CLC_3461   ctsR TRUE 0.986 23.000 0.681 NA   NA
 3744874 3744875 CLC_3461 CLC_3462 ctsR   FALSE 0.005 396.000 0.000 NA   NA
 3744875 3744876 CLC_3462 CLC_3463   fusA-2 FALSE 0.059 347.000 0.021 NA   NA
 3744877 3744878 CLC_3465 CLC_3467     FALSE 0.587 28.000 0.000 NA   NA
 3744879 3744880 CLC_3468 CLC_3469 rrfH rrlH FALSE 0.178 93.000 0.000 NA   NA
 3744883 3744884 CLC_3473 CLC_3648     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3744885 3744886 CLC_3477 CLC_3478 rrfI rrlI FALSE 0.177 94.000 0.000 NA   NA
 3744886 3744887 CLC_3478 CLC_3479 rrlI rrsI FALSE 0.053 222.000 0.000 NA   NA
 3744887 3744888 CLC_3479 CLC_3480 rrsI murD FALSE 0.002 571.000 0.000 NA   NA
 3744888 3744889 CLC_3480 CLC_3481 murD glyS FALSE 0.014 826.000 0.002 0.094 N NA
 3744889 3744890 CLC_3481 CLC_3482 glyS lysS FALSE 0.151 320.000 0.000 0.094 Y NA
 3744890 3744891 CLC_3482 CLC_3483 lysS greA-2 TRUE 0.967 19.000 0.098 1.000 N NA
 3744891 3744892 CLC_3483 CLC_3484 greA-2   FALSE 0.585 131.000 0.023 NA   NA
 3744892 3744893 CLC_3484 CLC_3485     TRUE 0.746 50.000 0.005 NA   NA
 3744893 3744894 CLC_3485 CLC_3486     TRUE 0.970 10.000 0.054 1.000 N NA
 3744894 3744895 CLC_3486 CLC_3487   fhs FALSE 0.597 155.000 0.011 1.000 N NA
 3744895 3744896 CLC_3487 CLC_3488 fhs ftsH-2 FALSE 0.256 203.000 0.000 0.094 N NA
 3744896 3744897 CLC_3488 CLC_3489 ftsH-2 hpt-2 TRUE 0.844 82.000 0.180 1.000 N NA
 3744897 3744898 CLC_3489 CLC_3490 hpt-2 tilS TRUE 0.993 -16.000 0.137 0.030 N NA
 3744898 3744899 CLC_3490 CLC_3491 tilS spoIIE TRUE 0.691 149.000 0.041 1.000 N NA
 3744900 3744901 CLC_3493 CLC_3495     TRUE 0.695 11.000 0.000 NA   NA
 3744901 3744902 CLC_3495 CLC_3649     FALSE 0.330 54.000 0.000 NA   NA
 3744902 3744903 CLC_3649 CLC_3498     FALSE 0.330 54.000 0.000 NA   NA
 3744903 3744904 CLC_3498 CLC_3500     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3744904 3744905 CLC_3500 CLC_3502     FALSE 0.517 32.000 0.000 NA   NA
 3744905 3744906 CLC_3502 CLC_3504     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3744906 3744907 CLC_3504 CLC_3506     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3744908 3744909 CLC_3507 CLC_3508     TRUE 0.863 62.000 0.179 1.000   NA
 3744909 3744910 CLC_3508 CLC_3509     TRUE 0.819 95.000 0.303 NA   NA
 3744910 3744911 CLC_3509 CLC_3510   yabP TRUE 0.988 15.000 0.774 NA   NA
 3744911 3744912 CLC_3510 CLC_3511 yabP   TRUE 0.716 120.000 0.108 NA   NA
 3744912 3744913 CLC_3511 CLC_3512   hup TRUE 0.762 74.000 0.024 1.000 N NA
 3744913 3744914 CLC_3512 CLC_3513 hup   FALSE 0.588 128.000 0.014 1.000   NA
 3744914 3744915 CLC_3513 CLC_3514   spoVB-2 TRUE 0.937 15.000 0.015 1.000   NA
 3744915 3744916 CLC_3514 CLC_3515 spoVB-2   TRUE 0.703 133.000 0.108 NA   NA
 3744916 3744917 CLC_3515 CLC_3516   prsA-1 FALSE 0.548 199.000 0.088 NA N NA
 3744917 3744918 CLC_3516 CLC_3517 prsA-1 mfd TRUE 0.707 84.000 0.016 1.000 N NA
 3744918 3744919 CLC_3517 CLC_3518 mfd pth TRUE 0.965 28.000 0.137 1.000 N NA
 3744919 3744920 CLC_3518 CLC_3519 pth   TRUE 0.654 110.000 0.009 1.000 N NA
 3744920 3744921 CLC_3519 CLC_3520     TRUE 0.937 35.000 0.095 1.000 N NA
 3744921 3744922 CLC_3520 CLC_3521     TRUE 0.997 1.000 0.653 1.000 Y NA
 3744922 3744923 CLC_3521 CLC_3522   prs TRUE 0.672 180.000 0.123 1.000 N NA
 3744923 3744924 CLC_3522 CLC_3523 prs glmU TRUE 0.963 21.000 0.069 1.000 N NA
 3744924 3744925 CLC_3523 CLC_3524 glmU spoVG TRUE 0.778 162.000 0.011 1.000 Y NA
 3744925 3744926 CLC_3524 CLC_3525 spoVG purR TRUE 0.777 103.000 0.099 1.000 N NA
 3744927 3744928 CLC_3526 CLC_3527 murC   TRUE 0.642 65.000 0.004 NA   NA
 3744928 3744929 CLC_3527 CLC_3528     FALSE 0.210 78.000 0.000 NA   NA
 3744929 3744930 CLC_3528 CLC_3530     FALSE 0.178 93.000 0.000 NA   NA
 3744930 3744931 CLC_3530 CLC_3531     TRUE 0.793 86.000 0.156 1.000   NA
 3744931 3744932 CLC_3531 CLC_3532     FALSE 0.187 275.000 0.044 NA   NA
 3744933 3744934 CLC_3533 CLC_3534     TRUE 0.874 45.000 0.067 1.000   NA
 3744934 3744935 CLC_3534 CLC_3535     TRUE 0.760 68.000 0.058 NA   NA
 3744936 3744937 CLC_3536 CLC_3537     TRUE 0.932 33.000 0.133 NA   NA
 3744938 3744939 CLC_3538 CLC_3539     FALSE 0.043 303.000 0.000 1.000 N NA
 3744939 3744940 CLC_3539 CLC_3540     TRUE 0.939 15.000 0.028 NA   NA
 3744940 3744941 CLC_3540 CLC_3541     TRUE 0.935 18.000 0.030 NA   NA
 3744941 3744942 CLC_3541 CLC_3542   murI FALSE 0.610 147.000 0.007 1.000 N NA
 3744945 3744946 CLC_3545 CLC_3546 murA-2   TRUE 0.947 26.000 0.058 1.000   NA
 3744946 3744947 CLC_3546 CLC_3547     TRUE 0.926 17.000 0.016 NA   NA
 3744947 3744948 CLC_3547 CLC_3548     TRUE 0.979 15.000 0.357 NA   NA
 3744948 3744949 CLC_3548 CLC_3549     FALSE 0.381 179.000 0.005 NA   NA
 3744950 3744951 CLC_3550 CLC_3551     FALSE 0.018 298.000 0.000 NA   NA
 3744951 3744952 CLC_3551 CLC_3552     TRUE 0.963 36.000 0.500 NA   NA
 3744953 3744954 CLC_3553 CLC_3554     FALSE 0.358 247.000 0.000 0.043 Y NA
 3744954 3744955 CLC_3554 CLC_3555   map-2 TRUE 0.938 32.000 0.059 1.000 N NA
 3744957 3744958 CLC_3557 CLC_3558     TRUE 0.995 -7.000 0.810 NA   NA
 3744958 3744959 CLC_3558 CLC_3559     FALSE 0.004 416.000 0.000 NA   NA
 3744959 3744960 CLC_3559 CLC_3560     TRUE 0.964 3.000 0.053 NA   NA
 3744960 3744961 CLC_3560 CLC_3561     TRUE 0.996 1.000 0.237 0.001 Y NA
 3744961 3744962 CLC_3561 CLC_3562     TRUE 0.981 9.000 0.260 1.000   NA
 3744962 3744963 CLC_3562 CLC_3563     FALSE 0.020 315.000 0.000 1.000   NA
 3744963 3744964 CLC_3563 CLC_3564     FALSE 0.045 300.000 0.000 1.000 N NA
 3744966 3744967 CLC_3566 CLC_3567     TRUE 0.782 107.000 0.220 NA   NA
 3744967 3744968 CLC_3567 CLC_3568     FALSE 0.464 181.000 0.031 NA   NA
 3744968 3744969 CLC_3568 CLC_3569     TRUE 0.676 88.000 0.031 1.000   NA
 3744970 3744971 CLC_3570 CLC_3571     TRUE 0.936 29.000 0.025 1.000 N NA
 3744971 3744972 CLC_3571 CLC_3572   accA FALSE 0.397 200.000 0.003 1.000 N NA
 3744972 3744973 CLC_3572 CLC_3573 accA accD TRUE 0.979 47.000 0.234 0.001 Y NA
 3744973 3744974 CLC_3573 CLC_3574 accD accC TRUE 0.990 20.000 0.090 0.001 Y NA
 3744974 3744975 CLC_3574 CLC_3575 accC fabZ TRUE 0.975 32.000 0.077 1.000 Y NA
 3744975 3744976 CLC_3575 CLC_3576 fabZ accB TRUE 0.988 20.000 0.058 0.004 Y NA
 3744976 3744977 CLC_3576 CLC_3577 accB fabF TRUE 0.990 4.000 0.074 1.000 Y NA
 3744977 3744978 CLC_3577 CLC_3578 fabF fabG-2 TRUE 0.949 20.000 0.000 1.000 Y NA
 3744978 3744979 CLC_3578 CLC_3579 fabG-2 fabD TRUE 0.968 18.000 0.000 0.004 Y NA
 3744979 3744980 CLC_3579 CLC_3580 fabD   TRUE 0.959 21.000 0.099 1.000   NA
 3744980 3744981 CLC_3580 CLC_3581   acpP-2 TRUE 0.788 126.000 0.216 1.000   NA
 3744981 3744982 CLC_3581 CLC_3582 acpP-2 fabH TRUE 0.935 41.000 0.121 0.004   NA
 3744982 3744983 CLC_3582 CLC_3583 fabH   TRUE 0.986 -7.000 0.098 1.000 N NA
 3744983 3744984 CLC_3583 CLC_3584     TRUE 0.947 16.000 0.032 1.000   NA
 3744984 3744985 CLC_3584 CLC_3585     FALSE 0.580 97.000 0.007 1.000   NA
 3744986 3744987 CLC_3586 CLC_3587     TRUE 0.993 -7.000 0.083 NA Y NA
 3744987 3744988 CLC_3587 CLC_3650     FALSE 0.182 91.000 0.000 NA   NA
 3744988 3744989 CLC_3650 CLC_3651     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3744989 3744990 CLC_3651 CLC_3652     TRUE 0.700 10.000 0.000 NA   NA
 3744990 3744991 CLC_3652 CLC_3653     TRUE 0.646 18.000 0.000 NA   NA
 3744991 3744992 CLC_3653 CLC_3654     FALSE 0.292 58.000 0.000 NA   NA
 3744992 3744993 CLC_3654 CLC_3600     TRUE 0.709 8.000 0.000 NA   NA
 3744993 3744994 CLC_3600 CLC_3655     TRUE 0.639 19.000 0.000 NA   NA
 3744994 3744995 CLC_3655 CLC_3656     TRUE 0.719 6.000 0.000 NA   NA
 3744995 3744996 CLC_3656 CLC_3657     TRUE 0.725 5.000 0.000 NA   NA
 3744996 3744997 CLC_3657 CLC_3608     TRUE 0.700 10.000 0.000 NA   NA
 3744997 3744998 CLC_3608 CLC_3609     TRUE 0.646 18.000 0.000 NA   NA
 3744999 3745000 CLC_3610 CLC_3611     TRUE 0.920 13.000 0.006 NA   NA
 3745002 3745003 CLC_3613 CLC_3614     TRUE 0.785 103.000 0.222 NA   NA
 3745003 3745004 CLC_3614 CLC_3615   purA FALSE 0.494 126.000 0.002 NA   NA
 3745004 3745005 CLC_3615 CLC_3616 purA   FALSE 0.305 232.000 0.033 1.000   NA
 3745005 3745006 CLC_3616 CLC_3617     FALSE 0.446 166.000 0.010 NA   NA
 3745006 3745007 CLC_3617 CLC_3618     FALSE 0.537 193.000 0.111 NA   NA
 3745007 3745008 CLC_3618 CLC_3619   dnaB FALSE 0.100 242.000 0.000 1.000 N NA
 3745008 3745009 CLC_3619 CLC_3620 dnaB   TRUE 0.957 31.000 0.053 0.015 N NA
 3745009 3745010 CLC_3620 CLC_3621   rplI TRUE 0.962 11.000 0.024 1.000 N NA
 3745010 3745011 CLC_3621 CLC_3622 rplI   TRUE 0.985 0.000 0.119 1.000 N NA
 3745011 3745012 CLC_3622 CLC_3623     TRUE 0.984 1.000 0.210 1.000   NA
 3745012 3745013 CLC_3623 CLC_3624     TRUE 0.965 12.000 0.116 NA   NA
 3745013 3745014 CLC_3624 CLC_3625   rpsR FALSE 0.531 148.000 0.015 NA   NA
 3745014 3745015 CLC_3625 CLC_3626 rpsR ssb TRUE 0.932 19.000 0.002 1.000 N NA
 3745015 3745016 CLC_3626 CLC_3627 ssb rpsF TRUE 0.937 16.000 0.002 1.000 N NA
 3745016 3745017 CLC_3627 CLC_3628 rpsF   FALSE 0.585 106.000 0.002 NA N NA
 3745017 3745018 CLC_3628 CLC_3629     FALSE 0.025 274.000 0.000 NA   NA
 3745018 3745019 CLC_3629 CLC_3630     TRUE 0.962 16.000 0.121 NA   NA
 3745019 3745020 CLC_3630 CLC_3631     TRUE 0.968 7.000 0.105 NA   NA
 3745021 3745022 CLC_3632 CLC_3633   ytvI TRUE 0.962 14.000 0.111 NA   NA
 3745022 3745023 CLC_3633 CLC_3634 ytvI   TRUE 0.802 58.000 0.058 NA   NA
 3745024 3745025 CLC_3635 CLC_3636     TRUE 0.786 53.000 0.024 NA   NA
 3745025 3745026 CLC_3636 CLC_3637     TRUE 0.873 38.000 0.047 NA   NA
 3745026 3745027 CLC_3637 CLC_3638   soj TRUE 0.991 16.000 0.827 1.000 N NA
 3745027 3745028 CLC_3638 CLC_3639 soj   TRUE 0.744 127.000 0.069 1.000 N NA
 3745028 3745029 CLC_3639 CLC_3640   gidB TRUE 0.768 100.000 0.089 1.000 N NA
 3745029 3745030 CLC_3640 CLC_3641 gidB gidA-2 TRUE 0.985 24.000 0.466 1.000 N NA
 3745030 3745031 CLC_3641 CLC_3642 gidA-2 trmE TRUE 0.981 9.000 0.266 1.000   NA
 3745031 3745032 CLC_3642 CLC_3643 trmE jag TRUE 0.889 48.000 0.116 1.000   NA
 3745032 3745033 CLC_3643 CLC_3644 jag oxaA TRUE 0.975 18.000 0.254 1.000   NA
 3745033 3745034 CLC_3644 CLC_3645 oxaA   TRUE 0.979 26.000 0.461 NA   NA
 3745034 3745035 CLC_3645 CLC_3646   rnpA TRUE 0.992 -3.000 0.540 NA   NA
 3745035 3745036 CLC_3646 CLC_3647 rnpA rpmH TRUE 0.956 55.000 0.787 1.000   NA