MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli SECEC SMS-3-5

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7300218 7300219 EcSMS35_0001 EcSMS35_0002 thrA thrB TRUE 0.987 2.000 0.133 1.000 Y NA
 7300219 7300220 EcSMS35_0002 EcSMS35_0003 thrB thrC TRUE 0.992 1.000 0.233 1.000 Y NA
 7300221 7300222 EcSMS35_0004 EcSMS35_0005     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7300222 7300223 EcSMS35_0005 EcSMS35_0006   agcS FALSE 0.159 70.000 0.028 NA   NA
 7300224 7300225 EcSMS35_0007 EcSMS35_0008 tal2 mogA FALSE 0.223 115.000 0.042 1.000 N NA
 7300226 7300227 EcSMS35_0009 EcSMS35_0010     FALSE 0.088 149.000 0.043 NA   NA
 7300227 7300228 EcSMS35_0010 EcSMS35_0011     TRUE 0.913 25.000 0.500 NA   NA
 7300229 7300230 EcSMS35_0012 EcSMS35_0013 dnaK dnaJ TRUE 0.924 89.000 0.236 0.003 Y NA
 7300230 7300231 EcSMS35_0013 EcSMS35_0014 dnaJ   FALSE 0.001 868.000 0.000 NA   NA
 7300231 7300232 EcSMS35_0014 EcSMS35_0015     TRUE 0.941 20.000 0.571 NA   NA
 7300232 7300233 EcSMS35_0015 EcSMS35_0016     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 7300233 7300234 EcSMS35_0016 EcSMS35_0017   nhaA FALSE 0.009 252.000 0.000 NA   NA
 7300234 7300235 EcSMS35_0017 EcSMS35_0018 nhaA nhaR TRUE 0.687 60.000 0.292 1.000 N NA
 7300236 7300237 EcSMS35_0019 EcSMS35_0020   xlyP TRUE 0.935 40.000 0.231 1.000 Y NA
 7300240 7300241 EcSMS35_0023 EcSMS35_0024 ribF ileS TRUE 0.759 43.000 0.254 1.000 N NA
 7300241 7300242 EcSMS35_0024 EcSMS35_0025 ileS lspA TRUE 0.890 0.000 0.045 1.000 N NA
 7300242 7300243 EcSMS35_0025 EcSMS35_0026 lspA fkpB FALSE 0.472 88.000 0.154 1.000 N NA
 7300243 7300244 EcSMS35_0026 EcSMS35_0027 fkpB ispH TRUE 0.987 2.000 0.626 1.000 N NA
 7300244 7300245 EcSMS35_0027 EcSMS35_0028 ispH rihC FALSE 0.196 66.000 0.028 NA N NA
 7300245 7300246 EcSMS35_0028 EcSMS35_0029 rihC dapB FALSE 0.041 167.000 0.003 NA N NA
 7300248 7300249 EcSMS35_0031 EcSMS35_0032   carA FALSE 0.417 13.000 0.002 NA   NA
 7300249 7300250 EcSMS35_0032 EcSMS35_0033 carA carB TRUE 0.990 18.000 0.345 0.001 Y NA
 7300253 7300254 EcSMS35_0036 EcSMS35_0037 caiE caiD TRUE 0.730 6.000 0.000 1.000   NA
 7300254 7300255 EcSMS35_0037 EcSMS35_0038 caiD caiC TRUE 0.776 109.000 0.000 0.023 Y NA
 7300255 7300256 EcSMS35_0038 EcSMS35_0039 caiC caiB TRUE 0.650 74.000 0.154 0.023 N NA
 7300256 7300257 EcSMS35_0039 EcSMS35_0040 caiB caiA TRUE 0.699 129.000 0.529 1.000 N NA
 7300257 7300258 EcSMS35_0040 EcSMS35_0041 caiA caiT TRUE 0.682 31.000 0.118 1.000 N NA
 7300259 7300260 EcSMS35_0042 EcSMS35_0043   fixA FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7300260 7300261 EcSMS35_0043 EcSMS35_0044 fixA fixB TRUE 0.984 15.000 0.231 0.013 Y NA
 7300261 7300262 EcSMS35_0044 EcSMS35_0045 fixB fixC TRUE 0.865 51.000 0.000 0.055 Y NA
 7300262 7300263 EcSMS35_0045 EcSMS35_0046 fixC fixX TRUE 0.995 -3.000 0.167 0.055 Y NA
 7300263 7300264 EcSMS35_0046 EcSMS35_0047 fixX   FALSE 0.262 59.000 0.000 1.000 N NA
 7300264 7300265 EcSMS35_0047 EcSMS35_0048   kefF FALSE 0.166 108.000 0.000 1.000   NA
 7300265 7300266 EcSMS35_0048 EcSMS35_0049 kefF kefC TRUE 0.984 -7.000 0.560 1.000   NA
 7300266 7300267 EcSMS35_0049 EcSMS35_0050 kefC folA FALSE 0.202 81.000 0.012 1.000 N NA
 7300268 7300269 EcSMS35_0051 EcSMS35_0052     FALSE 0.268 36.000 0.000 NA   NA
 7300269 7300270 EcSMS35_0052 EcSMS35_0053   apaH FALSE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 7300270 7300271 EcSMS35_0053 EcSMS35_0054 apaH apaG TRUE 0.937 7.000 0.267 NA N NA
 7300271 7300272 EcSMS35_0054 EcSMS35_0055 apaG ksgA TRUE 0.864 3.000 0.078 NA N NA
 7300272 7300273 EcSMS35_0055 EcSMS35_0056 ksgA pdxA TRUE 0.965 -3.000 0.197 1.000 N NA
 7300273 7300274 EcSMS35_0056 EcSMS35_0057 pdxA surA TRUE 0.988 0.000 0.561 1.000 N NA
 7300274 7300275 EcSMS35_0057 EcSMS35_0058 surA imp TRUE 0.616 53.000 0.182 1.000 N NA
 7300277 7300278 EcSMS35_0060 EcSMS35_0061   rapA TRUE 0.929 12.000 0.294 1.000 N NA
 7300278 7300279 EcSMS35_0061 EcSMS35_0062 rapA polB TRUE 0.644 164.000 0.098 0.075 Y NA
 7300279 7300280 EcSMS35_0062 EcSMS35_0063 polB araD FALSE 0.221 75.000 0.018 1.000 N NA
 7300280 7300281 EcSMS35_0063 EcSMS35_0064 araD araA FALSE 0.272 200.000 0.017 1.000 Y NA
 7300281 7300282 EcSMS35_0064 EcSMS35_0065 araA araB TRUE 0.870 11.000 0.138 1.000 N NA
 7300283 7300284 EcSMS35_0066 EcSMS35_0067 araC   FALSE 0.002 514.000 0.000 NA   NA
 7300284 7300285 EcSMS35_0067 EcSMS35_0068     TRUE 0.620 7.000 0.000 NA   NA
 7300285 7300286 EcSMS35_0068 EcSMS35_0069     FALSE 0.053 155.000 0.000 NA   NA
 7300287 7300288 EcSMS35_0070 EcSMS35_0071 thiQ thiP TRUE 0.985 -16.000 0.522 0.017 N NA
 7300288 7300289 EcSMS35_0071 EcSMS35_0072 thiP tbpA TRUE 0.988 -24.000 0.697 0.076 N NA
 7300293 7300294 EcSMS35_0076 EcSMS35_0077 leuD leuC TRUE 0.993 11.000 0.309 0.001 Y NA
 7300294 7300295 EcSMS35_0077 EcSMS35_0078 leuC leuB TRUE 0.996 3.000 0.275 0.001 Y NA
 7300295 7300296 EcSMS35_0078 EcSMS35_0079 leuB leuA TRUE 0.995 0.000 0.126 0.001 Y NA
 7300296 7300297 EcSMS35_0079 EcSMS35_0080 leuA   FALSE 0.016 217.000 0.000 NA   NA
 7300300 7300301 EcSMS35_0083 EcSMS35_0084 ilvI ilvH TRUE 0.994 -27.000 0.371 0.002 Y NA
 7300301 7300302 EcSMS35_0084 EcSMS35_0085 ilvH fruR FALSE 0.098 180.000 0.063 1.000 N NA
 7300302 7300303 EcSMS35_0085 EcSMS35_0086 fruR mraZ FALSE 0.001 602.000 0.000 NA   NA
 7300303 7300304 EcSMS35_0086 EcSMS35_0087 mraZ mraW TRUE 0.985 2.000 0.635 NA   NA
 7300304 7300305 EcSMS35_0087 EcSMS35_0088 mraW ftsL TRUE 0.970 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7300305 7300306 EcSMS35_0088 EcSMS35_0089 ftsL ftsI TRUE 0.809 16.000 0.124 1.000 N NA
 7300306 7300307 EcSMS35_0089 EcSMS35_0090 ftsI murE TRUE 0.974 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 7300307 7300308 EcSMS35_0090 EcSMS35_0091 murE murF TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 7300308 7300309 EcSMS35_0091 EcSMS35_0092 murF mraY TRUE 0.996 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 7300309 7300310 EcSMS35_0092 EcSMS35_0093 mraY murD TRUE 0.998 3.000 0.647 0.004 Y NA
 7300310 7300311 EcSMS35_0093 EcSMS35_0094 murD ftsW TRUE 0.987 0.000 0.297 0.003 N NA
 7300311 7300312 EcSMS35_0094 EcSMS35_0095 ftsW murG TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7300312 7300313 EcSMS35_0095 EcSMS35_0096 murG murC TRUE 0.916 54.000 0.283 1.000 Y NA
 7300313 7300314 EcSMS35_0096 EcSMS35_0097 murC ddl TRUE 0.993 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 7300314 7300315 EcSMS35_0097 EcSMS35_0098 ddl ftsQ TRUE 0.993 2.000 0.372 NA Y NA
 7300315 7300316 EcSMS35_0098 EcSMS35_0099 ftsQ ftsA TRUE 0.981 -3.000 0.389 NA N NA
 7300316 7300317 EcSMS35_0099 EcSMS35_0100 ftsA ftsZ TRUE 0.937 62.000 0.460 1.000 Y NA
 7300317 7300318 EcSMS35_0100 EcSMS35_0101 ftsZ lpxC FALSE 0.417 101.000 0.134 1.000 N NA
 7300318 7300319 EcSMS35_0101 EcSMS35_0102 lpxC secM FALSE 0.079 156.000 0.000 1.000   NA
 7300319 7300320 EcSMS35_0102 EcSMS35_0103 secM secA FALSE 0.335 62.000 0.065 1.000   NA
 7300320 7300321 EcSMS35_0103 EcSMS35_0104 secA mutT TRUE 0.551 60.000 0.168 1.000 N NA
 7300322 7300323 EcSMS35_0105 EcSMS35_0106     TRUE 0.944 10.000 0.356 NA   NA
 7300323 7300324 EcSMS35_0106 EcSMS35_0107   coaE TRUE 0.916 0.000 0.110 NA   NA
 7300326 7300327 EcSMS35_0109 EcSMS35_0110 pilC hofB TRUE 0.995 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 7300327 7300328 EcSMS35_0110 EcSMS35_0111 hofB pilA TRUE 0.992 10.000 0.556 NA Y NA
 7300328 7300329 EcSMS35_0111 EcSMS35_0112 pilA nadC FALSE 0.025 203.000 0.015 NA N NA
 7300330 7300331 EcSMS35_0113 EcSMS35_0114 ampD ampE TRUE 0.994 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 7300333 7300334 EcSMS35_0116 EcSMS35_0117     TRUE 0.784 3.000 0.000 1.000   NA
 7300334 7300335 EcSMS35_0117 EcSMS35_0118     TRUE 0.653 168.000 1.000 NA   NA
 7300335 7300336 EcSMS35_0118 EcSMS35_0119     TRUE 0.729 1.000 0.000 NA   NA
 7300336 7300337 EcSMS35_0119 EcSMS35_0120     FALSE 0.042 167.000 0.000 NA   NA
 7300337 7300338 EcSMS35_0120 EcSMS35_0121     FALSE 0.210 48.000 0.000 NA   NA
 7300338 7300339 EcSMS35_0121 EcSMS35_0123   pdhR FALSE 0.003 456.000 0.000 1.000   NA
 7300341 7300342 EcSMS35_0124 EcSMS35_0125 aceE aceF TRUE 0.973 15.000 0.220 1.000 Y NA
 7300342 7300343 EcSMS35_0125 EcSMS35_0126 aceF lpdA TRUE 0.856 145.000 0.463 1.000 Y NA
 7300345 7300346 EcSMS35_0128 EcSMS35_0129 acnB   FALSE 0.076 175.000 0.068 NA   NA
 7300347 7300348 EcSMS35_0130 EcSMS35_0131 speD speE TRUE 0.964 16.000 0.162 1.000 Y NA
 7300348 7300349 EcSMS35_0131 EcSMS35_0132 speE   TRUE 0.608 106.000 0.354 NA   NA
 7300354 7300355 EcSMS35_0137 EcSMS35_0138     TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 7300355 7300356 EcSMS35_0138 EcSMS35_0139     FALSE 0.225 105.000 0.037 1.000 N NA
 7300356 7300357 EcSMS35_0139 EcSMS35_0140     TRUE 0.879 64.000 0.222 1.000 Y NA
 7300359 7300360 EcSMS35_0142 EcSMS35_0143     FALSE 0.144 69.000 0.000 NA   NA
 7300361 7300362 EcSMS35_0144 EcSMS35_0145 panC panB TRUE 0.994 12.000 0.395 0.001 Y NA
 7300362 7300363 EcSMS35_0145 EcSMS35_0146 panB   FALSE 0.186 112.000 0.000 1.000 N NA
 7300363 7300364 EcSMS35_0146 EcSMS35_0147     FALSE 0.522 54.000 0.000 0.010   NA
 7300364 7300365 EcSMS35_0147 EcSMS35_0148     TRUE 0.958 27.000 0.571 0.010   NA
 7300365 7300366 EcSMS35_0148 EcSMS35_0149     TRUE 0.975 15.000 0.571 0.010   NA
 7300366 7300367 EcSMS35_0149 EcSMS35_0150   htrE TRUE 0.948 20.000 0.571 1.000   NA
 7300367 7300368 EcSMS35_0150 EcSMS35_0151 htrE   TRUE 0.987 35.000 1.000 1.000 Y NA
 7300368 7300369 EcSMS35_0151 EcSMS35_0152     TRUE 0.925 98.000 0.500 1.000 Y NA
 7300369 7300370 EcSMS35_0152 EcSMS35_0153   folK FALSE 0.005 371.000 0.000 1.000 N NA
 7300370 7300371 EcSMS35_0153 EcSMS35_0154 folK pcnB TRUE 0.971 -3.000 0.234 1.000 N NA
 7300371 7300372 EcSMS35_0154 EcSMS35_0155 pcnB gluQ TRUE 0.807 93.000 0.131 1.000 Y NA
 7300372 7300373 EcSMS35_0155 EcSMS35_0156 gluQ dksA TRUE 0.769 37.000 0.231 1.000 N NA
 7300373 7300374 EcSMS35_0156 EcSMS35_0157 dksA sfsA FALSE 0.137 178.000 0.151 NA   NA
 7300374 7300375 EcSMS35_0157 EcSMS35_0158 sfsA ligT TRUE 0.570 15.000 0.045 NA   NA
 7300376 7300377 EcSMS35_0159 EcSMS35_0160 hrpB mrcB FALSE 0.473 94.000 0.158 1.000 N NA
 7300379 7300380 EcSMS35_0162 EcSMS35_0163 fhuA fhuC TRUE 0.886 51.000 0.156 1.000 Y NA
 7300380 7300381 EcSMS35_0163 EcSMS35_0164 fhuC fhuD TRUE 0.982 0.000 0.031 1.000 Y NA
 7300381 7300382 EcSMS35_0164 EcSMS35_0165 fhuD fhuB TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7300384 7300385 EcSMS35_0167 EcSMS35_0168 clcA yadR FALSE 0.151 82.000 0.031 NA   NA
 7300386 7300387 EcSMS35_0169 EcSMS35_0170   btuF TRUE 0.692 38.000 0.213 NA   NA
 7300387 7300388 EcSMS35_0170 EcSMS35_0171 btuF mtnN TRUE 0.894 -7.000 0.073 1.000 N NA
 7300389 7300390 EcSMS35_0172 EcSMS35_0173 dgt degP FALSE 0.293 130.000 0.101 1.000 N NA
 7300390 7300391 EcSMS35_0173 EcSMS35_0174 degP cdaR FALSE 0.136 155.000 0.080 NA N NA
 7300392 7300393 EcSMS35_0175 EcSMS35_0176   dapD FALSE 0.006 315.000 0.035 NA   NA
 7300393 7300394 EcSMS35_0176 EcSMS35_0177 dapD glnD TRUE 0.654 31.000 0.097 1.000 N NA
 7300394 7300395 EcSMS35_0177 EcSMS35_0178 glnD map TRUE 0.638 62.000 0.243 1.000 N NA
 7300398 7300399 EcSMS35_0181 EcSMS35_0182 tsf pyrH TRUE 0.551 147.000 0.416 1.000 N NA
 7300399 7300400 EcSMS35_0182 EcSMS35_0183 pyrH frr TRUE 0.659 150.000 0.626 1.000 N NA
 7300400 7300401 EcSMS35_0183 EcSMS35_0184 frr dxr FALSE 0.235 92.000 0.032 1.000 N NA
 7300401 7300402 EcSMS35_0184 EcSMS35_0185 dxr uppS FALSE 0.331 186.000 0.025 1.000 Y NA
 7300402 7300403 EcSMS35_0185 EcSMS35_0186 uppS cdsA TRUE 0.987 13.000 0.400 1.000 Y NA
 7300403 7300404 EcSMS35_0186 EcSMS35_0187 cdsA rseP TRUE 0.798 12.000 0.080 1.000 N NA
 7300404 7300405 EcSMS35_0187 EcSMS35_0188 rseP yaeT TRUE 0.946 30.000 0.204 1.000 Y NA
 7300405 7300406 EcSMS35_0188 EcSMS35_0189 yaeT skp TRUE 0.875 122.000 0.354 1.000 Y NA
 7300406 7300407 EcSMS35_0189 EcSMS35_0190 skp lpxD TRUE 0.997 4.000 0.814 1.000 Y NA
 7300407 7300408 EcSMS35_0190 EcSMS35_0191 lpxD fabZ TRUE 0.839 105.000 0.796 1.000 N NA
 7300408 7300409 EcSMS35_0191 EcSMS35_0192 fabZ lpxA TRUE 0.989 4.000 0.850 1.000 N NA
 7300409 7300410 EcSMS35_0192 EcSMS35_0193 lpxA lpxB TRUE 0.994 0.000 0.289 1.000 Y NA
 7300410 7300411 EcSMS35_0193 EcSMS35_0194 lpxB rnhB TRUE 0.963 -3.000 0.186 1.000 N NA
 7300411 7300412 EcSMS35_0194 EcSMS35_0195 rnhB dnaE TRUE 0.902 37.000 0.104 1.000 Y NA
 7300412 7300413 EcSMS35_0195 EcSMS35_0196 dnaE accA TRUE 0.836 13.000 0.122 1.000 N NA
 7300413 7300414 EcSMS35_0196 EcSMS35_0197 accA ldcC1 FALSE 0.182 99.000 0.010 1.000 N NA
 7300414 7300415 EcSMS35_0197 EcSMS35_0198 ldcC1   TRUE 0.756 57.000 0.039 NA Y NA
 7300415 7300416 EcSMS35_0198 EcSMS35_0199   tilS FALSE 0.164 65.000 0.015 NA N NA
 7300417 7300418 EcSMS35_0200 EcSMS35_0201 rof   TRUE 0.929 -7.000 0.179 NA   NA
 7300419 7300420 EcSMS35_0202 EcSMS35_0203     TRUE 0.868 -3.000 0.034 1.000   NA
 7300420 7300421 EcSMS35_0203 EcSMS35_0204   cutF FALSE 0.508 14.000 0.027 NA   NA
 7300422 7300423 EcSMS35_0205 EcSMS35_0206   proS FALSE 0.138 53.000 0.002 NA   NA
 7300423 7300424 EcSMS35_0206 EcSMS35_0207 proS   FALSE 0.164 111.000 0.048 NA   NA
 7300424 7300425 EcSMS35_0207 EcSMS35_0208   rcsF TRUE 0.964 -3.000 0.247 NA   NA
 7300425 7300426 EcSMS35_0208 EcSMS35_0209 rcsF metQ FALSE 0.434 169.000 0.500 NA   NA
 7300426 7300427 EcSMS35_0209 EcSMS35_0210 metQ metI TRUE 0.974 40.000 0.411 0.060 Y NA
 7300427 7300428 EcSMS35_0210 EcSMS35_0211 metI metN TRUE 0.996 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 7300429 7300430 EcSMS35_0212 EcSMS35_0213   rrs FALSE 0.003 366.000 0.000 NA   NA
 7300430 7300431 EcSMS35_0213 EcSMS35_0214 rrs   FALSE 0.144 69.000 0.000 NA   NA
 7300431 7300432 EcSMS35_0214 EcSMS35_0215     FALSE 0.242 42.000 0.000 NA   NA
 7300432 7300433 EcSMS35_0215 EcSMS35_0218   rrl FALSE 0.037 174.000 0.000 NA   NA
 7300433 7300434 EcSMS35_0218 EcSMS35_0219 rrl rrf FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7300434 7300435 EcSMS35_0219 EcSMS35_0220 rrf   FALSE 0.179 54.000 0.000 NA   NA
 7300435 7300436 EcSMS35_0220 EcSMS35_0222   dkgB FALSE 0.047 162.000 0.000 NA   NA
 7300438 7300439 EcSMS35_0223 EcSMS35_0224     FALSE 0.252 74.000 0.066 NA   NA
 7300440 7300441 EcSMS35_0225 EcSMS35_0226 mltD gloB FALSE 0.143 210.000 0.233 1.000   NA
 7300444 7300445 EcSMS35_0229 EcSMS35_0230 dnaQ   FALSE 0.083 132.000 0.000 NA   NA
 7300449 7300450 EcSMS35_0234 EcSMS35_0236 gmhA   FALSE 0.500 116.000 0.229 1.000   NA
 7300451 7300452 EcSMS35_0235 EcSMS35_0237   yafQ FALSE 0.014 224.000 0.000 NA   NA
 7300452 7300453 EcSMS35_0237 EcSMS35_0238 yafQ dinJ TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7300454 7300455 EcSMS35_0239 EcSMS35_0240     FALSE 0.045 176.000 0.000 NA N NA
 7300456 7300457 EcSMS35_0241 EcSMS35_0242 lfhA flhB TRUE 0.997 -16.000 0.667 0.009 Y NA
 7300457 7300458 EcSMS35_0242 EcSMS35_0243 flhB lfiR TRUE 0.998 -10.000 1.000 1.000 Y NA
 7300458 7300459 EcSMS35_0243 EcSMS35_0244 lfiR lfiQ TRUE 0.992 2.000 0.281 1.000 Y NA
 7300459 7300460 EcSMS35_0244 EcSMS35_0245 lfiQ fliP TRUE 0.995 3.000 0.263 0.009 Y NA
 7300460 7300461 EcSMS35_0245 EcSMS35_0246 fliP lfiN TRUE 0.981 -3.000 0.368 1.000   NA
 7300461 7300462 EcSMS35_0246 EcSMS35_0247 lfiN lfiM TRUE 0.901 -7.000 0.123 NA   NA
 7300463 7300464 EcSMS35_0248 EcSMS35_0249 lafK lfiE TRUE 0.782 15.000 0.091 1.000 N NA
 7300464 7300465 EcSMS35_0249 EcSMS35_0250 lfiE fliF TRUE 0.998 5.000 1.000 0.009 Y NA
 7300465 7300466 EcSMS35_0250 EcSMS35_0251 fliF fliG TRUE 0.998 -22.000 0.970 0.009 Y NA
 7300466 7300467 EcSMS35_0251 EcSMS35_0252 fliG fliH TRUE 0.998 3.000 0.789 0.005 Y NA
 7300467 7300468 EcSMS35_0252 EcSMS35_0253 fliH lfiI TRUE 0.998 -7.000 0.816 1.000 Y NA
 7300468 7300469 EcSMS35_0253 EcSMS35_0254 lfiI lfiJ TRUE 0.812 3.000 0.035 1.000   NA
 7300469 7300470 EcSMS35_0254 EcSMS35_0255 lfiJ   TRUE 0.750 3.000 0.006 1.000   NA
 7300471 7300472 EcSMS35_0256 EcSMS35_0257     FALSE 0.014 227.000 0.000 NA   NA
 7300472 7300473 EcSMS35_0257 EcSMS35_0258     FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 7300473 7300474 EcSMS35_0258 EcSMS35_0259   lafV FALSE 0.034 179.000 0.000 NA   NA
 7300474 7300475 EcSMS35_0259 EcSMS35_0260 lafV lfgN FALSE 0.116 128.000 0.038 NA   NA
 7300475 7300476 EcSMS35_0260 EcSMS35_0261 lfgN lfgM TRUE 0.980 13.000 0.585 0.004   NA
 7300476 7300477 EcSMS35_0261 EcSMS35_0262 lfgM lfgA FALSE 0.341 80.000 0.113 NA   NA
 7300478 7300479 EcSMS35_0263 EcSMS35_0264 lfgB flgC TRUE 0.998 3.000 0.972 1.000 Y NA
 7300479 7300480 EcSMS35_0264 EcSMS35_0265 flgC lfgD TRUE 0.998 0.000 0.914 NA Y NA
 7300480 7300481 EcSMS35_0265 EcSMS35_0266 lfgD lfgE TRUE 0.991 23.000 0.970 NA Y NA
 7300481 7300482 EcSMS35_0266 EcSMS35_0267 lfgE flgF TRUE 0.999 0.000 1.000 0.006 Y NA
 7300482 7300483 EcSMS35_0267 EcSMS35_0268 flgF flgG TRUE 0.981 79.000 0.971 0.006 Y NA
 7300483 7300484 EcSMS35_0268 EcSMS35_0269 flgG flgH TRUE 0.980 83.000 0.941 0.009 Y NA
 7300484 7300485 EcSMS35_0269 EcSMS35_0270 flgH flgI TRUE 0.999 0.000 0.912 0.011 Y NA
 7300485 7300486 EcSMS35_0270 EcSMS35_0271 flgI lfgJ TRUE 0.981 0.000 0.457 NA   NA
 7300486 7300487 EcSMS35_0271 EcSMS35_0272 lfgJ lfgK FALSE 0.034 421.000 0.457 NA   NA
 7300487 7300488 EcSMS35_0272 EcSMS35_0273 lfgK lfgL TRUE 0.978 15.000 0.576 0.002   NA
 7300488 7300489 EcSMS35_0273 EcSMS35_0274 lfgL lafW TRUE 0.957 17.000 0.667 NA   NA
 7300491 7300492 EcSMS35_0276 EcSMS35_0277 lafA lafB FALSE 0.365 206.000 0.121 1.000 Y NA
 7300492 7300493 EcSMS35_0277 EcSMS35_0278 lafB lafC TRUE 0.995 23.000 0.865 0.004 Y NA
 7300493 7300494 EcSMS35_0278 EcSMS35_0279 lafC lafD TRUE 0.763 5.000 0.054 NA   NA
 7300494 7300495 EcSMS35_0279 EcSMS35_0280 lafD lafE TRUE 0.877 -3.000 0.062 NA   NA
 7300495 7300496 EcSMS35_0280 EcSMS35_0281 lafE lafF TRUE 0.946 8.000 0.296 1.000   NA
 7300496 7300497 EcSMS35_0281 EcSMS35_0282 lafF lafS TRUE 0.903 20.000 0.333 1.000   NA
 7300497 7300498 EcSMS35_0282 EcSMS35_0283 lafS lafT TRUE 0.957 13.000 0.500 1.000 N NA
 7300498 7300499 EcSMS35_0283 EcSMS35_0284 lafT lafU TRUE 0.997 3.000 0.846 1.000 Y NA
 7300499 7300500 EcSMS35_0284 EcSMS35_0285 lafU dinB FALSE 0.237 71.000 0.000 1.000 N NA
 7300500 7300501 EcSMS35_0285 EcSMS35_0286 dinB   FALSE 0.229 52.000 0.000 NA N NA
 7300501 7300502 EcSMS35_0286 EcSMS35_0287     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7300502 7300503 EcSMS35_0287 EcSMS35_0288     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7300503 7300504 EcSMS35_0288 EcSMS35_0289     FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 7300504 7300505 EcSMS35_0289 EcSMS35_0290   prfH TRUE 0.972 -3.000 0.303 NA   NA
 7300507 7300508 EcSMS35_0292 EcSMS35_0293 gpt frsA FALSE 0.169 92.000 0.040 NA   NA
 7300508 7300509 EcSMS35_0293 EcSMS35_0294 frsA crl FALSE 0.234 58.000 0.048 NA   NA
 7300511 7300512 EcSMS35_0296 EcSMS35_0297 proB proA TRUE 0.975 12.000 0.026 0.001 Y NA
 7300512 7300513 EcSMS35_0297 EcSMS35_0298 proA   FALSE 0.106 116.000 0.000 NA   NA
 7300513 7300514 EcSMS35_0298 EcSMS35_0299     FALSE 0.045 164.000 0.000 NA   NA
 7300514 7300515 EcSMS35_0299 EcSMS35_0300     FALSE 0.116 102.000 0.000 NA   NA
 7300516 7300517 EcSMS35_0301 EcSMS35_0302     TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.013   NA
 7300517 7300518 EcSMS35_0302 EcSMS35_0303     TRUE 0.981 -3.000 0.417 NA   NA
 7300519 7300520 EcSMS35_0304 EcSMS35_0305     TRUE 0.644 120.000 0.000 1.000 Y NA
 7300520 7300521 EcSMS35_0305 EcSMS35_0306     FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7300521 7300522 EcSMS35_0306 EcSMS35_0307     FALSE 0.129 86.000 0.000 NA   NA
 7300522 7300523 EcSMS35_0307 EcSMS35_0308     TRUE 0.968 12.000 0.667 NA   NA
 7300523 7300524 EcSMS35_0308 EcSMS35_0309     TRUE 0.977 9.000 0.667 NA   NA
 7300524 7300525 EcSMS35_0309 EcSMS35_0310     TRUE 0.969 20.000 1.000 NA   NA
 7300525 7300526 EcSMS35_0310 EcSMS35_0311     FALSE 0.002 452.000 0.000 NA   NA
 7300526 7300527 EcSMS35_0311 EcSMS35_0312     FALSE 0.021 205.000 0.000 NA   NA
 7300527 7300528 EcSMS35_0312 EcSMS35_0313     FALSE 0.017 215.000 0.000 NA   NA
 7300528 7300529 EcSMS35_0313 EcSMS35_0314     FALSE 0.002 459.000 0.000 NA   NA
 7300530 7300531 EcSMS35_0315 EcSMS35_0316     TRUE 0.967 -31.000 0.571 NA   NA
 7300531 7300532 EcSMS35_0316 EcSMS35_0317     TRUE 0.969 -10.000 0.429 NA   NA
 7300532 7300533 EcSMS35_0317 EcSMS35_0318     TRUE 0.844 26.000 0.308 NA   NA
 7300533 7300534 EcSMS35_0318 EcSMS35_0319   matB TRUE 0.720 58.000 0.385 NA   NA
 7300534 7300535 EcSMS35_0319 EcSMS35_0320 matB matA TRUE 0.686 75.000 0.400 NA   NA
 7300535 7300536 EcSMS35_0320 EcSMS35_0321 matA   FALSE 0.002 453.000 0.000 NA   NA
 7300538 7300539 EcSMS35_0323 EcSMS35_0324 rpmJ rpmE2 TRUE 0.932 0.000 0.004 0.013   NA
 7300539 7300540 EcSMS35_0324 EcSMS35_0325 rpmE2   FALSE 0.002 940.000 0.000 1.000 N NA
 7300540 7300541 EcSMS35_0325 EcSMS35_0326     FALSE 0.017 245.000 0.000 1.000   NA
 7300542 7300543 EcSMS35_0327 EcSMS35_0328     FALSE 0.374 200.000 0.000 0.067 Y NA
 7300544 7300545 EcSMS35_0329 EcSMS35_0330     TRUE 0.902 27.000 0.438 1.000   NA
 7300549 7300550 EcSMS35_0334 EcSMS35_0335     TRUE 0.620 12.000 0.043 NA   NA
 7300550 7300551 EcSMS35_0335 EcSMS35_0336     TRUE 0.776 109.000 0.667 NA   NA
 7300552 7300553 EcSMS35_0337 EcSMS35_0338     FALSE 0.002 526.000 0.000 NA N NA
 7300553 7300554 EcSMS35_0338 EcSMS35_0339     TRUE 0.982 11.000 0.286 NA Y NA
 7300554 7300555 EcSMS35_0339 EcSMS35_0340     TRUE 0.984 -7.000 0.286 0.001   NA
 7300556 7300557 EcSMS35_0341 EcSMS35_0342   betA FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 7300557 7300558 EcSMS35_0342 EcSMS35_0343 betA betB TRUE 0.967 14.000 0.634 1.000 N NA
 7300558 7300559 EcSMS35_0343 EcSMS35_0344 betB betI TRUE 0.950 14.000 0.459 1.000 N NA
 7300560 7300561 EcSMS35_0345 EcSMS35_0346 betT   FALSE 0.002 876.000 0.000 1.000 N NA
 7300562 7300563 EcSMS35_0347 EcSMS35_0348     FALSE 0.127 92.000 0.000 NA   NA
 7300564 7300565 EcSMS35_0349 EcSMS35_0350     TRUE 0.903 40.000 0.667 NA   NA
 7300565 7300566 EcSMS35_0350 EcSMS35_0351     TRUE 0.969 -10.000 0.429 NA   NA
 7300566 7300567 EcSMS35_0351 EcSMS35_0352     TRUE 0.990 0.000 0.714 NA   NA
 7300567 7300568 EcSMS35_0352 EcSMS35_0353     FALSE 0.348 95.000 0.125 NA   NA
 7300568 7300569 EcSMS35_0353 EcSMS35_0354     TRUE 0.938 10.000 0.278 1.000 N NA
 7300569 7300570 EcSMS35_0354 EcSMS35_0355     FALSE 0.014 224.000 0.000 NA   NA
 7300570 7300571 EcSMS35_0355 EcSMS35_0356     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7300571 7300572 EcSMS35_0356 EcSMS35_0357     FALSE 0.011 243.000 0.000 NA   NA
 7300572 7300573 EcSMS35_0357 EcSMS35_0358     FALSE 0.003 344.000 0.000 NA   NA
 7300575 7300576 EcSMS35_0360 EcSMS35_0362     FALSE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 7300578 7300579 EcSMS35_0363 EcSMS35_0364 prpB prpC TRUE 0.873 45.000 0.502 1.000 N NA
 7300579 7300580 EcSMS35_0364 EcSMS35_0365 prpC prpD TRUE 0.753 34.000 0.216 1.000   NA
 7300580 7300581 EcSMS35_0365 EcSMS35_0366 prpD prpE TRUE 0.713 40.000 0.038 0.001   NA
 7300581 7300582 EcSMS35_0366 EcSMS35_0367 prpE codB FALSE 0.022 237.000 0.000 1.000 N NA
 7300582 7300583 EcSMS35_0367 EcSMS35_0368 codB codA TRUE 0.989 -10.000 0.250 1.000 Y NA
 7300585 7300586 EcSMS35_0370 EcSMS35_0371 cynT cynS TRUE 0.907 31.000 0.075 1.000 Y NA
 7300586 7300587 EcSMS35_0371 EcSMS35_0372 cynS cynX TRUE 0.868 33.000 0.000 1.000 Y NA
 7300588 7300589 EcSMS35_0373 EcSMS35_0374 lacA lacY TRUE 0.618 57.000 0.222 1.000   NA
 7300589 7300590 EcSMS35_0374 EcSMS35_0375 lacY lacZ TRUE 0.693 52.000 0.261 1.000   NA
 7300590 7300591 EcSMS35_0375 EcSMS35_0376 lacZ lacI FALSE 0.423 123.000 0.174 1.000 N NA
 7300591 7300592 EcSMS35_0376 EcSMS35_0377 lacI mhpR TRUE 0.804 77.000 0.000 0.053 Y NA
 7300593 7300594 EcSMS35_0378 EcSMS35_0379 mhpA mhpB TRUE 0.985 2.000 0.333 0.006   NA
 7300594 7300595 EcSMS35_0379 EcSMS35_0380 mhpB mhpC TRUE 0.896 18.000 0.300 1.000   NA
 7300595 7300596 EcSMS35_0380 EcSMS35_0381 mhpC mhpD TRUE 0.939 10.000 0.300 1.000   NA
 7300596 7300597 EcSMS35_0381 EcSMS35_0382 mhpD mhpF TRUE 0.996 -3.000 0.444 1.000 Y NA
 7300597 7300598 EcSMS35_0382 EcSMS35_0383 mhpF mhpE TRUE 0.993 -3.000 0.750 1.000 N NA
 7300598 7300599 EcSMS35_0383 EcSMS35_0384 mhpE   FALSE 0.517 176.000 0.600 1.000 N NA
 7300599 7300600 EcSMS35_0384 EcSMS35_0385     FALSE 0.116 102.000 0.000 NA   NA
 7300601 7300602 EcSMS35_0386 EcSMS35_0387 fghA2 adhC TRUE 0.645 92.000 0.327 1.000   NA
 7300602 7300603 EcSMS35_0387 EcSMS35_0388 adhC   TRUE 0.882 35.000 0.531 NA   NA
 7300603 7300604 EcSMS35_0388 EcSMS35_0389     FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 7300604 7300605 EcSMS35_0389 EcSMS35_0390     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7300605 7300606 EcSMS35_0390 EcSMS35_0391     FALSE 0.101 119.000 0.000 NA   NA
 7300606 7300607 EcSMS35_0391 EcSMS35_0392     TRUE 0.900 10.000 0.214 NA   NA
 7300607 7300608 EcSMS35_0392 EcSMS35_0393     FALSE 0.002 438.000 0.000 NA   NA
 7300609 7300610 EcSMS35_0394 EcSMS35_0395 tauA tauB TRUE 0.946 14.000 0.047 1.000 Y NA
 7300610 7300611 EcSMS35_0395 EcSMS35_0396 tauB tauC TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 7300611 7300612 EcSMS35_0396 EcSMS35_0397 tauC tauD TRUE 0.967 -3.000 0.214 1.000 N NA
 7300615 7300616 EcSMS35_0399 EcSMS35_0401     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.073 Y NA
 7300617 7300618 EcSMS35_0402 EcSMS35_0403     TRUE 0.804 86.000 0.667 NA   NA
 7300620 7300621 EcSMS35_0405 EcSMS35_0406   smbA FALSE 0.417 20.000 0.000 NA   NA
 7300621 7300622 EcSMS35_0406 EcSMS35_0407 smbA   TRUE 0.613 13.000 0.000 1.000   NA
 7300626 7300627 EcSMS35_0411 EcSMS35_0412     FALSE 0.033 182.000 0.000 NA   NA
 7300627 7300628 EcSMS35_0412 EcSMS35_0413   phoA FALSE 0.138 100.000 0.032 NA   NA
 7300628 7300629 EcSMS35_0413 EcSMS35_0414 phoA psiF FALSE 0.120 119.000 0.032 NA   NA
 7300629 7300630 EcSMS35_0414 EcSMS35_0415 psiF adrA FALSE 0.507 102.000 0.250 NA   NA
 7300632 7300633 EcSMS35_0417 EcSMS35_0418   aroL FALSE 0.025 183.000 0.007 NA   NA
 7300633 7300634 EcSMS35_0418 EcSMS35_0419 aroL   FALSE 0.275 50.000 0.044 NA   NA
 7300634 7300635 EcSMS35_0419 EcSMS35_0420   aroM FALSE 0.009 258.000 0.000 NA   NA
 7300635 7300636 EcSMS35_0420 EcSMS35_0421 aroM   FALSE 0.209 72.000 0.049 NA   NA
 7300636 7300637 EcSMS35_0421 EcSMS35_0422     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7300640 7300641 EcSMS35_0425 EcSMS35_0426 araJ sbcC FALSE 0.316 42.000 0.030 NA N NA
 7300641 7300642 EcSMS35_0426 EcSMS35_0427 sbcC sbcD TRUE 0.992 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 7300643 7300644 EcSMS35_0428 EcSMS35_0429   phoB FALSE 0.139 73.000 0.000 NA   NA
 7300644 7300645 EcSMS35_0429 EcSMS35_0430 phoB phoR TRUE 0.962 58.000 0.453 0.016 Y NA
 7300647 7300648 EcSMS35_0432 EcSMS35_0433 brnQ proY TRUE 0.938 73.000 0.348 0.087 Y NA
 7300648 7300649 EcSMS35_0433 EcSMS35_0434 proY malZ FALSE 0.217 156.000 0.123 1.000 N NA
 7300649 7300650 EcSMS35_0434 EcSMS35_0435 malZ   FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 7300652 7300653 EcSMS35_0437 EcSMS35_0438 queA tgt TRUE 0.965 55.000 0.360 0.001 Y NA
 7300653 7300654 EcSMS35_0438 EcSMS35_0439 tgt yajC TRUE 0.878 23.000 0.325 NA N NA
 7300654 7300655 EcSMS35_0439 EcSMS35_0440 yajC secD TRUE 0.888 28.000 0.045 NA Y NA
 7300655 7300656 EcSMS35_0440 EcSMS35_0441 secD secF TRUE 0.990 11.000 0.206 0.001 Y NA
 7300656 7300657 EcSMS35_0441 EcSMS35_0442 secF   FALSE 0.103 151.000 0.000 1.000 N NA
 7300657 7300658 EcSMS35_0442 EcSMS35_0443     TRUE 0.960 -7.000 0.300 NA   NA
 7300658 7300659 EcSMS35_0443 EcSMS35_0444     FALSE 0.128 88.000 0.000 NA   NA
 7300660 7300661 EcSMS35_0445 EcSMS35_0446 tsx1   FALSE 0.005 299.000 0.000 NA   NA
 7300664 7300665 EcSMS35_0449 EcSMS35_0450 nrdR ribD TRUE 0.950 4.000 0.277 NA N NA
 7300665 7300666 EcSMS35_0450 EcSMS35_0451 ribD ribH TRUE 0.847 89.000 0.034 0.001 Y NA
 7300666 7300667 EcSMS35_0451 EcSMS35_0452 ribH nusB TRUE 0.914 20.000 0.347 1.000 N NA
 7300667 7300668 EcSMS35_0452 EcSMS35_0453 nusB thiL TRUE 0.578 78.000 0.225 1.000 N NA
 7300668 7300669 EcSMS35_0453 EcSMS35_0454 thiL pgpA TRUE 0.937 -13.000 0.206 1.000 N NA
 7300670 7300671 EcSMS35_0455 EcSMS35_0456   dxs FALSE 0.257 55.000 0.009 1.000 N NA
 7300671 7300672 EcSMS35_0456 EcSMS35_0457 dxs ispA TRUE 0.921 25.000 0.060 1.000 Y NA
 7300672 7300673 EcSMS35_0457 EcSMS35_0458 ispA xseB TRUE 0.876 0.000 0.035 1.000 N NA
 7300675 7300676 EcSMS35_0460 EcSMS35_0461 thiJ panE TRUE 0.853 -37.000 0.155 NA   NA
 7300679 7300680 EcSMS35_0464 EcSMS35_0465     FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 7300681 7300682 EcSMS35_0466 EcSMS35_0467     TRUE 0.729 -16.000 0.000 1.000   NA
 7300682 7300683 EcSMS35_0467 EcSMS35_0468   cyoE FALSE 0.046 185.000 0.000 1.000   NA
 7300683 7300684 EcSMS35_0468 EcSMS35_0469 cyoE cyoD TRUE 0.905 12.000 0.118 0.086 N NA
 7300684 7300685 EcSMS35_0469 EcSMS35_0470 cyoD cyoC TRUE 0.998 0.000 0.485 0.053 Y NA
 7300685 7300686 EcSMS35_0470 EcSMS35_0471 cyoC cyoB TRUE 0.998 -10.000 0.697 0.053 Y NA
 7300686 7300687 EcSMS35_0471 EcSMS35_0472 cyoB cyoA TRUE 0.958 22.000 0.041 0.004 Y NA
 7300689 7300690 EcSMS35_0474 EcSMS35_0475 ampG   TRUE 0.708 44.000 0.256 NA   NA
 7300690 7300691 EcSMS35_0475 EcSMS35_0476     FALSE 0.200 50.000 0.000 NA   NA
 7300692 7300693 EcSMS35_0477 EcSMS35_0478     FALSE 0.195 51.000 0.000 NA   NA
 7300693 7300694 EcSMS35_0478 EcSMS35_0479   tig FALSE 0.064 147.000 0.000 NA   NA
 7300694 7300695 EcSMS35_0479 EcSMS35_0480 tig clpP FALSE 0.400 246.000 0.351 1.000 Y NA
 7300695 7300696 EcSMS35_0480 EcSMS35_0481 clpP clpX TRUE 0.867 126.000 0.352 1.000 Y NA
 7300696 7300697 EcSMS35_0481 EcSMS35_0482 clpX lon TRUE 0.620 188.000 0.201 0.097 Y NA
 7300697 7300698 EcSMS35_0482 EcSMS35_0483 lon hupB FALSE 0.036 209.000 0.000 1.000 N NA
 7300698 7300699 EcSMS35_0483 EcSMS35_0484 hupB ppiD FALSE 0.049 192.000 0.000 1.000 N NA
 7300699 7300700 EcSMS35_0484 EcSMS35_0485 ppiD   FALSE 0.116 151.000 0.033 1.000 N NA
 7300700 7300701 EcSMS35_0485 EcSMS35_0486     FALSE 0.177 106.000 0.027 1.000   NA
 7300702 7300703 EcSMS35_0487 EcSMS35_0488 queC   FALSE 0.209 65.000 0.019 1.000   NA
 7300704 7300705 EcSMS35_0489 EcSMS35_0490 cof   FALSE 0.082 153.000 0.020 1.000   NA
 7300705 7300706 EcSMS35_0490 EcSMS35_0491   mdlA TRUE 0.762 30.000 0.179 1.000 N NA
 7300706 7300707 EcSMS35_0491 EcSMS35_0492 mdlA mdlB TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.001 Y NA
 7300709 7300710 EcSMS35_0494 EcSMS35_0495 glnK amt TRUE 0.739 30.000 0.156 1.000 N NA
 7300715 7300716 EcSMS35_0500 EcSMS35_0501     FALSE 0.045 164.000 0.000 NA   NA
 7300716 7300717 EcSMS35_0501 EcSMS35_0502   maa FALSE 0.321 116.000 0.101 1.000   NA
 7300717 7300718 EcSMS35_0502 EcSMS35_0503 maa   FALSE 0.086 172.000 0.076 NA   NA
 7300718 7300719 EcSMS35_0503 EcSMS35_0504     TRUE 0.573 26.000 0.080 NA   NA
 7300719 7300720 EcSMS35_0504 EcSMS35_0505     FALSE 0.002 546.000 0.000 NA   NA
 7300720 7300721 EcSMS35_0505 EcSMS35_0506   acrA TRUE 0.927 23.000 0.458 1.000 N NA
 7300722 7300723 EcSMS35_0507 EcSMS35_0508 acrR kefA FALSE 0.111 128.000 0.000 NA N NA
 7300724 7300725 EcSMS35_0509 EcSMS35_0510   priC TRUE 0.941 14.000 0.474 NA   NA
 7300726 7300727 EcSMS35_0511 EcSMS35_0512   apt FALSE 0.078 153.000 0.043 NA   NA
 7300727 7300728 EcSMS35_0512 EcSMS35_0513 apt dnaX FALSE 0.276 129.000 0.088 1.000 N NA
 7300728 7300729 EcSMS35_0513 EcSMS35_0514 dnaX   TRUE 0.764 53.000 0.411 NA   NA
 7300729 7300730 EcSMS35_0514 EcSMS35_0515   recR TRUE 0.987 0.000 0.604 NA   NA
 7300730 7300731 EcSMS35_0515 EcSMS35_0516 recR htpG FALSE 0.201 110.000 0.028 1.000 N NA
 7300733 7300734 EcSMS35_0518 EcSMS35_0520 adk hemH FALSE 0.134 132.000 0.013 1.000 N NA
 7300737 7300738 EcSMS35_0522 EcSMS35_0523   fsr FALSE 0.015 238.000 0.000 NA N NA
 7300740 7300741 EcSMS35_0525 EcSMS35_0526     FALSE 0.021 204.000 0.022 NA   NA
 7300741 7300742 EcSMS35_0526 EcSMS35_0527   copA FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 7300743 7300744 EcSMS35_0528 EcSMS35_0529 glsA1   TRUE 0.975 3.000 0.028 1.000 Y NA
 7300744 7300745 EcSMS35_0529 EcSMS35_0530   cueR FALSE 0.163 125.000 0.000 1.000 N NA
 7300746 7300747 EcSMS35_0531 EcSMS35_0532     FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   NA
 7300747 7300748 EcSMS35_0532 EcSMS35_0533     FALSE 0.179 54.000 0.000 NA   NA
 7300748 7300749 EcSMS35_0533 EcSMS35_0534     FALSE 0.119 98.000 0.000 NA   NA
 7300750 7300751 EcSMS35_0535 EcSMS35_0536     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7300752 7300753 EcSMS35_0537 EcSMS35_0538     TRUE 0.994 -3.000 0.313 NA Y NA
 7300754 7300755 EcSMS35_0539 EcSMS35_0540     TRUE 0.607 -13.000 0.012 NA   NA
 7300756 7300757 EcSMS35_0541 EcSMS35_0542 ybbN   FALSE 0.450 61.000 0.118 1.000   NA
 7300757 7300758 EcSMS35_0542 EcSMS35_0543   tesA TRUE 0.588 29.000 0.072 1.000   NA
 7300759 7300760 EcSMS35_0544 EcSMS35_0545     TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 7300761 7300762 EcSMS35_0546 EcSMS35_0547 selU   FALSE 0.190 69.000 0.012 1.000   NA
 7300763 7300764 EcSMS35_0548 EcSMS35_0549 allA allR TRUE 0.766 123.000 0.625 1.000 N NA
 7300764 7300765 EcSMS35_0549 EcSMS35_0550 allR gcl FALSE 0.261 90.000 0.054 1.000   NA
 7300765 7300766 EcSMS35_0550 EcSMS35_0551 gcl hyi TRUE 0.735 13.000 0.065 1.000   NA
 7300766 7300767 EcSMS35_0551 EcSMS35_0552 hyi   FALSE 0.448 100.000 0.154 1.000 N NA
 7300767 7300768 EcSMS35_0552 EcSMS35_0553     FALSE 0.072 170.000 0.000 1.000 N NA
 7300768 7300769 EcSMS35_0553 EcSMS35_0554   allB TRUE 0.856 61.000 0.161 1.000 Y NA
 7300769 7300770 EcSMS35_0554 EcSMS35_0555 allB   FALSE 0.169 56.000 0.000 NA   NA
 7300770 7300771 EcSMS35_0555 EcSMS35_0556     FALSE 0.398 22.000 0.000 NA   NA
 7300771 7300772 EcSMS35_0556 EcSMS35_0557     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7300772 7300773 EcSMS35_0557 EcSMS35_0558     FALSE 0.242 42.000 0.000 NA   NA
 7300773 7300774 EcSMS35_0558 EcSMS35_0559     FALSE 0.398 22.000 0.000 NA   NA
 7300775 7300776 EcSMS35_0560 EcSMS35_0561   allC TRUE 0.699 11.000 0.059 NA   NA
 7300776 7300777 EcSMS35_0561 EcSMS35_0562 allC allD TRUE 0.819 22.000 0.174 1.000 N NA
 7300778 7300779 EcSMS35_0563 EcSMS35_0564     TRUE 0.952 10.000 0.412 NA   NA
 7300779 7300780 EcSMS35_0564 EcSMS35_0565     TRUE 0.910 11.000 0.265 NA   NA
 7300780 7300781 EcSMS35_0565 EcSMS35_0566   arcC TRUE 0.979 -3.000 0.375 NA   NA
 7300782 7300783 EcSMS35_0567 EcSMS35_0568 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 7300783 7300784 EcSMS35_0568 EcSMS35_0569 purE lpxH FALSE 0.146 117.000 0.016 1.000   NA
 7300784 7300785 EcSMS35_0569 EcSMS35_0570 lpxH ppiB TRUE 0.953 3.000 0.237 1.000   NA
 7300787 7300788 EcSMS35_0572 EcSMS35_0573     FALSE 0.093 108.000 0.011 NA   NA
 7300788 7300789 EcSMS35_0573 EcSMS35_0574   folD TRUE 0.862 2.000 0.055 1.000   NA
 7300790 7300791 EcSMS35_0575 EcSMS35_0576     FALSE 0.208 219.000 0.000 1.000 Y NA
 7300791 7300792 EcSMS35_0576 EcSMS35_0577   sfmD TRUE 0.987 31.000 0.875 1.000 Y NA
 7300792 7300793 EcSMS35_0577 EcSMS35_0578 sfmD   TRUE 0.995 13.000 0.875 1.000 Y NA
 7300793 7300794 EcSMS35_0578 EcSMS35_0579     FALSE 0.229 329.000 0.875 0.010   NA
 7300796 7300797 EcSMS35_0581 EcSMS35_0582     FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7300798 7300799 EcSMS35_0583 EcSMS35_0584     FALSE 0.032 183.000 0.000 NA   NA
 7300799 7300800 EcSMS35_0584 EcSMS35_0585     TRUE 0.980 1.000 0.500 NA   NA
 7300800 7300801 EcSMS35_0585 EcSMS35_0586   nfrB TRUE 0.913 -13.000 0.159 1.000   NA
 7300801 7300802 EcSMS35_0586 EcSMS35_0587 nfrB cusS FALSE 0.210 150.000 0.000 0.097 N NA
 7300802 7300803 EcSMS35_0587 EcSMS35_0588 cusS cusR TRUE 0.998 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 7300804 7300805 EcSMS35_0589 EcSMS35_0590   cusC TRUE 0.540 -45.000 0.000 NA   NA
 7300805 7300806 EcSMS35_0590 EcSMS35_0591 cusC cusF TRUE 0.917 24.000 0.500 NA   NA
 7300806 7300807 EcSMS35_0591 EcSMS35_0592 cusF cusB FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7300807 7300808 EcSMS35_0592 EcSMS35_0593 cusB cusA TRUE 0.961 12.000 0.500 1.000 N NA
 7300808 7300809 EcSMS35_0593 EcSMS35_0594 cusA pheP FALSE 0.361 102.000 0.000 0.085 N NA
 7300810 7300811 EcSMS35_0595 EcSMS35_0596   nfnB FALSE 0.121 108.000 0.012 NA N NA
 7300811 7300812 EcSMS35_0596 EcSMS35_0597 nfnB   TRUE 0.733 79.000 0.500 NA   NA
 7300812 7300813 EcSMS35_0597 EcSMS35_0598     FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 7300813 7300814 EcSMS35_0598 EcSMS35_0599     FALSE 0.147 66.000 0.000 NA   NA
 7300816 7300817 EcSMS35_0601 EcSMS35_0602 entD fepA TRUE 0.578 175.000 0.700 1.000 N NA
 7300818 7300819 EcSMS35_0603 EcSMS35_0604   fes FALSE 0.101 119.000 0.000 NA   NA
 7300819 7300820 EcSMS35_0604 EcSMS35_0605 fes   TRUE 0.960 3.000 0.320 NA   NA
 7300820 7300821 EcSMS35_0605 EcSMS35_0606   entF TRUE 0.898 -3.000 0.080 NA   NA
 7300821 7300822 EcSMS35_0606 EcSMS35_0608 entF fepE FALSE 0.031 215.000 0.000 1.000 N NA
 7300823 7300824 EcSMS35_0607 EcSMS35_0609 fepC fepG TRUE 0.985 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 7300824 7300825 EcSMS35_0609 EcSMS35_0610 fepG fepD TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 7300828 7300829 EcSMS35_0613 EcSMS35_0614 entC entE TRUE 0.995 10.000 0.667 1.000 Y NA
 7300829 7300830 EcSMS35_0614 EcSMS35_0615 entE entB TRUE 0.992 14.000 0.667 1.000 Y NA
 7300830 7300831 EcSMS35_0615 EcSMS35_0616 entB entA TRUE 0.982 0.000 0.024 1.000 Y NA
 7300831 7300832 EcSMS35_0616 EcSMS35_0617 entA   TRUE 0.977 3.000 0.065 NA Y NA
 7300832 7300833 EcSMS35_0617 EcSMS35_0618   cstA FALSE 0.204 181.000 0.222 NA N NA
 7300833 7300834 EcSMS35_0618 EcSMS35_0619 cstA   TRUE 0.573 113.000 0.333 NA   NA
 7300837 7300838 EcSMS35_0622 EcSMS35_0623     TRUE 0.736 -15.000 0.000 1.000   NA
 7300838 7300839 EcSMS35_0623 EcSMS35_0624     FALSE 0.469 147.000 0.333 1.000   NA
 7300839 7300840 EcSMS35_0624 EcSMS35_0625   dsbG FALSE 0.050 205.000 0.067 NA N NA
 7300841 7300842 EcSMS35_0626 EcSMS35_0627 ahpC ahpF TRUE 0.965 99.000 0.551 0.001 Y NA
 7300843 7300844 EcSMS35_0628 EcSMS35_0629 uspG rnk FALSE 0.006 356.000 0.000 1.000 N NA
 7300844 7300845 EcSMS35_0629 EcSMS35_0630 rnk rna FALSE 0.023 230.000 0.018 1.000 N NA
 7300845 7300846 EcSMS35_0630 EcSMS35_0631 rna   FALSE 0.187 114.000 0.024 1.000 N NA
 7300846 7300847 EcSMS35_0631 EcSMS35_0632   citG TRUE 0.530 83.000 0.194 1.000 N NA
 7300847 7300848 EcSMS35_0632 EcSMS35_0633 citG citX TRUE 0.990 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 7300848 7300849 EcSMS35_0633 EcSMS35_0634 citX citF TRUE 0.792 4.000 0.000 1.000 N NA
 7300849 7300850 EcSMS35_0634 EcSMS35_0635 citF citE TRUE 0.897 11.000 0.000 0.001 N NA
 7300850 7300851 EcSMS35_0635 EcSMS35_0636 citE citD TRUE 0.995 -3.000 0.537 0.001 N NA
 7300851 7300852 EcSMS35_0636 EcSMS35_0637 citD citC TRUE 0.935 15.000 0.000 1.000 Y NA
 7300853 7300854 EcSMS35_0638 EcSMS35_0639 dpiB dpiA TRUE 0.956 -31.000 0.000 1.000 Y NA
 7300858 7300859 EcSMS35_0643 EcSMS35_0644   cspE FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 7300861 7300862 EcSMS35_0646 EcSMS35_0647   tatE FALSE 0.404 129.000 0.196 1.000   NA
 7300863 7300864 EcSMS35_0648 EcSMS35_0649 lipA   FALSE 0.030 209.000 0.005 1.000 N NA
 7300864 7300865 EcSMS35_0649 EcSMS35_0650   lipB FALSE 0.016 260.000 0.000 1.000 N NA
 7300865 7300866 EcSMS35_0650 EcSMS35_0651 lipB   FALSE 0.469 101.000 0.219 NA   NA
 7300866 7300867 EcSMS35_0651 EcSMS35_0652   dacA FALSE 0.239 110.000 0.081 NA   NA
 7300867 7300868 EcSMS35_0652 EcSMS35_0653 dacA rlpA TRUE 0.854 140.000 0.475 NA Y NA
 7300868 7300869 EcSMS35_0653 EcSMS35_0654 rlpA mrdB TRUE 0.655 11.000 0.035 NA N NA
 7300869 7300870 EcSMS35_0654 EcSMS35_0655 mrdB mrdA TRUE 0.854 3.000 0.046 1.000 N NA
 7300870 7300871 EcSMS35_0655 EcSMS35_0656 mrdA   FALSE 0.341 31.000 0.031 NA   NA
 7300871 7300872 EcSMS35_0656 EcSMS35_0657     TRUE 0.953 4.000 0.307 NA   NA
 7300872 7300873 EcSMS35_0657 EcSMS35_0658   cobC FALSE 0.008 260.000 0.000 NA   NA
 7300873 7300874 EcSMS35_0658 EcSMS35_0659 cobC nadD TRUE 0.637 24.000 0.057 1.000 N NA
 7300874 7300875 EcSMS35_0659 EcSMS35_0660 nadD holA TRUE 0.864 2.000 0.045 1.000 N NA
 7300875 7300876 EcSMS35_0660 EcSMS35_0661 holA   TRUE 0.954 0.000 0.199 NA N NA
 7300876 7300877 EcSMS35_0661 EcSMS35_0662   leuS TRUE 0.841 15.000 0.182 NA N NA
 7300878 7300879 EcSMS35_0663 EcSMS35_0665     TRUE 0.564 -34.000 0.000 NA   NA
 7300881 7300882 EcSMS35_0666 EcSMS35_0667     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300884 7300885 EcSMS35_0669 EcSMS35_0670     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7300886 7300887 EcSMS35_0671 EcSMS35_0672 hscC rihA FALSE 0.158 84.000 0.000 NA N NA
 7300887 7300888 EcSMS35_0672 EcSMS35_0673 rihA gltL FALSE 0.424 118.000 0.195 NA N NA
 7300888 7300889 EcSMS35_0673 EcSMS35_0674 gltL gltK TRUE 0.995 0.000 0.379 1.000 Y NA
 7300889 7300890 EcSMS35_0674 EcSMS35_0675 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.016 Y NA
 7300890 7300891 EcSMS35_0675 EcSMS35_0676 gltJ gltI FALSE 0.518 170.000 0.000 0.058 Y NA
 7300891 7300892 EcSMS35_0676 EcSMS35_0677 gltI   FALSE 0.069 143.000 0.000 NA   NA
 7300894 7300895 EcSMS35_0678 EcSMS35_0680 lnt corC TRUE 0.938 25.000 0.557 1.000 N NA
 7300895 7300896 EcSMS35_0680 EcSMS35_0681 corC   FALSE 0.393 90.000 0.150 NA   NA
 7300896 7300897 EcSMS35_0681 EcSMS35_0682     TRUE 0.983 -3.000 0.457 NA   NA
 7300897 7300898 EcSMS35_0682 EcSMS35_0683     FALSE 0.159 59.000 0.000 NA   NA
 7300898 7300899 EcSMS35_0683 EcSMS35_0684   miaB TRUE 0.591 -25.000 0.000 NA   NA
 7300901 7300902 EcSMS35_0686 EcSMS35_0687     FALSE 0.268 36.000 0.000 NA   NA
 7300902 7300903 EcSMS35_0687 EcSMS35_0688     FALSE 0.216 47.000 0.000 NA   NA
 7300903 7300904 EcSMS35_0688 EcSMS35_0689     FALSE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 7300904 7300905 EcSMS35_0689 EcSMS35_0690     FALSE 0.279 34.000 0.000 NA   NA
 7300905 7300906 EcSMS35_0690 EcSMS35_0691     FALSE 0.387 23.000 0.000 NA   NA
 7300906 7300907 EcSMS35_0691 EcSMS35_0692     TRUE 0.620 7.000 0.000 NA   NA
 7300907 7300908 EcSMS35_0692 EcSMS35_0693   asnB FALSE 0.003 380.000 0.000 NA   NA
 7300910 7300911 EcSMS35_0695 EcSMS35_0696 nagD nagC TRUE 0.852 48.000 0.070 1.000 Y NA
 7300911 7300912 EcSMS35_0696 EcSMS35_0697 nagC nagA TRUE 0.994 9.000 0.571 1.000 Y NA
 7300912 7300913 EcSMS35_0697 EcSMS35_0698 nagA nagB TRUE 0.975 60.000 0.557 0.001 Y NA
 7300913 7300914 EcSMS35_0698 EcSMS35_0699 nagB   FALSE 0.240 49.000 0.033 NA   NA
 7300917 7300918 EcSMS35_0702 EcSMS35_0703 glnS   FALSE 0.003 442.000 0.000 1.000   NA
 7300918 7300919 EcSMS35_0703 EcSMS35_0704     FALSE 0.200 50.000 0.000 NA   NA
 7300920 7300921 EcSMS35_0705 EcSMS35_0706 fur fldA FALSE 0.037 289.000 0.156 1.000 N NA
 7300921 7300922 EcSMS35_0706 EcSMS35_0707 fldA   TRUE 0.601 140.000 0.473 1.000   NA
 7300922 7300923 EcSMS35_0707 EcSMS35_0708   ybfF FALSE 0.402 140.000 0.276 NA   NA
 7300924 7300925 EcSMS35_0709 EcSMS35_0710 seqA pgm TRUE 0.764 26.000 0.151 1.000 N NA
 7300925 7300926 EcSMS35_0710 EcSMS35_0711 pgm   FALSE 0.021 205.000 0.000 NA   NA
 7300927 7300928 EcSMS35_0712 EcSMS35_0713     FALSE 0.133 78.000 0.000 NA   NA
 7300928 7300929 EcSMS35_0713 EcSMS35_0714   potE FALSE 0.098 122.000 0.000 NA   NA
 7300929 7300930 EcSMS35_0714 EcSMS35_0715 potE speF TRUE 0.988 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7300930 7300931 EcSMS35_0715 EcSMS35_0716 speF kdpE FALSE 0.003 596.000 0.000 1.000 N NA
 7300931 7300932 EcSMS35_0716 EcSMS35_0717 kdpE kdpD TRUE 0.996 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 7300932 7300933 EcSMS35_0717 EcSMS35_0718 kdpD kdpC TRUE 0.916 -7.000 0.100 1.000 N NA
 7300933 7300934 EcSMS35_0718 EcSMS35_0719 kdpC kdpB TRUE 0.998 9.000 0.877 0.001 Y NA
 7300934 7300935 EcSMS35_0719 EcSMS35_0720 kdpB kdpA TRUE 0.980 23.000 0.201 0.001 Y NA
 7300936 7300937 EcSMS35_0721 EcSMS35_0722     FALSE 0.488 101.000 0.231 NA   NA
 7300937 7300938 EcSMS35_0722 EcSMS35_0723   phrB TRUE 0.771 -3.000 0.019 NA   NA
 7300940 7300941 EcSMS35_0725 EcSMS35_0726     FALSE 0.511 23.000 0.050 NA   NA
 7300941 7300942 EcSMS35_0726 EcSMS35_0727     TRUE 0.994 -6.000 0.379 NA Y NA
 7300942 7300943 EcSMS35_0727 EcSMS35_0728     TRUE 0.929 -10.000 0.211 NA   NA
 7300943 7300944 EcSMS35_0728 EcSMS35_0730   nei FALSE 0.414 36.000 0.037 1.000   NA
 7300945 7300946 EcSMS35_0729 EcSMS35_0731 abrB   FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7300946 7300947 EcSMS35_0731 EcSMS35_0732   gltA FALSE 0.064 147.000 0.000 NA   NA
 7300948 7300949 EcSMS35_0733 EcSMS35_0734   sdhC FALSE 0.002 521.000 0.000 NA   NA
 7300949 7300950 EcSMS35_0734 EcSMS35_0735 sdhC sdhD TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 7300950 7300951 EcSMS35_0735 EcSMS35_0736 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 7300951 7300952 EcSMS35_0736 EcSMS35_0737 sdhA sdhB TRUE 0.994 16.000 0.604 0.002 Y NA
 7300952 7300953 EcSMS35_0737 EcSMS35_0738 sdhB sucA FALSE 0.328 201.000 0.067 1.000 Y NA
 7300953 7300954 EcSMS35_0738 EcSMS35_0739 sucA sucB TRUE 0.991 15.000 0.667 1.000 Y NA
 7300954 7300955 EcSMS35_0739 EcSMS35_0740 sucB sucC TRUE 0.809 94.000 0.136 1.000 Y NA
 7300955 7300956 EcSMS35_0740 EcSMS35_0741 sucC sucD TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 7300956 7300957 EcSMS35_0741 EcSMS35_0742 sucD   FALSE 0.015 249.000 0.000 1.000   NA
 7300957 7300958 EcSMS35_0742 EcSMS35_0743     FALSE 0.011 271.000 0.000 1.000   NA
 7300959 7300960 EcSMS35_0744 EcSMS35_0745 cobO   TRUE 0.699 10.000 0.012 1.000 N NA
 7300960 7300961 EcSMS35_0745 EcSMS35_0746     TRUE 0.907 108.000 0.429 1.000 Y NA
 7300961 7300962 EcSMS35_0746 EcSMS35_0747     FALSE 0.152 161.000 0.121 NA   NA
 7300962 7300963 EcSMS35_0747 EcSMS35_0748     TRUE 0.990 -3.000 0.689 NA   NA
 7300963 7300964 EcSMS35_0748 EcSMS35_0749     TRUE 0.958 4.000 0.333 NA   NA
 7300964 7300965 EcSMS35_0749 EcSMS35_0750   mutE TRUE 0.998 0.000 0.651 1.000 Y NA
 7300965 7300966 EcSMS35_0750 EcSMS35_0751 mutE   TRUE 0.918 19.000 0.429 NA   NA
 7300966 7300967 EcSMS35_0751 EcSMS35_0752   mamA TRUE 0.976 0.000 0.367 NA   NA
 7300967 7300968 EcSMS35_0752 EcSMS35_0753 mamA   FALSE 0.002 547.000 0.000 NA   NA
 7300968 7300969 EcSMS35_0753 EcSMS35_0754     FALSE 0.130 81.000 0.000 NA   NA
 7300970 7300971 EcSMS35_0755 EcSMS35_0756 cydA cydB1 TRUE 0.956 16.000 0.000 0.052 Y NA
 7300971 7300972 EcSMS35_0756 EcSMS35_0757 cydB1   TRUE 0.794 15.000 0.149 NA   NA
 7300972 7300973 EcSMS35_0757 EcSMS35_0758     TRUE 0.970 0.000 0.310 NA   NA
 7300973 7300974 EcSMS35_0758 EcSMS35_0759   ybgC FALSE 0.157 150.000 0.095 NA   NA
 7300974 7300975 EcSMS35_0759 EcSMS35_0760 ybgC tolQ TRUE 0.990 -3.000 0.593 1.000   NA
 7300975 7300976 EcSMS35_0760 EcSMS35_0761 tolQ tolR TRUE 0.997 4.000 0.556 0.071 Y NA
 7300976 7300977 EcSMS35_0761 EcSMS35_0762 tolR tolA FALSE 0.402 65.000 0.114 NA N NA
 7300977 7300978 EcSMS35_0762 EcSMS35_0763 tolA tolB FALSE 0.156 130.000 0.051 NA N NA
 7300978 7300979 EcSMS35_0763 EcSMS35_0764 tolB pal TRUE 0.914 35.000 0.592 1.000 N NA
 7300979 7300980 EcSMS35_0764 EcSMS35_0765 pal ygbF TRUE 0.832 10.000 0.088 1.000   NA
 7300980 7300981 EcSMS35_0765 EcSMS35_0766 ygbF   FALSE 0.045 164.000 0.000 NA   NA
 7300981 7300982 EcSMS35_0766 EcSMS35_0767     FALSE 0.273 35.000 0.000 NA   NA
 7300982 7300983 EcSMS35_0767 EcSMS35_0768     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7300983 7300984 EcSMS35_0768 EcSMS35_0769     FALSE 0.190 52.000 0.000 NA   NA
 7300984 7300985 EcSMS35_0769 EcSMS35_0770     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7300985 7300986 EcSMS35_0770 EcSMS35_0771     FALSE 0.210 48.000 0.000 NA   NA
 7300986 7300987 EcSMS35_0771 EcSMS35_0772     FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   NA
 7300987 7300988 EcSMS35_0772 EcSMS35_0773   nadA FALSE 0.010 249.000 0.000 NA   NA
 7300988 7300989 EcSMS35_0773 EcSMS35_0775 nadA pnuC TRUE 0.851 38.000 0.023 1.000 Y NA
 7300990 7300991 EcSMS35_0774 EcSMS35_0776 zitB   FALSE 0.107 114.000 0.000 NA   NA
 7300993 7300994 EcSMS35_0778 EcSMS35_0779 gpmA galM FALSE 0.257 203.000 0.009 1.000 Y NA
 7300994 7300995 EcSMS35_0779 EcSMS35_0780 galM galK TRUE 0.993 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 7300995 7300996 EcSMS35_0780 EcSMS35_0781 galK galT TRUE 0.986 4.000 0.370 0.001 N NA
 7300996 7300997 EcSMS35_0781 EcSMS35_0782 galT galE TRUE 0.924 10.000 0.053 0.001 N NA
 7300997 7300998 EcSMS35_0782 EcSMS35_0783 galE modF FALSE 0.013 262.000 0.023 1.000   NA
 7300998 7300999 EcSMS35_0783 EcSMS35_0784 modF modE FALSE 0.372 68.000 0.009 0.095   NA
 7301000 7301001 EcSMS35_0785 EcSMS35_0786   modA FALSE 0.092 167.000 0.072 NA   NA
 7301001 7301002 EcSMS35_0786 EcSMS35_0787 modA modB TRUE 0.999 0.000 0.627 0.001 Y NA
 7301002 7301003 EcSMS35_0787 EcSMS35_0788 modB modC TRUE 0.998 3.000 0.537 0.001 Y NA
 7301007 7301008 EcSMS35_0792 EcSMS35_0793     FALSE 0.135 76.000 0.000 NA   NA
 7301008 7301009 EcSMS35_0793 EcSMS35_0794     FALSE 0.284 183.000 0.300 1.000 N NA
 7301010 7301011 EcSMS35_0795 EcSMS35_0796     FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7301011 7301012 EcSMS35_0796 EcSMS35_0797   bioA FALSE 0.119 59.000 0.003 NA   NA
 7301013 7301014 EcSMS35_0798 EcSMS35_0799 bioB bioF TRUE 0.996 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 7301014 7301015 EcSMS35_0799 EcSMS35_0800 bioF bioC TRUE 0.990 -13.000 0.133 0.002 Y NA
 7301015 7301016 EcSMS35_0800 EcSMS35_0801 bioC bioD TRUE 0.990 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 7301016 7301017 EcSMS35_0801 EcSMS35_0802 bioD uvrB FALSE 0.006 579.000 0.000 0.095 N NA
 7301019 7301020 EcSMS35_0804 EcSMS35_0805 moaA moaB TRUE 0.971 22.000 0.108 0.003 Y NA
 7301020 7301021 EcSMS35_0805 EcSMS35_0806 moaB moaC TRUE 0.991 3.000 0.109 0.003 Y NA
 7301021 7301022 EcSMS35_0806 EcSMS35_0807 moaC moaD TRUE 0.994 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 7301022 7301023 EcSMS35_0807 EcSMS35_0808 moaD moaE TRUE 0.998 2.000 0.501 0.003 Y NA
 7301023 7301024 EcSMS35_0808 EcSMS35_0809 moaE   FALSE 0.079 137.000 0.025 NA   NA
 7301024 7301025 EcSMS35_0809 EcSMS35_0810     FALSE 0.026 207.000 0.037 NA   NA
 7301026 7301027 EcSMS35_0811 EcSMS35_0812     TRUE 0.880 0.000 0.071 NA   NA
 7301027 7301028 EcSMS35_0812 EcSMS35_0813     TRUE 0.975 -3.000 0.333 NA   NA
 7301030 7301031 EcSMS35_0814 EcSMS35_0816     TRUE 0.996 11.000 0.609 0.006 Y NA
 7301031 7301032 EcSMS35_0816 EcSMS35_0817     TRUE 0.989 -7.000 0.547 0.095   NA
 7301032 7301033 EcSMS35_0817 EcSMS35_0818     TRUE 0.983 -7.000 0.545 1.000   NA
 7301033 7301034 EcSMS35_0818 EcSMS35_0819     TRUE 0.957 3.000 0.236 1.000 N NA
 7301035 7301036 EcSMS35_0820 EcSMS35_0821     FALSE 0.050 157.000 0.000 NA   NA
 7301036 7301037 EcSMS35_0821 EcSMS35_0822     TRUE 0.931 0.000 0.143 NA   NA
 7301037 7301038 EcSMS35_0822 EcSMS35_0823   dinG FALSE 0.039 171.000 0.000 NA   NA
 7301038 7301039 EcSMS35_0823 EcSMS35_0824 dinG   TRUE 0.538 28.000 0.041 1.000 N NA
 7301039 7301040 EcSMS35_0824 EcSMS35_0825     FALSE 0.258 141.000 0.000 0.059 N NA
 7301041 7301042 EcSMS35_0826 EcSMS35_0827     FALSE 0.008 265.000 0.027 NA   NA
 7301042 7301043 EcSMS35_0827 EcSMS35_0828     FALSE 0.201 74.000 0.000 1.000   NA
 7301043 7301044 EcSMS35_0828 EcSMS35_0829   fiu TRUE 0.663 42.000 0.171 1.000   NA
 7301044 7301045 EcSMS35_0829 EcSMS35_0830 fiu   FALSE 0.008 265.000 0.000 NA   NA
 7301047 7301048 EcSMS35_0831 EcSMS35_0833   glnQ FALSE 0.129 117.000 0.000 NA N NA
 7301048 7301049 EcSMS35_0833 EcSMS35_0834 glnQ glnP TRUE 0.985 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 7301049 7301050 EcSMS35_0834 EcSMS35_0835 glnP glnH TRUE 0.700 139.000 0.051 0.071 Y NA
 7301050 7301051 EcSMS35_0835 EcSMS35_0836 glnH dps FALSE 0.004 404.000 0.000 1.000 N NA
 7301051 7301052 EcSMS35_0836 EcSMS35_0837 dps rhtA FALSE 0.008 300.000 0.044 NA   NA
 7301054 7301055 EcSMS35_0839 EcSMS35_0840     FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 7301056 7301057 EcSMS35_0841 EcSMS35_0842 mntR   TRUE 0.859 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7301059 7301060 EcSMS35_0844 EcSMS35_0845     FALSE 0.139 73.000 0.000 NA   NA
 7301061 7301062 EcSMS35_0846 EcSMS35_0847   supH FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7301062 7301063 EcSMS35_0847 EcSMS35_0848 supH   FALSE 0.099 146.000 0.000 1.000   NA
 7301063 7301064 EcSMS35_0848 EcSMS35_0849     TRUE 0.978 6.000 0.316 0.003 N NA
 7301066 7301067 EcSMS35_0851 EcSMS35_0852 moeB moeA TRUE 0.997 0.000 0.323 0.003 Y NA
 7301068 7301069 EcSMS35_0853 EcSMS35_0854   gsiA TRUE 0.882 -13.000 0.104 1.000   NA
 7301069 7301070 EcSMS35_0854 EcSMS35_0855 gsiA gsiB TRUE 0.708 20.000 0.083 1.000   NA
 7301070 7301071 EcSMS35_0855 EcSMS35_0856 gsiB gsiC TRUE 0.995 18.000 0.803 0.057 Y NA
 7301071 7301072 EcSMS35_0856 EcSMS35_0857 gsiC gsiD TRUE 0.998 3.000 0.689 0.057 Y NA
 7301072 7301073 EcSMS35_0857 EcSMS35_0858 gsiD   FALSE 0.044 177.000 0.000 NA N NA
 7301073 7301074 EcSMS35_0858 EcSMS35_0859     TRUE 0.637 110.000 0.000 NA Y NA
 7301075 7301076 EcSMS35_0860 EcSMS35_0861     TRUE 0.952 -10.000 0.300 NA   NA
 7301076 7301077 EcSMS35_0861 EcSMS35_0862     FALSE 0.014 226.000 0.000 NA   NA
 7301078 7301079 EcSMS35_0863 EcSMS35_0865 bssR   FALSE 0.162 111.000 0.047 NA   NA
 7301082 7301083 EcSMS35_0867 EcSMS35_0868 deoR   TRUE 0.629 58.000 0.235 1.000   NA
 7301085 7301086 EcSMS35_0870 EcSMS35_0871   ybjI FALSE 0.127 92.000 0.000 NA   NA
 7301086 7301087 EcSMS35_0871 EcSMS35_0872 ybjI   TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301092 7301093 EcSMS35_0877 EcSMS35_0878   nfsA TRUE 0.889 -16.000 0.159 NA   NA
 7301093 7301094 EcSMS35_0878 EcSMS35_0879 nfsA rimK FALSE 0.256 61.000 0.000 1.000 N NA
 7301094 7301095 EcSMS35_0879 EcSMS35_0880 rimK   FALSE 0.232 88.000 0.065 NA   NA
 7301095 7301096 EcSMS35_0880 EcSMS35_0881     TRUE 0.542 -43.000 0.000 NA   NA
 7301096 7301097 EcSMS35_0881 EcSMS35_0882   potF FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 7301097 7301098 EcSMS35_0882 EcSMS35_0883 potF potG TRUE 0.951 95.000 0.679 1.000 Y NA
 7301098 7301099 EcSMS35_0883 EcSMS35_0884 potG potH TRUE 0.996 10.000 0.857 1.000 Y NA
 7301099 7301100 EcSMS35_0884 EcSMS35_0885 potH potI TRUE 0.998 -3.000 0.528 0.057 Y NA
 7301100 7301101 EcSMS35_0885 EcSMS35_0886 potI   TRUE 0.606 60.000 0.264 NA   NA
 7301101 7301102 EcSMS35_0886 EcSMS35_0887   rumB TRUE 0.699 41.000 0.226 NA   NA
 7301103 7301104 EcSMS35_0888 EcSMS35_0889 artJ artM FALSE 0.394 226.000 0.143 0.071 Y NA
 7301104 7301105 EcSMS35_0889 EcSMS35_0890 artM artQ TRUE 0.999 0.000 0.714 0.016 Y NA
 7301105 7301106 EcSMS35_0890 EcSMS35_0891 artQ artI TRUE 0.992 7.000 0.260 0.057 Y NA
 7301106 7301107 EcSMS35_0891 EcSMS35_0892 artI artP TRUE 0.978 18.000 0.323 1.000 Y NA
 7301107 7301108 EcSMS35_0892 EcSMS35_0893 artP   FALSE 0.039 218.000 0.081 NA   NA
 7301109 7301110 EcSMS35_0894 EcSMS35_0895     FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7301110 7301111 EcSMS35_0895 EcSMS35_0897   amiD TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301112 7301113 EcSMS35_0896 EcSMS35_0898     TRUE 0.845 63.000 0.022 0.008 Y NA
 7301113 7301114 EcSMS35_0898 EcSMS35_0899   ltaE TRUE 0.807 11.000 0.074 1.000 N NA
 7301114 7301115 EcSMS35_0899 EcSMS35_0900 ltaE poxB TRUE 0.866 37.000 0.041 1.000 Y NA
 7301115 7301116 EcSMS35_0900 EcSMS35_0901 poxB hcr FALSE 0.148 133.000 0.025 1.000 N NA
 7301116 7301117 EcSMS35_0901 EcSMS35_0902 hcr hcp TRUE 0.969 12.000 0.000 0.015 Y NA
 7301117 7301118 EcSMS35_0902 EcSMS35_0903 hcp   FALSE 0.068 144.000 0.000 NA   NA
 7301119 7301120 EcSMS35_0904 EcSMS35_0905     FALSE 0.002 809.000 0.000 1.000 N NA
 7301120 7301121 EcSMS35_0905 EcSMS35_0906     FALSE 0.507 53.000 0.105 1.000 N NA
 7301121 7301122 EcSMS35_0906 EcSMS35_0908     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7301124 7301125 EcSMS35_0909 EcSMS35_0910   pbpG FALSE 0.165 165.000 0.145 NA   NA
 7301127 7301128 EcSMS35_0912 EcSMS35_0913 bglX   FALSE 0.040 252.000 0.099 1.000 N NA
 7301128 7301129 EcSMS35_0913 EcSMS35_0914     TRUE 0.984 7.000 0.521 0.056 N NA
 7301129 7301130 EcSMS35_0914 EcSMS35_0915     TRUE 0.995 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 7301130 7301131 EcSMS35_0915 EcSMS35_0916     TRUE 0.995 5.000 0.542 1.000 Y NA
 7301133 7301134 EcSMS35_0918 EcSMS35_0919     TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.016 Y NA
 7301134 7301135 EcSMS35_0919 EcSMS35_0920     FALSE 0.315 47.000 0.051 NA   NA
 7301136 7301137 EcSMS35_0921 EcSMS35_0922     FALSE 0.094 125.000 0.000 NA   NA
 7301137 7301138 EcSMS35_0922 EcSMS35_0923     TRUE 0.944 -3.000 0.160 NA   NA
 7301138 7301139 EcSMS35_0923 EcSMS35_0924     TRUE 0.899 -7.000 0.120 NA   NA
 7301139 7301140 EcSMS35_0924 EcSMS35_0925     TRUE 0.791 11.000 0.100 NA   NA
 7301140 7301141 EcSMS35_0925 EcSMS35_0926     FALSE 0.001 576.000 0.000 NA   NA
 7301141 7301142 EcSMS35_0926 EcSMS35_0927     FALSE 0.155 61.000 0.000 NA   NA
 7301142 7301143 EcSMS35_0927 EcSMS35_0928   molR TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7301143 7301144 EcSMS35_0928 EcSMS35_0929 molR metG FALSE 0.071 141.000 0.000 NA   NA
 7301145 7301146 EcSMS35_0930 EcSMS35_0931     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 7301146 7301147 EcSMS35_0931 EcSMS35_0932     FALSE 0.005 296.000 0.000 NA   NA
 7301147 7301148 EcSMS35_0932 EcSMS35_0933     FALSE 0.130 81.000 0.000 NA   NA
 7301148 7301149 EcSMS35_0933 EcSMS35_0934     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301149 7301150 EcSMS35_0934 EcSMS35_0935     TRUE 0.566 16.000 0.000 1.000   NA
 7301151 7301152 EcSMS35_0936 EcSMS35_0937   rcnA FALSE 0.016 219.000 0.000 NA   NA
 7301153 7301154 EcSMS35_0938 EcSMS35_0939 rcnR   FALSE 0.004 330.000 0.000 NA   NA
 7301154 7301155 EcSMS35_0939 EcSMS35_0940     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301155 7301156 EcSMS35_0940 EcSMS35_0941     FALSE 0.115 104.000 0.000 NA   NA
 7301156 7301157 EcSMS35_0941 EcSMS35_0942     TRUE 0.957 11.000 0.500 NA   NA
 7301157 7301158 EcSMS35_0942 EcSMS35_0943     FALSE 0.417 20.000 0.000 NA   NA
 7301158 7301159 EcSMS35_0943 EcSMS35_0944     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7301159 7301160 EcSMS35_0944 EcSMS35_0945     TRUE 0.620 7.000 0.000 NA   NA
 7301160 7301161 EcSMS35_0945 EcSMS35_0946     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301161 7301162 EcSMS35_0946 EcSMS35_0947     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 7301162 7301163 EcSMS35_0947 EcSMS35_0948     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301163 7301164 EcSMS35_0948 EcSMS35_0949     FALSE 0.387 23.000 0.000 NA   NA
 7301166 7301167 EcSMS35_0951 EcSMS35_0952     FALSE 0.250 55.000 0.048 NA   NA
 7301167 7301168 EcSMS35_0952 EcSMS35_0953     TRUE 0.852 2.000 0.071 NA   NA
 7301168 7301169 EcSMS35_0953 EcSMS35_0954     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7301169 7301170 EcSMS35_0954 EcSMS35_0955     TRUE 0.924 0.000 0.125 NA   NA
 7301170 7301171 EcSMS35_0955 EcSMS35_0956     FALSE 0.010 262.000 0.000 NA N NA
 7301171 7301172 EcSMS35_0956 EcSMS35_0957     TRUE 0.964 -16.000 0.444 NA   NA
 7301172 7301173 EcSMS35_0957 EcSMS35_0958     TRUE 0.631 6.000 0.000 NA   NA
 7301175 7301176 EcSMS35_0960 EcSMS35_0961 thiM thiD TRUE 0.992 -3.000 0.037 0.005 Y NA
 7301176 7301177 EcSMS35_0961 EcSMS35_0962 thiD   FALSE 0.246 65.000 0.000 1.000 N NA
 7301177 7301178 EcSMS35_0962 EcSMS35_0964     FALSE 0.306 52.000 0.000 1.000 N NA
 7301179 7301180 EcSMS35_0963 EcSMS35_0965     TRUE 0.989 -3.000 0.600 NA N NA
 7301180 7301181 EcSMS35_0965 EcSMS35_0966   yegT TRUE 0.978 -3.000 0.364 NA   NA
 7301182 7301183 EcSMS35_0967 EcSMS35_0968 fbaB gatY FALSE 0.312 229.000 0.000 0.002 Y NA
 7301183 7301184 EcSMS35_0968 EcSMS35_0969 gatY   TRUE 0.944 29.000 0.000 0.001 Y NA
 7301184 7301185 EcSMS35_0969 EcSMS35_0970   gatA TRUE 0.957 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7301185 7301186 EcSMS35_0970 EcSMS35_0971 gatA gatB TRUE 0.927 31.000 0.000 0.012 Y NA
 7301186 7301187 EcSMS35_0971 EcSMS35_0972 gatB gatC TRUE 0.983 4.000 0.000 0.019 Y NA
 7301187 7301188 EcSMS35_0972 EcSMS35_0973 gatC gatD FALSE 0.334 48.000 0.000 1.000 N NA
 7301188 7301189 EcSMS35_0973 EcSMS35_0974 gatD gatR FALSE 0.201 100.000 0.000 1.000 N NA
 7301192 7301193 EcSMS35_0977 EcSMS35_0978     FALSE 0.115 103.000 0.000 NA   NA
 7301193 7301194 EcSMS35_0978 EcSMS35_0979     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7301194 7301195 EcSMS35_0979 EcSMS35_0980     FALSE 0.009 254.000 0.000 NA   NA
 7301195 7301196 EcSMS35_0980 EcSMS35_0981   baeR FALSE 0.066 180.000 0.062 NA   NA
 7301196 7301197 EcSMS35_0981 EcSMS35_0982 baeR baeS TRUE 0.997 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 7301197 7301198 EcSMS35_0982 EcSMS35_0983 baeS mdtD TRUE 0.952 -3.000 0.139 1.000 N NA
 7301198 7301199 EcSMS35_0983 EcSMS35_0984 mdtD mdtC TRUE 0.978 1.000 0.438 NA N NA
 7301199 7301200 EcSMS35_0984 EcSMS35_0985 mdtC mdtB TRUE 0.980 1.000 0.062 NA Y NA
 7301200 7301201 EcSMS35_0985 EcSMS35_0986 mdtB mdtA TRUE 0.804 0.000 0.000 NA N NA
 7301202 7301203 EcSMS35_0987 EcSMS35_0988     FALSE 0.133 78.000 0.000 NA   NA
 7301209 7301210 EcSMS35_0994 EcSMS35_0995 udk dcd TRUE 0.786 92.000 0.098 1.000 Y NA
 7301210 7301211 EcSMS35_0995 EcSMS35_0996 dcd asmA TRUE 0.593 22.000 0.057 NA N NA
 7301212 7301213 EcSMS35_0997 EcSMS35_0998     TRUE 0.949 -10.000 0.286 NA   NA
 7301213 7301214 EcSMS35_0998 EcSMS35_0999     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 7301215 7301216 EcSMS35_1000 EcSMS35_1001   wzb TRUE 0.952 6.000 0.286 1.000 N NA
 7301216 7301217 EcSMS35_1001 EcSMS35_1002 wzb wzc TRUE 0.812 3.000 0.000 1.000 N NA
 7301217 7301218 EcSMS35_1002 EcSMS35_1003 wzc wcaA TRUE 0.673 92.000 0.000 NA Y NA
 7301218 7301219 EcSMS35_1003 EcSMS35_1004 wcaA   TRUE 0.953 3.000 0.259 NA N NA
 7301219 7301220 EcSMS35_1004 EcSMS35_1005   wcaC TRUE 0.973 -3.000 0.259 1.000 N NA
 7301220 7301221 EcSMS35_1005 EcSMS35_1006 wcaC wcaD TRUE 0.952 -25.000 0.400 NA   NA
 7301221 7301222 EcSMS35_1006 EcSMS35_1007 wcaD wcaE TRUE 0.931 11.000 0.333 NA   NA
 7301222 7301223 EcSMS35_1007 EcSMS35_1008 wcaE   TRUE 0.665 16.000 0.077 NA   NA
 7301223 7301224 EcSMS35_1008 EcSMS35_1009   gmd FALSE 0.448 27.000 0.022 1.000   NA
 7301224 7301225 EcSMS35_1009 EcSMS35_1010 gmd fcl TRUE 0.986 3.000 0.000 0.008 Y NA
 7301225 7301226 EcSMS35_1010 EcSMS35_1011 fcl nudD TRUE 0.951 3.000 0.217 1.000 N NA
 7301226 7301227 EcSMS35_1011 EcSMS35_1012 nudD wcaI TRUE 0.943 -3.000 0.108 1.000 N NA
 7301227 7301228 EcSMS35_1012 EcSMS35_1013 wcaI cpsB TRUE 0.985 3.000 0.123 1.000 Y NA
 7301228 7301229 EcSMS35_1013 EcSMS35_1014 cpsB cpsG TRUE 0.874 102.000 1.000 1.000 N NA
 7301229 7301230 EcSMS35_1014 EcSMS35_1015 cpsG   TRUE 0.820 55.000 0.538 NA N NA
 7301230 7301231 EcSMS35_1015 EcSMS35_1016   wzxC TRUE 0.961 2.000 0.304 NA   NA
 7301231 7301232 EcSMS35_1016 EcSMS35_1017 wzxC wcaK FALSE 0.328 72.000 0.095 NA   NA
 7301232 7301233 EcSMS35_1017 EcSMS35_1018 wcaK wcaL TRUE 0.914 -3.000 0.095 NA   NA
 7301233 7301234 EcSMS35_1018 EcSMS35_1019 wcaL wcaM TRUE 0.919 11.000 0.292 NA   NA
 7301234 7301235 EcSMS35_1019 EcSMS35_1020 wcaM gne FALSE 0.119 158.000 0.083 NA   NA
 7301235 7301236 EcSMS35_1020 EcSMS35_1021 gne galF FALSE 0.196 243.000 0.074 1.000 Y NA
 7301236 7301237 EcSMS35_1021 EcSMS35_1022 galF   FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 7301237 7301238 EcSMS35_1022 EcSMS35_1023     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7301238 7301239 EcSMS35_1023 EcSMS35_1024     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7301239 7301240 EcSMS35_1024 EcSMS35_1025     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301240 7301241 EcSMS35_1025 EcSMS35_1026     TRUE 0.539 -49.000 0.000 NA   NA
 7301241 7301242 EcSMS35_1026 EcSMS35_1027     TRUE 0.715 -19.000 0.000 1.000   NA
 7301242 7301243 EcSMS35_1027 EcSMS35_1028     FALSE 0.387 23.000 0.000 NA   NA
 7301243 7301244 EcSMS35_1028 EcSMS35_1029     FALSE 0.398 22.000 0.000 NA   NA
 7301244 7301245 EcSMS35_1029 EcSMS35_1030     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7301245 7301246 EcSMS35_1030 EcSMS35_1031   gnd FALSE 0.005 387.000 0.000 1.000 N NA
 7301246 7301247 EcSMS35_1031 EcSMS35_1032 gnd ugd FALSE 0.019 248.000 0.000 1.000 N NA
 7301247 7301248 EcSMS35_1032 EcSMS35_1033 ugd   TRUE 0.534 146.000 0.000 1.000 Y NA
 7301249 7301250 EcSMS35_1034 EcSMS35_1035 hisIE hisF TRUE 0.998 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 7301250 7301251 EcSMS35_1035 EcSMS35_1036 hisF hisA TRUE 0.996 -18.000 0.433 0.002 Y NA
 7301251 7301252 EcSMS35_1036 EcSMS35_1037 hisA hisH TRUE 0.996 0.000 0.210 0.002 Y NA
 7301252 7301253 EcSMS35_1037 EcSMS35_1038 hisH hisB TRUE 0.994 0.000 0.128 0.002 Y NA
 7301253 7301254 EcSMS35_1038 EcSMS35_1039 hisB hisC TRUE 0.997 0.000 0.341 0.002 Y NA
 7301254 7301255 EcSMS35_1039 EcSMS35_1040 hisC hisD TRUE 0.997 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 7301255 7301256 EcSMS35_1040 EcSMS35_1041 hisD hisG TRUE 0.991 6.000 0.171 0.002 Y NA
 7301257 7301258 EcSMS35_1042 EcSMS35_1043     FALSE 0.085 130.000 0.000 NA   NA
 7301258 7301259 EcSMS35_1043 EcSMS35_1044     FALSE 0.332 46.000 0.015 1.000 N NA
 7301259 7301260 EcSMS35_1044 EcSMS35_1045   yeeF FALSE 0.014 267.000 0.000 1.000 N NA
 7301260 7301261 EcSMS35_1045 EcSMS35_1046 yeeF   FALSE 0.304 31.000 0.000 NA   NA
 7301261 7301262 EcSMS35_1046 EcSMS35_1047     FALSE 0.273 35.000 0.000 NA   NA
 7301262 7301263 EcSMS35_1047 EcSMS35_1048     TRUE 0.932 14.000 0.419 NA   NA
 7301264 7301265 EcSMS35_1049 EcSMS35_1050 sbcB   FALSE 0.095 124.000 0.000 NA   NA
 7301266 7301267 EcSMS35_1051 EcSMS35_1052 dacD gyrI FALSE 0.298 119.000 0.110 NA N NA
 7301267 7301268 EcSMS35_1052 EcSMS35_1054 gyrI   FALSE 0.068 198.000 0.096 NA   NA
 7301271 7301272 EcSMS35_1056 EcSMS35_1057     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 7301272 7301273 EcSMS35_1057 EcSMS35_1058     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7301273 7301274 EcSMS35_1058 EcSMS35_1059     FALSE 0.110 110.000 0.000 NA   NA
 7301274 7301275 EcSMS35_1059 EcSMS35_1060     FALSE 0.128 89.000 0.000 NA   NA
 7301275 7301276 EcSMS35_1060 EcSMS35_1061     FALSE 0.036 176.000 0.000 NA   NA
 7301276 7301277 EcSMS35_1061 EcSMS35_1062     FALSE 0.152 63.000 0.000 NA   NA
 7301277 7301278 EcSMS35_1062 EcSMS35_1063     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301278 7301279 EcSMS35_1063 EcSMS35_1064     FALSE 0.129 82.000 0.000 NA   NA
 7301281 7301282 EcSMS35_1065 EcSMS35_1067     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301282 7301283 EcSMS35_1067 EcSMS35_1068     FALSE 0.077 136.000 0.000 NA   NA
 7301283 7301284 EcSMS35_1068 EcSMS35_1069     TRUE 0.992 -3.000 0.800 NA   NA
 7301284 7301285 EcSMS35_1069 EcSMS35_1070     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 7301285 7301286 EcSMS35_1070 EcSMS35_1071     FALSE 0.078 218.000 0.000 0.009   NA
 7301286 7301287 EcSMS35_1071 EcSMS35_1072     FALSE 0.129 84.000 0.000 NA   NA
 7301288 7301289 EcSMS35_1073 EcSMS35_1074     TRUE 0.997 -3.000 0.571 1.000 Y NA
 7301290 7301291 EcSMS35_1075 EcSMS35_1076     FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 7301292 7301293 EcSMS35_1077 EcSMS35_1078     FALSE 0.001 649.000 0.000 NA   NA
 7301293 7301294 EcSMS35_1078 EcSMS35_1079     FALSE 0.001 680.000 0.000 NA   NA
 7301294 7301295 EcSMS35_1079 EcSMS35_1080     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 7301296 7301297 EcSMS35_1081 EcSMS35_1082     TRUE 0.829 3.000 0.067 NA   NA
 7301297 7301298 EcSMS35_1082 EcSMS35_1083     FALSE 0.166 57.000 0.000 NA   NA
 7301298 7301299 EcSMS35_1083 EcSMS35_1084     FALSE 0.483 14.000 0.000 NA   NA
 7301299 7301300 EcSMS35_1084 EcSMS35_1085     FALSE 0.002 419.000 0.000 NA   NA
 7301301 7301302 EcSMS35_1086 EcSMS35_1088     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.068 Y NA
 7301303 7301304 EcSMS35_1087 EcSMS35_1089     FALSE 0.023 223.000 0.000 1.000   NA
 7301304 7301305 EcSMS35_1089 EcSMS35_1090     TRUE 0.783 59.000 0.467 1.000   NA
 7301306 7301307 EcSMS35_1091 EcSMS35_1092     FALSE 0.007 270.000 0.000 NA   NA
 7301307 7301308 EcSMS35_1092 EcSMS35_1093     FALSE 0.009 256.000 0.000 NA   NA
 7301309 7301310 EcSMS35_1094 EcSMS35_1095     FALSE 0.457 120.000 0.192 1.000 N NA
 7301310 7301311 EcSMS35_1095 EcSMS35_1096     TRUE 0.989 -3.000 0.385 0.057 N NA
 7301311 7301312 EcSMS35_1096 EcSMS35_1097   dgoK_2 TRUE 0.997 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 7301312 7301313 EcSMS35_1097 EcSMS35_1098 dgoK_2 dgoR_2 TRUE 0.993 -3.000 0.733 1.000 N NA
 7301314 7301315 EcSMS35_1099 EcSMS35_1100     FALSE 0.008 263.000 0.000 NA   NA
 7301315 7301316 EcSMS35_1100 EcSMS35_1101     TRUE 0.739 120.000 0.000 0.068 Y NA
 7301316 7301317 EcSMS35_1101 EcSMS35_1102     FALSE 0.024 220.000 0.000 1.000   NA
 7301317 7301318 EcSMS35_1102 EcSMS35_1103     FALSE 0.002 1252.000 0.000 1.000   NA
 7301318 7301319 EcSMS35_1103 EcSMS35_1104     TRUE 0.583 105.000 0.273 1.000 N NA
 7301319 7301320 EcSMS35_1104 EcSMS35_1105     TRUE 0.904 -40.000 0.226 NA N NA
 7301320 7301321 EcSMS35_1105 EcSMS35_1106     FALSE 0.257 64.000 0.061 NA   NA
 7301322 7301323 EcSMS35_1107 EcSMS35_1108     FALSE 0.174 55.000 0.000 NA   NA
 7301323 7301324 EcSMS35_1108 EcSMS35_1109     FALSE 0.015 222.000 0.000 NA   NA
 7301326 7301327 EcSMS35_1111 EcSMS35_1112     FALSE 0.004 327.000 0.000 NA   NA
 7301329 7301330 EcSMS35_1114 EcSMS35_1115     TRUE 0.927 -3.000 0.078 1.000 N NA
 7301331 7301332 EcSMS35_1116 EcSMS35_1117     FALSE 0.277 156.000 0.195 1.000   NA
 7301332 7301333 EcSMS35_1117 EcSMS35_1118   ansB FALSE 0.006 488.000 0.089 1.000   NA
 7301334 7301335 EcSMS35_1119 EcSMS35_1120     FALSE 0.025 979.000 0.000 0.084 Y NA
 7301337 7301338 EcSMS35_1122 EcSMS35_1123     FALSE 0.178 65.000 0.002 1.000   NA
 7301339 7301340 EcSMS35_1124 EcSMS35_1125     FALSE 0.002 386.000 0.000 NA   NA
 7301340 7301341 EcSMS35_1125 EcSMS35_1126     TRUE 0.638 -15.000 0.000 NA   NA
 7301342 7301343 EcSMS35_1127 EcSMS35_1128     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301344 7301345 EcSMS35_1129 EcSMS35_1130     FALSE 0.027 191.000 0.000 NA   NA
 7301345 7301346 EcSMS35_1130 EcSMS35_1131   cobU FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7301346 7301347 EcSMS35_1131 EcSMS35_1132 cobU cobS TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7301347 7301348 EcSMS35_1132 EcSMS35_1133 cobS cobT TRUE 0.976 12.000 0.056 0.004 Y NA
 7301348 7301349 EcSMS35_1133 EcSMS35_1134 cobT   FALSE 0.133 65.000 0.015 NA   NA
 7301351 7301352 EcSMS35_1136 EcSMS35_1137 nac cbl TRUE 0.892 102.000 0.222 0.062 Y NA
 7301354 7301355 EcSMS35_1139 EcSMS35_1140     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 7301355 7301356 EcSMS35_1140 EcSMS35_1141     FALSE 0.012 238.000 0.000 NA   NA
 7301357 7301358 EcSMS35_1142 EcSMS35_1143   amn FALSE 0.003 343.000 0.000 NA   NA
 7301358 7301359 EcSMS35_1143 EcSMS35_1144 amn shiA FALSE 0.195 102.000 0.021 1.000 N NA
 7301361 7301362 EcSMS35_1146 EcSMS35_1147     FALSE 0.005 313.000 0.000 NA   NA
 7301362 7301363 EcSMS35_1147 EcSMS35_1148     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 7301365 7301366 EcSMS35_1150 EcSMS35_1151     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301366 7301367 EcSMS35_1151 EcSMS35_1152     FALSE 0.159 59.000 0.000 NA   NA
 7301367 7301368 EcSMS35_1152 EcSMS35_1153     FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 7301368 7301369 EcSMS35_1153 EcSMS35_1154   dicB TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301371 7301372 EcSMS35_1156 EcSMS35_1157     FALSE 0.313 30.000 0.000 NA   NA
 7301372 7301373 EcSMS35_1157 EcSMS35_1158     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7301374 7301375 EcSMS35_1159 EcSMS35_1160     TRUE 0.631 -16.000 0.000 NA   NA
 7301375 7301376 EcSMS35_1160 EcSMS35_1161     TRUE 0.579 -28.000 0.000 NA   NA
 7301376 7301377 EcSMS35_1161 EcSMS35_1162     FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7301377 7301378 EcSMS35_1162 EcSMS35_1163     FALSE 0.279 34.000 0.000 NA   NA
 7301378 7301379 EcSMS35_1163 EcSMS35_1164     FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301379 7301380 EcSMS35_1164 EcSMS35_1165     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301380 7301381 EcSMS35_1165 EcSMS35_1166     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301381 7301382 EcSMS35_1166 EcSMS35_1167     TRUE 0.604 -22.000 0.000 NA   NA
 7301382 7301383 EcSMS35_1167 EcSMS35_1168     FALSE 0.126 94.000 0.000 NA   NA
 7301383 7301384 EcSMS35_1168 EcSMS35_1169     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7301384 7301385 EcSMS35_1169 EcSMS35_1170     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301385 7301386 EcSMS35_1170 EcSMS35_1171     FALSE 0.021 204.000 0.000 NA   NA
 7301386 7301387 EcSMS35_1171 EcSMS35_1172     FALSE 0.001 588.000 0.000 NA   NA
 7301389 7301390 EcSMS35_1174 EcSMS35_1175     TRUE 0.729 1.000 0.000 NA   NA
 7301390 7301391 EcSMS35_1175 EcSMS35_1176     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301391 7301392 EcSMS35_1176 EcSMS35_1177     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 7301392 7301393 EcSMS35_1177 EcSMS35_1178     TRUE 0.729 1.000 0.000 NA   NA
 7301393 7301394 EcSMS35_1178 EcSMS35_1179     TRUE 0.729 1.000 0.000 NA   NA
 7301394 7301395 EcSMS35_1179 EcSMS35_1180     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7301395 7301396 EcSMS35_1180 EcSMS35_1181     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 7301396 7301397 EcSMS35_1181 EcSMS35_1182     TRUE 0.647 5.000 0.000 NA   NA
 7301397 7301398 EcSMS35_1182 EcSMS35_1183     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 7301398 7301399 EcSMS35_1183 EcSMS35_1184     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000   NA
 7301399 7301400 EcSMS35_1184 EcSMS35_1185     FALSE 0.002 542.000 0.000 NA   NA
 7301400 7301401 EcSMS35_1185 EcSMS35_1186     TRUE 0.905 0.000 0.094 NA   NA
 7301401 7301402 EcSMS35_1186 EcSMS35_1187     TRUE 0.909 12.000 0.286 NA   NA
 7301402 7301403 EcSMS35_1187 EcSMS35_1188     TRUE 0.987 0.000 0.600 NA   NA
 7301403 7301404 EcSMS35_1188 EcSMS35_1189     TRUE 0.912 -22.000 0.222 NA   NA
 7301404 7301405 EcSMS35_1189 EcSMS35_1190     TRUE 0.819 15.000 0.174 NA   NA
 7301405 7301406 EcSMS35_1190 EcSMS35_1191     FALSE 0.390 52.000 0.087 NA   NA
 7301406 7301407 EcSMS35_1191 EcSMS35_1192     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7301407 7301408 EcSMS35_1192 EcSMS35_1193     FALSE 0.003 347.000 0.000 NA   NA
 7301408 7301409 EcSMS35_1193 EcSMS35_1194     TRUE 0.989 -3.000 0.635 NA   NA
 7301409 7301410 EcSMS35_1194 EcSMS35_1195     TRUE 0.593 60.000 0.250 NA   NA
 7301410 7301411 EcSMS35_1195 EcSMS35_1196     TRUE 0.958 15.000 0.643 NA   NA
 7301411 7301412 EcSMS35_1196 EcSMS35_1197     TRUE 0.975 12.000 0.818 NA   NA
 7301412 7301413 EcSMS35_1197 EcSMS35_1198     FALSE 0.222 46.000 0.000 NA   NA
 7301413 7301414 EcSMS35_1198 EcSMS35_1199     TRUE 0.712 -7.000 0.000 NA   NA
 7301414 7301415 EcSMS35_1199 EcSMS35_1200     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301415 7301416 EcSMS35_1200 EcSMS35_1201     TRUE 0.647 5.000 0.000 NA   NA
 7301416 7301417 EcSMS35_1201 EcSMS35_1202     TRUE 0.530 -102.000 0.000 NA   NA
 7301417 7301418 EcSMS35_1202 EcSMS35_1203     TRUE 0.769 61.000 0.500 NA   NA
 7301418 7301419 EcSMS35_1203 EcSMS35_1204     FALSE 0.145 68.000 0.000 NA   NA
 7301419 7301420 EcSMS35_1204 EcSMS35_1206     TRUE 0.740 65.000 0.000 1.000 Y NA
 7301421 7301422 EcSMS35_1205 EcSMS35_1207     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.067 Y NA
 7301423 7301424 EcSMS35_1208 EcSMS35_1209     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7301424 7301425 EcSMS35_1209 EcSMS35_1210     FALSE 0.263 37.000 0.000 NA   NA
 7301426 7301427 EcSMS35_1211 EcSMS35_1212     FALSE 0.005 343.000 0.000 1.000   NA
 7301427 7301428 EcSMS35_1212 EcSMS35_1213     FALSE 0.014 257.000 0.000 1.000   NA
 7301428 7301429 EcSMS35_1213 EcSMS35_1214     TRUE 0.994 1.000 0.790 0.049   NA
 7301429 7301430 EcSMS35_1214 EcSMS35_1215     FALSE 0.164 109.000 0.000 1.000   NA
 7301431 7301432 EcSMS35_1216 EcSMS35_1217     TRUE 0.999 0.000 0.857 0.001 Y NA
 7301433 7301434 EcSMS35_1218 EcSMS35_1219 hchA   FALSE 0.408 21.000 0.000 NA   NA
 7301437 7301438 EcSMS35_1222 EcSMS35_1223     FALSE 0.401 40.000 0.062 NA   NA
 7301438 7301439 EcSMS35_1223 EcSMS35_1224   dcm FALSE 0.212 67.000 0.000 1.000   NA
 7301439 7301440 EcSMS35_1224 EcSMS35_1226 dcm vsr TRUE 0.976 -19.000 0.000 0.067 Y NA
 7301442 7301443 EcSMS35_1227 EcSMS35_1228     FALSE 0.138 79.000 0.025 NA   NA
 7301443 7301444 EcSMS35_1228 EcSMS35_1230     FALSE 0.153 189.000 0.208 NA   NA
 7301445 7301446 EcSMS35_1229 EcSMS35_1231     FALSE 0.005 297.000 0.000 NA   NA
 7301448 7301449 EcSMS35_1233 EcSMS35_1234 rcsA fliR FALSE 0.011 290.000 0.000 1.000 N NA
 7301449 7301450 EcSMS35_1234 EcSMS35_1235 fliR fliQ TRUE 0.980 9.000 0.000 0.003 Y NA
 7301450 7301451 EcSMS35_1235 EcSMS35_1236 fliQ fliP TRUE 0.997 10.000 0.827 0.008 Y NA
 7301451 7301452 EcSMS35_1236 EcSMS35_1237 fliP fliO TRUE 0.992 0.000 0.203 1.000 Y NA
 7301452 7301453 EcSMS35_1237 EcSMS35_1238 fliO fliN TRUE 0.995 3.000 0.443 1.000 Y NA
 7301453 7301454 EcSMS35_1238 EcSMS35_1239 fliN fliM TRUE 0.995 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 7301454 7301455 EcSMS35_1239 EcSMS35_1240 fliM fliL TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 7301455 7301456 EcSMS35_1240 EcSMS35_1241 fliL fliK TRUE 0.779 105.000 0.119 1.000 Y NA
 7301456 7301457 EcSMS35_1241 EcSMS35_1242 fliK fliJ TRUE 0.997 -3.000 0.317 0.008 Y NA
 7301457 7301458 EcSMS35_1242 EcSMS35_1243 fliJ fliI TRUE 0.919 19.000 0.006 1.000 Y NA
 7301458 7301459 EcSMS35_1243 EcSMS35_1244 fliI fliH TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7301459 7301460 EcSMS35_1244 EcSMS35_1245 fliH fliG TRUE 0.987 -7.000 0.000 0.005 Y NA
 7301460 7301461 EcSMS35_1245 EcSMS35_1246 fliG fliF TRUE 0.994 -7.000 0.220 0.008 Y NA
 7301462 7301463 EcSMS35_1247 EcSMS35_1248 fliE   FALSE 0.003 351.000 0.000 NA   NA
 7301464 7301465 EcSMS35_1249 EcSMS35_1250     FALSE 0.109 111.000 0.000 NA   NA
 7301465 7301466 EcSMS35_1250 EcSMS35_1251     FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 7301466 7301467 EcSMS35_1251 EcSMS35_1252     TRUE 0.992 -3.000 0.844 NA   NA
 7301469 7301470 EcSMS35_1254 EcSMS35_1255 amyA fliT FALSE 0.400 78.000 0.115 1.000   NA
 7301470 7301471 EcSMS35_1255 EcSMS35_1256 fliT fliS TRUE 0.975 0.000 0.324 1.000   NA
 7301471 7301472 EcSMS35_1256 EcSMS35_1257 fliS fliD TRUE 0.982 25.000 0.284 0.003 Y NA
 7301475 7301476 EcSMS35_1260 EcSMS35_1261 fliA   TRUE 0.546 46.000 0.108 1.000   NA
 7301476 7301477 EcSMS35_1261 EcSMS35_1262   fliY TRUE 0.603 88.000 0.280 1.000   NA
 7301477 7301478 EcSMS35_1262 EcSMS35_1263 fliY dcyD TRUE 0.915 105.000 0.469 1.000 Y NA
 7301478 7301479 EcSMS35_1263 EcSMS35_1264 dcyD   TRUE 0.944 15.000 0.050 1.000 Y NA
 7301479 7301480 EcSMS35_1264 EcSMS35_1265   yecC TRUE 0.991 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 7301480 7301481 EcSMS35_1265 EcSMS35_1266 yecC sdiA FALSE 0.043 230.000 0.071 1.000 N NA
 7301483 7301484 EcSMS35_1268 EcSMS35_1269   uvrY FALSE 0.012 239.000 0.000 NA   NA
 7301484 7301485 EcSMS35_1269 EcSMS35_1270 uvrY uvrC TRUE 0.967 -3.000 0.086 0.021 N NA
 7301485 7301486 EcSMS35_1270 EcSMS35_1271 uvrC pgsA TRUE 0.644 57.000 0.227 1.000 N NA
 7301486 7301487 EcSMS35_1271 EcSMS35_1272 pgsA   FALSE 0.056 152.000 0.000 NA   NA
 7301487 7301488 EcSMS35_1272 EcSMS35_1273     FALSE 0.174 55.000 0.000 NA   NA
 7301488 7301489 EcSMS35_1273 EcSMS35_1274     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7301489 7301490 EcSMS35_1274 EcSMS35_1275     FALSE 0.024 196.000 0.000 NA   NA
 7301495 7301496 EcSMS35_1280 EcSMS35_1281     FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 7301499 7301500 EcSMS35_1284 EcSMS35_1285   araF FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 7301500 7301501 EcSMS35_1285 EcSMS35_1286 araF araG TRUE 0.983 70.000 0.917 0.002 Y NA
 7301501 7301502 EcSMS35_1286 EcSMS35_1287 araG araH TRUE 0.993 15.000 0.451 0.002 Y NA
 7301502 7301503 EcSMS35_1287 EcSMS35_1288 araH otsB FALSE 0.440 167.000 0.037 1.000 Y NA
 7301503 7301504 EcSMS35_1288 EcSMS35_1289 otsB otsA TRUE 0.985 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 7301506 7301507 EcSMS35_1291 EcSMS35_1292   flhD TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301507 7301508 EcSMS35_1292 EcSMS35_1293 flhD flhC TRUE 0.938 3.000 0.000 0.001   NA
 7301508 7301509 EcSMS35_1293 EcSMS35_1294 flhC motA TRUE 0.623 127.000 0.408 1.000   NA
 7301509 7301510 EcSMS35_1294 EcSMS35_1295 motA motB TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 7301510 7301511 EcSMS35_1295 EcSMS35_1296 motB cheA TRUE 0.996 11.000 0.913 1.000 Y NA
 7301511 7301512 EcSMS35_1296 EcSMS35_1297 cheA cheW TRUE 0.990 21.000 0.447 0.004 Y NA
 7301512 7301513 EcSMS35_1297 EcSMS35_1298 cheW tar TRUE 0.714 145.000 0.043 0.005 Y NA
 7301513 7301514 EcSMS35_1298 EcSMS35_1299 tar tap TRUE 0.962 46.000 0.235 0.001 Y NA
 7301514 7301515 EcSMS35_1299 EcSMS35_1300 tap cheR TRUE 0.964 19.000 0.188 1.000 Y NA
 7301515 7301516 EcSMS35_1300 EcSMS35_1301 cheR cheB TRUE 0.974 3.000 0.000 1.000 Y NA
 7301516 7301517 EcSMS35_1301 EcSMS35_1302 cheB cheY TRUE 0.962 15.000 0.000 0.012 Y NA
 7301517 7301518 EcSMS35_1302 EcSMS35_1303 cheY cheZ TRUE 0.952 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7301519 7301520 EcSMS35_1304 EcSMS35_1305     TRUE 0.853 -31.000 0.146 NA   NA
 7301520 7301521 EcSMS35_1305 EcSMS35_1306     FALSE 0.129 82.000 0.000 NA   NA
 7301522 7301523 EcSMS35_1307 EcSMS35_1308 flhB flhA TRUE 0.996 -7.000 0.287 0.008 Y NA
 7301523 7301524 EcSMS35_1308 EcSMS35_1309 flhA flhE TRUE 0.977 0.000 0.158 0.003   NA
 7301526 7301527 EcSMS35_1311 EcSMS35_1312   cutC TRUE 0.633 14.000 0.057 NA   NA
 7301527 7301528 EcSMS35_1312 EcSMS35_1313 cutC torY FALSE 0.004 388.000 0.000 1.000 N NA
 7301528 7301529 EcSMS35_1313 EcSMS35_1314 torY torZ TRUE 0.990 25.000 0.481 0.001 Y NA
 7301530 7301531 EcSMS35_1315 EcSMS35_1316     TRUE 0.973 -3.000 0.315 NA   NA
 7301531 7301532 EcSMS35_1316 EcSMS35_1317     FALSE 0.480 41.000 0.089 NA   NA
 7301532 7301533 EcSMS35_1317 EcSMS35_1318     FALSE 0.460 53.000 0.126 NA   NA
 7301533 7301534 EcSMS35_1318 EcSMS35_1319     TRUE 0.909 -3.000 0.089 NA   NA
 7301535 7301536 EcSMS35_1320 EcSMS35_1321 aspS ntpA TRUE 0.871 2.000 0.050 1.000 N NA
 7301536 7301537 EcSMS35_1321 EcSMS35_1322 ntpA   FALSE 0.374 29.000 0.035 NA   NA
 7301537 7301538 EcSMS35_1322 EcSMS35_1323   ruvC TRUE 0.766 35.000 0.277 NA   NA
 7301540 7301541 EcSMS35_1325 EcSMS35_1326 ruvA ruvB TRUE 0.997 9.000 0.549 0.001 Y NA
 7301542 7301543 EcSMS35_1327 EcSMS35_1328 znuB znuC TRUE 0.999 -3.000 0.755 0.089 Y NA
 7301544 7301545 EcSMS35_1329 EcSMS35_1330 znuA   TRUE 0.815 16.000 0.131 1.000 N NA
 7301545 7301546 EcSMS35_1330 EcSMS35_1331   msbB TRUE 0.857 119.000 0.299 1.000 Y NA
 7301547 7301548 EcSMS35_1332 EcSMS35_1333 pykA   FALSE 0.248 128.000 0.071 1.000 N NA
 7301549 7301550 EcSMS35_1334 EcSMS35_1335   zwf FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 7301550 7301551 EcSMS35_1335 EcSMS35_1336 zwf edd FALSE 0.185 235.000 0.041 1.000 Y NA
 7301551 7301552 EcSMS35_1336 EcSMS35_1337 edd eda TRUE 0.971 37.000 0.523 1.000 Y NA
 7301554 7301555 EcSMS35_1339 EcSMS35_1340     FALSE 0.186 55.000 0.027 NA   NA
 7301555 7301556 EcSMS35_1340 EcSMS35_1341     FALSE 0.005 317.000 0.028 NA   NA
 7301556 7301557 EcSMS35_1341 EcSMS35_1343   prtB FALSE 0.056 207.000 0.092 NA   NA
 7301558 7301559 EcSMS35_1342 EcSMS35_1344 exoX   TRUE 0.927 24.000 0.500 1.000   NA
 7301559 7301560 EcSMS35_1344 EcSMS35_1345   holE FALSE 0.516 102.000 0.222 1.000   NA
 7301561 7301562 EcSMS35_1346 EcSMS35_1347     TRUE 0.983 4.000 0.613 1.000   NA
 7301562 7301563 EcSMS35_1347 EcSMS35_1348     TRUE 0.968 13.000 0.704 NA   NA
 7301563 7301564 EcSMS35_1348 EcSMS35_1349   pphA FALSE 0.002 396.000 0.000 NA   NA
 7301565 7301566 EcSMS35_1350 EcSMS35_1351     TRUE 0.609 105.000 0.353 NA   NA
 7301566 7301567 EcSMS35_1351 EcSMS35_1352   yebU FALSE 0.295 118.000 0.121 NA   NA
 7301567 7301568 EcSMS35_1352 EcSMS35_1353 yebU   TRUE 0.702 74.000 0.420 NA   NA
 7301568 7301569 EcSMS35_1353 EcSMS35_1354     TRUE 0.979 -37.000 0.840 NA   NA
 7301570 7301571 EcSMS35_1355 EcSMS35_1356   proQ TRUE 0.734 97.000 0.081 NA Y NA
 7301571 7301572 EcSMS35_1356 EcSMS35_1357 proQ prc TRUE 0.851 26.000 0.304 NA N NA
 7301572 7301573 EcSMS35_1357 EcSMS35_1358 prc   FALSE 0.139 192.000 0.042 0.019 N NA
 7301577 7301578 EcSMS35_1362 EcSMS35_1363     TRUE 0.742 75.000 0.500 NA   NA
 7301578 7301579 EcSMS35_1363 EcSMS35_1364     FALSE 0.001 670.000 0.000 NA   NA
 7301579 7301580 EcSMS35_1364 EcSMS35_1365   cspC TRUE 0.868 13.000 0.214 NA   NA
 7301580 7301581 EcSMS35_1365 EcSMS35_1367 cspC rrmA FALSE 0.082 166.000 0.038 1.000   NA
 7301582 7301583 EcSMS35_1366 EcSMS35_1368     FALSE 0.002 429.000 0.000 NA   NA
 7301583 7301584 EcSMS35_1368 EcSMS35_1369   manZ TRUE 0.869 55.000 0.755 NA   NA
 7301584 7301585 EcSMS35_1369 EcSMS35_1370 manZ manY TRUE 0.997 13.000 0.939 0.018 Y NA
 7301585 7301586 EcSMS35_1370 EcSMS35_1371 manY manX TRUE 0.833 63.000 0.000 0.018 Y NA
 7301588 7301589 EcSMS35_1373 EcSMS35_1374   sdaA TRUE 0.571 131.000 0.389 NA N NA
 7301589 7301590 EcSMS35_1374 EcSMS35_1375 sdaA   FALSE 0.343 184.000 0.409 1.000   NA
 7301590 7301591 EcSMS35_1375 EcSMS35_1376   pabB TRUE 0.899 4.000 0.116 1.000   NA
 7301593 7301594 EcSMS35_1378 EcSMS35_1379     FALSE 0.002 422.000 0.000 NA   NA
 7301595 7301596 EcSMS35_1380 EcSMS35_1381     FALSE 0.420 58.000 0.082 1.000 N NA
 7301596 7301597 EcSMS35_1381 EcSMS35_1382   slp FALSE 0.396 39.000 0.024 1.000 N NA
 7301597 7301598 EcSMS35_1382 EcSMS35_1383 slp fadD FALSE 0.125 205.000 0.169 1.000 N NA
 7301598 7301599 EcSMS35_1383 EcSMS35_1384 fadD rnd FALSE 0.445 70.000 0.115 1.000 N NA
 7301600 7301601 EcSMS35_1385 EcSMS35_1386     TRUE 0.537 56.000 0.043 0.048 N NA
 7301601 7301602 EcSMS35_1386 EcSMS35_1387     FALSE 0.440 32.000 0.000 1.000 N NA
 7301602 7301603 EcSMS35_1387 EcSMS35_1388   ttuC FALSE 0.118 251.000 0.333 1.000 N NA
 7301604 7301605 EcSMS35_1389 EcSMS35_1390     FALSE 0.159 127.000 0.000 1.000 N NA
 7301607 7301608 EcSMS35_1392 EcSMS35_1393     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7301608 7301609 EcSMS35_1393 EcSMS35_1394     FALSE 0.442 17.000 0.000 NA   NA
 7301609 7301610 EcSMS35_1394 EcSMS35_1395     FALSE 0.523 12.000 0.000 NA   NA
 7301611 7301612 EcSMS35_1396 EcSMS35_1397     TRUE 0.839 18.000 0.222 NA   NA
 7301614 7301615 EcSMS35_1399 EcSMS35_1400   yeaN FALSE 0.138 55.000 0.007 NA   NA
 7301619 7301620 EcSMS35_1404 EcSMS35_1405     FALSE 0.448 43.000 0.083 NA   NA
 7301620 7301621 EcSMS35_1405 EcSMS35_1406     FALSE 0.518 181.000 0.000 0.005 Y NA
 7301621 7301622 EcSMS35_1406 EcSMS35_1407     FALSE 0.006 288.000 0.000 NA   NA
 7301622 7301623 EcSMS35_1407 EcSMS35_1408     TRUE 0.777 113.000 0.683 NA   NA
 7301624 7301625 EcSMS35_1409 EcSMS35_1410 mipA   FALSE 0.239 90.000 0.067 NA   NA
 7301626 7301627 EcSMS35_1411 EcSMS35_1412   gapA TRUE 0.824 84.000 0.154 1.000 Y NA
 7301628 7301629 EcSMS35_1413 EcSMS35_1414 msrB   TRUE 0.677 42.000 0.216 NA   NA
 7301629 7301630 EcSMS35_1414 EcSMS35_1415     FALSE 0.003 370.000 0.000 NA   NA
 7301630 7301631 EcSMS35_1415 EcSMS35_1416   ydjK TRUE 0.837 27.000 0.250 1.000 N NA
 7301631 7301632 EcSMS35_1416 EcSMS35_1417 ydjK gutB TRUE 0.838 17.000 0.167 1.000 N NA
 7301632 7301633 EcSMS35_1417 EcSMS35_1418 gutB   TRUE 0.907 21.000 0.194 0.017 N NA
 7301633 7301634 EcSMS35_1418 EcSMS35_1419     TRUE 0.992 5.000 0.368 1.000 Y NA
 7301634 7301635 EcSMS35_1419 EcSMS35_1420     TRUE 0.937 10.000 0.269 1.000 N NA
 7301635 7301636 EcSMS35_1420 EcSMS35_1421     FALSE 0.467 137.000 0.269 1.000 N NA
 7301636 7301637 EcSMS35_1421 EcSMS35_1422   ydjE TRUE 0.767 117.000 0.125 1.000 Y NA
 7301638 7301639 EcSMS35_1423 EcSMS35_1424 pncA ansA TRUE 0.739 11.000 0.040 1.000 N NA
 7301639 7301640 EcSMS35_1424 EcSMS35_1425 ansA sppA FALSE 0.174 167.000 0.113 1.000 N NA
 7301641 7301642 EcSMS35_1426 EcSMS35_1427   selD FALSE 0.201 117.000 0.033 1.000 N NA
 7301642 7301643 EcSMS35_1427 EcSMS35_1428 selD topB TRUE 0.814 5.000 0.041 1.000 N NA
 7301648 7301649 EcSMS35_1433 EcSMS35_1434     FALSE 0.422 67.000 0.111 1.000   NA
 7301649 7301650 EcSMS35_1434 EcSMS35_1435   ynjC TRUE 0.989 0.000 0.602 1.000   NA
 7301650 7301651 EcSMS35_1435 EcSMS35_1436 ynjC   TRUE 0.973 -27.000 0.627 NA   NA
 7301651 7301652 EcSMS35_1436 EcSMS35_1437     TRUE 0.623 10.000 0.032 NA   NA
 7301652 7301653 EcSMS35_1437 EcSMS35_1438     TRUE 0.898 0.000 0.087 NA   NA
 7301653 7301654 EcSMS35_1438 EcSMS35_1439     TRUE 0.819 15.000 0.174 NA   NA
 7301654 7301655 EcSMS35_1439 EcSMS35_1440     TRUE 0.827 5.000 0.083 NA   NA
 7301655 7301656 EcSMS35_1440 EcSMS35_1441   xth FALSE 0.038 167.000 0.016 NA   NA
 7301656 7301657 EcSMS35_1441 EcSMS35_1442 xth   FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7301658 7301659 EcSMS35_1443 EcSMS35_1444 astC astA TRUE 0.998 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 7301659 7301660 EcSMS35_1444 EcSMS35_1445 astA astD TRUE 0.962 -3.000 0.179 1.000 N NA
 7301660 7301661 EcSMS35_1445 EcSMS35_1446 astD astB TRUE 0.978 -3.000 0.306 1.000 N NA
 7301661 7301662 EcSMS35_1446 EcSMS35_1447 astB astE TRUE 0.986 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 7301662 7301663 EcSMS35_1447 EcSMS35_1448 astE spy FALSE 0.005 330.000 0.000 NA N NA
 7301663 7301664 EcSMS35_1448 EcSMS35_1450 spy   FALSE 0.025 203.000 0.028 NA   NA
 7301665 7301666 EcSMS35_1449 EcSMS35_1451 cho nadE FALSE 0.022 230.000 0.010 1.000 N NA
 7301667 7301668 EcSMS35_1452 EcSMS35_1453 osmE chbB FALSE 0.013 260.000 0.000 1.000   NA
 7301668 7301669 EcSMS35_1453 EcSMS35_1454 chbB chbC TRUE 0.957 85.000 0.500 0.012 Y NA
 7301669 7301670 EcSMS35_1454 EcSMS35_1455 chbC chbA TRUE 0.985 51.000 0.833 0.012 Y NA
 7301670 7301671 EcSMS35_1455 EcSMS35_1456 chbA chbR TRUE 0.978 11.000 0.727 1.000 N NA
 7301671 7301672 EcSMS35_1456 EcSMS35_1457 chbR chbF TRUE 0.798 104.000 0.625 1.000 N NA
 7301672 7301673 EcSMS35_1457 EcSMS35_1458 chbF   TRUE 0.968 13.000 0.429 0.020   NA
 7301675 7301676 EcSMS35_1460 EcSMS35_1461 cedA   FALSE 0.006 289.000 0.000 NA   NA
 7301677 7301678 EcSMS35_1462 EcSMS35_1463     FALSE 0.220 133.000 0.102 NA   NA
 7301678 7301679 EcSMS35_1463 EcSMS35_1464     FALSE 0.095 163.000 0.068 NA   NA
 7301681 7301682 EcSMS35_1466 EcSMS35_1467     FALSE 0.113 106.000 0.000 NA   NA
 7301682 7301683 EcSMS35_1467 EcSMS35_1468   pfkB FALSE 0.117 101.000 0.000 NA   NA
 7301685 7301686 EcSMS35_1470 EcSMS35_1471     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 7301687 7301688 EcSMS35_1472 EcSMS35_1473 thrS infC TRUE 0.814 112.000 0.186 1.000 Y NA
 7301688 7301689 EcSMS35_1473 EcSMS35_1474 infC rpmI TRUE 0.946 97.000 0.652 1.000 Y NA
 7301689 7301690 EcSMS35_1474 EcSMS35_1475 rpmI rplT TRUE 0.986 54.000 0.928 0.011 Y NA
 7301690 7301691 EcSMS35_1475 EcSMS35_1476 rplT pheS FALSE 0.160 306.000 0.202 1.000 Y NA
 7301691 7301692 EcSMS35_1476 EcSMS35_1477 pheS pheT TRUE 0.995 15.000 0.574 0.001 Y NA
 7301692 7301693 EcSMS35_1477 EcSMS35_1478 pheT ihfA TRUE 0.937 5.000 0.208 1.000 N NA
 7301693 7301694 EcSMS35_1478 EcSMS35_1479 ihfA btuC FALSE 0.202 101.000 0.023 1.000 N NA
 7301694 7301695 EcSMS35_1479 EcSMS35_1480 btuC btuE FALSE 0.408 63.000 0.084 1.000 N NA
 7301695 7301696 EcSMS35_1480 EcSMS35_1481 btuE btuD TRUE 0.858 0.000 0.000 1.000 N NA
 7301696 7301697 EcSMS35_1481 EcSMS35_1482 btuD   FALSE 0.163 78.000 0.000 NA N NA
 7301697 7301698 EcSMS35_1482 EcSMS35_1483     FALSE 0.013 247.000 0.000 NA N NA
 7301698 7301699 EcSMS35_1483 EcSMS35_1484     FALSE 0.174 63.000 0.031 NA   NA
 7301700 7301701 EcSMS35_1485 EcSMS35_1486   aroH FALSE 0.209 105.000 0.054 NA N NA
 7301701 7301702 EcSMS35_1486 EcSMS35_1487 aroH   FALSE 0.236 157.000 0.165 1.000   NA
 7301703 7301704 EcSMS35_1488 EcSMS35_1489   ppsA FALSE 0.179 54.000 0.000 NA   NA
 7301704 7301705 EcSMS35_1489 EcSMS35_1490 ppsA   FALSE 0.003 489.000 0.000 1.000 N NA
 7301705 7301706 EcSMS35_1490 EcSMS35_1491     FALSE 0.408 36.000 0.000 1.000 N NA
 7301706 7301707 EcSMS35_1491 EcSMS35_1492     TRUE 0.606 11.000 0.000 NA N NA
 7301707 7301708 EcSMS35_1492 EcSMS35_1493     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7301709 7301710 EcSMS35_1494 EcSMS35_1495 fadK   FALSE 0.420 57.000 0.080 1.000 N NA
 7301710 7301711 EcSMS35_1495 EcSMS35_1496     TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.048 Y NA
 7301711 7301712 EcSMS35_1496 EcSMS35_1497     TRUE 0.985 55.000 1.000 0.048 Y NA
 7301712 7301713 EcSMS35_1497 EcSMS35_1498     TRUE 0.996 20.000 1.000 0.012 Y NA
 7301714 7301715 EcSMS35_1499 EcSMS35_1500     FALSE 0.115 103.000 0.000 NA   NA
 7301716 7301717 EcSMS35_1501 EcSMS35_1502   pct TRUE 0.991 11.000 0.500 1.000 Y NA
 7301717 7301718 EcSMS35_1502 EcSMS35_1503 pct aroD FALSE 0.112 146.000 0.019 1.000 N NA
 7301718 7301719 EcSMS35_1503 EcSMS35_1504 aroD   TRUE 0.921 31.000 0.113 1.000 Y NA
 7301719 7301720 EcSMS35_1504 EcSMS35_1505     TRUE 0.762 12.000 0.082 NA N NA
 7301720 7301721 EcSMS35_1505 EcSMS35_1506   ydiM FALSE 0.014 227.000 0.000 NA   NA
 7301721 7301722 EcSMS35_1506 EcSMS35_1507 ydiM   FALSE 0.338 100.000 0.095 1.000   NA
 7301722 7301723 EcSMS35_1507 EcSMS35_1508   ydiK FALSE 0.002 429.000 0.000 NA   NA
 7301724 7301725 EcSMS35_1509 EcSMS35_1510   ydiL TRUE 0.938 -3.000 0.129 NA N NA
 7301725 7301726 EcSMS35_1510 EcSMS35_1511 ydiL   FALSE 0.139 100.000 0.032 NA   NA
 7301726 7301727 EcSMS35_1511 EcSMS35_1512   sufA FALSE 0.002 549.000 0.000 NA   NA
 7301727 7301728 EcSMS35_1512 EcSMS35_1513 sufA sufB TRUE 0.683 9.000 0.041 NA   NA
 7301728 7301729 EcSMS35_1513 EcSMS35_1514 sufB sufC TRUE 0.991 10.000 0.466 1.000 Y NA
 7301729 7301730 EcSMS35_1514 EcSMS35_1515 sufC sufD TRUE 0.992 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 7301730 7301731 EcSMS35_1515 EcSMS35_1516 sufD sufS TRUE 0.964 -3.000 0.193 1.000 N NA
 7301731 7301732 EcSMS35_1516 EcSMS35_1517 sufS sufE TRUE 0.848 13.000 0.183 NA   NA
 7301732 7301733 EcSMS35_1517 EcSMS35_1518 sufE   FALSE 0.125 149.000 0.069 NA   NA
 7301734 7301735 EcSMS35_1519 EcSMS35_1520 lpp pykF FALSE 0.009 311.000 0.000 1.000 N NA
 7301738 7301739 EcSMS35_1523 EcSMS35_1524     TRUE 0.992 21.000 0.600 0.014 Y NA
 7301739 7301740 EcSMS35_1524 EcSMS35_1525     TRUE 0.943 13.000 0.458 NA   NA
 7301740 7301741 EcSMS35_1525 EcSMS35_1526     TRUE 0.882 13.000 0.235 NA   NA
 7301741 7301742 EcSMS35_1526 EcSMS35_1527     TRUE 0.996 -3.000 0.444 NA Y NA
 7301742 7301743 EcSMS35_1527 EcSMS35_1528     TRUE 0.933 4.000 0.222 NA   NA
 7301744 7301745 EcSMS35_1529 EcSMS35_1530   ydhR FALSE 0.093 126.000 0.000 NA   NA
 7301745 7301746 EcSMS35_1530 EcSMS35_1531 ydhR   FALSE 0.112 108.000 0.000 NA   NA
 7301746 7301747 EcSMS35_1531 EcSMS35_1532     TRUE 0.697 3.000 0.000 NA   NA
 7301751 7301752 EcSMS35_1536 EcSMS35_1537 cfa   FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000 N NA
 7301755 7301756 EcSMS35_1540 EcSMS35_1541     FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 7301757 7301758 EcSMS35_1542 EcSMS35_1543 sodB   FALSE 0.146 128.000 0.015 1.000 N NA
 7301760 7301761 EcSMS35_1545 EcSMS35_1546 lhr rnt FALSE 0.413 93.000 0.000 0.012   NA
 7301761 7301762 EcSMS35_1546 EcSMS35_1547 rnt gloA FALSE 0.415 103.000 0.136 1.000 N NA
 7301762 7301763 EcSMS35_1547 EcSMS35_1548 gloA nemA FALSE 0.301 81.000 0.057 1.000 N NA
 7301763 7301764 EcSMS35_1548 EcSMS35_1549 nemA   TRUE 0.847 37.000 0.362 1.000 N NA
 7301765 7301766 EcSMS35_1550 EcSMS35_1551   ydhF FALSE 0.282 49.000 0.045 NA   NA
 7301766 7301767 EcSMS35_1551 EcSMS35_1552 ydhF sodC_1 FALSE 0.214 81.000 0.033 1.000   NA
 7301768 7301769 EcSMS35_1553 EcSMS35_1554     TRUE 0.763 0.000 0.000 NA   NA
 7301769 7301770 EcSMS35_1554 EcSMS35_1555     TRUE 0.971 3.000 0.412 NA   NA
 7301771 7301772 EcSMS35_1556 EcSMS35_1557     FALSE 0.365 25.000 0.000 NA   NA
 7301774 7301775 EcSMS35_1559 EcSMS35_1560 anmK   FALSE 0.146 98.000 0.034 NA   NA
 7301775 7301776 EcSMS35_1560 EcSMS35_1561   pdxH FALSE 0.189 59.000 0.034 NA   NA
 7301776 7301777 EcSMS35_1561 EcSMS35_1562 pdxH tyrS FALSE 0.210 129.000 0.054 1.000 N NA
 7301777 7301778 EcSMS35_1562 EcSMS35_1563 tyrS pdxY FALSE 0.303 62.000 0.041 1.000 N NA
 7301779 7301780 EcSMS35_1564 EcSMS35_1565 gst tppB TRUE 0.653 105.000 0.344 1.000 N NA
 7301780 7301781 EcSMS35_1565 EcSMS35_1566 tppB nth FALSE 0.003 610.000 0.000 1.000 N NA
 7301781 7301782 EcSMS35_1566 EcSMS35_1567 nth rnfE TRUE 0.938 0.000 0.109 1.000 N NA
 7301782 7301783 EcSMS35_1567 EcSMS35_1568 rnfE rnfG TRUE 0.998 4.000 0.908 0.048 Y NA
 7301783 7301784 EcSMS35_1568 EcSMS35_1569 rnfG rnfD TRUE 0.998 4.000 0.924 0.048 Y NA
 7301784 7301785 EcSMS35_1569 EcSMS35_1570 rnfD rnfC TRUE 0.999 1.000 0.814 0.048 Y NA
 7301785 7301786 EcSMS35_1570 EcSMS35_1571 rnfC rnfB TRUE 0.997 -7.000 0.537 0.048 Y NA
 7301786 7301787 EcSMS35_1571 EcSMS35_1572 rnfB rnfA TRUE 0.998 0.000 0.564 0.048 Y NA
 7301787 7301788 EcSMS35_1572 EcSMS35_1573 rnfA   FALSE 0.406 77.000 0.148 NA   NA
 7301788 7301789 EcSMS35_1573 EcSMS35_1574     FALSE 0.347 86.000 0.120 NA   NA
 7301791 7301792 EcSMS35_1576 EcSMS35_1577 add malY FALSE 0.409 104.000 0.132 1.000 N NA
 7301792 7301793 EcSMS35_1577 EcSMS35_1578 malY malX TRUE 0.971 10.000 0.531 1.000 N NA
 7301794 7301795 EcSMS35_1579 EcSMS35_1580 malI   FALSE 0.186 112.000 0.000 1.000 N NA
 7301795 7301796 EcSMS35_1580 EcSMS35_1581   uidR FALSE 0.021 240.000 0.000 1.000 N NA
 7301796 7301797 EcSMS35_1581 EcSMS35_1582 uidR uidA FALSE 0.004 390.000 0.000 1.000 N NA
 7301797 7301798 EcSMS35_1582 EcSMS35_1583 uidA uidB TRUE 0.994 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 7301798 7301799 EcSMS35_1583 EcSMS35_1584 uidB uidC TRUE 0.748 57.000 0.375 1.000   NA
 7301800 7301801 EcSMS35_1585 EcSMS35_1586   manA TRUE 0.810 101.000 0.778 NA   NA
 7301802 7301803 EcSMS35_1587 EcSMS35_1589 fumA fumC TRUE 0.725 143.000 0.000 0.001 Y NA
 7301804 7301805 EcSMS35_1588 EcSMS35_1590 tus rstB TRUE 0.559 64.000 0.200 1.000   NA
 7301805 7301806 EcSMS35_1590 EcSMS35_1591 rstB rstA TRUE 0.986 4.000 0.181 1.000 Y NA
 7301808 7301809 EcSMS35_1592 EcSMS35_1594   arcD TRUE 0.664 37.000 0.140 1.000 N NA
 7301809 7301810 EcSMS35_1594 EcSMS35_1595 arcD ydgH FALSE 0.111 186.000 0.143 NA   NA
 7301811 7301812 EcSMS35_1596 EcSMS35_1597 pntA pntB TRUE 0.997 11.000 0.745 0.001 Y NA
 7301814 7301815 EcSMS35_1599 EcSMS35_1600 mdtJ mdtI TRUE 0.998 -13.000 0.869 0.077 Y NA
 7301816 7301817 EcSMS35_1601 EcSMS35_1602     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 7301820 7301821 EcSMS35_1605 EcSMS35_1606   mic TRUE 0.846 135.000 0.408 NA Y NA
 7301821 7301822 EcSMS35_1606 EcSMS35_1608 mic bioD2 TRUE 0.643 125.000 0.455 NA N NA
 7301823 7301824 EcSMS35_1607 EcSMS35_1609   dmsD FALSE 0.076 195.000 0.079 1.000   NA
 7301824 7301825 EcSMS35_1609 EcSMS35_1610 dmsD dmsC2 TRUE 0.592 43.000 0.125 1.000   NA
 7301825 7301826 EcSMS35_1610 EcSMS35_1611 dmsC2 dmsB_1 TRUE 0.966 2.000 0.333 NA   NA
 7301826 7301827 EcSMS35_1611 EcSMS35_1612 dmsB_1   TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7301827 7301828 EcSMS35_1612 EcSMS35_1613   ynfE FALSE 0.128 88.000 0.000 NA   NA
 7301828 7301829 EcSMS35_1613 EcSMS35_1614 ynfE   FALSE 0.189 199.000 0.304 NA   NA
 7301831 7301832 EcSMS35_1616 EcSMS35_1617 speG   FALSE 0.401 35.000 0.055 NA   NA
 7301833 7301834 EcSMS35_1618 EcSMS35_1619   rspA FALSE 0.031 206.000 0.020 1.000   NA
 7301834 7301835 EcSMS35_1619 EcSMS35_1620 rspA rspB TRUE 0.741 12.000 0.049 1.000 N NA
 7301835 7301836 EcSMS35_1620 EcSMS35_1621 rspB ydfJ FALSE 0.266 58.000 0.000 1.000 N NA
 7301836 7301837 EcSMS35_1621 EcSMS35_1622 ydfJ   TRUE 0.559 -37.000 0.000 NA   NA
 7301837 7301838 EcSMS35_1622 EcSMS35_1623     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7301839 7301840 EcSMS35_1624 EcSMS35_1625     FALSE 0.035 177.000 0.000 NA   NA
 7301840 7301841 EcSMS35_1625 EcSMS35_1626     FALSE 0.188 89.000 0.000 1.000   NA
 7301842 7301843 EcSMS35_1627 EcSMS35_1628 dcp   FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 7301843 7301844 EcSMS35_1628 EcSMS35_1629     FALSE 0.009 255.000 0.000 NA   NA
 7301848 7301849 EcSMS35_1633 EcSMS35_1634     TRUE 0.968 114.000 0.789 0.012 Y NA
 7301849 7301850 EcSMS35_1634 EcSMS35_1635     TRUE 0.956 28.000 0.105 0.012 Y NA
 7301850 7301851 EcSMS35_1635 EcSMS35_1636   bglH TRUE 0.939 56.000 0.250 0.013 Y NA
 7301851 7301852 EcSMS35_1636 EcSMS35_1637 bglH celA TRUE 0.904 25.000 0.000 1.000 Y NA
 7301853 7301854 EcSMS35_1638 EcSMS35_1639 marB marA FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7301854 7301855 EcSMS35_1639 EcSMS35_1640 marA marR TRUE 0.993 21.000 0.667 0.046 Y NA
 7301858 7301859 EcSMS35_1643 EcSMS35_1645     FALSE 0.263 37.000 0.000 NA   NA
 7301860 7301861 EcSMS35_1644 EcSMS35_1646     FALSE 0.194 78.000 0.000 1.000   NA
 7301862 7301863 EcSMS35_1647 EcSMS35_1648   glsA2 FALSE 0.249 64.000 0.000 1.000 N NA
 7301863 7301864 EcSMS35_1648 EcSMS35_1649 glsA2   TRUE 0.811 0.000 0.037 NA   NA
 7301864 7301865 EcSMS35_1649 EcSMS35_1650     FALSE 0.195 139.000 0.098 NA   NA
 7301865 7301866 EcSMS35_1650 EcSMS35_1651   uxaB FALSE 0.025 228.000 0.000 1.000 N NA
 7301866 7301867 EcSMS35_1651 EcSMS35_1652 uxaB   FALSE 0.094 197.000 0.143 NA   NA
 7301868 7301869 EcSMS35_1653 EcSMS35_1654 tam lsrG FALSE 0.238 57.000 0.000 1.000   NA
 7301869 7301870 EcSMS35_1654 EcSMS35_1655 lsrG lsrF FALSE 0.489 24.000 0.000 1.000   NA
 7301870 7301871 EcSMS35_1655 EcSMS35_1656 lsrF lsrB TRUE 0.879 27.000 0.000 NA Y NA
 7301871 7301872 EcSMS35_1656 EcSMS35_1657 lsrB lsrD TRUE 0.994 12.000 0.844 NA Y NA
 7301872 7301873 EcSMS35_1657 EcSMS35_1658 lsrD lsrC TRUE 0.999 0.000 0.788 0.052 Y NA
 7301873 7301874 EcSMS35_1658 EcSMS35_1659 lsrC lsrA TRUE 0.998 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 7301875 7301876 EcSMS35_1660 EcSMS35_1661 lsrR lsrK FALSE 0.221 79.000 0.000 1.000 N NA
 7301876 7301877 EcSMS35_1661 EcSMS35_1662 lsrK   FALSE 0.002 530.000 0.000 1.000   NA
 7301877 7301878 EcSMS35_1662 EcSMS35_1663     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 7301878 7301879 EcSMS35_1663 EcSMS35_1664     FALSE 0.001 768.000 0.000 NA   NA
 7301879 7301880 EcSMS35_1664 EcSMS35_1665     FALSE 0.046 363.000 0.000 1.000 Y NA
 7301880 7301881 EcSMS35_1665 EcSMS35_1666     TRUE 0.715 78.000 0.000 1.000 Y NA
 7301881 7301882 EcSMS35_1666 EcSMS35_1667     TRUE 0.939 14.000 0.000 1.000 Y NA
 7301882 7301883 EcSMS35_1667 EcSMS35_1669     TRUE 0.968 13.000 0.000 0.009 Y NA
 7301884 7301885 EcSMS35_1668 EcSMS35_1670     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.064 Y NA
 7301886 7301887 EcSMS35_1671 EcSMS35_1672     FALSE 0.006 339.000 0.000 1.000   NA
 7301887 7301888 EcSMS35_1672 EcSMS35_1673     FALSE 0.010 248.000 0.000 NA   NA
 7301888 7301889 EcSMS35_1673 EcSMS35_1674     FALSE 0.137 75.000 0.000 NA   NA
 7301889 7301890 EcSMS35_1674 EcSMS35_1675     FALSE 0.003 464.000 0.000 1.000 N NA
 7301890 7301891 EcSMS35_1675 EcSMS35_1676     TRUE 0.864 52.000 0.600 1.000   NA
 7301891 7301892 EcSMS35_1676 EcSMS35_1677     FALSE 0.009 291.000 0.000 1.000   NA
 7301892 7301893 EcSMS35_1677 EcSMS35_1678     TRUE 0.583 38.000 0.000 0.065   NA
 7301893 7301894 EcSMS35_1678 EcSMS35_1679   pqqL TRUE 0.541 57.000 0.167 1.000   NA
 7301894 7301895 EcSMS35_1679 EcSMS35_1680 pqqL gadA FALSE 0.005 362.000 0.000 1.000   NA
 7301895 7301896 EcSMS35_1680 EcSMS35_1681 gadA gadC TRUE 0.583 156.000 0.103 1.000 Y NA
 7301896 7301897 EcSMS35_1681 EcSMS35_1682 gadC   FALSE 0.019 236.000 0.000 1.000   NA
 7301897 7301898 EcSMS35_1682 EcSMS35_1683     FALSE 0.004 376.000 0.000 1.000   NA
 7301898 7301899 EcSMS35_1683 EcSMS35_1684   dos TRUE 0.993 1.000 0.130 0.005 Y NA
 7301899 7301900 EcSMS35_1684 EcSMS35_1685 dos ddpX FALSE 0.016 258.000 0.000 1.000 N NA
 7301900 7301901 EcSMS35_1685 EcSMS35_1686 ddpX   TRUE 0.793 14.000 0.091 1.000 N NA
 7301901 7301902 EcSMS35_1686 EcSMS35_1687   yddR TRUE 0.990 2.000 0.091 0.052 Y NA
 7301902 7301903 EcSMS35_1687 EcSMS35_1688 yddR yddQ TRUE 0.994 -3.000 0.143 0.052 Y NA
 7301903 7301904 EcSMS35_1688 EcSMS35_1689 yddQ   TRUE 0.995 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 7301904 7301905 EcSMS35_1689 EcSMS35_1690     TRUE 0.995 -7.000 0.219 0.002 Y NA
 7301906 7301907 EcSMS35_1691 EcSMS35_1692 osmC   FALSE 0.103 118.000 0.000 NA   NA
 7301908 7301909 EcSMS35_1693 EcSMS35_1694   rpsV TRUE 0.744 102.000 0.571 NA   NA
 7301909 7301910 EcSMS35_1694 EcSMS35_1695 rpsV sfcA TRUE 0.654 157.000 0.750 1.000   NA
 7301910 7301911 EcSMS35_1695 EcSMS35_1696 sfcA   FALSE 0.121 134.000 0.000 1.000   NA
 7301911 7301912 EcSMS35_1696 EcSMS35_1697     FALSE 0.099 146.000 0.000 1.000   NA
 7301913 7301914 EcSMS35_1698 EcSMS35_1699 fdnI fdnH TRUE 0.996 -7.000 0.333 0.002 Y NA
 7301914 7301915 EcSMS35_1699 EcSMS35_1700 fdnH fdnG TRUE 0.993 13.000 0.429 0.002 Y NA
 7301916 7301917 EcSMS35_1701 EcSMS35_1702     FALSE 0.032 258.000 0.000 0.099   NA
 7301917 7301918 EcSMS35_1702 EcSMS35_1703     FALSE 0.061 170.000 0.000 1.000   NA
 7301918 7301919 EcSMS35_1703 EcSMS35_1704     FALSE 0.470 63.000 0.000 0.011   NA
 7301919 7301920 EcSMS35_1704 EcSMS35_1705   narU FALSE 0.008 310.000 0.000 1.000   NA
 7301920 7301921 EcSMS35_1705 EcSMS35_1706 narU narZ TRUE 0.786 95.000 0.556 1.000 N NA
 7301921 7301922 EcSMS35_1706 EcSMS35_1707 narZ narY TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 7301922 7301923 EcSMS35_1707 EcSMS35_1708 narY narW TRUE 0.999 0.000 0.714 0.003 Y NA
 7301923 7301924 EcSMS35_1708 EcSMS35_1709 narW narV TRUE 0.999 -3.000 0.714 0.003 Y NA
 7301924 7301925 EcSMS35_1709 EcSMS35_1710 narV   FALSE 0.191 80.000 0.000 1.000   NA
 7301929 7301930 EcSMS35_1714 EcSMS35_1715     TRUE 0.598 -24.000 0.000 NA   NA
 7301930 7301931 EcSMS35_1715 EcSMS35_1716     TRUE 0.621 -18.000 0.000 NA   NA
 7301937 7301938 EcSMS35_1722 EcSMS35_1724     TRUE 0.572 -31.000 0.000 NA   NA
 7301940 7301941 EcSMS35_1725 EcSMS35_1726     TRUE 0.888 -3.000 0.070 NA   NA
 7301942 7301943 EcSMS35_1727 EcSMS35_1728     FALSE 0.129 86.000 0.000 NA   NA
 7301945 7301946 EcSMS35_1729 EcSMS35_1731 ydcW ydcV TRUE 0.849 22.000 0.216 1.000 N NA
 7301946 7301947 EcSMS35_1731 EcSMS35_1732 ydcV ydcU TRUE 0.998 -10.000 0.821 0.052 Y NA
 7301947 7301948 EcSMS35_1732 EcSMS35_1733 ydcU ydcT TRUE 0.998 1.000 0.643 0.052 Y NA
 7301948 7301949 EcSMS35_1733 EcSMS35_1734 ydcT ydcS TRUE 0.993 18.000 0.609 0.052 Y NA
 7301949 7301950 EcSMS35_1734 EcSMS35_1735 ydcS   FALSE 0.148 245.000 0.000 1.000 Y NA
 7301950 7301951 EcSMS35_1735 EcSMS35_1736     FALSE 0.192 79.000 0.000 1.000   NA
 7301952 7301953 EcSMS35_1737 EcSMS35_1738     FALSE 0.105 117.000 0.000 NA   NA
 7301954 7301955 EcSMS35_1739 EcSMS35_1740     FALSE 0.203 73.000 0.000 1.000   NA
 7301959 7301960 EcSMS35_1744 EcSMS35_1745   tehB FALSE 0.014 303.000 0.088 NA   NA
 7301960 7301961 EcSMS35_1745 EcSMS35_1746 tehB tehA TRUE 0.957 -3.000 0.175 1.000   NA
 7301963 7301964 EcSMS35_1747 EcSMS35_1749 rimL   FALSE 0.160 63.000 0.026 NA   NA
 7301964 7301965 EcSMS35_1749 EcSMS35_1750   mdoD FALSE 0.076 140.000 0.026 NA   NA
 7301965 7301966 EcSMS35_1750 EcSMS35_1751 mdoD   FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 7301968 7301969 EcSMS35_1753 EcSMS35_1754 trg   FALSE 0.001 620.000 0.000 NA   NA
 7301969 7301970 EcSMS35_1754 EcSMS35_1755     FALSE 0.011 245.000 0.000 NA   NA
 7301972 7301973 EcSMS35_1757 EcSMS35_1758 aldA   FALSE 0.033 197.000 0.040 NA   NA
 7301973 7301974 EcSMS35_1758 EcSMS35_1759   hrpA FALSE 0.007 273.000 0.000 NA   NA
 7301976 7301977 EcSMS35_1761 EcSMS35_1762     TRUE 0.977 14.000 0.285 NA Y NA
 7301977 7301978 EcSMS35_1762 EcSMS35_1763   cdsA2 FALSE 0.452 16.000 0.000 NA   NA
 7301978 7301979 EcSMS35_1763 EcSMS35_1764 cdsA2   TRUE 0.980 0.000 0.179 0.002   NA
 7301979 7301980 EcSMS35_1764 EcSMS35_1765     FALSE 0.040 170.000 0.000 NA   NA
 7301980 7301981 EcSMS35_1765 EcSMS35_1766     FALSE 0.150 64.000 0.000 NA   NA
 7301981 7301982 EcSMS35_1766 EcSMS35_1767     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7301982 7301983 EcSMS35_1767 EcSMS35_1768     FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 7301983 7301984 EcSMS35_1768 EcSMS35_1769     TRUE 0.980 8.000 0.726 NA   NA
 7301984 7301985 EcSMS35_1769 EcSMS35_1770     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7301986 7301987 EcSMS35_1771 EcSMS35_1773 idhA hslJ FALSE 0.135 111.000 0.000 NA N NA
 7301989 7301990 EcSMS35_1774 EcSMS35_1775   ydbK FALSE 0.253 71.000 0.065 NA   NA
 7301990 7301991 EcSMS35_1775 EcSMS35_1776 ydbK ompN FALSE 0.005 366.000 0.000 1.000 N NA
 7301991 7301992 EcSMS35_1776 EcSMS35_1777 ompN uspF FALSE 0.125 141.000 0.000 1.000 N NA
 7301992 7301993 EcSMS35_1777 EcSMS35_1778 uspF   FALSE 0.045 176.000 0.000 NA N NA
 7301994 7301995 EcSMS35_1779 EcSMS35_1780 dbpA zntB FALSE 0.003 478.000 0.000 1.000 N NA
 7301997 7301998 EcSMS35_1782 EcSMS35_1783   abgR FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 7301999 7302000 EcSMS35_1784 EcSMS35_1785 abgA abgB TRUE 0.975 0.000 0.128 0.002   NA
 7302000 7302001 EcSMS35_1785 EcSMS35_1786 abgB abgT FALSE 0.520 31.000 0.080 NA   NA
 7302001 7302002 EcSMS35_1786 EcSMS35_1787 abgT ogt TRUE 0.606 11.000 0.000 NA N NA
 7302002 7302003 EcSMS35_1787 EcSMS35_1788 ogt fnr FALSE 0.046 195.000 0.000 1.000 N NA
 7302003 7302004 EcSMS35_1788 EcSMS35_1789 fnr uspE TRUE 0.876 152.000 0.619 1.000 Y NA
 7302007 7302008 EcSMS35_1792 EcSMS35_1793 mppA   FALSE 0.007 337.000 0.000 1.000 N NA
 7302009 7302010 EcSMS35_1794 EcSMS35_1795     FALSE 0.207 71.000 0.000 1.000   NA
 7302010 7302011 EcSMS35_1795 EcSMS35_1797     FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000 N NA
 7302014 7302015 EcSMS35_1799 EcSMS35_1800 tyrR   FALSE 0.213 148.000 0.137 NA   NA
 7302015 7302016 EcSMS35_1800 EcSMS35_1801     TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA   NA
 7302018 7302019 EcSMS35_1803 EcSMS35_1804 ompG   TRUE 0.808 45.000 0.222 0.052   NA
 7302019 7302020 EcSMS35_1804 EcSMS35_1805   pgmB TRUE 0.790 14.000 0.103 1.000   NA
 7302020 7302021 EcSMS35_1805 EcSMS35_1806 pgmB   TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000   NA
 7302021 7302022 EcSMS35_1806 EcSMS35_1807     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000   NA
 7302022 7302023 EcSMS35_1807 EcSMS35_1808     TRUE 0.887 22.000 0.347 NA   NA
 7302023 7302024 EcSMS35_1808 EcSMS35_1809     TRUE 0.872 18.000 0.261 NA N NA
 7302024 7302025 EcSMS35_1809 EcSMS35_1810     TRUE 0.778 31.000 0.205 1.000 N NA
 7302025 7302026 EcSMS35_1810 EcSMS35_1811     TRUE 0.998 -13.000 0.805 0.052 Y NA
 7302026 7302027 EcSMS35_1811 EcSMS35_1812     TRUE 0.992 21.000 0.620 0.052 Y NA
 7302027 7302028 EcSMS35_1812 EcSMS35_1813     TRUE 0.984 14.000 0.360 1.000 Y NA
 7302028 7302029 EcSMS35_1813 EcSMS35_1814   pspE FALSE 0.032 214.000 0.000 1.000 N NA
 7302029 7302030 EcSMS35_1814 EcSMS35_1815 pspE pspD FALSE 0.384 75.000 0.133 NA   NA
 7302030 7302031 EcSMS35_1815 EcSMS35_1816 pspD pspC TRUE 0.880 9.000 0.167 NA   NA
 7302031 7302032 EcSMS35_1816 EcSMS35_1817 pspC pspB TRUE 0.992 0.000 0.913 NA   NA
 7302032 7302033 EcSMS35_1817 EcSMS35_1818 pspB pspA TRUE 0.872 54.000 0.739 NA   NA
 7302035 7302036 EcSMS35_1820 EcSMS35_1821 gabT1 puuB TRUE 0.899 38.000 0.100 1.000 Y NA
 7302036 7302037 EcSMS35_1821 EcSMS35_1822 puuB puuC TRUE 0.989 2.000 0.500 0.027 N NA
 7302037 7302038 EcSMS35_1822 EcSMS35_1823 puuC puuR FALSE 0.128 150.000 0.040 1.000 N NA
 7302038 7302039 EcSMS35_1823 EcSMS35_1824 puuR puuD TRUE 0.529 27.000 0.046 1.000   NA
 7302040 7302041 EcSMS35_1825 EcSMS35_1826 puuA   FALSE 0.078 303.000 0.000 1.000 Y NA
 7302041 7302042 EcSMS35_1826 EcSMS35_1827     FALSE 0.080 134.000 0.000 NA   NA
 7302042 7302043 EcSMS35_1827 EcSMS35_1828   sapA FALSE 0.004 337.000 0.000 NA   NA
 7302043 7302044 EcSMS35_1828 EcSMS35_1829 sapA sapB TRUE 0.984 -3.000 0.264 0.052 N NA
 7302044 7302045 EcSMS35_1829 EcSMS35_1830 sapB sapC TRUE 0.993 -13.000 0.284 0.052 Y NA
 7302045 7302046 EcSMS35_1830 EcSMS35_1831 sapC sapD TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 7302046 7302047 EcSMS35_1831 EcSMS35_1832 sapD sapF TRUE 0.998 2.000 0.684 0.016 Y NA
 7302048 7302049 EcSMS35_1833 EcSMS35_1834 eefD eefC TRUE 0.940 9.000 0.143 0.052 N NA
 7302049 7302050 EcSMS35_1834 EcSMS35_1835 eefC eefB TRUE 0.981 4.000 0.367 0.052 N NA
 7302050 7302051 EcSMS35_1835 EcSMS35_1836 eefB eefA TRUE 0.954 0.000 0.167 1.000 N NA
 7302051 7302052 EcSMS35_1836 EcSMS35_1837 eefA eefR FALSE 0.428 149.000 0.286 1.000 N NA
 7302052 7302053 EcSMS35_1837 EcSMS35_1838 eefR   FALSE 0.036 176.000 0.000 NA   NA
 7302054 7302055 EcSMS35_1839 EcSMS35_1840 fabI   FALSE 0.118 145.000 0.057 NA   NA
 7302055 7302056 EcSMS35_1840 EcSMS35_1841   rnb FALSE 0.356 68.000 0.105 NA   NA
 7302056 7302057 EcSMS35_1841 EcSMS35_1842 rnb   FALSE 0.023 235.000 0.000 1.000 N NA
 7302057 7302058 EcSMS35_1842 EcSMS35_1843     FALSE 0.149 148.000 0.083 NA   NA
 7302058 7302059 EcSMS35_1843 EcSMS35_1844     FALSE 0.388 90.000 0.146 NA   NA
 7302059 7302060 EcSMS35_1844 EcSMS35_1845     FALSE 0.007 269.000 0.000 NA   NA
 7302061 7302062 EcSMS35_1846 EcSMS35_1847   pyrF TRUE 0.899 -3.000 0.045 1.000 N NA
 7302064 7302065 EcSMS35_1849 EcSMS35_1850     TRUE 0.974 7.000 0.576 NA   NA
 7302065 7302066 EcSMS35_1850 EcSMS35_1851   pgpB FALSE 0.215 149.000 0.143 NA   NA
 7302068 7302069 EcSMS35_1853 EcSMS35_1854 acnA   FALSE 0.004 320.000 0.000 NA   NA
 7302069 7302070 EcSMS35_1854 EcSMS35_1855     TRUE 0.980 3.000 0.556 NA   NA
 7302070 7302071 EcSMS35_1855 EcSMS35_1856   cysB FALSE 0.004 331.000 0.000 NA   NA
 7302071 7302072 EcSMS35_1856 EcSMS35_1857 cysB topA FALSE 0.031 209.000 0.008 1.000 N NA
 7302075 7302076 EcSMS35_1860 EcSMS35_1861   btuR TRUE 0.904 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7302077 7302078 EcSMS35_1862 EcSMS35_1863     TRUE 0.548 11.000 0.000 NA   NA
 7302078 7302079 EcSMS35_1863 EcSMS35_1864   rluB FALSE 0.040 170.000 0.000 NA   NA
 7302079 7302080 EcSMS35_1864 EcSMS35_1865 rluB   FALSE 0.018 211.000 0.000 NA   NA
 7302080 7302081 EcSMS35_1865 EcSMS35_1866     FALSE 0.328 28.000 0.000 NA   NA
 7302081 7302082 EcSMS35_1866 EcSMS35_1867     TRUE 0.917 -39.000 0.281 NA   NA
 7302083 7302084 EcSMS35_1868 EcSMS35_1869 trpE trpD TRUE 0.991 0.000 0.010 0.001 Y NA
 7302084 7302085 EcSMS35_1869 EcSMS35_1870 trpD trpC TRUE 0.976 1.000 0.003 1.000 Y NA
 7302085 7302086 EcSMS35_1870 EcSMS35_1871 trpC trpB TRUE 0.973 12.000 0.005 0.001 Y NA
 7302086 7302087 EcSMS35_1871 EcSMS35_1872 trpB trpA TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 7302087 7302088 EcSMS35_1872 EcSMS35_1873 trpA   FALSE 0.002 381.000 0.000 NA   NA
 7302088 7302089 EcSMS35_1873 EcSMS35_1874   yciF FALSE 0.148 65.000 0.000 NA   NA
 7302089 7302090 EcSMS35_1874 EcSMS35_1875 yciF   FALSE 0.077 273.000 0.115 0.001   NA
 7302092 7302093 EcSMS35_1877 EcSMS35_1878   ispZ FALSE 0.474 30.000 0.061 NA   NA
 7302093 7302094 EcSMS35_1878 EcSMS35_1879 ispZ yciA FALSE 0.409 105.000 0.167 NA N NA
 7302096 7302097 EcSMS35_1881 EcSMS35_1882     FALSE 0.055 153.000 0.000 NA   NA
 7302097 7302098 EcSMS35_1882 EcSMS35_1884     FALSE 0.111 109.000 0.000 NA   NA
 7302099 7302100 EcSMS35_1883 EcSMS35_1885     FALSE 0.065 146.000 0.000 NA   NA
 7302101 7302102 EcSMS35_1886 EcSMS35_1887     FALSE 0.323 44.000 0.000 1.000   NA
 7302102 7302103 EcSMS35_1887 EcSMS35_1888     TRUE 0.969 -42.000 0.000 0.063 Y NA
 7302103 7302104 EcSMS35_1888 EcSMS35_1889     TRUE 0.977 -25.000 0.000 0.012 Y NA
 7302104 7302105 EcSMS35_1889 EcSMS35_1890   kch FALSE 0.002 686.000 0.000 1.000 N NA
 7302105 7302106 EcSMS35_1890 EcSMS35_1891 kch cls FALSE 0.005 371.000 0.000 1.000 N NA
 7302106 7302107 EcSMS35_1891 EcSMS35_1892 cls   TRUE 0.731 35.000 0.231 NA   NA
 7302108 7302109 EcSMS35_1893 EcSMS35_1894 oppF oppD TRUE 0.998 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 7302109 7302110 EcSMS35_1894 EcSMS35_1895 oppD oppC TRUE 0.991 12.000 0.554 1.000 Y NA
 7302110 7302111 EcSMS35_1895 EcSMS35_1896 oppC oppB TRUE 0.995 18.000 0.870 0.051 Y NA
 7302111 7302112 EcSMS35_1896 EcSMS35_1897 oppB oppA TRUE 0.879 86.000 0.151 0.051 Y NA
 7302114 7302115 EcSMS35_1898 EcSMS35_1900     FALSE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 7302118 7302119 EcSMS35_1903 EcSMS35_1904     FALSE 0.127 92.000 0.000 NA   NA
 7302120 7302121 EcSMS35_1905 EcSMS35_1906 galU   FALSE 0.179 202.000 0.235 1.000 N NA
 7302121 7302122 EcSMS35_1906 EcSMS35_1907     FALSE 0.245 92.000 0.048 1.000   NA
 7302123 7302124 EcSMS35_1908 EcSMS35_1909   purU TRUE 0.600 50.000 0.200 NA   NA
 7302124 7302125 EcSMS35_1909 EcSMS35_1910 purU   FALSE 0.048 159.000 0.000 NA   NA
 7302125 7302126 EcSMS35_1910 EcSMS35_1911     FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   NA
 7302127 7302128 EcSMS35_1912 EcSMS35_1913 narI narJ TRUE 0.998 0.000 0.500 0.003 Y NA
 7302128 7302129 EcSMS35_1913 EcSMS35_1914 narJ narH TRUE 0.999 -3.000 0.588 0.003 Y NA
 7302129 7302130 EcSMS35_1914 EcSMS35_1915 narH narG TRUE 0.998 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 7302130 7302131 EcSMS35_1915 EcSMS35_1916 narG narK FALSE 0.004 394.000 0.000 1.000 N NA
 7302131 7302132 EcSMS35_1916 EcSMS35_1917 narK   FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 7302133 7302134 EcSMS35_1918 EcSMS35_1919 narX narL TRUE 0.997 -7.000 0.521 0.014 Y NA
 7302137 7302138 EcSMS35_1922 EcSMS35_1923   chaB FALSE 0.174 158.000 0.140 NA   NA
 7302139 7302140 EcSMS35_1924 EcSMS35_1925     FALSE 0.003 379.000 0.000 NA   NA
 7302140 7302141 EcSMS35_1925 EcSMS35_1926     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 7302142 7302143 EcSMS35_1927 EcSMS35_1928 kdsA sirB1 TRUE 0.570 36.000 0.089 1.000   NA
 7302143 7302144 EcSMS35_1928 EcSMS35_1929 sirB1   TRUE 0.922 4.000 0.195 NA   NA
 7302144 7302145 EcSMS35_1929 EcSMS35_1930   hemK TRUE 0.923 -3.000 0.109 NA   NA
 7302145 7302146 EcSMS35_1930 EcSMS35_1931 hemK prfA TRUE 0.995 0.000 0.229 0.041 Y NA
 7302146 7302147 EcSMS35_1931 EcSMS35_1932 prfA hemA TRUE 0.801 42.000 0.171 0.041 N NA
 7302148 7302149 EcSMS35_1933 EcSMS35_1934 lolB ipk TRUE 0.952 0.000 0.157 1.000 N NA
 7302149 7302150 EcSMS35_1934 EcSMS35_1935 ipk prs FALSE 0.287 85.000 0.053 1.000 N NA
 7302150 7302151 EcSMS35_1935 EcSMS35_1936 prs ychM FALSE 0.172 125.000 0.027 1.000 N NA
 7302153 7302154 EcSMS35_1938 EcSMS35_1939 pth engD TRUE 0.808 117.000 0.184 1.000 Y NA
 7302156 7302157 EcSMS35_1941 EcSMS35_1942 dhaK dhaL TRUE 0.991 11.000 0.226 0.001 Y NA
 7302157 7302158 EcSMS35_1942 EcSMS35_1943 dhaL dhaM TRUE 0.843 11.000 0.118 1.000   NA
 7302158 7302159 EcSMS35_1943 EcSMS35_1944 dhaM   FALSE 0.339 27.000 0.000 NA   NA
 7302161 7302162 EcSMS35_1946 EcSMS35_1947 treA   FALSE 0.007 330.000 0.000 1.000 N NA
 7302162 7302163 EcSMS35_1947 EcSMS35_1948     TRUE 0.996 0.000 0.422 1.000 Y NA
 7302163 7302164 EcSMS35_1948 EcSMS35_1949     TRUE 0.998 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 7302164 7302165 EcSMS35_1949 EcSMS35_1950     TRUE 0.836 10.000 0.123 NA   NA
 7302165 7302166 EcSMS35_1950 EcSMS35_1951   modD TRUE 0.816 -3.000 0.034 NA   NA
 7302166 7302167 EcSMS35_1951 EcSMS35_1952 modD   TRUE 0.541 26.000 0.034 1.000 N NA
 7302171 7302172 EcSMS35_1956 EcSMS35_1957 ldcA cvrA FALSE 0.339 95.000 0.103 NA N NA
 7302172 7302173 EcSMS35_1957 EcSMS35_1958 cvrA   FALSE 0.001 749.000 0.000 NA   NA
 7302174 7302175 EcSMS35_1959 EcSMS35_1960 dadX dadA TRUE 0.901 10.000 0.168 1.000 N NA
 7302178 7302179 EcSMS35_1963 EcSMS35_1964 nhaB dsbB TRUE 0.721 146.000 0.723 1.000 N NA
 7302180 7302181 EcSMS35_1965 EcSMS35_1966 umuC umuD TRUE 0.858 0.000 0.000 1.000 N NA
 7302183 7302184 EcSMS35_1968 EcSMS35_1969     FALSE 0.300 77.000 0.088 NA   NA
 7302184 7302185 EcSMS35_1969 EcSMS35_1970     FALSE 0.231 72.000 0.056 NA   NA
 7302188 7302189 EcSMS35_1973 EcSMS35_1974 minC minD TRUE 0.981 24.000 0.466 1.000 Y NA
 7302189 7302190 EcSMS35_1974 EcSMS35_1975 minD minE TRUE 0.995 4.000 0.618 NA Y NA
 7302192 7302193 EcSMS35_1977 EcSMS35_1978     TRUE 0.717 2.000 0.000 NA   NA
 7302193 7302194 EcSMS35_1978 EcSMS35_1979     TRUE 0.579 10.000 0.000 NA   NA
 7302195 7302196 EcSMS35_1980 EcSMS35_1981     FALSE 0.002 491.000 0.000 NA   NA
 7302196 7302197 EcSMS35_1981 EcSMS35_1982     FALSE 0.105 117.000 0.000 NA   NA
 7302197 7302198 EcSMS35_1982 EcSMS35_1983     FALSE 0.083 132.000 0.000 NA   NA
 7302198 7302199 EcSMS35_1983 EcSMS35_1984     FALSE 0.002 395.000 0.000 NA   NA
 7302199 7302200 EcSMS35_1984 EcSMS35_1985     FALSE 0.030 185.000 0.000 NA   NA
 7302201 7302202 EcSMS35_1986 EcSMS35_1987   mlrA FALSE 0.230 205.000 0.333 1.000 N NA
 7302202 7302203 EcSMS35_1987 EcSMS35_1988 mlrA   FALSE 0.015 221.000 0.000 NA   NA
 7302205 7302206 EcSMS35_1990 EcSMS35_1991 rluE   TRUE 0.909 10.000 0.182 1.000 N NA
 7302206 7302207 EcSMS35_1991 EcSMS35_1992   mnmA TRUE 0.578 54.000 0.158 1.000 N NA
 7302207 7302208 EcSMS35_1992 EcSMS35_1993 mnmA   TRUE 0.663 36.000 0.180 NA   NA
 7302208 7302209 EcSMS35_1993 EcSMS35_1994   purB TRUE 0.857 4.000 0.093 NA   NA
 7302209 7302210 EcSMS35_1994 EcSMS35_1995 purB phoP FALSE 0.066 169.000 0.011 1.000 N NA
 7302210 7302211 EcSMS35_1995 EcSMS35_1996 phoP phoQ TRUE 0.998 0.000 0.940 1.000 Y NA
 7302211 7302212 EcSMS35_1996 EcSMS35_1997 phoQ   TRUE 0.691 76.000 0.408 NA   NA
 7302214 7302215 EcSMS35_1999 EcSMS35_2000   potA TRUE 0.609 -21.000 0.000 NA   NA
 7302215 7302216 EcSMS35_2000 EcSMS35_2001 potA potB TRUE 0.996 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 7302216 7302217 EcSMS35_2001 EcSMS35_2002 potB potC TRUE 0.996 -3.000 0.286 0.051 Y NA
 7302217 7302218 EcSMS35_2002 EcSMS35_2003 potC potD TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.051 Y NA
 7302218 7302219 EcSMS35_2003 EcSMS35_2004 potD   FALSE 0.162 58.000 0.000 NA   NA
 7302219 7302220 EcSMS35_2004 EcSMS35_2005     TRUE 0.780 -3.000 0.000 NA   NA
 7302221 7302222 EcSMS35_2006 EcSMS35_2007 npdA nagK TRUE 0.958 16.000 0.119 1.000 Y NA
 7302222 7302223 EcSMS35_2007 EcSMS35_2008 nagK lolE TRUE 0.809 29.000 0.225 1.000 N NA
 7302223 7302224 EcSMS35_2008 EcSMS35_2009 lolE lolD TRUE 0.968 0.000 0.125 0.063 N NA
 7302224 7302225 EcSMS35_2009 EcSMS35_2010 lolD lolC TRUE 0.967 -7.000 0.175 0.063 N NA
 7302226 7302227 EcSMS35_2011 EcSMS35_2012   mfd FALSE 0.110 128.000 0.003 1.000   NA
 7302227 7302228 EcSMS35_2012 EcSMS35_2013 mfd   FALSE 0.080 148.000 0.006 1.000   NA
 7302231 7302232 EcSMS35_2016 EcSMS35_2017   ndh FALSE 0.041 227.000 0.071 1.000   NA
 7302232 7302233 EcSMS35_2017 EcSMS35_2018 ndh   FALSE 0.004 400.000 0.057 NA   NA
 7302233 7302234 EcSMS35_2018 EcSMS35_2019   nagZ TRUE 0.645 23.000 0.091 NA   NA
 7302234 7302235 EcSMS35_2019 EcSMS35_2020 nagZ thiK TRUE 0.800 11.000 0.069 1.000 N NA
 7302235 7302236 EcSMS35_2020 EcSMS35_2021 thiK   TRUE 0.941 -19.000 0.310 NA   NA
 7302236 7302237 EcSMS35_2021 EcSMS35_2022     TRUE 0.947 14.000 0.516 NA   NA
 7302237 7302238 EcSMS35_2022 EcSMS35_2023   hinT FALSE 0.464 27.000 0.051 NA   NA
 7302239 7302240 EcSMS35_2024 EcSMS35_2025   fhuE FALSE 0.287 33.000 0.000 NA   NA
 7302241 7302242 EcSMS35_2026 EcSMS35_2027 ptsG   FALSE 0.005 295.000 0.004 NA N NA
 7302242 7302243 EcSMS35_2027 EcSMS35_2028   holB TRUE 0.966 11.000 0.110 NA Y NA
 7302243 7302244 EcSMS35_2028 EcSMS35_2029 holB tmk TRUE 0.967 -3.000 0.211 1.000 N NA
 7302244 7302245 EcSMS35_2029 EcSMS35_2030 tmk   TRUE 0.928 -10.000 0.209 NA   NA
 7302245 7302246 EcSMS35_2030 EcSMS35_2031   pabC TRUE 0.934 3.000 0.204 NA   NA
 7302246 7302247 EcSMS35_2031 EcSMS35_2032 pabC fabF FALSE 0.451 120.000 0.187 1.000 N NA
 7302247 7302248 EcSMS35_2032 EcSMS35_2033 fabF acpP TRUE 0.903 88.000 0.346 1.000 Y NA
 7302248 7302249 EcSMS35_2033 EcSMS35_2034 acpP fabG TRUE 0.663 211.000 0.321 0.003 Y NA
 7302249 7302250 EcSMS35_2034 EcSMS35_2035 fabG fabD TRUE 0.993 13.000 0.432 0.003 Y NA
 7302250 7302251 EcSMS35_2035 EcSMS35_2036 fabD fabH TRUE 0.982 16.000 0.182 0.003 Y NA
 7302251 7302252 EcSMS35_2036 EcSMS35_2037 fabH plsX TRUE 0.955 68.000 0.380 0.003 Y NA
 7302252 7302253 EcSMS35_2037 EcSMS35_2038 plsX rpmF TRUE 0.730 81.000 0.418 1.000 N NA
 7302253 7302254 EcSMS35_2038 EcSMS35_2039 rpmF   TRUE 0.846 52.000 0.599 NA   NA
 7302257 7302258 EcSMS35_2042 EcSMS35_2043 rne   FALSE 0.121 134.000 0.000 1.000   NA
 7302258 7302259 EcSMS35_2043 EcSMS35_2044     TRUE 0.848 -3.000 0.000 1.000   NA
 7302260 7302261 EcSMS35_2045 EcSMS35_2046 flgL flgK TRUE 0.985 12.000 0.142 0.002 Y NA
 7302261 7302262 EcSMS35_2046 EcSMS35_2047 flgK flgJ TRUE 0.978 66.000 0.705 0.003 Y NA
 7302262 7302263 EcSMS35_2047 EcSMS35_2048 flgJ flgI TRUE 0.990 0.000 0.036 0.009 Y NA
 7302263 7302264 EcSMS35_2048 EcSMS35_2049 flgI flgH TRUE 0.977 12.000 0.073 0.009 Y NA
 7302264 7302265 EcSMS35_2049 EcSMS35_2050 flgH flgG TRUE 0.950 53.000 0.268 0.008 Y NA
 7302265 7302266 EcSMS35_2050 EcSMS35_2051 flgG flgF TRUE 0.925 137.000 0.420 0.001 Y NA
 7302266 7302267 EcSMS35_2051 EcSMS35_2052 flgF flgE TRUE 0.991 20.000 0.476 0.005 Y NA
 7302267 7302268 EcSMS35_2052 EcSMS35_2053 flgE flgD TRUE 0.932 25.000 0.116 NA Y NA
 7302268 7302269 EcSMS35_2053 EcSMS35_2054 flgD flgC TRUE 0.972 12.000 0.186 NA Y NA
 7302269 7302270 EcSMS35_2054 EcSMS35_2055 flgC flgB TRUE 0.998 4.000 0.824 0.005 Y NA
 7302270 7302271 EcSMS35_2055 EcSMS35_2056 flgB   FALSE 0.442 17.000 0.000 NA   NA
 7302272 7302273 EcSMS35_2057 EcSMS35_2058 flgA flgM TRUE 0.890 76.000 0.330 NA Y NA
 7302273 7302274 EcSMS35_2058 EcSMS35_2059 flgM flgN TRUE 0.995 5.000 0.361 0.003 Y NA
 7302275 7302276 EcSMS35_2060 EcSMS35_2061 mviN   FALSE 0.164 110.000 0.022 1.000   NA
 7302276 7302277 EcSMS35_2061 EcSMS35_2062     TRUE 0.890 2.000 0.103 NA   NA
 7302277 7302278 EcSMS35_2062 EcSMS35_2063   rimJ TRUE 0.810 11.000 0.116 NA   NA
 7302279 7302280 EcSMS35_2064 EcSMS35_2065 mdtH grxB FALSE 0.386 64.000 0.103 NA N NA
 7302280 7302281 EcSMS35_2065 EcSMS35_2066 grxB   FALSE 0.174 134.000 0.078 NA   NA
 7302281 7302282 EcSMS35_2066 EcSMS35_2067   pyrC FALSE 0.113 106.000 0.022 NA   NA
 7302282 7302283 EcSMS35_2067 EcSMS35_2068 pyrC dinI FALSE 0.159 74.000 0.031 NA   NA
 7302283 7302284 EcSMS35_2068 EcSMS35_2069 dinI bssS FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 7302284 7302285 EcSMS35_2069 EcSMS35_2070 bssS solA TRUE 0.639 115.000 0.423 NA   NA
 7302285 7302286 EcSMS35_2070 EcSMS35_2071 solA   TRUE 0.693 48.000 0.269 NA   NA
 7302288 7302289 EcSMS35_2073 EcSMS35_2074   yceI TRUE 0.983 4.000 0.676 NA   NA
 7302291 7302292 EcSMS35_2076 EcSMS35_2077 lpxL mdtG TRUE 0.729 172.000 0.857 0.074 N NA
 7302292 7302293 EcSMS35_2077 EcSMS35_2078 mdtG msyB TRUE 0.623 83.000 0.333 NA   NA
 7302294 7302295 EcSMS35_2079 EcSMS35_2080   mdoH FALSE 0.136 173.000 0.135 NA   NA
 7302295 7302296 EcSMS35_2080 EcSMS35_2081 mdoH mdoG TRUE 0.919 23.000 0.469 NA N NA
 7302297 7302298 EcSMS35_2082 EcSMS35_2083     TRUE 0.670 4.000 0.000 NA   NA
 7302298 7302299 EcSMS35_2083 EcSMS35_2084   mdoC FALSE 0.229 45.000 0.000 NA   NA
 7302300 7302301 EcSMS35_2085 EcSMS35_2086     TRUE 0.848 2.000 0.046 1.000   NA
 7302301 7302302 EcSMS35_2086 EcSMS35_2087     FALSE 0.137 95.000 0.028 NA   NA
 7302302 7302303 EcSMS35_2087 EcSMS35_2088   csgC FALSE 0.092 277.000 0.429 NA   NA
 7302303 7302304 EcSMS35_2088 EcSMS35_2089 csgC csgA TRUE 0.843 58.000 0.667 NA   NA
 7302304 7302305 EcSMS35_2089 EcSMS35_2090 csgA csgB TRUE 0.891 41.000 0.333 0.008   NA
 7302308 7302309 EcSMS35_2093 EcSMS35_2094 csgD csgE TRUE 0.906 5.000 0.176 NA   NA
 7302309 7302310 EcSMS35_2094 EcSMS35_2095 csgE csgF TRUE 0.946 25.000 0.723 NA   NA
 7302310 7302311 EcSMS35_2095 EcSMS35_2096 csgF csgG FALSE 0.429 27.000 0.043 NA   NA
 7302312 7302313 EcSMS35_2097 EcSMS35_2098     FALSE 0.414 72.000 0.145 NA   NA
 7302313 7302314 EcSMS35_2098 EcSMS35_2099     TRUE 0.911 24.000 0.417 1.000   NA
 7302314 7302315 EcSMS35_2099 EcSMS35_2100     TRUE 0.876 55.000 0.169 1.000 Y NA
 7302317 7302318 EcSMS35_2102 EcSMS35_2103   phoH FALSE 0.001 563.000 0.000 NA   NA
 7302318 7302319 EcSMS35_2103 EcSMS35_2104 phoH   FALSE 0.004 345.000 0.000 NA N NA
 7302319 7302320 EcSMS35_2104 EcSMS35_2105     TRUE 0.990 6.000 0.378 NA Y NA
 7302320 7302321 EcSMS35_2105 EcSMS35_2106     TRUE 0.917 58.000 0.356 NA Y NA
 7302323 7302324 EcSMS35_2108 EcSMS35_2109 putP   TRUE 0.672 -10.000 0.000 NA   NA
 7302324 7302325 EcSMS35_2109 EcSMS35_2110     FALSE 0.295 32.000 0.000 NA   NA
 7302328 7302329 EcSMS35_2113 EcSMS35_2114     TRUE 0.990 -3.000 0.621 NA N NA
 7302329 7302330 EcSMS35_2114 EcSMS35_2115     TRUE 0.948 12.000 0.442 NA N NA
 7302330 7302331 EcSMS35_2115 EcSMS35_2116     TRUE 0.951 8.000 0.365 NA   NA
 7302331 7302332 EcSMS35_2116 EcSMS35_2117     TRUE 0.966 -3.000 0.256 NA   NA
 7302332 7302333 EcSMS35_2117 EcSMS35_2118     TRUE 0.983 11.000 0.625 0.026   NA
 7302333 7302334 EcSMS35_2118 EcSMS35_2119     TRUE 0.940 21.000 0.533 1.000   NA
 7302334 7302335 EcSMS35_2119 EcSMS35_2120   wrbA FALSE 0.002 629.000 0.000 1.000   NA
 7302335 7302336 EcSMS35_2120 EcSMS35_2121 wrbA   TRUE 0.864 21.000 0.290 NA   NA
 7302337 7302338 EcSMS35_2122 EcSMS35_2123 agp   FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 7302339 7302340 EcSMS35_2124 EcSMS35_2125 cbpA cbpM TRUE 0.984 0.000 0.512 NA   NA
 7302341 7302342 EcSMS35_2126 EcSMS35_2127 torD torA TRUE 0.960 -3.000 0.077 0.045   NA
 7302342 7302343 EcSMS35_2127 EcSMS35_2128 torA torC TRUE 0.989 0.000 0.000 0.045 Y NA
 7302346 7302347 EcSMS35_2131 EcSMS35_2132 torS   FALSE 0.158 83.000 0.000 NA N NA
 7302348 7302349 EcSMS35_2133 EcSMS35_2134     FALSE 0.025 195.000 0.000 NA   NA
 7302349 7302350 EcSMS35_2134 EcSMS35_2135     FALSE 0.131 80.000 0.000 NA   NA
 7302352 7302353 EcSMS35_2136 EcSMS35_2138 appA appB FALSE 0.046 185.000 0.000 1.000   NA
 7302353 7302354 EcSMS35_2138 EcSMS35_2139 appB appC TRUE 0.983 12.000 0.158 0.045 Y NA
 7302354 7302355 EcSMS35_2139 EcSMS35_2140 appC hyaF FALSE 0.146 134.000 0.061 NA   NA
 7302355 7302356 EcSMS35_2140 EcSMS35_2141 hyaF hyaE TRUE 0.991 -3.000 0.769 NA   NA
 7302356 7302357 EcSMS35_2141 EcSMS35_2142 hyaE hyaD TRUE 0.915 -3.000 0.096 NA   NA
 7302357 7302358 EcSMS35_2142 EcSMS35_2143 hyaD hyaC TRUE 0.992 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 7302358 7302359 EcSMS35_2143 EcSMS35_2144 hyaC hyaB TRUE 0.987 19.000 0.355 0.045 Y NA
 7302359 7302360 EcSMS35_2144 EcSMS35_2145 hyaB hyaA TRUE 0.992 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7302361 7302362 EcSMS35_2146 EcSMS35_2147     FALSE 0.501 13.000 0.000 NA   NA
 7302362 7302363 EcSMS35_2147 EcSMS35_2148     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 7302363 7302364 EcSMS35_2148 EcSMS35_2150   tusE FALSE 0.374 92.000 0.140 NA   NA
 7302366 7302367 EcSMS35_2151 EcSMS35_2152     FALSE 0.364 58.000 0.094 NA   NA
 7302369 7302370 EcSMS35_2154 EcSMS35_2155     FALSE 0.252 40.000 0.000 NA   NA
 7302370 7302371 EcSMS35_2155 EcSMS35_2156   mgsA FALSE 0.197 97.000 0.055 NA   NA
 7302373 7302374 EcSMS35_2158 EcSMS35_2160     TRUE 0.797 10.000 0.090 NA   NA
 7302380 7302381 EcSMS35_2165 EcSMS35_2166   fabA TRUE 0.662 69.000 0.290 1.000 N NA
 7302382 7302383 EcSMS35_2167 EcSMS35_2168   pqiB TRUE 0.986 -3.000 0.531 NA   NA
 7302383 7302384 EcSMS35_2168 EcSMS35_2169 pqiB pqiA TRUE 0.985 5.000 0.819 NA   NA
 7302384 7302385 EcSMS35_2169 EcSMS35_2170 pqiA uup FALSE 0.142 130.000 0.054 NA   NA
 7302385 7302386 EcSMS35_2170 EcSMS35_2171 uup rlmL TRUE 0.746 12.000 0.061 1.000   NA
 7302388 7302389 EcSMS35_2172 EcSMS35_2174   pyrD FALSE 0.090 174.000 0.081 NA   NA
 7302389 7302390 EcSMS35_2174 EcSMS35_2175 pyrD   FALSE 0.187 111.000 0.000 1.000 N NA
 7302390 7302391 EcSMS35_2175 EcSMS35_2176     TRUE 0.988 14.000 0.500 1.000 Y NA
 7302391 7302392 EcSMS35_2176 EcSMS35_2177     TRUE 0.996 11.000 0.667 0.008 Y NA
 7302392 7302393 EcSMS35_2177 EcSMS35_2178     TRUE 0.800 102.000 0.000 0.008 Y NA
 7302393 7302394 EcSMS35_2178 EcSMS35_2179     TRUE 0.973 -9.000 0.000 1.000 Y NA
 7302394 7302395 EcSMS35_2179 EcSMS35_2180     TRUE 0.987 25.000 0.667 1.000 Y NA
 7302395 7302396 EcSMS35_2180 EcSMS35_2181     TRUE 0.919 108.000 0.500 1.000 Y NA
 7302397 7302398 EcSMS35_2182 EcSMS35_2183     TRUE 0.938 -7.000 0.169 1.000   NA
 7302398 7302399 EcSMS35_2183 EcSMS35_2184   ssuD TRUE 0.981 -3.000 0.341 1.000 N NA
 7302399 7302400 EcSMS35_2184 EcSMS35_2185 ssuD ssuC TRUE 0.932 9.000 0.226 1.000 N NA
 7302400 7302401 EcSMS35_2185 EcSMS35_2186 ssuC ssuB TRUE 0.997 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 7302402 7302403 EcSMS35_2187 EcSMS35_2188 pepN   FALSE 0.216 36.000 0.006 NA   NA
 7302404 7302405 EcSMS35_2189 EcSMS35_2190 pncB asnC FALSE 0.086 168.000 0.034 1.000 N NA
 7302405 7302406 EcSMS35_2190 EcSMS35_2191 asnC ompF FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000 N NA
 7302406 7302407 EcSMS35_2191 EcSMS35_2192 ompF aspC FALSE 0.064 185.000 0.036 1.000 N NA
 7302408 7302409 EcSMS35_2193 EcSMS35_2194     TRUE 0.591 27.000 0.089 NA   NA
 7302409 7302410 EcSMS35_2194 EcSMS35_2195     FALSE 0.305 181.000 0.372 NA   NA
 7302410 7302411 EcSMS35_2195 EcSMS35_2196   mukB FALSE 0.013 261.000 0.000 1.000   NA
 7302411