MicrobesOnline Operon Predictions for Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7295079 7295080 SeD_A0002 SeD_A0003 thrA thrB TRUE 0.989 2.000 0.133 1.000 Y NA
 7295080 7295081 SeD_A0003 SeD_A0004 thrB thrC TRUE 0.992 4.000 0.233 1.000 Y NA
 7295082 7295083 SeD_A0005 SeD_A0006     FALSE 0.158 79.000 0.028 NA   NA
 7295084 7295085 SeD_A0007 SeD_A0008 tal2 mogA FALSE 0.235 111.000 0.042 1.000 N NA
 7295086 7295087 SeD_A0009 SeD_A0010     FALSE 0.095 150.000 0.000 NA   NA
 7295087 7295088 SeD_A0010 SeD_A0011     FALSE 0.362 36.000 0.000 NA   NA
 7295089 7295090 SeD_A0012 SeD_A0013 dnaK dnaJ TRUE 0.901 86.000 0.236 0.004 Y NA
 7295090 7295091 SeD_A0013 SeD_A0014 dnaJ   FALSE 0.156 112.000 0.000 NA   NA
 7295091 7295092 SeD_A0014 SeD_A0015     FALSE 0.226 56.000 0.000 NA   NA
 7295092 7295093 SeD_A0015 SeD_A0016     TRUE 0.565 169.000 0.600 NA   NA
 7295094 7295095 SeD_A0017 SeD_A0018     TRUE 0.966 17.000 0.600 NA   NA
 7295096 7295097 SeD_A0019 SeD_A0020     FALSE 0.166 92.000 0.000 NA   NA
 7295097 7295098 SeD_A0020 SeD_A0021     FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 7295098 7295099 SeD_A0021 SeD_A0022     FALSE 0.003 430.000 0.000 NA N NA
 7295099 7295100 SeD_A0022 SeD_A0023     TRUE 0.986 -40.000 0.500 1.000 Y NA
 7295100 7295101 SeD_A0023 SeD_A0024     TRUE 0.997 5.000 0.667 1.000 Y NA
 7295101 7295102 SeD_A0024 SeD_A0025     TRUE 0.997 1.000 0.500 1.000 Y NA
 7295102 7295103 SeD_A0025 SeD_A0026     TRUE 0.978 40.000 0.500 0.012 Y NA
 7295103 7295104 SeD_A0026 SeD_A0027     TRUE 0.995 16.000 0.667 0.012 Y NA
 7295104 7295105 SeD_A0027 SeD_A0028     TRUE 0.943 62.000 0.500 1.000 Y NA
 7295105 7295106 SeD_A0028 SeD_A0029     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7295106 7295107 SeD_A0029 SeD_A0030     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7295111 7295112 SeD_A0034 SeD_A0035     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 7295113 7295114 SeD_A0036 SeD_A0037     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7295115 7295116 SeD_A0038 SeD_A0039     TRUE 0.638 99.000 0.286 1.000   NA
 7295116 7295117 SeD_A0039 SeD_A0040     TRUE 0.569 25.000 0.000 1.000   NA
 7295117 7295118 SeD_A0040 SeD_A0041     FALSE 0.144 127.000 0.000 NA   NA
 7295118 7295119 SeD_A0041 SeD_A0042   nhaA FALSE 0.070 163.000 0.000 NA   NA
 7295119 7295120 SeD_A0042 SeD_A0043 nhaA nhaR TRUE 0.703 62.000 0.292 1.000 N NA
 7295121 7295122 SeD_A0044 SeD_A0045     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 7295122 7295123 SeD_A0045 SeD_A0046     FALSE 0.285 46.000 0.000 NA   NA
 7295123 7295124 SeD_A0046 SeD_A0047   rpsT FALSE 0.002 456.000 0.000 NA   NA
 7295125 7295126 SeD_A0048 SeD_A0049   ribF TRUE 0.711 8.000 0.019 NA   NA
 7295126 7295127 SeD_A0049 SeD_A0050 ribF ileS TRUE 0.963 9.000 0.254 1.000 N NA
 7295127 7295128 SeD_A0050 SeD_A0051 ileS lspA TRUE 0.892 0.000 0.045 1.000 N NA
 7295128 7295129 SeD_A0051 SeD_A0052 lspA fkpB FALSE 0.301 155.000 0.154 1.000 N NA
 7295129 7295130 SeD_A0052 SeD_A0053 fkpB ispH TRUE 0.990 3.000 0.626 1.000 N NA
 7295132 7295133 SeD_A0055 SeD_A0056     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7295134 7295135 SeD_A0057 SeD_A0058     TRUE 0.998 2.000 1.000 1.000 Y NA
 7295135 7295136 SeD_A0058 SeD_A0059     FALSE 0.326 96.000 0.068 1.000 N NA
 7295136 7295137 SeD_A0059 SeD_A0060   oadA TRUE 0.997 13.000 0.886 0.003 Y NA
 7295137 7295138 SeD_A0060 SeD_A0061 oadA   TRUE 0.996 16.000 0.720 0.003 Y NA
 7295138 7295139 SeD_A0061 SeD_A0062     FALSE 0.527 159.000 0.060 1.000 Y NA
 7295140 7295141 SeD_A0063 SeD_A0064 citC citD TRUE 0.976 30.000 0.426 1.000 Y NA
 7295141 7295142 SeD_A0064 SeD_A0065 citD citE TRUE 0.992 -3.000 0.537 0.002 N NA
 7295142 7295143 SeD_A0065 SeD_A0066 citE citF TRUE 0.981 11.000 0.373 0.002 N NA
 7295143 7295144 SeD_A0066 SeD_A0067 citF citX TRUE 0.909 18.000 0.231 1.000 N NA
 7295144 7295145 SeD_A0067 SeD_A0068 citX citG TRUE 0.986 -22.000 0.400 1.000 Y NA
 7295145 7295146 SeD_A0068 SeD_A0069 citG dapB FALSE 0.048 180.000 0.002 1.000 N NA
 7295147 7295148 SeD_A0070 SeD_A0071     FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
 7295149 7295150 SeD_A0072 SeD_A0073 carA carB TRUE 0.989 19.000 0.345 0.001 Y NA
 7295150 7295151 SeD_A0073 SeD_A0074 carB   FALSE 0.011 274.000 0.000 NA   NA
 7295152 7295153 SeD_A0075 SeD_A0076     FALSE 0.300 110.000 0.069 1.000   NA
 7295153 7295154 SeD_A0076 SeD_A0077   caiC TRUE 0.827 54.000 0.000 0.026 Y NA
 7295154 7295155 SeD_A0077 SeD_A0078 caiC   TRUE 0.636 63.000 0.154 0.026 N NA
 7295155 7295156 SeD_A0078 SeD_A0079   caiA TRUE 0.838 58.000 0.529 1.000 N NA
 7295156 7295157 SeD_A0079 SeD_A0080 caiA caiT FALSE 0.457 35.000 0.000 1.000 N NA
 7295158 7295159 SeD_A0081 SeD_A0082   fixA FALSE 0.476 68.000 0.154 NA   NA
 7295159 7295160 SeD_A0082 SeD_A0083 fixA fixB TRUE 0.961 16.000 0.000 0.016 Y NA
 7295160 7295161 SeD_A0083 SeD_A0084 fixB fixC TRUE 0.839 50.000 0.000 0.057 Y NA
 7295161 7295162 SeD_A0084 SeD_A0085 fixC   TRUE 0.992 -3.000 0.167 0.057 Y NA
 7295162 7295163 SeD_A0085 SeD_A0086     FALSE 0.221 81.000 0.000 1.000 N NA
 7295163 7295164 SeD_A0086 SeD_A0087     FALSE 0.165 89.000 0.000 NA   NA
 7295164 7295165 SeD_A0087 SeD_A0088   kefF FALSE 0.449 100.000 0.160 NA   NA
 7295165 7295166 SeD_A0088 SeD_A0089 kefF   TRUE 0.981 -7.000 0.560 1.000   NA
 7295169 7295170 SeD_A0092 SeD_A0093 apaH apaG TRUE 0.952 11.000 0.267 NA N NA
 7295170 7295171 SeD_A0093 SeD_A0094 apaG ksgA TRUE 0.904 3.000 0.078 NA N NA
 7295171 7295172 SeD_A0094 SeD_A0095 ksgA pdxA TRUE 0.963 -3.000 0.197 1.000 N NA
 7295172 7295173 SeD_A0095 SeD_A0096 pdxA surA TRUE 0.990 0.000 0.561 1.000 N NA
 7295173 7295174 SeD_A0096 SeD_A0097 surA imp TRUE 0.635 54.000 0.182 1.000 N NA
 7295174 7295175 SeD_A0097 SeD_A0098 imp   TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7295177 7295178 SeD_A0100 SeD_A0101   rapA TRUE 0.956 12.000 0.294 1.000 N NA
 7295178 7295179 SeD_A0101 SeD_A0102 rapA   TRUE 0.583 174.000 0.098 0.059 Y NA
 7295179 7295180 SeD_A0102 SeD_A0103     FALSE 0.302 44.000 0.000 NA   NA
 7295182 7295183 SeD_A0105 SeD_A0106 araD araA TRUE 0.571 141.000 0.017 1.000 Y NA
 7295183 7295184 SeD_A0106 SeD_A0107 araA araB TRUE 0.918 11.000 0.138 1.000 N NA
 7295185 7295186 SeD_A0108 SeD_A0109     FALSE 0.435 119.000 0.167 NA   NA
 7295187 7295188 SeD_A0110 SeD_A0111 thiQ thiP TRUE 0.977 -16.000 0.522 0.017 N NA
 7295188 7295189 SeD_A0111 SeD_A0112 thiP tbpA TRUE 0.979 -24.000 0.697 0.070 N NA
 7295189 7295190 SeD_A0112 SeD_A0114 tbpA   FALSE 0.206 45.000 0.010 NA   NA
 7295190 7295191 SeD_A0114 SeD_A0115   sgrR TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7295192 7295193 SeD_A0116 SeD_A0118     FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 7295194 7295195 SeD_A0119 SeD_A0120 leuD leuC TRUE 0.994 11.000 0.309 0.001 Y NA
 7295195 7295196 SeD_A0120 SeD_A0121 leuC leuB TRUE 0.996 3.000 0.275 0.002 Y NA
 7295196 7295197 SeD_A0121 SeD_A0122 leuB leuA TRUE 0.993 0.000 0.126 0.002 Y NA
 7295198 7295199 SeD_A0124 SeD_A0125 leuO ilvB FALSE 0.012 292.000 0.000 1.000 N NA
 7295199 7295200 SeD_A0125 SeD_A0126 ilvB ilvH TRUE 0.997 0.000 0.371 0.002 Y NA
 7295200 7295201 SeD_A0126 SeD_A0127 ilvH fruR FALSE 0.020 284.000 0.063 1.000 N NA
 7295201 7295202 SeD_A0127 SeD_A0128 fruR mraZ FALSE 0.002 606.000 0.000 NA   NA
 7295202 7295203 SeD_A0128 SeD_A0129 mraZ mraW TRUE 0.990 2.000 0.635 NA   NA
 7295203 7295204 SeD_A0129 SeD_A0130 mraW ftsL TRUE 0.968 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7295204 7295205 SeD_A0130 SeD_A0131 ftsL ftsI TRUE 0.861 16.000 0.124 1.000 N NA
 7295205 7295206 SeD_A0131 SeD_A0132 ftsI murE TRUE 0.962 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 7295206 7295207 SeD_A0132 SeD_A0133 murE murF TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 7295207 7295208 SeD_A0133 SeD_A0134 murF mraY TRUE 0.994 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 7295208 7295209 SeD_A0134 SeD_A0135 mraY murD TRUE 0.998 3.000 0.647 0.005 Y NA
 7295209 7295210 SeD_A0135 SeD_A0136 murD ftsW TRUE 0.986 0.000 0.297 0.003 N NA
 7295210 7295211 SeD_A0136 SeD_A0137 ftsW murG TRUE 0.990 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7295211 7295212 SeD_A0137 SeD_A0138 murG murC TRUE 0.869 119.000 0.283 1.000 Y NA
 7295212 7295213 SeD_A0138 SeD_A0139 murC ddl TRUE 0.988 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 7295213 7295214 SeD_A0139 SeD_A0140 ddl ftsQ TRUE 0.995 2.000 0.372 NA Y NA
 7295214 7295215 SeD_A0140 SeD_A0141 ftsQ ftsA TRUE 0.980 -3.000 0.389 NA N NA
 7295215 7295216 SeD_A0141 SeD_A0142 ftsA ftsZ TRUE 0.939 61.000 0.460 1.000 Y NA
 7295216 7295217 SeD_A0142 SeD_A0143 ftsZ lpxC FALSE 0.453 101.000 0.134 1.000 N NA
 7295217 7295218 SeD_A0143 SeD_A0144 lpxC secM FALSE 0.010 279.000 0.000 NA   NA
 7295218 7295219 SeD_A0144 SeD_A0145 secM secA FALSE 0.201 62.000 0.000 NA   NA
 7295219 7295220 SeD_A0145 SeD_A0146 secA   FALSE 0.340 152.000 0.168 1.000 N NA
 7295223 7295224 SeD_A0149 SeD_A0150     TRUE 0.969 10.000 0.356 NA   NA
 7295224 7295225 SeD_A0150 SeD_A0152   coaE TRUE 0.931 0.000 0.110 NA   NA
 7295227 7295228 SeD_A0154 SeD_A0155     TRUE 0.994 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 7295228 7295229 SeD_A0155 SeD_A0156     TRUE 0.995 10.000 0.556 NA Y NA
 7295229 7295230 SeD_A0156 SeD_A0157   nadC FALSE 0.017 222.000 0.015 NA N NA
 7295231 7295232 SeD_A0158 SeD_A0159     TRUE 0.993 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 7295233 7295234 SeD_A0160 SeD_A0162     TRUE 0.980 0.000 0.333 1.000   NA
 7295237 7295238 SeD_A0164 SeD_A0165 pdhR aceE FALSE 0.409 160.000 0.276 1.000 N NA
 7295238 7295239 SeD_A0165 SeD_A0166 aceE aceF TRUE 0.981 15.000 0.220 1.000 Y NA
 7295239 7295240 SeD_A0166 SeD_A0167 aceF lpdA TRUE 0.685 201.000 0.463 1.000 Y NA
 7295240 7295241 SeD_A0167 SeD_A0168 lpdA   FALSE 0.164 87.000 0.000 NA   NA
 7295241 7295242 SeD_A0168 SeD_A0169     FALSE 0.164 83.000 0.000 NA   NA
 7295243 7295244 SeD_A0170 SeD_A0171     TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7295246 7295247 SeD_A0173 SeD_A0174     FALSE 0.003 418.000 0.000 NA   NA
 7295248 7295249 SeD_A0175 SeD_A0176     FALSE 0.057 175.000 0.000 NA   NA
 7295249 7295250 SeD_A0176 SeD_A0177     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295250 7295251 SeD_A0177 SeD_A0178   pdxA TRUE 0.957 -10.000 0.361 NA   NA
 7295251 7295252 SeD_A0178 SeD_A0179 pdxA   TRUE 0.983 10.000 0.533 1.000 N NA
 7295253 7295254 SeD_A0180 SeD_A0181   speE TRUE 0.965 21.000 0.162 1.000 Y NA
 7295254 7295255 SeD_A0181 SeD_A0182 speE   TRUE 0.660 107.000 0.354 NA   NA
 7295260 7295261 SeD_A0187 SeD_A0188     TRUE 0.998 -3.000 0.688 0.099 Y NA
 7295262 7295263 SeD_A0189 SeD_A0190     TRUE 0.973 9.000 0.000 1.000 Y NA
 7295263 7295264 SeD_A0190 SeD_A0191     TRUE 0.908 27.000 0.000 1.000 Y NA
 7295264 7295265 SeD_A0191 SeD_A0192     TRUE 0.806 48.000 0.000 1.000 Y NA
 7295265 7295266 SeD_A0192 SeD_A0193     FALSE 0.026 215.000 0.000 NA   NA
 7295267 7295268 SeD_A0194 SeD_A0195     TRUE 0.875 68.000 0.222 1.000 Y NA
 7295269 7295270 SeD_A0196 SeD_A0197 panD panC TRUE 0.900 95.000 0.342 1.000 Y NA
 7295270 7295271 SeD_A0197 SeD_A0198 panC panB TRUE 0.931 126.000 0.395 0.001 Y NA
 7295271 7295272 SeD_A0198 SeD_A0199 panB folK TRUE 0.772 121.000 0.117 1.000 Y NA
 7295272 7295273 SeD_A0199 SeD_A0200 folK pcnB TRUE 0.969 -3.000 0.234 1.000 N NA
 7295273 7295274 SeD_A0200 SeD_A0201 pcnB   FALSE 0.244 246.000 0.131 1.000 Y NA
 7295274 7295275 SeD_A0201 SeD_A0202   dksA TRUE 0.886 24.000 0.231 1.000 N NA
 7295275 7295276 SeD_A0202 SeD_A0203 dksA sfsA FALSE 0.185 177.000 0.151 NA   NA
 7295276 7295277 SeD_A0203 SeD_A0204 sfsA   TRUE 0.646 17.000 0.045 NA   NA
 7295278 7295279 SeD_A0205 SeD_A0206 hrpB mrcB FALSE 0.388 141.000 0.158 1.000 N NA
 7295281 7295282 SeD_A0208 SeD_A0209 fhuA fhuC TRUE 0.890 49.000 0.156 1.000 Y NA
 7295282 7295283 SeD_A0209 SeD_A0210 fhuC   TRUE 0.983 0.000 0.047 1.000 Y NA
 7295283 7295284 SeD_A0210 SeD_A0211     TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7295285 7295286 SeD_A0212 SeD_A0213     FALSE 0.162 103.000 0.000 NA   NA
 7295287 7295288 SeD_A0214 SeD_A0215     TRUE 0.966 86.000 1.000 1.000 Y NA
 7295288 7295289 SeD_A0215 SeD_A0216     TRUE 0.995 18.000 1.000 1.000 Y NA
 7295289 7295290 SeD_A0216 SeD_A0217     TRUE 0.982 19.000 0.333 1.000 Y NA
 7295290 7295291 SeD_A0217 SeD_A0218     TRUE 0.998 -3.000 0.571 0.012 Y NA
 7295291 7295292 SeD_A0218 SeD_A0219     TRUE 0.987 0.000 0.000 0.012 Y NA
 7295292 7295293 SeD_A0219 SeD_A0220     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295295 7295296 SeD_A0222 SeD_A0223     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7295296 7295297 SeD_A0223 SeD_A0224   yadR FALSE 0.161 82.000 0.031 NA   NA
 7295298 7295299 SeD_A0225 SeD_A0226     TRUE 0.757 37.000 0.213 NA   NA
 7295299 7295300 SeD_A0226 SeD_A0227   mtnN TRUE 0.902 5.000 0.073 1.000 N NA
 7295301 7295302 SeD_A0228 SeD_A0229 dgt degP FALSE 0.349 130.000 0.101 1.000 N NA
 7295302 7295303 SeD_A0229 SeD_A0230 degP   FALSE 0.181 153.000 0.080 NA N NA
 7295304 7295305 SeD_A0231 SeD_A0232     FALSE 0.047 186.000 0.000 NA   NA
 7295307 7295308 SeD_A0234 SeD_A0235 dapD glnD TRUE 0.704 30.000 0.097 1.000 N NA
 7295308 7295309 SeD_A0235 SeD_A0236 glnD map FALSE 0.118 238.000 0.243 1.000 N NA
 7295310 7295311 SeD_A0237 SeD_A0238   rpsB FALSE 0.435 29.000 0.000 NA   NA
 7295311 7295312 SeD_A0238 SeD_A0239 rpsB tsf TRUE 0.590 258.000 0.748 1.000 Y NA
 7295312 7295313 SeD_A0239 SeD_A0240 tsf pyrH TRUE 0.623 145.000 0.416 1.000 N NA
 7295313 7295314 SeD_A0240 SeD_A0241 pyrH frr TRUE 0.726 147.000 0.626 1.000 N NA
 7295314 7295315 SeD_A0241 SeD_A0242 frr dxr FALSE 0.303 54.000 0.032 1.000 N NA
 7295315 7295316 SeD_A0242 SeD_A0243 dxr uppS FALSE 0.067 313.000 0.025 1.000 Y NA
 7295316 7295317 SeD_A0243 SeD_A0244 uppS cdsA TRUE 0.991 13.000 0.400 1.000 Y NA
 7295317 7295318 SeD_A0244 SeD_A0245 cdsA rseP TRUE 0.862 12.000 0.080 1.000 N NA
 7295318 7295319 SeD_A0245 SeD_A0246 rseP yaeT TRUE 0.949 32.000 0.204 1.000 Y NA
 7295319 7295320 SeD_A0246 SeD_A0247 yaeT skp TRUE 0.891 123.000 0.354 1.000 Y NA
 7295320 7295321 SeD_A0247 SeD_A0248 skp lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 7295321 7295322 SeD_A0248 SeD_A0249 lpxD fabZ TRUE 0.859 106.000 0.796 1.000 N NA
 7295322 7295323 SeD_A0249 SeD_A0250 fabZ lpxA TRUE 0.993 4.000 0.850 1.000 N NA
 7295323 7295324 SeD_A0250 SeD_A0251 lpxA lpxB TRUE 0.994 0.000 0.289 1.000 Y NA
 7295324 7295325 SeD_A0251 SeD_A0252 lpxB rnhB TRUE 0.961 -3.000 0.186 1.000 N NA
 7295325 7295326 SeD_A0252 SeD_A0253 rnhB dnaE TRUE 0.949 24.000 0.104 1.000 Y NA
 7295326 7295327 SeD_A0253 SeD_A0254 dnaE accA TRUE 0.889 13.000 0.122 1.000 N NA
 7295327 7295328 SeD_A0254 SeD_A0255 accA   FALSE 0.044 180.000 0.003 1.000   NA
 7295328 7295329 SeD_A0255 SeD_A0256   ldcC FALSE 0.430 76.000 0.118 1.000   NA
 7295329 7295330 SeD_A0256 SeD_A0257 ldcC   TRUE 0.754 56.000 0.039 NA Y NA
 7295330 7295331 SeD_A0257 SeD_A0258   tilS FALSE 0.162 63.000 0.015 NA N NA
 7295332 7295333 SeD_A0259 SeD_A0260 rof   TRUE 0.597 53.000 0.179 NA   NA
 7295334 7295335 SeD_A0261 SeD_A0262     TRUE 0.851 -3.000 0.034 1.000   NA
 7295335 7295336 SeD_A0262 SeD_A0263     FALSE 0.376 32.000 0.027 NA   NA
 7295337 7295338 SeD_A0264 SeD_A0265 proS   FALSE 0.201 111.000 0.048 NA   NA
 7295338 7295339 SeD_A0265 SeD_A0266   rcsF TRUE 0.883 -36.000 0.247 NA   NA
 7295339 7295340 SeD_A0266 SeD_A0267 rcsF metQ TRUE 0.733 119.000 0.500 NA   NA
 7295340 7295341 SeD_A0267 SeD_A0268 metQ metI TRUE 0.963 39.000 0.411 NA Y NA
 7295341 7295342 SeD_A0268 SeD_A0269 metI metN TRUE 0.995 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 7295345 7295346 SeD_A0272 SeD_A0273 rrs   FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 7295346 7295347 SeD_A0273 SeD_A0274     FALSE 0.157 111.000 0.000 NA   NA
 7295347 7295348 SeD_A0274 SeD_A0275     TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7295348 7295349 SeD_A0275 SeD_A0276   rrf FALSE 0.001 3343.000 0.000 NA   NA
 7295349 7295350 SeD_A0276 SeD_A0277 rrf   FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 7295350 7295351 SeD_A0277 SeD_A0278   dkgB FALSE 0.068 164.000 0.000 NA   NA
 7295353 7295354 SeD_A0280 SeD_A0281     FALSE 0.129 132.000 0.029 NA   NA
 7295354 7295355 SeD_A0281 SeD_A0282     FALSE 0.269 78.000 0.066 NA   NA
 7295356 7295357 SeD_A0283 SeD_A0284 mltD gloB FALSE 0.149 219.000 0.233 1.000   NA
 7295360 7295361 SeD_A0287 SeD_A0288 dnaQ   FALSE 0.133 133.000 0.000 NA   NA
 7295362 7295363 SeD_A0289 SeD_A0290     TRUE 0.990 11.000 1.000 NA   NA
 7295363 7295364 SeD_A0290 SeD_A0291   vasA FALSE 0.550 -28.000 0.000 NA   NA
 7295364 7295365 SeD_A0291 SeD_A0292 vasA   TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7295365 7295366 SeD_A0292 SeD_A0293     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295366 7295367 SeD_A0293 SeD_A0294     TRUE 0.650 -13.000 0.000 NA   NA
 7295368 7295369 SeD_A0295 SeD_A0296     FALSE 0.166 100.000 0.000 NA   NA
 7295369 7295370 SeD_A0296 SeD_A0297     FALSE 0.512 24.000 0.000 NA   NA
 7295370 7295371 SeD_A0297 SeD_A0298     FALSE 0.011 274.000 0.000 NA   NA
 7295371 7295372 SeD_A0298 SeD_A0299     TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7295372 7295373 SeD_A0299 SeD_A0300     FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 7295373 7295374 SeD_A0300 SeD_A0301     TRUE 0.776 112.000 0.583 NA   NA
 7295374 7295375 SeD_A0301 SeD_A0302     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7295375 7295376 SeD_A0302 SeD_A0303     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295376 7295377 SeD_A0303 SeD_A0304     TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7295377 7295378 SeD_A0304 SeD_A0305     FALSE 0.010 278.000 0.000 NA   NA
 7295378 7295379 SeD_A0305 SeD_A0306     FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7295379 7295380 SeD_A0306 SeD_A0307     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7295380 7295381 SeD_A0307 SeD_A0308     FALSE 0.468 27.000 0.000 NA   NA
 7295381 7295382 SeD_A0308 SeD_A0309     TRUE 0.931 27.000 0.500 NA   NA
 7295382 7295383 SeD_A0309 SeD_A0310     FALSE 0.003 397.000 0.000 NA   NA
 7295383 7295384 SeD_A0310 SeD_A0311     FALSE 0.512 24.000 0.000 NA   NA
 7295384 7295385 SeD_A0311 SeD_A0312     TRUE 0.562 19.000 0.000 NA   NA
 7295385 7295386 SeD_A0312 SeD_A0313     FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 7295386 7295387 SeD_A0313 SeD_A0314     FALSE 0.105 145.000 0.000 NA   NA
 7295388 7295389 SeD_A0315 SeD_A0316     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 7295390 7295391 SeD_A0317 SeD_A0318     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295393 7295394 SeD_A0320 SeD_A0321     FALSE 0.002 448.000 0.000 NA   NA
 7295394 7295395 SeD_A0321 SeD_A0322     FALSE 0.001 671.000 0.000 NA   NA
 7295395 7295396 SeD_A0322 SeD_A0323     FALSE 0.004 373.000 0.000 NA   NA
 7295397 7295398 SeD_A0324 SeD_A0325     FALSE 0.039 195.000 0.000 NA   NA
 7295399 7295400 SeD_A0326 SeD_A0327     FALSE 0.001 694.000 0.000 NA   NA
 7295402 7295403 SeD_A0329 SeD_A0330     FALSE 0.155 116.000 0.000 NA   NA
 7295403 7295404 SeD_A0330 SeD_A0331     TRUE 0.978 22.000 1.000 1.000   NA
 7295404 7295405 SeD_A0331 SeD_A0332     FALSE 0.004 408.000 0.000 1.000   NA
 7295405 7295406 SeD_A0332 SeD_A0333     FALSE 0.002 481.000 0.000 NA   NA
 7295406 7295407 SeD_A0333 SeD_A0334     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7295408 7295409 SeD_A0335 SeD_A0336     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7295409 7295410 SeD_A0336 SeD_A0337     FALSE 0.186 69.000 0.000 NA   NA
 7295410 7295411 SeD_A0337 SeD_A0338     FALSE 0.007 310.000 0.000 NA   NA
 7295411 7295412 SeD_A0338 SeD_A0339   fadE FALSE 0.158 109.000 0.000 NA   NA
 7295413 7295414 SeD_A0340 SeD_A0341 gmhA   FALSE 0.162 213.000 0.229 1.000   NA
 7295416 7295417 SeD_A0343 SeD_A0344     FALSE 0.024 219.000 0.000 NA   NA
 7295417 7295418 SeD_A0344 SeD_A0345   prfH TRUE 0.973 -3.000 0.303 NA   NA
 7295420 7295421 SeD_A0347 SeD_A0348 gpt frsA FALSE 0.178 89.000 0.000 NA N NA
 7295421 7295422 SeD_A0348 SeD_A0349 frsA   FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7295426 7295427 SeD_A0353 SeD_A0354 proB proA TRUE 0.976 12.000 0.026 0.001 Y NA
 7295427 7295428 SeD_A0354 SeD_A0355 proA   FALSE 0.155 116.000 0.000 NA   NA
 7295429 7295430 SeD_A0356 SeD_A0357     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295431 7295432 SeD_A0358 SeD_A0359     FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 7295432 7295433 SeD_A0359 SeD_A0360     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7295433 7295434 SeD_A0360 SeD_A0361   leuC FALSE 0.184 132.000 0.000 1.000 N NA
 7295434 7295435 SeD_A0361 SeD_A0362 leuC leuD TRUE 0.993 2.000 0.116 0.001 Y NA
 7295435 7295436 SeD_A0362 SeD_A0363 leuD   TRUE 0.714 15.000 0.000 1.000 N NA
 7295436 7295437 SeD_A0363 SeD_A0364     TRUE 0.863 0.000 0.000 1.000   NA
 7295437 7295438 SeD_A0364 SeD_A0365     FALSE 0.445 34.000 0.000 1.000   NA
 7295438 7295439 SeD_A0365 SeD_A0366     FALSE 0.001 1151.000 0.000 NA   NA
 7295440 7295441 SeD_A0367 SeD_A0368     TRUE 0.605 -34.000 0.000 1.000   NA
 7295441 7295442 SeD_A0368 SeD_A0369     TRUE 0.828 5.000 0.000 1.000   NA
 7295442 7295443 SeD_A0369 SeD_A0370     TRUE 0.996 -16.000 1.000 1.000 Y NA
 7295443 7295444 SeD_A0370 SeD_A0371     TRUE 0.927 62.000 0.385 1.000 Y NA
 7295445 7295446 SeD_A0372 SeD_A0373     FALSE 0.081 156.000 0.000 NA   NA
 7295446 7295447 SeD_A0373 SeD_A0374     FALSE 0.006 326.000 0.000 NA   NA
 7295447 7295448 SeD_A0374 SeD_A0375     FALSE 0.499 100.000 0.182 NA N NA
 7295448 7295449 SeD_A0375 SeD_A0376     TRUE 0.978 -27.000 1.000 NA   NA
 7295449 7295450 SeD_A0376 SeD_A0377     FALSE 0.003 400.000 0.000 NA   NA
 7295450 7295451 SeD_A0377 SeD_A0378     FALSE 0.148 144.000 0.000 1.000 N NA
 7295451 7295452 SeD_A0378 SeD_A0379     TRUE 0.724 11.000 0.000 NA   NA
 7295452 7295453 SeD_A0379 SeD_A0380     FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7295454 7295455 SeD_A0381 SeD_A0382     TRUE 0.971 17.000 0.500 0.054 N NA
 7295455 7295456 SeD_A0382 SeD_A0383     TRUE 0.959 -3.000 0.179 1.000 N NA
 7295457 7295458 SeD_A0384 SeD_A0385   cueR TRUE 0.976 -3.000 0.304 1.000 N NA
 7295458 7295459 SeD_A0385 SeD_A0386 cueR   TRUE 0.590 78.000 0.222 1.000 N NA
 7295461 7295462 SeD_A0388 SeD_A0389     FALSE 0.062 189.000 0.000 1.000 N NA
 7295462 7295463 SeD_A0389 SeD_A0390     TRUE 0.893 13.000 0.076 0.057 N NA
 7295463 7295464 SeD_A0390 SeD_A0391     FALSE 0.003 495.000 0.000 1.000 N NA
 7295464 7295465 SeD_A0391 SeD_A0392   cydB TRUE 0.996 -3.000 0.333 0.055 Y NA
 7295465 7295466 SeD_A0392 SeD_A0393 cydB   TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7295466 7295467 SeD_A0393 SeD_A0394     FALSE 0.031 206.000 0.000 NA   NA
 7295467 7295468 SeD_A0394 SeD_A0395     FALSE 0.391 164.000 0.280 1.000 N NA
 7295471 7295472 SeD_A0398 SeD_A0399 prpR prpR FALSE 0.522 -40.000 0.000 NA   NA
 7295473 7295474 SeD_A0400 SeD_A0401 prpB prpC TRUE 0.762 123.000 0.502 1.000 N NA
 7295474 7295475 SeD_A0401 SeD_A0402 prpC prpD TRUE 0.778 38.000 0.216 1.000   NA
 7295475 7295476 SeD_A0402 SeD_A0403 prpD prpE TRUE 0.635 41.000 0.038 0.001   NA
 7295480 7295481 SeD_A0407 SeD_A0408     FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7295482 7295483 SeD_A0409 SeD_A0410     FALSE 0.285 46.000 0.000 NA   NA
 7295484 7295485 SeD_A0411 SeD_A0412 smbA   TRUE 0.741 15.000 0.045 1.000   NA
 7295489 7295490 SeD_A0416 SeD_A0417     FALSE 0.063 169.000 0.000 NA   NA
 7295490 7295491 SeD_A0417 SeD_A0419     FALSE 0.008 297.000 0.000 NA   NA
 7295493 7295494 SeD_A0421 SeD_A0422   adrA TRUE 0.576 92.000 0.250 NA   NA
 7295496 7295497 SeD_A0424 SeD_A0425     FALSE 0.514 -43.000 0.000 NA   NA
 7295497 7295498 SeD_A0425 SeD_A0426   aroL FALSE 0.021 202.000 0.007 NA   NA
 7295498 7295499 SeD_A0426 SeD_A0427 aroL   FALSE 0.468 27.000 0.000 NA   NA
 7295499 7295500 SeD_A0427 SeD_A0428     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 7295500 7295501 SeD_A0428 SeD_A0429     FALSE 0.233 71.000 0.049 NA   NA
 7295504 7295505 SeD_A0432 SeD_A0433     FALSE 0.159 119.000 0.030 NA N NA
 7295505 7295506 SeD_A0433 SeD_A0434     TRUE 0.986 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 7295507 7295508 SeD_A0435 SeD_A0436 phoB phoR TRUE 0.947 70.000 0.453 0.016 Y NA
 7295510 7295511 SeD_A0438 SeD_A0439 brnQ proY TRUE 0.973 15.000 0.087 0.091 Y NA
 7295511 7295512 SeD_A0439 SeD_A0440 proY   FALSE 0.071 162.000 0.000 NA   NA
 7295513 7295514 SeD_A0442 SeD_A0443   acpH FALSE 0.028 210.000 0.014 1.000   NA
 7295515 7295516 SeD_A0444 SeD_A0445 queA tgt TRUE 0.739 197.000 0.360 0.001 Y NA
 7295516 7295517 SeD_A0445 SeD_A0446 tgt yajC TRUE 0.911 23.000 0.325 NA N NA
 7295517 7295518 SeD_A0446 SeD_A0447 yajC secD TRUE 0.900 28.000 0.045 NA Y NA
 7295518 7295519 SeD_A0447 SeD_A0448 secD secF TRUE 0.991 11.000 0.206 0.001 Y NA
 7295519 7295520 SeD_A0448 SeD_A0449 secF   FALSE 0.075 145.000 0.015 NA   NA
 7295520 7295521 SeD_A0449 SeD_A0450     TRUE 0.927 26.000 0.452 NA   NA
 7295521 7295522 SeD_A0450 SeD_A0451     FALSE 0.080 170.000 0.000 1.000   NA
 7295522 7295523 SeD_A0451 SeD_A0452     FALSE 0.003 393.000 0.000 NA   NA
 7295524 7295525 SeD_A0453 SeD_A0454     FALSE 0.007 300.000 0.000 NA   NA
 7295526 7295527 SeD_A0455 SeD_A0456   nrdR FALSE 0.557 -27.000 0.000 NA   NA
 7295527 7295528 SeD_A0456 SeD_A0457 nrdR ribD TRUE 0.968 4.000 0.277 NA N NA
 7295528 7295529 SeD_A0457 SeD_A0458 ribD ribH TRUE 0.779 89.000 0.034 0.002 Y NA
 7295529 7295530 SeD_A0458 SeD_A0459 ribH nusB TRUE 0.931 21.000 0.347 1.000 N NA
 7295530 7295531 SeD_A0459 SeD_A0460 nusB thiL TRUE 0.588 79.000 0.225 1.000 N NA
 7295531 7295532 SeD_A0460 SeD_A0461 thiL pgpA TRUE 0.923 -13.000 0.206 1.000 N NA
 7295533 7295534 SeD_A0462 SeD_A0463   dxs FALSE 0.223 57.000 0.009 1.000 N NA
 7295534 7295535 SeD_A0463 SeD_A0464 dxs ispA TRUE 0.935 24.000 0.060 1.000 Y NA
 7295535 7295536 SeD_A0464 SeD_A0465 ispA xseB TRUE 0.869 1.000 0.035 1.000 N NA
 7295538 7295539 SeD_A0467 SeD_A0468 phnV phnU TRUE 0.980 -6.000 0.375 0.054 N NA
 7295539 7295540 SeD_A0468 SeD_A0469 phnU phnT TRUE 0.990 3.000 0.500 0.054 N NA
 7295540 7295541 SeD_A0469 SeD_A0470 phnT phnS TRUE 0.990 6.000 0.576 0.054 N NA
 7295541 7295542 SeD_A0470 SeD_A0471 phnS   FALSE 0.148 198.000 0.152 1.000 N NA
 7295543 7295544 SeD_A0472 SeD_A0473 phnW   TRUE 0.975 10.000 0.315 0.063   NA
 7295545 7295546 SeD_A0474 SeD_A0475   panE TRUE 0.817 -37.000 0.155 NA   NA
 7295549 7295550 SeD_A0478 SeD_A0479     TRUE 0.863 12.000 0.000 0.011   NA
 7295551 7295552 SeD_A0480 SeD_A0481 cyoE cyoD TRUE 0.902 15.000 0.118 0.091 N NA
 7295552 7295553 SeD_A0481 SeD_A0482 cyoD cyoC TRUE 0.997 0.000 0.485 0.055 Y NA
 7295553 7295554 SeD_A0482 SeD_A0483 cyoC cyoB TRUE 0.996 -10.000 0.697 0.055 Y NA
 7295554 7295555 SeD_A0483 SeD_A0484 cyoB cyoA TRUE 0.979 11.000 0.041 0.005 Y NA
 7295555 7295556 SeD_A0484 SeD_A0485 cyoA   FALSE 0.015 247.000 0.000 NA   NA
 7295556 7295557 SeD_A0485 SeD_A0486   ampG FALSE 0.164 84.000 0.000 NA   NA
 7295557 7295558 SeD_A0486 SeD_A0487 ampG   FALSE 0.302 44.000 0.000 NA   NA
 7295559 7295560 SeD_A0488 SeD_A0489   tig FALSE 0.006 347.000 0.000 NA N NA
 7295560 7295561 SeD_A0489 SeD_A0490 tig clpP TRUE 0.861 140.000 0.351 1.000 Y NA
 7295561 7295562 SeD_A0490 SeD_A0491 clpP clpX FALSE 0.402 252.000 0.352 1.000 Y NA
 7295562 7295563 SeD_A0491 SeD_A0492 clpX lon TRUE 0.632 186.000 0.201 0.095 Y NA
 7295563 7295564 SeD_A0492 SeD_A0493 lon hupB FALSE 0.041 209.000 0.000 1.000 N NA
 7295564 7295565 SeD_A0493 SeD_A0494 hupB ppiD FALSE 0.012 291.000 0.000 1.000 N NA
 7295565 7295566 SeD_A0494 SeD_A0495 ppiD   FALSE 0.131 150.000 0.033 1.000 N NA
 7295566 7295567 SeD_A0495 SeD_A0496     FALSE 0.190 104.000 0.027 1.000   NA
 7295568 7295569 SeD_A0497 SeD_A0498     FALSE 0.193 65.000 0.000 NA   NA
 7295569 7295570 SeD_A0498 SeD_A0499     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7295573 7295574 SeD_A0502 SeD_A0503     TRUE 0.731 41.000 0.179 1.000 N NA
 7295574 7295575 SeD_A0503 SeD_A0504     TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.006 Y NA
 7295575 7295576 SeD_A0504 SeD_A0505     FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7295576 7295577 SeD_A0505 SeD_A0506     FALSE 0.252 51.000 0.000 NA   NA
 7295577 7295578 SeD_A0506 SeD_A0507   nrgA TRUE 0.762 32.000 0.156 1.000 N NA
 7295584 7295585 SeD_A0513 SeD_A0514 rpmE2 rpmJ TRUE 0.939 6.000 0.083 0.013   NA
 7295586 7295587 SeD_A0515 SeD_A0516     FALSE 0.327 118.000 0.101 NA   NA
 7295587 7295588 SeD_A0516 SeD_A0517     FALSE 0.103 179.000 0.076 NA   NA
 7295588 7295589 SeD_A0517 SeD_A0518     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7295589 7295590 SeD_A0518 SeD_A0519   acrB FALSE 0.002 496.000 0.000 NA   NA
 7295590 7295591 SeD_A0519 SeD_A0520 acrB acrA TRUE 0.945 23.000 0.458 1.000 N NA
 7295592 7295593 SeD_A0521 SeD_A0522 acrR   FALSE 0.159 125.000 0.000 NA N NA
 7295594 7295595 SeD_A0523 SeD_A0524     FALSE 0.197 70.000 0.037 NA   NA
 7295595 7295596 SeD_A0524 SeD_A0525     TRUE 0.964 14.000 0.474 NA   NA
 7295597 7295598 SeD_A0526 SeD_A0527   apt FALSE 0.105 153.000 0.043 NA   NA
 7295598 7295599 SeD_A0527 SeD_A0528 apt dnaX FALSE 0.353 114.000 0.088 1.000 N NA
 7295599 7295600 SeD_A0528 SeD_A0530 dnaX   TRUE 0.830 46.000 0.411 NA   NA
 7295600 7295601 SeD_A0530 SeD_A0531   recR TRUE 0.989 0.000 0.604 NA   NA
 7295601 7295602 SeD_A0531 SeD_A0532 recR htpG FALSE 0.201 111.000 0.028 1.000 N NA
 7295602 7295603 SeD_A0532 SeD_A0533 htpG   FALSE 0.164 88.000 0.000 NA   NA
 7295603 7295604 SeD_A0533 SeD_A0534   adk FALSE 0.133 133.000 0.000 NA   NA
 7295604 7295605 SeD_A0534 SeD_A0535 adk   FALSE 0.168 79.000 0.000 NA   NA
 7295605 7295606 SeD_A0535 SeD_A0536   hemH TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7295615 7295616 SeD_A0545 SeD_A0546     FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7295616 7295617 SeD_A0546 SeD_A0547   copA FALSE 0.086 154.000 0.000 NA   NA
 7295619 7295620 SeD_A0549 SeD_A0550     TRUE 0.994 -3.000 0.313 NA Y NA
 7295621 7295622 SeD_A0551 SeD_A0552     TRUE 0.860 -13.000 0.127 NA   NA
 7295623 7295624 SeD_A0553 SeD_A0554     TRUE 0.695 33.000 0.118 1.000   NA
 7295624 7295625 SeD_A0554 SeD_A0556     FALSE 0.179 155.000 0.072 1.000   NA
 7295626 7295627 SeD_A0555 SeD_A0557     TRUE 0.996 -3.000 0.535 NA Y NA
 7295627 7295628 SeD_A0557 SeD_A0558     FALSE 0.052 186.000 0.034 NA N NA
 7295628 7295629 SeD_A0558 SeD_A0559     FALSE 0.015 257.000 0.000 NA N NA
 7295629 7295630 SeD_A0559 SeD_A0560     TRUE 0.945 37.000 0.261 NA Y NA
 7295630 7295631 SeD_A0560 SeD_A0561     TRUE 0.997 -7.000 0.957 1.000 Y NA
 7295632 7295633 SeD_A0562 SeD_A0563 ybbB   FALSE 0.177 70.000 0.012 1.000   NA
 7295634 7295635 SeD_A0564 SeD_A0565 allA allR TRUE 0.826 79.000 0.625 1.000 N NA
 7295635 7295636 SeD_A0565 SeD_A0566 allR gcl FALSE 0.266 85.000 0.054 1.000   NA
 7295636 7295637 SeD_A0566 SeD_A0567 gcl hyi TRUE 0.817 13.000 0.065 1.000   NA
 7295637 7295638 SeD_A0567 SeD_A0568 hyi   FALSE 0.481 101.000 0.154 1.000 N NA
 7295638 7295639 SeD_A0568 SeD_A0569     FALSE 0.312 66.000 0.051 1.000 N NA
 7295639 7295640 SeD_A0569 SeD_A0570     TRUE 0.616 96.000 0.250 1.000 N NA
 7295640 7295641 SeD_A0570 SeD_A0571   allB TRUE 0.823 79.000 0.161 1.000 Y NA
 7295641 7295642 SeD_A0571 SeD_A0572 allB   TRUE 0.859 59.000 0.161 1.000 Y NA
 7295642 7295643 SeD_A0572 SeD_A0573     TRUE 0.820 23.000 0.133 1.000 N NA
 7295644 7295645 SeD_A0574 SeD_A0575   allC TRUE 0.811 11.000 0.059 NA   NA
 7295645 7295646 SeD_A0575 SeD_A0576 allC allD TRUE 0.860 22.000 0.174 1.000 N NA
 7295647 7295648 SeD_A0577 SeD_A0578     TRUE 0.974 10.000 0.412 NA   NA
 7295648 7295649 SeD_A0578 SeD_A0579     TRUE 0.820 33.000 0.265 NA   NA
 7295649 7295650 SeD_A0579 SeD_A0580   arcC TRUE 0.977 4.000 0.375 NA   NA
 7295651 7295652 SeD_A0581 SeD_A0582 purK purE TRUE 0.993 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 7295652 7295653 SeD_A0582 SeD_A0583 purE lpxH FALSE 0.154 118.000 0.016 1.000   NA
 7295653 7295654 SeD_A0583 SeD_A0584 lpxH ppiB TRUE 0.969 3.000 0.237 1.000   NA
 7295656 7295657 SeD_A0586 SeD_A0587     TRUE 0.873 -3.000 0.059 NA   NA
 7295657 7295658 SeD_A0587 SeD_A0588     TRUE 0.858 -7.000 0.087 NA   NA
 7295658 7295659 SeD_A0588 SeD_A0589     FALSE 0.097 127.000 0.011 NA   NA
 7295659 7295660 SeD_A0589 SeD_A0590   folD TRUE 0.894 2.000 0.055 1.000   NA
 7295661 7295662 SeD_A0591 SeD_A0592     FALSE 0.177 74.000 0.000 NA   NA
 7295662 7295663 SeD_A0592 SeD_A0593     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7295663 7295664 SeD_A0593 SeD_A0594     FALSE 0.302 44.000 0.000 NA   NA
 7295664 7295665 SeD_A0594 SeD_A0595     TRUE 0.989 31.000 0.875 1.000 Y NA
 7295665 7295666 SeD_A0595 SeD_A0596     TRUE 0.995 15.000 0.875 NA Y NA
 7295666 7295667 SeD_A0596 SeD_A0597     TRUE 0.997 10.000 0.875 NA Y NA
 7295668 7295669 SeD_A0598 SeD_A0599     FALSE 0.002 604.000 0.000 NA   NA
 7295669 7295670 SeD_A0599 SeD_A0600     FALSE 0.526 -39.000 0.000 NA   NA
 7295670 7295671 SeD_A0600 SeD_A0601     FALSE 0.005 378.000 0.000 1.000   NA
 7295673 7295674 SeD_A0603 SeD_A0604     FALSE 0.001 652.000 0.000 NA   NA
 7295674 7295675 SeD_A0604 SeD_A0605     FALSE 0.164 82.000 0.000 NA   NA
 7295675 7295676 SeD_A0605 SeD_A0606     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7295676 7295677 SeD_A0606 SeD_A0607     TRUE 0.980 -3.000 0.400 NA   NA
 7295677 7295678 SeD_A0607 SeD_A0608     FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7295678 7295679 SeD_A0608 SeD_A0609     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295679 7295680 SeD_A0609 SeD_A0610     TRUE 0.984 11.000 0.667 NA   NA
 7295680 7295681 SeD_A0610 SeD_A0611     FALSE 0.002 573.000 0.000 NA   NA
 7295681 7295682 SeD_A0611 SeD_A0612     TRUE 0.991 1.000 0.667 1.000   NA
 7295682 7295683 SeD_A0612 SeD_A0613     TRUE 0.762 9.000 0.000 NA   NA
 7295683 7295684 SeD_A0613 SeD_A0614     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295684 7295685 SeD_A0614 SeD_A0615     FALSE 0.006 332.000 0.000 NA   NA
 7295685 7295686 SeD_A0615 SeD_A0616     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 7295686 7295687 SeD_A0616 SeD_A0617     FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 7295688 7295689 SeD_A0618 SeD_A0619     FALSE 0.101 147.000 0.000 NA   NA
 7295690 7295691 SeD_A0620 SeD_A0622     FALSE 0.001 804.000 0.000 NA   NA
 7295692 7295693 SeD_A0621 SeD_A0623     FALSE 0.005 344.000 0.000 NA   NA
 7295693 7295694 SeD_A0623 SeD_A0624     FALSE 0.076 174.000 0.000 1.000   NA
 7295694 7295695 SeD_A0624 SeD_A0625     TRUE 0.992 -3.000 0.571 0.009   NA
 7295695 7295696 SeD_A0625 SeD_A0626     TRUE 0.774 56.000 0.400 NA   NA
 7295696 7295697 SeD_A0626 SeD_A0627     TRUE 0.921 -3.000 0.105 NA   NA
 7295697 7295698 SeD_A0627 SeD_A0628     FALSE 0.006 316.000 0.000 NA   NA
 7295698 7295699 SeD_A0628 SeD_A0629     FALSE 0.001 1272.000 0.000 NA   NA
 7295699 7295700 SeD_A0629 SeD_A0630     FALSE 0.004 380.000 0.000 NA   NA
 7295700 7295701 SeD_A0630 SeD_A0631     TRUE 0.621 -16.000 0.000 NA   NA
 7295701 7295702 SeD_A0631 SeD_A0632     TRUE 0.849 -3.000 0.000 1.000   NA
 7295704 7295705 SeD_A0634 SeD_A0635     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 7295705 7295706 SeD_A0635 SeD_A0636     FALSE 0.003 436.000 0.000 NA   NA
 7295706 7295707 SeD_A0636 SeD_A0637     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 7295707 7295708 SeD_A0637 SeD_A0638     TRUE 0.916 -22.000 0.286 NA   NA
 7295708 7295709 SeD_A0638 SeD_A0639     TRUE 0.945 0.000 0.143 NA   NA
 7295709 7295710 SeD_A0639 SeD_A0640     TRUE 0.937 14.000 0.286 NA   NA
 7295710 7295711 SeD_A0640 SeD_A0641     TRUE 0.951 0.000 0.161 NA   NA
 7295711 7295712 SeD_A0641 SeD_A0642     FALSE 0.327 41.000 0.000 NA   NA
 7295712 7295713 SeD_A0642 SeD_A0643     TRUE 0.621 -16.000 0.000 NA   NA
 7295713 7295714 SeD_A0643 SeD_A0644     TRUE 0.943 -40.000 0.500 NA   NA
 7295714 7295715 SeD_A0644 SeD_A0645     TRUE 0.968 4.000 0.286 NA   NA
 7295715 7295716 SeD_A0645 SeD_A0646     TRUE 0.992 0.000 0.750 NA   NA
 7295716 7295717 SeD_A0646 SeD_A0647     TRUE 0.988 3.000 0.600 NA   NA
 7295717 7295718 SeD_A0647 SeD_A0648     TRUE 0.961 11.000 0.333 NA   NA
 7295718 7295719 SeD_A0648 SeD_A0649     TRUE 0.953 0.000 0.167 NA   NA
 7295720 7295721 SeD_A0650 SeD_A0651     FALSE 0.003 410.000 0.000 NA   NA
 7295721 7295722 SeD_A0651 SeD_A0652     FALSE 0.166 100.000 0.000 NA   NA
 7295724 7295725 SeD_A0654 SeD_A0655     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7295725 7295726 SeD_A0655 SeD_A0656     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295726 7295727 SeD_A0656 SeD_A0657     FALSE 0.001 879.000 0.000 NA   NA
 7295727 7295728 SeD_A0657 SeD_A0658     FALSE 0.004 387.000 0.000 NA   NA
 7295728 7295729 SeD_A0658 SeD_A0659     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7295729 7295730 SeD_A0659 SeD_A0660     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295730 7295731 SeD_A0660 SeD_A0661     FALSE 0.003 425.000 0.000 NA   NA
 7295731 7295732 SeD_A0661 SeD_A0662     FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 7295735 7295736 SeD_A0665 SeD_A0666     TRUE 0.662 157.000 0.667 NA   NA
 7295736 7295737 SeD_A0666 SeD_A0667     TRUE 0.718 13.000 0.043 NA   NA
 7295741 7295742 SeD_A0671 SeD_A0672     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7295742 7295743 SeD_A0672 SeD_A0673     FALSE 0.500 -130.000 0.000 NA   NA
 7295744 7295745 SeD_A0674 SeD_A0675     TRUE 0.822 97.000 0.667 NA   NA
 7295745 7295746 SeD_A0675 SeD_A0676     TRUE 0.963 0.000 0.208 NA   NA
 7295748 7295749 SeD_A0678 SeD_A0679     TRUE 0.877 91.000 1.000 NA   NA
 7295749 7295750 SeD_A0679 SeD_A0680     TRUE 0.753 12.000 0.000 1.000   NA
 7295750 7295751 SeD_A0680 SeD_A0681     TRUE 0.914 47.000 0.700 1.000 N NA
 7295752 7295753 SeD_A0682 SeD_A0683     TRUE 0.864 31.000 0.320 NA   NA
 7295753 7295754 SeD_A0683 SeD_A0684   entF TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295754 7295755 SeD_A0684 SeD_A0685 entF   FALSE 0.021 250.000 0.000 1.000 N NA
 7295756 7295757 SeD_A0686 SeD_A0687     TRUE 0.985 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 7295757 7295758 SeD_A0687 SeD_A0688     TRUE 0.996 0.000 0.300 0.052 Y NA
 7295761 7295762 SeD_A0691 SeD_A0692   entE TRUE 0.971 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7295762 7295763 SeD_A0692 SeD_A0693 entE   TRUE 0.955 14.000 0.000 1.000 Y NA
 7295763 7295764 SeD_A0693 SeD_A0694     TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7295764 7295765 SeD_A0694 SeD_A0695     TRUE 0.982 3.000 0.065 NA Y NA
 7295765 7295766 SeD_A0695 SeD_A0696   cstA FALSE 0.246 182.000 0.222 NA N NA
 7295766 7295767 SeD_A0696 SeD_A0697 cstA   TRUE 0.698 64.000 0.333 NA   NA
 7295770 7295771 SeD_A0701 SeD_A0702     TRUE 0.930 -27.000 0.333 1.000   NA
 7295771 7295772 SeD_A0702 SeD_A0703     FALSE 0.122 150.000 0.000 1.000   NA
 7295772 7295773 SeD_A0703 SeD_A0704   dsbG FALSE 0.007 317.000 0.000 NA N NA
 7295774 7295775 SeD_A0705 SeD_A0706 ahpC ahpF FALSE 0.016 242.000 0.000 NA   NA
 7295775 7295776 SeD_A0706 SeD_A0707 ahpF   FALSE 0.006 333.000 0.000 NA   NA
 7295776 7295777 SeD_A0707 SeD_A0709     FALSE 0.021 224.000 0.000 NA   NA
 7295777 7295778 SeD_A0709 SeD_A0710     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295778 7295779 SeD_A0710 SeD_A0711     TRUE 0.995 0.000 1.000 1.000   NA
 7295781 7295782 SeD_A0713 SeD_A0714     FALSE 0.163 85.000 0.000 NA   NA
 7295783 7295784 SeD_A0715 SeD_A0716     FALSE 0.018 235.000 0.000 NA   NA
 7295784 7295785 SeD_A0716 SeD_A0717     FALSE 0.503 -112.000 0.000 NA   NA
 7295785 7295786 SeD_A0717 SeD_A0718     FALSE 0.157 110.000 0.000 NA   NA
 7295786 7295787 SeD_A0718 SeD_A0719   citG FALSE 0.065 167.000 0.000 NA   NA
 7295787 7295788 SeD_A0719 SeD_A0720 citG citX TRUE 0.985 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 7295788 7295789 SeD_A0720 SeD_A0721 citX citF TRUE 0.966 4.000 0.231 1.000 N NA
 7295789 7295790 SeD_A0721 SeD_A0722 citF citE TRUE 0.983 10.000 0.373 0.002 N NA
 7295790 7295791 SeD_A0722 SeD_A0723 citE citD TRUE 0.992 -3.000 0.537 0.002 N NA
 7295791 7295792 SeD_A0723 SeD_A0724 citD citC TRUE 0.979 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7295793 7295794 SeD_A0725 SeD_A0726     FALSE 0.050 182.000 0.000 NA   NA
 7295794 7295795 SeD_A0726 SeD_A0727     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7295797 7295798 SeD_A0729 SeD_A0730 pagP cspE FALSE 0.333 188.000 0.333 1.000   NA
 7295800 7295801 SeD_A0732 SeD_A0733   tatE FALSE 0.491 129.000 0.196 1.000   NA
 7295802 7295803 SeD_A0734 SeD_A0735 lipA   FALSE 0.327 41.000 0.000 NA   NA
 7295803 7295804 SeD_A0735 SeD_A0736     FALSE 0.413 31.000 0.000 NA   NA
 7295804 7295805 SeD_A0736 SeD_A0737   lipB FALSE 0.010 302.000 0.000 1.000 N NA
 7295805 7295806 SeD_A0737 SeD_A0738 lipB   FALSE 0.538 100.000 0.219 NA   NA
 7295806 7295807 SeD_A0738 SeD_A0739   dacA FALSE 0.291 109.000 0.081 NA   NA
 7295807 7295808 SeD_A0739 SeD_A0740 dacA   TRUE 0.883 140.000 0.475 NA Y NA
 7295808 7295809 SeD_A0740 SeD_A0741   mrdB TRUE 0.750 11.000 0.035 NA N NA
 7295809 7295810 SeD_A0741 SeD_A0742 mrdB mrdA TRUE 0.882 3.000 0.046 1.000 N NA
 7295810 7295811 SeD_A0742 SeD_A0743 mrdA   FALSE 0.405 31.000 0.031 NA   NA
 7295811 7295812 SeD_A0743 SeD_A0744     TRUE 0.971 4.000 0.307 NA   NA
 7295812 7295813 SeD_A0744 SeD_A0745     FALSE 0.119 140.000 0.000 NA   NA
 7295813 7295814 SeD_A0745 SeD_A0746   cobC FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 7295816 7295817 SeD_A0748 SeD_A0749 nadD holA TRUE 0.819 -7.000 0.045 1.000 N NA
 7295817 7295818 SeD_A0749 SeD_A0750 holA   TRUE 0.963 0.000 0.199 NA N NA
 7295818 7295819 SeD_A0750 SeD_A0751   leuS TRUE 0.898 15.000 0.182 NA N NA
 7295820 7295821 SeD_A0752 SeD_A0753     TRUE 0.961 -37.000 0.409 0.001   NA
 7295821 7295822 SeD_A0753 SeD_A0754     FALSE 0.316 50.000 0.000 1.000   NA
 7295822 7295823 SeD_A0754 SeD_A0755     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 7295823 7295824 SeD_A0755 SeD_A0756     FALSE 0.190 67.000 0.000 NA   NA
 7295824 7295825 SeD_A0756 SeD_A0757     FALSE 0.167 93.000 0.000 NA   NA
 7295827 7295828 SeD_A0759 SeD_A0760     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295828 7295829 SeD_A0760 SeD_A0761     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7295829 7295830 SeD_A0761 SeD_A0762     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295831 7295832 SeD_A0763 SeD_A0764     FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7295832 7295833 SeD_A0764 SeD_A0765   rihA FALSE 0.400 32.000 0.000 NA   NA
 7295833 7295834 SeD_A0765 SeD_A0766 rihA gltL FALSE 0.494 117.000 0.195 NA N NA
 7295834 7295835 SeD_A0766 SeD_A0767 gltL gltK TRUE 0.996 0.000 0.379 1.000 Y NA
 7295835 7295836 SeD_A0767 SeD_A0768 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.016 Y NA
 7295836 7295837 SeD_A0768 SeD_A0769 gltJ sroC TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7295837 7295838 SeD_A0769 SeD_A0770 sroC gltI TRUE 0.753 -4.000 0.000 NA   NA
 7295838 7295839 SeD_A0770 SeD_A0771 gltI lnt FALSE 0.007 355.000 0.000 1.000 N NA
 7295839 7295840 SeD_A0771 SeD_A0772 lnt corC TRUE 0.960 -31.000 0.557 1.000 N NA
 7295840 7295841 SeD_A0772 SeD_A0773 corC   TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295841 7295842 SeD_A0773 SeD_A0774     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7295842 7295843 SeD_A0774 SeD_A0775     TRUE 0.983 -3.000 0.457 NA   NA
 7295843 7295844 SeD_A0775 SeD_A0776   miaB FALSE 0.184 205.000 0.220 1.000 N NA
 7295846 7295847 SeD_A0778 SeD_A0779     FALSE 0.130 135.000 0.000 NA   NA
 7295847 7295848 SeD_A0779 SeD_A0780     FALSE 0.317 42.000 0.000 NA   NA
 7295848 7295849 SeD_A0780 SeD_A0781     FALSE 0.293 45.000 0.000 NA   NA
 7295849 7295850 SeD_A0781 SeD_A0782     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7295850 7295851 SeD_A0782 SeD_A0783     FALSE 0.369 35.000 0.000 NA   NA
 7295851 7295852 SeD_A0783 SeD_A0784     FALSE 0.522 23.000 0.000 NA   NA
 7295852 7295853 SeD_A0784 SeD_A0785     TRUE 0.772 7.000 0.000 NA   NA
 7295853 7295854 SeD_A0785 SeD_A0786   asnB FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7295854 7295855 SeD_A0786 SeD_A0787 asnB   FALSE 0.012 291.000 0.000 1.000 N NA
 7295855 7295856 SeD_A0787 SeD_A0788   nagC TRUE 0.849 47.000 0.070 1.000 Y NA
 7295856 7295857 SeD_A0788 SeD_A0789 nagC nagA TRUE 0.996 5.000 0.571 1.000 Y NA
 7295857 7295858 SeD_A0789 SeD_A0790 nagA nagB TRUE 0.968 60.000 0.557 0.001 Y NA
 7295859 7295860 SeD_A0791 SeD_A0792 nagE glnS FALSE 0.027 211.000 0.006 1.000 N NA
 7295860 7295861 SeD_A0792 SeD_A0793 glnS   FALSE 0.001 661.000 0.000 NA   NA
 7295861 7295862 SeD_A0793 SeD_A0794     FALSE 0.155 116.000 0.000 NA   NA
 7295862 7295863 SeD_A0794 SeD_A0795     FALSE 0.258 50.000 0.000 NA   NA
 7295864 7295865 SeD_A0796 SeD_A0797     FALSE 0.389 51.000 0.069 NA   NA
 7295865 7295866 SeD_A0797 SeD_A0798   cobZ TRUE 0.974 -13.000 0.618 NA   NA
 7295866 7295867 SeD_A0798 SeD_A0799 cobZ   FALSE 0.282 98.000 0.053 1.000 N NA
 7295867 7295868 SeD_A0799 SeD_A0800   fur FALSE 0.286 115.000 0.020 0.065 N NA
 7295868 7295869 SeD_A0800 SeD_A0801 fur fldA FALSE 0.044 282.000 0.156 1.000 N NA
 7295869 7295870 SeD_A0801 SeD_A0803 fldA   TRUE 0.835 52.000 0.473 1.000   NA
 7295873 7295874 SeD_A0805 SeD_A0806 seqA pgm TRUE 0.821 25.000 0.151 1.000 N NA
 7295875 7295876 SeD_A0807 SeD_A0808   potE FALSE 0.403 47.000 0.050 1.000   NA
 7295876 7295877 SeD_A0808 SeD_A0809 potE speF TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7295877 7295878 SeD_A0809 SeD_A0810 speF   FALSE 0.002 763.000 0.000 1.000 N NA
 7295878 7295879 SeD_A0810 SeD_A0811     TRUE 0.995 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 7295879 7295880 SeD_A0811 SeD_A0812   kdpC TRUE 0.933 -3.000 0.100 1.000 N NA
 7295880 7295881 SeD_A0812 SeD_A0813 kdpC kdpB TRUE 0.998 9.000 0.877 0.001 Y NA
 7295881 7295882 SeD_A0813 SeD_A0814 kdpB kdpA TRUE 0.981 21.000 0.201 0.001 Y NA
 7295882 7295883 SeD_A0814 SeD_A0815 kdpA kdpF TRUE 0.941 0.000 0.000 0.001   NA
 7295884 7295885 SeD_A0816 SeD_A0817     FALSE 0.094 112.000 0.004 NA   NA
 7295887 7295888 SeD_A0819 SeD_A0820     TRUE 0.686 16.000 0.050 NA   NA
 7295888 7295889 SeD_A0820 SeD_A0821     TRUE 0.993 -6.000 0.379 NA Y NA
 7295889 7295890 SeD_A0821 SeD_A0822     TRUE 0.923 -10.000 0.211 NA   NA
 7295890 7295891 SeD_A0822 SeD_A0823     FALSE 0.200 122.000 0.037 1.000   NA
 7295892 7295893 SeD_A0824 SeD_A0825   gltA FALSE 0.076 137.000 0.005 NA   NA
 7295894 7295895 SeD_A0826 SeD_A0827 sdhC sdhD TRUE 0.996 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 7295895 7295896 SeD_A0827 SeD_A0828 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 7295896 7295897 SeD_A0828 SeD_A0829 sdhA sdhB TRUE 0.996 14.000 0.604 0.002 Y NA
 7295897 7295898 SeD_A0829 SeD_A0830 sdhB sucA FALSE 0.026 526.000 0.067 1.000 Y NA
 7295898 7295899 SeD_A0830 SeD_A0831 sucA sucB TRUE 0.994 15.000 0.667 1.000 Y NA
 7295899 7295900 SeD_A0831 SeD_A0832 sucB sucC TRUE 0.728 142.000 0.136 1.000 Y NA
 7295900 7295901 SeD_A0832 SeD_A0833 sucC   TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 7295901 7295902 SeD_A0833 SeD_A0834     FALSE 0.435 29.000 0.000 NA   NA
 7295902 7295903 SeD_A0834 SeD_A0835     FALSE 0.164 87.000 0.000 NA   NA
 7295903 7295904 SeD_A0835 SeD_A0836   cydA FALSE 0.001 1217.000 0.000 NA   NA
 7295904 7295905 SeD_A0836 SeD_A0837 cydA cydB1 TRUE 0.959 16.000 0.000 0.052 Y NA
 7295905 7295906 SeD_A0837 SeD_A0838 cydB1   TRUE 0.868 15.000 0.149 NA   NA
 7295906 7295907 SeD_A0838 SeD_A0839     TRUE 0.976 0.000 0.310 NA   NA
 7295907 7295908 SeD_A0839 SeD_A0840     FALSE 0.050 229.000 0.095 NA   NA
 7295908 7295909 SeD_A0840 SeD_A0841   tolQ TRUE 0.989 -3.000 0.593 1.000   NA
 7295909 7295910 SeD_A0841 SeD_A0842 tolQ tolR TRUE 0.997 4.000 0.556 0.064 Y NA
 7295910 7295911 SeD_A0842 SeD_A0843 tolR tolA FALSE 0.427 65.000 0.114 NA N NA
 7295911 7295912 SeD_A0843 SeD_A0844 tolA tolB FALSE 0.213 121.000 0.051 NA N NA
 7295912 7295913 SeD_A0844 SeD_A0845 tolB pal TRUE 0.927 35.000 0.592 1.000 N NA
 7295913 7295914 SeD_A0845 SeD_A0846 pal   TRUE 0.895 10.000 0.088 1.000   NA
 7295914 7295915 SeD_A0846 SeD_A0847     FALSE 0.068 164.000 0.000 NA   NA
 7295915 7295916 SeD_A0847 SeD_A0848     FALSE 0.128 136.000 0.000 NA   NA
 7295916 7295917 SeD_A0848 SeD_A0849     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7295917 7295918 SeD_A0849 SeD_A0850     FALSE 0.123 138.000 0.000 NA   NA
 7295918 7295919 SeD_A0850 SeD_A0851   nadA FALSE 0.018 234.000 0.000 NA   NA
 7295919 7295920 SeD_A0851 SeD_A0852 nadA   TRUE 0.913 25.000 0.023 1.000 Y NA
 7295921 7295922 SeD_A0853 SeD_A0854     FALSE 0.228 111.000 0.057 NA   NA
 7295924 7295925 SeD_A0856 SeD_A0857     TRUE 0.989 15.000 0.262 0.002 Y NA
 7295928 7295929 SeD_A0860 SeD_A0861     FALSE 0.371 89.000 0.000 0.008 N NA
 7295929 7295930 SeD_A0861 SeD_A0862   oadA TRUE 0.996 16.000 0.720 0.003 Y NA
 7295930 7295931 SeD_A0862 SeD_A0863 oadA   TRUE 0.997 13.000 0.886 0.003 Y NA
 7295931 7295932 SeD_A0863 SeD_A0864     FALSE 0.133 119.000 0.019 NA N NA
 7295932 7295933 SeD_A0864 SeD_A0865     FALSE 0.004 380.000 0.000 NA N NA
 7295933 7295934 SeD_A0865 SeD_A0866     TRUE 0.998 0.000 0.833 1.000 Y NA
 7295935 7295936 SeD_A0867 SeD_A0868 gpmA galM FALSE 0.175 224.000 0.009 1.000 Y NA
 7295936 7295937 SeD_A0868 SeD_A0869 galM galK TRUE 0.987 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 7295937 7295938 SeD_A0869 SeD_A0870 galK galT TRUE 0.988 3.000 0.370 0.001 N NA
 7295938 7295939 SeD_A0870 SeD_A0871 galT galE TRUE 0.919 11.000 0.053 0.001 N NA
 7295939 7295940 SeD_A0871 SeD_A0872 galE   FALSE 0.022 223.000 0.000 NA   NA
 7295940 7295941 SeD_A0872 SeD_A0873     FALSE 0.060 171.000 0.000 NA   NA
 7295941 7295942 SeD_A0873 SeD_A0874     FALSE 0.347 68.000 0.000 0.090   NA
 7295943 7295944 SeD_A0875 SeD_A0876   modA FALSE 0.120 167.000 0.072 NA   NA
 7295944 7295945 SeD_A0876 SeD_A0877 modA modB TRUE 0.998 0.000 0.627 0.001 Y NA
 7295945 7295946 SeD_A0877 SeD_A0878 modB modC TRUE 0.998 3.000 0.537 0.001 Y NA
 7295950 7295951 SeD_A0882 SeD_A0883 hutI hutG TRUE 0.958 -3.000 0.171 1.000 N NA
 7295951 7295952 SeD_A0883 SeD_A0884 hutG hutC FALSE 0.482 45.000 0.062 1.000 N NA
 7295952 7295953 SeD_A0884 SeD_A0885 hutC hutU FALSE 0.055 197.000 0.037 1.000 N NA
 7295953 7295954 SeD_A0885 SeD_A0886 hutU hutH TRUE 0.996 2.000 0.315 0.001 Y NA
 7295955 7295956 SeD_A0887 SeD_A0888   bioA FALSE 0.170 48.000 0.003 NA   NA
 7295957 7295958 SeD_A0889 SeD_A0890 bioB bioF TRUE 0.994 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 7295958 7295959 SeD_A0890 SeD_A0891 bioF bioC TRUE 0.981 -16.000 0.133 0.002 Y NA
 7295959 7295960 SeD_A0891 SeD_A0892 bioC bioD TRUE 0.981 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 7295960 7295961 SeD_A0892 SeD_A0893 bioD uvrB FALSE 0.004 651.000 0.000 0.090 N NA
 7295961 7295962 SeD_A0893 SeD_A0894 uvrB   FALSE 0.003 490.000 0.000 1.000   NA
 7295964 7295965 SeD_A0896 SeD_A0897 moaA moaB TRUE 0.968 22.000 0.108 0.004 Y NA
 7295965 7295966 SeD_A0897 SeD_A0898 moaB moaC TRUE 0.991 3.000 0.109 0.004 Y NA
 7295966 7295967 SeD_A0898 SeD_A0899 moaC moaD TRUE 0.990 -7.000 0.175 0.004 Y NA
 7295967 7295968 SeD_A0899 SeD_A0900 moaD moaE TRUE 0.998 2.000 0.501 0.004 Y NA
 7295968 7295969 SeD_A0900 SeD_A0901 moaE   FALSE 0.242 48.000 0.025 NA   NA
 7295969 7295970 SeD_A0901 SeD_A0902     FALSE 0.112 145.000 0.037 NA   NA
 7295970 7295971 SeD_A0902 SeD_A0903     FALSE 0.425 30.000 0.000 NA   NA
 7295971 7295972 SeD_A0903 SeD_A0904     TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7295972 7295973 SeD_A0904 SeD_A0905     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295974 7295975 SeD_A0906 SeD_A0907     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7295975 7295976 SeD_A0907 SeD_A0908     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295978 7295979 SeD_A0910 SeD_A0911     TRUE 0.858 116.000 0.609 0.005 N NA
 7295979 7295980 SeD_A0911 SeD_A0912     TRUE 0.985 -7.000 0.547 0.090   NA
 7295980 7295981 SeD_A0912 SeD_A0913     TRUE 0.980 -7.000 0.545 1.000   NA
 7295981 7295982 SeD_A0913 SeD_A0914     TRUE 0.973 0.000 0.236 1.000 N NA
 7295983 7295984 SeD_A0915 SeD_A0916   dinG FALSE 0.304 208.000 0.029 0.090 Y NA
 7295984 7295985 SeD_A0916 SeD_A0917 dinG   FALSE 0.545 30.000 0.041 1.000 N NA
 7295990 7295991 SeD_A0922 SeD_A0923   glnQ FALSE 0.182 119.000 0.039 NA N NA
 7295991 7295992 SeD_A0923 SeD_A0924 glnQ glnP TRUE 0.978 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 7295992 7295993 SeD_A0924 SeD_A0925 glnP glnH TRUE 0.642 144.000 0.000 0.064 Y NA
 7295993 7295994 SeD_A0925 SeD_A0926 glnH   FALSE 0.003 477.000 0.000 1.000 N NA
 7295994 7295995 SeD_A0926 SeD_A0927     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7295995 7295996 SeD_A0927 SeD_A0928     FALSE 0.435 29.000 0.000 NA   NA
 7295999 7296000 SeD_A0931 SeD_A0932     FALSE 0.355 37.000 0.000 NA   NA
 7296000 7296001 SeD_A0932 SeD_A0933     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 7296001 7296002 SeD_A0933 SeD_A0934     TRUE 0.820 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7296004 7296005 SeD_A0936 SeD_A0937     FALSE 0.001 710.000 0.000 NA   NA
 7296005 7296006 SeD_A0937 SeD_A0939     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7296007 7296008 SeD_A0940 SeD_A0941     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 7296009 7296010 SeD_A0942 SeD_A0943     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296011 7296012 SeD_A0944 SeD_A0945     TRUE 0.982 6.000 0.316 0.003 N NA
 7296012 7296013 SeD_A0945 SeD_A0946   moeB FALSE 0.014 278.000 0.000 1.000 N NA
 7296013 7296014 SeD_A0946 SeD_A0947 moeB   TRUE 0.997 0.000 0.323 0.004 Y NA
 7296015 7296016 SeD_A0948 SeD_A0949     TRUE 0.777 11.000 0.000 1.000   NA
 7296016 7296017 SeD_A0949 SeD_A0950     FALSE 0.457 33.000 0.000 1.000   NA
 7296017 7296018 SeD_A0950 SeD_A0951   gsiC TRUE 0.975 61.000 0.803 0.051 Y NA
 7296018 7296019 SeD_A0951 SeD_A0952 gsiC   TRUE 0.998 3.000 0.689 0.051 Y NA
 7296021 7296022 SeD_A0954 SeD_A0955   bssR FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 7296022 7296023 SeD_A0955 SeD_A0956 bssR   FALSE 0.001 713.000 0.000 NA   NA
 7296023 7296024 SeD_A0956 SeD_A0957     TRUE 0.610 23.000 0.000 1.000 N NA
 7296024 7296025 SeD_A0957 SeD_A0958     TRUE 0.976 11.000 0.000 0.015 Y NA
 7296025 7296026 SeD_A0958 SeD_A0959     FALSE 0.387 33.000 0.000 NA   NA
 7296026 7296027 SeD_A0959 SeD_A0960     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7296027 7296028 SeD_A0960 SeD_A0961     FALSE 0.006 448.000 0.000 0.052 N NA
 7296029 7296030 SeD_A0962 SeD_A0963     FALSE 0.015 265.000 0.000 1.000   NA
 7296031 7296032 SeD_A0964 SeD_A0965     FALSE 0.541 21.000 0.000 NA   NA
 7296035 7296036 SeD_A0968 SeD_A0969     TRUE 0.616 72.000 0.235 1.000   NA
 7296038 7296039 SeD_A0971 SeD_A0972     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296041 7296042 SeD_A0974 SeD_A0975 rybB   FALSE 0.166 80.000 0.000 NA   NA
 7296045 7296046 SeD_A0978 SeD_A0979   nfsA TRUE 0.870 -16.000 0.159 NA   NA
 7296046 7296047 SeD_A0979 SeD_A0980 nfsA rimK FALSE 0.498 58.000 0.114 1.000 N NA
 7296047 7296048 SeD_A0980 SeD_A0981 rimK   FALSE 0.454 96.000 0.161 NA   NA
 7296048 7296049 SeD_A0981 SeD_A0982     FALSE 0.005 346.000 0.000 NA   NA
 7296049 7296050 SeD_A0982 SeD_A0983   potG TRUE 0.951 88.000 0.679 1.000 Y NA
 7296050 7296051 SeD_A0983 SeD_A0984 potG   TRUE 0.997 10.000 0.857 1.000 Y NA
 7296051 7296052 SeD_A0984 SeD_A0985     TRUE 0.997 -3.000 0.528 0.051 Y NA
 7296052 7296053 SeD_A0985 SeD_A0986     TRUE 0.608 74.000 0.264 NA   NA
 7296053 7296054 SeD_A0986 SeD_A0987   rumB TRUE 0.733 43.000 0.226 NA   NA
 7296054 7296055 SeD_A0987 SeD_A0988 rumB   FALSE 0.010 295.000 0.000 1.000   NA
 7296055 7296056 SeD_A0988 SeD_A0989     TRUE 0.969 30.000 0.800 0.015   NA
 7296056 7296057 SeD_A0989 SeD_A0990     TRUE 0.990 10.000 0.800 1.000 N NA
 7296058 7296059 SeD_A0991 SeD_A0992 artJ artM FALSE 0.330 237.000 0.143 0.051 Y NA
 7296059 7296060 SeD_A0992 SeD_A0993 artM artQ TRUE 0.998 0.000 0.714 0.015 Y NA
 7296060 7296061 SeD_A0993 SeD_A0994 artQ artI TRUE 0.993 7.000 0.260 0.051 Y NA
 7296061 7296062 SeD_A0994 SeD_A0995 artI artP TRUE 0.983 18.000 0.323 1.000 Y NA
 7296062 7296063 SeD_A0995 SeD_A0996 artP   FALSE 0.041 230.000 0.081 NA   NA
 7296064 7296065 SeD_A0997 SeD_A0998     TRUE 0.820 -3.000 0.037 NA   NA
 7296066 7296067 SeD_A0999 SeD_A1000     TRUE 0.755 96.000 0.022 0.009 Y NA
 7296067 7296068 SeD_A1000 SeD_A1001   ltaE TRUE 0.870 11.000 0.074 1.000 N NA
 7296068 7296069 SeD_A1001 SeD_A1002 ltaE poxB TRUE 0.861 39.000 0.041 1.000 Y NA
 7296069 7296070 SeD_A1002 SeD_A1003 poxB hcr FALSE 0.095 159.000 0.025 1.000 N NA
 7296070 7296071 SeD_A1003 SeD_A1004 hcr hcp TRUE 0.981 9.000 0.000 0.016 Y NA
 7296071 7296072 SeD_A1004 SeD_A1005 hcp   FALSE 0.108 144.000 0.000 NA   NA
 7296075 7296076 SeD_A1008 SeD_A1009     TRUE 0.994 -3.000 0.789 0.100 N NA
 7296076 7296077 SeD_A1009 SeD_A1010     FALSE 0.400 32.000 0.000 NA   NA
 7296079 7296080 SeD_A1012 SeD_A1013 clpS clpA TRUE 0.931 31.000 0.596 NA   NA
 7296081 7296082 SeD_A1014 SeD_A1015     FALSE 0.060 171.000 0.000 NA   NA
 7296082 7296083 SeD_A1015 SeD_A1016     FALSE 0.099 148.000 0.000 NA   NA
 7296083 7296084 SeD_A1016 SeD_A1017     TRUE 0.920 20.000 0.333 NA   NA
 7296086 7296087 SeD_A1019 SeD_A1020 infA aat FALSE 0.008 312.000 0.020 1.000 N NA
 7296087 7296088 SeD_A1020 SeD_A1021 aat cydC TRUE 0.839 45.000 0.049 1.000 Y NA
 7296088 7296089 SeD_A1021 SeD_A1022 cydC cydD TRUE 0.998 1.000 0.631 0.005 Y NA
 7296089 7296090 SeD_A1022 SeD_A1023 cydD trxB TRUE 0.698 114.000 0.049 1.000 Y NA
 7296091 7296092 SeD_A1024 SeD_A1025 lrp   TRUE 0.632 135.000 0.345 1.000 N NA
 7296092 7296093 SeD_A1025 SeD_A1026   lolA FALSE 0.553 143.000 0.305 1.000 N NA
 7296093 7296094 SeD_A1026 SeD_A1027 lolA   TRUE 0.940 10.000 0.167 1.000 N NA
 7296094 7296095 SeD_A1027 SeD_A1028   serS FALSE 0.049 259.000 0.078 0.089 N NA
 7296095 7296096 SeD_A1028 SeD_A1029 serS   FALSE 0.025 237.000 0.000 1.000 N NA
 7296096 7296097 SeD_A1029 SeD_A1030   dmsB_1 TRUE 0.988 11.000 0.172 0.051 Y NA
 7296097 7296098 SeD_A1030 SeD_A1031 dmsB_1 dmsC1 TRUE 0.855 2.000 0.000 1.000   NA
 7296098 7296099 SeD_A1031 SeD_A1032 dmsC1   FALSE 0.005 350.000 0.000 NA   NA
 7296099 7296100 SeD_A1032 SeD_A1033     FALSE 0.027 218.000 0.000 NA N NA
 7296102 7296103 SeD_A1035 SeD_A1036     FALSE 0.008 299.000 0.000 NA   NA
 7296104 7296105 SeD_A1037 SeD_A1038 pflB2   TRUE 0.748 60.000 0.345 1.000 N NA
 7296105 7296106 SeD_A1038 SeD_A1039     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 7296107 7296108 SeD_A1040 SeD_A1041   serC FALSE 0.032 186.000 0.014 NA   NA
 7296110 7296111 SeD_A1042 SeD_A1044 aroA   FALSE 0.105 143.000 0.003 1.000 N NA
 7296111 7296112 SeD_A1044 SeD_A1045   cmk FALSE 0.056 173.000 0.004 1.000 N NA
 7296112 7296113 SeD_A1045 SeD_A1046 cmk rpsA TRUE 0.620 114.000 0.281 1.000 N NA
 7296113 7296114 SeD_A1046 SeD_A1047 rpsA ihfB FALSE 0.452 156.000 0.292 1.000 N NA
 7296114 7296115 SeD_A1047 SeD_A1048 ihfB   FALSE 0.008 281.000 0.003 1.000   NA
 7296115 7296116 SeD_A1048 SeD_A1049   msbA TRUE 0.672 37.000 0.075 0.085   NA
 7296116 7296117 SeD_A1049 SeD_A1050 msbA lpxK TRUE 0.964 -3.000 0.205 1.000 N NA
 7296117 7296118 SeD_A1050 SeD_A1051 lpxK   FALSE 0.236 44.000 0.017 NA   NA
 7296118 7296119 SeD_A1051 SeD_A1052     FALSE 0.185 52.000 0.016 NA   NA
 7296119 7296120 SeD_A1052 SeD_A1053   kdsB TRUE 0.972 -3.000 0.265 1.000   NA
 7296120 7296121 SeD_A1053 SeD_A1054 kdsB   FALSE 0.023 211.000 0.023 NA   NA
 7296123 7296124 SeD_A1056 SeD_A1057 smtA mukF TRUE 0.961 -7.000 0.325 NA N NA
 7296124 7296125 SeD_A1057 SeD_A1058 mukF mukE TRUE 0.939 -19.000 0.036 NA Y NA
 7296125 7296126 SeD_A1058 SeD_A1059 mukE mukB TRUE 0.989 0.000 0.000 0.001 Y NA
 7296126 7296127 SeD_A1059 SeD_A1060 mukB   FALSE 0.007 345.000 0.000 1.000   NA
 7296127 7296128 SeD_A1060 SeD_A1061     FALSE 0.121 260.000 0.372 NA   NA
 7296128 7296129 SeD_A1061 SeD_A1062     TRUE 0.664 28.000 0.089 NA   NA
 7296130 7296131 SeD_A1063 SeD_A1064 aspC   FALSE 0.098 185.000 0.060 1.000 N NA
 7296133 7296134 SeD_A1066 SeD_A1067   asnC FALSE 0.514 -43.000 0.000 NA   NA
 7296134 7296135 SeD_A1067 SeD_A1068 asnC   FALSE 0.033 201.000 0.005 1.000 N NA
 7296135 7296136 SeD_A1068 SeD_A1069     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7296137 7296138 SeD_A1070 SeD_A1071     FALSE 0.177 74.000 0.000 NA   NA
 7296138 7296139 SeD_A1071 SeD_A1072     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7296140 7296141 SeD_A1073 SeD_A1074 pncB   FALSE 0.055 195.000 0.000 1.000 N NA
 7296141 7296142 SeD_A1074 SeD_A1075     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 7296142 7296143 SeD_A1075 SeD_A1076     FALSE 0.327 41.000 0.000 NA   NA
 7296143 7296144 SeD_A1076 SeD_A1077     TRUE 0.604 43.000 0.130 NA   NA
 7296144 7296145 SeD_A1077 SeD_A1078     FALSE 0.002 646.000 0.000 NA   NA
 7296145 7296146 SeD_A1078 SeD_A1079     FALSE 0.116 141.000 0.000 NA   NA
 7296146 7296147 SeD_A1079 SeD_A1080     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7296148 7296149 SeD_A1081 SeD_A1082     TRUE 0.697 -9.000 0.000 NA   NA
 7296149 7296150 SeD_A1082 SeD_A1083     TRUE 0.583 -22.000 0.000 NA   NA
 7296150 7296151 SeD_A1083 SeD_A1084     TRUE 0.849 3.000 0.000 1.000   NA
 7296151 7296152 SeD_A1084 SeD_A1085     TRUE 0.821 41.000 0.333 NA   NA
 7296152 7296153 SeD_A1085 SeD_A1086     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296153 7296154 SeD_A1086 SeD_A1087     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296154 7296155 SeD_A1087 SeD_A1088     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7296155 7296156 SeD_A1088 SeD_A1089     FALSE 0.032 205.000 0.000 NA   NA
 7296156 7296157 SeD_A1089 SeD_A1090     FALSE 0.081 156.000 0.000 NA   NA
 7296157 7296158 SeD_A1090 SeD_A1091     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 7296158 7296159 SeD_A1091 SeD_A1092     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296159 7296160 SeD_A1092 SeD_A1093     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296160 7296161 SeD_A1093 SeD_A1094     FALSE 0.133 133.000 0.000 NA   NA
 7296161 7296162 SeD_A1094 SeD_A1095     FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 7296162 7296163 SeD_A1095 SeD_A1096     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296163 7296164 SeD_A1096 SeD_A1097     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296164 7296165 SeD_A1097 SeD_A1098     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 7296165 7296166 SeD_A1098 SeD_A1099     FALSE 0.201 62.000 0.000 NA   NA
 7296166 7296167 SeD_A1099 SeD_A1100     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7296167 7296168 SeD_A1100 SeD_A1101     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296168 7296169 SeD_A1101 SeD_A1102     TRUE 0.974 -28.000 0.833 NA   NA
 7296169 7296170 SeD_A1102 SeD_A1103     TRUE 0.977 1.000 0.333 NA   NA
 7296170 7296171 SeD_A1103 SeD_A1104     FALSE 0.541 21.000 0.000 NA   NA
 7296171 7296172 SeD_A1104 SeD_A1105     TRUE 0.973 18.000 0.750 NA   NA
 7296172 7296173 SeD_A1105 SeD_A1106     FALSE 0.193 65.000 0.000 NA   NA
 7296173 7296174 SeD_A1106 SeD_A1107     TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7296174 7296175 SeD_A1107 SeD_A1108     TRUE 0.978 -15.000 0.750 NA   NA
 7296175 7296176 SeD_A1108 SeD_A1109     TRUE 0.977 -16.000 0.750 NA   NA
 7296176 7296177 SeD_A1109 SeD_A1110     TRUE 0.986 5.000 0.600 NA   NA
 7296177 7296178 SeD_A1110 SeD_A1111     TRUE 0.987 4.000 0.600 NA   NA
 7296178 7296179 SeD_A1111 SeD_A1112     TRUE 0.991 0.000 0.667 NA   NA
 7296181 7296182 SeD_A1113 SeD_A1115     TRUE 0.986 0.000 0.500 NA   NA
 7296182 7296183 SeD_A1115 SeD_A1116     FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7296183 7296184 SeD_A1116 SeD_A1117     TRUE 0.924 42.000 0.750 NA   NA
 7296184 7296185 SeD_A1117 SeD_A1118     TRUE 0.982 0.000 0.400 NA   NA
 7296185 7296186 SeD_A1118 SeD_A1119     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 7296186 7296187 SeD_A1119 SeD_A1120     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 7296187 7296188 SeD_A1120 SeD_A1121     TRUE 0.992 -3.000 0.800 NA   NA
 7296188 7296189 SeD_A1121 SeD_A1122     TRUE 0.970 -16.000 0.600 NA   NA
 7296189 7296190 SeD_A1122 SeD_A1123     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296190 7296191 SeD_A1123 SeD_A1124     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296193 7296194 SeD_A1126 SeD_A1127     FALSE 0.011 268.000 0.000 NA   NA
 7296197 7296198 SeD_A1130 SeD_A1131     FALSE 0.011 271.000 0.000 NA   NA
 7296199 7296200 SeD_A1132 SeD_A1133 pepN pyrD FALSE 0.032 208.000 0.014 1.000 N NA
 7296200 7296201 SeD_A1133 SeD_A1134 pyrD   FALSE 0.134 166.000 0.081 NA   NA
 7296203 7296204 SeD_A1136 SeD_A1137 rlmL   TRUE 0.812 13.000 0.061 1.000   NA
 7296204 7296205 SeD_A1137 SeD_A1138     TRUE 0.723 15.000 0.054 NA   NA
 7296205 7296206 SeD_A1138 SeD_A1139     TRUE 0.991 5.000 0.819 NA   NA
 7296206 7296207 SeD_A1139 SeD_A1140     TRUE 0.986 -3.000 0.531 NA   NA
 7296208 7296209 SeD_A1141 SeD_A1142   fabA FALSE 0.003 431.000 0.000 NA   NA
 7296209 7296210 SeD_A1142 SeD_A1143 fabA   TRUE 0.680 69.000 0.290 1.000 N NA
 7296212 7296213 SeD_A1145 SeD_A1146 ompA   FALSE 0.011 300.000 0.000 1.000 N NA
 7296215 7296216 SeD_A1148 SeD_A1149 yccS   TRUE 0.758 19.000 0.090 NA   NA
 7296218 7296219 SeD_A1151 SeD_A1152 mgsA   FALSE 0.234 95.000 0.055 NA   NA
 7296221 7296222 SeD_A1154 SeD_A1155     FALSE 0.408 58.000 0.094 NA   NA
 7296223 7296224 SeD_A1156 SeD_A1157     TRUE 0.968 17.000 0.625 NA   NA
 7296224 7296225 SeD_A1157 SeD_A1158     FALSE 0.260 49.000 0.007 1.000 N NA
 7296226 7296227 SeD_A1159 SeD_A1160     FALSE 0.126 87.000 0.018 NA   NA
 7296228 7296229 SeD_A1161 SeD_A1162     FALSE 0.153 119.000 0.000 NA   NA
 7296230 7296231 SeD_A1163 SeD_A1164     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7296233 7296234 SeD_A1166 SeD_A1167     TRUE 0.932 17.000 0.333 NA   NA
 7296236 7296237 SeD_A1169 SeD_A1170     FALSE 0.222 80.000 0.000 1.000 N NA
 7296237 7296238 SeD_A1170 SeD_A1171     TRUE 0.998 -7.000 0.857 0.001 Y NA
 7296240 7296241 SeD_A1173 SeD_A1174 hpaC hpaB TRUE 0.941 18.000 0.226 0.001   NA
 7296241 7296242 SeD_A1174 SeD_A1175 hpaB hpaR FALSE 0.082 218.000 0.000 0.001 N NA
 7296243 7296244 SeD_A1176 SeD_A1177   hpaE TRUE 0.990 -3.000 0.510 0.058 N NA
 7296244 7296245 SeD_A1177 SeD_A1178 hpaE hpaD TRUE 0.982 2.000 0.378 1.000   NA
 7296245 7296246 SeD_A1178 SeD_A1179 hpaD hpcD TRUE 0.968 10.000 0.330 1.000   NA
 7296246 7296247 SeD_A1179 SeD_A1180 hpcD hpaH FALSE 0.518 144.000 0.282 1.000 N NA
 7296247 7296248 SeD_A1180 SeD_A1181 hpaH hpaI TRUE 0.975 11.000 0.439 1.000 N NA
 7296248 7296249 SeD_A1181 SeD_A1182 hpaI hpaX TRUE 0.832 73.000 0.175 NA Y NA
 7296249 7296250 SeD_A1182 SeD_A1183 hpaX hpaA TRUE 0.952 10.000 0.233 NA N NA
 7296250 7296251 SeD_A1183 SeD_A1184 hpaA   TRUE 0.809 14.000 0.067 1.000   NA
 7296251 7296252 SeD_A1184 SeD_A1185     FALSE 0.001 1218.000 0.000 NA   NA
 7296253 7296254 SeD_A1186 SeD_A1187     TRUE 0.987 0.000 0.512 NA   NA
 7296255 7296256 SeD_A1188 SeD_A1189     TRUE 0.825 49.000 0.438 NA   NA
 7296256 7296257 SeD_A1189 SeD_A1190     TRUE 0.996 -3.000 0.317 0.003 Y NA
 7296257 7296258 SeD_A1190 SeD_A1191     TRUE 0.992 -10.000 0.298 0.003 Y NA
 7296258 7296259 SeD_A1191 SeD_A1192     FALSE 0.169 133.000 0.000 1.000   NA
 7296260 7296261 SeD_A1193 SeD_A1194   wrbA TRUE 0.904 21.000 0.290 NA   NA
 7296262 7296263 SeD_A1195 SeD_A1196     FALSE 0.116 137.000 0.028 NA   NA
 7296264 7296265 SeD_A1197 SeD_A1198   putA FALSE 0.400 59.000 0.094 NA   NA
 7296266 7296267 SeD_A1199 SeD_A1200   putP FALSE 0.020 229.000 0.000 NA   NA
 7296267 7296268 SeD_A1200 SeD_A1201 putP   FALSE 0.001 893.000 0.000 NA   NA
 7296269 7296270 SeD_A1202 SeD_A1203     FALSE 0.013 286.000 0.000 1.000 N NA
 7296270 7296271 SeD_A1203 SeD_A1204     FALSE 0.008 337.000 0.000 1.000 N NA
 7296272 7296273 SeD_A1205 SeD_A1206     TRUE 0.819 45.000 0.375 NA   NA
 7296273 7296274 SeD_A1206 SeD_A1207     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 7296274 7296275 SeD_A1207 SeD_A1208     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7296275 7296276 SeD_A1208 SeD_A1209     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7296278 7296279 SeD_A1211 SeD_A1212     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7296280 7296281 SeD_A1213 SeD_A1214     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296281 7296282 SeD_A1214 SeD_A1215     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 7296282 7296283 SeD_A1215 SeD_A1216     TRUE 0.857 33.000 0.333 NA   NA
 7296283 7296284 SeD_A1216 SeD_A1217     TRUE 0.883 16.000 0.182 NA   NA
 7296284 7296285 SeD_A1217 SeD_A1218     TRUE 0.958 11.000 0.312 NA   NA
 7296285 7296286 SeD_A1218 SeD_A1219     TRUE 0.841 79.000 0.750 NA   NA
 7296286 7296287 SeD_A1219 SeD_A1220     TRUE 0.991 2.000 0.711 NA   NA
 7296287 7296288 SeD_A1220 SeD_A1221   clpB TRUE 0.827 -3.000 0.039 NA   NA
 7296288 7296289 SeD_A1221 SeD_A1222 clpB   TRUE 0.967 13.000 0.471 NA   NA
 7296289 7296290 SeD_A1222 SeD_A1223     TRUE 0.988 5.000 0.673 NA   NA
 7296290 7296291 SeD_A1223 SeD_A1224     TRUE 0.991 3.000 0.765 NA   NA
 7296291 7296292 SeD_A1224 SeD_A1225     TRUE 0.993 -3.000 0.862 NA   NA
 7296292 7296293 SeD_A1225 SeD_A1226     TRUE 0.941 25.000 0.510 NA   NA
 7296293 7296294 SeD_A1226 SeD_A1227     TRUE 0.973 -36.000 0.863 NA   NA
 7296294 7296295 SeD_A1227 SeD_A1228     TRUE 0.985 5.000 0.552 NA   NA
 7296295 7296296 SeD_A1228 SeD_A1229     TRUE 0.989 -3.000 0.627 NA   NA
 7296296 7296297 SeD_A1229 SeD_A1230     FALSE 0.253 49.000 0.030 NA   NA
 7296297 7296298 SeD_A1230 SeD_A1231     FALSE 0.429 30.000 0.034 NA   NA
 7296299 7296300 SeD_A1232 SeD_A1233     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 7296300 7296301 SeD_A1233 SeD_A1234     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7296301 7296302 SeD_A1234 SeD_A1235     TRUE 0.571 102.000 0.250 NA   NA
 7296302 7296303 SeD_A1235 SeD_A1236     FALSE 0.001 947.000 0.000 NA   NA
 7296303 7296304 SeD_A1236 SeD_A1237     FALSE 0.002 649.000 0.000 NA   NA
 7296304 7296305 SeD_A1237 SeD_A1238     FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 7296305 7296306 SeD_A1238 SeD_A1239     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296306 7296307 SeD_A1239 SeD_A1240     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7296309 7296310 SeD_A1242 SeD_A1243     FALSE 0.221 57.000 0.000 NA   NA
 7296310 7296311 SeD_A1243 SeD_A1244     FALSE 0.002 540.000 0.000 NA   NA
 7296312 7296313 SeD_A1245 SeD_A1246     FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 7296314 7296315 SeD_A1247 SeD_A1248     FALSE 0.253 80.000 0.062 NA   NA
 7296315 7296316 SeD_A1248 SeD_A1249     FALSE 0.344 74.000 0.074 1.000   NA
 7296316 7296317 SeD_A1249 SeD_A1250     TRUE 0.962 -19.000 0.048 0.051 Y NA
 7296319 7296320 SeD_A1252 SeD_A1253     FALSE 0.002 427.000 0.008 NA   NA
 7296322 7296323 SeD_A1255 SeD_A1256     TRUE 0.574 -23.000 0.000 NA   NA
 7296326 7296327 SeD_A1259 SeD_A1260 rcsA   TRUE 0.807 -42.000 0.154 NA   NA
 7296327 7296328 SeD_A1260 SeD_A1261   fliR FALSE 0.028 211.000 0.000 NA   NA
 7296328 7296329 SeD_A1261 SeD_A1262 fliR fliQ TRUE 0.982 9.000 0.028 0.002 Y NA
 7296329 7296330 SeD_A1262 SeD_A1263 fliQ fliP TRUE 0.998 10.000 0.827 0.009 Y NA
 7296330 7296331 SeD_A1263 SeD_A1264 fliP   TRUE 0.992 0.000 0.203 1.000 Y NA
 7296331 7296332 SeD_A1264 SeD_A1265   fliN TRUE 0.996 0.000 0.443 1.000 Y NA
 7296332 7296333 SeD_A1265 SeD_A1266 fliN fliM TRUE 0.993 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 7296333 7296334 SeD_A1266 SeD_A1267 fliM fliL TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 7296334 7296335 SeD_A1267 SeD_A1268 fliL   TRUE 0.785 105.000 0.119 1.000 Y NA
 7296335 7296336 SeD_A1268 SeD_A1269   fliJ TRUE 0.996 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 7296336 7296337 SeD_A1269 SeD_A1270 fliJ fliI TRUE 0.944 22.000 0.073 1.000 Y NA
 7296337 7296338 SeD_A1270 SeD_A1271 fliI fliH TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7296338 7296339 SeD_A1271 SeD_A1272 fliH fliG TRUE 0.975 -7.000 0.005 0.003 Y NA
 7296339 7296340 SeD_A1272 SeD_A1273 fliG fliF TRUE 0.991 -7.000 0.220 0.005 Y NA
 7296341 7296342 SeD_A1274 SeD_A1275   fliE FALSE 0.411 47.000 0.067 NA   NA
 7296343 7296344 SeD_A1276 SeD_A1277     FALSE 0.012 265.000 0.000 NA   NA
 7296344 7296345 SeD_A1277 SeD_A1278     TRUE 0.992 -3.000 0.844 NA   NA
 7296347 7296348 SeD_A1280 SeD_A1281     FALSE 0.436 72.000 0.115 1.000   NA
 7296348 7296349 SeD_A1281 SeD_A1282   fliS TRUE 0.980 0.000 0.324 1.000   NA
 7296349 7296350 SeD_A1282 SeD_A1284 fliS fliD TRUE 0.990 15.000 0.284 0.002 Y NA
 7296351 7296352 SeD_A1283 SeD_A1285     TRUE 0.576 18.000 0.000 NA   NA
 7296352 7296353 SeD_A1285 SeD_A1286     FALSE 0.168 79.000 0.000 NA   NA
 7296353 7296354 SeD_A1286 SeD_A1287   fliA FALSE 0.014 227.000 0.012 NA   NA
 7296354 7296355 SeD_A1287 SeD_A1288 fliA   FALSE 0.165 89.000 0.000 NA   NA
 7296355 7296356 SeD_A1288 SeD_A1289   fliY FALSE 0.101 147.000 0.000 NA   NA
 7296356 7296357 SeD_A1289 SeD_A1290 fliY   TRUE 0.851 154.000 0.469 1.000 Y NA
 7296357 7296358 SeD_A1290 SeD_A1291     TRUE 0.937 21.000 0.050 1.000 Y NA
 7296358 7296359 SeD_A1291 SeD_A1292     TRUE 0.989 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 7296359 7296360 SeD_A1292 SeD_A1293     FALSE 0.045 233.000 0.071 1.000 N NA
 7296361 7296362 SeD_A1294 SeD_A1295     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296363 7296364 SeD_A1296 SeD_A1297 uvrY uvrC TRUE 0.952 -3.000 0.086 0.020 N NA
 7296364 7296365 SeD_A1297 SeD_A1298 uvrC pgsA TRUE 0.671 57.000 0.227 1.000 N NA
 7296365 7296366 SeD_A1298 SeD_A1299 pgsA   FALSE 0.090 152.000 0.000 NA   NA
 7296366 7296367 SeD_A1299 SeD_A1300     FALSE 0.239 53.000 0.000 NA   NA
 7296367 7296368 SeD_A1300 SeD_A1301     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7296368 7296369 SeD_A1301 SeD_A1302     FALSE 0.012 265.000 0.000 NA   NA
 7296369 7296370 SeD_A1302 SeD_A1303     FALSE 0.557 -27.000 0.000 NA   NA
 7296370 7296371 SeD_A1303 SeD_A1304     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 7296371 7296372 SeD_A1304 SeD_A1305     FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 7296372 7296373 SeD_A1305 SeD_A1306     FALSE 0.017 239.000 0.000 NA   NA
 7296376 7296377 SeD_A1309 SeD_A1310 ftnA   FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7296377 7296378 SeD_A1310 SeD_A1311     FALSE 0.498 25.000 0.000 NA   NA
 7296381 7296382 SeD_A1314 SeD_A1315   otsB FALSE 0.002 633.000 0.000 NA   NA
 7296382 7296383 SeD_A1315 SeD_A1316 otsB otsA TRUE 0.968 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 7296385 7296386 SeD_A1318 SeD_A1319     FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 7296386 7296387 SeD_A1319 SeD_A1320   flhC TRUE 0.935 3.000 0.000 0.001   NA
 7296387 7296388 SeD_A1320 SeD_A1321 flhC motA TRUE 0.699 125.000 0.408 1.000   NA
 7296388 7296389 SeD_A1321 SeD_A1322 motA motB TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 7296389 7296390 SeD_A1322 SeD_A1323 motB   TRUE 0.997 11.000 0.913 1.000 Y NA
 7296390 7296391 SeD_A1323 SeD_A1324     TRUE 0.990 21.000 0.447 0.004 Y NA
 7296393 7296394 SeD_A1326 SeD_A1327   cheR FALSE 0.472 161.000 0.037 1.000 Y NA
 7296394 7296395 SeD_A1327 SeD_A1328 cheR cheB TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7296395 7296396 SeD_A1328 SeD_A1329 cheB cheY TRUE 0.991 18.000 0.467 0.012 Y NA
 7296396 7296397 SeD_A1329 SeD_A1330 cheY   TRUE 0.967 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7296397 7296398 SeD_A1330 SeD_A1331   flhB FALSE 0.316 194.000 0.000 1.000 Y NA
 7296398 7296399 SeD_A1331 SeD_A1332 flhB flhA TRUE 0.993 -7.000 0.287 0.009 Y NA
 7296399 7296400 SeD_A1332 SeD_A1333 flhA   TRUE 0.974 0.000 0.158 0.002   NA
 7296403 7296404 SeD_A1336 SeD_A1337   argS FALSE 0.041 189.000 0.002 1.000 N NA
 7296404 7296405 SeD_A1337 SeD_A1338 argS   TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7296406 7296407 SeD_A1339 SeD_A1340     TRUE 0.656 20.000 0.057 NA   NA
 7296408 7296409 SeD_A1341 SeD_A1342     TRUE 0.974 -3.000 0.315 NA   NA
 7296409 7296410 SeD_A1342 SeD_A1343     FALSE 0.539 41.000 0.089 NA   NA
 7296410 7296411 SeD_A1343 SeD_A1344     FALSE 0.509 53.000 0.126 NA   NA
 7296411 7296412 SeD_A1344 SeD_A1345     TRUE 0.911 -3.000 0.089 NA   NA
 7296413 7296414 SeD_A1346 SeD_A1347 aspS ntpA FALSE 0.268 103.000 0.050 1.000 N NA
 7296414 7296415 SeD_A1347 SeD_A1348 ntpA   FALSE 0.433 30.000 0.035 NA   NA
 7296415 7296416 SeD_A1348 SeD_A1349   ruvC TRUE 0.805 37.000 0.277 NA   NA
 7296416 7296417 SeD_A1349 SeD_A1350 ruvC   FALSE 0.437 31.000 0.000 NA N NA
 7296419 7296420 SeD_A1352 SeD_A1353   ruvA FALSE 0.005 360.000 0.000 NA   NA
 7296420 7296421 SeD_A1353 SeD_A1354 ruvA ruvB TRUE 0.997 9.000 0.549 0.001 Y NA
 7296422 7296423 SeD_A1355 SeD_A1356 znuB znuC TRUE 0.998 -3.000 0.755 0.085 Y NA
 7296424 7296425 SeD_A1357 SeD_A1358 znuA   TRUE 0.866 16.000 0.131 1.000 N NA
 7296425 7296426 SeD_A1358 SeD_A1359   msbB TRUE 0.876 117.000 0.299 1.000 Y NA
 7296427 7296428 SeD_A1360 SeD_A1361 pykA   FALSE 0.302 124.000 0.071 1.000 N NA
 7296431 7296432 SeD_A1363 SeD_A1365 edd eda TRUE 0.974 38.000 0.523 1.000 Y NA
 7296434 7296435 SeD_A1367 SeD_A1368     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 7296435 7296436 SeD_A1368 SeD_A1369     FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7296436 7296437 SeD_A1369 SeD_A1370     FALSE 0.064 213.000 0.092 NA   NA
 7296438 7296439 SeD_A1371 SeD_A1372     TRUE 0.963 24.000 0.667 1.000   NA
 7296439 7296440 SeD_A1372 SeD_A1373     TRUE 0.560 108.000 0.222 1.000   NA
 7296441 7296442 SeD_A1374 SeD_A1375     TRUE 0.990 1.000 0.613 1.000   NA
 7296442 7296443 SeD_A1375 SeD_A1376     TRUE 0.973 17.000 0.704 NA   NA
 7296446 7296447 SeD_A1379 SeD_A1380     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA   NA
 7296447 7296448 SeD_A1380 SeD_A1381     FALSE 0.008 291.000 0.000 NA   NA
 7296448 7296449 SeD_A1381 SeD_A1382   recT FALSE 0.278 47.000 0.000 NA   NA
 7296449 7296450 SeD_A1382 SeD_A1383 recT   TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7296450 7296451 SeD_A1383 SeD_A1384     FALSE 0.116 141.000 0.000 NA   NA
 7296451 7296452 SeD_A1384 SeD_A1385     FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7296452 7296453 SeD_A1385 SeD_A1386     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7296453 7296454 SeD_A1386 SeD_A1387     FALSE 0.001 1018.000 0.000 NA   NA
 7296455 7296456 SeD_A1388 SeD_A1389     FALSE 0.278 47.000 0.000 NA   NA
 7296456 7296457 SeD_A1389 SeD_A1390     TRUE 0.899 32.000 0.444 NA   NA
 7296461 7296462 SeD_A1394 SeD_A1395     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7296462 7296463 SeD_A1395 SeD_A1396     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296463 7296464 SeD_A1396 SeD_A1397     FALSE 0.139 130.000 0.000 NA   NA
 7296464 7296465 SeD_A1397 SeD_A1398     FALSE 0.168 97.000 0.000 NA   NA
 7296465 7296466 SeD_A1398 SeD_A1399     FALSE 0.013 261.000 0.000 NA   NA
 7296468 7296469 SeD_A1401 SeD_A1402     TRUE 0.650 -13.000 0.000 NA   NA
 7296469 7296470 SeD_A1402 SeD_A1403     TRUE 0.849 -3.000 0.000 1.000   NA
 7296470 7296471 SeD_A1403 SeD_A1404     FALSE 0.030 208.000 0.000 NA   NA
 7296471 7296472 SeD_A1404 SeD_A1405     FALSE 0.508 -46.000 0.000 NA   NA
 7296472 7296473 SeD_A1405 SeD_A1406     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296473 7296474 SeD_A1406 SeD_A1407     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296474 7296475 SeD_A1407 SeD_A1408     TRUE 0.576 -49.000 0.000 1.000   NA
 7296475 7296476 SeD_A1408 SeD_A1409     TRUE 0.770 91.000 0.537 NA   NA
 7296476 7296477 SeD_A1409 SeD_A1410     TRUE 0.909 -7.000 0.152 NA   NA
 7296477 7296478 SeD_A1410 SeD_A1411     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7296478 7296479 SeD_A1411 SeD_A1412     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296479 7296480 SeD_A1412 SeD_A1413     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7296480 7296481 SeD_A1413 SeD_A1414     FALSE 0.285 46.000 0.000 NA   NA
 7296481 7296482 SeD_A1414 SeD_A1415     FALSE 0.199 63.000 0.000 NA   NA
 7296482 7296483 SeD_A1415 SeD_A1416     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7296483 7296484 SeD_A1416 SeD_A1417     TRUE 0.980 -3.000 0.400 NA   NA
 7296484 7296485 SeD_A1417 SeD_A1418     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7296487 7296488 SeD_A1420 SeD_A1421     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7296488 7296489 SeD_A1421 SeD_A1422     FALSE 0.159 108.000 0.000 NA   NA
 7296489 7296490 SeD_A1422 SeD_A1423     FALSE 0.181 72.000 0.000 NA   NA
 7296490 7296491 SeD_A1423 SeD_A1425     FALSE 0.150 122.000 0.000 NA   NA
 7296491 7296492 SeD_A1425 SeD_A1426     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7296492 7296493 SeD_A1426 SeD_A1427     FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 7296493 7296494 SeD_A1427 SeD_A1428     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296497 7296498 SeD_A1431 SeD_A1432     FALSE 0.001 954.000 0.000 NA   NA
 7296498 7296499 SeD_A1432 SeD_A1433     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296500 7296501 SeD_A1434 SeD_A1435     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296502 7296503 SeD_A1436 SeD_A1437     FALSE 0.088 153.000 0.000 NA   NA
 7296503 7296504 SeD_A1437 SeD_A1438     FALSE 0.193 65.000 0.000 NA   NA
 7296505 7296506 SeD_A1439 SeD_A1440     FALSE 0.084 155.000 0.000 NA   NA
 7296506 7296507 SeD_A1440 SeD_A1441     FALSE 0.514 -43.000 0.000 NA   NA
 7296507 7296508 SeD_A1441 SeD_A1442     FALSE 0.001 784.000 0.000 NA   NA
 7296508 7296509 SeD_A1442 SeD_A1443     FALSE 0.538 -33.000 0.000 NA   NA
 7296510 7296511 SeD_A1444 SeD_A1445     FALSE 0.002 488.000 0.000 NA   NA
 7296511 7296512 SeD_A1445 SeD_A1446     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7296512 7296513 SeD_A1446 SeD_A1447     FALSE 0.001 1442.000 0.000 NA   NA
 7296514 7296515 SeD_A1448 SeD_A1449     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296515 7296516 SeD_A1449 SeD_A1450     TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7296518 7296519 SeD_A1452 SeD_A1453     FALSE 0.157 111.000 0.000 NA   NA
 7296520 7296521 SeD_A1454 SeD_A1455     FALSE 0.004 382.000 0.000 NA   NA
 7296521 7296522 SeD_A1455 SeD_A1456     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 7296523 7296524 SeD_A1457 SeD_A1458     FALSE 0.177 74.000 0.000 NA   NA
 7296524 7296525 SeD_A1458 SeD_A1459     FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7296525 7296526 SeD_A1459 SeD_A1460     FALSE 0.387 33.000 0.000 NA   NA
 7296526 7296527 SeD_A1460 SeD_A1461   pphA TRUE 0.576 18.000 0.000 NA   NA
 7296528 7296529 SeD_A1462 SeD_A1463     FALSE 0.410 168.000 0.353 NA   NA
 7296529 7296530 SeD_A1463 SeD_A1464     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7296530 7296531 SeD_A1464 SeD_A1465   yebU FALSE 0.550 -28.000 0.000 NA   NA
 7296531 7296532 SeD_A1465 SeD_A1466 yebU   TRUE 0.720 78.000 0.420 NA   NA
 7296532 7296533 SeD_A1466 SeD_A1467     TRUE 0.973 -31.000 0.840 NA   NA
 7296534 7296535 SeD_A1468 SeD_A1469   proQ TRUE 0.741 98.000 0.081 NA Y NA
 7296535 7296536 SeD_A1469 SeD_A1470 proQ prc TRUE 0.914 20.000 0.304 NA N NA
 7296536 7296537 SeD_A1470 SeD_A1471 prc   FALSE 0.114 193.000 0.042 0.017 N NA
 7296541 7296542 SeD_A1475 SeD_A1476     TRUE 0.773 71.000 0.500 NA   NA
 7296542 7296543 SeD_A1476 SeD_A1477     FALSE 0.021 226.000 0.000 NA   NA
 7296543 7296544 SeD_A1477 SeD_A1478   cspC FALSE 0.002 463.000 0.000 NA   NA
 7296544 7296545 SeD_A1478 SeD_A1479 cspC   FALSE 0.033 220.000 0.000 1.000 N NA
 7296545 7296546 SeD_A1479 SeD_A1480   rrmA FALSE 0.280 66.000 0.045 1.000   NA
 7296547 7296548 SeD_A1481 SeD_A1483     FALSE 0.003 410.000 0.000 NA   NA
 7296548 7296549 SeD_A1483 SeD_A1484   manZ TRUE 0.876 59.000 0.755 NA   NA
 7296549 7296550 SeD_A1484 SeD_A1485 manZ manY TRUE 0.997 13.000 0.939 0.014 Y NA
 7296550 7296551 SeD_A1485 SeD_A1486 manY manX TRUE 0.887 53.000 0.106 0.014 Y NA
 7296555 7296556 SeD_A1490 SeD_A1491     FALSE 0.145 264.000 0.409 1.000 N NA
 7296556 7296557 SeD_A1491 SeD_A1492   pabB TRUE 0.935 4.000 0.116 1.000 N NA
 7296560 7296561 SeD_A1495 SeD_A1496     FALSE 0.434 58.000 0.082 1.000 N NA
 7296561 7296562 SeD_A1496 SeD_A1497   slp FALSE 0.218 72.000 0.024 1.000 N NA
 7296562 7296563 SeD_A1497 SeD_A1498 slp   FALSE 0.148 205.000 0.169 1.000 N NA
 7296563 7296564 SeD_A1498 SeD_A1499     FALSE 0.519 -41.000 0.000 NA   NA
 7296564 7296565 SeD_A1499 SeD_A1500   rnd FALSE 0.485 26.000 0.000 NA   NA
 7296566 7296567 SeD_A1501 SeD_A1502 minE minD TRUE 0.997 4.000 0.618 NA Y NA
 7296567 7296568 SeD_A1502 SeD_A1503 minD minC TRUE 0.984 24.000 0.466 1.000 Y NA
 7296569 7296570 SeD_A1504 SeD_A1505     FALSE 0.350 50.000 0.056 NA   NA
 7296570 7296571 SeD_A1505 SeD_A1506     FALSE 0.327 78.000 0.088 NA   NA
 7296571 7296572 SeD_A1506 SeD_A1507     FALSE 0.005 352.000 0.000 NA   NA
 7296575 7296576 SeD_A1510 SeD_A1511     FALSE 0.180 109.000 0.036 NA N NA
 7296576 7296577 SeD_A1511 SeD_A1512   nhaB TRUE 0.787 142.000 0.723 1.000 N NA
 7296580 7296581 SeD_A1515 SeD_A1516   dadX TRUE 0.910 14.000 0.168 1.000 N NA
 7296582 7296583 SeD_A1517 SeD_A1518   ldcA FALSE 0.367 97.000 0.103 NA N NA
 7296589 7296590 SeD_A1524 SeD_A1525   cydB FALSE 0.003 497.000 0.000 1.000 N NA
 7296590 7296591 SeD_A1525 SeD_A1526 cydB   TRUE 0.986 12.000 0.158 0.048 Y NA
 7296591 7296592 SeD_A1526 SeD_A1527     FALSE 0.176 75.000 0.000 NA   NA
 7296592 7296593 SeD_A1527 SeD_A1528     TRUE 0.898 -3.000 0.077 NA   NA
 7296593 7296594 SeD_A1528 SeD_A1529   hybD TRUE 0.845 -10.000 0.096 NA   NA
 7296594 7296595 SeD_A1529 SeD_A1530 hybD cybH TRUE 0.991 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 7296595 7296596 SeD_A1530 SeD_A1531 cybH   TRUE 0.987 19.000 0.355 0.047 Y NA
 7296596 7296597 SeD_A1531 SeD_A1532     TRUE 0.998 -3.000 0.611 0.002 Y NA
 7296597 7296598 SeD_A1532 SeD_A1533     FALSE 0.002 575.000 0.000 NA   NA
 7296598 7296599 SeD_A1533 SeD_A1534     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7296599 7296600 SeD_A1534 SeD_A1535     TRUE 0.923 39.000 0.667 NA   NA
 7296602 7296603 SeD_A1537 SeD_A1538 engD pth TRUE 0.825 117.000 0.184 1.000 Y NA
 7296605 7296606 SeD_A1540 SeD_A1541   prs FALSE 0.185 125.000 0.027 1.000 N NA
 7296608 7296609 SeD_A1543 SeD_A1544 ipk lolB TRUE 0.856 0.000 0.024 1.000 N NA
 7296610 7296611 SeD_A1545 SeD_A1546   hemA FALSE 0.064 168.000 0.000 NA   NA
 7296611 7296612 SeD_A1546 SeD_A1547 hemA prfA TRUE 0.791 41.000 0.171 0.042 N NA
 7296612 7296613 SeD_A1547 SeD_A1548 prfA   TRUE 0.995 0.000 0.229 0.042 Y NA
 7296613 7296614 SeD_A1548 SeD_A1549     TRUE 0.902 9.000 0.109 NA   NA
 7296614 7296615 SeD_A1549 SeD_A1550   sirB1 TRUE 0.952 4.000 0.195 NA   NA
 7296615 7296616 SeD_A1550 SeD_A1551 sirB1 kdsA TRUE 0.607 38.000 0.089 1.000   NA
 7296621 7296622 SeD_A1556 SeD_A1557 narL   TRUE 0.996 -7.000 0.521 0.014 Y NA
 7296623 7296624 SeD_A1558 SeD_A1559   narG FALSE 0.005 388.000 0.000 1.000 N NA
 7296624 7296625 SeD_A1559 SeD_A1560 narG narH TRUE 0.997 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 7296625 7296626 SeD_A1560 SeD_A1561 narH narJ TRUE 0.998 -3.000 0.588 0.004 Y NA
 7296626 7296627 SeD_A1561 SeD_A1562 narJ narI TRUE 0.998 0.000 0.500 0.004 Y NA
 7296630 7296631 SeD_A1565 SeD_A1566     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7296631 7296632 SeD_A1566 SeD_A1567     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7296632 7296633 SeD_A1567 SeD_A1568     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296633 7296634 SeD_A1568 SeD_A1569     FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7296634 7296635 SeD_A1569 SeD_A1570     TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7296635 7296636 SeD_A1570 SeD_A1571     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7296636 7296637 SeD_A1571 SeD_A1572   purU FALSE 0.133 133.000 0.000 NA   NA
 7296637 7296638 SeD_A1572 SeD_A1573 purU   TRUE 0.640 51.000 0.200 NA   NA
 7296639 7296640 SeD_A1574 SeD_A1575     FALSE 0.251 91.000 0.048 1.000   NA
 7296640 7296641 SeD_A1575 SeD_A1576   galU FALSE 0.208 203.000 0.235 1.000 N NA
 7296645 7296646 SeD_A1580 SeD_A1581     FALSE 0.001 764.000 0.000 NA N NA
 7296646 7296647 SeD_A1581 SeD_A1582   oppB TRUE 0.837 122.000 0.151 0.046 Y NA
 7296647 7296648 SeD_A1582 SeD_A1583 oppB oppC TRUE 0.997 15.000 0.870 0.046 Y NA
 7296648 7296649 SeD_A1583 SeD_A1584 oppC oppD TRUE 0.994 12.000 0.554 1.000 Y NA
 7296649 7296650 SeD_A1584 SeD_A1585 oppD oppF TRUE 0.997 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 7296650 7296651 SeD_A1585 SeD_A1586 oppF   TRUE 0.816 48.000 0.042 1.000 Y NA
 7296652 7296653 SeD_A1587 SeD_A1588   cls FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7296657 7296658 SeD_A1592 SeD_A1593   ispZ FALSE 0.226 170.000 0.167 NA N NA
 7296658 7296659 SeD_A1593 SeD_A1594 ispZ   FALSE 0.324 57.000 0.061 NA   NA
 7296659 7296660 SeD_A1594 SeD_A1595     TRUE 0.807 26.000 0.169 NA   NA
 7296662 7296663 SeD_A1597 SeD_A1598     TRUE 0.886 20.000 0.115 0.002   NA
 7296663 7296664 SeD_A1598 SeD_A1599     TRUE 0.579 74.000 0.115 0.002   NA
 7296664 7296665 SeD_A1599 SeD_A1600     FALSE 0.165 90.000 0.000 NA   NA
 7296665 7296666 SeD_A1600 SeD_A1601   trpA FALSE 0.002 480.000 0.000 NA   NA
 7296666 7296667 SeD_A1601 SeD_A1602 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 7296667 7296668 SeD_A1602 SeD_A1603 trpB   TRUE 0.993 10.000 0.221 0.001 Y NA
 7296668 7296669 SeD_A1603 SeD_A1604   trpD TRUE 0.993 4.000 0.293 1.000 Y NA
 7296669 7296670 SeD_A1604 SeD_A1605 trpD trpE TRUE 0.987 0.000 0.010 0.001 Y NA
 7296671 7296672 SeD_A1607 SeD_A1608     TRUE 0.962 8.000 0.281 NA   NA
 7296672 7296673 SeD_A1608 SeD_A1609   rluB TRUE 0.729 101.000 0.075 NA Y NA
 7296674 7296675 SeD_A1610 SeD_A1611 cobO   TRUE 0.888 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7296678 7296679 SeD_A1614 SeD_A1615 topA cysB FALSE 0.003 411.000 0.008 1.000 N NA
 7296679 7296680 SeD_A1615 SeD_A1616 cysB   FALSE 0.008 293.000 0.000 NA   NA
 7296680 7296681 SeD_A1616 SeD_A1617     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7296681 7296682 SeD_A1617 SeD_A1618   acnA FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7296684 7296685 SeD_A1620 SeD_A1621     FALSE 0.275 150.000 0.143 NA   NA
 7296685 7296686 SeD_A1621 SeD_A1622     TRUE 0.984 7.000 0.576 NA   NA
 7296688 7296689 SeD_A1623 SeD_A1625 pyrF   TRUE 0.892 0.000 0.045 1.000 N NA
 7296690 7296691 SeD_A1626 SeD_A1627     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 7296691 7296692 SeD_A1627 SeD_A1628     FALSE 0.422 87.000 0.146 NA   NA
 7296692 7296693 SeD_A1628 SeD_A1629     FALSE 0.285 122.000 0.083 NA   NA
 7296693 7296694 SeD_A1629 SeD_A1630   rnb FALSE 0.020 253.000 0.000 1.000 N NA
 7296694 7296695 SeD_A1630 SeD_A1631 rnb   FALSE 0.165 89.000 0.000 NA   NA
 7296695 7296696 SeD_A1631 SeD_A1632   fabI FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 7296696 7296697 SeD_A1632 SeD_A1633 fabI   FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 7296698 7296699 SeD_A1634 SeD_A1635     FALSE 0.002 467.000 0.000 NA   NA
 7296700 7296701 SeD_A1636 SeD_A1637 sapF sapD TRUE 0.998 2.000 0.684 0.015 Y NA
 7296701 7296702 SeD_A1637 SeD_A1638 sapD sapC TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 7296702 7296703 SeD_A1638 SeD_A1639 sapC sapB TRUE 0.989 -13.000 0.284 0.046 Y NA
 7296703 7296704 SeD_A1639 SeD_A1640 sapB   TRUE 0.980 -3.000 0.264 0.046 N NA
 7296704 7296705 SeD_A1640 SeD_A1641   pspF TRUE 0.718 112.000 0.402 1.000 N NA
 7296706 7296707 SeD_A1642 SeD_A1643 pspA pspB TRUE 0.870 60.000 0.739 NA   NA
 7296707 7296708 SeD_A1643 SeD_A1644 pspB pspC TRUE 0.994 0.000 0.913 NA   NA
 7296708 7296709 SeD_A1644 SeD_A1645 pspC pspD TRUE 0.823 23.000 0.167 NA   NA
 7296709 7296710 SeD_A1645 SeD_A1646 pspD   FALSE 0.421 76.000 0.133 NA   NA
 7296710 7296711 SeD_A1646 SeD_A1647     FALSE 0.067 149.000 0.013 NA   NA
 7296711 7296712 SeD_A1647 SeD_A1648     TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA   NA
 7296712 7296713 SeD_A1648 SeD_A1649     FALSE 0.279 148.000 0.137 NA   NA
 7296719 7296720 SeD_A1655 SeD_A1656     FALSE 0.014 276.000 0.000 1.000   NA
 7296722 7296723 SeD_A1658 SeD_A1659     FALSE 0.033 204.000 0.000 NA   NA
 7296724 7296725 SeD_A1660 SeD_A1661     FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 7296726 7296727 SeD_A1662 SeD_A1663     TRUE 0.715 75.000 0.400 NA   NA
 7296727 7296728 SeD_A1663 SeD_A1664     FALSE 0.468 27.000 0.000 NA   NA
 7296728 7296729 SeD_A1664 SeD_A1665     FALSE 0.123 138.000 0.000 NA   NA
 7296730 7296731 SeD_A1666 SeD_A1667     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7296732 7296733 SeD_A1668 SeD_A1669     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296736 7296737 SeD_A1672 SeD_A1673 uspE fnr TRUE 0.896 151.000 0.619 1.000 Y NA
 7296737 7296738 SeD_A1673 SeD_A1674 fnr   FALSE 0.054 196.000 0.000 1.000 N NA
 7296739 7296740 SeD_A1675 SeD_A1676     FALSE 0.017 239.000 0.000 NA   NA
 7296740 7296741 SeD_A1676 SeD_A1677     TRUE 0.724 11.000 0.000 NA   NA
 7296741 7296742 SeD_A1677 SeD_A1678   zntB FALSE 0.190 146.000 0.019 0.091 N NA
 7296742 7296743 SeD_A1678 SeD_A1679 zntB   FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 7296743 7296744 SeD_A1679 SeD_A1680     FALSE 0.179 73.000 0.000 NA   NA
 7296745 7296746 SeD_A1681 SeD_A1682     FALSE 0.175 52.000 0.012 NA   NA
 7296747 7296748 SeD_A1683 SeD_A1684     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7296752 7296753 SeD_A1689 SeD_A1690     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7296754 7296755 SeD_A1691 SeD_A1692     FALSE 0.121 111.000 0.012 NA N NA
 7296756 7296757 SeD_A1693 SeD_A1694     TRUE 0.898 0.000 0.068 NA   NA
 7296757 7296758 SeD_A1694 SeD_A1695     TRUE 0.988 8.000 0.726 NA   NA
 7296758 7296759 SeD_A1695 SeD_A1696     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7296761 7296762 SeD_A1698 SeD_A1699 hrpA   FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7296762 7296763 SeD_A1699 SeD_A1700     FALSE 0.154 117.000 0.000 NA   NA
 7296764 7296765 SeD_A1701 SeD_A1702     FALSE 0.151 121.000 0.000 NA   NA
 7296765 7296766 SeD_A1702 SeD_A1703     FALSE 0.002 464.000 0.000 NA   NA
 7296766 7296767 SeD_A1703 SeD_A1704     FALSE 0.126 137.000 0.000 NA   NA
 7296767 7296768 SeD_A1704 SeD_A1705     TRUE 0.981 -3.000 0.048 1.000 Y NA
 7296768 7296769 SeD_A1705 SeD_A1706     TRUE 0.924 25.000 0.044 1.000 Y NA
 7296769 7296770 SeD_A1706 SeD_A1707     TRUE 0.772 7.000 0.000 NA   NA
 7296770 7296771 SeD_A1707 SeD_A1708     TRUE 0.772 7.000 0.000 NA   NA
 7296776 7296777 SeD_A1713 SeD_A1714     FALSE 0.001 763.000 0.000 NA   NA
 7296777 7296778 SeD_A1714 SeD_A1715     TRUE 0.917 32.000 0.531 NA   NA
 7296778 7296779 SeD_A1715 SeD_A1716     FALSE 0.206 169.000 0.122 1.000 N NA
 7296781 7296782 SeD_A1718 SeD_A1719     TRUE 0.565 49.000 0.143 NA   NA
 7296782 7296783 SeD_A1719 SeD_A1720   mdoD FALSE 0.020 256.000 0.000 1.000 N NA
 7296783 7296784 SeD_A1720 SeD_A1721 mdoD   FALSE 0.032 205.000 0.000 NA   NA
 7296784 7296785 SeD_A1721 SeD_A1722     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7296786 7296787 SeD_A1723 SeD_A1724     TRUE 0.863 0.000 0.000 1.000   NA
 7296787 7296788 SeD_A1724 SeD_A1725     TRUE 0.971 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7296788 7296789 SeD_A1725 SeD_A1726     TRUE 0.963 12.000 0.000 1.000 Y NA
 7296789 7296790 SeD_A1726 SeD_A1727     TRUE 0.726 132.000 0.500 1.000   NA
 7296790 7296791 SeD_A1727 SeD_A1728     TRUE 0.970 14.000 0.500 1.000   NA
 7296791 7296792 SeD_A1728 SeD_A1729     TRUE 0.987 11.000 0.148 0.014 Y NA
 7296792 7296793 SeD_A1729 SeD_A1730     TRUE 0.987 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 7296796 7296797 SeD_A1733 SeD_A1734   tehB TRUE 0.907 -13.000 0.175 1.000   NA
 7296797 7296798 SeD_A1734 SeD_A1735 tehB   FALSE 0.175 156.000 0.088 NA   NA
 7296800 7296801 SeD_A1737 SeD_A1738     FALSE 0.209 79.000 0.032 1.000   NA
 7296802 7296803 SeD_A1739 SeD_A1740   sifB FALSE 0.011 274.000 0.000 NA   NA
 7296804 7296805 SeD_A1741 SeD_A1742     FALSE 0.002 522.000 0.000 NA   NA
 7296805 7296806 SeD_A1742 SeD_A1743     FALSE 0.174 136.000 0.000 1.000 N NA
 7296806 7296807 SeD_A1743 SeD_A1744     FALSE 0.209 115.000 0.000 1.000 N NA
 7296807 7296808 SeD_A1744 SeD_A1745     FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 7296809 7296810 SeD_A1746 SeD_A1747     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296810 7296811 SeD_A1747 SeD_A1748     TRUE 0.939 5.000 0.167 NA   NA
 7296813 7296814 SeD_A1750 SeD_A1751   yncA TRUE 0.901 0.000 0.070 NA   NA
 7296815 7296816 SeD_A1752 SeD_A1753     FALSE 0.008 334.000 0.000 1.000   NA
 7296818 7296819 SeD_A1755 SeD_A1756     FALSE 0.464 145.000 0.273 NA   NA
 7296821 7296822 SeD_A1758 SeD_A1759     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7296822 7296823 SeD_A1759 SeD_A1760     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 7296824 7296825 SeD_A1761 SeD_A1762   narV FALSE 0.202 106.000 0.000 1.000   NA
 7296825 7296826 SeD_A1762 SeD_A1763 narV narW TRUE 0.997 -3.000 0.429 0.004 Y NA
 7296826 7296827 SeD_A1763 SeD_A1764 narW narY TRUE 0.999 0.000 0.714 0.004 Y NA
 7296827 7296828 SeD_A1764 SeD_A1765 narY   TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 7296828 7296829 SeD_A1765 SeD_A1766     TRUE 0.800 92.000 0.556 1.000 N NA
 7296829 7296830 SeD_A1766 SeD_A1767     FALSE 0.044 203.000 0.000 1.000   NA
 7296832 7296833 SeD_A1769 SeD_A1770     FALSE 0.206 84.000 0.000 1.000   NA
 7296833 7296834 SeD_A1770 SeD_A1771     FALSE 0.004 523.000 0.000 0.090   NA
 7296835 7296836 SeD_A1772 SeD_A1774 fdnG fdnH TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7296836 7296837 SeD_A1774 SeD_A1775 fdnH   TRUE 0.994 -7.000 0.333 0.001 Y NA
 7296838 7296839 SeD_A1776 SeD_A1777     FALSE 0.012 282.000 0.000 1.000   NA
 7296839 7296840 SeD_A1777 SeD_A1778   rpsV TRUE 0.632 177.000 0.750 1.000   NA
 7296840 7296841 SeD_A1778 SeD_A1779 rpsV   TRUE 0.786 95.000 0.571 NA   NA
 7296842 7296843 SeD_A1780 SeD_A1781   hdeB FALSE 0.005 350.000 0.000 NA   NA
 7296843 7296844 SeD_A1781 SeD_A1782 hdeB   FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7296844 7296845 SeD_A1782 SeD_A1783   treZ FALSE 0.141 129.000 0.000 NA   NA
 7296845 7296846 SeD_A1783 SeD_A1784 treZ treY TRUE 0.995 -3.000 0.263 0.003 Y NA
 7296846 7296847 SeD_A1784 SeD_A1785 treY glgX TRUE 0.815 57.000 0.015 0.003 Y NA
 7296848 7296849 SeD_A1786 SeD_A1787   nhaC TRUE 0.749 13.000 0.000 1.000 N NA
 7296849 7296850 SeD_A1787 SeD_A1788 nhaC   TRUE 0.611 144.000 0.385 1.000 N NA
 7296853 7296854 SeD_A1791 SeD_A1792   pqaA FALSE 0.128 136.000 0.000 NA   NA
 7296854 7296855 SeD_A1792 SeD_A1793 pqaA   FALSE 0.056 177.000 0.000 NA   NA
 7296855 7296856 SeD_A1793 SeD_A1794     TRUE 0.651 -25.000 0.000 1.000 N NA
 7296857 7296858 SeD_A1795 SeD_A1796     FALSE 0.072 166.000 0.000 NA N NA
 7296859 7296860 SeD_A1797 SeD_A1798     TRUE 0.998 3.000 0.611 0.002 Y NA
 7296860 7296861 SeD_A1798 SeD_A1799   cybH TRUE 0.984 -49.000 0.355 0.046 Y NA
 7296861 7296862 SeD_A1799 SeD_A1800 cybH hybD TRUE 0.989 6.000 0.177 1.000 Y NA
 7296862 7296863 SeD_A1800 SeD_A1801 hybD hypC TRUE 0.970 0.000 0.250 NA   NA
 7296863 7296864 SeD_A1801 SeD_A1802 hypC   TRUE 0.973 -3.000 0.308 NA   NA
 7296864 7296865 SeD_A1802 SeD_A1803     TRUE 0.974 18.000 0.769 NA   NA
 7296865 7296866 SeD_A1803 SeD_A1804     TRUE 0.664 -12.000 0.000 NA   NA
 7296866 7296867 SeD_A1804 SeD_A1805   hypA TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7296870 7296871 SeD_A1808 SeD_A1809     FALSE 0.023 221.000 0.000 NA   NA
 7296871 7296872 SeD_A1809 SeD_A1810     TRUE 0.837 0.000 0.037 NA   NA
 7296872 7296873 SeD_A1810 SeD_A1811     FALSE 0.194 73.000 0.016 1.000 N NA
 7296874 7296875 SeD_A1812 SeD_A1813     FALSE 0.154 116.000 0.027 NA N NA
 7296877 7296878 SeD_A1815 SeD_A1816 marR   TRUE 0.993 20.000 0.667 0.046 Y NA
 7296878 7296879 SeD_A1816 SeD_A1817     TRUE 0.946 29.000 0.667 NA   NA
 7296881 7296882 SeD_A1819 SeD_A1820     TRUE 0.747 -6.000 0.000 NA   NA
 7296882 7296883 SeD_A1820 SeD_A1821     FALSE 0.023 221.000 0.000 NA   NA
 7296886 7296887 SeD_A1824 SeD_A1825     FALSE 0.090 152.000 0.000 NA   NA
 7296888 7296889 SeD_A1826 SeD_A1827     FALSE 0.214 130.000 0.047 1.000   NA
 7296889 7296890 SeD_A1827 SeD_A1828     FALSE 0.371 181.000 0.375 NA   NA
 7296893 7296894 SeD_A1831 SeD_A1832     FALSE 0.167 93.000 0.000 NA   NA
 7296894 7296895 SeD_A1832 SeD_A1833     TRUE 0.819 1.000 0.000 NA   NA
 7296895 7296896 SeD_A1833 SeD_A1834     TRUE 0.724 11.000 0.000 NA   NA
 7296896 7296897 SeD_A1834 SeD_A1835     FALSE 0.190 122.000 0.000 1.000   NA
 7296898 7296899 SeD_A1836 SeD_A1837   speG FALSE 0.463 36.000 0.055 NA   NA
 7296901 7296902 SeD_A1839 SeD_A1840     FALSE 0.420 157.000 0.304 NA   NA
 7296902 7296903 SeD_A1840 SeD_A1841     TRUE 0.908 99.000 0.231 0.001 Y NA
 7296903 7296904 SeD_A1841 SeD_A1842   dmsB_1 TRUE 0.997 11.000 0.667 0.046 Y NA
 7296904 7296905 SeD_A1842 SeD_A1843 dmsB_1 dmsC TRUE 0.855 2.000 0.000 1.000   NA
 7296905 7296906 SeD_A1843 SeD_A1844 dmsC   FALSE 0.374 43.000 0.000 1.000   NA
 7296906 7296907 SeD_A1844 SeD_A1845     FALSE 0.009 305.000 0.000 1.000   NA
 7296907 7296908 SeD_A1845 SeD_A1846     TRUE 0.935 29.000 0.403 0.045 N NA
 7296908 7296909 SeD_A1846 SeD_A1847     TRUE 0.977 10.000 0.313 0.045 N NA
 7296909 7296910 SeD_A1847 SeD_A1848     TRUE 0.999 0.000 0.903 0.089 Y NA
 7296910 7296911 SeD_A1848 SeD_A1849     FALSE 0.202 172.000 0.079 0.089 N NA
 7296912 7296913 SeD_A1850 SeD_A1851 bioD2 mic TRUE 0.705 126.000 0.455 NA N NA
 7296913 7296914 SeD_A1851 SeD_A1852 mic   TRUE 0.891 128.000 0.408 NA Y NA
 7296915 7296916 SeD_A1853 SeD_A1854     FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 7296916 7296917 SeD_A1854 SeD_A1855     FALSE 0.258 50.000 0.000 NA   NA
 7296917 7296918 SeD_A1855 SeD_A1856     FALSE 0.192 100.000 0.042 NA   NA
 7296919 7296920 SeD_A1857 SeD_A1858     TRUE 0.997 -13.000 0.869 0.076 Y NA
 7296920 7296921 SeD_A1858 SeD_A1859     FALSE 0.265 112.000 0.071 NA   NA
 7296923 7296924 SeD_A1861 SeD_A1862 pntB pntA TRUE 0.998 11.000 0.745 0.001 Y NA
 7296925 7296926 SeD_A1863 SeD_A1864     FALSE 0.008 299.000 0.000 NA   NA
 7296928 7296929 SeD_A1867 SeD_A1868     FALSE 0.164 87.000 0.000 NA   NA
 7296931 7296932 SeD_A1870 SeD_A1871     FALSE 0.097 159.000 0.000 1.000   NA
 7296932 7296933 SeD_A1871 SeD_A1872     FALSE 0.198 111.000 0.000 1.000   NA
 7296933 7296934 SeD_A1872 SeD_A1873   tus FALSE 0.558 76.000 0.200 1.000   NA
 7296935 7296936 SeD_A1874 SeD_A1875 fumC fumB FALSE 0.556 168.000 0.000 0.001 Y NA
 7296937 7296938 SeD_A1876 SeD_A1877 manA   TRUE 0.841 103.000 0.778 NA   NA
 7296938 7296939 SeD_A1877 SeD_A1878     FALSE 0.043 190.000 0.000 NA   NA
 7296939 7296940 SeD_A1878 SeD_A1879   add FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 7296942 7296943 SeD_A1881 SeD_A1882     FALSE 0.477 56.000 0.120 NA   NA
 7296943 7296944 SeD_A1882 SeD_A1883   rnfA FALSE 0.440 77.000 0.148 NA   NA
 7296944 7296945 SeD_A1883 SeD_A1884 rnfA rnfB TRUE 0.998 0.000 0.564 0.046 Y NA
 7296945 7296946 SeD_A1884 SeD_A1885 rnfB   TRUE 0.996 -7.000 0.537 0.046 Y NA
 7296946 7296947 SeD_A1885 SeD_A1886   rnfD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.046 Y NA
 7296947 7296948 SeD_A1886 SeD_A1887 rnfD   TRUE 0.999 4.000 0.924 0.046 Y NA
 7296948 7296949 SeD_A1887 SeD_A1888     TRUE 0.999 3.000 0.908 0.046 Y NA
 7296949 7296950 SeD_A1888 SeD_A1889   nth TRUE 0.943 0.000 0.109 1.000 N NA
 7296950 7296951 SeD_A1889 SeD_A1890 nth tppB FALSE 0.002 602.000 0.000 1.000 N NA
 7296951 7296952 SeD_A1890 SeD_A1891 tppB gst TRUE 0.686 104.000 0.344 1.000 N NA
 7296953 7296954 SeD_A1892 SeD_A1893     FALSE 0.285 46.000 0.000 NA   NA
 7296954 7296955 SeD_A1893 SeD_A1894   tyrS FALSE 0.206 60.000 0.000 NA   NA
 7296955 7296956 SeD_A1894 SeD_A1895 tyrS pdxH FALSE 0.250 127.000 0.054 1.000 N NA
 7296956 7296957 SeD_A1895 SeD_A1896 pdxH   FALSE 0.212 59.000 0.034 NA   NA
 7296957 7296958 SeD_A1896 SeD_A1897   anmK FALSE 0.171 94.000 0.034 NA   NA
 7296961 7296962 SeD_A1900 SeD_A1901     TRUE 0.981 3.000 0.412 NA   NA
 7296962 7296963 SeD_A1901 SeD_A1902     TRUE 0.919 0.000 0.088 NA   NA
 7296964 7296965 SeD_A1903 SeD_A1904 sodC   FALSE 0.209 80.000 0.033 1.000   NA
 7296965 7296966 SeD_A1904 SeD_A1905     FALSE 0.301 51.000 0.045 NA   NA
 7296967 7296968 SeD_A1906 SeD_A1907     TRUE 0.762 59.000 0.362 1.000 N NA
 7296968 7296969 SeD_A1907 SeD_A1908   gloA FALSE 0.321 69.000 0.057 1.000 N NA
 7296969 7296970 SeD_A1908 SeD_A1909 gloA rnt FALSE 0.455 101.000 0.136 1.000 N NA
 7296972 7296973 SeD_A1911 SeD_A1912     FALSE 0.117 127.000 0.015 NA N NA
 7296973 7296974 SeD_A1912 SeD_A1913   purR FALSE 0.003 468.000 0.000 1.000 N NA
 7296976 7296977 SeD_A1915 SeD_A1916   cfa FALSE 0.012 290.000 0.000 1.000 N NA
 7296979 7296980 SeD_A1918 SeD_A1919     FALSE 0.092 151.000 0.000 NA   NA
 7296980 7296981 SeD_A1919 SeD_A1920     TRUE 0.762 9.000 0.000 NA   NA
 7296982 7296983 SeD_A1921 SeD_A1922   epaR TRUE 0.996 -3.000 0.406 0.076 Y NA
 7296983 7296984 SeD_A1922 SeD_A1923 epaR   TRUE 0.819 1.000 0.000 NA   NA
 7296984 7296985 SeD_A1923 SeD_A1924   epaP FALSE 0.095 150.000 0.000 NA   NA
 7296985 7296986 SeD_A1924 SeD_A1925 epaP epaO TRUE 0.838 68.000 0.154 1.000 Y NA
 7296986 7296987 SeD_A1925 SeD_A1926 epaO   TRUE 0.854 -19.000 0.154 NA   NA
 7296987 7296988 SeD_A1926 SeD_A1927     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7296988 7296989 SeD_A1927 SeD_A1928     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296989 7296990 SeD_A1928 SeD_A1929     TRUE 0.993 -40.000 0.647 0.007 Y NA
 7296990 7296991 SeD_A1929 SeD_A1930     TRUE 0.974 -15.000 0.636 NA   NA
 7296991 7296992 SeD_A1930 SeD_A1931     TRUE 0.743 58.000 0.364 NA   NA
 7296992 7296993 SeD_A1931 SeD_A1932     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7296993 7296994 SeD_A1932 SeD_A1933     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296994 7296995 SeD_A1933 SeD_A1934     FALSE 0.181 294.000 0.786 NA   NA
 7296995 7296996 SeD_A1934 SeD_A1935     TRUE 0.988 -3.000 0.407 0.009   NA
 7296996 7296997 SeD_A1935 SeD_A1936     TRUE 0.981 -3.000 0.407 NA   NA
 7296997 7296998 SeD_A1936 SeD_A1937   eprI TRUE 0.968 -22.000 0.650 NA   NA
 7296998 7296999 SeD_A1937 SeD_A1938 eprI   FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7296999 7297000 SeD_A1938 SeD_A1939     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297000 7297001 SeD_A1939 SeD_A1940     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7297001 7297002 SeD_A1940 SeD_A1941     FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7297002 7297003 SeD_A1941 SeD_A1942     FALSE 0.012 264.000 0.000 NA   NA
 7297003 7297004 SeD_A1942 SeD_A1943     FALSE 0.354 100.000 0.105 NA   NA
 7297004 7297005 SeD_A1943 SeD_A1944     TRUE 0.990 3.000 0.632 1.000   NA
 7297005 7297006 SeD_A1944 SeD_A1945     FALSE 0.511 -45.000 0.000 NA   NA
 7297006 7297007 SeD_A1945 SeD_A1946     FALSE 0.002 536.000 0.000 NA   NA
 7297007 7297008 SeD_A1946 SeD_A1947     TRUE 0.844 17.000 0.146 NA   NA
 7297008 7297009 SeD_A1947 SeD_A1948     TRUE 0.950 -7.000 0.268 NA   NA
 7297010 7297011 SeD_A1949 SeD_A1950     TRUE 0.919 31.000 0.000 0.011 Y NA
 7297011 7297012 SeD_A1950 SeD_A1951     FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 7297012 7297013 SeD_A1951 SeD_A1952     TRUE 0.635 15.000 0.000 NA   NA
 7297013 7297014 SeD_A1952 SeD_A1953     FALSE 0.060 172.000 0.000 NA   NA
 7297015 7297016 SeD_A1954 SeD_A1955     FALSE 0.168 98.000 0.000 NA   NA
 7297016 7297017 SeD_A1955 SeD_A1956     TRUE 0.991 -25.000 0.600 1.000 Y NA
 7297018 7297019 SeD_A1957 SeD_A1958     TRUE 0.978 1.000 0.000 NA Y NA
 7297019 7297020 SeD_A1958 SeD_A1959     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7297020 7297021 SeD_A1959 SeD_A1960     FALSE 0.008 323.000 0.000 1.000   NA
 7297021 7297022 SeD_A1960 SeD_A1961     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7297022 7297023 SeD_A1961 SeD_A1962     FALSE 0.209 59.000 0.000 NA   NA
 7297023 7297024 SeD_A1962 SeD_A1963     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 7297024 7297025 SeD_A1963 SeD_A1964   pykF FALSE 0.004 402.000 0.000 1.000 N NA
 7297025 7297026 SeD_A1964 SeD_A1965 pykF lpp FALSE 0.010 311.000 0.000 1.000 N NA
 7297026 7297027 SeD_A1965 SeD_A1966 lpp   TRUE 0.767 83.000 0.032 0.005 Y NA
 7297028 7297029 SeD_A1967 SeD_A1968     FALSE 0.147 155.000 0.069 NA   NA
 7297029 7297030 SeD_A1968 SeD_A1969     TRUE 0.910 13.000 0.183 NA   NA
 7297030 7297031 SeD_A1969 SeD_A1970   sufD TRUE 0.962 -3.000 0.193 1.000 N NA
 7297031 7297032 SeD_A1970 SeD_A1971 sufD sufC TRUE 0.988 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 7297032 7297033 SeD_A1971 SeD_A1972 sufC sufB TRUE 0.989 17.000 0.466 1.000 Y NA
 7297033 7297034 SeD_A1972 SeD_A1973 sufB sufA TRUE 0.791 9.000 0.041 NA   NA
 7297035 7297036 SeD_A1974 SeD_A1975     FALSE 0.204 61.000 0.000 NA   NA
 7297037 7297038 SeD_A1976 SeD_A1977     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7297038 7297039 SeD_A1977 SeD_A1978     TRUE 0.937 -3.000 0.129 NA N NA
 7297040 7297041 SeD_A1979 SeD_A1980   rprA FALSE 0.049 183.000 0.000 NA   NA
 7297041 7297042 SeD_A1980 SeD_A1981 rprA   FALSE 0.064 168.000 0.000 NA   NA
 7297042 7297043 SeD_A1981 SeD_A1982     FALSE 0.284 141.000 0.095 1.000   NA
 7297043 7297044 SeD_A1982 SeD_A1983     FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 7297044 7297045 SeD_A1983 SeD_A1984     FALSE 0.355 67.000 0.082 NA N NA
 7297045 7297046 SeD_A1984 SeD_A1985   aroD TRUE 0.885 45.000 0.113 1.000 Y NA
 7297046 7297047 SeD_A1985 SeD_A1986 aroD   FALSE 0.099 154.000 0.019 1.000 N NA
 7297047 7297048 SeD_A1986 SeD_A1987     TRUE 0.992 14.000 0.500 1.000 Y NA
 7297050 7297051 SeD_A1989 SeD_A1990   ydiQ FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 7297051 7297052 SeD_A1990 SeD_A1991 ydiQ   TRUE 0.995 22.000 1.000 0.013 Y NA
 7297052 7297053 SeD_A1991 SeD_A1992     TRUE 0.981 57.000 1.000 0.045 Y NA
 7297053 7297054 SeD_A1992 SeD_A1993     TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.045 Y NA
 7297054 7297055 SeD_A1993 SeD_A1994     FALSE 0.351 90.000 0.080 1.000 N NA
 7297057 7297058 SeD_A1996 SeD_A1997     FALSE 0.071 162.000 0.000 NA   NA
 7297058 7297059 SeD_A1997 SeD_A1998     FALSE 0.298 156.000 0.165 1.000   NA
 7297059 7297060 SeD_A1998 SeD_A1999     FALSE 0.120 157.000 0.054 NA N NA
 7297061 7297062 SeD_A2000 SeD_A2001     FALSE 0.195 62.000 0.031 NA   NA
 7297062 7297063 SeD_A2001 SeD_A2002     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA N NA
 7297063 7297064 SeD_A2002 SeD_A2003     FALSE 0.186 77.000 0.000 NA N NA
 7297064 7297065 SeD_A2003 SeD_A2004   btuE TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000 N NA
 7297065 7297066 SeD_A2004 SeD_A2005 btuE   FALSE 0.364 92.000 0.084 1.000 N NA
 7297066 7297067 SeD_A2005 SeD_A2006   ihfA FALSE 0.042 203.000 0.023 1.000 N NA
 7297067 7297068 SeD_A2006 SeD_A2007 ihfA pheT TRUE 0.959 5.000 0.208 1.000 N NA
 7297068 7297069 SeD_A2007 SeD_A2008 pheT pheS TRUE 0.995 16.000 0.574 0.001 Y NA
 7297069 7297070 SeD_A2008 SeD_A2009 pheS rplT FALSE 0.169 302.000 0.202 1.000 Y NA
 7297070 7297071 SeD_A2009 SeD_A2010 rplT rpmI TRUE 0.984 51.000 0.928 0.011 Y NA
 7297071 7297072 SeD_A2010 SeD_A2011 rpmI infC TRUE 0.948 96.000 0.652 1.000 Y NA
 7297072 7297073 SeD_A2011 SeD_A2012 infC thrS TRUE 0.829 112.000 0.186 1.000 Y NA
 7297075 7297076 SeD_A2014 SeD_A2015     FALSE 0.201 62.000 0.000 NA   NA
 7297079 7297080 SeD_A2018 SeD_A2019 pfkB   FALSE 0.148 96.000 0.025 NA   NA
 7297080 7297081 SeD_A2019 SeD_A2020     FALSE 0.118 107.000 0.016 NA   NA
 7297083 7297084 SeD_A2022 SeD_A2023     FALSE 0.207 138.000 0.068 NA   NA
 7297084 7297085 SeD_A2023 SeD_A2024     FALSE 0.279 137.000 0.102 NA   NA
 7297088 7297089 SeD_A2027 SeD_A2028     TRUE 0.976 13.000 0.429 0.017   NA
 7297089 7297090 SeD_A2028 SeD_A2029     TRUE 0.802 125.000 0.625 1.000 N NA
 7297090 7297091 SeD_A2029 SeD_A2030     TRUE 0.987 11.000 0.727 1.000 N NA
 7297091 7297092 SeD_A2030 SeD_A2031   chbC TRUE 0.983 51.000 0.833 0.008 Y NA
 7297092 7297093 SeD_A2031 SeD_A2032 chbC chbB TRUE 0.868 83.000 0.167 0.008 Y NA
 7297093 7297094 SeD_A2032 SeD_A2033 chbB osmE FALSE 0.010 301.000 0.000 1.000   NA
 7297094 7297095 SeD_A2033 SeD_A2035 osmE   FALSE 0.136 132.000 0.000 NA   NA
 7297096 7297097 SeD_A2034 SeD_A2036 nadE   FALSE 0.154 121.000 0.010 1.000 N NA
 7297098 7297099 SeD_A2037 SeD_A2038 spy   FALSE 0.164 84.000 0.000 NA   NA
 7297099 7297100 SeD_A2038 SeD_A2039   astE FALSE 0.121 139.000 0.000 NA   NA
 7297100 7297101 SeD_A2039 SeD_A2040 astE astB TRUE 0.981 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 7297101 7297102 SeD_A2040 SeD_A2041 astB astD TRUE 0.977 -3.000 0.306 1.000 N NA
 7297102 7297103 SeD_A2041 SeD_A2042 astD astA TRUE 0.959 -3.000 0.179 1.000 N NA
 7297103 7297104 SeD_A2042 SeD_A2043 astA   TRUE 0.995 -9.000 0.625 1.000 Y NA
 7297105 7297106 SeD_A2044 SeD_A2045 xth   FALSE 0.309 73.000 0.056 1.000 N NA
 7297109 7297110 SeD_A2048 SeD_A2049 topB selD TRUE 0.856 5.000 0.041 1.000 N NA
 7297110 7297111 SeD_A2049 SeD_A2050 selD   FALSE 0.208 118.000 0.033 1.000 N NA
 7297112 7297113 SeD_A2051 SeD_A2052 sppA ansA FALSE 0.421 96.000 0.113 1.000 N NA
 7297113 7297114 SeD_A2052 SeD_A2053 ansA   TRUE 0.585 27.000 0.040 1.000 N NA
 7297115 7297116 SeD_A2054 SeD_A2055     TRUE 0.744 136.000 0.125 1.000 Y NA
 7297116 7297117 SeD_A2055 SeD_A2056     TRUE 0.581 130.000 0.269 1.000 N NA
 7297117 7297118 SeD_A2056 SeD_A2057     TRUE 0.962 10.000 0.269 1.000 N NA
 7297118 7297119 SeD_A2057 SeD_A2058     TRUE 0.994 5.000 0.368 1.000 Y NA
 7297119 7297120 SeD_A2058 SeD_A2059   gutB TRUE 0.910 22.000 0.194 0.013 N NA
 7297120 7297121 SeD_A2059 SeD_A2060 gutB   TRUE 0.931 11.000 0.167 1.000 N NA
 7297121 7297122 SeD_A2060 SeD_A2061     TRUE 0.875 27.000 0.250 1.000 N NA
 7297122 7297123 SeD_A2061 SeD_A2062     FALSE 0.154 117.000 0.000 NA   NA
 7297125 7297126 SeD_A2064 SeD_A2065   msrB TRUE 0.727 42.000 0.216 NA   NA
 7297127 7297128 SeD_A2066 SeD_A2067 gapA   FALSE 0.118 329.000 0.154 1.000 Y NA
 7297129 7297130 SeD_A2068 SeD_A2069     FALSE 0.202 106.000 0.000 1.000   NA
 7297130 7297131 SeD_A2069 SeD_A2070     FALSE 0.009 290.000 0.000 NA   NA
 7297132 7297133 SeD_A2071 SeD_A2072     TRUE 0.809 123.000 0.683 NA   NA
 7297133 7297134 SeD_A2072 SeD_A2073     FALSE 0.002 640.000 0.000 NA   NA
 7297134 7297135 SeD_A2073 SeD_A2074     FALSE 0.522 41.000 0.083 NA   NA
 7297136 7297137 SeD_A2075 SeD_A2076     FALSE 0.413 31.000 0.000 NA   NA
 7297143 7297144 SeD_A2082 SeD_A2083     FALSE 0.266 69.000 0.057 NA   NA
 7297146 7297147 SeD_A2085 SeD_A2087     TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7297149 7297150 SeD_A2088 SeD_A2089     FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 7297150 7297151 SeD_A2089 SeD_A2091     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7297153 7297154 SeD_A2092 SeD_A2093     FALSE 0.303 197.000 0.000 1.000 Y NA
 7297156 7297157 SeD_A2095 SeD_A2096     FALSE 0.356 69.000 0.000 0.055   NA
 7297157 7297158 SeD_A2096 SeD_A2097     FALSE 0.063 169.000 0.000 NA   NA
 7297158 7297159 SeD_A2097 SeD_A2098     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7297159 7297160 SeD_A2098 SeD_A2100     FALSE 0.159 108.000 0.000 NA   NA
 7297161 7297162 SeD_A2099 SeD_A2101     FALSE 0.004 389.000 0.000 NA   NA
 7297163 7297164 SeD_A2102 SeD_A2103     TRUE 0.887 -6.000 0.000 0.014   NA
 7297164 7297165 SeD_A2103 SeD_A2104     TRUE 0.797 -6.000 0.000 1.000   NA
 7297165 7297166 SeD_A2104 SeD_A2105     TRUE 0.970 -10.000 0.000 0.044 Y NA
 7297166 7297167 SeD_A2105 SeD_A2106     TRUE 0.998 0.000 0.500 0.044 Y NA
 7297168 7297169 SeD_A2107 SeD_A2108     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 7297171 7297172 SeD_A2109 SeD_A2111     FALSE 0.097 149.000 0.000 NA   NA
 7297173 7297174 SeD_A2112 SeD_A2113     FALSE 0.349 38.000 0.000 NA   NA
 7297174 7297175 SeD_A2113 SeD_A2114     FALSE 0.006 339.000 0.000 NA   NA
 7297179 7297180 SeD_A2118 SeD_A2119     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7297180 7297181 SeD_A2119 SeD_A2120     FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 7297181 7297182 SeD_A2120 SeD_A2121     FALSE 0.004 380.000 0.000 NA   NA
 7297183 7297184 SeD_A2122 SeD_A2123     FALSE 0.001 668.000 0.000 NA   NA
 7297184 7297185 SeD_A2123 SeD_A2124     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 7297185 7297186 SeD_A2124 SeD_A2125     FALSE 0.002 490.000 0.000 NA   NA
 7297186 7297187 SeD_A2125 SeD_A2126     FALSE 0.003 430.000 0.000 NA   NA
 7297188 7297189 SeD_A2127 SeD_A2128   icd FALSE 0.002 461.000 0.000 NA   NA
 7297190 7297191 SeD_A2129 SeD_A2130     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297191 7297192 SeD_A2130 SeD_A2131     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7297192 7297193 SeD_A2131 SeD_A2132   mnmA TRUE 0.599 54.000 0.158 1.000 N NA
 7297193 7297194 SeD_A2132 SeD_A2133 mnmA   FALSE 0.481 87.000 0.180 NA   NA
 7297194 7297195 SeD_A2133 SeD_A2134   purB TRUE 0.907 4.000 0.093 NA   NA
 7297195 7297196 SeD_A2134 SeD_A2135 purB   FALSE 0.153 124.000 0.011 1.000 N NA
 7297196 7297197 SeD_A2135 SeD_A2136     TRUE 0.998 0.000 0.940 1.000 Y NA
 7297197 7297198 SeD_A2136 SeD_A2137     TRUE 0.706 81.000 0.408 NA   NA
 7297199 7297200 SeD_A2138 SeD_A2139   pepT TRUE 0.838 4.000 0.000 1.000   NA
 7297201 7297202 SeD_A2140 SeD_A2141 potA potB TRUE 0.995 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 7297202 7297203 SeD_A2141 SeD_A2142 potB   FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7297203 7297204 SeD_A2142 SeD_A2143   sifA FALSE 0.209 59.000 0.000 NA   NA
 7297204 7297205 SeD_A2143 SeD_A2144 sifA   FALSE 0.166 91.000 0.000 NA   NA
 7297205 7297206 SeD_A2144 SeD_A2145   potC FALSE 0.162 103.000 0.000 NA   NA
 7297206 7297207 SeD_A2145 SeD_A2146 potC potD TRUE 0.929 25.000 0.007 0.044 Y NA
 7297208 7297209 SeD_A2147 SeD_A2148 npdA nagK TRUE 0.961 19.000 0.119 1.000 Y NA
 7297209 7297210 SeD_A2148 SeD_A2149 nagK lolE TRUE 0.846 29.000 0.225 1.000 N NA
 7297210 7297211 SeD_A2149 SeD_A2150 lolE lolD TRUE 0.965 0.000 0.125 0.055 N NA
 7297211 7297212 SeD_A2150 SeD_A2151 lolD lolC TRUE 0.952 -7.000 0.175 0.055 N NA
 7297212 7297213 SeD_A2151 SeD_A2152 lolC   FALSE 0.058 174.000 0.000 NA   NA
 7297214 7297215 SeD_A2153 SeD_A2154 mfd   FALSE 0.088 148.000 0.006 1.000   NA
 7297218 7297219 SeD_A2157 SeD_A2158   ndh FALSE 0.117 179.000 0.071 1.000   NA
 7297219 7297220 SeD_A2158 SeD_A2159 ndh   FALSE 0.032 228.000 0.057 NA   NA
 7297220 7297221 SeD_A2159 SeD_A2160   nagZ TRUE 0.709 25.000 0.091 NA   NA
 7297221 7297222 SeD_A2160 SeD_A2161 nagZ thiK TRUE 0.865 11.000 0.069 1.000 N NA
 7297222 7297223 SeD_A2161 SeD_A2162 thiK   TRUE 0.929 -19.000 0.310 NA   NA
 7297223 7297224 SeD_A2162 SeD_A2163     TRUE 0.969 14.000 0.516 NA   NA
 7297224 7297225 SeD_A2163 SeD_A2164     TRUE 0.858 3.000 0.051 NA   NA
 7297227 7297228 SeD_A2166 SeD_A2167 ptsG   FALSE 0.005 295.000 0.004 NA N NA
 7297228 7297229 SeD_A2167 SeD_A2168     TRUE 0.978 11.000 0.110 NA Y NA
 7297229 7297230 SeD_A2168 SeD_A2169   tmk TRUE 0.965 -3.000 0.211 1.000 N NA
 7297230 7297231 SeD_A2169 SeD_A2170 tmk   TRUE 0.922 -10.000 0.209 NA   NA
 7297231 7297232 SeD_A2170 SeD_A2171     TRUE 0.958 3.000 0.204 NA   NA
 7297232 7297233 SeD_A2171 SeD_A2172   fabF FALSE 0.507 124.000 0.187 1.000 N NA
 7297233 7297234 SeD_A2172 SeD_A2173 fabF acpP TRUE 0.899 86.000 0.346 1.000 Y NA
 7297234 7297235 SeD_A2173 SeD_A2174 acpP fabG TRUE 0.844 156.000 0.321 0.003 Y NA
 7297235 7297236 SeD_A2174 SeD_A2175 fabG fabD TRUE 0.994 13.000 0.432 0.003 Y NA
 7297236 7297237 SeD_A2175 SeD_A2176 fabD fabH TRUE 0.984 16.000 0.182 0.003 Y NA
 7297237 7297238 SeD_A2176 SeD_A2177 fabH plsX TRUE 0.935 80.000 0.380 0.003 Y NA
 7297240 7297241 SeD_A2179 SeD_A2181   sraB FALSE 0.355 37.000 0.000 NA   NA
 7297243 7297244 SeD_A2182 SeD_A2184     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7297244 7297245 SeD_A2184 SeD_A2185     FALSE 0.123 138.000 0.000 NA   NA
 7297247 7297248 SeD_A2188 SeD_A2189 flgL flgK TRUE 0.983 15.000 0.142 0.001 Y NA
 7297248 7297249 SeD_A2189 SeD_A2190 flgK flgJ TRUE 0.973 65.000 0.705 0.002 Y NA
 7297249 7297250 SeD_A2190 SeD_A2191 flgJ flgI TRUE 0.988 0.000 0.036 0.006 Y NA
 7297250 7297251 SeD_A2191 SeD_A2192 flgI flgH TRUE 0.981 12.000 0.073 0.006 Y NA
 7297251 7297252 SeD_A2192 SeD_A2193 flgH flgG TRUE 0.909 88.000 0.268 0.005 Y NA
 7297252 7297253 SeD_A2193 SeD_A2194 flgG flgF TRUE 0.994 14.000 0.420 0.001 Y NA
 7297253 7297254 SeD_A2194 SeD_A2195 flgF flgE TRUE 0.991 21.000 0.476 0.003 Y NA
 7297254 7297255 SeD_A2195 SeD_A2196 flgE flgD TRUE 0.938 27.000 0.116 NA Y NA
 7297255 7297256 SeD_A2196 SeD_A2197 flgD flgC TRUE 0.982 12.000 0.186 NA Y NA
 7297256 7297257 SeD_A2197 SeD_A2198 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 7297258 7297259 SeD_A2199 SeD_A2200 flgA   TRUE 0.885 92.000 0.330 NA Y NA
 7297259 7297260 SeD_A2200 SeD_A2201     TRUE 0.976 35.000 0.361 0.002 Y NA
 7297261 7297262 SeD_A2202 SeD_A2203 mviN   FALSE 0.013 265.000 0.022 1.000   NA
 7297262 7297263 SeD_A2203 SeD_A2204     TRUE 0.923 2.000 0.103 NA   NA
 7297263 7297264 SeD_A2204 SeD_A2205     TRUE 0.632 36.000 0.116 NA   NA
 7297265 7297266 SeD_A2206 SeD_A2207   grxB FALSE 0.409 64.000 0.103 NA N NA
 7297266 7297267 SeD_A2207 SeD_A2208 grxB   FALSE 0.266 125.000 0.078 NA   NA
 7297267 7297268 SeD_A2208 SeD_A2209   pyrC FALSE 0.133 105.000 0.022 NA   NA
 7297268 7297269 SeD_A2209 SeD_A2210 pyrC   FALSE 0.172 74.000 0.031 NA   NA
 7297269 7297270 SeD_A2210 SeD_A2211   bssS FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 7297270 7297271 SeD_A2211 SeD_A2212 bssS solA TRUE 0.700 113.000 0.423 NA   NA
 7297271 7297272 SeD_A2212 SeD_A2213 solA   TRUE 0.781 41.000 0.269 NA   NA
 7297274 7297275 SeD_A2215 SeD_A2216     TRUE 0.990 -3.000 0.676 NA   NA
 7297277 7297278 SeD_A2218 SeD_A2219     TRUE 0.806 155.000 0.857 0.073 N NA
 7297278 7297279 SeD_A2219 SeD_A2220     TRUE 0.651 82.000 0.333 NA   NA
 7297280 7297281 SeD_A2221 SeD_A2222     FALSE 0.413 98.000 0.135 NA   NA
 7297281 7297282 SeD_A2222 SeD_A2223   mdoG TRUE 0.974 -7.000 0.469 NA N NA
 7297284 7297285 SeD_A2225 SeD_A2226     FALSE 0.189 119.000 0.046 NA   NA
 7297285 7297286 SeD_A2226 SeD_A2227     FALSE 0.151 87.000 0.028 NA   NA
 7297286 7297287 SeD_A2227 SeD_A2228   csgC TRUE 0.673 131.000 0.429 NA   NA
 7297287 7297288 SeD_A2228 SeD_A2229 csgC   TRUE 0.852 62.000 0.667 NA   NA
 7297288 7297289 SeD_A2229 SeD_A2230   csgB TRUE 0.876 42.000 0.333 0.010   NA
 7297290 7297291 SeD_A2231 SeD_A2232 csgD   TRUE 0.944 5.000 0.176 NA   NA
 7297291 7297292 SeD_A2232 SeD_A2233     TRUE 0.957 27.000 0.723 NA   NA
 7297292 7297293 SeD_A2233 SeD_A2234     TRUE 0.668 27.000 0.085 NA   NA
 7297294 7297295 SeD_A2235 SeD_A2236     FALSE 0.453 71.000 0.145 NA   NA
 7297295 7297296 SeD_A2236 SeD_A2237     TRUE 0.935 24.000 0.417 1.000   NA
 7297296 7297297 SeD_A2237 SeD_A2239     TRUE 0.826 85.000 0.169 1.000 Y NA
 7297298 7297299 SeD_A2238 SeD_A2240     FALSE 0.181 72.000 0.000 NA   NA
 7297299 7297300 SeD_A2240 SeD_A2241     FALSE 0.001 871.000 0.000 NA   NA
 7297301 7297302 SeD_A2242 SeD_A2243     FALSE 0.154 117.000 0.000 NA   NA
 7297302 7297303 SeD_A2243 SeD_A2244     FALSE 0.002 479.000 0.000 NA   NA
 7297303 7297304 SeD_A2244 SeD_A2245     FALSE 0.001 739.000 0.000 NA   NA
 7297306 7297307 SeD_A2247 SeD_A2248     FALSE 0.130 135.000 0.000 NA   NA
 7297307 7297308 SeD_A2248 SeD_A2249     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7297308 7297309 SeD_A2249 SeD_A2250     TRUE 0.650 -13.000 0.000 NA   NA
 7297309 7297310 SeD_A2250 SeD_A2251     TRUE 0.947 3.000 0.167 NA   NA
 7297310 7297311 SeD_A2251 SeD_A2252     TRUE 0.917 -7.000 0.167 NA   NA
 7297311 7297312 SeD_A2252 SeD_A2253     TRUE 0.982 5.000 0.500 NA   NA
 7297312