MicrobesOnline Operon Predictions for Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7295079 7295080 SeD_A0002 SeD_A0003 thrA thrB TRUE 0.989 2.000 0.133 1.000 Y NA
 7295080 7295081 SeD_A0003 SeD_A0004 thrB thrC TRUE 0.992 4.000 0.233 1.000 Y NA
 7295082 7295083 SeD_A0005 SeD_A0006     FALSE 0.158 79.000 0.028 NA   NA
 7295084 7295085 SeD_A0007 SeD_A0008 tal2 mogA FALSE 0.235 111.000 0.042 1.000 N NA
 7295086 7295087 SeD_A0009 SeD_A0010     FALSE 0.095 150.000 0.000 NA   NA
 7295087 7295088 SeD_A0010 SeD_A0011     FALSE 0.362 36.000 0.000 NA   NA
 7295089 7295090 SeD_A0012 SeD_A0013 dnaK dnaJ TRUE 0.901 86.000 0.236 0.004 Y NA
 7295090 7295091 SeD_A0013 SeD_A0014 dnaJ   FALSE 0.156 112.000 0.000 NA   NA
 7295091 7295092 SeD_A0014 SeD_A0015     FALSE 0.226 56.000 0.000 NA   NA
 7295092 7295093 SeD_A0015 SeD_A0016     TRUE 0.565 169.000 0.600 NA   NA
 7295094 7295095 SeD_A0017 SeD_A0018     TRUE 0.966 17.000 0.600 NA   NA
 7295096 7295097 SeD_A0019 SeD_A0020     FALSE 0.166 92.000 0.000 NA   NA
 7295097 7295098 SeD_A0020 SeD_A0021     FALSE 0.010 281.000 0.000 NA   NA
 7295098 7295099 SeD_A0021 SeD_A0022     FALSE 0.003 430.000 0.000 NA N NA
 7295099 7295100 SeD_A0022 SeD_A0023     TRUE 0.986 -40.000 0.500 1.000 Y NA
 7295100 7295101 SeD_A0023 SeD_A0024     TRUE 0.997 5.000 0.667 1.000 Y NA
 7295101 7295102 SeD_A0024 SeD_A0025     TRUE 0.997 1.000 0.500 1.000 Y NA
 7295102 7295103 SeD_A0025 SeD_A0026     TRUE 0.978 40.000 0.500 0.012 Y NA
 7295103 7295104 SeD_A0026 SeD_A0027     TRUE 0.995 16.000 0.667 0.012 Y NA
 7295104 7295105 SeD_A0027 SeD_A0028     TRUE 0.943 62.000 0.500 1.000 Y NA
 7295105 7295106 SeD_A0028 SeD_A0029     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7295106 7295107 SeD_A0029 SeD_A0030     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7295111 7295112 SeD_A0034 SeD_A0035     FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 7295113 7295114 SeD_A0036 SeD_A0037     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7295115 7295116 SeD_A0038 SeD_A0039     TRUE 0.638 99.000 0.286 1.000   NA
 7295116 7295117 SeD_A0039 SeD_A0040     TRUE 0.569 25.000 0.000 1.000   NA
 7295117 7295118 SeD_A0040 SeD_A0041     FALSE 0.144 127.000 0.000 NA   NA
 7295118 7295119 SeD_A0041 SeD_A0042   nhaA FALSE 0.070 163.000 0.000 NA   NA
 7295119 7295120 SeD_A0042 SeD_A0043 nhaA nhaR TRUE 0.703 62.000 0.292 1.000 N NA
 7295121 7295122 SeD_A0044 SeD_A0045     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 7295122 7295123 SeD_A0045 SeD_A0046     FALSE 0.285 46.000 0.000 NA   NA
 7295123 7295124 SeD_A0046 SeD_A0047   rpsT FALSE 0.002 456.000 0.000 NA   NA
 7295125 7295126 SeD_A0048 SeD_A0049   ribF TRUE 0.711 8.000 0.019 NA   NA
 7295126 7295127 SeD_A0049 SeD_A0050 ribF ileS TRUE 0.963 9.000 0.254 1.000 N NA
 7295127 7295128 SeD_A0050 SeD_A0051 ileS lspA TRUE 0.892 0.000 0.045 1.000 N NA
 7295128 7295129 SeD_A0051 SeD_A0052 lspA fkpB FALSE 0.301 155.000 0.154 1.000 N NA
 7295129 7295130 SeD_A0052 SeD_A0053 fkpB ispH TRUE 0.990 3.000 0.626 1.000 N NA
 7295132 7295133 SeD_A0055 SeD_A0056     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7295134 7295135 SeD_A0057 SeD_A0058     TRUE 0.998 2.000 1.000 1.000 Y NA
 7295135 7295136 SeD_A0058 SeD_A0059     FALSE 0.326 96.000 0.068 1.000 N NA
 7295136 7295137 SeD_A0059 SeD_A0060   oadA TRUE 0.997 13.000 0.886 0.003 Y NA
 7295137 7295138 SeD_A0060 SeD_A0061 oadA   TRUE 0.996 16.000 0.720 0.003 Y NA
 7295138 7295139 SeD_A0061 SeD_A0062     FALSE 0.527 159.000 0.060 1.000 Y NA
 7295140 7295141 SeD_A0063 SeD_A0064 citC citD TRUE 0.976 30.000 0.426 1.000 Y NA
 7295141 7295142 SeD_A0064 SeD_A0065 citD citE TRUE 0.992 -3.000 0.537 0.002 N NA
 7295142 7295143 SeD_A0065 SeD_A0066 citE citF TRUE 0.981 11.000 0.373 0.002 N NA
 7295143 7295144 SeD_A0066 SeD_A0067 citF citX TRUE 0.909 18.000 0.231 1.000 N NA
 7295144 7295145 SeD_A0067 SeD_A0068 citX citG TRUE 0.986 -22.000 0.400 1.000 Y NA
 7295145 7295146 SeD_A0068 SeD_A0069 citG dapB FALSE 0.048 180.000 0.002 1.000 N NA
 7295147 7295148 SeD_A0070 SeD_A0071     FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
 7295149 7295150 SeD_A0072 SeD_A0073 carA carB TRUE 0.989 19.000 0.345 0.001 Y NA
 7295150 7295151 SeD_A0073 SeD_A0074 carB   FALSE 0.011 274.000 0.000 NA   NA
 7295152 7295153 SeD_A0075 SeD_A0076     FALSE 0.300 110.000 0.069 1.000   NA
 7295153 7295154 SeD_A0076 SeD_A0077   caiC TRUE 0.827 54.000 0.000 0.026 Y NA
 7295154 7295155 SeD_A0077 SeD_A0078 caiC   TRUE 0.636 63.000 0.154 0.026 N NA
 7295155 7295156 SeD_A0078 SeD_A0079   caiA TRUE 0.838 58.000 0.529 1.000 N NA
 7295156 7295157 SeD_A0079 SeD_A0080 caiA caiT FALSE 0.457 35.000 0.000 1.000 N NA
 7295158 7295159 SeD_A0081 SeD_A0082   fixA FALSE 0.476 68.000 0.154 NA   NA
 7295159 7295160 SeD_A0082 SeD_A0083 fixA fixB TRUE 0.961 16.000 0.000 0.016 Y NA
 7295160 7295161 SeD_A0083 SeD_A0084 fixB fixC TRUE 0.839 50.000 0.000 0.057 Y NA
 7295161 7295162 SeD_A0084 SeD_A0085 fixC   TRUE 0.992 -3.000 0.167 0.057 Y NA
 7295162 7295163 SeD_A0085 SeD_A0086     FALSE 0.221 81.000 0.000 1.000 N NA
 7295163 7295164 SeD_A0086 SeD_A0087     FALSE 0.165 89.000 0.000 NA   NA
 7295164 7295165 SeD_A0087 SeD_A0088   kefF FALSE 0.449 100.000 0.160 NA   NA
 7295165 7295166 SeD_A0088 SeD_A0089 kefF   TRUE 0.981 -7.000 0.560 1.000   NA
 7295169 7295170 SeD_A0092 SeD_A0093 apaH apaG TRUE 0.952 11.000 0.267 NA N NA
 7295170 7295171 SeD_A0093 SeD_A0094 apaG ksgA TRUE 0.904 3.000 0.078 NA N NA
 7295171 7295172 SeD_A0094 SeD_A0095 ksgA pdxA TRUE 0.963 -3.000 0.197 1.000 N NA
 7295172 7295173 SeD_A0095 SeD_A0096 pdxA surA TRUE 0.990 0.000 0.561 1.000 N NA
 7295173 7295174 SeD_A0096 SeD_A0097 surA imp TRUE 0.635 54.000 0.182 1.000 N NA
 7295174 7295175 SeD_A0097 SeD_A0098 imp   TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7295177 7295178 SeD_A0100 SeD_A0101   rapA TRUE 0.956 12.000 0.294 1.000 N NA
 7295178 7295179 SeD_A0101 SeD_A0102 rapA   TRUE 0.583 174.000 0.098 0.059 Y NA
 7295179 7295180 SeD_A0102 SeD_A0103     FALSE 0.302 44.000 0.000 NA   NA
 7295182 7295183 SeD_A0105 SeD_A0106 araD araA TRUE 0.571 141.000 0.017 1.000 Y NA
 7295183 7295184 SeD_A0106 SeD_A0107 araA araB TRUE 0.918 11.000 0.138 1.000 N NA
 7295185 7295186 SeD_A0108 SeD_A0109     FALSE 0.435 119.000 0.167 NA   NA
 7295187 7295188 SeD_A0110 SeD_A0111 thiQ thiP TRUE 0.977 -16.000 0.522 0.017 N NA
 7295188 7295189 SeD_A0111 SeD_A0112 thiP tbpA TRUE 0.979 -24.000 0.697 0.070 N NA
 7295189 7295190 SeD_A0112 SeD_A0114 tbpA   FALSE 0.206 45.000 0.010 NA   NA
 7295190 7295191 SeD_A0114 SeD_A0115   sgrR TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7295192 7295193 SeD_A0116 SeD_A0118     FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 7295194 7295195 SeD_A0119 SeD_A0120 leuD leuC TRUE 0.994 11.000 0.309 0.001 Y NA
 7295195 7295196 SeD_A0120 SeD_A0121 leuC leuB TRUE 0.996 3.000 0.275 0.002 Y NA
 7295196 7295197 SeD_A0121 SeD_A0122 leuB leuA TRUE 0.993 0.000 0.126 0.002 Y NA
 7295198 7295199 SeD_A0124 SeD_A0125 leuO ilvB FALSE 0.012 292.000 0.000 1.000 N NA
 7295199 7295200 SeD_A0125 SeD_A0126 ilvB ilvH TRUE 0.997 0.000 0.371 0.002 Y NA
 7295200 7295201 SeD_A0126 SeD_A0127 ilvH fruR FALSE 0.020 284.000 0.063 1.000 N NA
 7295201 7295202 SeD_A0127 SeD_A0128 fruR mraZ FALSE 0.002 606.000 0.000 NA   NA
 7295202 7295203 SeD_A0128 SeD_A0129 mraZ mraW TRUE 0.990 2.000 0.635 NA   NA
 7295203 7295204 SeD_A0129 SeD_A0130 mraW ftsL TRUE 0.968 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7295204 7295205 SeD_A0130 SeD_A0131 ftsL ftsI TRUE 0.861 16.000 0.124 1.000 N NA
 7295205 7295206 SeD_A0131 SeD_A0132 ftsI murE TRUE 0.962 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 7295206 7295207 SeD_A0132 SeD_A0133 murE murF TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 7295207 7295208 SeD_A0133 SeD_A0134 murF mraY TRUE 0.994 -6.000 0.309 0.005 Y NA
 7295208 7295209 SeD_A0134 SeD_A0135 mraY murD TRUE 0.998 3.000 0.647 0.005 Y NA
 7295209 7295210 SeD_A0135 SeD_A0136 murD ftsW TRUE 0.986 0.000 0.297 0.003 N NA
 7295210 7295211 SeD_A0136 SeD_A0137 ftsW murG TRUE 0.990 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7295211 7295212 SeD_A0137 SeD_A0138 murG murC TRUE 0.869 119.000 0.283 1.000 Y NA
 7295212 7295213 SeD_A0138 SeD_A0139 murC ddl TRUE 0.988 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 7295213 7295214 SeD_A0139 SeD_A0140 ddl ftsQ TRUE 0.995 2.000 0.372 NA Y NA
 7295214 7295215 SeD_A0140 SeD_A0141 ftsQ ftsA TRUE 0.980 -3.000 0.389 NA N NA
 7295215 7295216 SeD_A0141 SeD_A0142 ftsA ftsZ TRUE 0.939 61.000 0.460 1.000 Y NA
 7295216 7295217 SeD_A0142 SeD_A0143 ftsZ lpxC FALSE 0.453 101.000 0.134 1.000 N NA
 7295217 7295218 SeD_A0143 SeD_A0144 lpxC secM FALSE 0.010 279.000 0.000 NA   NA
 7295218 7295219 SeD_A0144 SeD_A0145 secM secA FALSE 0.201 62.000 0.000 NA   NA
 7295219 7295220 SeD_A0145 SeD_A0146 secA   FALSE 0.340 152.000 0.168 1.000 N NA
 7295223 7295224 SeD_A0149 SeD_A0150     TRUE 0.969 10.000 0.356 NA   NA
 7295224 7295225 SeD_A0150 SeD_A0152   coaE TRUE 0.931 0.000 0.110 NA   NA
 7295227 7295228 SeD_A0154 SeD_A0155     TRUE 0.994 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 7295228 7295229 SeD_A0155 SeD_A0156     TRUE 0.995 10.000 0.556 NA Y NA
 7295229 7295230 SeD_A0156 SeD_A0157   nadC FALSE 0.017 222.000 0.015 NA N NA
 7295231 7295232 SeD_A0158 SeD_A0159     TRUE 0.993 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 7295233 7295234 SeD_A0160 SeD_A0162     TRUE 0.980 0.000 0.333 1.000   NA
 7295237 7295238 SeD_A0164 SeD_A0165 pdhR aceE FALSE 0.409 160.000 0.276 1.000 N NA
 7295238 7295239 SeD_A0165 SeD_A0166 aceE aceF TRUE 0.981 15.000 0.220 1.000 Y NA
 7295239 7295240 SeD_A0166 SeD_A0167 aceF lpdA TRUE 0.685 201.000 0.463 1.000 Y NA
 7295240 7295241 SeD_A0167 SeD_A0168 lpdA   FALSE 0.164 87.000 0.000 NA   NA
 7295241 7295242 SeD_A0168 SeD_A0169     FALSE 0.164 83.000 0.000 NA   NA
 7295243 7295244 SeD_A0170 SeD_A0171     TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7295246 7295247 SeD_A0173 SeD_A0174     FALSE 0.003 418.000 0.000 NA   NA
 7295248 7295249 SeD_A0175 SeD_A0176     FALSE 0.057 175.000 0.000 NA   NA
 7295249 7295250 SeD_A0176 SeD_A0177     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295250 7295251 SeD_A0177 SeD_A0178   pdxA TRUE 0.957 -10.000 0.361 NA   NA
 7295251 7295252 SeD_A0178 SeD_A0179 pdxA   TRUE 0.983 10.000 0.533 1.000 N NA
 7295253 7295254 SeD_A0180 SeD_A0181   speE TRUE 0.965 21.000 0.162 1.000 Y NA
 7295254 7295255 SeD_A0181 SeD_A0182 speE   TRUE 0.660 107.000 0.354 NA   NA
 7295260 7295261 SeD_A0187 SeD_A0188     TRUE 0.998 -3.000 0.688 0.099 Y NA
 7295262 7295263 SeD_A0189 SeD_A0190     TRUE 0.973 9.000 0.000 1.000 Y NA
 7295263 7295264 SeD_A0190 SeD_A0191     TRUE 0.908 27.000 0.000 1.000 Y NA
 7295264 7295265 SeD_A0191 SeD_A0192     TRUE 0.806 48.000 0.000 1.000 Y NA
 7295265 7295266 SeD_A0192 SeD_A0193     FALSE 0.026 215.000 0.000 NA   NA
 7295267 7295268 SeD_A0194 SeD_A0195     TRUE 0.875 68.000 0.222 1.000 Y NA
 7295269 7295270 SeD_A0196 SeD_A0197 panD panC TRUE 0.900 95.000 0.342 1.000 Y NA
 7295270 7295271 SeD_A0197 SeD_A0198 panC panB TRUE 0.931 126.000 0.395 0.001 Y NA
 7295271 7295272 SeD_A0198 SeD_A0199 panB folK TRUE 0.772 121.000 0.117 1.000 Y NA
 7295272 7295273 SeD_A0199 SeD_A0200 folK pcnB TRUE 0.969 -3.000 0.234 1.000 N NA
 7295273 7295274 SeD_A0200 SeD_A0201 pcnB   FALSE 0.244 246.000 0.131 1.000 Y NA
 7295274 7295275 SeD_A0201 SeD_A0202   dksA TRUE 0.886 24.000 0.231 1.000 N NA
 7295275 7295276 SeD_A0202 SeD_A0203 dksA sfsA FALSE 0.185 177.000 0.151 NA   NA
 7295276 7295277 SeD_A0203 SeD_A0204 sfsA   TRUE 0.646 17.000 0.045 NA   NA
 7295278 7295279 SeD_A0205 SeD_A0206 hrpB mrcB FALSE 0.388 141.000 0.158 1.000 N NA
 7295281 7295282 SeD_A0208 SeD_A0209 fhuA fhuC TRUE 0.890 49.000 0.156 1.000 Y NA
 7295282 7295283 SeD_A0209 SeD_A0210 fhuC   TRUE 0.983 0.000 0.047 1.000 Y NA
 7295283 7295284 SeD_A0210 SeD_A0211     TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7295285 7295286 SeD_A0212 SeD_A0213     FALSE 0.162 103.000 0.000 NA   NA
 7295287 7295288 SeD_A0214 SeD_A0215     TRUE 0.966 86.000 1.000 1.000 Y NA
 7295288 7295289 SeD_A0215 SeD_A0216     TRUE 0.995 18.000 1.000 1.000 Y NA
 7295289 7295290 SeD_A0216 SeD_A0217     TRUE 0.982 19.000 0.333 1.000 Y NA
 7295290 7295291 SeD_A0217 SeD_A0218     TRUE 0.998 -3.000 0.571 0.012 Y NA
 7295291 7295292 SeD_A0218 SeD_A0219     TRUE 0.987 0.000 0.000 0.012 Y NA
 7295292 7295293 SeD_A0219 SeD_A0220     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295295 7295296 SeD_A0222 SeD_A0223     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7295296 7295297 SeD_A0223 SeD_A0224   yadR FALSE 0.161 82.000 0.031 NA   NA
 7295298 7295299 SeD_A0225 SeD_A0226     TRUE 0.757 37.000 0.213 NA   NA
 7295299 7295300 SeD_A0226 SeD_A0227   mtnN TRUE 0.902 5.000 0.073 1.000 N NA
 7295301 7295302 SeD_A0228 SeD_A0229 dgt degP FALSE 0.349 130.000 0.101 1.000 N NA
 7295302 7295303 SeD_A0229 SeD_A0230 degP   FALSE 0.181 153.000 0.080 NA N NA
 7295304 7295305 SeD_A0231 SeD_A0232     FALSE 0.047 186.000 0.000 NA   NA
 7295307 7295308 SeD_A0234 SeD_A0235 dapD glnD TRUE 0.704 30.000 0.097 1.000 N NA
 7295308 7295309 SeD_A0235 SeD_A0236 glnD map FALSE 0.118 238.000 0.243 1.000 N NA
 7295310 7295311 SeD_A0237 SeD_A0238   rpsB FALSE 0.435 29.000 0.000 NA   NA
 7295311 7295312 SeD_A0238 SeD_A0239 rpsB tsf TRUE 0.590 258.000 0.748 1.000 Y NA
 7295312 7295313 SeD_A0239 SeD_A0240 tsf pyrH TRUE 0.623 145.000 0.416 1.000 N NA
 7295313 7295314 SeD_A0240 SeD_A0241 pyrH frr TRUE 0.726 147.000 0.626 1.000 N NA
 7295314 7295315 SeD_A0241 SeD_A0242 frr dxr FALSE 0.303 54.000 0.032 1.000 N NA
 7295315 7295316 SeD_A0242 SeD_A0243 dxr uppS FALSE 0.067 313.000 0.025 1.000 Y NA
 7295316 7295317 SeD_A0243 SeD_A0244 uppS cdsA TRUE 0.991 13.000 0.400 1.000 Y NA
 7295317 7295318 SeD_A0244 SeD_A0245 cdsA rseP TRUE 0.862 12.000 0.080 1.000 N NA
 7295318 7295319 SeD_A0245 SeD_A0246 rseP yaeT TRUE 0.949 32.000 0.204 1.000 Y NA
 7295319 7295320 SeD_A0246 SeD_A0247 yaeT skp TRUE 0.891 123.000 0.354 1.000 Y NA
 7295320 7295321 SeD_A0247 SeD_A0248 skp lpxD TRUE 0.998 4.000 0.814 1.000 Y NA
 7295321 7295322 SeD_A0248 SeD_A0249 lpxD fabZ TRUE 0.859 106.000 0.796 1.000 N NA
 7295322 7295323 SeD_A0249 SeD_A0250 fabZ lpxA TRUE 0.993 4.000 0.850 1.000 N NA
 7295323 7295324 SeD_A0250 SeD_A0251 lpxA lpxB TRUE 0.994 0.000 0.289 1.000 Y NA
 7295324 7295325 SeD_A0251 SeD_A0252 lpxB rnhB TRUE 0.961 -3.000 0.186 1.000 N NA
 7295325 7295326 SeD_A0252 SeD_A0253 rnhB dnaE TRUE 0.949 24.000 0.104 1.000 Y NA
 7295326 7295327 SeD_A0253 SeD_A0254 dnaE accA TRUE 0.889 13.000 0.122 1.000 N NA
 7295327 7295328 SeD_A0254 SeD_A0255 accA   FALSE 0.044 180.000 0.003 1.000   NA
 7295328 7295329 SeD_A0255 SeD_A0256   ldcC FALSE 0.430 76.000 0.118 1.000   NA
 7295329 7295330 SeD_A0256 SeD_A0257 ldcC   TRUE 0.754 56.000 0.039 NA Y NA
 7295330 7295331 SeD_A0257 SeD_A0258   tilS FALSE 0.162 63.000 0.015 NA N NA
 7295332 7295333 SeD_A0259 SeD_A0260 rof   TRUE 0.597 53.000 0.179 NA   NA
 7295334 7295335 SeD_A0261 SeD_A0262     TRUE 0.851 -3.000 0.034 1.000   NA
 7295335 7295336 SeD_A0262 SeD_A0263     FALSE 0.376 32.000 0.027 NA   NA
 7295337 7295338 SeD_A0264 SeD_A0265 proS   FALSE 0.201 111.000 0.048 NA   NA
 7295338 7295339 SeD_A0265 SeD_A0266   rcsF TRUE 0.883 -36.000 0.247 NA   NA
 7295339 7295340 SeD_A0266 SeD_A0267 rcsF metQ TRUE 0.733 119.000 0.500 NA   NA
 7295340 7295341 SeD_A0267 SeD_A0268 metQ metI TRUE 0.963 39.000 0.411 NA Y NA
 7295341 7295342 SeD_A0268 SeD_A0269 metI metN TRUE 0.995 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 7295345 7295346 SeD_A0272 SeD_A0273 rrs   FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 7295346 7295347 SeD_A0273 SeD_A0274     FALSE 0.157 111.000 0.000 NA   NA
 7295347 7295348 SeD_A0274 SeD_A0275     TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7295348 7295349 SeD_A0275 SeD_A0276   rrf FALSE 0.001 3343.000 0.000 NA   NA
 7295349 7295350 SeD_A0276 SeD_A0277 rrf   FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 7295350 7295351 SeD_A0277 SeD_A0278   dkgB FALSE 0.068 164.000 0.000 NA   NA
 7295353 7295354 SeD_A0280 SeD_A0281     FALSE 0.129 132.000 0.029 NA   NA
 7295354 7295355 SeD_A0281 SeD_A0282     FALSE 0.269 78.000 0.066 NA   NA
 7295356 7295357 SeD_A0283 SeD_A0284 mltD gloB FALSE 0.149 219.000 0.233 1.000   NA
 7295360 7295361 SeD_A0287 SeD_A0288 dnaQ   FALSE 0.133 133.000 0.000 NA   NA
 7295362 7295363 SeD_A0289 SeD_A0290     TRUE 0.990 11.000 1.000 NA   NA
 7295363 7295364 SeD_A0290 SeD_A0291   vasA FALSE 0.550 -28.000 0.000 NA   NA
 7295364 7295365 SeD_A0291 SeD_A0292 vasA   TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7295365 7295366 SeD_A0292 SeD_A0293     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295366 7295367 SeD_A0293 SeD_A0294     TRUE 0.650 -13.000 0.000 NA   NA
 7295368 7295369 SeD_A0295 SeD_A0296     FALSE 0.166 100.000 0.000 NA   NA
 7295369 7295370 SeD_A0296 SeD_A0297     FALSE 0.512 24.000 0.000 NA   NA
 7295370 7295371 SeD_A0297 SeD_A0298     FALSE 0.011 274.000 0.000 NA   NA
 7295371 7295372 SeD_A0298 SeD_A0299     TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7295372 7295373 SeD_A0299 SeD_A0300     FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 7295373 7295374 SeD_A0300 SeD_A0301     TRUE 0.776 112.000 0.583 NA   NA
 7295374 7295375 SeD_A0301 SeD_A0302     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7295375 7295376 SeD_A0302 SeD_A0303     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295376 7295377 SeD_A0303 SeD_A0304     TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7295377 7295378 SeD_A0304 SeD_A0305     FALSE 0.010 278.000 0.000 NA   NA
 7295378 7295379 SeD_A0305 SeD_A0306     FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7295379 7295380 SeD_A0306 SeD_A0307     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7295380 7295381 SeD_A0307 SeD_A0308     FALSE 0.468 27.000 0.000 NA   NA
 7295381 7295382 SeD_A0308 SeD_A0309     TRUE 0.931 27.000 0.500 NA   NA
 7295382 7295383 SeD_A0309 SeD_A0310     FALSE 0.003 397.000 0.000 NA   NA
 7295383 7295384 SeD_A0310 SeD_A0311     FALSE 0.512 24.000 0.000 NA   NA
 7295384 7295385 SeD_A0311 SeD_A0312     TRUE 0.562 19.000 0.000 NA   NA
 7295385 7295386 SeD_A0312 SeD_A0313     FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 7295386 7295387 SeD_A0313 SeD_A0314     FALSE 0.105 145.000 0.000 NA   NA
 7295388 7295389 SeD_A0315 SeD_A0316     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 7295390 7295391 SeD_A0317 SeD_A0318     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295393 7295394 SeD_A0320 SeD_A0321     FALSE 0.002 448.000 0.000 NA   NA
 7295394 7295395 SeD_A0321 SeD_A0322     FALSE 0.001 671.000 0.000 NA   NA
 7295395 7295396 SeD_A0322 SeD_A0323     FALSE 0.004 373.000 0.000 NA   NA
 7295397 7295398 SeD_A0324 SeD_A0325     FALSE 0.039 195.000 0.000 NA   NA
 7295399 7295400 SeD_A0326 SeD_A0327     FALSE 0.001 694.000 0.000 NA   NA
 7295402 7295403 SeD_A0329 SeD_A0330     FALSE 0.155 116.000 0.000 NA   NA
 7295403 7295404 SeD_A0330 SeD_A0331     TRUE 0.978 22.000 1.000 1.000   NA
 7295404 7295405 SeD_A0331 SeD_A0332     FALSE 0.004 408.000 0.000 1.000   NA
 7295405 7295406 SeD_A0332 SeD_A0333     FALSE 0.002 481.000 0.000 NA   NA
 7295406 7295407 SeD_A0333 SeD_A0334     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7295408 7295409 SeD_A0335 SeD_A0336     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7295409 7295410 SeD_A0336 SeD_A0337     FALSE 0.186 69.000 0.000 NA   NA
 7295410 7295411 SeD_A0337 SeD_A0338     FALSE 0.007 310.000 0.000 NA   NA
 7295411 7295412 SeD_A0338 SeD_A0339   fadE FALSE 0.158 109.000 0.000 NA   NA
 7295413 7295414 SeD_A0340 SeD_A0341 gmhA   FALSE 0.162 213.000 0.229 1.000   NA
 7295416 7295417 SeD_A0343 SeD_A0344     FALSE 0.024 219.000 0.000 NA   NA
 7295417 7295418 SeD_A0344 SeD_A0345   prfH TRUE 0.973 -3.000 0.303 NA   NA
 7295420 7295421 SeD_A0347 SeD_A0348 gpt frsA FALSE 0.178 89.000 0.000 NA N NA
 7295421 7295422 SeD_A0348 SeD_A0349 frsA   FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7295426 7295427 SeD_A0353 SeD_A0354 proB proA TRUE 0.976 12.000 0.026 0.001 Y NA
 7295427 7295428 SeD_A0354 SeD_A0355 proA   FALSE 0.155 116.000 0.000 NA   NA
 7295429 7295430 SeD_A0356 SeD_A0357     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295431 7295432 SeD_A0358 SeD_A0359     FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 7295432 7295433 SeD_A0359 SeD_A0360     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7295433 7295434 SeD_A0360 SeD_A0361   leuC FALSE 0.184 132.000 0.000 1.000 N NA
 7295434 7295435 SeD_A0361 SeD_A0362 leuC leuD TRUE 0.993 2.000 0.116 0.001 Y NA
 7295435 7295436 SeD_A0362 SeD_A0363 leuD   TRUE 0.714 15.000 0.000 1.000 N NA
 7295436 7295437 SeD_A0363 SeD_A0364     TRUE 0.863 0.000 0.000 1.000   NA
 7295437 7295438 SeD_A0364 SeD_A0365     FALSE 0.445 34.000 0.000 1.000   NA
 7295438 7295439 SeD_A0365 SeD_A0366     FALSE 0.001 1151.000 0.000 NA   NA
 7295440 7295441 SeD_A0367 SeD_A0368     TRUE 0.605 -34.000 0.000 1.000   NA
 7295441 7295442 SeD_A0368 SeD_A0369     TRUE 0.828 5.000 0.000 1.000   NA
 7295442 7295443 SeD_A0369 SeD_A0370     TRUE 0.996 -16.000 1.000 1.000 Y NA
 7295443 7295444 SeD_A0370 SeD_A0371     TRUE 0.927 62.000 0.385 1.000 Y NA
 7295445 7295446 SeD_A0372 SeD_A0373     FALSE 0.081 156.000 0.000 NA   NA
 7295446 7295447 SeD_A0373 SeD_A0374     FALSE 0.006 326.000 0.000 NA   NA
 7295447 7295448 SeD_A0374 SeD_A0375     FALSE 0.499 100.000 0.182 NA N NA
 7295448 7295449 SeD_A0375 SeD_A0376     TRUE 0.978 -27.000 1.000 NA   NA
 7295449 7295450 SeD_A0376 SeD_A0377     FALSE 0.003 400.000 0.000 NA   NA
 7295450 7295451 SeD_A0377 SeD_A0378     FALSE 0.148 144.000 0.000 1.000 N NA
 7295451 7295452 SeD_A0378 SeD_A0379     TRUE 0.724 11.000 0.000 NA   NA
 7295452 7295453 SeD_A0379 SeD_A0380     FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7295454 7295455 SeD_A0381 SeD_A0382     TRUE 0.971 17.000 0.500 0.054 N NA
 7295455 7295456 SeD_A0382 SeD_A0383     TRUE 0.959 -3.000 0.179 1.000 N NA
 7295457 7295458 SeD_A0384 SeD_A0385   cueR TRUE 0.976 -3.000 0.304 1.000 N NA
 7295458 7295459 SeD_A0385 SeD_A0386 cueR   TRUE 0.590 78.000 0.222 1.000 N NA
 7295461 7295462 SeD_A0388 SeD_A0389     FALSE 0.062 189.000 0.000 1.000 N NA
 7295462 7295463 SeD_A0389 SeD_A0390     TRUE 0.893 13.000 0.076 0.057 N NA
 7295463 7295464 SeD_A0390 SeD_A0391     FALSE 0.003 495.000 0.000 1.000 N NA
 7295464 7295465 SeD_A0391 SeD_A0392   cydB TRUE 0.996 -3.000 0.333 0.055 Y NA
 7295465 7295466 SeD_A0392 SeD_A0393 cydB   TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7295466 7295467 SeD_A0393 SeD_A0394     FALSE 0.031 206.000 0.000 NA   NA
 7295467 7295468 SeD_A0394 SeD_A0395     FALSE 0.391 164.000 0.280 1.000 N NA
 7295471 7295472 SeD_A0398 SeD_A0399 prpR prpR FALSE 0.522 -40.000 0.000 NA   NA
 7295473 7295474 SeD_A0400 SeD_A0401 prpB prpC TRUE 0.762 123.000 0.502 1.000 N NA
 7295474 7295475 SeD_A0401 SeD_A0402 prpC prpD TRUE 0.778 38.000 0.216 1.000   NA
 7295475 7295476 SeD_A0402 SeD_A0403 prpD prpE TRUE 0.635 41.000 0.038 0.001   NA
 7295480 7295481 SeD_A0407 SeD_A0408     FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7295482 7295483 SeD_A0409 SeD_A0410     FALSE 0.285 46.000 0.000 NA   NA
 7295484 7295485 SeD_A0411 SeD_A0412 smbA   TRUE 0.741 15.000 0.045 1.000   NA
 7295489 7295490 SeD_A0416 SeD_A0417     FALSE 0.063 169.000 0.000 NA   NA
 7295490 7295491 SeD_A0417 SeD_A0419     FALSE 0.008 297.000 0.000 NA   NA
 7295493 7295494 SeD_A0421 SeD_A0422   adrA TRUE 0.576 92.000 0.250 NA   NA
 7295496 7295497 SeD_A0424 SeD_A0425     FALSE 0.514 -43.000 0.000 NA   NA
 7295497 7295498 SeD_A0425 SeD_A0426   aroL FALSE 0.021 202.000 0.007 NA   NA
 7295498 7295499 SeD_A0426 SeD_A0427 aroL   FALSE 0.468 27.000 0.000 NA   NA
 7295499 7295500 SeD_A0427 SeD_A0428     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 7295500 7295501 SeD_A0428 SeD_A0429     FALSE 0.233 71.000 0.049 NA   NA
 7295504 7295505 SeD_A0432 SeD_A0433     FALSE 0.159 119.000 0.030 NA N NA
 7295505 7295506 SeD_A0433 SeD_A0434     TRUE 0.986 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 7295507 7295508 SeD_A0435 SeD_A0436 phoB phoR TRUE 0.947 70.000 0.453 0.016 Y NA
 7295510 7295511 SeD_A0438 SeD_A0439 brnQ proY TRUE 0.973 15.000 0.087 0.091 Y NA
 7295511 7295512 SeD_A0439 SeD_A0440 proY   FALSE 0.071 162.000 0.000 NA   NA
 7295513 7295514 SeD_A0442 SeD_A0443   acpH FALSE 0.028 210.000 0.014 1.000   NA
 7295515 7295516 SeD_A0444 SeD_A0445 queA tgt TRUE 0.739 197.000 0.360 0.001 Y NA
 7295516 7295517 SeD_A0445 SeD_A0446 tgt yajC TRUE 0.911 23.000 0.325 NA N NA
 7295517 7295518 SeD_A0446 SeD_A0447 yajC secD TRUE 0.900 28.000 0.045 NA Y NA
 7295518 7295519 SeD_A0447 SeD_A0448 secD secF TRUE 0.991 11.000 0.206 0.001 Y NA
 7295519 7295520 SeD_A0448 SeD_A0449 secF   FALSE 0.075 145.000 0.015 NA   NA
 7295520 7295521 SeD_A0449 SeD_A0450     TRUE 0.927 26.000 0.452 NA   NA
 7295521 7295522 SeD_A0450 SeD_A0451     FALSE 0.080 170.000 0.000 1.000   NA
 7295522 7295523 SeD_A0451 SeD_A0452     FALSE 0.003 393.000 0.000 NA   NA
 7295524 7295525 SeD_A0453 SeD_A0454     FALSE 0.007 300.000 0.000 NA   NA
 7295526 7295527 SeD_A0455 SeD_A0456   nrdR FALSE 0.557 -27.000 0.000 NA   NA
 7295527 7295528 SeD_A0456 SeD_A0457 nrdR ribD TRUE 0.968 4.000 0.277 NA N NA
 7295528 7295529 SeD_A0457 SeD_A0458 ribD ribH TRUE 0.779 89.000 0.034 0.002 Y NA
 7295529 7295530 SeD_A0458 SeD_A0459 ribH nusB TRUE 0.931 21.000 0.347 1.000 N NA
 7295530 7295531 SeD_A0459 SeD_A0460 nusB thiL TRUE 0.588 79.000 0.225 1.000 N NA
 7295531 7295532 SeD_A0460 SeD_A0461 thiL pgpA TRUE 0.923 -13.000 0.206 1.000 N NA
 7295533 7295534 SeD_A0462 SeD_A0463   dxs FALSE 0.223 57.000 0.009 1.000 N NA
 7295534 7295535 SeD_A0463 SeD_A0464 dxs ispA TRUE 0.935 24.000 0.060 1.000 Y NA
 7295535 7295536 SeD_A0464 SeD_A0465 ispA xseB TRUE 0.869 1.000 0.035 1.000 N NA
 7295538 7295539 SeD_A0467 SeD_A0468 phnV phnU TRUE 0.980 -6.000 0.375 0.054 N NA
 7295539 7295540 SeD_A0468 SeD_A0469 phnU phnT TRUE 0.990 3.000 0.500 0.054 N NA
 7295540 7295541 SeD_A0469 SeD_A0470 phnT phnS TRUE 0.990 6.000 0.576 0.054 N NA
 7295541 7295542 SeD_A0470 SeD_A0471 phnS   FALSE 0.148 198.000 0.152 1.000 N NA
 7295543 7295544 SeD_A0472 SeD_A0473 phnW   TRUE 0.975 10.000 0.315 0.063   NA
 7295545 7295546 SeD_A0474 SeD_A0475   panE TRUE 0.817 -37.000 0.155 NA   NA
 7295549 7295550 SeD_A0478 SeD_A0479     TRUE 0.863 12.000 0.000 0.011   NA
 7295551 7295552 SeD_A0480 SeD_A0481 cyoE cyoD TRUE 0.902 15.000 0.118 0.091 N NA
 7295552 7295553 SeD_A0481 SeD_A0482 cyoD cyoC TRUE 0.997 0.000 0.485 0.055 Y NA
 7295553 7295554 SeD_A0482 SeD_A0483 cyoC cyoB TRUE 0.996 -10.000 0.697 0.055 Y NA
 7295554 7295555 SeD_A0483 SeD_A0484 cyoB cyoA TRUE 0.979 11.000 0.041 0.005 Y NA
 7295555 7295556 SeD_A0484 SeD_A0485 cyoA   FALSE 0.015 247.000 0.000 NA   NA
 7295556 7295557 SeD_A0485 SeD_A0486   ampG FALSE 0.164 84.000 0.000 NA   NA
 7295557 7295558 SeD_A0486 SeD_A0487 ampG   FALSE 0.302 44.000 0.000 NA   NA
 7295559 7295560 SeD_A0488 SeD_A0489   tig FALSE 0.006 347.000 0.000 NA N NA
 7295560 7295561 SeD_A0489 SeD_A0490 tig clpP TRUE 0.861 140.000 0.351 1.000 Y NA
 7295561 7295562 SeD_A0490 SeD_A0491 clpP clpX FALSE 0.402 252.000 0.352 1.000 Y NA
 7295562 7295563 SeD_A0491 SeD_A0492 clpX lon TRUE 0.632 186.000 0.201 0.095 Y NA
 7295563 7295564 SeD_A0492 SeD_A0493 lon hupB FALSE 0.041 209.000 0.000 1.000 N NA
 7295564 7295565 SeD_A0493 SeD_A0494 hupB ppiD FALSE 0.012 291.000 0.000 1.000 N NA
 7295565 7295566 SeD_A0494 SeD_A0495 ppiD   FALSE 0.131 150.000 0.033 1.000 N NA
 7295566 7295567 SeD_A0495 SeD_A0496     FALSE 0.190 104.000 0.027 1.000   NA
 7295568 7295569 SeD_A0497 SeD_A0498     FALSE 0.193 65.000 0.000 NA   NA
 7295569 7295570 SeD_A0498 SeD_A0499     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7295573 7295574 SeD_A0502 SeD_A0503     TRUE 0.731 41.000 0.179 1.000 N NA
 7295574 7295575 SeD_A0503 SeD_A0504     TRUE 0.998 -7.000 0.911 0.006 Y NA
 7295575 7295576 SeD_A0504 SeD_A0505     FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7295576 7295577 SeD_A0505 SeD_A0506     FALSE 0.252 51.000 0.000 NA   NA
 7295577 7295578 SeD_A0506 SeD_A0507   nrgA TRUE 0.762 32.000 0.156 1.000 N NA
 7295584 7295585 SeD_A0513 SeD_A0514 rpmE2 rpmJ TRUE 0.939 6.000 0.083 0.013   NA
 7295586 7295587 SeD_A0515 SeD_A0516     FALSE 0.327 118.000 0.101 NA   NA
 7295587 7295588 SeD_A0516 SeD_A0517     FALSE 0.103 179.000 0.076 NA   NA
 7295588 7295589 SeD_A0517 SeD_A0518     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7295589 7295590 SeD_A0518 SeD_A0519   acrB FALSE 0.002 496.000 0.000 NA   NA
 7295590 7295591 SeD_A0519 SeD_A0520 acrB acrA TRUE 0.945 23.000 0.458 1.000 N NA
 7295592 7295593 SeD_A0521 SeD_A0522 acrR   FALSE 0.159 125.000 0.000 NA N NA
 7295594 7295595 SeD_A0523 SeD_A0524     FALSE 0.197 70.000 0.037 NA   NA
 7295595 7295596 SeD_A0524 SeD_A0525     TRUE 0.964 14.000 0.474 NA   NA
 7295597 7295598 SeD_A0526 SeD_A0527   apt FALSE 0.105 153.000 0.043 NA   NA
 7295598 7295599 SeD_A0527 SeD_A0528 apt dnaX FALSE 0.353 114.000 0.088 1.000 N NA
 7295599 7295600 SeD_A0528 SeD_A0530 dnaX   TRUE 0.830 46.000 0.411 NA   NA
 7295600 7295601 SeD_A0530 SeD_A0531   recR TRUE 0.989 0.000 0.604 NA   NA
 7295601 7295602 SeD_A0531 SeD_A0532 recR htpG FALSE 0.201 111.000 0.028 1.000 N NA
 7295602 7295603 SeD_A0532 SeD_A0533 htpG   FALSE 0.164 88.000 0.000 NA   NA
 7295603 7295604 SeD_A0533 SeD_A0534   adk FALSE 0.133 133.000 0.000 NA   NA
 7295604 7295605 SeD_A0534 SeD_A0535 adk   FALSE 0.168 79.000 0.000 NA   NA
 7295605 7295606 SeD_A0535 SeD_A0536   hemH TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7295615 7295616 SeD_A0545 SeD_A0546     FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7295616 7295617 SeD_A0546 SeD_A0547   copA FALSE 0.086 154.000 0.000 NA   NA
 7295619 7295620 SeD_A0549 SeD_A0550     TRUE 0.994 -3.000 0.313 NA Y NA
 7295621 7295622 SeD_A0551 SeD_A0552     TRUE 0.860 -13.000 0.127 NA   NA
 7295623 7295624 SeD_A0553 SeD_A0554     TRUE 0.695 33.000 0.118 1.000   NA
 7295624 7295625 SeD_A0554 SeD_A0556     FALSE 0.179 155.000 0.072 1.000   NA
 7295626 7295627 SeD_A0555 SeD_A0557     TRUE 0.996 -3.000 0.535 NA Y NA
 7295627 7295628 SeD_A0557 SeD_A0558     FALSE 0.052 186.000 0.034 NA N NA
 7295628 7295629 SeD_A0558 SeD_A0559     FALSE 0.015 257.000 0.000 NA N NA
 7295629 7295630 SeD_A0559 SeD_A0560     TRUE 0.945 37.000 0.261 NA Y NA
 7295630 7295631 SeD_A0560 SeD_A0561     TRUE 0.997 -7.000 0.957 1.000 Y NA
 7295632 7295633 SeD_A0562 SeD_A0563 ybbB   FALSE 0.177 70.000 0.012 1.000   NA
 7295634 7295635 SeD_A0564 SeD_A0565 allA allR TRUE 0.826 79.000 0.625 1.000 N NA
 7295635 7295636 SeD_A0565 SeD_A0566 allR gcl FALSE 0.266 85.000 0.054 1.000   NA
 7295636 7295637 SeD_A0566 SeD_A0567 gcl hyi TRUE 0.817 13.000 0.065 1.000   NA
 7295637 7295638 SeD_A0567 SeD_A0568 hyi   FALSE 0.481 101.000 0.154 1.000 N NA
 7295638 7295639 SeD_A0568 SeD_A0569     FALSE 0.312 66.000 0.051 1.000 N NA
 7295639 7295640 SeD_A0569 SeD_A0570     TRUE 0.616 96.000 0.250 1.000 N NA
 7295640 7295641 SeD_A0570 SeD_A0571   allB TRUE 0.823 79.000 0.161 1.000 Y NA
 7295641 7295642 SeD_A0571 SeD_A0572 allB   TRUE 0.859 59.000 0.161 1.000 Y NA
 7295642 7295643 SeD_A0572 SeD_A0573     TRUE 0.820 23.000 0.133 1.000 N NA
 7295644 7295645 SeD_A0574 SeD_A0575   allC TRUE 0.811 11.000 0.059 NA   NA
 7295645 7295646 SeD_A0575 SeD_A0576 allC allD TRUE 0.860 22.000 0.174 1.000 N NA
 7295647 7295648 SeD_A0577 SeD_A0578     TRUE 0.974 10.000 0.412 NA   NA
 7295648 7295649 SeD_A0578 SeD_A0579     TRUE 0.820 33.000 0.265 NA   NA
 7295649 7295650 SeD_A0579 SeD_A0580   arcC TRUE 0.977 4.000 0.375 NA   NA
 7295651 7295652 SeD_A0581 SeD_A0582 purK purE TRUE 0.993 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 7295652 7295653 SeD_A0582 SeD_A0583 purE lpxH FALSE 0.154 118.000 0.016 1.000   NA
 7295653 7295654 SeD_A0583 SeD_A0584 lpxH ppiB TRUE 0.969 3.000 0.237 1.000   NA
 7295656 7295657 SeD_A0586 SeD_A0587     TRUE 0.873 -3.000 0.059 NA   NA
 7295657 7295658 SeD_A0587 SeD_A0588     TRUE 0.858 -7.000 0.087 NA   NA
 7295658 7295659 SeD_A0588 SeD_A0589     FALSE 0.097 127.000 0.011 NA   NA
 7295659 7295660 SeD_A0589 SeD_A0590   folD TRUE 0.894 2.000 0.055 1.000   NA
 7295661 7295662 SeD_A0591 SeD_A0592     FALSE 0.177 74.000 0.000 NA   NA
 7295662 7295663 SeD_A0592 SeD_A0593     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7295663 7295664 SeD_A0593 SeD_A0594     FALSE 0.302 44.000 0.000 NA   NA
 7295664 7295665 SeD_A0594 SeD_A0595     TRUE 0.989 31.000 0.875 1.000 Y NA
 7295665 7295666 SeD_A0595 SeD_A0596     TRUE 0.995 15.000 0.875 NA Y NA
 7295666 7295667 SeD_A0596 SeD_A0597     TRUE 0.997 10.000 0.875 NA Y NA
 7295668 7295669 SeD_A0598 SeD_A0599     FALSE 0.002 604.000 0.000 NA   NA
 7295669 7295670 SeD_A0599 SeD_A0600     FALSE 0.526 -39.000 0.000 NA   NA
 7295670 7295671 SeD_A0600 SeD_A0601     FALSE 0.005 378.000 0.000 1.000   NA
 7295673 7295674 SeD_A0603 SeD_A0604     FALSE 0.001 652.000 0.000 NA   NA
 7295674 7295675 SeD_A0604 SeD_A0605     FALSE 0.164 82.000 0.000 NA   NA
 7295675 7295676 SeD_A0605 SeD_A0606     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7295676 7295677 SeD_A0606 SeD_A0607     TRUE 0.980 -3.000 0.400 NA   NA
 7295677 7295678 SeD_A0607 SeD_A0608     FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7295678 7295679 SeD_A0608 SeD_A0609     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295679 7295680 SeD_A0609 SeD_A0610     TRUE 0.984 11.000 0.667 NA   NA
 7295680 7295681 SeD_A0610 SeD_A0611     FALSE 0.002 573.000 0.000 NA   NA
 7295681 7295682 SeD_A0611 SeD_A0612     TRUE 0.991 1.000 0.667 1.000   NA
 7295682 7295683 SeD_A0612 SeD_A0613     TRUE 0.762 9.000 0.000 NA   NA
 7295683 7295684 SeD_A0613 SeD_A0614     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295684 7295685 SeD_A0614 SeD_A0615     FALSE 0.006 332.000 0.000 NA   NA
 7295685 7295686 SeD_A0615 SeD_A0616     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 7295686 7295687 SeD_A0616 SeD_A0617     FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 7295688 7295689 SeD_A0618 SeD_A0619     FALSE 0.101 147.000 0.000 NA   NA
 7295690 7295691 SeD_A0620 SeD_A0622     FALSE 0.001 804.000 0.000 NA   NA
 7295692 7295693 SeD_A0621 SeD_A0623     FALSE 0.005 344.000 0.000 NA   NA
 7295693 7295694 SeD_A0623 SeD_A0624     FALSE 0.076 174.000 0.000 1.000   NA
 7295694 7295695 SeD_A0624 SeD_A0625     TRUE 0.992 -3.000 0.571 0.009   NA
 7295695 7295696 SeD_A0625 SeD_A0626     TRUE 0.774 56.000 0.400 NA   NA
 7295696 7295697 SeD_A0626 SeD_A0627     TRUE 0.921 -3.000 0.105 NA   NA
 7295697 7295698 SeD_A0627 SeD_A0628     FALSE 0.006 316.000 0.000 NA   NA
 7295698 7295699 SeD_A0628 SeD_A0629     FALSE 0.001 1272.000 0.000 NA   NA
 7295699 7295700 SeD_A0629 SeD_A0630     FALSE 0.004 380.000 0.000 NA   NA
 7295700 7295701 SeD_A0630 SeD_A0631     TRUE 0.621 -16.000 0.000 NA   NA
 7295701 7295702 SeD_A0631 SeD_A0632     TRUE 0.849 -3.000 0.000 1.000   NA
 7295704 7295705 SeD_A0634 SeD_A0635     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 7295705 7295706 SeD_A0635 SeD_A0636     FALSE 0.003 436.000 0.000 NA   NA
 7295706 7295707 SeD_A0636 SeD_A0637     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 7295707 7295708 SeD_A0637 SeD_A0638     TRUE 0.916 -22.000 0.286 NA   NA
 7295708 7295709 SeD_A0638 SeD_A0639     TRUE 0.945 0.000 0.143 NA   NA
 7295709 7295710 SeD_A0639 SeD_A0640     TRUE 0.937 14.000 0.286 NA   NA
 7295710 7295711 SeD_A0640 SeD_A0641     TRUE 0.951 0.000 0.161 NA   NA
 7295711 7295712 SeD_A0641 SeD_A0642     FALSE 0.327 41.000 0.000 NA   NA
 7295712 7295713 SeD_A0642 SeD_A0643     TRUE 0.621 -16.000 0.000 NA   NA
 7295713 7295714 SeD_A0643 SeD_A0644     TRUE 0.943 -40.000 0.500 NA   NA
 7295714 7295715 SeD_A0644 SeD_A0645     TRUE 0.968 4.000 0.286 NA   NA
 7295715 7295716 SeD_A0645 SeD_A0646     TRUE 0.992 0.000 0.750 NA   NA
 7295716 7295717 SeD_A0646 SeD_A0647     TRUE 0.988 3.000 0.600 NA   NA
 7295717 7295718 SeD_A0647 SeD_A0648     TRUE 0.961 11.000 0.333 NA   NA
 7295718 7295719 SeD_A0648 SeD_A0649     TRUE 0.953 0.000 0.167 NA   NA
 7295720 7295721 SeD_A0650 SeD_A0651     FALSE 0.003 410.000 0.000 NA   NA
 7295721 7295722 SeD_A0651 SeD_A0652     FALSE 0.166 100.000 0.000 NA   NA
 7295724 7295725 SeD_A0654 SeD_A0655     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7295725 7295726 SeD_A0655 SeD_A0656     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295726 7295727 SeD_A0656 SeD_A0657     FALSE 0.001 879.000 0.000 NA   NA
 7295727 7295728 SeD_A0657 SeD_A0658     FALSE 0.004 387.000 0.000 NA   NA
 7295728 7295729 SeD_A0658 SeD_A0659     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7295729 7295730 SeD_A0659 SeD_A0660     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295730 7295731 SeD_A0660 SeD_A0661     FALSE 0.003 425.000 0.000 NA   NA
 7295731 7295732 SeD_A0661 SeD_A0662     FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 7295735 7295736 SeD_A0665 SeD_A0666     TRUE 0.662 157.000 0.667 NA   NA
 7295736 7295737 SeD_A0666 SeD_A0667     TRUE 0.718 13.000 0.043 NA   NA
 7295741 7295742 SeD_A0671 SeD_A0672     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7295742 7295743 SeD_A0672 SeD_A0673     FALSE 0.500 -130.000 0.000 NA   NA
 7295744 7295745 SeD_A0674 SeD_A0675     TRUE 0.822 97.000 0.667 NA   NA
 7295745 7295746 SeD_A0675 SeD_A0676     TRUE 0.963 0.000 0.208 NA   NA
 7295748 7295749 SeD_A0678 SeD_A0679     TRUE 0.877 91.000 1.000 NA   NA
 7295749 7295750 SeD_A0679 SeD_A0680     TRUE 0.753 12.000 0.000 1.000   NA
 7295750 7295751 SeD_A0680 SeD_A0681     TRUE 0.914 47.000 0.700 1.000 N NA
 7295752 7295753 SeD_A0682 SeD_A0683     TRUE 0.864 31.000 0.320 NA   NA
 7295753 7295754 SeD_A0683 SeD_A0684   entF TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295754 7295755 SeD_A0684 SeD_A0685 entF   FALSE 0.021 250.000 0.000 1.000 N NA
 7295756 7295757 SeD_A0686 SeD_A0687     TRUE 0.985 -3.000 0.077 1.000 Y NA
 7295757 7295758 SeD_A0687 SeD_A0688     TRUE 0.996 0.000 0.300 0.052 Y NA
 7295761 7295762 SeD_A0691 SeD_A0692   entE TRUE 0.971 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7295762 7295763 SeD_A0692 SeD_A0693 entE   TRUE 0.955 14.000 0.000 1.000 Y NA
 7295763 7295764 SeD_A0693 SeD_A0694     TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7295764 7295765 SeD_A0694 SeD_A0695     TRUE 0.982 3.000 0.065 NA Y NA
 7295765 7295766 SeD_A0695 SeD_A0696   cstA FALSE 0.246 182.000 0.222 NA N NA
 7295766 7295767 SeD_A0696 SeD_A0697 cstA   TRUE 0.698 64.000 0.333 NA   NA
 7295770 7295771 SeD_A0701 SeD_A0702     TRUE 0.930 -27.000 0.333 1.000   NA
 7295771 7295772 SeD_A0702 SeD_A0703     FALSE 0.122 150.000 0.000 1.000   NA
 7295772 7295773 SeD_A0703 SeD_A0704   dsbG FALSE 0.007 317.000 0.000 NA N NA
 7295774 7295775 SeD_A0705 SeD_A0706 ahpC ahpF FALSE 0.016 242.000 0.000 NA   NA
 7295775 7295776 SeD_A0706 SeD_A0707 ahpF   FALSE 0.006 333.000 0.000 NA   NA
 7295776 7295777 SeD_A0707 SeD_A0709     FALSE 0.021 224.000 0.000 NA   NA
 7295777 7295778 SeD_A0709 SeD_A0710     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295778 7295779 SeD_A0710 SeD_A0711     TRUE 0.995 0.000 1.000 1.000   NA
 7295781 7295782 SeD_A0713 SeD_A0714     FALSE 0.163 85.000 0.000 NA   NA
 7295783 7295784 SeD_A0715 SeD_A0716     FALSE 0.018 235.000 0.000 NA   NA
 7295784 7295785 SeD_A0716 SeD_A0717     FALSE 0.503 -112.000 0.000 NA   NA
 7295785 7295786 SeD_A0717 SeD_A0718     FALSE 0.157 110.000 0.000 NA   NA
 7295786 7295787 SeD_A0718 SeD_A0719   citG FALSE 0.065 167.000 0.000 NA   NA
 7295787 7295788 SeD_A0719 SeD_A0720 citG citX TRUE 0.985 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 7295788 7295789 SeD_A0720 SeD_A0721 citX citF TRUE 0.966 4.000 0.231 1.000 N NA
 7295789 7295790 SeD_A0721 SeD_A0722 citF citE TRUE 0.983 10.000 0.373 0.002 N NA
 7295790 7295791 SeD_A0722 SeD_A0723 citE citD TRUE 0.992 -3.000 0.537 0.002 N NA
 7295791 7295792 SeD_A0723 SeD_A0724 citD citC TRUE 0.979 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7295793 7295794 SeD_A0725 SeD_A0726     FALSE 0.050 182.000 0.000 NA   NA
 7295794 7295795 SeD_A0726 SeD_A0727     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7295797 7295798 SeD_A0729 SeD_A0730 pagP cspE FALSE 0.333 188.000 0.333 1.000   NA
 7295800 7295801 SeD_A0732 SeD_A0733   tatE FALSE 0.491 129.000 0.196 1.000   NA
 7295802 7295803 SeD_A0734 SeD_A0735 lipA   FALSE 0.327 41.000 0.000 NA   NA
 7295803 7295804 SeD_A0735 SeD_A0736     FALSE 0.413 31.000 0.000 NA   NA
 7295804 7295805 SeD_A0736 SeD_A0737   lipB FALSE 0.010 302.000 0.000 1.000 N NA
 7295805 7295806 SeD_A0737 SeD_A0738 lipB   FALSE 0.538 100.000 0.219 NA   NA
 7295806 7295807 SeD_A0738 SeD_A0739   dacA FALSE 0.291 109.000 0.081 NA   NA
 7295807 7295808 SeD_A0739 SeD_A0740 dacA   TRUE 0.883 140.000 0.475 NA Y NA
 7295808 7295809 SeD_A0740 SeD_A0741   mrdB TRUE 0.750 11.000 0.035 NA N NA
 7295809 7295810 SeD_A0741 SeD_A0742 mrdB mrdA TRUE 0.882 3.000 0.046 1.000 N NA
 7295810 7295811 SeD_A0742 SeD_A0743 mrdA   FALSE 0.405 31.000 0.031 NA   NA
 7295811 7295812 SeD_A0743 SeD_A0744     TRUE 0.971 4.000 0.307 NA   NA
 7295812 7295813 SeD_A0744 SeD_A0745     FALSE 0.119 140.000 0.000 NA   NA
 7295813 7295814 SeD_A0745 SeD_A0746   cobC FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 7295816 7295817 SeD_A0748 SeD_A0749 nadD holA TRUE 0.819 -7.000 0.045 1.000 N NA
 7295817 7295818 SeD_A0749 SeD_A0750 holA   TRUE 0.963 0.000 0.199 NA N NA
 7295818 7295819 SeD_A0750 SeD_A0751   leuS TRUE 0.898 15.000 0.182 NA N NA
 7295820 7295821 SeD_A0752 SeD_A0753     TRUE 0.961 -37.000 0.409 0.001   NA
 7295821 7295822 SeD_A0753 SeD_A0754     FALSE 0.316 50.000 0.000 1.000   NA
 7295822 7295823 SeD_A0754 SeD_A0755     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 7295823 7295824 SeD_A0755 SeD_A0756     FALSE 0.190 67.000 0.000 NA   NA
 7295824 7295825 SeD_A0756 SeD_A0757     FALSE 0.167 93.000 0.000 NA   NA
 7295827 7295828 SeD_A0759 SeD_A0760     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295828 7295829 SeD_A0760 SeD_A0761     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7295829 7295830 SeD_A0761 SeD_A0762     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295831 7295832 SeD_A0763 SeD_A0764     FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7295832 7295833 SeD_A0764 SeD_A0765   rihA FALSE 0.400 32.000 0.000 NA   NA
 7295833 7295834 SeD_A0765 SeD_A0766 rihA gltL FALSE 0.494 117.000 0.195 NA N NA
 7295834 7295835 SeD_A0766 SeD_A0767 gltL gltK TRUE 0.996 0.000 0.379 1.000 Y NA
 7295835 7295836 SeD_A0767 SeD_A0768 gltK gltJ TRUE 0.999 0.000 0.933 0.016 Y NA
 7295836 7295837 SeD_A0768 SeD_A0769 gltJ sroC TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7295837 7295838 SeD_A0769 SeD_A0770 sroC gltI TRUE 0.753 -4.000 0.000 NA   NA
 7295838 7295839 SeD_A0770 SeD_A0771 gltI lnt FALSE 0.007 355.000 0.000 1.000 N NA
 7295839 7295840 SeD_A0771 SeD_A0772 lnt corC TRUE 0.960 -31.000 0.557 1.000 N NA
 7295840 7295841 SeD_A0772 SeD_A0773 corC   TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295841 7295842 SeD_A0773 SeD_A0774     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7295842 7295843 SeD_A0774 SeD_A0775     TRUE 0.983 -3.000 0.457 NA   NA
 7295843 7295844 SeD_A0775 SeD_A0776   miaB FALSE 0.184 205.000 0.220 1.000 N NA
 7295846 7295847 SeD_A0778 SeD_A0779     FALSE 0.130 135.000 0.000 NA   NA
 7295847 7295848 SeD_A0779 SeD_A0780     FALSE 0.317 42.000 0.000 NA   NA
 7295848 7295849 SeD_A0780 SeD_A0781     FALSE 0.293 45.000 0.000 NA   NA
 7295849 7295850 SeD_A0781 SeD_A0782     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7295850 7295851 SeD_A0782 SeD_A0783     FALSE 0.369 35.000 0.000 NA   NA
 7295851 7295852 SeD_A0783 SeD_A0784     FALSE 0.522 23.000 0.000 NA   NA
 7295852 7295853 SeD_A0784 SeD_A0785     TRUE 0.772 7.000 0.000 NA   NA
 7295853 7295854 SeD_A0785 SeD_A0786   asnB FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7295854 7295855 SeD_A0786 SeD_A0787 asnB   FALSE 0.012 291.000 0.000 1.000 N NA
 7295855 7295856 SeD_A0787 SeD_A0788   nagC TRUE 0.849 47.000 0.070 1.000 Y NA
 7295856 7295857 SeD_A0788 SeD_A0789 nagC nagA TRUE 0.996 5.000 0.571 1.000 Y NA
 7295857 7295858 SeD_A0789 SeD_A0790 nagA nagB TRUE 0.968 60.000 0.557 0.001 Y NA
 7295859 7295860 SeD_A0791 SeD_A0792 nagE glnS FALSE 0.027 211.000 0.006 1.000 N NA
 7295860 7295861 SeD_A0792 SeD_A0793 glnS   FALSE 0.001 661.000 0.000 NA   NA
 7295861 7295862 SeD_A0793 SeD_A0794     FALSE 0.155 116.000 0.000 NA   NA
 7295862 7295863 SeD_A0794 SeD_A0795     FALSE 0.258 50.000 0.000 NA   NA
 7295864 7295865 SeD_A0796 SeD_A0797     FALSE 0.389 51.000 0.069 NA   NA
 7295865 7295866 SeD_A0797 SeD_A0798   cobZ TRUE 0.974 -13.000 0.618 NA   NA
 7295866 7295867 SeD_A0798 SeD_A0799 cobZ   FALSE 0.282 98.000 0.053 1.000 N NA
 7295867 7295868 SeD_A0799 SeD_A0800   fur FALSE 0.286 115.000 0.020 0.065 N NA
 7295868 7295869 SeD_A0800 SeD_A0801 fur fldA FALSE 0.044 282.000 0.156 1.000 N NA
 7295869 7295870 SeD_A0801 SeD_A0803 fldA   TRUE 0.835 52.000 0.473 1.000   NA
 7295873 7295874 SeD_A0805 SeD_A0806 seqA pgm TRUE 0.821 25.000 0.151 1.000 N NA
 7295875 7295876 SeD_A0807 SeD_A0808   potE FALSE 0.403 47.000 0.050 1.000   NA
 7295876 7295877 SeD_A0808 SeD_A0809 potE speF TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7295877 7295878 SeD_A0809 SeD_A0810 speF   FALSE 0.002 763.000 0.000 1.000 N NA
 7295878 7295879 SeD_A0810 SeD_A0811     TRUE 0.995 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 7295879 7295880 SeD_A0811 SeD_A0812   kdpC TRUE 0.933 -3.000 0.100 1.000 N NA
 7295880 7295881 SeD_A0812 SeD_A0813 kdpC kdpB TRUE 0.998 9.000 0.877 0.001 Y NA
 7295881 7295882 SeD_A0813 SeD_A0814 kdpB kdpA TRUE 0.981 21.000 0.201 0.001 Y NA
 7295882 7295883 SeD_A0814 SeD_A0815 kdpA kdpF TRUE 0.941 0.000 0.000 0.001   NA
 7295884 7295885 SeD_A0816 SeD_A0817     FALSE 0.094 112.000 0.004 NA   NA
 7295887 7295888 SeD_A0819 SeD_A0820     TRUE 0.686 16.000 0.050 NA   NA
 7295888 7295889 SeD_A0820 SeD_A0821     TRUE 0.993 -6.000 0.379 NA Y NA
 7295889 7295890 SeD_A0821 SeD_A0822     TRUE 0.923 -10.000 0.211 NA   NA
 7295890 7295891 SeD_A0822 SeD_A0823     FALSE 0.200 122.000 0.037 1.000   NA
 7295892 7295893 SeD_A0824 SeD_A0825   gltA FALSE 0.076 137.000 0.005 NA   NA
 7295894 7295895 SeD_A0826 SeD_A0827 sdhC sdhD TRUE 0.996 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 7295895 7295896 SeD_A0827 SeD_A0828 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.002 Y NA
 7295896 7295897 SeD_A0828 SeD_A0829 sdhA sdhB TRUE 0.996 14.000 0.604 0.002 Y NA
 7295897 7295898 SeD_A0829 SeD_A0830 sdhB sucA FALSE 0.026 526.000 0.067 1.000 Y NA
 7295898 7295899 SeD_A0830 SeD_A0831 sucA sucB TRUE 0.994 15.000 0.667 1.000 Y NA
 7295899 7295900 SeD_A0831 SeD_A0832 sucB sucC TRUE 0.728 142.000 0.136 1.000 Y NA
 7295900 7295901 SeD_A0832 SeD_A0833 sucC   TRUE 0.999 0.000 0.806 0.001 Y NA
 7295901 7295902 SeD_A0833 SeD_A0834     FALSE 0.435 29.000 0.000 NA   NA
 7295902 7295903 SeD_A0834 SeD_A0835     FALSE 0.164 87.000 0.000 NA   NA
 7295903 7295904 SeD_A0835 SeD_A0836   cydA FALSE 0.001 1217.000 0.000 NA   NA
 7295904 7295905 SeD_A0836 SeD_A0837 cydA cydB1 TRUE 0.959 16.000 0.000 0.052 Y NA
 7295905 7295906 SeD_A0837 SeD_A0838 cydB1   TRUE 0.868 15.000 0.149 NA   NA
 7295906 7295907 SeD_A0838 SeD_A0839     TRUE 0.976 0.000 0.310 NA   NA
 7295907 7295908 SeD_A0839 SeD_A0840     FALSE 0.050 229.000 0.095 NA   NA
 7295908 7295909 SeD_A0840 SeD_A0841   tolQ TRUE 0.989 -3.000 0.593 1.000   NA
 7295909 7295910 SeD_A0841 SeD_A0842 tolQ tolR TRUE 0.997 4.000 0.556 0.064 Y NA
 7295910 7295911 SeD_A0842 SeD_A0843 tolR tolA FALSE 0.427 65.000 0.114 NA N NA
 7295911 7295912 SeD_A0843 SeD_A0844 tolA tolB FALSE 0.213 121.000 0.051 NA N NA
 7295912 7295913 SeD_A0844 SeD_A0845 tolB pal TRUE 0.927 35.000 0.592 1.000 N NA
 7295913 7295914 SeD_A0845 SeD_A0846 pal   TRUE 0.895 10.000 0.088 1.000   NA
 7295914 7295915 SeD_A0846 SeD_A0847     FALSE 0.068 164.000 0.000 NA   NA
 7295915 7295916 SeD_A0847 SeD_A0848     FALSE 0.128 136.000 0.000 NA   NA
 7295916 7295917 SeD_A0848 SeD_A0849     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7295917 7295918 SeD_A0849 SeD_A0850     FALSE 0.123 138.000 0.000 NA   NA
 7295918 7295919 SeD_A0850 SeD_A0851   nadA FALSE 0.018 234.000 0.000 NA   NA
 7295919 7295920 SeD_A0851 SeD_A0852 nadA   TRUE 0.913 25.000 0.023 1.000 Y NA
 7295921 7295922 SeD_A0853 SeD_A0854     FALSE 0.228 111.000 0.057 NA   NA
 7295924 7295925 SeD_A0856 SeD_A0857     TRUE 0.989 15.000 0.262 0.002 Y NA
 7295928 7295929 SeD_A0860 SeD_A0861     FALSE 0.371 89.000 0.000 0.008 N NA
 7295929 7295930 SeD_A0861 SeD_A0862   oadA TRUE 0.996 16.000 0.720 0.003 Y NA
 7295930 7295931 SeD_A0862 SeD_A0863 oadA   TRUE 0.997 13.000 0.886 0.003 Y NA
 7295931 7295932 SeD_A0863 SeD_A0864     FALSE 0.133 119.000 0.019 NA N NA
 7295932 7295933 SeD_A0864 SeD_A0865     FALSE 0.004 380.000 0.000 NA N NA
 7295933 7295934 SeD_A0865 SeD_A0866     TRUE 0.998 0.000 0.833 1.000 Y NA
 7295935 7295936 SeD_A0867 SeD_A0868 gpmA galM FALSE 0.175 224.000 0.009 1.000 Y NA
 7295936 7295937 SeD_A0868 SeD_A0869 galM galK TRUE 0.987 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 7295937 7295938 SeD_A0869 SeD_A0870 galK galT TRUE 0.988 3.000 0.370 0.001 N NA
 7295938 7295939 SeD_A0870 SeD_A0871 galT galE TRUE 0.919 11.000 0.053 0.001 N NA
 7295939 7295940 SeD_A0871 SeD_A0872 galE   FALSE 0.022 223.000 0.000 NA   NA
 7295940 7295941 SeD_A0872 SeD_A0873     FALSE 0.060 171.000 0.000 NA   NA
 7295941 7295942 SeD_A0873 SeD_A0874     FALSE 0.347 68.000 0.000 0.090   NA
 7295943 7295944 SeD_A0875 SeD_A0876   modA FALSE 0.120 167.000 0.072 NA   NA
 7295944 7295945 SeD_A0876 SeD_A0877 modA modB TRUE 0.998 0.000 0.627 0.001 Y NA
 7295945 7295946 SeD_A0877 SeD_A0878 modB modC TRUE 0.998 3.000 0.537 0.001 Y NA
 7295950 7295951 SeD_A0882 SeD_A0883 hutI hutG TRUE 0.958 -3.000 0.171 1.000 N NA
 7295951 7295952 SeD_A0883 SeD_A0884 hutG hutC FALSE 0.482 45.000 0.062 1.000 N NA
 7295952 7295953 SeD_A0884 SeD_A0885 hutC hutU FALSE 0.055 197.000 0.037 1.000 N NA
 7295953 7295954 SeD_A0885 SeD_A0886 hutU hutH TRUE 0.996 2.000 0.315 0.001 Y NA
 7295955 7295956 SeD_A0887 SeD_A0888   bioA FALSE 0.170 48.000 0.003 NA   NA
 7295957 7295958 SeD_A0889 SeD_A0890 bioB bioF TRUE 0.994 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 7295958 7295959 SeD_A0890 SeD_A0891 bioF bioC TRUE 0.981 -16.000 0.133 0.002 Y NA
 7295959 7295960 SeD_A0891 SeD_A0892 bioC bioD TRUE 0.981 -7.000 0.054 0.002 Y NA
 7295960 7295961 SeD_A0892 SeD_A0893 bioD uvrB FALSE 0.004 651.000 0.000 0.090 N NA
 7295961 7295962 SeD_A0893 SeD_A0894 uvrB   FALSE 0.003 490.000 0.000 1.000   NA
 7295964 7295965 SeD_A0896 SeD_A0897 moaA moaB TRUE 0.968 22.000 0.108 0.004 Y NA
 7295965 7295966 SeD_A0897 SeD_A0898 moaB moaC TRUE 0.991 3.000 0.109 0.004 Y NA
 7295966 7295967 SeD_A0898 SeD_A0899 moaC moaD TRUE 0.990 -7.000 0.175 0.004 Y NA
 7295967 7295968 SeD_A0899 SeD_A0900 moaD moaE TRUE 0.998 2.000 0.501 0.004 Y NA
 7295968 7295969 SeD_A0900 SeD_A0901 moaE   FALSE 0.242 48.000 0.025 NA   NA
 7295969 7295970 SeD_A0901 SeD_A0902     FALSE 0.112 145.000 0.037 NA   NA
 7295970 7295971 SeD_A0902 SeD_A0903     FALSE 0.425 30.000 0.000 NA   NA
 7295971 7295972 SeD_A0903 SeD_A0904     TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7295972 7295973 SeD_A0904 SeD_A0905     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295974 7295975 SeD_A0906 SeD_A0907     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7295975 7295976 SeD_A0907 SeD_A0908     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295978 7295979 SeD_A0910 SeD_A0911     TRUE 0.858 116.000 0.609 0.005 N NA
 7295979 7295980 SeD_A0911 SeD_A0912     TRUE 0.985 -7.000 0.547 0.090   NA
 7295980 7295981 SeD_A0912 SeD_A0913     TRUE 0.980 -7.000 0.545 1.000   NA
 7295981 7295982 SeD_A0913 SeD_A0914     TRUE 0.973 0.000 0.236 1.000 N NA
 7295983 7295984 SeD_A0915 SeD_A0916   dinG FALSE 0.304 208.000 0.029 0.090 Y NA
 7295984 7295985 SeD_A0916 SeD_A0917 dinG   FALSE 0.545 30.000 0.041 1.000 N NA
 7295990 7295991 SeD_A0922 SeD_A0923   glnQ FALSE 0.182 119.000 0.039 NA N NA
 7295991 7295992 SeD_A0923 SeD_A0924 glnQ glnP TRUE 0.978 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 7295992 7295993 SeD_A0924 SeD_A0925 glnP glnH TRUE 0.642 144.000 0.000 0.064 Y NA
 7295993 7295994 SeD_A0925 SeD_A0926 glnH   FALSE 0.003 477.000 0.000 1.000 N NA
 7295994 7295995 SeD_A0926 SeD_A0927     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7295995 7295996 SeD_A0927 SeD_A0928     FALSE 0.435 29.000 0.000 NA   NA
 7295999 7296000 SeD_A0931 SeD_A0932     FALSE 0.355 37.000 0.000 NA   NA
 7296000 7296001 SeD_A0932 SeD_A0933     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 7296001 7296002 SeD_A0933 SeD_A0934     TRUE 0.820 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7296004 7296005 SeD_A0936 SeD_A0937     FALSE 0.001 710.000 0.000 NA   NA
 7296005 7296006 SeD_A0937 SeD_A0939     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7296007 7296008 SeD_A0940 SeD_A0941     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 7296009 7296010 SeD_A0942 SeD_A0943     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296011 7296012 SeD_A0944 SeD_A0945     TRUE 0.982 6.000 0.316 0.003 N NA
 7296012 7296013 SeD_A0945 SeD_A0946   moeB FALSE 0.014 278.000 0.000 1.000 N NA
 7296013 7296014 SeD_A0946 SeD_A0947 moeB   TRUE 0.997 0.000 0.323 0.004 Y NA
 7296015 7296016 SeD_A0948 SeD_A0949     TRUE 0.777 11.000 0.000 1.000   NA
 7296016 7296017 SeD_A0949 SeD_A0950     FALSE 0.457 33.000 0.000 1.000   NA
 7296017 7296018 SeD_A0950 SeD_A0951   gsiC TRUE 0.975 61.000 0.803 0.051 Y NA
 7296018 7296019 SeD_A0951 SeD_A0952 gsiC   TRUE 0.998 3.000 0.689 0.051 Y NA
 7296021 7296022 SeD_A0954 SeD_A0955   bssR FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 7296022 7296023 SeD_A0955 SeD_A0956 bssR   FALSE 0.001 713.000 0.000 NA   NA
 7296023 7296024 SeD_A0956 SeD_A0957     TRUE 0.610 23.000 0.000 1.000 N NA
 7296024 7296025 SeD_A0957 SeD_A0958     TRUE 0.976 11.000 0.000 0.015 Y NA
 7296025 7296026 SeD_A0958 SeD_A0959     FALSE 0.387 33.000 0.000 NA   NA
 7296026 7296027 SeD_A0959 SeD_A0960     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7296027 7296028 SeD_A0960 SeD_A0961     FALSE 0.006 448.000 0.000 0.052 N NA
 7296029 7296030 SeD_A0962 SeD_A0963     FALSE 0.015 265.000 0.000 1.000   NA
 7296031 7296032 SeD_A0964 SeD_A0965     FALSE 0.541 21.000 0.000 NA   NA
 7296035 7296036 SeD_A0968 SeD_A0969     TRUE 0.616 72.000 0.235 1.000   NA
 7296038 7296039 SeD_A0971 SeD_A0972     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296041 7296042 SeD_A0974 SeD_A0975 rybB   FALSE 0.166 80.000 0.000 NA   NA
 7296045 7296046 SeD_A0978 SeD_A0979   nfsA TRUE 0.870 -16.000 0.159 NA   NA
 7296046 7296047 SeD_A0979 SeD_A0980 nfsA rimK FALSE 0.498 58.000 0.114 1.000 N NA
 7296047 7296048 SeD_A0980 SeD_A0981 rimK   FALSE 0.454 96.000 0.161 NA   NA
 7296048 7296049 SeD_A0981 SeD_A0982     FALSE 0.005 346.000 0.000 NA   NA
 7296049 7296050 SeD_A0982 SeD_A0983   potG TRUE 0.951 88.000 0.679 1.000 Y NA
 7296050 7296051 SeD_A0983 SeD_A0984 potG   TRUE 0.997 10.000 0.857 1.000 Y NA
 7296051 7296052 SeD_A0984 SeD_A0985     TRUE 0.997 -3.000 0.528 0.051 Y NA
 7296052 7296053 SeD_A0985 SeD_A0986     TRUE 0.608 74.000 0.264 NA   NA
 7296053 7296054 SeD_A0986 SeD_A0987   rumB TRUE 0.733 43.000 0.226 NA   NA
 7296054 7296055 SeD_A0987 SeD_A0988 rumB   FALSE 0.010 295.000 0.000 1.000   NA
 7296055 7296056 SeD_A0988 SeD_A0989     TRUE 0.969 30.000 0.800 0.015   NA
 7296056 7296057 SeD_A0989 SeD_A0990     TRUE 0.990 10.000 0.800 1.000 N NA
 7296058 7296059 SeD_A0991 SeD_A0992 artJ artM FALSE 0.330 237.000 0.143 0.051 Y NA
 7296059 7296060 SeD_A0992 SeD_A0993 artM artQ TRUE 0.998 0.000 0.714 0.015 Y NA
 7296060 7296061 SeD_A0993 SeD_A0994 artQ artI TRUE 0.993 7.000 0.260 0.051 Y NA
 7296061 7296062 SeD_A0994 SeD_A0995 artI artP TRUE 0.983 18.000 0.323 1.000 Y NA
 7296062 7296063 SeD_A0995 SeD_A0996 artP   FALSE 0.041 230.000 0.081 NA   NA
 7296064 7296065 SeD_A0997 SeD_A0998     TRUE 0.820 -3.000 0.037 NA   NA
 7296066 7296067 SeD_A0999 SeD_A1000     TRUE 0.755 96.000 0.022 0.009 Y NA
 7296067 7296068 SeD_A1000 SeD_A1001   ltaE TRUE 0.870 11.000 0.074 1.000 N NA
 7296068 7296069 SeD_A1001 SeD_A1002 ltaE poxB TRUE 0.861 39.000 0.041 1.000 Y NA
 7296069 7296070 SeD_A1002 SeD_A1003 poxB hcr FALSE 0.095 159.000 0.025 1.000 N NA
 7296070 7296071 SeD_A1003 SeD_A1004 hcr hcp TRUE 0.981 9.000 0.000 0.016 Y NA
 7296071 7296072 SeD_A1004 SeD_A1005 hcp   FALSE 0.108 144.000 0.000 NA   NA
 7296075 7296076 SeD_A1008 SeD_A1009     TRUE 0.994 -3.000 0.789 0.100 N NA
 7296076 7296077 SeD_A1009 SeD_A1010     FALSE 0.400 32.000 0.000 NA   NA
 7296079 7296080 SeD_A1012 SeD_A1013 clpS clpA TRUE 0.931 31.000 0.596 NA   NA
 7296081 7296082 SeD_A1014 SeD_A1015     FALSE 0.060 171.000 0.000 NA   NA
 7296082 7296083 SeD_A1015 SeD_A1016     FALSE 0.099 148.000 0.000 NA   NA
 7296083 7296084 SeD_A1016 SeD_A1017     TRUE 0.920 20.000 0.333 NA   NA
 7296086 7296087 SeD_A1019 SeD_A1020 infA aat FALSE 0.008 312.000 0.020 1.000 N NA
 7296087 7296088 SeD_A1020 SeD_A1021 aat cydC TRUE 0.839 45.000 0.049 1.000 Y NA
 7296088 7296089 SeD_A1021 SeD_A1022 cydC cydD TRUE 0.998 1.000 0.631 0.005 Y NA
 7296089 7296090 SeD_A1022 SeD_A1023 cydD trxB TRUE 0.698 114.000 0.049 1.000 Y NA
 7296091 7296092 SeD_A1024 SeD_A1025 lrp   TRUE 0.632 135.000 0.345 1.000 N NA
 7296092 7296093 SeD_A1025 SeD_A1026   lolA FALSE 0.553 143.000 0.305 1.000 N NA
 7296093 7296094 SeD_A1026 SeD_A1027 lolA   TRUE 0.940 10.000 0.167 1.000 N NA
 7296094 7296095 SeD_A1027 SeD_A1028   serS FALSE 0.049 259.000 0.078 0.089 N NA
 7296095 7296096 SeD_A1028 SeD_A1029 serS   FALSE 0.025 237.000 0.000 1.000 N NA
 7296096 7296097 SeD_A1029 SeD_A1030   dmsB_1 TRUE 0.988 11.000 0.172 0.051 Y NA
 7296097 7296098 SeD_A1030 SeD_A1031 dmsB_1 dmsC1 TRUE 0.855 2.000 0.000 1.000   NA
 7296098 7296099 SeD_A1031 SeD_A1032 dmsC1   FALSE 0.005 350.000 0.000 NA   NA
 7296099 7296100 SeD_A1032 SeD_A1033     FALSE 0.027 218.000 0.000 NA N NA
 7296102 7296103 SeD_A1035 SeD_A1036     FALSE 0.008 299.000 0.000 NA   NA
 7296104 7296105 SeD_A1037 SeD_A1038 pflB2   TRUE 0.748 60.000 0.345 1.000 N NA
 7296105 7296106 SeD_A1038 SeD_A1039     FALSE 0.003 447.000 0.000 NA   NA
 7296107 7296108 SeD_A1040 SeD_A1041   serC FALSE 0.032 186.000 0.014 NA   NA
 7296110 7296111 SeD_A1042 SeD_A1044 aroA   FALSE 0.105 143.000 0.003 1.000 N NA
 7296111 7296112 SeD_A1044 SeD_A1045   cmk FALSE 0.056 173.000 0.004 1.000 N NA
 7296112 7296113 SeD_A1045 SeD_A1046 cmk rpsA TRUE 0.620 114.000 0.281 1.000 N NA
 7296113 7296114 SeD_A1046 SeD_A1047 rpsA ihfB FALSE 0.452 156.000 0.292 1.000 N NA
 7296114 7296115 SeD_A1047 SeD_A1048 ihfB   FALSE 0.008 281.000 0.003 1.000   NA
 7296115 7296116 SeD_A1048 SeD_A1049   msbA TRUE 0.672 37.000 0.075 0.085   NA
 7296116 7296117 SeD_A1049 SeD_A1050 msbA lpxK TRUE 0.964 -3.000 0.205 1.000 N NA
 7296117 7296118 SeD_A1050 SeD_A1051 lpxK   FALSE 0.236 44.000 0.017 NA   NA
 7296118 7296119 SeD_A1051 SeD_A1052     FALSE 0.185 52.000 0.016 NA   NA
 7296119 7296120 SeD_A1052 SeD_A1053   kdsB TRUE 0.972 -3.000 0.265 1.000   NA
 7296120 7296121 SeD_A1053 SeD_A1054 kdsB   FALSE 0.023 211.000 0.023 NA   NA
 7296123 7296124 SeD_A1056 SeD_A1057 smtA mukF TRUE 0.961 -7.000 0.325 NA N NA
 7296124 7296125 SeD_A1057 SeD_A1058 mukF mukE TRUE 0.939 -19.000 0.036 NA Y NA
 7296125 7296126 SeD_A1058 SeD_A1059 mukE mukB TRUE 0.989 0.000 0.000 0.001 Y NA
 7296126 7296127 SeD_A1059 SeD_A1060 mukB   FALSE 0.007 345.000 0.000 1.000   NA
 7296127 7296128 SeD_A1060 SeD_A1061     FALSE 0.121 260.000 0.372 NA   NA
 7296128 7296129 SeD_A1061 SeD_A1062     TRUE 0.664 28.000 0.089 NA   NA
 7296130 7296131 SeD_A1063 SeD_A1064 aspC   FALSE 0.098 185.000 0.060 1.000 N NA
 7296133 7296134 SeD_A1066 SeD_A1067   asnC FALSE 0.514 -43.000 0.000 NA   NA
 7296134 7296135 SeD_A1067 SeD_A1068 asnC   FALSE 0.033 201.000 0.005 1.000 N NA
 7296135 7296136 SeD_A1068 SeD_A1069     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7296137 7296138 SeD_A1070 SeD_A1071     FALSE 0.177 74.000 0.000 NA   NA
 7296138 7296139 SeD_A1071 SeD_A1072     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7296140 7296141 SeD_A1073 SeD_A1074 pncB   FALSE 0.055 195.000 0.000 1.000 N NA
 7296141 7296142 SeD_A1074 SeD_A1075     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 7296142 7296143 SeD_A1075 SeD_A1076     FALSE 0.327 41.000 0.000 NA   NA
 7296143 7296144 SeD_A1076 SeD_A1077     TRUE 0.604 43.000 0.130 NA   NA
 7296144 7296145 SeD_A1077 SeD_A1078     FALSE 0.002 646.000 0.000 NA   NA
 7296145 7296146 SeD_A1078 SeD_A1079     FALSE 0.116 141.000 0.000 NA   NA
 7296146 7296147 SeD_A1079 SeD_A1080     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7296148 7296149 SeD_A1081 SeD_A1082     TRUE 0.697 -9.000 0.000 NA   NA
 7296149 7296150 SeD_A1082 SeD_A1083     TRUE 0.583 -22.000 0.000 NA   NA
 7296150 7296151 SeD_A1083 SeD_A1084     TRUE 0.849 3.000 0.000 1.000   NA
 7296151 7296152 SeD_A1084 SeD_A1085     TRUE 0.821 41.000 0.333 NA   NA
 7296152 7296153 SeD_A1085 SeD_A1086     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296153 7296154 SeD_A1086 SeD_A1087     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296154 7296155 SeD_A1087 SeD_A1088     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7296155 7296156 SeD_A1088 SeD_A1089     FALSE 0.032 205.000 0.000 NA   NA
 7296156 7296157 SeD_A1089 SeD_A1090     FALSE 0.081 156.000 0.000 NA   NA
 7296157 7296158 SeD_A1090 SeD_A1091     FALSE 0.006 335.000 0.000 NA   NA
 7296158 7296159 SeD_A1091 SeD_A1092     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296159 7296160 SeD_A1092 SeD_A1093     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296160 7296161 SeD_A1093 SeD_A1094     FALSE 0.133 133.000 0.000 NA   NA
 7296161 7296162 SeD_A1094 SeD_A1095     FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 7296162 7296163 SeD_A1095 SeD_A1096     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296163 7296164 SeD_A1096 SeD_A1097     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296164 7296165 SeD_A1097 SeD_A1098     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 7296165 7296166 SeD_A1098 SeD_A1099     FALSE 0.201 62.000 0.000 NA   NA
 7296166 7296167 SeD_A1099 SeD_A1100     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7296167 7296168 SeD_A1100 SeD_A1101     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296168 7296169 SeD_A1101 SeD_A1102     TRUE 0.974 -28.000 0.833 NA   NA
 7296169 7296170 SeD_A1102 SeD_A1103     TRUE 0.977 1.000 0.333 NA   NA
 7296170 7296171 SeD_A1103 SeD_A1104     FALSE 0.541 21.000 0.000 NA   NA
 7296171 7296172 SeD_A1104 SeD_A1105     TRUE 0.973 18.000 0.750 NA   NA
 7296172 7296173 SeD_A1105 SeD_A1106     FALSE 0.193 65.000 0.000 NA   NA
 7296173 7296174 SeD_A1106 SeD_A1107     TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7296174 7296175 SeD_A1107 SeD_A1108     TRUE 0.978 -15.000 0.750 NA   NA
 7296175 7296176 SeD_A1108 SeD_A1109     TRUE 0.977 -16.000 0.750 NA   NA
 7296176 7296177 SeD_A1109 SeD_A1110     TRUE 0.986 5.000 0.600 NA   NA
 7296177 7296178 SeD_A1110 SeD_A1111     TRUE 0.987 4.000 0.600 NA   NA
 7296178 7296179 SeD_A1111 SeD_A1112     TRUE 0.991 0.000 0.667 NA   NA
 7296181 7296182 SeD_A1113 SeD_A1115     TRUE 0.986 0.000 0.500 NA   NA
 7296182 7296183 SeD_A1115 SeD_A1116     FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7296183 7296184 SeD_A1116 SeD_A1117     TRUE 0.924 42.000 0.750 NA   NA
 7296184 7296185 SeD_A1117 SeD_A1118     TRUE 0.982 0.000 0.400 NA   NA
 7296185 7296186 SeD_A1118 SeD_A1119     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 7296186 7296187 SeD_A1119 SeD_A1120     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA   NA
 7296187 7296188 SeD_A1120 SeD_A1121     TRUE 0.992 -3.000 0.800 NA   NA
 7296188 7296189 SeD_A1121 SeD_A1122     TRUE 0.970 -16.000 0.600 NA   NA
 7296189 7296190 SeD_A1122 SeD_A1123     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296190 7296191 SeD_A1123 SeD_A1124     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296193 7296194 SeD_A1126 SeD_A1127     FALSE 0.011 268.000 0.000 NA   NA
 7296197 7296198 SeD_A1130 SeD_A1131     FALSE 0.011 271.000 0.000 NA   NA
 7296199 7296200 SeD_A1132 SeD_A1133 pepN pyrD FALSE 0.032 208.000 0.014 1.000 N NA
 7296200 7296201 SeD_A1133 SeD_A1134 pyrD   FALSE 0.134 166.000 0.081 NA   NA
 7296203 7296204 SeD_A1136 SeD_A1137 rlmL   TRUE 0.812 13.000 0.061 1.000   NA
 7296204 7296205 SeD_A1137 SeD_A1138     TRUE 0.723 15.000 0.054 NA   NA
 7296205 7296206 SeD_A1138 SeD_A1139     TRUE 0.991 5.000 0.819 NA   NA
 7296206 7296207 SeD_A1139 SeD_A1140     TRUE 0.986 -3.000 0.531 NA   NA
 7296208 7296209 SeD_A1141 SeD_A1142   fabA FALSE 0.003 431.000 0.000 NA   NA
 7296209 7296210 SeD_A1142 SeD_A1143 fabA   TRUE 0.680 69.000 0.290 1.000 N NA
 7296212 7296213 SeD_A1145 SeD_A1146 ompA   FALSE 0.011 300.000 0.000 1.000 N NA
 7296215 7296216 SeD_A1148 SeD_A1149 yccS   TRUE 0.758 19.000 0.090 NA   NA
 7296218 7296219 SeD_A1151 SeD_A1152 mgsA   FALSE 0.234 95.000 0.055 NA   NA
 7296221 7296222 SeD_A1154 SeD_A1155     FALSE 0.408 58.000 0.094 NA   NA
 7296223 7296224 SeD_A1156 SeD_A1157     TRUE 0.968 17.000 0.625 NA   NA
 7296224 7296225 SeD_A1157 SeD_A1158     FALSE 0.260 49.000 0.007 1.000 N NA
 7296226 7296227 SeD_A1159 SeD_A1160     FALSE 0.126 87.000 0.018 NA   NA
 7296228 7296229 SeD_A1161 SeD_A1162     FALSE 0.153 119.000 0.000 NA   NA
 7296230 7296231 SeD_A1163 SeD_A1164     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7296233 7296234 SeD_A1166 SeD_A1167     TRUE 0.932 17.000 0.333 NA   NA
 7296236 7296237 SeD_A1169 SeD_A1170     FALSE 0.222 80.000 0.000 1.000 N NA
 7296237 7296238 SeD_A1170 SeD_A1171     TRUE 0.998 -7.000 0.857 0.001 Y NA
 7296240 7296241 SeD_A1173 SeD_A1174 hpaC hpaB TRUE 0.941 18.000 0.226 0.001   NA
 7296241 7296242 SeD_A1174 SeD_A1175 hpaB hpaR FALSE 0.082 218.000 0.000 0.001 N NA
 7296243 7296244 SeD_A1176 SeD_A1177   hpaE TRUE 0.990 -3.000 0.510 0.058 N NA
 7296244 7296245 SeD_A1177 SeD_A1178 hpaE hpaD TRUE 0.982 2.000 0.378 1.000   NA
 7296245 7296246 SeD_A1178 SeD_A1179 hpaD hpcD TRUE 0.968 10.000 0.330 1.000   NA
 7296246 7296247 SeD_A1179 SeD_A1180 hpcD hpaH FALSE 0.518 144.000 0.282 1.000 N NA
 7296247 7296248 SeD_A1180 SeD_A1181 hpaH hpaI TRUE 0.975 11.000 0.439 1.000 N NA
 7296248 7296249 SeD_A1181 SeD_A1182 hpaI hpaX TRUE 0.832 73.000 0.175 NA Y NA
 7296249 7296250 SeD_A1182 SeD_A1183 hpaX hpaA TRUE 0.952 10.000 0.233 NA N NA
 7296250 7296251 SeD_A1183 SeD_A1184 hpaA   TRUE 0.809 14.000 0.067 1.000   NA
 7296251 7296252 SeD_A1184 SeD_A1185     FALSE 0.001 1218.000 0.000 NA   NA
 7296253 7296254 SeD_A1186 SeD_A1187     TRUE 0.987 0.000 0.512 NA   NA
 7296255 7296256 SeD_A1188 SeD_A1189     TRUE 0.825 49.000 0.438 NA   NA
 7296256 7296257 SeD_A1189 SeD_A1190     TRUE 0.996 -3.000 0.317 0.003 Y NA
 7296257 7296258 SeD_A1190 SeD_A1191     TRUE 0.992 -10.000 0.298 0.003 Y NA
 7296258 7296259 SeD_A1191 SeD_A1192     FALSE 0.169 133.000 0.000 1.000   NA
 7296260 7296261 SeD_A1193 SeD_A1194   wrbA TRUE 0.904 21.000 0.290 NA   NA
 7296262 7296263 SeD_A1195 SeD_A1196     FALSE 0.116 137.000 0.028 NA   NA
 7296264 7296265 SeD_A1197 SeD_A1198   putA FALSE 0.400 59.000 0.094 NA   NA
 7296266 7296267 SeD_A1199 SeD_A1200   putP FALSE 0.020 229.000 0.000 NA   NA
 7296267 7296268 SeD_A1200 SeD_A1201 putP   FALSE 0.001 893.000 0.000 NA   NA
 7296269 7296270 SeD_A1202 SeD_A1203     FALSE 0.013 286.000 0.000 1.000 N NA
 7296270 7296271 SeD_A1203 SeD_A1204     FALSE 0.008 337.000 0.000 1.000 N NA
 7296272 7296273 SeD_A1205 SeD_A1206     TRUE 0.819 45.000 0.375 NA   NA
 7296273 7296274 SeD_A1206 SeD_A1207     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 7296274 7296275 SeD_A1207 SeD_A1208     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7296275 7296276 SeD_A1208 SeD_A1209     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7296278 7296279 SeD_A1211 SeD_A1212     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7296280 7296281 SeD_A1213 SeD_A1214     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296281 7296282 SeD_A1214 SeD_A1215     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 7296282 7296283 SeD_A1215 SeD_A1216     TRUE 0.857 33.000 0.333 NA   NA
 7296283 7296284 SeD_A1216 SeD_A1217     TRUE 0.883 16.000 0.182 NA   NA
 7296284 7296285 SeD_A1217 SeD_A1218     TRUE 0.958 11.000 0.312 NA   NA
 7296285 7296286 SeD_A1218 SeD_A1219     TRUE 0.841 79.000 0.750 NA   NA
 7296286 7296287 SeD_A1219 SeD_A1220     TRUE 0.991 2.000 0.711 NA   NA
 7296287 7296288 SeD_A1220 SeD_A1221   clpB TRUE 0.827 -3.000 0.039 NA   NA
 7296288 7296289 SeD_A1221 SeD_A1222 clpB   TRUE 0.967 13.000 0.471 NA   NA
 7296289 7296290 SeD_A1222 SeD_A1223     TRUE 0.988 5.000 0.673 NA   NA
 7296290 7296291 SeD_A1223 SeD_A1224     TRUE 0.991 3.000 0.765 NA   NA
 7296291 7296292 SeD_A1224 SeD_A1225     TRUE 0.993 -3.000 0.862 NA   NA
 7296292 7296293 SeD_A1225 SeD_A1226     TRUE 0.941 25.000 0.510 NA   NA
 7296293 7296294 SeD_A1226 SeD_A1227     TRUE 0.973 -36.000 0.863 NA   NA
 7296294 7296295 SeD_A1227 SeD_A1228     TRUE 0.985 5.000 0.552 NA   NA
 7296295 7296296 SeD_A1228 SeD_A1229     TRUE 0.989 -3.000 0.627 NA   NA
 7296296 7296297 SeD_A1229 SeD_A1230     FALSE 0.253 49.000 0.030 NA   NA
 7296297 7296298 SeD_A1230 SeD_A1231     FALSE 0.429 30.000 0.034 NA   NA
 7296299 7296300 SeD_A1232 SeD_A1233     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 7296300 7296301 SeD_A1233 SeD_A1234     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7296301 7296302 SeD_A1234 SeD_A1235     TRUE 0.571 102.000 0.250 NA   NA
 7296302 7296303 SeD_A1235 SeD_A1236     FALSE 0.001 947.000 0.000 NA   NA
 7296303 7296304 SeD_A1236 SeD_A1237     FALSE 0.002 649.000 0.000 NA   NA
 7296304 7296305 SeD_A1237 SeD_A1238     FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 7296305 7296306 SeD_A1238 SeD_A1239     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296306 7296307 SeD_A1239 SeD_A1240     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7296309 7296310 SeD_A1242 SeD_A1243     FALSE 0.221 57.000 0.000 NA   NA
 7296310 7296311 SeD_A1243 SeD_A1244     FALSE 0.002 540.000 0.000 NA   NA
 7296312 7296313 SeD_A1245 SeD_A1246     FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 7296314 7296315 SeD_A1247 SeD_A1248     FALSE 0.253 80.000 0.062 NA   NA
 7296315 7296316 SeD_A1248 SeD_A1249     FALSE 0.344 74.000 0.074 1.000   NA
 7296316 7296317 SeD_A1249 SeD_A1250     TRUE 0.962 -19.000 0.048 0.051 Y NA
 7296319 7296320 SeD_A1252 SeD_A1253     FALSE 0.002 427.000 0.008 NA   NA
 7296322 7296323 SeD_A1255 SeD_A1256     TRUE 0.574 -23.000 0.000 NA   NA
 7296326 7296327 SeD_A1259 SeD_A1260 rcsA   TRUE 0.807 -42.000 0.154 NA   NA
 7296327 7296328 SeD_A1260 SeD_A1261   fliR FALSE 0.028 211.000 0.000 NA   NA
 7296328 7296329 SeD_A1261 SeD_A1262 fliR fliQ TRUE 0.982 9.000 0.028 0.002 Y NA
 7296329 7296330 SeD_A1262 SeD_A1263 fliQ fliP TRUE 0.998 10.000 0.827 0.009 Y NA
 7296330 7296331 SeD_A1263 SeD_A1264 fliP   TRUE 0.992 0.000 0.203 1.000 Y NA
 7296331 7296332 SeD_A1264 SeD_A1265   fliN TRUE 0.996 0.000 0.443 1.000 Y NA
 7296332 7296333 SeD_A1265 SeD_A1266 fliN fliM TRUE 0.993 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 7296333 7296334 SeD_A1266 SeD_A1267 fliM fliL TRUE 0.999 5.000 0.957 0.001 Y NA
 7296334 7296335 SeD_A1267 SeD_A1268 fliL   TRUE 0.785 105.000 0.119 1.000 Y NA
 7296335 7296336 SeD_A1268 SeD_A1269   fliJ TRUE 0.996 -3.000 0.317 0.005 Y NA
 7296336 7296337 SeD_A1269 SeD_A1270 fliJ fliI TRUE 0.944 22.000 0.073 1.000 Y NA
 7296337 7296338 SeD_A1270 SeD_A1271 fliI fliH TRUE 0.981 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7296338 7296339 SeD_A1271 SeD_A1272 fliH fliG TRUE 0.975 -7.000 0.005 0.003 Y NA
 7296339 7296340 SeD_A1272 SeD_A1273 fliG fliF TRUE 0.991 -7.000 0.220 0.005 Y NA
 7296341 7296342 SeD_A1274 SeD_A1275   fliE FALSE 0.411 47.000 0.067 NA   NA
 7296343 7296344 SeD_A1276 SeD_A1277     FALSE 0.012 265.000 0.000 NA   NA
 7296344 7296345 SeD_A1277 SeD_A1278     TRUE 0.992 -3.000 0.844 NA   NA
 7296347 7296348 SeD_A1280 SeD_A1281     FALSE 0.436 72.000 0.115 1.000   NA
 7296348 7296349 SeD_A1281 SeD_A1282   fliS TRUE 0.980 0.000 0.324 1.000   NA
 7296349 7296350 SeD_A1282 SeD_A1284 fliS fliD TRUE 0.990 15.000 0.284 0.002 Y NA
 7296351 7296352 SeD_A1283 SeD_A1285     TRUE 0.576 18.000 0.000 NA   NA
 7296352 7296353 SeD_A1285 SeD_A1286     FALSE 0.168 79.000 0.000 NA   NA
 7296353 7296354 SeD_A1286 SeD_A1287   fliA FALSE 0.014 227.000 0.012 NA   NA
 7296354 7296355 SeD_A1287 SeD_A1288 fliA   FALSE 0.165 89.000 0.000 NA   NA
 7296355 7296356 SeD_A1288 SeD_A1289   fliY FALSE 0.101 147.000 0.000 NA   NA
 7296356 7296357 SeD_A1289 SeD_A1290 fliY   TRUE 0.851 154.000 0.469 1.000 Y NA
 7296357 7296358 SeD_A1290 SeD_A1291     TRUE 0.937 21.000 0.050 1.000 Y NA
 7296358 7296359 SeD_A1291 SeD_A1292     TRUE 0.989 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 7296359 7296360 SeD_A1292 SeD_A1293     FALSE 0.045 233.000 0.071 1.000 N NA
 7296361 7296362 SeD_A1294 SeD_A1295     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296363 7296364 SeD_A1296 SeD_A1297 uvrY uvrC TRUE 0.952 -3.000 0.086 0.020 N NA
 7296364 7296365 SeD_A1297 SeD_A1298 uvrC pgsA TRUE 0.671 57.000 0.227 1.000 N NA
 7296365 7296366 SeD_A1298 SeD_A1299 pgsA   FALSE 0.090 152.000 0.000 NA   NA
 7296366 7296367 SeD_A1299 SeD_A1300     FALSE 0.239 53.000 0.000 NA   NA
 7296367 7296368 SeD_A1300 SeD_A1301     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7296368 7296369 SeD_A1301 SeD_A1302     FALSE 0.012 265.000 0.000 NA   NA
 7296369 7296370 SeD_A1302 SeD_A1303     FALSE 0.557 -27.000 0.000 NA   NA
 7296370 7296371 SeD_A1303 SeD_A1304     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 7296371 7296372 SeD_A1304 SeD_A1305     FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 7296372 7296373 SeD_A1305 SeD_A1306     FALSE 0.017 239.000 0.000 NA   NA
 7296376 7296377 SeD_A1309 SeD_A1310 ftnA   FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7296377 7296378 SeD_A1310 SeD_A1311     FALSE 0.498 25.000 0.000 NA   NA
 7296381 7296382 SeD_A1314 SeD_A1315   otsB FALSE 0.002 633.000 0.000 NA   NA
 7296382 7296383 SeD_A1315 SeD_A1316 otsB otsA TRUE 0.968 -25.000 0.068 0.001 Y NA
 7296385 7296386 SeD_A1318 SeD_A1319     FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 7296386 7296387 SeD_A1319 SeD_A1320   flhC TRUE 0.935 3.000 0.000 0.001   NA
 7296387 7296388 SeD_A1320 SeD_A1321 flhC motA TRUE 0.699 125.000 0.408 1.000   NA
 7296388 7296389 SeD_A1321 SeD_A1322 motA motB TRUE 0.996 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 7296389 7296390 SeD_A1322 SeD_A1323 motB   TRUE 0.997 11.000 0.913 1.000 Y NA
 7296390 7296391 SeD_A1323 SeD_A1324     TRUE 0.990 21.000 0.447 0.004 Y NA
 7296393 7296394 SeD_A1326 SeD_A1327   cheR FALSE 0.472 161.000 0.037 1.000 Y NA
 7296394 7296395 SeD_A1327 SeD_A1328 cheR cheB TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7296395 7296396 SeD_A1328 SeD_A1329 cheB cheY TRUE 0.991 18.000 0.467 0.012 Y NA
 7296396 7296397 SeD_A1329 SeD_A1330 cheY   TRUE 0.967 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7296397 7296398 SeD_A1330 SeD_A1331   flhB FALSE 0.316 194.000 0.000 1.000 Y NA
 7296398 7296399 SeD_A1331 SeD_A1332 flhB flhA TRUE 0.993 -7.000 0.287 0.009 Y NA
 7296399 7296400 SeD_A1332 SeD_A1333 flhA   TRUE 0.974 0.000 0.158 0.002   NA
 7296403 7296404 SeD_A1336 SeD_A1337   argS FALSE 0.041 189.000 0.002 1.000 N NA
 7296404 7296405 SeD_A1337 SeD_A1338 argS   TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7296406 7296407 SeD_A1339 SeD_A1340     TRUE 0.656 20.000 0.057 NA   NA
 7296408 7296409 SeD_A1341 SeD_A1342     TRUE 0.974 -3.000 0.315 NA   NA
 7296409 7296410 SeD_A1342 SeD_A1343     FALSE 0.539 41.000 0.089 NA   NA
 7296410 7296411 SeD_A1343 SeD_A1344     FALSE 0.509 53.000 0.126 NA   NA
 7296411 7296412 SeD_A1344 SeD_A1345     TRUE 0.911 -3.000 0.089 NA   NA
 7296413 7296414 SeD_A1346 SeD_A1347 aspS ntpA FALSE 0.268 103.000 0.050 1.000 N NA
 7296414 7296415 SeD_A1347 SeD_A1348 ntpA   FALSE 0.433 30.000 0.035 NA   NA
 7296415 7296416 SeD_A1348 SeD_A1349   ruvC TRUE 0.805 37.000 0.277 NA   NA
 7296416 7296417 SeD_A1349 SeD_A1350 ruvC   FALSE 0.437 31.000 0.000 NA N NA
 7296419 7296420 SeD_A1352 SeD_A1353   ruvA FALSE 0.005 360.000 0.000 NA   NA
 7296420 7296421 SeD_A1353 SeD_A1354 ruvA ruvB TRUE 0.997 9.000 0.549 0.001 Y NA
 7296422 7296423 SeD_A1355 SeD_A1356 znuB znuC TRUE 0.998 -3.000 0.755 0.085 Y NA
 7296424 7296425 SeD_A1357 SeD_A1358 znuA   TRUE 0.866 16.000 0.131 1.000 N NA
 7296425 7296426 SeD_A1358 SeD_A1359   msbB TRUE 0.876 117.000 0.299 1.000 Y NA
 7296427 7296428 SeD_A1360 SeD_A1361 pykA   FALSE 0.302 124.000 0.071 1.000 N NA
 7296431 7296432 SeD_A1363 SeD_A1365 edd eda TRUE 0.974 38.000 0.523 1.000 Y NA
 7296434 7296435 SeD_A1367 SeD_A1368     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 7296435 7296436 SeD_A1368 SeD_A1369     FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7296436 7296437 SeD_A1369 SeD_A1370     FALSE 0.064 213.000 0.092 NA   NA
 7296438 7296439 SeD_A1371 SeD_A1372     TRUE 0.963 24.000 0.667 1.000   NA
 7296439 7296440 SeD_A1372 SeD_A1373     TRUE 0.560 108.000 0.222 1.000   NA
 7296441 7296442 SeD_A1374 SeD_A1375     TRUE 0.990 1.000 0.613 1.000   NA
 7296442 7296443 SeD_A1375 SeD_A1376     TRUE 0.973 17.000 0.704 NA   NA
 7296446 7296447 SeD_A1379 SeD_A1380     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA   NA
 7296447 7296448 SeD_A1380 SeD_A1381     FALSE 0.008 291.000 0.000 NA   NA
 7296448 7296449 SeD_A1381 SeD_A1382   recT FALSE 0.278 47.000 0.000 NA   NA
 7296449 7296450 SeD_A1382 SeD_A1383 recT   TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7296450 7296451 SeD_A1383 SeD_A1384     FALSE 0.116 141.000 0.000 NA   NA
 7296451 7296452 SeD_A1384 SeD_A1385     FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7296452 7296453 SeD_A1385 SeD_A1386     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7296453 7296454 SeD_A1386 SeD_A1387     FALSE 0.001 1018.000 0.000 NA   NA
 7296455 7296456 SeD_A1388 SeD_A1389     FALSE 0.278 47.000 0.000 NA   NA
 7296456 7296457 SeD_A1389 SeD_A1390     TRUE 0.899 32.000 0.444 NA   NA
 7296461 7296462 SeD_A1394 SeD_A1395     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7296462 7296463 SeD_A1395 SeD_A1396     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296463 7296464 SeD_A1396 SeD_A1397     FALSE 0.139 130.000 0.000 NA   NA
 7296464 7296465 SeD_A1397 SeD_A1398     FALSE 0.168 97.000 0.000 NA   NA
 7296465 7296466 SeD_A1398 SeD_A1399     FALSE 0.013 261.000 0.000 NA   NA
 7296468 7296469 SeD_A1401 SeD_A1402     TRUE 0.650 -13.000 0.000 NA   NA
 7296469 7296470 SeD_A1402 SeD_A1403     TRUE 0.849 -3.000 0.000 1.000   NA
 7296470 7296471 SeD_A1403 SeD_A1404     FALSE 0.030 208.000 0.000 NA   NA
 7296471 7296472 SeD_A1404 SeD_A1405     FALSE 0.508 -46.000 0.000 NA   NA
 7296472 7296473 SeD_A1405 SeD_A1406     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296473 7296474 SeD_A1406 SeD_A1407     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296474 7296475 SeD_A1407 SeD_A1408     TRUE 0.576 -49.000 0.000 1.000   NA
 7296475 7296476 SeD_A1408 SeD_A1409     TRUE 0.770 91.000 0.537 NA   NA
 7296476 7296477 SeD_A1409 SeD_A1410     TRUE 0.909 -7.000 0.152 NA   NA
 7296477 7296478 SeD_A1410 SeD_A1411     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7296478 7296479 SeD_A1411 SeD_A1412     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296479 7296480 SeD_A1412 SeD_A1413     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7296480 7296481 SeD_A1413 SeD_A1414     FALSE 0.285 46.000 0.000 NA   NA
 7296481 7296482 SeD_A1414 SeD_A1415     FALSE 0.199 63.000 0.000 NA   NA
 7296482 7296483 SeD_A1415 SeD_A1416     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7296483 7296484 SeD_A1416 SeD_A1417     TRUE 0.980 -3.000 0.400 NA   NA
 7296484 7296485 SeD_A1417 SeD_A1418     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7296487 7296488 SeD_A1420 SeD_A1421     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7296488 7296489 SeD_A1421 SeD_A1422     FALSE 0.159 108.000 0.000 NA   NA
 7296489 7296490 SeD_A1422 SeD_A1423     FALSE 0.181 72.000 0.000 NA   NA
 7296490 7296491 SeD_A1423 SeD_A1425     FALSE 0.150 122.000 0.000 NA   NA
 7296491 7296492 SeD_A1425 SeD_A1426     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7296492 7296493 SeD_A1426 SeD_A1427     FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 7296493 7296494 SeD_A1427 SeD_A1428     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296497 7296498 SeD_A1431 SeD_A1432     FALSE 0.001 954.000 0.000 NA   NA
 7296498 7296499 SeD_A1432 SeD_A1433     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296500 7296501 SeD_A1434 SeD_A1435     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296502 7296503 SeD_A1436 SeD_A1437     FALSE 0.088 153.000 0.000 NA   NA
 7296503 7296504 SeD_A1437 SeD_A1438     FALSE 0.193 65.000 0.000 NA   NA
 7296505 7296506 SeD_A1439 SeD_A1440     FALSE 0.084 155.000 0.000 NA   NA
 7296506 7296507 SeD_A1440 SeD_A1441     FALSE 0.514 -43.000 0.000 NA   NA
 7296507 7296508 SeD_A1441 SeD_A1442     FALSE 0.001 784.000 0.000 NA   NA
 7296508 7296509 SeD_A1442 SeD_A1443     FALSE 0.538 -33.000 0.000 NA   NA
 7296510 7296511 SeD_A1444 SeD_A1445     FALSE 0.002 488.000 0.000 NA   NA
 7296511 7296512 SeD_A1445 SeD_A1446     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7296512 7296513 SeD_A1446 SeD_A1447     FALSE 0.001 1442.000 0.000 NA   NA
 7296514 7296515 SeD_A1448 SeD_A1449     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7296515 7296516 SeD_A1449 SeD_A1450     TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7296518 7296519 SeD_A1452 SeD_A1453     FALSE 0.157 111.000 0.000 NA   NA
 7296520 7296521 SeD_A1454 SeD_A1455     FALSE 0.004 382.000 0.000 NA   NA
 7296521 7296522 SeD_A1455 SeD_A1456     FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 7296523 7296524 SeD_A1457 SeD_A1458     FALSE 0.177 74.000 0.000 NA   NA
 7296524 7296525 SeD_A1458 SeD_A1459     FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7296525 7296526 SeD_A1459 SeD_A1460     FALSE 0.387 33.000 0.000 NA   NA
 7296526 7296527 SeD_A1460 SeD_A1461   pphA TRUE 0.576 18.000 0.000 NA   NA
 7296528 7296529 SeD_A1462 SeD_A1463     FALSE 0.410 168.000 0.353 NA   NA
 7296529 7296530 SeD_A1463 SeD_A1464     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7296530 7296531 SeD_A1464 SeD_A1465   yebU FALSE 0.550 -28.000 0.000 NA   NA
 7296531 7296532 SeD_A1465 SeD_A1466 yebU   TRUE 0.720 78.000 0.420 NA   NA
 7296532 7296533 SeD_A1466 SeD_A1467     TRUE 0.973 -31.000 0.840 NA   NA
 7296534 7296535 SeD_A1468 SeD_A1469   proQ TRUE 0.741 98.000 0.081 NA Y NA
 7296535 7296536 SeD_A1469 SeD_A1470 proQ prc TRUE 0.914 20.000 0.304 NA N NA
 7296536 7296537 SeD_A1470 SeD_A1471 prc   FALSE 0.114 193.000 0.042 0.017 N NA
 7296541 7296542 SeD_A1475 SeD_A1476     TRUE 0.773 71.000 0.500 NA   NA
 7296542 7296543 SeD_A1476 SeD_A1477     FALSE 0.021 226.000 0.000 NA   NA
 7296543 7296544 SeD_A1477 SeD_A1478   cspC FALSE 0.002 463.000 0.000 NA   NA
 7296544 7296545 SeD_A1478 SeD_A1479 cspC   FALSE 0.033 220.000 0.000 1.000 N NA
 7296545 7296546 SeD_A1479 SeD_A1480   rrmA FALSE 0.280 66.000 0.045 1.000   NA
 7296547 7296548 SeD_A1481 SeD_A1483     FALSE 0.003 410.000 0.000 NA   NA
 7296548 7296549 SeD_A1483 SeD_A1484   manZ TRUE 0.876 59.000 0.755 NA   NA
 7296549 7296550 SeD_A1484 SeD_A1485 manZ manY TRUE 0.997 13.000 0.939 0.014 Y NA
 7296550 7296551 SeD_A1485 SeD_A1486 manY manX TRUE 0.887 53.000 0.106 0.014 Y NA
 7296555 7296556 SeD_A1490 SeD_A1491     FALSE 0.145 264.000 0.409 1.000 N NA
 7296556 7296557 SeD_A1491 SeD_A1492   pabB TRUE 0.935 4.000 0.116 1.000 N NA
 7296560 7296561 SeD_A1495 SeD_A1496     FALSE 0.434 58.000 0.082 1.000 N NA
 7296561 7296562 SeD_A1496 SeD_A1497   slp FALSE 0.218 72.000 0.024 1.000 N NA
 7296562 7296563 SeD_A1497 SeD_A1498 slp   FALSE 0.148 205.000 0.169 1.000 N NA
 7296563 7296564 SeD_A1498 SeD_A1499     FALSE 0.519 -41.000 0.000 NA   NA
 7296564 7296565 SeD_A1499 SeD_A1500   rnd FALSE 0.485 26.000 0.000 NA   NA
 7296566 7296567 SeD_A1501 SeD_A1502 minE minD TRUE 0.997 4.000 0.618 NA Y NA
 7296567 7296568 SeD_A1502 SeD_A1503 minD minC TRUE 0.984 24.000 0.466 1.000 Y NA
 7296569 7296570 SeD_A1504 SeD_A1505     FALSE 0.350 50.000 0.056 NA   NA
 7296570 7296571 SeD_A1505 SeD_A1506     FALSE 0.327 78.000 0.088 NA   NA
 7296571 7296572 SeD_A1506 SeD_A1507     FALSE 0.005 352.000 0.000 NA   NA
 7296575 7296576 SeD_A1510 SeD_A1511     FALSE 0.180 109.000 0.036 NA N NA
 7296576 7296577 SeD_A1511 SeD_A1512   nhaB TRUE 0.787 142.000 0.723 1.000 N NA
 7296580 7296581 SeD_A1515 SeD_A1516   dadX TRUE 0.910 14.000 0.168 1.000 N NA
 7296582 7296583 SeD_A1517 SeD_A1518   ldcA FALSE 0.367 97.000 0.103 NA N NA
 7296589 7296590 SeD_A1524 SeD_A1525   cydB FALSE 0.003 497.000 0.000 1.000 N NA
 7296590 7296591 SeD_A1525 SeD_A1526 cydB   TRUE 0.986 12.000 0.158 0.048 Y NA
 7296591 7296592 SeD_A1526 SeD_A1527     FALSE 0.176 75.000 0.000 NA   NA
 7296592 7296593 SeD_A1527 SeD_A1528     TRUE 0.898 -3.000 0.077 NA   NA
 7296593 7296594 SeD_A1528 SeD_A1529   hybD TRUE 0.845 -10.000 0.096 NA   NA
 7296594 7296595 SeD_A1529 SeD_A1530 hybD cybH TRUE 0.991 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 7296595 7296596 SeD_A1530 SeD_A1531 cybH   TRUE 0.987 19.000 0.355 0.047 Y NA
 7296596 7296597 SeD_A1531 SeD_A1532     TRUE 0.998 -3.000 0.611 0.002 Y NA
 7296597 7296598 SeD_A1532 SeD_A1533     FALSE 0.002 575.000 0.000 NA   NA
 7296598 7296599 SeD_A1533 SeD_A1534     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7296599 7296600 SeD_A1534 SeD_A1535     TRUE 0.923 39.000 0.667 NA   NA
 7296602 7296603 SeD_A1537 SeD_A1538 engD pth TRUE 0.825 117.000 0.184 1.000 Y NA
 7296605 7296606 SeD_A1540 SeD_A1541   prs FALSE 0.185 125.000 0.027 1.000 N NA
 7296608 7296609 SeD_A1543 SeD_A1544 ipk lolB TRUE 0.856 0.000 0.024 1.000 N NA
 7296610 7296611 SeD_A1545 SeD_A1546   hemA FALSE 0.064 168.000 0.000 NA   NA
 7296611 7296612 SeD_A1546 SeD_A1547 hemA prfA TRUE 0.791 41.000 0.171 0.042 N NA
 7296612 7296613 SeD_A1547 SeD_A1548 prfA   TRUE 0.995 0.000 0.229 0.042 Y NA
 7296613 7296614 SeD_A1548 SeD_A1549     TRUE 0.902 9.000 0.109 NA   NA
 7296614 7296615 SeD_A1549 SeD_A1550   sirB1 TRUE 0.952 4.000 0.195 NA   NA
 7296615 7296616 SeD_A1550 SeD_A1551 sirB1 kdsA TRUE 0.607 38.000 0.089 1.000   NA
 7296621 7296622 SeD_A1556 SeD_A1557 narL   TRUE 0.996 -7.000 0.521 0.014 Y NA
 7296623 7296624 SeD_A1558 SeD_A1559   narG FALSE 0.005 388.000 0.000 1.000 N NA
 7296624 7296625 SeD_A1559 SeD_A1560 narG narH TRUE 0.997 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 7296625 7296626 SeD_A1560 SeD_A1561 narH narJ TRUE 0.998 -3.000 0.588 0.004 Y NA
 7296626 7296627 SeD_A1561 SeD_A1562 narJ narI TRUE 0.998 0.000 0.500 0.004 Y NA
 7296630 7296631 SeD_A1565 SeD_A1566     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7296631 7296632 SeD_A1566 SeD_A1567     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7296632 7296633 SeD_A1567 SeD_A1568     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296633 7296634 SeD_A1568 SeD_A1569     FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7296634 7296635 SeD_A1569 SeD_A1570     TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7296635 7296636 SeD_A1570 SeD_A1571     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7296636 7296637 SeD_A1571 SeD_A1572   purU FALSE 0.133 133.000 0.000 NA   NA
 7296637 7296638 SeD_A1572 SeD_A1573 purU   TRUE 0.640 51.000 0.200 NA   NA
 7296639 7296640 SeD_A1574 SeD_A1575     FALSE 0.251 91.000 0.048 1.000   NA
 7296640 7296641 SeD_A1575 SeD_A1576   galU FALSE 0.208 203.000 0.235 1.000 N NA
 7296645 7296646 SeD_A1580 SeD_A1581     FALSE 0.001 764.000 0.000 NA N NA
 7296646 7296647 SeD_A1581 SeD_A1582   oppB TRUE 0.837 122.000 0.151 0.046 Y NA
 7296647 7296648 SeD_A1582 SeD_A1583 oppB oppC TRUE 0.997 15.000 0.870 0.046 Y NA
 7296648 7296649 SeD_A1583 SeD_A1584 oppC oppD TRUE 0.994 12.000 0.554 1.000 Y NA
 7296649 7296650 SeD_A1584 SeD_A1585 oppD oppF TRUE 0.997 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 7296650 7296651 SeD_A1585 SeD_A1586 oppF   TRUE 0.816 48.000 0.042 1.000 Y NA
 7296652 7296653 SeD_A1587 SeD_A1588   cls FALSE 0.377 34.000 0.000 NA   NA
 7296657 7296658 SeD_A1592 SeD_A1593   ispZ FALSE 0.226 170.000 0.167 NA N NA
 7296658 7296659 SeD_A1593 SeD_A1594 ispZ   FALSE 0.324 57.000 0.061 NA   NA
 7296659 7296660 SeD_A1594 SeD_A1595     TRUE 0.807 26.000 0.169 NA   NA
 7296662 7296663 SeD_A1597 SeD_A1598     TRUE 0.886 20.000 0.115 0.002   NA
 7296663 7296664 SeD_A1598 SeD_A1599     TRUE 0.579 74.000 0.115 0.002   NA
 7296664 7296665 SeD_A1599 SeD_A1600     FALSE 0.165 90.000 0.000 NA   NA
 7296665 7296666 SeD_A1600 SeD_A1601   trpA FALSE 0.002 480.000 0.000 NA   NA
 7296666 7296667 SeD_A1601 SeD_A1602 trpA trpB TRUE 0.999 0.000 0.947 0.001 Y NA
 7296667 7296668 SeD_A1602 SeD_A1603 trpB   TRUE 0.993 10.000 0.221 0.001 Y NA
 7296668 7296669 SeD_A1603 SeD_A1604   trpD TRUE 0.993 4.000 0.293 1.000 Y NA
 7296669 7296670 SeD_A1604 SeD_A1605 trpD trpE TRUE 0.987 0.000 0.010 0.001 Y NA
 7296671 7296672 SeD_A1607 SeD_A1608     TRUE 0.962 8.000 0.281 NA   NA
 7296672 7296673 SeD_A1608 SeD_A1609   rluB TRUE 0.729 101.000 0.075 NA Y NA
 7296674 7296675 SeD_A1610 SeD_A1611 cobO   TRUE 0.888 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7296678 7296679 SeD_A1614 SeD_A1615 topA cysB FALSE 0.003 411.000 0.008 1.000 N NA
 7296679 7296680 SeD_A1615 SeD_A1616 cysB   FALSE 0.008 293.000 0.000 NA   NA
 7296680 7296681 SeD_A1616 SeD_A1617     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7296681 7296682 SeD_A1617 SeD_A1618   acnA FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7296684 7296685 SeD_A1620 SeD_A1621     FALSE 0.275 150.000 0.143 NA   NA
 7296685 7296686 SeD_A1621 SeD_A1622     TRUE 0.984 7.000 0.576 NA   NA
 7296688 7296689 SeD_A1623 SeD_A1625 pyrF   TRUE 0.892 0.000 0.045 1.000 N NA
 7296690 7296691 SeD_A1626 SeD_A1627     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 7296691 7296692 SeD_A1627 SeD_A1628     FALSE 0.422 87.000 0.146 NA   NA
 7296692 7296693 SeD_A1628 SeD_A1629     FALSE 0.285 122.000 0.083 NA   NA
 7296693 7296694 SeD_A1629 SeD_A1630   rnb FALSE 0.020 253.000 0.000 1.000 N NA
 7296694 7296695 SeD_A1630 SeD_A1631 rnb   FALSE 0.165 89.000 0.000 NA   NA
 7296695 7296696 SeD_A1631 SeD_A1632   fabI FALSE 0.036 200.000 0.000 NA   NA
 7296696 7296697 SeD_A1632 SeD_A1633 fabI   FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 7296698 7296699 SeD_A1634 SeD_A1635     FALSE 0.002 467.000 0.000 NA   NA
 7296700 7296701 SeD_A1636 SeD_A1637 sapF sapD TRUE 0.998 2.000 0.684 0.015 Y NA
 7296701 7296702 SeD_A1637 SeD_A1638 sapD sapC TRUE 0.998 0.000 0.667 1.000 Y NA
 7296702 7296703 SeD_A1638 SeD_A1639 sapC sapB TRUE 0.989 -13.000 0.284 0.046 Y NA
 7296703 7296704 SeD_A1639 SeD_A1640 sapB   TRUE 0.980 -3.000 0.264 0.046 N NA
 7296704 7296705 SeD_A1640 SeD_A1641   pspF TRUE 0.718 112.000 0.402 1.000 N NA
 7296706 7296707 SeD_A1642 SeD_A1643 pspA pspB TRUE 0.870 60.000 0.739 NA   NA
 7296707 7296708 SeD_A1643 SeD_A1644 pspB pspC TRUE 0.994 0.000 0.913 NA   NA
 7296708 7296709 SeD_A1644 SeD_A1645 pspC pspD TRUE 0.823 23.000 0.167 NA   NA
 7296709 7296710 SeD_A1645 SeD_A1646 pspD   FALSE 0.421 76.000 0.133 NA   NA
 7296710 7296711 SeD_A1646 SeD_A1647     FALSE 0.067 149.000 0.013 NA   NA
 7296711 7296712 SeD_A1647 SeD_A1648     TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA   NA
 7296712 7296713 SeD_A1648 SeD_A1649     FALSE 0.279 148.000 0.137 NA   NA
 7296719 7296720 SeD_A1655 SeD_A1656     FALSE 0.014 276.000 0.000 1.000   NA
 7296722 7296723 SeD_A1658 SeD_A1659     FALSE 0.033 204.000 0.000 NA   NA
 7296724 7296725 SeD_A1660 SeD_A1661     FALSE 0.003 392.000 0.000 NA   NA
 7296726 7296727 SeD_A1662 SeD_A1663     TRUE 0.715 75.000 0.400 NA   NA
 7296727 7296728 SeD_A1663 SeD_A1664     FALSE 0.468 27.000 0.000 NA   NA
 7296728 7296729 SeD_A1664 SeD_A1665     FALSE 0.123 138.000 0.000 NA   NA
 7296730 7296731 SeD_A1666 SeD_A1667     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7296732 7296733 SeD_A1668 SeD_A1669     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296736 7296737 SeD_A1672 SeD_A1673 uspE fnr TRUE 0.896 151.000 0.619 1.000 Y NA
 7296737 7296738 SeD_A1673 SeD_A1674 fnr   FALSE 0.054 196.000 0.000 1.000 N NA
 7296739 7296740 SeD_A1675 SeD_A1676     FALSE 0.017 239.000 0.000 NA   NA
 7296740 7296741 SeD_A1676 SeD_A1677     TRUE 0.724 11.000 0.000 NA   NA
 7296741 7296742 SeD_A1677 SeD_A1678   zntB FALSE 0.190 146.000 0.019 0.091 N NA
 7296742 7296743 SeD_A1678 SeD_A1679 zntB   FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 7296743 7296744 SeD_A1679 SeD_A1680     FALSE 0.179 73.000 0.000 NA   NA
 7296745 7296746 SeD_A1681 SeD_A1682     FALSE 0.175 52.000 0.012 NA   NA
 7296747 7296748 SeD_A1683 SeD_A1684     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7296752 7296753 SeD_A1689 SeD_A1690     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7296754 7296755 SeD_A1691 SeD_A1692     FALSE 0.121 111.000 0.012 NA N NA
 7296756 7296757 SeD_A1693 SeD_A1694     TRUE 0.898 0.000 0.068 NA   NA
 7296757 7296758 SeD_A1694 SeD_A1695     TRUE 0.988 8.000 0.726 NA   NA
 7296758 7296759 SeD_A1695 SeD_A1696     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7296761 7296762 SeD_A1698 SeD_A1699 hrpA   FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7296762 7296763 SeD_A1699 SeD_A1700     FALSE 0.154 117.000 0.000 NA   NA
 7296764 7296765 SeD_A1701 SeD_A1702     FALSE 0.151 121.000 0.000 NA   NA
 7296765 7296766 SeD_A1702 SeD_A1703     FALSE 0.002 464.000 0.000 NA   NA
 7296766 7296767 SeD_A1703 SeD_A1704     FALSE 0.126 137.000 0.000 NA   NA
 7296767 7296768 SeD_A1704 SeD_A1705     TRUE 0.981 -3.000 0.048 1.000 Y NA
 7296768 7296769 SeD_A1705 SeD_A1706     TRUE 0.924 25.000 0.044 1.000 Y NA
 7296769 7296770 SeD_A1706 SeD_A1707     TRUE 0.772 7.000 0.000 NA   NA
 7296770 7296771 SeD_A1707 SeD_A1708     TRUE 0.772 7.000 0.000 NA   NA
 7296776 7296777 SeD_A1713 SeD_A1714     FALSE 0.001 763.000 0.000 NA   NA
 7296777 7296778 SeD_A1714 SeD_A1715     TRUE 0.917 32.000 0.531 NA   NA
 7296778 7296779 SeD_A1715 SeD_A1716     FALSE 0.206 169.000 0.122 1.000 N NA
 7296781 7296782 SeD_A1718 SeD_A1719     TRUE 0.565 49.000 0.143 NA   NA
 7296782 7296783 SeD_A1719 SeD_A1720   mdoD FALSE 0.020 256.000 0.000 1.000 N NA
 7296783 7296784 SeD_A1720 SeD_A1721 mdoD   FALSE 0.032 205.000 0.000 NA   NA
 7296784 7296785 SeD_A1721 SeD_A1722     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7296786 7296787 SeD_A1723 SeD_A1724     TRUE 0.863 0.000 0.000 1.000   NA
 7296787 7296788 SeD_A1724 SeD_A1725     TRUE 0.971 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7296788 7296789 SeD_A1725 SeD_A1726     TRUE 0.963 12.000 0.000 1.000 Y NA
 7296789 7296790 SeD_A1726 SeD_A1727     TRUE 0.726 132.000 0.500 1.000   NA
 7296790 7296791 SeD_A1727 SeD_A1728     TRUE 0.970 14.000 0.500 1.000   NA
 7296791 7296792 SeD_A1728 SeD_A1729     TRUE 0.987 11.000 0.148 0.014 Y NA
 7296792 7296793 SeD_A1729 SeD_A1730     TRUE 0.987 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 7296796 7296797 SeD_A1733 SeD_A1734   tehB TRUE 0.907 -13.000 0.175 1.000   NA
 7296797 7296798 SeD_A1734 SeD_A1735 tehB   FALSE 0.175 156.000 0.088 NA   NA
 7296800 7296801 SeD_A1737 SeD_A1738     FALSE 0.209 79.000 0.032 1.000   NA
 7296802 7296803 SeD_A1739 SeD_A1740   sifB FALSE 0.011 274.000 0.000 NA   NA
 7296804 7296805 SeD_A1741 SeD_A1742     FALSE 0.002 522.000 0.000 NA   NA
 7296805 7296806 SeD_A1742 SeD_A1743     FALSE 0.174 136.000 0.000 1.000 N NA
 7296806 7296807 SeD_A1743 SeD_A1744     FALSE 0.209 115.000 0.000 1.000 N NA
 7296807 7296808 SeD_A1744 SeD_A1745     FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 7296809 7296810 SeD_A1746 SeD_A1747     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296810 7296811 SeD_A1747 SeD_A1748     TRUE 0.939 5.000 0.167 NA   NA
 7296813 7296814 SeD_A1750 SeD_A1751   yncA TRUE 0.901 0.000 0.070 NA   NA
 7296815 7296816 SeD_A1752 SeD_A1753     FALSE 0.008 334.000 0.000 1.000   NA
 7296818 7296819 SeD_A1755 SeD_A1756     FALSE 0.464 145.000 0.273 NA   NA
 7296821 7296822 SeD_A1758 SeD_A1759     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7296822 7296823 SeD_A1759 SeD_A1760     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 7296824 7296825 SeD_A1761 SeD_A1762   narV FALSE 0.202 106.000 0.000 1.000   NA
 7296825 7296826 SeD_A1762 SeD_A1763 narV narW TRUE 0.997 -3.000 0.429 0.004 Y NA
 7296826 7296827 SeD_A1763 SeD_A1764 narW narY TRUE 0.999 0.000 0.714 0.004 Y NA
 7296827 7296828 SeD_A1764 SeD_A1765 narY   TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 7296828 7296829 SeD_A1765 SeD_A1766     TRUE 0.800 92.000 0.556 1.000 N NA
 7296829 7296830 SeD_A1766 SeD_A1767     FALSE 0.044 203.000 0.000 1.000   NA
 7296832 7296833 SeD_A1769 SeD_A1770     FALSE 0.206 84.000 0.000 1.000   NA
 7296833 7296834 SeD_A1770 SeD_A1771     FALSE 0.004 523.000 0.000 0.090   NA
 7296835 7296836 SeD_A1772 SeD_A1774 fdnG fdnH TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7296836 7296837 SeD_A1774 SeD_A1775 fdnH   TRUE 0.994 -7.000 0.333 0.001 Y NA
 7296838 7296839 SeD_A1776 SeD_A1777     FALSE 0.012 282.000 0.000 1.000   NA
 7296839 7296840 SeD_A1777 SeD_A1778   rpsV TRUE 0.632 177.000 0.750 1.000   NA
 7296840 7296841 SeD_A1778 SeD_A1779 rpsV   TRUE 0.786 95.000 0.571 NA   NA
 7296842 7296843 SeD_A1780 SeD_A1781   hdeB FALSE 0.005 350.000 0.000 NA   NA
 7296843 7296844 SeD_A1781 SeD_A1782 hdeB   FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7296844 7296845 SeD_A1782 SeD_A1783   treZ FALSE 0.141 129.000 0.000 NA   NA
 7296845 7296846 SeD_A1783 SeD_A1784 treZ treY TRUE 0.995 -3.000 0.263 0.003 Y NA
 7296846 7296847 SeD_A1784 SeD_A1785 treY glgX TRUE 0.815 57.000 0.015 0.003 Y NA
 7296848 7296849 SeD_A1786 SeD_A1787   nhaC TRUE 0.749 13.000 0.000 1.000 N NA
 7296849 7296850 SeD_A1787 SeD_A1788 nhaC   TRUE 0.611 144.000 0.385 1.000 N NA
 7296853 7296854 SeD_A1791 SeD_A1792   pqaA FALSE 0.128 136.000 0.000 NA   NA
 7296854 7296855 SeD_A1792 SeD_A1793 pqaA   FALSE 0.056 177.000 0.000 NA   NA
 7296855 7296856 SeD_A1793 SeD_A1794     TRUE 0.651 -25.000 0.000 1.000 N NA
 7296857 7296858 SeD_A1795 SeD_A1796     FALSE 0.072 166.000 0.000 NA N NA
 7296859 7296860 SeD_A1797 SeD_A1798     TRUE 0.998 3.000 0.611 0.002 Y NA
 7296860 7296861 SeD_A1798 SeD_A1799   cybH TRUE 0.984 -49.000 0.355 0.046 Y NA
 7296861 7296862 SeD_A1799 SeD_A1800 cybH hybD TRUE 0.989 6.000 0.177 1.000 Y NA
 7296862 7296863 SeD_A1800 SeD_A1801 hybD hypC TRUE 0.970 0.000 0.250 NA   NA
 7296863 7296864 SeD_A1801 SeD_A1802 hypC   TRUE 0.973 -3.000 0.308 NA   NA
 7296864 7296865 SeD_A1802 SeD_A1803     TRUE 0.974 18.000 0.769 NA   NA
 7296865 7296866 SeD_A1803 SeD_A1804     TRUE 0.664 -12.000 0.000 NA   NA
 7296866 7296867 SeD_A1804 SeD_A1805   hypA TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7296870 7296871 SeD_A1808 SeD_A1809     FALSE 0.023 221.000 0.000 NA   NA
 7296871 7296872 SeD_A1809 SeD_A1810     TRUE 0.837 0.000 0.037 NA   NA
 7296872 7296873 SeD_A1810 SeD_A1811     FALSE 0.194 73.000 0.016 1.000 N NA
 7296874 7296875 SeD_A1812 SeD_A1813     FALSE 0.154 116.000 0.027 NA N NA
 7296877 7296878 SeD_A1815 SeD_A1816 marR   TRUE 0.993 20.000 0.667 0.046 Y NA
 7296878 7296879 SeD_A1816 SeD_A1817     TRUE 0.946 29.000 0.667 NA   NA
 7296881 7296882 SeD_A1819 SeD_A1820     TRUE 0.747 -6.000 0.000 NA   NA
 7296882 7296883 SeD_A1820 SeD_A1821     FALSE 0.023 221.000 0.000 NA   NA
 7296886 7296887 SeD_A1824 SeD_A1825     FALSE 0.090 152.000 0.000 NA   NA
 7296888 7296889 SeD_A1826 SeD_A1827     FALSE 0.214 130.000 0.047 1.000   NA
 7296889 7296890 SeD_A1827 SeD_A1828     FALSE 0.371 181.000 0.375 NA   NA
 7296893 7296894 SeD_A1831 SeD_A1832     FALSE 0.167 93.000 0.000 NA   NA
 7296894 7296895 SeD_A1832 SeD_A1833     TRUE 0.819 1.000 0.000 NA   NA
 7296895 7296896 SeD_A1833 SeD_A1834     TRUE 0.724 11.000 0.000 NA   NA
 7296896 7296897 SeD_A1834 SeD_A1835     FALSE 0.190 122.000 0.000 1.000   NA
 7296898 7296899 SeD_A1836 SeD_A1837   speG FALSE 0.463 36.000 0.055 NA   NA
 7296901 7296902 SeD_A1839 SeD_A1840     FALSE 0.420 157.000 0.304 NA   NA
 7296902 7296903 SeD_A1840 SeD_A1841     TRUE 0.908 99.000 0.231 0.001 Y NA
 7296903 7296904 SeD_A1841 SeD_A1842   dmsB_1 TRUE 0.997 11.000 0.667 0.046 Y NA
 7296904 7296905 SeD_A1842 SeD_A1843 dmsB_1 dmsC TRUE 0.855 2.000 0.000 1.000   NA
 7296905 7296906 SeD_A1843 SeD_A1844 dmsC   FALSE 0.374 43.000 0.000 1.000   NA
 7296906 7296907 SeD_A1844 SeD_A1845     FALSE 0.009 305.000 0.000 1.000   NA
 7296907 7296908 SeD_A1845 SeD_A1846     TRUE 0.935 29.000 0.403 0.045 N NA
 7296908 7296909 SeD_A1846 SeD_A1847     TRUE 0.977 10.000 0.313 0.045 N NA
 7296909 7296910 SeD_A1847 SeD_A1848     TRUE 0.999 0.000 0.903 0.089 Y NA
 7296910 7296911 SeD_A1848 SeD_A1849     FALSE 0.202 172.000 0.079 0.089 N NA
 7296912 7296913 SeD_A1850 SeD_A1851 bioD2 mic TRUE 0.705 126.000 0.455 NA N NA
 7296913 7296914 SeD_A1851 SeD_A1852 mic   TRUE 0.891 128.000 0.408 NA Y NA
 7296915 7296916 SeD_A1853 SeD_A1854     FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 7296916 7296917 SeD_A1854 SeD_A1855     FALSE 0.258 50.000 0.000 NA   NA
 7296917 7296918 SeD_A1855 SeD_A1856     FALSE 0.192 100.000 0.042 NA   NA
 7296919 7296920 SeD_A1857 SeD_A1858     TRUE 0.997 -13.000 0.869 0.076 Y NA
 7296920 7296921 SeD_A1858 SeD_A1859     FALSE 0.265 112.000 0.071 NA   NA
 7296923 7296924 SeD_A1861 SeD_A1862 pntB pntA TRUE 0.998 11.000 0.745 0.001 Y NA
 7296925 7296926 SeD_A1863 SeD_A1864     FALSE 0.008 299.000 0.000 NA   NA
 7296928 7296929 SeD_A1867 SeD_A1868     FALSE 0.164 87.000 0.000 NA   NA
 7296931 7296932 SeD_A1870 SeD_A1871     FALSE 0.097 159.000 0.000 1.000   NA
 7296932 7296933 SeD_A1871 SeD_A1872     FALSE 0.198 111.000 0.000 1.000   NA
 7296933 7296934 SeD_A1872 SeD_A1873   tus FALSE 0.558 76.000 0.200 1.000   NA
 7296935 7296936 SeD_A1874 SeD_A1875 fumC fumB FALSE 0.556 168.000 0.000 0.001 Y NA
 7296937 7296938 SeD_A1876 SeD_A1877 manA   TRUE 0.841 103.000 0.778 NA   NA
 7296938 7296939 SeD_A1877 SeD_A1878     FALSE 0.043 190.000 0.000 NA   NA
 7296939 7296940 SeD_A1878 SeD_A1879   add FALSE 0.004 367.000 0.000 NA   NA
 7296942 7296943 SeD_A1881 SeD_A1882     FALSE 0.477 56.000 0.120 NA   NA
 7296943 7296944 SeD_A1882 SeD_A1883   rnfA FALSE 0.440 77.000 0.148 NA   NA
 7296944 7296945 SeD_A1883 SeD_A1884 rnfA rnfB TRUE 0.998 0.000 0.564 0.046 Y NA
 7296945 7296946 SeD_A1884 SeD_A1885 rnfB   TRUE 0.996 -7.000 0.537 0.046 Y NA
 7296946 7296947 SeD_A1885 SeD_A1886   rnfD TRUE 0.999 1.000 0.814 0.046 Y NA
 7296947 7296948 SeD_A1886 SeD_A1887 rnfD   TRUE 0.999 4.000 0.924 0.046 Y NA
 7296948 7296949 SeD_A1887 SeD_A1888     TRUE 0.999 3.000 0.908 0.046 Y NA
 7296949 7296950 SeD_A1888 SeD_A1889   nth TRUE 0.943 0.000 0.109 1.000 N NA
 7296950 7296951 SeD_A1889 SeD_A1890 nth tppB FALSE 0.002 602.000 0.000 1.000 N NA
 7296951 7296952 SeD_A1890 SeD_A1891 tppB gst TRUE 0.686 104.000 0.344 1.000 N NA
 7296953 7296954 SeD_A1892 SeD_A1893     FALSE 0.285 46.000 0.000 NA   NA
 7296954 7296955 SeD_A1893 SeD_A1894   tyrS FALSE 0.206 60.000 0.000 NA   NA
 7296955 7296956 SeD_A1894 SeD_A1895 tyrS pdxH FALSE 0.250 127.000 0.054 1.000 N NA
 7296956 7296957 SeD_A1895 SeD_A1896 pdxH   FALSE 0.212 59.000 0.034 NA   NA
 7296957 7296958 SeD_A1896 SeD_A1897   anmK FALSE 0.171 94.000 0.034 NA   NA
 7296961 7296962 SeD_A1900 SeD_A1901     TRUE 0.981 3.000 0.412 NA   NA
 7296962 7296963 SeD_A1901 SeD_A1902     TRUE 0.919 0.000 0.088 NA   NA
 7296964 7296965 SeD_A1903 SeD_A1904 sodC   FALSE 0.209 80.000 0.033 1.000   NA
 7296965 7296966 SeD_A1904 SeD_A1905     FALSE 0.301 51.000 0.045 NA   NA
 7296967 7296968 SeD_A1906 SeD_A1907     TRUE 0.762 59.000 0.362 1.000 N NA
 7296968 7296969 SeD_A1907 SeD_A1908   gloA FALSE 0.321 69.000 0.057 1.000 N NA
 7296969 7296970 SeD_A1908 SeD_A1909 gloA rnt FALSE 0.455 101.000 0.136 1.000 N NA
 7296972 7296973 SeD_A1911 SeD_A1912     FALSE 0.117 127.000 0.015 NA N NA
 7296973 7296974 SeD_A1912 SeD_A1913   purR FALSE 0.003 468.000 0.000 1.000 N NA
 7296976 7296977 SeD_A1915 SeD_A1916   cfa FALSE 0.012 290.000 0.000 1.000 N NA
 7296979 7296980 SeD_A1918 SeD_A1919     FALSE 0.092 151.000 0.000 NA   NA
 7296980 7296981 SeD_A1919 SeD_A1920     TRUE 0.762 9.000 0.000 NA   NA
 7296982 7296983 SeD_A1921 SeD_A1922   epaR TRUE 0.996 -3.000 0.406 0.076 Y NA
 7296983 7296984 SeD_A1922 SeD_A1923 epaR   TRUE 0.819 1.000 0.000 NA   NA
 7296984 7296985 SeD_A1923 SeD_A1924   epaP FALSE 0.095 150.000 0.000 NA   NA
 7296985 7296986 SeD_A1924 SeD_A1925 epaP epaO TRUE 0.838 68.000 0.154 1.000 Y NA
 7296986 7296987 SeD_A1925 SeD_A1926 epaO   TRUE 0.854 -19.000 0.154 NA   NA
 7296987 7296988 SeD_A1926 SeD_A1927     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7296988 7296989 SeD_A1927 SeD_A1928     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7296989 7296990 SeD_A1928 SeD_A1929     TRUE 0.993 -40.000 0.647 0.007 Y NA
 7296990 7296991 SeD_A1929 SeD_A1930     TRUE 0.974 -15.000 0.636 NA   NA
 7296991 7296992 SeD_A1930 SeD_A1931     TRUE 0.743 58.000 0.364 NA   NA
 7296992 7296993 SeD_A1931 SeD_A1932     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7296993 7296994 SeD_A1932 SeD_A1933     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7296994 7296995 SeD_A1933 SeD_A1934     FALSE 0.181 294.000 0.786 NA   NA
 7296995 7296996 SeD_A1934 SeD_A1935     TRUE 0.988 -3.000 0.407 0.009   NA
 7296996 7296997 SeD_A1935 SeD_A1936     TRUE 0.981 -3.000 0.407 NA   NA
 7296997 7296998 SeD_A1936 SeD_A1937   eprI TRUE 0.968 -22.000 0.650 NA   NA
 7296998 7296999 SeD_A1937 SeD_A1938 eprI   FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7296999 7297000 SeD_A1938 SeD_A1939     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297000 7297001 SeD_A1939 SeD_A1940     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7297001 7297002 SeD_A1940 SeD_A1941     FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7297002 7297003 SeD_A1941 SeD_A1942     FALSE 0.012 264.000 0.000 NA   NA
 7297003 7297004 SeD_A1942 SeD_A1943     FALSE 0.354 100.000 0.105 NA   NA
 7297004 7297005 SeD_A1943 SeD_A1944     TRUE 0.990 3.000 0.632 1.000   NA
 7297005 7297006 SeD_A1944 SeD_A1945     FALSE 0.511 -45.000 0.000 NA   NA
 7297006 7297007 SeD_A1945 SeD_A1946     FALSE 0.002 536.000 0.000 NA   NA
 7297007 7297008 SeD_A1946 SeD_A1947     TRUE 0.844 17.000 0.146 NA   NA
 7297008 7297009 SeD_A1947 SeD_A1948     TRUE 0.950 -7.000 0.268 NA   NA
 7297010 7297011 SeD_A1949 SeD_A1950     TRUE 0.919 31.000 0.000 0.011 Y NA
 7297011 7297012 SeD_A1950 SeD_A1951     FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 7297012 7297013 SeD_A1951 SeD_A1952     TRUE 0.635 15.000 0.000 NA   NA
 7297013 7297014 SeD_A1952 SeD_A1953     FALSE 0.060 172.000 0.000 NA   NA
 7297015 7297016 SeD_A1954 SeD_A1955     FALSE 0.168 98.000 0.000 NA   NA
 7297016 7297017 SeD_A1955 SeD_A1956     TRUE 0.991 -25.000 0.600 1.000 Y NA
 7297018 7297019 SeD_A1957 SeD_A1958     TRUE 0.978 1.000 0.000 NA Y NA
 7297019 7297020 SeD_A1958 SeD_A1959     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7297020 7297021 SeD_A1959 SeD_A1960     FALSE 0.008 323.000 0.000 1.000   NA
 7297021 7297022 SeD_A1960 SeD_A1961     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7297022 7297023 SeD_A1961 SeD_A1962     FALSE 0.209 59.000 0.000 NA   NA
 7297023 7297024 SeD_A1962 SeD_A1963     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 7297024 7297025 SeD_A1963 SeD_A1964   pykF FALSE 0.004 402.000 0.000 1.000 N NA
 7297025 7297026 SeD_A1964 SeD_A1965 pykF lpp FALSE 0.010 311.000 0.000 1.000 N NA
 7297026 7297027 SeD_A1965 SeD_A1966 lpp   TRUE 0.767 83.000 0.032 0.005 Y NA
 7297028 7297029 SeD_A1967 SeD_A1968     FALSE 0.147 155.000 0.069 NA   NA
 7297029 7297030 SeD_A1968 SeD_A1969     TRUE 0.910 13.000 0.183 NA   NA
 7297030 7297031 SeD_A1969 SeD_A1970   sufD TRUE 0.962 -3.000 0.193 1.000 N NA
 7297031 7297032 SeD_A1970 SeD_A1971 sufD sufC TRUE 0.988 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 7297032 7297033 SeD_A1971 SeD_A1972 sufC sufB TRUE 0.989 17.000 0.466 1.000 Y NA
 7297033 7297034 SeD_A1972 SeD_A1973 sufB sufA TRUE 0.791 9.000 0.041 NA   NA
 7297035 7297036 SeD_A1974 SeD_A1975     FALSE 0.204 61.000 0.000 NA   NA
 7297037 7297038 SeD_A1976 SeD_A1977     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7297038 7297039 SeD_A1977 SeD_A1978     TRUE 0.937 -3.000 0.129 NA N NA
 7297040 7297041 SeD_A1979 SeD_A1980   rprA FALSE 0.049 183.000 0.000 NA   NA
 7297041 7297042 SeD_A1980 SeD_A1981 rprA   FALSE 0.064 168.000 0.000 NA   NA
 7297042 7297043 SeD_A1981 SeD_A1982     FALSE 0.284 141.000 0.095 1.000   NA
 7297043 7297044 SeD_A1982 SeD_A1983     FALSE 0.004 364.000 0.000 NA   NA
 7297044 7297045 SeD_A1983 SeD_A1984     FALSE 0.355 67.000 0.082 NA N NA
 7297045 7297046 SeD_A1984 SeD_A1985   aroD TRUE 0.885 45.000 0.113 1.000 Y NA
 7297046 7297047 SeD_A1985 SeD_A1986 aroD   FALSE 0.099 154.000 0.019 1.000 N NA
 7297047 7297048 SeD_A1986 SeD_A1987     TRUE 0.992 14.000 0.500 1.000 Y NA
 7297050 7297051 SeD_A1989 SeD_A1990   ydiQ FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 7297051 7297052 SeD_A1990 SeD_A1991 ydiQ   TRUE 0.995 22.000 1.000 0.013 Y NA
 7297052 7297053 SeD_A1991 SeD_A1992     TRUE 0.981 57.000 1.000 0.045 Y NA
 7297053 7297054 SeD_A1992 SeD_A1993     TRUE 0.997 -3.000 0.400 0.045 Y NA
 7297054 7297055 SeD_A1993 SeD_A1994     FALSE 0.351 90.000 0.080 1.000 N NA
 7297057 7297058 SeD_A1996 SeD_A1997     FALSE 0.071 162.000 0.000 NA   NA
 7297058 7297059 SeD_A1997 SeD_A1998     FALSE 0.298 156.000 0.165 1.000   NA
 7297059 7297060 SeD_A1998 SeD_A1999     FALSE 0.120 157.000 0.054 NA N NA
 7297061 7297062 SeD_A2000 SeD_A2001     FALSE 0.195 62.000 0.031 NA   NA
 7297062 7297063 SeD_A2001 SeD_A2002     FALSE 0.007 314.000 0.000 NA N NA
 7297063 7297064 SeD_A2002 SeD_A2003     FALSE 0.186 77.000 0.000 NA N NA
 7297064 7297065 SeD_A2003 SeD_A2004   btuE TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000 N NA
 7297065 7297066 SeD_A2004 SeD_A2005 btuE   FALSE 0.364 92.000 0.084 1.000 N NA
 7297066 7297067 SeD_A2005 SeD_A2006   ihfA FALSE 0.042 203.000 0.023 1.000 N NA
 7297067 7297068 SeD_A2006 SeD_A2007 ihfA pheT TRUE 0.959 5.000 0.208 1.000 N NA
 7297068 7297069 SeD_A2007 SeD_A2008 pheT pheS TRUE 0.995 16.000 0.574 0.001 Y NA
 7297069 7297070 SeD_A2008 SeD_A2009 pheS rplT FALSE 0.169 302.000 0.202 1.000 Y NA
 7297070 7297071 SeD_A2009 SeD_A2010 rplT rpmI TRUE 0.984 51.000 0.928 0.011 Y NA
 7297071 7297072 SeD_A2010 SeD_A2011 rpmI infC TRUE 0.948 96.000 0.652 1.000 Y NA
 7297072 7297073 SeD_A2011 SeD_A2012 infC thrS TRUE 0.829 112.000 0.186 1.000 Y NA
 7297075 7297076 SeD_A2014 SeD_A2015     FALSE 0.201 62.000 0.000 NA   NA
 7297079 7297080 SeD_A2018 SeD_A2019 pfkB   FALSE 0.148 96.000 0.025 NA   NA
 7297080 7297081 SeD_A2019 SeD_A2020     FALSE 0.118 107.000 0.016 NA   NA
 7297083 7297084 SeD_A2022 SeD_A2023     FALSE 0.207 138.000 0.068 NA   NA
 7297084 7297085 SeD_A2023 SeD_A2024     FALSE 0.279 137.000 0.102 NA   NA
 7297088 7297089 SeD_A2027 SeD_A2028     TRUE 0.976 13.000 0.429 0.017   NA
 7297089 7297090 SeD_A2028 SeD_A2029     TRUE 0.802 125.000 0.625 1.000 N NA
 7297090 7297091 SeD_A2029 SeD_A2030     TRUE 0.987 11.000 0.727 1.000 N NA
 7297091 7297092 SeD_A2030 SeD_A2031   chbC TRUE 0.983 51.000 0.833 0.008 Y NA
 7297092 7297093 SeD_A2031 SeD_A2032 chbC chbB TRUE 0.868 83.000 0.167 0.008 Y NA
 7297093 7297094 SeD_A2032 SeD_A2033 chbB osmE FALSE 0.010 301.000 0.000 1.000   NA
 7297094 7297095 SeD_A2033 SeD_A2035 osmE   FALSE 0.136 132.000 0.000 NA   NA
 7297096 7297097 SeD_A2034 SeD_A2036 nadE   FALSE 0.154 121.000 0.010 1.000 N NA
 7297098 7297099 SeD_A2037 SeD_A2038 spy   FALSE 0.164 84.000 0.000 NA   NA
 7297099 7297100 SeD_A2038 SeD_A2039   astE FALSE 0.121 139.000 0.000 NA   NA
 7297100 7297101 SeD_A2039 SeD_A2040 astE astB TRUE 0.981 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 7297101 7297102 SeD_A2040 SeD_A2041 astB astD TRUE 0.977 -3.000 0.306 1.000 N NA
 7297102 7297103 SeD_A2041 SeD_A2042 astD astA TRUE 0.959 -3.000 0.179 1.000 N NA
 7297103 7297104 SeD_A2042 SeD_A2043 astA   TRUE 0.995 -9.000 0.625 1.000 Y NA
 7297105 7297106 SeD_A2044 SeD_A2045 xth   FALSE 0.309 73.000 0.056 1.000 N NA
 7297109 7297110 SeD_A2048 SeD_A2049 topB selD TRUE 0.856 5.000 0.041 1.000 N NA
 7297110 7297111 SeD_A2049 SeD_A2050 selD   FALSE 0.208 118.000 0.033 1.000 N NA
 7297112 7297113 SeD_A2051 SeD_A2052 sppA ansA FALSE 0.421 96.000 0.113 1.000 N NA
 7297113 7297114 SeD_A2052 SeD_A2053 ansA   TRUE 0.585 27.000 0.040 1.000 N NA
 7297115 7297116 SeD_A2054 SeD_A2055     TRUE 0.744 136.000 0.125 1.000 Y NA
 7297116 7297117 SeD_A2055 SeD_A2056     TRUE 0.581 130.000 0.269 1.000 N NA
 7297117 7297118 SeD_A2056 SeD_A2057     TRUE 0.962 10.000 0.269 1.000 N NA
 7297118 7297119 SeD_A2057 SeD_A2058     TRUE 0.994 5.000 0.368 1.000 Y NA
 7297119 7297120 SeD_A2058 SeD_A2059   gutB TRUE 0.910 22.000 0.194 0.013 N NA
 7297120 7297121 SeD_A2059 SeD_A2060 gutB   TRUE 0.931 11.000 0.167 1.000 N NA
 7297121 7297122 SeD_A2060 SeD_A2061     TRUE 0.875 27.000 0.250 1.000 N NA
 7297122 7297123 SeD_A2061 SeD_A2062     FALSE 0.154 117.000 0.000 NA   NA
 7297125 7297126 SeD_A2064 SeD_A2065   msrB TRUE 0.727 42.000 0.216 NA   NA
 7297127 7297128 SeD_A2066 SeD_A2067 gapA   FALSE 0.118 329.000 0.154 1.000 Y NA
 7297129 7297130 SeD_A2068 SeD_A2069     FALSE 0.202 106.000 0.000 1.000   NA
 7297130 7297131 SeD_A2069 SeD_A2070     FALSE 0.009 290.000 0.000 NA   NA
 7297132 7297133 SeD_A2071 SeD_A2072     TRUE 0.809 123.000 0.683 NA   NA
 7297133 7297134 SeD_A2072 SeD_A2073     FALSE 0.002 640.000 0.000 NA   NA
 7297134 7297135 SeD_A2073 SeD_A2074     FALSE 0.522 41.000 0.083 NA   NA
 7297136 7297137 SeD_A2075 SeD_A2076     FALSE 0.413 31.000 0.000 NA   NA
 7297143 7297144 SeD_A2082 SeD_A2083     FALSE 0.266 69.000 0.057 NA   NA
 7297146 7297147 SeD_A2085 SeD_A2087     TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7297149 7297150 SeD_A2088 SeD_A2089     FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 7297150 7297151 SeD_A2089 SeD_A2091     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7297153 7297154 SeD_A2092 SeD_A2093     FALSE 0.303 197.000 0.000 1.000 Y NA
 7297156 7297157 SeD_A2095 SeD_A2096     FALSE 0.356 69.000 0.000 0.055   NA
 7297157 7297158 SeD_A2096 SeD_A2097     FALSE 0.063 169.000 0.000 NA   NA
 7297158 7297159 SeD_A2097 SeD_A2098     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7297159 7297160 SeD_A2098 SeD_A2100     FALSE 0.159 108.000 0.000 NA   NA
 7297161 7297162 SeD_A2099 SeD_A2101     FALSE 0.004 389.000 0.000 NA   NA
 7297163 7297164 SeD_A2102 SeD_A2103     TRUE 0.887 -6.000 0.000 0.014   NA
 7297164 7297165 SeD_A2103 SeD_A2104     TRUE 0.797 -6.000 0.000 1.000   NA
 7297165 7297166 SeD_A2104 SeD_A2105     TRUE 0.970 -10.000 0.000 0.044 Y NA
 7297166 7297167 SeD_A2105 SeD_A2106     TRUE 0.998 0.000 0.500 0.044 Y NA
 7297168 7297169 SeD_A2107 SeD_A2108     FALSE 0.102 146.000 0.000 NA   NA
 7297171 7297172 SeD_A2109 SeD_A2111     FALSE 0.097 149.000 0.000 NA   NA
 7297173 7297174 SeD_A2112 SeD_A2113     FALSE 0.349 38.000 0.000 NA   NA
 7297174 7297175 SeD_A2113 SeD_A2114     FALSE 0.006 339.000 0.000 NA   NA
 7297179 7297180 SeD_A2118 SeD_A2119     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7297180 7297181 SeD_A2119 SeD_A2120     FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 7297181 7297182 SeD_A2120 SeD_A2121     FALSE 0.004 380.000 0.000 NA   NA
 7297183 7297184 SeD_A2122 SeD_A2123     FALSE 0.001 668.000 0.000 NA   NA
 7297184 7297185 SeD_A2123 SeD_A2124     FALSE 0.042 191.000 0.000 NA   NA
 7297185 7297186 SeD_A2124 SeD_A2125     FALSE 0.002 490.000 0.000 NA   NA
 7297186 7297187 SeD_A2125 SeD_A2126     FALSE 0.003 430.000 0.000 NA   NA
 7297188 7297189 SeD_A2127 SeD_A2128   icd FALSE 0.002 461.000 0.000 NA   NA
 7297190 7297191 SeD_A2129 SeD_A2130     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297191 7297192 SeD_A2130 SeD_A2131     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7297192 7297193 SeD_A2131 SeD_A2132   mnmA TRUE 0.599 54.000 0.158 1.000 N NA
 7297193 7297194 SeD_A2132 SeD_A2133 mnmA   FALSE 0.481 87.000 0.180 NA   NA
 7297194 7297195 SeD_A2133 SeD_A2134   purB TRUE 0.907 4.000 0.093 NA   NA
 7297195 7297196 SeD_A2134 SeD_A2135 purB   FALSE 0.153 124.000 0.011 1.000 N NA
 7297196 7297197 SeD_A2135 SeD_A2136     TRUE 0.998 0.000 0.940 1.000 Y NA
 7297197 7297198 SeD_A2136 SeD_A2137     TRUE 0.706 81.000 0.408 NA   NA
 7297199 7297200 SeD_A2138 SeD_A2139   pepT TRUE 0.838 4.000 0.000 1.000   NA
 7297201 7297202 SeD_A2140 SeD_A2141 potA potB TRUE 0.995 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 7297202 7297203 SeD_A2141 SeD_A2142 potB   FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7297203 7297204 SeD_A2142 SeD_A2143   sifA FALSE 0.209 59.000 0.000 NA   NA
 7297204 7297205 SeD_A2143 SeD_A2144 sifA   FALSE 0.166 91.000 0.000 NA   NA
 7297205 7297206 SeD_A2144 SeD_A2145   potC FALSE 0.162 103.000 0.000 NA   NA
 7297206 7297207 SeD_A2145 SeD_A2146 potC potD TRUE 0.929 25.000 0.007 0.044 Y NA
 7297208 7297209 SeD_A2147 SeD_A2148 npdA nagK TRUE 0.961 19.000 0.119 1.000 Y NA
 7297209 7297210 SeD_A2148 SeD_A2149 nagK lolE TRUE 0.846 29.000 0.225 1.000 N NA
 7297210 7297211 SeD_A2149 SeD_A2150 lolE lolD TRUE 0.965 0.000 0.125 0.055 N NA
 7297211 7297212 SeD_A2150 SeD_A2151 lolD lolC TRUE 0.952 -7.000 0.175 0.055 N NA
 7297212 7297213 SeD_A2151 SeD_A2152 lolC   FALSE 0.058 174.000 0.000 NA   NA
 7297214 7297215 SeD_A2153 SeD_A2154 mfd   FALSE 0.088 148.000 0.006 1.000   NA
 7297218 7297219 SeD_A2157 SeD_A2158   ndh FALSE 0.117 179.000 0.071 1.000   NA
 7297219 7297220 SeD_A2158 SeD_A2159 ndh   FALSE 0.032 228.000 0.057 NA   NA
 7297220 7297221 SeD_A2159 SeD_A2160   nagZ TRUE 0.709 25.000 0.091 NA   NA
 7297221 7297222 SeD_A2160 SeD_A2161 nagZ thiK TRUE 0.865 11.000 0.069 1.000 N NA
 7297222 7297223 SeD_A2161 SeD_A2162 thiK   TRUE 0.929 -19.000 0.310 NA   NA
 7297223 7297224 SeD_A2162 SeD_A2163     TRUE 0.969 14.000 0.516 NA   NA
 7297224 7297225 SeD_A2163 SeD_A2164     TRUE 0.858 3.000 0.051 NA   NA
 7297227 7297228 SeD_A2166 SeD_A2167 ptsG   FALSE 0.005 295.000 0.004 NA N NA
 7297228 7297229 SeD_A2167 SeD_A2168     TRUE 0.978 11.000 0.110 NA Y NA
 7297229 7297230 SeD_A2168 SeD_A2169   tmk TRUE 0.965 -3.000 0.211 1.000 N NA
 7297230 7297231 SeD_A2169 SeD_A2170 tmk   TRUE 0.922 -10.000 0.209 NA   NA
 7297231 7297232 SeD_A2170 SeD_A2171     TRUE 0.958 3.000 0.204 NA   NA
 7297232 7297233 SeD_A2171 SeD_A2172   fabF FALSE 0.507 124.000 0.187 1.000 N NA
 7297233 7297234 SeD_A2172 SeD_A2173 fabF acpP TRUE 0.899 86.000 0.346 1.000 Y NA
 7297234 7297235 SeD_A2173 SeD_A2174 acpP fabG TRUE 0.844 156.000 0.321 0.003 Y NA
 7297235 7297236 SeD_A2174 SeD_A2175 fabG fabD TRUE 0.994 13.000 0.432 0.003 Y NA
 7297236 7297237 SeD_A2175 SeD_A2176 fabD fabH TRUE 0.984 16.000 0.182 0.003 Y NA
 7297237 7297238 SeD_A2176 SeD_A2177 fabH plsX TRUE 0.935 80.000 0.380 0.003 Y NA
 7297240 7297241 SeD_A2179 SeD_A2181   sraB FALSE 0.355 37.000 0.000 NA   NA
 7297243 7297244 SeD_A2182 SeD_A2184     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7297244 7297245 SeD_A2184 SeD_A2185     FALSE 0.123 138.000 0.000 NA   NA
 7297247 7297248 SeD_A2188 SeD_A2189 flgL flgK TRUE 0.983 15.000 0.142 0.001 Y NA
 7297248 7297249 SeD_A2189 SeD_A2190 flgK flgJ TRUE 0.973 65.000 0.705 0.002 Y NA
 7297249 7297250 SeD_A2190 SeD_A2191 flgJ flgI TRUE 0.988 0.000 0.036 0.006 Y NA
 7297250 7297251 SeD_A2191 SeD_A2192 flgI flgH TRUE 0.981 12.000 0.073 0.006 Y NA
 7297251 7297252 SeD_A2192 SeD_A2193 flgH flgG TRUE 0.909 88.000 0.268 0.005 Y NA
 7297252 7297253 SeD_A2193 SeD_A2194 flgG flgF TRUE 0.994 14.000 0.420 0.001 Y NA
 7297253 7297254 SeD_A2194 SeD_A2195 flgF flgE TRUE 0.991 21.000 0.476 0.003 Y NA
 7297254 7297255 SeD_A2195 SeD_A2196 flgE flgD TRUE 0.938 27.000 0.116 NA Y NA
 7297255 7297256 SeD_A2196 SeD_A2197 flgD flgC TRUE 0.982 12.000 0.186 NA Y NA
 7297256 7297257 SeD_A2197 SeD_A2198 flgC flgB TRUE 0.999 4.000 0.824 0.003 Y NA
 7297258 7297259 SeD_A2199 SeD_A2200 flgA   TRUE 0.885 92.000 0.330 NA Y NA
 7297259 7297260 SeD_A2200 SeD_A2201     TRUE 0.976 35.000 0.361 0.002 Y NA
 7297261 7297262 SeD_A2202 SeD_A2203 mviN   FALSE 0.013 265.000 0.022 1.000   NA
 7297262 7297263 SeD_A2203 SeD_A2204     TRUE 0.923 2.000 0.103 NA   NA
 7297263 7297264 SeD_A2204 SeD_A2205     TRUE 0.632 36.000 0.116 NA   NA
 7297265 7297266 SeD_A2206 SeD_A2207   grxB FALSE 0.409 64.000 0.103 NA N NA
 7297266 7297267 SeD_A2207 SeD_A2208 grxB   FALSE 0.266 125.000 0.078 NA   NA
 7297267 7297268 SeD_A2208 SeD_A2209   pyrC FALSE 0.133 105.000 0.022 NA   NA
 7297268 7297269 SeD_A2209 SeD_A2210 pyrC   FALSE 0.172 74.000 0.031 NA   NA
 7297269 7297270 SeD_A2210 SeD_A2211   bssS FALSE 0.009 287.000 0.000 NA   NA
 7297270 7297271 SeD_A2211 SeD_A2212 bssS solA TRUE 0.700 113.000 0.423 NA   NA
 7297271 7297272 SeD_A2212 SeD_A2213 solA   TRUE 0.781 41.000 0.269 NA   NA
 7297274 7297275 SeD_A2215 SeD_A2216     TRUE 0.990 -3.000 0.676 NA   NA
 7297277 7297278 SeD_A2218 SeD_A2219     TRUE 0.806 155.000 0.857 0.073 N NA
 7297278 7297279 SeD_A2219 SeD_A2220     TRUE 0.651 82.000 0.333 NA   NA
 7297280 7297281 SeD_A2221 SeD_A2222     FALSE 0.413 98.000 0.135 NA   NA
 7297281 7297282 SeD_A2222 SeD_A2223   mdoG TRUE 0.974 -7.000 0.469 NA N NA
 7297284 7297285 SeD_A2225 SeD_A2226     FALSE 0.189 119.000 0.046 NA   NA
 7297285 7297286 SeD_A2226 SeD_A2227     FALSE 0.151 87.000 0.028 NA   NA
 7297286 7297287 SeD_A2227 SeD_A2228   csgC TRUE 0.673 131.000 0.429 NA   NA
 7297287 7297288 SeD_A2228 SeD_A2229 csgC   TRUE 0.852 62.000 0.667 NA   NA
 7297288 7297289 SeD_A2229 SeD_A2230   csgB TRUE 0.876 42.000 0.333 0.010   NA
 7297290 7297291 SeD_A2231 SeD_A2232 csgD   TRUE 0.944 5.000 0.176 NA   NA
 7297291 7297292 SeD_A2232 SeD_A2233     TRUE 0.957 27.000 0.723 NA   NA
 7297292 7297293 SeD_A2233 SeD_A2234     TRUE 0.668 27.000 0.085 NA   NA
 7297294 7297295 SeD_A2235 SeD_A2236     FALSE 0.453 71.000 0.145 NA   NA
 7297295 7297296 SeD_A2236 SeD_A2237     TRUE 0.935 24.000 0.417 1.000   NA
 7297296 7297297 SeD_A2237 SeD_A2239     TRUE 0.826 85.000 0.169 1.000 Y NA
 7297298 7297299 SeD_A2238 SeD_A2240     FALSE 0.181 72.000 0.000 NA   NA
 7297299 7297300 SeD_A2240 SeD_A2241     FALSE 0.001 871.000 0.000 NA   NA
 7297301 7297302 SeD_A2242 SeD_A2243     FALSE 0.154 117.000 0.000 NA   NA
 7297302 7297303 SeD_A2243 SeD_A2244     FALSE 0.002 479.000 0.000 NA   NA
 7297303 7297304 SeD_A2244 SeD_A2245     FALSE 0.001 739.000 0.000 NA   NA
 7297306 7297307 SeD_A2247 SeD_A2248     FALSE 0.130 135.000 0.000 NA   NA
 7297307 7297308 SeD_A2248 SeD_A2249     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7297308 7297309 SeD_A2249 SeD_A2250     TRUE 0.650 -13.000 0.000 NA   NA
 7297309 7297310 SeD_A2250 SeD_A2251     TRUE 0.947 3.000 0.167 NA   NA
 7297310 7297311 SeD_A2251 SeD_A2252     TRUE 0.917 -7.000 0.167 NA   NA
 7297311 7297312 SeD_A2252 SeD_A2253     TRUE 0.982 5.000 0.500 NA   NA
 7297312 7297313 SeD_A2253 SeD_A2254     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7297313 7297314 SeD_A2254 SeD_A2255     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297314 7297315 SeD_A2255 SeD_A2256     TRUE 0.914 34.000 0.556 NA   NA
 7297315 7297316 SeD_A2256 SeD_A2257     TRUE 0.748 85.000 0.500 NA   NA
 7297316 7297317 SeD_A2257 SeD_A2258     TRUE 0.993 -3.000 0.900 NA   NA
 7297317 7297318 SeD_A2258 SeD_A2259     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 7297318 7297319 SeD_A2259 SeD_A2260     TRUE 0.984 -10.000 0.800 NA   NA
 7297319 7297320 SeD_A2260 SeD_A2261     TRUE 0.980 4.000 0.417 NA   NA
 7297320 7297321 SeD_A2261 SeD_A2262     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 7297321 7297322 SeD_A2262 SeD_A2263     TRUE 0.616 -28.000 0.047 NA   NA
 7297322 7297323 SeD_A2263 SeD_A2264     TRUE 0.872 -3.000 0.058 NA   NA
 7297323 7297324 SeD_A2264 SeD_A2265     TRUE 0.976 3.000 0.333 NA   NA
 7297324 7297325 SeD_A2265 SeD_A2266     FALSE 0.440 51.000 0.087 NA   NA
 7297325 7297326 SeD_A2266 SeD_A2268     TRUE 0.635 15.000 0.000 NA   NA
 7297326 7297327 SeD_A2268 SeD_A2269     TRUE 0.583 -22.000 0.000 NA   NA
 7297327 7297328 SeD_A2269 SeD_A2270     TRUE 0.989 0.000 0.600 NA   NA
 7297328 7297329 SeD_A2270 SeD_A2271     TRUE 0.878 12.000 0.120 NA   NA
 7297329 7297330 SeD_A2271 SeD_A2272     TRUE 0.957 -3.000 0.200 NA   NA
 7297330 7297331 SeD_A2272 SeD_A2273     FALSE 0.317 127.000 0.105 NA   NA
 7297331 7297332 SeD_A2273 SeD_A2274     FALSE 0.143 128.000 0.000 NA   NA
 7297332 7297333 SeD_A2274 SeD_A2275     FALSE 0.001 661.000 0.000 NA   NA
 7297333 7297334 SeD_A2275 SeD_A2276     TRUE 0.918 -16.000 0.250 NA   NA
 7297334 7297335 SeD_A2276 SeD_A2277     TRUE 0.993 4.000 1.000 NA   NA
 7297335 7297336 SeD_A2277 SeD_A2278     FALSE 0.001 663.000 0.000 NA   NA
 7297336 7297337 SeD_A2278 SeD_A2279     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7297337 7297338 SeD_A2279 SeD_A2280     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7297338 7297339 SeD_A2280 SeD_A2281     TRUE 0.591 17.000 0.000 NA   NA
 7297339 7297340 SeD_A2281 SeD_A2282     TRUE 0.973 9.000 0.000 1.000 Y NA
 7297340 7297341 SeD_A2282 SeD_A2283     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297341 7297342 SeD_A2283 SeD_A2284     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297342 7297343 SeD_A2284 SeD_A2285     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297343 7297344 SeD_A2285 SeD_A2286     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 7297344 7297345 SeD_A2286 SeD_A2287     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297345 7297346 SeD_A2287 SeD_A2288     FALSE 0.435 29.000 0.000 NA   NA
 7297347 7297348 SeD_A2289 SeD_A2290     FALSE 0.006 318.000 0.000 NA   NA
 7297349 7297350 SeD_A2291 SeD_A2293     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7297351 7297352 SeD_A2292 SeD_A2294     TRUE 0.635 58.000 0.233 NA   NA
 7297352 7297353 SeD_A2294 SeD_A2295     FALSE 0.139 137.000 0.039 NA   NA
 7297353 7297354 SeD_A2295 SeD_A2296     FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 7297354 7297355 SeD_A2296 SeD_A2297     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297355 7297356 SeD_A2297 SeD_A2298     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7297356 7297357 SeD_A2298 SeD_A2299     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297357 7297358 SeD_A2299 SeD_A2300     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 7297358 7297359 SeD_A2300 SeD_A2301     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7297361 7297362 SeD_A2303 SeD_A2304     FALSE 0.166 100.000 0.000 NA   NA
 7297362 7297363 SeD_A2304 SeD_A2305     FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 7297364 7297365 SeD_A2306 SeD_A2307     FALSE 0.002 479.000 0.000 NA   NA
 7297365 7297366 SeD_A2307 SeD_A2308     FALSE 0.005 362.000 0.000 NA   NA
 7297366 7297367 SeD_A2308 SeD_A2309     FALSE 0.190 67.000 0.000 NA   NA
 7297369 7297370 SeD_A2311 SeD_A2312     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7297370 7297371 SeD_A2312 SeD_A2313     FALSE 0.004 408.000 0.000 1.000   NA
 7297373 7297374 SeD_A2315 SeD_A2316     FALSE 0.047 186.000 0.000 NA   NA
 7297374 7297375 SeD_A2316 SeD_A2317     TRUE 0.755 95.000 0.500 NA   NA
 7297375 7297376 SeD_A2317 SeD_A2318     TRUE 0.818 88.000 0.667 NA   NA
 7297377 7297378 SeD_A2319 SeD_A2320     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 7297379 7297380 SeD_A2321 SeD_A2322     FALSE 0.244 52.000 0.000 NA   NA
 7297383 7297384 SeD_A2324 SeD_A2326     FALSE 0.001 1258.000 0.000 NA   NA
 7297384 7297385 SeD_A2326 SeD_A2327     TRUE 0.967 28.000 1.000 NA   NA
 7297385 7297386 SeD_A2327 SeD_A2328     FALSE 0.056 383.000 0.500 NA   NA
 7297386 7297387 SeD_A2328 SeD_A2329     FALSE 0.542 161.000 0.500 NA   NA
 7297387 7297388 SeD_A2329 SeD_A2330     FALSE 0.162 103.000 0.000 NA   NA
 7297389 7297390 SeD_A2331 SeD_A2332     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 7297390 7297391 SeD_A2332 SeD_A2333     FALSE 0.293 45.000 0.000 NA   NA
 7297391 7297392 SeD_A2333 SeD_A2334     FALSE 0.164 82.000 0.000 NA   NA
 7297392 7297393 SeD_A2334 SeD_A2335     TRUE 0.727 151.000 0.750 NA   NA
 7297396 7297397 SeD_A2338 SeD_A2339     FALSE 0.005 343.000 0.000 NA   NA
 7297397 7297398 SeD_A2339 SeD_A2340     FALSE 0.446 57.000 0.000 0.008   NA
 7297398 7297399 SeD_A2340 SeD_A2341     FALSE 0.413 31.000 0.000 NA   NA
 7297399 7297400 SeD_A2341 SeD_A2342     FALSE 0.293 45.000 0.000 NA   NA
 7297400 7297401 SeD_A2342 SeD_A2343     FALSE 0.166 92.000 0.000 NA   NA
 7297404 7297405 SeD_A2346 SeD_A2347     FALSE 0.001 876.000 0.000 NA   NA
 7297405 7297406 SeD_A2347 SeD_A2348     FALSE 0.119 140.000 0.000 NA   NA
 7297408 7297409 SeD_A2350 SeD_A2351   cobT FALSE 0.124 78.000 0.015 NA   NA
 7297409 7297410 SeD_A2351 SeD_A2352 cobT cobS TRUE 0.944 27.000 0.056 0.008 Y NA
 7297410 7297411 SeD_A2352 SeD_A2353 cobS cobU TRUE 0.976 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 7297411 7297412 SeD_A2353 SeD_A2354 cobU cobQ TRUE 0.976 -3.000 0.003 1.000 Y NA
 7297412 7297413 SeD_A2354 SeD_A2355 cobQ cbiO TRUE 0.859 -3.000 0.033 1.000 N NA
 7297413 7297414 SeD_A2355 SeD_A2356 cbiO cbiQ TRUE 0.991 9.000 0.152 0.001 Y NA
 7297414 7297415 SeD_A2356 SeD_A2357 cbiQ   TRUE 0.997 -13.000 0.804 0.001 Y NA
 7297415 7297416 SeD_A2357 SeD_A2358   cbiM TRUE 0.999 2.000 0.861 0.008 Y NA
 7297416 7297417 SeD_A2358 SeD_A2359 cbiM cobI TRUE 0.943 -3.000 0.058 0.008 N NA
 7297417 7297418 SeD_A2359 SeD_A2360 cobI   TRUE 0.981 -3.000 0.048 1.000 Y NA
 7297418 7297419 SeD_A2360 SeD_A2361   cobK TRUE 0.979 3.000 0.029 1.000 Y NA
 7297419 7297420 SeD_A2361 SeD_A2362 cobK cobJ TRUE 0.997 -3.000 0.423 0.008 Y NA
 7297420 7297421 SeD_A2362 SeD_A2363 cobJ   TRUE 0.997 0.000 0.352 0.008 Y NA
 7297421 7297422 SeD_A2363 SeD_A2364   cobM TRUE 0.991 -19.000 0.397 0.008 Y NA
 7297422 7297423 SeD_A2364 SeD_A2365 cobM   TRUE 0.969 -16.000 0.056 0.008 Y NA
 7297423 7297424 SeD_A2365 SeD_A2366   cbiE TRUE 0.992 -10.000 0.300 0.001 Y NA
 7297424 7297425 SeD_A2366 SeD_A2367 cbiE cbiD TRUE 0.988 -6.000 0.126 0.008 Y NA
 7297425 7297426 SeD_A2367 SeD_A2368 cbiD cbiC TRUE 0.994 0.000 0.168 0.008 Y NA
 7297426 7297427 SeD_A2368 SeD_A2369 cbiC cobD TRUE 0.986 11.000 0.107 0.008 Y NA
 7297427 7297428 SeD_A2369 SeD_A2370 cobD cobB TRUE 0.992 -3.000 0.124 0.008 Y NA
 7297428 7297429 SeD_A2370 SeD_A2372 cobB   FALSE 0.002 598.000 0.000 1.000 N NA
 7297429 7297430 SeD_A2372 SeD_A2373     FALSE 0.160 217.000 0.231 1.000 N NA
 7297431 7297432 SeD_A2374 SeD_A2375 pduA   TRUE 0.910 -3.000 0.083 NA N NA
 7297432 7297433 SeD_A2375 SeD_A2376   pduC TRUE 0.648 19.000 0.000 1.000 N NA
 7297433 7297434 SeD_A2376 SeD_A2377 pduC   TRUE 0.899 11.000 0.000 0.001   NA
 7297434 7297435 SeD_A2377 SeD_A2378     TRUE 0.988 15.000 0.759 0.001   NA
 7297435 7297436 SeD_A2378 SeD_A2379     TRUE 0.979 10.000 0.500 NA   NA
 7297436 7297437 SeD_A2379 SeD_A2380     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7297437 7297438 SeD_A2380 SeD_A2381     TRUE 0.562 19.000 0.000 NA   NA
 7297438 7297439 SeD_A2381 SeD_A2382     TRUE 0.988 25.000 0.645 NA Y NA
 7297439 7297440 SeD_A2382 SeD_A2383     TRUE 0.993 0.000 0.242 NA Y NA
 7297440 7297441 SeD_A2383 SeD_A2384     TRUE 0.965 -3.000 0.242 NA   NA
 7297441 7297442 SeD_A2384 SeD_A2385     TRUE 0.970 4.000 0.296 NA   NA
 7297442 7297443 SeD_A2385 SeD_A2386     TRUE 0.956 10.000 0.268 NA   NA
 7297443 7297444 SeD_A2386 SeD_A2387     TRUE 0.849 -3.000 0.000 1.000   NA
 7297444 7297445 SeD_A2387 SeD_A2388     TRUE 0.973 12.000 0.000 0.023 Y NA
 7297445 7297446 SeD_A2388 SeD_A2389     TRUE 0.993 -3.000 0.259 1.000 Y NA
 7297446 7297447 SeD_A2389 SeD_A2390     TRUE 0.997 3.000 0.714 NA Y NA
 7297447 7297448 SeD_A2390 SeD_A2391     TRUE 0.761 27.000 0.133 NA N NA
 7297448 7297449 SeD_A2391 SeD_A2392   eutP TRUE 0.990 5.000 0.200 1.000 Y NA
 7297449 7297450 SeD_A2392 SeD_A2393 eutP ackA TRUE 0.942 -15.000 0.292 1.000 N NA
 7297450 7297451 SeD_A2393 SeD_A2394 ackA   FALSE 0.505 94.000 0.080 0.003 N NA
 7297452 7297453 SeD_A2395 SeD_A2396     FALSE 0.071 245.000 0.180 NA   NA
 7297453 7297454 SeD_A2396 SeD_A2397     FALSE 0.317 119.000 0.096 NA   NA
 7297454 7297455 SeD_A2397 SeD_A2398   dacD FALSE 0.233 151.000 0.110 NA N NA
 7297455 7297456 SeD_A2398 SeD_A2399 dacD   FALSE 0.200 124.000 0.000 1.000 N NA
 7297456 7297457 SeD_A2399 SeD_A2400     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.043 Y NA
 7297457 7297458 SeD_A2400 SeD_A2401   phsA TRUE 0.992 15.000 0.400 0.043 Y NA
 7297462 7297463 SeD_A2405 SeD_A2406 yeeF   FALSE 0.013 286.000 0.000 1.000 N NA
 7297463 7297464 SeD_A2406 SeD_A2407     FALSE 0.303 46.000 0.015 1.000 N NA
 7297465 7297466 SeD_A2409 SeD_A2410 hisG hisD TRUE 0.878 103.000 0.171 0.002 Y NA
 7297466 7297467 SeD_A2410 SeD_A2411 hisD hisC TRUE 0.996 -3.000 0.294 0.002 Y NA
 7297467 7297468 SeD_A2411 SeD_A2412 hisC hisB TRUE 0.996 -3.000 0.341 0.002 Y NA
 7297468 7297469 SeD_A2412 SeD_A2413 hisB hisH TRUE 0.993 0.000 0.128 0.002 Y NA
 7297469 7297470 SeD_A2413 SeD_A2414 hisH hisA TRUE 0.995 0.000 0.210 0.002 Y NA
 7297470 7297471 SeD_A2414 SeD_A2415 hisA hisF TRUE 0.993 -18.000 0.433 0.002 Y NA
 7297471 7297472 SeD_A2415 SeD_A2416 hisF   TRUE 0.996 -6.000 0.430 0.002 Y NA
 7297473 7297474 SeD_A2417 SeD_A2418     TRUE 0.585 143.000 0.000 1.000 Y NA
 7297474 7297475 SeD_A2418 SeD_A2419     FALSE 0.201 62.000 0.000 NA   NA
 7297475 7297476 SeD_A2419 SeD_A2420   gnd TRUE 0.664 -12.000 0.000 NA   NA
 7297476 7297477 SeD_A2420 SeD_A2421 gnd   FALSE 0.065 164.000 0.005 1.000 N NA
 7297477 7297478 SeD_A2421 SeD_A2422     FALSE 0.243 71.000 0.000 1.000 N NA
 7297478 7297479 SeD_A2422 SeD_A2423     TRUE 0.727 -13.000 0.000 1.000 N NA
 7297479 7297480 SeD_A2423 SeD_A2424     TRUE 0.790 1.000 0.023 NA   NA
 7297480 7297481 SeD_A2424 SeD_A2425     TRUE 0.790 1.000 0.023 NA   NA
 7297481 7297482 SeD_A2425 SeD_A2426     FALSE 0.017 575.000 0.000 NA Y NA
 7297482 7297483 SeD_A2426 SeD_A2427     TRUE 0.931 2.000 0.118 NA   NA
 7297483 7297484 SeD_A2427 SeD_A2428     FALSE 0.455 86.000 0.167 NA   NA
 7297484 7297485 SeD_A2428 SeD_A2429     TRUE 0.991 -3.000 0.111 0.007 Y NA
 7297485 7297486 SeD_A2429 SeD_A2430     TRUE 0.890 36.000 0.018 0.019 Y NA
 7297486 7297487 SeD_A2430 SeD_A2431   rfbG TRUE 0.966 27.000 0.247 1.000 Y NA
 7297487 7297488 SeD_A2431 SeD_A2432 rfbG rfbF TRUE 0.997 5.000 0.624 1.000 Y NA
 7297488 7297489 SeD_A2432 SeD_A2433 rfbF   TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7297489 7297490 SeD_A2433 SeD_A2434   rfbC TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 7297490 7297491 SeD_A2434 SeD_A2435 rfbC rfbA TRUE 0.991 4.000 0.211 1.000 Y NA
 7297491 7297492 SeD_A2435 SeD_A2436 rfbA rfbD TRUE 0.903 42.000 0.053 0.002 Y NA
 7297492 7297493 SeD_A2436 SeD_A2437 rfbD rfbB TRUE 0.992 0.000 0.084 0.002 Y NA
 7297493 7297494 SeD_A2437 SeD_A2438 rfbB galF FALSE 0.044 377.000 0.000 1.000 Y NA
 7297494 7297495 SeD_A2438 SeD_A2439 galF wcaM FALSE 0.289 178.000 0.259 NA   NA
 7297495 7297496 SeD_A2439 SeD_A2440 wcaM   TRUE 0.921 17.000 0.292 NA   NA
 7297496 7297497 SeD_A2440 SeD_A2441     TRUE 0.915 -3.000 0.095 NA   NA
 7297497 7297498 SeD_A2441 SeD_A2442     TRUE 0.741 22.000 0.095 NA   NA
 7297498 7297499 SeD_A2442 SeD_A2443     TRUE 0.758 48.000 0.304 NA   NA
 7297499 7297500 SeD_A2443 SeD_A2444   cpsG TRUE 0.844 54.000 0.538 NA N NA
 7297500 7297501 SeD_A2444 SeD_A2445 cpsG cpsB TRUE 0.883 111.000 1.000 1.000 N NA
 7297501 7297502 SeD_A2445 SeD_A2446 cpsB wcaI TRUE 0.988 3.000 0.123 1.000 Y NA
 7297502 7297503 SeD_A2446 SeD_A2447 wcaI nudD TRUE 0.937 -3.000 0.108 1.000 N NA
 7297503 7297504 SeD_A2447 SeD_A2448 nudD fcl TRUE 0.966 3.000 0.217 1.000 N NA
 7297504 7297505 SeD_A2448 SeD_A2449 fcl gmd TRUE 0.986 3.000 0.000 0.007 Y NA
 7297505 7297506 SeD_A2449 SeD_A2450 gmd   TRUE 0.582 24.000 0.000 1.000   NA
 7297506 7297507 SeD_A2450 SeD_A2451     TRUE 0.765 16.000 0.077 NA   NA
 7297507 7297508 SeD_A2451 SeD_A2452   wcaD TRUE 0.951 13.000 0.333 NA   NA
 7297508 7297509 SeD_A2452 SeD_A2453 wcaD   TRUE 0.938 -25.000 0.400 NA   NA
 7297509 7297510 SeD_A2453 SeD_A2454     TRUE 0.972 -3.000 0.259 1.000 N NA
 7297510 7297511 SeD_A2454 SeD_A2455     TRUE 0.969 3.000 0.259 NA N NA
 7297511 7297512 SeD_A2455 SeD_A2456     TRUE 0.975 18.000 0.231 NA Y NA
 7297512 7297513 SeD_A2456 SeD_A2457   wzb TRUE 0.991 -3.000 0.667 1.000 N NA
 7297513 7297514 SeD_A2457 SeD_A2458 wzb   TRUE 0.969 6.000 0.286 1.000 N NA
 7297515 7297516 SeD_A2459 SeD_A2460     FALSE 0.002 626.000 0.000 NA   NA
 7297517 7297518 SeD_A2461 SeD_A2462   dcd FALSE 0.471 39.000 0.057 NA N NA
 7297518 7297519 SeD_A2462 SeD_A2463 dcd udk TRUE 0.774 91.000 0.098 1.000 Y NA
 7297519 7297520 SeD_A2463 SeD_A2464 udk   FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7297521 7297522 SeD_A2465 SeD_A2466     FALSE 0.498 25.000 0.000 NA   NA
 7297524 7297525 SeD_A2468 SeD_A2469     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297525 7297526 SeD_A2469 SeD_A2470     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7297528 7297529 SeD_A2472 SeD_A2473   mdtB TRUE 0.839 0.000 0.000 NA N NA
 7297529 7297530 SeD_A2473 SeD_A2474 mdtB mdtC TRUE 0.978 1.000 0.000 NA Y NA
 7297530 7297531 SeD_A2474 SeD_A2475 mdtC   TRUE 0.985 -3.000 0.438 1.000 N NA
 7297531 7297532 SeD_A2475 SeD_A2476     TRUE 0.953 0.000 0.139 1.000 N NA
 7297532 7297533 SeD_A2476 SeD_A2477     TRUE 0.998 -3.000 0.591 0.012 Y NA
 7297533 7297534 SeD_A2477 SeD_A2478     FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 7297534 7297535 SeD_A2478 SeD_A2479     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 7297535 7297536 SeD_A2479 SeD_A2480     TRUE 0.966 11.000 0.375 NA   NA
 7297536 7297537 SeD_A2480 SeD_A2481     FALSE 0.155 116.000 0.000 NA   NA
 7297537 7297538 SeD_A2481 SeD_A2482     FALSE 0.164 84.000 0.000 NA   NA
 7297542 7297543 SeD_A2486 SeD_A2487 yegT   TRUE 0.978 -3.000 0.364 NA   NA
 7297543 7297544 SeD_A2487 SeD_A2488     TRUE 0.988 -3.000 0.600 NA N NA
 7297545 7297546 SeD_A2489 SeD_A2490   thiD FALSE 0.512 36.000 0.049 1.000 N NA
 7297546 7297547 SeD_A2490 SeD_A2491 thiD thiM TRUE 0.970 -13.000 0.037 0.004 Y NA
 7297547 7297548 SeD_A2491 SeD_A2493 thiM   FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7297550 7297551 SeD_A2495 SeD_A2496     TRUE 0.964 16.000 0.500 1.000   NA
 7297551 7297552 SeD_A2496 SeD_A2497     TRUE 0.991 29.000 1.000 1.000 Y NA
 7297552 7297553 SeD_A2497 SeD_A2498     TRUE 0.884 62.000 0.222 1.000 Y NA
 7297553 7297554 SeD_A2498 SeD_A2499     FALSE 0.010 279.000 0.000 NA   NA
 7297554 7297555 SeD_A2499 SeD_A2500     FALSE 0.010 278.000 0.000 NA   NA
 7297556 7297557 SeD_A2501 SeD_A2502 metG   FALSE 0.016 241.000 0.000 NA   NA
 7297557 7297558 SeD_A2502 SeD_A2503     FALSE 0.010 280.000 0.000 NA   NA
 7297559 7297560 SeD_A2504 SeD_A2505     FALSE 0.352 47.000 0.051 NA   NA
 7297560 7297561 SeD_A2505 SeD_A2506     TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.012 Y NA
 7297563 7297564 SeD_A2508 SeD_A2509     TRUE 0.992 -16.000 0.542 1.000 Y NA
 7297564 7297565 SeD_A2509 SeD_A2510     TRUE 0.994 -7.000 0.489 1.000 Y NA
 7297565 7297566 SeD_A2510 SeD_A2511     TRUE 0.990 4.000 0.521 0.042 N NA
 7297566 7297567 SeD_A2511 SeD_A2512     FALSE 0.150 181.000 0.099 1.000 N NA
 7297569 7297570 SeD_A2514 SeD_A2515 pbpG   FALSE 0.108 205.000 0.145 NA   NA
 7297572 7297573 SeD_A2517 SeD_A2518     FALSE 0.373 45.000 0.000 1.000 N NA
 7297573 7297574 SeD_A2518 SeD_A2519     FALSE 0.252 51.000 0.000 NA   NA
 7297576 7297577 SeD_A2521 SeD_A2522     FALSE 0.165 109.000 0.013 1.000 N NA
 7297577 7297578 SeD_A2522 SeD_A2523   maiA TRUE 0.869 15.000 0.120 1.000 N NA
 7297578 7297579 SeD_A2523 SeD_A2524 maiA   TRUE 0.822 9.000 0.000 1.000 N NA
 7297579 7297580 SeD_A2524 SeD_A2525   gtdA TRUE 0.946 16.000 0.000 1.000 Y NA
 7297580 7297581 SeD_A2525 SeD_A2526 gtdA   TRUE 0.979 12.000 0.600 NA N NA
 7297582 7297583 SeD_A2527 SeD_A2528     FALSE 0.136 132.000 0.000 NA   NA
 7297583 7297584 SeD_A2528 SeD_A2529     TRUE 0.979 -3.000 0.340 1.000   NA
 7297584 7297585 SeD_A2529 SeD_A2530   cdd FALSE 0.368 154.000 0.198 1.000 N NA
 7297585 7297586 SeD_A2530 SeD_A2531 cdd   FALSE 0.070 177.000 0.045 NA   NA
 7297586 7297587 SeD_A2531 SeD_A2532     TRUE 0.762 3.000 0.019 NA   NA
 7297587 7297588 SeD_A2532 SeD_A2533     FALSE 0.034 205.000 0.036 NA   NA
 7297588 7297589 SeD_A2533 SeD_A2534     TRUE 0.868 -6.000 0.062 1.000 N NA
 7297590 7297591 SeD_A2535 SeD_A2537 mglC   TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7297591 7297592 SeD_A2537 SeD_A2539     FALSE 0.131 134.000 0.000 NA   NA
 7297592 7297593 SeD_A2539 SeD_A2540   galS FALSE 0.002 499.000 0.000 NA   NA
 7297593 7297594 SeD_A2540 SeD_A2541 galS   TRUE 0.614 150.000 0.500 NA   NA
 7297594 7297595 SeD_A2541 SeD_A2542   folE TRUE 0.978 15.000 0.719 NA   NA
 7297597 7297598 SeD_A2544 SeD_A2545     TRUE 0.934 -40.000 0.400 1.000   NA
 7297599 7297600 SeD_A2546 SeD_A2547 serB   FALSE 0.410 33.000 0.000 NA N NA
 7297601 7297602 SeD_A2548 SeD_A2549     FALSE 0.005 387.000 0.000 1.000 N NA
 7297602 7297603 SeD_A2549 SeD_A2550     FALSE 0.061 190.000 0.000 1.000 N NA
 7297603 7297604 SeD_A2550 SeD_A2552     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7297605 7297606 SeD_A2551 SeD_A2553     FALSE 0.189 79.000 0.040 NA   NA
 7297607 7297608 SeD_A2554 SeD_A2555   fruK TRUE 0.991 17.000 0.562 1.000 Y NA
 7297608 7297609 SeD_A2555 SeD_A2556 fruK fruB TRUE 0.989 0.000 0.112 1.000 Y NA
 7297610 7297611 SeD_A2557 SeD_A2558     FALSE 0.163 85.000 0.000 NA   NA
 7297611 7297612 SeD_A2558 SeD_A2559     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7297613 7297614 SeD_A2560 SeD_A2561     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7297615 7297616 SeD_A2562 SeD_A2563     FALSE 0.059 213.000 0.085 NA   NA
 7297616 7297617 SeD_A2563 SeD_A2564     TRUE 0.969 3.000 0.275 NA   NA
 7297617 7297618 SeD_A2564 SeD_A2565   spr FALSE 0.003 414.000 0.000 NA   NA
 7297618 7297619 SeD_A2565 SeD_A2566 spr   FALSE 0.025 374.000 0.219 NA N NA
 7297619 7297620 SeD_A2566 SeD_A2567     TRUE 0.691 107.000 0.394 NA N NA
 7297620 7297621 SeD_A2567 SeD_A2568     TRUE 0.993 10.000 0.848 0.042   NA
 7297621 7297622 SeD_A2568 SeD_A2569     TRUE 0.995 0.000 0.833 0.042   NA
 7297622 7297623 SeD_A2569 SeD_A2570     TRUE 0.992 2.000 0.758 1.000   NA
 7297624 7297625 SeD_A2571 SeD_A2572   bcr FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 7297625 7297626 SeD_A2572 SeD_A2573 bcr rsuA TRUE 0.823 28.000 0.182 1.000 N NA
 7297627 7297628 SeD_A2574 SeD_A2575     FALSE 0.304 125.000 0.024 0.015 N NA
 7297629 7297630 SeD_A2576 SeD_A2577   ndpA FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7297631 7297632 SeD_A2578 SeD_A2579     FALSE 0.433 32.000 0.040 NA   NA
 7297632 7297633 SeD_A2579 SeD_A2580     FALSE 0.179 73.000 0.000 NA   NA
 7297634 7297635 SeD_A2581 SeD_A2582     FALSE 0.072 161.000 0.000 NA   NA
 7297635 7297636 SeD_A2582 SeD_A2583     FALSE 0.063 169.000 0.000 NA   NA
 7297636 7297637 SeD_A2583 SeD_A2584     FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 7297637 7297638 SeD_A2584 SeD_A2585     FALSE 0.310 43.000 0.000 NA   NA
 7297641 7297642 SeD_A2588 SeD_A2589     FALSE 0.003 394.000 0.000 NA   NA
 7297643 7297644 SeD_A2590 SeD_A2591     TRUE 0.997 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 7297644 7297645 SeD_A2591 SeD_A2592   ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.004 Y NA
 7297645 7297646 SeD_A2592 SeD_A2593 ccmF   TRUE 0.994 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 7297646 7297647 SeD_A2593 SeD_A2594   ccmD TRUE 0.980 -3.000 0.344 1.000 N NA
 7297647 7297648 SeD_A2594 SeD_A2595 ccmD   TRUE 0.912 36.000 0.501 1.000 N NA
 7297648 7297649 SeD_A2595 SeD_A2596   ccmB TRUE 0.978 43.000 0.501 0.002 Y NA
 7297649 7297650 SeD_A2596 SeD_A2597 ccmB ccmA TRUE 0.998 -3.000 0.503 0.004 Y NA
 7297650 7297651 SeD_A2597 SeD_A2598 ccmA napC TRUE 0.743 15.000 0.043 1.000 N NA
 7297651 7297652 SeD_A2598 SeD_A2599 napC napB TRUE 0.996 10.000 0.490 0.004 Y NA
 7297652 7297653 SeD_A2599 SeD_A2600 napB napH TRUE 0.914 116.000 0.316 0.008 Y NA
 7297653 7297654 SeD_A2600 SeD_A2601 napH napG TRUE 0.987 -13.000 0.795 0.042   NA
 7297654 7297655 SeD_A2601 SeD_A2602 napG napA TRUE 0.972 7.000 0.243 0.042   NA
 7297655 7297656 SeD_A2602 SeD_A2603 napA napD TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297656 7297657 SeD_A2603 SeD_A2604 napD napF TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7297659 7297660 SeD_A2606 SeD_A2607     FALSE 0.315 76.000 0.076 NA N NA
 7297660 7297661 SeD_A2607 SeD_A2608     TRUE 0.893 3.000 0.068 NA N NA
 7297661 7297662 SeD_A2608 SeD_A2609     FALSE 0.185 84.000 0.019 1.000 N NA
 7297662 7297663 SeD_A2609 SeD_A2610     FALSE 0.298 115.000 0.066 1.000 N NA
 7297664 7297665 SeD_A2612 SeD_A2613 micF   FALSE 0.007 303.000 0.000 NA   NA
 7297665 7297666 SeD_A2613 SeD_A2614   rcsB TRUE 0.991 17.000 0.558 1.000 Y NA
 7297667 7297668 SeD_A2615 SeD_A2616   gyrA FALSE 0.049 217.000 0.013 0.073 N NA
 7297668 7297669 SeD_A2616 SeD_A2617 gyrA   FALSE 0.004 410.000 0.000 1.000 N NA
 7297669 7297670 SeD_A2617 SeD_A2618     TRUE 0.976 15.000 0.667 NA N NA
 7297671 7297672 SeD_A2619 SeD_A2620   ubiG FALSE 0.157 83.000 0.004 1.000 N NA
 7297672 7297673 SeD_A2620 SeD_A2621 ubiG nrdA FALSE 0.011 299.000 0.000 1.000 N NA
 7297673 7297674 SeD_A2621 SeD_A2622 nrdA nrdB TRUE 0.772 113.000 0.000 0.001 Y NA
 7297674 7297675 SeD_A2622 SeD_A2623 nrdB   TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000 N NA
 7297678 7297679 SeD_A2626 SeD_A2627 glpQ glpT TRUE 0.980 5.000 0.396 1.000 N NA
 7297680 7297681 SeD_A2628 SeD_A2629 glpA   TRUE 0.988 -10.000 0.650 0.001 N NA
 7297681 7297682 SeD_A2629 SeD_A2630   glpC TRUE 0.992 -3.000 0.547 0.001 N NA
 7297682 7297683 SeD_A2630 SeD_A2631 glpC   FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
 7297684 7297685 SeD_A2632 SeD_A2633     TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 7297685 7297686 SeD_A2633 SeD_A2634     TRUE 0.869 26.000 0.250 NA N NA
 7297686 7297687 SeD_A2634 SeD_A2635     FALSE 0.343 56.000 0.060 NA N NA
 7297687 7297688 SeD_A2635 SeD_A2636     TRUE 0.854 14.000 0.090 1.000 N NA
 7297688 7297689 SeD_A2636 SeD_A2637     FALSE 0.020 250.000 0.000 1.000   NA
 7297689 7297690 SeD_A2637 SeD_A2638     FALSE 0.137 115.000 0.005 1.000   NA
 7297693 7297694 SeD_A2641 SeD_A2642     TRUE 0.995 3.000 0.378 NA Y NA
 7297694 7297695 SeD_A2642 SeD_A2643     TRUE 0.991 -3.000 0.220 NA Y NA
 7297695 7297696 SeD_A2643 SeD_A2644     TRUE 0.996 -3.000 0.447 1.000 Y NA
 7297696 7297697 SeD_A2644 SeD_A2645   arnT TRUE 0.854 -3.000 0.031 1.000 N NA
 7297697 7297698 SeD_A2645 SeD_A2646 arnT   TRUE 0.953 -3.000 0.158 1.000 N NA
 7297698 7297699 SeD_A2646 SeD_A2647     TRUE 0.966 0.000 0.226 NA   NA
 7297700 7297701 SeD_A2648 SeD_A2649   menE FALSE 0.104 98.000 0.005 NA   NA
 7297701 7297702 SeD_A2649 SeD_A2650 menE menC TRUE 0.984 -3.000 0.283 0.001 N NA
 7297702 7297703 SeD_A2650 SeD_A2651 menC menB TRUE 0.995 0.000 0.171 0.001 Y NA
 7297703 7297704 SeD_A2651 SeD_A2652 menB   TRUE 0.929 15.000 0.280 NA   NA
 7297704 7297705 SeD_A2652 SeD_A2653   menD TRUE 0.978 -3.000 0.355 NA   NA
 7297705 7297706 SeD_A2653 SeD_A2654 menD   TRUE 0.877 86.000 0.281 1.000 Y NA
 7297706 7297707 SeD_A2654 SeD_A2655     FALSE 0.194 101.000 0.043 NA   NA
 7297707 7297708 SeD_A2655 SeD_A2656     FALSE 0.383 55.000 0.077 NA   NA
 7297709 7297710 SeD_A2657 SeD_A2658 rnz   FALSE 0.408 66.000 0.091 1.000   NA
 7297711 7297712 SeD_A2659 SeD_A2660     FALSE 0.157 111.000 0.000 NA   NA
 7297714 7297715 SeD_A2662 SeD_A2663 nuoN nuoM TRUE 0.997 7.000 0.437 0.001 Y NA
 7297715 7297716 SeD_A2663 SeD_A2664 nuoM nuoL FALSE 0.506 314.000 0.713 0.001 Y NA
 7297716 7297717 SeD_A2664 SeD_A2665 nuoL nuoK TRUE 0.994 -3.000 0.211 0.005 Y NA
 7297717 7297718 SeD_A2665 SeD_A2666 nuoK nuoJ TRUE 0.995 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 7297718 7297719 SeD_A2666 SeD_A2667 nuoJ nuoI TRUE 0.995 11.000 0.428 0.005 Y NA
 7297719 7297720 SeD_A2667 SeD_A2668 nuoI nuoH TRUE 0.993 15.000 0.423 0.005 Y NA
 7297720 7297721 SeD_A2668 SeD_A2669 nuoH nuoG TRUE 0.998 -3.000 0.664 0.005 Y NA
 7297721 7297722 SeD_A2669 SeD_A2670 nuoG nuoF TRUE 0.963 31.000 0.180 0.005 Y NA
 7297722 7297723 SeD_A2670 SeD_A2671 nuoF nuoE TRUE 0.994 -3.000 0.186 0.005 Y NA
 7297723 7297724 SeD_A2671 SeD_A2672 nuoE nuoC TRUE 0.997 3.000 0.407 0.005 Y NA
 7297724 7297725 SeD_A2672 SeD_A2673 nuoC   TRUE 0.966 87.000 0.691 0.003 Y NA
 7297725 7297726 SeD_A2673 SeD_A2674   nuoA TRUE 0.991 16.000 0.377 0.003 Y NA
 7297726 7297727 SeD_A2674 SeD_A2675 nuoA   FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 7297727 7297728 SeD_A2675 SeD_A2676     FALSE 0.166 80.000 0.000 NA   NA
 7297728 7297729 SeD_A2676 SeD_A2677     FALSE 0.001 674.000 0.000 NA   NA
 7297730 7297731 SeD_A2678 SeD_A2679     TRUE 0.583 -22.000 0.000 NA   NA
 7297731 7297732 SeD_A2679 SeD_A2680     FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7297733 7297734 SeD_A2681 SeD_A2682     TRUE 0.666 77.000 0.308 1.000   NA
 7297734 7297735 SeD_A2682 SeD_A2683     TRUE 0.966 11.000 0.375 NA   NA
 7297735 7297736 SeD_A2683 SeD_A2684     TRUE 0.760 38.000 0.221 NA   NA
 7297737 7297738 SeD_A2685 SeD_A2686   ackA FALSE 0.355 37.000 0.000 NA   NA
 7297738 7297739 SeD_A2686 SeD_A2687 ackA pta TRUE 0.830 77.000 0.634 1.000   NA
 7297739 7297740 SeD_A2687 SeD_A2688 pta   FALSE 0.024 218.000 0.000 NA   NA
 7297741 7297742 SeD_A2689 SeD_A2690     TRUE 0.998 -7.000 0.742 0.001 Y NA
 7297742 7297743 SeD_A2690 SeD_A2691   ulaA TRUE 0.954 -3.000 0.167 1.000   NA
 7297743 7297744 SeD_A2691 SeD_A2692 ulaA   TRUE 0.797 21.000 0.052 0.012   NA
 7297744 7297745 SeD_A2692 SeD_A2694     TRUE 0.843 81.000 0.117 0.008 Y NA
 7297746 7297747 SeD_A2693 SeD_A2695     FALSE 0.165 81.000 0.000 NA   NA
 7297748 7297749 SeD_A2696 SeD_A2697     TRUE 0.654 57.000 0.143 0.010   NA
 7297749 7297750 SeD_A2697 SeD_A2698     FALSE 0.421 56.000 0.092 NA   NA
 7297751 7297752 SeD_A2699 SeD_A2700     FALSE 0.146 126.000 0.000 NA   NA
 7297753 7297754 SeD_A2701 SeD_A2702 hisP hisM TRUE 0.996 11.000 0.643 1.000 Y NA
 7297754 7297755 SeD_A2702 SeD_A2703 hisM hisQ TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.012 Y NA
 7297755 7297756 SeD_A2703 SeD_A2704 hisQ   TRUE 0.892 183.000 0.833 0.041 Y NA
 7297756 7297757 SeD_A2704 SeD_A2705     FALSE 0.217 238.000 0.000 0.012 Y NA
 7297759 7297760 SeD_A2707 SeD_A2708     FALSE 0.559 27.000 0.000 1.000 N NA
 7297760 7297761 SeD_A2708 SeD_A2709     TRUE 0.936 64.000 0.500 NA Y NA
 7297761 7297762 SeD_A2709 SeD_A2710     TRUE 0.996 2.000 0.500 NA Y NA
 7297762 7297763 SeD_A2710 SeD_A2711     TRUE 0.773 91.000 0.095 1.000 Y NA
 7297765 7297766 SeD_A2713 SeD_A2714 purF cvpA TRUE 0.811 38.000 0.262 1.000   NA
 7297766 7297767 SeD_A2714 SeD_A2715 cvpA   FALSE 0.020 311.000 0.116 NA   NA
 7297767 7297768 SeD_A2715 SeD_A2716   folC TRUE 0.924 -10.000 0.216 NA   NA
 7297768 7297769 SeD_A2716 SeD_A2717 folC accD TRUE 0.750 68.000 0.383 1.000 N NA
 7297769 7297770 SeD_A2717 SeD_A2718 accD   FALSE 0.075 150.000 0.020 NA   NA
 7297770 7297771 SeD_A2718 SeD_A2719   truA FALSE 0.283 49.000 0.038 NA   NA
 7297771 7297772 SeD_A2719 SeD_A2720 truA   TRUE 0.883 0.000 0.040 1.000 N NA
 7297772 7297773 SeD_A2720 SeD_A2721   pdxB TRUE 0.852 68.000 0.097 0.008 Y NA
 7297778 7297779 SeD_A2727 SeD_A2728     FALSE 0.010 280.000 0.000 NA   NA
 7297779 7297780 SeD_A2728 SeD_A2729     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7297781 7297782 SeD_A2730 SeD_A2731     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7297784 7297785 SeD_A2733 SeD_A2734     TRUE 0.889 33.000 0.425 NA   NA
 7297785 7297786 SeD_A2734 SeD_A2735     TRUE 0.948 0.000 0.153 NA   NA
 7297786 7297787 SeD_A2735 SeD_A2736   mepA TRUE 0.957 0.000 0.160 1.000   NA
 7297787 7297788 SeD_A2736 SeD_A2737 mepA aroC TRUE 0.831 4.000 0.025 1.000 N NA
 7297788 7297789 SeD_A2737 SeD_A2738 aroC prmB FALSE 0.362 36.000 0.000 NA   NA
 7297790 7297791 SeD_A2739 SeD_A2740     FALSE 0.529 -37.000 0.000 NA   NA
 7297792 7297793 SeD_A2741 SeD_A2742 sixA fadJ FALSE 0.041 209.000 0.000 1.000 N NA
 7297793 7297794 SeD_A2742 SeD_A2743 fadJ fadI TRUE 0.996 0.000 0.430 1.000 Y NA
 7297794 7297795 SeD_A2743 SeD_A2744 fadI   FALSE 0.053 179.000 0.000 NA   NA
 7297798 7297799 SeD_A2747 SeD_A2748     FALSE 0.176 75.000 0.000 NA   NA
 7297799 7297800 SeD_A2748 SeD_A2749     FALSE 0.001 676.000 0.000 NA   NA
 7297800 7297801 SeD_A2749 SeD_A2750     FALSE 0.008 291.000 0.000 NA   NA
 7297801 7297802 SeD_A2750 SeD_A2751     FALSE 0.022 241.000 0.000 1.000   NA
 7297803 7297804 SeD_A2752 SeD_A2753     FALSE 0.001 871.000 0.000 NA   NA
 7297804 7297805 SeD_A2753 SeD_A2754     FALSE 0.016 268.000 0.000 1.000 N NA
 7297805 7297806 SeD_A2754 SeD_A2755     TRUE 0.994 -10.000 0.500 0.072 Y NA
 7297806 7297807 SeD_A2755 SeD_A2757     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297807 7297808 SeD_A2757 SeD_A2758     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7297810 7297811 SeD_A2760 SeD_A2761     FALSE 0.074 160.000 0.000 NA   NA
 7297812 7297813 SeD_A2762 SeD_A2763     FALSE 0.155 115.000 0.000 NA   NA
 7297814 7297815 SeD_A2764 SeD_A2765   glk FALSE 0.002 723.000 0.000 1.000 N NA
 7297818 7297819 SeD_A2769 SeD_A2770     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297819 7297820 SeD_A2770 SeD_A2771     FALSE 0.513 114.000 0.214 NA   NA
 7297823 7297824 SeD_A2774 SeD_A2775     FALSE 0.043 190.000 0.000 NA   NA
 7297824 7297825 SeD_A2775 SeD_A2776     FALSE 0.327 41.000 0.000 NA   NA
 7297826 7297827 SeD_A2777 SeD_A2778     TRUE 0.981 2.000 0.250 0.004   NA
 7297829 7297830 SeD_A2780 SeD_A2781     FALSE 0.293 45.000 0.000 NA   NA
 7297830 7297831 SeD_A2781 SeD_A2782     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 7297831 7297832 SeD_A2782 SeD_A2783     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7297833 7297834 SeD_A2784 SeD_A2785     FALSE 0.429 52.000 0.087 NA   NA
 7297834 7297835 SeD_A2785 SeD_A2786   nupG TRUE 0.613 59.000 0.222 NA   NA
 7297835 7297836 SeD_A2786 SeD_A2787 nupG xapA FALSE 0.504 55.000 0.111 1.000   NA
 7297840 7297841 SeD_A2791 SeD_A2792   ligA TRUE 0.762 2.000 0.017 NA   NA
 7297841 7297842 SeD_A2792 SeD_A2793 ligA zipA FALSE 0.432 72.000 0.106 1.000 N NA
 7297843 7297844 SeD_A2794 SeD_A2795   cysK TRUE 0.587 164.000 0.122 1.000 Y NA
 7297846 7297847 SeD_A2797 SeD_A2798 ptsH ptsI TRUE 0.930 49.000 0.187 0.008 Y NA
 7297847 7297848 SeD_A2798 SeD_A2799 ptsI crr TRUE 0.950 41.000 0.203 0.008 Y NA
 7297849 7297850 SeD_A2800 SeD_A2801   pdxK TRUE 0.945 -3.000 0.160 NA   NA
 7297851 7297852 SeD_A2802 SeD_A2803     TRUE 0.788 15.000 0.059 1.000 N NA
 7297852 7297853 SeD_A2803 SeD_A2804     FALSE 0.209 59.000 0.000 NA   NA
 7297853 7297854 SeD_A2804 SeD_A2805     TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7297855 7297856 SeD_A2806 SeD_A2807 cysM cysA FALSE 0.299 68.000 0.049 1.000 N NA
 7297856 7297857 SeD_A2807 SeD_A2808 cysA cysW TRUE 0.982 -10.000 0.180 1.000 Y NA
 7297857 7297858 SeD_A2808 SeD_A2809 cysW cysT TRUE 0.994 0.000 0.583 0.000 N NA
 7297858 7297859 SeD_A2809 SeD_A2810 cysT cysP TRUE 0.992 0.000 0.479 0.001 N NA
 7297859 7297860 SeD_A2810 SeD_A2811 cysP fabG FALSE 0.106 158.000 0.000 1.000 N NA
 7297860 7297861 SeD_A2811 SeD_A2812 fabG   FALSE 0.019 238.000 0.000 NA N NA
 7297861 7297862 SeD_A2812 SeD_A2813     TRUE 0.656 95.000 0.333 NA   NA
 7297862 7297863 SeD_A2813 SeD_A2814     TRUE 0.576 62.000 0.204 NA   NA
 7297863 7297864 SeD_A2814 SeD_A2815     TRUE 0.754 -13.000 0.059 NA   NA
 7297865 7297866 SeD_A2816 SeD_A2817 amiA hemF TRUE 0.843 3.000 0.025 1.000 N NA
 7297866 7297867 SeD_A2817 SeD_A2818 hemF   FALSE 0.071 162.000 0.000 NA   NA
 7297867 7297868 SeD_A2818 SeD_A2819     FALSE 0.141 129.000 0.000 NA   NA
 7297868 7297869 SeD_A2819 SeD_A2820     FALSE 0.003 432.000 0.000 NA   NA
 7297870 7297871 SeD_A2821 SeD_A2822     FALSE 0.290 48.000 0.000 NA N NA
 7297871 7297872 SeD_A2822 SeD_A2823     TRUE 0.695 13.000 0.000 NA N NA
 7297872 7297873 SeD_A2823 SeD_A2824   eutC TRUE 0.973 10.000 0.043 1.000 Y NA
 7297873 7297874 SeD_A2824 SeD_A2825 eutC eutB TRUE 0.960 19.000 0.000 0.000 Y NA
 7297874 7297875 SeD_A2825 SeD_A2826 eutB eutA TRUE 0.959 12.000 0.000 NA Y NA
 7297875 7297876 SeD_A2826 SeD_A2827 eutA eutH TRUE 0.977 -3.000 0.000 NA Y NA
 7297876 7297877 SeD_A2827 SeD_A2828 eutH   FALSE 0.557 120.000 0.222 1.000 N NA
 7297877 7297878 SeD_A2828 SeD_A2829   eutJ TRUE 0.754 -10.000 0.000 1.000 N NA
 7297878 7297879 SeD_A2829 SeD_A2830 eutJ eutE TRUE 0.791 11.000 0.000 1.000 N NA
 7297879 7297880 SeD_A2830 SeD_A2831 eutE eutN TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7297880 7297881 SeD_A2831 SeD_A2832 eutN   FALSE 0.165 101.000 0.000 NA   NA
 7297881 7297882 SeD_A2832 SeD_A2833   eutD FALSE 0.327 41.000 0.000 NA   NA
 7297882 7297883 SeD_A2833 SeD_A2834 eutD   TRUE 0.884 -3.000 0.048 1.000 N NA
 7297883 7297884 SeD_A2834 SeD_A2835     TRUE 0.991 -3.000 0.214 NA Y NA
 7297884 7297885 SeD_A2835 SeD_A2836   eutP TRUE 0.927 -22.000 0.017 NA Y NA
 7297885 7297886 SeD_A2836 SeD_A2837 eutP   TRUE 0.954 13.000 0.017 1.000 Y NA
 7297886 7297887 SeD_A2837 SeD_A2838     FALSE 0.007 417.000 0.070 1.000 N NA
 7297888 7297889 SeD_A2839 SeD_A2840 tal1 tkt TRUE 0.992 20.000 0.739 1.000 Y NA
 7297890 7297891 SeD_A2841 SeD_A2842     FALSE 0.143 128.000 0.000 NA   NA
 7297891 7297892 SeD_A2842 SeD_A2843     TRUE 0.620 125.000 0.333 NA   NA
 7297895 7297896 SeD_A2846 SeD_A2847   acrD FALSE 0.110 185.000 0.000 0.069 N NA
 7297896 7297897 SeD_A2847 SeD_A2848 acrD   FALSE 0.003 574.000 0.000 1.000 N NA
 7297897 7297898 SeD_A2848 SeD_A2849   dapE TRUE 0.973 4.000 0.292 1.000 N NA
 7297898 7297899 SeD_A2849 SeD_A2850 dapE   FALSE 0.412 28.000 0.025 NA   NA
 7297900 7297901 SeD_A2851 SeD_A2852     TRUE 0.594 16.000 0.029 NA   NA
 7297901 7297902 SeD_A2852 SeD_A2853   purC FALSE 0.085 131.000 0.006 NA   NA
 7297902 7297903 SeD_A2853 SeD_A2854 purC   FALSE 0.048 175.000 0.019 NA N NA
 7297903 7297904 SeD_A2854 SeD_A2855   dapA TRUE 0.979 17.000 0.267 NA Y NA
 7297905 7297906 SeD_A2856 SeD_A2857 gcvR bcp TRUE 0.940 0.000 0.102 1.000 N NA
 7297907 7297908 SeD_A2858 SeD_A2859     TRUE 0.993 6.000 0.295 1.000 Y NA
 7297908 7297909 SeD_A2859 SeD_A2860     TRUE 0.657 68.000 0.290 NA N NA
 7297909 7297910 SeD_A2860 SeD_A2861     FALSE 0.007 301.000 0.000 NA   NA
 7297911 7297912 SeD_A2862 SeD_A2863   arsC TRUE 0.799 40.000 0.259 1.000   NA
 7297913 7297914 SeD_A2864 SeD_A2865   uraA FALSE 0.244 71.000 0.048 NA N NA
 7297914 7297915 SeD_A2865 SeD_A2866 uraA upp TRUE 0.776 88.000 0.101 1.000 Y NA
 7297916 7297917 SeD_A2867 SeD_A2868   purM FALSE 0.369 35.000 0.000 NA   NA
 7297917 7297918 SeD_A2868 SeD_A2869 purM purN TRUE 0.996 0.000 0.230 0.001 Y NA
 7297918 7297919 SeD_A2869 SeD_A2870 purN ppk FALSE 0.049 189.000 0.017 1.000 N NA
 7297919 7297920 SeD_A2870 SeD_A2871 ppk   TRUE 0.986 -34.000 0.486 1.000 Y NA
 7297923 7297924 SeD_A2874 SeD_A2875   guaA FALSE 0.022 223.000 0.000 NA   NA
 7297924 7297925 SeD_A2875 SeD_A2876 guaA guaB TRUE 0.907 70.000 0.190 0.000 Y NA
 7297927 7297928 SeD_A2878 SeD_A2879     TRUE 0.583 -22.000 0.000 NA   NA
 7297928 7297929 SeD_A2879 SeD_A2880     FALSE 0.001 703.000 0.000 NA   NA
 7297929 7297930 SeD_A2880 SeD_A2881     FALSE 0.066 166.000 0.000 NA   NA
 7297930 7297931 SeD_A2881 SeD_A2882     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7297931 7297932 SeD_A2882 SeD_A2884     FALSE 0.123 138.000 0.000 NA   NA
 7297934 7297935 SeD_A2885 SeD_A2886     FALSE 0.005 346.000 0.000 NA   NA
 7297935 7297936 SeD_A2886 SeD_A2887   engA FALSE 0.165 89.000 0.000 NA   NA
 7297936 7297937 SeD_A2887 SeD_A2888 engA   FALSE 0.176 75.000 0.000 NA   NA
 7297937 7297938 SeD_A2888 SeD_A2889     TRUE 0.977 11.000 0.492 1.000   NA
 7297938 7297939 SeD_A2889 SeD_A2890   hisS TRUE 0.938 14.000 0.259 1.000   NA
 7297939 7297940 SeD_A2890 SeD_A2891 hisS   FALSE 0.550 20.000 0.000 NA   NA
 7297940 7297941 SeD_A2891 SeD_A2892   ispG TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7297941 7297942 SeD_A2892 SeD_A2893 ispG   TRUE 0.863 27.000 0.233 1.000   NA
 7297942 7297943 SeD_A2893 SeD_A2894     FALSE 0.126 137.000 0.000 NA   NA
 7297943 7297944 SeD_A2894 SeD_A2895     FALSE 0.387 33.000 0.000 NA   NA
 7297944 7297945 SeD_A2895 SeD_A2896   ndk FALSE 0.126 207.000 0.156 1.000   NA
 7297945 7297946 SeD_A2896 SeD_A2897 ndk   FALSE 0.141 121.000 0.002 1.000 N NA
 7297946 7297947 SeD_A2897 SeD_A2898     TRUE 0.955 0.000 0.154 1.000   NA
 7297947 7297948 SeD_A2898 SeD_A2899   dmsB TRUE 0.985 -7.000 0.667 1.000   NA
 7297948 7297949 SeD_A2899 SeD_A2900 dmsB   TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.041 Y NA
 7297949 7297950 SeD_A2900 SeD_A2901   pbpC FALSE 0.179 156.000 0.070 1.000 N NA
 7297950 7297951 SeD_A2901 SeD_A2902 pbpC   TRUE 0.819 1.000 0.000 NA   NA
 7297951 7297952 SeD_A2902 SeD_A2903     FALSE 0.204 61.000 0.000 NA   NA
 7297958 7297959 SeD_A2909 SeD_A2910 sseB   FALSE 0.482 140.000 0.253 NA   NA
 7297959 7297960 SeD_A2910 SeD_A2911   iscX FALSE 0.229 178.000 0.171 1.000   NA
 7297960 7297961 SeD_A2911 SeD_A2912 iscX fdx TRUE 0.981 12.000 0.625 1.000   NA
 7297961 7297962 SeD_A2912 SeD_A2913 fdx hscA TRUE 0.993 2.000 0.794 1.000 N NA
 7297962 7297963 SeD_A2913 SeD_A2914 hscA hscB TRUE 0.995 13.000 0.634 1.000 Y NA
 7297963 7297964 SeD_A2914 SeD_A2915 hscB iscA FALSE 0.402 196.000 0.500 1.000   NA
 7297964 7297965 SeD_A2915 SeD_A2916 iscA iscU TRUE 0.933 29.000 0.359 0.002   NA
 7297965 7297966 SeD_A2916 SeD_A2917 iscU iscS TRUE 0.926 28.000 0.448 1.000 N NA
 7297968 7297969 SeD_A2919 SeD_A2920 iscR   FALSE 0.240 160.000 0.126 1.000 N NA
 7297970 7297971 SeD_A2921 SeD_A2922 suhB   FALSE 0.061 145.000 0.003 NA   NA
 7297971 7297972 SeD_A2922 SeD_A2923   asrA FALSE 0.050 182.000 0.000 NA   NA
 7297972 7297973 SeD_A2923 SeD_A2924 asrA asrB TRUE 0.982 4.000 0.318 0.022   NA
 7297973 7297974 SeD_A2924 SeD_A2925 asrB asrC TRUE 0.997 11.000 0.636 0.022 Y NA
 7297975 7297976 SeD_A2926 SeD_A2927     TRUE 0.897 -9.000 0.150 NA   NA
 7297978 7297979 SeD_A2929 SeD_A2930   glyA FALSE 0.060 196.000 0.044 1.000   NA
 7297979 7297980 SeD_A2930 SeD_A2931 glyA   FALSE 0.123 138.000 0.000 NA   NA
 7297981 7297982 SeD_A2932 SeD_A2933 hmp   FALSE 0.070 182.000 0.000 1.000 N NA
 7297982 7297983 SeD_A2933 SeD_A2934   cadB FALSE 0.007 361.000 0.000 1.000 N NA
 7297983 7297984 SeD_A2934 SeD_A2935 cadB   TRUE 0.687 83.000 0.000 1.000 Y NA
 7297984 7297985 SeD_A2935 SeD_A2936     TRUE 0.938 56.000 0.400 1.000 Y NA
 7297986 7297987 SeD_A2937 SeD_A2938     FALSE 0.483 77.000 0.146 1.000 N NA
 7297987 7297988 SeD_A2938 SeD_A2939     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7297988 7297989 SeD_A2939 SeD_A2940     FALSE 0.166 80.000 0.000 NA   NA
 7297990 7297991 SeD_A2941 SeD_A2942     FALSE 0.550 20.000 0.000 NA   NA
 7297993 7297994 SeD_A2944 SeD_A2945     TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7297995 7297996 SeD_A2946 SeD_A2947   yfhB FALSE 0.333 58.000 0.062 NA N NA
 7297996 7297997 SeD_A2947 SeD_A2948 yfhB   TRUE 0.930 4.000 0.125 NA N NA
 7297997 7297998 SeD_A2948 SeD_A2949   murQ TRUE 0.909 11.000 0.125 1.000   NA
 7298000 7298001 SeD_A2951 SeD_A2952 panE   FALSE 0.554 22.000 0.000 NA N NA
 7298002 7298003 SeD_A2953 SeD_A2954     FALSE 0.349 38.000 0.000 NA   NA
 7298004 7298005 SeD_A2955 SeD_A2956 acpS pdxJ TRUE 0.980 0.000 0.326 1.000 N NA
 7298005 7298006 SeD_A2956 SeD_A2957 pdxJ recO TRUE 0.920 12.000 0.166 1.000 N NA
 7298006 7298007 SeD_A2957 SeD_A2958 recO era TRUE 0.885 12.000 0.109 1.000   NA
 7298007 7298008 SeD_A2958 SeD_A2959 era rnc TRUE 0.961 -3.000 0.127 0.041   NA
 7298008 7298009 SeD_A2959 SeD_A2961 rnc lepB FALSE 0.084 217.000 0.117 1.000   NA
 7298009 7298010 SeD_A2961 SeD_A2962 lepB lepA TRUE 0.891 17.000 0.187 1.000   NA
 7298010 7298011 SeD_A2962 SeD_A2963 lepA   FALSE 0.020 252.000 0.045 NA N NA
 7298011 7298012 SeD_A2963 SeD_A2964   rseB TRUE 0.997 -3.000 0.609 NA Y NA
 7298012 7298013 SeD_A2964 SeD_A2965 rseB rseA TRUE 0.998 0.000 0.856 NA Y NA
 7298013 7298014 SeD_A2965 SeD_A2966 rseA rpoE TRUE 0.944 32.000 0.705 NA N NA
 7298014 7298015 SeD_A2966 SeD_A2967 rpoE   FALSE 0.072 161.000 0.000 NA   NA
 7298018 7298019 SeD_A2970 SeD_A2971     FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7298025 7298026 SeD_A2977 SeD_A2978     FALSE 0.331 73.000 0.084 NA   NA
 7298026 7298027 SeD_A2978 SeD_A2979     TRUE 0.647 54.000 0.222 NA   NA
 7298027 7298028 SeD_A2979 SeD_A2980   pssA FALSE 0.510 115.000 0.121 0.047 N NA
 7298028 7298029 SeD_A2980 SeD_A2981 pssA   FALSE 0.502 45.000 0.089 NA   NA
 7298030 7298031 SeD_A2982 SeD_A2983     FALSE 0.214 104.000 0.051 NA   NA
 7298031 7298032 SeD_A2983 SeD_A2984   rrf FALSE 0.029 209.000 0.000 NA   NA
 7298032 7298033 SeD_A2984 SeD_A2986 rrf rrl FALSE 0.037 197.000 0.000 NA   NA
 7298033 7298034 SeD_A2986 SeD_A2987 rrl   FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 7298034 7298035 SeD_A2987 SeD_A2988   rrs FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7298035 7298036 SeD_A2988 SeD_A2989 rrs clpB FALSE 0.002 463.000 0.000 NA   NA
 7298036 7298037 SeD_A2989 SeD_A2990 clpB   FALSE 0.314 130.000 0.108 NA   NA
 7298037 7298038 SeD_A2990 SeD_A2991   rluD TRUE 0.949 -3.000 0.168 NA   NA
 7298039 7298040 SeD_A2992 SeD_A2993     FALSE 0.006 272.000 0.004 NA   NA
 7298040 7298041 SeD_A2993 SeD_A2994   pheA FALSE 0.012 251.000 0.015 NA N NA
 7298042 7298043 SeD_A2995 SeD_A2996   tyrA FALSE 0.231 58.000 0.000 NA N NA
 7298043 7298044 SeD_A2996 SeD_A2997 tyrA aroF TRUE 0.971 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7298044 7298045 SeD_A2997 SeD_A2998 aroF   FALSE 0.057 175.000 0.000 NA   NA
 7298046 7298047 SeD_A2999 SeD_A3000     TRUE 0.754 74.000 0.475 NA   NA
 7298048 7298049 SeD_A3001 SeD_A3002 rplS trmD TRUE 0.974 41.000 0.567 1.000 Y NA
 7298049 7298050 SeD_A3002 SeD_A3003 trmD rimM TRUE 0.976 45.000 0.672 1.000 Y NA
 7298050 7298051 SeD_A3003 SeD_A3004 rimM rpsP TRUE 0.990 16.000 0.342 0.010 Y NA
 7298051 7298052 SeD_A3004 SeD_A3005 rpsP ffh FALSE 0.147 253.000 0.361 1.000 N NA
 7298053 7298054 SeD_A3006 SeD_A3007     FALSE 0.193 65.000 0.000 NA   NA
 7298054 7298055 SeD_A3007 SeD_A3008     FALSE 0.106 85.000 0.008 NA   NA
 7298057 7298058 SeD_A3009 SeD_A3011 ppnK recN FALSE 0.509 86.000 0.170 1.000 N NA
 7298058 7298059 SeD_A3011 SeD_A3012 recN   FALSE 0.166 149.000 0.049 1.000 N NA
 7298060 7298061 SeD_A3013 SeD_A3014     TRUE 0.872 -10.000 0.124 NA   NA
 7298064 7298065 SeD_A3017 SeD_A3018     TRUE 0.647 65.000 0.250 1.000   NA
 7298065 7298066 SeD_A3018 SeD_A3019     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7298066 7298067 SeD_A3019 SeD_A3020     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7298067 7298068 SeD_A3020 SeD_A3021     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7298068 7298069 SeD_A3021 SeD_A3023     FALSE 0.181 72.000 0.000 NA   NA
 7298069 7298070 SeD_A3023 SeD_A3024     FALSE 0.271 48.000 0.000 NA   NA
 7298071 7298072 SeD_A3025 SeD_A3026     TRUE 0.991 -3.000 0.750 NA   NA
 7298072 7298073 SeD_A3026 SeD_A3027     TRUE 0.976 -3.000 0.333 NA   NA
 7298073 7298074 SeD_A3027 SeD_A3028     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7298074 7298075 SeD_A3028 SeD_A3029     TRUE 0.635 15.000 0.000 NA   NA
 7298075 7298076 SeD_A3029 SeD_A3030     FALSE 0.230 55.000 0.000 NA   NA
 7298076 7298077 SeD_A3030 SeD_A3031     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7298077 7298078 SeD_A3031 SeD_A3032     FALSE 0.138 131.000 0.000 NA   NA
 7298078 7298079 SeD_A3032 SeD_A3033     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7298079 7298080 SeD_A3033 SeD_A3034     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7298080 7298081 SeD_A3034 SeD_A3035     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7298081 7298082 SeD_A3035 SeD_A3036     TRUE 0.650 -13.000 0.000 NA   NA
 7298082 7298083 SeD_A3036 SeD_A3037     TRUE 0.985 -3.000 0.500 NA   NA
 7298085 7298086 SeD_A3039 SeD_A3040   gpR TRUE 0.989 -7.000 1.000 NA   NA
 7298086 7298087 SeD_A3040 SeD_A3041 gpR   TRUE 0.879 96.000 1.000 NA   NA
 7298087 7298088 SeD_A3041 SeD_A3042     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 7298088 7298089 SeD_A3042 SeD_A3043     TRUE 0.990 2.000 0.667 NA   NA
 7298089 7298090 SeD_A3043 SeD_A3044     TRUE 0.972 -19.000 0.667 NA   NA
 7298090 7298091 SeD_A3044 SeD_A3045     TRUE 0.993 4.000 1.000 NA   NA
 7298091 7298092 SeD_A3045 SeD_A3046     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 7298092 7298093 SeD_A3046 SeD_A3047     TRUE 0.925 96.000 1.000 0.001   NA
 7298093 7298094 SeD_A3047 SeD_A3048     TRUE 0.994 4.000 1.000 1.000   NA
 7298094 7298095 SeD_A3048 SeD_A3049     TRUE 0.658 17.000 0.000 1.000   NA
 7298096 7298097 SeD_A3050 SeD_A3051     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA   NA
 7298098 7298099 SeD_A3052 SeD_A3053     TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7298101 7298102 SeD_A3055 SeD_A3056     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 7298102 7298103 SeD_A3056 SeD_A3057     FALSE 0.081 156.000 0.000 NA   NA
 7298103 7298104 SeD_A3057 SeD_A3058     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 7298104 7298105 SeD_A3058 SeD_A3059     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7298105 7298106 SeD_A3059 SeD_A3060     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7298106 7298107 SeD_A3060 SeD_A3061     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 7298109 7298110 SeD_A3063 SeD_A3064     FALSE 0.362 36.000 0.000 NA   NA
 7298111 7298112 SeD_A3065 SeD_A3066     TRUE 0.979 4.000 0.400 NA N NA
 7298112 7298113 SeD_A3066 SeD_A3067     FALSE 0.001 1252.000 0.000 NA   NA
 7298114 7298115 SeD_A3068 SeD_A3069     FALSE 0.054 222.000 0.000 0.042   NA
 7298116 7298117 SeD_A3070 SeD_A3071     FALSE 0.002 626.000 0.000 NA   NA
 7298117 7298118 SeD_A3071 SeD_A3072     TRUE 0.775 81.000 0.500 1.000 N NA
 7298118 7298119 SeD_A3072 SeD_A3073     FALSE 0.170 110.000 0.000 NA N NA
 7298119 7298120 SeD_A3073 SeD_A3074     FALSE 0.539 32.000 0.065 NA   NA
 7298121 7298122 SeD_A3075 SeD_A3076     FALSE 0.002 532.000 0.000 NA   NA
 7298122 7298123 SeD_A3076 SeD_A3077     FALSE 0.004 375.000 0.000 NA   NA
 7298124 7298125 SeD_A3078 SeD_A3079     FALSE 0.166 100.000 0.000 NA   NA
 7298125 7298126 SeD_A3079 SeD_A3080     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7298126 7298127 SeD_A3080 SeD_A3081     FALSE 0.002 516.000 0.000 NA   NA
 7298128 7298129 SeD_A3082 SeD_A3083 hoxN   FALSE 0.181 133.000 0.000 1.000 N NA
 7298129 7298130 SeD_A3083 SeD_A3084     TRUE 0.995 -13.000 0.765 1.000 Y NA
 7298131 7298132 SeD_A3085 SeD_A3086     TRUE 0.957 15.000 0.426 NA   NA
 7298132 7298133 SeD_A3086 SeD_A3087     TRUE 0.887 11.000 0.115 NA   NA
 7298133 7298134 SeD_A3087 SeD_A3088     FALSE 0.068 164.000 0.000 NA   NA
 7298134 7298135 SeD_A3088 SeD_A3089     FALSE 0.468 27.000 0.000 NA   NA
 7298135 7298136 SeD_A3089 SeD_A3091     FALSE 0.485 26.000 0.000 NA   NA
 7298136 7298137 SeD_A3091 SeD_A3092   gabD TRUE 0.600 22.000 0.000 1.000   NA
 7298137 7298138 SeD_A3092 SeD_A3093 gabD   TRUE 0.635 15.000 0.000 NA   NA
 7298138 7298139 SeD_A3093 SeD_A3095   gabP FALSE 0.139 130.000 0.000 NA   NA
 7298139 7298140 SeD_A3095 SeD_A3096 gabP   TRUE 0.916 42.000 0.625 1.000 N NA
 7298141 7298142 SeD_A3097 SeD_A3098     FALSE 0.195 100.000 0.027 1.000   NA
 7298143 7298144 SeD_A3099 SeD_A3100     TRUE 0.877 10.000 0.083 NA N NA
 7298144 7298145 SeD_A3100 SeD_A3101     FALSE 0.156 79.000 0.028 NA   NA
 7298147 7298148 SeD_A3103 SeD_A3104     FALSE 0.026 215.000 0.000 NA   NA
 7298149 7298150 SeD_A3105 SeD_A3106     TRUE 0.621 -16.000 0.000 NA   NA
 7298153 7298154 SeD_A3109 SeD_A3110     TRUE 0.635 15.000 0.000 NA   NA
 7298154 7298155 SeD_A3110 SeD_A3111     FALSE 0.167 99.000 0.000 NA   NA
 7298155 7298156 SeD_A3111 SeD_A3112   nrdI TRUE 0.805 -3.000 0.026 NA N NA
 7298156 7298157 SeD_A3112 SeD_A3113 nrdI   TRUE 0.964 -27.000 0.162 NA Y NA
 7298157 7298158 SeD_A3113 SeD_A3114   nrdF TRUE 0.990 11.000 0.167 0.001 Y NA
 7298158 7298159 SeD_A3114 SeD_A3115 nrdF proV FALSE 0.007 355.000 0.000 1.000 N NA
 7298159 7298160 SeD_A3115 SeD_A3116 proV   TRUE 0.997 -7.000 0.630 0.078 Y NA
 7298160 7298161 SeD_A3116 SeD_A3117   proX TRUE 0.968 70.000 0.695 0.039 Y NA
 7298161 7298162 SeD_A3117 SeD_A3118 proX   FALSE 0.254 165.000 0.174 NA N NA
 7298162 7298163 SeD_A3118 SeD_A3119   mprA FALSE 0.002 497.000 0.000 NA N NA
 7298163 7298164 SeD_A3119 SeD_A3120 mprA emrA FALSE 0.367 127.000 0.107 1.000 N NA
 7298164 7298165 SeD_A3120 SeD_A3121 emrA emrB TRUE 0.981 17.000 0.875 1.000 N NA
 7298170 7298171 SeD_A3127 SeD_A3128 gshA   FALSE 0.286 77.000 0.071 NA   NA
 7298171 7298172 SeD_A3128 SeD_A3129     TRUE 0.884 -3.000 0.067 NA   NA
 7298172 7298173 SeD_A3129 SeD_A3130     FALSE 0.020 229.000 0.000 NA   NA
 7298173 7298174 SeD_A3130 SeD_A3131     FALSE 0.204 61.000 0.000 NA   NA
 7298174 7298175 SeD_A3131 SeD_A3132     FALSE 0.204 61.000 0.000 NA   NA
 7298175 7298176 SeD_A3132 SeD_A3133     FALSE 0.206 60.000 0.000 NA   NA
 7298176 7298177 SeD_A3133 SeD_A3134     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7298177 7298178 SeD_A3134 SeD_A3135   csrA FALSE 0.007 303.000 0.000 NA   NA
 7298178 7298179 SeD_A3135 SeD_A3136 csrA alaS FALSE 0.021 235.000 0.020 1.000 N NA
 7298179 7298180 SeD_A3136 SeD_A3137 alaS recX FALSE 0.047 236.000 0.085 1.000   NA
 7298180 7298181 SeD_A3137 SeD_A3138 recX recA TRUE 0.625 117.000 0.296 1.000   NA
 7298181 7298182 SeD_A3138 SeD_A3139 recA   FALSE 0.301 85.000 0.082 NA   NA
 7298182 7298183 SeD_A3139 SeD_A3140   mltB FALSE 0.002 479.000 0.026 NA   NA
 7298184 7298185 SeD_A3141 SeD_A3142     TRUE 0.996 -3.000 0.349 0.007 Y NA
 7298185 7298186 SeD_A3142 SeD_A3143   srlB TRUE 0.996 12.000 0.533 0.007 Y NA
 7298186 7298187 SeD_A3143 SeD_A3144 srlB srlD TRUE 0.950 12.000 0.260 1.000 N NA
 7298187 7298188 SeD_A3144 SeD_A3145 srlD   FALSE 0.529 77.000 0.197 NA N NA
 7298188 7298189 SeD_A3145 SeD_A3146   srlR FALSE 0.470 198.000 0.183 NA Y NA
 7298189 7298190 SeD_A3146 SeD_A3147 srlR gutQ TRUE 0.982 -7.000 0.562 1.000 N NA
 7298192 7298193 SeD_A3149 SeD_A3150 norV   TRUE 0.925 -3.000 0.111 NA   NA
 7298194 7298195 SeD_A3151 SeD_A3152 hypF   FALSE 0.114 146.000 0.018 1.000 N NA
 7298195 7298196 SeD_A3152 SeD_A3153     TRUE 0.765 -31.000 0.105 NA   NA
 7298196 7298197 SeD_A3153 SeD_A3154     FALSE 0.168 98.000 0.000 NA   NA
 7298197 7298198 SeD_A3154 SeD_A3155   hycI FALSE 0.418 27.000 0.022 NA   NA
 7298198 7298199 SeD_A3155 SeD_A3156 hycI   TRUE 0.964 -7.000 0.360 NA   NA
 7298199 7298200 SeD_A3156 SeD_A3157   hycG TRUE 0.914 -3.000 0.094 NA   NA
 7298200 7298201 SeD_A3157 SeD_A3158 hycG hycF TRUE 0.985 0.000 0.067 1.000 Y NA
 7298201 7298202 SeD_A3158 SeD_A3159 hycF hycE TRUE 0.971 10.000 0.000 1.000 Y NA
 7298202 7298203 SeD_A3159 SeD_A3160 hycE hycD TRUE 0.938 18.000 0.000 1.000 Y NA
 7298203 7298204 SeD_A3160 SeD_A3161 hycD hycC TRUE 0.995 3.000 0.382 1.000 Y NA
 7298204 7298205 SeD_A3161 SeD_A3162 hycC hycB TRUE 0.991 0.000 0.154 1.000 Y NA
 7298205 7298206 SeD_A3162 SeD_A3163 hycB   TRUE 0.722 146.000 0.667 NA   NA
 7298207 7298208 SeD_A3164 SeD_A3165 hypA hypB TRUE 0.777 69.000 0.306 0.002   NA
 7298208 7298209 SeD_A3165 SeD_A3166 hypB hypC2 TRUE 0.959 -9.000 0.000 NA Y NA
 7298209 7298210 SeD_A3166 SeD_A3167 hypC2 hypD TRUE 0.979 0.000 0.000 NA Y NA
 7298210 7298211 SeD_A3167 SeD_A3168 hypD hypE TRUE 0.995 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 7298211 7298212 SeD_A3168 SeD_A3169 hypE   FALSE 0.021 234.000 0.019 1.000 N NA
 7298214 7298215 SeD_A3171 SeD_A3172     TRUE 0.998 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 7298215 7298216 SeD_A3172 SeD_A3173     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.069 Y NA
 7298216 7298217 SeD_A3173 SeD_A3174     TRUE 0.996 -9.000 0.525 0.004 Y NA
 7298218 7298219 SeD_A3175 SeD_A3176     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7298219 7298220 SeD_A3176 SeD_A3177     FALSE 0.004 384.000 0.000 NA   NA
 7298220 7298221 SeD_A3177 SeD_A3178     FALSE 0.005 345.000 0.000 NA   NA
 7298221 7298222 SeD_A3178 SeD_A3179     TRUE 0.697 87.000 0.400 NA   NA
 7298222 7298223 SeD_A3179 SeD_A3180     TRUE 0.974 -43.000 1.000 NA   NA
 7298223 7298224 SeD_A3180 SeD_A3181     TRUE 0.950 -7.000 0.238 1.000   NA
 7298224 7298225 SeD_A3181 SeD_A3182     TRUE 0.971 -3.000 0.286 NA   NA
 7298225 7298226 SeD_A3182 SeD_A3183   eprI TRUE 0.967 19.000 0.667 NA   NA
 7298226 7298227 SeD_A3183 SeD_A3184 eprI eprH TRUE 0.958 25.000 0.667 NA   NA
 7298228 7298229 SeD_A3185 SeD_A3186     FALSE 0.003 1091.000 0.000 0.041 N NA
 7298229 7298230 SeD_A3186 SeD_A3187     TRUE 0.644 18.000 0.000 1.000   NA
 7298231 7298232 SeD_A3188 SeD_A3189     TRUE 0.777 11.000 0.000 1.000   NA
 7298232 7298233 SeD_A3189 SeD_A3190     FALSE 0.468 27.000 0.000 NA   NA
 7298233 7298234 SeD_A3190 SeD_A3191     FALSE 0.166 80.000 0.000 NA   NA
 7298234 7298235 SeD_A3191 SeD_A3192     TRUE 0.788 19.000 0.111 NA   NA
 7298235 7298236 SeD_A3192 SeD_A3193     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7298236 7298237 SeD_A3193 SeD_A3194     FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 7298237 7298238 SeD_A3194 SeD_A3195     FALSE 0.449 28.000 0.000 NA   NA
 7298238 7298239 SeD_A3195 SeD_A3196     TRUE 0.981 3.000 0.375 1.000   NA
 7298239 7298240 SeD_A3196 SeD_A3197     TRUE 0.655 138.000 0.409 1.000   NA
 7298240 7298241 SeD_A3197 SeD_A3198   epaR TRUE 0.996 -13.000 0.682 0.066 Y NA
 7298241 7298242 SeD_A3198 SeD_A3199 epaR   TRUE 0.999 4.000 1.000 0.066 Y NA
 7298242 7298243 SeD_A3199 SeD_A3200   spaP TRUE 0.994 26.000 0.833 0.007 Y NA
 7298243 7298244 SeD_A3200 SeD_A3201 spaP epaO TRUE 0.995 -10.000 0.625 1.000 Y NA
 7298244 7298245 SeD_A3201 SeD_A3202 epaO   TRUE 0.960 0.000 0.188 NA   NA
 7298245 7298246 SeD_A3202 SeD_A3203     TRUE 0.989 0.000 0.571 NA   NA
 7298246 7298247 SeD_A3203 SeD_A3204     TRUE 0.921 -22.000 0.300 NA   NA
 7298247 7298248 SeD_A3204 SeD_A3205     TRUE 0.962 -3.000 0.200 1.000   NA
 7298248 7298249 SeD_A3205 SeD_A3206     TRUE 0.936 24.000 0.300 0.007   NA
 7298249 7298250 SeD_A3206 SeD_A3207     TRUE 0.909 25.000 0.320 1.000   NA
 7298250 7298251 SeD_A3207 SeD_A3208     TRUE 0.980 -3.000 0.360 1.000   NA
 7298251 7298252 SeD_A3208 SeD_A3209     TRUE 0.631 141.000 0.385 1.000 N NA
 7298253 7298254 SeD_A3210 SeD_A3211     FALSE 0.002 861.000 0.000 1.000   NA
 7298254 7298255 SeD_A3211 SeD_A3212     TRUE 0.987 0.000 0.483 1.000   NA
 7298258 7298259 SeD_A3215 SeD_A3216     TRUE 0.969 27.000 1.000 NA   NA
 7298259 7298260 SeD_A3216 SeD_A3217     FALSE 0.003 423.000 0.000 NA   NA
 7298262 7298263 SeD_A3219 SeD_A3220     TRUE 0.991 -3.000 0.714 NA   NA
 7298265 7298266 SeD_A3222 SeD_A3223     TRUE 0.991 -3.000 0.186 1.000 Y NA
 7298266 7298267 SeD_A3223 SeD_A3224     FALSE 0.150 123.000 0.000 NA   NA
 7298267 7298268 SeD_A3224 SeD_A3225     TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7298268 7298269 SeD_A3225 SeD_A3226     TRUE 0.910 -3.000 0.088 NA   NA
 7298269 7298270 SeD_A3226 SeD_A3227     TRUE 0.968 -6.000 0.355 NA   NA
 7298273 7298274 SeD_A3230 SeD_A3231 kpdB kpdC TRUE 0.996 0.000 0.250 0.001 Y NA
 7298274 7298275 SeD_A3231 SeD_A3232 kpdC kpdD TRUE 0.984 11.000 0.444 0.001   NA
 7298276 7298277 SeD_A3233 SeD_A3234 rpoS nlpD FALSE 0.518 63.000 0.142 1.000 N NA
 7298279 7298280 SeD_A3236 SeD_A3237 pcm surE TRUE 0.971 -6.000 0.353 1.000   NA
 7298280 7298281 SeD_A3237 SeD_A3238 surE truD TRUE 0.904 -25.000 0.235 1.000   NA
 7298281 7298282 SeD_A3238 SeD_A3239 truD ispF TRUE 0.956 -3.000 0.173 1.000   NA
 7298282 7298283 SeD_A3239 SeD_A3240 ispF ispD TRUE 0.996 0.000 0.419 1.000 Y NA
 7298283 7298284 SeD_A3240 SeD_A3241 ispD ftsB TRUE 0.882 19.000 0.185 1.000 N NA
 7298284 7298285 SeD_A3241 SeD_A3242 ftsB   FALSE 0.038 191.000 0.028 NA   NA
 7298285 7298286 SeD_A3242 SeD_A3243   cysC FALSE 0.513 96.000 0.198 NA   NA
 7298286 7298287 SeD_A3243 SeD_A3244 cysC cysN TRUE 0.988 -13.000 0.340 1.000 Y NA
 7298287 7298288 SeD_A3244 SeD_A3245 cysN cysD TRUE 0.990 10.000 0.574 0.000 N NA
 7298289 7298290 SeD_A3246 SeD_A3247     TRUE 0.635 15.000 0.000 NA   NA
 7298291 7298292 SeD_A3248 SeD_A3249 cas2 cas1 TRUE 0.987 0.000 0.509 NA   NA
 7298292 7298293 SeD_A3249 SeD_A3250 cas1 cse3 TRUE 0.988 -3.000 0.589 NA   NA
 7298293 7298294 SeD_A3250 SeD_A3251 cse3 cas5 TRUE 0.923 -18.000 0.282 NA   NA
 7298294 7298295 SeD_A3251 SeD_A3252 cas5 cse4 TRUE 0.986 11.000 0.780 NA   NA
 7298295 7298296 SeD_A3252 SeD_A3253 cse4 cse2 TRUE 0.935 14.000 0.276 NA   NA
 7298296 7298297 SeD_A3253 SeD_A3254 cse2 cse1 TRUE 0.976 -3.000 0.336 NA   NA
 7298297 7298298 SeD_A3254 SeD_A3256 cse1   TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7298300 7298301 SeD_A3258 SeD_A3259 cysH cysI FALSE 0.419 102.000 0.116 1.000 N NA
 7298301 7298302 SeD_A3259 SeD_A3260 cysI cysJ TRUE 0.999 0.000 0.791 0.000 Y NA
 7298302 7298303 SeD_A3260 SeD_A3261 cysJ   FALSE 0.006 325.000 0.000 NA   NA
 7298305 7298306 SeD_A3263 SeD_A3264     FALSE 0.002 552.000 0.000 NA   NA
 7298306 7298307 SeD_A3264 SeD_A3265     FALSE 0.413 31.000 0.000 NA   NA
 7298307 7298308 SeD_A3265 SeD_A3266   eno FALSE 0.130 136.000 0.010 1.000 N NA
 7298308 7298309 SeD_A3266 SeD_A3267 eno pyrG FALSE 0.320 83.000 0.068 1.000 N NA
 7298309 7298310 SeD_A3267 SeD_A3268 pyrG mazG FALSE 0.024 228.000 0.025 1.000   NA
 7298311 7298312 SeD_A3269 SeD_A3270     TRUE 0.628 134.000 0.000 1.000 Y NA
 7298312 7298313 SeD_A3270 SeD_A3271     TRUE 0.959 13.000 0.000 1.000 Y NA
 7298313 7298314 SeD_A3271 SeD_A3272     TRUE 0.932 20.000 0.000 1.000 Y NA
 7298314 7298315 SeD_A3272 SeD_A3273     TRUE 0.980 15.000 0.571 0.009   NA
 7298315 7298316 SeD_A3273 SeD_A3274     TRUE 0.982 -3.000 0.286 0.009   NA
 7298316 7298317 SeD_A3274 SeD_A3275     FALSE 0.230 55.000 0.000 NA   NA
 7298318 7298319 SeD_A3276 SeD_A3277 relA rumA FALSE 0.475 52.000 0.082 1.000 N NA
 7298321 7298322 SeD_A3279 SeD_A3280     FALSE 0.238 78.000 0.037 1.000 N NA
 7298322 7298323 SeD_A3280 SeD_A3281     FALSE 0.541 21.000 0.000 NA   NA
 7298323 7298324 SeD_A3281 SeD_A3282     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7298324 7298325 SeD_A3282 SeD_A3283   gudP TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7298327 7298328 SeD_A3285 SeD_A3286     TRUE 0.893 19.000 0.209 1.000 N NA
 7298328 7298329 SeD_A3286 SeD_A3287     TRUE 0.987 0.000 0.518 NA   NA
 7298329 7298330 SeD_A3287 SeD_A3288     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 7298330 7298331 SeD_A3288 SeD_A3289     FALSE 0.025 217.000 0.000 NA   NA
 7298332 7298333 SeD_A3290 SeD_A3291 queF   FALSE 0.281 113.000 0.079 NA   NA
 7298335 7298336 SeD_A3293 SeD_A3294     TRUE 0.895 59.000 0.238 1.000 Y NA
 7298336 7298337 SeD_A3294 SeD_A3295   xni FALSE 0.101 170.000 0.044 1.000 N NA
 7298338 7298339 SeD_A3296 SeD_A3297 fucO fucA TRUE 0.769 17.000 0.066 1.000 N NA
 7298339 7298340 SeD_A3297 SeD_A3298 fucA   FALSE 0.086 154.000 0.000 NA   NA
 7298340 7298341 SeD_A3298 SeD_A3299     FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7298342 7298343 SeD_A3300 SeD_A3301 fucP fucI TRUE 0.915 32.000 0.104 NA Y NA
 7298343 7298344 SeD_A3301 SeD_A3302 fucI fucK TRUE 0.874 101.000 0.269 1.000 Y NA
 7298344 7298345 SeD_A3302 SeD_A3303 fucK   TRUE 0.992 2.000 0.211 1.000 Y NA
 7298345 7298346 SeD_A3303 SeD_A3304     TRUE 0.917 58.000 0.308 1.000 Y NA
 7298347 7298348 SeD_A3305 SeD_A3306     TRUE 0.905 -7.000 0.144 NA   NA
 7298348 7298349 SeD_A3306 SeD_A3307   gcvA TRUE 0.738 19.000 0.081 NA   NA
 7298352 7298353 SeD_A3310 SeD_A3311 csdA   TRUE 0.971 0.000 0.122 0.001   NA
 7298353 7298354 SeD_A3311 SeD_A3312   rarD FALSE 0.014 273.000 0.000 1.000   NA
 7298355 7298356 SeD_A3313 SeD_A3314     FALSE 0.157 110.000 0.000 NA   NA
 7298357 7298358 SeD_A3315 SeD_A3316     FALSE 0.425 30.000 0.000 NA   NA
 7298361 7298362 SeD_A3319 SeD_A3320 recD recB TRUE 0.998 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 7298362 7298363 SeD_A3320 SeD_A3321 recB   TRUE 0.890 -7.000 0.092 1.000 N NA
 7298363 7298364 SeD_A3321 SeD_A3322   recC FALSE 0.151 178.000 0.092 1.000 N NA
 7298364 7298365 SeD_A3322 SeD_A3323 recC ppdC TRUE 0.775 16.000 0.076 NA N NA
 7298365 7298366 SeD_A3323 SeD_A3324 ppdC   TRUE 0.967 -15.000 0.538 NA   NA
 7298366 7298367 SeD_A3324 SeD_A3325     TRUE 0.979 -3.000 0.373 NA   NA
 7298367 7298368 SeD_A3325 SeD_A3326     TRUE 0.990 -9.000 0.368 NA Y NA
 7298370 7298371 SeD_A3328 SeD_A3329 thyA lgt TRUE 0.944 7.000 0.164 1.000 N NA
 7298371 7298372 SeD_A3329 SeD_A3330 lgt ptsP FALSE 0.024 216.000 0.003 1.000 N NA
 7298372 7298373 SeD_A3330 SeD_A3331 ptsP nudH TRUE 0.749 13.000 0.000 1.000 N NA
 7298374 7298375 SeD_A3332 SeD_A3333   mutH FALSE 0.362 36.000 0.000 NA   NA
 7298375 7298376 SeD_A3333 SeD_A3334 mutH   FALSE 0.092 182.000 0.052 1.000 N NA
 7298376 7298377 SeD_A3334 SeD_A3335     FALSE 0.458 170.000 0.429 NA   NA
 7298377 7298378 SeD_A3335 SeD_A3336   tas FALSE 0.050 191.000 0.043 NA   NA
 7298379 7298380 SeD_A3337 SeD_A3338     TRUE 0.893 -7.000 0.124 NA   NA
 7298380 7298381 SeD_A3338 SeD_A3339     FALSE 0.166 91.000 0.000 NA   NA
 7298381 7298382 SeD_A3339 SeD_A3341     FALSE 0.155 116.000 0.000 NA   NA
 7298382 7298383 SeD_A3341 SeD_A3343     FALSE 0.166 92.000 0.000 NA   NA
 7298384 7298385 SeD_A3342 SeD_A3344     TRUE 0.986 14.000 0.200 0.039 Y NA
 7298388 7298389 SeD_A3347 SeD_A3348     FALSE 0.160 113.000 0.011 1.000 N NA
 7298389 7298390 SeD_A3348 SeD_A3349   kduD FALSE 0.007 354.000 0.000 1.000 N NA
 7298390 7298391 SeD_A3349 SeD_A3350 kduD kduI TRUE 0.708 57.000 0.269 1.000 N NA
 7298391 7298392 SeD_A3350 SeD_A3351 kduI   TRUE 0.697 -9.000 0.000 NA   NA
 7298392 7298393 SeD_A3351 SeD_A3352     FALSE 0.011 269.000 0.000 NA   NA
 7298393 7298394 SeD_A3352 SeD_A3353     FALSE 0.274 93.000 0.050 1.000 N NA
 7298395 7298396 SeD_A3354 SeD_A3355     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7298396 7298397 SeD_A3355 SeD_A3356     TRUE 0.591 17.000 0.000 NA   NA
 7298400 7298401 SeD_A3359 SeD_A3360     TRUE 0.966 -13.000 0.500 NA   NA
 7298401 7298402 SeD_A3360 SeD_A3361     TRUE 0.648 144.000 0.500 NA   NA
 7298402 7298403 SeD_A3361 SeD_A3362     TRUE 0.986 -3.000 0.500 1.000   NA
 7298403 7298404 SeD_A3362 SeD_A3363     TRUE 0.845 41.000 0.000 1.000 Y NA
 7298404 7298405 SeD_A3363 SeD_A3364     TRUE 0.668 120.000 0.000 1.000 Y NA
 7298405 7298406 SeD_A3364 SeD_A3365     FALSE 0.001 719.000 0.000 NA   NA
 7298406 7298407 SeD_A3365 SeD_A3366     FALSE 0.278 47.000 0.000 NA   NA
 7298407 7298408 SeD_A3366 SeD_A3367     FALSE 0.285 46.000 0.000 NA   NA
 7298408 7298409 SeD_A3367 SeD_A3368     FALSE 0.002 577.000 0.000 NA   NA
 7298409 7298410 SeD_A3368 SeD_A3369     TRUE 0.991 -3.000 0.727 NA   NA
 7298410 7298411 SeD_A3369 SeD_A3371     FALSE 0.002 575.000 0.000 NA   NA
 7298413 7298414 SeD_A3372 SeD_A3373     FALSE 0.168 79.000 0.000 NA   NA
 7298415 7298416 SeD_A3374 SeD_A3375   idi FALSE 0.252 51.000 0.000 NA   NA
 7298417 7298418 SeD_A3376 SeD_A3377 lysS prfB TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7298418 7298419 SeD_A3377 SeD_A3378 prfB recJ FALSE 0.006 322.000 0.000 NA   NA
 7298419 7298420 SeD_A3378 SeD_A3379 recJ   TRUE 0.907 6.000 0.082 1.000 N NA
 7298420 7298421 SeD_A3379 SeD_A3380   xerD TRUE 0.739 24.000 0.079 1.000 N NA
 7298423 7298424 SeD_A3382 SeD_A3384     TRUE 0.718 -19.000 0.061 NA   NA
 7298425 7298426 SeD_A3383 SeD_A3385     FALSE 0.494 15.000 0.004 NA   NA
 7298427 7298428 SeD_A3386 SeD_A3387     FALSE 0.183 162.000 0.113 NA   NA
 7298430 7298431 SeD_A3389 SeD_A3390   gcvP FALSE 0.002 456.000 0.000 NA   NA
 7298431 7298432 SeD_A3390 SeD_A3391 gcvP gcvH TRUE 0.711 163.000 0.249 1.000 Y NA
 7298432 7298433 SeD_A3391 SeD_A3392 gcvH gcvT TRUE 0.984 26.000 0.317 0.001 Y NA
 7298435 7298436 SeD_A3394 SeD_A3395   ubiH TRUE 0.942 126.000 0.474 0.001 Y NA
 7298436 7298437 SeD_A3395 SeD_A3396 ubiH pepP TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7298437 7298438 SeD_A3396 SeD_A3397 pepP   FALSE 0.485 26.000 0.000 NA   NA
 7298439 7298440 SeD_A3398 SeD_A3399     FALSE 0.317 42.000 0.000 NA   NA
 7298440 7298441 SeD_A3399 SeD_A3400     FALSE 0.541 21.000 0.000 NA   NA
 7298441 7298442 SeD_A3400 SeD_A3401     TRUE 0.635 15.000 0.000 NA   NA
 7298443 7298444 SeD_A3402 SeD_A3403 serA rpiA FALSE 0.011 267.000 0.000 NA   NA
 7298445 7298446 SeD_A3404 SeD_A3405     FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7298447 7298448 SeD_A3406 SeD_A3408     FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7298448 7298449 SeD_A3408 SeD_A3409     FALSE 0.035 201.000 0.000 NA   NA
 7298449 7298450 SeD_A3409 SeD_A3410   fbaA FALSE 0.029 233.000 0.038 1.000 N NA
 7298450 7298451 SeD_A3410 SeD_A3411 fbaA pgk TRUE 0.795 102.000 0.056 0.004 Y NA
 7298451 7298452 SeD_A3411 SeD_A3412 pgk epd TRUE 0.961 22.000 0.070 0.004 Y NA
 7298453 7298454 SeD_A3413 SeD_A3414     TRUE 0.718 26.000 0.103 NA   NA
 7298454 7298455 SeD_A3414 SeD_A3415     TRUE 0.989 1.000 0.605 NA   NA
 7298455 7298456 SeD_A3415 SeD_A3416     TRUE 0.971 -12.000 0.093 1.000 Y NA
 7298456 7298457 SeD_A3416 SeD_A3417     TRUE 0.992 -6.000 0.214 0.012 Y NA
 7298460 7298461 SeD_A3420 SeD_A3421 speB   FALSE 0.032 205.000 0.000 NA   NA
 7298461 7298462 SeD_A3421 SeD_A3422     FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 7298462 7298463 SeD_A3422 SeD_A3424     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7298463 7298464 SeD_A3424 SeD_A3425     FALSE 0.153 119.000 0.000 NA   NA
 7298464 7298465 SeD_A3425 SeD_A3426     TRUE 0.916 3.000 0.027 0.021 N NA
 7298467 7298468 SeD_A3428 SeD_A3429     FALSE 0.032 205.000 0.000 NA   NA
 7298468 7298469 SeD_A3429 SeD_A3430   speA FALSE 0.105 145.000 0.000 NA   NA
 7298469 7298470 SeD_A3430 SeD_A3431 speA   FALSE 0.108 87.000 0.009 NA   NA
 7298471 7298472 SeD_A3432 SeD_A3433   metK FALSE 0.057 149.000 0.004 NA   NA
 7298472 7298473 SeD_A3433 SeD_A3434 metK galP FALSE 0.003 493.000 0.000 1.000 N NA
 7298473 7298474 SeD_A3434 SeD_A3435 galP sprT FALSE 0.195 79.000 0.042 NA   NA
 7298474 7298475 SeD_A3435 SeD_A3436 sprT endA FALSE 0.529 96.000 0.210 NA   NA
 7298475 7298476 SeD_A3436 SeD_A3437 endA   TRUE 0.805 29.000 0.201 NA   NA
 7298476 7298477 SeD_A3437 SeD_A3438   gshB TRUE 0.848 20.000 0.173 NA   NA
 7298477 7298478 SeD_A3438 SeD_A3439 gshB   FALSE 0.079 216.000 0.120 NA N NA
 7298478 7298479 SeD_A3439 SeD_A3440     TRUE 0.972 0.000 0.263 NA N NA
 7298480 7298481 SeD_A3441 SeD_A3442     FALSE 0.181 133.000 0.000 1.000 N NA
 7298482 7298483 SeD_A3443 SeD_A3444     TRUE 0.866 19.000 0.189 NA   NA
 7298483 7298484 SeD_A3444 SeD_A3445     TRUE 0.903 -3.000 0.081 NA   NA
 7298484 7298485 SeD_A3445 SeD_A3446   rdgB TRUE 0.697 8.000 0.016 NA   NA
 7298485 7298486 SeD_A3446 SeD_A3447 rdgB   TRUE 0.947 -7.000 0.218 1.000 N NA
 7298487 7298488 SeD_A3448 SeD_A3449   ansB FALSE 0.101 133.000 0.018 NA   NA
 7298488 7298489 SeD_A3449 SeD_A3450 ansB   FALSE 0.040 189.000 0.027 NA   NA
 7298489 7298490 SeD_A3450 SeD_A3451     TRUE 0.580 50.000 0.155 NA   NA
 7298490 7298491 SeD_A3451 SeD_A3452   trmB TRUE 0.921 0.000 0.092 NA   NA
 7298492 7298493 SeD_A3453 SeD_A3454 mutY   TRUE 0.765 28.000 0.150 NA N NA
 7298493 7298494 SeD_A3454 SeD_A3455   mltC FALSE 0.391 113.000 0.128 NA N NA
 7298498 7298499 SeD_A3459 SeD_A3460     FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7298499 7298500 SeD_A3460 SeD_A3461     FALSE 0.160 105.000 0.000 NA   NA
 7298501 7298502 SeD_A3462 SeD_A3463     TRUE 0.934 25.000 0.417 1.000 N NA
 7298502 7298503 SeD_A3463 SeD_A3464     TRUE 0.959 24.000 0.600 1.000 N NA
 7298505 7298506 SeD_A3466 SeD_A3467     TRUE 0.642 69.000 0.182 0.045   NA
 7298508 7298509 SeD_A3469 SeD_A3470     TRUE 0.978 -22.000 0.864 NA   NA
 7298509 7298510 SeD_A3470 SeD_A3471     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7298510 7298511 SeD_A3471 SeD_A3472     FALSE 0.179 73.000 0.000 NA   NA
 7298511 7298512 SeD_A3472 SeD_A3473     TRUE 0.850 15.000 0.125 NA   NA
 7298514 7298515 SeD_A3475 SeD_A3476     FALSE 0.060 171.000 0.000 NA   NA
 7298515 7298516 SeD_A3476 SeD_A3477     FALSE 0.001 723.000 0.000 NA   NA
 7298516 7298517 SeD_A3477 SeD_A3478     TRUE 0.614 39.000 0.000 0.003   NA
 7298517 7298518 SeD_A3478 SeD_A3479   exuT FALSE 0.003 396.000 0.000 NA   NA
 7298519 7298520 SeD_A3480 SeD_A3481 uxuA   TRUE 0.732 111.000 0.070 1.000 Y NA
 7298520 7298521 SeD_A3481 SeD_A3482   uxaC TRUE 0.995 12.000 0.647 1.000 Y NA
 7298522 7298523 SeD_A3483 SeD_A3484     FALSE 0.201 62.000 0.000 NA   NA
 7298527 7298528 SeD_A3488 SeD_A3490     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7298528 7298529 SeD_A3490 SeD_A3491   hypC FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7298529 7298530 SeD_A3491 SeD_A3492 hypC hypA TRUE 0.949 28.000 0.667 NA   NA
 7298530 7298531 SeD_A3492 SeD_A3493 hypA   TRUE 0.797 -7.000 0.055 NA   NA
 7298531 7298532 SeD_A3493 SeD_A3494   hybD TRUE 0.954 -7.000 0.291 NA   NA
 7298532 7298533 SeD_A3494 SeD_A3495 hybD hybC TRUE 0.998 0.000 0.828 1.000 Y NA
 7298533 7298534 SeD_A3495 SeD_A3496 hybC hybB TRUE 0.977 -3.000 0.000 NA Y NA
 7298534 7298535 SeD_A3496 SeD_A3497 hybB hybA TRUE 0.955 -10.000 0.000 NA Y NA
 7298535 7298536 SeD_A3497 SeD_A3498 hybA hybO TRUE 0.997 3.000 0.615 NA Y NA
 7298536 7298537 SeD_A3498 SeD_A3499 hybO   TRUE 0.825 8.000 0.051 NA   NA
 7298537 7298538 SeD_A3499 SeD_A3500     TRUE 0.947 -3.000 0.167 NA   NA
 7298538 7298539 SeD_A3500 SeD_A3501     TRUE 0.708 85.000 0.417 NA   NA
 7298539 7298540 SeD_A3501 SeD_A3502     FALSE 0.007 307.000 0.000 NA   NA
 7298540 7298541 SeD_A3502 SeD_A3503     FALSE 0.014 280.000 0.052 NA   NA
 7298542 7298543 SeD_A3504 SeD_A3505     TRUE 0.985 -13.000 1.000 NA   NA
 7298543 7298544 SeD_A3505 SeD_A3506     FALSE 0.269 124.000 0.078 NA   NA
 7298545 7298546 SeD_A3507 SeD_A3508 exbD exbB TRUE 0.998 7.000 0.810 0.047 Y NA
 7298546 7298547 SeD_A3508 SeD_A3509 exbB   TRUE 0.776 -7.000 0.048 NA   NA
 7298548 7298549 SeD_A3510 SeD_A3511 metC   FALSE 0.432 140.000 0.212 NA   NA
 7298550 7298551 SeD_A3512 SeD_A3513     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7298552 7298553 SeD_A3514 SeD_A3515   dkgA FALSE 0.532 106.000 0.200 1.000   NA
 7298553 7298554 SeD_A3515 SeD_A3516 dkgA   FALSE 0.037 197.000 0.000 NA   NA
 7298554 7298555 SeD_A3516 SeD_A3517     FALSE 0.293 45.000 0.000 NA   NA
 7298556 7298557 SeD_A3518 SeD_A3519     FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7298558 7298559 SeD_A3520 SeD_A3521     TRUE 0.984 42.000 1.000 NA Y NA
 7298559 7298560 SeD_A3521 SeD_A3522     TRUE 0.997 11.000 1.000 NA Y NA
 7298561 7298562 SeD_A3523 SeD_A3524     FALSE 0.504 74.000 0.154 1.000 N NA
 7298562 7298563 SeD_A3524 SeD_A3525   parC FALSE 0.023 257.000 0.043 1.000 N NA
 7298563 7298564 SeD_A3525 SeD_A3526 parC   TRUE 0.640 111.000 0.005 1.000 Y NA
 7298564 7298565 SeD_A3526 SeD_A3527     FALSE 0.245 72.000 0.053 NA   NA
 7298566 7298567 SeD_A3528 SeD_A3529     TRUE 0.997 -3.000 0.526 1.000 Y NA
 7298567 7298568 SeD_A3529 SeD_A3530     TRUE 0.747 -6.000 0.000 NA   NA
 7298568 7298569 SeD_A3530 SeD_A3531     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7298569 7298570 SeD_A3531 SeD_A3532     TRUE 0.730 32.000 0.074 0.021   NA
 7298571 7298572 SeD_A3533 SeD_A3534   parE TRUE 0.772 7.000 0.000 NA   NA
 7298572 7298573 SeD_A3534 SeD_A3535 parE yqiA TRUE 0.826 28.000 0.217 NA   NA
 7298573 7298574 SeD_A3535 SeD_A3536 yqiA icc TRUE 0.984 0.000 0.427 NA   NA
 7298574 7298575 SeD_A3536 SeD_A3537 icc   TRUE 0.929 25.000 0.433 NA   NA
 7298575 7298576 SeD_A3537 SeD_A3538   nudF TRUE 0.982 -3.000 0.443 NA   NA
 7298577 7298578 SeD_A3539 SeD_A3540 tolC   FALSE 0.284 213.000 0.480 NA   NA
 7298578 7298579 SeD_A3540 SeD_A3541     TRUE 0.987 6.000 0.632 NA   NA
 7298583 7298584 SeD_A3545 SeD_A3546     TRUE 0.954 20.000 0.500 1.000   NA
 7298584 7298585 SeD_A3546 SeD_A3547     TRUE 0.970 15.000 0.375 0.004   NA
 7298588 7298589 SeD_A3551 SeD_A3552     FALSE 0.168 97.000 0.000 NA   NA
 7298590 7298591 SeD_A3553 SeD_A3554     TRUE 0.965 19.000 0.641 NA   NA
 7298592 7298593 SeD_A3555 SeD_A3556     FALSE 0.163 85.000 0.000 NA   NA
 7298593 7298594 SeD_A3556 SeD_A3557   glnE FALSE 0.511 48.000 0.083 1.000 N NA
 7298594 7298595 SeD_A3557 SeD_A3558 glnE   FALSE 0.249 118.000 0.053 1.000   NA
 7298596 7298597 SeD_A3559 SeD_A3560   cca FALSE 0.420 63.000 0.106 NA N NA
 7298598 7298599 SeD_A3561 SeD_A3562 bacA folB FALSE 0.450 98.000 0.128 1.000 N NA
 7298602 7298603 SeD_A3565 SeD_A3566 rpsU dnaG FALSE 0.042 235.000 0.067 1.000 N NA
 7298603 7298604 SeD_A3566 SeD_A3567 dnaG rpoD FALSE 0.500 150.000 0.299 1.000 N NA
 7298609 7298610 SeD_A3572 SeD_A3573     FALSE 0.058 388.000 0.000 0.003 Y NA
 7298611 7298612 SeD_A3574 SeD_A3575   rocD FALSE 0.012 262.000 0.000 NA   NA
 7298612 7298613 SeD_A3575 SeD_A3576 rocD   FALSE 0.074 171.000 0.024 1.000 N NA
 7298615 7298616 SeD_A3578 SeD_A3579     FALSE 0.070 152.000 0.019 NA   NA
 7298616 7298617 SeD_A3579 SeD_A3580     FALSE 0.130 89.000 0.019 NA   NA
 7298617 7298618 SeD_A3580 SeD_A3581     FALSE 0.014 271.000 0.000 1.000   NA
 7298618 7298619 SeD_A3581 SeD_A3582     FALSE 0.020 255.000 0.000 1.000 N NA
 7298619 7298620 SeD_A3582 SeD_A3583     FALSE 0.002 450.000 0.000 NA   NA
 7298620 7298621 SeD_A3583 SeD_A3584     TRUE 0.985 4.000 0.529 NA   NA
 7298621 7298622 SeD_A3584 SeD_A3585     TRUE 0.738 145.000 0.684 NA   NA
 7298622 7298623 SeD_A3585 SeD_A3586     TRUE 0.903 42.000 0.609 NA   NA
 7298623 7298624 SeD_A3586 SeD_A3587     TRUE 0.954 3.000 0.185 NA   NA
 7298624 7298625 SeD_A3587 SeD_A3588     TRUE 0.954 -3.000 0.185 NA   NA
 7298625 7298626 SeD_A3588 SeD_A3589     FALSE 0.274 155.000 0.161 NA   NA
 7298626 7298627 SeD_A3589 SeD_A3590     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 7298627 7298628 SeD_A3590 SeD_A3591     FALSE 0.165 90.000 0.000 NA   NA
 7298628 7298629 SeD_A3591 SeD_A3592     FALSE 0.149 124.000 0.000 NA   NA
 7298631 7298632 SeD_A3594 SeD_A3595     FALSE 0.374 24.000 0.005 NA   NA
 7298633 7298634 SeD_A3596 SeD_A3597     TRUE 0.791 26.000 0.157 NA   NA
 7298634 7298635 SeD_A3597 SeD_A3598     FALSE 0.068 315.000 0.000 1.000 Y NA
 7298635 7298636 SeD_A3598 SeD_A3599   pflB FALSE 0.246 70.000 0.000 1.000 N NA
 7298636 7298637 SeD_A3599 SeD_A3600 pflB ackA TRUE 0.957 34.000 0.286 1.000 Y NA
 7298637 7298638 SeD_A3600 SeD_A3601 ackA tdcC TRUE 0.701 67.000 0.308 1.000 N NA
 7298638 7298639 SeD_A3601 SeD_A3602 tdcC tdcB TRUE 0.928 21.000 0.029 1.000 Y NA
 7298639 7298640 SeD_A3602 SeD_A3603 tdcB   FALSE 0.201 98.000 0.023 1.000 N NA
 7298640 7298641 SeD_A3603 SeD_A3604     FALSE 0.002 541.000 0.000 NA   NA
 7298641 7298642 SeD_A3604 SeD_A3605     FALSE 0.193 65.000 0.000 NA   NA
 7298642 7298643 SeD_A3605 SeD_A3606   garK FALSE 0.166 91.000 0.000 NA   NA
 7298643 7298644 SeD_A3606 SeD_A3607 garK garR FALSE 0.168 98.000 0.000 NA   NA
 7298644 7298645 SeD_A3607 SeD_A3608 garR garL TRUE 0.932 26.000 0.424 1.000 N NA
 7298646 7298647 SeD_A3609 SeD_A3610   garD FALSE 0.020 228.000 0.000 NA   NA
 7298647 7298648 SeD_A3610 SeD_A3611 garD gatY FALSE 0.019 231.000 0.000 NA   NA
 7298648 7298649 SeD_A3611 SeD_A3612 gatY   TRUE 0.958 120.000 0.600 0.000 Y NA
 7298649 7298650 SeD_A3612 SeD_A3613     TRUE 0.996 15.000 1.000 1.000 Y NA
 7298650 7298651 SeD_A3613 SeD_A3614     TRUE 0.991 31.000 0.800 0.007 Y NA
 7298651 7298652 SeD_A3614 SeD_A3615     TRUE 0.994 4.000 0.214 0.011 Y NA
 7298652 7298653 SeD_A3615 SeD_A3616     TRUE 0.655 44.000 0.143 1.000 N NA
 7298653 7298654 SeD_A3616 SeD_A3617     FALSE 0.211 111.000 0.000 1.000 N NA
 7298656 7298657 SeD_A3619 SeD_A3620     TRUE 0.829 -42.000 0.172 NA   NA
 7298657 7298658 SeD_A3620 SeD_A3621   diaA TRUE 0.870 22.000 0.187 1.000 N NA
 7298658 7298659 SeD_A3621 SeD_A3622 diaA   TRUE 0.984 10.000 0.613 NA   NA
 7298664 7298665 SeD_A3627 SeD_A3628     TRUE 0.964 -6.000 0.295 1.000   NA
 7298666 7298667 SeD_A3629 SeD_A3630     TRUE 0.998 9.000 0.948 0.003 Y NA
 7298667 7298668 SeD_A3630 SeD_A3631     FALSE 0.069 178.000 0.041 NA N NA
 7298671 7298672 SeD_A3634 SeD_A3635 mtr deaD FALSE 0.087 154.000 0.009 1.000 N NA
 7298672 7298673 SeD_A3635 SeD_A3636 deaD nlpI FALSE 0.092 179.000 0.053 1.000   NA
 7298673 7298674 SeD_A3636 SeD_A3637 nlpI pnp FALSE 0.157 110.000 0.000 NA   NA
 7298676 7298677 SeD_A3639 SeD_A3641 rpsO truB TRUE 0.745 151.000 0.211 1.000 Y NA
 7298677 7298678 SeD_A3641 SeD_A3642 truB rbfA TRUE 0.995 0.000 0.318 1.000 Y NA
 7298678 7298679 SeD_A3642 SeD_A3643 rbfA infB TRUE 0.625 221.000 0.530 1.000 Y NA
 7298679 7298680 SeD_A3643 SeD_A3644 infB nusA TRUE 0.918 25.000 0.342 1.000 N NA
 7298680 7298681 SeD_A3644 SeD_A3645 nusA   TRUE 0.957 28.000 0.759 NA   NA
 7298681 7298682 SeD_A3645 SeD_A3646     FALSE 0.030 208.000 0.000 NA   NA
 7298683 7298684 SeD_A3647 SeD_A3648 argG   FALSE 0.099 158.000 0.000 1.000   NA
 7298685 7298686 SeD_A3649 SeD_A3650   secG TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7298686 7298687 SeD_A3650 SeD_A3651 secG glmM FALSE 0.024 223.000 0.016 1.000 N NA
 7298687 7298688 SeD_A3651 SeD_A3653 glmM folP TRUE 0.955 -7.000 0.260 1.000 N NA
 7298690 7298691 SeD_A3654 SeD_A3655 hflB rrmJ FALSE 0.483 95.000 0.152 1.000 N NA
 7298694 7298695 SeD_A3658 SeD_A3659 dacB   TRUE 0.762 9.000 0.000 NA   NA
 7298696 7298697 SeD_A3660 SeD_A3661 obgE   TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7298697 7298698 SeD_A3661 SeD_A3662   rpmA FALSE 0.156 114.000 0.000 NA   NA
 7298699 7298700 SeD_A3663 SeD_A3664   ispB FALSE 0.192 66.000 0.000 NA   NA
 7298700 7298701 SeD_A3664 SeD_A3665 ispB   FALSE 0.027 232.000 0.000 1.000 N NA
 7298702 7298703 SeD_A3666 SeD_A3667 murA   TRUE 0.689 54.000 0.258 NA N NA
 7298703 7298704 SeD_A3667 SeD_A3668     FALSE 0.390 188.000 0.453 NA   NA
 7298704 7298705 SeD_A3668 SeD_A3669   ttg2D TRUE 0.976 0.000 0.308 NA   NA
 7298705 7298706 SeD_A3669 SeD_A3670 ttg2D   TRUE 0.866 19.000 0.188 NA   NA
 7298706 7298707 SeD_A3670 SeD_A3671     TRUE 0.985 5.000 0.562 NA   NA
 7298707 7298708 SeD_A3671 SeD_A3672     TRUE 0.995 8.000 0.530 NA Y NA
 7298709 7298710 SeD_A3673 SeD_A3674   kdsD TRUE 0.932 14.000 0.226 1.000 N NA
 7298710 7298711 SeD_A3674 SeD_A3675 kdsD kdsC TRUE 0.961 21.000 0.598 1.000   NA
 7298711 7298712 SeD_A3675 SeD_A3676 kdsC   TRUE 0.988 -3.000 0.617 NA   NA
 7298712 7298713 SeD_A3676 SeD_A3677   lptA TRUE 0.942 -31.000 0.459 NA   NA
 7298713 7298714 SeD_A3677 SeD_A3678 lptA lptB TRUE 0.983 7.000 0.543 NA   NA
 7298714 7298715 SeD_A3678 SeD_A3679 lptB rpoN TRUE 0.639 48.000 0.163 1.000   NA
 7298715 7298716 SeD_A3679 SeD_A3680 rpoN yfiA TRUE 0.971 23.000 0.820 NA N NA
 7298716 7298717 SeD_A3680 SeD_A3681 yfiA ptsN TRUE 0.827 118.000 0.728 NA N NA
 7298717 7298718 SeD_A3681 SeD_A3682 ptsN   TRUE 0.663 46.000 0.186 NA   NA
 7298718 7298719 SeD_A3682 SeD_A3683   ptsO TRUE 0.953 -3.000 0.182 NA   NA
 7298719 7298720 SeD_A3683 SeD_A3684 ptsO   FALSE 0.015 250.000 0.000 NA   NA
 7298721 7298722 SeD_A3685 SeD_A3686 mtgA elbB TRUE 0.883 -3.000 0.066 NA   NA
 7298724 7298725 SeD_A3688 SeD_A3689     FALSE 0.409 94.000 0.113 1.000   NA
 7298726 7298727 SeD_A3690 SeD_A3691 gltB gltD TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7298727 7298728 SeD_A3691 SeD_A3692 gltD   FALSE 0.021 226.000 0.000 NA   NA
 7298728 7298729 SeD_A3692 SeD_A3693   codB FALSE 0.166 92.000 0.000 NA   NA
 7298729 7298730 SeD_A3693 SeD_A3694 codB   TRUE 0.984 -13.000 0.250 1.000 Y NA
 7298731 7298732 SeD_A3695 SeD_A3696     TRUE 0.991 -3.000 0.222 NA Y NA
 7298732 7298733 SeD_A3696 SeD_A3697     TRUE 0.995 -3.000 0.238 0.001 Y NA
 7298733 7298734 SeD_A3697 SeD_A3698     TRUE 0.891 47.000 0.143 1.000 Y NA
 7298734 7298735 SeD_A3698 SeD_A3699   nanA FALSE 0.208 116.000 0.000 1.000 N NA
 7298735 7298736 SeD_A3699 SeD_A3700 nanA   FALSE 0.177 135.000 0.000 1.000 N NA
 7298736 7298737 SeD_A3700 SeD_A3701   sspB FALSE 0.100 118.000 0.009 NA   NA
 7298737 7298738 SeD_A3701 SeD_A3702 sspB sspA TRUE 0.991 6.000 0.831 NA   NA
 7298738 7298739 SeD_A3702 SeD_A3703 sspA   FALSE 0.012 263.000 0.000 NA   NA
 7298739 7298740 SeD_A3703 SeD_A3704   rpsI FALSE 0.076 158.000 0.000 NA   NA
 7298740 7298741 SeD_A3704 SeD_A3705 rpsI rplM TRUE 0.994 16.000 0.601 0.009 Y NA
 7298741 7298742 SeD_A3705 SeD_A3706 rplM   FALSE 0.004 302.000 0.003 NA   NA
 7298743 7298744 SeD_A3707 SeD_A3708     FALSE 0.251 157.000 0.154 NA   NA
 7298744 7298745 SeD_A3708 SeD_A3709   degS TRUE 0.915 93.000 0.262 0.001 Y NA
 7298746 7298747 SeD_A3710 SeD_A3711     FALSE 0.144 89.000 0.019 NA N NA
 7298747 7298748 SeD_A3711 SeD_A3712   oadA TRUE 0.998 13.000 0.886 0.002 Y NA
 7298748 7298749 SeD_A3712 SeD_A3713 oadA   TRUE 0.996 16.000 0.720 0.002 Y NA
 7298749 7298750 SeD_A3713 SeD_A3714     FALSE 0.476 157.000 0.025 1.000 Y NA
 7298750 7298751 SeD_A3714 SeD_A3715     TRUE 0.999 0.000 0.667 0.000 Y NA
 7298751 7298752 SeD_A3715 SeD_A3716     TRUE 0.569 33.000 0.057 1.000 N NA
 7298752 7298753 SeD_A3716 SeD_A3717     FALSE 0.238 211.000 0.333 1.000 N NA
 7298753 7298754 SeD_A3717 SeD_A3718     TRUE 0.993 -13.000 0.429 0.003 Y NA
 7298754 7298755 SeD_A3718 SeD_A3719   mdh FALSE 0.176 120.000 0.020 1.000 N NA
 7298756 7298757 SeD_A3720 SeD_A3721 argR   FALSE 0.004 365.000 0.000 NA   NA
 7298757 7298758 SeD_A3721 SeD_A3722     TRUE 0.799 104.000 0.625 NA   NA
 7298759 7298760 SeD_A3723 SeD_A3724   aaeB FALSE 0.054 172.000 0.027 NA   NA
 7298760 7298761 SeD_A3724 SeD_A3725 aaeB aaeA TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 7298761 7298762 SeD_A3725 SeD_A3726 aaeA aaeX TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7298764 7298765 SeD_A3728 SeD_A3729 tldD   FALSE 0.141 145.000 0.050 NA   NA
 7298765 7298766 SeD_A3729 SeD_A3730   cafA TRUE 0.603 111.000 0.296 NA   NA
 7298766 7298767 SeD_A3730 SeD_A3731 cafA maf TRUE 0.965 -10.000 0.417 NA N NA
 7298767 7298768 SeD_A3731 SeD_A3732 maf mreD TRUE 0.948 9.000 0.206 NA N NA
 7298768 7298769 SeD_A3732 SeD_A3733 mreD mreC TRUE 0.998 0.000 0.550 0.002 Y NA
 7298769 7298770 SeD_A3733 SeD_A3734 mreC mreB TRUE 0.868 65.000 0.689 1.000 N NA
 7298770 7298771 SeD_A3734 SeD_A3735 mreB   FALSE 0.010 308.000 0.000 1.000 N NA
 7298772 7298773 SeD_A3736 SeD_A3737     FALSE 0.271 113.000 0.059 1.000   NA
 7298773 7298774 SeD_A3737 SeD_A3738     TRUE 0.995 1.000 0.790 0.038   NA
 7298774 7298775 SeD_A3738 SeD_A3739   accB FALSE 0.004 393.000 0.000 1.000   NA
 7298775 7298776 SeD_A3739 SeD_A3740 accB accC TRUE 0.993 11.000 0.275 0.001 Y NA
 7298776 7298777 SeD_A3740 SeD_A3741 accC   FALSE 0.337 109.000 0.103 NA   NA
 7298777 7298778 SeD_A3741 SeD_A3742   panF TRUE 0.981 -10.000 0.682 NA   NA
 7298778 7298779 SeD_A3742 SeD_A3743 panF prmA TRUE 0.790 12.000 0.041 1.000 N NA
 7298781 7298782 SeD_A3745 SeD_A3746 dusB fis TRUE 0.822 26.000 0.161 1.000 N NA
 7298782 7298783 SeD_A3746 SeD_A3747 fis   TRUE 0.663 86.000 0.016 1.000 Y NA
 7298783 7298784 SeD_A3747 SeD_A3748     FALSE 0.416 83.000 0.143 NA   NA
 7298784 7298785 SeD_A3748 SeD_A3749     FALSE 0.092 151.000 0.000 NA   NA
 7298787 7298788 SeD_A3751 SeD_A3752     FALSE 0.049 183.000 0.000 NA   NA
 7298788 7298789 SeD_A3752 SeD_A3754     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7298792 7298793 SeD_A3757 SeD_A3758 rrf   FALSE 0.343 39.000 0.000 NA   NA
 7298793 7298794 SeD_A3758 SeD_A3759   rrf TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7298794 7298795 SeD_A3759 SeD_A3761 rrf rrl FALSE 0.037 197.000 0.000 NA   NA
 7298795 7298796 SeD_A3761 SeD_A3762 rrl   FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 7298796 7298797 SeD_A3762 SeD_A3763   rrs FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7298801 7298802 SeD_A3767 SeD_A3768   aroE TRUE 0.835 -3.000 0.043 NA   NA
 7298802 7298803 SeD_A3768 SeD_A3769 aroE   TRUE 0.900 5.000 0.087 NA N NA
 7298803 7298804 SeD_A3769 SeD_A3770     TRUE 0.931 5.000 0.137 NA N NA
 7298804 7298805 SeD_A3770 SeD_A3771   smg TRUE 0.890 27.000 0.331 NA   NA
 7298805 7298806 SeD_A3771 SeD_A3772 smg   TRUE 0.798 -28.000 0.124 NA   NA
 7298807 7298808 SeD_A3773 SeD_A3774 def fmt TRUE 0.967 16.000 0.058 0.014 Y NA
 7298808 7298809 SeD_A3774 SeD_A3775 fmt sun TRUE 0.928 52.000 0.305 1.000 Y NA
 7298809 7298810 SeD_A3775 SeD_A3776 sun trkA TRUE 0.813 22.000 0.122 1.000 N NA
 7298810 7298811 SeD_A3776 SeD_A3777 trkA mscL FALSE 0.161 142.000 0.035 1.000 N NA
 7298812 7298813 SeD_A3778 SeD_A3779 zntR   TRUE 0.870 11.000 0.095 NA   NA
 7298813 7298814 SeD_A3779 SeD_A3780   rplQ FALSE 0.110 108.000 0.012 NA   NA
 7298814 7298815 SeD_A3780 SeD_A3781 rplQ rpoA TRUE 0.946 41.000 0.873 1.000 N NA
 7298815 7298816 SeD_A3781 SeD_A3782 rpoA rpsD TRUE 0.949 26.000 0.549 1.000 N NA
 7298816 7298817 SeD_A3782 SeD_A3783 rpsD rpsK TRUE 0.983 34.000 0.509 0.012 Y NA
 7298817 7298818 SeD_A3783 SeD_A3784 rpsK rpsM TRUE 0.996 17.000 0.810 0.009 Y NA
 7298820 7298821 SeD_A3787 SeD_A3788 secY rplO TRUE 0.990 8.000 0.730 1.000 N NA
 7298821 7298822 SeD_A3788 SeD_A3789 rplO rpmD TRUE 0.998 4.000 0.653 0.001 Y NA
 7298822 7298823 SeD_A3789 SeD_A3790 rpmD rpsE TRUE 0.998 4.000 0.789 0.012 Y NA
 7298823 7298824 SeD_A3790 SeD_A3791 rpsE rplR TRUE 0.960 15.000 0.007 0.012 Y NA
 7298824 7298825 SeD_A3791 SeD_A3792 rplR rplF TRUE 0.977 10.000 0.008 0.009 Y NA
 7298825 7298826 SeD_A3792 SeD_A3793 rplF rpsH TRUE 0.997 13.000 0.808 0.009 Y NA
 7298826 7298827 SeD_A3793 SeD_A3794 rpsH rpsN TRUE 0.981 34.000 0.473 0.009 Y NA
 7298827 7298828 SeD_A3794 SeD_A3795 rpsN rplE TRUE 0.993 15.000 0.496 0.009 Y NA
 7298828 7298829 SeD_A3795 SeD_A3796 rplE rplX TRUE 0.996 15.000 0.758 0.009 Y NA
 7298829 7298830 SeD_A3796 SeD_A3797 rplX rplN TRUE 0.998 11.000 0.810 0.012 Y NA
 7298830 7298831 SeD_A3797 SeD_A3798 rplN rpsQ TRUE 0.919 164.000 0.791 0.012 Y NA
 7298831 7298832 SeD_A3798 SeD_A3799 rpsQ rpmC TRUE 0.999 0.000 0.828 0.009 Y NA
 7298832 7298833 SeD_A3799 SeD_A3800 rpmC rplP TRUE 0.999 0.000 0.802 0.009 Y NA
 7298833 7298834 SeD_A3800 SeD_A3801 rplP rpsC TRUE 0.997 13.000 0.828 0.012 Y NA
 7298834 7298835 SeD_A3801 SeD_A3802 rpsC rplV TRUE 0.995 18.000 0.719 0.012 Y NA
 7298835 7298836 SeD_A3802 SeD_A3803 rplV rpsS TRUE 0.996 15.000 0.769 0.012 Y NA
 7298836 7298837 SeD_A3803 SeD_A3804 rpsS rplB TRUE 0.996 17.000 0.820 0.012 Y NA
 7298837 7298838 SeD_A3804 SeD_A3805 rplB rplW TRUE 0.996 18.000 0.849 0.012 Y NA
 7298838 7298839 SeD_A3805 SeD_A3806 rplW rplD TRUE 0.998 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 7298839 7298840 SeD_A3806 SeD_A3807 rplD rplC TRUE 0.996 11.000 0.486 0.009 Y NA
 7298840 7298841 SeD_A3807 SeD_A3808 rplC rpsJ TRUE 0.972 33.000 0.307 0.012 Y NA
 7298843 7298844 SeD_A3810 SeD_A3811 bfr bfd TRUE 0.687 73.000 0.000 NA Y NA
 7298844 7298845 SeD_A3811 SeD_A3813 bfd tuf2 FALSE 0.033 185.000 0.007 NA N NA
 7298847 7298848 SeD_A3814 SeD_A3815 fusA rpsG TRUE 0.941 97.000 0.579 1.000 Y NA
 7298848 7298849 SeD_A3815 SeD_A3816 rpsG rpsL TRUE 0.962 96.000 0.620 0.002 Y NA
 7298849 7298850 SeD_A3816 SeD_A3817 rpsL dsrH FALSE 0.227 126.000 0.058 NA N NA
 7298850 7298851 SeD_A3817 SeD_A3818 dsrH tusC TRUE 0.997 8.000 0.804 NA Y NA
 7298851 7298852 SeD_A3818 SeD_A3819 tusC tusD TRUE 0.998 0.000 0.790 NA Y NA
 7298852 7298853 SeD_A3819 SeD_A3820 tusD   TRUE 0.965 0.000 0.220 NA   NA
 7298853 7298854 SeD_A3820 SeD_A3821     FALSE 0.082 276.000 0.310 NA   NA
 7298856 7298857 SeD_A3823 SeD_A3824 slyD   TRUE 0.706 95.000 0.370 1.000   NA
 7298857 7298858 SeD_A3824 SeD_A3825   kefB TRUE 0.975 10.000 0.400 1.000   NA
 7298858 7298859 SeD_A3825 SeD_A3826 kefB kefG TRUE 0.994 0.000 0.927 1.000   NA
 7298860 7298861 SeD_A3827 SeD_A3828     FALSE 0.070 163.000 0.000 NA   NA
 7298863 7298864 SeD_A3830 SeD_A3831     TRUE 0.962 -3.000 0.222 NA   NA
 7298864 7298865 SeD_A3831 SeD_A3832     TRUE 0.739 51.000 0.303 NA   NA
 7298867 7298868 SeD_A3834 SeD_A3835 crp   FALSE 0.510 49.000 0.111 NA   NA
 7298869 7298870 SeD_A3836 SeD_A3837 argD pabA TRUE 0.762 86.000 0.088 1.000 Y NA
 7298870 7298871 SeD_A3837 SeD_A3838 pabA fic FALSE 0.399 32.000 0.008 1.000 N NA
 7298871 7298872 SeD_A3838 SeD_A3839 fic   TRUE 0.943 -10.000 0.286 NA   NA
 7298872 7298873 SeD_A3839 SeD_A3840   ppiA TRUE 0.665 109.000 0.364 NA   NA
 7298876 7298877 SeD_A3842 SeD_A3844 nirB nirD TRUE 0.996 -3.000 0.829 0.000 N NA
 7298877 7298878 SeD_A3844 SeD_A3845 nirD nirC TRUE 0.593 196.000 0.283 1.000 Y NA
 7298878 7298879 SeD_A3845 SeD_A3846 nirC cysG TRUE 0.871 12.000 0.087 1.000 N NA
 7298879 7298880 SeD_A3846 SeD_A3847 cysG   FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 7298880 7298881 SeD_A3847 SeD_A3848     FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 7298882 7298883 SeD_A3849 SeD_A3850 trpS gph TRUE 0.903 -7.000 0.118 1.000   NA
 7298883 7298884 SeD_A3850 SeD_A3851 gph rpe TRUE 0.904 -7.000 0.120 1.000   NA
 7298884 7298885 SeD_A3851 SeD_A3852 rpe dam TRUE 0.685 18.000 0.040 1.000 N NA
 7298885 7298886 SeD_A3852 SeD_A3853 dam   FALSE 0.256 181.000 0.234 NA   NA
 7298886 7298887 SeD_A3853 SeD_A3854   aroB FALSE 0.139 98.000 0.022 NA   NA
 7298887 7298888 SeD_A3854 SeD_A3855 aroB aroK TRUE 0.889 57.000 0.208 1.000 Y NA
 7298888 7298889 SeD_A3855 SeD_A3857 aroK   FALSE 0.002 465.000 0.000 NA   NA
 7298889 7298890 SeD_A3857 SeD_A3858     FALSE 0.501 -127.000 0.000 NA   NA
 7298890 7298891 SeD_A3858 SeD_A3859     TRUE 0.853 44.000 0.444 NA   NA
 7298891 7298892 SeD_A3859 SeD_A3860     TRUE 0.943 -16.000 0.348 NA   NA
 7298892 7298893 SeD_A3860 SeD_A3861     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7298896 7298897 SeD_A3864 SeD_A3865     FALSE 0.471 65.000 0.122 1.000   NA
 7298897 7298898 SeD_A3865 SeD_A3866   hslR TRUE 0.836 11.000 0.056 1.000   NA
 7298898 7298899 SeD_A3866 SeD_A3867 hslR hslO TRUE 0.846 19.000 0.140 1.000 N NA
 7298902 7298903 SeD_A3870 SeD_A3871 envZ ompR TRUE 0.996 6.000 0.584 1.000 Y NA
 7298904 7298905 SeD_A3872 SeD_A3873 greB   TRUE 0.797 99.000 0.123 1.000 Y NA
 7298905 7298906 SeD_A3873 SeD_A3874   feoA FALSE 0.004 437.000 0.000 1.000 N NA
 7298906 7298907 SeD_A3874 SeD_A3875 feoA feoB TRUE 0.970 19.000 0.177 1.000 Y NA
 7298907 7298908 SeD_A3875 SeD_A3876 feoB   TRUE 0.966 13.000 0.455 NA   NA
 7298908 7298909 SeD_A3876 SeD_A3877     FALSE 0.244 52.000 0.000 NA   NA
 7298909 7298910 SeD_A3877 SeD_A3878     FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 7298912 7298913 SeD_A3880 SeD_A3881 gntX gntY FALSE 0.368 59.000 0.066 1.000   NA
 7298913 7298914 SeD_A3881 SeD_A3882 gntY gntT FALSE 0.005 377.000 0.000 1.000   NA
 7298915 7298916 SeD_A3883 SeD_A3884 malQ   TRUE 0.988 10.000 0.137 0.014 Y NA
 7298918 7298919 SeD_A3886 SeD_A3887     TRUE 0.947 3.000 0.167 NA   NA
 7298919 7298920 SeD_A3887 SeD_A3888     FALSE 0.158 109.000 0.000 NA   NA
 7298920 7298921 SeD_A3888 SeD_A3889   rtcA TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7298921 7298922 SeD_A3889 SeD_A3890 rtcA rtcB TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7298922 7298923 SeD_A3890 SeD_A3891 rtcB   FALSE 0.005 345.000 0.000 NA   NA
 7298925 7298926 SeD_A3893 SeD_A3894     FALSE 0.537 94.000 0.190 1.000   NA
 7298926 7298927 SeD_A3894 SeD_A3895   glpE TRUE 0.738 76.000 0.405 1.000   NA
 7298929 7298930 SeD_A3897 SeD_A3898     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7298930 7298931 SeD_A3898 SeD_A3899   gldA FALSE 0.083 158.000 0.000 NA N NA
 7298932 7298933 SeD_A3900 SeD_A3901     TRUE 0.977 -3.000 0.000 NA Y NA
 7298933 7298934 SeD_A3901 SeD_A3902     TRUE 0.869 44.000 0.000 0.043 Y NA
 7298935 7298936 SeD_A3903 SeD_A3904     FALSE 0.077 178.000 0.000 1.000 N NA
 7298936 7298937 SeD_A3904 SeD_A3905   glgA TRUE 0.974 20.000 0.228 1.000 Y NA
 7298937 7298938 SeD_A3905 SeD_A3906 glgA glgC TRUE 0.995 0.000 0.307 1.000 Y NA
 7298938 7298939 SeD_A3906 SeD_A3907 glgC glgX TRUE 0.982 15.000 0.228 1.000 Y NA
 7298939 7298940 SeD_A3907 SeD_A3908 glgX glgB TRUE 0.991 -3.000 0.098 0.002 Y NA
 7298940 7298941 SeD_A3908 SeD_A3909 glgB asd FALSE 0.007 349.000 0.000 1.000 N NA
 7298941 7298942 SeD_A3909 SeD_A3910 asd gntU FALSE 0.050 355.000 0.000 1.000 Y NA
 7298942 7298943 SeD_A3910 SeD_A3911 gntU gntK TRUE 0.989 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 7298943 7298944 SeD_A3911 SeD_A3912 gntK gntR FALSE 0.077 178.000 0.000 1.000 N NA
 7298944 7298945 SeD_A3912 SeD_A3913 gntR   FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7298945 7298946 SeD_A3913 SeD_A3914     FALSE 0.149 124.000 0.000 NA   NA
 7298946 7298947 SeD_A3914 SeD_A3915     FALSE 0.014 253.000 0.000 NA   NA
 7298950 7298951 SeD_A3918 SeD_A3919     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7298951 7298952 SeD_A3919 SeD_A3920     FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 7298952 7298953 SeD_A3920 SeD_A3921     TRUE 0.884 -3.000 0.067 NA   NA
 7298956 7298957 SeD_A3924 SeD_A3925 ugpQ ugpC TRUE 0.920 -3.000 0.080 1.000 N NA
 7298957 7298958 SeD_A3925 SeD_A3926 ugpC   TRUE 0.995 2.000 0.272 0.036 Y NA
 7298958 7298959 SeD_A3926 SeD_A3927   ugpA TRUE 0.996 -3.000 0.306 0.036 Y NA
 7298959 7298960 SeD_A3927 SeD_A3928 ugpA ugpB TRUE 0.967 105.000 0.793 0.036 Y NA
 7298960 7298961 SeD_A3928 SeD_A3929 ugpB   FALSE 0.017 259.000 0.000 1.000   NA
 7298961 7298962 SeD_A3929 SeD_A3930     TRUE 0.826 -3.000 0.039 NA   NA
 7298962 7298963 SeD_A3930 SeD_A3931   livF FALSE 0.239 131.000 0.068 NA N NA
 7298963 7298964 SeD_A3931 SeD_A3932 livF livG TRUE 0.999 2.000 0.967 0.012 Y NA
 7298964 7298965 SeD_A3932 SeD_A3933 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 7298965 7298966 SeD_A3933 SeD_A3934 livM livH TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.036 Y NA
 7298966 7298967 SeD_A3934 SeD_A3935 livH livK TRUE 0.884 60.000 0.217 1.000 Y NA
 7298968 7298969 SeD_A3936 SeD_A3937     TRUE 0.583 -22.000 0.000 NA   NA
 7298970 7298971 SeD_A3938 SeD_A3939   rpoH FALSE 0.009 322.000 0.000 1.000 N NA
 7298971 7298972 SeD_A3939 SeD_A3940 rpoH ftsX FALSE 0.029 246.000 0.051 1.000 N NA
 7298972 7298973 SeD_A3940 SeD_A3941 ftsX ftsE TRUE 0.981 -7.000 0.121 1.000 Y NA
 7298973 7298974 SeD_A3941 SeD_A3942 ftsE   TRUE 0.958 3.000 0.117 0.064 N NA
 7298975 7298976 SeD_A3943 SeD_A3944 rsmD   TRUE 0.787 -10.000 0.063 NA   NA
 7298980 7298981 SeD_A3948 SeD_A3949 zntA   FALSE 0.050 200.000 0.000 1.000 N NA
 7298983 7298984 SeD_A3951 SeD_A3952     FALSE 0.281 73.000 0.066 NA   NA
 7298986 7298987 SeD_A3954 SeD_A3955     FALSE 0.244 52.000 0.000 NA   NA
 7298987 7298988 SeD_A3955 SeD_A3956   nikR FALSE 0.235 55.000 0.010 1.000 N NA
 7298989 7298990 SeD_A3957 SeD_A3959     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7298990 7298991 SeD_A3959 SeD_A3960     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7298996 7298997 SeD_A3965 SeD_A3966 uspA   FALSE 0.009 324.000 0.000 1.000 N NA
 7298998 7298999 SeD_A3967 SeD_A3968     TRUE 0.898 7.000 0.098 NA   NA
 7298999 7299000 SeD_A3968 SeD_A3969     FALSE 0.052 182.000 0.018 1.000   NA
 7299004 7299005 SeD_A3973 SeD_A3974     TRUE 0.736 59.000 0.333 1.000   NA
 7299005 7299006 SeD_A3974 SeD_A3975     TRUE 0.706 54.000 0.286 NA   NA
 7299006 7299007 SeD_A3975 SeD_A3976     TRUE 0.664 64.000 0.286 NA N NA
 7299007 7299008 SeD_A3976 SeD_A3977     FALSE 0.337 179.000 0.286 1.000 N NA
 7299013 7299014 SeD_A3982 SeD_A3983     FALSE 0.402 73.000 0.098 1.000   NA
 7299014 7299015 SeD_A3983 SeD_A3984     FALSE 0.007 351.000 0.000 1.000   NA
 7299016 7299017 SeD_A3985 SeD_A3986     FALSE 0.170 110.000 0.000 NA N NA
 7299017 7299018 SeD_A3986 SeD_A3987     FALSE 0.209 59.000 0.000 NA   NA
 7299020 7299021 SeD_A3989 SeD_A3990   dctA FALSE 0.034 262.000 0.088 1.000   NA
 7299021 7299022 SeD_A3990 SeD_A3991 dctA   FALSE 0.447 158.000 0.229 0.072 N NA
 7299022 7299023 SeD_A3991 SeD_A3992     FALSE 0.148 174.000 0.088 1.000   NA
 7299023 7299024 SeD_A3992 SeD_A3993   bcsZ TRUE 0.926 -18.000 0.263 1.000   NA
 7299024 7299025 SeD_A3993 SeD_A3994 bcsZ bcsB TRUE 0.838 4.000 0.000 1.000   NA
 7299025 7299026 SeD_A3994 SeD_A3995 bcsB bcsA TRUE 0.899 11.000 0.000 0.001   NA
 7299026 7299027 SeD_A3995 SeD_A3996 bcsA   TRUE 0.987 -3.000 0.545 NA N NA
 7299027 7299028 SeD_A3996 SeD_A3997     TRUE 0.984 1.000 0.464 NA   NA
 7299029 7299030 SeD_A3998 SeD_A3999     FALSE 0.387 33.000 0.000 NA   NA
 7299030 7299031 SeD_A3999 SeD_A4000     TRUE 0.915 -3.000 0.095 NA   NA
 7299031 7299032 SeD_A4000 SeD_A4001     TRUE 0.921 -3.000 0.105 NA   NA
 7299034 7299035 SeD_A4003 SeD_A4004     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299035 7299036 SeD_A4004 SeD_A4005     FALSE 0.154 118.000 0.000 NA   NA
 7299037 7299038 SeD_A4006 SeD_A4007 dppF dppD TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 7299038 7299039 SeD_A4007 SeD_A4008 dppD dppC TRUE 0.995 11.000 0.560 1.000 Y NA
 7299039 7299040 SeD_A4008 SeD_A4009 dppC dppB TRUE 0.998 10.000 0.779 0.036 Y NA
 7299040 7299041 SeD_A4009 SeD_A4010 dppB dppA TRUE 0.656 157.000 0.087 0.036 Y NA
 7299041 7299042 SeD_A4010 SeD_A4011 dppA   FALSE 0.005 583.000 0.000 0.036 N NA
 7299042 7299043 SeD_A4011 SeD_A4012     FALSE 0.348 58.000 0.071 NA   NA
 7299044 7299045 SeD_A4013 SeD_A4014     TRUE 0.621 -16.000 0.000 NA   NA
 7299046 7299047 SeD_A4015 SeD_A4016     TRUE 0.753 -5.000 0.000 NA   NA
 7299047 7299048 SeD_A4016 SeD_A4017     FALSE 0.165 90.000 0.000 NA   NA
 7299048 7299049 SeD_A4017 SeD_A4018     FALSE 0.032 218.000 0.000 1.000   NA
 7299049 7299050 SeD_A4018 SeD_A4019     TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 7299050 7299051 SeD_A4019 SeD_A4020     TRUE 0.576 18.000 0.000 NA   NA
 7299051 7299052 SeD_A4020 SeD_A4021     FALSE 0.504 -81.000 0.000 NA   NA
 7299052 7299053 SeD_A4021 SeD_A4022     FALSE 0.522 23.000 0.000 NA   NA
 7299053 7299054 SeD_A4022 SeD_A4023     TRUE 0.941 85.000 0.600 1.000 Y NA
 7299054 7299055 SeD_A4023 SeD_A4024     FALSE 0.021 509.000 0.000 1.000 Y NA
 7299056 7299057 SeD_A4025 SeD_A4026     TRUE 0.637 -22.000 0.028 1.000   NA
 7299059 7299060 SeD_A4028 SeD_A4029     FALSE 0.034 219.000 0.000 1.000 N NA
 7299061 7299062 SeD_A4030 SeD_A4031     FALSE 0.095 150.000 0.000 NA   NA
 7299063 7299064 SeD_A4032 SeD_A4033     FALSE 0.089 288.000 0.000 1.000 Y NA
 7299064 7299065 SeD_A4033 SeD_A4034     FALSE 0.058 174.000 0.000 NA   NA
 7299066 7299067 SeD_A4035 SeD_A4036     FALSE 0.001 838.000 0.000 NA   NA
 7299067 7299068 SeD_A4036 SeD_A4037   glyS FALSE 0.002 597.000 0.000 NA   NA
 7299068 7299069 SeD_A4037 SeD_A4038 glyS glyQ TRUE 0.998 10.000 0.651 0.000 Y NA
 7299069 7299070 SeD_A4038 SeD_A4039 glyQ   FALSE 0.079 139.000 0.010 NA   NA
 7299072 7299073 SeD_A4041 SeD_A4042     FALSE 0.413 31.000 0.000 NA   NA
 7299073 7299074 SeD_A4042 SeD_A4043   xylB TRUE 0.772 7.000 0.000 NA   NA
 7299074 7299075 SeD_A4043 SeD_A4044 xylB xylA TRUE 0.691 100.000 0.034 1.000 Y NA
 7299077 7299078 SeD_A4046 SeD_A4047 bax   FALSE 0.413 31.000 0.000 NA   NA
 7299079 7299080 SeD_A4048 SeD_A4049 malS avtA FALSE 0.151 174.000 0.085 1.000 N NA
 7299081 7299082 SeD_A4050 SeD_A4051     FALSE 0.208 117.000 0.000 1.000 N NA
 7299082 7299083 SeD_A4051 SeD_A4052     FALSE 0.193 65.000 0.000 NA   NA
 7299084 7299085 SeD_A4053 SeD_A4054     TRUE 0.809 12.000 0.062 NA N NA
 7299085 7299086 SeD_A4054 SeD_A4055     TRUE 0.786 24.000 0.136 NA   NA
 7299086 7299087 SeD_A4055 SeD_A4056     FALSE 0.252 139.000 0.091 NA   NA
 7299087 7299088 SeD_A4056 SeD_A4057     TRUE 0.998 3.000 0.864 NA Y NA
 7299088 7299089 SeD_A4057 SeD_A4058     TRUE 0.963 12.000 0.000 1.000 Y NA
 7299089 7299090 SeD_A4058 SeD_A4059     TRUE 0.978 4.000 0.000 1.000 Y NA
 7299090 7299091 SeD_A4059 SeD_A4060   sgbH TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 7299091 7299092 SeD_A4060 SeD_A4061 sgbH   TRUE 0.992 -7.000 0.360 1.000 Y NA
 7299092 7299093 SeD_A4061 SeD_A4062   sgbE TRUE 0.988 -6.000 0.200 1.000 Y NA
 7299098 7299099 SeD_A4067 SeD_A4068 selB selA TRUE 0.993 -3.000 0.569 0.000 N NA
 7299099 7299100 SeD_A4068 SeD_A4069 selA   FALSE 0.200 99.000 0.040 NA N NA
 7299101 7299102 SeD_A4070 SeD_A4071   mtlD FALSE 0.425 231.000 0.292 1.000 Y NA
 7299102 7299103 SeD_A4071 SeD_A4072 mtlD mtlR TRUE 0.965 -3.000 0.230 NA N NA
 7299105 7299106 SeD_A4074 SeD_A4075     FALSE 0.165 81.000 0.000 NA   NA
 7299106 7299107 SeD_A4075 SeD_A4076     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 7299107 7299108 SeD_A4076 SeD_A4077     TRUE 0.772 44.000 0.286 NA   NA
 7299108 7299109 SeD_A4077 SeD_A4078   lldP FALSE 0.011 299.000 0.000 1.000 N NA
 7299109 7299110 SeD_A4078 SeD_A4079 lldP   TRUE 0.991 -3.000 0.652 1.000 N NA
 7299110 7299111 SeD_A4079 SeD_A4080   lldD TRUE 0.977 -3.000 0.309 1.000 N NA
 7299111 7299112 SeD_A4080 SeD_A4081 lldD   FALSE 0.225 64.000 0.020 1.000 N NA
 7299114 7299115 SeD_A4083 SeD_A4084     TRUE 0.848 74.000 0.667 1.000 N NA
 7299116 7299117 SeD_A4085 SeD_A4086 cysE gpsA TRUE 0.751 78.000 0.429 1.000 N NA
 7299117 7299118 SeD_A4086 SeD_A4087 gpsA secB TRUE 0.968 0.000 0.206 1.000 N NA
 7299118 7299119 SeD_A4087 SeD_A4088 secB grxC FALSE 0.404 44.000 0.038 1.000 N NA
 7299119 7299120 SeD_A4088 SeD_A4089 grxC   FALSE 0.221 87.000 0.048 NA N NA
 7299121 7299122 SeD_A4090 SeD_A4091 gpmI   TRUE 0.941 10.000 0.170 1.000 N NA
 7299122 7299123 SeD_A4091 SeD_A4092     TRUE 0.917 4.000 0.088 1.000   NA
 7299124 7299125 SeD_A4093 SeD_A4094   tdh FALSE 0.009 294.000 0.000 NA N NA
 7299125 7299126 SeD_A4094 SeD_A4095 tdh kbl TRUE 0.983 10.000 0.547 1.000 N NA
 7299127 7299128 SeD_A4096 SeD_A4097 rfaD rfaF TRUE 0.989 3.000 0.146 1.000 Y NA
 7299128 7299129 SeD_A4097 SeD_A4098 rfaF rfaC TRUE 0.995 0.000 0.205 0.001 Y NA
 7299129 7299130 SeD_A4098 SeD_A4099 rfaC   TRUE 0.839 40.000 0.036 NA Y NA
 7299131 7299132 SeD_A4100 SeD_A4102     FALSE 0.166 100.000 0.000 NA   NA
 7299132 7299133 SeD_A4102 SeD_A4103     FALSE 0.095 150.000 0.000 NA   NA
 7299133 7299134 SeD_A4103 SeD_A4104     TRUE 0.930 23.000 0.375 1.000   NA
 7299134 7299135 SeD_A4104 SeD_A4105     TRUE 0.996 18.000 0.833 0.001 Y NA
 7299135 7299136 SeD_A4105 SeD_A4106     TRUE 0.988 6.000 0.167 1.000 Y NA
 7299136 7299137 SeD_A4106 SeD_A4107     FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 7299137 7299138 SeD_A4107 SeD_A4108     FALSE 0.226 56.000 0.000 NA   NA
 7299138 7299139 SeD_A4108 SeD_A4109     TRUE 0.905 -7.000 0.121 1.000   NA
 7299139 7299140 SeD_A4109 SeD_A4110     TRUE 0.985 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 7299141 7299142 SeD_A4111 SeD_A4112 waaA coaD TRUE 0.792 9.000 0.020 1.000 N NA
 7299143 7299144 SeD_A4113 SeD_A4114 mutM rpmG FALSE 0.228 98.000 0.034 1.000 N NA
 7299144 7299145 SeD_A4114 SeD_A4115 rpmG rpmB TRUE 0.986 21.000 0.332 0.009 Y NA
 7299145 7299146 SeD_A4115 SeD_A4116 rpmB radC FALSE 0.023 218.000 0.002 1.000 N NA
 7299147 7299148 SeD_A4117 SeD_A4118 coaBC dut TRUE 0.583 -22.000 0.000 NA   NA
 7299148 7299149 SeD_A4118 SeD_A4119 dut slmA FALSE 0.293 108.000 0.060 1.000 N NA
 7299150 7299151 SeD_A4120 SeD_A4121 pyrE rph FALSE 0.196 79.000 0.022 1.000 N NA
 7299154 7299155 SeD_A4124 SeD_A4125     FALSE 0.015 251.000 0.000 NA   NA
 7299157 7299158 SeD_A4127 SeD_A4128 gmk rpoZ TRUE 0.828 55.000 0.471 1.000 N NA
 7299158 7299159 SeD_A4128 SeD_A4129 rpoZ   TRUE 0.980 19.000 0.291 1.000 Y NA
 7299159 7299160 SeD_A4129 SeD_A4130   trmH TRUE 0.920 5.000 0.095 1.000 N NA
 7299160 7299161 SeD_A4130 SeD_A4131 trmH recG TRUE 0.901 6.000 0.076 1.000 N NA
 7299163 7299164 SeD_A4133 SeD_A4134     FALSE 0.554 121.000 0.257 NA   NA
 7299165 7299166 SeD_A4135 SeD_A4136     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7299166 7299167 SeD_A4136 SeD_A4137     FALSE 0.271 48.000 0.000 NA   NA
 7299168 7299169 SeD_A4138 SeD_A4139     FALSE 0.157 110.000 0.000 NA   NA
 7299171 7299172 SeD_A4141 SeD_A4143     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299172 7299173 SeD_A4143 SeD_A4144     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7299173 7299174 SeD_A4144 SeD_A4145     FALSE 0.046 187.000 0.000 NA   NA
 7299176 7299177 SeD_A4147 SeD_A4148     FALSE 0.176 75.000 0.000 NA   NA
 7299178 7299179 SeD_A4149 SeD_A4150     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7299179 7299180 SeD_A4150 SeD_A4151     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299180 7299181 SeD_A4151 SeD_A4152     FALSE 0.001 662.000 0.000 NA   NA
 7299183 7299184 SeD_A4154 SeD_A4155   mgtA FALSE 0.011 267.000 0.000 NA   NA
 7299188 7299189 SeD_A4159 SeD_A4160     FALSE 0.018 236.000 0.000 NA   NA
 7299189 7299190 SeD_A4160 SeD_A4161     TRUE 0.966 -13.000 0.455 1.000   NA
 7299190 7299191 SeD_A4161 SeD_A4162     TRUE 0.979 4.000 0.364 1.000 N NA
 7299191 7299192 SeD_A4162 SeD_A4163     TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.011 Y NA
 7299192 7299193 SeD_A4163 SeD_A4164     TRUE 0.911 146.000 0.500 0.011 Y NA
 7299193 7299194 SeD_A4164 SeD_A4165     TRUE 0.997 11.000 0.667 0.007 Y NA
 7299194 7299195 SeD_A4165 SeD_A4166     FALSE 0.024 219.000 0.000 NA   NA
 7299195 7299196 SeD_A4166 SeD_A4167     FALSE 0.550 -28.000 0.000 NA   NA
 7299196 7299197 SeD_A4167 SeD_A4168     FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 7299198 7299199 SeD_A4169 SeD_A4170     TRUE 0.633 -15.000 0.000 NA   NA
 7299199 7299200 SeD_A4170 SeD_A4171     TRUE 0.583 -22.000 0.000 NA   NA
 7299202 7299203 SeD_A4173 SeD_A4174     TRUE 0.972 -16.000 0.636 NA   NA
 7299204 7299205 SeD_A4175 SeD_A4176   uhpT FALSE 0.094 193.000 0.091 NA   NA
 7299205 7299206 SeD_A4176 SeD_A4177 uhpT uhpC TRUE 0.661 143.000 0.000 0.036 Y NA
 7299206 7299207 SeD_A4177 SeD_A4178 uhpC uhpB TRUE 0.883 10.000 0.000 0.060 N NA
 7299207 7299208 SeD_A4178 SeD_A4179 uhpB uhpA TRUE 0.990 0.000 0.074 0.011 Y NA
 7299208 7299209 SeD_A4179 SeD_A4180 uhpA   FALSE 0.341 75.000 0.074 1.000   NA
 7299209 7299210 SeD_A4180 SeD_A4181   fucP TRUE 0.970 12.000 0.464 NA   NA
 7299210 7299211 SeD_A4181 SeD_A4182 fucP rbsK TRUE 0.948 31.000 0.209 NA Y NA
 7299213 7299214 SeD_A4184 SeD_A4185 ilvN ilvB TRUE 0.993 4.000 0.649 0.001   NA
 7299215 7299216 SeD_A4186 SeD_A4187   emrD FALSE 0.061 203.000 0.054 1.000   NA
 7299218 7299219 SeD_A4189 SeD_A4190   dsdA TRUE 0.956 18.000 0.083 1.000 Y NA
 7299220 7299221 SeD_A4191 SeD_A4192     TRUE 0.982 -3.000 0.429 NA   NA
 7299221 7299222 SeD_A4192 SeD_A4194     TRUE 0.975 -10.000 0.571 NA   NA
 7299224 7299225 SeD_A4195 SeD_A4196     FALSE 0.425 30.000 0.000 NA   NA
 7299225 7299226 SeD_A4196 SeD_A4197   ibpB FALSE 0.080 189.000 0.069 NA   NA
 7299226 7299227 SeD_A4197 SeD_A4198 ibpB ibpA TRUE 0.746 110.000 0.099 NA Y NA
 7299227 7299228 SeD_A4198 SeD_A4200 ibpA   FALSE 0.013 258.000 0.000 NA   NA
 7299230 7299231 SeD_A4201 SeD_A4202     FALSE 0.150 122.000 0.000 NA   NA
 7299231 7299232 SeD_A4202 SeD_A4203     TRUE 0.997 -3.000 0.578 1.000 Y NA
 7299232 7299233 SeD_A4203 SeD_A4204   ccmF TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.003 Y NA
 7299233 7299234 SeD_A4204 SeD_A4205 ccmF   TRUE 0.994 -3.000 0.211 0.003 Y NA
 7299234 7299235 SeD_A4205 SeD_A4206   ccmD TRUE 0.980 -3.000 0.344 1.000 N NA
 7299235 7299236 SeD_A4206 SeD_A4207 ccmD   TRUE 0.912 36.000 0.501 1.000 N NA
 7299236 7299237 SeD_A4207 SeD_A4208   ccmB TRUE 0.979 43.000 0.501 0.001 Y NA
 7299237 7299238 SeD_A4208 SeD_A4209 ccmB ccmA TRUE 0.998 -3.000 0.503 0.003 Y NA
 7299238 7299239 SeD_A4209 SeD_A4210 ccmA   TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7299239 7299240 SeD_A4210 SeD_A4211   torD FALSE 0.103 190.000 0.000 0.036   NA
 7299240 7299241 SeD_A4211 SeD_A4212 torD torA TRUE 0.914 -7.000 0.077 0.036   NA
 7299241 7299242 SeD_A4212 SeD_A4213 torA torC TRUE 0.990 -10.000 0.263 0.036 Y NA
 7299244 7299245 SeD_A4215 SeD_A4217 torT   FALSE 0.498 25.000 0.000 NA   NA
 7299247 7299248 SeD_A4218 SeD_A4219     FALSE 0.513 124.000 0.192 1.000 N NA
 7299248 7299249 SeD_A4219 SeD_A4220     TRUE 0.987 -3.000 0.385 0.042 N NA
 7299249 7299250 SeD_A4220 SeD_A4221     TRUE 0.995 -16.000 0.909 1.000 Y NA
 7299250 7299251 SeD_A4221 SeD_A4222   dgoR TRUE 0.992 -3.000 0.733 1.000 N NA
 7299251 7299252 SeD_A4222 SeD_A4223 dgoR   FALSE 0.017 261.000 0.000 1.000   NA
 7299253 7299254 SeD_A4224 SeD_A4225     TRUE 0.675 17.000 0.000 1.000 N NA
 7299254 7299255 SeD_A4225 SeD_A4226     FALSE 0.155 115.000 0.000 NA   NA
 7299256 7299257 SeD_A4227 SeD_A4228 gyrB recF TRUE 0.974 29.000 0.249 0.003 Y NA
 7299257 7299258 SeD_A4228 SeD_A4229 recF dnaN TRUE 0.820 148.000 0.318 1.000 Y NA
 7299258 7299259 SeD_A4229 SeD_A4230 dnaN dnaA TRUE 0.994 5.000 0.328 1.000 Y NA
 7299260 7299261 SeD_A4231 SeD_A4232 rpmH rnpA TRUE 0.978 17.000 0.787 1.000   NA
 7299261 7299262 SeD_A4232 SeD_A4233 rnpA   FALSE 0.069 224.000 0.105 1.000 N NA
 7299262 7299263 SeD_A4233 SeD_A4234   trmE TRUE 0.566 102.000 0.221 1.000   NA
 7299263 7299264 SeD_A4234 SeD_A4235 trmE   FALSE 0.049 183.000 0.000 NA   NA
 7299264 7299265 SeD_A4235 SeD_A4236     TRUE 0.953 -31.000 0.526 NA N NA
 7299265 7299266 SeD_A4236 SeD_A4237     FALSE 0.231 158.000 0.114 1.000 N NA
 7299266 7299267 SeD_A4237 SeD_A4238     TRUE 0.905 0.000 0.074 NA   NA
 7299270 7299271 SeD_A4241 SeD_A4242 phoU pstB TRUE 0.985 15.000 0.317 NA Y NA
 7299271 7299272 SeD_A4242 SeD_A4243 pstB pstA TRUE 0.973 51.000 0.526 0.001 Y NA
 7299272 7299273 SeD_A4243 SeD_A4244 pstA pstC TRUE 0.998 0.000 0.537 0.001 Y NA
 7299273 7299274 SeD_A4244 SeD_A4245 pstC pstS TRUE 0.833 136.000 0.145 0.001 Y NA
 7299274 7299275 SeD_A4245 SeD_A4246 pstS   FALSE 0.066 166.000 0.000 NA   NA
 7299275 7299276 SeD_A4246 SeD_A4247     FALSE 0.545 -30.000 0.000 NA   NA
 7299276 7299277 SeD_A4247 SeD_A4248     FALSE 0.264 49.000 0.000 NA   NA
 7299279 7299280 SeD_A4250 SeD_A4251 glmS glmU FALSE 0.378 189.000 0.055 1.000 Y NA
 7299280 7299281 SeD_A4251 SeD_A4252 glmU   FALSE 0.143 128.000 0.000 NA   NA
 7299281 7299282 SeD_A4252 SeD_A4253     TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7299282 7299283 SeD_A4253 SeD_A4254   atpC FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 7299283 7299284 SeD_A4254 SeD_A4255 atpC atpD TRUE 0.994 27.000 0.837 0.002 Y NA
 7299284 7299285 SeD_A4255 SeD_A4256 atpD atpG TRUE 0.993 27.000 0.724 0.002 Y NA
 7299285 7299286 SeD_A4256 SeD_A4257 atpG atpA TRUE 0.984 51.000 0.846 0.002 Y NA
 7299286 7299287 SeD_A4257 SeD_A4258 atpA atpH TRUE 0.997 13.000 0.864 0.002 Y NA
 7299287 7299288 SeD_A4258 SeD_A4259 atpH atpF TRUE 0.988 15.000 0.242 0.002 Y NA
 7299288 7299289 SeD_A4259 SeD_A4260 atpF atpE TRUE 0.972 60.000 0.666 0.002 Y NA
 7299289 7299290 SeD_A4260 SeD_A4261 atpE atpB TRUE 0.977 47.000 0.557 0.003 Y NA
 7299290 7299291 SeD_A4261 SeD_A4262 atpB atpI TRUE 0.908 9.000 0.000 0.003   NA
 7299291 7299292 SeD_A4262 SeD_A4263 atpI   FALSE 0.004 370.000 0.000 NA   NA
 7299292 7299293 SeD_A4263 SeD_A4264     FALSE 0.159 108.000 0.000 NA   NA
 7299293 7299294 SeD_A4264 SeD_A4265   gidB FALSE 0.157 111.000 0.000 NA   NA
 7299294 7299295 SeD_A4265 SeD_A4266 gidB gidA TRUE 0.754 103.000 0.466 1.000 N NA
 7299295 7299296 SeD_A4266 SeD_A4267 gidA mioC FALSE 0.006 379.000 0.000 1.000 N NA
 7299296 7299297 SeD_A4267 SeD_A4268 mioC asnC FALSE 0.497 90.000 0.165 1.000 N NA
 7299299 7299300 SeD_A4270 SeD_A4271 yieM   TRUE 0.975 -6.000 0.443 NA   NA
 7299301 7299302 SeD_A4272 SeD_A4273 trkD rbsD FALSE 0.036 217.000 0.000 1.000 N NA
 7299302 7299303 SeD_A4273 SeD_A4274 rbsD rbsA TRUE 0.980 -37.000 0.337 1.000 Y NA
 7299303 7299304 SeD_A4274 SeD_A4275 rbsA rbsC TRUE 0.996 6.000 0.504 1.000 Y NA
 7299304 7299305 SeD_A4275 SeD_A4276 rbsC rbsB TRUE 0.991 25.000 0.847 NA Y NA
 7299305 7299306 SeD_A4276 SeD_A4277 rbsB rbsK TRUE 0.864 133.000 0.347 NA Y NA
 7299306 7299307 SeD_A4277 SeD_A4278 rbsK   TRUE 0.985 4.000 0.500 1.000 N NA
 7299308 7299309 SeD_A4279 SeD_A4280     TRUE 0.878 12.000 0.100 1.000   NA
 7299310 7299311 SeD_A4281 SeD_A4282 rrs   FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7299311 7299312 SeD_A4282 SeD_A4283   rrl FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 7299312 7299313 SeD_A4283 SeD_A4285 rrl rrf FALSE 0.037 197.000 0.000 NA   NA
 7299313 7299314 SeD_A4285 SeD_A4286 rrf   FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 7299314 7299315 SeD_A4286 SeD_A4287     TRUE 0.772 7.000 0.000 NA   NA
 7299319 7299320 SeD_A4291 SeD_A4292 ilvG ilvM TRUE 0.996 -3.000 0.943 0.001   NA
 7299320 7299321 SeD_A4292 SeD_A4293 ilvM ilvE TRUE 0.893 18.000 0.205 1.000   NA
 7299321 7299322 SeD_A4293 SeD_A4294 ilvE ilvD FALSE 0.546 160.000 0.075 1.000 Y NA
 7299322 7299323 SeD_A4294 SeD_A4295 ilvD ilvA TRUE 0.987 3.000 0.106 1.000 Y NA
 7299323 7299324 SeD_A4295 SeD_A4296 ilvA   FALSE 0.017 238.000 0.000 NA   NA
 7299324 7299325 SeD_A4296 SeD_A4297     TRUE 0.979 -3.000 0.385 NA   NA
 7299330 7299331 SeD_A4302 SeD_A4303 gppA rhlB TRUE 0.665 137.000 0.406 1.000 N NA
 7299332 7299333 SeD_A4304 SeD_A4305 trxA rho FALSE 0.008 419.000 0.087 1.000 N NA
 7299333 7299334 SeD_A4305 SeD_A4306 rho wecA FALSE 0.028 230.000 0.000 1.000 N NA
 7299334 7299335 SeD_A4306 SeD_A4307 wecA   TRUE 0.997 12.000 0.735 0.003 Y NA
 7299335 7299336 SeD_A4307 SeD_A4308     TRUE 0.976 56.000 0.677 0.003 Y NA
 7299336 7299337 SeD_A4308 SeD_A4309   wecC TRUE 0.995 -3.000 0.348 1.000 Y NA
 7299337 7299338 SeD_A4309 SeD_A4310 wecC rfbB2 TRUE 0.994 0.000 0.273 1.000 Y NA
 7299338 7299339 SeD_A4310 SeD_A4311 rfbB2   TRUE 0.947 33.000 0.739 1.000   NA
 7299339 7299340 SeD_A4311 SeD_A4312   wecD TRUE 0.857 -22.000 0.145 1.000   NA
 7299340 7299341 SeD_A4312 SeD_A4313 wecD wecE TRUE 0.965 5.000 0.248 1.000   NA
 7299341 7299342 SeD_A4313 SeD_A4314 wecE   TRUE 0.967 2.000 0.218 1.000   NA
 7299342 7299343 SeD_A4314 SeD_A4315   wecF TRUE 0.989 -3.000 0.605 1.000   NA
 7299343 7299344 SeD_A4315 SeD_A4316 wecF wzyE TRUE 0.991 -3.000 0.684 1.000   NA
 7299344 7299345 SeD_A4316 SeD_A4317 wzyE   TRUE 0.942 -3.000 0.126 1.000   NA
 7299345 7299346 SeD_A4317 SeD_A4318     FALSE 0.036 207.000 0.019 1.000 N NA
 7299346 7299347 SeD_A4318 SeD_A4319     FALSE 0.162 103.000 0.000 NA   NA
 7299347 7299348 SeD_A4319 SeD_A4320     FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 7299348 7299349 SeD_A4320 SeD_A4321     FALSE 0.550 20.000 0.000 NA   NA
 7299349 7299350 SeD_A4321 SeD_A4322     FALSE 0.317 42.000 0.000 NA   NA
 7299350 7299351 SeD_A4322 SeD_A4323     FALSE 0.007 306.000 0.000 NA   NA
 7299352 7299353 SeD_A4324 SeD_A4325 hemY   TRUE 0.990 0.000 0.144 1.000 Y NA
 7299353 7299354 SeD_A4325 SeD_A4326   hemD TRUE 0.989 22.000 0.600 1.000 Y NA
 7299354 7299355 SeD_A4326 SeD_A4327 hemD hemC TRUE 0.995 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 7299357 7299358 SeD_A4329 SeD_A4330 cyaY   FALSE 0.185 70.000 0.000 NA   NA
 7299358 7299359 SeD_A4330 SeD_A4332     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299360 7299361 SeD_A4333 SeD_A4334   dapF FALSE 0.327 37.000 0.021 NA N NA
 7299361 7299362 SeD_A4334 SeD_A4335 dapF   TRUE 0.951 -3.000 0.175 NA   NA
 7299362 7299363 SeD_A4335 SeD_A4336   xerC TRUE 0.991 -3.000 0.714 NA   NA
 7299363 7299364 SeD_A4336 SeD_A4337 xerC   TRUE 0.982 0.000 0.367 1.000   NA
 7299364 7299365 SeD_A4337 SeD_A4338   uvrD FALSE 0.363 136.000 0.128 1.000   NA
 7299365 7299366 SeD_A4338 SeD_A4339 uvrD corA FALSE 0.003 472.000 0.021 1.000 N NA
 7299369 7299370 SeD_A4342 SeD_A4343 rarD   FALSE 0.533 44.000 0.099 NA   NA
 7299371 7299372 SeD_A4344 SeD_A4345   recQ FALSE 0.329 66.000 0.057 1.000 N NA
 7299372 7299373 SeD_A4345 SeD_A4346 recQ   FALSE 0.292 64.000 0.043 1.000 N NA
 7299375 7299376 SeD_A4348 SeD_A4349 pldB   TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7299378 7299379 SeD_A4351 SeD_A4352 metE   FALSE 0.045 188.000 0.000 NA   NA
 7299379 7299380 SeD_A4352 SeD_A4353     FALSE 0.221 57.000 0.000 NA   NA
 7299382 7299383 SeD_A4355 SeD_A4356 udp   FALSE 0.136 140.000 0.041 NA   NA
 7299383 7299384 SeD_A4356 SeD_A4357   ubiE FALSE 0.211 96.000 0.047 NA   NA
 7299384 7299385 SeD_A4357 SeD_A4358 ubiE   TRUE 0.927 10.000 0.145 1.000   NA
 7299385 7299386 SeD_A4358 SeD_A4359   ubiB TRUE 0.984 -3.000 0.432 1.000   NA
 7299386 7299387 SeD_A4359 SeD_A4360 ubiB tatA FALSE 0.048 206.000 0.044 1.000   NA
 7299387 7299388 SeD_A4360 SeD_A4361 tatA   TRUE 0.978 4.000 0.000 1.000 Y NA
 7299388 7299389 SeD_A4361 SeD_A4362   tatC TRUE 0.977 3.000 0.000 NA Y NA
 7299389 7299390 SeD_A4362 SeD_A4363 tatC   TRUE 0.710 30.000 0.121 NA N NA
 7299392 7299393 SeD_A4365 SeD_A4366 ubiD fre TRUE 0.746 86.000 0.090 NA Y NA
 7299393 7299394 SeD_A4366 SeD_A4367 fre   FALSE 0.034 203.000 0.000 NA   NA
 7299395 7299396 SeD_A4368 SeD_A4369 fadA fadB TRUE 0.996 10.000 0.607 1.000 Y NA
 7299397 7299398 SeD_A4370 SeD_A4371 pepQ   TRUE 0.948 0.000 0.127 1.000   NA
 7299398 7299399 SeD_A4371 SeD_A4372   trkH TRUE 0.760 39.000 0.202 1.000   NA
 7299399 7299400 SeD_A4372 SeD_A4373 trkH hemG TRUE 0.973 12.000 0.455 1.000 N NA
 7299400 7299401 SeD_A4373 SeD_A4374 hemG rrs FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7299401 7299402 SeD_A4374 SeD_A4375 rrs   FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 7299402 7299403 SeD_A4375 SeD_A4376     FALSE 0.158 109.000 0.000 NA   NA
 7299403 7299404 SeD_A4376 SeD_A4377     TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7299404 7299405 SeD_A4377 SeD_A4378   rrl FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7299405 7299406 SeD_A4378 SeD_A4380 rrl rrf FALSE 0.036 198.000 0.000 NA   NA
 7299407 7299408 SeD_A4381 SeD_A4382 mobB mobA TRUE 0.971 -18.000 0.064 0.003 Y NA
 7299409 7299410 SeD_A4383 SeD_A4384     FALSE 0.365 77.000 0.106 NA   NA
 7299410 7299411 SeD_A4384 SeD_A4385     TRUE 0.806 17.000 0.111 NA   NA
 7299412 7299413 SeD_A4386 SeD_A4387     FALSE 0.036 198.000 0.000 NA   NA
 7299414 7299415 SeD_A4388 SeD_A4389   spf FALSE 0.121 139.000 0.000 NA   NA
 7299417 7299418 SeD_A4391 SeD_A4392     FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7299418 7299419 SeD_A4392 SeD_A4393   hemN FALSE 0.114 189.000 0.107 NA   NA
 7299420 7299421 SeD_A4394 SeD_A4395 glnG glnL TRUE 0.997 9.000 0.587 0.060 Y NA
 7299421 7299422 SeD_A4395 SeD_A4396 glnL glnA FALSE 0.020 275.000 0.053 1.000 N NA
 7299424 7299425 SeD_A4398 SeD_A4399     TRUE 0.801 -15.000 0.087 NA   NA
 7299425 7299426 SeD_A4399 SeD_A4400     FALSE 0.084 155.000 0.000 NA   NA
 7299426 7299427 SeD_A4400 SeD_A4401     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7299427 7299428 SeD_A4401 SeD_A4402     TRUE 0.927 -7.000 0.167 1.000   NA
 7299428 7299429 SeD_A4402 SeD_A4403     TRUE 0.567 52.000 0.158 NA   NA
 7299429 7299430 SeD_A4403 SeD_A4404   ompL FALSE 0.079 157.000 0.000 NA   NA
 7299430 7299431 SeD_A4404 SeD_A4405 ompL uidB TRUE 0.828 68.000 0.625 NA   NA
 7299431 7299432 SeD_A4405 SeD_A4406 uidB   TRUE 0.984 46.000 0.750 0.005 Y NA
 7299432 7299433 SeD_A4406 SeD_A4407     TRUE 0.817 46.000 0.000 1.000 Y NA
 7299433 7299434 SeD_A4407 SeD_A4408     TRUE 0.882 44.000 0.000 0.003 Y NA
 7299434 7299435 SeD_A4408 SeD_A4409     TRUE 0.929 19.000 0.017 1.000 Y NA
 7299435 7299436 SeD_A4409 SeD_A4410     TRUE 0.953 16.000 0.051 1.000 Y NA
 7299436 7299437 SeD_A4410 SeD_A4411     TRUE 0.896 23.000 0.250 1.000 N NA
 7299437 7299438 SeD_A4411 SeD_A4412     TRUE 0.664 -12.000 0.000 NA   NA
 7299439 7299440 SeD_A4413 SeD_A4414     TRUE 0.871 34.000 0.000 1.000 Y NA
 7299440 7299441 SeD_A4414 SeD_A4415   yihX FALSE 0.055 191.000 0.000 1.000   NA
 7299441 7299442 SeD_A4415 SeD_A4416 yihX rbn TRUE 0.794 -6.000 0.031 1.000   NA
 7299442 7299443 SeD_A4416 SeD_A4417 rbn dtd TRUE 0.906 -3.000 0.069 1.000   NA
 7299443 7299444 SeD_A4417 SeD_A4418 dtd   TRUE 0.901 -3.000 0.065 1.000   NA
 7299445 7299446 SeD_A4419 SeD_A4420     TRUE 0.950 15.000 0.375 NA   NA
 7299446 7299447 SeD_A4420 SeD_A4421     FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7299447 7299448 SeD_A4421 SeD_A4423     FALSE 0.040 194.000 0.000 NA   NA
 7299449 7299450 SeD_A4422 SeD_A4424     TRUE 0.972 1.000 0.280 NA   NA
 7299451 7299452 SeD_A4425 SeD_A4426 fdhE fdoI TRUE 0.955 -3.000 0.182 NA N NA
 7299452 7299453 SeD_A4426 SeD_A4427 fdoI fdoH TRUE 0.999 -3.000 0.944 0.001 Y NA
 7299453 7299454 SeD_A4427 SeD_A4428 fdoH fdoG TRUE 0.675 13.000 0.000 NA   NA
 7299454 7299455 SeD_A4428 SeD_A4429 fdoG fdxG FALSE 0.264 49.000 0.000 NA   NA
 7299458 7299459 SeD_A4432 SeD_A4433     TRUE 0.819 1.000 0.000 NA   NA
 7299459 7299460 SeD_A4433 SeD_A4434     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299461 7299462 SeD_A4435 SeD_A4436     TRUE 0.991 0.000 0.675 NA   NA
 7299464 7299465 SeD_A4438 SeD_A4439 rhaU fucO TRUE 0.880 -3.000 0.063 NA   NA
 7299465 7299466 SeD_A4439 SeD_A4440 fucO rhaD FALSE 0.356 127.000 0.041 0.007 N NA
 7299466 7299467 SeD_A4440 SeD_A4441 rhaD rhaA TRUE 0.798 144.000 0.247 1.000 Y NA
 7299467 7299468 SeD_A4441 SeD_A4442 rhaA rhaB TRUE 0.995 -3.000 0.387 1.000 Y NA
 7299469 7299470 SeD_A4443 SeD_A4444     TRUE 0.938 153.000 0.800 0.015 Y NA
 7299472 7299473 SeD_A4446 SeD_A4447     FALSE 0.369 35.000 0.000 NA   NA
 7299473 7299474 SeD_A4447 SeD_A4448     FALSE 0.039 195.000 0.000 NA   NA
 7299474 7299475 SeD_A4448 SeD_A4449     FALSE 0.355 37.000 0.000 NA   NA
 7299476 7299477 SeD_A4450 SeD_A4451     TRUE 0.963 -7.000 0.000 NA Y NA
 7299477 7299478 SeD_A4451 SeD_A4452     TRUE 0.990 19.000 0.600 NA Y NA
 7299479 7299480 SeD_A4453 SeD_A4454 sodA   FALSE 0.469 70.000 0.129 1.000   NA
 7299480 7299481 SeD_A4454 SeD_A4455     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7299482 7299483 SeD_A4456 SeD_A4457 cpxA cpxR TRUE 0.998 -3.000 0.791 1.000 Y NA
 7299484 7299485 SeD_A4458 SeD_A4459 cpxP fieF FALSE 0.522 148.000 0.031 NA Y NA
 7299485 7299486 SeD_A4459 SeD_A4460 fieF pfkA FALSE 0.074 185.000 0.040 1.000 N NA
 7299486 7299487 SeD_A4460 SeD_A4461 pfkA   FALSE 0.059 204.000 0.049 1.000 N NA
 7299487 7299488 SeD_A4461 SeD_A4462   cdh FALSE 0.165 101.000 0.000 NA   NA
 7299488 7299489 SeD_A4462 SeD_A4463 cdh gph FALSE 0.012 264.000 0.000 NA   NA
 7299489 7299490 SeD_A4463 SeD_A4464 gph   TRUE 0.967 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7299490 7299491 SeD_A4464 SeD_A4465     TRUE 0.767 10.000 0.000 NA N NA
 7299491 7299492 SeD_A4465 SeD_A4466     FALSE 0.215 63.000 0.000 NA N NA
 7299492 7299493 SeD_A4466 SeD_A4467     FALSE 0.168 98.000 0.000 NA   NA
 7299493 7299494 SeD_A4467 SeD_A4468     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7299495 7299496 SeD_A4469 SeD_A4470     TRUE 0.951 14.000 0.000 NA Y NA
 7299496 7299497 SeD_A4470 SeD_A4471     FALSE 0.191 129.000 0.000 1.000 N NA
 7299497 7299498 SeD_A4471 SeD_A4473     FALSE 0.143 128.000 0.000 NA   NA
 7299499 7299500 SeD_A4472 SeD_A4474     TRUE 0.997 -6.000 0.818 1.000 Y NA
 7299500 7299501 SeD_A4474 SeD_A4475     TRUE 0.999 0.000 0.788 0.035 Y NA
 7299501 7299502 SeD_A4475 SeD_A4476     TRUE 0.997 8.000 0.844 NA Y NA
 7299502 7299503 SeD_A4476 SeD_A4477     TRUE 0.886 29.000 0.000 NA Y NA
 7299503 7299504 SeD_A4477 SeD_A4478     FALSE 0.365 44.000 0.000 1.000   NA
 7299504 7299505 SeD_A4478 SeD_A4479     TRUE 0.725 10.000 0.007 1.000   NA
 7299506 7299507 SeD_A4480 SeD_A4481 tpiA   FALSE 0.228 113.000 0.058 NA   NA
 7299509 7299510 SeD_A4483 SeD_A4484   glpX FALSE 0.429 97.000 0.117 1.000 N NA
 7299510 7299511 SeD_A4484 SeD_A4485 glpX glpK FALSE 0.190 112.000 0.025 1.000 N NA
 7299511 7299512 SeD_A4485 SeD_A4486 glpK glpF TRUE 0.628 21.000 0.000 1.000 N NA
 7299514 7299515 SeD_A4488 SeD_A4489   rraA TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299515 7299516 SeD_A4489 SeD_A4490 rraA menA TRUE 0.805 93.000 0.158 NA Y NA
 7299516 7299517 SeD_A4490 SeD_A4491 menA hslU FALSE 0.309 67.000 0.051 1.000 N NA
 7299517 7299518 SeD_A4491 SeD_A4492 hslU hslV TRUE 0.997 10.000 0.752 1.000 Y NA
 7299518 7299519 SeD_A4492 SeD_A4493 hslV ftsN FALSE 0.399 92.000 0.122 NA N NA
 7299519 7299520 SeD_A4493 SeD_A4494 ftsN cytR TRUE 0.579 94.000 0.245 NA N NA
 7299520 7299521 SeD_A4494 SeD_A4495 cytR   FALSE 0.089 155.000 0.013 1.000 N NA
 7299523 7299524 SeD_A4497 SeD_A4498     FALSE 0.035 201.000 0.000 NA   NA
 7299527 7299528 SeD_A4501 SeD_A4502 metB metL TRUE 0.996 3.000 0.428 1.000 Y NA
 7299529 7299530 SeD_A4503 SeD_A4504     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7299530 7299531 SeD_A4504 SeD_A4506     FALSE 0.018 235.000 0.000 NA   NA
 7299532 7299533 SeD_A4507 SeD_A4508   glyA FALSE 0.017 265.000 0.000 1.000 N NA
 7299535 7299536 SeD_A4509 SeD_A4511   metF FALSE 0.157 110.000 0.000 NA   NA
 7299536 7299537 SeD_A4511 SeD_A4512 metF katG FALSE 0.068 165.000 0.010 1.000 N NA
 7299538 7299539 SeD_A4513 SeD_A4514   gldA FALSE 0.013 259.000 0.000 NA   NA
 7299539 7299540 SeD_A4514 SeD_A4515 gldA fsaB TRUE 0.981 12.000 0.600 1.000 N NA
 7299540 7299541 SeD_A4515 SeD_A4516 fsaB   TRUE 0.993 11.000 0.400 1.000 Y NA
 7299542 7299543 SeD_A4517 SeD_A4518     TRUE 0.992 15.000 0.400 0.007 Y NA
 7299543 7299544 SeD_A4518 SeD_A4519   pflD TRUE 0.639 99.000 0.280 1.000 N NA
 7299544 7299545 SeD_A4519 SeD_A4520 pflD   TRUE 0.949 -34.000 0.312 0.002 N NA
 7299545 7299546 SeD_A4520 SeD_A4521     TRUE 0.955 2.000 0.156 1.000 N NA
 7299547 7299548 SeD_A4522 SeD_A4523     FALSE 0.234 161.000 0.130 1.000   NA
 7299548 7299549 SeD_A4523 SeD_A4524   ppc FALSE 0.037 211.000 0.000 1.000   NA
 7299549 7299550 SeD_A4524 SeD_A4525 ppc argE FALSE 0.008 369.000 0.053 1.000 N NA
 7299551 7299552 SeD_A4526 SeD_A4527 argC argB TRUE 0.986 11.000 0.097 0.001 Y NA
 7299552 7299553 SeD_A4527 SeD_A4528 argB argH TRUE 0.647 118.000 0.017 1.000 Y NA
 7299557 7299558 SeD_A4532 SeD_A4533     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7299560 7299561 SeD_A4536 SeD_A4537 btuB murI TRUE 0.709 14.000 0.025 1.000 N NA
 7299561 7299562 SeD_A4537 SeD_A4538 murI rrs FALSE 0.004 387.000 0.000 NA   NA
 7299562 7299563 SeD_A4538 SeD_A4539 rrs   FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 7299563 7299564 SeD_A4539 SeD_A4540     FALSE 0.158 109.000 0.000 NA   NA
 7299564 7299565 SeD_A4540 SeD_A4541     TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7299565 7299566 SeD_A4541 SeD_A4542   rrl FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7299566 7299567 SeD_A4542 SeD_A4544 rrl rrf FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7299567 7299568 SeD_A4544 SeD_A4545 rrf murB FALSE 0.050 182.000 0.000 NA   NA
 7299568 7299569 SeD_A4545 SeD_A4546 murB   TRUE 0.965 -3.000 0.211 1.000 N NA
 7299571 7299572 SeD_A4548 SeD_A4549     TRUE 0.768 8.000 0.000 NA   NA
 7299572 7299573 SeD_A4549 SeD_A4550     FALSE 0.154 117.000 0.000 NA   NA
 7299573 7299574 SeD_A4550 SeD_A4551     TRUE 0.777 6.000 0.000 NA   NA
 7299574 7299575 SeD_A4551 SeD_A4552   tuf1 FALSE 0.155 115.000 0.000 NA   NA
 7299575 7299576 SeD_A4552 SeD_A4553 tuf1 secE FALSE 0.018 230.000 0.002 1.000 N NA
 7299576 7299577 SeD_A4553 SeD_A4554 secE nusG TRUE 0.872 2.000 0.037 1.000 N NA
 7299577 7299578 SeD_A4554 SeD_A4555 nusG rplK TRUE 0.692 158.000 0.681 1.000 N NA
 7299578 7299579 SeD_A4555 SeD_A4556 rplK rplA TRUE 0.998 4.000 0.838 0.011 Y NA
 7299579 7299580 SeD_A4556 SeD_A4557 rplA rplJ FALSE 0.131 420.000 0.302 0.011 Y NA
 7299580 7299581 SeD_A4557 SeD_A4558 rplJ rplL TRUE 0.977 67.000 0.884 0.009 Y NA
 7299581 7299582 SeD_A4558 SeD_A4559 rplL   TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7299582 7299583 SeD_A4559 SeD_A4560   rpoB FALSE 0.014 252.000 0.000 NA   NA
 7299583 7299584 SeD_A4560 SeD_A4561 rpoB rpoC TRUE 0.919 77.000 0.851 0.000   NA
 7299584 7299585 SeD_A4561 SeD_A4562 rpoC   FALSE 0.164 83.000 0.000 NA   NA
 7299588 7299589 SeD_A4565 SeD_A4566 thiH thiG TRUE 0.996 -3.000 0.277 0.003 Y NA
 7299589 7299590 SeD_A4566 SeD_A4567 thiG thiS TRUE 0.968 -13.000 0.087 1.000 Y NA
 7299590 7299591 SeD_A4567 SeD_A4568 thiS thiF TRUE 0.991 -19.000 0.548 1.000 Y NA
 7299591 7299592 SeD_A4568 SeD_A4569 thiF thiE TRUE 0.988 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 7299592 7299593 SeD_A4569 SeD_A4570 thiE thiC TRUE 0.990 0.000 0.063 0.003 Y NA
 7299593 7299594 SeD_A4570 SeD_A4572 thiC   FALSE 0.006 364.000 0.000 1.000 N NA
 7299595 7299596 SeD_A4573 SeD_A4574 nudC hemE FALSE 0.438 41.000 0.040 1.000 N NA
 7299596 7299597 SeD_A4574 SeD_A4575 hemE nfi TRUE 0.802 10.000 0.028 1.000 N NA
 7299597 7299598 SeD_A4575 SeD_A4576 nfi   FALSE 0.516 42.000 0.086 NA   NA
 7299598 7299599 SeD_A4576 SeD_A4577   hupA FALSE 0.331 187.000 0.355 NA   NA
 7299599 7299600 SeD_A4577 SeD_A4578 hupA   TRUE 0.962 12.000 0.375 NA   NA
 7299602 7299603 SeD_A4580 SeD_A4581     TRUE 0.981 6.000 0.000 0.062 Y NA
 7299604 7299605 SeD_A4582 SeD_A4583 purD purH TRUE 0.981 16.000 0.238 1.000 Y NA
 7299605 7299606 SeD_A4583 SeD_A4584 purH   FALSE 0.006 326.000 0.000 NA   NA
 7299607 7299608 SeD_A4585 SeD_A4586 rrs   FALSE 0.163 86.000 0.000 NA   NA
 7299608 7299609 SeD_A4586 SeD_A4587   rrl FALSE 0.041 193.000 0.000 NA   NA
 7299609 7299610 SeD_A4587 SeD_A4589 rrl rrf FALSE 0.167 94.000 0.000 NA   NA
 7299612 7299613 SeD_A4591 SeD_A4592 metA aceB FALSE 0.016 266.000 0.000 1.000 N NA
 7299613 7299614 SeD_A4592 SeD_A4593 aceB aceA TRUE 0.931 32.000 0.129 1.000 Y NA
 7299614 7299615 SeD_A4593 SeD_A4594 aceA   TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7299615 7299616 SeD_A4594 SeD_A4595   aceK TRUE 0.572 -24.000 0.000 NA   NA
 7299617 7299618 SeD_A4596 SeD_A4597     TRUE 0.621 -16.000 0.000 NA   NA
 7299618 7299619 SeD_A4597 SeD_A4598     FALSE 0.149 124.000 0.000 NA   NA
 7299620 7299621 SeD_A4599 SeD_A4600 metH   FALSE 0.146 126.000 0.000 NA   NA
 7299621 7299622 SeD_A4600 SeD_A4601     FALSE 0.530 22.000 0.000 NA   NA
 7299624 7299625 SeD_A4603 SeD_A4604     FALSE 0.278 47.000 0.000 NA   NA
 7299626 7299627 SeD_A4605 SeD_A4606     FALSE 0.199 63.000 0.000 NA   NA
 7299627 7299628 SeD_A4606 SeD_A4607     TRUE 0.711 -13.000 0.000 1.000   NA
 7299628 7299629 SeD_A4607 SeD_A4608     TRUE 0.785 17.000 0.000 0.041   NA
 7299629 7299630 SeD_A4608 SeD_A4609     FALSE 0.512 24.000 0.000 NA   NA
 7299633 7299634 SeD_A4612 SeD_A4613     FALSE 0.508 -46.000 0.000 NA   NA
 7299636 7299637 SeD_A4615 SeD_A4616 pgi   FALSE 0.003 441.000 0.000 NA   NA
 7299637 7299638 SeD_A4616 SeD_A4617     TRUE 0.870 64.000 0.778 NA   NA
 7299638 7299639 SeD_A4617 SeD_A4618     TRUE 0.993 -3.000 1.000 NA   NA
 7299639 7299640 SeD_A4618 SeD_A4619     TRUE 0.944 0.000 0.140 NA   NA
 7299640 7299641 SeD_A4619 SeD_A4620     FALSE 0.112 143.000 0.000 NA   NA
 7299642 7299643 SeD_A4621 SeD_A4622 malG malF TRUE 0.996 15.000 0.814 0.035 Y NA
 7299643 7299644 SeD_A4622 SeD_A4623 malF malE TRUE 0.684 132.000 0.060 1.000 Y NA
 7299645 7299646 SeD_A4624 SeD_A4625 malK lamB TRUE 0.844 89.000 0.133 0.043 Y NA
 7299646 7299647 SeD_A4625 SeD_A4626 lamB malM FALSE 0.274 164.000 0.171 1.000   NA
 7299647 7299648 SeD_A4626 SeD_A4627 malM ubiC FALSE 0.045 181.000 0.025 NA   NA
 7299648 7299649 SeD_A4627 SeD_A4628 ubiC ubiA TRUE 0.983 14.000 0.248 NA Y NA
 7299651 7299652 SeD_A4630 SeD_A4631 dgkA lexA FALSE 0.448 109.000 0.141 1.000 N NA
 7299652 7299653 SeD_A4631 SeD_A4632 lexA   FALSE 0.075 179.000 0.033 1.000 N NA
 7299653 7299654 SeD_A4632 SeD_A4633     TRUE 0.609 -18.000 0.000 NA   NA
 7299654 7299655 SeD_A4633 SeD_A4634     TRUE 0.562 19.000 0.000 NA   NA
 7299657 7299658 SeD_A4636 SeD_A4637     FALSE 0.167 88.000 0.017 1.000   NA
 7299658 7299659 SeD_A4637 SeD_A4638   pspG FALSE 0.064 168.000 0.000 NA   NA
 7299661 7299662 SeD_A4640 SeD_A4641 dnaB alr TRUE 0.873 32.000 0.317 1.000 N NA
 7299664 7299665 SeD_A4643 SeD_A4644 tyrB aphA FALSE 0.054 187.000 0.026 1.000   NA
 7299665 7299666 SeD_A4644 SeD_A4645 aphA   FALSE 0.092 129.000 0.009 NA   NA
 7299666 7299667 SeD_A4645 SeD_A4646     TRUE 0.758 3.000 0.018 NA   NA
 7299668 7299669 SeD_A4647 SeD_A4648     TRUE 0.985 -13.000 1.000 NA   NA
 7299669 7299670 SeD_A4648 SeD_A4649   uvrA FALSE 0.063 144.000 0.003 NA   NA
 7299671 7299672 SeD_A4650 SeD_A4651 ssb   FALSE 0.003 391.000 0.000 NA   NA
 7299672 7299673 SeD_A4651 SeD_A4652     FALSE 0.002 510.000 0.000 NA   NA
 7299673 7299674 SeD_A4652 SeD_A4653     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299674 7299675 SeD_A4653 SeD_A4654     FALSE 0.009 383.000 0.091 NA   NA
 7299675 7299676 SeD_A4654 SeD_A4655     TRUE 0.963 24.000 0.667 1.000   NA
 7299676 7299677 SeD_A4655 SeD_A4656     TRUE 0.772 17.000 0.000 0.068   NA
 7299677 7299678 SeD_A4656 SeD_A4657     FALSE 0.402 40.000 0.000 1.000   NA
 7299682 7299683 SeD_A4661 SeD_A4662 soxR   FALSE 0.008 293.000 0.028 NA N NA
 7299683 7299684 SeD_A4662 SeD_A4663     FALSE 0.005 348.000 0.000 NA   NA
 7299684 7299685 SeD_A4663 SeD_A4664     FALSE 0.428 105.000 0.130 1.000   NA
 7299687 7299688 SeD_A4665 SeD_A4667     TRUE 0.989 -7.000 0.840 1.000   NA
 7299689 7299690 SeD_A4668 SeD_A4669 actP   TRUE 0.991 -3.000 0.733 NA   NA
 7299690 7299691 SeD_A4669 SeD_A4670   acsA FALSE 0.060 240.000 0.147 NA   NA
 7299692 7299693 SeD_A4671 SeD_A4672 nrfA nrfB FALSE 0.385 112.000 0.000 0.001   NA
 7299693 7299694 SeD_A4672 SeD_A4673 nrfB nrfC TRUE 0.935 -3.000 0.000 0.001   NA
 7299694 7299695 SeD_A4673 SeD_A4674 nrfC nrfD TRUE 0.996 -3.000 0.927 0.001 N NA
 7299695 7299696 SeD_A4674 SeD_A4675 nrfD ccmF TRUE 0.972 -7.000 0.400 1.000 N NA
 7299696 7299697 SeD_A4675 SeD_A4676 ccmF   TRUE 0.987 -3.000 0.107 1.000 Y NA
 7299697 7299698 SeD_A4676 SeD_A4677   gltP FALSE 0.008 345.000 0.000 1.000 N NA
 7299699 7299700 SeD_A4678 SeD_A4679   fdhA FALSE 0.056 177.000 0.000 NA   NA
 7299700 7299701 SeD_A4679 SeD_A4680 fdhA   FALSE 0.264 49.000 0.000 NA   NA
 7299701 7299702 SeD_A4680 SeD_A4681     FALSE 0.004 366.000 0.000 NA   NA
 7299702 7299703 SeD_A4681 SeD_A4682     FALSE 0.019 258.000 0.000 1.000 N NA
 7299703 7299704 SeD_A4682 SeD_A4683     FALSE 0.090 152.000 0.000 NA   NA
 7299704 7299705 SeD_A4683 SeD_A4684   phnA FALSE 0.107 120.000 0.013 NA   NA
 7299707 7299708 SeD_A4686 SeD_A4687     TRUE 0.990 1.000 0.143 1.000 Y NA
 7299708 7299709 SeD_A4687 SeD_A4688     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299709 7299710 SeD_A4688 SeD_A4689     FALSE 0.010 275.000 0.000 NA   NA
 7299710 7299711 SeD_A4689 SeD_A4690     FALSE 0.407 140.000 0.167 1.000 N NA
 7299711 7299712 SeD_A4690 SeD_A4691   adiA FALSE 0.009 328.000 0.000 1.000 N NA
 7299712 7299713 SeD_A4691 SeD_A4692 adiA   FALSE 0.028 230.000 0.000 1.000 N NA
 7299714 7299715 SeD_A4693 SeD_A4694     TRUE 0.851 84.000 0.214 1.000 Y NA
 7299716 7299717 SeD_A4695 SeD_A4696 fumB dcuB FALSE 0.184 96.000 0.022 1.000   NA
 7299717 7299718 SeD_A4696 SeD_A4697 dcuB   FALSE 0.101 147.000 0.000 NA   NA
 7299718 7299719 SeD_A4697 SeD_A4698     FALSE 0.003 410.000 0.000 NA   NA
 7299719 7299720 SeD_A4698 SeD_A4699     TRUE 0.989 -3.000 0.086 0.059 Y NA
 7299721 7299722 SeD_A4700 SeD_A4701   dmsB TRUE 0.991 14.000 0.500 NA Y NA
 7299722 7299723 SeD_A4701 SeD_A4702 dmsB dmsC TRUE 0.987 -7.000 0.800 NA   NA
 7299723 7299724 SeD_A4702 SeD_A4703 dmsC   FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7299726 7299727 SeD_A4705 SeD_A4706     FALSE 0.028 210.000 0.000 NA   NA
 7299728 7299729 SeD_A4707 SeD_A4708     FALSE 0.165 89.000 0.000 NA   NA
 7299729 7299730 SeD_A4708 SeD_A4709     FALSE 0.172 77.000 0.000 NA   NA
 7299730 7299731 SeD_A4709 SeD_A4710     TRUE 0.858 12.000 0.000 0.015   NA
 7299731 7299732 SeD_A4710 SeD_A4711     FALSE 0.012 264.000 0.000 NA   NA
 7299733 7299734 SeD_A4712 SeD_A4713     TRUE 0.849 -3.000 0.000 1.000   NA
 7299735 7299736 SeD_A4714 SeD_A4715     FALSE 0.310 43.000 0.000 NA   NA
 7299738 7299739 SeD_A4717 SeD_A4718     FALSE 0.155 115.000 0.000 NA   NA
 7299739 7299740 SeD_A4718 SeD_A4719   dipZ TRUE 0.783 37.000 0.217 1.000   NA
 7299740 7299741 SeD_A4719 SeD_A4720 dipZ cutA TRUE 0.804 -24.000 0.092 1.000 N NA
 7299741 7299742 SeD_A4720 SeD_A4721 cutA dcuA FALSE 0.171 121.000 0.024 1.000   NA
 7299742 7299743 SeD_A4721 SeD_A4722 dcuA aspA FALSE 0.518 115.000 0.195 1.000   NA
 7299743 7299744 SeD_A4722 SeD_A4723 aspA   FALSE 0.387 33.000 0.000 NA   NA
 7299747 7299748 SeD_A4726 SeD_A4727 groES groEL TRUE 0.980 44.000 0.631 0.061 Y NA
 7299748 7299749 SeD_A4727 SeD_A4728 groEL   FALSE 0.027 244.000 0.062 NA   NA
 7299750 7299751 SeD_A4729 SeD_A4730     FALSE 0.009 282.000 0.000 NA   NA
 7299752 7299753 SeD_A4731 SeD_A4732 efp   TRUE 0.630 19.000 0.000 1.000   NA
 7299755 7299756 SeD_A4734 SeD_A4735     FALSE 0.271 48.000 0.000 NA   NA
 7299757 7299758 SeD_A4736 SeD_A4737     FALSE 0.207 112.000 0.031 1.000 N NA
 7299758 7299759 SeD_A4737 SeD_A4738   frdC TRUE 0.998 11.000 0.787 0.002 Y NA
 7299759 7299760 SeD_A4738 SeD_A4739 frdC frdB TRUE 0.996 11.000 0.454 0.002 Y NA
 7299760 7299761 SeD_A4739 SeD_A4740 frdB frdA TRUE 0.996 -7.000 0.470 0.002 Y NA
 7299762 7299763 SeD_A4741 SeD_A4742     FALSE 0.015 247.000 0.009 1.000 N NA
 7299763 7299764 SeD_A4742 SeD_A4743     FALSE 0.244 52.000 0.000 NA   NA
 7299765 7299766 SeD_A4744 SeD_A4745   psd TRUE 0.853 19.000 0.148 1.000 N NA
 7299766 7299767 SeD_A4745 SeD_A4746 psd rsgA FALSE 0.374 92.000 0.095 1.000   NA
 7299770 7299771 SeD_A4749 SeD_A4750     FALSE 0.079 157.000 0.000 NA   NA
 7299771 7299772 SeD_A4750 SeD_A4751     FALSE 0.079 157.000 0.000 NA   NA
 7299774 7299775 SeD_A4752 SeD_A4754     TRUE 0.800 -25.000 0.118 NA   NA
 7299775 7299776 SeD_A4754 SeD_A4755     TRUE 0.805 17.000 0.109 NA   NA
 7299776 7299777 SeD_A4755 SeD_A4756   mutL TRUE 0.902 10.000 0.092 1.000 N NA
 7299777 7299778 SeD_A4756 SeD_A4757 mutL miaA TRUE 0.955 -7.000 0.188 0.061 N NA
 7299778 7299779 SeD_A4757 SeD_A4758 miaA hfq TRUE 0.783 83.000 0.531 1.000   NA
 7299779 7299780 SeD_A4758 SeD_A4759 hfq hflX FALSE 0.477 72.000 0.141 1.000   NA
 7299780 7299781 SeD_A4759 SeD_A4760 hflX hflK FALSE 0.172 215.000 0.184 0.058   NA
 7299781 7299782 SeD_A4760 SeD_A4761 hflK hflC TRUE 0.999 3.000 0.947 0.008 Y NA
 7299782 7299783 SeD_A4761 SeD_A4762 hflC   TRUE 0.669 79.000 0.348 NA   NA
 7299783 7299784 SeD_A4762 SeD_A4763   purA FALSE 0.215 103.000 0.051 NA   NA
 7299784 7299785 SeD_A4763 SeD_A4764 purA nsrR FALSE 0.080 144.000 0.010 NA N NA
 7299785 7299786 SeD_A4764 SeD_A4765 nsrR rnr TRUE 0.848 38.000 0.038 NA Y NA
 7299786 7299787 SeD_A4765 SeD_A4766 rnr   TRUE 0.584 91.000 0.147 0.011 N NA
 7299787 7299788 SeD_A4766 SeD_A4767     FALSE 0.077 133.000 0.002 NA   NA
 7299788 7299789 SeD_A4767 SeD_A4768     TRUE 0.983 15.000 0.911 NA   NA
 7299789 7299790 SeD_A4768 SeD_A4769     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7299790 7299791 SeD_A4769 SeD_A4770     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299791 7299792 SeD_A4770 SeD_A4771     TRUE 0.938 18.000 0.379 NA   NA
 7299792 7299793 SeD_A4771 SeD_A4772     TRUE 0.977 10.000 0.470 NA   NA
 7299793 7299794 SeD_A4772 SeD_A4773     TRUE 0.852 3.000 0.049 NA   NA
 7299794 7299795 SeD_A4773 SeD_A4774     FALSE 0.414 85.000 0.133 NA N NA
 7299796 7299797 SeD_A4775 SeD_A4776     TRUE 0.751 131.000 0.588 NA   NA
 7299799 7299800 SeD_A4778 SeD_A4779     FALSE 0.311 105.000 0.071 1.000   NA
 7299801 7299802 SeD_A4780 SeD_A4781 ulaA ulaB TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7299802 7299803 SeD_A4781 SeD_A4782 ulaB ulaC TRUE 0.750 10.000 0.000 NA   NA
 7299803 7299804 SeD_A4782 SeD_A4783 ulaC ulaD TRUE 0.988 14.000 0.328 1.000 Y NA
 7299804 7299805 SeD_A4783 SeD_A4784 ulaD ulaE TRUE 0.990 10.000 0.250 1.000 Y NA
 7299805 7299806 SeD_A4784 SeD_A4785 ulaE sgaE TRUE 0.992 0.000 0.200 1.000 Y NA
 7299808 7299809 SeD_A4787 SeD_A4788 rpsF priB TRUE 0.929 7.000 0.122 1.000 N NA
 7299809 7299810 SeD_A4788 SeD_A4789 priB rpsR TRUE 0.936 5.000 0.128 1.000 N NA
 7299810 7299811 SeD_A4789 SeD_A4790 rpsR rplI TRUE 0.976 42.000 0.499 0.008 Y NA
 7299811 7299812 SeD_A4790 SeD_A4791 rplI   FALSE 0.096 148.000 0.006 1.000 N NA
 7299814 7299815 SeD_A4793 SeD_A4794     FALSE 0.011 296.000 0.000 1.000 N NA
 7299815 7299816 SeD_A4794 SeD_A4795     FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 7299816 7299817 SeD_A4795 SeD_A4796     TRUE 0.984 15.000 1.000 NA   NA
 7299818 7299819 SeD_A4797 SeD_A4798     FALSE 0.180 103.000 0.039 NA   NA
 7299819 7299820 SeD_A4798 SeD_A4799     FALSE 0.204 81.000 0.031 1.000   NA
 7299826 7299827 SeD_A4805 SeD_A4806   msrA FALSE 0.057 183.000 0.042 NA   NA
 7299828 7299829 SeD_A4807 SeD_A4808     FALSE 0.317 42.000 0.000 NA   NA
 7299829 7299830 SeD_A4808 SeD_A4809     TRUE 0.987 -3.000 0.575 NA   NA
 7299830 7299831 SeD_A4809 SeD_A4810     TRUE 0.947 3.000 0.167 NA   NA
 7299832 7299833 SeD_A4811 SeD_A4812     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299833 7299834 SeD_A4812 SeD_A4813   ppa FALSE 0.004 410.000 0.000 1.000   NA
 7299834 7299835 SeD_A4813 SeD_A4814 ppa fbp FALSE 0.034 227.000 0.043 1.000 N NA
 7299835 7299836 SeD_A4814 SeD_A4815 fbp   TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299839 7299840 SeD_A4818 SeD_A4819 pmbA   FALSE 0.157 99.000 0.028 NA   NA
 7299840 7299841 SeD_A4819 SeD_A4820     FALSE 0.012 287.000 0.000 1.000   NA
 7299841 7299842 SeD_A4820 SeD_A4821     TRUE 0.987 11.000 0.821 NA   NA
 7299842 7299843 SeD_A4821 SeD_A4822     TRUE 0.994 0.000 0.893 NA   NA
 7299843 7299844 SeD_A4822 SeD_A4823     TRUE 0.973 23.000 0.897 NA   NA
 7299844 7299845 SeD_A4823 SeD_A4824     TRUE 0.988 12.000 0.966 NA   NA
 7299845 7299846 SeD_A4824 SeD_A4825     TRUE 0.790 59.000 0.475 NA   NA
 7299846 7299847 SeD_A4825 SeD_A4826     TRUE 0.979 -16.000 0.750 1.000   NA
 7299847 7299848 SeD_A4826 SeD_A4827     TRUE 0.990 -3.000 0.679 NA   NA
 7299848 7299849 SeD_A4827 SeD_A4828     TRUE 0.888 17.000 0.208 NA   NA
 7299849 7299850 SeD_A4828 SeD_A4829     FALSE 0.493 78.000 0.172 NA N NA
 7299850 7299851 SeD_A4829 SeD_A4830     TRUE 0.986 -10.000 0.875 NA N NA
 7299852 7299853 SeD_A4831 SeD_A4832 nrdG nrdD FALSE 0.290 217.000 0.464 1.000 N NA
 7299855 7299856 SeD_A4834 SeD_A4835 treC treB TRUE 0.969 50.000 0.650 1.000 Y NA
 7299856 7299857 SeD_A4835 SeD_A4837 treB treR FALSE 0.424 138.000 0.168 1.000 N NA
 7299858 7299859 SeD_A4836 SeD_A4838   mgtA FALSE 0.029 209.000 0.000 NA   NA
 7299860 7299861 SeD_A4839 SeD_A4840     FALSE 0.253 75.000 0.057 NA   NA
 7299861 7299862 SeD_A4840 SeD_A4841   pyrI FALSE 0.334 77.000 0.084 NA N NA
 7299862 7299863 SeD_A4841 SeD_A4842 pyrI pyrB TRUE 0.989 13.000 0.197 0.001 Y NA
 7299863 7299864 SeD_A4842 SeD_A4843 pyrB pyrL FALSE 0.362 36.000 0.000 NA   NA
 7299864 7299865 SeD_A4843 SeD_A4844 pyrL   FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7299865 7299866 SeD_A4844 SeD_A4845     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7299866 7299867 SeD_A4845 SeD_A4846     FALSE 0.177 74.000 0.000 NA   NA
 7299867 7299868 SeD_A4846 SeD_A4847   argF TRUE 0.636 56.000 0.222 NA   NA
 7299868 7299869 SeD_A4847 SeD_A4848 argF   TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7299869 7299870 SeD_A4848 SeD_A4849   arcC TRUE 0.565 -25.000 0.000 NA   NA
 7299870 7299871 SeD_A4849 SeD_A4850 arcC arcA TRUE 0.996 11.000 0.750 1.000 Y NA
 7299872 7299873 SeD_A4851 SeD_A4852     FALSE 0.004 384.000 0.000 NA   NA
 7299875 7299876 SeD_A4854 SeD_A4855     TRUE 0.828 12.000 0.078 NA   NA
 7299877 7299878 SeD_A4856 SeD_A4857     FALSE 0.168 79.000 0.000 NA   NA
 7299878 7299879 SeD_A4857 SeD_A4858     FALSE 0.159 107.000 0.000 NA   NA
 7299881 7299882 SeD_A4861 SeD_A4862 valS holC TRUE 0.935 0.000 0.089 1.000 N NA
 7299882 7299883 SeD_A4862 SeD_A4863 holC pepA TRUE 0.771 98.000 0.494 1.000 N NA
 7299884 7299885 SeD_A4864 SeD_A4865     TRUE 0.993 0.000 0.631 0.058   NA
 7299886 7299887 SeD_A4866 SeD_A4867     TRUE 0.603 64.000 0.200 1.000 N NA
 7299887 7299888 SeD_A4867 SeD_A4868     TRUE 0.884 -10.000 0.111 1.000 N NA
 7299888 7299889 SeD_A4868 SeD_A4869     TRUE 0.938 25.000 0.444 1.000 N NA
 7299892 7299893 SeD_A4872 SeD_A4873     FALSE 0.002 494.000 0.000 NA   NA
 7299893 7299894 SeD_A4873 SeD_A4874     FALSE 0.172 77.000 0.000 NA   NA
 7299894 7299895 SeD_A4874 SeD_A4875     FALSE 0.158 109.000 0.000 NA   NA
 7299895 7299896 SeD_A4875 SeD_A4876     TRUE 0.990 3.000 0.667 NA   NA
 7299897 7299898 SeD_A4877 SeD_A4878     FALSE 0.008 293.000 0.000 NA   NA
 7299898 7299899 SeD_A4878 SeD_A4879     FALSE 0.004 368.000 0.000 NA   NA
 10195456 7299900 SeD_A5014 SeD_A4880     FALSE 0.498 -220.000 0.000 NA   NA
 7299900 7299901 SeD_A4880 SeD_A4881     FALSE 0.030 208.000 0.000 NA   NA
 7299901 7299902 SeD_A4881 SeD_A4882     TRUE 0.942 17.000 0.000 1.000 Y NA
 7299902 10195457 SeD_A4882 SeD_A5016     TRUE 0.754 -9.000 0.000 1.000   NA
 10195457 7299903 SeD_A5016 SeD_A4883     FALSE 0.499 -151.000 0.000 NA   NA
 7299905 7299906 SeD_A4885 SeD_A4886     TRUE 0.696 -15.000 0.000 1.000   NA
 7299906 7299907 SeD_A4886 SeD_A4887     TRUE 0.592 -21.000 0.000 NA   NA
 7299907 7299908 SeD_A4887 SeD_A4888     FALSE 0.150 123.000 0.000 NA   NA
 7299908 7299909 SeD_A4888 SeD_A4889     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7299911 7299912 SeD_A4891 SeD_A4892     FALSE 0.012 263.000 0.000 NA   NA
 7299914 7299915 SeD_A4894 SeD_A4895     FALSE 0.002 469.000 0.000 NA   NA
 7299915 7299916 SeD_A4895 SeD_A4896     TRUE 0.819 1.000 0.000 NA   NA
 7299919 7299920 SeD_A4899 SeD_A4900     TRUE 0.724 11.000 0.000 NA   NA
 7299920 7299921 SeD_A4900 SeD_A4901     FALSE 0.007 305.000 0.000 NA   NA
 7299922 7299923 SeD_A4902 SeD_A4903     FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 7299923 7299924 SeD_A4903 SeD_A4904     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7299924 7299925 SeD_A4904 SeD_A4905     FALSE 0.204 61.000 0.000 NA   NA
 7299925 7299926 SeD_A4905 SeD_A4906     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7299930 7299931 SeD_A4910 SeD_A4911     FALSE 0.005 353.000 0.000 NA   NA
 7299934 7299935 SeD_A4914 SeD_A4915   iadA FALSE 0.217 119.000 0.037 1.000 N NA
 7299935 7299936 SeD_A4915 SeD_A4916 iadA   TRUE 0.721 13.000 0.028 1.000   NA
 7299936 7299937 SeD_A4916 SeD_A4917     TRUE 0.926 -3.000 0.019 0.001   NA
 7299937 7299938 SeD_A4917 SeD_A4918     FALSE 0.001 873.000 0.000 NA   NA
 7299938 7299939 SeD_A4918 SeD_A4919     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 7299939 7299940 SeD_A4919 SeD_A4920     FALSE 0.164 87.000 0.000 NA   NA
 7299940 7299941 SeD_A4920 SeD_A4921     FALSE 0.221 57.000 0.000 NA   NA
 7299942 7299943 SeD_A4922 SeD_A4923     FALSE 0.181 72.000 0.000 NA   NA
 7299943 7299944 SeD_A4923 SeD_A4924     TRUE 0.633 -15.000 0.000 NA   NA
 7299946 7299947 SeD_A4926 SeD_A4927     FALSE 0.032 205.000 0.000 NA   NA
 7299948 7299949 SeD_A4928 SeD_A4929     FALSE 0.068 164.000 0.000 NA   NA
 7299949 7299950 SeD_A4929 SeD_A4930     FALSE 0.168 95.000 0.000 NA   NA
 7299950 7299951 SeD_A4930 SeD_A4931     FALSE 0.002 488.000 0.000 NA   NA
 7299951 7299952 SeD_A4931 SeD_A4932     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 7299952 7299953 SeD_A4932 SeD_A4933     TRUE 0.635 15.000 0.000 NA   NA
 7299953 7299954 SeD_A4933 SeD_A4934     FALSE 0.550 -28.000 0.000 NA   NA
 7299956 7299957 SeD_A4936 SeD_A4937     TRUE 0.784 5.000 0.000 NA   NA
 7299957 7299958 SeD_A4937 SeD_A4939     FALSE 0.003 847.000 0.000 0.035   NA
 7299959 7299960 SeD_A4938 SeD_A4940     FALSE 0.128 136.000 0.000 NA   NA
 7299960 7299961 SeD_A4940 SeD_A4941     FALSE 0.252 51.000 0.000 NA   NA
 7299961 7299962 SeD_A4941 SeD_A4942     TRUE 0.976 -13.000 0.654 NA   NA
 7299963 7299964 SeD_A4943 SeD_A4944     TRUE 0.937 11.000 0.212 NA   NA
 7299964 7299965 SeD_A4944 SeD_A4945     TRUE 0.772 95.000 0.531 NA   NA
 7299968 7299969 SeD_A4948 SeD_A4949     TRUE 0.876 102.000 0.667 0.010 N NA
 7299969 7299970 SeD_A4949 SeD_A4950     TRUE 0.982 15.000 0.143 0.006 Y NA
 7299970 7299971 SeD_A4950 SeD_A4951     TRUE 0.993 26.000 0.800 0.010 Y NA
 7299971 7299972 SeD_A4951 SeD_A4952     TRUE 0.958 -22.000 0.000 0.010 Y NA
 7299972 7299973 SeD_A4952 SeD_A4953     TRUE 0.867 13.000 0.100 1.000   NA
 7299973 7299974 SeD_A4953 SeD_A4954     TRUE 0.917 18.000 0.167 0.003   NA
 7299975 7299976 SeD_A4955 SeD_A4956     FALSE 0.009 283.000 0.000 NA   NA
 7299976 7299977 SeD_A4956 SeD_A4957     TRUE 0.745 58.000 0.368 NA   NA
 7299977 7299978 SeD_A4957 SeD_A4958     TRUE 0.991 3.000 0.778 NA   NA
 7299978 7299979 SeD_A4958 SeD_A4959     FALSE 0.207 93.000 0.046 NA   NA
 7299979 7299980 SeD_A4959 SeD_A4960     TRUE 0.983 -9.000 0.704 NA   NA
 7299980 7299981 SeD_A4960 SeD_A4961     TRUE 0.657 14.000 0.000 NA   NA
 7299983 7299984 SeD_A4963 SeD_A4964     FALSE 0.075 159.000 0.000 NA   NA
 7299984 7299985 SeD_A4964 SeD_A4965     FALSE 0.334 121.000 0.108 NA   NA
 7299987 7299988 SeD_A4967 SeD_A4968     FALSE 0.413 31.000 0.000 NA   NA
 7299988 7299989 SeD_A4968 SeD_A4969     FALSE 0.468 27.000 0.000 NA   NA
 7299989 7299990 SeD_A4969 SeD_A4970   rsmC FALSE 0.043 190.000 0.000 NA   NA
 7299991 7299992 SeD_A4971 SeD_A4972 holD rimI FALSE 0.425 95.000 0.121 1.000   NA
 7299992 7299993 SeD_A4972 SeD_A4973 rimI yjjG FALSE 0.540 22.000 0.018 1.000   NA
 7299993 7299994 SeD_A4973 SeD_A4974 yjjG prfC FALSE 0.159 92.000 0.012 1.000   NA
 7299994 7299995 SeD_A4974 SeD_A4975 prfC   FALSE 0.041 192.000 0.000 NA   NA
 7299995 7299996 SeD_A4975 SeD_A4976   osmY FALSE 0.174 76.000 0.000 NA   NA
 7299996 7299997 SeD_A4976 SeD_A4977 osmY   FALSE 0.146 129.000 0.035 NA   NA
 7299997 7299998 SeD_A4977 SeD_A4978     FALSE 0.519 103.000 0.211 NA   NA
 7299998 7299999 SeD_A4978 SeD_A4979     TRUE 0.869 -3.000 0.057 NA   NA
 7300000 7300001 SeD_A4980 SeD_A4981     TRUE 0.973 -28.000 0.810 NA   NA
 7300002 7300003 SeD_A4982 SeD_A4983 deoC deoA TRUE 0.866 124.000 0.286 1.000 Y NA
 7300003 7300004 SeD_A4983 SeD_A4984 deoA deoB TRUE 0.810 52.000 0.398 1.000 N NA
 7300004 7300005 SeD_A4984 SeD_A4985 deoB deoD FALSE 0.293 210.000 0.414 1.000 N NA
 7300005 7300006 SeD_A4985 SeD_A4986 deoD   FALSE 0.002 548.000 0.041 NA   NA
 7300007 7300008 SeD_A4987 SeD_A4989 lplA   FALSE 0.519 34.000 0.066 NA   NA
 7300009 7300010 SeD_A4988 SeD_A4990   serB TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7300010 7300011 SeD_A4990 SeD_A4991 serB radA FALSE 0.198 84.000 0.024 1.000 N NA
 7300011 7300012 SeD_A4991 SeD_A4992 radA   FALSE 0.108 151.000 0.021 1.000 N NA
 7300014 7300015 SeD_A4994 SeD_A4995   trpR TRUE 0.588 58.000 0.167 1.000 N NA
 7300019 7300020 SeD_A4999 SeD_A5000     TRUE 0.696 13.000 0.038 NA   NA
 7300020 7300021 SeD_A5000 SeD_A5001     TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 7300021 7300022 SeD_A5001 SeD_A5002     FALSE 0.215 58.000 0.000 NA   NA
 7300023 7300024 SeD_A5004 SeD_A5005     TRUE 0.583 41.000 0.000 0.007   NA
 7300024 7300025 SeD_A5005 SeD_A5006     TRUE 0.993 18.000 0.750 1.000 Y NA
 7300025 7300026 SeD_A5006 SeD_A5007     TRUE 0.911 154.000 0.750 1.000 Y NA
 7300026 7300027 SeD_A5007 SeD_A5008     TRUE 0.970 71.000 1.000 1.000 Y NA
 7300027 7300028 SeD_A5008 SeD_A5009     FALSE 0.006 339.000 0.000 NA   NA
 7300030 7300031 SeD_A5011 SeD_A5012   arcA FALSE 0.011 267.000 0.000 NA   NA
 7300032 7295079 SeD_A5013 SeD_A0002   thrA FALSE 0.007 361.000 0.000 1.000 N NA
 7294957 7294958 SeD_B0001 SeD_B0002     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7294959 7294960 SeD_B0003 SeD_B0004     FALSE 0.221 57.000 0.000 NA   NA
 7294960 7294961 SeD_B0004 SeD_B0005     TRUE 0.650 -13.000 0.000 NA   NA
 7294961 7294962 SeD_B0005 SeD_B0006     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7294962 7294963 SeD_B0006 SeD_B0007     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7294966 7294967 SeD_B0010 SeD_B0011     FALSE 0.043 207.000 0.000 1.000 N NA
 7294967 7294968 SeD_B0011 SeD_B0013     TRUE 0.964 -16.000 0.364 0.035   NA
 7294968 7294969 SeD_B0013 SeD_B0014     TRUE 0.927 -10.000 0.200 1.000   NA
 7294970 7294971 SeD_B0015 SeD_B0016     FALSE 0.030 208.000 0.000 NA   NA
 7294974 7294975 SeD_B0019 SeD_B0020     FALSE 0.058 174.000 0.000 NA   NA
 7294975 7294976 SeD_B0020 SeD_B0021     FALSE 0.508 -46.000 0.000 NA   NA
 7294976 7294977 SeD_B0021 SeD_B0022     FALSE 0.244 52.000 0.000 NA   NA
 7294979 7294980 SeD_B0024 SeD_B0025     FALSE 0.235 54.000 0.000 NA   NA
 7294980 7294981 SeD_B0025 SeD_B0026     FALSE 0.164 88.000 0.000 NA   NA
 7294984 7294985 SeD_B0029 SeD_B0030     FALSE 0.512 24.000 0.000 NA   NA
 7294985 7294986 SeD_B0030 SeD_B0031     TRUE 0.747 -6.000 0.000 NA   NA
 7294986 7294987 SeD_B0031 SeD_B0032     FALSE 0.498 25.000 0.000 NA   NA
 7294987 7294988 SeD_B0032 SeD_B0033     TRUE 0.762 9.000 0.000 NA   NA
 7294988 7294989 SeD_B0033 SeD_B0034     FALSE 0.369 35.000 0.000 NA   NA
 7294989 7294990 SeD_B0034 SeD_B0035     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7294990 7294991 SeD_B0035 SeD_B0036     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7294991 7294992 SeD_B0036 SeD_B0037     TRUE 0.990 2.000 0.667 NA   NA
 7294995 7294996 SeD_B0039 SeD_B0041     TRUE 0.723 -7.000 0.000 NA   NA
 7294999 7295000 SeD_B0044 SeD_B0045     FALSE 0.485 26.000 0.000 NA   NA
 7295000 7295001 SeD_B0045 SeD_B0046     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7295001 7295002 SeD_B0046 SeD_B0047     FALSE 0.065 167.000 0.000 NA   NA
 7295002 7295003 SeD_B0047 SeD_B0048     FALSE 0.179 73.000 0.000 NA   NA
 7295003 7295004 SeD_B0048 SeD_B0049     FALSE 0.147 125.000 0.000 NA   NA
 7295004 7295005 SeD_B0049 SeD_B0050     TRUE 0.825 0.000 0.000 NA   NA
 7295005 7295006 SeD_B0050 SeD_B0051     TRUE 0.650 -13.000 0.000 NA   NA
 7295006 7295007 SeD_B0051 SeD_B0052     TRUE 0.979 28.000 1.000 0.007   NA
 7295007 7295008 SeD_B0052 SeD_B0053     FALSE 0.049 236.000 0.000 0.007   NA
 7295009 7295010 SeD_B0054 SeD_B0055     FALSE 0.302 44.000 0.000 NA   NA
 7295010 7295011 SeD_B0055 SeD_B0056     FALSE 0.108 144.000 0.000 NA   NA
 7295011 7295012 SeD_B0056 SeD_B0057     FALSE 0.001 691.000 0.000 NA   NA
 7295012 7295013 SeD_B0057 SeD_B0058     FALSE 0.362 36.000 0.000 NA   NA
 7295013 7295014 SeD_B0058 SeD_B0059     FALSE 0.009 286.000 0.000 NA   NA
 7295014 7295015 SeD_B0059 SeD_B0061     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295015 7295016 SeD_B0061 SeD_B0062     FALSE 0.170 78.000 0.000 NA   NA
 7295018 7295019 SeD_B0064 SeD_B0065     TRUE 0.565 -25.000 0.000 NA   NA
 7295020 7295021 SeD_B0066 SeD_B0067     TRUE 0.697 12.000 0.000 NA   NA
 7295023 7295024 SeD_B0069 SeD_B0070     FALSE 0.170 78.000 0.000 NA   NA
 7295024 7295025 SeD_B0070 SeD_B0071     FALSE 0.136 132.000 0.000 NA   NA
 7295025 7295026 SeD_B0071 SeD_B0072     TRUE 0.591 17.000 0.000 NA   NA
 7295026 7295027 SeD_B0072 SeD_B0073     FALSE 0.026 214.000 0.000 NA   NA
 7295027 7295028 SeD_B0073 SeD_B0074     FALSE 0.529 -37.000 0.000 NA   NA
 7295028 7295029 SeD_B0074 SeD_B0075     FALSE 0.154 117.000 0.000 NA   NA
 7295029 7295030 SeD_B0075 SeD_B0076   traX TRUE 0.872 55.000 0.667 NA   NA
 7295030 7295031 SeD_B0076 SeD_B0077 traX traI TRUE 0.920 20.000 0.333 NA   NA
 7295032 7295033 SeD_B0078 SeD_B0079     FALSE 0.002 651.000 0.000 NA   NA
 7295033 7295034 SeD_B0079 SeD_B0080     FALSE 0.172 77.000 0.000 NA   NA
 7295034 7295035 SeD_B0080 SeD_B0081     FALSE 0.160 106.000 0.000 NA   NA
 7295035 7295036 SeD_B0081 SeD_B0082     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7295037 7295038 SeD_B0083 SeD_B0084     FALSE 0.033 204.000 0.000 NA   NA
 7295038 7295039 SeD_B0084 SeD_B0085     FALSE 0.005 343.000 0.000 NA   NA
 7295039 7295040 SeD_B0085 SeD_B0086     TRUE 0.610 16.000 0.000 NA   NA
 7295040 7295041 SeD_B0086 SeD_B0087     TRUE 0.929 -3.000 0.120 NA   NA
 7295041 7295042 SeD_B0087 SeD_B0088     TRUE 0.887 5.000 0.080 NA   NA
 7295042 7295043 SeD_B0088 SeD_B0089     TRUE 0.796 4.000 0.000 NA   NA
 7295043 7295044 SeD_B0089 SeD_B0090     FALSE 0.072 161.000 0.000 NA   NA
 7295044 7295045 SeD_B0090 SeD_B0091     TRUE 0.972 -3.000 0.300 NA   NA
 7295045 7295046 SeD_B0091 SeD_B0092     TRUE 0.971 -3.000 0.286 NA   NA
 7295046 7295047 SeD_B0092 SeD_B0094     TRUE 0.809 3.000 0.000 NA   NA
 7295047 7295048 SeD_B0094 SeD_B0095     TRUE 0.816 2.000 0.000 NA   NA
 7295048 7295049 SeD_B0095 SeD_B0096     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA Y NA
 7295049 7295050 SeD_B0096 SeD_B0097     TRUE 0.998 5.000 0.833 NA Y NA
 7295050 7295051 SeD_B0097 SeD_B0098     FALSE 0.074 160.000 0.000 NA   NA
 7295051 7295052 SeD_B0098 SeD_B0099     FALSE 0.542 -31.000 0.000 NA   NA
 7295052 7295053 SeD_B0099 SeD_B0100     TRUE 0.979 10.000 0.500 NA   NA
 7295053 7295054 SeD_B0100 SeD_B0101     TRUE 0.981 1.000 0.400 NA   NA
 7295054 7295055 SeD_B0101 SeD_B0102     TRUE 0.981 11.000 0.600 NA   NA
 7295055 7295056 SeD_B0102 SeD_B0103     TRUE 0.787 142.000 0.800 NA   NA
 7295056 7295057 SeD_B0103 SeD_B0104     TRUE 0.943 -22.000 0.400 NA   NA
 7295057 7295058 SeD_B0104 SeD_B0105     TRUE 0.935 33.000 0.667 NA   NA
 7295058 7295059 SeD_B0105 SeD_B0106     FALSE 0.001 794.000 0.000 NA   NA
 7295059 7295060 SeD_B0106 SeD_B0107     TRUE 0.964 3.000 0.231 NA   NA
 7295061 7295062 SeD_B0108 SeD_B0109     TRUE 0.600 -19.000 0.000 NA   NA
 7295063 7295064 SeD_B0110 SeD_B0111     FALSE 0.310 43.000 0.000 NA   NA
 7295064 7295065 SeD_B0111 SeD_B0112     FALSE 0.167 93.000 0.000 NA   NA
 7295065 7295066 SeD_B0112 SeD_B0113     TRUE 0.680 -10.000 0.000 NA   NA
 7295066 7295067 SeD_B0113 SeD_B0114     FALSE 0.293 45.000 0.000 NA   NA
 7295067 7295068 SeD_B0114 SeD_B0115     FALSE 0.166 80.000 0.000 NA   NA
 7295068 7295069 SeD_B0115 SeD_B0116     TRUE 0.975 -10.000 0.571 NA   NA
 7295069 7295070 SeD_B0116 SeD_B0117     TRUE 0.808 -3.000 0.000 NA   NA
 7295070 7295071 SeD_B0117 SeD_B0118     FALSE 0.002 591.000 0.000 NA   NA
 7295071 7295072 SeD_B0118 SeD_B0119     FALSE 0.160 105.000 0.000 NA   NA
 7295073 7295074 SeD_B0120 SeD_B0121     FALSE 0.336 40.000 0.000 NA   NA
 7295074 7295075 SeD_B0121 SeD_B0122     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 7295076 7295077 SeD_B0123 SeD_B0124     FALSE 0.018 235.000 0.000 NA   NA
 7295077 7295078 SeD_B0124 SeD_B0125     TRUE 0.632 52.000 0.176 1.000   NA