MicrobesOnline Operon Predictions for Azorhizobium caulinodans ORS 571

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3726627 3726628 AZC_0001 AZC_0002     TRUE 0.989 -3.000 0.135 NA   NA
 3726628 3726629 AZC_0002 AZC_0003     TRUE 0.989 -3.000 0.169 NA N NA
 3726629 3726630 AZC_0003 AZC_0004     TRUE 0.958 5.000 0.078 1.000 N NA
 3726630 3726631 AZC_0004 AZC_0005     TRUE 0.967 4.000 0.092 1.000 N NA
 3726631 3726632 AZC_0005 AZC_0006     FALSE 0.072 90.000 0.000 1.000 N NA
 3726632 3726633 AZC_0006 AZC_0007     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3726633 3726634 AZC_0007 AZC_0008     FALSE 0.130 122.000 0.000 0.092 N NA
 3726634 3726635 AZC_0008 AZC_0009     TRUE 0.992 -3.000 0.220 1.000 N NA
 3726635 3726636 AZC_0009 AZC_0010     TRUE 0.852 59.000 0.457 NA   NA
 3726636 3726637 AZC_0010 AZC_0011     TRUE 0.918 22.000 0.222 NA   NA
 3726637 3726638 AZC_0011 AZC_0012     TRUE 0.947 14.000 0.213 NA   NA
 3726638 3726639 AZC_0012 AZC_0013     TRUE 0.542 99.000 0.231 1.000 N NA
 3726639 3726640 AZC_0013 AZC_0014     TRUE 0.464 89.000 0.113 1.000 N NA
 3726640 3726641 AZC_0014 AZC_0015     FALSE 0.327 193.000 0.112 1.000   NA
 3726641 3726642 AZC_0015 AZC_0016   lysR FALSE 0.094 98.000 0.000 1.000   NA
 3726642 3726643 AZC_0016 AZC_0017 lysR   FALSE 0.042 342.000 0.000 NA   NA
 3726643 3726644 AZC_0017 AZC_0018   nusA TRUE 0.997 0.000 0.759 NA   NA
 3726644 3726645 AZC_0018 AZC_0019 nusA   TRUE 0.951 22.000 0.075 NA Y NA
 3726645 3726646 AZC_0019 AZC_0020     TRUE 0.992 -3.000 0.223 NA N NA
 3726646 3726647 AZC_0020 AZC_0021     TRUE 0.827 232.000 0.530 1.000 Y NA
 3726647 3726648 AZC_0021 AZC_0022     TRUE 0.997 0.000 0.318 1.000 Y NA
 3726648 3726649 AZC_0022 AZC_0023     FALSE 0.192 33.000 0.000 NA N NA
 3726650 3726651 AZC_0024 AZC_0025     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 3726651 3726652 AZC_0025 AZC_0026     TRUE 0.722 219.000 0.281 NA Y NA
 3726652 3726653 AZC_0026 AZC_0027     FALSE 0.052 96.000 0.000 NA N NA
 3726654 3726655 AZC_0028 AZC_0029 marR   FALSE 0.050 114.000 0.000 1.000 N NA
 3726655 3726656 AZC_0029 AZC_0030     FALSE 0.128 46.000 0.000 NA N NA
 3726658 3726659 AZC_0032 AZC_0033     FALSE 0.058 102.000 0.000 1.000 N NA
 3726659 3726660 AZC_0033 AZC_0034     FALSE 0.152 39.000 0.000 NA N NA
 3726662 3726663 AZC_0036 AZC_0037     TRUE 0.995 -3.000 0.182 0.018 N NA
 3726663 3726664 AZC_0037 AZC_0038     TRUE 0.537 18.000 0.000 1.000   NA
 3726664 3726665 AZC_0038 AZC_0039   wcbD FALSE 0.064 160.000 0.000 1.000   NA
 3726665 3726666 AZC_0039 AZC_0040 wcbD   TRUE 0.997 -3.000 0.194 NA Y NA
 3726666 3726667 AZC_0040 AZC_0041   wcbD TRUE 0.995 -3.000 0.056 NA Y NA
 3726667 3726668 AZC_0041 AZC_0042 wcbD wzt TRUE 0.979 9.000 0.036 1.000 Y NA
 3726671 3726672 AZC_0045 AZC_0046     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3726673 3726674 AZC_0047 AZC_0048     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 3726674 3726675 AZC_0048 AZC_0049     FALSE 0.058 137.000 0.000 NA   NA
 3726676 3726677 AZC_0050 AZC_0051 wbpY   TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.018 Y NA
 3726677 3726678 AZC_0051 AZC_0052     FALSE 0.402 24.000 0.000 NA   NA
 3726678 3726679 AZC_0052 AZC_0053     FALSE 0.055 166.000 0.000 NA   NA
 3726679 3726680 AZC_0053 AZC_0054     TRUE 0.998 4.000 0.444 0.004 Y NA
 3726680 3726681 AZC_0054 AZC_0055     FALSE 0.052 267.000 0.000 1.000   NA
 3726681 3726682 AZC_0055 AZC_0056     FALSE 0.070 123.000 0.000 1.000   NA
 3726682 3726683 AZC_0056 AZC_0057     FALSE 0.068 93.000 0.000 1.000 N NA
 3726683 3726684 AZC_0057 AZC_0058     FALSE 0.061 175.000 0.000 1.000   NA
 3726684 3726685 AZC_0058 AZC_0059     TRUE 0.908 19.000 0.156 NA   NA
 3726686 3726687 AZC_0060 AZC_0061     FALSE 0.034 261.000 0.000 1.000 N NA
 3726687 3726688 AZC_0061 AZC_0062     TRUE 0.458 199.000 0.000 0.015 Y NA
 3726689 3726690 AZC_0063 AZC_0064     TRUE 0.740 333.000 0.335 1.000 Y NA
 3726690 3726691 AZC_0064 AZC_0065     FALSE 0.048 231.000 0.000 NA   NA
 3726691 3726692 AZC_0065 AZC_0066     TRUE 0.984 4.000 0.240 NA   NA
 3726692 3726693 AZC_0066 AZC_0067     TRUE 0.971 17.000 0.520 NA   NA
 3726693 3726694 AZC_0067 AZC_0068     TRUE 0.979 2.000 0.128 NA   NA
 3726694 3726695 AZC_0068 AZC_0069     TRUE 0.990 -3.000 0.139 1.000   NA
 3726695 3726696 AZC_0069 AZC_0070     TRUE 0.997 0.000 0.944 1.000   NA
 3726696 3726697 AZC_0070 AZC_0071     TRUE 0.997 0.000 0.623 0.091   NA
 3726697 3726698 AZC_0071 AZC_0072     TRUE 0.896 62.000 0.660 1.000   NA
 3726698 3726699 AZC_0072 AZC_0073     TRUE 0.733 178.000 0.791 NA   NA
 3726703 3726704 AZC_0077 AZC_0078     FALSE 0.056 160.000 0.000 NA   NA
 3726704 3726705 AZC_0078 AZC_0079     FALSE 0.135 59.000 0.000 1.000 N NA
 3726705 3726706 AZC_0079 AZC_0080     TRUE 0.446 41.000 0.009 1.000 N NA
 3726706 3726707 AZC_0080 AZC_0081     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3726707 3726708 AZC_0081 AZC_0082   glcE TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3726708 3726709 AZC_0082 AZC_0083 glcE glcD TRUE 0.990 16.000 0.266 0.014 Y NA
 3726710 3726711 AZC_0084 AZC_0085 lysR azlC FALSE 0.101 66.000 0.000 NA N NA
 3726711 3726712 AZC_0085 AZC_0086 azlC   TRUE 0.948 29.000 0.595 NA   NA
 3726713 3726714 AZC_0087 AZC_0088     TRUE 0.499 18.000 0.000 NA   NA
 3726714 3726715 AZC_0088 AZC_0089     FALSE 0.047 234.000 0.000 NA   NA
 3726716 3726717 AZC_0090 AZC_0091     TRUE 0.873 79.000 0.261 NA Y NA
 3726717 3726718 AZC_0091 AZC_0092     TRUE 0.545 15.000 0.000 NA   NA
 3726719 3726720 AZC_0093 AZC_0094     FALSE 0.240 43.000 0.000 1.000   NA
 3726720 3726721 AZC_0094 AZC_0095     FALSE 0.249 41.000 0.000 1.000   NA
 3726721 3726722 AZC_0095 AZC_0096   ftsK FALSE 0.202 160.000 0.035 1.000 N NA
 3726722 3726723 AZC_0096 AZC_0097 ftsK   TRUE 0.896 14.000 0.081 1.000 N NA
 3726723 3726724 AZC_0097 AZC_0098     FALSE 0.115 198.000 0.003 1.000 N NA
 3726724 3726725 AZC_0098 AZC_0099     TRUE 0.502 63.000 0.049 1.000 N NA
 3726728 3726729 AZC_0102 AZC_0103     FALSE 0.146 50.000 0.000 1.000 N NA
 3726730 3726731 AZC_0104 AZC_0105     TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000   NA
 3726731 3726732 AZC_0105 AZC_0106     FALSE 0.158 72.000 0.000 1.000   NA
 3726732 3726733 AZC_0106 AZC_0107     FALSE 0.072 120.000 0.000 1.000   NA
 3726734 3726735 AZC_0108 AZC_0109 fef-1   FALSE 0.227 46.000 0.000 1.000   NA
 3726735 3726736 AZC_0109 AZC_0110     FALSE 0.289 33.000 0.000 NA   NA
 3726736 3726737 AZC_0110 AZC_0111     TRUE 0.988 11.000 0.733 NA   NA
 3726737 3726738 AZC_0111 AZC_0112     TRUE 0.841 1.000 0.000 NA   NA
 3726740 3726741 AZC_0114 AZC_0115     FALSE 0.049 326.000 0.000 1.000   NA
 3726742 3726743 AZC_0116 AZC_0117 marR   FALSE 0.065 157.000 0.000 1.000   NA
 3726744 3726745 AZC_0118 AZC_0119     FALSE 0.028 680.000 0.000 1.000 N NA
 3726745 3726746 AZC_0119 AZC_0120     FALSE 0.381 101.000 0.071 1.000   NA
 3726747 3726748 AZC_0121 AZC_0122     TRUE 0.998 -3.000 0.179 0.074 Y NA
 3726748 3726749 AZC_0122 AZC_0123     TRUE 0.986 5.000 0.179 0.074   NA
 3726750 3726751 AZC_0124 AZC_0125     TRUE 0.459 23.000 0.000 1.000   NA
 3726751 3726752 AZC_0125 AZC_0126     TRUE 0.999 -7.000 0.613 1.000 Y NA
 3726752 3726753 AZC_0126 AZC_0127   lysR TRUE 0.459 37.000 0.000 0.079 N NA
 3726754 3726755 AZC_0128 AZC_0129     TRUE 0.982 -3.000 0.046 1.000   NA
 3726755 3726756 AZC_0129 AZC_0130     TRUE 0.979 -3.000 0.038 NA   NA
 3726756 3726757 AZC_0130 AZC_0131     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3726757 3726758 AZC_0131 AZC_0132     TRUE 0.851 14.000 0.027 NA   NA
 3726758 3726759 AZC_0132 AZC_0133     TRUE 0.998 -3.000 0.882 NA   NA
 3726759 3726760 AZC_0133 AZC_0134     TRUE 0.915 48.000 0.711 NA   NA
 3726760 3726761 AZC_0134 AZC_0135     TRUE 0.998 -3.000 0.391 NA Y NA
 3726761 3726762 AZC_0135 AZC_0136     FALSE 0.366 98.000 0.087 NA N NA
 3726763 3726764 AZC_0137 AZC_0138     TRUE 0.924 11.000 0.083 1.000 N NA
 3726765 3726766 AZC_0139 AZC_0140     FALSE 0.421 41.000 0.008 NA N NA
 3726766 3726767 AZC_0140 AZC_0141     TRUE 0.559 71.000 0.108 1.000 N NA
 3726768 3726769 AZC_0142 AZC_0143     FALSE 0.209 53.000 0.000 1.000   NA
 3726769 3726770 AZC_0143 AZC_0144     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 3726771 3726772 AZC_0145 AZC_0146     TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000   NA
 3726774 3726775 AZC_0148 AZC_0149     FALSE 0.048 361.000 0.000 1.000   NA
 3726778 3726779 AZC_0152 AZC_0153     TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3726779 3726780 AZC_0153 AZC_0154     TRUE 0.997 -3.000 0.538 NA   NA
 3726780 3726781 AZC_0154 AZC_0155     TRUE 0.992 5.000 0.583 1.000   NA
 3726782 3726783 AZC_0156 AZC_0157     FALSE 0.218 131.000 0.038 1.000 N NA
 3726783 3726784 AZC_0157 AZC_0158     TRUE 0.933 4.000 0.010 NA   NA
 3726784 3726785 AZC_0158 AZC_0159     TRUE 0.704 31.000 0.044 NA   NA
 3726785 3726786 AZC_0159 AZC_0160     TRUE 0.940 2.000 0.018 NA N NA
 3726786 3726787 AZC_0160 AZC_0161     TRUE 0.689 73.000 0.256 NA N NA
 3726787 3726788 AZC_0161 AZC_0162     FALSE 0.049 116.000 0.000 1.000 N NA
 3726789 3726790 AZC_0163 AZC_0164     FALSE 0.320 174.000 0.000 1.000 Y NA
 3726791 3726792 AZC_0165 AZC_0166     TRUE 0.999 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 3726795 3726796 AZC_0169 AZC_0170   dctM TRUE 0.987 -3.000 0.000 NA Y NA
 3726796 3726797 AZC_0170 AZC_0171 dctM dctP TRUE 0.764 34.000 0.000 1.000 Y NA
 3726797 3726798 AZC_0171 AZC_0172 dctP   TRUE 0.710 4.000 0.000 NA N NA
 3726798 3726799 AZC_0172 AZC_0173     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 3726799 3726800 AZC_0173 AZC_0174     FALSE 0.043 328.000 0.000 NA   NA
 3726800 3726801 AZC_0174 AZC_0175     TRUE 0.989 -3.000 0.137 NA   NA
 3726801 3726802 AZC_0175 AZC_0176     TRUE 0.465 82.000 0.083 1.000 N NA
 3726802 3726803 AZC_0176 AZC_0177     TRUE 0.867 36.000 0.208 0.091 N NA
 3726803 3726804 AZC_0177 AZC_0178     TRUE 0.771 29.000 0.080 1.000 N NA
 3726804 3726805 AZC_0178 AZC_0179     TRUE 0.808 24.000 0.074 1.000 N NA
 3726809 3726810 AZC_0183 AZC_0184 fepC   TRUE 0.999 -3.000 0.857 NA Y NA
 3726810 3726811 AZC_0184 AZC_0185     TRUE 0.997 -3.000 0.182 NA Y NA
 3726811 3726812 AZC_0185 AZC_0186     TRUE 0.976 15.000 0.156 NA Y NA
 3726812 3726813 AZC_0186 AZC_0187     TRUE 0.558 97.000 0.242 1.000 N NA
 3726813 3726814 AZC_0187 AZC_0188     FALSE 0.042 918.000 0.000 1.000   NA
 3726814 3726815 AZC_0188 AZC_0189     FALSE 0.067 138.000 0.000 1.000   NA
 3726815 3726816 AZC_0189 AZC_0190     TRUE 0.711 40.000 0.000 1.000 Y NA
 3726816 3726817 AZC_0190 AZC_0191     FALSE 0.151 48.000 0.000 1.000 N NA
 3726817 3726818 AZC_0191 AZC_0192     FALSE 0.410 1255.000 0.000 0.002 Y NA
 3726818 3726819 AZC_0192 AZC_0193     FALSE 0.037 201.000 0.000 1.000 N NA
 3726819 3726820 AZC_0193 AZC_0194     TRUE 0.999 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 3726821 3726822 AZC_0195 AZC_0196     FALSE 0.039 178.000 0.000 1.000 N NA
 3726823 3726824 AZC_0197 AZC_0198     TRUE 0.999 -3.000 0.800 NA Y NA
 3726824 3726825 AZC_0198 AZC_0199     TRUE 0.997 4.000 0.400 NA Y NA
 3726825 3726826 AZC_0199 AZC_0200     TRUE 0.989 32.000 0.704 0.046 Y NA
 3726826 3726827 AZC_0200 AZC_0201     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3726827 3726828 AZC_0201 AZC_0202     FALSE 0.069 83.000 0.000 NA N NA
 3726828 3726829 AZC_0202 AZC_0203     TRUE 0.978 11.000 0.419 NA   NA
 3726829 3726830 AZC_0203 AZC_0204   lysR TRUE 0.483 90.000 0.116 NA   NA
 3726834 3726835 AZC_0208 AZC_0209     FALSE 0.042 159.000 0.000 1.000 N NA
 3726835 3726836 AZC_0209 AZC_0210     FALSE 0.064 118.000 0.000 NA   NA
 3726838 3726839 AZC_0212 AZC_0213     FALSE 0.045 284.000 0.000 NA   NA
 3726839 3726840 AZC_0213 AZC_0214     FALSE 0.206 90.000 0.003 1.000 N NA
 3726840 3726841 AZC_0214 AZC_trnS01   trnS FALSE 0.044 303.000 0.000 NA   NA
 3726841 3726842 AZC_trnS01 AZC_0215 trnS   FALSE 0.057 151.000 0.000 NA   NA
 3726842 3726843 AZC_0215 AZC_0216     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3726843 3726844 AZC_0216 AZC_0217     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3726846 3726847 AZC_0218 AZC_0219     FALSE 0.072 108.000 0.000 NA   NA
 3726847 3726848 AZC_0219 AZC_0220     FALSE 0.040 456.000 0.000 NA   NA
 3726849 3726850 AZC_0221 AZC_0222 hslU   TRUE 0.938 90.000 0.752 1.000 Y NA
 3726850 3726851 AZC_0222 AZC_0223     TRUE 0.486 19.000 0.000 NA   NA
 3726851 3726852 AZC_0223 AZC_0224     TRUE 0.973 1.000 0.071 NA   NA
 3726856 3726857 AZC_0228 AZC_0229 metW   TRUE 0.992 4.000 0.509 NA   NA
 3726858 3726859 AZC_0230 AZC_0231     TRUE 0.943 28.000 0.116 1.000 Y NA
 3726859 3726860 AZC_0231 AZC_0232     FALSE 0.095 78.000 0.000 1.000 N NA
 3726862 3726863 AZC_0234 AZC_0235     TRUE 0.592 69.000 0.000 1.000 Y NA
 3726866 3726867 AZC_0238 AZC_0239     FALSE 0.042 154.000 0.000 1.000 N NA
 3726867 3726868 AZC_0239 AZC_0240     TRUE 0.855 91.000 0.303 1.000 Y NA
 3726869 3726870 AZC_0241 AZC_0242 asnC   FALSE 0.247 31.000 0.000 1.000 N NA
 3726871 3726872 AZC_0243 AZC_0244     TRUE 0.816 57.000 0.333 NA   NA
 3726873 3726874 AZC_0245 AZC_0246   lysR TRUE 0.559 49.000 0.044 NA   NA
 3726876 3726877 AZC_0248 AZC_0249     FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 3726877 3726878 AZC_0249 AZC_0250     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3726878 3726879 AZC_0250 AZC_0251     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3726881 3726882 AZC_0253 AZC_0254     FALSE 0.031 351.000 0.000 1.000 N NA
 3726882 3726883 AZC_0254 AZC_0255     FALSE 0.040 170.000 0.000 1.000 N NA
 3726884 3726885 AZC_0256 AZC_0257   lepA FALSE 0.058 144.000 0.000 NA   NA
 3726885 3726886 AZC_0257 AZC_0258 lepA hemY FALSE 0.216 95.000 0.002 1.000   NA
 3726886 3726887 AZC_0258 AZC_0259 hemY   TRUE 0.996 -3.000 0.408 NA   NA
 3726887 3726888 AZC_0259 AZC_0260     TRUE 0.951 15.000 0.263 NA   NA
 3726888 3726889 AZC_0260 AZC_0261     TRUE 0.995 4.000 0.056 0.001 Y NA
 3726890 3726891 AZC_0262 AZC_0263     TRUE 0.816 23.000 0.070 1.000 N NA
 3726896 3726897 AZC_0268 AZC_0269     FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 3726897 3726898 AZC_0269 AZC_0270     FALSE 0.059 129.000 0.000 NA   NA
 3726899 3726900 AZC_0271 AZC_0272 lysR   FALSE 0.286 28.000 0.000 1.000 N NA
 3726900 3726901 AZC_0272 AZC_0273     FALSE 0.102 94.000 0.000 1.000   NA
 3726902 3726903 AZC_0274 AZC_0275     FALSE 0.042 340.000 0.000 NA   NA
 3726903 3726904 AZC_0275 AZC_0276     FALSE 0.038 662.000 0.000 NA   NA
 3726904 3726905 AZC_0276 AZC_trnE03   trnE FALSE 0.038 643.000 0.000 NA   NA
 3726905 3726906 AZC_trnE03 AZC_0277 trnE   FALSE 0.065 117.000 0.000 NA   NA
 3726908 3726909 AZC_0279 AZC_0280     TRUE 0.995 -7.000 0.408 NA N NA
 3726909 3726910 AZC_0280 AZC_0281   cpaA FALSE 0.162 146.000 0.014 1.000 N NA
 3726910 3726911 AZC_0281 AZC_0282 cpaA   TRUE 0.936 12.000 0.125 NA   NA
 3726911 3726912 AZC_0282 AZC_0283     FALSE 0.050 201.000 0.000 NA   NA
 3726914 3726915 AZC_0285 AZC_0286   hrpB FALSE 0.036 226.000 0.000 1.000 N NA
 3726916 3726917 AZC_0287 AZC_0288     FALSE 0.064 162.000 0.000 1.000   NA
 3726917 3726918 AZC_0288 AZC_0289     TRUE 0.456 184.000 0.231 1.000   NA
 3726924 3726925 AZC_0295 AZC_0296     FALSE 0.032 177.000 0.000 NA N NA
 3726925 3726926 AZC_0296 AZC_0297     FALSE 0.037 761.000 0.000 NA   NA
 3726926 3726927 AZC_0297 AZC_0298     FALSE 0.071 109.000 0.000 NA   NA
 3726927 3726928 AZC_0298 AZC_0299     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 3726930 3726931 AZC_0301 AZC_0302     FALSE 0.037 203.000 0.000 1.000 N NA
 3726931 3726932 AZC_0302 AZC_0303     FALSE 0.030 416.000 0.000 1.000 N NA
 3726933 3726934 AZC_0304 AZC_0305     FALSE 0.140 200.000 0.000 0.032 N NA
 3726934 3726935 AZC_0305 AZC_0306     TRUE 0.598 154.000 0.071 1.000 Y NA
 3726937 3726938 AZC_0308 AZC_0309     FALSE 0.225 137.000 0.033 NA   NA
 3726938 3726939 AZC_0309 AZC_0310     FALSE 0.266 94.000 0.016 NA   NA
 3726942 3726943 AZC_0313 AZC_0314   argJ FALSE 0.149 69.000 0.000 NA   NA
 3726943 3726944 AZC_0314 AZC_0315 argJ   TRUE 0.972 -3.000 0.024 1.000 N NA
 3726944 3726945 AZC_0315 AZC_0316     FALSE 0.042 336.000 0.000 NA   NA
 3726946 3726947 AZC_0317 AZC_0318     FALSE 0.360 68.000 0.004 1.000   NA
 3726947 3726948 AZC_0318 AZC_0319     TRUE 0.757 6.000 0.000 NA   NA
 3726948 3726949 AZC_0319 AZC_0320     FALSE 0.059 132.000 0.000 NA   NA
 3726951 3726952 AZC_0322 AZC_0323     TRUE 0.902 44.000 0.588 NA   NA
 3726953 3726954 AZC_0324 AZC_0325     FALSE 0.091 100.000 0.000 1.000   NA
 3726955 3726956 AZC_0326 AZC_0327     FALSE 0.030 424.000 0.000 1.000 N NA
 3726959 3726960 AZC_0330 AZC_0331     FALSE 0.052 180.000 0.000 NA   NA
 3726961 3726962 AZC_0332 AZC_0333     TRUE 0.711 76.000 0.257 1.000   NA
 3726963 3726964 AZC_0334 AZC_0335     FALSE 0.048 227.000 0.000 NA   NA
 3726964 3726965 AZC_0335 AZC_0336     FALSE 0.063 119.000 0.000 NA   NA
 3726969 3726970 AZC_0340 AZC_0341     FALSE 0.038 599.000 0.000 NA   NA
 3726972 3726973 AZC_0343 AZC_0344   ptsN TRUE 0.503 194.000 0.353 NA N NA
 3726973 3726974 AZC_0344 AZC_0345 ptsN   FALSE 0.176 59.000 0.000 NA   NA
 3726975 3726976 AZC_0346 AZC_0347     FALSE 0.247 37.000 0.000 NA   NA
 3726976 3726977 AZC_0347 AZC_0348     TRUE 0.944 44.000 0.955 NA   NA
 3726977 3726978 AZC_0348 AZC_0349     FALSE 0.133 187.000 0.013 NA N NA
 3726978 3726979 AZC_0349 AZC_0350     FALSE 0.178 109.000 0.013 NA N NA
 3726979 3726980 AZC_0350 AZC_0351     FALSE 0.072 81.000 0.000 NA N NA
 3726980 3726981 AZC_0351 AZC_0352     TRUE 0.875 31.000 0.000 0.024 Y NA
 3726981 3726982 AZC_0352 AZC_0353     FALSE 0.056 104.000 0.000 1.000 N NA
 3726982 3726983 AZC_0353 AZC_0354     TRUE 0.996 -16.000 0.452 NA   NA
 3726983 3726984 AZC_0354 AZC_0355     FALSE 0.057 151.000 0.000 NA   NA
 3726986 3726987 AZC_0357 AZC_0358     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 3726987 3726988 AZC_0358 AZC_0359     TRUE 0.774 64.000 0.286 NA   NA
 3726990 3726991 AZC_0361 AZC_0362     TRUE 0.969 -3.000 0.009 NA   NA
 3726991 3726992 AZC_0362 AZC_0363   gntR TRUE 0.885 25.000 0.192 NA   NA
 3726992 3726993 AZC_0363 AZC_0364 gntR   FALSE 0.042 1074.000 0.000 1.000   NA
 3726994 3726995 AZC_0365 AZC_0366     FALSE 0.036 2269.000 0.000 NA   NA
 3726998 3726999 AZC_0369 AZC_0370     FALSE 0.048 229.000 0.000 NA   NA
 3726999 3727000 AZC_0370 AZC_0371     TRUE 0.774 16.000 0.006 NA   NA
 3727002 3727003 AZC_0373 AZC_0374     TRUE 0.897 10.000 0.023 NA   NA
 3727004 3727005 AZC_0375 AZC_0376     FALSE 0.201 46.000 0.000 NA   NA
 3727007 3727008 AZC_0378 AZC_0379     FALSE 0.106 86.000 0.000 NA   NA
 3727008 3727009 AZC_0379 AZC_0380     FALSE 0.047 233.000 0.000 NA   NA
 3727009 3727010 AZC_0380 AZC_0381     FALSE 0.056 160.000 0.000 NA   NA
 3727012 3727013 AZC_0383 AZC_0384     FALSE 0.065 116.000 0.000 NA   NA
 3727013 3727014 AZC_0384 AZC_0385     FALSE 0.085 96.000 0.000 NA   NA
 3727014 3727015 AZC_0385 AZC_0386   matE TRUE 0.732 20.000 0.006 NA   NA
 3727018 3727019 AZC_0389 AZC_0390     TRUE 0.988 -13.000 0.095 NA   NA
 3727019 3727020 AZC_0390 AZC_0391     FALSE 0.222 41.000 0.000 NA   NA
 3727022 3727023 AZC_0393 AZC_0394     TRUE 0.998 -3.000 0.751 NA N NA
 3727025 3727026 AZC_0396 AZC_0397     TRUE 0.994 -3.000 0.258 1.000   NA
 3727027 3727028 AZC_0398 AZC_0399     TRUE 0.878 31.000 0.259 NA   NA
 3727028 3727029 AZC_0399 AZC_0400     FALSE 0.326 144.000 0.096 NA   NA
 3727029 3727030 AZC_0400 AZC_0401     FALSE 0.145 159.000 0.004 NA   NA
 3727030 3727031 AZC_0401 AZC_0402     TRUE 0.982 -3.000 0.047 1.000   NA
 3727032 3727033 AZC_0403 AZC_0404     FALSE 0.188 64.000 0.000 1.000   NA
 3727035 3727036 AZC_0406 AZC_0407     TRUE 0.686 25.000 0.012 NA   NA
 3727036 3727037 AZC_0407 AZC_0408     FALSE 0.099 89.000 0.000 NA   NA
 3727038 3727039 AZC_0409 AZC_0410     FALSE 0.221 124.000 0.028 NA   NA
 3727039 3727040 AZC_0410 AZC_0411     FALSE 0.359 30.000 0.000 1.000   NA
 3727040 3727041 AZC_0411 AZC_0412     FALSE 0.389 25.000 0.000 NA   NA
 3727045 3727046 AZC_0416 AZC_0417     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3727046 3727047 AZC_0417 AZC_0418     FALSE 0.067 114.000 0.000 NA   NA
 3727048 3727049 AZC_0419 AZC_0420     TRUE 0.997 4.000 0.154 0.002 Y NA
 3727049 3727050 AZC_0420 AZC_0421     FALSE 0.034 156.000 0.000 NA N NA
 3727051 3727052 AZC_0422 AZC_0423     TRUE 0.943 8.000 0.056 1.000   NA
 3727053 3727054 AZC_0424 AZC_0425     TRUE 0.799 50.000 0.000 0.007 Y NA
 3727056 3727057 AZC_0427 AZC_0428     TRUE 0.893 8.000 0.019 NA N NA
 3727058 3727059 AZC_0429 AZC_0430     TRUE 0.599 30.000 0.007 NA   NA
 3727059 3727060 AZC_0430 AZC_0431     TRUE 0.999 -3.000 0.829 0.001   NA
 3727060 3727061 AZC_0431 AZC_0432     TRUE 0.971 11.000 0.087 0.001   NA
 3727062 3727063 AZC_0433 AZC_0434   marR TRUE 0.598 46.000 0.067 1.000 N NA
 3727065 3727066 AZC_0436 AZC_0437     FALSE 0.041 396.000 0.000 NA   NA
 3727067 3727068 AZC_0438 AZC_0439     FALSE 0.284 190.000 0.075 1.000   NA
 3727068 3727069 AZC_0439 AZC_0440     FALSE 0.041 371.000 0.000 NA   NA
 3727070 3727071 AZC_0441 AZC_0442     FALSE 0.050 206.000 0.000 NA   NA
 3727072 3727073 AZC_0443 AZC_0444     FALSE 0.058 138.000 0.000 NA   NA
 3727074 3727075 AZC_0445 AZC_0446     TRUE 0.573 36.000 0.014 1.000   NA
 3727075 3727076 AZC_0446 AZC_0447     FALSE 0.058 142.000 0.000 NA   NA
 3727076 3727077 AZC_0447 AZC_0448     FALSE 0.271 35.000 0.000 NA   NA
 3727078 3727079 AZC_0449 AZC_0450     FALSE 0.198 47.000 0.000 NA   NA
 3727081 3727082 AZC_0452 AZC_0453     FALSE 0.105 92.000 0.000 1.000   NA
 3727083 3727084 AZC_0454 AZC_0455     FALSE 0.131 75.000 0.000 NA   NA
 3727084 3727085 AZC_0455 AZC_0456   mutY FALSE 0.187 52.000 0.000 NA   NA
 3727086 3727087 AZC_0457 AZC_0458     TRUE 0.728 81.000 0.333 NA   NA
 3727089 3727090 AZC_0460 AZC_0461     TRUE 0.850 163.000 0.236 0.001 Y NA
 3727094 3727095 AZC_0465 AZC_0466 iclR   FALSE 0.118 87.000 0.000 1.000   NA
 3727095 3727096 AZC_0466 AZC_0467   gntR FALSE 0.060 181.000 0.000 1.000   NA
 3727096 3727097 AZC_0467 AZC_0468 gntR   FALSE 0.223 99.000 0.017 1.000 N NA
 3727097 3727098 AZC_0468 AZC_0469     FALSE 0.282 135.000 0.076 1.000 N NA
 3727098 3727099 AZC_0469 AZC_0470     TRUE 0.449 400.000 0.000 0.001 Y NA
 3727099 3727100 AZC_0470 AZC_0471     FALSE 0.050 306.000 0.000 1.000   NA
 3727100 3727101 AZC_0471 AZC_0472     FALSE 0.263 39.000 0.000 1.000   NA
 3727104 3727105 AZC_0475 AZC_0476 gntR   TRUE 0.980 2.000 0.133 1.000   NA
 3727105 3727106 AZC_0476 AZC_0477     TRUE 0.651 37.000 0.044 1.000   NA
 3727106 3727107 AZC_0477 AZC_0478     TRUE 0.959 39.000 0.429 1.000 Y NA
 3727107 3727108 AZC_0478 AZC_0479     TRUE 0.996 6.000 0.231 0.045 Y NA
 3727108 3727109 AZC_0479 AZC_0480     TRUE 0.996 -3.000 0.064 1.000 Y NA
 3727109 3727110 AZC_0480 AZC_0481     TRUE 0.999 0.000 0.617 0.098 Y NA
 3727110 3727111 AZC_0481 AZC_0482     FALSE 0.029 446.000 0.000 1.000 N NA
 3727111 3727112 AZC_0482 AZC_0483     TRUE 0.994 4.000 0.037 0.001 Y NA
 3727113 3727114 AZC_0484 AZC_0485     FALSE 0.044 298.000 0.000 NA   NA
 3727115 3727116 AZC_0486 AZC_0487     TRUE 0.594 142.000 0.071 NA Y NA
 3727118 3727119 AZC_0489 AZC_0490     FALSE 0.316 213.000 0.143 1.000 N NA
 3727120 3727121 AZC_0491 AZC_0492     TRUE 0.861 25.000 0.141 NA   NA
 3727124 3727125 AZC_0495 AZC_0496     TRUE 0.993 -3.000 0.236 1.000   NA
 3727125 3727126 AZC_0496 AZC_0497     TRUE 0.992 2.000 0.432 NA   NA
 3727126 3727127 AZC_0497 AZC_0498     FALSE 0.173 167.000 0.014 NA   NA
 3727127 3727128 AZC_0498 AZC_0499     FALSE 0.297 96.000 0.026 1.000   NA
 3727128 3727129 AZC_0499 AZC_0500     TRUE 0.951 12.000 0.181 1.000   NA
 3727129 3727130 AZC_0500 AZC_0501     FALSE 0.369 97.000 0.078 1.000 N NA
 3727130 3727131 AZC_0501 AZC_0502     TRUE 0.847 75.000 0.032 0.003 Y NA
 3727131 3727132 AZC_0502 AZC_0503     TRUE 0.943 28.000 0.011 0.003 Y NA
 3727132 3727133 AZC_0503 AZC_0504     TRUE 0.822 161.000 0.439 1.000 Y NA
 3727133 3727134 AZC_0504 AZC_0505     FALSE 0.057 149.000 0.000 NA   NA
 3727135 3727136 AZC_0506 AZC_0507     TRUE 0.874 17.000 0.068 NA   NA
 3727136 3727137 AZC_0507 AZC_0508     FALSE 0.178 300.000 0.034 NA   NA
 3727137 3727138 AZC_0508 AZC_0509     TRUE 0.972 2.000 0.077 NA   NA
 3727138 3727139 AZC_0509 AZC_0510     FALSE 0.186 232.000 0.031 NA   NA
 3727141 3727142 AZC_0512 AZC_0513   ruvC FALSE 0.231 45.000 0.000 1.000   NA
 3727142 3727143 AZC_0513 AZC_0514 ruvC   TRUE 0.518 34.000 0.002 NA   NA
 3727143 3727144 AZC_0514 AZC_0515   ruvA TRUE 0.685 22.000 0.002 NA   NA
 3727145 3727146 AZC_0516 AZC_0517     TRUE 0.990 -3.000 0.162 NA   NA
 3727147 3727148 AZC_0518 AZC_0519   ruvB TRUE 0.524 45.000 0.000 0.009   NA
 3727148 3727149 AZC_0519 AZC_0520 ruvB   FALSE 0.389 103.000 0.082 1.000   NA
 3727149 3727150 AZC_0520 AZC_0521   tolQ TRUE 0.696 136.000 0.593 1.000   NA
 3727150 3727151 AZC_0521 AZC_0522 tolQ tolR TRUE 0.995 4.000 0.220 1.000 Y NA
 3727151 3727152 AZC_0522 AZC_0523 tolR tolA TRUE 0.952 12.000 0.195 NA   NA
 3727152 3727153 AZC_0523 AZC_0524 tolA   TRUE 0.863 15.000 0.043 NA   NA
 3727153 3727154 AZC_0524 AZC_0525     TRUE 0.572 469.000 0.592 1.000 N NA
 3727154 3727155 AZC_0525 AZC_0526     FALSE 0.409 197.000 0.199 1.000   NA
 3727155 3727156 AZC_0526 AZC_0527   mesJ TRUE 0.485 86.000 0.085 1.000   NA
 3727156 3727157 AZC_0527 AZC_0528 mesJ ftsH TRUE 0.459 96.000 0.145 1.000 N NA
 3727157 3727158 AZC_0528 AZC_0529 ftsH   FALSE 0.028 695.000 0.000 1.000 N NA
 3727158 3727159 AZC_0529 AZC_0530     FALSE 0.139 188.000 0.011 1.000 N NA
 3727159 3727160 AZC_0530 AZC_0531     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3727162 3727163 AZC_0533 AZC_0534 radA   FALSE 0.384 110.000 0.094 1.000   NA
 3727163 3727164 AZC_0534 AZC_0535     TRUE 0.881 21.000 0.101 1.000   NA
 3727164 3727165 AZC_0535 AZC_0536     FALSE 0.374 104.000 0.100 1.000 N NA
 3727165 3727166 AZC_0536 AZC_0537     FALSE 0.069 92.000 0.000 1.000 N NA
 3727166 3727167 AZC_0537 AZC_0538     FALSE 0.083 74.000 0.000 NA N NA
 3727167 3727168 AZC_0538 AZC_0539     TRUE 0.989 -3.000 0.141 NA   NA
 3727168 3727169 AZC_0539 AZC_0540     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3727170 3727171 AZC_0541 AZC_0542     FALSE 0.187 52.000 0.000 NA   NA
 3727172 3727173 AZC_0543 AZC_0544     TRUE 0.850 37.000 0.267 1.000   NA
 3727174 3727175 AZC_0545 AZC_0546     FALSE 0.207 55.000 0.000 1.000   NA
 3727176 3727177 AZC_0547 AZC_0548     TRUE 0.909 9.000 0.025 NA   NA
 3727178 3727179 AZC_0549 AZC_0550     FALSE 0.331 130.000 0.095 NA   NA
 3727179 3727180 AZC_0550 AZC_0551     TRUE 0.583 55.000 0.062 NA   NA
 3727181 3727182 AZC_0552 AZC_0553     TRUE 0.689 19.000 0.005 NA N NA
 3727183 3727184 AZC_0554 AZC_0555     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3727184 3727185 AZC_0555 AZC_0556     FALSE 0.263 39.000 0.000 1.000   NA
 3727185 3727186 AZC_0556 AZC_0557     FALSE 0.068 130.000 0.000 1.000   NA
 3727187 3727188 AZC_0558 AZC_0559     TRUE 0.962 1.000 0.036 NA   NA
 3727188 3727189 AZC_0559 AZC_0560     FALSE 0.382 105.000 0.091 NA   NA
 3727191 3727192 AZC_0562 AZC_0563     TRUE 0.999 -3.000 0.465 1.000 Y NA
 3727192 3727193 AZC_0563 AZC_0564     TRUE 0.991 13.000 0.400 1.000 Y NA
 3727193 3727194 AZC_0564 AZC_0565   cobW TRUE 0.505 45.000 0.020 NA   NA
 3727196 3727197 AZC_0567 AZC_0568     TRUE 0.475 86.000 0.090 NA   NA
 3727197 3727198 AZC_0568 AZC_0569     TRUE 0.966 5.000 0.097 NA   NA
 3727198 3727199 AZC_0569 AZC_0570     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3727200 3727201 AZC_0571 AZC_0572   luxR FALSE 0.296 125.000 0.067 NA   NA
 3727204 3727205 AZC_0575 AZC_0576     TRUE 0.534 92.000 0.197 1.000 N NA
 3727205 3727206 AZC_0576 AZC_0577     TRUE 0.781 51.000 0.013 1.000 Y NA
 3727207 3727208 AZC_0578 AZC_0579     FALSE 0.035 233.000 0.000 1.000 N NA
 3727208 3727209 AZC_0579 AZC_0580   lysR FALSE 0.027 793.000 0.000 1.000 N NA
 3727210 3727211 AZC_0581 AZC_0582   cydD TRUE 0.972 -3.000 0.025 1.000 N NA
 3727211 3727212 AZC_0582 AZC_0583 cydD   TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.006 Y NA
 3727212 3727213 AZC_0583 AZC_0584   cydA TRUE 0.774 75.000 0.059 1.000 Y NA
 3727213 3727214 AZC_0584 AZC_0585 cydA   TRUE 0.999 5.000 0.953 0.071 Y NA
 3727214 3727215 AZC_0585 AZC_0586     TRUE 0.932 19.000 0.230 NA   NA
 3727216 3727217 AZC_0587 AZC_0588     FALSE 0.113 89.000 0.000 1.000   NA
 3727217 3727218 AZC_0588 AZC_0589     FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 3727218 3727219 AZC_0589 AZC_0590     TRUE 0.673 5.000 0.000 NA N NA
 3727219 3727220 AZC_0590 AZC_0591     FALSE 0.044 292.000 0.000 NA   NA
 3727220 3727221 AZC_0591 AZC_0592     FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 3727222 3727223 AZC_0593 AZC_0594 tetR hupT FALSE 0.062 97.000 0.000 1.000 N NA
 3727223 3727224 AZC_0594 AZC_0595 hupT hupU TRUE 0.994 -3.000 0.319 1.000 N NA
 3727224 3727225 AZC_0595 AZC_0596 hupU hupV TRUE 0.999 -3.000 0.389 0.001 Y NA
 3727225 3727226 AZC_0596 AZC_0597 hupV hypF TRUE 0.879 8.000 0.008 1.000 N NA
 3727226 3727227 AZC_0597 AZC_0598 hypF hupS FALSE 0.036 216.000 0.000 1.000 N NA
 3727227 3727228 AZC_0598 AZC_0599 hupS hupL TRUE 1.000 -3.000 0.611 0.001 Y NA
 3727228 3727229 AZC_0599 AZC_0600 hupL hupC TRUE 0.993 13.000 0.355 0.071 Y NA
 3727229 3727230 AZC_0600 AZC_0601 hupC hupD TRUE 0.642 265.000 0.177 1.000 Y NA
 3727230 3727231 AZC_0601 AZC_0602 hupD hupF TRUE 0.983 5.000 0.308 NA N NA
 3727231 3727232 AZC_0602 AZC_0603 hupF hupG TRUE 0.991 0.000 0.308 NA   NA
 3727232 3727233 AZC_0603 AZC_0604 hupG hupH TRUE 0.924 10.000 0.051 NA   NA
 3727233 3727234 AZC_0604 AZC_0605 hupH hupJ TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3727234 3727235 AZC_0605 AZC_0606 hupJ hupK TRUE 0.996 -3.000 0.255 0.071   NA
 3727235 3727236 AZC_0606 AZC_0607 hupK hypA TRUE 0.994 3.000 0.262 0.004   NA
 3727236 3727237 AZC_0607 AZC_0608 hypA hypB TRUE 0.990 0.000 0.086 0.004   NA
 3727237 3727238 AZC_0608 AZC_0609 hypB hoxA TRUE 0.933 5.000 0.029 1.000 N NA
 3727238 3727239 AZC_0609 AZC_0610 hoxA hypC TRUE 0.959 10.000 0.200 NA N NA
 3727239 3727240 AZC_0610 AZC_0611 hypC hypD TRUE 0.973 13.000 0.080 NA Y NA
 3727240 3727241 AZC_0611 AZC_0612 hypD hypE TRUE 0.998 -3.000 0.353 1.000 Y NA
 3727241 3727242 AZC_0612 AZC_0613 hypE hupE TRUE 0.718 66.000 0.005 NA Y NA
 3727242 3727243 AZC_0613 AZC_16r01 hupE   FALSE 0.036 1100.000 0.000 NA   NA
 3727243 3727244 AZC_16r01 AZC_trnI04   trnI FALSE 0.048 227.000 0.000 NA   NA
 3727244 3727245 AZC_trnI04 AZC_trnA05 trnI trnA FALSE 0.178 58.000 0.000 NA   NA
 3727245 3727246 AZC_trnA05 AZC_23r01 trnA   FALSE 0.040 407.000 0.000 NA   NA
 3727246 3727247 AZC_23r01 AZC_5r01     FALSE 0.131 75.000 0.000 NA   NA
 3727247 3727248 AZC_5r01 AZC_0614     FALSE 0.041 376.000 0.000 NA   NA
 3727248 3727249 AZC_0614 AZC_0615     FALSE 0.414 26.000 0.000 1.000   NA
 3727249 3727250 AZC_0615 AZC_0616     TRUE 0.980 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3727250 3727251 AZC_0616 AZC_0617     TRUE 0.876 31.000 0.000 0.019 Y NA
 3727251 3727252 AZC_0617 AZC_0618   marR TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.019 Y NA
 3727253 3727254 AZC_0619 AZC_0620   cheY FALSE 0.375 913.000 0.000 0.019 Y NA
 3727256 3727257 AZC_0622 AZC_0623   motD TRUE 0.860 29.000 0.188 NA   NA
 3727257 3727258 AZC_0623 AZC_0624 motD motC TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727258 3727259 AZC_0624 AZC_0625 motC motB TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3727259 3727260 AZC_0625 AZC_0626 motB   TRUE 0.983 9.000 0.421 NA   NA
 3727260 3727261 AZC_0626 AZC_0627   fliF TRUE 0.987 -3.000 0.105 NA   NA
 3727261 3727262 AZC_0627 AZC_0628 fliF fliP FALSE 0.254 470.000 0.000 1.000 Y NA
 3727262 3727263 AZC_0628 AZC_0629 fliP fliL TRUE 0.997 -3.000 0.605 1.000   NA
 3727263 3727264 AZC_0629 AZC_0630 fliL   TRUE 0.984 19.000 0.576 0.005   NA
 3727264 3727265 AZC_0630 AZC_0631     TRUE 0.995 0.000 0.592 NA   NA
 3727265 3727266 AZC_0631 AZC_0632     TRUE 0.595 300.000 0.531 NA   NA
 3727266 3727267 AZC_0632 AZC_0633   flgA TRUE 0.998 -3.000 0.261 NA Y NA
 3727267 3727268 AZC_0633 AZC_0634 flgA flgG TRUE 0.930 42.000 0.252 NA Y NA
 3727268 3727269 AZC_0634 AZC_0635 flgG fliE_2 TRUE 0.997 13.000 0.771 0.004 Y NA
 3727269 3727270 AZC_0635 AZC_0636 fliE_2 flgC TRUE 0.998 -3.000 0.115 0.002 Y NA
 3727270 3727271 AZC_0636 AZC_0637 flgC flgB TRUE 0.999 0.000 0.804 0.002 Y NA
 3727271 3727272 AZC_0637 AZC_0638 flgB   FALSE 0.296 80.000 0.007 NA   NA
 3727272 3727273 AZC_0638 AZC_0639     TRUE 0.992 5.000 0.595 NA   NA
 3727273 3727274 AZC_0639 AZC_0640   fliG TRUE 0.991 16.000 0.571 1.000 Y NA
 3727274 3727275 AZC_0640 AZC_0641 fliG fliN TRUE 0.998 11.000 0.875 0.004 Y NA
 3727275 3727276 AZC_0641 AZC_0642 fliN   TRUE 0.490 113.000 0.207 NA   NA
 3727276 3727277 AZC_0642 AZC_0643   fliM TRUE 0.987 2.000 0.242 NA   NA
 3727277 3727278 AZC_0643 AZC_0644 fliM motA TRUE 0.998 5.000 0.879 1.000 Y NA
 3727279 3727280 AZC_0645 AZC_0646   fliI TRUE 0.952 62.000 0.529 1.000 Y NA
 3727280 3727281 AZC_0646 AZC_0647 fliI flaE FALSE 0.389 109.000 0.000 1.000 Y NA
 3727281 3727282 AZC_0647 AZC_0648 flaE flgK TRUE 0.968 37.000 0.250 0.004 Y NA
 3727282 3727283 AZC_0648 AZC_0649 flgK   TRUE 0.996 10.000 0.333 0.004 Y NA
 3727283 3727284 AZC_0649 AZC_0650   flaF TRUE 0.961 21.000 0.114 NA Y NA
 3727284 3727285 AZC_0650 AZC_0651 flaF flbT TRUE 0.999 -3.000 0.829 NA Y NA
 3727285 3727286 AZC_0651 AZC_0652 flbT flgD TRUE 0.941 69.000 0.528 NA Y NA
 3727286 3727287 AZC_0652 AZC_0653 flgD fliQ TRUE 0.999 -3.000 0.509 NA Y NA
 3727287 3727288 AZC_0653 AZC_0654 fliQ flhA TRUE 0.860 285.000 0.349 0.001 Y NA
 3727288 3727289 AZC_0654 AZC_0655 flhA   TRUE 0.999 -3.000 0.442 1.000 Y NA
 3727289 3727290 AZC_0655 AZC_0656     TRUE 0.977 4.000 0.148 NA   NA
 3727290 3727291 AZC_0656 AZC_0657     TRUE 0.708 54.000 0.160 NA   NA
 3727291 3727292 AZC_0657 AZC_0658     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727292 3727293 AZC_0658 AZC_0659     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727293 3727294 AZC_0659 AZC_0660     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727294 3727295 AZC_0660 AZC_0661   cheA TRUE 0.456 207.000 0.000 0.014 Y NA
 3727295 3727296 AZC_0661 AZC_0662 cheA cheW TRUE 0.996 -3.000 0.009 0.014 Y NA
 3727296 3727297 AZC_0662 AZC_0663 cheW cheY2 TRUE 0.812 29.000 0.000 1.000 Y NA
 3727297 3727298 AZC_0663 AZC_0664 cheY2   TRUE 0.999 -3.000 0.268 0.019 Y NA
 3727298 3727299 AZC_0664 AZC_0665     TRUE 0.996 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 3727299 3727300 AZC_0665 AZC_0666     TRUE 0.574 72.000 0.000 1.000 Y NA
 3727302 3727303 AZC_0668 AZC_trnQ06   trnQ FALSE 0.058 143.000 0.000 NA   NA
 3727304 3727305 AZC_0669 AZC_0670     TRUE 0.545 15.000 0.000 NA   NA
 3727306 3727307 AZC_0671 AZC_0672   lysR TRUE 0.873 20.000 0.092 NA   NA
 3727308 3727309 AZC_0673 AZC_0674     FALSE 0.043 143.000 0.000 1.000 N NA
 3727309 3727310 AZC_0674 AZC_0675     TRUE 0.452 65.000 0.026 NA   NA
 3727311 3727312 AZC_0676 AZC_0677     FALSE 0.258 157.000 0.048 1.000   NA
 3727313 3727314 AZC_0678 AZC_0679     FALSE 0.213 43.000 0.000 NA   NA
 3727314 3727315 AZC_0679 AZC_0680     TRUE 0.802 28.000 0.026 0.069 N NA
 3727315 3727316 AZC_0680 AZC_0681     TRUE 0.999 -3.000 0.640 0.015 Y NA
 3727316 3727317 AZC_0681 AZC_0682     TRUE 0.980 14.000 0.360 0.070   NA
 3727317 3727318 AZC_0682 AZC_0683     TRUE 0.904 37.000 0.462 1.000   NA
 3727318 3727319 AZC_0683 AZC_0684     TRUE 0.467 70.000 0.052 1.000 N NA
 3727319 3727320 AZC_0684 AZC_0685   nrtB TRUE 0.995 12.000 0.323 0.001 Y NA
 3727320 3727321 AZC_0685 AZC_0686 nrtB nrtA TRUE 0.914 141.000 0.915 NA Y NA
 3727321 3727322 AZC_0686 AZC_0687 nrtA   FALSE 0.026 315.000 0.000 NA N NA
 3727322 3727323 AZC_0687 AZC_0688     FALSE 0.153 47.000 0.000 1.000 N NA
 3727323 3727324 AZC_0688 AZC_0689   dnaJ FALSE 0.048 118.000 0.000 1.000 N NA
 3727324 3727325 AZC_0689 AZC_0690 dnaJ dnaK TRUE 0.792 417.000 0.236 0.003 Y NA
 3727325 3727326 AZC_0690 AZC_0691 dnaK   FALSE 0.028 243.000 0.000 NA N NA
 3727326 3727327 AZC_0691 AZC_0692     TRUE 0.996 -3.000 0.466 NA N NA
 3727327 3727328 AZC_0692 AZC_0693     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 3727329 3727330 AZC_0694 AZC_0695     TRUE 0.993 0.000 0.420 NA   NA
 3727330 3727331 AZC_0695 AZC_0696     FALSE 0.207 55.000 0.000 1.000   NA
 3727334 3727335 AZC_0699 AZC_0700     FALSE 0.053 250.000 0.000 1.000   NA
 3727335 3727336 AZC_0700 AZC_0701     TRUE 0.620 51.000 0.069 1.000   NA
 3727337 3727338 AZC_0702 AZC_0703     FALSE 0.051 194.000 0.000 NA   NA
 3727338 3727339 AZC_0703 AZC_0704     TRUE 0.592 72.000 0.123 NA   NA
 3727339 3727340 AZC_0704 AZC_0705     FALSE 0.305 111.000 0.054 NA   NA
 3727340 3727341 AZC_0705 AZC_0706     FALSE 0.311 34.000 0.000 1.000   NA
 3727341 3727342 AZC_0706 AZC_0707     FALSE 0.033 283.000 0.000 1.000 N NA
 3727342 3727343 AZC_0707 AZC_0708     TRUE 0.714 20.000 0.012 NA N NA
 3727343 3727344 AZC_0708 AZC_0709     TRUE 0.623 62.000 0.132 NA N NA
 3727344 3727345 AZC_0709 AZC_0710     FALSE 0.033 295.000 0.000 1.000 N NA
 3727345 3727346 AZC_0710 AZC_0711     TRUE 0.986 -3.000 0.085 NA   NA
 3727346 3727347 AZC_0711 AZC_0712     TRUE 0.975 18.000 0.642 NA   NA
 3727347 3727348 AZC_0712 AZC_0713     FALSE 0.358 234.000 0.196 1.000 N NA
 3727348 3727349 AZC_0713 AZC_0714     TRUE 1.000 -3.000 0.863 0.044 Y NA
 3727349 3727350 AZC_0714 AZC_0715     TRUE 0.593 78.000 0.173 1.000 N NA
 3727352 3727353 AZC_0717 AZC_0718     FALSE 0.042 360.000 0.000 NA   NA
 3727353 3727354 AZC_0718 AZC_0719     FALSE 0.052 182.000 0.000 NA   NA
 3727354 3727355 AZC_0719 AZC_0720     FALSE 0.101 88.000 0.000 NA   NA
 3727355 3727356 AZC_0720 AZC_0721     TRUE 0.995 -3.000 0.333 NA   NA
 3727359 3727360 AZC_0724 AZC_0725     TRUE 0.502 133.000 0.000 0.014 Y NA
 3727360 3727361 AZC_0725 AZC_0726     TRUE 0.519 120.000 0.000 0.014 Y NA
 3727362 3727363 AZC_0727 AZC_0728     TRUE 0.978 25.000 0.375 1.000 Y NA
 3727365 3727366 AZC_0730 AZC_0731 gntR   TRUE 0.525 81.000 0.000 1.000 Y NA
 3727366 3727367 AZC_0731 AZC_0732     FALSE 0.116 190.000 0.000 0.086 N NA
 3727367 3727368 AZC_0732 AZC_0733     FALSE 0.299 23.000 0.000 NA N NA
 3727369 3727370 AZC_0734 AZC_0735     FALSE 0.038 535.000 0.000 NA   NA
 3727370 3727371 AZC_0735 AZC_0736     FALSE 0.261 30.000 0.000 1.000 N NA
 3727372 3727373 AZC_0737 AZC_0738     FALSE 0.051 190.000 0.000 NA   NA
 3727373 3727374 AZC_0738 AZC_0739     FALSE 0.110 90.000 0.000 1.000   NA
 3727374 3727375 AZC_0739 AZC_0740     FALSE 0.118 87.000 0.000 1.000   NA
 3727377 3727378 AZC_0742 AZC_0743 marR   TRUE 0.980 -3.000 0.054 1.000 N NA
 3727379 3727380 AZC_0744 AZC_0745     FALSE 0.169 63.000 0.000 NA   NA
 3727380 3727381 AZC_0745 AZC_0746     FALSE 0.207 104.000 0.005 1.000   NA
 3727383 3727384 AZC_0748 AZC_0749     FALSE 0.053 177.000 0.000 NA   NA
 3727384 3727385 AZC_0749 AZC_0750     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 3727385 3727386 AZC_0750 AZC_0751     TRUE 0.779 5.000 0.000 NA   NA
 3727386 3727387 AZC_0751 AZC_0752     FALSE 0.444 22.000 0.000 NA   NA
 3727387 3727388 AZC_0752 AZC_0753     FALSE 0.276 89.000 0.012 NA   NA
 3727390 3727391 AZC_0755 AZC_0756     FALSE 0.173 61.000 0.000 NA   NA
 3727391 3727392 AZC_0756 AZC_0757     TRUE 0.988 0.000 0.212 NA   NA
 3727395 3727396 AZC_0760 AZC_0761     TRUE 0.998 5.000 0.703 NA Y NA
 3727396 3727397 AZC_0761 AZC_0762     TRUE 0.999 4.000 0.730 0.001 Y NA
 3727397 3727398 AZC_0762 AZC_0763     TRUE 0.657 149.000 0.128 1.000 Y NA
 3727400 3727401 AZC_0765 AZC_0766     TRUE 0.748 169.000 0.151 0.086 Y NA
 3727401 3727402 AZC_0766 AZC_0767     FALSE 0.362 109.000 0.075 1.000   NA
 3727403 3727404 AZC_0768 AZC_0769     FALSE 0.040 171.000 0.000 1.000 N NA
 3727406 3727407 AZC_0771 AZC_0772     FALSE 0.343 31.000 0.000 1.000   NA
 3727407 3727408 AZC_0772 AZC_0773     TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.007   NA
 3727408 3727409 AZC_0773 AZC_0774     TRUE 0.777 79.000 0.071 1.000 Y NA
 3727409 3727410 AZC_0774 AZC_0775     TRUE 0.999 -3.000 0.762 0.095 Y NA
 3727410 3727411 AZC_0775 AZC_0776     TRUE 0.979 19.000 0.147 0.095 Y NA
 3727411 3727412 AZC_0776 AZC_0777     TRUE 0.638 80.000 0.000 0.095 Y NA
 3727413 3727414 AZC_0778 AZC_0779     FALSE 0.125 78.000 0.000 NA   NA
 3727414 3727415 AZC_0779 AZC_0780     TRUE 0.945 30.000 0.571 1.000   NA
 3727415 3727416 AZC_0780 AZC_0781   lacI FALSE 0.042 159.000 0.000 1.000 N NA
 3727416 3727417 AZC_0781 AZC_0782 lacI   TRUE 0.998 -3.000 0.761 1.000 N NA
 3727417 3727418 AZC_0782 AZC_0783     TRUE 0.778 313.000 0.870 0.095 N NA
 3727418 3727419 AZC_0783 AZC_0784     TRUE 0.998 -3.000 0.660 0.095 N NA
 3727419 3727420 AZC_0784 AZC_0785     TRUE 0.997 9.000 0.632 0.095 Y NA
 3727420 3727421 AZC_0785 AZC_0786     TRUE 0.972 5.000 0.132 1.000   NA
 3727422 3727423 AZC_0787 AZC_0788     TRUE 0.967 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3727423 3727424 AZC_0788 AZC_0789     TRUE 0.924 8.000 0.026 1.000   NA
 3727427 3727428 AZC_0792 AZC_0793     TRUE 0.558 95.000 0.200 1.000   NA
 3727429 3727430 AZC_0794 AZC_0795     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3727430 3727431 AZC_0795 AZC_0796     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727431 3727432 AZC_0796 AZC_0797     TRUE 0.947 23.000 0.069 1.000 Y NA
 3727432 3727433 AZC_0797 AZC_0798     TRUE 0.933 35.000 0.050 0.019 Y NA
 3727434 3727435 AZC_0799 AZC_0800     FALSE 0.148 138.000 0.003 NA   NA
 3727435 3727436 AZC_0800 AZC_0801     FALSE 0.082 85.000 0.000 1.000 N NA
 3727436 3727437 AZC_0801 AZC_0802     FALSE 0.036 209.000 0.000 1.000 N NA
 3727437 3727438 AZC_0802 AZC_trnL07   trnL FALSE 0.054 171.000 0.000 NA   NA
 3727441 3727442 AZC_0805 AZC_0806     FALSE 0.139 72.000 0.000 NA   NA
 3727442 3727443 AZC_0806 AZC_0807     TRUE 0.842 81.000 0.048 0.006 Y NA
 3727443 3727444 AZC_0807 AZC_0808     TRUE 0.702 207.000 0.222 1.000 Y NA
 3727444 3727445 AZC_0808 AZC_0809     TRUE 0.999 -3.000 0.450 0.007 Y NA
 3727445 3727446 AZC_0809 AZC_0810     TRUE 0.998 4.000 0.528 1.000 Y NA
 3727446 3727447 AZC_0810 AZC_0811     TRUE 0.999 -3.000 0.694 0.095 Y NA
 3727447 3727448 AZC_0811 AZC_0812     TRUE 0.911 176.000 0.697 0.095 Y NA
 3727451 3727452 AZC_0815 AZC_0816     TRUE 0.497 86.000 0.000 1.000 Y NA
 3727452 3727453 AZC_0816 AZC_0817     TRUE 0.930 72.000 0.308 0.095 Y NA
 3727453 3727454 AZC_0817 AZC_0818     TRUE 0.999 -3.000 0.615 1.000 Y NA
 3727454 3727455 AZC_0818 AZC_0819     FALSE 0.153 47.000 0.000 1.000 N NA
 3727455 3727456 AZC_0819 AZC_0820     TRUE 0.837 23.000 0.094 1.000 N NA
 3727456 3727457 AZC_0820 AZC_0821     FALSE 0.034 257.000 0.000 1.000 N NA
 3727458 3727459 AZC_0822 AZC_0823     TRUE 0.994 -3.000 0.309 1.000 N NA
 3727459 3727460 AZC_0823 AZC_0824     FALSE 0.027 942.000 0.000 1.000 N NA
 3727460 3727461 AZC_0824 AZC_0825     FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3727462 3727463 AZC_0826 AZC_0827     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3727464 3727465 AZC_trnT08 AZC_0828 trnT   FALSE 0.089 94.000 0.000 NA   NA
 3727465 3727466 AZC_0828 AZC_0829     FALSE 0.059 131.000 0.000 NA   NA
 3727466 3727467 AZC_0829 AZC_0830     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3727467 3727468 AZC_0830 AZC_0831     FALSE 0.137 73.000 0.000 NA   NA
 3727469 3727470 AZC_0832 AZC_0833     FALSE 0.038 667.000 0.000 NA   NA
 3727470 3727471 AZC_0833 AZC_0834   dnaB TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727471 3727472 AZC_0834 AZC_0835 dnaB   TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3727472 3727473 AZC_0835 AZC_0836     FALSE 0.217 42.000 0.000 NA   NA
 3727473 3727474 AZC_0836 AZC_0837     FALSE 0.039 459.000 0.000 NA   NA
 3727474 3727475 AZC_0837 AZC_0838     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3727475 3727476 AZC_0838 AZC_0839     TRUE 0.912 -7.000 0.000 NA   NA
 3727476 3727477 AZC_0839 AZC_0840     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727477 3727478 AZC_0840 AZC_0841     TRUE 0.799 26.000 0.067 NA   NA
 3727478 3727479 AZC_0841 AZC_0842     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 3727479 3727480 AZC_0842 AZC_0843     FALSE 0.056 158.000 0.000 NA   NA
 3727480 3727481 AZC_0843 AZC_0844     TRUE 0.979 16.000 0.667 NA   NA
 3727481 3727482 AZC_0844 AZC_0845     TRUE 0.853 79.000 0.667 NA   NA
 3727482 3727483 AZC_0845 AZC_0846     TRUE 0.994 0.000 0.500 NA   NA
 3727483 3727484 AZC_0846 AZC_0847     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA   NA
 3727484 3727485 AZC_0847 AZC_0848     TRUE 0.917 35.000 0.500 NA   NA
 3727485 3727486 AZC_0848 AZC_0849     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3727486 3727487 AZC_0849 AZC_0850     FALSE 0.051 191.000 0.000 NA   NA
 3727487 3727488 AZC_0850 AZC_0851     TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 3727488 3727489 AZC_0851 AZC_0852     FALSE 0.037 715.000 0.000 NA   NA
 3727489 3727490 AZC_0852 AZC_0853     TRUE 0.725 8.000 0.000 NA   NA
 3727490 3727491 AZC_0853 AZC_0854     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727491 3727492 AZC_0854 AZC_0855     FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3727492 3727493 AZC_0855 AZC_0856     FALSE 0.166 64.000 0.000 NA   NA
 3727493 3727494 AZC_0856 AZC_0857     FALSE 0.205 45.000 0.000 NA   NA
 3727494 3727495 AZC_0857 AZC_0858     FALSE 0.171 62.000 0.000 NA   NA
 3727495 3727496 AZC_0858 AZC_0859     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727496 3727497 AZC_0859 AZC_0860     FALSE 0.056 158.000 0.000 NA   NA
 3727498 3727499 AZC_0861 AZC_0862     FALSE 0.039 532.000 0.000 NA   NA
 3727499 3727500 AZC_0862 AZC_0863     FALSE 0.051 194.000 0.000 NA   NA
 3727500 3727501 AZC_0863 AZC_0864     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727501 3727502 AZC_0864 AZC_0865     FALSE 0.041 384.000 0.000 NA   NA
 3727505 3727506 AZC_0868 AZC_0869     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 3727507 3727508 AZC_0870 AZC_0871     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727508 3727509 AZC_0871 AZC_0872     TRUE 0.968 15.000 0.421 NA   NA
 3727509 3727510 AZC_0872 AZC_0873     FALSE 0.036 1467.000 0.000 NA   NA
 3727510 3727511 AZC_0873 AZC_0874     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 3727511 3727512 AZC_0874 AZC_0875     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3727514 3727515 AZC_0877 AZC_0878   trmH FALSE 0.030 394.000 0.000 1.000 N NA
 3727515 3727516 AZC_0878 AZC_0879 trmH   FALSE 0.104 64.000 0.000 NA N NA
 3727517 3727518 AZC_trnY09 AZC_trnG10 trnY trnG FALSE 0.240 38.000 0.000 NA   NA
 3727518 3727519 AZC_trnG10 AZC_0880 trnG   FALSE 0.055 162.000 0.000 NA   NA
 3727519 3727520 AZC_0880 AZC_trnW11   trnW FALSE 0.048 216.000 0.000 NA   NA
 3727520 3727521 AZC_trnW11 AZC_0881 trnW secE FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 3727521 3727522 AZC_0881 AZC_0882 secE nusG TRUE 0.998 -3.000 0.843 1.000 N NA
 3727522 3727523 AZC_0882 AZC_0883 nusG   TRUE 0.653 276.000 0.681 1.000 N NA
 3727523 3727524 AZC_0883 AZC_0884     TRUE 0.999 6.000 0.838 0.016 Y NA
 3727524 3727525 AZC_0884 AZC_0885     TRUE 0.793 587.000 0.302 0.016 Y NA
 3727525 3727526 AZC_0885 AZC_0886     TRUE 0.986 52.000 0.884 0.012 Y NA
 3727526 3727527 AZC_0886 AZC_0887     FALSE 0.422 241.000 0.223 1.000   NA
 3727527 3727528 AZC_0887 AZC_0888     TRUE 0.892 116.000 0.851 0.001   NA
 3727528 3727529 AZC_0888 AZC_0889     TRUE 0.636 81.000 0.002 1.000 Y NA
 3727530 3727531 AZC_0890 AZC_0891     TRUE 0.494 154.000 0.250 1.000   NA
 3727532 3727533 AZC_0892 AZC_0893     FALSE 0.178 171.000 0.018 NA   NA
 3727533 3727534 AZC_0893 AZC_0894     FALSE 0.051 192.000 0.000 NA   NA
 3727534 3727535 AZC_0894 AZC_0895     FALSE 0.058 140.000 0.000 NA   NA
 3727535 3727536 AZC_0895 AZC_0896   rgpF TRUE 0.486 19.000 0.000 NA   NA
 3727536 3727537 AZC_0896 AZC_0897 rgpF   FALSE 0.180 57.000 0.000 NA   NA
 3727539 3727540 AZC_0899 AZC_0900     FALSE 0.051 192.000 0.000 NA   NA
 3727541 3727542 AZC_0901 AZC_0902     FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 3727542 3727543 AZC_0902 AZC_0903     FALSE 0.407 68.000 0.000 0.027   NA
 3727543 3727544 AZC_0903 AZC_0904     TRUE 0.779 5.000 0.000 NA   NA
 3727544 3727545 AZC_0904 AZC_0905     FALSE 0.066 115.000 0.000 NA   NA
 3727545 3727546 AZC_0905 AZC_0906     TRUE 0.883 53.000 0.525 1.000   NA
 3727547 3727548 AZC_0907 AZC_0908     FALSE 0.028 610.000 0.000 1.000 N NA
 3727549 3727550 AZC_0909 AZC_0910     TRUE 0.869 9.000 0.003 NA   NA
 3727551 3727552 AZC_0911 AZC_0912   lysR FALSE 0.074 117.000 0.000 1.000   NA
 3727554 3727555 AZC_0914 AZC_0915     FALSE 0.054 239.000 0.000 1.000   NA
 3727555 3727556 AZC_0915 AZC_0916     FALSE 0.036 212.000 0.000 1.000 N NA
 3727559 3727560 AZC_0919 AZC_0920   cysW TRUE 0.992 2.000 0.070 1.000 Y NA
 3727560 3727561 AZC_0920 AZC_0921 cysW cysT TRUE 0.999 -3.000 0.935 0.001 N NA
 3727561 3727562 AZC_0921 AZC_0922 cysT   TRUE 0.499 146.000 0.097 0.002 N NA
 3727562 3727563 AZC_0922 AZC_0923     FALSE 0.324 79.000 0.019 1.000 N NA
 3727563 3727564 AZC_0923 AZC_0924     TRUE 0.958 9.000 0.139 NA   NA
 3727564 3727565 AZC_0924 AZC_0925     TRUE 0.907 29.000 0.309 NA   NA
 3727565 3727566 AZC_0925 AZC_0926     TRUE 0.978 23.000 0.919 NA   NA
 3727567 3727568 AZC_0927 AZC_0928     TRUE 0.995 10.000 0.830 0.001 N NA
 3727568 3727569 AZC_0928 AZC_0929     FALSE 0.030 419.000 0.000 1.000 N NA
 3727570 3727571 AZC_0930 AZC_0931     FALSE 0.118 87.000 0.000 1.000   NA
 3727572 3727573 AZC_0932 AZC_0933     TRUE 0.774 46.000 0.000 0.084 Y NA
 3727573 3727574 AZC_0933 AZC_0934     FALSE 0.073 107.000 0.000 NA   NA
 3727576 3727577 AZC_0936 AZC_0937     FALSE 0.359 30.000 0.000 1.000   NA
 3727577 3727578 AZC_0937 AZC_0938     TRUE 0.483 75.000 0.061 NA   NA
 3727578 3727579 AZC_0938 AZC_0939     TRUE 0.990 3.000 0.362 NA   NA
 3727580 3727581 AZC_0940 AZC_0941 yaeC   FALSE 0.041 112.000 0.000 NA N NA
 3727581 3727582 AZC_0941 AZC_0942     TRUE 0.749 24.000 0.038 1.000 N NA
 3727585 3727586 AZC_0945 AZC_0946     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 3727586 3727587 AZC_0946 AZC_0947     FALSE 0.029 212.000 0.000 NA N NA
 3727587 3727588 AZC_0947 AZC_0948     FALSE 0.066 146.000 0.000 1.000   NA
 3727591 3727592 AZC_0951 AZC_0952   algI TRUE 0.986 3.000 0.250 NA   NA
 3727592 3727593 AZC_0952 AZC_0953 algI   TRUE 0.701 22.000 0.015 NA N NA
 3727595 3727596 AZC_0955 AZC_0956     FALSE 0.188 191.000 0.022 1.000   NA
 3727596 3727597 AZC_0956 AZC_0957     TRUE 0.687 54.000 0.140 NA   NA
 3727597 3727598 AZC_0957 AZC_0958     FALSE 0.046 247.000 0.000 NA   NA
 3727598 3727599 AZC_0958 AZC_0959     FALSE 0.292 138.000 0.069 NA   NA
 3727600 3727601 AZC_0960 AZC_0961     TRUE 0.965 0.000 0.043 1.000 N NA
 3727601 3727602 AZC_0961 AZC_0962     TRUE 0.632 68.000 0.137 NA   NA
 3727602 3727603 AZC_0962 AZC_0963     TRUE 0.893 82.000 0.972 NA   NA
 3727604 3727605 AZC_0964 AZC_0965   lysR FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3727608 3727609 AZC_0968 AZC_0969     TRUE 0.843 53.000 0.400 NA   NA
 3727609 3727610 AZC_0969 AZC_0970     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.001 Y NA
 3727610 3727611 AZC_0970 AZC_0971     FALSE 0.056 104.000 0.000 1.000 N NA
 3727611 3727612 AZC_0971 AZC_0972     TRUE 0.982 5.000 0.000 0.019 Y NA
 3727613 3727614 AZC_0973 AZC_0974     FALSE 0.039 178.000 0.000 1.000 N NA
 3727614 3727615 AZC_0974 AZC_0975     TRUE 0.490 14.000 0.000 1.000 N NA
 3727616 3727617 AZC_0976 AZC_0977     TRUE 0.972 -3.000 0.016 NA   NA
 3727618 3727619 AZC_0978 AZC_0979     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727621 3727622 AZC_0981 AZC_0982     FALSE 0.050 203.000 0.000 NA   NA
 3727622 3727623 AZC_0982 AZC_0983     TRUE 0.988 13.000 0.286 1.000 Y NA
 3727624 3727625 AZC_0984 AZC_0985     TRUE 0.579 442.000 0.140 1.000 Y NA
 3727625 3727626 AZC_0985 AZC_0986     FALSE 0.214 50.000 0.000 1.000   NA
 3727627 3727628 AZC_0987 AZC_0988     FALSE 0.048 221.000 0.000 NA   NA
 3727628 3727629 AZC_0988 AZC_0989     FALSE 0.039 178.000 0.000 1.000 N NA
 3727629 3727630 AZC_0989 AZC_0990     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727630 3727631 AZC_0990 AZC_0991     FALSE 0.075 104.000 0.000 NA   NA
 3727631 3727632 AZC_0991 AZC_0992     FALSE 0.058 102.000 0.000 1.000 N NA
 3727632 3727633 AZC_0992 AZC_0993   iclR FALSE 0.172 41.000 0.000 1.000 N NA
 3727634 3727635 AZC_0994 AZC_0995     TRUE 1.000 -7.000 0.857 0.001 Y NA
 3727635 3727636 AZC_0995 AZC_0996     TRUE 0.994 12.000 0.517 1.000 Y NA
 3727636 3727637 AZC_0996 AZC_0997     FALSE 0.032 313.000 0.000 1.000 N NA
 3727639 3727640 AZC_0999 AZC_1000     FALSE 0.085 106.000 0.000 1.000   NA
 3727641 3727642 AZC_1001 AZC_1002 cobW   TRUE 0.956 22.000 0.458 NA   NA
 3727642 3727643 AZC_1002 AZC_1003   ndvA FALSE 0.348 237.000 0.188 1.000 N NA
 3727644 3727645 AZC_1004 AZC_1005     FALSE 0.185 53.000 0.000 NA   NA
 3727645 3727646 AZC_1005 AZC_1006     TRUE 0.952 19.000 0.333 1.000   NA
 3727646 3727647 AZC_1006 AZC_1007     TRUE 0.985 0.000 0.167 1.000   NA
 3727647 3727648 AZC_1007 AZC_1008     FALSE 0.046 450.000 0.000 1.000   NA
 3727649 3727650 AZC_1009 AZC_1010   lysE FALSE 0.138 57.000 0.000 1.000 N NA
 3727650 3727651 AZC_1010 AZC_1011 lysE   FALSE 0.195 48.000 0.000 NA   NA
 3727651 3727652 AZC_1011 AZC_1012   recF FALSE 0.065 117.000 0.000 NA   NA
 3727652 3727653 AZC_1012 AZC_1013 recF   TRUE 0.986 15.000 0.318 1.000 Y NA
 3727653 3727654 AZC_1013 AZC_1014   dnaA TRUE 0.741 284.000 0.328 1.000 Y NA
 3727654 3727655 AZC_1014 AZC_1015 dnaA   FALSE 0.027 1148.000 0.000 1.000 N NA
 3727656 3727657 AZC_1016 AZC_1017     FALSE 0.389 44.000 0.003 1.000 N NA
 3727657 3727658 AZC_1017 AZC_1018     TRUE 0.999 -3.000 0.375 0.001 Y NA
 3727658 3727659 AZC_1018 AZC_1019     TRUE 0.966 -3.000 0.005 NA   NA
 3727659 3727660 AZC_1019 AZC_1020     FALSE 0.181 116.000 0.008 NA   NA
 3727660 3727661 AZC_1020 AZC_1021     FALSE 0.129 63.000 0.000 1.000 N NA
 3727662 3727663 AZC_1022 AZC_1023     TRUE 0.998 -3.000 0.947 NA   NA
 3727664 3727665 AZC_1024 AZC_1025     TRUE 0.995 -3.000 0.383 1.000 N NA
 3727665 3727666 AZC_1025 AZC_1026     FALSE 0.041 161.000 0.000 1.000 N NA
 3727666 3727667 AZC_1026 AZC_1027     FALSE 0.365 27.000 0.000 NA   NA
 3727667 3727668 AZC_1027 AZC_1028     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727668 3727669 AZC_1028 AZC_1029     FALSE 0.037 717.000 0.000 NA   NA
 3727669 3727670 AZC_1029 AZC_1030     FALSE 0.072 90.000 0.000 1.000 N NA
 3727670 3727671 AZC_1030 AZC_1031     FALSE 0.381 54.000 0.000 0.069 N NA
 3727671 3727672 AZC_1031 AZC_1032     FALSE 0.045 123.000 0.000 1.000 N NA
 3727672 3727673 AZC_1032 AZC_1033     FALSE 0.050 318.000 0.000 1.000   NA
 3727674 3727675 AZC_1034 AZC_1035 fdxB   FALSE 0.042 334.000 0.000 NA   NA
 3727675 3727676 AZC_1035 AZC_1036   nifX TRUE 0.975 10.000 0.309 NA   NA
 3727676 3727677 AZC_1036 AZC_1037 nifX nifN TRUE 0.979 26.000 0.663 0.004   NA
 3727677 3727678 AZC_1037 AZC_1038 nifN nifE TRUE 0.998 6.000 0.475 0.002 Y NA
 3727678 3727679 AZC_1038 AZC_1039 nifE nifK TRUE 0.892 138.000 0.380 0.002 Y NA
 3727679 3727680 AZC_1039 AZC_1040 nifK nifD TRUE 0.980 80.000 0.902 0.001 Y NA
 3727680 3727681 AZC_1040 AZC_1041 nifD nifH2 TRUE 0.756 68.000 0.098 0.001 N NA
 3727682 3727683 AZC_1042 AZC_1043 sufE fdxN FALSE 0.051 187.000 0.000 NA   NA
 3727683 3727684 AZC_1043 AZC_1044 fdxN sufB FALSE 0.164 131.000 0.004 1.000   NA
 3727684 3727685 AZC_1044 AZC_1045 sufB sufC TRUE 0.989 17.000 0.466 1.000 Y NA
 3727685 3727686 AZC_1045 AZC_1046 sufC sufD TRUE 0.999 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 3727686 3727687 AZC_1046 AZC_1047 sufD sufS TRUE 0.991 -3.000 0.193 1.000 N NA
 3727688 3727689 AZC_1048 AZC_1049   nifA TRUE 0.566 16.000 0.000 1.000   NA
 3727689 3727690 AZC_1049 AZC_1050 nifA ahpD FALSE 0.058 199.000 0.000 1.000   NA
 3727690 3727691 AZC_1050 AZC_1051 ahpD   TRUE 0.967 5.000 0.095 1.000   NA
 3727692 3727693 AZC_1052 AZC_1053   modD FALSE 0.180 125.000 0.011 NA   NA
 3727694 3727695 AZC_1054 AZC_1055     FALSE 0.072 90.000 0.000 1.000 N NA
 3727695 3727696 AZC_1055 AZC_1056     TRUE 0.999 -3.000 0.491 0.001 Y NA
 3727696 3727697 AZC_1056 AZC_1057     TRUE 0.966 79.000 0.568 0.001 Y NA
 3727697 3727698 AZC_1057 AZC_1058   phnC TRUE 0.928 124.000 0.589 0.002 Y NA
 3727698 3727699 AZC_1058 AZC_1059 phnC   FALSE 0.029 519.000 0.000 1.000 N NA
 3727699 3727700 AZC_1059 AZC_1060     FALSE 0.269 99.000 0.034 1.000 N NA
 3727701 3727702 AZC_1061 AZC_1062 tetR   TRUE 0.469 155.000 0.233 NA   NA
 3727702 3727703 AZC_1062 AZC_1063     FALSE 0.054 170.000 0.000 NA   NA
 3727703 3727704 AZC_1063 AZC_1064     FALSE 0.084 107.000 0.000 1.000   NA
 3727704 3727705 AZC_1064 AZC_1065     TRUE 0.709 48.000 0.135 1.000   NA
 3727705 3727706 AZC_1065 AZC_1066     FALSE 0.056 213.000 0.000 1.000   NA
 3727706 3727707 AZC_1066 AZC_1067     TRUE 0.983 -3.000 0.054 1.000   NA
 3727710 3727711 AZC_1070 AZC_1071     FALSE 0.074 106.000 0.000 NA   NA
 3727711 3727712 AZC_1071 AZC_1072     TRUE 0.927 12.000 0.111 1.000 N NA
 3727713 3727714 AZC_1073 AZC_1074     TRUE 0.852 23.000 0.000 NA Y NA
 3727714 3727715 AZC_1074 AZC_1075   marR FALSE 0.138 57.000 0.000 1.000 N NA
 3727715 3727716 AZC_1075 AZC_1076 marR   TRUE 0.998 -3.000 0.800 NA   NA
 3727716 3727717 AZC_1076 AZC_1077   hlyD FALSE 0.050 206.000 0.000 NA   NA
 3727717 3727718 AZC_1077 AZC_1078 hlyD   FALSE 0.035 235.000 0.000 1.000 N NA
 3727719 3727720 AZC_1079 AZC_1080 lysR   FALSE 0.037 754.000 0.000 NA   NA
 3727720 3727721 AZC_1080 AZC_1081     FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 3727721 3727722 AZC_1081 AZC_1082     FALSE 0.283 119.000 0.048 1.000   NA
 3727724 3727725 AZC_1084 AZC_1085     FALSE 0.216 101.000 0.016 1.000 N NA
 3727728 3727729 AZC_1088 AZC_1089     TRUE 0.964 9.000 0.177 NA   NA
 3727729 3727730 AZC_1089 AZC_1090     FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 3727731 3727732 AZC_1091 AZC_1092     TRUE 0.586 59.000 0.069 NA   NA
 3727733 3727734 AZC_1093 AZC_1094     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3727734 3727735 AZC_1094 AZC_1095     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727735 3727736 AZC_1095 AZC_1096     FALSE 0.145 70.000 0.000 NA   NA
 3727737 3727738 AZC_1097 AZC_1098     TRUE 0.998 -3.000 0.941 NA   NA
 3727738 3727739 AZC_1098 AZC_1099     TRUE 0.984 11.000 0.582 NA   NA
 3727744 3727745 AZC_1104 AZC_1105     FALSE 0.052 180.000 0.000 NA   NA
 3727746 3727747 AZC_1106 AZC_1107     TRUE 0.872 68.000 0.600 1.000   NA
 3727747 3727748 AZC_1107 AZC_1108   gntR FALSE 0.076 88.000 0.000 1.000 N NA
 3727749 3727750 AZC_1109 AZC_1110     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 3727750 3727751 AZC_1110 AZC_1111     FALSE 0.047 234.000 0.000 NA   NA
 3727751 3727752 AZC_1111 AZC_1112     FALSE 0.051 192.000 0.000 NA   NA
 3727752 3727753 AZC_1112 AZC_1113     TRUE 0.923 27.000 0.345 NA   NA
 3727755 3727756 AZC_1115 AZC_1116     TRUE 0.987 -3.000 0.093 NA   NA
 3727756 3727757 AZC_1116 AZC_1117     FALSE 0.208 185.000 0.035 NA   NA
 3727757 3727758 AZC_1117 AZC_1118     TRUE 0.808 27.000 0.082 NA   NA
 3727758 3727759 AZC_1118 AZC_1119     TRUE 0.997 -3.000 0.577 NA   NA
 3727759 3727760 AZC_1119 AZC_1120     TRUE 0.880 36.000 0.344 NA   NA
 3727760 3727761 AZC_1120 AZC_1121     TRUE 0.957 9.000 0.133 NA   NA
 3727762 3727763 AZC_1122 AZC_1123     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3727764 3727765 AZC_1124 AZC_1125     TRUE 0.984 8.000 0.390 NA   NA
 3727765 3727766 AZC_1125 AZC_1126     TRUE 0.996 -3.000 0.500 NA   NA
 3727766 3727767 AZC_1126 AZC_1127     TRUE 0.898 40.000 0.500 NA   NA
 3727767 3727768 AZC_1127 AZC_1128     FALSE 0.298 32.000 0.000 NA   NA
 3727768 3727769 AZC_1128 AZC_1129     FALSE 0.037 755.000 0.000 NA   NA
 3727769 3727770 AZC_1129 AZC_1130     TRUE 0.986 29.000 0.713 1.000 Y NA
 3727770 3727771 AZC_1130 AZC_1131   lipA FALSE 0.202 110.000 0.023 NA N NA
 3727771 3727772 AZC_1131 AZC_1132 lipA cycH FALSE 0.035 132.000 0.000 NA N NA
 3727772 3727773 AZC_1132 AZC_1133 cycH cycJ TRUE 0.792 80.000 0.096 1.000 Y NA
 3727773 3727774 AZC_1133 AZC_1134 cycJ ccmF TRUE 0.998 -3.000 0.125 0.002 Y NA
 3727774 3727775 AZC_1134 AZC_1135 ccmF cycL TRUE 0.997 5.000 0.644 NA Y NA
 3727775 3727776 AZC_1135 AZC_1136 cycL   FALSE 0.380 108.000 0.000 NA Y NA
 3727776 3727777 AZC_1136 AZC_1137     FALSE 0.029 481.000 0.000 1.000 N NA
 3727779 3727780 AZC_1139 AZC_1140     FALSE 0.051 112.000 0.000 1.000 N NA
 3727782 3727783 AZC_1142 AZC_1143     FALSE 0.039 490.000 0.000 NA   NA
 3727785 3727786 AZC_1145 AZC_1146   greA FALSE 0.377 344.000 0.241 1.000 N NA
 3727788 3727789 AZC_1148 AZC_1149   lysR FALSE 0.265 135.000 0.065 1.000 N NA
 3727789 3727790 AZC_1149 AZC_1150 lysR   FALSE 0.028 734.000 0.000 1.000 N NA
 3727791 3727792 AZC_1151 AZC_1152     TRUE 0.775 95.000 0.600 NA   NA
 3727792 3727793 AZC_1152 AZC_1153     TRUE 0.968 -3.000 0.008 NA   NA
 3727793 3727794 AZC_1153 AZC_trnSec12   trnSec TRUE 0.911 -131.000 0.000 NA   NA
 3727794 3727795 AZC_trnSec12 AZC_1154 trnSec   FALSE 0.036 1980.000 0.000 NA   NA
 3727795 3727796 AZC_1154 AZC_1155     TRUE 0.959 0.000 0.016 1.000   NA
 3727796 3727797 AZC_1155 AZC_1156     TRUE 0.943 8.000 0.083 NA N NA
 3727797 3727798 AZC_1156 AZC_1157     FALSE 0.350 194.000 0.182 NA N NA
 3727798 3727799 AZC_1157 AZC_1158     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.001 Y NA
 3727799 3727800 AZC_1158 AZC_1159     TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001   NA
 3727800 3727801 AZC_1159 AZC_1160     TRUE 0.877 13.000 0.000 0.002   NA
 3727802 3727803 AZC_1161 AZC_1162     TRUE 0.979 -3.000 0.054 NA N NA
 3727803 3727804 AZC_1162 AZC_1163     TRUE 0.619 85.000 0.005 NA Y NA
 3727804 3727805 AZC_1163 AZC_1164     FALSE 0.249 91.000 0.008 NA   NA
 3727806 3727807 AZC_1165 AZC_1166     FALSE 0.081 110.000 0.000 1.000   NA
 3727807 3727808 AZC_1166 AZC_1167     TRUE 0.975 3.000 0.000 1.000 Y NA
 3727808 3727809 AZC_1167 AZC_1168     FALSE 0.103 87.000 0.000 NA   NA
 3727809 3727810 AZC_1168 AZC_1169     FALSE 0.195 48.000 0.000 NA   NA
 3727810 3727811 AZC_1169 AZC_1170     TRUE 0.997 -7.000 0.250 0.002   NA
 3727811 3727812 AZC_1170 AZC_1171     TRUE 0.991 0.000 0.100 0.002   NA
 3727812 3727813 AZC_1171 AZC_1172     TRUE 0.998 9.000 0.533 0.002 Y NA
 3727814 3727815 AZC_1173 AZC_1174     TRUE 0.995 5.000 0.636 0.067 N NA
 3727815 3727816 AZC_1174 AZC_1175   araC TRUE 0.974 5.000 0.182 1.000 N NA
 3727816 3727817 AZC_1175 AZC_1176 araC   TRUE 0.954 16.000 0.333 1.000 N NA
 3727817 3727818 AZC_1176 AZC_1177     TRUE 0.996 4.000 0.148 0.066 Y NA
 3727818 3727819 AZC_1177 AZC_1178     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.019 Y NA
 3727819 3727820 AZC_1178 AZC_1179     TRUE 1.000 -3.000 0.776 0.019 Y NA
 3727822 3727823 AZC_1181 AZC_1182     FALSE 0.173 61.000 0.000 NA   NA
 3727824 3727825 AZC_1183 AZC_1184     TRUE 0.997 -3.000 0.634 1.000 N NA
 3727826 3727827 AZC_1185 AZC_1186     TRUE 0.959 65.000 0.469 0.092 Y NA
 3727827 3727828 AZC_1186 AZC_1187     TRUE 0.999 4.000 0.844 1.000 Y NA
 3727831 3727832 AZC_1190 AZC_1191 fkbM asnC FALSE 0.057 146.000 0.000 NA   NA
 3727833 3727834 AZC_1192 AZC_1193     FALSE 0.356 116.000 0.000 NA Y NA
 3727837 3727838 AZC_1196 AZC_1197     TRUE 0.733 24.000 0.032 1.000 N NA
 3727839 3727840 AZC_1198 AZC_1199   dnaJ TRUE 0.582 335.000 0.519 NA   NA
 3727842 3727843 AZC_1201 AZC_1202     FALSE 0.212 163.000 0.032 NA   NA
 3727843 3727844 AZC_1202 AZC_1203     TRUE 0.978 -3.000 0.032 NA   NA
 3727846 3727847 AZC_1205 AZC_1206 cysA   FALSE 0.162 44.000 0.000 1.000 N NA
 3727847 3727848 AZC_1206 AZC_1207   chaA FALSE 0.163 148.000 0.015 1.000 N NA
 3727848 3727849 AZC_1207 AZC_1208 chaA   TRUE 0.683 23.000 0.011 1.000 N NA
 3727850 3727851 AZC_1209 AZC_1210     FALSE 0.144 52.000 0.000 1.000 N NA
 3727851 3727852 AZC_1210 AZC_1211     FALSE 0.042 150.000 0.000 1.000 N NA
 3727852 3727853 AZC_1211 AZC_1212   sbcD TRUE 0.997 0.000 0.312 1.000 Y NA
 3727854 3727855 AZC_1213 AZC_1214     FALSE 0.063 119.000 0.000 NA   NA
 3727855 3727856 AZC_1214 AZC_1215     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727856 3727857 AZC_1215 AZC_1216     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727858 3727859 AZC_1217 AZC_1218     TRUE 0.996 -3.000 0.008 0.002 Y NA
 3727860 3727861 AZC_1219 AZC_1220 surE   FALSE 0.047 233.000 0.000 NA   NA
 3727861 3727862 AZC_1220 AZC_1221     TRUE 0.620 52.000 0.078 NA   NA
 3727862 3727863 AZC_1221 AZC_1222     FALSE 0.028 229.000 0.000 NA N NA
 3727866 3727867 AZC_1225 AZC_1226     FALSE 0.058 145.000 0.000 NA   NA
 3727867 3727868 AZC_1226 AZC_1227     FALSE 0.276 115.000 0.045 NA   NA
 3727869 3727870 AZC_1228 AZC_1229     FALSE 0.090 93.000 0.000 NA   NA
 3727872 3727873 AZC_1231 AZC_1232     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.092 Y NA
 3727873 3727874 AZC_1232 AZC_1233     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.092 Y NA
 3727874 3727875 AZC_1233 AZC_1234     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.092 Y NA
 3727875 3727876 AZC_1234 AZC_1235     TRUE 0.999 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 3727876 3727877 AZC_1235 AZC_1236     TRUE 0.952 17.000 0.300 1.000   NA
 3727877 3727878 AZC_1236 AZC_1237     TRUE 0.997 -3.000 0.300 0.067   NA
 3727878 3727879 AZC_1237 AZC_1238     TRUE 0.994 2.000 0.333 0.066   NA
 3727879 3727880 AZC_1238 AZC_1239     TRUE 0.546 77.000 0.000 1.000 Y NA
 3727881 3727882 AZC_1240 AZC_1241     TRUE 0.827 21.000 0.043 1.000   NA
 3727882 3727883 AZC_1241 AZC_1242     FALSE 0.045 124.000 0.000 1.000 N NA
 3727884 3727885 AZC_1243 AZC_1244     FALSE 0.380 88.000 0.058 1.000 N NA
 3727885 3727886 AZC_1244 AZC_1245     TRUE 0.754 8.000 0.000 1.000   NA
 3727887 3727888 AZC_1246 AZC_1247     FALSE 0.180 57.000 0.000 NA   NA
 3727889 3727890 AZC_1248 AZC_1249 bcpB   FALSE 0.058 142.000 0.000 NA   NA
 3727891 3727892 AZC_1250 AZC_1251     FALSE 0.356 19.000 0.000 NA N NA
 3727892 3727893 AZC_1251 AZC_1252     TRUE 0.969 9.000 0.204 NA   NA
 3727897 3727898 AZC_1256 AZC_1257     FALSE 0.425 201.000 0.222 NA   NA
 3727899 3727900 AZC_1258 AZC_1259 exbB exbD TRUE 0.998 4.000 0.810 1.000 Y NA
 3727900 3727901 AZC_1259 AZC_1260 exbD   TRUE 0.985 -3.000 0.089 1.000 N NA
 3727901 3727902 AZC_1260 AZC_1261     FALSE 0.039 177.000 0.000 1.000 N NA
 3727902 3727903 AZC_1261 AZC_1262     FALSE 0.278 106.000 0.052 NA N NA
 3727903 3727904 AZC_1262 AZC_1263   ribD TRUE 0.979 6.000 0.277 NA N NA
 3727904 3727905 AZC_1263 AZC_1264 ribD   TRUE 0.837 130.000 0.456 1.000 Y NA
 3727905 3727906 AZC_1264 AZC_1265     TRUE 0.704 145.000 0.030 0.001 Y NA
 3727906 3727907 AZC_1265 AZC_1266   nusB TRUE 0.820 50.000 0.347 1.000 N NA
 3727907 3727908 AZC_1266 AZC_1267 nusB   TRUE 0.913 22.000 0.225 1.000 N NA
 3727908 3727909 AZC_1267 AZC_1268     FALSE 0.029 453.000 0.000 1.000 N NA
 3727909 3727910 AZC_1268 AZC_1269   arsR FALSE 0.027 859.000 0.000 1.000 N NA
 3727910 3727911 AZC_1269 AZC_1270 arsR   TRUE 0.883 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3727911 3727912 AZC_1270 AZC_1271     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3727912 3727913 AZC_1271 AZC_1272     TRUE 0.849 24.000 0.000 1.000 Y NA
 3727914 3727915 AZC_1273 AZC_1274   arsH TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 3727915 3727916 AZC_1274 AZC_1275 arsH   TRUE 0.512 17.000 0.000 NA   NA
 3727916 3727917 AZC_1275 AZC_1276     FALSE 0.178 35.000 0.000 NA N NA
 3727917 3727918 AZC_1276 AZC_1277     FALSE 0.044 303.000 0.000 NA   NA
 3727918 3727919 AZC_1277 AZC_1278     TRUE 0.769 48.000 0.218 NA   NA
 3727919 3727920 AZC_1278 AZC_1279     TRUE 0.998 -3.000 0.857 NA N NA
 3727921 3727922 AZC_1280 AZC_1281     FALSE 0.033 276.000 0.000 1.000 N NA
 3727922 3727923 AZC_1281 AZC_1282     TRUE 0.465 186.000 0.000 0.015 Y NA
 3727923 3727924 AZC_1282 AZC_1283     FALSE 0.034 268.000 0.000 1.000 N NA
 3727924 3727925 AZC_1283 AZC_1284     TRUE 0.999 -3.000 0.538 NA Y NA
 3727925 3727926 AZC_1284 AZC_1285     TRUE 0.968 43.000 0.636 NA Y NA
 3727928 3727929 AZC_1287 AZC_1288     FALSE 0.080 111.000 0.000 1.000   NA
 3727929 3727930 AZC_1288 AZC_1289     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727930 3727931 AZC_1289 AZC_1290     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3727933 3727934 AZC_1292 AZC_1293     TRUE 0.961 30.000 0.800 NA   NA
 3727934 3727935 AZC_1293 AZC_1294     FALSE 0.377 26.000 0.000 NA   NA
 3727937 3727938 AZC_1296 AZC_1297     TRUE 0.990 -3.000 0.152 NA   NA
 3727939 3727940 AZC_1298 AZC_1299 lysR   FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 3727940 3727941 AZC_1299 AZC_1300     TRUE 0.984 33.000 0.500 0.022 Y NA
 3727944 3727945 AZC_1303 AZC_1304     FALSE 0.060 185.000 0.000 1.000   NA
 3727945 3727946 AZC_1304 AZC_1305     TRUE 0.990 4.000 0.364 1.000   NA
 3727947 3727948 AZC_1306 AZC_1307     FALSE 0.050 198.000 0.000 NA   NA
 3727948 3727949 AZC_1307 AZC_1308   lysR FALSE 0.037 201.000 0.000 1.000 N NA
 3727950 3727951 AZC_1309 AZC_1310     TRUE 0.966 26.000 0.750 NA   NA
 3727953 3727954 AZC_1312 AZC_1313     TRUE 0.988 -3.000 0.111 NA   NA
 3727955 3727956 AZC_1314 AZC_1315 araC   FALSE 0.031 337.000 0.000 1.000 N NA
 3727958 3727959 AZC_1317 AZC_1318     FALSE 0.083 108.000 0.000 1.000   NA
 3727959 3727960 AZC_1318 AZC_1319     TRUE 0.985 2.000 0.088 0.082   NA
 3727960 3727961 AZC_1319 AZC_1320     TRUE 0.679 10.000 0.000 NA   NA
 3727961 3727962 AZC_1320 AZC_1321     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727962 3727963 AZC_1321 AZC_1322     TRUE 0.779 5.000 0.000 NA   NA
 3727963 3727964 AZC_1322 AZC_1323     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3727966 3727967 AZC_1325 AZC_1326     FALSE 0.027 874.000 0.000 1.000 N NA
 3727967 3727968 AZC_1326 AZC_1327   araC FALSE 0.029 446.000 0.000 1.000 N NA
 3727969 3727970 AZC_1328 AZC_1329     FALSE 0.041 388.000 0.000 NA   NA
 3727970 3727971 AZC_1329 AZC_1330     FALSE 0.044 295.000 0.000 NA   NA
 3727971 3727972 AZC_1330 AZC_1331   fecI FALSE 0.042 348.000 0.000 NA   NA
 3727972 3727973 AZC_1331 AZC_1332 fecI fecR TRUE 0.826 105.000 1.000 NA N NA
 3727973 3727974 AZC_1332 AZC_1333 fecR   FALSE 0.356 116.000 0.000 NA Y NA
 3727975 3727976 AZC_1334 AZC_1335     FALSE 0.414 26.000 0.000 1.000   NA
 3727977 3727978 AZC_1336 AZC_1337 lysR   FALSE 0.045 283.000 0.000 NA   NA
 3727978 3727979 AZC_1337 AZC_1338     FALSE 0.117 81.000 0.000 NA   NA
 3727979 3727980 AZC_1338 AZC_1339     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3727980 3727981 AZC_1339 AZC_1340     FALSE 0.294 85.000 0.000 0.066   NA
 3727981 3727982 AZC_1340 AZC_1341     FALSE 0.348 126.000 0.000 1.000 Y NA
 3727982 3727983 AZC_1341 AZC_1342   crcB FALSE 0.027 261.000 0.000 NA N NA
 3727983 3727984 AZC_1342 AZC_1343 crcB   FALSE 0.185 34.000 0.000 NA N NA
 3727987 3727988 AZC_1346 AZC_1347     FALSE 0.044 553.000 0.000 1.000   NA
 3727988 3727989 AZC_1347 AZC_1348     FALSE 0.035 240.000 0.000 1.000 N NA
 3727990 3727991 AZC_1349 AZC_1350     FALSE 0.183 55.000 0.000 NA   NA
 3727991 3727992 AZC_1350 AZC_1351     TRUE 0.995 -3.000 0.050 1.000 Y NA
 3727992 3727993 AZC_1351 AZC_1352     FALSE 0.029 446.000 0.000 1.000 N NA
 3727994 3727995 AZC_1353 AZC_1354     TRUE 0.999 -3.000 0.556 0.066 Y NA
 3727995 3727996 AZC_1354 AZC_1355     FALSE 0.129 63.000 0.000 1.000 N NA
 3727996 3727997 AZC_1355 AZC_1356     FALSE 0.033 270.000 0.000 1.000 N NA
 3727997 3727998 AZC_1356 AZC_1357     FALSE 0.038 189.000 0.000 1.000 N NA
 3727998 3727999 AZC_1357 AZC_1358     TRUE 0.579 64.000 0.074 NA   NA
 3727999 3728000 AZC_1358 AZC_1359     TRUE 0.936 10.000 0.074 NA   NA
 3728001 3728002 AZC_1360 AZC_1361   nodW TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.022 Y NA
 3728002 3728003 AZC_1361 AZC_1362 nodW   TRUE 0.901 27.000 0.000 0.018 Y NA
 3728004 3728005 AZC_1363 AZC_1364   hlyD TRUE 0.993 -3.000 0.292 NA N NA
 3728006 3728007 AZC_1365 AZC_1366     TRUE 0.596 63.000 0.072 1.000   NA
 3728011 3728012 AZC_1370 AZC_1371     FALSE 0.161 66.000 0.000 NA   NA
 3728012 3728013 AZC_1371 AZC_1372     TRUE 0.951 27.000 0.565 NA   NA
 3728013 3728014 AZC_1372 AZC_1373     TRUE 0.878 57.000 0.543 NA   NA
 3728014 3728015 AZC_1373 AZC_1374     FALSE 0.398 112.000 0.122 NA   NA
 3728015 3728016 AZC_1374 AZC_1375     TRUE 0.992 -3.000 0.224 1.000 N NA
 3728016 3728017 AZC_1375 AZC_1376     FALSE 0.286 28.000 0.000 1.000 N NA
 3728017 3728018 AZC_1376 AZC_1377     FALSE 0.058 102.000 0.000 1.000 N NA
 3728018 3728019 AZC_1377 AZC_1378   tetR FALSE 0.034 264.000 0.000 1.000 N NA
 3728019 3728020 AZC_1378 AZC_1379 tetR   FALSE 0.068 133.000 0.000 1.000   NA
 3728020 3728021 AZC_1379 AZC_1380   matE TRUE 0.481 22.000 0.000 1.000   NA
 3728022 3728023 AZC_1381 AZC_1382   marR TRUE 0.762 43.000 0.185 NA   NA
 3728024 3728025 AZC_1383 AZC_1384     FALSE 0.318 88.000 0.000 0.011   NA
 3728025 3728026 AZC_1384 AZC_1385     FALSE 0.325 30.000 0.000 NA   NA
 3728027 3728028 AZC_1386 AZC_1387     FALSE 0.055 233.000 0.000 1.000   NA
 3728028 3728029 AZC_1387 AZC_1388     TRUE 0.481 116.000 0.200 1.000   NA
 3728030 3728031 AZC_1389 AZC_1390     FALSE 0.166 64.000 0.000 NA   NA
 3728032 3728033 AZC_1391 AZC_1392     FALSE 0.182 66.000 0.000 1.000   NA
 3728033 3728034 AZC_1392 AZC_1393     TRUE 0.935 4.000 0.000 0.066   NA
 3728034 3728035 AZC_1393 AZC_1394     TRUE 0.997 2.000 0.143 0.002 Y NA
 3728037 3728038 AZC_1396 AZC_1397     FALSE 0.058 196.000 0.000 1.000   NA
 3728038 3728039 AZC_1397 AZC_1398     FALSE 0.138 194.000 0.000 0.042 N NA
 3728039 3728040 AZC_1398 AZC_1399     FALSE 0.053 174.000 0.000 NA   NA
 3728040 3728041 AZC_1399 AZC_1400     FALSE 0.074 106.000 0.000 NA   NA
 3728041 3728042 AZC_1400 AZC_1401     TRUE 0.999 5.000 0.917 0.001 Y NA
 3728042 3728043 AZC_1401 AZC_1402     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.066 Y NA
 3728044 3728045 AZC_1403 AZC_1404     TRUE 0.999 -3.000 0.263 0.003 Y NA
 3728045 3728046 AZC_1404 AZC_1405     FALSE 0.266 355.000 0.000 1.000 Y NA
 3728046 3728047 AZC_1405 AZC_1406     FALSE 0.064 118.000 0.000 NA   NA
 3728051 3728052 AZC_1410 AZC_1411     TRUE 0.486 46.000 0.017 NA   NA
 3728052 3728053 AZC_1411 AZC_1412     TRUE 0.977 4.000 0.167 1.000 N NA
 3728053 3728054 AZC_1412 AZC_1413     TRUE 0.940 11.000 0.133 1.000 N NA
 3728054 3728055 AZC_1413 AZC_1414     TRUE 0.988 -3.000 0.133 1.000 N NA
 3728055 3728056 AZC_1414 AZC_1415     FALSE 0.299 85.000 0.021 1.000 N NA
 3728056 3728057 AZC_1415 AZC_1416     TRUE 0.971 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3728057 3728058 AZC_1416 AZC_1417     TRUE 0.966 32.000 0.357 1.000 Y NA
 3728058 3728059 AZC_1417 AZC_1418     TRUE 0.999 -3.000 0.357 0.091 Y NA
 3728059 3728060 AZC_1418 AZC_1419     TRUE 0.961 41.000 0.500 NA Y NA
 3728060 3728061 AZC_1419 AZC_1420     TRUE 0.647 97.000 0.333 NA   NA
 3728065 3728066 AZC_1424 AZC_1425     TRUE 0.945 16.000 0.271 1.000 N NA
 3728066 3728067 AZC_1425 AZC_1426     TRUE 0.999 -3.000 0.405 0.001 Y NA
 3728067 3728068 AZC_1426 AZC_1427     TRUE 1.000 -3.000 0.625 0.001 Y NA
 3728068 3728069 AZC_1427 AZC_1428     TRUE 0.997 13.000 0.583 0.001 Y NA
 3728069 3728070 AZC_1428 AZC_1429     TRUE 0.992 -3.000 0.242 1.000 N NA
 3728070 3728071 AZC_1429 AZC_1430     FALSE 0.033 288.000 0.000 1.000 N NA
 3728071 3728072 AZC_1430 AZC_1431     TRUE 0.987 4.000 0.000 0.003 Y NA
 3728072 3728073 AZC_1431 AZC_1432     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3728073 3728074 AZC_1432 AZC_1433   nnrS TRUE 0.788 23.000 0.041 NA   NA
 3728074 3728075 AZC_1433 AZC_1434 nnrS   FALSE 0.171 62.000 0.000 NA   NA
 3728076 3728077 AZC_1435 AZC_1436     FALSE 0.050 114.000 0.000 1.000 N NA
 3728077 3728078 AZC_1436 AZC_1437     TRUE 1.000 -19.000 0.824 0.042 Y NA
 3728078 3728079 AZC_1437 AZC_1438     TRUE 0.999 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 3728079 3728080 AZC_1438 AZC_1439     TRUE 0.999 2.000 1.000 0.090 Y NA
 3728080 3728081 AZC_1439 AZC_1440     TRUE 0.989 29.000 0.867 1.000 Y NA
 3728081 3728082 AZC_1440 AZC_1441     FALSE 0.348 80.000 0.028 1.000 N NA
 3728082 3728083 AZC_1441 AZC_1442     TRUE 0.720 76.000 0.314 1.000 N NA
 3728083 3728084 AZC_1442 AZC_1443     TRUE 0.999 0.000 0.782 0.001 Y NA
 3728084 3728085 AZC_1443 AZC_1444     FALSE 0.066 150.000 0.000 1.000   NA
 3728090 3728091 AZC_1449 AZC_1450     TRUE 0.998 11.000 1.000 0.012 Y NA
 3728091 3728092 AZC_1450 AZC_1451     TRUE 0.966 57.000 0.500 0.090 Y NA
 3728092 3728093 AZC_1451 AZC_1452     TRUE 0.979 29.000 0.500 1.000 Y NA
 3728093 3728094 AZC_1452 AZC_1453     TRUE 0.463 91.000 0.000 1.000 Y NA
 3728094 3728095 AZC_1453 AZC_1454     TRUE 0.916 14.000 0.000 1.000 Y NA
 3728095 3728096 AZC_1454 AZC_1455     FALSE 0.121 86.000 0.000 1.000   NA
 3728101 3728102 AZC_trnM13 AZC_1460 trnM   FALSE 0.045 267.000 0.000 NA   NA
 3728105 3728106 AZC_1463 AZC_1464     FALSE 0.187 52.000 0.000 NA   NA
 3728106 3728107 AZC_1464 AZC_1465     FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 3728108 3728109 AZC_1466 AZC_1467   thrB TRUE 0.988 -3.000 0.104 1.000   NA
 3728109 3728110 AZC_1467 AZC_1468 thrB   TRUE 0.986 4.000 0.251 1.000   NA
 3728110 3728111 AZC_1468 AZC_1469     FALSE 0.092 92.000 0.000 NA   NA
 3728114 3728115 AZC_1472 AZC_1473     TRUE 0.996 -3.000 0.412 NA   NA
 3728116 3728117 AZC_1474 AZC_1475     FALSE 0.081 110.000 0.000 1.000   NA
 3728117 3728118 AZC_1475 AZC_1476     FALSE 0.067 134.000 0.000 1.000   NA
 3728120 3728121 AZC_1478 AZC_1479     FALSE 0.247 37.000 0.000 NA   NA
 3728121 3728122 AZC_1479 AZC_1480     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728122 3728123 AZC_1480 AZC_1481     FALSE 0.123 79.000 0.000 NA   NA
 3728124 3728125 AZC_1482 AZC_1483     TRUE 0.817 14.000 0.011 NA   NA
 3728126 3728127 AZC_1484 AZC_1485     FALSE 0.377 26.000 0.000 NA   NA
 3728127 3728128 AZC_1485 AZC_1486     FALSE 0.306 82.000 0.011 NA   NA
 3728131 3728132 AZC_1489 AZC_1490     FALSE 0.143 53.000 0.000 1.000 N NA
 3728132 3728133 AZC_1490 AZC_1491     TRUE 0.864 39.000 0.375 1.000 N NA
 3728134 3728135 AZC_1492 AZC_1493     FALSE 0.336 123.000 0.111 1.000 N NA
 3728135 3728136 AZC_1493 AZC_1494     TRUE 0.996 2.000 0.444 0.002   NA
 3728136 3728137 AZC_1494 AZC_1495     TRUE 0.998 -3.000 0.433 0.002   NA
 3728137 3728138 AZC_1495 AZC_1496     TRUE 0.998 14.000 0.875 0.002 Y NA
 3728139 3728140 AZC_1497 AZC_1498 araC   FALSE 0.102 573.000 0.000 0.095   NA
 3728141 3728142 AZC_1499 AZC_1500     TRUE 0.906 89.000 0.493 1.000 Y NA
 3728142 3728143 AZC_1500 AZC_1501     TRUE 0.996 14.000 0.901 1.000 Y NA
 3728143 3728144 AZC_1501 AZC_1502     TRUE 0.999 -3.000 0.786 1.000 Y NA
 3728144 3728145 AZC_1502 AZC_1503     FALSE 0.272 96.000 0.029 1.000 N NA
 3728145 3728146 AZC_1503 AZC_1504     FALSE 0.063 168.000 0.000 1.000   NA
 3728149 3728150 AZC_1506 AZC_1507 arsR   TRUE 0.478 44.000 0.020 1.000 N NA
 3728150 3728151 AZC_1507 AZC_1508     FALSE 0.074 118.000 0.000 1.000   NA
 3728151 3728152 AZC_1508 AZC_1509     FALSE 0.070 125.000 0.000 1.000   NA
 3728152 3728153 AZC_1509 AZC_1510     TRUE 0.996 8.000 0.466 1.000 Y NA
 3728153 3728154 AZC_1510 AZC_1511     FALSE 0.027 1101.000 0.000 1.000 N NA
 3728154 3728155 AZC_1511 AZC_1512     TRUE 0.863 340.000 0.556 0.090 Y NA
 3728155 3728156 AZC_1512 AZC_1513     TRUE 1.000 -3.000 0.818 0.090 Y NA
 3728156 3728157 AZC_1513 AZC_1514     TRUE 0.998 -3.000 0.818 1.000   NA
 3728157 3728158 AZC_1514 AZC_1515     FALSE 0.056 215.000 0.000 1.000   NA
 3728158 3728159 AZC_1515 AZC_1516     TRUE 0.935 15.000 0.189 NA   NA
 3728159 3728160 AZC_1516 AZC_1517   gntR TRUE 0.879 33.000 0.300 NA   NA
 3728161 3728162 AZC_1518 AZC_1519     FALSE 0.134 74.000 0.000 NA   NA
 3728163 3728164 AZC_1520 AZC_1521     TRUE 0.998 2.000 0.600 NA Y NA
 3728164 3728165 AZC_1521 AZC_1522     TRUE 0.649 50.000 0.000 NA Y NA
 3728167 3728168 AZC_1524 AZC_1525     TRUE 0.712 23.000 0.011 NA   NA
 3728170 3728171 AZC_1527 AZC_1528     FALSE 0.392 2086.000 0.000 0.006 Y NA
 3728171 3728172 AZC_1528 AZC_1529     FALSE 0.259 421.000 0.000 1.000 Y NA
 3728172 3728173 AZC_1529 AZC_1530     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3728174 3728175 AZC_trnQ15 AZC_1531 trnQ   FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 3728175 3728176 AZC_1531 AZC_1532     FALSE 0.040 455.000 0.000 NA   NA
 3728176 3728177 AZC_1532 AZC_1533     TRUE 0.997 -3.000 0.632 NA   NA
 3728177 3728178 AZC_1533 AZC_1534     TRUE 0.917 -3.000 0.000 1.000   NA
 3728178 3728179 AZC_1534 AZC_1535   argK TRUE 0.949 5.000 0.054 1.000 N NA
 3728179 3728180 AZC_1535 AZC_1536 argK   FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 3728180 3728181 AZC_1536 AZC_1537     TRUE 0.902 79.000 1.000 NA   NA
 3728183 3728184 AZC_1539 AZC_1540     FALSE 0.382 45.000 0.005 NA N NA
 3728184 3728185 AZC_1540 AZC_1541     TRUE 0.548 81.000 0.128 NA   NA
 3728185 3728186 AZC_1541 AZC_1542     FALSE 0.289 33.000 0.000 NA   NA
 3728186 3728187 AZC_1542 AZC_1543     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3728188 3728189 AZC_1544 AZC_1545     TRUE 0.995 -3.000 0.347 NA   NA
 3728189 3728190 AZC_1545 AZC_1546     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 3728190 3728191 AZC_1546 AZC_1547     FALSE 0.145 70.000 0.000 NA   NA
 3728192 3728193 AZC_1548 AZC_1549     TRUE 0.991 0.000 0.029 1.000 Y NA
 3728193 3728194 AZC_1549 AZC_1550     TRUE 0.989 -3.000 0.161 1.000 N NA
 3728194 3728195 AZC_1550 AZC_1551     FALSE 0.247 197.000 0.071 1.000 N NA
 3728195 3728196 AZC_1551 AZC_1552     TRUE 0.999 2.000 0.742 1.000 Y NA
 3728196 3728197 AZC_1552 AZC_1553     TRUE 0.999 2.000 0.871 0.090 Y NA
 3728197 3728198 AZC_1553 AZC_1554     TRUE 0.864 438.000 0.593 0.090 Y NA
 3728200 3728201 AZC_1556 AZC_1557     FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3728201 3728202 AZC_1557 AZC_1558     FALSE 0.030 198.000 0.000 NA N NA
 3728202 3728203 AZC_1558 AZC_1559     FALSE 0.120 80.000 0.000 NA   NA
 3728204 3728205 AZC_1560 AZC_1561     TRUE 0.478 70.000 0.045 NA   NA
 3728205 3728206 AZC_1561 AZC_trnR16   trnR FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 3728207 3728208 AZC_1562 AZC_1563     FALSE 0.045 283.000 0.000 NA   NA
 3728209 3728210 AZC_1564 AZC_1565     FALSE 0.029 498.000 0.000 1.000 N NA
 3728210 3728211 AZC_1565 AZC_1566     TRUE 0.986 21.000 0.201 0.001 Y NA
 3728211 3728212 AZC_1566 AZC_1567     TRUE 0.997 16.000 0.877 0.001 Y NA
 3728212 3728213 AZC_1567 AZC_1568     FALSE 0.241 428.000 0.106 1.000 N NA
 3728213 3728214 AZC_1568 AZC_1569     TRUE 0.999 -3.000 0.695 1.000 Y NA
 3728214 3728215 AZC_1569 AZC_1570     FALSE 0.045 270.000 0.000 NA   NA
 3728215 3728216 AZC_1570 AZC_1571     FALSE 0.057 148.000 0.000 NA   NA
 3728216 3728217 AZC_1571 AZC_1572     FALSE 0.029 515.000 0.000 1.000 N NA
 3728217 3728218 AZC_1572 AZC_1573     FALSE 0.398 85.000 0.047 NA   NA
 3728220 3728221 AZC_1575 AZC_1576   hlyD FALSE 0.038 185.000 0.000 1.000 N NA
 3728221 3728222 AZC_1576 AZC_1577 hlyD   TRUE 0.985 4.000 0.300 NA N NA
 3728222 3728223 AZC_1577 AZC_1578     FALSE 0.048 229.000 0.000 NA   NA
 3728223 3728224 AZC_1578 AZC_1579     FALSE 0.058 141.000 0.000 NA   NA
 3728224 3728225 AZC_1579 AZC_1580     FALSE 0.045 282.000 0.000 NA   NA
 3728225 3728226 AZC_1580 AZC_1581     TRUE 0.988 -3.000 0.103 1.000   NA
 3728226 3728227 AZC_1581 AZC_1582     TRUE 0.830 4.000 0.000 1.000   NA
 3728227 3728228 AZC_1582 AZC_1583     TRUE 0.961 8.000 0.120 1.000   NA
 3728230 3728231 AZC_1585 AZC_1586     TRUE 0.675 327.000 0.129 0.089 Y NA
 3728231 3728232 AZC_1586 AZC_1587     TRUE 0.997 13.000 0.815 0.012 Y NA
 3728232 3728233 AZC_1587 AZC_1588     TRUE 0.999 -3.000 0.734 1.000 Y NA
 3728235 3728236 AZC_1590 AZC_1591   dnaJ TRUE 0.893 30.000 0.286 NA   NA
 3728238 3728239 AZC_1593 AZC_1594   clpS FALSE 0.130 325.000 0.011 NA   NA
 3728239 3728240 AZC_1594 AZC_1595 clpS   TRUE 0.674 166.000 0.596 NA   NA
 3728241 3728242 AZC_1596 AZC_1597     TRUE 0.983 -3.000 0.014 0.080 N NA
 3728242 3728243 AZC_1597 AZC_1598     TRUE 0.997 -3.000 0.180 1.000 Y NA
 3728244 3728245 AZC_1599 AZC_1600     TRUE 0.994 -3.000 0.275 NA   NA
 3728246 3728247 AZC_1601 AZC_1602 glnA glnB TRUE 0.884 54.000 0.145 1.000 Y NA
 3728249 3728250 AZC_1604 AZC_1605     FALSE 0.122 231.000 0.000 0.064 N NA
 3728251 3728252 AZC_1606 AZC_trnL17 lysR trnL FALSE 0.054 173.000 0.000 NA   NA
 3728252 3728253 AZC_trnL17 AZC_1607 trnL   FALSE 0.076 103.000 0.000 NA   NA
 3728253 3728254 AZC_1607 AZC_1608     TRUE 0.928 65.000 0.351 1.000 Y NA
 3728254 3728255 AZC_1608 AZC_1609   clpX TRUE 0.724 562.000 0.352 1.000 Y NA
 3728255 3728256 AZC_1609 AZC_1610 clpX   TRUE 0.721 139.000 0.201 1.000 Y NA
 3728256 3728257 AZC_1610 AZC_1611     FALSE 0.031 352.000 0.000 1.000 N NA
 3728261 3728262 AZC_trnV18 AZC_1615 trnV   FALSE 0.059 131.000 0.000 NA   NA
 3728262 3728263 AZC_1615 AZC_1616     FALSE 0.046 246.000 0.000 NA   NA
 3728264 3728265 AZC_trnD19 AZC_1617 trnD   FALSE 0.043 316.000 0.000 NA   NA
 3728265 3728266 AZC_1617 AZC_1618     FALSE 0.079 100.000 0.000 NA   NA
 3728266 3728267 AZC_1618 AZC_1619     FALSE 0.137 73.000 0.000 NA   NA
 3728267 3728268 AZC_1619 AZC_1620     TRUE 0.553 10.000 0.000 NA N NA
 3728268 3728269 AZC_1620 AZC_1621     FALSE 0.043 109.000 0.000 NA N NA
 3728269 3728270 AZC_1621 AZC_1622     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA N NA
 3728270 3728271 AZC_1622 AZC_1623     TRUE 0.994 4.000 0.182 NA Y NA
 3728271 3728272 AZC_1623 AZC_1624     TRUE 0.988 23.000 0.643 1.000 Y NA
 3728272 3728273 AZC_1624 AZC_1625     TRUE 0.996 -3.000 0.094 1.000 Y NA
 3728273 3728274 AZC_1625 AZC_1626     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3728280 3728281 AZC_1632 AZC_1633   yjbN FALSE 0.032 314.000 0.000 1.000 N NA
 3728281 3728282 AZC_1633 AZC_1634 yjbN   FALSE 0.046 262.000 0.000 NA   NA
 3728282 3728283 AZC_1634 AZC_1635     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728284 3728285 AZC_1636 AZC_1637 gntR   FALSE 0.037 197.000 0.000 1.000 N NA
 3728285 3728286 AZC_1637 AZC_1638     FALSE 0.052 276.000 0.000 1.000   NA
 3728286 3728287 AZC_1638 AZC_1639     FALSE 0.131 82.000 0.000 1.000   NA
 3728287 3728288 AZC_1639 AZC_1640     TRUE 0.995 -3.000 0.043 NA Y NA
 3728288 3728289 AZC_1640 AZC_1641     TRUE 0.995 -3.000 0.043 NA Y NA
 3728289 3728290 AZC_1641 AZC_1642     TRUE 0.847 -3.000 0.000 NA N NA
 3728290 3728291 AZC_1642 AZC_1643     FALSE 0.028 238.000 0.000 NA N NA
 3728291 3728292 AZC_1643 AZC_1644     FALSE 0.146 120.000 0.000 0.080 N NA
 3728292 3728293 AZC_1644 AZC_1645     TRUE 0.994 -7.000 0.025 1.000 Y NA
 3728293 3728294 AZC_1645 AZC_1646     TRUE 0.980 -3.000 0.034 1.000   NA
 3728294 3728295 AZC_1646 AZC_1647     TRUE 0.986 -3.000 0.086 NA   NA
 3728295 3728296 AZC_1647 AZC_1648     TRUE 0.982 5.000 0.241 NA   NA
 3728296 3728297 AZC_1648 AZC_1649     TRUE 0.972 5.000 0.147 NA   NA
 3728297 3728298 AZC_1649 AZC_1650     TRUE 0.988 -3.000 0.118 NA   NA
 3728298 3728299 AZC_1650 AZC_1651     TRUE 0.995 -12.000 0.333 NA   NA
 3728299 3728300 AZC_1651 AZC_1652     TRUE 0.978 7.000 0.250 NA   NA
 3728300 3728301 AZC_1652 AZC_1653     TRUE 0.966 32.000 0.357 1.000 Y NA
 3728301 3728302 AZC_1653 AZC_1654   mipA TRUE 0.989 -7.000 0.143 1.000 N NA
 3728303 3728304 AZC_1655 AZC_1656   mazG TRUE 0.853 2.000 0.000 1.000   NA
 3728305 3728306 AZC_1657 AZC_1658     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3728307 3728308 AZC_1659 AZC_1660     TRUE 0.979 19.000 0.791 NA   NA
 3728308 3728309 AZC_1660 AZC_1661   sixA TRUE 0.942 4.000 0.020 NA   NA
 3728310 3728311 AZC_1662 AZC_1663   mipA FALSE 0.041 113.000 0.000 NA N NA
 3728311 3728312 AZC_1663 AZC_1664 mipA   FALSE 0.030 193.000 0.000 NA N NA
 3728312 3728313 AZC_1664 AZC_1665     TRUE 0.486 19.000 0.000 NA   NA
 3728313 3728314 AZC_1665 AZC_1666     FALSE 0.062 122.000 0.000 NA   NA
 3728314 3728315 AZC_1666 AZC_1667     FALSE 0.028 576.000 0.000 1.000 N NA
 3728315 3728316 AZC_1667 AZC_1668     TRUE 0.999 -3.000 0.396 0.003 Y NA
 3728316 3728317 AZC_1668 AZC_1669     TRUE 0.978 31.000 0.262 0.003 Y NA
 3728317 3728318 AZC_1669 AZC_1670     TRUE 0.996 12.000 0.483 0.006 Y NA
 3728318 3728319 AZC_1670 AZC_1671     TRUE 0.840 353.000 0.355 0.006 Y NA
 3728319 3728320 AZC_1671 AZC_1672     TRUE 0.998 4.000 0.343 0.006 Y NA
 3728320 3728321 AZC_1672 AZC_1673     TRUE 0.757 6.000 0.000 NA   NA
 3728321 3728322 AZC_1673 AZC_1674     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3728322 3728323 AZC_1674 AZC_1675     TRUE 0.957 82.000 0.515 0.006 Y NA
 3728323 3728324 AZC_1675 AZC_1676     TRUE 0.971 62.000 0.500 0.006 Y NA
 3728324 3728325 AZC_1676 AZC_1677     TRUE 0.875 240.000 0.442 0.006 Y NA
 3728325 3728326 AZC_1677 AZC_1678     TRUE 0.995 14.000 0.484 0.003 Y NA
 3728326 3728327 AZC_1678 AZC_1679     TRUE 0.998 5.000 0.451 0.006 Y NA
 3728327 3728328 AZC_1679 AZC_1680     TRUE 0.998 3.000 0.251 0.002 Y NA
 3728328 3728329 AZC_1680 AZC_1681     TRUE 0.994 16.000 0.453 0.002 Y NA
 3728329 3728330 AZC_1681 AZC_1682     TRUE 0.520 201.000 0.372 1.000 N NA
 3728330 3728331 AZC_1682 AZC_1683     TRUE 0.978 9.000 0.307 1.000   NA
 3728331 3728332 AZC_1683 AZC_1684     TRUE 0.656 58.000 0.105 1.000   NA
 3728332 3728333 AZC_1684 AZC_1685     TRUE 0.942 13.000 0.172 NA   NA
 3728333 3728334 AZC_1685 AZC_1686     FALSE 0.107 636.000 0.006 NA   NA
 3728334 3728335 AZC_1686 AZC_1687   lolC TRUE 0.984 -3.000 0.076 1.000 N NA
 3728335 3728336 AZC_1687 AZC_1688 lolC lolD TRUE 0.997 -3.000 0.620 1.000 N NA
 3728338 3728339 AZC_1690 AZC_1691     FALSE 0.094 91.000 0.000 NA   NA
 3728341 3728342 AZC_1693 AZC_1694     TRUE 0.918 104.000 0.748 1.000 Y NA
 3728342 3728343 AZC_1694 AZC_1695     TRUE 0.938 24.000 0.416 1.000 N NA
 3728343 3728344 AZC_1695 AZC_1696     TRUE 0.629 259.000 0.626 1.000 N NA
 3728344 3728345 AZC_1696 AZC_1697     TRUE 0.967 14.000 0.409 1.000 N NA
 3728345 3728346 AZC_1697 AZC_1698     TRUE 0.999 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 3728346 3728347 AZC_1698 AZC_1699     TRUE 0.993 10.000 0.372 1.000 Y NA
 3728347 3728348 AZC_1699 AZC_1700     TRUE 0.905 39.000 0.568 1.000 N NA
 3728348 3728349 AZC_1700 AZC_1701     TRUE 0.907 23.000 0.002 1.000 Y NA
 3728349 3728350 AZC_1701 AZC_1702   lpxD TRUE 0.698 71.000 0.005 1.000 Y NA
 3728350 3728351 AZC_1702 AZC_1703 lpxD fabZ TRUE 0.992 -3.000 0.212 1.000 N NA
 3728351 3728352 AZC_1703 AZC_1704 fabZ   TRUE 0.993 -3.000 0.264 1.000 N NA
 3728352 3728353 AZC_1704 AZC_1705     TRUE 0.990 7.000 0.552 NA   NA
 3728353 3728354 AZC_1705 AZC_1706     TRUE 0.991 -3.000 0.173 NA   NA
 3728356 3728357 AZC_1708 AZC_1709     TRUE 0.908 13.000 0.069 NA   NA
 3728358 3728359 AZC_1710 AZC_1711 gltA   FALSE 0.152 115.000 0.005 1.000 N NA
 3728359 3728360 AZC_1711 AZC_1712     TRUE 0.468 75.000 0.005 0.044 N NA
 3728360 3728361 AZC_1712 AZC_1713     FALSE 0.307 134.000 0.078 NA   NA
 3728364 3728365 AZC_1716 AZC_1717     FALSE 0.271 114.000 0.000 0.001   NA
 3728365 3728366 AZC_1717 AZC_1718     FALSE 0.068 133.000 0.000 1.000   NA
 3728366 3728367 AZC_1718 AZC_1719     TRUE 0.573 214.000 0.083 1.000 Y NA
 3728369 3728370 AZC_1721 AZC_1722     FALSE 0.058 139.000 0.000 NA   NA
 3728370 3728371 AZC_1722 AZC_1723     FALSE 0.163 65.000 0.000 NA   NA
 3728372 3728373 AZC_1724 AZC_1725     FALSE 0.409 49.000 0.004 NA   NA
 3728374 3728375 AZC_1726 AZC_1727     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728375 3728376 AZC_1727 AZC_1728     FALSE 0.365 27.000 0.000 NA   NA
 3728376 3728377 AZC_1728 AZC_1729     FALSE 0.033 283.000 0.000 1.000 N NA
 3728377 3728378 AZC_1729 AZC_1730     FALSE 0.149 69.000 0.000 NA   NA
 3728378 3728379 AZC_1730 AZC_1731     FALSE 0.296 96.000 0.029 NA   NA
 3728379 3728380 AZC_1731 AZC_1732     FALSE 0.159 115.000 0.006 1.000 N NA
 3728380 3728381 AZC_1732 AZC_1733   scpA TRUE 0.980 0.000 0.103 NA   NA
 3728381 3728382 AZC_1733 AZC_1734 scpA scpB TRUE 0.997 -3.000 0.570 NA   NA
 3728382 3728383 AZC_1734 AZC_1735 scpB   TRUE 0.962 -3.000 0.011 NA N NA
 3728383 3728384 AZC_1735 AZC_1736   tatA TRUE 0.636 70.000 0.176 1.000 N NA
 3728384 3728385 AZC_1736 AZC_1737 tatA tatB TRUE 0.879 152.000 0.353 0.006 Y NA
 3728385 3728386 AZC_1737 AZC_1738 tatB   TRUE 0.973 34.000 0.535 NA Y NA
 3728386 3728387 AZC_1738 AZC_1739     FALSE 0.226 196.000 0.065 NA N NA
 3728387 3728388 AZC_1739 AZC_1740     FALSE 0.030 402.000 0.000 1.000 N NA
 3728388 3728389 AZC_1740 AZC_1741   pdhA FALSE 0.309 159.000 0.104 1.000 N NA
 3728389 3728390 AZC_1741 AZC_1742 pdhA   TRUE 0.845 11.000 0.005 NA   NA
 3728390 3728391 AZC_1742 AZC_1743   pdhB TRUE 0.903 6.000 0.005 NA   NA
 3728391 3728392 AZC_1743 AZC_1744 pdhB pdhC TRUE 0.983 16.000 0.254 1.000 Y NA
 3728392 3728393 AZC_1744 AZC_1745 pdhC   FALSE 0.158 148.000 0.007 NA   NA
 3728393 3728394 AZC_1745 AZC_1746   lpdA FALSE 0.172 120.000 0.007 NA   NA
 3728394 3728395 AZC_1746 AZC_1747 lpdA   FALSE 0.178 146.000 0.022 1.000 N NA
 3728395 3728396 AZC_1747 AZC_1748     TRUE 0.956 5.000 0.081 NA N NA
 3728399 3728400 AZC_1751 AZC_1752     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728400 3728401 AZC_1752 AZC_1753     FALSE 0.259 36.000 0.000 NA   NA
 3728401 3728402 AZC_1753 AZC_1754     TRUE 0.482 68.000 0.043 NA   NA
 3728403 3728404 AZC_trnP20 AZC_trnP21 trnP trnP FALSE 0.052 180.000 0.000 NA   NA
 3728404 3728405 AZC_trnP21 AZC_1755 trnP   FALSE 0.058 135.000 0.000 NA   NA
 3728406 3728407 AZC_1756 AZC_1757     FALSE 0.040 443.000 0.000 NA   NA
 3728408 3728409 AZC_1758 AZC_1759     TRUE 0.981 31.000 0.654 NA Y NA
 3728409 3728410 AZC_1759 AZC_1760     TRUE 0.998 6.000 0.758 0.088 Y NA
 3728410 3728411 AZC_1760 AZC_1761     TRUE 0.994 7.000 0.823 1.000   NA
 3728411 3728412 AZC_1761 AZC_1762     TRUE 0.763 470.000 0.731 0.041   NA
 3728412 3728413 AZC_1762 AZC_1763     TRUE 0.944 14.000 0.221 1.000 N NA
 3728413 3728414 AZC_1763 AZC_1764     TRUE 0.992 11.000 0.664 0.003 N NA
 3728414 3728415 AZC_1764 AZC_1765     TRUE 0.872 0.000 0.000 1.000   NA
 3728415 3728416 AZC_1765 AZC_1766     TRUE 0.681 11.000 0.000 1.000   NA
 3728416 3728417 AZC_1766 AZC_1767   ureE TRUE 0.906 45.000 0.315 0.001 N NA
 3728417 3728418 AZC_1767 AZC_1768 ureE ureF TRUE 0.989 22.000 0.330 0.003 Y NA
 3728418 3728419 AZC_1768 AZC_1769 ureF ureG TRUE 0.999 -3.000 0.283 0.003 Y NA
 3728419 3728420 AZC_1769 AZC_1770 ureG   FALSE 0.444 22.000 0.000 NA   NA
 3728421 3728422 AZC_1771 AZC_1772     FALSE 0.042 947.000 0.000 1.000   NA
 3728422 3728423 AZC_1772 AZC_1773     TRUE 0.787 461.000 0.220 0.001 Y NA
 3728423 3728424 AZC_1773 AZC_1774     TRUE 0.938 26.000 0.014 0.079 Y NA
 3728424 3728425 AZC_1774 AZC_1775     TRUE 0.777 229.000 0.157 0.002 Y NA
 3728429 3728430 AZC_1779 AZC_1780     FALSE 0.198 47.000 0.000 NA   NA
 3728430 3728431 AZC_1780 AZC_1781     FALSE 0.043 329.000 0.000 NA   NA
 3728434 3728435 AZC_1784 AZC_1785     TRUE 0.968 -3.000 0.005 1.000   NA
 3728435 3728436 AZC_1785 AZC_1786     TRUE 0.982 -3.000 0.048 1.000   NA
 3728437 3728438 AZC_1787 AZC_1788     FALSE 0.171 62.000 0.000 NA   NA
 3728438 3728439 AZC_1788 AZC_1789     FALSE 0.046 245.000 0.000 NA   NA
 3728440 3728441 AZC_1790 AZC_1791     TRUE 0.481 22.000 0.000 1.000   NA
 3728441 3728442 AZC_1791 AZC_1792     FALSE 0.061 123.000 0.000 NA   NA
 3728442 3728443 AZC_1792 AZC_1793     FALSE 0.187 52.000 0.000 NA   NA
 3728443 3728444 AZC_1793 AZC_1794     TRUE 0.825 13.000 0.015 1.000 N NA
 3728445 3728446 AZC_1795 AZC_1796     TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3728446 3728447 AZC_1796 AZC_1797     TRUE 0.936 22.000 0.000 0.002 Y NA
 3728447 3728448 AZC_1797 AZC_1798     FALSE 0.396 20.000 0.000 1.000 N NA
 3728448 3728449 AZC_1798 AZC_1799     TRUE 0.799 59.000 0.333 1.000 N NA
 3728449 3728450 AZC_1799 AZC_1800     TRUE 0.998 13.000 1.000 0.088 Y NA
 3728450 3728451 AZC_1800 AZC_1801     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.088 Y NA
 3728451 3728452 AZC_1801 AZC_1802     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.088 Y NA
 3728452 3728453 AZC_1802 AZC_1803     TRUE 0.535 101.000 0.250 NA N NA
 3728453 3728454 AZC_1803 AZC_1804     TRUE 0.823 15.000 0.019 NA   NA
 3728454 3728455 AZC_1804 AZC_1805   lysR FALSE 0.320 77.000 0.005 1.000   NA
 3728457 3728458 AZC_1807 AZC_1808 osmC   FALSE 0.034 266.000 0.000 1.000 N NA
 3728458 3728459 AZC_1808 AZC_1809     TRUE 0.970 10.000 0.000 0.043 Y NA
 3728459 3728460 AZC_1809 AZC_1810     FALSE 0.038 189.000 0.000 1.000 N NA
 3728460 3728461 AZC_1810 AZC_1811     TRUE 0.753 67.000 0.000 0.012 Y NA
 3728461 3728462 AZC_1811 AZC_1812     FALSE 0.308 107.000 0.062 1.000 N NA
 3728462 3728463 AZC_1812 AZC_1813     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728463 3728464 AZC_1813 AZC_1814     FALSE 0.108 85.000 0.000 NA   NA
 3728464 3728465 AZC_1814 AZC_1815     FALSE 0.127 584.000 0.000 0.043   NA
 3728465 3728466 AZC_1815 AZC_1816     FALSE 0.033 165.000 0.000 NA N NA
 3728466 3728467 AZC_1816 AZC_1817     TRUE 0.650 102.000 0.365 NA   NA
 3728467 3728468 AZC_1817 AZC_1818     TRUE 0.808 104.000 0.805 NA   NA
 3728469 3728470 AZC_1819 AZC_1820     FALSE 0.074 117.000 0.000 1.000   NA
 3728470 3728471 AZC_1820 AZC_1821     TRUE 0.750 182.000 0.150 0.064 Y NA
 3728474 3728475 AZC_1824 AZC_1825     FALSE 0.301 35.000 0.000 1.000   NA
 3728476 3728477 AZC_1826 AZC_1827     TRUE 0.945 10.000 0.119 1.000 N NA
 3728478 3728479 AZC_1828 AZC_1829     FALSE 0.194 100.000 0.000 0.064 N NA
 3728479 3728480 AZC_1829 AZC_1830     FALSE 0.156 46.000 0.000 1.000 N NA
 3728480 3728481 AZC_1830 AZC_1831   oac3 FALSE 0.042 149.000 0.000 1.000 N NA
 3728481 3728482 AZC_1831 AZC_1832 oac3 oac2 TRUE 0.994 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 3728482 3728483 AZC_1832 AZC_1833 oac2 oac1 TRUE 0.996 0.000 0.068 0.004 Y NA
 3728483 3728484 AZC_1833 AZC_1834 oac1   TRUE 0.997 2.000 0.337 1.000 Y NA
 3728484 3728485 AZC_1834 AZC_1835     FALSE 0.051 195.000 0.000 NA   NA
 3728486 3728487 AZC_1836 AZC_1837     TRUE 0.898 176.000 0.600 0.088 Y NA
 3728487 3728488 AZC_1837 AZC_1838     TRUE 0.999 -3.000 0.600 0.012 Y NA
 3728488 3728489 AZC_1838 AZC_1839     TRUE 0.999 1.000 0.750 1.000 Y NA
 3728490 3728491 AZC_1840 AZC_1841     FALSE 0.328 78.000 0.000 0.011 N NA
 3728492 3728493 AZC_1842 AZC_1843     TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.079   NA
 3728493 3728494 AZC_1843 AZC_1844   nac FALSE 0.191 63.000 0.000 1.000   NA
 3728496 3728497 AZC_1846 AZC_1847     FALSE 0.052 185.000 0.000 NA   NA
 3728497 3728498 AZC_1847 AZC_1848     TRUE 0.735 121.000 0.202 1.000 Y NA
 3728498 3728499 AZC_1848 AZC_1849     TRUE 0.954 8.000 0.112 1.000 N NA
 3728499 3728500 AZC_1849 AZC_1850     FALSE 0.035 237.000 0.000 1.000 N NA
 3728500 3728501 AZC_1850 AZC_1851   recJ FALSE 0.053 109.000 0.000 1.000 N NA
 3728502 3728503 AZC_1852 AZC_1853     TRUE 0.981 5.000 0.228 NA   NA
 3728505 3728506 AZC_1855 AZC_1856     FALSE 0.232 108.000 0.028 1.000 N NA
 3728506 3728507 AZC_1856 AZC_1857     TRUE 0.900 22.000 0.159 1.000   NA
 3728507 3728508 AZC_1857 AZC_1858     TRUE 0.996 -3.000 0.406 NA   NA
 3728508 3728509 AZC_1858 AZC_1859     TRUE 0.943 7.000 0.050 NA   NA
 3728511 3728512 AZC_1861 AZC_1862     FALSE 0.047 404.000 0.000 1.000   NA
 3728513 3728514 AZC_1863 AZC_1864 tetR   TRUE 0.550 17.000 0.000 1.000   NA
 3728516 3728517 AZC_1866 AZC_1867   trmH FALSE 0.058 140.000 0.000 NA   NA
 3728517 3728518 AZC_1867 AZC_trnM22 trmH trnM FALSE 0.049 208.000 0.000 NA   NA
 3728519 3728520 AZC_1868 AZC_1869     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000   NA
 3728520 3728521 AZC_1869 AZC_1870     TRUE 0.996 11.000 0.500 0.088 Y NA
 3728521 3728522 AZC_1870 AZC_1871     TRUE 0.999 0.000 0.500 0.088 Y NA
 3728522 3728523 AZC_1871 AZC_1872     TRUE 0.745 36.000 0.000 1.000 Y NA
 3728523 3728524 AZC_1872 AZC_1873   lysR FALSE 0.045 127.000 0.000 1.000 N NA
 3728525 3728526 AZC_1874 AZC_1875     TRUE 0.987 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3728526 3728527 AZC_1875 AZC_1876   maoC TRUE 0.911 15.000 0.043 0.079 N NA
 3728527 3728528 AZC_1876 AZC_1877 maoC   TRUE 0.978 -3.000 0.043 1.000 N NA
 3728528 3728529 AZC_1877 AZC_1878     FALSE 0.043 141.000 0.000 1.000 N NA
 3728531 3728532 AZC_1880 AZC_1881     TRUE 0.995 -3.000 0.375 NA   NA
 3728532 3728533 AZC_1881 AZC_1882     TRUE 0.994 -3.000 0.308 1.000 N NA
 3728533 3728534 AZC_1882 AZC_1883     FALSE 0.361 57.000 0.000 0.079 N NA
 3728534 3728535 AZC_1883 AZC_1884     FALSE 0.152 39.000 0.000 NA N NA
 3728535 3728536 AZC_1884 AZC_1885     TRUE 0.550 74.000 0.000 NA Y NA
 3728536 3728537 AZC_1885 AZC_1886     TRUE 0.982 4.000 0.000 0.088 Y NA
 3728537 3728538 AZC_1886 AZC_1887     TRUE 0.993 -3.000 0.000 0.040 Y NA
 3728538 3728539 AZC_1887 AZC_1888     FALSE 0.247 31.000 0.000 1.000 N NA
 3728539 3728540 AZC_1888 AZC_1889     FALSE 0.044 538.000 0.000 1.000   NA
 3728540 3728541 AZC_1889 AZC_1890     FALSE 0.094 91.000 0.000 NA   NA
 3728541 3728542 AZC_1890 AZC_1891     TRUE 0.568 14.000 0.000 NA   NA
 3728543 3728544 AZC_1892 AZC_1893     TRUE 0.978 6.000 0.211 1.000   NA
 3728544 3728545 AZC_1893 AZC_1894     TRUE 0.634 97.000 0.158 0.063   NA
 3728545 3728546 AZC_1894 AZC_1895   lysR FALSE 0.393 176.000 0.200 1.000 N NA
 3728547 3728548 AZC_1896 AZC_1897 dctP dctM TRUE 0.999 -3.000 0.500 NA Y NA
 3728549 3728550 AZC_1898 AZC_1899     TRUE 0.833 2.000 0.000 NA   NA
 3728550 3728551 AZC_1899 AZC_1900     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728551 3728552 AZC_1900 AZC_1901     TRUE 0.545 15.000 0.000 NA   NA
 3728552 3728553 AZC_1901 AZC_1902     FALSE 0.041 377.000 0.000 NA   NA
 3728553 3728554 AZC_1902 AZC_1903     FALSE 0.075 105.000 0.000 NA   NA
 3728554 3728555 AZC_1903 AZC_1904     TRUE 0.990 1.000 0.333 NA N NA
 3728557 3728558 AZC_1906 AZC_1907     TRUE 0.545 64.000 0.050 1.000   NA
 3728558 3728559 AZC_1907 AZC_1908     TRUE 0.619 117.000 0.375 1.000   NA
 3728559 3728560 AZC_1908 AZC_1909     TRUE 0.994 27.000 0.804 0.001 Y NA
 3728560 3728561 AZC_1909 AZC_1910     TRUE 0.947 17.000 0.141 0.079   NA
 3728563 3728564 AZC_1912 AZC_1913     TRUE 0.877 71.000 0.667 1.000   NA
 3728564 3728565 AZC_1913 AZC_1914     FALSE 0.059 130.000 0.000 NA   NA
 3728565 3728566 AZC_1914 AZC_1915     FALSE 0.042 345.000 0.000 NA   NA
 3728566 3728567 AZC_1915 AZC_1916     FALSE 0.041 396.000 0.000 NA   NA
 3728567 3728568 AZC_1916 AZC_1917     FALSE 0.330 84.000 0.021 NA   NA
 3728568 3728569 AZC_1917 AZC_1918     FALSE 0.440 134.000 0.190 1.000   NA
 3728570 3728571 AZC_1919 AZC_1920     FALSE 0.052 181.000 0.000 NA   NA
 3728571 3728572 AZC_1920 AZC_1921     FALSE 0.070 123.000 0.000 1.000   NA
 3728572 3728573 AZC_1921 AZC_1922   fhaC TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3728574 3728575 AZC_1923 AZC_1924     TRUE 0.946 10.000 0.000 1.000 Y NA
 3728575 3728576 AZC_1924 AZC_1925     TRUE 0.997 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 3728576 3728577 AZC_1925 AZC_1926     TRUE 0.998 -3.000 0.167 0.012 Y NA
 3728577 3728578 AZC_1926 AZC_1927     TRUE 0.761 49.000 0.000 0.087 Y NA
 3728579 3728580 AZC_1928 AZC_1929 lysR   FALSE 0.045 272.000 0.000 NA   NA
 3728580 3728581 AZC_1929 AZC_1930     FALSE 0.115 82.000 0.000 NA   NA
 3728582 3728583 AZC_1931 AZC_1932     TRUE 0.927 36.000 0.333 0.040   NA
 3728583 3728584 AZC_1932 AZC_1933     FALSE 0.188 51.000 0.000 NA   NA
 3728584 3728585 AZC_1933 AZC_trnE23   trnE FALSE 0.081 99.000 0.000 NA   NA
 3728585 3728586 AZC_trnE23 AZC_1934 trnE   FALSE 0.040 442.000 0.000 NA   NA
 3728587 3728588 AZC_1935 AZC_1936     TRUE 0.720 165.000 0.082 0.040 Y NA
 3728588 3728589 AZC_1936 AZC_1937     TRUE 0.938 17.000 0.226 NA   NA
 3728590 3728591 AZC_1938 AZC_1939     FALSE 0.065 117.000 0.000 NA   NA
 3728592 3728593 AZC_1940 AZC_1941     TRUE 0.904 53.000 0.200 1.000 Y NA
 3728594 3728595 AZC_1942 AZC_1943     TRUE 0.992 24.000 0.914 1.000 Y NA
 3728595 3728596 AZC_1943 AZC_1944     TRUE 0.808 116.000 0.333 NA Y NA
 3728598 3728599 AZC_1946 AZC_1947     TRUE 0.581 9.000 0.000 NA N NA
 3728601 3728602 AZC_1949 AZC_1950 lysR   FALSE 0.049 115.000 0.000 1.000 N NA
 3728602 3728603 AZC_1950 AZC_1951     TRUE 0.814 107.000 0.294 1.000 Y NA
 3728603 3728604 AZC_1951 AZC_1952     TRUE 0.997 11.000 0.833 1.000 Y NA
 3728605 3728606 AZC_1953 AZC_1954     TRUE 0.947 50.000 0.424 1.000 Y NA
 3728607 3728608 AZC_1955 AZC_1956     FALSE 0.425 25.000 0.000 1.000   NA
 3728608 3728609 AZC_1956 AZC_1957     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000   NA
 3728609 3728610 AZC_1957 AZC_1958     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.087 Y NA
 3728610 3728611 AZC_1958 AZC_1959     TRUE 1.000 -3.000 0.833 0.087 Y NA
 3728611 3728612 AZC_1959 AZC_1960     TRUE 0.591 88.000 0.222 1.000 N NA
 3728612 3728613 AZC_1960 AZC_1961     TRUE 0.992 -3.000 0.111 0.063 N NA
 3728613 3728614 AZC_1961 AZC_1962     TRUE 0.996 -3.000 0.500 1.000 N NA
 3728614 3728615 AZC_1962 AZC_1963     FALSE 0.120 308.000 0.000 0.043 N NA
 3728615 3728616 AZC_1963 AZC_1964   lysR FALSE 0.065 95.000 0.000 1.000 N NA
 3728616 3728617 AZC_1964 AZC_1965 lysR   TRUE 0.997 0.000 1.000 1.000 N NA
 3728617 3728618 AZC_1965 AZC_1966     TRUE 0.961 11.000 0.231 1.000 N NA
 3728618 3728619 AZC_1966 AZC_1967   gntR FALSE 0.034 264.000 0.000 1.000 N NA
 3728621 3728622 AZC_1969 AZC_1970     TRUE 0.998 10.000 1.000 0.087 Y NA
 3728622 3728623 AZC_1970 AZC_1971     TRUE 0.938 187.000 1.000 0.087 Y NA
 3728623 3728624 AZC_1971 AZC_1972     TRUE 0.987 23.000 0.400 0.087 Y NA
 3728627 3728628 AZC_1975 AZC_1976     TRUE 0.958 2.000 0.046 NA N NA
 3728628 3728629 AZC_1976 AZC_1977     FALSE 0.170 36.000 0.000 NA N NA
 3728629 3728630 AZC_1977 AZC_1978     TRUE 0.999 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 3728630 3728631 AZC_1978 AZC_1979     TRUE 0.974 38.000 0.667 NA Y NA
 3728631 3728632 AZC_1979 AZC_1980     TRUE 0.983 -3.000 0.077 NA N NA
 3728632 3728633 AZC_1980 AZC_1981     FALSE 0.028 600.000 0.000 1.000 N NA
 3728634 3728635 AZC_1982 AZC_1983     TRUE 0.999 -3.000 0.388 0.006 Y NA
 3728635 3728636 AZC_1983 AZC_1984     TRUE 0.998 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 3728636 3728637 AZC_1984 AZC_1985     TRUE 0.998 2.000 0.452 0.087 Y NA
 3728637 3728638 AZC_1985 AZC_1986     TRUE 0.835 132.000 0.290 0.087 Y NA
 3728640 3728641 AZC_1988 AZC_1989     TRUE 0.996 -3.000 0.462 1.000 N NA
 3728641 3728642 AZC_1989 AZC_1990     TRUE 0.999 -3.000 0.423 0.087 Y NA
 3728642 3728643 AZC_1990 AZC_1991     TRUE 0.999 -3.000 0.308 0.087 Y NA
 3728643 3728644 AZC_1991 AZC_1992     TRUE 0.998 4.000 0.348 0.087 Y NA
 3728646 3728647 AZC_1994 AZC_1995     FALSE 0.189 119.000 0.000 0.064   NA
 3728648 3728649 AZC_1996 AZC_1997   lysR FALSE 0.044 128.000 0.000 1.000 N NA
 3728651 3728652 AZC_1999 AZC_2000     FALSE 0.050 114.000 0.000 1.000 N NA
 3728652 3728653 AZC_2000 AZC_2001   pdxJ TRUE 0.572 70.000 0.026 0.043 N NA
 3728653 3728654 AZC_2001 AZC_2002 pdxJ   TRUE 0.994 -3.000 0.326 1.000 N NA
 3728654 3728655 AZC_2002 AZC_2003     FALSE 0.237 213.000 0.070 1.000 N NA
 3728655 3728656 AZC_2003 AZC_2004     TRUE 0.981 -3.000 0.062 1.000 N NA
 3728656 3728657 AZC_2004 AZC_2005     TRUE 0.993 -3.000 0.098 0.042   NA
 3728657 3728658 AZC_2005 AZC_2006   recO TRUE 0.919 8.000 0.021 1.000   NA
 3728658 3728659 AZC_2006 AZC_2007 recO   FALSE 0.395 610.000 0.020 1.000 Y NA
 3728659 3728660 AZC_2007 AZC_2008     TRUE 0.896 5.000 0.003 1.000 N NA
 3728663 3728664 AZC_2011 AZC_2012     TRUE 1.000 -3.000 1.000 0.006 Y NA
 3728664 3728665 AZC_2012 AZC_2013     TRUE 0.999 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 3728665 3728666 AZC_2013 AZC_2014     TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.087 Y NA
 3728666 3728667 AZC_2014 AZC_2015     TRUE 0.991 16.000 0.375 0.087 Y NA
 3728667 3728668 AZC_2015 AZC_2016     FALSE 0.404 178.000 0.182 1.000   NA
 3728668 3728669 AZC_2016 AZC_2017     TRUE 0.542 42.000 0.000 0.009   NA
 3728672 3728673 AZC_2020 AZC_2021     TRUE 0.489 81.000 0.097 1.000 N NA
 3728673 3728674 AZC_2021 AZC_2022   yjgF FALSE 0.220 30.000 0.000 NA N NA
 3728674 3728675 AZC_2022 AZC_2023 yjgF   TRUE 0.970 10.000 0.286 NA N NA
 3728676 3728677 AZC_2024 AZC_2025 dadA asnC FALSE 0.312 139.000 0.100 1.000 N NA
 3728677 3728678 AZC_2025 AZC_2026 asnC   TRUE 0.816 56.000 0.316 1.000   NA
 3728678 3728679 AZC_2026 AZC_2027     TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000   NA
 3728679 3728680 AZC_2027 AZC_2028     TRUE 1.000 -3.000 0.900 0.087 Y NA
 3728680 3728681 AZC_2028 AZC_2029     TRUE 0.947 75.000 0.450 0.087 Y NA
 3728681 3728682 AZC_2029 AZC_2030     TRUE 0.745 84.000 0.375 1.000   NA
 3728682 3728683 AZC_2030 AZC_2031     TRUE 0.516 173.000 0.300 1.000   NA
 3728683 3728684 AZC_2031 AZC_2032     TRUE 0.940 13.000 0.150 1.000   NA
 3728685 3728686 AZC_2033 AZC_2034     TRUE 0.945 17.000 0.250 1.000   NA
 3728687 3728688 AZC_2035 AZC_2036     TRUE 0.795 42.000 0.000 0.078 Y NA
 3728688 3728689 AZC_2036 AZC_2037     TRUE 0.981 5.000 0.235 NA   NA
 3728689 3728690 AZC_2037 AZC_2038     TRUE 0.939 28.000 0.476 NA   NA
 3728692 3728693 AZC_2040 AZC_2041   lysR FALSE 0.030 200.000 0.000 NA N NA
 3728696 3728697 AZC_2044 AZC_2045     TRUE 0.874 39.000 0.412 1.000 N NA
 3728697 3728698 AZC_2045 AZC_2046     TRUE 0.955 94.000 0.800 0.087 Y NA
 3728698 3728699 AZC_2046 AZC_2047     TRUE 1.000 -3.000 0.850 0.087 Y NA
 3728699 3728700 AZC_2047 AZC_2048     TRUE 0.982 11.000 0.471 1.000   NA
 3728700 3728701 AZC_2048 AZC_2049     FALSE 0.096 90.000 0.000 NA   NA
 3728703 3728704 AZC_2051 AZC_2052 lysR   TRUE 0.498 107.000 0.200 NA   NA
 3728704 3728705 AZC_2052 AZC_2053     TRUE 0.778 22.000 0.028 NA   NA
 3728705 3728706 AZC_2053 AZC_2054     TRUE 0.586 35.000 0.018 NA   NA
 3728707 3728708 AZC_2055 AZC_2056     FALSE 0.120 80.000 0.000 NA   NA
 3728708 3728709 AZC_2056 AZC_2057     TRUE 0.990 12.000 0.196 0.087 Y NA
 3728709 3728710 AZC_2057 AZC_2058     TRUE 0.999 -3.000 0.741 1.000 Y NA
 3728711 3728712 AZC_2059 AZC_2060     TRUE 0.528 16.000 0.000 NA   NA
 3728712 3728713 AZC_2060 AZC_2061     TRUE 0.971 7.000 0.182 NA   NA
 3728713 3728714 AZC_2061 AZC_2062     TRUE 0.992 16.000 0.400 0.078 Y NA
 3728714 3728715 AZC_2062 AZC_2063   luxE TRUE 0.923 -7.000 0.000 1.000   NA
 3728715 3728716 AZC_2063 AZC_2064 luxE luxC TRUE 0.980 4.000 0.024 0.001   NA
 3728716 3728717 AZC_2064 AZC_2065 luxC   FALSE 0.072 120.000 0.000 1.000   NA
 3728717 3728718 AZC_2065 AZC_2066     TRUE 0.774 37.000 0.179 1.000 N NA
 3728718 3728719 AZC_2066 AZC_2067   lrp FALSE 0.054 107.000 0.000 1.000 N NA
 3728720 3728721 AZC_2068 AZC_2069 lysE   FALSE 0.383 111.000 0.000 1.000 Y NA
 3728721 3728722 AZC_2069 AZC_2070     TRUE 0.978 19.000 0.233 1.000 Y NA
 3728722 3728723 AZC_2070 AZC_2071     TRUE 0.999 -3.000 0.867 1.000 Y NA
 3728723 3728724 AZC_2071 AZC_2072     TRUE 0.789 91.000 0.067 0.087 Y NA
 3728726 3728727 AZC_2074 AZC_2075     TRUE 0.979 9.000 0.129 0.005   NA
 3728727 3728728 AZC_2075 AZC_2076     TRUE 0.756 34.000 0.097 NA   NA
 3728728 3728729 AZC_2076 AZC_2077     TRUE 0.933 20.000 0.250 NA   NA
 3728729 3728730 AZC_2077 AZC_2078     TRUE 0.998 -3.000 0.917 1.000   NA
 3728730 3728731 AZC_2078 AZC_2079     TRUE 0.999 0.000 1.000 0.087 Y NA
 3728731 3728732 AZC_2079 AZC_2080     TRUE 0.958 61.000 0.417 0.087 Y NA
 3728732 3728733 AZC_2080 AZC_2081     FALSE 0.047 400.000 0.000 1.000   NA
 3728733 3728734 AZC_2081 AZC_2082     FALSE 0.158 72.000 0.000 1.000   NA
 3728734 3728735 AZC_2082 AZC_2083     TRUE 0.473 20.000 0.000 NA   NA
 3728735 3728736 AZC_2083 AZC_2084     TRUE 0.981 2.000 0.154 NA   NA
 3728736 3728737 AZC_2084 AZC_2085     TRUE 0.919 16.000 0.150 NA   NA
 3728738 3728739 AZC_2086 AZC_2087 arsR   FALSE 0.043 138.000 0.000 1.000 N NA
 3728740 3728741 AZC_2088 AZC_2089     FALSE 0.261 92.000 0.000 0.063   NA
 3728741 3728742 AZC_2089 AZC_2090   deoR FALSE 0.079 112.000 0.000 1.000   NA
 3728743 3728744 AZC_2091 AZC_2092     FALSE 0.129 83.000 0.000 1.000   NA
 3728744 3728745 AZC_2092 AZC_2093     TRUE 0.995 4.000 0.124 0.087 Y NA
 3728745 3728746 AZC_2093 AZC_2094     TRUE 0.997 -3.000 0.423 0.087 N NA
 3728746 3728747 AZC_2094 AZC_2095     TRUE 0.757 51.000 0.097 0.087   NA
 3728748 3728749 AZC_2096 AZC_2097     FALSE 0.050 320.000 0.000 1.000   NA
 3728750 3728751 AZC_2098 AZC_2099     TRUE 0.998 12.000 0.915 0.010 Y NA
 3728751 3728752 AZC_2099 AZC_2100     TRUE 1.000 -3.000 0.847 0.063 Y NA
 3728752 3728753 AZC_2100 AZC_2101     TRUE 1.000 -3.000 0.906 0.063 Y NA
 3728753 3728754 AZC_2101 AZC_2102   surF1 TRUE 0.998 -3.000 0.849 NA   NA
 3728754 3728755 AZC_2102 AZC_2103 surF1   TRUE 0.946 13.000 0.188 NA   NA
 3728755 3728756 AZC_2103 AZC_2104   fis TRUE 0.999 -49.000 0.682 1.000 Y NA
 3728758 3728759 AZC_2106 AZC_2107     TRUE 0.999 0.000 0.449 0.001 Y NA
 3728759 3728760 AZC_2107 AZC_2108   gntR FALSE 0.070 91.000 0.000 1.000 N NA
 3728760 3728761 AZC_2108 AZC_2109 gntR   TRUE 0.995 -3.000 0.364 1.000 N NA
 3728761 3728762 AZC_2109 AZC_2110     TRUE 0.919 79.000 0.455 1.000 Y NA
 3728762 3728763 AZC_2110 AZC_2111     TRUE 0.999 0.000 0.571 0.087 Y NA
 3728763 3728764 AZC_2111 AZC_2112     TRUE 0.999 -3.000 0.643 1.000 Y NA
 3728764 3728765 AZC_2112 AZC_2113     TRUE 0.999 -7.000 0.533 0.040 Y NA
 3728765 3728766 AZC_2113 AZC_2114     TRUE 0.980 2.000 0.133 1.000   NA
 3728766 3728767 AZC_2114 AZC_2115     TRUE 0.518 86.000 0.111 1.000   NA
 3728767 3728768 AZC_2115 AZC_2116     TRUE 0.996 -3.000 0.278 0.043 N NA
 3728768 3728769 AZC_2116 AZC_2117     TRUE 1.000 -3.000 0.933 0.002 Y NA
 3728769 3728770 AZC_2117 AZC_2118     TRUE 0.999 -3.000 0.737 1.000 Y NA
 3728772 3728773 AZC_2120 AZC_2121     TRUE 0.725 8.000 0.000 NA   NA
 3728773 3728774 AZC_2121 AZC_2122     FALSE 0.038 601.000 0.000 NA   NA
 3728774 3728775 AZC_2122 AZC_2123     TRUE 0.476 87.000 0.000 NA Y NA
 3728777 3728778 AZC_2125 AZC_2126 nlp   TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728778 3728779 AZC_2126 AZC_2127     FALSE 0.280 34.000 0.000 NA   NA
 3728779 3728780 AZC_2127 AZC_2128     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728780 3728781 AZC_2128 AZC_2129     FALSE 0.439 24.000 0.000 1.000   NA
 3728781 3728782 AZC_2129 AZC_2130     TRUE 0.986 2.000 0.222 NA   NA
 3728782 3728783 AZC_2130 AZC_2131     TRUE 0.994 -3.000 0.308 NA   NA
 3728783 3728784 AZC_2131 AZC_2132   dnaA FALSE 0.043 326.000 0.000 NA   NA
 3728784 3728785 AZC_2132 AZC_2133 dnaA   TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3728785 3728786 AZC_2133 AZC_2134     FALSE 0.051 190.000 0.000 NA   NA
 3728786 3728787 AZC_2134 AZC_2135     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728789 3728790 AZC_2137 AZC_2138     TRUE 0.855 0.000 0.000 NA   NA
 3728790 3728791 AZC_2138 AZC_2139     TRUE 0.807 4.000 0.000 NA   NA
 3728791 3728792 AZC_2139 AZC_2140     TRUE 0.991 -3.000 0.194 NA   NA
 3728792 3728793 AZC_2140 AZC_2141     TRUE 0.993 -3.000 0.250 NA   NA
 3728793 3728794 AZC_2141 AZC_2142     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728794 3728795 AZC_2142 AZC_2143     TRUE 0.991 -3.000 0.190 NA   NA
 3728795 3728796 AZC_2143 AZC_2144     TRUE 0.965 5.000 0.095 NA   NA
 3728796 3728797 AZC_2144 AZC_2145     FALSE 0.052 181.000 0.000 NA   NA
 3728797 3728798 AZC_2145 AZC_2146     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 3728798 3728799 AZC_2146 AZC_2147     FALSE 0.044 298.000 0.000 NA   NA
 3728799 3728800 AZC_2147 AZC_2148     TRUE 0.810 25.000 0.069 NA   NA
 3728800 3728801 AZC_2148 AZC_2149     TRUE 0.770 33.000 0.103 NA   NA
 3728801 3728802 AZC_2149 AZC_2150     TRUE 0.704 9.000 0.000 NA   NA
 3728802 3728803 AZC_2150 AZC_2151     FALSE 0.074 106.000 0.000 NA   NA
 3728803 3728804 AZC_2151 AZC_2152     TRUE 0.995 -3.000 0.317 NA   NA
 3728804 3728805 AZC_2152 AZC_2153     TRUE 0.987 -3.000 0.100 NA   NA
 3728805 3728806 AZC_2153 AZC_2154     TRUE 0.996 -3.000 0.429 NA   NA
 3728806 3728807 AZC_2154 AZC_2155     TRUE 0.976 9.000 0.286 NA   NA
 3728807 3728808 AZC_2155 AZC_2156     TRUE 0.930 26.000 0.364 NA   NA
 3728808 3728809 AZC_2156 AZC_2157     TRUE 0.991 -3.000 0.182 NA   NA
 3728809 3728810 AZC_2157 AZC_2158   gpI TRUE 0.988 -3.000 0.125 NA   NA
 3728810 3728811 AZC_2158 AZC_2159 gpI   TRUE 0.946 12.000 0.167 NA   NA
 3728811 3728812 AZC_2159 AZC_2160     FALSE 0.053 175.000 0.000 NA   NA
 3728812 3728813 AZC_2160 AZC_2161     TRUE 0.647 11.000 0.000 NA   NA
 3728813 3728814 AZC_2161 AZC_2162     FALSE 0.036 1751.000 0.000 NA   NA
 3728814 3728815 AZC_2162 AZC_2163     TRUE 0.894 23.000 0.182 NA   NA
 3728815 3728816 AZC_2163 AZC_2164     TRUE 0.987 11.000 0.667 NA   NA
 3728816 3728817 AZC_2164 AZC_2165     FALSE 0.055 163.000 0.000 NA   NA
 3728817 3728818 AZC_2165 AZC_2166     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 3728818 3728819 AZC_2166 AZC_2167     FALSE 0.049 213.000 0.000 NA   NA
 3728819 3728820 AZC_2167 AZC_2168     FALSE 0.444 22.000 0.000 NA   NA
 3728820 3728821 AZC_2168 AZC_2169     FALSE 0.153 68.000 0.000 NA   NA
 3728822 3728823 AZC_2170 AZC_trnS24   trnS FALSE 0.051 190.000 0.000 NA   NA
 3728824 3728825 AZC_2171 AZC_2172   dacC TRUE 0.949 30.000 0.198 NA Y NA
 3728825 3728826 AZC_2172 AZC_2173 dacC   TRUE 0.874 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3728826 3728827 AZC_2173 AZC_2174     TRUE 0.450 16.000 0.000 1.000 N NA
 3728827 3728828 AZC_2174 AZC_2175     TRUE 0.740 31.000 0.075 1.000 N NA
 3728829 3728830 AZC_2176 AZC_2177   bioY FALSE 0.068 113.000 0.000 NA   NA
 3728831 3728832 AZC_2178 AZC_2179 tatD   FALSE 0.400 51.000 0.004 NA   NA
 3728832 3728833 AZC_2179 AZC_2180     FALSE 0.224 170.000 0.040 NA   NA
 3728835 3728836 AZC_2182 AZC_2183 lrgA lrgB TRUE 0.995 5.000 0.840 NA   NA
 3728839 3728840 AZC_2186 AZC_2187 mrp   FALSE 0.063 87.000 0.000 NA N NA
 3728841 3728842 AZC_2188 AZC_2189     FALSE 0.422 68.000 0.022 NA   NA
 3728842 3728843 AZC_2189 AZC_2190