MicrobesOnline Operon Predictions for Geobacillus thermodenitrificans NG80-2

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3693438 3693439 GTNG_0001 GTNG_0002 dnaA   TRUE 0.785 172.000 0.328 1.000 Y NA
 3693439 3693440 GTNG_0002 GTNG_0003     FALSE 0.208 190.000 0.103 1.000   NA
 3693440 3693441 GTNG_0003 GTNG_0004   recF TRUE 0.828 12.000 0.209 1.000   NA
 3693441 3693442 GTNG_0004 GTNG_0005 recF gyrB TRUE 0.977 46.000 0.249 0.006 Y NA
 3693442 3693443 GTNG_0005 GTNG_0006 gyrB   TRUE 0.910 153.000 0.306 0.002 Y NA
 3693443 3693444 GTNG_0006 GTNG_0007     FALSE 0.446 129.000 0.019 1.000 N NA
 3693444 3693445 GTNG_0007 GTNG_16s001     FALSE 0.002 429.000 0.000 NA   NA
 3693445 3693446 GTNG_16s001 GTNG_t001     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA   NA
 3693446 3693447 GTNG_t001 GTNG_t002     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693447 3693448 GTNG_t002 GTNG_23s001     FALSE 0.028 188.000 0.000 NA   NA
 3693448 3693449 GTNG_23s001 GTNG_5s001     FALSE 0.095 99.000 0.000 NA   NA
 3693451 3693452 GTNG_0009 GTNG_0010 guaB   TRUE 0.753 104.000 0.267 1.000 N NA
 3693452 3693453 GTNG_0010 GTNG_0011     FALSE 0.454 130.000 0.024 1.000 N NA
 3693453 3693454 GTNG_0011 GTNG_0012     TRUE 0.910 25.000 0.000 NA Y NA
 3693454 3693455 GTNG_0012 GTNG_0013     FALSE 0.028 280.000 0.000 NA N NA
 3693457 3693458 GTNG_0015 GTNG_0016   dnaZX FALSE 0.011 432.000 0.000 1.000 N NA
 3693458 3693459 GTNG_0016 GTNG_0017 dnaZX   TRUE 0.750 23.000 0.071 NA   NA
 3693459 3693460 GTNG_0017 GTNG_0018   recR TRUE 0.920 10.000 0.604 NA   NA
 3693460 3693461 GTNG_0018 GTNG_0019 recR   TRUE 0.752 24.000 0.071 NA   NA
 3693461 3693462 GTNG_0019 GTNG_0020     TRUE 0.750 79.000 0.417 NA   NA
 3693462 3693463 GTNG_0020 GTNG_16s002     FALSE 0.002 417.000 0.000 NA   NA
 3693463 3693464 GTNG_16s002 GTNG_t003     FALSE 0.015 226.000 0.000 NA   NA
 3693464 3693465 GTNG_t003 GTNG_t004     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693465 3693466 GTNG_t004 GTNG_23s002     FALSE 0.028 188.000 0.000 NA   NA
 3693466 3693467 GTNG_23s002 GTNG_5s002     FALSE 0.027 189.000 0.000 NA   NA
 3693467 3693468 GTNG_5s002 GTNG_0021   csfB FALSE 0.338 20.000 0.000 NA   NA
 3693468 3693469 GTNG_0021 GTNG_0022 csfB   FALSE 0.337 203.000 0.400 NA   NA
 3693469 3693470 GTNG_0022 GTNG_0023   tmk TRUE 0.858 24.000 0.045 1.000 N NA
 3693470 3693471 GTNG_0023 GTNG_0024 tmk   TRUE 0.935 32.000 0.254 1.000 N NA
 3693471 3693472 GTNG_0024 GTNG_0025     TRUE 0.883 15.000 0.372 NA   NA
 3693472 3693473 GTNG_0025 GTNG_0026     TRUE 0.821 17.000 0.183 NA   NA
 3693473 3693474 GTNG_0026 GTNG_0027     TRUE 0.719 61.000 0.193 NA   NA
 3693474 3693475 GTNG_0027 GTNG_0028     TRUE 0.886 17.000 0.078 0.007   NA
 3693477 3693478 GTNG_0030 GTNG_0031     TRUE 0.595 142.000 0.221 NA N NA
 3693478 3693479 GTNG_0031 GTNG_0032     FALSE 0.050 202.000 0.007 NA   NA
 3693479 3693480 GTNG_0032 GTNG_0033     TRUE 0.580 -121.000 0.000 NA   NA
 3693480 3693481 GTNG_0033 GTNG_0034     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3693481 3693482 GTNG_0034 GTNG_0035   ksgA TRUE 0.940 -7.000 0.093 1.000 N NA
 3693482 3693483 GTNG_0035 GTNG_0036 ksgA yabG FALSE 0.261 94.000 0.022 NA   NA
 3693483 3693484 GTNG_0036 GTNG_0037 yabG   FALSE 0.202 183.000 0.116 NA   NA
 3693484 3693485 GTNG_0037 GTNG_0038     FALSE 0.033 354.000 0.163 NA   NA
 3693485 3693486 GTNG_0038 GTNG_0039     FALSE 0.060 238.000 0.024 1.000   NA
 3693486 3693487 GTNG_0039 GTNG_0040     TRUE 0.767 55.000 0.062 1.000 N NA
 3693487 3693488 GTNG_0040 GTNG_0041     TRUE 0.854 53.000 0.227 NA N NA
 3693488 3693489 GTNG_0041 GTNG_0042     TRUE 0.765 125.000 0.377 NA N NA
 3693489 3693490 GTNG_0042 GTNG_0043     TRUE 0.704 133.000 0.014 1.000 Y NA
 3693490 3693491 GTNG_0043 GTNG_0044     TRUE 0.809 13.000 0.069 1.000 N NA
 3693491 3693492 GTNG_0044 GTNG_0045     TRUE 0.555 76.000 0.027 1.000 N NA
 3693492 3693493 GTNG_0045 GTNG_0046     TRUE 0.978 61.000 0.496 0.029 Y NA
 3693493 3693494 GTNG_0046 GTNG_0047     FALSE 0.284 103.000 0.033 NA   NA
 3693494 3693495 GTNG_0047 GTNG_0048     FALSE 0.301 90.000 0.035 NA   NA
 3693495 3693496 GTNG_0048 GTNG_0049     FALSE 0.300 223.000 0.026 NA Y NA
 3693496 3693497 GTNG_0049 GTNG_0050     FALSE 0.118 229.000 0.147 NA   NA
 3693497 3693498 GTNG_0050 GTNG_0051     TRUE 0.683 7.000 0.058 1.000   NA
 3693498 3693499 GTNG_0051 GTNG_0052     TRUE 0.677 12.000 0.054 1.000   NA
 3693499 3693500 GTNG_0052 GTNG_0053     FALSE 0.429 117.000 0.108 NA   NA
 3693500 3693501 GTNG_0053 GTNG_0054     TRUE 0.974 -3.000 0.774 NA   NA
 3693501 3693502 GTNG_0054 GTNG_0055     TRUE 0.678 16.000 0.074 NA   NA
 3693502 3693503 GTNG_0055 GTNG_0056     TRUE 0.636 121.000 0.134 1.000 N NA
 3693503 3693504 GTNG_0056 GTNG_t005     FALSE 0.033 179.000 0.000 NA   NA
 3693504 3693505 GTNG_t005 GTNG_t006     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693505 3693506 GTNG_t006 GTNG_0057     FALSE 0.023 197.000 0.000 NA   NA
 3693506 3693507 GTNG_0057 GTNG_0058     TRUE 0.596 67.000 0.132 NA   NA
 3693507 3693508 GTNG_0058 GTNG_0059     TRUE 0.918 -37.000 0.133 NA   NA
 3693508 3693509 GTNG_0059 GTNG_0060   mesJ TRUE 0.700 56.000 0.018 1.000 N NA
 3693509 3693510 GTNG_0060 GTNG_0061 mesJ   TRUE 0.877 12.000 0.067 0.050 N NA
 3693510 3693511 GTNG_0061 GTNG_0062     TRUE 0.711 95.000 0.192 1.000 N NA
 3693511 3693512 GTNG_0062 GTNG_0063   coaA FALSE 0.123 232.000 0.029 1.000 N NA
 3693512 3693513 GTNG_0063 GTNG_0064 coaA hslO TRUE 0.791 9.000 0.060 1.000 N NA
 3693513 3693514 GTNG_0064 GTNG_0065 hslO   TRUE 0.568 87.000 0.053 1.000 N NA
 3693514 3693515 GTNG_0065 GTNG_0066     TRUE 0.819 115.000 0.107 1.000 Y NA
 3693515 3693516 GTNG_0066 GTNG_0067     TRUE 0.988 3.000 0.452 0.013 Y NA
 3693516 3693517 GTNG_0067 GTNG_0068     TRUE 0.986 0.000 0.532 1.000 Y NA
 3693517 3693518 GTNG_0068 GTNG_0069     TRUE 0.990 -3.000 0.519 1.000 Y NA
 3693518 3693519 GTNG_0069 GTNG_0070     TRUE 0.987 -37.000 0.176 1.000 Y NA
 3693519 3693520 GTNG_0070 GTNG_0071     TRUE 0.959 1.000 0.142 1.000 Y NA
 3693520 3693521 GTNG_0071 GTNG_0072     TRUE 0.914 -48.000 0.003 1.000 N NA
 3693521 3693522 GTNG_0072 GTNG_0073     TRUE 0.737 16.000 0.002 1.000 N NA
 3693522 3693523 GTNG_0073 GTNG_0074   lysS TRUE 0.773 85.000 0.021 1.000 Y NA
 3693523 3693524 GTNG_0074 GTNG_5s003 lysS   FALSE 0.009 260.000 0.000 NA   NA
 3693524 3693525 GTNG_5s003 GTNG_t007     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3693525 3693526 GTNG_t007 GTNG_t008     FALSE 0.065 142.000 0.000 NA   NA
 3693526 3693527 GTNG_t008 GTNG_t009     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3693527 3693528 GTNG_t009 GTNG_t010     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693528 3693529 GTNG_t010 GTNG_t011     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3693529 3693530 GTNG_t011 GTNG_t012     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3693530 3693531 GTNG_t012 GTNG_t013     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693531 3693532 GTNG_t013 GTNG_t014     FALSE 0.240 13.000 0.000 NA   NA
 3693532 3693533 GTNG_t014 GTNG_16s003     FALSE 0.183 59.000 0.000 NA   NA
 3693533 3693534 GTNG_16s003 GTNG_23s003     FALSE 0.003 388.000 0.000 NA   NA
 3693534 3693535 GTNG_23s003 GTNG_5s004     FALSE 0.025 193.000 0.000 NA   NA
 3693535 3693536 GTNG_5s004 GTNG_0075     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 3693536 3693537 GTNG_0075 GTNG_0076     TRUE 0.935 15.000 0.681 NA   NA
 3693537 3693538 GTNG_0076 GTNG_0077     TRUE 0.956 5.000 0.848 1.000   NA
 3693538 3693539 GTNG_0077 GTNG_0078     TRUE 0.972 -3.000 0.425 1.000 N NA
 3693539 3693540 GTNG_0078 GTNG_0079     TRUE 0.895 75.000 0.062 0.017 Y NA
 3693540 3693541 GTNG_0079 GTNG_0080     FALSE 0.090 206.000 0.056 NA   NA
 3693541 3693542 GTNG_0080 GTNG_0081   ispD TRUE 0.798 22.000 0.108 NA   NA
 3693542 3693543 GTNG_0081 GTNG_0082 ispD ispF TRUE 0.973 15.000 0.419 1.000 Y NA
 3693543 3693544 GTNG_0082 GTNG_0083 ispF   FALSE 0.206 210.000 0.076 1.000 N NA
 3693544 3693545 GTNG_0083 GTNG_0084     FALSE 0.024 374.000 0.008 1.000 N NA
 3693545 3693546 GTNG_0084 GTNG_0085   cysS TRUE 0.961 -22.000 0.039 0.050 N NA
 3693546 3693547 GTNG_0085 GTNG_0086 cysS   TRUE 0.845 31.000 0.129 1.000   NA
 3693547 3693548 GTNG_0086 GTNG_0087     TRUE 0.952 -3.000 0.150 0.005   NA
 3693548 3693549 GTNG_0087 GTNG_0088     TRUE 0.738 4.000 0.109 NA   NA
 3693549 3693550 GTNG_0088 GTNG_0089     TRUE 0.773 70.000 0.361 NA   NA
 3693550 3693551 GTNG_0089 GTNG_0090   rpmG TRUE 0.754 107.000 0.282 1.000 N NA
 3693551 3693552 GTNG_0090 GTNG_0091 rpmG secE TRUE 0.843 41.000 0.080 1.000 N NA
 3693552 3693553 GTNG_0091 GTNG_0092 secE nusG TRUE 0.898 108.000 0.843 1.000 N NA
 3693553 3693554 GTNG_0092 GTNG_0093 nusG rplK FALSE 0.470 241.000 0.681 1.000 N NA
 3693554 3693555 GTNG_0093 GTNG_0094 rplK rplA TRUE 0.875 203.000 0.838 0.024 Y NA
 3693555 3693556 GTNG_0094 GTNG_0095 rplA   TRUE 0.597 251.000 0.302 0.024 Y NA
 3693556 3693557 GTNG_0095 GTNG_0096   rplL TRUE 0.991 48.000 0.884 0.018 Y NA
 3693557 3693558 GTNG_0096 GTNG_0097 rplL   TRUE 0.781 106.000 0.050 1.000 Y NA
 3693558 3693559 GTNG_0097 GTNG_0098   rpoB FALSE 0.018 406.000 0.008 1.000 N NA
 3693559 3693560 GTNG_0098 GTNG_0099 rpoB   TRUE 0.990 58.000 0.851 0.001 Y NA
 3693560 3693561 GTNG_0099 GTNG_0100     FALSE 0.497 137.000 0.065 1.000 N NA
 3693561 3693562 GTNG_0100 GTNG_0101   rpsL TRUE 0.927 91.000 0.239 0.024 Y NA
 3693562 3693563 GTNG_0101 GTNG_0102 rpsL   TRUE 0.981 40.000 0.224 0.003 Y NA
 3693563 3693564 GTNG_0102 GTNG_0103     TRUE 0.800 191.000 0.579 1.000 Y NA
 3693564 3693565 GTNG_0103 GTNG_0104     TRUE 0.954 123.000 0.400 0.001 Y NA
 3693565 3693566 GTNG_0104 GTNG_0105   rpsJ FALSE 0.147 428.000 0.318 1.000 Y NA
 3693566 3693567 GTNG_0105 GTNG_0106 rpsJ   TRUE 0.990 26.000 0.467 0.024 Y NA
 3693567 3693568 GTNG_0106 GTNG_0107   rplD TRUE 0.992 30.000 0.544 0.018 Y NA
 3693568 3693569 GTNG_0107 GTNG_0108 rplD rplW TRUE 0.986 0.000 0.307 0.018 Y NA
 3693569 3693570 GTNG_0108 GTNG_0109 rplW rplB TRUE 0.995 28.000 0.849 0.024 Y NA
 3693570 3693571 GTNG_0109 GTNG_0110 rplB rpsS TRUE 0.994 34.000 0.820 0.024 Y NA
 3693571 3693572 GTNG_0110 GTNG_0111 rpsS rplV TRUE 0.994 19.000 0.769 0.024 Y NA
 3693572 3693573 GTNG_0111 GTNG_0112 rplV rpsC TRUE 0.991 4.000 0.719 0.024 Y NA
 3693573 3693574 GTNG_0112 GTNG_0113 rpsC rplP TRUE 0.993 3.000 0.828 0.024 Y NA
 3693574 3693575 GTNG_0113 GTNG_0114 rplP   TRUE 0.994 0.000 0.802 0.018 Y NA
 3693575 3693576 GTNG_0114 GTNG_0115   rpsQ TRUE 0.994 23.000 0.828 0.018 Y NA
 3693576 3693577 GTNG_0115 GTNG_0116 rpsQ   TRUE 0.989 50.000 0.791 0.024 Y NA
 3693577 3693578 GTNG_0116 GTNG_0117   rplE FALSE 0.117 376.000 0.003 0.024 Y NA
 3693578 3693579 GTNG_0117 GTNG_0118 rplE   TRUE 0.991 30.000 0.496 0.018 Y NA
 3693579 3693580 GTNG_0118 GTNG_0119     TRUE 0.990 34.000 0.473 0.018 Y NA
 3693580 3693581 GTNG_0119 GTNG_0120   rplF TRUE 0.994 33.000 0.808 0.018 Y NA
 3693581 3693582 GTNG_0120 GTNG_0121 rplF   TRUE 0.994 34.000 0.815 0.018 Y NA
 3693582 3693583 GTNG_0121 GTNG_0122     TRUE 0.993 18.000 0.814 0.024 Y NA
 3693583 3693584 GTNG_0122 GTNG_0123   rpmD TRUE 0.990 14.000 0.789 0.024 Y NA
 3693584 3693585 GTNG_0123 GTNG_0124 rpmD rplO TRUE 0.994 26.000 0.653 0.003 Y NA
 3693585 3693586 GTNG_0124 GTNG_0125 rplO secY TRUE 0.975 0.000 0.730 1.000 N NA
 3693586 3693587 GTNG_0125 GTNG_0126 secY adk TRUE 0.905 44.000 0.241 1.000 N NA
 3693587 3693588 GTNG_0126 GTNG_0127 adk   TRUE 0.961 -3.000 0.290 1.000 N NA
 3693588 3693589 GTNG_0127 GTNG_0128   infA FALSE 0.509 209.000 0.160 1.000 Y NA
 3693589 3693590 GTNG_0128 GTNG_0129 infA rpsM TRUE 0.746 169.000 0.075 0.024 Y NA
 3693590 3693591 GTNG_0129 GTNG_0130 rpsM   TRUE 0.994 26.000 0.810 0.018 Y NA
 3693591 3693592 GTNG_0130 GTNG_0131     TRUE 0.581 172.000 0.308 1.000 N NA
 3693592 3693593 GTNG_0131 GTNG_0132   rplQ TRUE 0.903 116.000 0.873 1.000 N NA
 3693593 3693594 GTNG_0132 GTNG_0133 rplQ   TRUE 0.570 121.000 0.074 1.000 N NA
 3693594 3693595 GTNG_0133 GTNG_0134     TRUE 0.997 -24.000 0.713 0.028 Y NA
 3693595 3693596 GTNG_0134 GTNG_0135     TRUE 0.983 -10.000 0.139 1.000 Y NA
 3693596 3693597 GTNG_0135 GTNG_0136   truA TRUE 0.868 13.000 0.170 1.000 N NA
 3693597 3693598 GTNG_0136 GTNG_0137 truA rplM FALSE 0.139 324.000 0.052 1.000 Y NA
 3693598 3693599 GTNG_0137 GTNG_0138 rplM rpsI TRUE 0.992 23.000 0.601 0.018 Y NA
 3693599 3693600 GTNG_0138 GTNG_0139 rpsI   FALSE 0.236 123.000 0.021 NA   NA
 3693600 3693601 GTNG_0139 GTNG_0140     TRUE 0.688 67.000 0.211 NA   NA
 3693601 3693602 GTNG_0140 GTNG_0141   mrp FALSE 0.446 181.000 0.211 1.000 N NA
 3693606 3693607 GTNG_16s004 GTNG_23s004     FALSE 0.011 249.000 0.000 NA   NA
 3693607 3693608 GTNG_23s004 GTNG_5s005     FALSE 0.059 150.000 0.000 NA   NA
 3693608 3693609 GTNG_5s005 GTNG_t015     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3693609 3693610 GTNG_t015 GTNG_t016     FALSE 0.231 8.000 0.000 NA   NA
 3693610 3693611 GTNG_t016 GTNG_t017     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3693611 3693612 GTNG_t017 GTNG_t018     FALSE 0.091 104.000 0.000 NA   NA
 3693612 3693613 GTNG_t018 GTNG_t019     FALSE 0.075 132.000 0.000 NA   NA
 3693613 3693614 GTNG_t019 GTNG_t020     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693614 3693615 GTNG_t020 GTNG_t021     FALSE 0.235 7.000 0.000 NA   NA
 3693615 3693616 GTNG_t021 GTNG_0145     FALSE 0.029 185.000 0.000 NA   NA
 3693616 3693617 GTNG_0145 GTNG_0146     FALSE 0.023 335.000 0.000 1.000 N NA
 3693617 3693618 GTNG_0146 GTNG_0147     FALSE 0.391 95.000 0.000 1.000 N NA
 3693618 3693619 GTNG_0147 GTNG_0148     TRUE 0.977 15.000 0.583 NA Y NA
 3693619 3693620 GTNG_0148 GTNG_0149     FALSE 0.333 73.000 0.028 NA   NA
 3693620 3693621 GTNG_0149 GTNG_0150     TRUE 0.971 -7.000 0.502 NA   NA
 3693621 3693622 GTNG_0150 GTNG_0151     TRUE 0.832 28.000 0.150 NA   NA
 3693622 3693623 GTNG_0151 GTNG_0152     FALSE 0.015 526.000 0.030 1.000 N NA
 3693623 3693624 GTNG_0152 GTNG_0153     FALSE 0.009 327.000 0.000 1.000   NA
 3693624 3693625 GTNG_0153 GTNG_0154     FALSE 0.008 348.000 0.000 1.000   NA
 3693625 3693626 GTNG_0154 GTNG_0155     FALSE 0.001 579.000 0.000 NA   NA
 3693626 3693627 GTNG_0155 GTNG_0156     FALSE 0.270 265.000 0.667 NA   NA
 3693627 3693628 GTNG_0156 GTNG_0157     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693628 3693629 GTNG_0157 GTNG_0160     FALSE 0.001 812.000 0.000 NA   NA
 3693629 3693630 GTNG_0160 GTNG_0161     FALSE 0.001 756.000 0.000 NA   NA
 3693630 3693631 GTNG_0161 GTNG_0162     TRUE 0.862 11.000 0.333 NA   NA
 3693631 3693632 GTNG_0162 GTNG_0163     TRUE 0.684 17.000 0.062 NA   NA
 3693634 3693635 GTNG_0165 GTNG_0166     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3693637 3693638 GTNG_0168 GTNG_0169     TRUE 0.556 101.000 0.051 1.000 N NA
 3693638 3693639 GTNG_0169 GTNG_0170   rocD TRUE 0.681 60.000 0.023 1.000 N NA
 3693639 3693640 GTNG_0170 GTNG_0171 rocD   FALSE 0.014 290.000 0.000 1.000   NA
 3693641 3693642 GTNG_0172 GTNG_0173   fhuB TRUE 0.996 -3.000 0.857 0.056 Y NA
 3693642 3693643 GTNG_0173 GTNG_0174 fhuB fhuD TRUE 0.946 72.000 0.487 1.000 Y NA
 3693643 3693644 GTNG_0174 GTNG_0175 fhuD fhuC TRUE 0.989 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 3693644 3693645 GTNG_0175 GTNG_0176 fhuC   FALSE 0.089 118.000 0.000 NA   NA
 3693646 3693647 GTNG_0177 GTNG_0178     TRUE 0.976 -28.000 0.286 1.000 N NA
 3693650 3693651 GTNG_0181 GTNG_0182     FALSE 0.157 65.000 0.000 NA   NA
 3693651 3693652 GTNG_0182 GTNG_0183     TRUE 0.995 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3693653 3693654 GTNG_0184 GTNG_0185     FALSE 0.332 19.000 0.000 NA   NA
 3693654 3693655 GTNG_0185 GTNG_0186     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693655 3693656 GTNG_0186 GTNG_0187     FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 3693656 3693657 GTNG_0187 GTNG_0188     FALSE 0.377 125.000 0.049 1.000   NA
 3693659 3693660 GTNG_0190 GTNG_0191   spo0M FALSE 0.438 67.000 0.045 NA   NA
 3693660 3693661 GTNG_0191 GTNG_0192 spo0M   FALSE 0.001 531.000 0.000 NA   NA
 3693661 3693662 GTNG_0192 GTNG_0193     FALSE 0.071 213.000 0.000 NA N NA
 3693664 3693665 GTNG_0195 GTNG_0196     TRUE 0.933 11.000 0.714 NA   NA
 3693665 3693666 GTNG_0196 GTNG_0197     TRUE 0.934 12.000 0.714 NA   NA
 3693666 3693667 GTNG_0197 GTNG_0198   ddl TRUE 0.566 157.000 0.004 NA Y NA
 3693667 3693668 GTNG_0198 GTNG_0199 ddl   TRUE 0.965 17.000 0.044 0.005 Y NA
 3693668 3693669 GTNG_0199 GTNG_0200     TRUE 0.726 68.000 0.214 1.000   NA
 3693669 3693670 GTNG_0200 GTNG_0201     FALSE 0.314 79.000 0.006 1.000   NA
 3693672 3693673 GTNG_0203 GTNG_0204 acpS   FALSE 0.496 80.000 0.038 NA N NA
 3693673 3693674 GTNG_0204 GTNG_0205     FALSE 0.234 295.000 0.194 NA Y NA
 3693674 3693675 GTNG_0205 GTNG_0206     FALSE 0.504 128.000 0.043 1.000 N NA
 3693675 3693676 GTNG_0206 GTNG_0207     TRUE 0.896 5.000 0.221 1.000 N NA
 3693676 3693677 GTNG_0207 GTNG_0208     FALSE 0.183 59.000 0.000 NA   NA
 3693677 3693678 GTNG_0208 GTNG_0209     FALSE 0.004 324.000 0.000 NA   NA
 3693678 3693679 GTNG_0209 GTNG_0210     FALSE 0.174 221.000 0.215 NA   NA
 3693679 3693680 GTNG_0210 GTNG_t022     FALSE 0.012 238.000 0.000 NA   NA
 3693680 3693681 GTNG_t022 GTNG_t023     FALSE 0.235 7.000 0.000 NA   NA
 3693681 3693682 GTNG_t023 GTNG_t024     FALSE 0.289 17.000 0.000 NA   NA
 3693682 3693683 GTNG_t024 GTNG_t025     FALSE 0.335 31.000 0.000 NA   NA
 3693683 3693684 GTNG_t025 GTNG_t026     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3693684 3693685 GTNG_t026 GTNG_t027     FALSE 0.046 163.000 0.000 NA   NA
 3693685 3693686 GTNG_t027 GTNG_t028     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3693686 3693687 GTNG_t028 GTNG_t029     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693687 3693688 GTNG_t029 GTNG_t030     FALSE 0.117 74.000 0.000 NA   NA
 3693688 3693689 GTNG_t030 GTNG_t031     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693689 3693690 GTNG_t031 GTNG_t032     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3693690 3693691 GTNG_t032 GTNG_16s005     FALSE 0.099 85.000 0.000 NA   NA
 3693691 3693692 GTNG_16s005 GTNG_23s005     FALSE 0.003 390.000 0.000 NA   NA
 3693692 3693693 GTNG_23s005 GTNG_5s006     FALSE 0.010 252.000 0.000 NA   NA
 3693693 3693694 GTNG_5s006 GTNG_0211     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 3693694 3693695 GTNG_0211 GTNG_0212     TRUE 0.908 -3.000 0.217 NA   NA
 3693695 3693696 GTNG_0212 GTNG_0213     TRUE 0.934 -40.000 0.127 1.000   NA
 3693696 3693697 GTNG_0213 GTNG_0214     TRUE 0.870 -3.000 0.090 1.000   NA
 3693699 3693700 GTNG_0216 GTNG_0217 moaC   TRUE 0.607 16.000 0.013 1.000   NA
 3693700 3693701 GTNG_0217 GTNG_0218     TRUE 0.664 16.000 0.033 1.000   NA
 3693701 3693702 GTNG_0218 GTNG_0219     TRUE 0.796 21.000 0.107 NA   NA
 3693703 3693704 GTNG_0220 GTNG_0221     TRUE 0.825 -3.000 0.080 NA   NA
 3693705 3693706 GTNG_0222 GTNG_0223 groES groEL TRUE 0.969 103.000 0.674 0.006 Y NA
 3693707 3693708 GTNG_0224 GTNG_0225     TRUE 0.981 10.000 0.667 1.000 Y NA
 3693711 3693712 GTNG_0228 GTNG_0229     TRUE 0.813 123.000 0.714 NA   NA
 3693712 3693713 GTNG_0229 GTNG_0230     TRUE 0.968 -3.000 0.642 NA   NA
 3693713 3693714 GTNG_0230 GTNG_0231   guaA FALSE 0.055 198.000 0.007 NA   NA
 3693714 3693715 GTNG_0231 GTNG_0232 guaA   FALSE 0.009 518.000 0.000 1.000 N NA
 3693715 3693716 GTNG_0232 GTNG_0233     FALSE 0.195 57.000 0.000 NA   NA
 3693716 3693717 GTNG_0233 GTNG_0234     FALSE 0.002 437.000 0.000 NA   NA
 3693717 3693718 GTNG_0234 GTNG_0235     FALSE 0.299 142.000 0.042 1.000   NA
 3693718 3693719 GTNG_0235 GTNG_16s006     FALSE 0.014 230.000 0.000 NA   NA
 3693719 3693720 GTNG_16s006 GTNG_23s006     FALSE 0.003 387.000 0.000 NA   NA
 3693720 3693721 GTNG_23s006 GTNG_5s007     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 3693723 3693724 GTNG_0237 GTNG_0238 purE purK TRUE 0.987 -7.000 0.038 0.001 Y NA
 3693724 3693725 GTNG_0238 GTNG_0239 purK purB TRUE 0.962 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 3693725 3693726 GTNG_0239 GTNG_0240 purB purC TRUE 0.843 74.000 0.072 1.000 Y NA
 3693726 3693727 GTNG_0240 GTNG_0241 purC   TRUE 0.993 -12.000 0.460 1.000 Y NA
 3693727 3693728 GTNG_0241 GTNG_0242   purL TRUE 0.996 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 3693728 3693729 GTNG_0242 GTNG_0243 purL purQ TRUE 0.996 -16.000 0.346 0.001 Y NA
 3693729 3693730 GTNG_0243 GTNG_0244 purQ purF TRUE 0.988 -24.000 0.223 1.000 Y NA
 3693730 3693731 GTNG_0244 GTNG_0245 purF purM TRUE 0.885 98.000 0.248 1.000 Y NA
 3693731 3693732 GTNG_0245 GTNG_0246 purM purN TRUE 0.990 -3.000 0.238 0.003 Y NA
 3693732 3693733 GTNG_0246 GTNG_0247 purN purH TRUE 0.989 -34.000 0.225 1.000 Y NA
 3693733 3693734 GTNG_0247 GTNG_0248 purH purD TRUE 0.974 27.000 0.238 1.000 Y NA
 3693736 3693737 GTNG_0250 GTNG_0251     TRUE 0.862 20.000 0.200 NA   NA
 3693737 3693738 GTNG_0251 GTNG_0252     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 3693738 3693739 GTNG_0252 GTNG_0253     FALSE 0.001 927.000 0.000 NA   NA
 3693739 3693740 GTNG_0253 GTNG_0254     FALSE 0.223 106.000 0.015 NA   NA
 3693740 3693741 GTNG_0254 GTNG_0255     TRUE 0.711 29.000 0.049 NA   NA
 3693741 3693742 GTNG_0255 GTNG_0256   ligA TRUE 0.976 22.000 0.103 0.012 Y NA
 3693742 3693743 GTNG_0256 GTNG_0257 ligA   TRUE 0.642 -3.000 0.004 NA   NA
 3693743 3693744 GTNG_0257 GTNG_0258     FALSE 0.002 400.000 0.000 NA   NA
 3693745 3693746 GTNG_0259 GTNG_0260     FALSE 0.389 130.000 0.105 NA   NA
 3693747 3693748 GTNG_0261 GTNG_0262 gatC gatA TRUE 0.991 13.000 0.643 0.001 Y NA
 3693748 3693749 GTNG_0262 GTNG_0263 gatA gatB TRUE 0.988 14.000 0.492 0.001 Y NA
 3693749 3693750 GTNG_0263 GTNG_0264 gatB   FALSE 0.190 187.000 0.002 1.000 N NA
 3693750 3693751 GTNG_0264 GTNG_0265   sunA FALSE 0.003 672.000 0.000 1.000   NA
 3693751 3693752 GTNG_0265 GTNG_0266 sunA spaB FALSE 0.001 775.000 0.000 NA   NA
 3693752 3693753 GTNG_0266 GTNG_0267 spaB spaT FALSE 0.246 167.000 0.103 NA   NA
 3693753 3693754 GTNG_0267 GTNG_0268 spaT spaC TRUE 0.907 -31.000 0.069 1.000   NA
 3693754 3693755 GTNG_0268 GTNG_0269 spaC spaR FALSE 0.009 343.000 0.000 1.000   NA
 3693755 3693756 GTNG_0269 GTNG_0270 spaR spaK TRUE 0.986 -13.000 0.037 0.021 Y NA
 3693757 3693758 GTNG_0271 GTNG_0272 spaI spaG TRUE 0.841 55.000 0.333 NA   NA
 3693758 3693759 GTNG_0272 GTNG_0273 spaG spaE FALSE 0.268 176.000 0.163 NA   NA
 3693759 3693760 GTNG_0273 GTNG_0274 spaE spaF TRUE 0.933 19.000 0.449 NA   NA
 3693760 3693761 GTNG_0274 GTNG_0275 spaF   FALSE 0.007 655.000 0.000 1.000 N NA
 3693761 3693762 GTNG_0275 GTNG_0276     FALSE 0.103 390.000 0.018 0.100 Y NA
 3693762 3693763 GTNG_0276 GTNG_0277     TRUE 0.877 17.000 0.125 1.000 N NA
 3693763 3693764 GTNG_0277 GTNG_0278     FALSE 0.007 279.000 0.000 NA   NA
 3693765 3693766 GTNG_0279 GTNG_0280     FALSE 0.001 1087.000 0.000 NA   NA
 3693767 3693768 GTNG_0281 GTNG_0282     FALSE 0.447 173.000 0.333 NA   NA
 3693768 3693769 GTNG_0282 GTNG_0283     TRUE 0.986 -40.000 0.833 NA   NA
 3693769 3693770 GTNG_0283 GTNG_0284     FALSE 0.432 161.000 0.250 NA   NA
 3693770 3693771 GTNG_0284 GTNG_0285     TRUE 0.991 -46.000 0.304 1.000 Y NA
 3693772 3693773 GTNG_0286 GTNG_0287 hhoA   FALSE 0.209 53.000 0.000 NA   NA
 3693773 3693774 GTNG_0287 GTNG_0288     FALSE 0.002 413.000 0.000 NA   NA
 3693774 3693775 GTNG_0288 GTNG_0289   panF TRUE 0.888 -3.000 0.170 NA   NA
 3693775 3693776 GTNG_0289 GTNG_0290 panF   TRUE 0.849 4.000 0.095 1.000 N NA
 3693776 3693777 GTNG_0290 GTNG_0291     TRUE 0.950 4.000 0.143 1.000 Y NA
 3693777 3693778 GTNG_0291 GTNG_0292     TRUE 0.980 27.000 0.600 0.082 N NA
 3693778 3693779 GTNG_0292 GTNG_0293     FALSE 0.225 369.000 0.600 0.047 N NA
 3693781 3693782 GTNG_0295 GTNG_0296     TRUE 0.936 22.000 0.464 NA   NA
 3693782 3693783 GTNG_0296 GTNG_0297     FALSE 0.205 145.000 0.033 NA   NA
 3693783 3693784 GTNG_0297 GTNG_0298     TRUE 0.810 75.000 0.299 1.000 N NA
 3693786 3693787 GTNG_0300 GTNG_0301     TRUE 0.740 -25.000 0.000 1.000   NA
 3693787 3693788 GTNG_0301 GTNG_0302     FALSE 0.344 25.000 0.000 NA   NA
 3693788 3693789 GTNG_0302 GTNG_0303     FALSE 0.002 401.000 0.000 NA   NA
 11461047 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3566.000 0.000 NA   NA
 11603410 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3566.000 0.000 NA   NA
 11745802 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3566.000 0.000 NA   NA
 11461048 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3596.000 0.000 NA   NA
 11603411 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3596.000 0.000 NA   NA
 11745803 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3596.000 0.000 NA   NA
 11461049 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3632.000 0.000 NA   NA
 11603412 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3632.000 0.000 NA   NA
 11745804 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3632.000 0.000 NA   NA
 11461050 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3662.000 0.000 NA   NA
 11603413 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3662.000 0.000 NA   NA
 11745805 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3662.000 0.000 NA   NA
 11461051 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3699.000 0.000 NA   NA
 11603414 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3699.000 0.000 NA   NA
 11745806 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3699.000 0.000 NA   NA
 11461052 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3729.000 0.000 NA   NA
 11603415 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3729.000 0.000 NA   NA
 11745807 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3729.000 0.000 NA   NA
 11461053 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3766.000 0.000 NA   NA
 11603416 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3766.000 0.000 NA   NA
 11745808 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3766.000 0.000 NA   NA
 11461054 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3796.000 0.000 NA   NA
 11603417 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3796.000 0.000 NA   NA
 11745809 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3796.000 0.000 NA   NA
 11461055 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3832.000 0.000 NA   NA
 11603418 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3832.000 0.000 NA   NA
 11745810 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3832.000 0.000 NA   NA
 11461056 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3862.000 0.000 NA   NA
 11603419 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3862.000 0.000 NA   NA
 11745811 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3862.000 0.000 NA   NA
 11461057 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3900.000 0.000 NA   NA
 11603420 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3900.000 0.000 NA   NA
 11745812 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3900.000 0.000 NA   NA
 11461058 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3930.000 0.000 NA   NA
 11603421 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3930.000 0.000 NA   NA
 11745813 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3930.000 0.000 NA   NA
 11461059 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3966.000 0.000 NA   NA
 11603422 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3966.000 0.000 NA   NA
 11745814 3693786   GTNG_0300     FALSE NA 3966.000 0.000 NA   NA
 3693791 3693792 GTNG_0305 GTNG_0307     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA   NA
 3693792 3693793 GTNG_0307 GTNG_0308     TRUE 0.978 -7.000 0.667 NA   NA
 3693793 3693794 GTNG_0308 GTNG_0309     TRUE 0.933 -7.000 0.222 NA   NA
 3693794 3693795 GTNG_0309 GTNG_0310     FALSE 0.003 376.000 0.000 NA   NA
 3693795 3693796 GTNG_0310 GTNG_0311     FALSE 0.088 120.000 0.000 NA   NA
 3693796 3693797 GTNG_0311 GTNG_0312     FALSE 0.002 415.000 0.000 NA   NA
 3693797 3693798 GTNG_0312 GTNG_0313     TRUE 0.578 -73.000 0.000 NA   NA
 3693798 3693799 GTNG_0313 GTNG_0314     FALSE 0.001 682.000 0.000 NA   NA
 3693799 3693800 GTNG_0314 GTNG_0315     FALSE 0.006 1050.000 0.000 1.000 N NA
 3693800 3693801 GTNG_0315 GTNG_0316     FALSE 0.024 195.000 0.000 NA   NA
 3693803 3693804 GTNG_0318 GTNG_0319     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 3693805 3693806 GTNG_0320 GTNG_0321     FALSE 0.081 174.000 0.000 1.000   NA
 3693806 3693807 GTNG_0321 GTNG_0322     FALSE 0.039 314.000 0.000 0.014   NA
 3693808 3693809 GTNG_0323 GTNG_0324     TRUE 0.895 -3.000 0.184 NA   NA
 3693809 3693810 GTNG_0324 GTNG_0325     FALSE 0.002 470.000 0.000 NA   NA
 3693815 3693816 GTNG_0330 GTNG_0331 resE   TRUE 0.991 0.000 0.833 1.000 Y NA
 3693816 3693817 GTNG_0331 GTNG_0332     TRUE 0.840 116.000 0.500 1.000 N NA
 3693817 3693818 GTNG_0332 GTNG_0333     TRUE 0.968 32.000 0.571 1.000 N NA
 3693818 3693819 GTNG_0333 GTNG_0334     FALSE 0.004 444.000 0.000 1.000   NA
 3693820 3693821 GTNG_0335 GTNG_0336 manC   TRUE 0.983 -3.000 0.087 0.012 Y NA
 3693821 3693822 GTNG_0336 GTNG_0337     TRUE 0.795 20.000 0.068 1.000   NA
 3693822 3693823 GTNG_0337 GTNG_0338   manB TRUE 0.849 -49.000 0.010 1.000   NA
 3693823 3693824 GTNG_0338 GTNG_0339 manB   FALSE 0.071 262.000 0.007 1.000 N NA
 3693824 3693825 GTNG_0339 GTNG_0340     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 3693825 3693826 GTNG_0340 GTNG_0341     TRUE 0.951 23.000 0.600 NA   NA
 3693826 3693827 GTNG_0341 GTNG_0342     TRUE 0.926 7.000 0.115 NA Y NA
 3693829 3693830 GTNG_0344 GTNG_0345     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 3693830 3693831 GTNG_0345 GTNG_0346   thiC FALSE 0.013 405.000 0.000 1.000 N NA
 3693831 3693832 GTNG_0346 GTNG_0347 thiC   FALSE 0.022 343.000 0.000 1.000 N NA
 3693832 3693833 GTNG_0347 GTNG_0348     TRUE 0.994 -18.000 0.556 1.000 Y NA
 3693833 3693834 GTNG_0348 GTNG_0349     TRUE 0.529 135.000 0.082 1.000 N NA
 3693834 3693835 GTNG_0349 GTNG_0350     FALSE 0.499 152.000 0.107 1.000 N NA
 3693836 3693837 GTNG_0351 GTNG_0352     TRUE 0.923 0.000 0.205 1.000 N NA
 3693837 3693838 GTNG_0352 GTNG_0353     FALSE 0.315 136.000 0.000 1.000 N NA
 3693838 3693839 GTNG_0353 GTNG_0354     TRUE 0.992 22.000 0.667 0.054 Y NA
 3693839 3693840 GTNG_0354 GTNG_0355     TRUE 0.997 -13.000 0.800 0.046 Y NA
 3693840 3693841 GTNG_0355 GTNG_0356     TRUE 0.726 -13.000 0.003 NA   NA
 3693841 3693842 GTNG_0356 GTNG_0357     TRUE 0.641 -3.000 0.004 NA   NA
 3693842 3693843 GTNG_0357 GTNG_0358     FALSE 0.174 62.000 0.000 NA   NA
 3693843 3693844 GTNG_0358 GTNG_0359     FALSE 0.096 97.000 0.000 NA   NA
 3693844 3693845 GTNG_0359 GTNG_0360     TRUE 0.934 16.000 0.549 1.000   NA
 3693846 3693847 GTNG_0361 GTNG_0362 hutP   FALSE 0.222 150.000 0.044 NA   NA
 3693847 3693848 GTNG_0362 GTNG_0363     FALSE 0.192 100.000 0.000 1.000   NA
 3693848 3693849 GTNG_0363 GTNG_0364     FALSE 0.015 281.000 0.000 1.000   NA
 3693849 3693850 GTNG_0364 GTNG_0365     TRUE 0.796 43.000 0.038 1.000 N NA
 3693851 3693852 GTNG_0366 GTNG_0367     TRUE 0.982 -3.000 0.447 0.001   NA
 3693852 3693853 GTNG_0367 GTNG_0368     TRUE 0.990 19.000 0.947 NA Y NA
 3693853 3693854 GTNG_0368 GTNG_0369     TRUE 0.778 110.000 0.395 NA N NA
 3693855 3693856 GTNG_0370 GTNG_0371     TRUE 0.692 107.000 0.000 1.000 Y NA
 3693856 3693857 GTNG_0371 GTNG_0372     TRUE 0.986 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 3693861 3693862 GTNG_0376 GTNG_0377     TRUE 0.610 2.000 0.029 NA   NA
 3693862 3693863 GTNG_0377 GTNG_0378     FALSE 0.060 203.000 0.019 NA   NA
 3693863 3693864 GTNG_0378 GTNG_0379     FALSE 0.253 102.000 0.021 NA   NA
 3693865 3693866 GTNG_0380 GTNG_0381     TRUE 0.930 14.000 0.644 NA   NA
 3693868 3693869 GTNG_0383 GTNG_0384     FALSE 0.368 88.000 0.029 1.000   NA
 3693869 3693870 GTNG_0384 GTNG_0385     TRUE 0.906 11.000 0.438 1.000   NA
 3693870 3693871 GTNG_0385 GTNG_0386     FALSE 0.457 141.000 0.049 1.000 N NA
 3693871 3693872 GTNG_0386 GTNG_0387   sat TRUE 0.967 13.000 0.101 0.002 Y NA
 3693872 3693873 GTNG_0387 GTNG_0388 sat   TRUE 0.901 48.000 0.009 1.000 Y NA
 3693873 3693874 GTNG_0388 GTNG_0389     TRUE 0.716 12.000 0.005 1.000 N NA
 3693874 3693875 GTNG_0389 GTNG_0390     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 3693876 3693877 GTNG_0391 GTNG_0392     FALSE 0.384 68.000 0.003 1.000   NA
 3693878 3693879 GTNG_0393 GTNG_0394     FALSE 0.372 120.000 0.077 NA   NA
 3693880 3693881 GTNG_0395 GTNG_0396     FALSE 0.436 153.000 0.212 NA   NA
 3693883 3693884 GTNG_0398 GTNG_0399     FALSE 0.468 173.000 0.185 1.000 N NA
 3693884 3693885 GTNG_0399 GTNG_0400     FALSE 0.505 160.000 0.160 1.000 N NA
 3693885 3693886 GTNG_0400 GTNG_0401     TRUE 0.862 12.000 0.164 1.000 N NA
 3693888 3693889 GTNG_0403 GTNG_0404     FALSE 0.003 716.000 0.000 1.000   NA
 3693889 3693890 GTNG_0404 GTNG_0405     FALSE 0.144 624.000 0.312 0.052 Y NA
 3693890 3693891 GTNG_0405 GTNG_0406     TRUE 0.982 4.000 0.375 0.052 Y NA
 3693891 3693892 GTNG_0406 GTNG_0407     TRUE 0.923 23.000 0.000 1.000 Y NA
 3693894 3693895 GTNG_0409 GTNG_0410     FALSE 0.247 15.000 0.000 NA   NA
 3693895 3693896 GTNG_0410 GTNG_0411     FALSE 0.006 291.000 0.000 NA   NA
 3693896 3693897 GTNG_0411 GTNG_0412     TRUE 0.954 14.000 1.000 NA   NA
 3693897 3693898 GTNG_0412 GTNG_0413     FALSE 0.110 428.000 1.000 NA   NA
 3693898 3693899 GTNG_0413 GTNG_0414     TRUE 0.952 12.000 1.000 NA   NA
 3693899 3693900 GTNG_0414 GTNG_0415     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3693900 3693901 GTNG_0415 GTNG_0416     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 3693901 3693902 GTNG_0416 GTNG_0417     TRUE 0.813 45.000 0.211 NA   NA
 3693902 3693903 GTNG_0417 GTNG_0418     TRUE 0.960 35.000 0.833 NA   NA
 3693903 3693904 GTNG_0418 GTNG_0419     TRUE 0.944 37.000 0.623 NA   NA
 3693904 3693905 GTNG_0419 GTNG_0420     TRUE 0.833 24.000 0.151 NA   NA
 3693905 3693906 GTNG_0420 GTNG_0421     TRUE 0.951 -10.000 0.286 NA   NA
 3693906 3693907 GTNG_0421 GTNG_0422     FALSE 0.245 47.000 0.000 NA   NA
 3693907 3693908 GTNG_0422 GTNG_0423     TRUE 0.906 7.000 0.500 NA   NA
 3693908 3693909 GTNG_0423 GTNG_0424     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693909 3693910 GTNG_0424 GTNG_0425     FALSE 0.017 217.000 0.000 NA   NA
 3693910 3693911 GTNG_0425 GTNG_0426     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3693911 3693912 GTNG_0426 GTNG_0427     FALSE 0.001 525.000 0.000 NA   NA
 3693912 3693913 GTNG_0427 GTNG_0428     FALSE 0.002 397.000 0.000 NA   NA
 3693913 3693914 GTNG_0428 GTNG_0429     FALSE 0.083 127.000 0.000 NA   NA
 3693914 3693915 GTNG_0429 GTNG_0430     TRUE 0.904 18.000 0.333 NA   NA
 3693915 3693916 GTNG_0430 GTNG_0431     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 3693916 3693917 GTNG_0431 GTNG_0432     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3693917 3693918 GTNG_0432 GTNG_0433     FALSE 0.343 24.000 0.000 NA   NA
 3693918 3693919 GTNG_0433 GTNG_0434     FALSE 0.002 411.000 0.000 NA   NA
 3693920 3693921 GTNG_0435 GTNG_0436     TRUE 0.828 42.000 0.054 0.062   NA
 3693922 3693923 GTNG_0437 GTNG_0438     FALSE 0.001 628.000 0.000 NA   NA
 3693923 3693924 GTNG_0438 GTNG_0439     TRUE 0.945 28.000 0.514 NA   NA
 3693924 3693925 GTNG_0439 GTNG_0440     TRUE 0.705 65.000 0.210 NA   NA
 3693925 3693926 GTNG_0440 GTNG_0441     TRUE 0.971 -3.000 0.679 NA   NA
 3693926 3693927 GTNG_0441 GTNG_0442     TRUE 0.993 3.000 0.853 0.020 Y NA
 3693927 3693928 GTNG_0442 GTNG_0443     FALSE 0.006 375.000 0.000 1.000   NA
 3693928 3693929 GTNG_0443 GTNG_0444   tipA FALSE 0.036 220.000 0.000 1.000   NA
 3693929 3693930 GTNG_0444 GTNG_0445 tipA   FALSE 0.001 973.000 0.000 NA   NA
 3693930 3693931 GTNG_0445 GTNG_0446     FALSE 0.003 372.000 0.000 NA   NA
 3693931 3693932 GTNG_0446 GTNG_0447     FALSE 0.002 458.000 0.000 NA   NA
 3693932 3693933 GTNG_0447 GTNG_0448     TRUE 0.849 8.000 0.303 NA   NA
 3693933 3693934 GTNG_0448 GTNG_0449     FALSE 0.088 109.000 0.000 NA   NA
 3693934 3693935 GTNG_0449 GTNG_0450     TRUE 0.982 -7.000 0.833 NA   NA
 3693935 3693936 GTNG_0450 GTNG_0451     FALSE 0.088 111.000 0.000 NA   NA
 3693937 3693938 GTNG_0452 GTNG_0453     TRUE 0.758 100.000 0.259 1.000 N NA
 3693940 3693941 GTNG_0455 GTNG_0456     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 3693941 3693942 GTNG_0456 GTNG_0457     FALSE 0.010 252.000 0.000 NA   NA
 3693943 3693944 GTNG_0458 GTNG_0459 recX   FALSE 0.421 69.000 0.045 NA   NA
 3693945 3693946 GTNG_0460 GTNG_0461   sspK TRUE 0.560 75.000 0.160 NA   NA
 3693946 3693947 GTNG_0461 GTNG_0462 sspK   TRUE 0.732 19.000 0.066 NA   NA
 3693947 3693948 GTNG_0462 GTNG_0463     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 3693948 3693949 GTNG_0463 GTNG_0464     TRUE 0.985 -7.000 1.000 NA   NA
 3693950 3693951 GTNG_0465 GTNG_0466     FALSE 0.009 261.000 0.000 NA   NA
 3693951 3693952 GTNG_0466 GTNG_0467     TRUE 0.798 17.000 0.023 1.000 N NA
 3693952 3693953 GTNG_0467 GTNG_0468     FALSE 0.015 435.000 0.002 1.000 N NA
 3693955 3693956 GTNG_0470 GTNG_0471 fabI   TRUE 0.825 59.000 0.282 1.000   NA
 3693956 3693957 GTNG_0471 GTNG_0472     FALSE 0.031 183.000 0.000 NA   NA
 3693957 3693958 GTNG_0472 GTNG_0473     FALSE 0.194 131.000 0.015 NA   NA
 3693958 3693959 GTNG_0473 GTNG_0474     TRUE 0.668 66.000 0.077 NA N NA
 3693959 3693960 GTNG_0474 GTNG_0475     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3693960 3693961 GTNG_0475 GTNG_0476     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3693961 3693962 GTNG_0476 GTNG_0477     TRUE 0.998 -34.000 1.000 0.003 Y NA
 3693962 3693963 GTNG_0477 GTNG_0478   dppA TRUE 0.983 48.000 0.750 1.000 Y NA
 3693963 3693964 GTNG_0478 GTNG_0479 dppA dppB TRUE 0.900 71.000 0.067 0.051 Y NA
 3693964 3693965 GTNG_0479 GTNG_0480 dppB dppC TRUE 0.993 20.000 0.779 0.051 Y NA
 3693966 3693967 GTNG_0481 GTNG_0482     FALSE 0.349 118.000 0.066 NA   NA
 3693967 3693968 GTNG_0482 GTNG_0483     FALSE 0.013 356.000 0.036 NA   NA
 3693969 3693970 GTNG_0484 GTNG_0485     TRUE 0.968 -7.000 0.488 NA   NA
 3693970 3693971 GTNG_0485 GTNG_0486     TRUE 0.914 5.000 0.500 NA   NA
 3693971 3693972 GTNG_0486 GTNG_0487   ldh FALSE 0.212 152.000 0.042 NA   NA
 3693972 3693973 GTNG_0487 GTNG_0488 ldh   FALSE 0.139 186.000 0.065 NA   NA
 3693973 3693974 GTNG_0488 GTNG_0489     FALSE 0.321 64.000 0.005 NA   NA
 3693974 3693975 GTNG_0489 GTNG_0490     FALSE 0.110 226.000 0.005 1.000 N NA
 3693977 3693978 GTNG_0492 GTNG_16s007     FALSE 0.002 472.000 0.000 NA   NA
 3693978 3693979 GTNG_16s007 GTNG_23s007     FALSE 0.002 392.000 0.000 NA   NA
 3693979 3693980 GTNG_23s007 GTNG_5s008     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA   NA
 3693980 3693981 GTNG_5s008 GTNG_t033     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3693981 3693982 GTNG_t033 GTNG_t034     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3693982 3693983 GTNG_t034 GTNG_t035     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693983 3693984 GTNG_t035 GTNG_t036     FALSE 0.034 178.000 0.000 NA   NA
 3693984 3693985 GTNG_t036 GTNG_t037     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3693985 3693986 GTNG_t037 GTNG_t038     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3693986 3693987 GTNG_t038 GTNG_t039     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693987 3693988 GTNG_t039 GTNG_t040     FALSE 0.231 8.000 0.000 NA   NA
 3693988 3693989 GTNG_t040 GTNG_t041     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3693989 3693990 GTNG_t041 GTNG_t042     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3693990 3693991 GTNG_t042 GTNG_t043     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3693991 3693992 GTNG_t043 GTNG_t044     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3693992 3693993 GTNG_t044 GTNG_t045     FALSE 0.231 9.000 0.000 NA   NA
 3693993 3693994 GTNG_t045 GTNG_t046     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3693994 3693995 GTNG_t046 GTNG_t047     FALSE 0.335 31.000 0.000 NA   NA
 3693995 3693996 GTNG_t047 GTNG_t048     FALSE 0.231 9.000 0.000 NA   NA
 3693996 3693997 GTNG_t048 GTNG_t049     FALSE 0.335 31.000 0.000 NA   NA
 3693997 3693998 GTNG_t049 GTNG_t050     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3693998 3693999 GTNG_t050 GTNG_t051     FALSE 0.012 243.000 0.000 NA   NA
 3693999 3694000 GTNG_t051 GTNG_t052     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3694000 3694001 GTNG_t052 GTNG_t053     FALSE 0.243 6.000 0.000 NA   NA
 3694003 3694004 GTNG_0494 GTNG_0495     TRUE 0.706 59.000 0.174 NA   NA
 3694004 3694005 GTNG_0495 GTNG_0496     TRUE 0.788 24.000 0.097 NA   NA
 3694005 3694006 GTNG_0496 GTNG_0497     FALSE 0.025 325.000 0.000 1.000 N NA
 3694006 3694007 GTNG_0497 GTNG_0498     FALSE 0.399 226.000 0.683 NA   NA
 3694010 3694011 GTNG_0501 GTNG_0502     TRUE 0.984 66.000 1.000 0.076 Y NA
 3694012 3694013 GTNG_0503 GTNG_0504     FALSE 0.267 180.000 0.037 1.000 N NA
 3694013 3694014 GTNG_0504 GTNG_0505     FALSE 0.011 310.000 0.000 1.000   NA
 3694014 3694015 GTNG_0505 GTNG_0506     FALSE 0.276 127.000 0.010 1.000   NA
 3694015 3694016 GTNG_0506 GTNG_0507     FALSE 0.266 131.000 0.013 1.000   NA
 3694019 3694020 GTNG_0510 GTNG_0511   bdbC TRUE 0.965 -3.000 0.236 0.004   NA
 3694021 3694022 GTNG_0512 GTNG_0513     FALSE 0.360 114.000 0.037 1.000   NA
 3694026 3694027 GTNG_0517 GTNG_0518     FALSE 0.014 285.000 0.000 1.000   NA
 3694027 3694028 GTNG_0518 GTNG_0519     TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.052 Y NA
 3694028 3694029 GTNG_0519 GTNG_0520     FALSE 0.028 187.000 0.000 NA   NA
 3694029 3694030 GTNG_0520 GTNG_0521     FALSE 0.008 267.000 0.000 NA   NA
 3694030 3694031 GTNG_0521 GTNG_0522     FALSE 0.002 413.000 0.000 NA   NA
 3694031 3694032 GTNG_0522 GTNG_0523     TRUE 0.630 7.000 0.067 NA   NA
 3694034 3694035 GTNG_0525 GTNG_0526     TRUE 0.871 -7.000 0.086 NA   NA
 3694035 3694036 GTNG_0526 GTNG_0527     FALSE 0.053 203.000 0.011 NA   NA
 3694036 3694037 GTNG_0527 GTNG_0528     FALSE 0.394 138.000 0.011 1.000 N NA
 3694037 3694038 GTNG_0528 GTNG_0529     FALSE 0.286 100.000 0.031 NA   NA
 3694038 3694039 GTNG_0529 GTNG_0530     FALSE 0.212 141.000 0.031 NA   NA
 3694041 3694042 GTNG_0532 GTNG_0533     TRUE 0.758 16.000 0.138 NA   NA
 3694042 3694043 GTNG_0533 GTNG_0534     TRUE 0.963 -3.000 0.469 1.000   NA
 3694043 3694044 GTNG_0534 GTNG_0535   tenI TRUE 0.710 17.000 0.000 1.000 N NA
 3694044 3694045 GTNG_0535 GTNG_0536 tenI   TRUE 0.819 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3694045 3694046 GTNG_0536 GTNG_0537   thiS TRUE 0.954 -3.000 0.239 1.000 N NA
 3694046 3694047 GTNG_0537 GTNG_0538 thiS thiG TRUE 0.940 2.000 0.054 1.000 Y NA
 3694047 3694048 GTNG_0538 GTNG_0539 thiG moeB TRUE 0.973 -3.000 0.009 0.039 Y NA
 3694048 3694049 GTNG_0539 GTNG_0540 moeB   FALSE 0.012 510.000 0.000 0.039   NA
 3694052 3694053 GTNG_0543 GTNG_0544     TRUE 0.701 135.000 0.321 NA N NA
 3694053 3694054 GTNG_0544 GTNG_0545     FALSE 0.458 83.000 0.107 NA   NA
 3694054 3694055 GTNG_0545 GTNG_0546     FALSE 0.002 472.000 0.000 NA   NA
 3694055 3694056 GTNG_0546 GTNG_0547     TRUE 0.855 -3.000 0.111 NA   NA
 3694056 3694057 GTNG_0547 GTNG_0548     TRUE 0.981 -3.000 0.583 0.039   NA
 3694057 3694058 GTNG_0548 GTNG_0549     TRUE 0.897 4.000 0.167 0.039   NA
 3694059 3694060 GTNG_0550 GTNG_0551     TRUE 0.730 73.000 0.321 NA   NA
 3694060 3694061 GTNG_0551 GTNG_0552     FALSE 0.212 145.000 0.036 NA   NA
 3694061 3694062 GTNG_0552 GTNG_0553     FALSE 0.218 223.000 0.091 0.039   NA
 3694064 3694065 GTNG_0555 GTNG_0556     TRUE 0.961 -7.000 0.382 NA   NA
 3694065 3694066 GTNG_0556 GTNG_0557     FALSE 0.250 119.000 0.024 NA   NA
 3694066 3694067 GTNG_0557 GTNG_0558     FALSE 0.068 247.000 0.087 NA   NA
 3694067 3694068 GTNG_0558 GTNG_0559     FALSE 0.196 123.000 0.008 NA   NA
 3694068 3694069 GTNG_0559 GTNG_0560     FALSE 0.255 95.000 0.020 NA   NA
 3694069 3694070 GTNG_0560 GTNG_0561     FALSE 0.002 462.000 0.000 NA   NA
 3694072 3694073 GTNG_0563 GTNG_0564   prsA FALSE 0.003 365.000 0.000 NA   NA
 3694075 3694076 GTNG_0566 GTNG_0567   escB TRUE 0.951 -3.000 0.271 NA N NA
 3694076 3694077 GTNG_0567 GTNG_0568 escB   FALSE 0.011 247.000 0.000 NA   NA
 3694077 3694078 GTNG_0568 GTNG_0569   hemE FALSE 0.130 146.000 0.002 NA   NA
 3694078 3694079 GTNG_0569 GTNG_0570 hemE hemH TRUE 0.946 16.000 0.131 1.000 Y NA
 3694079 3694080 GTNG_0570 GTNG_0571 hemH   TRUE 0.976 -7.000 0.069 1.000 Y NA
 3694080 3694081 GTNG_0571 GTNG_0572     FALSE 0.194 200.000 0.038 1.000 N NA
 3694081 3694082 GTNG_0572 GTNG_0573     TRUE 0.548 75.000 0.150 NA   NA
 3694082 3694083 GTNG_0573 GTNG_0574     FALSE 0.001 622.000 0.000 NA   NA
 3694083 3694084 GTNG_0574 GTNG_0575     FALSE 0.347 127.000 0.037 1.000   NA
 3694084 3694085 GTNG_0575 GTNG_0576     TRUE 0.730 137.000 0.571 NA   NA
 3694085 3694086 GTNG_0576 GTNG_0577     FALSE 0.458 70.000 0.067 NA   NA
 3694086 3694087 GTNG_0577 GTNG_0578     TRUE 0.893 -34.000 0.048 1.000   NA
 3694089 3694090 GTNG_0580 GTNG_0581     TRUE 0.854 -7.000 0.069 NA   NA
 3694092 3694093 GTNG_0583 GTNG_0584     FALSE 0.202 106.000 0.008 NA   NA
 3694093 3694094 GTNG_0584 GTNG_0585     FALSE 0.309 132.000 0.067 NA   NA
 3694094 3694095 GTNG_0585 GTNG_0586     FALSE 0.294 94.000 0.033 NA   NA
 3694095 3694096 GTNG_0586 GTNG_0587     TRUE 0.918 -3.000 0.246 NA   NA
 3694096 3694097 GTNG_0587 GTNG_0588     FALSE 0.139 248.000 0.086 1.000 N NA
 3694097 3694098 GTNG_0588 GTNG_0589     TRUE 0.994 -3.000 0.408 0.002 Y NA
 3694098 3694099 GTNG_0589 GTNG_0590   sbcD TRUE 0.941 18.000 0.041 1.000 Y NA
 3694099 3694100 GTNG_0590 GTNG_0591 sbcD yirY TRUE 0.991 -3.000 0.669 0.002 N NA
 3694101 3694102 GTNG_0592 GTNG_0593 gerPF gerPE TRUE 0.797 0.000 0.111 NA   NA
 3694102 3694103 GTNG_0593 GTNG_0594 gerPE gerpD TRUE 0.911 -3.000 0.222 NA   NA
 3694103 3694104 GTNG_0594 GTNG_0595 gerpD gerpC TRUE 0.849 3.000 0.231 NA   NA
 3694104 3694105 GTNG_0595 GTNG_0596 gerpC gerpB TRUE 0.843 84.000 0.769 NA   NA
 3694105 3694106 GTNG_0596 GTNG_0597 gerpB gerPA TRUE 0.954 16.000 0.889 NA   NA
 3694106 3694107 GTNG_0597 GTNG_0598 gerPA   TRUE 0.555 69.000 0.111 NA   NA
 3694112 3694113 GTNG_0603 GTNG_0604     FALSE 0.391 141.000 0.141 NA   NA
 3694113 3694114 GTNG_0604 GTNG_0605     FALSE 0.441 123.000 0.125 NA   NA
 3694120 3694121 GTNG_0611 GTNG_0612     TRUE 0.968 70.000 0.800 1.000 Y NA
 3694121 3694122 GTNG_0612 GTNG_0613     TRUE 0.994 0.000 0.909 0.049 Y NA
 3694122 3694123 GTNG_0613 GTNG_0614     TRUE 0.914 74.000 0.273 1.000 Y NA
 3694123 3694124 GTNG_0614 GTNG_0615     TRUE 0.882 17.000 0.136 1.000 N NA
 3694124 3694125 GTNG_0615 GTNG_0616     TRUE 0.847 116.000 0.045 0.048 Y NA
 3694125 3694126 GTNG_0616 GTNG_0617     FALSE 0.117 200.000 0.000 1.000 N NA
 3694126 3694127 GTNG_0617 GTNG_0618     TRUE 0.994 29.000 0.698 0.003 Y NA
 3694127 3694128 GTNG_0618 GTNG_0619     TRUE 0.961 30.000 0.026 0.076 Y NA
 3694129 3694130 GTNG_0620 GTNG_0621   metH FALSE 0.022 344.000 0.000 1.000 N NA
 3694130 3694131 GTNG_0621 GTNG_0622 metH   TRUE 0.988 -7.000 0.045 0.001 Y NA
 3694132 3694133 GTNG_0623 GTNG_0624     TRUE 0.997 -30.000 0.928 1.000 Y NA
 3694133 3694134 GTNG_0624 GTNG_0625     TRUE 0.993 -3.000 0.492 0.049 Y NA
 3694134 3694135 GTNG_0625 GTNG_0626     TRUE 0.981 1.000 0.253 0.049 Y NA
 3694138 3694139 GTNG_0630 GTNG_0631     FALSE 0.007 280.000 0.000 NA   NA
 3694139 3694140 GTNG_0631 GTNG_0632     FALSE 0.001 956.000 0.000 NA   NA
 3694140 3694141 GTNG_0632 GTNG_0633     FALSE 0.212 175.000 0.097 NA   NA
 3694141 3694142 GTNG_0633 GTNG_0634     FALSE 0.003 368.000 0.000 NA   NA
 3694143 3694144 GTNG_0635 GTNG_0636     FALSE 0.049 198.000 0.000 1.000   NA
 3694144 3694145 GTNG_0636 GTNG_0637     TRUE 0.992 -16.000 1.000 1.000 N NA
 3694146 3694147 GTNG_0638 GTNG_0639     FALSE 0.136 171.000 0.031 NA   NA
 3694147 3694148 GTNG_0639 GTNG_0640     TRUE 0.715 6.000 0.071 1.000   NA
 3694148 3694149 GTNG_0640 GTNG_0641     TRUE 0.945 -3.000 0.071 0.001   NA
 3694149 3694150 GTNG_0641 GTNG_0642     FALSE 0.037 217.000 0.000 1.000   NA
 3694151 3694152 GTNG_0643 GTNG_0644 norZ   FALSE 0.003 364.000 0.000 NA   NA
 3694152 3694153 GTNG_0644 GTNG_0645   mobA FALSE 0.220 82.000 0.007 NA   NA
 3694153 3694154 GTNG_0645 GTNG_0646 mobA   FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 3694154 3694155 GTNG_0646 GTNG_0647   pqqE FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 3694155 3694156 GTNG_0647 GTNG_0648 pqqE   FALSE 0.003 355.000 0.000 NA   NA
 3694156 3694157 GTNG_0648 GTNG_0649   narK FALSE 0.001 1227.000 0.000 NA   NA
 3694157 3694158 GTNG_0649 GTNG_0650 narK nirK FALSE 0.012 300.000 0.000 1.000   NA
 3694160 3694161 GTNG_0652 GTNG_0653   narG FALSE 0.330 32.000 0.000 NA   NA
 3694161 3694162 GTNG_0653 GTNG_0654 narG narH TRUE 0.983 -10.000 0.000 0.001 Y NA
 3694162 3694163 GTNG_0654 GTNG_0655 narH narJ TRUE 0.984 -25.000 0.000 0.003 Y NA
 3694163 3694164 GTNG_0655 GTNG_0656 narJ narI TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 3694166 3694167 GTNG_0658 GTNG_0659 modB moaA TRUE 0.706 55.000 0.019 1.000 N NA
 3694169 3694170 GTNG_0661 GTNG_0662   moeA TRUE 0.791 50.000 0.065 1.000 N NA
 3694170 3694171 GTNG_0662 GTNG_0663 moeA mobB TRUE 0.985 -3.000 0.100 0.003 Y NA
 3694171 3694172 GTNG_0663 GTNG_0664 mobB   TRUE 0.981 -3.000 0.040 0.003 Y NA
 3694172 3694173 GTNG_0664 GTNG_0665     TRUE 0.995 -3.000 0.501 0.003 Y NA
 3694173 3694174 GTNG_0665 GTNG_0666     FALSE 0.444 6.000 0.006 NA   NA
 3694175 3694176 GTNG_0667 GTNG_0668     FALSE 0.004 442.000 0.000 1.000   NA
 3694177 3694178 GTNG_0669 GTNG_0670     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694178 3694179 GTNG_0670 GTNG_0671   argJ TRUE 0.988 26.000 0.303 0.003 Y NA
 3694179 3694180 GTNG_0671 GTNG_0672 argJ   TRUE 0.961 13.000 0.067 0.003 Y NA
 3694180 3694181 GTNG_0672 GTNG_0673   argD TRUE 0.986 -3.000 0.322 1.000 Y NA
 3694181 3694182 GTNG_0673 GTNG_0674 argD carA TRUE 0.898 93.000 0.286 1.000 Y NA
 3694182 3694183 GTNG_0674 GTNG_0675 carA carB TRUE 0.997 -7.000 0.714 0.001 Y NA
 3694183 3694184 GTNG_0675 GTNG_0676 carB   TRUE 0.961 -3.000 0.027 1.000 Y NA
 3694184 3694185 GTNG_0676 GTNG_0677     FALSE 0.047 214.000 0.011 NA   NA
 3694185 3694186 GTNG_0677 GTNG_0678   clpB FALSE 0.204 107.000 0.009 NA   NA
 3694186 3694187 GTNG_0678 GTNG_0679 clpB   FALSE 0.172 178.000 0.000 1.000 N NA
 3694187 3694188 GTNG_0679 GTNG_0680     FALSE 0.196 90.000 0.000 1.000   NA
 3694192 3694193 GTNG_0684 GTNG_0685 fabH fabF TRUE 0.974 38.000 0.076 0.001 Y NA
 3694193 3694194 GTNG_0685 GTNG_0686 fabF   FALSE 0.239 176.000 0.039 NA N NA
 3694194 3694195 GTNG_0686 GTNG_0687     TRUE 0.537 99.000 0.179 NA   NA
 3694195 3694196 GTNG_0687 GTNG_0688     TRUE 0.681 86.000 0.320 NA   NA
 3694197 3694198 GTNG_0689 GTNG_0690     FALSE 0.004 329.000 0.000 NA   NA
 3694199 3694200 GTNG_0691 GTNG_0692 oppA oppB TRUE 0.791 146.000 0.052 0.049 Y NA
 3694200 3694201 GTNG_0692 GTNG_0693 oppB oppC TRUE 0.977 0.000 0.165 0.049 Y NA
 3694201 3694202 GTNG_0693 GTNG_0694 oppC oppD TRUE 0.989 22.000 0.706 1.000 Y NA
 3694202 3694203 GTNG_0694 GTNG_0695 oppD   TRUE 0.996 -43.000 0.375 0.003 Y NA
 3694207 3694208 GTNG_0699 GTNG_0700 mecA cls TRUE 0.758 97.000 0.314 NA N NA
 3694208 3694209 GTNG_0700 GTNG_0701 cls   TRUE 0.560 85.000 0.189 NA   NA
 3694209 3694210 GTNG_0701 GTNG_0702     TRUE 0.922 33.000 0.398 NA   NA
 3694211 3694212 GTNG_0703 GTNG_0704     FALSE 0.008 272.000 0.000 NA   NA
 3694212 3694213 GTNG_0704 GTNG_0705     TRUE 0.940 -142.000 0.138 1.000   NA
 3694213 3694214 GTNG_0705 GTNG_0706     FALSE 0.262 102.000 0.024 NA   NA
 3694214 3694215 GTNG_0706 GTNG_0707     TRUE 0.897 -3.000 0.188 NA   NA
 3694216 3694217 GTNG_0708 GTNG_0709     TRUE 0.645 101.000 0.283 NA   NA
 3694217 3694218 GTNG_0709 GTNG_0710   ppnK TRUE 0.976 -3.000 0.725 1.000   NA
 3694218 3694219 GTNG_0710 GTNG_0711 ppnK   TRUE 0.832 116.000 0.480 1.000 N NA
 3694220 3694221 GTNG_0712 GTNG_0713     FALSE 0.342 118.000 0.028 1.000   NA
 3694222 3694223 GTNG_0714 GTNG_0715 fabL   FALSE 0.120 179.000 0.035 NA   NA
 3694225 3694226 GTNG_0717 GTNG_0718     TRUE 0.918 6.000 0.556 NA   NA
 3694226 3694227 GTNG_0718 GTNG_0719     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3694228 3694229 GTNG_0720 GTNG_0721     TRUE 0.977 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 3694229 3694230 GTNG_0721 GTNG_0722     TRUE 0.977 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 3694230 3694231 GTNG_0722 GTNG_0723     FALSE 0.019 207.000 0.000 NA   NA
 3694231 3694232 GTNG_0723 GTNG_0724     FALSE 0.021 201.000 0.000 NA   NA
 3694234 3694235 GTNG_0726 GTNG_0727     FALSE 0.459 226.000 0.857 NA   NA
 3694236 3694237 GTNG_0728 GTNG_0729     FALSE 0.009 266.000 0.000 NA   NA
 3694237 3694238 GTNG_0729 GTNG_0730     TRUE 0.952 28.000 0.600 NA   NA
 3694238 3694239 GTNG_0730 GTNG_0731     TRUE 0.706 164.000 0.800 NA   NA
 3694239 3694240 GTNG_0731 GTNG_0732     TRUE 0.844 97.000 0.800 NA   NA
 3694240 3694241 GTNG_0732 GTNG_0733   spoVAC TRUE 0.914 12.000 0.556 NA   NA
 3694241 3694242 GTNG_0733 GTNG_0734 spoVAC   TRUE 0.970 -15.000 0.444 NA   NA
 3694242 3694243 GTNG_0734 GTNG_0735   spoVAE TRUE 0.915 11.000 0.571 NA   NA
 3694243 3694244 GTNG_0735 GTNG_0736 spoVAE   TRUE 0.916 12.000 0.571 NA   NA
 3694244 3694245 GTNG_0736 GTNG_0737     TRUE 0.908 13.000 0.500 NA   NA
 3694246 3694247 GTNG_0738 GTNG_0739     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694248 3694249 GTNG_0740 GTNG_0741     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 3694250 3694251 GTNG_0742 GTNG_0743     TRUE 0.889 0.000 0.213 1.000   NA
 3694251 3694252 GTNG_0743 GTNG_0744     TRUE 0.917 39.000 0.287 NA N NA
 3694253 3694254 GTNG_0745 GTNG_0746     TRUE 0.990 4.000 0.600 0.006 Y NA
 3694255 3694256 GTNG_0747 GTNG_0748     TRUE 0.799 17.000 0.154 NA   NA
 3694257 3694258 GTNG_0749 GTNG_0750     TRUE 0.904 3.000 0.385 NA   NA
 3694258 3694259 GTNG_0750 GTNG_0751     TRUE 0.723 -3.000 0.024 NA   NA
 3694259 3694260 GTNG_0751 GTNG_t054     FALSE 0.078 130.000 0.000 NA   NA
 3694261 3694262 GTNG_0752 GTNG_0753     FALSE 0.209 53.000 0.000 NA   NA
 3694264 3694265 GTNG_0755 GTNG_0756     FALSE 0.312 137.000 0.000 1.000 N NA
 3694266 3694267 GTNG_0757 GTNG_0758     FALSE 0.002 857.000 0.000 1.000   NA
 3694267 3694268 GTNG_0758 GTNG_0759     TRUE 0.921 48.000 0.000 0.059 Y NA
 3694268 3694269 GTNG_0759 GTNG_0760     FALSE 0.002 2080.000 0.000 1.000   NA
 3694269 3694270 GTNG_0760 GTNG_0761   hsdR FALSE 0.002 774.000 0.000 1.000   NA
 3694270 3694271 GTNG_0761 GTNG_0762 hsdR   TRUE 0.990 1.000 0.567 0.059 Y NA
 3694271 3694272 GTNG_0762 GTNG_0763     TRUE 0.989 -3.000 0.267 0.059 Y NA
 3694275 3694276 GTNG_0766 GTNG_0767     FALSE 0.319 34.000 0.000 NA   NA
 3694277 3694278 GTNG_0768 GTNG_0769     TRUE 0.935 -9.000 0.054 0.059   NA
 3694278 3694279 GTNG_0769 GTNG_0770     FALSE 0.090 105.000 0.000 NA   NA
 3694279 3694280 GTNG_0770 GTNG_0771     FALSE 0.214 52.000 0.000 NA   NA
 3694280 3694281 GTNG_0771 GTNG_0772     FALSE 0.025 193.000 0.000 NA   NA
 3694282 3694283 GTNG_0773 GTNG_0774     FALSE 0.001 588.000 0.000 NA   NA
 3694283 3694284 GTNG_0774 GTNG_0775     TRUE 0.859 -3.000 0.118 NA   NA
 3694284 3694285 GTNG_0775 GTNG_0776     FALSE 0.002 392.000 0.000 NA   NA
 3694286 3694287 GTNG_0777 GTNG_0778     FALSE 0.204 207.000 0.054 0.059   NA
 3694287 3694288 GTNG_0778 GTNG_0779     FALSE 0.467 71.000 0.000 1.000 N NA
 3694288 3694289 GTNG_0779 GTNG_0780     FALSE 0.036 219.000 0.000 1.000   NA
 3694289 3694290 GTNG_0780 GTNG_0781     FALSE 0.002 926.000 0.000 1.000   NA
 3694290 3694291 GTNG_0781 GTNG_0782   fixA FALSE 0.005 413.000 0.000 1.000   NA
 3694291 3694292 GTNG_0782 GTNG_0783 fixA fixB TRUE 0.879 77.000 0.036 0.013 Y NA
 3694292 3694293 GTNG_0783 GTNG_0784 fixB   FALSE 0.507 -7.000 0.000 NA   NA
 3694293 3694294 GTNG_0784 GTNG_0785     FALSE 0.201 56.000 0.000 NA   NA
 3694294 3694295 GTNG_0785 GTNG_0786     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3694295 3694296 GTNG_0786 GTNG_0787     FALSE 0.333 0.000 0.000 NA   NA
 3694296 3694297 GTNG_0787 GTNG_0788     TRUE 0.660 -3.000 0.008 NA   NA
 3694297 3694298 GTNG_0788 GTNG_0789     FALSE 0.100 83.000 0.000 NA   NA
 3694298 3694299 GTNG_0789 GTNG_0790     FALSE 0.002 518.000 0.000 NA   NA
 3694300 3694301 GTNG_0791 GTNG_0792     TRUE 0.985 -3.000 0.308 1.000 Y NA
 3694301 3694302 GTNG_0792 GTNG_0793     FALSE 0.084 225.000 0.000 1.000 N NA
 3694302 3694303 GTNG_0793 GTNG_0794     TRUE 0.977 2.000 0.920 1.000 N NA
 3694304 3694305 GTNG_0795 GTNG_0796 nrdE nrdF TRUE 0.905 106.000 0.101 0.001 Y NA
 3694305 3694306 GTNG_0796 GTNG_0797 nrdF   FALSE 0.120 73.000 0.000 NA   NA
 3694306 3694307 GTNG_0797 GTNG_0798     FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 3694307 3694308 GTNG_0798 GTNG_0799     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3694308 3694309 GTNG_0799 GTNG_0800     FALSE 0.132 70.000 0.000 NA   NA
 3694309 3694310 GTNG_0800 GTNG_0801     TRUE 0.544 -16.000 0.000 NA   NA
 3694310 3694311 GTNG_0801 GTNG_0802     FALSE 0.089 116.000 0.000 NA   NA
 3694311 3694312 GTNG_0802 GTNG_0803     FALSE 0.002 399.000 0.000 NA   NA
 3694313 3694314 GTNG_0804 GTNG_0805     FALSE 0.008 273.000 0.000 NA   NA
 3694315 3694316 GTNG_0806 GTNG_0807     TRUE 0.841 35.000 0.047 1.000 N NA
 3694316 3694317 GTNG_0807 GTNG_0808     FALSE 0.224 163.000 0.000 1.000 N NA
 3694317 3694318 GTNG_0808 GTNG_0809     FALSE 0.208 182.000 0.005 1.000 N NA
 3694318 3694319 GTNG_0809 GTNG_0810     FALSE 0.452 52.000 0.016 NA   NA
 3694319 3694320 GTNG_0810 GTNG_0811     FALSE 0.001 622.000 0.000 NA   NA
 3694320 3694321 GTNG_0811 GTNG_0812     TRUE 0.963 20.000 0.800 NA   NA
 3694321 3694322 GTNG_0812 GTNG_0813     TRUE 0.603 105.000 0.250 NA   NA
 3694322 3694323 GTNG_0813 GTNG_0814     TRUE 0.944 23.000 0.444 1.000   NA
 3694323 3694324 GTNG_0814 GTNG_0815     TRUE 0.987 -10.000 0.625 0.074   NA
 3694325 3694326 GTNG_0816 GTNG_0817     TRUE 0.927 0.000 0.409 NA   NA
 3694327 3694328 GTNG_0818 GTNG_0819     FALSE 0.031 302.000 0.000 1.000 N NA
 3694328 3694329 GTNG_0819 GTNG_0820     TRUE 0.967 -3.000 0.605 NA   NA
 3694331 3694332 GTNG_0822 GTNG_0823     FALSE 0.399 184.000 0.176 1.000 N NA
 3694332 3694333 GTNG_0823 GTNG_0824     TRUE 0.905 61.000 0.092 1.000 Y NA
 3694333 3694334 GTNG_0824 GTNG_0825     TRUE 0.960 126.000 0.677 0.048 Y NA
 3694334 3694335 GTNG_0825 GTNG_0826     TRUE 0.990 15.000 0.825 0.048 Y NA
 3694335 3694336 GTNG_0826 GTNG_0827     FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 3694336 3694337 GTNG_0827 GTNG_0828     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3694337 3694338 GTNG_0828 GTNG_0829     TRUE 0.954 -3.000 0.444 NA   NA
 3694338 3694339 GTNG_0829 GTNG_0830     FALSE 0.338 30.000 0.000 NA   NA
 3694341 3694342 GTNG_0832 GTNG_0833     TRUE 0.934 -10.000 0.061 1.000 N NA
 3694343 3694344 GTNG_0834 GTNG_0835     TRUE 0.997 -58.000 0.952 1.000 Y NA
 3694344 3694345 GTNG_0835 GTNG_0836     TRUE 0.986 -3.000 0.403 NA Y NA
 3694345 3694346 GTNG_0836 GTNG_0837   mtnA TRUE 0.889 -13.000 0.015 NA N NA
 3694346 3694347 GTNG_0837 GTNG_0838 mtnA mtnK TRUE 0.553 75.000 0.104 1.000   NA
 3694347 3694348 GTNG_0838 GTNG_0839 mtnK   FALSE 0.008 346.000 0.000 1.000   NA
 3694349 3694350 GTNG_0840 GTNG_0841   mtnW FALSE 0.080 274.000 0.043 1.000 N NA
 3694350 3694351 GTNG_0841 GTNG_0842 mtnW mtnX TRUE 0.982 -3.000 0.304 0.001 N NA
 3694351 3694352 GTNG_0842 GTNG_0843 mtnX mtnB TRUE 0.957 -3.000 0.253 1.000 N NA
 3694352 3694353 GTNG_0843 GTNG_0844 mtnB   TRUE 0.817 30.000 0.087 1.000   NA
 3694355 3694356 GTNG_0846 GTNG_0847     FALSE 0.110 210.000 0.087 NA   NA
 3694357 3694358 GTNG_0848 GTNG_0849     TRUE 0.706 19.000 0.021 1.000   NA
 3694358 3694359 GTNG_0849 GTNG_0850     TRUE 0.762 119.000 0.029 1.000 Y NA
 3694360 3694361 GTNG_0851 GTNG_0852     FALSE 0.194 97.000 0.000 1.000   NA
 3694361 3694362 GTNG_0852 GTNG_0853     FALSE 0.259 134.000 0.014 1.000   NA
 3694362 3694363 GTNG_0853 GTNG_0854     TRUE 0.983 -3.000 0.713 1.000 N NA
 3694363 3694364 GTNG_0854 GTNG_0855     TRUE 0.769 12.000 0.037 1.000 N NA
 3694366 3694367 GTNG_0857 GTNG_0858     FALSE 0.426 112.000 0.108 NA   NA
 3694367 3694368 GTNG_0858 GTNG_0859     FALSE 0.102 80.000 0.000 NA   NA
 3694368 3694369 GTNG_0859 GTNG_0860     FALSE 0.060 147.000 0.000 NA   NA
 3694369 3694370 GTNG_0860 GTNG_0861     TRUE 0.973 7.000 0.867 0.007   NA
 3694370 3694371 GTNG_0861 GTNG_0862     TRUE 0.942 27.000 0.200 0.007   NA
 3694371 3694372 GTNG_0862 GTNG_0863     FALSE 0.135 171.000 0.004 1.000   NA
 3694372 3694373 GTNG_0863 GTNG_0864     TRUE 0.821 -3.000 0.041 1.000   NA
 3694373 3694374 GTNG_0864 GTNG_0865     TRUE 0.893 57.000 0.307 1.000 N NA
 3694374 3694375 GTNG_0865 GTNG_0866     TRUE 0.742 49.000 0.101 1.000   NA
 3694375 3694376 GTNG_0866 GTNG_0867     FALSE 0.431 65.000 0.008 1.000   NA
 3694377 3694378 GTNG_0868 GTNG_0869     FALSE 0.177 165.000 0.048 NA   NA
 3694378 3694379 GTNG_0869 GTNG_0870     FALSE 0.358 86.000 0.057 NA   NA
 3694380 3694381 GTNG_0871 GTNG_0872     FALSE 0.018 269.000 0.000 1.000   NA
 3694381 3694382 GTNG_0872 GTNG_0873     FALSE 0.315 68.000 0.012 NA   NA
 3694382 3694383 GTNG_0873 GTNG_0874     TRUE 0.533 77.000 0.150 NA   NA
 3694384 3694385 GTNG_0875 GTNG_0876     FALSE 0.060 188.000 0.000 1.000   NA
 3694386 3694387 GTNG_0877 GTNG_0878     FALSE 0.027 240.000 0.000 1.000   NA
 3694387 3694388 GTNG_0878 GTNG_0879   hpr TRUE 0.855 112.000 0.031 0.007 Y NA
 3694388 3694389 GTNG_0879 GTNG_0880 hpr   TRUE 0.978 0.000 0.132 0.007 Y NA
 3694390 3694391 GTNG_0881 GTNG_0882     FALSE 0.048 160.000 0.000 NA   NA
 3694391 3694392 GTNG_0882 GTNG_0883     FALSE 0.045 164.000 0.000 NA   NA
 3694393 3694394 GTNG_0884 GTNG_0885   kgd FALSE 0.011 434.000 0.000 1.000 N NA
 3694394 3694395 GTNG_0885 GTNG_0886 kgd   TRUE 0.992 -3.000 0.667 1.000 Y NA
 3694395 3694396 GTNG_0886 GTNG_0887     TRUE 0.547 23.000 0.004 NA   NA
 3694396 3694397 GTNG_0887 GTNG_0888     FALSE 0.281 106.000 0.035 NA   NA
 3694397 3694398 GTNG_0888 GTNG_0889     TRUE 0.781 116.000 0.050 1.000 Y NA
 3694398 3694399 GTNG_0889 GTNG_0890     TRUE 0.730 129.000 0.022 1.000 Y NA
 3694399 3694400 GTNG_0890 GTNG_0891     TRUE 0.980 23.000 0.346 1.000 Y NA
 3694400 3694401 GTNG_0891 GTNG_0892     TRUE 0.984 22.000 0.300 0.074 Y NA
 3694401 3694402 GTNG_0892 GTNG_0893     FALSE 0.389 97.000 0.000 1.000 N NA
 3694402 3694403 GTNG_0893 GTNG_0894     FALSE 0.209 53.000 0.000 NA   NA
 3694403 3694404 GTNG_0894 GTNG_0895     TRUE 0.644 7.000 0.073 NA   NA
 3694404 3694405 GTNG_0895 GTNG_0896     TRUE 0.893 -3.000 0.039 1.000 N NA
 3694406 3694407 GTNG_0897 GTNG_0898     FALSE 0.256 157.000 0.079 NA   NA
 3694408 3694409 GTNG_0899 GTNG_0900     FALSE 0.482 69.000 0.071 NA   NA
 3694409 3694410 GTNG_0900 GTNG_0901     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 3694411 3694412 GTNG_0902 GTNG_0903     TRUE 0.706 52.000 0.136 NA   NA
 3694413 3694414 GTNG_0904 GTNG_0905     FALSE 0.056 283.000 0.043 NA N NA
 3694414 3694415 GTNG_0905 GTNG_0906     TRUE 0.838 19.000 0.167 NA   NA
 3694415 3694416 GTNG_0906 GTNG_0907     FALSE 0.457 114.000 0.133 NA   NA
 3694416 3694417 GTNG_0907 GTNG_0908     FALSE 0.451 104.000 0.120 NA   NA
 3694419 3694420 GTNG_0910 GTNG_0911     TRUE 0.698 74.000 0.121 1.000 N NA
 3694420 3694421 GTNG_0911 GTNG_0912     TRUE 0.869 57.000 0.372 1.000   NA
 3694421 3694422 GTNG_0912 GTNG_0913     TRUE 0.774 31.000 0.091 NA   NA
 3694422 3694423 GTNG_0913 GTNG_0914     FALSE 0.020 203.000 0.000 NA   NA
 3694423 3694424 GTNG_0914 GTNG_0915     TRUE 0.856 78.000 0.000 0.002 Y NA
 3694424 3694425 GTNG_0915 GTNG_0916   ktrA TRUE 0.527 105.000 0.041 1.000 N NA
 3694426 3694427 GTNG_0917 GTNG_0918     TRUE 0.965 -3.000 0.576 NA   NA
 3694428 3694429 GTNG_0919 GTNG_0920     FALSE 0.006 286.000 0.000 NA   NA
 3694431 3694432 GTNG_0922 GTNG_0923     TRUE 0.988 4.000 0.484 0.003 Y NA
 3694432 3694433 GTNG_0923 GTNG_0924     TRUE 0.976 75.000 0.883 0.073 Y NA
 3694433 3694434 GTNG_0924 GTNG_0925     TRUE 0.988 5.000 0.948 1.000 Y NA
 3694434 3694435 GTNG_0925 GTNG_0926     FALSE 0.013 235.000 0.000 NA   NA
 3694439 3694440 GTNG_0930 GTNG_0931     TRUE 0.759 17.000 0.108 NA   NA
 3694440 3694441 GTNG_0931 GTNG_0932     FALSE 0.251 112.000 0.024 NA   NA
 3694441 3694442 GTNG_0932 GTNG_0933     TRUE 0.839 57.000 0.342 NA   NA
 3694444 3694445 GTNG_0935 GTNG_0936 typA   FALSE 0.274 106.000 0.032 NA   NA
 3694445 3694446 GTNG_0936 GTNG_0937     TRUE 0.931 20.000 0.429 NA   NA
 3694447 3694448 GTNG_0938 GTNG_0939     FALSE 0.028 333.000 0.096 NA   NA
 3694451 3694452 GTNG_0942 GTNG_0943     TRUE 0.631 125.000 0.300 NA   NA
 3694452 3694453 GTNG_0943 GTNG_0944     TRUE 0.719 60.000 0.046 1.000 N NA
 3694455 3694456 GTNG_0946 GTNG_0947     TRUE 0.751 76.000 0.084 0.064 N NA
 3694456 3694457 GTNG_0947 GTNG_0948     TRUE 0.995 23.000 0.755 0.003 Y NA
 3694457 3694458 GTNG_0948 GTNG_0949     TRUE 0.995 0.000 0.925 0.005 Y NA
 3694458 3694459 GTNG_0949 GTNG_0950     TRUE 0.993 5.000 0.950 0.005 Y NA
 3694459 3694460 GTNG_0950 GTNG_0951   ctaG TRUE 0.816 106.000 0.707 NA   NA
 3694460 3694461 GTNG_0951 GTNG_0952 ctaG   TRUE 0.889 48.000 0.415 NA   NA
 3694461 3694462 GTNG_0952 GTNG_0953     FALSE 0.417 77.000 0.074 NA   NA
 3694464 3694465 GTNG_0955 GTNG_0956     TRUE 0.523 128.000 0.155 1.000   NA
 3694465 3694466 GTNG_0956 GTNG_0957     TRUE 0.874 39.000 0.276 NA   NA
 3694466 3694467 GTNG_0957 GTNG_0958     TRUE 0.953 4.000 0.852 NA   NA
 3694467 3694468 GTNG_0958 GTNG_0959     TRUE 0.911 41.000 0.440 NA   NA
 3694468 3694469 GTNG_0959 GTNG_0960     FALSE 0.068 260.000 0.110 NA   NA
 3694469 3694470 GTNG_0960 GTNG_0961     TRUE 0.941 20.000 0.500 NA   NA
 3694472 3694473 GTNG_0963 GTNG_0964   coaD TRUE 0.981 -34.000 0.367 1.000 N NA
 3694475 3694476 GTNG_0966 GTNG_0967   ylbL TRUE 0.746 6.000 0.095 1.000   NA
 3694478 3694479 GTNG_0969 GTNG_0970     TRUE 0.966 -3.000 0.599 NA   NA
 3694479 3694480 GTNG_0970 GTNG_0971     FALSE 0.458 118.000 0.010 1.000 N NA
 3694480 3694481 GTNG_0971 GTNG_0972     TRUE 0.528 71.000 0.069 1.000   NA
 3694481 3694482 GTNG_0972 GTNG_0973     FALSE 0.300 98.000 0.008 1.000   NA
 3694482 3694483 GTNG_0973 GTNG_0974     TRUE 0.875 -7.000 0.091 NA   NA
 3694483 3694484 GTNG_0974 GTNG_0975     TRUE 0.728 41.000 0.099 NA   NA
 3694484 3694485 GTNG_0975 GTNG_0976   mraW FALSE 0.016 279.000 0.003 NA   NA
 3694485 3694486 GTNG_0976 GTNG_0977 mraW ftsL TRUE 0.797 51.000 0.077 1.000 N NA
 3694486 3694487 GTNG_0977 GTNG_0978 ftsL   TRUE 0.915 7.000 0.316 1.000 N NA
 3694487 3694488 GTNG_0978 GTNG_0979     TRUE 0.942 72.000 0.157 0.001 Y NA
 3694488 3694489 GTNG_0979 GTNG_0980   murE TRUE 0.851 113.000 0.181 1.000 Y NA
 3694489 3694490 GTNG_0980 GTNG_0981 murE   TRUE 0.841 -3.000 0.095 NA   NA
 3694490 3694491 GTNG_0981 GTNG_0982   mraY TRUE 0.739 -15.000 0.005 NA   NA
 3694491 3694492 GTNG_0982 GTNG_0983 mraY murD TRUE 0.993 34.000 0.647 0.005 Y NA
 3694492 3694493 GTNG_0983 GTNG_0984 murD   TRUE 0.893 53.000 0.067 0.002 N NA
 3694493 3694494 GTNG_0984 GTNG_0985     FALSE 0.097 224.000 0.015 NA N NA
 3694494 3694495 GTNG_0985 GTNG_0986     TRUE 0.813 -46.000 0.022 NA   NA
 3694495 3694496 GTNG_0986 GTNG_0987     TRUE 0.957 27.000 0.667 NA   NA
 3694496 3694497 GTNG_0987 GTNG_0988     TRUE 0.812 2.000 0.165 NA   NA
 3694497 3694498 GTNG_0988 GTNG_0989   ftsA FALSE 0.125 191.000 0.062 NA   NA
 3694498 3694499 GTNG_0989 GTNG_0990 ftsA   TRUE 0.984 27.000 0.460 1.000 Y NA
 3694499 3694500 GTNG_0990 GTNG_0991     FALSE 0.105 198.000 0.024 1.000   NA
 3694500 3694501 GTNG_0991 GTNG_0992     TRUE 0.949 51.000 0.856 1.000   NA
 3694501 3694502 GTNG_0992 GTNG_0993     TRUE 0.962 107.000 0.602 0.009 Y NA
 3694502 3694503 GTNG_0993 GTNG_0994     TRUE 0.645 96.000 0.276 NA   NA
 3694503 3694504 GTNG_0994 GTNG_0995     FALSE 0.253 133.000 0.039 NA   NA
 3694504 3694505 GTNG_0995 GTNG_0996     TRUE 0.799 -3.000 0.061 NA   NA
 3694505 3694506 GTNG_0996 GTNG_0997     TRUE 0.859 22.000 0.194 NA   NA
 3694506 3694507 GTNG_0997 GTNG_0998     TRUE 0.782 4.000 0.158 NA   NA
 3694507 3694508 GTNG_0998 GTNG_0999     TRUE 0.522 121.000 0.138 1.000   NA
 3694508 3694509 GTNG_0999 GTNG_1000     TRUE 0.902 56.000 0.579 NA   NA
 3694509 3694510 GTNG_1000 GTNG_1001   ileS FALSE 0.019 370.000 0.012 NA N NA
 3694510 3694511 GTNG_1001 GTNG_1002 ileS lspA FALSE 0.466 94.000 0.004 1.000 N NA
 3694511 3694512 GTNG_1002 GTNG_1003 lspA   TRUE 0.812 1.000 0.022 1.000 N NA
 3694512 3694513 GTNG_1003 GTNG_1004     FALSE 0.267 184.000 0.048 1.000 N NA
 3694513 3694514 GTNG_1004 GTNG_1005     TRUE 0.741 157.000 0.140 1.000 Y NA
 3694514 3694515 GTNG_1005 GTNG_1006   pyrB TRUE 0.655 162.000 0.064 1.000 Y NA
 3694515 3694516 GTNG_1006 GTNG_1007 pyrB pyrC TRUE 0.994 -37.000 0.452 1.000 Y NA
 3694516 3694517 GTNG_1007 GTNG_1008 pyrC pyrAA TRUE 0.958 2.000 0.155 1.000 Y NA
 3694517 3694518 GTNG_1008 GTNG_1009 pyrAA carB TRUE 0.991 -7.000 0.117 0.001 Y NA
 3694518 3694519 GTNG_1009 GTNG_1010 carB pyrDII TRUE 0.935 -3.000 0.147 1.000 N NA
 3694519 3694520 GTNG_1010 GTNG_1011 pyrDII pyrD TRUE 0.990 -3.000 0.592 0.001 N NA
 3694520 3694521 GTNG_1011 GTNG_1012 pyrD pyrF TRUE 0.987 -28.000 0.003 0.001 Y NA
 3694521 3694522 GTNG_1012 GTNG_1013 pyrF pyrE TRUE 0.955 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 3694523 3694524 GTNG_1014 GTNG_1016     FALSE 0.088 107.000 0.000 NA   NA
 3694525 3694526 GTNG_1017 GTNG_1018     FALSE 0.305 91.000 0.037 NA   NA
 3694526 3694527 GTNG_1018 GTNG_1019     TRUE 0.739 57.000 0.189 NA   NA
 3694527 3694528 GTNG_1019 GTNG_1020   gmk TRUE 0.740 12.000 0.143 NA   NA
 3694528 3694529 GTNG_1020 GTNG_1021 gmk   TRUE 0.974 -3.000 0.471 1.000 N NA
 3694529 3694530 GTNG_1021 GTNG_1022     TRUE 0.870 50.000 0.192 1.000 N NA
 3694530 3694531 GTNG_1022 GTNG_1023   priA TRUE 0.922 -3.000 0.099 1.000 N NA
 3694531 3694532 GTNG_1023 GTNG_1024 priA   TRUE 0.807 17.000 0.029 1.000 N NA
 3694532 3694533 GTNG_1024 GTNG_1025     TRUE 0.946 7.000 0.031 0.024 Y NA
 3694533 3694534 GTNG_1025 GTNG_1026     TRUE 0.990 -13.000 0.305 1.000 Y NA
 3694534 3694535 GTNG_1026 GTNG_1027     TRUE 0.770 10.000 0.135 1.000   NA
 3694535 3694536 GTNG_1027 GTNG_1028     TRUE 0.757 6.000 0.105 1.000   NA
 3694536 3694537 GTNG_1028 GTNG_1029     TRUE 0.983 6.000 0.704 1.000 Y NA
 3694537 3694538 GTNG_1029 GTNG_1030     TRUE 0.835 5.000 0.196 1.000   NA
 3694538 3694539 GTNG_1030 GTNG_1031   rpe TRUE 0.853 4.000 0.213 1.000   NA
 3694539 3694540 GTNG_1031 GTNG_1032 rpe   TRUE 0.569 147.000 0.166 1.000 N NA
 3694542 3694543 GTNG_1034 GTNG_1035     TRUE 0.948 24.000 0.567 NA   NA
 3694543 3694544 GTNG_1035 GTNG_1036     TRUE 0.542 65.000 0.045 1.000   NA
 3694544 3694545 GTNG_1036 GTNG_1037     TRUE 0.961 76.000 0.353 0.001 Y NA
 3694545 3694546 GTNG_1037 GTNG_1038   recG TRUE 0.768 9.000 0.039 1.000 N NA
 3694546 3694547 GTNG_1038 GTNG_1039 recG   FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3694547 3694548 GTNG_1039 GTNG_1040     FALSE 0.204 55.000 0.000 NA   NA
 3694548 3694549 GTNG_1040 GTNG_1041   plsX TRUE 0.928 -16.000 0.035 1.000 N NA
 3694549 3694550 GTNG_1041 GTNG_1042 plsX fabD TRUE 0.975 18.000 0.106 0.005 Y NA
 3694550 3694551 GTNG_1042 GTNG_1043 fabD fabG TRUE 0.980 0.000 0.149 0.005 Y NA
 3694551 3694552 GTNG_1043 GTNG_1044 fabG acpP TRUE 0.959 51.000 0.100 0.005 Y NA
 3694552 3694553 GTNG_1044 GTNG_1045 acpP rnc FALSE 0.307 180.000 0.068 1.000 N NA
 3694553 3694554 GTNG_1045 GTNG_1046 rnc smc FALSE 0.481 158.000 0.120 1.000 N NA
 3694554 3694555 GTNG_1046 GTNG_1047 smc ftsY TRUE 0.950 19.000 0.165 0.014 N NA
 3694555 3694556 GTNG_1047 GTNG_1048 ftsY   FALSE 0.081 251.000 0.081 1.000   NA
 3694556 3694557 GTNG_1048 GTNG_1049   ffh TRUE 0.933 -13.000 0.151 1.000   NA
 3694557 3694558 GTNG_1049 GTNG_1050 ffh   TRUE 0.808 95.000 0.361 1.000 N NA
 3694558 3694559 GTNG_1050 GTNG_1051     TRUE 0.898 12.000 0.385 1.000   NA
 3694559 3694560 GTNG_1051 GTNG_1052     TRUE 0.622 48.000 0.061 NA   NA
 3694560 3694561 GTNG_1052 GTNG_1053   rimM TRUE 0.574 7.000 0.041 NA   NA
 3694561 3694562 GTNG_1053 GTNG_1054 rimM   TRUE 0.992 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 3694562 3694563 GTNG_1054 GTNG_1055     TRUE 0.726 212.000 0.567 1.000 Y NA
 3694563 3694564 GTNG_1055 GTNG_1056     FALSE 0.491 103.000 0.020 1.000 N NA
 3694564 3694565 GTNG_1056 GTNG_1057   rbgA TRUE 0.864 19.000 0.049 0.063   NA
 3694565 3694566 GTNG_1057 GTNG_1058 rbgA   TRUE 0.561 93.000 0.148 1.000   NA
 3694566 3694567 GTNG_1058 GTNG_1059     FALSE 0.203 82.000 0.002 NA   NA
 3694567 3694568 GTNG_1059 GTNG_1060     TRUE 0.774 -12.000 0.016 NA   NA
 3694568 3694569 GTNG_1060 GTNG_1061   sucC FALSE 0.365 116.000 0.038 1.000   NA
 3694569 3694570 GTNG_1061 GTNG_1062 sucC   TRUE 0.982 18.000 0.173 0.001 Y NA
 3694570 3694571 GTNG_1062 GTNG_1063     TRUE 0.643 68.000 0.037 1.000 N NA
 3694571 3694572 GTNG_1063 GTNG_1064     TRUE 0.892 79.000 0.238 1.000 Y NA
 3694572 3694573 GTNG_1064 GTNG_1065   xerC TRUE 0.830 67.000 0.007 1.000 Y NA
 3694573 3694574 GTNG_1065 GTNG_1066 xerC hslV TRUE 0.898 25.000 0.113 1.000 N NA
 3694574 3694575 GTNG_1066 GTNG_1067 hslV hslU TRUE 0.990 19.000 0.752 1.000 Y NA
 3694575 3694576 GTNG_1067 GTNG_1068 hslU codY TRUE 0.880 17.000 0.131 1.000 N NA
 3694576 3694577 GTNG_1068 GTNG_1069 codY flgB FALSE 0.178 204.000 0.037 1.000 N NA
 3694577 3694578 GTNG_1069 GTNG_1070 flgB flgC TRUE 0.992 4.000 0.804 0.004 Y NA
 3694578 3694579 GTNG_1070 GTNG_1071 flgC fliE TRUE 0.981 20.000 0.156 0.004 Y NA
 3694579 3694580 GTNG_1071 GTNG_1072 fliE fliF TRUE 0.916 96.000 0.164 0.005 Y NA
 3694580 3694581 GTNG_1072 GTNG_1073 fliF fliG TRUE 0.986 13.000 0.477 0.005 Y NA
 3694581 3694582 GTNG_1073 GTNG_1074 fliG fliH TRUE 0.988 -16.000 0.048 0.004 Y NA
 3694582 3694583 GTNG_1074 GTNG_1075 fliH fliI TRUE 0.981 20.000 0.152 0.004 Y NA
 3694583 3694584 GTNG_1075 GTNG_1076 fliI fliJ TRUE 0.985 29.000 0.241 0.007 Y NA
 3694584 3694585 GTNG_1076 GTNG_1077 fliJ   FALSE 0.504 1.000 0.000 1.000   NA
 3694585 3694586 GTNG_1077 GTNG_1078   fliK TRUE 0.631 -3.000 0.000 1.000   NA
 3694586 3694587 GTNG_1078 GTNG_1079 fliK flgD FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3694587 3694588 GTNG_1079 GTNG_1080 flgD flgG TRUE 0.531 17.000 0.012 NA   NA
 3694588 3694589 GTNG_1080 GTNG_1081 flgG   TRUE 0.895 45.000 0.014 NA Y NA
 3694589 3694590 GTNG_1081 GTNG_1082   fliL TRUE 0.981 -13.000 0.149 NA Y NA
 3694590 3694591 GTNG_1082 GTNG_1083 fliL fliM TRUE 0.990 28.000 0.323 0.001 Y NA
 3694591 3694592 GTNG_1083 GTNG_1084 fliM fliY TRUE 0.996 -7.000 0.508 0.001 Y NA
 3694592 3694593 GTNG_1084 GTNG_1085 fliY   TRUE 0.971 26.000 0.203 1.000 Y NA
 3694593 3694594 GTNG_1085 GTNG_1086   fliZ TRUE 0.840 15.000 0.101 1.000 N NA
 3694594 3694595 GTNG_1086 GTNG_1087 fliZ fliP TRUE 0.991 -7.000 0.386 1.000 Y NA
 3694595 3694596 GTNG_1087 GTNG_1088 fliP fliQ TRUE 0.976 16.000 0.206 0.005 Y NA
 3694596 3694597 GTNG_1088 GTNG_1089 fliQ fliR TRUE 0.992 7.000 0.817 0.002 Y NA
 3694597 3694598 GTNG_1089 GTNG_1090 fliR flhB TRUE 0.988 2.000 0.750 1.000 Y NA
 3694598 3694599 GTNG_1090 GTNG_1091 flhB flhA TRUE 0.983 19.000 0.203 0.005 Y NA
 3694599 3694600 GTNG_1091 GTNG_1092 flhA   FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694600 3694601 GTNG_1092 GTNG_1094     FALSE 0.495 -6.000 0.000 NA   NA
 3694601 3694602 GTNG_1094 GTNG_1095     TRUE 0.855 10.000 0.153 1.000 N NA
 3694602 3694603 GTNG_1095 GTNG_1096     TRUE 0.984 14.000 0.390 0.005 Y NA
 3694603 3694604 GTNG_1096 GTNG_1097   cheW TRUE 0.734 194.000 0.184 0.005 Y NA
 3694604 3694605 GTNG_1097 GTNG_1098 cheW cheC TRUE 0.963 24.000 0.180 NA Y NA
 3694605 3694606 GTNG_1098 GTNG_1099 cheC cheD TRUE 0.990 -3.000 0.606 NA Y NA
 3694606 3694607 GTNG_1099 GTNG_1100 cheD   TRUE 0.897 31.000 0.120 1.000 N NA
 3694607 3694608 GTNG_1100 GTNG_1101     TRUE 0.777 -49.000 0.008 NA   NA
 3694608 3694609 GTNG_1101 GTNG_1102     TRUE 0.715 9.000 0.125 NA   NA
 3694609 3694610 GTNG_1102 GTNG_1103   rpsB FALSE 0.141 154.000 0.012 NA   NA
 3694610 3694611 GTNG_1103 GTNG_1104 rpsB tsf TRUE 0.909 158.000 0.748 1.000 Y NA
 3694611 3694612 GTNG_1104 GTNG_1105 tsf pyrH TRUE 0.971 -3.000 0.416 1.000 N NA
 3694612 3694613 GTNG_1105 GTNG_1106 pyrH   TRUE 0.964 3.000 0.626 1.000 N NA
 3694613 3694614 GTNG_1106 GTNG_1107     TRUE 0.833 82.000 0.409 1.000 N NA
 3694614 3694615 GTNG_1107 GTNG_1108     TRUE 0.973 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 3694615 3694616 GTNG_1108 GTNG_1109     TRUE 0.925 12.000 0.071 1.000 Y NA
 3694616 3694617 GTNG_1109 GTNG_1110     TRUE 0.952 15.000 0.568 1.000 N NA
 3694617 3694618 GTNG_1110 GTNG_1111     TRUE 0.888 29.000 0.095 1.000 N NA
 3694618 3694619 GTNG_1111 GTNG_1112   polC TRUE 0.732 83.000 0.070 0.041 N NA
 3694619 3694620 GTNG_1112 GTNG_1113 polC   FALSE 0.208 160.000 0.059 NA   NA
 3694620 3694621 GTNG_1113 GTNG_1114   nusA TRUE 0.962 25.000 0.759 NA   NA
 3694621 3694622 GTNG_1114 GTNG_1115 nusA   TRUE 0.960 7.000 0.323 NA Y NA
 3694622 3694623 GTNG_1115 GTNG_1116     TRUE 0.977 -10.000 0.408 NA N NA
 3694623 3694624 GTNG_1116 GTNG_1117   infB TRUE 0.968 20.000 0.223 NA Y NA
 3694624 3694625 GTNG_1117 GTNG_1118 infB   TRUE 0.847 -3.000 0.102 NA   NA
 3694625 3694626 GTNG_1118 GTNG_1119   rbfA TRUE 0.736 16.000 0.113 NA   NA
 3694626 3694627 GTNG_1119 GTNG_1120 rbfA   TRUE 0.925 54.000 0.111 1.000 Y NA
 3694627 3694628 GTNG_1120 GTNG_1121     TRUE 0.927 42.000 0.308 1.000 N NA
 3694628 3694629 GTNG_1121 GTNG_1122     TRUE 0.652 88.000 0.119 1.000 N NA
 3694629 3694630 GTNG_1122 GTNG_1123     TRUE 0.875 138.000 0.335 1.000 Y NA
 3694630 3694631 GTNG_1123 GTNG_1124     TRUE 0.531 112.000 0.048 1.000 N NA
 3694631 3694632 GTNG_1124 GTNG_1125     TRUE 0.926 -13.000 0.127 1.000   NA
 3694634 3694635 GTNG_1127 GTNG_1128   spoVFB TRUE 0.943 0.000 0.450 1.000   NA
 3694635 3694636 GTNG_1128 GTNG_1129 spoVFB   FALSE 0.489 121.000 0.025 1.000 N NA
 3694636 3694637 GTNG_1129 GTNG_1130     TRUE 0.952 21.000 0.065 1.000 Y NA
 3694637 3694638 GTNG_1130 GTNG_1131     TRUE 0.964 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 3694638 3694639 GTNG_1131 GTNG_1132     FALSE 0.214 182.000 0.083 1.000   NA
 3694639 3694640 GTNG_1132 GTNG_1133     FALSE 0.181 118.000 0.000 1.000   NA
 3694640 3694641 GTNG_1133 GTNG_1134     TRUE 0.839 -3.000 0.094 NA   NA
 3694641 3694642 GTNG_1134 GTNG_1135     FALSE 0.321 106.000 0.052 NA   NA
 3694642 3694643 GTNG_1135 GTNG_1136     FALSE 0.504 153.000 0.115 1.000 N NA
 3694643 3694644 GTNG_1136 GTNG_1137     FALSE 0.500 80.000 0.087 1.000   NA
 3694644 3694645 GTNG_1137 GTNG_1138     FALSE 0.035 301.000 0.048 1.000   NA
 3694645 3694646 GTNG_1138 GTNG_1139     TRUE 0.960 -3.000 0.438 1.000   NA
 3694646 3694647 GTNG_1139 GTNG_1140     TRUE 0.974 1.000 0.720 0.046   NA
 3694647 3694648 GTNG_1140 GTNG_1141     FALSE 0.274 165.000 0.077 1.000   NA
 3694648 3694649 GTNG_1141 GTNG_1142     TRUE 0.993 -19.000 0.872 0.005   NA
 3694649 3694650 GTNG_1142 GTNG_1143   fabG TRUE 0.872 58.000 0.397 1.000   NA
 3694650 3694651 GTNG_1143 GTNG_1144 fabG   TRUE 0.848 58.000 0.386 NA   NA
 3694651 3694652 GTNG_1144 GTNG_1145     TRUE 0.677 129.000 0.388 NA   NA
 3694652 3694653 GTNG_1145 GTNG_1146     TRUE 0.933 22.000 0.371 1.000   NA
 3694653 3694654 GTNG_1146 GTNG_1147     FALSE 0.444 118.000 0.077 1.000   NA
 3694654 3694655 GTNG_1147 GTNG_1148   cinA FALSE 0.040 352.000 0.151 1.000   NA
 3694655 3694656 GTNG_1148 GTNG_1149 cinA   FALSE 0.078 256.000 0.083 1.000   NA
 3694658 3694659 GTNG_1151 GTNG_1152     TRUE 0.639 106.000 0.245 1.000   NA
 3694659 3694660 GTNG_1152 GTNG_1153     TRUE 0.552 -22.000 0.000 NA   NA
 3694660 3694661 GTNG_1153 GTNG_1154     FALSE 0.097 94.000 0.000 NA   NA
 3694661 3694662 GTNG_1154 GTNG_1155     FALSE 0.312 172.000 0.041 1.000 N NA
 3694662 3694663 GTNG_1155 GTNG_1156     TRUE 0.997 -33.000 0.437 0.001 Y NA
 3694663 3694664 GTNG_1156 GTNG_1157     TRUE 0.614 64.000 0.004 1.000 N NA
 3694664 3694665 GTNG_1157 GTNG_1158     TRUE 0.649 2.000 0.041 NA   NA
 3694665 3694666 GTNG_1158 GTNG_1159     FALSE 0.045 346.000 0.209 NA   NA
 3694666 3694667 GTNG_1159 GTNG_1160   mutS FALSE 0.281 93.000 0.027 NA   NA
 3694667 3694668 GTNG_1160 GTNG_1161 mutS mutL TRUE 0.979 15.000 0.220 0.001 Y NA
 3694668 3694669 GTNG_1161 GTNG_1162 mutL   FALSE 0.036 291.000 0.000 1.000 N NA
 3694671 3694672 GTNG_1164 GTNG_1165     FALSE 0.088 114.000 0.000 NA   NA
 3694672 3694673 GTNG_1165 GTNG_1167   miaA FALSE 0.021 201.000 0.000 NA   NA
 3694673 3694674 GTNG_1167 GTNG_1168 miaA hfq TRUE 0.946 -16.000 0.192 1.000   NA
 3694674 3694675 GTNG_1168 GTNG_1169 hfq   FALSE 0.022 336.000 0.037 1.000   NA
 3694675 3694676 GTNG_1169 GTNG_1170     FALSE 0.311 163.000 0.100 1.000   NA
 3694676 3694677 GTNG_1170 GTNG_1171     TRUE 0.984 22.000 0.444 1.000 Y NA
 3694677 3694678 GTNG_1171 GTNG_1172     TRUE 0.928 16.000 0.333 1.000 N NA
 3694678 3694679 GTNG_1172 GTNG_1173     TRUE 0.951 3.000 0.250 0.037 N NA
 3694679 3694680 GTNG_1173 GTNG_1174     TRUE 0.977 14.000 0.500 1.000 Y NA
 3694680 3694681 GTNG_1174 GTNG_1175     TRUE 0.845 112.000 0.167 1.000 Y NA
 3694681 3694682 GTNG_1175 GTNG_1176     FALSE 0.112 157.000 0.000 1.000   NA
 3694683 3694684 GTNG_1177 GTNG_1178     FALSE 0.003 360.000 0.000 NA   NA
 3694685 3694686 GTNG_1179 GTNG_1180     TRUE 0.705 14.000 0.065 1.000   NA
 3694686 3694687 GTNG_1180 GTNG_1181     TRUE 0.688 77.000 0.138 1.000 N NA
 3694687 3694688 GTNG_1181 GTNG_1182     TRUE 0.952 40.000 0.481 1.000 N NA
 3694690 3694691 GTNG_1184 GTNG_1185     TRUE 0.649 13.000 0.038 1.000   NA
 3694691 3694692 GTNG_1185 GTNG_1186     TRUE 0.953 -22.000 0.264 NA   NA
 3694692 3694693 GTNG_1186 GTNG_1187   tkt TRUE 0.587 78.000 0.196 NA   NA
 3694693 3694694 GTNG_1187 GTNG_1188 tkt   FALSE 0.437 188.000 0.440 NA   NA
 3694694 3694695 GTNG_1188 GTNG_1189     TRUE 0.566 89.000 0.197 NA   NA
 3694695 3694696 GTNG_1189 GTNG_1190     TRUE 0.543 126.000 0.214 NA   NA
 3694696 3694697 GTNG_1190 GTNG_1191     TRUE 0.995 2.000 0.911 0.003 Y NA
 3694698 3694699 GTNG_1192 GTNG_1193     FALSE 0.267 4.000 0.000 NA   NA
 3694700 3694701 GTNG_1194 GTNG_1195 ccdA   TRUE 0.932 63.000 0.625 1.000 N NA
 3694701 3694702 GTNG_1195 GTNG_1196   ccdC FALSE 0.519 184.000 0.375 NA N NA
 3694704 3694705 GTNG_1198 GTNG_1199   celR TRUE 0.962 -57.000 0.143 1.000 N NA
 3694705 3694706 GTNG_1199 GTNG_1200 celR celA TRUE 0.673 157.000 0.143 0.007 N NA
 3694706 3694707 GTNG_1200 GTNG_1201 celA celB TRUE 0.984 17.000 0.300 0.005 Y NA
 3694707 3694708 GTNG_1201 GTNG_1202 celB celCD TRUE 0.939 16.000 0.300 0.005   NA
 3694712 3694713 GTNG_1206 GTNG_1207     FALSE 0.181 106.000 0.000 1.000   NA
 3694715 3694716 GTNG_1209 GTNG_1210     TRUE 0.931 7.000 0.680 NA   NA
 3694717 3694718 GTNG_1211 GTNG_1212   cspB TRUE 0.760 132.000 0.619 NA   NA
 3694718 3694719 GTNG_1212 GTNG_1213 cspB   FALSE 0.001 545.000 0.000 NA   NA
 3694720 3694721 GTNG_1214 GTNG_1215     FALSE 0.020 203.000 0.000 NA   NA
 3694721 3694722 GTNG_1215 GTNG_1216   glpK TRUE 0.729 61.000 0.057 1.000 N NA
 3694722 3694723 GTNG_1216 GTNG_1217 glpK   FALSE 0.005 319.000 0.000 NA   NA
 3694723 3694724 GTNG_1217 GTNG_1218     FALSE 0.232 11.000 0.000 NA   NA
 3694726 3694727 GTNG_1220 GTNG_1221     FALSE 0.132 70.000 0.000 NA   NA
 3694729 3694730 GTNG_1223 GTNG_1224     TRUE 0.767 5.000 0.023 1.000 N NA
 3694730 3694731 GTNG_1224 GTNG_1225     FALSE 0.294 164.000 0.012 1.000 N NA
 3694731 3694732 GTNG_1225 GTNG_1226     TRUE 0.854 16.000 0.110 1.000 N NA
 3694732 3694733 GTNG_1226 GTNG_1227     FALSE 0.331 97.000 0.018 1.000   NA
 3694733 3694734 GTNG_1227 GTNG_1228     FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 3694736 3694737 GTNG_1230 GTNG_1231     FALSE 0.282 97.000 0.028 NA   NA
 3694737 3694738 GTNG_1231 GTNG_1232     TRUE 0.855 0.000 0.085 NA N NA
 3694739 3694740 GTNG_1233 GTNG_1235     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3694741 3694742 GTNG_1236 GTNG_1237     FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 3694742 3694743 GTNG_1237 GTNG_1238     FALSE 0.231 10.000 0.000 NA   NA
 3694743 3694744 GTNG_1238 GTNG_1239     TRUE 0.535 -13.000 0.000 NA   NA
 3694744 3694745 GTNG_1239 GTNG_1240     FALSE 0.001 702.000 0.000 NA   NA
 3694745 3694746 GTNG_1240 GTNG_1241     FALSE 0.406 49.000 0.000 1.000   NA
 3694746 3694747 GTNG_1241 GTNG_1242     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3694747 3694748 GTNG_1242 GTNG_1243     FALSE 0.003 352.000 0.000 NA   NA
 3694748 3694749 GTNG_1243 GTNG_t055     FALSE 0.519 -9.000 0.000 NA   NA
 3694751 3694752 GTNG_1245 GTNG_1246     FALSE 0.004 351.000 0.000 NA   NA
 3694752 3694753 GTNG_1246 GTNG_16s008     FALSE 0.001 1037.000 0.000 NA   NA
 3694753 3694754 GTNG_16s008 GTNG_23s008     FALSE 0.071 136.000 0.000 NA   NA
 3694754 3694755 GTNG_23s008 GTNG_5s009     FALSE 0.025 194.000 0.000 NA   NA
 3694755 3694756 GTNG_5s009 GTNG_1247     FALSE 0.002 403.000 0.000 NA   NA
 3694756 3694757 GTNG_1247 GTNG_1248     FALSE 0.262 43.000 0.000 NA   NA
 3694757 3694758 GTNG_1248 GTNG_1249     FALSE 0.002 405.000 0.000 NA   NA
 3694758 3694759 GTNG_1249 GTNG_1250     FALSE 0.001 970.000 0.000 NA   NA
 3694759 3694760 GTNG_1250 GTNG_1251     FALSE 0.004 334.000 0.000 NA   NA
 3694761 3694762 GTNG_1252 GTNG_1253     TRUE 0.743 115.000 0.013 1.000 Y NA
 3694762 3694763 GTNG_1253 GTNG_1254     FALSE 0.029 233.000 0.000 1.000   NA
 3694765 3694766 GTNG_1256 GTNG_1257     FALSE 0.195 57.000 0.000 NA   NA
 3694767 3694768 GTNG_1258 GTNG_1259     FALSE 0.001 611.000 0.000 NA   NA
 3694768 3694769 GTNG_1259 GTNG_1260     FALSE 0.310 99.000 0.000 NA N NA
 3694770 3694771 GTNG_1261 GTNG_1262     FALSE 0.069 138.000 0.000 NA   NA
 3694771 3694772 GTNG_1262 GTNG_1263     TRUE 0.932 16.000 0.429 NA N NA
 3694773 3694774 GTNG_1264 GTNG_1265     TRUE 0.788 57.000 0.250 NA   NA
 3694774 3694775 GTNG_1265 GTNG_1266     FALSE 0.155 176.000 0.056 NA   NA
 3694775 3694776 GTNG_1266 GTNG_1267     TRUE 0.859 15.000 0.139 1.000 N NA
 3694778 3694779 GTNG_1269 GTNG_1270     TRUE 0.995 25.000 0.791 0.001 Y NA
 3694779 3694780 GTNG_1270 GTNG_1271     FALSE 0.054 259.000 0.000 1.000 N NA
 3694780 3694781 GTNG_1271 GTNG_1272     FALSE 0.009 531.000 0.000 1.000 N NA
 3694781 3694782 GTNG_1272 GTNG_1273     TRUE 0.997 -7.000 0.870 0.046 Y NA
 3694782 3694783 GTNG_1273 GTNG_1274     TRUE 0.995 -6.000 0.870 1.000 Y NA
 3694783 3694784 GTNG_1274 GTNG_1275     FALSE 0.384 256.000 0.196 1.000 Y NA
 3694784 3694785 GTNG_1275 GTNG_1276     FALSE 0.039 280.000 0.000 1.000 N NA
 3694785 3694786 GTNG_1276 GTNG_1277     FALSE 0.002 393.000 0.000 NA   NA
 3694786 3694787 GTNG_1277 GTNG_1278     TRUE 0.943 -3.000 0.360 NA   NA
 3694787 3694788 GTNG_1278 GTNG_1279     TRUE 0.764 -3.000 0.040 NA   NA
 3694788 3694789 GTNG_1279 GTNG_1280     TRUE 0.864 -55.000 0.049 NA   NA
 3694789 3694790 GTNG_1280 GTNG_1281     FALSE 0.252 45.000 0.000 NA   NA
 3694790 3694791 GTNG_1281 GTNG_1282     FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 3694792 3694793 GTNG_1283 GTNG_1284     FALSE 0.017 217.000 0.000 NA   NA
 3694794 3694795 GTNG_1285 GTNG_1286     FALSE 0.062 224.000 0.000 NA N NA
 3694795 3694796 GTNG_1286 GTNG_1287     FALSE 0.070 238.000 0.000 1.000 N NA
 3694796 3694797 GTNG_1287 GTNG_1288     FALSE 0.018 362.000 0.000 1.000 N NA
 3694797 3694798 GTNG_1288 GTNG_1289     TRUE 0.874 26.000 0.068 1.000 N NA
 3694798 3694799 GTNG_1289 GTNG_1290     TRUE 0.772 16.000 0.153 NA   NA
 3694801 3694802 GTNG_1292 GTNG_1293   gltD TRUE 0.904 144.000 0.222 0.001 Y NA
 3694802 3694803 GTNG_1293 GTNG_1294 gltD   FALSE 0.445 116.000 0.005 1.000 N NA
 3694803 3694804 GTNG_1294 GTNG_1295     FALSE 0.016 219.000 0.000 NA   NA
 3694805 3694806 GTNG_1296 GTNG_1297     FALSE 0.002 475.000 0.000 NA   NA
 3694806 3694807 GTNG_1297 GTNG_1298     TRUE 0.892 -3.000 0.038 1.000 N NA
 3694810 3694811 GTNG_1301 GTNG_1302     FALSE 0.445 123.000 0.083 1.000   NA
 3694813 3694814 GTNG_1304 GTNG_1305     FALSE 0.063 143.000 0.000 NA   NA
 3694814 3694815 GTNG_1305 GTNG_1306     TRUE 0.562 139.000 0.286 NA   NA
 3694817 3694818 GTNG_1308 GTNG_1309 xpaC   TRUE 0.946 -3.000 0.373 NA   NA
 3694820 3694821 GTNG_1311 GTNG_1312     FALSE 0.457 151.000 0.222 NA   NA
 3694821 3694822 GTNG_1312 GTNG_1313     FALSE 0.274 166.000 0.125 NA   NA
 3694822 3694823 GTNG_1313 GTNG_1314     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3694823 3694824 GTNG_1314 GTNG_1315     FALSE 0.507 -7.000 0.000 NA   NA
 3694825 3694826 GTNG_1316 GTNG_1317     FALSE 0.197 197.000 0.167 NA   NA
 3694827 3694828 GTNG_1318 GTNG_1319     TRUE 0.989 -3.000 0.273 0.045 Y NA
 3694828 3694829 GTNG_1319 GTNG_1320     TRUE 0.970 17.000 0.273 1.000 Y NA
 3694829 3694830 GTNG_1320 GTNG_1321     TRUE 0.911 0.000 0.333 NA   NA
 3694830 3694831 GTNG_1321 GTNG_1322     FALSE 0.019 207.000 0.000 NA   NA
 3694831 3694832 GTNG_1322 GTNG_1323     TRUE 0.556 -25.000 0.000 NA   NA
 3694832 3694833 GTNG_1323 GTNG_1324     FALSE 0.001 943.000 0.000 NA   NA
 3694833 3694834 GTNG_1324 GTNG_1325     TRUE 0.884 57.000 0.500 NA   NA
 3694834 3694835 GTNG_1325 GTNG_1326     FALSE 0.253 193.000 0.056 0.070   NA
 3694836 3694837 GTNG_1327 GTNG_1328     TRUE 0.990 -31.000 0.556 0.004   NA
 3694837 3694838 GTNG_1328 GTNG_1329     TRUE 0.951 -7.000 0.250 1.000   NA
 3694840 3694841 GTNG_1331 GTNG_1332     FALSE 0.002 403.000 0.000 NA   NA
 3694842 3694843 GTNG_1333 GTNG_1334     TRUE 0.978 -10.000 0.648 NA   NA
 3694843 3694844 GTNG_1334 GTNG_1335     TRUE 0.748 -3.000 0.034 NA   NA
 3694844 3694845 GTNG_1335 GTNG_1336     FALSE 0.061 146.000 0.000 NA   NA
 3694845 3694846 GTNG_1336 GTNG_1337     TRUE 0.964 -3.000 0.321 1.000 N NA
 3694846 3694847 GTNG_1337 GTNG_1338     TRUE 0.967 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 3694847 3694848 GTNG_1338 GTNG_1339     FALSE 0.014 395.000 0.000 1.000 N NA
 3694848 3694849 GTNG_1339 GTNG_1340     FALSE 0.478 70.000 0.000 1.000 N NA
 3694849 3694850 GTNG_1340 GTNG_1341     FALSE 0.358 69.000 0.024 NA   NA
 3694850 3694851 GTNG_1341 GTNG_1342     FALSE 0.488 15.000 0.014 NA   NA
 3694851 3694852 GTNG_1342 GTNG_1343     FALSE 0.445 10.000 0.009 NA   NA
 3694853 3694854 GTNG_1344 GTNG_1345     FALSE 0.293 117.000 0.000 NA N NA
 3694854 3694855 GTNG_1345 GTNG_1346     TRUE 0.889 38.000 0.000 NA Y NA
 3694855 3694856 GTNG_1346 GTNG_1347     TRUE 0.996 -10.000 0.957 1.000 Y NA
 3694857 3694858 GTNG_1348 GTNG_1349     FALSE 0.009 264.000 0.000 NA   NA
 3694858 3694859 GTNG_1349 GTNG_1350     FALSE 0.413 128.000 0.074 1.000   NA
 3694859 3694860 GTNG_1350 GTNG_1351     TRUE 0.847 3.000 0.077 1.000 N NA
 3694860 3694861 GTNG_1351 GTNG_1352     TRUE 0.993 -19.000 0.191 0.002 Y NA
 3694861 3694862 GTNG_1352 GTNG_1353     TRUE 0.974 -13.000 0.447 1.000   NA
 3694862 3694863 GTNG_1353 GTNG_1354     TRUE 0.904 -3.000 0.158 1.000   NA
 3694863 3694864 GTNG_1354 GTNG_1355     FALSE 0.116 155.000 0.000 1.000   NA
 3694864 3694865 GTNG_1355 GTNG_1356     FALSE 0.136 204.000 0.000 0.036   NA
 3694865 3694866 GTNG_1356 GTNG_1357     TRUE 0.757 0.000 0.043 1.000   NA
 3694866 3694867 GTNG_1357 GTNG_1358     FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 3694867 3694868 GTNG_1358 GTNG_1359     TRUE 0.694 2.000 0.062 NA   NA
 3694868 3694869 GTNG_1359 GTNG_1360     FALSE 0.184 176.000 0.005 NA N NA
 3694869 3694870 GTNG_1360 GTNG_1361     TRUE 0.959 16.000 0.044 0.005 Y NA
 3694870 3694871 GTNG_1361 GTNG_1362   thiE TRUE 0.968 6.000 0.142 0.005 Y NA
 3694873 3694874 GTNG_1364 GTNG_1365     TRUE 0.950 3.000 0.750 NA   NA
 3694874 3694875 GTNG_1365 GTNG_1366     TRUE 0.828 88.000 0.600 1.000   NA
 3694875 3694876 GTNG_1366 GTNG_1367     FALSE 0.467 130.000 0.167 NA   NA
 3694877 3694878 GTNG_1368 GTNG_1369     TRUE 0.852 -67.000 0.000 NA N NA
 3694878 3694879 GTNG_1369 GTNG_1370     FALSE 0.333 0.000 0.000 NA   NA
 3694879 3694880 GTNG_1370 GTNG_1371     FALSE 0.002 451.000 0.000 NA   NA
 3694880 3694881 GTNG_1371 GTNG_1372     TRUE 0.945 39.000 0.667 NA   NA
 3694882 3694883 GTNG_1373 GTNG_1374     FALSE 0.028 187.000 0.000 NA   NA
 3694883 3694884 GTNG_1374 GTNG_1375     FALSE 0.217 107.000 0.013 NA   NA
 3694885 3694886 GTNG_1376 GTNG_1377     TRUE 0.807 4.000 0.188 NA   NA
 3694887 3694888 GTNG_1378 GTNG_1379     TRUE 0.593 57.000 0.000 1.000 N NA
 3694888 3694889 GTNG_1379 GTNG_1380     TRUE 0.932 -3.000 0.136 1.000 N NA
 3694889 3694890 GTNG_1380 GTNG_1381     FALSE 0.332 162.000 0.027 1.000 N NA
 3694890 3694891 GTNG_1381 GTNG_1382     TRUE 0.966 3.000 0.096 0.040 Y NA
 3694891 3694892 GTNG_1382 GTNG_1383     TRUE 0.983 -3.000 0.039 0.001 Y NA
 3694892 3694893 GTNG_1383 GTNG_1384     TRUE 0.751 108.000 0.022 1.000 Y NA
 3694893 3694894 GTNG_1384 GTNG_1385     FALSE 0.518 179.000 0.022 1.000 Y NA
 3694894 3694895 GTNG_1385 GTNG_1386     TRUE 0.865 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3694895 3694896 GTNG_1386 GTNG_1387     FALSE 0.289 165.000 0.012 1.000 N NA
 3694896 3694897 GTNG_1387 GTNG_1388     FALSE 0.070 248.000 0.000 0.055   NA
 3694897 3694898 GTNG_1388 GTNG_1389     TRUE 0.731 113.000 0.185 0.013   NA
 3694898 3694899 GTNG_1389 GTNG_1390     FALSE 0.003 900.000 0.017 NA   NA
 3694899 3694900 GTNG_1390 GTNG_1391     FALSE 0.001 641.000 0.000 NA   NA
 3694900 3694901 GTNG_1391 GTNG_1392     TRUE 0.815 131.000 0.012 0.013 Y NA
 3694901 3694902 GTNG_1392 GTNG_1393     TRUE 0.628 118.000 0.118 1.000 N NA
 3694903 3694904 GTNG_1394 GTNG_1395     TRUE 0.979 2.000 0.786 0.003   NA
 3694904 3694905 GTNG_1395 GTNG_1396     TRUE 0.919 22.000 0.357 NA   NA
 3694906 3694907 GTNG_1397 GTNG_1398 xpt   TRUE 0.949 0.000 0.056 1.000 Y NA
 3694908 3694909 GTNG_1399 GTNG_1400     TRUE 0.988 0.000 0.667 1.000 Y NA
 3694909 3694910 GTNG_1400 GTNG_1401     FALSE 0.001 1189.000 0.000 NA   NA
 3694911 3694912 GTNG_1402 GTNG_1403     TRUE 0.940 -3.000 0.279 1.000   NA
 3694912 3694913 GTNG_1403 GTNG_1404     FALSE 0.065 236.000 0.029 1.000   NA
 3694913 3694914 GTNG_1404 GTNG_1405     FALSE 0.230 185.000 0.107 1.000   NA
 3694914 3694915 GTNG_1405 GTNG_1406     FALSE 0.384 116.000 0.046 1.000   NA
 3694915 3694916 GTNG_1406 GTNG_1407   tlpA FALSE 0.076 232.000 0.000 1.000 N NA
 3694916 3694917 GTNG_1407 GTNG_1408 tlpA sspN FALSE 0.011 312.000 0.000 1.000   NA
 3694917 3694918 GTNG_1408 GTNG_1409 sspN   TRUE 0.959 -3.000 0.500 NA   NA
 3694918 3694919 GTNG_1409 GTNG_1410     FALSE 0.449 116.000 0.125 NA   NA
 3694919 3694920 GTNG_1410 GTNG_1411     TRUE 0.906 -69.000 0.097 NA   NA
 3694920 3694921 GTNG_1411 GTNG_1412     TRUE 0.704 -3.000 0.019 NA   NA
 3694923 3694924 GTNG_1414 GTNG_1415     FALSE 0.005 310.000 0.000 NA   NA
 3694926 3694927 GTNG_1417 GTNG_1418     FALSE 0.086 195.000 0.004 1.000   NA
 3694927 3694928 GTNG_1418 GTNG_1419     FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 3694928 3694929 GTNG_1419 GTNG_1420     FALSE 0.434 81.000 0.091 NA   NA
 3694929 3694930 GTNG_1420 GTNG_1421     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 3694932 3694933 GTNG_1423 GTNG_1424     TRUE 0.539 100.000 0.182 NA   NA
 3694935 3694936 GTNG_1426 GTNG_1427     FALSE 0.008 271.000 0.000 NA   NA
 3694936 3694937 GTNG_1427 GTNG_1428     TRUE 0.883 55.000 0.253 1.000 N NA
 3694939 3694940 GTNG_1430 GTNG_1431     FALSE 0.426 78.000 0.000 0.082   NA
 3694940 3694941 GTNG_1431 GTNG_1432     FALSE 0.098 89.000 0.000 NA   NA
 3694941 3694942 GTNG_1432 GTNG_1433     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694942 3694943 GTNG_1433 GTNG_1434   rarD FALSE 0.033 302.000 0.000 0.081   NA
 3694943 3694944 GTNG_1434 GTNG_1435 rarD   FALSE 0.001 620.000 0.000 NA   NA
 3694945 3694946 GTNG_1436 GTNG_1437     TRUE 0.618 96.000 0.009 0.081 N NA
 3694946 3694947 GTNG_1437 GTNG_1438     FALSE 0.088 121.000 0.000 NA   NA
 3694947 3694948 GTNG_1438 GTNG_1439     FALSE 0.019 208.000 0.000 NA   NA
 3694953 3694954 GTNG_1444 GTNG_1445     TRUE 0.525 -10.000 0.000 NA   NA
 3694954 3694955 GTNG_1445 GTNG_1446     FALSE 0.485 129.000 0.037 1.000 N NA
 3694955 3694956 GTNG_1446 GTNG_1447     TRUE 0.899 60.000 0.074 1.000 Y NA
 3694956 3694957 GTNG_1447 GTNG_1448     TRUE 0.893 66.000 0.019 0.069 Y NA
 3694957 3694958 GTNG_1448 GTNG_1449     TRUE 0.897 23.000 0.029 0.002   NA
 3694958 3694959 GTNG_1449 GTNG_1450     TRUE 0.849 118.000 0.778 1.000   NA
 3694959 3694960 GTNG_1450 GTNG_1451     TRUE 0.983 29.000 0.690 0.069 N NA
 3694960 3694961 GTNG_1451 GTNG_1452     FALSE 0.430 282.000 0.426 1.000 Y NA
 3694963 3694964 GTNG_1454 GTNG_1455     TRUE 0.753 4.000 0.081 1.000   NA
 3694964 3694965 GTNG_1455 GTNG_1456     TRUE 0.712 137.000 0.441 1.000   NA
 3694965 3694966 GTNG_1456 GTNG_1457     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 3694966 3694967 GTNG_1457 GTNG_1458     FALSE 0.086 123.000 0.000 NA   NA
 3694969 3694970 GTNG_1460 GTNG_1461     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3694971 3694972 GTNG_1462 GTNG_1463 kinB   FALSE 0.003 354.000 0.000 NA   NA
 3694972 3694973 GTNG_1463 GTNG_1464   gerXC FALSE 0.091 104.000 0.000 NA   NA
 3694973 3694974 GTNG_1464 GTNG_1465 gerXC gerXA TRUE 0.981 -3.000 0.500 0.006   NA
 3694974 3694975 GTNG_1465 GTNG_1466 gerXA gerXB TRUE 0.987 -3.000 0.750 0.006   NA
 3694976 3694977 GTNG_1467 GTNG_1468     TRUE 0.983 -34.000 0.419 1.000 N NA
 3694977 3694978 GTNG_1468 GTNG_1469     TRUE 0.936 -7.000 0.231 NA   NA
 3694980 3694981 GTNG_1471 GTNG_1472 gerKA gerKC TRUE 0.989 -3.000 0.889 0.006   NA
 3694981 3694982 GTNG_1472 GTNG_1473 gerKC gerKB TRUE 0.957 66.000 0.900 0.006   NA
 3694982 3694983 GTNG_1473 GTNG_1474 gerKB   FALSE 0.030 232.000 0.000 1.000   NA
 3694983 3694984 GTNG_1474 GTNG_1475   rsbW TRUE 0.908 13.000 0.022 1.000 Y NA
 3694984 3694985 GTNG_1475 GTNG_1476 rsbW   FALSE 0.400 63.000 0.022 NA   NA
 3694985 3694986 GTNG_1476 GTNG_1477     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 3694986 3694987 GTNG_1477 GTNG_1478     TRUE 0.997 -16.000 0.500 0.003 Y NA
 3694988 3694989 GTNG_1479 GTNG_1480     TRUE 0.904 -9.000 0.133 NA   NA
 3694989 3694990 GTNG_1480 GTNG_1481     FALSE 0.022 198.000 0.000 NA   NA
 3694991 3694992 GTNG_1482 GTNG_1483     FALSE 0.003 724.000 0.000 1.000   NA
 3694992 3694993 GTNG_1483 GTNG_1484     FALSE 0.179 110.000 0.000 1.000   NA
 3694993 3694994 GTNG_1484 GTNG_1485     FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 3694994 3694995 GTNG_1485 GTNG_1486     TRUE 0.665 19.000 0.035 NA   NA
 3694995 3694996 GTNG_1486 GTNG_1487     TRUE 0.982 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 3694996 3694997 GTNG_1487 GTNG_1488     TRUE 0.865 129.000 0.250 1.000 Y NA
 3694997 3694998 GTNG_1488 GTNG_1489     TRUE 0.887 85.000 0.667 1.000 N NA
 3694998 3694999 GTNG_1489 GTNG_1490     TRUE 0.920 27.000 0.182 1.000 N NA
 3694999 3695000 GTNG_1490 GTNG_1491     TRUE 0.986 -16.000 0.545 1.000 N NA
 3695000 3695001 GTNG_1491 GTNG_1492     FALSE 0.164 129.000 0.000 1.000   NA
 3695001 3695002 GTNG_1492 GTNG_1493     FALSE 0.005 312.000 0.000 NA   NA
 3695002 3695003 GTNG_1493 GTNG_1494     TRUE 0.591 11.000 0.050 NA   NA
 3695003 3695004 GTNG_1494 GTNG_1495   bcrA TRUE 0.986 -3.000 0.850 1.000 N NA
 3695004 3695005 GTNG_1495 GTNG_1496 bcrA bcrB TRUE 0.981 -7.000 0.791 NA   NA
 3695005 3695006 GTNG_1496 GTNG_t056 bcrB   FALSE 0.001 648.000 0.000 NA   NA
 3695006 3695007 GTNG_t056 GTNG_t057     FALSE 0.231 9.000 0.000 NA   NA
 3695007 3695008 GTNG_t057 GTNG_1497     FALSE 0.005 304.000 0.000 NA   NA
 3695008 3695009 GTNG_1497 GTNG_1498     FALSE 0.021 201.000 0.000 NA   NA
 3695009 3695010 GTNG_1498 GTNG_1499     TRUE 0.723 36.000 0.000 1.000 N NA
 3695012 3695013 GTNG_1501 GTNG_1502     TRUE 0.577 -69.000 0.000 NA   NA
 3695013 3695014 GTNG_1502 GTNG_1503     FALSE 0.028 313.000 0.000 1.000 N NA
 3695014 3695015 GTNG_1503 GTNG_1504     TRUE 0.955 38.000 0.136 1.000 Y NA
 3695015 3695016 GTNG_1504 GTNG_1505     TRUE 0.969 20.000 0.238 NA Y NA
 3695016 3695017 GTNG_1505 GTNG_1506     TRUE 0.987 -3.000 0.429 NA Y NA
 3695017 3695018 GTNG_1506 GTNG_1507     TRUE 0.885 115.000 0.273 1.000 Y NA
 3695018 3695019 GTNG_1507 GTNG_1508     TRUE 0.940 20.000 0.273 1.000 N NA
 3695019 3695020 GTNG_1508 GTNG_1509     TRUE 0.740 64.000 0.083 1.000 N NA
 3695020 3695021 GTNG_1509 GTNG_1510     TRUE 0.991 0.000 0.590 0.044 Y NA
 3695021 3695022 GTNG_1510 GTNG_1511     TRUE 0.982 3.000 0.513 1.000 Y NA
 3695022 3695023 GTNG_1511 GTNG_1512     TRUE 0.996 -7.000 0.621 0.022 Y NA
 3695023 3695024 GTNG_1512 GTNG_1513     TRUE 0.879 157.000 0.591 NA Y NA
 3695024 3695025 GTNG_1513 GTNG_1514     FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 3695026 3695027 GTNG_1515 GTNG_1516     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 3695028 3695029 GTNG_1517 GTNG_1518     TRUE 0.994 0.000 0.750 0.003 Y NA
 3695029 3695030 GTNG_1518 GTNG_1519     TRUE 0.985 -7.000 0.524 0.046   NA
 3695030 3695031 GTNG_1519 GTNG_1520     TRUE 0.949 36.000 0.667 NA   NA
 3695031 3695032 GTNG_1520 GTNG_1521     FALSE 0.004 321.000 0.000 NA   NA
 3695032 3695033 GTNG_1521 GTNG_1522     FALSE 0.325 91.000 0.043 NA   NA
 3695033 3695034 GTNG_1522 GTNG_1523     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 3695034 3695035 GTNG_1523 GTNG_1524     FALSE 0.006 295.000 0.000 NA   NA
 3695037 3695038 GTNG_1526 GTNG_1527     FALSE 0.008 269.000 0.000 NA   NA
 3695038 3695039 GTNG_1527 GTNG_1528     TRUE 0.941 88.000 0.333 0.039 Y NA
 3695039 3695040 GTNG_1528 GTNG_1529     TRUE 0.986 44.000 0.571 0.069 Y NA
 3695041 3695042 GTNG_1530 GTNG_1531     FALSE 0.059 378.000 0.000 1.000 Y NA
 3695042 3695043 GTNG_1531 GTNG_1532     FALSE 0.003 379.000 0.000 NA   NA
 3695044 3695045 GTNG_1533 GTNG_1534     TRUE 0.781 15.000 0.176 NA   NA
 3695045 3695046 GTNG_1534 GTNG_1535     TRUE 0.949 16.000 0.000 0.001 Y NA
 3695046 3695047 GTNG_1535 GTNG_1536     FALSE 0.052 157.000 0.000 NA   NA
 3695047 3695048 GTNG_1536 GTNG_1538     FALSE 0.012 242.000 0.000 NA   NA
 3695050 3695051 GTNG_1540 GTNG_1541     TRUE 0.975 -7.000 0.600 NA   NA
 3695051 3695052 GTNG_1541 GTNG_1542     TRUE 0.863 -3.000 0.125 NA   NA
 3695052 3695053 GTNG_1542 GTNG_1543     FALSE 0.317 129.000 0.028 1.000   NA
 3695053 3695054 GTNG_1543 GTNG_1544     TRUE 0.578 -73.000 0.000 NA   NA
 3695054 3695055 GTNG_1544 GTNG_1545   cotB FALSE 0.039 172.000 0.000 NA   NA
 3695055 3695056 GTNG_1545 GTNG_1546 cotB   TRUE 0.612 122.000 0.267 NA   NA
 3695057 3695058 GTNG_1547 GTNG_1548     FALSE 0.004 328.000 0.000 NA   NA
 3695061 3695062 GTNG_1551 GTNG_1552     TRUE 0.754 106.000 0.500 NA   NA
 3695062 3695063 GTNG_1552 GTNG_1553     FALSE 0.036 175.000 0.000 NA   NA
 3695063 3695064 GTNG_1553 GTNG_1554   uvsE FALSE 0.006 296.000 0.000 NA   NA
 3695064 3695065 GTNG_1554 GTNG_1555 uvsE   FALSE 0.004 1195.000 0.000 NA N NA
 3695065 3695066 GTNG_1555 GTNG_1556     FALSE 0.098 86.000 0.000 NA   NA
 3695066 3695067 GTNG_1556 GTNG_1557     FALSE 0.236 73.000 0.000 1.000   NA
 3695067 3695068 GTNG_1557 GTNG_1558     FALSE 0.002 409.000 0.000 NA   NA
 3695068 3695069 GTNG_1558 GTNG_1559     FALSE 0.098 86.000 0.000 NA   NA
 3695069 3695070 GTNG_1559 GTNG_1560     TRUE 0.862 67.000 0.000 0.067 Y NA
 3695070 3695071 GTNG_1560 GTNG_1561     FALSE 0.005 1223.000 0.000 1.000 N NA
 3695071 3695072 GTNG_1561 GTNG_1562     FALSE 0.005 397.000 0.000 1.000   NA
 3695072 3695073 GTNG_1562 GTNG_1563     FALSE 0.344 26.000 0.000 NA   NA
 3695074 3695075 GTNG_1564 GTNG_1565     FALSE 0.098 87.000 0.000 NA   NA
 3695076 3695077 GTNG_1566 GTNG_1567     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 3695077 3695078 GTNG_1567 GTNG_1568     FALSE 0.022 256.000 0.000 1.000   NA
 3695078 3695079 GTNG_1568 GTNG_1569     FALSE 0.003 639.000 0.000 1.000   NA
 3695079 3695080 GTNG_1569 GTNG_1570     FALSE 0.002 404.000 0.000 NA   NA
 3695080 3695081 GTNG_1570 GTNG_1571     FALSE 0.341 29.000 0.000 NA   NA
 3695081 3695082 GTNG_1571 GTNG_1572     FALSE 0.016 278.000 0.000 1.000   NA
 3695082 3695083 GTNG_1572 GTNG_1573     FALSE 0.179 111.000 0.000 1.000   NA
 3695084 3695085 GTNG_1574 GTNG_1575     FALSE 0.283 3.000 0.000 NA   NA
 3695086 3695087 GTNG_1576 GTNG_1577     FALSE 0.083 127.000 0.000 NA   NA
 3695087 3695088 GTNG_1577 GTNG_1578     FALSE 0.106 234.000 0.000 0.008   NA
 3695090 3695091 GTNG_1580 GTNG_1581     FALSE 0.001 1949.000 0.000 NA   NA
 3695091 3695092 GTNG_1581 GTNG_1582     FALSE 0.004 442.000 0.000 1.000   NA
 3695092 3695093 GTNG_1582 GTNG_1583     FALSE 0.003 551.000 0.000 1.000   NA
 3695095 3695096 GTNG_1585 GTNG_1587     FALSE 0.021 202.000 0.000 NA   NA
 3695098 3695099 GTNG_1589 GTNG_1590     FALSE 0.017 216.000 0.000 NA   NA
 3695099 3695100 GTNG_1590 GTNG_1591     FALSE 0.106 78.000 0.000 NA   NA
 3695100 3695101 GTNG_1591 GTNG_1592     TRUE 0.921 48.000 0.000 0.053 Y NA
 3695103 3695104 GTNG_1594 GTNG_1595     FALSE 0.008 274.000 0.000 NA   NA
 3695104 3695105 GTNG_1595 GTNG_1596     FALSE 0.042 167.000 0.000 NA   NA
 3695105 3695106 GTNG_1596 GTNG_1597     FALSE 0.489 2.000 0.000 1.000   NA
 3695106 3695107 GTNG_1597 GTNG_1598   arsR FALSE 0.002 1367.000 0.000 1.000   NA
 3695107 3695108 GTNG_1598 GTNG_1599 arsR   TRUE 0.897 28.000 0.111 1.000 N NA
 3695108 3695109 GTNG_1599 GTNG_1600     TRUE 0.936 21.000 0.250 1.000 N NA
 3695111 3695112 GTNG_1602 GTNG_1603     FALSE 0.472 76.000 0.062 1.000   NA
 3695112 3695113 GTNG_1603 GTNG_1604     FALSE 0.004 440.000 0.000 1.000   NA
 3695115 3695116 GTNG_1606 GTNG_1607     FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695116 3695117 GTNG_1607 GTNG_1608     FALSE 0.006 774.000 0.000 1.000 N NA
 3695117 3695118 GTNG_1608 GTNG_1609     TRUE 0.981 3.000 0.500 1.000 Y NA
 3695118 3695119 GTNG_1609 GTNG_1610     TRUE 0.628 13.000 0.062 NA   NA
 3695119 3695120 GTNG_1610 GTNG_1611     FALSE 0.341 107.000 0.062 NA   NA
 3695120 3695121 GTNG_1611 GTNG_1612     TRUE 0.784 117.000 0.500 1.000   NA
 3695121 3695122 GTNG_1612 GTNG_1613     TRUE 0.942 23.000 0.500 NA   NA
 3695122 3695123 GTNG_1613 GTNG_1614     FALSE 0.004 349.000 0.000 NA   NA
 3695123 3695124 GTNG_1614 GTNG_1615     FALSE 0.260 16.000 0.000 NA   NA
 3695124 3695125 GTNG_1615 GTNG_1617     FALSE 0.338 30.000 0.000 NA   NA
 3695129 3695130 GTNG_1621 GTNG_1622     FALSE 0.096 98.000 0.000 NA   NA
 3695130 3695131 GTNG_1622 GTNG_1623     FALSE 0.001 571.000 0.000 NA   NA
 3695131 3695132 GTNG_1623 GTNG_1624     FALSE 0.207 207.000 0.054 0.053   NA
 3695132 3695133 GTNG_1624 GTNG_1625     FALSE 0.231 180.000 0.000 0.008   NA
 3695136 3695137 GTNG_1628 GTNG_1629     FALSE 0.010 255.000 0.000 NA   NA
 3695137 3695138 GTNG_1629 GTNG_1630     TRUE 0.655 20.000 0.029 NA   NA
 3695138 3695139 GTNG_1630 GTNG_1631     TRUE 0.941 11.000 0.822 NA   NA
 3695139 3695140 GTNG_1631 GTNG_1632     FALSE 0.425 105.000 0.067 1.000   NA
 3695140 3695141 GTNG_1632 GTNG_1633   purU FALSE 0.333 120.000 0.025 1.000   NA
 3695141 3695142 GTNG_1633 GTNG_1634 purU   FALSE 0.227 162.000 0.000 1.000 N NA
 3695143 3695144 GTNG_1635 GTNG_1636     FALSE 0.002 513.000 0.000 NA   NA
 3695144 3695145 GTNG_1636 GTNG_1637     FALSE 0.102 81.000 0.000 NA   NA
 3695146 3695147 GTNG_1638 GTNG_1639     FALSE 0.287 176.000 0.039 1.000 N NA
 3695147 3695148 GTNG_1639 GTNG_1640     FALSE 0.293 117.000 0.039 NA   NA
 3695148 3695149 GTNG_1640 GTNG_1641     FALSE 0.003 363.000 0.000 NA   NA
 3695149 3695150 GTNG_1641 GTNG_1642     FALSE 0.173 199.000 0.019 1.000 N NA
 3695150 3695151 GTNG_1642 GTNG_1643     TRUE 0.951 23.000 0.336 1.000 N NA
 3695151 3695152 GTNG_1643 GTNG_1644     TRUE 0.794 111.000 0.070 1.000 Y NA
 3695154 3695155 GTNG_1646 GTNG_1647     TRUE 0.946 55.000 0.019 0.001 Y NA
 3695155 3695156 GTNG_1647 GTNG_1648     FALSE 0.043 243.000 0.030 NA   NA
 3695158 3695159 GTNG_1650 GTNG_1651     TRUE 0.637 52.000 0.083 NA   NA
 3695161 3695162 GTNG_t058 GTNG_t059     FALSE 0.332 19.000 0.000 NA   NA
 3695162 3695163 GTNG_t059 GTNG_t060     FALSE 0.235 12.000 0.000 NA   NA
 3695163 3695164 GTNG_t060 GTNG_t061     FALSE 0.295 38.000 0.000 NA   NA
 3695164 3695165 GTNG_t061 GTNG_t062     FALSE 0.314 18.000 0.000 NA   NA
 3695165 3695166 GTNG_t062 GTNG_t063     FALSE 0.231 9.000 0.000 NA   NA
 3695166 3695167 GTNG_t063 GTNG_t064     FALSE 0.252 5.000 0.000 NA   NA
 3695167 3695168 GTNG_t064 GTNG_5s010     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3695168 3695169 GTNG_5s010 GTNG_1653     FALSE 0.001 1033.000 0.000 NA   NA
 3695173 3695174 GTNG_1657 GTNG_1658     FALSE 0.002 431.000 0.000 NA   NA
 3695175 3695176 GTNG_1659 GTNG_1660     FALSE 0.002 446.000 0.000 NA   NA
 3695178 3695179 GTNG_1662 GTNG_1663     TRUE 0.605 21.000 0.016 NA   NA
 3695180 3695181 GTNG_1664 GTNG_1665     TRUE 0.960 35.000 0.828 NA   NA
 3695181 3695182 GTNG_1665 GTNG_1666     TRUE 0.796 23.000 0.068 1.000   NA
 3695182 3695183 GTNG_1666 GTNG_1667     FALSE 0.014 228.000 0.000 NA   NA
 3695183 3695184 GTNG_1667 GTNG_1668     FALSE 0.316 108.000 0.050 NA   NA
 3695184 3695185 GTNG_1668 GTNG_1669     FALSE 0.004 339.000 0.000 NA   NA
 3695185 3695186 GTNG_1669 GTNG_1670     FALSE 0.088 175.000 0.007 NA   NA
 3695186 3695187 GTNG_1670 GTNG_1671   thyA TRUE 0.978 -70.000 0.295 1.000 N NA
 3695187 3695188 GTNG_1671 GTNG_1672 thyA   FALSE 0.326 77.000 0.007 1.000   NA
 3695188 3695189 GTNG_1672 GTNG_1673     FALSE 0.452 99.000 0.111 NA   NA
 3695189 3695190 GTNG_1673 GTNG_1674     TRUE 0.602 16.000 0.040 NA   NA
 3695190 3695191 GTNG_1674 GTNG_1675     FALSE 0.011 249.000 0.000 NA   NA
 3695191 3695192 GTNG_1675 GTNG_1676     FALSE 0.418 73.000 0.061 NA   NA
 3695192 3695193 GTNG_1676 GTNG_1677     FALSE 0.001 580.000 0.000 NA   NA
 3695193 3695194 GTNG_1677 GTNG_1678     TRUE 0.862 26.000 0.049 1.000 N NA
 3695194 3695195 GTNG_1678 GTNG_1679     FALSE 0.259 169.000 0.122 NA   NA
 3695197 3695198 GTNG_1681 GTNG_1682 btuR   TRUE 0.973 -19.000 0.009 1.000 Y NA
 3695198 3695199 GTNG_1682 GTNG_1683   cobT TRUE 0.961 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 3695199 3695200 GTNG_1683 GTNG_1684 cobT cbiP TRUE 0.667 176.000 0.016 0.010 Y NA
 3695200 3695201 GTNG_1684 GTNG_1685 cbiP cbiA TRUE 0.984 -7.000 0.010 0.003 Y NA
 3695201 3695202 GTNG_1685 GTNG_1686 cbiA cbiG TRUE 0.988 -54.000 0.032 0.010 Y NA
 3695202 3695203 GTNG_1686 GTNG_1687 cbiG cbiF TRUE 0.987 2.000 0.397 0.010 Y NA
 3695203 3695204 GTNG_1687 GTNG_1688 cbiF cbiL TRUE 0.991 -3.000 0.291 0.010 Y NA
 3695204 3695205 GTNG_1688 GTNG_1689 cbiL cbiET TRUE 0.985 -3.000 0.128 0.010 Y NA
 3695205 3695206 GTNG_1689 GTNG_1690 cbiET cbiD TRUE 0.991 -34.000 0.107 0.010 Y NA
 3695206 3695207 GTNG_1690 GTNG_1691 cbiD cbiC TRUE 0.961 7.000 0.102 0.010 Y NA
 3695207 3695208 GTNG_1691 GTNG_1692 cbiC cbiJ TRUE 0.851 115.000 0.026 0.010 Y NA
 3695208 3695209 GTNG_1692 GTNG_1693 cbiJ cbiX TRUE 0.829 16.000 0.026 0.010   NA
 3695209 3695210 GTNG_1693 GTNG_1694 cbiX cbiH FALSE 0.198 213.000 0.025 0.010   NA
 3695210 3695211 GTNG_1694 GTNG_1695 cbiH cbiO TRUE 0.632 64.000 0.011 1.000 N NA
 3695211 3695212 GTNG_1695 GTNG_1696 cbiO cbiQ TRUE 0.986 -3.000 0.335 1.000 Y NA
 3695212 3695213 GTNG_1696 GTNG_1697 cbiQ cbiN TRUE 0.998 -16.000 0.804 0.002 Y NA
 3695213 3695214 GTNG_1697 GTNG_1698 cbiN cbiM TRUE 0.992 5.000 0.861 0.010 Y NA
 3695214 3695215 GTNG_1698 GTNG_1699 cbiM   TRUE 0.808 1.000 0.019 1.000 N NA
 3695215 3695216 GTNG_1699 GTNG_1700     FALSE 0.052 236.000 0.000 NA N NA
 3695216 3695217 GTNG_1700 GTNG_t065     FALSE 0.010 258.000 0.000 NA   NA
 3695219 3695220 GTNG_1702 GTNG_1703     TRUE 0.564 13.000 0.008 1.000   NA
 3695222 3695223 GTNG_1705 GTNG_1706     TRUE 0.663 82.000 0.125 1.000 N NA
 3695223 3695224 GTNG_1706 GTNG_1707     FALSE 0.017 368.000 0.000 1.000 N NA
 3695224 3695225 GTNG_1707 GTNG_1708     TRUE 0.845 43.000 0.250 NA   NA
 3695225 3695226 GTNG_1708 GTNG_1709     FALSE 0.397 83.000 0.074 NA   NA
 3695226 3695227 GTNG_1709 GTNG_1710     FALSE 0.019 393.000 0.000 0.030   NA
 3695227 3695228 GTNG_1710 GTNG_1711     FALSE 0.274 76.000 0.017 NA   NA
 3695229 3695230 GTNG_1712 GTNG_1713 narG2 narH2 TRUE 0.996 -10.000 0.429 0.001 Y NA
 3695230 3695231 GTNG_1713 GTNG_1714 narH2 narJ2 TRUE 0.989 54.000 0.750 0.003 Y NA
 3695231 3695232 GTNG_1714 GTNG_1715 narJ2 narI2 TRUE 0.995 -24.000 0.294 0.003 Y NA
 3695233 3695234 GTNG_1716 GTNG_1717   porA FALSE 0.244 137.000 0.000 NA N NA
 3695234 3695235 GTNG_1717 GTNG_1718 porA porG TRUE 0.994 18.000 0.786 0.001 Y NA
 3695235 3695236 GTNG_1718 GTNG_1719 porG hemD FALSE 0.139 191.000 0.000 1.000 N NA
 3695236 3695237 GTNG_1719 GTNG_1720 hemD   FALSE 0.256 104.000 0.024 NA   NA
 3695237 3695238 GTNG_1720 GTNG_1721     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 3695239 3695240 GTNG_1722 GTNG_1723     FALSE 0.135 193.000 0.000 1.000 N NA
 3695243 3695244 GTNG_1726 GTNG_1727     TRUE 0.991 26.000 0.816 1.000 Y NA
 3695244 3695245 GTNG_1727 GTNG_1728     TRUE 0.993 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 3695245 3695246 GTNG_1728 GTNG_1729     FALSE 0.060 188.000 0.000 1.000   NA
 3695246 3695247 GTNG_1729 GTNG_1730   nosF FALSE 0.480 17.000 0.000 1.000   NA
 3695247 3695248 GTNG_1730 GTNG_1731 nosF nosY FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695248 3695249 GTNG_1731 GTNG_1732 nosY nosD FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695249 3695250 GTNG_1732 GTNG_1733 nosD   FALSE 0.430 -3.000 0.000 NA   NA
 3695250 3695251 GTNG_1733 GTNG_1734   nosZ TRUE 0.824 52.000 0.281 NA   NA
 3695251 3695252 GTNG_1734 GTNG_1735 nosZ   TRUE 0.787 22.000 0.000 0.045   NA
 3695252 3695253 GTNG_1735 GTNG_1736     FALSE 0.082 173.000 0.000 1.000   NA
 3695253 3695254 GTNG_1736 GTNG_1737     FALSE 0.228 185.000 0.154 NA   NA
 3695254 3695255 GTNG_1737 GTNG_1738     FALSE 0.001 589.000 0.000 NA   NA
 3695255 3695256 GTNG_1738 GTNG_1739     TRUE 0.962 -3.000 0.517 NA   NA
 3695256 3695257 GTNG_1739 GTNG_1740     TRUE 0.972 3.000 0.308 1.000 Y NA
 3695259 3695260 GTNG_1742 GTNG_1743     FALSE 0.020 263.000 0.000 1.000   NA
 3695260 3695261 GTNG_1743 GTNG_1744     TRUE 0.911 34.000 0.353 NA   NA
 3695263 3695264 GTNG_1746 GTNG_1747     TRUE 0.711 151.000 0.364 1.000 N NA
 3695264 3695265 GTNG_1747 GTNG_1748     TRUE 0.970 27.000 0.190 1.000 Y NA
 3695265 3695266 GTNG_1748 GTNG_1749     TRUE 0.978 17.000 0.190 0.005 Y NA
 3695266 3695267 GTNG_1749 GTNG_1750     TRUE 0.992 2.000 0.667 0.005 Y NA
 3695267 3695268 GTNG_1750 GTNG_1751     FALSE 0.042 276.000 0.000 1.000 N NA
 3695270 3695271 GTNG_1753 GTNG_1754     FALSE 0.121 176.000 0.031 NA   NA
 3695271 3695272 GTNG_1754 GTNG_1755     TRUE 0.538 104.000 0.021 0.038   NA
 3695272 3695273 GTNG_1755 GTNG_1756   xylB FALSE 0.023 255.000 0.000 1.000   NA
 3695273 3695274 GTNG_1756 GTNG_1757 xylB xylA TRUE 0.935 15.000 0.091 1.000 Y NA
 3695274 3695275 GTNG_1757 GTNG_1758 xylA   TRUE 0.817 99.000 0.000 0.015 Y NA
 3695275 3695276 GTNG_1758 GTNG_1759     FALSE 0.010 446.000 0.000 1.000 N NA
 3695276 3695277 GTNG_1759 GTNG_1760     TRUE 0.559 23.000 0.005 NA   NA
 3695279 3695280 GTNG_1762 GTNG_1763   uxuB FALSE 0.498 80.000 0.133 NA   NA
 3695280 3695281 GTNG_1763 GTNG_1764 uxuB uxuA TRUE 0.980 -24.000 0.367 1.000 N NA
 3695281 3695282 GTNG_1764 GTNG_1765 uxuA uxaC TRUE 0.965 21.000 0.000 0.001 Y NA
 3695282 3695283 GTNG_1765 GTNG_1766 uxaC uxuR TRUE 0.686 42.000 0.000 1.000 N NA
 3695283 3695284 GTNG_1766 GTNG_1767 uxuR kdgA FALSE 0.369 118.000 0.000 1.000 N NA
 3695284 3695285 GTNG_1767 GTNG_1768 kdgA kdgK TRUE 0.914 18.000 0.000 1.000 Y NA
 3695285 3695286 GTNG_1768 GTNG_1769 kdgK xynB TRUE 0.957 33.000 0.105 1.000 Y NA
 3695286 3695287 GTNG_1769 GTNG_1770 xynB   TRUE 0.965 17.000 0.056 0.007 Y NA
 3695287 3695288 GTNG_1770 GTNG_1771     TRUE 0.930 16.000 0.056 1.000 Y NA
 3695288 3695289 GTNG_1771 GTNG_1772     TRUE 0.991 15.000 0.833 0.043 Y NA
 3695289 3695290 GTNG_1772 GTNG_1773     TRUE 0.943 131.000 0.500 0.043 Y NA
 3695290 3695291 GTNG_1773 GTNG_1774   xynA2 FALSE 0.031 549.000 0.000 1.000 Y NA
 3695291 3695292 GTNG_1774 GTNG_1775 xynA2 xynB2 TRUE 0.947 -3.000 0.143 0.015   NA
 3695292 3695293 GTNG_1775 GTNG_1776 xynB2   TRUE 0.696 111.000 0.143 0.015   NA
 3695293 3695294 GTNG_1776 GTNG_1777     TRUE 0.978 14.000 0.286 0.015 Y NA
 3695294 3695295 GTNG_1777 GTNG_1778     FALSE 0.288 216.000 0.000 1.000 Y NA
 3695295 3695296 GTNG_1778 GTNG_1779     TRUE 0.988 15.000 0.625 0.043 Y NA
 3695296 3695297 GTNG_1779 GTNG_1780     TRUE 0.968 76.000 0.625 0.043 Y NA
 3695297 3695298 GTNG_1780 GTNG_1781     TRUE 0.837 115.000 0.700 1.000   NA
 3695298 3695299 GTNG_1781 GTNG_1782     TRUE 0.983 0.000 0.889 0.017   NA
 3695299 3695300 GTNG_1782 GTNG_1783     FALSE 0.002 506.000 0.000 NA   NA
 3695302 3695303 GTNG_1788 GTNG_1789     TRUE 0.984 -3.000 0.500 0.067 N NA
 3695303 3695304 GTNG_1789 GTNG_1790     FALSE 0.345 58.000 0.000 1.000   NA
 3695304 3695305 GTNG_1790 GTNG_1791     TRUE 0.792 63.000 0.250 1.000   NA
 3695305 3695306 GTNG_1791 GTNG_1792     TRUE 0.967 40.000 0.250 1.000 Y NA
 3695306 3695307 GTNG_1792 GTNG_1793     TRUE 0.983 4.000 0.375 0.043 Y NA
 3695307 3695308 GTNG_1793 GTNG_1794     TRUE 0.930 128.000 0.350 0.043 Y NA
 3695308 3695309 GTNG_1794 GTNG_1795   araA FALSE 0.035 501.000 0.000 1.000 Y NA
 3695309 3695310 GTNG_1795 GTNG_1796 araA araB TRUE 0.882 17.000 0.138 1.000 N NA
 3695310 3695311 GTNG_1796 GTNG_1797 araB araD TRUE 0.934 16.000 0.108 0.001 N NA
 3695311 3695312 GTNG_1797 GTNG_1798 araD araR TRUE 0.624 92.000 0.095 1.000 N NA
 3695312 3695313 GTNG_1798 GTNG_1799 araR   FALSE 0.367 120.000 0.000 1.000 N NA
 3695313 3695314 GTNG_1799 GTNG_1800     TRUE 0.988 2.000 0.778 1.000 Y NA
 3695314 3695315 GTNG_1800 GTNG_1801     TRUE 0.834 74.000 0.095 NA Y NA
 3695315 3695316 GTNG_1801 GTNG_1802     FALSE 0.048 285.000 0.027 NA N NA
 3695316 3695317 GTNG_1802 GTNG_1803     TRUE 0.974 14.000 0.636 0.016 N NA
 3695317 3695318 GTNG_1803 GTNG_1804     TRUE 0.889 19.000 0.152 NA N NA
 3695318 3695319 GTNG_1804 GTNG_1805   fbaA FALSE 0.018 1166.000 0.000 NA Y NA
 3695319 3695320 GTNG_1805 GTNG_1806 fbaA   TRUE 0.560 79.000 0.038 1.000 N NA
 3695320 3695321 GTNG_1806 GTNG_1807     TRUE 0.960 17.000 0.556 1.000 N NA
 3695321 3695322 GTNG_1807 GTNG_1808   iolB TRUE 0.928 38.000 0.019 1.000 Y NA
 3695322 3695323 GTNG_1808 GTNG_1809 iolB iolE TRUE 0.882 14.000 0.000 1.000 Y NA
 3695323 3695324 GTNG_1809 GTNG_1810 iolE iolD FALSE 0.397 84.000 0.000 1.000 N NA
 3695324 3695325 GTNG_1810 GTNG_1811 iolD   TRUE 0.635 70.000 0.140 1.000   NA
 3695325 3695326 GTNG_1811 GTNG_1812     FALSE 0.027 240.000 0.000 1.000   NA
 3695326 3695327 GTNG_1812 GTNG_1813     TRUE 0.586 46.000 0.000 NA N NA
 3695327 3695328 GTNG_1813 GTNG_1814     TRUE 0.885 51.000 0.027 NA Y NA
 3695328 3695329 GTNG_1814 GTNG_1815     TRUE 0.922 9.000 0.068 1.000 Y NA
 3695329 3695330 GTNG_1815 GTNG_1816     FALSE 0.026 243.000 0.000 1.000   NA
 3695330 3695331 GTNG_1816 GTNG_1817     FALSE 0.467 80.000 0.000 0.038   NA
 3695333 3695334 GTNG_1819 GTNG_1820     FALSE 0.011 431.000 0.000 1.000 N NA
 3695334 3695335 GTNG_1820 GTNG_1821     TRUE 0.897 41.000 0.000 1.000 Y NA
 3695335 3695336 GTNG_1821 GTNG_1822     TRUE 0.994 22.000 0.818 0.043 Y NA
 3695336 3695337 GTNG_1822 GTNG_1823     TRUE 0.993 35.000 0.857 0.043 Y NA
 3695339 3695340 GTNG_1825 GTNG_1826     TRUE 0.697 122.000 0.083 0.067 N NA
 3695340 3695341 GTNG_1826 GTNG_1827     TRUE 0.596 122.000 0.095 1.000 N NA
 3695341 3695342 GTNG_1827 GTNG_1828     FALSE 0.220 240.000 0.000 1.000 Y NA
 3695343 3695344 GTNG_1829 GTNG_1830     FALSE 0.510 167.000 0.200 1.000 N NA
 3695344 3695345 GTNG_1830 GTNG_1831     FALSE 0.001 819.000 0.000 NA   NA
 3695346 3695347 GTNG_1832 GTNG_1833     FALSE 0.416 70.000 0.019 1.000   NA
 3695349 3695350 GTNG_1835 GTNG_1836     TRUE 0.692 115.000 0.000 1.000 Y NA
 3695350 3695351 GTNG_1836 GTNG_1837     TRUE 0.928 29.000 0.214 1.000 N NA
 3695351 3695352 GTNG_1837 GTNG_1838     FALSE 0.085 171.000 0.000 1.000   NA
 3695352 3695353 GTNG_1838 GTNG_1839     TRUE 0.608 64.000 0.074 1.000   NA
 3695353 3695354 GTNG_1839 GTNG_1840     TRUE 0.993 19.000 0.750 0.065 Y NA
 3695354 3695355 GTNG_1840 GTNG_1841     TRUE 0.801 75.000 0.500 NA   NA
 3695355 3695356 GTNG_1841 GTNG_1842   tctB FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 3695356 3695357 GTNG_1842 GTNG_1843 tctB tctC TRUE 0.862 56.000 0.400 NA   NA
 3695357 3695358 GTNG_1843 GTNG_1844 tctC   FALSE 0.005 393.000 0.000 1.000   NA
 3695358 3695359 GTNG_1844 GTNG_1845     TRUE 0.947 0.000 0.043 1.000 Y NA
 3695359 3695360 GTNG_1845 GTNG_1846     TRUE 0.918 6.000 0.115 0.005 N NA
 3695360 3695361 GTNG_1846 GTNG_1847     FALSE 0.117 434.000 0.336 0.005 N NA
 3695361 3695362 GTNG_1847 GTNG_1848     FALSE 0.018 210.000 0.000 NA   NA
 3695362 3695363 GTNG_1848 GTNG_1849     FALSE 0.006 297.000 0.000 NA   NA
 3695363 3695364 GTNG_1849 GTNG_1850     TRUE 0.710 17.000 0.000 1.000 N NA
 3695364 3695365 GTNG_1850 GTNG_1851     TRUE 0.751 31.000 0.000 1.000 N NA
 3695365 3695366 GTNG_1851 GTNG_1852     FALSE 0.089 381.000 0.333 1.000 N NA
 3695366 3695367 GTNG_1852 GTNG_1853     FALSE 0.009 515.000 0.000 1.000 N NA
 3695367 3695368 GTNG_1853 GTNG_1854     TRUE 0.563 64.000 0.000 0.066   NA
 3695368 3695369 GTNG_1854 GTNG_1855