MicrobesOnline Operon Predictions for Mycobacterium tuberculosis H37Ra

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3689300 3689301 MRA_0001 MRA_0002 dnaA dnaN FALSE 0.070 528.000 0.328 1.000 Y NA
 3689301 3689302 MRA_0002 MRA_0003 dnaN recF TRUE 0.920 20.000 0.318 1.000 Y NA
 3689302 3689303 MRA_0003 MRA_0004 recF   TRUE 0.960 -3.000 0.099 NA   NA
 3689303 3689304 MRA_0004 MRA_0005   gyrB FALSE 0.093 126.000 0.022 NA   NA
 3689304 3689305 MRA_0005 MRA_0006 gyrB gyrA TRUE 0.963 35.000 0.306 0.001 Y NA
 3689305 3689306 MRA_0006 MRA_0007 gyrA   FALSE 0.140 96.000 0.009 NA   NA
 3689306 3689307 MRA_0007 MRA_t01     FALSE 0.152 59.000 0.000 NA   NA
 3689307 3689308 MRA_t01 MRA_t02     FALSE 0.031 152.000 0.000 NA   NA
 3689311 3689312 MRA_0010 MRA_0011     FALSE 0.075 107.000 0.000 NA   NA
 3689312 3689313 MRA_0011 MRA_0012     TRUE 0.794 51.000 0.308 0.087   NA
 3689313 3689314 MRA_0012 MRA_0013     FALSE 0.034 146.000 0.000 NA   NA
 3689315 3689316 MRA_0014 MRA_0015   trpG FALSE 0.434 37.000 0.098 NA   NA
 3689317 3689318 MRA_0016 MRA_0017 pknB pknA TRUE 0.999 -3.000 0.426 0.004 Y NA
 3689318 3689319 MRA_0017 MRA_0018 pknA pbpA TRUE 0.989 -3.000 0.574 1.000 N NA
 3689319 3689320 MRA_0018 MRA_0019 pbpA rodA TRUE 0.973 -3.000 0.250 1.000 N NA
 3689320 3689321 MRA_0019 MRA_0020 rodA ppp TRUE 0.955 -3.000 0.145 1.000 N NA
 3689321 3689322 MRA_0020 MRA_0021 ppp   TRUE 0.711 89.000 0.216 NA Y NA
 3689322 3689323 MRA_0021 MRA_0022     FALSE 0.135 124.000 0.069 NA   NA
 3689328 3689329 MRA_0026 MRA_0027     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 3689329 3689330 MRA_0027 MRA_0028     TRUE 0.832 38.000 0.750 NA   NA
 3689330 3689331 MRA_0028 MRA_0029     TRUE 0.646 115.000 1.000 NA   NA
 3689331 3689332 MRA_0029 MRA_0030     FALSE 0.476 121.000 0.600 NA   NA
 3689332 3689333 MRA_0030 MRA_0031     TRUE 0.957 8.000 0.800 NA   NA
 3689333 3689334 MRA_0031 MRA_0032     FALSE 0.009 238.000 0.000 NA   NA
 3689334 3689335 MRA_0032 MRA_0033     TRUE 0.810 70.000 1.000 NA   NA
 3689335 3689336 MRA_0033 MRA_0034     FALSE 0.212 29.000 0.000 NA   NA
 3689336 3689337 MRA_0034 MRA_0035   bioF2 FALSE 0.002 501.000 0.000 NA   NA
 3689337 3689338 MRA_0035 MRA_0036 bioF2 acpA TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3689338 3689339 MRA_0036 MRA_0037 acpA   TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689339 3689340 MRA_0037 MRA_0038   fadD34 TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689341 3689342 MRA_0039 MRA_0040     FALSE 0.478 48.000 0.174 NA   NA
 3689344 3689345 MRA_0042 MRA_0043   mtc28 TRUE 0.761 82.000 0.875 NA   NA
 3689347 3689348 MRA_0045 MRA_0046     FALSE 0.441 159.000 0.000 0.035 Y NA
 3689348 3689349 MRA_0046 MRA_0047     FALSE 0.252 133.000 0.412 NA N NA
 3689349 3689350 MRA_0047 MRA_0048     TRUE 0.694 16.000 0.235 NA   NA
 3689350 3689351 MRA_0048 MRA_0049   ino1 FALSE 0.300 82.000 0.059 1.000   NA
 3689351 3689352 MRA_0049 MRA_0050 ino1   TRUE 0.664 61.000 0.608 NA N NA
 3689352 3689353 MRA_0050 MRA_0051     FALSE 0.248 101.000 0.122 NA   NA
 3689354 3689355 MRA_0052 MRA_0053   ponA1 FALSE 0.014 419.000 0.200 NA   NA
 3689355 3689356 MRA_0053 MRA_0054 ponA1   TRUE 0.973 -3.000 0.204 NA   NA
 3689356 3689357 MRA_0054 MRA_0055     FALSE 0.391 32.000 0.061 NA   NA
 3689357 3689358 MRA_0055 MRA_0056   rpsF FALSE 0.016 219.000 0.002 NA   NA
 3689358 3689359 MRA_0056 MRA_0057 rpsF ssb FALSE 0.101 104.000 0.029 1.000 N NA
 3689359 3689360 MRA_0057 MRA_0058 ssb rpsR FALSE 0.230 42.000 0.030 1.000 N NA
 3689360 3689361 MRA_0058 MRA_0059 rpsR rplI TRUE 0.963 33.000 0.499 0.020 Y NA
 3689361 3689362 MRA_0059 MRA_0059A rplI   FALSE 0.212 29.000 0.000 NA   NA
 3689362 3689363 MRA_0059A MRA_0060   dnaB TRUE 0.762 -21.000 0.000 NA   NA
 3689363 3689364 MRA_0060 MRA_0061 dnaB   FALSE 0.020 180.000 0.000 NA   NA
 3689364 3689365 MRA_0061 MRA_0062     TRUE 0.747 17.000 0.317 NA   NA
 3689365 3689366 MRA_0062 MRA_0063     FALSE 0.233 24.000 0.000 NA   NA
 3689366 3689367 MRA_0063 MRA_0064   celA1 FALSE 0.042 136.000 0.000 NA   NA
 3689367 3689368 MRA_0064 MRA_0065 celA1   FALSE 0.004 229.000 0.000 1.000 N NA
 3689368 3689369 MRA_0065 MRA_0066     FALSE 0.013 258.000 0.000 1.000   NA
 3689369 3689370 MRA_0066 MRA_0067     FALSE 0.007 262.000 0.000 NA   NA
 3689371 3689372 MRA_0068 MRA_0069 icd2   FALSE 0.024 118.000 0.000 1.000 N NA
 3689374 3689375 MRA_0071 MRA_0072 sdaA glyA2 TRUE 0.993 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 3689376 3689377 MRA_0073 MRA_0074     FALSE 0.001 431.000 0.000 1.000 N NA
 3689377 3689378 MRA_0074 MRA_0075   glnQ1 TRUE 0.986 3.000 1.000 1.000 N NA
 3689378 3689379 MRA_0075 MRA_0076 glnQ1   FALSE 0.049 80.000 0.000 1.000 N NA
 3689379 3689380 MRA_0076 MRA_0077     FALSE 0.169 13.000 0.000 1.000 N NA
 3689381 3689382 MRA_0078 MRA_0079     FALSE 0.143 64.000 0.000 NA   NA
 3689384 3689385 MRA_0081 MRA_0082     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689386 3689387 MRA_0083 MRA_0084     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689387 3689388 MRA_0084 MRA_0085     FALSE 0.149 95.000 0.000 1.000   NA
 3689388 3689389 MRA_0085 MRA_0086     TRUE 0.735 5.000 0.043 1.000 N NA
 3689389 3689390 MRA_0086 MRA_0087     TRUE 0.997 -3.000 0.085 0.007 Y NA
 3689390 3689391 MRA_0087 MRA_0088   hycD TRUE 0.983 6.000 0.398 1.000 Y NA
 3689391 3689392 MRA_0088 MRA_0089 hycD hycP TRUE 0.975 11.000 0.679 NA Y NA
 3689392 3689393 MRA_0089 MRA_0090 hycP hycQ TRUE 0.998 0.000 0.864 NA Y NA
 3689393 3689394 MRA_0090 MRA_0091 hycQ hycE TRUE 0.999 -3.000 0.659 0.007 Y NA
 3689394 3689395 MRA_0091 MRA_0092 hycE   FALSE 0.195 35.000 0.000 NA   NA
 3689395 3689396 MRA_0092 MRA_0093     FALSE 0.029 157.000 0.000 NA   NA
 3689396 3689397 MRA_0093 MRA_0094     FALSE 0.051 129.000 0.000 NA   NA
 3689397 3689398 MRA_0094 MRA_0095   mtn FALSE 0.003 434.000 0.000 NA   NA
 3689398 3689399 MRA_0095 MRA_0096 mtn ctpA FALSE 0.019 132.000 0.000 1.000 N NA
 3689400 3689401 MRA_0097 MRA_0098     FALSE 0.180 47.000 0.000 NA   NA
 3689401 3689402 MRA_0098 MRA_0099     FALSE 0.037 142.000 0.000 NA   NA
 3689403 3689404 MRA_0100 MRA_0101     FALSE 0.441 19.000 0.167 NA N NA
 3689404 3689405 MRA_0101 MRA_0102     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 3689405 3689406 MRA_0102 MRA_0103   fadD10 TRUE 0.955 5.000 0.444 NA   NA
 3689406 3689407 MRA_0103 MRA_0104 fadD10   TRUE 0.980 5.000 0.800 1.000   NA
 3689407 3689408 MRA_0104 MRA_0105   nrp1 TRUE 0.968 -18.000 0.364 NA   NA
 3689408 3689409 MRA_0105 MRA_0106 nrp1 nrp2 FALSE 0.215 28.000 0.000 NA   NA
 3689409 3689410 MRA_0106 MRA_0107 nrp2   FALSE 0.022 175.000 0.000 NA   NA
 3689415 3689416 MRA_0112 MRA_0114 ctpI2   FALSE 0.004 354.000 0.000 NA   NA
 3689417 3689418 MRA_0115 MRA_0116     FALSE 0.095 148.000 0.091 NA   NA
 3689418 3689419 MRA_0116 MRA_0117     FALSE 0.032 181.000 0.000 1.000   NA
 3689419 3689420 MRA_0117 MRA_0118   gca FALSE 0.002 282.000 0.000 1.000 N NA
 3689420 3689421 MRA_0118 MRA_0119 gca gmhA FALSE 0.054 74.000 0.000 1.000 N NA
 3689421 3689422 MRA_0119 MRA_0120 gmhA gmhB FALSE 0.089 32.000 0.000 1.000 N NA
 3689422 3689423 MRA_0120 MRA_0121 gmhB hddA TRUE 0.893 0.000 0.000 1.000   NA
 3689423 3689424 MRA_0121 MRA_0122 hddA   FALSE 0.005 292.000 0.000 NA   NA
 3689429 3689430 MRA_0127 MRA_0128 fusA2   FALSE 0.089 137.000 0.009 1.000   NA
 3689431 3689432 MRA_0129 MRA_0130     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689432 3689433 MRA_0130 MRA_0131     FALSE 0.005 309.000 0.000 NA   NA
 3689433 3689434 MRA_0131 MRA_0132   pepA FALSE 0.031 152.000 0.000 NA   NA
 3689434 3689435 MRA_0132 MRA_0133 pepA treS FALSE 0.070 109.000 0.013 1.000 N NA
 3689435 3689436 MRA_0133 MRA_0134 treS   FALSE 0.576 103.000 0.071 NA Y NA
 3689436 3689437 MRA_0134 MRA_0135     FALSE 0.366 68.000 0.136 NA   NA
 3689440 3689441 MRA_0138 MRA_0139 fadE1 fgd2 FALSE 0.507 42.000 0.286 NA N NA
 3689442 3689443 MRA_0140 MRA_0141   ephF FALSE 0.008 297.000 0.000 1.000   NA
 3689447 3689448 MRA_0145 MRA_0146     TRUE 0.983 1.000 0.538 NA   NA
 3689448 3689449 MRA_0146 MRA_0147     FALSE 0.266 61.000 0.034 NA   NA
 3689453 3689454 MRA_0151 MRA_0152     FALSE 0.542 89.000 0.571 NA N NA
 3689454 3689455 MRA_0152 MRA_0153     TRUE 0.918 43.000 0.556 NA Y NA
 3689455 3689456 MRA_0153 MRA_0154     FALSE 0.452 95.000 0.444 NA N NA
 3689456 3689457 MRA_0154 MRA_0155     TRUE 0.753 75.000 0.875 1.000 N NA
 3689457 3689458 MRA_0155 MRA_0156     TRUE 0.974 7.000 0.700 0.082 N NA
 3689459 3689460 MRA_0157 MRA_0158     FALSE 0.002 592.000 0.000 NA   NA
 3689460 3689461 MRA_0158 MRA_0159     FALSE 0.437 10.000 0.000 NA   NA
 3689461 3689462 MRA_0159 MRA_0161   ptbB FALSE 0.008 259.000 0.000 NA   NA
 3689462 3689463 MRA_0161 MRA_0162 ptbB fadE2 TRUE 0.939 2.000 0.226 1.000 N NA
 3689464 3689465 MRA_0163 MRA_0164 pntAa pntAb TRUE 0.997 1.000 0.829 0.001   NA
 3689465 3689466 MRA_0164 MRA_0165 pntAb pntB TRUE 0.996 -3.000 0.321 0.001   NA
 3689466 3689467 MRA_0165 MRA_0166 pntB   FALSE 0.002 306.000 0.000 1.000 N NA
 3689468 3689469 MRA_0167 MRA_0168     FALSE 0.099 92.000 0.000 NA   NA
 3689472 3689473 MRA_0171 MRA_0172     FALSE 0.256 54.000 0.020 NA   NA
 3689475 3689476 MRA_0174 MRA_0175 fadD5 yrbE1A FALSE 0.121 204.000 0.000 NA Y NA
 3689476 3689477 MRA_0175 MRA_0176 yrbE1A yrbE1B TRUE 0.997 2.000 1.000 NA Y NA
 3689477 3689478 MRA_0176 MRA_0177 yrbE1B mce1A TRUE 0.994 5.000 1.000 NA Y NA
 3689478 3689479 MRA_0177 MRA_0178 mce1A mce1B TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.010 Y NA
 3689479 3689480 MRA_0178 MRA_0179 mce1B mce1C TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.010 Y NA
 3689480 3689481 MRA_0179 MRA_0180 mce1C mce1D TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.010 Y NA
 3689481 3689482 MRA_0180 MRA_0181 mce1D lprK TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.010 Y NA
 3689482 3689483 MRA_0181 MRA_0182 lprK mce1F TRUE 0.999 -6.000 0.800 0.010 Y NA
 3689483 3689484 MRA_0182 MRA_0183 mce1F   TRUE 0.623 36.000 0.286 NA   NA
 3689484 3689485 MRA_0183 MRA_0184     TRUE 0.984 3.000 0.750 NA   NA
 3689485 3689486 MRA_0184 MRA_0185     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3689486 3689487 MRA_0185 MRA_0186     TRUE 0.988 -33.000 1.000 NA   NA
 3689488 3689489 MRA_0187 MRA_0188 lprO   FALSE 0.524 80.000 0.333 NA   NA
 3689489 3689490 MRA_0188 MRA_0189     FALSE 0.219 27.000 0.000 NA   NA
 3689490 3689491 MRA_0189 MRA_0190   sigG FALSE 0.273 17.000 0.000 NA   NA
 3689492 3689493 MRA_0191 MRA_0192     FALSE 0.387 42.000 0.068 NA   NA
 3689493 3689494 MRA_0192 MRA_0193     TRUE 0.991 -3.000 0.600 NA   NA
 3689494 3689495 MRA_0193 MRA_0194   bglS TRUE 0.638 45.000 0.273 1.000   NA
 3689495 3689496 MRA_0194 MRA_0195 bglS   FALSE 0.006 361.000 0.000 1.000   NA
 3689496 3689497 MRA_0195 MRA_0196     FALSE 0.058 119.000 0.000 NA   NA
 3689499 3689500 MRA_0198 MRA_0199     FALSE 0.161 128.000 0.125 NA   NA
 3689500 3689501 MRA_0199 MRA_0200     TRUE 0.695 34.000 0.375 NA   NA
 3689503 3689504 MRA_0202 MRA_0203     FALSE 0.001 437.000 0.000 1.000 N NA
 3689504 3689505 MRA_0203 MRA_0204     FALSE 0.308 113.000 0.000 0.059   NA
 3689505 3689506 MRA_0204 MRA_0205     TRUE 0.976 0.000 0.276 1.000   NA
 3689508 3689509 MRA_0207 MRA_0208     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3689510 3689511 MRA_0209 MRA_0210   mmpL11 TRUE 0.994 -3.000 0.750 1.000   NA
 3689515 3689516 MRA_0214 MRA_0215 mmpL3   FALSE 0.454 66.000 0.217 NA   NA
 3689516 3689517 MRA_0215 MRA_0216   trmB TRUE 0.867 3.000 0.040 NA   NA
 3689518 3689519 MRA_0217 MRA_0218     TRUE 0.990 -3.000 0.529 NA   NA
 3689519 3689520 MRA_0218 MRA_0219   pckA FALSE 0.036 184.000 0.026 NA   NA
 3689521 3689522 MRA_0220 MRA_0221 nadR   TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.077 N NA
 3689527 3689528 MRA_0226 MRA_0227     TRUE 0.959 2.000 0.273 NA   NA
 3689528 3689529 MRA_0227 MRA_0228   lipC TRUE 0.773 10.000 0.182 NA   NA
 3689529 3689530 MRA_0228 MRA_0229 lipC   TRUE 0.864 44.000 1.000 NA   NA
 3689530 3689531 MRA_0229 MRA_0230   echA1 TRUE 0.680 31.000 0.333 NA   NA
 3689532 3689533 MRA_0231 MRA_0232     FALSE 0.294 99.000 0.104 1.000   NA
 3689535 3689536 MRA_0234 MRA_0235     TRUE 0.831 10.000 0.265 NA   NA
 3689538 3689539 MRA_0237 MRA_0238   php TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689540 3689541 MRA_0239 MRA_0240 fadE4   FALSE 0.177 135.000 0.250 1.000 N NA
 3689541 3689542 MRA_0240 MRA_0241   nrdB TRUE 0.982 -3.000 0.357 1.000 N NA
 3689543 3689544 MRA_0242 MRA_0243 gabD1   FALSE 0.224 26.000 0.000 NA   NA
 3689544 3689545 MRA_0243 MRA_0244     FALSE 0.368 35.000 0.053 NA   NA
 3689545 3689546 MRA_0244 MRA_0245     TRUE 0.749 47.000 0.526 NA   NA
 3689547 3689548 MRA_0246 MRA_0247 lpqI   FALSE 0.324 76.000 0.185 1.000 N NA
 3689548 3689549 MRA_0247 MRA_0248     FALSE 0.146 62.000 0.000 NA   NA
 3689549 3689550 MRA_0248 MRA_0249     FALSE 0.501 8.000 0.000 NA   NA
 3689551 3689552 MRA_0250 MRA_0251   fabG TRUE 0.981 11.000 0.412 0.081 Y NA
 3689555 3689556 MRA_0254 MRA_0255     FALSE 0.005 316.000 0.000 NA   NA
 3689557 3689558 MRA_0256 MRA_0257   sdhA TRUE 0.999 1.000 0.826 0.004 Y NA
 3689558 3689559 MRA_0257 MRA_0258 sdhA   TRUE 0.863 31.000 0.860 NA   NA
 3689559 3689560 MRA_0258 MRA_0259     FALSE 0.358 80.000 0.171 NA   NA
 3689560 3689561 MRA_0259 MRA_0260   hsp FALSE 0.100 145.000 0.091 NA   NA
 3689562 3689563 MRA_0261 MRA_0262 nirB nirD TRUE 0.875 26.000 0.286 0.001 N NA
 3689564 3689565 MRA_0263 MRA_0264 cobU cobQ1 TRUE 0.818 25.000 0.031 1.000 Y NA
 3689565 3689566 MRA_0264 MRA_0265 cobQ1   FALSE 0.024 19.000 0.000 NA N NA
 3689568 3689569 MRA_0266 MRA_0267     FALSE 0.521 25.000 0.071 1.000   NA
 3689569 3689570 MRA_0267 MRA_0268     TRUE 0.976 -3.000 0.173 1.000   NA
 3689570 3689571 MRA_0268 MRA_0269   narK3 FALSE 0.007 100.000 0.000 NA N NA
 3689571 3689572 MRA_0269 MRA_0270 narK3 aac FALSE 0.038 141.000 0.000 NA   NA
 3689572 3689573 MRA_0270 MRA_0271 aac   TRUE 0.715 10.000 0.101 NA   NA
 3689573 3689574 MRA_0271 MRA_0272     TRUE 0.947 17.000 0.551 NA Y NA
 3689574 3689575 MRA_0272 MRA_0273     FALSE 0.141 96.000 0.050 1.000 N NA
 3689575 3689576 MRA_0273 MRA_0274   oplA FALSE 0.112 22.000 0.000 1.000 N NA
 3689578 3689579 MRA_0276 MRA_0277     FALSE 0.012 65.000 0.000 NA N NA
 3689581 3689582 MRA_0279 MRA_0280 fadE6   FALSE 0.063 114.000 0.000 NA   NA
 3689582 3689583 MRA_0280 MRA_0281     TRUE 0.994 -3.000 0.833 NA   NA
 3689587 3689588 MRA_0285 MRA_0286     FALSE 0.233 24.000 0.000 NA   NA
 3689588 3689589 MRA_0286 MRA_0287     FALSE 0.096 95.000 0.000 NA   NA
 3689589 3689590 MRA_0287 MRA_0288     FALSE 0.008 250.000 0.000 NA   NA
 3689591 3689592 MRA_0289 MRA_0290     TRUE 0.796 24.000 0.667 NA N NA
 3689592 3689593 MRA_0290 MRA_0291     FALSE 0.011 224.000 0.000 NA   NA
 3689593 3689594 MRA_0291 MRA_0292     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3689594 3689595 MRA_0292 MRA_0293     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 3689595 3689596 MRA_0293 MRA_0294     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 3689596 3689597 MRA_0294 MRA_0295     TRUE 0.720 51.000 0.500 NA   NA
 3689597 3689598 MRA_0295 MRA_0296     FALSE 0.174 49.000 0.000 NA   NA
 3689598 3689599 MRA_0296 MRA_0297   esxH FALSE 0.208 30.000 0.000 NA   NA
 3689599 3689600 MRA_0297 MRA_0298 esxH   FALSE 0.396 11.000 0.000 NA   NA
 3689600 3689601 MRA_0298 MRA_0299     TRUE 0.835 47.000 0.818 NA   NA
 3689601 3689602 MRA_0299 MRA_0300   mycP3 TRUE 0.991 -3.000 0.556 NA   NA
 3689602 3689603 MRA_0300 MRA_0301 mycP3   TRUE 0.991 -3.000 0.556 NA   NA
 3689606 3689607 MRA_0304 MRA_0305     TRUE 0.727 10.000 0.118 NA   NA
 3689608 3689609 MRA_0306 MRA_0307     FALSE 0.058 143.000 0.000 1.000   NA
 3689609 3689610 MRA_0307 MRA_0308     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689610 3689611 MRA_0308 MRA_0309     FALSE 0.177 48.000 0.000 NA   NA
 3689611 3689612 MRA_0309 MRA_0310     TRUE 0.988 -3.000 0.444 NA   NA
 3689612 3689613 MRA_0310 MRA_0311     FALSE 0.042 136.000 0.000 NA   NA
 3689613 3689614 MRA_0311 MRA_0312     TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3689615 3689616 MRA_0313 MRA_0314     TRUE 0.963 -451.000 0.000 NA Y NA
 3689619 3689620 MRA_0317 MRA_0318     FALSE 0.198 102.000 0.067 NA   NA
 3689622 3689623 MRA_0320 MRA_0321     FALSE 0.233 155.000 0.333 1.000   NA
 3689623 3689624 MRA_0321 MRA_0322     FALSE 0.129 72.000 0.000 NA   NA
 3689626 3689627 MRA_0324 MRA_0325     FALSE 0.537 49.000 0.286 1.000 N NA
 3689628 3689629 MRA_0326 MRA_t04 glpQ2   FALSE 0.008 261.000 0.000 NA   NA
 3689629 3689630 MRA_t04 MRA_0327     FALSE 0.203 31.000 0.000 NA   NA
 3689631 3689632 MRA_0328 MRA_0329 pcp   FALSE 0.129 72.000 0.000 NA   NA
 3689632 3689633 MRA_0329 MRA_0330   dcd FALSE 0.276 32.000 0.007 NA   NA
 3689633 3689634 MRA_0330 MRA_0331 dcd udgA FALSE 0.032 106.000 0.000 1.000 N NA
 3689636 3689637 MRA_0333 MRA_0334     FALSE 0.541 7.000 0.000 NA   NA
 3689637 3689638 MRA_0334 MRA_0335     FALSE 0.437 10.000 0.000 NA   NA
 3689641 3689642 MRA_0338 MRA_0339     FALSE 0.315 27.000 0.000 1.000   NA
 3689643 3689644 MRA_0340 MRA_0341     FALSE 0.125 75.000 0.000 NA   NA
 3689644 3689645 MRA_0341 MRA_0342     TRUE 0.721 27.000 0.368 NA   NA
 3689645 3689646 MRA_0342 MRA_0343   rmlA TRUE 0.631 30.000 0.273 NA   NA
 3689649 3689650 MRA_0346 MRA_0347 aspC   FALSE 0.226 31.000 0.023 1.000 N NA
 3689650 3689651 MRA_0347 MRA_0348     FALSE 0.116 109.000 0.057 1.000 N NA
 3689652 3689653 MRA_0349 MRA_0350   iniB FALSE 0.110 189.000 0.286 NA   NA
 3689653 3689654 MRA_0350 MRA_0351 iniB iniA TRUE 0.784 37.000 0.500 1.000   NA
 3689654 3689655 MRA_0351 MRA_0352 iniA iniC TRUE 0.997 -3.000 0.583 0.006   NA
 3689659 3689660 MRA_0356 MRA_0357     TRUE 0.750 3.000 0.000 NA   NA
 3689660 3689661 MRA_0357 MRA_0358     TRUE 0.750 3.000 0.000 NA   NA
 3689661 3689662 MRA_0358 MRA_0359   dnaK FALSE 0.011 227.000 0.000 NA   NA
 3689662 3689663 MRA_0359 MRA_0360 dnaK grpE TRUE 0.997 -3.000 0.074 0.005 Y NA
 3689663 3689664 MRA_0360 MRA_0361 grpE dnaJ1 TRUE 0.921 36.000 0.068 0.005 Y NA
 3689664 3689665 MRA_0361 MRA_0362 dnaJ1 hspR TRUE 0.911 0.000 0.074 1.000 N NA
 3689666 3689667 MRA_0363 MRA_0364     FALSE 0.122 77.000 0.000 NA   NA
 3689667 3689668 MRA_0364 MRA_0365     FALSE 0.032 151.000 0.000 NA   NA
 3689668 3689669 MRA_0365 MRA_0366   purA TRUE 0.947 -3.000 0.052 NA   NA
 3689670 3689671 MRA_0367 MRA_0368     FALSE 0.542 11.000 0.020 NA   NA
 3689673 3689674 MRA_0370 MRA_0371   mgtE FALSE 0.011 222.000 0.000 NA   NA
 3689677 3689678 MRA_0374 MRA_0375     TRUE 0.645 25.000 0.000 0.072   NA
 3689680 3689681 MRA_0377 MRA_0378     TRUE 0.877 6.000 0.208 NA   NA
 3689681 3689682 MRA_0378 MRA_0379     FALSE 0.359 101.000 0.250 NA   NA
 3689682 3689683 MRA_0379 MRA_0380     TRUE 0.973 -3.000 0.200 NA   NA
 3689683 3689684 MRA_0380 MRA_0381     TRUE 0.984 -3.000 0.333 NA   NA
 3689684 3689685 MRA_0381 MRA_0382     TRUE 0.838 19.000 0.750 NA N NA
 3689685 3689686 MRA_0382 MRA_0383     TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.001 Y NA
 3689686 3689687 MRA_0383 MRA_0384     TRUE 0.992 15.000 0.909 0.001 Y NA
 3689687 3689688 MRA_0384 MRA_0385     FALSE 0.343 76.000 0.250 NA N NA
 3689689 3689690 MRA_0386 MRA_0386A     FALSE 0.008 251.000 0.000 NA   NA
 3689690 3689691 MRA_0386A MRA_0387   secE2 FALSE 0.058 119.000 0.000 NA   NA
 3689692 3689693 MRA_0388 MRA_0389     TRUE 0.895 -15.000 0.055 NA   NA
 3689693 3689694 MRA_0389 MRA_0390   pyrE FALSE 0.368 18.000 0.012 NA   NA
 3689694 3689695 MRA_0390 MRA_0391 pyrE   FALSE 0.164 81.000 0.006 NA   NA
 3689695 3689696 MRA_0391 MRA_0392   clpB FALSE 0.157 86.000 0.009 NA   NA
 3689697 3689698 MRA_0393 MRA_0394     FALSE 0.034 104.000 0.000 1.000 N NA
 3689700 3689701 MRA_0396 MRA_0397 purT   TRUE 0.795 -3.000 0.019 NA N NA
 3689701 3689702 MRA_0397 MRA_0398   metZ TRUE 0.920 -3.000 0.092 NA N NA
 3689706 3689707 MRA_0401A MRA_0402     FALSE 0.591 6.000 0.000 NA   NA
 3689708 3689709 MRA_0403 MRA_0404     FALSE 0.003 426.000 0.000 NA   NA
 3689709 3689710 MRA_0404 MRA_0405   lpqK TRUE 0.875 7.000 0.250 NA   NA
 3689710 3689711 MRA_0405 MRA_0406 lpqK fadE7 FALSE 0.234 10.000 0.000 1.000 N NA
 3689713 3689714 MRA_0408 MRA_0409 mmpL1 mmpS1 TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3689715 3689716 MRA_0410 MRA_0411 fadD30 pks6 TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3689718 3689719 MRA_0413 MRA_0414 fgd1 pta TRUE 0.913 -7.000 0.021 1.000   NA
 3689719 3689720 MRA_0414 MRA_0415 pta ackA TRUE 0.958 -7.000 0.185 1.000   NA
 3689721 3689722 MRA_0416 MRA_0417 pknG glnH TRUE 0.997 0.000 0.622 1.000 Y NA
 3689722 3689723 MRA_0417 MRA_0418 glnH   TRUE 0.992 0.000 0.895 NA   NA
 3689726 3689727 MRA_0421 MRA_0422 thiO thiS TRUE 0.990 -3.000 0.625 1.000 N NA
 3689727 3689728 MRA_0422 MRA_0423 thiS thiG TRUE 0.987 -7.000 0.104 1.000 Y NA
 3689728 3689729 MRA_0423 MRA_0424 thiG lpqL FALSE 0.005 372.000 0.000 1.000   NA
 3689729 3689730 MRA_0424 MRA_0425 lpqL lpqM FALSE 0.458 88.000 0.000 0.032   NA
 3689731 3689732 MRA_0426 MRA_0427     FALSE 0.027 161.000 0.000 NA   NA
 3689732 3689733 MRA_0427 MRA_0428   thiD TRUE 0.950 -3.000 0.059 NA   NA
 3689733 3689734 MRA_0428 MRA_0429 thiD thiC TRUE 0.917 27.000 0.015 0.006 Y NA
 3689734 3689735 MRA_0429 MRA_0429A thiC   FALSE 0.031 152.000 0.000 NA   NA
 3689735 3689736 MRA_0429A MRA_0430   ctpH TRUE 0.726 50.000 0.500 NA   NA
 3689736 3689737 MRA_0430 MRA_0431 ctpH   FALSE 0.538 52.000 0.250 NA   NA
 3689737 3689738 MRA_0431 MRA_0432   xthA FALSE 0.025 201.000 0.015 NA   NA
 3689738 3689739 MRA_0432 MRA_0433 xthA   TRUE 0.901 3.000 0.088 NA   NA
 3689739 3689740 MRA_0433 MRA_0434   def TRUE 0.984 0.000 0.488 NA   NA
 3689741 3689742 MRA_0435 MRA_0436     FALSE 0.516 32.000 0.176 NA   NA
 3689742 3689743 MRA_0436 MRA_0437   sodC TRUE 0.759 33.000 0.500 NA   NA
 3689743 3689744 MRA_0437 MRA_0438 sodC   TRUE 0.943 2.000 0.128 1.000   NA
 3689744 3689745 MRA_0438 MRA_0439     FALSE 0.290 60.000 0.010 1.000   NA
 3689746 3689747 MRA_0440 MRA_0441   pssA TRUE 0.900 -3.000 0.025 1.000 N NA
 3689747 3689748 MRA_0441 MRA_0442 pssA psd TRUE 0.997 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 3689748 3689749 MRA_0442 MRA_0443 psd moeA2 FALSE 0.156 61.000 0.018 1.000 N NA
 3689749 3689750 MRA_0443 MRA_0444 moeA2   TRUE 0.658 19.000 0.188 1.000   NA
 3689752 3689753 MRA_0446 MRA_0447     FALSE 0.219 27.000 0.000 NA   NA
 3689755 3689756 MRA_0449 MRA_0450   sigK FALSE 0.413 44.000 0.091 NA   NA
 3689756 3689757 MRA_0450 MRA_0451 sigK   FALSE 0.424 49.000 0.065 1.000   NA
 3689757 3689758 MRA_0451 MRA_0452   ufaA1 TRUE 0.772 9.000 0.081 1.000   NA
 3689758 3689759 MRA_0452 MRA_0453 ufaA1   TRUE 0.953 -3.000 0.067 NA   NA
 3689759 3689760 MRA_0453 MRA_0454     TRUE 0.774 60.000 0.722 NA   NA
 3689760 3689761 MRA_0454 MRA_0455   mmpL4 FALSE 0.346 40.000 0.007 1.000   NA
 3689761 3689762 MRA_0455 MRA_0456 mmpL4 mmpS4 TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 3689763 3689764 MRA_0457 MRA_0458     FALSE 0.004 343.000 0.000 NA   NA
 3689765 3689766 MRA_0459 MRA_0460     FALSE 0.108 85.000 0.000 NA   NA
 3689766 3689767 MRA_0460 MRA_0461   echA2 FALSE 0.254 68.000 0.039 NA   NA
 3689767 3689768 MRA_0461 MRA_0462 echA2   FALSE 0.011 273.000 0.000 1.000   NA
 3689768 3689769 MRA_0462 MRA_0463     FALSE 0.017 229.000 0.000 1.000   NA
 3689770 3689771 MRA_0464 MRA_0465     TRUE 0.903 0.000 0.021 NA   NA
 3689771 3689772 MRA_0465 MRA_0466     FALSE 0.281 60.000 0.042 NA   NA
 3689772 3689773 MRA_0466 MRA_0467     TRUE 0.869 38.000 1.000 NA   NA
 3689773 3689774 MRA_0467 MRA_0468   lpd FALSE 0.228 64.000 0.017 NA   NA
 3689774 3689775 MRA_0468 MRA_0469 lpd   TRUE 0.664 8.000 0.028 NA   NA
 3689776 3689777 MRA_0470 MRA_0471     TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 3689778 3689779 MRA_0472 MRA_0473   icl FALSE 0.003 275.000 0.000 1.000 N NA
 3689779 3689780 MRA_0473 MRA_0474 icl fadB2 FALSE 0.147 82.000 0.036 1.000 N NA
 3689780 3689781 MRA_0474 MRA_0475 fadB2 umaA FALSE 0.112 133.000 0.130 1.000 N NA
 3689782 3689783 MRA_0476 MRA_0477 pcaA   FALSE 0.058 143.000 0.000 1.000   NA
 3689783 3689784 MRA_0477 MRA_0478     TRUE 0.740 -69.000 0.000 NA   NA
 3689784 3689785 MRA_0478 MRA_0479     FALSE 0.437 10.000 0.000 NA   NA
 3689786 3689787 MRA_0480 MRA_0481     FALSE 0.212 87.000 0.047 NA   NA
 3689787 3689788 MRA_0481 MRA_0482   hbhA FALSE 0.024 354.000 0.282 NA   NA
 3689788 3689789 MRA_0482 MRA_0483 hbhA   FALSE 0.310 112.000 0.270 NA   NA
 3689789 3689790 MRA_0483 MRA_0484     TRUE 0.877 5.000 0.143 NA   NA
 3689790 3689791 MRA_0484 MRA_0485   deoC TRUE 0.911 0.000 0.030 NA   NA
 3689792 3689793 MRA_0486 MRA_0487     TRUE 0.959 -3.000 0.091 NA   NA
 3689793 3689794 MRA_0487 MRA_0488     FALSE 0.048 182.000 0.061 NA   NA
 3689795 3689796 MRA_0489 MRA_0490 murB lprQ FALSE 0.265 62.000 0.036 NA   NA
 3689798 3689799 MRA_0492 MRA_0493     FALSE 0.233 48.000 0.082 NA N NA
 3689799 3689800 MRA_0493 MRA_0494     TRUE 0.991 -3.000 0.541 NA   NA
 3689800 3689801 MRA_0494 MRA_0495     FALSE 0.004 326.000 0.000 NA   NA
 3689801 3689802 MRA_0495 MRA_0496   gpm1 FALSE 0.046 157.000 0.000 1.000   NA
 3689802 3689803 MRA_0496 MRA_0497 gpm1 senX3 FALSE 0.075 174.000 0.196 1.000 N NA
 3689803 3689804 MRA_0497 MRA_0498 senX3 regX3 FALSE 0.319 228.000 0.437 1.000 Y NA
 3689805 3689806 MRA_0499 MRA_0499A     TRUE 0.982 -3.000 0.300 NA   NA
 3689806 3689807 MRA_0499A MRA_0500     TRUE 0.973 -3.000 0.200 NA   NA
 3689810 3689811 MRA_0503 MRA_0504     TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 3689811 3689812 MRA_0504 MRA_0505     TRUE 0.592 16.000 0.127 NA   NA
 3689812 3689813 MRA_0505 MRA_0506     FALSE 0.540 16.000 0.076 NA   NA
 3689813 3689814 MRA_0506 MRA_0507   proC FALSE 0.586 25.000 0.143 1.000   NA
 3689814 3689815 MRA_0507 MRA_0508 proC   FALSE 0.181 141.000 0.186 1.000   NA
 3689815 3689816 MRA_0508 MRA_0509   galE2 FALSE 0.008 307.000 0.000 1.000   NA
 3689816 3689817 MRA_0509 MRA_0510 galE2   TRUE 0.956 7.000 0.796 1.000 N NA
 3689818 3689819 MRA_0511 MRA_0512 cmaA2   TRUE 0.786 23.000 0.400 1.000   NA
 3689819 3689820 MRA_0512 MRA_0513   serB1 FALSE 0.115 162.000 0.145 1.000   NA
 3689821 3689822 MRA_0514 MRA_0515 mmpS2 mmpL2 TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3689822 3689823 MRA_0515 MRA_0515A mmpL2   TRUE 0.862 -7.000 0.007 NA   NA
 3689823 3689824 MRA_0515A MRA_0516   hemA FALSE 0.253 50.000 0.012 NA   NA
 3689824 3689825 MRA_0516 MRA_0517 hemA hemC TRUE 0.982 10.000 0.178 0.002 Y NA
 3689825 3689826 MRA_0517 MRA_0518 hemC hemD TRUE 0.926 33.000 0.044 0.002 Y NA
 3689826 3689827 MRA_0518 MRA_0519 hemD hemB TRUE 0.939 86.000 0.429 0.002 Y NA
 3689827 3689828 MRA_0519 MRA_0520 hemB   FALSE 0.527 13.000 0.039 NA   NA
 3689828 3689829 MRA_0520 MRA_0521     TRUE 0.986 -3.000 0.389 NA   NA
 3689829 3689830 MRA_0521 MRA_0522     FALSE 0.083 103.000 0.000 NA   NA
 3689832 3689833 MRA_0524 MRA_0525     FALSE 0.251 132.000 0.333 1.000 N NA
 3689835 3689836 MRA_0527 MRA_0528     TRUE 0.803 -7.000 0.000 NA   NA
 3689836 3689837 MRA_0528 MRA_0529   gabP FALSE 0.044 135.000 0.000 NA   NA
 3689839 3689840 MRA_0531 MRA_0532 hemL   TRUE 0.936 0.000 0.204 NA N NA
 3689840 3689841 MRA_0532 MRA_0533     FALSE 0.248 15.000 0.035 NA N NA
 3689841 3689842 MRA_0533 MRA_0534   ccdA TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3689842 3689843 MRA_0534 MRA_0535 ccdA   TRUE 0.810 33.000 0.131 NA Y NA
 3689843 3689844 MRA_0535 MRA_0536   ccsA TRUE 0.991 -3.000 0.082 NA Y NA
 3689844 3689845 MRA_0536 MRA_0537 ccsA   FALSE 0.590 42.000 0.308 1.000 N NA
 3689845 3689846 MRA_0537 MRA_0538     FALSE 0.014 205.000 0.000 NA   NA
 3689846 3689847 MRA_0538 MRA_0539     FALSE 0.034 147.000 0.000 NA   NA
 3689848 3689849 MRA_0540 MRA_0541 fabH menA FALSE 0.105 82.000 0.011 1.000 N NA
 3689850 3689851 MRA_0542 MRA_0543 pnp galE3 TRUE 0.866 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3689853 3689854 MRA_0545 MRA_0546     FALSE 0.362 33.000 0.048 NA   NA
 3689854 3689855 MRA_0546 MRA_0547     TRUE 0.961 -3.000 0.109 NA   NA
 3689856 3689857 MRA_0548 MRA_0549   menE FALSE 0.467 12.000 0.008 NA   NA
 3689857 3689858 MRA_0549 MRA_0550 menE   FALSE 0.227 69.000 0.024 NA   NA
 3689858 3689859 MRA_0550 MRA_0551     FALSE 0.150 60.000 0.000 NA   NA
 3689859 3689860 MRA_0551 MRA_0552   pitA TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689860 3689861 MRA_0552 MRA_0553 pitA   FALSE 0.198 120.000 0.167 NA   NA
 3689861 3689862 MRA_0553 MRA_0554     FALSE 0.315 63.000 0.069 NA   NA
 3689862 3689863 MRA_0554 MRA_0555   menB TRUE 0.874 -27.000 0.008 1.000   NA
 3689863 3689864 MRA_0555 MRA_0556 menB   FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 3689864 3689865 MRA_0556 MRA_0557     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689865 3689866 MRA_0557 MRA_0558   fadD8 FALSE 0.017 192.000 0.000 NA   NA
 3689867 3689868 MRA_0559 MRA_0560   menC TRUE 0.954 -3.000 0.028 1.000   NA
 3689868 3689869 MRA_0560 MRA_0561 menC bpoC TRUE 0.985 -3.000 0.038 0.070   NA
 3689869 3689870 MRA_0561 MRA_0562 bpoC menD FALSE 0.375 43.000 0.022 1.000   NA
 3689870 3689871 MRA_0562 MRA_0563 menD   TRUE 0.948 -3.000 0.055 NA   NA
 3689871 3689872 MRA_0563 MRA_0564   pimB FALSE 0.516 62.000 0.259 NA   NA
 3689872 3689873 MRA_0564 MRA_0565 pimB ubiE FALSE 0.270 17.000 0.013 1.000 N NA
 3689874 3689875 MRA_0566 MRA_0567     FALSE 0.562 34.000 0.222 NA   NA
 3689875 3689876 MRA_0567 MRA_0568     FALSE 0.272 25.000 0.029 1.000 N NA
 3689877 3689878 MRA_0569 MRA_0570 grcC1 htpX FALSE 0.120 101.000 0.042 1.000 N NA
 3689879 3689880 MRA_0571 MRA_0572 gpsA1   FALSE 0.317 61.000 0.133 1.000 N NA
 3689880 3689881 MRA_0572 MRA_0573     FALSE 0.168 78.000 0.005 NA   NA
 3689882 3689883 MRA_t05 MRA_0574     FALSE 0.047 132.000 0.000 NA   NA
 3689883 3689884 MRA_0574 MRA_0575   cyp135B1 FALSE 0.028 110.000 0.000 1.000 N NA
 3689884 3689885 MRA_0575 MRA_0576 cyp135B1   FALSE 0.044 135.000 0.000 NA   NA
 3689885 3689886 MRA_0576 MRA_0577   nrdZ TRUE 0.664 26.000 0.286 NA   NA
 3689887 3689888 MRA_0578 MRA_0579     FALSE 0.011 224.000 0.000 NA   NA
 3689888 3689889 MRA_0579 MRA_0580     FALSE 0.002 468.000 0.000 NA   NA
 3689889 3689890 MRA_0580 MRA_0581     FALSE 0.054 10.000 0.000 NA N NA
 3689890 3689891 MRA_0581 MRA_0582     FALSE 0.001 185.000 0.000 NA N NA
 3689892 3689893 MRA_0583 MRA_0584     FALSE 0.584 14.000 0.080 NA   NA
 3689898 3689899 MRA_0589 MRA_0590   lpqN TRUE 0.734 -186.000 0.000 NA   NA
 3689902 3689903 MRA_0593 MRA_0594   yrbE2A TRUE 0.794 -3.000 0.019 NA N NA
 3689903 3689904 MRA_0594 MRA_0595 yrbE2A yrbE2B TRUE 0.991 2.000 0.333 NA Y NA
 3689904 3689905 MRA_0595 MRA_0596 yrbE2B mce2A TRUE 0.992 6.000 1.000 NA Y NA
 3689905 3689906 MRA_0596 MRA_0597 mce2A mce2B TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.009 Y NA
 3689906 3689907 MRA_0597 MRA_0598 mce2B   TRUE 0.743 -51.000 0.000 NA   NA
 3689907 3689908 MRA_0598 MRA_0599   mce2C TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689908 3689909 MRA_0599 MRA_0600 mce2C mce2D TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.009 Y NA
 3689909 3689910 MRA_0600 MRA_0601 mce2D lprL TRUE 0.998 -3.000 0.333 0.009 Y NA
 3689910 3689911 MRA_0601 MRA_0602 lprL mce2F TRUE 0.996 5.000 0.500 0.009 Y NA
 3689912 3689913 MRA_0603 MRA_0604     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689913 3689914 MRA_0604 MRA_0605     FALSE 0.019 183.000 0.000 NA   NA
 3689914 3689915 MRA_0605 MRA_0606     FALSE 0.008 251.000 0.000 NA   NA
 3689915 3689916 MRA_0606 MRA_0607     TRUE 0.987 -3.000 0.400 NA   NA
 3689916 3689917 MRA_0607 MRA_0608     FALSE 0.081 104.000 0.000 NA   NA
 3689917 3689918 MRA_0608 MRA_0608A     FALSE 0.099 114.000 0.000 1.000   NA
 3689918 3689919 MRA_0608A MRA_0609   tcrA FALSE 0.272 44.000 0.000 1.000   NA
 3689920 3689921 MRA_0610 MRA_0611   lpqO FALSE 0.129 72.000 0.000 NA   NA
 3689921 3689922 MRA_0611 MRA_0612 lpqO   FALSE 0.012 217.000 0.000 NA   NA
 3689922 3689923 MRA_0612 MRA_0613     TRUE 0.784 2.000 0.000 NA   NA
 3689923 3689924 MRA_0613 MRA_0614     FALSE 0.160 54.000 0.000 NA   NA
 3689924 3689925 MRA_0614 MRA_0615     FALSE 0.183 45.000 0.000 NA   NA
 3689925 3689926 MRA_0615 MRA_0616     TRUE 0.980 -3.000 0.273 NA   NA
 3689926 3689927 MRA_0616 MRA_0617     TRUE 0.742 -57.000 0.000 NA   NA
 3689927 3689928 MRA_0617 MRA_0618     FALSE 0.006 283.000 0.000 NA   NA
 3689929 3689930 MRA_0619 MRA_0620     FALSE 0.164 52.000 0.000 NA   NA
 3689933 3689934 MRA_0623 MRA_0624     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689936 3689937 MRA_0626 MRA_0627   galTa FALSE 0.051 129.000 0.000 NA   NA
 3689937 3689938 MRA_0627 MRA_0628 galTa galTb TRUE 0.990 -3.000 0.000 0.001   NA
 3689938 3689939 MRA_0628 MRA_0629 galTb galK TRUE 0.997 -3.000 0.370 0.001   NA
 3689939 3689940 MRA_0629 MRA_0630 galK   FALSE 0.003 395.000 0.000 NA   NA
 3689940 3689941 MRA_0630 MRA_0631     FALSE 0.424 104.000 0.333 NA   NA
 3689941 3689942 MRA_0631 MRA_0632     FALSE 0.098 93.000 0.000 NA   NA
 3689942 3689943 MRA_0632 MRA_0633     TRUE 0.960 0.000 0.200 NA   NA
 3689945 3689946 MRA_0635 MRA_0636     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3689947 3689948 MRA_0637 MRA_0638   recD FALSE 0.098 93.000 0.000 NA   NA
 3689948 3689949 MRA_0638 MRA_0639 recD recB TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 3689949 3689950 MRA_0639 MRA_0640 recB recC TRUE 0.999 0.000 0.542 0.001 Y NA
 3689950 3689951 MRA_0640 MRA_0641 recC echA3 FALSE 0.003 277.000 0.000 1.000 N NA
 3689951 3689952 MRA_0641 MRA_0642 echA3   FALSE 0.360 49.000 0.067 NA   NA
 3689952 3689953 MRA_0642 MRA_0643     FALSE 0.044 154.000 0.006 NA   NA
 3689954 3689955 MRA_0644 MRA_t06     FALSE 0.049 130.000 0.000 NA   NA
 3689955 3689956 MRA_t06 MRA_t07     FALSE 0.194 37.000 0.000 NA   NA
 3689956 3689957 MRA_t07 MRA_0645   rpmG FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 3689957 3689958 MRA_0645 MRA_0646 rpmG   FALSE 0.368 51.000 0.079 NA   NA
 3689958 3689959 MRA_0646 MRA_0647     TRUE 0.992 0.000 0.818 NA   NA
 3689959 3689960 MRA_0647 MRA_0648     TRUE 0.734 86.000 0.818 NA   NA
 3689960 3689961 MRA_0648 MRA_t08     FALSE 0.015 199.000 0.000 NA   NA
 3689961 3689962 MRA_t08 MRA_0649   secE FALSE 0.038 141.000 0.000 NA   NA
 3689962 3689963 MRA_0649 MRA_0650 secE nusG FALSE 0.173 32.000 0.006 1.000 N NA
 3689963 3689964 MRA_0650 MRA_0651 nusG rplK TRUE 0.755 52.000 0.681 1.000 N NA
 3689964 3689965 MRA_0651 MRA_0652 rplK rplA TRUE 0.968 67.000 0.838 0.022 Y NA
 3689966 3689967 MRA_0653 MRA_0654 mmaA4 mmaA3 TRUE 0.933 65.000 0.286 0.004 Y NA
 3689967 3689968 MRA_0654 MRA_0655 mmaA3 mmaA2 TRUE 0.857 148.000 0.667 0.004 Y NA
 3689968 3689969 MRA_0655 MRA_0656 mmaA2 mmaA1 TRUE 0.732 167.000 0.400 0.004 Y NA
 3689969 3689970 MRA_0656 MRA_0657 mmaA1 lipG TRUE 0.710 47.000 0.444 NA   NA
 3689970 3689971 MRA_0657 MRA_0658 lipG   TRUE 0.765 12.000 0.243 NA   NA
 3689972 3689973 MRA_0659 MRA_0660   fabD2 TRUE 0.995 -3.000 0.857 1.000   NA
 3689973 3689974 MRA_0660 MRA_0661 fabD2   TRUE 0.893 0.000 0.000 1.000   NA
 3689974 3689975 MRA_0661 MRA_0662   rplJ FALSE 0.002 331.000 0.000 1.000 N NA
 3689975 3689976 MRA_0662 MRA_0663 rplJ rplL TRUE 0.980 37.000 0.884 0.017 Y NA
 3689978 3689979 MRA_0665 MRA_0666   mkl FALSE 0.307 12.000 0.038 NA N NA
 3689980 3689981 MRA_0667 MRA_0667A     FALSE 0.096 95.000 0.000 NA   NA
 3689981 3689982 MRA_0667A MRA_0668     FALSE 0.123 76.000 0.000 NA   NA
 3689982 3689983 MRA_0668 MRA_0669     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 3689983 3689984 MRA_0669 MRA_0670     TRUE 0.853 -13.000 0.000 1.000   NA
 3689984 3689985 MRA_0670 MRA_0671     FALSE 0.069 110.000 0.000 NA   NA
 3689985 3689986 MRA_0671 MRA_0672     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689987 3689988 MRA_0673 MRA_0673A atsD   FALSE 0.200 32.000 0.000 NA   NA
 3689988 3689989 MRA_0673A MRA_0674     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689989 3689990 MRA_0674 MRA_0675     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3689990 3689991 MRA_0675 MRA_0676   rpoB FALSE 0.002 498.000 0.000 NA   NA
 3689991 3689992 MRA_0676 MRA_0677 rpoB rpoC TRUE 0.984 45.000 0.851 0.001 Y NA
 3689993 3689994 MRA_0678 MRA_0679     TRUE 0.736 -136.000 0.000 NA   NA
 3689995 3689996 MRA_0680 MRA_0681 end lpqP FALSE 0.163 32.000 0.004 1.000 N NA
 3689996 3689997 MRA_0681 MRA_0682 lpqP fadE8 FALSE 0.256 60.000 0.071 1.000 N NA
 3689997 3689998 MRA_0682 MRA_0683 fadE8 echA4 TRUE 0.953 11.000 0.286 1.000 Y NA
 3689998 3689999 MRA_0683 MRA_0684 echA4   TRUE 0.932 3.000 0.292 NA N NA
 3689999 3690000 MRA_0684 MRA_0685   echA5 TRUE 0.915 -3.000 0.083 NA N NA
 3690001 3690002 MRA_0686 MRA_0687 mmpL5   TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3690004 3690005 MRA_0688 MRA_0689     TRUE 0.987 2.000 0.778 NA   NA
 3690006 3690007 MRA_0690 MRA_0691   rpsL FALSE 0.003 249.000 0.000 1.000 N NA
 3690007 3690008 MRA_0691 MRA_0692 rpsL rpsG TRUE 0.999 0.000 0.620 0.003 Y NA
 3690008 3690009 MRA_0692 MRA_0693 rpsG fusA1 TRUE 0.881 81.000 0.579 1.000 Y NA
 3690009 3690010 MRA_0693 MRA_0694 fusA1 tuf FALSE 0.579 231.000 0.400 0.001 Y NA
 3690010 3690011 MRA_0694 MRA_0695 tuf   FALSE 0.040 138.000 0.000 NA   NA
 3690011 3690012 MRA_0695 MRA_0696   fabG FALSE 0.207 153.000 0.333 NA   NA
 3690012 3690013 MRA_0696 MRA_0697 fabG   TRUE 0.875 14.000 0.214 0.072   NA
 3690014 3690015 MRA_0698 MRA_0699     FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 3690015 3690016 MRA_0699 MRA_0700     TRUE 0.958 -3.000 0.088 NA   NA
 3690017 3690018 MRA_0700A MRA_0701   pqqE TRUE 0.989 -3.000 0.484 NA   NA
 3690018 3690019 MRA_0701 MRA_0702 pqqE lldD1 TRUE 0.980 3.000 0.548 1.000   NA
 3690019 3690020 MRA_0702 MRA_0703 lldD1   FALSE 0.194 190.000 0.464 1.000   NA
 3690020 3690021 MRA_0703 MRA_0704     TRUE 0.699 49.000 0.440 NA   NA
 3690021 3690022 MRA_0704 MRA_0705     TRUE 0.985 2.000 0.667 NA   NA
 3690022 3690023 MRA_0705 MRA_0706     FALSE 0.003 461.000 0.000 NA   NA
 3690023 3690024 MRA_0706 MRA_0707     FALSE 0.019 185.000 0.000 NA   NA
 3690024 3690025 MRA_0707 MRA_0708   rpsJ FALSE 0.002 637.000 0.000 NA   NA
 3690025 3690026 MRA_0708 MRA_0709 rpsJ rplC TRUE 0.974 17.000 0.467 0.022 Y NA
 3690026 3690027 MRA_0709 MRA_0710 rplC rplD TRUE 0.998 0.000 0.361 0.017 Y NA
 3690027 3690028 MRA_0710 MRA_0711 rplD rplW TRUE 0.998 0.000 0.513 0.017 Y NA
 3690028 3690029 MRA_0711 MRA_0712 rplW rplB TRUE 0.956 93.000 0.849 0.014 Y NA
 3690029 3690030 MRA_0712 MRA_0713 rplB rpsS TRUE 0.977 41.000 0.820 0.022 Y NA
 3690030 3690031 MRA_0713 MRA_0714 rpsS rplV TRUE 0.999 -3.000 0.769 0.022 Y NA
 3690031 3690032 MRA_0714 MRA_0715 rplV rpsC TRUE 0.999 0.000 0.719 0.022 Y NA
 3690032 3690033 MRA_0715 MRA_0716 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.022 Y NA
 3690033 3690034 MRA_0716 MRA_0717 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.017 Y NA
 3690034 3690035 MRA_0717 MRA_0718 rpmC rpsQ TRUE 0.999 -3.000 0.828 0.017 Y NA
 3690035 3690036 MRA_0718 MRA_0719 rpsQ atsA FALSE 0.019 169.000 0.005 1.000 N NA
 3690036 3690037 MRA_0719 MRA_0720 atsA   FALSE 0.562 48.000 0.250 NA   NA
 3690037 3690038 MRA_0720 MRA_0721     FALSE 0.073 301.000 0.600 NA   NA
 3690038 3690039 MRA_0721 MRA_0722   rplN FALSE 0.002 486.000 0.000 NA   NA
 3690039 3690040 MRA_0722 MRA_0723 rplN rplX TRUE 0.999 1.000 0.810 0.022 Y NA
 3690040 3690041 MRA_0723 MRA_0724 rplX rplE TRUE 0.999 0.000 0.758 0.017 Y NA
 3690041 3690042 MRA_0724 MRA_0725 rplE rpsN TRUE 0.995 5.000 0.496 0.017 Y NA
 3690042 3690043 MRA_0725 MRA_0726 rpsN rpsH TRUE 0.730 164.000 0.473 0.017 Y NA
 3690043 3690044 MRA_0726 MRA_0727 rpsH rplF TRUE 0.982 24.000 0.808 0.017 Y NA
 3690044 3690045 MRA_0727 MRA_0728 rplF rplR TRUE 0.998 3.000 0.815 0.017 Y NA
 3690045 3690046 MRA_0728 MRA_0729 rplR rpsE TRUE 0.984 20.000 0.814 0.022 Y NA
 3690046 3690047 MRA_0729 MRA_0730 rpsE rpmD TRUE 0.998 3.000 0.789 0.022 Y NA
 3690047 3690048 MRA_0730 MRA_0731 rpmD rplO TRUE 0.999 0.000 0.653 0.002 Y NA
 3690048 3690049 MRA_0731 MRA_0732 rplO sppA FALSE 0.088 33.000 0.000 1.000 N NA
 3690050 3690051 MRA_0733 MRA_0734     FALSE 0.520 93.000 0.000 NA Y NA
 3690051 3690052 MRA_0734 MRA_0735   fucA FALSE 0.001 203.000 0.000 NA N NA
 3690052 3690053 MRA_0735 MRA_0736 fucA serA2 TRUE 0.928 -3.000 0.058 1.000 N NA
 3690054 3690055 MRA_0737 MRA_0738 xylB   FALSE 0.565 13.000 0.018 1.000   NA
 3690057 3690058 MRA_0740 MRA_0741 secY adk TRUE 0.927 -3.000 0.057 1.000 N NA
 3690058 3690059 MRA_0741 MRA_0742 adk mapA TRUE 0.976 3.000 0.606 1.000 N NA
 3690059 3690060 MRA_0742 MRA_0743 mapA sigL FALSE 0.253 73.000 0.099 1.000 N NA
 3690060 3690061 MRA_0743 MRA_0744 sigL   TRUE 0.911 64.000 0.697 NA Y NA
 3690061 3690062 MRA_0744 MRA_0745     FALSE 0.159 55.000 0.000 NA   NA
 3690062 3690063 MRA_0745 MRA_0746     FALSE 0.261 48.000 0.000 1.000   NA
 3690063 3690064 MRA_0746 MRA_0747     FALSE 0.004 358.000 0.000 NA   NA
 3690064 3690065 MRA_0747 MRA_0748     FALSE 0.009 245.000 0.000 NA   NA
 3690065 3690066 MRA_0748 MRA_0749     FALSE 0.061 115.000 0.000 NA   NA
 3690066 3690067 MRA_0749 MRA_0750     FALSE 0.010 231.000 0.000 NA   NA
 3690067 3690068 MRA_0750 MRA_0751     FALSE 0.037 142.000 0.000 NA   NA
 3690069 3690070 MRA_0752 MRA_0753     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690071 3690072 MRA_0754 MRA_0755     FALSE 0.003 399.000 0.000 NA   NA
 3690072 3690073 MRA_0755 MRA_0756     FALSE 0.155 91.000 0.000 1.000   NA
 3690073 3690074 MRA_0756 MRA_0757     FALSE 0.233 24.000 0.000 NA   NA
 3690077 3690078 MRA_0760 MRA_0761 mmsB fadE9 TRUE 0.914 11.000 0.051 1.000 Y NA
 3690078 3690079 MRA_0761 MRA_0762 fadE9 mmsA TRUE 0.807 7.000 0.197 1.000 N NA
 3690081 3690082 MRA_0764 MRA_0765     FALSE 0.005 302.000 0.000 NA   NA
 3690082 3690083 MRA_0765 MRA_t09     FALSE 0.061 115.000 0.000 NA   NA
 3690083 3690084 MRA_t09 MRA_0766     FALSE 0.215 28.000 0.000 NA   NA
 3690085 3690086 MRA_0767 MRA_0768 phoP phoR TRUE 0.974 45.000 0.824 0.049 Y NA
 3690087 3690088 MRA_0769 MRA_0770     FALSE 0.362 41.000 0.014 1.000   NA
 3690088 3690089 MRA_0770 MRA_0771   adhB TRUE 0.925 13.000 0.750 1.000   NA
 3690089 3690090 MRA_0771 MRA_0771A adhB   FALSE 0.497 99.000 0.400 NA   NA
 3690090 3690091 MRA_0771A MRA_0772     TRUE 0.985 3.000 0.800 NA   NA
 3690091 3690092 MRA_0772 MRA_0773   cyp51 TRUE 0.978 3.000 0.733 NA N NA
 3690092 3690093 MRA_0773 MRA_0774 cyp51   TRUE 0.969 0.000 0.212 1.000   NA
 3690093 3690094 MRA_0774 MRA_0775   cyp123 TRUE 0.972 0.000 0.231 1.000   NA
 3690094 3690095 MRA_0775 MRA_0776 cyp123   TRUE 0.989 -3.000 0.571 1.000 N NA
 3690096 3690097 MRA_0777 MRA_0778 aldA   TRUE 0.908 31.000 0.812 0.071 N NA
 3690097 3690098 MRA_0778 MRA_0779     TRUE 0.658 140.000 0.480 1.000 Y NA
 3690098 3690099 MRA_0779 MRA_0780     TRUE 0.992 -3.000 0.560 1.000   NA
 3690099 3690100 MRA_0780 MRA_0781   purD FALSE 0.544 12.000 0.003 1.000   NA
 3690101 3690102 MRA_0782 MRA_0783 ggtA   FALSE 0.427 51.000 0.073 1.000   NA
 3690105 3690106 MRA_0786 MRA_0787 purB cyp126 TRUE 0.606 5.000 0.006 1.000 N NA
 3690108 3690109 MRA_0789 MRA_0790 hemH ptrBa TRUE 0.956 -3.000 0.035 1.000   NA
 3690109 3690110 MRA_0790 MRA_0791 ptrBa ptrBb TRUE 0.978 -211.000 0.031 0.001   NA
 3690112 3690113 MRA_0793 MRA_0794     FALSE 0.563 16.000 0.048 1.000   NA
 3690115 3690116 MRA_0796 MRA_0797   purS FALSE 0.077 106.000 0.000 NA   NA
 3690116 3690117 MRA_0797 MRA_0798 purS purQ TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 3690118 3690119 MRA_0799 MRA_0800     FALSE 0.243 22.000 0.000 NA   NA
 3690119 3690120 MRA_0800 MRA_0801     TRUE 0.954 -3.000 0.070 NA   NA
 3690120 3690121 MRA_0801 MRA_0802     TRUE 0.965 -3.000 0.250 NA N NA
 3690124 3690125 MRA_0805 MRA_0806     TRUE 0.798 51.000 0.308 0.074   NA
 3690125 3690126 MRA_0806 MRA_0807     TRUE 0.822 55.000 0.000 0.074 Y NA
 3690127 3690128 MRA_0808 MRA_0809 cfp29   TRUE 0.980 -3.000 0.267 NA   NA
 3690129 3690130 MRA_0810 MRA_0811 pepC   FALSE 0.550 12.000 0.038 NA   NA
 3690132 3690133 MRA_0813 MRA_0814 purL   TRUE 0.925 -3.000 0.000 1.000   NA
 3690133 3690134 MRA_0814 MRA_0815     FALSE 0.088 121.000 0.000 1.000   NA
 3690136 3690137 MRA_0817 MRA_0818   purF FALSE 0.195 87.000 0.034 NA   NA
 3690137 3690138 MRA_0818 MRA_0819 purF purM TRUE 0.874 31.000 0.248 1.000 Y NA
 3690139 3690140 MRA_0820 MRA_0821     FALSE 0.058 147.000 0.017 NA   NA
 3690142 3690143 MRA_0823 MRA_0824   sseC1-1 FALSE 0.055 163.000 0.043 NA   NA
 3690143 3690144 MRA_0824 MRA_0825 sseC1-1 cysA2 TRUE 0.984 2.000 0.557 1.000   NA
 3690144 3690145 MRA_0825 MRA_0826 cysA2 thiX FALSE 0.009 293.000 0.000 1.000   NA
 3690145 3690146 MRA_0826 MRA_0827 thiX   TRUE 0.986 -3.000 0.371 NA   NA
 3690147 3690148 MRA_0828 MRA_0829     TRUE 0.977 -3.000 0.196 1.000   NA
 3690148 3690149 MRA_0829 MRA_0830   phoT FALSE 0.365 43.000 0.016 1.000   NA
 3690150 3690151 MRA_0831 MRA_0832 phoY2   TRUE 0.660 58.000 0.579 NA N NA
 3690151 3690152 MRA_0832 MRA_0833     FALSE 0.007 166.000 0.005 NA N NA
 3690152 3690153 MRA_0833 MRA_0834   desA1 FALSE 0.198 88.000 0.004 1.000   NA
 3690153 3690154 MRA_0834 MRA_0835 desA1   FALSE 0.230 162.000 0.375 1.000   NA
 3690156 3690157 MRA_0837 MRA_0838     FALSE 0.067 58.000 0.000 1.000 N NA
 3690159 3690160 MRA_0840 MRA_t10     FALSE 0.097 94.000 0.000 NA   NA
 3690161 3690162 MRA_t11 MRA_t12     FALSE 0.193 38.000 0.000 NA   NA
 3690162 3690163 MRA_t12 MRA_t13     FALSE 0.208 30.000 0.000 NA   NA
 3690163 3690164 MRA_t13 MRA_0841     FALSE 0.002 665.000 0.000 NA   NA
 3690164 3690165 MRA_0841 MRA_0841A     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690168 3690169 MRA_0844 MRA_0845     FALSE 0.131 71.000 0.000 NA   NA
 3690170 3690171 MRA_0846 MRA_0847 lpqR   FALSE 0.133 87.000 0.033 1.000 N NA
 3690173 3690174 MRA_0849 MRA_0850     FALSE 0.006 277.000 0.000 NA   NA
 3690174 3690175 MRA_0850 MRA_0851     TRUE 0.847 -16.000 0.000 1.000   NA
 3690179 3690180 MRA_0855 MRA_0856 lpqS cysK2 FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 3690180 3690181 MRA_0856 MRA_0857 cysK2   TRUE 0.987 0.000 0.500 1.000   NA
 3690181 3690182 MRA_0857 MRA_0858     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690186 3690187 MRA_0862 MRA_0863   far TRUE 0.923 6.000 0.333 NA   NA
 3690187 3690188 MRA_0863 MRA_0864 far   FALSE 0.063 114.000 0.000 NA   NA
 3690188 3690189 MRA_0864 MRA_0865     FALSE 0.215 28.000 0.000 NA   NA
 3690191 3690192 MRA_0867 MRA_0868 fadA fadB TRUE 0.993 5.000 0.750 1.000 Y NA
 3690193 3690194 MRA_0869 MRA_0870 ercc3   FALSE 0.079 191.000 0.206 NA   NA
 3690195 3690196 MRA_0870A MRA_0871   moaC FALSE 0.558 10.000 0.012 NA   NA
 3690196 3690197 MRA_0871 MRA_0872 moaC mog TRUE 0.997 -3.000 0.016 0.005 Y NA
 3690197 3690198 MRA_0872 MRA_0873 mog moaE2 TRUE 0.997 -3.000 0.015 0.005 Y NA
 3690199 3690200 MRA_0874 MRA_0875 rpfA moaD2 FALSE 0.004 448.000 0.000 1.000   NA
 3690200 3690201 MRA_0875 MRA_0876 moaD2 moaA TRUE 0.990 4.000 0.410 1.000 Y NA
 3690201 3690202 MRA_0876 MRA_0877 moaA   TRUE 0.935 -3.000 0.026 NA   NA
 3690206 3690207 MRA_0881 MRA_0882     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 3690207 3690208 MRA_0882 MRA_0883     TRUE 0.988 -3.000 0.432 NA   NA
 3690210 3690211 MRA_0885 MRA_0886     FALSE 0.006 278.000 0.000 NA   NA
 3690212 3690213 MRA_0887 MRA_0888     TRUE 0.904 -3.000 0.029 1.000 N NA
 3690213 3690214 MRA_0888 MRA_0889     TRUE 0.955 -3.000 0.075 NA   NA
 3690215 3690216 MRA_0890 MRA_0891   serC FALSE 0.130 157.000 0.214 NA   NA
 3690217 3690218 MRA_0892 MRA_0893   fprB TRUE 0.906 19.000 0.846 1.000   NA
 3690219 3690220 MRA_0894 MRA_0895     FALSE 0.002 763.000 0.000 NA   NA
 3690222 3690223 MRA_0897 MRA_0898 citA   FALSE 0.161 87.000 0.000 1.000   NA
 3690223 3690224 MRA_0898 MRA_0899     TRUE 0.856 2.000 0.000 1.000   NA
 3690227 3690228 MRA_0902 MRA_0903     FALSE 0.122 77.000 0.000 NA   NA
 3690228 3690229 MRA_0903 MRA_0904   gltA FALSE 0.023 173.000 0.000 NA   NA
 3690230 3690231 MRA_0905 MRA_0905A     FALSE 0.470 26.000 0.091 NA   NA
 3690232 3690233 MRA_0906 MRA_0907 ompA   TRUE 0.780 13.000 0.286 NA   NA
 3690233 3690234 MRA_0907 MRA_0908     TRUE 0.989 0.000 0.667 NA   NA
 3690235 3690236 MRA_0909 MRA_0910 prrB prrA TRUE 0.959 11.000 0.333 1.000 Y NA
 3690236 3690237 MRA_0910 MRA_0911 prrA accD3 FALSE 0.020 131.000 0.000 1.000 N NA
 3690238 3690239 MRA_0912 MRA_0913 echA6   TRUE 0.919 6.000 0.314 NA   NA
 3690239 3690240 MRA_0913 MRA_0914     TRUE 0.936 -15.000 0.171 NA   NA
 3690240 3690241 MRA_0914 MRA_0915   ctpE TRUE 0.950 -3.000 0.119 1.000 N NA
 3690241 3690242 MRA_0915 MRA_0916 ctpE   FALSE 0.002 557.000 0.000 NA   NA
 3690242 3690243 MRA_0916 MRA_0917     TRUE 0.863 6.000 0.182 NA   NA
 3690243 3690244 MRA_0917 MRA_0918     FALSE 0.092 98.000 0.000 NA   NA
 3690244 3690245 MRA_0918 MRA_0919     FALSE 0.314 65.000 0.071 NA   NA
 3690246 3690247 MRA_0920 MRA_0921     TRUE 0.963 2.000 0.417 NA N NA
 3690247 3690248 MRA_0921 MRA_0922     FALSE 0.008 93.000 0.000 NA N NA
 3690248 3690249 MRA_0922 MRA_0923     FALSE 0.308 15.000 0.000 NA   NA
 3690250 3690251 MRA_0924 MRA_0925 betP   TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690251 3690252 MRA_0925 MRA_0926     FALSE 0.102 89.000 0.000 NA   NA
 3690252 3690253 MRA_0926 MRA_0927     TRUE 0.968 -3.000 0.091 1.000   NA
 3690254 3690255 MRA_t14 MRA_0928     FALSE 0.081 104.000 0.000 NA   NA
 3690256 3690257 MRA_0929 MRA_0930     TRUE 0.981 0.000 0.000 NA Y NA
 3690258 3690259 MRA_0931 MRA_0932   mntH TRUE 0.890 1.000 0.029 NA   NA
 3690259 3690260 MRA_0932 MRA_0933 mntH   FALSE 0.297 32.000 0.014 NA   NA
 3690260 3690261 MRA_0933 MRA_0934     FALSE 0.199 77.000 0.018 NA   NA
 3690261 3690262 MRA_0934 MRA_0935     TRUE 0.742 54.000 0.500 1.000   NA
 3690263 3690264 MRA_0936 MRA_0937 pstS3 pstC2 TRUE 0.972 13.000 0.200 0.004 Y NA
 3690264 3690265 MRA_0937 MRA_0938 pstC2 pstA1 TRUE 0.997 -3.000 0.037 0.004 Y NA
 3690266 3690267 MRA_0939 MRA_0940 pknD pstS2 TRUE 0.829 22.000 0.667 1.000 N NA
 3690268 3690269 MRA_0941 MRA_0942 pstB pstS1 TRUE 0.922 21.000 0.000 0.004 Y NA
 3690269 3690270 MRA_0942 MRA_0943 pstS1 pstC1 TRUE 0.979 60.000 1.000 0.004 Y NA
 3690270 3690271 MRA_0943 MRA_0944 pstC1 pstA2 TRUE 0.998 2.000 0.636 0.004 Y NA
 3690273 3690274 MRA_0946 MRA_0947     TRUE 0.917 -3.000 0.043 1.000 N NA
 3690275 3690276 MRA_0948 MRA_0949     FALSE 0.347 85.000 0.182 NA   NA
 3690279 3690280 MRA_0951 MRA_0952     TRUE 0.848 6.000 0.082 1.000   NA
 3690281 3690282 MRA_0953 MRA_0954 pgi   FALSE 0.002 615.000 0.000 NA   NA
 3690282 3690283 MRA_0954 MRA_0955     FALSE 0.273 17.000 0.000 NA   NA
 3690286 3690287 MRA_0958 MRA_0959 sucC sucD TRUE 0.985 13.000 0.382 0.001 Y NA
 3690289 3690290 MRA_0961 MRA_0962     FALSE 0.548 40.000 0.218 NA   NA
 3690290 3690291 MRA_0962 MRA_0963   purN FALSE 0.126 116.000 0.044 NA   NA
 3690291 3690292 MRA_0963 MRA_0964 purN purH TRUE 0.995 -3.000 0.225 1.000 Y NA
 3690292 3690293 MRA_0964 MRA_0965 purH   FALSE 0.057 107.000 0.002 1.000 N NA
 3690293 3690294 MRA_0965 MRA_0966     TRUE 0.988 -7.000 0.645 1.000   NA
 3690294 3690295 MRA_0966 MRA_0967     FALSE 0.238 54.000 0.000 1.000   NA
 3690295 3690296 MRA_0967 MRA_0968     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690296 3690297 MRA_0968 MRA_0969     FALSE 0.031 152.000 0.000 NA   NA
 3690298 3690299 MRA_0970 MRA_0971 lprP   FALSE 0.019 183.000 0.000 NA   NA
 3690299 3690300 MRA_0971 MRA_0971A     FALSE 0.090 99.000 0.000 NA   NA
 3690300 3690301 MRA_0971A MRA_0972     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 3690301 3690302 MRA_0972 MRA_0973     FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 3690303 3690304 MRA_0974 MRA_0975     FALSE 0.233 57.000 0.012 NA   NA
 3690304 3690305 MRA_0975 MRA_0976   ctpV TRUE 0.706 56.000 0.500 NA   NA
 3690305 3690306 MRA_0976 MRA_0977 ctpV   TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 3690307 3690308 MRA_0978 MRA_0979 echA7 fadE12 TRUE 0.992 0.000 0.203 1.000 Y NA
 3690308 3690309 MRA_0979 MRA_0980 fadE12 accA2 TRUE 0.998 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 3690309 3690310 MRA_0980 MRA_0981 accA2 accD2 TRUE 0.997 6.000 0.875 0.004 Y NA
 3690310 3690311 MRA_0981 MRA_0982 accD2 fadE13 TRUE 0.994 3.000 0.548 1.000 Y NA
 3690311 3690312 MRA_0982 MRA_0983 fadE13   TRUE 0.991 -3.000 0.562 NA   NA
 3690314 3690315 MRA_0985 MRA_0985A     FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 3690318 3690319 MRA_0988 MRA_0989 mprA mprB TRUE 0.999 0.000 0.655 0.007 Y NA
 3690319 3690320 MRA_0989 MRA_0990 mprB pepD TRUE 0.666 44.000 0.424 1.000 N NA
 3690320 3690321 MRA_0990 MRA_0991 pepD moaB2 TRUE 0.978 0.000 0.423 1.000 N NA
 3690323 3690324 MRA_0993 MRA_0994     TRUE 0.990 -7.000 0.210 1.000 Y NA
 3690324 3690325 MRA_0994 MRA_0995     TRUE 0.853 7.000 0.152 1.000   NA
 3690326 3690327 MRA_0996 MRA_0997 grcC2   FALSE 0.148 61.000 0.000 NA   NA
 3690327 3690328 MRA_0997 MRA_0998     FALSE 0.212 73.000 0.022 NA   NA
 3690328 3690329 MRA_0998 MRA_0999     FALSE 0.240 74.000 0.041 NA   NA
 3690330 3690331 MRA_1000 MRA_1001 galU moeA1 FALSE 0.330 77.000 0.196 1.000 N NA
 3690331 3690332 MRA_1001 MRA_1002 moeA1 rimJ TRUE 0.597 63.000 0.427 1.000 N NA
 3690332 3690333 MRA_1002 MRA_1003 rimJ   FALSE 0.109 161.000 0.183 NA   NA
 3690333 3690334 MRA_1003 MRA_t15     FALSE 0.167 51.000 0.000 NA   NA
 3690334 3690335 MRA_t15 MRA_1004     FALSE 0.006 278.000 0.000 NA   NA
 3690335 3690336 MRA_1004 MRA_1006     FALSE 0.020 181.000 0.000 NA   NA
 3690336 3690337 MRA_1006 MRA_1007     FALSE 0.233 24.000 0.000 NA   NA
 3690337 3690338 MRA_1007 MRA_1008     FALSE 0.261 18.000 0.000 NA   NA
 3690343 3690344 MRA_1013 MRA_1014   pabB FALSE 0.266 35.000 0.006 NA   NA
 3690347 3690348 MRA_1017 MRA_1018 tatD rpfB FALSE 0.020 208.000 0.008 NA   NA
 3690348 3690349 MRA_1018 MRA_1019 rpfB ksgA TRUE 0.874 -27.000 0.008 1.000   NA
 3690349 3690350 MRA_1019 MRA_1020 ksgA ispE FALSE 0.183 86.000 0.068 1.000 N NA
 3690350 3690351 MRA_1020 MRA_1020A ispE   FALSE 0.273 17.000 0.000 NA   NA
 3690351 3690352 MRA_1020A MRA_1021   pks16 FALSE 0.014 204.000 0.000 NA   NA
 3690353 3690354 MRA_1022 MRA_1023 pth rplY TRUE 0.982 13.000 0.496 0.025 Y NA
 3690354 3690355 MRA_1023 MRA_1024 rplY lpqT FALSE 0.012 217.000 0.000 NA   NA
 3690355 3690356 MRA_1024 MRA_1025 lpqT prsA FALSE 0.194 36.000 0.000 NA   NA
 3690356 3690357 MRA_1025 MRA_1026 prsA glmU FALSE 0.118 92.000 0.026 1.000 N NA
 3690357 3690358 MRA_1026 MRA_t16 glmU   FALSE 0.291 16.000 0.000 NA   NA
 3690359 3690360 MRA_1027 MRA_1028   mfd TRUE 0.846 59.000 0.013 0.050 Y NA
 3690360 3690361 MRA_1028 MRA_1029 mfd   TRUE 0.933 0.000 0.026 1.000   NA
 3690361 3690362 MRA_1029 MRA_1030   lpqU FALSE 0.103 88.000 0.000 NA   NA
 3690362 3690363 MRA_1030 MRA_1031 lpqU eno FALSE 0.038 97.000 0.012 NA N NA
 3690363 3690364 MRA_1031 MRA_1032 eno   TRUE 0.736 5.000 0.043 1.000 N NA
 3690364 3690365 MRA_1032 MRA_1033     TRUE 0.697 17.000 0.252 NA   NA
 3690365 3690366 MRA_1033 MRA_1034     TRUE 0.956 -9.000 0.243 NA   NA
 3690367 3690368 MRA_1035 MRA_1036 kdpE kdpD TRUE 0.997 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 3690369 3690370 MRA_1036A MRA_1037 kdpF kdpA TRUE 0.991 0.000 0.152 0.001   NA
 3690370 3690371 MRA_1037 MRA_1038 kdpA kdpB TRUE 0.998 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 3690371 3690372 MRA_1038 MRA_1039 kdpB kdpC TRUE 0.996 0.000 0.015 0.001 Y NA
 3690373 3690374 MRA_1040 MRA_1041 trcS trcR TRUE 0.991 8.000 0.556 0.047 Y NA
 3690374 3690375 MRA_1041 MRA_1042 trcR   FALSE 0.001 182.000 0.000 NA N NA
 3690375 3690376 MRA_1042 MRA_1043     FALSE 0.136 68.000 0.000 NA   NA
 3690376 3690377 MRA_1043 MRA_1044     FALSE 0.196 34.000 0.000 NA   NA
 3690377 3690378 MRA_1044 MRA_1045   esxV1 FALSE 0.067 111.000 0.000 NA   NA
 3690378 3690379 MRA_1045 MRA_1046 esxV1 esxJ FALSE 0.219 27.000 0.000 NA   NA
 3690379 3690380 MRA_1046 MRA_1047 esxJ   FALSE 0.034 146.000 0.000 NA   NA
 3690380 3690381 MRA_1047 MRA_1048     TRUE 0.713 77.000 0.667 NA   NA
 3690381 3690382 MRA_1048 MRA_1049     FALSE 0.002 788.000 0.000 NA   NA
 3690382 3690383 MRA_1049 MRA_1050     FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 3690383 3690384 MRA_1050 MRA_1051     TRUE 0.985 -343.000 0.250 NA Y NA
 3690384 3690385 MRA_1051 MRA_1052     FALSE 0.006 282.000 0.000 NA   NA
 3690386 3690387 MRA_1053 MRA_1054     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690391 3690392 MRA_1058 MRA_1059     FALSE 0.257 49.000 0.000 1.000   NA
 3690396 3690397 MRA_1063 MRA_1064     TRUE 0.960 -147.000 0.000 0.010   NA
 3690397 3690398 MRA_1064 MRA_t17     FALSE 0.237 23.000 0.000 NA   NA
 3690398 3690399 MRA_t17 MRA_1065     FALSE 0.027 159.000 0.000 NA   NA
 3690401 3690402 MRA_1067 MRA_1068   fadD14 FALSE 0.222 107.000 0.125 NA   NA
 3690402 3690403 MRA_1068 MRA_1069 fadD14   FALSE 0.539 76.000 0.286 1.000   NA
 3690403 3690404 MRA_1069 MRA_1070     FALSE 0.570 53.000 0.286 NA   NA
 3690404 3690405 MRA_1070 MRA_1071     TRUE 0.670 34.000 0.333 NA   NA
 3690405 3690406 MRA_1071 MRA_1072     TRUE 0.932 5.000 0.250 1.000   NA
 3690407 3690408 MRA_1073 MRA_1074   lpqV FALSE 0.184 81.000 0.016 NA   NA
 3690409 3690410 MRA_1075 MRA_1076     TRUE 0.988 -3.000 0.429 NA   NA
 3690411 3690412 MRA_1077 MRA_1078     FALSE 0.004 333.000 0.000 NA   NA
 3690412 3690413 MRA_1078 MRA_1079     FALSE 0.003 362.000 0.000 NA   NA
 3690413 3690414 MRA_1079 MRA_1080   echA8 TRUE 0.979 -3.000 0.259 NA   NA
 3690414 3690415 MRA_1080 MRA_1081 echA8 echA9 TRUE 0.968 12.000 0.128 0.007 Y NA
 3690416 3690417 MRA_1082 MRA_1083     FALSE 0.060 116.000 0.000 NA   NA
 3690418 3690419 MRA_1084 MRA_1085 fadA3   FALSE 0.071 53.000 0.000 1.000 N NA
 3690420 3690421 MRA_1086 MRA_1087 lipU cbs FALSE 0.164 57.000 0.017 1.000 N NA
 3690421 3690422 MRA_1087 MRA_1088 cbs pra FALSE 0.030 202.000 0.034 NA   NA
 3690422 3690423 MRA_1088 MRA_1089 pra metB FALSE 0.328 32.000 0.028 NA   NA
 3690424 3690425 MRA_1090 MRA_1091 greA   FALSE 0.099 186.000 0.250 NA   NA
 3690426 3690427 MRA_1092 MRA_1093 mca   TRUE 0.960 -3.000 0.099 NA   NA
 3690427 3690428 MRA_1093 MRA_1094     TRUE 0.851 -13.000 0.011 NA   NA
 3690430 3690431 MRA_1096 MRA_1097     FALSE 0.021 177.000 0.000 NA   NA
 3690431 3690432 MRA_1097 MRA_1098     FALSE 0.021 177.000 0.000 NA   NA
 3690432 3690433 MRA_1098 MRA_1099     FALSE 0.044 135.000 0.000 NA   NA
 3690433 3690434 MRA_1099 MRA_1100   celA2a FALSE 0.002 570.000 0.000 NA   NA
 3690434 3690435 MRA_1100 MRA_1101 celA2a celA2b TRUE 0.975 -22.000 0.000 0.001   NA
 3690435 3690436 MRA_1101 MRA_1102 celA2b   FALSE 0.003 415.000 0.000 NA   NA
 3690438 3690439 MRA_1104 MRA_1105 glyA desA2 FALSE 0.290 105.000 0.143 1.000   NA
 3690439 3690440 MRA_1105 MRA_1106 desA2 phoH2 FALSE 0.039 211.000 0.046 1.000   NA
 3690440 3690441 MRA_1106 MRA_1107 phoH2   FALSE 0.218 87.000 0.108 1.000 N NA
 3690442 3690443 MRA_1108 MRA_1109   fumC TRUE 0.928 -3.000 0.014 NA   NA
 3690443 3690444 MRA_1109 MRA_1110 fumC glpX FALSE 0.332 31.000 0.071 1.000 N NA
 3690446 3690447 MRA_1112 MRA_1113     FALSE 0.065 112.000 0.000 NA   NA
 3690447 3690448 MRA_1113 MRA_1114     TRUE 0.977 0.000 0.286 1.000   NA
 3690449 3690450 MRA_1115 MRA_1116     FALSE 0.005 321.000 0.000 NA   NA
 3690451 3690452 MRA_1117 MRA_1118   xseB FALSE 0.410 10.000 0.009 1.000 N NA
 3690452 3690453 MRA_1118 MRA_1119 xseB xseA TRUE 0.998 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 3690453 3690454 MRA_1119 MRA_1120 xseA   TRUE 0.934 -3.000 0.024 NA   NA
 3690457 3690458 MRA_1123 MRA_1123A     FALSE 0.103 88.000 0.000 NA   NA
 3690458 3690459 MRA_1123A MRA_1124     TRUE 0.993 -3.000 0.689 NA   NA
 3690459 3690460 MRA_1124 MRA_1125     FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 3690463 3690464 MRA_1128 MRA_1128A     FALSE 0.197 33.000 0.000 NA   NA
 3690464 3690465 MRA_1128A MRA_1129     TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.006   NA
 3690466 3690467 MRA_1130 MRA_1131 zwf1 gnd2 TRUE 0.845 22.000 0.062 1.000 Y NA
 3690469 3690470 MRA_1133 MRA_1134 ephC   TRUE 0.838 5.000 0.070 NA   NA
 3690471 3690472 MRA_1135 MRA_1136   ppdK TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 3690472 3690473 MRA_1136 MRA_1137 ppdK   FALSE 0.013 213.000 0.000 NA   NA
 3690473 3690474 MRA_1137 MRA_1138     FALSE 0.085 102.000 0.000 NA   NA
 3690475 3690476 MRA_1139 MRA_1140   gltA1 TRUE 0.979 -3.000 0.216 1.000   NA
 3690476 3690477 MRA_1140 MRA_1141 gltA1   FALSE 0.362 12.000 0.000 NA   NA
 3690481 3690482 MRA_1145 MRA_1146     FALSE 0.253 50.000 0.000 1.000   NA
 3690482 3690483 MRA_1146 MRA_1147     FALSE 0.104 87.000 0.000 NA   NA
 3690484 3690485 MRA_1148 MRA_1149     TRUE 0.976 -3.000 0.176 1.000   NA
 3690487 3690488 MRA_1151 MRA_1152 echA11 echA10 FALSE 0.554 143.000 0.000 0.007 Y NA
 3690489 3690490 MRA_1153 MRA_1154 mcr   TRUE 0.888 12.000 0.636 1.000 N NA
 3690490 3690491 MRA_1154 MRA_1155   mmpL13a FALSE 0.004 515.000 0.000 1.000   NA
 3690491 3690492 MRA_1155 MRA_1156 mmpL13a mmpL13b TRUE 0.952 -66.000 0.000 0.046   NA
 3690492 3690493 MRA_1156 MRA_1157 mmpL13b   FALSE 0.155 133.000 0.080 1.000   NA
 3690495 3690496 MRA_1159 MRA_1160     TRUE 0.985 -343.000 0.250 NA Y NA
 3690499 3690500 MRA_1163 MRA_1164 omt   TRUE 0.959 -3.000 0.091 NA   NA
 3690501 3690502 MRA_1165 MRA_1166     FALSE 0.004 434.000 0.000 1.000   NA
 3690503 3690504 MRA_1167 MRA_1168     TRUE 0.841 8.000 0.222 NA   NA
 3690507 3690508 MRA_1171 MRA_1172 mutT2 narG FALSE 0.002 308.000 0.000 1.000 N NA
 3690508 3690509 MRA_1172 MRA_1173 narG narH TRUE 0.954 39.000 0.227 0.001 Y NA
 3690509 3690510 MRA_1173 MRA_1174 narH narJ TRUE 0.929 57.000 0.182 0.002 Y NA
 3690510 3690511 MRA_1174 MRA_1175 narJ narI TRUE 0.994 3.000 0.059 0.002 Y NA
 3690511 3690512 MRA_1175 MRA_1176 narI typA FALSE 0.192 22.000 0.002 1.000 N NA
 3690512 3690513 MRA_1176 MRA_1177 typA lpqW FALSE 0.107 98.000 0.025 1.000 N NA
 3690514 3690515 MRA_1178 MRA_1179     FALSE 0.011 72.000 0.000 NA N NA
 3690515 3690516 MRA_1179 MRA_1180     FALSE 0.261 18.000 0.000 NA   NA
 3690517 3690518 MRA_1181 MRA_1182 mshB   FALSE 0.514 92.000 0.387 NA   NA
 3690521 3690522 MRA_1185 MRA_1186   fadH FALSE 0.015 201.000 0.000 NA   NA
 3690522 3690523 MRA_1186 MRA_1187 fadH   TRUE 0.920 -3.000 0.093 NA N NA
 3690524 3690525 MRA_1188 MRA_1189 fdxC   FALSE 0.237 33.000 0.029 1.000 N NA
 3690527 3690528 MRA_1191 MRA_1192 pks3 papA3 FALSE 0.535 53.000 0.250 NA   NA
 3690528 3690529 MRA_1192 MRA_1193 papA3 mmpL10 TRUE 0.817 67.000 1.000 NA   NA
 3690530 3690531 MRA_1194 MRA_1195   fadD21 FALSE 0.025 165.000 0.000 NA   NA
 3690531 3690532 MRA_1195 MRA_1196 fadD21   FALSE 0.178 177.000 0.000 NA Y NA
 3690533 3690534 MRA_1197 MRA_1198 rocA   TRUE 0.944 0.000 0.181 1.000 N NA
 3690534 3690535 MRA_1198 MRA_1199   sigI FALSE 0.048 82.000 0.000 1.000 N NA
 3690535 3690536 MRA_1199 MRA_1200 sigI   FALSE 0.291 16.000 0.000 NA   NA
 3690536 3690537 MRA_1200 MRA_1201     FALSE 0.128 73.000 0.000 NA   NA
 3690537 3690538 MRA_1201 MRA_1202     FALSE 0.113 82.000 0.000 NA   NA
 3690538 3690539 MRA_1202 MRA_1203   fadD36 TRUE 0.598 40.000 0.000 0.064   NA
 3690541 3690542 MRA_1205 MRA_1205A     FALSE 0.180 47.000 0.000 NA   NA
 3690542 3690543 MRA_1205A MRA_1206   esxK FALSE 0.006 290.000 0.000 NA   NA
 3690543 3690544 MRA_1206 MRA_1207 esxK esxL FALSE 0.167 51.000 0.000 NA   NA
 3690549 3690550 MRA_1212 MRA_1213     FALSE 0.295 31.000 0.000 1.000   NA
 3690551 3690552 MRA_1214 MRA_1215   fadD6 TRUE 0.623 50.000 0.324 NA   NA
 3690552 3690553 MRA_1215 MRA_1216 fadD6 folP2 FALSE 0.343 66.000 0.172 1.000 N NA
 3690553 3690554 MRA_1216 MRA_1217 folP2   TRUE 0.965 -3.000 0.136 NA   NA
 3690554 3690555 MRA_1217 MRA_1218     FALSE 0.351 39.000 0.045 NA   NA
 3690555 3690556 MRA_1218 MRA_1219   tagA TRUE 0.926 -3.000 0.013 NA   NA
 3690556 3690557 MRA_1219 MRA_1220 tagA   FALSE 0.129 107.000 0.021 NA   NA
 3690560 3690561 MRA_1223 MRA_1224     FALSE 0.045 134.000 0.000 NA   NA
 3690561 3690562 MRA_1224 MRA_1225     FALSE 0.512 28.000 0.080 1.000   NA
 3690562 3690563 MRA_1225 MRA_1226     TRUE 0.600 9.000 0.111 NA N NA
 3690563 3690564 MRA_1226 MRA_1227     TRUE 0.950 -3.000 0.185 NA N NA
 3690564 3690565 MRA_1227 MRA_1228     TRUE 0.859 -10.000 0.000 1.000   NA
 3690565 3690566 MRA_1228 MRA_1229     FALSE 0.060 142.000 0.000 1.000   NA
 3690567 3690568 MRA_1230 MRA_1231 sigE   TRUE 0.941 -37.000 0.224 NA   NA
 3690568 3690569 MRA_1231 MRA_1232   htrA TRUE 0.718 67.000 0.607 NA   NA
 3690569 3690570 MRA_1232 MRA_1233 htrA tatB TRUE 0.942 2.000 0.242 1.000 N NA
 3690571 3690572 MRA_1234 MRA_1235     FALSE 0.148 111.000 0.054 NA   NA
 3690572 3690573 MRA_1235 MRA_1236     TRUE 0.991 -3.000 0.542 NA   NA
 3690575 3690576 MRA_1238 MRA_1239 mrp   FALSE 0.529 13.000 0.089 1.000 N NA
 3690576 3690577 MRA_1239 MRA_1240     FALSE 0.173 125.000 0.139 NA   NA
 3690577 3690578 MRA_1240 MRA_1241     TRUE 0.994 -3.000 0.806 NA   NA
 3690578 3690579 MRA_1241 MRA_1242     FALSE 0.146 62.000 0.000 NA   NA
 3690580 3690581 MRA_1243 MRA_1244   lpqY TRUE 0.622 21.000 0.211 NA   NA
 3690581 3690582 MRA_1244 MRA_1245 lpqY sugA TRUE 0.998 -3.000 0.252 0.022 Y NA
 3690582 3690583 MRA_1245 MRA_1246 sugA sugB TRUE 0.997 5.000 0.723 0.022 Y NA
 3690583 3690584 MRA_1246 MRA_1247 sugB sugC TRUE 0.990 5.000 0.191 0.022 Y NA
 3690586 3690587 MRA_1249 MRA_1250 mdh   FALSE 0.123 76.000 0.000 NA   NA
 3690587 3690588 MRA_1250 MRA_1251     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 3690591 3690592 MRA_1254 MRA_1255     FALSE 0.156 57.000 0.000 NA   NA
 3690592 3690593 MRA_1255 MRA_1255A     TRUE 0.987 -3.000 0.000 NA Y NA
 3690593 3690594 MRA_1255A MRA_1256   kgd FALSE 0.005 113.000 0.000 NA N NA
 3690594 3690595 MRA_1256 MRA_1257 kgd   FALSE 0.027 193.000 0.013 NA   NA
 3690597 3690598 MRA_1259 MRA_1260   lprE FALSE 0.403 56.000 0.133 NA   NA
 3690599 3690600 MRA_1261 MRA_1262 deaD   TRUE 0.860 -3.000 0.006 1.000 N NA
 3690601 3690602 MRA_1263 MRA_1264   cyp130 TRUE 0.990 0.000 0.833 1.000 N NA
 3690602 3690603 MRA_1264 MRA_1265 cyp130   FALSE 0.419 114.000 0.500 1.000 N NA
 3690603 3690604 MRA_1265 MRA_1266     TRUE 0.973 -3.000 0.143 1.000   NA
 3690605 3690606 MRA_1267 MRA_1268     TRUE 0.626 2.000 0.016 NA N NA
 3690607 3690608 MRA_1269 MRA_1270     TRUE 0.874 5.000 0.136 NA   NA
 3690609 3690610 MRA_1271 MRA_1272 amiB2   FALSE 0.053 75.000 0.000 1.000 N NA
 3690610 3690611 MRA_1272 MRA_1273     FALSE 0.023 173.000 0.000 NA   NA
 3690612 3690613 MRA_1274 MRA_1275 pknH embR FALSE 0.044 341.000 0.000 1.000 Y NA
 3690613 3690614 MRA_1275 MRA_1276 embR   FALSE 0.008 311.000 0.000 1.000   NA
 3690614 3690615 MRA_1276 MRA_1277     FALSE 0.011 223.000 0.000 NA   NA
 3690615 3690616 MRA_1277 MRA_1278   lprA TRUE 0.756 61.000 0.667 NA   NA
 3690616 3690617 MRA_1278 MRA_1279 lprA   FALSE 0.013 213.000 0.000 NA   NA
 3690617 3690618 MRA_1279 MRA_1280     FALSE 0.073 108.000 0.000 NA   NA
 3690618 3690619 MRA_1280 MRA_1281     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.004 Y NA
 3690620 3690621 MRA_1282 MRA_1283 lprB lprC TRUE 0.993 -3.000 0.692 NA   NA
 3690623 3690624 MRA_1285 MRA_1286     TRUE 0.995 -3.000 0.312 NA Y NA
 3690624 3690625 MRA_1286 MRA_1287     FALSE 0.137 21.000 0.017 NA N NA
 3690626 3690627 MRA_1288 MRA_1289 oppA oppD TRUE 0.991 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 3690627 3690628 MRA_1289 MRA_1290 oppD oppC TRUE 0.996 -3.000 0.303 1.000 Y NA
 3690628 3690629 MRA_1290 MRA_1291 oppC oppB TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.022 Y NA
 3690630 3690631 MRA_1292 MRA_1293   cysD FALSE 0.227 94.000 0.136 1.000 N NA
 3690631 3690632 MRA_1293 MRA_1294 cysD cysN TRUE 0.995 0.000 0.483 0.001 N NA
 3690632 3690633 MRA_1294 MRA_1295 cysN   FALSE 0.199 54.000 0.073 NA N NA
 3690633 3690634 MRA_1295 MRA_1296     FALSE 0.154 58.000 0.000 NA   NA
 3690634 3690635 MRA_1296 MRA_1297     FALSE 0.174 49.000 0.000 NA   NA
 3690638 3690639 MRA_1299 MRA_t18     FALSE 0.004 359.000 0.000 NA   NA
 3690640 3690641 MRA_1300 MRA_1301 argS lysA TRUE 0.935 -3.000 0.071 1.000 N NA
 3690641 3690642 MRA_1301 MRA_1302 lysA thrA TRUE 0.977 4.000 0.071 1.000 Y NA
 3690642 3690643 MRA_1302 MRA_1303 thrA thrC TRUE 0.994 -3.000 0.194 1.000 Y NA
 3690643 3690644 MRA_1303 MRA_1304 thrC thrB FALSE 0.232 218.000 0.221 1.000 Y NA
 3690644 3690645 MRA_1304 MRA_1305 thrB rho FALSE 0.028 257.000 0.000 0.083 N NA
 3690645 3690646 MRA_1305 MRA_1306 rho rpmE FALSE 0.075 151.000 0.115 1.000 N NA
 3690646 3690647 MRA_1306 MRA_1307 rpmE prfA TRUE 0.684 90.000 0.110 1.000 Y NA
 3690647 3690648 MRA_1307 MRA_1308 prfA hemK TRUE 0.992 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 3690648 3690649 MRA_1308 MRA_1309 hemK   TRUE 0.954 16.000 0.583 NA Y NA
 3690649 3690650 MRA_1309 MRA_1310   rfe FALSE 0.306 84.000 0.248 NA N NA
 3690650 3690651 MRA_1310 MRA_1311 rfe   FALSE 0.013 257.000 0.000 1.000   NA
 3690651 3690652 MRA_1311 MRA_1312   atpB TRUE 0.981 -7.000 0.021 0.004   NA
 3690652 3690653 MRA_1312 MRA_1313 atpB atpE TRUE 0.970 49.000 0.557 0.003 Y NA
 3690653 3690654 MRA_1313 MRA_1314 atpE atpF TRUE 0.918 31.000 0.012 0.003 Y NA
 3690654 3690655 MRA_1314 MRA_1315 atpF atpH TRUE 0.981 7.000 0.008 0.003 Y NA
 3690655 3690656 MRA_1315 MRA_1316 atpH atpA TRUE 0.982 45.000 0.864 0.003 Y NA
 3690656 3690657 MRA_1316 MRA_1317 atpA atpG TRUE 0.996 7.000 0.846 0.003 Y NA
 3690657 3690658 MRA_1317 MRA_1318 atpG atpD TRUE 0.979 40.000 0.724 0.003 Y NA
 3690658 3690659 MRA_1318 MRA_1319 atpD atpC TRUE 0.991 14.000 0.837 0.003 Y NA
 3690659 3690660 MRA_1319 MRA_1320 atpC   TRUE 0.709 8.000 0.054 NA   NA
 3690661 3690662 MRA_1321 MRA_1322     FALSE 0.040 166.000 0.000 1.000   NA
 3690663 3690664 MRA_1323 MRA_r01 murA   FALSE 0.007 269.000 0.000 NA   NA
 3690664 3690665 MRA_r01 MRA_r02     FALSE 0.007 273.000 0.000 NA   NA
 3690665 3690666 MRA_r02 MRA_r03     FALSE 0.081 104.000 0.000 NA   NA
 3690667 3690668 MRA_1324 MRA_1325 ogt alkA TRUE 0.993 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 3690668 3690669 MRA_1325 MRA_1326 alkA   FALSE 0.049 81.000 0.000 1.000 N NA
 3690669 3690670 MRA_1326 MRA_1327     TRUE 0.859 70.000 0.000 0.002 Y NA
 3690670 3690671 MRA_1327 MRA_1328     TRUE 0.954 13.000 0.000 0.002 Y NA
 3690672 3690673 MRA_1329 MRA_1329A     FALSE 0.536 23.000 0.141 NA   NA
 3690675 3690676 MRA_1331 MRA_1332 fadA4   FALSE 0.065 130.000 0.035 1.000 N NA
 3690677 3690678 MRA_1333 MRA_1334   glgB FALSE 0.031 152.000 0.000 NA   NA
 3690678 3690679 MRA_1334 MRA_1335 glgB glgE TRUE 0.984 8.000 0.159 0.004 Y NA
 3690681 3690682 MRA_1337 MRA_1338 dinG   FALSE 0.387 24.000 0.080 1.000 N NA
 3690683 3690684 MRA_1339 MRA_1340 clpS   TRUE 0.986 -40.000 0.823 NA   NA
 3690684 3690685 MRA_1340 MRA_1341     FALSE 0.540 17.000 0.093 NA   NA
 3690685 3690686 MRA_1341 MRA_1342     TRUE 0.694 8.000 0.044 NA   NA
 3690686 3690687 MRA_1342 MRA_1343   cfp10a FALSE 0.500 22.000 0.093 NA   NA
 3690687 3690688 MRA_1343 MRA_1344 cfp10a cysM FALSE 0.556 10.000 0.052 1.000 N NA
 3690688 3690689 MRA_1344 MRA_1345 cysM   TRUE 0.915 -9.000 0.032 1.000   NA
 3690689 3690690 MRA_1345 MRA_1346   murI TRUE 0.952 -3.000 0.024 1.000   NA
 3690690 3690691 MRA_1346 MRA_1347 murI   FALSE 0.479 27.000 0.054 1.000   NA
 3690691 3690692 MRA_1347 MRA_1348   rph FALSE 0.549 17.000 0.053 1.000   NA
 3690692 3690693 MRA_1348 MRA_1349 rph   FALSE 0.543 39.000 0.262 1.000 N NA
 3690694 3690695 MRA_1350 MRA_1351   lprD TRUE 0.981 -3.000 0.286 NA   NA
 3690696 3690697 MRA_1352 MRA_1353   fadD33 TRUE 0.992 -7.000 0.286 1.000 Y NA
 3690697 3690698 MRA_1353 MRA_1354 fadD33 fadE14 TRUE 0.992 0.000 0.200 1.000 Y NA
 3690700 3690701 MRA_t19 MRA_1356     FALSE 0.009 236.000 0.000 NA   NA
 3690701 3690702 MRA_1356 MRA_1357     TRUE 0.999 -3.000 0.686 0.004 Y NA
 3690702 3690703 MRA_1357 MRA_1358   fabG FALSE 0.021 129.000 0.000 1.000 N NA
 3690703 3690704 MRA_1358 MRA_1359 fabG   TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690704 3690705 MRA_1359 MRA_1360     FALSE 0.014 203.000 0.000 NA   NA
 3690706 3690707 MRA_1361 MRA_1362     FALSE 0.117 20.000 0.000 1.000 N NA
 3690707 3690708 MRA_1362 MRA_1363   moeY FALSE 0.258 9.000 0.000 1.000 N NA
 3690708 3690709 MRA_1363 MRA_1364 moeY   TRUE 0.973 -3.000 0.200 NA   NA
 3690709 3690710 MRA_1364 MRA_1365     FALSE 0.002 473.000 0.000 NA   NA
 3690711 3690712 MRA_1366 MRA_1367     FALSE 0.543 82.000 0.000 0.006   NA
 3690715 3690716 MRA_1370 MRA_1371     FALSE 0.005 315.000 0.000 NA   NA
 3690716 3690717 MRA_1371 MRA_1372     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690717 3690718 MRA_1372 MRA_1373     FALSE 0.005 291.000 0.000 NA   NA
 3690718 3690719 MRA_1373 MRA_1374   rsfA FALSE 0.328 139.000 0.000 1.000 Y NA
 3690720 3690721 MRA_1375 MRA_1376     TRUE 0.750 -31.000 0.000 NA   NA
 3690724 3690725 MRA_1379 MRA_1380     TRUE 0.802 51.000 0.308 0.068   NA
 3690726 3690727 MRA_1381 MRA_1382     TRUE 0.903 -3.000 0.028 1.000 N NA
 3690727 3690728 MRA_1382 MRA_1383     TRUE 0.703 6.000 0.000 1.000   NA
 3690730 3690731 MRA_1384 MRA_1385     TRUE 0.981 -3.000 0.282 NA   NA
 3690732 3690733 MRA_1386 MRA_1387     FALSE 0.396 11.000 0.000 NA   NA
 3690734 3690735 MRA_1388 MRA_1389 pyrR pyrB TRUE 0.995 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 3690735 3690736 MRA_1389 MRA_1390 pyrB pyrC TRUE 0.997 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 3690736 3690737 MRA_1390 MRA_1391 pyrC   TRUE 0.949 -3.000 0.057 NA   NA
 3690737 3690738 MRA_1391 MRA_1392   carA TRUE 0.947 -3.000 0.050 NA   NA
 3690738 3690739 MRA_1392 MRA_1393 carA carB TRUE 0.998 0.000 0.345 0.001 Y NA
 3690739 3690740 MRA_1393 MRA_1394 carB pyrF TRUE 0.993 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 3690740 3690741 MRA_1394 MRA_1395 pyrF   FALSE 0.016 195.000 0.000 NA   NA
 3690741 3690742 MRA_1395 MRA_1396     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 3690742 3690743 MRA_1396 MRA_1397   mihF FALSE 0.005 306.000 0.000 NA   NA
 3690743 3690744 MRA_1397 MRA_1398 mihF gmk FALSE 0.130 135.000 0.054 1.000   NA
 3690744 3690745 MRA_1398 MRA_1399 gmk rpoZ TRUE 0.616 66.000 0.471 1.000 N NA
 3690745 3690746 MRA_1399 MRA_1400 rpoZ dfp FALSE 0.590 16.000 0.192 1.000 N NA
 3690746 3690747 MRA_1400 MRA_1401 dfp metK FALSE 0.476 128.000 0.059 1.000 Y NA
 3690748 3690749 MRA_1402 MRA_1403   cyp132 TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.060 N NA
 3690751 3690752 MRA_1405 MRA_1406     FALSE 0.017 192.000 0.000 NA   NA
 3690752 3690753 MRA_1406 MRA_1407     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690753 3690754 MRA_1407 MRA_1408   lipH FALSE 0.170 83.000 0.000 1.000   NA
 3690754 3690755 MRA_1408 MRA_1409 lipH lipI TRUE 0.948 25.000 0.250 0.027 Y NA
 3690756 3690757 MRA_1410 MRA_1411   priA FALSE 0.233 81.000 0.050 NA   NA
 3690761 3690762 MRA_1415 MRA_1416 fmt fmu TRUE 0.996 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 3690762 3690763 MRA_1416 MRA_1417 fmu rpe FALSE 0.333 25.000 0.056 1.000 N NA
 3690763 3690764 MRA_1417 MRA_1418 rpe ribG TRUE 0.903 -3.000 0.028 1.000 N NA
 3690765 3690766 MRA_1419 MRA_1420   lprG TRUE 0.844 6.000 0.143 NA   NA
 3690767 3690768 MRA_1421 MRA_1422 ribC   FALSE 0.012 214.000 0.000 NA   NA
 3690768 3690769 MRA_1422 MRA_1423     TRUE 0.787 -10.000 0.000 NA   NA
 3690769 3690770 MRA_1423 MRA_1424   ribA2 FALSE 0.079 105.000 0.000 NA   NA
 3690770 3690771 MRA_1424 MRA_1425 ribA2 ribH TRUE 0.958 15.000 0.041 0.002 Y NA
 3690771 3690772 MRA_1425 MRA_1426 ribH   TRUE 0.927 -3.000 0.014 NA   NA
 3690772 3690773 MRA_1426 MRA_1427   lprH FALSE 0.527 25.000 0.143 NA   NA
 3690773 3690774 MRA_1427 MRA_1428 lprH   FALSE 0.020 180.000 0.000 NA   NA
 3690774 3690775 MRA_1428 MRA_1429   uvrC FALSE 0.143 64.000 0.000 NA   NA
 3690775 3690776 MRA_1429 MRA_1430 uvrC   TRUE 0.955 -3.000 0.073 NA   NA
 3690776 3690777 MRA_1430 MRA_1431     TRUE 0.979 -3.000 0.259 NA   NA
 3690777 3690778 MRA_1431 MRA_1432   whiA TRUE 0.989 -3.000 0.470 NA   NA
 3690781 3690782 MRA_1435 MRA_1436 lipO fadD12 TRUE 0.998 0.000 0.857 1.000 Y NA
 3690782 3690783 MRA_1436 MRA_1437 fadD12   TRUE 0.991 4.000 0.429 1.000 Y NA
 3690784 3690785 MRA_1438 MRA_1439     FALSE 0.009 240.000 0.000 NA   NA
 3690785 3690786 MRA_1439 MRA_1440     FALSE 0.067 111.000 0.000 NA   NA
 3690786 3690787 MRA_1440 MRA_1441     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 3690787 3690788 MRA_1441 MRA_1442     FALSE 0.025 164.000 0.000 NA   NA
 3690788 3690789 MRA_1442 MRA_1442A     FALSE 0.541 7.000 0.000 NA   NA
 3690791 3690792 MRA_1444 MRA_1445 gap pgk TRUE 0.993 3.000 0.055 0.003 Y NA
 3690792 3690793 MRA_1445 MRA_1446 pgk tpiA TRUE 0.993 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 3690800 3690801 MRA_1453 MRA_1454   devB FALSE 0.445 17.000 0.038 NA   NA
 3690801 3690802 MRA_1454 MRA_1455 devB opcA TRUE 0.993 -3.000 0.179 NA Y NA
 3690802 3690803 MRA_1455 MRA_1456 opcA zwf2 TRUE 0.760 53.000 0.104 NA Y NA
 3690803 3690804 MRA_1456 MRA_1457 zwf2 tal TRUE 0.992 -3.000 0.067 1.000 Y NA
 3690804 3690805 MRA_1457 MRA_1458 tal tkt TRUE 0.874 17.000 0.090 1.000 Y NA
 3690805 3690806 MRA_1458 MRA_1459 tkt   FALSE 0.003 439.000 0.000 NA   NA
 3690812 3690813 MRA_1465 MRA_1466     FALSE 0.385 112.000 0.022 0.044   NA
 3690813 3690814 MRA_1466 MRA_1467     TRUE 0.977 -3.000 0.186 1.000   NA
 3690814 3690815 MRA_1467 MRA_1468     FALSE 0.448 103.000 0.357 NA   NA
 3690816 3690817 MRA_1469 MRA_1470     TRUE 0.946 -3.000 0.100 1.000 N NA
 3690817 3690818 MRA_1470 MRA_1471     TRUE 0.994 -3.000 0.266 0.001 N NA
 3690818 3690819 MRA_1471 MRA_1472     TRUE 0.997 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 3690819 3690820 MRA_1472 MRA_1473   csd TRUE 0.891 2.000 0.093 1.000 N NA
 3690820 3690821 MRA_1473 MRA_1474 csd   TRUE 0.972 -3.000 0.249 1.000 N NA
 3690821 3690822 MRA_1474 MRA_1475     TRUE 0.923 -25.000 0.152 NA   NA
 3690823 3690824 MRA_1476 MRA_1477 fadE15   FALSE 0.300 107.000 0.222 NA   NA
 3690825 3690826 MRA_1478 MRA_1479 ctpD trxA FALSE 0.196 44.000 0.018 1.000 N NA
 3690826 3690827 MRA_1479 MRA_1480 trxA trxB1 TRUE 0.969 16.000 0.222 0.003 Y NA
 3690827 3690828 MRA_1480 MRA_1481 trxB1 echA12 TRUE 0.818 22.000 0.636 1.000 N NA
 3690828 3690829 MRA_1481 MRA_1482 echA12   FALSE 0.489 36.000 0.090 1.000   NA
 3690829 3690830 MRA_1482 MRA_1483     FALSE 0.319 97.000 0.191 NA   NA
 3690831 3690832 MRA_1484 MRA_1485   acn TRUE 0.763 11.000 0.256 1.000 N NA
 3690833 3690834 MRA_1486 MRA_1487     FALSE 0.011 226.000 0.000 NA   NA
 3690834 3690835 MRA_1487 MRA_1488     TRUE 0.796 11.000 0.250 NA   NA
 3690835 3690836 MRA_1488 MRA_1489   moxR1 FALSE 0.126 139.000 0.120 NA   NA
 3690836 3690837 MRA_1489 MRA_1490 moxR1   TRUE 0.995 -3.000 0.920 NA   NA
 3690837 3690838 MRA_1490 MRA_1491     TRUE 0.933 11.000 0.760 NA   NA
 3690840 3690841 MRA_1493 MRA_1494 fabG1 inhA TRUE 0.922 19.000 0.078 0.100 Y NA
 3690841 3690842 MRA_1494 MRA_1495 inhA hemH TRUE 0.669 6.000 0.038 1.000 N NA
 3690844 3690845 MRA_1496 MRA_1497     TRUE 0.888 22.000 0.259 NA Y NA
 3690845 3690846 MRA_1497 MRA_1498     TRUE 0.645 10.000 0.049 NA   NA
 3690846 3690847 MRA_1498 MRA_1499     FALSE 0.196 34.000 0.000 NA   NA
 3690847 3690848 MRA_1499 MRA_1500     FALSE 0.032 150.000 0.000 NA   NA
 3690850 3690851 MRA_1502 MRA_1503 mutA mutB TRUE 0.996 1.000 0.115 0.001 Y NA
 3690851 3690852 MRA_1503 MRA_1504 mutB   FALSE 0.325 14.000 0.000 NA   NA
 3690852 3690853 MRA_1504 MRA_1505     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690853 3690854 MRA_1505 MRA_1506     TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3690854 3690855 MRA_1506 MRA_1507   lipL FALSE 0.153 53.000 0.011 1.000 N NA
 3690856 3690857 MRA_1508 MRA_1509     FALSE 0.012 214.000 0.000 NA   NA
 3690858 3690859 MRA_1510 MRA_1511     FALSE 0.183 45.000 0.000 NA   NA
 3690859 3690860 MRA_1511 MRA_1512     FALSE 0.566 12.000 0.167 NA N NA
 3690860 3690861 MRA_1512 MRA_1513     FALSE 0.040 213.000 0.105 NA   NA
 3690862 3690863 MRA_1514 MRA_1515     FALSE 0.384 109.000 0.000 0.015   NA
 3690863 3690864 MRA_1515 MRA_1516     FALSE 0.104 137.000 0.027 1.000   NA
 3690864 3690865 MRA_1516 MRA_1517     TRUE 0.942 -3.000 0.004 1.000   NA
 3690865 3690866 MRA_1517 MRA_1518     FALSE 0.006 284.000 0.000 NA   NA
 3690866 3690867 MRA_1518 MRA_1519     FALSE 0.002 673.000 0.000 NA   NA
 3690868 3690869 MRA_1520 MRA_1521     TRUE 0.772 -16.000 0.000 NA   NA
 3690869 3690870 MRA_1521 MRA_1522     FALSE 0.014 202.000 0.000 NA   NA
 3690870 3690871 MRA_1522 MRA_1523   gmdA FALSE 0.002 481.000 0.000 NA   NA
 3690871 3690872 MRA_1523 MRA_1524 gmdA epiA TRUE 0.998 -3.000 0.160 0.003 Y NA
 3690872 3690873 MRA_1524 MRA_1525 epiA   TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690874 3690875 MRA_1526 MRA_1527     FALSE 0.195 35.000 0.000 NA   NA
 3690875 3690876 MRA_1527 MRA_1528     TRUE 0.750 3.000 0.000 NA   NA
 3690877 3690878 MRA_1529 MRA_1530     FALSE 0.469 9.000 0.000 NA   NA
 3690878 3690879 MRA_1530 MRA_1531     FALSE 0.049 130.000 0.000 NA   NA
 3690879 3690880 MRA_1531 MRA_1532     FALSE 0.224 26.000 0.000 NA   NA
 3690880 3690881 MRA_1532 MRA_1533   fadD25 FALSE 0.001 234.000 0.000 NA N NA
 3690883 3690884 MRA_1535 MRA_1536     FALSE 0.094 30.000 0.000 1.000 N NA
 3690884 3690885 MRA_1536 MRA_1537   wbbL2 FALSE 0.180 47.000 0.000 NA   NA
 3690886 3690887 MRA_1538 MRA_1539   pks5 FALSE 0.109 23.000 0.000 1.000 N NA
 3690887 3690888 MRA_1539 MRA_1540 pks5 papA4 FALSE 0.002 544.000 0.000 NA   NA
 3690889 3690890 MRA_1541 MRA_1542 fadD24 adh FALSE 0.024 117.000 0.000 1.000 N NA
 3690890 3690891 MRA_1542 MRA_1543 adh   TRUE 0.982 -3.000 0.300 NA   NA
 3690893 3690894 MRA_1545 MRA_1546     TRUE 0.925 -3.000 0.000 1.000   NA
 3690894 3690895 MRA_1546 MRA_1547     FALSE 0.002 565.000 0.000 NA   NA
 3690895 3690896 MRA_1547 MRA_1548   ileS FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 3690896 3690897 MRA_1548 MRA_1549 ileS dinX FALSE 0.013 212.000 0.014 1.000 N NA
 3690899 3690900 MRA_1551 MRA_1552 lspA   TRUE 0.890 -7.000 0.073 1.000 N NA
 3690901 3690902 MRA_1553 MRA_1554 lprI glbN FALSE 0.307 55.000 0.050 NA   NA
 3690903 3690904 MRA_1555 MRA_1556     TRUE 0.989 5.000 0.750 0.063   NA
 3690904 3690905 MRA_1556 MRA_1557     FALSE 0.243 22.000 0.000 NA   NA
 3690905 3690906 MRA_1557 MRA_1558     FALSE 0.174 49.000 0.000 NA   NA
 3690906 3690907 MRA_1558 MRA_1559   dnaE FALSE 0.184 68.000 0.003 NA   NA
 3690909 3690910 MRA_1561 MRA_1562 fadD11.1 fadD11 TRUE 0.946 -321.000 0.000 0.060   NA
 3690910 3690911 MRA_1562 MRA_1563 fadD11 plsB1 TRUE 0.969 14.000 0.333 0.099 Y NA
 3690911 3690912 MRA_1563 MRA_1564 plsB1 frdA FALSE 0.001 371.000 0.000 1.000 N NA
 3690912 3690913 MRA_1564 MRA_1565 frdA frdB TRUE 0.997 3.000 0.470 0.003 Y NA
 3690913 3690914 MRA_1565 MRA_1566 frdB frdC TRUE 0.999 -3.000 0.454 0.003 Y NA
 3690914 3690915 MRA_1566 MRA_1567 frdC frdD TRUE 0.999 -3.000 0.787 0.003 Y NA
 3690915 3690916 MRA_1567 MRA_1568 frdD   FALSE 0.059 68.000 0.000 1.000 N NA
 3690916 3690917 MRA_1568 MRA_1569   mmpL6 FALSE 0.064 139.000 0.000 1.000   NA
 3690917 3690918 MRA_1569 MRA_1570 mmpL6   FALSE 0.437 10.000 0.000 NA   NA
 3690918 3690919 MRA_1570 MRA_1571   ilvA FALSE 0.332 35.000 0.033 NA   NA
 3690919 3690920 MRA_1571 MRA_1572 ilvA   FALSE 0.017 38.000 0.000 NA N NA
 3690920 3690921 MRA_1572 MRA_1573     FALSE 0.591 6.000 0.000 NA   NA
 3690922 3690923 MRA_1574 MRA_1575 treZ treY TRUE 0.997 -7.000 0.263 0.004 Y NA
 3690923 3690924 MRA_1575 MRA_1576 treY treX TRUE 0.992 4.000 0.061 0.004 Y NA
 3690924 3690925 MRA_1576 MRA_1577 treX   FALSE 0.321 39.000 0.073 1.000 N NA
 3690925 3690926 MRA_1577 MRA_1578     FALSE 0.403 99.000 0.400 NA N NA
 3690926 3690927 MRA_1578 MRA_1579     FALSE 0.009 240.000 0.000 NA   NA
 3690928 3690929 MRA_1580 MRA_1581 bioA bioF1 TRUE 0.998 -3.000 0.033 0.001 Y NA
 3690929 3690930 MRA_1581 MRA_1582 bioF1 bioD TRUE 0.998 -3.000 0.214 0.001 Y NA
 3690930 3690931 MRA_1582 MRA_1583 bioD   TRUE 0.937 0.000 0.036 1.000   NA
 3690931 3690932 MRA_1583 MRA_1584     FALSE 0.007 266.000 0.000 NA   NA
 3690932 3690933 MRA_1584 MRA_1585     FALSE 0.013 206.000 0.000 NA   NA
 3690933 3690934 MRA_1585 MRA_1586     TRUE 0.745 -42.000 0.000 NA   NA
 3690935 3690936 MRA_1587 MRA_1588     FALSE 0.501 8.000 0.000 NA   NA
 3690936 3690937 MRA_1588 MRA_1589     FALSE 0.023 174.000 0.000 NA   NA
 3690937 3690938 MRA_1589 MRA_1590     FALSE 0.115 81.000 0.000 NA   NA
 3690938 3690939 MRA_1590 MRA_1591     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690939 3690940 MRA_1591 MRA_1592     FALSE 0.325 14.000 0.000 NA   NA
 3690940 3690941 MRA_1592 MRA_1593     FALSE 0.016 196.000 0.000 NA   NA
 3690941 3690942 MRA_1593 MRA_1594     TRUE 0.836 0.000 0.000 NA   NA
 3690942 3690943 MRA_1594 MRA_1595     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690943 3690944 MRA_1595 MRA_1596     FALSE 0.158 56.000 0.000 NA   NA
 3690944 3690945 MRA_1596 MRA_1597     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3690945 3690946 MRA_1597 MRA_1598     TRUE 0.728 -343.000 0.000 NA   NA
 3690946 3690947 MRA_1598 MRA_1598A     TRUE 0.655 5.000 0.000 NA   NA
 3690948 3690949 MRA_1599 MRA_1600 bioB   TRUE 0.899 1.000 0.041 NA   NA
 3690949 3690950 MRA_1600 MRA_1601     TRUE 0.985 -3.000 0.361 NA   NA
 3690951 3690952 MRA_1602 MRA_1603     FALSE 0.049 257.000 0.273 NA   NA
 3690953 3690954 MRA_1604 MRA_1605 nadA nadB TRUE 0.997 0.000 0.210 0.002 Y NA
 3690954 3690955 MRA_1605 MRA_1606 nadB nadC TRUE 0.998 0.000 0.223 0.002 Y NA
 3690955 3690956 MRA_1606 MRA_1607 nadC   FALSE 0.257 49.000 0.000 1.000   NA
 3690958 3690959 MRA_1609 MRA_1610 hisD hisC1 TRUE 0.998 -3.000 0.112 0.003 Y NA
 3690959 3690960 MRA_1610 MRA_1611 hisC1 hisB TRUE 0.999 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 3690960 3690961 MRA_1611 MRA_1612 hisB hisH TRUE 0.997 -3.000 0.046 0.003 Y NA
 3690961 3690962 MRA_1612 MRA_1613 hisH hisA TRUE 0.991 10.000 0.491 0.003 Y NA
 3690962 3690963 MRA_1613 MRA_1614 hisA impA TRUE 0.836 8.000 0.266 1.000 N NA
 3690963 3690964 MRA_1614 MRA_1615 impA hisF TRUE 0.802 2.000 0.021 1.000 N NA
 3690964 3690965 MRA_1615 MRA_1616 hisF hisI TRUE 0.999 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 3690965 3690966 MRA_1616 MRA_1617 hisI chaA FALSE 0.015 181.000 0.002 1.000 N NA
 3690968 3690969 MRA_1619 MRA_1620 trpE   TRUE 0.986 -10.000 0.690 NA   NA
 3690969 3690970 MRA_1620 MRA_1621   trpC FALSE 0.236 90.000 0.070 NA   NA
 3690970 3690971 MRA_1621 MRA_1622 trpC trpB TRUE 0.903 69.000 0.070 0.001 Y NA
 3690971 3690972 MRA_1622 MRA_1623 trpB trpA TRUE 0.997 0.000 0.153 0.001 Y NA
 3690972 3690973 MRA_1623 MRA_1624 trpA lgt TRUE 0.826 0.000 0.011 1.000 N NA
 3690973 3690974 MRA_1624 MRA_1625 lgt   FALSE 0.002 676.000 0.000 NA   NA
 3690974 3690975 MRA_1625 MRA_1626     TRUE 0.925 -10.000 0.111 NA   NA
 3690975 3690976 MRA_1626 MRA_1627   pykA FALSE 0.235 108.000 0.083 1.000   NA
 3690976 3690977 MRA_1627 MRA_1628 pykA tesB1 TRUE 0.881 8.000 0.361 1.000 N NA
 3690977 3690978 MRA_1628 MRA_1629 tesB1   FALSE 0.480 58.000 0.214 NA   NA
 3690979 3690980 MRA_1630 MRA_1631 cydC cydD TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 3690980 3690981 MRA_1631 MRA_1632 cydD cydB TRUE 0.711 87.000 0.151 1.000 Y NA
 3690981 3690982 MRA_1632 MRA_1633 cydB cydA TRUE 0.981 30.000 0.925 0.043 Y NA
 3690982 3690983 MRA_1633 MRA_1634 cydA   FALSE 0.189 111.000 0.104 NA   NA
 3690983 3690984 MRA_1634 MRA_1635   cya FALSE 0.536 29.000 0.176 NA   NA
 3690984 3690985 MRA_1635 MRA_t20 cya   FALSE 0.133 70.000 0.000 NA   NA
 3690987 3690988 MRA_1637 MRA_1638     TRUE 0.995 -3.000 0.850 NA   NA
 3690989 3690990 MRA_1639 MRA_1640 polA rpsA FALSE 0.020 163.000 0.005 1.000 N NA
 3690990 3690991 MRA_1640 MRA_1641 rpsA coaE FALSE 0.250 26.000 0.024 1.000 N NA
 3690993 3690994 MRA_1643 MRA_1644 uvrB   TRUE 0.943 -3.000 0.006 1.000   NA
 3690999 3691000 MRA_1649 MRA_1650     FALSE 0.291 16.000 0.000 NA   NA
 3691000 3691001 MRA_1650 MRA_1651   lysS FALSE 0.311 59.000 0.057 NA   NA
 3691002 3691003 MRA_1652 MRA_1653 infC rpmI TRUE 0.929 50.000 0.652 1.000 Y NA
 3691003 3691004 MRA_1653 MRA_1654 rpmI rplT TRUE 0.973 62.000 0.928 0.015 Y NA
 3691004 3691005 MRA_1654 MRA_1655 rplT tsnR TRUE 0.912 33.000 0.057 0.012 Y NA
 3691007 3691008 MRA_1657 MRA_1658     FALSE 0.341 78.000 0.143 NA   NA
 3691008 3691009 MRA_1658 MRA_1659     TRUE 0.856 7.000 0.214 NA   NA
 3691009 3691010 MRA_1659 MRA_1660   pheS FALSE 0.022 196.000 0.002 NA   NA
 3691010 3691011 MRA_1660 MRA_1661 pheS pheT TRUE 0.999 0.000 0.574 0.001 Y NA
 3691013 3691014 MRA_1663 MRA_1664 argC argJ TRUE 0.999 -3.000 0.303 0.002 Y NA
 3691014 3691015 MRA_1664 MRA_1665 argJ argB TRUE 0.998 -3.000 0.239 0.002 Y NA
 3691015 3691016 MRA_1665 MRA_1666 argB argD TRUE 0.993 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 3691016 3691017 MRA_1666 MRA_1667 argD argF TRUE 0.993 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 3691017 3691018 MRA_1667 MRA_1668 argF argR TRUE 0.942 -3.000 0.088 1.000 N NA
 3691018 3691019 MRA_1668 MRA_1669 argR argG FALSE 0.591 9.000 0.054 1.000 N NA
 3691019 3691020 MRA_1669 MRA_1670 argG argH TRUE 0.799 80.000 0.278 1.000 Y NA
 3691020 3691021 MRA_1670 MRA_1671 argH pks10 FALSE 0.055 109.000 0.003 1.000 N NA
 3691021 3691022 MRA_1671 MRA_1672 pks10 pks7 TRUE 0.964 83.000 1.000 0.017 Y NA
 3691022 3691023 MRA_1672 MRA_1673 pks7 pks8 TRUE 0.987 20.000 1.000 0.009 Y NA
 3691023 3691024 MRA_1673 MRA_1674 pks8 pks17 TRUE 0.994 0.000 0.000 0.009 Y NA
 3691024 3691025 MRA_1674 MRA_1675 pks17 pks9 TRUE 0.980 6.000 0.000 0.005 Y NA
 3691025 3691026 MRA_1675 MRA_1676 pks9 pks11 TRUE 0.854 147.000 0.750 0.017 Y NA
 3691027 3691028 MRA_1677 MRA_1678 cyp139   FALSE 0.502 15.000 0.008 1.000   NA
 3691028 3691029 MRA_1678 MRA_1679     TRUE 0.977 -6.000 0.008 0.015   NA
 3691030 3691031 MRA_1679A MRA_1680     FALSE 0.197 33.000 0.000 NA   NA
 3691031 3691032 MRA_1680 MRA_1681     FALSE 0.501 8.000 0.000 NA   NA
 3691033 3691034 MRA_1682 MRA_1683     FALSE 0.008 93.000 0.000 NA N NA
 3691034 3691035 MRA_1683 MRA_1684     FALSE 0.020 28.000 0.000 NA N NA
 3691038 3691039 MRA_1687 MRA_1688   dsbF TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.003   NA
 3691039 3691040 MRA_1688 MRA_1689 dsbF   FALSE 0.086 101.000 0.000 NA   NA
 3691040 3691041 MRA_1689 MRA_1690   fadE16 TRUE 0.916 0.000 0.037 NA   NA
 3691041 3691042 MRA_1690 MRA_1691 fadE16   TRUE 0.738 9.000 0.222 NA N NA
 3691042 3691043 MRA_1691 MRA_1692   moeX TRUE 0.945 -3.000 0.047 NA   NA
 3691043 3691044 MRA_1692 MRA_1693 moeX   FALSE 0.027 161.000 0.000 NA   NA
 3691044 3691045 MRA_1693 MRA_1694     FALSE 0.007 274.000 0.000 NA   NA
 3691045 3691046 MRA_1694 MRA_1694A     TRUE 0.871 -7.000 0.013 NA   NA
 3691047 3691048 MRA_1695 MRA_1696     TRUE 0.977 2.000 0.400 1.000   NA
 3691048 3691049 MRA_1696 MRA_1697     TRUE 0.843 72.000 0.089 0.079 Y NA
 3691050 3691051 MRA_1698 MRA_1699 mpg tyrS FALSE 0.514 12.000 0.067 1.000 N NA
 3691051 3691052 MRA_1699 MRA_1700 tyrS lprJ FALSE 0.002 651.000 0.000 NA   NA
 3691052 3691053 MRA_1700 MRA_1701 lprJ   FALSE 0.192 39.000 0.000 NA   NA
 3691053 3691054 MRA_1701 MRA_1702     TRUE 0.991 -3.000 0.500 1.000   NA
 3691054 3691055 MRA_1702 MRA_1702A     TRUE 0.967 -3.000 0.083 1.000   NA
 3691055 3691056 MRA_1702A MRA_1703   tlyA TRUE 0.709 8.000 0.014 1.000   NA
 3691056 3691057 MRA_1703 MRA_1704 tlyA ppnK TRUE 0.929 0.000 0.120 1.000 N NA
 3691057 3691058 MRA_1704 MRA_1705 ppnK recN FALSE 0.522 14.000 0.094 1.000 N NA
 3691058 3691059 MRA_1705 MRA_1706 recN   FALSE 0.475 96.000 0.049 0.079   NA
 3691059 3691060 MRA_1706 MRA_1707     TRUE 0.876 22.000 0.798 NA   NA
 3691060 3691061 MRA_1707 MRA_1708   pyrG FALSE 0.064 140.000 0.014 NA   NA
 3691061 3691062 MRA_1708 MRA_1709 pyrG   TRUE 0.931 -7.000 0.055 1.000   NA
 3691062 3691063 MRA_1709 MRA_1710   xerD TRUE 0.963 -3.000 0.063 1.000   NA
 3691064 3691065 MRA_1711 MRA_1712     FALSE 0.002 556.000 0.000 NA   NA
 3691065 3691066 MRA_1712 MRA_1713   cycA FALSE 0.213 65.000 0.000 1.000   NA
 3691066 3691067 MRA_1713 MRA_1714 cycA   FALSE 0.017 41.000 0.000 NA N NA
 3691067 3691068 MRA_1714 MRA_1715     TRUE 0.700 40.000 0.000 NA Y NA
 3691068 3691069 MRA_1715 MRA_1716     FALSE 0.002 604.000 0.000 NA   NA
 3691070 3691071 MRA_1717 MRA_1718     FALSE 0.122 18.000 0.000 1.000 N NA
 3691071 3691072 MRA_1718 MRA_1719     TRUE 0.952 -3.000 0.065 NA   NA
 3691072 3691073 MRA_1719 MRA_1720     TRUE 0.991 -3.000 0.570 NA   NA
 3691073 3691074 MRA_1720 MRA_1721     TRUE 0.961 -3.000 0.224 NA N NA
 3691074 3691075 MRA_1721 MRA_1722   cmk TRUE 0.916 -3.000 0.042 1.000 N NA
 3691075 3691076 MRA_1722 MRA_1723 cmk engA TRUE 0.989 -3.000 0.060 0.014   NA
 3691076 3691077 MRA_1723 MRA_1724 engA   FALSE 0.036 174.000 0.000 1.000   NA
 3691077 3691078 MRA_1724 MRA_1725   fadB3 TRUE 0.991 -6.000 0.000 0.062 Y NA
 3691078 3691079 MRA_1725 MRA_1726 fadB3   TRUE 0.908 3.000 0.105 NA   NA
 3691079 3691080 MRA_1726 MRA_1727     TRUE 0.836 0.000 0.000 NA   NA
 3691080 3691081 MRA_1727 MRA_1728     FALSE 0.162 53.000 0.000 NA   NA
 3691081 3691082 MRA_1728 MRA_1729     FALSE 0.441 14.000 0.000 1.000   NA
 3691082 3691083 MRA_1729 MRA_t21     FALSE 0.016 193.000 0.000 NA   NA
 3691084 3691085 MRA_1730 MRA_1731     TRUE 0.969 -3.000 0.167 NA   NA
 3691086 3691087 MRA_1732 MRA_1733     TRUE 0.951 -3.000 0.121 1.000 N NA
 3691088 3691089 MRA_1734 MRA_1735     TRUE 0.787 -10.000 0.000 NA   NA
 3691090 3691091 MRA_1736 MRA_1737     FALSE 0.197 33.000 0.000 NA   NA
 3691092 3691093 MRA_1738 MRA_1739     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3691093 3691094 MRA_1739 MRA_1740     FALSE 0.004 123.000 0.000 NA N NA
 3691096 3691097 MRA_1742 MRA_1743     FALSE 0.143 64.000 0.000 NA   NA
 3691097 3691098 MRA_1743 MRA_1744     FALSE 0.006 287.000 0.000 NA   NA
 3691098 3691099 MRA_1744 MRA_1745     FALSE 0.011 275.000 0.000 1.000   NA
 3691099 3691100 MRA_1745 MRA_1746     FALSE 0.409 99.000 0.000 0.045   NA
 3691100 3691101 MRA_1746 MRA_1747   narX FALSE 0.140 99.000 0.000 1.000   NA
 3691101 3691102 MRA_1747 MRA_1748 narX narK2 TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3691105 3691106 MRA_1751 MRA_1752     TRUE 0.836 0.000 0.000 NA   NA
 3691106 3691107 MRA_1752 MRA_1753     FALSE 0.501 8.000 0.000 NA   NA
 3691107 3691108 MRA_1753 MRA_1754   pknE FALSE 0.097 94.000 0.000 NA   NA
 3691109 3691110 MRA_1755 MRA_1756   idi TRUE 0.787 -10.000 0.000 NA   NA
 3691111 3691112 MRA_1757 MRA_1758 pknF   FALSE 0.389 62.000 0.000 0.078 N NA
 3691112 3691113 MRA_1758 MRA_1759     FALSE 0.003 373.000 0.000 NA   NA
 3691114 3691115 MRA_1760 MRA_1761   fadD1 FALSE 0.109 84.000 0.000 NA   NA
 3691116 3691117 MRA_1762 MRA_1763     FALSE 0.052 127.000 0.000 NA   NA
 3691118 3691119 MRA_1764 MRA_1765     FALSE 0.014 204.000 0.000 NA   NA
 3691119 3691120 MRA_1765 MRA_1766   plcD FALSE 0.019 184.000 0.000 NA   NA
 3691120 3691121 MRA_1766 MRA_1767 plcD   FALSE 0.049 80.000 0.000 1.000 N NA
 3691121 3691122 MRA_1767 MRA_1768     TRUE 0.803 51.000 0.308 0.064   NA
 3691122 3691123 MRA_1768 MRA_1768A     TRUE 0.818 -225.000 0.000 1.000   NA
 3691123 3691124 MRA_1768A MRA_1768B     FALSE 0.080 129.000 0.000 1.000   NA
 3691125 3691126 MRA_1768C MRA_1768D   mmpL14 FALSE 0.024 201.000 0.000 1.000   NA
 3691127 3691128 MRA_1769 MRA_1770     TRUE 0.803 51.000 0.308 0.064   NA
 3691131 3691132 MRA_1773 MRA_1774     FALSE 0.020 181.000 0.000 NA   NA
 3691133 3691134 MRA_1775 MRA_1776     TRUE 0.993 0.000 1.000 NA   NA
 3691135 3691136 MRA_1777 MRA_1778     TRUE 0.803 51.000 0.308 0.064   NA
 3691136 3691137 MRA_1778 MRA_1779     TRUE 0.985 -133.000 0.286 0.010   NA
 3691138 3691139 MRA_1780 MRA_1781     FALSE 0.003 627.000 0.000 1.000   NA
 3691140 3691141 MRA_1782 MRA_1783     FALSE 0.136 68.000 0.000 NA   NA
 3691141 3691142 MRA_1783 MRA_1784     FALSE 0.058 181.000 0.087 NA   NA
 3691142 3691143 MRA_1784 MRA_1785     FALSE 0.055 156.000 0.025 NA   NA
 3691143 3691144 MRA_1785 MRA_1786     TRUE 0.636 8.000 0.016 NA   NA
 3691144 3691145 MRA_1786 MRA_1787     TRUE 0.949 -3.000 0.016 1.000   NA
 3691145 3691146 MRA_1787 MRA_1788     FALSE 0.018 189.000 0.000 NA   NA
 3691148 3691149 MRA_1790 MRA_1791     TRUE 0.937 0.000 0.080 NA   NA
 3691152 3691153 MRA_1794 MRA_1795     FALSE 0.029 156.000 0.000 NA   NA
 3691156 3691157 MRA_1797 MRA_1798     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3691159 3691160 MRA_1800 MRA_1801     FALSE 0.002 150.000 0.000 NA N NA
 3691160 3691161 MRA_1801 MRA_1802     FALSE 0.119 79.000 0.000 NA   NA
 3691161 3691162 MRA_1802 MRA_1803     TRUE 0.896 14.000 0.667 NA   NA
 3691162 3691163 MRA_1803 MRA_1804     FALSE 0.025 454.000 0.000 NA Y NA
 3691163 3691164 MRA_1804 MRA_1805     FALSE 0.003 427.000 0.000 NA   NA
 3691164 3691165 MRA_1805 MRA_1806   esxN FALSE 0.002 491.000 0.000 NA   NA
 3691165 3691166 MRA_1806 MRA_1807 esxN   FALSE 0.552 88.000 0.429 NA   NA
 3691166 3691167 MRA_1807 MRA_1808     FALSE 0.007 272.000 0.000 NA   NA
 3691167 3691168 MRA_1808 MRA_1809   mycP5 TRUE 0.989 -22.000 1.000 NA   NA
 3691168 3691169 MRA_1809 MRA_1810 mycP5   TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3691169 3691170 MRA_1810 MRA_1811     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 3691170 3691171 MRA_1811 MRA_1812   lppT FALSE 0.002 627.000 0.000 NA   NA
 3691171 3691172 MRA_1812 MRA_1813 lppT   FALSE 0.083 103.000 0.000 NA   NA
 3691172 3691173 MRA_1813 MRA_1814     FALSE 0.020 581.000 0.000 NA Y NA
 3691173 3691174 MRA_1814 MRA_1815     FALSE 0.409 112.000 0.000 NA Y NA
 3691175 3691176 MRA_1816 MRA_1817     FALSE 0.033 148.000 0.000 NA   NA
 3691176 3691177 MRA_1817 MRA_1817A     FALSE 0.004 338.000 0.000 NA   NA
 3691178 3691179 MRA_1818 MRA_1819     FALSE 0.308 15.000 0.000 NA   NA
 3691179 3691180 MRA_1819 MRA_1820     FALSE 0.042 324.000 0.000 NA Y NA
 3691180 3691181 MRA_1820 MRA_1821     TRUE 0.741 132.000 0.667 NA Y NA
 3691181 3691182 MRA_1821 MRA_1822     FALSE 0.195 245.000 1.000 NA   NA
 3691182 3691183 MRA_1822 MRA_1823   mgtC FALSE 0.050 154.000 0.014 NA   NA
 3691184 3691185 MRA_1824 MRA_1825     FALSE 0.004 322.000 0.000 NA   NA
 3691186 3691187 MRA_1826 MRA_1827 erg3   FALSE 0.162 105.000 0.045 NA   NA
 3691187 3691188 MRA_1827 MRA_1828     FALSE 0.217 63.000 0.000 1.000   NA
 3691188 3691189 MRA_1828 MRA_1829     FALSE 0.001 635.000 0.000 1.000 N NA
 3691190 3691191 MRA_1830 MRA_1831     FALSE 0.044 135.000 0.000 NA   NA
 3691192 3691193 MRA_1832 MRA_1833 ilvG secA2 FALSE 0.483 15.000 0.082 1.000 N NA
 3691193 3691194 MRA_1833 MRA_1834 secA2 pgsA2 FALSE 0.022 197.000 0.038 1.000 N NA
 3691194 3691195 MRA_1834 MRA_1835 pgsA2   TRUE 0.932 -7.000 0.114 NA   NA
 3691195 3691196 MRA_1835 MRA_1836     TRUE 0.733 29.000 0.409 NA   NA
 3691196 3691197 MRA_1836 MRA_1837     TRUE 0.793 17.000 0.409 NA   NA
 3691197 3691198 MRA_1837 MRA_1838   gcvH TRUE 0.723 38.000 0.434 NA   NA
 3691198 3691199 MRA_1838 MRA_1839 gcvH cfp17 FALSE 0.031 240.000 0.242 NA N NA
 3691199 3691200 MRA_1839 MRA_1840 cfp17   TRUE 0.991 -3.000 0.707 NA N NA
 3691200 3691201 MRA_1840 MRA_1841     FALSE 0.180 119.000 0.133 NA   NA
 3691201 3691202 MRA_1841 MRA_1842     FALSE 0.007 404.000 0.043 NA   NA
 3691202 3691203 MRA_1842 MRA_1842A     FALSE 0.276 53.000 0.028 NA   NA
 3691203 3691204 MRA_1842A MRA_1843   gcvB FALSE 0.228 49.000 0.002 NA   NA
 3691207 3691208 MRA_1846 MRA_1847     FALSE 0.291 16.000 0.000 NA   NA
 3691208 3691209 MRA_1847 MRA_1848   glcB FALSE 0.154 120.000 0.089 NA   NA
 3691209 3691210 MRA_1848 MRA_1849 glcB   FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 3691210 3691211 MRA_1849 MRA_1850     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3691211 3691212 MRA_1850 MRA_1851     FALSE 0.152 59.000 0.000 NA   NA
 3691212 3691213 MRA_1851 MRA_1852     FALSE 0.025 163.000 0.000 NA   NA
 11482671 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5694.000 0.000 NA   NA
 11625034 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5694.000 0.000 NA   NA
 11767426 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5694.000 0.000 NA   NA
 11482672 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5714.000 0.000 NA   NA
 11625035 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5714.000 0.000 NA   NA
 11767427 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5714.000 0.000 NA   NA
 11482673 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5763.000 0.000 NA   NA
 11625036 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5763.000 0.000 NA   NA
 11767428 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5763.000 0.000 NA   NA
 11482674 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5783.000 0.000 NA   NA
 11625037 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5783.000 0.000 NA   NA
 11767429 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5783.000 0.000 NA   NA
 11482675 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5802.000 0.000 NA   NA
 11625038 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5802.000 0.000 NA   NA
 11767430 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5802.000 0.000 NA   NA
 11482676 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5822.000 0.000 NA   NA
 11625039 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5822.000 0.000 NA   NA
 11767431 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5822.000 0.000 NA   NA
 11482677 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5853.000 0.000 NA   NA
 11625040 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5853.000 0.000 NA   NA
 11767432 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5853.000 0.000 NA   NA
 11482678 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5873.000 0.000 NA   NA
 11625041 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5873.000 0.000 NA   NA
 11767433 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5873.000 0.000 NA   NA
 11482679 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5892.000 0.000 NA   NA
 11625042 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5892.000 0.000 NA   NA
 11767434 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5892.000 0.000 NA   NA
 11482680 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5912.000 0.000 NA   NA
 11625043 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5912.000 0.000 NA   NA
 11767435 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5912.000 0.000 NA   NA
 11482681 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5937.000 0.000 NA   NA
 11625044 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5937.000 0.000 NA   NA
 11767436 3691207   MRA_1846     FALSE NA 5937.000 0.000 NA   NA
 3691213 3691214 MRA_1852 MRA_1853     TRUE 0.996 0.000 0.815 0.057   NA
 3691214 3691215 MRA_1853 MRA_1854   guaB1 FALSE 0.157 174.000 0.038 0.094   NA
 3691215 3691216 MRA_1854 MRA_1855 guaB1 gnd1 FALSE 0.220 33.000 0.023 1.000 N NA
 3691216 3691217 MRA_1855 MRA_1856 gnd1   FALSE 0.232 30.000 0.023 1.000 N NA
 3691217 3691218 MRA_1856 MRA_1857     TRUE 0.903 15.000 0.850 1.000 N NA
 3691219 3691220 MRA_1858 MRA_1859   ureA FALSE 0.402 49.000 0.222 NA N NA
 3691220 3691221 MRA_1859 MRA_1860 ureA ureB TRUE 0.998 -3.000 0.052 0.001 Y NA
 3691221 3691222 MRA_1860 MRA_1861 ureB ureC TRUE 0.999 0.000 0.486 0.001 Y NA
 3691222 3691223 MRA_1861 MRA_1862 ureC ureF TRUE 0.984 0.000 0.061 0.002 N NA
 3691223 3691224 MRA_1862 MRA_1863 ureF ureG TRUE 0.989 11.000 0.439 0.002 Y NA
 3691224 3691225 MRA_1863 MRA_1864 ureG ureD TRUE 0.937 8.000 0.032 0.002   NA
 3691226 3691227 MRA_1865 MRA_1866 ndh   TRUE 0.661 142.000 0.500 1.000 Y NA
 3691227 3691228 MRA_1866 MRA_1867     TRUE 0.746 39.000 0.571 1.000 N NA
 3691229 3691230 MRA_1868 MRA_1869 modA modB TRUE 0.998 3.000 0.578 0.001 Y NA
 3691230 3691231 MRA_1869 MRA_1870 modB modC TRUE 0.944 7.000 0.018 1.000 Y NA
 3691231 3691232 MRA_1870 MRA_1871 modC apa FALSE 0.383 53.000 0.052 1.000   NA
 3691232 3691233 MRA_1871 MRA_1872 apa   FALSE 0.017 452.000 0.238 1.000   NA
 3691233 3691234 MRA_1872 MRA_1873   adhA FALSE 0.449 74.000 0.189 1.000   NA
 3691235 3691236 MRA_1874 MRA_1875     TRUE 0.803 -7.000 0.000 NA   NA
 3691236 3691237 MRA_1875 MRA_1876     TRUE 0.925 -3.000 0.000 1.000   NA
 3691238 3691239 MRA_1877 MRA_1878     FALSE 0.016 288.000 0.143 1.000 N NA
 3691239 3691240 MRA_1878 MRA_1879     FALSE 0.281 99.000 0.214 1.000 N NA
 3691241 3691242 MRA_1880 MRA_1881     FALSE 0.137 100.000 0.000 1.000   NA
 3691242 3691243 MRA_1881 MRA_1882     FALSE 0.141 65.000 0.000 NA   NA
 3691243 3691244 MRA_1882 MRA_1883   lldD2 FALSE 0.237 23.000 0.000 NA   NA
 3691245 3691246 MRA_1884 MRA_1885     FALSE 0.128 73.000 0.000 NA   NA
 3691246 3691247 MRA_1885 MRA_1886     TRUE 0.747 11.000 0.188 NA   NA
 3691247 3691248 MRA_1886 MRA_1887   bfrA FALSE 0.004 516.000 0.000 1.000   NA
 3691248 3691249 MRA_1887 MRA_1888 bfrA   FALSE 0.246 85.000 0.135 1.000 N NA
 3691249 3691250 MRA_1888 MRA_1889   glnA3 FALSE 0.069 55.000 0.000 1.000 N NA
 3691250 3691251 MRA_1889 MRA_1890 glnA3   TRUE 0.970 3.000 0.364 1.000   NA
 3691252 3691253 MRA_1891 MRA_1892 cyp140 lppE FALSE 0.572 50.000 0.273 NA   NA
 3691253 3691254 MRA_1892 MRA_1893 lppE   FALSE 0.391 41.000 0.070 NA   NA
 3691254 3691255 MRA_1893 MRA_1894     FALSE 0.461 28.000 0.093 NA   NA
 3691255 3691256 MRA_1894 MRA_1895   rpfC TRUE 0.690 39.000 0.375 NA   NA
 3691256 3691257 MRA_1895 MRA_1896 rpfC   FALSE 0.588 12.000 0.018 1.000   NA
 3691257 3691258 MRA_1896 MRA_1897   fbpB FALSE 0.385 18.000 0.018 NA   NA
 3691260 3691261 MRA_1899 MRA_1899A     FALSE 0.003 365.000 0.000 NA   NA
 3691261 3691262 MRA_1899A MRA_1900     FALSE 0.186 44.000 0.000 NA   NA
 3691262 3691263 MRA_1900 MRA_1901     FALSE 0.152 59.000 0.000 NA   NA
 3691264 3691265 MRA_1902 MRA_1903     TRUE 0.758 17.000 0.333 NA   NA
 3691265 3691266 MRA_1903 MRA_1904     TRUE 0.879 10.000 0.375 NA   NA
 3691268 3691269 MRA_1906 MRA_1907     FALSE 0.033 148.000 0.000 NA   NA
 3691270 3691271 MRA_1908 MRA_1909     FALSE 0.313 5.000 0.004 NA N NA
 3691273 3691274 MRA_1910 MRA_1911 lppD lipJ TRUE 0.836 0.000 0.000 NA   NA
 3691277 3691278 MRA_1914 MRA_1915     FALSE 0.018 186.000 0.000 NA   NA
 3691279 3691280 MRA_1916 MRA_1917 aao   FALSE 0.497 30.000 0.143 NA   NA
 3691280 3691281 MRA_1917 MRA_1918     FALSE 0.004 340.000 0.000 NA   NA
 3691281 3691282 MRA_1918 MRA_1919   katG FALSE 0.541 7.000 0.000 NA   NA
 3691282 3691283 MRA_1919 MRA_1920 katG furA TRUE 0.799 38.000 0.057 1.000 Y NA
 3691283 3691284 MRA_1920 MRA_1921 furA   FALSE 0.079 105.000 0.000 NA   NA
 3691284 3691285 MRA_1921 MRA_1922   lppC FALSE 0.111 83.000 0.000 NA   NA
 3691285 3691286 MRA_1922 MRA_1923 lppC fadB5 FALSE 0.088 100.000 0.000 NA   NA
 3691289 3691290 MRA_1926 MRA_1927 aceAa aceAb TRUE 0.985 0.000 0.000 0.001   NA
 3691291 3691292 MRA_1928 MRA_1929     FALSE 0.038 338.000 0.000 NA Y NA
 3691292 3691293 MRA_1929 MRA_1930     FALSE 0.003 449.000 0.000 NA   NA
 3691296 3691297 MRA_1933 MRA_1934   lipD TRUE 0.997 -9.000 0.333 0.004 Y NA
 3691302 3691303 MRA_1939 MRA_1940     FALSE 0.183 45.000 0.000 NA   NA
 3691303 3691304 MRA_1940 MRA_1940A     FALSE 0.362 12.000 0.000 NA   NA
 3691304 3691305 MRA_1940A MRA_1941     FALSE 0.261 18.000 0.000 NA   NA
 3691307 3691308 MRA_1943 MRA_1944 fadE18 fadE17 TRUE 0.999 2.000 0.800 0.011 Y NA
 3691308 3691309 MRA_1944 MRA_1945 fadE17 echA13 TRUE 0.963 15.000 0.600 1.000 Y NA
 3691310 3691311 MRA_1946 MRA_1947     TRUE 0.992 3.000 0.500 NA Y NA
 3691311 3691312 MRA_1947 MRA_1948   ephB TRUE 0.948 12.000 1.000 1.000   NA
 3691312 3691313 MRA_1948 MRA_1949 ephB   TRUE 0.987 -3.000 0.333 1.000   NA
 3691313 3691314 MRA_1949 MRA_1950   ribA1 TRUE 0.956 -3.000 0.036 1.000   NA
 3691314 3691315 MRA_1950 MRA_1951 ribA1   TRUE 0.911 -3.000 0.036 1.000 N NA
 3691316 3691317 MRA_1952 MRA_1953     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 3691317 3691318 MRA_1953 MRA_1954     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3691322 3691323 MRA_1958 MRA_1959     FALSE 0.396 11.000 0.000 NA   NA
 3691323 3691324 MRA_1959 MRA_1960     FALSE 0.248 21.000 0.000 NA   NA
 3691324 3691325 MRA_1960 MRA_1961     TRUE 0.803 1.000 0.000 NA   NA
 3691326 3691327 MRA_1962 MRA_1963     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3691327 3691328 MRA_1963 MRA_1964     FALSE 0.004 335.000 0.000 NA   NA
 3691328 3691329 MRA_1964 MRA_1965     FALSE 0.189 42.000 0.000 NA   NA
 3691329 3691330 MRA_1965 MRA_1966     TRUE 0.925 -3.000 0.000 1.000   NA
 3691331 3691332 MRA_1967 MRA_1968     FALSE 0.174 49.000 0.000 NA   NA
 3691332 3691333 MRA_1968 MRA_1969     TRUE 0.986 -3.000 0.385 NA   NA
 3691335 3691336 MRA_1971 MRA_1972     TRUE 0.943 4.000 0.286 NA   NA
 3691336 3691337 MRA_1972 MRA_1973   mce3R FALSE 0.197 33.000 0.000 NA   NA
 3691338 3691339 MRA_1974 MRA_1975   yrbE3A FALSE 0.002 494.000 0.000 NA   NA
 3691339 3691340 MRA_1975 MRA_1976 yrbE3A yrbE3B TRUE 0.985 10.000 1.000 NA Y NA
 3691340 3691341 MRA_1976 MRA_1977 yrbE3B mce3A TRUE 0.992 5.000 0.750 NA Y NA
 3691341 3691342 MRA_1977 MRA_1978 mce3A mce3B TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 3691342 3691343 MRA_1978 MRA_1979 mce3B mce3C TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 3691343 3691344 MRA_1979 MRA_1980 mce3C mce3D TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.007 Y NA
 3691344 3691345 MRA_1980 MRA_1981 mce3D lprM TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.007 Y NA
 3691345 3691346 MRA_1981 MRA_1982 lprM mce3F TRUE 0.998 1.000 0.400 0.007 Y NA
 3691346 3691347 MRA_1982 MRA_1983 mce3F   TRUE 0.761 22.000 0.400 NA   NA
 3691347 3691348 MRA_1983 MRA_1984     TRUE 0.990 -3.000 0.500 NA   NA
 3691348 3691349 MRA_1984 MRA_1985     FALSE 0.340 13.000 0.000 NA   NA
 3691349 3691350 MRA_1985 MRA_1986     FALSE 0.291 16.000 0.000 NA   NA
 3691352 3691353 MRA_1988 MRA_1989     FALSE 0.030 108.000 0.000 1.000 N NA
 3691354 3691355 MRA_1990 MRA_1991   mpt64 FALSE 0.021 179.000 0.000 NA   NA
 3691355 3691356 MRA_1991 MRA_1992 mpt64 nrdF FALSE 0.017 191.000 0.000 NA   NA
 3691356 3691357 MRA_1992 MRA_1993 nrdF   FALSE 0.011 225.000 0.000 NA   NA
 3691357 3691358 MRA_1993 MRA_1994     TRUE 0.807 9.000 0.200 NA   NA
 3691363 3691364 MRA_1999 MRA_2000     FALSE 0.005 416.000 0.000 1.000   NA
 3691364 3691365 MRA_2000 MRA_2001     FALSE 0.017 226.000 0.000 1.000   NA
 3691365 3691366 MRA_2001 MRA_2002     FALSE 0.020 180.000 0.000 NA   NA
 3691367 3691368 MRA_2003 MRA_2004     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 3691368 3691369 MRA_2004 MRA_2005     FALSE 0.009 244.000 0.000 NA   NA
 3691369 3691370 MRA_2005 MRA_2006     FALSE 0.102 89.000 0.000 NA   NA
 3691370 3691371 MRA_2006 MRA_2007     TRUE 0.966 -6.000 0.000 0.061   NA
 3691371 3691372 MRA_2007 MRA_2008   ctpG FALSE 0.137 100.000 0.000 1.000   NA
 3691372 3691373 MRA_2008 MRA_2009 ctpG   TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3691373 3691374 MRA_2009 MRA_2010     FALSE 0.162 53.000 0.000 NA   NA
 3691375 3691376 MRA_2011 MRA_2012     FALSE 0.095 96.000 0.000 NA   NA
 3691376 3691377 MRA_2012 MRA_2013   ctpF FALSE 0.006 202.000 0.000 1.000 N NA
 3691378 3691379 MRA_2014 MRA_2015     FALSE 0.040 95.000 0.000 1.000 N NA
 3691380 3691381 MRA_2016 MRA_2017     TRUE 0.727 10.000 0.118 NA   NA
 3691381 3691382 MRA_2017 MRA_2018   fabG3-1 TRUE 0.623 76.000 0.000 1.000 Y NA
 3691383 3691384 MRA_2019 MRA_2020     FALSE 0.231 58.000 0.000 1.000   NA
 3691384 3691385 MRA_2020 MRA_2021     FALSE 0.345 22.000 0.000 1.000   NA
 3691387 3691388 MRA_2023 MRA_2024 fdxA   FALSE 0.018 189.000 0.000 NA   NA
 3691389 3691390 MRA_2025 MRA_2026     TRUE 0.803 1.000 0.000 NA   NA
 3691392 3691393 MRA_2028 MRA_2029     FALSE 0.002 845.000 0.000 NA   NA
 3691393 3691394 MRA_2029 MRA_2030     TRUE 0.961 -46.000 0.000 0.012   NA
 3691396 3691397 MRA_2032 MRA_2033     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3691397 3691398 MRA_2033 MRA_2034     FALSE 0.009 242.000 0.000 NA   NA
 3691398 3691399 MRA_2034 MRA_2035     TRUE 0.963 -10.000 0.294 NA   NA
 3691400 3691401 MRA_2036 MRA_2037     FALSE 0.108 85.000 0.000 NA   NA
 3691401 3691402 MRA_2037 MRA_2038     TRUE 0.892 9.000 0.375 NA   NA
 3691402 3691403 MRA_2038 MRA_2038A     FALSE 0.229 25.000 0.000 NA   NA
 3691403 3691404 MRA_2038A MRA_2039     FALSE 0.002 585.000 0.000 NA   NA
 3691404 3691405 MRA_2039 MRA_2040     FALSE 0.004 510.000 0.000 1.000   NA
 3691405 3691406 MRA_2040 MRA_2041     FALSE 0.025 115.000 0.000 1.000 N NA
 3691406 3691407 MRA_2041 MRA_2042     TRUE 0.735 40.000 0.000 1.000 Y NA
 3691407 3691408 MRA_2042 MRA_2043     TRUE 0.672 61.000 0.000 1.000 Y NA
 3691408 3691409 MRA_2043 MRA_2044   pfkB TRUE 0.747 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3691409 3691410 MRA_2044 MRA_2045 pfkB   FALSE 0.543 17.000 0.050 1.000   NA
 3691410 3691411 MRA_2045 MRA_2046   hspX TRUE 0.804 12.000 0.300 NA   NA
 3691414 3691415 MRA_2049 MRA_2050     TRUE 0.973 -3.000 0.200 NA   NA
 3691415 3691416 MRA_2050 MRA_2051     TRUE 0.967 -3.000 0.150 NA   NA
 3691417 3691418 MRA_2052 MRA_2053     TRUE 0.980 2.000 0.444 1.000   NA
 3691418 3691419 MRA_2053 MRA_2054     TRUE 0.994 3.000 0.211 0.019 Y NA
 3691419 3691420 MRA_2054 MRA_2055     TRUE 0.995 -13.000 0.211 0.019 Y NA
 3691420 3691421 MRA_2055 MRA_2056     TRUE 0.998 -3.000 0.235 0.019 Y NA
 3691421 3691422 MRA_2056 MRA_2057     TRUE 0.758 38.000 0.118 0.026   NA
 3691422 3691423 MRA_2057 MRA_2058   pncA TRUE 0.918 0.000 0.005 1.000   NA
 3691423 3691424 MRA_2058 MRA_2059 pncA   FALSE 0.190 41.000 0.000 NA   NA
 3691424 3691425 MRA_2059 MRA_2060   lipT FALSE 0.107 86.000 0.000 NA   NA
 3691427 3691428 MRA_2062 MRA_2063   pks12 TRUE 0.978 5.000 1.000 1.000 N NA
 3691428 3691429 MRA_2063 MRA_2064 pks12   FALSE 0.005 307.000 0.000 NA   NA
 3691431 3691432 MRA_2066 MRA_2067 ppm1   FALSE 0.292 158.000 0.041 0.003   NA
 3691432 3691433 MRA_2067 MRA_2068   fxsA TRUE 0.847 5.000 0.037 1.000   NA
 3691435 3691436 MRA_2070 MRA_2071 rpsR2 rpsN TRUE 0.993 1.000 0.024 0.014 Y NA
 3691436 3691437 MRA_2071 MRA_2072 rpsN rpmG TRUE 0.993 2.000 0.052 0.014 Y NA
 3691437 3691438 MRA_2072 MRA_2073 rpmG rpmB TRUE 0.998 0.000 0.332 0.014 Y NA
 3691440 3691441 MRA_2074A MRA_2075   cobN FALSE 0.274 84.000 0.045 1.000   NA
 3691442 3691443 MRA_2076 MRA_2077     TRUE 0.963 -7.000 0.000 0.061   NA
 3691443 3691444 MRA_2077 MRA_2078   cobG FALSE 0.571 -16.000 0.000 1.000 N NA
 3691444 3691445 MRA_2078 MRA_2079 cobG cobH TRUE 0.792 10.000 0.255 1.000 N NA
 3691445 3691446 MRA_2079 MRA_2080 cobH cobI TRUE 0.997 -3.000 0.096 0.008 Y NA
 3691447 3691448 MRA_2081 MRA_2082   blaC FALSE 0.402 16.000 0.000 1.000   NA
 3691450 3691451 MRA_2084 MRA_2085 cobK cobM TRUE 0.997 -3.000 0.076 0.008 Y NA
 3691451 3691452 MRA_2085 MRA_2086 cobM cobL TRUE 0.997 -3.000 0.065 0.008 Y NA
 3691452 3691453 MRA_2086 MRA_2087 cobL   TRUE 0.631 68.000 0.364 1.000   NA
 3691455 3691456 MRA_2089 MRA_2090     FALSE 0.028 158.000 0.000 NA   NA
 3691456 3691457 MRA_2090 MRA_2091     FALSE 0.195 35.000 0.000 NA   NA
 3691457 3691458 MRA_2091 MRA_2091A     TRUE 0.803 1.000 0.000 NA   NA
 3691459 3691460 MRA_2092 MRA_2093     TRUE 0.977 -18.000 0.500 NA   NA
 3691460 3691461 MRA_2093 MRA_2094   lppJ TRUE 0.766 -19.000 0.000 NA   NA
 3691461 3691462 MRA_2094 MRA_2095 lppJ   TRUE 0.739 -79.000 0.000 NA   NA
 3691464 3691465 MRA_2098 MRA_2099     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3691465 3691466 MRA_2099 MRA_2100     TRUE 0.803 -7.000 0.000 NA   NA
 3691466 3691467 MRA_2100 MRA_2101     FALSE 0.111 83.000 0.000 NA   NA
 3691467 3691468 MRA_2101 MRA_2102     TRUE 0.762 -21.000 0.000 NA   NA
 3691468 3691469 MRA_2102 MRA_2103   pknJ FALSE 0.002 495.000 0.000 NA   NA
 3691472 3691473 MRA_2106 MRA_2107   helY FALSE 0.432 42.000 0.105 NA   NA
 3691473 3691474 MRA_2107 MRA_2108 helY tatC FALSE 0.322 49.000 0.166 NA N NA
 3691474 3691475 MRA_2108 MRA_2109 tatC tatA TRUE 0.828 17.000 0.031 NA Y NA
 3691475 3691476 MRA_2109 MRA_2110 tatA   FALSE 0.209 68.000 0.110 NA N NA
 3691476 3691477 MRA_2110 MRA_2111     TRUE 0.998 -3.000 0.767 NA Y NA
 3691477 3691478 MRA_2111 MRA_2112     TRUE 0.800 9.000 0.188 NA   NA
 3691478 3691479 MRA_2112 MRA_2113     FALSE 0.008 249.000 0.000 NA   NA
 3691480 3691481 MRA_2114 MRA_2115   helZ FALSE 0.025 199.000 0.000 1.000   NA
 3691481 3691482 MRA_2115 MRA_2116 helZ   FALSE 0.325 110.000 0.222 1.000   NA
 3691483 3691484 MRA_2117 MRA_2118     TRUE 0.955 7.000 0.667 NA   NA
 3691484 3691485 MRA_2118 MRA_2119     FALSE 0.291 16.000 0.000 NA   NA
 3691486 3691487 MRA_2120 MRA_2121     TRUE 0.805 51.000 0.308 0.061   NA
 3691487 3691488 MRA_2121 MRA_2122     FALSE 0.002 633.000 0.000 NA   NA
 3691488 3691489 MRA_2122 MRA_2123     TRUE 0.839 56.000 1.000 NA   NA
 3691490 3691491 MRA_2124 MRA_2125 prcA prcB TRUE 0.999 -3.000 0.797 0.001 Y NA
 3691491 3691492 MRA_2125 MRA_2126 prcB   TRUE 0.990 -3.000 0.512 NA   NA
 3691492 3691493 MRA_2126 MRA_2127     FALSE 0.567 113.000 0.706 NA   NA
 3691494 3691495 MRA_2128 MRA_2129     TRUE 0.756 11.000 0.200 NA   NA
 3691497 3691498 MRA_2131 MRA_2132 lppK   TRUE 0.668 8.000 0.030 NA   NA
 3691501 3691502 MRA_2135 MRA_2136   hisG FALSE 0.231 79.000 0.006 1.000   NA
 3691502 3691503 MRA_2136 MRA_2137 hisG hisE TRUE 0.994 3.000 0.081 0.003 Y NA
 3691508 3691509 MRA_2141 MRA_2142 ansP1   TRUE 0.836 0.000 0.000 NA   NA
 3691510 3691511 MRA_2143 MRA_2144   cysS1 FALSE 0.542 26.000 0.096 1.000   NA
 3691511 3691512 MRA_2144 MRA_2145 cysS1 cysQ FALSE 0.277 58.000 0.082 1.000 N NA
 3691514 3691515 MRA_2147 MRA_2148     TRUE 0.937 11.000 0.810 NA   NA
 3691515 3691516 MRA_2148 MRA_2149     TRUE 0.726 64.000 0.608 NA   NA
 3691516 3691517 MRA_2149 MRA_2150   uppP TRUE 0.904 -3.000 0.071 NA N NA
 3691517 3691518 MRA_2150 MRA_2151 uppP   FALSE 0.244 64.000 0.026 NA   NA
 3691519 3691520 MRA_2152 MRA_2153 lppL pyrD FALSE 0.005 314.000 0.000 NA   NA
 3691521 3691522 MRA_2154 MRA_2155     FALSE 0.537 48.000 0.224 NA   NA
 3691524 3691525 MRA_2156 MRA_2157     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3691527 3691528 MRA_2159 MRA_2160   wag31 FALSE 0.291 95.000 0.149 NA   NA
 3691528 3691529 MRA_2160 MRA_2161 wag31   FALSE 0.024 268.000 0.114 NA   NA
 3691529 3691530 MRA_2161 MRA_2162     FALSE 0.098 162.000 0.165 NA   NA
 3691530 3691531 MRA_2162 MRA_2163     TRUE 0.991 -3.000 0.581 NA   NA
 3691531 3691532 MRA_2163 MRA_2164   yfiH TRUE 0.788 6.000 0.061 NA   NA
 3691532 3691533 MRA_2164 MRA_2165 yfiH ftsZ TRUE 0.661 11.000 0.082 NA   NA
 3691533 3691534 MRA_2165 MRA_2166 ftsZ ftsQ FALSE 0.042 173.000 0.067 1.000 N NA
 3691534 3691535 MRA_2166 MRA_2167 ftsQ murC TRUE 0.993 -3.000 0.134 1.000 Y NA
 3691535 3691536 MRA_2167 MRA_2168 murC murG TRUE 0.995 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 3691536 3691537 MRA_2168 MRA_2169 murG ftsW TRUE 0.959 -3.000 0.167 1.000 N NA
 3691537 3691538 MRA_2169 MRA_2170 ftsW murD TRUE 0.864 12.000 0.081 0.004 N NA
 3691538 3691539 MRA_2170 MRA_2171 murD mraY TRUE 0.998 2.000 0.647 0.004 Y NA
 3691539 3691540 MRA_2171 MRA_2172 mraY murF TRUE 0.997 -3.000 0.071 0.004 Y NA
 3691540 3691541 MRA_2172 MRA_2173 murF murE TRUE 0.999 -3.000 0.367 0.001 Y NA
 3691541 3691542 MRA_2173 MRA_2174 murE   FALSE 0.237 23.000 0.000 NA   NA
 3691542 3691543 MRA_2174 MRA_2175     TRUE 0.882 -3.000 0.000 NA   NA
 3691543 3691544 MRA_2175 MRA_2176     FALSE 0.007 268.000 0.000 NA   NA
 3691544 3691545 MRA_2176 MRA_2177     FALSE 0.083 103.000 0.000 NA   NA
 3691545 3691546 MRA_2177 MRA_2178   pbpB FALSE 0.013 210.000 0.000 NA   NA
 3691546 3691547 MRA_2178 MRA_2179 pbpB   TRUE 0.966 -3.000 0.144 NA   NA
 3691547 3691548 MRA_2179 MRA_2180   mraW TRUE 0.937 -3.000 0.028 NA   NA
 3691548 3691549 MRA_2180 MRA_2181 mraW   TRUE 0.983 2.000 0.635 NA   NA
 3691549 3691550 MRA_2181 MRA_2182     FALSE 0.005 301.000 0.000 NA   NA
 3691550 3691551 MRA_2182 MRA_2183     TRUE 0.806 51.000 0.308 0.060   NA
 3691551 3691552 MRA_2183 MRA_2184     FALSE 0.035 145.000 0.000 NA   NA
 3691553 3691554 MRA_2185 MRA_2186   lppM FALSE 0.384 96.000 0.250 NA   NA
 3691556 3691557 MRA_2188 MRA_2189 idsA2   TRUE 0.945 4.000 0.298 NA   NA
 3691560 3691561 MRA_2192 MRA_2193   aroG FALSE 0.005 385.000 0.000 1.000   NA
 3691561 3691562 MRA_2193 MRA_2194 aroG   FALSE 0.496 91.000 0.301 1.000   NA
 3691562 3691563 MRA_2194 MRA_2195     TRUE 0.736 10.000 0.132 NA   NA
 3691565 3691566 MRA_2197 MRA_2198     FALSE 0.553 86.000 0.417 NA