MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium botulinum A str. ATCC 3502

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3672420 3672421 CBO0001 CBO0002 dnaA dnaG TRUE 0.654 263.000 0.328 1.000 Y NA
 3672421 3672422 CBO0002 CBO0003 dnaG   TRUE 0.954 19.000 0.103 1.000   NA
 3672422 3672423 CBO0003 CBO0004   recF TRUE 0.831 60.000 0.209 1.000   NA
 3672423 3672424 CBO0004 CBO0005 recF   TRUE 0.917 21.000 0.024 NA   NA
 3672424 3672425 CBO0005 CBO0006   gyrB TRUE 0.911 18.000 0.017 NA   NA
 3672425 3672426 CBO0006 CBO0007 gyrB gyrA TRUE 0.991 26.000 0.306 0.002 Y NA
 3672426 3672427 CBO0007 CBOr001 gyrA 16S_rRNA FALSE 0.008 406.000 0.000 NA   NA
 3672427 3672428 CBOr001 CBOr010 16S_rRNA 23S_rRNA FALSE 0.105 208.000 0.000 NA   NA
 3672428 3672429 CBOr010 CBOr019 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.267 89.000 0.000 NA   NA
 3672429 3672430 CBOr019 CBOt079 5S_rRNA tRNA_Met(CAT) TRUE 0.870 0.000 0.000 NA   NA
 3672430 3672431 CBOt079 CBOt029 tRNA_Met(CAT) tRNA_Ala(TGC) TRUE 0.832 4.000 0.000 NA   NA
 3672431 3672432 CBOt029 CBO0008 tRNA_Ala(TGC)   FALSE 0.207 165.000 0.000 NA   NA
 3672432 3672433 CBO0008 CBO0009     TRUE 0.929 16.000 0.029 NA   NA
 3672433 3672434 CBO0009 CBO0010     FALSE 0.551 101.000 0.014 1.000   NA
 3672434 3672435 CBO0010 CBO0011     TRUE 0.937 5.000 0.011 1.000   NA
 3672435 3672436 CBO0011 CBO0012     FALSE 0.547 137.000 0.016 NA   NA
 3672436 3672437 CBO0012 CBO0013     TRUE 0.960 25.000 0.214 NA   NA
 3672437 3672438 CBO0013 CBO0014     TRUE 0.975 17.000 0.370 NA   NA
 3672438 3672439 CBO0014 CBO0016   serS FALSE 0.011 370.000 0.000 NA   NA
 3672439 3672440 CBO0016 CBOt093 serS tRNA_Ser(TGA) FALSE 0.038 276.000 0.000 NA   NA
 3672440 3672441 CBOt093 CBOt090 tRNA_Ser(TGA) tRNA_Ser(GCT) TRUE 0.754 21.000 0.000 NA   NA
 3672441 3672442 CBOt090 CBOt094 tRNA_Ser(GCT) tRNA_Ser(TGA) FALSE 0.023 307.000 0.000 NA   NA
 3672442 3672443 CBOt094 CBOt091 tRNA_Ser(TGA) tRNA_Ser(GCT) TRUE 0.754 21.000 0.000 NA   NA
 3672443 3672444 CBOt091 CBOt033 tRNA_Ser(GCT) tRNA_Arg(ACG) FALSE 0.271 85.000 0.000 NA   NA
 3672445 3672446 CBO0017 CBO0018 psd1   FALSE 0.127 198.000 0.000 NA   NA
 3672446 3672447 CBO0018 CBO0019     FALSE 0.156 185.000 0.000 NA   NA
 3672448 3672449 CBO0020 CBO0021     FALSE 0.304 73.000 0.000 NA   NA
 3672449 3672450 CBO0021 CBO0022     TRUE 0.988 9.000 0.667 NA   NA
 3672450 3672451 CBO0022 CBO0023     TRUE 0.797 12.000 0.000 NA   NA
 3672451 3672452 CBO0023 CBO0024     TRUE 0.762 17.000 0.000 NA   NA
 3672453 3672454 CBO0025 CBO0026 psd2   TRUE 0.588 103.000 0.026 NA   NA
 3672454 3672455 CBO0026 CBO0027     FALSE 0.294 76.000 0.000 NA   NA
 3672456 3672457 CBOt034 CBO0028 tRNA_Arg(CCT)   FALSE 0.276 134.000 0.000 NA   NA
 3672457 3672458 CBO0028 CBO0029   mdeA TRUE 0.584 160.000 0.034 1.000 N NA
 3672458 3672459 CBO0029 CBO0030 mdeA   FALSE 0.347 124.000 0.000 1.000 N NA
 3672459 3672460 CBO0030 CBOt092   tRNA_Ser(GGA) FALSE 0.205 166.000 0.000 NA   NA
 3672460 3672461 CBOt092 CBOm0001 tRNA_Ser(GGA)   FALSE 0.273 124.000 0.000 NA   NA
 3672461 3672462 CBOm0001 CBO0031   dnaH FALSE 0.209 164.000 0.000 NA   NA
 3672462 3672463 CBO0031 CBO0032 dnaH   TRUE 0.752 65.000 0.100 NA   NA
 3672463 3672464 CBO0032 CBO0033   recR TRUE 0.964 33.000 0.604 NA   NA
 3672464 3672465 CBO0033 CBO0034 recR   TRUE 0.909 30.000 0.071 NA   NA
 3672465 3672466 CBO0034 CBO0035   bofA TRUE 0.816 150.000 0.417 NA   NA
 3672466 3672467 CBO0035 CBO0036 bofA sfsA FALSE 0.447 151.000 0.005 NA   NA
 3672467 3672468 CBO0036 CBO0037 sfsA   TRUE 0.660 56.000 0.015 NA   NA
 3672468 3672469 CBO0037 CBO0038     FALSE 0.295 118.000 0.000 1.000   NA
 3672469 3672470 CBO0038 CBO0039     FALSE 0.301 134.000 0.000 1.000   NA
 3672470 3672471 CBO0039 CBO0040     FALSE 0.005 563.000 0.000 1.000 N NA
 3672471 3672472 CBO0040 CBO0041     TRUE 0.643 59.000 0.007 1.000 N NA
 3672472 3672473 CBO0041 CBO0042     TRUE 0.909 29.000 0.035 1.000 N NA
 3672473 3672474 CBO0042 CBOr002   16S_rRNA FALSE 0.011 378.000 0.000 NA   NA
 3672474 3672475 CBOr002 CBOr011 16S_rRNA 23S_rRNA FALSE 0.101 209.000 0.000 NA   NA
 3672475 3672476 CBOr011 CBOr020 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.272 122.000 0.000 NA   NA
 3672476 3672477 CBOr020 CBOt075 5S_rRNA tRNA_Lys(TTT) TRUE 0.878 -2.000 0.000 NA   NA
 3672479 3672480 CBOr003 CBOt030 16S_rRNA tRNA_Ala(TGC) FALSE 0.276 131.000 0.000 NA   NA
 3672480 3672481 CBOt030 CBOt065 tRNA_Ala(TGC) tRNA_Ile(GAT) TRUE 0.822 6.000 0.000 NA   NA
 3672481 3672482 CBOt065 CBOr012 tRNA_Ile(GAT) 23S_rRNA FALSE 0.301 74.000 0.000 NA   NA
 3672482 3672483 CBOr012 CBOr021 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.276 133.000 0.000 NA   NA
 3672483 3672484 CBOr021 CBOt076 5S_rRNA tRNA_Lys(TTT) TRUE 0.878 -2.000 0.000 NA   NA
 3672484 3672485 CBOt076 CBO0043 tRNA_Lys(TTT)   FALSE 0.015 343.000 0.000 NA   NA
 3672485 3672486 CBO0043 CBO0043A     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 3672486 3672487 CBO0043A CBOr004   16S_rRNA FALSE 0.003 636.000 0.000 NA   NA
 3672487 3672488 CBOr004 CBOr013 16S_rRNA 23S_rRNA FALSE 0.101 209.000 0.000 NA   NA
 3672488 3672489 CBOr013 CBOr022 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.277 106.000 0.000 NA   NA
 3672489 3672490 CBOr022 CBOt083 5S_rRNA tRNA_Phe(GAA) TRUE 0.877 -1.000 0.000 NA   NA
 3672490 3672491 CBOt083 CBO0044 tRNA_Phe(GAA) dltB FALSE 0.101 209.000 0.000 NA   NA
 3672491 3672492 CBO0044 CBO0045 dltB   FALSE 0.251 147.000 0.000 NA   NA
 3672492 3672493 CBO0045 CBO0046   dltD TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 3672493 3672494 CBO0046 CBOr005 dltD 16S_rRNA FALSE 0.002 900.000 0.000 NA   NA
 3672494 3672495 CBOr005 CBOr014 16S_rRNA 23S_rRNA FALSE 0.105 208.000 0.000 NA   NA
 3672495 3672496 CBOr014 CBOr023 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.420 53.000 0.000 NA   NA
 3672496 3672497 CBOr023 CBOt084 5S_rRNA tRNA_Phe(GAA) TRUE 0.877 -1.000 0.000 NA   NA
 3672497 3672498 CBOt084 CBO0047 tRNA_Phe(GAA)   FALSE 0.267 141.000 0.000 NA   NA
 3672498 3672499 CBO0047 CBOr006   16S_rRNA FALSE 0.004 513.000 0.000 NA   NA
 3672499 3672500 CBOr006 CBOr015 16S_rRNA 23S_rRNA FALSE 0.101 209.000 0.000 NA   NA
 3672500 3672501 CBOr015 CBOr024 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.277 106.000 0.000 NA   NA
 3672501 3672502 CBOr024 CBO0048 5S_rRNA   FALSE 0.013 362.000 0.000 NA   NA
 3672502 3672503 CBO0048 CBOt046   tRNA_Cys(GCA) FALSE 0.279 82.000 0.000 NA   NA
 3672504 3672505 CBO0049 CBO0050     TRUE 0.866 36.000 0.039 NA N NA
 3672508 3672509 CBO0052A CBO0053     TRUE 0.987 -21.000 0.120 NA   NA
 3672509 3672510 CBO0053 CBO0054     TRUE 0.934 24.000 0.034 1.000 N NA
 3672510 3672511 CBO0054 CBO0055     TRUE 0.624 81.000 0.034 NA   NA
 3672511 3672512 CBO0055 CBO0056     TRUE 0.912 18.000 0.018 NA   NA
 3672512 3672513 CBO0056 CBO0057     TRUE 0.986 2.000 0.372 NA   NA
 3672513 3672514 CBO0057 CBO0058     TRUE 0.920 12.000 0.011 NA   NA
 3672514 3672515 CBO0058 CBO0059     TRUE 0.826 82.000 0.333 1.000   NA
 3672515 3672516 CBO0059 CBO0060     FALSE 0.514 121.000 0.006 1.000   NA
 3672516 3672517 CBO0060 CBO0061     TRUE 0.958 20.000 0.078 0.009   NA
 3672517 3672518 CBO0061 CBO0062     FALSE 0.407 156.000 0.002 NA   NA
 3672520 3672521 CBO0064 CBO0065   arcA1 FALSE 0.008 422.000 0.000 1.000   NA
 3672522 3672523 CBO0066 CBO0067 ispF   FALSE 0.502 76.000 0.003 NA   NA
 3672526 3672527 CBO0070 CBO0071 spmA spmB TRUE 0.989 13.000 0.655 0.004   NA
 3672529 3672530 CBO0073 CBO0074     TRUE 0.885 29.000 0.016 1.000 N NA
 3672530 3672531 CBO0074 CBO0075   metG FALSE 0.014 382.000 0.000 1.000 N NA
 3672531 3672532 CBO0075 CBO0076 metG   FALSE 0.389 165.000 0.003 NA   NA
 3672532 3672533 CBO0076 CBO0077     FALSE 0.439 151.000 0.004 NA   NA
 3672533 3672534 CBO0077 CBO0078     TRUE 0.696 27.000 0.000 NA   NA
 3672534 3672535 CBO0078 CBO0079     FALSE 0.361 58.000 0.000 NA   NA
 3672535 3672536 CBO0079 CBO0080     TRUE 0.614 73.000 0.020 1.000   NA
 3672536 3672537 CBO0080 CBO0081   ksgA TRUE 0.984 -7.000 0.093 1.000 N NA
 3672537 3672538 CBO0081 CBO0082 ksgA   FALSE 0.534 79.000 0.010 NA   NA
 3672538 3672539 CBO0082 CBO0083     TRUE 0.757 157.000 0.278 NA   NA
 3672539 3672540 CBO0083 CBO0084     TRUE 0.677 169.000 0.188 NA   NA
 3672540 3672541 CBO0084 CBO0085     TRUE 0.668 168.000 0.167 NA   NA
 3672541 3672542 CBO0085 CBO0086     TRUE 0.983 11.000 0.350 1.000 N NA
 3672542 3672543 CBO0086 CBO0087     TRUE 0.997 -3.000 0.349 NA Y NA
 3672543 3672544 CBO0087 CBO0088     TRUE 0.598 82.000 0.019 NA N NA
 3672544 3672545 CBO0088 CBO0089     FALSE 0.293 140.000 0.000 1.000   NA
 3672545 3672546 CBO0089 CBO0090     TRUE 0.777 15.000 0.000 NA   NA
 3672548 3672549 CBO0092 CBO0093     FALSE 0.373 57.000 0.000 NA   NA
 3672549 3672550 CBO0093 CBO0094   nrdD FALSE 0.031 290.000 0.000 NA   NA
 3672550 3672551 CBO0094 CBO0095 nrdD nrdG TRUE 0.977 17.000 0.315 1.000 N NA
 3672552 3672553 CBO0096 CBO0097     TRUE 0.974 2.000 0.111 NA   NA
 3672553 3672554 CBO0097 CBO0098     FALSE 0.271 121.000 0.000 NA   NA
 3672555 3672556 CBO0099 CBO0100 ileS ccpA FALSE 0.519 151.000 0.009 1.000 N NA
 3672556 3672557 CBO0100 CBO0101 ccpA   FALSE 0.282 216.000 0.017 1.000 N NA
 3672557 3672558 CBO0101 CBO0102     TRUE 0.792 75.000 0.160 1.000 N NA
 3672558 3672559 CBO0102 CBO0103     FALSE 0.017 336.000 0.000 NA   NA
 3672559 3672560 CBO0103 CBO0104     TRUE 0.962 5.000 0.066 NA   NA
 3672560 3672561 CBO0104 CBO0105     TRUE 0.966 20.000 0.210 1.000   NA
 3672561 3672562 CBO0105 CBO0106     FALSE 0.091 225.000 0.000 1.000   NA
 3672562 3672563 CBO0106 CBO0107     TRUE 0.686 187.000 0.333 1.000   NA
 3672565 3672566 CBO0109 CBO0110     TRUE 0.963 15.000 0.143 NA   NA
 3672566 3672567 CBO0110 CBO0111     TRUE 0.958 27.000 0.250 NA   NA
 3672567 3672568 CBO0111 CBO0112     TRUE 0.988 13.000 0.800 NA   NA
 3672570 3672571 CBO0114 CBO0115     TRUE 0.721 124.000 0.119 NA   NA
 3672571 3672572 CBO0115 CBO0116     FALSE 0.504 196.000 0.116 NA   NA
 3672572 3672573 CBO0116 CBO0117     TRUE 0.686 105.000 0.082 NA   NA
 3672573 3672574 CBO0117 CBO0119   cphB FALSE 0.068 380.000 0.109 1.000   NA
 3672574 3672575 CBO0119 CBO0120 cphB cphA TRUE 0.951 44.000 0.605 1.000 N NA
 3672575 3672576 CBO0120 CBO0121 cphA ipk TRUE 0.587 93.000 0.016 1.000 N NA
 3672576 3672577 CBO0121 CBO0122 ipk   FALSE 0.401 166.000 0.005 NA   NA
 3672577 3672578 CBO0122 CBO0123     TRUE 0.792 60.000 0.133 NA   NA
 3672578 3672579 CBO0123 CBO0124     TRUE 0.979 20.000 0.333 0.007   NA
 3672579 3672580 CBO0124 CBO0125     TRUE 0.939 50.000 0.500 0.007   NA
 3672580 3672581 CBO0125 CBO0126     TRUE 0.740 73.000 0.109 NA   NA
 3672583 3672584 CBO0128 CBO0129     FALSE 0.495 103.000 0.003 1.000   NA
 3672584 3672585 CBO0129 CBO0130     TRUE 0.885 25.000 0.011 NA   NA
 3672585 3672586 CBO0130 CBO0131     TRUE 0.626 132.000 0.039 NA   NA
 3672586 3672587 CBO0131 CBO0132   pyrG FALSE 0.157 234.000 0.004 NA   NA
 3672587 3672588 CBO0132 CBO0133 pyrG   FALSE 0.006 439.000 0.000 NA   NA
 3672588 3672589 CBO0133 CBO0134   rho FALSE 0.383 172.000 0.006 NA   NA
 3672591 3672592 CBO0136 CBO0137 tdK   TRUE 0.902 17.000 0.010 NA   NA
 3672592 3672593 CBO0137 CBO0138     TRUE 0.964 8.000 0.098 NA   NA
 3672593 3672594 CBO0138 CBO0139   prfA TRUE 0.891 82.000 0.081 1.000 Y NA
 3672594 3672595 CBO0139 CBO0140 prfA   TRUE 0.858 28.000 0.009 NA   NA
 3672595 3672596 CBO0140 CBO0141     TRUE 0.782 60.000 0.116 NA   NA
 3672596 3672597 CBO0141 CBO0142     TRUE 0.944 21.000 0.052 NA N NA
 3672597 3672598 CBO0142 CBO0143     TRUE 0.961 9.000 0.056 NA N NA
 3672598 3672599 CBO0143 CBO0144   rpiB TRUE 0.767 60.000 0.065 1.000 N NA
 3672599 3672600 CBO0144 CBO0145 rpiB upp TRUE 0.883 30.000 0.019 1.000 N NA
 3672600 3672601 CBO0145 CBO0146 upp   FALSE 0.069 507.000 0.041 1.000 Y NA
 3672601 3672602 CBO0146 CBO0147   tagO TRUE 0.643 108.000 0.029 1.000 N NA
 3672602 3672603 CBO0147 CBO0148 tagO mnaA TRUE 0.993 14.000 0.346 1.000 Y NA
 3672603 3672604 CBO0148 CBO0149 mnaA   FALSE 0.005 492.000 0.000 1.000   NA
 3672604 3672605 CBO0149 CBO0150   atpA TRUE 0.977 15.000 0.330 1.000   NA
 3672605 3672606 CBO0150 CBO0151 atpA atpC TRUE 0.817 40.000 0.009 0.007   NA
 3672606 3672607 CBO0151 CBO0152 atpC atpB TRUE 0.768 76.000 0.095 0.007   NA
 3672607 3672608 CBO0152 CBO0153 atpB atpH TRUE 0.991 3.000 0.040 0.007 Y NA
 3672608 3672609 CBO0153 CBO0154 atpH atpA TRUE 0.997 11.000 0.864 0.007 Y NA
 3672609 3672610 CBO0154 CBO0155 atpA atpG TRUE 0.996 22.000 0.846 0.007 Y NA
 3672610 3672611 CBO0155 CBO0156 atpG atpD TRUE 0.996 14.000 0.724 0.007 Y NA
 3672611 3672612 CBO0156 CBO0157 atpD atpC TRUE 0.995 25.000 0.837 0.007 Y NA
 3672612 3672613 CBO0157 CBO0158 atpC   FALSE 0.303 193.000 0.007 NA   NA
 3672613 3672614 CBO0158 CBO0159   murA TRUE 0.971 24.000 0.346 NA   NA
 3672614 3672615 CBO0159 CBO0160 murA spoIIC FALSE 0.331 270.000 0.243 1.000 N NA
 3672615 3672616 CBO0160 CBO0161 spoIIC   FALSE 0.026 532.000 0.090 1.000 N NA
 3672616 3672617 CBO0161 CBO0162   spoIIID TRUE 0.708 108.000 0.093 1.000   NA
 3672617 3672618 CBO0162 CBO0163 spoIIID mreB TRUE 0.808 100.000 0.284 1.000   NA
 3672619 3672620 CBO0164 CBO0165     TRUE 0.702 49.000 0.010 NA   NA
 3672621 3672622 CBOt096 CBOt101 tRNA_Thr(TGT) tRNA_Tyr(GTA) TRUE 0.822 6.000 0.000 NA   NA
 3672622 3672623 CBOt101 CBOt103 tRNA_Tyr(GTA) tRNA_Val(TAC) TRUE 0.783 14.000 0.000 NA   NA
 3672623 3672624 CBOt103 CBOt097 tRNA_Val(TAC) tRNA_Thr(TGT) TRUE 0.759 18.000 0.000 NA   NA
 3672624 3672625 CBOt097 CBOt102 tRNA_Thr(TGT) tRNA_Tyr(GTA) TRUE 0.822 6.000 0.000 NA   NA
 3672625 3672626 CBOt102 CBO0168 tRNA_Tyr(GTA) metE FALSE 0.021 316.000 0.000 NA   NA
 3672626 3672627 CBO0168 CBO0169 metE   FALSE 0.488 191.000 0.052 1.000 N NA
 3672627 3672628 CBO0169 CBO0170     TRUE 0.923 26.000 0.051 NA   NA
 3672628 3672629 CBO0170 CBO0171     TRUE 0.942 27.000 0.130 NA   NA
 3672629 3672630 CBO0171 CBO0172     FALSE 0.038 425.000 0.080 NA   NA
 3672630 3672631 CBO0172 CBO0173   secA FALSE 0.312 228.000 0.050 NA N NA
 3672631 3672632 CBO0173 CBO0175 secA prfB FALSE 0.065 364.000 0.048 1.000 N NA
 3672634 3672636 CBO0177 CBO0178     FALSE 0.307 72.000 0.000 NA   NA
 3672635 10726510 CBO0178a CBO0178b     FALSE 0.269 96.000 0.000 NA   NA
 3672636 3672635 CBO0178 CBO0178a     TRUE 0.924 -116.000 0.000 NA   NA
 10726510 3672637 CBO0178b CBO0179     FALSE 0.002 882.000 0.000 NA   NA
 3672637 3672638 CBO0179 CBO0180     TRUE 0.984 12.000 0.500 NA   NA
 3672638 3672639 CBO0180 CBO0181     TRUE 0.955 14.000 0.077 1.000   NA
 3672639 3672640 CBO0181 CBO0182     TRUE 0.581 84.000 0.022 1.000   NA
 3672640 3672641 CBO0182 CBO0183     TRUE 0.886 40.000 0.109 1.000   NA
 3672644 3672645 CBO0186 CBO0187 leuS   FALSE 0.014 377.000 0.000 NA N NA
 3672645 3672646 CBO0187 CBOt048   tRNA_Gln(CTG) FALSE 0.153 186.000 0.000 NA   NA
 3672646 3672647 CBOt048 CBO0188 tRNA_Gln(CTG)   FALSE 0.410 54.000 0.000 NA   NA
 3672647 3672648 CBO0188 CBO0189     TRUE 0.951 25.000 0.138 NA   NA
 3672648 3672649 CBO0189 CBO0190     TRUE 0.984 -13.000 0.098 NA   NA
 3672649 3672650 CBO0190 CBO0191     TRUE 0.968 4.000 0.098 NA   NA
 3672652 3672653 CBO0193 CBO0194     FALSE 0.081 226.000 0.000 NA   NA
 3672653 3672654 CBO0194 CBO0195     TRUE 0.681 117.000 0.082 NA   NA
 3672655 3672656 CBO0196 CBO0197     FALSE 0.530 138.000 0.013 NA   NA
 3672658 3672659 CBO0199 CBO0200     TRUE 0.709 106.000 0.094 1.000   NA
 3672659 3672660 CBO0200 CBO0201     TRUE 0.822 74.000 0.281 NA   NA
 3672662 3672663 CBO0203 CBO0204   sleB FALSE 0.314 230.000 0.041 0.063   NA
 3672663 3672664 CBO0204 CBO0205 sleB cysK1 FALSE 0.014 364.000 0.000 1.000   NA
 3672664 3672665 CBO0205 CBO0206 cysK1 cysA TRUE 0.990 15.000 0.101 0.002 Y NA
 3672665 3672666 CBO0206 CBO0207 cysA   TRUE 0.949 22.000 0.064 1.000 N NA
 3672666 3672667 CBO0207 CBO0208   plsD TRUE 0.670 148.000 0.064 1.000 N NA
 3672667 3672668 CBO0208 CBO0209 plsD nth TRUE 0.564 93.000 0.011 1.000 N NA
 3672668 3672669 CBO0209 CBO0210 nth   FALSE 0.305 152.000 0.000 1.000 N NA
 3672670 3672671 CBO0211 CBO0212     TRUE 0.867 26.000 0.004 1.000   NA
 3672671 3672672 CBO0212 CBO0213     TRUE 0.574 110.000 0.018 1.000   NA
 3672673 3672674 CBO0214 CBO0215     FALSE 0.492 205.000 0.000 1.000 Y NA
 3672674 3672675 CBO0215 CBO0216   spl TRUE 0.606 147.000 0.027 1.000 N NA
 3672675 3672676 CBO0216 CBO0217 spl   TRUE 0.562 128.000 0.008 1.000 N NA
 3672676 3672677 CBO0217 CBO0218     TRUE 0.924 13.000 0.016 NA   NA
 3672677 3672678 CBO0218 CBO0219     FALSE 0.030 294.000 0.000 NA   NA
 3672678 3672679 CBO0219 CBO0220     FALSE 0.553 184.000 0.097 1.000   NA
 3672679 3672680 CBO0220 CBO0221     TRUE 0.988 2.000 0.438 1.000   NA
 3672680 3672681 CBO0221 CBO0222     TRUE 0.995 -7.000 0.720 0.039   NA
 3672681 3672682 CBO0222 CBO0223     FALSE 0.523 112.000 0.007 1.000   NA
 3672682 3672683 CBO0223 CBO0224   hno FALSE 0.126 329.000 0.125 1.000 N NA
 3672683 3672684 CBO0224 CBO0225 hno cggR FALSE 0.356 288.000 0.034 1.000 Y NA
 3672684 3672685 CBO0225 CBO0226 cggR gap1 TRUE 0.847 78.000 0.348 1.000 N NA
 3672685 3672686 CBO0226 CBO0227 gap1 pgk FALSE 0.401 298.000 0.063 0.004 Y NA
 3672686 3672687 CBO0227 CBO0228 pgk tpiA TRUE 0.930 62.000 0.141 1.000 Y NA
 3672687 3672688 CBO0228 CBO0229 tpiA gpmI TRUE 0.904 92.000 0.138 1.000 Y NA
 3672688 3672689 CBO0229 CBO0230 gpmI eno TRUE 0.897 56.000 0.016 1.000 Y NA
 3672689 3672690 CBO0230 CBO0231 eno secG FALSE 0.231 223.000 0.006 1.000 N NA
 3672690 3672691 CBO0231 CBO0232 secG rnr FALSE 0.408 209.000 0.064 1.000 N NA
 3672691 3672692 CBO0232 CBO0233 rnr surE FALSE 0.009 409.000 0.000 1.000   NA
 3672692 3672693 CBO0233 CBO0234 surE smpB FALSE 0.058 257.000 0.000 1.000   NA
 3672695 3672696 CBOm0002 CBO0237     FALSE 0.002 780.000 0.000 NA   NA
 3672699 3672700 CBO0240 CBO0240B     FALSE 0.038 276.000 0.000 NA   NA
 3672701 3672702 CBO0241 CBO0242     FALSE 0.199 188.000 0.000 1.000 N NA
 3672702 3672703 CBO0242 CBO0243     FALSE 0.015 359.000 0.000 1.000   NA
 3672703 3672704 CBO0243 CBO0244     FALSE 0.010 384.000 0.000 NA   NA
 3672704 3672705 CBO0244 CBO0245     FALSE 0.016 341.000 0.000 NA   NA
 3672705 3672706 CBO0245 CBO0246     FALSE 0.004 502.000 0.000 NA   NA
 3672706 3672707 CBO0246 CBO0247   kdgT FALSE 0.108 212.000 0.000 1.000   NA
 3672707 3672708 CBO0247 CBO0248 kdgT   FALSE 0.104 214.000 0.000 1.000   NA
 3672708 3672709 CBO0248 CBO0249     TRUE 0.999 -22.000 1.000 1.000 Y NA
 3672709 3672710 CBO0249 CBO0250     FALSE 0.005 557.000 0.000 1.000 N NA
 3672710 3672711 CBO0250 CBO0251     FALSE 0.004 544.000 0.000 1.000   NA
 3672711 3672712 CBO0251 CBO0252     FALSE 0.298 114.000 0.000 1.000   NA
 3672712 3672713 CBO0252 CBO0253     TRUE 0.737 26.000 0.000 1.000   NA
 3672713 3672714 CBO0253 CBO0254     FALSE 0.244 159.000 0.000 1.000   NA
 3672714 3672715 CBO0254 CBO0255     TRUE 0.926 26.000 0.050 1.000   NA
 3672715 3672716 CBO0255 CBO0256     TRUE 0.781 63.000 0.095 1.000 N NA
 3672718 3672719 CBO0258 CBO0259 xdhA1 xdhB2 TRUE 0.998 0.000 0.800 0.002 Y NA
 3672719 3672720 CBO0259 CBO0260 xdhB2 xdhC1 TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 3672720 3672721 CBO0260 CBO0261 xdhC1   FALSE 0.013 357.000 0.000 NA   NA
 3672721 3672722 CBO0261 CBO0262   ccdA1 TRUE 0.970 11.000 0.167 NA   NA
 3672722 3672723 CBO0262 CBO0263 ccdA1 resA TRUE 0.991 22.000 0.318 1.000 Y NA
 3672723 3672724 CBO0263 CBO0264 resA   TRUE 0.949 25.000 0.091 1.000 N NA
 3672724 3672725 CBO0264 CBO0265     TRUE 0.997 -7.000 0.278 1.000 Y NA
 3672727 3672728 CBO0267 CBO0268     TRUE 0.907 163.000 0.294 1.000 Y NA
 3672729 3672730 CBO0269 CBO0270     TRUE 0.995 16.000 0.500 0.005 Y NA
 3672731 3672732 CBO0271 CBO0272     FALSE 0.266 167.000 0.000 1.000 N NA
 3672732 3672733 CBO0272 CBO0273     TRUE 0.995 1.000 0.235 1.000 Y NA
 3672733 3672734 CBO0273 CBO0274     TRUE 0.838 120.000 0.353 1.000 N NA
 3672734 3672735 CBO0274 CBO0275     TRUE 0.975 14.000 0.286 NA   NA
 3672735 3672736 CBO0275 CBO0276   alr FALSE 0.062 240.000 0.000 NA   NA
 3672736 3672737 CBO0276 CBO0277 alr   FALSE 0.006 520.000 0.000 1.000 N NA
 3672737 3672738 CBO0277 CBO0278   glvA1 FALSE 0.139 316.000 0.000 1.000 Y NA
 3672738 3672739 CBO0278 CBO0279 glvA1 crr FALSE 0.142 314.000 0.000 1.000 Y NA
 3672739 3672740 CBO0279 CBO0280 crr   FALSE 0.048 283.000 0.000 1.000 N NA
 3672742 3672743 CBO0282 CBO0283 cspA   FALSE 0.015 342.000 0.000 NA   NA
 3672743 3672744 CBO0283 CBO0284     FALSE 0.006 435.000 0.000 NA   NA
 3672744 3672745 CBO0284 CBO0285     TRUE 0.726 152.000 0.158 NA N NA
 3672745 3672746 CBO0285 CBO0286     TRUE 0.912 27.000 0.035 1.000   NA
 3672746 3672747 CBO0286 CBO0287     FALSE 0.007 438.000 0.000 1.000   NA
 3672747 3672748 CBO0287 CBO0288     TRUE 0.848 107.000 0.385 1.000 N NA
 3672748 3672749 CBO0288 CBO0289   glvA2 TRUE 0.677 262.000 0.385 1.000 Y NA
 3672749 3672750 CBO0289 CBO0290 glvA2   TRUE 0.993 13.000 0.375 1.000 Y NA
 3672750 3672751 CBO0290 CBO0291     TRUE 0.940 138.000 0.286 0.011 Y NA
 3672751 3672752 CBO0291 CBO0292   kdgA TRUE 0.949 52.000 0.091 0.062 Y NA
 3672752 3672753 CBO0292 CBO0293 kdgA kdgK TRUE 0.992 2.000 0.091 1.000 Y NA
 3672753 3672754 CBO0293 CBO0294 kdgK ade FALSE 0.069 260.000 0.000 1.000 N NA
 3672754 3672755 CBO0294 CBO0295 ade cssR FALSE 0.012 403.000 0.000 1.000 N NA
 3672755 3672756 CBO0295 CBO0296 cssR cssS TRUE 0.998 0.000 0.889 1.000 Y NA
 3672756 3672757 CBO0296 CBO0297 cssS   FALSE 0.042 285.000 0.000 NA N NA
 3672757 3672758 CBO0297 CBO0298     TRUE 0.914 -16.000 0.000 NA   NA
 3672758 3672759 CBO0298 CBO0299     TRUE 0.889 119.000 0.750 1.000   NA
 3672759 3672760 CBO0299 CBO0300     FALSE 0.015 356.000 0.000 1.000   NA
 3672760 3672761 CBO0300 CBO0301     FALSE 0.062 265.000 0.000 1.000 N NA
 3672761 3672762 CBO0301 CBO0302     TRUE 0.993 3.000 0.167 1.000 Y NA
 3672762 3672763 CBO0302 CBO0303     TRUE 0.997 2.000 0.750 1.000 Y NA
 3672763 3672764 CBO0303 CBO0304     TRUE 0.649 36.000 0.000 1.000 N NA
 3672766 3672767 CBO0306 CBO0307     FALSE 0.342 61.000 0.000 NA   NA
 3672769 3672770 CBO0309 CBO0310   fhuD1 TRUE 0.633 31.000 0.000 NA   NA
 3672770 3672771 CBO0310 CBO0311 fhuD1 fhuB1 TRUE 0.946 27.000 0.000 1.000 Y NA
 3672771 3672772 CBO0311 CBO0312 fhuB1 fhuG1 TRUE 0.986 -3.000 0.000 0.039 Y NA
 3672772 3672773 CBO0312 CBO0313 fhuG1 fhuC1 TRUE 0.969 11.000 0.000 1.000 Y NA
 3672773 3672774 CBO0313 CBO0314 fhuC1   TRUE 0.916 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3672776 3672777 CBO0316 CBO0317 pbuX xpt TRUE 0.980 23.000 0.032 1.000 Y NA
 3672777 3672778 CBO0317 CBO0318 xpt   FALSE 0.008 451.000 0.000 1.000 N NA
 3672778 3672779 CBO0318 CBO0319     TRUE 0.997 13.000 1.000 1.000 Y NA
 3672779 3672780 CBO0319 CBO0320   upk1 TRUE 0.699 176.000 0.222 1.000 N NA
 3672780 3672781 CBO0320 CBO0321 upk1   TRUE 0.993 15.000 0.333 1.000 Y NA
 3672781 3672782 CBO0321 CBO0322     TRUE 0.993 0.000 0.750 NA   NA
 3672782 3672783 CBO0322 CBO0323     TRUE 0.981 24.000 0.667 NA   NA
 3672783 3672784 CBO0323 CBO0324     FALSE 0.018 327.000 0.000 NA   NA
 3672784 3672785 CBO0324 CBO0325     TRUE 0.992 3.000 0.869 NA   NA
 3672785 3672786 CBO0325 CBO0326     FALSE 0.029 296.000 0.000 NA   NA
 3672786 3672787 CBO0326 CBO0327     FALSE 0.008 405.000 0.000 NA   NA
 3672787 3672788 CBO0327 CBO0328     TRUE 0.810 33.000 0.009 NA   NA
 3672788 3672789 CBO0328 CBO0329     FALSE 0.502 135.000 0.006 NA   NA
 3672789 3672790 CBO0329 CBO0330     FALSE 0.019 324.000 0.000 NA   NA
 3672790 3672791 CBO0330 CBO0331     TRUE 0.842 179.000 1.000 NA   NA
 3672791 3672792 CBO0331 CBO0332     TRUE 0.993 -7.000 0.556 NA   NA
 3672792 3672793 CBO0332 CBO0332A     TRUE 0.994 -16.000 0.556 NA   NA
 3672793 3672794 CBO0332A CBO0333     TRUE 0.784 72.000 0.179 NA   NA
 3672794 3672795 CBO0333 CBO0334     FALSE 0.102 231.000 0.000 1.000 N NA
 3672795 3672796 CBO0334 CBO0335     FALSE 0.009 397.000 0.000 NA   NA
 3672796 3672797 CBO0335 CBO0336     TRUE 0.978 27.000 0.667 NA   NA
 3672797 3672798 CBO0336 CBO0337     FALSE 0.081 226.000 0.000 NA   NA
 3672798 3672799 CBO0337 CBO0338     TRUE 0.996 -13.000 1.000 NA   NA
 3672799 3672800 CBO0338 CBO0339     TRUE 0.915 75.000 1.000 NA   NA
 3672800 3672801 CBO0339 CBO0340     TRUE 0.906 83.000 1.000 NA   NA
 3672801 3672802 CBO0340 CBO0341     FALSE 0.091 232.000 0.000 NA N NA
 3672804 3672805 CBO0343 CBO0344     TRUE 0.956 119.000 0.667 1.000 Y NA
 3672805 3672806 CBO0344 CBO0345   aad FALSE 0.009 428.000 0.000 1.000 N NA
 3672806 3672807 CBO0345 CBO0346 aad   FALSE 0.020 319.000 0.000 NA   NA
 3672807 3672808 CBO0346 CBO0347     TRUE 0.628 63.000 0.019 NA   NA
 3672809 3672810 CBO0348 CBO0349     FALSE 0.014 355.000 0.000 NA   NA
 3672811 3672812 CBO0350 CBO0351     FALSE 0.009 411.000 0.000 1.000   NA
 3672812 3672813 CBO0351 CBO0352     TRUE 0.665 108.000 0.038 1.000 N NA
 3672813 3672814 CBO0352 CBO0353     TRUE 0.986 10.000 0.038 1.000 Y NA
 3672814 3672815 CBO0353 CBO0354     TRUE 0.749 63.000 0.091 NA   NA
 3672815 3672816 CBO0354 CBO0355     TRUE 0.848 44.000 0.087 NA   NA
 3672816 3672817 CBO0355 CBO0356     TRUE 0.935 26.000 0.087 NA   NA
 3672818 3672819 CBO0357 CBO0358     FALSE 0.142 191.000 0.000 NA   NA
 3672820 3672821 CBO0359 CBO0360     FALSE 0.156 192.000 0.000 1.000   NA
 3672821 3672822 CBO0360 CBO0361     FALSE 0.027 305.000 0.000 1.000   NA
 3672824 3672825 CBO0363 CBO0364     FALSE 0.535 131.000 0.013 NA   NA
 3672825 3672826 CBO0364 CBO0365     TRUE 0.988 -54.000 0.105 1.000   NA
 3672826 3672827 CBO0365 CBO0366     TRUE 0.991 26.000 0.429 1.000 Y NA
 3672827 3672828 CBO0366 CBO0367     FALSE 0.352 108.000 0.000 1.000 N NA
 3672828 3672829 CBO0367 CBO0368   rnfC FALSE 0.003 1224.000 0.000 1.000 N NA
 3672829 3672830 CBO0368 CBO0369 rnfC rnfD TRUE 0.993 23.000 0.431 0.057 Y NA
 3672830 3672831 CBO0369 CBO0370 rnfD rnfG TRUE 0.998 0.000 0.678 0.057 Y NA
 3672831 3672832 CBO0370 CBO0371 rnfG rnfE TRUE 0.989 14.000 0.091 0.057 Y NA
 3672832 3672833 CBO0371 CBO0372 rnfE rnfA TRUE 0.966 51.000 0.237 0.057 Y NA
 3672833 3672834 CBO0372 CBO0373 rnfA rnfB TRUE 0.992 14.000 0.221 0.057 Y NA
 3672834 3672835 CBO0373 CBO0374 rnfB   FALSE 0.015 346.000 0.000 NA   NA
 3672836 3672837 CBO0375 CBO0376     TRUE 0.942 18.000 0.059 NA   NA
 3672837 3672838 CBO0376 CBO0377     TRUE 0.782 115.000 0.231 NA   NA
 3672839 3672840 CBO0378 CBO0379     FALSE 0.003 606.000 0.000 NA   NA
 3672840 3672841 CBO0379 CBO0380     FALSE 0.003 635.000 0.000 NA   NA
 3672842 3672843 CBO0381 CBO0382     FALSE 0.274 126.000 0.000 NA   NA
 3672844 3672845 CBO0383 CBO0384     FALSE 0.009 397.000 0.000 NA   NA
 3672845 3672846 CBO0384 CBO0385     TRUE 0.676 195.000 0.014 1.000 Y NA
 3672846 3672847 CBO0385 CBO0386     TRUE 0.965 36.000 0.040 0.003 Y NA
 3672847 3672848 CBO0386 CBO0387     TRUE 0.996 2.000 0.270 0.003 Y NA
 3672848 3672849 CBO0387 CBO0388     TRUE 0.806 126.000 0.294 NA   NA
 3672849 3672850 CBO0388 CBO0389     FALSE 0.005 487.000 0.000 NA   NA
 3672852 3672853 CBO0391 CBO0392     TRUE 0.814 78.000 0.286 NA   NA
 3672853 3672854 CBO0392 CBO0393     TRUE 0.794 87.000 0.250 1.000   NA
 3672854 3672855 CBO0393 CBO0394     FALSE 0.053 253.000 0.000 NA   NA
 3672855 3672856 CBO0394 CBO0395     TRUE 0.619 82.000 0.034 NA   NA
 3672858 3672859 CBO0397 CBO0398     TRUE 0.691 137.000 0.079 1.000   NA
 3672860 3672861 CBO0399 CBO0400   ftsH FALSE 0.004 597.000 0.000 1.000 N NA
 3672862 3672863 CBO0401 CBO0402   rnh TRUE 0.965 -25.000 0.003 NA   NA
 3672863 3672864 CBO0402 CBO0403 rnh   FALSE 0.548 63.000 0.003 NA   NA
 3672864 3672865 CBO0403 CBO0404     FALSE 0.166 181.000 0.000 NA   NA
 3672865 3672866 CBO0404 CBO0405     TRUE 0.965 32.000 0.429 0.027   NA
 3672866 3672867 CBO0405 CBO0406     FALSE 0.021 314.000 0.000 NA   NA
 3672867 3672868 CBO0406 CBO0407     TRUE 0.633 31.000 0.000 NA   NA
 3672868 3672869 CBO0407 CBO0408     FALSE 0.112 205.000 0.000 NA   NA
 3672869 3672870 CBO0408 CBO0409   clpB FALSE 0.012 364.000 0.000 NA   NA
 3672871 3672872 CBO0410 CBO0411     TRUE 0.927 58.000 0.796 1.000   NA
 3672873 3672874 CBO0412 CBO0413     FALSE 0.014 349.000 0.000 NA   NA
 3672874 3672875 CBO0413 CBO0414   upk2 TRUE 0.856 108.000 0.500 NA   NA
 3672875 3672876 CBO0414 CBOr007 upk2 16S_rRNA FALSE 0.009 401.000 0.000 NA   NA
 3672876 3672877 CBOr007 CBOt031 16S_rRNA tRNA_Ala(TGC) FALSE 0.276 131.000 0.000 NA   NA
 3672877 3672878 CBOt031 CBOt066 tRNA_Ala(TGC) tRNA_Ile(GAT) TRUE 0.822 6.000 0.000 NA   NA
 3672878 3672879 CBOt066 CBOr016 tRNA_Ile(GAT) 23S_rRNA FALSE 0.301 74.000 0.000 NA   NA
 3672879 3672880 CBOr016 CBOr025 23S_rRNA 5S_rRNA FALSE 0.276 133.000 0.000 NA   NA
 3672880 3672881 CBOr025 CBOt039 5S_rRNA tRNA_Asn(GTT) TRUE 0.870 0.000 0.000 NA   NA
 3672883 3672884 CBO0416 CBO0417     FALSE 0.004 748.000 0.000 1.000 N NA
 3672884 3672885 CBO0417 CBO0418     TRUE 0.654 144.000 0.027 0.061 N NA
 3672885 3672886 CBO0418 CBO0419     TRUE 0.970 33.000 0.054 0.061 Y NA
 3672886 3672887 CBO0419 CBO0420     FALSE 0.150 309.000 0.000 1.000 Y NA
 3672887 3672888 CBO0420 CBO0421     FALSE 0.006 518.000 0.000 1.000 N NA
 3672889 3672890 CBO0422 CBO0423   panD FALSE 0.473 88.000 0.004 NA   NA
 3672890 3672891 CBO0423 CBO0424 panD panC TRUE 0.927 149.000 0.342 1.000 Y NA
 3672891 3672892 CBO0424 CBO0425 panC panB TRUE 0.973 54.000 0.395 0.001 Y NA
 3672895 3672896 CBO0428 CBO0429     TRUE 0.990 3.000 0.667 NA   NA
 3672898 3672899 CBO0431 CBO0432 hypB   FALSE 0.357 236.000 0.115 1.000 N NA
 3672899 3672900 CBO0432 CBO0433   hypA TRUE 0.899 53.000 0.333 1.000   NA
 3672900 3672901 CBO0433 CBO0434 hypA   TRUE 0.913 39.000 0.214 NA   NA
 3672903 3672904 CBO0436 CBO0437 addA   TRUE 0.561 140.000 0.010 1.000 N NA
 3672904 3672905 CBO0437 CBO0438   pepT TRUE 0.708 77.000 0.056 1.000 N NA
 3672906 3672907 CBO0439 CBO0440     FALSE 0.531 40.000 0.000 NA   NA
 3672908 3672909 CBO0441 CBO0442     FALSE 0.264 142.000 0.000 NA   NA
 3672909 3672910 CBO0442 CBO0443     FALSE 0.110 206.000 0.000 NA   NA
 3672910 3672911 CBO0443 CBO0444     FALSE 0.009 401.000 0.000 NA   NA
 3672912 3672913 CBO0445 CBO0446     TRUE 0.995 13.000 0.461 0.050 Y NA
 3672915 3672916 CBO0448 CBO0449   thiC FALSE 0.055 266.000 0.000 NA N NA
 3672916 3672917 CBO0449 CBO0450 thiC thiK TRUE 0.997 -9.000 0.190 0.005 Y NA
 3672917 3672918 CBO0450 CBO0451 thiK thiD1 TRUE 0.620 232.000 0.039 0.005 Y NA
 3672919 3672920 CBO0452 CBO0453 ddl   FALSE 0.473 156.000 0.004 1.000 N NA
 3672920 3672921 CBO0453 CBO0454     TRUE 0.993 4.000 0.182 1.000 Y NA
 3672921 3672922 CBO0454 CBO0455     TRUE 0.996 1.000 0.241 0.038 Y NA
 3672922 3672923 CBO0455 CBO0456     TRUE 0.991 12.000 0.167 1.000 Y NA
 3672923 3672924 CBO0456 CBO0457     TRUE 0.992 2.000 0.048 0.037 Y NA
 3672924 3672925 CBO0457 CBO0458     TRUE 0.948 29.000 0.222 NA   NA
 3672925 3672926 CBO0458 CBO0459     FALSE 0.008 402.000 0.000 NA   NA
 3672926 3672927 CBO0459 CBO0460     TRUE 0.992 -6.000 0.500 NA   NA
 3672927 3672928 CBO0460 CBO0461     FALSE 0.264 142.000 0.000 NA   NA
 3672928 3672929 CBO0461 CBO0462     TRUE 0.581 61.000 0.007 NA   NA
 3672929 3672930 CBO0462 CBO0463     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3672930 3672931 CBO0463 CBO0464     FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 3672931 3672932 CBO0464 CBO0465     FALSE 0.105 274.000 0.010 NA   NA
 3672932 3672933 CBO0465 CBO0466     FALSE 0.521 134.000 0.010 NA   NA
 3672933 3672934 CBO0466 CBO0467     FALSE 0.512 176.000 0.050 NA   NA
 3672934 3672935 CBO0467 CBO0468     TRUE 0.954 2.000 0.025 NA   NA
 3672936 3672937 CBO0469 CBO0470     TRUE 0.754 21.000 0.000 NA   NA
 3672938 3672939 CBO0471 CBO0472   sbcD FALSE 0.011 377.000 0.000 NA   NA
 3672939 3672940 CBO0472 CBO0473 sbcD sbcC TRUE 0.997 -25.000 0.669 0.004 N NA
 3672940 3672941 CBO0473 CBO0474 sbcC   TRUE 0.853 28.000 0.005 1.000   NA
 3672941 3672942 CBO0474 CBO0475     FALSE 0.002 811.000 0.000 NA   NA
 3672944 3672945 CBO0477 CBO0478     TRUE 0.707 76.000 0.053 1.000 N NA
 3672945 3672946 CBO0478 CBOt051   tRNA_Glu(CTC) FALSE 0.007 420.000 0.000 NA   NA
 3672946 3672947 CBOt051 CBO0479 tRNA_Glu(CTC)   FALSE 0.274 127.000 0.000 NA   NA
 3672947 3672948 CBO0479 CBO0479A     TRUE 0.921 -36.000 0.000 NA   NA
 3672948 3672949 CBO0479A CBO0480     FALSE 0.002 822.000 0.000 NA   NA
 3672951 3672952 CBO0482 CBO0483     FALSE 0.002 957.000 0.000 NA   NA
 3672952 3672953 CBO0483 CBO0484     FALSE 0.054 268.000 0.000 NA N NA
 3672953 3672954 CBO0484 CBO0485     TRUE 0.988 10.000 0.667 NA   NA
 3672954 3672955 CBO0485 CBO0486   SagA FALSE 0.022 311.000 0.000 NA   NA
 3672955 3672956 CBO0486 CBO0487 SagA SagB TRUE 0.708 165.000 0.222 NA   NA
 3672956 3672957 CBO0487 CBO0488 SagB sagC TRUE 0.979 4.000 0.222 NA   NA
 3672957 3672958 CBO0488 CBO0489 sagC sagD TRUE 0.974 16.000 0.318 NA   NA
 3672958 3672959 CBO0489 CBO0490 sagD sagE TRUE 0.985 -25.000 0.091 NA   NA
 3672959 3672960 CBO0490 CBO0491 sagE sagF TRUE 0.991 8.000 1.000 NA   NA
 3672960 3672961 CBO0491 CBO0492 sagF sagG FALSE 0.022 309.000 0.000 NA   NA
 3672961 3672962 CBO0492 CBO0493 sagG sagH TRUE 0.989 3.000 0.500 NA N NA
 3672962 3672963 CBO0493 CBO0494 sagH sagI TRUE 0.980 2.000 0.160 NA N NA
 3672963 3672964 CBO0494 CBO0495 sagI   FALSE 0.300 128.000 0.000 1.000   NA
 3672965 3672966 CBO0496 CBO0497     TRUE 0.836 118.000 0.409 NA   NA
 3672966 3672967 CBO0497 CBO0498     TRUE 0.690 100.000 0.091 NA   NA
 3672968 3672969 CBO0499 CBO0500 trmB   FALSE 0.095 213.000 0.000 NA   NA
 3672971 3672972 CBO0502 CBO0503 fabG   TRUE 0.709 63.000 0.032 1.000 N NA
 3672974 3672975 CBO0505 CBO0506     FALSE 0.066 263.000 0.000 1.000 N NA
 3672975 3672976 CBO0506 CBO0507     FALSE 0.032 297.000 0.000 1.000   NA
 3672976 3672977 CBO0507 CBO0508     TRUE 0.948 36.000 0.400 1.000   NA
 3672977 3672978 CBO0508 CBO0509     FALSE 0.492 205.000 0.000 1.000 Y NA
 3672978 3672979 CBO0509 CBO0510   serS FALSE 0.007 482.000 0.000 1.000 N NA
 3672979 3672980 CBO0510 CBO0511 serS   FALSE 0.005 578.000 0.000 1.000 N NA
 3672981 3672982 CBO0512 CBO0513     FALSE 0.019 330.000 0.000 1.000   NA
 3672985 3672986 CBO0517 CBO0518     FALSE 0.182 175.000 0.000 NA   NA
 3672991 3672992 CBO0523 CBO0524     FALSE 0.248 148.000 0.000 NA   NA
 3672995 3672996 CBO0527 CBO0528     FALSE 0.003 624.000 0.000 NA   NA
 3672996 3672997 CBO0528 CBO0529     FALSE 0.057 438.000 0.000 0.006 Y NA
 3672997 3672998 CBO0529 CBO0530     FALSE 0.016 352.000 0.000 1.000   NA
 3672998 3672999 CBO0530 CBO0531     TRUE 0.730 45.000 0.008 1.000   NA
 3673000 3673001 CBO0532 CBO0533     FALSE 0.193 294.000 0.000 1.000 Y NA
 3673001 3673002 CBO0533 CBO0534     TRUE 0.997 0.000 0.455 0.001 Y NA
 3673003 3673004 CBO0535 CBO0536     FALSE 0.006 447.000 0.000 NA   NA
 3673006 3673007 CBO0538 CBO0539     TRUE 0.995 3.000 0.313 NA Y NA
 3673007 3673008 CBO0539 CBO0540     TRUE 0.588 34.000 0.000 NA   NA
 3673008 3673009 CBO0540 CBO0541     FALSE 0.147 189.000 0.000 NA   NA
 3673009 3673010 CBO0541 CBO0542   pepP FALSE 0.086 220.000 0.000 NA   NA
 3673011 3673012 CBO0543 CBO0543A     FALSE 0.008 406.000 0.000 NA   NA
 3673012 3673013 CBO0543A CBO0544     TRUE 0.803 14.000 0.000 1.000   NA
 3673014 3673015 CBO0545 CBO0546     FALSE 0.005 472.000 0.000 NA   NA
 3673015 3673016 CBO0546 CBO0547     FALSE 0.164 182.000 0.000 NA   NA
 3673016 3673017 CBO0547 CBO0548     FALSE 0.323 66.000 0.000 NA   NA
 3673017 3673018 CBO0548 CBO0549     FALSE 0.043 268.000 0.000 NA   NA
 3673018 3673019 CBO0549 CBO0550   cstA TRUE 0.972 10.000 0.184 NA   NA
 3673019 3673020 CBO0550 CBO0551 cstA   FALSE 0.005 461.000 0.000 NA   NA
 3673020 3673021 CBO0551 CBO0552     FALSE 0.002 920.000 0.000 NA   NA
 3673023 3673024 CBO0555 CBO0556 mscL   FALSE 0.012 366.000 0.000 NA   NA
 3673026 3673027 CBO0558 CBO0558A     FALSE 0.005 488.000 0.000 NA   NA
 3673027 3673028 CBO0558A CBO0559     TRUE 0.988 -7.000 0.165 1.000 N NA
 3673028 3673029 CBO0559 CBO0560     TRUE 0.966 0.000 0.035 NA   NA
 3673029 3673030 CBO0560 CBO0561   potA FALSE 0.002 817.000 0.000 NA   NA
 3673030 3673031 CBO0561 CBO0562 potA potB TRUE 0.998 0.000 0.789 1.000 Y NA
 3673031 3673032 CBO0562 CBO0563 potB potCD TRUE 0.989 3.000 0.022 0.037 Y NA
 3673034 3673035 CBO0565 CBO0566     FALSE 0.003 593.000 0.000 NA   NA
 3673035 3673036 CBO0566 CBO0567     FALSE 0.008 404.000 0.000 NA   NA
 3673036 3673037 CBO0567 CBO0568     FALSE 0.045 265.000 0.000 NA   NA
 3673037 3673038 CBO0568 CBO0569     TRUE 0.754 21.000 0.000 NA   NA
 3673038 3673039 CBO0569 CBO0570     TRUE 0.832 4.000 0.000 NA   NA
 3673041 3673042 CBO0573 CBO0574     FALSE 0.204 174.000 0.000 1.000   NA
 3673042 3673043 CBO0574 CBO0575     FALSE 0.003 829.000 0.000 1.000 N NA
 3673043 3673044 CBO0575 CBO0576     FALSE 0.003 614.000 0.000 NA   NA
 3673044 3673045 CBO0576 CBO0577     TRUE 0.966 40.000 1.000 NA   NA
 3673045 3673046 CBO0577 CBO0578     FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 3673048 3673049 CBO0580 CBO0581     TRUE 0.981 -7.000 0.080 1.000   NA
 3673049 3673050 CBO0581 CBO0582     TRUE 0.969 37.000 1.000 NA   NA
 3673050 3673051 CBO0582 CBO0583     TRUE 0.927 35.000 0.222 NA   NA
 3673051 3673052 CBO0583 CBO0584     TRUE 0.780 110.000 0.222 NA   NA
 3673052 3673053 CBO0584 CBO0585     TRUE 0.975 23.000 0.400 NA   NA
 3673053 3673054 CBO0585 CBO0586     TRUE 0.969 3.000 0.095 NA   NA
 3673054 3673055 CBO0586 CBO0587     TRUE 0.974 15.000 0.238 NA N NA
 3673055 3673056 CBO0587 CBO0588     FALSE 0.004 548.000 0.000 NA   NA
 3673056 3673057 CBO0588 CBO0589     FALSE 0.276 131.000 0.000 NA   NA
 3673057 3673058 CBO0589 CBO0590     FALSE 0.361 58.000 0.000 NA   NA
 3673058 3673059 CBO0590 CBO0591     FALSE 0.009 398.000 0.000 NA   NA
 3673062 3673063 CBO0594 CBO0595     FALSE 0.023 335.000 0.000 1.000 N NA
 3673064 3673065 CBO0596 CBO0597   asnC FALSE 0.002 818.000 0.000 NA   NA
 3673065 3673066 CBO0597 CBO0598 asnC   FALSE 0.038 294.000 0.000 NA N NA
 3673066 3673067 CBO0598 CBO0599     TRUE 0.987 7.000 0.571 NA   NA
 3673067 3673068 CBO0599 CBO0600     FALSE 0.115 203.000 0.000 NA   NA
 3673068 3673069 CBO0600 CBO0601     TRUE 0.991 2.000 0.714 NA   NA
 3673069 3673070 CBO0601 CBO0602     FALSE 0.003 602.000 0.000 NA   NA
 3673070 3673071 CBO0602 CBO0603     FALSE 0.006 444.000 0.000 NA   NA
 3673071 3673072 CBO0603 CBO0604     TRUE 0.986 13.000 0.667 NA   NA
 3673072 3673073 CBO0604 CBO0605     FALSE 0.006 463.000 0.000 1.000   NA
 3673073 3673074 CBO0605 CBO0606     FALSE 0.204 197.000 0.000 0.010   NA
 3673074 3673075 CBO0606 CBO0607     FALSE 0.201 175.000 0.000 1.000   NA
 3673075 3673076 CBO0607 CBO0608     TRUE 0.997 5.000 0.692 1.000 Y NA
 3673076 3673077 CBO0608 CBO0609     FALSE 0.149 206.000 0.000 1.000 N NA
 3673077 3673078 CBO0609 CBO0610     TRUE 0.954 21.000 0.085 1.000 N NA
 3673078 3673079 CBO0610 CBO0611     TRUE 0.999 -10.000 0.932 1.000 Y NA
 3673080 3673081 CBO0612 CBO0613     FALSE 0.261 143.000 0.000 NA   NA
 3673081 3673082 CBO0613 CBO0614     TRUE 0.983 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3673085 3673086 CBO0617 CBO0618     TRUE 0.753 170.000 0.286 1.000 N NA
 3673088 3673089 CBO0620 CBO0621     TRUE 0.697 103.000 0.083 1.000   NA
 3673090 3673091 CBO0622 CBO0623 csaA   FALSE 0.305 208.000 0.023 1.000   NA
 3673091 3673092 CBO0623 CBO0624     FALSE 0.046 297.000 0.000 0.026   NA
 3673093 3673094 CBO0625 CBO0626     FALSE 0.275 128.000 0.000 NA   NA
 3673094 3673095 CBO0626 CBO0627     FALSE 0.201 383.000 0.667 0.036 N NA
 3673095 3673096 CBO0627 CBO0628     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 3673098 3673099 CBO0630 CBO0631     FALSE 0.078 228.000 0.000 NA   NA
 3673099 3673100 CBO0631 CBO0632     FALSE 0.361 58.000 0.000 NA   NA
 3673101 3673102 CBO0633 CBO0634     TRUE 0.902 23.000 0.015 NA   NA
 3673102 3673103 CBO0634 CBO0636     TRUE 0.728 48.000 0.015 NA   NA
 3673103 3673104 CBO0636 CBO0637     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 3673106 3673107 CBO0639 CBO0640     FALSE 0.511 139.000 0.006 1.000   NA
 3673108 3673109 CBO0641 CBO0642     FALSE 0.426 55.000 0.000 1.000   NA
 3673109 3673110 CBO0642 CBO0643   rhlE FALSE 0.057 259.000 0.000 1.000   NA
 3673110 3673111 CBO0643 CBO0644 rhlE   FALSE 0.004 576.000 0.000 1.000   NA
 3673111 3673112 CBO0644 CBO0645     TRUE 0.729 172.000 0.286 1.000   NA
 3673112 3673113 CBO0645 CBO0646     TRUE 0.961 28.000 0.250 1.000 N NA
 3673115 3673116 CBO0648 CBO0649     FALSE 0.299 127.000 0.000 1.000   NA
 3673116 3673117 CBO0649 CBO0650     FALSE 0.009 395.000 0.000 NA   NA
 3673117 3673118 CBO0650 CBO0651     FALSE 0.320 67.000 0.000 NA   NA
 3673118 3673119 CBO0651 CBO0652     FALSE 0.276 131.000 0.000 NA   NA
 3673121 3673122 CBO0654 CBO0655     TRUE 0.645 205.000 0.409 1.000   NA
 3673122 3673123 CBO0655 CBO0656     TRUE 0.958 12.000 0.074 1.000   NA
 3673123 3673124 CBO0656 CBO0657     FALSE 0.003 627.000 0.000 1.000   NA
 3673124 3673125 CBO0657 CBO0658   flrD TRUE 0.737 159.000 0.190 1.000 N NA
 3673125 3673126 CBO0658 CBO0659 flrD   TRUE 0.772 60.000 0.071 1.000 N NA
 3673126 3673127 CBO0659 CBO0660     TRUE 0.936 26.000 0.089 NA   NA
 3673129 3673130 CBO0662 CBO0663 gltC   FALSE 0.003 609.000 0.000 1.000   NA
 3673130 3673131 CBO0663 CBO0664     TRUE 0.966 7.000 0.100 NA   NA
 3673133 3673134 CBO0666 CBO0667     FALSE 0.239 151.000 0.000 NA   NA
 3673134 3673135 CBO0667 CBO0668     FALSE 0.373 57.000 0.000 NA   NA
 3673135 3673136 CBO0668 CBO0669     TRUE 0.988 -37.000 0.118 1.000   NA
 3673136 3673137 CBO0669 CBO0670     TRUE 0.978 31.000 1.000 NA   NA
 3673137 3673138 CBO0670 CBO0671     TRUE 0.783 14.000 0.000 NA   NA
 3673138 3673139 CBO0671 CBO0672     FALSE 0.003 720.000 0.000 NA   NA
 3673140 3673141 CBO0673 CBO0674     TRUE 0.992 -3.000 0.571 NA   NA
 3673142 3673143 CBO0675 CBO0676     TRUE 0.563 136.000 0.008 1.000 N NA
 3673143 3673144 CBO0676 CBO0677     FALSE 0.521 162.000 0.031 NA   NA
 3673144 3673145 CBO0677 CBO0678   hsdM FALSE 0.039 275.000 0.000 NA   NA
 3673145 3673146 CBO0678 CBO0679 hsdM hsdS TRUE 0.881 95.000 0.041 0.057 Y NA
 3673146 3673147 CBO0679 CBO0680 hsdS   FALSE 0.268 88.000 0.000 NA   NA
 3673147 3673148 CBO0680 CBO0681     FALSE 0.140 192.000 0.000 NA   NA
 3673148 3673149 CBO0681 CBO0682   hsdR FALSE 0.258 144.000 0.000 NA   NA
 3673149 3673150 CBO0682 CBO0683 hsdR pcrA FALSE 0.518 58.000 0.000 0.057 N NA
 3673152 3673153 CBO0685 CBO0686   fhuD2 FALSE 0.007 470.000 0.000 1.000 N NA
 3673153 3673154 CBO0686 CBO0687 fhuD2 fhuB2 TRUE 0.948 96.000 0.500 1.000 Y NA
 3673154 3673155 CBO0687 CBO0688 fhuB2 fhuG2 TRUE 0.998 0.000 0.750 0.037 Y NA
 3673155 3673156 CBO0688 CBO0689 fhuG2 fhuC2 TRUE 0.658 228.000 0.100 1.000 Y NA
 3673156 3673157 CBO0689 CBO0690 fhuC2 nifH TRUE 0.980 30.000 0.150 1.000 Y NA
 3673157 3673158 CBO0690 CBO0691 nifH nifE1 TRUE 0.991 3.000 0.571 0.054 N NA
 3673158 3673159 CBO0691 CBO0692 nifE1 nifE2 TRUE 0.990 40.000 1.000 0.040 Y NA
 3673159 3673160 CBO0692 CBO0693 nifE2   FALSE 0.027 323.000 0.000 1.000 N NA
 3673160 3673161 CBO0693 CBO0694     FALSE 0.431 52.000 0.000 NA   NA
 3673163 3673164 CBO0696 CBO0697 gcvT gcvH TRUE 0.788 125.000 0.000 0.001 Y NA
 3673164 3673165 CBO0697 CBO0698 gcvH gcvP TRUE 0.984 3.000 0.005 1.000 Y NA
 3673165 3673166 CBO0698 CBO0699 gcvP gcvP' TRUE 0.997 0.000 0.316 0.001 Y NA
 3673166 3673167 CBO0699 CBO0700 gcvP' pdhD1 FALSE 0.355 194.000 0.010 1.000 N NA
 3673167 3673168 CBO0700 CBO0701 pdhD1 lplA1 TRUE 0.962 18.000 0.118 1.000 N NA
 3673168 3673169 CBO0701 CBO0702 lplA1   FALSE 0.008 410.000 0.000 NA   NA
 3673169 3673170 CBO0702 CBO0703     FALSE 0.013 362.000 0.000 NA   NA
 3673170 3673171 CBO0703 CBO0704     TRUE 0.821 94.000 0.375 NA   NA
 3673171 3673172 CBO0704 CBO0705     FALSE 0.118 202.000 0.000 NA   NA
 3673172 3673173 CBO0705 CBO0706     FALSE 0.003 710.000 0.000 NA   NA
 3673173 3673174 CBO0706 CBO0707     FALSE 0.410 54.000 0.000 NA   NA
 3673174 3673175 CBO0707 CBO0708     FALSE 0.019 326.000 0.000 NA   NA
 3673175 3673176 CBO0708 CBO0709     TRUE 0.902 52.000 0.273 1.000 N NA
 3673176 3673177 CBO0709 CBO0710     TRUE 0.985 -16.000 0.094 1.000   NA
 3673177 3673178 CBO0710 CBO0711     FALSE 0.117 208.000 0.000 1.000   NA
 3673178 3673179 CBO0711 CBO0712     FALSE 0.151 194.000 0.000 1.000   NA
 3673180 3673181 CBO0713 CBO0714     TRUE 0.793 83.000 0.250 NA   NA
 3673181 3673182 CBO0714 CBO0715     FALSE 0.004 492.000 0.000 NA   NA
 3673183 3673184 CBO0715A CBO0716     FALSE 0.003 593.000 0.000 NA   NA
 3673184 3673185 CBO0716 CBO0717     TRUE 0.713 26.000 0.000 NA   NA
 3673187 3673188 CBO0719 CBO0720     FALSE 0.004 508.000 0.000 NA   NA
 3673188 3673189 CBO0720 CBO0721     FALSE 0.350 199.000 0.027 NA   NA
 3673189 3673190 CBO0721 CBO0722     FALSE 0.273 114.000 0.000 NA   NA
 3673190 3673191 CBO0722 CBO0723     FALSE 0.410 54.000 0.000 NA   NA
 3673192 3673193 CBO0724 CBO0725 cysK luxS TRUE 0.973 -16.000 0.010 1.000 N NA
 3673193 3673194 CBO0725 CBO0726 luxS metC TRUE 0.974 2.000 0.048 0.044 N NA
 3673194 3673195 CBO0726 CBO0727 metC   TRUE 0.610 101.000 0.021 1.000 N NA
 3673196 3673197 CBO0728 CBO0729 chiA merP FALSE 0.017 366.000 0.000 1.000 N NA
 3673198 3673199 CBO0730 CBO0731     TRUE 0.653 88.000 0.061 NA   NA
 3673199 3673200 CBO0731 CBO0732     FALSE 0.004 534.000 0.000 NA   NA
 3673200 3673201 CBO0732 CBO0733     FALSE 0.291 93.000 0.000 1.000   NA
 3673202 3673203 CBO0734 CBO0735     FALSE 0.274 102.000 0.000 NA   NA
 3673203 3673204 CBO0735 CBO0736     TRUE 0.758 19.000 0.000 NA   NA
 3673204 3673205 CBO0736 CBO0737     FALSE 0.269 86.000 0.000 NA   NA
 3673205 3673206 CBO0737 CBO0738     FALSE 0.276 129.000 0.000 NA   NA
 3673206 3673207 CBO0738 CBO0739     FALSE 0.058 244.000 0.000 NA   NA
 3673207 3673208 CBO0739 CBO0740     FALSE 0.065 238.000 0.000 NA   NA
 3673208 3673209 CBO0740 CBO0741     TRUE 0.756 20.000 0.000 NA   NA
 3673209 3673210 CBO0741 CBO0742     FALSE 0.245 149.000 0.000 NA   NA
 3673211 3673212 CBO0743 CBO0744     FALSE 0.214 162.000 0.000 NA   NA
 3673213 3673214 CBO0745 CBO0746     TRUE 0.751 22.000 0.000 NA   NA
 3673214 3673215 CBO0746 CBO0746A     FALSE 0.267 91.000 0.000 NA   NA
 3673215 3673216 CBO0746A CBO0747     TRUE 0.745 23.000 0.000 NA   NA
 3673222 3673223 CBO0753 CBO0754 arsR arsD TRUE 0.773 22.000 0.000 1.000   NA
 3673223 3673224 CBO0754 CBO0755 arsD arsA TRUE 0.957 19.000 0.116 1.000   NA
 3673224 3673225 CBO0755 CBO0756 arsA arsB TRUE 0.891 99.000 0.093 1.000 Y NA
 3673225 3673226 CBO0756 CBO0757 arsB   FALSE 0.050 259.000 0.000 NA   NA
 3673226 3673227 CBO0757 CBO0759     FALSE 0.022 311.000 0.000 NA   NA
 3673227 3673228 CBO0759 CBO0760     FALSE 0.004 508.000 0.000 NA   NA
 3673228 3673229 CBO0760 CBO0761     TRUE 0.991 10.000 1.000 NA   NA
 3673229 3673230 CBO0761 CBO0762     TRUE 0.665 29.000 0.000 NA   NA
 3673230 3673231 CBO0762 CBO0763     FALSE 0.052 255.000 0.000 NA   NA
 3673231 3673232 CBO0763 CBO0764     TRUE 0.832 4.000 0.000 NA   NA
 3673232 3673233 CBO0764 CBO0765     FALSE 0.011 374.000 0.000 NA   NA
 3673233 3673234 CBO0765 CBO0766     TRUE 0.992 -7.000 0.400 NA   NA
 3673234 3673235 CBO0766 CBO0767     FALSE 0.069 234.000 0.000 NA   NA
 3673235 3673236 CBO0767 CBO0767A     FALSE 0.003 691.000 0.000 NA   NA
 3673236 3673237 CBO0767A CBO0768     TRUE 0.969 -10.000 0.017 NA   NA
 3673237 3673238 CBO0768 CBO0769     TRUE 0.939 12.000 0.017 1.000 N NA
 3673238 3673239 CBO0769 CBO0770     TRUE 0.832 46.000 0.047 1.000 N NA
 3673239 3673240 CBO0770 CBO0771   thiD2 TRUE 0.687 78.000 0.043 1.000 N NA
 3673240 3673241 CBO0771 CBO0772 thiD2   FALSE 0.522 172.000 0.043 NA   NA
 3673243 3673244 CBO0774 CBO0775     TRUE 0.992 3.000 0.833 NA   NA
 3673244 3673245 CBO0775 CBO0776     FALSE 0.038 276.000 0.000 NA   NA
 3673245 3673246 CBO0776 CBO0777     FALSE 0.062 421.000 0.167 1.000 N NA
 3673246 3673247 CBO0777 CBO0778     TRUE 0.992 0.000 0.667 NA   NA
 3673247 3673248 CBO0778 CBO0779     FALSE 0.314 251.000 0.167 NA   NA
 3673248 3673249 CBO0779 CBO0780     TRUE 0.885 45.000 0.167 1.000   NA
 3673249 3673250 CBO0780 CBO0781     FALSE 0.002 955.000 0.000 NA   NA
 3673250 3673251 CBO0781 CBO0782     FALSE 0.035 280.000 0.000 NA   NA
 3673251 3673252 CBO0782 CBO0783     FALSE 0.546 184.000 0.100 NA   NA
 3673252 3673253 CBO0783 CBO0784     TRUE 0.998 -13.000 0.750 NA Y NA
 3673253 3673254 CBO0784 CBO0785     FALSE 0.131 196.000 0.000 NA   NA
 3673254 3673255 CBO0785 CBO0786     FALSE 0.078 228.000 0.000 NA   NA
 3673255 3673256 CBO0786 CBO0787     TRUE 0.945 154.000 0.636 1.000 Y NA
 3673256 3673257 CBO0787 CBO0788     FALSE 0.160 190.000 0.000 1.000   NA
 3673259 3673260 CBO0790 CBO0791   dapB FALSE 0.003 666.000 0.000 NA   NA
 3673260 3673261 CBO0791 CBO0792 dapB sseA TRUE 0.810 22.000 0.000 1.000 N NA
 3673262 3673263 CBO0793 CBO0794     FALSE 0.026 300.000 0.000 NA   NA
 3673263 3673264 CBO0794 CBO0795     FALSE 0.473 46.000 0.000 NA   NA
 3673265 3673266 CBO0796 CBO0797     TRUE 0.758 19.000 0.000 NA   NA
 3673266 3673267 CBO0797 CBO0798     FALSE 0.030 294.000 0.000 NA   NA
 3673267 3673268 CBO0798 CBO0799     FALSE 0.291 77.000 0.000 NA   NA
 3673269 3673270 CBO0800 CBO0801   ha70 FALSE 0.268 95.000 0.000 NA   NA
 3673270 3673271 CBO0801 CBO0802 ha70 ha-17 TRUE 0.981 14.000 0.429 NA   NA
 3673271 3673272 CBO0802 CBO0803 ha-17 ha-33 TRUE 0.845 63.000 0.286 NA   NA
 3673273 3673274 CBO0804 CBO0805 botR ant TRUE 0.843 162.000 0.667 1.000   NA
 3673274 3673275 CBO0805 CBO0806 ant atx TRUE 0.649 44.000 0.000 0.001   NA
 3673277 3673278 CBO0809 CBO0810     FALSE 0.276 132.000 0.000 NA   NA
 3673278 3673279 CBO0810 CBO0811     FALSE 0.156 185.000 0.000 NA   NA
 3673279 3673280 CBO0811 CBO0812     FALSE 0.017 336.000 0.000 NA   NA
 3673280 3673281 CBO0812 CBO0813     FALSE 0.005 566.000 0.000 1.000 N NA
 3673281 3673282 CBO0813 CBO0814     TRUE 0.968 151.000 1.000 0.001 Y NA
 3673284 3673285 CBO0816 CBO0817 feoA feoB TRUE 0.601 145.000 0.033 1.000   NA
 3673285 3673286 CBO0817 CBO0818 feoB feoB' TRUE 0.985 -3.000 0.105 0.005   NA
 3673286 3673287 CBO0818 CBO0819 feoB' cobC FALSE 0.004 715.000 0.000 1.000 N NA
 3673287 3673288 CBO0819 CBO0820 cobC   FALSE 0.350 136.000 0.000 1.000 N NA
 3673288 3673289 CBO0820 CBO0821   cobS FALSE 0.058 271.000 0.000 1.000 N NA
 3673289 3673290 CBO0821 CBO0822 cobS   FALSE 0.005 458.000 0.000 NA   NA
 3673290 3673291 CBO0822 CBO0823     FALSE 0.022 309.000 0.000 NA   NA
 3673291 3673292 CBO0823 CBO0824     TRUE 0.651 131.000 0.053 NA   NA
 3673292 3673293 CBO0824 CBO0825     TRUE 0.986 18.000 0.828 NA   NA
 3673293 3673294 CBO0825 CBO0826     FALSE 0.003 569.000 0.000 NA   NA
 3673294 3673295 CBO0826 CBO0827     FALSE 0.041 271.000 0.000 NA   NA
 3673295 3673296 CBO0827 CBO0828   dhpS TRUE 0.731 173.000 0.003 1.000 Y NA
 3673296 3673297 CBO0828 CBO0829 dhpS   FALSE 0.481 132.000 0.003 NA   NA
 3673297 3673298 CBO0829 CBO0830   folK FALSE 0.471 100.000 0.003 NA   NA
 3673298 3673299 CBO0830 CBO0831 folK   FALSE 0.322 119.000 0.000 NA N NA
 3673299 3673300 CBO0831 CBO0832     FALSE 0.025 320.000 0.000 NA N NA
 3673300 3673301 CBO0832 CBO0833     TRUE 0.774 55.000 0.039 1.000 N NA
 3673301 3673302 CBO0833 CBO0834   degT TRUE 0.848 142.000 0.012 0.019 Y NA
 3673302 3673303 CBO0834 CBO0835 degT   FALSE 0.003 859.000 0.000 1.000   NA
 3673303 3673304 CBO0835 CBO0836     FALSE 0.006 471.000 0.000 1.000   NA
 3673304 3673305 CBO0836 CBO0837     TRUE 0.987 5.000 0.500 NA   NA
 3673307 3673308 CBO0839 CBO0840     FALSE 0.275 103.000 0.000 NA   NA
 3673308 3673309 CBO0840 CBO0841     FALSE 0.026 300.000 0.000 NA   NA
 3673309 3673310 CBO0841 CBO0842     FALSE 0.245 149.000 0.000 NA   NA
 3673310 3673311 CBO0842 CBO0843     FALSE 0.129 197.000 0.000 NA   NA
 3673311 3673312 CBO0843 CBO0844     FALSE 0.023 319.000 0.000 1.000   NA
 3673313 3673314 CBO0845 CBO0846     TRUE 0.964 19.000 0.200 NA   NA
 3673314 3673315 CBO0846 CBO0847     TRUE 0.982 -3.000 0.100 1.000 N NA
 3673316 3673317 CBO0848 CBO0849     FALSE 0.003 685.000 0.000 NA   NA
 3673317 3673318 CBO0849 CBO0850     FALSE 0.004 524.000 0.000 1.000   NA
 3673318 3673319 CBO0850 CBO0851     FALSE 0.361 58.000 0.000 NA   NA
 3673320 3673321 CBO0852 CBO0853     TRUE 0.852 18.000 0.000 0.004   NA
 3673321 3673322 CBO0853 CBO0854     FALSE 0.301 105.000 0.000 1.000   NA
 3673322 3673323 CBO0854 CBO0855     FALSE 0.119 344.000 0.000 0.061 Y NA
 3673324 3673325 CBO0856 CBO0857     TRUE 0.898 -7.000 0.000 NA   NA
 3673325 3673326 CBO0857 CBO0858     FALSE 0.361 58.000 0.000 NA   NA
 3673326 3673327 CBO0858 CBO0859     FALSE 0.114 204.000 0.000 NA   NA
 3673328 3673329 CBO0860 CBO0861     FALSE 0.039 275.000 0.000 NA   NA
 3673330 3673331 CBO0862 CBO0863   lipA FALSE 0.014 364.000 0.000 1.000   NA
 3673332 3673333 CBO0864 CBO0865 oxdD   FALSE 0.205 166.000 0.000 NA   NA
 3673333 3673334 CBO0865 CBO0866     TRUE 0.619 58.000 0.010 NA   NA
 3673335 3673336 CBO0867 CBO0868     FALSE 0.045 273.000 0.000 1.000   NA
 3673337 3673338 CBO0869 CBO0870     FALSE 0.270 97.000 0.000 NA   NA
 3673342 3673343 CBO0874 CBO0875     TRUE 0.989 0.000 0.400 NA   NA
 3673343 3673344 CBO0875 CBO0876   def FALSE 0.003 681.000 0.000 NA   NA
 3673346 3673347 CBO0878 CBO0879     FALSE 0.059 243.000 0.000 NA   NA
 3673348 3673349 CBO0880 CBO0881 licT bglC FALSE 0.298 125.000 0.000 1.000   NA
 3673349 3673350 CBO0881 CBO0882 bglC ascB FALSE 0.120 329.000 0.000 1.000 Y NA
 3673350 3673351 CBO0882 CBO0883 ascB   FALSE 0.271 119.000 0.000 NA   NA
 3673353 3673354 CBO0885 CBO0886     FALSE 0.008 424.000 0.000 1.000   NA
 3673354 3673355 CBO0886 CBO0887     FALSE 0.058 244.000 0.000 NA   NA
 3673355 3673356 CBO0887 CBO0888     FALSE 0.014 353.000 0.000 NA   NA
 3673362 3673363 CBO0895 CBO0896     TRUE 0.649 30.000 0.000 NA   NA
 3673363 3673364 CBO0896 CBO0897     FALSE 0.013 356.000 0.000 NA   NA
 3673365 3673366 CBO0898 CBO0899     FALSE 0.185 174.000 0.000 NA   NA
 3673366 3673367 CBO0899 CBO0900     FALSE 0.046 264.000 0.000 NA   NA
 3673367 3673368 CBO0900 CBO0901     FALSE 0.277 106.000 0.000 NA   NA
 3673369 3673370 CBO0902 CBO0903     FALSE 0.004 539.000 0.000 NA   NA
 3673372 3673373 CBO0905 CBO0906     TRUE 0.997 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 3673373 3673374 CBO0906 CBO0907     FALSE 0.014 352.000 0.000 NA   NA
 3673374 3673375 CBO0907 CBO0908     FALSE 0.008 405.000 0.000 NA   NA
 3673375 3673376 CBO0908 CBO0909     FALSE 0.017 342.000 0.000 1.000   NA
 3673376 3673377 CBO0909 CBO0910     TRUE 0.745 79.000 0.100 1.000 N NA
 3673377 3673378 CBO0910 CBO0911   cobU FALSE 0.051 278.000 0.000 1.000 N NA
 3673379 3673380 CBO0912 CBO0913     FALSE 0.031 290.000 0.000 NA   NA
 3673381 3673382 CBO0914 CBO0915 cbiP cbiB TRUE 0.993 2.000 0.092 0.012 Y NA
 3673382 3673383 CBO0915 CBO0916 cbiB cobD FALSE 0.302 219.000 0.026 1.000 N NA
 3673383 3673384 CBO0916 CBO0917 cobD cbiM FALSE 0.131 274.000 0.013 1.000 N NA
 3673384 3673385 CBO0917 CBO0917A cbiM cbiN TRUE 0.998 4.000 0.861 0.012 Y NA
 3673385 3673386 CBO0917A CBO0918 cbiN cbiQ TRUE 0.999 -22.000 0.804 0.002 Y NA
 3673386 3673387 CBO0918 CBO0919 cbiQ   FALSE 0.010 409.000 0.000 NA N NA
 3673387 3673388 CBO0919 CBO0920   hemC TRUE 0.993 -31.000 0.009 NA Y NA
 3673388 3673389 CBO0920 CBO0921 hemC hemD TRUE 0.860 136.000 0.031 1.000 Y NA
 3673389 3673390 CBO0921 CBO0922 hemD   FALSE 0.255 145.000 0.000 NA   NA
 3673390 3673391 CBO0922 CBO0923   hemB FALSE 0.049 262.000 0.000 NA   NA
 3673391 3673392 CBO0923 CBO0924 hemB cbiA TRUE 0.818 121.000 0.005 1.000 Y NA
 3673392 3673393 CBO0924 CBO0925 cbiA cbiC TRUE 0.986 25.000 0.097 0.012 Y NA
 3673393 3673394 CBO0925 CBO0926 cbiC   FALSE 0.136 194.000 0.000 NA   NA
 3673394 3673395 CBO0926 CBO0927     FALSE 0.179 176.000 0.000 NA   NA
 3673395 3673396 CBO0927 CBO0928     FALSE 0.027 306.000 0.000 1.000   NA
 3673396 3673397 CBO0928 CBO0929     FALSE 0.384 56.000 0.000 NA   NA
 3673397 3673398 CBO0929 CBO0930     FALSE 0.272 122.000 0.000 NA   NA
 3673398 3673399 CBO0930 CBO0931     FALSE 0.316 77.000 0.000 1.000   NA
 3673399 3673400 CBO0931 CBO0932     FALSE 0.061 251.000 0.000 1.000   NA
 3673400 3673401 CBO0932 CBO0933     TRUE 0.888 30.000 0.032 1.000   NA
 3673401 3673402 CBO0933 CBO0934     TRUE 0.756 52.000 0.032 NA   NA
 3673402 3673403 CBO0934 CBO0935     TRUE 0.794 108.000 0.250 NA   NA
 3673403 3673404 CBO0935 CBO0936   cbiD FALSE 0.301 74.000 0.000 NA   NA
 3673404 3673405 CBO0936 CBO0937 cbiD cbiE TRUE 0.863 177.000 0.126 0.011 Y NA
 3673405 3673406 CBO0937 CBO0938 cbiE   FALSE 0.080 227.000 0.000 NA   NA
 3673406 3673407 CBO0938 CBO0939   cbiT FALSE 0.139 193.000 0.000 NA   NA
 3673407 3673408 CBO0939 CBO0940 cbiT   TRUE 0.870 0.000 0.000 NA   NA
 3673408 3673409 CBO0940 CBO0941     TRUE 0.566 36.000 0.000 NA   NA
 3673409 3673410 CBO0941 CBO0941A     TRUE 0.843 48.000 0.100 NA   NA
 3673410 3673411 CBO0941A CBO0942     TRUE 0.907 106.000 1.000 NA   NA
 3673411 3673412 CBO0942 CBO0943     TRUE 0.930 43.000 0.400 NA   NA
 3673412 3673413 CBO0943 CBO0944     FALSE 0.347 60.000 0.000 NA   NA
 3673413 3673414 CBO0944 CBO0945     FALSE 0.295 120.000 0.000 1.000   NA
 3673414 3673415 CBO0945 CBO0946   cbiL FALSE 0.041 295.000 0.000 1.000 N NA
 3673415 3673416 CBO0946 CBO0947 cbiL cbiF TRUE 0.993 19.000 0.291 0.011 Y NA
 3673416 3673417 CBO0947 CBO0948 cbiF cbiG TRUE 0.610 291.000 0.397 0.011 Y NA
 3673417 3673418 CBO0948 CBO0949 cbiG cbiH TRUE 0.931 158.000 0.352 0.011 Y NA
 3673418 3673419 CBO0949 CBO0950 cbiH cbiJ TRUE 0.952 134.000 0.423 0.011 Y NA
 3673419 3673420 CBO0950 CBO0951 cbiJ   FALSE 0.513 80.000 0.006 NA   NA
 3673420 3673421 CBO0951 CBO0952   cbiK FALSE 0.523 176.000 0.056 NA   NA
 3673421 3673422 CBO0952 CBO0953 cbiK pduX TRUE 0.952 13.000 0.040 1.000 N NA
 3673422 3673423 CBO0953 CBO0954 pduX btuR FALSE 0.319 148.000 0.000 1.000 N NA
 3673423 3673424 CBO0954 CBO0955 btuR   FALSE 0.093 235.000 0.000 1.000 N NA
 3673424 3673425 CBO0955 CBO0956   nirC TRUE 0.762 90.000 0.152 1.000 N NA
 3673425 3673426 CBO0956 CBO0957 nirC asrA TRUE 0.963 20.000 0.174 1.000   NA
 3673426 3673427 CBO0957 CBO0958 asrA asrB TRUE 0.996 -13.000 0.750 0.038   NA
 3673427 3673428 CBO0958 CBO0959 asrB asrC TRUE 0.996 13.000 0.720 0.038 Y NA
 3673428 3673429 CBO0959 CBO0960 asrC   FALSE 0.019 354.000 0.000 1.000 N NA
 3673429 3673430 CBO0960 CBO0961   modA FALSE 0.030 312.000 0.000 1.000 N NA
 3673430 3673431 CBO0961 CBO0962 modA modB TRUE 0.983 20.000 0.556 1.000 N NA
 3673431 3673432 CBO0962 CBO0963 modB   TRUE 0.983 15.000 0.444 1.000 N NA
 3673432 3673433 CBO0963 CBO0964     TRUE 0.982 -16.000 0.067 NA   NA
 3673435 3673436 CBO0966 CBO0967     TRUE 0.986 21.000 0.833 NA   NA
 3673436 3673437 CBO0967 CBO0968     TRUE 0.991 4.000 0.833 NA   NA
 3673437 3673438 CBO0968 CBO0970     FALSE 0.021 645.000 0.154 NA   NA
 3673438 3673439 CBO0970 CBO0971     TRUE 0.998 -10.000 0.765 1.000 Y NA
 3673440 3673441 CBO0972 CBO0973 fecE   TRUE 0.997 1.000 0.625 1.000 Y NA
 3673441 3673442 CBO0973 CBO0974     TRUE 0.996 1.000 0.375 1.000 Y NA
 3673442 3673443 CBO0974 CBO0975   dhaK FALSE 0.005 558.000 0.000 1.000 N NA
 3673443 3673444 CBO0975 CBO0976 dhaK gldA TRUE 0.959 11.000 0.053 1.000 N NA
 3673444 3673445 CBO0976 CBO0977 gldA   FALSE 0.022 312.000 0.000 NA   NA
 3673446 3673447 CBO0979 CBO0980     TRUE 0.578 35.000 0.000 NA   NA
 3673447 3673448 CBO0980 CBO0981     TRUE 0.798 27.000 0.000 0.011   NA
 3673448 3673449 CBO0981 CBO0982     FALSE 0.235 153.000 0.000 NA   NA
 3673449 3673450 CBO0982 CBO0983     FALSE 0.334 63.000 0.000 NA   NA
 3673450 3673451 CBO0983 CBO0984   dkgA FALSE 0.271 118.000 0.000 NA   NA
 3673451 3673452 CBO0984 CBO0985 dkgA   TRUE 0.766 101.000 0.200 NA   NA
 3673452 3673453 CBO0985 CBO0986     TRUE 0.822 46.000 0.061 NA   NA
 3673453 3673454 CBO0986 CBO0987     FALSE 0.098 210.000 0.000 NA   NA
 3673454 3673455 CBO0987 CBO0988     TRUE 0.979 17.000 0.486 NA   NA
 3673455 3673456 CBO0988 CBO0989     FALSE 0.275 135.000 0.000 NA   NA
 3673456 3673457 CBO0989 CBO0990     TRUE 0.870 63.000 0.400 NA   NA
 3673459 3673460 CBO0992 CBO0993     TRUE 0.982 26.000 0.833 NA   NA
 3673462 3673463 CBO0994 CBO0995   recQ FALSE 0.058 244.000 0.000 NA   NA
 3673463 3673464 CBO0995 CBO0996 recQ   FALSE 0.252 172.000 0.000 1.000 N NA
 3673466 3673467 CBO0998 CBO0999     FALSE 0.297 115.000 0.000 1.000   NA
 3673467 3673468 CBO0999 CBO1000     FALSE 0.006 447.000 0.000 NA   NA
 3673468 3673469 CBO1000 CBO1001     TRUE 0.988 2.000 0.444 NA   NA
 3673469 3673470 CBO1001 CBO1002   nrdG TRUE 0.982 0.000 0.167 NA   NA
 3673470 3673471 CBO1002 CBO1003 nrdG   TRUE 0.987 14.000 0.077 1.000 Y NA
 3673471 3673472 CBO1003 CBO1004     TRUE 0.962 15.000 0.135 NA   NA
 3673472 3673473 CBO1004 CBO1005   glcA FALSE 0.005 484.000 0.000 NA   NA
 3673473 3673474 CBO1005 CBO1006 glcA   TRUE 0.925 29.000 0.098 NA   NA
 3673474 3673475 CBO1006 CBO1007   etfB TRUE 0.861 43.000 0.098 NA   NA
 3673475 3673476 CBO1007 CBO1008 etfB etfB TRUE 0.993 32.000 0.875 0.022 Y NA
 3673476 3673477 CBO1008 CBO1009 etfB glcD TRUE 0.978 61.000 0.875 0.009 Y NA
 3673477 3673478 CBO1009 CBO1010 glcD   FALSE 0.042 269.000 0.000 NA   NA
 3673478 3673479 CBO1010 CBO1011     FALSE 0.275 128.000 0.000 NA   NA
 3673479 3673480 CBO1011 CBO1012     FALSE 0.131 196.000 0.000 NA   NA
 3673480 3673481 CBO1012 CBO1013     TRUE 0.965 2.000 0.051 NA   NA
 3673482 3673483 CBO1014 CBO1015     FALSE 0.002 929.000 0.000 NA   NA
 3673484 3673485 CBO1016 CBO1017     FALSE 0.186 303.000 0.000 0.060 Y NA
 3673485 3673486 CBO1017 CBO1018     FALSE 0.092 215.000 0.000 NA   NA
 3673488 3673489 CBO1020 CBO1021     FALSE 0.241 160.000 0.000 1.000   NA
 3673489 3673490 CBO1021 CBO1022     TRUE 0.825 16.000 0.000 1.000 N NA
 3673494 3673495 CBO1026 CBO1027     FALSE 0.276 134.000 0.000 NA   NA
 3673495 3673496 CBO1027 CBO1028     FALSE 0.004 545.000 0.000 NA   NA
 3673496 3673497 CBO1028 CBO1029   feoA TRUE 0.996 17.000 0.791 0.007 Y NA
 3673497 3673498 CBO1029 CBO1030 feoA feoB TRUE 0.992 32.000 0.871 1.000 Y NA
 3673498 3673499 CBO1030 CBO1031 feoB   TRUE 0.927 21.000 0.029 1.000   NA
 3673501 3673502 CBO1033 CBO1034   tlp FALSE 0.027 299.000 0.000 NA   NA
 3673502 3673503 CBO1034 CBO1035 tlp   FALSE 0.089 218.000 0.000 NA   NA
 3673503 3673504 CBO1035 CBO1036     TRUE 0.997 1.000 0.462 1.000 Y NA
 3673504 3673505 CBO1036 CBO1037     FALSE 0.276 104.000 0.000 NA   NA
 3673505 3673506 CBO1037 CBO1038   cypC FALSE 0.028 297.000 0.000 NA   NA
 3673508 3673509 CBO1040 CBO1041     FALSE 0.042 270.000 0.000 NA   NA
 3673509 3673510 CBO1041 CBO1042     TRUE 0.998 0.000 0.833 1.000 Y NA
 3673511 3673512 CBO1043 CBO1044     FALSE 0.084 236.000 0.000 NA N NA
 3673513 3673514 CBO1045 CBO1045A     TRUE 0.999 -10.000 0.870 0.035 Y NA
 3673514 3673515 CBO1045A CBO1046     TRUE 0.998 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 3673515 3673516 CBO1046 CBO1047     TRUE 0.926 74.000 0.196 1.000 Y NA
 3673516 3673517 CBO1047 CBO1048     FALSE 0.373 57.000 0.000 NA   NA
 3673517 3673518 CBO1048 CBO1049     TRUE 0.803 11.000 0.000 NA   NA
 3673518 3673519 CBO1049 CBO1050     FALSE 0.006 515.000 0.000 1.000 N NA
 3673519 3673520 CBO1050 CBO1051     TRUE 0.996 2.000 0.389 0.007 Y NA
 3673521 3673522 CBO1052 CBO1053     TRUE 0.997 3.000 1.000 NA Y NA
 3673522 3673523 CBO1053 CBO1054     FALSE 0.268 88.000 0.000 NA   NA
 3673523 3673524 CBO1054 CBO1055     FALSE 0.064 239.000 0.000 NA   NA
 3673525 3673526 CBO1056 CBO1057   chiD FALSE 0.237 188.000 0.000 0.006   NA
 3673526 3673527 CBO1057 CBO1058 chiD   FALSE 0.026 327.000 0.000 1.000 N NA
 3673527 3673528 CBO1058 CBO1059     FALSE 0.064 324.000 0.023 NA   NA
 3673528 3673529 CBO1059 CBO1060     FALSE 0.480 165.000 0.023 NA   NA
 3673530 3673531 CBO1061 CBO1062     FALSE 0.540 116.000 0.015 NA   NA
 3673531 3673532 CBO1062 CBO1063     FALSE 0.011 384.000 0.000 1.000   NA
 3673533 3673534 CBO1064 CBO1065     FALSE 0.012 375.000 0.000 1.000   NA
 3673534 3673535 CBO1065 CBO1066     TRUE 0.745 23.000 0.000 NA   NA
 3673535 3673536 CBO1066 CBO1067     FALSE 0.267 91.000 0.000 NA   NA
 3673536 3673537 CBO1067 CBO1068   glpA FALSE 0.117 208.000 0.000 1.000   NA
 3673537 3673538 CBO1068 CBO1069 glpA   TRUE 0.827 57.000 0.107 0.038   NA
 3673538 3673539 CBO1069 CBO1070     TRUE 0.986 3.000 0.300 0.038   NA
 3673539 3673540 CBO1070 CBO1071   glpT TRUE 0.572 89.000 0.021 1.000   NA
 3673540 3673541 CBO1071 CBO1072 glpT argS FALSE 0.005 582.000 0.000 1.000 N NA
 3673541 3673542 CBO1072 CBO1073 argS arcT FALSE 0.008 445.000 0.000 1.000 N NA
 3673542 3673543 CBO1073 CBO1074 arcT   FALSE 0.295 139.000 0.000 1.000   NA
 3673544 3673545 CBO1075 CBO1076   feoB FALSE 0.276 111.000 0.000 NA   NA
 3673545 3673546 CBO1076 CBO1077 feoB feoA TRUE 0.992 15.000 0.308 1.000 Y NA
 3673547 3673548 CBO1078 CBO1079     FALSE 0.095 213.000 0.000 NA   NA
 3673548 3673549 CBO1079 CBO1080     FALSE 0.056 248.000 0.000 NA   NA
 3673549 3673550 CBO1080 CBO1081     FALSE 0.339 62.000 0.000 NA   NA
 3673550 3673551 CBO1081 CBO1082     FALSE 0.037 277.000 0.000 NA   NA
 3673551 3673552 CBO1082 CBO1084   metN1 FALSE 0.036 278.000 0.000 NA   NA
 3673552 3673553 CBO1084 CBO1085 metN1 metI1 TRUE 0.997 2.000 0.511 1.000 Y NA
 3673553 3673554 CBO1085 CBO1086 metI1 metQ1 TRUE 0.944 55.000 0.154 NA Y NA
 3673554 3673555 CBO1086 CBO1087 metQ1 metQ2 TRUE 0.848 189.000 0.250 NA Y NA
 3673555 3673556 CBO1087 CBO1088 metQ2   FALSE 0.078 228.000 0.000 NA   NA
 3673556 3673557 CBO1088 CBO1089     FALSE 0.045 265.000 0.000 NA   NA
 3673557 3673558 CBO1089 CBO1090     FALSE 0.197 170.000 0.000 NA   NA
 3673558 3673559 CBO1090 CBO1091     FALSE 0.005 506.000 0.000 1.000   NA
 3673559 3673560 CBO1091 CBO1092     FALSE 0.058 245.000 0.000 NA   NA
 3673560 3673561 CBO1092 CBO1093     FALSE 0.101 209.000 0.000 NA   NA
 3673565 3673566 CBO1097 CBO1098     FALSE 0.489 143.000 0.008 NA   NA
 3673566 3673567 CBO1098 CBO1099   aldH TRUE 0.645 56.000 0.008 1.000   NA
 3673568 3673569 CBO1100 CBO1101     FALSE 0.030 597.000 0.000 0.003 Y NA
 3673570 3673571 CBO1102 CBO1103     TRUE 0.977 18.000 0.333 1.000 N NA
 3673571 3673572 CBO1103 CBO1104     FALSE 0.008 419.000 0.000 1.000   NA
 3673572 3673573 CBO1104 CBO1105     FALSE 0.271 99.000 0.000 NA   NA
 3673575 3673576 CBO1107 CBO1108   potB TRUE 0.981 2.000 0.217 NA   NA
 3673576 3673577 CBO1108 CBO1109 potB   TRUE 0.986 23.000 0.084 0.034 Y NA
 3673577 3673578 CBO1109 CBO1110   potA TRUE 0.983 12.000 0.308 0.034 N NA
 3673578 3673579 CBO1110 CBO1111 potA   FALSE 0.025 303.000 0.000 NA   NA
 3673579 3673580 CBO1111 CBO1112     TRUE 0.564 104.000 0.020 NA   NA
 3673580 3673581 CBO1112 CBO1113     TRUE 0.826 10.000 0.000 1.000   NA
 3673581 3673582 CBO1113 CBO1114     FALSE 0.294 76.000 0.000 NA   NA
 3673582 3673583 CBO1114 CBO1115     TRUE 0.967 1.000 0.050 NA   NA
 3673583 3673584 CBO1115 CBO1116   maa FALSE 0.032 288.000 0.000 NA   NA
 3673586 3673587 CBO1118 CBO1119     FALSE 0.042 276.000 0.000 1.000   NA
 3673587 3673588 CBO1119 CBO1120     FALSE 0.496 160.000 0.017 1.000   NA
 3673590 3673591 CBO1122 CBO1123     FALSE 0.065 238.000 0.000 NA   NA
 3673591 3673592 CBO1123 CBO1124     FALSE 0.273 114.000 0.000 NA   NA
 3673592 3673593 CBO1124 CBO1126     FALSE 0.004 1003.000 0.000 0.055 N NA
 3673593 3673594 CBO1126 CBO1127   serA TRUE 0.693 228.000 0.110 0.055 Y NA
 3673594 3673595 CBO1127 CBO1128 serA   TRUE 0.984 -22.000 0.072 NA   NA
 3673595 3673596 CBO1128 CBO1129   flrD FALSE 0.003 601.000 0.000 NA   NA
 3673596 3673597 CBO1129 CBO1130 flrD   TRUE 0.602 159.000 0.056 1.000   NA
 3673599 3673600 CBO1132 CBO1133 busR   TRUE 0.732 111.000 0.118 1.000   NA
 3673600 3673601 CBO1133 CBO1134   nam FALSE 0.030 299.000 0.000 1.000   NA
 3673601 3673602 CBO1134 CBO1135 nam pspE FALSE 0.453 158.000 0.004 NA N NA
 3673602 3673603 CBO1135 CBO1136 pspE   FALSE 0.294 76.000 0.000 NA   NA
 3673603 3673604 CBO1136 CBO1137     FALSE 0.037 277.000 0.000 NA   NA
 3673604 3673605 CBO1137 CBO1138     TRUE 0.561 177.000 0.091 NA   NA
 3673605 3673606 CBO1138 CBO1139   xpt FALSE 0.489 161.000 0.009 1.000 N NA
 3673606 3673607 CBO1139 CBO1140 xpt   FALSE 0.027 298.000 0.000 NA   NA
 3673607 3673608 CBO1140 CBO1141     FALSE 0.023 307.000 0.000 NA   NA
 3673608 3673609 CBO1141 CBO1142     TRUE 0.742 196.000 0.667 NA   NA
 3673609 3673610 CBO1142 CBO1143     FALSE 0.015 344.000 0.000 NA   NA
 3673610 3673611 CBO1143 CBO1144     FALSE 0.170 180.000 0.000 NA   NA
 3673611 3673612 CBO1144 CBO1145     TRUE 0.665 137.000 0.065 NA   NA
 3673612 3673613 CBO1145 CBO1146     FALSE 0.003 771.000 0.000 NA   NA
 3673613 3673614 CBO1146 CBO1147     TRUE 0.834 182.000 1.000 NA   NA
 3673614 3673615 CBO1147 CBO1148     TRUE 0.898 -7.000 0.000 NA   NA
 3673615 3673616 CBO1148 CBO1149     FALSE 0.015 347.000 0.000 NA   NA
 3673616 3673617 CBO1149 CBO1150     TRUE 0.979 1.000 0.000 1.000 Y NA
 3673617 3673618 CBO1150 CBO1151     TRUE 0.863 54.000 0.000 0.034 Y NA
 3673618 3673619 CBO1151 CBO1152     FALSE 0.323 75.000 0.000 1.000   NA
 3673619 3673620 CBO1152 CBO1153     FALSE 0.323 75.000 0.000 1.000   NA
 3673620 3673621 CBO1153 CBO1154     TRUE 0.981 2.000 0.000 0.034 Y NA
 3673621 3673622 CBO1154 CBO1155     TRUE 0.997 -37.000 0.900 0.034 N NA
 3673624 3673625 CBO1157 CBO1159   rpsA FALSE 0.007 417.000 0.000 NA   NA
 3673625 3673626 CBO1159 CBO1160 rpsA   FALSE 0.362 183.000 0.008 1.000   NA
 3673626 3673627 CBO1160 CBO1161     TRUE 0.557 172.000 0.067 NA   NA
 3673627 3673628 CBO1161 CBO1162     FALSE 0.002 869.000 0.000 NA   NA
 3673628 3673629 CBO1162 CBO1163     TRUE 0.994 0.000 0.857 NA   NA
 3673629 3673630 CBO1163 CBO1164     TRUE 0.992 -37.000 0.231 1.000   NA
 3673630 3673631 CBO1164 CBO1165     FALSE 0.017 330.000 0.000 NA   NA
 3673631 3673632 CBO1165 CBO1166   asdA FALSE 0.007 433.000 0.000 NA   NA
 3673634 3673635 CBO1168 CBO1169     TRUE 0.965 -6.000 0.012 NA N NA
 3673635 3673636 CBO1169 CBO1170   panE FALSE 0.006 492.000 0.000 NA N NA
 3673636 3673637 CBO1170 CBO1171 panE fchA FALSE 0.035 303.000 0.000 1.000 N NA
 3673637 3673638 CBO1171 CBO1172 fchA   TRUE 0.983 0.000 0.082 0.001 N NA
 3673638 3673639 CBO1172 CBO1173     FALSE 0.022 320.000 0.000 1.000   NA
 3673641 3673642 CBO1176 CBO1177     FALSE 0.524 120.000 0.012 NA   NA
 3673642 3673643 CBO1177 CBO1178     FALSE 0.004 672.000 0.000 NA N NA
 3673643 3673644 CBO1178 CBO1179   cysK2 FALSE 0.103 329.000 0.083 NA N NA
 3673644 3673645 CBO1179 CBO1180 cysK2   TRUE 0.975 45.000 0.400 1.000 Y NA
 3673645 3673646 CBO1180 CBO1181     TRUE 0.985 35.000 0.400 0.034 Y NA
 3673646 3673647 CBO1181 CBO1182   iscS TRUE 0.931 101.000 0.286 1.000 Y NA
 3673647 3673648 CBO1182 CBO1183 iscS   FALSE 0.333 72.000 0.000 1.000   NA
 3673648 3673649 CBO1183 CBO1185   trmU FALSE 0.010 399.000 0.000 1.000   NA
 3673649 3673650 CBO1185 CBO1186 trmU   FALSE 0.022 340.000 0.000 1.000 N NA
 3673650 3673651 CBO1186 CBO1187     TRUE 0.995 21.000 0.875 NA Y NA
 3673651 3673652 CBO1187 CBO1188     FALSE 0.014 373.000 0.000 NA N NA
 3673652 3673653 CBO1188 CBO1189     TRUE 0.898 -7.000 0.000 NA   NA
 3673653 3673654 CBO1189 CBO1190     FALSE 0.003 603.000 0.000 NA   NA
 3673654 3673655 CBO1190 CBO1191     FALSE 0.017 329.000 0.000 NA   NA
 3673657 3673658 CBO1193 CBO1194     TRUE 0.993 -3.000 0.556 1.000 N NA
 3673658 3673659 CBO1194 CBO1195     FALSE 0.026 301.000 0.000 NA   NA
 3673659 3673660 CBO1195 CBO1197     FALSE 0.004 511.000 0.000 NA   NA
 3673662 3673663 CBO1199 CBO1200     TRUE 0.783 14.000 0.000 NA   NA
 3673663 3673664 CBO1200 CBO1201     FALSE 0.387 64.000 0.000 NA N NA
 3673664 3673665 CBO1201 CBO1202     TRUE 0.974 3.000 0.000 NA Y NA
 3673665 3673666 CBO1202 CBO1203     FALSE 0.005 671.000 0.000 0.005   NA
 3673666 3673667 CBO1203 CBO1204   tyrR FALSE 0.003 769.000 0.000 1.000   NA
 3673667 3673668 CBO1204 CBO1205 tyrR   FALSE 0.045 287.000 0.000 1.000 N NA
 3673668 3673669 CBO1205 CBO1206     TRUE 0.996 -7.000 0.833 1.000 N NA
 3673669 3673670 CBO1206 CBO1207     TRUE 0.985 1.000 0.278 NA   NA
 3673672 3673673 CBO1210 CBO1211     FALSE 0.147 189.000 0.000 NA   NA
 3673673 3673674 CBO1211 CBO1212     FALSE 0.287 78.000 0.000 NA   NA
 3673674 3673675 CBO1212 CBO1213     TRUE 0.593 174.000 0.095 1.000   NA
 3673675 3673676 CBO1213 CBO1214   sdhB FALSE 0.012 400.000 0.000 1.000 N NA
 3673676 3673677 CBO1214 CBO1215 sdhB sdhA TRUE 0.992 13.000 0.146 0.001 Y NA
 3673681 3673682 CBO1218 CBO1219     FALSE 0.314 69.000 0.000 NA   NA
 3673683 3673684 CBO1220 CBO1221     FALSE 0.011 380.000 0.000 NA   NA
 3673684 3673685 CBO1221 CBO1221A     TRUE 0.898 -7.000 0.000 NA   NA
 3673685 3673686 CBO1221A CBO1222     TRUE 0.746 107.000 0.154 NA   NA
 3673686 3673687 CBO1222 CBO1223     TRUE 0.805 74.000 0.231 NA   NA
 3673687 3673688 CBO1223 CBO1224     TRUE 0.931 37.000 0.286 NA   NA
 3673688 3673689 CBO1224 CBO1225   appC TRUE 0.596 173.000 0.071 1.000 N NA
 3673689 3673690 CBO1225 CBO1226 appC appB TRUE 0.998 -3.000 0.786 0.034 Y NA
 3673690 3673691 CBO1226 CBO1227 appB appA TRUE 0.909 199.000 0.688 0.034 Y NA
 3673692 3673693 CBO1228 CBO1229   cotJB TRUE 0.909 34.000 0.125 NA   NA
 3673693 3673694 CBO1229 CBO1230 cotJB cotJC TRUE 0.890 31.000 0.047 NA   NA
 3673694 3673695 CBO1230 CBO1231 cotJC   FALSE 0.094 230.000 0.000 NA N NA
 3673695 3673696 CBO1231 CBO1232     TRUE 0.984 17.000 0.667 NA   NA
 3673696 3673697 CBO1232 CBO1233     FALSE 0.003 647.000 0.000 NA   NA
 3673705 3673706 CBO1241 CBO1242     FALSE 0.008 434.000 0.000 NA N NA
 3673706 3673707 CBO1242 CBO1243     TRUE 0.815 8.000 0.000 NA   NA
 3673707 3673708 CBO1243 CBO1243A     TRUE 0.758 19.000 0.000 NA   NA
 3673708 3673709 CBO1243A CBO1244     TRUE 0.990 12.000 1.000 NA   NA
 3673711 3673712 CBO1246 CBO1247     FALSE 0.002 997.000 0.000 NA   NA
 3673712 3673713 CBO1247 CBO1248     FALSE 0.003 644.000 0.000 NA   NA
 3673713 3673714 CBO1248 CBO1248A     FALSE 0.217 161.000 0.000 NA   NA
 3673714 3673715 CBO1248A CBO1249     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 3673715 3673716 CBO1249 CBO1249A     TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3673716 3673717 CBO1249A CBO1250     FALSE 0.016 340.000 0.000 NA   NA
 3673717 3673718 CBO1250 CBO1251     FALSE 0.033 284.000 0.000 NA   NA
 3673718 3673719 CBO1251 CBO1252   grxC FALSE 0.020 319.000 0.000 NA   NA
 3673720 3673721 CBO1253 CBO1254 gapN trxB1 TRUE 0.808 40.000 0.014 1.000 N NA
 3673722 3673723 CBO1255 CBO1256 grdX grdE TRUE 0.829 91.000 0.400 NA   NA
 3673723 3673724 CBO1256 CBO1257 grdE grdB TRUE 0.948 33.000 0.222 0.002   NA
 3673724 3673725 CBO1257 CBO1259 grdB trxB2 FALSE 0.008 412.000 0.000 1.000   NA
 3673725 3673726 CBO1259 CBO1260 trxB2 trxA TRUE 0.979 34.000 0.226 1.000 Y NA
 3673726 3673727 CBO1260 CBO1261 trxA grdA FALSE 0.294 86.000 0.000 1.000   NA
 3673727 3673728 CBO1261 CBO1263 grdA grdC FALSE 0.040 443.000 0.054 0.002   NA
 3673728 3673729 CBO1263 CBO1264 grdC grdD TRUE 0.987 16.000 0.622 0.002   NA
 3673729 3673730 CBO1264 CBO1265 grdD   FALSE 0.010 427.000 0.000 1.000 N NA
 3673730 3673731 CBO1265 CBO1266     TRUE 0.622 66.000 0.005 0.053   NA
 3673731 3673732 CBO1266 CBO1267   mtnK FALSE 0.007 436.000 0.000 1.000   NA
 3673732 3673733 CBO1267 CBO1268 mtnK mtnA TRUE 0.711 140.000 0.104 1.000   NA
 3673733 3673734 CBO1268 CBO1269 mtnA   TRUE 0.736 24.000 0.000 NA   NA
 3673734 3673735 CBO1269 CBO1270     TRUE 0.762 17.000 0.000 NA   NA
 3673735 3673736 CBO1270 CBO1271     TRUE 0.907 174.000 0.400 1.000 Y NA
 3673736 3673737 CBO1271 CBO1273     FALSE 0.023 307.000 0.000 NA   NA
 3673739 3673740 CBO1275 CBO1276     TRUE 0.599 162.000 0.074 NA   NA
 3673740 3673741 CBO1276 CBO1277     TRUE 0.610 142.000 0.038 NA   NA
 3673741 3673742 CBO1277 CBO1278     TRUE 0.982 -3.000 0.135 NA   NA
 3673742 3673743 CBO1278 CBO1279     FALSE 0.010 383.000 0.000 NA   NA
 3673743 3673744 CBO1279 CBO1280     TRUE 0.680 84.000 0.080 NA   NA
 3673745 3673746 CBO1281 CBO1281A     FALSE 0.010 381.000 0.000 NA   NA
 3673747 3673748 CBO1283 CBO1284     TRUE 0.983 19.000 0.667 NA   NA
 3673748 3673749 CBO1284 CBO1285   xdhA2 TRUE 0.838 57.000 0.200 NA   NA
 3673749 3673750 CBO1285 CBO1286 xdhA2 xdhB2 TRUE 0.995 14.000 0.500 0.002 Y NA
 3673750 3673751 CBO1286 CBO1287 xdhB2 xdhC2 TRUE 0.991 32.000 0.667 0.050 Y NA
 3673751 3673752 CBO1287 CBO1288 xdhC2 guaD TRUE 0.732 116.000 0.100 1.000 N NA
 3673752 3673753 CBO1288 CBO1289 guaD   FALSE 0.014 390.000 0.000 1.000 N NA
 3673753 3673754 CBO1289 CBO1290     FALSE 0.022 312.000 0.000 NA   NA
 3673754 3673755 CBO1290 CBO1291     FALSE 0.323 66.000 0.000 NA   NA
 3673755 3673756 CBO1291 CBO1292   tal FALSE 0.003 727.000 0.000 NA   NA
 3673756 3673757 CBO1292 CBO1293 tal   FALSE 0.010 399.000 0.000 1.000   NA
 3673757 3673758 CBO1293 CBO1294     FALSE 0.027 305.000 0.000 1.000   NA
 3673758 3673759 CBO1294 CBO1295     FALSE 0.029 315.000 0.000 1.000 N NA
 3673759 3673760 CBO1295 CBO1296     TRUE 0.980 -7.000 0.067 1.000   NA
 3673760 3673761 CBO1296 CBO1297     TRUE 0.950 6.000 0.033 NA   NA
 3673761 3673762 CBO1297 CBO1298     FALSE 0.256 281.000 0.230 NA   NA
 3673762 3673763 CBO1298 CBO1300     FALSE 0.007 417.000 0.000 NA   NA
 3673763 3673764 CBO1300 CBO1301     FALSE 0.078 228.000 0.000 NA   NA
 3673764 3673765 CBO1301 CBO1302     FALSE 0.017 335.000 0.000 NA   NA
 3673765 3673766 CBO1302 CBO1303     FALSE 0.038 276.000 0.000 NA   NA
 3673766 3673767 CBO1303 CBO1304     TRUE 0.932 37.000 0.287 NA   NA
 3673767 3673768 CBO1304 CBO1305     TRUE 0.876 123.000 0.024 0.001 Y NA
 3673768 3673769 CBO1305 CBO1306     FALSE 0.073 382.000 0.000 1.000 Y NA
 3673769 3673770 CBO1306 CBO1308     FALSE 0.007 478.000 0.000 1.000 N NA
 3673770 3673771 CBO1308 CBO1309     FALSE 0.016 338.000 0.000 NA   NA
 3673771 3673772 CBO1309 CBO1310     FALSE 0.542 164.000 0.040 NA   NA
 3673772 3673773 CBO1310 CBO1311     FALSE 0.007 419.000 0.000 NA   NA
 3673775 3673776 CBO1313 CBO1314     TRUE 0.915 25.000 0.032 NA   NA
 3673778 3673779 CBO1316 CBO1317     FALSE 0.003 592.000 0.000 NA   NA
 3673779 3673780 CBO1317 CBO1318   trkA FALSE 0.002 788.000 0.000 NA   NA
 3673780 3673781 CBO1318 CBO1319 trkA   TRUE 0.996 -3.000 0.163 0.004 Y NA
 3673781 3673782 CBO1319 CBO1320     FALSE 0.142 191.000 0.000 NA   NA
 3673782 3673783 CBO1320 CBO1321     FALSE 0.274 102.000 0.000 NA   NA
 3673784 3673785 CBO1322 CBO1323     TRUE 0.964 15.000 0.158 NA   NA
 3673785 3673786 CBO1323 CBO1324     FALSE 0.017 342.000 0.000 1.000   NA
 3673787 3673788 CBO1325 CBO1326 rbr   FALSE 0.037 295.000 0.000 NA N NA
 3673790 3673791 CBO1328 CBO1329     FALSE 0.010 387.000 0.000 NA   NA
 3673791 3673792 CBO1329 CBO1330     FALSE 0.029 295.000 0.000 NA   NA
 3673792 3673793 CBO1330 CBO1331     TRUE 0.584 209.000 0.312 NA N NA
 3673793 3673794 CBO1331 CBO1332     TRUE 0.888 147.000 0.077 0.050 Y NA
 3673794 3673795 CBO1332 CBO1333     FALSE 0.536 199.000 0.111 0.050   NA
 3673796 3673797 CBO1334 CBO1335     FALSE 0.231 178.000 0.000 1.000 N NA
 3673798 3673799 CBO1336 CBO1337     FALSE 0.035 303.000 0.000 1.000 N NA
 3673799 3673800 CBO1337 CBO1338     TRUE 0.989 22.000 0.214 1.000 Y NA
 3673800 3673801 CBO1338 CBO1339     TRUE 0.994 3.000 0.255 1.000 Y NA
 3673802 3673803 CBO1340 CBO1341     TRUE 0.753 75.000 0.133 NA   NA
 3673804 3673805 CBO1342 CBO1343     FALSE 0.062 280.000 0.000 0.004   NA
 3673805 3673806 CBO1343 CBO1344     TRUE 0.719 113.000 0.107 1.000   NA
 3673806 3673807 CBO1344 CBO1346     FALSE 0.042 424.000 0.089 1.000   NA
 3673807 3673808 CBO1346 CBO1347     FALSE 0.017 332.000 0.000 NA   NA
 3673808 3673809 CBO1347 CBO1348     FALSE 0.034 283.000 0.000 NA   NA
 3673809 3673810 CBO1348 CBO1349     FALSE 0.272 115.000 0.000 NA   NA
 3673810 3673811 CBO1349 CBO1350     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 3673811 3673812 CBO1350 CBO1351     TRUE 0.918 53.000 0.500 NA   NA
 3673812 3673813 CBO1351 CBO1352     TRUE 0.985 0.000 0.250 NA   NA
 3673815 3673816 CBO1354 CBO1355     FALSE 0.008 458.000 0.000 1.000 N NA
 3673816 3673817 CBO1355 CBO1356     TRUE 0.996 -3.000 0.235 0.033 Y NA
 3673817 3673818 CBO1356 CBO1357     TRUE 0.995 9.000 0.353 0.033 Y NA
 3673818 3673819 CBO1357 CBO1358     TRUE 0.900 99.000 0.118 1.000 Y NA
 3673819 3673820 CBO1358 CBO1359     TRUE 0.982 -6.000 0.059 0.032   NA
 3673820 3673821 CBO1359 CBO1360     FALSE 0.006 444.000 0.000 NA   NA
 3673822 3673823 CBO1361 CBO1362     TRUE 0.995 0.000 0.231 1.000 Y NA
 3673826 3673827 CBO1365 CBO1366     TRUE 0.625 135.000 0.025 1.000 N NA
 3673827 3673828 CBO1366 CBO1368     FALSE 0.003 934.000 0.000 NA N NA
 3673828 3673829 CBO1368 CBO1369     TRUE 0.998 -28.000 0.646 NA Y NA
 3673829 3673830 CBO1369 CBO1370     TRUE 0.927 141.000 0.270 1.000 Y NA
 3673830 3673831 CBO1370 CBO1372     FALSE 0.221 279.000 0.000 1.000 Y NA
 3673831 3673832 CBO1372 CBO1373     TRUE 0.984 -30.000 0.035 0.057   NA
 3673832 3673833 CBO1373 CBO1374     TRUE 0.631 127.000 0.035 1.000   NA
 3673833 3673834 CBO1374 CBO1376     FALSE 0.035 290.000 0.000 1.000   NA
 3673834 3673835 CBO1376 CBO1377     FALSE 0.017 346.000 0.000 1.000   NA
 3673835 3673836 CBO1377 CBO1378     FALSE 0.255 145.000 0.000 NA   NA
 3673836 3673837 CBO1378 CBO1379     TRUE 0.922 13.000 0.015 NA   NA
 3673837 3673838 CBO1379 CBO1380     TRUE 0.937 183.000 0.800 0.018 Y NA
 3673838 3673839 CBO1380 CBO1381     FALSE 0.221 351.000 0.600 1.000 N NA
 3673839 3673840 CBO1381 CBO1382     TRUE 0.966 106.000 1.000 NA Y NA
 3673840 3673841 CBO1382 CBO1383     TRUE 0.990 2.000 0.600 NA   NA
 3673841 3673842 CBO1383 CBO1384     TRUE 0.987 4.000 0.500 NA   NA
 3673843 3673844 CBO1385 CBO1386     FALSE 0.004 558.000 0.000 NA   NA
 3673844 3673845 CBO1386 CBO1387   cspB TRUE 0.717 168.000 0.250 NA   NA
 3673846 3673847 CBO1388 CBO1389     FALSE 0.389 58.000 0.000 1.000   NA
 3673847 3673848 CBO1389 CBO1390     FALSE 0.010 398.000 0.000 1.000   NA
 3673850 3673851 CBO1391A CBO1392     TRUE 0.994 -13.000 0.500 1.000   NA
 3673851 3673852 CBO1392 CBO1393     TRUE 0.783 173.000 0.500 NA   NA
 3673852 3673853 CBO1393 CBO1394     FALSE 0.006 440.000 0.000 NA   NA
 3673853 3673854 CBO1394 CBO1395     TRUE 0.998 2.000 1.000 1.000 Y NA
 3673854 3673855 CBO1395 CBO1396     TRUE 0.906 59.000 0.500 1.000 N NA
 3673855 3673856 CBO1396 CBO1397     TRUE 0.989 -10.000 0.222 1.000   NA
 3673856 3673857 CBO1397 CBO1398     FALSE 0.314 69.000 0.000 NA   NA
 3673857 3673858 CBO1398 CBO1399     FALSE 0.011 376.000 0.000 NA   NA
 3673858 3673859 CBO1399 CBO1400     FALSE 0.010 384.000 0.000 NA   NA
 3673859 3673860 CBO1400 CBO1401     TRUE 0.736 88.000 0.000 1.000 Y NA
 3673860 3673861 CBO1401 CBO1402     TRUE 0.993 19.000 0.400 1.000 Y NA
 3673861 3673862 CBO1402 CBO1403     FALSE 0.011 395.000 0.000 1.000   NA
 3673866 3673867 CBO1407 CBO1408 bdh   FALSE 0.010 384.000 0.000 NA   NA
 3673867 3673868 CBO1408 CBO1409     TRUE 0.818 158.000 0.500 NA   NA
 3673870 3673871 CBO1411 CBO1412     TRUE 0.997 2.000 0.643 0.033 Y NA
 3673871 3673872 CBO1412 CBO1413     TRUE 0.633 131.000 0.041 NA   NA
 3673872 3673873 CBO1413 CBO1414     FALSE 0.268 95.000 0.000 NA   NA
 3673873 3673874 CBO1414 CBO1415     FALSE 0.145 190.000 0.000 NA   NA
 3673874 3673875 CBO1415 CBO1416     TRUE 0.822 6.000 0.000 NA   NA
 3673875 3673876 CBO1416 CBO1417     FALSE 0.272 123.000 0.000 NA   NA
 3673876 3673877 CBO1417 CBO1418     FALSE 0.277 110.000 0.000 NA   NA
 3673877 3673878 CBO1418 CBO1419     FALSE 0.214 162.000 0.000 NA   NA
 3673878 3673879 CBO1419 CBO1420     FALSE 0.384 56.000 0.000 NA   NA
 3673879 3673880 CBO1420 CBO1421     FALSE 0.038 276.000 0.000 NA   NA
 3673880 3673881 CBO1421 CBO1422   uviB FALSE 0.083 224.000 0.000 NA   NA
 3673881 3673882 CBO1422 CBO1423 uviB   TRUE 0.994 -7.000 0.667 NA   NA
 3673882 3673883 CBO1423 CBO1424     TRUE 0.870 0.000 0.000 NA   NA
 3673883 3673884 CBO1424 CBO1425     FALSE 0.011 368.000 0.000 NA   NA
 3673884 3673885 CBO1425 CBO1426     TRUE 0.992 2.000 0.750 NA   NA
 3673885 3673886 CBO1426 CBO1427     FALSE 0.003 659.000 0.000 NA   NA
 3673886 3673887 CBO1427 CBO1428     FALSE 0.011 375.000 0.000 NA   NA
 3673887 3673888 CBO1428 CBO1429     FALSE 0.014 351.000 0.000 NA   NA
 3673888 3673889 CBO1429 CBO1430     FALSE 0.115 203.000 0.000 NA   NA
 3673889 3673890 CBO1430 CBO1431     FALSE 0.499 220.000 0.250 1.000   NA
 3673890 3673891 CBO1431 CBO1432     FALSE 0.413 56.000 0.000 1.000   NA
 3673891 3673892 CBO1432 CBO1433   rluC FALSE 0.007 480.000 0.000 1.000 N NA
 3673892 3673893 CBO1433 CBO1434 rluC   TRUE 0.925 32.000 0.137 1.000   NA
 3673897 3673898 CBO1438 CBO1439     FALSE 0.018 361.000 0.000 1.000 N NA
 3673899 3673900 CBO1440 CBO1442     FALSE 0.197 170.000 0.000 NA   NA
 3673900 3673901 CBO1442 CBO1443     TRUE 0.972 137.000 1.000 0.005 Y NA
 3673901 3673902 CBO1443 CBO1444     TRUE 0.779 116.000 0.000 0.005 Y NA
 3673902 3673903 CBO1444 CBO1445     TRUE 0.779 120.000 0.000 0.005 Y NA
 3673903 3673904 CBO1445 CBO1446     TRUE 0.931 34.000 0.000 0.005 Y NA
 3673904 3673905 CBO1446 CBO1447   nadC FALSE 0.004 603.000 0.000 1.000 N NA
 3673905 3673906 CBO1447 CBO1447A nadC nadB TRUE 0.995 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 3673906 3673907 CBO1447A CBO1448 nadB nadA TRUE 0.989 3.000 0.042 1.000 Y NA
 3673909 3673910 CBO1450 CBO1451     FALSE 0.536 121.000 0.002 0.051   NA
 3673911 3673912 CBO1453 CBO1454 mraZ mraW TRUE 0.877 80.000 0.635 NA   NA
 3673912 3673913 CBO1454 CBO1455 mraW   FALSE 0.533 82.000 0.008 1.000   NA
 3673913 3673914 CBO1455 CBO1456   spoVD TRUE 0.955 16.000 0.096 1.000   NA
 3673914 3673915 CBO1456 CBO1457 spoVD murE TRUE 0.737 230.000 0.265 1.000 Y NA
 3673915 3673916 CBO1457 CBO1458 murE murF TRUE 0.991 26.000 0.328 0.003 Y NA
 3673916 3673917 CBO1458 CBO1459 murF mraY TRUE 0.960 36.000 0.024 0.005 Y NA
 3673917 3673918 CBO1459 CBO1460 mraY ftsW TRUE 0.658 79.000 0.014 0.005 N NA
 3673918 3673919 CBO1460 CBO1461 ftsW divIB FALSE 0.069 319.000 0.015 NA N NA
 3673919 3673920 CBO1461 CBO1462 divIB   TRUE 0.926 11.000 0.014 NA   NA
 3673920 3673921 CBO1462 CBO1463   sbp TRUE 0.875 34.000 0.053 NA   NA
 3673921 3673922 CBO1463 CBO1464 sbp   TRUE 0.968 1.000 0.053 NA   NA
 3673922 3673923 CBO1464 CBO1465     FALSE 0.545 93.000 0.017 NA   NA
 3673923 3673924 CBO1465 CBO1466     TRUE 0.926 21.000 0.032 NA   NA
 3673924 3673925 CBO1466 CBO1467     TRUE 0.969 17.000 0.246 NA   NA
 3673925 3673926 CBO1467 CBO1468     TRUE 0.978 1.000 0.118 1.000   NA
 3673926 3673927 CBO1468 CBO1469   divIVA TRUE 0.984 16.000 0.579 1.000   NA
 3673927 3673928 CBO1469 CBO1470 divIVA aroB FALSE 0.025 408.000 0.006 1.000 N NA
 3673928 3673929 CBO1470 CBO1471 aroB mtn TRUE 0.949 1.000 0.003 1.000 N NA
 3673929 3673930 CBO1471 CBO1472 mtn   TRUE 0.672 121.000 0.046 1.000 N NA
 3673930 3673931 CBO1472 CBO1473   aroA TRUE 0.816 134.000 0.003 1.000 Y NA
 3673931 3673932 CBO1473 CBO1474 aroA   FALSE 0.123 217.000 0.000 1.000 N NA
 3673932 3673933 CBO1474 CBO1475   lspA FALSE 0.045 404.000 0.050 1.000 N NA
 3673933 3673934 CBO1475 CBO1476 lspA rluD1 TRUE 0.971 4.000 0.082 1.000 N NA
 3673934 3673935 CBO1476 CBO1478 rluD1 pyrR FALSE 0.025 487.000 0.048 1.000 N NA
 3673935 3673936 CBO1478 CBO1479 pyrR pyrP TRUE 0.961 44.000 0.140 1.000 Y NA
 3673936 3673937 CBO1479 CBO1480 pyrP exoA FALSE 0.005 590.000 0.000 1.000 N NA
 3673937 3673938 CBO1480 CBO1481 exoA   FALSE 0.413 223.000 0.000 1.000 Y NA
 3673938 3673939 CBO1481 CBO1482     FALSE 0.083 231.000 0.000 1.000   NA
 3673939 3673940 CBO1482 CBO1483   modA FALSE 0.411 178.000 0.015 1.000   NA
 3673940 3673941 CBO1483 CBO1484 modA modB TRUE 0.996 10.000 0.430 0.001 Y NA
 3673941 3673942 CBO1484 CBO1485 modB modC FALSE 0.418 328.000 0.342 1.000 Y NA
 3673942 3673943 CBO1485 CBO1486 modC   TRUE 0.677 54.000 0.013 NA   NA
 3673943 3673944 CBO1486 CBO1487     FALSE 0.010 382.000 0.000 NA   NA
 3673944 3673945 CBO1487 CBO1488     FALSE 0.026 300.000 0.000 NA   NA
 3673945 3673946 CBO1488 CBO1489     FALSE 0.040 273.000 0.000 NA   NA
 3673946 3673947 CBO1489 CBO1490     TRUE 0.825 88.000 0.308 1.000 N NA
 3673947 3673948 CBO1490 CBO1491     FALSE 0.288 142.000 0.000 1.000   NA
 3673948 3673949 CBO1491 CBO1492   cobW TRUE 0.732 90.000 0.147 NA   NA
 3673949 3673950 CBO1492 CBO1493 cobW   TRUE 0.966 23.000 0.235 NA   NA
 3673950 3673951 CBO1493 CBO1494   mtbC TRUE 0.947 26.000 0.118 1.000   NA
 3673951 3673952 CBO1494 CBO1495 mtbC mtbA TRUE 0.727 85.000 0.118 1.000   NA
 3673954 3673955 CBO1497 CBO1498     FALSE 0.274 102.000 0.000 NA   NA
 3673955 3673956 CBO1498 CBO1499   metN2 TRUE 0.941 23.000 0.044 1.000 N NA
 3673956 3673957 CBO1499 CBO1500 metN2 metI2 TRUE 0.994 2.000 0.178 1.000 Y NA
 3673957 3673958 CBO1500 CBO1501 metI2 metQ3 TRUE 0.939 144.000 0.444 NA Y NA
 3673960 3673961 CBO1503 CBO1504   asnA FALSE 0.025 329.000 0.000 1.000 N NA
 3673963 3673964 CBO1506 CBO1507     TRUE 0.972 27.000 0.024 1.000 Y NA
 3673964 3673965 CBO1507 CBO1508     FALSE 0.023 317.000 0.000 1.000   NA
 3673967 3673968 CBO1510 CBO1511     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 3673968 3673969 CBO1511 CBO1513     TRUE 0.797 12.000 0.000 NA   NA
 3673969 3673970 CBO1513 CBO1514     FALSE 0.013 362.000 0.000 NA   NA
 3673970 3673971 CBO1514 CBO1515     TRUE 0.944 13.000 0.041 NA   NA
 3673971 3673972 CBO1515 CBO1516     TRUE 0.995 -7.000 0.611 0.033 N NA
 3673972 3673973 CBO1516 CBO1517     TRUE 0.981 36.000 0.278 0.033 Y NA
 3673973 3673974 CBO1517 CBO1518     TRUE 0.962 46.000 0.121 0.033 Y NA
 3673980 3673981 CBO1524 CBO1525     FALSE 0.277 108.000 0.000 NA   NA
 3673981 3673982 CBO1525 CBO1526     FALSE 0.011 368.000 0.000 NA   NA
 3673982 3673983 CBO1526 CBO1527     FALSE 0.149 206.000 0.000 1.000 N NA
 3673983 3673984 CBO1527 CBO1528     TRUE 0.930 27.000 0.087 NA   NA
 3673985 3673986 CBO1529 CBO1530     TRUE 0.822 6.000 0.000 NA   NA
 3673987 3673988 CBO1531 CBO1532   ogt TRUE 0.858 29.000 0.014 NA   NA
 3673988 3673989 CBO1532 CBO1533 ogt   TRUE 0.658 57.000 0.014 1.000   NA
 3673989 3673990 CBO1533 CBO1534     TRUE 0.731 165.000 0.263 NA   NA
 3673990 3673991 CBO1534 CBO1535     TRUE 0.955 25.000 0.168 NA   NA
 3673991 3673992 CBO1535 CBO1536     FALSE 0.011 390.000 0.000 1.000   NA
 3673992 3673993 CBO1536 CBO1537     FALSE 0.450 53.000 0.000 1.000   NA
 3673993 3673994 CBO1537 CBO1538     FALSE 0.522 57.000 0.000 0.003   NA
 3673994 3673995 CBO1538 CBO1539     FALSE 0.009 486.000 0.000 0.097 N NA
 3673995 3673996 CBO1539 CBO1541     FALSE 0.009 436.000 0.000 1.000 N NA
 3673996 3673997 CBO1541 CBO1542     FALSE 0.270 98.000 0.000 NA   NA
 3673997 3673998 CBO1542 CBO1543     FALSE 0.108 366.000 0.250 NA   NA
 3673998 3673999 CBO1543 CBO1544     FALSE 0.271 117.000 0.000 NA   NA
 3674003 3674004 CBO1548 CBO1549     FALSE 0.275 103.000 0.000 NA   NA
 3674005 3674006 CBO1550 CBO1551     TRUE 0.639 88.000 0.051 NA   NA
 3674007 3674008 CBO1552 CBO1553     TRUE 0.892 117.000 0.722 NA N NA
 3674008 3674009 CBO1553 CBO1554     TRUE 0.962 18.000 0.135 NA N NA
 3674009 3674010 CBO1554 CBO1555     TRUE 0.989 2.000 0.405 1.000 N NA
 3674010 3674011 CBO1555 CBO1556   folE TRUE 0.988 4.000 0.429 1.000 N NA
 3674011 3674012 CBO1556 CBO1557 folE   FALSE 0.386 184.000 0.015 1.000   NA
 3674012 3674013 CBO1557 CBO1558     FALSE 0.506 115.000 0.005 1.000   NA
 3674013 3674014 CBO1558 CBO1559     FALSE 0.182 175.000 0.000 NA   NA
 3674014 3674015 CBO1559 CBO1560     FALSE 0.019 322.000 0.000 NA   NA
 3674015 3674016 CBO1560 CBO1561   deoR TRUE 0.931 22.000 0.040 NA   NA
 3674016 3674017 CBO1561 CBO1563 deoR deoC FALSE 0.171 292.000 0.077 1.000 N NA
 3674017 3674018 CBO1563 CBO1564 deoC rbsK FALSE 0.064 344.000 0.026 1.000 N NA
 3674018 3674019 CBO1564 CBO1565 rbsK hisZ FALSE 0.008 448.000 0.000 1.000 N NA
 3674019 3674020 CBO1565 CBO1566 hisZ hisG TRUE 0.992 16.000 0.239 0.004 Y NA
 3674020 3674021 CBO1566 CBO1567 hisG hisD TRUE 0.943 78.000 0.254 0.004 Y NA
 3674021 3674022 CBO1567 CBO1568 hisD hisB TRUE 0.896 150.000 0.096 0.004 Y NA
 3674022 3674023 CBO1568 CBO1569 hisB hisH TRUE 0.919 128.000 0.125 0.004 Y NA
 3674023 3674024 CBO1569 CBO1570 hisH hisA TRUE 0.996 -3.000 0.124 0.004 Y NA
 3674024 3674025 CBO1570 CBO1571 hisA hisC TRUE 0.991 -3.000 0.004 0.004 Y NA
 3674025 3674026 CBO1571 CBO1572 hisC hisF TRUE 0.676 197.000 0.002 0.004 Y NA
 3674026 3674027 CBO1572 CBO1573 hisF hisI TRUE 0.943 153.000 0.430 0.004 Y NA
 3674027 3674028 CBO1573 CBO1574 hisI hisE TRUE 0.923 125.000 0.152 0.004 Y NA
 3674028 3674029 CBO1574 CBO1575 hisE   FALSE 0.490 136.000 0.005 NA   NA
 3674029 3674030 CBO1575 CBO1576     TRUE 0.972 14.000 0.231 NA   NA
 3674030 3674031 CBO1576 CBO1577     TRUE 0.971 18.000 0.267 NA   NA
 3674033 3674034 CBO1579 CBO1580     TRUE 0.690 81.000 0.070 1.000   NA
 3674034 3674035 CBO1580 CBO1581     TRUE 0.602 153.000 0.047 1.000   NA
 3674035 3674036 CBO1581 CBO1582     FALSE 0.031 298.000 0.000 1.000   NA
 3674036 3674037 CBO1582 CBO1583     TRUE 0.959 3.000 0.041 NA   NA
 3674037 3674038 CBO1583 CBO1584     TRUE 0.987 3.000 0.490 NA   NA
 3674038 3674039 CBO1584 CBO1585     TRUE 0.819 117.000 0.352 NA   NA
 3674039 3674040 CBO1585 CBO1586     TRUE 0.999 -9.000 0.741 0.018 Y NA
 3674040 3674041 CBO1586 CBO1587   arcA2 FALSE 0.005 564.000 0.000 1.000 N NA
 3674041 3674042 CBO1587 CBO1588 arcA2 arcD TRUE 0.848 125.000 0.022 1.000 Y NA
 3674044 3674045 CBO1590 CBO1591     FALSE 0.272 138.000 0.000 NA   NA
 3674045 3674046 CBO1591 CBO1592     FALSE 0.267 93.000 0.000 NA   NA
 3674048 3674049 CBO1595 CBO1596     FALSE 0.485 190.000 0.067 1.000   NA
 3674049 3674050 CBO1596 CBO1597     FALSE 0.008 419.000 0.000 1.000   NA
 3674050 3674051 CBO1597 CBO1598     FALSE 0.064 247.000 0.000 1.000   NA
 3674051 3674052 CBO1598 CBO1599     TRUE 0.776 149.000 0.222 1.000 N NA
 3674052 3674053 CBO1599 CBO1600     TRUE 0.998 2.000 0.900 0.006 Y NA
 3674053 3674054 CBO1600 CBO1601     FALSE 0.013 392.000 0.000 1.000 N NA
 3674054 3674055 CBO1601 CBO1602   glcK FALSE 0.161 304.000 0.000 1.000 Y NA
 3674055 3674056 CBO1602 CBO1604 glcK malL FALSE 0.316 247.000 0.000 1.000 Y NA
 3674056 3674057 CBO1604 CBO1605 malL   TRUE 0.966 42.000 0.167 1.000 Y NA
 3674057 3674058 CBO1605 CBO1606     TRUE 0.989 4.000 0.610 NA   NA
 3674058 3674059 CBO1606 CBO1607     FALSE 0.082 225.000 0.000 NA   NA
 3674061 3674062 CBO1609 CBO1610     TRUE 0.836 158.000 0.600 NA   NA
 3674063 3674064 CBO1612 CBO1613     TRUE 0.997 -22.000 0.261 1.000 Y NA
 3674066 3674067 CBO1615 CBO1616     TRUE 0.971 12.000 0.171 1.000   NA
 3674068 3674069 CBO1618 CBO1619     TRUE 0.844 178.000 1.000 NA   NA
 3674071 3674072 CBO1621 CBO1622 metF   TRUE 0.629 164.000 0.045 0.002   NA
 3674072 3674073 CBO1622 CBO1623   metH TRUE 0.987 -10.000 0.075 0.001   NA
 3674075 3674076 CBO1625 CBO1626     TRUE 0.994 -7.000 0.667 NA   NA
 3674076 3674077 CBO1626 CBO1627     FALSE 0.071 233.000 0.000 NA   NA
 3674077 3674078 CBO1627 CBO1628   acoR TRUE 0.808 10.000 0.000 NA   NA
 3674078 3674079 CBO1628 CBO1629 acoR   TRUE 0.674 169.000 0.182 NA   NA
 3674079 3674080 CBO1629 CBO1630   acoA TRUE 0.942 21.000 0.065 NA   NA
 3674080 3674081 CBO1630 CBO1631 acoA acoB TRUE 0.993 3.000 0.076 0.001 Y NA
 3674081 3674082 CBO1631 CBO1632 acoB acoX TRUE 0.873 53.000 0.162 0.052   NA
 3674082 3674083 CBO1632 CBO1633 acoX acoC TRUE 0.902 36.000 0.081 0.052   NA
 3674083 3674084 CBO1633 CBO1634 acoC acoL TRUE 0.990 13.000 0.148 1.000 Y NA
 3674084 3674085 CBO1634 CBO1635 acoL lplA2 TRUE 0.945 25.000 0.074 1.000 N NA
 3674085 3674086 CBO1635 CBO1636 lplA2 opuBA FALSE 0.023 339.000 0.000 1.000 N NA
 3674086 3674087 CBO1636 CBO1637 opuBA opuBB TRUE 0.996 -10.000 0.793 0.096 N NA
 3674087 3674088 CBO1637 CBO1638 opuBB thrC FALSE 0.003 815.000 0.000 1.000 N NA
 3674088 3674089 CBO1638 CBO1639 thrC thrB TRUE 0.993 10.000 0.233 1.000 Y NA
 3674089 3674090 CBO1639 CBO1640 thrB apk TRUE 0.827 127.000 0.008 1.000 Y NA
 3674090 3674091 CBO1640 CBO1641 apk hom TRUE 0.595 223.000 0.010 0.002 Y NA
 3674091 3674092 CBO1641 CBO1642 hom   FALSE 0.005 587.000 0.000 1.000 N NA
 3674092 3674093 CBO1642 CBO1643     FALSE 0.006 509.000 0.000 1.000 N NA
 3674093 3674094 CBO1643 CBO1644   pyrK1 FALSE 0.120 329.000 0.000 1.000 Y NA
 3674094 3674095 CBO1644 CBO1645 pyrK1 aspB TRUE 0.994 0.000 0.667 0.048 N NA
 3674095 3674096 CBO1645 CBO1646 aspB   FALSE 0.076 229.000 0.000 NA   NA
 3674096 3674097 CBO1646 CBO1647     FALSE 0.500 43.000 0.000 NA   NA
 3674097 3674098 CBO1647 CBO1648     FALSE 0.036 278.000 0.000 NA   NA
 3674098 3674099 CBO1648 CBO1649     TRUE 0.617 32.000 0.000 NA   NA
 3674099 3674100 CBO1649 CBO1650     FALSE 0.268 94.000 0.000 NA   NA
 3674100 3674101 CBO1650 CBO1651     FALSE 0.170 180.000 0.000 NA   NA
 3674101 3674102 CBO1651 CBO1652     FALSE 0.013 359.000 0.000 NA   NA
 3674102 3674103 CBO1652 CBO1653     FALSE 0.195 171.000 0.000 NA   NA
 3674103 3674104 CBO1653 CBO1654     FALSE 0.153 186.000 0.000 NA   NA
 3674104 3674105 CBO1654 CBO1655     FALSE 0.005 468.000 0.000 NA   NA
 3674105 3674106 CBO1655 CBO1656     FALSE 0.228 156.000 0.000 NA   NA
 3674106 3674107 CBO1656 CBO1657     FALSE 0.384 56.000 0.000 NA   NA
 3674107 3674108 CBO1657 CBO1658     FALSE 0.005 459.000 0.000 NA   NA
 3674108 3674109 CBO1658 CBO1659     TRUE 0.950 33.000 0.379 NA   NA
 3674109 3674110 CBO1659 CBO1660   alr FALSE 0.006 438.000 0.000 NA   NA
 3674110 3674111 CBO1660 CBO1661 alr   FALSE 0.010 421.000 0.000 1.000 N NA
 3674111 3674112 CBO1661 CBO1662     TRUE 0.607 127.000 0.016 0.096   NA
 3674112 3674113 CBO1662 CBO1663     FALSE 0.062 240.000 0.000 NA   NA
 3674115 3674116 CBO1665 CBO1666     FALSE 0.034 283.000 0.000 NA   NA
 3674116 3674117 CBO1666 CBO1667     FALSE 0.002 913.000 0.000 NA   NA
 3674118 3674119 CBO1668 CBO1669     FALSE 0.261 143.000 0.000 NA   NA
 3674124 3674125 CBO1674 CBO1675     TRUE 0.631 137.000 0.027 1.000 N NA
 3674125 3674126 CBO1675 CBO1676     TRUE 0.996 14.000 0.667 0.032 Y NA
 3674126 3674127 CBO1676 CBO1677     TRUE 0.998 4.000 1.000 0.032 Y NA
 3674127 3674128 CBO1677 CBO1678     TRUE 0.983 31.000 0.265 1.000 Y NA
 3674129 3674130 CBO1679 CBO1679A     TRUE 0.920 -13.000 0.000 1.000   NA
 3674130 3674131 CBO1679A CBO1680     FALSE 0.283 172.000 0.000 0.023   NA
 3674131 3674132 CBO1680 CBO1681     TRUE 0.839 3.000 0.000 NA   NA
 3674133 3674134 CBO1682 CBO1683     TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 3674134 3674135 CBO1683 CBO1684     TRUE 0.850 2.000 0.000 NA   NA
 3674135 3674136 CBO1684 CBO1685     TRUE 0.790 13.000 0.000 NA   NA
 3674136 3674137 CBO1685 CBO1686     FALSE 0.270 97.000 0.000 NA   NA
 3674137 3674138 CBO1686 CBO1687     FALSE 0.145 190.000 0.000 NA   NA
 3674138 3674139 CBO1687 CBO1688     TRUE 0.870 0.000 0.000 NA   NA
 3674139 3674140 CBO1688 CBO1689     TRUE 0.850 2.000 0.000 NA   NA
 3674140 3674141 CBO1689 CBO1690     TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 3674141 3674142 CBO1690 CBO1691   erF TRUE 0.970 0.000 0.051 NA   NA
 3674142 3674143 CBO1691 CBO1692 erF   TRUE 0.850 2.000 0.000 NA   NA
 3674143 3674144 CBO1692 CBO1693     TRUE 0.803 11.000 0.000 NA   NA
 3674144 3674145 CBO1693 CBO1694     TRUE 0.995 -70.000 0.500 NA   NA
 3674145 3674146 CBO1694 CBO1695     TRUE 0.898 -7.000 0.000 NA   NA
 3674146 3674147 CBO1695 CBO1696     TRUE 0.790 13.000 0.000 NA   NA
 3674147 3674148 CBO1696 CBO1697     FALSE 0.323 66.000 0.000 NA   NA
 3674148 3674149 CBO1697 CBO1698     FALSE 0.510 42.000 0.000 NA   NA
 3674149 3674150 CBO1698 CBO1699     FALSE 0.320 67.000 0.000 NA   NA
 3674150 3674151 CBO1699 CBO1700     FALSE 0.384 56.000 0.000 NA   NA
 3674151 3674152 CBO1700 CBO1701     TRUE 0.617 32.000 0.000 NA   NA
 3674152 3674153 CBO1701 CBO1702     TRUE 0.649 30.000 0.000 NA   NA
 3674153 3674154 CBO1702 CBO1703     FALSE 0.317 68.000 0.000 NA   NA
 3674154 3674155 CBO1703 CBO1704     TRUE 0.751 22.000 0.000 NA   NA
 3674155 3674156 CBO1704 CBO1705     FALSE 0.327 65.000 0.000 NA   NA
 3674156 3674157 CBO1705 CBO1706     FALSE 0.410 54.000 0.000 NA   NA
 3674157 3674158 CBO1706 CBO1707     TRUE 0.762 17.000 0.000 NA   NA
 3674158 3674159 CBO1707 CBO1708     FALSE 0.353 59.000 0.000 NA   NA
 3674159 3674160 CBO1708 CBO1709     FALSE 0.271 99.000 0.000 NA   NA
 3674160 3674161 CBO1709 CBO1710     FALSE 0.182 175.000 0.000 NA   NA
 3674161 3674162 CBO1710 CBO1711     TRUE 0.870 0.000 0.000 NA   NA
 3674162 3674163 CBO1711 CBO1712     TRUE 0.839 3.000 0.000 NA   NA
 3674163 3674164 CBO1712 CBO1712A     TRUE 0.803 11.000 0.000 NA   NA
 3674164 3674165 CBO1712A CBO1713     TRUE 0.850 2.000 0.000 NA   NA
 3674165 3674166 CBO1713 CBO1714     FALSE 0.269 86.000 0.000 NA   NA
 3674166 3674167 CBO1714 CBO1715     FALSE 0.276 104.000 0.000 NA   NA
 3674167 3674168 CBO1715 CBO1716     TRUE 0.870 0.000 0.000 NA   NA
 3674168 3674169 CBO1716 CBO1717     TRUE 0.898 -7.000 0.000 NA   NA
 3674169 3674170 CBO1717 CBO1718     FALSE 0.258 144.000 0.000 NA   NA
 3674170 3674171 CBO1718 CBOt028   tRNA TRUE 0.783 14.000 0.000 NA   NA
 3674171 3674172 CBOt028 CBO1719 tRNA   FALSE 0.195 171.000 0.000 NA   NA
 3674172 3674173 CBO1719 CBO1720     FALSE 0.199 169.000 0.000 NA   NA
 3674173 3674174 CBO1720 CBO1721     FALSE 0.518 41.000 0.000 NA   NA
 3674174 3674175 CBO1721 CBO1722     TRUE 0.992 -7.000 0.294 0.001   NA
 3674175 3674176 CBO1722 CBO1723     TRUE 0.978 14.000 0.368 NA   NA
 3674176 3674177 CBO1723 CBO1724     TRUE 0.991 -19.000 0.263 NA   NA
 3674177 3674178 CBO1724 CBO1725     TRUE 0.745 23.000 0.000 NA   NA
 3674178 3674179 CBO1725 CBO1726     TRUE 0.803 11.000 0.000 NA   NA
 3674179 3674180 CBO1726 CBO1727     FALSE 0.271 117.000 0.000 NA   NA
 3674180 3674181 CBO1727 CBO1728     TRUE 0.969 20.000 0.250 NA   NA
 3674181 3674182 CBO1728 CBO1729     TRUE 0.978 14.000 0.375 NA   NA
 3674182 3674183 CBO1729 CBO1730     TRUE 0.991 2.000 0.667 NA   NA
 3674183 3674184 CBO1730 CBO1731     TRUE 0.870 0.000 0.000 NA   NA
 3674184 3674185 CBO1731 CBO1732     TRUE 0.910 -13.000 0.000 NA   NA
 3674185 3674186 CBO1732 CBO1733     FALSE 0.214 162.000 0.000 NA   NA
 3674186 3674187 CBO1733 CBO1734     TRUE 0.832 4.000 0.000 NA   NA
 3674187 3674188 CBO1734 CBO1735     TRUE 0.762 17.000 0.000 NA   NA
 3674188 3674189 CBO1735 CBO1736     FALSE 0.061 241.000 0.000 NA   NA
 3674189 3674190 CBO1736 CBO1737     FALSE 0.268 88.000 0.000 NA   NA
 3674190 3674191 CBO1737 CBO1738     TRUE 0.870 0.000 0.000 NA   NA
 3674191 3674192 CBO1738 CBO1739     TRUE 0.797 12.000 0.000 NA   NA
 3674192 3674193 CBO1739 CBO1740     TRUE 0.985 10.000 0.500 NA   NA
 3674193 3674194 CBO1740 CBO1741     TRUE 0.983 -3.000 0.160 NA   NA
 3674194 3674195 CBO1741 CBO1742     TRUE 0.992 1.000 0.720 NA   NA
 3674195 3674196 CBO1742 CBO1743     TRUE 0.995 -19.000 0.708 NA   NA
 3674196 3674197 CBO1743 CBO1744     TRUE 0.832 4.000 0.000 NA   NA
 3674197 3674198 CBO1744 CBO1745     TRUE 0.602 33.000 0.000 NA   NA
 3674198 3674199 CBO1745 CBO1746     TRUE 0.898 -7.000 0.000 NA   NA
 3674199 3674200 CBO1746 CBO1747     FALSE 0.009 396.000 0.000 NA   NA
 3674200 3674201 CBO1747 CBO1748     FALSE 0.136 194.000 0.000 NA   NA
 3674201 3674202 CBO1748 CBO1749     TRUE 0.745 23.000 0.000 NA   NA
 3674202 3674203 CBO1749 CBO1750     TRUE 0.783 14.000 0.000 NA   NA
 3674203 3674204 CBO1750 CBO1751     FALSE 0.518 41.000 0.000 NA   NA
 3674204 3674205 CBO1751 CBO1752     FALSE 0.151 187.000 0.000 NA   NA
 3674205 3674206 CBO1752 CBO1753     FALSE 0.361 58.000 0.000 NA   NA
 3674206 3674207 CBO1753 CBO1753A     FALSE 0.274 127.000 0.000 NA   NA
 3674207 3674208 CBO1753A CBO1753B     TRUE 0.566 36.000 0.000 NA   NA
 3674208 3674209 CBO1753B CBO1754     TRUE 0.910 -13.000 0.000 NA   NA
 3674209 3674210 CBO1754 CBO1755     TRUE 0.803 11.000 0.000 NA   NA
 3674210 3674211 CBO1755 CBO1756     FALSE 0.027 298.000 0.000 NA   NA
 3674213 3674214 CBO1758 CBO1759     FALSE 0.041 272.000 0.000 NA   NA
 3674216 3674217 CBO1761 CBO1762     FALSE 0.530 151.000 0.011 1.000 N NA
 3674217 3674218 CBO1762 CBO1763   fpk FALSE 0.164 200.000 0.000 1.000 N NA
 3674220 3674221 CBO1765 CBO1766     TRUE 0.855 152.000 0.667 NA   NA
 3674223 3674224 CBO1768 CBO1769     TRUE 0.554 37.000 0.000 NA   NA
 3674225 3674226 CBO1770 CBO1771     FALSE 0.008 402.000 0.000 NA   NA
 3674227 3674228 CBO1772 CBO1773 cspC   FALSE 0.015 376.000 0.000 1.000 N NA
 3674230 3674231 CBO1775 CBO1776   asrC FALSE 0.003 571.000 0.000 NA   NA
 3674233 3674234 CBO1778 CBO1779 rhlE   FALSE 0.022 323.000 0.000 1.000   NA
 3674234 3674235 CBO1779 CBO1780   csdA FALSE 0.371 179.000 0.006 1.000   NA
 3674235 3674236 CBO1780 CBO1781 csdA   FALSE 0.526 154.000 0.025 NA   NA
 3674236 3674237 CBO1781 CBO1782     FALSE 0.009 399.000 0.000 NA   NA
 3674237 3674238 CBO1782 CBO1783     FALSE 0.009 406.000 0.000 1.000   NA
 3674240 3674241 CBO1785 CBO1786     FALSE 0.342 61.000 0.000 NA   NA
 3674241 3674242 CBO1786 CBO1787   cheX TRUE 0.993 0.000 0.100 NA Y NA
 3674244 3674245 CBO1789 CBO1790     FALSE 0.493 61.000 0.000 0.002   NA
 3674246 3674247 CBO1791 CBO1792     FALSE 0.004 519.000 0.000 NA   NA
 3674251 3674252 CBO1796 CBO1797   hfQ TRUE 0.675 101.000 0.064 1.000   NA
 3674252 3674253 CBO1797 CBO1798 hfQ miaA TRUE 0.766 86.000 0.192 1.000   NA
 3674253 3674254 CBO1798 CBO1799 miaA mutL TRUE 0.960 16.000 0.097 1.000 N NA
 3674254 3674255 CBO1799 CBO1800 mutL mutS TRUE 0.927 146.000 0.220 0.002 Y NA
 3674255 3674256 CBO1800 CBO1801 mutS   TRUE 0.681 80.000 0.041 1.000 N NA
 3674257 3674258 CBO1802 CBO1803     TRUE 0.684 85.000 0.087 NA   NA
 3674258 3674259 CBO1803 CBO1804   aspC TRUE 0.644 55.000 0.008 NA   NA
 3674260 3674261 CBO1805 CBO1806   cotS TRUE 0.868 82.000 0.571 NA   NA
 3674261 3674262 CBO1806 CBO1807 cotS   FALSE 0.056 248.000 0.000 NA   NA
 3674262 3674263 CBO1807 CBO1808   cmk TRUE 0.732 64.000 0.047 1.000 N NA
 3674263 3674264 CBO1808 CBO1809 cmk aroH TRUE 0.632 76.000 0.020 1.000 N NA
 3674264 3674265 CBO1809 CBO1810 aroH   TRUE 0.963 0.000 0.024 1.000   NA
 3674265 3674266 CBO1810 CBO1811   gluD FALSE 0.033 295.000 0.000 1.000   NA
 3674266 3674267 CBO1811 CBO1812 gluD   FALSE 0.313 235.000 0.068 1.000 N NA
 3674267 3674268 CBO1812 CBO1813   rluB FALSE 0.041 368.000 0.013 1.000 N NA
 3674268 3674269 CBO1813 CBO1814 rluB   FALSE 0.005 463.000 0.000 NA   NA
 3674269 3674270 CBO1814 CBO1815     FALSE 0.270 98.000 0.000 NA   NA
 3674270 3674271 CBO1815 CBO1816     FALSE 0.029 295.000 0.000 NA   NA
 3674272 3674273 CBO1817 CBO1818     FALSE 0.013 373.000 0.000 1.000   NA
 3674274 3674275 CBO1819 CBO1820 ccdA2   TRUE 0.962 2.000 0.034 1.000   NA
 3674275 3674276 CBO1820 CBO1821     TRUE 0.722 115.000 0.111 1.000   NA
 3674276 3674277 CBO1821 CBO1822     TRUE 0.716 131.000 0.111 NA   NA
 3674278 3674279 CBO1823 CBO1824     FALSE 0.188 173.000 0.000 NA   NA
 3674280 3674281 CBO1825 CBO1826     FALSE 0.297 138.000 0.000 1.000   NA
 3674281 3674282 CBO1826 CBO1827     FALSE 0.156 185.000 0.000 NA   NA
 3674282 3674283 CBO1827 CBO1828     FALSE 0.072 232.000 0.000 NA   NA
 3674283 3674284 CBO1828 CBO1828A     TRUE 0.974 -19.000 0.019 NA   NA
 3674285 3674286 CBO1829 CBO1830     TRUE 0.982 3.000 0.200 0.046   NA
 3674286 3674287 CBO1830 CBO1831     TRUE 0.981 -3.000 0.111 1.000   NA
 3674287 3674288 CBO1831 CBO1832     TRUE 0.668 135.000 0.056 1.000   NA
 3674289 3674290 CBO1833 CBO1834 hypE hypD TRUE 0.909 168.000 0.353 1.000 Y NA
 3674290 3674291 CBO1834 CBO1835 hypD hydA TRUE 0.743 183.000 0.023 1.000 Y NA
 3674291 3674292 CBO1835 CBO1836 hydA hypQ4 TRUE 0.929 7.000 0.008 1.000   NA
 3674292 3674293 CBO1836 CBO1837 hypQ4   TRUE 0.884 -3.000 0.000 NA   NA
 3674293 3674294 CBO1837 CBO1838   hypQ3 FALSE 0.274 127.000 0.000 NA   NA
 3674294 3674295 CBO1838 CBO1839 hypQ3 hupD FALSE 0.512 160.000 0.022 1.000   NA
 3674295 3674296 CBO1839 CBO1840 hupD hupL TRUE 0.969 33.000 0.079 1.000 Y NA
 3674296 3674297 CBO1840 CBO1841 hupL hupS TRUE 0.968 102.000 0.778 0.001 Y NA
 3674300 3674301 CBO1844 CBO1845     FALSE 0.002 885.000 0.000 NA   NA
 3674302 3674303 CBO1846 CBO1847   hymC FALSE 0.014 362.000 0.000 1.000   NA
 3674303 3674304 CBO1847 CBO1848 hymC hymB TRUE 0.954 20.000 0.048 0.001   NA
 3674304 3674305 CBO1848 CBO1849 hymB hymA TRUE 0.992 12.000 0.154 0.001 Y NA
 3674305 3674306 CBO1849 CBO1850 hymA   FALSE 0.007 476.000 0.000 1.000 N NA
 3674306 3674307 CBO1850 CBO1851     FALSE 0.064 259.000 0.000 NA N NA
 3674310 3674311 CBO1854 CBO1855     FALSE 0.317 68.000 0.000 NA   NA
 3674312 3674313 CBO1856 CBO1857 scpB scpA TRUE 0.993 -7.000 0.570 NA   NA
 3674313 3674314 CBO1857 CBO1858 scpA   TRUE 0.968 -25.000 0.006 NA   NA
 3674314 3674315 CBO1858 CBO1859   dacF FALSE 0.266 213.000 0.021 NA   NA
 3674315 3674316 CBO1859 CBO1860 dacF ecsC TRUE 0.554 123.000 0.018 NA   NA
 3674316 3674317 CBO1860 CBO1861 ecsC   FALSE 0.222 159.000 0.000 NA   NA
 3674317 3674318 CBO1861 CBO1862     TRUE 0.562 142.000 0.024 NA   NA
 3674318 3674319 CBO1862 CBO1863   pdp TRUE 0.664 107.000 0.061 NA   NA
 3674319 3674320 CBO1863 CBO1864 pdp deoD FALSE 0.206 286.000 0.000 1.000 Y NA
 3674320 3674321 CBO1864 CBO1865 deoD xerD2 TRUE 0.787 38.000 0.004 1.000 N NA
 3674321 3674322 CBO1865 CBO1865A xerD2   TRUE 0.655 52.000 0.004 NA   NA
 3674322 3674323 CBO1865A CBO1866   spoIIM TRUE 0.975 -9.000 0.034 NA   NA
 3674323 3674324 CBO1866 CBO1867 spoIIM nudF FALSE 0.343 205.000 0.033 NA   NA
 3674324 3674325 CBO1867 CBO1868 nudF   FALSE 0.007 484.000 0.000 1.000 N NA
 3674325 3674326 CBO1868 CBO1869     FALSE 0.003 817.000 0.000 1.000   NA
 3674326 3674327 CBO1869 CBO1870     FALSE 0.002 1485.000 0.000 NA   NA
 3674327 3674328 CBO1870 CBO1871     FALSE 0.275 136.000 0.000 NA   NA
 3674328 3674329 CBO1871 CBO1872   spo0A FALSE 0.120 287.000 0.027 1.000   NA
 3674329 3674330 CBO1872 CBO1873 spo0A spoIVB FALSE 0.082 430.000 0.393 1.000   NA
 3674330 3674331 CBO1873 CBO1874 spoIVB metA FALSE 0.008 422.000 0.000 1.000   NA
 3674331 3674332 CBO1874 CBO1875 metA hom TRUE 0.965 27.000 0.005 1.000 Y NA
 3674332 3674333 CBO1875 CBO1876 hom cysD TRUE 0.941 40.000 0.017 1.000 Y NA
 3674333 3674334 CBO1876 CBO1877 cysD radB FALSE 0.038 299.000 0.000 1.000 N NA
 3674334 3674335 CBO1877 CBO1878 radB argR TRUE 0.962 13.000 0.086 1.000 N NA
 3674335 3674336 CBO1878 CBO1879 argR   TRUE 0.978 2.000 0.117 1.000 N NA
 3674336 3674337 CBO1879 CBO1880     TRUE 0.982 0.000 0.120 1.000 N NA
 3674337 3674338 CBO1880 CBO1881   dxs TRUE 0.967 22.000 0.189 1.000 N NA
 3674338 3674339 CBO1881 CBO1882 dxs   TRUE 0.964 1.000 0.037 NA   NA
 3674339 3674340 CBO1882 CBO1883   ispA FALSE 0.002 801.000 0.000 NA   NA
 3674340 3674341 CBO1883 CBO1884 ispA xseB TRUE 0.687 113.000 0.053 1.000 N NA
 3674341 3674342 CBO1884 CBO1885 xseB xseA TRUE 0.953 123.000 0.412 0.001 Y NA
 3674342 3674343 CBO1885 CBO1886 xseA nusB TRUE 0.707 71.000 0.043 1.000 N NA
 3674343 3674344 CBO1886 CBO1887 nusB   TRUE 0.778 139.000 0.223 NA   NA
 3674344 3674345 CBO1887 CBO1888     TRUE 0.715 82.000 0.108 NA   NA
 3674345 3674346 CBO1888 CBO1889   spoIIIAG TRUE 0.875 62.000 0.407 NA   NA
 3674346 3674347 CBO1889 CBO1890 spoIIIAG spoIIIAF TRUE 0.901 138.000 0.907 NA   NA
 3674347 3674348 CBO1890 CBO1891 spoIIIAF spoIIIAE TRUE 0.969 36.000 0.918 NA   NA
 3674348 3674349 CBO1891 CBO1892 spoIIIAE spoIIIAD TRUE 0.990 9.000 0.864 NA   NA
 3674349 3674350 CBO1892 CBO1893 spoIIIAD spoIIIAC TRUE 0.982 27.000 0.895 NA   NA
 3674350 3674351 CBO1893 CBO1894 spoIIIAC spoIIIAB TRUE 0.961 43.000 0.926 NA   NA
 3674351 3674352 CBO1894 CBO1895 spoIIIAB spoIIIAA TRUE 0.957 37.000 0.604 NA   NA
 3674352 3674353 CBO1895 CBO1896 spoIIIAA   FALSE 0.507 195.000 0.112 NA   NA
 3674353 3674354 CBO1896 CBO1897   efp TRUE 0.823 41.000 0.037 NA   NA
 3674354 3674355 CBO1897 CBO1898 efp aroQ TRUE 0.562 89.000 0.010 1.000 N NA
 3674355 3674356 CBO1898 CBO1899 aroQ aroK TRUE 0.805 155.000 0.015 1.000 Y NA
 3674356 3674357 CBO1899 CBO1900 aroK   TRUE 0.564 134.000 0.020 NA   NA
 3674357 3674358 CBO1900 CBO1901     TRUE 0.992 6.000 1.000 NA   NA
 3674358 3674359 CBO1901 CBO1902     TRUE 0.975 16.000 0.333 NA   NA
 3674359 3674360 CBO1902 CBO1903     TRUE 0.990 1.000 0.500 NA   NA
 3674360 3674361 CBO1903 CBO1904     TRUE 0.980 18.000 0.500 NA   NA
 3674361 3674362 CBO1904 CBO1905     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 3674362 3674363 CBO1905 CBO1906     TRUE 0.986 14.000 0.667 NA   NA
 3674363 3674364 CBO1906 CBO1907     FALSE 0.079 402.000 0.250 NA   NA
 3674364 3674365 CBO1907 CBO1908     TRUE 0.803 186.000 0.109 NA Y NA
 3674365 3674366 CBO1908 CBO1909     TRUE 0.898 145.000 0.135 1.000 Y NA
 3674366 3674367 CBO1909 CBO1910     FALSE 0.245 149.000 0.000 NA   NA
 3674367 3674368 CBO1910 CBO1911     FALSE 0.269 96.000 0.000 NA   NA
 3674368 3674369 CBO1911 CBO1912   dapF TRUE 0.860 1.000 0.000 NA   NA
 3674370 3674371 CBO1913 CBO1914   truA1 TRUE 0.576 69.000 0.005 NA N NA
 3674372 3674373 CBO1915 CBO1916     TRUE 0.822 6.000 0.000 NA   NA
 3674375 3674376 CBO1918 CBO1919     FALSE 0.004 505.000 0.000 NA   NA
 3674376 3674377 CBO1919 CBO1920   closI FALSE 0.006 470.000 0.000 1.000   NA
 3674378 10726511 CBO1921 CBO1921a     TRUE 0.924 -119.000 0.000 NA   NA
 10726511 3674379 CBO1921a CBO1921b     FALSE 0.004 539.000 0.000 NA   NA
 3674379 3674380 CBO1921b CBO1922     TRUE 0.999 -10.000 0.857 1.000 Y NA
 3674383 3674384 CBO1925 CBO1926     TRUE 0.997 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3674384 3674385 CBO1926 CBO1927     FALSE 0.246 283.000 0.222 NA   NA
 3674385 3674386 CBO1927 CBO1928     TRUE 0.856 156.000 0.714 NA   NA
 3674386 3674387 CBO1928 CBO1929     TRUE 0.900 63.000 0.625 NA   NA
 3674387 3674388 CBO1929 CBO1930     FALSE 0.024 590.000 0.000 1.000 Y NA
 3674388 3674389 CBO1930 CBO1931     TRUE 0.999 -3.000 0.933 0.006 Y NA
 3674391 3674392 CBO1933 CBO1934 chlN moaD TRUE 0.990 2.000 0.571 1.000   NA
 3674392 3674393 CBO1934 CBO1935 moaD aorA TRUE 0.572 153.000 0.033 1.000   NA
 3674393 3674394 CBO1935 CBO1936 aorA   FALSE 0.272 115.000 0.000 NA   NA
 3674394 3674395 CBO1936 CBO1937   aorR FALSE 0.199 169.000 0.000 NA   NA
 3674395 3674396 CBO1937 CBO1938 aorR   TRUE 0.928 50.000 0.500 1.000   NA
 3674396 3674397 CBO1938 CBO1939   moaC TRUE 0.941 2.000 0.006 1.000   NA
 3674397 3674398 CBO1939 CBO1940 moaC bisA TRUE 0.992 4.000 0.071 0.002 Y NA
 3674398 3674399 CBO1940 CBO1941 bisA moeA2 TRUE 0.927 59.000 0.053 0.002 Y NA
 3674399 3674400 CBO1941 CBO1942 moeA2 bisB TRUE 0.996 12.000 0.481 0.002 Y NA
 3674400 3674401 CBO1942 CBO1943 bisB chlG TRUE 0.980 24.000 0.017 0.002 Y NA
 3674401 3674402 CBO1943 CBO1944 chlG tupC FALSE 0.541 95.000 0.006 1.000 N NA
 3674402 3674403 CBO1944 CBO1945 tupC tupB TRUE 0.991 -3.000 0.389 1.000 N NA
 3674403 3674404 CBO1945 CBO1946 tupB tupA TRUE 0.996 9.000 0.524 0.031 Y NA
 3674404 3674405 CBO1946 CBO1947 tupA   FALSE 0.120 219.000 0.000 1.000 N NA
 3674405 3674406 CBO1947 CBO1948     TRUE 0.973 0.000 0.071 NA   NA
 3674406 3674407 CBO1948 CBO1949     FALSE 0.061 241.000 0.000 NA   NA
 3674407 3674408 CBO1949 CBO1950     FALSE 0.019 322.000 0.000 NA   NA
 3674408 3674409 CBO1950 CBO1951     TRUE 0.986 15.000 0.667 1.000   NA
 3674409 3674410 CBO1951 CBO1952     FALSE 0.003 799.000