MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81116

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3660219 3660220 C8J_0001 C8J_0002 dnaA dnaN FALSE 0.580 160.000 0.328 1.000 Y NA
 3660220 3660221 C8J_0002 C8J_0003 dnaN gyrB TRUE 0.827 29.000 0.114 1.000 Y NA
 3660222 3660223 C8J_0004 C8J_0005     TRUE 0.989 3.000 0.180 0.063   NA
 3660224 3660225 C8J_0006 C8J_0007   gltB FALSE 0.134 135.000 0.025 1.000   NA
 3660225 3660226 C8J_0007 C8J_0008 gltB gltD TRUE 0.995 11.000 0.222 0.002 Y NA
 3660227 3660228 C8J_0009 C8J_0010 rnhB   FALSE 0.342 33.000 0.002 1.000   NA
 3660228 3660229 C8J_0010 C8J_0011     FALSE 0.168 65.000 0.004 1.000   NA
 3660231 3660232 C8J_0013 C8J_0014     FALSE 0.103 92.000 0.000 NA   NA
 3660234 3660235 C8J_0016 C8J_0017     TRUE 0.939 12.000 0.667 NA   NA
 3660235 3660236 C8J_0017 C8J_0018     FALSE 0.299 106.000 0.143 NA   NA
 3660236 3660237 C8J_0018 C8J_0019     TRUE 0.968 -10.000 0.800 1.000 N NA
 3660237 3660238 C8J_0019 C8J_0020     FALSE 0.173 96.000 0.028 1.000 N NA
 3660238 3660239 C8J_0020 C8J_0021     FALSE 0.192 112.000 0.042 1.000 N NA
 3660240 3660241 C8J_0022 C8J_0023 purB nrdA TRUE 0.752 16.000 0.012 1.000 Y NA
 3660242 3660243 C8J_0024 C8J_0025     FALSE 0.094 120.000 0.009 1.000   NA
 3660244 3660245 C8J_0026 C8J_0027 pyrG recJ TRUE 0.775 -13.000 0.026 1.000 N NA
 3660245 3660246 C8J_0027 C8J_0028 recJ ansA FALSE 0.084 137.000 0.004 1.000 N NA
 3660246 3660247 C8J_0028 C8J_Cj16SA ansA   FALSE 0.086 588.000 0.000 NA   NA
 3660247 3660248 C8J_Cj16SA C8J_t0001     FALSE 0.093 105.000 0.000 NA   NA
 3660248 3660249 C8J_t0001 C8J_t0002     TRUE 0.736 9.000 0.000 NA   NA
 3660249 3660250 C8J_t0002 C8J_Cj23SA     FALSE 0.085 541.000 0.000 NA   NA
 3660250 3660251 C8J_Cj23SA C8J_Cj5SA     FALSE 0.083 285.000 0.000 NA   NA
 3660251 3660252 C8J_Cj5SA C8J_0029     FALSE 0.084 399.000 0.000 NA   NA
 3660252 3660253 C8J_0029 C8J_0030     TRUE 0.622 41.000 0.136 NA   NA
 3660253 3660254 C8J_0030 C8J_0031     FALSE 0.547 44.000 0.091 NA N NA
 3660254 3660255 C8J_0031 C8J_0032     TRUE 0.983 -7.000 0.750 1.000 Y NA
 3660257 3660258 C8J_0034 C8J_0035     TRUE 0.958 2.000 0.222 NA   NA
 3660258 3660259 C8J_0035 C8J_0036     FALSE 0.413 22.000 0.000 NA   NA
 3660260 3660261 C8J_0037 C8J_0038     TRUE 0.695 -3.000 0.019 NA   NA
 3660263 3660264 C8J_0040 C8J_0041     FALSE 0.299 178.000 0.182 NA   NA
 3660264 3660265 C8J_0041 C8J_0042   typA TRUE 0.707 0.000 0.006 NA   NA
 3660266 3660267 C8J_0043 C8J_0044     TRUE 0.887 21.000 0.500 1.000   NA
 3660267 3660268 C8J_0044 C8J_0045   flgD FALSE 0.400 54.000 0.053 NA   NA
 3660268 3660269 C8J_0045 C8J_0046 flgD flgE TRUE 0.983 4.000 0.341 NA Y NA
 3660270 3660271 C8J_0047 C8J_0048     TRUE 0.979 1.000 0.714 NA   NA
 3660273 3660274 C8J_0050 C8J_0051 trmU   TRUE 0.738 0.000 0.012 NA   NA
 3660274 3660275 C8J_0051 C8J_0052   fliY FALSE 0.355 69.000 0.085 NA   NA
 3660275 3660276 C8J_0052 C8J_0053 fliY fliM TRUE 0.994 -3.000 0.142 0.003 Y NA
 3660276 3660277 C8J_0053 C8J_0054 fliM fliA TRUE 0.920 0.000 0.118 1.000 N NA
 3660277 3660278 C8J_0054 C8J_0055 fliA   TRUE 0.870 -19.000 0.112 NA   NA
 3660278 3660279 C8J_0055 C8J_0056     TRUE 0.782 19.000 0.159 NA   NA
 3660279 3660280 C8J_0056 C8J_0057   flhF TRUE 0.945 -7.000 0.382 1.000 N NA
 3660280 3660281 C8J_0057 C8J_0058 flhF folK TRUE 0.825 10.000 0.035 1.000 N NA
 3660281 3660282 C8J_0058 C8J_0059 folK aroQ TRUE 0.827 3.000 0.009 1.000 N NA
 3660283 3660284 C8J_0060 C8J_0061   sppA TRUE 0.812 -12.000 0.035 1.000 N NA
 3660284 3660285 C8J_0061 C8J_0062 sppA   FALSE 0.116 79.000 0.009 NA   NA
 3660286 3660287 C8J_0063 C8J_0064     TRUE 0.722 61.000 0.667 NA   NA
 3660287 3660288 C8J_0064 C8J_0065     TRUE 0.998 3.000 0.667 0.015 Y NA
 3660288 3660289 C8J_0065 C8J_0066     FALSE 0.122 179.000 0.022 1.000   NA
 3660289 3660290 C8J_0066 C8J_0067     TRUE 0.992 -7.000 0.209 0.002   NA
 3660290 3660291 C8J_0067 C8J_0068     TRUE 0.979 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 3660291 3660292 C8J_0068 C8J_0069   lctP FALSE 0.402 123.000 0.075 1.000 Y NA
 3660292 3660293 C8J_0069 C8J_0070 lctP cdtC FALSE 0.274 172.000 0.125 1.000   NA
 3660293 3660294 C8J_0070 C8J_0071 cdtC cdtB TRUE 0.993 11.000 0.500 0.003   NA
 3660294 3660295 C8J_0071 C8J_0072 cdtB cdtA TRUE 0.993 -3.000 0.421 0.003   NA
 3660296 3660297 C8J_0073 C8J_0074   cydA TRUE 0.983 1.000 0.887 NA   NA
 3660297 3660298 C8J_0074 C8J_0075 cydA cydB TRUE 0.997 0.000 0.962 0.062 Y NA
 3660298 3660299 C8J_0075 C8J_0076 cydB   TRUE 0.864 10.000 0.078 NA   NA
 3660300 3660301 C8J_0077 C8J_0078   ung FALSE 0.098 120.000 0.011 1.000 N NA
 3660302 3660303 C8J_0079 C8J_0081 aspA   TRUE 0.792 17.000 0.127 1.000   NA
 3660303 3660304 C8J_0081 C8J_0082     FALSE 0.136 108.000 0.027 NA   NA
 3660304 3660305 C8J_0082 C8J_0083     TRUE 0.942 10.000 0.372 NA   NA
 3660305 3660306 C8J_0083 C8J_0084     TRUE 0.865 24.000 0.516 NA   NA
 3660306 3660307 C8J_0084 C8J_0085     FALSE 0.295 82.000 0.087 NA   NA
 3660307 3660308 C8J_0085 C8J_0086     TRUE 0.947 10.000 0.414 NA   NA
 3660308 3660309 C8J_0086 C8J_0087   rplU FALSE 0.071 159.000 0.005 NA   NA
 3660309 3660310 C8J_0087 C8J_0088 rplU rpmA TRUE 0.994 11.000 0.667 0.033 Y NA
 3660310 3660311 C8J_0088 C8J_0089 rpmA   FALSE 0.440 109.000 0.335 1.000   NA
 3660311 3660312 C8J_0089 C8J_0090   proB FALSE 0.348 123.000 0.206 1.000   NA
 3660312 3660313 C8J_0090 C8J_0091 proB fmt FALSE 0.164 74.000 0.014 1.000 N NA
 3660313 3660314 C8J_0091 C8J_0092 fmt   TRUE 0.785 -19.000 0.029 1.000 N NA
 3660314 3660315 C8J_0092 C8J_0093     TRUE 0.811 -3.000 0.040 1.000 N NA
 3660315 3660316 C8J_0093 C8J_0094     TRUE 0.981 6.000 0.827 1.000 N NA
 3660316 3660317 C8J_0094 C8J_0095   atpF' FALSE 0.331 61.000 0.037 1.000 N NA
 3660317 3660318 C8J_0095 C8J_0096 atpF' atpF TRUE 0.989 11.000 0.110 0.008 Y NA
 3660318 3660319 C8J_0096 C8J_0097 atpF atpH TRUE 0.996 3.000 0.132 0.008 Y NA
 3660319 3660320 C8J_0097 C8J_0098 atpH atpA TRUE 0.995 14.000 0.864 0.008 Y NA
 3660320 3660321 C8J_0098 C8J_0099 atpA atpG TRUE 0.998 9.000 0.846 0.008 Y NA
 3660321 3660322 C8J_0099 C8J_0100 atpG atpD TRUE 0.991 25.000 0.724 0.008 Y NA
 3660322 3660323 C8J_0100 C8J_0101 atpD atpC TRUE 0.999 4.000 0.837 0.008 Y NA
 3660323 3660324 C8J_0101 C8J_0102 atpC exbB3 TRUE 0.861 0.000 0.036 1.000 N NA
 3660324 3660325 C8J_0102 C8J_0103 exbB3   TRUE 0.997 9.000 0.944 0.057 Y NA
 3660325 3660326 C8J_0103 C8J_0104     TRUE 0.969 3.000 0.343 NA   NA
 3660326 3660327 C8J_0104 C8J_0105     TRUE 0.920 10.000 0.213 NA   NA
 3660327 3660328 C8J_0105 C8J_0106   pal TRUE 0.677 77.000 0.702 1.000 N NA
 3660328 3660329 C8J_0106 C8J_0107 pal   TRUE 0.983 4.000 0.794 1.000   NA
 3660329 3660330 C8J_0107 C8J_0108     TRUE 0.920 14.000 0.543 1.000   NA
 3660330 3660331 C8J_0108 C8J_0109   fabD TRUE 0.689 -96.000 0.013 1.000 N NA
 3660331 3660332 C8J_0109 C8J_0110 fabD pfs TRUE 0.863 0.000 0.037 1.000 N NA
 3660332 3660333 C8J_0110 C8J_0111 pfs   TRUE 0.794 -3.000 0.042 NA N NA
 3660333 3660334 C8J_0111 C8J_0112     TRUE 0.761 5.000 0.009 NA N NA
 3660334 3660335 C8J_0112 C8J_0113     TRUE 0.714 0.000 0.007 NA   NA
 3660335 3660336 C8J_0113 C8J_0114     FALSE 0.612 -3.000 0.003 NA   NA
 3660336 3660337 C8J_0114 C8J_0115     FALSE 0.110 86.000 0.000 NA   NA
 3660338 3660339 C8J_0116 C8J_0117 dusB   TRUE 0.707 -3.000 0.021 NA   NA
 3660339 3660340 C8J_0117 C8J_0118     TRUE 0.952 -10.000 0.523 NA   NA
 3660340 3660341 C8J_0118 C8J_0119     TRUE 0.686 12.000 0.029 NA   NA
 3660341 3660342 C8J_0119 C8J_0120   accD TRUE 0.888 2.000 0.035 NA   NA
 3660342 3660343 C8J_0120 C8J_0121 accD   TRUE 0.786 9.000 0.016 1.000 N NA
 3660343 3660344 C8J_0121 C8J_0122     TRUE 0.751 0.000 0.008 1.000 N NA
 3660345 3660346 C8J_0123 C8J_0124 tyrA   FALSE 0.147 80.000 0.013 1.000 N NA
 3660346 3660347 C8J_0124 C8J_0125   lpxC TRUE 0.918 0.000 0.022 1.000 Y NA
 3660347 3660348 C8J_0125 C8J_0126 lpxC   TRUE 0.714 12.000 0.035 NA N NA
 3660348 3660349 C8J_0126 C8J_0127   thrB TRUE 0.838 9.000 0.032 NA N NA
 3660349 3660350 C8J_0127 C8J_0128 thrB   FALSE 0.575 25.000 0.044 NA N NA
 3660350 3660351 C8J_0128 C8J_0129   infB TRUE 0.901 -13.000 0.171 NA N NA
 3660351 3660352 C8J_0129 C8J_0130 infB   TRUE 0.976 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 3660352 3660353 C8J_0130 C8J_0131     TRUE 0.785 -10.000 0.033 NA   NA
 3660354 3660355 C8J_0132 C8J_0133     TRUE 0.981 -13.000 0.250 0.047   NA
 3660357 3660358 C8J_0135 C8J_0136     TRUE 0.980 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 3660358 3660359 C8J_0136 C8J_0137     TRUE 0.961 13.000 0.509 1.000 Y NA
 3660360 3660361 C8J_0138 C8J_0139     FALSE 0.082 135.000 0.000 NA   NA
 3660362 3660363 C8J_0140 C8J_0141     FALSE 0.323 35.000 0.000 NA   NA
 3660363 3660364 C8J_0141 C8J_0142     FALSE 0.603 11.000 0.000 NA   NA
 3660364 3660365 C8J_0142 C8J_0143   trxB FALSE 0.082 243.000 0.000 NA   NA
 3660365 3660366 C8J_0143 C8J_0144 trxB trx FALSE 0.321 134.000 0.035 1.000 Y NA
 3660366 3660367 C8J_0144 C8J_0145 trx   FALSE 0.314 57.000 0.027 1.000 N NA
 3660367 3660368 C8J_0145 C8J_0146   hom TRUE 0.744 0.000 0.003 1.000 N NA
 3660368 3660369 C8J_0146 C8J_0147 hom   TRUE 0.923 4.000 0.009 1.000 Y NA
 3660369 3660370 C8J_0147 C8J_0148     TRUE 0.809 12.000 0.098 NA   NA
 3660370 3660371 C8J_0148 C8J_0149     TRUE 0.970 -6.000 0.882 NA   NA
 3660371 3660372 C8J_0149 C8J_0150     TRUE 0.785 -7.000 0.033 NA   NA
 3660372 3660373 C8J_0150 C8J_0151     TRUE 0.670 14.000 0.031 1.000   NA
 3660373 3660374 C8J_0151 C8J_0152   rpmE TRUE 0.897 3.000 0.031 1.000   NA
 3660374 3660375 C8J_0152 C8J_0153 rpmE   FALSE 0.167 79.000 0.023 NA   NA
 3660375 3660376 C8J_0153 C8J_0154     TRUE 0.921 2.000 0.070 NA   NA
 3660376 3660377 C8J_0154 C8J_0155     TRUE 0.949 0.000 0.300 NA   NA
 3660377 3660378 C8J_0155 C8J_0156     TRUE 0.766 0.000 0.011 1.000   NA
 3660378 3660379 C8J_0156 C8J_0157     TRUE 0.894 -3.000 0.139 1.000 N NA
 3660379 3660380 C8J_0157 C8J_0158   moaA TRUE 0.890 3.000 0.028 1.000 N NA
 3660380 3660381 C8J_0158 C8J_0159 moaA   TRUE 0.728 13.000 0.042 1.000   NA
 3660381 3660382 C8J_0159 C8J_0160     TRUE 0.945 -3.000 0.476 NA   NA
 3660382 3660383 C8J_0160 C8J_0161     TRUE 0.869 -9.000 0.100 NA   NA
 3660389 3660390 C8J_0166 C8J_0167     FALSE 0.611 36.000 0.014 1.000 Y NA
 3660390 3660391 C8J_0167 C8J_0168     TRUE 0.956 -13.000 0.529 1.000 N NA
 3660391 3660392 C8J_0168 C8J_0169     TRUE 0.996 0.000 0.618 0.047 Y NA
 3660392 3660393 C8J_0169 C8J_0170     TRUE 0.858 11.000 0.130 NA   NA
 3660394 3660395 C8J_0171 C8J_0172     FALSE 0.290 99.000 0.103 1.000   NA
 3660396 3660397 C8J_0173 C8J_0174     TRUE 0.704 10.000 0.009 1.000   NA
 3660397 3660398 C8J_0174 C8J_0175     TRUE 0.860 -7.000 0.009 1.000 Y NA
 3660398 3660399 C8J_0175 C8J_0176   purN FALSE 0.153 72.000 0.009 1.000 N NA
 3660399 3660400 C8J_0176 C8J_0177 purN   TRUE 0.678 -9.000 0.014 NA N NA
 3660400 3660401 C8J_0177 C8J_0178     TRUE 0.621 -16.000 0.004 NA   NA
 3660401 3660402 C8J_0178 C8J_0179     TRUE 0.787 2.000 0.007 NA   NA
 3660402 3660403 C8J_0179 C8J_0180   def TRUE 0.835 -3.000 0.054 1.000 N NA
 3660403 3660404 C8J_0180 C8J_0181 def clpP FALSE 0.477 36.000 0.030 1.000 N NA
 3660404 3660405 C8J_0181 C8J_0182 clpP tig TRUE 0.979 0.000 0.351 1.000 Y NA
 3660406 3660407 C8J_0183 C8J_0184 folE fliI TRUE 0.989 0.000 0.378 0.062 N NA
 3660408 3660409 C8J_0185 C8J_0186 purF dapB TRUE 0.869 2.000 0.022 1.000 N NA
 3660409 3660410 C8J_0186 C8J_0187 dapB   FALSE 0.178 63.000 0.003 1.000 N NA
 3660410 3660411 C8J_0187 C8J_0188     TRUE 0.705 0.000 0.005 NA   NA
 3660411 3660412 C8J_0188 C8J_0189     FALSE 0.542 135.000 0.750 NA   NA
 3660412 3660413 C8J_0189 C8J_0190     FALSE 0.404 64.000 0.100 NA   NA
 3660413 3660414 C8J_0190 C8J_0191     TRUE 0.901 -70.000 0.200 NA   NA
 3660415 3660416 C8J_0192 C8J_0193     FALSE 0.130 187.000 0.029 NA   NA
 3660416 3660417 C8J_0193 C8J_0194     FALSE 0.249 74.000 0.043 NA   NA
 3660417 3660418 C8J_0194 C8J_0195   thrS FALSE 0.213 132.000 0.063 1.000 N NA
 3660418 3660419 C8J_0195 C8J_0196 thrS infC TRUE 0.923 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 3660419 3660420 C8J_0196 C8J_0197 infC   FALSE 0.309 39.000 0.004 1.000 N NA
 3660420 3660421 C8J_0197 C8J_0198     FALSE 0.332 40.000 0.000 1.000   NA
 3660421 3660422 C8J_0198 C8J_0199     FALSE 0.592 149.000 0.000 0.003   NA
 3660422 3660423 C8J_0199 C8J_0200     FALSE 0.097 98.000 0.000 NA   NA
 3660423 3660424 C8J_0200 C8J_0201     FALSE 0.151 69.000 0.000 NA   NA
 3660424 3660425 C8J_0201 C8J_0202   argC FALSE 0.135 82.000 0.000 1.000   NA
 3660425 3660426 C8J_0202 C8J_0203 argC   TRUE 0.753 10.000 0.019 1.000   NA
 3660426 3660427 C8J_0203 C8J_0204   argB TRUE 0.694 10.000 0.006 1.000   NA
 3660427 3660428 C8J_0204 C8J_0205 argB argD TRUE 0.949 4.000 0.030 1.000 Y NA
 3660431 3660432 C8J_0208 C8J_0209   nrdB TRUE 0.833 -13.000 0.048 1.000 N NA
 3660432 3660433 C8J_0209 C8J_0210 nrdB   FALSE 0.557 14.000 0.019 NA   NA
 3660433 3660434 C8J_0210 C8J_0211   pyrE TRUE 0.844 1.000 0.025 NA   NA
 3660434 3660435 C8J_0211 C8J_0212 pyrE frr TRUE 0.884 3.000 0.026 1.000 N NA
 3660435 3660436 C8J_0212 C8J_0213 frr secG FALSE 0.556 16.000 0.017 1.000 N NA
 3660436 3660437 C8J_0213 C8J_0214 secG   FALSE 0.085 104.000 0.007 NA   NA
 3660438 3660439 C8J_0215 C8J_0216 cynT   TRUE 0.865 -3.000 0.105 NA N NA
 3660440 3660441 C8J_0217 C8J_0218     TRUE 0.858 10.000 0.056 1.000 N NA
 3660441 3660442 C8J_0218 C8J_0219     FALSE 0.191 178.000 0.052 1.000 N NA
 3660442 3660443 C8J_0219 C8J_0220     FALSE 0.433 137.000 0.429 NA   NA
 3660444 3660445 C8J_0221 C8J_0222 rpmI   TRUE 0.946 94.000 0.928 0.032 Y NA
 3660446 3660447 C8J_0223 C8J_0224     FALSE 0.235 162.000 0.105 NA   NA
 3660448 3660449 C8J_0225 C8J_0226     TRUE 0.788 31.000 0.333 NA   NA
 3660450 3660451 C8J_0227 C8J_0228     TRUE 0.968 3.000 0.333 NA   NA
 3660452 3660453 C8J_0229 C8J_0230 moaC   TRUE 0.824 -22.000 0.057 NA   NA
 3660453 3660454 C8J_0230 C8J_0231     TRUE 0.694 14.000 0.047 NA   NA
 3660456 3660457 C8J_0233 C8J_0234   dgkA TRUE 0.892 -3.000 0.136 1.000   NA
 3660457 3660458 C8J_0234 C8J_0235 dgkA   TRUE 0.926 -3.000 0.273 1.000   NA
 3660458 3660459 C8J_0235 C8J_0236   pyrC TRUE 0.684 -10.000 0.009 1.000   NA
 3660460 3660461 C8J_0237 C8J_0238     FALSE 0.539 56.000 0.154 NA   NA
 3660461 3660462 C8J_0238 C8J_0239     FALSE 0.409 80.000 0.154 1.000   NA
 3660464 3660465 C8J_0241 C8J_0242     TRUE 0.984 11.000 0.148 0.060 Y NA
 3660465 3660466 C8J_0242 C8J_0243     FALSE 0.085 481.000 0.000 NA   NA
 3660466 3660467 C8J_0243 C8J_0244     TRUE 0.978 0.000 0.867 NA   NA
 3660467 3660468 C8J_0244 C8J_0245     TRUE 0.763 13.000 0.075 NA   NA
 3660468 3660469 C8J_0245 C8J_0246   ilvE TRUE 0.789 13.000 0.098 NA N NA
 3660470 3660471 C8J_0247 C8J_0248     TRUE 0.666 -3.000 0.008 1.000   NA
 3660471 3660472 C8J_0248 C8J_0249     TRUE 0.708 0.000 0.006 NA   NA
 3660472 3660473 C8J_0249 C8J_0250   fabZ FALSE 0.175 95.000 0.035 NA   NA
 3660473 3660474 C8J_0250 C8J_0251 fabZ lpxA TRUE 0.949 0.000 0.264 1.000 N NA
 3660474 3660475 C8J_0251 C8J_0252 lpxA clpX TRUE 0.782 -7.000 0.027 1.000 N NA
 3660475 3660476 C8J_0252 C8J_0253 clpX mreB TRUE 0.735 12.000 0.034 1.000 N NA
 3660476 3660477 C8J_0253 C8J_0254 mreB   TRUE 0.965 -10.000 0.689 1.000 N NA
 3660477 3660478 C8J_0254 C8J_0255   carB FALSE 0.108 260.000 0.016 1.000 N NA
 3660478 3660479 C8J_0255 C8J_0256 carB   TRUE 0.671 -3.000 0.016 NA N NA
 3660480 3660481 C8J_0257 C8J_0258 tal serB TRUE 0.844 0.000 0.029 1.000 N NA
 3660481 3660482 C8J_0258 C8J_0259 serB cheW TRUE 0.782 0.000 0.015 1.000 N NA
 3660482 3660483 C8J_0259 C8J_0260 cheW cheA TRUE 0.995 5.000 0.137 0.016 Y NA
 3660483 3660484 C8J_0260 C8J_0261 cheA cheV TRUE 0.996 4.000 0.147 0.009 Y NA
 3660484 3660485 C8J_0261 C8J_0262 cheV   TRUE 0.843 -7.000 0.065 NA   NA
 3660485 3660486 C8J_0262 C8J_0263   greA FALSE 0.083 151.000 0.012 NA   NA
 3660486 3660487 C8J_0263 C8J_0264 greA lpxB TRUE 0.754 12.000 0.042 1.000 N NA
 3660487 3660488 C8J_0264 C8J_0265 lpxB   TRUE 0.654 -3.000 0.003 1.000   NA
 3660488 3660489 C8J_0265 C8J_0266     FALSE 0.097 127.000 0.000 1.000   NA
 3660489 3660490 C8J_0266 C8J_0267     TRUE 0.830 2.000 0.000 1.000   NA
 3660490 3660491 C8J_0267 C8J_0268     FALSE 0.098 356.000 0.000 1.000   NA
 3660491 3660492 C8J_0268 C8J_0269     TRUE 0.672 142.000 0.182 0.046   NA
 3660493 3660494 C8J_0270 C8J_0271 surE   TRUE 0.838 -7.000 0.051 1.000   NA
 3660494 3660495 C8J_0271 C8J_0272     TRUE 0.670 -16.000 0.007 1.000   NA
 3660496 3660497 C8J_0273 C8J_0274 panD panC TRUE 0.968 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 3660497 3660498 C8J_0274 C8J_0275 panC panB TRUE 0.996 11.000 0.395 0.002 Y NA
 3660500 3660501 C8J_0277 C8J_0278 modC modB TRUE 0.965 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 3660501 3660502 C8J_0278 C8J_0279 modB   TRUE 0.893 -7.000 0.122 1.000   NA
 3660502 3660503 C8J_0279 C8J_0280   modA TRUE 0.872 -3.000 0.098 1.000   NA
 3660503 3660504 C8J_0280 C8J_0281 modA bioC FALSE 0.254 51.000 0.008 1.000   NA
 3660504 3660505 C8J_0281 C8J_0282 bioC   TRUE 0.833 -3.000 0.065 NA   NA
 3660505 3660506 C8J_0282 C8J_0283   bioF TRUE 0.936 -3.000 0.389 NA   NA
 3660508 3660509 C8J_0285 C8J_0286 bioD   TRUE 0.811 10.000 0.030 1.000 N NA
 3660509 3660510 C8J_0286 C8J_0287     TRUE 0.997 3.000 0.444 0.079 Y NA
 3660511 3660512 C8J_0288 C8J_0289   pth TRUE 0.993 -3.000 0.496 0.049 Y NA
 3660512 3660513 C8J_0289 C8J_0290 pth   TRUE 0.893 2.000 0.031 1.000   NA
 3660513 3660514 C8J_0290 C8J_0291   lysA FALSE 0.361 44.000 0.021 1.000   NA
 3660514 3660515 C8J_0291 C8J_0292 lysA   TRUE 0.841 2.000 0.015 1.000 N NA
 3660515 3660516 C8J_0292 C8J_0293   pheA TRUE 0.752 -12.000 0.021 1.000 N NA
 3660516 3660517 C8J_0293 C8J_0294 pheA hisC TRUE 0.900 -10.000 0.028 1.000 Y NA
 3660517 3660518 C8J_0294 C8J_0295 hisC fliF FALSE 0.510 52.000 0.084 1.000 N NA
 3660518 3660519 C8J_0295 C8J_0296 fliF fliG TRUE 0.997 0.000 0.477 0.013 Y NA
 3660519 3660520 C8J_0296 C8J_0297 fliG fliH TRUE 0.996 8.000 0.308 0.009 Y NA
 3660520 3660521 C8J_0297 C8J_0298 fliH dxs TRUE 0.842 -7.000 0.052 1.000 N NA
 3660521 3660522 C8J_0298 C8J_0299 dxs   FALSE 0.143 86.000 0.017 1.000 N NA
 3660522 3660523 C8J_0299 C8J_0300     FALSE 0.398 46.000 0.033 NA   NA
 3660523 3660524 C8J_0300 C8J_0301   ubiE TRUE 0.795 3.000 0.008 NA   NA
 3660524 3660525 C8J_0301 C8J_0302 ubiE xseA TRUE 0.705 -3.000 0.016 1.000 N NA
 3660525 3660526 C8J_0302 C8J_0303 xseA serC TRUE 0.709 10.000 0.010 1.000 N NA
 3660526 3660527 C8J_0303 C8J_0304 serC   TRUE 0.614 -3.000 0.004 NA N NA
 3660528 3660529 C8J_0305 C8J_0306 fabH plsX TRUE 0.989 -7.000 0.058 0.008 Y NA
 3660529 3660530 C8J_0306 C8J_0307 plsX   TRUE 0.967 6.000 0.418 1.000   NA
 3660530 3660531 C8J_0307 C8J_0308     FALSE 0.536 24.000 0.032 NA   NA
 3660531 3660532 C8J_0308 C8J_0309   ndk TRUE 0.871 1.000 0.033 NA   NA
 3660532 3660533 C8J_0309 C8J_0310 ndk fdxA FALSE 0.110 113.000 0.015 1.000   NA
 3660534 3660535 C8J_0311 C8J_0312 ahpC flhB FALSE 0.091 119.000 0.006 1.000 N NA
 3660536 3660537 C8J_0313 C8J_0314   motA TRUE 0.975 3.000 0.119 1.000 Y NA
 3660537 3660538 C8J_0314 C8J_0315 motA polA FALSE 0.492 16.000 0.006 1.000 N NA
 3660539 3660540 C8J_0316 C8J_0317     TRUE 0.859 -3.000 0.097 NA N NA
 3660541 3660542 C8J_0318 C8J_0319   uvrA TRUE 0.747 5.000 0.002 NA   NA
 3660542 3660543 C8J_0319 C8J_0320 uvrA   FALSE 0.141 73.000 0.003 1.000   NA
 3660544 3660545 C8J_0321 C8J_0322   trpE FALSE 0.089 165.000 0.016 NA   NA
 3660545 3660546 C8J_0322 C8J_0323 trpE trpD TRUE 0.987 -3.000 0.019 0.002 Y NA
 3660546 3660547 C8J_0323 C8J_0324 trpD trpF TRUE 0.923 -13.000 0.052 1.000 Y NA
 3660547 3660548 C8J_0324 C8J_0325 trpF trpB TRUE 0.996 -3.000 0.375 0.003 Y NA
 3660548 3660549 C8J_0325 C8J_0326 trpB trpA TRUE 0.996 -7.000 0.248 0.002 Y NA
 3660549 3660550 C8J_0326 C8J_0327 trpA   FALSE 0.163 71.000 0.017 NA   NA
 3660550 3660551 C8J_0327 C8J_0328   fliN TRUE 0.969 0.000 0.625 NA   NA
 3660551 3660552 C8J_0328 C8J_0329 fliN   TRUE 0.974 1.000 0.531 NA   NA
 3660553 3660554 C8J_0330 C8J_0331   fdxB TRUE 0.978 0.000 0.806 1.000   NA
 3660554 3660555 C8J_0331 C8J_0332 fdxB   FALSE 0.352 113.000 0.200 1.000   NA
 3660555 3660556 C8J_0332 C8J_0333     FALSE 0.258 79.000 0.043 1.000 N NA
 3660556 3660557 C8J_0333 C8J_0334     TRUE 0.816 -15.000 0.040 1.000   NA
 3660558 3660559 C8J_0335 C8J_0336     FALSE 0.104 94.000 0.004 1.000 N NA
 3660559 3660560 C8J_0336 C8J_0337   lspA TRUE 0.826 -7.000 0.042 1.000 N NA
 3660560 3660561 C8J_0337 C8J_0338 lspA   TRUE 0.709 -16.000 0.020 NA   NA
 3660564 3660565 C8J_0341 C8J_0342 cmeC cmeB TRUE 0.982 -7.000 0.241 0.046 N NA
 3660565 3660566 C8J_0342 C8J_0343 cmeB cmeA TRUE 0.981 0.000 0.945 1.000 N NA
 3660566 3660567 C8J_0343 C8J_0344 cmeA   FALSE 0.343 95.000 0.145 1.000   NA
 3660567 3660568 C8J_0344 C8J_0345     TRUE 0.969 -13.000 0.818 1.000   NA
 3660569 3660570 C8J_0346 C8J_0347 rpsU   FALSE 0.088 117.000 0.012 NA   NA
 3660570 3660571 C8J_0347 C8J_0348     TRUE 0.967 10.000 0.763 NA   NA
 3660571 3660572 C8J_0348 C8J_0349     TRUE 0.946 3.000 0.118 1.000 N NA
 3660572 3660573 C8J_0349 C8J_0350     TRUE 0.724 -10.000 0.021 NA   NA
 3660573 3660574 C8J_0350 C8J_0351     FALSE 0.103 93.000 0.012 NA   NA
 3660574 3660575 C8J_0351 C8J_0352     TRUE 0.878 11.000 0.176 NA   NA
 3660575 3660576 C8J_0352 C8J_0353     TRUE 0.901 0.000 0.097 NA   NA
 3660577 3660578 C8J_0354 C8J_0355     TRUE 0.994 0.000 0.790 0.059   NA
 3660578 3660579 C8J_0355 C8J_0356     FALSE 0.219 55.000 0.003 1.000   NA
 3660579 3660580 C8J_0356 C8J_0357   nusB TRUE 0.748 -3.000 0.023 1.000 N NA
 3660580 3660581 C8J_0357 C8J_0358 nusB ribH TRUE 0.874 0.000 0.045 1.000 N NA
 3660581 3660582 C8J_0358 C8J_0359 ribH kdsA TRUE 0.772 -3.000 0.027 1.000 N NA
 3660582 3660583 C8J_0359 C8J_0360 kdsA   TRUE 0.614 -3.000 0.005 NA   NA
 3660584 3660585 C8J_0361 C8J_0362   aroK TRUE 0.699 -10.000 0.000 1.000   NA
 3660585 3660586 C8J_0362 C8J_0363 aroK trpS TRUE 0.686 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3660586 3660587 C8J_0363 C8J_0364 trpS serS TRUE 0.956 11.000 0.010 0.060 Y NA
 3660587 3660588 C8J_0364 C8J_0365 serS   TRUE 0.727 10.000 0.014 1.000   NA
 3660589 3660590 C8J_0366 C8J_0367   pyk FALSE 0.176 98.000 0.037 NA   NA
 3660590 3660591 C8J_0367 C8J_0368 pyk   TRUE 0.925 49.000 0.073 0.002   NA
 3660591 3660592 C8J_0368 C8J_0369     FALSE 0.091 119.000 0.007 1.000   NA
 3660592 3660593 C8J_0369 C8J_0370     TRUE 0.627 -13.000 0.003 NA   NA
 3660593 3660594 C8J_0370 C8J_0371     TRUE 0.957 -3.000 0.667 NA   NA
 3660594 3660595 C8J_0371 C8J_0372     TRUE 0.822 -3.000 0.057 NA   NA
 3660596 3660597 C8J_0373 C8J_0374 gatC   FALSE 0.160 68.000 0.003 1.000   NA
 3660597 3660598 C8J_0374 C8J_0375   fur TRUE 0.871 2.000 0.023 1.000   NA
 3660598 3660599 C8J_0375 C8J_0376 fur lysS TRUE 0.850 1.000 0.022 1.000 N NA
 3660599 3660600 C8J_0376 C8J_0377 lysS glyA TRUE 0.819 -3.000 0.044 1.000 N NA
 3660600 3660601 C8J_0377 C8J_0378 glyA   TRUE 0.919 -3.000 0.271 NA   NA
 3660601 3660602 C8J_0378 C8J_0379     TRUE 0.889 14.000 0.387 NA   NA
 3660602 3660603 C8J_0379 C8J_0380   aroE TRUE 0.700 -3.000 0.020 NA   NA
 3660605 3660606 C8J_0382 C8J_0383 lgt frdC FALSE 0.168 69.000 0.010 1.000 N NA
 3660606 3660607 C8J_0383 C8J_0384 frdC frdA TRUE 0.992 -16.000 0.128 0.005 Y NA
 3660607 3660608 C8J_0384 C8J_0385 frdA frdB TRUE 0.993 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 3660608 3660609 C8J_0385 C8J_0386 frdB   FALSE 0.470 28.000 0.022 1.000   NA
 3660609 3660610 C8J_0386 C8J_0387     TRUE 0.994 -10.000 0.750 0.010   NA
 3660610 3660611 C8J_0387 C8J_0388     TRUE 0.944 0.000 0.222 1.000   NA
 3660611 3660612 C8J_0388 C8J_0389     FALSE 0.323 136.000 0.182 1.000   NA
 3660612 3660613 C8J_0389 C8J_0390     TRUE 0.998 2.000 0.500 0.002   NA
 3660613 3660614 C8J_0390 C8J_0391     FALSE 0.514 171.000 0.667 NA   NA
 3660614 3660615 C8J_0391 C8J_0392     TRUE 0.902 20.000 0.667 NA   NA
 3660617 3660618 C8J_0394 C8J_0395     FALSE 0.153 74.000 0.017 NA   NA
 3660619 3660620 C8J_0396 C8J_0397     FALSE 0.604 61.000 0.333 NA   NA
 3660621 3660622 C8J_0398 C8J_0399     FALSE 0.082 252.000 0.000 NA   NA
 3660622 3660623 C8J_0399 C8J_0400     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 3660623 3660624 C8J_0400 C8J_0401     FALSE 0.128 78.000 0.000 NA   NA
 3660624 3660625 C8J_0401 C8J_0402     TRUE 0.651 -7.000 0.010 NA   NA
 3660625 3660626 C8J_0402 C8J_0403     TRUE 0.724 76.000 1.000 NA   NA
 3660628 3660629 C8J_0405 C8J_0406     TRUE 0.917 -7.000 0.237 NA   NA
 3660629 3660630 C8J_0406 C8J_Cj16SB     FALSE 0.085 479.000 0.000 NA   NA
 3660630 3660631 C8J_Cj16SB C8J_t0004     FALSE 0.093 105.000 0.000 NA   NA
 3660631 3660632 C8J_t0004 C8J_t0005     TRUE 0.736 9.000 0.000 NA   NA
 3660632 3660633 C8J_t0005 C8J_Cj23SB     FALSE 0.085 541.000 0.000 NA   NA
 3660633 3660634 C8J_Cj23SB C8J_Cj5SB     FALSE 0.083 285.000 0.000 NA   NA
 3660635 3660636 C8J_0407 C8J_0408 murD mraY TRUE 0.998 0.000 0.647 0.008 Y NA
 3660637 3660638 C8J_0409 C8J_0410 pgm fabG FALSE 0.186 72.000 0.018 1.000 N NA
 3660638 3660639 C8J_0410 C8J_0411 fabG   TRUE 0.690 10.000 0.005 1.000   NA
 3660639 3660640 C8J_0411 C8J_0412   sdhA FALSE 0.098 337.000 0.000 1.000   NA
 3660640 3660641 C8J_0412 C8J_0413 sdhA sdhB TRUE 0.995 -3.000 0.279 0.005 Y NA
 3660641 3660642 C8J_0413 C8J_0414 sdhB sdhC TRUE 0.997 4.000 0.175 0.005 Y NA
 3660644 3660645 C8J_0416 C8J_0417 acpP fabF TRUE 0.806 26.000 0.066 1.000 Y NA
 3660645 3660646 C8J_0417 C8J_0418 fabF accA TRUE 0.960 2.000 0.046 1.000 Y NA
 3660646 3660647 C8J_0418 C8J_0419 accA   FALSE 0.097 134.000 0.000 1.000 N NA
 3660647 3660648 C8J_0419 C8J_0420     FALSE 0.305 83.000 0.083 1.000   NA
 3660649 3660650 C8J_0421 C8J_0422     TRUE 0.863 10.000 0.077 NA   NA
 3660650 3660651 C8J_0422 C8J_0423   rpmB FALSE 0.071 185.000 0.004 NA   NA
 3660652 3660653 C8J_0424 C8J_0425 rpe dnaQ TRUE 0.928 -3.000 0.279 1.000 N NA
 3660653 3660654 C8J_0425 C8J_0426 dnaQ thiC FALSE 0.088 183.000 0.007 1.000 N NA
 3660655 3660656 C8J_0427 C8J_0428     TRUE 0.946 -10.000 0.448 NA   NA
 3660656 3660657 C8J_0428 C8J_0429     TRUE 0.969 -3.000 1.000 NA   NA
 3660657 3660658 C8J_0429 C8J_0430     TRUE 0.974 2.000 0.462 NA   NA
 3660658 3660659 C8J_0430 C8J_0431   miaB FALSE 0.468 32.000 0.029 NA   NA
 3660659 3660660 C8J_0431 C8J_0432 miaB   TRUE 0.775 -3.000 0.033 NA   NA
 3660663 3660664 C8J_0435 C8J_0436     TRUE 0.924 0.000 0.130 1.000   NA
 3660664 3660665 C8J_0436 C8J_0437   recG TRUE 0.871 -10.000 0.084 1.000   NA
 3660667 3660668 C8J_0439 C8J_0440     TRUE 0.665 17.000 0.048 NA N NA
 3660668 3660669 C8J_0440 C8J_0441     TRUE 0.997 -7.000 0.841 0.014 Y NA
 3660669 3660670 C8J_0441 C8J_0442     TRUE 0.992 2.000 0.773 1.000 Y NA
 3660670 3660671 C8J_0442 C8J_t0006     FALSE 0.087 115.000 0.000 NA   NA
 3660671 3660672 C8J_t0006 C8J_t0007     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 3660672 3660673 C8J_t0007 C8J_t0008     TRUE 0.753 7.000 0.000 NA   NA
 3660673 3660674 C8J_t0008 C8J_t0009     FALSE 0.093 105.000 0.000 NA   NA
 3660674 3660675 C8J_t0009 C8J_0443   tuf FALSE 0.151 69.000 0.000 NA   NA
 3660675 3660676 C8J_0443 C8J_0444 tuf rpmG TRUE 0.702 53.000 0.099 1.000 Y NA
 3660676 3660677 C8J_0444 C8J_t0010 rpmG   FALSE 0.527 13.000 0.000 NA   NA
 3660677 3660678 C8J_t0010 C8J_0445   secE FALSE 0.441 19.000 0.000 NA   NA
 3660678 3660679 C8J_0445 C8J_0446 secE nusG TRUE 0.973 10.000 0.843 1.000   NA
 3660679 3660680 C8J_0446 C8J_0447 nusG rplK TRUE 0.893 26.000 0.681 1.000 N NA
 3660680 3660681 C8J_0447 C8J_0448 rplK rplA TRUE 0.973 55.000 0.838 0.041 Y NA
 3660681 3660682 C8J_0448 C8J_0449 rplA rplJ TRUE 0.845 152.000 0.302 0.041 Y NA
 3660682 3660683 C8J_0449 C8J_0450 rplJ rplL TRUE 0.992 21.000 0.884 0.031 Y NA
 3660683 3660684 C8J_0450 C8J_0451 rplL rpoB FALSE 0.366 118.000 0.223 1.000   NA
 3660684 3660685 C8J_0451 C8J_0452 rpoB rpoC TRUE 0.997 -7.000 0.851 0.002   NA
 3660685 3660686 C8J_0452 C8J_0453 rpoC rpsL FALSE 0.283 120.000 0.122 1.000 N NA
 3660686 3660687 C8J_0453 C8J_0454 rpsL rpsG TRUE 0.967 70.000 0.620 0.006 Y NA
 3660687 3660688 C8J_0454 C8J_0455 rpsG fusA TRUE 0.964 13.000 0.579 1.000 Y NA
 3660688 3660689 C8J_0455 C8J_t0011 fusA   FALSE 0.353 29.000 0.000 NA   NA
 3660689 3660690 C8J_t0011 C8J_0456     FALSE 0.455 18.000 0.000 NA   NA
 3660690 3660691 C8J_0456 C8J_0457     TRUE 0.736 6.000 0.006 NA   NA
 3660691 3660692 C8J_0457 C8J_0458     TRUE 0.841 -10.000 0.064 NA   NA
 3660692 3660693 C8J_0458 C8J_0459     TRUE 0.911 -27.000 0.228 NA   NA
 3660693 3660694 C8J_0459 C8J_0460   trpC TRUE 0.819 -3.000 0.044 1.000   NA
 3660694 3660695 C8J_0460 C8J_0461 trpC   TRUE 0.794 10.000 0.026 1.000 N NA
 3660695 3660696 C8J_0461 C8J_0462     TRUE 0.774 -10.000 0.030 NA   NA
 3660696 3660697 C8J_0462 C8J_0463     FALSE 0.086 739.000 0.000 NA   NA
 3660697 3660698 C8J_0463 C8J_0464     FALSE 0.104 91.000 0.000 NA   NA
 3660698 3660699 C8J_0464 C8J_0465     FALSE 0.098 97.000 0.000 NA   NA
 3660699 3660700 C8J_0465 C8J_0466     FALSE 0.082 240.000 0.000 NA   NA
 3660701 3660702 C8J_0467 C8J_0468 hemH   TRUE 0.656 -3.000 0.005 1.000   NA
 3660702 3660703 C8J_0468 C8J_0469     TRUE 0.933 5.000 0.117 1.000   NA
 3660704 3660705 C8J_0470 C8J_0471 alaS maf TRUE 0.754 0.000 0.015 NA N NA
 3660705 3660706 C8J_0471 C8J_0472 maf pbpA TRUE 0.737 -3.000 0.026 NA N NA
 3660707 3660708 C8J_0473 C8J_0474 clpB   FALSE 0.257 112.000 0.108 NA   NA
 3660709 3660710 C8J_0475 C8J_0476   purC TRUE 0.912 2.000 0.045 1.000 N NA
 3660710 3660711 C8J_0476 C8J_0477 purC   TRUE 0.983 9.000 0.460 1.000 Y NA
 3660711 3660712 C8J_0477 C8J_0478   purQ TRUE 0.999 2.000 0.656 0.002 Y NA
 3660712 3660713 C8J_0478 C8J_0479 purQ   TRUE 0.786 -3.000 0.038 NA   NA
 3660713 3660714 C8J_0479 C8J_0480     TRUE 0.967 -19.000 0.846 NA   NA
 3660714 3660715 C8J_0480 C8J_0481     TRUE 0.951 -6.000 0.038 0.097 N NA
 3660715 3660716 C8J_0481 C8J_0482   htpG FALSE 0.146 73.000 0.007 1.000 N NA
 3660716 3660717 C8J_0482 C8J_0483 htpG   TRUE 0.623 -3.000 0.007 NA N NA
 3660717 3660718 C8J_0483 C8J_0484     TRUE 0.958 0.000 0.400 NA   NA
 3660718 3660719 C8J_0484 C8J_0485     TRUE 0.951 4.000 0.200 NA   NA
 3660720 3660721 C8J_0486 C8J_0487 pbpB fliE TRUE 0.958 7.000 0.303 1.000 N NA
 3660721 3660722 C8J_0487 C8J_0488 fliE flgC TRUE 0.996 7.000 0.271 0.008 Y NA
 3660722 3660723 C8J_0488 C8J_0489 flgC flgB TRUE 0.985 10.000 0.804 1.000 Y NA
 3660723 3660724 C8J_0489 C8J_0490 flgB   FALSE 0.108 80.000 0.005 NA   NA
 3660725 3660726 C8J_0491 C8J_0492   icd FALSE 0.084 117.000 0.011 NA   NA
 3660726 3660727 C8J_0492 C8J_0493 icd mdh TRUE 0.886 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 3660727 3660728 C8J_0493 C8J_0494 mdh sucC TRUE 0.936 1.000 0.022 1.000 Y NA
 3660728 3660729 C8J_0494 C8J_0495 sucC sucD TRUE 0.996 10.000 0.169 0.001 Y NA
 3660729 3660730 C8J_0495 C8J_0496 sucD oorD TRUE 0.891 14.000 0.097 1.000 Y NA
 3660730 3660731 C8J_0496 C8J_0497 oorD oorA TRUE 0.997 9.000 0.316 0.003 Y NA
 3660731 3660732 C8J_0497 C8J_0498 oorA oorB TRUE 0.999 1.000 0.771 0.003 Y NA
 3660732 3660733 C8J_0498 C8J_0499 oorB oorC TRUE 0.996 -3.000 0.324 0.003 Y NA
 3660733 3660734 C8J_0499 C8J_0500 oorC   FALSE 0.212 139.000 0.083 NA   NA
 3660734 3660735 C8J_0500 C8J_0501     TRUE 0.977 3.000 0.514 NA   NA
 3660735 3660736 C8J_0501 C8J_0502     TRUE 0.635 14.000 0.030 NA   NA
 3660736 3660737 C8J_0502 C8J_0503   hemA TRUE 0.944 0.000 0.051 1.000 Y NA
 3660737 3660738 C8J_0503 C8J_0504 hemA proS TRUE 0.957 -13.000 0.040 0.058 N NA
 3660738 3660739 C8J_0504 C8J_0505 proS   TRUE 0.741 -3.000 0.022 1.000   NA
 3660739 3660740 C8J_0505 C8J_0506   hemC TRUE 0.690 -3.000 0.013 1.000   NA
 3660740 3660741 C8J_0506 C8J_0507 hemC   TRUE 0.838 -3.000 0.009 NA Y NA
 3660741 3660742 C8J_0507 C8J_0508   flaG FALSE 0.094 157.000 0.018 NA N NA
 3660742 3660743 C8J_0508 C8J_0509 flaG fliD TRUE 0.969 3.000 0.092 NA Y NA
 3660743 3660744 C8J_0509 C8J_0510 fliD fliS TRUE 0.995 12.000 0.608 0.005 Y NA
 3660744 3660745 C8J_0510 C8J_0511 fliS   TRUE 0.814 -19.000 0.051 NA   NA
 3660747 3660748 C8J_0512 C8J_0513 efp   FALSE 0.071 159.000 0.002 NA   NA
 3660748 3660749 C8J_0513 C8J_0514     TRUE 0.970 -13.000 0.939 NA   NA
 3660749 3660750 C8J_0514 C8J_0515     TRUE 0.917 10.000 0.202 NA   NA
 3660750 3660751 C8J_0515 C8J_0516     FALSE 0.090 125.000 0.014 NA   NA
 3660751 3660752 C8J_0516 C8J_0517     TRUE 0.721 11.000 0.029 NA   NA
 3660753 3660754 C8J_0518 C8J_0519   proA FALSE 0.523 12.000 0.003 NA   NA
 3660755 3660756 C8J_0520 C8J_0521     FALSE 0.094 181.000 0.011 1.000 N NA
 3660758 3660759 C8J_0523 C8J_0524 dnaB   FALSE 0.095 102.000 0.012 NA   NA
 3660759 3660760 C8J_0524 C8J_0525     TRUE 0.971 -9.000 1.000 NA   NA
 3660760 3660761 C8J_0525 C8J_0526     FALSE 0.132 76.000 0.000 NA   NA
 3660761 3660762 C8J_0526 C8J_0527     TRUE 0.735 0.000 0.000 NA   NA
 3660762 3660763 C8J_0527 C8J_0528     TRUE 0.793 4.000 0.000 NA   NA
 3660763 3660764 C8J_0528 C8J_0529     TRUE 0.642 -97.000 0.000 NA   NA
 3660764 3660765 C8J_0529 C8J_0530     TRUE 0.753 7.000 0.000 NA   NA
 3660765 3660766 C8J_0530 C8J_0531     TRUE 0.946 9.000 0.273 NA   NA
 3660766 3660767 C8J_0531 C8J_0532     FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 3660767 3660768 C8J_0532 C8J_0533     TRUE 0.881 -3.000 0.133 NA   NA
 3660769 3660770 C8J_t0012 C8J_t0013     FALSE 0.323 35.000 0.000 NA   NA
 3660771 3660772 C8J_0534 C8J_0535 ribB   FALSE 0.568 12.000 0.004 1.000   NA
 3660772 3660773 C8J_0535 C8J_0536   ilvB FALSE 0.463 18.000 0.004 1.000   NA
 3660773 3660774 C8J_0536 C8J_0537 ilvB ilvH TRUE 0.996 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 3660774 3660775 C8J_0537 C8J_0538 ilvH lpxD TRUE 0.832 -3.000 0.052 1.000 N NA
 3660776 3660777 C8J_0539 C8J_0540 queA tatC TRUE 0.796 -7.000 0.036 NA N NA
 3660777 3660778 C8J_0540 C8J_0541 tatC   TRUE 0.987 1.000 0.535 NA Y NA
 3660778 3660779 C8J_0541 C8J_0542     FALSE 0.214 59.000 0.011 1.000 N NA
 3660780 3660781 C8J_0543 C8J_0544     TRUE 0.917 2.000 0.051 1.000 N NA
 3660781 3660782 C8J_0544 C8J_0545     TRUE 0.892 1.000 0.050 NA   NA
 3660782 3660783 C8J_0545 C8J_0546     TRUE 0.884 6.000 0.053 NA   NA
 3660783 3660784 C8J_0546 C8J_0547   folP TRUE 0.919 2.000 0.054 1.000   NA
 3660784 3660785 C8J_0547 C8J_0548 folP ligA TRUE 0.792 1.000 0.006 1.000 N NA
 3660785 3660786 C8J_0548 C8J_0549 ligA   TRUE 0.617 -19.000 0.003 NA   NA
 3660786 3660787 C8J_0549 C8J_0550   tlyA TRUE 0.613 -3.000 0.005 NA   NA
 3660787 3660788 C8J_0550 C8J_0551 tlyA ribF TRUE 0.685 -31.000 0.000 1.000 N NA
 3660788 3660789 C8J_0551 C8J_0552 ribF   TRUE 0.699 -10.000 0.000 1.000   NA
 3660790 3660791 C8J_0553 C8J_0554     TRUE 0.946 -3.000 0.500 NA   NA
 3660791 3660792 C8J_0554 C8J_0555     FALSE 0.211 59.000 0.017 NA   NA
 3660792 3660793 C8J_0555 C8J_0556     TRUE 0.741 11.000 0.033 NA   NA
 3660793 3660794 C8J_0556 C8J_0557   nth TRUE 0.962 -3.000 0.004 0.004 N NA
 3660795 3660796 C8J_0558 C8J_0559 peb4 fba TRUE 0.861 0.000 0.036 1.000 N NA
 3660796 3660797 C8J_0559 C8J_0560 fba   FALSE 0.169 95.000 0.027 1.000   NA
 3660797 3660798 C8J_0560 C8J_0561     TRUE 0.923 -3.000 0.250 1.000   NA
 3660798 3660799 C8J_0561 C8J_0562     TRUE 0.850 -13.000 0.060 1.000 N NA
 3660800 3660801 C8J_0563 C8J_0564     TRUE 0.613 51.000 0.160 1.000   NA
 3660801 3660802 C8J_0564 C8J_0565   dsbD TRUE 0.909 -3.000 0.185 1.000   NA
 3660803 3660804 C8J_0566 C8J_0567     TRUE 0.933 9.000 0.154 1.000   NA
 3660804 3660805 C8J_0567 C8J_0568     FALSE 0.419 79.000 0.158 1.000   NA
 3660805 3660806 C8J_0568 C8J_0569     TRUE 0.985 0.000 0.258 0.095 N NA
 3660806 3660807 C8J_0569 C8J_0570     TRUE 0.987 2.000 0.152 0.095 N NA
 3660808 3660809 C8J_0571 C8J_0572     TRUE 0.932 -13.000 0.280 1.000   NA
 3660809 3660810 C8J_0572 C8J_0573     TRUE 0.954 1.000 0.244 NA   NA
 3660810 3660811 C8J_0573 C8J_0574   cft FALSE 0.463 43.000 0.047 NA N NA
 3660812 3660813 C8J_0575 C8J_0576 pstS pstC TRUE 0.935 10.000 0.079 NA Y NA
 3660813 3660814 C8J_0576 C8J_0577 pstC   TRUE 0.997 -3.000 0.485 0.003 Y NA
 3660814 3660815 C8J_0577 C8J_0578   pstB TRUE 0.996 -3.000 0.402 0.003 Y NA
 3660815 3660816 C8J_0578 C8J_0579 pstB   FALSE 0.488 78.000 0.000 0.094 N NA
 3660816 3660817 C8J_0579 C8J_0580     TRUE 0.851 -24.000 0.085 NA   NA
 3660817 3660818 C8J_0580 C8J_0581     TRUE 0.675 42.000 0.211 NA   NA
 3660818 3660819 C8J_0581 C8J_0582   hypF TRUE 0.689 -19.000 0.018 NA   NA
 3660819 3660820 C8J_0582 C8J_0583 hypF hypB TRUE 0.851 78.000 0.064 0.018 Y NA
 3660820 3660821 C8J_0583 C8J_0584 hypB hypC TRUE 0.981 0.000 0.463 NA Y NA
 3660821 3660822 C8J_0584 C8J_0585 hypC hypD TRUE 0.941 -16.000 0.123 NA Y NA
 3660822 3660823 C8J_0585 C8J_0586 hypD hypE TRUE 0.872 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 3660823 3660824 C8J_0586 C8J_0587 hypE hypA TRUE 0.903 0.000 0.080 1.000   NA
 3660825 3660826 C8J_0588 C8J_0589     FALSE 0.444 93.000 0.002 0.043   NA
 3660826 3660827 C8J_0589 C8J_0590     TRUE 0.770 -7.000 0.024 1.000 N NA
 3660828 3660829 C8J_0591 C8J_0592 ilvC   TRUE 0.825 4.000 0.013 1.000   NA
 3660829 3660830 C8J_0592 C8J_0593   dprA TRUE 0.755 -10.000 0.022 1.000   NA
 3660830 3660831 C8J_0593 C8J_0594 dprA   TRUE 0.891 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 3660831 3660832 C8J_0594 C8J_0595     TRUE 0.644 -10.000 0.008 NA N NA
 3660833 3660834 C8J_0596 C8J_0597 mrsA ppa FALSE 0.301 41.000 0.006 1.000 N NA
 3660834 3660835 C8J_0597 C8J_0598 ppa adk TRUE 0.734 10.000 0.015 1.000 N NA
 3660835 3660836 C8J_0598 C8J_0599 adk aspS TRUE 0.759 -3.000 0.025 1.000 N NA
 3660837 3660838 C8J_0600 C8J_0601   recN TRUE 0.896 0.000 0.066 1.000 N NA
 3660838 3660839 C8J_0601 C8J_0602 recN   FALSE 0.325 104.000 0.141 1.000 N NA
 3660839 3660840 C8J_0602 C8J_0603     TRUE 0.674 -9.000 0.013 NA N NA
 3660840 3660841 C8J_0603 C8J_0604     TRUE 0.819 0.000 0.028 NA N NA
 3660841 3660842 C8J_0604 C8J_0605     TRUE 0.936 -40.000 0.115 NA Y NA
 3660842 3660843 C8J_0605 C8J_0606     TRUE 0.799 6.000 0.020 NA   NA
 3660843 3660844 C8J_0606 C8J_0607     TRUE 0.736 -9.000 0.023 NA   NA
 3660844 3660845 C8J_0607 C8J_0608     TRUE 0.663 -18.000 0.013 NA   NA
 3660845 3660846 C8J_0608 C8J_0609     TRUE 0.791 -3.000 0.041 NA   NA
 3660846 3660847 C8J_0609 C8J_0610     TRUE 0.622 -3.000 0.007 NA   NA
 3660847 3660848 C8J_0610 C8J_0611   pbpC TRUE 0.885 1.000 0.043 NA   NA
 3660849 3660850 C8J_0612 C8J_0613     TRUE 0.848 16.000 0.051 1.000 Y NA
 3660850 3660851 C8J_0613 C8J_0614     TRUE 0.868 171.000 0.062 0.001 Y NA
 3660851 3660852 C8J_0614 C8J_0615     FALSE 0.193 127.000 0.062 NA   NA
 3660852 3660853 C8J_0615 C8J_0616     TRUE 0.960 -7.000 0.667 NA   NA
 3660853 3660854 C8J_0616 C8J_0617   era TRUE 0.678 -10.000 0.015 NA   NA
 3660854 3660855 C8J_0617 C8J_0618 era hslU TRUE 0.829 -3.000 0.051 1.000   NA
 3660855 3660856 C8J_0618 C8J_0619 hslU hslV TRUE 0.982 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 3660856 3660857 C8J_0619 C8J_0620 hslV rplI TRUE 0.858 0.000 0.034 1.000 N NA
 3660857 3660858 C8J_0620 C8J_0621 rplI argG FALSE 0.554 13.000 0.009 1.000 N NA
 3660859 3660860 C8J_0622 C8J_0623     TRUE 0.642 -3.000 0.011 NA   NA
 3660860 3660861 C8J_0623 C8J_0624     TRUE 0.799 -7.000 0.039 NA   NA
 3660861 3660862 C8J_0624 C8J_0625   rpoN TRUE 0.873 0.000 0.044 1.000   NA
 3660862 3660863 C8J_0625 C8J_0626 rpoN dcuB FALSE 0.158 164.000 0.033 1.000   NA
 3660863 3660864 C8J_0626 C8J_0627 dcuB   FALSE 0.080 160.000 0.000 NA   NA
 3660864 3660865 C8J_0627 C8J_0628     FALSE 0.112 84.000 0.000 NA   NA
 3660865 3660866 C8J_0628 C8J_0629   kdpB TRUE 0.996 10.000 0.201 0.002 Y NA
 3660866 3660867 C8J_0629 C8J_0630 kdpB   TRUE 0.999 2.000 0.877 0.002 Y NA
 3660867 3660868 C8J_0630 C8J_0631   kdpD' TRUE 0.965 3.000 0.000 0.094 N NA
 3660870 3660871 C8J_0633 C8J_0634     TRUE 0.962 -10.000 0.714 NA   NA
 3660871 3660872 C8J_0634 C8J_0635     TRUE 0.926 -3.000 0.316 NA   NA
 3660872 3660873 C8J_0635 C8J_0636   priA TRUE 0.679 -18.000 0.016 NA N NA
 3660874 3660875 C8J_0637 C8J_0638     TRUE 0.983 2.000 0.679 1.000   NA
 3660875 3660876 C8J_0638 C8J_0639     TRUE 0.963 -9.000 0.667 1.000   NA
 3660876 3660877 C8J_0639 C8J_0640     TRUE 0.865 15.000 0.261 1.000 N NA
 3660877 3660878 C8J_0640 C8J_0641     TRUE 0.925 53.000 0.263 0.009   NA
 3660878 3660879 C8J_0641 C8J_0642     FALSE 0.083 284.000 0.000 NA   NA
 3660879 3660880 C8J_0642 C8J_0643     FALSE 0.082 234.000 0.000 NA   NA
 3660880 3660881 C8J_0643 C8J_0644     FALSE 0.418 174.000 0.400 NA   NA
 3660882 3660883 C8J_0645 C8J_0646     FALSE 0.084 341.000 0.000 NA   NA
 3660883 3660884 C8J_0646 C8J_0647     TRUE 0.646 -3.000 0.000 NA   NA
 3660885 3660886 C8J_0648 C8J_0649     FALSE 0.183 60.000 0.000 NA   NA
 3660887 3660888 C8J_0650 C8J_0651     FALSE 0.268 45.000 0.000 NA   NA
 3660889 3660890 C8J_0652 C8J_0653     TRUE 0.702 11.000 0.026 NA   NA
 3660893 3660894 C8J_0656 C8J_0657 pta ackA TRUE 0.894 14.000 0.103 1.000 Y NA
 3660894 3660895 C8J_0657 C8J_0658 ackA   FALSE 0.256 71.000 0.040 NA   NA
 3660896 3660897 C8J_0659 C8J_0660   mraW TRUE 0.832 0.000 0.031 NA   NA
 3660898 3660899 C8J_0661 C8J_0662   ftsA TRUE 0.959 3.000 0.184 1.000   NA
 3660899 3660900 C8J_0662 C8J_0663 ftsA ftsZ TRUE 0.889 16.000 0.114 1.000 Y NA
 3660900 3660901 C8J_0663 C8J_0664 ftsZ flgG2 FALSE 0.085 155.000 0.002 1.000 N NA
 3660901 3660902 C8J_0664 C8J_0665 flgG2 flgG TRUE 0.983 29.000 0.377 0.009 Y NA
 3660904 3660905 C8J_0667 C8J_0668     TRUE 0.836 -3.000 0.068 NA   NA
 3660905 3660906 C8J_0668 C8J_0669   purE TRUE 0.835 1.000 0.018 1.000 N NA
 3660906 3660907 C8J_0669 C8J_0670 purE   TRUE 0.724 10.000 0.019 NA   NA
 3660907 3660908 C8J_0670 C8J_0671   glyQ FALSE 0.556 12.000 0.011 NA   NA
 3660908 3660909 C8J_0671 C8J_0672 glyQ   TRUE 0.801 -13.000 0.041 NA   NA
 3660909 3660910 C8J_0672 C8J_0673     TRUE 0.940 10.000 0.342 NA   NA
 3660910 3660911 C8J_0673 C8J_0674   waaA TRUE 0.875 -3.000 0.122 NA   NA
 3660911 3660912 C8J_0674 C8J_0675 waaA   TRUE 0.894 -19.000 0.133 1.000 N NA
 3660912 3660913 C8J_0675 C8J_0676   ffh FALSE 0.185 68.000 0.013 1.000 N NA
 3660913 3660914 C8J_0676 C8J_0677 ffh rpsP TRUE 0.618 65.000 0.361 1.000 N NA
 3660914 3660915 C8J_0677 C8J_0678 rpsP   TRUE 0.974 3.000 0.385 1.000   NA
 3660915 3660916 C8J_0678 C8J_0679   rimM TRUE 0.937 -7.000 0.324 1.000   NA
 3660916 3660917 C8J_0679 C8J_0680 rimM trmD TRUE 0.980 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 3660917 3660918 C8J_0680 C8J_0681 trmD rplS TRUE 0.973 11.000 0.567 1.000 Y NA
 3660918 3660919 C8J_0681 C8J_0682 rplS   FALSE 0.085 133.000 0.003 1.000   NA
 3660919 3660920 C8J_0682 C8J_0683     FALSE 0.473 24.000 0.018 1.000   NA
 3660920 3660921 C8J_0683 C8J_0684     TRUE 0.696 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3660921 3660922 C8J_0684 C8J_0685   dnaE FALSE 0.089 438.000 0.002 1.000 N NA
 3660923 3660924 C8J_0686 C8J_0687   flaC FALSE 0.301 36.000 0.009 NA   NA
 3660924 3660925 C8J_0687 C8J_0688 flaC   TRUE 0.675 38.000 0.172 NA   NA
 3660925 3660926 C8J_0688 C8J_0689     TRUE 0.674 13.000 0.033 NA   NA
 3660926 3660927 C8J_0689 C8J_0690     TRUE 0.851 -3.000 0.068 1.000 N NA
 3660929 3660930 C8J_0692 C8J_0693 mog corA FALSE 0.465 21.000 0.011 1.000 N NA
 3660931 3660932 C8J_0694 C8J_0695     TRUE 0.813 11.000 0.073 NA   NA
 3660932 3660933 C8J_0695 C8J_0696     TRUE 0.882 0.000 0.065 NA   NA
 3660933 3660934 C8J_0696 C8J_0697     TRUE 0.930 -3.000 0.290 1.000   NA
 3660934 3660935 C8J_0697 C8J_0698     TRUE 0.995 1.000 0.774 0.042   NA
 3660935 3660936 C8J_0698 C8J_0699     TRUE 0.996 4.000 0.360 0.042 Y NA
 3660936 3660937 C8J_0699 C8J_0700     TRUE 0.941 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 3660939 3660940 C8J_0702 C8J_0703     TRUE 0.645 -34.000 0.000 NA   NA
 3660940 3660941 C8J_0703 C8J_0704     TRUE 0.980 0.000 1.000 NA   NA
 3660941 3660942 C8J_0704 C8J_0705     FALSE 0.560 12.000 0.000 NA   NA
 3660942 3660943 C8J_0705 C8J_0706     FALSE 0.080 167.000 0.000 NA   NA
 3660943 3660944 C8J_0706 C8J_Cj16SC     FALSE 0.085 509.000 0.000 NA   NA
 3660944 3660945 C8J_Cj16SC C8J_t0014     FALSE 0.093 105.000 0.000 NA   NA
 3660945 3660946 C8J_t0014 C8J_t0015     TRUE 0.736 9.000 0.000 NA   NA
 3660946 3660947 C8J_t0015 C8J_Cj23SC     FALSE 0.085 541.000 0.000 NA   NA
 3660947 3660948 C8J_Cj23SC C8J_Cj5SC     FALSE 0.083 285.000 0.000 NA   NA
 3660948 3660949 C8J_Cj5SC C8J_0707     FALSE 0.082 223.000 0.000 NA   NA
 3660949 3660950 C8J_0707 C8J_0708   hrcA FALSE 0.082 217.000 0.000 NA   NA
 3660950 3660951 C8J_0708 C8J_0709 hrcA grpE TRUE 0.787 -3.000 0.038 NA N NA
 3660951 3660952 C8J_0709 C8J_0710 grpE dnaK TRUE 0.953 23.000 0.029 0.011 Y NA
 3660952 3660953 C8J_0710 C8J_0711 dnaK   FALSE 0.084 353.000 0.000 NA   NA
 3660953 3660954 C8J_0711 C8J_0712     FALSE 0.275 70.000 0.045 NA   NA
 3660955 3660956 C8J_0713 C8J_0714 aspB cysE FALSE 0.422 173.000 0.102 1.000 Y NA
 3660956 3660957 C8J_0714 C8J_0715 cysE speA TRUE 0.958 1.000 0.055 1.000 Y NA
 3660957 3660958 C8J_0715 C8J_0716 speA hisS TRUE 0.810 0.000 0.021 1.000 N NA
 3660958 3660959 C8J_0716 C8J_0717 hisS tmk TRUE 0.720 -3.000 0.018 1.000 N NA
 3660959 3660960 C8J_0717 C8J_0718 tmk kdtB TRUE 0.811 -9.000 0.034 1.000 N NA
 3660960 3660961 C8J_0718 C8J_0719 kdtB   TRUE 0.678 40.000 0.032 1.000 Y NA
 3660961 3660962 C8J_0719 C8J_0720     TRUE 0.901 -3.000 0.191 NA N NA
 3660962 3660963 C8J_0720 C8J_0721     FALSE 0.176 84.000 0.028 NA N NA
 3660963 3660964 C8J_0721 C8J_0722     TRUE 0.987 10.000 1.000 NA Y NA
 3660964 3660965 C8J_0722 C8J_0723     TRUE 0.905 49.000 0.800 NA Y NA
 3660965 3660966 C8J_0723 C8J_0724     FALSE 0.461 192.000 0.154 NA Y NA
 3660966 3660967 C8J_0724 C8J_0725     TRUE 0.977 -18.000 0.511 1.000 Y NA
 3660967 3660968 C8J_0725 C8J_0726   valS TRUE 0.786 5.000 0.007 1.000 N NA
 3660968 3660969 C8J_0726 C8J_0727 valS   FALSE 0.367 23.000 0.005 NA   NA
 3660970 3660971 C8J_0728 C8J_0729     FALSE 0.253 49.000 0.012 NA   NA
 3660971 3660972 C8J_0729 C8J_0730   tpx FALSE 0.085 98.000 0.004 NA   NA
 3660972 3660973 C8J_0730 C8J_0731 tpx napA FALSE 0.097 247.000 0.000 1.000 N NA
 3660973 3660974 C8J_0731 C8J_0732 napA napG TRUE 0.959 18.000 0.270 0.053   NA
 3660974 3660975 C8J_0732 C8J_0733 napG napH TRUE 0.995 0.000 0.795 0.025   NA
 3660975 3660976 C8J_0733 C8J_0734 napH napB TRUE 0.978 0.000 0.385 NA Y NA
 3660976 3660977 C8J_0734 C8J_0735 napB   TRUE 0.931 5.000 0.132 NA   NA
 3660977 3660978 C8J_0735 C8J_0736   napD TRUE 0.890 -7.000 0.139 NA   NA
 3660978 3660979 C8J_0736 C8J_0737 napD   TRUE 0.884 10.000 0.111 NA   NA
 3660979 3660980 C8J_0737 C8J_0738     FALSE 0.561 82.000 0.500 NA   NA
 3660980 3660981 C8J_0738 C8J_0739     TRUE 0.881 -3.000 0.133 NA   NA
 3660981 3660982 C8J_0739 C8J_0740     TRUE 0.927 -31.000 0.325 NA   NA
 3660982 3660983 C8J_0740 C8J_0741   purU TRUE 0.848 -3.000 0.064 1.000 N NA
 3660985 3660986 C8J_0743 C8J_0744     TRUE 0.968 4.000 0.333 1.000   NA
 3660986 3660987 C8J_0744 C8J_0745     FALSE 0.097 98.000 0.000 NA   NA
 3660988 3660989 C8J_0746 C8J_0747 murF   TRUE 0.934 1.000 0.129 NA   NA
 3660989 3660990 C8J_0747 C8J_0748     TRUE 0.907 2.000 0.052 NA   NA
 3660990 3660991 C8J_0748 C8J_0749   ddlA FALSE 0.208 60.000 0.018 NA   NA
 3660991 3660992 C8J_0749 C8J_0750 ddlA ruvA TRUE 0.729 10.000 0.014 1.000 N NA
 3660992 3660993 C8J_0750 C8J_0751 ruvA   TRUE 0.656 -24.000 0.004 1.000   NA
 3660994 3660995 C8J_0752 C8J_0753 mviN cysS TRUE 0.834 0.000 0.027 1.000   NA
 3660995 3660996 C8J_0753 C8J_0754 cysS msbA TRUE 0.707 -7.000 0.013 1.000 N NA
 3660996 3660997 C8J_0754 C8J_0755 msbA pyrD FALSE 0.413 32.000 0.017 1.000 N NA
 3660997 3660998 C8J_0755 C8J_0756 pyrD   TRUE 0.825 -3.000 0.048 1.000   NA
 3660998 3660999 C8J_0756 C8J_0757   dapA TRUE 0.922 -7.000 0.217 1.000   NA
 3660999 3661000 C8J_0757 C8J_0758 dapA   TRUE 0.946 0.000 0.238 1.000 N NA
 3661001 3661002 C8J_0759 C8J_0760     TRUE 0.684 13.000 0.035 NA   NA
 3661003 3661004 C8J_0761 C8J_0762 nadE lpxK TRUE 0.865 4.000 0.024 1.000 N NA
 3661004 3661005 C8J_0762 C8J_0763 lpxK thrC TRUE 0.673 -3.000 0.009 1.000 N NA
 3661005 3661006 C8J_0763 C8J_0764 thrC kdsB TRUE 0.722 -15.000 0.017 1.000 N NA
 3661006 3661007 C8J_0764 C8J_0765 kdsB   FALSE 0.108 87.000 0.000 NA   NA
 3661007 3661008 C8J_0765 C8J_0766     FALSE 0.101 94.000 0.000 NA   NA
 3661010 3661011 C8J_0768 C8J_0769 glmU dfp TRUE 0.710 -3.000 0.016 1.000 N NA
 3661011 3661012 C8J_0769 C8J_0770 dfp   TRUE 0.726 -3.000 0.024 NA   NA
 3661012 3661013 C8J_0770 C8J_0771   uppS TRUE 0.792 4.000 0.012 NA   NA
 3661013 3661014 C8J_0771 C8J_0772 uppS   FALSE 0.420 30.000 0.017 1.000 N NA
 3661014 3661015 C8J_0772 C8J_0773     TRUE 0.865 0.000 0.039 1.000   NA
 3661015 3661016 C8J_0773 C8J_0774   truA TRUE 0.888 0.000 0.059 1.000   NA
 3661017 3661018 C8J_0775 C8J_0776 ilvA   TRUE 0.829 0.000 0.030 NA   NA
 3661020 3661021 C8J_0778 C8J_0779 trmA   TRUE 0.837 -3.000 0.056 1.000 N NA
 3661021 3661022 C8J_0779 C8J_0780     TRUE 0.823 -3.000 0.047 1.000   NA
 3661022 3661023 C8J_0780 C8J_0781     TRUE 0.715 -3.000 0.018 1.000   NA
 3661023 3661024 C8J_0781 C8J_0782   acnB FALSE 0.202 60.000 0.010 1.000   NA
 3661026 3661027 C8J_0784 C8J_0785   metS TRUE 0.906 4.000 0.046 1.000   NA
 3661027 3661028 C8J_0785 C8J_0786 metS   TRUE 0.755 10.000 0.024 NA   NA
 3661028 3661029 C8J_0786 C8J_0787   fbp TRUE 0.964 -7.000 0.778 NA   NA
 3661029 3661030 C8J_0787 C8J_0788 fbp mobB TRUE 0.811 2.000 0.005 1.000 N NA
 3661032 3661033 C8J_0790 C8J_0791     TRUE 0.846 -3.000 0.080 NA   NA
 3661033 3661034 C8J_0791 C8J_0792   gltX TRUE 0.938 3.000 0.088 1.000   NA
 3661035 3661036 C8J_0793 C8J_0794   psd TRUE 0.777 -3.000 0.028 1.000   NA
 3661037 3661038 C8J_0795 C8J_0796     TRUE 0.684 -3.000 0.000 1.000   NA
 3661038 3661039 C8J_0796 C8J_0797     TRUE 0.699 -7.000 0.000 1.000   NA
 3661039 3661040 C8J_0797 C8J_0798     TRUE 0.927 -22.000 0.318 NA   NA
 3661040 3661041 C8J_0798 C8J_0799     TRUE 0.945 0.000 0.269 NA   NA
 3661041 3661042 C8J_0799 C8J_0800   hemL TRUE 0.948 -3.000 0.462 1.000   NA
 3661042 3661043 C8J_0800 C8J_0801 hemL   TRUE 0.915 -3.000 0.212 1.000   NA
 3661044 3661045 C8J_0802 C8J_0803 folD lepP TRUE 0.898 10.000 0.117 1.000 N NA
 3661046 3661047 C8J_0804 C8J_0805   murA TRUE 0.754 -3.000 0.024 1.000 N NA
 3661047 3661048 C8J_0805 C8J_0806 murA   FALSE 0.142 66.000 0.004 NA   NA
 3661050 3661051 C8J_0808 C8J_0809 pabA pabB TRUE 0.985 -3.000 0.048 0.016 Y NA
 3661051 3661052 C8J_0809 C8J_0810 pabB   TRUE 0.687 -10.000 0.009 1.000 N NA
 3661053 3661054 C8J_0811 C8J_0812 dsbA dsbB FALSE 0.560 12.000 0.000 NA   NA
 3661054 3661055 C8J_0812 C8J_0813 dsbB   FALSE 0.111 100.000 0.000 1.000   NA
 3661055 3661056 C8J_0813 C8J_0814     FALSE 0.366 86.000 0.143 1.000   NA
 3661059 3661060 C8J_0817 C8J_0818     TRUE 0.924 -3.000 0.294 NA   NA
 3661060 3661061 C8J_0818 C8J_0819     TRUE 0.895 -16.000 0.154 NA   NA
 3661061 3661062 C8J_0819 C8J_0820   flhA TRUE 0.916 9.000 0.106 1.000   NA
 3661062 3661063 C8J_0820 C8J_0821 flhA   TRUE 0.825 -13.000 0.053 NA N NA
 3661065 3661066 C8J_0823 C8J_0824 ftsK flaD FALSE 0.318 109.000 0.145 1.000   NA
 3661067 3661068 C8J_t0016 C8J_t0017     FALSE 0.603 11.000 0.000 NA   NA
 3661069 3661070 C8J_0825 C8J_0826     TRUE 0.804 4.000 0.007 1.000   NA
 3661070 3661071 C8J_0826 C8J_0827     TRUE 0.962 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 3661071 3661072 C8J_0827 C8J_0828   serA TRUE 0.663 -22.000 0.006 1.000 N NA
 3661072 3661073 C8J_0828 C8J_0829 serA   TRUE 0.731 -3.000 0.025 NA   NA
 3661073 3661074 C8J_0829 C8J_0830   rpsA TRUE 0.717 48.000 0.343 NA   NA
 3661074 3661075 C8J_0830 C8J_0831 rpsA lytB FALSE 0.273 132.000 0.118 1.000 N NA
 3661075 3661076 C8J_0831 C8J_0832 lytB aroA TRUE 0.803 -10.000 0.032 1.000 N NA
 3661076 3661077 C8J_0832 C8J_0833 aroA pheT TRUE 0.707 12.000 0.028 1.000 N NA
 3661077 3661078 C8J_0833 C8J_0834 pheT pheS TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 3661080 3661081 C8J_0836 C8J_0837 thiJ   TRUE 0.666 -7.000 0.012 NA   NA
 3661082 3661083 C8J_0838 C8J_0839   glnQ TRUE 0.941 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 3661084 3661085 C8J_0840 C8J_0841     FALSE 0.104 104.000 0.009 1.000 N NA
 3661085 3661086 C8J_0841 C8J_0842   alr TRUE 0.817 3.000 0.005 1.000 N NA
 3661086 3661087 C8J_0842 C8J_0843 alr   TRUE 0.824 1.000 0.021 NA   NA
 3661088 3661089 C8J_0844 C8J_0845     FALSE 0.205 86.000 0.042 NA   NA
 3661089 3661090 C8J_0845 C8J_0846     TRUE 0.915 4.000 0.069 NA   NA
 3661090 3661091 C8J_0846 C8J_0847     TRUE 0.901 -3.000 0.192 NA   NA
 3661092 3661093 C8J_0848 C8J_0849 cysM hupB FALSE 0.130 127.000 0.024 1.000 N NA
 3661093 3661094 C8J_0849 C8J_0850 hupB   FALSE 0.349 102.000 0.167 1.000   NA
 3661096 3661097 C8J_0852 C8J_0853     TRUE 0.649 -22.000 0.000 NA   NA
 3661097 3661098 C8J_0853 C8J_0854   cstA FALSE 0.085 120.000 0.000 NA   NA
 3661098 3661099 C8J_0854 C8J_0855 cstA prsA FALSE 0.100 167.000 0.014 1.000 N NA
 3661099 3661100 C8J_0855 C8J_0856 prsA   FALSE 0.321 108.000 0.029 1.000 Y NA
 3661100 3661101 C8J_0856 C8J_0857     TRUE 0.997 11.000 0.947 0.013 Y NA
 3661101 3661102 C8J_0857 C8J_0858   pebA TRUE 0.997 2.000 0.400 0.040 Y NA
 3661102 3661103 C8J_0858 C8J_0859 pebA pebC TRUE 0.944 22.000 0.594 1.000 Y NA
 3661103 3661104 C8J_0859 C8J_0860 pebC cheR FALSE 0.295 136.000 0.143 1.000 N NA
 3661104 3661105 C8J_0860 C8J_0861 cheR cheB' TRUE 0.820 16.000 0.154 1.000   NA
 3661106 3661107 C8J_0862 C8J_0863 rpiB   TRUE 0.905 0.000 0.103 NA   NA
 3661107 3661108 C8J_0863 C8J_0864   apt TRUE 0.751 -3.000 0.028 NA   NA
 3661108 3661109 C8J_0864 C8J_0865 apt   FALSE 0.546 19.000 0.026 NA   NA
 3661109 3661110 C8J_0865 C8J_0866   pepA TRUE 0.915 -3.000 0.250 NA   NA
 3661110 3661111 C8J_0866 C8J_0867 pepA   TRUE 0.766 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3661112 3661113 C8J_0868 C8J_0869 argH pckA TRUE 0.695 10.000 0.006 1.000 N NA
 3661113 3661114 C8J_0869 C8J_0870 pckA   TRUE 0.797 13.000 0.016 1.000 Y NA
 3661114 3661115 C8J_0870 C8J_0871     TRUE 0.652 33.000 0.100 1.000   NA
 3661115 3661116 C8J_0871 C8J_0872     TRUE 0.991 13.000 0.444 0.002   NA
 3661117 3661118 C8J_0873 C8J_t0018 atpE   FALSE 0.323 35.000 0.000 NA   NA
 3661118 3661119 C8J_t0018 C8J_0874     FALSE 0.087 1307.000 0.000 NA   NA
 3661119 3661120 C8J_0874 C8J_0875     FALSE 0.081 148.000 0.000 NA   NA
 3661121 3661122 C8J_0876 C8J_0877     TRUE 0.659 -13.000 0.000 NA   NA
 3661122 3661123 C8J_0877 C8J_0878     TRUE 0.663 -9.000 0.000 NA   NA
 3661123 3661124 C8J_0878 C8J_0879     FALSE 0.086 547.000 0.000 NA   NA
 3661126 3661127 C8J_0881 C8J_0882 aas   FALSE 0.263 45.000 0.011 NA   NA
 3661127 3661128 C8J_0882 C8J_t0019     FALSE 0.158 67.000 0.000 NA   NA
 3661128 3661129 C8J_t0019 C8J_t0020     FALSE 0.231 52.000 0.000 NA   NA
 3661129 3661130 C8J_t0020 C8J_t0021     TRUE 0.753 7.000 0.000 NA   NA
 3661130 3661131 C8J_t0021 C8J_t0022     FALSE 0.431 20.000 0.000 NA   NA
 3661131 3661132 C8J_t0022 C8J_t0023     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 3661132 3661133 C8J_t0023 C8J_t0024     FALSE 0.231 52.000 0.000 NA   NA
 3661133 3661134 C8J_t0024 C8J_t0025     TRUE 0.749 8.000 0.000 NA   NA
 3661134 3661135 C8J_t0025 C8J_0883   glnP FALSE 0.175 62.000 0.000 NA   NA
 3661135 3661136 C8J_0883 C8J_0884 glnP   FALSE 0.460 23.000 0.015 1.000 N NA
 3661136 3661137 C8J_0884 C8J_0885   secA TRUE 0.976 -3.000 0.201 0.088 N NA
 3661139 3661140 C8J_0887 C8J_0888     TRUE 0.956 10.000 0.529 NA   NA
 3661142 3661143 C8J_0890 C8J_0891     TRUE 0.730 -3.000 0.020 1.000   NA
 3661143 3661144 C8J_0891 C8J_0892     TRUE 0.737 -3.000 0.025 NA N NA
 3661144 3661145 C8J_0892 C8J_0893     FALSE 0.143 99.000 0.026 NA N NA
 3661145 3661146 C8J_0893 C8J_0894     TRUE 0.958 10.000 0.556 NA N NA
 3661146 3661147 C8J_0894 C8J_0895   purH FALSE 0.100 99.000 0.003 1.000 N NA
 3661147 3661148 C8J_0895 C8J_0896 purH   TRUE 0.818 3.000 0.005 1.000 N NA
 3661148 3661149 C8J_0896 C8J_0897   purL TRUE 0.684 -3.000 0.011 1.000 N NA
 3661149 3661150 C8J_0897 C8J_0898 purL trmE TRUE 0.621 11.000 0.008 1.000   NA
 3661150 3661151 C8J_0898 C8J_0899 trmE   TRUE 0.818 -7.000 0.049 NA   NA
 3661151 3661152 C8J_0899 C8J_0900     TRUE 0.826 -3.000 0.061 NA   NA
 3661152 3661153 C8J_0900 C8J_0901     TRUE 0.943 -3.000 0.461 NA   NA
 3661153 3661154 C8J_0901 C8J_0902   rnpA TRUE 0.950 -33.000 0.540 NA   NA
 3661154 3661155 C8J_0902 C8J_0903 rnpA   TRUE 0.965 -3.000 0.787 1.000   NA
 3661156 3661157 C8J_0904 C8J_0905     TRUE 0.874 -3.000 0.102 1.000   NA
 3661157 3661158 C8J_0905 C8J_0906     TRUE 0.926 -3.000 0.323 NA   NA
 3661160 3661161 C8J_0908 C8J_0909     FALSE 0.104 91.000 0.000 NA   NA
 3661161 3661162 C8J_0909 C8J_0910     FALSE 0.098 97.000 0.000 NA   NA
 3661162 3661163 C8J_0910 C8J_0911     FALSE 0.082 240.000 0.000 NA   NA
 3661163 3661164 C8J_0911 C8J_0912     FALSE 0.215 55.000 0.000 NA N NA
 3661164 3661165 C8J_0912 C8J_0913     TRUE 0.959 10.000 0.000 0.012   NA
 3661165 3661166 C8J_0913 C8J_0914     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.012   NA
 3661166 3661167 C8J_0914 C8J_0915     FALSE 0.106 89.000 0.000 NA   NA
 3661167 3661168 C8J_0915 C8J_0916     FALSE 0.149 72.000 0.015 NA   NA
 3661169 3661170 C8J_0917 C8J_0918     TRUE 0.956 9.000 0.375 NA   NA
 3661172 3661173 C8J_0920 C8J_0921     TRUE 0.845 41.000 0.049 0.039 N NA
 3661174 3661175 C8J_0922 C8J_0923     FALSE 0.097 91.000 0.009 NA   NA
 3661176 3661177 C8J_0924 C8J_0925 hipO   TRUE 0.830 2.000 0.000 1.000   NA
 3661179 3661180 C8J_0927 C8J_0928     TRUE 0.913 3.000 0.056 NA   NA
 3661180 3661181 C8J_0928 C8J_0929   hemN TRUE 0.995 2.000 0.419 0.024 N NA
 3661181 3661182 C8J_0929 C8J_0930 hemN   TRUE 0.943 -13.000 0.419 NA   NA
 3661182 3661183 C8J_0930 C8J_0931   argF TRUE 0.734 -3.000 0.025 NA   NA
 3661183 3661184 C8J_0931 C8J_0932 argF hemB TRUE 0.731 -3.000 0.020 1.000 N NA
 3661185 3661186 C8J_0933 C8J_0934 ribA gidB TRUE 0.828 1.000 0.017 1.000 N NA
 3661187 3661188 C8J_0935 C8J_0936     FALSE 0.130 90.000 0.020 NA   NA
 3661189 3661190 C8J_0937 C8J_0938   rpoD TRUE 0.746 80.000 0.006 0.011 Y NA
 3661191 3661192 C8J_0939 C8J_0940     TRUE 0.789 -3.000 0.040 NA   NA
 3661194 3661195 C8J_0942 C8J_0943     TRUE 0.923 4.000 0.067 1.000 N NA
 3661195 3661196 C8J_0943 C8J_0944     TRUE 0.846 -3.000 0.063 1.000 N NA
 3661196 3661197 C8J_0944 C8J_0945   aroB TRUE 0.813 -3.000 0.041 1.000 N NA
 3661197 3661198 C8J_0945 C8J_0946 aroB   FALSE 0.420 46.000 0.031 1.000   NA
 3661199 3661200 C8J_0947 C8J_0948 tgt   TRUE 0.976 2.000 0.444 1.000 N NA
 3661200 3661201 C8J_0948 C8J_t0026     FALSE 0.222 53.000 0.000 NA   NA
 3661202 3661203 C8J_0949 C8J_0950     TRUE 0.967 1.000 0.400 NA   NA
 3661203 3661204 C8J_0950 C8J_0951   livF TRUE 0.856 18.000 0.280 1.000 N NA
 3661204 3661205 C8J_0951 C8J_0952 livF livG TRUE 0.994 -13.000 0.381 0.019 Y NA
 3661205 3661206 C8J_0952 C8J_0953 livG livM TRUE 0.956 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 3661206 3661207 C8J_0953 C8J_0954 livM livH TRUE 0.998 3.000 0.771 0.039 Y NA
 3661207 3661208 C8J_0954 C8J_0955 livH   TRUE 0.845 19.000 0.085 NA Y NA
 3661208 3661209 C8J_0955 C8J_0956   livJ TRUE 0.960 22.000 1.000 NA Y NA
 3661209 3661210 C8J_0956 C8J_0957 livJ   TRUE 0.782 31.000 0.312 NA N NA
 3661210 3661211 C8J_0957 C8J_0958     TRUE 0.943 9.000 0.250 NA   NA
 3661211 3661212 C8J_0958 C8J_0959     FALSE 0.440 52.000 0.062 NA   NA
 3661212 3661213 C8J_0959 C8J_0960   asd TRUE 0.805 9.000 0.025 NA   NA
 3661213 3661214 C8J_0960 C8J_0961 asd   TRUE 0.826 0.000 0.025 1.000 N NA
 3661214 3661215 C8J_0961 C8J_0962     FALSE 0.565 57.000 0.205 NA   NA
 3661215 3661216 C8J_0962 C8J_0963     TRUE 0.622 108.000 0.900 NA   NA
 3661216 3661217 C8J_0963 C8J_0964   gyrA FALSE 0.154 64.000 0.008 NA   NA
 3661217 3661218 C8J_0964 C8J_0965 gyrA   FALSE 0.301 41.000 0.007 1.000   NA
 3661218 3661219 C8J_0965 C8J_0966   mapA FALSE 0.279 144.000 0.152 NA   NA
 3661219 3661220 C8J_0966 C8J_0967 mapA lepA FALSE 0.115 77.000 0.003 NA   NA
 3661221 3661222 C8J_0968 C8J_0969     TRUE 0.914 -3.000 0.207 1.000 N NA
 3661222 3661223 C8J_0969 C8J_0970     TRUE 0.992 3.000 0.844 NA Y NA
 3661224 3661225 C8J_0971 C8J_0972     TRUE 0.848 1.000 0.022 1.000   NA
 3661225 3661226 C8J_0972 C8J_0973     TRUE 0.758 0.000 0.016 NA   NA
 3661226 3661227 C8J_0973 C8J_0974   pycA TRUE 0.969 4.000 0.400 NA   NA
 3661228 3661229 C8J_0975 C8J_0976   murG TRUE 0.959 -3.000 0.647 1.000 N NA
 3661230 3661231 C8J_0977 C8J_0978     TRUE 0.941 8.000 0.214 NA   NA
 3661231 3661232 C8J_0978 C8J_0979     FALSE 0.607 63.000 0.357 NA   NA
 3661232 3661233 C8J_0979 C8J_0980     TRUE 0.788 -3.000 0.031 1.000 N NA
 3661233 3661234 C8J_0980 C8J_0981   thiH TRUE 0.993 -10.000 0.128 0.004 Y NA
 3661234 3661235 C8J_0981 C8J_0982 thiH thiG TRUE 0.998 3.000 0.277 0.004 Y NA
 3661235 3661236 C8J_0982 C8J_0983 thiG moeB TRUE 0.985 3.000 0.054 0.031   NA
 3661236 3661237 C8J_0983 C8J_0984 moeB thiS TRUE 0.957 0.000 0.346 1.000   NA
 3661237 3661238 C8J_0984 C8J_0985 thiS   TRUE 0.684 -3.000 0.000 1.000   NA
 3661238 3661239 C8J_0985 C8J_0986     FALSE 0.084 126.000 0.000 NA   NA
 3661239 3661240 C8J_0986 C8J_0987     TRUE 0.936 0.000 0.208 NA   NA
 3661240 3661241 C8J_0987 C8J_0988     FALSE 0.502 14.000 0.000 NA   NA
 3661241 3661242 C8J_0988 C8J_0989   dapE TRUE 0.692 10.000 0.005 1.000 N NA
 3661242 3661243 C8J_0989 C8J_0990 dapE   TRUE 0.925 5.000 0.018 1.000 Y NA
 3661243 3661244 C8J_0990 C8J_0991     TRUE 0.948 -7.000 0.417 1.000 N NA
 3661244 3661245 C8J_0991 C8J_0992     TRUE 0.918 43.000 0.250 0.039 N NA
 3661245 3661246 C8J_0992 C8J_0993     TRUE 0.647 -25.000 0.000 NA   NA
 3661246 3661247 C8J_0993 C8J_0994   mutS TRUE 0.736 9.000 0.000 NA   NA
 3661247 3661248 C8J_0994 C8J_0995 mutS   TRUE 0.914 -7.000 0.217 NA   NA
 3661248 3661249 C8J_0995 C8J_0996   murC TRUE 0.674 -7.000 0.014 NA   NA
 3661249 3661250 C8J_0996 C8J_0997 murC   FALSE 0.087 124.000 0.004 1.000   NA
 3661250 3661251 C8J_0997 C8J_0998     TRUE 0.805 -7.000 0.032 1.000   NA
 3661251 3661252 C8J_0998 C8J_0999   guaB TRUE 0.661 -3.000 0.007 1.000   NA
 3661252 3661253 C8J_0999 C8J_1000 guaB gatA TRUE 0.816 10.000 0.032 1.000 N NA
 3661253 3661254 C8J_1000 C8J_1001 gatA   FALSE 0.612 -3.000 0.003 NA   NA
 3661254 3661255 C8J_1001 C8J_1002   ileS TRUE 0.863 -6.000 0.091 NA   NA
 3661256 3661257 C8J_1003 C8J_1004     TRUE 0.819 12.000 0.111 NA   NA
 3661257 3661258 C8J_1004 C8J_1005     FALSE 0.094 176.000 0.000 1.000   NA
 3661258 3661259 C8J_1005 C8J_1006     TRUE 0.945 -3.000 0.000 0.025   NA
 3661259 3661260 C8J_1006 C8J_1007   rdxA TRUE 0.991 0.000 0.333 0.025   NA
 3661260 3661261 C8J_1007 C8J_1008 rdxA pgsA FALSE 0.087 125.000 0.003 1.000 N NA
 3661261 3661262 C8J_1008 C8J_1009 pgsA   TRUE 0.939 -3.000 0.023 0.066 N NA
 3661262 3661263 C8J_1009 C8J_1010     TRUE 0.631 -7.000 0.002 NA   NA
 3661263 3661264 C8J_1010 C8J_1011   rpsF FALSE 0.096 87.000 0.002 NA   NA
 3661264 3661265 C8J_1011 C8J_1012 rpsF ssb TRUE 0.857 9.000 0.033 1.000 N NA
 3661265 3661266 C8J_1012 C8J_1013 ssb rpsR TRUE 0.768 11.000 0.034 1.000 N NA
 3661267 3661268 C8J_1014 C8J_1015 lon   TRUE 0.697 17.000 0.062 NA   NA
 3661269 3661270 C8J_1016 C8J_1017   proC TRUE 0.890 0.000 0.075 NA   NA
 3661270 3661271 C8J_1017 C8J_1018 proC   TRUE 0.842 -3.000 0.075 NA   NA
 3661271 3661272 C8J_1018 C8J_1019     TRUE 0.963 -3.000 0.800 NA   NA
 3661272 3661273 C8J_1019 C8J_1020     TRUE 0.812 57.000 1.000 NA   NA
 3661274 3661275 C8J_1021 C8J_1022   thiE TRUE 0.903 -22.000 0.032 1.000 Y NA
 3661275 3661276 C8J_1022 C8J_1023 thiE thiD TRUE 0.992 -10.000 0.079 0.004 Y NA
 3661276 3661277 C8J_1023 C8J_1024 thiD   TRUE 0.705 -3.000 0.016 1.000 N NA
 3661277 3661278 C8J_1024 C8J_1025     TRUE 0.718 -3.000 0.018 1.000   NA
 3661278 3661279 C8J_1025 C8J_1026   mfd TRUE 0.813 2.000 0.006 1.000   NA
 3661279 3661280 C8J_1026 C8J_1027 mfd   TRUE 0.798 0.000 0.023 NA N NA
 3661280 3661281 C8J_1027 C8J_1028     TRUE 0.948 -63.000 0.178 NA Y NA
 3661281 3661282 C8J_1028 C8J_1029   folC TRUE 0.804 -13.000 0.032 1.000 N NA
 3661282 3661283 C8J_1029 C8J_1030 folC   TRUE 0.884 -10.000 0.104 1.000   NA
 3661283 3661284 C8J_1030 C8J_1031     TRUE 0.945 -16.000 0.455 NA   NA
 3661284 3661285 C8J_1031 C8J_1032   leuS TRUE 0.766 -3.000 0.031 NA   NA
 3661285 3661286 C8J_1032 C8J_1033 leuS secF TRUE 0.700 10.000 0.008 1.000 N NA
 3661286 3661287 C8J_1033 C8J_1034 secF secD TRUE 0.998 0.000 0.436 0.002 Y NA
 3661287 3661288 C8J_1034 C8J_1035 secD   TRUE 0.926 -7.000 0.068 NA Y NA
 3661291 3661292 C8J_1038 C8J_1039   pyrB TRUE 0.692 10.000 0.005 1.000 N NA
 3661292 3661293 C8J_1039 C8J_1040 pyrB   TRUE 0.800 4.000 0.005 1.000 N NA
 3661293 3661294 C8J_1040 C8J_1041     TRUE 0.878 -6.000 0.115 NA   NA
 3661294 3661295 C8J_1041 C8J_1042     TRUE 0.741 -3.000 0.026 NA   NA
 3661295 3661296 C8J_1042 C8J_1043   truB TRUE 0.822 -3.000 0.046 1.000 N NA
 3661296 3661297 C8J_1043 C8J_1044 truB csrA TRUE 0.971 -6.000 0.046 0.023 N NA
 3661297 3661298 C8J_1044 C8J_1045 csrA   TRUE 0.806 -3.000 0.036 1.000 N NA
 3661298 3661299 C8J_1045 C8J_1046   smpB TRUE 0.779 -3.000 0.028 1.000 N NA
 3661299 3661300 C8J_1046 C8J_1047 smpB   TRUE 0.628 11.000 0.009 1.000   NA
 3661300 3661301 C8J_1047 C8J_1048     TRUE 0.798 0.000 0.024 NA   NA
 3661301 3661302 C8J_1048 C8J_1049   clpA TRUE 0.952 -3.000 0.596 NA   NA
 3661302 3661303 C8J_1049 C8J_1050 clpA aat TRUE 0.934 -25.000 0.087 1.000 Y NA
 3661304 3661305 C8J_1051 C8J_1052     FALSE 0.471 81.000 0.286 NA N NA
 3661305 3661306 C8J_1052 C8J_1053   msrB TRUE 0.899 3.000 0.041 NA N NA
 3661308 3661309 C8J_1055 C8J_1056 pssA   TRUE 0.978 10.000 0.466 1.000 Y NA
 3661309 3661310 C8J_1056 C8J_1057   ftsH TRUE 0.817 -3.000 0.043 1.000 N NA
 3661310 3661311 C8J_1057 C8J_1058 ftsH   TRUE 0.958 4.000 0.217 1.000 N NA
 3661311 3661312 C8J_1058 C8J_1059   cheY TRUE 0.761 23.000 0.146 1.000 N NA
 3661312 3661313 C8J_1059 C8J_1060 cheY wlaM FALSE 0.223 113.000 0.062 1.000   NA
 3661313 3661314 C8J_1060 C8J_1061 wlaM wlaL TRUE 0.946 0.000 0.242 1.000   NA
 3661314 3661315 C8J_1061 C8J_1062 wlaL wlaK TRUE 0.975 2.000 0.133 1.000 Y NA
 3661315 3661316 C8J_1062 C8J_1063 wlaK pglD FALSE 0.255 98.000 0.070 1.000   NA
 3661316 3661317 C8J_1063 C8J_1064 pglD pglC TRUE 0.862 -13.000 0.074 1.000   NA
 3661317 3661318 C8J_1064 C8J_1065 pglC pglA TRUE 0.949 -7.000 0.128 1.000 Y NA
 3661318 3661319 C8J_1065 C8J_1066 pglA wlaF TRUE 0.842 10.000 0.045 1.000   NA
 3661319 3661320 C8J_1066 C8J_1067 wlaF pglJ TRUE 0.970 4.000 0.375 1.000   NA
 3661320 3661321 C8J_1067 C8J_1068 pglJ pglI TRUE 0.956 -12.000 0.208 NA Y NA
 3661321 3661322 C8J_1068 C8J_1069 pglI wlaC TRUE 0.962 -7.000 0.267 NA Y NA
 3661322 3661323 C8J_1069 C8J_1070 wlaC wlaB TRUE 0.937 0.000 0.179 1.000 N NA
 3661323 3661324 C8J_1070 C8J_1071 wlaB galE TRUE 0.873 -6.000 0.086 1.000 N NA
 3661324 3661325 C8J_1071 C8J_1072 galE wlaX FALSE 0.451 59.000 0.086 1.000 N NA
 3661326 3661327 C8J_1073 C8J_1074 waaC waaM TRUE 0.962 -10.000 0.231 1.000 Y NA
 3661327 3661328 C8J_1074 C8J_1075 waaM   TRUE 0.909 -3.000 0.050 NA Y NA
 3661328 3661329 C8J_1075 C8J_1076     TRUE 0.805 11.000 0.007 NA Y NA
 3661329 3661330 C8J_1076 C8J_1077     TRUE 0.992 0.000 0.040 0.004 Y NA
 3661330 3661331 C8J_1077 C8J_1078     TRUE 0.965 3.000 0.286 NA   NA
 3661331 3661332 C8J_1078 C8J_1079     TRUE 0.699 22.000 0.097 NA   NA
 3661332 3661333 C8J_1079 C8J_1080     TRUE 0.673 -10.000 0.014 NA   NA
 3661333 3661334 C8J_1080 C8J_1081     TRUE 0.699 -7.000 0.000 1.000   NA
 3661334 3661335 C8J_1081 C8J_1082     FALSE 0.443 19.000 0.000 NA N NA
 3661335 3661336 C8J_1082 C8J_1083     TRUE 0.957 -45.000 0.250 NA Y NA
 3661336 3661337 C8J_1083 C8J_1084     TRUE 0.843 -31.000 0.012 NA Y NA
 3661338 3661339 C8J_1085 C8J_1086     TRUE 0.957 -3.000 0.667 NA   NA
 3661339 3661340 C8J_1086 C8J_1087     TRUE 0.655 -16.000 0.000 NA   NA
 3661341 3661342 C8J_1088 C8J_1089     TRUE 0.909 -7.000 0.200 NA   NA
 3661342 3661343 C8J_1089 C8J_1090     TRUE 0.902 -3.000 0.200 NA   NA
 3661345 3661346 C8J_1092 C8J_1093 waaF   FALSE 0.468 52.000 0.000 NA Y NA
 3661346 3661347 C8J_1093 C8J_1094     TRUE 0.946 10.000 0.400 NA   NA
 3661348 3661349 C8J_1095 C8J_1096 gmhA-1 waaE TRUE 0.895 -3.000 0.142 1.000 N NA
 3661349 3661350 C8J_1096 C8J_1097 waaE waaD TRUE 0.991 -7.000 0.096 0.008 Y NA
 3661350 3661351 C8J_1097 C8J_1098 waaD   TRUE 0.929 1.000 0.093 1.000 N NA
 3661353 3661354 C8J_1100 C8J_1101     TRUE 0.979 -3.000 0.713 NA Y NA
 3661355 3661356 C8J_1102 C8J_1103 rho dnaX TRUE 0.959 4.000 0.009 0.097 N NA
 3661357 3661358 C8J_1104 C8J_1105     FALSE 0.255 72.000 0.042 NA   NA
 3661358 3661359 C8J_1105 C8J_1106     TRUE 0.989 0.000 0.067 0.003   NA
 3661359 3661360 C8J_1106 C8J_1107     TRUE 0.843 -10.000 0.053 1.000   NA
 3661360 3661361 C8J_1107 C8J_1108     FALSE 0.285 74.000 0.059 NA   NA
 3661361 3661362 C8J_1108 C8J_1109     FALSE 0.251 71.000 0.037 NA   NA
 3661362 3661363 C8J_1109 C8J_1110     TRUE 0.848 -3.000 0.083 NA   NA
 3661365 3661366 C8J_1112 C8J_1113     FALSE 0.225 81.000 0.043 NA   NA
 3661366 3661367 C8J_1113 C8J_1114     TRUE 0.810 11.000 0.070 NA   NA
 3661367 3661368 C8J_1114 C8J_1115   ppi FALSE 0.086 164.000 0.015 NA   NA
 3661368 3661369 C8J_1115 C8J_1116 ppi   TRUE 0.672 10.000 0.010 NA   NA
 3661370 3661371 C8J_1117 C8J_1118     TRUE 0.997 0.000 0.869 0.065 Y NA
 3661372 3661373 C8J_1119 C8J_1120 argS   FALSE 0.598 12.000 0.011 1.000 N NA
 3661373 3661374 C8J_1120 C8J_1121   gmk TRUE 0.820 2.000 0.009 1.000 N NA
 3661374 3661375 C8J_1121 C8J_1122 gmk   TRUE 0.810 3.000 0.000 NA   NA
 3661375 3661376 C8J_1122 C8J_1123   fliR FALSE 0.200 57.000 0.000 NA   NA
 3661376 3661377 C8J_1123 C8J_1124 fliR   TRUE 0.801 -13.000 0.032 1.000 N NA
 3661377 3661378 C8J_1124 C8J_1125   tsf TRUE 0.616 13.000 0.019 1.000 N NA
 3661378 3661379 C8J_1125 C8J_1126 tsf rpsB TRUE 0.988 0.000 0.748 1.000 Y NA
 3661379 3661380 C8J_1126 C8J_1127 rpsB   FALSE 0.090 116.000 0.003 1.000 N NA
 3661380 3661381 C8J_1127 C8J_1128   petC FALSE 0.244 126.000 0.087 1.000 N NA
 3661381 3661382 C8J_1128 C8J_1129 petC petB TRUE 0.993 -3.000 0.103 0.002 Y NA
 3661382 3661383 C8J_1129 C8J_1130 petB petA TRUE 0.997 2.000 0.093 0.002 Y NA
 3661383 3661384 C8J_1130 C8J_1131 petA arsB FALSE 0.288 90.000 0.083 1.000 N NA
 3661384 3661385 C8J_1131 C8J_1132 arsB gidA TRUE 0.789 1.000 0.003 1.000 N NA
 3661385 3661386 C8J_1132 C8J_1133 gidA   FALSE 0.113 86.000 0.004 1.000   NA
 3661386 3661387 C8J_1133 C8J_1134     TRUE 0.983 18.000 0.556 0.009   NA
 3661387 3661388 C8J_1134 C8J_1135     TRUE 0.849 121.000 0.444 0.009   NA
 3661392 3661393 C8J_1139 C8J_1140   gpsA TRUE 0.696 10.000 0.007 1.000 N NA
 3661393 3661394 C8J_1140 C8J_1141 gpsA gatB TRUE 0.762 0.000 0.011 1.000 N NA
 3661395 3661396 C8J_1142 C8J_1143 luxS   FALSE 0.484 312.000 0.000 0.019   NA
 3661396 3661397 C8J_1143 C8J_1144     FALSE 0.175 112.000 0.043 NA   NA
 3661397 3661398 C8J_1144 C8J_1145   metE FALSE 0.528 12.000 0.006 NA N NA
 3661398 3661399 C8J_1145 C8J_1146 metE metF TRUE 0.992 10.000 0.050 0.002 Y NA
 3661400 3661401 C8J_1147 C8J_1148 atpB radA FALSE 0.157 69.000 0.003 1.000 N NA
 3661401 3661402 C8J_1148 C8J_1149 radA ftsY TRUE 0.968 0.000 0.015 0.019 N NA
 3661402 3661403 C8J_1149 C8J_1150 ftsY   TRUE 0.744 0.000 0.003 1.000 N NA
 3661404 3661405 C8J_1151 C8J_1152     TRUE 0.838 -79.000 0.059 1.000   NA
 3661405 3661406 C8J_1152 C8J_1153     TRUE 0.727 9.000 0.010 NA   NA
 3661406 3661407 C8J_1153 C8J_1154   comE3 TRUE 0.707 0.000 0.005 NA   NA
 3661408 3661409 C8J_1155 C8J_1156 rbn glcD TRUE 0.887 4.000 0.031 1.000   NA
 3661409 3661410 C8J_1156 C8J_1157 glcD   TRUE 0.973 3.000 0.404 NA   NA
 3661412 3661413 C8J_1159 C8J_1160     TRUE 0.781 2.000 0.005 NA   NA
 3661413 3661414 C8J_1160 C8J_1161   ribE TRUE 0.637 -36.000 0.011 NA   NA
 3661414 3661415 C8J_1161 C8J_1162 ribE   TRUE 0.706 9.000 0.004 NA   NA
 3661416 3661417 C8J_1163 C8J_1164 groES groEL TRUE 0.986 21.000 0.356 0.010 Y NA
 3661418 3661419 C8J_1165 C8J_1166     TRUE 0.985 -7.000 0.846 1.000 Y NA
 3661420 3661421 C8J_1167 C8J_1168     TRUE 0.642 11.000 0.000 1.000   NA
 3661422 3661423 C8J_t0027 C8J_1169     FALSE 0.102 93.000 0.000 NA   NA
 3661423 3661424 C8J_1169 C8J_1170     TRUE 0.983 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 3661424 3661425 C8J_1170 C8J_1171   htrA FALSE 0.527 76.000 0.294 1.000 N NA
 3661426 3661427 C8J_1172 C8J_1173 cbpA hspR TRUE 0.867 16.000 0.282 1.000 N NA
 3661427 3661428 C8J_1173 C8J_1174 hspR kefB TRUE 0.859 6.000 0.028 1.000 N NA
 3661428 3661429 C8J_1174 C8J_1175 kefB   TRUE 0.927 10.000 0.250 NA   NA
 3661429 3661430 C8J_1175 C8J_1176     TRUE 0.932 -3.000 0.364 NA   NA
 3661430 3661431 C8J_1176 C8J_1177   glyS FALSE 0.216 56.000 0.006 1.000   NA
 3661431 3661432 C8J_1177 C8J_1178 glyS   TRUE 0.667 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3661432 3661433 C8J_1178 C8J_1179     TRUE 0.646 -3.000 0.012 NA   NA
 3661435 3661436 C8J_1181 C8J_1182 pdxJ pdxA TRUE 0.992 -3.000 0.048 0.001 Y NA
 3661438 3661439 C8J_1184 C8J_1185     TRUE 0.682 56.000 0.400 NA   NA
 3661439 3661440 C8J_1185 C8J_1186   hemE FALSE 0.071 180.000 0.004 NA   NA
 3661440 3661441 C8J_1186 C8J_1187 hemE   TRUE 0.714 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3661442 3661443 C8J_1188 C8J_1189   uvrC TRUE 0.781 2.000 0.005 NA   NA
 3661443 3661444 C8J_1189 C8J_1190 uvrC   TRUE 0.700 -7.000 0.018 NA   NA
 3661445 3661446 C8J_1191 C8J_1192 guaA   FALSE 0.098 86.000 0.002 NA   NA
 3661446 3661447 C8J_1192 C8J_1193     FALSE 0.306 38.000 0.000 NA   NA
 3661447 3661448 C8J_1193 C8J_1194   purD FALSE 0.155 68.000 0.000 NA   NA
 3661448 3661449 C8J_1194 C8J_1195 purD   TRUE 0.677 -3.000 0.017 NA   NA
 3661449 3661450 C8J_1195 C8J_1196     TRUE 0.896 -10.000 0.149 NA   NA
 3661450 3661451 C8J_1196 C8J_1197   pnp FALSE 0.156 70.000 0.007 1.000 N NA
 3661451 3661452 C8J_1197 C8J_1198 pnp   TRUE 0.617 -3.000 0.002 NA N NA
 3661452 3661453 C8J_1198 C8J_1199     FALSE 0.175 58.000 0.006 NA   NA
 3661454 3661455 C8J_1200 C8J_1201     TRUE 0.878 18.000 0.429 NA   NA
 3661456 3661457 C8J_1202 C8J_1203   porA FALSE 0.082 252.000 0.000 NA   NA
 3661459 3661460 C8J_1205 C8J_1206 racR racS TRUE 0.973 -3.000 0.448 1.000 Y NA
 3661460 3661461 C8J_1206 C8J_1207 racS recR TRUE 0.767 0.000 0.011 1.000 N NA
 3661462 3661463 C8J_1208 C8J_1209 hydD hydC TRUE 0.963 -3.000 0.277 1.000 Y NA
 3661463 3661464 C8J_1209 C8J_1210 hydC hydB TRUE 0.988 11.000 0.270 0.048 Y NA
 3661464 3661465 C8J_1210 C8J_1211 hydB hydA TRUE 0.999 3.000 0.951 0.002 Y NA
 3661465 3661466 C8J_1211 C8J_1212 hydA   FALSE 0.094 120.000 0.009 1.000 N NA
 3661466 3661467 C8J_1212 C8J_1213   amiA TRUE 0.730 -3.000 0.020 1.000 N NA
 3661467 3661468 C8J_1213 C8J_1214 amiA   TRUE 0.879 0.000 0.050 1.000   NA
 3661468 3661469 C8J_1214 C8J_1215   tyrS TRUE 0.816 -3.000 0.043 1.000   NA
 3661469 3661470 C8J_1215 C8J_1216 tyrS spoT TRUE 0.761 12.000 0.045 1.000 N NA
 3661470 3661471 C8J_1216 C8J_1217 spoT rpoZ TRUE 0.876 -16.000 0.018 1.000 Y NA
 3661471 3661472 C8J_1217 C8J_1218 rpoZ pyrH TRUE 0.613 11.000 0.004 1.000 N NA
 3661472 3661473 C8J_1218 C8J_1219 pyrH   FALSE 0.241 52.000 0.002 1.000 N NA
 3661473 3661474 C8J_1219 C8J_1220     TRUE 0.846 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 3661474 3661475 C8J_1220 C8J_1221   lolD TRUE 0.974 -13.000 0.431 1.000 Y NA
 3661475 3661476 C8J_1221 C8J_1222 lolD   FALSE 0.298 70.000 0.044 1.000   NA
 3661476 3661477 C8J_1222 C8J_1223     TRUE 0.877 0.000 0.060 NA   NA
 3661477 3661478 C8J_1223 C8J_1224     TRUE 0.765 -52.000 0.031 NA   NA
 3661479 3661480 C8J_1225 C8J_t0028     FALSE 0.217 54.000 0.000 NA   NA
 3661482 3661483 C8J_1226 C8J_1227 ktrB ktrA TRUE 0.996 11.000 0.647 0.004 Y NA
 3661484 3661485 C8J_1228 C8J_1229   upp TRUE 0.733 6.000 0.005 NA   NA
 3661485 3661486 C8J_1229 C8J_1230 upp   TRUE 0.668 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3661486 3661487 C8J_1230 C8J_1231   gltX2 TRUE 0.865 2.000 0.021 1.000 N NA
 3661489 3661490 C8J_1233 C8J_1234 accC-2 accB TRUE 0.996 2.000 0.071 0.003 Y NA
 3661491 3661492 C8J_1235 C8J_1236     FALSE 0.294 49.000 0.014 1.000   NA
 3661492 3661493 C8J_1236 C8J_1237     TRUE 0.983 2.000 0.678 1.000   NA
 3661493 3661494 C8J_1237 C8J_1238     TRUE 0.714 -7.000 0.020 NA   NA
 3661494 3661495 C8J_1238 C8J_1239     TRUE 0.646 -3.000 0.000 NA   NA
 3661495 3661496 C8J_1239 C8J_1240     TRUE 0.891 1.000 0.037 1.000 N NA
 3661496 3661497 C8J_1240 C8J_1241     TRUE 0.844 -13.000 0.056 1.000 N NA
 3661497 3661498 C8J_1241 C8J_1242     TRUE 0.804 2.000 0.000 NA   NA
 3661500 3661501 C8J_1244 C8J_1245 neuA2   TRUE 0.967 -16.000 0.355 NA Y NA
 3661501 3661502 C8J_1245 C8J_1246     TRUE 0.883 -3.000 0.137 NA N NA
 3661502 3661503 C8J_1246 C8J_1247     TRUE 0.721 70.000 0.000 0.004   NA
 3661504 3661505 C8J_1248 C8J_1249   hisH-1 TRUE 0.990 1.000 0.011 0.007 Y NA
 3661505 3661506 C8J_1249 C8J_1250 hisH-1   TRUE 0.954 -3.000 0.625 NA N NA
 3661507 3661508 C8J_1251 C8J_1252 neuB   TRUE 0.652 -3.000 0.012 NA   NA
 3661508 3661509 C8J_1252 C8J_1253     FALSE 0.424 21.000 0.000 NA   NA
 3661509 3661510 C8J_1253 C8J_1254     TRUE 0.659 -13.000 0.000 NA   NA
 3661511 3661512 C8J_1255 C8J_1256     TRUE 0.963 174.000 1.000 0.003 Y NA
 3661512 3661513 C8J_1256 C8J_1257     FALSE 0.608 83.000 0.667 NA   NA
 3661513 3661514 C8J_1257 C8J_1258     TRUE 0.681 10.000 0.000 NA   NA
 3661514 3661515 C8J_1258 C8J_1259     TRUE 0.968 0.000 0.600 NA   NA
 3661515 3661516 C8J_1259 C8J_1260     TRUE 0.790 1.000 0.005 1.000 N NA
 3661516 3661517 C8J_1260 C8J_1261     TRUE 0.664 -3.000 0.008 1.000   NA
 3661517 3661518 C8J_1261 C8J_1262   dxr TRUE 0.812 2.000 0.006 1.000   NA
 3661518 3661519 C8J_1262 C8J_1263 dxr cdsA TRUE 0.969 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 3661519 3661520 C8J_1263 C8J_1264 cdsA   TRUE 0.713 9.000 0.007 NA   NA
 3661520 3661521 C8J_1264 C8J_1265     TRUE 0.869 2.000 0.028 NA   NA
 3661522 3661523 C8J_1266 C8J_1267 mobA pldA TRUE 0.698 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3661523 3661524 C8J_1267 C8J_1268 pldA ceuB FALSE 0.479 86.000 0.019 0.082 N NA
 3661524 3661525 C8J_1268 C8J_1269 ceuB ceuC TRUE 0.996 -7.000 0.870 0.037 Y NA
 3661525 3661526 C8J_1269 C8J_1270 ceuC ceuD TRUE 0.984 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 3661526 3661527 C8J_1270 C8J_1271 ceuD ceuE TRUE 0.876 13.000 0.055 1.000 Y NA
 3661527 3661528 C8J_1271 C8J_1272 ceuE   FALSE 0.081 156.000 0.000 NA   NA
 3661528 3661529 C8J_1272 C8J_1273     TRUE 0.782 1.000 0.000 NA   NA
 3661530 3661531 C8J_t0030 C8J_1274     FALSE 0.168 64.000 0.000 NA   NA
 3661531 3661532 C8J_1274 C8J_1275   nrfA FALSE 0.406 136.000 0.375 NA   NA
 3661532 3661533 C8J_1275 C8J_1276 nrfA   TRUE 0.970 15.000 0.043 0.001 N NA
 3661535 3661536 C8J_1278 C8J_1279     FALSE 0.100 564.000 0.000 1.000   NA
 3661537 3661538 C8J_1280 C8J_1281 ruvB amaA TRUE 0.826 4.000 0.019 NA   NA
 3661539 3661540 C8J_1282 C8J_1283 fumC glmS FALSE 0.088 135.000 0.007 1.000 N NA
 3661540 3661541 C8J_1283 C8J_1284 glmS   TRUE 0.962 5.000 0.312 1.000 N NA
 3661541 3661542 C8J_1284 C8J_1286     TRUE 0.662 -10.000 0.000 NA   NA
 3661543 3661544 C8J_1287 C8J_1288     TRUE 0.854 10.000 0.053 1.000   NA
 3661544 3661545 C8J_1288 C8J_1289     TRUE 0.722 14.000 0.048 1.000   NA
 3661545 3661546 C8J_1289 C8J_1290     FALSE 0.324 45.000 0.016 1.000   NA
 3661546 3661547 C8J_1290 C8J_1291     TRUE 0.965 10.000 0.684 NA N NA
 3661547 3661548 C8J_1291 C8J_1292     TRUE 0.944 0.000 0.263 NA   NA
 3661552 3661553 C8J_1296 C8J_1297 selA selB TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.001 N NA
 3661553 3661554 C8J_1297 C8J_1298 selB   FALSE 0.403 49.000 0.031 1.000 N NA
 3661554 3661555 C8J_1298 C8J_1299     TRUE 0.910 6.000 0.091 NA   NA
 3661556 3661557 C8J_1300 C8J_1301 fldA   TRUE 0.957 0.000 0.391 NA   NA
 3661557 3661558 C8J_1301 C8J_1302     TRUE 0.933 3.000 0.094 NA   NA
 3661559 3661560 C8J_1303 C8J_1304 katA   FALSE 0.444 57.000 0.091 NA   NA
 3661562 3661563 C8J_1306 C8J_1307     TRUE 0.956 4.000 0.238 NA N NA
 3661563 3661564 C8J_1307 C8J_1308   metC TRUE 0.931 13.000 0.600 1.000 N NA
 3661564 3661565 C8J_1308 C8J_1309 metC purB-2 TRUE 0.690 10.000 0.004 1.000 N NA
 3661565 3661566 C8J_1309 C8J_1310 purB-2   TRUE 0.744 9.000 0.003 1.000   NA
 3661566 3661567 C8J_1310 C8J_1311     FALSE 0.325 82.000 0.094 1.000   NA
 3661567 3661568 C8J_1311 C8J_1312   feoB TRUE 0.930 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 3661569 3661570 C8J_1313 C8J_1314 hydA2 fabI TRUE 0.932 4.000 0.088 1.000 N NA
 3661570 3661571 C8J_1314 C8J_1315 fabI tpiA TRUE 0.985 4.000 0.071 0.034 N NA
 3661571 3661572 C8J_1315 C8J_1316 tpiA pgk TRUE 0.881 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 3661572 3661573 C8J_1316 C8J_1317 pgk gapA TRUE 0.993 3.000 0.020 0.006 Y NA
 3661574 3661575 C8J_1318 C8J_1319     TRUE 0.756 28.000 0.221 NA   NA
 3661576 3661577 C8J_1320 C8J_1321   algC FALSE 0.235 48.000 0.007 NA   NA
 3661578 3661579 C8J_1322 C8J_1323 fliL acpS TRUE 0.876 0.000 0.047 1.000 N NA
 3661580 3661581 C8J_1324 C8J_1325     TRUE 0.957 -3.000 0.600 1.000   NA
 3661581 3661582 C8J_1325 C8J_1326     TRUE 0.880 -3.000 0.132 NA   NA
 3661582 3661583 C8J_1326 C8J_1327   kpsS FALSE 0.261 73.000 0.046 NA   NA
 3661583 3661584 C8J_1327 C8J_1328 kpsS   TRUE 0.984 -3.000 0.056 0.002   NA
 3661584 3661585 C8J_1328 C8J_1329     FALSE 0.095 182.000 0.000 1.000   NA
 3661585 3661586 C8J_1329 C8J_1330     TRUE 0.782 -7.000 0.027 1.000   NA
 3661586 3661587 C8J_1330 C8J_1331     TRUE 0.962 0.000 0.000 0.029   NA
 3661587 3661588 C8J_1331 C8J_1332     FALSE 0.469 113.000 0.000 0.029   NA
 3661588 3661589 C8J_1332 C8J_1333     TRUE 0.926 4.000 0.000 1.000 Y NA
 3661589 3661590 C8J_1333 C8J_1334     FALSE 0.082 133.000 0.000 NA   NA
 3661590 3661591 C8J_1334 C8J_1335     FALSE 0.370 27.000 0.000 NA   NA
 3661591 3661592 C8J_1335 C8J_1336     TRUE 0.646 -3.000 0.000 NA   NA
 3661592 3661593 C8J_1336 C8J_1337     FALSE 0.455 18.000 0.000 NA   NA
 3661593 3661594 C8J_1337 C8J_1338     FALSE 0.109 104.000 0.000 1.000   NA
 3661594 3661595 C8J_1338 C8J_1339     TRUE 0.944 -3.000 0.124 1.000 Y NA
 3661595 3661596 C8J_1339 C8J_1340     TRUE 0.735 0.000 0.000 NA   NA
 3661596 3661597 C8J_1340 C8J_1341     TRUE 0.646 -3.000 0.000 NA   NA
 3661597 3661598 C8J_1341 C8J_1342     TRUE 0.988 -13.000 0.000 0.001 Y NA
 3661598 3661599 C8J_1342 C8J_1343     TRUE 0.857 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3661599 3661600 C8J_1343 C8J_1344     TRUE 0.931 2.000 0.000 1.000 Y NA
 3661600 3661601 C8J_1344 C8J_1345     TRUE 0.857 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3661601 3661602 C8J_1345 C8J_1346     TRUE 0.912 6.000 0.000 1.000 Y NA
 3661602 3661603 C8J_1346 C8J_1347     FALSE 0.484 53.000 0.000 1.000 Y NA
 3661603 3661604 C8J_1347 C8J_1348     TRUE 0.852 -10.000 0.000 NA Y NA
 3661604 3661605 C8J_1348 C8J_1349     TRUE 0.890 0.000 0.000 NA Y NA
 3661605 3661606 C8J_1349 C8J_1350   kpsF TRUE 0.943 1.000 0.033 NA Y NA
 3661606 3661607 C8J_1350 C8J_1351 kpsF kpsD TRUE 0.906 11.000 0.056 1.000 Y NA
 3661607 3661608 C8J_1351 C8J_1352 kpsD kpsE TRUE 0.994 2.000 0.200 0.080 Y NA
 3661608 3661609 C8J_1352 C8J_1353 kpsE kpsT TRUE 0.974 0.000 0.257 1.000 Y NA
 3661609 3661610 C8J_1353 C8J_1354 kpsT kpsM TRUE 0.990 -3.000 0.306 0.093 Y NA
 3661610 3661611 C8J_1354 C8J_1355 kpsM   FALSE 0.296 72.000 0.048 1.000   NA
 3661612 3661613 C8J_1356 C8J_1357   dut TRUE 0.627 37.000 0.120 NA   NA
 3661613 3661614 C8J_1357 C8J_1358 dut   TRUE 0.930 2.000 0.092 NA   NA
 3661615 3661616 C8J_1359 C8J_1360     TRUE 0.741 -10.000 0.019 1.000 N NA
 3661618 3661619 C8J_1362 C8J_1363     FALSE 0.080 118.000 0.008 NA   NA
 3661619 3661620 C8J_1363 C8J_1364     TRUE 0.744 -31.000 0.022 1.000   NA
 3661621 3661622 C8J_1365 C8J_1366     TRUE 0.885 -3.000 0.143 NA   NA
 3661622 3661623 C8J_1366 C8J_1367     TRUE 0.809 -7.000 0.043 NA   NA
 3661623 3661624 C8J_1367 C8J_1368   flgI FALSE 0.342 59.000 0.035 1.000 N NA
 3661624 3661625 C8J_1368 C8J_1369 flgI   TRUE 0.841 33.000 0.569 NA   NA
 3661625 3661626 C8J_1369 C8J_1370     TRUE 0.659 63.000 0.469 NA   NA
 3661626 3661627 C8J_1370 C8J_1371     TRUE 0.974 45.000 0.677 0.004   NA
 3661627 3661628 C8J_1371 C8J_1372     TRUE 0.995 10.000 0.558 0.004   NA
 3661628 3661629 C8J_1372 C8J_1373     TRUE 0.750 17.000 0.084 1.000   NA
 3661629 3661630 C8J_1373 C8J_1374     TRUE 0.894 4.000 0.035 1.000   NA
 3661631 3661632 C8J_1375 C8J_1376 ctsF   TRUE 0.956 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 3661632 3661633 C8J_1376 C8J_1377   ctsX TRUE 0.970 2.000 0.333 1.000   NA
 3661633 3661634 C8J_1377 C8J_1378 ctsX   TRUE 0.981 4.000 0.667 1.000   NA
 3661634 3661635 C8J_1378 C8J_1379   ctsD TRUE 0.910 -7.000 0.167 1.000   NA
 3661635 3661636 C8J_1379 C8J_1380 ctsD ctsR TRUE 0.895 -22.000 0.167 NA   NA
 3661636 3661637 C8J_1380 C8J_1381 ctsR   FALSE 0.441 39.000 0.032 NA   NA
 3661637 3661638 C8J_1381 C8J_1382     FALSE 0.243 93.000 0.056 1.000   NA
 3661638 3661639 C8J_1382 C8J_1383   cadF TRUE 0.896 0.000 0.068 1.000   NA
 3661639 3661640 C8J_1383 C8J_1384 cadF rpsI FALSE 0.134 125.000 0.024 1.000 N NA
 3661640 3661641 C8J_1384 C8J_1385 rpsI rplM TRUE 0.996 3.000 0.231 0.025 Y NA
 3661641 3661642 C8J_1385 C8J_1386 rplM   FALSE 0.123 84.000 0.009 1.000 N NA
 3661642 3661643 C8J_1386 C8J_1387     TRUE 0.986 -3.000 0.117 0.036 Y NA
 3661643 3661644 C8J_1387 C8J_1388     TRUE 0.854 -3.000 0.091 NA   NA
 3661644 3661645 C8J_1388 C8J_1389     TRUE 0.868 -13.000 0.102 NA   NA
 3661645 3661646 C8J_1389 C8J_1390     TRUE 0.915 -3.000 0.250 NA   NA
 3661646 3661647 C8J_1390 C8J_1391     TRUE 0.907 -3.000 0.211 NA   NA
 3661647 3661648 C8J_1391 C8J_1392   ccoP TRUE 0.968 0.000 0.579 NA   NA
 3661648 3661649 C8J_1392 C8J_1393 ccoP ccoQ TRUE 0.995 0.000 0.286 0.002 N NA
 3661649 3661650 C8J_1393 C8J_1394 ccoQ ccoO TRUE 0.998 5.000 0.738 0.002 N NA
 3661650 3661651 C8J_1394 C8J_1395 ccoO ccoN TRUE 0.988 13.000 0.283 0.002 N NA
 3661651 3661652 C8J_1395 C8J_1396 ccoN   FALSE 0.213 126.000 0.062 1.000 N NA
 3661652 3661653 C8J_1396 C8J_1397     TRUE 0.990 3.000 0.000 0.009 Y NA
 3661653 3661654 C8J_1397 C8J_1398     TRUE 0.646 -3.000 0.000 NA   NA
 3661654 3661655 C8J_1398 C8J_1399   carA TRUE 0.639 -3.000 0.011 NA   NA
 3661655 3661656 C8J_1399 C8J_1400 carA   TRUE 0.851 0.000 0.041 NA   NA
 3661656 3661657 C8J_1400 C8J_1401     FALSE 0.299 93.000 0.120 NA   NA
 3661657 3661658 C8J_1401 C8J_1402     TRUE 0.894 -7.000 0.147 NA   NA
 3661658 3661659 C8J_1402 C8J_1403   purA TRUE 0.662 -3.000 0.014 NA   NA
 3661659 3661660 C8J_1403 C8J_t0031 purA   FALSE 0.363 28.000 0.000 NA   NA
 3661662 3661663 C8J_1405 C8J_1406 putP   TRUE 0.795 18.000 0.141 1.000 N NA
 3661663 3661664 C8J_1406 C8J_1407   selD FALSE 0.096 130.000 0.011 1.000 N NA
 3661664 3661665 C8J_1407 C8J_1408 selD   FALSE 0.284 106.000 0.104 1.000 N NA
 3661665 3661666 C8J_1408 C8J_1409     FALSE 0.113 112.000 0.015 1.000 N NA
 3661666 3661667 C8J_1409 C8J_1410     FALSE 0.221 113.000 0.077 NA   NA
 3661667 3661668 C8J_1410 C8J_1411   fdhD TRUE 0.902 -7.000 0.172 NA   NA
 3661668 3661669 C8J_1411 C8J_1412 fdhD fdhC TRUE 0.880 167.000 0.138 0.003 Y NA
 3661669 3661670 C8J_1412 C8J_1413 fdhC fdhB TRUE 0.995 -3.000 0.200 0.003 Y NA
 3661670 3661671 C8J_1413 C8J_1414 fdhB   TRUE 0.992 -3.000 0.333 0.003   NA
 3661671 3661672 C8J_1414 C8J_1415     TRUE 0.847 49.000 0.000 0.003   NA
 3661672 3661673 C8J_1415 C8J_1416     TRUE 0.735 0.000 0.000 NA   NA
 3661673 3661674 C8J_1416 C8J_1417     TRUE 0.934 -25.000 0.375 NA   NA
 3661674 3661675 C8J_1417 C8J_1418   nspC FALSE 0.097 304.000 0.000 1.000   NA
 3661676 3661677 C8J_1419 C8J_1420     TRUE 0.825 2.000 0.010 1.000 N NA
 3661677 3661678 C8J_1420 C8J_1421     TRUE 0.987 1.000 0.501 1.000 Y NA
 3661678 3661679 C8J_1421 C8J_1422   moeA2 TRUE 0.992 4.000 0.018 0.005 Y NA
 11470601 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 608.000 0.000 NA   NA
 11612964 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 608.000 0.000 NA   NA
 11755356 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 608.000 0.000 NA   NA
 11470602 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 578.000 0.000 NA   NA
 11612965 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 578.000 0.000 NA   NA
 11755357 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 578.000 0.000 NA   NA
 11470603 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 542.000 0.000 NA   NA
 11612966 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 542.000 0.000 NA   NA
 11755358 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 542.000 0.000 NA   NA
 11470604 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 512.000 0.000 NA   NA
 11612967 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 512.000 0.000 NA   NA
 11755359 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 512.000 0.000 NA   NA
 11470605 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 476.000 0.000 NA   NA
 11612968 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 476.000 0.000 NA   NA
 11755360 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 476.000 0.000 NA   NA
 11470606 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 446.000 0.000 NA   NA
 11612969 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 446.000 0.000 NA   NA
 11755361 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 446.000 0.000 NA   NA
 11470607 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 410.000 0.000 NA   NA
 11612970 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 410.000 0.000 NA   NA
 11755362 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 410.000 0.000 NA   NA
 11470608 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 380.000 0.000 NA   NA
 11612971 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 380.000 0.000 NA   NA
 11755363 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 380.000 0.000 NA   NA
 11470609 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 344.000 0.000 NA   NA
 11612972 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 344.000 0.000 NA   NA
 11755364 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 344.000 0.000 NA   NA
 11470610 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 314.000 0.000 NA   NA
 11612973 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 314.000 0.000 NA   NA
 11755365 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 314.000 0.000 NA   NA
 11470611 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 278.000 0.000 NA   NA
 11612974 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 278.000 0.000 NA   NA
 11755366 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 278.000 0.000 NA   NA
 11470612 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 248.000 0.000 NA   NA
 11612975 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 248.000 0.000 NA   NA
 11755367 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 248.000 0.000 NA   NA
 11470613 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 212.000 0.000 NA   NA
 11612976 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 212.000 0.000 NA   NA
 11755368 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 212.000 0.000 NA   NA
 11470614 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 182.000 0.000 NA   NA
 11612977 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 182.000 0.000 NA   NA
 11755369 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 182.000 0.000 NA   NA
 11470615 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 146.000 0.000 NA   NA
 11612978 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 146.000 0.000 NA   NA
 11755370 3661680   C8J_1423   cas2 FALSE NA 146.000 0.000 NA   NA
 3661680 3661681 C8J_1423 C8J_1424 cas2 cas1 TRUE 0.969 -7.000 0.876 NA   NA
 3661681 3661682 C8J_1424 C8J_1425 cas1   TRUE 0.950 -3.000 0.546 NA   NA
 3661684 3661685 C8J_1427 C8J_1428   purM FALSE 0.164 60.000 0.003 NA N NA
 3661686 3661687 C8J_1429 C8J_1430   dapF TRUE 0.709 -3.000 0.016 1.000 N NA
 3661687 3661688 C8J_1430 C8J_1431 dapF   FALSE 0.103 107.000 0.010 1.000   NA
 3661689 3661690 C8J_1432 C8J_1433     FALSE 0.246 67.000 0.030 NA   NA
 3661690 3661691 C8J_1433 C8J_1434   pgi FALSE 0.097 127.000 0.011 1.000 N NA
 3661691 3661692 C8J_1434 C8J_1435 pgi galU TRUE 0.763 -6.000 0.023 1.000 N NA
 3661692 3661693 C8J_1435 C8J_1436 galU acs FALSE 0.218 82.000 0.032 1.000 N NA
 3661693 3661694 C8J_1436 C8J_1437 acs   FALSE 0.157 138.000 0.032 1.000 N NA
 3661694 3661695 C8J_1437 C8J_1438     TRUE 0.973 2.000 0.389 1.000 N NA
 3661696 3661697 C8J_1439 C8J_1440     FALSE 0.078 142.000 0.010 NA   NA
 3661697 3661698 C8J_1440 C8J_1441     TRUE 0.853 10.000 0.053 1.000   NA
 3661698 3661699 C8J_1441 C8J_1442     TRUE 0.940 -19.000 0.122 NA Y NA
 3661700 3661701 C8J_1443 C8J_1444     FALSE 0.520 33.000 0.034 1.000   NA
 3661702 3661703 C8J_1445 C8J_1446     TRUE 0.881 -7.000 0.120 NA N NA
 3661705 3661706 C8J_1448 C8J_1449     FALSE 0.213 90.000 0.049 NA   NA
 3661706 3661707 C8J_1449 C8J_1450     TRUE 0.854 -10.000 0.079 NA   NA
 3661707 3661708 C8J_1450 C8J_1451     TRUE 0.891 -3.000 0.154 NA   NA
 3661708 3661709 C8J_1451 C8J_1452   hsdM TRUE 0.696 145.000 0.042 0.035 Y NA
 3661710 3661711 C8J_1453 C8J_1454     FALSE 0.305 108.000 0.150 NA   NA
 3661711 3661712 C8J_1454 C8J_1455     FALSE 0.575 58.000 0.200 1.000   NA
 3661713 3661714 C8J_1456 C8J_1457   arsR TRUE 0.845 10.000 0.057 NA   NA
 3661714 3661715 C8J_1457 C8J_1458 arsR arsC TRUE 0.800 -3.000 0.034 1.000 N NA
 3661715 3661716 C8J_1458 C8J_1459 arsC   TRUE 0.895 -6.000 0.125 1.000 N NA
 3661719 3661720 C8J_1462 C8J_1463 pflA nuoN FALSE 0.499 23.000 0.020 1.000   NA
 3661720 3661721 C8J_1463 C8J_1464 nuoN nuoM TRUE 0.989 -10.000 0.024 0.002 Y NA
 3661721 3661722 C8J_1464 C8J_1465 nuoM nuoL TRUE 0.996 2.000 0.056 0.002 Y NA
 3661722 3661723 C8J_1465 C8J_1466 nuoL nuoK TRUE 0.994 2.000 0.056 0.009 Y NA
 3661723 3661724 C8J_1466 C8J_1467 nuoK nuoJ TRUE 0.990 -3.000 0.064 0.004 Y NA
 3661724 3661725 C8J_1467 C8J_1468 nuoJ nuoI TRUE 0.995 -3.000 0.442 0.009 Y NA
 3661725 3661726 C8J_1468 C8J_1469 nuoI nuoH TRUE 0.996 10.000 0.500 0.009 Y NA
 3661726 3661727 C8J_1469 C8J_1470 nuoH nuoG TRUE 0.989 -7.000 0.065 0.009 Y NA
 3661727 3661728 C8J_1470 C8J_1471 nuoG   TRUE 0.991 -3.000 0.444 0.009   NA
 3661728 3661729 C8J_1471 C8J_1472     TRUE 0.991 -3.000 0.464 0.009   NA
 3661729 3661730 C8J_1472 C8J_1473   nuoD TRUE 0.993 -3.000 0.650 0.009   NA
 3661730 3661731 C8J_1473 C8J_1474 nuoD nuoC TRUE 0.998 2.000 0.650 0.009 Y NA
 3661731 3661732 C8J_1474 C8J_1475 nuoC nuoB TRUE 0.998 0.000 0.703 0.004 Y NA
 3661732 3661733 C8J_1475 C8J_1476 nuoB nuoA TRUE 0.997 -18.000 0.571 0.004 Y NA
 3661733 3661734 C8J_1476 C8J_1477 nuoA   FALSE 0.209 113.000 0.053 1.000 N NA
 3661734 3661735 C8J_1477 C8J_1478     TRUE 0.985 -7.000 0.039 0.017 Y NA
 3661735 3661736 C8J_1478 C8J_1479     TRUE 0.861 39.000 0.278 1.000 Y NA
 3661736 3661737 C8J_1479 C8J_1480     TRUE 0.995 -7.000 0.647 0.035 Y NA
 3661737 3661738 C8J_1480 C8J_1481     TRUE 0.995 0.000 0.412 0.035 Y NA
 3661739 3661740 C8J_1482 C8J_1483     TRUE 0.928 12.000 0.000 0.023   NA
 3661740 3661741 C8J_1483 C8J_1484     TRUE 0.642 11.000 0.000 1.000   NA
 3661741 3661742 C8J_1484 C8J_1485     TRUE 0.962 -13.000 0.667 1.000   NA
 3661742 3661743 C8J_1485 C8J_1486     TRUE 0.973 0.000 0.667 1.000   NA
 3661743 3661744 C8J_1486 C8J_1487     FALSE 0.182 67.000 0.000 1.000   NA
 3661745 3661746 C8J_1488 C8J_1490     TRUE 0.789 50.000 0.043 0.060 N NA
 3661747 3661748 C8J_1491 C8J_1492   infA FALSE 0.111 88.000 0.002 1.000   NA
 3661748 3661749 C8J_1492 C8J_1493 infA   FALSE 0.254 172.000 0.104 1.000   NA
 3661749 3661750 C8J_1493 C8J_1494   rpsM TRUE 0.992 3.000 0.194 0.024   NA
 3661750 3661751 C8J_1494 C8J_1495 rpsM   TRUE 0.997 10.000 0.810 0.024 Y NA
 3661751 3661752 C8J_1495 C8J_1496   rpsD TRUE 0.982 28.000 0.509 0.032 Y NA
 3661752 3661753 C8J_1496 C8J_1497 rpsD rpoA TRUE 0.928 13.000 0.549 1.000 N NA
 3661753 3661754 C8J_1497 C8J_1498 rpoA rplQ TRUE 0.985 4.000 0.873 1.000 N NA
 3661754 3661755 C8J_1498 C8J_1499 rplQ hisG FALSE 0.084 174.000 0.004 1.000 N NA
 3661755 3661756 C8J_1499 C8J_1500 hisG hisD TRUE 0.996 8.000 0.171 0.007 Y NA
 3661756 3661757 C8J_1500 C8J_1501 hisD hisB TRUE 0.979 -3.000 0.010 0.007 Y NA
 3661757 3661758 C8J_1501 C8J_1502 hisB hisH TRUE 0.992 -3.000 0.128 0.007 Y NA
 3661758 3661759 C8J_1502 C8J_1503 hisH hisA TRUE 0.994 -3.000 0.210 0.007 Y NA
 3661759 3661760 C8J_1503 C8J_1504 hisA hisF TRUE 0.996 -18.000 0.433 0.007 Y NA
 3661760 3661761 C8J_1504 C8J_1505 hisF hisI TRUE 0.998 2.000 0.430 0.007 Y NA
 3661762 3661763 C8J_1506 C8J_1507 dapD mrp FALSE 0.575 26.000 0.036 1.000 N NA
 3661764 3661765 C8J_1508 C8J_1509     TRUE 0.771 -3.000 0.027 1.000 N NA
 3661765 3661766 C8J_1509 C8J_1510     TRUE 0.760 -22.000 0.025 1.000 N NA
 3661766 3661767 C8J_1510 C8J_1511   pgpA TRUE 0.901 5.000 0.052 1.000 N NA
 3661767 3661768 C8J_1511 C8J_1512 pgpA rpsT FALSE 0.130 79.000 0.004 1.000 N NA
 3661768 3661769 C8J_1512 C8J_1513 rpsT prfA TRUE 0.790 19.000 0.029 1.000 Y NA
 3661771 3661772 C8J_1515 C8J_1516 chuA chuB TRUE 0.991 -46.000 0.250 0.035 Y NA
 3661772 3661773 C8J_1516 C8J_1517 chuB chuC TRUE 0.973 0.000 0.226 1.000 Y NA
 3661773 3661774 C8J_1517 C8J_1518 chuC chuD TRUE 0.941 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 3661778 3661779 C8J_1522 C8J_t0032     FALSE 0.140 72.000 0.000 NA   NA
 3661779 3661780 C8J_t0032 C8J_t0033     TRUE 0.681 10.000 0.000 NA   NA
 3661780 3661781 C8J_t0033 C8J_t0034     FALSE 0.441 19.000 0.000 NA   NA
 3661781 3661782 C8J_t0034 C8J_t0035     FALSE 0.413 22.000 0.000 NA   NA
 3661782 3661783 C8J_t0035 C8J_1523     FALSE 0.183 60.000 0.000 NA   NA
 3661783 3661784 C8J_1523 C8J_1524   ribD FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 3661784 3661785 C8J_1524 C8J_1525 ribD   TRUE 0.618 -19.000 0.005 NA   NA
 3661786 3661787 C8J_1526 C8J_1527 sdaA sdaC TRUE 0.902 15.000 0.133 1.000 Y NA
 3661787 3661788 C8J_1527 C8J_1528 sdaC   FALSE 0.083 260.000 0.000 NA   NA
 3661788 3661789 C8J_1528 C8J_1529     TRUE 0.616 65.000 0.400 NA   NA
 3661790 3661791 C8J_1530 C8J_1531 exbB2 exbD TRUE 0.996 -7.000 0.815 0.041 Y NA
 3661791 3661792 C8J_1531 C8J_1532 exbD tonB2 TRUE 0.972 -3.000 0.148 0.077 N NA
 3661793 3661794 C8J_1533 C8J_1534     TRUE 0.977 4.000 0.600 NA   NA
 3661796 3661797 C8J_1536 C8J_1537 aroC rnc TRUE 0.847 0.000 0.030 1.000 N NA
 3661797 3661798 C8J_1537 C8J_1538 rnc rnhA TRUE 0.802 -13.000 0.032 1.000 N NA
 3661798 3661799 C8J_1538 C8J_1539 rnhA   TRUE 0.685 -13.000 0.009 1.000   NA
 3661800 3661801 C8J_1540 C8J_1541 dnaG   FALSE 0.135 82.000 0.011 1.000 N NA
 3661801 3661802 C8J_1541 C8J_1542     TRUE 0.884 -13.000 0.107 1.000   NA
 3661802 3661803 C8J_1542 C8J_1543   murE TRUE 0.844 -16.000 0.057 1.000   NA
 3661803 3661804 C8J_1543 C8J_1544 murE   TRUE 0.769 4.000 0.006 NA   NA
 3661804 3661805 C8J_1544 C8J_1545     TRUE 0.636 -3.000 0.010 NA   NA
 3661805 3661806 C8J_1545 C8J_1546   ispA TRUE 0.903 -3.000 0.167 1.000   NA
 3661806 3661807 C8J_1546 C8J_1547 ispA tkt TRUE 0.948 10.000 0.375 1.000 N NA
 3661807 3661808 C8J_1547 C8J_1548 tkt   TRUE 0.943 2.000 0.132 NA N NA
 3661808 3661809 C8J_1548 C8J_1549     TRUE 0.992 1.000 0.912 NA Y NA
 3661809 3661810 C8J_1549 C8J_1550     TRUE 0.993 3.000 0.912 NA Y NA
 3661810 3661811 C8J_1550 C8J_1551     TRUE 0.912 0.000 0.120 NA   NA
 3661811 3661812 C8J_1551 C8J_1552     FALSE 0.294 56.000 0.027 NA   NA
 3661813 3661814 C8J_1553 C8J_1554 map murI TRUE 0.691 10.000 0.005 1.000 N NA
 3661814 3661815 C8J_1554 C8J_1555 murI nlpC TRUE 0.916 2.000 0.005 NA Y NA
 3661815 3661816 C8J_1555 C8J_1556 nlpC nhaA-1 TRUE 0.937 9.000 0.211 NA N NA
 3661816 3661817 C8J_1556 C8J_1557 nhaA-1 nhaA1 TRUE 0.997 -3.000 0.571 0.004 Y NA
 3661817 3661818 C8J_1557 C8J_1558 nhaA1   FALSE 0.492 160.000 0.600 NA   NA
 3661819 3661820 C8J_1559 C8J_1560     FALSE 0.084 350.000 0.000 NA   NA
 3661820 3661821 C8J_1560 C8J_1561   p19 TRUE 0.956 -3.000 0.238 NA Y NA
 3661821 3661822 C8J_1561 C8J_1562 p19   FALSE 0.512 82.000 0.386 NA   NA
 3661822 3661823 C8J_1562 C8J_1563     TRUE 0.961 -10.000 0.625 1.000   NA
 3661823 3661824 C8J_1563 C8J_1564     TRUE 0.992 -10.000 0.878 0.076 N NA
 3661824 3661825 C8J_1564 C8J_1565     TRUE 0.936 0.000 0.175 1.000 N NA
 3661825 3661826 C8J_1565 C8J_1566     TRUE 0.622 33.000 0.078 1.000   NA
 3661826 3661827 C8J_1566 C8J_1567     TRUE 0.988 -39.000 0.147 0.003   NA
 3661828 3661829 C8J_1568 C8J_1569     FALSE 0.083 280.000 0.000 NA   NA
 3661829 3661830 C8J_1569 C8J_t0036     FALSE 0.081 175.000 0.000 NA   NA
 3661830 3661831 C8J_t0036 C8J_t0037     TRUE 0.760 6.000 0.000 NA   NA
 3661831 3661832 C8J_t0037 C8J_t0038     FALSE 0.488 15.000 0.000 NA   NA
 3661832 3661833 C8J_t0038 C8J_t0039     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 3661833 3661834 C8J_t0039 C8J_t0040     FALSE 0.382 25.000 0.000 NA   NA
 3661834 3661835 C8J_t0040 C8J_1570     FALSE 0.277 43.000 0.000 NA   NA
 3661835 3661836 C8J_1570 C8J_1571     TRUE 0.810 0.000 0.026 NA   NA
 3661836 3661837 C8J_1571 C8J_1572     TRUE 0.965 -10.000 0.788 NA   NA
 3661837 3661838 C8J_1572 C8J_1573   eno FALSE 0.365 66.000 0.080 NA   NA
 3661838 3661839 C8J_1573 C8J_1574 eno recA TRUE 0.857 0.000 0.033 1.000 N NA
 3661840 3661841 C8J_1575 C8J_1576   fliQ TRUE 0.780 12.000 0.068 NA   NA
 3661841 3661842 C8J_1576 C8J_1577 fliQ murB TRUE 0.850 -3.000 0.066 1.000 N NA
 3661843 3661844 C8J_1578 C8J_1579   cysQ FALSE 0.418 46.000 0.039 NA   NA
 3661844 3661845 C8J_1579 C8J_1580 cysQ gltA FALSE 0.178 81.000 0.022 1.000 N NA
 3661845 3661846 C8J_1580 C8J_1581 gltA   FALSE 0.122 115.000 0.019 1.000 N NA
 3661846 3661847 C8J_1581 C8J_1582   bioB TRUE 0.718 -19.000 0.017 1.000 N NA
 3661847 3661848 C8J_1582 C8J_1583 bioB topA TRUE 0.821 2.000 0.009 1.000 N NA
 3661849 3661850 C8J_1584 C8J_1585     TRUE 0.686 83.000 0.000 0.034 Y NA
 3661850 3661851 C8J_1585 C8J_1586     TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.034 Y NA
 3661851 3661852 C8J_1586 C8J_1587     TRUE 0.985 4.000 0.000 0.034 Y NA
 3661852 3661853 C8J_1587 C8J_1588     FALSE 0.168 64.000 0.000 NA   NA
 3661853 3661854 C8J_1588 C8J_1589     TRUE 0.663 -6.000 0.000 NA   NA
 3661854 3661855 C8J_1589 C8J_1590     FALSE 0.601 12.000 0.000 1.000   NA
 3661855 3661856 C8J_1590 C8J_1591     TRUE 0.687 -22.000 0.000 1.000   NA
 3661857 3661858 C8J_1592 C8J_1593 secY rplO TRUE 0.976 0.000 0.730 1.000 N NA
 3661858 3661859 C8J_1593 C8J_1594 rplO rpsE TRUE 0.994 5.000 0.148 0.031 Y NA
 3661859 3661860 C8J_1594 C8J_1595 rpsE rplR TRUE 0.995 12.000 0.814 0.031 Y NA
 3661860 3661861 C8J_1595 C8J_1596 rplR rplF TRUE 0.997 10.000 0.815 0.024 Y NA
 3661861 3661862 C8J_1596 C8J_1597 rplF rpsH TRUE 0.957 79.000 0.808 0.024 Y NA
 3661862 3661863 C8J_1597 C8J_1598 rpsH rpsN TRUE 0.996 10.000 0.473 0.024 Y NA
 3661863 3661864 C8J_1598 C8J_1599 rpsN rplE TRUE 0.998 2.000 0.496 0.024 Y NA
 3661864 3661865 C8J_1599 C8J_1600 rplE rplX TRUE 0.998 4.000 0.758 0.024 Y NA
 3661865 3661866 C8J_1600 C8J_1601 rplX rplN TRUE 0.997 0.000 0.810 0.031 Y NA
 3661866 3661867 C8J_1601 C8J_1602 rplN rpsQ TRUE 0.997 0.000 0.791 0.031 Y NA
 3661867 3661868 C8J_1602 C8J_1603 rpsQ rpmC TRUE 0.994 10.000 0.828 0.024   NA
 3661868 3661869 C8J_1603 C8J_1604 rpmC rplP TRUE 0.994 -13.000 0.802 0.024   NA
 3661869 3661870 C8J_1604 C8J_1605 rplP rpsC TRUE 0.998 3.000 0.828 0.031 Y NA
 3661870 3661871 C8J_1605 C8J_1606 rpsC   TRUE 0.997 0.000 0.719 0.031 Y NA
 3661871 3661872 C8J_1606 C8J_1607   rpsS TRUE 0.995 11.000 0.769 0.031 Y NA
 3661872 3661873 C8J_1607 C8J_1608 rpsS rplB TRUE 0.998 2.000 0.820 0.031 Y NA
 3661873 3661874 C8J_1608 C8J_1609 rplB rplW TRUE 0.993 2.000 0.849 1.000 Y NA
 3661874 3661875 C8J_1609 C8J_1610 rplW rplD TRUE 0.990 3.000 0.513 1.000 Y NA
 3661875 3661876 C8J_1610 C8J_1611 rplD rplC TRUE 0.994 -3.000 0.361 0.024 Y NA
 3661876 3661877 C8J_1611 C8J_1612 rplC rpsJ TRUE 0.995 10.000 0.467 0.031 Y NA
 3661877 3661878 C8J_1612 C8J_1613 rpsJ   FALSE 0.210 198.000 0.003 1.000 Y NA
 3661878 3661879 C8J_1613 C8J_1614     TRUE 0.654 36.000 0.118 1.000   NA
 3661879 3661880 C8J_1614 C8J_1615   ksgA TRUE 0.773 -25.000 0.028 1.000   NA
 3661881 3661882 C8J_1616 C8J_1617     TRUE 0.859 23.000 0.011 0.027   NA
 3661882 3661883 C8J_1617 C8J_1618     TRUE 0.615 -3.000 0.002 NA   NA
 3661883 3661884 C8J_1618 C8J_1619     TRUE 0.771 5.000 0.000 NA   NA
 3661886 3661887 C8J_t0042 C8J_1620     FALSE 0.086 699.000 0.000 NA   NA
 3661887 3661888 C8J_1620 C8J_t0043     FALSE 0.081 140.000 0.000 NA   NA
 3661888 3661889 C8J_t0043 C8J_t0044     TRUE 0.793 4.000 0.000 NA   NA
 3661889 3661890 C8J_t0044 C8J_1621     FALSE 0.363 28.000 0.000 NA   NA
 3661891 3661892 C8J_1622 C8J_1623 leuD leuC TRUE 0.998 2.000 0.309 0.001 Y NA
 3661892 3661893 C8J_1623 C8J_1624 leuC leuB TRUE 0.996 -7.000 0.275 0.002 Y NA
 3661893 3661894 C8J_1624 C8J_1625 leuB leuA TRUE 0.994 -3.000 0.126 0.002 Y NA
 3661896 3661897 C8J_1627 C8J_1628     FALSE 0.084 138.000 0.005 1.000   NA
 3661897 3661898 C8J_1628 C8J_1629     FALSE 0.096 246.000 0.000 1.000   NA
 3661898 3661899 C8J_1629 C8J_1630   ruvC FALSE 0.085 204.000 0.002 1.000 N NA