MicrobesOnline Operon Predictions for Rhodopseudomonas palustris TIE-1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7133523 7133524 Rpal_0001 Rpal_0002 dnaA   TRUE 0.594 234.000 0.328 1.000 Y NA
 7133524 7133525 Rpal_0002 Rpal_0003   recF FALSE 0.538 244.000 0.318 1.000 Y NA
 7133525 7133526 Rpal_0003 Rpal_0004 recF gyrB TRUE 0.784 217.000 0.249 0.003 Y NA
 7133529 7133530 Rpal_0007 Rpal_0008     TRUE 0.960 0.000 0.400 1.000   NA
 7133530 7133531 Rpal_0008 Rpal_0009     TRUE 0.869 10.000 0.059 1.000   NA
 7133531 7133532 Rpal_0009 Rpal_0010     FALSE 0.004 394.000 0.000 1.000 N NA
 7133532 7133533 Rpal_0010 Rpal_0011     TRUE 0.802 140.000 0.800 NA   NA
 7133533 7133534 Rpal_0011 Rpal_0012     TRUE 0.741 139.000 0.600 NA   NA
 7133534 7133535 Rpal_0012 Rpal_0013     TRUE 0.753 2.000 0.010 NA   NA
 7133535 7133536 Rpal_0013 Rpal_0014     TRUE 0.992 0.000 0.713 NA Y NA
 7133536 7133537 Rpal_0014 Rpal_0015     TRUE 0.936 35.000 0.206 NA Y NA
 7133537 7133538 Rpal_0015 Rpal_0016     TRUE 0.763 20.000 0.092 NA N NA
 7133538 7133539 Rpal_0016 Rpal_0017     TRUE 0.760 117.000 0.116 1.000 Y NA
 7133539 7133540 Rpal_0017 Rpal_0018     TRUE 0.961 8.000 0.101 0.002   NA
 7133540 7133541 Rpal_0018 Rpal_0019     TRUE 0.986 10.000 0.500 0.002   NA
 7133541 7133542 Rpal_0019 Rpal_0020     TRUE 0.974 13.000 0.351 0.002 N NA
 7133542 7133543 Rpal_0020 Rpal_0021     FALSE 0.008 311.000 0.000 1.000 N NA
 7133543 7133544 Rpal_0021 Rpal_0022     FALSE 0.164 74.000 0.000 1.000 N NA
 7133544 7133545 Rpal_0022 Rpal_0023     TRUE 0.614 119.000 0.000 1.000 Y NA
 7133547 7133548 Rpal_0025 Rpal_0026     FALSE 0.047 273.000 0.054 1.000 N NA
 7133549 7133550 Rpal_0027 Rpal_0028     FALSE 0.054 215.000 0.000 NA   NA
 7133551 7133552 Rpal_0029 Rpal_0030 purH   FALSE 0.249 186.000 0.068 NA   NA
 7133552 7133553 Rpal_0030 Rpal_0031     FALSE 0.036 299.000 0.071 NA   NA
 7133554 7133555 Rpal_0032 Rpal_0033     FALSE 0.358 86.000 0.062 NA   NA
 7133558 7133559 Rpal_0036 Rpal_0037 pheT   FALSE 0.247 145.000 0.005 1.000   NA
 7133559 7133560 Rpal_0037 Rpal_0038     FALSE 0.077 231.000 0.003 1.000   NA
 7133560 7133561 Rpal_0038 Rpal_0039   rplT TRUE 0.810 144.000 0.202 1.000 Y NA
 7133561 7133562 Rpal_0039 Rpal_0040 rplT rpmI TRUE 0.973 84.000 0.928 0.012 Y NA
 7133562 7133563 Rpal_0040 Rpal_0041 rpmI infC FALSE 0.343 334.000 0.652 1.000 Y NA
 7133565 7133566 Rpal_0043 Rpal_0044     TRUE 0.732 45.000 0.213 1.000 N NA
 7133569 7133570 Rpal_R0001 Rpal_0047     FALSE 0.118 169.000 0.000 NA   NA
 7133570 7133571 Rpal_0047 Rpal_0048     FALSE 0.176 230.000 0.151 NA   NA
 7133571 7133572 Rpal_0048 Rpal_0049     TRUE 0.898 9.000 0.144 NA   NA
 7133572 7133573 Rpal_0049 Rpal_0050     TRUE 0.724 136.000 0.543 NA   NA
 7133573 7133574 Rpal_0050 Rpal_0051     FALSE 0.396 31.000 0.000 NA   NA
 7133574 7133575 Rpal_0051 Rpal_0052     FALSE 0.356 36.000 0.000 NA   NA
 7133575 7133576 Rpal_0052 Rpal_0053     FALSE 0.433 58.000 0.070 NA N NA
 7133576 7133577 Rpal_0053 Rpal_0054     FALSE 0.131 276.000 0.353 NA N NA
 7133578 7133579 Rpal_0055 Rpal_0056     TRUE 0.925 51.000 0.955 NA   NA
 7133579 7133580 Rpal_0056 Rpal_0057   ugpC FALSE 0.257 154.000 0.056 NA N NA
 7133580 7133581 Rpal_0057 Rpal_0058 ugpC   TRUE 0.994 3.000 0.464 0.056 Y NA
 7133581 7133582 Rpal_0058 Rpal_0059     TRUE 0.994 0.000 0.559 0.056 Y NA
 7133582 7133583 Rpal_0059 Rpal_0060     TRUE 0.813 165.000 0.063 0.056 Y NA
 7133583 7133584 Rpal_0060 Rpal_0061     FALSE 0.199 232.000 0.214 1.000 N NA
 7133584 7133585 Rpal_0061 Rpal_0062     TRUE 0.657 46.000 0.130 1.000 N NA
 7133585 7133586 Rpal_0062 Rpal_R0002     FALSE 0.004 401.000 0.000 NA   NA
 7133586 7133587 Rpal_R0002 Rpal_0063     FALSE 0.182 71.000 0.000 NA   NA
 7133590 7133591 Rpal_0066 Rpal_0067 cmk rpsA FALSE 0.083 301.000 0.281 1.000 N NA
 7133591 7133592 Rpal_0067 Rpal_0068 rpsA   FALSE 0.110 229.000 0.057 1.000 N NA
 7133592 7133593 Rpal_0068 Rpal_0069   ihfB FALSE 0.406 166.000 0.142 1.000 N NA
 7133593 7133594 Rpal_0069 Rpal_0070 ihfB   TRUE 0.640 38.000 0.069 NA   NA
 7133594 7133595 Rpal_0070 Rpal_0071     FALSE 0.320 59.000 0.007 NA   NA
 7133595 7133596 Rpal_0071 Rpal_0072     TRUE 0.993 14.000 0.375 0.001 Y NA
 7133596 7133597 Rpal_0072 Rpal_0073   trpA TRUE 0.994 0.000 0.344 0.001 Y NA
 7133597 7133598 Rpal_0073 Rpal_0074 trpA   FALSE 0.506 110.000 0.232 1.000 N NA
 7133598 7133599 Rpal_0074 Rpal_0075     TRUE 0.934 -3.000 0.383 1.000 N NA
 7133600 7133601 Rpal_0076 Rpal_0077     FALSE 0.510 97.000 0.173 1.000   NA
 7133601 7133602 Rpal_0077 Rpal_0078     TRUE 0.991 -3.000 0.863 NA Y NA
 7133602 7133603 Rpal_0078 Rpal_0079     FALSE 0.498 76.000 0.196 NA N NA
 7133603 7133604 Rpal_0079 Rpal_0080     FALSE 0.248 158.000 0.025 NA   NA
 7133604 7133605 Rpal_0080 Rpal_0081     FALSE 0.243 104.000 0.026 NA   NA
 7133605 7133606 Rpal_0081 Rpal_0082     TRUE 0.820 -3.000 0.085 NA   NA
 7133606 7133607 Rpal_0082 Rpal_0083   dut FALSE 0.070 220.000 0.005 1.000 N NA
 7133607 7133608 Rpal_0083 Rpal_0084 dut   TRUE 0.880 -3.000 0.201 1.000 N NA
 7133608 7133609 Rpal_0084 Rpal_0085     FALSE 0.489 54.000 0.025 1.000   NA
 7133609 7133610 Rpal_0085 Rpal_0086   ubiE TRUE 0.866 -3.000 0.115 1.000   NA
 7133613 7133614 Rpal_0089 Rpal_0090     FALSE 0.060 125.000 0.000 NA N NA
 7133615 7133616 Rpal_0091 Rpal_0092     FALSE 0.256 53.000 0.000 NA   NA
 7133616 7133617 Rpal_0092 Rpal_0093     FALSE 0.127 129.000 0.000 NA   NA
 7133617 7133618 Rpal_0093 Rpal_0094     FALSE 0.031 239.000 0.000 NA   NA
 7133618 7133619 Rpal_0094 Rpal_0095     TRUE 0.872 79.000 1.000 NA   NA
 7133619 7133620 Rpal_0095 Rpal_0096     FALSE 0.002 541.000 0.000 NA   NA
 7133621 7133622 Rpal_0097 Rpal_0098     TRUE 0.902 -3.000 0.250 NA   NA
 7133622 7133623 Rpal_0098 Rpal_0099     TRUE 0.735 49.000 0.231 NA   NA
 7133623 7133624 Rpal_0099 Rpal_0100     TRUE 0.928 4.000 0.231 1.000 N NA
 7133624 7133625 Rpal_0100 Rpal_0101     FALSE 0.121 139.000 0.000 1.000 N NA
 7133626 7133627 Rpal_0102 Rpal_0103     TRUE 0.992 -3.000 0.444 0.002 Y NA
 7133627 7133628 Rpal_0103 Rpal_0104     TRUE 0.995 3.000 0.889 1.000 Y NA
 7133628 7133629 Rpal_0104 Rpal_0105     TRUE 0.995 -3.000 0.889 0.056 Y NA
 7133629 7133630 Rpal_0105 Rpal_0106     TRUE 0.992 29.000 0.889 0.056 Y NA
 7133630 7133631 Rpal_0106 Rpal_0107     FALSE 0.456 90.000 0.143 NA   NA
 7133631 7133632 Rpal_0107 Rpal_0108     TRUE 0.856 -3.000 0.143 NA   NA
 7133634 7133635 Rpal_0110 Rpal_0111     TRUE 0.910 20.000 0.000 NA Y NA
 7133635 7133636 Rpal_0111 Rpal_0112     TRUE 0.887 30.000 0.000 1.000 Y NA
 7133636 7133637 Rpal_0112 Rpal_0113     FALSE 0.304 41.000 0.000 1.000 N NA
 7133639 7133640 Rpal_0115 Rpal_0116     TRUE 0.966 9.000 0.444 1.000   NA
 7133641 7133642 Rpal_0117 Rpal_0118     TRUE 0.906 -3.000 0.259 NA   NA
 7133644 7133645 Rpal_0120 Rpal_0121     TRUE 0.934 26.000 0.048 1.000 Y NA
 7133645 7133646 Rpal_0121 Rpal_0122     TRUE 0.965 5.000 0.029 1.000 Y NA
 7133646 7133647 Rpal_0122 Rpal_0123     TRUE 0.995 2.000 0.500 0.004 Y NA
 7133647 7133648 Rpal_0123 Rpal_0124     FALSE 0.145 88.000 0.000 NA   NA
 7133648 7133649 Rpal_0124 Rpal_0125     FALSE 0.138 93.000 0.000 NA   NA
 7133649 7133650 Rpal_0125 Rpal_0126     TRUE 0.771 -7.000 0.080 1.000 N NA
 7133651 7133652 Rpal_0127 Rpal_0128     TRUE 0.963 -3.000 0.308 0.018   NA
 7133652 7133653 Rpal_0128 Rpal_0129     TRUE 0.832 65.000 0.538 1.000   NA
 7133653 7133654 Rpal_0129 Rpal_0130     TRUE 0.993 23.000 0.800 0.056 Y NA
 7133654 7133655 Rpal_0130 Rpal_0131     TRUE 0.994 -3.000 0.778 0.056 Y NA
 7133655 7133656 Rpal_0131 Rpal_0132     TRUE 0.986 -7.000 0.381 0.056 Y NA
 7133658 7133659 Rpal_0134 Rpal_0135     TRUE 0.799 -3.000 0.071 1.000 N NA
 7133659 7133660 Rpal_0135 Rpal_0136     TRUE 0.984 -10.000 0.643 NA Y NA
 7133660 7133661 Rpal_0136 Rpal_0137     TRUE 0.822 16.000 0.080 NA   NA
 7133661 7133662 Rpal_0137 Rpal_0138     TRUE 0.964 5.000 0.185 0.016   NA
 7133662 7133663 Rpal_0138 Rpal_0139     FALSE 0.115 170.000 0.000 NA   NA
 7133663 7133664 Rpal_0139 Rpal_0140     TRUE 0.906 5.000 0.157 NA   NA
 7133664 7133665 Rpal_0140 Rpal_0141     TRUE 0.988 21.000 0.672 1.000 Y NA
 7133665 7133666 Rpal_0141 Rpal_0142     TRUE 0.631 161.000 0.000 1.000 Y NA
 7133666 7133667 Rpal_0142 Rpal_0143     TRUE 0.903 67.000 0.087 0.014 Y NA
 7133667 7133668 Rpal_0143 Rpal_0144     TRUE 0.922 61.000 0.130 0.014 Y NA
 7133668 7133669 Rpal_0144 Rpal_0145     TRUE 0.996 0.000 0.808 0.014 Y NA
 7133669 7133670 Rpal_0145 Rpal_0146     TRUE 0.988 -3.000 0.615 1.000 Y NA
 7133670 7133671 Rpal_0146 Rpal_0147     TRUE 0.915 0.000 0.212 NA   NA
 7133673 7133674 Rpal_0149 Rpal_R0003     FALSE 0.043 225.000 0.000 NA   NA
 7133674 7133675 Rpal_R0003 Rpal_0150     FALSE 0.134 153.000 0.000 NA   NA
 7133676 7133677 Rpal_0151 Rpal_0152 rplU rpmA TRUE 0.961 90.000 0.667 0.012 Y NA
 7133677 7133678 Rpal_0152 Rpal_0153 rpmA   TRUE 0.703 135.000 0.035 1.000 Y NA
 7133678 7133679 Rpal_0153 Rpal_0154     FALSE 0.058 212.000 0.000 NA   NA
 7133679 7133680 Rpal_0154 Rpal_0155     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 7133682 7133683 Rpal_0157 Rpal_0158 obgE   FALSE 0.415 139.000 0.087 1.000   NA
 7133683 7133684 Rpal_0158 Rpal_0159   proA TRUE 0.753 204.000 0.065 0.001 Y NA
 7133684 7133685 Rpal_0159 Rpal_0160 proA nadD TRUE 0.823 25.000 0.170 1.000 N NA
 7133685 7133686 Rpal_0160 Rpal_0161 nadD   FALSE 0.279 215.000 0.221 NA   NA
 7133686 7133687 Rpal_0161 Rpal_0162     TRUE 0.613 90.000 0.307 NA   NA
 7133687 7133688 Rpal_0162 Rpal_0163     TRUE 0.774 20.000 0.067 NA   NA
 7133688 7133689 Rpal_0163 Rpal_0164     TRUE 0.966 -3.000 0.408 0.026 N NA
 7133689 7133690 Rpal_0164 Rpal_0165     TRUE 0.545 151.000 0.210 1.000   NA
 7133690 7133691 Rpal_0165 Rpal_0166     TRUE 0.727 39.000 0.109 1.000   NA
 7133693 7133694 Rpal_0168 Rpal_0169     TRUE 0.659 -3.000 0.010 1.000 N NA
 7133695 7133696 Rpal_0170 Rpal_0171 atpC   TRUE 0.965 114.000 0.837 0.005 Y NA
 7133696 7133697 Rpal_0171 Rpal_0172     TRUE 0.973 72.000 0.724 0.005 Y NA
 7133697 7133698 Rpal_0172 Rpal_0173     TRUE 0.967 144.000 0.846 0.005 Y NA
 7133698 7133699 Rpal_0173 Rpal_0174     TRUE 0.997 0.000 0.864 0.005 Y NA
 7133702 7133703 Rpal_0177 Rpal_0178 xerC   FALSE 0.228 141.000 0.020 NA   NA
 7133704 7133705 Rpal_0179 Rpal_0180     FALSE 0.494 40.000 0.021 NA   NA
 7133705 7133706 Rpal_0180 Rpal_0181     TRUE 0.561 32.000 0.023 1.000 N NA
 7133706 7133707 Rpal_0181 Rpal_0182     TRUE 0.908 8.000 0.172 NA   NA
 7133707 7133708 Rpal_0182 Rpal_0183     FALSE 0.348 59.000 0.014 NA   NA
 7133708 7133709 Rpal_0183 Rpal_0184   sucA TRUE 0.922 105.000 0.667 1.000 Y NA
 7133709 7133710 Rpal_0184 Rpal_0185 sucA   TRUE 0.756 128.000 0.092 1.000 Y NA
 7133710 7133711 Rpal_0185 Rpal_0186   sucC TRUE 0.949 65.000 0.256 0.001 Y NA
 7133711 7133712 Rpal_0186 Rpal_0187 sucC   TRUE 0.780 96.000 0.113 1.000 Y NA
 7133712 7133713 Rpal_0187 Rpal_0188     FALSE 0.259 146.000 0.032 NA   NA
 7133713 7133714 Rpal_0188 Rpal_0189     FALSE 0.270 83.000 0.021 NA   NA
 7133714 7133715 Rpal_0189 Rpal_0190     FALSE 0.194 206.000 0.077 1.000 N NA
 7133716 7133717 Rpal_0191 Rpal_0192     TRUE 0.992 4.000 0.626 NA Y NA
 7133717 7133718 Rpal_0192 Rpal_0193     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 7133718 7133719 Rpal_0193 Rpal_0194     FALSE 0.458 -1594.000 0.000 NA   NA
 7133719 7133720 Rpal_0194 Rpal_0195     FALSE 0.415 29.000 0.000 NA   NA
 7133720 7133721 Rpal_0195 Rpal_0196     FALSE 0.001 600.000 0.000 NA N NA
 7133722 7133723 Rpal_0197 Rpal_0198     FALSE 0.004 404.000 0.000 NA   NA
 7133723 7133724 Rpal_0198 Rpal_0199     FALSE 0.255 167.000 0.038 NA   NA
 7133725 7133726 Rpal_0200 Rpal_0201     TRUE 0.993 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 7133726 7133727 Rpal_0201 Rpal_0202     TRUE 0.956 93.000 0.501 0.001 Y NA
 7133727 7133728 Rpal_0202 Rpal_0203     TRUE 0.969 0.000 0.501 1.000   NA
 7133728 7133729 Rpal_0203 Rpal_0204     TRUE 0.888 17.000 0.172 1.000   NA
 7133729 7133730 Rpal_0204 Rpal_0205     FALSE 0.127 140.000 0.000 NA   NA
 7133731 7133732 Rpal_0206 Rpal_0207     TRUE 0.764 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7133733 7133734 Rpal_0208 Rpal_0209     FALSE 0.008 364.000 0.000 1.000   NA
 7133734 7133735 Rpal_0209 Rpal_0210     FALSE 0.004 383.000 0.000 NA   NA
 7133738 7133739 Rpal_0213 Rpal_0214     TRUE 0.906 0.000 0.188 NA   NA
 7133739 7133740 Rpal_0214 Rpal_0215   sdhB FALSE 0.069 237.000 0.006 1.000   NA
 7133740 7133741 Rpal_0215 Rpal_0216 sdhB sdhA TRUE 0.957 108.000 0.604 0.001 Y NA
 7133741 7133742 Rpal_0216 Rpal_0217 sdhA   TRUE 0.997 4.000 0.705 0.001 Y NA
 7133742 7133743 Rpal_0217 Rpal_0218     TRUE 0.990 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 7133746 7133747 Rpal_0221 Rpal_0222     FALSE 0.043 222.000 0.000 1.000 N NA
 7133747 7133748 Rpal_0222 Rpal_0223     TRUE 0.794 116.000 0.476 0.078   NA
 7133748 7133749 Rpal_0223 Rpal_0224     FALSE 0.051 273.000 0.035 1.000   NA
 7133752 7133753 Rpal_0227 Rpal_0228     FALSE 0.129 144.000 0.000 NA   NA
 7133754 7133755 Rpal_0229 Rpal_0230     FALSE 0.188 136.000 0.005 NA   NA
 7133758 7133759 Rpal_0233 Rpal_0234   leuD FALSE 0.001 750.000 0.000 1.000 N NA
 7133759 7133760 Rpal_0234 Rpal_0235 leuD   FALSE 0.437 86.000 0.112 NA   NA
 7133761 7133762 Rpal_0236 Rpal_0237     FALSE 0.037 232.000 0.000 NA   NA
 7133762 7133763 Rpal_0237 Rpal_0238     TRUE 0.661 111.000 0.429 NA   NA
 7133763 7133764 Rpal_0238 Rpal_0239     TRUE 0.659 121.000 0.429 NA   NA
 7133765 7133766 Rpal_0240 Rpal_0241     FALSE 0.288 77.000 0.022 NA   NA
 7133766 7133767 Rpal_0241 Rpal_0242   rplS FALSE 0.171 120.000 0.002 NA   NA
 7133767 7133768 Rpal_0242 Rpal_0243 rplS   TRUE 0.904 114.000 0.567 1.000 Y NA
 7133768 7133769 Rpal_0243 Rpal_0244   rimM TRUE 0.924 143.000 0.672 1.000 Y NA
 7133769 7133770 Rpal_0244 Rpal_0245 rimM rpsP TRUE 0.992 13.000 0.342 0.012 Y NA
 7133770 7133771 Rpal_0245 Rpal_0246 rpsP   TRUE 0.596 170.000 0.361 1.000 N NA
 7133772 7133773 Rpal_0247 Rpal_0248     FALSE 0.042 226.000 0.000 NA   NA
 7133774 7133775 Rpal_0249 Rpal_0250     TRUE 0.897 -3.000 0.235 NA   NA
 7133776 7133777 Rpal_0251 Rpal_0252 dapF   TRUE 0.875 0.000 0.109 1.000 N NA
 7133778 7133779 Rpal_0253 Rpal_0254     FALSE 0.150 186.000 0.012 NA   NA
 7133779 7133780 Rpal_0254 Rpal_0255   gpsA TRUE 0.826 3.000 0.042 NA   NA
 7133780 7133781 Rpal_0255 Rpal_0256 gpsA   TRUE 0.650 36.000 0.070 1.000 N NA
 7133782 7133783 Rpal_0257 Rpal_0258     FALSE 0.453 52.000 0.032 NA   NA
 7133783 7133784 Rpal_0258 Rpal_0259     TRUE 0.852 9.000 0.067 NA   NA
 7133784 7133785 Rpal_0259 Rpal_R0004     FALSE 0.132 159.000 0.000 NA   NA
 7133787 7133788 Rpal_0261 Rpal_0262     FALSE 0.109 174.000 0.000 NA   NA
 7133789 7133790 Rpal_0263 Rpal_0264     FALSE 0.478 115.000 0.212 NA   NA
 7133792 7133793 Rpal_0266 Rpal_0267     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7133793 7133794 Rpal_0267 Rpal_R0005     FALSE 0.064 205.000 0.000 NA   NA
 7133795 7133796 Rpal_0268 Rpal_0269     TRUE 0.864 27.000 0.222 1.000   NA
 7133796 7133797 Rpal_0269 Rpal_0270     FALSE 0.463 90.000 0.148 NA   NA
 7133801 7133802 Rpal_0274 Rpal_0275     FALSE 0.123 146.000 0.000 1.000 N NA
 7133802 7133803 Rpal_0275 Rpal_0276     FALSE 0.452 75.000 0.095 1.000 N NA
 7133803 7133804 Rpal_0276 Rpal_0277     FALSE 0.009 310.000 0.000 1.000 N NA
 7133804 7133805 Rpal_0277 Rpal_0278     TRUE 0.756 38.000 0.197 1.000 N NA
 7133805 7133806 Rpal_0278 Rpal_0279     FALSE 0.272 119.000 0.020 1.000   NA
 7133806 7133807 Rpal_0279 Rpal_0280     TRUE 0.799 102.000 0.778 NA   NA
 7133807 7133808 Rpal_0280 Rpal_0281     FALSE 0.228 123.000 0.023 NA   NA
 7133808 7133809 Rpal_0281 Rpal_0282     TRUE 0.835 14.000 0.081 1.000 N NA
 7133809 7133810 Rpal_0282 Rpal_0283     TRUE 0.724 18.000 0.035 1.000 N NA
 7133810 7133811 Rpal_0283 Rpal_0284     FALSE 0.041 289.000 0.068 1.000 N NA
 7133812 7133813 Rpal_0285 Rpal_0286     TRUE 0.937 40.000 0.261 NA Y NA
 7133816 7133817 Rpal_0289 Rpal_0290   leuS FALSE 0.059 206.000 0.000 1.000 N NA
 7133817 7133818 Rpal_0290 Rpal_0291 leuS   TRUE 0.780 -13.000 0.090 NA   NA
 7133818 7133819 Rpal_0291 Rpal_0292   holA TRUE 0.559 57.000 0.097 NA   NA
 7133820 7133821 Rpal_0293 Rpal_0294     TRUE 0.781 173.000 0.827 1.000 N NA
 7133821 7133822 Rpal_0294 Rpal_0295   gidB TRUE 0.889 28.000 0.339 1.000 N NA
 7133822 7133823 Rpal_0295 Rpal_0296 gidB   TRUE 0.651 173.000 0.466 1.000 N NA
 7133823 7133824 Rpal_0296 Rpal_0297   trmE TRUE 0.576 166.000 0.266 1.000   NA
 7133824 7133825 Rpal_0297 Rpal_0298 trmE rho FALSE 0.379 88.000 0.050 1.000   NA
 7133825 7133826 Rpal_0298 Rpal_0299 rho   FALSE 0.044 260.000 0.024 NA   NA
 7133827 7133828 Rpal_0300 Rpal_0301     TRUE 0.852 -3.000 0.135 NA   NA
 7133828 7133829 Rpal_0301 Rpal_0302   coaE FALSE 0.147 97.000 0.011 NA N NA
 7133829 7133830 Rpal_0302 Rpal_0303 coaE   TRUE 0.687 36.000 0.092 1.000 N NA
 7133832 7133833 Rpal_0305 Rpal_0306     TRUE 0.912 -22.000 0.324 1.000   NA
 7133833 7133834 Rpal_0306 Rpal_0307     TRUE 0.949 6.000 0.332 NA   NA
 7133835 7133836 Rpal_0308 Rpal_0309 hslU   FALSE 0.426 42.000 0.007 NA   NA
 7133836 7133837 Rpal_0309 Rpal_0310     TRUE 0.653 -3.000 0.005 NA   NA
 7133838 7133839 Rpal_0311 Rpal_0312 hisB   TRUE 0.661 28.000 0.041 NA   NA
 7133839 7133840 Rpal_0312 Rpal_0313   hisH TRUE 0.941 -3.000 0.417 NA   NA
 7133840 7133841 Rpal_0313 Rpal_0314 hisH   TRUE 0.979 -3.000 0.070 0.004 Y NA
 7133841 7133842 Rpal_0314 Rpal_0315     TRUE 0.994 11.000 0.433 0.004 Y NA
 7133842 7133843 Rpal_0315 Rpal_0316   hisE TRUE 0.939 54.000 0.105 0.004 Y NA
 7133843 7133844 Rpal_0316 Rpal_0317 hisE   FALSE 0.439 75.000 0.086 1.000 N NA
 7133845 7133846 Rpal_0318 Rpal_0319     FALSE 0.416 161.000 0.130 NA   NA
 7133846 7133847 Rpal_0319 Rpal_0320     FALSE 0.173 127.000 0.004 1.000 N NA
 7133847 7133848 Rpal_0320 Rpal_0321     FALSE 0.194 100.000 0.005 NA   NA
 7133848 7133849 Rpal_0321 Rpal_0322     TRUE 0.895 -3.000 0.231 NA   NA
 7133849 7133850 Rpal_0322 Rpal_0323     TRUE 0.553 86.000 0.231 1.000 N NA
 7133850 7133851 Rpal_0323 Rpal_0324     FALSE 0.048 237.000 0.005 1.000 N NA
 7133851 7133852 Rpal_0324 Rpal_0325     FALSE 0.403 73.000 0.064 1.000 N NA
 7133852 7133853 Rpal_0325 Rpal_0326     TRUE 0.853 -13.000 0.165 1.000   NA
 7133857 7133858 Rpal_0330 Rpal_0331     TRUE 0.856 -10.000 0.218 1.000 N NA
 7133858 7133859 Rpal_0331 Rpal_0332   rph TRUE 0.742 52.000 0.262 1.000 N NA
 7133860 7133861 Rpal_0333 Rpal_0334 hrcA   FALSE 0.424 91.000 0.120 1.000 N NA
 7133863 7133864 Rpal_0336 Rpal_0337 dnaK   TRUE 0.795 215.000 0.236 0.002 Y NA
 7133864 7133865 Rpal_0337 Rpal_0338     FALSE 0.320 94.000 0.057 1.000 N NA
 7133865 7133866 Rpal_0338 Rpal_0339     FALSE 0.491 102.000 0.208 NA   NA
 7133866 7133867 Rpal_0339 Rpal_0340     TRUE 0.759 8.000 0.012 NA   NA
 7133867 7133868 Rpal_0340 Rpal_0341     TRUE 0.686 26.000 0.044 NA   NA
 7133868 7133869 Rpal_0341 Rpal_0342     FALSE 0.209 97.000 0.010 NA   NA
 7133870 7133871 Rpal_0343 Rpal_0344     FALSE 0.193 92.000 0.004 1.000 N NA
 7133871 7133872 Rpal_0344 Rpal_0345     TRUE 0.868 15.000 0.142 NA   NA
 7133874 7133875 Rpal_0347 Rpal_0348     FALSE 0.120 129.000 0.000 1.000 N NA
 7133875 7133876 Rpal_0348 Rpal_0349     FALSE 0.002 574.000 0.000 1.000 N NA
 7133876 7133877 Rpal_0349 Rpal_0350   aceK FALSE 0.211 88.000 0.007 1.000 N NA
 7133877 7133878 Rpal_0350 Rpal_0351 aceK   FALSE 0.007 336.000 0.000 NA   NA
 7133879 7133880 Rpal_0352 Rpal_0353     TRUE 0.968 -3.000 0.024 0.046 Y NA
 7133880 7133881 Rpal_0353 Rpal_0354     TRUE 0.792 5.000 0.024 NA   NA
 7133884 7133885 Rpal_0357 Rpal_0358     TRUE 0.993 -3.000 0.420 0.001 Y NA
 7133885 7133886 Rpal_0358 Rpal_0359     FALSE 0.365 188.000 0.145 1.000   NA
 7133886 7133887 Rpal_0359 Rpal_0360     TRUE 0.962 -3.000 0.304 0.017   NA
 7133887 7133888 Rpal_0360 Rpal_0361     TRUE 0.937 163.000 0.829 1.000 Y NA
 7133889 7133890 Rpal_0362 Rpal_0363     FALSE 0.146 189.000 0.018 1.000 N NA
 7133890 7133891 Rpal_0363 Rpal_0364     FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 7133894 7133895 Rpal_0367 Rpal_0368     FALSE 0.470 79.000 0.125 NA   NA
 7133896 7133897 Rpal_0369 Rpal_0370     TRUE 0.618 99.000 0.333 NA   NA
 7133898 7133899 Rpal_0371 Rpal_0372     FALSE 0.113 222.000 0.046 1.000 N NA
 7133900 7133901 Rpal_0373 Rpal_R0006     FALSE 0.020 264.000 0.000 NA   NA
 7133902 7133903 Rpal_0374 Rpal_0375     FALSE 0.065 201.000 0.000 1.000 N NA
 7133905 7133906 Rpal_0377 Rpal_0378     FALSE 0.185 140.000 0.000 1.000   NA
 7133906 7133907 Rpal_0378 Rpal_0379     FALSE 0.173 74.000 0.000 NA   NA
 7133908 7133909 Rpal_0380 Rpal_0381     TRUE 0.798 153.000 0.667 1.000   NA
 7133911 7133912 Rpal_0383 Rpal_0384     FALSE 0.224 115.000 0.025 1.000 N NA
 7133912 7133913 Rpal_0384 Rpal_0385   glgC FALSE 0.016 272.000 0.000 1.000 N NA
 7133913 7133914 Rpal_0385 Rpal_0386 glgC   TRUE 0.961 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7133914 7133915 Rpal_0386 Rpal_0387     FALSE 0.123 146.000 0.000 1.000 N NA
 7133915 7133916 Rpal_0387 Rpal_0388     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7133917 7133918 Rpal_0389 Rpal_0390 radC   FALSE 0.415 95.000 0.115 NA   NA
 7133924 7133925 Rpal_0396 Rpal_0397     FALSE 0.027 241.000 0.000 1.000 N NA
 7133925 7133926 Rpal_0397 Rpal_0398     FALSE 0.256 101.000 0.008 1.000   NA
 7133926 7133927 Rpal_0398 Rpal_0399     TRUE 0.926 -3.000 0.333 NA   NA
 7133927 7133928 Rpal_0399 Rpal_0400     TRUE 0.853 0.000 0.074 NA   NA
 7133928 7133929 Rpal_0400 Rpal_0401     TRUE 0.911 5.000 0.004 0.043   NA
 7133929 7133930 Rpal_0401 Rpal_0402     FALSE 0.147 187.000 0.012 NA   NA
 7133930 7133931 Rpal_0402 Rpal_0403     FALSE 0.241 154.000 0.021 NA   NA
 7133935 7133936 Rpal_0407 Rpal_0408   phhB FALSE 0.426 83.000 0.094 NA   NA
 7133938 7133939 Rpal_0410 Rpal_0411     TRUE 0.927 5.000 0.224 NA   NA
 7133940 7133941 Rpal_0412 Rpal_0413     FALSE 0.170 110.000 0.003 1.000 N NA
 7133941 7133942 Rpal_0413 Rpal_0414     FALSE 0.257 176.000 0.028 1.000   NA
 7133942 7133943 Rpal_0414 Rpal_0415     FALSE 0.410 77.000 0.048 1.000   NA
 7133943 7133944 Rpal_0415 Rpal_0416     FALSE 0.494 36.000 0.013 1.000 N NA
 7133945 7133946 Rpal_0417 Rpal_0418     FALSE 0.244 107.000 0.029 NA   NA
 7133946 7133947 Rpal_0418 Rpal_0419     TRUE 0.846 26.000 0.220 NA   NA
 7133949 7133950 Rpal_0420 Rpal_0421     TRUE 0.685 82.000 0.375 NA   NA
 7133950 7133951 Rpal_0421 Rpal_0422     FALSE 0.291 104.000 0.048 NA   NA
 7133951 7133952 Rpal_0422 Rpal_0423     FALSE 0.351 121.000 0.057 1.000   NA
 7133952 7133953 Rpal_0423 Rpal_0424     FALSE 0.243 183.000 0.057 NA   NA
 7133953 7133954 Rpal_0424 Rpal_0425     FALSE 0.349 137.000 0.077 NA   NA
 7133954 7133955 Rpal_0425 Rpal_0426     FALSE 0.116 121.000 0.000 1.000 N NA
 7133958 7133959 Rpal_0429 Rpal_0430     TRUE 0.935 62.000 0.451 1.000 Y NA
 7133959 7133960 Rpal_0430 Rpal_0431     TRUE 0.806 176.000 0.265 1.000 Y NA
 7133961 7133962 Rpal_0432 Rpal_0433     FALSE 0.041 228.000 0.000 NA   NA
 7133964 7133965 Rpal_0435 Rpal_0436     FALSE 0.012 290.000 0.000 1.000 N NA
 7133965 7133966 Rpal_0436 Rpal_0437   rpsO FALSE 0.213 339.000 0.335 1.000 Y NA
 7133966 7133967 Rpal_0437 Rpal_0438 rpsO truB TRUE 0.982 3.000 0.211 1.000 Y NA
 7133967 7133968 Rpal_0438 Rpal_0439 truB rbfA TRUE 0.985 0.000 0.318 1.000 Y NA
 7133968 7133969 Rpal_0439 Rpal_0440 rbfA infB TRUE 0.887 174.000 0.530 1.000 Y NA
 7133969 7133970 Rpal_0440 Rpal_0441 infB   TRUE 0.844 -7.000 0.223 NA N NA
 7133970 7133971 Rpal_0441 Rpal_0442   nusA TRUE 0.820 62.000 0.075 NA Y NA
 7133971 7133972 Rpal_0442 Rpal_0443 nusA   TRUE 0.979 3.000 0.759 NA   NA
 7133973 7133974 Rpal_0444 Rpal_0445     FALSE 0.124 124.000 0.000 NA   NA
 7133975 7133976 Rpal_0446 Rpal_0447 trmB   FALSE 0.351 75.000 0.018 1.000   NA
 7133976 7133977 Rpal_0447 Rpal_0448   lnt FALSE 0.346 201.000 0.231 1.000 N NA
 7133977 7133978 Rpal_0448 Rpal_0449 lnt   TRUE 0.886 -3.000 0.213 NA   NA
 7133978 7133979 Rpal_0449 Rpal_0450     TRUE 0.924 2.000 0.222 NA   NA
 7133979 7133980 Rpal_0450 Rpal_0451     TRUE 0.775 69.000 0.457 NA   NA
 7133980 7133981 Rpal_0451 Rpal_0452     TRUE 0.921 7.000 0.220 1.000 N NA
 7133981 7133982 Rpal_0452 Rpal_0453     FALSE 0.453 120.000 0.008 0.042   NA
 7133982 7133983 Rpal_0453 Rpal_0454     FALSE 0.442 88.000 0.082 1.000   NA
 7133983 7133984 Rpal_0454 Rpal_0455     FALSE 0.506 63.000 0.061 1.000   NA
 7133984 7133985 Rpal_0455 Rpal_0456     TRUE 0.877 23.000 0.209 1.000   NA
 7133985 7133986 Rpal_0456 Rpal_0457     TRUE 0.732 136.000 0.061 1.000 Y NA
 7133986 7133987 Rpal_0457 Rpal_0458     FALSE 0.442 146.000 0.151 NA   NA
 7133987 7133988 Rpal_0458 Rpal_0459     FALSE 0.067 245.000 0.042 NA   NA
 7133988 7133989 Rpal_0459 Rpal_0460     TRUE 0.589 56.000 0.078 1.000   NA
 7133991 7133992 Rpal_0462 Rpal_0463     FALSE 0.334 130.000 0.073 1.000 N NA
 7133993 7133994 Rpal_0464 Rpal_0465     TRUE 0.824 162.000 0.889 NA   NA
 7133995 7133996 Rpal_0466 Rpal_0467     FALSE 0.127 140.000 0.000 NA   NA
 7133996 7133997 Rpal_0467 Rpal_0468     TRUE 0.964 3.000 0.405 1.000   NA
 7133997 7133998 Rpal_0468 Rpal_0469     TRUE 0.934 0.000 0.282 1.000 N NA
 7133998 7133999 Rpal_0469 Rpal_0470     TRUE 0.991 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 7133999 7134000 Rpal_0470 Rpal_0471     TRUE 0.992 9.000 0.702 NA Y NA
 7134001 7134002 Rpal_0472 Rpal_0473     FALSE 0.007 375.000 0.000 1.000   NA
 7134004 7134005 Rpal_0475 Rpal_0476     FALSE 0.139 92.000 0.000 NA   NA
 7134007 7134008 Rpal_0477 Rpal_0478     FALSE 0.397 134.000 0.111 NA   NA
 7134008 7134009 Rpal_0478 Rpal_0479     TRUE 0.828 58.000 0.500 NA   NA
 7134011 7134012 Rpal_0481 Rpal_0482     TRUE 0.988 27.000 0.476 0.009 Y NA
 7134012 7134013 Rpal_0482 Rpal_0483     TRUE 0.978 34.000 0.636 1.000 Y NA
 7134014 7134015 Rpal_0484 Rpal_0485     TRUE 0.934 3.000 0.250 NA   NA
 7134015 7134016 Rpal_0485 Rpal_0486     TRUE 0.641 177.000 0.556 NA N NA
 7134017 7134018 Rpal_0487 Rpal_0488     TRUE 0.941 12.000 0.277 1.000   NA
 7134019 7134020 Rpal_0489 Rpal_0490     FALSE 0.004 523.000 0.012 1.000 N NA
 7134020 7134021 Rpal_0490 Rpal_0491     FALSE 0.259 75.000 0.011 1.000 N NA
 7134021 7134022 Rpal_0491 Rpal_0492     TRUE 0.783 31.000 0.116 1.000   NA
 7134022 7134023 Rpal_0492 Rpal_0493     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 7134024 7134025 Rpal_0494 Rpal_0495 rpmB   FALSE 0.007 325.000 0.000 1.000 N NA
 7134026 7134027 Rpal_0496 Rpal_0497     TRUE 0.874 25.000 0.260 NA   NA
 7134027 7134028 Rpal_0497 Rpal_0498     TRUE 0.646 -3.000 0.000 1.000   NA
 7134028 7134029 Rpal_0498 Rpal_0499     TRUE 0.736 5.000 0.000 1.000   NA
 7134033 7134034 Rpal_0503 Rpal_0504   aroB FALSE 0.377 48.000 0.005 NA   NA
 7134034 7134035 Rpal_0504 Rpal_0505 aroB   TRUE 0.976 11.000 0.147 1.000 Y NA
 7134036 7134037 Rpal_0506 Rpal_0507     TRUE 0.758 17.000 0.043 NA   NA
 7134039 7134040 Rpal_0509 Rpal_0510     FALSE 0.007 372.000 0.003 NA   NA
 7134045 7134046 Rpal_0515 Rpal_0516     TRUE 0.977 4.000 0.700 1.000 N NA
 7134046 7134047 Rpal_0516 Rpal_0517     TRUE 0.855 -7.000 0.206 1.000 N NA
 7134048 7134049 Rpal_0518 Rpal_0519     FALSE 0.151 165.000 0.016 NA N NA
 7134049 7134050 Rpal_0519 Rpal_0520   ispG TRUE 0.549 14.000 0.002 NA N NA
 7134052 7134053 Rpal_0522 Rpal_0523     TRUE 0.949 18.000 0.444 1.000   NA
 7134054 7134055 Rpal_0524 Rpal_0525     TRUE 0.871 8.000 0.085 NA   NA
 7134056 7134057 Rpal_0526 Rpal_0527 mtgA rpmF FALSE 0.275 162.000 0.016 1.000   NA
 7134057 7134058 Rpal_0527 Rpal_0528 rpmF   FALSE 0.052 243.000 0.016 NA   NA
 7134062 7134063 Rpal_0532 Rpal_0533     TRUE 0.670 183.000 0.071 1.000 Y NA
 7134063 7134064 Rpal_0533 Rpal_0534     FALSE 0.422 77.000 0.080 NA   NA
 7134065 7134066 Rpal_0535 Rpal_0536     FALSE 0.292 131.000 0.024 1.000   NA
 7134068 7134069 Rpal_0538 Rpal_0539     FALSE 0.003 747.000 0.000 1.000   NA
 7134071 7134072 Rpal_0541 Rpal_R0009     FALSE 0.050 218.000 0.000 NA   NA
 7134075 7134076 Rpal_0544 Rpal_0545     TRUE 0.562 154.000 0.263 NA   NA
 7134076 7134077 Rpal_0545 Rpal_0546     TRUE 0.895 -3.000 0.231 NA   NA
 7134077 7134078 Rpal_0546 Rpal_0547     FALSE 0.135 95.000 0.000 NA   NA
 7134081 7134082 Rpal_0550 Rpal_0551     TRUE 0.970 -3.000 0.898 NA N NA
 7134085 7134086 Rpal_0554 Rpal_0555     TRUE 0.551 38.000 0.033 NA   NA
 7134086 7134087 Rpal_0555 Rpal_0556     TRUE 0.763 -3.000 0.046 NA   NA
 7134088 7134089 Rpal_0557 Rpal_0558     FALSE 0.177 120.000 0.000 1.000   NA
 7134091 7134092 Rpal_0560 Rpal_0561     FALSE 0.298 71.000 0.016 NA   NA
 7134092 7134093 Rpal_0561 Rpal_0562     FALSE 0.461 131.000 0.182 NA   NA
 7134093 7134094 Rpal_0562 Rpal_0563     FALSE 0.155 176.000 0.000 1.000   NA
 7134094 7134095 Rpal_0563 Rpal_0564     FALSE 0.533 76.000 0.125 1.000   NA
 7134098 7134099 Rpal_0567 Rpal_0568     FALSE 0.126 163.000 0.000 NA   NA
 7134099 7134100 Rpal_0568 Rpal_0569     FALSE 0.126 128.000 0.000 NA   NA
 7134101 7134102 Rpal_0570 Rpal_0571     FALSE 0.032 261.000 0.000 1.000   NA
 7134102 7134103 Rpal_0571 Rpal_0572     FALSE 0.202 90.000 0.004 NA   NA
 7134105 7134106 Rpal_0574 Rpal_0575     TRUE 0.915 92.000 0.560 1.000 Y NA
 7134107 7134108 Rpal_0576 Rpal_0577     TRUE 0.962 -3.000 0.594 1.000   NA
 7134108 7134109 Rpal_0577 Rpal_0578     FALSE 0.508 139.000 0.188 1.000   NA
 7134109 7134110 Rpal_0578 Rpal_0579     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 7134113 7134114 Rpal_0582 Rpal_0583     FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 7134114 7134115 Rpal_0583 Rpal_0584     FALSE 0.232 151.000 0.017 NA   NA
 7134116 7134117 Rpal_0585 Rpal_0586     FALSE 0.407 95.000 0.108 NA   NA
 7134117 7134118 Rpal_0586 Rpal_0587     FALSE 0.074 192.000 0.000 1.000 N NA
 7134119 7134120 Rpal_0588 Rpal_0589     FALSE 0.524 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7134120 7134121 Rpal_0589 Rpal_0590     FALSE 0.389 30.000 0.000 1.000 N NA
 7134121 7134122 Rpal_0590 Rpal_0591     FALSE 0.420 41.000 0.000 1.000   NA
 7134124 7134125 Rpal_0593 Rpal_0594     FALSE 0.118 164.000 0.000 1.000 N NA
 7134126 7134127 Rpal_0595 Rpal_0596 argJ   FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134127 7134128 Rpal_0596 Rpal_0597     TRUE 0.636 8.000 0.000 NA   NA
 7134129 7134130 Rpal_0598 Rpal_0599     FALSE 0.189 146.000 0.000 1.000   NA
 7134130 7134131 Rpal_0599 Rpal_0600     TRUE 0.573 27.000 0.010 NA   NA
 7134132 7134133 Rpal_0601 Rpal_0602     TRUE 0.560 43.000 0.027 1.000   NA
 7134133 7134134 Rpal_0602 Rpal_0603     TRUE 0.786 -3.000 0.035 1.000   NA
 7134134 7134135 Rpal_0603 Rpal_0604     TRUE 0.707 -3.000 0.022 NA   NA
 7134135 7134136 Rpal_0604 Rpal_0605     FALSE 0.089 222.000 0.021 NA   NA
 7134137 7134138 Rpal_0606 Rpal_0607     FALSE 0.191 128.000 0.006 NA   NA
 7134139 7134140 Rpal_0608 Rpal_0609     FALSE 0.021 336.000 0.069 1.000 N NA
 7134140 7134141 Rpal_0609 Rpal_0610   prfA TRUE 0.656 57.000 0.034 0.031 N NA
 7134141 7134142 Rpal_0610 Rpal_0611 prfA   TRUE 0.985 -3.000 0.229 0.031 Y NA
 7134142 7134143 Rpal_0611 Rpal_0612     FALSE 0.006 452.000 0.021 NA   NA
 7134145 7134146 Rpal_0614 Rpal_0615     TRUE 0.681 33.000 0.071 NA   NA
 7134147 7134148 Rpal_0616 Rpal_0617     TRUE 0.628 -3.000 0.024 NA N NA
 7134148 7134149 Rpal_0617 Rpal_0618     TRUE 0.885 5.000 0.108 1.000 N NA
 7134150 7134151 Rpal_R0060 Rpal_0619 ffs   FALSE 0.098 180.000 0.000 NA   NA
 7134151 7134152 Rpal_0619 Rpal_0620     TRUE 0.927 22.000 0.411 NA   NA
 7134152 7134153 Rpal_0620 Rpal_0621   recR TRUE 0.752 98.000 0.604 NA   NA
 7134153 7134154 Rpal_0621 Rpal_0622 recR   TRUE 0.632 20.000 0.008 NA   NA
 7134155 7134156 Rpal_0623 Rpal_0624     FALSE 0.278 68.000 0.006 NA   NA
 7134157 7134158 Rpal_0625 Rpal_0626 def fmt TRUE 0.860 79.000 0.050 0.019 Y NA
 7134158 7134159 Rpal_0626 Rpal_0627 fmt truA TRUE 0.647 187.000 0.069 1.000 Y NA
 7134160 7134161 Rpal_0628 Rpal_0629     TRUE 0.795 0.000 0.010 1.000   NA
 7134161 7134162 Rpal_0629 Rpal_0630   dapD TRUE 0.716 19.000 0.009 1.000   NA
 7134162 7134163 Rpal_0630 Rpal_0631 dapD   FALSE 0.303 185.000 0.071 1.000   NA
 7134163 7134164 Rpal_0631 Rpal_0632     TRUE 0.885 -3.000 0.041 0.092   NA
 7134164 7134165 Rpal_0632 Rpal_0633     FALSE 0.266 102.000 0.012 1.000   NA
 7134165 7134166 Rpal_0633 Rpal_0634     FALSE 0.204 125.000 0.012 NA   NA
 7134166 7134167 Rpal_0634 Rpal_0635   engB TRUE 0.770 0.000 0.022 NA   NA
 7134167 7134168 Rpal_0635 Rpal_0636 engB   TRUE 0.586 152.000 0.082 0.057   NA
 7134168 7134169 Rpal_0636 Rpal_0637     TRUE 0.833 17.000 0.105 1.000 N NA
 7134169 7134170 Rpal_0637 Rpal_0638   rpmH TRUE 0.965 24.000 0.787 1.000   NA
 7134171 7134172 Rpal_0639 Rpal_R0010     FALSE 0.024 250.000 0.000 NA   NA
 7134173 7134174 Rpal_0640 Rpal_0641     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134175 7134176 Rpal_0642 Rpal_0643     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134176 7134177 Rpal_0643 Rpal_0644     FALSE 0.198 65.000 0.000 NA   NA
 7134177 7134178 Rpal_0644 Rpal_0645     TRUE 0.967 5.000 0.500 NA   NA
 7134178 7134179 Rpal_0645 Rpal_0646     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134179 7134180 Rpal_0646 Rpal_0647     TRUE 0.895 12.000 0.111 1.000   NA
 7134180 7134181 Rpal_0647 Rpal_0648     TRUE 0.924 2.000 0.222 NA   NA
 7134181 7134182 Rpal_0648 Rpal_0649     TRUE 0.940 0.000 0.308 NA   NA
 7134182 7134183 Rpal_0649 Rpal_0650     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134183 7134184 Rpal_0650 Rpal_0651     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7134184 7134185 Rpal_0651 Rpal_0652     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7134185 7134186 Rpal_0652 Rpal_0653     FALSE 0.002 615.000 0.000 NA   NA
 7134186 7134187 Rpal_0653 Rpal_0654     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134187 7134188 Rpal_0654 Rpal_0655     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134188 7134189 Rpal_0655 Rpal_0656     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134189 7134190 Rpal_0656 Rpal_0657     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134190 7134191 Rpal_0657 Rpal_0658     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134191 7134192 Rpal_0658 Rpal_0659     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134192 7134193 Rpal_0659 Rpal_0660     FALSE 0.290 46.000 0.000 NA   NA
 7134193 7134194 Rpal_0660 Rpal_0661     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134194 7134195 Rpal_0661 Rpal_0662     FALSE 0.121 117.000 0.000 NA   NA
 7134195 7134196 Rpal_0662 Rpal_0663     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134196 7134197 Rpal_0663 Rpal_0664     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134197 7134198 Rpal_0664 Rpal_0665     FALSE 0.459 -73.000 0.000 NA   NA
 7134198 7134199 Rpal_0665 Rpal_0666     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134199 7134200 Rpal_0666 Rpal_0667     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7134200 7134201 Rpal_0667 Rpal_0668     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134201 7134202 Rpal_0668 Rpal_0669     TRUE 0.958 5.000 0.400 NA   NA
 7134202 7134203 Rpal_0669 Rpal_0670     TRUE 0.832 -3.000 0.100 NA   NA
 7134203 7134204 Rpal_0670 Rpal_0671     TRUE 0.851 -6.000 0.190 NA   NA
 7134204 7134205 Rpal_0671 Rpal_0672     TRUE 0.956 3.000 0.381 NA   NA
 7134205 7134206 Rpal_0672 Rpal_0673     FALSE 0.018 272.000 0.000 NA   NA
 7134206 7134207 Rpal_0673 Rpal_0674     TRUE 0.946 0.000 0.333 NA   NA
 7134207 7134208 Rpal_0674 Rpal_R0011     TRUE 0.628 10.000 0.000 NA   NA
 7134208 7134209 Rpal_R0011 Rpal_0675     FALSE 0.275 49.000 0.000 NA   NA
 7134209 7134210 Rpal_0675 Rpal_0676     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134210 7134211 Rpal_0676 Rpal_0677     FALSE 0.128 104.000 0.000 NA   NA
 7134211 7134212 Rpal_0677 Rpal_0678     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134212 7134213 Rpal_0678 Rpal_0679     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7134213 7134214 Rpal_0679 Rpal_0680     TRUE 0.943 0.000 0.317 NA   NA
 7134214 7134215 Rpal_0680 Rpal_0681     TRUE 0.832 -3.000 0.100 NA   NA
 7134215 7134216 Rpal_0681 Rpal_0682     TRUE 0.942 -3.000 0.429 NA   NA
 7134216 7134217 Rpal_0682 Rpal_0683     TRUE 0.639 6.000 0.000 NA   NA
 7134217 7134218 Rpal_0683 Rpal_0684     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7134218 7134219 Rpal_0684 Rpal_0685     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134219 7134220 Rpal_0685 Rpal_0686     TRUE 0.818 -3.000 0.083 NA   NA
 7134220 7134221 Rpal_0686 Rpal_0687     TRUE 0.897 12.000 0.167 NA   NA
 7134221 7134222 Rpal_0687 Rpal_0688     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7134222 7134223 Rpal_0688 Rpal_0689     FALSE 0.488 22.000 0.000 NA   NA
 7134223 7134224 Rpal_0689 Rpal_0690     FALSE 0.222 59.000 0.000 NA   NA
 7134224 7134225 Rpal_0690 Rpal_0691     FALSE 0.133 97.000 0.000 NA   NA
 7134225 7134226 Rpal_0691 Rpal_0692     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134226 7134227 Rpal_0692 Rpal_0693     FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 7134227 7134228 Rpal_0693 Rpal_0694     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134228 7134229 Rpal_0694 Rpal_0695     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134229 7134230 Rpal_0695 Rpal_0696     TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7134230 7134231 Rpal_0696 Rpal_0697     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134231 7134232 Rpal_0697 Rpal_0698     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134232 7134233 Rpal_0698 Rpal_0699     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134233 7134234 Rpal_0699 Rpal_0700     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7134234 7134235 Rpal_0700 Rpal_0701     FALSE 0.008 320.000 0.000 NA   NA
 7134235 7134236 Rpal_0701 Rpal_0702     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7134237 7134238 Rpal_0703 Rpal_0704     TRUE 0.818 27.000 0.182 NA   NA
 7134238 7134239 Rpal_0704 Rpal_0705     FALSE 0.438 77.000 0.088 NA   NA
 7134240 7134241 Rpal_0706 Rpal_0707     TRUE 0.642 143.000 0.389 1.000 N NA
 7134241 7134242 Rpal_0707 Rpal_0708     TRUE 0.809 62.000 0.037 1.000 Y NA
 7134242 7134243 Rpal_0708 Rpal_0709     TRUE 0.984 0.000 0.043 0.002 Y NA
 7134243 7134244 Rpal_0709 Rpal_0710     FALSE 0.538 96.000 0.238 NA   NA
 7134244 7134245 Rpal_0710 Rpal_0711     FALSE 0.004 378.000 0.000 NA   NA
 7134245 7134246 Rpal_0711 Rpal_0712   flgE TRUE 0.968 20.000 0.250 NA Y NA
 7134246 7134247 Rpal_0712 Rpal_0713 flgE   TRUE 0.925 6.000 0.222 NA   NA
 7134247 7134248 Rpal_0713 Rpal_0714     TRUE 0.884 25.000 0.286 NA   NA
 7134248 7134249 Rpal_0714 Rpal_0715     TRUE 0.978 22.000 0.583 0.002   NA
 7134249 7134250 Rpal_0715 Rpal_0716   flgL TRUE 0.995 16.000 0.750 0.005 Y NA
 7134251 7134252 Rpal_0717 Rpal_0718     TRUE 0.962 28.000 0.105 0.091 Y NA
 7134252 7134253 Rpal_0718 Rpal_0719     TRUE 0.911 57.000 0.250 1.000 Y NA
 7134253 7134254 Rpal_0719 Rpal_0720     TRUE 0.631 65.000 0.225 1.000 N NA
 7134254 7134255 Rpal_0720 Rpal_0721     TRUE 0.974 29.000 1.000 0.091 N NA
 7134256 7134257 Rpal_0722 Rpal_0723     TRUE 0.578 89.000 0.222 1.000   NA
 7134257 7134258 Rpal_0723 Rpal_0724     FALSE 0.171 169.000 0.000 1.000   NA
 7134258 7134259 Rpal_0724 Rpal_0725     TRUE 0.996 -3.000 0.800 0.001 Y NA
 7134259 7134260 Rpal_0725 Rpal_0726     TRUE 0.992 12.000 0.875 0.001   NA
 7134260 7134261 Rpal_0726 Rpal_0727     TRUE 0.925 94.000 0.875 0.001   NA
 7134261 7134262 Rpal_0727 Rpal_0728     TRUE 0.809 116.000 0.222 1.000 Y NA
 7134262 7134263 Rpal_0728 Rpal_0729     TRUE 0.840 17.000 0.111 NA   NA
 7134264 7134265 Rpal_0730 Rpal_0731     TRUE 0.833 55.000 0.545 NA N NA
 7134265 7134266 Rpal_0731 Rpal_0732     FALSE 0.124 99.000 0.000 1.000 N NA
 7134266 7134267 Rpal_0732 Rpal_0733     TRUE 0.979 -3.000 0.115 0.033 Y NA
 7134267 7134268 Rpal_0733 Rpal_0734     TRUE 0.985 -3.000 0.269 0.053 Y NA
 7134268 7134269 Rpal_0734 Rpal_0735     TRUE 0.891 86.000 0.429 NA Y NA
 7134269 7134270 Rpal_0735 Rpal_0736     TRUE 0.720 177.000 0.750 NA N NA
 7134271 7134272 Rpal_0737 Rpal_0738     TRUE 0.995 -3.000 0.714 0.001 Y NA
 7134272 7134273 Rpal_0738 Rpal_0739     TRUE 0.995 -3.000 0.714 0.001 Y NA
 7134275 7134276 Rpal_0741 Rpal_0742     FALSE 0.531 36.000 0.021 NA   NA
 7134276 7134277 Rpal_0742 Rpal_0743     FALSE 0.320 129.000 0.063 NA   NA
 7134277 7134278 Rpal_0743 Rpal_0744     TRUE 0.839 171.000 1.000 1.000   NA
 7134278 7134279 Rpal_0744 Rpal_0745     FALSE 0.043 328.000 0.000 0.006   NA
 7134280 7134281 Rpal_0746 Rpal_0747     FALSE 0.183 67.000 0.000 1.000 N NA
 7134282 7134283 Rpal_0748 Rpal_0749     TRUE 0.953 -3.000 0.464 1.000   NA
 7134283 7134284 Rpal_0749 Rpal_0750     TRUE 0.962 3.000 0.125 0.004   NA
 7134286 7134287 Rpal_0752 Rpal_0753     FALSE 0.130 161.000 0.000 NA   NA
 7134288 7134289 Rpal_0754 Rpal_0755     TRUE 0.767 -19.000 0.056 1.000   NA
 7134289 7134290 Rpal_0755 Rpal_0756     TRUE 0.957 -3.000 0.068 1.000 Y NA
 7134290 7134291 Rpal_0756 Rpal_0757     TRUE 0.963 -3.000 0.104 1.000 Y NA
 7134291 7134292 Rpal_0757 Rpal_0758   phnK TRUE 0.997 0.000 0.859 0.032 Y NA
 7134292 7134293 Rpal_0758 Rpal_0759 phnK   TRUE 0.990 -7.000 0.883 1.000 Y NA
 7134293 7134294 Rpal_0759 Rpal_0760     TRUE 0.992 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 7134294 7134295 Rpal_0760 Rpal_0761   phnH TRUE 0.998 4.000 0.960 0.002 Y NA
 7134295 7134296 Rpal_0761 Rpal_0762 phnH   TRUE 0.998 3.000 0.967 0.002 Y NA
 7134298 7134299 Rpal_0764 Rpal_0765     FALSE 0.131 147.000 0.000 NA   NA
 7134299 7134300 Rpal_0765 Rpal_0766     TRUE 0.993 -3.000 0.491 0.001 Y NA
 7134300 7134301 Rpal_0766 Rpal_0767     TRUE 0.971 69.000 0.568 0.001 Y NA
 7134301 7134302 Rpal_0767 Rpal_0768     TRUE 0.953 110.000 0.589 0.002 Y NA
 7134303 7134304 Rpal_0769 Rpal_0770     TRUE 0.796 -3.000 0.041 1.000   NA
 7134304 7134305 Rpal_0770 Rpal_0771     TRUE 0.707 23.000 0.041 NA   NA
 7134309 7134310 Rpal_0775 Rpal_0776     FALSE 0.217 60.000 0.000 NA   NA
 7134312 7134313 Rpal_0778 Rpal_0779     TRUE 0.739 106.000 0.600 NA   NA
 7134313 7134314 Rpal_0779 Rpal_0780     FALSE 0.112 172.000 0.000 NA   NA
 7134314 7134315 Rpal_0780 Rpal_0781     FALSE 0.306 43.000 0.000 NA   NA
 7134316 7134317 Rpal_0782 Rpal_0783     TRUE 0.675 -3.000 0.013 1.000 N NA
 7134318 7134319 Rpal_0784 Rpal_0785     TRUE 0.682 -3.000 0.013 NA   NA
 7134319 7134320 Rpal_0785 Rpal_0786     TRUE 0.879 4.000 0.063 1.000   NA
 7134320 7134321 Rpal_0786 Rpal_0787   cobN TRUE 0.599 135.000 0.274 1.000   NA
 7134321 7134322 Rpal_0787 Rpal_0788 cobN   TRUE 0.954 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 7134322 7134323 Rpal_0788 Rpal_0789     TRUE 0.858 148.000 0.078 0.007 Y NA
 7134324 7134325 Rpal_0790 Rpal_0791     TRUE 0.784 2.000 0.024 1.000 N NA
 7134327 7134328 Rpal_0793 Rpal_0794     TRUE 0.993 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7134328 7134329 Rpal_0794 Rpal_0795     TRUE 0.979 8.000 0.188 1.000 Y NA
 7134329 7134330 Rpal_0795 Rpal_0796     FALSE 0.118 333.000 0.000 0.056 Y NA
 7134330 7134331 Rpal_0796 Rpal_0797     TRUE 0.729 -3.000 0.033 1.000 N NA
 7134332 7134333 Rpal_0798 Rpal_0799     FALSE 0.001 555.000 0.000 NA N NA
 7134333 7134334 Rpal_0799 Rpal_0800     TRUE 0.993 11.000 0.750 NA Y NA
 7134334 7134335 Rpal_0800 Rpal_0801     TRUE 0.936 13.000 0.000 NA Y NA
 7134335 7134336 Rpal_0801 Rpal_0802     FALSE 0.001 531.000 0.000 NA N NA
 7134336 7134337 Rpal_0802 Rpal_0803     FALSE 0.129 265.000 0.243 1.000 N NA
 7134337 7134338 Rpal_0803 Rpal_0804     TRUE 0.996 -3.000 0.870 0.008 Y NA
 7134338 7134339 Rpal_0804 Rpal_0805     TRUE 0.965 12.000 0.466 1.000   NA
 7134339 7134340 Rpal_0805 Rpal_0806     TRUE 0.966 0.000 0.180 0.002   NA
 7134340 7134341 Rpal_0806 Rpal_0807     TRUE 0.971 -10.000 0.458 0.002   NA
 7134341 7134342 Rpal_0807 Rpal_0808     FALSE 0.433 64.000 0.057 NA   NA
 7134342 7134343 Rpal_0808 Rpal_0809     FALSE 0.020 263.000 0.000 NA   NA
 7134343 7134344 Rpal_0809 Rpal_0810     FALSE 0.258 145.000 0.036 1.000 N NA
 7134344 7134345 Rpal_0810 Rpal_0811     FALSE 0.399 75.000 0.000 0.074 N NA
 7134345 7134346 Rpal_0811 Rpal_0812     TRUE 0.834 -3.000 0.070 1.000   NA
 7134346 7134347 Rpal_0812 Rpal_0813     TRUE 0.974 0.000 0.674 NA   NA
 7134347 7134348 Rpal_0813 Rpal_0814     FALSE 0.103 177.000 0.000 NA   NA
 7134349 7134350 Rpal_0815 Rpal_0816     TRUE 0.573 140.000 0.250 1.000   NA
 7134350 7134351 Rpal_0816 Rpal_0817     TRUE 0.712 99.000 0.500 NA   NA
 7134351 7134352 Rpal_0817 Rpal_0818     FALSE 0.002 742.000 0.000 NA   NA
 7134352 7134353 Rpal_0818 Rpal_0819     TRUE 0.946 -10.000 0.070 1.000 Y NA
 7134353 7134354 Rpal_0819 Rpal_0820     TRUE 0.992 5.000 0.935 0.001 N NA
 7134354 7134355 Rpal_0820 Rpal_0821     FALSE 0.134 293.000 0.097 0.001 N NA
 7134355 7134356 Rpal_0821 Rpal_0822     FALSE 0.215 125.000 0.019 1.000 N NA
 7134357 7134358 Rpal_0823 Rpal_0824     TRUE 0.984 22.000 0.830 0.001 N NA
 7134359 7134360 Rpal_0825 Rpal_0826     FALSE 0.121 132.000 0.000 1.000 N NA
 7134360 7134361 Rpal_0826 Rpal_0827     TRUE 0.902 1.000 0.161 1.000 N NA
 7134361 7134362 Rpal_0827 Rpal_0828     TRUE 0.960 -3.000 0.625 NA   NA
 7134362 7134363 Rpal_0828 Rpal_0829     TRUE 0.888 14.000 0.179 NA   NA
 7134363 7134364 Rpal_0829 Rpal_0830     TRUE 0.994 5.000 0.742 1.000 Y NA
 7134364 7134365 Rpal_0830 Rpal_0831     TRUE 0.994 20.000 0.871 0.052 Y NA
 7134365 7134366 Rpal_0831 Rpal_0832     TRUE 0.896 198.000 0.593 0.052 Y NA
 7134367 7134368 Rpal_0833 Rpal_0834     FALSE 0.007 331.000 0.000 1.000 N NA
 7134369 7134370 Rpal_0835 Rpal_0836     TRUE 0.604 21.000 0.000 1.000   NA
 7134371 7134372 Rpal_0837 Rpal_0838     TRUE 0.625 106.000 0.000 1.000 Y NA
 7134373 7134374 Rpal_0839 Rpal_0840     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134374 7134375 Rpal_0840 Rpal_0841     TRUE 0.834 -3.000 0.103 NA   NA
 7134375 7134376 Rpal_0841 Rpal_R0012     FALSE 0.003 470.000 0.000 NA   NA
 7134376 7134377 Rpal_R0012 Rpal_0842     FALSE 0.094 183.000 0.000 NA   NA
 7134379 7134380 Rpal_0844 Rpal_0845     FALSE 0.115 119.000 0.000 1.000 N NA
 7134380 7134381 Rpal_0845 Rpal_0846     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 7134383 7134384 Rpal_0848 Rpal_0849     TRUE 0.906 81.000 0.833 0.074   NA
 7134384 7134385 Rpal_0849 Rpal_0850     TRUE 0.977 9.000 0.714 NA   NA
 7134385 7134386 Rpal_0850 Rpal_0851     FALSE 0.454 189.000 0.294 NA   NA
 7134388 7134389 Rpal_0853 Rpal_0854     FALSE 0.377 121.000 0.111 1.000 N NA
 7134390 7134391 Rpal_0855 Rpal_0856     FALSE 0.035 253.000 0.000 1.000   NA
 7134392 7134393 Rpal_0857 Rpal_0858     FALSE 0.483 56.000 0.054 NA   NA
 7134393 7134394 Rpal_0858 Rpal_0859     TRUE 0.645 34.000 0.057 NA   NA
 7134394 7134395 Rpal_0859 Rpal_0860     TRUE 0.710 114.000 0.538 NA   NA
 7134397 7134398 Rpal_0862 Rpal_0863     FALSE 0.311 87.000 0.045 1.000 N NA
 7134399 7134400 Rpal_0864 Rpal_0865     TRUE 0.837 -3.000 0.108 NA   NA
 7134401 7134402 Rpal_0866 Rpal_0867     FALSE 0.391 144.000 0.071 1.000   NA
 7134402 7134403 Rpal_0867 Rpal_0868     FALSE 0.193 138.000 0.009 1.000 N NA
 7134403 7134404 Rpal_0868 Rpal_0869     TRUE 0.719 19.000 0.033 NA   NA
 7134404 7134405 Rpal_0869 Rpal_0870     FALSE 0.381 72.000 0.049 NA   NA
 7134405 7134406 Rpal_0870 Rpal_0871     TRUE 0.968 -3.000 0.751 1.000 N NA
 7134409 7134410 Rpal_0874 Rpal_0875     FALSE 0.193 176.000 0.020 NA   NA
 7134410 7134411 Rpal_0875 Rpal_0876     TRUE 0.808 65.000 0.460 1.000   NA
 7134413 7134414 Rpal_0878 Rpal_0879     FALSE 0.148 86.000 0.000 NA   NA
 7134415 7134416 Rpal_0880 Rpal_0881     TRUE 0.910 -3.000 0.274 NA   NA
 7134416 7134417 Rpal_0881 Rpal_0882     FALSE 0.081 237.000 0.019 1.000   NA
 7134417 7134418 Rpal_0882 Rpal_0883     FALSE 0.034 254.000 0.000 1.000   NA
 7134419 7134420 Rpal_0884 Rpal_0885     FALSE 0.371 94.000 0.080 NA   NA
 7134420 7134421 Rpal_0885 Rpal_0886     TRUE 0.808 171.000 0.247 1.000 Y NA
 7134421 7134422 Rpal_0886 Rpal_0887     TRUE 0.905 125.000 0.562 1.000 Y NA
 7134424 7134425 Rpal_0889 Rpal_0890     FALSE 0.368 94.000 0.082 1.000 N NA
 7134425 7134426 Rpal_0890 Rpal_0891     FALSE 0.367 146.000 0.057 1.000   NA
 7134427 7134428 Rpal_0892 Rpal_0893     TRUE 0.700 -3.000 0.018 NA   NA
 7134429 7134430 Rpal_0894 Rpal_0895     TRUE 0.897 0.000 0.154 NA   NA
 7134430 7134431 Rpal_0895 Rpal_0896     FALSE 0.153 83.000 0.000 NA   NA
 7134431 7134432 Rpal_0896 Rpal_0897     TRUE 0.592 115.000 0.333 1.000 N NA
 7134434 7134435 Rpal_0899 Rpal_0900     TRUE 0.977 68.000 0.741 0.002 Y NA
 7134435 7134436 Rpal_0900 Rpal_0901     TRUE 0.682 73.000 0.153 0.056 N NA
 7134436 7134437 Rpal_0901 Rpal_0902     TRUE 0.739 12.000 0.012 NA   NA
 7134437 7134438 Rpal_0902 Rpal_0903     TRUE 0.716 15.000 0.017 NA   NA
 7134438 7134439 Rpal_0903 Rpal_0904     TRUE 0.790 72.000 0.536 1.000 N NA
 7134439 7134440 Rpal_0904 Rpal_0905     FALSE 0.402 163.000 0.122 NA   NA
 7134440 7134441 Rpal_0905 Rpal_0906     TRUE 0.888 -3.000 0.220 NA   NA
 7134441 7134442 Rpal_0906 Rpal_0907     FALSE 0.196 147.000 0.006 NA   NA
 7134442 7134443 Rpal_0907 Rpal_0908     TRUE 0.871 -3.000 0.129 1.000   NA
 7134443 7134444 Rpal_0908 Rpal_0909     TRUE 0.873 62.000 0.674 1.000   NA
 7134444 7134445 Rpal_0909 Rpal_0910     FALSE 0.389 119.000 0.120 NA   NA
 7134446 7134447 Rpal_0911 Rpal_0912     TRUE 0.997 6.000 0.863 0.004 Y NA
 7134447 7134448 Rpal_0912 Rpal_0913     TRUE 0.871 58.000 0.278 0.004   NA
 7134448 7134449 Rpal_0913 Rpal_0914     TRUE 0.947 49.000 0.628 0.005   NA
 7134449 7134450 Rpal_0914 Rpal_0915     TRUE 0.581 70.000 0.195 NA   NA
 7134451 7134452 Rpal_0916 Rpal_0917     TRUE 0.774 46.000 0.267 NA   NA
 7134452 7134453 Rpal_0917 Rpal_0918     TRUE 0.624 24.000 0.015 NA   NA
 7134456 7134457 Rpal_0921 Rpal_0922     FALSE 0.305 188.000 0.133 1.000 N NA
 7134457 7134458 Rpal_0922 Rpal_0923     FALSE 0.232 221.000 0.143 1.000   NA
 7134458 7134459 Rpal_0923 Rpal_0924     FALSE 0.178 166.000 0.000 1.000   NA
 7134459 7134460 Rpal_0924 Rpal_0925     FALSE 0.049 216.000 0.000 1.000 N NA
 7134461 7134462 Rpal_0926 Rpal_0927     TRUE 0.990 5.000 0.465 1.000 Y NA
 7134462 7134463 Rpal_0927 Rpal_0928     TRUE 0.989 6.000 0.400 1.000 Y NA
 7134463 7134464 Rpal_0928 Rpal_0929     FALSE 0.404 147.000 0.112 NA   NA
 7134464 7134465 Rpal_0929 Rpal_0930     TRUE 0.855 -3.000 0.141 NA   NA
 7134465 7134466 Rpal_0930 Rpal_0931     TRUE 0.583 35.000 0.036 NA   NA
 7134466 7134467 Rpal_0931 Rpal_0932     FALSE 0.357 61.000 0.022 NA   NA
 7134468 7134469 Rpal_0933 Rpal_0934     TRUE 0.566 110.000 0.300 1.000 N NA
 7134469 7134470 Rpal_0934 Rpal_0935     FALSE 0.005 295.000 0.000 NA N NA
 7134470 7134471 Rpal_0935 Rpal_0936     FALSE 0.294 98.000 0.045 NA   NA
 7134471 7134472 Rpal_0936 Rpal_0937     TRUE 0.794 11.000 0.032 NA   NA
 7134472 7134473 Rpal_0937 Rpal_0938     TRUE 0.583 143.000 0.257 1.000   NA
 7134473 7134474 Rpal_0938 Rpal_0939     FALSE 0.002 664.000 0.000 NA   NA
 7134475 7134476 Rpal_0940 Rpal_0941     TRUE 0.867 5.000 0.077 NA   NA
 7134476 7134477 Rpal_0941 Rpal_0942     TRUE 0.678 156.000 0.420 NA   NA
 7134477 7134478 Rpal_0942 Rpal_0943   hemH FALSE 0.330 176.000 0.067 1.000   NA
 7134478 7134479 Rpal_0943 Rpal_0944 hemH   FALSE 0.327 157.000 0.092 NA N NA
 7134479 7134480 Rpal_0944 Rpal_0945     TRUE 0.977 17.000 0.313 NA Y NA
 7134481 7134482 Rpal_0946 Rpal_0947     FALSE 0.005 350.000 0.000 1.000 N NA
 7134483 7134484 Rpal_0948 Rpal_0949     FALSE 0.522 113.000 0.250 NA   NA
 7134485 7134486 Rpal_0950 Rpal_0951     TRUE 0.942 110.000 0.914 1.000 Y NA
 7134486 7134487 Rpal_0951 Rpal_0952     FALSE 0.195 249.000 0.000 NA Y NA
 7134487 7134488 Rpal_0952 Rpal_0953     FALSE 0.126 128.000 0.000 NA   NA
 7134490 7134491 Rpal_0955 Rpal_0956     FALSE 0.263 124.000 0.041 1.000 N NA
 7134494 7134495 Rpal_0959 Rpal_0960   gltD TRUE 0.899 173.000 0.236 0.001 Y NA
 7134495 7134496 Rpal_0960 Rpal_0961 gltD   FALSE 0.008 358.000 0.000 1.000   NA
 7134497 7134498 Rpal_0962 Rpal_0963     FALSE 0.002 1040.000 0.000 1.000   NA
 7134500 7134501 Rpal_0965 Rpal_0966     FALSE 0.329 147.000 0.038 1.000   NA
 7134501 7134502 Rpal_0966 Rpal_0967     FALSE 0.019 268.000 0.000 NA   NA
 7134502 7134503 Rpal_0967 Rpal_0968     FALSE 0.124 124.000 0.000 NA   NA
 7134505 7134506 Rpal_0970 Rpal_0971     FALSE 0.280 48.000 0.000 NA   NA
 7134508 7134509 Rpal_0973 Rpal_0974     FALSE 0.001 699.000 0.000 NA N NA
 7134509 7134510 Rpal_0974 Rpal_0975     FALSE 0.065 151.000 0.000 NA N NA
 7134511 7134512 Rpal_0976 Rpal_R0013     FALSE 0.150 85.000 0.000 NA   NA
 7134512 7134513 Rpal_R0013 Rpal_0977     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7134514 7134515 Rpal_0978 Rpal_0979     FALSE 0.329 155.000 0.061 NA   NA
 7134515 7134516 Rpal_0979 Rpal_0980     TRUE 0.555 166.000 0.286 NA   NA
 7134520 7134521 Rpal_0984 Rpal_0985     FALSE 0.412 123.000 0.143 1.000 N NA
 7134522 7134523 Rpal_0986 Rpal_0987     FALSE 0.017 421.000 0.141 NA   NA
 7134526 7134527 Rpal_0990 Rpal_0991     TRUE 0.564 137.000 0.236 1.000   NA
 7134527 7134528 Rpal_0991 Rpal_0992     TRUE 0.851 0.000 0.073 NA   NA
 7134529 7134530 Rpal_0993 Rpal_0994     TRUE 0.933 -3.000 0.324 1.000   NA
 7134530 7134531 Rpal_0994 Rpal_0995     FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 7134531 7134532 Rpal_0995 Rpal_0996     TRUE 0.864 85.000 1.000 NA   NA
 7134533 7134534 Rpal_0997 Rpal_0998     TRUE 0.864 4.000 0.073 NA   NA
 7134536 7134537 Rpal_1000 Rpal_1001     TRUE 0.947 -3.000 0.051 NA Y NA
 7134538 7134539 Rpal_1002 Rpal_1003     TRUE 0.955 4.000 0.381 1.000 N NA
 7134539 7134540 Rpal_1003 Rpal_1004     TRUE 0.982 69.000 0.948 0.002 Y NA
 7134543 7134544 Rpal_1007 Rpal_1008     FALSE 0.295 105.000 0.026 1.000   NA
 7134544 7134545 Rpal_1008 Rpal_1009     TRUE 0.891 17.000 0.181 1.000   NA
 7134545 7134546 Rpal_1009 Rpal_1010     TRUE 0.864 6.000 0.078 1.000 N NA
 7134546 7134547 Rpal_1010 Rpal_1011     FALSE 0.408 55.000 0.026 1.000 N NA
 7134547 7134548 Rpal_1011 Rpal_1012     TRUE 0.852 -3.000 0.135 NA   NA
 7134548 7134549 Rpal_1012 Rpal_1013   pgk FALSE 0.189 99.000 0.004 NA   NA
 7134549 7134550 Rpal_1013 Rpal_1014 pgk   TRUE 0.595 222.000 0.011 0.003 Y NA
 7134550 7134551 Rpal_1014 Rpal_1015     TRUE 0.748 216.000 0.439 1.000 Y NA
 7134552 7134553 Rpal_1016 Rpal_1017     TRUE 0.798 -3.000 0.068 NA   NA
 7134554 7134555 Rpal_1018 Rpal_1019     FALSE 0.392 47.000 0.009 1.000 N NA
 7134555 7134556 Rpal_1019 Rpal_1020     FALSE 0.285 63.000 0.006 1.000 N NA
 7134556 7134557 Rpal_1020 Rpal_1021     TRUE 0.660 3.000 0.010 NA N NA
 7134557 7134558 Rpal_1021 Rpal_1022     FALSE 0.046 223.000 0.007 NA N NA
 7134558 7134559 Rpal_1022 Rpal_1023     FALSE 0.007 415.000 0.020 1.000 N NA
 7134559 7134560 Rpal_1023 Rpal_1024     FALSE 0.181 83.000 0.015 NA N NA
 7134560 7134561 Rpal_1024 Rpal_1025     FALSE 0.289 106.000 0.078 NA N NA
 7134563 7134564 Rpal_1027 Rpal_1028     TRUE 0.826 174.000 0.303 1.000 Y NA
 7134565 7134566 Rpal_R0014 Rpal_1029     FALSE 0.129 103.000 0.000 NA   NA
 7134566 7134567 Rpal_1029 Rpal_1030     FALSE 0.243 218.000 0.000 0.005   NA
 7134567 7134568 Rpal_1030 Rpal_1031     FALSE 0.530 18.000 0.000 NA   NA
 7134568 7134569 Rpal_1031 Rpal_1032     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7134569 7134570 Rpal_1032 Rpal_1033     FALSE 0.470 24.000 0.000 NA   NA
 7134570 7134571 Rpal_1033 Rpal_1034     FALSE 0.284 47.000 0.000 NA   NA
 7134571 7134572 Rpal_1034 Rpal_1035     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134572 7134573 Rpal_1035 Rpal_1036     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7134573 7134574 Rpal_1036 Rpal_1037     FALSE 0.047 221.000 0.000 NA   NA
 7134575 7134576 Rpal_1038 Rpal_1039     TRUE 0.949 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7134576 7134577 Rpal_1039 Rpal_1040     FALSE 0.032 261.000 0.000 1.000   NA
 7134578 7134579 Rpal_1041 Rpal_1042     FALSE 0.040 229.000 0.000 NA   NA
 7134579 7134580 Rpal_1042 Rpal_1043     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7134581 7134582 Rpal_1044 Rpal_1045     FALSE 0.001 608.000 0.000 NA N NA
 7134582 7134583 Rpal_1045 Rpal_1046     TRUE 0.550 15.000 0.000 1.000 N NA
 7134583 7134584 Rpal_1046 Rpal_1047     TRUE 0.903 26.000 0.000 1.000 Y NA
 7134584 7134585 Rpal_1047 Rpal_1048     FALSE 0.002 526.000 0.000 NA   NA
 7134585 7134586 Rpal_1048 Rpal_1049     FALSE 0.061 209.000 0.000 NA   NA
 7134586 7134587 Rpal_1049 Rpal_1050     TRUE 0.967 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 7134587 7134588 Rpal_1050 Rpal_1051     TRUE 0.993 -19.000 0.697 0.004 Y NA
 7134588 7134589 Rpal_1051 Rpal_1052     TRUE 0.997 5.000 0.727 0.004 Y NA
 7134589 7134590 Rpal_1052 Rpal_1053     TRUE 0.996 -3.000 0.818 0.005 Y NA
 7134590 7134591 Rpal_1053 Rpal_1054     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134591 7134592 Rpal_1054 Rpal_1055     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134592 7134593 Rpal_1055 Rpal_1056     TRUE 0.964 -3.000 0.671 NA   NA
 7134593 7134594 Rpal_1056 Rpal_1057     TRUE 0.975 -3.000 0.029 0.004 Y NA
 7134595 7134596 Rpal_1058 Rpal_1059     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134596 7134597 Rpal_1059 Rpal_1060     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 7134597 7134598 Rpal_1060 Rpal_1061     FALSE 0.459 25.000 0.000 NA   NA
 7134598 7134599 Rpal_1061 Rpal_1062     FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7134599 7134600 Rpal_1062 Rpal_1063     FALSE 0.002 568.000 0.000 NA   NA
 7134602 7134603 Rpal_1065 Rpal_1066     FALSE 0.002 624.000 0.000 NA   NA
 7134603 7134604 Rpal_1066 Rpal_1067     FALSE 0.115 170.000 0.000 NA   NA
 7134604 7134605 Rpal_1067 Rpal_1068     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7134605 7134606 Rpal_1068 Rpal_1069     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134606 7134607 Rpal_1069 Rpal_1070     FALSE 0.127 140.000 0.000 NA   NA
 7134607 7134608 Rpal_1070 Rpal_1071     FALSE 0.381 33.000 0.000 NA   NA
 7134608 7134609 Rpal_1071 Rpal_1072     FALSE 0.003 490.000 0.000 NA   NA
 7134609 7134610 Rpal_1072 Rpal_1073     FALSE 0.488 22.000 0.000 NA   NA
 7134612 7134613 Rpal_1075 Rpal_1076     TRUE 0.634 1.000 0.000 NA   NA
 7134617 7134618 Rpal_1080 Rpal_1081     FALSE 0.010 301.000 0.000 NA   NA
 7134618 7134619 Rpal_1081 Rpal_1082     FALSE 0.240 56.000 0.000 NA   NA
 7134621 7134622 Rpal_1084 Rpal_1085     TRUE 0.600 27.000 0.017 NA   NA
 7134622 7134623 Rpal_1085 Rpal_1086     TRUE 0.910 2.000 0.017 0.072   NA
 7134623 7134624 Rpal_1086 Rpal_1087     TRUE 0.982 -3.000 0.667 0.017   NA
 7134626 7134627 Rpal_1089 Rpal_1090     TRUE 0.963 4.000 0.444 NA   NA
 7134627 7134628 Rpal_1090 Rpal_1091     TRUE 0.949 13.000 0.400 1.000 N NA
 7134628 7134629 Rpal_1091 Rpal_1092     TRUE 0.971 -3.000 0.400 0.003 N NA
 7134629 7134630 Rpal_1092 Rpal_1093     TRUE 0.897 30.000 0.400 NA   NA
 7134630 7134631 Rpal_1093 Rpal_1094     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 7134631 7134632 Rpal_1094 Rpal_1095     FALSE 0.037 230.000 0.000 1.000 N NA
 7134634 7134635 Rpal_1097 Rpal_1098     FALSE 0.465 -19.000 0.000 NA   NA
 7134635 7134636 Rpal_1098 Rpal_1099     FALSE 0.002 549.000 0.000 NA   NA
 7134637 7134638 Rpal_1100 Rpal_1101     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134638 7134639 Rpal_1101 Rpal_1102     FALSE 0.129 102.000 0.000 NA   NA
 7134639 7134640 Rpal_1102 Rpal_1103     FALSE 0.003 588.000 0.000 1.000   NA
 7134640 7134641 Rpal_1103 Rpal_1104     FALSE 0.039 230.000 0.000 NA   NA
 7134641 7134642 Rpal_1104 Rpal_1105     FALSE 0.071 199.000 0.000 NA   NA
 7134642 7134643 Rpal_1105 Rpal_1106     FALSE 0.001 918.000 0.000 NA   NA
 7134644 7134645 Rpal_1107 Rpal_1108     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134646 7134647 Rpal_1109 Rpal_1110     TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7134647 7134648 Rpal_1110 Rpal_1111     FALSE 0.186 70.000 0.000 NA   NA
 7134648 7134649 Rpal_1111 Rpal_1112     TRUE 0.954 -3.000 0.538 NA   NA
 7134649 7134650 Rpal_1112 Rpal_1113     FALSE 0.157 80.000 0.000 NA   NA
 7134650 7134651 Rpal_1113 Rpal_1114     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 7134653 7134654 Rpal_1116 Rpal_1117     TRUE 0.638 2.000 0.000 NA   NA
 7134654 7134655 Rpal_1117 Rpal_1118     FALSE 0.460 -49.000 0.000 NA   NA
 7134656 7134657 Rpal_1119 Rpal_1120     TRUE 0.632 9.000 0.000 NA   NA
 7134657 7134658 Rpal_1120 Rpal_1121     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134658 7134659 Rpal_1121 Rpal_1122     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134659 7134660 Rpal_1122 Rpal_1123     TRUE 0.978 11.000 0.779 NA   NA
 7134660 7134661 Rpal_1123 Rpal_1124     TRUE 0.622 11.000 0.000 NA   NA
 7134661 7134662 Rpal_1124 Rpal_1125     TRUE 0.639 6.000 0.000 NA   NA
 7134662 7134663 Rpal_1125 Rpal_1126     TRUE 0.896 4.000 0.129 NA   NA
 7134663 7134664 Rpal_1126 Rpal_1127     TRUE 0.717 0.000 0.000 1.000   NA
 7134665 7134666 Rpal_1128 Rpal_1129     TRUE 0.923 -7.000 0.400 NA   NA
 7134666 7134667 Rpal_1129 Rpal_1130     TRUE 0.951 -21.000 0.667 NA   NA
 7134667 7134668 Rpal_1130 Rpal_1131     TRUE 0.985 5.000 1.000 NA   NA
 7134669 7134670 Rpal_1132 Rpal_1133     TRUE 0.580 14.000 0.000 NA   NA
 7134670 7134671 Rpal_1133 Rpal_1134     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134671 7134672 Rpal_1134 Rpal_1135     FALSE 0.128 138.000 0.000 NA   NA
 7134672 7134673 Rpal_1135 Rpal_1136     TRUE 0.938 0.000 0.300 NA   NA
 7134673 7134674 Rpal_1136 Rpal_1137     TRUE 0.748 32.000 0.125 NA   NA
 7134674 7134675 Rpal_1137 Rpal_1138     FALSE 0.115 170.000 0.000 NA   NA
 7134677 7134678 Rpal_1140 Rpal_1141     FALSE 0.077 194.000 0.000 NA   NA
 7134678 7134679 Rpal_1141 Rpal_1142     TRUE 0.639 6.000 0.000 NA   NA
 7134680 7134681 Rpal_1143 Rpal_1144     FALSE 0.002 535.000 0.000 NA   NA
 7134681 7134682 Rpal_1144 Rpal_1145     FALSE 0.290 46.000 0.000 NA   NA
 7134683 7134684 Rpal_1146 Rpal_1147     FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 7134684 7134685 Rpal_1147 Rpal_1148     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134685 7134686 Rpal_1148 Rpal_1149     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134686 7134687 Rpal_1149 Rpal_1150     FALSE 0.474 -10.000 0.000 NA   NA
 7134687 7134688 Rpal_1150 Rpal_1151     FALSE 0.134 153.000 0.000 NA   NA
 7134688 7134689 Rpal_1151 Rpal_1152     FALSE 0.001 1250.000 0.000 NA   NA
 7134689 7134690 Rpal_1152 Rpal_1153     TRUE 0.973 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 7134690 7134691 Rpal_1153 Rpal_1154     FALSE 0.485 236.000 0.000 0.001 Y NA
 7134691 7134692 Rpal_1154 Rpal_1155     TRUE 0.978 19.000 0.056 0.001 Y NA
 7134692 7134693 Rpal_1155 Rpal_1156     TRUE 0.988 17.000 0.355 0.071 Y NA
 7134693 7134694 Rpal_1156 Rpal_1157     TRUE 0.795 128.000 0.177 1.000 Y NA
 7134694 7134695 Rpal_1157 Rpal_1158     TRUE 0.712 14.000 0.038 NA N NA
 7134695 7134696 Rpal_1158 Rpal_1159     FALSE 0.488 22.000 0.000 NA   NA
 7134696 7134697 Rpal_1159 Rpal_1160     FALSE 0.323 221.000 0.308 NA   NA
 7134697 7134698 Rpal_1160 Rpal_1161     TRUE 0.969 -3.000 0.769 NA   NA
 7134698 7134699 Rpal_1161 Rpal_1162     TRUE 0.888 -3.000 0.219 NA   NA
 7134699 7134700 Rpal_1162 Rpal_1163     TRUE 0.873 -10.000 0.247 NA   NA
 7134700 7134701 Rpal_1163 Rpal_1164     TRUE 0.805 -3.000 0.073 NA   NA
 7134701 7134702 Rpal_1164 Rpal_1165     TRUE 0.926 -7.000 0.095 0.003   NA
 7134702 7134703 Rpal_1165 Rpal_1166     TRUE 0.954 0.000 0.086 0.003   NA
 7134703 7134704 Rpal_1166 Rpal_1167     TRUE 0.963 5.000 0.018 1.000 Y NA
 7134704 7134705 Rpal_1167 Rpal_1168     TRUE 0.965 0.000 0.069 NA Y NA
 7134705 7134706 Rpal_1168 Rpal_1169     TRUE 0.992 -3.000 0.917 NA Y NA
 7134706 7134707 Rpal_1169 Rpal_1170     TRUE 0.961 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 7134707 7134708 Rpal_1170 Rpal_1171     FALSE 0.489 41.000 0.024 1.000 N NA
 7134708 7134709 Rpal_1171 Rpal_1172     TRUE 0.975 -10.000 0.200 0.087 Y NA
 7134709 7134710 Rpal_1172 Rpal_1173     TRUE 0.766 106.000 0.000 0.015 Y NA
 7134712 7134713 Rpal_1175 Rpal_1176     TRUE 0.943 -3.000 0.444 1.000 N NA
 7134713 7134714 Rpal_1176 Rpal_1177     TRUE 0.905 47.000 0.133 1.000 Y NA
 7134714 7134715 Rpal_1177 Rpal_1178     TRUE 0.869 212.000 0.867 1.000 Y NA
 7134715 7134716 Rpal_1178 Rpal_1179     TRUE 0.997 3.000 1.000 0.050 Y NA
 7134716 7134717 Rpal_1179 Rpal_1180     TRUE 0.992 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 7134717 7134718 Rpal_1180 Rpal_1181     TRUE 0.993 -19.000 0.824 0.031 Y NA
 7134722 7134723 Rpal_1185 Rpal_1186     FALSE 0.003 443.000 0.000 NA   NA
 7134724 7134725 Rpal_1187 Rpal_1188     FALSE 0.048 379.000 0.000 1.000 Y NA
 7134729 7134730 Rpal_1192 Rpal_1193     TRUE 0.801 14.000 0.052 NA   NA
 7134733 7134734 Rpal_1196 Rpal_1197     FALSE 0.340 79.000 0.045 NA   NA
 7134734 7134735 Rpal_1197 Rpal_1198     FALSE 0.303 140.000 0.030 1.000   NA
 7134735 7134736 Rpal_1198 Rpal_1199     TRUE 0.987 16.000 0.688 0.001   NA
 7134740 7134741 Rpal_1203 Rpal_1204     FALSE 0.187 133.000 0.000 1.000   NA
 7134742 7134743 Rpal_1205 Rpal_1206     FALSE 0.489 119.000 0.222 NA   NA
 7134744 7134745 Rpal_1207 Rpal_1208     FALSE 0.222 89.000 0.036 NA N NA
 7134745 7134746 Rpal_1208 Rpal_1209     FALSE 0.024 250.000 0.000 NA   NA
 7134748 7134749 Rpal_1211 Rpal_1212     TRUE 0.919 2.000 0.212 1.000 N NA
 7134749 7134750 Rpal_1212 Rpal_1213     TRUE 0.838 -3.000 0.165 NA N NA
 7134750 7134751 Rpal_1213 Rpal_1214     FALSE 0.257 62.000 0.019 NA N NA
 7134751 7134752 Rpal_1214 Rpal_1215     FALSE 0.061 209.000 0.000 NA   NA
 7134752 7134753 Rpal_1215 Rpal_1216     TRUE 0.972 5.000 0.600 NA   NA
 7134753 7134754 Rpal_1216 Rpal_1217     TRUE 0.980 -3.000 1.000 1.000   NA
 7134756 7134757 Rpal_1219 Rpal_1220     FALSE 0.269 139.000 0.038 NA   NA
 7134757 7134758 Rpal_1220 Rpal_1221     FALSE 0.184 113.000 0.009 1.000 N NA
 7134758 7134759 Rpal_1221 Rpal_1222     TRUE 0.995 -3.000 1.000 0.086 Y NA
 7134760 7134761 Rpal_1223 Rpal_1224     FALSE 0.276 168.000 0.050 NA   NA
 7134762 7134763 Rpal_1225 Rpal_1226   rnhB TRUE 0.697 97.000 0.022 1.000 Y NA
 7134763 7134764 Rpal_1226 Rpal_1227 rnhB   FALSE 0.269 72.000 0.009 NA   NA
 7134766 7134767 Rpal_1229 Rpal_1230     FALSE 0.098 259.000 0.091 1.000   NA
 7134767 7134768 Rpal_1230 Rpal_1231     FALSE 0.437 105.000 0.107 1.000   NA
 7134770 7134771 Rpal_1233 Rpal_1234     TRUE 0.948 -7.000 0.525 1.000   NA
 7134771 7134772 Rpal_1234 Rpal_1235     FALSE 0.096 246.000 0.061 1.000   NA
 7134772 7134773 Rpal_1235 Rpal_1236     FALSE 0.292 119.000 0.055 NA   NA
 7134773 7134774 Rpal_1236 Rpal_1237   glyQ FALSE 0.005 426.000 0.006 NA   NA
 7134774 7134775 Rpal_1237 Rpal_1238 glyQ   FALSE 0.298 82.000 0.008 1.000   NA
 7134775 7134776 Rpal_1238 Rpal_1239   glyS TRUE 0.801 0.000 0.013 1.000   NA
 7134776 7134777 Rpal_1239 Rpal_1240 glyS   FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 7134779 7134780 Rpal_1242 Rpal_1243     FALSE 0.263 92.000 0.028 NA   NA
 7134780 7134781 Rpal_1243 Rpal_1244     FALSE 0.013 317.000 0.000 1.000   NA
 7134782 7134783 Rpal_1245 Rpal_1246     TRUE 0.987 17.000 0.223 0.002 Y NA
 7134783 7134784 Rpal_1246 Rpal_1247     TRUE 0.908 94.000 0.210 0.002 Y NA
 7134785 7134786 Rpal_1248 Rpal_1249     TRUE 0.757 115.000 0.667 NA   NA
 7134787 7134788 Rpal_1250 Rpal_1251     FALSE 0.509 52.000 0.053 NA   NA
 7134788 7134789 Rpal_1251 Rpal_1252     TRUE 0.880 -3.000 0.147 1.000   NA
 7134789 7134790 Rpal_1252 Rpal_1253     TRUE 0.696 67.000 0.258 1.000   NA
 7134792 7134793 Rpal_1255 Rpal_1256     TRUE 0.806 -3.000 0.047 1.000   NA
 7134794 7134795 Rpal_1257 Rpal_1258     FALSE 0.002 509.000 0.000 NA   NA
 7134796 7134797 Rpal_1259 Rpal_1260     TRUE 0.688 131.000 0.462 NA   NA
 7134797 7134798 Rpal_1260 Rpal_1261     TRUE 0.677 63.000 0.259 NA   NA
 7134798 7134799 Rpal_1261 Rpal_1262     TRUE 0.810 -3.000 0.077 NA   NA
 7134800 7134801 Rpal_1263 Rpal_1264     FALSE 0.448 26.000 0.000 NA   NA
 7134801 7134802 Rpal_1264 Rpal_1265     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134803 7134804 Rpal_1266 Rpal_1267     FALSE 0.190 119.000 0.035 NA N NA
 7134805 7134806 Rpal_1268 Rpal_1269     FALSE 0.383 126.000 0.111 1.000 N NA
 7134806 7134807 Rpal_1269 Rpal_1270     TRUE 0.905 -7.000 0.278 1.000   NA
 7134807 7134808 Rpal_1270 Rpal_R0015     FALSE 0.122 121.000 0.000 NA   NA
 7134810 7134811 Rpal_1272 Rpal_1273     FALSE 0.122 115.000 0.000 NA   NA
 7134811 7134812 Rpal_1273 Rpal_1274     TRUE 0.902 -3.000 0.250 NA   NA
 7134812 7134813 Rpal_1274 Rpal_1275     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134813 7134814 Rpal_1275 Rpal_1276     TRUE 0.871 52.000 0.596 NA   NA
 7134814 7134815 Rpal_1276 Rpal_1277     TRUE 0.885 3.000 0.103 NA   NA
 7134817 7134818 Rpal_1279 Rpal_1280     FALSE 0.396 154.000 0.100 NA   NA
 7134818 7134819 Rpal_1280 Rpal_1281     FALSE 0.433 116.000 0.167 NA   NA
 7134819 7134820 Rpal_1281 Rpal_1282     TRUE 0.638 77.000 0.286 NA   NA
 7134820 7134821 Rpal_1282 Rpal_1283     FALSE 0.253 136.000 0.030 NA   NA
 7134821 7134822 Rpal_1283 Rpal_1284     FALSE 0.514 61.000 0.091 1.000 N NA
 7134822 7134823 Rpal_1284 Rpal_1285     FALSE 0.221 195.000 0.045 1.000   NA
 7134827 7134828 Rpal_1289 Rpal_1290 ruvC ruvA TRUE 0.914 185.000 0.451 0.006 Y NA
 7134828 7134829 Rpal_1290 Rpal_1291 ruvA   TRUE 0.651 -3.000 0.008 1.000 N NA
 7134829 7134830 Rpal_1291 Rpal_1292   ruvB FALSE 0.144 179.000 0.005 1.000 N NA
 7134830 7134831 Rpal_1292 Rpal_1293 ruvB   TRUE 0.891 8.000 0.082 1.000   NA
 7134831 7134832 Rpal_1293 Rpal_1294     FALSE 0.261 100.000 0.009 1.000   NA
 7134832 7134833 Rpal_1294 Rpal_1295     FALSE 0.124 110.000 0.000 NA   NA
 7134833 7134834 Rpal_1295 Rpal_1296     TRUE 0.600 58.000 0.143 NA   NA
 7134834 7134835 Rpal_1296 Rpal_1297     TRUE 0.840 17.000 0.111 NA   NA
 7134835 7134836 Rpal_1297 Rpal_1298     FALSE 0.133 150.000 0.000 NA   NA
 7134836 7134837 Rpal_1298 Rpal_1299     TRUE 0.973 -3.000 0.867 NA   NA
 7134841 7134842 Rpal_1303 Rpal_1304     FALSE 0.277 139.000 0.041 NA   NA
 7134842 7134843 Rpal_1304 Rpal_1305     FALSE 0.520 143.000 0.233 NA   NA
 7134843 7134844 Rpal_1305 Rpal_1306     FALSE 0.293 150.000 0.044 NA   NA
 7134844 7134845 Rpal_1306 Rpal_1307     TRUE 0.914 -16.000 0.381 NA   NA
 7134845 7134846 Rpal_1307 Rpal_1308     FALSE 0.009 308.000 0.000 1.000 N NA
 7134846 7134847 Rpal_1308 Rpal_1309     TRUE 0.880 98.000 0.220 0.060 Y NA
 7134847 7134848 Rpal_1309 Rpal_1310     TRUE 0.698 49.000 0.195 NA   NA
 7134848 7134849 Rpal_1310 Rpal_1311   tolB FALSE 0.363 73.000 0.043 NA   NA
 7134849 7134850 Rpal_1311 Rpal_1312 tolB   FALSE 0.161 171.000 0.005 1.000 N NA
 7134850 7134851 Rpal_1312 Rpal_1313     FALSE 0.367 195.000 0.226 NA   NA
 7134851 7134852 Rpal_1313 Rpal_1314     FALSE 0.007 327.000 0.000 NA   NA
 7134852 7134853 Rpal_1314 Rpal_1315     FALSE 0.529 156.000 0.199 1.000   NA
 7134853 7134854 Rpal_1315 Rpal_1316     TRUE 0.610 55.000 0.085 1.000   NA
 7134854 7134855 Rpal_1316 Rpal_1317     FALSE 0.161 232.000 0.145 1.000 N NA
 7134855 7134856 Rpal_1317 Rpal_1318     FALSE 0.062 133.000 0.000 NA N NA
 7134856 7134857 Rpal_1318 Rpal_1319     TRUE 0.837 -3.000 0.108 NA   NA
 7134857 7134858 Rpal_1319 Rpal_1320     FALSE 0.087 187.000 0.000 NA   NA
 7134858 7134859 Rpal_1320 Rpal_1321     FALSE 0.271 124.000 0.017 1.000   NA
 7134859 7134860 Rpal_1321 Rpal_1322     TRUE 0.901 163.000 0.266 0.017 Y NA
 7134860 7134861 Rpal_1322 Rpal_1323     TRUE 0.984 -3.000 0.227 0.046 Y NA
 7134861 7134862 Rpal_1323 Rpal_1324     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 7134862 7134863 Rpal_1324 Rpal_1325     FALSE 0.003 421.000 0.000 NA   NA
 7134865 7134866 Rpal_1327 Rpal_1328     FALSE 0.405 145.000 0.118 NA   NA
 7134867 7134868 Rpal_1329 Rpal_1330     FALSE 0.465 113.000 0.200 NA   NA
 7134868 7134869 Rpal_1330 Rpal_1331   groEL TRUE 0.595 215.000 0.750 NA   NA
 7134869 7134870 Rpal_1331 Rpal_1332 groEL groES TRUE 0.980 40.000 0.833 1.000 Y NA
 7134871 7134872 Rpal_1333 Rpal_1334     TRUE 0.830 44.000 0.357 NA   NA
 7134875 7134876 Rpal_1337 Rpal_1338     FALSE 0.391 116.000 0.122 NA   NA
 7134876 7134877 Rpal_1338 Rpal_1339     TRUE 0.940 -3.000 0.412 NA   NA
 7134877 7134878 Rpal_1339 Rpal_1340   hisG FALSE 0.156 94.000 0.012 NA N NA
 7134878 7134879 Rpal_1340 Rpal_1341 hisG hisZ TRUE 0.974 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 7134879 7134880 Rpal_1341 Rpal_1342 hisZ   FALSE 0.227 145.000 0.018 NA   NA
 7134881 7134882 Rpal_1343 Rpal_1344   ubiA TRUE 0.658 -3.000 0.007 NA   NA
 7134884 7134885 Rpal_1346 Rpal_1347     TRUE 0.838 -13.000 0.182 NA   NA
 7134885 7134886 Rpal_1347 Rpal_1348     TRUE 0.899 38.000 0.515 NA   NA
 7134886 7134887 Rpal_1348 Rpal_1349     FALSE 0.376 88.000 0.074 NA   NA
 7134887 7134888 Rpal_1349 Rpal_1350   lpxK TRUE 0.938 -7.000 0.037 1.000 Y NA
 7134889 7134890 Rpal_1351 Rpal_1352   xseA FALSE 0.221 147.000 0.015 NA   NA
 7134891 7134892 Rpal_1353 Rpal_1354     FALSE 0.242 164.000 0.006 1.000   NA
 7134894 7134895 Rpal_1356 Rpal_1357     FALSE 0.102 239.000 0.079 1.000 N NA
 7134896 7134897 Rpal_1358 Rpal_1359     TRUE 0.751 0.000 0.017 1.000 N NA
 7134897 7134898 Rpal_1359 Rpal_1360     TRUE 0.990 27.000 0.501 0.002 Y NA
 7134898 7134899 Rpal_1360 Rpal_1361     TRUE 0.812 -3.000 0.082 1.000 N NA
 7134899 7134900 Rpal_1361 Rpal_1362   uvrC FALSE 0.505 140.000 0.227 1.000 N NA
 7134902 7134903 Rpal_1364 Rpal_1365     FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 7134905 7134906 Rpal_1367 Rpal_1368     FALSE 0.234 169.000 0.030 NA   NA
 7134906 7134907 Rpal_1368 Rpal_1369   hisS FALSE 0.302 139.000 0.029 1.000   NA
 7134908 7134909 Rpal_1370 Rpal_1371     FALSE 0.322 97.000 0.089 NA N NA
 7134909 7134910 Rpal_1371 Rpal_1372     TRUE 0.853 13.000 0.135 NA N NA
 7134911 7134912 Rpal_1373 Rpal_1374     TRUE 0.811 167.000 0.876 NA   NA
 7134912 7134913 Rpal_1374 Rpal_1375     TRUE 0.971 -3.000 0.816 NA   NA
 7134913 7134914 Rpal_1375 Rpal_1376     TRUE 0.975 0.000 0.697 NA   NA
 7134915 7134916 Rpal_1377 Rpal_1378     TRUE 0.928 -3.000 0.346 NA   NA
 7134916 7134917 Rpal_1378 Rpal_1379     TRUE 0.792 -3.000 0.063 NA   NA
 7134917 7134918 Rpal_1379 Rpal_1380     TRUE 0.718 -3.000 0.026 NA   NA
 7134919 7134920 Rpal_1381 Rpal_1382     FALSE 0.237 78.000 0.006 NA   NA
 7134920 7134921 Rpal_1382 Rpal_1383     TRUE 0.767 11.000 0.022 1.000 N NA
 7134922 7134923 Rpal_1384 Rpal_1385     TRUE 0.949 41.000 0.045 0.001 Y NA
 7134923 7134924 Rpal_1385 Rpal_1386     FALSE 0.212 159.000 0.013 1.000 N NA
 7134924 7134925 Rpal_1386 Rpal_1387     FALSE 0.397 91.000 0.091 NA   NA
 7134926 7134927 Rpal_1388 Rpal_1389     TRUE 0.724 -3.000 0.032 1.000 N NA
 7134928 7134929 Rpal_1390 Rpal_1391     TRUE 0.705 120.000 0.519 NA   NA
 7134929 7134930 Rpal_1391 Rpal_1392     FALSE 0.004 399.000 0.000 1.000 N NA
 7134930 7134931 Rpal_1392 Rpal_1393     TRUE 0.638 109.000 0.397 1.000 N NA
 7134931 7134932 Rpal_1393 Rpal_1394     FALSE 0.190 135.000 0.008 1.000 N NA
 7134932 7134933 Rpal_1394 Rpal_1395     FALSE 0.180 104.000 0.005 1.000 N NA
 7134936 7134937 Rpal_1398 Rpal_1399     TRUE 0.622 190.000 0.000 0.085 Y NA
 7134939 7134940 Rpal_1401 Rpal_1402     TRUE 0.768 42.000 0.231 NA   NA
 7134940 7134941 Rpal_1402 Rpal_1403     TRUE 0.840 -7.000 0.172 NA   NA
 7134941 7134942 Rpal_1403 Rpal_1404     TRUE 0.815 19.000 0.094 NA   NA
 7134942 7134943 Rpal_1404 Rpal_1405     TRUE 0.688 174.000 0.556 NA   NA
 7134943 7134944 Rpal_1405 Rpal_1406     FALSE 0.048 220.000 0.000 NA   NA
 7134944 7134945 Rpal_1406 Rpal_1407     FALSE 0.537 136.000 0.250 NA   NA
 7134945 7134946 Rpal_1407 Rpal_1408     TRUE 0.842 109.000 0.917 1.000   NA
 7134946 7134947 Rpal_1408 Rpal_1409     TRUE 0.996 14.000 1.000 0.049 Y NA
 7134947 7134948 Rpal_1409 Rpal_1410     TRUE 0.833 165.000 0.267 1.000 Y NA
 7134952 7134953 Rpal_1414 Rpal_1415     TRUE 0.838 29.000 0.231 NA   NA
 7134953 7134954 Rpal_1415 Rpal_1416     FALSE 0.512 107.000 0.231 NA   NA
 7134955 7134956 Rpal_1417 Rpal_1418     TRUE 0.990 -3.000 0.312 0.001 Y NA
 7134956 7134957 Rpal_1418 Rpal_1419     TRUE 0.995 -3.000 0.833 0.069 Y NA
 7134957 7134958 Rpal_1419 Rpal_1420     TRUE 0.987 2.000 0.057 0.001 Y NA
 7134958 7134959 Rpal_1420 Rpal_1421     TRUE 0.994 15.000 0.505 0.001 Y NA
 7134959 7134960 Rpal_1421 Rpal_1422     TRUE 0.731 24.000 0.061 1.000 N NA
 7134960 7134961 Rpal_1422 Rpal_1423     FALSE 0.056 210.000 0.000 1.000 N NA
 7134961 7134962 Rpal_1423 Rpal_1424     TRUE 0.997 3.000 1.000 0.049 Y NA
 7134962 7134963 Rpal_1424 Rpal_1425     TRUE 0.993 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7134963 7134964 Rpal_1425 Rpal_1426     TRUE 0.991 4.000 0.286 0.030 Y NA
 7134964 7134965 Rpal_1426 Rpal_1427     FALSE 0.450 -16.000 0.000 1.000 N NA
 7134965 7134966 Rpal_1427 Rpal_1428     FALSE 0.310 40.000 0.000 1.000 N NA
 7134967 7134968 Rpal_1429 Rpal_1430     TRUE 0.992 19.000 0.500 0.008 Y NA
 7134968 7134969 Rpal_1430 Rpal_1431     TRUE 0.980 4.000 0.174 1.000 Y NA
 7134970 7134971 Rpal_1432 Rpal_1433     TRUE 0.996 5.000 0.667 0.059 Y NA
 7134971 7134972 Rpal_1433 Rpal_1434     TRUE 0.958 -3.000 0.600 1.000 N NA
 7134974 7134975 Rpal_1436 Rpal_1437     TRUE 0.554 16.000 0.000 NA   NA
 7134975 7134976 Rpal_1437 Rpal_1438     TRUE 0.786 -13.000 0.096 NA   NA
 7134976 7134977 Rpal_1438 Rpal_1439     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134977 7134978 Rpal_1439 Rpal_1440     FALSE 0.079 192.000 0.000 NA   NA
 7134979 7134980 Rpal_1441 Rpal_1442     TRUE 0.945 -10.000 0.310 0.021 N NA
 7134981 7134982 Rpal_1443 Rpal_1444     TRUE 0.848 167.000 0.367 NA Y NA
 7134982 7134983 Rpal_1444 Rpal_1445     TRUE 0.996 15.000 0.888 0.049 Y NA
 7134983 7134984 Rpal_1445 Rpal_1446     TRUE 0.975 11.000 0.639 1.000   NA
 7134984 7134985 Rpal_1446 Rpal_1447     TRUE 0.985 11.000 0.600 0.030   NA
 7134985 7134986 Rpal_1447 Rpal_1448     TRUE 0.840 37.000 0.312 1.000 N NA
 7134986 7134987 Rpal_1448 Rpal_1449     FALSE 0.333 238.000 0.478 NA   NA
 7134989 7134990 Rpal_1451 Rpal_1452     FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 7134990 7134991 Rpal_1452 Rpal_1453     FALSE 0.390 89.000 0.087 1.000 N NA
 7134991 7134992 Rpal_1453 Rpal_1454     FALSE 0.433 97.000 0.143 1.000 N NA
 7134994 7134995 Rpal_1456 Rpal_1457   fliF FALSE 0.291 200.000 0.113 1.000   NA
 7134995 7134996 Rpal_1457 Rpal_1458 fliF fliG TRUE 0.997 7.000 0.762 0.005 Y NA
 7134996 7134997 Rpal_1458 Rpal_1459 fliG fliH TRUE 0.971 0.000 0.121 NA Y NA
 7134997 7134998 Rpal_1459 Rpal_1460 fliH   TRUE 0.959 18.000 0.127 NA Y NA
 7134998 7134999 Rpal_1460 Rpal_1461     TRUE 0.856 48.000 0.484 1.000 N NA
 7135000 7135001 Rpal_1462 Rpal_1463     TRUE 0.889 55.000 0.714 NA   NA
 7135001 7135002 Rpal_1463 Rpal_1464     TRUE 0.721 37.000 0.130 NA   NA
 7135003 7135004 Rpal_1465 Rpal_1466     FALSE 0.304 132.000 0.054 NA   NA
 7135007 7135008 Rpal_1469 Rpal_1470     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7135009 7135010 Rpal_1471 Rpal_1472     FALSE 0.254 158.000 0.006 1.000   NA
 7135010 7135011 Rpal_1472 Rpal_1473     FALSE 0.002 585.000 0.000 NA   NA
 7135012 7135013 Rpal_1474 Rpal_1475     TRUE 0.913 -7.000 0.355 NA   NA
 7135018 7135019 Rpal_1480 Rpal_1481 dnaG   FALSE 0.164 260.000 0.299 1.000 N NA
 7135019 7135020 Rpal_1481 Rpal_1482     FALSE 0.247 73.000 0.004 NA   NA
 7135020 7135021 Rpal_1482 Rpal_1483     TRUE 0.580 14.000 0.000 NA   NA
 7135022 7135023 Rpal_1484 Rpal_1485     TRUE 0.963 10.000 0.467 NA   NA
 7135023 7135024 Rpal_1485 Rpal_1486     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 7135026 7135027 Rpal_1488 Rpal_1489     FALSE 0.123 189.000 0.000 1.000   NA
 7135028 7135029 Rpal_1490 Rpal_1491     FALSE 0.018 272.000 0.000 NA   NA
 7135032 7135033 Rpal_1494 Rpal_1495     TRUE 0.958 13.000 0.050 NA Y NA
 7135034 7135035 Rpal_1496 Rpal_1497 mnmA   TRUE 0.674 20.000 0.024 1.000 N NA
 7135035 7135036 Rpal_1497 Rpal_1498     TRUE 0.897 46.000 0.643 NA   NA
 7135036 7135037 Rpal_1498 Rpal_R0016     FALSE 0.121 118.000 0.000 NA   NA
 7135039 7135040 Rpal_1500 Rpal_1501     FALSE 0.162 230.000 0.000 0.041   NA
 7135040 7135041 Rpal_1501 Rpal_1502     TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 7135041 7135042 Rpal_1502 Rpal_1503     FALSE 0.124 110.000 0.000 NA   NA
 7135042 7135043 Rpal_1503 Rpal_1504     TRUE 0.634 1.000 0.000 NA   NA
 7135045 7135046 Rpal_1507 Rpal_1508     FALSE 0.130 101.000 0.000 NA   NA
 7135046 7135047 Rpal_1508 Rpal_1509     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135047 7135048 Rpal_1509 Rpal_1510     FALSE 0.372 34.000 0.000 NA   NA
 7135048 7135049 Rpal_1510 Rpal_1511     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7135049 7135050 Rpal_1511 Rpal_1512     FALSE 0.130 161.000 0.000 NA   NA
 7135050 7135051 Rpal_1512 Rpal_1513     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 7135051 7135052 Rpal_1513 Rpal_1514     FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 7135052 7135053 Rpal_1514 Rpal_1515     FALSE 0.014 285.000 0.000 NA   NA
 7135053 7135054 Rpal_1515 Rpal_1516     FALSE 0.039 230.000 0.000 NA   NA
 7135054 7135055 Rpal_1516 Rpal_1517     FALSE 0.004 401.000 0.000 NA   NA
 7135055 7135056 Rpal_1517 Rpal_1518     TRUE 0.873 56.000 0.000 0.025 Y NA
 7135056 7135057 Rpal_1518 Rpal_1519     TRUE 0.990 -3.000 0.400 0.021 Y NA
 7135057 7135058 Rpal_1519 Rpal_1520     FALSE 0.007 377.000 0.000 1.000   NA
 7135058 7135059 Rpal_1520 Rpal_1521     FALSE 0.186 162.000 0.000 1.000   NA
 7135059 7135060 Rpal_1521 Rpal_1522     TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7135061 7135062 Rpal_1523 Rpal_1524     FALSE 0.123 146.000 0.000 1.000 N NA
 7135062 7135063 Rpal_1524 Rpal_1525     TRUE 0.745 131.000 0.000 0.053 Y NA
 7135063 7135064 Rpal_1525 Rpal_1526     FALSE 0.013 316.000 0.000 1.000   NA
 7135064 7135065 Rpal_1526 Rpal_1527     FALSE 0.097 181.000 0.000 NA   NA
 7135065 7135066 Rpal_1527 Rpal_1528     TRUE 0.976 3.000 0.167 NA Y NA
 7135066 7135067 Rpal_1528 Rpal_1529     FALSE 0.424 11.000 0.000 NA N NA
 7135067 7135068 Rpal_1529 Rpal_1530     TRUE 0.943 -3.000 0.500 NA N NA
 7135069 7135070 Rpal_1531 Rpal_1532     FALSE 0.024 246.000 0.000 1.000 N NA
 7135070 7135071 Rpal_1532 Rpal_1533     TRUE 0.989 19.000 0.667 1.000 Y NA
 7135071 7135072 Rpal_1533 Rpal_1534     TRUE 0.986 -3.000 0.286 0.068 Y NA
 7135072 7135073 Rpal_1534 Rpal_1535     FALSE 0.216 84.000 0.000 1.000   NA
 7135073 7135074 Rpal_1535 Rpal_1536     FALSE 0.121 116.000 0.000 NA   NA
 7135074 7135075 Rpal_1536 Rpal_1537     FALSE 0.089 186.000 0.000 NA   NA
 7135075 7135076 Rpal_1537 Rpal_1538     FALSE 0.036 194.000 0.000 NA N NA
 7135078 7135079 Rpal_1540 Rpal_1541     TRUE 0.831 14.000 0.074 NA   NA
 7135079 7135080 Rpal_1541 Rpal_1542     TRUE 0.807 -3.000 0.074 NA   NA
 7135082 7135083 Rpal_1544 Rpal_1545   fumC FALSE 0.185 130.000 0.000 1.000   NA
 7135083 7135084 Rpal_1545 Rpal_1546 fumC   TRUE 0.728 2.000 0.003 NA   NA
 7135084 7135085 Rpal_1546 Rpal_1547     TRUE 0.818 -3.000 0.083 NA   NA
 7135085 7135086 Rpal_1547 Rpal_1548     TRUE 0.831 -3.000 0.099 NA   NA
 7135086 7135087 Rpal_1548 Rpal_1549     FALSE 0.002 1052.000 0.000 1.000   NA
 7135087 7135088 Rpal_1549 Rpal_1550     TRUE 0.850 -3.000 0.000 0.038   NA
 7135088 7135089 Rpal_1550 Rpal_1551     TRUE 0.907 27.000 0.400 1.000 N NA
 7135089 7135090 Rpal_1551 Rpal_1552     TRUE 0.978 9.000 0.750 1.000 N NA
 7135090 7135091 Rpal_1552 Rpal_1553     TRUE 0.945 13.000 0.182 0.038 N NA
 7135091 7135092 Rpal_1553 Rpal_1554     FALSE 0.466 -7.000 0.000 1.000 N NA
 7135092 7135093 Rpal_1554 Rpal_1555     FALSE 0.524 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7135093 7135094 Rpal_1555 Rpal_1556     TRUE 0.989 -3.000 0.400 0.048 Y NA
 7135094 7135095 Rpal_1556 Rpal_1557     TRUE 0.978 -10.000 0.400 1.000 Y NA
 7135095 7135096 Rpal_1557 Rpal_1558     TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.030 Y NA
 7135096 7135097 Rpal_1558 Rpal_1559     TRUE 0.871 30.000 0.000 NA Y NA
 7135097 7135098 Rpal_1559 Rpal_1560     FALSE 0.120 57.000 0.000 NA N NA
 7135098 7135099 Rpal_1560 Rpal_1561     FALSE 0.079 192.000 0.000 NA   NA
 7135100 7135101 Rpal_1562 Rpal_1563     TRUE 0.988 11.000 0.667 0.005   NA
 7135102 7135103 Rpal_1564 Rpal_1565     FALSE 0.005 415.000 0.000 1.000   NA
 7135103 7135104 Rpal_1565 Rpal_1566     FALSE 0.125 149.000 0.000 1.000 N NA
 7135105 7135106 Rpal_1567 Rpal_1568     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135106 7135107 Rpal_1568 Rpal_1569     FALSE 0.138 93.000 0.000 NA   NA
 7135107 7135108 Rpal_1569 Rpal_1570     FALSE 0.461 -37.000 0.000 NA   NA
 7135109 7135110 Rpal_1571 Rpal_1572     TRUE 0.986 -3.000 0.286 0.048 Y NA
 7135110 7135111 Rpal_1572 Rpal_1573     TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7135111 7135112 Rpal_1573 Rpal_1574     TRUE 0.839 42.000 0.000 1.000 Y NA
 7135113 7135114 Rpal_1575 Rpal_1576     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135114 7135115 Rpal_1576 Rpal_1577     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135115 7135116 Rpal_1577 Rpal_1578     TRUE 0.622 11.000 0.000 NA   NA
 7135116 7135117 Rpal_1578 Rpal_1579     FALSE 0.518 19.000 0.000 NA   NA
 7135117 7135118 Rpal_1579 Rpal_1580     FALSE 0.002 543.000 0.000 NA   NA
 7135118 7135119 Rpal_1580 Rpal_1581     FALSE 0.142 90.000 0.000 NA   NA
 7135120 7135121 Rpal_1582 Rpal_1583     FALSE 0.182 71.000 0.000 NA   NA
 7135121 7135122 Rpal_1583 Rpal_1584     TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7135122 7135123 Rpal_1584 Rpal_1585     FALSE 0.524 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7135123 7135124 Rpal_1585 Rpal_1586     FALSE 0.178 113.000 0.000 1.000   NA
 7135125 7135126 Rpal_1587 Rpal_1588     TRUE 0.604 0.000 0.000 1.000 N NA
 7135126 7135127 Rpal_1588 Rpal_1589     TRUE 0.982 3.000 0.835 NA   NA
 7135127 7135128 Rpal_1589 Rpal_1590     TRUE 0.984 3.000 0.931 NA   NA
 7135128 7135129 Rpal_1590 Rpal_1591     TRUE 0.833 39.000 0.314 NA   NA
 7135129 7135130 Rpal_1591 Rpal_1592     TRUE 0.991 -3.000 0.797 1.000 Y NA
 7135130 7135131 Rpal_1592 Rpal_1593     TRUE 0.979 34.000 0.719 NA Y NA
 7135131 7135132 Rpal_1593 Rpal_1594     FALSE 0.002 374.000 0.000 NA N NA
 7135135 7135136 Rpal_1597 Rpal_1598     FALSE 0.060 126.000 0.000 NA N NA
 7135136 7135137 Rpal_1598 Rpal_1599     TRUE 0.981 8.000 0.250 NA Y NA
 7135137 7135138 Rpal_1599 Rpal_1600     TRUE 0.975 -7.000 0.133 0.030 Y NA
 7135138 7135139 Rpal_1600 Rpal_1601     TRUE 0.971 14.000 0.133 1.000 Y NA
 7135139 7135140 Rpal_1601 Rpal_1602     TRUE 0.994 -3.000 0.750 0.048 Y NA
 7135141 7135142 Rpal_1603 Rpal_1604     TRUE 0.950 -3.000 0.500 1.000 N NA
 7135142 7135143 Rpal_1604 Rpal_1605     TRUE 0.685 88.000 0.400 NA   NA
 7135143 7135144 Rpal_1605 Rpal_1606     TRUE 0.750 97.000 0.600 NA   NA
 7135145 7135146 Rpal_1607 Rpal_1608     TRUE 0.778 -13.000 0.088 NA   NA
 7135146 7135147 Rpal_1608 Rpal_1609     TRUE 0.706 165.000 0.044 1.000 Y NA
 7135147 7135148 Rpal_1609 Rpal_1610     FALSE 0.200 190.000 0.052 1.000 N NA
 7135148 7135149 Rpal_1610 Rpal_1611     TRUE 0.990 -10.000 0.914 1.000 Y NA
 7135149 7135150 Rpal_1611 Rpal_1612     TRUE 0.924 29.000 0.073 NA Y NA
 7135151 7135152 Rpal_1613 Rpal_1614     TRUE 0.618 96.000 0.385 NA N NA
 7135152 7135153 Rpal_1614 Rpal_1615     FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 7135155 7135156 Rpal_1617 Rpal_1618     FALSE 0.427 58.000 0.038 NA   NA
 7135156 7135157 Rpal_1618 Rpal_1619     TRUE 0.852 -3.000 0.135 NA   NA
 7135157 7135158 Rpal_1619 Rpal_1620     TRUE 0.707 83.000 0.412 NA   NA
 7135158 7135159 Rpal_1620 Rpal_1621     TRUE 0.990 14.000 0.941 0.005   NA
 7135159 7135160 Rpal_1621 Rpal_1622     TRUE 0.992 12.000 1.000 0.005   NA
 7135160 7135161 Rpal_1622 Rpal_1623   nifH TRUE 0.873 50.000 0.267 0.005 N NA
 7135161 7135162 Rpal_1623 Rpal_1624 nifH   FALSE 0.007 524.000 0.000 0.099 N NA
 7135162 7135163 Rpal_1624 Rpal_1625     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7135163 7135164 Rpal_1625 Rpal_1626     FALSE 0.094 183.000 0.000 NA   NA
 7135164 7135165 Rpal_1626 Rpal_1627     TRUE 0.987 10.000 0.545 0.001   NA
 7135165 7135166 Rpal_1627 Rpal_1628     FALSE 0.019 292.000 0.000 1.000   NA
 7135167 7135168 Rpal_1629 Rpal_1630     FALSE 0.284 47.000 0.000 NA   NA
 7135168 7135169 Rpal_1630 Rpal_1631     TRUE 0.981 -3.000 0.080 0.002 Y NA
 7135169 7135170 Rpal_1631 Rpal_1632     TRUE 0.972 -9.000 0.300 1.000 Y NA
 7135170 7135171 Rpal_1632 Rpal_1633     TRUE 0.982 53.000 0.800 0.048 Y NA
 7135171 7135172 Rpal_1633 Rpal_1634     TRUE 0.993 -3.000 0.600 0.048 Y NA
 7135172 7135173 Rpal_1634 Rpal_1635     TRUE 0.784 26.000 0.118 1.000 N NA
 7135173 7135174 Rpal_1635 Rpal_1636     TRUE 0.939 64.000 0.316 0.083 Y NA
 7135174 7135175 Rpal_1636 Rpal_1637     TRUE 0.693 38.000 0.105 NA   NA
 7135177 7135178 Rpal_1639 Rpal_1640     TRUE 0.887 5.000 0.107 NA   NA
 7135178 7135179 Rpal_1640 Rpal_1641     FALSE 0.247 111.000 0.032 NA   NA
 7135179 7135180 Rpal_1641 Rpal_1642     TRUE 0.973 38.000 0.794 0.001   NA
 7135180 7135181 Rpal_1642 Rpal_1643     TRUE 0.933 57.000 0.529 0.001   NA
 7135181 7135182 Rpal_1643 Rpal_1644     TRUE 0.878 141.000 0.590 0.001   NA
 7135183 7135184 Rpal_1645 Rpal_1646     FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7135184 7135185 Rpal_1646 Rpal_1647     FALSE 0.139 92.000 0.000 NA   NA
 7135189 7135190 Rpal_1651 Rpal_1652     TRUE 0.900 -3.000 0.250 1.000 N NA
 7135190 7135191 Rpal_1652 Rpal_1653     TRUE 0.917 -3.000 0.300 NA   NA
 7135191 7135192 Rpal_1653 Rpal_1654     TRUE 0.915 3.000 0.189 NA   NA
 7135192 7135193 Rpal_1654 Rpal_1655     TRUE 0.647 29.000 0.041 NA   NA
 7135193 7135194 Rpal_1655 Rpal_1656     FALSE 0.138 93.000 0.000 NA   NA
 7135194 7135195 Rpal_1656 Rpal_1657     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135195 7135196 Rpal_1657 Rpal_1658     FALSE 0.306 43.000 0.000 NA   NA
 7135196 7135197 Rpal_1658 Rpal_1659     TRUE 0.996 11.000 0.818 0.048 Y NA
 7135197 7135198 Rpal_1659 Rpal_1660     TRUE 0.932 171.000 0.556 0.048 Y NA
 7135198 7135199 Rpal_1660 Rpal_1661     FALSE 0.004 379.000 0.000 NA   NA
 7135199 7135200 Rpal_1661 Rpal_1662     FALSE 0.022 254.000 0.000 NA   NA
 7135201 7135202 Rpal_1663 Rpal_1664     TRUE 0.913 48.000 0.870 NA N NA
 7135202 7135203 Rpal_1664 Rpal_1665     TRUE 0.985 5.000 0.660 0.048 N NA
 7135203 7135204 Rpal_1665 Rpal_1666     TRUE 0.993 -3.000 0.632 0.048 Y NA
 7135204 7135205 Rpal_1666 Rpal_1667     TRUE 0.905 0.000 0.132 1.000   NA
 7135205 7135206 Rpal_1667 Rpal_1668     TRUE 0.595 104.000 0.273 1.000   NA
 7135206 7135207 Rpal_1668 Rpal_1669     FALSE 0.403 131.000 0.080 1.000   NA
 7135209 7135210 Rpal_1671 Rpal_1672     FALSE 0.158 178.000 0.007 NA   NA
 7135210 7135211 Rpal_1672 Rpal_1673     FALSE 0.176 217.000 0.090 NA   NA
 7135211 7135212 Rpal_1673 Rpal_1674     TRUE 0.680 39.000 0.102 NA   NA
 7135213 7135214 Rpal_1675 Rpal_1676     FALSE 0.122 135.000 0.000 1.000 N NA
 7135214 7135215 Rpal_1676 Rpal_1677     TRUE 0.995 5.000 0.600 0.025 Y NA
 7135216 7135217 Rpal_1678 Rpal_1679     TRUE 0.903 13.000 0.000 0.004   NA
 7135217 7135218 Rpal_1679 Rpal_1680     TRUE 0.774 187.000 1.000 NA   NA
 7135218 7135219 Rpal_1680 Rpal_1681     TRUE 0.975 19.000 1.000 NA   NA
 7135219 7135220 Rpal_1681 Rpal_1682     TRUE 0.554 16.000 0.000 NA   NA
 7135220 7135221 Rpal_1682 Rpal_1683     FALSE 0.127 141.000 0.000 NA   NA
 7135221 7135222 Rpal_1683 Rpal_1684     FALSE 0.005 350.000 0.000 1.000 N NA
 7135222 7135223 Rpal_1684 Rpal_1685     TRUE 0.969 11.000 0.600 1.000 N NA
 7135223 7135224 Rpal_1685 Rpal_1686     FALSE 0.417 138.000 0.133 NA   NA
 7135225 7135226 Rpal_1687 Rpal_1688     FALSE 0.448 115.000 0.133 1.000   NA
 7135226 7135227 Rpal_1688 Rpal_1689     TRUE 0.567 61.000 0.133 NA   NA
 7135227 7135228 Rpal_1689 Rpal_1690     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135228 7135229 Rpal_1690 Rpal_1691     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135230 7135231 Rpal_1692 Rpal_1693     TRUE 0.960 6.000 0.005 1.000 Y NA
 7135231 7135232 Rpal_1693 Rpal_1694   bchD TRUE 0.993 -3.000 0.465 0.001 Y NA
 7135233 7135234 Rpal_1695 Rpal_1696   hemE FALSE 0.004 383.000 0.000 NA   NA
 7135235 7135236 Rpal_1697 Rpal_1698     TRUE 0.936 11.000 0.286 NA   NA
 7135236 7135237 Rpal_1698 Rpal_1699     FALSE 0.335 76.000 0.041 1.000 N NA
 7135237 7135238 Rpal_1699 Rpal_1700     TRUE 0.923 -3.000 0.332 1.000 N NA
 7135238 7135239 Rpal_1700 Rpal_1701     FALSE 0.015 303.000 0.004 1.000 N NA
 7135241 7135242 Rpal_1703 Rpal_1704     TRUE 0.942 36.000 0.833 NA   NA
 7135243 7135244 Rpal_1705 Rpal_1706     TRUE 0.980 5.000 0.434 0.045   NA
 7135245 7135246 Rpal_1707 Rpal_1708     TRUE 0.873 50.000 0.500 1.000   NA
 7135246 7135247 Rpal_1708 Rpal_1709     TRUE 0.796 89.000 0.627 1.000   NA
 7135247 7135248 Rpal_1709 Rpal_1710     TRUE 0.991 0.000 0.882 0.002 N NA
 7135248 7135249 Rpal_1710 Rpal_1711     TRUE 0.972 24.000 0.491 0.002   NA
 7135249 7135250 Rpal_1711 Rpal_1712     TRUE 0.988 0.000 0.632 0.002   NA
 7135250 7135251 Rpal_1712 Rpal_1713     FALSE 0.445 78.000 0.096 NA   NA
 7135251 7135252 Rpal_1713 Rpal_1714     FALSE 0.433 154.000 0.135 NA   NA
 7135252 7135253 Rpal_1714 Rpal_1715     TRUE 0.990 16.000 0.946 0.004   NA
 7135253 7135254 Rpal_1715 Rpal_1716     TRUE 0.908 132.000 0.829 0.004   NA
 7135254 7135255 Rpal_1716 Rpal_1717     TRUE 0.982 28.000 0.895 0.004   NA
 7135255 7135256 Rpal_1717 Rpal_1718     FALSE 0.049 285.000 0.053 1.000   NA
 7135256 7135257 Rpal_1718 Rpal_1719     TRUE 0.873 -7.000 0.200 1.000   NA
 7135257 7135258 Rpal_1719 Rpal_1720     TRUE 0.970 3.000 0.640 NA N NA
 7135258 7135259 Rpal_1720 Rpal_1721     TRUE 0.937 2.000 0.314 NA N NA
 7135259 7135260 Rpal_1721 Rpal_1722     TRUE 0.786 20.000 0.078 1.000 N NA
 7135260 7135261 Rpal_1722 Rpal_1723     TRUE 0.882 37.000 0.429 NA   NA
 7135263 7135264 Rpal_1725 Rpal_1726     TRUE 0.975 1.000 0.318 0.021   NA
 7135265 7135266 Rpal_1727 Rpal_1728     TRUE 0.568 61.000 0.089 1.000   NA
 7135267 7135268 Rpal_1729 Rpal_1730     TRUE 0.971 -3.000 0.311 0.001   NA
 7135268 7135269 Rpal_1730 Rpal_1731     TRUE 0.996 3.000 0.591 0.001 Y NA
 7135269 7135270 Rpal_1731 Rpal_1732   bchH TRUE 0.946 -25.000 0.278 0.003 N NA
 7135270 7135271 Rpal_1732 Rpal_1733 bchH chlL TRUE 0.966 -3.000 0.344 0.003 N NA
 7135271 7135272 Rpal_1733 Rpal_1734 chlL   TRUE 0.974 0.000 0.274 0.003   NA
 7135272 7135273 Rpal_1734 Rpal_1735     TRUE 0.810 -3.000 0.077 NA   NA
 7135273 7135274 Rpal_1735 Rpal_1736     TRUE 0.885 23.000 0.265 NA   NA
 7135274 7135275 Rpal_1736 Rpal_1737     TRUE 0.974 -3.000 0.912 NA   NA
 7135275 7135276 Rpal_1737 Rpal_1738     TRUE 0.955 16.000 0.515 NA   NA
 7135276 7135277 Rpal_1738 Rpal_1739     TRUE 0.965 3.000 0.481 NA   NA
 7135277 7135278 Rpal_1739 Rpal_1740     TRUE 0.931 -3.000 0.361 NA   NA
 7135278 7135279 Rpal_1740 Rpal_1741     TRUE 0.942 14.000 0.375 NA   NA
 7135279 7135280 Rpal_1741 Rpal_1742     TRUE 0.873 -3.000 0.184 NA   NA
 7135282 7135283 Rpal_1744 Rpal_1745     TRUE 0.955 22.000 0.000 0.020 Y NA
 7135283 7135284 Rpal_1745 Rpal_1746     TRUE 0.987 16.000 0.250 0.020 Y NA
 7135284 7135285 Rpal_1746 Rpal_1747   rbcL FALSE 0.065 201.000 0.000 1.000 N NA
 7135285 7135286 Rpal_1747 Rpal_1748 rbcL   TRUE 0.991 14.000 1.000 0.001 N NA
 7135286 7135287 Rpal_1748 Rpal_1749     TRUE 0.919 3.000 0.149 1.000   NA
 7135289 7135290 Rpal_1751 Rpal_1752     FALSE 0.167 76.000 0.000 NA   NA
 7135290 7135291 Rpal_1752 Rpal_1753     TRUE 0.966 9.000 0.066 NA Y NA
 7135291 7135292 Rpal_1753 Rpal_1754     TRUE 0.970 -3.000 0.033 0.048 Y NA
 7135292 7135293 Rpal_1754 Rpal_1755     TRUE 0.968 -13.000 0.065 0.029 Y NA
 7135294 7135295 Rpal_1756 Rpal_1757     TRUE 0.974 4.000 0.556 1.000   NA
 7135295 7135296 Rpal_1757 Rpal_1758     TRUE 0.731 152.000 0.051 1.000 Y NA
 7135297 7135298 Rpal_1759 Rpal_1760     FALSE 0.074 271.000 0.111 1.000 N NA
 7135298 7135299 Rpal_1760 Rpal_1761     FALSE 0.250 78.000 0.010 NA   NA
 7135299 7135300 Rpal_1761 Rpal_1762     TRUE 0.879 5.000 0.091 NA   NA
 7135300 7135301 Rpal_1762 Rpal_1763     TRUE 0.867 14.000 0.127 NA   NA
 7135304 7135305 Rpal_1766 Rpal_1767     FALSE 0.088 319.000 0.000 1.000 Y NA
 7135305 7135306 Rpal_1767 Rpal_1768     TRUE 0.688 165.000 0.030 1.000 Y NA
 7135308 7135309 Rpal_1770 Rpal_1771     FALSE 0.064 205.000 0.000 NA   NA
 7135309 7135310 Rpal_1771 Rpal_1772     TRUE 0.970 -3.000 0.791 NA   NA
 7135311 7135312 Rpal_1773 Rpal_1774     TRUE 0.737 59.000 0.267 1.000   NA
 7135312 7135313 Rpal_1774 Rpal_1775     FALSE 0.073 198.000 0.000 NA   NA
 7135314 7135315 Rpal_1776 Rpal_1777   rpsD FALSE 0.008 313.000 0.000 1.000 N NA
 7135315 7135316 Rpal_1777 Rpal_1778 rpsD   FALSE 0.081 190.000 0.000 NA   NA
 7135316 7135317 Rpal_1778 Rpal_1779     TRUE 0.948 0.000 0.350 NA   NA
 7135317 7135318 Rpal_1779 Rpal_1780     FALSE 0.364 52.000 0.006 NA   NA
 7135318 7135319 Rpal_1780 Rpal_1781     FALSE 0.075 83.000 0.000 NA N NA
 7135320 7135321 Rpal_1782 Rpal_1783     FALSE 0.010 338.000 0.000 1.000   NA
 7135321 7135322 Rpal_1783 Rpal_1784     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7135322 7135323 Rpal_1784 Rpal_1785     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135323 7135324 Rpal_1785 Rpal_1786     FALSE 0.004 403.000 0.000 NA   NA
 7135325 7135326 Rpal_1787 Rpal_1788     FALSE 0.443 75.000 0.085 NA   NA
 7135328 7135329 Rpal_1790 Rpal_1791     FALSE 0.093 184.000 0.000 NA   NA
 7135331 7135332 Rpal_1793 Rpal_1794     FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 7135332 7135333 Rpal_1794 Rpal_1795     TRUE 0.826 45.000 0.354 NA   NA
 7135334 7135335 Rpal_1796 Rpal_1797     TRUE 0.793 -3.000 0.064 NA   NA
 7135335 7135336 Rpal_1797 Rpal_1798     FALSE 0.463 60.000 0.059 NA   NA
 7135337 7135338 Rpal_1799 Rpal_1800     FALSE 0.075 268.000 0.100 NA   NA
 7135338 7135339 Rpal_1800 Rpal_1801     TRUE 0.954 13.000 0.433 NA   NA
 7135339 7135340 Rpal_1801 Rpal_1802     FALSE 0.310 201.000 0.200 1.000 N NA
 7135340 7135341 Rpal_1802 Rpal_1803     TRUE 0.864 35.000 0.200 0.067 N NA
 7135342 7135343 Rpal_1804 Rpal_1805     FALSE 0.127 96.000 0.000 1.000 N NA
 7135344 7135345 Rpal_1806 Rpal_1807     TRUE 0.645 69.000 0.250 NA   NA
 7135346 7135347 Rpal_1808 Rpal_1809     FALSE 0.415 113.000 0.143 NA   NA
 7135350 7135351 Rpal_R0017 Rpal_1812     FALSE 0.128 143.000 0.000 NA   NA
 7135351 7135352 Rpal_1812 Rpal_1813     FALSE 0.029 241.000 0.000 NA   NA
 7135355 7135356 Rpal_1816 Rpal_1817     FALSE 0.252 191.000 0.085 NA   NA
 7135356 7135357 Rpal_1817 Rpal_1818     TRUE 0.974 -3.000 0.043 0.012 Y NA
 7135357 7135358 Rpal_1818 Rpal_1819     TRUE 0.910 68.000 0.333 1.000 Y NA
 7135358 7135359 Rpal_1819 Rpal_1820     TRUE 0.820 142.000 0.042 0.020 Y NA
 7135359 7135360 Rpal_1820 Rpal_1821     TRUE 0.968 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 7135362 7135363 Rpal_1823 Rpal_1824 fliI   FALSE 0.372 110.000 0.067 1.000   NA
 7135363 7135364 Rpal_1824 Rpal_1825     FALSE 0.253 176.000 0.025 1.000   NA
 7135364 7135365 Rpal_1825 Rpal_1826     TRUE 0.929 0.000 0.254 NA   NA
 7135366 7135367 Rpal_1827 Rpal_1828   flhA FALSE 0.007 332.000 0.000 NA   NA
 7135370 7135371 Rpal_R0018 Rpal_1831     FALSE 0.306 43.000 0.000 NA   NA
 7135371 7135372 Rpal_1831 Rpal_1832     FALSE 0.004 381.000 0.000 1.000 N NA
 7135375 7135376 Rpal_1835 Rpal_1836     TRUE 0.709 29.000 0.070 NA   NA
 7135376 7135377 Rpal_1836 Rpal_1837     FALSE 0.512 99.000 0.222 NA   NA
 7135377 7135378 Rpal_1837 Rpal_1838     TRUE 0.551 77.000 0.200 NA   NA
 7135379 7135380 Rpal_1839 Rpal_1840     TRUE 0.984 -3.000 0.484 NA Y NA
 7135380 7135381 Rpal_1840 Rpal_1841     TRUE 0.945 -7.000 0.647 NA N NA
 7135385 7135386 Rpal_1845 Rpal_1846     FALSE 0.300 44.000 0.000 NA   NA
 7135386 7135387 Rpal_1846 Rpal_1847     FALSE 0.136 94.000 0.000 NA   NA
 7135388 7135389 Rpal_1848 Rpal_1849     FALSE 0.129 135.000 0.000 NA   NA
 7135389 7135390 Rpal_1849 Rpal_1850     FALSE 0.062 161.000 0.000 NA N NA
 7135393 7135394 Rpal_1853 Rpal_1854     FALSE 0.061 209.000 0.000 NA   NA
 7135395 7135396 Rpal_1855 Rpal_1856     TRUE 0.683 142.000 0.455 NA   NA
 7135398 7135399 Rpal_1858 Rpal_1859     FALSE 0.269 108.000 0.040 NA   NA
 7135399 7135400 Rpal_1859 Rpal_1860     TRUE 0.879 28.000 0.032 0.002   NA
 7135400 7135401 Rpal_1860 Rpal_1861     FALSE 0.301 156.000 0.048 NA   NA
 7135401 7135402 Rpal_1861 Rpal_1862     FALSE 0.022 255.000 0.000 NA   NA
 7135402 7135403 Rpal_1862 Rpal_1863     TRUE 0.799 29.000 0.119 1.000   NA
 7135403 7135404 Rpal_1863 Rpal_1864     TRUE 0.921 -28.000 0.368 1.000   NA
 7135404 7135405 Rpal_1864 Rpal_1865     FALSE 0.346 158.000 0.070 NA   NA
 7135406 7135407 Rpal_1866 Rpal_1867     TRUE 0.977 4.000 0.633 1.000   NA
 7135409 7135410 Rpal_1869 Rpal_1870     TRUE 0.607 178.000 0.429 1.000 N NA
 7135410 7135411 Rpal_1870 Rpal_1871     FALSE 0.032 645.000 0.000 0.082 Y NA
 7135411 7135412 Rpal_1871 Rpal_1872     TRUE 0.718 179.000 0.000 0.012 Y NA
 7135412 7135413 Rpal_1872 Rpal_1873     TRUE 0.974 -3.000 0.043 0.012 Y NA
 7135413 7135414 Rpal_1873 Rpal_1874     TRUE 0.935 54.000 0.333 1.000 Y NA
 7135414 7135415 Rpal_1874 Rpal_1875     TRUE 0.970 12.000 0.625 NA   NA
 7135415 7135416 Rpal_1875 Rpal_1876     FALSE 0.248 229.000 0.250 NA   NA
 7135420 7135421 Rpal_1880 Rpal_1881     FALSE 0.004 485.000 0.000 1.000   NA
 7135422 7135423 Rpal_1882 Rpal_1883     TRUE 0.726 71.000 0.381 1.000 N NA
 7135424 7135425 Rpal_R0019 Rpal_1884     FALSE 0.050 218.000 0.000 NA   NA
 7135425 7135426 Rpal_1884 Rpal_1885     FALSE 0.122 121.000 0.000 NA   NA
 7135426 7135427 Rpal_1885 Rpal_1886     FALSE 0.501 72.000 0.120 NA   NA
 7135428 7135429 Rpal_1887 Rpal_1888     TRUE 0.804 132.000 0.800 NA   NA
 7135430 7135431 Rpal_1889 Rpal_1890     FALSE 0.072 202.000 0.009 NA N NA
 7135431 7135432 Rpal_1890 Rpal_1891     FALSE 0.149 153.000 0.011 NA N NA
 7135434 7135435 Rpal_1893 Rpal_1894     FALSE 0.518 19.000 0.000 NA   NA
 7135438 7135439 Rpal_1897 Rpal_1898     FALSE 0.121 118.000 0.000 NA   NA
 7135441 7135442 Rpal_1900 Rpal_1901     FALSE 0.004 412.000 0.000 NA   NA
 7135442 7135443 Rpal_1901 Rpal_1902     FALSE 0.534 105.000 0.250 NA   NA
 7135443 7135444 Rpal_1902 Rpal_1903     FALSE 0.371 279.000 0.300 1.000 Y NA
 7135445 7135446 Rpal_1904 Rpal_1905     FALSE 0.016 457.000 0.182 1.000 N NA
 7135446 7135447 Rpal_1905 Rpal_1906     TRUE 0.674 224.000 0.211 0.081 Y NA
 7135447 7135448 Rpal_1906 Rpal_1907     TRUE 0.957 51.000 0.316 0.081 Y NA
 7135448 7135449 Rpal_1907 Rpal_1908     TRUE 0.861 167.000 0.357 1.000 Y NA
 7135449 7135450 Rpal_1908 Rpal_1909     TRUE 0.954 137.000 0.636 0.008 Y NA
 7135450 7135451 Rpal_1909 Rpal_1910     TRUE 0.955 151.000 0.625 0.008 Y NA
 7135451 7135452 Rpal_1910 Rpal_1911     TRUE 0.585 167.000 0.175 0.066 N NA
 7135454 7135455 Rpal_1913 Rpal_1914     TRUE 0.959 12.000 0.455 NA   NA
 7135455 7135456 Rpal_1914 Rpal_1915     FALSE 0.023 251.000 0.000 NA   NA
 7135456 7135457 Rpal_1915 Rpal_1916     FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 7135460 7135461 Rpal_1919 Rpal_1920     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7135462 7135463 Rpal_1921 Rpal_1922     TRUE 0.590 -3.000 0.015 NA N NA
 7135464 7135465 Rpal_1923 Rpal_1924     TRUE 0.828 15.000 0.124 NA N NA
 7135466 7135467 Rpal_1925 Rpal_1926     TRUE 0.862 57.000 0.000 0.044 Y NA
 7135467 7135468 Rpal_1926 Rpal_1927     FALSE 0.029 242.000 0.000 NA   NA
 7135469 7135470 Rpal_1928 Rpal_1929     FALSE 0.001 962.000 0.000 NA   NA
 7135470 7135471 Rpal_1929 Rpal_1930     FALSE 0.459 53.000 0.012 1.000   NA
 7135471 7135472 Rpal_1930 Rpal_1931     FALSE 0.250 179.000 0.031 1.000   NA
 7135472 7135473 Rpal_1931 Rpal_1932     TRUE 0.863 23.000 0.038 0.066   NA
 7135473 7135474 Rpal_1932 Rpal_1933     TRUE 0.844 69.000 0.778 NA N NA
 7135474 7135475 Rpal_1933 Rpal_1934     FALSE 0.492 101.000 0.250 NA N NA
 7135477 7135478 Rpal_1936 Rpal_1937     FALSE 0.084 186.000 0.000 1.000 N NA
 7135478 7135479 Rpal_1937 Rpal_1938     FALSE 0.407 43.000 0.000 1.000   NA
 7135479 7135480 Rpal_1938 Rpal_1939     TRUE 0.973 0.000 0.600 1.000   NA
 7135480 7135481 Rpal_1939 Rpal_1940     TRUE 0.995 2.000 0.650 0.047 Y NA
 7135481 7135482 Rpal_1940 Rpal_1941     FALSE 0.440 197.000 0.000 NA Y NA
 7135484 7135485 Rpal_1943 Rpal_1944     FALSE 0.434 141.000 0.150 NA   NA
 7135485 7135486 Rpal_1944 Rpal_1945     TRUE 0.918 35.000 0.074 1.000 Y NA
 7135486 7135487 Rpal_1945 Rpal_1946     FALSE 0.488 70.000 0.103 1.000 N NA
 7135488 7135489 Rpal_1947 Rpal_1948     FALSE 0.529 58.000 0.082 NA   NA
 7135489 7135490 Rpal_1948 Rpal_1949     TRUE 0.915 128.000 0.679 NA Y NA
 7135490 7135491 Rpal_1949 Rpal_1950     TRUE 0.997 0.000 0.957 0.047 Y NA
 7135491 7135492 Rpal_1950 Rpal_1951     TRUE 0.993 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 7135492 7135493 Rpal_1951 Rpal_1952     TRUE 0.991 -16.000 0.636 0.029 Y NA
 7135493 7135494 Rpal_1952 Rpal_1953     FALSE 0.072 194.000 0.000 1.000 N NA
 7135494 7135495 Rpal_1953 Rpal_1954     FALSE 0.026 213.000 0.000 NA N NA
 7135495 7135496 Rpal_1954 Rpal_1955     TRUE 0.946 -10.000 0.667 NA N NA
 7135497 7135498 Rpal_1956 Rpal_1957     TRUE 0.706 40.000 0.094 1.000   NA
 7135499 7135500 Rpal_1958 Rpal_1959     TRUE 0.899 8.000 0.143 NA   NA
 7135500 7135501 Rpal_1959 Rpal_1960     TRUE 0.926 19.000 0.367 NA   NA
 7135502 7135503 Rpal_1961 Rpal_1962     FALSE 0.123 122.000 0.000 NA   NA
 7135505 7135506 Rpal_1964 Rpal_1965     FALSE 0.209 298.000 0.021 0.081 Y NA
 7135507 7135508 Rpal_1966 Rpal_1967     TRUE 0.808 149.000 0.050 0.081 Y NA
 7135509 7135510 Rpal_1968 Rpal_1969     FALSE 0.480 161.000 0.058 0.081 N NA
 7135510 7135511 Rpal_1969 Rpal_1970     TRUE 0.827 -3.000 0.092 NA   NA
 7135512 7135513 Rpal_1971 Rpal_1972     FALSE 0.201 101.000 0.008 NA   NA
 7135513 7135514 Rpal_1972 Rpal_1973     FALSE 0.121 138.000 0.000 1.000 N NA
 7135514 7135515 Rpal_1973 Rpal_1974     FALSE 0.004 382.000 0.000 NA   NA
 7135515 7135516 Rpal_1974 Rpal_1975     FALSE 0.470 24.000 0.000 NA   NA
 7135516 7135517 Rpal_1975 Rpal_1976     FALSE 0.003 422.000 0.000 NA   NA
 7135518 7135519 Rpal_1977 Rpal_1978     FALSE 0.320 288.000 0.308 NA Y NA
 7135519 7135520 Rpal_1978 Rpal_1979     TRUE 0.979 6.000 0.750 NA   NA
 7135521 7135522 Rpal_1980 Rpal_1981     TRUE 0.918 -7.000 0.326 1.000   NA
 7135523 7135524 Rpal_1982 Rpal_1983     FALSE 0.008 339.000 0.020 NA N NA
 7135525 7135526 Rpal_1984 Rpal_1985     TRUE 0.920 147.000 0.700 NA Y NA
 7135526 7135527 Rpal_1985 Rpal_1986     TRUE 0.993 7.000 0.750 NA Y NA
 7135527 7135528 Rpal_1986 Rpal_1987     TRUE 0.664 167.000 0.217 0.050   NA
 7135528 7135529 Rpal_1987 Rpal_1988     FALSE 0.017 298.000 0.000 1.000   NA
 7135529 7135530 Rpal_1988 Rpal_1989     TRUE 0.996 12.000 0.778 0.080 Y NA
 7135530 7135531 Rpal_1989 Rpal_1990     FALSE 0.189 239.000 0.200 1.000   NA
 7135531 7135532 Rpal_1990 Rpal_1991     TRUE 0.716 80.000 0.417 NA   NA
 7135532 7135533 Rpal_1991 Rpal_1992     FALSE 0.004 316.000 0.000 NA N NA
 7135534 7135535 Rpal_1993 Rpal_1994     TRUE 0.974 -3.000 0.050 0.029 Y NA
 7135535 7135536 Rpal_1994 Rpal_1995     TRUE 0.983 6.000 0.075 0.047 Y NA
 7135539 7135540 Rpal_1998 Rpal_1999     FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7135541 7135542 Rpal_2000 Rpal_2001     FALSE 0.370 200.000 0.300 NA N NA
 7135542 7135543 Rpal_2001 Rpal_2002     FALSE 0.013 243.000 0.000 NA N NA
 7135543 7135544 Rpal_2002 Rpal_2003     TRUE 0.816 97.000 0.748 1.000   NA
 7135545 7135546 Rpal_2004 Rpal_2005     TRUE 0.855 53.000 0.514 NA   NA
 7135546 7135547 Rpal_2005 Rpal_2006   dnaE2 TRUE 0.877 152.000 0.366 1.000 Y NA
 7135549 7135550 Rpal_2008 Rpal_2009     FALSE 0.371 49.000 0.000 1.000   NA
 7135550 7135551 Rpal_2009 Rpal_2010     FALSE 0.073 220.000 0.000 1.000   NA
 7135551 7135552 Rpal_2010 Rpal_2011     TRUE 0.712 157.000 0.500 1.000 N NA
 7135552 7135553 Rpal_2011 Rpal_2012     FALSE 0.232 200.000 0.091 NA   NA
 7135554 7135555 Rpal_2013 Rpal_2014     FALSE 0.276 199.000 0.143 1.000 N NA
 7135555 7135556 Rpal_2014 Rpal_2015     TRUE 0.791 84.000 0.643 NA   NA
 7135557 7135558 Rpal_2016 Rpal_2017     TRUE 0.981 3.000 0.812 NA   NA
 7135558 7135559 Rpal_2017 Rpal_2018     FALSE 0.393 117.000 0.125 NA   NA
 7135559 7135560 Rpal_2018 Rpal_2019     TRUE 0.741 61.000 0.333 NA   NA
 7135561 7135562 Rpal_2020 Rpal_2021     TRUE 0.764 38.000 0.200 NA   NA
 7135563 7135564 Rpal_2022 Rpal_2023     TRUE 0.969 -3.000 0.786 NA   NA
 7135564 7135565 Rpal_2023 Rpal_2024     FALSE 0.003 486.000 0.000 NA   NA
 7135565 7135566 Rpal_2024 Rpal_2025     FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 7135566 7135567 Rpal_2025 Rpal_2026     FALSE 0.009 311.000 0.000 NA   NA
 7135567 7135568 Rpal_2026 Rpal_2027     FALSE 0.217 154.000 0.012 NA   NA
 7135568 7135569 Rpal_2027 Rpal_2028     FALSE 0.119 168.000 0.000 NA   NA
 7135570 7135571 Rpal_2029 Rpal_2030     FALSE 0.129 133.000 0.000 NA   NA
 7135571 7135572 Rpal_2030 Rpal_2031     FALSE 0.331 106.000 0.069 NA   NA
 7135572 7135573 Rpal_2031 Rpal_2032     TRUE 0.549 67.000 0.143 NA   NA
 7135573 7135574 Rpal_2032 Rpal_2033     TRUE 0.770 -3.000 0.054 1.000 N NA
 7135574 7135575 Rpal_2033 Rpal_2034     FALSE 0.210 87.000 0.000 1.000   NA
 7135575 7135576 Rpal_2034 Rpal_2035     TRUE 0.869 -9.000 0.000 0.001   NA
 7135576 7135577 Rpal_2035 Rpal_2036     FALSE 0.071 199.000 0.000 NA   NA
 7135577 7135578 Rpal_2036 Rpal_2037     FALSE 0.212 61.000 0.000 NA   NA
 7135578 7135579 Rpal_2037 Rpal_2038     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135579 7135580 Rpal_2038 Rpal_2039     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA N NA
 7135580 7135581 Rpal_2039 Rpal_2040     TRUE 0.610 63.000 0.028 0.080   NA
 7135581 7135582 Rpal_2040 Rpal_2041     TRUE 0.921 -3.000 0.117 0.080   NA
 7135582 7135583 Rpal_2041 Rpal_2042     FALSE 0.208 158.000 0.012 1.000 N NA
 7135583 7135584 Rpal_2042 Rpal_2043     TRUE 0.966 2.000 0.037 1.000 Y NA
 7135584 7135585 Rpal_2043 Rpal_2044     TRUE 0.986 -3.000 0.486 1.000 Y NA
 7135585 7135586 Rpal_2044 Rpal_2045     FALSE 0.523 66.000 0.077 1.000   NA
 7135586 7135587 Rpal_2045 Rpal_2046     TRUE 0.833 18.000 0.111 NA   NA
 7135588 7135589 Rpal_2047 Rpal_2048     FALSE 0.023 298.000 0.025 NA   NA
 7135589 7135590 Rpal_2048 Rpal_2049     FALSE 0.006 344.000 0.000 1.000 N NA
 7135590 7135591 Rpal_2049 Rpal_2050     FALSE 0.464 114.000 0.200 NA   NA
 7135591 7135592 Rpal_2050 Rpal_2051     TRUE 0.917 -3.000 0.300 NA   NA
 7135592 7135593 Rpal_2051 Rpal_2052     TRUE 0.966 14.000 0.625 NA   NA
 7135593 7135594 Rpal_2052 Rpal_2053     TRUE 0.968 -3.000 0.750 NA   NA
 7135595 7135596 Rpal_2054 Rpal_2055     FALSE 0.003 457.000 0.000 1.000 N NA
 7135597 7135598 Rpal_2056 Rpal_2057     FALSE 0.348 188.000 0.180 NA   NA
 7135600 7135601 Rpal_2059 Rpal_2060     FALSE 0.123 122.000 0.000 NA   NA
 7135602 7135603 Rpal_2061 Rpal_2062     FALSE 0.320 116.000 0.069 NA   NA
 7135604 7135605 Rpal_2063 Rpal_2064     TRUE 0.709 77.000 0.333 1.000   NA
 7135605 7135606 Rpal_2064 Rpal_2065     FALSE 0.369 153.000 0.082 NA   NA
 7135607 7135608 Rpal_2066 Rpal_2067     FALSE 0.415 152.000 0.118 NA   NA
 7135608 7135609 Rpal_2067 Rpal_2068     TRUE 0.689 80.000 0.375 NA   NA
 7135610 7135611 Rpal_2069 Rpal_2070     TRUE 0.881 18.000 0.211 NA   NA
 7135612 7135613 Rpal_2071 Rpal_2072     TRUE 0.975 -3.000 0.941 NA   NA
 7135613 7135614 Rpal_2072 Rpal_2073     TRUE 0.889 44.000 0.582 NA   NA
 7135615 7135616 Rpal_2074 Rpal_2075     FALSE 0.251 54.000 0.000 NA   NA
 7135618 7135619 Rpal_2077 Rpal_2078     TRUE 0.972 10.000 0.385 0.065 N NA
 7135619 7135620 Rpal_2078 Rpal_2079     TRUE 0.676 76.000 0.385 NA N NA
 7135621 7135622 Rpal_2080 Rpal_2081     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135622 7135623 Rpal_2081 Rpal_2082     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135625 7135626 Rpal_2084 Rpal_2085     FALSE 0.115 116.000 0.000 1.000 N NA
 7135627 7135628 Rpal_2086 Rpal_2087     FALSE 0.352 124.000 0.083 NA   NA
 7135628 7135629 Rpal_2087 Rpal_2088     FALSE 0.524 112.000 0.250 NA   NA
 7135629 7135630 Rpal_2088 Rpal_2089     FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 7135630 7135631 Rpal_2089 Rpal_2090     FALSE 0.015 278.000 0.000 NA   NA
 7135631 7135632 Rpal_2090 Rpal_2091     FALSE 0.031 238.000 0.000 NA   NA
 7135632 7135633 Rpal_2091 Rpal_2092     FALSE 0.127 140.000 0.000 NA   NA
 7135633 7135634 Rpal_2092 Rpal_2093     TRUE 0.730 26.000 0.066 NA   NA
 7135634 7135635 Rpal_2093 Rpal_2094     TRUE 0.970 5.000 0.545 NA   NA
 7135635 7135636 Rpal_2094 Rpal_2095     FALSE 0.388 125.000 0.111 NA   NA
 7135636 7135637 Rpal_2095 Rpal_2096     TRUE 0.619 131.000 0.345 NA   NA
 7135637 7135638 Rpal_2096 Rpal_2097     FALSE 0.015 280.000 0.000 NA   NA
 7135638 7135639 Rpal_2097 Rpal_2098     TRUE 0.950 -3.000 0.500 NA   NA
 7135640 7135641 Rpal_2099 Rpal_2100     TRUE 0.941 12.000 0.317 NA   NA
 7135642 7135643 Rpal_2101 Rpal_2102     TRUE 0.876 77.000 1.000 NA   NA
 7135643 7135644 Rpal_2102 Rpal_2103     TRUE 0.662 98.000 0.400 NA   NA
 7135645 7135646 Rpal_2104 Rpal_2105     FALSE 0.153 83.000 0.000 NA   NA
 7135647 7135648 Rpal_2106 Rpal_2107     TRUE 0.827 -3.000 0.093 NA   NA
 7135648 7135649 Rpal_2107 Rpal_2108     TRUE 0.711 -3.000 0.023 NA   NA
 7135649 7135650 Rpal_2108 Rpal_2109     TRUE 0.773 13.000 0.031 NA   NA
 7135650 7135651 Rpal_2109 Rpal_2110     TRUE 0.969 10.000 0.577 NA   NA
 7135651 7135652 Rpal_2110 Rpal_2111     TRUE 0.956 -3.000 0.578 NA   NA
 7135652 7135653 Rpal_2111 Rpal_2112     TRUE 0.970 -3.000 0.800 NA   NA
 7135653 7135654 Rpal_2112 Rpal_2113     TRUE 0.773 139.000 0.678 NA   NA
 7135654 7135655 Rpal_2113 Rpal_2114     FALSE 0.026 246.000 0.000 NA   NA
 7135655 7135656 Rpal_2114 Rpal_2115     FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 7135656 7135657 Rpal_2115 Rpal_2116     TRUE 0.887 40.000 0.500 NA   NA
 7135657 7135658 Rpal_2116 Rpal_2117     FALSE 0.198 65.000 0.000 NA   NA
 7135660 7135661 Rpal_2119 Rpal_2120     TRUE 0.952 2.000 0.353 NA   NA
 7135661 7135662 Rpal_2120 Rpal_2121     FALSE 0.437 27.000 0.000 NA   NA
 7135662 7135663 Rpal_2121 Rpal_2122     FALSE 0.134 155.000 0.000 NA   NA
 7135663 7135664 Rpal_2122 Rpal_2123     TRUE 0.872 10.000 0.091 NA   NA
 7135664 7135665 Rpal_2123 Rpal_2124     FALSE 0.330 216.000 0.286 NA   NA
 7135665 7135666 Rpal_2124 Rpal_2125     TRUE 0.973 3.000 0.625 NA   NA
 7135666 7135667 Rpal_2125 Rpal_2126     FALSE 0.291 112.000 0.053 NA   NA
 7135667 7135668 Rpal_2126 Rpal_2127     TRUE 0.991 16.000 0.713 1.000 Y NA
 7135668 7135669 Rpal_2127 Rpal_2128     FALSE 0.284 97.000 0.069 NA N NA
 7135669 7135670 Rpal_2128 Rpal_2129     FALSE 0.045 223.000 0.000 NA   NA
 7135670 7135671 Rpal_2129 Rpal_2130     FALSE 0.459 163.000 0.184 NA   NA
 7135671 7135672 Rpal_2130 Rpal_2131     TRUE 0.751 114.000 0.096 1.000 Y NA
 7135672 7135673 Rpal_2131 Rpal_2132     TRUE 0.983 -3.000 0.125 0.002 Y NA
 7135673 7135674 Rpal_2132 Rpal_2133     TRUE 0.990 14.000 0.644 NA Y NA
 7135675 7135676 Rpal_2134 Rpal_2135 amiF   FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7135676 7135677 Rpal_2135 Rpal_2136     FALSE 0.129 103.000 0.000 NA   NA
 7135679 7135680 Rpal_2138 Rpal_2139     TRUE 0.934 54.000 0.556 0.005   NA
 7135681 7135682 Rpal_2140 Rpal_2141     FALSE 0.034 232.000 0.000 1.000 N NA
 7135682 7135683 Rpal_2141 Rpal_2142     FALSE 0.426 235.000 0.000 0.024 Y NA
 7135683 7135684 Rpal_2142 Rpal_2143     TRUE 0.582 212.000 0.000 0.014 Y NA
 7135684 7135685 Rpal_2143 Rpal_2144     TRUE 0.960 -3.000 0.081 1.000 Y NA
 7135686 7135687 Rpal_2145 Rpal_2146     TRUE 0.794 101.000 0.750 NA   NA
 7135689 7135690 Rpal_2148 Rpal_2149     FALSE 0.123 216.000 0.043 1.000 N NA
 7135690 7135691 Rpal_2149 Rpal_2150     FALSE 0.418 131.000 0.140 1.000 N NA
 7135691 7135692 Rpal_2150 Rpal_2151     TRUE 0.719 43.000 0.130 1.000   NA
 7135692 7135693 Rpal_2151 Rpal_2152     FALSE 0.048 238.000 0.000 1.000   NA
 7135693 7135694 Rpal_2152 Rpal_2153     FALSE 0.318 156.000 0.059 1.000 N NA
 7135694 7135695 Rpal_2153 Rpal_2154     FALSE 0.063 101.000 0.000 NA N NA
 7135695 7135696 Rpal_2154 Rpal_2155     FALSE 0.056 169.000 0.000 NA N NA
 7135696 7135697 Rpal_2155 Rpal_2156     FALSE 0.391 117.000 0.129 1.000 N NA
 7135697 7135698 Rpal_2156 Rpal_2157     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 7135699 7135700 Rpal_2158 Rpal_2159     TRUE 0.988 -3.000 0.825 0.001   NA
 7135700 7135701 Rpal_2159 Rpal_2160     TRUE 0.985 5.000 0.404 0.001   NA
 7135701 7135702 Rpal_2160 Rpal_2161     TRUE 0.974 -3.000 0.361 0.001   NA
 7135703 7135704 Rpal_2162 Rpal_2163     TRUE 0.864 12.000 0.091 NA   NA
 7135704 7135705 Rpal_2163 Rpal_2164     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135707 7135708 Rpal_2166 Rpal_2167     FALSE 0.190 99.000 0.000 1.000   NA
 7135708 7135709 Rpal_2167 Rpal_2168     FALSE 0.126 127.000 0.000 NA   NA
 7135709 7135710 Rpal_2168 Rpal_2169     FALSE 0.059 112.000 0.000 NA N NA
 7135711 7135712 Rpal_2170 Rpal_2171     TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.010 Y NA
 7135712 7135713 Rpal_2171 Rpal_2172     TRUE 0.962 -3.000 0.739 NA N NA
 7135713 7135714 Rpal_2172 Rpal_2173     TRUE 0.902 2.000 0.150 NA   NA
 7135714 7135715 Rpal_2173 Rpal_2174     TRUE 0.925 32.000 0.600 NA   NA
 7135715 7135716 Rpal_2174 Rpal_2175     TRUE 0.911 59.000 1.000 NA   NA
 7135717 7135718 Rpal_2176 Rpal_2177     FALSE 0.018 267.000 0.000 1.000 N NA
 7135719 7135720 Rpal_2178 Rpal_2179     TRUE 0.981 0.000 1.000 NA N NA
 7135720 7135721 Rpal_2179 Rpal_2180     FALSE 0.059 111.000 0.000 NA N NA
 7135722 7135723 Rpal_2181 Rpal_2182     TRUE 0.849 -3.000 0.130 NA   NA
 7135723 7135724 Rpal_2182 Rpal_2183     FALSE 0.085 188.000 0.000 NA   NA
 7135724 7135725 Rpal_2183 Rpal_2184     TRUE 0.898 23.000 0.305 NA   NA
 7135725 7135726 Rpal_2184 Rpal_2185     TRUE 0.598 45.000 0.074 NA   NA
 7135726 7135727 Rpal_2185 Rpal_2186     FALSE 0.240 169.000 0.037 1.000 N NA
 7135728 7135729 Rpal_2187 Rpal_2188     FALSE 0.086 251.000 0.138 NA N NA
 7135730 7135731 Rpal_2189 Rpal_2190     TRUE 0.887 38.000 0.465 NA   NA
 7135731 7135732 Rpal_2190 Rpal_2191   moaA FALSE 0.204 174.000 0.051 NA N NA
 7135732 7135733 Rpal_2191 Rpal_2192 moaA   TRUE 0.589 107.000 0.312 NA   NA
 7135733 7135734 Rpal_2192 Rpal_2193     FALSE 0.394 164.000 0.116 NA   NA
 7135735 7135736 Rpal_2194 Rpal_2195     TRUE 0.718 27.000 0.065 NA   NA
 7135736 7135737 Rpal_2195 Rpal_2196     TRUE 0.875 18.000 0.200 NA   NA
 7135737 7135738 Rpal_2196 Rpal_2197     FALSE 0.246 189.000 0.079 1.000 N NA
 7135738 7135739 Rpal_2197 Rpal_2198     FALSE 0.324 131.000 0.067 1.000 N NA
 7135739 7135740 Rpal_2198 Rpal_2199     FALSE 0.540 47.000 0.057 1.000 N NA
 7135741 7135742 Rpal_2200 Rpal_2201     FALSE 0.041 228.000 0.000 NA   NA
 7135743 7135744 Rpal_2202 Rpal_2203     FALSE 0.198 36.000 0.000 NA N NA
 7135747 7135748 Rpal_2206 Rpal_2207     FALSE 0.089 186.000 0.000 NA   NA
 7135749 7135750 Rpal_2208 Rpal_2209 cysS   FALSE 0.021 284.000 0.004 NA   NA
 7135750 7135751 Rpal_2209 Rpal_2210     TRUE 0.832 0.000 0.057 NA   NA
 7135751 7135752 Rpal_2210 Rpal_2211     TRUE 0.807 -3.000 0.048 1.000   NA
 7135752 7135753 Rpal_2211 Rpal_2212     TRUE 0.590 182.000 0.006 1.000 Y NA
 7135753 7135754 Rpal_2212 Rpal_2213     TRUE 0.928 12.000 0.267 1.000 N NA
 7135755 7135756 Rpal_2214 Rpal_2215     FALSE 0.180 183.000 0.024 NA   NA
 7135757 7135758 Rpal_2216 Rpal_2217     TRUE 0.570 49.000 0.075 1.000 N NA
 7135758 7135759 Rpal_2217 Rpal_2218     TRUE 0.922 75.000 0.466 1.000 Y NA
 7135759 7135760 Rpal_2218 Rpal_2219     FALSE 0.148 151.000 0.011 NA N NA
 7135760 7135761 Rpal_2219 Rpal_2220     FALSE 0.017 232.000 0.000 NA N NA
 7135761 7135762 Rpal_2220 Rpal_2221     TRUE 0.911 31.000 0.030 1.000 Y NA
 7135762 7135763 Rpal_2221 Rpal_2222     FALSE 0.032 234.000 0.000 1.000 N NA
 7135763 7135764 Rpal_2222 Rpal_2223     FALSE 0.500 210.000 0.056 NA Y NA
 7135764 7135765 Rpal_2223 Rpal_2224     TRUE 0.687 23.000 0.061 NA N NA
 7135765 7135766 Rpal_2224 Rpal_2225     TRUE 0.970 8.000 0.061 1.000 Y NA
 7135766 7135767 Rpal_2225 Rpal_2226     FALSE 0.178 113.000 0.000 1.000   NA
 7135768 7135769 Rpal_2227 Rpal_2228     FALSE 0.013 286.000 0.000 1.000 N NA
 7135769 7135770 Rpal_2228 Rpal_2229     TRUE 0.924 0.000 0.248 1.000 N NA
 7135770 7135771 Rpal_2229 Rpal_2230     TRUE 0.689 97.000 0.453 1.000 N NA
 7135771 7135772 Rpal_2230 Rpal_2231     TRUE 0.996 11.000 0.784 0.015 Y NA
 7135772 7135773 Rpal_2231 Rpal_2232     TRUE 0.980 -7.000 0.490 NA Y NA
 7135773 7135774 Rpal_2232 Rpal_2233     TRUE 0.972 26.000 0.394 NA Y NA
 7135774 7135775 Rpal_2233 Rpal_2234     FALSE 0.121 167.000 0.000 NA   NA
 7135782 7135783 Rpal_2241 Rpal_2242 miaA   FALSE 0.012 366.000 0.038 1.000 N NA
 7135783 7135784 Rpal_2242 Rpal_2243   ilvH TRUE 0.892 132.000 0.146 0.001 Y NA
 7135786 7135787 Rpal_2245 Rpal_2246     FALSE 0.148 195.000 0.003 1.000   NA
 7135787 7135788 Rpal_2246 Rpal_2247     FALSE 0.012 289.000 0.000 1.000 N NA
 7135788 7135789 Rpal_2247 Rpal_2248     FALSE 0.339 99.000 0.105 NA N NA
 7135789 7135790 Rpal_2248 Rpal_2249     FALSE 0.283 127.000 0.045 NA   NA
 7135790 7135791 Rpal_2249 Rpal_2250     FALSE 0.003 587.000 0.000 1.000   NA
 7135792 7135793 Rpal_2251 Rpal_2252     TRUE 0.933 -3.000 0.382 1.000 N NA
 7135794 7135795 Rpal_2253 Rpal_2254     TRUE 0.778 230.000 0.706 1.000 Y NA
 7135795 7135796 Rpal_2254 Rpal_2255     TRUE 0.938 59.000 0.235 0.045 Y NA
 7135796 7135797 Rpal_2255 Rpal_2256     TRUE 0.920 8.000 0.167 1.000   NA
 7135799 7135800 Rpal_2258 Rpal_2259     FALSE 0.133 97.000 0.000 NA   NA
 7135800 7135801 Rpal_2259 Rpal_2260     FALSE 0.064 224.000 0.005 1.000 N NA
 7135801 7135802 Rpal_2260 Rpal_2261     TRUE 0.765 139.000 0.151 NA Y NA
 7135802 7135803 Rpal_2261 Rpal_2262     TRUE 0.991 -3.000 0.882 NA Y NA
 7135803 7135804 Rpal_2262 Rpal_2263     FALSE 0.327 133.000 0.065 NA   NA
 7135804 7135805 Rpal_2263 Rpal_R0020     FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 7135808 7135809 Rpal_2266 Rpal_2267     FALSE 0.128 143.000 0.000 NA   NA
 7135809 7135810 Rpal_2267 Rpal_2268     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135810 7135811 Rpal_2268 Rpal_2269     TRUE 0.622 11.000 0.000 NA   NA
 7135811 7135812 Rpal_2269 Rpal_2270     TRUE 0.971 -9.000 1.000 NA   NA
 7135812 7135813 Rpal_2270 Rpal_2271     TRUE 0.842 133.000 1.000 NA   NA
 7135813 7135814 Rpal_2271 Rpal_2272     TRUE 0.983 12.000 1.000 NA   NA
 7135815 7135816 Rpal_2273 Rpal_2274     FALSE 0.004 395.000 0.000 NA   NA
 7135816 7135817 Rpal_2274 Rpal_2275     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7135817 7135818 Rpal_2275 Rpal_2276     FALSE 0.008 325.000 0.000 NA   NA
 7135818 7135819 Rpal_2276 Rpal_2277     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7135819 7135820 Rpal_2277 Rpal_2278     FALSE 0.002 517.000 0.000 NA   NA
 7135820 7135821 Rpal_2278 Rpal_2279     TRUE 0.913 -3.000 0.286 NA   NA
 7135821 7135822 Rpal_2279 Rpal_2280     FALSE 0.011 298.000 0.000 NA   NA
 7135822 7135823 Rpal_2280 Rpal_2281     FALSE 0.004 410.000 0.000 NA   NA
 7135825 7135826 Rpal_2283 Rpal_2284     TRUE 0.639 6.000 0.000 NA   NA
 7135828 7135829 Rpal_2286 Rpal_2287     FALSE 0.009 525.000 0.000 0.099   NA
 7135829 7135830 Rpal_2287 Rpal_2288     FALSE 0.004 389.000 0.000 NA   NA
 7135831 7135832 Rpal_2289 Rpal_2290     FALSE 0.062 207.000 0.000 NA   NA
 7135832 7135833 Rpal_2290 Rpal_2291     FALSE 0.463 173.000 0.222 NA   NA
 7135833 7135834 Rpal_2291 Rpal_2292     FALSE 0.507 102.000 0.222 NA   NA
 7135834 7135835 Rpal_2292 Rpal_2293     FALSE 0.398 79.000 0.071 NA   NA
 7135835 7135836 Rpal_2293 Rpal_2294     FALSE 0.321 166.000 0.071 1.000 N NA
 7135836 7135837 Rpal_2294 Rpal_2295     FALSE 0.008 321.000 0.000 NA   NA
 7135838 7135839 Rpal_2296 Rpal_2297     TRUE 0.840 140.000 1.000 NA   NA
 7135839 7135840 Rpal_2297 Rpal_2298     TRUE 0.909 60.000 1.000 NA   NA
 7135840 7135841 Rpal_2298 Rpal_2299     TRUE 0.980 -3.000 1.000 1.000   NA
 7135841 7135842 Rpal_2299 Rpal_2300     TRUE 0.923 58.000 1.000 1.000   NA
 7135842 7135843 Rpal_2300 Rpal_2301     TRUE 0.983 0.000 1.000 NA   NA
 7135843 7135844 Rpal_2301 Rpal_2302     TRUE 0.781 72.000 0.500 NA   NA
 7135844 7135845 Rpal_2302 Rpal_2303     FALSE 0.001 1716.000 0.000 NA   NA
 7135845 7135846 Rpal_2303 Rpal_2304     TRUE 0.622 11.000 0.000 NA   NA
 7135846 7135847 Rpal_2304 Rpal_2305     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135848 7135849 Rpal_2306 Rpal_2307     FALSE 0.246 55.000 0.000 NA   NA
 7135849 7135850 Rpal_2307 Rpal_2308     TRUE 0.632 9.000 0.000 NA   NA
 7135850 7135851 Rpal_2308 Rpal_2309     FALSE 0.003 441.000 0.000 NA   NA
 7135854 7135855 Rpal_2312 Rpal_2313     TRUE 0.983 0.000 1.000 NA   NA
 7135855 7135856 Rpal_2313 Rpal_2314     TRUE 0.977 -3.000 1.000 NA   NA
 7135856 7135857 Rpal_2314 Rpal_2315     TRUE 0.977 -3.000 1.000 NA   NA
 7135859 7135860 Rpal_2317 Rpal_2318     FALSE 0.460 -46.000 0.000 NA   NA
 7135860 7135861 Rpal_2318 Rpal_2319     TRUE 0.814 4.000 0.036 NA   NA
 7135861 7135862 Rpal_2319 Rpal_2320     TRUE 0.740 -3.000 0.036 NA   NA
 7135862 7135863 Rpal_2320 Rpal_2321     FALSE 0.002 591.000 0.000 NA   NA
 7135863 7135864 Rpal_2321 Rpal_2322     TRUE 0.889 71.000 1.000 NA   NA
 7135864 7135865 Rpal_2322 Rpal_2323     TRUE 0.983 11.000 1.000 NA   NA
 7135866 7135867 Rpal_2324 Rpal_2325     FALSE 0.003 503.000 0.000 NA   NA
 7135868 7135869 Rpal_2326 Rpal_2327     FALSE 0.148 86.000 0.000 NA   NA
 7135869 7135870 Rpal_2327 Rpal_2328     FALSE 0.003 463.000 0.000 NA   NA
 7135872 7135873 Rpal_2330 Rpal_2331     TRUE 0.739 90.000 0.533 1.000 N NA
 7135874 7135875 Rpal_2332 Rpal_2333     FALSE 0.318 41.000 0.000 NA   NA
 7135878 7135879 Rpal_2336 Rpal_2337     FALSE 0.126 128.000 0.000 NA   NA
 7135879 7135880 Rpal_2337 Rpal_2338     TRUE 0.541 17.000 0.000 NA   NA
 7135882 7135883 Rpal_R0021 Rpal_2340     FALSE 0.094 183.000 0.000 NA   NA
 7135883 7135884 Rpal_2340 Rpal_2341     FALSE 0.130 146.000 0.000 NA   NA
 7135884 7135885 Rpal_2341 Rpal_2342     TRUE 0.951 23.000 0.650 1.000 N NA
 7135885 7135886 Rpal_2342 Rpal_2343     FALSE 0.123 122.000 0.000 NA   NA
 7135886 7135887 Rpal_2343 Rpal_2344     FALSE 0.246 55.000 0.000 NA   NA
 7135887 7135888 Rpal_2344 Rpal_2345     TRUE 0.646 -3.000 0.000 1.000   NA
 7135888 7135889 Rpal_2345 Rpal_2346     FALSE 0.513 30.000 0.000 1.000   NA
 7135889 7135890 Rpal_2346 Rpal_2347     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135891 7135892 Rpal_2348 Rpal_2349     FALSE 0.173 74.000 0.000 NA   NA
 7135893 7135894 Rpal_2350 Rpal_2351     TRUE 0.871 19.000 0.064 0.098 N NA
 7135894 7135895 Rpal_2351 Rpal_2352     TRUE 0.960 3.000 0.146 0.003 N NA
 7135895 7135896 Rpal_2352 Rpal_2353     TRUE 0.976 -3.000 0.963 1.000 N NA
 7135896 7135897 Rpal_2353 Rpal_2354     TRUE 0.950 -3.000 0.500 NA   NA
 7135897 7135898 Rpal_2354 Rpal_2355     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135898 7135899 Rpal_2355 Rpal_2356     FALSE 0.398 13.000 0.000 NA N NA
 7135899 7135900 Rpal_2356 Rpal_2357     FALSE 0.356 36.000 0.000 NA   NA
 7135900 7135901 Rpal_2357 Rpal_2358     FALSE 0.146 87.000 0.000 NA   NA
 7135901 7135902 Rpal_2358 Rpal_2359     TRUE 0.844 -3.000 0.119 NA   NA
 7135902 7135903 Rpal_2359 Rpal_2360     TRUE 0.954 20.000 0.625 NA   NA
 7135904 7135905 Rpal_2361 Rpal_2362     FALSE 0.127 105.000 0.000 NA   NA
 7135905 7135906 Rpal_2362 Rpal_2363     FALSE 0.181 68.000 0.000 1.000 N NA
 7135906 7135907 Rpal_2363 Rpal_2364     TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.023 Y NA
 7135907 7135908 Rpal_2364 Rpal_2365     FALSE 0.145 88.000 0.000 NA   NA
 7135908 7135909 Rpal_2365 Rpal_2366     FALSE 0.128 143.000 0.000 NA   NA
 7135909 7135910 Rpal_2366 Rpal_2367     TRUE 0.993 4.000 0.667 1.000 Y NA
 7135911 7135912 Rpal_2368 Rpal_2369     FALSE 0.139 92.000 0.000 NA   NA
 7135915 7135916 Rpal_2372 Rpal_2373     TRUE 0.974 0.000 0.115 1.000 Y NA
 7135916 7135917 Rpal_2373 Rpal_2374     TRUE 0.971 -13.000 0.065 0.006 Y NA
 7135917 7135918 Rpal_2374 Rpal_2375     TRUE 0.972 -3.000 0.397 0.006   NA
 7135918 7135919 Rpal_2375 Rpal_2376     TRUE 0.943 -3.000 0.139 0.006   NA
 7135921 7135922 Rpal_2378 Rpal_2379     TRUE 0.983 -3.000 0.138 0.006 Y NA
 7135922 7135923 Rpal_2379 Rpal_2380   cobH TRUE 0.984 -3.000 0.191 0.006 Y NA
 7135923 7135924 Rpal_2380 Rpal_2381 cobH   TRUE 0.717 -3.000 0.025 NA   NA
 7135924 7135925 Rpal_2381 Rpal_2382     FALSE 0.004 401.000 0.000 NA   NA
 7135925 7135926 Rpal_2382 Rpal_2383     TRUE 0.947 -13.000 0.618 NA   NA
 7135927 7135928 Rpal_2384 Rpal_2385     TRUE 0.970 -3.000 0.005 0.006 Y NA
 7135928 7135929 Rpal_2385 Rpal_2386     TRUE 0.854 84.000 0.036 0.006 Y NA
 7135929 7135930 Rpal_2386 Rpal_2387     TRUE 0.898 32.000 0.010 1.000 Y NA
 7135930 7135931 Rpal_2387 Rpal_2388     FALSE 0.115 120.000 0.000 1.000 N NA
 7135933 7135934 Rpal_2390 Rpal_2391     TRUE 0.841 25.000 0.200 NA   NA
 7135934 7135935 Rpal_2391 Rpal_2392     TRUE 0.735 -3.000 0.033 NA   NA
 7135935 7135936 Rpal_2392 Rpal_2393     TRUE 0.951 2.000 0.344 NA   NA
 7135936 7135937 Rpal_2393 Rpal_2394     TRUE 0.835 20.000 0.138 NA   NA
 7135937 7135938 Rpal_2394 Rpal_2395     TRUE 0.968 -3.000 0.750 NA   NA
 7135939 7135940 Rpal_2396 Rpal_2397     FALSE 0.318 41.000 0.000 NA   NA
 7135940 7135941 Rpal_2397 Rpal_2398     FALSE 0.134 152.000 0.000 NA   NA
 7135941 7135942 Rpal_2398 Rpal_2399     TRUE 0.929 -13.000 0.400 1.000   NA
 7135942 7135943 Rpal_2399 Rpal_2400     TRUE 0.885 89.000 0.667 0.019   NA
 7135946 7135947 Rpal_2403 Rpal_2404     TRUE 0.921 148.000 0.703 NA Y NA
 7135947 7135948 Rpal_2404 Rpal_2405     TRUE 0.997 6.000 0.730 0.000 Y NA
 7135948 7135949 Rpal_2405 Rpal_2406     TRUE 0.912 43.000 0.128 1.000 Y NA
 7135950 7135951 Rpal_2407 Rpal_2408     TRUE 0.863 -21.000 0.231 NA   NA
 7135951 7135952 Rpal_2408 Rpal_2409   hmuV FALSE 0.062 204.000 0.000 1.000 N NA
 7135952 7135953 Rpal_2409 Rpal_2410 hmuV   TRUE 0.978 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 7135953 7135954 Rpal_2410 Rpal_2411     TRUE 0.992 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 7135954 7135955 Rpal_2411 Rpal_2412     TRUE 0.759 -3.000 0.044 NA   NA
 7135956 7135957 Rpal_2413 Rpal_2414     TRUE 0.896 -12.000 0.261 1.000   NA
 7135957 7135958 Rpal_2414 Rpal_2415     FALSE 0.225 218.000 0.118 1.000   NA
 7135958 7135959 Rpal_2415 Rpal_2416     TRUE 0.840 78.000 0.700 1.000   NA
 7135959 7135960 Rpal_2416 Rpal_2417     TRUE 0.838 17.000 0.108 NA   NA
 7135960 7135961 Rpal_2417 Rpal_2418     TRUE 0.631 -7.000 0.041 NA N NA
 7135961 7135962 Rpal_2418 Rpal_2419     TRUE 0.972 6.000 0.000 0.053 Y NA
 7135962 7135963 Rpal_2419 Rpal_2420     TRUE 0.781 -3.000 0.000 0.097 N NA
 7135964 7135965 Rpal_2421 Rpal_2422     FALSE 0.121 167.000 0.000 NA   NA
 7135966 7135967 Rpal_2423 Rpal_2424     FALSE 0.359 130.000 0.083 NA   NA
 7135967 7135968 Rpal_2424 Rpal_2425     TRUE 0.983 5.000 0.917 NA   NA
 7135968 7135969 Rpal_2425 Rpal_2426     FALSE 0.130 161.000 0.000 NA   NA
 7135971 7135972 Rpal_2428 Rpal_2429     TRUE 0.612 94.000 0.160 0.063 N NA
 7135972 7135973 Rpal_2429 Rpal_2430     TRUE 0.849 140.000 0.070 0.007 Y NA
 7135973 7135974 Rpal_2430 Rpal_2431     FALSE 0.095 240.000 0.105 NA N NA
 7135974 7135975 Rpal_2431 Rpal_2432     FALSE 0.060 165.000 0.000 NA N NA
 7135975 7135976 Rpal_2432 Rpal_2433     FALSE 0.178 121.000 0.000 1.000   NA
 7135976 7135977 Rpal_2433 Rpal_2434     TRUE 0.647 166.000 0.161 0.034   NA
 7135977 7135978 Rpal_2434 Rpal_2435     FALSE 0.405 240.000 0.102 1.000 Y NA
 7135978 7135979 Rpal_2435 Rpal_2436     TRUE 0.989 12.000 0.184 0.002 Y NA
 7135979 7135980 Rpal_2436 Rpal_2437     TRUE 0.872 122.000 0.227 0.077 Y NA
 7135980 7135981 Rpal_2437 Rpal_2438     TRUE 0.788 179.000 0.091 0.077 Y NA
 7135981 7135982 Rpal_2438 Rpal_2439     FALSE 0.536 104.000 0.250 NA   NA
 7135984 7135985 Rpal_2441 Rpal_2442     TRUE 0.762 19.000 0.030 1.000   NA
 7135985 7135986 Rpal_2442 Rpal_2443     FALSE 0.235 190.000 0.045 1.000   NA
 7135986 7135987 Rpal_2443 Rpal_2444     FALSE 0.063 203.000 0.000 1.000 N NA
 7135987 7135988 Rpal_2444 Rpal_2445     FALSE 0.024 247.000 0.000 1.000 N NA
 7135988 7135989 Rpal_2445 Rpal_2446     FALSE 0.118 109.000 0.000 1.000 N NA
 7135989 7135990 Rpal_2446 Rpal_2447     FALSE 0.127 106.000 0.000 NA   NA
 7135990 7135991 Rpal_2447 Rpal_2448     FALSE 0.196 66.000 0.000 NA   NA
 7135993 7135994 Rpal_2450 Rpal_2451     FALSE 0.442 136.000 0.154 NA   NA
 7135995 7135996 Rpal_2452 Rpal_2453     FALSE 0.089 186.000 0.000 NA   NA
 7135997 7135998 Rpal_2454 Rpal_2455     FALSE 0.003 694.000 0.000 1.000   NA
 7135999 7136000 Rpal_2456 Rpal_2457   groEL FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 7136000 7136001 Rpal_2457 Rpal_2458 groEL groES TRUE 0.936 166.000 0.600 0.092 Y NA
 7136003 7136004 Rpal_2460 Rpal_2461     FALSE 0.025 247.000 0.000 NA   NA
 7136005 7136006 Rpal_2462 Rpal_2463     TRUE 0.832 -10.000 0.114 1.000   NA
 7136009 7136010 Rpal_2466 Rpal_2467     TRUE 0.787 33.000 0.024 0.076   NA
 7136010 7136011 Rpal_2467 Rpal_2468     TRUE 0.659 19.000 0.012 NA   NA
 7136011 7136012 Rpal_2468 Rpal_2469     FALSE 0.377 214.000 0.383 NA N NA
 7136012 7136013 Rpal_2469 Rpal_2470     TRUE 0.811 50.000 0.365 NA   NA
 7136013 7136014 Rpal_2470 Rpal_2471     TRUE 0.809 147.000 0.805 NA   NA
 7136015 7136016 Rpal_2472 Rpal_2473     FALSE 0.364 154.000 0.052 1.000   NA
 7136016 7136017 Rpal_2473 Rpal_2474     FALSE 0.020 329.000 0.024 1.000   NA
 7136019 7136020 Rpal_2476 Rpal_2477     FALSE 0.028 420.000 0.278 1.000 N NA
 7136020 7136021 Rpal_2477 Rpal_2478     TRUE 0.882 0.000 0.125 1.000 N NA
 7136021 7136022 Rpal_2478 Rpal_2479     FALSE 0.314 92.000 0.054 1.000 N NA
 7136022 7136023 Rpal_2479 Rpal_2480     TRUE 0.982 19.000 0.222 0.041 Y NA
 7136023 7136024 Rpal_2480 Rpal_2481     FALSE 0.145 204.000 0.011 1.000   NA
 7136025 7136026 Rpal_2482 Rpal_2483     TRUE 0.611 12.000 0.000 NA   NA
 7136026 7136027 Rpal_2483 Rpal_2484     FALSE 0.186 104.000 0.000 1.000   NA
 7136027 7136028 Rpal_2484 Rpal_2485     TRUE 0.786 11.000 0.028 NA   NA
 7136029 7136030 Rpal_2486 Rpal_2487     FALSE 0.423 195.000 0.286 NA   NA
 7136034 7136035 Rpal_2491 Rpal_2492     FALSE 0.126 163.000 0.000 NA   NA
 7136037 7136038 Rpal_2494 Rpal_2495     FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 7136038 7136039 Rpal_2495 Rpal_2496     FALSE 0.017 298.000 0.000 1.000   NA
 7136039 7136040 Rpal_2496 Rpal_2497     FALSE 0.078 193.000 0.000 NA   NA
 7136040 7136041 Rpal_2497 Rpal_2498   guaA FALSE 0.040 234.000 0.013 NA N NA
 7136041 7136042 Rpal_2498 Rpal_2499 guaA   FALSE 0.131 147.000 0.000 NA   NA
 7136042 7136043 Rpal_2499 Rpal_2500     FALSE 0.193 67.000 0.000 NA   NA
 7136044 7136045 Rpal_2501 Rpal_2502     FALSE 0.002 576.000 0.000 NA   NA
 7136045 7136046 Rpal_2502 Rpal_2503     FALSE 0.013 290.000 0.000 NA   NA
 7136046 7136047 Rpal_2503 Rpal_2504     FALSE 0.011 328.000 0.000 1.000   NA
 7136047 7136048 Rpal_2504 Rpal_2505     FALSE 0.102 178.000 0.000 NA   NA
 7136048 7136049 Rpal_2505 Rpal_2506     TRUE 0.977 0.000 0.750 NA   NA
 7136049 7136050 Rpal_2506 Rpal_2507     FALSE 0.079 192.000 0.000 NA   NA
 7136051 7136052 Rpal_2508 Rpal_2509     FALSE 0.040 229.000 0.000 NA   NA
 7136052 7136053 Rpal_2509 Rpal_2510     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 7136054 7136055 Rpal_2511 Rpal_2512     FALSE 0.189 188.000 0.038 NA   NA
 7136055 7136056 Rpal_2512 Rpal_2513     FALSE 0.359 114.000 0.091 NA   NA
 7136057 7136058 Rpal_2514 Rpal_2515     FALSE 0.332 39.000 0.000 NA   NA
 7136058 7136059 Rpal_2515 Rpal_2516     FALSE 0.465 -19.000 0.000 NA   NA
 7136059 7136060 Rpal_2516 Rpal_2517     FALSE 0.113 171.000 0.000 NA   NA
 7136060 7136061 Rpal_2517 Rpal_2518     TRUE 0.982 -7.000 0.254 0.027 Y NA
 7136061 7136062 Rpal_2518 Rpal_2519     TRUE 0.927 39.000 0.158 1.000 Y NA
 7136062 7136063 Rpal_2519 Rpal_2520     TRUE 0.997 2.000 0.902 0.044 Y NA
 7136065 7136066 Rpal_2522 Rpal_2523     TRUE 0.983 15.000 0.396 NA Y NA
 7136067 7136068 Rpal_2524 Rpal_2525     TRUE 0.776 43.000 0.250 NA   NA
 7136068 7136069 Rpal_2525 Rpal_2526     FALSE 0.143 89.000 0.000 NA   NA
 7136070 7136071 Rpal_2527 Rpal_2528     FALSE 0.002 1036.000 0.000 1.000   NA
 7136072 7136073 Rpal_2529 Rpal_2530     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136073 7136074 Rpal_2530 Rpal_2531     FALSE 0.017 273.000 0.000 NA   NA
 7136075 7136076 Rpal_2532 Rpal_2533     TRUE 0.953 12.000 0.400 NA   NA
 7136076 7136077 Rpal_2533 Rpal_2534     FALSE 0.129 136.000 0.000 NA   NA
 7136078 7136079 Rpal_2535 Rpal_2536     FALSE 0.077 194.000 0.000 NA   NA
 7136080 7136081 Rpal_2537 Rpal_2538     FALSE 0.004 473.000 0.000 1.000   NA
 7136081 7136082 Rpal_2538 Rpal_2539     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136082 7136083 Rpal_2539 Rpal_2540     FALSE 0.004 379.000 0.000 NA   NA
 7136083 7136084 Rpal_2540 Rpal_2541     TRUE 0.727 69.000 0.000 1.000 Y NA
 7136084 7136085 Rpal_2541 Rpal_2542     FALSE 0.120 129.000 0.000 1.000 N NA
 7136085 7136086 Rpal_2542 Rpal_2543     FALSE 0.273 274.000 0.000 0.017 Y NA
 7136088 7136089 Rpal_2545 Rpal_2546     TRUE 0.982 19.000 0.250 0.076 Y NA
 7136089 7136090 Rpal_2546 Rpal_2547     TRUE 0.951 59.000 0.575 1.000 Y NA
 7136090 7136091 Rpal_2547 Rpal_2548     TRUE 0.991 8.000 0.529 1.000 Y NA
 7136091 7136092 Rpal_2548 Rpal_2549     FALSE 0.016 366.000 0.000 0.062 N NA
 7136094 7136095 Rpal_2551 Rpal_2552     TRUE 0.978 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 7136095 7136096 Rpal_2552 Rpal_2553     TRUE 0.991 -3.000 0.792 1.000 Y NA
 7136097 7136098 Rpal_2554 Rpal_2555     TRUE 0.950 -3.000 0.500 NA   NA
 7136098 7136099 Rpal_2555 Rpal_2556     TRUE 0.580 14.000 0.000 NA   NA
 7136100 7136101 Rpal_2557 Rpal_2558     TRUE 0.981 4.000 0.047 0.062 Y NA
 7136102 7136103 Rpal_2559 Rpal_2560     TRUE 0.941 25.000 0.000 0.076 Y NA
 7136103 7136104 Rpal_2560 Rpal_2561     TRUE 0.971 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7136104 7136105 Rpal_2561 Rpal_2562     FALSE 0.184 128.000 0.000 1.000   NA
 7136105 7136106 Rpal_2562 Rpal_2563     FALSE 0.162 78.000 0.000 NA   NA
 7136106 7136107 Rpal_2563 Rpal_2564     TRUE 0.954 0.000 0.400 NA   NA
 7136108 7136109 Rpal_2565 Rpal_2566     FALSE 0.128 104.000 0.000 NA   NA
 7136109 7136110 Rpal_2566 Rpal_2567     FALSE 0.391 168.000 0.133 1.000 N NA
 7136110 7136111 Rpal_2567 Rpal_2568     TRUE 0.771 29.000 0.133 1.000 N NA
 7136111 7136112 Rpal_2568 Rpal_2569     TRUE 0.876 50.000 0.600 1.000 N NA
 7136112 7136113 Rpal_2569 Rpal_2570     TRUE 0.977 0.000 0.167 1.000 Y NA
 7136113 7136114 Rpal_2570 Rpal_2571     TRUE 0.832 79.000 0.167 1.000 Y NA
 7136114 7136115 Rpal_2571 Rpal_2572     TRUE 0.982 -3.000 0.200 0.044 Y NA
 7136115 7136116 Rpal_2572 Rpal_2573     TRUE 0.986 13.000 0.200 0.044 Y NA
 7136116 7136117 Rpal_2573 Rpal_2574     TRUE 0.974 -3.000 0.800 1.000   NA
 7136117 7136118 Rpal_2574 Rpal_2575     FALSE 0.242 75.000 0.000 1.000   NA
 7136118 7136119 Rpal_2575 Rpal_2576     FALSE 0.004 372.000 0.000 1.000 N NA
 7136120 7136121 Rpal_2577 Rpal_2578     TRUE 0.708 -3.000 0.022 NA   NA
 7136121 7136122 Rpal_2578 Rpal_2579     TRUE 0.938 -7.000 0.500 NA   NA
 7136122 7136123 Rpal_2579 Rpal_2580     TRUE 0.952 -13.000 0.667 NA   NA
 7136123 7136124 Rpal_2580 Rpal_2581     TRUE 0.841 18.000 0.125 NA   NA
 7136124 7136125 Rpal_2581 Rpal_2582     TRUE 0.636 8.000 0.000 NA   NA
 7136127 7136128 Rpal_2584 Rpal_2585     TRUE 0.684 55.000 0.167 1.000   NA
 7136128 7136129 Rpal_2585 Rpal_2586     TRUE 0.862 67.000 0.167 1.000 Y NA
 7136131 7136132 Rpal_2588 Rpal_2589     TRUE 0.634 1.000 0.000 NA   NA
 7136132 7136133 Rpal_2589 Rpal_2590     FALSE 0.027 245.000 0.000 NA   NA
 7136133 7136134 Rpal_2590 Rpal_2591     FALSE 0.312 42.000 0.000 NA   NA
 7136134 7136135 Rpal_2591 Rpal_2592     TRUE 0.976 0.000 0.000 0.005 Y NA
 7136135 7136136 Rpal_2592 Rpal_2593     FALSE 0.040 225.000 0.000 1.000 N NA
 7136138 7136139 Rpal_2595 Rpal_2596     FALSE 0.022 282.000 0.000 1.000   NA
 7136139 7136140 Rpal_2596 Rpal_2597     FALSE 0.407 43.000 0.000 1.000   NA
 7136140 7136141 Rpal_2597 Rpal_2598     FALSE 0.389 46.000 0.000 1.000   NA
 7136141 7136142 Rpal_2598 Rpal_2599     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136143 7136144 Rpal_2600 Rpal_2601     TRUE 0.987 2.000 0.133 0.013 Y NA
 7136146 7136147 Rpal_2603 Rpal_2604     TRUE 0.839 78.000 0.222 NA Y NA
 7136147 7136148 Rpal_2604 Rpal_2605     TRUE 0.938 -46.000 0.055 1.000 Y NA
 7136148 7136149 Rpal_2605 Rpal_2606     FALSE 0.341 36.000 0.000 1.000 N NA
 7136149 7136150 Rpal_2606 Rpal_2607     FALSE 0.400 29.000 0.000 1.000 N NA
 7136150 7136151 Rpal_2607 Rpal_2608     TRUE 0.973 13.000 0.000 0.005 Y NA
 7136154 7136155 Rpal_2611 Rpal_2612     TRUE 0.971 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 7136155 7136156 Rpal_2612 Rpal_2613     TRUE 0.566 74.000 0.200 NA   NA
 7136157 7136158 Rpal_2614 Rpal_2615     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136158 7136159 Rpal_2615 Rpal_2616     FALSE 0.034 234.000 0.000 NA   NA
 7136159 7136160 Rpal_2616 Rpal_2617     TRUE 0.552 173.000 0.000 NA Y NA
 7136160 7136161 Rpal_2617 Rpal_2618     FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7136162 7136163 Rpal_2619 Rpal_2620     FALSE 0.358 115.000 0.091 NA   NA
 7136163 7136164 Rpal_2620 Rpal_2621     FALSE 0.442 151.000 0.150 1.000 N NA
 7136164 7136165 Rpal_2621 Rpal_2622     TRUE 0.876 14.000 0.150 1.000 N NA
 7136165 7136166 Rpal_2622 Rpal_2623     TRUE 0.799 99.000 0.214 NA Y NA
 7136166 7136167 Rpal_2623 Rpal_2624     TRUE 0.632 122.000 0.012 NA Y NA
 7136167 7136168 Rpal_2624 Rpal_2625     TRUE 0.992 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 7136168 7136169 Rpal_2625 Rpal_2626     TRUE 0.994 -7.000 0.870 0.044 Y NA
 7136169 7136170 Rpal_2626 Rpal_2627     TRUE 0.981 -3.000 0.356 1.000 Y NA
 7136170 7136171 Rpal_2627 Rpal_2628     FALSE 0.431 10.000 0.000 NA N NA
 7136171 7136172 Rpal_2628 Rpal_2629     TRUE 0.956 0.000 0.412 NA   NA
 7136172 7136173 Rpal_2629 Rpal_2630     TRUE 0.915 -3.000 0.292 NA   NA
 7136173 7136174 Rpal_2630 Rpal_2631     TRUE 0.980 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 7136174 7136175 Rpal_2631 Rpal_2632     TRUE 0.993 -16.000 0.571 0.000 Y NA
 7136177 7136178 Rpal_2634 Rpal_2635     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136178 7136179 Rpal_2635 Rpal_2636     FALSE 0.470 24.000 0.000 NA   NA
 7136179 7136180 Rpal_2636 Rpal_2637     FALSE 0.002 604.000 0.000 NA   NA
 7136180 7136181 Rpal_2637 Rpal_2638     FALSE 0.023 253.000 0.000 NA   NA
 7136181 7136182 Rpal_2638 Rpal_2639     TRUE 0.993 21.000 0.564 0.000 Y NA
 7136182 7136183 Rpal_2639 Rpal_2640     FALSE 0.008 320.000 0.000 1.000 N NA
 7136183 7136184 Rpal_2640 Rpal_2641     TRUE 0.819 -43.000 0.152 NA   NA
 7136184 7136185 Rpal_2641 Rpal_2642     TRUE 0.927 18.000 0.356 NA   NA
 7136185 7136186 Rpal_2642 Rpal_2643     FALSE 0.007 335.000 0.000 NA   NA
 7136186 7136187 Rpal_2643 Rpal_2644     FALSE 0.262 52.000 0.000 NA   NA
 7136188 7136189 Rpal_2645 Rpal_2646     TRUE 0.725 -3.000 0.029 NA   NA
 7136189 7136190 Rpal_2646 Rpal_2647     TRUE 0.814 36.000 0.216 1.000   NA
 7136190 7136191 Rpal_2647 Rpal_2648     TRUE 0.965 11.000 0.502 1.000 N NA
 7136191 7136192 Rpal_2648 Rpal_2649     FALSE 0.518 33.000 0.010 NA   NA
 7136192 7136193 Rpal_2649 Rpal_2650     FALSE 0.006 350.000 0.000 NA   NA
 7136193 7136194 Rpal_2650 Rpal_2651     FALSE 0.001 858.000 0.000 1.000 N NA
 7136194 7136195 Rpal_2651 Rpal_2652   cobN TRUE 0.617 9.000 0.000 1.000 N NA
 7136195 7136196 Rpal_2652 Rpal_2653 cobN   TRUE 0.905 -3.000 0.263 1.000 N NA
 7136196 7136197 Rpal_2653 Rpal_2654     TRUE 0.978 0.000 0.778 NA   NA
 7136197 7136198 Rpal_2654 Rpal_2655     FALSE 0.001 1008.000 0.000 NA   NA
 7136200 7136201 Rpal_2656 Rpal_2657     TRUE 0.826 73.000 0.600 1.000   NA
 7136201 7136202 Rpal_2657 Rpal_2658     TRUE 0.907 12.000 0.147 1.000   NA
 7136203 7136204 Rpal_2659 Rpal_2660     FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 7136205 7136206 Rpal_2661 Rpal_2662     TRUE 0.972 -3.000 0.938 NA N NA
 7136206 7136207 Rpal_2662 Rpal_2663     TRUE 0.940 12.000 0.375 NA N NA
 7136207 7136208 Rpal_2663 Rpal_2664     TRUE 0.933 119.000 0.909 NA Y NA
 7136208 7136209 Rpal_2664 Rpal_2665     TRUE 0.996 12.000 0.833 0.044 Y NA
 7136209 7136210 Rpal_2665 Rpal_2666     TRUE 0.994 0.000 0.833 1.000 Y NA
 7136210 7136211 Rpal_2666 Rpal_2667     TRUE 0.992 -7.000 0.625 0.027 Y NA
 7136211 7136212 Rpal_2667 Rpal_2668     TRUE 0.936 26.000 0.562 1.000 N NA
 7136212 7136213 Rpal_2668 Rpal_2669     TRUE 0.956 16.000 0.152 0.001   NA
 7136213 7136214 Rpal_2669 Rpal_2670     TRUE 0.807 16.000 0.042 1.000   NA
 7136216 7136217 Rpal_2672 Rpal_2673     TRUE 0.997 4.000 0.629 0.001 Y NA
 7136218 7136219 Rpal_2674 Rpal_2675     FALSE 0.123 123.000 0.000 NA   NA
 7136220 7136221 Rpal_2676 Rpal_2677     FALSE 0.007 274.000 0.000 NA N NA
 7136222 7136223 Rpal_2678 Rpal_2679     FALSE 0.262 52.000 0.000 NA   NA
 7136223 7136224 Rpal_2679 Rpal_2680     FALSE 0.135 96.000 0.000 NA   NA
 7136224 7136225 Rpal_2680 Rpal_2681     TRUE 0.940 -19.000 0.056 1.000 Y NA
 7136225 7136226 Rpal_2681 Rpal_2682     TRUE 0.976 0.000 0.200 NA Y NA
 7136227 7136228 Rpal_2683 Rpal_2684     FALSE 0.524 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7136228 7136229 Rpal_2684 Rpal_2685     TRUE 0.754 22.000 0.000 0.075 N NA
 7136229 7136230 Rpal_2685 Rpal_2686     FALSE 0.006 337.000 0.000 1.000 N NA
 7136230 7136231 Rpal_2686 Rpal_2687     TRUE 0.991 -22.000 0.667 0.044 Y NA
 7136231 7136232 Rpal_2687 Rpal_2688     TRUE 0.986 -6.000 0.630 1.000 Y NA
 7136234 7136235 Rpal_2690 Rpal_2691     TRUE 0.827 -13.000 0.167 1.000 N NA
 7136235 7136236 Rpal_2691 Rpal_2692     TRUE 0.908 20.000 0.308 NA   NA
 7136236 7136237 Rpal_2692 Rpal_2693     FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 7136238 7136239 Rpal_2694 Rpal_2695     FALSE 0.212 61.000 0.000 NA   NA
 7136239 7136240 Rpal_2695 Rpal_R0023     FALSE 0.002 606.000 0.000 NA   NA
 7136242 7136243 Rpal_2697 Rpal_2698     FALSE 0.029 241.000 0.000 NA   NA
 7136247 7136248 Rpal_2702 Rpal_2703     TRUE 0.682 14.000 0.000 1.000   NA
 7136250 7136251 Rpal_2705 Rpal_2706     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7136251 7136252 Rpal_2706 Rpal_2707   aat FALSE 0.179 124.000 0.004 NA   NA
 7136252 7136253 Rpal_2707 Rpal_2708 aat   FALSE 0.310 60.000 0.006 NA   NA
 7136253 7136254 Rpal_2708 Rpal_2709     FALSE 0.028 243.000 0.000 NA   NA
 7136254 7136255 Rpal_2709 Rpal_2710     FALSE 0.122 133.000 0.000 1.000 N NA
 7136255 7136256 Rpal_2710 Rpal_2711     TRUE 0.980 -3.000 0.114 0.018 Y NA
 7136256 7136257 Rpal_2711 Rpal_2712     TRUE 0.981 -3.000 0.341 1.000 Y NA
 7136257 7136258 Rpal_2712 Rpal_2713     FALSE 0.377 189.000 0.072 0.090 N NA
 7136258 7136259 Rpal_2713 Rpal_2714     TRUE 0.883 118.000 0.153 0.002 Y NA
 7136259 7136260 Rpal_2714 Rpal_2715     FALSE 0.490 39.000 0.020 1.000 N NA
 7136260 7136261 Rpal_2715 Rpal_2716     FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 7136262 7136263 Rpal_2717 Rpal_2718     FALSE 0.006 338.000 0.000 NA   NA
 7136263 7136264 Rpal_2718 Rpal_2719     TRUE 0.646 -3.000 0.000 1.000   NA
 7136265 7136266 Rpal_2720 Rpal_2721     FALSE 0.499 191.000 0.000 1.000 Y NA
 7136266 7136267 Rpal_2721 Rpal_2722     FALSE 0.058 212.000 0.000 NA   NA
 7136267 7136268 Rpal_2722 Rpal_2723     FALSE 0.087 187.000 0.000 NA   NA
 7136269 7136270 Rpal_2724 Rpal_2725     FALSE 0.203 129.000 0.010 NA   NA
 7136270 7136271 Rpal_2725 Rpal_2726     TRUE 0.575 99.000 0.286 NA   NA
 7136272 7136273 Rpal_2727 Rpal_2728     FALSE 0.122 114.000 0.000 NA   NA
 7136274 7136275 Rpal_2729 Rpal_2730     TRUE 0.711 220.000 0.396 1.000 Y NA
 7136275 7136276 Rpal_2730 Rpal_2731     FALSE 0.259 119.000 0.041 1.000 N NA
 7136276 7136277 Rpal_2731 Rpal_2732     TRUE 0.729 7.000 0.005 1.000 N NA
 7136278 7136279 Rpal_2733 Rpal_2734     FALSE 0.284 96.000 0.015 1.000   NA
 7136281 7136282 Rpal_2736 Rpal_2737     FALSE 0.022 221.000 0.000 NA N NA
 7136282 7136283 Rpal_2737 Rpal_2738     FALSE 0.171 85.000 0.012 NA N NA
 7136286 7136287 Rpal_2741 Rpal_2742     FALSE 0.437 83.000 0.109 1.000 N NA
 7136287 7136288 Rpal_2742 Rpal_2743     TRUE 0.895 133.000 0.466 1.000 Y NA
 7136288 7136289 Rpal_2743 Rpal_2744     TRUE 0.981 24.000 0.482 1.000 Y NA
 7136289 7136290 Rpal_2744 Rpal_2745     TRUE 0.874 -3.000 0.193 1.000 N NA
 7136290 7136291 Rpal_2745 Rpal_2746     TRUE 0.920 -3.000 0.309 NA   NA
 7136291 7136292 Rpal_2746 Rpal_2747     TRUE 0.765 8.000 0.014 NA   NA
 7136292 7136293 Rpal_2747 Rpal_2748     FALSE 0.213 130.000 0.013 NA   NA
 7136293 7136294 Rpal_2748 Rpal_2749     FALSE 0.134 154.000 0.000 NA   NA
 7136294 7136295 Rpal_2749 Rpal_2750     TRUE 0.639 6.000 0.000 NA   NA
 7136295 7136296 Rpal_2750 Rpal_2751     FALSE 0.344 -3.000 0.000 NA N NA
 7136296 7136297 Rpal_2751 Rpal_2752     FALSE 0.072 86.000 0.000 NA N NA
 7136297 7136298 Rpal_2752 Rpal_2753     FALSE 0.058 115.000 0.000 NA N NA
 7136299 7136300 Rpal_2754 Rpal_2755     FALSE 0.432 99.000 0.144 1.000 N NA
 7136300 7136301 Rpal_2755 Rpal_2756     FALSE 0.162 274.000 0.000 1.000 Y NA
 7136302 7136303 Rpal_2757 Rpal_2758     FALSE 0.409 178.000 0.143 1.000   NA
 7136306 7136307 Rpal_2761 Rpal_2762     FALSE 0.205 220.000 0.143 NA   NA
 7136308 7136309 Rpal_2763 Rpal_2764     TRUE 0.958 14.000 0.500 NA   NA
 7136311 7136312 Rpal_2766 Rpal_2767     TRUE 0.649 86.000 0.333 NA   NA
 7136314 7136315 Rpal_2769 Rpal_2770     TRUE 0.777 15.000 0.046 1.000 N NA
 7136315 7136316 Rpal_2770 Rpal_2771     FALSE 0.421 70.000 0.037 1.000   NA
 7136316 7136317 Rpal_2771 Rpal_2772     FALSE 0.034 255.000 0.000 1.000   NA
 7136317 7136318 Rpal_2772 Rpal_2773     FALSE 0.025 247.000 0.000 NA   NA
 7136319 7136320 Rpal_2774 Rpal_2775     FALSE 0.002 350.000 0.000 NA N NA
 7136321 7136322 Rpal_2776 Rpal_2777     TRUE 0.994 0.000 0.876 1.000 Y NA
 7136322 7136323 Rpal_2777 Rpal_2778     TRUE 0.829 66.000 0.112 NA Y NA
 7136323 7136324 Rpal_2778 Rpal_2779     TRUE 0.645 71.000 0.308 NA N NA
 7136326 7136327 Rpal_2781 Rpal_2782     FALSE 0.181 185.000 0.027 NA   NA
 7136327 7136328 Rpal_2782 Rpal_2783     TRUE 0.845 79.000 0.202 1.000 Y NA
 7136328 7136329 Rpal_2783 Rpal_2784   glpX FALSE 0.528 63.000 0.112 1.000 N NA
 7136329 7136330 Rpal_2784 Rpal_2785 glpX   FALSE 0.264 108.000 0.013 1.000   NA
 7136330 7136331 Rpal_2785 Rpal_2786     TRUE 0.613 66.000 0.035 0.074   NA
 7136331 7136332 Rpal_2786 Rpal_2787     FALSE 0.239 164.000 0.005 1.000   NA
 7136333 7136334 Rpal_2788 Rpal_2789     FALSE 0.395 85.000 0.079 NA   NA
 7136334 7136335 Rpal_2789 Rpal_2790     TRUE 0.843 18.000 0.128 NA   NA
 7136338 7136339 Rpal_2793 Rpal_2794     TRUE 0.867 -3.000 0.174 1.000 N NA
 7136339 7136340 Rpal_2794 Rpal_2795     FALSE 0.268 161.000 0.037 NA   NA
 7136346 7136347 Rpal_2800 Rpal_2801     TRUE 0.717 204.000 0.082 0.036 Y NA
 7136347 7136348 Rpal_2801 Rpal_2802     FALSE 0.359 198.000 0.226 NA   NA
 7136348 7136349 Rpal_2802 Rpal_R0025     FALSE 0.156 81.000 0.000 NA   NA
 7136349 7136350 Rpal_R0025 Rpal_2803     FALSE 0.041 228.000 0.000 NA   NA
 7136350 7136351 Rpal_2803 Rpal_2804     FALSE 0.472 -12.000 0.000 NA   NA
 7136351 7136352 Rpal_2804 Rpal_2805     FALSE 0.002 560.000 0.000 NA   NA
 7136354 7136355 Rpal_2807 Rpal_2808     FALSE 0.156 200.000 0.012 1.000   NA
 7136355 7136356 Rpal_2808 Rpal_2809     TRUE 0.968 17.000 0.158 1.000 Y NA
 7136356 7136357 Rpal_2809 Rpal_2810     FALSE 0.427 121.000 0.036 0.074 N NA
 7136358 7136359 Rpal_2811 Rpal_2812     TRUE 0.992 -3.000 0.900 NA Y NA
 7136359 7136360 Rpal_2812 Rpal_2813     TRUE 0.979 -3.000 0.359 NA Y NA
 7136361 7136362 Rpal_2814 Rpal_2815     FALSE 0.002 525.000 0.000 NA   NA
 7136362 7136363 Rpal_2815 Rpal_2816     FALSE 0.097 177.000 0.000 1.000 N NA
 7136365 7136366 Rpal_2818 Rpal_2819     TRUE 0.966 -3.000 0.704 NA   NA
 7136368 7136369 Rpal_2821 Rpal_2822     FALSE 0.018 271.000 0.000 NA   NA
 7136371 7136372 Rpal_2823 Rpal_2824     TRUE 0.730 150.000 0.473 1.000   NA
 7136372 7136373 Rpal_2824 Rpal_2825     TRUE 0.874 51.000 0.098 NA Y NA
 7136373 7136374 Rpal_2825 Rpal_2826     TRUE 0.946 2.000 0.310 NA   NA
 7136374 7136375 Rpal_2826 Rpal_2827     TRUE 0.561 64.000 0.143 NA   NA
 7136375 7136376 Rpal_2827 Rpal_2828     TRUE 0.906 0.000 0.187 NA   NA
 7136376 7136377 Rpal_2828 Rpal_2829     FALSE 0.134 153.000 0.000 NA   NA
 7136377 7136378 Rpal_2829 Rpal_2830     FALSE 0.022 254.000 0.000 NA   NA
 7136380 7136381 Rpal_2832 Rpal_2833     TRUE 0.975 21.000 0.129 0.043 Y NA
 7136381 7136382 Rpal_2833 Rpal_2834     TRUE 0.995 -3.000 0.815 0.006 Y NA
 7136382 7136383 Rpal_2834 Rpal_2835     TRUE 0.965 16.000 0.101 1.000 Y NA
 7136384 7136385 Rpal_2836 Rpal_2837     FALSE 0.130 146.000 0.000 NA   NA
 7136385 7136386 Rpal_2837 Rpal_2838     FALSE 0.264 110.000 0.041 1.000 N NA
 7136386 7136387 Rpal_2838 Rpal_2839     FALSE 0.469 60.000 0.062 NA   NA
 7136387 7136388 Rpal_2839 Rpal_2840     TRUE 0.978 3.000 0.722 NA   NA
 7136389 7136390 Rpal_2841 Rpal_2842     TRUE 0.987 -10.000 0.484 0.094 Y NA
 7136390 7136391 Rpal_2842 Rpal_2843     TRUE 0.800 71.000 0.630 NA N NA
 7136391 7136392 Rpal_2843 Rpal_2844     TRUE 0.994 0.000 0.963 NA Y NA
 7136392 7136393 Rpal_2844 Rpal_2845     TRUE 0.890 8.000 0.122 NA   NA
 7136395 7136396 Rpal_2846 Rpal_2847     TRUE 0.967 3.000 0.500 NA   NA
 7136397 7136398 Rpal_2848 Rpal_2849     FALSE 0.074 196.000 0.000 NA   NA
 7136398 7136399 Rpal_2849 Rpal_R0028     FALSE 0.080 191.000 0.000 NA   NA
 7136400 7136401 Rpal_2850 Rpal_2851     FALSE 0.108 211.000 0.019 1.000 N NA
 7136401 7136402 Rpal_2851 Rpal_2852     FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 7136402 7136403 Rpal_2852 Rpal_2853   valS FALSE 0.258 142.000 0.033 NA   NA
 7136403 7136404 Rpal_2853 Rpal_2854 valS   TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7136404 7136405 Rpal_2854 Rpal_2855     FALSE 0.074 196.000 0.000 NA   NA
 7136407 7136408 Rpal_2857 Rpal_2858     TRUE 0.691 27.000 0.081 NA N NA
 7136409 7136410 Rpal_2859 Rpal_2860     TRUE 0.851 3.000 0.061 NA   NA
 7136411 7136412 Rpal_2861 Rpal_2862     TRUE 0.824 -3.000 0.094 1.000 N NA
 7136412 7136413 Rpal_2862 Rpal_2863     TRUE 0.990 10.000 0.297 0.074 Y NA
 7136413 7136414 Rpal_2863 Rpal_2864     TRUE 0.872 160.000 0.205 0.074 Y NA
 7136414 7136415 Rpal_2864 Rpal_2865     TRUE 0.991 17.000 0.533 0.074 Y NA
 7136415 7136416 Rpal_2865 Rpal_2866     TRUE 0.638 41.000 0.085 1.000 N NA
 7136416 7136417 Rpal_2866 Rpal_2867   hfq FALSE 0.487 182.000 0.243 1.000   NA
 7136417 7136418 Rpal_2867 Rpal_2868 hfq   TRUE 0.896 12.000 0.115 1.000   NA
 7136418 7136419 Rpal_2868 Rpal_2869     FALSE 0.132 203.000 0.003 1.000   NA
 7136421 7136422 Rpal_2871 Rpal_2872 coaD   TRUE 0.715 17.000 0.027 1.000 N NA
 7136422 7136423 Rpal_2872 Rpal_2873     TRUE 0.952 10.000 0.375 NA   NA
 7136423 7136424 Rpal_2873 Rpal_2874     TRUE 0.833 -24.000 0.180 NA   NA
 7136424 7136425 Rpal_2874 Rpal_2875   queA FALSE 0.225 170.000 0.031 1.000 N NA
 7136425 7136426 Rpal_2875 Rpal_2876 queA tgt TRUE 0.992 -3.000 0.360 0.000 Y NA
 7136427 7136428 Rpal_2877 Rpal_2878     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136428 7136429 Rpal_2878 Rpal_2879     FALSE 0.029 241.000 0.000 NA   NA
 7136429 7136430 Rpal_2879 Rpal_2880     FALSE 0.186 162.000 0.000 1.000   NA
 7136430 7136431 Rpal_2880 Rpal_2881     TRUE 0.838 11.000 0.036 1.000   NA
 7136431 7136432 Rpal_2881 Rpal_2882     TRUE 0.990 8.000 0.472 1.000 Y NA
 7136432 7136433 Rpal_2882 Rpal_2883     TRUE 0.776 -3.000 0.057 1.000 N NA
 7136433 7136434 Rpal_2883 Rpal_2884     TRUE 0.572 45.000 0.065 1.000 N NA
 7136435 7136436 Rpal_2885 Rpal_2886     TRUE 0.669 42.000 0.075 1.000   NA
 7136436 7136437 Rpal_2886 Rpal_2887     TRUE 0.972 2.000 0.364 0.060 N NA
 7136437 7136438 Rpal_2887 Rpal_2888     TRUE 0.996 0.000 0.800 0.060 Y NA
 7136441 7136442 Rpal_2891 Rpal_2892     FALSE 0.388 32.000 0.000 NA   NA
 7136442 7136443 Rpal_2892 Rpal_2893     TRUE 0.841 29.000 0.244 1.000 N NA
 7136443 7136444 Rpal_2893 Rpal_2894     TRUE 0.985 0.000 0.318 1.000 Y NA
 7136444 7136445 Rpal_2894 Rpal_2895     TRUE 0.957 124.000 0.795 0.043 Y NA
 7136445 7136446 Rpal_2895 Rpal_2896     FALSE 0.002 550.000 0.000 1.000 N NA
 7136446 7136447 Rpal_2896 Rpal_2897     FALSE 0.030 240.000 0.000 NA   NA
 7136448 7136449 Rpal_2898 Rpal_2899     FALSE 0.372 32.000 0.000 1.000 N NA
 7136449 7136450 Rpal_2899 Rpal_2900     TRUE 0.973 19.000 0.068 0.043 Y NA
 7136450 7136451 Rpal_2900 Rpal_2901     TRUE 0.922 -3.000 0.085 0.006 N NA
 7136451 7136452 Rpal_2901 Rpal_2902     FALSE 0.021 547.000 0.000 NA Y NA
 7136452 7136453 Rpal_2902 Rpal_2903     TRUE 0.942 11.000 0.000 NA Y NA
 7136453 7136454 Rpal_2903 Rpal_2904     TRUE 0.992 0.000 0.630 1.000 Y NA
 7136454 7136455 Rpal_2904 Rpal_2905     FALSE 0.284 47.000 0.000 NA   NA
 7136455 7136456 Rpal_2905 Rpal_2906     FALSE 0.002 560.000 0.000 NA   NA
 7136456 7136457 Rpal_2906 Rpal_2907     FALSE 0.436 39.000 0.000 1.000   NA
 7136457 7136458 Rpal_2907 Rpal_2908     TRUE 0.548 66.000 0.000 0.005 N NA
 7136458 7136459 Rpal_2908 Rpal_2909     TRUE 0.975 12.000 0.000 0.005 Y NA
 7136459 7136460 Rpal_2909 Rpal_2910     FALSE 0.038 295.000 0.000 0.060 N NA
 7136461 7136462 Rpal_2911 Rpal_2912     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136462 7136463 Rpal_2912 Rpal_2913     FALSE 0.524 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7136465 7136466 Rpal_2915 Rpal_2916     TRUE 0.980 -3.000 1.000 1.000   NA
 7136466 7136467 Rpal_2916 Rpal_2917     TRUE 0.997 4.000 1.000 0.043 Y NA
 7136467 7136468 Rpal_2917 Rpal_2918     TRUE 0.992 25.000 0.714 0.043 Y NA
 7136468 7136469 Rpal_2918 Rpal_2919     FALSE 0.169 170.000 0.000 1.000   NA
 7136469 7136470 Rpal_2919 Rpal_2920     FALSE 0.404 30.000 0.000 NA   NA
 7136470 7136471 Rpal_2920 Rpal_2921     FALSE 0.003 455.000 0.000 NA   NA
 7136474 7136475 Rpal_2924 Rpal_2925     FALSE 0.296 91.000 0.041 NA   NA
 7136476 7136477 Rpal_2926 Rpal_2927     TRUE 0.963 26.000 0.400 0.003   NA
 7136477 7136478 Rpal_2927 Rpal_R0029     FALSE 0.005 358.000 0.000 NA   NA
 7136478 7136479 Rpal_R0029 Rpal_2928     FALSE 0.134 156.000 0.000 NA   NA
 7136479 7136480 Rpal_2928 Rpal_2929     FALSE 0.254 188.000 0.078 NA   NA
 7136482 7136483 Rpal_2931 Rpal_2932     TRUE 0.848 74.000 0.769 NA   NA
 7136484 7136485 Rpal_2933 Rpal_2934     TRUE 0.748 127.000 0.083 1.000 Y NA
 7136485 7136486 Rpal_2934 Rpal_2935     FALSE 0.065 258.000 0.059 NA   NA
 7136488 7136489 Rpal_2937 Rpal_2938     TRUE 0.812 -3.000 0.078 NA   NA
 7136490 7136491 Rpal_2939 Rpal_2940     TRUE 0.895 49.000 0.667 NA   NA
 7136491 7136492 Rpal_2940 Rpal_2941     TRUE 0.892 5.000 0.127 1.000 N NA
 7136494 7136495 Rpal_2943 Rpal_2944     FALSE 0.133 149.000 0.000 NA   NA
 7136498 7136499 Rpal_2947 Rpal_2948     TRUE 0.793 -3.000 0.068 1.000 N NA
 7136499 7136500 Rpal_2948 Rpal_2949     FALSE 0.510 87.000 0.200 1.000 N NA
 7136501 7136502 Rpal_2950 Rpal_2951     FALSE 0.004 399.000 0.000 1.000 N NA
 7136503 7136504 Rpal_2952 Rpal_2953     TRUE 0.997 8.000 0.857 0.043 Y NA
 7136504 7136505 Rpal_2953 Rpal_2954     TRUE 0.987 -7.000 0.692 1.000 Y NA
 7136505 7136506 Rpal_2954 Rpal_2955     TRUE 0.949 2.000 0.333 1.000 N NA
 7136507 7136508 Rpal_2956 Rpal_2957     TRUE 0.860 28.000 0.261 NA   NA
 7136508 7136509 Rpal_2957 Rpal_2958     TRUE 0.985 -3.000 0.518 NA Y NA
 7136510 7136511 Rpal_2959 Rpal_2960     TRUE 0.900 13.000 0.194 NA   NA
 7136511 7136512 Rpal_2960 Rpal_2961     FALSE 0.187 132.000 0.000 1.000   NA
 7136512 7136513 Rpal_2961 Rpal_2962   mscL TRUE 0.961 11.000 0.020 1.000 Y NA
 7136513 7136514 Rpal_2962 Rpal_2963 mscL smpB FALSE 0.474 38.000 0.012 1.000 N NA
 7136514 7136515 Rpal_2963 Rpal_2964 smpB   TRUE 0.926 23.000 0.007 1.000 Y NA
 7136516 7136517 Rpal_2965 Rpal_2966     TRUE 0.919 6.000 0.204 NA   NA
 7136518 7136519 Rpal_2967 Rpal_2968     FALSE 0.424 266.000 0.291 1.000 Y NA
 7136519 7136520 Rpal_2968 Rpal_2969     FALSE 0.244 150.000 0.026 1.000 N NA
 7136520 7136521 Rpal_2969 Rpal_2970   acpS TRUE 0.923 -3.000 0.326 1.000 N NA
 7136521 7136522 Rpal_2970 Rpal_2971 acpS   FALSE 0.089 242.000 0.070 1.000 N NA
 7136522 7136523 Rpal_2971 Rpal_2972     TRUE 0.784 -3.000 0.062 1.000 N NA
 7136523 7136524 Rpal_2972 Rpal_2973   era TRUE 0.910 -7.000 0.098 0.034   NA
 7136524 7136525 Rpal_2973 Rpal_2974 era   TRUE 0.819 -3.000 0.084 NA   NA
 7136525 7136526 Rpal_2974 Rpal_2975   recO FALSE 0.434 43.000 0.010 NA   NA
 7136528 7136529 Rpal_2977 Rpal_2978     TRUE 0.605 10.000 0.003 NA N NA
 7136529 7136530 Rpal_2978 Rpal_2979     FALSE 0.140 86.000 0.000 1.000 N NA
 7136534 7136535 Rpal_2983 Rpal_2984     TRUE 0.918 -10.000 0.391 NA   NA
 7136535 7136536 Rpal_2984 Rpal_2985     TRUE 0.894 -3.000 0.227 NA   NA
 7136537 7136538 Rpal_2986 Rpal_2987     FALSE 0.524 69.000 0.128 NA   NA
 7136538 7136539 Rpal_2987 Rpal_2988     FALSE 0.313 158.000 0.055 NA   NA
 7136540 7136541 Rpal_2989 Rpal_2990     FALSE 0.409 78.000 0.075 NA   NA
 7136541 7136542 Rpal_2990 Rpal_2991     FALSE 0.005 353.000 0.000 1.000 N NA
 7136542 7136543 Rpal_2991 Rpal_2992     FALSE 0.055 214.000 0.000 NA   NA
 7136543 7136544 Rpal_2992 Rpal_2993     TRUE 0.974 17.000 0.889 NA   NA
 7136544 7136545 Rpal_2993 Rpal_2994     TRUE 0.901 15.000 0.222 NA   NA
 7136545 7136546 Rpal_2994 Rpal_2995     FALSE 0.240 56.000 0.000 NA   NA
 7136548 7136549 Rpal_2997 Rpal_2998     FALSE 0.089 186.000 0.000 NA   NA
 7136549 7136550 Rpal_2998 Rpal_2999     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7136551 7136552 Rpal_3000 Rpal_3001     FALSE 0.129 145.000 0.000 NA   NA
 7136552 7136553 Rpal_3001 Rpal_3002     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 7136553 7136554 Rpal_3002 Rpal_3003     TRUE 0.963 -3.000 0.667 NA   NA
 7136555 7136556 Rpal_3004 Rpal_3005 glyA nrdR FALSE 0.240 103.000 0.052 NA N NA
 7136556 7136557 Rpal_3005 Rpal_3006 nrdR   TRUE 0.895 -3.000 0.277 NA N NA
 7136557 7136558 Rpal_3006 Rpal_3007     TRUE 0.989 11.000 0.456 1.000 Y NA
 7136558 7136559 Rpal_3007 Rpal_3008   ribH TRUE 0.843 130.000 0.030 0.001 Y NA
 7136559 7136560 Rpal_3008 Rpal_3009 ribH nusB TRUE 0.951 6.000 0.347 1.000 N NA
 7136560 7136561 Rpal_3009 Rpal_3010 nusB   FALSE 0.122 115.000 0.000 NA   NA
 7136561 7136562 Rpal_3010 Rpal_3011     FALSE 0.123 122.000 0.000 NA   NA
 7136562 7136563 Rpal_3011 Rpal_3012   hppA FALSE 0.035 231.000 0.000 1.000 N NA
 7136563 7136564 Rpal_3012 Rpal_3013 hppA   FALSE 0.126 163.000 0.000 NA   NA
 7136564 7136565 Rpal_3013 Rpal_3014     FALSE 0.016 275.000 0.000 NA   NA
 7136565 7136566 Rpal_3014 Rpal_3015     TRUE 0.722 36.000 0.125 NA   NA
 7136568 7136569 Rpal_3017 Rpal_3018     TRUE 0.797 18.000 0.071 NA   NA
 7136569 7136570 Rpal_3018 Rpal_3019     FALSE 0.075 241.000 0.044 NA   NA
 7136570 7136571 Rpal_3019 Rpal_3020     TRUE 0.991 -3.000 0.380 0.003 Y NA
 7136571 7136572 Rpal_3020 Rpal_3021   ihfA FALSE 0.484 134.000 0.207 1.000 N NA
 7136572 7136573 Rpal_3021 Rpal_3022 ihfA   TRUE 0.676 15.000 0.008 1.000 N NA
 7136573 7136574 Rpal_3022 Rpal_R0030     FALSE 0.008 318.000 0.000 NA   NA
 7136575 7136576 Rpal_3023 Rpal_3024     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136576 7136577 Rpal_3024 Rpal_3025     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136577 7136578 Rpal_3025 Rpal_3026     FALSE 0.462 -28.000 0.000 NA   NA
 7136578 7136579 Rpal_3026 Rpal_3027     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136579 7136580 Rpal_3027 Rpal_3028     TRUE 0.638 2.000 0.000 NA   NA
 7136580 7136581 Rpal_3028 Rpal_3029     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136581 7136582 Rpal_3029 Rpal_3030     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136582 7136583 Rpal_3030 Rpal_3031     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136583 7136584 Rpal_3031 Rpal_3032     FALSE 0.081 215.000 0.000 1.000   NA
 7136584 7136585 Rpal_3032 Rpal_3033     TRUE 0.622 11.000 0.000 NA   NA
 7136585 7136586 Rpal_3033 Rpal_3034     TRUE 0.642 5.000 0.000 NA   NA
 7136586 7136587 Rpal_3034 Rpal_3035     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7136587 7136588 Rpal_3035 Rpal_3036     FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7136588 7136589 Rpal_3036 Rpal_3037     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136589 7136590 Rpal_3037 Rpal_3038     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136590 7136591 Rpal_3038 Rpal_3039     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136591 7136592 Rpal_3039 Rpal_3040     TRUE 0.639 6.000 0.000 NA   NA
 7136592 7136593 Rpal_3040 Rpal_3041     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136593 7136594 Rpal_3041 Rpal_3042     TRUE 0.554 16.000 0.000 NA   NA
 7136594 7136595 Rpal_3042 Rpal_3043     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 7136595 7136596 Rpal_3043 Rpal_3044     TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7136597 7136598 Rpal_3045 Rpal_3046     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136598 7136599 Rpal_3046 Rpal_3047     FALSE 0.132 148.000 0.000 NA   NA
 7136599 7136600 Rpal_3047 Rpal_3048     FALSE 0.404 30.000 0.000 NA   NA
 7136600 7136601 Rpal_3048 Rpal_3049     TRUE 0.729 1.000 0.000 1.000   NA
 7136601 7136602 Rpal_3049 Rpal_3050     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7136602 7136603 Rpal_3050 Rpal_3051     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136603 7136604 Rpal_3051 Rpal_3052     FALSE 0.246 55.000 0.000 NA   NA
 7136604 7136605 Rpal_3052 Rpal_3053     FALSE 0.003 448.000 0.000 NA   NA
 7136605 7136606 Rpal_3053 Rpal_3054     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7136606 7136607 Rpal_3054 Rpal_3055     TRUE 0.638 7.000 0.000 NA   NA
 7136607 7136608 Rpal_3055 Rpal_3056     FALSE 0.222 59.000 0.000 NA   NA
 7136608 7136609 Rpal_3056 Rpal_3057     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136609 7136610 Rpal_3057 Rpal_3058     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7136610 7136611 Rpal_3058 Rpal_3059     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7136611 7136612 Rpal_3059 Rpal_3060     TRUE 0.984 7.000 1.000 NA   NA
 7136612 7136613 Rpal_3060 Rpal_3061     TRUE 0.984 1.000 1.000 NA   NA
 7136613 7136614 Rpal_3061 Rpal_3062     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 7136614 7136615 Rpal_3062 Rpal_3063     FALSE 0.100 179.000 0.000 NA   NA
 7136615 7136616 Rpal_3063 Rpal_3064     TRUE 0.827 73.000 0.667 NA   NA
 7136616 7136617 Rpal_3064 Rpal_3065     TRUE 0.766 105.000 0.667 NA   NA
 7136617 7136618 Rpal_3065 Rpal_3066     TRUE 0.964 0.000 0.500 NA   NA
 7136618 7136619 Rpal_3066 Rpal_3067     TRUE 0.977 -3.000 1.000 NA   NA
 7136619 7136620 Rpal_3067 Rpal_3068     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7136620 7136621 Rpal_3068 Rpal_3069     TRUE 0.973 0.000 0.667 NA   NA
 7136621 7136622 Rpal_3069 Rpal_3070     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7136622 7136623 Rpal_3070 Rpal_3071     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7136623 7136624 Rpal_3071 Rpal_3072     FALSE 0.002 748.000 0.000 NA   NA
 7136624 7136625 Rpal_3072 Rpal_3073     FALSE 0.046 222.000 0.000 NA   NA
 7136625 7136626 Rpal_3073 Rpal_3074     TRUE 0.632 9.000 0.000 NA   NA
 7136626 7136627 Rpal_3074 Rpal_3075     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136627 7136628 Rpal_3075 Rpal_3076     FALSE 0.364 35.000 0.000 NA   NA
 7136628 7136629 Rpal_3076 Rpal_3077     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7136629 7136630 Rpal_3077 Rpal_3078     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7136630 7136631 Rpal_3078 Rpal_3079     TRUE 0.642 5.000 0.000 NA   NA
 7136631 7136632 Rpal_3079 Rpal_3080     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136633 7136634 Rpal_3081 Rpal_3082     FALSE 0.135 95.000 0.000 NA   NA
 7136635 7136636 Rpal_3083 Rpal_3084     FALSE 0.009 317.000 0.000 NA   NA
 7136636 7136637 Rpal_3084 Rpal_3085     FALSE 0.131 160.000 0.000 NA   NA
 7136639 7136640 Rpal_3087 Rpal_3088     TRUE 0.678 39.000 0.100 NA   NA
 7136641 7136642 Rpal_3089 Rpal_3090     TRUE 0.884 111.000 0.500 NA Y NA
 7136650 7136651 Rpal_3098 Rpal_3099     TRUE 0.622 2.000 0.000 1.000 N NA
 7136653 7136654 Rpal_3101 Rpal_3102     TRUE 0.719 28.000 0.070 NA   NA
 7136654 7136655 Rpal_3102 Rpal_3103     FALSE 0.285 95.000 0.040 NA   NA
 7136655 7136656 Rpal_3103 Rpal_3104     FALSE 0.225 150.000 0.015 NA   NA
 7136657 7136658 Rpal_3105 Rpal_3106   rplM FALSE 0.160 156.000 0.015 NA N NA
 7136658 7136659 Rpal_3106 Rpal_3107 rplM rpsI TRUE 0.991 2.000 0.231 0.009 Y NA
 7136659 7136660 Rpal_3107 Rpal_3108 rpsI   FALSE 0.015 275.000 0.000 1.000 N NA
 7136660 7136661 Rpal_3108 Rpal_3109     FALSE 0.455 79.000 0.074 1.000   NA
 7136665 7136666 Rpal_3113 Rpal_3114     TRUE 0.880 3.000 0.099 1.000 N NA
 7136666 7136667 Rpal_3114 Rpal_3115     TRUE 0.917 -3.000 0.254 1.000   NA
 7136667 7136668 Rpal_3115 Rpal_3116     FALSE 0.452 81.000 0.075 1.000   NA
 7136668 7136669 Rpal_3116 Rpal_3117     TRUE 0.910 4.000 0.221 NA N NA
 7136669 7136670 Rpal_3117 Rpal_3118     TRUE 0.802 26.000 0.139 NA   NA
 7136671 7136672 Rpal_3119 Rpal_3120     TRUE 0.831 55.000 0.467 1.000 N NA
 7136672 7136673 Rpal_3120 Rpal_3121     TRUE 0.987 13.000 0.409 1.000 Y NA
 7136675 7136676 Rpal_3123 Rpal_3124     FALSE 0.474 91.000 0.167 NA   NA
 7136676 7136677 Rpal_3124 Rpal_3125     TRUE 0.763 90.000 0.600 NA   NA
 7136680 7136681 Rpal_3128 Rpal_3129     TRUE 0.995 -9.000 0.881 0.008 Y NA
 7136681 7136682 Rpal_3129 Rpal_3130     TRUE 0.996 -3.000 0.976 0.008 Y NA
 7136682 7136683 Rpal_3130 Rpal_3131     TRUE 0.993 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 7136683 7136684 Rpal_3131 Rpal_3132     TRUE 0.995 -3.000 0.937 0.045 Y NA
 7136684 7136685 Rpal_3132 Rpal_3133     TRUE 0.993 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 7136686 7136687 Rpal_3134 Rpal_3135     TRUE 0.829 21.000 0.136 NA   NA
 7136687 7136688 Rpal_3135 Rpal_3136     TRUE 0.871 154.000 0.121 0.012 Y NA
 7136689 7136690 Rpal_3137 Rpal_3138     TRUE 0.862 -3.000 0.160 1.000 N NA
 7136691 7136692 Rpal_3139 Rpal_3141     FALSE 0.025 247.000 0.000 NA   NA
 7136694 7136695 Rpal_3143 Rpal_3144     FALSE 0.176 73.000 0.000 NA   NA
 7136696 7136697 Rpal_3145 Rpal_3146     TRUE 0.987 -3.000 0.761 0.001   NA
 7136697 7136698 Rpal_3146 Rpal_3147     TRUE 0.991 0.000 0.761 0.000   NA
 7136698 7136699 Rpal_3147 Rpal_3148     FALSE 0.124 124.000 0.000 NA   NA
 7136700 7136701 Rpal_3149 Rpal_3150     FALSE 0.290 82.000 0.005 1.000   NA
 7136702 7136703 Rpal_3151 Rpal_3152 mazG   FALSE 0.238 79.000 0.007 NA   NA
 7136703 7136704 Rpal_3152 Rpal_3153     TRUE 0.826 -3.000 0.091 NA   NA
 7136706 7136707 Rpal_3155 Rpal_3156   uvrA FALSE 0.009 310.000 0.000 1.000 N NA
 7136707 7136708 Rpal_3156 Rpal_3157 uvrA   FALSE 0.172 112.000 0.002 NA   NA
 7136708 7136709 Rpal_3157 Rpal_3158     FALSE 0.003 460.000 0.000 NA   NA
 7136710 7136711 Rpal_3159 Rpal_3160     TRUE 0.628 10.000 0.000 NA   NA
 7136712 7136713 Rpal_3161 Rpal_3162     FALSE 0.342 38.000 0.000 NA   NA
 7136713 7136714 Rpal_3162 Rpal_3163     FALSE 0.015 277.000 0.000 NA   NA
 7136714 7136715 Rpal_3163 Rpal_3164     FALSE 0.129 133.000 0.000 NA   NA
 7136717 7136718 Rpal_3166 Rpal_3167     FALSE 0.003 500.000 0.000 NA   NA
 7136718 7136719 Rpal_3167 Rpal_3168     FALSE 0.218 137.000 0.015 NA   NA
 7136720 7136721 Rpal_3169 Rpal_3170     TRUE 0.865 -3.000 0.165 NA   NA
 7136721 7136722 Rpal_3170 Rpal_3171   secF FALSE 0.401 161.000 0.113 NA   NA
 7136722 7136723 Rpal_3171 Rpal_3172 secF secD TRUE 0.988 26.000 0.356 0.000 Y NA
 7136723 7136724 Rpal_3172 Rpal_3173 secD   TRUE 0.889 45.000 0.099 NA Y NA
 7136725 7136726 Rpal_3174 Rpal_3175     FALSE 0.185 169.000 0.009 NA   NA
 7136729 7136730 Rpal_3178 Rpal_3179     FALSE 0.352 121.000 0.089 1.000 N NA
 7136732 7136733 Rpal_3181 Rpal_3182   surE FALSE 0.058 212.000 0.000 NA   NA
 7136733 7136734 Rpal_3182 Rpal_3183 surE   FALSE 0.128 142.000 0.000 NA   NA
 7136734 7136735 Rpal_3183 Rpal_3184     FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 7136735 7136736 Rpal_3184 Rpal_3185     TRUE 0.730 6.000 0.004 NA   NA
 7136736 7136737 Rpal_3185 Rpal_3186     FALSE 0.180 111.000 0.000 1.000   NA
 7136737 7136738 Rpal_3186 Rpal_3187     FALSE 0.470 24.000 0.000 NA   NA
 7136738 7136739 Rpal_3187 Rpal_3188     TRUE 0.937 -3.000 0.019 NA Y NA
 7136739 7136740 Rpal_3188 Rpal_3189   tatA FALSE 0.346 217.000 0.000 NA Y NA
 7136740 7136741 Rpal_3189 Rpal_3190 tatA   FALSE 0.261 147.000 0.060 NA N NA
 7136741 7136742 Rpal_3190 Rpal_3191     TRUE 0.948 21.000 0.570 NA   NA
 7136742 7136743 Rpal_3191 Rpal_3192     TRUE 0.834 -3.000 0.103 NA   NA
 7136743 7136744 Rpal_3192 Rpal_3193     FALSE 0.486 49.000 0.038 NA   NA
 7136744 7136745 Rpal_3193 Rpal_3194   argS FALSE 0.244 85.000 0.013 NA   NA
 7136745 7136746 Rpal_3194 Rpal_3195 argS   FALSE 0.427 67.000 0.062 1.000 N NA
 7136747 7136748 Rpal_3196 Rpal_3197     FALSE 0.038 231.000 0.000 NA   NA
 7136748 7136749 Rpal_3197 Rpal_3198     TRUE 0.894 -3.000 0.227 NA   NA
 7136750 7136751 Rpal_3199 Rpal_3200     FALSE 0.123 122.000 0.000 NA   NA
 7136751 7136752 Rpal_3200 Rpal_3201     TRUE 0.765 163.000 0.667 NA   NA
 7136754 7136755 Rpal_3203 Rpal_3204     FALSE 0.470 -13.000 0.000 NA   NA
 7136755 7136756 Rpal_3204 Rpal_3205     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7136756 7136757 Rpal_3205 Rpal_3206     TRUE 0.823 76.000 0.121 1.000 Y NA
 7136757 7136758 Rpal_3206 Rpal_3207     TRUE 0.777 13.000 0.033 NA   NA
 7136758 7136759 Rpal_3207 Rpal_3208     FALSE 0.008 426.000 0.035 NA   NA
 7136759 7136760 Rpal_3208 Rpal_3209     TRUE 0.972 59.000 0.456 0.001 Y NA
 7136760 7136761 Rpal_3209 Rpal_3210     FALSE 0.395 153.000 0.104 1.000 N NA
 7136761 7136762 Rpal_3210 Rpal_3211     FALSE 0.245 89.000 0.017 NA   NA
 7136762 7136763 Rpal_3211 Rpal_3212     FALSE 0.306 139.000 0.056 NA   NA
 7136765 7136766 Rpal_3214 Rpal_3215     FALSE 0.298 85.000 0.035 NA   NA
 7136766 7136767 Rpal_3215 Rpal_3216   eno FALSE 0.210 111.000 0.018 1.000 N NA
 7136768 7136769 Rpal_3217 Rpal_3218     FALSE 0.123 123.000 0.000 NA   NA
 7136771 7136772 Rpal_3220 Rpal_3221 mdoD   TRUE 0.801 -12.000 0.169 NA N NA
 7136773 7136774 Rpal_3222 Rpal_3223     TRUE 0.679 0.000 0.018 NA N NA
 7136774 7136775 Rpal_3223 Rpal_3224     TRUE 0.665 -3.000 0.009 NA   NA
 7136775 7136776 Rpal_3224 Rpal_3225     FALSE 0.446 123.000 0.176 NA   NA
 7136777 7136778 Rpal_3226 Rpal_3227     FALSE 0.474 -10.000 0.000 NA   NA
 7136780 7136781 Rpal_3229 Rpal_3230     FALSE 0.123 112.000 0.000 NA   NA
 7136782 7136783 Rpal_3231 Rpal_3232 pyrG secG FALSE 0.339 167.000 0.083 1.000 N NA
 7136783 7136784 Rpal_3232 Rpal_3233 secG   FALSE 0.405 176.000 0.184 1.000 N NA
 7136785 7136786 Rpal_3234 Rpal_3235   trpD FALSE 0.480 37.000 0.012 1.000 N NA
 7136786 7136787 Rpal_3235 Rpal_3236 trpD trpC TRUE 0.848 131.000 0.293 1.000 Y NA
 7136787 7136788 Rpal_3236 Rpal_3237 trpC moaC TRUE 0.878 11.000 0.113 1.000 N NA
 7136788 7136789 Rpal_3237 Rpal_3238 moaC   FALSE 0.434 38.000 0.004 1.000 N NA
 7136790 7136791 Rpal_3239 Rpal_3240     FALSE 0.460 -46.000 0.000 NA   NA
 7136792 7136793 Rpal_3241 Rpal_3242     TRUE 0.587 169.000 0.333 NA   NA
 7136795 7136796 Rpal_3244 Rpal_3245     TRUE 0.687 31.000 0.067 NA   NA
 7136796 7136797 Rpal_3245 Rpal_3246     FALSE 0.132 148.000 0.000 NA   NA
 7136799 7136800 Rpal_3248 Rpal_3249     FALSE 0.454 177.000 0.232 1.000 N NA
 7136801 7136802 Rpal_3250 Rpal_3251     FALSE 0.211 92.000 0.008 NA   NA
 7136803 7136804 Rpal_3252 Rpal_3253 gltX gltA FALSE 0.416 151.000 0.127 1.000 N NA
 7136805 7136806 Rpal_3254 Rpal_3255   lpxB FALSE 0.120 140.000 0.000 1.000 N NA
 7136806 7136807 Rpal_3255 Rpal_3256 lpxB   TRUE 0.869 -3.000 0.173 NA   NA
 7136807 7136808 Rpal_3256 Rpal_3257     TRUE 0.957 16.000 0.552 NA   NA
 7136808 7136809 Rpal_3257 Rpal_3258   fabZ TRUE 0.933 9.000 0.264 1.000 N NA
 7136809 7136810 Rpal_3258 Rpal_3259 fabZ lpxD TRUE 0.913 0.000 0.212 1.000 N NA
 7136810 7136811 Rpal_3259 Rpal_3260 lpxD   TRUE 0.903 30.000 0.008 1.000 Y NA
 7136811 7136812 Rpal_3260 Rpal_3261     TRUE 0.621 173.000 0.004 1.000 Y NA
 7136812 7136813 Rpal_3261 Rpal_3262     TRUE 0.881 46.000 0.568 1.000 N NA
 7136813 7136814 Rpal_3262 Rpal_3263     TRUE 0.988 5.000 0.372 1.000 Y NA
 7136814 7136815 Rpal_3263 Rpal_3264     TRUE 0.989 6.000 0.400 1.000 Y NA
 7136815 7136816 Rpal_3264 Rpal_3265   frr FALSE 0.446 212.000 0.409 1.000 N NA
 7136816 7136817 Rpal_3265 Rpal_3266 frr   TRUE 0.831 66.000 0.626 1.000 N NA
 7136817 7136818 Rpal_3266 Rpal_3267   tsf TRUE 0.757 68.000 0.416 1.000 N NA
 7136818 7136819 Rpal_3267 Rpal_3268 tsf rpsB TRUE 0.928 125.000 0.748 1.000 Y NA
 7136819 7136820 Rpal_3268 Rpal_3269 rpsB   FALSE 0.050 235.000 0.000 1.000   NA
 7136820 7136821 Rpal_3269 Rpal_3270   dnaE FALSE 0.242 162.000 0.005 1.000   NA
 7136821 7136822 Rpal_3270 Rpal_3271 dnaE   FALSE 0.162 173.000 0.005 NA   NA
 7136823 7136824 Rpal_3272 Rpal_3273     TRUE 0.739 106.000 0.600 NA   NA
 7136825 7136826 Rpal_3274 Rpal_3275     TRUE 0.969 12.000 0.620 1.000 N NA
 7136826 7136827 Rpal_3275 Rpal_3276     FALSE 0.361 92.000 0.076 1.000 N NA
 7136827 7136828 Rpal_3276 Rpal_3277     FALSE 0.155 176.000 0.006 1.000 N NA
 7136828 7136829 Rpal_3277 Rpal_3278     TRUE 0.836 18.000 0.115 NA   NA
 7136829 7136830 Rpal_3278 Rpal_3279     TRUE 0.963 -3.000 0.667 NA   NA
 7136830 7136831 Rpal_3279 Rpal_3280     TRUE 0.676 129.000 0.444 NA   NA
 7136831 7136832 Rpal_3280 Rpal_3281     FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 7136832 7136833 Rpal_3281 Rpal_3282     TRUE 0.911 4.000 0.172 NA   NA
 7136833 7136834 Rpal_3282 Rpal_3283     TRUE 0.706 42.000 0.105 1.000   NA
 7136834 7136835 Rpal_3283 Rpal_3284     TRUE 0.948 0.000 0.307 1.000   NA
 7136835 7136836 Rpal_3284 Rpal_3285     TRUE 0.952 1.000 0.372 1.000 N NA
 7136836 7136837 Rpal_3285 Rpal_3286     TRUE 0.991 20.000 0.453 0.008 Y NA
 7136837 7136838 Rpal_3286 Rpal_3287     TRUE 0.991 1.000 0.251 0.008 Y NA
 7136838 7136839 Rpal_3287 Rpal_3288     TRUE 0.966 60.000 0.451 0.008 Y NA
 7136839 7136840 Rpal_3288 Rpal_3289     TRUE 0.993 -3.000 0.484 0.004 Y NA
 7136840 7136841 Rpal_3289 Rpal_3290     TRUE 0.994 10.000 0.442 0.008 Y NA
 7136841 7136842 Rpal_3290 Rpal_3291     TRUE 0.995 8.000 0.500 0.008 Y NA
 7136842 7136843 Rpal_3291 Rpal_3292     TRUE 0.995 10.000 0.515 0.008 Y NA
 7136843 7136844 Rpal_3292 Rpal_3293     TRUE 0.994 6.000 0.395 0.008 Y NA
 7136844 7136845 Rpal_3293 Rpal_3294     TRUE 0.694 19.000 0.024 NA   NA
 7136845 7136846 Rpal_3294 Rpal_3295     TRUE 0.702 -3.000 0.019 NA   NA
 7136846 7136847 Rpal_3295 Rpal_3296     TRUE 0.798 3.000 0.027 NA   NA
 7136847 7136848 Rpal_3296 Rpal_3297     TRUE 0.748 -3.000 0.039 NA   NA
 7136848 7136849 Rpal_3297 Rpal_3298     TRUE 0.975 52.000 0.483 0.008 Y NA
 7136849 7136850 Rpal_3298 Rpal_3299     TRUE 0.990 14.000 0.262 0.004 Y NA
 7136850 7136851 Rpal_3299 Rpal_3300     TRUE 0.993 12.000 0.396 0.004 Y NA
 7136854 7136855 Rpal_3302 Rpal_3303     FALSE 0.041 298.000 0.089 1.000 N NA
 7136855 7136856 Rpal_3303 Rpal_3304     FALSE 0.125 149.000 0.000 1.000 N NA
 7136856 7136857 Rpal_3304 Rpal_3305     TRUE 0.955 29.000 0.854 1.000 N NA
 7136857 7136858 Rpal_3305 Rpal_R0032     FALSE 0.138 93.000 0.000 NA   NA
 7136858 7136859 Rpal_R0032 Rpal_3306     FALSE 0.007 330.000 0.000 NA   NA
 7136860 7136861 Rpal_3307 Rpal_3308   clpX FALSE 0.262 321.000 0.201 0.085 Y NA
 7136861 7136862 Rpal_3308 Rpal_3309 clpX   FALSE 0.150 393.000 0.352 1.000 Y NA
 7136862 7136863 Rpal_3309 Rpal_3310   tig FALSE 0.284 313.000 0.351 1.000 Y NA
 7136863 7136864 Rpal_3310 Rpal_R0033 tig   FALSE 0.132 148.000 0.000 NA   NA
 7136864 7136865 Rpal_R0033 Rpal_3311     FALSE 0.132 159.000 0.000 NA   NA
 7136868 7136869 Rpal_3314 Rpal_3315     TRUE 0.804 90.000 0.145 1.000 Y NA
 7136869 7136870 Rpal_3315 Rpal_3316     FALSE 0.013 285.000 0.000 1.000 N NA
 7136870 7136871 Rpal_3316 Rpal_3317     TRUE 0.794 13.000 0.041 NA   NA
 7136872 7136873 Rpal_3318 Rpal_3319   bioD TRUE 0.984 -3.000 0.124 0.001 Y NA
 7136873 7136874 Rpal_3319 Rpal_3320 bioD   TRUE 0.969 -3.000 0.176 1.000 Y NA
 7136874 7136875 Rpal_3320 Rpal_3321     FALSE 0.127 141.000 0.000 NA   NA
 7136875 7136876 Rpal_3321 Rpal_3322     TRUE 0.567 89.000 0.250 NA   NA
 7136876 7136877 Rpal_3322 Rpal_3323     FALSE 0.366 200.000 0.250 1.000 N NA
 7136877 7136878 Rpal_3323 Rpal_3324     FALSE 0.182 109.000 0.000 1.000   NA
 7136879 7136880 Rpal_3325 Rpal_3326     FALSE 0.077 329.000 0.000 1.000 Y NA
 7136880 7136881 Rpal_3326 Rpal_3327     FALSE 0.125 164.000 0.000 NA   NA
 7136883 7136884 Rpal_3329 Rpal_3330     FALSE 0.002 834.000 0.000 NA   NA
 7136884 7136885 Rpal_3330 Rpal_3331     FALSE 0.010 305.000 0.000 NA   NA
 7136886 7136887 Rpal_3332 Rpal_3333     TRUE 0.611 12.000 0.000 NA   NA
 7136887 7136888 Rpal_3333 Rpal_3334     TRUE 0.642 5.000 0.000 NA   NA
 7136888 7136889 Rpal_3334 Rpal_3335     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136889 7136890 Rpal_3335 Rpal_3336     TRUE 0.554 16.000 0.000 NA   NA
 7136890 7136891 Rpal_3336 Rpal_3337     FALSE 0.487 -6.000 0.000 NA   NA
 7136891 7136892 Rpal_3337 Rpal_3338     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7136892 7136893 Rpal_3338 Rpal_3339     TRUE 0.642 5.000 0.000 NA   NA
 7136893 7136894 Rpal_3339 Rpal_3340     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136894 7136895 Rpal_3340 Rpal_3341     TRUE 0.632 9.000 0.000 NA   NA
 7136895 7136896 Rpal_3341 Rpal_3342     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136896 7136897 Rpal_3342 Rpal_3343     TRUE 0.638 2.000 0.000 NA   NA
 7136897 7136898 Rpal_3343 Rpal_3344     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7136898 7136899 Rpal_3344 Rpal_3345     TRUE 0.956 -3.000 0.571 NA   NA
 7136899 7136900 Rpal_3345 Rpal_3346     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136900 7136901 Rpal_3346 Rpal_3347     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7136901 7136902 Rpal_3347 Rpal_3348     FALSE 0.462 93.000 0.156 NA   NA
 7136902 7136903 Rpal_3348 Rpal_3349     TRUE 0.973 13.000 0.714 NA   NA
 7136903 7136904 Rpal_3349 Rpal_3350     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7136904 7136905 Rpal_3350 Rpal_3351     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136905 7136906 Rpal_3351 Rpal_3352     TRUE 0.770 -3.000 0.050 NA   NA
 7136906 7136907 Rpal_3352 Rpal_3353     TRUE 0.823 0.000 0.050 NA   NA
 7136907 7136908 Rpal_3353 Rpal_3354     TRUE 0.642 5.000 0.000 NA   NA
 7136908 7136909 Rpal_3354 Rpal_R0034     FALSE 0.122 115.000 0.000 NA   NA
 7136909 7136910 Rpal_R0034 Rpal_3355     FALSE 0.477 -9.000 0.000 NA   NA
 7136910 7136911 Rpal_3355 Rpal_3356     TRUE 0.934 12.000 0.286 NA   NA
 7136911 7136912 Rpal_3356 Rpal_3357     TRUE 0.722 53.000 0.241 NA   NA
 7136912 7136913 Rpal_3357 Rpal_3358     TRUE 0.572 156.000 0.276 NA   NA
 7136913 7136914 Rpal_3358 Rpal_3359     FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7136914 7136915 Rpal_3359 Rpal_3360     TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7136916 7136917 Rpal_3361 Rpal_3362     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136917 7136918 Rpal_3362 Rpal_3363     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136918 7136919 Rpal_3363 Rpal_3364     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136919 7136920 Rpal_3364 Rpal_3365     FALSE 0.505 20.000 0.000 NA   NA
 7136920 7136921 Rpal_3365 Rpal_3366     FALSE 0.381 33.000 0.000 NA   NA
 7136921 7136922 Rpal_3366 Rpal_3367     FALSE 0.415 29.000 0.000 NA   NA
 7136922 7136923 Rpal_3367 Rpal_3368     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136923 7136924 Rpal_3368 Rpal_3369     TRUE 0.919 -3.000 0.308 NA   NA
 7136924 7136925 Rpal_3369 Rpal_3370     FALSE 0.474 -10.000 0.000 NA   NA
 7136925 7136926 Rpal_3370 Rpal_3371     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136926 7136927 Rpal_3371 Rpal_3372     TRUE 0.638 2.000 0.000 NA   NA
 7136927 7136928 Rpal_3372 Rpal_3373     TRUE 0.646 -3.000 0.000 1.000   NA
 7136928 7136929 Rpal_3373 Rpal_3374     TRUE 0.646 -3.000 0.000 1.000   NA
 7136929 7136930 Rpal_3374 Rpal_3375     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136930 7136931 Rpal_3375 Rpal_3376     TRUE 0.638 2.000 0.000 NA   NA
 7136931 7136932 Rpal_3376 Rpal_3377     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7136932 7136933 Rpal_3377 Rpal_3378     FALSE 0.470 -13.000 0.000 NA   NA
 7136933 7136934 Rpal_3378 Rpal_3379     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136934 7136935 Rpal_3379 Rpal_3380     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136935 7136936 Rpal_3380 Rpal_3381     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136936 7136937 Rpal_3381 Rpal_3382     FALSE 0.126 107.000 0.000 NA   NA
 7136937 7136938 Rpal_3382 Rpal_3383     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136938 7136939 Rpal_3383 Rpal_3384     FALSE 0.459 -52.000 0.000 NA   NA
 7136939 7136940 Rpal_3384 Rpal_3385     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7136940 7136941 Rpal_3385 Rpal_3386     TRUE 0.877 -3.000 0.194 NA   NA
 7136941 7136942 Rpal_3386 Rpal_3387     TRUE 0.934 5.000 0.250 NA   NA
 7136942 7136943 Rpal_3387 Rpal_3388     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136943 7136944 Rpal_3388 Rpal_3389     FALSE 0.480 23.000 0.000 NA   NA
 7136944 7136945 Rpal_3389 Rpal_3390     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136945 7136946 Rpal_3390 Rpal_3391     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136946 7136947 Rpal_3391 Rpal_3392     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7136947 7136948 Rpal_3392 Rpal_3393     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7136948 7136949 Rpal_3393 Rpal_3394     TRUE 0.918 -7.000 0.381 NA   NA
 7136951 7136952 Rpal_3396 Rpal_3397     FALSE 0.376 126.000 0.000 0.070   NA
 7136952 7136953 Rpal_3397 Rpal_3398     FALSE 0.289 62.000 0.000 1.000   NA
 7136954 7136955 Rpal_3399 Rpal_3400     FALSE 0.129 134.000 0.000 NA   NA
 7136955 7136956 Rpal_3400 Rpal_3401     FALSE 0.008 325.000 0.000 NA   NA
 7136956 7136957 Rpal_3401 Rpal_3402     FALSE 0.128 142.000 0.000 NA   NA
 7136957 7136958 Rpal_3402 Rpal_3403     FALSE 0.129 133.000 0.000 NA   NA
 7136959 7136960 Rpal_3404 Rpal_3405     TRUE 0.961 22.000 0.750 NA   NA
 7136960 7136961 Rpal_3405 Rpal_3406     FALSE 0.089 186.000 0.000 NA   NA
 7136961 7136962 Rpal_3406 Rpal_3407     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7136963 7136964 Rpal_3408 Rpal_3409     TRUE 0.959 24.000 0.169 1.000 Y NA
 7136964 7136965 Rpal_3409 Rpal_3410     TRUE 0.993 6.000 0.695 1.000 Y NA
 7136965 7136966 Rpal_3410 Rpal_3411     TRUE 0.764 46.000 0.106 0.089 N NA
 7136966 7136967 Rpal_3411 Rpal_3412     TRUE 0.997 13.000 0.877 0.001 Y NA
 7136967 7136968 Rpal_3412 Rpal_3413     TRUE 0.986 19.000 0.201 0.001 Y NA
 7136968 7136969 Rpal_3413 Rpal_3414     TRUE 0.897 40.000 0.172 0.001   NA
 7136970 7136971 Rpal_3415 Rpal_3416     FALSE 0.342 38.000 0.000 NA   NA
 7136973 7136974 Rpal_3418 Rpal_3419     TRUE 0.906 13.000 0.000 0.003   NA
 7136975 7136976 Rpal_3420 Rpal_3421     FALSE 0.134 151.000 0.000 NA   NA
 7136976 7136977 Rpal_3421 Rpal_3422     TRUE 0.906 13.000 0.000 0.003   NA
 7136978 7136979 Rpal_3423 Rpal_3424     FALSE 0.466 224.000 0.000 0.070 Y NA
 7136979 7136980 Rpal_3424 Rpal_3425     TRUE 0.997 4.000 0.800 0.001 Y NA
 7136980 7136981 Rpal_3425 Rpal_3426     TRUE 0.996 1.000 0.833 0.070 Y NA
 7136981 7136982 Rpal_3426 Rpal_3427     TRUE 0.995 -3.000 0.833 0.017 Y NA
 7136983 7136984 Rpal_3428 Rpal_3429     TRUE 0.624 130.000 0.361 1.000 N NA
 7136985 7136986 Rpal_3430 Rpal_3431     FALSE 0.128 131.000 0.000 NA   NA
 7136986 7136987 Rpal_3431 Rpal_3432     FALSE 0.129 135.000 0.000 NA   NA
 7136989 7136990 Rpal_3434 Rpal_3435     TRUE 0.902 46.000 0.667 NA   NA
 7136991 7136992 Rpal_3436 Rpal_3437     FALSE 0.032 261.000 0.000 1.000   NA
 7136993 7136994 Rpal_3438 Rpal_3439     FALSE 0.237 176.000 0.042 NA   NA
 7136995 7136996 Rpal_3440 Rpal_3441     FALSE 0.057 255.000 0.043 NA   NA
 7136996 7136997 Rpal_3441 Rpal_3442     FALSE 0.472 148.000 0.227 NA N NA
 7136999 7137000 Rpal_3444 Rpal_3445     FALSE 0.129 133.000 0.000 NA   NA
 7137003 7137004 Rpal_3448 Rpal_3449     TRUE 0.734 154.000 0.545 NA   NA
 7137004 7137005 Rpal_3449 Rpal_3450     TRUE 0.943 38.000 0.909 1.000 N NA
 7137006 7137007 Rpal_3451 Rpal_3452     FALSE 0.343 106.000 0.075 NA   NA
 7137007 7137008 Rpal_3452 Rpal_3453   aspS FALSE 0.398 46.000 0.009 1.000 N NA
 7137009 7137010 Rpal_3454 Rpal_3455     FALSE 0.206 104.000 0.011 NA   NA
 7137010 7137011 Rpal_3455 Rpal_3456     TRUE 0.656 -3.000 0.006 NA   NA
 7137012 7137013 Rpal_3457 Rpal_3458     TRUE 0.974 13.000 0.149 1.000 Y NA
 7137013 7137014 Rpal_3458 Rpal_3459     FALSE 0.477 151.000 0.134 1.000   NA
 7137014 7137015 Rpal_3459 Rpal_3460     TRUE 0.607 43.000 0.045 1.000   NA
 7137016 7137017 Rpal_3461 Rpal_3462     TRUE 0.992 9.000 0.230 0.001 Y NA
 7137020 7137021 Rpal_3465 Rpal_3466     FALSE 0.258 73.000 0.009 1.000 N NA
 7137023 7137024 Rpal_3468 Rpal_3469     FALSE 0.241 131.000 0.025 NA   NA
 7137024 7137025 Rpal_3469 Rpal_3470     TRUE 0.921 11.000 0.230 1.000 N NA
 7137026 7137027 Rpal_3471 Rpal_3472     TRUE 0.985 11.000 0.631 0.043   NA
 7137027 7137028 Rpal_3472 Rpal_3473     TRUE 0.912 0.000 0.153 1.000   NA
 7137028 7137029 Rpal_3473 Rpal_3474     FALSE 0.511 79.000 0.116 1.000   NA
 7137029 7137030 Rpal_3474 Rpal_3475   pdxA FALSE 0.505 61.000 0.056 1.000   NA
 7137030 7137031 Rpal_3475 Rpal_3476 pdxA ksgA TRUE 0.875 -3.000 0.197 1.000 N NA
 7137031 7137032 Rpal_3476 Rpal_3477 ksgA   TRUE 0.733 17.000 0.009 1.000   NA
 7137032 7137033 Rpal_3477 Rpal_3478     TRUE 0.602 159.000 0.312 NA   NA
 7137034 7137035 Rpal_3479 Rpal_3480 gmk   TRUE 0.948 3.000 0.276 1.000   NA
 7137035 7137036 Rpal_3480 Rpal_3481     FALSE 0.317 103.000 0.060 NA   NA
 7137036 7137037 Rpal_3481 Rpal_3482     FALSE 0.260 203.000 0.134 NA   NA
 7137037 7137038 Rpal_3482 Rpal_3483   acpP TRUE 0.775 97.000 0.106 1.000 Y NA
 7137038 7137039 Rpal_3483 Rpal_3484 acpP   FALSE 0.458 305.000 0.321 0.003 Y NA
 7137039 7137040 Rpal_3484 Rpal_3485     TRUE 0.991 20.000 0.432 0.003 Y NA
 7137041 7137042 Rpal_3486 Rpal_3487   rpsF FALSE 0.106 172.000 0.000 1.000 N NA
 7137042 7137043 Rpal_3487 Rpal_3488 rpsF rpsR TRUE 0.993 6.000 0.319 0.009 Y NA
 7137043 7137044 Rpal_3488 Rpal_3489 rpsR   FALSE 0.255 128.000 0.033 NA   NA
 7137044 7137045 Rpal_3489 Rpal_3490   rplI TRUE 0.595 36.000 0.043 NA   NA
 7137049 7137050 Rpal_3494 Rpal_3495     FALSE 0.487 68.000 0.096 1.000 N NA
 7137051 7137052 Rpal_3496 Rpal_3497     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7137052 7137053 Rpal_3497 Rpal_3498     FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 7137054 7137055 Rpal_3499 Rpal_3500     FALSE 0.227 214.000 0.094 1.000   NA
 7137055 7137056 Rpal_3500 Rpal_3501     TRUE 0.821 24.000 0.101 1.000   NA
 7137056 7137057 Rpal_3501 Rpal_3502     FALSE 0.429 130.000 0.100 1.000   NA
 7137057 7137058 Rpal_3502 Rpal_3503     FALSE 0.234 84.000 0.009 NA   NA
 7137059 7137060 Rpal_3504 Rpal_3505   engA TRUE 0.869 -3.000 0.004 0.043   NA
 7137060 7137061 Rpal_3505 Rpal_3506 engA   FALSE 0.281 74.000 0.014 NA   NA
 7137061 7137062 Rpal_3506 Rpal_3507     TRUE 0.664 46.000 0.132 NA   NA
 7137062 7137063 Rpal_3507 Rpal_3508   panB FALSE 0.240 163.000 0.026 NA   NA
 7137063 7137064 Rpal_3508 Rpal_3509 panB   TRUE 0.776 3.000 0.017 NA   NA
 7137066 7137067 Rpal_3511 Rpal_3512     FALSE 0.128 143.000 0.000 NA   NA
 7137067 7137068 Rpal_3512 Rpal_3513     FALSE 0.002 675.000 0.000 NA   NA
 7137068 7137069 Rpal_3513 Rpal_3514     FALSE 0.002 524.000 0.000 NA   NA
 7137069 7137070 Rpal_3514 Rpal_3515     FALSE 0.257 96.000 0.005 1.000   NA
 7137070 7137071 Rpal_3515 Rpal_3516     FALSE 0.342 142.000 0.048 1.000   NA
 7137071 7137072 Rpal_3516 Rpal_3517   gatA FALSE 0.224 77.000 0.004 1.000 N NA
 7137073 7137074 Rpal_3518 Rpal_3519     FALSE 0.470 -13.000 0.000 NA   NA
 7137075 7137076 Rpal_3520 Rpal_3521   gatC TRUE 0.742 12.000 0.013 NA   NA
 7137076 7137077 Rpal_3521 Rpal_3522 gatC   FALSE 0.291 87.000 0.010 1.000   NA
 7137078 7137079 Rpal_3523 Rpal_3524     TRUE 0.594 22.000 0.004 NA   NA
 7137080 7137081 Rpal_3525 Rpal_3526     FALSE 0.147 82.000 0.000 1.000 N NA
 7137082 7137083 Rpal_3527 Rpal_3528 pyrB   TRUE 0.983 20.000 0.452 1.000 Y NA
 7137083 7137084 Rpal_3528 Rpal_3529     FALSE 0.441 144.000 0.108 1.000   NA
 7137084 7137085 Rpal_3529 Rpal_3530     FALSE 0.147 179.000 0.000 1.000   NA
 7137085 7137086 Rpal_3530 Rpal_3531     FALSE 0.253 72.000 0.000 1.000   NA
 7137086 7137087 Rpal_3531 Rpal_3532     FALSE 0.068 91.000 0.000 NA N NA
 7137087 7137088 Rpal_3532 Rpal_3533     TRUE 0.642 5.000 0.000 NA   NA
 7137090 7137091 Rpal_3535 Rpal_3536     TRUE 0.826 3.000 0.045 1.000 N NA
 7137091 7137092 Rpal_3536 Rpal_3537     TRUE 0.823 0.000 0.050 NA   NA
 7137092 7137093 Rpal_3537 Rpal_3538     TRUE 0.750 70.000 0.406 NA   NA
 7137096 7137097 Rpal_3541 Rpal_3542 pleD   TRUE 0.994 11.000 0.461 0.017 Y NA
 7137098 7137099 Rpal_3543 Rpal_3544     TRUE 0.894 -3.000 0.228 NA   NA
 7137101 7137102 Rpal_3546 Rpal_3547     TRUE 0.955 20.000 0.696 NA N NA
 7137102 7137103 Rpal_3547 Rpal_3548     TRUE 0.584 93.000 0.280 NA   NA
 7137103 7137104 Rpal_3548 Rpal_3549     TRUE 0.640 50.000 0.131 NA   NA
 7137105 7137106 Rpal_3550 Rpal_3551     TRUE 0.616 49.000 0.100 NA   NA
 7137106 7137107 Rpal_3551 Rpal_3552     TRUE 0.910 -3.000 0.275 NA   NA
 7137111 7137112 Rpal_3556 Rpal_3557   clpS TRUE 0.613 194.000 0.596 NA   NA
 7137113 7137114 Rpal_3558 Rpal_3559     FALSE 0.002 356.000 0.000 NA N NA
 7137115 7137116 Rpal_3560 Rpal_3561     TRUE 0.739 56.000 0.286 NA   NA
 7137116 7137117 Rpal_3561 Rpal_3562     FALSE 0.159 79.000 0.000 NA   NA
 7137117 7137118 Rpal_3562 Rpal_3563     FALSE 0.016 275.000 0.000 NA   NA
 7137120 7137121 Rpal_3565 Rpal_3566     TRUE 0.713 39.000 0.140 NA   NA
 7137121 7137122 Rpal_3566 Rpal_3567     TRUE 0.669 180.000 0.571 NA   NA
 7137122 7137123 Rpal_3567 Rpal_3568     FALSE 0.056 213.000 0.000 NA   NA
 7137125 7137126 Rpal_3570 Rpal_3571     FALSE 0.401 75.000 0.064 NA   NA
 7137126 7137127 Rpal_3571 Rpal_3572     TRUE 0.817 55.000 0.375 1.000   NA
 7137127 7137128 Rpal_3572 Rpal_3573     TRUE 0.580 45.000 0.069 1.000 N NA
 7137129 7137130 Rpal_3574 Rpal_3575     TRUE 0.960 138.000 0.692 0.004 Y NA
 7137130 7137131 Rpal_3575 Rpal_3576     FALSE 0.148 86.000 0.000 NA   NA
 7137131 7137132 Rpal_3576 Rpal_3577     TRUE 0.964 0.000 0.500 NA   NA
 7137133 7137134 Rpal_R0035 Rpal_3578     FALSE 0.159 79.000 0.000 NA   NA
 7137135 7137136 Rpal_3579 Rpal_3580 lipB   FALSE 0.017 271.000 0.000 1.000 N NA
 7137139 7137140 Rpal_3583 Rpal_3584     TRUE 0.802 0.000 0.041 1.000 N NA
 7137140 7137141 Rpal_3584 Rpal_3585     TRUE 0.913 7.000 0.050 0.069 N NA
 7137143 7137144 Rpal_3587 Rpal_3588     FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 7137145 7137146 Rpal_3589 Rpal_3590     FALSE 0.227 79.000 0.000 1.000   NA
 7137151 7137152 Rpal_3594 Rpal_3595     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7137152 7137153 Rpal_3595 Rpal_3596     FALSE 0.001 2264.000 0.000 NA   NA
 7137153 7137154 Rpal_3596 Rpal_3597     FALSE 0.056 213.000 0.000 NA   NA
 7137155 7137156 Rpal_3598 Rpal_3599     FALSE 0.124 165.000 0.000 NA   NA
 7137157 7137158 Rpal_3600 Rpal_3601     FALSE 0.423 187.000 0.250 1.000 N NA
 7137158 7137159 Rpal_3601 Rpal_3602     TRUE 0.559 154.000 0.222 1.000   NA
 7137159 7137160 Rpal_3602 Rpal_3603     TRUE 0.914 5.000 0.135 1.000   NA
 7137160 7137161 Rpal_3603 Rpal_3604     FALSE 0.516 103.000 0.077 0.069 N NA
 7137161 7137162 Rpal_3604 Rpal_3605     TRUE 0.901 146.000 0.273 0.037 Y NA
 7137162 7137163 Rpal_3605 Rpal_3606     FALSE 0.480 187.000 0.308 NA   NA
 7137163 7137164 Rpal_3606 Rpal_3607     TRUE 0.966 0.000 0.538 NA   NA
 7137164 7137165 Rpal_3607 Rpal_3608     FALSE 0.012 289.000 0.000 1.000 N NA
 7137166 7137167 Rpal_3609 Rpal_3610     FALSE 0.027 245.000 0.000 NA   NA
 7137168 7137169 Rpal_3611 Rpal_3612     TRUE 0.650 106.000 0.400 NA   NA
 7137169 7137170 Rpal_3612 Rpal_3613     FALSE 0.143 89.000 0.000 NA   NA
 7137170 7137171 Rpal_3613 Rpal_3614     TRUE 0.666 68.000 0.275 1.000 N NA
 7137172 7137173 Rpal_3615 Rpal_3616     TRUE 0.953 13.000 0.421 NA   NA
 7137174 7137175 Rpal_3617 Rpal_3618     FALSE 0.033 199.000 0.000 NA N NA
 7137177 7137178 Rpal_3620 Rpal_3621     TRUE 0.769 -3.000 0.025 1.000   NA
 7137178 7137179 Rpal_3621 Rpal_3622     FALSE 0.310 70.000 0.018 NA   NA
 7137179 7137180 Rpal_3622 Rpal_3623     TRUE 0.760 15.000 0.036 NA   NA
 7137180 7137181 Rpal_3623 Rpal_3624     FALSE 0.305 68.000 0.014 NA   NA
 7137181 7137182 Rpal_3624 Rpal_3625     FALSE 0.037 232.000 0.000 NA   NA
 7137182 7137183 Rpal_3625 Rpal_3626     FALSE 0.003 490.000 0.000 NA   NA
 7137184 7137185 Rpal_3627 Rpal_3628     FALSE 0.427 28.000 0.000 NA   NA
 7137185 7137186 Rpal_3628 Rpal_3629     TRUE 0.628 10.000 0.000 NA   NA
 7137186 7137187 Rpal_3629 Rpal_3630     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7137187 7137188 Rpal_3630 Rpal_3631     FALSE 0.128 138.000 0.000 NA   NA
 7137188 7137189 Rpal_3631 Rpal_3632     FALSE 0.060 205.000 0.000 1.000 N NA
 7137190 7137191 Rpal_3633 Rpal_3634     FALSE 0.127 106.000 0.000 NA   NA
 7137191 7137192 Rpal_3634 Rpal_3635     FALSE 0.186 70.000 0.000 NA   NA
 7137192 7137193 Rpal_3635 Rpal_3636     FALSE 0.010 301.000 0.000 1.000 N NA
 7137193 7137194 Rpal_3636 Rpal_3637     FALSE 0.110 226.000 0.051 1.000 N NA
 7137194 7137195 Rpal_3637 Rpal_3638     FALSE 0.286 83.000 0.056 NA N NA
 7137197 7137198 Rpal_3640 Rpal_3641   rplQ FALSE 0.013 285.000 0.000 1.000 N NA
 7137198 7137199 Rpal_3641 Rpal_3642 rplQ   TRUE 0.826 156.000 0.873 1.000 N NA
 7137199 7137200 Rpal_3642 Rpal_3643     TRUE 0.587 134.000 0.308 1.000 N NA
 7137200 7137201 Rpal_3643 Rpal_3644   rpsM TRUE 0.964 131.000 0.810 0.009 Y NA
 7137201 7137202 Rpal_3644 Rpal_3645 rpsM   TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7137202 7137203 Rpal_3645 Rpal_3646     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 7137203 7137204 Rpal_3646 Rpal_3647   secY TRUE 0.652 -3.000 0.008 1.000 N NA
 7137204 7137205 Rpal_3647 Rpal_3648 secY rplO TRUE 0.792 153.000 0.730 1.000 N NA
 7137205 7137206 Rpal_3648 Rpal_3649 rplO rpmD TRUE 0.996 13.000 0.653 0.001 Y NA
 7137206 7137207 Rpal_3649 Rpal_3650 rpmD rpsE TRUE 0.980 59.000 0.789 0.012 Y NA
 7137207 7137208 Rpal_3650 Rpal_3651 rpsE rplR TRUE 0.980 61.000 0.814 0.012 Y NA
 7137208 7137209 Rpal_3651 Rpal_3652 rplR rplF TRUE 0.997 12.000 0.815 0.009 Y NA
 7137209 7137210 Rpal_3652 Rpal_3653 rplF rpsH TRUE 0.962 113.000 0.808 0.009 Y NA
 7137210 7137211 Rpal_3653 Rpal_3654 rpsH rpsN TRUE 0.989 16.000 0.295 0.009 Y NA
 7137211 7137212 Rpal_3654 Rpal_3655 rpsN rplE TRUE 0.970 44.000 0.309 0.009 Y NA
 7137212 7137213 Rpal_3655 Rpal_3656 rplE rplX TRUE 0.994 -7.000 0.758 0.009 Y NA
 7137213 7137214 Rpal_3656 Rpal_3657 rplX rplN TRUE 0.997 0.000 0.810 0.012 Y NA
 7137214 7137215 Rpal_3657 Rpal_3658 rplN rpsQ TRUE 0.977 64.000 0.791 0.012 Y NA
 7137215 7137216 Rpal_3658 Rpal_3659 rpsQ   TRUE 0.996 13.000 0.828 0.009 Y NA
 7137216 7137217 Rpal_3659 Rpal_3660   rplP TRUE 0.997 6.000 0.802 0.009 Y NA
 7137217 7137218 Rpal_3660 Rpal_3661 rplP rpsC TRUE 0.991 33.000 0.828 0.012 Y NA
 7137218 7137219 Rpal_3661 Rpal_3662 rpsC rplV TRUE 0.975 23.000 0.109 0.012 Y NA
 7137219 7137220 Rpal_3662 Rpal_3663 rplV rpsS TRUE 0.986 11.000 0.119 0.012 Y NA
 7137220 7137221 Rpal_3663 Rpal_3664 rpsS rplB TRUE 0.996 12.000 0.820 0.012 Y NA
 7137221 7137222 Rpal_3664 Rpal_3665 rplB rplW TRUE 0.996 14.000 0.849 0.009 Y NA
 7137222 7137223 Rpal_3665 Rpal_3666 rplW rplD TRUE 0.993 -3.000 0.513 0.009 Y NA
 7137223 7137224 Rpal_3666 Rpal_3667 rplD rplC TRUE 0.995 2.000 0.486 0.009 Y NA
 7137224 7137225 Rpal_3667 Rpal_3668 rplC rpsJ TRUE 0.963 51.000 0.307 0.012 Y NA
 7137225 7137226 Rpal_3668 Rpal_3669 rpsJ   TRUE 0.874 88.000 0.318 1.000 Y NA
 7137226 7137227 Rpal_3669 Rpal_3670     TRUE 0.961 39.000 0.102 0.001 Y NA
 7137227 7137228 Rpal_3670 Rpal_3671     TRUE 0.937 31.000 0.114 1.000 Y NA
 7137228 7137229 Rpal_3671 Rpal_3672   rpsL TRUE 0.995 16.000 0.620 0.002 Y NA
 7137232 7137233 Rpal_3675 Rpal_3676     FALSE 0.002 613.000 0.000 NA   NA
 7137238 7137239 Rpal_3681 Rpal_3682     FALSE 0.052 216.000 0.000 NA   NA
 7137241 7137242 Rpal_3684 Rpal_3685     TRUE 0.658 120.000 0.438 1.000 N NA
 7137242 7137243 Rpal_3685 Rpal_3686     FALSE 0.010 303.000 0.000 1.000 N NA
 7137243 7137244 Rpal_3686 Rpal_3687   rpoB TRUE 0.920 143.000 0.851 0.000   NA
 7137244 7137245 Rpal_3687 Rpal_3688 rpoB rplL FALSE 0.023 466.000 0.223 1.000   NA
 7137245 7137246 Rpal_3688 Rpal_3689 rplL rplJ TRUE 0.984 56.000 0.884 0.009 Y NA
 7137246 7137247 Rpal_3689 Rpal_3690 rplJ   FALSE 0.001 903.000 0.000 1.000 N NA
 7137247 7137248 Rpal_3690 Rpal_3691   rplA FALSE 0.191 100.000 0.007 1.000 N NA
 7137248 7137249 Rpal_3691 Rpal_3692 rplA rplK TRUE 0.997 8.000 0.838 0.012 Y NA
 7137249 7137250 Rpal_3692 Rpal_3693 rplK nusG FALSE 0.519 223.000 0.681 1.000 N NA
 7137250 7137251 Rpal_3693 Rpal_3694 nusG secE TRUE 0.972 17.000 0.843 1.000 N NA
 7137251 7137252 Rpal_3694 Rpal_3695 secE   FALSE 0.007 329.000 0.000 1.000 N NA
 7137252 7137253 Rpal_3695 Rpal_3696     TRUE 0.783 -3.000 0.000 0.087 N NA
 7137253 7137254 Rpal_3696 Rpal_3697     TRUE 0.964 15.000 0.000 0.048 Y NA
 7137254 7137255 Rpal_3697 Rpal_3698     FALSE 0.344 -3.000 0.000 NA N NA
 7137255 7137256 Rpal_3698 Rpal_3699     TRUE 0.595 102.000 0.000 NA Y NA
 7137256 7137257 Rpal_3699 Rpal_3700     TRUE 0.665 76.000 0.000 NA Y NA
 7137257 7137258 Rpal_3700 Rpal_3701     FALSE 0.062 143.000 0.000 NA N NA
 7137258 7137259 Rpal_3701 Rpal_R0037     FALSE 0.005 351.000 0.000 NA   NA
 7137259 7137260 Rpal_R0037 Rpal_3702     FALSE 0.153 83.000 0.000 NA   NA
 7137260 7137261 Rpal_3702 Rpal_3703     TRUE 0.636 17.000 0.002 NA   NA
 7137263 7137264 Rpal_3705 Rpal_3706     FALSE 0.425 184.000 0.233 1.000 N NA
 7137265 7137266 Rpal_3707 Rpal_3708     FALSE 0.027 242.000 0.000 1.000 N NA
 7137267 7137268 Rpal_3709 Rpal_3710     TRUE 0.581 152.000 0.286 NA   NA
 7137270 7137271 Rpal_3712 Rpal_3713     FALSE 0.060 210.000 0.000 NA   NA
 7137271 7137272 Rpal_3713 Rpal_3714     FALSE 0.008 326.000 0.000 NA   NA
 7137272 7137273 Rpal_3714 Rpal_3715     TRUE 0.993 -3.000 0.628 0.024 Y NA
 7137273 7137274 Rpal_3715 Rpal_3716     TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7137274 7137275 Rpal_3716 Rpal_3717     TRUE 0.974 5.000 0.000 0.040 Y NA
 7137275 7137276 Rpal_3717 Rpal_3718     FALSE 0.519 247.000 0.377 NA Y NA
 7137276 7137277 Rpal_3718 Rpal_3719     FALSE 0.003 446.000 0.000 NA   NA
 7137277 7137278 Rpal_3719 Rpal_3720     FALSE 0.125 164.000 0.000 NA   NA
 7137278 7137279 Rpal_3720 Rpal_3721     TRUE 0.932 -82.000 0.500 1.000 N NA
 7137280 7137281 Rpal_3722 Rpal_3723     TRUE 0.985 12.000 0.375 NA Y NA
 7137281 7137282 Rpal_3723 Rpal_3724     TRUE 0.987 -3.000 0.625 NA Y NA
 7137282 7137283 Rpal_3724 Rpal_3725     TRUE 0.968 24.000 0.250 1.000 Y NA
 7137283 7137284 Rpal_3725 Rpal_3726     TRUE 0.938 15.000 0.000 1.000 Y NA
 7137284 7137285 Rpal_3726 Rpal_3727     FALSE 0.019 262.000 0.000 1.000 N NA
 7137286 7137287 Rpal_3728 Rpal_3729     FALSE 0.133 150.000 0.000 NA   NA
 7137287 7137288 Rpal_3729 Rpal_R0038     FALSE 0.125 125.000 0.000 NA   NA
 7137289 7137290 Rpal_3730 Rpal_3731     TRUE 0.891 15.000 0.200 NA   NA
 7137290 7137291 Rpal_3731 Rpal_3732     FALSE 0.129 144.000 0.000 NA   NA
 7137291 7137292 Rpal_3732 Rpal_3733     FALSE 0.049 216.000 0.000 1.000 N NA
 7137292 7137293 Rpal_3733 Rpal_3734     TRUE 0.575 160.000 0.333 NA N NA
 7137294 7137295 Rpal_3735 Rpal_3736     FALSE 0.182 71.000 0.000 NA   NA
 7137299 7137300 Rpal_3740 Rpal_3741     TRUE 0.611 12.000 0.000 NA   NA
 7137301 7137302 Rpal_3742 Rpal_3743     FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7137303 7137304 Rpal_3744 Rpal_3745     FALSE 0.383 47.000 0.007 1.000 N NA
 7137304 7137305 Rpal_3745 Rpal_3746     FALSE 0.032 236.000 0.000 NA   NA
 7137305 7137306 Rpal_3746 Rpal_3747     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 7137308 7137309 Rpal_3749 Rpal_3750     FALSE 0.004 379.000 0.000 NA   NA
 7137310 7137311 Rpal_3751 Rpal_3752     FALSE 0.467 -15.000 0.000 NA   NA
 7137311 7137312 Rpal_3752 Rpal_3753     FALSE 0.381 33.000 0.000 NA   NA
 7137312 7137313 Rpal_3753 Rpal_3754     TRUE 0.853 57.000 0.596 NA   NA
 7137314 7137315 Rpal_3755 Rpal_3756     FALSE 0.129 135.000 0.000 NA   NA
 7137315 7137316 Rpal_3756 Rpal_3757     FALSE 0.108 175.000 0.000 NA   NA
 7137316 7137317 Rpal_3757 Rpal_3758     FALSE 0.063 206.000 0.000 NA   NA
 7137317 7137318 Rpal_3758 Rpal_3759     FALSE 0.538 16.000 0.000 1.000 N NA
 7137318 7137319 Rpal_3759 Rpal_3760     TRUE 0.628 142.000 0.000 1.000 Y NA
 7137319 7137320 Rpal_3760 Rpal_3761     TRUE 0.983 -3.000 0.167 0.013 Y NA
 7137320 7137321 Rpal_3761 Rpal_3762     TRUE 0.981 23.000 0.167 0.002 Y NA
 7137322 7137323 Rpal_3763 Rpal_3764     FALSE 0.202 91.000 0.000 1.000   NA
 7137323 7137324 Rpal_3764 Rpal_3765     FALSE 0.285 63.000 0.000 1.000   NA
 7137324 7137325 Rpal_3765 Rpal_3766     FALSE 0.121 137.000 0.000 1.000 N NA
 7137327 7137328 Rpal_3768 Rpal_3769     TRUE 0.784 23.000 0.087 NA   NA
 7137329 7137330 Rpal_3770 Rpal_3771     FALSE 0.185 142.000 0.000 1.000   NA
 7137331 7137332 Rpal_3772 Rpal_3773     TRUE 0.698 76.000 0.000 1.000 Y NA
 7137332 7137333 Rpal_3773 Rpal_3774     TRUE 0.883 31.000 0.000 1.000 Y NA
 7137335 7137336 Rpal_3776 Rpal_3777     TRUE 0.865 59.000 0.667 NA   NA
 7137336 7137337 Rpal_3777 Rpal_3778     TRUE 0.833 57.000 0.500 NA   NA
 7137337 7137338 Rpal_3778 Rpal_3779     FALSE 0.002 905.000 0.000 NA   NA
 7137338 7137339 Rpal_3779 Rpal_3780     FALSE 0.002 781.000 0.000 NA   NA
 7137340 7137341 Rpal_3781 Rpal_3782     TRUE 0.822 -3.000 0.087 NA   NA
 7137342 7137343 Rpal_3783 Rpal_3784     FALSE 0.040 229.000 0.000 NA   NA
 7137346 7137347 Rpal_3787 Rpal_3788     TRUE 0.622 11.000 0.000 NA   NA
 7137347 7137348 Rpal_3788 Rpal_3789     FALSE 0.182 71.000 0.000 NA   NA
 7137349 7137350 Rpal_3790 Rpal_3791     FALSE 0.153 83.000 0.000 NA   NA
 7137351 7137352 Rpal_3792 Rpal_3793     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7137352 7137353 Rpal_3793 Rpal_3794     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7137353 7137354 Rpal_3794 Rpal_3795     FALSE 0.474 -10.000 0.000 NA   NA
 7137357 7137358 Rpal_3798 Rpal_3799     FALSE 0.466 -16.000 0.000 NA   NA
 7137358 7137359 Rpal_3799 Rpal_3800     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7137359 7137360 Rpal_3800 Rpal_3801     FALSE 0.466 -16.000 0.000 NA   NA
 7137361 7137362 Rpal_3802 Rpal_3803     TRUE 0.890 0.000 0.000 0.033   NA
 7137362 7137363 Rpal_3803 Rpal_3804     TRUE 0.854 -3.000 0.000 0.033   NA
 7137363 7137364 Rpal_3804 Rpal_3805     FALSE 0.337 126.000 0.048 1.000   NA
 7137365 7137366 Rpal_3806 Rpal_3807     TRUE 0.622 11.000 0.000 NA   NA
 7137366 7137367 Rpal_3807 Rpal_3808     TRUE 0.973 0.000 0.667 NA   NA
 7137367 7137368 Rpal_3808 Rpal_3809     TRUE 0.598 -28.000 0.010 NA   NA
 7137369 7137370 Rpal_3810 Rpal_3811     FALSE 0.005 360.000 0.000 NA   NA
 7137370 7137371 Rpal_3811 Rpal_3812     FALSE 0.005 360.000 0.000 NA   NA
 7137372 7137373 Rpal_3813 Rpal_3814     TRUE 0.611 12.000 0.000 NA   NA
 7137373 7137374 Rpal_3814 Rpal_3815     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7137375 7137376 Rpal_3816 Rpal_3817     FALSE 0.002 642.000 0.000 NA   NA
 7137378 7137379 Rpal_3819 Rpal_3820     FALSE 0.269 50.000 0.000 NA   NA
 7137380 7137381 Rpal_3821 Rpal_3822     FALSE 0.129 137.000 0.000 NA   NA
 7137381 7137382 Rpal_3822 Rpal_3823     FALSE 0.020 263.000 0.000 NA   NA
 7137382 7137383 Rpal_3823 Rpal_3824     TRUE 0.614 116.000 0.000 1.000 Y NA
 7137383 7137384 Rpal_3824 Rpal_3825     FALSE 0.119 128.000 0.000 1.000 N NA
 7137385 7137386 Rpal_3826 Rpal_3827     TRUE 0.993 -3.000 0.628 0.024 Y NA
 7137386 7137387 Rpal_3827 Rpal_3828     TRUE 0.964 -3.000 0.116 1.000 Y NA
 7137387 7137388 Rpal_3828 Rpal_3829     TRUE 0.985 5.000 0.082 0.039 Y NA
 7137388 7137389 Rpal_3829 Rpal_3830     TRUE 0.648 226.000 0.377 NA Y NA
 7137390 7137391 Rpal_3831 Rpal_3832     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 7137391 7137392 Rpal_3832 Rpal_3833     FALSE 0.467 -15.000 0.000 NA   NA
 7137393 7137394 Rpal_3834 Rpal_3835     FALSE 0.126 163.000 0.000 NA   NA
 7137398 7137399 Rpal_3839 Rpal_3840     TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.020 Y NA
 7137399 7137400 Rpal_3840 Rpal_3841     FALSE 0.129 145.000 0.000 NA   NA
 7137400 7137401 Rpal_3841 Rpal_3842     FALSE 0.191 68.000 0.000 NA   NA
 7137405 7137406 Rpal_3845 Rpal_3846     TRUE 0.914 58.000 1.000 NA   NA
 7137407 7137408 Rpal_R0040 Rpal_3847     FALSE 0.001 1426.000 0.000 NA   NA
 7137409 7137410 Rpal_3848 Rpal_3849     FALSE 0.133 150.000 0.000 NA   NA
 7137412 7137413 Rpal_3851 Rpal_3852     FALSE 0.133 158.000 0.000 NA   NA
 7137413 7137414 Rpal_3852 Rpal_3853     FALSE 0.093 184.000 0.000 NA   NA
 7137414 7137415 Rpal_3853 Rpal_3854     FALSE 0.483 180.000 0.273 NA   NA
 7137415 7137416 Rpal_3854 Rpal_3855     FALSE 0.138 93.000 0.000 NA   NA
 7137417 7137418 Rpal_3856 Rpal_3857 ppnK   FALSE 0.126 97.000 0.000 1.000 N NA
 7137419 7137420 Rpal_3858 Rpal_3859     FALSE 0.020 264.000 0.000 NA   NA
 7137420 7137421 Rpal_3859 Rpal_3860     FALSE 0.005 363.000 0.000 NA   NA
 7137422 7137423 Rpal_3861 Rpal_3862     TRUE 0.928 18.000 0.357 NA   NA
 7137425 7137426 Rpal_3864 Rpal_3865     TRUE 0.977 36.000 0.700 NA Y NA
 7137426 7137427 Rpal_3865 Rpal_3866     TRUE 0.941 -3.000 0.031 NA Y NA
 7137427 7137428 Rpal_3866 Rpal_3867     FALSE 0.295 61.000 0.000 1.000   NA
 7137428 7137429 Rpal_3867 Rpal_3868     FALSE 0.227 79.000 0.000 1.000   NA
 7137432 7137433 Rpal_3871 Rpal_3872 hisI folE TRUE 0.632 29.000 0.038 1.000 N NA
 7137437 7137438 Rpal_3876 Rpal_3877     FALSE 0.153 83.000 0.000 NA   NA
 7137439 7137440 Rpal_3878 Rpal_3879     TRUE 0.745 101.000 0.600 NA   NA
 7137440 7137441 Rpal_3879 Rpal_3880     FALSE 0.300 44.000 0.000 NA   NA
 7137442 7137443 Rpal_3881 Rpal_3882     TRUE 0.818 5.000 0.038 NA   NA
 7137444 7137445 Rpal_3883 Rpal_3884     FALSE 0.129 145.000 0.000 NA   NA
 7137450 7137451 Rpal_3889 Rpal_3890     FALSE 0.196 95.000 0.000 1.000   NA
 7137451 7137452 Rpal_3890 Rpal_3891     FALSE 0.059 211.000 0.000 NA   NA
 7137454 7137455 Rpal_3893 Rpal_3894     TRUE 0.885 -3.000 0.211 NA   NA
 7137455 7137456 Rpal_3894 Rpal_3895     TRUE 0.793 29.000 0.158 NA   NA
 7137458 7137459 Rpal_3897 Rpal_3898     FALSE 0.066 238.000 0.005 1.000   NA
 7137462 7137463 Rpal_3901 Rpal_3902     FALSE 0.007 332.000 0.000 NA   NA
 7137464 7137465 Rpal_3903 Rpal_3904     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7137465 7137466 Rpal_3904 Rpal_3905     FALSE 0.003 456.000 0.000 NA   NA
 7137467 7137468 Rpal_3906 Rpal_3907     FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 7137470 7137471 Rpal_3909 Rpal_3910     FALSE 0.045 223.000 0.000 NA   NA
 7137471 7137472 Rpal_3910 Rpal_3911     FALSE 0.480 23.000 0.000 NA   NA
 7137473 7137474 Rpal_3912 Rpal_3913     FALSE 0.442 60.000 0.050 NA   NA
 7137476 7137477 Rpal_3915 Rpal_3916     TRUE 0.622 169.000 0.386 NA   NA
 7137477 7137478 Rpal_3916 Rpal_3917     FALSE 0.235 221.000 0.200 NA   NA
 7137478 7137479 Rpal_3917 Rpal_3918     FALSE 0.481 170.000 0.226 NA   NA
 7137480 7137481 Rpal_3919 Rpal_3920     TRUE 0.964 19.000 0.745 NA   NA
 7137483 7137484 Rpal_3922 Rpal_3923     FALSE 0.133 97.000 0.000 NA   NA
 7137485 7137486 Rpal_3924 Rpal_3925     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7137486 7137487 Rpal_3925 Rpal_3926     TRUE 0.580 14.000 0.000 NA   NA
 7137487 7137488 Rpal_3926 Rpal_3927     TRUE 0.726 -3.000 0.029 NA   NA
 7137488 7137489 Rpal_3927 Rpal_R0041     FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 7137490 7137491 Rpal_3928 Rpal_3929     TRUE 0.870 -7.000 0.194 1.000   NA
 7137491 7137492 Rpal_3929 Rpal_3930     FALSE 0.429 132.000 0.148 1.000 N NA
 7137493 7137494 Rpal_3931 Rpal_3932     FALSE 0.437 27.000 0.000 NA   NA
 7137496 7137497 Rpal_3934 Rpal_3935     TRUE 0.881 161.000 0.400 1.000 Y NA
 7137497 7137498 Rpal_3935 Rpal_3936     TRUE 0.933 34.000 0.128 1.000 Y NA
 7137498 7137499 Rpal_3936 Rpal_3937     TRUE 0.980 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 7137499 7137500 Rpal_3937 Rpal_3938     TRUE 0.690 22.000 0.032 NA   NA
 7137500 7137501 Rpal_3938 Rpal_3939     TRUE 0.916 2.000 0.200 NA   NA
 7137501 7137502 Rpal_3939 Rpal_3940     TRUE 0.542 50.000 0.037 1.000   NA
 7137502 7137503 Rpal_3940 Rpal_3941     FALSE 0.326 160.000 0.065 1.000 N NA
 7137503 7137504 Rpal_3941 Rpal_3942     TRUE 0.577 74.000 0.250 NA N NA
 7137505 7137506 Rpal_3943 Rpal_3944     FALSE 0.060 125.000 0.000 NA N NA
 7137507 7137508 Rpal_3945 Rpal_3946     TRUE 0.769 -91.000 0.091 1.000 N NA
 7137509 7137510 Rpal_3947 Rpal_3948     FALSE 0.093 184.000 0.000 NA   NA
 7137510 7137511 Rpal_3948 Rpal_3949     TRUE 0.964 28.000 1.000 NA   NA
 7137511 7137512 Rpal_3949 Rpal_3950     FALSE 0.522 121.000 0.250 NA   NA
 7137513 7137514 Rpal_3951 Rpal_3952     TRUE 0.966 -3.000 0.714 NA   NA
 7137514 7137515 Rpal_3952 Rpal_3953     FALSE 0.367 182.000 0.214 NA N NA
 7137517 7137518 Rpal_3955 Rpal_3956     TRUE 0.956 22.000 0.111 1.000 Y NA
 7137518 7137519 Rpal_3956 Rpal_3957     FALSE 0.088 258.000 0.111 1.000 N NA
 7137519 7137520 Rpal_3957 Rpal_3958     TRUE 0.805 177.000 0.273 1.000 Y NA
 7137520 7137521 Rpal_3958 Rpal_3959     TRUE 0.994 -7.000 0.917 0.039 Y NA
 7137521 7137522 Rpal_3959 Rpal_3960     FALSE 0.280 231.000 0.000 NA Y NA
 7137522 7137523 Rpal_3960 Rpal_3961     TRUE 0.870 77.000 0.300 NA Y NA
 7137524 7137525 Rpal_3962 Rpal_3963     FALSE 0.500 182.000 0.143 0.066 N NA
 7137525 7137526 Rpal_3963 Rpal_3964     TRUE 0.885 83.000 0.333 1.000 Y NA
 7137527 7137528 Rpal_3965 Rpal_3966     TRUE 0.863 105.000 0.818 0.084 N NA
 7137528 7137529 Rpal_3966 Rpal_3967     TRUE 0.991 4.000 0.273 0.046 Y NA
 7137529 7137530 Rpal_3967 Rpal_3968     TRUE 0.980 -3.000 1.000 1.000   NA
 7137530 7137531 Rpal_3968 Rpal_3969     TRUE 0.960 26.000 0.750 1.000   NA
 7137531 7137532 Rpal_3969 Rpal_3970     FALSE 0.014 284.000 0.000 NA   NA
 7137533 7137534 Rpal_3971 Rpal_3972     TRUE 0.958 3.000 0.458 NA N NA
 7137535 7137536 Rpal_3973 Rpal_3974     TRUE 0.970 -3.000 0.800 NA   NA
 7137537 7137538 Rpal_R0042 Rpal_3975     FALSE 0.034 234.000 0.000 NA   NA
 7137538 7137539 Rpal_3975 Rpal_3976     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7137539 7137540 Rpal_3976 Rpal_3977     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7137540 7137541 Rpal_3977 Rpal_3978     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7137541 7137542 Rpal_3978 Rpal_3979     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7137542 7137543 Rpal_3979 Rpal_3980     TRUE 0.974 3.000 0.636 NA   NA
 7137543 7137544 Rpal_3980 Rpal_3981     TRUE 0.941 6.000 0.286 NA   NA
 7137544 7137545 Rpal_3981 Rpal_3982     TRUE 0.957 -9.000 0.714 NA   NA
 7137545 7137546 Rpal_3982 Rpal_3983     TRUE 0.949 2.000 0.333 NA   NA
 7137546 7137547 Rpal_3983 Rpal_3984     TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7137547 7137548 Rpal_3984 Rpal_3985     TRUE 0.911 2.000 0.182 NA   NA
 7137548 7137549 Rpal_3985 Rpal_3986     TRUE 0.979 0.000 0.818 NA   NA
 7137549 7137550 Rpal_3986 Rpal_3987     FALSE 0.464 -21.000 0.000 NA   NA
 7137550 7137551 Rpal_3987 Rpal_3988     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7137551 7137552 Rpal_3988 Rpal_3989     TRUE 0.856 -25.000 0.222 NA   NA
 7137552 7137553 Rpal_3989 Rpal_3990     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7137553 7137554 Rpal_3990 Rpal_3991     TRUE 0.829 -3.000 0.095 NA   NA
 7137554 7137555 Rpal_3991 Rpal_3992     TRUE 0.973 0.000 0.667 NA   NA
 7137555 7137556 Rpal_3992 Rpal_3993     FALSE 0.127 105.000 0.000 NA   NA
 7137556 7137557 Rpal_3993 Rpal_3994     FALSE 0.071 199.000 0.000 NA   NA
 7137557 7137558 Rpal_3994 Rpal_3995     FALSE 0.052 216.000 0.000 NA   NA
 7137559 7137560 Rpal_3996 Rpal_3997     TRUE 0.728 9.000 0.000 1.000   NA
 7137562 7137563 Rpal_3999 Rpal_4000     FALSE 0.060 110.000 0.000 NA N NA
 7137563 7137564 Rpal_4000 Rpal_4001     FALSE 0.034 234.000 0.000 NA   NA
 7137564 7137565 Rpal_4001 Rpal_4002     TRUE 0.765 6.000 0.013 NA   NA
 7137565 7137566 Rpal_4002 Rpal_4003     FALSE 0.231 215.000 0.150 NA   NA
 7137566 7137567 Rpal_4003 Rpal_4004     FALSE 0.242 243.000 0.348 NA   NA
 7137567 7137568 Rpal_4004 Rpal_4005     TRUE 0.996 -3.000 0.947 0.006 Y NA
 7137568 7137569 Rpal_4005 Rpal_4006     FALSE 0.260 145.000 0.037 1.000 N NA
 7137569 7137570 Rpal_4006 Rpal_4007   thyA TRUE 0.849 -3.000 0.134 1.000 N NA
 7137570 7137571 Rpal_4007 Rpal_4008 thyA   FALSE 0.212 173.000 0.004 1.000   NA
 7137571 7137572 Rpal_4008 Rpal_4009     FALSE 0.507 102.000 0.222 NA   NA
 7137572 7137573 Rpal_4009 Rpal_4010     TRUE 0.983 11.000 1.000 NA   NA
 7137573 7137574 Rpal_4010 Rpal_4011     FALSE 0.466 73.000 0.094 NA   NA
 7137574 7137575 Rpal_4011 Rpal_4012     TRUE 0.991 -3.000 0.357 0.001 Y NA
 7137576 7137577 Rpal_R0062 Rpal_4013 ssrA   FALSE 0.054 215.000 0.000 NA   NA
 7137577 7137578 Rpal_4013 Rpal_4014   fumC FALSE 0.293 111.000 0.054 NA   NA
 7137578 7137579 Rpal_4014 Rpal_4015 fumC   FALSE 0.045 265.000 0.033 NA   NA
 7137579 7137580 Rpal_4015 Rpal_4016     TRUE 0.861 -3.000 0.152 NA   NA
 7137581 7137582 Rpal_4017 Rpal_4018     FALSE 0.129 136.000 0.000 NA   NA
 7137585 7137586 Rpal_4021 Rpal_4022     TRUE 0.738 0.000 0.010 NA   NA
 7137586 7137587 Rpal_4022 Rpal_4023     FALSE 0.002 784.000 0.000 NA   NA
 7137587 7137588 Rpal_4023 Rpal_4024     FALSE 0.012 295.000 0.000 NA   NA
 7137588 7137589 Rpal_4024 Rpal_4025     TRUE 0.974 3.000 0.411 0.079 N NA
 7137597 7137598 Rpal_4033 Rpal_4034     FALSE 0.008 374.000 0.013 1.000 N NA
 7137601 7137602 Rpal_4037 Rpal_4038     TRUE 0.891 13.000 0.117 1.000   NA
 7137602 7137603 Rpal_4038 Rpal_4039   lpxC FALSE 0.151 227.000 0.064 1.000   NA
 7137603 7137604 Rpal_4039 Rpal_4040 lpxC   FALSE 0.027 347.000 0.134 1.000 N NA
 7137604 7137605 Rpal_4040 Rpal_4041     TRUE 0.783 94.000 0.114 1.000 Y NA
 7137605 7137606 Rpal_4041 Rpal_4042     TRUE 0.822 -3.000 0.137 NA N NA
 7137606 7137607 Rpal_4042 Rpal_4043     FALSE 0.255 319.000 0.372 NA Y NA
 7137607 7137608 Rpal_4043 Rpal_4044     FALSE 0.184 110.000 0.005 NA   NA
 7137610 7137611 Rpal_4046 Rpal_4047 murB murC TRUE 0.891 86.000 0.108 0.003 Y NA
 7137611 7137612 Rpal_4047 Rpal_4048 murC murG TRUE 0.844 137.000 0.283 1.000 Y NA
 7137612 7137613 Rpal_4048 Rpal_4049 murG   TRUE 0.974 5.000 0.647 1.000 N NA
 7137613 7137614 Rpal_4049 Rpal_4050   murD TRUE 0.766 146.000 0.297 0.002 N NA
 7137614 7137615 Rpal_4050 Rpal_4051 murD mraY TRUE 0.935 188.000 0.647 0.003 Y NA
 7137615 7137616 Rpal_4051 Rpal_4052 mraY   TRUE 0.993 11.000 0.309 0.003 Y NA
 7137616 7137617 Rpal_4052 Rpal_4053   murE TRUE 0.994 -3.000 0.569 0.001 Y NA
 7137617 7137618 Rpal_4053 Rpal_4054 murE   TRUE 0.702 113.000 0.043 1.000 Y NA
 7137618 7137619 Rpal_4054 Rpal_4055     TRUE 0.894 -3.000 0.228 NA   NA
 7137619 7137620 Rpal_4055 Rpal_4056     TRUE 0.823 -3.000 0.089 NA   NA
 7137621 7137622 Rpal_4057 Rpal_R0059     FALSE 0.123 112.000 0.000 NA   NA
 7137623 7137624 Rpal_4058 Rpal_4059     TRUE 0.954 2.000 0.375 NA   NA
 7137624 7137625 Rpal_4059 Rpal_4060     FALSE 0.514 49.000 0.048 NA   NA
 7137625 7137626 Rpal_4060 Rpal_4061     TRUE 0.768 151.000 0.586 1.000   NA
 7137628 7137629 Rpal_4063 Rpal_4064     FALSE 0.278 124.000 0.045 NA   NA
 7137632 7137633 Rpal_4067 Rpal_4068     FALSE 0.155 233.000 0.000 0.030   NA
 7137633 7137634 Rpal_4068 Rpal_4069     TRUE 0.833 -3.000 0.000 0.066   NA
 7137634 7137635 Rpal_4069 Rpal_4070     TRUE 0.852 -3.000 0.000 0.036   NA
 7137636 7137637 Rpal_4071 Rpal_4072     TRUE 0.815 127.000 0.222 1.000 Y NA
 7137637 7137638 Rpal_4072 Rpal_4073     TRUE 0.973 0.000 0.273 0.000 N NA
 7137638 7137639 Rpal_4073 Rpal_4074     TRUE 0.841 -7.000 0.182 1.000 N NA
 7137639 7137640 Rpal_4074 Rpal_4075     FALSE 0.246 55.000 0.000 NA   NA
 7137640 7137641 Rpal_4075 Rpal_4076     TRUE 0.847 12.000 0.073 NA   NA
 7137641 7137642 Rpal_4076 Rpal_4077     TRUE 0.781 -3.000 0.056 NA   NA
 7137643 7137644 Rpal_4078 Rpal_4079     FALSE 0.048 238.000 0.000 1.000   NA
 7137644 7137645 Rpal_4079 Rpal_4080   arsM TRUE 0.584 -10.000 0.000 1.000   NA
 7137646 7137647 Rpal_4081 Rpal_4082     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7137647 7137648 Rpal_4082 Rpal_4083   tnaA FALSE 0.023 251.000 0.000 NA   NA
 7137649 7137650 Rpal_4084 Rpal_4085     FALSE 0.081 190.000 0.000 NA   NA
 7137650 7137651 Rpal_4085 Rpal_4086     FALSE 0.133 157.000 0.000 NA   NA
 7137652 7137653 Rpal_4087 Rpal_4088     FALSE 0.013 288.000 0.000 NA   NA
 7137654 7137655 Rpal_4089 Rpal_4090     TRUE 0.992 -3.000 0.857 1.000 Y NA
 7137657 7137658 Rpal_4092 Rpal_4093     TRUE 0.909 -9.000 0.351 1.000 N NA
 7137658 7137659 Rpal_4093 Rpal_4094   thiG FALSE 0.335 253.000 0.095 1.000 Y NA
 7137659 7137660 Rpal_4094 Rpal_4095 thiG   TRUE 0.976 -13.000 0.118 0.005 Y NA
 7137660 7137661 Rpal_4095 Rpal_4096     TRUE 0.636 224.000 0.063 0.005 Y NA
 7137661 7137662 Rpal_4096 Rpal_4097     FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 7137662 7137663 Rpal_4097 Rpal_4098     FALSE 0.019 268.000 0.000 NA   NA
 7137664 7137665 Rpal_4099 Rpal_4100     FALSE 0.081 190.000 0.000 NA   NA
 7137665 7137666 Rpal_4100 Rpal_4101     FALSE 0.122 121.000 0.000 NA   NA
 7137666 7137667 Rpal_4101 Rpal_4102     TRUE 0.953 -12.000 0.667 NA   NA
 7137669 7137670 Rpal_4104 Rpal_4105     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 7137671 7137672 Rpal_4106 Rpal_4107     FALSE 0.128 162.000 0.000 NA   NA
 7137676 7137677 Rpal_4111 Rpal_4112     FALSE 0.048 220.000 0.000 NA   NA
 7137677 7137678 Rpal_4112 Rpal_4113     FALSE 0.127 106.000 0.000 NA   NA
 7137681 7137682 Rpal_4116 Rpal_4117     TRUE 0.813 -13.000 0.135 NA   NA
 7137683 7137684 Rpal_4118 Rpal_4119     FALSE 0.129 137.000 0.000 NA   NA
 7137685 7137686 Rpal_4120 Rpal_4121     TRUE 0.611 123.000 0.348 NA   NA
 7137687 7137688 Rpal_4122 Rpal_4123     FALSE 0.047 221.000 0.000 NA   NA
 7137689 7137690 Rpal_4124 Rpal_4125     TRUE 0.856 0.000 0.078 NA   NA
 7137690 7137691 Rpal_4125 Rpal_4126     FALSE 0.258 175.000 0.051 NA   NA
 7137692 7137693 Rpal_4127 Rpal_4128     TRUE 0.908 -13.000 0.350 NA   NA
 7137698 7137699 Rpal_4133 Rpal_4134     TRUE 0.733 118.000 0.111 NA Y NA
 7137699 7137700 Rpal_4134 Rpal_4135     FALSE 0.294 147.000 0.046 NA   NA
 7137701 7137702 Rpal_4136 Rpal_4137     FALSE 0.169 170.000 0.000 1.000   NA
 7137702 7137703 Rpal_4137 Rpal_4138     FALSE 0.293 115.000 0.030 1.000   NA
 7137703 7137704 Rpal_4138 Rpal_4139     FALSE 0.003 605.000 0.000 1.000   NA
 7137704 7137705 Rpal_4139 Rpal_4140     TRUE 0.939 4.000 0.277 1.000 N NA
 7137705 7137706 Rpal_4140 Rpal_4141     TRUE 0.903 31.000 0.450 1.000 N NA
 7137707 7137708 Rpal_4142 Rpal_4143     FALSE 0.289 141.000 0.048 NA   NA
 7137708 7137709 Rpal_4143 Rpal_4144     FALSE 0.332 149.000 0.067 1.000 N NA
 7137709 7137710 Rpal_4144 Rpal_4145     FALSE 0.392 152.000 0.097 NA   NA
 7137712 7137713 Rpal_4147 Rpal_4148     TRUE 0.807 -3.000 0.075 NA   NA
 7137713 7137714 Rpal_4148 Rpal_4149     TRUE 0.756 19.000 0.054 1.000 N NA
 7137714 7137715 Rpal_4149 Rpal_4150     TRUE 0.699 72.000 0.333 NA   NA
 7137718 7137719 Rpal_4153 Rpal_4154     FALSE 0.505 20.000 0.000 NA   NA
 7137719 7137720 Rpal_4154 Rpal_4155     FALSE 0.137 216.000 0.051 NA   NA
 7137720 7137721 Rpal_4155 Rpal_4156     TRUE 0.855 187.000 0.208 0.002 Y NA
 7137721 7137722 Rpal_4156 Rpal_4157     TRUE 0.965 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 7137722 7137723 Rpal_4157 Rpal_4158     TRUE 0.977 3.000 0.130 1.000 Y NA
 7137723 7137724 Rpal_4158 Rpal_4159     TRUE 0.948 -16.000 0.087 1.000 Y NA
 7137724 7137725 Rpal_4159 Rpal_4160     TRUE 0.709 124.000 0.462 1.000   NA
 7137726 7137727 Rpal_4161 Rpal_4162     TRUE 0.983 5.000 0.242 1.000 Y NA
 7137728 7137729 Rpal_4163 Rpal_4164     TRUE 0.986 11.000 0.544 0.003   NA
 7137729 7137730 Rpal_4164 Rpal_4165     TRUE 0.978 -3.000 0.049 0.003 Y NA
 7137730 7137731 Rpal_4165 Rpal_4166     TRUE 0.873 238.000 0.812 0.001 Y NA
 7137731 7137732 Rpal_4166 Rpal_4167     TRUE 0.981 -3.000 0.067 0.001 Y NA
 7137732 7137733 Rpal_4167 Rpal_4168     TRUE 0.992 0.000 0.263 0.003 Y NA
 7137738 7137739 Rpal_4173 Rpal_4174     FALSE 0.340 64.000 0.021 NA   NA
 7137741 7137742 Rpal_4176 Rpal_4177     FALSE 0.530 79.000 0.136 1.000   NA
 7137744 7137745 Rpal_4179 Rpal_4180     TRUE 0.987 -10.000 0.330 0.003 Y NA
 7137745 7137746 Rpal_4180 Rpal_4181     TRUE 0.824 9.000 0.021 1.000   NA
 7137746 7137747 Rpal_4181 Rpal_4182   ureC FALSE 0.142 204.000 0.010 1.000   NA
 7137747 7137748 Rpal_4182 Rpal_4183 ureC   TRUE 0.758 -3.000 0.019 1.000   NA
 7137748 7137749 Rpal_4183 Rpal_4184   ureB TRUE 0.827 0.000 0.029 1.000   NA
 7137749 7137750 Rpal_4184 Rpal_4185 ureB ureA TRUE 0.956 162.000 0.595 0.001 Y NA
 7137750 7137751 Rpal_4185 Rpal_4186 ureA   TRUE 0.947 47.000 0.664 0.003 N NA
 7137751 7137752 Rpal_4186 Rpal_4187     FALSE 0.339 199.000 0.221 1.000 N NA
 7137752 7137753 Rpal_4187 Rpal_4188     TRUE 0.785 202.000 0.731 0.023   NA
 7137753 7137754 Rpal_4188 Rpal_4189     TRUE 0.975 -3.000 0.823 1.000   NA
 7137754 7137755 Rpal_4189 Rpal_4190     TRUE 0.950 173.000 0.758 0.038 Y NA
 7137755 7137756 Rpal_4190 Rpal_4191     TRUE 0.908 110.000 0.654 NA Y NA
 7137757 7137758 Rpal_4192 Rpal_4193   infA TRUE 0.938 25.000 0.055 1.000 Y NA
 7137758 7137759 Rpal_4193 Rpal_4194 infA   FALSE 0.013 282.000 0.000 1.000 N NA
 7137760 7137761 Rpal_4195 Rpal_4196     TRUE 0.973 13.000 0.194 NA Y NA
 7137762 7137763 Rpal_4197 Rpal_4198     FALSE 0.068 328.000 0.000 NA Y NA
 7137763 7137764 Rpal_4198 Rpal_4199     TRUE 0.567 107.000 0.292 NA   NA
 7137764 7137765 Rpal_4199 Rpal_4200     TRUE 0.961 15.000 0.583 NA   NA
 7137765 7137766 Rpal_4200 Rpal_4201     TRUE 0.935 20.000 0.500 NA N NA
 7137766 7137767 Rpal_4201 Rpal_4202     TRUE 0.938 -3.000 0.462 NA N NA
 7137767 7137768 Rpal_4202 Rpal_4203     TRUE 0.976 21.000 0.324 1.000 Y NA
 7137768 7137769 Rpal_4203 Rpal_4204     TRUE 0.990 13.000 0.618 NA Y NA
 7137769 7137770 Rpal_4204 Rpal_4205     TRUE 0.994 9.000 0.818 NA Y NA
 7137772 7137773 Rpal_4207 Rpal_4208     TRUE 0.925 -7.000 0.408 NA   NA
 7137774 7137775 Rpal_4209 Rpal_4210     TRUE 0.860 8.000 0.046 1.000   NA
 7137775 7137776 Rpal_4210 Rpal_4211     TRUE 0.981 6.000 0.744 1.000   NA
 7137776 7137777 Rpal_4211 Rpal_4212     TRUE 0.990 0.000 0.882 0.038   NA
 7137777 7137778 Rpal_4212 Rpal_4213     TRUE 0.988 2.000 0.711 0.038   NA
 7137778 7137779 Rpal_4213 Rpal_4214     TRUE 0.991 15.000 0.391 0.038 Y NA
 7137779 7137780 Rpal_4214 Rpal_4215     FALSE 0.187 213.000 0.087 1.000 N NA
 7137781 7137782 Rpal_4216 Rpal_4217     FALSE 0.447 72.000 0.083 1.000 N NA
 7137784 7137785 Rpal_4219 Rpal_4220     TRUE 0.862 -3.000 0.107 1.000   NA
 7137785 7137786 Rpal_4220 Rpal_4221     TRUE 0.647 17.000 0.000 1.000   NA
 7137788 7137789 Rpal_4223 Rpal_4224   metH TRUE 0.983 13.000 0.037 0.001 Y NA
 7137789 7137790 Rpal_4224 Rpal_4225 metH   FALSE 0.006 1135.000 0.000 0.030 N NA
 7137792 7137793 Rpal_4227 Rpal_4228     TRUE 0.939 -3.000 0.466 NA N NA
 7137793 7137794 Rpal_4228 Rpal_4229     FALSE 0.306 21.000 0.000 NA N NA
 7137794 7137795 Rpal_4229 Rpal_4230     FALSE 0.125 358.000 0.000 0.001 Y NA
 7137795 7137796 Rpal_4230 Rpal_4231   nirA TRUE 0.670 43.000 0.000 0.009 N NA
 7137796 7137797 Rpal_4231 Rpal_4232 nirA   TRUE 0.993 -3.000 0.640 0.053 Y NA
 7137798 7137799 Rpal_4233 Rpal_4234     FALSE 0.306 269.000 0.125 1.000 Y NA
 7137799 7137800 Rpal_4234 Rpal_4235     TRUE 0.961 169.000 0.688 0.000 Y NA
 7137800 7137801 Rpal_4235 Rpal_4236     TRUE 0.728 214.000 0.364 1.000 Y NA
 7137801 7137802 Rpal_4236 Rpal_4237     TRUE 0.981 32.000 0.667 1.000 Y NA
 7137802 7137803 Rpal_4237 Rpal_4238     TRUE 0.847 179.000 0.400 1.000 Y NA
 7137804 7137805 Rpal_4239 Rpal_4240     TRUE 0.889 31.000 0.389 1.000 N NA
 7137805 7137806 Rpal_4240 Rpal_4241     TRUE 0.992 -3.000 0.533 0.023 Y NA
 7137806 7137807 Rpal_4241 Rpal_4242     TRUE 0.990 11.000 0.500 1.000 Y NA
 7137807 7137808 Rpal_4242 Rpal_4243     TRUE 0.997 3.000 0.857 0.038 Y NA
 7137808 7137809 Rpal_4243 Rpal_4244     TRUE 0.625 199.000 0.143 NA Y NA
 7137809 7137810 Rpal_4244 Rpal_4245     TRUE 0.904 181.000 0.800 NA Y NA
 7137810 7137811 Rpal_4245 Rpal_4246     FALSE 0.054 348.000 0.000 NA Y NA
 7137813 7137814 Rpal_4248 Rpal_4249     FALSE 0.078 189.000 0.000 1.000 N NA
 7137816 7137817 Rpal_4251 Rpal_4252     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7137818 7137819 Rpal_4253 Rpal_4254     FALSE 0.014 331.000 0.020 1.000 N NA
 7137820 7137821 Rpal_4255 Rpal_4256 ispH   TRUE 0.836 40.000 0.293 1.000   NA
 7137822 7137823 Rpal_4257 Rpal_4258     TRUE 0.792 34.000 0.154 1.000   NA
 7137825 7137826 Rpal_4260 Rpal_4261     TRUE 0.960 -3.000 0.633 1.000 N NA
 7137826 7137827 Rpal_4261 Rpal_4262     TRUE 0.854 34.000 0.269 1.000   NA
 7137827 7137828 Rpal_4262 Rpal_4263     TRUE 0.950 0.000 0.315 1.000   NA
 7137828 7137829 Rpal_4263 Rpal_4264     TRUE 0.989 -3.000 0.255 0.001 Y NA
 7137829 7137830 Rpal_4264 Rpal_4265     FALSE 0.156 205.000 0.020 1.000   NA
 7137832 7137833 Rpal_4267 Rpal_4268     FALSE 0.145 208.000 0.016 1.000   NA
 7137833 7137834 Rpal_4268 Rpal_4269     TRUE 0.811 8.000 0.039 1.000 N NA
 7137834 7137835 Rpal_4269 Rpal_4270     FALSE 0.039 228.000 0.000 1.000 N NA
 7137835 7137836 Rpal_4270 Rpal_4271     FALSE 0.343 62.000 0.022 1.000 N NA
 7137836 7137837 Rpal_4271 Rpal_4272     TRUE 0.670 53.000 0.185 NA   NA
 7137837 7137838 Rpal_4272 Rpal_4273     FALSE 0.067 203.000 0.000 NA   NA
 7137838 7137839 Rpal_4273 Rpal_4274     TRUE 0.967 -3.000 0.734 NA   NA
 7137839 7137840 Rpal_4274 Rpal_4275     TRUE 0.948 26.000 0.667 NA   NA
 7137840 7137841 Rpal_4275 Rpal_4276     FALSE 0.010 306.000 0.000 NA   NA
 7137841 7137842 Rpal_4276 Rpal_4277     FALSE 0.393 184.000 0.206 1.000 N NA
 7137842 7137843 Rpal_4277 Rpal_4278     TRUE 0.723 41.000 0.176 1.000 N NA
 7137844 7137845 Rpal_4279 Rpal_4280     TRUE 0.748 21.000 0.058 1.000 N NA
 7137845 7137846 Rpal_4280 Rpal_4281     TRUE 0.880 -7.000 0.252 1.000 N NA
 7137846 7137847 Rpal_4281 Rpal_4282     FALSE 0.260 231.000 0.245 1.000   NA
 7137847 7137848 Rpal_4282 Rpal_4283     FALSE 0.481 151.000 0.138 1.000   NA
 7137848 7137849 Rpal_4283 Rpal_4284     TRUE 0.851 29.000 0.261 1.000 N NA
 7137850 7137851 Rpal_4285 Rpal_4286     TRUE 0.970 9.000 0.571 NA   NA
 7137851 7137852 Rpal_4286 Rpal_4287     TRUE 0.969 -6.000 0.919 NA   NA
 7137852 7137853 Rpal_4287 Rpal_4288   paaB TRUE 0.824 116.000 0.943 NA   NA
 7137853 7137854 Rpal_4288 Rpal_4289 paaB paaA TRUE 0.802 174.000 0.920 NA   NA
 7137856 7137857 Rpal_4291 Rpal_4292     FALSE 0.058 212.000 0.000 NA   NA
 7137857 7137858 Rpal_4292 Rpal_4293     FALSE 0.275 49.000 0.000 NA   NA
 7137858 7137859 Rpal_4293 Rpal_4294     TRUE 0.816 19.000 0.095 NA   NA
 7137859 7137860 Rpal_4294 Rpal_4295     FALSE 0.453 91.000 0.143 NA   NA
 7137860 7137861 Rpal_4295 Rpal_4296     FALSE 0.231 280.000 0.625 1.000 N NA
 7137861 7137862 Rpal_4296 Rpal_4297     TRUE 0.694 142.000 0.304 0.082 N NA
 7137862 7137863 Rpal_4297 Rpal_4298     TRUE 0.969 2.000 0.565 1.000 N NA
 7137864 7137865 Rpal_4299 Rpal_4300     FALSE 0.113 171.000 0.000 NA   NA
 7137868 7137869 Rpal_4303 Rpal_4304     FALSE 0.482 125.000 0.161 1.000   NA
 7137869 7137870 Rpal_4304 Rpal_4305     TRUE 0.867 20.000 0.153 1.000   NA
 7137871 7137872 Rpal_4306 Rpal_4307     FALSE 0.130 146.000 0.000 NA   NA
 7137872 7137873 Rpal_4307 Rpal_4308     TRUE 0.588 98.000 0.300 NA   NA
 7137874 7137875 Rpal_4309 Rpal_4310     FALSE 0.008 326.000 0.000 NA   NA
 7137875 7137876 Rpal_4310 Rpal_4311     TRUE 0.977 -3.000 0.671 0.077 N NA
 7137876 7137877 Rpal_4311 Rpal_4312     TRUE 0.991 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 7137877 7137878 Rpal_4312 Rpal_4313     TRUE 0.839 -3.000 0.117 1.000 N NA
 7137878 7137879 Rpal_4313 Rpal_4314     FALSE 0.173 71.000 0.000 1.000 N NA
 7137881 7137882 Rpal_4316 Rpal_4317     FALSE 0.506 62.000 0.086 NA   NA
 7137882 7137883 Rpal_4317 Rpal_4318     FALSE 0.124 110.000 0.000 NA   NA
 7137885 7137886 Rpal_4320 Rpal_4321     TRUE 0.945 -3.000 0.447 NA   NA
 7137886 7137887 Rpal_4321 Rpal_4322     TRUE 0.920 31.000 0.533 NA   NA
 7137887 7137888 Rpal_4322 Rpal_4323     TRUE 0.849 39.000 0.355 NA   NA
 7137888 7137889 Rpal_4323 Rpal_4324     FALSE 0.142 325.000 0.645 NA   NA
 7137889 7137890 Rpal_4324 Rpal_4325     TRUE 0.883 20.000 0.200 1.000   NA
 7137890 7137891 Rpal_4325 Rpal_4326     TRUE 0.976 76.000 0.800 0.002 Y NA
 7137891 7137892 Rpal_4326 Rpal_4327     TRUE 0.698 176.000 0.600 NA   NA
 7137892 7137893 Rpal_4327 Rpal_4328     FALSE 0.329 193.000 0.182 NA   NA
 7137893 7137894 Rpal_4328 Rpal_4329     FALSE 0.011 300.000 0.000 NA   NA
 7137895 7137896 Rpal_4330 Rpal_4331     TRUE 0.992 13.000 0.406 0.037 Y NA
 7137896 7137897 Rpal_4331 Rpal_4332     TRUE 0.983 -3.000 0.386 1.000 Y NA
 7137897 7137898 Rpal_4332 Rpal_4333     TRUE 0.965 137.000 0.881 0.023 Y NA
 7137898 7137899 Rpal_4333 Rpal_4334     TRUE 0.720 179.000 0.119 1.000 Y NA
 7137900 7137901 Rpal_4335 Rpal_4336     TRUE 0.720 71.000 0.000 1.000 Y NA
 7137901 7137902 Rpal_4336 Rpal_4337     FALSE 0.009 305.000 0.000 1.000 N NA
 7137907 7137908 Rpal_4342 Rpal_4343     FALSE 0.003 473.000 0.000 1.000 N NA
 7137909 7137910 Rpal_4344 Rpal_4345     FALSE 0.234 57.000 0.000 NA   NA
 7137910 7137911 Rpal_4345 Rpal_4346     FALSE 0.470 24.000 0.000 NA   NA
 7137911 7137912 Rpal_4346 Rpal_4347     TRUE 0.855 183.000 0.460 1.000 Y NA
 7137913 7137914 Rpal_4348 Rpal_4349     FALSE 0.002 572.000 0.000 NA   NA
 7137915 7137916 Rpal_4350 Rpal_4351     TRUE 0.934 -19.000 0.500 NA   NA
 7137916 7137917 Rpal_4351 Rpal_4352     FALSE 0.125 109.000 0.000 NA   NA
 7137917 7137918 Rpal_4352 Rpal_4353     FALSE 0.009 317.000 0.000 NA   NA
 7137920 7137921 Rpal_4355 Rpal_4356     FALSE 0.062 208.000 0.000 NA   NA
 7137921 7137922 Rpal_4356 Rpal_4357     FALSE 0.182 71.000 0.000 NA   NA
 7137922 7137923 Rpal_4357 Rpal_4358     FALSE 0.107 61.000 0.000 NA N NA
 7137923 7137924 Rpal_4358 Rpal_4359     TRUE 0.634 1.000 0.000 NA   NA
 7137924 7137925 Rpal_4359 Rpal_4360     FALSE 0.179 72.000 0.000 NA   NA
 7137925 7137926 Rpal_4360 Rpal_4361     FALSE 0.092 181.000 0.000 1.000 N NA
 7137927 7137928 Rpal_4362 Rpal_4363     FALSE 0.186 131.000 0.000 1.000   NA
 7137928 7137929 Rpal_4363 Rpal_4364     FALSE 0.169 170.000 0.000 1.000   NA
 7137929 7137930 Rpal_4364 Rpal_4365     FALSE 0.433 141.000 0.154 1.000 N NA
 7137930 7137931 Rpal_4365 Rpal_4366     FALSE 0.496 21.000 0.000 NA   NA
 7137931 7137932 Rpal_4366 Rpal_4367     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7137934 7137935 Rpal_4369 Rpal_4370     FALSE 0.039 230.000 0.000 NA   NA
 7137936 7137937 Rpal_4371 Rpal_4372   alaS TRUE 0.732 2.000 0.000 1.000   NA
 7137938 7137939 Rpal_4373 Rpal_4374 gcvT   TRUE 0.991 10.000 0.202 0.001 Y NA
 7137939 7137940 Rpal_4374 Rpal_4375     TRUE 0.762 168.000 0.130 1.000 Y NA
 7137941 7137942 Rpal_4376 Rpal_4377 recA   FALSE 0.020 259.000 0.000 1.000 N NA
 7137945 7137946 Rpal_4380 Rpal_4381     FALSE 0.004 383.000 0.000 NA   NA
 7137946 7137947 Rpal_4381 Rpal_4382     FALSE 0.022 258.000 0.000 NA   NA
 7137948 7137949 Rpal_4383 Rpal_4384     TRUE 0.709 161.000 0.500 NA   NA
 7137949 7137950 Rpal_4384 Rpal_4385     FALSE 0.318 41.000 0.000 NA   NA
 7137954 7137955 Rpal_4389 Rpal_4390     FALSE 0.474 73.000 0.069 1.000   NA
 7137958 7137959 Rpal_4393 Rpal_4394     FALSE 0.133 150.000 0.000 NA   NA
 7137962 7137963 Rpal_4397 Rpal_4398     FALSE 0.243 107.000 0.028 NA   NA
 7137963 7137964 Rpal_4398 Rpal_4399     TRUE 0.891 -3.000 0.222 NA   NA
 7137965 7137966 Rpal_4400 Rpal_4401     FALSE 0.051 217.000 0.000 NA   NA
 7137966 7137967 Rpal_4401 Rpal_4402     FALSE 0.129 144.000 0.000 NA   NA
 7137968 7137969 Rpal_4403 Rpal_4404     FALSE 0.315 121.000 0.040 1.000   NA
 7137969 7137970 Rpal_4404 Rpal_4405     FALSE 0.019 339.000 0.035 1.000   NA
 7137970 7137971 Rpal_4405 Rpal_4406   flhB TRUE 0.603 110.000 0.200 0.082 N NA
 7137971 7137972 Rpal_4406 Rpal_4407 flhB fliR TRUE 0.987 27.000 0.788 1.000 Y NA
 7137972 7137973 Rpal_4407 Rpal_4408 fliR fliQ TRUE 0.973 107.000 0.929 0.001 Y NA
 7137973 7137974 Rpal_4408 Rpal_4409 fliQ fliE TRUE 0.890 161.000 0.444 1.000 Y NA
 7137974 7137975 Rpal_4409 Rpal_4410 fliE flgC TRUE 0.987 36.000 0.556 0.003 Y NA
 7137975 7137976 Rpal_4410 Rpal_4411 flgC flgB TRUE 0.975 22.000 0.066 0.003 Y NA
 7137977 7137978 Rpal_4412 Rpal_4413   fliP TRUE 0.948 -3.000 0.414 1.000   NA
 7137981 7137982 Rpal_4416 Rpal_4417     FALSE 0.432 26.000 0.000 1.000 N NA
 7137982 7137983 Rpal_4417 Rpal_4418     FALSE 0.102 178.000 0.000 NA   NA
 7137983 7137984 Rpal_4418 Rpal_4419     TRUE 0.934 -3.000 0.381 NA   NA
 7137984 7137985 Rpal_4419 Rpal_4420   fliM TRUE 0.817 -3.000 0.083 NA   NA
 7137985 7137986 Rpal_4420 Rpal_4421 fliM fliL TRUE 0.994 7.000 0.323 0.001 Y NA
 7137987 7137988 Rpal_4422 Rpal_4423 flgF flgG TRUE 0.993 13.000 0.353 0.001 Y NA
 7137988 7137989 Rpal_4423 Rpal_4424 flgG flgA TRUE 0.988 13.000 0.529 NA Y NA
 7137989 7137990 Rpal_4424 Rpal_4425 flgA flgH TRUE 0.992 6.000 0.652 NA Y NA
 7137991 7137992 Rpal_4426 Rpal_4427     TRUE 0.979 13.000 0.909 1.000 N NA
 7137993 7137994 Rpal_4428 Rpal_4429     FALSE 0.074 196.000 0.000 NA   NA
 7137995 7137996 Rpal_4430 Rpal_4431   fliX FALSE 0.353 121.000 0.086 NA   NA
 7137997 7137998 Rpal_4432 Rpal_4433 flgI   TRUE 0.930 0.000 0.261 NA   NA
 7137998 7137999 Rpal_4433 Rpal_4434     TRUE 0.894 18.000 0.239 NA   NA
 7137999 7138000 Rpal_4434 Rpal_4435     FALSE 0.503 181.000 0.300 NA   NA
 7138001 7138002 Rpal_4436 Rpal_4437 flaF flbT TRUE 0.937 4.000 0.263 NA   NA
 7138002 7138003 Rpal_4437 Rpal_4438 flbT   FALSE 0.388 216.000 0.000 1.000 Y NA
 7138005 7138006 Rpal_4440 Rpal_4441     TRUE 0.579 24.000 0.000 1.000   NA
 7138006 7138007 Rpal_4441 Rpal_4442     TRUE 0.646 -3.000 0.000 1.000   NA
 7138007 7138008 Rpal_4442 Rpal_4443     TRUE 0.991 -3.000 0.438 0.012 Y NA
 7138008 7138009 Rpal_4443 Rpal_4444     TRUE 0.898 6.000 0.143 1.000 N NA
 7138009 7138010 Rpal_4444 Rpal_4445     TRUE 0.727 151.000 0.047 1.000 Y NA
 7138010 7138011 Rpal_4445 Rpal_4446     TRUE 0.983 11.000 0.026 0.001 Y NA
 7138011 7138012 Rpal_4446 Rpal_4447     TRUE 0.861 -3.000 0.005 0.064   NA
 7138012 7138013 Rpal_4447 Rpal_4448     TRUE 0.900 9.000 0.103 1.000   NA
 7138013 7138014 Rpal_4448 Rpal_4449     TRUE 0.982 -3.000 0.111 0.003 Y NA
 7138014 7138015 Rpal_4449 Rpal_4450     FALSE 0.121 142.000 0.000 1.000 N NA
 7138015 7138016 Rpal_4450 Rpal_4451     FALSE 0.123 123.000 0.000 NA   NA
 7138016 7138017 Rpal_4451 Rpal_4452     FALSE 0.134 156.000 0.000 NA   NA
 7138017 7138018 Rpal_4452 Rpal_4453     FALSE 0.066 308.000 0.000 0.001   NA
 7138018 7138019 Rpal_4453 Rpal_4454     TRUE 0.992 9.000 0.923 0.004   NA
 7138019 7138020 Rpal_4454 Rpal_4455     TRUE 0.979 39.000 0.786 1.000 Y NA
 7138021 7138022 Rpal_4456 Rpal_4457     FALSE 0.442 190.000 0.286 NA   NA
 7138023 7138024 Rpal_4458 Rpal_4459     FALSE 0.184 152.000 0.024 NA N NA
 7138024 7138025 Rpal_4459 Rpal_4460     FALSE 0.349 135.000 0.080 1.000 N NA
 7138026 7138027 Rpal_4461 Rpal_4462     TRUE 0.875 44.000 0.063 NA Y NA
 7138031 7138032 Rpal_4466 Rpal_4467     TRUE 0.638 94.000 0.350 NA   NA
 7138033 7138034 Rpal_4468 Rpal_4469     FALSE 0.269 90.000 0.028 NA   NA
 7138034 7138035 Rpal_4469 Rpal_4470     TRUE 0.904 8.000 0.158 NA   NA
 7138036 7138037 Rpal_4471 Rpal_4472     FALSE 0.507 69.000 0.111 NA   NA
 7138037 7138038 Rpal_4472 Rpal_4473     TRUE 0.994 0.000 0.444 0.005 Y NA
 7138039 7138040 Rpal_4474 Rpal_4475     FALSE 0.112 168.000 0.000 1.000 N NA
 7138042 7138043 Rpal_4477 Rpal_4478     TRUE 0.656 97.000 0.451 NA N NA
 7138044 7138045 Rpal_4479 Rpal_4480     FALSE 0.466 -16.000 0.000 NA   NA
 7138045 7138046 Rpal_4480 Rpal_4481     FALSE 0.005 426.000 0.000 1.000   NA
 7138046 7138047 Rpal_4481 Rpal_4482     FALSE 0.027 245.000 0.000 NA   NA
 7138048 7138049 Rpal_4483 Rpal_4484     TRUE 0.888 138.000 0.500 NA Y NA
 7138049 7138050 Rpal_4484 Rpal_4485     TRUE 0.995 3.000 1.000 NA Y NA
 7138054 7138055 Rpal_4489 Rpal_4490     TRUE 0.600 50.000 0.098 1.000 N NA
 7138055 7138056 Rpal_4490 Rpal_4491     TRUE 0.939 0.000 0.255 1.000   NA
 7138056 7138057 Rpal_4491 Rpal_4492     FALSE 0.490 54.000 0.025 1.000   NA
 7138057 7138058 Rpal_4492 Rpal_4493     TRUE 0.788 93.000 0.122 1.000 Y NA
 7138060 7138061 Rpal_4495 Rpal_4496     TRUE 0.975 34.000 0.269 0.009 Y NA
 7138061 7138062 Rpal_4496 Rpal_4497     TRUE 0.852 112.000 0.150 0.052 Y NA
 7138062 7138063 Rpal_4497 Rpal_4498     FALSE 0.026 246.000 0.000 NA   NA
 7138065 7138066 Rpal_4500 Rpal_4501     FALSE 0.206 186.000 0.018 1.000   NA
 7138066 7138067 Rpal_4501 Rpal_4502     TRUE 0.620 58.000 0.117 1.000   NA
 7138067 7138068 Rpal_4502 Rpal_4503     FALSE 0.261 141.000 0.011 1.000   NA
 7138069 7138070 Rpal_4504 Rpal_4505     FALSE 0.375 58.000 0.020 NA   NA
 7138071 7138072 Rpal_4506 Rpal_4507     TRUE 0.929 41.000 0.017 0.012 Y NA
 7138072 7138073 Rpal_4507 Rpal_4508     TRUE 0.959 25.000 0.191 1.000 Y NA
 7138074 7138075 Rpal_4509 Rpal_4510     FALSE 0.382 71.000 0.050 1.000 N NA
 7138075 7138076 Rpal_4510 Rpal_4511     TRUE 0.806 -3.000 0.077 1.000 N NA
 7138078 7138079 Rpal_4513 Rpal_4514     FALSE 0.226 122.000 0.025 1.000 N NA
 7138079 7138080 Rpal_4514 Rpal_4515     FALSE 0.365 62.000 0.030 1.000 N NA
 7138085 7138086 Rpal_4520 Rpal_4521     FALSE 0.131 147.000 0.000 NA   NA
 7138086 7138087 Rpal_4521 Rpal_4522     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7138087 7138088 Rpal_4522 Rpal_4523     TRUE 0.642 5.000 0.000 NA   NA
 7138089 7138090 Rpal_4524 Rpal_4525     FALSE 0.408 213.000 0.000 1.000 Y NA
 7138092 7138093 Rpal_4527 Rpal_4528     FALSE 0.002 524.000 0.000 NA   NA
 7138094 7138095 Rpal_4529 Rpal_4530     FALSE 0.015 277.000 0.000 NA   NA
 7138095 7138096 Rpal_4530 Rpal_4531     FALSE 0.404 30.000 0.000 NA   NA
 7138097 7138098 Rpal_4532 Rpal_4533     FALSE 0.470 -13.000 0.000 NA   NA
 7138098 7138099 Rpal_4533 Rpal_4534     FALSE 0.121 116.000 0.000 NA   NA
 7138099 7138100 Rpal_4534 Rpal_4535     FALSE 0.186 70.000 0.000 NA   NA
 7138100 7138101 Rpal_4535 Rpal_4536     TRUE 0.945 1.000 0.000 NA Y NA
 7138101 7138102 Rpal_4536 Rpal_4537     TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7138102 7138103 Rpal_4537 Rpal_4538     FALSE 0.005 347.000 0.000 1.000 N NA
 7138107 7138108 Rpal_4542 Rpal_4543     TRUE 0.937 0.000 0.294 NA   NA
 7138108 7138109 Rpal_4543 Rpal_4544     FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7138110 7138111 Rpal_4545 Rpal_4546     FALSE 0.403 261.000 0.005 0.001 Y NA
 7138111 7138112 Rpal_4546 Rpal_4547     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7138113 7138114 Rpal_4548 Rpal_4549     FALSE 0.018 268.000 0.000 1.000 N NA
 7138114 7138115 Rpal_4549 Rpal_4550     TRUE 0.880 149.000 0.385 1.000 Y NA
 7138115 7138116 Rpal_4550 Rpal_4551     TRUE 0.995 4.000 0.591 0.037 Y NA
 7138116 7138117 Rpal_4551 Rpal_4552     TRUE 0.987 -3.000 0.545 1.000 Y NA
 7138117 7138118 Rpal_4552 Rpal_4553     TRUE 0.991 -7.000 0.550 0.023 Y NA
 7138119 7138120 Rpal_4554 Rpal_4555     TRUE 0.965 17.000 0.128 1.000 Y NA
 7138120 7138121 Rpal_4555 Rpal_4556     TRUE 0.995 21.000 0.913 0.023 Y NA
 7138121 7138122 Rpal_4556 Rpal_4557     TRUE 0.993 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 7138122 7138123 Rpal_4557 Rpal_4558     TRUE 0.997 0.000 0.913 0.037 Y NA
 7138123 7138124 Rpal_4558 Rpal_4559     TRUE 0.875 151.000 0.409 NA Y NA
 7138125 7138126 Rpal_4560 Rpal_4561     TRUE 0.747 56.000 0.300 NA   NA
 7138128 7138129 Rpal_4563 Rpal_4564     FALSE 0.011 247.000 0.000 NA N NA
 7138129 7138130 Rpal_4564 Rpal_4565     TRUE 0.781 129.000 0.194 NA Y NA
 7138130 7138131 Rpal_4565 Rpal_4566     TRUE 0.992 -3.000 0.549 0.037 Y NA
 7138131 7138132 Rpal_4566 Rpal_4567     TRUE 0.989 -3.000 0.647 1.000 Y NA
 7138132 7138133 Rpal_4567 Rpal_4568     TRUE 0.990 0.000 0.257 0.023 Y NA
 7138133 7138134 Rpal_4568 Rpal_4569     FALSE 0.122 166.000 0.000 NA   NA
 7138134 7138135 Rpal_4569 Rpal_4570     FALSE 0.466 122.000 0.200 NA   NA
 7138135 7138136 Rpal_4570 Rpal_4571     FALSE 0.050 218.000 0.000 NA   NA
 7138136 7138137 Rpal_4571 Rpal_4572     TRUE 0.940 -3.000 0.421 1.000 N NA
 7138137 7138138 Rpal_4572 Rpal_4573     TRUE 0.747 101.000 0.621 1.000 N NA
 7138138 7138139 Rpal_4573 Rpal_4574     TRUE 0.943 106.000 0.589 0.037 Y NA
 7138139 7138140 Rpal_4574 Rpal_4575     TRUE 0.950 58.000 0.615 NA Y NA
 7138140 7138141 Rpal_4575 Rpal_4576     TRUE 0.597 270.000 0.732 NA Y NA
 7138141 7138142 Rpal_4576 Rpal_4577     FALSE 0.001 1181.000 0.000 1.000 N NA
 7138144 7138145 Rpal_4579 Rpal_4580     FALSE 0.124 165.000 0.000 NA   NA
 7138145 7138146 Rpal_4580 Rpal_4581     FALSE 0.002 677.000 0.000 NA   NA
 7138146 7138147 Rpal_4581 Rpal_4582     TRUE 0.959 40.000 0.167 0.012 Y NA
 7138147 7138148 Rpal_4582 Rpal_4583     TRUE 0.964 -3.000 0.000 0.012 Y NA
 7138148 7138149 Rpal_4583 Rpal_4584     TRUE 0.944 -3.000 0.444 NA   NA
 7138149 7138150 Rpal_4584 Rpal_4585     FALSE 0.140 91.000 0.000 NA   NA
 7138150 7138151 Rpal_4585 Rpal_4586     TRUE 0.782 51.000 0.271 1.000   NA
 7138151 7138152 Rpal_4586 Rpal_4587     TRUE 0.551 71.000 0.000 0.012   NA
 7138152 7138153 Rpal_4587 Rpal_4588     TRUE 0.646 -3.000 0.000 1.000   NA
 7138153 7138154 Rpal_4588 Rpal_4589     FALSE 0.381 47.000 0.000 1.000   NA
 7138154 7138155 Rpal_4589 Rpal_4590     TRUE 0.790 -3.000 0.000 0.076 N NA
 7138155 7138156 Rpal_4590 Rpal_4591     FALSE 0.131 100.000 0.000 NA   NA
 7138156 7138157 Rpal_4591 Rpal_4592     FALSE 0.256 53.000 0.000 NA   NA
 7138157 7138158 Rpal_4592 Rpal_4593     TRUE 0.606 11.000 0.000 1.000 N NA
 7138158 7138159 Rpal_4593 Rpal_4594     FALSE 0.204 63.000 0.000 NA   NA
 7138161 7138162 Rpal_4596 Rpal_4597     TRUE 0.904 -6.000 0.077 0.031   NA
 7138162 7138163 Rpal_4597 Rpal_4598     FALSE 0.138 93.000 0.000 NA   NA
 7138165 7138166 Rpal_4600 Rpal_4601     FALSE 0.128 139.000 0.000 NA   NA
 7138167 7138168 Rpal_4602 Rpal_4603     FALSE 0.034 234.000 0.000 NA   NA
 7138168 7138169 Rpal_4603 Rpal_4604     TRUE 0.969 31.000 0.087 0.001 Y NA
 7138170 7138171 Rpal_R0043 Rpal_4605   carB FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 7138171 7138172 Rpal_4605 Rpal_4606 carB greA FALSE 0.252 224.000 0.241 1.000 N NA
 7138172 7138173 Rpal_4606 Rpal_4607 greA   FALSE 0.198 179.000 0.005 1.000   NA
 7138175 7138176 Rpal_4609 Rpal_4610     TRUE 0.847 9.000 0.065 1.000 N NA
 7138177 7138178 Rpal_4611 Rpal_4612     FALSE 0.313 212.000 0.233 NA   NA
 7138178 7138179 Rpal_4612 Rpal_4613     FALSE 0.434 94.000 0.133 NA   NA
 7138179 7138180 Rpal_4613 Rpal_4614     TRUE 0.652 141.000 0.400 NA   NA
 7138180 7138181 Rpal_4614 Rpal_4615     FALSE 0.049 219.000 0.000 NA   NA
 7138181 7138182 Rpal_4615 Rpal_R0044     FALSE 0.033 235.000 0.000 NA   NA
 7138182 7138183 Rpal_R0044 Rpal_4616     FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 7138183 7138184 Rpal_4616 Rpal_4617     FALSE 0.221 224.000 0.200 NA   NA
 7138185 7138186 Rpal_4618 Rpal_4619     FALSE 0.003 548.000 0.000 1.000   NA
 7138186 7138187 Rpal_4619 Rpal_4620     TRUE 0.932 -3.000 0.364 NA   NA
 7138187 7138188 Rpal_4620 Rpal_4621     FALSE 0.455 84.000 0.125 NA   NA
 7138190 7138191 Rpal_4623 Rpal_4624     FALSE 0.333 176.000 0.100 NA   NA
 7138191 7138192 Rpal_4624 Rpal_4625     FALSE 0.133 150.000 0.000 NA   NA
 7138192 7138193 Rpal_4625 Rpal_4626     TRUE 0.979 -3.000 0.314 1.000 Y NA
 7138193 7138194 Rpal_4626 Rpal_4627     TRUE 0.741 -3.000 0.038 1.000 N NA
 7138194 7138195 Rpal_4627 Rpal_4628     FALSE 0.217 139.000 0.015 NA   NA
 7138197 7138198 Rpal_4630 Rpal_4631     FALSE 0.115 120.000 0.000 1.000 N NA
 7138198 7138199 Rpal_4631 Rpal_4632     TRUE 0.816 144.000 0.043 0.037 Y NA
 7138199 7138200 Rpal_4632 Rpal_4633     FALSE 0.489 117.000 0.222 NA   NA
 7138201 7138202 Rpal_4634 Rpal_4635     TRUE 0.997 12.000 0.833 0.000 Y NA
 7138204 7138205 Rpal_4637 Rpal_4638     TRUE 0.600 308.000 0.758 0.037 Y NA
 7138205 7138206 Rpal_4638 Rpal_4639     TRUE 0.976 -3.000 0.258 1.000 Y NA
 7138206 7138207 Rpal_4639 Rpal_4640     FALSE 0.123 101.000 0.000 1.000 N NA
 7138208 7138209 Rpal_4641 Rpal_4642     TRUE 0.948 12.000 0.000 1.000 Y NA
 7138209 7138210 Rpal_4642 Rpal_4643     TRUE 0.954 4.000 0.000 1.000 Y NA
 7138210 7138211 Rpal_4643 Rpal_4644     FALSE 0.321 57.000 0.000 1.000   NA
 7138211 7138212 Rpal_4644 Rpal_4645     TRUE 0.928 12.000 0.222 1.000   NA
 7138214 7138215 Rpal_4647 Rpal_4648     FALSE 0.202 91.000 0.000 1.000   NA
 7138215 7138216 Rpal_4648 Rpal_4649     TRUE 0.886 0.000 0.000 0.040   NA
 7138216 7138217 Rpal_4649 Rpal_4650     FALSE 0.016 275.000 0.000 NA   NA
 7138221 7138222 Rpal_4654 Rpal_4655     TRUE 0.987 -3.000 0.201 0.000 Y NA
 7138222 7138223 Rpal_4655 Rpal_4656   rpsU FALSE 0.265 157.000 0.009 1.000   NA
 7138224 7138225 Rpal_4657 Rpal_4658     FALSE 0.444 150.000 0.147 NA   NA
 7138227 7138228 Rpal_4660 Rpal_4661     TRUE 0.974 14.000 0.306 0.001   NA
 7138228 7138229 Rpal_4661 Rpal_4662     TRUE 0.908 26.000 0.058 0.001   NA
 7138229 7138230 Rpal_4662 Rpal_4663     FALSE 0.135 196.000 0.017 NA   NA
 7138230 7138231 Rpal_4663 Rpal_4664     FALSE 0.013 287.000 0.000 NA   NA
 7138231 7138232 Rpal_4664 Rpal_4665     FALSE 0.222 59.000 0.000 NA   NA
 7138233 7138234 Rpal_4666 Rpal_4667     FALSE 0.270 96.000 0.037 1.000 N NA
 7138234 7138235 Rpal_4667 Rpal_4668     FALSE 0.009 348.000 0.000 1.000   NA
 7138235 7138236 Rpal_4668 Rpal_4669     FALSE 0.008 322.000 0.000 NA   NA
 7138237 7138238 Rpal_4670 Rpal_4671     FALSE 0.270 188.000 0.090 NA   NA
 7138239 7138240 Rpal_4672 Rpal_4673     TRUE 0.948 -3.000 0.487 NA   NA
 7138241 7138242 Rpal_4674 Rpal_4675     TRUE 0.720 -3.000 0.026 NA   NA
 7138242 7138243 Rpal_4675 Rpal_4676     FALSE 0.182 71.000 0.000 NA   NA
 7138243 7138244 Rpal_4676 Rpal_4677   rpmJ FALSE 0.191 98.000 0.000 1.000   NA
 7138245 7138246 Rpal_4678 Rpal_4679     FALSE 0.100 266.000 0.012 0.063   NA
 7138246 7138247 Rpal_4679 Rpal_4680     FALSE 0.265 77.000 0.013 NA   NA
 7138248 7138249 Rpal_4681 Rpal_4682     TRUE 0.704 174.000 0.600 NA   NA
 7138249 7138250 Rpal_4682 Rpal_4683     TRUE 0.973 -25.000 0.600 0.011   NA
 7138250 7138251 Rpal_4683 Rpal_4684     FALSE 0.039 230.000 0.000 NA   NA
 7138252 7138253 Rpal_4685 Rpal_4686     TRUE 0.542 56.000 0.081 NA   NA
 7138254 7138255 Rpal_4687 Rpal_4688     TRUE 0.757 49.000 0.222 1.000   NA
 7138255 7138256 Rpal_4688 Rpal_4689     TRUE 0.626 95.000 0.333 NA   NA
 7138256 7138257 Rpal_4689 Rpal_4690     FALSE 0.027 244.000 0.000 NA   NA
 7138259 7138260 Rpal_4692 Rpal_4693     FALSE 0.130 146.000 0.000 NA   NA
 7138260 7138261 Rpal_4693 Rpal_4694     TRUE 0.897 -13.000 0.309 NA   NA
 7138261 7138262 Rpal_4694 Rpal_4695     TRUE 0.982 11.000 0.919 NA   NA
 7138262 7138263 Rpal_4695 Rpal_4696     TRUE 0.817 -3.000 0.082 NA   NA
 7138264 7138265 Rpal_4697 Rpal_4698     FALSE 0.164 191.000 0.030 NA   NA
 7138266 7138267 Rpal_4699 Rpal_4700     TRUE 0.693 157.000 0.455 NA   NA
 7138267 7138268 Rpal_4700 Rpal_4701     TRUE 0.967 26.000 1.000 NA   NA
 7138270 7138271 Rpal_4703 Rpal_4704     FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 7138272 7138273 Rpal_4705 Rpal_4706     TRUE 0.917 0.000 0.220 NA   NA
 7138274 7138275 Rpal_4707 Rpal_4708     FALSE 0.027 248.000 0.010 NA N NA
 7138279 7138280 Rpal_4712 Rpal_4713     TRUE 0.920 53.000 0.250 1.000 Y NA
 7138282 7138283 Rpal_4715 Rpal_4716     TRUE 0.981 12.000 0.917 NA   NA
 7138283 7138284 Rpal_4716 Rpal_4717     TRUE 0.995 3.000 1.000 NA Y NA
 7138286 7138287 Rpal_4719 Rpal_4720     FALSE 0.456 140.000 0.041 0.063 N NA
 7138289 7138290 Rpal_4722 Rpal_4723     FALSE 0.096 270.000 0.125 1.000   NA
 7138291 7138292 Rpal_4724 Rpal_4725     TRUE 0.762 87.000 0.500 1.000   NA
 7138292 7138293 Rpal_4725 Rpal_4726     FALSE 0.486 145.000 0.208 1.000 N NA
 7138293 7138294 Rpal_4726 Rpal_4727   fixJ TRUE 0.991 -7.000 0.583 0.019 Y NA
 7138294 7138295 Rpal_4727 Rpal_4728 fixJ   TRUE 0.945 86.000 0.455 0.015 Y NA
 7138295 7138296 Rpal_4728 Rpal_4729   fixK TRUE 0.861 199.000 0.417 0.063 Y NA
 7138296 7138297 Rpal_4729 Rpal_4730 fixK   FALSE 0.007 330.000 0.000 1.000 N NA
 7138298 7138299 Rpal_4731 Rpal_4732     TRUE 0.995 11.000 0.437 0.002 Y NA
 7138299 7138300 Rpal_4732 Rpal_4733     TRUE 0.973 -9.000 0.057 0.002 Y NA
 7138300 7138301 Rpal_4733 Rpal_4734     TRUE 0.981 3.000 0.016 0.007 Y NA
 7138301 7138302 Rpal_4734 Rpal_4735     TRUE 0.988 -3.000 0.269 0.003 Y NA
 7138302 7138303 Rpal_4735 Rpal_4736     TRUE 0.991 -3.000 0.428 0.007 Y NA
 7138303 7138304 Rpal_4736 Rpal_4737     TRUE 0.991 -3.000 0.423 0.007 Y NA
 7138304 7138305 Rpal_4737 Rpal_4738     TRUE 0.994 -3.000 0.664 0.007 Y NA
 7138305 7138306 Rpal_4738 Rpal_4739     TRUE 0.984 -3.000 0.184 0.007 Y NA
 7138306 7138307 Rpal_4739 Rpal_4740     TRUE 0.987 -3.000 0.236 0.005 Y NA
 7138307 7138308 Rpal_4740 Rpal_4741     TRUE 0.991 -3.000 0.407 0.005 Y NA
 7138308 7138309 Rpal_4741 Rpal_4742     TRUE 0.995 -3.000 0.691 0.003 Y NA
 7138309 7138310 Rpal_4742 Rpal_4743     TRUE 0.991 -3.000 0.377 0.003 Y NA
 7138311 7138312 Rpal_4744 Rpal_4745     FALSE 0.430 170.000 0.188 1.000 N NA
 7138312 7138313 Rpal_4745 Rpal_4746     FALSE 0.075 272.000 0.125 1.000 N NA
 7138313 7138314 Rpal_4746 Rpal_4747     FALSE 0.069 245.000 0.048 1.000 N NA
 7138314 7138315 Rpal_4747 Rpal_4748     FALSE 0.120 141.000 0.000 1.000 N NA
 7138316 7138317 Rpal_4749 Rpal_4750 rnhA   TRUE 0.861 -3.000 0.104 1.000   NA
 7138317 7138318 Rpal_4750 Rpal_4751   ispH TRUE 0.586 100.000 0.251 1.000   NA
 7138320 7138321 Rpal_4753 Rpal_4754     FALSE 0.003 495.000 0.000 NA   NA
 7138322 7138323 Rpal_4755 Rpal_4756     FALSE 0.005 352.000 0.000 NA   NA
 7138323 7138324 Rpal_4756 Rpal_4757     FALSE 0.063 206.000 0.000 NA   NA
 7138324 7138325 Rpal_4757 Rpal_4758     FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 7138327 7138328 Rpal_4760 Rpal_4761     FALSE 0.087 187.000 0.000 NA   NA
 7138330 7138331 Rpal_4763 Rpal_4764     FALSE 0.167 76.000 0.000 NA   NA
 7138331 7138332 Rpal_4764 Rpal_4765     TRUE 0.686 43.000 0.000 0.034   NA
 7138334 7138335 Rpal_4767 Rpal_4768     TRUE 0.828 0.000 0.054 NA   NA
 7138335 7138336 Rpal_4768 Rpal_4769     FALSE 0.187 133.000 0.000 1.000   NA
 7138336 7138337 Rpal_4769 Rpal_4770     FALSE 0.031 336.000 0.000 0.039   NA
 7138337 7138338 Rpal_4770 Rpal_4771     TRUE 0.906 13.000 0.000 0.003   NA
 7138338 7138339 Rpal_4771 Rpal_4772     FALSE 0.003 469.000 0.000 NA   NA
 7138340 7138341 Rpal_4773 Rpal_4774     FALSE 0.455 38.000 0.006 NA   NA
 7138341 7138342 Rpal_4774 Rpal_4775     FALSE 0.011 296.000 0.000 NA   NA
 7138343 7138344 Rpal_4776 Rpal_4777     FALSE 0.005 447.000 0.000 1.000   NA
 7138344 7138345 Rpal_4777 Rpal_4778     FALSE 0.191 159.000 0.000 1.000   NA
 7138350 7138351 Rpal_4783 Rpal_4784     FALSE 0.277 130.000 0.018 1.000   NA
 7138353 7138354 Rpal_4786 Rpal_4787     TRUE 0.695 84.000 0.400 NA   NA
 7138354 7138355 Rpal_4787 Rpal_4788     TRUE 0.627 203.000 0.000 0.009 Y NA
 7138355 7138356 Rpal_4788 Rpal_4789     FALSE 0.025 245.000 0.000 1.000 N NA
 7138356 7138357 Rpal_4789 Rpal_4790     TRUE 0.761 170.000 0.140 1.000 Y NA
 7138357 7138358 Rpal_4790 Rpal_4791     FALSE 0.002 726.000 0.000 1.000 N NA
 7138358 7138359 Rpal_4791 Rpal_4792     TRUE 0.969 -25.000 0.500 0.011   NA
 7138359 7138360 Rpal_4792 Rpal_4793     FALSE 0.261 173.000 0.024 1.000   NA
 7138360 7138361 Rpal_4793 Rpal_4794     TRUE 0.862 12.000 0.061 1.000   NA
 7138361 7138362 Rpal_4794 Rpal_4795     TRUE 0.563 64.000 0.098 1.000   NA
 7138362 7138363 Rpal_4795 Rpal_4796     TRUE 0.827 146.000 0.412 0.005   NA
 7138363 7138364 Rpal_4796 Rpal_4797     FALSE 0.011 310.000 0.015 NA N NA
 7138364 7138365 Rpal_4797 Rpal_4798     TRUE 0.599 172.000 0.008 NA Y NA
 7138365 7138366 Rpal_4798 Rpal_4799     FALSE 0.068 202.000 0.000 NA   NA
 7138367 7138368 Rpal_4800 Rpal_4801     FALSE 0.155 191.000 0.027 1.000 N NA
 7138368 7138369 Rpal_4801 Rpal_4802     FALSE 0.125 149.000 0.000 1.000 N NA
 7138370 7138371 Rpal_4803 Rpal_4804     FALSE 0.202 102.000 0.011 1.000 N NA
 7138371 7138372 Rpal_4804 Rpal_4805     TRUE 0.559 42.000 0.023 1.000   NA
 7138372 7138373 Rpal_4805 Rpal_4806     FALSE 0.246 171.000 0.015 1.000   NA
 7138373 7138374 Rpal_4806 Rpal_4807     FALSE 0.058 212.000 0.000 NA   NA
 7138374 7138375 Rpal_4807 Rpal_4808     FALSE 0.030 240.000 0.000 NA   NA
 7138375 7138376 Rpal_4808 Rpal_4809     FALSE 0.314 125.000 0.062 NA   NA
 7138377 7138378 Rpal_4810 Rpal_4811     FALSE 0.340 137.000 0.071 NA   NA
 7138378 7138379 Rpal_4811 Rpal_4812     FALSE 0.237 91.000 0.016 NA   NA
 7138379 7138380 Rpal_4812 Rpal_4813     FALSE 0.052 214.000 0.000 1.000 N NA
 7138382 7138383 Rpal_4815 Rpal_4816     FALSE 0.015 281.000 0.000 NA   NA
 7138383 7138384 Rpal_4816 Rpal_4817     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7138387 7138388 Rpal_4820 Rpal_4821     FALSE 0.005 298.000 0.000 NA N NA
 7138388 7138389 Rpal_4821 Rpal_4822     FALSE 0.459 25.000 0.000 NA   NA
 7138390 7138391 Rpal_4823 Rpal_4824     FALSE 0.297 60.000 0.004 NA   NA
 7138391 7138392 Rpal_4824 Rpal_4825     FALSE 0.140 91.000 0.000 NA   NA
 7138392 7138393 Rpal_4825 Rpal_4826     TRUE 0.968 1.000 0.519 NA   NA
 7138393 7138394 Rpal_4826 Rpal_4827     FALSE 0.004 411.000 0.000 NA   NA
 7138394 7138395 Rpal_4827 Rpal_4828     TRUE 0.983 12.000 1.000 NA   NA
 7138396 7138397 Rpal_4829 Rpal_4830     FALSE 0.003 428.000 0.000 NA   NA
 7138398 7138399 Rpal_4831 Rpal_4832     FALSE 0.003 484.000 0.000 NA   NA
 7138399 7138400 Rpal_4832 Rpal_4833     FALSE 0.413 208.000 0.333 NA   NA
 7138401 7138402 Rpal_4834 Rpal_4835     FALSE 0.379 149.000 0.090 NA   NA
 7138402 7138403 Rpal_4835 Rpal_4836     TRUE 0.994 9.000 0.433 0.034 Y NA
 7138405 7138406 Rpal_4838 Rpal_4839     TRUE 0.797 128.000 0.184 1.000 Y NA
 7138406 7138407 Rpal_4839 Rpal_4840     TRUE 0.990 22.000 0.496 0.013 Y NA
 7138407 7138408 Rpal_4840 Rpal_4841     FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 7138409 7138410 Rpal_4842 Rpal_4843     TRUE 0.868 -3.000 0.170 NA   NA
 7138410 7138411 Rpal_4843 Rpal_4844     TRUE 0.837 -3.000 0.107 NA   NA
 7138411 7138412 Rpal_4844 Rpal_4845     FALSE 0.060 233.000 0.010 NA   NA
 7138412 7138413 Rpal_4845 Rpal_4846     FALSE 0.465 169.000 0.209 NA   NA
 7138415 7138416 Rpal_4848 Rpal_4849     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7138416 7138417 Rpal_4849 Rpal_4850     FALSE 0.193 97.000 0.000 1.000   NA
 7138418 7138419 Rpal_4851 Rpal_4852     FALSE 0.515 279.000 0.592 1.000 Y NA
 7138419 7138420 Rpal_4852 Rpal_4853     TRUE 0.989 -3.000 0.392 0.063 Y NA
 7138422 7138423 Rpal_4855 Rpal_4856 mutL   FALSE 0.067 235.000 0.002 1.000   NA
 7138423 7138424 Rpal_4856 Rpal_4857     FALSE 0.280 151.000 0.014 1.000   NA
 7138424 7138425 Rpal_4857 Rpal_4858     TRUE 0.982 -3.000 0.598 0.003   NA
 7138425 7138426 Rpal_4858 Rpal_4859     FALSE 0.329 171.000 0.083 NA   NA
 7138426 7138427 Rpal_4859 Rpal_4860     TRUE 0.630 81.000 0.294 NA   NA
 7138427 7138428 Rpal_4860 Rpal_4861   ileS FALSE 0.286 159.000 0.045 1.000 N NA
 7138428 7138429 Rpal_4861 Rpal_4862 ileS   FALSE 0.181 183.000 0.003 1.000   NA
 7138429 7138430 Rpal_4862 Rpal_4863     TRUE 0.731 -3.000 0.008 1.000   NA
 7138430 7138431 Rpal_4863 Rpal_4864     FALSE 0.185 123.000 0.008 1.000 N NA
 7138431 7138432 Rpal_4864 Rpal_4865     FALSE 0.420 105.000 0.137 NA   NA
 7138433 7138434 Rpal_4866 Rpal_4867     TRUE 0.968 10.000 0.550 NA   NA
 7138434 7138435 Rpal_4867 Rpal_4868     FALSE 0.128 142.000 0.000 NA   NA
 7138435 7138436 Rpal_4868 Rpal_4869     FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7138436 7138437 Rpal_4869 Rpal_4870     FALSE 0.024 249.000 0.000 NA   NA
 7138437 7138438 Rpal_4870 Rpal_4871     FALSE 0.132 148.000 0.000 NA   NA
 7138439 7138440 Rpal_4872 Rpal_4873     TRUE 0.858 17.000 0.098 1.000   NA
 7138440 7138441 Rpal_4873 Rpal_4874     FALSE 0.098 229.000 0.043 1.000 N NA
 7138443 7138444 Rpal_4876 Rpal_4877     FALSE 0.019 265.000 0.000 NA   NA
 7138444 7138445 Rpal_4877 Rpal_4878     TRUE 0.756 25.000 0.077 NA   NA
 7138446 7138447 Rpal_4879 Rpal_4880     FALSE 0.015 279.000 0.000 NA   NA
 7138447 7138448 Rpal_4880 Rpal_4881     FALSE 0.240 56.000 0.000 NA   NA
 7138448 7138449 Rpal_4881 Rpal_4882     FALSE 0.361 82.000 0.089 NA N NA
 7138449 7138450 Rpal_4882 Rpal_4883     TRUE 0.637 260.000 0.750 NA Y NA
 7138450 7138451 Rpal_4883 Rpal_4884     FALSE 0.343 414.000 0.708 0.022 Y NA
 7138451 7138452 Rpal_4884 Rpal_4885     TRUE 0.991 -3.000 0.746 1.000 Y NA
 7138452 7138453 Rpal_4885 Rpal_4886     TRUE 0.994 -3.000 0.687 0.036 Y NA
 7138453 7138454 Rpal_4886 Rpal_4887     FALSE 0.005 372.000 0.000 NA   NA
 7138454 7138455 Rpal_4887 Rpal_4888     FALSE 0.027 244.000 0.000 NA   NA
 7138456 7138457 Rpal_4889 Rpal_4890     TRUE 0.819 73.000 0.640 NA   NA
 7138457 7138458 Rpal_4890 Rpal_4891     TRUE 0.981 8.000 0.854 NA   NA
 7138458 7138459 Rpal_4891 Rpal_4892     TRUE 0.997 0.000 0.922 0.036 Y NA
 7138459 7138460 Rpal_4892 Rpal_4893     TRUE 0.997 0.000 0.847 0.036 Y NA
 7138460 7138461 Rpal_4893 Rpal_4894     TRUE 0.997 13.000 0.865 0.001 Y NA
 7138461 7138462 Rpal_4894 Rpal_4895   glpD TRUE 0.806 -3.000 0.077 1.000 N NA
 7138462 7138463 Rpal_4895 Rpal_4896 glpD   FALSE 0.238 196.000 0.089 1.000 N NA
 7138465 7138466 Rpal_4898 Rpal_4899     FALSE 0.002 521.000 0.000 NA   NA
 7138466 7138467 Rpal_4899 Rpal_4900     TRUE 0.969 18.000 0.727 1.000   NA
 7138467 7138468 Rpal_4900 Rpal_4901     TRUE 0.966 18.000 0.818 NA N NA
 7138468 7138469 Rpal_4901 Rpal_4902     TRUE 0.960 22.000 0.818 NA N NA
 7138469 7138470 Rpal_4902 Rpal_4903     FALSE 0.258 120.000 0.038 NA   NA
 7138470 7138471 Rpal_4903 Rpal_4904     FALSE 0.244 107.000 0.029 NA   NA
 7138475 7138476 Rpal_4908 Rpal_4909     FALSE 0.005 347.000 0.000 1.000 N NA
 7138476 7138477 Rpal_4909 Rpal_4910     FALSE 0.100 179.000 0.000 NA   NA
 7138478 7138479 Rpal_4911 Rpal_4912     TRUE 0.668 110.000 0.385 1.000   NA
 7138479 7138480 Rpal_4912 Rpal_4913     FALSE 0.355 119.000 0.140 NA N NA
 7138481 7138482 Rpal_4914 Rpal_4915     FALSE 0.399 44.000 0.000 1.000   NA
 7138482 7138483 Rpal_4915 Rpal_4916     FALSE 0.123 112.000 0.000 NA   NA
 7138483 7138484 Rpal_4916 Rpal_4917     TRUE 0.887 5.000 0.106 NA   NA
 7138484 7138485 Rpal_4917 Rpal_4918     FALSE 0.089 186.000 0.000 NA   NA
 7138485 7138486 Rpal_4918 Rpal_R0045     FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 7138486 7138487 Rpal_R0045 Rpal_R0046     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7138487 7138488 Rpal_R0046 Rpal_R0047     FALSE 0.004 412.000 0.000 NA   NA
 7138488 7138489 Rpal_R0047 Rpal_R0048     FALSE 0.372 34.000 0.000 NA   NA
 7138489 7138490 Rpal_R0048 Rpal_R0049     FALSE 0.050 218.000 0.000 NA   NA
 7138491 7138492 Rpal_4919 Rpal_4920     FALSE 0.516 147.000 0.188 1.000   NA
 7138495 7138496 Rpal_4923 Rpal_4924     FALSE 0.046 222.000 0.000 NA   NA
 7138496 7138497 Rpal_4924 Rpal_4925   metX TRUE 0.968 3.000 0.509 NA   NA
 7138498 7138499 Rpal_4926 Rpal_4927     TRUE 0.901 43.000 0.084 1.000 Y NA
 7138499 7138500 Rpal_4927 Rpal_4928     TRUE 0.970 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 7138500 7138501 Rpal_4928 Rpal_4929     FALSE 0.003 453.000 0.000 NA   NA
 7138501 7138502 Rpal_4929 Rpal_4930     FALSE 0.460 -46.000 0.000 NA   NA
 7138506 7138507 Rpal_4934 Rpal_4935     FALSE 0.016 304.000 0.000 1.000   NA
 7138507 7138508 Rpal_4935 Rpal_4936     FALSE 0.012 294.000 0.000 NA   NA
 7138509 7138510 Rpal_4937 Rpal_4938     FALSE 0.159 79.000 0.000 NA   NA
 7138510 7138511 Rpal_4938 Rpal_4939     TRUE 0.963 -3.000 0.667 NA   NA
 7138511 7138512 Rpal_4939 Rpal_4940     TRUE 0.731 -3.000 0.031 NA   NA
 7138513 7138514 Rpal_4941 Rpal_4942     FALSE 0.091 209.000 0.000 1.000   NA
 7138514 7138515 Rpal_4942 Rpal_4943     FALSE 0.474 -10.000 0.000 NA   NA
 7138515 7138516 Rpal_4943 Rpal_4944     TRUE 0.839 -3.000 0.111 NA   NA
 7138517 7138518 Rpal_4945 Rpal_4946     TRUE 0.864 2.000 0.077 NA   NA
 7138518 7138519 Rpal_4946 Rpal_R0050     FALSE 0.148 86.000 0.000 NA   NA
 7138523 7138524 Rpal_4950 Rpal_4951     TRUE 0.642 24.000 0.048 NA N NA
 7138524 7138525 Rpal_4951 Rpal_4952     FALSE 0.275 25.000 0.000 NA N NA
 7138525 7138526 Rpal_4952 Rpal_4953     TRUE 0.930 40.000 0.800 NA   NA
 7138526 7138527 Rpal_4953 Rpal_4954     TRUE 0.831 28.000 0.211 NA   NA
 7138527 7138528 Rpal_4954 Rpal_4955     TRUE 0.709 40.000 0.143 NA   NA
 7138528 7138529 Rpal_4955 Rpal_4956     FALSE 0.239 212.000 0.143 NA   NA
 7138529 7138530 Rpal_4956 Rpal_4957     TRUE 0.935 -16.000 0.250 0.050   NA
 7138530 7138531 Rpal_4957 Rpal_4958     TRUE 0.817 70.000 0.518 1.000   NA
 7138531 7138532 Rpal_4958 Rpal_4959     FALSE 0.433 143.000 0.147 NA   NA
 7138532 7138533 Rpal_4959 Rpal_4960     TRUE 0.728 39.000 0.156 NA   NA
 7138534 7138535 Rpal_4961 Rpal_4962     TRUE 0.990 14.000 0.926 0.008   NA
 7138535 7138536 Rpal_4962 Rpal_4963     FALSE 0.397 172.000 0.148 NA   NA
 7138537 7138538 Rpal_4964 Rpal_4965     TRUE 0.934 29.000 0.111 NA Y NA
 7138539 7138540 Rpal_4966 Rpal_4967     TRUE 0.749 39.000 0.190 NA   NA
 7138540 7138541 Rpal_4967 Rpal_4968     TRUE 0.595 77.000 0.238 NA   NA
 7138542 7138543 Rpal_4969 Rpal_4970     FALSE 0.135 232.000 0.095 NA   NA
 7138543 7138544 Rpal_4970 Rpal_4971     FALSE 0.070 200.000 0.000 NA   NA
 7138544 7138545 Rpal_4971 Rpal_4972     TRUE 0.909 -3.000 0.270 NA   NA
 7138545 7138546 Rpal_4972 Rpal_4973     TRUE 0.969 1.000 0.567 1.000 N NA
 7138546 7138547 Rpal_4973 Rpal_4974     FALSE 0.204 196.000 0.000 0.078 N NA
 7138547 7138548 Rpal_4974 Rpal_4975     TRUE 0.827 -37.000 0.000 0.011   NA
 7138548 7138549 Rpal_4975 Rpal_4976     FALSE 0.422 170.000 0.000 0.011   NA
 7138549 7138550 Rpal_4976 Rpal_4977     TRUE 0.827 -37.000 0.000 0.011   NA
 7138550 7138551 Rpal_4977 Rpal_4978     FALSE 0.195 177.000 0.002 1.000   NA
 7138552 7138553 Rpal_4979 Rpal_4980     TRUE 0.611 143.000 0.333 NA   NA
 7138553 7138554 Rpal_4980 Rpal_4981     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 7138554 7138555 Rpal_4981 Rpal_4982     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7138555 7138556 Rpal_4982 Rpal_4983     FALSE 0.001 1109.000 0.000 NA   NA
 7138556 7138557 Rpal_4983 Rpal_4984     FALSE 0.018 275.000 0.012 NA N NA
 7138557 7138558 Rpal_4984 Rpal_4985     FALSE 0.208 116.000 0.016 NA   NA
 7138558 7138559 Rpal_4985 Rpal_4986     TRUE 0.587 136.000 0.307 NA   NA
 7138559 7138560 Rpal_4986 Rpal_4987     FALSE 0.256 181.000 0.061 NA   NA
 7138560 7138561 Rpal_4987 Rpal_4988     TRUE 0.604 59.000 0.154 NA   NA
 7138561 7138562 Rpal_4988 Rpal_4989     FALSE 0.073 198.000 0.000 NA   NA
 7138563 7138564 Rpal_4990 Rpal_4991     FALSE 0.215 151.000 0.013 1.000 N NA
 7138566 7138567 Rpal_4993 Rpal_4994     FALSE 0.194 134.000 0.009 1.000 N NA
 7138567 7138568 Rpal_4994 Rpal_4995     FALSE 0.075 233.000 0.028 NA   NA
 7138568 7138569 Rpal_4995 Rpal_4996     FALSE 0.188 179.000 0.022 NA   NA
 7138569 7138570 Rpal_4996 Rpal_4997     FALSE 0.144 181.000 0.000 1.000   NA
 7138570 7138571 Rpal_4997 Rpal_4998     FALSE 0.132 186.000 0.000 1.000   NA
 7138571 7138572 Rpal_4998 Rpal_4999     FALSE 0.336 100.000 0.000 0.062 N NA
 7138572 7138573 Rpal_4999 Rpal_5000     FALSE 0.132 148.000 0.000 NA   NA
 7138573 7138574 Rpal_5000 Rpal_5001     TRUE 0.960 9.000 0.433 NA   NA
 7138574 7138575 Rpal_5001 Rpal_5002     TRUE 0.739 147.000 0.588 NA   NA
 7138577 7138578 Rpal_5004 Rpal_5005     TRUE 0.970 10.000 0.000 0.062 Y NA
 7138579 7138580 Rpal_5006 Rpal_5007     FALSE 0.187 136.000 0.000 1.000   NA
 7138580 7138581 Rpal_5007 Rpal_5008     FALSE 0.029 242.000 0.000 NA   NA
 7138584 7138585 Rpal_5011 Rpal_5012     TRUE 0.590 136.000 0.308 NA   NA
 7138587 7138588 Rpal_5014 Rpal_5015     FALSE 0.024 276.000 0.000 1.000   NA
 7138588 7138589 Rpal_5015 Rpal_5016     FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 7138589 7138590 Rpal_5016 Rpal_R0051     FALSE 0.004 378.000 0.000 NA   NA
 7138590 7138591 Rpal_R0051 Rpal_5017     FALSE 0.129 136.000 0.000 NA   NA
 7138591 7138592 Rpal_5017 Rpal_5018     TRUE 0.794 -10.000 0.102 NA   NA
 7138592 7138593 Rpal_5018 Rpal_5019     FALSE 0.204 97.000 0.008 NA   NA
 7138593 7138594 Rpal_5019 Rpal_5020     FALSE 0.002 579.000 0.000 NA   NA
 7138594 7138595 Rpal_5020 Rpal_5021     TRUE 0.883 59.000 0.768 NA   NA
 7138595 7138596 Rpal_5021 Rpal_5022   hisD TRUE 0.863 -3.000 0.157 NA   NA
 7138596 7138597 Rpal_5022 Rpal_5023 hisD   FALSE 0.370 124.000 0.096 NA   NA
 7138597 7138598 Rpal_5023 Rpal_5024     TRUE 0.835 20.000 0.138 NA   NA
 7138598 7138599 Rpal_5024 Rpal_5025     FALSE 0.198 160.000 0.007 NA   NA
 7138601 7138602 Rpal_5027 Rpal_5028     TRUE 0.778 32.000 0.167 NA   NA
 7138603 7138604 Rpal_5029 Rpal_R0052     FALSE 0.091 185.000 0.000 NA   NA
 7138604 7138605 Rpal_R0052 Rpal_5030     FALSE 0.066 204.000 0.000 NA   NA
 7138605 7138606 Rpal_5030 Rpal_5031     FALSE 0.125 125.000 0.000 NA   NA
 7138607 7138608 Rpal_5032 Rpal_5033     TRUE 0.799 27.000 0.150 1.000 N NA
 7138608 7138609 Rpal_5033 Rpal_5034     TRUE 0.587 53.000 0.100 1.000 N NA
 7138609 7138610 Rpal_5034 Rpal_5035     TRUE 0.988 12.000 0.500 NA Y NA
 7138610 7138611 Rpal_5035 Rpal_5036     TRUE 0.892 34.000 0.500 NA N NA
 7138612 7138613 Rpal_5037 Rpal_5038     TRUE 0.717 44.000 0.043 0.061 N NA
 7138613 7138614 Rpal_5038 Rpal_5039     TRUE 0.808 0.000 0.043 1.000 N NA
 7138614 7138615 Rpal_5039 Rpal_5040     TRUE 0.900 41.000 0.600 1.000 N NA
 7138619 7138620 Rpal_5044 Rpal_5045     FALSE 0.140 178.000 0.024 NA N NA
 7138621 7138622 Rpal_5046 Rpal_5047     TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7138622 7138623 Rpal_5047 Rpal_5048     FALSE 0.454 24.000 0.000 1.000 N NA
 7138623 7138624 Rpal_5048 Rpal_5049     FALSE 0.248 83.000 0.013 NA   NA
 7138626 7138627 Rpal_5051 Rpal_5052     FALSE 0.038 231.000 0.000 NA   NA
 7138627 7138628 Rpal_5052 Rpal_5053     FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 7138628 7138629 Rpal_5053 Rpal_5054     FALSE 0.125 109.000 0.000 NA   NA
 7138630 7138631 Rpal_5055 Rpal_5056     TRUE 0.932 -16.000 0.418 1.000   NA
 7138631 7138632 Rpal_5056 Rpal_5057     TRUE 0.983 -13.000 0.923 0.035   NA
 7138632 7138633 Rpal_5057 Rpal_5058     TRUE 0.684 82.000 0.318 1.000   NA
 7138634 7138635 Rpal_5059 Rpal_5060     FALSE 0.177 120.000 0.000 1.000   NA
 7138636 7138637 Rpal_5061 Rpal_5062     TRUE 0.733 31.000 0.098 NA   NA
 7138637 7138638 Rpal_5062 Rpal_5063     FALSE 0.331 228.000 0.000 1.000 Y NA
 7138639 7138640 Rpal_5064 Rpal_5065     TRUE 0.659 16.000 0.000 1.000   NA
 7138641 7138642 Rpal_5066 Rpal_5067     TRUE 0.955 22.000 0.667 NA   NA
 7138645 7138646 Rpal_5070 Rpal_5071     TRUE 0.960 13.000 0.037 1.000 Y NA
 7138647 7138648 Rpal_5072 Rpal_5073     TRUE 0.895 15.000 0.058 0.061 N NA
 7138650 7138651 Rpal_5075 Rpal_5076     TRUE 0.868 -13.000 0.200 1.000   NA
 7138651 7138652 Rpal_5076 Rpal_5077     TRUE 0.993 -7.000 0.769 0.061 Y NA
 7138653 7138654 Rpal_5078 Rpal_5079     TRUE 0.580 35.000 0.011 1.000   NA
 7138655 7138656 Rpal_5080 Rpal_5081     FALSE 0.474 74.000 0.103 NA   NA
 7138656 7138657 Rpal_5081 Rpal_5082     FALSE 0.103 177.000 0.000 NA   NA
 7138658 7138659 Rpal_5083 Rpal_5084     TRUE 0.982 34.000 0.461 0.050 Y NA
 7138659 7138660 Rpal_5084 Rpal_5085     TRUE 0.993 13.000 0.491 0.050 Y NA
 7138660 7138661 Rpal_5085 Rpal_5086     TRUE 0.985 25.000 0.330 0.010 Y NA
 7138661 7138662 Rpal_5086 Rpal_5087   nifW FALSE 0.046 333.000 0.189 1.000   NA
 7138662 7138663 Rpal_5087 Rpal_5088 nifW   TRUE 0.886 29.000 0.300 1.000   NA
 7138663 7138664 Rpal_5088 Rpal_5089     TRUE 0.969 -7.000 0.250 1.000 Y NA
 7138664 7138665 Rpal_5089 Rpal_5090     TRUE 0.966 -3.000 0.716 1.000 N NA
 7138665 7138666 Rpal_5090 Rpal_5091     TRUE 0.830 28.000 0.210 NA   NA
 7138666 7138667 Rpal_5091 Rpal_5092     FALSE 0.056 282.000 0.094 NA   NA
 7138667 7138668 Rpal_5092 Rpal_5093     TRUE 0.926 18.000 0.307 1.000   NA
 7138668 7138669 Rpal_5093 Rpal_5094     TRUE 0.684 61.000 0.253 NA   NA
 7138669 7138670 Rpal_5094 Rpal_5095     TRUE 0.944 19.000 0.486 NA   NA
 7138670 7138671 Rpal_5095 Rpal_5096     TRUE 0.945 2.000 0.309 NA   NA
 7138671 7138672 Rpal_5096 Rpal_5097     TRUE 0.941 56.000 0.663 0.004   NA
 7138672 7138673 Rpal_5097 Rpal_5098     TRUE 0.995 11.000 0.475 0.001 Y NA
 7138673 7138674 Rpal_5098 Rpal_5099     TRUE 0.978 40.000 0.380 0.004 Y NA
 7138674 7138675 Rpal_5099 Rpal_5100     TRUE 0.973 89.000 0.902 0.004 Y NA
 7138675 7138676 Rpal_5100 Rpal_5101   nifH TRUE 0.626 72.000 0.033 0.004 N NA
 7138676 7138677 Rpal_5101 Rpal_5102 nifH   FALSE 0.002 577.000 0.000 NA   NA
 7138677 7138678 Rpal_5102 Rpal_5103     TRUE 0.851 16.000 0.120 NA   NA
 7138678 7138679 Rpal_5103 Rpal_5104     TRUE 0.894 3.000 0.127 NA   NA
 7138679 7138680 Rpal_5104 Rpal_5105     TRUE 0.868 38.000 0.089 0.004   NA
 7138680 7138681 Rpal_5105 Rpal_5106     TRUE 0.974 0.000 0.286 0.004   NA
 7138681 7138682 Rpal_5106 Rpal_5107     TRUE 0.887 -3.000 0.171 1.000   NA
 7138682 7138683 Rpal_5107 Rpal_5108     TRUE 0.963 -10.000 0.385 0.007   NA
 7138683 7138684 Rpal_5108 Rpal_5109     TRUE 0.930 4.000 0.233 NA   NA
 7138684 7138685 Rpal_5109 Rpal_5110     TRUE 0.769 11.000 0.020 NA   NA
 7138685 7138686 Rpal_5110 Rpal_5111     TRUE 0.737 24.000 0.061 NA   NA
 7138686 7138687 Rpal_5111 Rpal_5112     FALSE 0.373 159.000 0.087 NA   NA
 7138687 7138688 Rpal_5112 Rpal_5113     FALSE 0.017 273.000 0.000 NA   NA
 7138688 7138689 Rpal_5113 Rpal_5114     FALSE 0.008 313.000 0.000 1.000 N NA
 7138691 7138692 Rpal_5116 Rpal_5117     TRUE 0.969 38.000 0.500 1.000 Y NA
 7138694 7138695 Rpal_5119 Rpal_5120     FALSE 0.087 385.000 0.000 0.009 Y NA
 7138695 7138696 Rpal_5120 Rpal_5121     FALSE 0.063 206.000 0.000 NA   NA
 7138696 7138697 Rpal_5121 Rpal_5122     FALSE 0.011 297.000 0.000 NA   NA
 7138697 7138698 Rpal_5122 Rpal_5123     TRUE 0.873 59.000 0.135 1.000 Y NA
 7138698 7138699 Rpal_5123 Rpal_5124     TRUE 0.957 62.000 0.692 1.000 Y NA
 7138699 7138700 Rpal_5124 Rpal_5125     TRUE 0.617 35.000 0.051 1.000 N NA
 7138700 7138701 Rpal_5125 Rpal_5126     TRUE 0.853 38.000 0.120 0.008 N NA
 7138703 7138704 Rpal_5128 Rpal_5129     TRUE 0.660 81.000 0.333 1.000 N NA
 7138704 7138705 Rpal_5129 Rpal_5130     TRUE 0.963 34.000 0.750 0.035 N NA
 7138705 7138706 Rpal_5130 Rpal_5131     TRUE 0.941 -3.000 0.429 1.000 N NA
 7138707 7138708 Rpal_5132 Rpal_5133     TRUE 0.997 0.000 0.750 0.001 Y NA
 7138708 7138709 Rpal_5133 Rpal_5134     FALSE 0.381 33.000 0.000 NA   NA
 7138709 7138710 Rpal_5134 Rpal_5135     TRUE 0.541 17.000 0.000 NA   NA
 7138710 7138711 Rpal_5135 Rpal_5136     FALSE 0.155 82.000 0.000 NA   NA
 7138711 7138712 Rpal_5136 Rpal_5137     TRUE 0.867 31.000 0.000 NA Y NA
 7138712 7138713 Rpal_5137 Rpal_5138     TRUE 0.601 47.000 0.130 NA N NA
 7138713 7138714 Rpal_5138 Rpal_5139     FALSE 0.366 33.000 0.000 1.000 N NA
 7138714 7138715 Rpal_5139 Rpal_5140     FALSE 0.234 77.000 0.000 1.000   NA
 7138716 7138717 Rpal_R0061 Rpal_R0053     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7138717 7138718 Rpal_R0053 Rpal_R0054     FALSE 0.004 412.000 0.000 NA   NA
 7138718 7138719 Rpal_R0054 Rpal_R0055     FALSE 0.372 34.000 0.000 NA   NA
 7138719 7138720 Rpal_R0055 Rpal_R0056     FALSE 0.050 218.000 0.000 NA   NA
 7138720 7138721 Rpal_R0056 Rpal_R0057     FALSE 0.002 868.000 0.000 NA   NA
 7138721 7138722 Rpal_R0057 Rpal_5141     FALSE 0.061 209.000 0.000 NA   NA
 7138722 7138723 Rpal_5141 Rpal_5142     TRUE 0.844 157.000 0.021 0.001 Y NA
 7138723 7138724 Rpal_5142 Rpal_5143     TRUE 0.956 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 7138724 7138725 Rpal_5143 Rpal_5144     FALSE 0.202 182.000 0.037 1.000 N NA
 7138725 7138726 Rpal_5144 Rpal_5145     FALSE 0.123 101.000 0.000 1.000 N NA
 7138727 7138728 Rpal_5146 Rpal_5147     FALSE 0.009 305.000 0.000 1.000 N NA
 7138728 7138729 Rpal_5147 Rpal_5148     TRUE 0.845 111.000 0.125 0.050 Y NA
 7138729 7138730 Rpal_5148 Rpal_5149     TRUE 0.936 109.000 0.525 0.050 Y NA
 7138730 7138731 Rpal_5149 Rpal_5150     TRUE 0.659 185.000 0.068 1.000 Y NA
 7138732 7138733 Rpal_5151 Rpal_5152     FALSE 0.106 293.000 0.045 0.001 N NA
 7138733 7138734 Rpal_5152 Rpal_5153     TRUE 0.781 -3.000 0.060 1.000 N NA
 7138734 7138735 Rpal_5153 Rpal_5154     TRUE 0.593 57.000 0.085 1.000   NA
 7138735 7138736 Rpal_5154 Rpal_5155     FALSE 0.141 227.000 0.081 NA   NA
 7138736 7138737 Rpal_5155 Rpal_5156     FALSE 0.233 290.000 0.681 NA   NA
 7138738 7138739 Rpal_5157 Rpal_5158     FALSE 0.166 171.000 0.000 1.000   NA
 7138739 7138740 Rpal_5158 Rpal_5159     TRUE 0.684 105.000 0.400 1.000   NA
 7138740 7138741 Rpal_5159 Rpal_5160     FALSE 0.403 159.000 0.167 NA N NA
 7138741 7138742 Rpal_5160 Rpal_5161     TRUE 0.977 0.000 0.857 NA N NA
 7138742 7138743 Rpal_5161 Rpal_5162     FALSE 0.387 42.000 0.022 NA N NA
 7138743 7138744 Rpal_5162 Rpal_5163     FALSE 0.275 82.000 0.022 NA   NA
 7138747 7138748 Rpal_5166 Rpal_5167 lysK   TRUE 0.621 34.000 0.050 1.000 N NA
 7138750 7138751 Rpal_5169 Rpal_5170     FALSE 0.514 176.000 0.286 NA   NA
 7138752 7138753 Rpal_5171 Rpal_5172     FALSE 0.111 173.000 0.000 NA   NA
 7138753 7138754 Rpal_5172 Rpal_5173     FALSE 0.133 149.000 0.000 NA   NA
 7138756 7138757 Rpal_5175 Rpal_5176     TRUE 0.890 22.000 0.227 1.000   NA
 7138757 7138758 Rpal_5176 Rpal_5177     FALSE 0.450 127.000 0.175 NA   NA
 7138758 7138759 Rpal_5177 Rpal_5178     FALSE 0.382 208.000 0.300 NA   NA
 7138759 7138760 Rpal_5178 Rpal_5179     TRUE 0.962 3.000 0.382 1.000   NA
 7138760 7138761 Rpal_5179 Rpal_5180     TRUE 0.901 0.000 0.176 1.000 N NA
 7138761 7138762 Rpal_5180 Rpal_5181     FALSE 0.119 249.000 0.117 1.000   NA
 7138762 7138763 Rpal_5181 Rpal_5182     TRUE 0.608 106.000 0.294 1.000   NA
 7138763 7138764 Rpal_5182 Rpal_5183     TRUE 0.991 0.000 0.750 0.001   NA
 7138764 7138765 Rpal_5183 Rpal_5184     TRUE 0.984 2.000 0.588 0.050   NA
 7138765 7138766 Rpal_5184 Rpal_5185     FALSE 0.078 193.000 0.000 NA   NA
 7138766 7138767 Rpal_5185 Rpal_5186     FALSE 0.127 106.000 0.000 NA   NA
 7138767 7138768 Rpal_5186 Rpal_5187     FALSE 0.233 102.000 0.021 NA   NA
 7138768 7138769 Rpal_5187 Rpal_5188     FALSE 0.519 53.000 0.059 NA   NA
 7138769 7138770 Rpal_5188 Rpal_5189     FALSE 0.379 146.000 0.093 NA   NA
 7138770 7138771 Rpal_5189 Rpal_5190     FALSE 0.282 157.000 0.040 NA   NA
 7138771 7138772 Rpal_5190 Rpal_5191     FALSE 0.454 190.000 0.300 NA   NA
 7138772 7138773 Rpal_5191 Rpal_5192     TRUE 0.763 126.000 0.667 NA   NA
 7138776 7138777 Rpal_5195 Rpal_5196     FALSE 0.203 148.000 0.008 NA   NA
 7138777 7138778 Rpal_5196 Rpal_5197     TRUE 0.990 -3.000 0.308 0.001 Y NA
 7138778 7138779 Rpal_5197 Rpal_5198     TRUE 0.818 246.000 0.660 0.001 Y NA
 7138779 7138780 Rpal_5198 Rpal_5199     TRUE 0.598 145.000 0.026 0.001   NA
 7138783 7138784 Rpal_5202 Rpal_5203     TRUE 0.939 -3.000 0.231 0.050 N NA
 7138784 7138785 Rpal_5203 Rpal_5204     FALSE 0.029 239.000 0.000 1.000 N NA
 7138785 7138786 Rpal_5204 Rpal_5205   pyrE FALSE 0.008 319.000 0.000 1.000 N NA
 7138786 7138787 Rpal_5205 Rpal_5206 pyrE   FALSE 0.231 160.000 0.019 NA   NA
 7138789 7138790 Rpal_5208 Rpal_5209     FALSE 0.036 281.000 0.039 NA   NA
 7138790 7138791 Rpal_5209 Rpal_5210     FALSE 0.379 56.000 0.017 NA   NA
 7138791 7138792 Rpal_5210 Rpal_5211     FALSE 0.017 271.000 0.000 1.000 N NA
 7138792 7138793 Rpal_5211 Rpal_5212     FALSE 0.183 127.000 0.000 1.000   NA
 7138796 7138797 Rpal_5215 Rpal_5216     TRUE 0.916 14.000 0.250 NA   NA
 7138797 7138798 Rpal_5216 Rpal_5217     TRUE 0.676 156.000 0.417 NA   NA
 7138798 7138799 Rpal_5217 Rpal_5218     TRUE 0.958 -7.000 0.139 1.000 Y NA
 7138800 7138801 Rpal_5219 Rpal_5220     TRUE 0.544 60.000 0.104 NA   NA
 7138804 7138805 Rpal_5223 Rpal_5224     TRUE 0.735 9.000 0.006 NA   NA
 7138805 7138806 Rpal_5224 Rpal_5225     FALSE 0.342 55.000 0.005 NA   NA
 7138808 7138809 Rpal_5227 Rpal_5228     FALSE 0.244 109.000 0.029 NA   NA
 7138811 7138812 Rpal_5230 Rpal_5231     FALSE 0.355 166.000 0.092 1.000 N NA
 7138812 7138813 Rpal_5231 Rpal_5232     TRUE 0.990 0.000 0.242 0.010 Y NA
 7138813 7138814 Rpal_5232 Rpal_5233     FALSE 0.297 106.000 0.028 1.000   NA
 7138814 7138815 Rpal_5233 Rpal_5234     TRUE 0.649 53.000 0.156 NA   NA
 7138817 7138818 Rpal_5236 Rpal_5237     FALSE 0.473 100.000 0.022 0.073   NA
 7138821 7138822 Rpal_5240 Rpal_5241     FALSE 0.003 416.000 0.000 NA   NA
 7138824 7138825 Rpal_5243 Rpal_5244     FALSE 0.089 186.000 0.000 NA   NA
 7138825 7138826 Rpal_5244 Rpal_5245     FALSE 0.015 280.000 0.000 NA   NA
 7138827 7138828 Rpal_5246 Rpal_R0058     FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 7138834 7138835 Rpal_5252 Rpal_5253     TRUE 0.953 0.000 0.333 1.000   NA
 7138835 7138836 Rpal_5253 Rpal_5254     TRUE 0.919 -3.000 0.308 NA   NA
 7138838 7138839 Rpal_5256 Rpal_5257   hslO FALSE 0.001 985.000 0.000 NA   NA
 7138839 7138840 Rpal_5257 Rpal_5258 hslO   FALSE 0.048 272.000 0.052 1.000 N NA
 7138840 7138841 Rpal_5258 Rpal_5259   argD TRUE 0.967 0.000 0.058 1.000 Y NA
 7138843 7138844 Rpal_5261 Rpal_5262     FALSE 0.420 78.000 0.128 NA N NA
 7138844 7138845 Rpal_5262 Rpal_5263     TRUE 0.948 24.000 0.126 NA Y NA
 7138845 7138846 Rpal_5263 Rpal_5264     TRUE 0.994 -3.000 0.526 0.001 Y NA
 7138846 7138847 Rpal_5264 Rpal_5265     TRUE 0.996 2.000 0.537 0.001 Y NA
 7138847 7138848 Rpal_5265 Rpal_5266     TRUE 0.778 214.000 0.178 0.001 Y NA
 7138848 7138849 Rpal_5266 Rpal_5267     FALSE 0.227 149.000 0.019 1.000 N NA
 7138849 7138850 Rpal_5267 Rpal_5268     TRUE 0.773 4.000 0.015 NA   NA
 7138850 7138851 Rpal_5268 Rpal_5269     FALSE 0.183 248.000 0.286 NA   NA
 7138851 7138852 Rpal_5269 Rpal_5270     TRUE 0.982 4.000 0.846 NA   NA
 7138853 7138854 Rpal_5271 Rpal_5272     TRUE 0.703 61.000 0.240 1.000   NA
 7138854 7138855 Rpal_5272 Rpal_5273     FALSE 0.042 223.000 0.000 1.000 N NA
 7138857 7138858 Rpal_5275 Rpal_5276     TRUE 0.985 -30.000 0.310 0.010 Y NA
 7138858 7138859 Rpal_5276 Rpal_5277     TRUE 0.991 -3.000 0.414 0.015 Y NA
 7138859 7138860 Rpal_5277 Rpal_5278     TRUE 0.735 205.000 0.150 0.061 Y NA
 7138860 7138861 Rpal_5278 Rpal_5279     FALSE 0.002 507.000 0.000 1.000 N NA
 7138861 7138862 Rpal_5279 Rpal_5280     TRUE 0.986 20.000 0.324 0.049 Y NA
 7138862 7138863 Rpal_5280 Rpal_5281     TRUE 0.909 -3.000 0.270 NA   NA
 7138863 7138864 Rpal_5281 Rpal_5282     TRUE 0.647 42.000 0.091 NA   NA
 7138864 7138865 Rpal_5282 Rpal_5283     TRUE 0.672 46.000 0.140 NA   NA
 7138866 7138867 Rpal_5284 Rpal_5285     TRUE 0.962 168.000 0.808 0.006 Y NA
 7138869 7138870 Rpal_5287 Rpal_5288     FALSE 0.352 86.000 0.091 NA N NA
 7138870 7138871 Rpal_5288 Rpal_5289     FALSE 0.298 76.000 0.024 NA   NA
 7138872 7138873 Rpal_5290 Rpal_5291     FALSE 0.094 183.000 0.000 NA   NA
 7138873 7138874 Rpal_5291 Rpal_5292     FALSE 0.109 174.000 0.000 NA   NA
 7138878 7138879 Rpal_5296 Rpal_5297     TRUE 0.964 -3.000 0.680 1.000 N NA
 7138879 7138880 Rpal_5297 Rpal_5298     TRUE 0.955 -10.000 0.627 1.000   NA
 7138880 7138881 Rpal_5298 Rpal_5299     FALSE 0.501 67.000 0.098 NA   NA
 7138882 7138883 Rpal_5300 Rpal_5301     FALSE 0.360 86.000 0.097 NA N NA
 7138883 7138884 Rpal_5301 Rpal_5302     FALSE 0.199 88.000 0.004 1.000 N NA
 7138884 7138885 Rpal_5302 Rpal_5303     FALSE 0.404 88.000 0.003 0.072 N NA
 7138885 7138886 Rpal_5303 Rpal_5304     TRUE 0.993 -3.000 0.963 1.000 Y NA
 7138886 7138887 Rpal_5304 Rpal_5305     TRUE 0.954 0.000 0.344 1.000   NA
 7138887 7138888 Rpal_5305 Rpal_5306     FALSE 0.300 98.000 0.049 NA   NA
 7138888 7138889 Rpal_5306 Rpal_5307   mtnA FALSE 0.141 184.000 0.006 NA   NA
 7138889 7138890 Rpal_5307 Rpal_5308 mtnA   FALSE 0.218 175.000 0.034 1.000 N NA
 7138891 7138892 Rpal_5309 Rpal_5310     TRUE 0.766 166.000 0.444 0.060 N NA
 7138894 7138895 Rpal_5312 Rpal_5313     FALSE 0.158 76.000 0.000 1.000 N NA
 7138895 7138896 Rpal_5313 Rpal_5314     FALSE 0.297 67.000 0.011 NA   NA
 7138900 7138901 Rpal_5318 Rpal_5319     FALSE 0.240 56.000 0.000 NA   NA
 7138902 7138903 Rpal_5320 Rpal_5321     FALSE 0.229 135.000 0.022 1.000 N NA
 7138903 7138904 Rpal_5321 Rpal_5322     FALSE 0.240 168.000 0.032 NA   NA
 7138905 7133523 Rpal_5323 Rpal_0001 rpsT dnaA FALSE 0.001 1234.000 0.000 1.000 N NA