MicrobesOnline Operon Predictions for Rhodopseudomonas palustris TIE-1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7133523 7133524 Rpal_0001 Rpal_0002 dnaA   TRUE 0.594 234.000 0.328 1.000 Y NA
 7133524 7133525 Rpal_0002 Rpal_0003   recF FALSE 0.538 244.000 0.318 1.000 Y NA
 7133525 7133526 Rpal_0003 Rpal_0004 recF gyrB TRUE 0.784 217.000 0.249 0.003 Y NA
 7133529 7133530 Rpal_0007 Rpal_0008     TRUE 0.960 0.000 0.400 1.000   NA
 7133530 7133531 Rpal_0008 Rpal_0009     TRUE 0.869 10.000 0.059 1.000   NA
 7133531 7133532 Rpal_0009 Rpal_0010     FALSE 0.004 394.000 0.000 1.000 N NA
 7133532 7133533 Rpal_0010 Rpal_0011     TRUE 0.802 140.000 0.800 NA   NA
 7133533 7133534 Rpal_0011 Rpal_0012     TRUE 0.741 139.000 0.600 NA   NA
 7133534 7133535 Rpal_0012 Rpal_0013     TRUE 0.753 2.000 0.010 NA   NA
 7133535 7133536 Rpal_0013 Rpal_0014     TRUE 0.992 0.000 0.713 NA Y NA
 7133536 7133537 Rpal_0014 Rpal_0015     TRUE 0.936 35.000 0.206 NA Y NA
 7133537 7133538 Rpal_0015 Rpal_0016     TRUE 0.763 20.000 0.092 NA N NA
 7133538 7133539 Rpal_0016 Rpal_0017     TRUE 0.760 117.000 0.116 1.000 Y NA
 7133539 7133540 Rpal_0017 Rpal_0018     TRUE 0.961 8.000 0.101 0.002   NA
 7133540 7133541 Rpal_0018 Rpal_0019     TRUE 0.986 10.000 0.500 0.002   NA
 7133541 7133542 Rpal_0019 Rpal_0020     TRUE 0.974 13.000 0.351 0.002 N NA
 7133542 7133543 Rpal_0020 Rpal_0021     FALSE 0.008 311.000 0.000 1.000 N NA
 7133543 7133544 Rpal_0021 Rpal_0022     FALSE 0.164 74.000 0.000 1.000 N NA
 7133544 7133545 Rpal_0022 Rpal_0023     TRUE 0.614 119.000 0.000 1.000 Y NA
 7133547 7133548 Rpal_0025 Rpal_0026     FALSE 0.047 273.000 0.054 1.000 N NA
 7133549 7133550 Rpal_0027 Rpal_0028     FALSE 0.054 215.000 0.000 NA   NA
 7133551 7133552 Rpal_0029 Rpal_0030 purH   FALSE 0.249 186.000 0.068 NA   NA
 7133552 7133553 Rpal_0030 Rpal_0031     FALSE 0.036 299.000 0.071 NA   NA
 7133554 7133555 Rpal_0032 Rpal_0033     FALSE 0.358 86.000 0.062 NA   NA
 7133558 7133559 Rpal_0036 Rpal_0037 pheT   FALSE 0.247 145.000 0.005 1.000   NA
 7133559 7133560 Rpal_0037 Rpal_0038     FALSE 0.077 231.000 0.003 1.000   NA
 7133560 7133561 Rpal_0038 Rpal_0039   rplT TRUE 0.810 144.000 0.202 1.000 Y NA
 7133561 7133562 Rpal_0039 Rpal_0040 rplT rpmI TRUE 0.973 84.000 0.928 0.012 Y NA
 7133562 7133563 Rpal_0040 Rpal_0041 rpmI infC FALSE 0.343 334.000 0.652 1.000 Y NA
 7133565 7133566 Rpal_0043 Rpal_0044     TRUE 0.732 45.000 0.213 1.000 N NA
 7133569 7133570 Rpal_R0001 Rpal_0047     FALSE 0.118 169.000 0.000 NA   NA
 7133570 7133571 Rpal_0047 Rpal_0048     FALSE 0.176 230.000 0.151 NA   NA
 7133571 7133572 Rpal_0048 Rpal_0049     TRUE 0.898 9.000 0.144 NA   NA
 7133572 7133573 Rpal_0049 Rpal_0050     TRUE 0.724 136.000 0.543 NA   NA
 7133573 7133574 Rpal_0050 Rpal_0051     FALSE 0.396 31.000 0.000 NA   NA
 7133574 7133575 Rpal_0051 Rpal_0052     FALSE 0.356 36.000 0.000 NA   NA
 7133575 7133576 Rpal_0052 Rpal_0053     FALSE 0.433 58.000 0.070 NA N NA
 7133576 7133577 Rpal_0053 Rpal_0054     FALSE 0.131 276.000 0.353 NA N NA
 7133578 7133579 Rpal_0055 Rpal_0056     TRUE 0.925 51.000 0.955 NA   NA
 7133579 7133580 Rpal_0056 Rpal_0057   ugpC FALSE 0.257 154.000 0.056 NA N NA
 7133580 7133581 Rpal_0057 Rpal_0058 ugpC   TRUE 0.994 3.000 0.464 0.056 Y NA
 7133581 7133582 Rpal_0058 Rpal_0059     TRUE 0.994 0.000 0.559 0.056 Y NA
 7133582 7133583 Rpal_0059 Rpal_0060     TRUE 0.813 165.000 0.063 0.056 Y NA
 7133583 7133584 Rpal_0060 Rpal_0061     FALSE 0.199 232.000 0.214 1.000 N NA
 7133584 7133585 Rpal_0061 Rpal_0062     TRUE 0.657 46.000 0.130 1.000 N NA
 7133585 7133586 Rpal_0062 Rpal_R0002     FALSE 0.004 401.000 0.000 NA   NA
 7133586 7133587 Rpal_R0002 Rpal_0063     FALSE 0.182 71.000 0.000 NA   NA
 7133590 7133591 Rpal_0066 Rpal_0067 cmk rpsA FALSE 0.083 301.000 0.281 1.000 N NA
 7133591 7133592 Rpal_0067 Rpal_0068 rpsA   FALSE 0.110 229.000 0.057 1.000 N NA
 7133592 7133593 Rpal_0068 Rpal_0069   ihfB FALSE 0.406 166.000 0.142 1.000 N NA
 7133593 7133594 Rpal_0069 Rpal_0070 ihfB   TRUE 0.640 38.000 0.069 NA   NA
 7133594 7133595 Rpal_0070 Rpal_0071     FALSE 0.320 59.000 0.007 NA   NA
 7133595 7133596 Rpal_0071 Rpal_0072     TRUE 0.993 14.000 0.375 0.001 Y NA
 7133596 7133597 Rpal_0072 Rpal_0073   trpA TRUE 0.994 0.000 0.344 0.001 Y NA
 7133597 7133598 Rpal_0073 Rpal_0074 trpA   FALSE 0.506 110.000 0.232 1.000 N NA
 7133598 7133599 Rpal_0074 Rpal_0075     TRUE 0.934 -3.000 0.383 1.000 N NA
 7133600 7133601 Rpal_0076 Rpal_0077     FALSE 0.510 97.000 0.173 1.000   NA
 7133601 7133602 Rpal_0077 Rpal_0078     TRUE 0.991 -3.000 0.863 NA Y NA
 7133602 7133603 Rpal_0078 Rpal_0079     FALSE 0.498 76.000 0.196 NA N NA
 7133603 7133604 Rpal_0079 Rpal_0080     FALSE 0.248 158.000 0.025 NA   NA
 7133604 7133605 Rpal_0080 Rpal_0081     FALSE 0.243 104.000 0.026 NA   NA
 7133605 7133606 Rpal_0081 Rpal_0082     TRUE 0.820 -3.000 0.085 NA   NA
 7133606 7133607 Rpal_0082 Rpal_0083   dut FALSE 0.070 220.000 0.005 1.000 N NA
 7133607 7133608 Rpal_0083 Rpal_0084 dut   TRUE 0.880 -3.000 0.201 1.000 N NA
 7133608 7133609 Rpal_0084 Rpal_0085     FALSE 0.489 54.000 0.025 1.000   NA
 7133609 7133610 Rpal_0085 Rpal_0086   ubiE TRUE 0.866 -3.000 0.115 1.000   NA
 7133613 7133614 Rpal_0089 Rpal_0090     FALSE 0.060 125.000 0.000 NA N NA
 7133615 7133616 Rpal_0091 Rpal_0092     FALSE 0.256 53.000 0.000 NA   NA
 7133616 7133617 Rpal_0092 Rpal_0093     FALSE 0.127 129.000 0.000 NA   NA
 7133617 7133618 Rpal_0093 Rpal_0094     FALSE 0.031 239.000 0.000 NA   NA
 7133618 7133619 Rpal_0094 Rpal_0095     TRUE 0.872 79.000 1.000 NA   NA
 7133619 7133620 Rpal_0095 Rpal_0096     FALSE 0.002 541.000 0.000 NA   NA
 7133621 7133622 Rpal_0097 Rpal_0098     TRUE 0.902 -3.000 0.250 NA   NA
 7133622 7133623 Rpal_0098 Rpal_0099     TRUE 0.735 49.000 0.231 NA   NA
 7133623 7133624 Rpal_0099 Rpal_0100     TRUE 0.928 4.000 0.231 1.000 N NA
 7133624 7133625 Rpal_0100 Rpal_0101     FALSE 0.121 139.000 0.000 1.000 N NA
 7133626 7133627 Rpal_0102 Rpal_0103     TRUE 0.992 -3.000 0.444 0.002 Y NA
 7133627 7133628 Rpal_0103 Rpal_0104     TRUE 0.995 3.000 0.889 1.000 Y NA
 7133628 7133629 Rpal_0104 Rpal_0105     TRUE 0.995 -3.000 0.889 0.056 Y NA
 7133629 7133630 Rpal_0105 Rpal_0106     TRUE 0.992 29.000 0.889 0.056 Y NA
 7133630 7133631 Rpal_0106 Rpal_0107     FALSE 0.456 90.000 0.143 NA   NA
 7133631 7133632 Rpal_0107 Rpal_0108     TRUE 0.856 -3.000 0.143 NA   NA
 7133634 7133635 Rpal_0110 Rpal_0111     TRUE 0.910 20.000 0.000 NA Y NA
 7133635 7133636 Rpal_0111 Rpal_0112     TRUE 0.887 30.000 0.000 1.000 Y NA
 7133636 7133637 Rpal_0112 Rpal_0113     FALSE 0.304 41.000 0.000 1.000 N NA
 7133639 7133640 Rpal_0115 Rpal_0116     TRUE 0.966 9.000 0.444 1.000   NA
 7133641 7133642 Rpal_0117 Rpal_0118     TRUE 0.906 -3.000 0.259 NA   NA
 7133644 7133645 Rpal_0120 Rpal_0121     TRUE 0.934 26.000 0.048 1.000 Y NA
 7133645 7133646 Rpal_0121 Rpal_0122     TRUE 0.965 5.000 0.029 1.000 Y NA
 7133646 7133647 Rpal_0122 Rpal_0123     TRUE 0.995 2.000 0.500 0.004 Y NA
 7133647 7133648 Rpal_0123 Rpal_0124     FALSE 0.145 88.000 0.000 NA   NA
 7133648 7133649 Rpal_0124 Rpal_0125     FALSE 0.138 93.000 0.000 NA   NA
 7133649 7133650 Rpal_0125 Rpal_0126     TRUE 0.771 -7.000 0.080 1.000 N NA
 7133651 7133652 Rpal_0127 Rpal_0128     TRUE 0.963 -3.000 0.308 0.018   NA
 7133652 7133653 Rpal_0128 Rpal_0129     TRUE 0.832 65.000 0.538 1.000   NA
 7133653 7133654 Rpal_0129 Rpal_0130     TRUE 0.993 23.000 0.800 0.056 Y NA
 7133654 7133655 Rpal_0130 Rpal_0131     TRUE 0.994 -3.000 0.778 0.056 Y NA
 7133655 7133656 Rpal_0131 Rpal_0132     TRUE 0.986 -7.000 0.381 0.056 Y NA
 7133658 7133659 Rpal_0134 Rpal_0135     TRUE 0.799 -3.000 0.071 1.000 N NA
 7133659 7133660 Rpal_0135 Rpal_0136     TRUE 0.984 -10.000 0.643 NA Y NA
 7133660 7133661 Rpal_0136 Rpal_0137     TRUE 0.822 16.000 0.080 NA   NA
 7133661 7133662 Rpal_0137 Rpal_0138     TRUE 0.964 5.000 0.185 0.016   NA
 7133662 7133663 Rpal_0138 Rpal_0139     FALSE 0.115 170.000 0.000 NA   NA
 7133663 7133664 Rpal_0139 Rpal_0140     TRUE 0.906 5.000 0.157 NA   NA
 7133664 7133665 Rpal_0140 Rpal_0141     TRUE 0.988 21.000 0.672 1.000 Y NA
 7133665 7133666 Rpal_0141 Rpal_0142     TRUE 0.631 161.000 0.000 1.000 Y NA
 7133666 7133667 Rpal_0142 Rpal_0143     TRUE 0.903 67.000 0.087 0.014 Y NA
 7133667 7133668 Rpal_0143 Rpal_0144     TRUE 0.922 61.000 0.130 0.014 Y NA
 7133668 7133669 Rpal_0144 Rpal_0145     TRUE 0.996 0.000 0.808 0.014 Y NA
 7133669 7133670 Rpal_0145 Rpal_0146     TRUE 0.988 -3.000 0.615 1.000 Y NA
 7133670 7133671 Rpal_0146 Rpal_0147     TRUE 0.915 0.000 0.212 NA   NA
 7133673 7133674 Rpal_0149 Rpal_R0003     FALSE 0.043 225.000 0.000 NA   NA
 7133674 7133675 Rpal_R0003 Rpal_0150     FALSE 0.134 153.000 0.000 NA   NA
 7133676 7133677 Rpal_0151 Rpal_0152 rplU rpmA TRUE 0.961 90.000 0.667 0.012 Y NA
 7133677 7133678 Rpal_0152 Rpal_0153 rpmA   TRUE 0.703 135.000 0.035 1.000 Y NA
 7133678 7133679 Rpal_0153 Rpal_0154     FALSE 0.058 212.000 0.000 NA   NA
 7133679 7133680 Rpal_0154 Rpal_0155     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 7133682 7133683 Rpal_0157 Rpal_0158 obgE   FALSE 0.415 139.000 0.087 1.000   NA
 7133683 7133684 Rpal_0158 Rpal_0159   proA TRUE 0.753 204.000 0.065 0.001 Y NA
 7133684 7133685 Rpal_0159 Rpal_0160 proA nadD TRUE 0.823 25.000 0.170 1.000 N NA
 7133685 7133686 Rpal_0160 Rpal_0161 nadD   FALSE 0.279 215.000 0.221 NA   NA
 7133686 7133687 Rpal_0161 Rpal_0162     TRUE 0.613 90.000 0.307 NA   NA
 7133687 7133688 Rpal_0162 Rpal_0163     TRUE 0.774 20.000 0.067 NA   NA
 7133688 7133689 Rpal_0163 Rpal_0164     TRUE 0.966 -3.000 0.408 0.026 N NA
 7133689 7133690 Rpal_0164 Rpal_0165     TRUE 0.545 151.000 0.210 1.000   NA
 7133690 7133691 Rpal_0165 Rpal_0166     TRUE 0.727 39.000 0.109 1.000   NA
 7133693 7133694 Rpal_0168 Rpal_0169     TRUE 0.659 -3.000 0.010 1.000 N NA
 7133695 7133696 Rpal_0170 Rpal_0171 atpC   TRUE 0.965 114.000 0.837 0.005 Y NA
 7133696 7133697 Rpal_0171 Rpal_0172     TRUE 0.973 72.000 0.724 0.005 Y NA
 7133697 7133698 Rpal_0172 Rpal_0173     TRUE 0.967 144.000 0.846 0.005 Y NA
 7133698 7133699 Rpal_0173 Rpal_0174     TRUE 0.997 0.000 0.864 0.005 Y NA
 7133702 7133703 Rpal_0177 Rpal_0178 xerC   FALSE 0.228 141.000 0.020 NA   NA
 7133704 7133705 Rpal_0179 Rpal_0180     FALSE 0.494 40.000 0.021 NA   NA
 7133705 7133706 Rpal_0180 Rpal_0181     TRUE 0.561 32.000 0.023 1.000 N NA
 7133706 7133707 Rpal_0181 Rpal_0182     TRUE 0.908 8.000 0.172 NA   NA
 7133707 7133708 Rpal_0182 Rpal_0183     FALSE 0.348 59.000 0.014 NA   NA
 7133708 7133709 Rpal_0183 Rpal_0184   sucA TRUE 0.922 105.000 0.667 1.000 Y NA
 7133709 7133710 Rpal_0184 Rpal_0185 sucA   TRUE 0.756 128.000 0.092 1.000 Y NA
 7133710 7133711 Rpal_0185 Rpal_0186   sucC TRUE 0.949 65.000 0.256 0.001 Y NA
 7133711 7133712 Rpal_0186 Rpal_0187 sucC   TRUE 0.780 96.000 0.113 1.000 Y NA
 7133712 7133713 Rpal_0187 Rpal_0188     FALSE 0.259 146.000 0.032 NA   NA
 7133713 7133714 Rpal_0188 Rpal_0189     FALSE 0.270 83.000 0.021 NA   NA
 7133714 7133715 Rpal_0189 Rpal_0190     FALSE 0.194 206.000 0.077 1.000 N NA
 7133716 7133717 Rpal_0191 Rpal_0192     TRUE 0.992 4.000 0.626 NA Y NA
 7133717 7133718 Rpal_0192 Rpal_0193     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 7133718 7133719 Rpal_0193 Rpal_0194     FALSE 0.458 -1594.000 0.000 NA   NA
 7133719 7133720 Rpal_0194 Rpal_0195     FALSE 0.415 29.000 0.000 NA   NA
 7133720 7133721 Rpal_0195 Rpal_0196     FALSE 0.001 600.000 0.000 NA N NA
 7133722 7133723 Rpal_0197 Rpal_0198     FALSE 0.004 404.000 0.000 NA   NA
 7133723 7133724 Rpal_0198 Rpal_0199     FALSE 0.255 167.000 0.038 NA   NA
 7133725 7133726 Rpal_0200 Rpal_0201     TRUE 0.993 -3.000 0.503 0.002 Y NA
 7133726 7133727 Rpal_0201 Rpal_0202     TRUE 0.956 93.000 0.501 0.001 Y NA
 7133727 7133728 Rpal_0202 Rpal_0203     TRUE 0.969 0.000 0.501 1.000   NA
 7133728 7133729 Rpal_0203 Rpal_0204     TRUE 0.888 17.000 0.172 1.000   NA
 7133729 7133730 Rpal_0204 Rpal_0205     FALSE 0.127 140.000 0.000 NA   NA
 7133731 7133732 Rpal_0206 Rpal_0207     TRUE 0.764 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7133733 7133734 Rpal_0208 Rpal_0209     FALSE 0.008 364.000 0.000 1.000   NA
 7133734 7133735 Rpal_0209 Rpal_0210     FALSE 0.004 383.000 0.000 NA   NA
 7133738 7133739 Rpal_0213 Rpal_0214     TRUE 0.906 0.000 0.188 NA   NA
 7133739 7133740 Rpal_0214 Rpal_0215   sdhB FALSE 0.069 237.000 0.006 1.000   NA
 7133740 7133741 Rpal_0215 Rpal_0216 sdhB sdhA TRUE 0.957 108.000 0.604 0.001 Y NA
 7133741 7133742 Rpal_0216 Rpal_0217 sdhA   TRUE 0.997 4.000 0.705 0.001 Y NA
 7133742 7133743 Rpal_0217 Rpal_0218     TRUE 0.990 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 7133746 7133747 Rpal_0221 Rpal_0222     FALSE 0.043 222.000 0.000 1.000 N NA
 7133747 7133748 Rpal_0222 Rpal_0223     TRUE 0.794 116.000 0.476 0.078   NA
 7133748 7133749 Rpal_0223 Rpal_0224     FALSE 0.051 273.000 0.035 1.000   NA
 7133752 7133753 Rpal_0227 Rpal_0228     FALSE 0.129 144.000 0.000 NA   NA
 7133754 7133755 Rpal_0229 Rpal_0230     FALSE 0.188 136.000 0.005 NA   NA
 7133758 7133759 Rpal_0233 Rpal_0234   leuD FALSE 0.001 750.000 0.000 1.000 N NA
 7133759 7133760 Rpal_0234 Rpal_0235 leuD   FALSE 0.437 86.000 0.112 NA   NA
 7133761 7133762 Rpal_0236 Rpal_0237     FALSE 0.037 232.000 0.000 NA   NA
 7133762 7133763 Rpal_0237 Rpal_0238     TRUE 0.661 111.000 0.429 NA   NA
 7133763 7133764 Rpal_0238 Rpal_0239     TRUE 0.659 121.000 0.429 NA   NA
 7133765 7133766 Rpal_0240 Rpal_0241     FALSE 0.288 77.000 0.022 NA   NA
 7133766 7133767 Rpal_0241 Rpal_0242   rplS FALSE 0.171 120.000 0.002 NA   NA
 7133767 7133768 Rpal_0242 Rpal_0243 rplS   TRUE 0.904 114.000 0.567 1.000 Y NA
 7133768 7133769 Rpal_0243 Rpal_0244   rimM TRUE 0.924 143.000 0.672 1.000 Y NA
 7133769 7133770 Rpal_0244 Rpal_0245 rimM rpsP TRUE 0.992 13.000 0.342 0.012 Y NA
 7133770 7133771 Rpal_0245 Rpal_0246 rpsP   TRUE 0.596 170.000 0.361 1.000 N NA
 7133772 7133773 Rpal_0247 Rpal_0248     FALSE 0.042 226.000 0.000 NA   NA
 7133774 7133775 Rpal_0249 Rpal_0250     TRUE 0.897 -3.000 0.235 NA   NA
 7133776 7133777 Rpal_0251 Rpal_0252 dapF   TRUE 0.875 0.000 0.109 1.000 N NA
 7133778 7133779 Rpal_0253 Rpal_0254     FALSE 0.150 186.000 0.012 NA   NA
 7133779 7133780 Rpal_0254 Rpal_0255   gpsA TRUE 0.826 3.000 0.042 NA   NA
 7133780 7133781 Rpal_0255 Rpal_0256 gpsA   TRUE 0.650 36.000 0.070 1.000 N NA
 7133782 7133783 Rpal_0257 Rpal_0258     FALSE 0.453 52.000 0.032 NA   NA
 7133783 7133784 Rpal_0258 Rpal_0259     TRUE 0.852 9.000 0.067 NA   NA
 7133784 7133785 Rpal_0259 Rpal_R0004     FALSE 0.132 159.000 0.000 NA   NA
 7133787 7133788 Rpal_0261 Rpal_0262     FALSE 0.109 174.000 0.000 NA   NA
 7133789 7133790 Rpal_0263 Rpal_0264     FALSE 0.478 115.000 0.212 NA   NA
 7133792 7133793 Rpal_0266 Rpal_0267     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7133793 7133794 Rpal_0267 Rpal_R0005     FALSE 0.064 205.000 0.000 NA   NA
 7133795 7133796 Rpal_0268 Rpal_0269     TRUE 0.864 27.000 0.222 1.000   NA
 7133796 7133797 Rpal_0269 Rpal_0270     FALSE 0.463 90.000 0.148 NA   NA
 7133801 7133802 Rpal_0274 Rpal_0275     FALSE 0.123 146.000 0.000 1.000 N NA
 7133802 7133803 Rpal_0275 Rpal_0276     FALSE 0.452 75.000 0.095 1.000 N NA
 7133803 7133804 Rpal_0276 Rpal_0277     FALSE 0.009 310.000 0.000 1.000 N NA
 7133804 7133805 Rpal_0277 Rpal_0278     TRUE 0.756 38.000 0.197 1.000 N NA
 7133805 7133806 Rpal_0278 Rpal_0279     FALSE 0.272 119.000 0.020 1.000   NA
 7133806 7133807 Rpal_0279 Rpal_0280     TRUE 0.799 102.000 0.778 NA   NA
 7133807 7133808 Rpal_0280 Rpal_0281     FALSE 0.228 123.000 0.023 NA   NA
 7133808 7133809 Rpal_0281 Rpal_0282     TRUE 0.835 14.000 0.081 1.000 N NA
 7133809 7133810 Rpal_0282 Rpal_0283     TRUE 0.724 18.000 0.035 1.000 N NA
 7133810 7133811 Rpal_0283 Rpal_0284     FALSE 0.041 289.000 0.068 1.000 N NA
 7133812 7133813 Rpal_0285 Rpal_0286     TRUE 0.937 40.000 0.261 NA Y NA
 7133816 7133817 Rpal_0289 Rpal_0290   leuS FALSE 0.059 206.000 0.000 1.000 N NA
 7133817 7133818 Rpal_0290 Rpal_0291 leuS   TRUE 0.780 -13.000 0.090 NA   NA
 7133818 7133819 Rpal_0291 Rpal_0292   holA TRUE 0.559 57.000 0.097 NA   NA
 7133820 7133821 Rpal_0293 Rpal_0294     TRUE 0.781 173.000 0.827 1.000 N NA
 7133821 7133822 Rpal_0294 Rpal_0295   gidB TRUE 0.889 28.000 0.339 1.000 N NA
 7133822 7133823 Rpal_0295 Rpal_0296 gidB   TRUE 0.651 173.000 0.466 1.000 N NA
 7133823 7133824 Rpal_0296 Rpal_0297   trmE TRUE 0.576 166.000 0.266 1.000   NA
 7133824 7133825 Rpal_0297 Rpal_0298 trmE rho FALSE 0.379 88.000 0.050 1.000   NA
 7133825 7133826 Rpal_0298 Rpal_0299 rho   FALSE 0.044 260.000 0.024 NA   NA
 7133827 7133828 Rpal_0300 Rpal_0301     TRUE 0.852 -3.000 0.135 NA   NA
 7133828 7133829 Rpal_0301 Rpal_0302   coaE FALSE 0.147 97.000 0.011 NA N NA
 7133829 7133830 Rpal_0302 Rpal_0303 coaE   TRUE 0.687 36.000 0.092 1.000 N NA
 7133832 7133833 Rpal_0305 Rpal_0306     TRUE 0.912 -22.000 0.324 1.000   NA
 7133833 7133834 Rpal_0306 Rpal_0307     TRUE 0.949 6.000 0.332 NA   NA
 7133835 7133836 Rpal_0308 Rpal_0309 hslU   FALSE 0.426 42.000 0.007 NA   NA
 7133836 7133837 Rpal_0309 Rpal_0310     TRUE 0.653 -3.000 0.005 NA   NA
 7133838 7133839 Rpal_0311 Rpal_0312 hisB   TRUE 0.661 28.000 0.041 NA   NA
 7133839 7133840 Rpal_0312 Rpal_0313   hisH TRUE 0.941 -3.000 0.417 NA   NA
 7133840 7133841 Rpal_0313 Rpal_0314 hisH   TRUE 0.979 -3.000 0.070 0.004 Y NA
 7133841 7133842 Rpal_0314 Rpal_0315     TRUE 0.994 11.000 0.433 0.004 Y NA
 7133842 7133843 Rpal_0315 Rpal_0316   hisE TRUE 0.939 54.000 0.105 0.004 Y NA
 7133843 7133844 Rpal_0316 Rpal_0317 hisE   FALSE 0.439 75.000 0.086 1.000 N NA
 7133845 7133846 Rpal_0318 Rpal_0319     FALSE 0.416 161.000 0.130 NA   NA
 7133846 7133847 Rpal_0319 Rpal_0320     FALSE 0.173 127.000 0.004 1.000 N NA
 7133847 7133848 Rpal_0320 Rpal_0321     FALSE 0.194 100.000 0.005 NA   NA
 7133848 7133849 Rpal_0321 Rpal_0322     TRUE 0.895 -3.000 0.231 NA   NA
 7133849 7133850 Rpal_0322 Rpal_0323     TRUE 0.553 86.000 0.231 1.000 N NA
 7133850 7133851 Rpal_0323 Rpal_0324     FALSE 0.048 237.000 0.005 1.000 N NA
 7133851 7133852 Rpal_0324 Rpal_0325     FALSE 0.403 73.000 0.064 1.000 N NA
 7133852 7133853 Rpal_0325 Rpal_0326     TRUE 0.853 -13.000 0.165 1.000   NA
 7133857 7133858 Rpal_0330 Rpal_0331     TRUE 0.856 -10.000 0.218 1.000 N NA
 7133858 7133859 Rpal_0331 Rpal_0332   rph TRUE 0.742 52.000 0.262 1.000 N NA
 7133860 7133861 Rpal_0333 Rpal_0334 hrcA   FALSE 0.424 91.000 0.120 1.000 N NA
 7133863 7133864 Rpal_0336 Rpal_0337 dnaK   TRUE 0.795 215.000 0.236 0.002 Y NA
 7133864 7133865 Rpal_0337 Rpal_0338     FALSE 0.320 94.000 0.057 1.000 N NA
 7133865 7133866 Rpal_0338 Rpal_0339     FALSE 0.491 102.000 0.208 NA   NA
 7133866 7133867 Rpal_0339 Rpal_0340     TRUE 0.759 8.000 0.012 NA   NA
 7133867 7133868 Rpal_0340 Rpal_0341     TRUE 0.686 26.000 0.044 NA   NA
 7133868 7133869 Rpal_0341 Rpal_0342     FALSE 0.209 97.000 0.010 NA   NA
 7133870 7133871 Rpal_0343 Rpal_0344     FALSE 0.193 92.000 0.004 1.000 N NA
 7133871 7133872 Rpal_0344 Rpal_0345     TRUE 0.868 15.000 0.142 NA   NA
 7133874 7133875 Rpal_0347 Rpal_0348     FALSE 0.120 129.000 0.000 1.000 N NA
 7133875 7133876 Rpal_0348 Rpal_0349     FALSE 0.002 574.000 0.000 1.000 N NA
 7133876 7133877 Rpal_0349 Rpal_0350   aceK FALSE 0.211 88.000 0.007 1.000 N NA
 7133877 7133878 Rpal_0350 Rpal_0351 aceK   FALSE 0.007 336.000 0.000 NA   NA
 7133879 7133880 Rpal_0352 Rpal_0353     TRUE 0.968 -3.000 0.024 0.046 Y NA
 7133880 7133881 Rpal_0353 Rpal_0354     TRUE 0.792 5.000 0.024 NA   NA
 7133884 7133885 Rpal_0357 Rpal_0358     TRUE 0.993 -3.000 0.420 0.001 Y NA
 7133885 7133886 Rpal_0358 Rpal_0359     FALSE 0.365 188.000 0.145 1.000   NA
 7133886 7133887 Rpal_0359 Rpal_0360     TRUE 0.962 -3.000 0.304 0.017   NA
 7133887 7133888 Rpal_0360 Rpal_0361     TRUE 0.937 163.000 0.829 1.000 Y NA
 7133889 7133890 Rpal_0362 Rpal_0363     FALSE 0.146 189.000 0.018 1.000 N NA
 7133890 7133891 Rpal_0363 Rpal_0364     FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 7133894 7133895 Rpal_0367 Rpal_0368     FALSE 0.470 79.000 0.125 NA   NA
 7133896 7133897 Rpal_0369 Rpal_0370     TRUE 0.618 99.000 0.333 NA   NA
 7133898 7133899 Rpal_0371 Rpal_0372     FALSE 0.113 222.000 0.046 1.000 N NA
 7133900 7133901 Rpal_0373 Rpal_R0006     FALSE 0.020 264.000 0.000 NA   NA
 7133902 7133903 Rpal_0374 Rpal_0375     FALSE 0.065 201.000 0.000 1.000 N NA
 7133905 7133906 Rpal_0377 Rpal_0378     FALSE 0.185 140.000 0.000 1.000   NA
 7133906 7133907 Rpal_0378 Rpal_0379     FALSE 0.173 74.000 0.000 NA   NA
 7133908 7133909 Rpal_0380 Rpal_0381     TRUE 0.798 153.000 0.667 1.000   NA
 7133911 7133912 Rpal_0383 Rpal_0384     FALSE 0.224 115.000 0.025 1.000 N NA
 7133912 7133913 Rpal_0384 Rpal_0385   glgC FALSE 0.016 272.000 0.000 1.000 N NA
 7133913 7133914 Rpal_0385 Rpal_0386 glgC   TRUE 0.961 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7133914 7133915 Rpal_0386 Rpal_0387     FALSE 0.123 146.000 0.000 1.000 N NA
 7133915 7133916 Rpal_0387 Rpal_0388     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7133917 7133918 Rpal_0389 Rpal_0390 radC   FALSE 0.415 95.000 0.115 NA   NA
 7133924 7133925 Rpal_0396 Rpal_0397     FALSE 0.027 241.000 0.000 1.000 N NA
 7133925 7133926 Rpal_0397 Rpal_0398     FALSE 0.256 101.000 0.008 1.000   NA
 7133926 7133927 Rpal_0398 Rpal_0399     TRUE 0.926 -3.000 0.333 NA   NA
 7133927 7133928 Rpal_0399 Rpal_0400     TRUE 0.853 0.000 0.074 NA   NA
 7133928 7133929 Rpal_0400 Rpal_0401     TRUE 0.911 5.000 0.004 0.043   NA
 7133929 7133930 Rpal_0401 Rpal_0402     FALSE 0.147 187.000 0.012 NA   NA
 7133930 7133931 Rpal_0402 Rpal_0403     FALSE 0.241 154.000 0.021 NA   NA
 7133935 7133936 Rpal_0407 Rpal_0408   phhB FALSE 0.426 83.000 0.094 NA   NA
 7133938 7133939 Rpal_0410 Rpal_0411     TRUE 0.927 5.000 0.224 NA   NA
 7133940 7133941 Rpal_0412 Rpal_0413     FALSE 0.170 110.000 0.003 1.000 N NA
 7133941 7133942 Rpal_0413 Rpal_0414     FALSE 0.257 176.000 0.028 1.000   NA
 7133942 7133943 Rpal_0414 Rpal_0415     FALSE 0.410 77.000 0.048 1.000   NA
 7133943 7133944 Rpal_0415 Rpal_0416     FALSE 0.494 36.000 0.013 1.000 N NA
 7133945 7133946 Rpal_0417 Rpal_0418     FALSE 0.244 107.000 0.029 NA   NA
 7133946 7133947 Rpal_0418 Rpal_0419     TRUE 0.846 26.000 0.220 NA   NA
 7133949 7133950 Rpal_0420 Rpal_0421     TRUE 0.685 82.000 0.375 NA   NA
 7133950 7133951 Rpal_0421 Rpal_0422     FALSE 0.291 104.000 0.048 NA   NA
 7133951 7133952 Rpal_0422 Rpal_0423     FALSE 0.351 121.000 0.057 1.000   NA
 7133952 7133953 Rpal_0423 Rpal_0424     FALSE 0.243 183.000 0.057 NA   NA
 7133953 7133954 Rpal_0424 Rpal_0425     FALSE 0.349 137.000 0.077 NA   NA
 7133954 7133955 Rpal_0425 Rpal_0426     FALSE 0.116 121.000 0.000 1.000 N NA
 7133958 7133959 Rpal_0429 Rpal_0430     TRUE 0.935 62.000 0.451 1.000 Y NA
 7133959 7133960 Rpal_0430 Rpal_0431     TRUE 0.806 176.000 0.265 1.000 Y NA
 7133961 7133962 Rpal_0432 Rpal_0433     FALSE 0.041 228.000 0.000 NA   NA
 7133964 7133965 Rpal_0435 Rpal_0436     FALSE 0.012 290.000 0.000 1.000 N NA
 7133965 7133966 Rpal_0436 Rpal_0437   rpsO FALSE 0.213 339.000 0.335 1.000 Y NA
 7133966 7133967 Rpal_0437 Rpal_0438 rpsO truB TRUE 0.982 3.000 0.211 1.000 Y NA
 7133967 7133968 Rpal_0438 Rpal_0439 truB rbfA TRUE 0.985 0.000 0.318 1.000 Y NA
 7133968 7133969 Rpal_0439 Rpal_0440 rbfA infB TRUE 0.887 174.000 0.530 1.000 Y NA
 7133969 7133970 Rpal_0440 Rpal_0441 infB   TRUE 0.844 -7.000 0.223 NA N NA
 7133970 7133971 Rpal_0441 Rpal_0442   nusA TRUE 0.820 62.000 0.075 NA Y NA
 7133971 7133972 Rpal_0442 Rpal_0443 nusA   TRUE 0.979 3.000 0.759 NA   NA
 7133973 7133974 Rpal_0444 Rpal_0445     FALSE 0.124 124.000 0.000 NA   NA
 7133975 7133976 Rpal_0446 Rpal_0447 trmB   FALSE 0.351 75.000 0.018 1.000   NA
 7133976 7133977 Rpal_0447 Rpal_0448   lnt FALSE 0.346 201.000 0.231 1.000 N NA
 7133977 7133978 Rpal_0448 Rpal_0449 lnt   TRUE 0.886 -3.000 0.213 NA   NA
 7133978 7133979 Rpal_0449 Rpal_0450     TRUE 0.924 2.000 0.222 NA   NA
 7133979 7133980 Rpal_0450 Rpal_0451     TRUE 0.775 69.000 0.457 NA   NA
 7133980 7133981 Rpal_0451 Rpal_0452     TRUE 0.921 7.000 0.220 1.000 N NA
 7133981 7133982 Rpal_0452 Rpal_0453     FALSE 0.453 120.000 0.008 0.042   NA
 7133982 7133983 Rpal_0453 Rpal_0454     FALSE 0.442 88.000 0.082 1.000   NA
 7133983 7133984 Rpal_0454 Rpal_0455     FALSE 0.506 63.000 0.061 1.000   NA
 7133984 7133985 Rpal_0455 Rpal_0456     TRUE 0.877 23.000 0.209 1.000   NA
 7133985 7133986 Rpal_0456 Rpal_0457     TRUE 0.732 136.000 0.061 1.000 Y NA
 7133986 7133987 Rpal_0457 Rpal_0458     FALSE 0.442 146.000 0.151 NA   NA
 7133987 7133988 Rpal_0458 Rpal_0459     FALSE 0.067 245.000 0.042 NA   NA
 7133988 7133989 Rpal_0459 Rpal_0460     TRUE 0.589 56.000 0.078 1.000   NA
 7133991 7133992 Rpal_0462 Rpal_0463     FALSE 0.334 130.000 0.073 1.000 N NA
 7133993 7133994 Rpal_0464 Rpal_0465     TRUE 0.824 162.000 0.889 NA   NA
 7133995 7133996 Rpal_0466 Rpal_0467     FALSE 0.127 140.000 0.000 NA   NA
 7133996 7133997 Rpal_0467 Rpal_0468     TRUE 0.964 3.000 0.405 1.000   NA
 7133997 7133998 Rpal_0468 Rpal_0469     TRUE 0.934 0.000 0.282 1.000 N NA
 7133998 7133999 Rpal_0469 Rpal_0470     TRUE 0.991 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 7133999 7134000 Rpal_0470 Rpal_0471     TRUE 0.992 9.000 0.702 NA Y NA
 7134001 7134002 Rpal_0472 Rpal_0473     FALSE 0.007 375.000 0.000 1.000   NA
 7134004 7134005 Rpal_0475 Rpal_0476     FALSE 0.139 92.000 0.000 NA   NA
 7134007 7134008 Rpal_0477 Rpal_0478     FALSE 0.397 134.000 0.111 NA   NA
 7134008 7134009 Rpal_0478 Rpal_0479     TRUE 0.828 58.000 0.500 NA   NA
 7134011 7134012 Rpal_0481 Rpal_0482     TRUE 0.988 27.000 0.476 0.009 Y NA
 7134012 7134013 Rpal_0482 Rpal_0483     TRUE 0.978 34.000 0.636 1.000 Y NA
 7134014 7134015 Rpal_0484 Rpal_0485     TRUE 0.934 3.000 0.250 NA   NA
 7134015 7134016 Rpal_0485 Rpal_0486     TRUE 0.641 177.000 0.556 NA N NA
 7134017 7134018 Rpal_0487 Rpal_0488     TRUE 0.941 12.000 0.277 1.000   NA
 7134019 7134020 Rpal_0489 Rpal_0490     FALSE 0.004 523.000 0.012 1.000 N NA
 7134020 7134021 Rpal_0490 Rpal_0491     FALSE 0.259 75.000 0.011 1.000 N NA
 7134021 7134022 Rpal_0491 Rpal_0492     TRUE 0.783 31.000 0.116 1.000   NA
 7134022 7134023 Rpal_0492 Rpal_0493     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 7134024 7134025 Rpal_0494 Rpal_0495 rpmB   FALSE 0.007 325.000 0.000 1.000 N NA
 7134026 7134027 Rpal_0496 Rpal_0497     TRUE 0.874 25.000 0.260 NA   NA
 7134027 7134028 Rpal_0497 Rpal_0498     TRUE 0.646 -3.000 0.000 1.000   NA
 7134028 7134029 Rpal_0498 Rpal_0499     TRUE 0.736 5.000 0.000 1.000   NA
 7134033 7134034 Rpal_0503 Rpal_0504   aroB FALSE 0.377 48.000 0.005 NA   NA
 7134034 7134035 Rpal_0504 Rpal_0505 aroB   TRUE 0.976 11.000 0.147 1.000 Y NA
 7134036 7134037 Rpal_0506 Rpal_0507     TRUE 0.758 17.000 0.043 NA   NA
 7134039 7134040 Rpal_0509 Rpal_0510     FALSE 0.007 372.000 0.003 NA   NA
 7134045 7134046 Rpal_0515 Rpal_0516     TRUE 0.977 4.000 0.700 1.000 N NA
 7134046 7134047 Rpal_0516 Rpal_0517     TRUE 0.855 -7.000 0.206 1.000 N NA
 7134048 7134049 Rpal_0518 Rpal_0519     FALSE 0.151 165.000 0.016 NA N NA
 7134049 7134050 Rpal_0519 Rpal_0520   ispG TRUE 0.549 14.000 0.002 NA N NA
 7134052 7134053 Rpal_0522 Rpal_0523     TRUE 0.949 18.000 0.444 1.000   NA
 7134054 7134055 Rpal_0524 Rpal_0525     TRUE 0.871 8.000 0.085 NA   NA
 7134056 7134057 Rpal_0526 Rpal_0527 mtgA rpmF FALSE 0.275 162.000 0.016 1.000   NA
 7134057 7134058 Rpal_0527 Rpal_0528 rpmF   FALSE 0.052 243.000 0.016 NA   NA
 7134062 7134063 Rpal_0532 Rpal_0533     TRUE 0.670 183.000 0.071 1.000 Y NA
 7134063 7134064 Rpal_0533 Rpal_0534     FALSE 0.422 77.000 0.080 NA   NA
 7134065 7134066 Rpal_0535 Rpal_0536     FALSE 0.292 131.000 0.024 1.000   NA
 7134068 7134069 Rpal_0538 Rpal_0539     FALSE 0.003 747.000 0.000 1.000   NA
 7134071 7134072 Rpal_0541 Rpal_R0009     FALSE 0.050 218.000 0.000 NA   NA
 7134075 7134076 Rpal_0544 Rpal_0545     TRUE 0.562 154.000 0.263 NA   NA
 7134076 7134077 Rpal_0545 Rpal_0546     TRUE 0.895 -3.000 0.231 NA   NA
 7134077 7134078 Rpal_0546 Rpal_0547     FALSE 0.135 95.000 0.000 NA   NA
 7134081 7134082 Rpal_0550 Rpal_0551     TRUE 0.970 -3.000 0.898 NA N NA
 7134085 7134086 Rpal_0554 Rpal_0555     TRUE 0.551 38.000 0.033 NA   NA
 7134086 7134087 Rpal_0555 Rpal_0556     TRUE 0.763 -3.000 0.046 NA   NA
 7134088 7134089 Rpal_0557 Rpal_0558     FALSE 0.177 120.000 0.000 1.000   NA
 7134091 7134092 Rpal_0560 Rpal_0561     FALSE 0.298 71.000 0.016 NA   NA
 7134092 7134093 Rpal_0561 Rpal_0562     FALSE 0.461 131.000 0.182 NA   NA
 7134093 7134094 Rpal_0562 Rpal_0563     FALSE 0.155 176.000 0.000 1.000   NA
 7134094 7134095 Rpal_0563 Rpal_0564     FALSE 0.533 76.000 0.125 1.000   NA
 7134098 7134099 Rpal_0567 Rpal_0568     FALSE 0.126 163.000 0.000 NA   NA
 7134099 7134100 Rpal_0568 Rpal_0569     FALSE 0.126 128.000 0.000 NA   NA
 7134101 7134102 Rpal_0570 Rpal_0571     FALSE 0.032 261.000 0.000 1.000   NA
 7134102 7134103 Rpal_0571 Rpal_0572     FALSE 0.202 90.000 0.004 NA   NA
 7134105 7134106 Rpal_0574 Rpal_0575     TRUE 0.915 92.000 0.560 1.000 Y NA
 7134107 7134108 Rpal_0576 Rpal_0577     TRUE 0.962 -3.000 0.594 1.000   NA
 7134108 7134109 Rpal_0577 Rpal_0578     FALSE 0.508 139.000 0.188 1.000   NA
 7134109 7134110 Rpal_0578 Rpal_0579     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 7134113 7134114 Rpal_0582 Rpal_0583     FALSE 0.013 292.000 0.000 NA   NA
 7134114 7134115 Rpal_0583 Rpal_0584     FALSE 0.232 151.000 0.017 NA   NA
 7134116 7134117 Rpal_0585 Rpal_0586     FALSE 0.407 95.000 0.108 NA   NA
 7134117 7134118 Rpal_0586 Rpal_0587     FALSE 0.074 192.000 0.000 1.000 N NA
 7134119 7134120 Rpal_0588 Rpal_0589     FALSE 0.524 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7134120 7134121 Rpal_0589 Rpal_0590     FALSE 0.389 30.000 0.000 1.000 N NA
 7134121 7134122 Rpal_0590 Rpal_0591     FALSE 0.420 41.000 0.000 1.000   NA
 7134124 7134125 Rpal_0593 Rpal_0594     FALSE 0.118 164.000 0.000 1.000 N NA
 7134126 7134127 Rpal_0595 Rpal_0596 argJ   FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134127 7134128 Rpal_0596 Rpal_0597     TRUE 0.636 8.000 0.000 NA   NA
 7134129 7134130 Rpal_0598 Rpal_0599     FALSE 0.189 146.000 0.000 1.000   NA
 7134130 7134131 Rpal_0599 Rpal_0600     TRUE 0.573 27.000 0.010 NA   NA
 7134132 7134133 Rpal_0601 Rpal_0602     TRUE 0.560 43.000 0.027 1.000   NA
 7134133 7134134 Rpal_0602 Rpal_0603     TRUE 0.786 -3.000 0.035 1.000   NA
 7134134 7134135 Rpal_0603 Rpal_0604     TRUE 0.707 -3.000 0.022 NA   NA
 7134135 7134136 Rpal_0604 Rpal_0605     FALSE 0.089 222.000 0.021 NA   NA
 7134137 7134138 Rpal_0606 Rpal_0607     FALSE 0.191 128.000 0.006 NA   NA
 7134139 7134140 Rpal_0608 Rpal_0609     FALSE 0.021 336.000 0.069 1.000 N NA
 7134140 7134141 Rpal_0609 Rpal_0610   prfA TRUE 0.656 57.000 0.034 0.031 N NA
 7134141 7134142 Rpal_0610 Rpal_0611 prfA   TRUE 0.985 -3.000 0.229 0.031 Y NA
 7134142 7134143 Rpal_0611 Rpal_0612     FALSE 0.006 452.000 0.021 NA   NA
 7134145 7134146 Rpal_0614 Rpal_0615     TRUE 0.681 33.000 0.071 NA   NA
 7134147 7134148 Rpal_0616 Rpal_0617     TRUE 0.628 -3.000 0.024 NA N NA
 7134148 7134149 Rpal_0617 Rpal_0618     TRUE 0.885 5.000 0.108 1.000 N NA
 7134150 7134151 Rpal_R0060 Rpal_0619 ffs   FALSE 0.098 180.000 0.000 NA   NA
 7134151 7134152 Rpal_0619 Rpal_0620     TRUE 0.927 22.000 0.411 NA   NA
 7134152 7134153 Rpal_0620 Rpal_0621   recR TRUE 0.752 98.000 0.604 NA   NA
 7134153 7134154 Rpal_0621 Rpal_0622 recR   TRUE 0.632 20.000 0.008 NA   NA
 7134155 7134156 Rpal_0623 Rpal_0624     FALSE 0.278 68.000 0.006 NA   NA
 7134157 7134158 Rpal_0625 Rpal_0626 def fmt TRUE 0.860 79.000 0.050 0.019 Y NA
 7134158 7134159 Rpal_0626 Rpal_0627 fmt truA TRUE 0.647 187.000 0.069 1.000 Y NA
 7134160 7134161 Rpal_0628 Rpal_0629     TRUE 0.795 0.000 0.010 1.000   NA
 7134161 7134162 Rpal_0629 Rpal_0630   dapD TRUE 0.716 19.000 0.009 1.000   NA
 7134162 7134163 Rpal_0630 Rpal_0631 dapD   FALSE 0.303 185.000 0.071 1.000   NA
 7134163 7134164 Rpal_0631 Rpal_0632     TRUE 0.885 -3.000 0.041 0.092   NA
 7134164 7134165 Rpal_0632 Rpal_0633     FALSE 0.266 102.000 0.012 1.000   NA
 7134165 7134166 Rpal_0633 Rpal_0634     FALSE 0.204 125.000 0.012 NA   NA
 7134166 7134167 Rpal_0634 Rpal_0635   engB TRUE 0.770 0.000 0.022 NA   NA
 7134167 7134168 Rpal_0635 Rpal_0636 engB   TRUE 0.586 152.000 0.082 0.057   NA
 7134168 7134169 Rpal_0636 Rpal_0637     TRUE 0.833 17.000 0.105 1.000 N NA
 7134169 7134170 Rpal_0637 Rpal_0638   rpmH TRUE 0.965 24.000 0.787 1.000   NA
 7134171 7134172 Rpal_0639 Rpal_R0010     FALSE 0.024 250.000 0.000 NA   NA
 7134173 7134174 Rpal_0640 Rpal_0641     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134175 7134176 Rpal_0642 Rpal_0643     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134176 7134177 Rpal_0643 Rpal_0644     FALSE 0.198 65.000 0.000 NA   NA
 7134177 7134178 Rpal_0644 Rpal_0645     TRUE 0.967 5.000 0.500 NA   NA
 7134178 7134179 Rpal_0645 Rpal_0646     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134179 7134180 Rpal_0646 Rpal_0647     TRUE 0.895 12.000 0.111 1.000   NA
 7134180 7134181 Rpal_0647 Rpal_0648     TRUE 0.924 2.000 0.222 NA   NA
 7134181 7134182 Rpal_0648 Rpal_0649     TRUE 0.940 0.000 0.308 NA   NA
 7134182 7134183 Rpal_0649 Rpal_0650     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134183 7134184 Rpal_0650 Rpal_0651     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7134184 7134185 Rpal_0651 Rpal_0652     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7134185 7134186 Rpal_0652 Rpal_0653     FALSE 0.002 615.000 0.000 NA   NA
 7134186 7134187 Rpal_0653 Rpal_0654     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134187 7134188 Rpal_0654 Rpal_0655     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134188 7134189 Rpal_0655 Rpal_0656     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134189 7134190 Rpal_0656 Rpal_0657     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134190 7134191 Rpal_0657 Rpal_0658     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134191 7134192 Rpal_0658 Rpal_0659     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134192 7134193 Rpal_0659 Rpal_0660     FALSE 0.290 46.000 0.000 NA   NA
 7134193 7134194 Rpal_0660 Rpal_0661     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134194 7134195 Rpal_0661 Rpal_0662     FALSE 0.121 117.000 0.000 NA   NA
 7134195 7134196 Rpal_0662 Rpal_0663     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134196 7134197 Rpal_0663 Rpal_0664     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134197 7134198 Rpal_0664 Rpal_0665     FALSE 0.459 -73.000 0.000 NA   NA
 7134198 7134199 Rpal_0665 Rpal_0666     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134199 7134200 Rpal_0666 Rpal_0667     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7134200 7134201 Rpal_0667 Rpal_0668     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134201 7134202 Rpal_0668 Rpal_0669     TRUE 0.958 5.000 0.400 NA   NA
 7134202 7134203 Rpal_0669 Rpal_0670     TRUE 0.832 -3.000 0.100 NA   NA
 7134203 7134204 Rpal_0670 Rpal_0671     TRUE 0.851 -6.000 0.190 NA   NA
 7134204 7134205 Rpal_0671 Rpal_0672     TRUE 0.956 3.000 0.381 NA   NA
 7134205 7134206 Rpal_0672 Rpal_0673     FALSE 0.018 272.000 0.000 NA   NA
 7134206 7134207 Rpal_0673 Rpal_0674     TRUE 0.946 0.000 0.333 NA   NA
 7134207 7134208 Rpal_0674 Rpal_R0011     TRUE 0.628 10.000 0.000 NA   NA
 7134208 7134209 Rpal_R0011 Rpal_0675     FALSE 0.275 49.000 0.000 NA   NA
 7134209 7134210 Rpal_0675 Rpal_0676     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134210 7134211 Rpal_0676 Rpal_0677     FALSE 0.128 104.000 0.000 NA   NA
 7134211 7134212 Rpal_0677 Rpal_0678     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134212 7134213 Rpal_0678 Rpal_0679     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7134213 7134214 Rpal_0679 Rpal_0680     TRUE 0.943 0.000 0.317 NA   NA
 7134214 7134215 Rpal_0680 Rpal_0681     TRUE 0.832 -3.000 0.100 NA   NA
 7134215 7134216 Rpal_0681 Rpal_0682     TRUE 0.942 -3.000 0.429 NA   NA
 7134216 7134217 Rpal_0682 Rpal_0683     TRUE 0.639 6.000 0.000 NA   NA
 7134217 7134218 Rpal_0683 Rpal_0684     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7134218 7134219 Rpal_0684 Rpal_0685     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134219 7134220 Rpal_0685 Rpal_0686     TRUE 0.818 -3.000 0.083 NA   NA
 7134220 7134221 Rpal_0686 Rpal_0687     TRUE 0.897 12.000 0.167 NA   NA
 7134221 7134222 Rpal_0687 Rpal_0688     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7134222 7134223 Rpal_0688 Rpal_0689     FALSE 0.488 22.000 0.000 NA   NA
 7134223 7134224 Rpal_0689 Rpal_0690     FALSE 0.222 59.000 0.000 NA   NA
 7134224 7134225 Rpal_0690 Rpal_0691     FALSE 0.133 97.000 0.000 NA   NA
 7134225 7134226 Rpal_0691 Rpal_0692     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134226 7134227 Rpal_0692 Rpal_0693     FALSE 0.014 282.000 0.000 NA   NA
 7134227 7134228 Rpal_0693 Rpal_0694     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134228 7134229 Rpal_0694 Rpal_0695     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134229 7134230 Rpal_0695 Rpal_0696     TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7134230 7134231 Rpal_0696 Rpal_0697     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134231 7134232 Rpal_0697 Rpal_0698     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134232 7134233 Rpal_0698 Rpal_0699     TRUE 0.596 13.000 0.000 NA   NA
 7134233 7134234 Rpal_0699 Rpal_0700     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7134234 7134235 Rpal_0700 Rpal_0701     FALSE 0.008 320.000 0.000 NA   NA
 7134235 7134236 Rpal_0701 Rpal_0702     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7134237 7134238 Rpal_0703 Rpal_0704     TRUE 0.818 27.000 0.182 NA   NA
 7134238 7134239 Rpal_0704 Rpal_0705     FALSE 0.438 77.000 0.088 NA   NA
 7134240 7134241 Rpal_0706 Rpal_0707     TRUE 0.642 143.000 0.389 1.000 N NA
 7134241 7134242 Rpal_0707 Rpal_0708     TRUE 0.809 62.000 0.037 1.000 Y NA
 7134242 7134243 Rpal_0708 Rpal_0709     TRUE 0.984 0.000 0.043 0.002 Y NA
 7134243 7134244 Rpal_0709 Rpal_0710     FALSE 0.538 96.000 0.238 NA   NA
 7134244 7134245 Rpal_0710 Rpal_0711     FALSE 0.004 378.000 0.000 NA   NA
 7134245 7134246 Rpal_0711 Rpal_0712   flgE TRUE 0.968 20.000 0.250 NA Y NA
 7134246 7134247 Rpal_0712 Rpal_0713 flgE   TRUE 0.925 6.000 0.222 NA   NA
 7134247 7134248 Rpal_0713 Rpal_0714     TRUE 0.884 25.000 0.286 NA   NA
 7134248 7134249 Rpal_0714 Rpal_0715     TRUE 0.978 22.000 0.583 0.002   NA
 7134249 7134250 Rpal_0715 Rpal_0716   flgL TRUE 0.995 16.000 0.750 0.005 Y NA
 7134251 7134252 Rpal_0717 Rpal_0718     TRUE 0.962 28.000 0.105 0.091 Y NA
 7134252 7134253 Rpal_0718 Rpal_0719     TRUE 0.911 57.000 0.250 1.000 Y NA
 7134253 7134254 Rpal_0719 Rpal_0720     TRUE 0.631 65.000 0.225 1.000 N NA
 7134254 7134255 Rpal_0720 Rpal_0721     TRUE 0.974 29.000 1.000 0.091 N NA
 7134256 7134257 Rpal_0722 Rpal_0723     TRUE 0.578 89.000 0.222 1.000   NA
 7134257 7134258 Rpal_0723 Rpal_0724     FALSE 0.171 169.000 0.000 1.000   NA
 7134258 7134259 Rpal_0724 Rpal_0725     TRUE 0.996 -3.000 0.800 0.001 Y NA
 7134259 7134260 Rpal_0725 Rpal_0726     TRUE 0.992 12.000 0.875 0.001   NA
 7134260 7134261 Rpal_0726 Rpal_0727     TRUE 0.925 94.000 0.875 0.001   NA
 7134261 7134262 Rpal_0727 Rpal_0728     TRUE 0.809 116.000 0.222 1.000 Y NA
 7134262 7134263 Rpal_0728 Rpal_0729     TRUE 0.840 17.000 0.111 NA   NA
 7134264 7134265 Rpal_0730 Rpal_0731     TRUE 0.833 55.000 0.545 NA N NA
 7134265 7134266 Rpal_0731 Rpal_0732     FALSE 0.124 99.000 0.000 1.000 N NA
 7134266 7134267 Rpal_0732 Rpal_0733     TRUE 0.979 -3.000 0.115 0.033 Y NA
 7134267 7134268 Rpal_0733 Rpal_0734     TRUE 0.985 -3.000 0.269 0.053 Y NA
 7134268 7134269 Rpal_0734 Rpal_0735     TRUE 0.891 86.000 0.429 NA Y NA
 7134269 7134270 Rpal_0735 Rpal_0736     TRUE 0.720 177.000 0.750 NA N NA
 7134271 7134272 Rpal_0737 Rpal_0738     TRUE 0.995 -3.000 0.714 0.001 Y NA
 7134272 7134273 Rpal_0738 Rpal_0739     TRUE 0.995 -3.000 0.714 0.001 Y NA
 7134275 7134276 Rpal_0741 Rpal_0742     FALSE 0.531 36.000 0.021 NA   NA
 7134276 7134277 Rpal_0742 Rpal_0743     FALSE 0.320 129.000 0.063 NA   NA
 7134277 7134278 Rpal_0743 Rpal_0744     TRUE 0.839 171.000 1.000 1.000   NA
 7134278 7134279 Rpal_0744 Rpal_0745     FALSE 0.043 328.000 0.000 0.006   NA
 7134280 7134281 Rpal_0746 Rpal_0747     FALSE 0.183 67.000 0.000 1.000 N NA
 7134282 7134283 Rpal_0748 Rpal_0749     TRUE 0.953 -3.000 0.464 1.000   NA
 7134283 7134284 Rpal_0749 Rpal_0750     TRUE 0.962 3.000 0.125 0.004   NA
 7134286 7134287 Rpal_0752 Rpal_0753     FALSE 0.130 161.000 0.000 NA   NA
 7134288 7134289 Rpal_0754 Rpal_0755     TRUE 0.767 -19.000 0.056 1.000   NA
 7134289 7134290 Rpal_0755 Rpal_0756     TRUE 0.957 -3.000 0.068 1.000 Y NA
 7134290 7134291 Rpal_0756 Rpal_0757     TRUE 0.963 -3.000 0.104 1.000 Y NA
 7134291 7134292 Rpal_0757 Rpal_0758   phnK TRUE 0.997 0.000 0.859 0.032 Y NA
 7134292 7134293 Rpal_0758 Rpal_0759 phnK   TRUE 0.990 -7.000 0.883 1.000 Y NA
 7134293 7134294 Rpal_0759 Rpal_0760     TRUE 0.992 -3.000 0.880 1.000 Y NA
 7134294 7134295 Rpal_0760 Rpal_0761   phnH TRUE 0.998 4.000 0.960 0.002 Y NA
 7134295 7134296 Rpal_0761 Rpal_0762 phnH   TRUE 0.998 3.000 0.967 0.002 Y NA
 7134298 7134299 Rpal_0764 Rpal_0765     FALSE 0.131 147.000 0.000 NA   NA
 7134299 7134300 Rpal_0765 Rpal_0766     TRUE 0.993 -3.000 0.491 0.001 Y NA
 7134300 7134301 Rpal_0766 Rpal_0767     TRUE 0.971 69.000 0.568 0.001 Y NA
 7134301 7134302 Rpal_0767 Rpal_0768     TRUE 0.953 110.000 0.589 0.002 Y NA
 7134303 7134304 Rpal_0769 Rpal_0770     TRUE 0.796 -3.000 0.041 1.000   NA
 7134304 7134305 Rpal_0770 Rpal_0771     TRUE 0.707 23.000 0.041 NA   NA
 7134309 7134310 Rpal_0775 Rpal_0776     FALSE 0.217 60.000 0.000 NA   NA
 7134312 7134313 Rpal_0778 Rpal_0779     TRUE 0.739 106.000 0.600 NA   NA
 7134313 7134314 Rpal_0779 Rpal_0780     FALSE 0.112 172.000 0.000 NA   NA
 7134314 7134315 Rpal_0780 Rpal_0781     FALSE 0.306 43.000 0.000 NA   NA
 7134316 7134317 Rpal_0782 Rpal_0783     TRUE 0.675 -3.000 0.013 1.000 N NA
 7134318 7134319 Rpal_0784 Rpal_0785     TRUE 0.682 -3.000 0.013 NA   NA
 7134319 7134320 Rpal_0785 Rpal_0786     TRUE 0.879 4.000 0.063 1.000   NA
 7134320 7134321 Rpal_0786 Rpal_0787   cobN TRUE 0.599 135.000 0.274 1.000   NA
 7134321 7134322 Rpal_0787 Rpal_0788 cobN   TRUE 0.954 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 7134322 7134323 Rpal_0788 Rpal_0789     TRUE 0.858 148.000 0.078 0.007 Y NA
 7134324 7134325 Rpal_0790 Rpal_0791     TRUE 0.784 2.000 0.024 1.000 N NA
 7134327 7134328 Rpal_0793 Rpal_0794     TRUE 0.993 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7134328 7134329 Rpal_0794 Rpal_0795     TRUE 0.979 8.000 0.188 1.000 Y NA
 7134329 7134330 Rpal_0795 Rpal_0796     FALSE 0.118 333.000 0.000 0.056 Y NA
 7134330 7134331 Rpal_0796 Rpal_0797     TRUE 0.729 -3.000 0.033 1.000 N NA
 7134332 7134333 Rpal_0798 Rpal_0799     FALSE 0.001 555.000 0.000 NA N NA
 7134333 7134334 Rpal_0799 Rpal_0800     TRUE 0.993 11.000 0.750 NA Y NA
 7134334 7134335 Rpal_0800 Rpal_0801     TRUE 0.936 13.000 0.000 NA Y NA
 7134335 7134336 Rpal_0801 Rpal_0802     FALSE 0.001 531.000 0.000 NA N NA
 7134336 7134337 Rpal_0802 Rpal_0803     FALSE 0.129 265.000 0.243 1.000 N NA
 7134337 7134338 Rpal_0803 Rpal_0804     TRUE 0.996 -3.000 0.870 0.008 Y NA
 7134338 7134339 Rpal_0804 Rpal_0805     TRUE 0.965 12.000 0.466 1.000   NA
 7134339 7134340 Rpal_0805 Rpal_0806     TRUE 0.966 0.000 0.180 0.002   NA
 7134340 7134341 Rpal_0806 Rpal_0807     TRUE 0.971 -10.000 0.458 0.002   NA
 7134341 7134342 Rpal_0807 Rpal_0808     FALSE 0.433 64.000 0.057 NA   NA
 7134342 7134343 Rpal_0808 Rpal_0809     FALSE 0.020 263.000 0.000 NA   NA
 7134343 7134344 Rpal_0809 Rpal_0810     FALSE 0.258 145.000 0.036 1.000 N NA
 7134344 7134345 Rpal_0810 Rpal_0811     FALSE 0.399 75.000 0.000 0.074 N NA
 7134345 7134346 Rpal_0811 Rpal_0812     TRUE 0.834 -3.000 0.070 1.000   NA
 7134346 7134347 Rpal_0812 Rpal_0813     TRUE 0.974 0.000 0.674 NA   NA
 7134347 7134348 Rpal_0813 Rpal_0814     FALSE 0.103 177.000 0.000 NA   NA
 7134349 7134350 Rpal_0815 Rpal_0816     TRUE 0.573 140.000 0.250 1.000   NA
 7134350 7134351 Rpal_0816 Rpal_0817     TRUE 0.712 99.000 0.500 NA   NA
 7134351 7134352 Rpal_0817 Rpal_0818     FALSE 0.002 742.000 0.000 NA   NA
 7134352 7134353 Rpal_0818 Rpal_0819     TRUE 0.946 -10.000 0.070 1.000 Y NA
 7134353 7134354 Rpal_0819 Rpal_0820     TRUE 0.992 5.000 0.935 0.001 N NA
 7134354 7134355 Rpal_0820 Rpal_0821     FALSE 0.134 293.000 0.097 0.001 N NA
 7134355 7134356 Rpal_0821 Rpal_0822     FALSE 0.215 125.000 0.019 1.000 N NA
 7134357 7134358 Rpal_0823 Rpal_0824     TRUE 0.984 22.000 0.830 0.001 N NA
 7134359 7134360 Rpal_0825 Rpal_0826     FALSE 0.121 132.000 0.000 1.000 N NA
 7134360 7134361 Rpal_0826 Rpal_0827     TRUE 0.902 1.000 0.161 1.000 N NA
 7134361 7134362 Rpal_0827 Rpal_0828     TRUE 0.960 -3.000 0.625 NA   NA
 7134362 7134363 Rpal_0828 Rpal_0829     TRUE 0.888 14.000 0.179 NA   NA
 7134363 7134364 Rpal_0829 Rpal_0830     TRUE 0.994 5.000 0.742 1.000 Y NA
 7134364 7134365 Rpal_0830 Rpal_0831     TRUE 0.994 20.000 0.871 0.052 Y NA
 7134365 7134366 Rpal_0831 Rpal_0832     TRUE 0.896 198.000 0.593 0.052 Y NA
 7134367 7134368 Rpal_0833 Rpal_0834     FALSE 0.007 331.000 0.000 1.000 N NA
 7134369 7134370 Rpal_0835 Rpal_0836     TRUE 0.604 21.000 0.000 1.000   NA
 7134371 7134372 Rpal_0837 Rpal_0838     TRUE 0.625 106.000 0.000 1.000 Y NA
 7134373 7134374 Rpal_0839 Rpal_0840     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134374 7134375 Rpal_0840 Rpal_0841     TRUE 0.834 -3.000 0.103 NA   NA
 7134375 7134376 Rpal_0841 Rpal_R0012     FALSE 0.003 470.000 0.000 NA   NA
 7134376 7134377 Rpal_R0012 Rpal_0842     FALSE 0.094 183.000 0.000 NA   NA
 7134379 7134380 Rpal_0844 Rpal_0845     FALSE 0.115 119.000 0.000 1.000 N NA
 7134380 7134381 Rpal_0845 Rpal_0846     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 7134383 7134384 Rpal_0848 Rpal_0849     TRUE 0.906 81.000 0.833 0.074   NA
 7134384 7134385 Rpal_0849 Rpal_0850     TRUE 0.977 9.000 0.714 NA   NA
 7134385 7134386 Rpal_0850 Rpal_0851     FALSE 0.454 189.000 0.294 NA   NA
 7134388 7134389 Rpal_0853 Rpal_0854     FALSE 0.377 121.000 0.111 1.000 N NA
 7134390 7134391 Rpal_0855 Rpal_0856     FALSE 0.035 253.000 0.000 1.000   NA
 7134392 7134393 Rpal_0857 Rpal_0858     FALSE 0.483 56.000 0.054 NA   NA
 7134393 7134394 Rpal_0858 Rpal_0859     TRUE 0.645 34.000 0.057 NA   NA
 7134394 7134395 Rpal_0859 Rpal_0860     TRUE 0.710 114.000 0.538 NA   NA
 7134397 7134398 Rpal_0862 Rpal_0863     FALSE 0.311 87.000 0.045 1.000 N NA
 7134399 7134400 Rpal_0864 Rpal_0865     TRUE 0.837 -3.000 0.108 NA   NA
 7134401 7134402 Rpal_0866 Rpal_0867     FALSE 0.391 144.000 0.071 1.000   NA
 7134402 7134403 Rpal_0867 Rpal_0868     FALSE 0.193 138.000 0.009 1.000 N NA
 7134403 7134404 Rpal_0868 Rpal_0869     TRUE 0.719 19.000 0.033 NA   NA
 7134404 7134405 Rpal_0869 Rpal_0870     FALSE 0.381 72.000 0.049 NA   NA
 7134405 7134406 Rpal_0870 Rpal_0871     TRUE 0.968 -3.000 0.751 1.000 N NA
 7134409 7134410 Rpal_0874 Rpal_0875     FALSE 0.193 176.000 0.020 NA   NA
 7134410 7134411 Rpal_0875 Rpal_0876     TRUE 0.808 65.000 0.460 1.000   NA
 7134413 7134414 Rpal_0878 Rpal_0879     FALSE 0.148 86.000 0.000 NA   NA
 7134415 7134416 Rpal_0880 Rpal_0881     TRUE 0.910 -3.000 0.274 NA   NA
 7134416 7134417 Rpal_0881 Rpal_0882     FALSE 0.081 237.000 0.019 1.000   NA
 7134417 7134418 Rpal_0882 Rpal_0883     FALSE 0.034 254.000 0.000 1.000   NA
 7134419 7134420 Rpal_0884 Rpal_0885     FALSE 0.371 94.000 0.080 NA   NA
 7134420 7134421 Rpal_0885 Rpal_0886     TRUE 0.808 171.000 0.247 1.000 Y NA
 7134421 7134422 Rpal_0886 Rpal_0887     TRUE 0.905 125.000 0.562 1.000 Y NA
 7134424 7134425 Rpal_0889 Rpal_0890     FALSE 0.368 94.000 0.082 1.000 N NA
 7134425 7134426 Rpal_0890 Rpal_0891     FALSE 0.367 146.000 0.057 1.000   NA
 7134427 7134428 Rpal_0892 Rpal_0893     TRUE 0.700 -3.000 0.018 NA   NA
 7134429 7134430 Rpal_0894 Rpal_0895     TRUE 0.897 0.000 0.154 NA   NA
 7134430 7134431 Rpal_0895 Rpal_0896     FALSE 0.153 83.000 0.000 NA   NA
 7134431 7134432 Rpal_0896 Rpal_0897     TRUE 0.592 115.000 0.333 1.000 N NA
 7134434 7134435 Rpal_0899 Rpal_0900     TRUE 0.977 68.000 0.741 0.002 Y NA
 7134435 7134436 Rpal_0900 Rpal_0901     TRUE 0.682 73.000 0.153 0.056 N NA
 7134436 7134437 Rpal_0901 Rpal_0902     TRUE 0.739 12.000 0.012 NA   NA
 7134437 7134438 Rpal_0902 Rpal_0903     TRUE 0.716 15.000 0.017 NA   NA
 7134438 7134439 Rpal_0903 Rpal_0904     TRUE 0.790 72.000 0.536 1.000 N NA
 7134439 7134440 Rpal_0904 Rpal_0905     FALSE 0.402 163.000 0.122 NA   NA
 7134440 7134441 Rpal_0905 Rpal_0906     TRUE 0.888 -3.000 0.220 NA   NA
 7134441 7134442 Rpal_0906 Rpal_0907     FALSE 0.196 147.000 0.006 NA   NA
 7134442 7134443 Rpal_0907 Rpal_0908     TRUE 0.871 -3.000 0.129 1.000   NA
 7134443 7134444 Rpal_0908 Rpal_0909     TRUE 0.873 62.000 0.674 1.000   NA
 7134444 7134445 Rpal_0909 Rpal_0910     FALSE 0.389 119.000 0.120 NA   NA
 7134446 7134447 Rpal_0911 Rpal_0912     TRUE 0.997 6.000 0.863 0.004 Y NA
 7134447 7134448 Rpal_0912 Rpal_0913     TRUE 0.871 58.000 0.278 0.004   NA
 7134448 7134449 Rpal_0913 Rpal_0914     TRUE 0.947 49.000 0.628 0.005   NA
 7134449 7134450 Rpal_0914 Rpal_0915     TRUE 0.581 70.000 0.195 NA   NA
 7134451 7134452 Rpal_0916 Rpal_0917     TRUE 0.774 46.000 0.267 NA   NA
 7134452 7134453 Rpal_0917 Rpal_0918     TRUE 0.624 24.000 0.015 NA   NA
 7134456 7134457 Rpal_0921 Rpal_0922     FALSE 0.305 188.000 0.133 1.000 N NA
 7134457 7134458 Rpal_0922 Rpal_0923     FALSE 0.232 221.000 0.143 1.000   NA
 7134458 7134459 Rpal_0923 Rpal_0924     FALSE 0.178 166.000 0.000 1.000   NA
 7134459 7134460 Rpal_0924 Rpal_0925     FALSE 0.049 216.000 0.000 1.000 N NA
 7134461 7134462 Rpal_0926 Rpal_0927     TRUE 0.990 5.000 0.465 1.000 Y NA
 7134462 7134463 Rpal_0927 Rpal_0928     TRUE 0.989 6.000 0.400 1.000 Y NA
 7134463 7134464 Rpal_0928 Rpal_0929     FALSE 0.404 147.000 0.112 NA   NA
 7134464 7134465 Rpal_0929 Rpal_0930     TRUE 0.855 -3.000 0.141 NA   NA
 7134465 7134466 Rpal_0930 Rpal_0931     TRUE 0.583 35.000 0.036 NA   NA
 7134466 7134467 Rpal_0931 Rpal_0932     FALSE 0.357 61.000 0.022 NA   NA
 7134468 7134469 Rpal_0933 Rpal_0934     TRUE 0.566 110.000 0.300 1.000 N NA
 7134469 7134470 Rpal_0934 Rpal_0935     FALSE 0.005 295.000 0.000 NA N NA
 7134470 7134471 Rpal_0935 Rpal_0936     FALSE 0.294 98.000 0.045 NA   NA
 7134471 7134472 Rpal_0936 Rpal_0937     TRUE 0.794 11.000 0.032 NA   NA
 7134472 7134473 Rpal_0937 Rpal_0938     TRUE 0.583 143.000 0.257 1.000   NA
 7134473 7134474 Rpal_0938 Rpal_0939     FALSE 0.002 664.000 0.000 NA   NA
 7134475 7134476 Rpal_0940 Rpal_0941     TRUE 0.867 5.000 0.077 NA   NA
 7134476 7134477 Rpal_0941 Rpal_0942     TRUE 0.678 156.000 0.420 NA   NA
 7134477 7134478 Rpal_0942 Rpal_0943   hemH FALSE 0.330 176.000 0.067 1.000   NA
 7134478 7134479 Rpal_0943 Rpal_0944 hemH   FALSE 0.327 157.000 0.092 NA N NA
 7134479 7134480 Rpal_0944 Rpal_0945     TRUE 0.977 17.000 0.313 NA Y NA
 7134481 7134482 Rpal_0946 Rpal_0947     FALSE 0.005 350.000 0.000 1.000 N NA
 7134483 7134484 Rpal_0948 Rpal_0949     FALSE 0.522 113.000 0.250 NA   NA
 7134485 7134486 Rpal_0950 Rpal_0951     TRUE 0.942 110.000 0.914 1.000 Y NA
 7134486 7134487 Rpal_0951 Rpal_0952     FALSE 0.195 249.000 0.000 NA Y NA
 7134487 7134488 Rpal_0952 Rpal_0953     FALSE 0.126 128.000 0.000 NA   NA
 7134490 7134491 Rpal_0955 Rpal_0956     FALSE 0.263 124.000 0.041 1.000 N NA
 7134494 7134495 Rpal_0959 Rpal_0960   gltD TRUE 0.899 173.000 0.236 0.001 Y NA
 7134495 7134496 Rpal_0960 Rpal_0961 gltD   FALSE 0.008 358.000 0.000 1.000   NA
 7134497 7134498 Rpal_0962 Rpal_0963     FALSE 0.002 1040.000 0.000 1.000   NA
 7134500 7134501 Rpal_0965 Rpal_0966     FALSE 0.329 147.000 0.038 1.000   NA
 7134501 7134502 Rpal_0966 Rpal_0967     FALSE 0.019 268.000 0.000 NA   NA
 7134502 7134503 Rpal_0967 Rpal_0968     FALSE 0.124 124.000 0.000 NA   NA
 7134505 7134506 Rpal_0970 Rpal_0971     FALSE 0.280 48.000 0.000 NA   NA
 7134508 7134509 Rpal_0973 Rpal_0974     FALSE 0.001 699.000 0.000 NA N NA
 7134509 7134510 Rpal_0974 Rpal_0975     FALSE 0.065 151.000 0.000 NA N NA
 7134511 7134512 Rpal_0976 Rpal_R0013     FALSE 0.150 85.000 0.000 NA   NA
 7134512 7134513 Rpal_R0013 Rpal_0977     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7134514 7134515 Rpal_0978 Rpal_0979     FALSE 0.329 155.000 0.061 NA   NA
 7134515 7134516 Rpal_0979 Rpal_0980     TRUE 0.555 166.000 0.286 NA   NA
 7134520 7134521 Rpal_0984 Rpal_0985     FALSE 0.412 123.000 0.143 1.000 N NA
 7134522 7134523 Rpal_0986 Rpal_0987     FALSE 0.017 421.000 0.141 NA   NA
 7134526 7134527 Rpal_0990 Rpal_0991     TRUE 0.564 137.000 0.236 1.000   NA
 7134527 7134528 Rpal_0991 Rpal_0992     TRUE 0.851 0.000 0.073 NA   NA
 7134529 7134530 Rpal_0993 Rpal_0994     TRUE 0.933 -3.000 0.324 1.000   NA
 7134530 7134531 Rpal_0994 Rpal_0995     FALSE 0.014 283.000 0.000 NA   NA
 7134531 7134532 Rpal_0995 Rpal_0996     TRUE 0.864 85.000 1.000 NA   NA
 7134533 7134534 Rpal_0997 Rpal_0998     TRUE 0.864 4.000 0.073 NA   NA
 7134536 7134537 Rpal_1000 Rpal_1001     TRUE 0.947 -3.000 0.051 NA Y NA
 7134538 7134539 Rpal_1002 Rpal_1003     TRUE 0.955 4.000 0.381 1.000 N NA
 7134539 7134540 Rpal_1003 Rpal_1004     TRUE 0.982 69.000 0.948 0.002 Y NA
 7134543 7134544 Rpal_1007 Rpal_1008     FALSE 0.295 105.000 0.026 1.000   NA
 7134544 7134545 Rpal_1008 Rpal_1009     TRUE 0.891 17.000 0.181 1.000   NA
 7134545 7134546 Rpal_1009 Rpal_1010     TRUE 0.864 6.000 0.078 1.000 N NA
 7134546 7134547 Rpal_1010 Rpal_1011     FALSE 0.408 55.000 0.026 1.000 N NA
 7134547 7134548 Rpal_1011 Rpal_1012     TRUE 0.852 -3.000 0.135 NA   NA
 7134548 7134549 Rpal_1012 Rpal_1013   pgk FALSE 0.189 99.000 0.004 NA   NA
 7134549 7134550 Rpal_1013 Rpal_1014 pgk   TRUE 0.595 222.000 0.011 0.003 Y NA
 7134550 7134551 Rpal_1014 Rpal_1015     TRUE 0.748 216.000 0.439 1.000 Y NA
 7134552 7134553 Rpal_1016 Rpal_1017     TRUE 0.798 -3.000 0.068 NA   NA
 7134554 7134555 Rpal_1018 Rpal_1019     FALSE 0.392 47.000 0.009 1.000 N NA
 7134555 7134556 Rpal_1019 Rpal_1020     FALSE 0.285 63.000 0.006 1.000 N NA
 7134556 7134557 Rpal_1020 Rpal_1021     TRUE 0.660 3.000 0.010 NA N NA
 7134557 7134558 Rpal_1021 Rpal_1022     FALSE 0.046 223.000 0.007 NA N NA
 7134558 7134559 Rpal_1022 Rpal_1023     FALSE 0.007 415.000 0.020 1.000 N NA
 7134559 7134560 Rpal_1023 Rpal_1024     FALSE 0.181 83.000 0.015 NA N NA
 7134560 7134561 Rpal_1024 Rpal_1025     FALSE 0.289 106.000 0.078 NA N NA
 7134563 7134564 Rpal_1027 Rpal_1028     TRUE 0.826 174.000 0.303 1.000 Y NA
 7134565 7134566 Rpal_R0014 Rpal_1029     FALSE 0.129 103.000 0.000 NA   NA
 7134566 7134567 Rpal_1029 Rpal_1030     FALSE 0.243 218.000 0.000 0.005   NA
 7134567 7134568 Rpal_1030 Rpal_1031     FALSE 0.530 18.000 0.000 NA   NA
 7134568 7134569 Rpal_1031 Rpal_1032     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7134569 7134570 Rpal_1032 Rpal_1033     FALSE 0.470 24.000 0.000 NA   NA
 7134570 7134571 Rpal_1033 Rpal_1034     FALSE 0.284 47.000 0.000 NA   NA
 7134571 7134572 Rpal_1034 Rpal_1035     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134572 7134573 Rpal_1035 Rpal_1036     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7134573 7134574 Rpal_1036 Rpal_1037     FALSE 0.047 221.000 0.000 NA   NA
 7134575 7134576 Rpal_1038 Rpal_1039     TRUE 0.949 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7134576 7134577 Rpal_1039 Rpal_1040     FALSE 0.032 261.000 0.000 1.000   NA
 7134578 7134579 Rpal_1041 Rpal_1042     FALSE 0.040 229.000 0.000 NA   NA
 7134579 7134580 Rpal_1042 Rpal_1043     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7134581 7134582 Rpal_1044 Rpal_1045     FALSE 0.001 608.000 0.000 NA N NA
 7134582 7134583 Rpal_1045 Rpal_1046     TRUE 0.550 15.000 0.000 1.000 N NA
 7134583 7134584 Rpal_1046 Rpal_1047     TRUE 0.903 26.000 0.000 1.000 Y NA
 7134584 7134585 Rpal_1047 Rpal_1048     FALSE 0.002 526.000 0.000 NA   NA
 7134585 7134586 Rpal_1048 Rpal_1049     FALSE 0.061 209.000 0.000 NA   NA
 7134586 7134587 Rpal_1049 Rpal_1050     TRUE 0.967 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 7134587 7134588 Rpal_1050 Rpal_1051     TRUE 0.993 -19.000 0.697 0.004 Y NA
 7134588 7134589 Rpal_1051 Rpal_1052     TRUE 0.997 5.000 0.727 0.004 Y NA
 7134589 7134590 Rpal_1052 Rpal_1053     TRUE 0.996 -3.000 0.818 0.005 Y NA
 7134590 7134591 Rpal_1053 Rpal_1054     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134591 7134592 Rpal_1054 Rpal_1055     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134592 7134593 Rpal_1055 Rpal_1056     TRUE 0.964 -3.000 0.671 NA   NA
 7134593 7134594 Rpal_1056 Rpal_1057     TRUE 0.975 -3.000 0.029 0.004 Y NA
 7134595 7134596 Rpal_1058 Rpal_1059     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134596 7134597 Rpal_1059 Rpal_1060     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 7134597 7134598 Rpal_1060 Rpal_1061     FALSE 0.459 25.000 0.000 NA   NA
 7134598 7134599 Rpal_1061 Rpal_1062     FALSE 0.004 385.000 0.000 NA   NA
 7134599 7134600 Rpal_1062 Rpal_1063     FALSE 0.002 568.000 0.000 NA   NA
 7134602 7134603 Rpal_1065 Rpal_1066     FALSE 0.002 624.000 0.000 NA   NA
 7134603 7134604 Rpal_1066 Rpal_1067     FALSE 0.115 170.000 0.000 NA   NA
 7134604 7134605 Rpal_1067 Rpal_1068     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7134605 7134606 Rpal_1068 Rpal_1069     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134606 7134607 Rpal_1069 Rpal_1070     FALSE 0.127 140.000 0.000 NA   NA
 7134607 7134608 Rpal_1070 Rpal_1071     FALSE 0.381 33.000 0.000 NA   NA
 7134608 7134609 Rpal_1071 Rpal_1072     FALSE 0.003 490.000 0.000 NA   NA
 7134609 7134610 Rpal_1072 Rpal_1073     FALSE 0.488 22.000 0.000 NA   NA
 7134612 7134613 Rpal_1075 Rpal_1076     TRUE 0.634 1.000 0.000 NA   NA
 7134617 7134618 Rpal_1080 Rpal_1081     FALSE 0.010 301.000 0.000 NA   NA
 7134618 7134619 Rpal_1081 Rpal_1082     FALSE 0.240 56.000 0.000 NA   NA
 7134621 7134622 Rpal_1084 Rpal_1085     TRUE 0.600 27.000 0.017 NA   NA
 7134622 7134623 Rpal_1085 Rpal_1086     TRUE 0.910 2.000 0.017 0.072   NA
 7134623 7134624 Rpal_1086 Rpal_1087     TRUE 0.982 -3.000 0.667 0.017   NA
 7134626 7134627 Rpal_1089 Rpal_1090     TRUE 0.963 4.000 0.444 NA   NA
 7134627 7134628 Rpal_1090 Rpal_1091     TRUE 0.949 13.000 0.400 1.000 N NA
 7134628 7134629 Rpal_1091 Rpal_1092     TRUE 0.971 -3.000 0.400 0.003 N NA
 7134629 7134630 Rpal_1092 Rpal_1093     TRUE 0.897 30.000 0.400 NA   NA
 7134630 7134631 Rpal_1093 Rpal_1094     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 7134631 7134632 Rpal_1094 Rpal_1095     FALSE 0.037 230.000 0.000 1.000 N NA
 7134634 7134635 Rpal_1097 Rpal_1098     FALSE 0.465 -19.000 0.000 NA   NA
 7134635 7134636 Rpal_1098 Rpal_1099     FALSE 0.002 549.000 0.000 NA   NA
 7134637 7134638 Rpal_1100 Rpal_1101     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134638 7134639 Rpal_1101 Rpal_1102     FALSE 0.129 102.000 0.000 NA   NA
 7134639 7134640 Rpal_1102 Rpal_1103     FALSE 0.003 588.000 0.000 1.000   NA
 7134640 7134641 Rpal_1103 Rpal_1104     FALSE 0.039 230.000 0.000 NA   NA
 7134641 7134642 Rpal_1104 Rpal_1105     FALSE 0.071 199.000 0.000 NA   NA
 7134642 7134643 Rpal_1105 Rpal_1106     FALSE 0.001 918.000 0.000 NA   NA
 7134644 7134645 Rpal_1107 Rpal_1108     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134646 7134647 Rpal_1109 Rpal_1110     TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7134647 7134648 Rpal_1110 Rpal_1111     FALSE 0.186 70.000 0.000 NA   NA
 7134648 7134649 Rpal_1111 Rpal_1112     TRUE 0.954 -3.000 0.538 NA   NA
 7134649 7134650 Rpal_1112 Rpal_1113     FALSE 0.157 80.000 0.000 NA   NA
 7134650 7134651 Rpal_1113 Rpal_1114     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 7134653 7134654 Rpal_1116 Rpal_1117     TRUE 0.638 2.000 0.000 NA   NA
 7134654 7134655 Rpal_1117 Rpal_1118     FALSE 0.460 -49.000 0.000 NA   NA
 7134656 7134657 Rpal_1119 Rpal_1120     TRUE 0.632 9.000 0.000 NA   NA
 7134657 7134658 Rpal_1120 Rpal_1121     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134658 7134659 Rpal_1121 Rpal_1122     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134659 7134660 Rpal_1122 Rpal_1123     TRUE 0.978 11.000 0.779 NA   NA
 7134660 7134661 Rpal_1123 Rpal_1124     TRUE 0.622 11.000 0.000 NA   NA
 7134661 7134662 Rpal_1124 Rpal_1125     TRUE 0.639 6.000 0.000 NA   NA
 7134662 7134663 Rpal_1125 Rpal_1126     TRUE 0.896 4.000 0.129 NA   NA
 7134663 7134664 Rpal_1126 Rpal_1127     TRUE 0.717 0.000 0.000 1.000   NA
 7134665 7134666 Rpal_1128 Rpal_1129     TRUE 0.923 -7.000 0.400 NA   NA
 7134666 7134667 Rpal_1129 Rpal_1130     TRUE 0.951 -21.000 0.667 NA   NA
 7134667 7134668 Rpal_1130 Rpal_1131     TRUE 0.985 5.000 1.000 NA   NA
 7134669 7134670 Rpal_1132 Rpal_1133     TRUE 0.580 14.000 0.000 NA   NA
 7134670 7134671 Rpal_1133 Rpal_1134     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7134671 7134672 Rpal_1134 Rpal_1135     FALSE 0.128 138.000 0.000 NA   NA
 7134672 7134673 Rpal_1135 Rpal_1136     TRUE 0.938 0.000 0.300 NA   NA
 7134673 7134674 Rpal_1136 Rpal_1137     TRUE 0.748 32.000 0.125 NA   NA
 7134674 7134675 Rpal_1137 Rpal_1138     FALSE 0.115 170.000 0.000 NA   NA
 7134677 7134678 Rpal_1140 Rpal_1141     FALSE 0.077 194.000 0.000 NA   NA
 7134678 7134679 Rpal_1141 Rpal_1142     TRUE 0.639 6.000 0.000 NA   NA
 7134680 7134681 Rpal_1143 Rpal_1144     FALSE 0.002 535.000 0.000 NA   NA
 7134681 7134682 Rpal_1144 Rpal_1145     FALSE 0.290 46.000 0.000 NA   NA
 7134683 7134684 Rpal_1146 Rpal_1147     FALSE 0.106 176.000 0.000 NA   NA
 7134684 7134685 Rpal_1147 Rpal_1148     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134685 7134686 Rpal_1148 Rpal_1149     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134686 7134687 Rpal_1149 Rpal_1150     FALSE 0.474 -10.000 0.000 NA   NA
 7134687 7134688 Rpal_1150 Rpal_1151     FALSE 0.134 153.000 0.000 NA   NA
 7134688 7134689 Rpal_1151 Rpal_1152     FALSE 0.001 1250.000 0.000 NA   NA
 7134689 7134690 Rpal_1152 Rpal_1153     TRUE 0.973 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 7134690 7134691 Rpal_1153 Rpal_1154     FALSE 0.485 236.000 0.000 0.001 Y NA
 7134691 7134692 Rpal_1154 Rpal_1155     TRUE 0.978 19.000 0.056 0.001 Y NA
 7134692 7134693 Rpal_1155 Rpal_1156     TRUE 0.988 17.000 0.355 0.071 Y NA
 7134693 7134694 Rpal_1156 Rpal_1157     TRUE 0.795 128.000 0.177 1.000 Y NA
 7134694 7134695 Rpal_1157 Rpal_1158     TRUE 0.712 14.000 0.038 NA N NA
 7134695 7134696 Rpal_1158 Rpal_1159     FALSE 0.488 22.000 0.000 NA   NA
 7134696 7134697 Rpal_1159 Rpal_1160     FALSE 0.323 221.000 0.308 NA   NA
 7134697 7134698 Rpal_1160 Rpal_1161     TRUE 0.969 -3.000 0.769 NA   NA
 7134698 7134699 Rpal_1161 Rpal_1162     TRUE 0.888 -3.000 0.219 NA   NA
 7134699 7134700 Rpal_1162 Rpal_1163     TRUE 0.873 -10.000 0.247 NA   NA
 7134700 7134701 Rpal_1163 Rpal_1164     TRUE 0.805 -3.000 0.073 NA   NA
 7134701 7134702 Rpal_1164 Rpal_1165     TRUE 0.926 -7.000 0.095 0.003   NA
 7134702 7134703 Rpal_1165 Rpal_1166     TRUE 0.954 0.000 0.086 0.003   NA
 7134703 7134704 Rpal_1166 Rpal_1167     TRUE 0.963 5.000 0.018 1.000 Y NA
 7134704 7134705 Rpal_1167 Rpal_1168     TRUE 0.965 0.000 0.069 NA Y NA
 7134705 7134706 Rpal_1168 Rpal_1169     TRUE 0.992 -3.000 0.917 NA Y NA
 7134706 7134707 Rpal_1169 Rpal_1170     TRUE 0.961 -3.000 0.085 1.000 Y NA
 7134707 7134708 Rpal_1170 Rpal_1171     FALSE 0.489 41.000 0.024 1.000 N NA
 7134708 7134709 Rpal_1171 Rpal_1172     TRUE 0.975 -10.000 0.200 0.087 Y NA
 7134709 7134710 Rpal_1172 Rpal_1173     TRUE 0.766 106.000 0.000 0.015 Y NA
 7134712 7134713 Rpal_1175 Rpal_1176     TRUE 0.943 -3.000 0.444 1.000 N NA
 7134713 7134714 Rpal_1176 Rpal_1177     TRUE 0.905 47.000 0.133 1.000 Y NA
 7134714 7134715 Rpal_1177 Rpal_1178     TRUE 0.869 212.000 0.867 1.000 Y NA
 7134715 7134716 Rpal_1178 Rpal_1179     TRUE 0.997 3.000 1.000 0.050 Y NA
 7134716 7134717 Rpal_1179 Rpal_1180     TRUE 0.992 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 7134717 7134718 Rpal_1180 Rpal_1181     TRUE 0.993 -19.000 0.824 0.031 Y NA
 7134722 7134723 Rpal_1185 Rpal_1186     FALSE 0.003 443.000 0.000 NA   NA
 7134724 7134725 Rpal_1187 Rpal_1188     FALSE 0.048 379.000 0.000 1.000 Y NA
 7134729 7134730 Rpal_1192 Rpal_1193     TRUE 0.801 14.000 0.052 NA   NA
 7134733 7134734 Rpal_1196 Rpal_1197     FALSE 0.340 79.000 0.045 NA   NA
 7134734 7134735 Rpal_1197 Rpal_1198     FALSE 0.303 140.000 0.030 1.000   NA
 7134735 7134736 Rpal_1198 Rpal_1199     TRUE 0.987 16.000 0.688 0.001   NA
 7134740 7134741 Rpal_1203 Rpal_1204     FALSE 0.187 133.000 0.000 1.000   NA
 7134742 7134743 Rpal_1205 Rpal_1206     FALSE 0.489 119.000 0.222 NA   NA
 7134744 7134745 Rpal_1207 Rpal_1208     FALSE 0.222 89.000 0.036 NA N NA
 7134745 7134746 Rpal_1208 Rpal_1209     FALSE 0.024 250.000 0.000 NA   NA
 7134748 7134749 Rpal_1211 Rpal_1212     TRUE 0.919 2.000 0.212 1.000 N NA
 7134749 7134750 Rpal_1212 Rpal_1213     TRUE 0.838 -3.000 0.165 NA N NA
 7134750 7134751 Rpal_1213 Rpal_1214     FALSE 0.257 62.000 0.019 NA N NA
 7134751 7134752 Rpal_1214 Rpal_1215     FALSE 0.061 209.000 0.000 NA   NA
 7134752 7134753 Rpal_1215 Rpal_1216     TRUE 0.972 5.000 0.600 NA   NA
 7134753 7134754 Rpal_1216 Rpal_1217     TRUE 0.980 -3.000 1.000 1.000   NA
 7134756 7134757 Rpal_1219 Rpal_1220     FALSE 0.269 139.000 0.038 NA   NA
 7134757 7134758 Rpal_1220 Rpal_1221     FALSE 0.184 113.000 0.009 1.000 N NA
 7134758 7134759 Rpal_1221 Rpal_1222     TRUE 0.995 -3.000 1.000 0.086 Y NA
 7134760 7134761 Rpal_1223 Rpal_1224     FALSE 0.276 168.000 0.050 NA   NA
 7134762 7134763 Rpal_1225 Rpal_1226   rnhB TRUE 0.697 97.000 0.022 1.000 Y NA
 7134763 7134764 Rpal_1226 Rpal_1227 rnhB   FALSE 0.269 72.000 0.009 NA   NA
 7134766 7134767 Rpal_1229 Rpal_1230     FALSE 0.098 259.000 0.091 1.000   NA
 7134767 7134768 Rpal_1230 Rpal_1231     FALSE 0.437 105.000 0.107 1.000   NA
 7134770 7134771 Rpal_1233 Rpal_1234     TRUE 0.948 -7.000 0.525 1.000   NA
 7134771 7134772 Rpal_1234 Rpal_1235     FALSE 0.096 246.000 0.061 1.000   NA
 7134772 7134773 Rpal_1235 Rpal_1236     FALSE 0.292 119.000 0.055 NA   NA
 7134773 7134774 Rpal_1236 Rpal_1237   glyQ FALSE 0.005 426.000 0.006 NA   NA
 7134774 7134775 Rpal_1237 Rpal_1238 glyQ   FALSE 0.298 82.000 0.008 1.000   NA
 7134775 7134776 Rpal_1238 Rpal_1239   glyS TRUE 0.801 0.000 0.013 1.000   NA
 7134776 7134777 Rpal_1239 Rpal_1240 glyS   FALSE 0.003 459.000 0.000 NA   NA
 7134779 7134780 Rpal_1242 Rpal_1243     FALSE 0.263 92.000 0.028 NA   NA
 7134780 7134781 Rpal_1243 Rpal_1244     FALSE 0.013 317.000 0.000 1.000   NA
 7134782 7134783 Rpal_1245 Rpal_1246     TRUE 0.987 17.000 0.223 0.002 Y NA
 7134783 7134784 Rpal_1246 Rpal_1247     TRUE 0.908 94.000 0.210 0.002 Y NA
 7134785 7134786 Rpal_1248 Rpal_1249     TRUE 0.757 115.000 0.667 NA   NA
 7134787 7134788 Rpal_1250 Rpal_1251     FALSE 0.509 52.000 0.053 NA   NA
 7134788 7134789 Rpal_1251 Rpal_1252     TRUE 0.880 -3.000 0.147 1.000   NA
 7134789 7134790 Rpal_1252 Rpal_1253     TRUE 0.696 67.000 0.258 1.000   NA
 7134792 7134793 Rpal_1255 Rpal_1256     TRUE 0.806 -3.000 0.047 1.000   NA
 7134794 7134795 Rpal_1257 Rpal_1258     FALSE 0.002 509.000 0.000 NA   NA
 7134796 7134797 Rpal_1259 Rpal_1260     TRUE 0.688 131.000 0.462 NA   NA
 7134797 7134798 Rpal_1260 Rpal_1261     TRUE 0.677 63.000 0.259 NA   NA
 7134798 7134799 Rpal_1261 Rpal_1262     TRUE 0.810 -3.000 0.077 NA   NA
 7134800 7134801 Rpal_1263 Rpal_1264     FALSE 0.448 26.000 0.000 NA   NA
 7134801 7134802 Rpal_1264 Rpal_1265     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134803 7134804 Rpal_1266 Rpal_1267     FALSE 0.190 119.000 0.035 NA N NA
 7134805 7134806 Rpal_1268 Rpal_1269     FALSE 0.383 126.000 0.111 1.000 N NA
 7134806 7134807 Rpal_1269 Rpal_1270     TRUE 0.905 -7.000 0.278 1.000   NA
 7134807 7134808 Rpal_1270 Rpal_R0015     FALSE 0.122 121.000 0.000 NA   NA
 7134810 7134811 Rpal_1272 Rpal_1273     FALSE 0.122 115.000 0.000 NA   NA
 7134811 7134812 Rpal_1273 Rpal_1274     TRUE 0.902 -3.000 0.250 NA   NA
 7134812 7134813 Rpal_1274 Rpal_1275     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134813 7134814 Rpal_1275 Rpal_1276     TRUE 0.871 52.000 0.596 NA   NA
 7134814 7134815 Rpal_1276 Rpal_1277     TRUE 0.885 3.000 0.103 NA   NA
 7134817 7134818 Rpal_1279 Rpal_1280     FALSE 0.396 154.000 0.100 NA   NA
 7134818 7134819 Rpal_1280 Rpal_1281     FALSE 0.433 116.000 0.167 NA   NA
 7134819 7134820 Rpal_1281 Rpal_1282     TRUE 0.638 77.000 0.286 NA   NA
 7134820 7134821 Rpal_1282 Rpal_1283     FALSE 0.253 136.000 0.030 NA   NA
 7134821 7134822 Rpal_1283 Rpal_1284     FALSE 0.514 61.000 0.091 1.000 N NA
 7134822 7134823 Rpal_1284 Rpal_1285     FALSE 0.221 195.000 0.045 1.000   NA
 7134827 7134828 Rpal_1289 Rpal_1290 ruvC ruvA TRUE 0.914 185.000 0.451 0.006 Y NA
 7134828 7134829 Rpal_1290 Rpal_1291 ruvA   TRUE 0.651 -3.000 0.008 1.000 N NA
 7134829 7134830 Rpal_1291 Rpal_1292   ruvB FALSE 0.144 179.000 0.005 1.000 N NA
 7134830 7134831 Rpal_1292 Rpal_1293 ruvB   TRUE 0.891 8.000 0.082 1.000   NA
 7134831 7134832 Rpal_1293 Rpal_1294     FALSE 0.261 100.000 0.009 1.000   NA
 7134832 7134833 Rpal_1294 Rpal_1295     FALSE 0.124 110.000 0.000 NA   NA
 7134833 7134834 Rpal_1295 Rpal_1296     TRUE 0.600 58.000 0.143 NA   NA
 7134834 7134835 Rpal_1296 Rpal_1297     TRUE 0.840 17.000 0.111 NA   NA
 7134835 7134836 Rpal_1297 Rpal_1298     FALSE 0.133 150.000 0.000 NA   NA
 7134836 7134837 Rpal_1298 Rpal_1299     TRUE 0.973 -3.000 0.867 NA   NA
 7134841 7134842 Rpal_1303 Rpal_1304     FALSE 0.277 139.000 0.041 NA   NA
 7134842 7134843 Rpal_1304 Rpal_1305     FALSE 0.520 143.000 0.233 NA   NA
 7134843 7134844 Rpal_1305 Rpal_1306     FALSE 0.293 150.000 0.044 NA   NA
 7134844 7134845 Rpal_1306 Rpal_1307     TRUE 0.914 -16.000 0.381 NA   NA
 7134845 7134846 Rpal_1307 Rpal_1308     FALSE 0.009 308.000 0.000 1.000 N NA
 7134846 7134847 Rpal_1308 Rpal_1309     TRUE 0.880 98.000 0.220 0.060 Y NA
 7134847 7134848 Rpal_1309 Rpal_1310     TRUE 0.698 49.000 0.195 NA   NA
 7134848 7134849 Rpal_1310 Rpal_1311   tolB FALSE 0.363 73.000 0.043 NA   NA
 7134849 7134850 Rpal_1311 Rpal_1312 tolB   FALSE 0.161 171.000 0.005 1.000 N NA
 7134850 7134851 Rpal_1312 Rpal_1313     FALSE 0.367 195.000 0.226 NA   NA
 7134851 7134852 Rpal_1313 Rpal_1314     FALSE 0.007 327.000 0.000 NA   NA
 7134852 7134853 Rpal_1314 Rpal_1315     FALSE 0.529 156.000 0.199 1.000   NA
 7134853 7134854 Rpal_1315 Rpal_1316     TRUE 0.610 55.000 0.085 1.000   NA
 7134854 7134855 Rpal_1316 Rpal_1317     FALSE 0.161 232.000 0.145 1.000 N NA
 7134855 7134856 Rpal_1317 Rpal_1318     FALSE 0.062 133.000 0.000 NA N NA
 7134856 7134857 Rpal_1318 Rpal_1319     TRUE 0.837 -3.000 0.108 NA   NA
 7134857 7134858 Rpal_1319 Rpal_1320     FALSE 0.087 187.000 0.000 NA   NA
 7134858 7134859 Rpal_1320 Rpal_1321     FALSE 0.271 124.000 0.017 1.000   NA
 7134859 7134860 Rpal_1321 Rpal_1322     TRUE 0.901 163.000 0.266 0.017 Y NA
 7134860 7134861 Rpal_1322 Rpal_1323     TRUE 0.984 -3.000 0.227 0.046 Y NA
 7134861 7134862 Rpal_1323 Rpal_1324     FALSE 0.170 75.000 0.000 NA   NA
 7134862 7134863 Rpal_1324 Rpal_1325     FALSE 0.003 421.000 0.000 NA   NA
 7134865 7134866 Rpal_1327 Rpal_1328     FALSE 0.405 145.000 0.118 NA   NA
 7134867 7134868 Rpal_1329 Rpal_1330     FALSE 0.465 113.000 0.200 NA   NA
 7134868 7134869 Rpal_1330 Rpal_1331   groEL TRUE 0.595 215.000 0.750 NA   NA
 7134869 7134870 Rpal_1331 Rpal_1332 groEL groES TRUE 0.980 40.000 0.833 1.000 Y NA
 7134871 7134872 Rpal_1333 Rpal_1334     TRUE 0.830 44.000 0.357 NA   NA
 7134875 7134876 Rpal_1337 Rpal_1338     FALSE 0.391 116.000 0.122 NA   NA
 7134876 7134877 Rpal_1338 Rpal_1339     TRUE 0.940 -3.000 0.412 NA   NA
 7134877 7134878 Rpal_1339 Rpal_1340   hisG FALSE 0.156 94.000 0.012 NA N NA
 7134878 7134879 Rpal_1340 Rpal_1341 hisG hisZ TRUE 0.974 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 7134879 7134880 Rpal_1341 Rpal_1342 hisZ   FALSE 0.227 145.000 0.018 NA   NA
 7134881 7134882 Rpal_1343 Rpal_1344   ubiA TRUE 0.658 -3.000 0.007 NA   NA
 7134884 7134885 Rpal_1346 Rpal_1347     TRUE 0.838 -13.000 0.182 NA   NA
 7134885 7134886 Rpal_1347 Rpal_1348     TRUE 0.899 38.000 0.515 NA   NA
 7134886 7134887 Rpal_1348 Rpal_1349     FALSE 0.376 88.000 0.074 NA   NA
 7134887 7134888 Rpal_1349 Rpal_1350   lpxK TRUE 0.938 -7.000 0.037 1.000 Y NA
 7134889 7134890 Rpal_1351 Rpal_1352   xseA FALSE 0.221 147.000 0.015 NA   NA
 7134891 7134892 Rpal_1353 Rpal_1354     FALSE 0.242 164.000 0.006 1.000   NA
 7134894 7134895 Rpal_1356 Rpal_1357     FALSE 0.102 239.000 0.079 1.000 N NA
 7134896 7134897 Rpal_1358 Rpal_1359     TRUE 0.751 0.000 0.017 1.000 N NA
 7134897 7134898 Rpal_1359 Rpal_1360     TRUE 0.990 27.000 0.501 0.002 Y NA
 7134898 7134899 Rpal_1360 Rpal_1361     TRUE 0.812 -3.000 0.082 1.000 N NA
 7134899 7134900 Rpal_1361 Rpal_1362   uvrC FALSE 0.505 140.000 0.227 1.000 N NA
 7134902 7134903 Rpal_1364 Rpal_1365     FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 7134905 7134906 Rpal_1367 Rpal_1368     FALSE 0.234 169.000 0.030 NA   NA
 7134906 7134907 Rpal_1368 Rpal_1369   hisS FALSE 0.302 139.000 0.029 1.000   NA
 7134908 7134909 Rpal_1370 Rpal_1371     FALSE 0.322 97.000 0.089 NA N NA
 7134909 7134910 Rpal_1371 Rpal_1372     TRUE 0.853 13.000 0.135 NA N NA
 7134911 7134912 Rpal_1373 Rpal_1374     TRUE 0.811 167.000 0.876 NA   NA
 7134912 7134913 Rpal_1374 Rpal_1375     TRUE 0.971 -3.000 0.816 NA   NA
 7134913 7134914 Rpal_1375 Rpal_1376     TRUE 0.975 0.000 0.697 NA   NA
 7134915 7134916 Rpal_1377 Rpal_1378     TRUE 0.928 -3.000 0.346 NA   NA
 7134916 7134917 Rpal_1378 Rpal_1379     TRUE 0.792 -3.000 0.063 NA   NA
 7134917 7134918 Rpal_1379 Rpal_1380     TRUE 0.718 -3.000 0.026 NA   NA
 7134919 7134920 Rpal_1381 Rpal_1382     FALSE 0.237 78.000 0.006 NA   NA
 7134920 7134921 Rpal_1382 Rpal_1383     TRUE 0.767 11.000 0.022 1.000 N NA
 7134922 7134923 Rpal_1384 Rpal_1385     TRUE 0.949 41.000 0.045 0.001 Y NA
 7134923 7134924 Rpal_1385 Rpal_1386     FALSE 0.212 159.000 0.013 1.000 N NA
 7134924 7134925 Rpal_1386 Rpal_1387     FALSE 0.397 91.000 0.091 NA   NA
 7134926 7134927 Rpal_1388 Rpal_1389     TRUE 0.724 -3.000 0.032 1.000 N NA
 7134928 7134929 Rpal_1390 Rpal_1391     TRUE 0.705 120.000 0.519 NA   NA
 7134929 7134930 Rpal_1391 Rpal_1392     FALSE 0.004 399.000 0.000 1.000 N NA
 7134930 7134931 Rpal_1392 Rpal_1393     TRUE 0.638 109.000 0.397 1.000 N NA
 7134931 7134932 Rpal_1393 Rpal_1394     FALSE 0.190 135.000 0.008 1.000 N NA
 7134932 7134933 Rpal_1394 Rpal_1395     FALSE 0.180 104.000 0.005 1.000 N NA
 7134936 7134937 Rpal_1398 Rpal_1399     TRUE 0.622 190.000 0.000 0.085 Y NA
 7134939 7134940 Rpal_1401 Rpal_1402     TRUE 0.768 42.000 0.231 NA   NA
 7134940 7134941 Rpal_1402 Rpal_1403     TRUE 0.840 -7.000 0.172 NA   NA
 7134941 7134942 Rpal_1403 Rpal_1404     TRUE 0.815 19.000 0.094 NA   NA
 7134942 7134943 Rpal_1404 Rpal_1405     TRUE 0.688 174.000 0.556 NA   NA
 7134943 7134944 Rpal_1405 Rpal_1406     FALSE 0.048 220.000 0.000 NA   NA
 7134944 7134945 Rpal_1406 Rpal_1407     FALSE 0.537 136.000 0.250 NA   NA
 7134945 7134946 Rpal_1407 Rpal_1408     TRUE 0.842 109.000 0.917 1.000   NA
 7134946 7134947 Rpal_1408 Rpal_1409     TRUE 0.996 14.000 1.000 0.049 Y NA
 7134947 7134948 Rpal_1409 Rpal_1410     TRUE 0.833 165.000 0.267 1.000 Y NA
 7134952 7134953 Rpal_1414 Rpal_1415     TRUE 0.838 29.000 0.231 NA   NA
 7134953 7134954 Rpal_1415 Rpal_1416     FALSE 0.512 107.000 0.231 NA   NA
 7134955 7134956 Rpal_1417 Rpal_1418     TRUE 0.990 -3.000 0.312 0.001 Y NA
 7134956 7134957 Rpal_1418 Rpal_1419     TRUE 0.995 -3.000 0.833 0.069 Y NA
 7134957 7134958 Rpal_1419 Rpal_1420     TRUE 0.987 2.000 0.057 0.001 Y NA
 7134958 7134959 Rpal_1420 Rpal_1421     TRUE 0.994 15.000 0.505 0.001 Y NA
 7134959 7134960 Rpal_1421 Rpal_1422     TRUE 0.731 24.000 0.061 1.000 N NA
 7134960 7134961 Rpal_1422 Rpal_1423     FALSE 0.056 210.000 0.000 1.000 N NA
 7134961 7134962 Rpal_1423 Rpal_1424     TRUE 0.997 3.000 1.000 0.049 Y NA
 7134962 7134963 Rpal_1424 Rpal_1425     TRUE 0.993 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7134963 7134964 Rpal_1425 Rpal_1426     TRUE 0.991 4.000 0.286 0.030 Y NA
 7134964 7134965 Rpal_1426 Rpal_1427     FALSE 0.450 -16.000 0.000 1.000 N NA
 7134965 7134966 Rpal_1427 Rpal_1428     FALSE 0.310 40.000 0.000 1.000 N NA
 7134967 7134968 Rpal_1429 Rpal_1430     TRUE 0.992 19.000 0.500 0.008 Y NA
 7134968 7134969 Rpal_1430 Rpal_1431     TRUE 0.980 4.000 0.174 1.000 Y NA
 7134970 7134971 Rpal_1432 Rpal_1433     TRUE 0.996 5.000 0.667 0.059 Y NA
 7134971 7134972 Rpal_1433 Rpal_1434     TRUE 0.958 -3.000 0.600 1.000 N NA
 7134974 7134975 Rpal_1436 Rpal_1437     TRUE 0.554 16.000 0.000 NA   NA
 7134975 7134976 Rpal_1437 Rpal_1438     TRUE 0.786 -13.000 0.096 NA   NA
 7134976 7134977 Rpal_1438 Rpal_1439     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7134977 7134978 Rpal_1439 Rpal_1440     FALSE 0.079 192.000 0.000 NA   NA
 7134979 7134980 Rpal_1441 Rpal_1442     TRUE 0.945 -10.000 0.310 0.021 N NA
 7134981 7134982 Rpal_1443 Rpal_1444     TRUE 0.848 167.000 0.367 NA Y NA
 7134982 7134983 Rpal_1444 Rpal_1445     TRUE 0.996 15.000 0.888 0.049 Y NA
 7134983 7134984 Rpal_1445 Rpal_1446     TRUE 0.975 11.000 0.639 1.000   NA
 7134984 7134985 Rpal_1446 Rpal_1447     TRUE 0.985 11.000 0.600 0.030   NA
 7134985 7134986 Rpal_1447 Rpal_1448     TRUE 0.840 37.000 0.312 1.000 N NA
 7134986 7134987 Rpal_1448 Rpal_1449     FALSE 0.333 238.000 0.478 NA   NA
 7134989 7134990 Rpal_1451 Rpal_1452     FALSE 0.021 261.000 0.000 NA   NA
 7134990 7134991 Rpal_1452 Rpal_1453     FALSE 0.390 89.000 0.087 1.000 N NA
 7134991 7134992 Rpal_1453 Rpal_1454     FALSE 0.433 97.000 0.143 1.000 N NA
 7134994 7134995 Rpal_1456 Rpal_1457   fliF FALSE 0.291 200.000 0.113 1.000   NA
 7134995 7134996 Rpal_1457 Rpal_1458 fliF fliG TRUE 0.997 7.000 0.762 0.005 Y NA
 7134996 7134997 Rpal_1458 Rpal_1459 fliG fliH TRUE 0.971 0.000 0.121 NA Y NA
 7134997 7134998 Rpal_1459 Rpal_1460 fliH   TRUE 0.959 18.000 0.127 NA Y NA
 7134998 7134999 Rpal_1460 Rpal_1461     TRUE 0.856 48.000 0.484 1.000 N NA
 7135000 7135001 Rpal_1462 Rpal_1463     TRUE 0.889 55.000 0.714 NA   NA
 7135001 7135002 Rpal_1463 Rpal_1464     TRUE 0.721 37.000 0.130 NA   NA
 7135003 7135004 Rpal_1465 Rpal_1466     FALSE 0.304 132.000 0.054 NA   NA
 7135007 7135008 Rpal_1469 Rpal_1470     FALSE 0.035 233.000 0.000 NA   NA
 7135009 7135010 Rpal_1471 Rpal_1472     FALSE 0.254 158.000 0.006 1.000   NA
 7135010 7135011 Rpal_1472 Rpal_1473     FALSE 0.002 585.000 0.000 NA   NA
 7135012 7135013 Rpal_1474 Rpal_1475     TRUE 0.913 -7.000 0.355 NA   NA
 7135018 7135019 Rpal_1480 Rpal_1481 dnaG   FALSE 0.164 260.000 0.299 1.000 N NA
 7135019 7135020 Rpal_1481 Rpal_1482     FALSE 0.247 73.000 0.004 NA   NA
 7135020 7135021 Rpal_1482 Rpal_1483     TRUE 0.580 14.000 0.000 NA   NA
 7135022 7135023 Rpal_1484 Rpal_1485     TRUE 0.963 10.000 0.467 NA   NA
 7135023 7135024 Rpal_1485 Rpal_1486     FALSE 0.006 341.000 0.000 NA   NA
 7135026 7135027 Rpal_1488 Rpal_1489     FALSE 0.123 189.000 0.000 1.000   NA
 7135028 7135029 Rpal_1490 Rpal_1491     FALSE 0.018 272.000 0.000 NA   NA
 7135032 7135033 Rpal_1494 Rpal_1495     TRUE 0.958 13.000 0.050 NA Y NA
 7135034 7135035 Rpal_1496 Rpal_1497 mnmA   TRUE 0.674 20.000 0.024 1.000 N NA
 7135035 7135036 Rpal_1497 Rpal_1498     TRUE 0.897 46.000 0.643 NA   NA
 7135036 7135037 Rpal_1498 Rpal_R0016     FALSE 0.121 118.000 0.000 NA   NA
 7135039 7135040 Rpal_1500 Rpal_1501     FALSE 0.162 230.000 0.000 0.041   NA
 7135040 7135041 Rpal_1501 Rpal_1502     TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 7135041 7135042 Rpal_1502 Rpal_1503     FALSE 0.124 110.000 0.000 NA   NA
 7135042 7135043 Rpal_1503 Rpal_1504     TRUE 0.634 1.000 0.000 NA   NA
 7135045 7135046 Rpal_1507 Rpal_1508     FALSE 0.130 101.000 0.000 NA   NA
 7135046 7135047 Rpal_1508 Rpal_1509     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135047 7135048 Rpal_1509 Rpal_1510     FALSE 0.372 34.000 0.000 NA   NA
 7135048 7135049 Rpal_1510 Rpal_1511     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 7135049 7135050 Rpal_1511 Rpal_1512     FALSE 0.130 161.000 0.000 NA   NA
 7135050 7135051 Rpal_1512 Rpal_1513     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 7135051 7135052 Rpal_1513 Rpal_1514     FALSE 0.007 333.000 0.000 NA   NA
 7135052 7135053 Rpal_1514 Rpal_1515     FALSE 0.014 285.000 0.000 NA   NA
 7135053 7135054 Rpal_1515 Rpal_1516     FALSE 0.039 230.000 0.000 NA   NA
 7135054 7135055 Rpal_1516 Rpal_1517     FALSE 0.004 401.000 0.000 NA   NA
 7135055 7135056 Rpal_1517 Rpal_1518     TRUE 0.873 56.000 0.000 0.025 Y NA
 7135056 7135057 Rpal_1518 Rpal_1519     TRUE 0.990 -3.000 0.400 0.021 Y NA
 7135057 7135058 Rpal_1519 Rpal_1520     FALSE 0.007 377.000 0.000 1.000   NA
 7135058 7135059 Rpal_1520 Rpal_1521     FALSE 0.186 162.000 0.000 1.000   NA
 7135059 7135060 Rpal_1521 Rpal_1522     TRUE 0.566 15.000 0.000 NA   NA
 7135061 7135062 Rpal_1523 Rpal_1524     FALSE 0.123 146.000 0.000 1.000 N NA
 7135062 7135063 Rpal_1524 Rpal_1525     TRUE 0.745 131.000 0.000 0.053 Y NA
 7135063 7135064 Rpal_1525 Rpal_1526     FALSE 0.013 316.000 0.000 1.000   NA
 7135064 7135065 Rpal_1526 Rpal_1527     FALSE 0.097 181.000 0.000 NA   NA
 7135065 7135066 Rpal_1527 Rpal_1528     TRUE 0.976 3.000 0.167 NA Y NA
 7135066 7135067 Rpal_1528 Rpal_1529     FALSE 0.424 11.000 0.000 NA N NA
 7135067 7135068 Rpal_1529 Rpal_1530     TRUE 0.943 -3.000 0.500 NA N NA
 7135069 7135070 Rpal_1531 Rpal_1532     FALSE 0.024 246.000 0.000 1.000 N NA
 7135070 7135071 Rpal_1532 Rpal_1533     TRUE 0.989 19.000 0.667 1.000 Y NA
 7135071 7135072 Rpal_1533 Rpal_1534     TRUE 0.986 -3.000 0.286 0.068 Y NA
 7135072 7135073 Rpal_1534 Rpal_1535     FALSE 0.216 84.000 0.000 1.000   NA
 7135073 7135074 Rpal_1535 Rpal_1536     FALSE 0.121 116.000 0.000 NA   NA
 7135074 7135075 Rpal_1536 Rpal_1537     FALSE 0.089 186.000 0.000 NA   NA
 7135075 7135076 Rpal_1537 Rpal_1538     FALSE 0.036 194.000 0.000 NA N NA
 7135078 7135079 Rpal_1540 Rpal_1541     TRUE 0.831 14.000 0.074 NA   NA
 7135079 7135080 Rpal_1541 Rpal_1542     TRUE 0.807 -3.000 0.074 NA   NA
 7135082 7135083 Rpal_1544 Rpal_1545   fumC FALSE 0.185 130.000 0.000 1.000   NA
 7135083 7135084 Rpal_1545 Rpal_1546 fumC   TRUE 0.728 2.000 0.003 NA   NA
 7135084 7135085 Rpal_1546 Rpal_1547     TRUE 0.818 -3.000 0.083 NA   NA
 7135085 7135086 Rpal_1547 Rpal_1548     TRUE 0.831 -3.000 0.099 NA   NA
 7135086 7135087 Rpal_1548 Rpal_1549     FALSE 0.002 1052.000 0.000 1.000   NA
 7135087 7135088 Rpal_1549 Rpal_1550     TRUE 0.850 -3.000 0.000 0.038   NA
 7135088 7135089 Rpal_1550 Rpal_1551     TRUE 0.907 27.000 0.400 1.000 N NA
 7135089 7135090 Rpal_1551 Rpal_1552     TRUE 0.978 9.000 0.750 1.000 N NA
 7135090 7135091 Rpal_1552 Rpal_1553     TRUE 0.945 13.000 0.182 0.038 N NA
 7135091 7135092 Rpal_1553 Rpal_1554     FALSE 0.466 -7.000 0.000 1.000 N NA
 7135092 7135093 Rpal_1554 Rpal_1555     FALSE 0.524 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7135093 7135094 Rpal_1555 Rpal_1556     TRUE 0.989 -3.000 0.400 0.048 Y NA
 7135094 7135095 Rpal_1556 Rpal_1557     TRUE 0.978 -10.000 0.400 1.000 Y NA
 7135095 7135096 Rpal_1557 Rpal_1558     TRUE 0.996 -3.000 1.000 0.030 Y NA
 7135096 7135097 Rpal_1558 Rpal_1559     TRUE 0.871 30.000 0.000 NA Y NA
 7135097 7135098 Rpal_1559 Rpal_1560     FALSE 0.120 57.000 0.000 NA N NA
 7135098 7135099 Rpal_1560 Rpal_1561     FALSE 0.079 192.000 0.000 NA   NA
 7135100 7135101 Rpal_1562 Rpal_1563     TRUE 0.988 11.000 0.667 0.005   NA
 7135102 7135103 Rpal_1564 Rpal_1565     FALSE 0.005 415.000 0.000 1.000   NA
 7135103 7135104 Rpal_1565 Rpal_1566     FALSE 0.125 149.000 0.000 1.000 N NA
 7135105 7135106 Rpal_1567 Rpal_1568     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135106 7135107 Rpal_1568 Rpal_1569     FALSE 0.138 93.000 0.000 NA   NA
 7135107 7135108 Rpal_1569 Rpal_1570     FALSE 0.461 -37.000 0.000 NA   NA
 7135109 7135110 Rpal_1571 Rpal_1572     TRUE 0.986 -3.000 0.286 0.048 Y NA
 7135110 7135111 Rpal_1572 Rpal_1573     TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7135111 7135112 Rpal_1573 Rpal_1574     TRUE 0.839 42.000 0.000 1.000 Y NA
 7135113 7135114 Rpal_1575 Rpal_1576     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135114 7135115 Rpal_1576 Rpal_1577     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135115 7135116 Rpal_1577 Rpal_1578     TRUE 0.622 11.000 0.000 NA   NA
 7135116 7135117 Rpal_1578 Rpal_1579     FALSE 0.518 19.000 0.000 NA   NA
 7135117 7135118 Rpal_1579 Rpal_1580     FALSE 0.002 543.000 0.000 NA   NA
 7135118 7135119 Rpal_1580 Rpal_1581     FALSE 0.142 90.000 0.000 NA   NA
 7135120 7135121 Rpal_1582 Rpal_1583     FALSE 0.182 71.000 0.000 NA   NA
 7135121 7135122 Rpal_1583 Rpal_1584     TRUE 0.931 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7135122 7135123 Rpal_1584 Rpal_1585     FALSE 0.524 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7135123 7135124 Rpal_1585 Rpal_1586     FALSE 0.178 113.000 0.000 1.000   NA
 7135125 7135126 Rpal_1587 Rpal_1588     TRUE 0.604 0.000 0.000 1.000 N NA
 7135126 7135127 Rpal_1588 Rpal_1589     TRUE 0.982 3.000 0.835 NA   NA
 7135127 7135128 Rpal_1589 Rpal_1590     TRUE 0.984 3.000 0.931 NA   NA
 7135128 7135129 Rpal_1590 Rpal_1591     TRUE 0.833 39.000 0.314 NA   NA
 7135129 7135130 Rpal_1591 Rpal_1592     TRUE 0.991 -3.000 0.797 1.000 Y NA
 7135130 7135131 Rpal_1592 Rpal_1593     TRUE 0.979 34.000 0.719 NA Y NA
 7135131 7135132 Rpal_1593 Rpal_1594     FALSE 0.002 374.000 0.000 NA N NA
 7135135 7135136 Rpal_1597 Rpal_1598     FALSE 0.060 126.000 0.000 NA N NA
 7135136 7135137 Rpal_1598 Rpal_1599     TRUE 0.981 8.000 0.250 NA Y NA
 7135137 7135138 Rpal_1599 Rpal_1600     TRUE 0.975 -7.000 0.133 0.030 Y NA
 7135138 7135139 Rpal_1600 Rpal_1601     TRUE 0.971 14.000 0.133 1.000 Y NA
 7135139 7135140 Rpal_1601 Rpal_1602     TRUE 0.994 -3.000 0.750 0.048 Y NA
 7135141 7135142 Rpal_1603 Rpal_1604     TRUE 0.950 -3.000 0.500 1.000 N NA
 7135142 7135143 Rpal_1604 Rpal_1605     TRUE 0.685 88.000 0.400 NA   NA
 7135143 7135144 Rpal_1605 Rpal_1606     TRUE 0.750 97.000 0.600 NA   NA
 7135145 7135146 Rpal_1607 Rpal_1608     TRUE 0.778 -13.000 0.088 NA   NA
 7135146 7135147 Rpal_1608 Rpal_1609     TRUE 0.706 165.000 0.044 1.000 Y NA
 7135147 7135148 Rpal_1609 Rpal_1610     FALSE 0.200 190.000 0.052 1.000 N NA
 7135148 7135149 Rpal_1610 Rpal_1611     TRUE 0.990 -10.000 0.914 1.000 Y NA
 7135149 7135150 Rpal_1611 Rpal_1612     TRUE 0.924 29.000 0.073 NA Y NA
 7135151 7135152 Rpal_1613 Rpal_1614     TRUE 0.618 96.000 0.385 NA N NA
 7135152 7135153 Rpal_1614 Rpal_1615     FALSE 0.024 248.000 0.000 NA   NA
 7135155 7135156 Rpal_1617 Rpal_1618     FALSE 0.427 58.000 0.038 NA   NA
 7135156 7135157 Rpal_1618 Rpal_1619     TRUE 0.852 -3.000 0.135 NA   NA
 7135157 7135158 Rpal_1619 Rpal_1620     TRUE 0.707 83.000 0.412 NA   NA
 7135158 7135159 Rpal_1620 Rpal_1621     TRUE 0.990 14.000 0.941 0.005   NA
 7135159 7135160 Rpal_1621 Rpal_1622     TRUE 0.992 12.000 1.000 0.005   NA
 7135160 7135161 Rpal_1622 Rpal_1623   nifH TRUE 0.873 50.000 0.267 0.005 N NA
 7135161 7135162 Rpal_1623 Rpal_1624 nifH   FALSE 0.007 524.000 0.000 0.099 N NA
 7135162 7135163 Rpal_1624 Rpal_1625     TRUE 0.644 4.000 0.000 NA   NA
 7135163 7135164 Rpal_1625 Rpal_1626     FALSE 0.094 183.000 0.000 NA   NA
 7135164 7135165 Rpal_1626 Rpal_1627     TRUE 0.987 10.000 0.545 0.001   NA
 7135165 7135166 Rpal_1627 Rpal_1628     FALSE 0.019 292.000 0.000 1.000   NA
 7135167 7135168 Rpal_1629 Rpal_1630     FALSE 0.284 47.000 0.000 NA   NA
 7135168 7135169 Rpal_1630 Rpal_1631     TRUE 0.981 -3.000 0.080 0.002 Y NA
 7135169 7135170 Rpal_1631 Rpal_1632     TRUE 0.972 -9.000 0.300 1.000 Y NA
 7135170 7135171 Rpal_1632 Rpal_1633     TRUE 0.982 53.000 0.800 0.048 Y NA
 7135171 7135172 Rpal_1633 Rpal_1634     TRUE 0.993 -3.000 0.600 0.048 Y NA
 7135172 7135173 Rpal_1634 Rpal_1635     TRUE 0.784 26.000 0.118 1.000 N NA
 7135173 7135174 Rpal_1635 Rpal_1636     TRUE 0.939 64.000 0.316 0.083 Y NA
 7135174 7135175 Rpal_1636 Rpal_1637     TRUE 0.693 38.000 0.105 NA   NA
 7135177 7135178 Rpal_1639 Rpal_1640     TRUE 0.887 5.000 0.107 NA   NA
 7135178 7135179 Rpal_1640 Rpal_1641     FALSE 0.247 111.000 0.032 NA   NA
 7135179 7135180 Rpal_1641 Rpal_1642     TRUE 0.973 38.000 0.794 0.001   NA
 7135180 7135181 Rpal_1642 Rpal_1643     TRUE 0.933 57.000 0.529 0.001   NA
 7135181 7135182 Rpal_1643 Rpal_1644     TRUE 0.878 141.000 0.590 0.001   NA
 7135183 7135184 Rpal_1645 Rpal_1646     FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7135184 7135185 Rpal_1646 Rpal_1647     FALSE 0.139 92.000 0.000 NA   NA
 7135189 7135190 Rpal_1651 Rpal_1652     TRUE 0.900 -3.000 0.250 1.000 N NA
 7135190 7135191 Rpal_1652 Rpal_1653     TRUE 0.917 -3.000 0.300 NA   NA
 7135191 7135192 Rpal_1653 Rpal_1654     TRUE 0.915 3.000 0.189 NA   NA
 7135192 7135193 Rpal_1654 Rpal_1655     TRUE 0.647 29.000 0.041 NA   NA
 7135193 7135194 Rpal_1655 Rpal_1656     FALSE 0.138 93.000 0.000 NA   NA
 7135194 7135195 Rpal_1656 Rpal_1657     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135195 7135196 Rpal_1657 Rpal_1658     FALSE 0.306 43.000 0.000 NA   NA
 7135196 7135197 Rpal_1658 Rpal_1659     TRUE 0.996 11.000 0.818 0.048 Y NA
 7135197 7135198 Rpal_1659 Rpal_1660     TRUE 0.932 171.000 0.556 0.048 Y NA
 7135198 7135199 Rpal_1660 Rpal_1661     FALSE 0.004 379.000 0.000 NA   NA
 7135199 7135200 Rpal_1661 Rpal_1662     FALSE 0.022 254.000 0.000 NA   NA
 7135201 7135202 Rpal_1663 Rpal_1664     TRUE 0.913 48.000 0.870 NA N NA
 7135202 7135203 Rpal_1664 Rpal_1665     TRUE 0.985 5.000 0.660 0.048 N NA
 7135203 7135204 Rpal_1665 Rpal_1666     TRUE 0.993 -3.000 0.632 0.048 Y NA
 7135204 7135205 Rpal_1666 Rpal_1667     TRUE 0.905 0.000 0.132 1.000   NA
 7135205 7135206 Rpal_1667 Rpal_1668     TRUE 0.595 104.000 0.273 1.000   NA
 7135206 7135207 Rpal_1668 Rpal_1669     FALSE 0.403 131.000 0.080 1.000   NA
 7135209 7135210 Rpal_1671 Rpal_1672     FALSE 0.158 178.000 0.007 NA   NA
 7135210 7135211 Rpal_1672 Rpal_1673     FALSE 0.176 217.000 0.090 NA   NA
 7135211 7135212 Rpal_1673 Rpal_1674     TRUE 0.680 39.000 0.102 NA   NA
 7135213 7135214 Rpal_1675 Rpal_1676     FALSE 0.122 135.000 0.000 1.000 N NA
 7135214 7135215 Rpal_1676 Rpal_1677     TRUE 0.995 5.000 0.600 0.025 Y NA
 7135216 7135217 Rpal_1678 Rpal_1679     TRUE 0.903 13.000 0.000 0.004   NA
 7135217 7135218 Rpal_1679 Rpal_1680     TRUE 0.774 187.000 1.000 NA   NA
 7135218 7135219 Rpal_1680 Rpal_1681     TRUE 0.975 19.000 1.000 NA   NA
 7135219 7135220 Rpal_1681 Rpal_1682     TRUE 0.554 16.000 0.000 NA   NA
 7135220 7135221 Rpal_1682 Rpal_1683     FALSE 0.127 141.000 0.000 NA   NA
 7135221 7135222 Rpal_1683 Rpal_1684     FALSE 0.005 350.000 0.000 1.000 N NA
 7135222 7135223 Rpal_1684 Rpal_1685     TRUE 0.969 11.000 0.600 1.000 N NA
 7135223 7135224 Rpal_1685 Rpal_1686     FALSE 0.417 138.000 0.133 NA   NA
 7135225 7135226 Rpal_1687 Rpal_1688     FALSE 0.448 115.000 0.133 1.000   NA
 7135226 7135227 Rpal_1688 Rpal_1689     TRUE 0.567 61.000 0.133 NA   NA
 7135227 7135228 Rpal_1689 Rpal_1690     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135228 7135229 Rpal_1690 Rpal_1691     TRUE 0.619 0.000 0.000 NA   NA
 7135230 7135231 Rpal_1692 Rpal_1693     TRUE 0.960 6.000 0.005 1.000 Y NA
 7135231 7135232 Rpal_1693 Rpal_1694   bchD TRUE 0.993 -3.000 0.465 0.001 Y NA
 7135233 7135234 Rpal_1695 Rpal_1696   hemE FALSE 0.004 383.000 0.000 NA   NA
 7135235 7135236 Rpal_1697 Rpal_1698     TRUE 0.936 11.000 0.286 NA   NA
 7135236 7135237 Rpal_1698 Rpal_1699     FALSE 0.335 76.000 0.041 1.000 N NA
 7135237 7135238 Rpal_1699 Rpal_1700     TRUE 0.923 -3.000 0.332 1.000 N NA
 7135238 7135239 Rpal_1700 Rpal_1701     FALSE 0.015 303.000 0.004 1.000 N NA
 7135241 7135242 Rpal_1703 Rpal_1704     TRUE 0.942 36.000 0.833 NA   NA
 7135243 7135244 Rpal_1705 Rpal_1706     TRUE 0.980 5.000 0.434 0.045   NA
 7135245 7135246 Rpal_1707 Rpal_1708     TRUE 0.873 50.000 0.500 1.000   NA
 7135246 7135247 Rpal_1708 Rpal_1709     TRUE 0.796 89.000 0.627 1.000   NA
 7135247 7135248 Rpal_1709 Rpal_1710     TRUE 0.991 0.000 0.882 0.002 N NA
 7135248 7135249 Rpal_1710 Rpal_1711     TRUE 0.972 24.000 0.491 0.002   NA
 7135249 7135250 Rpal_1711 Rpal_1712     TRUE 0.988 0.000 0.632 0.002   NA
 7135250 7135251 Rpal_1712 Rpal_1713     FALSE 0.445 78.000 0.096 NA   NA
 7135251 7135252 Rpal_1713 Rpal_1714     FALSE 0.433 154.000 0.135 NA   NA
 7135252 7135253 Rpal_1714 Rpal_1715     TRUE 0.990 16.000 0.946 0.004   NA
 7135253 7135254 Rpal_1715 Rpal_1716     TRUE 0.908 132.000 0.829 0.004   NA
 7135254 7135255 Rpal_1716 Rpal_1717     TRUE 0.982 28.000 0.895 0.004   NA
 7135255 7135256 Rpal_1717 Rpal_1718     FALSE 0.049 285.000 0.053 1.000   NA
 7135256 7135257 Rpal_1718 Rpal_1719     TRUE 0.873 -7.000 0.200 1.000   NA
 7135257 7135258 Rpal_1719 Rpal_1720     TRUE 0.970 3.000 0.640 NA N NA
 7135258 7135259 Rpal_1720 Rpal_1721     TRUE 0.937 2.000 0.314 NA N NA
 7135259 7135260 Rpal_1721 Rpal_1722     TRUE 0.786 20.000 0.078 1.000 N NA
 7135260 7135261 Rpal_1722 Rpal_1723     TRUE 0.882 37.000 0.429 NA   NA
 7135263 7135264 Rpal_1725 Rpal_1726     TRUE 0.975 1.000 0.318 0.021   NA
 7135265 7135266 Rpal_1727 Rpal_1728     TRUE 0.568 61.000 0.089 1.000   NA
 7135267 7135268 Rpal_1729 Rpal_1730     TRUE 0.971 -3.000 0.311 0.001   NA
 7135268 7135269 Rpal_1730 Rpal_1731     TRUE 0.996 3.000 0.591 0.001 Y NA
 7135269 7135270 Rpal_1731 Rpal_1732   bchH TRUE 0.946 -25.000 0.278 0.003 N NA
 7135270 7135271 Rpal_1732 Rpal_1733 bchH chlL TRUE 0.966 -3.000 0.344 0.003 N NA
 7135271 7135272 Rpal_1733 Rpal_1734 chlL   TRUE 0.974 0.000 0.274 0.003   NA
 7135272 7135273 Rpal_1734 Rpal_1735     TRUE 0.810 -3.000 0.077 NA   NA
 7135273 7135274 Rpal_1735 Rpal_1736     TRUE 0.885 23.000 0.265 NA   NA
 7135274 7135275 Rpal_1736 Rpal_1737     TRUE 0.974 -3.000 0.912 NA   NA
 7135275 7135276 Rpal_1737 Rpal_1738     TRUE 0.955 16.000 0.515 NA   NA
 7135276 7135277 Rpal_1738 Rpal_1739     TRUE 0.965 3.000 0.481 NA   NA
 7135277 7135278 Rpal_1739 Rpal_1740     TRUE 0.931 -3.000 0.361 NA   NA
 7135278 7135279 Rpal_1740 Rpal_1741     TRUE 0.942 14.000 0.375 NA   NA
 7135279 7135280 Rpal_1741 Rpal_1742     TRUE 0.873 -3.000 0.184 NA   NA
 7135282 7135283 Rpal_1744 Rpal_1745     TRUE 0.955 22.000 0.000 0.020 Y NA
 7135283 7135284 Rpal_1745 Rpal_1746     TRUE 0.987 16.000 0.250 0.020 Y NA
 7135284 7135285 Rpal_1746 Rpal_1747   rbcL FALSE 0.065 201.000 0.000 1.000 N NA
 7135285 7135286 Rpal_1747 Rpal_1748 rbcL   TRUE 0.991 14.000 1.000 0.001 N NA
 7135286 7135287 Rpal_1748 Rpal_1749     TRUE 0.919 3.000 0.149 1.000   NA
 7135289 7135290 Rpal_1751 Rpal_1752     FALSE 0.167 76.000 0.000 NA   NA
 7135290 7135291 Rpal_1752 Rpal_1753     TRUE 0.966 9.000 0.066 NA Y NA
 7135291 7135292 Rpal_1753 Rpal_1754     TRUE 0.970 -3.000 0.033 0.048 Y NA
 7135292 7135293 Rpal_1754 Rpal_1755     TRUE 0.968 -13.000 0.065 0.029 Y NA
 7135294 7135295 Rpal_1756 Rpal_1757     TRUE 0.974 4.000 0.556 1.000   NA
 7135295 7135296 Rpal_1757 Rpal_1758     TRUE 0.731 152.000 0.051 1.000 Y NA
 7135297 7135298 Rpal_1759 Rpal_1760     FALSE 0.074 271.000 0.111 1.000 N NA
 7135298 7135299 Rpal_1760 Rpal_1761     FALSE 0.250 78.000 0.010 NA   NA
 7135299 7135300 Rpal_1761 Rpal_1762     TRUE 0.879 5.000 0.091 NA   NA
 7135300 7135301 Rpal_1762 Rpal_1763     TRUE 0.867 14.000 0.127 NA   NA
 7135304 7135305 Rpal_1766 Rpal_1767     FALSE 0.088 319.000 0.000 1.000 Y NA
 7135305 7135306 Rpal_1767 Rpal_1768     TRUE 0.688 165.000 0.030 1.000 Y NA
 7135308 7135309 Rpal_1770 Rpal_1771     FALSE 0.064 205.000 0.000 NA   NA
 7135309 7135310 Rpal_1771 Rpal_1772     TRUE 0.970 -3.000 0.791 NA   NA
 7135311 7135312 Rpal_1773 Rpal_1774     TRUE 0.737 59.000 0.267 1.000   NA
 7135312 7135313 Rpal_1774 Rpal_1775     FALSE 0.073 198.000 0.000 NA   NA
 7135314 7135315 Rpal_1776 Rpal_1777   rpsD FALSE 0.008 313.000 0.000 1.000 N NA
 7135315 7135316 Rpal_1777 Rpal_1778 rpsD   FALSE 0.081 190.000 0.000 NA   NA
 7135316 7135317 Rpal_1778 Rpal_1779     TRUE 0.948 0.000 0.350 NA   NA
 7135317 7135318 Rpal_1779 Rpal_1780     FALSE 0.364 52.000 0.006 NA   NA
 7135318 7135319 Rpal_1780 Rpal_1781     FALSE 0.075 83.000 0.000 NA N NA
 7135320 7135321 Rpal_1782 Rpal_1783     FALSE 0.010 338.000 0.000 1.000   NA
 7135321 7135322 Rpal_1783 Rpal_1784     TRUE 0.642 3.000 0.000 NA   NA
 7135322 7135323 Rpal_1784 Rpal_1785     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135323 7135324 Rpal_1785 Rpal_1786     FALSE 0.004 403.000 0.000 NA   NA
 7135325 7135326 Rpal_1787 Rpal_1788     FALSE 0.443 75.000 0.085 NA   NA
 7135328 7135329 Rpal_1790 Rpal_1791     FALSE 0.093 184.000 0.000 NA   NA
 7135331 7135332 Rpal_1793 Rpal_1794     FALSE 0.005 355.000 0.000 NA   NA
 7135332 7135333 Rpal_1794 Rpal_1795     TRUE 0.826 45.000 0.354 NA   NA
 7135334 7135335 Rpal_1796 Rpal_1797     TRUE 0.793 -3.000 0.064 NA   NA
 7135335 7135336 Rpal_1797 Rpal_1798     FALSE 0.463 60.000 0.059 NA   NA
 7135337 7135338 Rpal_1799 Rpal_1800     FALSE 0.075 268.000 0.100 NA   NA
 7135338 7135339 Rpal_1800 Rpal_1801     TRUE 0.954 13.000 0.433 NA   NA
 7135339 7135340 Rpal_1801 Rpal_1802     FALSE 0.310 201.000 0.200 1.000 N NA
 7135340 7135341 Rpal_1802 Rpal_1803     TRUE 0.864 35.000 0.200 0.067 N NA
 7135342 7135343 Rpal_1804 Rpal_1805     FALSE 0.127 96.000 0.000 1.000 N NA
 7135344 7135345 Rpal_1806 Rpal_1807     TRUE 0.645 69.000 0.250 NA   NA
 7135346 7135347 Rpal_1808 Rpal_1809     FALSE 0.415 113.000 0.143 NA   NA
 7135350 7135351 Rpal_R0017 Rpal_1812     FALSE 0.128 143.000 0.000 NA   NA
 7135351 7135352 Rpal_1812 Rpal_1813     FALSE 0.029 241.000 0.000 NA   NA
 7135355 7135356 Rpal_1816 Rpal_1817     FALSE 0.252 191.000 0.085 NA   NA
 7135356 7135357 Rpal_1817 Rpal_1818     TRUE 0.974 -3.000 0.043 0.012 Y NA
 7135357 7135358 Rpal_1818 Rpal_1819     TRUE 0.910 68.000 0.333 1.000 Y NA
 7135358 7135359 Rpal_1819 Rpal_1820     TRUE 0.820 142.000 0.042 0.020 Y NA
 7135359 7135360 Rpal_1820 Rpal_1821     TRUE 0.968 -3.000 0.155 1.000 Y NA
 7135362 7135363 Rpal_1823 Rpal_1824 fliI   FALSE 0.372 110.000 0.067 1.000   NA
 7135363 7135364 Rpal_1824 Rpal_1825     FALSE 0.253 176.000 0.025 1.000   NA
 7135364 7135365 Rpal_1825 Rpal_1826     TRUE 0.929 0.000 0.254 NA   NA
 7135366 7135367 Rpal_1827 Rpal_1828   flhA FALSE 0.007 332.000 0.000 NA   NA
 7135370 7135371 Rpal_R0018 Rpal_1831     FALSE 0.306 43.000 0.000 NA   NA
 7135371 7135372 Rpal_1831 Rpal_1832     FALSE 0.004 381.000 0.000 1.000 N NA
 7135375 7135376 Rpal_1835 Rpal_1836     TRUE 0.709 29.000 0.070 NA   NA
 7135376 7135377 Rpal_1836 Rpal_1837     FALSE 0.512 99.000 0.222 NA   NA
 7135377 7135378 Rpal_1837 Rpal_1838     TRUE 0.551 77.000 0.200 NA   NA
 7135379 7135380 Rpal_1839 Rpal_1840     TRUE 0.984 -3.000 0.484 NA Y NA
 7135380 7135381 Rpal_1840 Rpal_1841     TRUE 0.945 -7.000 0.647 NA N NA
 7135385 7135386 Rpal_1845 Rpal_1846     FALSE 0.300 44.000 0.000 NA   NA
 7135386 7135387 Rpal_1846 Rpal_1847     FALSE 0.136 94.000 0.000 NA   NA
 7135388 7135389 Rpal_1848 Rpal_1849     FALSE 0.129 135.000 0.000 NA   NA
 7135389 7135390 Rpal_1849 Rpal_1850     FALSE 0.062 161.000 0.000 NA N NA
 7135393 7135394 Rpal_1853 Rpal_1854     FALSE 0.061 209.000 0.000 NA   NA
 7135395 7135396 Rpal_1855 Rpal_1856     TRUE 0.683 142.000 0.455 NA   NA
 7135398 7135399 Rpal_1858 Rpal_1859     FALSE 0.269 108.000 0.040 NA   NA
 7135399 7135400 Rpal_1859 Rpal_1860     TRUE 0.879 28.000 0.032 0.002   NA
 7135400 7135401 Rpal_1860 Rpal_1861     FALSE 0.301 156.000 0.048 NA   NA
 7135401 7135402 Rpal_1861 Rpal_1862     FALSE 0.022 255.000 0.000 NA   NA
 7135402 7135403 Rpal_1862 Rpal_1863     TRUE 0.799 29.000 0.119 1.000   NA
 7135403 7135404 Rpal_1863 Rpal_1864     TRUE 0.921 -28.000 0.368 1.000   NA
 7135404 7135405 Rpal_1864 Rpal_1865     FALSE 0.346 158.000 0.070 NA   NA
 7135406 7135407 Rpal_1866 Rpal_1867     TRUE 0.977 4.000 0.633 1.000   NA
 7135409 7135410 Rpal_1869 Rpal_1870     TRUE 0.607 178.000 0.429 1.000 N NA
 7135410 7135411 Rpal_1870 Rpal_1871     FALSE 0.032 645.000 0.000 0.082 Y NA
 7135411 7135412 Rpal_1871 Rpal_1872     TRUE 0.718 179.000 0.000 0.012 Y NA
 7135412 7135413 Rpal_1872 Rpal_1873     TRUE 0.974 -3.000 0.043 0.012 Y NA
 7135413 7135414 Rpal_1873 Rpal_1874     TRUE 0.935 54.000 0.333 1.000 Y NA
 7135414 7135415 Rpal_1874 Rpal_1875     TRUE 0.970 12.000 0.625 NA   NA
 7135415 7135416 Rpal_1875 Rpal_1876     FALSE 0.248 229.000 0.250 NA   NA
 7135420 7135421 Rpal_1880 Rpal_1881     FALSE 0.004 485.000 0.000 1.000   NA
 7135422 7135423 Rpal_1882 Rpal_1883     TRUE 0.726 71.000 0.381 1.000 N NA
 7135424 7135425 Rpal_R0019 Rpal_1884     FALSE 0.050 218.000 0.000 NA   NA
 7135425 7135426 Rpal_1884 Rpal_1885     FALSE 0.122 121.000 0.000 NA   NA
 7135426 7135427 Rpal_1885 Rpal_1886     FALSE 0.501 72.000 0.120 NA   NA
 7135428 7135429 Rpal_1887 Rpal_1888     TRUE 0.804 132.000 0.800 NA   NA
 7135430 7135431 Rpal_1889 Rpal_1890     FALSE 0.072 202.000 0.009 NA N NA
 7135431 7135432 Rpal_1890 Rpal_1891     FALSE 0.149 153.000 0.011 NA N NA
 7135434 7135435 Rpal_1893 Rpal_1894     FALSE 0.518 19.000 0.000 NA   NA
 7135438 7135439 Rpal_1897 Rpal_1898     FALSE 0.121 118.000 0.000 NA   NA
 7135441 7135442 Rpal_1900 Rpal_1901     FALSE 0.004 412.000 0.000 NA   NA
 7135442 7135443 Rpal_1901 Rpal_1902     FALSE 0.534 105.000 0.250 NA   NA
 7135443 7135444 Rpal_1902 Rpal_1903     FALSE 0.371 279.000 0.300 1.000 Y NA
 7135445 7135446 Rpal_1904 Rpal_1905     FALSE 0.016 457.000 0.182 1.000 N NA
 7135446 7135447 Rpal_1905 Rpal_1906     TRUE 0.674 224.000 0.211 0.081 Y NA
 7135447 7135448 Rpal_1906 Rpal_1907     TRUE 0.957 51.000 0.316 0.081 Y NA
 7135448 7135449 Rpal_1907 Rpal_1908     TRUE 0.861 167.000 0.357 1.000 Y NA
 7135449 7135450 Rpal_1908 Rpal_1909     TRUE 0.954 137.000 0.636 0.008 Y NA
 7135450 7135451 Rpal_1909 Rpal_1910     TRUE 0.955 151.000 0.625 0.008 Y NA
 7135451 7135452 Rpal_1910 Rpal_1911     TRUE 0.585 167.000 0.175 0.066 N NA
 7135454 7135455 Rpal_1913 Rpal_1914     TRUE 0.959 12.000 0.455 NA   NA
 7135455 7135456 Rpal_1914 Rpal_1915     FALSE 0.023 251.000 0.000 NA   NA
 7135456 7135457 Rpal_1915 Rpal_1916     FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 7135460 7135461 Rpal_1919 Rpal_1920     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7135462 7135463 Rpal_1921 Rpal_1922     TRUE 0.590 -3.000 0.015 NA N NA
 7135464 7135465 Rpal_1923 Rpal_1924     TRUE 0.828 15.000 0.124 NA N NA
 7135466 7135467 Rpal_1925 Rpal_1926     TRUE 0.862 57.000 0.000 0.044 Y NA
 7135467 7135468 Rpal_1926 Rpal_1927     FALSE 0.029 242.000 0.000 NA   NA
 7135469 7135470 Rpal_1928 Rpal_1929     FALSE 0.001 962.000 0.000 NA   NA
 7135470 7135471 Rpal_1929 Rpal_1930     FALSE 0.459 53.000 0.012 1.000   NA
 7135471 7135472 Rpal_1930 Rpal_1931     FALSE 0.250 179.000 0.031 1.000   NA
 7135472 7135473 Rpal_1931 Rpal_1932     TRUE 0.863 23.000 0.038 0.066   NA
 7135473 7135474 Rpal_1932 Rpal_1933     TRUE 0.844 69.000 0.778 NA N NA
 7135474 7135475 Rpal_1933 Rpal_1934     FALSE 0.492 101.000 0.250 NA N NA
 7135477 7135478 Rpal_1936 Rpal_1937     FALSE 0.084 186.000 0.000 1.000 N NA
 7135478 7135479 Rpal_1937 Rpal_1938     FALSE 0.407 43.000 0.000 1.000   NA
 7135479 7135480 Rpal_1938 Rpal_1939     TRUE 0.973 0.000 0.600 1.000   NA
 7135480 7135481 Rpal_1939 Rpal_1940     TRUE 0.995 2.000 0.650 0.047 Y NA
 7135481 7135482 Rpal_1940 Rpal_1941     FALSE 0.440 197.000 0.000 NA Y NA
 7135484 7135485 Rpal_1943 Rpal_1944     FALSE 0.434 141.000 0.150 NA   NA
 7135485 7135486 Rpal_1944 Rpal_1945     TRUE 0.918 35.000 0.074 1.000 Y NA
 7135486 7135487 Rpal_1945 Rpal_1946     FALSE 0.488 70.000 0.103 1.000 N NA
 7135488 7135489 Rpal_1947 Rpal_1948     FALSE 0.529 58.000 0.082 NA   NA
 7135489 7135490 Rpal_1948 Rpal_1949     TRUE 0.915 128.000 0.679 NA Y NA
 7135490 7135491 Rpal_1949 Rpal_1950     TRUE 0.997 0.000 0.957 0.047 Y NA
 7135491 7135492 Rpal_1950 Rpal_1951     TRUE 0.993 -3.000 0.913 1.000 Y NA
 7135492 7135493 Rpal_1951 Rpal_1952     TRUE 0.991 -16.000 0.636 0.029 Y NA
 7135493 7135494 Rpal_1952 Rpal_1953     FALSE 0.072 194.000 0.000 1.000 N NA
 7135494 7135495 Rpal_1953 Rpal_1954     FALSE 0.026 213.000 0.000 NA N NA
 7135495 7135496 Rpal_1954 Rpal_1955     TRUE 0.946 -10.000 0.667 NA N NA
 7135497 7135498 Rpal_1956 Rpal_1957     TRUE 0.706 40.000 0.094 1.000   NA
 7135499 7135500 Rpal_1958 Rpal_1959     TRUE 0.899 8.000 0.143 NA   NA
 7135500 7135501 Rpal_1959 Rpal_1960     TRUE 0.926 19.000 0.367 NA   NA
 7135502 7135503 Rpal_1961 Rpal_1962     FALSE 0.123 122.000 0.000 NA   NA
 7135505 7135506 Rpal_1964 Rpal_1965     FALSE 0.209 298.000 0.021 0.081 Y NA
 7135507 7135508 Rpal_1966 Rpal_1967     TRUE 0.808 149.000 0.050 0.081 Y NA
 7135509 7135510 Rpal_1968 Rpal_1969     FALSE 0.480 161.000 0.058 0.081 N NA
 7135510 7135511 Rpal_1969 Rpal_1970     TRUE 0.827 -3.000 0.092 NA   NA
 7135512 7135513 Rpal_1971 Rpal_1972     FALSE 0.201 101.000 0.008 NA   NA
 7135513 7135514 Rpal_1972 Rpal_1973     FALSE 0.121 138.000 0.000 1.000 N NA
 7135514 7135515 Rpal_1973 Rpal_1974     FALSE 0.004 382.000 0.000 NA   NA
 7135515 7135516 Rpal_1974 Rpal_1975     FALSE 0.470 24.000 0.000 NA   NA
 7135516 7135517 Rpal_1975 Rpal_1976     FALSE 0.003 422.000 0.000 NA   NA
 7135518 7135519 Rpal_1977 Rpal_1978     FALSE 0.320 288.000 0.308 NA Y NA
 7135519 7135520 Rpal_1978 Rpal_1979     TRUE 0.979 6.000 0.750 NA   NA
 7135521 7135522 Rpal_1980 Rpal_1981     TRUE 0.918 -7.000 0.326 1.000   NA
 7135523 7135524 Rpal_1982 Rpal_1983     FALSE 0.008 339.000 0.020 NA N NA
 7135525 7135526 Rpal_1984 Rpal_1985     TRUE 0.920 147.000 0.700 NA Y NA
 7135526 7135527 Rpal_1985 Rpal_1986     TRUE 0.993 7.000 0.750 NA Y NA
 7135527 7135528 Rpal_1986 Rpal_1987     TRUE 0.664 167.000 0.217 0.050   NA
 7135528 7135529 Rpal_1987 Rpal_1988     FALSE 0.017 298.000 0.000 1.000   NA
 7135529 7135530 Rpal_1988 Rpal_1989     TRUE 0.996 12.000 0.778 0.080 Y NA
 7135530 7135531 Rpal_1989 Rpal_1990     FALSE 0.189 239.000 0.200 1.000   NA
 7135531 7135532 Rpal_1990 Rpal_1991     TRUE 0.716 80.000 0.417 NA   NA
 7135532 7135533 Rpal_1991 Rpal_1992     FALSE 0.004 316.000 0.000 NA N NA
 7135534 7135535 Rpal_1993 Rpal_1994     TRUE 0.974 -3.000 0.050 0.029 Y NA
 7135535 7135536 Rpal_1994 Rpal_1995     TRUE 0.983 6.000 0.075 0.047 Y NA
 7135539 7135540 Rpal_1998 Rpal_1999     FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7135541 7135542 Rpal_2000 Rpal_2001     FALSE 0.370 200.000 0.300 NA N NA
 7135542 7135543 Rpal_2001 Rpal_2002     FALSE 0.013 243.000 0.000 NA N NA
 7135543 7135544 Rpal_2002 Rpal_2003     TRUE 0.816 97.000 0.748 1.000   NA
 7135545 7135546 Rpal_2004 Rpal_2005     TRUE 0.855 53.000 0.514 NA   NA
 7135546 7135547 Rpal_2005 Rpal_2006   dnaE2 TRUE 0.877 152.000 0.366 1.000 Y NA
 7135549 7135550 Rpal_2008 Rpal_2009     FALSE 0.371 49.000 0.000 1.000   NA
 7135550 7135551 Rpal_2009 Rpal_2010     FALSE 0.073 220.000 0.000 1.000   NA
 7135551 7135552 Rpal_2010 Rpal_2011     TRUE 0.712 157.000 0.500 1.000 N NA
 7135552 7135553 Rpal_2011 Rpal_2012     FALSE 0.232 200.000 0.091 NA   NA
 7135554 7135555 Rpal_2013 Rpal_2014     FALSE 0.276 199.000 0.143 1.000 N NA
 7135555 7135556 Rpal_2014 Rpal_2015     TRUE 0.791 84.000 0.643 NA   NA
 7135557 7135558 Rpal_2016 Rpal_2017     TRUE 0.981 3.000 0.812 NA   NA
 7135558 7135559 Rpal_2017 Rpal_2018     FALSE 0.393 117.000 0.125 NA   NA
 7135559 7135560 Rpal_2018 Rpal_2019     TRUE 0.741 61.000 0.333 NA   NA
 7135561 7135562 Rpal_2020 Rpal_2021     TRUE 0.764 38.000 0.200 NA   NA
 7135563 7135564 Rpal_2022 Rpal_2023     TRUE 0.969 -3.000 0.786 NA   NA
 7135564 7135565 Rpal_2023 Rpal_2024     FALSE 0.003 486.000 0.000 NA   NA
 7135565 7135566 Rpal_2024 Rpal_2025     FALSE 0.003 438.000 0.000 NA   NA
 7135566 7135567 Rpal_2025 Rpal_2026     FALSE 0.009 311.000 0.000 NA   NA
 7135567 7135568 Rpal_2026 Rpal_2027     FALSE 0.217 154.000 0.012 NA   NA
 7135568 7135569 Rpal_2027 Rpal_2028     FALSE 0.119 168.000 0.000 NA   NA
 7135570 7135571 Rpal_2029 Rpal_2030     FALSE 0.129 133.000 0.000 NA   NA
 7135571 7135572 Rpal_2030 Rpal_2031     FALSE 0.331 106.000 0.069 NA   NA
 7135572 7135573 Rpal_2031 Rpal_2032     TRUE 0.549 67.000 0.143 NA   NA
 7135573 7135574 Rpal_2032 Rpal_2033     TRUE 0.770 -3.000 0.054 1.000 N NA
 7135574 7135575 Rpal_2033 Rpal_2034     FALSE 0.210 87.000 0.000 1.000   NA
 7135575 7135576 Rpal_2034 Rpal_2035     TRUE 0.869 -9.000 0.000 0.001   NA
 7135576 7135577 Rpal_2035 Rpal_2036     FALSE 0.071 199.000 0.000 NA   NA
 7135577 7135578 Rpal_2036 Rpal_2037     FALSE 0.212 61.000 0.000 NA   NA
 7135578 7135579 Rpal_2037 Rpal_2038     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135579 7135580 Rpal_2038 Rpal_2039     FALSE 0.101 64.000 0.000 NA N NA
 7135580 7135581 Rpal_2039 Rpal_2040     TRUE 0.610 63.000 0.028 0.080   NA
 7135581 7135582 Rpal_2040 Rpal_2041     TRUE 0.921 -3.000 0.117 0.080   NA
 7135582 7135583 Rpal_2041 Rpal_2042     FALSE 0.208 158.000 0.012 1.000 N NA
 7135583 7135584 Rpal_2042 Rpal_2043     TRUE 0.966 2.000 0.037 1.000 Y NA
 7135584 7135585 Rpal_2043 Rpal_2044     TRUE 0.986 -3.000 0.486 1.000 Y NA
 7135585 7135586 Rpal_2044 Rpal_2045     FALSE 0.523 66.000 0.077 1.000   NA
 7135586 7135587 Rpal_2045 Rpal_2046     TRUE 0.833 18.000 0.111 NA   NA
 7135588 7135589 Rpal_2047 Rpal_2048     FALSE 0.023 298.000 0.025 NA   NA
 7135589 7135590 Rpal_2048 Rpal_2049     FALSE 0.006 344.000 0.000 1.000 N NA
 7135590 7135591 Rpal_2049 Rpal_2050     FALSE 0.464 114.000 0.200 NA   NA
 7135591 7135592 Rpal_2050 Rpal_2051     TRUE 0.917 -3.000 0.300 NA   NA
 7135592 7135593 Rpal_2051 Rpal_2052     TRUE 0.966 14.000 0.625 NA   NA
 7135593 7135594 Rpal_2052 Rpal_2053     TRUE 0.968 -3.000 0.750 NA   NA
 7135595 7135596 Rpal_2054 Rpal_2055     FALSE 0.003 457.000 0.000 1.000 N NA
 7135597 7135598 Rpal_2056 Rpal_2057     FALSE 0.348 188.000 0.180 NA   NA
 7135600 7135601 Rpal_2059 Rpal_2060     FALSE 0.123 122.000 0.000 NA   NA
 7135602 7135603 Rpal_2061 Rpal_2062     FALSE 0.320 116.000 0.069 NA   NA
 7135604 7135605 Rpal_2063 Rpal_2064     TRUE 0.709 77.000 0.333 1.000   NA
 7135605 7135606 Rpal_2064 Rpal_2065     FALSE 0.369 153.000 0.082 NA   NA
 7135607 7135608 Rpal_2066 Rpal_2067     FALSE 0.415 152.000 0.118 NA   NA
 7135608 7135609 Rpal_2067 Rpal_2068     TRUE 0.689 80.000 0.375 NA   NA
 7135610 7135611 Rpal_2069 Rpal_2070     TRUE 0.881 18.000 0.211 NA   NA
 7135612 7135613 Rpal_2071 Rpal_2072     TRUE 0.975 -3.000 0.941 NA   NA
 7135613 7135614 Rpal_2072 Rpal_2073     TRUE 0.889 44.000 0.582 NA   NA
 7135615 7135616 Rpal_2074 Rpal_2075     FALSE 0.251 54.000 0.000 NA   NA
 7135618 7135619 Rpal_2077 Rpal_2078     TRUE 0.972 10.000 0.385 0.065 N NA
 7135619 7135620 Rpal_2078 Rpal_2079     TRUE 0.676 76.000 0.385 NA N NA
 7135621 7135622 Rpal_2080 Rpal_2081     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135622 7135623 Rpal_2081 Rpal_2082     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135625 7135626 Rpal_2084 Rpal_2085     FALSE 0.115 116.000 0.000 1.000 N NA
 7135627 7135628 Rpal_2086 Rpal_2087     FALSE 0.352 124.000 0.083 NA   NA
 7135628 7135629 Rpal_2087 Rpal_2088     FALSE 0.524 112.000 0.250 NA   NA
 7135629 7135630 Rpal_2088 Rpal_2089     FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 7135630 7135631 Rpal_2089 Rpal_2090     FALSE 0.015 278.000 0.000 NA   NA
 7135631 7135632 Rpal_2090 Rpal_2091     FALSE 0.031 238.000 0.000 NA   NA
 7135632 7135633 Rpal_2091 Rpal_2092     FALSE 0.127 140.000 0.000 NA   NA
 7135633 7135634 Rpal_2092 Rpal_2093     TRUE 0.730 26.000 0.066 NA   NA
 7135634 7135635 Rpal_2093 Rpal_2094     TRUE 0.970 5.000 0.545 NA   NA
 7135635 7135636 Rpal_2094 Rpal_2095     FALSE 0.388 125.000 0.111 NA   NA
 7135636 7135637 Rpal_2095 Rpal_2096     TRUE 0.619 131.000 0.345 NA   NA
 7135637 7135638 Rpal_2096 Rpal_2097     FALSE 0.015 280.000 0.000 NA   NA
 7135638 7135639 Rpal_2097 Rpal_2098     TRUE 0.950 -3.000 0.500 NA   NA
 7135640 7135641 Rpal_2099 Rpal_2100     TRUE 0.941 12.000 0.317 NA   NA
 7135642 7135643 Rpal_2101 Rpal_2102     TRUE 0.876 77.000 1.000 NA   NA
 7135643 7135644 Rpal_2102 Rpal_2103     TRUE 0.662 98.000 0.400 NA   NA
 7135645 7135646 Rpal_2104 Rpal_2105     FALSE 0.153 83.000 0.000 NA   NA
 7135647 7135648 Rpal_2106 Rpal_2107     TRUE 0.827 -3.000 0.093 NA   NA
 7135648 7135649 Rpal_2107 Rpal_2108     TRUE 0.711 -3.000 0.023 NA   NA
 7135649 7135650 Rpal_2108 Rpal_2109     TRUE 0.773 13.000 0.031 NA   NA
 7135650 7135651 Rpal_2109 Rpal_2110     TRUE 0.969 10.000 0.577 NA   NA
 7135651 7135652 Rpal_2110 Rpal_2111     TRUE 0.956 -3.000 0.578 NA   NA
 7135652 7135653 Rpal_2111 Rpal_2112     TRUE 0.970 -3.000 0.800 NA   NA
 7135653 7135654 Rpal_2112 Rpal_2113     TRUE 0.773 139.000 0.678 NA   NA
 7135654 7135655 Rpal_2113 Rpal_2114     FALSE 0.026 246.000 0.000 NA   NA
 7135655 7135656 Rpal_2114 Rpal_2115     FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 7135656 7135657 Rpal_2115 Rpal_2116     TRUE 0.887 40.000 0.500 NA   NA
 7135657 7135658 Rpal_2116 Rpal_2117     FALSE 0.198 65.000 0.000 NA   NA
 7135660 7135661 Rpal_2119 Rpal_2120     TRUE 0.952 2.000 0.353 NA   NA
 7135661 7135662 Rpal_2120 Rpal_2121     FALSE 0.437 27.000 0.000 NA   NA
 7135662 7135663 Rpal_2121 Rpal_2122     FALSE 0.134 155.000 0.000 NA   NA
 7135663 7135664 Rpal_2122 Rpal_2123     TRUE 0.872 10.000 0.091 NA   NA
 7135664 7135665 Rpal_2123 Rpal_2124     FALSE 0.330 216.000 0.286 NA   NA
 7135665 7135666 Rpal_2124 Rpal_2125     TRUE 0.973 3.000 0.625 NA   NA
 7135666 7135667 Rpal_2125 Rpal_2126     FALSE 0.291 112.000 0.053 NA   NA
 7135667 7135668 Rpal_2126 Rpal_2127     TRUE 0.991 16.000 0.713 1.000 Y NA
 7135668 7135669 Rpal_2127 Rpal_2128     FALSE 0.284 97.000 0.069 NA N NA
 7135669 7135670 Rpal_2128 Rpal_2129     FALSE 0.045 223.000 0.000 NA   NA
 7135670 7135671 Rpal_2129 Rpal_2130     FALSE 0.459 163.000 0.184 NA   NA
 7135671 7135672 Rpal_2130 Rpal_2131     TRUE 0.751 114.000 0.096 1.000 Y NA
 7135672 7135673 Rpal_2131 Rpal_2132     TRUE 0.983 -3.000 0.125 0.002 Y NA
 7135673 7135674 Rpal_2132 Rpal_2133     TRUE 0.990 14.000 0.644 NA Y NA
 7135675 7135676 Rpal_2134 Rpal_2135 amiF   FALSE 0.122 120.000 0.000 NA   NA
 7135676 7135677 Rpal_2135 Rpal_2136     FALSE 0.129 103.000 0.000 NA   NA
 7135679 7135680 Rpal_2138 Rpal_2139     TRUE 0.934 54.000 0.556 0.005   NA
 7135681 7135682 Rpal_2140 Rpal_2141     FALSE 0.034 232.000 0.000 1.000 N NA
 7135682 7135683 Rpal_2141 Rpal_2142     FALSE 0.426 235.000 0.000 0.024 Y NA
 7135683 7135684 Rpal_2142 Rpal_2143     TRUE 0.582 212.000 0.000 0.014 Y NA
 7135684 7135685 Rpal_2143 Rpal_2144     TRUE 0.960 -3.000 0.081 1.000 Y NA
 7135686 7135687 Rpal_2145 Rpal_2146     TRUE 0.794 101.000 0.750 NA   NA
 7135689 7135690 Rpal_2148 Rpal_2149     FALSE 0.123 216.000 0.043 1.000 N NA
 7135690 7135691 Rpal_2149 Rpal_2150     FALSE 0.418 131.000 0.140 1.000 N NA
 7135691 7135692 Rpal_2150 Rpal_2151     TRUE 0.719 43.000 0.130 1.000   NA
 7135692 7135693 Rpal_2151 Rpal_2152     FALSE 0.048 238.000 0.000 1.000   NA
 7135693 7135694 Rpal_2152 Rpal_2153     FALSE 0.318 156.000 0.059 1.000 N NA
 7135694 7135695 Rpal_2153 Rpal_2154     FALSE 0.063 101.000 0.000 NA N NA
 7135695 7135696 Rpal_2154 Rpal_2155     FALSE 0.056 169.000 0.000 NA N NA
 7135696 7135697 Rpal_2155 Rpal_2156     FALSE 0.391 117.000 0.129 1.000 N NA
 7135697 7135698 Rpal_2156 Rpal_2157     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 7135699 7135700 Rpal_2158 Rpal_2159     TRUE 0.988 -3.000 0.825 0.001   NA
 7135700 7135701 Rpal_2159 Rpal_2160     TRUE 0.985 5.000 0.404 0.001   NA
 7135701 7135702 Rpal_2160 Rpal_2161     TRUE 0.974 -3.000 0.361 0.001   NA
 7135703 7135704 Rpal_2162 Rpal_2163     TRUE 0.864 12.000 0.091 NA   NA
 7135704 7135705 Rpal_2163 Rpal_2164     FALSE 0.540 -3.000 0.000 NA   NA
 7135707 7135708 Rpal_2166 Rpal_2167     FALSE 0.190 99.000 0.000 1.000   NA
 7135708 7135709 Rpal_2167 Rpal_2168     FALSE 0.126 127.000 0.000 NA   NA
 7135709 7135710 Rpal_2168 Rpal_2169     FALSE 0.059 112.000 0.000 NA N NA
 7135711 7135712 Rpal_2170 Rpal_2171     TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.010 Y NA
 7135712 7135713 Rpal_2171 Rpal_2172     TRUE 0.962 -3.000 0.739 NA N NA
 7135713 7135714 Rpal_2172 Rpal_2173     TRUE 0.902 2.000 0.150 NA   NA
 7135714 7135715 Rpal_2173 Rpal_2174     TRUE 0.925 32.000 0.600 NA   NA
 7135715 7135716 Rpal_2174 Rpal_2175     TRUE 0.911 59.000 1.000 NA   NA
 7135717 7135718 Rpal_2176 Rpal_2177     FALSE 0.018 267.000 0.000 1.000 N NA
 7135719 7135720 Rpal_2178 Rpal_2179     TRUE 0.981 0.000 1.000 NA N NA
 7135720 7135721 Rpal_2179 Rpal_2180     FALSE 0.059 111.000 0.000 NA N NA
 7135722 7135723 Rpal_2181 Rpal_2182     TRUE 0.849 -3.000 0.130 NA   NA
 7135723 7135724 Rpal_2182 Rpal_2183     FALSE 0.085 188.000 0.000 NA   NA
 7135724 7135725 Rpal_2183 Rpal_2184     TRUE 0.898 23.000 0.305 NA   NA
 7135725 7135726 Rpal_2184 Rpal_2185     TRUE 0.598 45.000 0.074 NA   NA
 7135726 7135727 Rpal_2185 Rpal_2186     FALSE 0.240 169.000 0.037 1.000 N NA
 7135728 7135729 Rpal_2187 Rpal_2188     FALSE 0.086 251.000 0.138 NA N NA
 7135730 7135731 Rpal_2189 Rpal_2190     TRUE 0.887 38.000 0.465 NA   NA
 7135731 7135732 Rpal_2190 Rpal_2191   moaA FALSE 0.204 174.000 0.051 NA N NA
 7135732 7135733 Rpal_2191 Rpal_2192 moaA   TRUE 0.589 107.000 0.312 NA   NA
 7135733 7135734 Rpal_2192 Rpal_2193     FALSE 0.394 164.000 0.116 NA   NA
 7135735 7135736 Rpal_2194 Rpal_2195     TRUE 0.718 27.000 0.065 NA   NA
 7135736 7135737 Rpal_2195 Rpal_2196     TRUE 0.875 18.000 0.200 NA   NA
 7135737 7135738 Rpal_2196 Rpal_2197     FALSE 0.246 189.000 0.079 1.000 N NA
 7135738 7135739 Rpal_2197 Rpal_2198     FALSE 0.324 131.000 0.067 1.000 N NA
 7135739 7135740 Rpal_2198 Rpal_2199     FALSE 0.540 47.000 0.057 1.000 N NA
 7135741 7135742 Rpal_2200 Rpal_2201     FALSE 0.041 228.000 0.000 NA   NA
 7135743 7135744 Rpal_2202 Rpal_2203     FALSE 0.198 36.000 0.000 NA N NA
 7135747 7135748 Rpal_2206 Rpal_2207     FALSE 0.089 186.000 0.000 NA   NA
 7135749 7135750 Rpal_2208 Rpal_2209 cysS   FALSE 0.021 284.000 0.004 NA   NA
 7135750 7135751 Rpal_2209 Rpal_2210     TRUE 0.832 0.000 0.057 NA   NA
 7135751 7135752 Rpal_2210 Rpal_2211     TRUE 0.807 -3.000 0.048 1.000   NA
 7135752 7135753 Rpal_2211 Rpal_2212     TRUE