MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus suis 98HAH33

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3593220 3593221 SSU98_0001 SSU98_0002 dnaA   TRUE 0.847 154.000 0.328 1.000 Y NA
 3593221 3593222 SSU98_0002 SSU98_0003     TRUE 0.975 -3.000 0.000 0.004   NA
 3593222 3593223 SSU98_0003 SSU98_0004     TRUE 0.542 92.000 0.056 1.000   NA
 3593223 3593224 SSU98_0004 SSU98_0005     TRUE 0.886 10.000 0.015 NA   NA
 3593224 3593225 SSU98_0005 SSU98_0006     FALSE 0.398 98.000 0.010 NA   NA
 3593225 3593226 SSU98_0006 SSU98_0007     FALSE 0.339 68.000 0.002 1.000 N NA
 3593226 3593227 SSU98_0007 SSU98_0008     TRUE 0.980 -12.000 0.007 0.019   NA
 3593227 3593228 SSU98_0008 SSU98_0009     TRUE 0.610 158.000 0.184 1.000   NA
 3593228 3593229 SSU98_0009 SSU98_0010     TRUE 0.973 0.000 0.137 NA   NA
 3593229 3593230 SSU98_0010 SSU98_0011     TRUE 0.950 -6.000 0.018 NA   NA
 3593230 3593231 SSU98_0011 SSU98_0012     FALSE 0.398 141.000 0.024 NA   NA
 3593231 3593232 SSU98_0012 SSU98_0013     TRUE 0.954 -13.000 0.053 NA   NA
 3593232 3593233 SSU98_0013 SSU98_0014     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3593233 3593234 SSU98_0014 SSU98_0015     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 3593234 3593235 SSU98_0015 SSU98_0016     TRUE 0.915 1.000 0.014 1.000 N NA
 3593235 3593236 SSU98_0016 SSU98_0017     TRUE 0.959 8.000 0.067 0.063 N NA
 3593236 3593237 SSU98_0017 SSU98_0018     TRUE 0.908 22.000 0.192 1.000 N NA
 3593237 3593238 SSU98_0018 SSU98_0019     FALSE 0.092 338.000 0.006 1.000   NA
 3593238 3593239 SSU98_0019 SSU98_2252     FALSE 0.014 532.000 0.000 NA   NA
 3593239 3593240 SSU98_2252 SSU98_2192     FALSE 0.340 52.000 0.000 NA   NA
 3593240 3593241 SSU98_2192 SSU98_2259     FALSE 0.054 279.000 0.000 NA   NA
 3593241 3593242 SSU98_2259 SSU98_2248     FALSE 0.205 85.000 0.000 NA   NA
 3593242 3593243 SSU98_2248 SSU98_2193     TRUE 0.754 5.000 0.000 NA   NA
 3593243 3593244 SSU98_2193 SSU98_2194     TRUE 0.784 3.000 0.000 NA   NA
 3593244 3593245 SSU98_2194 SSU98_2195     FALSE 0.381 46.000 0.000 NA   NA
 3593245 3593246 SSU98_2195 SSU98_2196     TRUE 0.765 4.000 0.000 NA   NA
 3593246 3593247 SSU98_2196 SSU98_2197     TRUE 0.653 15.000 0.000 NA   NA
 3593247 3593248 SSU98_2197 SSU98_2198     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 3593248 3593249 SSU98_2198 SSU98_2199     TRUE 0.734 8.000 0.000 NA   NA
 3593249 3593250 SSU98_2199 SSU98_2200     TRUE 0.612 19.000 0.000 NA   NA
 3593250 3593251 SSU98_2200 SSU98_2201     FALSE 0.392 45.000 0.000 NA   NA
 3593251 3593252 SSU98_2201 SSU98_2202     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 3593252 3593253 SSU98_2202 SSU98_2203     TRUE 0.633 17.000 0.000 NA   NA
 3593253 3593254 SSU98_2203 SSU98_2204     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 3593254 3593255 SSU98_2204 SSU98_2205     TRUE 0.687 11.000 0.000 NA   NA
 3593257 3593258 SSU98_2206 SSU98_2207     TRUE 0.520 32.000 0.000 NA   NA
 3593258 3593259 SSU98_2207 SSU98_2208     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 3593259 3593260 SSU98_2208 SSU98_0022     FALSE 0.276 60.000 0.000 NA   NA
 3593260 3593261 SSU98_0022 SSU98_0023     FALSE 0.014 551.000 0.000 NA   NA
 3593261 3593262 SSU98_0023 SSU98_0024     TRUE 0.572 103.000 0.107 NA   NA
 3593262 3593263 SSU98_0024 SSU98_0025     TRUE 0.751 87.000 0.048 1.000 Y NA
 3593263 3593264 SSU98_0025 SSU98_0026     TRUE 0.910 -13.000 0.012 1.000 N NA
 3593264 3593265 SSU98_0026 SSU98_0027     TRUE 0.922 -3.000 0.011 1.000 N NA
 3593265 3593266 SSU98_0027 SSU98_0028     TRUE 0.987 -7.000 0.017 0.008   NA
 3593266 3593267 SSU98_0028 SSU98_0029     FALSE 0.445 118.000 0.017 1.000   NA
 3593267 3593268 SSU98_0029 SSU98_0030     TRUE 0.974 4.000 0.043 1.000 Y NA
 3593268 3593269 SSU98_0030 SSU98_0031     TRUE 0.974 3.000 0.024 1.000 Y NA
 3593269 3593270 SSU98_0031 SSU98_0032     TRUE 0.953 41.000 0.248 1.000 Y NA
 3593270 3593271 SSU98_0032 SSU98_0033   purN TRUE 0.998 -3.000 0.238 0.003 Y NA
 3593271 3593272 SSU98_0033 SSU98_0034 purN purH TRUE 0.984 10.000 0.225 1.000 Y NA
 3593272 3593273 SSU98_0034 SSU98_0035 purH   TRUE 0.846 126.000 0.238 1.000 Y NA
 3593273 3593274 SSU98_0035 SSU98_0036     TRUE 0.939 26.000 0.044 1.000 Y NA
 3593274 3593275 SSU98_0036 SSU98_0037     TRUE 0.997 -13.000 0.136 0.001 Y NA
 3593275 3593276 SSU98_0037 SSU98_0038     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3593276 3593277 SSU98_0038 SSU98_0039     FALSE 0.224 73.000 0.000 NA   NA
 3593277 3593278 SSU98_0039 SSU98_0040     TRUE 0.809 2.000 0.000 NA   NA
 3593278 3593279 SSU98_0040 SSU98_0041     FALSE 0.021 407.000 0.000 NA   NA
 3593279 3593280 SSU98_0041 SSU98_0042     FALSE 0.032 345.000 0.000 NA   NA
 3593280 3593281 SSU98_0042 SSU98_0043     FALSE 0.095 210.000 0.000 NA   NA
 3593281 3593282 SSU98_0043 SSU98_0044     TRUE 0.703 -39.000 0.000 NA   NA
 3593282 3593283 SSU98_0044 SSU98_0045     TRUE 0.846 -7.000 0.000 NA   NA
 3593283 3593284 SSU98_0045 SSU98_0046     TRUE 0.842 0.000 0.000 NA   NA
 3593284 3593285 SSU98_0046 SSU98_0047     TRUE 0.642 -79.000 0.000 NA   NA
 3593285 3593286 SSU98_0047 SSU98_0048     FALSE 0.184 102.000 0.000 NA   NA
 3593286 3593287 SSU98_0048 SSU98_0049   ruvB FALSE 0.045 295.000 0.000 NA   NA
 3593287 3593288 SSU98_0049 SSU98_0050 ruvB   TRUE 0.862 0.000 0.000 1.000   NA
 3593288 3593289 SSU98_0050 SSU98_0051     TRUE 0.941 2.000 0.000 0.067   NA
 3593289 3593290 SSU98_0051 SSU98_0052     FALSE 0.093 232.000 0.000 1.000   NA
 3593290 3593291 SSU98_0052 SSU98_0053     TRUE 0.730 -31.000 0.000 NA   NA
 3593291 3593292 SSU98_0053 SSU98_0054     FALSE 0.021 405.000 0.000 NA   NA
 3593294 3593295 SSU98_0056 SSU98_0057     TRUE 0.576 25.000 0.000 NA   NA
 3593295 3593296 SSU98_0057 SSU98_0058     FALSE 0.331 53.000 0.000 NA   NA
 3593296 3593297 SSU98_0058 SSU98_0059     TRUE 0.592 84.000 0.095 NA   NA
 3593297 3593298 SSU98_0059 SSU98_0060   mutL FALSE 0.180 115.000 0.000 NA   NA
 3593298 3593299 SSU98_0060 SSU98_0061 mutL ruvA TRUE 0.889 39.000 0.016 1.000 Y NA
 3593299 3593300 SSU98_0061 SSU98_0062 ruvA   FALSE 0.091 641.000 0.012 1.000 Y NA
 3593300 3593301 SSU98_0062 SSU98_0063     TRUE 0.940 1.000 0.011 1.000   NA
 3593301 3593302 SSU98_0063 SSU98_0064     TRUE 0.745 52.000 0.083 1.000   NA
 3593302 3593303 SSU98_0064 SSU98_0065   spxA FALSE 0.123 236.000 0.004 1.000 N NA
 3593303 3593304 SSU98_0065 SSU98_0066 spxA   FALSE 0.487 100.000 0.032 1.000   NA
 3593304 3593305 SSU98_0066 SSU98_0067     TRUE 0.991 0.000 0.537 1.000   NA
 3593305 3593306 SSU98_0067 SSU98_0068     TRUE 0.980 12.000 0.651 NA   NA
 3593306 3593307 SSU98_0068 SSU98_0069     FALSE 0.133 172.000 0.000 NA   NA
 3593307 3593308 SSU98_0069 SSU98_0070   rpsJ FALSE 0.011 663.000 0.000 NA   NA
 3593308 3593309 SSU98_0070 SSU98_0071 rpsJ   TRUE 0.903 97.000 0.467 0.037   NA
 3593309 3593310 SSU98_0071 SSU98_0072     TRUE 0.814 53.000 0.007 0.027   NA
 3593310 3593311 SSU98_0072 SSU98_0073   rplD TRUE 0.986 25.000 0.544 0.027   NA
 3593311 3593312 SSU98_0073 SSU98_0074 rplD rplW TRUE 0.997 0.000 0.307 0.027 Y NA
 3593312 3593313 SSU98_0074 SSU98_0075 rplW rplB TRUE 0.996 18.000 0.849 0.037 Y NA
 3593313 3593314 SSU98_0075 SSU98_0076 rplB rpsS TRUE 0.922 251.000 0.820 0.037 Y NA
 3593314 3593315 SSU98_0076 SSU98_0077 rpsS rplV TRUE 0.996 18.000 0.769 0.037 Y NA
 3593315 3593316 SSU98_0077 SSU98_0078 rplV rpsC TRUE 0.996 13.000 0.719 0.037 Y NA
 3593316 3593317 SSU98_0078 SSU98_0079 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.037 Y NA
 3593317 3593318 SSU98_0079 SSU98_0080 rplP   TRUE 0.997 10.000 0.802 0.027 Y NA
 3593318 3593319 SSU98_0080 SSU98_0081   rpsQ TRUE 0.996 24.000 0.828 0.027 Y NA
 3593319 3593320 SSU98_0081 SSU98_0082 rpsQ rplN TRUE 0.995 25.000 0.791 0.037 Y NA
 3593320 3593321 SSU98_0082 SSU98_0083 rplN rplX TRUE 0.967 139.000 0.810 0.037 Y NA
 3593321 3593322 SSU98_0083 SSU98_0084 rplX rplE TRUE 0.995 24.000 0.758 0.027 Y NA
 3593322 3593323 SSU98_0084 SSU98_0085 rplE rpsH FALSE 0.311 536.000 0.059 0.027 Y NA
 3593323 3593324 SSU98_0085 SSU98_0086 rpsH rplF TRUE 0.731 466.000 0.808 0.027 Y NA
 3593324 3593325 SSU98_0086 SSU98_0087 rplF rplR TRUE 0.979 80.000 0.815 0.027 Y NA
 3593325 3593326 SSU98_0087 SSU98_0088 rplR rpsE TRUE 0.996 19.000 0.814 0.037 Y NA
 3593326 3593327 SSU98_0088 SSU98_0089 rpsE rpmD TRUE 0.996 15.000 0.789 0.037 Y NA
 3593327 3593328 SSU98_0089 SSU98_0090 rpmD   TRUE 0.979 79.000 0.653 0.005 Y NA
 3593328 3593329 SSU98_0090 SSU98_0091     TRUE 0.983 14.000 0.730 1.000   NA
 3593329 3593330 SSU98_0091 SSU98_0092     TRUE 0.967 13.000 0.013 0.003   NA
 3593330 3593331 SSU98_0092 SSU98_0093   adk TRUE 0.728 94.000 0.241 1.000   NA
 3593331 3593332 SSU98_0093 SSU98_0094 adk infA FALSE 0.420 122.000 0.059 1.000 N NA
 3593332 3593333 SSU98_0094 SSU98_0095 infA rpsM TRUE 0.836 161.000 0.075 0.037 Y NA
 3593333 3593334 SSU98_0095 SSU98_0096 rpsM   TRUE 0.996 18.000 0.810 0.027 Y NA
 3593334 3593335 SSU98_0096 SSU98_0097     TRUE 0.861 45.000 0.308 1.000 N NA
 3593335 3593336 SSU98_0097 SSU98_0098   rplQ TRUE 0.981 15.000 0.873 1.000 N NA
 3593336 3593337 SSU98_0098 SSU98_2253 rplQ   FALSE 0.013 553.000 0.000 NA   NA
 3593337 3593338 SSU98_2253 SSU98_2209     FALSE 0.340 52.000 0.000 NA   NA
 3593338 3593339 SSU98_2209 SSU98_2257     FALSE 0.054 279.000 0.000 NA   NA
 3593339 3593340 SSU98_2257 SSU98_2249     FALSE 0.205 85.000 0.000 NA   NA
 3593340 3593341 SSU98_2249 SSU98_2210     TRUE 0.754 5.000 0.000 NA   NA
 3593341 3593342 SSU98_2210 SSU98_2211     TRUE 0.748 6.000 0.000 NA   NA
 3593342 3593343 SSU98_2211 SSU98_2212     TRUE 0.532 31.000 0.000 NA   NA
 3593343 3593344 SSU98_2212 SSU98_2213     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 3593344 3593345 SSU98_2213 SSU98_2214     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3593345 3593346 SSU98_2214 SSU98_2215     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3593348 3593349 SSU98_2216 SSU98_2217     TRUE 0.601 21.000 0.000 NA   NA
 3593349 3593350 SSU98_2217 SSU98_2218     TRUE 0.734 8.000 0.000 NA   NA
 3593350 3593351 SSU98_2218 SSU98_2219     TRUE 0.734 8.000 0.000 NA   NA
 3593351 3593352 SSU98_2219 SSU98_2220     TRUE 0.680 12.000 0.000 NA   NA
 3593352 3593353 SSU98_2220 SSU98_2221     TRUE 0.680 12.000 0.000 NA   NA
 3593354 3593355 SSU98_0101 SSU98_0102     TRUE 0.754 5.000 0.000 NA   NA
 3593355 3593356 SSU98_0102 SSU98_0103     TRUE 0.649 -73.000 0.000 NA   NA
 3593356 3593357 SSU98_0103 SSU98_0104     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 3593357 3593358 SSU98_0104 SSU98_0105     TRUE 0.852 61.000 0.429 NA   NA
 3593358 3593359 SSU98_0105 SSU98_0106     TRUE 0.992 5.000 1.000 NA   NA
 3593359 3593360 SSU98_0106 SSU98_0107     FALSE 0.034 336.000 0.000 NA   NA
 3593362 3593363 SSU98_0109 SSU98_0110     FALSE 0.127 179.000 0.000 NA   NA
 3593364 3593365 SSU98_0111 SSU98_0112     FALSE 0.009 899.000 0.000 NA   NA
 3593365 3593366 SSU98_0112 SSU98_0113     TRUE 0.979 1.000 0.192 1.000   NA
 3593366 3593367 SSU98_0113 SSU98_0114     TRUE 0.991 -67.000 0.673 1.000 Y NA
 3593367 3593368 SSU98_0114 SSU98_0115     TRUE 0.975 10.000 0.111 1.000 Y NA
 3593368 3593369 SSU98_0115 SSU98_0116     TRUE 0.631 85.000 0.188 1.000 N NA
 3593369 3593370 SSU98_0116 SSU98_0117     TRUE 0.633 17.000 0.000 NA   NA
 3593370 3593371 SSU98_0117 SSU98_0118     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3593372 3593373 SSU98_0119 SSU98_0120     TRUE 0.715 22.000 0.004 1.000 N NA
 3593374 3593375 SSU98_0121 SSU98_0122   rpoB FALSE 0.009 446.000 0.000 1.000 N NA
 3593375 3593376 SSU98_0122 SSU98_0123 rpoB   TRUE 0.984 118.000 0.851 0.002 Y NA
 3593376 3593377 SSU98_0123 SSU98_0124     FALSE 0.361 126.000 0.007 NA   NA
 3593378 3593379 SSU98_0125 SSU98_0126     TRUE 0.513 90.000 0.048 NA   NA
 3593380 3593381 SSU98_0127 SSU98_0128     TRUE 0.990 -16.000 0.639 1.000   NA
 3593381 3593382 SSU98_0128 SSU98_0129     TRUE 0.959 -22.000 0.000 0.005   NA
 3593382 3593383 SSU98_0129 SSU98_0130     TRUE 0.994 2.000 0.861 1.000   NA
 3593383 3593384 SSU98_0130 SSU98_0131     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 3593384 3593385 SSU98_0131 SSU98_0132     TRUE 0.746 -28.000 0.000 NA   NA
 3593385 3593386 SSU98_0132 SSU98_0133     TRUE 0.981 -13.000 0.250 NA   NA
 3593386 3593387 SSU98_0133 SSU98_0134     TRUE 0.973 -22.000 0.232 NA   NA
 3593387 3593388 SSU98_0134 SSU98_0135     TRUE 0.694 57.000 0.087 NA   NA
 3593388 3593389 SSU98_0135 SSU98_0136     TRUE 0.801 50.000 0.130 1.000   NA
 3593389 3593390 SSU98_0136 SSU98_0137     TRUE 0.996 -3.000 0.176 0.001   NA
 3593390 3593391 SSU98_0137 SSU98_0138     FALSE 0.176 123.000 0.000 NA   NA
 3593391 3593392 SSU98_0138 SSU98_0139     FALSE 0.308 56.000 0.000 NA   NA
 3593394 3593395 SSU98_0141 SSU98_0142     TRUE 0.976 -3.000 0.140 NA   NA
 3593395 3593396 SSU98_0142 SSU98_0143     FALSE 0.392 45.000 0.000 NA   NA
 3593396 3593397 SSU98_0143 SSU98_0144     TRUE 0.612 19.000 0.000 NA   NA
 3593399 3593400 SSU98_0145 SSU98_0147     FALSE 0.011 652.000 0.000 NA   NA
 3593402 3593403 SSU98_0149 SSU98_0150     TRUE 0.972 -3.000 0.000 0.010   NA
 3593403 3593404 SSU98_0150 SSU98_0151     TRUE 0.983 11.000 0.160 0.010   NA
 3593404 3593405 SSU98_0151 SSU98_0152     TRUE 0.992 -3.000 0.032 0.001   NA
 3593405 3593406 SSU98_0152 SSU98_0153   rpsL FALSE 0.093 232.000 0.000 1.000   NA
 3593406 3593407 SSU98_0153 SSU98_0154 rpsL   TRUE 0.993 17.000 0.224 0.005 Y NA
 3593407 3593408 SSU98_0154 SSU98_0155     FALSE 0.399 557.000 0.579 1.000 Y NA
 3593410 3593411 SSU98_0156 SSU98_0158     FALSE 0.031 271.000 0.000 1.000 N NA
 3593411 3593412 SSU98_0158 SSU98_0159     FALSE 0.182 107.000 0.000 NA   NA
 3593412 3593413 SSU98_0159 SSU98_0160   pgk FALSE 0.422 42.000 0.000 NA   NA
 3593413 3593414 SSU98_0160 SSU98_0161 pgk   FALSE 0.022 807.000 0.002 NA   NA
 3593414 3593415 SSU98_0161 SSU98_0162     TRUE 0.912 25.000 0.154 NA   NA
 3593415 3593416 SSU98_0162 SSU98_0163     TRUE 0.885 29.000 0.179 1.000 N NA
 3593417 3593418 SSU98_0164 SSU98_0165     TRUE 0.985 4.000 0.576 NA   NA
 3593418 3593419 SSU98_0165 SSU98_0166     FALSE 0.192 94.000 0.000 NA   NA
 3593420 3593421 SSU98_0167 SSU98_0168     TRUE 0.983 -3.000 0.209 1.000   NA
 3593421 3593422 SSU98_0168 SSU98_0169     TRUE 0.951 -13.000 0.030 1.000   NA
 3593424 3593425 SSU98_0171 SSU98_0172     TRUE 0.991 48.000 1.000 0.038 Y NA
 3593425 3593426 SSU98_0172 SSU98_0173     TRUE 0.997 11.000 0.800 0.038 Y NA
 3593426 3593427 SSU98_0173 SSU98_0174     TRUE 0.973 10.000 0.095 1.000 Y NA
 3593427 3593428 SSU98_0174 SSU98_0175     TRUE 0.737 -30.000 0.000 NA   NA
 3593428 3593429 SSU98_0175 SSU98_0176     FALSE 0.093 213.000 0.000 NA   NA
 3593429 3593430 SSU98_0176 SSU98_0177     TRUE 0.983 -16.000 0.338 NA   NA
 3593430 3593431 SSU98_0177 SSU98_0178     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3593431 3593432 SSU98_0178 SSU98_0179     FALSE 0.017 463.000 0.000 NA   NA
 3593432 3593433 SSU98_0179 SSU98_0180     FALSE 0.183 105.000 0.000 NA   NA
 3593433 3593434 SSU98_0180 SSU98_0181     TRUE 0.493 34.000 0.000 NA   NA
 3593435 3593436 SSU98_0182 SSU98_0183     TRUE 0.972 10.000 0.385 NA   NA
 3593436 3593437 SSU98_0183 SSU98_0184     FALSE 0.030 350.000 0.000 NA   NA
 3593437 3593438 SSU98_0184 SSU98_0185     FALSE 0.058 489.000 0.037 NA   NA
 3593439 3593440 SSU98_0186 SSU98_0187     FALSE 0.229 71.000 0.000 NA   NA
 3593440 3593441 SSU98_0187 SSU98_0188     FALSE 0.060 268.000 0.000 NA   NA
 3593441 3593442 SSU98_0188 SSU98_0189     TRUE 0.987 2.000 0.156 0.017 N NA
 3593442 3593443 SSU98_0189 SSU98_0190     TRUE 0.788 161.000 0.182 0.028   NA
 3593443 3593444 SSU98_0190 SSU98_0191     TRUE 0.948 33.000 0.125 0.028   NA
 3593444 3593445 SSU98_0191 SSU98_0194     FALSE 0.009 2134.000 0.000 1.000   NA
 3593447 3593448 SSU98_0196 SSU98_0197     FALSE 0.193 130.000 0.000 1.000   NA
 3593450 3593451 SSU98_0199 SSU98_0200     TRUE 0.705 140.000 0.326 NA   NA
 3593453 3593454 SSU98_0202 SSU98_0203     FALSE 0.208 43.000 0.000 NA N NA
 3593454 3593455 SSU98_0203 SSU98_0204     FALSE 0.074 240.000 0.000 NA   NA
 3593455 3593456 SSU98_0204 SSU98_0205     FALSE 0.184 102.000 0.000 NA   NA
 3593456 3593457 SSU98_0205 SSU98_0206     TRUE 0.576 3.000 0.000 NA N NA
 3593458 3593459 SSU98_0207 SSU98_0208     FALSE 0.109 194.000 0.000 NA   NA
 3593459 3593460 SSU98_0208 SSU98_0209     TRUE 0.765 -25.000 0.000 NA   NA
 3593461 3593462 SSU98_0210 SSU98_0211     TRUE 0.977 -19.000 0.250 NA   NA
 3593462 3593463 SSU98_0211 SSU98_0212     FALSE 0.015 503.000 0.000 NA   NA
 3593463 3593464 SSU98_0212 SSU98_0213     FALSE 0.268 61.000 0.000 NA   NA
 3593464 3593465 SSU98_0213 SSU98_0214     TRUE 0.612 19.000 0.000 NA   NA
 3593465 3593466 SSU98_0214 SSU98_0215     FALSE 0.089 217.000 0.000 NA   NA
 3593466 3593467 SSU98_0215 SSU98_0216     TRUE 0.997 -15.000 0.900 1.000 Y NA
 3593467 3593468 SSU98_0216 SSU98_0217     TRUE 0.953 39.000 0.222 1.000 Y NA
 3593468 3593469 SSU98_0217 SSU98_0218     TRUE 0.506 94.000 0.100 1.000 N NA
 3593469 3593470 SSU98_0218 SSU98_0219     FALSE 0.018 481.000 0.000 1.000   NA
 3593470 3593471 SSU98_0219 SSU98_0220     TRUE 0.941 -132.000 0.032 0.087   NA
 3593471 3593472 SSU98_0220 SSU98_0221     TRUE 0.987 1.000 0.032 0.005   NA
 3593473 3593474 SSU98_0222 SSU98_0223     FALSE 0.403 167.000 0.099 1.000 N NA
 3593474 3593475 SSU98_0223 SSU98_0224     TRUE 0.901 10.000 0.080 1.000 N NA
 3593476 3593477 SSU98_0225 SSU98_0226     FALSE 0.036 349.000 0.000 1.000   NA
 3593478 3593479 SSU98_0227 SSU98_0228     TRUE 0.936 81.000 0.650 1.000 Y NA
 3593480 3593481 SSU98_0229 SSU98_0230     FALSE 0.293 58.000 0.000 NA   NA
 3593481 3593482 SSU98_0230 SSU98_0231     TRUE 0.951 -3.000 0.019 NA   NA
 3593482 3593483 SSU98_0231 SSU98_0232     FALSE 0.487 151.000 0.070 1.000   NA
 3593483 3593484 SSU98_0232 SSU98_0233     FALSE 0.414 24.000 0.000 1.000 N NA
 3593484 3593485 SSU98_0233 SSU98_0234     FALSE 0.051 207.000 0.000 1.000 N NA
 3593485 3593486 SSU98_0234 SSU98_0235     FALSE 0.060 190.000 0.000 1.000 N NA
 3593486 3593487 SSU98_0235 SSU98_0236     FALSE 0.286 40.000 0.000 1.000 N NA
 3593487 3593488 SSU98_0236 SSU98_0237     FALSE 0.204 118.000 0.000 1.000   NA
 3593488 3593489 SSU98_0237 SSU98_0238     TRUE 0.782 -22.000 0.000 NA   NA
 3593489 3593490 SSU98_0238 SSU98_0239     FALSE 0.138 166.000 0.000 NA   NA
 3593490 3593491 SSU98_0239 SSU98_0240     TRUE 0.801 -18.000 0.000 NA   NA
 3593491 3593492 SSU98_0240 SSU98_0241     TRUE 0.654 -69.000 0.000 NA   NA
 3593492 3593493 SSU98_0241 SSU98_0242     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3593493 3593494 SSU98_0242 SSU98_0243     TRUE 0.730 -31.000 0.000 NA   NA
 3593494 3593495 SSU98_0243 SSU98_0244     TRUE 0.809 2.000 0.000 NA   NA
 3593495 3593496 SSU98_0244 SSU98_0245     FALSE 0.010 425.000 0.000 1.000 N NA
 3593496 3593497 SSU98_0245 SSU98_0246     FALSE 0.439 65.000 0.000 0.087 N NA
 3593497 3593498 SSU98_0246 SSU98_0247     TRUE 0.508 151.000 0.088 1.000   NA
 3593500 3593501 SSU98_0249 SSU98_0250     FALSE 0.013 333.000 0.000 NA N NA
 3593501 3593502 SSU98_0250 SSU98_0251     TRUE 0.950 -6.000 0.019 NA   NA
 3593503 3593504 SSU98_0252 SSU98_0253     TRUE 0.975 -52.000 0.500 NA   NA
 3593504 3593505 SSU98_0253 SSU98_0254     TRUE 0.933 -46.000 0.115 NA   NA
 3593505 3593506 SSU98_0254 SSU98_0255     FALSE 0.232 85.000 0.000 1.000   NA
 3593508 3593509 SSU98_0257 SSU98_0258     TRUE 0.987 -3.000 0.350 NA   NA
 3593509 3593510 SSU98_0258 SSU98_0259     TRUE 0.981 -13.000 0.250 NA   NA
 3593511 3593512 SSU98_0260 SSU98_0261     TRUE 0.957 -25.000 0.121 1.000   NA
 3593514 3593515 SSU98_0262 SSU98_0264     FALSE 0.194 129.000 0.000 1.000   NA
 3593515 3593516 SSU98_0264 SSU98_0265     TRUE 0.816 -195.000 0.007 NA   NA
 3593516 3593517 SSU98_0265 SSU98_0266     FALSE 0.110 193.000 0.000 NA   NA
 3593517 3593518 SSU98_0266 SSU98_0267     FALSE 0.080 248.000 0.000 1.000   NA
 3593518 3593519 SSU98_0267 SSU98_0268     FALSE 0.018 435.000 0.000 NA   NA
 3593519 3593520 SSU98_0268 SSU98_0269     FALSE 0.169 130.000 0.000 NA   NA
 3593520 3593521 SSU98_0269 SSU98_0270     FALSE 0.072 243.000 0.000 NA   NA
 3593522 3593523 SSU98_0271 SSU98_0272 rpmG rpmF TRUE 0.975 16.000 0.012 0.035 Y NA
 3593526 3593527 SSU98_0275 SSU98_0276     FALSE 0.025 402.000 0.000 1.000   NA
 3593527 3593528 SSU98_0276 SSU98_0277     TRUE 0.869 48.000 0.014 0.014   NA
 3593528 3593529 SSU98_0277 SSU98_0278     FALSE 0.201 89.000 0.000 NA   NA
 3593529 3593530 SSU98_0278 SSU98_0279     TRUE 0.730 -31.000 0.000 NA   NA
 3593530 3593531 SSU98_0279 SSU98_0280     TRUE 0.996 -82.000 0.576 0.014 Y NA
 3593531 3593532 SSU98_0280 SSU98_0281     FALSE 0.106 391.000 0.081 NA   NA
 3593532 3593533 SSU98_0281 SSU98_0282     TRUE 0.991 -3.000 0.562 NA   NA
 3593533 3593534 SSU98_0282 SSU98_0283     TRUE 0.970 -66.000 0.429 1.000   NA
 3593534 3593535 SSU98_0283 SSU98_0284     TRUE 0.862 0.000 0.000 1.000   NA
 3593535 3593536 SSU98_0284 SSU98_0285     FALSE 0.072 172.000 0.000 1.000 N NA
 3593536 3593537 SSU98_0285 SSU98_0286     TRUE 0.998 -7.000 0.281 0.005 Y NA
 3593537 3593538 SSU98_0286 SSU98_0287     TRUE 0.995 -58.000 0.312 0.005 Y NA
 3593538 3593539 SSU98_0287 SSU98_0288     TRUE 0.956 11.000 0.097 0.058 N NA
 3593540 3593541 SSU98_0289 SSU98_0290     TRUE 0.999 -13.000 0.911 0.014 Y NA
 3593542 3593543 SSU98_0291 SSU98_0292     TRUE 0.977 12.000 0.569 NA   NA
 3593543 3593544 SSU98_0292 SSU98_0293     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3593544 3593545 SSU98_0293 SSU98_0294   hrcA FALSE 0.023 298.000 0.000 1.000 N NA
 3593545 3593546 SSU98_0294 SSU98_0295 hrcA   TRUE 0.866 13.000 0.051 1.000 N NA
 3593546 3593547 SSU98_0295 SSU98_0296     TRUE 0.881 97.000 0.026 0.010 Y NA
 3593547 3593548 SSU98_0296 SSU98_0297     FALSE 0.031 347.000 0.000 NA   NA
 3593548 3593549 SSU98_0297 SSU98_0298     TRUE 0.765 -25.000 0.000 NA   NA
 3593549 3593550 SSU98_0298 SSU98_0299     FALSE 0.029 276.000 0.000 1.000 N NA
 3593550 3593551 SSU98_0299 SSU98_0300     TRUE 0.546 10.000 0.000 1.000 N NA
 3593551 3593552 SSU98_0300 SSU98_0301     FALSE 0.230 47.000 0.000 1.000 N NA
 3593552 3593553 SSU98_0301 SSU98_0302     TRUE 0.904 91.000 0.125 0.037 Y NA
 3593554 3593555 SSU98_0303 SSU98_0304     TRUE 0.746 -28.000 0.000 NA   NA
 3593555 3593556 SSU98_0304 SSU98_0305     FALSE 0.162 135.000 0.000 NA   NA
 3593556 3593557 SSU98_0305 SSU98_0306     FALSE 0.466 130.000 0.000 1.000 Y NA
 3593558 3593559 SSU98_0307 SSU98_0308 truA   TRUE 0.945 -10.000 0.058 1.000 N NA
 3593559 3593560 SSU98_0308 SSU98_0309     TRUE 0.961 -52.000 0.276 NA   NA
 3593560 3593561 SSU98_0309 SSU98_0310     TRUE 0.966 -19.000 0.149 NA   NA
 3593561 3593562 SSU98_0310 SSU98_0311     TRUE 0.842 0.000 0.000 NA   NA
 3593564 3593565 SSU98_0313 SSU98_0314     FALSE 0.065 254.000 0.000 NA   NA
 3593565 3593566 SSU98_0314 SSU98_0315     FALSE 0.445 80.000 0.057 NA N NA
 3593566 3593567 SSU98_0315 SSU98_0316     TRUE 0.609 26.000 0.000 1.000   NA
 3593567 3593568 SSU98_0316 SSU98_0317     TRUE 0.866 -7.000 0.000 1.000   NA
 3593568 3593569 SSU98_0317 SSU98_0318     TRUE 0.919 -43.000 0.000 0.025   NA
 3593569 3593570 SSU98_0318 SSU98_0319     FALSE 0.472 10.000 0.000 NA N NA
 3593572 3593573 SSU98_0321 SSU98_0322     FALSE 0.207 107.000 0.000 1.000   NA
 3593575 3593576 SSU98_0324 SSU98_0325 tig   TRUE 0.504 33.000 0.000 NA   NA
 3593576 3593577 SSU98_0325 SSU98_0326     FALSE 0.182 109.000 0.000 NA   NA
 3593577 3593578 SSU98_0326 SSU98_0327     FALSE 0.189 95.000 0.000 NA   NA
 3593578 3593579 SSU98_0327 SSU98_0328     FALSE 0.172 127.000 0.000 NA   NA
 3593579 3593580 SSU98_0328 SSU98_0329   pyrG FALSE 0.175 240.000 0.029 1.000 N NA
 3593580 3593581 SSU98_0329 SSU98_2222 pyrG   FALSE 0.052 281.000 0.000 NA   NA
 3593581 3593582 SSU98_2222 SSU98_0330     FALSE 0.078 235.000 0.000 NA   NA
 3593582 3593583 SSU98_0330 SSU98_0331   rpmB FALSE 0.011 393.000 0.000 1.000 N NA
 3593583 3593584 SSU98_0331 SSU98_2255 rpmB   FALSE 0.011 613.000 0.000 NA   NA
 3593584 3593585 SSU98_2255 SSU98_2223     TRUE 0.610 -1675.000 0.000 NA   NA
 3593585 3593586 SSU98_2223 SSU98_2256     FALSE 0.054 279.000 0.000 NA   NA
 3593586 3593587 SSU98_2256 SSU98_2250     FALSE 0.205 85.000 0.000 NA   NA
 3593587 3593588 SSU98_2250 SSU98_2224     TRUE 0.765 4.000 0.000 NA   NA
 3593588 3593589 SSU98_2224 SSU98_2225     TRUE 0.589 23.000 0.000 NA   NA
 3593589 3593590 SSU98_2225 SSU98_0333     FALSE 0.179 119.000 0.000 NA   NA
 3593592 3593593 SSU98_0335 SSU98_0336     TRUE 0.955 -10.000 0.030 1.000   NA
 3593595 3593596 SSU98_0338 SSU98_0339     FALSE 0.177 122.000 0.000 NA   NA
 3593596 3593597 SSU98_0339 SSU98_0340     TRUE 0.594 22.000 0.000 NA   NA
 3593597 3593598 SSU98_0340 SSU98_0341     FALSE 0.070 409.000 0.015 1.000   NA
 3593598 3593599 SSU98_0341 SSU98_0342     TRUE 0.790 34.000 0.083 1.000 N NA
 3593599 3593600 SSU98_0342 SSU98_0343   rplS FALSE 0.034 254.000 0.000 1.000 N NA
 3593600 3593601 SSU98_0343 SSU98_0344 rplS   FALSE 0.167 156.000 0.000 1.000   NA
 3593601 3593602 SSU98_0344 SSU98_0345   gatC FALSE 0.103 217.000 0.000 1.000   NA
 3593602 3593603 SSU98_0345 SSU98_0346 gatC gatA TRUE 0.999 0.000 0.643 0.002 Y NA
 3593603 3593604 SSU98_0346 SSU98_0347 gatA gatB TRUE 0.999 0.000 0.492 0.002 Y NA
 3593604 3593605 SSU98_0347 SSU98_0348 gatB   FALSE 0.202 121.000 0.000 1.000   NA
 3593605 3593606 SSU98_0348 SSU98_0349     TRUE 0.817 -15.000 0.000 NA   NA
 3593608 3593609 SSU98_0351 SSU98_0352     TRUE 0.993 10.000 0.107 0.002 Y NA
 3593609 3593610 SSU98_0352 SSU98_0353     FALSE 0.253 73.000 0.000 1.000   NA
 3593610 3593611 SSU98_0353 SSU98_0354     TRUE 0.977 6.000 0.111 0.085   NA
 3593611 3593612 SSU98_0354 SSU98_0355     TRUE 0.544 33.000 0.000 1.000   NA
 3593612 3593613 SSU98_0355 SSU98_0356     FALSE 0.097 207.000 0.000 NA   NA
 3593613 3593614 SSU98_0356 SSU98_0357     FALSE 0.133 172.000 0.000 NA   NA
 3593614 3593615 SSU98_0357 SSU98_0358     TRUE 0.990 1.000 0.555 1.000   NA
 3593615 3593616 SSU98_0358 SSU98_0359     FALSE 0.230 273.000 0.068 NA   NA
 3593616 3593617 SSU98_0359 SSU98_0360   nadD TRUE 0.913 13.000 0.150 NA N NA
 3593617 3593618 SSU98_0360 SSU98_0361 nadD   TRUE 0.992 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 3593618 3593619 SSU98_0361 SSU98_0362     FALSE 0.144 158.000 0.000 NA   NA
 3593619 3593620 SSU98_0362 SSU98_0363     FALSE 0.052 281.000 0.000 NA   NA
 3593620 3593621 SSU98_0363 SSU98_0364     FALSE 0.437 130.000 0.000 0.062   NA
 3593621 3593622 SSU98_0364 SSU98_0365     TRUE 0.921 2.000 0.008 NA   NA
 3593622 3593623 SSU98_0365 SSU98_0366     FALSE 0.194 302.000 0.085 NA   NA
 3593623 3593624 SSU98_0366 SSU98_0367     FALSE 0.402 44.000 0.000 NA   NA
 3593624 3593625 SSU98_0367 SSU98_0368     FALSE 0.286 59.000 0.000 NA   NA
 3593625 3593626 SSU98_0368 SSU98_0369     FALSE 0.448 96.000 0.023 NA   NA
 3593626 3593627 SSU98_0369 SSU98_0370     FALSE 0.213 96.000 0.000 1.000   NA
 3593627 3593628 SSU98_0370 SSU98_0371     FALSE 0.113 190.000 0.000 NA   NA
 3593628 3593629 SSU98_0371 SSU98_0372     TRUE 0.971 -10.000 0.125 NA   NA
 3593631 3593632 SSU98_0374 SSU98_0375     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 3593632 3593633 SSU98_0375 SSU98_0376     FALSE 0.070 246.000 0.000 NA   NA
 3593633 3593634 SSU98_0376 SSU98_0377     FALSE 0.050 305.000 0.000 1.000   NA
 3593634 3593635 SSU98_0377 SSU98_0378     TRUE 0.565 27.000 0.000 NA   NA
 3593635 3593636 SSU98_0378 SSU98_0379     FALSE 0.122 183.000 0.000 NA   NA
 3593636 3593637 SSU98_0379 SSU98_0380     TRUE 0.996 -16.000 0.289 0.037 Y NA
 3593638 3593639 SSU98_0381 SSU98_0382     TRUE 0.832 2.000 0.000 1.000   NA
 3593640 3593641 SSU98_0383 SSU98_0384     TRUE 0.955 34.000 0.610 NA   NA
 3593642 3593643 SSU98_0385 SSU98_0386     TRUE 0.974 11.000 0.486 NA   NA
 3593644 3593645 SSU98_0387 SSU98_0388     FALSE 0.027 364.000 0.000 NA   NA
 3593645 3593646 SSU98_0388 SSU98_0389     TRUE 0.897 -34.000 0.020 NA   NA
 3593646 3593647 SSU98_0389 SSU98_0390     TRUE 0.879 21.000 0.068 NA   NA
 3593647 3593648 SSU98_0390 SSU98_0391     FALSE 0.199 90.000 0.000 NA   NA
 3593648 3593649 SSU98_0391 SSU98_0392     FALSE 0.093 213.000 0.000 NA   NA
 3593651 3593652 SSU98_0394 SSU98_0395     FALSE 0.179 118.000 0.000 NA   NA
 3593652 3593653 SSU98_0395 SSU98_0396     TRUE 0.992 -3.000 0.530 1.000   NA
 3593653 3593654 SSU98_0396 SSU98_0397     FALSE 0.077 160.000 0.000 1.000 N NA
 3593655 3593656 SSU98_0398 SSU98_0400 gidB   TRUE 0.632 59.000 0.000 1.000 Y NA
 3593659 3593660 SSU98_0402 SSU98_0403     TRUE 0.860 71.000 0.579 NA   NA
 3593660 3593661 SSU98_0403 SSU98_0404     FALSE 0.013 557.000 0.000 NA   NA
 3593661 3593662 SSU98_0404 SSU98_0405     TRUE 0.626 -132.000 0.000 NA   NA
 3593662 3593663 SSU98_0405 SSU98_0406     FALSE 0.008 1105.000 0.000 NA   NA
 3593665 3593666 SSU98_0408 SSU98_0409   gmk FALSE 0.390 131.000 0.010 1.000   NA
 3593666 3593667 SSU98_0409 SSU98_0410 gmk   TRUE 0.949 24.000 0.471 1.000 N NA
 3593667 3593668 SSU98_0410 SSU98_0411     TRUE 0.556 145.000 0.032 0.080 N NA
 3593668 3593669 SSU98_0411 SSU98_0412   fmt FALSE 0.388 132.000 0.052 1.000 N NA
 3593669 3593670 SSU98_0412 SSU98_0413 fmt   TRUE 0.993 -13.000 0.305 1.000 Y NA
 3593670 3593671 SSU98_0413 SSU98_0414     TRUE 0.899 -37.000 0.074 1.000 N NA
 3593671 3593672 SSU98_0414 SSU98_0415     TRUE 0.997 0.000 0.704 1.000 Y NA
 3593672 3593673 SSU98_0415 SSU98_0416     FALSE 0.100 364.000 0.039 NA   NA
 3593673 3593674 SSU98_0416 SSU98_0417     TRUE 0.993 -3.000 0.679 NA   NA
 3593674 3593675 SSU98_0417 SSU98_0418     TRUE 0.613 -484.000 0.000 NA   NA
 3593675 3593676 SSU98_0418 SSU98_0419     FALSE 0.027 364.000 0.000 NA   NA
 3593676 3593677 SSU98_0419 SSU98_0420     TRUE 0.828 50.000 0.164 1.000   NA
 3593677 3593678 SSU98_0420 SSU98_0421     TRUE 0.972 2.000 0.151 1.000   NA
 3593679 3593680 SSU98_0422 SSU98_0423     TRUE 0.757 42.000 0.033 1.000   NA
 3593681 3593682 SSU98_0424 SSU98_0425     TRUE 0.975 -7.000 0.130 1.000   NA
 3593682 3593683 SSU98_0425 SSU98_0426     TRUE 0.795 41.000 0.080 NA   NA
 3593683 3593684 SSU98_0426 SSU98_2254     FALSE 0.036 330.000 0.000 NA   NA
 3593684 3593685 SSU98_2254 SSU98_2226     FALSE 0.340 52.000 0.000 NA   NA
 3593685 3593686 SSU98_2226 SSU98_2258     FALSE 0.050 283.000 0.000 NA   NA
 3593686 3593687 SSU98_2258 SSU98_2251     FALSE 0.205 85.000 0.000 NA   NA
 3593687 3593688 SSU98_2251 SSU98_2227     TRUE 0.754 5.000 0.000 NA   NA
 3593688 3593689 SSU98_2227 SSU98_2228     TRUE 0.784 3.000 0.000 NA   NA
 3593689 3593690 SSU98_2228 SSU98_2229     FALSE 0.381 46.000 0.000 NA   NA
 3593690 3593691 SSU98_2229 SSU98_2230     TRUE 0.765 4.000 0.000 NA   NA
 3593691 3593692 SSU98_2230 SSU98_2231     TRUE 0.653 15.000 0.000 NA   NA
 3593692 3593693 SSU98_2231 SSU98_2232     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 3593693 3593694 SSU98_2232 SSU98_2233     TRUE 0.734 8.000 0.000 NA   NA
 3593694 3593695 SSU98_2233 SSU98_2234     TRUE 0.612 19.000 0.000 NA   NA
 3593695 3593696 SSU98_2234 SSU98_2235     FALSE 0.392 45.000 0.000 NA   NA
 3593696 3593697 SSU98_2235 SSU98_0428     FALSE 0.183 106.000 0.000 NA   NA
 3593698 3593699 SSU98_0429 SSU98_0431     FALSE 0.070 247.000 0.000 NA   NA
 3593700 3593701 SSU98_0430 SSU98_0432 recX   TRUE 0.500 76.000 0.025 NA   NA
 3593701 3593702 SSU98_0432 SSU98_0433     TRUE 0.642 58.000 0.051 NA   NA
 3593702 3593703 SSU98_0433 SSU98_0434     FALSE 0.219 76.000 0.000 NA   NA
 3593703 3593704 SSU98_0434 SSU98_0435     TRUE 0.859 -10.000 0.000 1.000   NA
 3593706 3593707 SSU98_0437 SSU98_0438     TRUE 0.673 54.000 0.000 1.000 Y NA
 3593707 3593708 SSU98_0438 SSU98_0439     TRUE 0.992 42.000 0.810 0.026 Y NA
 3593708 3593709 SSU98_0439 SSU98_0440     TRUE 0.964 -49.000 0.000 0.026 Y NA
 3593709 3593710 SSU98_0440 SSU98_0441     TRUE 0.965 -3.000 0.000 0.026   NA
 3593710 3593711 SSU98_0441 SSU98_0442     TRUE 0.963 0.000 0.000 0.026   NA
 3593711 3593712 SSU98_0442 SSU98_0443     FALSE 0.300 216.000 0.000 1.000 Y NA
 3593712 3593713 SSU98_0443 SSU98_0444     FALSE 0.399 49.000 0.000 1.000   NA
 3593713 3593714 SSU98_0444 SSU98_0445     FALSE 0.072 242.000 0.000 NA   NA
 3593714 3593715 SSU98_0445 SSU98_0446     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3593715 3593716 SSU98_0446 SSU98_0447   valS FALSE 0.381 115.000 0.008 NA   NA
 3593716 3593717 SSU98_0447 SSU98_0448 valS   FALSE 0.216 78.000 0.000 NA   NA
 3593717 3593718 SSU98_0448 SSU98_0449     FALSE 0.229 71.000 0.000 NA   NA
 3593718 3593719 SSU98_0449 SSU98_0450     FALSE 0.085 227.000 0.000 NA   NA
 3593719 3593720 SSU98_0450 SSU98_0451     FALSE 0.214 95.000 0.000 1.000   NA
 3593720 3593721 SSU98_0451 SSU98_0452     TRUE 0.961 15.000 0.333 NA   NA
 3593721 3593722 SSU98_0452 SSU98_0453     FALSE 0.183 104.000 0.000 NA   NA
 3593722 3593723 SSU98_0453 SSU98_0454     TRUE 0.945 13.000 0.182 NA   NA
 3593723 3593724 SSU98_0454 SSU98_0455     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3593724 3593725 SSU98_0455 SSU98_0456     FALSE 0.401 84.000 0.005 NA   NA
 3593725 3593726 SSU98_0456 SSU98_0457     FALSE 0.187 133.000 0.000 1.000   NA
 3593726 3593727 SSU98_0457 SSU98_0458     TRUE 0.981 -13.000 0.012 0.017   NA
 3593727 3593728 SSU98_0458 SSU98_0459     TRUE 0.842 18.000 0.015 NA   NA
 3593730 3593731 SSU98_0461 SSU98_0462     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 3593731 3593732 SSU98_0462 SSU98_0463     TRUE 0.520 32.000 0.000 NA   NA
 3593732 3593733 SSU98_0463 SSU98_0464     TRUE 0.641 16.000 0.000 NA   NA
 3593733 3593734 SSU98_0464 SSU98_0465     FALSE 0.038 318.000 0.000 NA   NA
 3593734 3593735 SSU98_0465 SSU98_0466     FALSE 0.182 107.000 0.000 NA   NA
 3593735 3593736 SSU98_0466 SSU98_0467     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3593736 3593737 SSU98_0467 SSU98_0468     FALSE 0.422 42.000 0.000 NA   NA
 3593737 3593738 SSU98_0468 SSU98_0469   murD FALSE 0.040 664.000 0.000 NA Y NA
 3593738 3593739 SSU98_0469 SSU98_0470 murD murG TRUE 0.979 3.000 0.060 1.000 Y NA
 3593739 3593740 SSU98_0470 SSU98_0471 murG   TRUE 0.748 6.000 0.000 NA   NA
 3593740 3593741 SSU98_0471 SSU98_0472     TRUE 0.649 -73.000 0.000 NA   NA
 3593741 3593742 SSU98_0472 SSU98_0473     TRUE 0.734 8.000 0.000 NA   NA
 3593742 3593743 SSU98_0473 SSU98_0474     TRUE 0.721 153.000 0.389 NA   NA
 3593743 3593744 SSU98_0474 SSU98_0475     TRUE 0.982 26.000 0.460 1.000 Y NA
 3593744 3593745 SSU98_0475 SSU98_0476     TRUE 0.914 7.000 0.030 NA   NA
 3593747 3593748 SSU98_0478 SSU98_0479     TRUE 0.978 5.000 0.370 NA   NA
 3593748 3593749 SSU98_0479 SSU98_0480     TRUE 0.979 3.000 0.287 1.000   NA
 3593749 3593750 SSU98_0480 SSU98_0481     TRUE 0.982 9.000 0.579 NA   NA
 3593750 3593751 SSU98_0481 SSU98_0482     FALSE 0.124 182.000 0.000 NA   NA
 3593751 3593752 SSU98_0482 SSU98_0483   ileS TRUE 0.764 8.000 0.000 1.000   NA
 3593753 3593754 SSU98_0484 SSU98_0485     TRUE 0.741 55.000 0.114 NA   NA
 3593754 3593755 SSU98_0485 SSU98_0486     FALSE 0.352 180.000 0.079 1.000 N NA
 3593756 3593757 SSU98_0487 SSU98_0488     FALSE 0.274 230.000 0.044 NA   NA
 3593757 3593758 SSU98_0488 SSU98_0489     TRUE 0.997 -7.000 0.640 1.000 Y NA
 3593758 3593759 SSU98_0489 SSU98_0490     FALSE 0.326 130.000 0.017 1.000 N NA
 3593759 3593760 SSU98_0490 SSU98_0491     FALSE 0.008 1450.000 0.000 NA   NA
 3593760 3593761 SSU98_0491 SSU98_0492     TRUE 0.810 -16.000 0.000 NA   NA
 3593761 3593762 SSU98_0492 SSU98_0493     TRUE 0.612 19.000 0.000 NA   NA
 3593764 3593765 SSU98_0494 SSU98_0496     FALSE 0.025 257.000 0.000 NA N NA
 3593767 3593768 SSU98_0498 SSU98_0499     TRUE 0.767 295.000 0.156 0.003 Y NA
 3593774 3593775 SSU98_0505 SSU98_0506     TRUE 0.991 -28.000 0.923 1.000   NA
 3593775 3593776 SSU98_0506 SSU98_0507     FALSE 0.084 228.000 0.000 NA   NA
 3593776 3593777 SSU98_0507 SSU98_0508     TRUE 0.994 1.000 0.923 NA   NA
 3593777 3593778 SSU98_0508 SSU98_0509     FALSE 0.173 126.000 0.000 NA   NA
 3593778 3593779 SSU98_0509 SSU98_0510     TRUE 0.970 2.000 0.154 NA   NA
 3593780 3593781 SSU98_0511 SSU98_0512 lysS   FALSE 0.277 103.000 0.004 1.000 N NA
 3593781 3593782 SSU98_0512 SSU98_0513     TRUE 0.924 3.000 0.018 NA   NA
 3593782 3593783 SSU98_0513 SSU98_0514     TRUE 0.941 0.000 0.012 NA   NA
 3593783 3593784 SSU98_0514 SSU98_0515     FALSE 0.197 91.000 0.000 NA   NA
 3593784 3593785 SSU98_0515 SSU98_0516     FALSE 0.327 178.000 0.016 NA   NA
 3593785 3593786 SSU98_0516 SSU98_0517     FALSE 0.100 200.000 0.000 NA   NA
 3593787 3593788 SSU98_0518 SSU98_0519     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3593788 3593789 SSU98_0519 SSU98_0520     FALSE 0.160 137.000 0.000 NA   NA
 3593789 3593790 SSU98_0520 SSU98_0521     TRUE 0.798 21.000 0.028 1.000 N NA
 3593790 3593791 SSU98_0521 SSU98_0522     FALSE 0.100 115.000 0.000 1.000 N NA
 3593791 3593792 SSU98_0522 SSU98_0523     TRUE 0.981 -19.000 0.333 NA   NA
 3593792 3593793 SSU98_0523 SSU98_0524     FALSE 0.078 337.000 0.002 NA   NA
 3593793 3593794 SSU98_0524 SSU98_0525   tpiA FALSE 0.199 176.000 0.003 1.000 N NA
 3593795 3593796 SSU98_0526 SSU98_0527     TRUE 0.940 -22.000 0.035 1.000   NA
 3593797 3593798 SSU98_0528 SSU98_0529     TRUE 0.876 12.000 0.017 NA   NA
 3593800 3593801 SSU98_0531 SSU98_0532     TRUE 0.805 55.000 0.000 0.001   NA
 3593802 3593803 SSU98_0533 SSU98_0534     TRUE 0.967 17.000 0.471 NA   NA
 3593803 3593804 SSU98_0534 SSU98_0535     TRUE 0.696 136.000 0.412 1.000 N NA
 3593805 3593806 SSU98_0536 SSU98_0537     TRUE 0.966 -61.000 0.024 0.007   NA
 3593806 3593807 SSU98_0537 SSU98_0538     TRUE 0.615 85.000 0.098 1.000   NA
 3593807 3593808 SSU98_0538 SSU98_0539     TRUE 0.957 20.000 0.008 0.002   NA
 3593808 3593809 SSU98_0539 SSU98_0540     TRUE 0.761 114.000 0.008 0.002   NA
 3593809 3593810 SSU98_0540 SSU98_0541     TRUE 0.977 -7.000 0.000 0.002   NA
 3593810 3593811 SSU98_0541 SSU98_0542     TRUE 0.580 30.000 0.000 1.000   NA
 3593811 3593812 SSU98_0542 SSU98_0543     TRUE 0.982 -30.000 0.021 0.001   NA
 3593812 3593813 SSU98_0543 SSU98_0544     FALSE 0.161 161.000 0.000 1.000   NA
 3593813 3593814 SSU98_0544 SSU98_0545     TRUE 0.504 33.000 0.000 NA   NA
 3593814 3593815 SSU98_0545 SSU98_0546     TRUE 0.849 -6.000 0.000 NA   NA
 3593817 3593818 SSU98_0548 SSU98_0549     FALSE 0.452 43.000 0.000 1.000   NA
 3593818 3593819 SSU98_0549 SSU98_0550     FALSE 0.318 181.000 0.011 1.000   NA
 3593819 3593820 SSU98_0550 SSU98_0551     FALSE 0.081 152.000 0.000 1.000 N NA
 3593820 3593821 SSU98_0551 SSU98_0552     TRUE 0.977 10.000 0.130 1.000 Y NA
 3593821 3593822 SSU98_0552 SSU98_0553     TRUE 0.974 15.000 0.154 1.000 Y NA
 3593822 3593823 SSU98_0553 SSU98_0554     TRUE 0.653 15.000 0.000 NA   NA
 3593823 3593824 SSU98_0554 SSU98_0555     FALSE 0.008 1252.000 0.000 NA   NA
 3593826 3593827 SSU98_0557 SSU98_0558     FALSE 0.077 160.000 0.000 1.000 N NA
 3593827 3593828 SSU98_0558 SSU98_0559   proA TRUE 0.973 65.000 0.281 0.002 Y NA
 3593828 3593829 SSU98_0559 SSU98_0560 proA   TRUE 0.988 10.000 0.009 0.002 Y NA
 3593832 3593833 SSU98_0563 SSU98_0564     TRUE 0.930 29.000 0.231 1.000   NA
 3593834 3593835 SSU98_0565 SSU98_0566     TRUE 0.721 37.000 0.011 NA   NA
 3593835 3593836 SSU98_0566 SSU98_0567     FALSE 0.185 99.000 0.000 NA   NA
 3593836 3593837 SSU98_0567 SSU98_0568     TRUE 0.810 -16.000 0.000 NA   NA
 3593837 3593838 SSU98_0568 SSU98_0569     TRUE 0.623 18.000 0.000 NA   NA
 3593838 3593839 SSU98_0569 SSU98_0570     TRUE 0.982 10.000 0.800 1.000 N NA
 3593839 3593840 SSU98_0570 SSU98_0571     FALSE 0.294 39.000 0.000 1.000 N NA
 3593840 3593841 SSU98_0571 SSU98_0572     TRUE 0.842 25.000 0.000 NA Y NA
 3593841 3593842 SSU98_0572 SSU98_0573     TRUE 0.820 35.000 0.067 NA   NA
 3593842 3593843 SSU98_0573 SSU98_0574     FALSE 0.220 75.000 0.000 NA   NA
 3593843 3593844 SSU98_0574 SSU98_0575     TRUE 0.983 4.000 0.083 0.014   NA
 3593844 3593845 SSU98_0575 SSU98_0576     FALSE 0.011 661.000 0.000 NA   NA
 3593845 3593846 SSU98_0576 SSU98_0577     FALSE 0.487 35.000 0.000 NA   NA
 3593846 3593847 SSU98_0577 SSU98_0578     FALSE 0.159 139.000 0.000 NA   NA
 3593847 3593848 SSU98_0578 SSU98_0579     TRUE 0.846 -7.000 0.000 NA   NA
 3593848 3593849 SSU98_0579 SSU98_0580     FALSE 0.008 1843.000 0.000 NA   NA
 3593849 3593850 SSU98_0580 SSU98_0581     TRUE 0.919 9.000 0.033 1.000   NA
 3593850 3593851 SSU98_0581 SSU98_0582     FALSE 0.014 575.000 0.000 1.000   NA
 3593851 3593852 SSU98_0582 SSU98_0583     TRUE 0.990 12.000 0.549 1.000 Y NA
 3593852 3593853 SSU98_0583 SSU98_0584     TRUE 0.947 -10.000 0.013 1.000   NA
 3593853 3593854 SSU98_0584 SSU98_0585     TRUE 0.911 6.000 0.013 1.000   NA
 3593854 3593855 SSU98_0585 SSU98_0586     FALSE 0.124 182.000 0.000 NA   NA
 3593855 3593856 SSU98_0586 SSU98_0587     FALSE 0.011 617.000 0.000 NA   NA
 3593856 3593857 SSU98_0587 SSU98_0588     TRUE 0.866 18.000 0.000 NA Y NA
 3593857 3593858 SSU98_0588 SSU98_0589     FALSE 0.099 203.000 0.000 NA   NA
 3593858 3593859 SSU98_0589 SSU98_0590     FALSE 0.276 60.000 0.000 NA   NA
 3593859 3593860 SSU98_0590 SSU98_0591     FALSE 0.212 80.000 0.000 NA   NA
 3593860 3593861 SSU98_0591 SSU98_0592     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 3593861 3593862 SSU98_0592 SSU98_0593     FALSE 0.074 240.000 0.000 NA   NA
 3593862 3593863 SSU98_0593 SSU98_0594     FALSE 0.109 194.000 0.000 NA   NA
 3593865 3593866 SSU98_0596 SSU98_0597     FALSE 0.038 324.000 0.000 NA   NA
 3593867 3593868 SSU98_0598 SSU98_0599     TRUE 0.701 -40.000 0.000 NA   NA
 3593869 3593870 SSU98_0600 SSU98_0601   aroK TRUE 0.960 9.000 0.012 1.000 Y NA
 3593870 3593871 SSU98_0601 SSU98_0602 aroK   TRUE 0.982 -9.000 0.025 1.000 Y NA
 3593871 3593872 SSU98_0602 SSU98_0603     TRUE 0.831 12.000 0.025 NA N NA
 3593872 3593873 SSU98_0603 SSU98_0604     TRUE 0.543 66.000 0.093 NA N NA
 3593876 3593877 SSU98_0607 SSU98_0608     TRUE 0.983 3.000 0.414 NA   NA
 3593878 3593879 SSU98_0609 SSU98_0610     TRUE 0.623 18.000 0.000 NA   NA
 3593879 3593880 SSU98_0610 SSU98_0611     FALSE 0.478 36.000 0.000 NA   NA
 3593880 3593881 SSU98_0611 SSU98_0612     FALSE 0.286 59.000 0.000 NA   NA
 3593881 3593882 SSU98_0612 SSU98_0613     TRUE 0.981 -3.000 0.205 NA   NA
 3593882 3593883 SSU98_0613 SSU98_0614   asnC TRUE 0.870 15.000 0.068 1.000 N NA
 3593883 3593884 SSU98_0614 SSU98_0615 asnC   FALSE 0.072 242.000 0.000 NA   NA
 3593884 3593885 SSU98_0615 SSU98_0616     TRUE 0.995 -10.000 1.000 NA   NA
 3593885 3593886 SSU98_0616 SSU98_0617     FALSE 0.008 394.000 0.000 NA N NA
 3593886 3593887 SSU98_0617 SSU98_0618     FALSE 0.167 51.000 0.000 NA N NA
 3593887 3593888 SSU98_0618 SSU98_0619     TRUE 0.863 22.000 0.051 NA   NA
 3593888 3593889 SSU98_0619 SSU98_0620     TRUE 0.982 -3.000 0.214 NA   NA
 3593889 3593890 SSU98_0620 SSU98_0621     TRUE 0.990 -3.000 0.470 NA   NA
 3593890 3593891 SSU98_0621 SSU98_0622     FALSE 0.050 283.000 0.000 NA   NA
 3593891 3593892 SSU98_0622 SSU98_0623     FALSE 0.059 192.000 0.000 1.000 N NA
 3593892 3593893 SSU98_0623 SSU98_0624     TRUE 0.963 0.000 0.056 1.000   NA
 3593893 3593894 SSU98_0624 SSU98_0625     TRUE 0.910 19.000 0.104 1.000   NA
 3593894 3593895 SSU98_0625 SSU98_0626     TRUE 0.852 70.000 0.146 1.000 Y NA
 3593895 3593896 SSU98_0626 SSU98_0627     FALSE 0.038 343.000 0.000 1.000   NA
 3593896 3593897 SSU98_0627 SSU98_0628     TRUE 0.970 -16.000 0.140 1.000   NA
 3593897 3593898 SSU98_0628 SSU98_0629     FALSE 0.012 371.000 0.000 1.000 N NA
 3593898 3593899 SSU98_0629 SSU98_0630     TRUE 0.959 -9.000 0.000 0.034   NA
 3593900 3593901 SSU98_0631 SSU98_0632     FALSE 0.306 37.000 0.000 1.000 N NA
 3593901 3593902 SSU98_0632 SSU98_0633     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3593903 3593904 SSU98_0634 SSU98_0635     FALSE 0.008 1911.000 0.000 NA   NA
 3593904 3593905 SSU98_0635 SSU98_0636     FALSE 0.182 110.000 0.000 NA   NA
 3593907 3593908 SSU98_0638 SSU98_0639     TRUE 0.985 -3.000 0.435 NA N NA
 3593908 3593909 SSU98_0639 SSU98_0640     TRUE 0.912 43.000 0.387 NA   NA
 3593909 3593910 SSU98_0640 SSU98_0641     TRUE 0.988 -7.000 0.409 NA   NA
 3593911 3593912 SSU98_0642 SSU98_0643     FALSE 0.224 73.000 0.000 NA   NA
 3593912 3593913 SSU98_0643 SSU98_0644     FALSE 0.268 61.000 0.000 NA   NA
 3593914 3593915 SSU98_0645 SSU98_0646     TRUE 0.562 -34.000 0.000 1.000 N NA
 3593916 3593917 SSU98_0647 SSU98_0648     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.033 Y NA
 3593917 3593918 SSU98_0648 SSU98_0650     TRUE 0.981 -37.000 0.179 1.000 Y NA
 3593920 3593921 SSU98_0651 SSU98_0652   murE FALSE 0.377 152.000 0.062 1.000 N NA
 3593922 3593923 SSU98_0653 SSU98_0654     FALSE 0.437 63.000 0.014 1.000 N NA
 3593923 3593924 SSU98_0654 SSU98_0655     TRUE 0.935 -61.000 0.130 1.000   NA
 3593924 3593925 SSU98_0655 SSU98_0656     FALSE 0.043 325.000 0.000 1.000   NA
 3593925 3593926 SSU98_0656 SSU98_0657     FALSE 0.192 94.000 0.000 NA   NA
 3593926 3593927 SSU98_0657 SSU98_0658     TRUE 0.989 6.000 0.818 NA   NA
 3593929 3593930 SSU98_0660 SSU98_0661     TRUE 0.967 15.000 0.005 0.001   NA
 3593930 3593931 SSU98_0661 SSU98_0662     TRUE 0.980 -3.000 0.254 1.000 N NA
 3593931 3593932 SSU98_0662 SSU98_0663     TRUE 0.860 20.000 0.038 NA   NA
 3593932 3593933 SSU98_0663 SSU98_0664     TRUE 0.946 2.000 0.043 NA   NA
 3593933 3593934 SSU98_0664 SSU98_0665     FALSE 0.019 470.000 0.000 1.000   NA
 3593934 3593935 SSU98_0665 SSU98_0666     TRUE 0.947 0.000 0.012 1.000   NA
 3593935 3593936 SSU98_0666 SSU98_0667     TRUE 0.804 54.000 0.013 0.057   NA
 3593936 3593937 SSU98_0667 SSU98_0668     TRUE 0.877 3.000 0.009 1.000 N NA
 3593937 3593938 SSU98_0668 SSU98_0669     TRUE 0.930 -16.000 0.050 1.000 N NA
 3593939 3593940 SSU98_0670 SSU98_0671     FALSE 0.063 187.000 0.000 1.000 N NA
 3593943 3593944 SSU98_0674 SSU98_0675     FALSE 0.189 95.000 0.000 NA   NA
 3593944 3593945 SSU98_0675 SSU98_0676     FALSE 0.019 423.000 0.000 NA   NA
 3593948 3593949 SSU98_0679 SSU98_0680     FALSE 0.168 131.000 0.000 NA   NA
 3593949 3593950 SSU98_0680 SSU98_0681     TRUE 0.633 17.000 0.000 NA   NA
 3593950 3593951 SSU98_0681 SSU98_0682     TRUE 0.630 -118.000 0.000 NA   NA
 3593952 3593953 SSU98_0683 SSU98_0684     TRUE 0.980 -25.000 0.025 0.005   NA
 3593953 3593954 SSU98_0684 SSU98_0685     TRUE 0.924 4.000 0.000 0.074   NA
 3593954 3593955 SSU98_0685 SSU98_0686     FALSE 0.139 257.000 0.000 0.074 N NA
 3593956 3593957 SSU98_0687 SSU98_0688     TRUE 0.580 91.000 0.098 NA   NA
 3593957 3593958 SSU98_0688 SSU98_0689     TRUE 0.935 -16.000 0.019 NA   NA
 3593958 3593959 SSU98_0689 SSU98_0690     TRUE 0.950 -7.000 0.013 1.000   NA
 3593962 3593963 SSU98_0693 SSU98_0694     FALSE 0.220 93.000 0.000 1.000   NA
 3593963 3593964 SSU98_0694 SSU98_0695     TRUE 0.928 -58.000 0.000 0.006   NA
 3593964 3593965 SSU98_0695 SSU98_0696     TRUE 0.952 -16.000 0.050 1.000   NA
 3593965 3593966 SSU98_0696 SSU98_0697     TRUE 0.914 -223.000 0.000 0.005   NA
 3593966 3593967 SSU98_0697 SSU98_0698     TRUE 0.985 -7.000 0.075 0.074   NA
 3593967 3593968 SSU98_0698 SSU98_0699     TRUE 0.689 -48.000 0.000 NA   NA
 3593968 3593969 SSU98_0699 SSU98_0700     TRUE 0.810 -16.000 0.000 NA   NA
 3593971 3593972 SSU98_0702 SSU98_0703     TRUE 0.944 1.000 0.021 NA   NA
 3593972 3593973 SSU98_0703 SSU98_0704     TRUE 0.838 -10.000 0.000 NA   NA
 3593973 3593974 SSU98_0704 SSU98_0705     TRUE 0.724 46.000 0.048 NA   NA
 3593974 3593975 SSU98_0705 SSU98_0706     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3593977 3593978 SSU98_0708 SSU98_0709     TRUE 0.990 13.000 0.188 0.039 Y NA
 3593978 3593979 SSU98_0709 SSU98_0710     FALSE 0.341 188.000 0.091 1.000 N NA
 3593979 3593980 SSU98_0710 SSU98_0711     TRUE 0.996 33.000 0.889 0.014 Y NA
 3593980 3593981 SSU98_0711 SSU98_0712     TRUE 0.998 7.000 0.889 0.014 Y NA
 3593981 3593982 SSU98_0712 SSU98_0713     FALSE 0.472 152.000 0.132 1.000 N NA
 3593982 3593983 SSU98_0713 SSU98_0714     TRUE 0.954 15.000 0.368 1.000 N NA
 3593983 3593984 SSU98_0714 SSU98_0715     FALSE 0.352 32.000 0.000 1.000 N NA
 3593984 3593985 SSU98_0715 SSU98_0716   gldA TRUE 0.769 121.000 0.000 0.006 Y NA
 3593985 3593986 SSU98_0716 SSU98_0717 gldA   FALSE 0.073 169.000 0.000 1.000 N NA
 3593986 3593987 SSU98_0717 SSU98_0718     TRUE 0.790 73.000 0.063 1.000 Y NA
 3593987 3593988 SSU98_0718 SSU98_0719     FALSE 0.029 370.000 0.000 1.000   NA
 3593988 3593989 SSU98_0719 SSU98_0720     TRUE 0.980 -28.000 0.462 NA   NA
 3593989 3593990 SSU98_0720 SSU98_0721   glpK TRUE 0.694 185.000 0.462 NA   NA
 3593990 3593991 SSU98_0721 SSU98_0722 glpK   TRUE 0.983 67.000 0.500 0.001 Y NA
 3593991 3593992 SSU98_0722 SSU98_0723     TRUE 0.754 124.000 0.500 1.000 N NA
 3593992 3593993 SSU98_0723 SSU98_0724     FALSE 0.166 132.000 0.000 NA   NA
 3593993 3593994 SSU98_0724 SSU98_0725     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 3593994 3593995 SSU98_0725 SSU98_0726     FALSE 0.180 115.000 0.000 NA   NA
 3593997 3593998 SSU98_0728 SSU98_0729     FALSE 0.154 170.000 0.000 1.000   NA
 3593998 3593999 SSU98_0729 SSU98_0730     FALSE 0.164 289.000 0.000 0.052   NA
 3593999 3594000 SSU98_0730 SSU98_0731     FALSE 0.018 487.000 0.000 1.000   NA
 3594000 3594001 SSU98_0731 SSU98_0732     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3594001 3594002 SSU98_0732 SSU98_0733     TRUE 0.991 5.000 0.032 0.005 Y NA
 3594002 3594003 SSU98_0733 SSU98_0734     TRUE 0.966 -103.000 0.007 0.001   NA
 3594003 3594004 SSU98_0734 SSU98_0735     TRUE 0.990 -7.000 0.061 0.005   NA
 3594004 3594005 SSU98_0735 SSU98_0736     FALSE 0.009 780.000 0.000 NA   NA
 3594005 3594006 SSU98_0736 SSU98_0737     TRUE 0.923 12.000 0.098 NA   NA
 3594006 3594007 SSU98_0737 SSU98_0738     TRUE 0.925 5.000 0.039 NA   NA
 3594007 3594008 SSU98_0738 SSU98_0739     TRUE 0.687 11.000 0.000 NA   NA
 3594008 3594009 SSU98_0739 SSU98_0740     TRUE 0.958 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3594009 3594010 SSU98_0740 SSU98_0741     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.031 Y NA
 3594010 3594011 SSU98_0741 SSU98_0742     TRUE 0.532 31.000 0.000 NA   NA
 3594011 3594012 SSU98_0742 SSU98_0743     FALSE 0.012 595.000 0.000 NA   NA
 3594012 3594013 SSU98_0743 SSU98_0744     FALSE 0.214 79.000 0.000 NA   NA
 3594013 3594014 SSU98_0744 SSU98_0745     FALSE 0.009 842.000 0.000 NA   NA
 3594014 3594015 SSU98_0745 SSU98_0746     FALSE 0.201 89.000 0.000 NA   NA
 3594015 3594016 SSU98_0746 SSU98_0747     TRUE 0.633 17.000 0.000 NA   NA
 3594017 3594018 SSU98_0748 SSU98_0750     TRUE 0.775 49.000 0.111 NA   NA
 3594021 3594022 SSU98_0752 SSU98_0753 uvrC obgE FALSE 0.074 397.000 0.016 1.000   NA
 3594022 3594023 SSU98_0753 SSU98_0754 obgE   FALSE 0.075 362.000 0.009 NA   NA
 3594023 3594024 SSU98_0754 SSU98_0755     FALSE 0.027 364.000 0.000 NA   NA
 3594024 3594025 SSU98_0755 SSU98_0756     TRUE 0.670 17.000 0.000 1.000   NA
 3594025 3594026 SSU98_0756 SSU98_0757     FALSE 0.055 291.000 0.000 1.000   NA
 3594026 3594027 SSU98_0757 SSU98_0758     TRUE 0.986 -33.000 0.070 0.073 Y NA
 3594029 3594030 SSU98_0760 SSU98_0761     TRUE 0.989 -7.000 0.031 0.003   NA
 3594030 3594031 SSU98_0761 SSU98_0762     TRUE 0.808 30.000 0.025 NA   NA
 3594031 3594032 SSU98_0762 SSU98_0763     FALSE 0.135 169.000 0.000 NA   NA
 3594032 3594033 SSU98_0763 SSU98_0764     TRUE 0.958 -28.000 0.000 0.002   NA
 3594033 3594034 SSU98_0764 SSU98_0765     TRUE 0.601 21.000 0.000 NA   NA
 3594034 3594035 SSU98_0765 SSU98_0766     TRUE 0.801 -18.000 0.000 NA   NA
 3594035 3594036 SSU98_0766 SSU98_0767     FALSE 0.100 201.000 0.000 NA   NA
 3594036 3594037 SSU98_0767 SSU98_0768     FALSE 0.107 195.000 0.000 NA   NA
 3594037 3594038 SSU98_0768 SSU98_0769     FALSE 0.080 233.000 0.000 NA   NA
 3594038 3594039 SSU98_0769 SSU98_0770     TRUE 0.669 61.000 0.095 NA   NA
 3594039 3594040 SSU98_0770 SSU98_2236     FALSE 0.340 52.000 0.000 NA   NA
 3594040 3594041 SSU98_2236 SSU98_2237     FALSE 0.056 276.000 0.000 NA   NA
 3594041 3594042 SSU98_2237 SSU98_0771   rpsA FALSE 0.176 124.000 0.000 NA   NA
 3594042 3594043 SSU98_0771 SSU98_2238 rpsA   FALSE 0.104 196.000 0.000 NA   NA
 3594043 3594044 SSU98_2238 SSU98_0772     FALSE 0.286 59.000 0.000 NA   NA
 3594044 3594045 SSU98_0772 SSU98_0773     TRUE 0.945 -145.000 0.007 0.013   NA
 3594045 3594046 SSU98_0773 SSU98_0774     FALSE 0.010 668.000 0.000 NA   NA
 3594046 3594047 SSU98_0774 SSU98_0775     FALSE 0.087 223.000 0.000 NA   NA
 3594047 3594048 SSU98_0775 SSU98_0776     TRUE 0.978 2.000 0.349 1.000 N NA
 3594048 3594049 SSU98_0776 SSU98_0777     FALSE 0.201 122.000 0.000 1.000   NA
 3594049 3594050 SSU98_0777 SSU98_0778     TRUE 0.949 10.000 0.000 0.002   NA
 3594050 3594051 SSU98_0778 SSU98_0779     TRUE 0.968 -19.000 0.000 0.002   NA
 3594051 3594052 SSU98_0779 SSU98_0780   rplU FALSE 0.205 116.000 0.000 1.000   NA
 3594052 3594053 SSU98_0780 SSU98_0781 rplU rpmA TRUE 0.989 47.000 0.667 0.023 Y NA
 3594053 3594054 SSU98_0781 SSU98_0782 rpmA   FALSE 0.128 192.000 0.000 1.000   NA
 3594054 3594055 SSU98_0782 SSU98_0783     FALSE 0.235 83.000 0.000 1.000   NA
 3594055 3594056 SSU98_0783 SSU98_0784     FALSE 0.467 190.000 0.119 1.000   NA
 3594056 3594057 SSU98_0784 SSU98_0785     TRUE 0.960 -16.000 0.082 1.000   NA
 3594057 3594058 SSU98_0785 SSU98_0786     TRUE 0.963 -97.000 0.009 0.002   NA
 3594058 3594059 SSU98_0786 SSU98_0787     FALSE 0.291 63.000 0.000 1.000   NA
 3594059 3594060 SSU98_0787 SSU98_0788     TRUE 0.631 48.000 0.011 NA   NA
 3594060 3594061 SSU98_0788 SSU98_0789     FALSE 0.467 37.000 0.000 NA   NA
 3594061 3594062 SSU98_0789 SSU98_0790     FALSE 0.102 199.000 0.000 NA   NA
 3594062 3594063 SSU98_0790 SSU98_0791   pyrB TRUE 0.922 56.000 0.247 1.000 Y NA
 3594063 3594064 SSU98_0791 SSU98_0792 pyrB   FALSE 0.410 248.000 0.014 1.000 Y NA
 3594064 3594065 SSU98_0792 SSU98_0793   carB TRUE 0.771 294.000 0.117 0.001 Y NA
 3594065 3594066 SSU98_0793 SSU98_0794 carB   FALSE 0.212 80.000 0.000 NA   NA
 3594066 3594067 SSU98_0794 SSU98_0795     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594067 3594068 SSU98_0795 SSU98_0796     TRUE 0.842 0.000 0.000 NA   NA
 3594068 3594069 SSU98_0796 SSU98_0797     FALSE 0.255 64.000 0.000 NA   NA
 3594069 3594070 SSU98_0797 SSU98_0798     TRUE 0.959 22.000 0.385 1.000   NA
 3594070 3594071 SSU98_0798 SSU98_0799     TRUE 0.597 28.000 0.000 1.000   NA
 3594071 3594072 SSU98_0799 SSU98_0800     TRUE 0.998 9.000 0.846 0.012 Y NA
 3594074 3594075 SSU98_0801 SSU98_0803     TRUE 0.973 4.000 0.036 1.000 Y NA
 3594075 3594076 SSU98_0803 SSU98_0804   murB FALSE 0.041 235.000 0.000 1.000 N NA
 3594076 3594077 SSU98_0804 SSU98_0805 murB   TRUE 0.711 39.000 0.041 1.000 N NA
 3594077 3594078 SSU98_0805 SSU98_0806     TRUE 0.998 -31.000 0.928 0.032 Y NA
 3594078 3594079 SSU98_0806 SSU98_0807     TRUE 0.997 -27.000 0.492 0.032 Y NA
 3594079 3594080 SSU98_0807 SSU98_0808     TRUE 0.865 215.000 0.253 0.032 Y NA
 3594080 3594081 SSU98_0808 SSU98_0809     FALSE 0.356 114.000 0.022 1.000 N NA
 3594083 3594084 SSU98_0811 SSU98_0812     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.002   NA
 3594086 3594087 SSU98_0813 SSU98_0815     FALSE 0.179 142.000 0.000 1.000   NA
 3594087 3594088 SSU98_0815 SSU98_0816     TRUE 0.489 70.000 0.009 1.000   NA
 3594088 3594089 SSU98_0816 SSU98_0817     TRUE 0.919 45.000 0.036 0.003   NA
 3594089 3594090 SSU98_0817 SSU98_0818     FALSE 0.211 98.000 0.000 1.000   NA
 3594090 3594091 SSU98_0818 SSU98_0819     TRUE 0.843 -64.000 0.008 NA   NA
 3594091 3594092 SSU98_0819 SSU98_0820   trmD TRUE 0.992 -10.000 0.672 NA   NA
 3594092 3594093 SSU98_0820 SSU98_0821 trmD   TRUE 0.621 4.000 0.000 1.000 N NA
 3594093 3594094 SSU98_0821 SSU98_0822     FALSE 0.275 66.000 0.000 1.000   NA
 3594094 3594095 SSU98_0822 SSU98_0823     TRUE 0.826 -13.000 0.000 NA   NA
 3594095 3594096 SSU98_0823 SSU98_0824     TRUE 0.993 -3.000 0.721 NA   NA
 3594096 3594097 SSU98_0824 SSU98_0825     TRUE 0.998 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 3594097 3594098 SSU98_0825 SSU98_0826     FALSE 0.471 96.000 0.022 1.000   NA
 3594098 3594099 SSU98_0826 SSU98_0827     TRUE 0.967 2.000 0.139 NA   NA
 3594099 3594100 SSU98_0827 SSU98_0828     TRUE 0.870 9.000 0.004 NA   NA
 3594100 3594101 SSU98_0828 SSU98_0829     TRUE 0.929 -3.000 0.015 1.000 N NA
 3594101 3594102 SSU98_0829 SSU98_0830     TRUE 0.964 -7.000 0.056 1.000   NA
 3594102 3594103 SSU98_0830 SSU98_0831     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3594103 3594104 SSU98_0831 SSU98_0832     FALSE 0.299 57.000 0.000 NA   NA
 3594104 3594105 SSU98_0832 SSU98_0833     FALSE 0.020 410.000 0.000 NA   NA
 3594105 3594106 SSU98_0833 SSU98_0834   thyA FALSE 0.331 53.000 0.000 NA   NA
 3594106 3594107 SSU98_0834 SSU98_0835 thyA   FALSE 0.325 286.000 0.295 1.000 N NA
 3594107 3594108 SSU98_0835 SSU98_0836     TRUE 0.820 29.000 0.030 NA   NA
 3594108 3594109 SSU98_0836 SSU98_0837   clpX TRUE 0.815 22.000 0.012 NA   NA
 3594109 3594110 SSU98_0837 SSU98_0838 clpX   TRUE 0.867 23.000 0.043 1.000   NA
 3594110 3594111 SSU98_0838 SSU98_0839   ndk TRUE 0.627 23.000 0.000 1.000   NA
 3594111 3594112 SSU98_0839 SSU98_0840 ndk   FALSE 0.183 104.000 0.000 NA   NA
 3594112 3594113 SSU98_0840 SSU98_0841     FALSE 0.051 282.000 0.000 NA   NA
 3594115 3594116 SSU98_0843 SSU98_0844     FALSE 0.107 195.000 0.000 NA   NA
 3594116 3594117 SSU98_0844 SSU98_0845     TRUE 0.633 17.000 0.000 NA   NA
 3594117 3594118 SSU98_0845 SSU98_0846   prfA FALSE 0.060 436.000 0.062 1.000 N NA
 3594118 3594119 SSU98_0846 SSU98_0847 prfA   TRUE 0.987 0.000 0.084 1.000 Y NA
 3594119 3594120 SSU98_0847 SSU98_0848     TRUE 0.979 -13.000 0.029 NA Y NA
 3594120 3594121 SSU98_0848 SSU98_0849     TRUE 0.947 -3.000 0.012 NA   NA
 3594121 3594122 SSU98_0849 SSU98_0850   glyA TRUE 0.873 24.000 0.056 1.000   NA
 3594122 3594123 SSU98_0850 SSU98_0851 glyA   TRUE 0.969 0.000 0.103 NA   NA
 3594125 3594126 SSU98_0852 SSU98_0854     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3594126 3594127 SSU98_0854 SSU98_0855     FALSE 0.141 161.000 0.000 NA   NA
 3594127 3594128 SSU98_0855 SSU98_0856     FALSE 0.023 387.000 0.000 NA   NA
 3594128 3594129 SSU98_0856 SSU98_0857     TRUE 0.594 22.000 0.000 NA   NA
 3594130 3594131 SSU98_0858 SSU98_0859     TRUE 0.558 28.000 0.000 NA   NA
 3594132 3594133 SSU98_0860 SSU98_0861     TRUE 0.558 28.000 0.000 NA   NA
 3594133 3594134 SSU98_0861 SSU98_0862     TRUE 0.990 -3.000 0.490 NA   NA
 3594135 3594136 SSU98_0863 SSU98_0864     TRUE 0.746 -28.000 0.000 NA   NA
 3594136 3594137 SSU98_0864 SSU98_0865     TRUE 0.782 -22.000 0.000 NA   NA
 3594137 3594138 SSU98_0865 SSU98_0866     FALSE 0.016 480.000 0.000 NA   NA
 3594138 3594139 SSU98_0866 SSU98_0867     TRUE 0.660 -66.000 0.000 NA   NA
 3594140 3594141 SSU98_0868 SSU98_0869     FALSE 0.031 348.000 0.000 NA   NA
 3594141 3594142 SSU98_0869 SSU98_0870     TRUE 0.746 -28.000 0.000 NA   NA
 3594142 3594143 SSU98_0870 SSU98_0871     TRUE 0.641 16.000 0.000 NA   NA
 3594143 3594144 SSU98_0871 SSU98_0872     TRUE 0.633 17.000 0.000 NA   NA
 3594144 3594145 SSU98_0872 SSU98_0873     FALSE 0.012 576.000 0.000 NA   NA
 3594145 3594146 SSU98_0873 SSU98_0874     TRUE 0.990 -10.000 0.500 NA   NA
 3594146 3594147 SSU98_0874 SSU98_0875     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 3594149 3594150 SSU98_0877 SSU98_0878     TRUE 0.713 94.000 0.032 0.038   NA
 3594150 3594151 SSU98_0878 SSU98_0879     TRUE 0.943 13.000 0.151 1.000   NA
 3594151 3594152 SSU98_0879 SSU98_0880     FALSE 0.227 194.000 0.002 NA   NA
 3594152 3594153 SSU98_0880 SSU98_0881     TRUE 0.972 4.000 0.250 NA   NA
 3594153 3594154 SSU98_0881 SSU98_0882     FALSE 0.250 65.000 0.000 NA   NA
 3594154 3594155 SSU98_0882 SSU98_0883     FALSE 0.012 582.000 0.000 NA   NA
 3594155 3594156 SSU98_0883 SSU98_0884     FALSE 0.162 135.000 0.000 NA   NA
 3594156 3594157 SSU98_0884 SSU98_0885   xerS FALSE 0.029 358.000 0.000 NA   NA
 3594158 3594159 SSU98_0886 SSU98_0887     FALSE 0.123 76.000 0.000 1.000 N NA
 3594161 3594162 SSU98_0889 SSU98_0890     FALSE 0.306 30.000 0.000 NA N NA
 3594162 3594163 SSU98_0890 SSU98_0891     TRUE 0.985 -16.000 0.400 NA   NA
 3594163 3594164 SSU98_0891 SSU98_0892     TRUE 0.550 29.000 0.000 NA   NA
 3594164 3594165 SSU98_0892 SSU98_0893     FALSE 0.181 114.000 0.000 NA   NA
 3594165 3594166 SSU98_0893 SSU98_0894     TRUE 0.994 1.000 0.855 1.000   NA
 3594166 3594167 SSU98_0894 SSU98_0895     FALSE 0.160 137.000 0.000 NA   NA
 3594167 3594168 SSU98_0895 SSU98_0896     TRUE 0.968 2.000 0.143 NA   NA
 3594168 3594169 SSU98_0896 SSU98_0897     TRUE 0.673 -58.000 0.000 NA   NA
 3594169 3594170 SSU98_0897 SSU98_0898     TRUE 0.983 22.000 1.000 NA   NA
 3594170 3594171 SSU98_0898 SSU98_0899     FALSE 0.142 160.000 0.000 NA   NA
 3594171 3594172 SSU98_0899 SSU98_0900     FALSE 0.046 293.000 0.000 NA   NA
 3594172 3594173 SSU98_0900 SSU98_0901     TRUE 0.917 18.000 0.130 NA   NA
 3594173 3594174 SSU98_0901 SSU98_0902     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 3594174 3594175 SSU98_0902 SSU98_0903     TRUE 0.532 31.000 0.000 NA   NA
 3594175 3594176 SSU98_0903 SSU98_0904     FALSE 0.181 114.000 0.000 NA   NA
 3594176 3594177 SSU98_0904 SSU98_0905     TRUE 0.570 26.000 0.000 NA   NA
 3594177 3594178 SSU98_0905 SSU98_0906     FALSE 0.251 74.000 0.000 1.000   NA
 3594178 3594179 SSU98_0906 SSU98_0907     FALSE 0.120 196.000 0.000 1.000   NA
 3594179 3594180 SSU98_0907 SSU98_0908     FALSE 0.138 185.000 0.000 1.000   NA
 3594180 3594181 SSU98_0908 SSU98_0909     TRUE 0.955 11.000 0.222 NA   NA
 3594181 3594182 SSU98_0909 SSU98_0910     FALSE 0.055 278.000 0.000 NA   NA
 3594182 3594183 SSU98_0910 SSU98_0911     FALSE 0.042 330.000 0.000 1.000   NA
 3594183 3594184 SSU98_0911 SSU98_0912     TRUE 0.965 170.000 0.741 0.012 Y NA
 3594184 3594185 SSU98_0912 SSU98_0913     TRUE 0.835 31.000 0.056 NA   NA
 3594185 3594186 SSU98_0913 SSU98_0914     TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 3594186 3594187 SSU98_0914 SSU98_0915     TRUE 0.986 -16.000 0.462 NA   NA
 3594187 3594188 SSU98_0915 SSU98_0916     TRUE 0.638 21.000 0.000 1.000   NA
 3594188 3594189 SSU98_0916 SSU98_0917     TRUE 0.960 2.000 0.000 0.012   NA
 3594189 3594190 SSU98_0917 SSU98_0918     FALSE 0.013 599.000 0.000 1.000   NA
 3594190 3594191 SSU98_0918 SSU98_0919     FALSE 0.009 911.000 0.000 NA   NA
 3594191 3594192 SSU98_0919 SSU98_0920     TRUE 0.826 -13.000 0.000 NA   NA
 3594192 3594193 SSU98_0920 SSU98_0921     TRUE 0.842 0.000 0.000 NA   NA
 3594195 3594196 SSU98_0923 SSU98_0924     FALSE 0.208 82.000 0.000 NA   NA
 3594196 3594197 SSU98_0924 SSU98_0925     FALSE 0.010 688.000 0.000 NA   NA
 3594201 3594202 SSU98_0929 SSU98_0930     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594202 3594203 SSU98_0930 SSU98_0931     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594203 3594204 SSU98_0931 SSU98_0932     TRUE 0.784 3.000 0.000 NA   NA
 3594204 3594205 SSU98_0932 SSU98_0933     TRUE 0.765 -25.000 0.000 NA   NA
 3594205 3594206 SSU98_0933 SSU98_0934     FALSE 0.413 43.000 0.000 NA   NA
 3594206 3594207 SSU98_0934 SSU98_0935     TRUE 0.558 28.000 0.000 NA   NA
 3594207 3594208 SSU98_0935 SSU98_0936     FALSE 0.413 43.000 0.000 NA   NA
 3594208 3594209 SSU98_0936 SSU98_0937     FALSE 0.147 178.000 0.000 1.000   NA
 3594209 3594210 SSU98_0937 SSU98_0938     TRUE 0.550 29.000 0.000 NA   NA
 3594210 3594211 SSU98_0938 SSU98_0939     TRUE 0.641 16.000 0.000 NA   NA
 3594211 3594212 SSU98_0939 SSU98_0940     FALSE 0.010 756.000 0.000 NA   NA
 3594212 3594213 SSU98_0940 SSU98_0941     TRUE 0.979 -28.000 0.415 NA   NA
 3594213 3594214 SSU98_0941 SSU98_0942     FALSE 0.237 69.000 0.000 NA   NA
 3594214 3594215 SSU98_0942 SSU98_0943     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594215 3594216 SSU98_0943 SSU98_0944     TRUE 0.970 0.000 0.095 1.000   NA
 3594216 3594217 SSU98_0944 SSU98_0945     FALSE 0.443 40.000 0.000 NA   NA
 3594217 3594218 SSU98_0945 SSU98_0946     TRUE 0.826 -13.000 0.000 NA   NA
 3594218 3594219 SSU98_0946 SSU98_0947     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594219 3594220 SSU98_0947 SSU98_0948     FALSE 0.324 54.000 0.000 NA   NA
 3594220 3594221 SSU98_0948 SSU98_0949     FALSE 0.453 39.000 0.000 NA   NA
 3594221 3594222 SSU98_0949 SSU98_0950     FALSE 0.008 1401.000 0.000 NA   NA
 3594222 3594223 SSU98_0950 SSU98_0951     TRUE 0.995 -22.000 0.704 1.000 Y NA
 3594223 3594224 SSU98_0951 SSU98_0952     FALSE 0.103 198.000 0.000 NA   NA
 3594224 3594225 SSU98_0952 SSU98_0953     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3594225 3594226 SSU98_0953 SSU98_0954     TRUE 0.988 -22.000 0.667 NA   NA
 3594226 3594227 SSU98_0954 SSU98_0955     TRUE 0.926 -28.000 0.000 1.000 Y NA
 3594227 3594228 SSU98_0955 SSU98_0956     TRUE 0.748 6.000 0.000 NA   NA
 3594229 3594230 SSU98_0957 SSU98_0958     FALSE 0.182 108.000 0.000 NA   NA
 3594230 3594231 SSU98_0958 SSU98_0959     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3594231 3594232 SSU98_0959 SSU98_0960     TRUE 0.987 2.000 0.500 NA   NA
 3594232 3594233 SSU98_0960 SSU98_0961     TRUE 0.587 143.000 0.143 1.000   NA
 3594233 3594234 SSU98_0961 SSU98_0962     TRUE 0.688 15.000 0.000 1.000   NA
 3594234 3594235 SSU98_0962 SSU98_0963     TRUE 0.968 -19.000 0.143 1.000   NA
 3594235 3594236 SSU98_0963 SSU98_0964     TRUE 0.868 33.000 0.125 NA   NA
 3594236 3594237 SSU98_0964 SSU98_0965     FALSE 0.402 44.000 0.000 NA   NA
 3594237 3594238 SSU98_0965 SSU98_0966     FALSE 0.097 228.000 0.000 1.000   NA
 3594239 3594240 SSU98_0967 SSU98_0968     FALSE 0.413 43.000 0.000 NA   NA
 3594240 3594241 SSU98_0968 SSU98_0969     FALSE 0.009 908.000 0.000 NA   NA
 3594241 3594242 SSU98_0969 SSU98_0970     TRUE 0.876 71.000 0.667 NA   NA
 3594242 3594243 SSU98_0970 SSU98_0971     TRUE 0.959 16.000 0.333 NA   NA
 3594243 3594244 SSU98_0971 SSU98_0972     TRUE 0.947 25.000 0.333 NA   NA
 3594244 3594245 SSU98_0972 SSU98_0973     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594245 3594246 SSU98_0973 SSU98_0974     FALSE 0.053 280.000 0.000 NA   NA
 3594246 3594247 SSU98_0974 SSU98_0975     TRUE 0.978 20.000 0.333 0.069   NA
 3594247 3594248 SSU98_0975 SSU98_0976     TRUE 0.880 50.000 0.333 NA   NA
 3594248 3594249 SSU98_0976 SSU98_0977     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 3594249 3594250 SSU98_0977 SSU98_0978     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3594251 3594252 SSU98_0979 SSU98_0980     FALSE 0.335 205.000 0.061 NA   NA
 3594253 3594254 SSU98_0981 SSU98_0982     TRUE 0.990 2.000 0.667 NA   NA
 3594254 3594255 SSU98_0982 SSU98_0983     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594255 3594256 SSU98_0983 SSU98_0984     TRUE 0.782 -22.000 0.000 NA   NA
 3594256 3594257 SSU98_0984 SSU98_0985     TRUE 0.701 -40.000 0.000 NA   NA
 3594257 3594258 SSU98_0985 SSU98_0986     TRUE 0.612 19.000 0.000 NA   NA
 3594258 3594259 SSU98_0986 SSU98_0987     TRUE 0.748 6.000 0.000 NA   NA
 3594259 3594260 SSU98_0987 SSU98_0988     TRUE 0.842 0.000 0.000 NA   NA
 3594260 3594261 SSU98_0988 SSU98_0989     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594261 3594262 SSU98_0989 SSU98_0990     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594262 3594263 SSU98_0990 SSU98_0991     TRUE 0.784 3.000 0.000 NA   NA
 3594263 3594264 SSU98_0991 SSU98_0992     TRUE 0.986 5.000 0.667 NA   NA
 3594264 3594265 SSU98_0992 SSU98_0993     TRUE 0.990 -16.000 0.667 NA   NA
 3594265 3594266 SSU98_0993 SSU98_0994     FALSE 0.340 52.000 0.000 NA   NA
 3594266 3594267 SSU98_0994 SSU98_0995     TRUE 0.846 -7.000 0.000 NA   NA
 3594267 3594268 SSU98_0995 SSU98_0996     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594268 3594269 SSU98_0996 SSU98_0997     FALSE 0.117 187.000 0.000 NA   NA
 3594269 3594270 SSU98_0997 SSU98_0998     TRUE 0.964 66.000 0.884 1.000 Y NA
 3594270 3594271 SSU98_0998 SSU98_0999     FALSE 0.443 40.000 0.000 NA   NA
 3594271 3594272 SSU98_0999 SSU98_1000     FALSE 0.014 541.000 0.000 NA   NA
 3594272 3594273 SSU98_1000 SSU98_1001     TRUE 0.687 235.000 0.238 1.000 Y NA
 3594273 3594274 SSU98_1001 SSU98_1002     TRUE 0.860 -55.000 0.005 1.000   NA
 3594274 3594275 SSU98_1002 SSU98_1003     TRUE 0.687 11.000 0.000 NA   NA
 3594276 3594277 SSU98_1004 SSU98_1005     TRUE 0.979 -3.000 0.163 NA   NA
 3594277 3594278 SSU98_1005 SSU98_1006     FALSE 0.182 108.000 0.000 NA   NA
 3594278 3594279 SSU98_1006 SSU98_1007     TRUE 0.974 -10.000 0.146 NA   NA
 3594280 3594281 SSU98_1008 SSU98_1009   rnhB TRUE 0.784 3.000 0.000 NA   NA
 3594281 3594282 SSU98_1009 SSU98_1010 rnhB rbgA TRUE 0.974 -13.000 0.148 1.000   NA
 3594282 3594283 SSU98_1010 SSU98_1011 rbgA   FALSE 0.184 100.000 0.000 NA   NA
 3594283 3594284 SSU98_1011 SSU98_1012     TRUE 0.612 19.000 0.000 NA   NA
 3594284 3594285 SSU98_1012 SSU98_1013     FALSE 0.247 37.000 0.000 NA N NA
 3594285 3594286 SSU98_1013 SSU98_1014     FALSE 0.029 356.000 0.000 NA   NA
 3594286 3594287 SSU98_1014 SSU98_1015   pyrC FALSE 0.202 88.000 0.000 NA   NA
 3594287 3594288 SSU98_1015 SSU98_1016 pyrC   TRUE 0.611 40.000 0.009 1.000 N NA
 3594288 3594289 SSU98_1016 SSU98_1017     FALSE 0.472 10.000 0.000 NA N NA
 3594289 3594290 SSU98_1017 SSU98_1018     FALSE 0.077 109.000 0.000 NA N NA
 3594290 3594291 SSU98_1018 SSU98_1019     TRUE 0.545 57.000 0.004 1.000   NA
 3594291 3594292 SSU98_1019 SSU98_1020     TRUE 0.938 -7.000 0.003 1.000   NA
 3594292 3594293 SSU98_1020 SSU98_1021     TRUE 0.918 162.000 0.154 0.003 Y NA
 3594293 3594294 SSU98_1021 SSU98_1022     TRUE 0.993 10.000 0.592 0.002 N NA
 3594295 3594296 SSU98_1023 SSU98_1024     TRUE 0.718 -34.000 0.000 NA   NA
 3594296 3594297 SSU98_1024 SSU98_1025     FALSE 0.138 165.000 0.000 NA   NA
 3594297 3594298 SSU98_1025 SSU98_1026     TRUE 0.991 13.000 0.309 0.002   NA
 3594298 3594299 SSU98_1026 SSU98_1027     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.002   NA
 3594299 3594300 SSU98_1027 SSU98_1028     TRUE 0.958 9.000 0.163 1.000   NA
 3594300 3594301 SSU98_1028 SSU98_1029     FALSE 0.300 61.000 0.000 1.000   NA
 3594301 3594302 SSU98_1029 SSU98_1030     TRUE 0.881 39.000 0.000 0.001   NA
 3594303 3594304 SSU98_1031 SSU98_1032     TRUE 0.742 172.000 0.000 0.002 Y NA
 3594304 3594305 SSU98_1032 SSU98_1033     TRUE 0.619 62.000 0.111 1.000 N NA
 3594305 3594306 SSU98_1033 SSU98_1034     TRUE 0.955 -7.000 0.021 1.000   NA
 3594306 3594307 SSU98_1034 SSU98_1035     FALSE 0.245 78.000 0.000 1.000   NA
 3594307 3594308 SSU98_1035 SSU98_1036     TRUE 0.978 -3.000 0.000 0.002   NA
 3594308 3594309 SSU98_1036 SSU98_1037     FALSE 0.040 314.000 0.000 NA   NA
 3594309 3594310 SSU98_1037 SSU98_1038     TRUE 0.784 3.000 0.000 NA   NA
 3594311 3594312 SSU98_1039 SSU98_1040     TRUE 0.994 0.000 0.326 1.000 Y NA
 3594315 3594316 SSU98_1043 SSU98_1044     FALSE 0.008 1370.000 0.000 NA   NA
 3594316 3594317 SSU98_1044 SSU98_1045     FALSE 0.009 868.000 0.000 NA   NA
 3594317 3594318 SSU98_1045 SSU98_1046     FALSE 0.034 336.000 0.000 NA   NA
 3594318 3594319 SSU98_1046 SSU98_1047     TRUE 0.948 8.000 0.000 0.005   NA
 3594319 3594320 SSU98_1047 SSU98_1048     FALSE 0.281 65.000 0.000 1.000   NA
 3594320 3594321 SSU98_1048 SSU98_1049     FALSE 0.247 245.000 0.000 1.000 Y NA
 3594321 3594322 SSU98_1049 SSU98_1050     TRUE 0.962 15.000 0.000 0.014 Y NA
 3594322 3594323 SSU98_1050 SSU98_1051     TRUE 0.986 0.000 0.000 0.014 Y NA
 3594323 3594324 SSU98_1051 SSU98_1052     TRUE 0.926 32.000 0.250 1.000   NA
 3594324 3594325 SSU98_1052 SSU98_1053     TRUE 0.718 45.000 0.000 0.050   NA
 3594325 3594326 SSU98_1053 SSU98_1054     FALSE 0.037 346.000 0.000 1.000   NA
 3594326 3594327 SSU98_1054 SSU98_1055     TRUE 0.673 82.000 0.000 0.002   NA
 3594327 3594328 SSU98_1055 SSU98_1056     TRUE 0.729 -43.000 0.000 1.000   NA
 3594328 3594329 SSU98_1056 SSU98_1057     FALSE 0.438 146.000 0.000 1.000 Y NA
 3594329 3594330 SSU98_1057 SSU98_1058     TRUE 0.965 27.000 0.000 0.001 Y NA
 3594330 3594331 SSU98_1058 SSU98_1059     FALSE 0.293 58.000 0.000 NA   NA
 3594331 3594332 SSU98_1059 SSU98_1060     TRUE 0.765 -25.000 0.000 NA   NA
 3594333 3594334 SSU98_1061 SSU98_1062     FALSE 0.025 368.000 0.000 NA   NA
 3594334 3594335 SSU98_1062 SSU98_1063     FALSE 0.222 74.000 0.000 NA   NA
 3594335 3594336 SSU98_1063 SSU98_1064     TRUE 0.776 46.000 0.000 0.012   NA
 3594337 3594338 SSU98_1065 SSU98_1066     FALSE 0.158 140.000 0.000 NA   NA
 3594340 3594341 SSU98_1068 SSU98_1069     FALSE 0.077 106.000 0.000 NA N NA
 3594341 3594342 SSU98_1069 SSU98_1070     TRUE 0.614 -16.000 0.000 NA N NA
 3594342 3594343 SSU98_1070 SSU98_1071     TRUE 0.999 -13.000 0.895 0.011 Y NA
 3594343 3594344 SSU98_1071 SSU98_1072   eutD TRUE 0.681 2.000 0.000 1.000 N NA
 3594344 3594345 SSU98_1072 SSU98_1073 eutD   TRUE 0.882 12.000 0.067 1.000 N NA
 3594345 3594346 SSU98_1073 SSU98_1074   ppnK TRUE 0.968 0.000 0.150 1.000 N NA
 3594346 3594347 SSU98_1074 SSU98_1075 ppnK   TRUE 0.985 -46.000 0.725 1.000   NA
 3594348 3594349 SSU98_1076 SSU98_1077     FALSE 0.170 362.000 0.145 NA   NA
 3594349 3594350 SSU98_1077 SSU98_1078     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3594350 3594351 SSU98_1078 SSU98_1079     TRUE 0.969 11.000 0.089 1.000 Y NA
 3594351 3594352 SSU98_1079 SSU98_1080     TRUE 0.977 -10.000 0.166 NA   NA
 3594352 3594353 SSU98_1080 SSU98_1081     TRUE 0.934 -31.000 0.083 NA   NA
 3594353 3594354 SSU98_1081 SSU98_1082     TRUE 0.648 135.000 0.214 NA   NA
 3594354 3594355 SSU98_1082 SSU98_1083     TRUE 0.989 4.000 0.714 1.000   NA
 3594356 3594357 SSU98_1084 SSU98_1085 radC   FALSE 0.343 113.000 0.028 NA N NA
 3594357 3594358 SSU98_1085 SSU98_1086     TRUE 0.848 7.000 0.013 NA N NA
 3594360 3594361 SSU98_1088 SSU98_1089     TRUE 0.967 4.000 0.000 0.001   NA
 3594361 3594362 SSU98_1089 SSU98_1090     FALSE 0.360 54.000 0.000 1.000   NA
 3594362 3594363 SSU98_1090 SSU98_1091     TRUE 0.996 2.000 0.720 0.030   NA
 3594363 3594364 SSU98_1091 SSU98_1092     TRUE 0.978 -34.000 0.438 1.000   NA
 3594364 3594365 SSU98_1092 SSU98_1093     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 3594365 3594366 SSU98_1093 SSU98_1094     FALSE 0.203 87.000 0.000 NA   NA
 3594366 3594367 SSU98_1094 SSU98_1095     FALSE 0.237 81.000 0.000 1.000   NA
 3594367 3594368 SSU98_1095 SSU98_1096     TRUE 0.973 -28.000 0.051 1.000 Y NA
 3594368 3594369 SSU98_1096 SSU98_1097     TRUE 0.966 16.000 0.106 1.000 Y NA
 3594369 3594370 SSU98_1097 SSU98_1098     TRUE 0.946 -3.000 0.044 1.000 N NA
 3594371 3594372 SSU98_1099 SSU98_1100   rpsT FALSE 0.472 59.000 0.014 1.000 N NA
 3594373 3594374 SSU98_1101 SSU98_1102     FALSE 0.024 378.000 0.000 NA   NA
 3594376 3594377 SSU98_1104 SSU98_1105     TRUE 0.997 -7.000 0.606 1.000 Y NA
 3594377 3594378 SSU98_1105 SSU98_1106     TRUE 0.838 -10.000 0.000 NA   NA
 3594378 3594379 SSU98_1106 SSU98_1107     FALSE 0.192 94.000 0.000 NA   NA
 3594381 3594382 SSU98_1109 SSU98_1110     TRUE 0.977 29.000 0.413 NA Y NA
 3594382 3594383 SSU98_1110 SSU98_1111     TRUE 0.998 12.000 0.542 0.001 Y NA
 3594383 3594384 SSU98_1111 SSU98_1112     TRUE 0.995 25.000 0.490 0.003 Y NA
 3594384 3594385 SSU98_1112 SSU98_1113     TRUE 0.838 -10.000 0.000 NA   NA
 3594385 3594386 SSU98_1113 SSU98_1114     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594386 3594387 SSU98_1114 SSU98_1115     TRUE 0.971 3.000 0.206 NA   NA
 3594387 3594388 SSU98_1115 SSU98_1116     TRUE 0.904 -87.000 0.087 NA   NA
 3594388 3594389 SSU98_1116 SSU98_1117     TRUE 0.698 138.000 0.303 NA   NA
 3594389 3594390 SSU98_1117 SSU98_1118     TRUE 0.817 39.000 0.091 NA   NA
 3594390 3594391 SSU98_1118 SSU98_1119     FALSE 0.316 261.000 0.229 NA N NA
 3594391 3594392 SSU98_1119 SSU98_1120     TRUE 0.986 -10.000 0.337 NA   NA
 3594392 3594393 SSU98_1120 SSU98_1121   spxA TRUE 0.939 15.000 0.169 NA   NA
 3594393 3594394 SSU98_1121 SSU98_1122 spxA   FALSE 0.387 51.000 0.000 1.000   NA
 3594394 3594395 SSU98_1122 SSU98_1123     TRUE 0.741 -37.000 0.000 1.000   NA
 3594395 3594396 SSU98_1123 SSU98_1124     TRUE 0.927 35.000 0.308 1.000   NA
 3594396 3594397 SSU98_1124 SSU98_1125     TRUE 0.752 80.000 0.005 0.006   NA
 3594397 3594398 SSU98_1125 SSU98_1126     TRUE 0.977 -31.000 0.005 0.001   NA
 3594398 3594399 SSU98_1126 SSU98_1127     TRUE 0.520 32.000 0.000 NA   NA
 3594399 3594400 SSU98_1127 SSU98_1128     TRUE 0.565 27.000 0.000 NA   NA
 3594400 3594401 SSU98_1128 SSU98_1129     TRUE 0.680 12.000 0.000 NA   NA
 3594401 3594402 SSU98_1129 SSU98_1130     TRUE 0.903 -58.000 0.057 NA   NA
 3594402 3594403 SSU98_1130 SSU98_1131     TRUE 0.983 -3.000 0.229 NA   NA
 3594403 3594404 SSU98_1131 SSU98_1132     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 3594405 3594406 SSU98_1133 SSU98_1134     TRUE 0.866 18.000 0.000 NA Y NA
 3594407 3594408 SSU98_1135 SSU98_1136     TRUE 0.809 2.000 0.000 NA   NA
 3594408 3594409 SSU98_1136 SSU98_1137     TRUE 0.741 7.000 0.000 NA   NA
 3594409 3594410 SSU98_1137 SSU98_1138     TRUE 0.623 18.000 0.000 NA   NA
 3594411 3594412 SSU98_1139 SSU98_1140     TRUE 0.737 10.000 0.000 1.000   NA
 3594412 3594413 SSU98_1140 SSU98_1141     FALSE 0.171 128.000 0.000 NA   NA
 3594415 3594416 SSU98_1143 SSU98_1144     FALSE 0.030 350.000 0.000 NA   NA
 3594416 3594417 SSU98_1144 SSU98_1145     TRUE 0.680 12.000 0.000 NA   NA
 3594417 3594418 SSU98_1145 SSU98_1146     TRUE 0.673 -58.000 0.000 NA   NA
 3594419 3594420 SSU98_1147 SSU98_1148     TRUE 0.907 -25.000 0.012 NA   NA
 3594421 3594422 SSU98_1149 SSU98_1150     TRUE 0.765 4.000 0.000 NA   NA
 3594422 3594423 SSU98_1150 SSU98_1151     FALSE 0.299 57.000 0.000 NA   NA
 3594423 3594424 SSU98_1151 SSU98_1152     TRUE 0.902 30.000 0.000 0.002   NA
 3594424 3594425 SSU98_1152 SSU98_1153     FALSE 0.128 178.000 0.000 NA   NA
 3594428 3594429 SSU98_1156 SSU98_1158     TRUE 0.969 -127.000 0.142 1.000 Y NA
 3594429 3594430 SSU98_1158 SSU98_1157     TRUE 0.964 -219.000 0.008 0.001   NA
 3594430 3594431 SSU98_1157 SSU98_1159     FALSE 0.283 259.000 0.094 1.000   NA
 3594431 3594432 SSU98_1159 SSU98_1160     TRUE 0.973 9.000 0.073 1.000 Y NA
 3594434 3594435 SSU98_1162 SSU98_1163     TRUE 0.826 -13.000 0.000 NA   NA
 3594437 3594438 SSU98_1165 SSU98_1166   pheT FALSE 0.413 43.000 0.000 NA   NA
 3594438 3594439 SSU98_1166 SSU98_1167 pheT   TRUE 0.927 2.000 0.007 1.000   NA
 3594439 3594440 SSU98_1167 SSU98_1168   pheS FALSE 0.293 187.000 0.009 1.000   NA
 3594440 3594441 SSU98_1168 SSU98_1169 pheS   FALSE 0.008 456.000 0.000 1.000 N NA
 3594441 3594442 SSU98_1169 SSU98_1170     TRUE 0.994 11.000 0.182 0.002 Y NA
 3594442 3594443 SSU98_1170 SSU98_1171     FALSE 0.399 111.000 0.012 NA   NA
 3594443 3594444 SSU98_1171 SSU98_1172     TRUE 0.955 0.000 0.035 NA   NA
 3594444 3594445 SSU98_1172 SSU98_1173     TRUE 0.975 3.000 0.364 1.000 N NA
 3594445 3594446 SSU98_1173 SSU98_1174     TRUE 0.997 15.000 0.533 0.001 Y NA
 3594446 3594447 SSU98_1174 SSU98_1175     TRUE 0.991 -34.000 0.467 1.000 Y NA
 3594447 3594448 SSU98_1175 SSU98_1176     TRUE 0.834 111.000 0.583 1.000   NA
 3594448 3594449 SSU98_1176 SSU98_1177     TRUE 0.782 -22.000 0.000 NA   NA
 3594449 3594450 SSU98_1177 SSU98_1178     TRUE 0.817 -15.000 0.000 NA   NA
 3594450 3594451 SSU98_1178 SSU98_1179     FALSE 0.209 103.000 0.000 1.000   NA
 3594451 3594452 SSU98_1179 SSU98_1180     TRUE 0.985 -73.000 0.143 0.001   NA
 3594452 3594453 SSU98_1180 SSU98_1181     TRUE 0.543 133.000 0.095 1.000   NA
 3594453 3594454 SSU98_1181 SSU98_1182     TRUE 0.986 17.000 1.000 NA   NA
 3594454 3594455 SSU98_1182 SSU98_1183     FALSE 0.432 41.000 0.000 NA   NA
 3594455 3594456 SSU98_1183 SSU98_1184     FALSE 0.117 187.000 0.000 NA   NA
 3594456 3594457 SSU98_1184 SSU98_1185     TRUE 0.857 30.000 0.079 NA   NA
 3594457 3594458 SSU98_1185 SSU98_1186     TRUE 0.956 -22.000 0.110 NA   NA
 3594458 3594459 SSU98_1186 SSU98_1187     FALSE 0.021 308.000 0.000 1.000 N NA
 3594459 3594460 SSU98_1187 SSU98_1188     TRUE 0.998 10.000 0.837 0.004 Y NA
 3594460 3594461 SSU98_1188 SSU98_1189     TRUE 0.999 -19.000 0.724 0.004 Y NA
 3594461 3594462 SSU98_1189 SSU98_1190     TRUE 0.998 12.000 0.846 0.004 Y NA
 3594462 3594463 SSU98_1190 SSU98_1191     TRUE 0.997 22.000 0.864 0.004 Y NA
 3594463 3594464 SSU98_1191 SSU98_1192     TRUE 0.997 1.000 0.222 0.004 Y NA
 3594464 3594465 SSU98_1192 SSU98_1193     TRUE 0.963 18.000 0.032 0.005   NA
 3594465 3594466 SSU98_1193 SSU98_1194     TRUE 0.966 -58.000 0.005 0.002   NA
 3594466 3594467 SSU98_1194 SSU98_1195     TRUE 0.970 37.000 0.189 0.002   NA
 3594467 3594468 SSU98_1195 SSU98_1196     FALSE 0.183 137.000 0.000 1.000   NA
 3594468 3594469 SSU98_1196 SSU98_1197   ligA TRUE 0.828 11.000 0.013 1.000 N NA
 3594470 3594471 SSU98_1198 SSU98_1199     TRUE 0.947 2.000 0.045 NA   NA
 3594471 3594472 SSU98_1199 SSU98_1200     TRUE 0.995 -3.000 0.841 NA   NA
 3594472 3594473 SSU98_1200 SSU98_1201     TRUE 0.505 80.000 0.032 NA   NA
 3594473 3594474 SSU98_1201 SSU98_1202     FALSE 0.040 200.000 0.000 NA N NA
 3594474 3594475 SSU98_1202 SSU98_1203     TRUE 0.613 2.000 0.000 NA N NA
 3594476 3594477 SSU98_1204 SSU98_1205     TRUE 0.938 -10.000 0.005 1.000   NA
 3594477 3594478 SSU98_1205 SSU98_1206     TRUE 0.963 -10.000 0.000 0.023   NA
 3594478 3594479 SSU98_1206 SSU98_1207     TRUE 0.871 -3.000 0.000 1.000   NA
 3594479 3594480 SSU98_1207 SSU98_1208     TRUE 0.945 3.000 0.120 1.000 N NA
 3594482 3594483 SSU98_1210 SSU98_1211     TRUE 0.992 6.000 1.000 NA   NA
 3594483 3594484 SSU98_1211 SSU98_1212     FALSE 0.029 352.000 0.000 NA   NA
 3594486 3594487 SSU98_1214 SSU98_1215     TRUE 0.996 5.000 0.240 0.013 Y NA
 3594487 3594488 SSU98_1215 SSU98_1216     FALSE 0.079 156.000 0.000 1.000 N NA
 3594488 3594489 SSU98_1216 SSU98_1218     TRUE 0.985 3.000 0.140 1.000 Y NA
 3594491 3594492 SSU98_1219 SSU98_1220     TRUE 0.909 -34.000 0.000 0.051   NA
 3594493 3594494 SSU98_1221 SSU98_1222     TRUE 0.953 33.000 0.562 NA   NA
 3594494 3594495 SSU98_1222 SSU98_1223     FALSE 0.381 46.000 0.000 NA   NA
 3594495 3594496 SSU98_1223 SSU98_1224   nrdF TRUE 0.565 27.000 0.000 NA   NA
 3594497 3594498 SSU98_1225 SSU98_1226     TRUE 0.820 97.000 0.562 NA   NA
 3594498 3594499 SSU98_1226 SSU98_1227     FALSE 0.061 260.000 0.000 NA   NA
 3594499 3594500 SSU98_1227 SSU98_1228     TRUE 0.965 46.000 0.250 0.002   NA
 3594500 3594501 SSU98_1228 SSU98_1229     TRUE 0.898 68.000 0.250 0.030   NA
 3594501 3594502 SSU98_1229 SSU98_1230     TRUE 0.997 -3.000 0.250 0.001   NA
 3594502 3594503 SSU98_1230 SSU98_1231     FALSE 0.186 97.000 0.000 NA   NA
 3594503 3594504 SSU98_1231 SSU98_1232     TRUE 0.806 7.000 0.002 NA N NA
 3594504 3594505 SSU98_1232 SSU98_1233     TRUE 0.999 -13.000 0.933 0.022 Y NA
 3594505 3594506 SSU98_1233 SSU98_1234     TRUE 0.997 19.000 0.933 0.022 Y NA
 3594506 3594507 SSU98_1234 SSU98_1235     TRUE 0.967 10.000 0.267 1.000   NA
 3594507 3594508 SSU98_1235 SSU98_1236     TRUE 0.980 -3.000 0.160 1.000   NA
 3594508 3594509 SSU98_1236 SSU98_1237     FALSE 0.178 287.000 0.000 1.000 Y NA
 3594509 3594510 SSU98_1237 SSU98_1238     TRUE 0.989 -16.000 0.167 1.000 Y NA
 3594510 3594511 SSU98_1238 SSU98_1239     TRUE 0.962 17.000 0.094 1.000 Y NA
 3594511 3594512 SSU98_1239 SSU98_1240     TRUE 0.785 51.000 0.197 1.000 N NA
 3594512 3594513 SSU98_1240 SSU98_1241     FALSE 0.004 1072.000 0.000 1.000 N NA
 3594513 3594514 SSU98_1241 SSU98_1242     TRUE 0.645 -75.000 0.000 NA   NA
 3594514 3594515 SSU98_1242 SSU98_1243     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3594515 3594516 SSU98_1243 SSU98_1244     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3594516 3594517 SSU98_1244 SSU98_1245     TRUE 0.826 -13.000 0.000 NA   NA
 3594517 3594518 SSU98_1245 SSU98_1246     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3594518 3594519 SSU98_1246 SSU98_1247     TRUE 0.988 -3.000 0.362 NA   NA
 3594519 3594520 SSU98_1247 SSU98_1248     TRUE 0.883 13.000 0.029 NA   NA
 3594520 3594521 SSU98_1248 SSU98_1249     TRUE 0.838 -10.000 0.000 NA   NA
 3594521 3594522 SSU98_1249 SSU98_1250     TRUE 0.810 -16.000 0.000 NA   NA
 3594522 3594523 SSU98_1250 SSU98_1251     TRUE 0.493 34.000 0.000 NA   NA
 3594523 3594524 SSU98_1251 SSU98_1252   alaS FALSE 0.028 362.000 0.000 NA   NA
 3594524 3594525 SSU98_1252 SSU98_1253 alaS   FALSE 0.129 280.000 0.006 NA   NA
 3594525 3594526 SSU98_1253 SSU98_1254     TRUE 0.734 8.000 0.000 NA   NA
 3594526 3594527 SSU98_1254 SSU98_1255     FALSE 0.023 388.000 0.000 NA   NA
 3594527 3594528 SSU98_1255 SSU98_1256     FALSE 0.113 205.000 0.000 1.000   NA
 3594528 3594529 SSU98_1256 SSU98_1257     FALSE 0.148 154.000 0.000 NA   NA
 3594529 3594530 SSU98_1257 SSU98_1258     TRUE 0.641 16.000 0.000 NA   NA
 3594530 3594531 SSU98_1258 SSU98_1259     TRUE 0.782 -22.000 0.000 NA   NA
 3594531 3594532 SSU98_1259 SSU98_1260     FALSE 0.447 231.000 0.204 NA   NA
 3594532 3594533 SSU98_1260 SSU98_1261     FALSE 0.255 64.000 0.000 NA   NA
 3594536 3594537 SSU98_1264 SSU98_1265     TRUE 0.981 10.000 0.000 0.001 Y NA
 3594537 3594538 SSU98_1265 SSU98_1266   aroE TRUE 0.725 46.000 0.000 1.000 Y NA
 3594538 3594539 SSU98_1266 SSU98_1267 aroE aroB TRUE 0.947 13.000 0.010 1.000 Y NA
 3594540 3594541 SSU98_1268 SSU98_1269     TRUE 0.737 10.000 0.000 1.000   NA
 3594541 3594542 SSU98_1269 SSU98_1270     FALSE 0.317 55.000 0.000 NA   NA
 3594542 3594543 SSU98_1270 SSU98_1271     TRUE 0.949 24.000 0.333 NA   NA
 3594543 3594544 SSU98_1271 SSU98_1272     FALSE 0.015 494.000 0.000 NA   NA
 3594544 3594545 SSU98_1272 SSU98_1273     FALSE 0.184 102.000 0.000 NA   NA
 3594545 3594546 SSU98_1273 SSU98_1274     TRUE 0.983 -7.000 0.030 1.000 Y NA
 3594546 3594547 SSU98_1274 SSU98_1275     FALSE 0.092 215.000 0.000 NA   NA
 3594547 3594548 SSU98_1275 SSU98_1276     TRUE 0.916 10.000 0.058 NA   NA
 3594548 3594549 SSU98_1276 SSU98_1277     TRUE 0.960 8.000 0.010 1.000 Y NA
 3594549 3594550 SSU98_1277 SSU98_1278   aroD TRUE 0.983 4.000 0.000 0.003 Y NA
 3594550 3594551 SSU98_1278 SSU98_1279 aroD   TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594553 3594554 SSU98_1281 SSU98_1282   rplT FALSE 0.044 299.000 0.000 NA   NA
 3594554 3594555 SSU98_1282 SSU98_1283 rplT rpmI TRUE 0.994 44.000 0.928 0.020 Y NA
 3594555 3594556 SSU98_1283 SSU98_1284 rpmI infC TRUE 0.986 27.000 0.652 1.000 Y NA
 3594556 3594557 SSU98_1284 SSU98_1285 infC cmk FALSE 0.189 196.000 0.010 1.000 N NA
 3594557 3594558 SSU98_1285 SSU98_1287 cmk   TRUE 0.878 10.000 0.012 NA   NA
 3594560 3594561 SSU98_1288 SSU98_1289     FALSE 0.075 237.000 0.000 NA   NA
 3594561 3594562 SSU98_1289 SSU98_1290     TRUE 0.955 -10.000 0.041 NA   NA
 3594562 3594563 SSU98_1290 SSU98_1291     TRUE 0.991 0.000 0.568 NA   NA
 3594563 3594564 SSU98_1291 SSU98_1292     FALSE 0.183 104.000 0.000 NA   NA
 3594564 3594565 SSU98_1292 SSU98_1293     TRUE 0.987 0.000 0.000 0.012 Y NA
 3594565 3594566 SSU98_1293 SSU98_1294     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3594566 3594567 SSU98_1294 SSU98_1295     TRUE 0.784 3.000 0.000 NA   NA
 3594567 3594568 SSU98_1295 SSU98_1296     TRUE 0.734 8.000 0.000 NA   NA
 3594568 3594569 SSU98_1296 SSU98_1298     FALSE 0.095 211.000 0.000 NA   NA
 3594571 3594572 SSU98_1299 SSU98_1300     FALSE 0.049 286.000 0.000 NA   NA
 3594572 3594573 SSU98_1300 SSU98_1301     FALSE 0.067 253.000 0.000 NA   NA
 3594573 3594574 SSU98_1301 SSU98_1302     TRUE 0.956 0.000 0.094 1.000 N NA
 3594574 3594575 SSU98_1302 SSU98_1303     TRUE 0.784 3.000 0.000 NA   NA
 3594575 3594576 SSU98_1303 SSU98_1304     FALSE 0.227 72.000 0.000 NA   NA
 3594576 3594577 SSU98_1304 SSU98_1305     TRUE 0.986 -3.000 0.289 NA   NA
 3594578 3594579 SSU98_1306 SSU98_1307     TRUE 0.663 -63.000 0.000 NA   NA
 3594580 3594581 SSU98_1308 SSU98_1309     TRUE 0.542 120.000 0.000 0.002 N NA
 3594581 3594582 SSU98_1309 SSU98_1310     TRUE 0.501 38.000 0.000 1.000   NA
 3594582 3594583 SSU98_1310 SSU98_1311     TRUE 0.707 -58.000 0.000 1.000   NA
 3594583 3594584 SSU98_1311 SSU98_1313     TRUE 0.980 55.000 0.273 0.002 Y NA
 3594586 3594587 SSU98_1314 SSU98_1315     TRUE 0.975 0.000 0.150 NA   NA
 3594587 3594588 SSU98_1315 SSU98_1316     TRUE 0.990 0.000 0.149 1.000 Y NA
 3594588 3594589 SSU98_1316 SSU98_1317     TRUE 0.854 -12.000 0.000 1.000   NA
 3594589 3594590 SSU98_1317 SSU98_1318     FALSE 0.211 98.000 0.000 1.000   NA
 3594590 3594591 SSU98_1318 SSU98_1319     FALSE 0.317 167.000 0.011 NA   NA
 3594591 3594592 SSU98_1319 SSU98_1320     TRUE 0.984 -10.000 0.283 NA   NA
 3594592 3594593 SSU98_1320 SSU98_1321     TRUE 0.881 -37.000 0.012 NA   NA
 3594593 3594594 SSU98_1321 SSU98_1322     TRUE 0.842 10.000 0.021 NA N NA
 3594594 3594595 SSU98_1322 SSU98_1323     TRUE 0.491 53.000 0.009 1.000 N NA
 3594595 3594596 SSU98_1323 SSU98_1324     FALSE 0.019 433.000 0.000 NA   NA
 3594596 3594597 SSU98_1324 SSU98_1325     TRUE 0.790 -21.000 0.000 NA   NA
 3594597 3594598 SSU98_1325 SSU98_1326     FALSE 0.079 156.000 0.000 1.000 N NA
 3594599 3594600 SSU98_1327 SSU98_1328     TRUE 0.808 -22.000 0.000 1.000   NA
 3594601 3594602 SSU98_1329 SSU98_1330     TRUE 0.969 -3.000 0.074 1.000   NA
 3594602 3594603 SSU98_1330 SSU98_1331     TRUE 0.884 11.000 0.022 NA   NA
 3594603 3594604 SSU98_1331 SSU98_1332     TRUE 0.931 -16.000 0.014 NA   NA
 3594604 3594605 SSU98_1332 SSU98_1333   miaA TRUE 0.957 -7.000 0.027 1.000   NA
 3594609 3594610 SSU98_1337 SSU98_1338     FALSE 0.439 79.000 0.010 NA   NA
 3594610 3594611 SSU98_1338 SSU98_1339     TRUE 0.748 6.000 0.000 NA   NA
 3594611 3594612 SSU98_1339 SSU98_1340     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3594612 3594613 SSU98_1340 SSU98_1341     TRUE 0.737 10.000 0.000 1.000   NA
 3594613 3594614 SSU98_1341 SSU98_1342   frr FALSE 0.476 78.000 0.012 1.000   NA
 3594614 3594615 SSU98_1342 SSU98_1343 frr pyrH TRUE 0.772 135.000 0.626 1.000 N NA
 3594615 3594616 SSU98_1343 SSU98_1344 pyrH   FALSE 0.240 80.000 0.000 1.000   NA
 3594616 3594617 SSU98_1344 SSU98_1345     FALSE 0.174 150.000 0.000 1.000   NA
 3594617 3594618 SSU98_1345 SSU98_1346     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3594618 3594619 SSU98_1346 SSU98_1347   rplA FALSE 0.286 59.000 0.000 NA   NA
 3594619 3594620 SSU98_1347 SSU98_1348 rplA rplK TRUE 0.993 41.000 0.838 0.027 Y NA
 3594622 3594623 SSU98_1350 SSU98_1351     TRUE 0.904 0.000 0.010 NA N NA
 3594623 3594624 SSU98_1351 SSU98_1352     FALSE 0.096 125.000 0.000 1.000 N NA
 3594624 3594625 SSU98_1352 SSU98_1353     TRUE 0.979 18.000 0.273 1.000 Y NA
 3594625 3594626 SSU98_1353 SSU98_1354     TRUE 0.992 38.000 0.733 0.029 Y NA
 3594626 3594627 SSU98_1354 SSU98_1355     TRUE 0.998 10.000 0.933 0.029 Y NA
 3594627 3594628 SSU98_1355 SSU98_1356     TRUE 0.520 32.000 0.000 NA   NA
 3594628 3594629 SSU98_1356 SSU98_1357     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3594629 3594630 SSU98_1357 SSU98_1358     FALSE 0.145 157.000 0.000 NA   NA
 3594630 3594631 SSU98_1358 SSU98_1359     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3594632 3594633 SSU98_1360 SSU98_1361     FALSE 0.108 93.000 0.000 1.000 N NA
 3594636 3594637 SSU98_1364 SSU98_1365     TRUE 0.839 31.000 0.059 NA   NA
 3594637 3594638 SSU98_1365 SSU98_1366     FALSE 0.204 117.000 0.000 1.000   NA
 3594638 3594639 SSU98_1366 SSU98_1367     TRUE 0.705 13.000 0.000 1.000   NA
 3594639 3594640 SSU98_1367 SSU98_1368     TRUE 0.915 43.000 0.004 0.001   NA
 3594640 3594641 SSU98_1368 SSU98_1369     TRUE 0.634 51.000 0.010 1.000   NA
 3594641 3594642 SSU98_1369 SSU98_1370     TRUE 0.984 -3.000 0.002 0.008   NA
 3594642 3594643 SSU98_1370 SSU98_1371     TRUE 0.852 9.000 0.013 1.000 N NA
 3594643 3594644 SSU98_1371 SSU98_1372     FALSE 0.246 77.000 0.000 1.000   NA
 3594644 3594645 SSU98_1372 SSU98_1373     FALSE 0.430 163.000 0.000 0.027   NA
 3594645 3594646 SSU98_1373 SSU98_1374     FALSE 0.017 519.000 0.000 1.000   NA
 3594646 3594647 SSU98_1374 SSU98_1375     TRUE 0.927 7.000 0.038 1.000   NA
 3594647 3594648 SSU98_1375 SSU98_1376     TRUE 0.998 -7.000 0.597 0.047 Y NA
 3594649 3594650 SSU98_1377 SSU98_1378     TRUE 0.980 11.000 0.185 1.000 Y NA
 3594650 3594651 SSU98_1378 SSU98_1379     TRUE 0.994 15.000 0.400 0.029 Y NA
 3594651 3594652 SSU98_1379 SSU98_1380     TRUE 0.998 15.000 0.947 0.011 Y NA
 3594653 3594654 SSU98_1381 SSU98_1382 thrS   TRUE 0.868 14.000 0.018 NA   NA
 3594654 3594655 SSU98_1382 SSU98_1383     FALSE 0.064 256.000 0.000 NA   NA
 3594655 3594656 SSU98_1383 SSU98_1384     TRUE 0.861 15.000 0.016 NA   NA
 3594656 3594657 SSU98_1384 SSU98_1385     TRUE 0.998 1.000 0.413 0.012 Y NA
 3594663 3594664 SSU98_1391 SSU98_1392     FALSE 0.178 120.000 0.000 NA   NA
 3594664 3594665 SSU98_1392 SSU98_1393     FALSE 0.478 36.000 0.000 NA   NA
 3594665 3594666 SSU98_1393 SSU98_1394     FALSE 0.247 76.000 0.000 1.000   NA
 3594666 3594667 SSU98_1394 SSU98_1395     FALSE 0.171 152.000 0.000 1.000   NA
 3594667 3594668 SSU98_1395 SSU98_1396     TRUE 0.958 0.000 0.000 1.000 Y NA
 3594668 3594669 SSU98_1396 SSU98_1397     FALSE 0.201 89.000 0.000 NA   NA
 3594669 3594670 SSU98_1397 SSU98_1398     TRUE 0.755 -27.000 0.000 NA   NA
 3594670 3594671 SSU98_1398 SSU98_1399   tpx FALSE 0.086 226.000 0.000 NA   NA
 3594671 3594672 SSU98_1399 SSU98_1400 tpx   FALSE 0.065 184.000 0.000 1.000 N NA
 3594672 3594673 SSU98_1400 SSU98_1401     FALSE 0.018 331.000 0.000 1.000 N NA
 3594673 3594674 SSU98_1401 SSU98_1403     FALSE 0.306 194.000 0.071 1.000 N NA
 3594676 3594677 SSU98_1404 SSU98_1405 smpB   TRUE 0.981 3.000 0.143 0.027 N NA
 3594677 3594678 SSU98_1405 SSU98_1406   secG FALSE 0.063 432.000 0.064 1.000 N NA
 3594678 3594679 SSU98_1406 SSU98_1407 secG   FALSE 0.383 196.000 0.007 0.054 N NA
 3594679 3594680 SSU98_1407 SSU98_1408     TRUE 0.898 -13.000 0.007 1.000 N NA
 3594680 3594681 SSU98_1408 SSU98_1409     TRUE 0.951 -7.000 0.066 1.000 N NA
 3594681 3594682 SSU98_1409 SSU98_1410   era FALSE 0.038 547.000 0.004 1.000   NA
 3594682 3594683 SSU98_1410 SSU98_1411 era   TRUE 0.899 17.000 0.063 1.000   NA
 3594683 3594684 SSU98_1411 SSU98_1412     TRUE 0.939 -19.000 0.035 NA   NA
 3594686 3594687 SSU98_1414 SSU98_1415     TRUE 0.957 28.000 0.132 1.000 Y NA
 3594687 3594688 SSU98_1415 SSU98_1416     FALSE 0.014 578.000 0.000 1.000   NA
 3594688 3594689 SSU98_1416 SSU98_1417     FALSE 0.014 590.000 0.000 1.000   NA
 3594689 3594690 SSU98_1417 SSU98_1418     FALSE 0.360 54.000 0.000 1.000   NA
 3594690 3594691 SSU98_1418 SSU98_1419     TRUE 0.999 0.000 0.844 0.011 Y NA
 3594691 3594692 SSU98_1419 SSU98_1420     FALSE 0.067 252.000 0.000 NA   NA
 3594692 3594693 SSU98_1420 SSU98_2247     TRUE 0.601 21.000 0.000 NA   NA
 3594694 3594695 SSU98_1421 SSU98_1422     TRUE 0.998 -3.000 0.871 1.000 Y NA
 3594696 3594697 SSU98_1423 SSU98_1424     TRUE 0.990 -37.000 0.431 1.000 Y NA
 3594697 3594698 SSU98_1424 SSU98_1425     FALSE 0.447 89.000 0.053 1.000 N NA
 3594698 3594699 SSU98_1425 SSU98_1426     FALSE 0.402 44.000 0.000 NA   NA
 3594699 3594700 SSU98_1426 SSU98_1427     TRUE 0.662 14.000 0.000 NA   NA
 3594700 3594701 SSU98_1427 SSU98_1428     FALSE 0.072 127.000 0.000 NA N NA
 3594701 3594702 SSU98_1428 SSU98_1429     FALSE 0.154 146.000 0.000 NA   NA
 3594704 3594705 SSU98_1431 SSU98_1432     TRUE 0.746 -28.000 0.000 NA   NA
 3594706 3594707 SSU98_1433 SSU98_1434     TRUE 0.773 -24.000 0.000 NA   NA
 3594709 3594710 SSU98_1435 SSU98_1436     FALSE 0.010 673.000 0.000 NA   NA
 3594710 3594711 SSU98_1436 SSU98_1437     TRUE 0.915 16.000 0.000 0.010   NA
 3594711 3594712 SSU98_1437 SSU98_1438     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3594712 3594713 SSU98_1438 SSU98_1439     FALSE 0.039 315.000 0.000 NA   NA
 3594714 3594715 SSU98_1440 SSU98_1441     FALSE 0.430 148.000 0.044 NA   NA
 3594715 3594716 SSU98_1441 SSU98_1442   dnaG TRUE 0.963 3.000 0.209 1.000 N NA
 3594718 3594719 SSU98_1444 SSU98_1445     FALSE 0.230 86.000 0.000 1.000   NA
 3594719 3594720 SSU98_1445 SSU98_1446     FALSE 0.020 421.000 0.000 NA   NA
 3594720 3594721 SSU98_1446 SSU98_1447     TRUE 0.977 -25.000 0.330 NA   NA
 3594721 3594722 SSU98_1447 SSU98_1448     TRUE 0.953 10.000 0.023 0.022 N NA
 3594722 3594723 SSU98_1448 SSU98_1449     TRUE 0.916 -13.000 0.015 1.000 N NA
 3594723 3594724 SSU98_1449 SSU98_1450     FALSE 0.232 231.000 0.060 1.000 N NA
 3594726 3594727 SSU98_1452 SSU98_1453     FALSE 0.070 175.000 0.000 1.000 N NA
 3594727 3594728 SSU98_1453 SSU98_1454     TRUE 0.981 33.000 0.040 0.001 Y NA
 3594728 3594729 SSU98_1454 SSU98_1455     TRUE 0.516 12.000 0.000 1.000 N NA
 3594729 3594730 SSU98_1455 SSU98_1456     TRUE 0.729 0.000 0.000 1.000 N NA
 3594730 3594731 SSU98_1456 SSU98_1457     TRUE 0.990 -22.000 0.080 0.001   NA
 3594731 3594732 SSU98_1457 SSU98_1458     FALSE 0.124 329.000 0.018 1.000   NA
 3594733 3594734 SSU98_1459 SSU98_1460     FALSE 0.389 220.000 0.000 0.005   NA
 3594735 3594736 SSU98_1461 SSU98_1462     TRUE 0.967 -15.000 0.000 0.005   NA
 3594736 3594737 SSU98_1462 SSU98_1463     TRUE 0.993 0.000 0.045 0.064 Y NA
 3594737 3594738 SSU98_1463 SSU98_1464     TRUE 0.957 -3.000 0.034 NA   NA
 3594738 3594739 SSU98_1464 SSU98_1465     TRUE 0.765 -25.000 0.000 NA   NA
 3594739 3594740 SSU98_1465 SSU98_1466     FALSE 0.172 127.000 0.000 NA   NA
 3594741 3594742 SSU98_1467 SSU98_1468 trmE   FALSE 0.192 94.000 0.000 NA   NA
 3594743 3594744 SSU98_1469 SSU98_1470     TRUE 0.680 12.000 0.000 NA   NA
 3594744 3594745 SSU98_1470 SSU98_1471     FALSE 0.224 73.000 0.000 NA   NA
 3594745 3594746 SSU98_1471 SSU98_1472     FALSE 0.366 48.000 0.000 NA   NA
 3594746 3594747 SSU98_1472 SSU98_1473     TRUE 0.826 -13.000 0.000 NA   NA
 3594747 3594748 SSU98_1473 SSU98_1474     FALSE 0.471 41.000 0.000 1.000   NA
 3594748 3594749 SSU98_1474 SSU98_1475     TRUE 0.491 101.000 0.000 1.000 Y NA
 3594749 3594750 SSU98_1475 SSU98_1476     FALSE 0.028 371.000 0.000 1.000   NA
 3594750 3594751 SSU98_1476 SSU98_1477     FALSE 0.443 40.000 0.000 NA   NA
 3594751 3594752 SSU98_1477 SSU98_1478     FALSE 0.020 411.000 0.000 NA   NA
 3594752 3594753 SSU98_1478 SSU98_1479     TRUE 0.746 -28.000 0.000 NA   NA
 3594753 3594754 SSU98_1479 SSU98_1480     FALSE 0.191 131.000 0.000 1.000   NA
 3594754 3594755 SSU98_1480 SSU98_1481     FALSE 0.159 164.000 0.000 1.000   NA
 3594755 3594756 SSU98_1481 SSU98_1482     TRUE 0.955 7.000 0.150 NA   NA
 3594756 3594757 SSU98_1482 SSU98_1483     TRUE 0.988 -16.000 0.502 NA   NA
 3594758 3594759 SSU98_1484 SSU98_1485     TRUE 0.994 0.000 0.796 1.000   NA
 3594760 3594761 SSU98_1486 SSU98_1487     TRUE 0.832 2.000 0.000 1.000   NA
 3594761 3594762 SSU98_1487 SSU98_1488     FALSE 0.076 236.000 0.000 NA   NA
 3594762 3594763 SSU98_1488 SSU98_1489     FALSE 0.372 47.000 0.000 NA   NA
 3594763 3594764 SSU98_1489 SSU98_1490     TRUE 0.903 8.000 0.019 NA   NA
 3594764 3594765 SSU98_1490 SSU98_1491     TRUE 0.948 -31.000 0.130 NA   NA
 3594765 3594766 SSU98_1491 SSU98_1492     TRUE 0.756 66.000 0.217 NA   NA
 3594766 3594767 SSU98_1492 SSU98_1493     TRUE 0.703 65.000 0.143 NA   NA
 3594767 3594768 SSU98_1493 SSU98_1494     FALSE 0.033 339.000 0.000 NA   NA
 3594768 3594769 SSU98_1494 SSU98_1495     FALSE 0.478 36.000 0.000 NA   NA
 3594769 3594770 SSU98_1495 SSU98_1496     FALSE 0.122 183.000 0.000 NA   NA
 3594770 3594771 SSU98_1496 SSU98_1497     TRUE 0.995 -3.000 0.895 1.000   NA
 3594771 3594772 SSU98_1497 SSU98_1498     TRUE 0.953 23.000 0.368 NA   NA
 3594772 3594773 SSU98_1498 SSU98_1500     FALSE 0.010 724.000 0.000 NA   NA
 3594775 3594776 SSU98_1501 SSU98_1502     TRUE 0.950 11.000 0.259 1.000 N NA
 3594778 3594779 SSU98_1504 SSU98_1505     TRUE 0.967 4.000 0.182 1.000   NA
 3594779 3594780 SSU98_1505 SSU98_1506     TRUE 0.794 70.000 0.324 NA   NA
 3594781 3594782 SSU98_1507 SSU98_1508     TRUE 0.964 13.000 0.333 NA   NA
 3594783 3594784 SSU98_1509 SSU98_1510     FALSE 0.147 155.000 0.000 NA   NA
 3594784 3594785 SSU98_1510 SSU98_1511     TRUE 0.981 2.000 0.308 NA   NA
 3594785 3594786 SSU98_1511 SSU98_1513   eno FALSE 0.067 253.000 0.000 NA   NA
 3594787 3594788 SSU98_1512 SSU98_1514     TRUE 0.612 19.000 0.000 NA   NA
 3594791 3594792 SSU98_1517 SSU98_1518     FALSE 0.090 133.000 0.000 1.000 N NA
 3594792 3594793 SSU98_1518 SSU98_1519     TRUE 0.798 13.000 0.009 1.000 N NA
 3594793 3594794 SSU98_1519 SSU98_1520     FALSE 0.394 89.000 0.026 1.000 N NA
 3594794 3594795 SSU98_1520 SSU98_1521     TRUE 0.996 -16.000 0.429 0.003   NA
 3594795 3594796 SSU98_1521 SSU98_1522     FALSE 0.124 182.000 0.000 NA   NA
 3594796 3594797 SSU98_1522 SSU98_1523     TRUE 0.754 5.000 0.000 NA   NA
 3594797 3594798 SSU98_1523 SSU98_1524     FALSE 0.009 1464.000 0.000 1.000   NA
 3594798 3594799 SSU98_1524 SSU98_1525     FALSE 0.018 440.000 0.000 NA   NA
 3594799 3594800 SSU98_1525 SSU98_1526     TRUE 0.966 15.000 0.400 NA   NA
 3594800 3594801 SSU98_1526 SSU98_1527     TRUE 0.846 -7.000 0.000 NA   NA
 3594801 3594802 SSU98_1527 SSU98_1529     FALSE 0.078 235.000 0.000 NA   NA
 3594804 3594805 SSU98_1530 SSU98_1531     FALSE 0.166 132.000 0.000 NA   NA
 3594805 3594806 SSU98_1531 SSU98_1532     FALSE 0.432 41.000 0.000 NA   NA
 3594806 3594807 SSU98_1532 SSU98_1533     TRUE 0.826 -13.000 0.000 NA   NA
 3594807 3594808 SSU98_1533 SSU98_1534     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594808 3594809 SSU98_1534 SSU98_1535     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594809 3594810 SSU98_1535 SSU98_1536     TRUE 0.838 -10.000 0.000 NA   NA
 3594810 3594811 SSU98_1536 SSU98_1537     FALSE 0.045 297.000 0.000 NA   NA
 3594812 3594813 SSU98_1538 SSU98_1539     FALSE 0.308 56.000 0.000 NA   NA
 3594813 3594814 SSU98_1539 SSU98_1540     FALSE 0.010 687.000 0.000 NA   NA
 3594814 3594815 SSU98_1540 SSU98_1541     TRUE 0.518 142.000 0.000 0.011   NA
 3594816 3594817 SSU98_1542 SSU98_1543 rpmE2   FALSE 0.269 119.000 0.004 1.000 N NA
 3594817 3594818 SSU98_1543 SSU98_1544     TRUE 0.848 -13.000 0.000 1.000   NA
 3594819 3594820 SSU98_1545 SSU98_1546     FALSE 0.085 142.000 0.000 1.000 N NA
 3594820 3594821 SSU98_1546 SSU98_1547     FALSE 0.117 82.000 0.000 1.000 N NA
 3594821 3594822 SSU98_1547 SSU98_1548     TRUE 0.955 -10.000 0.094 1.000 N NA
 3594823 3594824 SSU98_2245 SSU98_1549     FALSE 0.063 257.000 0.000 NA   NA
 3594824 3594825 SSU98_1549 SSU98_1550     FALSE 0.033 256.000 0.000 1.000 N NA
 3594825 3594826 SSU98_1550 SSU98_1551   holA FALSE 0.321 113.000 0.012 1.000 N NA
 3594826 3594827 SSU98_1551 SSU98_1552 holA   FALSE 0.151 151.000 0.000 NA   NA
 3594827 3594828 SSU98_1552 SSU98_1553     FALSE 0.182 109.000 0.000 NA   NA
 3594828 3594829 SSU98_1553 SSU98_1554     FALSE 0.021 407.000 0.000 NA   NA
 3594829 3594830 SSU98_1554 SSU98_1555     TRUE 0.996 0.000 0.128 0.026 Y NA
 3594830 3594831 SSU98_1555 SSU98_1556     TRUE 0.994 0.000 0.349 1.000 Y NA
 3594831 3594832 SSU98_1556 SSU98_1557     TRUE 0.997 3.000 0.363 0.028 Y NA
 3594832 3594833 SSU98_1557 SSU98_1558     TRUE 0.660 216.000 0.150 1.000 Y NA
 3594833 3594834 SSU98_1558 SSU98_1559     TRUE 0.500 159.000 0.109 NA   NA
 3594834 3594835 SSU98_1559 SSU98_1560   clpP TRUE 0.496 127.000 0.065 NA   NA
 3594835 3594836 SSU98_1560 SSU98_1561 clpP upp FALSE 0.303 117.000 0.010 1.000 N NA
 3594836 3594837 SSU98_1561 SSU98_1562 upp   FALSE 0.486 15.000 0.000 1.000 N NA
 3594837 3594838 SSU98_1562 SSU98_1563     TRUE 0.811 73.000 0.000 0.010 Y NA
 3594838 3594839 SSU98_1563 SSU98_1564     TRUE 0.560 71.000 0.000 1.000 Y NA
 3594839 3594840 SSU98_1564 SSU98_1565     TRUE 0.967 181.000 0.925 0.028 Y NA
 3594840 3594841 SSU98_1565 SSU98_1566     TRUE 0.931 132.000 0.275 0.028 Y NA
 3594841 3594842 SSU98_1566 SSU98_1567     TRUE 0.984 13.000 0.286 1.000 Y NA
 3594843 3594844 SSU98_1568 SSU98_1569     TRUE 0.922 -28.000 0.000 0.046   NA
 3594845 3594846 SSU98_1570 SSU98_1571     TRUE 0.993 4.000 0.082 0.011 Y NA
 3594847 3594848 SSU98_1572 SSU98_1573     TRUE 0.662 14.000 0.000 NA   NA
 3594848 3594849 SSU98_1573 SSU98_1574     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3594849 3594850 SSU98_1574 SSU98_1575     FALSE 0.107 195.000 0.000 NA   NA
 3594850 3594851 SSU98_1575 SSU98_1576     TRUE 0.973 -22.000 0.209 1.000   NA
 3594851 3594852 SSU98_1576 SSU98_1577     TRUE 0.761 -31.000 0.000 1.000   NA
 3594853 3594854 SSU98_1578 SSU98_1579     FALSE 0.187 133.000 0.000 1.000   NA
 3594854 3594855 SSU98_1579 SSU98_1580     FALSE 0.181 112.000 0.000 NA   NA
 3594855 3594856 SSU98_1580 SSU98_1581     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3594856 3594857 SSU98_1581 SSU98_1582     TRUE 0.746 -28.000 0.000 NA   NA
 3594857 3594858 SSU98_1582 SSU98_1583     FALSE 0.440 145.000 0.000 1.000 Y NA
 3594858 3594859 SSU98_1583 SSU98_1584     FALSE 0.019 433.000 0.000 NA   NA
 3594859 3594860 SSU98_1584 SSU98_1585     FALSE 0.216 78.000 0.000 NA   NA
 3594860 3594861 SSU98_1585 SSU98_1586     FALSE 0.340 52.000 0.000 NA   NA
 3594861 3594862 SSU98_1586 SSU98_1587     FALSE 0.060 264.000 0.000 NA   NA
 3594864 3594865 SSU98_1589 SSU98_1590     TRUE 0.978 -3.000 0.142 1.000   NA
 3594865 3594866 SSU98_1590 SSU98_1591     FALSE 0.054 199.000 0.000 1.000 N NA
 3594866 3594867 SSU98_1591 SSU98_1592     TRUE 0.916 9.000 0.041 NA   NA
 3594867 3594868 SSU98_1592 SSU98_1593     TRUE 0.887 11.000 0.025 NA   NA
 3594868 3594869 SSU98_1593 SSU98_1594     TRUE 0.859 9.000 0.015 1.000 N NA
 3594869 3594870 SSU98_1594 SSU98_1595     FALSE 0.295 158.000 0.003 NA   NA
 3594870 3594871 SSU98_1595 SSU98_1596     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594871 3594872 SSU98_1596 SSU98_1597   fabG FALSE 0.183 104.000 0.000 NA   NA
 3594872 3594873 SSU98_1597 SSU98_1598 fabG   TRUE 0.993 -7.000 0.710 NA   NA
 3594873 3594874 SSU98_1598 SSU98_1599     FALSE 0.276 60.000 0.000 NA   NA
 3594874 3594875 SSU98_1599 SSU98_1600     TRUE 0.826 -13.000 0.000 NA   NA
 3594875 3594876 SSU98_1600 SSU98_1601     TRUE 0.852 -3.000 0.000 NA   NA
 3594876 3594877 SSU98_1601 SSU98_1602     FALSE 0.042 306.000 0.000 NA   NA
 3594877 3594878 SSU98_1602 SSU98_1603     FALSE 0.181 139.000 0.000 1.000   NA
 3594878 3594879 SSU98_1603 SSU98_1604     TRUE 0.995 -7.000 0.855 1.000   NA
 3594879 3594880 SSU98_1604 SSU98_1605     TRUE 0.647 187.000 0.492 1.000 N NA
 3594880 3594881 SSU98_1605 SSU98_1606     TRUE 0.997 -7.000 0.812 1.000 Y NA
 3594883 3594884 SSU98_1608 SSU98_1609     FALSE 0.154 147.000 0.000 NA   NA
 3594884 3594885 SSU98_1609 SSU98_1610     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3594885 3594886 SSU98_1610 SSU98_1611     TRUE 0.984 0.000 0.382 1.000 N NA
 3594886 3594887 SSU98_1611 SSU98_1612     TRUE 0.941 -10.000 0.046 1.000 N NA
 3594887 3594888 SSU98_1612 SSU98_1613     FALSE 0.041 309.000 0.000 NA   NA
 3594888 3594889 SSU98_1613 SSU98_1614     TRUE 0.975 -16.000 0.206 NA   NA
 3594889 3594890 SSU98_1614 SSU98_1615     TRUE 0.919 -46.000 0.079 NA   NA
 3594890 3594891 SSU98_1615 SSU98_1616     TRUE 0.978 -25.000 0.494 1.000 N NA
 3594892 3594893 SSU98_1617 SSU98_1618     FALSE 0.026 254.000 0.000 NA N NA
 3594893 3594894 SSU98_1618 SSU98_1619     TRUE 0.921 18.000 0.143 NA   NA
 3594894 3594895 SSU98_1619 SSU98_1620     TRUE 0.615 -261.000 0.000 NA   NA
 3594896 3594897 SSU98_1621 SSU98_1622     FALSE 0.234 70.000 0.000 NA   NA
 3594897 3594898 SSU98_1622 SSU98_1623     TRUE 0.978 -13.000 0.215 NA   NA
 3594898 3594899 SSU98_1623 SSU98_1624     TRUE 0.571 31.000 0.000 1.000   NA
 3594899 3594900 SSU98_1624 SSU98_1625     TRUE 0.838 -10.000 0.000 NA   NA
 3594902 3594903 SSU98_1627 SSU98_1628     TRUE 0.948 30.000 0.373 1.000   NA
 3594903 3594904 SSU98_1628 SSU98_1629     TRUE 0.961 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3594904 3594905 SSU98_1629 SSU98_1630     FALSE 0.425 96.000 0.052 1.000 N NA
 3594905 3594906 SSU98_1630 SSU98_1631     FALSE 0.181 139.000 0.000 1.000   NA
 3594906 3594907 SSU98_1631 SSU98_1632     FALSE 0.441 44.000 0.000 1.000   NA
 3594907 3594908 SSU98_1632 SSU98_1633     FALSE 0.011 399.000 0.000 1.000 N NA
 3594908 3594909 SSU98_1633 SSU98_1634     TRUE 0.828 1.000 0.000 NA   NA
 3594909 3594910 SSU98_1634 SSU98_1635     TRUE 0.809 2.000 0.000 NA   NA
 3594912 3594913 SSU98_1637 SSU98_1638     FALSE 0.364 195.000 0.067 NA   NA
 3594913 3594914 SSU98_1638 SSU98_1639     TRUE 0.928 0.000 0.030 NA N NA
 3594914 3594915 SSU98_1639 SSU98_1640     FALSE 0.472 65.000 0.007 NA   NA
 3594915 3594916 SSU98_1640 SSU98_1641     FALSE 0.091 216.000 0.000 NA   NA
 3594916 3594917 SSU98_1641 SSU98_1642     FALSE 0.076 115.000 0.000 NA N NA
 3594918 3594919 SSU98_1643 SSU98_1644     FALSE 0.153 148.000 0.000 NA   NA
 3594919 3594920 SSU98_1644 SSU98_1645     TRUE 0.838 -10.000 0.000 NA   NA
 3594921 3594922 SSU98_1646 SSU98_1647     TRUE 0.996 -3.000 0.231 0.001   NA
 3594922 3594923 SSU98_1647 SSU98_1648     FALSE 0.066 274.000 0.000 1.000   NA
 3594923 3594924 SSU98_1648 SSU98_1649     FALSE 0.018 336.000 0.000 1.000 N NA
 3594924 3594925 SSU98_1649 SSU98_1650     FALSE 0.046 222.000 0.000 1.000 N NA
 3594926 3594927 SSU98_1651 SSU98_1652     TRUE 0.948 -16.000 0.000 1.000 Y NA
 3594927 3594928 SSU98_1652 SSU98_1653     TRUE 0.887 62.000 0.183 1.000 Y NA
 3594928 3594929 SSU98_1653 SSU98_1654     FALSE 0.044 228.000 0.000 1.000 N NA
 3594932 3594933 SSU98_1657 SSU98_1658     TRUE 0.663 89.000 0.156 NA   NA
 3594933 3594934 SSU98_1658 SSU98_1659     TRUE 0.488 350.000 0.828 NA   NA
 3594934 3594935 SSU98_1659 SSU98_1660     TRUE 0.957 -37.000 0.203 NA   NA
 3594935 3594936 SSU98_1660 SSU98_1661     FALSE 0.385 94.000 0.006 NA   NA
 3594936 3594937 SSU98_1661 SSU98_1662     TRUE 0.942 -6.000 0.037 1.000 N NA
 3594937 3594938 SSU98_1662 SSU98_1663     TRUE 0.910 -25.000 0.048 1.000 N NA
 3594938 3594939 SSU98_1663 SSU98_1664     TRUE 0.948 -7.000 0.058 1.000 N NA
 3594939 3594940 SSU98_1664 SSU98_1665     TRUE 0.958 0.000 0.100 1.000 N NA
 3594940 3594941 SSU98_1665 SSU98_1666   xseA TRUE 0.998 -25.000 0.412 0.001 Y NA
 3594943 3594944 SSU98_1668 SSU98_1669     FALSE 0.173 126.000 0.000 NA   NA
 3594944 3594945 SSU98_1669 SSU98_1670     FALSE 0.036 349.000 0.000 1.000   NA
 3594945 3594946 SSU98_1670 SSU98_1671     TRUE 0.996 2.000 0.500 0.011   NA
 3594946 3594947 SSU98_1671 SSU98_1672     TRUE 0.952 -25.000 0.000 0.008   NA
 3594949 3594950 SSU98_1674 SSU98_1675     FALSE 0.051 760.000 0.000 0.012   NA
 3594950 3594951 SSU98_1675 SSU98_1676     FALSE 0.015 561.000 0.000 1.000   NA
 3594953 3594954 SSU98_1678 SSU98_1679     FALSE 0.442 121.000 0.028 NA   NA
 3594957 3594958 SSU98_1682 SSU98_1683     FALSE 0.101 108.000 0.000 1.000 N NA
 3594958 3594959 SSU98_1683 SSU98_1684   nadE TRUE 0.994 13.000 0.194 0.002 Y NA
 3594960 3594961 SSU98_1685 SSU98_1686     TRUE 0.946 -3.000 0.012 NA   NA
 3594961 3594962 SSU98_1686 SSU98_1687     TRUE 0.897 9.000 0.016 NA   NA
 3594962 3594963 SSU98_1687 SSU98_1688     FALSE 0.330 188.000 0.032 NA   NA
 3594963 3594964 SSU98_1688 SSU98_1689   coaD TRUE 0.787 -49.000 0.003 1.000 N NA
 3594964 3594965 SSU98_1689 SSU98_1690 coaD   TRUE 0.909 -10.000 0.008 1.000 N NA
 3594965 3594966 SSU98_1690 SSU98_1691     FALSE 0.042 308.000 0.000 NA   NA
 3594966 3594967 SSU98_1691 SSU98_1692     FALSE 0.299 57.000 0.000 NA   NA
 3594967 3594968 SSU98_1692 SSU98_1693     TRUE 0.958 -3.000 0.035 NA   NA
 3594968 3594969 SSU98_1693 SSU98_1694     FALSE 0.068 251.000 0.000 NA   NA
 3594969 3594970 SSU98_1694 SSU98_1695     TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.011 Y NA
 3594970 3594971 SSU98_1695 SSU98_1696     TRUE 0.980 9.000 0.500 NA   NA
 3594971 3594972 SSU98_1696 SSU98_1697     TRUE 0.975 -3.000 0.136 NA   NA
 3594972 3594973 SSU98_1697 SSU98_1698     FALSE 0.033 361.000 0.000 1.000   NA
 3594973 3594974 SSU98_1698 SSU98_1699     TRUE 0.992 -12.000 0.067 0.001   NA
 3594975 3594976 SSU98_1700 SSU98_1701     FALSE 0.189 95.000 0.000 NA   NA
 3594976 3594977 SSU98_1701 SSU98_1702     TRUE 0.746 -28.000 0.000 NA   NA
 3594977 3594978 SSU98_1702 SSU98_1703     FALSE 0.404 132.000 0.019 NA   NA
 3594978 3594979 SSU98_1703 SSU98_1704     TRUE 0.986 -10.000 0.351 NA   NA
 3594979 3594980 SSU98_1704 SSU98_1705     TRUE 0.981 -3.000 0.167 1.000   NA
 3594981 3594982 SSU98_1706 SSU98_1708     TRUE 0.967 25.000 0.600 NA   NA
 3594984 3594985 SSU98_1709 SSU98_1710     TRUE 0.940 11.000 0.000 0.003   NA
 3594985 3594986 SSU98_1710 SSU98_1711     FALSE 0.043 808.000 0.000 0.026   NA
 3594986 3594987 SSU98_1711 SSU98_1712   scpB TRUE 0.973 -10.000 0.224 NA N NA
 3594987 3594988 SSU98_1712 SSU98_1713 scpB scpA TRUE 0.986 -22.000 0.570 NA   NA
 3594988 3594989 SSU98_1713 SSU98_1714 scpA xerD TRUE 0.947 0.000 0.017 NA   NA
 3594989 3594990 SSU98_1714 SSU98_1715 xerD   TRUE 0.972 -3.000 0.111 NA   NA
 3594990 3594991 SSU98_1715 SSU98_1716     TRUE 0.958 -3.000 0.034 NA   NA
 3594991 3594992 SSU98_1716 SSU98_1717     TRUE 0.895 -27.000 0.004 1.000   NA
 3594992 3594993 SSU98_1717 SSU98_1718     TRUE 0.942 -3.000 0.034 1.000 N NA
 3594993 3594994 SSU98_1718 SSU98_1719     FALSE 0.467 90.000 0.014 1.000   NA
 3594994 3594995 SSU98_1719 SSU98_1720     TRUE 0.518 100.000 0.051 1.000   NA
 3594997 3594998 SSU98_1722 SSU98_1723     FALSE 0.378 224.000 0.123 NA   NA
 3594998 3594999 SSU98_1723 SSU98_1725     TRUE 0.728 47.000 0.043 1.000   NA
 3595000 3595001 SSU98_1724 SSU98_1726     TRUE 0.726 9.000 0.000 NA   NA
 3595001 3595002 SSU98_1726 SSU98_1727     TRUE 0.950 4.000 0.154 1.000 N NA
 3595002 3595003 SSU98_1727 SSU98_1728     TRUE 0.939 -103.000 0.000 0.001   NA
 3595004 3595005 SSU98_1729 SSU98_1730 greA   TRUE 0.593 74.000 0.079 NA   NA
 3595005 3595006 SSU98_1730 SSU98_1731     TRUE 0.651 72.000 0.120 NA   NA
 3595006 3595007 SSU98_1731 SSU98_1732   murC TRUE 0.883 -52.000 0.014 1.000   NA
 3595007 3595008 SSU98_1732 SSU98_1733 murC   TRUE 0.929 2.000 0.013 NA   NA
 3595008 3595009 SSU98_1733 SSU98_1734     TRUE 0.673 79.000 0.151 NA   NA
 3595009 3595010 SSU98_1734 SSU98_1735     FALSE 0.262 62.000 0.000 NA   NA
 3595010 3595011 SSU98_1735 SSU98_1736     TRUE 0.653 -72.000 0.000 NA   NA
 3595011 3595012 SSU98_1736 SSU98_1737     TRUE 0.809 2.000 0.000 NA   NA
 3595012 3595013 SSU98_1737 SSU98_1738   engA FALSE 0.239 68.000 0.000 NA   NA
 3595013 3595014 SSU98_1738 SSU98_1739 engA   TRUE 0.819 19.000 0.005 1.000   NA
 3595014 3595015 SSU98_1739 SSU98_1740     FALSE 0.275 185.000 0.048 NA N NA
 3595015 3595016 SSU98_1740 SSU98_1741     TRUE 0.997 0.000 0.817 NA Y NA
 3595016 3595017 SSU98_1741 SSU98_1742     TRUE 0.951 -13.000 0.109 NA N NA
 3595017 3595018 SSU98_1742 SSU98_1743     FALSE 0.227 72.000 0.000 NA   NA
 3595018 3595019 SSU98_1743 SSU98_1744     FALSE 0.199 90.000 0.000 NA   NA
 3595019 3595020 SSU98_1744 SSU98_1745     FALSE 0.353 82.000 0.012 1.000 N NA
 3595020 3595021 SSU98_1745 SSU98_1746     FALSE 0.359 97.000 0.002 NA   NA
 3595021 3595022 SSU98_1746 SSU98_1747     TRUE 0.705 10.000 0.000 NA   NA
 3595022 3595023 SSU98_1747 SSU98_1748     TRUE 0.925 14.000 0.117 NA   NA
 3595023 3595024 SSU98_1748 SSU98_1749     TRUE 0.623 18.000 0.000 NA   NA
 3595024 3595025 SSU98_1749 SSU98_1750     FALSE 0.214 79.000 0.000 NA   NA
 3595025 3595026 SSU98_1750 SSU98_1751     TRUE 0.632 -105.000 0.000 NA   NA
 3595026 3595027 SSU98_1751 SSU98_1752   mraY FALSE 0.195 92.000 0.000 NA   NA
 3595027 3595028 SSU98_1752 SSU98_1753 mraY   TRUE 0.980 2.000 0.038 1.000 Y NA
 3595028 3595029 SSU98_1753 SSU98_1754     TRUE 0.986 0.000 0.456 1.000 N NA
 3595029 3595030 SSU98_1754 SSU98_1755   mraW TRUE 0.890 11.000 0.077 1.000 N NA
 3595031 3595032 SSU98_1756 SSU98_1757     TRUE 0.687 11.000 0.000 NA   NA
 3595032 3595033 SSU98_1757 SSU98_1758     TRUE 0.653 15.000 0.000 NA   NA
 3595033 3595034 SSU98_1758 SSU98_1759     TRUE 0.687 11.000 0.000 NA   NA
 3595034 3595035 SSU98_1759 SSU98_1760     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 3595035 3595036 SSU98_1760 SSU98_1761     TRUE 0.838 -10.000 0.000 NA   NA
 3595036 3595037 SSU98_1761 SSU98_1762     FALSE 0.372 47.000 0.000 NA   NA
 3595038 3595039 SSU98_1763 SSU98_1764     TRUE 0.996 -28.000 1.000 1.000 Y NA
 3595039 3595040 SSU98_1764 SSU98_1765     TRUE 0.518 36.000 0.000 1.000   NA
 3595040 3595041 SSU98_1765 SSU98_1766     FALSE 0.214 79.000 0.000 NA   NA
 3595041 3595042 SSU98_1766 SSU98_1767     TRUE 0.765 -25.000 0.000 NA   NA
 3595042 3595043 SSU98_1767 SSU98_1768     FALSE 0.442 19.000 0.000 1.000 N NA
 3595044 3595045 SSU98_1769 SSU98_1770     FALSE 0.070 246.000 0.000 NA   NA
 3595045 3595046 SSU98_1770 SSU98_1771     TRUE 0.997 12.000 0.490 0.003 Y NA
 3595046 3595047 SSU98_1771 SSU98_1772     FALSE 0.019 321.000 0.000 1.000 N NA
 3595048 3595049 SSU98_1773 SSU98_1774     FALSE 0.017 449.000 0.000 NA   NA
 3595049 3595050 SSU98_1774 SSU98_1775   glyS TRUE 0.892 10.000 0.020 NA   NA
 3595050 3595051 SSU98_1775 SSU98_1776 glyS glyQ TRUE 0.999 0.000 0.651 0.001 Y NA
 3595051 3595052 SSU98_1776 SSU98_1777 glyQ   FALSE 0.040 311.000 0.000 NA   NA
 3595052 3595053 SSU98_1777 SSU98_1778     FALSE 0.060 267.000 0.000 NA   NA
 3595053 3595054 SSU98_1778 SSU98_1779     FALSE 0.124 182.000 0.000 NA   NA
 3595054 3595055 SSU98_1779 SSU98_1780     TRUE 0.998 1.000 0.938 1.000 Y NA
 3595055 3595056 SSU98_1780 SSU98_1781     TRUE 0.949 -16.000 0.104 1.000 N NA
 3595056 3595057 SSU98_1781 SSU98_1782     FALSE 0.060 157.000 0.000 NA N NA
 3595057 3595058 SSU98_1782 SSU98_1783     FALSE 0.152 150.000 0.000 NA   NA
 3595059 3595060 SSU98_1784 SSU98_1785     TRUE 0.993 4.000 0.050 0.002 Y NA
 3595062 3595063 SSU98_1787 SSU98_1788     FALSE 0.174 150.000 0.000 1.000   NA
 3595063 3595064 SSU98_1788 SSU98_1789     TRUE 0.996 32.000 0.943 0.020 Y NA
 3595064 3595065 SSU98_1789 SSU98_1790     TRUE 0.997 18.000 0.812 0.020 Y NA
 3595065 3595066 SSU98_1790 SSU98_1791     TRUE 0.890 60.000 0.583 NA   NA
 3595066 3595067 SSU98_1791 SSU98_1792     FALSE 0.381 89.000 0.003 NA   NA
 3595068 3595069 SSU98_1793 SSU98_1794     TRUE 0.926 45.000 0.011 0.060 Y NA
 3595069 3595070 SSU98_1794 SSU98_1795     TRUE 0.781 108.000 0.000 0.005 Y NA
 3595070 3595071 SSU98_1795 SSU98_1796     TRUE 0.970 -7.000 0.104 NA   NA
 3595073 3595074 SSU98_1798 SSU98_1799     FALSE 0.017 444.000 0.000 NA   NA
 3595074 3595075 SSU98_1799 SSU98_1800     TRUE 0.846 -7.000 0.000 NA   NA
 3595075 3595076 SSU98_1800 SSU98_1801     FALSE 0.287 64.000 0.000 1.000   NA
 3595076 3595077 SSU98_1801 SSU98_1802     TRUE 0.998 -3.000 0.234 0.001 Y NA
 3595077 3595078 SSU98_1802 SSU98_1803     TRUE 0.990 15.000 0.090 0.002 Y NA
 3595078 3595079 SSU98_1803 SSU98_1804     FALSE 0.361 294.000 0.045 1.000 Y NA
 3595079 3595080 SSU98_1804 SSU98_1805     TRUE 0.995 -3.000 0.047 0.006 Y NA
 3595080 3595081 SSU98_1805 SSU98_1806     TRUE 0.985 1.000 0.074 1.000 Y NA
 3595081 3595082 SSU98_1806 SSU98_1807   fabG TRUE 0.943 26.000 0.056 1.000 Y NA
 3595082 3595083 SSU98_1807 SSU98_1808 fabG   TRUE 0.997 10.000 0.432 0.006 Y NA
 3595083 3595084 SSU98_1808 SSU98_1809     TRUE 0.970 -10.000 0.099 1.000   NA
 3595084 3595085 SSU98_1809 SSU98_1810   acpP TRUE 0.610 173.000 0.216 1.000   NA
 3595085 3595086 SSU98_1810 SSU98_1811 acpP   TRUE 0.874 60.000 0.065 0.006   NA
 3595086 3595087 SSU98_1811 SSU98_1812     TRUE 0.954 -3.000 0.070 1.000 N NA
 3595087 3595088 SSU98_1812 SSU98_1813     FALSE 0.306 212.000 0.098 1.000 N NA
 3595088 3595089 SSU98_1813 SSU98_1814     FALSE 0.069 436.000 0.000 0.046   NA
 3595091 3595092 SSU98_1816 SSU98_1817 alr acpS TRUE 0.957 -7.000 0.093 1.000 N NA
 3595092 3595093 SSU98_1817 SSU98_1818 acpS secA FALSE 0.298 115.000 0.008 1.000 N NA
 3595093 3595094 SSU98_1818 SSU98_1819 secA   FALSE 0.040 311.000 0.000 NA   NA
 3595094 3595095 SSU98_1819 SSU98_1820     FALSE 0.011 609.000 0.000 NA   NA
 3595095 3595096 SSU98_1820 SSU98_1821     TRUE 0.874 80.000 0.235 1.000 Y NA
 3595097 3595098 SSU98_1822 SSU98_1823     TRUE 0.984 -19.000 0.571 1.000 N NA
 3595099 3595100 SSU98_1824 SSU98_1825 nusB   TRUE 0.981 -13.000 0.265 NA   NA
 3595100 3595101 SSU98_1825 SSU98_1826     TRUE 0.827 28.000 0.031 NA   NA
 3595101 3595102 SSU98_1826 SSU98_1827     FALSE 0.198 315.000 0.160 1.000 N NA
 3595102 3595103 SSU98_1827 SSU98_1828   uvrA FALSE 0.303 99.000 0.008 1.000 N NA
 3595104 3595105 SSU98_1829 SSU98_1830     TRUE 0.898 16.000 0.072 NA   NA
 3595106 3595107 SSU98_1831 SSU98_1832 rpsR   TRUE 0.683 33.000 0.012 1.000 N NA
 3595107 3595108 SSU98_1832 SSU98_1833   rpsF TRUE 0.816 12.000 0.012 1.000 N NA
 3595112 3595113 SSU98_1837 SSU98_1838     FALSE 0.205 274.000 0.000 1.000 Y NA
 3595113 3595114 SSU98_1838 SSU98_1839     FALSE 0.261 342.000 0.000 0.046 Y NA
 3595114 3595115 SSU98_1839 SSU98_1840     TRUE 0.932 287.000 0.769 0.001 Y NA
 3595117 3595118 SSU98_1842 SSU98_1843     TRUE 0.826 -13.000 0.000 NA   NA
 3595120 3595121 SSU98_1845 SSU98_1846     FALSE 0.381 46.000 0.000 NA   NA
 3595121 3595122 SSU98_1846 SSU98_1847     FALSE 0.092 234.000 0.000 1.000   NA
 3595122 3595123 SSU98_1847 SSU98_1848   infB TRUE 0.913 99.000 0.530 1.000 Y NA
 3595123 3595124 SSU98_1848 SSU98_1849 infB   TRUE 0.974 18.000 0.223 NA Y NA
 3595124 3595125 SSU98_1849 SSU98_1850     TRUE 0.981 -13.000 0.408 NA N NA
 3595125 3595126 SSU98_1850 SSU98_1851   nusA TRUE 0.981 17.000 0.323 NA Y NA