MicrobesOnline Operon Predictions for Stenotrophomonas maltophilia R551-3

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7078737 7078738 Smal_0001 Smal_0002 dnaA   FALSE 0.458 277.000 0.328 1.000 Y NA
 7078738 7078739 Smal_0002 Smal_0003   recF FALSE 0.391 998.000 0.318 1.000 Y NA
 7078739 7078740 Smal_0003 Smal_0004 recF gyrB TRUE 0.881 113.000 0.249 0.005 Y NA
 7078740 7078741 Smal_0004 Smal_0005 gyrB   FALSE 0.320 68.000 0.005 NA   NA
 7078741 7078742 Smal_0005 Smal_0006     FALSE 0.538 72.000 0.079 NA   NA
 7078742 7078743 Smal_0006 Smal_0007     FALSE 0.065 133.000 0.000 1.000   NA
 7078743 7078744 Smal_0007 Smal_0008     FALSE 0.051 144.000 0.000 1.000   NA
 7078744 7078745 Smal_0008 Smal_0009     TRUE 0.830 96.000 0.600 0.026 N NA
 7078745 7078746 Smal_0009 Smal_0010     TRUE 0.971 61.000 0.600 0.066 Y NA
 7078746 7078747 Smal_0010 Smal_0011     TRUE 0.998 4.000 0.857 0.053 Y NA
 7078747 7078748 Smal_0011 Smal_0012     FALSE 0.003 151.000 0.000 1.000 N NA
 7078748 7078749 Smal_0012 Smal_0013     TRUE 0.879 41.000 0.417 NA   NA
 7078749 7078750 Smal_0013 Smal_0014     TRUE 0.816 10.000 0.009 NA   NA
 7078750 7078751 Smal_0014 Smal_0015     FALSE 0.068 144.000 0.000 0.031 N NA
 7078751 7078752 Smal_0015 Smal_0016     FALSE 0.002 171.000 0.000 NA N NA
 7078752 7078753 Smal_0016 Smal_0017     FALSE 0.184 195.000 0.000 NA Y NA
 7078753 7078754 Smal_0017 Smal_0018     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7078755 7078756 Smal_0019 Smal_0020     FALSE 0.102 108.000 0.000 NA   NA
 7078756 7078757 Smal_0020 Smal_0021     FALSE 0.001 333.000 0.000 1.000 N NA
 7078760 7078761 Smal_0024 Smal_0025     FALSE 0.148 155.000 0.043 NA   NA
 7078761 7078762 Smal_0025 Smal_0026     TRUE 0.736 4.000 0.000 1.000   NA
 7078763 7078764 Smal_0027 Smal_0028     FALSE 0.035 158.000 0.000 NA   NA
 7078764 7078765 Smal_0028 Smal_0029     FALSE 0.150 97.000 0.000 1.000   NA
 7078765 7078766 Smal_0029 Smal_0030     FALSE 0.095 116.000 0.000 1.000   NA
 7078769 7078770 Smal_0033 Smal_0034     FALSE 0.040 148.000 0.000 NA   NA
 7078771 7078772 Smal_0035 Smal_0036     FALSE 0.014 285.000 0.000 NA   NA
 7078775 7078776 Smal_0039 Smal_0040     TRUE 0.982 12.000 0.846 NA   NA
 7078778 7078779 Smal_0042 Smal_0043     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7078779 7078780 Smal_0043 Smal_0044     FALSE 0.017 231.000 0.000 NA   NA
 7078780 7078781 Smal_0044 Smal_0045     FALSE 0.169 71.000 0.000 NA   NA
 7078781 7078782 Smal_0045 Smal_0046   mdoD FALSE 0.094 106.000 0.003 1.000 N NA
 7078783 7078784 Smal_0047 Smal_0048     TRUE 0.667 10.000 0.000 1.000   NA
 7078784 7078785 Smal_0048 Smal_0049     TRUE 0.613 36.000 0.000 0.019   NA
 7078786 7078787 Smal_0050 Smal_0051     FALSE 0.001 262.000 0.000 NA N NA
 7078789 7078790 Smal_0053 Smal_0054     TRUE 0.936 -3.000 0.008 1.000   NA
 7078790 7078791 Smal_0054 Smal_0055     FALSE 0.013 399.000 0.000 NA   NA
 7078791 7078792 Smal_0055 Smal_0056     TRUE 0.937 0.000 0.043 NA   NA
 7078794 7078795 Smal_0058 Smal_0059   rdgC FALSE 0.358 37.000 0.012 NA N NA
 7078795 7078796 Smal_0059 Smal_0060 rdgC   TRUE 0.635 60.000 0.121 NA   NA
 7078799 7078800 Smal_0063 Smal_0064 gltD gltB TRUE 0.872 86.000 0.032 0.001 Y NA
 7078800 7078801 Smal_0064 Smal_0065 gltB   FALSE 0.076 176.000 0.011 1.000   NA
 7078804 7078805 Smal_0068 Smal_0069     FALSE 0.076 120.000 0.000 NA   NA
 7078805 7078806 Smal_0069 Smal_0070     TRUE 0.740 1.000 0.000 NA   NA
 7078807 7078808 Smal_0071 Smal_0072     FALSE 0.003 145.000 0.000 1.000 N NA
 7078809 7078810 Smal_0073 Smal_0074     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7078810 7078811 Smal_0074 Smal_0075     TRUE 0.921 18.000 0.250 NA   NA
 7078811 7078812 Smal_0075 Smal_0076     FALSE 0.007 108.000 0.000 1.000 N NA
 7078812 7078813 Smal_0076 Smal_0077     TRUE 0.995 4.000 0.500 NA Y NA
 7078814 7078815 Smal_0078 Smal_0079     FALSE 0.204 67.000 0.000 1.000   NA
 7078815 7078816 Smal_0079 Smal_0080     TRUE 0.982 -3.000 0.185 1.000   NA
 7078817 7078818 Smal_0081 Smal_0082     FALSE 0.285 40.000 0.000 NA   NA
 7078819 7078820 Smal_0083 Smal_0084     TRUE 0.995 -3.000 0.724 NA   NA
 7078820 7078821 Smal_0084 Smal_0085     TRUE 0.980 -3.000 0.172 NA   NA
 7078821 7078822 Smal_0085 Smal_0086     TRUE 0.979 -3.000 0.161 NA   NA
 7078822 7078823 Smal_0086 Smal_0087     TRUE 0.950 8.000 0.193 NA   NA
 7078823 7078824 Smal_0087 Smal_0088     TRUE 0.900 17.000 0.168 NA   NA
 7078824 7078825 Smal_0088 Smal_0089     TRUE 0.991 0.000 0.720 NA   NA
 7078825 7078826 Smal_0089 Smal_0090     TRUE 0.890 22.000 0.200 NA   NA
 7078826 7078827 Smal_0090 Smal_0091     FALSE 0.386 28.000 0.000 NA   NA
 7078829 7078830 Smal_0093 Smal_0094     TRUE 0.703 4.000 0.000 NA   NA
 7078830 7078831 Smal_0094 Smal_0095     FALSE 0.002 158.000 0.000 1.000 N NA
 7078834 7078835 Smal_0098 Smal_0099     TRUE 0.591 38.000 0.079 NA N NA
 7078835 7078836 Smal_0099 Smal_0100     TRUE 0.928 5.000 0.083 NA   NA
 7078836 7078837 Smal_0100 Smal_0101     TRUE 0.975 -3.000 0.128 NA   NA
 7078837 7078838 Smal_0101 Smal_0102     TRUE 0.874 10.000 0.107 NA N NA
 7078838 7078839 Smal_0102 Smal_0103     FALSE 0.129 121.000 0.023 NA N NA
 7078839 7078840 Smal_0103 Smal_0104     TRUE 0.878 8.000 0.023 NA   NA
 7078840 7078841 Smal_0104 Smal_0105     FALSE 0.204 57.000 0.000 NA   NA
 7078841 7078842 Smal_0105 Smal_0106     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7078843 7078844 Smal_0107 Smal_0108     FALSE 0.435 74.000 0.100 NA N NA
 7078845 7078846 Smal_0109 Smal_0110     FALSE 0.134 270.000 0.000 1.000 Y NA
 7078846 7078847 Smal_0110 Smal_0111     TRUE 0.703 22.000 0.048 1.000 N NA
 7078847 7078848 Smal_0111 Smal_0112     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA N NA
 7078848 7078849 Smal_0112 Smal_0113     TRUE 0.621 107.000 0.300 NA   NA
 7078849 7078850 Smal_0113 Smal_0114     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7078850 7078851 Smal_0114 Smal_0115     FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 7078852 7078853 Smal_0116 Smal_0117     TRUE 0.992 -12.000 0.222 0.040   NA
 7078854 7078855 Smal_0118 Smal_0119     FALSE 0.181 66.000 0.000 NA   NA
 7078855 7078856 Smal_0119 Smal_0120     FALSE 0.099 109.000 0.000 NA   NA
 7078856 7078857 Smal_0120 Smal_0121     FALSE 0.159 80.000 0.000 NA   NA
 7078857 7078858 Smal_0121 Smal_0122     FALSE 0.006 116.000 0.000 1.000 N NA
 7078858 7078859 Smal_0122 Smal_0123     TRUE 0.998 -7.000 0.587 1.000 Y NA
 7078859 7078860 Smal_0123 Smal_0124     FALSE 0.145 94.000 0.007 1.000 N NA
 7078860 7078861 Smal_0124 Smal_0125     TRUE 0.984 32.000 0.375 0.002 Y NA
 7078862 7078863 Smal_0126 Smal_0127     FALSE 0.130 97.000 0.000 NA   NA
 7078865 7078866 Smal_0129 Smal_0130     TRUE 0.996 7.000 0.765 1.000 Y NA
 7078866 7078867 Smal_0130 Smal_0131     TRUE 0.926 104.000 0.600 1.000 Y NA
 7078868 7078869 Smal_0132 Smal_0133     TRUE 0.689 33.000 0.035 NA   NA
 7078869 7078870 Smal_0133 Smal_0134     FALSE 0.463 58.000 0.019 NA   NA
 7078870 7078871 Smal_0134 Smal_0135     FALSE 0.422 101.000 0.158 NA N NA
 7078871 7078872 Smal_0135 Smal_0136   gpsA TRUE 0.585 21.000 0.015 1.000 N NA
 7078875 7078876 Smal_0139 Smal_0140     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 7078876 7078877 Smal_0140 Smal_0141     FALSE 0.012 434.000 0.000 NA   NA
 7078877 7078878 Smal_0141 Smal_0142     FALSE 0.035 157.000 0.000 NA   NA
 7078878 7078879 Smal_0142 Smal_0143     FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 7078880 7078881 Smal_0144 Smal_0145     FALSE 0.082 122.000 0.000 1.000   NA
 7078881 7078882 Smal_0145 Smal_0146     TRUE 0.574 69.000 0.100 NA   NA
 7078882 7078883 Smal_0146 Smal_0147     FALSE 0.068 124.000 0.000 NA   NA
 7078883 7078884 Smal_0147 Smal_0148     FALSE 0.147 86.000 0.000 NA   NA
 7078885 7078886 Smal_0149 Smal_0150     TRUE 0.923 9.000 0.186 1.000 N NA
 7078886 7078887 Smal_0150 Smal_0151     FALSE 0.043 276.000 0.014 NA   NA
 7078887 7078888 Smal_0151 Smal_0152     FALSE 0.060 130.000 0.000 NA   NA
 7078888 7078889 Smal_0152 Smal_0153     FALSE 0.016 249.000 0.000 NA   NA
 7078889 7078890 Smal_0153 Smal_0154     FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 7078890 7078891 Smal_0154 Smal_0155     FALSE 0.022 199.000 0.000 NA   NA
 7078893 7078894 Smal_0157 Smal_0158     TRUE 0.783 66.000 0.000 0.047 Y NA
 7078897 7078898 Smal_0161 Smal_0162     TRUE 0.953 12.000 0.318 NA   NA
 7078899 7078900 Smal_0163 Smal_0164     FALSE 0.329 70.000 0.007 NA   NA
 7078901 7078902 Smal_0165 Smal_0166     FALSE 0.020 205.000 0.000 NA   NA
 7078902 7078903 Smal_0166 Smal_0167     FALSE 0.427 104.000 0.078 NA   NA
 7078903 7078904 Smal_0167 Smal_0168     TRUE 0.603 117.000 0.377 NA   NA
 7078906 7078907 Smal_0170 Smal_0171     TRUE 0.987 -3.000 0.418 1.000 N NA
 7078907 7078908 Smal_0171 Smal_0172     FALSE 0.501 83.000 0.070 NA   NA
 7078910 7078911 Smal_0174 Smal_0175   ubiB TRUE 0.991 -3.000 0.432 1.000   NA
 7078911 7078912 Smal_0175 Smal_0176 ubiB   TRUE 0.710 6.000 0.000 1.000   NA
 7078912 7078913 Smal_0176 Smal_0177     FALSE 0.118 108.000 0.000 1.000   NA
 7078915 7078916 Smal_0179 Smal_0180     TRUE 0.876 5.000 0.014 1.000   NA
 7078916 7078917 Smal_0180 Smal_0181     FALSE 0.006 112.000 0.000 1.000 N NA
 7078918 7078919 Smal_0182 Smal_0183     TRUE 0.985 4.000 0.600 NA   NA
 7078920 7078921 Smal_0184 Smal_0185     FALSE 0.016 58.000 0.000 1.000 N NA
 7078922 7078923 Smal_0186 Smal_0187     FALSE 0.190 277.000 0.000 0.079 Y NA
 7078924 7078925 Smal_0188 Smal_0189     TRUE 0.796 65.000 0.016 1.000 Y NA
 7078925 7078926 Smal_0189 Smal_0190     FALSE 0.001 420.000 0.000 1.000 N NA
 7078926 7078927 Smal_0190 Smal_0191     TRUE 0.949 17.000 0.000 0.011 Y NA
 7078930 7078931 Smal_0194 Smal_0195     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7078931 7078932 Smal_0195 Smal_0196     FALSE 0.013 401.000 0.000 NA   NA
 7078932 7078933 Smal_0196 Smal_0197     TRUE 0.958 27.000 0.158 1.000 Y NA
 7078933 7078934 Smal_0197 Smal_0198     TRUE 0.988 11.000 0.316 1.000 Y NA
 7078935 7078936 Smal_0199 Smal_0200     FALSE 0.001 206.000 0.000 1.000 N NA
 7078936 7078937 Smal_0200 Smal_0201     FALSE 0.179 184.000 0.158 NA   NA
 7078939 7078940 Smal_0203 Smal_0204     TRUE 0.954 -3.000 0.026 NA   NA
 7078942 7078943 Smal_0206 Smal_0207     TRUE 0.944 130.000 0.917 0.001 Y NA
 7078945 7078946 Smal_0209 Smal_0210     FALSE 0.016 56.000 0.000 NA N NA
 7078946 7078947 Smal_0210 Smal_0211     FALSE 0.084 155.000 0.031 1.000 N NA
 7078950 7078951 Smal_0214 Smal_0215     FALSE 0.353 56.000 0.004 NA   NA
 7078953 7078954 Smal_0217 Smal_0218     FALSE 0.014 298.000 0.000 NA   NA
 7078955 7078956 Smal_0219 Smal_0220     TRUE 0.679 15.000 0.019 1.000 N NA
 7078956 7078957 Smal_0220 Smal_0221     TRUE 0.996 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 7078957 7078958 Smal_0221 Smal_0222     TRUE 0.999 -3.000 0.627 0.002 Y NA
 7078958 7078959 Smal_0222 Smal_0223     TRUE 0.998 -3.000 0.687 1.000 Y NA
 7078960 7078961 Smal_0224 Smal_0225     FALSE 0.006 112.000 0.000 1.000 N NA
 7078962 7078963 Smal_0226 Smal_0227     FALSE 0.001 762.000 0.000 1.000 N NA
 7078963 7078964 Smal_0227 Smal_0228     FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 7078964 7078965 Smal_0228 Smal_0229     TRUE 0.609 74.000 0.143 NA   NA
 7078965 7078966 Smal_0229 Smal_0230     TRUE 0.970 23.000 0.214 1.000 Y NA
 7078967 7078968 Smal_0231 Smal_0232     TRUE 0.961 -33.000 0.020 NA   NA
 7078969 7078970 Smal_0233 Smal_0234     TRUE 0.967 -3.000 0.147 1.000 N NA
 7078970 7078971 Smal_0234 Smal_0235     TRUE 0.792 10.000 0.005 NA   NA
 7078971 7078972 Smal_0235 Smal_R0001     FALSE 0.277 41.000 0.000 NA   NA
 7078972 7078973 Smal_R0001 Smal_0236     FALSE 0.025 184.000 0.000 NA   NA
 7078973 7078974 Smal_0236 Smal_0237     TRUE 0.683 59.000 0.167 NA   NA
 7078974 7078975 Smal_0237 Smal_0238     FALSE 0.001 803.000 0.000 1.000 N NA
 7078975 7078976 Smal_0238 Smal_0239     FALSE 0.038 163.000 0.000 1.000   NA
 7078976 7078977 Smal_0239 Smal_0240     FALSE 0.021 204.000 0.000 NA   NA
 7078979 7078980 Smal_0242 Smal_0243     FALSE 0.123 139.000 0.011 NA   NA
 7078980 7078981 Smal_0243 Smal_0244     FALSE 0.100 156.000 0.014 NA   NA
 7078981 7078982 Smal_0244 Smal_0245     FALSE 0.289 106.000 0.014 1.000   NA
 7078983 7078984 Smal_0246 Smal_0247     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7078985 7078986 Smal_0248 Smal_0249     TRUE 0.924 -3.000 0.006 NA   NA
 7078987 7078988 Smal_0250 Smal_0251     FALSE 0.013 371.000 0.000 NA   NA
 7078988 7078989 Smal_0251 Smal_0252     TRUE 0.970 14.000 0.820 NA N NA
 7078989 7078990 Smal_0252 Smal_0253     TRUE 0.969 15.000 0.839 NA N NA
 7078990 7078991 Smal_0253 Smal_0254     TRUE 0.788 103.000 0.810 1.000 N NA
 7078992 7078993 Smal_0255 Smal_0256     TRUE 0.989 -3.000 0.357 NA   NA
 7078993 7078994 Smal_0256 Smal_0257     TRUE 0.668 7.000 0.000 NA   NA
 7078994 7078995 Smal_0257 Smal_0258     TRUE 0.997 -3.000 0.270 0.039 Y NA
 7078996 7078997 Smal_0259 Smal_0260     TRUE 0.996 -3.000 0.719 0.047   NA
 7078997 7078998 Smal_0260 Smal_0261     FALSE 0.061 136.000 0.000 1.000   NA
 7078998 7078999 Smal_0261 Smal_0262     TRUE 0.904 4.000 0.022 1.000   NA
 7078999 7079000 Smal_0262 Smal_0263     TRUE 0.641 32.000 0.018 NA   NA
 7079000 7079001 Smal_0263 Smal_0264     TRUE 0.813 68.000 0.455 NA   NA
 7079001 7079002 Smal_0264 Smal_0265     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 7079002 7079003 Smal_0265 Smal_0266     TRUE 0.987 9.000 0.857 NA   NA
 7079003 7079004 Smal_0266 Smal_0267     TRUE 0.569 102.000 0.192 NA   NA
 7079005 7079006 Smal_0268 Smal_0269     FALSE 0.102 108.000 0.000 NA   NA
 7079008 7079009 Smal_0271 Smal_0272     FALSE 0.028 191.000 0.000 1.000   NA
 7079016 7079017 Smal_0279 Smal_0280   argS TRUE 0.708 22.000 0.062 NA N NA
 7079017 7079018 Smal_0280 Smal_0281 argS radC FALSE 0.080 115.000 0.005 1.000 N NA
 7079021 7079022 Smal_0284 Smal_0285   dut TRUE 0.975 -3.000 0.201 1.000 N NA
 7079022 7079023 Smal_0285 Smal_0286 dut   TRUE 0.775 13.000 0.039 1.000 N NA
 7079024 7079025 Smal_0287 Smal_0288     TRUE 0.998 -19.000 0.379 1.000 Y NA
 7079025 7079026 Smal_0288 Smal_0289     FALSE 0.495 37.000 0.026 1.000 N NA
 7079026 7079027 Smal_0289 Smal_0290     TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.001 Y NA
 7079027 7079028 Smal_0290 Smal_0291     TRUE 0.990 11.000 0.145 0.001 Y NA
 7079028 7079029 Smal_0291 Smal_0292     TRUE 0.875 13.000 0.071 NA   NA
 7079029 7079030 Smal_0292 Smal_0293     FALSE 0.018 220.000 0.000 NA   NA
 7079030 7079031 Smal_0293 Smal_0294   pyrE TRUE 0.749 20.000 0.018 NA   NA
 7079032 7079033 Smal_0295 Smal_0296     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079033 7079034 Smal_0296 Smal_0297     FALSE 0.160 79.000 0.000 NA   NA
 7079035 7079036 Smal_0298 Smal_0299 anmK   TRUE 0.613 56.000 0.184 NA N NA
 7079037 7079038 Smal_0300 Smal_R0002     FALSE 0.012 528.000 0.000 NA   NA
 7079038 7079039 Smal_R0002 Smal_R0003     FALSE 0.137 93.000 0.000 NA   NA
 7079039 7079040 Smal_R0003 Smal_R0004     FALSE 0.361 31.000 0.000 NA   NA
 7079040 7079041 Smal_R0004 Smal_R0005     FALSE 0.018 227.000 0.000 NA   NA
 7079041 7079042 Smal_R0005 Smal_R0006     FALSE 0.063 127.000 0.000 NA   NA
 7079042 7079043 Smal_R0006 Smal_R0007     FALSE 0.012 509.000 0.000 NA   NA
 7079043 7079044 Smal_R0007 Smal_R0008     FALSE 0.137 93.000 0.000 NA   NA
 7079044 7079045 Smal_R0008 Smal_R0009     FALSE 0.361 31.000 0.000 NA   NA
 7079045 7079046 Smal_R0009 Smal_R0010     FALSE 0.018 227.000 0.000 NA   NA
 7079046 7079047 Smal_R0010 Smal_R0011     FALSE 0.065 126.000 0.000 NA   NA
 7079047 7079048 Smal_R0011 Smal_R0012     FALSE 0.056 133.000 0.000 NA   NA
 7079049 7079050 Smal_0301 Smal_0302     FALSE 0.451 87.000 0.049 NA   NA
 7079051 7079052 Smal_0303 Smal_0304     TRUE 0.704 109.000 0.408 0.038 N NA
 7079054 7079055 Smal_0306 Smal_0307     FALSE 0.191 86.000 0.000 0.063 N NA
 7079057 7079058 Smal_0309 Smal_0310     TRUE 0.865 12.000 0.042 NA   NA
 7079058 7079059 Smal_0310 Smal_0311     TRUE 0.981 60.000 0.741 0.002 Y NA
 7079059 7079060 Smal_0311 Smal_0312     TRUE 0.839 9.000 0.012 NA   NA
 7079060 7079061 Smal_0312 Smal_0313     TRUE 0.935 -3.000 0.010 NA   NA
 7079061 7079062 Smal_0313 Smal_0314     TRUE 0.952 15.000 0.536 1.000 N NA
 7079064 7079065 Smal_0316 Smal_0317     TRUE 0.834 97.000 0.722 NA   NA
 7079065 7079066 Smal_0317 Smal_0318     TRUE 0.950 11.000 0.255 NA   NA
 7079066 7079067 Smal_0318 Smal_0319     TRUE 0.992 5.000 0.321 1.000 Y NA
 7079067 7079068 Smal_0319 Smal_0320     FALSE 0.023 192.000 0.000 NA   NA
 7079069 7079070 Smal_0321 Smal_0322     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 7079070 7079071 Smal_0322 Smal_0323   dnaG FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 7079071 7079072 Smal_0323 Smal_0324 dnaG   FALSE 0.371 61.000 0.006 1.000   NA
 7079072 7079073 Smal_0324 Smal_0325     FALSE 0.133 104.000 0.000 1.000   NA
 7079073 7079074 Smal_0325 Smal_0326   rpsU FALSE 0.489 133.000 0.173 0.022   NA
 7079077 7079078 Smal_0329 Smal_0330     FALSE 0.321 59.000 0.023 NA N NA
 7079078 7079079 Smal_0330 Smal_0331     FALSE 0.004 129.000 0.000 NA N NA
 7079079 7079080 Smal_0331 Smal_0332     FALSE 0.057 132.000 0.000 NA   NA
 7079083 7079084 Smal_0335 Smal_0336     FALSE 0.099 109.000 0.000 NA   NA
 7079084 7079085 Smal_0336 Smal_0337     TRUE 0.953 -3.000 0.024 NA   NA
 7079085 7079086 Smal_0337 Smal_0338     TRUE 0.773 16.000 0.016 NA   NA
 7079086 7079087 Smal_0338 Smal_0339     FALSE 0.001 422.000 0.000 1.000 N NA
 7079087 7079088 Smal_0339 Smal_0340     TRUE 0.965 -3.000 0.055 NA   NA
 7079089 7079090 Smal_0341 Smal_0342     FALSE 0.348 52.000 0.023 NA N NA
 7079090 7079091 Smal_0342 Smal_0343     TRUE 0.582 56.000 0.143 1.000 N NA
 7079091 7079092 Smal_0343 Smal_0344     TRUE 0.945 -67.000 0.031 1.000 N NA
 7079092 7079093 Smal_0344 Smal_0345     FALSE 0.017 233.000 0.000 NA   NA
 7079093 7079094 Smal_0345 Smal_0346     FALSE 0.017 233.000 0.000 NA   NA
 7079094 7079095 Smal_0346 Smal_0347     FALSE 0.152 96.000 0.000 1.000   NA
 7079095 7079096 Smal_0347 Smal_0348     TRUE 0.624 32.000 0.015 NA   NA
 7079096 7079097 Smal_0348 Smal_0349     FALSE 0.224 163.000 0.160 NA   NA
 7079100 7079101 Smal_0352 Smal_0353     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7079101 7079102 Smal_0353 Smal_0354     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7079102 7079103 Smal_0354 Smal_0355     FALSE 0.470 20.000 0.000 NA   NA
 7079103 7079104 Smal_0355 Smal_0356     FALSE 0.235 49.000 0.000 NA   NA
 7079104 7079105 Smal_0356 Smal_0357     FALSE 0.021 200.000 0.000 NA   NA
 7079106 7079107 Smal_0358 Smal_0359     TRUE 0.595 76.000 0.132 NA   NA
 7079109 7079110 Smal_0361 Smal_0362     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 7079111 7079112 Smal_0363 Smal_0364     TRUE 0.639 60.000 0.223 NA N NA
 7079113 7079114 Smal_0365 Smal_0366 aceE   FALSE 0.012 75.000 0.000 1.000 N NA
 7079115 7079116 Smal_0367 Smal_0368     FALSE 0.012 453.000 0.000 NA   NA
 7079116 7079117 Smal_0368 Smal_0369     FALSE 0.071 122.000 0.000 NA   NA
 7079117 7079118 Smal_0369 Smal_0370     FALSE 0.015 283.000 0.000 NA   NA
 7079119 7079120 Smal_0371 Smal_0372     FALSE 0.142 89.000 0.000 NA   NA
 7079120 7079121 Smal_0372 Smal_0373     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.006   NA
 7079121 7079122 Smal_0373 Smal_0374     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.006   NA
 7079122 7079123 Smal_0374 Smal_0375     FALSE 0.012 531.000 0.000 NA   NA
 7079123 7079124 Smal_0375 Smal_0376     TRUE 0.995 -3.000 0.844 NA   NA
 7079124 7079125 Smal_0376 Smal_0377     TRUE 0.992 0.000 0.833 NA   NA
 7079126 7079127 Smal_0378 Smal_0379     FALSE 0.386 28.000 0.000 NA   NA
 7079128 7079129 Smal_0380 Smal_0381     FALSE 0.031 166.000 0.000 NA   NA
 7079129 7079130 Smal_0381 Smal_0382     FALSE 0.044 144.000 0.000 NA   NA
 7079130 7079131 Smal_0382 Smal_0383     FALSE 0.161 78.000 0.000 NA   NA
 7079131 7079132 Smal_0383 Smal_0384     FALSE 0.277 41.000 0.000 NA   NA
 7079133 7079134 Smal_0385 Smal_0386     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7079135 7079136 Smal_0387 Smal_0388     FALSE 0.076 120.000 0.000 NA   NA
 7079136 7079137 Smal_0388 Smal_0389     FALSE 0.016 245.000 0.000 NA   NA
 7079137 7079138 Smal_0389 Smal_0390     FALSE 0.369 30.000 0.000 NA   NA
 7079138 7079139 Smal_0390 Smal_0391     FALSE 0.053 135.000 0.000 NA   NA
 7079140 7079141 Smal_0392 Smal_0393     FALSE 0.012 455.000 0.000 NA   NA
 7079141 7079142 Smal_0393 Smal_0394     FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 7079148 7079149 Smal_0400 Smal_0401     FALSE 0.019 241.000 0.000 1.000   NA
 7079150 7079151 Smal_0402 Smal_0403     FALSE 0.253 -3.000 0.000 NA N NA
 7079153 7079154 Smal_0405 Smal_0406     FALSE 0.014 319.000 0.000 NA   NA
 7079158 7079159 Smal_0410 Smal_0411     FALSE 0.170 70.000 0.000 NA   NA
 7079159 7079160 Smal_0411 Smal_0412     TRUE 0.677 35.000 0.037 NA   NA
 7079160 7079161 Smal_0412 Smal_0413     TRUE 0.765 24.000 0.037 NA   NA
 7079161 7079162 Smal_0413 Smal_0414     FALSE 0.246 46.000 0.000 NA   NA
 7079162 7079163 Smal_0414 Smal_0415     FALSE 0.102 108.000 0.000 NA   NA
 7079163 7079164 Smal_0415 Smal_0416     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 7079164 7079165 Smal_0416 Smal_0417     FALSE 0.053 135.000 0.000 NA   NA
 7079165 7079166 Smal_0417 Smal_0418     FALSE 0.507 17.000 0.000 NA   NA
 7079166 7079167 Smal_0418 Smal_0419     FALSE 0.013 382.000 0.000 NA   NA
 7079167 7079168 Smal_0419 Smal_0420     FALSE 0.022 213.000 0.000 1.000   NA
 7079168 7079169 Smal_0420 Smal_0421     TRUE 0.993 -10.000 0.268 0.038   NA
 7079169 7079170 Smal_0421 Smal_0422     TRUE 0.760 34.000 0.100 NA   NA
 7079174 7079175 Smal_0426 Smal_0427     TRUE 0.995 -3.000 0.188 NA Y NA
 7079179 7079180 Smal_0431 Smal_0432     TRUE 0.692 32.000 0.032 NA   NA
 7079180 7079181 Smal_0432 Smal_0433     FALSE 0.092 118.000 0.000 1.000   NA
 7079184 7079185 Smal_0436 Smal_0437     FALSE 0.545 14.000 0.000 NA   NA
 7079185 7079186 Smal_0437 Smal_0438   motB TRUE 0.609 132.000 0.571 NA   NA
 7079186 7079187 Smal_0438 Smal_0439 motB   TRUE 0.995 4.000 0.571 1.000 Y NA
 7079187 7079188 Smal_0439 Smal_0440     FALSE 0.010 92.000 0.000 1.000 N NA
 7079189 7079190 Smal_0441 Smal_0442     FALSE 0.024 188.000 0.000 NA   NA
 7079192 7079193 Smal_0444 Smal_0445   alr TRUE 0.967 -21.000 0.099 1.000 N NA
 7079195 7079196 Smal_0447 Smal_0448     TRUE 0.887 44.000 0.500 NA   NA
 7079198 7079199 Smal_0450 Smal_0451     TRUE 0.993 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 7079199 7079200 Smal_0451 Smal_0452     TRUE 0.967 -3.000 0.053 1.000   NA
 7079201 7079202 Smal_0453 Smal_0454     TRUE 0.996 0.000 0.451 1.000 Y NA
 7079204 7079205 Smal_0456 Smal_0457     FALSE 0.169 86.000 0.000 1.000   NA
 7079206 7079207 Smal_0458 Smal_0459     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079207 7079208 Smal_0459 Smal_0460     TRUE 0.615 32.000 0.000 0.068   NA
 7079211 7079212 Smal_0463 Smal_0464     TRUE 0.934 -3.000 0.009 NA   NA
 7079214 7079215 Smal_0466 Smal_0467     FALSE 0.001 206.000 0.000 1.000 N NA
 7079215 7079216 Smal_0467 Smal_0468     TRUE 0.973 15.000 0.130 1.000 Y NA
 7079216 7079217 Smal_0468 Smal_0469     TRUE 0.985 3.000 0.080 1.000 Y NA
 7079218 7079219 Smal_0470 Smal_0471     TRUE 0.998 -3.000 0.566 1.000 Y NA
 7079220 7079221 Smal_0472 Smal_0473     TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7079223 7079224 Smal_0475 Smal_0476     FALSE 0.257 117.000 0.028 NA   NA
 7079225 7079226 Smal_0477 Smal_0478     FALSE 0.188 75.000 0.000 1.000   NA
 7079227 7079228 Smal_0479 Smal_0480     FALSE 0.107 687.000 0.000 1.000 Y NA
 7079229 7079230 Smal_0481 Smal_0482     TRUE 0.947 15.000 0.495 1.000 N NA
 7079232 7079233 Smal_0484 Smal_0485     TRUE 0.995 -3.000 0.857 NA   NA
 7079233 7079234 Smal_0485 Smal_0486     FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 7079234 7079235 Smal_0486 Smal_0487     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7079235 7079236 Smal_0487 Smal_0488     FALSE 0.071 367.000 0.081 NA   NA
 7079236 7079237 Smal_0488 Smal_0489     TRUE 0.790 124.000 0.133 0.014 Y NA
 7079237 7079238 Smal_0489 Smal_0490     FALSE 0.253 -3.000 0.000 NA N NA
 7079238 7079239 Smal_0490 Smal_0491     TRUE 0.955 5.000 0.000 NA Y NA
 7079239 7079240 Smal_0491 Smal_0492     TRUE 0.770 1.000 0.000 1.000   NA
 7079240 7079241 Smal_0492 Smal_0493     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7079241 7079242 Smal_0493 Smal_0494     TRUE 0.896 20.000 0.000 NA Y NA
 7079245 7079246 Smal_0497 Smal_0498     TRUE 0.978 -3.000 0.143 1.000   NA
 7079246 7079247 Smal_0498 Smal_0499     TRUE 0.981 3.000 0.250 0.033   NA
 7079247 7079248 Smal_0499 Smal_0500     TRUE 0.973 -3.000 0.192 1.000 N NA
 7079248 7079249 Smal_0500 Smal_0501     FALSE 0.001 393.000 0.000 1.000 N NA
 7079249 7079250 Smal_0501 Smal_0502     TRUE 0.997 0.000 0.316 0.011 Y NA
 7079251 7079252 Smal_0503 Smal_0504     TRUE 0.985 15.000 0.143 0.004 Y NA
 7079252 7079253 Smal_0504 Smal_0505     TRUE 0.995 -3.000 0.163 1.000 Y NA
 7079253 7079254 Smal_0505 Smal_0506     TRUE 0.992 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 7079254 7079255 Smal_0506 Smal_0507     FALSE 0.462 119.000 0.000 1.000 Y NA
 7079256 7079257 Smal_0508 Smal_0509     TRUE 0.958 12.000 0.500 1.000 N NA
 7079258 7079259 Smal_0510 Smal_0511     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7079259 7079260 Smal_0511 Smal_0512     TRUE 0.876 -22.000 0.000 NA   NA
 7079260 7079261 Smal_0512 Smal_0513     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079261 7079262 Smal_0513 Smal_0514     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079262 7079263 Smal_0514 Smal_0515     TRUE 0.876 -25.000 0.000 NA   NA
 7079265 7079266 Smal_0517 Smal_0518     TRUE 0.992 2.000 0.070 0.001 Y NA
 7079269 7079270 Smal_0521 Smal_0522     TRUE 0.982 -3.000 0.201 NA   NA
 7079270 7079271 Smal_0522 Smal_0523     TRUE 0.991 4.000 0.275 NA Y NA
 7079271 7079272 Smal_0523 Smal_0524     TRUE 0.995 2.000 0.472 NA Y NA
 7079274 7079275 Smal_0526 Smal_0527     FALSE 0.040 223.000 0.004 1.000   NA
 7079275 7079276 Smal_0527 Smal_0528     FALSE 0.012 594.000 0.000 NA   NA
 7079277 7079278 Smal_0529 Smal_0530     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079278 7079279 Smal_0530 Smal_0531     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079280 7079281 Smal_0532 Smal_0533   valS FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 7079281 7079282 Smal_0533 Smal_0534 valS   FALSE 0.519 34.000 0.002 1.000   NA
 7079282 7079283 Smal_0534 Smal_0535     TRUE 0.694 20.000 0.006 1.000   NA
 7079283 7079284 Smal_0535 Smal_0536     TRUE 0.743 83.000 0.494 1.000 N NA
 7079285 7079286 Smal_0537 Smal_0538     TRUE 0.996 -3.000 0.631 0.065   NA
 7079288 7079289 Smal_0540 Smal_0541 xerD   FALSE 0.111 101.000 0.004 1.000 N NA
 7079291 7079292 Smal_0543 Smal_0544     FALSE 0.014 439.000 0.000 1.000   NA
 7079292 7079293 Smal_0544 Smal_0545     FALSE 0.040 159.000 0.000 1.000   NA
 7079293 7079294 Smal_0545 Smal_0546     FALSE 0.003 137.000 0.000 1.000 N NA
 7079294 7079295 Smal_0546 Smal_0547     TRUE 0.982 25.000 0.255 0.005 Y NA
 7079295 7079296 Smal_0547 Smal_0548     TRUE 0.940 50.000 0.125 0.005 Y NA
 7079296 7079297 Smal_0548 Smal_0549     TRUE 0.995 7.000 0.348 0.005 Y NA
 7079297 7079298 Smal_0549 Smal_0550     TRUE 0.994 -3.000 0.130 NA Y NA
 7079298 7079299 Smal_0550 Smal_0551     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079299 7079300 Smal_0551 Smal_0552     TRUE 0.987 -3.000 0.308 NA   NA
 7079300 7079301 Smal_0552 Smal_0553     TRUE 0.964 -3.000 0.053 NA   NA
 7079301 7079302 Smal_0553 Smal_0554     TRUE 0.876 -25.000 0.000 NA   NA
 7079302 7079303 Smal_0554 Smal_0555     TRUE 0.996 -10.000 0.700 NA   NA
 7079303 7079304 Smal_0555 Smal_0556     TRUE 0.963 10.000 0.333 NA   NA
 7079304 7079305 Smal_0556 Smal_0557     FALSE 0.012 689.000 0.000 NA   NA
 7079305 7079306 Smal_0557 Smal_0558     TRUE 0.954 -3.000 0.026 NA   NA
 7079306 7079307 Smal_0558 Smal_0559     FALSE 0.210 109.000 0.007 NA   NA
 7079309 7079310 Smal_0561 Smal_0562     TRUE 0.639 86.000 0.000 1.000 Y NA
 7079310 7079311 Smal_0562 Smal_0563     TRUE 0.956 72.000 0.667 1.000 Y NA
 7079311 7079312 Smal_0563 Smal_0564     TRUE 0.999 -9.000 1.000 1.000 Y NA
 7079312 7079313 Smal_0564 Smal_0565     FALSE 0.001 268.000 0.000 1.000 N NA
 7079313 7079314 Smal_0565 Smal_0566     TRUE 0.990 -3.000 0.429 NA   NA
 7079314 7079315 Smal_0566 Smal_0567   nfrB TRUE 0.945 7.000 0.159 NA   NA
 7079315 7079316 Smal_0567 Smal_0568 nfrB   TRUE 0.965 -3.000 0.045 1.000   NA
 7079317 7079318 Smal_0569 Smal_0570     FALSE 0.155 83.000 0.000 NA   NA
 7079318 7079319 Smal_0570 Smal_0571     FALSE 0.030 184.000 0.000 1.000   NA
 7079320 7079321 Smal_0572 Smal_0573   glyA FALSE 0.188 188.000 0.182 NA   NA
 7079321 7079322 Smal_0573 Smal_0574 glyA   FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 7079322 7079323 Smal_0574 Smal_0575     FALSE 0.386 28.000 0.000 NA   NA
 7079323 7079324 Smal_0575 Smal_0576   nrdR FALSE 0.040 149.000 0.000 NA   NA
 7079324 7079325 Smal_0576 Smal_0577 nrdR   TRUE 0.617 80.000 0.277 NA N NA
 7079326 7079327 Smal_0578 Smal_0579     FALSE 0.053 135.000 0.000 NA   NA
 7079327 7079328 Smal_0579 Smal_0580     FALSE 0.038 153.000 0.000 NA   NA
 7079329 7079330 Smal_0581 Smal_0582     TRUE 0.988 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 7079330 7079331 Smal_0582 Smal_0583   ribH TRUE 0.754 186.000 0.417 0.002 Y NA
 7079331 7079332 Smal_0583 Smal_0584 ribH nusB TRUE 0.882 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7079332 7079333 Smal_0584 Smal_0585 nusB   FALSE 0.381 121.000 0.225 1.000 N NA
 7079334 7079335 Smal_0586 Smal_0587     FALSE 0.013 342.000 0.000 NA   NA
 7079335 7079336 Smal_0587 Smal_0588     TRUE 0.976 -3.000 0.130 NA   NA
 7079336 7079337 Smal_0588 Smal_0589     FALSE 0.179 111.000 0.004 NA   NA
 7079337 7079338 Smal_0589 Smal_0590     TRUE 0.984 -37.000 0.172 NA   NA
 7079339 7079340 Smal_0591 Smal_R0013     FALSE 0.032 165.000 0.000 NA   NA
 7079341 7079342 Smal_0592 Smal_0593     FALSE 0.013 359.000 0.000 NA   NA
 7079343 7079344 Smal_0594 Smal_0595   mraW TRUE 0.970 15.000 0.635 NA   NA
 7079344 7079345 Smal_0595 Smal_0596 mraW   TRUE 0.977 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7079345 7079346 Smal_0596 Smal_0597     TRUE 0.921 -3.000 0.024 1.000 N NA
 7079346 7079347 Smal_0597 Smal_0598   murE TRUE 0.989 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 7079347 7079348 Smal_0598 Smal_0599 murE   TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.003 Y NA
 7079348 7079349 Smal_0599 Smal_0600   mraY TRUE 0.998 -10.000 0.309 0.005 Y NA
 7079349 7079350 Smal_0600 Smal_0601 mraY   TRUE 0.930 2.000 0.018 0.005 N NA
 7079350 7079351 Smal_0601 Smal_0602   murG TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7079351 7079352 Smal_0602 Smal_0603 murG murC TRUE 0.951 41.000 0.283 1.000 Y NA
 7079352 7079353 Smal_0603 Smal_0604 murC ddl TRUE 0.997 -3.000 0.153 0.005 Y NA
 7079353 7079354 Smal_0604 Smal_0605 ddl   TRUE 0.997 -3.000 0.372 NA Y NA
 7079354 7079355 Smal_0605 Smal_0606     TRUE 0.985 -3.000 0.389 NA N NA
 7079355 7079356 Smal_0606 Smal_0607     TRUE 0.691 171.000 0.460 1.000 Y NA
 7079356 7079357 Smal_0607 Smal_0608   lpxC FALSE 0.107 194.000 0.134 1.000 N NA
 7079359 7079360 Smal_0610 Smal_0611     FALSE 0.046 299.000 0.068 1.000 N NA
 7079360 7079361 Smal_0611 Smal_0612     FALSE 0.088 113.000 0.006 1.000 N NA
 7079362 7079363 Smal_0613 Smal_0614     FALSE 0.277 41.000 0.000 NA   NA
 7079364 7079365 Smal_0615 Smal_0616     FALSE 0.342 37.000 0.000 1.000   NA
 7079365 7079366 Smal_0616 Smal_0617     TRUE 0.995 -3.000 0.077 0.037 Y NA
 7079367 7079368 Smal_0618 Smal_0619     TRUE 0.892 -12.000 0.000 1.000   NA
 7079368 7079369 Smal_0619 Smal_0620     TRUE 0.999 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 7079369 7079370 Smal_0620 Smal_0621     TRUE 0.979 3.000 0.375 1.000   NA
 7079371 7079372 Smal_0622 Smal_0623     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 7079373 7079374 Smal_0624 Smal_0625     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7079374 7079375 Smal_0625 Smal_0626     FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 7079376 7079377 Smal_0627 Smal_0628     FALSE 0.102 173.000 0.089 1.000 N NA
 7079378 7079379 Smal_0629 Smal_0630     FALSE 0.002 184.000 0.000 NA N NA
 7079380 7079381 Smal_0631 Smal_0632     TRUE 0.962 -3.000 0.046 NA   NA
 7079381 7079382 Smal_0632 Smal_0633     FALSE 0.019 212.000 0.000 NA   NA
 7079383 7079384 Smal_0634 Smal_0635     TRUE 0.647 9.000 0.000 NA   NA
 7079384 7079385 Smal_0635 Smal_0636     FALSE 0.015 271.000 0.000 NA   NA
 7079385 7079386 Smal_0636 Smal_0637     FALSE 0.168 115.000 0.002 1.000   NA
 7079386 7079387 Smal_0637 Smal_0638     FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 7079387 7079388 Smal_0638 Smal_0639     FALSE 0.157 82.000 0.000 NA   NA
 7079390 7079391 Smal_0641 Smal_0642     TRUE 0.607 26.000 0.027 1.000 N NA
 7079392 7079393 Smal_0643 Smal_0644     FALSE 0.058 241.000 0.023 NA   NA
 7079393 7079394 Smal_0644 Smal_0645     FALSE 0.174 145.000 0.046 NA   NA
 7079394 7079395 Smal_0645 Smal_0646     TRUE 0.949 5.000 0.160 NA   NA
 7079395 7079396 Smal_0646 Smal_0647     FALSE 0.427 74.000 0.024 NA   NA
 7079397 7079398 Smal_0648 Smal_0649     FALSE 0.118 103.000 0.000 NA   NA
 7079398 7079399 Smal_0649 Smal_0650     TRUE 0.989 -3.000 0.535 NA N NA
 7079400 7079401 Smal_0651 Smal_0652     FALSE 0.219 88.000 0.016 1.000 N NA
 7079401 7079402 Smal_0652 Smal_0653     TRUE 0.748 157.000 0.500 1.000 Y NA
 7079404 7079405 Smal_0655 Smal_0656     TRUE 0.572 33.000 0.037 1.000 N NA
 7079405 7079406 Smal_0656 Smal_0657     FALSE 0.001 265.000 0.000 NA N NA
 7079406 7079407 Smal_0657 Smal_0658     FALSE 0.012 549.000 0.000 NA   NA
 7079407 7079408 Smal_0658 Smal_0659     TRUE 0.703 4.000 0.000 NA   NA
 7079408 7079409 Smal_0659 Smal_0660     TRUE 0.908 0.000 0.015 NA   NA
 7079409 7079410 Smal_0660 Smal_0661     FALSE 0.379 52.000 0.005 NA   NA
 7079410 7079411 Smal_0661 Smal_0662   thyA TRUE 0.969 -3.000 0.164 1.000 N NA
 7079411 7079412 Smal_0662 Smal_0663 thyA   TRUE 0.647 9.000 0.000 NA   NA
 7079412 7079413 Smal_0663 Smal_0664     FALSE 0.545 14.000 0.000 NA   NA
 7079414 7079415 Smal_0665 Smal_0666   apaH TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079415 7079416 Smal_0666 Smal_0667 apaH apaG TRUE 0.931 16.000 0.267 NA   NA
 7079416 7079417 Smal_0667 Smal_0668 apaG ksgA TRUE 0.959 -10.000 0.078 NA N NA
 7079417 7079418 Smal_0668 Smal_0669 ksgA pdxA TRUE 0.973 -3.000 0.197 1.000 N NA
 7079418 7079419 Smal_0669 Smal_0670 pdxA   TRUE 0.978 4.000 0.561 1.000 N NA
 7079419 7079420 Smal_0670 Smal_0671     TRUE 0.912 -3.000 0.020 1.000 N NA
 7079420 7079421 Smal_0671 Smal_0672     TRUE 0.652 90.000 0.357 NA N NA
 7079421 7079422 Smal_0672 Smal_0673     TRUE 0.831 10.000 0.013 NA   NA
 7079422 7079423 Smal_0673 Smal_0674     TRUE 0.841 9.000 0.013 NA   NA
 7079424 7079425 Smal_0675 Smal_0676     TRUE 0.999 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 7079426 7079427 Smal_0677 Smal_0678     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079427 7079428 Smal_0678 Smal_0679     TRUE 0.967 -16.000 0.032 NA   NA
 7079428 7079429 Smal_0679 Smal_0680     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7079429 7079430 Smal_0680 Smal_0681     FALSE 0.235 49.000 0.000 NA   NA
 7079430 7079431 Smal_0681 Smal_0682     FALSE 0.258 44.000 0.000 NA   NA
 7079432 7079433 Smal_0683 Smal_0684     TRUE 0.798 10.000 0.006 NA   NA
 7079434 7079435 Smal_0685 Smal_0686     FALSE 0.395 51.000 0.027 1.000 N NA
 7079435 7079436 Smal_0686 Smal_0687     FALSE 0.522 124.000 0.008 1.000 Y NA
 7079436 7079437 Smal_0687 Smal_0688     FALSE 0.321 86.000 0.041 1.000 N NA
 7079437 7079438 Smal_0688 Smal_0689     TRUE 0.611 227.000 0.551 1.000 Y NA
 7079439 7079440 Smal_0690 Smal_0691     FALSE 0.485 49.000 0.012 1.000   NA
 7079442 7079443 Smal_0693 Smal_0694     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079444 7079445 Smal_0695 Smal_0696     TRUE 0.982 -7.000 0.135 1.000   NA
 7079445 7079446 Smal_0696 Smal_0697     TRUE 0.969 -3.000 0.068 1.000   NA
 7079446 7079447 Smal_0697 Smal_0698     TRUE 0.895 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7079448 7079449 Smal_0699 Smal_0700     FALSE 0.452 53.000 0.014 NA   NA
 7079450 7079451 Smal_0701 Smal_0702     TRUE 0.982 5.000 0.556 NA   NA
 7079451 7079452 Smal_0702 Smal_0703     TRUE 0.966 -3.000 0.065 NA   NA
 7079453 7079454 Smal_0704 Smal_0705     TRUE 0.994 -3.000 0.321 0.001   NA
 7079456 7079457 Smal_0707 Smal_0708     FALSE 0.442 60.000 0.017 NA   NA
 7079457 7079458 Smal_0708 Smal_0709     FALSE 0.027 175.000 0.000 NA   NA
 7079458 7079459 Smal_0709 Smal_0710     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079459 7079460 Smal_0710 Smal_0711     TRUE 0.732 2.000 0.000 NA   NA
 7079460 7079461 Smal_0711 Smal_0712     FALSE 0.013 368.000 0.000 NA   NA
 7079462 7079463 Smal_0713 Smal_0714     FALSE 0.406 71.000 0.018 NA   NA
 7079463 7079464 Smal_0714 Smal_0715     TRUE 0.994 -3.000 0.657 NA   NA
 7079465 7079466 Smal_0716 Smal_0717 rbn   TRUE 0.953 -3.000 0.020 1.000   NA
 7079469 7079470 Smal_0720 Smal_0721   prfA TRUE 0.647 6.000 0.004 1.000 N NA
 7079470 7079471 Smal_0721 Smal_0722 prfA hemA TRUE 0.987 -22.000 0.171 0.038 N NA
 7079472 7079473 Smal_0723 Smal_0724   lolB TRUE 0.957 -3.000 0.024 1.000   NA
 7079473 7079474 Smal_0724 Smal_0725 lolB ipk TRUE 0.968 -3.000 0.157 1.000 N NA
 7079474 7079475 Smal_0725 Smal_R0014 ipk   TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7079475 7079476 Smal_R0014 Smal_0726     FALSE 0.048 139.000 0.000 NA   NA
 7079476 7079477 Smal_0726 Smal_0727     FALSE 0.361 107.000 0.122 1.000 N NA
 7079477 7079478 Smal_0727 Smal_0728     TRUE 0.967 60.000 0.496 0.021 Y NA
 7079478 7079479 Smal_0728 Smal_0729     TRUE 0.824 106.000 0.184 1.000 Y NA
 7079482 7079483 Smal_0732 Smal_0733     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 7079483 7079484 Smal_0733 Smal_0734     FALSE 0.029 170.000 0.000 NA   NA
 7079484 7079485 Smal_0734 Smal_0735     FALSE 0.001 264.000 0.000 1.000 N NA
 7079485 7079486 Smal_0735 Smal_0736     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.030 Y NA
 7079486 7079487 Smal_0736 Smal_0737     FALSE 0.542 126.000 0.000 0.030 Y NA
 7079487 7079488 Smal_0737 Smal_0738     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.030 Y NA
 7079488 7079489 Smal_0738 Smal_0739     FALSE 0.002 162.000 0.000 1.000 N NA
 7079490 7079491 Smal_0740 Smal_0741     FALSE 0.175 105.000 0.015 1.000 N NA
 7079491 7079492 Smal_0741 Smal_R0015     FALSE 0.050 137.000 0.000 NA   NA
 7079492 7079493 Smal_R0015 Smal_R0016     FALSE 0.414 25.000 0.000 NA   NA
 7079493 7079494 Smal_R0016 Smal_R0017     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079494 7079495 Smal_R0017 Smal_0742     FALSE 0.270 42.000 0.000 NA   NA
 7079495 7079496 Smal_0742 Smal_R0018     FALSE 0.115 104.000 0.000 NA   NA
 7079496 7079497 Smal_R0018 Smal_0743   secE FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079497 7079498 Smal_0743 Smal_0744 secE nusG TRUE 0.979 11.000 0.843 1.000 N NA
 7079498 7079499 Smal_0744 Smal_0745 nusG rplK FALSE 0.247 298.000 0.681 1.000 N NA
 7079499 7079500 Smal_0745 Smal_0746 rplK rplA TRUE 0.998 5.000 0.838 0.018 Y NA
 7079500 7079501 Smal_0746 Smal_0747 rplA rplJ FALSE 0.407 384.000 0.302 1.000 Y NA
 7079501 7079502 Smal_0747 Smal_0748 rplJ rplL TRUE 0.971 64.000 0.884 1.000 Y NA
 7079502 7079503 Smal_0748 Smal_0749 rplL rpoB FALSE 0.133 365.000 0.223 1.000   NA
 7079503 7079504 Smal_0749 Smal_0750 rpoB   TRUE 0.929 88.000 0.851 0.001   NA
 7079504 7079505 Smal_0750 Smal_0751   rpsL FALSE 0.066 284.000 0.122 1.000 N NA
 7079505 7079506 Smal_0751 Smal_0752 rpsL   TRUE 0.995 13.000 0.620 0.003 Y NA
 7079506 7079507 Smal_0752 Smal_0753     TRUE 0.825 139.000 0.579 1.000 Y NA
 7079507 7079508 Smal_0753 Smal_0754     TRUE 0.972 52.000 0.400 0.001 Y NA
 7079508 7079509 Smal_0754 Smal_0755   rpsJ FALSE 0.429 334.000 0.318 1.000 Y NA
 7079509 7079510 Smal_0755 Smal_0756 rpsJ rplC TRUE 0.992 12.000 0.307 0.018 Y NA
 7079510 7079511 Smal_0756 Smal_0757 rplC rplD TRUE 0.994 13.000 0.486 0.013 Y NA
 7079511 7079512 Smal_0757 Smal_0758 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.013 Y NA
 7079512 7079513 Smal_0758 Smal_0759 rplW rplB TRUE 0.997 11.000 0.849 0.018 Y NA
 7079513 7079514 Smal_0759 Smal_0760 rplB rpsS TRUE 0.998 7.000 0.820 0.018 Y NA
 7079514 7079515 Smal_0760 Smal_0761 rpsS rplV TRUE 0.996 13.000 0.769 0.018 Y NA
 7079515 7079516 Smal_0761 Smal_0762 rplV rpsC TRUE 0.994 19.000 0.719 0.018 Y NA
 7079516 7079517 Smal_0762 Smal_0763 rpsC rplP TRUE 0.998 6.000 0.828 0.018 Y NA
 7079517 7079518 Smal_0763 Smal_0764 rplP   TRUE 0.998 0.000 0.802 0.013 Y NA
 7079518 7079519 Smal_0764 Smal_0765   rpsQ TRUE 0.997 12.000 0.828 0.013 Y NA
 7079519 7079520 Smal_0765 Smal_0766 rpsQ rplN TRUE 0.996 13.000 0.791 0.018 Y NA
 7079520 7079521 Smal_0766 Smal_0767 rplN rplX TRUE 0.995 17.000 0.810 0.018 Y NA
 7079521 7079522 Smal_0767 Smal_0768 rplX rplE TRUE 0.996 12.000 0.758 0.013 Y NA
 7079522 7079523 Smal_0768 Smal_0769 rplE rpsN TRUE 0.988 19.000 0.309 0.013 Y NA
 7079523 7079524 Smal_0769 Smal_0770 rpsN rpsH TRUE 0.563 260.000 0.295 0.013 Y NA
 7079524 7079525 Smal_0770 Smal_0771 rpsH rplF TRUE 0.995 19.000 0.808 0.013 Y NA
 7079525 7079526 Smal_0771 Smal_0772 rplF rplR TRUE 0.973 87.000 0.815 0.013 Y NA
 7079526 7079527 Smal_0772 Smal_0773 rplR rpsE TRUE 0.877 162.000 0.814 0.018 Y NA
 7079527 7079528 Smal_0773 Smal_0774 rpsE rpmD TRUE 0.999 -7.000 0.789 0.018 Y NA
 7079528 7079529 Smal_0774 Smal_0775 rpmD rplO TRUE 0.997 7.000 0.653 0.002 Y NA
 7079529 7079530 Smal_0775 Smal_0776 rplO secY TRUE 0.980 8.000 0.730 1.000 N NA
 7079530 7079531 Smal_0776 Smal_0777 secY rpsM FALSE 0.018 348.000 0.011 1.000 N NA
 7079531 7079532 Smal_0777 Smal_0778 rpsM   TRUE 0.997 12.000 0.810 0.013 Y NA
 7079532 7079533 Smal_0778 Smal_0779   rpsD TRUE 0.993 16.000 0.509 0.018 Y NA
 7079533 7079534 Smal_0779 Smal_0780 rpsD   TRUE 0.824 56.000 0.549 1.000 N NA
 7079534 7079535 Smal_0780 Smal_0781   rplQ FALSE 0.410 198.000 0.873 1.000 N NA
 7079535 7079536 Smal_0781 Smal_0782 rplQ   FALSE 0.001 238.000 0.000 1.000 N NA
 7079538 7079539 Smal_0784 Smal_0785     FALSE 0.016 773.000 0.015 NA N NA
 7079540 7079541 Smal_0786 Smal_0787     TRUE 0.634 42.000 0.045 NA   NA
 7079541 7079542 Smal_0787 Smal_0788     TRUE 0.758 12.000 0.006 NA   NA
 7079543 7079544 Smal_0789 Smal_0790     FALSE 0.133 119.000 0.018 1.000 N NA
 7079544 7079545 Smal_0790 Smal_0791     FALSE 0.005 123.000 0.000 1.000 N NA
 7079545 7079546 Smal_0791 Smal_0792   prpE FALSE 0.001 681.000 0.000 1.000 N NA
 7079546 7079547 Smal_0792 Smal_0793 prpE   FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 7079547 7079548 Smal_0793 Smal_0794     FALSE 0.329 34.000 0.000 NA   NA
 7079549 7079550 Smal_0795 Smal_0796     TRUE 0.562 85.000 0.111 1.000   NA
 7079550 7079551 Smal_0796 Smal_0797     FALSE 0.016 298.000 0.000 1.000   NA
 7079551 7079552 Smal_0797 Smal_0798     FALSE 0.165 74.000 0.000 NA   NA
 7079552 7079553 Smal_0798 Smal_0799     FALSE 0.016 238.000 0.000 NA   NA
 7079554 7079555 Smal_0800 Smal_0801     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 7079555 7079556 Smal_0801 Smal_0802     TRUE 0.905 21.000 0.227 NA   NA
 7079556 7079557 Smal_0802 Smal_0803     FALSE 0.521 85.000 0.091 NA   NA
 7079561 7079562 Smal_0807 Smal_0808     FALSE 0.155 200.000 0.143 1.000   NA
 7079562 7079563 Smal_0808 Smal_0809     FALSE 0.281 42.000 0.006 1.000 N NA
 7079563 7079564 Smal_0809 Smal_0810     FALSE 0.352 82.000 0.013 NA   NA
 7079564 7079565 Smal_0810 Smal_0811     FALSE 0.437 47.000 0.007 NA   NA
 7079565 7079566 Smal_0811 Smal_0812     TRUE 0.880 31.000 0.262 1.000   NA
 7079566 7079567 Smal_0812 Smal_0813     TRUE 0.841 10.000 0.012 1.000   NA
 7079570 7079571 Smal_0816 Smal_0817     FALSE 0.087 161.000 0.008 1.000   NA
 7079571 7079572 Smal_0817 Smal_0818     TRUE 0.982 -19.000 0.125 1.000   NA
 7079572 7079573 Smal_0818 Smal_0819     FALSE 0.050 145.000 0.000 1.000   NA
 7079573 7079574 Smal_0819 Smal_0820     FALSE 0.044 333.000 0.000 0.026   NA
 7079574 7079575 Smal_0820 Smal_0821     FALSE 0.017 295.000 0.000 1.000   NA
 7079575 7079576 Smal_0821 Smal_0822     FALSE 0.253 357.000 0.076 1.000 Y NA
 7079576 7079577 Smal_0822 Smal_0823     TRUE 0.862 5.000 0.045 1.000 N NA
 7079577 7079578 Smal_0823 Smal_0824     TRUE 0.897 107.000 0.453 1.000 Y NA
 7079578 7079579 Smal_0824 Smal_0825     FALSE 0.230 117.000 0.016 1.000   NA
 7079580 7079581 Smal_0826 Smal_0827     TRUE 0.962 -3.000 0.045 NA   NA
 7079581 7079582 Smal_0827 Smal_0828     FALSE 0.048 358.000 0.025 NA   NA
 7079582 7079583 Smal_0828 Smal_0829     FALSE 0.020 260.000 0.000 0.066 N NA
 7079583 7079584 Smal_0829 Smal_0830     TRUE 0.822 84.000 0.750 1.000 N NA
 7079584 7079585 Smal_0830 Smal_0831     FALSE 0.446 26.000 0.000 1.000   NA
 7079586 7079587 Smal_0832 Smal_0833     FALSE 0.036 155.000 0.000 NA   NA
 7079588 7079589 Smal_R0019 Smal_R0020     FALSE 0.292 39.000 0.000 NA   NA
 7079589 7079590 Smal_R0020 Smal_R0021     FALSE 0.027 175.000 0.000 NA   NA
 7079590 7079591 Smal_R0021 Smal_R0022     FALSE 0.159 80.000 0.000 NA   NA
 7079591 7079592 Smal_R0022 Smal_R0023     FALSE 0.022 198.000 0.000 NA   NA
 7079592 7079593 Smal_R0023 Smal_0834     FALSE 0.018 226.000 0.000 NA   NA
 7079593 7079594 Smal_0834 Smal_R0024     FALSE 0.047 140.000 0.000 NA   NA
 7079594 7079595 Smal_R0024 Smal_0835   tig FALSE 0.024 190.000 0.000 NA   NA
 7079595 7079596 Smal_0835 Smal_0836 tig clpP TRUE 0.922 77.000 0.351 1.000 Y NA
 7079596 7079597 Smal_0836 Smal_0837 clpP clpX TRUE 0.806 127.000 0.352 1.000 Y NA
 7079597 7079598 Smal_0837 Smal_0838 clpX   TRUE 0.730 143.000 0.201 0.098 Y NA
 7079598 7079599 Smal_0838 Smal_0839     FALSE 0.022 218.000 0.008 1.000 N NA
 7079599 7079600 Smal_0839 Smal_R0025     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7079600 7079601 Smal_R0025 Smal_R0026     FALSE 0.397 27.000 0.000 NA   NA
 7079601 7079602 Smal_R0026 Smal_R0027     FALSE 0.147 86.000 0.000 NA   NA
 7079602 7079603 Smal_R0027 Smal_R0028     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7079603 7079604 Smal_R0028 Smal_R0029     FALSE 0.106 107.000 0.000 NA   NA
 7079604 7079605 Smal_R0029 Smal_0840     FALSE 0.023 194.000 0.000 NA   NA
 7079606 7079607 Smal_0841 Smal_0842     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079608 7079609 Smal_0843 Smal_0844   rnhA TRUE 0.586 14.000 0.000 1.000   NA
 7079609 7079610 Smal_0844 Smal_0845 rnhA   TRUE 0.990 5.000 0.248 1.000 Y NA
 7079616 7079617 Smal_0850 Smal_0851     TRUE 0.935 0.000 0.032 1.000   NA
 7079617 7079618 Smal_0851 Smal_0852     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079620 7079621 Smal_0853 Smal_0854     FALSE 0.015 358.000 0.000 1.000   NA
 7079625 7079626 Smal_0857 Smal_0858     TRUE 0.974 7.000 0.411 NA   NA
 7079626 7079627 Smal_0858 Smal_0859   recR TRUE 0.734 112.000 0.604 NA   NA
 7079627 7079628 Smal_0859 Smal_0860 recR   FALSE 0.239 68.000 0.013 1.000 N NA
 7079629 7079630 Smal_0861 Smal_0862     TRUE 0.954 -3.000 0.025 NA   NA
 7079630 7079631 Smal_0862 Smal_0863     TRUE 0.996 -7.000 0.727 NA   NA
 7079631 7079632 Smal_0863 Smal_0864     TRUE 0.989 3.000 0.739 NA   NA
 7079635 7079636 Smal_0867 Smal_0868   rpmF TRUE 0.747 109.000 0.599 NA   NA
 7079636 7079637 Smal_0868 Smal_0869 rpmF   FALSE 0.205 92.000 0.014 1.000 N NA
 7079637 7079638 Smal_0869 Smal_0870     FALSE 0.162 77.000 0.000 NA   NA
 7079638 7079639 Smal_0870 Smal_0871     FALSE 0.030 169.000 0.000 NA   NA
 7079639 7079640 Smal_0871 Smal_0872   fabG TRUE 0.956 83.000 0.432 0.004 Y NA
 7079640 7079641 Smal_0872 Smal_0873 fabG acpP TRUE 0.789 153.000 0.321 0.004 Y NA
 7079641 7079642 Smal_0873 Smal_0874 acpP   TRUE 0.735 144.000 0.346 1.000 Y NA
 7079642 7079643 Smal_0874 Smal_0875     FALSE 0.466 93.000 0.030 0.013 N NA
 7079643 7079644 Smal_0875 Smal_0876     FALSE 0.057 198.000 0.010 NA   NA
 7079644 7079645 Smal_0876 Smal_0877     TRUE 0.983 -3.000 0.209 NA   NA
 7079645 7079646 Smal_0877 Smal_0878     TRUE 0.984 -3.000 0.211 0.097 N NA
 7079646 7079647 Smal_0878 Smal_0879     TRUE 0.985 -3.000 0.382 NA N NA
 7079647 7079648 Smal_0879 Smal_R0033     FALSE 0.029 170.000 0.000 NA   NA
 7079648 7079649 Smal_R0033 Smal_0880     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 7079650 7079651 Smal_0881 Smal_0882     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 7079651 7079652 Smal_0882 Smal_0883     TRUE 0.997 -16.000 1.000 NA   NA
 7079652 7079653 Smal_0883 Smal_0884     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7079653 7079654 Smal_0884 Smal_0885     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7079654 7079655 Smal_0885 Smal_0886     TRUE 0.607 81.000 0.154 NA   NA
 7079655 7079656 Smal_0886 Smal_0887     TRUE 0.973 3.000 0.308 NA   NA
 7079656 7079657 Smal_0887 Smal_0888     FALSE 0.106 107.000 0.000 NA   NA
 7079657 7079658 Smal_0888 Smal_0889     TRUE 0.732 2.000 0.000 NA   NA
 7079658 7079659 Smal_0889 Smal_0890     TRUE 0.660 8.000 0.000 NA   NA
 7079659 7079660 Smal_0890 Smal_0891     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7079660 7079661 Smal_0891 Smal_0892     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7079661 7079662 Smal_0892 Smal_0893     FALSE 0.216 53.000 0.000 NA   NA
 7079662 7079663 Smal_0893 Smal_0894     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 7079663 7079664 Smal_0894 Smal_0895     FALSE 0.013 353.000 0.000 NA   NA
 7079664 7079665 Smal_0895 Smal_0896     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079665 7079666 Smal_0896 Smal_0897     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079666 7079667 Smal_0897 Smal_0898     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079667 7079668 Smal_0898 Smal_0899     FALSE 0.013 335.000 0.000 NA   NA
 7079668 7079669 Smal_0899 Smal_0900     FALSE 0.038 153.000 0.000 NA   NA
 7079669 7079670 Smal_0900 Smal_0901     FALSE 0.270 42.000 0.000 NA   NA
 7079670 7079671 Smal_0901 Smal_0902     FALSE 0.164 75.000 0.000 NA   NA
 7079671 7079672 Smal_0902 Smal_0903     TRUE 0.740 1.000 0.000 NA   NA
 7079673 7079674 Smal_0904 Smal_0905     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7079674 7079675 Smal_0905 Smal_0906     FALSE 0.019 217.000 0.000 NA   NA
 7079675 7079676 Smal_0906 Smal_0907     FALSE 0.060 130.000 0.000 NA   NA
 7079676 7079677 Smal_0907 Smal_0908     TRUE 0.939 12.000 0.224 NA   NA
 7079678 7079679 Smal_0909 Smal_0910     TRUE 0.931 12.000 0.000 NA Y NA
 7079681 7079682 Smal_0912 Smal_0913     FALSE 0.009 99.000 0.000 1.000 N NA
 7079686 7079687 Smal_0917 Smal_0918     FALSE 0.009 100.000 0.000 1.000 N NA
 7079687 7079688 Smal_0918 Smal_0919     TRUE 0.999 -22.000 0.857 1.000 Y NA
 7079689 7079690 Smal_0920 Smal_0921     TRUE 0.902 5.000 0.100 1.000 N NA
 7079692 7079693 Smal_0923 Smal_0924     TRUE 0.949 0.000 0.078 NA   NA
 7079698 7079699 Smal_0929 Smal_0930     TRUE 0.940 19.000 0.357 NA   NA
 7079700 7079701 Smal_0931 Smal_0932     TRUE 0.995 10.000 0.436 0.014 Y NA
 7079701 7079702 Smal_0932 Smal_0933     FALSE 0.002 153.000 0.000 1.000 N NA
 7079704 7079705 Smal_0935 Smal_0936     FALSE 0.130 97.000 0.000 NA   NA
 7079705 7079706 Smal_0936 Smal_0937     FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 7079707 7079708 Smal_0938 Smal_0939     TRUE 0.964 -3.000 0.051 NA   NA
 7079709 7079710 Smal_0940 Smal_0941     TRUE 0.983 -7.000 0.263 NA N NA
 7079710 7079711 Smal_0941 Smal_0942   pyrB TRUE 0.686 16.000 0.022 1.000 N NA
 7079711 7079712 Smal_0942 Smal_0943 pyrB   FALSE 0.001 249.000 0.000 1.000 N NA
 7079713 7079714 Smal_0944 Smal_0945     TRUE 0.670 71.000 0.200 NA   NA
 7079714 7079715 Smal_0945 Smal_0946     FALSE 0.190 62.000 0.000 NA   NA
 7079715 7079716 Smal_0946 Smal_0947     FALSE 0.069 181.000 0.042 1.000 N NA
 7079716 7079717 Smal_0947 Smal_0948     TRUE 0.995 3.000 0.205 0.002 Y NA
 7079717 7079718 Smal_0948 Smal_0949     TRUE 0.998 -7.000 0.261 0.002 Y NA
 7079718 7079719 Smal_0949 Smal_0950     FALSE 0.095 573.000 0.171 NA   NA
 7079719 7079720 Smal_0950 Smal_0951     TRUE 0.860 28.000 0.194 NA   NA
 7079720 7079721 Smal_0951 Smal_0952     TRUE 0.992 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 7079721 7079722 Smal_0952 Smal_0953     TRUE 0.599 22.000 0.022 NA N NA
 7079722 7079723 Smal_0953 Smal_0954     FALSE 0.405 59.000 0.050 NA N NA
 7079723 7079724 Smal_0954 Smal_0955     TRUE 0.778 41.000 0.163 1.000   NA
 7079724 7079725 Smal_0955 Smal_0956     TRUE 0.987 0.000 0.543 NA   NA
 7079725 7079726 Smal_0956 Smal_0957     TRUE 0.723 105.000 0.459 NA   NA
 7079726 7079727 Smal_0957 Smal_0958     TRUE 0.993 -3.000 0.617 NA   NA
 7079727 7079728 Smal_0958 Smal_0959     TRUE 0.859 67.000 0.598 1.000   NA
 7079729 7079730 Smal_0960 Smal_0961     TRUE 0.787 22.000 0.129 NA N NA
 7079730 7079731 Smal_0961 Smal_0962     TRUE 0.941 -3.000 0.013 NA   NA
 7079732 7079733 Smal_0963 Smal_0964     TRUE 0.991 3.000 1.000 NA   NA
 7079733 7079734 Smal_0964 Smal_0965   purN FALSE 0.430 68.000 0.020 NA   NA
 7079734 7079735 Smal_0965 Smal_0966 purN   TRUE 0.928 -3.000 0.007 NA   NA
 7079735 7079736 Smal_0966 Smal_0967     FALSE 0.265 43.000 0.000 NA   NA
 7079736 7079737 Smal_0967 Smal_0968     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079737 7079738 Smal_0968 Smal_0969     TRUE 0.630 23.000 0.005 NA   NA
 7079739 7079740 Smal_0970 Smal_0971     TRUE 0.970 -3.000 0.087 NA   NA
 7079740 7079741 Smal_0971 Smal_0972     TRUE 0.972 0.000 0.217 NA   NA
 7079741 7079742 Smal_0972 Smal_0973     FALSE 0.012 487.000 0.000 NA   NA
 7079742 7079743 Smal_0973 Smal_0974     TRUE 0.985 -3.000 0.111 0.054   NA
 7079744 7079745 Smal_0975 Smal_0976     TRUE 0.994 -3.000 0.642 NA   NA
 7079745 7079746 Smal_0976 Smal_0977     FALSE 0.337 65.000 0.006 NA   NA
 7079746 7079747 Smal_0977 Smal_0978     FALSE 0.193 71.000 0.000 1.000   NA
 7079748 7079749 Smal_0979 Smal_0980     FALSE 0.013 353.000 0.000 NA   NA
 7079749 7079750 Smal_0980 Smal_0981     TRUE 0.846 18.000 0.074 NA   NA
 7079750 7079751 Smal_0981 Smal_0982     FALSE 0.322 35.000 0.000 NA   NA
 7079752 7079753 Smal_0983 Smal_0984     TRUE 0.989 -3.000 0.500 1.000 N NA
 7079753 7079754 Smal_0984 Smal_0985     TRUE 0.798 53.000 0.462 NA N NA
 7079754 7079755 Smal_0985 Smal_0986     TRUE 0.879 77.000 0.808 NA   NA
 7079755 7079756 Smal_0986 Smal_0987     TRUE 0.964 27.000 0.848 NA   NA
 7079756 7079757 Smal_0987 Smal_0988     FALSE 0.065 256.000 0.038 NA   NA
 7079757 7079758 Smal_0988 Smal_0989     FALSE 0.041 147.000 0.000 NA   NA
 7079758 7079759 Smal_0989 Smal_0990     FALSE 0.032 165.000 0.000 NA   NA
 7079759 7079760 Smal_0990 Smal_0991     TRUE 0.646 11.000 0.000 1.000   NA
 7079760 7079761 Smal_0991 Smal_0992     TRUE 0.798 69.000 0.395 1.000   NA
 7079761 7079762 Smal_0992 Smal_0993     FALSE 0.038 152.000 0.000 NA   NA
 7079762 7079763 Smal_0993 Smal_0994     FALSE 0.021 204.000 0.000 NA   NA
 7079763 7079764 Smal_0994 Smal_0995     TRUE 0.983 -3.000 0.217 NA   NA
 7079766 7079767 Smal_0997 Smal_0998     TRUE 0.937 -3.000 0.041 1.000 N NA
 7079767 7079768 Smal_0998 Smal_0999     TRUE 0.996 0.000 0.482 1.000 Y NA
 7079768 7079769 Smal_0999 Smal_1000     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079769 7079770 Smal_1000 Smal_1001     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7079770 7079771 Smal_1001 Smal_1002     TRUE 0.782 18.000 0.078 1.000 N NA
 7079773 7079774 Smal_1004 Smal_1005     TRUE 0.686 83.000 0.250 NA   NA
 7079774 7079775 Smal_1005 Smal_1006     TRUE 0.886 57.000 0.667 NA   NA
 7079775 7079776 Smal_1006 Smal_1007     FALSE 0.015 254.000 0.000 NA   NA
 7079778 7079779 Smal_1009 Smal_1010     TRUE 0.905 96.000 0.800 0.013   NA
 7079780 7079781 Smal_1011 Smal_1012     FALSE 0.432 80.000 0.029 NA   NA
 7079781 7079782 Smal_1012 Smal_1013   murD TRUE 0.960 -19.000 0.019 NA   NA
 7079787 7079788 Smal_1018 Smal_1019     FALSE 0.018 252.000 0.000 1.000   NA
 7079789 7079790 Smal_1020 Smal_1021     TRUE 0.982 -3.000 0.200 NA   NA
 7079790 7079791 Smal_1021 Smal_1022     TRUE 0.980 0.000 0.333 NA   NA
 7079791 7079792 Smal_1022 Smal_1023     FALSE 0.069 123.000 0.000 NA   NA
 7079792 7079793 Smal_1023 Smal_1024     FALSE 0.085 114.000 0.000 NA   NA
 7079794 7079795 Smal_1025 Smal_1026     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7079797 7079798 Smal_1028 Smal_1029     TRUE 0.917 13.000 0.150 1.000   NA
 7079799 7079800 Smal_1030 Smal_1031     TRUE 0.999 -10.000 0.667 0.095 Y NA
 7079802 7079803 Smal_1033 Smal_1034     FALSE 0.001 406.000 0.000 1.000 N NA
 7079803 7079804 Smal_1034 Smal_1035     TRUE 0.889 9.000 0.036 NA   NA
 7079804 7079805 Smal_1035 Smal_1036     TRUE 0.851 12.000 0.031 NA   NA
 7079805 7079806 Smal_1036 Smal_1037     TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.054 Y NA
 7079806 7079807 Smal_1037 Smal_1038     FALSE 0.012 501.000 0.000 NA   NA
 7079809 7079810 Smal_1040 Smal_1041     FALSE 0.003 149.000 0.000 NA N NA
 7079810 7079811 Smal_1041 Smal_1042     TRUE 0.901 28.000 0.471 NA N NA
 7079811 7079812 Smal_1042 Smal_1043     TRUE 0.989 0.000 0.600 NA   NA
 7079812 7079813 Smal_1043 Smal_1044     TRUE 0.856 15.000 0.064 NA   NA
 7079814 7079815 Smal_1045 Smal_1046     FALSE 0.055 19.000 0.000 NA N NA
 7079815 7079816 Smal_1046 Smal_1047     FALSE 0.459 21.000 0.000 NA   NA
 7079816 7079817 Smal_1047 Smal_1048     TRUE 0.601 13.000 0.000 1.000   NA
 7079817 7079818 Smal_1048 Smal_1049     TRUE 0.771 28.000 0.067 NA   NA
 7079819 7079820 Smal_1050 Smal_1051     FALSE 0.002 154.000 0.000 1.000 N NA
 7079821 7079822 Smal_1052 Smal_1053     FALSE 0.416 60.000 0.000 0.070   NA
 7079823 7079824 Smal_1054 Smal_1055     FALSE 0.065 126.000 0.000 NA   NA
 7079824 7079825 Smal_1055 Smal_1056     FALSE 0.033 163.000 0.000 NA   NA
 7079825 7079826 Smal_1056 Smal_1057     FALSE 0.167 72.000 0.000 NA   NA
 7079826 7079827 Smal_1057 Smal_1058     FALSE 0.530 15.000 0.000 NA   NA
 7079830 7079831 Smal_1061 Smal_1062     TRUE 0.764 25.000 0.042 NA   NA
 7079832 7079833 Smal_1063 Smal_1064     FALSE 0.019 211.000 0.000 NA   NA
 7079833 7079834 Smal_1064 Smal_1065     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7079834 7079835 Smal_1065 Smal_1066     FALSE 0.291 44.000 0.000 1.000   NA
 7079835 7079836 Smal_1066 Smal_1067     FALSE 0.026 197.000 0.000 1.000   NA
 7079836 7079837 Smal_1067 Smal_1068     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 7079837 7079838 Smal_1068 Smal_1069     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7079838 7079839 Smal_1069 Smal_1070     FALSE 0.161 78.000 0.000 NA   NA
 7079842 7079843 Smal_1073 Smal_1074     TRUE 0.633 107.000 0.300 1.000   NA
 7079843 7079844 Smal_1074 Smal_1075     FALSE 0.426 105.000 0.070 1.000   NA
 7079844 7079845 Smal_1075 Smal_1076     TRUE 0.975 -3.000 0.203 1.000 N NA
 7079845 7079846 Smal_1076 Smal_1077     TRUE 0.972 -3.000 0.085 1.000   NA
 7079846 7079847 Smal_1077 Smal_1078     TRUE 0.978 -7.000 0.102 NA   NA
 7079847 7079848 Smal_1078 Smal_1079     TRUE 0.994 -3.000 0.700 NA   NA
 7079848 7079849 Smal_1079 Smal_1080     TRUE 0.991 -3.000 0.438 NA   NA
 7079849 7079850 Smal_1080 Smal_1081     TRUE 0.961 11.000 0.342 NA   NA
 7079850 7079851 Smal_1081 Smal_1082     FALSE 0.028 191.000 0.000 1.000   NA
 7079851 7079852 Smal_1082 Smal_1083     FALSE 0.016 299.000 0.000 1.000   NA
 7079852 7079853 Smal_1083 Smal_1084     FALSE 0.027 196.000 0.000 1.000   NA
 7079853 7079854 Smal_1084 Smal_1085     FALSE 0.030 184.000 0.000 1.000   NA
 7079855 7079856 Smal_1086 Smal_1087     FALSE 0.036 168.000 0.000 1.000   NA
 7079857 7079858 Smal_1088 Smal_1089     FALSE 0.162 90.000 0.000 1.000   NA
 7079859 7079860 Smal_1090 Smal_1091     FALSE 0.067 255.000 0.043 NA   NA
 7079860 7079861 Smal_1091 Smal_1092     FALSE 0.045 142.000 0.000 NA   NA
 7079862 7079863 Smal_1093 Smal_1094   minE TRUE 0.570 38.000 0.015 NA   NA
 7079863 7079864 Smal_1094 Smal_1095 minE   TRUE 0.996 3.000 0.618 NA Y NA
 7079864 7079865 Smal_1095 Smal_1096   minC TRUE 0.972 36.000 0.466 1.000 Y NA
 7079865 7079866 Smal_1096 Smal_1097 minC   TRUE 0.891 3.000 0.013 1.000   NA
 7079867 7079868 Smal_1098 Smal_1099     TRUE 0.999 0.000 0.900 0.035 Y NA
 7079868 7079869 Smal_1099 Smal_1100     FALSE 0.017 235.000 0.000 NA   NA
 7079869 7079870 Smal_1100 Smal_1101     FALSE 0.267 106.000 0.013 NA   NA
 7079871 7079872 Smal_1102 Smal_1103     TRUE 0.630 10.000 0.000 NA   NA
 7079872 7079873 Smal_1103 Smal_1104     TRUE 0.703 4.000 0.000 NA   NA
 7079873 7079874 Smal_1104 Smal_1105     TRUE 0.950 -3.000 0.020 NA   NA
 7079874 7079875 Smal_1105 Smal_1106     TRUE 0.888 46.000 0.549 NA   NA
 7079877 7079878 Smal_1108 Smal_1109     FALSE 0.551 39.000 0.014 NA   NA
 7079880 7079881 Smal_1111 Smal_1112     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7079881 7079882 Smal_1112 Smal_1113     TRUE 0.894 5.000 0.026 NA   NA
 7079882 7079883 Smal_1113 Smal_1114     FALSE 0.552 128.000 0.021 1.000 Y NA
 7079885 7079886 Smal_1116 Smal_1117     FALSE 0.147 86.000 0.000 NA   NA
 7079886 7079887 Smal_1117 Smal_1118   uvrA TRUE 0.886 0.000 0.005 1.000   NA
 7079888 7079889 Smal_1119 Smal_1120 rplU rpmA TRUE 0.996 12.000 0.667 0.013 Y NA
 7079889 7079890 Smal_1120 Smal_1121 rpmA obgE FALSE 0.241 217.000 0.335 1.000   NA
 7079892 7079893 Smal_1123 Smal_1124     TRUE 0.644 76.000 0.169 1.000   NA
 7079893 7079894 Smal_1124 Smal_1125   ileS TRUE 0.979 -3.000 0.254 1.000 N NA
 7079894 7079895 Smal_1125 Smal_1126 ileS lspA TRUE 0.946 0.000 0.147 1.000 N NA
 7079895 7079896 Smal_1126 Smal_1127 lspA ispH TRUE 0.945 28.000 0.095 1.000 Y NA
 7079896 7079897 Smal_1127 Smal_1128 ispH   FALSE 0.027 195.000 0.000 1.000   NA
 7079897 7079898 Smal_1128 Smal_1129     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079899 7079900 Smal_1130 Smal_1131     TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 7079900 7079901 Smal_1131 Smal_1132     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079901 7079902 Smal_1132 Smal_1133     TRUE 0.925 13.000 0.000 NA Y NA
 7079902 7079903 Smal_1133 Smal_1134     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA N NA
 7079904 7079905 Smal_1135 Smal_1136     FALSE 0.144 99.000 0.000 1.000   NA
 7079905 7079906 Smal_1136 Smal_R0034     FALSE 0.224 51.000 0.000 NA   NA
 7079906 7079907 Smal_R0034 Smal_1137     FALSE 0.023 196.000 0.000 NA   NA
 7079908 7079909 Smal_1138 Smal_1139     FALSE 0.545 14.000 0.000 NA   NA
 7079910 7079911 Smal_1140 Smal_1141     TRUE 0.997 3.000 0.385 0.003 Y NA
 7079911 7079912 Smal_1141 Smal_1142     TRUE 0.998 -3.000 0.385 0.003 Y NA
 7079912 7079913 Smal_1142 Smal_1143     TRUE 0.982 0.000 0.000 0.042 Y NA
 7079915 7079916 Smal_1145 Smal_1146     FALSE 0.277 190.000 0.000 0.094 Y NA
 7079916 7079917 Smal_1146 Smal_1147     TRUE 0.916 49.000 0.727 1.000   NA
 7079917 7079918 Smal_1147 Smal_1148     FALSE 0.115 104.000 0.000 NA   NA
 7079920 7079921 Smal_1150 Smal_1151     FALSE 0.265 92.000 0.003 1.000   NA
 7079921 7079922 Smal_1151 Smal_1152     TRUE 0.965 -3.000 0.045 1.000   NA
 7079922 7079923 Smal_1152 Smal_1153   rpsP FALSE 0.108 102.000 0.004 1.000 N NA
 7079923 7079924 Smal_1153 Smal_1154 rpsP rimM TRUE 0.970 45.000 0.342 0.013 Y NA
 7079924 7079925 Smal_1154 Smal_1155 rimM trmD TRUE 0.995 9.000 0.672 1.000 Y NA
 7079925 7079926 Smal_1155 Smal_1156 trmD rplS TRUE 0.773 155.000 0.567 1.000 Y NA
 7079926 7079927 Smal_1156 Smal_1157 rplS   FALSE 0.155 83.000 0.000 NA   NA
 7079927 7079928 Smal_1157 Smal_1158     FALSE 0.159 80.000 0.000 NA   NA
 7079928 7079929 Smal_1158 Smal_1159     TRUE 0.811 39.000 0.208 NA   NA
 7079931 7079932 Smal_1161 Smal_1162     TRUE 0.630 10.000 0.000 NA   NA
 7079932 7079933 Smal_1162 Smal_1163     FALSE 0.099 114.000 0.000 1.000   NA
 7079934 7079935 Smal_1164 Smal_1165     FALSE 0.099 109.000 0.000 NA   NA
 7079935 7079936 Smal_1165 Smal_1166     FALSE 0.001 195.000 0.000 1.000 N NA
 7079939 7079940 Smal_1169 Smal_1170     FALSE 0.032 174.000 0.000 1.000   NA
 7079941 7079942 Smal_1171 Smal_1172     TRUE 0.995 -3.000 0.743 NA   NA
 7079942 7079943 Smal_1172 Smal_1173     TRUE 0.980 -15.000 0.119 NA   NA
 7079943 7079944 Smal_1173 Smal_1174     TRUE 0.957 -7.000 0.062 1.000 N NA
 7079944 7079945 Smal_1174 Smal_1175     FALSE 0.008 106.000 0.000 1.000 N NA
 7079946 7079947 Smal_1176 Smal_1177     FALSE 0.027 176.000 0.000 NA   NA
 7079948 7079949 Smal_1178 Smal_1179     TRUE 0.979 5.000 0.492 NA   NA
 7079949 7079950 Smal_1179 Smal_1180     FALSE 0.173 69.000 0.000 NA   NA
 7079950 7079951 Smal_1180 Smal_1181     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7079951 7079952 Smal_1181 Smal_1182     TRUE 0.935 4.000 0.086 NA   NA
 7079952 7079953 Smal_1182 Smal_1183     TRUE 0.809 29.000 0.118 NA   NA
 7079953 7079954 Smal_1183 Smal_1184     TRUE 0.887 63.000 0.152 1.000 Y NA
 7079954 7079955 Smal_1184 Smal_1185     FALSE 0.002 175.000 0.000 1.000 N NA
 7079955 7079956 Smal_1185 Smal_1186     TRUE 0.960 11.000 0.333 NA   NA
 7079956 7079957 Smal_1186 Smal_1187     TRUE 0.973 12.000 0.583 NA   NA
 7079957 7079958 Smal_1187 Smal_1188     TRUE 0.969 2.000 0.241 NA   NA
 7079958 7079959 Smal_1188 Smal_1189     FALSE 0.181 81.000 0.000 1.000   NA
 7079959 7079960 Smal_1189 Smal_1190     TRUE 0.993 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 7079960 7079961 Smal_1190 Smal_1191     FALSE 0.065 133.000 0.000 1.000   NA
 7079961 7079962 Smal_1191 Smal_1192     FALSE 0.165 74.000 0.000 NA   NA
 7079965 7079966 Smal_1195 Smal_1196     FALSE 0.161 220.000 0.000 1.000 Y NA
 7079968 7079969 Smal_1198 Smal_1199     FALSE 0.002 161.000 0.000 1.000 N NA
 7079970 7079971 Smal_1200 Smal_1201     FALSE 0.249 52.000 0.000 1.000   NA
 7079971 7079972 Smal_1201 Smal_1202     FALSE 0.031 150.000 0.002 1.000 N NA
 7079972 7079973 Smal_1202 Smal_1203     FALSE 0.267 96.000 0.007 NA   NA
 7079974 7079975 Smal_1204 Smal_1205     TRUE 0.997 4.000 0.776 1.000 Y NA
 7079975 7079976 Smal_1205 Smal_1206     TRUE 0.642 82.000 0.311 NA N NA
 7079976 7079977 Smal_1206 Smal_1207     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7079977 7079978 Smal_1207 Smal_1208     FALSE 0.028 172.000 0.000 NA   NA
 7079978 7079979 Smal_1208 Smal_1209   gltX FALSE 0.043 154.000 0.000 1.000   NA
 7079979 7079980 Smal_1209 Smal_1210 gltX   FALSE 0.403 35.000 0.012 1.000 N NA
 7079981 7079982 Smal_1211 Smal_1212     TRUE 0.976 11.000 0.578 NA   NA
 7079982 7079983 Smal_1212 Smal_1213     TRUE 0.976 0.000 0.276 NA   NA
 7079983 7079984 Smal_1213 Smal_1214     FALSE 0.020 230.000 0.000 1.000   NA
 7079985 7079986 Smal_1215 Smal_1216     TRUE 0.824 111.000 1.000 NA   NA
 7079987 7079988 Smal_1217 Smal_1218     FALSE 0.039 435.000 0.013 1.000   NA
 7079988 7079989 Smal_1218 Smal_1219     TRUE 0.996 -3.000 0.275 1.000 Y NA
 7079990 7079991 Smal_1220 Smal_1221     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 7079991 7079992 Smal_1221 Smal_1222     TRUE 0.915 12.000 0.138 NA   NA
 7079992 7079993 Smal_1222 Smal_1223     FALSE 0.400 81.000 0.021 NA   NA
 7079995 7079996 Smal_1225 Smal_1226     FALSE 0.015 228.000 0.004 1.000 N NA
 7079996 7079997 Smal_1226 Smal_1227     TRUE 0.660 110.000 0.000 0.009 Y NA
 7079997 7079998 Smal_1227 Smal_1228     TRUE 0.627 35.000 0.074 1.000 N NA
 7079998 7079999 Smal_1228 Smal_1229     FALSE 0.136 145.000 0.074 1.000 N NA
 7079999 7080000 Smal_1229 Smal_1230     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7080001 7080002 Smal_1231 Smal_1232     FALSE 0.246 46.000 0.000 NA   NA
 7080002 7080003 Smal_1232 Smal_1233     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080004 7080005 Smal_1234 Smal_1235     FALSE 0.230 172.000 0.000 1.000 Y NA
 7080005 7080006 Smal_1235 Smal_1236     FALSE 0.088 120.000 0.000 1.000   NA
 7080008 7080009 Smal_1238 Smal_1239     TRUE 0.957 -3.000 0.031 NA   NA
 7080010 7080011 Smal_1240 Smal_1241     TRUE 0.567 69.000 0.095 NA   NA
 7080014 7080015 Smal_1244 Smal_1245     TRUE 0.990 -3.000 0.417 NA   NA
 7080016 7080017 Smal_1246 Smal_1247     FALSE 0.401 94.000 0.034 NA   NA
 7080019 7080020 Smal_1249 Smal_1250     FALSE 0.085 114.000 0.000 NA   NA
 7080020 7080021 Smal_1250 Smal_1251   dnaE FALSE 0.208 56.000 0.000 NA   NA
 7080021 7080022 Smal_1251 Smal_1252 dnaE   FALSE 0.307 260.000 0.104 1.000 Y NA
 7080022 7080023 Smal_1252 Smal_1253   lpxB TRUE 0.972 -3.000 0.186 1.000 N NA
 7080023 7080024 Smal_1253 Smal_1254 lpxB   TRUE 0.996 -3.000 0.289 1.000 Y NA
 7080024 7080025 Smal_1254 Smal_1255   fabZ TRUE 0.673 17.000 0.022 1.000 N NA
 7080025 7080026 Smal_1255 Smal_1256 fabZ lpxD TRUE 0.911 -3.000 0.019 1.000 N NA
 7080026 7080027 Smal_1256 Smal_1257 lpxD   FALSE 0.111 464.000 0.000 1.000 Y NA
 7080027 7080028 Smal_1257 Smal_1258     TRUE 0.746 75.000 0.007 1.000 Y NA
 7080028 7080029 Smal_1258 Smal_1259     TRUE 0.830 56.000 0.568 1.000 N NA
 7080029 7080030 Smal_1259 Smal_1260     TRUE 0.994 3.000 0.372 1.000 Y NA
 7080030 7080031 Smal_1260 Smal_1261     TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 7080031 7080032 Smal_1261 Smal_1262     TRUE 0.966 6.000 0.409 1.000 N NA
 7080032 7080033 Smal_1262 Smal_1263   pyrH TRUE 0.757 97.000 0.626 1.000 N NA
 7080033 7080034 Smal_1263 Smal_1264 pyrH   FALSE 0.068 121.000 0.004 1.000 N NA
 7080034 7080035 Smal_1264 Smal_1265   tsf FALSE 0.012 258.000 0.002 1.000 N NA
 7080035 7080036 Smal_1265 Smal_1266 tsf rpsB TRUE 0.894 126.000 0.748 1.000 Y NA
 7080036 7080037 Smal_1266 Smal_1267 rpsB   FALSE 0.001 221.000 0.000 NA N NA
 7080037 7080038 Smal_1267 Smal_1268     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080038 7080039 Smal_1268 Smal_1269     FALSE 0.157 82.000 0.000 NA   NA
 7080039 7080040 Smal_1269 Smal_1270     TRUE 0.991 -3.000 0.444 NA   NA
 7080040 7080041 Smal_1270 Smal_1271     TRUE 0.995 8.000 0.667 NA Y NA
 7080041 7080042 Smal_1271 Smal_1272     TRUE 0.919 11.000 0.125 NA   NA
 7080043 7080044 Smal_1273 Smal_1274     TRUE 0.926 3.000 0.128 1.000 N NA
 7080044 7080045 Smal_1274 Smal_1275   dapD TRUE 0.821 0.000 0.012 1.000 N NA
 7080045 7080046 Smal_1275 Smal_1276 dapD   TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7080046 7080047 Smal_1276 Smal_1277     FALSE 0.350 32.000 0.000 NA   NA
 7080047 7080048 Smal_1277 Smal_1278     TRUE 0.981 -3.000 0.292 1.000 N NA
 7080050 7080051 Smal_1280 Smal_1281 asnB   FALSE 0.007 107.000 0.000 1.000 N NA
 7080054 7080055 Smal_1284 Smal_1285     FALSE 0.189 61.000 0.005 1.000 N NA
 7080056 7080057 Smal_1286 Smal_1287     TRUE 0.984 -3.000 0.333 1.000 N NA
 7080057 7080058 Smal_1287 Smal_1288     TRUE 0.927 12.000 0.278 1.000 N NA
 7080058 7080059 Smal_1288 Smal_1289     TRUE 0.989 8.000 0.900 1.000   NA
 7080060 7080061 Smal_1290 Smal_R0035     FALSE 0.013 330.000 0.000 NA   NA
 7080061 7080062 Smal_R0035 Smal_1291     FALSE 0.224 51.000 0.000 NA   NA
 7080064 7080065 Smal_R0036 Smal_R0037     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 7080066 7080067 Smal_1293 Smal_1294     FALSE 0.235 104.000 0.004 1.000   NA
 7080067 7080068 Smal_1294 Smal_1295     FALSE 0.047 199.000 0.002 1.000   NA
 7080069 7080070 Smal_1296 Smal_1297     TRUE 0.982 -3.000 0.303 1.000 N NA
 7080070 7080071 Smal_1297 Smal_1298     TRUE 0.940 -3.000 0.045 1.000 N NA
 7080072 7080073 Smal_1299 Smal_1300     TRUE 0.996 7.000 0.800 1.000 Y NA
 7080073 7080074 Smal_1300 Smal_1301     FALSE 0.219 178.000 0.000 1.000 Y NA
 7080075 7080076 Smal_1302 Smal_1303     FALSE 0.018 226.000 0.000 NA   NA
 7080076 7080077 Smal_1303 Smal_1304     TRUE 0.888 28.000 0.271 NA   NA
 7080077 7080078 Smal_1304 Smal_1305     TRUE 0.997 -7.000 0.914 NA   NA
 7080078 7080079 Smal_1305 Smal_1306     TRUE 0.966 -13.000 0.029 NA   NA
 7080079 7080080 Smal_1306 Smal_1307     FALSE 0.015 259.000 0.000 NA   NA
 7080080 7080081 Smal_1307 Smal_1308     TRUE 0.747 98.000 0.034 NA Y NA
 7080081 7080082 Smal_1308 Smal_1309     TRUE 0.992 20.000 0.526 0.002 Y NA
 7080082 7080083 Smal_1309 Smal_1310     TRUE 0.998 0.000 0.537 0.002 Y NA
 7080083 7080084 Smal_1310 Smal_1311     TRUE 0.875 83.000 0.033 0.002 Y NA
 7080084 7080085 Smal_1311 Smal_1312     FALSE 0.545 643.000 0.333 0.002 Y NA
 7080087 7080088 Smal_1314 Smal_1315     TRUE 0.877 0.000 0.005 NA   NA
 7080088 7080089 Smal_1315 Smal_1316     TRUE 0.949 5.000 0.160 NA   NA
 7080090 7080091 Smal_1317 Smal_1318     FALSE 0.059 286.000 0.028 1.000   NA
 7080091 7080092 Smal_1318 Smal_1319     TRUE 0.954 -3.000 0.021 1.000   NA
 7080094 7080095 Smal_1321 Smal_1322   rlmL FALSE 0.042 145.000 0.000 NA   NA
 7080096 7080097 Smal_1323 Smal_1324     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080097 7080098 Smal_1324 Smal_1325     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080098 7080099 Smal_1325 Smal_1326     FALSE 0.102 108.000 0.000 NA   NA
 7080099 7080100 Smal_1326 Smal_1327     FALSE 0.017 292.000 0.000 1.000   NA
 7080100 7080101 Smal_1327 Smal_1328     FALSE 0.199 119.000 0.013 NA   NA
 7080101 7080102 Smal_1328 Smal_1329     FALSE 0.546 64.000 0.064 NA   NA
 7080106 7080107 Smal_1333 Smal_1334     TRUE 0.601 86.000 0.267 1.000 N NA
 7080107 7080108 Smal_1334 Smal_1335     TRUE 0.706 59.000 0.000 NA Y NA
 7080110 7080111 Smal_1337 Smal_1338     FALSE 0.001 199.000 0.000 NA N NA
 7080112 7080113 Smal_1339 Smal_1340     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080113 7080114 Smal_1340 Smal_1341     TRUE 0.621 92.000 0.000 1.000 Y NA
 7080116 7080117 Smal_1343 Smal_1344     TRUE 0.997 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 7080117 7080118 Smal_1344 Smal_1345     TRUE 0.996 -3.000 0.094 0.044 Y NA
 7080118 7080119 Smal_1345 Smal_1346     FALSE 0.323 84.000 0.038 1.000 N NA
 7080120 7080121 Smal_1347 Smal_1348     TRUE 0.927 7.000 0.095 NA   NA
 7080121 7080122 Smal_1348 Smal_1349     TRUE 0.956 -3.000 0.029 NA   NA
 7080122 7080123 Smal_1349 Smal_1350     FALSE 0.456 65.000 0.024 NA   NA
 7080123 7080124 Smal_1350 Smal_1351     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 7080124 7080125 Smal_1351 Smal_1352     FALSE 0.265 43.000 0.000 NA   NA
 7080125 7080126 Smal_1352 Smal_1353     TRUE 0.991 -3.000 0.457 NA   NA
 7080127 7080128 Smal_1354 Smal_1355     TRUE 0.999 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 7080128 7080129 Smal_1355 Smal_1356     TRUE 0.995 -3.000 0.671 0.092 N NA
 7080130 7080131 Smal_1357 Smal_1358     FALSE 0.020 170.000 0.003 NA N NA
 7080132 7080133 Smal_1359 Smal_1360     TRUE 0.833 47.000 0.500 NA N NA
 7080133 7080134 Smal_1360 Smal_1361     FALSE 0.043 212.000 0.033 NA N NA
 7080134 7080135 Smal_1361 Smal_1362     TRUE 0.996 0.000 0.233 0.001 Y NA
 7080135 7080136 Smal_1362 Smal_1363     TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.001 Y NA
 7080136 7080137 Smal_1363 Smal_1364     FALSE 0.397 135.000 0.370 NA N NA
 7080137 7080138 Smal_1364 Smal_1365     TRUE 0.872 85.000 0.831 NA   NA
 7080139 7080140 Smal_1366 Smal_1367     FALSE 0.176 68.000 0.000 NA   NA
 7080140 7080141 Smal_1367 Smal_1368     FALSE 0.164 116.000 0.005 NA   NA
 7080141 7080142 Smal_1368 Smal_1369     TRUE 0.926 -3.000 0.006 NA   NA
 7080143 7080144 Smal_1370 Smal_1371     TRUE 0.997 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 7080144 7080145 Smal_1371 Smal_1372     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 7080147 7080148 Smal_1374 Smal_1375     TRUE 0.902 -3.000 0.016 1.000 N NA
 7080148 7080149 Smal_1375 Smal_1376     FALSE 0.020 231.000 0.000 1.000   NA
 7080149 7080150 Smal_1376 Smal_1377     FALSE 0.045 254.000 0.014 NA   NA
 7080150 7080151 Smal_1377 Smal_1378     FALSE 0.078 174.000 0.014 NA   NA
 7080151 7080152 Smal_1378 Smal_1379     TRUE 0.994 -3.000 0.119 NA Y NA
 7080152 7080153 Smal_1379 Smal_1380     TRUE 0.983 9.000 0.143 NA Y NA
 7080153 7080154 Smal_1380 Smal_1381     TRUE 0.986 6.000 0.171 NA Y NA
 7080154 7080155 Smal_1381 Smal_1382     TRUE 0.967 14.000 0.077 NA Y NA
 7080155 7080156 Smal_1382 Smal_1383     TRUE 0.977 24.000 0.346 NA Y NA
 7080156 7080157 Smal_1383 Smal_R0038     FALSE 0.238 48.000 0.000 NA   NA
 7080159 7080160 Smal_1385 Smal_R0039     FALSE 0.106 107.000 0.000 NA   NA
 7080160 7080161 Smal_R0039 Smal_R0040     FALSE 0.125 99.000 0.000 NA   NA
 7080162 7080163 Smal_1386 Smal_1387     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 7080163 7080164 Smal_1387 Smal_1388     FALSE 0.350 32.000 0.000 NA   NA
 7080164 7080165 Smal_1388 Smal_1389     FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 7080167 7080168 Smal_1391 Smal_1392     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7080169 7080170 Smal_1393 Smal_1394     TRUE 0.997 2.000 0.667 1.000 Y NA
 7080170 7080171 Smal_1394 Smal_1395     FALSE 0.226 59.000 0.000 1.000   NA
 7080171 7080172 Smal_1395 Smal_1396     TRUE 0.923 4.000 0.045 1.000   NA
 7080172 7080173 Smal_1396 Smal_1397     TRUE 0.998 4.000 0.746 0.055 Y NA
 7080173 7080174 Smal_1397 Smal_1398     TRUE 0.962 -3.000 0.120 1.000 N NA
 7080174 7080175 Smal_1398 Smal_1399   lpxK TRUE 0.958 0.000 0.205 1.000 N NA
 7080175 7080176 Smal_1399 Smal_1400 lpxK   TRUE 0.821 76.000 0.054 1.000 Y NA
 7080176 7080177 Smal_1400 Smal_1401     TRUE 0.942 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7080177 7080178 Smal_1401 Smal_1402     TRUE 0.927 -3.000 0.006 NA   NA
 7080178 7080179 Smal_1402 Smal_1403   uvrC TRUE 0.920 -3.000 0.004 NA   NA
 7080179 7080180 Smal_1403 Smal_1404 uvrC   TRUE 0.880 19.000 0.227 1.000 N NA
 7080180 7080181 Smal_1404 Smal_R0041     FALSE 0.029 171.000 0.000 NA   NA
 7080181 7080182 Smal_R0041 Smal_1405     FALSE 0.048 139.000 0.000 NA   NA
 7080182 7080183 Smal_1405 Smal_R0042     FALSE 0.082 116.000 0.000 NA   NA
 7080185 7080186 Smal_1407 Smal_1408     TRUE 0.985 -3.000 0.250 NA   NA
 7080186 7080187 Smal_1408 Smal_1409     TRUE 0.937 11.000 0.188 NA   NA
 7080187 7080188 Smal_1409 Smal_1410     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7080189 7080190 Smal_1411 Smal_1412     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7080191 7080192 Smal_R0043 Smal_R0044     FALSE 0.045 143.000 0.000 NA   NA
 7080192 7080193 Smal_R0044 Smal_R0045     FALSE 0.176 68.000 0.000 NA   NA
 7080193 7080194 Smal_R0045 Smal_1413     FALSE 0.024 191.000 0.000 NA   NA
 7080196 7080197 Smal_1415 Smal_1416     FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 7080198 7080199 Smal_1417 Smal_1418     FALSE 0.079 118.000 0.000 NA   NA
 7080199 7080200 Smal_1418 Smal_1419     FALSE 0.139 91.000 0.000 NA   NA
 7080201 7080202 Smal_1420 Smal_1421     FALSE 0.150 97.000 0.000 1.000   NA
 7080203 7080204 Smal_1422 Smal_1423     FALSE 0.030 169.000 0.000 NA   NA
 7080205 7080206 Smal_1424 Smal_1425     FALSE 0.013 354.000 0.000 NA   NA
 7080207 7080208 Smal_1426 Smal_1427     TRUE 0.967 -3.000 0.067 NA   NA
 7080209 7080210 Smal_1428 Smal_1429     FALSE 0.283 45.000 0.000 1.000   NA
 7080212 7080213 Smal_1430 Smal_1431     FALSE 0.053 142.000 0.000 1.000   NA
 7080213 7080214 Smal_1431 Smal_1432     FALSE 0.270 56.000 0.012 1.000 N NA
 7080214 7080215 Smal_1432 Smal_1433     FALSE 0.133 104.000 0.000 1.000   NA
 7080216 7080217 Smal_1434 Smal_1435     TRUE 0.966 -13.000 0.028 NA   NA
 7080218 7080219 Smal_1436 Smal_1437     FALSE 0.042 306.000 0.015 NA   NA
 7080219 7080220 Smal_1437 Smal_1438     FALSE 0.019 209.000 0.000 NA   NA
 7080220 7080221 Smal_1438 Smal_1439     FALSE 0.388 69.000 0.011 1.000   NA
 7080222 7080223 Smal_1440 Smal_1441     TRUE 0.986 -16.000 0.200 NA   NA
 7080224 7080225 Smal_1442 Smal_1443     TRUE 0.959 14.000 0.030 NA Y NA
 7080226 7080227 Smal_1444 Smal_1445     FALSE 0.006 111.000 0.000 1.000 N NA
 7080227 7080228 Smal_1445 Smal_1446     FALSE 0.001 235.000 0.000 1.000 N NA
 7080229 7080230 Smal_1447 Smal_1448   pyrG FALSE 0.013 401.000 0.000 NA   NA
 7080230 7080231 Smal_1448 Smal_1449 pyrG   FALSE 0.457 90.000 0.138 1.000 N NA
 7080231 7080232 Smal_1449 Smal_1450     TRUE 0.918 -3.000 0.004 NA   NA
 7080232 7080233 Smal_1450 Smal_1451     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080233 7080234 Smal_1451 Smal_1452   eno FALSE 0.231 98.000 0.003 NA   NA
 7080234 7080235 Smal_1452 Smal_1453 eno ftsB TRUE 0.946 5.000 0.241 1.000 N NA
 7080235 7080236 Smal_1453 Smal_1454 ftsB ispD TRUE 0.972 -3.000 0.185 1.000 N NA
 7080236 7080237 Smal_1454 Smal_1455 ispD ispF TRUE 0.971 35.000 0.419 1.000 Y NA
 7080237 7080238 Smal_1455 Smal_1456 ispF truD TRUE 0.981 -3.000 0.173 1.000   NA
 7080240 7080241 Smal_1458 Smal_1459 surE   TRUE 0.990 -3.000 0.353 1.000   NA
 7080241 7080242 Smal_1459 Smal_1460     TRUE 0.826 19.000 0.055 NA   NA
 7080242 7080243 Smal_1460 Smal_1461     TRUE 0.968 -3.000 0.074 NA   NA
 7080246 7080247 Smal_1464 Smal_1465     TRUE 0.786 14.000 0.014 NA   NA
 7080248 7080249 Smal_1466 Smal_1467     FALSE 0.388 70.000 0.066 NA N NA
 7080249 7080250 Smal_1467 Smal_1468     FALSE 0.113 105.000 0.000 NA   NA
 7080250 7080251 Smal_1468 Smal_1469     FALSE 0.012 547.000 0.000 NA   NA
 7080251 7080252 Smal_1469 Smal_1470   miaA TRUE 0.806 0.000 0.009 1.000 N NA
 7080252 7080253 Smal_1470 Smal_1471 miaA hfq TRUE 0.790 97.000 0.531 1.000   NA
 7080253 7080254 Smal_1471 Smal_1472 hfq   TRUE 0.904 15.000 0.141 1.000   NA
 7080254 7080255 Smal_1472 Smal_1473     FALSE 0.227 98.000 0.002 NA   NA
 7080255 7080256 Smal_1473 Smal_1474     TRUE 0.592 32.000 0.011 NA   NA
 7080256 7080257 Smal_1474 Smal_1475     FALSE 0.022 220.000 0.000 1.000   NA
 7080257 7080258 Smal_1475 Smal_1476   recA FALSE 0.029 205.000 0.000 0.051 N NA
 7080258 7080259 Smal_1476 Smal_1477 recA recX TRUE 0.598 111.000 0.296 1.000   NA
 7080259 7080260 Smal_1477 Smal_1478 recX alaS FALSE 0.405 110.000 0.085 1.000   NA
 7080260 7080261 Smal_1478 Smal_1479 alaS   FALSE 0.074 148.000 0.020 1.000 N NA
 7080261 7080262 Smal_1479 Smal_R0047     FALSE 0.160 79.000 0.000 NA   NA
 7080264 7080265 Smal_1481 Smal_1482     FALSE 0.389 112.000 0.182 1.000 N NA
 7080266 7080267 Smal_1483 Smal_1484     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080267 7080268 Smal_1484 Smal_1485     FALSE 0.011 87.000 0.000 NA N NA
 7080268 7080269 Smal_1485 Smal_1486     TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 7080271 7080272 Smal_1488 Smal_1489     FALSE 0.016 245.000 0.000 NA   NA
 7080273 7080274 Smal_1490 Smal_1491     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA N NA
 7080274 7080275 Smal_1491 Smal_1492     FALSE 0.314 142.000 0.000 NA Y NA
 7080275 7080276 Smal_1492 Smal_1493     TRUE 0.941 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7080277 7080278 Smal_1494 Smal_1495     TRUE 0.947 9.000 0.300 1.000 N NA
 7080278 7080279 Smal_1495 Smal_1496     FALSE 0.005 119.000 0.000 1.000 N NA
 7080279 7080280 Smal_1496 Smal_1497     TRUE 0.988 -3.000 0.139 0.007   NA
 7080283 7080284 Smal_1500 Smal_1501     FALSE 0.040 148.000 0.000 NA   NA
 7080287 7080288 Smal_R0048 Smal_R0049     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7080288 7080289 Smal_R0049 Smal_R0050     FALSE 0.170 70.000 0.000 NA   NA
 7080289 7080290 Smal_R0050 Smal_1504     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 7080290 7080291 Smal_1504 Smal_1505     TRUE 0.978 -3.000 0.148 NA   NA
 7080291 7080292 Smal_1505 Smal_1506     FALSE 0.387 107.000 0.065 NA   NA
 7080292 7080293 Smal_1506 Smal_1507     TRUE 0.872 13.000 0.065 NA   NA
 7080293 7080294 Smal_1507 Smal_1508     TRUE 0.955 -3.000 0.027 NA   NA
 7080294 7080295 Smal_1508 Smal_1509     FALSE 0.345 85.000 0.050 1.000 N NA
 7080295 7080296 Smal_1509 Smal_1510     FALSE 0.448 79.000 0.102 1.000 N NA
 7080297 7080298 Smal_1511 Smal_1512     TRUE 0.668 33.000 0.028 NA   NA
 7080302 7080303 Smal_1515 Smal_1516     TRUE 0.950 4.000 0.234 1.000 N NA
 7080303 7080304 Smal_1516 Smal_1517   panB TRUE 0.934 35.000 0.117 1.000 Y NA
 7080304 7080305 Smal_1517 Smal_1518 panB panC TRUE 0.998 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 7080305 7080306 Smal_1518 Smal_1519 panC   FALSE 0.167 72.000 0.000 NA   NA
 7080306 7080307 Smal_1519 Smal_1520     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7080307 7080308 Smal_1520 Smal_1521   pgi TRUE 0.880 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7080309 7080310 Smal_1522 Smal_1523     TRUE 0.995 -3.000 0.197 1.000 Y NA
 7080311 7080312 Smal_1524 Smal_1525 ispG   TRUE 0.990 -19.000 0.006 1.000 Y NA
 7080312 7080313 Smal_1525 Smal_1526     FALSE 0.001 201.000 0.000 1.000 N NA
 7080314 7080315 Smal_1527 Smal_1528     FALSE 0.206 237.000 0.008 1.000 Y NA
 7080315 7080316 Smal_1528 Smal_1529     TRUE 0.910 59.000 0.202 1.000 Y NA
 7080316 7080317 Smal_1529 Smal_1530   glk TRUE 0.990 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 7080317 7080318 Smal_1530 Smal_1531 glk   TRUE 0.992 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 7080321 7080322 Smal_1534 Smal_1535     FALSE 0.551 57.000 0.047 NA   NA
 7080322 7080323 Smal_1535 Smal_1536     TRUE 0.998 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 7080323 7080324 Smal_1536 Smal_1537   sdhA TRUE 0.991 32.000 0.705 0.001 Y NA
 7080324 7080325 Smal_1537 Smal_1538 sdhA sdhB TRUE 0.975 67.000 0.604 0.001 Y NA
 7080325 7080326 Smal_1538 Smal_1539 sdhB   FALSE 0.538 99.000 0.151 NA   NA
 7080326 7080327 Smal_1539 Smal_1540     TRUE 0.958 -49.000 0.016 NA   NA
 7080327 7080328 Smal_1540 Smal_1541     TRUE 0.719 24.000 0.020 NA   NA
 7080328 7080329 Smal_1541 Smal_1542     TRUE 0.995 -7.000 0.620 0.054 N NA
 7080329 7080330 Smal_1542 Smal_1543     FALSE 0.024 189.000 0.000 NA   NA
 7080331 7080332 Smal_1544 Smal_1545     TRUE 0.914 6.000 0.150 NA N NA
 7080332 7080333 Smal_1545 Smal_1546     FALSE 0.135 84.000 0.004 1.000 N NA
 7080336 7080337 Smal_1549 Smal_1550   coaD TRUE 0.890 27.000 0.367 1.000 N NA
 7080337 7080338 Smal_1550 Smal_1551 coaD   FALSE 0.362 62.000 0.007 NA   NA
 7080338 7080339 Smal_1551 Smal_1552     FALSE 0.172 133.000 0.020 NA   NA
 7080339 7080340 Smal_1552 Smal_1553     TRUE 0.968 -3.000 0.076 NA   NA
 7080340 7080341 Smal_1553 Smal_1554     FALSE 0.204 122.000 0.015 1.000   NA
 7080342 7080343 Smal_1555 Smal_1556   upp FALSE 0.044 144.000 0.000 NA   NA
 7080344 7080345 Smal_1557 Smal_1558     TRUE 0.972 0.000 0.220 NA   NA
 7080345 7080346 Smal_1558 Smal_1559     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080346 7080347 Smal_1559 Smal_1560     TRUE 0.621 12.000 0.000 1.000   NA
 7080349 7080350 Smal_1562 Smal_1563     FALSE 0.042 140.000 0.004 1.000 N NA
 7080352 7080353 Smal_1565 Smal_1566     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080353 7080354 Smal_1566 Smal_1567     TRUE 0.715 92.000 0.009 1.000 Y NA
 7080354 7080355 Smal_1567 Smal_1568     TRUE 0.714 113.000 0.750 1.000 N NA
 7080355 7080356 Smal_1568 Smal_1569     TRUE 0.564 65.000 0.160 1.000 N NA
 7080356 7080357 Smal_1569 Smal_1570     TRUE 0.975 -6.000 0.160 1.000 N NA
 7080357 7080358 Smal_1570 Smal_1571     FALSE 0.031 166.000 0.000 NA   NA
 7080361 7080362 Smal_1574 Smal_1575     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7080362 7080363 Smal_1575 Smal_1576     TRUE 0.956 6.000 0.208 NA   NA
 7080363 7080364 Smal_1576 Smal_1577     FALSE 0.110 106.000 0.000 NA   NA
 7080364 7080365 Smal_1577 Smal_1578     FALSE 0.188 63.000 0.000 NA   NA
 7080367 7080368 Smal_1580 Smal_1581     FALSE 0.386 28.000 0.000 NA   NA
 7080368 7080369 Smal_1581 Smal_1582     FALSE 0.025 187.000 0.000 NA   NA
 7080369 7080370 Smal_1582 Smal_1583     FALSE 0.001 372.000 0.000 1.000 N NA
 7080370 7080371 Smal_1583 Smal_1584     TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7080371 7080372 Smal_1584 Smal_1585     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 7080372 7080373 Smal_1585 Smal_1586     FALSE 0.185 64.000 0.000 NA   NA
 7080373 7080374 Smal_1586 Smal_R0052     FALSE 0.012 517.000 0.000 NA   NA
 7080375 7080376 Smal_1587 Smal_1588     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7080376 7080377 Smal_1588 Smal_1589     FALSE 0.046 141.000 0.000 NA   NA
 7080379 7080380 Smal_1591 Smal_1592     TRUE 0.926 4.000 0.063 NA   NA
 7080386 7080387 Smal_1598 Smal_1599 hrcA   FALSE 0.333 64.000 0.025 1.000 N NA
 7080387 7080388 Smal_1599 Smal_1600   dnaK FALSE 0.509 181.000 0.049 0.006 Y NA
 7080388 7080389 Smal_1600 Smal_1601 dnaK   TRUE 0.744 155.000 0.236 0.003 Y NA
 7080391 7080392 Smal_1603 Smal_1604     FALSE 0.001 645.000 0.000 NA N NA
 7080392 7080393 Smal_1604 Smal_1605     TRUE 0.854 -3.000 0.007 1.000 N NA
 7080394 7080395 Smal_1606 Smal_1607     FALSE 0.167 72.000 0.000 NA   NA
 7080395 7080396 Smal_1607 Smal_1608     TRUE 0.955 -7.000 0.012 1.000   NA
 7080396 7080397 Smal_1608 Smal_1609     FALSE 0.540 32.000 0.005 NA   NA
 7080397 7080398 Smal_1609 Smal_1610     TRUE 0.946 -3.000 0.017 NA   NA
 7080400 7080401 Smal_1612 Smal_1613     FALSE 0.024 191.000 0.000 NA   NA
 7080402 7080403 Smal_1614 Smal_1615 queA tgt TRUE 0.885 127.000 0.360 0.001 Y NA
 7080403 7080404 Smal_1615 Smal_1616 tgt yajC FALSE 0.364 135.000 0.325 NA N NA
 7080404 7080405 Smal_1616 Smal_1617 yajC secD TRUE 0.855 62.000 0.083 NA Y NA
 7080405 7080406 Smal_1617 Smal_1618 secD secF TRUE 0.982 16.000 0.084 0.001 Y NA
 7080406 7080407 Smal_1618 Smal_1619 secF   FALSE 0.014 717.000 0.000 1.000   NA
 7080408 7080409 Smal_1620 Smal_1621     FALSE 0.274 92.000 0.007 NA   NA
 7080409 7080410 Smal_1621 Smal_1622     TRUE 0.937 -3.000 0.011 NA   NA
 7080413 7080414 Smal_1625 Smal_1626     FALSE 0.090 155.000 0.046 NA N NA
 7080414 7080415 Smal_1626 Smal_1627     TRUE 0.654 33.000 0.023 NA   NA
 7080415 7080416 Smal_1627 Smal_1628     FALSE 0.024 562.000 0.004 NA   NA
 7080417 7080418 Smal_1629 Smal_1630     FALSE 0.036 155.000 0.000 NA   NA
 7080419 7080420 Smal_1631 Smal_1632     FALSE 0.016 329.000 0.000 1.000   NA
 7080420 7080421 Smal_1632 Smal_1633     FALSE 0.015 431.000 0.000 1.000   NA
 7080422 7080423 Smal_1634 Smal_1635     TRUE 0.969 10.000 0.000 0.006 Y NA
 7080424 7080425 Smal_1636 Smal_1637     TRUE 0.993 -3.000 0.778 NA N NA
 7080425 7080426 Smal_1637 Smal_1638     TRUE 0.997 -3.000 0.481 NA Y NA
 7080427 7080428 Smal_1639 Smal_1640     TRUE 0.963 -7.000 0.024 NA   NA
 7080428 7080429 Smal_1640 Smal_1641     TRUE 0.796 15.000 0.016 1.000   NA
 7080429 7080430 Smal_1641 Smal_1642     FALSE 0.371 165.000 0.364 1.000   NA
 7080430 7080431 Smal_1642 Smal_1643     TRUE 0.742 40.000 0.123 NA   NA
 7080431 7080432 Smal_1643 Smal_1644   rpmJ FALSE 0.114 147.000 0.014 NA   NA
 7080433 7080434 Smal_1645 Smal_1646 cmk rpsA FALSE 0.169 199.000 0.281 1.000 N NA
 7080434 7080435 Smal_1646 Smal_1647 rpsA ihfB TRUE 0.612 88.000 0.292 1.000 N NA
 7080435 7080436 Smal_1647 Smal_1648 ihfB   TRUE 0.666 78.000 0.208 NA   NA
 7080436 7080437 Smal_1648 Smal_1649     TRUE 0.981 7.000 0.576 NA   NA
 7080437 7080438 Smal_1649 Smal_1650     TRUE 0.864 4.000 0.038 1.000 N NA
 7080438 7080439 Smal_1650 Smal_1651     TRUE 0.982 4.000 0.048 1.000 Y NA
 7080439 7080440 Smal_1651 Smal_1652     TRUE 0.998 -3.000 0.350 0.012 Y NA
 7080441 7080442 Smal_1653 Smal_1654     TRUE 0.833 137.000 0.588 1.000 Y NA
 7080442 7080443 Smal_1654 Smal_1655     TRUE 0.709 27.000 0.019 1.000   NA
 7080444 7080445 Smal_1656 Smal_1657 ndk   TRUE 0.932 11.000 0.156 1.000   NA
 7080445 7080446 Smal_1657 Smal_1658     TRUE 0.978 -13.000 0.086 1.000   NA
 7080446 7080447 Smal_1658 Smal_1659     TRUE 0.910 19.000 0.204 1.000   NA
 7080447 7080448 Smal_1659 Smal_1660     FALSE 0.427 66.000 0.015 1.000   NA
 7080448 7080449 Smal_1660 Smal_1661     TRUE 0.986 0.000 0.492 1.000   NA
 7080449 7080450 Smal_1661 Smal_1662   engA TRUE 0.918 17.000 0.203 1.000   NA
 7080451 7080452 Smal_1663 Smal_1664     FALSE 0.134 95.000 0.000 NA   NA
 7080452 7080453 Smal_1664 Smal_1665     FALSE 0.510 75.000 0.143 1.000 N NA
 7080454 7080455 Smal_1666 Smal_1667     FALSE 0.058 131.000 0.000 NA   NA
 7080455 7080456 Smal_1667 Smal_1668     FALSE 0.018 221.000 0.000 NA   NA
 7080456 7080457 Smal_1668 Smal_1669     FALSE 0.001 227.000 0.000 1.000 N NA
 7080457 7080458 Smal_1669 Smal_1670     FALSE 0.028 484.000 0.004 1.000   NA
 7080458 7080459 Smal_1670 Smal_1671     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080459 7080460 Smal_1671 Smal_1672   guaA TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080461 7080462 Smal_1673 Smal_1674     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7080462 7080463 Smal_1674 Smal_1675     TRUE 0.977 0.000 0.293 NA   NA
 7080463 7080464 Smal_1675 Smal_1676     TRUE 0.611 42.000 0.033 NA   NA
 7080464 7080465 Smal_1676 Smal_1677     FALSE 0.011 769.000 0.000 NA   NA
 7080465 7080466 Smal_1677 Smal_1678     FALSE 0.012 553.000 0.000 NA   NA
 7080467 7080468 Smal_1679 Smal_1680     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7080471 7080472 Smal_1683 Smal_1684     TRUE 0.977 3.000 0.355 NA   NA
 7080472 7080473 Smal_1684 Smal_1685     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7080476 7080477 Smal_1688 Smal_1689     TRUE 0.667 135.000 0.059 0.065 Y NA
 7080477 7080478 Smal_1689 Smal_1690     TRUE 0.597 90.000 0.176 NA   NA
 7080479 7080480 Smal_1691 Smal_1692     FALSE 0.068 124.000 0.000 NA   NA
 7080481 7080482 Smal_1693 Smal_1694     FALSE 0.180 82.000 0.000 1.000   NA
 7080482 7080483 Smal_1694 Smal_1695     FALSE 0.035 158.000 0.000 NA   NA
 7080483 7080484 Smal_1695 Smal_1696     FALSE 0.530 15.000 0.000 NA   NA
 7080484 7080485 Smal_1696 Smal_1697     TRUE 0.900 19.000 0.000 NA Y NA
 7080485 7080486 Smal_1697 Smal_1698     TRUE 0.687 5.000 0.000 NA   NA
 7080486 7080487 Smal_1698 Smal_1699     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080487 7080488 Smal_1699 Smal_1700     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080488 7080489 Smal_1700 Smal_1701     TRUE 0.607 17.000 0.000 0.042 N NA
 7080491 7080492 Smal_1703 Smal_1704     TRUE 0.948 31.000 0.706 NA   NA
 7080493 7080494 Smal_1705 Smal_1706     FALSE 0.425 24.000 0.000 NA   NA
 7080494 7080495 Smal_1706 Smal_1707     TRUE 0.859 17.000 0.083 NA   NA
 7080495 7080496 Smal_1707 Smal_1708     FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 7080498 7080499 Smal_1710 Smal_1711     FALSE 0.014 64.000 0.000 NA N NA
 7080501 7080502 Smal_1713 Smal_1714     TRUE 0.644 29.000 0.000 0.059   NA
 7080502 7080503 Smal_1714 Smal_1715     TRUE 0.571 15.000 0.000 1.000   NA
 7080504 7080505 Smal_1716 Smal_1717     FALSE 0.270 42.000 0.000 NA   NA
 7080507 7080508 Smal_1719 Smal_1720     TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA   NA
 7080508 7080509 Smal_1720 Smal_1721     FALSE 0.125 99.000 0.000 NA   NA
 7080510 7080511 Smal_1722 Smal_1723   murB TRUE 0.932 -3.000 0.008 NA   NA
 7080511 7080512 Smal_1723 Smal_1724 murB   TRUE 0.702 9.000 0.009 1.000 N NA
 7080512 7080513 Smal_1724 Smal_1725     TRUE 0.824 9.000 0.006 1.000   NA
 7080513 7080514 Smal_1725 Smal_1726     TRUE 0.941 6.000 0.138 NA   NA
 7080514 7080515 Smal_1726 Smal_1727     FALSE 0.048 139.000 0.000 NA   NA
 7080515 7080516 Smal_1727 Smal_1728     TRUE 0.816 0.000 0.000 0.059 N NA
 7080524 7080525 Smal_1735 Smal_1736     TRUE 0.998 -10.000 0.200 0.032 Y NA
 7080526 7080527 Smal_1737 Smal_1738     TRUE 0.995 -3.000 0.156 1.000 Y NA
 7080527 7080528 Smal_1738 Smal_1739     TRUE 0.985 0.000 0.416 1.000   NA
 7080528 7080529 Smal_1739 Smal_1740     TRUE 0.968 -3.000 0.059 1.000   NA
 7080529 7080530 Smal_1740 Smal_1741     FALSE 0.174 84.000 0.000 1.000   NA
 7080532 7080533 Smal_1743 Smal_1744     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080533 7080534 Smal_1744 Smal_1745     FALSE 0.176 68.000 0.000 NA   NA
 7080536 7080537 Smal_1747 Smal_1748     FALSE 0.031 166.000 0.000 NA   NA
 7080537 7080538 Smal_1748 Smal_1749   thrA FALSE 0.013 358.000 0.000 NA   NA
 7080538 7080539 Smal_1749 Smal_1750 thrA   TRUE 0.988 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 7080539 7080540 Smal_1750 Smal_1751     TRUE 0.963 30.000 0.233 1.000 Y NA
 7080542 7080543 Smal_1753 Smal_1754 hisS   TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080543 7080544 Smal_1754 Smal_1755     FALSE 0.015 274.000 0.000 NA   NA
 7080544 7080545 Smal_1755 Smal_1756   hisG TRUE 0.604 35.000 0.013 1.000   NA
 7080545 7080546 Smal_1756 Smal_1757 hisG hisD TRUE 0.997 -3.000 0.171 0.003 Y NA
 7080546 7080547 Smal_1757 Smal_1758 hisD   TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 7080547 7080548 Smal_1758 Smal_1759     TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 7080548 7080549 Smal_1759 Smal_1760   hisH TRUE 0.997 -3.000 0.128 0.003 Y NA
 7080549 7080550 Smal_1760 Smal_1761 hisH   TRUE 0.997 -3.000 0.210 0.003 Y NA
 7080550 7080551 Smal_1761 Smal_1762     TRUE 0.999 -6.000 0.433 0.003 Y NA
 7080551 7080552 Smal_1762 Smal_1763     TRUE 0.999 -10.000 0.430 0.003 Y NA
 7080552 7080553 Smal_1763 Smal_1764     FALSE 0.077 157.000 0.003 1.000   NA
 7080553 7080554 Smal_1764 Smal_1765     FALSE 0.306 37.000 0.000 NA   NA
 7080554 7080555 Smal_1765 Smal_1766     FALSE 0.150 85.000 0.000 NA   NA
 7080555 7080556 Smal_1766 Smal_1767     FALSE 0.017 52.000 0.000 1.000 N NA
 7080556 7080557 Smal_1767 Smal_1768     TRUE 0.935 -3.000 0.038 1.000 N NA
 7080557 7080558 Smal_1768 Smal_1769     FALSE 0.115 402.000 0.000 1.000 Y NA
 7080558 7080559 Smal_1769 Smal_1770     FALSE 0.194 194.000 0.000 1.000 Y NA
 7080559 7080560 Smal_1770 Smal_1771     TRUE 0.963 12.000 0.304 0.003 N NA
 7080561 7080562 Smal_1772 Smal_1773     FALSE 0.025 202.000 0.000 1.000   NA
 7080563 7080564 Smal_1774 Smal_1775     FALSE 0.009 97.000 0.000 1.000 N NA
 7080564 7080565 Smal_1775 Smal_1776     FALSE 0.521 61.000 0.115 1.000 N NA
 7080565 7080566 Smal_1776 Smal_1777     TRUE 0.991 8.000 0.308 1.000 Y NA
 7080566 7080567 Smal_1777 Smal_1778     TRUE 0.992 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 7080567 7080568 Smal_1778 Smal_1779     FALSE 0.257 163.000 0.000 1.000 Y NA
 7080569 7080570 Smal_1780 Smal_1781     TRUE 0.966 4.000 0.231 1.000   NA
 7080570 7080571 Smal_1781 Smal_1782     TRUE 0.590 88.000 0.148 1.000   NA
 7080573 7080574 Smal_1784 Smal_1785     TRUE 0.977 83.000 0.833 0.002 Y NA
 7080577 7080578 Smal_1788 Smal_1789     TRUE 0.612 63.000 0.111 NA   NA
 7080578 7080579 Smal_1789 Smal_1790     TRUE 0.839 41.000 0.294 NA   NA
 7080580 7080581 Smal_1791 Smal_1792     TRUE 0.970 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7080582 7080583 Smal_1793 Smal_1794     FALSE 0.027 37.000 0.000 1.000 N NA
 7080583 7080584 Smal_1794 Smal_1795     TRUE 0.876 -19.000 0.000 NA   NA
 7080584 7080585 Smal_1795 Smal_1796     FALSE 0.152 84.000 0.000 NA   NA
 7080586 7080587 Smal_1797 Smal_1798     TRUE 0.972 -10.000 0.051 NA   NA
 7080587 7080588 Smal_1798 Smal_1799     FALSE 0.525 51.000 0.085 1.000 N NA
 7080588 7080589 Smal_1799 Smal_1800     FALSE 0.537 100.000 0.125 0.058 N NA
 7080589 7080590 Smal_1800 Smal_1801     TRUE 0.961 -3.000 0.042 NA   NA
 7080590 7080591 Smal_1801 Smal_1802     TRUE 0.909 3.000 0.027 NA   NA
 7080592 7080593 Smal_1803 Smal_1804     TRUE 0.995 -3.000 0.178 1.000 Y NA
 7080593 7080594 Smal_1804 Smal_1805     TRUE 0.916 0.000 0.019 NA   NA
 7080595 7080596 Smal_1806 Smal_1807     FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 7080596 7080597 Smal_1807 Smal_1808     FALSE 0.236 56.000 0.000 1.000   NA
 7080597 7080598 Smal_1808 Smal_1809   fabG FALSE 0.121 5.000 0.000 1.000 N NA
 7080599 7080600 Smal_1810 Smal_1811     FALSE 0.228 302.000 0.034 1.000 Y NA
 7080600 7080601 Smal_1811 Smal_1812   carB TRUE 0.818 150.000 0.345 0.001 Y NA
 7080601 7080602 Smal_1812 Smal_1813 carB greA TRUE 0.978 -3.000 0.241 1.000 N NA
 7080602 7080603 Smal_1813 Smal_1814 greA   TRUE 0.856 5.000 0.011 NA   NA
 7080604 7080605 Smal_1815 Smal_1816     TRUE 0.948 1.000 0.100 NA   NA
 7080608 7080609 Smal_1819 Smal_1820     FALSE 0.016 343.000 0.000 1.000   NA
 7080611 7080612 Smal_1822 Smal_1823     FALSE 0.169 71.000 0.000 NA   NA
 7080612 7080613 Smal_1823 Smal_1824     FALSE 0.265 49.000 0.000 1.000   NA
 7080613 7080614 Smal_1824 Smal_1825     FALSE 0.013 802.000 0.000 1.000   NA
 7080614 7080615 Smal_1825 Smal_1826     FALSE 0.014 64.000 0.000 1.000 N NA
 7080615 7080616 Smal_1826 Smal_1827   lysS FALSE 0.001 274.000 0.000 1.000 N NA
 7080616 7080617 Smal_1827 Smal_1828 lysS   FALSE 0.020 206.000 0.005 1.000 N NA
 7080617 7080618 Smal_1828 Smal_1829     TRUE 0.997 2.000 0.450 0.027 Y NA
 7080619 7080620 Smal_1830 Smal_1831     FALSE 0.481 202.000 0.108 0.058 Y NA
 7080620 7080621 Smal_1831 Smal_1832     FALSE 0.001 223.000 0.000 1.000 N NA
 7080621 7080622 Smal_1832 Smal_1833     TRUE 0.737 103.000 0.634 1.000 N NA
 7080622 7080623 Smal_1833 Smal_1834     TRUE 0.861 39.000 0.459 1.000 N NA
 7080626 7080627 Smal_1837 Smal_1838     TRUE 0.948 7.000 0.177 NA   NA
 7080627 7080628 Smal_1838 Smal_1839     TRUE 0.596 40.000 0.023 NA   NA
 7080628 7080629 Smal_1839 Smal_1840     FALSE 0.095 116.000 0.000 1.000   NA
 7080629 7080630 Smal_1840 Smal_1841     TRUE 0.925 0.000 0.000 0.005   NA
 7080631 7080632 Smal_1842 Smal_1843     FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 7080632 7080633 Smal_1843 Smal_1844     TRUE 0.996 -3.000 0.267 1.000 Y NA
 7080633 7080634 Smal_1844 Smal_1845     TRUE 0.992 -3.000 0.056 1.000 Y NA
 7080634 7080635 Smal_1845 Smal_1846     TRUE 0.813 38.000 0.000 1.000 Y NA
 7080635 7080636 Smal_1846 Smal_1847     FALSE 0.175 731.000 0.000 0.009 Y NA
 7080636 7080637 Smal_1847 Smal_1848     TRUE 0.600 102.000 0.222 NA   NA
 7080637 7080638 Smal_1848 Smal_1849     FALSE 0.451 137.000 0.333 NA   NA
 7080638 7080639 Smal_1849 Smal_1850     FALSE 0.126 205.000 0.200 1.000 N NA
 7080639 7080640 Smal_1850 Smal_1851     FALSE 0.002 153.000 0.000 1.000 N NA
 7080640 7080641 Smal_1851 Smal_1852     FALSE 0.190 393.000 0.000 0.009 Y NA
 7080641 7080642 Smal_1852 Smal_1853     TRUE 0.913 46.000 0.135 1.000 Y NA
 7080642 7080643 Smal_1853 Smal_1854     TRUE 0.992 -3.000 0.514 NA   NA
 7080643 7080644 Smal_1854 Smal_1855     FALSE 0.014 286.000 0.000 NA   NA
 7080644 7080645 Smal_1855 Smal_1856     FALSE 0.253 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7080645 7080646 Smal_1856 Smal_1857     TRUE 0.937 5.000 0.199 1.000 N NA
 7080646 7080647 Smal_1857 Smal_1858   motC TRUE 0.992 2.000 0.248 1.000 Y NA
 7080647 7080648 Smal_1858 Smal_1859 motC   FALSE 0.397 148.000 0.009 1.000 Y NA
 7080648 7080649 Smal_1859 Smal_1860     TRUE 0.994 3.000 0.341 1.000 Y NA
 7080649 7080650 Smal_1860 Smal_1861     TRUE 0.996 0.000 0.516 1.000 Y NA
 7080650 7080651 Smal_1861 Smal_1862     TRUE 0.744 70.000 0.283 0.095 N NA
 7080651 7080652 Smal_1862 Smal_1863     TRUE 0.988 -3.000 0.482 1.000 N NA
 7080652 7080653 Smal_1863 Smal_1864     TRUE 0.989 -13.000 0.241 0.087 N NA
 7080653 7080654 Smal_1864 Smal_1865   flhA FALSE 0.395 146.000 0.008 1.000 Y NA
 7080654 7080655 Smal_1865 Smal_1866 flhA flhB TRUE 0.995 -3.000 0.029 0.012 Y NA
 7080655 7080656 Smal_1866 Smal_1867 flhB   FALSE 0.107 119.000 0.012 1.000 N NA
 7080656 7080657 Smal_1867 Smal_1868     FALSE 0.002 165.000 0.000 1.000 N NA
 7080657 7080658 Smal_1868 Smal_1869     TRUE 0.981 14.000 0.215 1.000 Y NA
 7080658 7080659 Smal_1869 Smal_1870   fliP TRUE 0.917 83.000 0.177 0.012 Y NA
 7080659 7080660 Smal_1870 Smal_1871 fliP   TRUE 0.982 2.000 0.029 1.000 Y NA
 7080660 7080661 Smal_1871 Smal_1872     TRUE 0.997 -3.000 0.443 1.000 Y NA
 7080661 7080662 Smal_1872 Smal_1873   fliM TRUE 0.999 -3.000 0.741 0.001 Y NA
 7080662 7080663 Smal_1873 Smal_1874 fliM   TRUE 0.984 11.000 0.029 0.001 Y NA
 7080663 7080664 Smal_1874 Smal_1875     FALSE 0.361 173.000 0.025 1.000 Y NA
 7080664 7080665 Smal_1875 Smal_1876     TRUE 0.989 0.000 0.317 0.005   NA
 7080665 7080666 Smal_1876 Smal_1877     TRUE 0.922 4.000 0.044 1.000   NA
 7080666 7080667 Smal_1877 Smal_1878     TRUE 0.993 -3.000 0.085 NA Y NA
 7080667 7080668 Smal_1878 Smal_1879     TRUE 0.997 -3.000 0.320 NA Y NA
 7080668 7080669 Smal_1879 Smal_1880   fliF TRUE 0.998 -7.000 0.189 0.005 Y NA
 7080669 7080670 Smal_1880 Smal_1881 fliF   TRUE 0.997 13.000 0.910 0.005 Y NA
 7080670 7080671 Smal_1881 Smal_1882     FALSE 0.012 439.000 0.000 NA   NA
 7080671 7080672 Smal_1882 Smal_1883     FALSE 0.022 198.000 0.000 NA   NA
 7080672 7080673 Smal_1883 Smal_1884     TRUE 0.995 -3.000 0.050 0.095 Y NA
 7080673 7080674 Smal_1884 Smal_1885     TRUE 0.859 15.000 0.050 0.095 N NA
 7080675 7080676 Smal_1886 Smal_1887     TRUE 0.770 85.000 0.000 0.004 Y NA
 7080677 7080678 Smal_1888 Smal_1889     TRUE 0.665 86.000 0.238 NA   NA
 7080678 7080679 Smal_1889 Smal_1890     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080679 7080680 Smal_1890 Smal_1891     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080680 7080681 Smal_1891 Smal_1892     TRUE 0.898 131.000 0.500 0.002 Y NA
 7080681 7080682 Smal_1892 Smal_1893     FALSE 0.113 442.000 0.000 1.000 Y NA
 7080682 7080683 Smal_1893 Smal_1894     TRUE 0.778 87.000 0.000 0.001 Y NA
 7080683 7080684 Smal_1894 Smal_1895     TRUE 0.804 73.000 0.000 0.001 Y NA
 7080684 7080685 Smal_1895 Smal_1896   flgL FALSE 0.206 418.000 0.000 0.001 Y NA
 7080685 7080686 Smal_1896 Smal_1897 flgL flgK TRUE 0.997 -3.000 0.108 0.001 Y NA
 7080686 7080687 Smal_1897 Smal_1898 flgK flgJ TRUE 0.997 9.000 0.705 0.002 Y NA
 7080687 7080688 Smal_1898 Smal_1899 flgJ flgI TRUE 0.997 2.000 0.405 0.006 Y NA
 7080688 7080689 Smal_1899 Smal_1900 flgI flgH TRUE 0.989 9.000 0.106 0.006 Y NA
 7080689 7080690 Smal_1900 Smal_1901 flgH flgG TRUE 0.976 23.000 0.120 0.005 Y NA
 7080690 7080691 Smal_1901 Smal_1902 flgG flgF TRUE 0.900 103.000 0.174 0.001 Y NA
 7080691 7080692 Smal_1902 Smal_1903 flgF flgE TRUE 0.988 33.000 0.594 0.004 Y NA
 7080692 7080693 Smal_1903 Smal_1904 flgE flgD TRUE 0.986 33.000 0.875 NA Y NA
 7080693 7080694 Smal_1904 Smal_1905 flgD flgC TRUE 0.963 24.000 0.174 NA Y NA
 7080694 7080695 Smal_1905 Smal_1906 flgC flgB TRUE 0.997 4.000 0.611 0.003 Y NA
 7080695 7080696 Smal_1906 Smal_1907 flgB   TRUE 0.661 150.000 0.267 1.000 Y NA
 7080697 7080698 Smal_1908 Smal_1909 flgA   TRUE 0.769 76.000 0.371 NA   NA
 7080698 7080699 Smal_1909 Smal_1910     TRUE 0.984 -3.000 0.052 0.002   NA
 7080699 7080700 Smal_1910 Smal_1911     TRUE 0.741 92.000 0.364 1.000   NA
 7080701 7080702 Smal_1912 Smal_1913     TRUE 0.974 5.000 0.200 0.032   NA
 7080704 7080705 Smal_1915 Smal_1916     FALSE 0.176 68.000 0.000 NA   NA
 7080705 7080706 Smal_1916 Smal_1917     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7080706 7080707 Smal_1917 Smal_1918     FALSE 0.124 166.000 0.036 NA   NA
 7080707 7080708 Smal_1918 Smal_1919   mnmA TRUE 0.980 -3.000 0.180 NA   NA
 7080708 7080709 Smal_1919 Smal_1920 mnmA   TRUE 0.969 -3.000 0.158 1.000 N NA
 7080709 7080710 Smal_1920 Smal_1921     TRUE 0.879 2.000 0.010 NA   NA
 7080714 7080715 Smal_1925 Smal_1926     FALSE 0.061 129.000 0.000 NA   NA
 7080715 7080716 Smal_1926 Smal_1927   infA FALSE 0.028 172.000 0.000 NA   NA
 7080716 7080717 Smal_1927 Smal_1928 infA aat FALSE 0.248 87.000 0.020 1.000 N NA
 7080722 7080723 Smal_1933 Smal_1934     TRUE 0.630 40.000 0.033 NA   NA
 7080723 7080724 Smal_1934 Smal_1935   lolA FALSE 0.105 112.000 0.011 NA N NA
 7080724 7080725 Smal_1935 Smal_1936 lolA   FALSE 0.092 235.000 0.167 1.000 N NA
 7080725 7080726 Smal_1936 Smal_1937     FALSE 0.025 199.000 0.000 1.000   NA
 7080728 7080729 Smal_1939 Smal_1940     FALSE 0.282 123.000 0.065 NA   NA
 7080729 7080730 Smal_1940 Smal_1941     FALSE 0.220 52.000 0.000 NA   NA
 7080730 7080731 Smal_1941 Smal_1942     TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 7080731 7080732 Smal_1942 Smal_1943     TRUE 0.996 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 7080732 7080733 Smal_1943 Smal_1944     FALSE 0.183 65.000 0.000 NA   NA
 7080733 7080734 Smal_1944 Smal_1945     FALSE 0.012 441.000 0.000 NA   NA
 7080734 7080735 Smal_1945 Smal_1946     FALSE 0.017 232.000 0.000 NA   NA
 7080735 7080736 Smal_1946 Smal_1947     FALSE 0.094 111.000 0.000 NA   NA
 7080737 7080738 Smal_1948 Smal_1949     FALSE 0.454 141.000 0.000 0.026 Y NA
 7080738 7080739 Smal_1949 Smal_1950     FALSE 0.002 170.000 0.000 1.000 N NA
 7080739 7080740 Smal_1950 Smal_1951     TRUE 0.949 9.000 0.000 1.000 Y NA
 7080740 7080741 Smal_1951 Smal_1952     TRUE 0.988 -3.000 0.324 1.000   NA
 7080741 7080742 Smal_1952 Smal_1953     TRUE 0.974 -3.000 0.113 NA   NA
 7080742 7080743 Smal_1953 Smal_1954     TRUE 0.977 -10.000 0.087 NA   NA
 7080743 7080744 Smal_1954 Smal_1955     TRUE 0.965 -3.000 0.053 NA   NA
 7080744 7080745 Smal_1955 Smal_1956     TRUE 0.995 -3.000 0.722 NA   NA
 7080745 7080746 Smal_1956 Smal_1957     TRUE 0.933 2.000 0.047 1.000   NA
 7080746 7080747 Smal_1957 Smal_1958     FALSE 0.157 82.000 0.000 NA   NA
 7080748 7080749 Smal_1959 Smal_1960     TRUE 0.939 33.000 0.898 NA N NA
 7080749 7080750 Smal_1960 Smal_1961     FALSE 0.048 22.000 0.000 NA N NA
 7080751 7080752 Smal_1962 Smal_1963     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 7080755 7080756 Smal_1966 Smal_1967     FALSE 0.141 90.000 0.000 NA   NA
 7080756 7080757 Smal_1967 Smal_1968     FALSE 0.161 167.000 0.086 NA   NA
 7080761 7080762 Smal_1972 Smal_1973     FALSE 0.114 149.000 0.000 0.049   NA
 7080762 7080763 Smal_1973 Smal_1974     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080764 7080765 Smal_1975 Smal_1976     FALSE 0.012 536.000 0.000 NA   NA
 7080765 7080766 Smal_1976 Smal_1977     TRUE 0.733 55.000 0.000 1.000 Y NA
 7080766 7080767 Smal_1977 Smal_1978     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080768 7080769 Smal_1979 Smal_1980     FALSE 0.042 25.000 0.000 NA N NA
 7080769 7080770 Smal_1980 Smal_1981     FALSE 0.050 21.000 0.000 NA N NA
 7080770 7080771 Smal_1981 Smal_1982     FALSE 0.129 4.000 0.000 1.000 N NA
 7080771 7080772 Smal_1982 Smal_1983     TRUE 0.939 25.000 0.003 0.038 Y NA
 7080773 7080774 Smal_1984 Smal_1985     FALSE 0.012 431.000 0.000 NA   NA
 7080775 7080776 Smal_1986 Smal_1987     FALSE 0.012 457.000 0.000 NA   NA
 7080776 7080777 Smal_1987 Smal_1988     FALSE 0.016 241.000 0.000 NA   NA
 7080778 7080779 Smal_1989 Smal_1990     TRUE 0.876 -24.000 0.000 NA   NA
 7080779 7080780 Smal_1990 Smal_1991     FALSE 0.096 10.000 0.000 NA N NA
 7080780 7080781 Smal_1991 Smal_1992     TRUE 0.999 0.000 0.917 0.001 Y NA
 7080781 7080782 Smal_1992 Smal_1993     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.038 Y NA
 7080782 7080783 Smal_1993 Smal_1994     FALSE 0.001 481.000 0.000 1.000 N NA
 7080783 7080784 Smal_1994 Smal_1995     TRUE 0.895 23.000 0.333 1.000 N NA
 7080784 7080785 Smal_1995 Smal_1996     FALSE 0.003 139.000 0.000 1.000 N NA
 7080785 7080786 Smal_1996 Smal_1997     TRUE 0.942 -3.000 0.000 0.064   NA
 7080787 7080788 Smal_1998 Smal_1999     FALSE 0.208 56.000 0.000 NA   NA
 7080788 7080789 Smal_1999 Smal_2000     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7080790 7080791 Smal_2001 Smal_2002     FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 7080791 7080792 Smal_2002 Smal_2003     TRUE 0.688 63.000 0.188 NA   NA
 7080795 7080796 Smal_2006 Smal_2007     TRUE 0.870 64.000 0.378 0.028   NA
 7080796 7080797 Smal_2007 Smal_2008     TRUE 0.765 44.000 0.048 0.028   NA
 7080798 7080799 Smal_2009 Smal_2010     FALSE 0.003 139.000 0.000 1.000 N NA
 7080800 7080801 Smal_2011 Smal_2012     FALSE 0.080 12.000 0.000 NA N NA
 7080801 7080802 Smal_2012 Smal_2013     FALSE 0.446 26.000 0.000 1.000   NA
 7080802 7080803 Smal_2013 Smal_2014     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080804 7080805 Smal_2015 Smal_2016     FALSE 0.242 47.000 0.000 NA   NA
 7080805 7080806 Smal_2016 Smal_2017     TRUE 0.575 100.000 0.000 NA Y NA
 7080806 7080807 Smal_2017 Smal_2018     TRUE 0.985 -3.000 0.375 NA N NA
 7080807 7080808 Smal_2018 Smal_2019     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7080808 7080809 Smal_2019 Smal_2020     FALSE 0.015 266.000 0.000 NA   NA
 7080809 7080810 Smal_2020 Smal_2021     FALSE 0.027 176.000 0.000 NA   NA
 7080811 7080812 Smal_2022 Smal_2023     TRUE 0.993 -3.000 0.833 NA N NA
 7080812 7080813 Smal_2023 Smal_2024     FALSE 0.168 0.000 0.000 NA N NA
 7080813 7080814 Smal_2024 Smal_2025     FALSE 0.014 62.000 0.000 1.000 N NA
 7080814 7080815 Smal_2025 Smal_2026     TRUE 0.823 57.000 0.000 0.010 Y NA
 7080816 7080817 Smal_2027 Smal_2028     FALSE 0.016 239.000 0.000 NA   NA
 7080817 7080818 Smal_2028 Smal_2029     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7080819 7080820 Smal_2030 Smal_2031     TRUE 0.995 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 7080820 7080821 Smal_2031 Smal_2032     TRUE 0.939 87.000 0.562 1.000 Y NA
 7080821 7080822 Smal_2032 Smal_2033     TRUE 0.835 15.000 0.025 0.056 N NA
 7080822 7080823 Smal_2033 Smal_2034     FALSE 0.360 136.000 0.000 1.000 Y NA
 7080824 7080825 Smal_2035 Smal_2036     FALSE 0.130 97.000 0.000 NA   NA
 7080827 7080828 Smal_2038 Smal_2039     TRUE 0.887 0.000 0.031 1.000 N NA
 7080829 7080830 Smal_2040 Smal_2041     TRUE 0.602 59.000 0.088 NA   NA
 7080830 7080831 Smal_2041 Smal_2042     TRUE 0.937 39.000 0.775 NA   NA
 7080832 7080833 Smal_2043 Smal_2044     FALSE 0.406 26.000 0.000 NA   NA
 7080836 7080837 Smal_2047 Smal_2048     TRUE 0.647 9.000 0.000 NA   NA
 7080837 7080838 Smal_2048 Smal_2049     TRUE 0.991 -3.000 0.444 NA   NA
 7080838 7080839 Smal_2049 Smal_2050     FALSE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 7080840 7080841 Smal_2051 Smal_2052     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7080841 7080842 Smal_2052 Smal_2053     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7080843 7080844 Smal_2054 Smal_2055     FALSE 0.042 302.000 0.000 0.048   NA
 7080846 7080847 Smal_2057 Smal_2058     FALSE 0.522 33.000 0.029 NA N NA
 7080847 7080848 Smal_2058 Smal_2059     TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 7080848 7080849 Smal_2059 Smal_2060     FALSE 0.027 37.000 0.000 1.000 N NA
 7080852 7080853 Smal_2063 Smal_2064     FALSE 0.026 179.000 0.000 NA   NA
 7080853 7080854 Smal_2064 Smal_2065     FALSE 0.527 103.000 0.250 1.000 N NA
 7080855 7080856 Smal_2066 Smal_2067     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080856 7080857 Smal_2067 Smal_2068     TRUE 0.971 -3.000 0.091 NA   NA
 7080857 7080858 Smal_2068 Smal_2069     TRUE 0.702 61.000 0.318 NA N NA
 7080858 7080859 Smal_2069 Smal_2070     FALSE 0.048 22.000 0.000 1.000 N NA
 7080859 7080860 Smal_2070 Smal_2071     FALSE 0.089 11.000 0.000 1.000 N NA
 7080861 7080862 Smal_2072 Smal_2073     FALSE 0.071 122.000 0.000 NA   NA
 7080862 7080863 Smal_2073 Smal_2074     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7080863 7080864 Smal_2074 Smal_2075     FALSE 0.050 248.000 0.000 0.031   NA
 7080865 7080866 Smal_2076 Smal_2077     FALSE 0.109 111.000 0.000 1.000   NA
 7080867 7080868 Smal_2078 Smal_2079     TRUE 0.967 -3.000 0.069 NA   NA
 7080870 7080871 Smal_2081 Smal_2082     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.063 Y NA
 7080872 7080873 Smal_2083 Smal_2084     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080873 7080874 Smal_2084 Smal_2085     FALSE 0.173 69.000 0.000 NA   NA
 7080874 7080875 Smal_2085 Smal_2086     TRUE 0.991 -7.000 0.333 NA   NA
 7080877 7080878 Smal_2088 Smal_2089     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080878 7080879 Smal_2089 Smal_2090     TRUE 0.907 44.000 0.625 NA   NA
 7080879 7080880 Smal_2090 Smal_2091     TRUE 0.853 100.000 0.875 NA   NA
 7080880 7080881 Smal_2091 Smal_2092     TRUE 0.973 14.000 0.667 NA   NA
 7080881 7080882 Smal_2092 Smal_2093     TRUE 0.810 47.000 0.292 NA   NA
 7080882 7080883 Smal_2093 Smal_2094     FALSE 0.024 189.000 0.000 NA   NA
 7080883 7080884 Smal_2094 Smal_2095     FALSE 0.138 92.000 0.000 NA   NA
 7080884 7080885 Smal_2095 Smal_2096     FALSE 0.018 222.000 0.000 NA   NA
 7080885 7080886 Smal_2096 Smal_2097     FALSE 0.258 44.000 0.000 NA   NA
 7080886 7080887 Smal_2097 Smal_2098     FALSE 0.397 27.000 0.000 NA   NA
 7080887 7080888 Smal_2098 Smal_2099     TRUE 0.826 61.000 0.444 NA   NA
 7080888 7080889 Smal_2099 Smal_2100     TRUE 0.801 71.000 0.444 NA   NA
 7080889 7080890 Smal_2100 Smal_2101     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 7080890 7080891 Smal_2101 Smal_2102     TRUE 0.844 48.000 0.375 NA   NA
 7080891 7080892 Smal_2102 Smal_2103     TRUE 0.975 19.000 0.875 NA   NA
 7080892 7080893 Smal_2103 Smal_2104     FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 7080895 7080896 Smal_2106 Smal_2107     TRUE 0.815 21.000 0.062 NA   NA
 7080896 7080897 Smal_2107 Smal_2108     TRUE 0.995 -3.000 0.800 NA   NA
 7080898 7080899 Smal_2109 Smal_2110     FALSE 0.058 18.000 0.000 1.000 N NA
 7080900 7080901 Smal_2111 Smal_2112     FALSE 0.193 71.000 0.000 1.000   NA
 7080901 7080902 Smal_2112 Smal_2113     FALSE 0.063 127.000 0.000 NA   NA
 7080902 7080903 Smal_2113 Smal_2114     FALSE 0.028 172.000 0.000 NA   NA
 7080904 7080905 Smal_2115 Smal_2116     TRUE 0.973 3.000 0.439 1.000 N NA
 7080906 7080907 Smal_2117 Smal_2118     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 7080907 7080908 Smal_2118 Smal_2119     TRUE 0.997 4.000 0.826 1.000 Y NA
 7080908 7080909 Smal_2119 Smal_2120     FALSE 0.059 201.000 0.000 0.085   NA
 7080911 7080912 Smal_2122 Smal_2123     FALSE 0.183 196.000 0.000 NA Y NA
 7080912 7080913 Smal_2123 Smal_2124     FALSE 0.216 53.000 0.000 NA   NA
 7080913 7080914 Smal_2124 Smal_2125     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080914 7080915 Smal_2125 Smal_2126     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 7080916 7080917 Smal_2127 Smal_2128     FALSE 0.214 54.000 0.000 NA   NA
 7080919 7080920 Smal_2130 Smal_2131     FALSE 0.030 169.000 0.000 NA   NA
 7080920 7080921 Smal_2131 Smal_2132     FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 7080922 7080923 Smal_2133 Smal_2134     FALSE 0.016 306.000 0.000 1.000   NA
 7080923 7080924 Smal_2134 Smal_2135     FALSE 0.014 294.000 0.000 NA   NA
 7080924 7080925 Smal_2135 Smal_2136     FALSE 0.188 63.000 0.000 NA   NA
 7080925 7080926 Smal_2136 Smal_2137     TRUE 0.749 32.000 0.072 NA   NA
 7080926 7080927 Smal_2137 Smal_2138     FALSE 0.203 130.000 0.029 NA   NA
 7080927 7080928 Smal_2138 Smal_2139     TRUE 0.999 -7.000 0.800 1.000 Y NA
 7080928 7080929 Smal_2139 Smal_2140     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080930 7080931 Smal_2141 Smal_2142     TRUE 0.895 10.000 0.053 NA   NA
 7080932 7080933 Smal_2143 Smal_2144     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA N NA
 7080933 7080934 Smal_2144 Smal_2145     TRUE 0.660 72.000 0.000 NA Y NA
 7080934 7080935 Smal_2145 Smal_2146     FALSE 0.152 96.000 0.000 1.000   NA
 7080936 7080937 Smal_2147 Smal_2148     FALSE 0.012 478.000 0.000 NA   NA
 7080941 7080942 Smal_2152 Smal_2153     TRUE 0.967 5.000 0.270 1.000   NA
 7080942 7080943 Smal_2153 Smal_2154     FALSE 0.026 182.000 0.000 NA   NA
 7080943 7080944 Smal_2154 Smal_2155     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080944 7080945 Smal_2155 Smal_2156     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7080945 7080946 Smal_2156 Smal_2157     TRUE 0.897 3.000 0.019 NA   NA
 7080946 7080947 Smal_2157 Smal_2158     TRUE 0.998 -7.000 0.605 NA Y NA
 7080947 7080948 Smal_2158 Smal_2159     TRUE 0.957 12.000 0.336 NA   NA
 7080951 7080952 Smal_2162 Smal_2163     FALSE 0.106 112.000 0.000 1.000   NA
 7080952 7080953 Smal_2163 Smal_2164     TRUE 0.646 11.000 0.000 1.000   NA
 7080953 7080954 Smal_2164 Smal_2165     FALSE 0.020 46.000 0.000 1.000 N NA
 7080954 7080955 Smal_2165 Smal_2166     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7080958 7080959 Smal_2169 Smal_2170     TRUE 0.988 -3.000 0.455 1.000 N NA
 7080959 7080960 Smal_2170 Smal_2171     TRUE 0.997 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 7080961 7080962 Smal_2172 Smal_2173     TRUE 0.997 -7.000 0.222 1.000 Y NA
 7080963 7080964 Smal_2174 Smal_2175     FALSE 0.150 97.000 0.000 1.000   NA
 7080964 7080965 Smal_2175 Smal_2176     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7080965 7080966 Smal_2176 Smal_2177     FALSE 0.017 236.000 0.000 NA   NA
 7080968 7080969 Smal_2179 Smal_2180     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 7080969 7080970 Smal_2180 Smal_2181     TRUE 0.968 4.000 0.278 NA   NA
 7080970 7080971 Smal_2181 Smal_2182     FALSE 0.169 71.000 0.000 NA   NA
 7080971 7080972 Smal_2182 Smal_2183     TRUE 0.966 10.000 0.000 0.031 Y NA
 7080972 7080973 Smal_2183 Smal_2184     FALSE 0.102 113.000 0.000 1.000   NA
 7080973 7080974 Smal_2184 Smal_2185     TRUE 0.798 92.000 0.556 NA   NA
 7080974 7080975 Smal_2185 Smal_2186     TRUE 0.842 55.000 0.444 NA   NA
 7080975 7080976 Smal_2186 Smal_2187     FALSE 0.202 183.000 0.000 NA Y NA
 7080976 7080977 Smal_2187 Smal_2188     FALSE 0.011 83.000 0.000 NA N NA
 7080977 7080978 Smal_2188 Smal_2189     FALSE 0.437 141.000 0.000 0.062 Y NA