MicrobesOnline Operon Predictions for Stenotrophomonas maltophilia R551-3

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7078737 7078738 Smal_0001 Smal_0002 dnaA   FALSE 0.458 277.000 0.328 1.000 Y NA
 7078738 7078739 Smal_0002 Smal_0003   recF FALSE 0.391 998.000 0.318 1.000 Y NA
 7078739 7078740 Smal_0003 Smal_0004 recF gyrB TRUE 0.881 113.000 0.249 0.005 Y NA
 7078740 7078741 Smal_0004 Smal_0005 gyrB   FALSE 0.320 68.000 0.005 NA   NA
 7078741 7078742 Smal_0005 Smal_0006     FALSE 0.538 72.000 0.079 NA   NA
 7078742 7078743 Smal_0006 Smal_0007     FALSE 0.065 133.000 0.000 1.000   NA
 7078743 7078744 Smal_0007 Smal_0008     FALSE 0.051 144.000 0.000 1.000   NA
 7078744 7078745 Smal_0008 Smal_0009     TRUE 0.830 96.000 0.600 0.026 N NA
 7078745 7078746 Smal_0009 Smal_0010     TRUE 0.971 61.000 0.600 0.066 Y NA
 7078746 7078747 Smal_0010 Smal_0011     TRUE 0.998 4.000 0.857 0.053 Y NA
 7078747 7078748 Smal_0011 Smal_0012     FALSE 0.003 151.000 0.000 1.000 N NA
 7078748 7078749 Smal_0012 Smal_0013     TRUE 0.879 41.000 0.417 NA   NA
 7078749 7078750 Smal_0013 Smal_0014     TRUE 0.816 10.000 0.009 NA   NA
 7078750 7078751 Smal_0014 Smal_0015     FALSE 0.068 144.000 0.000 0.031 N NA
 7078751 7078752 Smal_0015 Smal_0016     FALSE 0.002 171.000 0.000 NA N NA
 7078752 7078753 Smal_0016 Smal_0017     FALSE 0.184 195.000 0.000 NA Y NA
 7078753 7078754 Smal_0017 Smal_0018     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7078755 7078756 Smal_0019 Smal_0020     FALSE 0.102 108.000 0.000 NA   NA
 7078756 7078757 Smal_0020 Smal_0021     FALSE 0.001 333.000 0.000 1.000 N NA
 7078760 7078761 Smal_0024 Smal_0025     FALSE 0.148 155.000 0.043 NA   NA
 7078761 7078762 Smal_0025 Smal_0026     TRUE 0.736 4.000 0.000 1.000   NA
 7078763 7078764 Smal_0027 Smal_0028     FALSE 0.035 158.000 0.000 NA   NA
 7078764 7078765 Smal_0028 Smal_0029     FALSE 0.150 97.000 0.000 1.000   NA
 7078765 7078766 Smal_0029 Smal_0030     FALSE 0.095 116.000 0.000 1.000   NA
 7078769 7078770 Smal_0033 Smal_0034     FALSE 0.040 148.000 0.000 NA   NA
 7078771 7078772 Smal_0035 Smal_0036     FALSE 0.014 285.000 0.000 NA   NA
 7078775 7078776 Smal_0039 Smal_0040     TRUE 0.982 12.000 0.846 NA   NA
 7078778 7078779 Smal_0042 Smal_0043     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7078779 7078780 Smal_0043 Smal_0044     FALSE 0.017 231.000 0.000 NA   NA
 7078780 7078781 Smal_0044 Smal_0045     FALSE 0.169 71.000 0.000 NA   NA
 7078781 7078782 Smal_0045 Smal_0046   mdoD FALSE 0.094 106.000 0.003 1.000 N NA
 7078783 7078784 Smal_0047 Smal_0048     TRUE 0.667 10.000 0.000 1.000   NA
 7078784 7078785 Smal_0048 Smal_0049     TRUE 0.613 36.000 0.000 0.019   NA
 7078786 7078787 Smal_0050 Smal_0051     FALSE 0.001 262.000 0.000 NA N NA
 7078789 7078790 Smal_0053 Smal_0054     TRUE 0.936 -3.000 0.008 1.000   NA
 7078790 7078791 Smal_0054 Smal_0055     FALSE 0.013 399.000 0.000 NA   NA
 7078791 7078792 Smal_0055 Smal_0056     TRUE 0.937 0.000 0.043 NA   NA
 7078794 7078795 Smal_0058 Smal_0059   rdgC FALSE 0.358 37.000 0.012 NA N NA
 7078795 7078796 Smal_0059 Smal_0060 rdgC   TRUE 0.635 60.000 0.121 NA   NA
 7078799 7078800 Smal_0063 Smal_0064 gltD gltB TRUE 0.872 86.000 0.032 0.001 Y NA
 7078800 7078801 Smal_0064 Smal_0065 gltB   FALSE 0.076 176.000 0.011 1.000   NA
 7078804 7078805 Smal_0068 Smal_0069     FALSE 0.076 120.000 0.000 NA   NA
 7078805 7078806 Smal_0069 Smal_0070     TRUE 0.740 1.000 0.000 NA   NA
 7078807 7078808 Smal_0071 Smal_0072     FALSE 0.003 145.000 0.000 1.000 N NA
 7078809 7078810 Smal_0073 Smal_0074     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7078810 7078811 Smal_0074 Smal_0075     TRUE 0.921 18.000 0.250 NA   NA
 7078811 7078812 Smal_0075 Smal_0076     FALSE 0.007 108.000 0.000 1.000 N NA
 7078812 7078813 Smal_0076 Smal_0077     TRUE 0.995 4.000 0.500 NA Y NA
 7078814 7078815 Smal_0078 Smal_0079     FALSE 0.204 67.000 0.000 1.000   NA
 7078815 7078816 Smal_0079 Smal_0080     TRUE 0.982 -3.000 0.185 1.000   NA
 7078817 7078818 Smal_0081 Smal_0082     FALSE 0.285 40.000 0.000 NA   NA
 7078819 7078820 Smal_0083 Smal_0084     TRUE 0.995 -3.000 0.724 NA   NA
 7078820 7078821 Smal_0084 Smal_0085     TRUE 0.980 -3.000 0.172 NA   NA
 7078821 7078822 Smal_0085 Smal_0086     TRUE 0.979 -3.000 0.161 NA   NA
 7078822 7078823 Smal_0086 Smal_0087     TRUE 0.950 8.000 0.193 NA   NA
 7078823 7078824 Smal_0087 Smal_0088     TRUE 0.900 17.000 0.168 NA   NA
 7078824 7078825 Smal_0088 Smal_0089     TRUE 0.991 0.000 0.720 NA   NA
 7078825 7078826 Smal_0089 Smal_0090     TRUE 0.890 22.000 0.200 NA   NA
 7078826 7078827 Smal_0090 Smal_0091     FALSE 0.386 28.000 0.000 NA   NA
 7078829 7078830 Smal_0093 Smal_0094     TRUE 0.703 4.000 0.000 NA   NA
 7078830 7078831 Smal_0094 Smal_0095     FALSE 0.002 158.000 0.000 1.000 N NA
 7078834 7078835 Smal_0098 Smal_0099     TRUE 0.591 38.000 0.079 NA N NA
 7078835 7078836 Smal_0099 Smal_0100     TRUE 0.928 5.000 0.083 NA   NA
 7078836 7078837 Smal_0100 Smal_0101     TRUE 0.975 -3.000 0.128 NA   NA
 7078837 7078838 Smal_0101 Smal_0102     TRUE 0.874 10.000 0.107 NA N NA
 7078838 7078839 Smal_0102 Smal_0103     FALSE 0.129 121.000 0.023 NA N NA
 7078839 7078840 Smal_0103 Smal_0104     TRUE 0.878 8.000 0.023 NA   NA
 7078840 7078841 Smal_0104 Smal_0105     FALSE 0.204 57.000 0.000 NA   NA
 7078841 7078842 Smal_0105 Smal_0106     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7078843 7078844 Smal_0107 Smal_0108     FALSE 0.435 74.000 0.100 NA N NA
 7078845 7078846 Smal_0109 Smal_0110     FALSE 0.134 270.000 0.000 1.000 Y NA
 7078846 7078847 Smal_0110 Smal_0111     TRUE 0.703 22.000 0.048 1.000 N NA
 7078847 7078848 Smal_0111 Smal_0112     FALSE 0.001 296.000 0.000 NA N NA
 7078848 7078849 Smal_0112 Smal_0113     TRUE 0.621 107.000 0.300 NA   NA
 7078849 7078850 Smal_0113 Smal_0114     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7078850 7078851 Smal_0114 Smal_0115     FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 7078852 7078853 Smal_0116 Smal_0117     TRUE 0.992 -12.000 0.222 0.040   NA
 7078854 7078855 Smal_0118 Smal_0119     FALSE 0.181 66.000 0.000 NA   NA
 7078855 7078856 Smal_0119 Smal_0120     FALSE 0.099 109.000 0.000 NA   NA
 7078856 7078857 Smal_0120 Smal_0121     FALSE 0.159 80.000 0.000 NA   NA
 7078857 7078858 Smal_0121 Smal_0122     FALSE 0.006 116.000 0.000 1.000 N NA
 7078858 7078859 Smal_0122 Smal_0123     TRUE 0.998 -7.000 0.587 1.000 Y NA
 7078859 7078860 Smal_0123 Smal_0124     FALSE 0.145 94.000 0.007 1.000 N NA
 7078860 7078861 Smal_0124 Smal_0125     TRUE 0.984 32.000 0.375 0.002 Y NA
 7078862 7078863 Smal_0126 Smal_0127     FALSE 0.130 97.000 0.000 NA   NA
 7078865 7078866 Smal_0129 Smal_0130     TRUE 0.996 7.000 0.765 1.000 Y NA
 7078866 7078867 Smal_0130 Smal_0131     TRUE 0.926 104.000 0.600 1.000 Y NA
 7078868 7078869 Smal_0132 Smal_0133     TRUE 0.689 33.000 0.035 NA   NA
 7078869 7078870 Smal_0133 Smal_0134     FALSE 0.463 58.000 0.019 NA   NA
 7078870 7078871 Smal_0134 Smal_0135     FALSE 0.422 101.000 0.158 NA N NA
 7078871 7078872 Smal_0135 Smal_0136   gpsA TRUE 0.585 21.000 0.015 1.000 N NA
 7078875 7078876 Smal_0139 Smal_0140     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 7078876 7078877 Smal_0140 Smal_0141     FALSE 0.012 434.000 0.000 NA   NA
 7078877 7078878 Smal_0141 Smal_0142     FALSE 0.035 157.000 0.000 NA   NA
 7078878 7078879 Smal_0142 Smal_0143     FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 7078880 7078881 Smal_0144 Smal_0145     FALSE 0.082 122.000 0.000 1.000   NA
 7078881 7078882 Smal_0145 Smal_0146     TRUE 0.574 69.000 0.100 NA   NA
 7078882 7078883 Smal_0146 Smal_0147     FALSE 0.068 124.000 0.000 NA   NA
 7078883 7078884 Smal_0147 Smal_0148     FALSE 0.147 86.000 0.000 NA   NA
 7078885 7078886 Smal_0149 Smal_0150     TRUE 0.923 9.000 0.186 1.000 N NA
 7078886 7078887 Smal_0150 Smal_0151     FALSE 0.043 276.000 0.014 NA   NA
 7078887 7078888 Smal_0151 Smal_0152     FALSE 0.060 130.000 0.000 NA   NA
 7078888 7078889 Smal_0152 Smal_0153     FALSE 0.016 249.000 0.000 NA   NA
 7078889 7078890 Smal_0153 Smal_0154     FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 7078890 7078891 Smal_0154 Smal_0155     FALSE 0.022 199.000 0.000 NA   NA
 7078893 7078894 Smal_0157 Smal_0158     TRUE 0.783 66.000 0.000 0.047 Y NA
 7078897 7078898 Smal_0161 Smal_0162     TRUE 0.953 12.000 0.318 NA   NA
 7078899 7078900 Smal_0163 Smal_0164     FALSE 0.329 70.000 0.007 NA   NA
 7078901 7078902 Smal_0165 Smal_0166     FALSE 0.020 205.000 0.000 NA   NA
 7078902 7078903 Smal_0166 Smal_0167     FALSE 0.427 104.000 0.078 NA   NA
 7078903 7078904 Smal_0167 Smal_0168     TRUE 0.603 117.000 0.377 NA   NA
 7078906 7078907 Smal_0170 Smal_0171     TRUE 0.987 -3.000 0.418 1.000 N NA
 7078907 7078908 Smal_0171 Smal_0172     FALSE 0.501 83.000 0.070 NA   NA
 7078910 7078911 Smal_0174 Smal_0175   ubiB TRUE 0.991 -3.000 0.432 1.000   NA
 7078911 7078912 Smal_0175 Smal_0176 ubiB   TRUE 0.710 6.000 0.000 1.000   NA
 7078912 7078913 Smal_0176 Smal_0177     FALSE 0.118 108.000 0.000 1.000   NA
 7078915 7078916 Smal_0179 Smal_0180     TRUE 0.876 5.000 0.014 1.000   NA
 7078916 7078917 Smal_0180 Smal_0181     FALSE 0.006 112.000 0.000 1.000 N NA
 7078918 7078919 Smal_0182 Smal_0183     TRUE 0.985 4.000 0.600 NA   NA
 7078920 7078921 Smal_0184 Smal_0185     FALSE 0.016 58.000 0.000 1.000 N NA
 7078922 7078923 Smal_0186 Smal_0187     FALSE 0.190 277.000 0.000 0.079 Y NA
 7078924 7078925 Smal_0188 Smal_0189     TRUE 0.796 65.000 0.016 1.000 Y NA
 7078925 7078926 Smal_0189 Smal_0190     FALSE 0.001 420.000 0.000 1.000 N NA
 7078926 7078927 Smal_0190 Smal_0191     TRUE 0.949 17.000 0.000 0.011 Y NA
 7078930 7078931 Smal_0194 Smal_0195     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7078931 7078932 Smal_0195 Smal_0196     FALSE 0.013 401.000 0.000 NA   NA
 7078932 7078933 Smal_0196 Smal_0197     TRUE 0.958 27.000 0.158 1.000 Y NA
 7078933 7078934 Smal_0197 Smal_0198     TRUE 0.988 11.000 0.316 1.000 Y NA
 7078935 7078936 Smal_0199 Smal_0200     FALSE 0.001 206.000 0.000 1.000 N NA
 7078936 7078937 Smal_0200 Smal_0201     FALSE 0.179 184.000 0.158 NA   NA
 7078939 7078940 Smal_0203 Smal_0204     TRUE 0.954 -3.000 0.026 NA   NA
 7078942 7078943 Smal_0206 Smal_0207     TRUE 0.944 130.000 0.917 0.001 Y NA
 7078945 7078946 Smal_0209 Smal_0210     FALSE 0.016 56.000 0.000 NA N NA
 7078946 7078947 Smal_0210 Smal_0211     FALSE 0.084 155.000 0.031 1.000 N NA
 7078950 7078951 Smal_0214 Smal_0215     FALSE 0.353 56.000 0.004 NA   NA
 7078953 7078954 Smal_0217 Smal_0218     FALSE 0.014 298.000 0.000 NA   NA
 7078955 7078956 Smal_0219 Smal_0220     TRUE 0.679 15.000 0.019 1.000 N NA
 7078956 7078957 Smal_0220 Smal_0221     TRUE 0.996 -3.000 0.242 1.000 Y NA
 7078957 7078958 Smal_0221 Smal_0222     TRUE 0.999 -3.000 0.627 0.002 Y NA
 7078958 7078959 Smal_0222 Smal_0223     TRUE 0.998 -3.000 0.687 1.000 Y NA
 7078960 7078961 Smal_0224 Smal_0225     FALSE 0.006 112.000 0.000 1.000 N NA
 7078962 7078963 Smal_0226 Smal_0227     FALSE 0.001 762.000 0.000 1.000 N NA
 7078963 7078964 Smal_0227 Smal_0228     FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 7078964 7078965 Smal_0228 Smal_0229     TRUE 0.609 74.000 0.143 NA   NA
 7078965 7078966 Smal_0229 Smal_0230     TRUE 0.970 23.000 0.214 1.000 Y NA
 7078967 7078968 Smal_0231 Smal_0232     TRUE 0.961 -33.000 0.020 NA   NA
 7078969 7078970 Smal_0233 Smal_0234     TRUE 0.967 -3.000 0.147 1.000 N NA
 7078970 7078971 Smal_0234 Smal_0235     TRUE 0.792 10.000 0.005 NA   NA
 7078971 7078972 Smal_0235 Smal_R0001     FALSE 0.277 41.000 0.000 NA   NA
 7078972 7078973 Smal_R0001 Smal_0236     FALSE 0.025 184.000 0.000 NA   NA
 7078973 7078974 Smal_0236 Smal_0237     TRUE 0.683 59.000 0.167 NA   NA
 7078974 7078975 Smal_0237 Smal_0238     FALSE 0.001 803.000 0.000 1.000 N NA
 7078975 7078976 Smal_0238 Smal_0239     FALSE 0.038 163.000 0.000 1.000   NA
 7078976 7078977 Smal_0239 Smal_0240     FALSE 0.021 204.000 0.000 NA   NA
 7078979 7078980 Smal_0242 Smal_0243     FALSE 0.123 139.000 0.011 NA   NA
 7078980 7078981 Smal_0243 Smal_0244     FALSE 0.100 156.000 0.014 NA   NA
 7078981 7078982 Smal_0244 Smal_0245     FALSE 0.289 106.000 0.014 1.000   NA
 7078983 7078984 Smal_0246 Smal_0247     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7078985 7078986 Smal_0248 Smal_0249     TRUE 0.924 -3.000 0.006 NA   NA
 7078987 7078988 Smal_0250 Smal_0251     FALSE 0.013 371.000 0.000 NA   NA
 7078988 7078989 Smal_0251 Smal_0252     TRUE 0.970 14.000 0.820 NA N NA
 7078989 7078990 Smal_0252 Smal_0253     TRUE 0.969 15.000 0.839 NA N NA
 7078990 7078991 Smal_0253 Smal_0254     TRUE 0.788 103.000 0.810 1.000 N NA
 7078992 7078993 Smal_0255 Smal_0256     TRUE 0.989 -3.000 0.357 NA   NA
 7078993 7078994 Smal_0256 Smal_0257     TRUE 0.668 7.000 0.000 NA   NA
 7078994 7078995 Smal_0257 Smal_0258     TRUE 0.997 -3.000 0.270 0.039 Y NA
 7078996 7078997 Smal_0259 Smal_0260     TRUE 0.996 -3.000 0.719 0.047   NA
 7078997 7078998 Smal_0260 Smal_0261     FALSE 0.061 136.000 0.000 1.000   NA
 7078998 7078999 Smal_0261 Smal_0262     TRUE 0.904 4.000 0.022 1.000   NA
 7078999 7079000 Smal_0262 Smal_0263     TRUE 0.641 32.000 0.018 NA   NA
 7079000 7079001 Smal_0263 Smal_0264     TRUE 0.813 68.000 0.455 NA   NA
 7079001 7079002 Smal_0264 Smal_0265     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 7079002 7079003 Smal_0265 Smal_0266     TRUE 0.987 9.000 0.857 NA   NA
 7079003 7079004 Smal_0266 Smal_0267     TRUE 0.569 102.000 0.192 NA   NA
 7079005 7079006 Smal_0268 Smal_0269     FALSE 0.102 108.000 0.000 NA   NA
 7079008 7079009 Smal_0271 Smal_0272     FALSE 0.028 191.000 0.000 1.000   NA
 7079016 7079017 Smal_0279 Smal_0280   argS TRUE 0.708 22.000 0.062 NA N NA
 7079017 7079018 Smal_0280 Smal_0281 argS radC FALSE 0.080 115.000 0.005 1.000 N NA
 7079021 7079022 Smal_0284 Smal_0285   dut TRUE 0.975 -3.000 0.201 1.000 N NA
 7079022 7079023 Smal_0285 Smal_0286 dut   TRUE 0.775 13.000 0.039 1.000 N NA
 7079024 7079025 Smal_0287 Smal_0288     TRUE 0.998 -19.000 0.379 1.000 Y NA
 7079025 7079026 Smal_0288 Smal_0289     FALSE 0.495 37.000 0.026 1.000 N NA
 7079026 7079027 Smal_0289 Smal_0290     TRUE 0.999 -3.000 0.877 0.001 Y NA
 7079027 7079028 Smal_0290 Smal_0291     TRUE 0.990 11.000 0.145 0.001 Y NA
 7079028 7079029 Smal_0291 Smal_0292     TRUE 0.875 13.000 0.071 NA   NA
 7079029 7079030 Smal_0292 Smal_0293     FALSE 0.018 220.000 0.000 NA   NA
 7079030 7079031 Smal_0293 Smal_0294   pyrE TRUE 0.749 20.000 0.018 NA   NA
 7079032 7079033 Smal_0295 Smal_0296     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079033 7079034 Smal_0296 Smal_0297     FALSE 0.160 79.000 0.000 NA   NA
 7079035 7079036 Smal_0298 Smal_0299 anmK   TRUE 0.613 56.000 0.184 NA N NA
 7079037 7079038 Smal_0300 Smal_R0002     FALSE 0.012 528.000 0.000 NA   NA
 7079038 7079039 Smal_R0002 Smal_R0003     FALSE 0.137 93.000 0.000 NA   NA
 7079039 7079040 Smal_R0003 Smal_R0004     FALSE 0.361 31.000 0.000 NA   NA
 7079040 7079041 Smal_R0004 Smal_R0005     FALSE 0.018 227.000 0.000 NA   NA
 7079041 7079042 Smal_R0005 Smal_R0006     FALSE 0.063 127.000 0.000 NA   NA
 7079042 7079043 Smal_R0006 Smal_R0007     FALSE 0.012 509.000 0.000 NA   NA
 7079043 7079044 Smal_R0007 Smal_R0008     FALSE 0.137 93.000 0.000 NA   NA
 7079044 7079045 Smal_R0008 Smal_R0009     FALSE 0.361 31.000 0.000 NA   NA
 7079045 7079046 Smal_R0009 Smal_R0010     FALSE 0.018 227.000 0.000 NA   NA
 7079046 7079047 Smal_R0010 Smal_R0011     FALSE 0.065 126.000 0.000 NA   NA
 7079047 7079048 Smal_R0011 Smal_R0012     FALSE 0.056 133.000 0.000 NA   NA
 7079049 7079050 Smal_0301 Smal_0302     FALSE 0.451 87.000 0.049 NA   NA
 7079051 7079052 Smal_0303 Smal_0304     TRUE 0.704 109.000 0.408 0.038 N NA
 7079054 7079055 Smal_0306 Smal_0307     FALSE 0.191 86.000 0.000 0.063 N NA
 7079057 7079058 Smal_0309 Smal_0310     TRUE 0.865 12.000 0.042 NA   NA
 7079058 7079059 Smal_0310 Smal_0311     TRUE 0.981 60.000 0.741 0.002 Y NA
 7079059 7079060 Smal_0311 Smal_0312     TRUE 0.839 9.000 0.012 NA   NA
 7079060 7079061 Smal_0312 Smal_0313     TRUE 0.935 -3.000 0.010 NA   NA
 7079061 7079062 Smal_0313 Smal_0314     TRUE 0.952 15.000 0.536 1.000 N NA
 7079064 7079065 Smal_0316 Smal_0317     TRUE 0.834 97.000 0.722 NA   NA
 7079065 7079066 Smal_0317 Smal_0318     TRUE 0.950 11.000 0.255 NA   NA
 7079066 7079067 Smal_0318 Smal_0319     TRUE 0.992 5.000 0.321 1.000 Y NA
 7079067 7079068 Smal_0319 Smal_0320     FALSE 0.023 192.000 0.000 NA   NA
 7079069 7079070 Smal_0321 Smal_0322     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 7079070 7079071 Smal_0322 Smal_0323   dnaG FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 7079071 7079072 Smal_0323 Smal_0324 dnaG   FALSE 0.371 61.000 0.006 1.000   NA
 7079072 7079073 Smal_0324 Smal_0325     FALSE 0.133 104.000 0.000 1.000   NA
 7079073 7079074 Smal_0325 Smal_0326   rpsU FALSE 0.489 133.000 0.173 0.022   NA
 7079077 7079078 Smal_0329 Smal_0330     FALSE 0.321 59.000 0.023 NA N NA
 7079078 7079079 Smal_0330 Smal_0331     FALSE 0.004 129.000 0.000 NA N NA
 7079079 7079080 Smal_0331 Smal_0332     FALSE 0.057 132.000 0.000 NA   NA
 7079083 7079084 Smal_0335 Smal_0336     FALSE 0.099 109.000 0.000 NA   NA
 7079084 7079085 Smal_0336 Smal_0337     TRUE 0.953 -3.000 0.024 NA   NA
 7079085 7079086 Smal_0337 Smal_0338     TRUE 0.773 16.000 0.016 NA   NA
 7079086 7079087 Smal_0338 Smal_0339     FALSE 0.001 422.000 0.000 1.000 N NA
 7079087 7079088 Smal_0339 Smal_0340     TRUE 0.965 -3.000 0.055 NA   NA
 7079089 7079090 Smal_0341 Smal_0342     FALSE 0.348 52.000 0.023 NA N NA
 7079090 7079091 Smal_0342 Smal_0343     TRUE 0.582 56.000 0.143 1.000 N NA
 7079091 7079092 Smal_0343 Smal_0344     TRUE 0.945 -67.000 0.031 1.000 N NA
 7079092 7079093 Smal_0344 Smal_0345     FALSE 0.017 233.000 0.000 NA   NA
 7079093 7079094 Smal_0345 Smal_0346     FALSE 0.017 233.000 0.000 NA   NA
 7079094 7079095 Smal_0346 Smal_0347     FALSE 0.152 96.000 0.000 1.000   NA
 7079095 7079096 Smal_0347 Smal_0348     TRUE 0.624 32.000 0.015 NA   NA
 7079096 7079097 Smal_0348 Smal_0349     FALSE 0.224 163.000 0.160 NA   NA
 7079100 7079101 Smal_0352 Smal_0353     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7079101 7079102 Smal_0353 Smal_0354     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7079102 7079103 Smal_0354 Smal_0355     FALSE 0.470 20.000 0.000 NA   NA
 7079103 7079104 Smal_0355 Smal_0356     FALSE 0.235 49.000 0.000 NA   NA
 7079104 7079105 Smal_0356 Smal_0357     FALSE 0.021 200.000 0.000 NA   NA
 7079106 7079107 Smal_0358 Smal_0359     TRUE 0.595 76.000 0.132 NA   NA
 7079109 7079110 Smal_0361 Smal_0362     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 7079111 7079112 Smal_0363 Smal_0364     TRUE 0.639 60.000 0.223 NA N NA
 7079113 7079114 Smal_0365 Smal_0366 aceE   FALSE 0.012 75.000 0.000 1.000 N NA
 7079115 7079116 Smal_0367 Smal_0368     FALSE 0.012 453.000 0.000 NA   NA
 7079116 7079117 Smal_0368 Smal_0369     FALSE 0.071 122.000 0.000 NA   NA
 7079117 7079118 Smal_0369 Smal_0370     FALSE 0.015 283.000 0.000 NA   NA
 7079119 7079120 Smal_0371 Smal_0372     FALSE 0.142 89.000 0.000 NA   NA
 7079120 7079121 Smal_0372 Smal_0373     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.006   NA
 7079121 7079122 Smal_0373 Smal_0374     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.006   NA
 7079122 7079123 Smal_0374 Smal_0375     FALSE 0.012 531.000 0.000 NA   NA
 7079123 7079124 Smal_0375 Smal_0376     TRUE 0.995 -3.000 0.844 NA   NA
 7079124 7079125 Smal_0376 Smal_0377     TRUE 0.992 0.000 0.833 NA   NA
 7079126 7079127 Smal_0378 Smal_0379     FALSE 0.386 28.000 0.000 NA   NA
 7079128 7079129 Smal_0380 Smal_0381     FALSE 0.031 166.000 0.000 NA   NA
 7079129 7079130 Smal_0381 Smal_0382     FALSE 0.044 144.000 0.000 NA   NA
 7079130 7079131 Smal_0382 Smal_0383     FALSE 0.161 78.000 0.000 NA   NA
 7079131 7079132 Smal_0383 Smal_0384     FALSE 0.277 41.000 0.000 NA   NA
 7079133 7079134 Smal_0385 Smal_0386     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7079135 7079136 Smal_0387 Smal_0388     FALSE 0.076 120.000 0.000 NA   NA
 7079136 7079137 Smal_0388 Smal_0389     FALSE 0.016 245.000 0.000 NA   NA
 7079137 7079138 Smal_0389 Smal_0390     FALSE 0.369 30.000 0.000 NA   NA
 7079138 7079139 Smal_0390 Smal_0391     FALSE 0.053 135.000 0.000 NA   NA
 7079140 7079141 Smal_0392 Smal_0393     FALSE 0.012 455.000 0.000 NA   NA
 7079141 7079142 Smal_0393 Smal_0394     FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 7079148 7079149 Smal_0400 Smal_0401     FALSE 0.019 241.000 0.000 1.000   NA
 7079150 7079151 Smal_0402 Smal_0403     FALSE 0.253 -3.000 0.000 NA N NA
 7079153 7079154 Smal_0405 Smal_0406     FALSE 0.014 319.000 0.000 NA   NA
 7079158 7079159 Smal_0410 Smal_0411     FALSE 0.170 70.000 0.000 NA   NA
 7079159 7079160 Smal_0411 Smal_0412     TRUE 0.677 35.000 0.037 NA   NA
 7079160 7079161 Smal_0412 Smal_0413     TRUE 0.765 24.000 0.037 NA   NA
 7079161 7079162 Smal_0413 Smal_0414     FALSE 0.246 46.000 0.000 NA   NA
 7079162 7079163 Smal_0414 Smal_0415     FALSE 0.102 108.000 0.000 NA   NA
 7079163 7079164 Smal_0415 Smal_0416     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 7079164 7079165 Smal_0416 Smal_0417     FALSE 0.053 135.000 0.000 NA   NA
 7079165 7079166 Smal_0417 Smal_0418     FALSE 0.507 17.000 0.000 NA   NA
 7079166 7079167 Smal_0418 Smal_0419     FALSE 0.013 382.000 0.000 NA   NA
 7079167 7079168 Smal_0419 Smal_0420     FALSE 0.022 213.000 0.000 1.000   NA
 7079168 7079169 Smal_0420 Smal_0421     TRUE 0.993 -10.000 0.268 0.038   NA
 7079169 7079170 Smal_0421 Smal_0422     TRUE 0.760 34.000 0.100 NA   NA
 7079174 7079175 Smal_0426 Smal_0427     TRUE 0.995 -3.000 0.188 NA Y NA
 7079179 7079180 Smal_0431 Smal_0432     TRUE 0.692 32.000 0.032 NA   NA
 7079180 7079181 Smal_0432 Smal_0433     FALSE 0.092 118.000 0.000 1.000   NA
 7079184 7079185 Smal_0436 Smal_0437     FALSE 0.545 14.000 0.000 NA   NA
 7079185 7079186 Smal_0437 Smal_0438   motB TRUE 0.609 132.000 0.571 NA   NA
 7079186 7079187 Smal_0438 Smal_0439 motB   TRUE 0.995 4.000 0.571 1.000 Y NA
 7079187 7079188 Smal_0439 Smal_0440     FALSE 0.010 92.000 0.000 1.000 N NA
 7079189 7079190 Smal_0441 Smal_0442     FALSE 0.024 188.000 0.000 NA   NA
 7079192 7079193 Smal_0444 Smal_0445   alr TRUE 0.967 -21.000 0.099 1.000 N NA
 7079195 7079196 Smal_0447 Smal_0448     TRUE 0.887 44.000 0.500 NA   NA
 7079198 7079199 Smal_0450 Smal_0451     TRUE 0.993 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 7079199 7079200 Smal_0451 Smal_0452     TRUE 0.967 -3.000 0.053 1.000   NA
 7079201 7079202 Smal_0453 Smal_0454     TRUE 0.996 0.000 0.451 1.000 Y NA
 7079204 7079205 Smal_0456 Smal_0457     FALSE 0.169 86.000 0.000 1.000   NA
 7079206 7079207 Smal_0458 Smal_0459     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079207 7079208 Smal_0459 Smal_0460     TRUE 0.615 32.000 0.000 0.068   NA
 7079211 7079212 Smal_0463 Smal_0464     TRUE 0.934 -3.000 0.009 NA   NA
 7079214 7079215 Smal_0466 Smal_0467     FALSE 0.001 206.000 0.000 1.000 N NA
 7079215 7079216 Smal_0467 Smal_0468     TRUE 0.973 15.000 0.130 1.000 Y NA
 7079216 7079217 Smal_0468 Smal_0469     TRUE 0.985 3.000 0.080 1.000 Y NA
 7079218 7079219 Smal_0470 Smal_0471     TRUE 0.998 -3.000 0.566 1.000 Y NA
 7079220 7079221 Smal_0472 Smal_0473     TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7079223 7079224 Smal_0475 Smal_0476     FALSE 0.257 117.000 0.028 NA   NA
 7079225 7079226 Smal_0477 Smal_0478     FALSE 0.188 75.000 0.000 1.000   NA
 7079227 7079228 Smal_0479 Smal_0480     FALSE 0.107 687.000 0.000 1.000 Y NA
 7079229 7079230 Smal_0481 Smal_0482     TRUE 0.947 15.000 0.495 1.000 N NA
 7079232 7079233 Smal_0484 Smal_0485     TRUE 0.995 -3.000 0.857 NA   NA
 7079233 7079234 Smal_0485 Smal_0486     FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 7079234 7079235 Smal_0486 Smal_0487     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7079235 7079236 Smal_0487 Smal_0488     FALSE 0.071 367.000 0.081 NA   NA
 7079236 7079237 Smal_0488 Smal_0489     TRUE 0.790 124.000 0.133 0.014 Y NA
 7079237 7079238 Smal_0489 Smal_0490     FALSE 0.253 -3.000 0.000 NA N NA
 7079238 7079239 Smal_0490 Smal_0491     TRUE 0.955 5.000 0.000 NA Y NA
 7079239 7079240 Smal_0491 Smal_0492     TRUE 0.770 1.000 0.000 1.000   NA
 7079240 7079241 Smal_0492 Smal_0493     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7079241 7079242 Smal_0493 Smal_0494     TRUE 0.896 20.000 0.000 NA Y NA
 7079245 7079246 Smal_0497 Smal_0498     TRUE 0.978 -3.000 0.143 1.000   NA
 7079246 7079247 Smal_0498 Smal_0499     TRUE 0.981 3.000 0.250 0.033   NA
 7079247 7079248 Smal_0499 Smal_0500     TRUE 0.973 -3.000 0.192 1.000 N NA
 7079248 7079249 Smal_0500 Smal_0501     FALSE 0.001 393.000 0.000 1.000 N NA
 7079249 7079250 Smal_0501 Smal_0502     TRUE 0.997 0.000 0.316 0.011 Y NA
 7079251 7079252 Smal_0503 Smal_0504     TRUE 0.985 15.000 0.143 0.004 Y NA
 7079252 7079253 Smal_0504 Smal_0505     TRUE 0.995 -3.000 0.163 1.000 Y NA
 7079253 7079254 Smal_0505 Smal_0506     TRUE 0.992 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 7079254 7079255 Smal_0506 Smal_0507     FALSE 0.462 119.000 0.000 1.000 Y NA
 7079256 7079257 Smal_0508 Smal_0509     TRUE 0.958 12.000 0.500 1.000 N NA
 7079258 7079259 Smal_0510 Smal_0511     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7079259 7079260 Smal_0511 Smal_0512     TRUE 0.876 -22.000 0.000 NA   NA
 7079260 7079261 Smal_0512 Smal_0513     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079261 7079262 Smal_0513 Smal_0514     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079262 7079263 Smal_0514 Smal_0515     TRUE 0.876 -25.000 0.000 NA   NA
 7079265 7079266 Smal_0517 Smal_0518     TRUE 0.992 2.000 0.070 0.001 Y NA
 7079269 7079270 Smal_0521 Smal_0522     TRUE 0.982 -3.000 0.201 NA   NA
 7079270 7079271 Smal_0522 Smal_0523     TRUE 0.991 4.000 0.275 NA Y NA
 7079271 7079272 Smal_0523 Smal_0524     TRUE 0.995 2.000 0.472 NA Y NA
 7079274 7079275 Smal_0526 Smal_0527     FALSE 0.040 223.000 0.004 1.000   NA
 7079275 7079276 Smal_0527 Smal_0528     FALSE 0.012 594.000 0.000 NA   NA
 7079277 7079278 Smal_0529 Smal_0530     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079278 7079279 Smal_0530 Smal_0531     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079280 7079281 Smal_0532 Smal_0533   valS FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 7079281 7079282 Smal_0533 Smal_0534 valS   FALSE 0.519 34.000 0.002 1.000   NA
 7079282 7079283 Smal_0534 Smal_0535     TRUE 0.694 20.000 0.006 1.000   NA
 7079283 7079284 Smal_0535 Smal_0536     TRUE 0.743 83.000 0.494 1.000 N NA
 7079285 7079286 Smal_0537 Smal_0538     TRUE 0.996 -3.000 0.631 0.065   NA
 7079288 7079289 Smal_0540 Smal_0541 xerD   FALSE 0.111 101.000 0.004 1.000 N NA
 7079291 7079292 Smal_0543 Smal_0544     FALSE 0.014 439.000 0.000 1.000   NA
 7079292 7079293 Smal_0544 Smal_0545     FALSE 0.040 159.000 0.000 1.000   NA
 7079293 7079294 Smal_0545 Smal_0546     FALSE 0.003 137.000 0.000 1.000 N NA
 7079294 7079295 Smal_0546 Smal_0547     TRUE 0.982 25.000 0.255 0.005 Y NA
 7079295 7079296 Smal_0547 Smal_0548     TRUE 0.940 50.000 0.125 0.005 Y NA
 7079296 7079297 Smal_0548 Smal_0549     TRUE 0.995 7.000 0.348 0.005 Y NA
 7079297 7079298 Smal_0549 Smal_0550     TRUE 0.994 -3.000 0.130 NA Y NA
 7079298 7079299 Smal_0550 Smal_0551     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079299 7079300 Smal_0551 Smal_0552     TRUE 0.987 -3.000 0.308 NA   NA
 7079300 7079301 Smal_0552 Smal_0553     TRUE 0.964 -3.000 0.053 NA   NA
 7079301 7079302 Smal_0553 Smal_0554     TRUE 0.876 -25.000 0.000 NA   NA
 7079302 7079303 Smal_0554 Smal_0555     TRUE 0.996 -10.000 0.700 NA   NA
 7079303 7079304 Smal_0555 Smal_0556     TRUE 0.963 10.000 0.333 NA   NA
 7079304 7079305 Smal_0556 Smal_0557     FALSE 0.012 689.000 0.000 NA   NA
 7079305 7079306 Smal_0557 Smal_0558     TRUE 0.954 -3.000 0.026 NA   NA
 7079306 7079307 Smal_0558 Smal_0559     FALSE 0.210 109.000 0.007 NA   NA
 7079309 7079310 Smal_0561 Smal_0562     TRUE 0.639 86.000 0.000 1.000 Y NA
 7079310 7079311 Smal_0562 Smal_0563     TRUE 0.956 72.000 0.667 1.000 Y NA
 7079311 7079312 Smal_0563 Smal_0564     TRUE 0.999 -9.000 1.000 1.000 Y NA
 7079312 7079313 Smal_0564 Smal_0565     FALSE 0.001 268.000 0.000 1.000 N NA
 7079313 7079314 Smal_0565 Smal_0566     TRUE 0.990 -3.000 0.429 NA   NA
 7079314 7079315 Smal_0566 Smal_0567   nfrB TRUE 0.945 7.000 0.159 NA   NA
 7079315 7079316 Smal_0567 Smal_0568 nfrB   TRUE 0.965 -3.000 0.045 1.000   NA
 7079317 7079318 Smal_0569 Smal_0570     FALSE 0.155 83.000 0.000 NA   NA
 7079318 7079319 Smal_0570 Smal_0571     FALSE 0.030 184.000 0.000 1.000   NA
 7079320 7079321 Smal_0572 Smal_0573   glyA FALSE 0.188 188.000 0.182 NA   NA
 7079321 7079322 Smal_0573 Smal_0574 glyA   FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 7079322 7079323 Smal_0574 Smal_0575     FALSE 0.386 28.000 0.000 NA   NA
 7079323 7079324 Smal_0575 Smal_0576   nrdR FALSE 0.040 149.000 0.000 NA   NA
 7079324 7079325 Smal_0576 Smal_0577 nrdR   TRUE 0.617 80.000 0.277 NA N NA
 7079326 7079327 Smal_0578 Smal_0579     FALSE 0.053 135.000 0.000 NA   NA
 7079327 7079328 Smal_0579 Smal_0580     FALSE 0.038 153.000 0.000 NA   NA
 7079329 7079330 Smal_0581 Smal_0582     TRUE 0.988 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 7079330 7079331 Smal_0582 Smal_0583   ribH TRUE 0.754 186.000 0.417 0.002 Y NA
 7079331 7079332 Smal_0583 Smal_0584 ribH nusB TRUE 0.882 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7079332 7079333 Smal_0584 Smal_0585 nusB   FALSE 0.381 121.000 0.225 1.000 N NA
 7079334 7079335 Smal_0586 Smal_0587     FALSE 0.013 342.000 0.000 NA   NA
 7079335 7079336 Smal_0587 Smal_0588     TRUE 0.976 -3.000 0.130 NA   NA
 7079336 7079337 Smal_0588 Smal_0589     FALSE 0.179 111.000 0.004 NA   NA
 7079337 7079338 Smal_0589 Smal_0590     TRUE 0.984 -37.000 0.172 NA   NA
 7079339 7079340 Smal_0591 Smal_R0013     FALSE 0.032 165.000 0.000 NA   NA
 7079341 7079342 Smal_0592 Smal_0593     FALSE 0.013 359.000 0.000 NA   NA
 7079343 7079344 Smal_0594 Smal_0595   mraW TRUE 0.970 15.000 0.635 NA   NA
 7079344 7079345 Smal_0595 Smal_0596 mraW   TRUE 0.977 -3.000 0.227 1.000 N NA
 7079345 7079346 Smal_0596 Smal_0597     TRUE 0.921 -3.000 0.024 1.000 N NA
 7079346 7079347 Smal_0597 Smal_0598   murE TRUE 0.989 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 7079347 7079348 Smal_0598 Smal_0599 murE   TRUE 0.999 -3.000 0.569 0.003 Y NA
 7079348 7079349 Smal_0599 Smal_0600   mraY TRUE 0.998 -10.000 0.309 0.005 Y NA
 7079349 7079350 Smal_0600 Smal_0601 mraY   TRUE 0.930 2.000 0.018 0.005 N NA
 7079350 7079351 Smal_0601 Smal_0602   murG TRUE 0.991 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7079351 7079352 Smal_0602 Smal_0603 murG murC TRUE 0.951 41.000 0.283 1.000 Y NA
 7079352 7079353 Smal_0603 Smal_0604 murC ddl TRUE 0.997 -3.000 0.153 0.005 Y NA
 7079353 7079354 Smal_0604 Smal_0605 ddl   TRUE 0.997 -3.000 0.372 NA Y NA
 7079354 7079355 Smal_0605 Smal_0606     TRUE 0.985 -3.000 0.389 NA N NA
 7079355 7079356 Smal_0606 Smal_0607     TRUE 0.691 171.000 0.460 1.000 Y NA
 7079356 7079357 Smal_0607 Smal_0608   lpxC FALSE 0.107 194.000 0.134 1.000 N NA
 7079359 7079360 Smal_0610 Smal_0611     FALSE 0.046 299.000 0.068 1.000 N NA
 7079360 7079361 Smal_0611 Smal_0612     FALSE 0.088 113.000 0.006 1.000 N NA
 7079362 7079363 Smal_0613 Smal_0614     FALSE 0.277 41.000 0.000 NA   NA
 7079364 7079365 Smal_0615 Smal_0616     FALSE 0.342 37.000 0.000 1.000   NA
 7079365 7079366 Smal_0616 Smal_0617     TRUE 0.995 -3.000 0.077 0.037 Y NA
 7079367 7079368 Smal_0618 Smal_0619     TRUE 0.892 -12.000 0.000 1.000   NA
 7079368 7079369 Smal_0619 Smal_0620     TRUE 0.999 -3.000 0.875 1.000 Y NA
 7079369 7079370 Smal_0620 Smal_0621     TRUE 0.979 3.000 0.375 1.000   NA
 7079371 7079372 Smal_0622 Smal_0623     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 7079373 7079374 Smal_0624 Smal_0625     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7079374 7079375 Smal_0625 Smal_0626     FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 7079376 7079377 Smal_0627 Smal_0628     FALSE 0.102 173.000 0.089 1.000 N NA
 7079378 7079379 Smal_0629 Smal_0630     FALSE 0.002 184.000 0.000 NA N NA
 7079380 7079381 Smal_0631 Smal_0632     TRUE 0.962 -3.000 0.046 NA   NA
 7079381 7079382 Smal_0632 Smal_0633     FALSE 0.019 212.000 0.000 NA   NA
 7079383 7079384 Smal_0634 Smal_0635     TRUE 0.647 9.000 0.000 NA   NA
 7079384 7079385 Smal_0635 Smal_0636     FALSE 0.015 271.000 0.000 NA   NA
 7079385 7079386 Smal_0636 Smal_0637     FALSE 0.168 115.000 0.002 1.000   NA
 7079386 7079387 Smal_0637 Smal_0638     FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 7079387 7079388 Smal_0638 Smal_0639     FALSE 0.157 82.000 0.000 NA   NA
 7079390 7079391 Smal_0641 Smal_0642     TRUE 0.607 26.000 0.027 1.000 N NA
 7079392 7079393 Smal_0643 Smal_0644     FALSE 0.058 241.000 0.023 NA   NA
 7079393 7079394 Smal_0644 Smal_0645     FALSE 0.174 145.000 0.046 NA   NA
 7079394 7079395 Smal_0645 Smal_0646     TRUE 0.949 5.000 0.160 NA   NA
 7079395 7079396 Smal_0646 Smal_0647     FALSE 0.427 74.000 0.024 NA   NA
 7079397 7079398 Smal_0648 Smal_0649     FALSE 0.118 103.000 0.000 NA   NA
 7079398 7079399 Smal_0649 Smal_0650     TRUE 0.989 -3.000 0.535 NA N NA
 7079400 7079401 Smal_0651 Smal_0652     FALSE 0.219 88.000 0.016 1.000 N NA
 7079401 7079402 Smal_0652 Smal_0653     TRUE 0.748 157.000 0.500 1.000 Y NA
 7079404 7079405 Smal_0655 Smal_0656     TRUE 0.572 33.000 0.037 1.000 N NA
 7079405 7079406 Smal_0656 Smal_0657     FALSE 0.001 265.000 0.000 NA N NA
 7079406 7079407 Smal_0657 Smal_0658     FALSE 0.012 549.000 0.000 NA   NA
 7079407 7079408 Smal_0658 Smal_0659     TRUE 0.703 4.000 0.000 NA   NA
 7079408 7079409 Smal_0659 Smal_0660     TRUE 0.908 0.000 0.015 NA   NA
 7079409 7079410 Smal_0660 Smal_0661     FALSE 0.379 52.000 0.005 NA   NA
 7079410 7079411 Smal_0661 Smal_0662   thyA TRUE 0.969 -3.000 0.164 1.000 N NA
 7079411 7079412 Smal_0662 Smal_0663 thyA   TRUE 0.647 9.000 0.000 NA   NA
 7079412 7079413 Smal_0663 Smal_0664     FALSE 0.545 14.000 0.000 NA   NA
 7079414 7079415 Smal_0665 Smal_0666   apaH TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079415 7079416 Smal_0666 Smal_0667 apaH apaG TRUE 0.931 16.000 0.267 NA   NA
 7079416 7079417 Smal_0667 Smal_0668 apaG ksgA TRUE 0.959 -10.000 0.078 NA N NA
 7079417 7079418 Smal_0668 Smal_0669 ksgA pdxA TRUE 0.973 -3.000 0.197 1.000 N NA
 7079418 7079419 Smal_0669 Smal_0670 pdxA   TRUE 0.978 4.000 0.561 1.000 N NA
 7079419 7079420 Smal_0670 Smal_0671     TRUE 0.912 -3.000 0.020 1.000 N NA
 7079420 7079421 Smal_0671 Smal_0672     TRUE 0.652 90.000 0.357 NA N NA
 7079421 7079422 Smal_0672 Smal_0673     TRUE 0.831 10.000 0.013 NA   NA
 7079422 7079423 Smal_0673 Smal_0674     TRUE 0.841 9.000 0.013 NA   NA
 7079424 7079425 Smal_0675 Smal_0676     TRUE 0.999 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 7079426 7079427 Smal_0677 Smal_0678     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079427 7079428 Smal_0678 Smal_0679     TRUE 0.967 -16.000 0.032 NA   NA
 7079428 7079429 Smal_0679 Smal_0680     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7079429 7079430 Smal_0680 Smal_0681     FALSE 0.235 49.000 0.000 NA   NA
 7079430 7079431 Smal_0681 Smal_0682     FALSE 0.258 44.000 0.000 NA   NA
 7079432 7079433 Smal_0683 Smal_0684     TRUE 0.798 10.000 0.006 NA   NA
 7079434 7079435 Smal_0685 Smal_0686     FALSE 0.395 51.000 0.027 1.000 N NA
 7079435 7079436 Smal_0686 Smal_0687     FALSE 0.522 124.000 0.008 1.000 Y NA
 7079436 7079437 Smal_0687 Smal_0688     FALSE 0.321 86.000 0.041 1.000 N NA
 7079437 7079438 Smal_0688 Smal_0689     TRUE 0.611 227.000 0.551 1.000 Y NA
 7079439 7079440 Smal_0690 Smal_0691     FALSE 0.485 49.000 0.012 1.000   NA
 7079442 7079443 Smal_0693 Smal_0694     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079444 7079445 Smal_0695 Smal_0696     TRUE 0.982 -7.000 0.135 1.000   NA
 7079445 7079446 Smal_0696 Smal_0697     TRUE 0.969 -3.000 0.068 1.000   NA
 7079446 7079447 Smal_0697 Smal_0698     TRUE 0.895 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7079448 7079449 Smal_0699 Smal_0700     FALSE 0.452 53.000 0.014 NA   NA
 7079450 7079451 Smal_0701 Smal_0702     TRUE 0.982 5.000 0.556 NA   NA
 7079451 7079452 Smal_0702 Smal_0703     TRUE 0.966 -3.000 0.065 NA   NA
 7079453 7079454 Smal_0704 Smal_0705     TRUE 0.994 -3.000 0.321 0.001   NA
 7079456 7079457 Smal_0707 Smal_0708     FALSE 0.442 60.000 0.017 NA   NA
 7079457 7079458 Smal_0708 Smal_0709     FALSE 0.027 175.000 0.000 NA   NA
 7079458 7079459 Smal_0709 Smal_0710     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079459 7079460 Smal_0710 Smal_0711     TRUE 0.732 2.000 0.000 NA   NA
 7079460 7079461 Smal_0711 Smal_0712     FALSE 0.013 368.000 0.000 NA   NA
 7079462 7079463 Smal_0713 Smal_0714     FALSE 0.406 71.000 0.018 NA   NA
 7079463 7079464 Smal_0714 Smal_0715     TRUE 0.994 -3.000 0.657 NA   NA
 7079465 7079466 Smal_0716 Smal_0717 rbn   TRUE 0.953 -3.000 0.020 1.000   NA
 7079469 7079470 Smal_0720 Smal_0721   prfA TRUE 0.647 6.000 0.004 1.000 N NA
 7079470 7079471 Smal_0721 Smal_0722 prfA hemA TRUE 0.987 -22.000 0.171 0.038 N NA
 7079472 7079473 Smal_0723 Smal_0724   lolB TRUE 0.957 -3.000 0.024 1.000   NA
 7079473 7079474 Smal_0724 Smal_0725 lolB ipk TRUE 0.968 -3.000 0.157 1.000 N NA
 7079474 7079475 Smal_0725 Smal_R0014 ipk   TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7079475 7079476 Smal_R0014 Smal_0726     FALSE 0.048 139.000 0.000 NA   NA
 7079476 7079477 Smal_0726 Smal_0727     FALSE 0.361 107.000 0.122 1.000 N NA
 7079477 7079478 Smal_0727 Smal_0728     TRUE 0.967 60.000 0.496 0.021 Y NA
 7079478 7079479 Smal_0728 Smal_0729     TRUE 0.824 106.000 0.184 1.000 Y NA
 7079482 7079483 Smal_0732 Smal_0733     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 7079483 7079484 Smal_0733 Smal_0734     FALSE 0.029 170.000 0.000 NA   NA
 7079484 7079485 Smal_0734 Smal_0735     FALSE 0.001 264.000 0.000 1.000 N NA
 7079485 7079486 Smal_0735 Smal_0736     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.030 Y NA
 7079486 7079487 Smal_0736 Smal_0737     FALSE 0.542 126.000 0.000 0.030 Y NA
 7079487 7079488 Smal_0737 Smal_0738     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.030 Y NA
 7079488 7079489 Smal_0738 Smal_0739     FALSE 0.002 162.000 0.000 1.000 N NA
 7079490 7079491 Smal_0740 Smal_0741     FALSE 0.175 105.000 0.015 1.000 N NA
 7079491 7079492 Smal_0741 Smal_R0015     FALSE 0.050 137.000 0.000 NA   NA
 7079492 7079493 Smal_R0015 Smal_R0016     FALSE 0.414 25.000 0.000 NA   NA
 7079493 7079494 Smal_R0016 Smal_R0017     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079494 7079495 Smal_R0017 Smal_0742     FALSE 0.270 42.000 0.000 NA   NA
 7079495 7079496 Smal_0742 Smal_R0018     FALSE 0.115 104.000 0.000 NA   NA
 7079496 7079497 Smal_R0018 Smal_0743   secE FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079497 7079498 Smal_0743 Smal_0744 secE nusG TRUE 0.979 11.000 0.843 1.000 N NA
 7079498 7079499 Smal_0744 Smal_0745 nusG rplK FALSE 0.247 298.000 0.681 1.000 N NA
 7079499 7079500 Smal_0745 Smal_0746 rplK rplA TRUE 0.998 5.000 0.838 0.018 Y NA
 7079500 7079501 Smal_0746 Smal_0747 rplA rplJ FALSE 0.407 384.000 0.302 1.000 Y NA
 7079501 7079502 Smal_0747 Smal_0748 rplJ rplL TRUE 0.971 64.000 0.884 1.000 Y NA
 7079502 7079503 Smal_0748 Smal_0749 rplL rpoB FALSE 0.133 365.000 0.223 1.000   NA
 7079503 7079504 Smal_0749 Smal_0750 rpoB   TRUE 0.929 88.000 0.851 0.001   NA
 7079504 7079505 Smal_0750 Smal_0751   rpsL FALSE 0.066 284.000 0.122 1.000 N NA
 7079505 7079506 Smal_0751 Smal_0752 rpsL   TRUE 0.995 13.000 0.620 0.003 Y NA
 7079506 7079507 Smal_0752 Smal_0753     TRUE 0.825 139.000 0.579 1.000 Y NA
 7079507 7079508 Smal_0753 Smal_0754     TRUE 0.972 52.000 0.400 0.001 Y NA
 7079508 7079509 Smal_0754 Smal_0755   rpsJ FALSE 0.429 334.000 0.318 1.000 Y NA
 7079509 7079510 Smal_0755 Smal_0756 rpsJ rplC TRUE 0.992 12.000 0.307 0.018 Y NA
 7079510 7079511 Smal_0756 Smal_0757 rplC rplD TRUE 0.994 13.000 0.486 0.013 Y NA
 7079511 7079512 Smal_0757 Smal_0758 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 0.013 Y NA
 7079512 7079513 Smal_0758 Smal_0759 rplW rplB TRUE 0.997 11.000 0.849 0.018 Y NA
 7079513 7079514 Smal_0759 Smal_0760 rplB rpsS TRUE 0.998 7.000 0.820 0.018 Y NA
 7079514 7079515 Smal_0760 Smal_0761 rpsS rplV TRUE 0.996 13.000 0.769 0.018 Y NA
 7079515 7079516 Smal_0761 Smal_0762 rplV rpsC TRUE 0.994 19.000 0.719 0.018 Y NA
 7079516 7079517 Smal_0762 Smal_0763 rpsC rplP TRUE 0.998 6.000 0.828 0.018 Y NA
 7079517 7079518 Smal_0763 Smal_0764 rplP   TRUE 0.998 0.000 0.802 0.013 Y NA
 7079518 7079519 Smal_0764 Smal_0765   rpsQ TRUE 0.997 12.000 0.828 0.013 Y NA
 7079519 7079520 Smal_0765 Smal_0766 rpsQ rplN TRUE 0.996 13.000 0.791 0.018 Y NA
 7079520 7079521 Smal_0766 Smal_0767 rplN rplX TRUE 0.995 17.000 0.810 0.018 Y NA
 7079521 7079522 Smal_0767 Smal_0768 rplX rplE TRUE 0.996 12.000 0.758 0.013 Y NA
 7079522 7079523 Smal_0768 Smal_0769 rplE rpsN TRUE 0.988 19.000 0.309 0.013 Y NA
 7079523 7079524 Smal_0769 Smal_0770 rpsN rpsH TRUE 0.563 260.000 0.295 0.013 Y NA
 7079524 7079525 Smal_0770 Smal_0771 rpsH rplF TRUE 0.995 19.000 0.808 0.013 Y NA
 7079525 7079526 Smal_0771 Smal_0772 rplF rplR TRUE 0.973 87.000 0.815 0.013 Y NA
 7079526 7079527 Smal_0772 Smal_0773 rplR rpsE TRUE 0.877 162.000 0.814 0.018 Y NA
 7079527 7079528 Smal_0773 Smal_0774 rpsE rpmD TRUE 0.999 -7.000 0.789 0.018 Y NA
 7079528 7079529 Smal_0774 Smal_0775 rpmD rplO TRUE 0.997 7.000 0.653 0.002 Y NA
 7079529 7079530 Smal_0775 Smal_0776 rplO secY TRUE 0.980 8.000 0.730 1.000 N NA
 7079530 7079531 Smal_0776 Smal_0777 secY rpsM FALSE 0.018 348.000 0.011 1.000 N NA
 7079531 7079532 Smal_0777 Smal_0778 rpsM   TRUE 0.997 12.000 0.810 0.013 Y NA
 7079532 7079533 Smal_0778 Smal_0779   rpsD TRUE 0.993 16.000 0.509 0.018 Y NA
 7079533 7079534 Smal_0779 Smal_0780 rpsD   TRUE 0.824 56.000 0.549 1.000 N NA
 7079534 7079535 Smal_0780 Smal_0781   rplQ FALSE 0.410 198.000 0.873 1.000 N NA
 7079535 7079536 Smal_0781 Smal_0782 rplQ   FALSE 0.001 238.000 0.000 1.000 N NA
 7079538 7079539 Smal_0784 Smal_0785     FALSE 0.016 773.000 0.015 NA N NA
 7079540 7079541 Smal_0786 Smal_0787     TRUE 0.634 42.000 0.045 NA   NA
 7079541 7079542 Smal_0787 Smal_0788     TRUE 0.758 12.000 0.006 NA   NA
 7079543 7079544 Smal_0789 Smal_0790     FALSE 0.133 119.000 0.018 1.000 N NA
 7079544 7079545 Smal_0790 Smal_0791     FALSE 0.005 123.000 0.000 1.000 N NA
 7079545 7079546 Smal_0791 Smal_0792   prpE FALSE 0.001 681.000 0.000 1.000 N NA
 7079546 7079547 Smal_0792 Smal_0793 prpE   FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 7079547 7079548 Smal_0793 Smal_0794     FALSE 0.329 34.000 0.000 NA   NA
 7079549 7079550 Smal_0795 Smal_0796     TRUE 0.562 85.000 0.111 1.000   NA
 7079550 7079551 Smal_0796 Smal_0797     FALSE 0.016 298.000 0.000 1.000   NA
 7079551 7079552 Smal_0797 Smal_0798     FALSE 0.165 74.000 0.000 NA   NA
 7079552 7079553 Smal_0798 Smal_0799     FALSE 0.016 238.000 0.000 NA   NA
 7079554 7079555 Smal_0800 Smal_0801     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 7079555 7079556 Smal_0801 Smal_0802     TRUE 0.905 21.000 0.227 NA   NA
 7079556 7079557 Smal_0802 Smal_0803     FALSE 0.521 85.000 0.091 NA   NA
 7079561 7079562 Smal_0807 Smal_0808     FALSE 0.155 200.000 0.143 1.000   NA
 7079562 7079563 Smal_0808 Smal_0809     FALSE 0.281 42.000 0.006 1.000 N NA
 7079563 7079564 Smal_0809 Smal_0810     FALSE 0.352 82.000 0.013 NA   NA
 7079564 7079565 Smal_0810 Smal_0811     FALSE 0.437 47.000 0.007 NA   NA
 7079565 7079566 Smal_0811 Smal_0812     TRUE 0.880 31.000 0.262 1.000   NA
 7079566 7079567 Smal_0812 Smal_0813     TRUE 0.841 10.000 0.012 1.000   NA
 7079570 7079571 Smal_0816 Smal_0817     FALSE 0.087 161.000 0.008 1.000   NA
 7079571 7079572 Smal_0817 Smal_0818     TRUE 0.982 -19.000 0.125 1.000   NA
 7079572 7079573 Smal_0818 Smal_0819     FALSE 0.050 145.000 0.000 1.000   NA
 7079573 7079574 Smal_0819 Smal_0820     FALSE 0.044 333.000 0.000 0.026   NA
 7079574 7079575 Smal_0820 Smal_0821     FALSE 0.017 295.000 0.000 1.000   NA
 7079575 7079576 Smal_0821 Smal_0822     FALSE 0.253 357.000 0.076 1.000 Y NA
 7079576 7079577 Smal_0822 Smal_0823     TRUE 0.862 5.000 0.045 1.000 N NA
 7079577 7079578 Smal_0823 Smal_0824     TRUE 0.897 107.000 0.453 1.000 Y NA
 7079578 7079579 Smal_0824 Smal_0825     FALSE 0.230 117.000 0.016 1.000   NA
 7079580 7079581 Smal_0826 Smal_0827     TRUE 0.962 -3.000 0.045 NA   NA
 7079581 7079582 Smal_0827 Smal_0828     FALSE 0.048 358.000 0.025 NA   NA
 7079582 7079583 Smal_0828 Smal_0829     FALSE 0.020 260.000 0.000 0.066 N NA
 7079583 7079584 Smal_0829 Smal_0830     TRUE 0.822 84.000 0.750 1.000 N NA
 7079584 7079585 Smal_0830 Smal_0831     FALSE 0.446 26.000 0.000 1.000   NA
 7079586 7079587 Smal_0832 Smal_0833     FALSE 0.036 155.000 0.000 NA   NA
 7079588 7079589 Smal_R0019 Smal_R0020     FALSE 0.292 39.000 0.000 NA   NA
 7079589 7079590 Smal_R0020 Smal_R0021     FALSE 0.027 175.000 0.000 NA   NA
 7079590 7079591 Smal_R0021 Smal_R0022     FALSE 0.159 80.000 0.000 NA   NA
 7079591 7079592 Smal_R0022 Smal_R0023     FALSE 0.022 198.000 0.000 NA   NA
 7079592 7079593 Smal_R0023 Smal_0834     FALSE 0.018 226.000 0.000 NA   NA
 7079593 7079594 Smal_0834 Smal_R0024     FALSE 0.047 140.000 0.000 NA   NA
 7079594 7079595 Smal_R0024 Smal_0835   tig FALSE 0.024 190.000 0.000 NA   NA
 7079595 7079596 Smal_0835 Smal_0836 tig clpP TRUE 0.922 77.000 0.351 1.000 Y NA
 7079596 7079597 Smal_0836 Smal_0837 clpP clpX TRUE 0.806 127.000 0.352 1.000 Y NA
 7079597 7079598 Smal_0837 Smal_0838 clpX   TRUE 0.730 143.000 0.201 0.098 Y NA
 7079598 7079599 Smal_0838 Smal_0839     FALSE 0.022 218.000 0.008 1.000 N NA
 7079599 7079600 Smal_0839 Smal_R0025     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7079600 7079601 Smal_R0025 Smal_R0026     FALSE 0.397 27.000 0.000 NA   NA
 7079601 7079602 Smal_R0026 Smal_R0027     FALSE 0.147 86.000 0.000 NA   NA
 7079602 7079603 Smal_R0027 Smal_R0028     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7079603 7079604 Smal_R0028 Smal_R0029     FALSE 0.106 107.000 0.000 NA   NA
 7079604 7079605 Smal_R0029 Smal_0840     FALSE 0.023 194.000 0.000 NA   NA
 7079606 7079607 Smal_0841 Smal_0842     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079608 7079609 Smal_0843 Smal_0844   rnhA TRUE 0.586 14.000 0.000 1.000   NA
 7079609 7079610 Smal_0844 Smal_0845 rnhA   TRUE 0.990 5.000 0.248 1.000 Y NA
 7079616 7079617 Smal_0850 Smal_0851     TRUE 0.935 0.000 0.032 1.000   NA
 7079617 7079618 Smal_0851 Smal_0852     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079620 7079621 Smal_0853 Smal_0854     FALSE 0.015 358.000 0.000 1.000   NA
 7079625 7079626 Smal_0857 Smal_0858     TRUE 0.974 7.000 0.411 NA   NA
 7079626 7079627 Smal_0858 Smal_0859   recR TRUE 0.734 112.000 0.604 NA   NA
 7079627 7079628 Smal_0859 Smal_0860 recR   FALSE 0.239 68.000 0.013 1.000 N NA
 7079629 7079630 Smal_0861 Smal_0862     TRUE 0.954 -3.000 0.025 NA   NA
 7079630 7079631 Smal_0862 Smal_0863     TRUE 0.996 -7.000 0.727 NA   NA
 7079631 7079632 Smal_0863 Smal_0864     TRUE 0.989 3.000 0.739 NA   NA
 7079635 7079636 Smal_0867 Smal_0868   rpmF TRUE 0.747 109.000 0.599 NA   NA
 7079636 7079637 Smal_0868 Smal_0869 rpmF   FALSE 0.205 92.000 0.014 1.000 N NA
 7079637 7079638 Smal_0869 Smal_0870     FALSE 0.162 77.000 0.000 NA   NA
 7079638 7079639 Smal_0870 Smal_0871     FALSE 0.030 169.000 0.000 NA   NA
 7079639 7079640 Smal_0871 Smal_0872   fabG TRUE 0.956 83.000 0.432 0.004 Y NA
 7079640 7079641 Smal_0872 Smal_0873 fabG acpP TRUE 0.789 153.000 0.321 0.004 Y NA
 7079641 7079642 Smal_0873 Smal_0874 acpP   TRUE 0.735 144.000 0.346 1.000 Y NA
 7079642 7079643 Smal_0874 Smal_0875     FALSE 0.466 93.000 0.030 0.013 N NA
 7079643 7079644 Smal_0875 Smal_0876     FALSE 0.057 198.000 0.010 NA   NA
 7079644 7079645 Smal_0876 Smal_0877     TRUE 0.983 -3.000 0.209 NA   NA
 7079645 7079646 Smal_0877 Smal_0878     TRUE 0.984 -3.000 0.211 0.097 N NA
 7079646 7079647 Smal_0878 Smal_0879     TRUE 0.985 -3.000 0.382 NA N NA
 7079647 7079648 Smal_0879 Smal_R0033     FALSE 0.029 170.000 0.000 NA   NA
 7079648 7079649 Smal_R0033 Smal_0880     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 7079650 7079651 Smal_0881 Smal_0882     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 7079651 7079652 Smal_0882 Smal_0883     TRUE 0.997 -16.000 1.000 NA   NA
 7079652 7079653 Smal_0883 Smal_0884     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7079653 7079654 Smal_0884 Smal_0885     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7079654 7079655 Smal_0885 Smal_0886     TRUE 0.607 81.000 0.154 NA   NA
 7079655 7079656 Smal_0886 Smal_0887     TRUE 0.973 3.000 0.308 NA   NA
 7079656 7079657 Smal_0887 Smal_0888     FALSE 0.106 107.000 0.000 NA   NA
 7079657 7079658 Smal_0888 Smal_0889     TRUE 0.732 2.000 0.000 NA   NA
 7079658 7079659 Smal_0889 Smal_0890     TRUE 0.660 8.000 0.000 NA   NA
 7079659 7079660 Smal_0890 Smal_0891     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7079660 7079661 Smal_0891 Smal_0892     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7079661 7079662 Smal_0892 Smal_0893     FALSE 0.216 53.000 0.000 NA   NA
 7079662 7079663 Smal_0893 Smal_0894     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 7079663 7079664 Smal_0894 Smal_0895     FALSE 0.013 353.000 0.000 NA   NA
 7079664 7079665 Smal_0895 Smal_0896     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079665 7079666 Smal_0896 Smal_0897     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079666 7079667 Smal_0897 Smal_0898     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079667 7079668 Smal_0898 Smal_0899     FALSE 0.013 335.000 0.000 NA   NA
 7079668 7079669 Smal_0899 Smal_0900     FALSE 0.038 153.000 0.000 NA   NA
 7079669 7079670 Smal_0900 Smal_0901     FALSE 0.270 42.000 0.000 NA   NA
 7079670 7079671 Smal_0901 Smal_0902     FALSE 0.164 75.000 0.000 NA   NA
 7079671 7079672 Smal_0902 Smal_0903     TRUE 0.740 1.000 0.000 NA   NA
 7079673 7079674 Smal_0904 Smal_0905     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7079674 7079675 Smal_0905 Smal_0906     FALSE 0.019 217.000 0.000 NA   NA
 7079675 7079676 Smal_0906 Smal_0907     FALSE 0.060 130.000 0.000 NA   NA
 7079676 7079677 Smal_0907 Smal_0908     TRUE 0.939 12.000 0.224 NA   NA
 7079678 7079679 Smal_0909 Smal_0910     TRUE 0.931 12.000 0.000 NA Y NA
 7079681 7079682 Smal_0912 Smal_0913     FALSE 0.009 99.000 0.000 1.000 N NA
 7079686 7079687 Smal_0917 Smal_0918     FALSE 0.009 100.000 0.000 1.000 N NA
 7079687 7079688 Smal_0918 Smal_0919     TRUE 0.999 -22.000 0.857 1.000 Y NA
 7079689 7079690 Smal_0920 Smal_0921     TRUE 0.902 5.000 0.100 1.000 N NA
 7079692 7079693 Smal_0923 Smal_0924     TRUE 0.949 0.000 0.078 NA   NA
 7079698 7079699 Smal_0929 Smal_0930     TRUE 0.940 19.000 0.357 NA   NA
 7079700 7079701 Smal_0931 Smal_0932     TRUE 0.995 10.000 0.436 0.014 Y NA
 7079701 7079702 Smal_0932 Smal_0933     FALSE 0.002 153.000 0.000 1.000 N NA
 7079704 7079705 Smal_0935 Smal_0936     FALSE 0.130 97.000 0.000 NA   NA
 7079705 7079706 Smal_0936 Smal_0937     FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 7079707 7079708 Smal_0938 Smal_0939     TRUE 0.964 -3.000 0.051 NA   NA
 7079709 7079710 Smal_0940 Smal_0941     TRUE 0.983 -7.000 0.263 NA N NA
 7079710 7079711 Smal_0941 Smal_0942   pyrB TRUE 0.686 16.000 0.022 1.000 N NA
 7079711 7079712 Smal_0942 Smal_0943 pyrB   FALSE 0.001 249.000 0.000 1.000 N NA
 7079713 7079714 Smal_0944 Smal_0945     TRUE 0.670 71.000 0.200 NA   NA
 7079714 7079715 Smal_0945 Smal_0946     FALSE 0.190 62.000 0.000 NA   NA
 7079715 7079716 Smal_0946 Smal_0947     FALSE 0.069 181.000 0.042 1.000 N NA
 7079716 7079717 Smal_0947 Smal_0948     TRUE 0.995 3.000 0.205 0.002 Y NA
 7079717 7079718 Smal_0948 Smal_0949     TRUE 0.998 -7.000 0.261 0.002 Y NA
 7079718 7079719 Smal_0949 Smal_0950     FALSE 0.095 573.000 0.171 NA   NA
 7079719 7079720 Smal_0950 Smal_0951     TRUE 0.860 28.000 0.194 NA   NA
 7079720 7079721 Smal_0951 Smal_0952     TRUE 0.992 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 7079721 7079722 Smal_0952 Smal_0953     TRUE 0.599 22.000 0.022 NA N NA
 7079722 7079723 Smal_0953 Smal_0954     FALSE 0.405 59.000 0.050 NA N NA
 7079723 7079724 Smal_0954 Smal_0955     TRUE 0.778 41.000 0.163 1.000   NA
 7079724 7079725 Smal_0955 Smal_0956     TRUE 0.987 0.000 0.543 NA   NA
 7079725 7079726 Smal_0956 Smal_0957     TRUE 0.723 105.000 0.459 NA   NA
 7079726 7079727 Smal_0957 Smal_0958     TRUE 0.993 -3.000 0.617 NA   NA
 7079727 7079728 Smal_0958 Smal_0959     TRUE 0.859 67.000 0.598 1.000   NA
 7079729 7079730 Smal_0960 Smal_0961     TRUE 0.787 22.000 0.129 NA N NA
 7079730 7079731 Smal_0961 Smal_0962     TRUE 0.941 -3.000 0.013 NA   NA
 7079732 7079733 Smal_0963 Smal_0964     TRUE 0.991 3.000 1.000 NA   NA
 7079733 7079734 Smal_0964 Smal_0965   purN FALSE 0.430 68.000 0.020 NA   NA
 7079734 7079735 Smal_0965 Smal_0966 purN   TRUE 0.928 -3.000 0.007 NA   NA
 7079735 7079736 Smal_0966 Smal_0967     FALSE 0.265 43.000 0.000 NA   NA
 7079736 7079737 Smal_0967 Smal_0968     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079737 7079738 Smal_0968 Smal_0969     TRUE 0.630 23.000 0.005 NA   NA
 7079739 7079740 Smal_0970 Smal_0971     TRUE 0.970 -3.000 0.087 NA   NA
 7079740 7079741 Smal_0971 Smal_0972     TRUE 0.972 0.000 0.217 NA   NA
 7079741 7079742 Smal_0972 Smal_0973     FALSE 0.012 487.000 0.000 NA   NA
 7079742 7079743 Smal_0973 Smal_0974     TRUE 0.985 -3.000 0.111 0.054   NA
 7079744 7079745 Smal_0975 Smal_0976     TRUE 0.994 -3.000 0.642 NA   NA
 7079745 7079746 Smal_0976 Smal_0977     FALSE 0.337 65.000 0.006 NA   NA
 7079746 7079747 Smal_0977 Smal_0978     FALSE 0.193 71.000 0.000 1.000   NA
 7079748 7079749 Smal_0979 Smal_0980     FALSE 0.013 353.000 0.000 NA   NA
 7079749 7079750 Smal_0980 Smal_0981     TRUE 0.846 18.000 0.074 NA   NA
 7079750 7079751 Smal_0981 Smal_0982     FALSE 0.322 35.000 0.000 NA   NA
 7079752 7079753 Smal_0983 Smal_0984     TRUE 0.989 -3.000 0.500 1.000 N NA
 7079753 7079754 Smal_0984 Smal_0985     TRUE 0.798 53.000 0.462 NA N NA
 7079754 7079755 Smal_0985 Smal_0986     TRUE 0.879 77.000 0.808 NA   NA
 7079755 7079756 Smal_0986 Smal_0987     TRUE 0.964 27.000 0.848 NA   NA
 7079756 7079757 Smal_0987 Smal_0988     FALSE 0.065 256.000 0.038 NA   NA
 7079757 7079758 Smal_0988 Smal_0989     FALSE 0.041 147.000 0.000 NA   NA
 7079758 7079759 Smal_0989 Smal_0990     FALSE 0.032 165.000 0.000 NA   NA
 7079759 7079760 Smal_0990 Smal_0991     TRUE 0.646 11.000 0.000 1.000   NA
 7079760 7079761 Smal_0991 Smal_0992     TRUE 0.798 69.000 0.395 1.000   NA
 7079761 7079762 Smal_0992 Smal_0993     FALSE 0.038 152.000 0.000 NA   NA
 7079762 7079763 Smal_0993 Smal_0994     FALSE 0.021 204.000 0.000 NA   NA
 7079763 7079764 Smal_0994 Smal_0995     TRUE 0.983 -3.000 0.217 NA   NA
 7079766 7079767 Smal_0997 Smal_0998     TRUE 0.937 -3.000 0.041 1.000 N NA
 7079767 7079768 Smal_0998 Smal_0999     TRUE 0.996 0.000 0.482 1.000 Y NA
 7079768 7079769 Smal_0999 Smal_1000     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7079769 7079770 Smal_1000 Smal_1001     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7079770 7079771 Smal_1001 Smal_1002     TRUE 0.782 18.000 0.078 1.000 N NA
 7079773 7079774 Smal_1004 Smal_1005     TRUE 0.686 83.000 0.250 NA   NA
 7079774 7079775 Smal_1005 Smal_1006     TRUE 0.886 57.000 0.667 NA   NA
 7079775 7079776 Smal_1006 Smal_1007     FALSE 0.015 254.000 0.000 NA   NA
 7079778 7079779 Smal_1009 Smal_1010     TRUE 0.905 96.000 0.800 0.013   NA
 7079780 7079781 Smal_1011 Smal_1012     FALSE 0.432 80.000 0.029 NA   NA
 7079781 7079782 Smal_1012 Smal_1013   murD TRUE 0.960 -19.000 0.019 NA   NA
 7079787 7079788 Smal_1018 Smal_1019     FALSE 0.018 252.000 0.000 1.000   NA
 7079789 7079790 Smal_1020 Smal_1021     TRUE 0.982 -3.000 0.200 NA   NA
 7079790 7079791 Smal_1021 Smal_1022     TRUE 0.980 0.000 0.333 NA   NA
 7079791 7079792 Smal_1022 Smal_1023     FALSE 0.069 123.000 0.000 NA   NA
 7079792 7079793 Smal_1023 Smal_1024     FALSE 0.085 114.000 0.000 NA   NA
 7079794 7079795 Smal_1025 Smal_1026     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7079797 7079798 Smal_1028 Smal_1029     TRUE 0.917 13.000 0.150 1.000   NA
 7079799 7079800 Smal_1030 Smal_1031     TRUE 0.999 -10.000 0.667 0.095 Y NA
 7079802 7079803 Smal_1033 Smal_1034     FALSE 0.001 406.000 0.000 1.000 N NA
 7079803 7079804 Smal_1034 Smal_1035     TRUE 0.889 9.000 0.036 NA   NA
 7079804 7079805 Smal_1035 Smal_1036     TRUE 0.851 12.000 0.031 NA   NA
 7079805 7079806 Smal_1036 Smal_1037     TRUE 0.998 -3.000 0.306 0.054 Y NA
 7079806 7079807 Smal_1037 Smal_1038     FALSE 0.012 501.000 0.000 NA   NA
 7079809 7079810 Smal_1040 Smal_1041     FALSE 0.003 149.000 0.000 NA N NA
 7079810 7079811 Smal_1041 Smal_1042     TRUE 0.901 28.000 0.471 NA N NA
 7079811 7079812 Smal_1042 Smal_1043     TRUE 0.989 0.000 0.600 NA   NA
 7079812 7079813 Smal_1043 Smal_1044     TRUE 0.856 15.000 0.064 NA   NA
 7079814 7079815 Smal_1045 Smal_1046     FALSE 0.055 19.000 0.000 NA N NA
 7079815 7079816 Smal_1046 Smal_1047     FALSE 0.459 21.000 0.000 NA   NA
 7079816 7079817 Smal_1047 Smal_1048     TRUE 0.601 13.000 0.000 1.000   NA
 7079817 7079818 Smal_1048 Smal_1049     TRUE 0.771 28.000 0.067 NA   NA
 7079819 7079820 Smal_1050 Smal_1051     FALSE 0.002 154.000 0.000 1.000 N NA
 7079821 7079822 Smal_1052 Smal_1053     FALSE 0.416 60.000 0.000 0.070   NA
 7079823 7079824 Smal_1054 Smal_1055     FALSE 0.065 126.000 0.000 NA   NA
 7079824 7079825 Smal_1055 Smal_1056     FALSE 0.033 163.000 0.000 NA   NA
 7079825 7079826 Smal_1056 Smal_1057     FALSE 0.167 72.000 0.000 NA   NA
 7079826 7079827 Smal_1057 Smal_1058     FALSE 0.530 15.000 0.000 NA   NA
 7079830 7079831 Smal_1061 Smal_1062     TRUE 0.764 25.000 0.042 NA   NA
 7079832 7079833 Smal_1063 Smal_1064     FALSE 0.019 211.000 0.000 NA   NA
 7079833 7079834 Smal_1064 Smal_1065     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7079834 7079835 Smal_1065 Smal_1066     FALSE 0.291 44.000 0.000 1.000   NA
 7079835 7079836 Smal_1066 Smal_1067     FALSE 0.026 197.000 0.000 1.000   NA
 7079836 7079837 Smal_1067 Smal_1068     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 7079837 7079838 Smal_1068 Smal_1069     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7079838 7079839 Smal_1069 Smal_1070     FALSE 0.161 78.000 0.000 NA   NA
 7079842 7079843 Smal_1073 Smal_1074     TRUE 0.633 107.000 0.300 1.000   NA
 7079843 7079844 Smal_1074 Smal_1075     FALSE 0.426 105.000 0.070 1.000   NA
 7079844 7079845 Smal_1075 Smal_1076     TRUE 0.975 -3.000 0.203 1.000 N NA
 7079845 7079846 Smal_1076 Smal_1077     TRUE 0.972 -3.000 0.085 1.000   NA
 7079846 7079847 Smal_1077 Smal_1078     TRUE 0.978 -7.000 0.102 NA   NA
 7079847 7079848 Smal_1078 Smal_1079     TRUE 0.994 -3.000 0.700 NA   NA
 7079848 7079849 Smal_1079 Smal_1080     TRUE 0.991 -3.000 0.438 NA   NA
 7079849 7079850 Smal_1080 Smal_1081     TRUE 0.961 11.000 0.342 NA   NA
 7079850 7079851 Smal_1081 Smal_1082     FALSE 0.028 191.000 0.000 1.000   NA
 7079851 7079852 Smal_1082 Smal_1083     FALSE 0.016 299.000 0.000 1.000   NA
 7079852 7079853 Smal_1083 Smal_1084     FALSE 0.027 196.000 0.000 1.000   NA
 7079853 7079854 Smal_1084 Smal_1085     FALSE 0.030 184.000 0.000 1.000   NA
 7079855 7079856 Smal_1086 Smal_1087     FALSE 0.036 168.000 0.000 1.000   NA
 7079857 7079858 Smal_1088 Smal_1089     FALSE 0.162 90.000 0.000 1.000   NA
 7079859 7079860 Smal_1090 Smal_1091     FALSE 0.067 255.000 0.043 NA   NA
 7079860 7079861 Smal_1091 Smal_1092     FALSE 0.045 142.000 0.000 NA   NA
 7079862 7079863 Smal_1093 Smal_1094   minE TRUE 0.570 38.000 0.015 NA   NA
 7079863 7079864 Smal_1094 Smal_1095 minE   TRUE 0.996 3.000 0.618 NA Y NA
 7079864 7079865 Smal_1095 Smal_1096   minC TRUE 0.972 36.000 0.466 1.000 Y NA
 7079865 7079866 Smal_1096 Smal_1097 minC   TRUE 0.891 3.000 0.013 1.000   NA
 7079867 7079868 Smal_1098 Smal_1099     TRUE 0.999 0.000 0.900 0.035 Y NA
 7079868 7079869 Smal_1099 Smal_1100     FALSE 0.017 235.000 0.000 NA   NA
 7079869 7079870 Smal_1100 Smal_1101     FALSE 0.267 106.000 0.013 NA   NA
 7079871 7079872 Smal_1102 Smal_1103     TRUE 0.630 10.000 0.000 NA   NA
 7079872 7079873 Smal_1103 Smal_1104     TRUE 0.703 4.000 0.000 NA   NA
 7079873 7079874 Smal_1104 Smal_1105     TRUE 0.950 -3.000 0.020 NA   NA
 7079874 7079875 Smal_1105 Smal_1106     TRUE 0.888 46.000 0.549 NA   NA
 7079877 7079878 Smal_1108 Smal_1109     FALSE 0.551 39.000 0.014 NA   NA
 7079880 7079881 Smal_1111 Smal_1112     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7079881 7079882 Smal_1112 Smal_1113     TRUE 0.894 5.000 0.026 NA   NA
 7079882 7079883 Smal_1113 Smal_1114     FALSE 0.552 128.000 0.021 1.000 Y NA
 7079885 7079886 Smal_1116 Smal_1117     FALSE 0.147 86.000 0.000 NA   NA
 7079886 7079887 Smal_1117 Smal_1118   uvrA TRUE 0.886 0.000 0.005 1.000   NA
 7079888 7079889 Smal_1119 Smal_1120 rplU rpmA TRUE 0.996 12.000 0.667 0.013 Y NA
 7079889 7079890 Smal_1120 Smal_1121 rpmA obgE FALSE 0.241 217.000 0.335 1.000   NA
 7079892 7079893 Smal_1123 Smal_1124     TRUE 0.644 76.000 0.169 1.000   NA
 7079893 7079894 Smal_1124 Smal_1125   ileS TRUE 0.979 -3.000 0.254 1.000 N NA
 7079894 7079895 Smal_1125 Smal_1126 ileS lspA TRUE 0.946 0.000 0.147 1.000 N NA
 7079895 7079896 Smal_1126 Smal_1127 lspA ispH TRUE 0.945 28.000 0.095 1.000 Y NA
 7079896 7079897 Smal_1127 Smal_1128 ispH   FALSE 0.027 195.000 0.000 1.000   NA
 7079897 7079898 Smal_1128 Smal_1129     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7079899 7079900 Smal_1130 Smal_1131     TRUE 0.993 -3.000 0.600 NA   NA
 7079900 7079901 Smal_1131 Smal_1132     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7079901 7079902 Smal_1132 Smal_1133     TRUE 0.925 13.000 0.000 NA Y NA
 7079902 7079903 Smal_1133 Smal_1134     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA N NA
 7079904 7079905 Smal_1135 Smal_1136     FALSE 0.144 99.000 0.000 1.000   NA
 7079905 7079906 Smal_1136 Smal_R0034     FALSE 0.224 51.000 0.000 NA   NA
 7079906 7079907 Smal_R0034 Smal_1137     FALSE 0.023 196.000 0.000 NA   NA
 7079908 7079909 Smal_1138 Smal_1139     FALSE 0.545 14.000 0.000 NA   NA
 7079910 7079911 Smal_1140 Smal_1141     TRUE 0.997 3.000 0.385 0.003 Y NA
 7079911 7079912 Smal_1141 Smal_1142     TRUE 0.998 -3.000 0.385 0.003 Y NA
 7079912 7079913 Smal_1142 Smal_1143     TRUE 0.982 0.000 0.000 0.042 Y NA
 7079915 7079916 Smal_1145 Smal_1146     FALSE 0.277 190.000 0.000 0.094 Y NA
 7079916 7079917 Smal_1146 Smal_1147     TRUE 0.916 49.000 0.727 1.000   NA
 7079917 7079918 Smal_1147 Smal_1148     FALSE 0.115 104.000 0.000 NA   NA
 7079920 7079921 Smal_1150 Smal_1151     FALSE 0.265 92.000 0.003 1.000   NA
 7079921 7079922 Smal_1151 Smal_1152     TRUE 0.965 -3.000 0.045 1.000   NA
 7079922 7079923 Smal_1152 Smal_1153   rpsP FALSE 0.108 102.000 0.004 1.000 N NA
 7079923 7079924 Smal_1153 Smal_1154 rpsP rimM TRUE 0.970 45.000 0.342 0.013 Y NA
 7079924 7079925 Smal_1154 Smal_1155 rimM trmD TRUE 0.995 9.000 0.672 1.000 Y NA
 7079925 7079926 Smal_1155 Smal_1156 trmD rplS TRUE 0.773 155.000 0.567 1.000 Y NA
 7079926 7079927 Smal_1156 Smal_1157 rplS   FALSE 0.155 83.000 0.000 NA   NA
 7079927 7079928 Smal_1157 Smal_1158     FALSE 0.159 80.000 0.000 NA   NA
 7079928 7079929 Smal_1158 Smal_1159     TRUE 0.811 39.000 0.208 NA   NA
 7079931 7079932 Smal_1161 Smal_1162     TRUE 0.630 10.000 0.000 NA   NA
 7079932 7079933 Smal_1162 Smal_1163     FALSE 0.099 114.000 0.000 1.000   NA
 7079934 7079935 Smal_1164 Smal_1165     FALSE 0.099 109.000 0.000 NA   NA
 7079935 7079936 Smal_1165 Smal_1166     FALSE 0.001 195.000 0.000 1.000 N NA
 7079939 7079940 Smal_1169 Smal_1170     FALSE 0.032 174.000 0.000 1.000   NA
 7079941 7079942 Smal_1171 Smal_1172     TRUE 0.995 -3.000 0.743 NA   NA
 7079942 7079943 Smal_1172 Smal_1173     TRUE 0.980 -15.000 0.119 NA   NA
 7079943 7079944 Smal_1173 Smal_1174     TRUE 0.957 -7.000 0.062 1.000 N NA
 7079944 7079945 Smal_1174 Smal_1175     FALSE 0.008 106.000 0.000 1.000 N NA
 7079946 7079947 Smal_1176 Smal_1177     FALSE 0.027 176.000 0.000 NA   NA
 7079948 7079949 Smal_1178 Smal_1179     TRUE 0.979 5.000 0.492 NA   NA
 7079949 7079950 Smal_1179 Smal_1180     FALSE 0.173 69.000 0.000 NA   NA
 7079950 7079951 Smal_1180 Smal_1181     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7079951 7079952 Smal_1181 Smal_1182     TRUE 0.935 4.000 0.086 NA   NA
 7079952 7079953 Smal_1182 Smal_1183     TRUE 0.809 29.000 0.118 NA   NA
 7079953 7079954 Smal_1183 Smal_1184     TRUE 0.887 63.000 0.152 1.000 Y NA
 7079954 7079955 Smal_1184 Smal_1185     FALSE 0.002 175.000 0.000 1.000 N NA
 7079955 7079956 Smal_1185 Smal_1186     TRUE 0.960 11.000 0.333 NA   NA
 7079956 7079957 Smal_1186 Smal_1187     TRUE 0.973 12.000 0.583 NA   NA
 7079957 7079958 Smal_1187 Smal_1188     TRUE 0.969 2.000 0.241 NA   NA
 7079958 7079959 Smal_1188 Smal_1189     FALSE 0.181 81.000 0.000 1.000   NA
 7079959 7079960 Smal_1189 Smal_1190     TRUE 0.993 -3.000 0.083 1.000 Y NA
 7079960 7079961 Smal_1190 Smal_1191     FALSE 0.065 133.000 0.000 1.000   NA
 7079961 7079962 Smal_1191 Smal_1192     FALSE 0.165 74.000 0.000 NA   NA
 7079965 7079966 Smal_1195 Smal_1196     FALSE 0.161 220.000 0.000 1.000 Y NA
 7079968 7079969 Smal_1198 Smal_1199     FALSE 0.002 161.000 0.000 1.000 N NA
 7079970 7079971 Smal_1200 Smal_1201     FALSE 0.249 52.000 0.000 1.000   NA
 7079971 7079972 Smal_1201 Smal_1202     FALSE 0.031 150.000 0.002 1.000 N NA
 7079972 7079973 Smal_1202 Smal_1203     FALSE 0.267 96.000 0.007 NA   NA
 7079974 7079975 Smal_1204 Smal_1205     TRUE 0.997 4.000 0.776 1.000 Y NA
 7079975 7079976 Smal_1205 Smal_1206     TRUE 0.642 82.000 0.311 NA N NA
 7079976 7079977 Smal_1206 Smal_1207     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7079977 7079978 Smal_1207 Smal_1208     FALSE 0.028 172.000 0.000 NA   NA
 7079978 7079979 Smal_1208 Smal_1209   gltX FALSE 0.043 154.000 0.000 1.000   NA
 7079979 7079980 Smal_1209 Smal_1210 gltX   FALSE 0.403 35.000 0.012 1.000 N NA
 7079981 7079982 Smal_1211 Smal_1212     TRUE 0.976 11.000 0.578 NA   NA
 7079982 7079983 Smal_1212 Smal_1213     TRUE 0.976 0.000 0.276 NA   NA
 7079983 7079984 Smal_1213 Smal_1214     FALSE 0.020 230.000 0.000 1.000   NA
 7079985 7079986 Smal_1215 Smal_1216     TRUE 0.824 111.000 1.000 NA   NA
 7079987 7079988 Smal_1217 Smal_1218     FALSE 0.039 435.000 0.013 1.000   NA
 7079988 7079989 Smal_1218 Smal_1219     TRUE 0.996 -3.000 0.275 1.000 Y NA
 7079990 7079991 Smal_1220 Smal_1221     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 7079991 7079992 Smal_1221 Smal_1222     TRUE 0.915 12.000 0.138 NA   NA
 7079992 7079993 Smal_1222 Smal_1223     FALSE 0.400 81.000 0.021 NA   NA
 7079995 7079996 Smal_1225 Smal_1226     FALSE 0.015 228.000 0.004 1.000 N NA
 7079996 7079997 Smal_1226 Smal_1227     TRUE 0.660 110.000 0.000 0.009 Y NA
 7079997 7079998 Smal_1227 Smal_1228     TRUE 0.627 35.000 0.074 1.000 N NA
 7079998 7079999 Smal_1228 Smal_1229     FALSE 0.136 145.000 0.074 1.000 N NA
 7079999 7080000 Smal_1229 Smal_1230     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7080001 7080002 Smal_1231 Smal_1232     FALSE 0.246 46.000 0.000 NA   NA
 7080002 7080003 Smal_1232 Smal_1233     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080004 7080005 Smal_1234 Smal_1235     FALSE 0.230 172.000 0.000 1.000 Y NA
 7080005 7080006 Smal_1235 Smal_1236     FALSE 0.088 120.000 0.000 1.000   NA
 7080008 7080009 Smal_1238 Smal_1239     TRUE 0.957 -3.000 0.031 NA   NA
 7080010 7080011 Smal_1240 Smal_1241     TRUE 0.567 69.000 0.095 NA   NA
 7080014 7080015 Smal_1244 Smal_1245     TRUE 0.990 -3.000 0.417 NA   NA
 7080016 7080017 Smal_1246 Smal_1247     FALSE 0.401 94.000 0.034 NA   NA
 7080019 7080020 Smal_1249 Smal_1250     FALSE 0.085 114.000 0.000 NA   NA
 7080020 7080021 Smal_1250 Smal_1251   dnaE FALSE 0.208 56.000 0.000 NA   NA
 7080021 7080022 Smal_1251 Smal_1252 dnaE   FALSE 0.307 260.000 0.104 1.000 Y NA
 7080022 7080023 Smal_1252 Smal_1253   lpxB TRUE 0.972 -3.000 0.186 1.000 N NA
 7080023 7080024 Smal_1253 Smal_1254 lpxB   TRUE 0.996 -3.000 0.289 1.000 Y NA
 7080024 7080025 Smal_1254 Smal_1255   fabZ TRUE 0.673 17.000 0.022 1.000 N NA
 7080025 7080026 Smal_1255 Smal_1256 fabZ lpxD TRUE 0.911 -3.000 0.019 1.000 N NA
 7080026 7080027 Smal_1256 Smal_1257 lpxD   FALSE 0.111 464.000 0.000 1.000 Y NA
 7080027 7080028 Smal_1257 Smal_1258     TRUE 0.746 75.000 0.007 1.000 Y NA
 7080028 7080029 Smal_1258 Smal_1259     TRUE 0.830 56.000 0.568 1.000 N NA
 7080029 7080030 Smal_1259 Smal_1260     TRUE 0.994 3.000 0.372 1.000 Y NA
 7080030 7080031 Smal_1260 Smal_1261     TRUE 0.997 -3.000 0.400 1.000 Y NA
 7080031 7080032 Smal_1261 Smal_1262     TRUE 0.966 6.000 0.409 1.000 N NA
 7080032 7080033 Smal_1262 Smal_1263   pyrH TRUE 0.757 97.000 0.626 1.000 N NA
 7080033 7080034 Smal_1263 Smal_1264 pyrH   FALSE 0.068 121.000 0.004 1.000 N NA
 7080034 7080035 Smal_1264 Smal_1265   tsf FALSE 0.012 258.000 0.002 1.000 N NA
 7080035 7080036 Smal_1265 Smal_1266 tsf rpsB TRUE 0.894 126.000 0.748 1.000 Y NA
 7080036 7080037 Smal_1266 Smal_1267 rpsB   FALSE 0.001 221.000 0.000 NA N NA
 7080037 7080038 Smal_1267 Smal_1268     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080038 7080039 Smal_1268 Smal_1269     FALSE 0.157 82.000 0.000 NA   NA
 7080039 7080040 Smal_1269 Smal_1270     TRUE 0.991 -3.000 0.444 NA   NA
 7080040 7080041 Smal_1270 Smal_1271     TRUE 0.995 8.000 0.667 NA Y NA
 7080041 7080042 Smal_1271 Smal_1272     TRUE 0.919 11.000 0.125 NA   NA
 7080043 7080044 Smal_1273 Smal_1274     TRUE 0.926 3.000 0.128 1.000 N NA
 7080044 7080045 Smal_1274 Smal_1275   dapD TRUE 0.821 0.000 0.012 1.000 N NA
 7080045 7080046 Smal_1275 Smal_1276 dapD   TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7080046 7080047 Smal_1276 Smal_1277     FALSE 0.350 32.000 0.000 NA   NA
 7080047 7080048 Smal_1277 Smal_1278     TRUE 0.981 -3.000 0.292 1.000 N NA
 7080050 7080051 Smal_1280 Smal_1281 asnB   FALSE 0.007 107.000 0.000 1.000 N NA
 7080054 7080055 Smal_1284 Smal_1285     FALSE 0.189 61.000 0.005 1.000 N NA
 7080056 7080057 Smal_1286 Smal_1287     TRUE 0.984 -3.000 0.333 1.000 N NA
 7080057 7080058 Smal_1287 Smal_1288     TRUE 0.927 12.000 0.278 1.000 N NA
 7080058 7080059 Smal_1288 Smal_1289     TRUE 0.989 8.000 0.900 1.000   NA
 7080060 7080061 Smal_1290 Smal_R0035     FALSE 0.013 330.000 0.000 NA   NA
 7080061 7080062 Smal_R0035 Smal_1291     FALSE 0.224 51.000 0.000 NA   NA
 7080064 7080065 Smal_R0036 Smal_R0037     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 7080066 7080067 Smal_1293 Smal_1294     FALSE 0.235 104.000 0.004 1.000   NA
 7080067 7080068 Smal_1294 Smal_1295     FALSE 0.047 199.000 0.002 1.000   NA
 7080069 7080070 Smal_1296 Smal_1297     TRUE 0.982 -3.000 0.303 1.000 N NA
 7080070 7080071 Smal_1297 Smal_1298     TRUE 0.940 -3.000 0.045 1.000 N NA
 7080072 7080073 Smal_1299 Smal_1300     TRUE 0.996 7.000 0.800 1.000 Y NA
 7080073 7080074 Smal_1300 Smal_1301     FALSE 0.219 178.000 0.000 1.000 Y NA
 7080075 7080076 Smal_1302 Smal_1303     FALSE 0.018 226.000 0.000 NA   NA
 7080076 7080077 Smal_1303 Smal_1304     TRUE 0.888 28.000 0.271 NA   NA
 7080077 7080078 Smal_1304 Smal_1305     TRUE 0.997 -7.000 0.914 NA   NA
 7080078 7080079 Smal_1305 Smal_1306     TRUE 0.966 -13.000 0.029 NA   NA
 7080079 7080080 Smal_1306 Smal_1307     FALSE 0.015 259.000 0.000 NA   NA
 7080080 7080081 Smal_1307 Smal_1308     TRUE 0.747 98.000 0.034 NA Y NA
 7080081 7080082 Smal_1308 Smal_1309     TRUE 0.992 20.000 0.526 0.002 Y NA
 7080082 7080083 Smal_1309 Smal_1310     TRUE 0.998 0.000 0.537 0.002 Y NA
 7080083 7080084 Smal_1310 Smal_1311     TRUE 0.875 83.000 0.033 0.002 Y NA
 7080084 7080085 Smal_1311 Smal_1312     FALSE 0.545 643.000 0.333 0.002 Y NA
 7080087 7080088 Smal_1314 Smal_1315     TRUE 0.877 0.000 0.005 NA   NA
 7080088 7080089 Smal_1315 Smal_1316     TRUE 0.949 5.000 0.160 NA   NA
 7080090 7080091 Smal_1317 Smal_1318     FALSE 0.059 286.000 0.028 1.000   NA
 7080091 7080092 Smal_1318 Smal_1319     TRUE 0.954 -3.000 0.021 1.000   NA
 7080094 7080095 Smal_1321 Smal_1322   rlmL FALSE 0.042 145.000 0.000 NA   NA
 7080096 7080097 Smal_1323 Smal_1324     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080097 7080098 Smal_1324 Smal_1325     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080098 7080099 Smal_1325 Smal_1326     FALSE 0.102 108.000 0.000 NA   NA
 7080099 7080100 Smal_1326 Smal_1327     FALSE 0.017 292.000 0.000 1.000   NA
 7080100 7080101 Smal_1327 Smal_1328     FALSE 0.199 119.000 0.013 NA   NA
 7080101 7080102 Smal_1328 Smal_1329     FALSE 0.546 64.000 0.064 NA   NA
 7080106 7080107 Smal_1333 Smal_1334     TRUE 0.601 86.000 0.267 1.000 N NA
 7080107 7080108 Smal_1334 Smal_1335     TRUE 0.706 59.000 0.000 NA Y NA
 7080110 7080111 Smal_1337 Smal_1338     FALSE 0.001 199.000 0.000 NA N NA
 7080112 7080113 Smal_1339 Smal_1340     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080113 7080114 Smal_1340 Smal_1341     TRUE 0.621 92.000 0.000 1.000 Y NA
 7080116 7080117 Smal_1343 Smal_1344     TRUE 0.997 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 7080117 7080118 Smal_1344 Smal_1345     TRUE 0.996 -3.000 0.094 0.044 Y NA
 7080118 7080119 Smal_1345 Smal_1346     FALSE 0.323 84.000 0.038 1.000 N NA
 7080120 7080121 Smal_1347 Smal_1348     TRUE 0.927 7.000 0.095 NA   NA
 7080121 7080122 Smal_1348 Smal_1349     TRUE 0.956 -3.000 0.029 NA   NA
 7080122 7080123 Smal_1349 Smal_1350     FALSE 0.456 65.000 0.024 NA   NA
 7080123 7080124 Smal_1350 Smal_1351     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 7080124 7080125 Smal_1351 Smal_1352     FALSE 0.265 43.000 0.000 NA   NA
 7080125 7080126 Smal_1352 Smal_1353     TRUE 0.991 -3.000 0.457 NA   NA
 7080127 7080128 Smal_1354 Smal_1355     TRUE 0.999 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 7080128 7080129 Smal_1355 Smal_1356     TRUE 0.995 -3.000 0.671 0.092 N NA
 7080130 7080131 Smal_1357 Smal_1358     FALSE 0.020 170.000 0.003 NA N NA
 7080132 7080133 Smal_1359 Smal_1360     TRUE 0.833 47.000 0.500 NA N NA
 7080133 7080134 Smal_1360 Smal_1361     FALSE 0.043 212.000 0.033 NA N NA
 7080134 7080135 Smal_1361 Smal_1362     TRUE 0.996 0.000 0.233 0.001 Y NA
 7080135 7080136 Smal_1362 Smal_1363     TRUE 0.999 -7.000 0.630 0.001 Y NA
 7080136 7080137 Smal_1363 Smal_1364     FALSE 0.397 135.000 0.370 NA N NA
 7080137 7080138 Smal_1364 Smal_1365     TRUE 0.872 85.000 0.831 NA   NA
 7080139 7080140 Smal_1366 Smal_1367     FALSE 0.176 68.000 0.000 NA   NA
 7080140 7080141 Smal_1367 Smal_1368     FALSE 0.164 116.000 0.005 NA   NA
 7080141 7080142 Smal_1368 Smal_1369     TRUE 0.926 -3.000 0.006 NA   NA
 7080143 7080144 Smal_1370 Smal_1371     TRUE 0.997 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 7080144 7080145 Smal_1371 Smal_1372     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 7080147 7080148 Smal_1374 Smal_1375     TRUE 0.902 -3.000 0.016 1.000 N NA
 7080148 7080149 Smal_1375 Smal_1376     FALSE 0.020 231.000 0.000 1.000   NA
 7080149 7080150 Smal_1376 Smal_1377     FALSE 0.045 254.000 0.014 NA   NA
 7080150 7080151 Smal_1377 Smal_1378     FALSE 0.078 174.000 0.014 NA   NA
 7080151 7080152 Smal_1378 Smal_1379     TRUE 0.994 -3.000 0.119 NA Y NA
 7080152 7080153 Smal_1379 Smal_1380     TRUE 0.983 9.000 0.143 NA Y NA
 7080153 7080154 Smal_1380 Smal_1381     TRUE 0.986 6.000 0.171 NA Y NA
 7080154 7080155 Smal_1381 Smal_1382     TRUE 0.967 14.000 0.077 NA Y NA
 7080155 7080156 Smal_1382 Smal_1383     TRUE 0.977 24.000 0.346 NA Y NA
 7080156 7080157 Smal_1383 Smal_R0038     FALSE 0.238 48.000 0.000 NA   NA
 7080159 7080160 Smal_1385 Smal_R0039     FALSE 0.106 107.000 0.000 NA   NA
 7080160 7080161 Smal_R0039 Smal_R0040     FALSE 0.125 99.000 0.000 NA   NA
 7080162 7080163 Smal_1386 Smal_1387     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 7080163 7080164 Smal_1387 Smal_1388     FALSE 0.350 32.000 0.000 NA   NA
 7080164 7080165 Smal_1388 Smal_1389     FALSE 0.091 112.000 0.000 NA   NA
 7080167 7080168 Smal_1391 Smal_1392     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7080169 7080170 Smal_1393 Smal_1394     TRUE 0.997 2.000 0.667 1.000 Y NA
 7080170 7080171 Smal_1394 Smal_1395     FALSE 0.226 59.000 0.000 1.000   NA
 7080171 7080172 Smal_1395 Smal_1396     TRUE 0.923 4.000 0.045 1.000   NA
 7080172 7080173 Smal_1396 Smal_1397     TRUE 0.998 4.000 0.746 0.055 Y NA
 7080173 7080174 Smal_1397 Smal_1398     TRUE 0.962 -3.000 0.120 1.000 N NA
 7080174 7080175 Smal_1398 Smal_1399   lpxK TRUE 0.958 0.000 0.205 1.000 N NA
 7080175 7080176 Smal_1399 Smal_1400 lpxK   TRUE 0.821 76.000 0.054 1.000 Y NA
 7080176 7080177 Smal_1400 Smal_1401     TRUE 0.942 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7080177 7080178 Smal_1401 Smal_1402     TRUE 0.927 -3.000 0.006 NA   NA
 7080178 7080179 Smal_1402 Smal_1403   uvrC TRUE 0.920 -3.000 0.004 NA   NA
 7080179 7080180 Smal_1403 Smal_1404 uvrC   TRUE 0.880 19.000 0.227 1.000 N NA
 7080180 7080181 Smal_1404 Smal_R0041     FALSE 0.029 171.000 0.000 NA   NA
 7080181 7080182 Smal_R0041 Smal_1405     FALSE 0.048 139.000 0.000 NA   NA
 7080182 7080183 Smal_1405 Smal_R0042     FALSE 0.082 116.000 0.000 NA   NA
 7080185 7080186 Smal_1407 Smal_1408     TRUE 0.985 -3.000 0.250 NA   NA
 7080186 7080187 Smal_1408 Smal_1409     TRUE 0.937 11.000 0.188 NA   NA
 7080187 7080188 Smal_1409 Smal_1410     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7080189 7080190 Smal_1411 Smal_1412     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7080191 7080192 Smal_R0043 Smal_R0044     FALSE 0.045 143.000 0.000 NA   NA
 7080192 7080193 Smal_R0044 Smal_R0045     FALSE 0.176 68.000 0.000 NA   NA
 7080193 7080194 Smal_R0045 Smal_1413     FALSE 0.024 191.000 0.000 NA   NA
 7080196 7080197 Smal_1415 Smal_1416     FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 7080198 7080199 Smal_1417 Smal_1418     FALSE 0.079 118.000 0.000 NA   NA
 7080199 7080200 Smal_1418 Smal_1419     FALSE 0.139 91.000 0.000 NA   NA
 7080201 7080202 Smal_1420 Smal_1421     FALSE 0.150 97.000 0.000 1.000   NA
 7080203 7080204 Smal_1422 Smal_1423     FALSE 0.030 169.000 0.000 NA   NA
 7080205 7080206 Smal_1424 Smal_1425     FALSE 0.013 354.000 0.000 NA   NA
 7080207 7080208 Smal_1426 Smal_1427     TRUE 0.967 -3.000 0.067 NA   NA
 7080209 7080210 Smal_1428 Smal_1429     FALSE 0.283 45.000 0.000 1.000   NA
 7080212 7080213 Smal_1430 Smal_1431     FALSE 0.053 142.000 0.000 1.000   NA
 7080213 7080214 Smal_1431 Smal_1432     FALSE 0.270 56.000 0.012 1.000 N NA
 7080214 7080215 Smal_1432 Smal_1433     FALSE 0.133 104.000 0.000 1.000   NA
 7080216 7080217 Smal_1434 Smal_1435     TRUE 0.966 -13.000 0.028 NA   NA
 7080218 7080219 Smal_1436 Smal_1437     FALSE 0.042 306.000 0.015 NA   NA
 7080219 7080220 Smal_1437 Smal_1438     FALSE 0.019 209.000 0.000 NA   NA
 7080220 7080221 Smal_1438 Smal_1439     FALSE 0.388 69.000 0.011 1.000   NA
 7080222 7080223 Smal_1440 Smal_1441     TRUE 0.986 -16.000 0.200 NA   NA
 7080224 7080225 Smal_1442 Smal_1443     TRUE 0.959 14.000 0.030 NA Y NA
 7080226 7080227 Smal_1444 Smal_1445     FALSE 0.006 111.000 0.000 1.000 N NA
 7080227 7080228 Smal_1445 Smal_1446     FALSE 0.001 235.000 0.000 1.000 N NA
 7080229 7080230 Smal_1447 Smal_1448   pyrG FALSE 0.013 401.000 0.000 NA   NA
 7080230 7080231 Smal_1448 Smal_1449 pyrG   FALSE 0.457 90.000 0.138 1.000 N NA
 7080231 7080232 Smal_1449 Smal_1450     TRUE 0.918 -3.000 0.004 NA   NA
 7080232 7080233 Smal_1450 Smal_1451     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080233 7080234 Smal_1451 Smal_1452   eno FALSE 0.231 98.000 0.003 NA   NA
 7080234 7080235 Smal_1452 Smal_1453 eno ftsB TRUE 0.946 5.000 0.241 1.000 N NA
 7080235 7080236 Smal_1453 Smal_1454 ftsB ispD TRUE 0.972 -3.000 0.185 1.000 N NA
 7080236 7080237 Smal_1454 Smal_1455 ispD ispF TRUE 0.971 35.000 0.419 1.000 Y NA
 7080237 7080238 Smal_1455 Smal_1456 ispF truD TRUE 0.981 -3.000 0.173 1.000   NA
 7080240 7080241 Smal_1458 Smal_1459 surE   TRUE 0.990 -3.000 0.353 1.000   NA
 7080241 7080242 Smal_1459 Smal_1460     TRUE 0.826 19.000 0.055 NA   NA
 7080242 7080243 Smal_1460 Smal_1461     TRUE 0.968 -3.000 0.074 NA   NA
 7080246 7080247 Smal_1464 Smal_1465     TRUE 0.786 14.000 0.014 NA   NA
 7080248 7080249 Smal_1466 Smal_1467     FALSE 0.388 70.000 0.066 NA N NA
 7080249 7080250 Smal_1467 Smal_1468     FALSE 0.113 105.000 0.000 NA   NA
 7080250 7080251 Smal_1468 Smal_1469     FALSE 0.012 547.000 0.000 NA   NA
 7080251 7080252 Smal_1469 Smal_1470   miaA TRUE 0.806 0.000 0.009 1.000 N NA
 7080252 7080253 Smal_1470 Smal_1471 miaA hfq TRUE 0.790 97.000 0.531 1.000   NA
 7080253 7080254 Smal_1471 Smal_1472 hfq   TRUE 0.904 15.000 0.141 1.000   NA
 7080254 7080255 Smal_1472 Smal_1473     FALSE 0.227 98.000 0.002 NA   NA
 7080255 7080256 Smal_1473 Smal_1474     TRUE 0.592 32.000 0.011 NA   NA
 7080256 7080257 Smal_1474 Smal_1475     FALSE 0.022 220.000 0.000 1.000   NA
 7080257 7080258 Smal_1475 Smal_1476   recA FALSE 0.029 205.000 0.000 0.051 N NA
 7080258 7080259 Smal_1476 Smal_1477 recA recX TRUE 0.598 111.000 0.296 1.000   NA
 7080259 7080260 Smal_1477 Smal_1478 recX alaS FALSE 0.405 110.000 0.085 1.000   NA
 7080260 7080261 Smal_1478 Smal_1479 alaS   FALSE 0.074 148.000 0.020 1.000 N NA
 7080261 7080262 Smal_1479 Smal_R0047     FALSE 0.160 79.000 0.000 NA   NA
 7080264 7080265 Smal_1481 Smal_1482     FALSE 0.389 112.000 0.182 1.000 N NA
 7080266 7080267 Smal_1483 Smal_1484     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080267 7080268 Smal_1484 Smal_1485     FALSE 0.011 87.000 0.000 NA N NA
 7080268 7080269 Smal_1485 Smal_1486     TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 7080271 7080272 Smal_1488 Smal_1489     FALSE 0.016 245.000 0.000 NA   NA
 7080273 7080274 Smal_1490 Smal_1491     TRUE 0.983 -3.000 0.333 NA N NA
 7080274 7080275 Smal_1491 Smal_1492     FALSE 0.314 142.000 0.000 NA Y NA
 7080275 7080276 Smal_1492 Smal_1493     TRUE 0.941 11.000 0.000 1.000 Y NA
 7080277 7080278 Smal_1494 Smal_1495     TRUE 0.947 9.000 0.300 1.000 N NA
 7080278 7080279 Smal_1495 Smal_1496     FALSE 0.005 119.000 0.000 1.000 N NA
 7080279 7080280 Smal_1496 Smal_1497     TRUE 0.988 -3.000 0.139 0.007   NA
 7080283 7080284 Smal_1500 Smal_1501     FALSE 0.040 148.000 0.000 NA   NA
 7080287 7080288 Smal_R0048 Smal_R0049     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7080288 7080289 Smal_R0049 Smal_R0050     FALSE 0.170 70.000 0.000 NA   NA
 7080289 7080290 Smal_R0050 Smal_1504     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 7080290 7080291 Smal_1504 Smal_1505     TRUE 0.978 -3.000 0.148 NA   NA
 7080291 7080292 Smal_1505 Smal_1506     FALSE 0.387 107.000 0.065 NA   NA
 7080292 7080293 Smal_1506 Smal_1507     TRUE 0.872 13.000 0.065 NA   NA
 7080293 7080294 Smal_1507 Smal_1508     TRUE 0.955 -3.000 0.027 NA   NA
 7080294 7080295 Smal_1508 Smal_1509     FALSE 0.345 85.000 0.050 1.000 N NA
 7080295 7080296 Smal_1509 Smal_1510     FALSE 0.448 79.000 0.102 1.000 N NA
 7080297 7080298 Smal_1511 Smal_1512     TRUE 0.668 33.000 0.028 NA   NA
 7080302 7080303 Smal_1515 Smal_1516     TRUE 0.950 4.000 0.234 1.000 N NA
 7080303 7080304 Smal_1516 Smal_1517   panB TRUE 0.934 35.000 0.117 1.000 Y NA
 7080304 7080305 Smal_1517 Smal_1518 panB panC TRUE 0.998 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 7080305 7080306 Smal_1518 Smal_1519 panC   FALSE 0.167 72.000 0.000 NA   NA
 7080306 7080307 Smal_1519 Smal_1520     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7080307 7080308 Smal_1520 Smal_1521   pgi TRUE 0.880 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7080309 7080310 Smal_1522 Smal_1523     TRUE 0.995 -3.000 0.197 1.000 Y NA
 7080311 7080312 Smal_1524 Smal_1525 ispG   TRUE 0.990 -19.000 0.006 1.000 Y NA
 7080312 7080313 Smal_1525 Smal_1526     FALSE 0.001 201.000 0.000 1.000 N NA
 7080314 7080315 Smal_1527 Smal_1528     FALSE 0.206 237.000 0.008 1.000 Y NA
 7080315 7080316 Smal_1528 Smal_1529     TRUE 0.910 59.000 0.202 1.000 Y NA
 7080316 7080317 Smal_1529 Smal_1530   glk TRUE 0.990 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 7080317 7080318 Smal_1530 Smal_1531 glk   TRUE 0.992 -3.000 0.055 1.000 Y NA
 7080321 7080322 Smal_1534 Smal_1535     FALSE 0.551 57.000 0.047 NA   NA
 7080322 7080323 Smal_1535 Smal_1536     TRUE 0.998 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 7080323 7080324 Smal_1536 Smal_1537   sdhA TRUE 0.991 32.000 0.705 0.001 Y NA
 7080324 7080325 Smal_1537 Smal_1538 sdhA sdhB TRUE 0.975 67.000 0.604 0.001 Y NA
 7080325 7080326 Smal_1538 Smal_1539 sdhB   FALSE 0.538 99.000 0.151 NA   NA
 7080326 7080327 Smal_1539 Smal_1540     TRUE 0.958 -49.000 0.016 NA   NA
 7080327 7080328 Smal_1540 Smal_1541     TRUE 0.719 24.000 0.020 NA   NA
 7080328 7080329 Smal_1541 Smal_1542     TRUE 0.995 -7.000 0.620 0.054 N NA
 7080329 7080330 Smal_1542 Smal_1543     FALSE 0.024 189.000 0.000 NA   NA
 7080331 7080332 Smal_1544 Smal_1545     TRUE 0.914 6.000 0.150 NA N NA
 7080332 7080333 Smal_1545 Smal_1546     FALSE 0.135 84.000 0.004 1.000 N NA
 7080336 7080337 Smal_1549 Smal_1550   coaD TRUE 0.890 27.000 0.367 1.000 N NA
 7080337 7080338 Smal_1550 Smal_1551 coaD   FALSE 0.362 62.000 0.007 NA   NA
 7080338 7080339 Smal_1551 Smal_1552     FALSE 0.172 133.000 0.020 NA   NA
 7080339 7080340 Smal_1552 Smal_1553     TRUE 0.968 -3.000 0.076 NA   NA
 7080340 7080341 Smal_1553 Smal_1554     FALSE 0.204 122.000 0.015 1.000   NA
 7080342 7080343 Smal_1555 Smal_1556   upp FALSE 0.044 144.000 0.000 NA   NA
 7080344 7080345 Smal_1557 Smal_1558     TRUE 0.972 0.000 0.220 NA   NA
 7080345 7080346 Smal_1558 Smal_1559     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080346 7080347 Smal_1559 Smal_1560     TRUE 0.621 12.000 0.000 1.000   NA
 7080349 7080350 Smal_1562 Smal_1563     FALSE 0.042 140.000 0.004 1.000 N NA
 7080352 7080353 Smal_1565 Smal_1566     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080353 7080354 Smal_1566 Smal_1567     TRUE 0.715 92.000 0.009 1.000 Y NA
 7080354 7080355 Smal_1567 Smal_1568     TRUE 0.714 113.000 0.750 1.000 N NA
 7080355 7080356 Smal_1568 Smal_1569     TRUE 0.564 65.000 0.160 1.000 N NA
 7080356 7080357 Smal_1569 Smal_1570     TRUE 0.975 -6.000 0.160 1.000 N NA
 7080357 7080358 Smal_1570 Smal_1571     FALSE 0.031 166.000 0.000 NA   NA
 7080361 7080362 Smal_1574 Smal_1575     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7080362 7080363 Smal_1575 Smal_1576     TRUE 0.956 6.000 0.208 NA   NA
 7080363 7080364 Smal_1576 Smal_1577     FALSE 0.110 106.000 0.000 NA   NA
 7080364 7080365 Smal_1577 Smal_1578     FALSE 0.188 63.000 0.000 NA   NA
 7080367 7080368 Smal_1580 Smal_1581     FALSE 0.386 28.000 0.000 NA   NA
 7080368 7080369 Smal_1581 Smal_1582     FALSE 0.025 187.000 0.000 NA   NA
 7080369 7080370 Smal_1582 Smal_1583     FALSE 0.001 372.000 0.000 1.000 N NA
 7080370 7080371 Smal_1583 Smal_1584     TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7080371 7080372 Smal_1584 Smal_1585     FALSE 0.019 215.000 0.000 NA   NA
 7080372 7080373 Smal_1585 Smal_1586     FALSE 0.185 64.000 0.000 NA   NA
 7080373 7080374 Smal_1586 Smal_R0052     FALSE 0.012 517.000 0.000 NA   NA
 7080375 7080376 Smal_1587 Smal_1588     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7080376 7080377 Smal_1588 Smal_1589     FALSE 0.046 141.000 0.000 NA   NA
 7080379 7080380 Smal_1591 Smal_1592     TRUE 0.926 4.000 0.063 NA   NA
 7080386 7080387 Smal_1598 Smal_1599 hrcA   FALSE 0.333 64.000 0.025 1.000 N NA
 7080387 7080388 Smal_1599 Smal_1600   dnaK FALSE 0.509 181.000 0.049 0.006 Y NA
 7080388 7080389 Smal_1600 Smal_1601 dnaK   TRUE 0.744 155.000 0.236 0.003 Y NA
 7080391 7080392 Smal_1603 Smal_1604     FALSE 0.001 645.000 0.000 NA N NA
 7080392 7080393 Smal_1604 Smal_1605     TRUE 0.854 -3.000 0.007 1.000 N NA
 7080394 7080395 Smal_1606 Smal_1607     FALSE 0.167 72.000 0.000 NA   NA
 7080395 7080396 Smal_1607 Smal_1608     TRUE 0.955 -7.000 0.012 1.000   NA
 7080396 7080397 Smal_1608 Smal_1609     FALSE 0.540 32.000 0.005 NA   NA
 7080397 7080398 Smal_1609 Smal_1610     TRUE 0.946 -3.000 0.017 NA   NA
 7080400 7080401 Smal_1612 Smal_1613     FALSE 0.024 191.000 0.000 NA   NA
 7080402 7080403 Smal_1614 Smal_1615 queA tgt TRUE 0.885 127.000 0.360 0.001 Y NA
 7080403 7080404 Smal_1615 Smal_1616 tgt yajC FALSE 0.364 135.000 0.325 NA N NA
 7080404 7080405 Smal_1616 Smal_1617 yajC secD TRUE 0.855 62.000 0.083 NA Y NA
 7080405 7080406 Smal_1617 Smal_1618 secD secF TRUE 0.982 16.000 0.084 0.001 Y NA
 7080406 7080407 Smal_1618 Smal_1619 secF   FALSE 0.014 717.000 0.000 1.000   NA
 7080408 7080409 Smal_1620 Smal_1621     FALSE 0.274 92.000 0.007 NA   NA
 7080409 7080410 Smal_1621 Smal_1622     TRUE 0.937 -3.000 0.011 NA   NA
 7080413 7080414 Smal_1625 Smal_1626     FALSE 0.090 155.000 0.046 NA N NA
 7080414 7080415 Smal_1626 Smal_1627     TRUE 0.654 33.000 0.023 NA   NA
 7080415 7080416 Smal_1627 Smal_1628     FALSE 0.024 562.000 0.004 NA   NA
 7080417 7080418 Smal_1629 Smal_1630     FALSE 0.036 155.000 0.000 NA   NA
 7080419 7080420 Smal_1631 Smal_1632     FALSE 0.016 329.000 0.000 1.000   NA
 7080420 7080421 Smal_1632 Smal_1633     FALSE 0.015 431.000 0.000 1.000   NA
 7080422 7080423 Smal_1634 Smal_1635     TRUE 0.969 10.000 0.000 0.006 Y NA
 7080424 7080425 Smal_1636 Smal_1637     TRUE 0.993 -3.000 0.778 NA N NA
 7080425 7080426 Smal_1637 Smal_1638     TRUE 0.997 -3.000 0.481 NA Y NA
 7080427 7080428 Smal_1639 Smal_1640     TRUE 0.963 -7.000 0.024 NA   NA
 7080428 7080429 Smal_1640 Smal_1641     TRUE 0.796 15.000 0.016 1.000   NA
 7080429 7080430 Smal_1641 Smal_1642     FALSE 0.371 165.000 0.364 1.000   NA
 7080430 7080431 Smal_1642 Smal_1643     TRUE 0.742 40.000 0.123 NA   NA
 7080431 7080432 Smal_1643 Smal_1644   rpmJ FALSE 0.114 147.000 0.014 NA   NA
 7080433 7080434 Smal_1645 Smal_1646 cmk rpsA FALSE 0.169 199.000 0.281 1.000 N NA
 7080434 7080435 Smal_1646 Smal_1647 rpsA ihfB TRUE 0.612 88.000 0.292 1.000 N NA
 7080435 7080436 Smal_1647 Smal_1648 ihfB   TRUE 0.666 78.000 0.208 NA   NA
 7080436 7080437 Smal_1648 Smal_1649     TRUE 0.981 7.000 0.576 NA   NA
 7080437 7080438 Smal_1649 Smal_1650     TRUE 0.864 4.000 0.038 1.000 N NA
 7080438 7080439 Smal_1650 Smal_1651     TRUE 0.982 4.000 0.048 1.000 Y NA
 7080439 7080440 Smal_1651 Smal_1652     TRUE 0.998 -3.000 0.350 0.012 Y NA
 7080441 7080442 Smal_1653 Smal_1654     TRUE 0.833 137.000 0.588 1.000 Y NA
 7080442 7080443 Smal_1654 Smal_1655     TRUE 0.709 27.000 0.019 1.000   NA
 7080444 7080445 Smal_1656 Smal_1657 ndk   TRUE 0.932 11.000 0.156 1.000   NA
 7080445 7080446 Smal_1657 Smal_1658     TRUE 0.978 -13.000 0.086 1.000   NA
 7080446 7080447 Smal_1658 Smal_1659     TRUE 0.910 19.000 0.204 1.000   NA
 7080447 7080448 Smal_1659 Smal_1660     FALSE 0.427 66.000 0.015 1.000   NA
 7080448 7080449 Smal_1660 Smal_1661     TRUE 0.986 0.000 0.492 1.000   NA
 7080449 7080450 Smal_1661 Smal_1662   engA TRUE 0.918 17.000 0.203 1.000   NA
 7080451 7080452 Smal_1663 Smal_1664     FALSE 0.134 95.000 0.000 NA   NA
 7080452 7080453 Smal_1664 Smal_1665     FALSE 0.510 75.000 0.143 1.000 N NA
 7080454 7080455 Smal_1666 Smal_1667     FALSE 0.058 131.000 0.000 NA   NA
 7080455 7080456 Smal_1667 Smal_1668     FALSE 0.018 221.000 0.000 NA   NA
 7080456 7080457 Smal_1668 Smal_1669     FALSE 0.001 227.000 0.000 1.000 N NA
 7080457 7080458 Smal_1669 Smal_1670     FALSE 0.028 484.000 0.004 1.000   NA
 7080458 7080459 Smal_1670 Smal_1671     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080459 7080460 Smal_1671 Smal_1672   guaA TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080461 7080462 Smal_1673 Smal_1674     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7080462 7080463 Smal_1674 Smal_1675     TRUE 0.977 0.000 0.293 NA   NA
 7080463 7080464 Smal_1675 Smal_1676     TRUE 0.611 42.000 0.033 NA   NA
 7080464 7080465 Smal_1676 Smal_1677     FALSE 0.011 769.000 0.000 NA   NA
 7080465 7080466 Smal_1677 Smal_1678     FALSE 0.012 553.000 0.000 NA   NA
 7080467 7080468 Smal_1679 Smal_1680     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7080471 7080472 Smal_1683 Smal_1684     TRUE 0.977 3.000 0.355 NA   NA
 7080472 7080473 Smal_1684 Smal_1685     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7080476 7080477 Smal_1688 Smal_1689     TRUE 0.667 135.000 0.059 0.065 Y NA
 7080477 7080478 Smal_1689 Smal_1690     TRUE 0.597 90.000 0.176 NA   NA
 7080479 7080480 Smal_1691 Smal_1692     FALSE 0.068 124.000 0.000 NA   NA
 7080481 7080482 Smal_1693 Smal_1694     FALSE 0.180 82.000 0.000 1.000   NA
 7080482 7080483 Smal_1694 Smal_1695     FALSE 0.035 158.000 0.000 NA   NA
 7080483 7080484 Smal_1695 Smal_1696     FALSE 0.530 15.000 0.000 NA   NA
 7080484 7080485 Smal_1696 Smal_1697     TRUE 0.900 19.000 0.000 NA Y NA
 7080485 7080486 Smal_1697 Smal_1698     TRUE 0.687 5.000 0.000 NA   NA
 7080486 7080487 Smal_1698 Smal_1699     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080487 7080488 Smal_1699 Smal_1700     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080488 7080489 Smal_1700 Smal_1701     TRUE 0.607 17.000 0.000 0.042 N NA
 7080491 7080492 Smal_1703 Smal_1704     TRUE 0.948 31.000 0.706 NA   NA
 7080493 7080494 Smal_1705 Smal_1706     FALSE 0.425 24.000 0.000 NA   NA
 7080494 7080495 Smal_1706 Smal_1707     TRUE 0.859 17.000 0.083 NA   NA
 7080495 7080496 Smal_1707 Smal_1708     FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 7080498 7080499 Smal_1710 Smal_1711     FALSE 0.014 64.000 0.000 NA N NA
 7080501 7080502 Smal_1713 Smal_1714     TRUE 0.644 29.000 0.000 0.059   NA
 7080502 7080503 Smal_1714 Smal_1715     TRUE 0.571 15.000 0.000 1.000   NA
 7080504 7080505 Smal_1716 Smal_1717     FALSE 0.270 42.000 0.000 NA   NA
 7080507 7080508 Smal_1719 Smal_1720     TRUE 0.994 -3.000 0.714 NA   NA
 7080508 7080509 Smal_1720 Smal_1721     FALSE 0.125 99.000 0.000 NA   NA
 7080510 7080511 Smal_1722 Smal_1723   murB TRUE 0.932 -3.000 0.008 NA   NA
 7080511 7080512 Smal_1723 Smal_1724 murB   TRUE 0.702 9.000 0.009 1.000 N NA
 7080512 7080513 Smal_1724 Smal_1725     TRUE 0.824 9.000 0.006 1.000   NA
 7080513 7080514 Smal_1725 Smal_1726     TRUE 0.941 6.000 0.138 NA   NA
 7080514 7080515 Smal_1726 Smal_1727     FALSE 0.048 139.000 0.000 NA   NA
 7080515 7080516 Smal_1727 Smal_1728     TRUE 0.816 0.000 0.000 0.059 N NA
 7080524 7080525 Smal_1735 Smal_1736     TRUE 0.998 -10.000 0.200 0.032 Y NA
 7080526 7080527 Smal_1737 Smal_1738     TRUE 0.995 -3.000 0.156 1.000 Y NA
 7080527 7080528 Smal_1738 Smal_1739     TRUE 0.985 0.000 0.416 1.000   NA
 7080528 7080529 Smal_1739 Smal_1740     TRUE 0.968 -3.000 0.059 1.000   NA
 7080529 7080530 Smal_1740 Smal_1741     FALSE 0.174 84.000 0.000 1.000   NA
 7080532 7080533 Smal_1743 Smal_1744     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080533 7080534 Smal_1744 Smal_1745     FALSE 0.176 68.000 0.000 NA   NA
 7080536 7080537 Smal_1747 Smal_1748     FALSE 0.031 166.000 0.000 NA   NA
 7080537 7080538 Smal_1748 Smal_1749   thrA FALSE 0.013 358.000 0.000 NA   NA
 7080538 7080539 Smal_1749 Smal_1750 thrA   TRUE 0.988 -3.000 0.009 1.000 Y NA
 7080539 7080540 Smal_1750 Smal_1751     TRUE 0.963 30.000 0.233 1.000 Y NA
 7080542 7080543 Smal_1753 Smal_1754 hisS   TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080543 7080544 Smal_1754 Smal_1755     FALSE 0.015 274.000 0.000 NA   NA
 7080544 7080545 Smal_1755 Smal_1756   hisG TRUE 0.604 35.000 0.013 1.000   NA
 7080545 7080546 Smal_1756 Smal_1757 hisG hisD TRUE 0.997 -3.000 0.171 0.003 Y NA
 7080546 7080547 Smal_1757 Smal_1758 hisD   TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.003 Y NA
 7080547 7080548 Smal_1758 Smal_1759     TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 7080548 7080549 Smal_1759 Smal_1760   hisH TRUE 0.997 -3.000 0.128 0.003 Y NA
 7080549 7080550 Smal_1760 Smal_1761 hisH   TRUE 0.997 -3.000 0.210 0.003 Y NA
 7080550 7080551 Smal_1761 Smal_1762     TRUE 0.999 -6.000 0.433 0.003 Y NA
 7080551 7080552 Smal_1762 Smal_1763     TRUE 0.999 -10.000 0.430 0.003 Y NA
 7080552 7080553 Smal_1763 Smal_1764     FALSE 0.077 157.000 0.003 1.000   NA
 7080553 7080554 Smal_1764 Smal_1765     FALSE 0.306 37.000 0.000 NA   NA
 7080554 7080555 Smal_1765 Smal_1766     FALSE 0.150 85.000 0.000 NA   NA
 7080555 7080556 Smal_1766 Smal_1767     FALSE 0.017 52.000 0.000 1.000 N NA
 7080556 7080557 Smal_1767 Smal_1768     TRUE 0.935 -3.000 0.038 1.000 N NA
 7080557 7080558 Smal_1768 Smal_1769     FALSE 0.115 402.000 0.000 1.000 Y NA
 7080558 7080559 Smal_1769 Smal_1770     FALSE 0.194 194.000 0.000 1.000 Y NA
 7080559 7080560 Smal_1770 Smal_1771     TRUE 0.963 12.000 0.304 0.003 N NA
 7080561 7080562 Smal_1772 Smal_1773     FALSE 0.025 202.000 0.000 1.000   NA
 7080563 7080564 Smal_1774 Smal_1775     FALSE 0.009 97.000 0.000 1.000 N NA
 7080564 7080565 Smal_1775 Smal_1776     FALSE 0.521 61.000 0.115 1.000 N NA
 7080565 7080566 Smal_1776 Smal_1777     TRUE 0.991 8.000 0.308 1.000 Y NA
 7080566 7080567 Smal_1777 Smal_1778     TRUE 0.992 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 7080567 7080568 Smal_1778 Smal_1779     FALSE 0.257 163.000 0.000 1.000 Y NA
 7080569 7080570 Smal_1780 Smal_1781     TRUE 0.966 4.000 0.231 1.000   NA
 7080570 7080571 Smal_1781 Smal_1782     TRUE 0.590 88.000 0.148 1.000   NA
 7080573 7080574 Smal_1784 Smal_1785     TRUE 0.977 83.000 0.833 0.002 Y NA
 7080577 7080578 Smal_1788 Smal_1789     TRUE 0.612 63.000 0.111 NA   NA
 7080578 7080579 Smal_1789 Smal_1790     TRUE 0.839 41.000 0.294 NA   NA
 7080580 7080581 Smal_1791 Smal_1792     TRUE 0.970 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7080582 7080583 Smal_1793 Smal_1794     FALSE 0.027 37.000 0.000 1.000 N NA
 7080583 7080584 Smal_1794 Smal_1795     TRUE 0.876 -19.000 0.000 NA   NA
 7080584 7080585 Smal_1795 Smal_1796     FALSE 0.152 84.000 0.000 NA   NA
 7080586 7080587 Smal_1797 Smal_1798     TRUE 0.972 -10.000 0.051 NA   NA
 7080587 7080588 Smal_1798 Smal_1799     FALSE 0.525 51.000 0.085 1.000 N NA
 7080588 7080589 Smal_1799 Smal_1800     FALSE 0.537 100.000 0.125 0.058 N NA
 7080589 7080590 Smal_1800 Smal_1801     TRUE 0.961 -3.000 0.042 NA   NA
 7080590 7080591 Smal_1801 Smal_1802     TRUE 0.909 3.000 0.027 NA   NA
 7080592 7080593 Smal_1803 Smal_1804     TRUE 0.995 -3.000 0.178 1.000 Y NA
 7080593 7080594 Smal_1804 Smal_1805     TRUE 0.916 0.000 0.019 NA   NA
 7080595 7080596 Smal_1806 Smal_1807     FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 7080596 7080597 Smal_1807 Smal_1808     FALSE 0.236 56.000 0.000 1.000   NA
 7080597 7080598 Smal_1808 Smal_1809   fabG FALSE 0.121 5.000 0.000 1.000 N NA
 7080599 7080600 Smal_1810 Smal_1811     FALSE 0.228 302.000 0.034 1.000 Y NA
 7080600 7080601 Smal_1811 Smal_1812   carB TRUE 0.818 150.000 0.345 0.001 Y NA
 7080601 7080602 Smal_1812 Smal_1813 carB greA TRUE 0.978 -3.000 0.241 1.000 N NA
 7080602 7080603 Smal_1813 Smal_1814 greA   TRUE 0.856 5.000 0.011 NA   NA
 7080604 7080605 Smal_1815 Smal_1816     TRUE 0.948 1.000 0.100 NA   NA
 7080608 7080609 Smal_1819 Smal_1820     FALSE 0.016 343.000 0.000 1.000   NA
 7080611 7080612 Smal_1822 Smal_1823     FALSE 0.169 71.000 0.000 NA   NA
 7080612 7080613 Smal_1823 Smal_1824     FALSE 0.265 49.000 0.000 1.000   NA
 7080613 7080614 Smal_1824 Smal_1825     FALSE 0.013 802.000 0.000 1.000   NA
 7080614 7080615 Smal_1825 Smal_1826     FALSE 0.014 64.000 0.000 1.000 N NA
 7080615 7080616 Smal_1826 Smal_1827   lysS FALSE 0.001 274.000 0.000 1.000 N NA
 7080616 7080617 Smal_1827 Smal_1828 lysS   FALSE 0.020 206.000 0.005 1.000 N NA
 7080617 7080618 Smal_1828 Smal_1829     TRUE 0.997 2.000 0.450 0.027 Y NA
 7080619 7080620 Smal_1830 Smal_1831     FALSE 0.481 202.000 0.108 0.058 Y NA
 7080620 7080621 Smal_1831 Smal_1832     FALSE 0.001 223.000 0.000 1.000 N NA
 7080621 7080622 Smal_1832 Smal_1833     TRUE 0.737 103.000 0.634 1.000 N NA
 7080622 7080623 Smal_1833 Smal_1834     TRUE 0.861 39.000 0.459 1.000 N NA
 7080626 7080627 Smal_1837 Smal_1838     TRUE 0.948 7.000 0.177 NA   NA
 7080627 7080628 Smal_1838 Smal_1839     TRUE 0.596 40.000 0.023 NA   NA
 7080628 7080629 Smal_1839 Smal_1840     FALSE 0.095 116.000 0.000 1.000   NA
 7080629 7080630 Smal_1840 Smal_1841     TRUE 0.925 0.000 0.000 0.005   NA
 7080631 7080632 Smal_1842 Smal_1843     FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 7080632 7080633 Smal_1843 Smal_1844     TRUE 0.996 -3.000 0.267 1.000 Y NA
 7080633 7080634 Smal_1844 Smal_1845     TRUE 0.992 -3.000 0.056 1.000 Y NA
 7080634 7080635 Smal_1845 Smal_1846     TRUE 0.813 38.000 0.000 1.000 Y NA
 7080635 7080636 Smal_1846 Smal_1847     FALSE 0.175 731.000 0.000 0.009 Y NA
 7080636 7080637 Smal_1847 Smal_1848     TRUE 0.600 102.000 0.222 NA   NA
 7080637 7080638 Smal_1848 Smal_1849     FALSE 0.451 137.000 0.333 NA   NA
 7080638 7080639 Smal_1849 Smal_1850     FALSE 0.126 205.000 0.200 1.000 N NA
 7080639 7080640 Smal_1850 Smal_1851     FALSE 0.002 153.000 0.000 1.000 N NA
 7080640 7080641 Smal_1851 Smal_1852     FALSE 0.190 393.000 0.000 0.009 Y NA
 7080641 7080642 Smal_1852 Smal_1853     TRUE 0.913 46.000 0.135 1.000 Y NA
 7080642 7080643 Smal_1853 Smal_1854     TRUE 0.992 -3.000 0.514 NA   NA
 7080643 7080644 Smal_1854 Smal_1855     FALSE 0.014 286.000 0.000 NA   NA
 7080644 7080645 Smal_1855 Smal_1856     FALSE 0.253 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7080645 7080646 Smal_1856 Smal_1857     TRUE 0.937 5.000 0.199 1.000 N NA
 7080646 7080647 Smal_1857 Smal_1858   motC TRUE 0.992 2.000 0.248 1.000 Y NA
 7080647 7080648 Smal_1858 Smal_1859 motC   FALSE 0.397 148.000 0.009 1.000 Y NA
 7080648 7080649 Smal_1859 Smal_1860     TRUE 0.994 3.000 0.341 1.000 Y NA
 7080649 7080650 Smal_1860 Smal_1861     TRUE 0.996 0.000 0.516 1.000 Y NA
 7080650 7080651 Smal_1861 Smal_1862     TRUE 0.744 70.000 0.283 0.095 N NA
 7080651 7080652 Smal_1862 Smal_1863     TRUE 0.988 -3.000 0.482 1.000 N NA
 7080652 7080653 Smal_1863 Smal_1864     TRUE 0.989 -13.000 0.241 0.087 N NA
 7080653 7080654 Smal_1864 Smal_1865   flhA FALSE 0.395 146.000 0.008 1.000 Y NA
 7080654 7080655 Smal_1865 Smal_1866 flhA flhB TRUE 0.995 -3.000 0.029 0.012 Y NA
 7080655 7080656 Smal_1866 Smal_1867 flhB   FALSE 0.107 119.000 0.012 1.000 N NA
 7080656 7080657 Smal_1867 Smal_1868     FALSE 0.002 165.000 0.000 1.000 N NA
 7080657 7080658 Smal_1868 Smal_1869     TRUE 0.981 14.000 0.215 1.000 Y NA
 7080658 7080659 Smal_1869 Smal_1870   fliP TRUE 0.917 83.000 0.177 0.012 Y NA
 7080659 7080660 Smal_1870 Smal_1871 fliP   TRUE 0.982 2.000 0.029 1.000 Y NA
 7080660 7080661 Smal_1871 Smal_1872     TRUE 0.997 -3.000 0.443 1.000 Y NA
 7080661 7080662 Smal_1872 Smal_1873   fliM TRUE 0.999 -3.000 0.741 0.001 Y NA
 7080662 7080663 Smal_1873 Smal_1874 fliM   TRUE 0.984 11.000 0.029 0.001 Y NA
 7080663 7080664 Smal_1874 Smal_1875     FALSE 0.361 173.000 0.025 1.000 Y NA
 7080664 7080665 Smal_1875 Smal_1876     TRUE 0.989 0.000 0.317 0.005   NA
 7080665 7080666 Smal_1876 Smal_1877     TRUE 0.922 4.000 0.044 1.000   NA
 7080666 7080667 Smal_1877 Smal_1878     TRUE 0.993 -3.000 0.085 NA Y NA
 7080667 7080668 Smal_1878 Smal_1879     TRUE 0.997 -3.000 0.320 NA Y NA
 7080668 7080669 Smal_1879 Smal_1880   fliF TRUE 0.998 -7.000 0.189 0.005 Y NA
 7080669 7080670 Smal_1880 Smal_1881 fliF   TRUE 0.997 13.000 0.910 0.005 Y NA
 7080670 7080671 Smal_1881 Smal_1882     FALSE 0.012 439.000 0.000 NA   NA
 7080671 7080672 Smal_1882 Smal_1883     FALSE 0.022 198.000 0.000 NA   NA
 7080672 7080673 Smal_1883 Smal_1884     TRUE 0.995 -3.000 0.050 0.095 Y NA
 7080673 7080674 Smal_1884 Smal_1885     TRUE 0.859 15.000 0.050 0.095 N NA
 7080675 7080676 Smal_1886 Smal_1887     TRUE 0.770 85.000 0.000 0.004 Y NA
 7080677 7080678 Smal_1888 Smal_1889     TRUE 0.665 86.000 0.238 NA   NA
 7080678 7080679 Smal_1889 Smal_1890     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080679 7080680 Smal_1890 Smal_1891     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080680 7080681 Smal_1891 Smal_1892     TRUE 0.898 131.000 0.500 0.002 Y NA
 7080681 7080682 Smal_1892 Smal_1893     FALSE 0.113 442.000 0.000 1.000 Y NA
 7080682 7080683 Smal_1893 Smal_1894     TRUE 0.778 87.000 0.000 0.001 Y NA
 7080683 7080684 Smal_1894 Smal_1895     TRUE 0.804 73.000 0.000 0.001 Y NA
 7080684 7080685 Smal_1895 Smal_1896   flgL FALSE 0.206 418.000 0.000 0.001 Y NA
 7080685 7080686 Smal_1896 Smal_1897 flgL flgK TRUE 0.997 -3.000 0.108 0.001 Y NA
 7080686 7080687 Smal_1897 Smal_1898 flgK flgJ TRUE 0.997 9.000 0.705 0.002 Y NA
 7080687 7080688 Smal_1898 Smal_1899 flgJ flgI TRUE 0.997 2.000 0.405 0.006 Y NA
 7080688 7080689 Smal_1899 Smal_1900 flgI flgH TRUE 0.989 9.000 0.106 0.006 Y NA
 7080689 7080690 Smal_1900 Smal_1901 flgH flgG TRUE 0.976 23.000 0.120 0.005 Y NA
 7080690 7080691 Smal_1901 Smal_1902 flgG flgF TRUE 0.900 103.000 0.174 0.001 Y NA
 7080691 7080692 Smal_1902 Smal_1903 flgF flgE TRUE 0.988 33.000 0.594 0.004 Y NA
 7080692 7080693 Smal_1903 Smal_1904 flgE flgD TRUE 0.986 33.000 0.875 NA Y NA
 7080693 7080694 Smal_1904 Smal_1905 flgD flgC TRUE 0.963 24.000 0.174 NA Y NA
 7080694 7080695 Smal_1905 Smal_1906 flgC flgB TRUE 0.997 4.000 0.611 0.003 Y NA
 7080695 7080696 Smal_1906 Smal_1907 flgB   TRUE 0.661 150.000 0.267 1.000 Y NA
 7080697 7080698 Smal_1908 Smal_1909 flgA   TRUE 0.769 76.000 0.371 NA   NA
 7080698 7080699 Smal_1909 Smal_1910     TRUE 0.984 -3.000 0.052 0.002   NA
 7080699 7080700 Smal_1910 Smal_1911     TRUE 0.741 92.000 0.364 1.000   NA
 7080701 7080702 Smal_1912 Smal_1913     TRUE 0.974 5.000 0.200 0.032   NA
 7080704 7080705 Smal_1915 Smal_1916     FALSE 0.176 68.000 0.000 NA   NA
 7080705 7080706 Smal_1916 Smal_1917     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7080706 7080707 Smal_1917 Smal_1918     FALSE 0.124 166.000 0.036 NA   NA
 7080707 7080708 Smal_1918 Smal_1919   mnmA TRUE 0.980 -3.000 0.180 NA   NA
 7080708 7080709 Smal_1919 Smal_1920 mnmA   TRUE 0.969 -3.000 0.158 1.000 N NA
 7080709 7080710 Smal_1920 Smal_1921     TRUE 0.879 2.000 0.010 NA   NA
 7080714 7080715 Smal_1925 Smal_1926     FALSE 0.061 129.000 0.000 NA   NA
 7080715 7080716 Smal_1926 Smal_1927   infA FALSE 0.028 172.000 0.000 NA   NA
 7080716 7080717 Smal_1927 Smal_1928 infA aat FALSE 0.248 87.000 0.020 1.000 N NA
 7080722 7080723 Smal_1933 Smal_1934     TRUE 0.630 40.000 0.033 NA   NA
 7080723 7080724 Smal_1934 Smal_1935   lolA FALSE 0.105 112.000 0.011 NA N NA
 7080724 7080725 Smal_1935 Smal_1936 lolA   FALSE 0.092 235.000 0.167 1.000 N NA
 7080725 7080726 Smal_1936 Smal_1937     FALSE 0.025 199.000 0.000 1.000   NA
 7080728 7080729 Smal_1939 Smal_1940     FALSE 0.282 123.000 0.065 NA   NA
 7080729 7080730 Smal_1940 Smal_1941     FALSE 0.220 52.000 0.000 NA   NA
 7080730 7080731 Smal_1941 Smal_1942     TRUE 0.999 -3.000 0.852 1.000 Y NA
 7080731 7080732 Smal_1942 Smal_1943     TRUE 0.996 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 7080732 7080733 Smal_1943 Smal_1944     FALSE 0.183 65.000 0.000 NA   NA
 7080733 7080734 Smal_1944 Smal_1945     FALSE 0.012 441.000 0.000 NA   NA
 7080734 7080735 Smal_1945 Smal_1946     FALSE 0.017 232.000 0.000 NA   NA
 7080735 7080736 Smal_1946 Smal_1947     FALSE 0.094 111.000 0.000 NA   NA
 7080737 7080738 Smal_1948 Smal_1949     FALSE 0.454 141.000 0.000 0.026 Y NA
 7080738 7080739 Smal_1949 Smal_1950     FALSE 0.002 170.000 0.000 1.000 N NA
 7080739 7080740 Smal_1950 Smal_1951     TRUE 0.949 9.000 0.000 1.000 Y NA
 7080740 7080741 Smal_1951 Smal_1952     TRUE 0.988 -3.000 0.324 1.000   NA
 7080741 7080742 Smal_1952 Smal_1953     TRUE 0.974 -3.000 0.113 NA   NA
 7080742 7080743 Smal_1953 Smal_1954     TRUE 0.977 -10.000 0.087 NA   NA
 7080743 7080744 Smal_1954 Smal_1955     TRUE 0.965 -3.000 0.053 NA   NA
 7080744 7080745 Smal_1955 Smal_1956     TRUE 0.995 -3.000 0.722 NA   NA
 7080745 7080746 Smal_1956 Smal_1957     TRUE 0.933 2.000 0.047 1.000   NA
 7080746 7080747 Smal_1957 Smal_1958     FALSE 0.157 82.000 0.000 NA   NA
 7080748 7080749 Smal_1959 Smal_1960     TRUE 0.939 33.000 0.898 NA N NA
 7080749 7080750 Smal_1960 Smal_1961     FALSE 0.048 22.000 0.000 NA N NA
 7080751 7080752 Smal_1962 Smal_1963     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 7080755 7080756 Smal_1966 Smal_1967     FALSE 0.141 90.000 0.000 NA   NA
 7080756 7080757 Smal_1967 Smal_1968     FALSE 0.161 167.000 0.086 NA   NA
 7080761 7080762 Smal_1972 Smal_1973     FALSE 0.114 149.000 0.000 0.049   NA
 7080762 7080763 Smal_1973 Smal_1974     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080764 7080765 Smal_1975 Smal_1976     FALSE 0.012 536.000 0.000 NA   NA
 7080765 7080766 Smal_1976 Smal_1977     TRUE 0.733 55.000 0.000 1.000 Y NA
 7080766 7080767 Smal_1977 Smal_1978     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080768 7080769 Smal_1979 Smal_1980     FALSE 0.042 25.000 0.000 NA N NA
 7080769 7080770 Smal_1980 Smal_1981     FALSE 0.050 21.000 0.000 NA N NA
 7080770 7080771 Smal_1981 Smal_1982     FALSE 0.129 4.000 0.000 1.000 N NA
 7080771 7080772 Smal_1982 Smal_1983     TRUE 0.939 25.000 0.003 0.038 Y NA
 7080773 7080774 Smal_1984 Smal_1985     FALSE 0.012 431.000 0.000 NA   NA
 7080775 7080776 Smal_1986 Smal_1987     FALSE 0.012 457.000 0.000 NA   NA
 7080776 7080777 Smal_1987 Smal_1988     FALSE 0.016 241.000 0.000 NA   NA
 7080778 7080779 Smal_1989 Smal_1990     TRUE 0.876 -24.000 0.000 NA   NA
 7080779 7080780 Smal_1990 Smal_1991     FALSE 0.096 10.000 0.000 NA N NA
 7080780 7080781 Smal_1991 Smal_1992     TRUE 0.999 0.000 0.917 0.001 Y NA
 7080781 7080782 Smal_1992 Smal_1993     TRUE 0.999 -3.000 0.705 0.038 Y NA
 7080782 7080783 Smal_1993 Smal_1994     FALSE 0.001 481.000 0.000 1.000 N NA
 7080783 7080784 Smal_1994 Smal_1995     TRUE 0.895 23.000 0.333 1.000 N NA
 7080784 7080785 Smal_1995 Smal_1996     FALSE 0.003 139.000 0.000 1.000 N NA
 7080785 7080786 Smal_1996 Smal_1997     TRUE 0.942 -3.000 0.000 0.064   NA
 7080787 7080788 Smal_1998 Smal_1999     FALSE 0.208 56.000 0.000 NA   NA
 7080788 7080789 Smal_1999 Smal_2000     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7080790 7080791 Smal_2001 Smal_2002     FALSE 0.015 272.000 0.000 NA   NA
 7080791 7080792 Smal_2002 Smal_2003     TRUE 0.688 63.000 0.188 NA   NA
 7080795 7080796 Smal_2006 Smal_2007     TRUE 0.870 64.000 0.378 0.028   NA
 7080796 7080797 Smal_2007 Smal_2008     TRUE 0.765 44.000 0.048 0.028   NA
 7080798 7080799 Smal_2009 Smal_2010     FALSE 0.003 139.000 0.000 1.000 N NA
 7080800 7080801 Smal_2011 Smal_2012     FALSE 0.080 12.000 0.000 NA N NA
 7080801 7080802 Smal_2012 Smal_2013     FALSE 0.446 26.000 0.000 1.000   NA
 7080802 7080803 Smal_2013 Smal_2014     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7080804 7080805 Smal_2015 Smal_2016     FALSE 0.242 47.000 0.000 NA   NA
 7080805 7080806 Smal_2016 Smal_2017     TRUE 0.575 100.000 0.000 NA Y NA
 7080806 7080807 Smal_2017 Smal_2018     TRUE 0.985 -3.000 0.375 NA N NA
 7080807 7080808 Smal_2018 Smal_2019     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7080808 7080809 Smal_2019 Smal_2020     FALSE 0.015 266.000 0.000 NA   NA
 7080809 7080810 Smal_2020 Smal_2021     FALSE 0.027 176.000 0.000 NA   NA
 7080811 7080812 Smal_2022 Smal_2023     TRUE 0.993 -3.000 0.833 NA N NA
 7080812 7080813 Smal_2023 Smal_2024     FALSE 0.168 0.000 0.000 NA N NA
 7080813 7080814 Smal_2024 Smal_2025     FALSE 0.014 62.000 0.000 1.000 N NA
 7080814 7080815 Smal_2025 Smal_2026     TRUE 0.823 57.000 0.000 0.010 Y NA
 7080816 7080817 Smal_2027 Smal_2028     FALSE 0.016 239.000 0.000 NA   NA
 7080817 7080818 Smal_2028 Smal_2029     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7080819 7080820 Smal_2030 Smal_2031     TRUE 0.995 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 7080820 7080821 Smal_2031 Smal_2032     TRUE 0.939 87.000 0.562 1.000 Y NA
 7080821 7080822 Smal_2032 Smal_2033     TRUE 0.835 15.000 0.025 0.056 N NA
 7080822 7080823 Smal_2033 Smal_2034     FALSE 0.360 136.000 0.000 1.000 Y NA
 7080824 7080825 Smal_2035 Smal_2036     FALSE 0.130 97.000 0.000 NA   NA
 7080827 7080828 Smal_2038 Smal_2039     TRUE 0.887 0.000 0.031 1.000 N NA
 7080829 7080830 Smal_2040 Smal_2041     TRUE 0.602 59.000 0.088 NA   NA
 7080830 7080831 Smal_2041 Smal_2042     TRUE 0.937 39.000 0.775 NA   NA
 7080832 7080833 Smal_2043 Smal_2044     FALSE 0.406 26.000 0.000 NA   NA
 7080836 7080837 Smal_2047 Smal_2048     TRUE 0.647 9.000 0.000 NA   NA
 7080837 7080838 Smal_2048 Smal_2049     TRUE 0.991 -3.000 0.444 NA   NA
 7080838 7080839 Smal_2049 Smal_2050     FALSE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 7080840 7080841 Smal_2051 Smal_2052     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7080841 7080842 Smal_2052 Smal_2053     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7080843 7080844 Smal_2054 Smal_2055     FALSE 0.042 302.000 0.000 0.048   NA
 7080846 7080847 Smal_2057 Smal_2058     FALSE 0.522 33.000 0.029 NA N NA
 7080847 7080848 Smal_2058 Smal_2059     TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 7080848 7080849 Smal_2059 Smal_2060     FALSE 0.027 37.000 0.000 1.000 N NA
 7080852 7080853 Smal_2063 Smal_2064     FALSE 0.026 179.000 0.000 NA   NA
 7080853 7080854 Smal_2064 Smal_2065     FALSE 0.527 103.000 0.250 1.000 N NA
 7080855 7080856 Smal_2066 Smal_2067     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080856 7080857 Smal_2067 Smal_2068     TRUE 0.971 -3.000 0.091 NA   NA
 7080857 7080858 Smal_2068 Smal_2069     TRUE 0.702 61.000 0.318 NA N NA
 7080858 7080859 Smal_2069 Smal_2070     FALSE 0.048 22.000 0.000 1.000 N NA
 7080859 7080860 Smal_2070 Smal_2071     FALSE 0.089 11.000 0.000 1.000 N NA
 7080861 7080862 Smal_2072 Smal_2073     FALSE 0.071 122.000 0.000 NA   NA
 7080862 7080863 Smal_2073 Smal_2074     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7080863 7080864 Smal_2074 Smal_2075     FALSE 0.050 248.000 0.000 0.031   NA
 7080865 7080866 Smal_2076 Smal_2077     FALSE 0.109 111.000 0.000 1.000   NA
 7080867 7080868 Smal_2078 Smal_2079     TRUE 0.967 -3.000 0.069 NA   NA
 7080870 7080871 Smal_2081 Smal_2082     TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.063 Y NA
 7080872 7080873 Smal_2083 Smal_2084     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080873 7080874 Smal_2084 Smal_2085     FALSE 0.173 69.000 0.000 NA   NA
 7080874 7080875 Smal_2085 Smal_2086     TRUE 0.991 -7.000 0.333 NA   NA
 7080877 7080878 Smal_2088 Smal_2089     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080878 7080879 Smal_2089 Smal_2090     TRUE 0.907 44.000 0.625 NA   NA
 7080879 7080880 Smal_2090 Smal_2091     TRUE 0.853 100.000 0.875 NA   NA
 7080880 7080881 Smal_2091 Smal_2092     TRUE 0.973 14.000 0.667 NA   NA
 7080881 7080882 Smal_2092 Smal_2093     TRUE 0.810 47.000 0.292 NA   NA
 7080882 7080883 Smal_2093 Smal_2094     FALSE 0.024 189.000 0.000 NA   NA
 7080883 7080884 Smal_2094 Smal_2095     FALSE 0.138 92.000 0.000 NA   NA
 7080884 7080885 Smal_2095 Smal_2096     FALSE 0.018 222.000 0.000 NA   NA
 7080885 7080886 Smal_2096 Smal_2097     FALSE 0.258 44.000 0.000 NA   NA
 7080886 7080887 Smal_2097 Smal_2098     FALSE 0.397 27.000 0.000 NA   NA
 7080887 7080888 Smal_2098 Smal_2099     TRUE 0.826 61.000 0.444 NA   NA
 7080888 7080889 Smal_2099 Smal_2100     TRUE 0.801 71.000 0.444 NA   NA
 7080889 7080890 Smal_2100 Smal_2101     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 7080890 7080891 Smal_2101 Smal_2102     TRUE 0.844 48.000 0.375 NA   NA
 7080891 7080892 Smal_2102 Smal_2103     TRUE 0.975 19.000 0.875 NA   NA
 7080892 7080893 Smal_2103 Smal_2104     FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 7080895 7080896 Smal_2106 Smal_2107     TRUE 0.815 21.000 0.062 NA   NA
 7080896 7080897 Smal_2107 Smal_2108     TRUE 0.995 -3.000 0.800 NA   NA
 7080898 7080899 Smal_2109 Smal_2110     FALSE 0.058 18.000 0.000 1.000 N NA
 7080900 7080901 Smal_2111 Smal_2112     FALSE 0.193 71.000 0.000 1.000   NA
 7080901 7080902 Smal_2112 Smal_2113     FALSE 0.063 127.000 0.000 NA   NA
 7080902 7080903 Smal_2113 Smal_2114     FALSE 0.028 172.000 0.000 NA   NA
 7080904 7080905 Smal_2115 Smal_2116     TRUE 0.973 3.000 0.439 1.000 N NA
 7080906 7080907 Smal_2117 Smal_2118     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 7080907 7080908 Smal_2118 Smal_2119     TRUE 0.997 4.000 0.826 1.000 Y NA
 7080908 7080909 Smal_2119 Smal_2120     FALSE 0.059 201.000 0.000 0.085   NA
 7080911 7080912 Smal_2122 Smal_2123     FALSE 0.183 196.000 0.000 NA Y NA
 7080912 7080913 Smal_2123 Smal_2124     FALSE 0.216 53.000 0.000 NA   NA
 7080913 7080914 Smal_2124 Smal_2125     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080914 7080915 Smal_2125 Smal_2126     TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 7080916 7080917 Smal_2127 Smal_2128     FALSE 0.214 54.000 0.000 NA   NA
 7080919 7080920 Smal_2130 Smal_2131     FALSE 0.030 169.000 0.000 NA   NA
 7080920 7080921 Smal_2131 Smal_2132     FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 7080922 7080923 Smal_2133 Smal_2134     FALSE 0.016 306.000 0.000 1.000   NA
 7080923 7080924 Smal_2134 Smal_2135     FALSE 0.014 294.000 0.000 NA   NA
 7080924 7080925 Smal_2135 Smal_2136     FALSE 0.188 63.000 0.000 NA   NA
 7080925 7080926 Smal_2136 Smal_2137     TRUE 0.749 32.000 0.072 NA   NA
 7080926 7080927 Smal_2137 Smal_2138     FALSE 0.203 130.000 0.029 NA   NA
 7080927 7080928 Smal_2138 Smal_2139     TRUE 0.999 -7.000 0.800 1.000 Y NA
 7080928 7080929 Smal_2139 Smal_2140     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080930 7080931 Smal_2141 Smal_2142     TRUE 0.895 10.000 0.053 NA   NA
 7080932 7080933 Smal_2143 Smal_2144     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA N NA
 7080933 7080934 Smal_2144 Smal_2145     TRUE 0.660 72.000 0.000 NA Y NA
 7080934 7080935 Smal_2145 Smal_2146     FALSE 0.152 96.000 0.000 1.000   NA
 7080936 7080937 Smal_2147 Smal_2148     FALSE 0.012 478.000 0.000 NA   NA
 7080941 7080942 Smal_2152 Smal_2153     TRUE 0.967 5.000 0.270 1.000   NA
 7080942 7080943 Smal_2153 Smal_2154     FALSE 0.026 182.000 0.000 NA   NA
 7080943 7080944 Smal_2154 Smal_2155     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7080944 7080945 Smal_2155 Smal_2156     TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7080945 7080946 Smal_2156 Smal_2157     TRUE 0.897 3.000 0.019 NA   NA
 7080946 7080947 Smal_2157 Smal_2158     TRUE 0.998 -7.000 0.605 NA Y NA
 7080947 7080948 Smal_2158 Smal_2159     TRUE 0.957 12.000 0.336 NA   NA
 7080951 7080952 Smal_2162 Smal_2163     FALSE 0.106 112.000 0.000 1.000   NA
 7080952 7080953 Smal_2163 Smal_2164     TRUE 0.646 11.000 0.000 1.000   NA
 7080953 7080954 Smal_2164 Smal_2165     FALSE 0.020 46.000 0.000 1.000 N NA
 7080954 7080955 Smal_2165 Smal_2166     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7080958 7080959 Smal_2169 Smal_2170     TRUE 0.988 -3.000 0.455 1.000 N NA
 7080959 7080960 Smal_2170 Smal_2171     TRUE 0.997 -3.000 0.333 1.000 Y NA
 7080961 7080962 Smal_2172 Smal_2173     TRUE 0.997 -7.000 0.222 1.000 Y NA
 7080963 7080964 Smal_2174 Smal_2175     FALSE 0.150 97.000 0.000 1.000   NA
 7080964 7080965 Smal_2175 Smal_2176     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7080965 7080966 Smal_2176 Smal_2177     FALSE 0.017 236.000 0.000 NA   NA
 7080968 7080969 Smal_2179 Smal_2180     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 7080969 7080970 Smal_2180 Smal_2181     TRUE 0.968 4.000 0.278 NA   NA
 7080970 7080971 Smal_2181 Smal_2182     FALSE 0.169 71.000 0.000 NA   NA
 7080971 7080972 Smal_2182 Smal_2183     TRUE 0.966 10.000 0.000 0.031 Y NA
 7080972 7080973 Smal_2183 Smal_2184     FALSE 0.102 113.000 0.000 1.000   NA
 7080973 7080974 Smal_2184 Smal_2185     TRUE 0.798 92.000 0.556 NA   NA
 7080974 7080975 Smal_2185 Smal_2186     TRUE 0.842 55.000 0.444 NA   NA
 7080975 7080976 Smal_2186 Smal_2187     FALSE 0.202 183.000 0.000 NA Y NA
 7080976 7080977 Smal_2187 Smal_2188     FALSE 0.011 83.000 0.000 NA N NA
 7080977 7080978 Smal_2188 Smal_2189     FALSE 0.437 141.000 0.000 0.062 Y NA
 7080979 7080980 Smal_2190 Smal_2191     FALSE 0.167 72.000 0.000 NA   NA
 7080980 7080981 Smal_2191 Smal_2192     TRUE 0.822 55.000 0.000 0.024 Y NA
 7080981 7080982 Smal_2192 Smal_2193     FALSE 0.011 86.000 0.000 1.000 N NA
 7080982 7080983 Smal_2193 Smal_2194     FALSE 0.074 127.000 0.000 1.000   NA
 7080984 7080985 Smal_2195 Smal_2196     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7080985 7080986 Smal_2196 Smal_2197     TRUE 0.865 43.000 0.360 1.000   NA
 7080986 7080987 Smal_2197 Smal_2198     TRUE 0.940 4.000 0.190 1.000 N NA
 7080987 7080988 Smal_2198 Smal_2199     TRUE 0.986 11.000 0.655 0.051   NA
 7080988 7080989 Smal_2199 Smal_2200     TRUE 0.901 39.000 0.472 1.000   NA
 7080992 7080993 Smal_2203 Smal_2204     TRUE 0.879 9.000 0.000 0.004   NA
 7080993 7080994 Smal_2204 Smal_2205     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7080995 7080996 Smal_2206 Smal_2207     FALSE 0.023 207.000 0.000 1.000   NA
 7080996 7080997 Smal_2207 Smal_2208     TRUE 0.953 99.000 0.500 0.002 Y NA
 7080997 7080998 Smal_2208 Smal_2209     FALSE 0.001 218.000 0.000 1.000 N NA
 7080998 7080999 Smal_2209 Smal_2210     TRUE 0.997 8.000 0.653 0.004 Y NA
 7080999 7081000 Smal_2210 Smal_2211     TRUE 0.999 -3.000 0.776 0.004 Y NA
 7081000 7081001 Smal_2211 Smal_2212     TRUE 0.992 -3.000 0.044 1.000 Y NA
 7081001 7081002 Smal_2212 Smal_2213     TRUE 0.968 -3.000 0.061 1.000   NA
 7081002 7081003 Smal_2213 Smal_2214     TRUE 0.986 -3.000 0.136 0.054   NA
 7081003 7081004 Smal_2214 Smal_2215     TRUE 0.972 10.000 0.029 1.000 Y NA
 7081004 7081005 Smal_2215 Smal_2216     FALSE 0.202 58.000 0.000 NA   NA
 7081005 7081006 Smal_2216 Smal_2217     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7081006 7081007 Smal_2217 Smal_2218     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 7081007 7081008 Smal_2218 Smal_2219     TRUE 0.814 70.000 0.667 NA N NA
 7081008 7081009 Smal_2219 Smal_2220     FALSE 0.548 17.000 0.000 1.000   NA
 7081009 7081010 Smal_2220 Smal_2221     FALSE 0.014 471.000 0.000 1.000   NA
 7081011 7081012 Smal_2222 Smal_2223     TRUE 0.996 -3.000 0.880 NA   NA
 7081012 7081013 Smal_2223 Smal_2224     FALSE 0.020 208.000 0.000 NA   NA
 7081013 7081014 Smal_2224 Smal_2225     TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000   NA
 7081015 7081016 Smal_2226 Smal_2227     TRUE 0.994 -10.000 0.500 1.000   NA
 7081016 7081017 Smal_2227 Smal_2228     TRUE 0.998 4.000 0.583 0.001 Y NA
 7081017 7081018 Smal_2228 Smal_2229     FALSE 0.053 20.000 0.000 1.000 N NA
 7081018 7081019 Smal_2229 Smal_2230     FALSE 0.080 12.000 0.000 1.000 N NA
 7081019 7081020 Smal_2230 Smal_2231     FALSE 0.006 114.000 0.000 1.000 N NA
 7081020 7081021 Smal_2231 Smal_2232     FALSE 0.044 24.000 0.000 1.000 N NA
 7081021 7081022 Smal_2232 Smal_2233     FALSE 0.129 4.000 0.000 1.000 N NA
 7081022 7081023 Smal_2233 Smal_2234     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7081023 7081024 Smal_2234 Smal_2235     TRUE 0.985 0.000 0.000 0.001 Y NA
 7081024 7081025 Smal_2235 Smal_2236     TRUE 0.985 0.000 0.000 0.001 Y NA
 7081025 7081026 Smal_2236 Smal_2237     FALSE 0.012 73.000 0.000 1.000 N NA
 7081026 7081027 Smal_2237 Smal_2238     FALSE 0.042 146.000 0.000 NA   NA
 7081027 7081028 Smal_2238 Smal_2239     TRUE 0.921 -3.000 0.005 NA   NA
 7081028 7081029 Smal_2239 Smal_2240     TRUE 0.873 37.000 0.013 NA Y NA
 7081029 7081030 Smal_2240 Smal_2241     TRUE 0.976 4.000 0.014 1.000 Y NA
 7081030 7081031 Smal_2241 Smal_2242     TRUE 0.970 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7081031 7081032 Smal_2242 Smal_2243   moaC TRUE 0.985 0.000 0.000 0.001 Y NA
 7081032 7081033 Smal_2243 Smal_2244 moaC   TRUE 0.985 9.000 0.019 0.001 Y NA
 7081039 7081040 Smal_2250 Smal_2251     FALSE 0.016 239.000 0.000 NA   NA
 7081040 7081041 Smal_2251 Smal_2252     FALSE 0.001 442.000 0.000 NA N NA
 7081042 7081043 Smal_2253 Smal_2254     TRUE 0.975 5.000 0.391 NA   NA
 7081043 7081044 Smal_2254 Smal_2255     TRUE 0.962 2.000 0.182 NA   NA
 7081044 7081045 Smal_2255 Smal_2256     TRUE 0.989 -3.000 0.500 1.000 N NA
 7081045 7081046 Smal_2256 Smal_2257     FALSE 0.053 135.000 0.000 NA   NA
 7081046 7081047 Smal_2257 Smal_2258     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 7081047 7081048 Smal_2258 Smal_2259     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081048 7081049 Smal_2259 Smal_2260     FALSE 0.150 85.000 0.000 NA   NA
 7081049 7081050 Smal_2260 Smal_2261     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7081050 7081051 Smal_2261 Smal_2262     FALSE 0.177 83.000 0.000 1.000   NA
 7081053 7081054 Smal_2264 Smal_2265     TRUE 0.908 11.000 0.098 NA   NA
 7081054 7081055 Smal_2265 Smal_2266     TRUE 0.994 -3.000 0.679 NA   NA
 7081055 7081056 Smal_2266 Smal_2267     TRUE 0.996 -10.000 0.717 NA   NA
 7081056 7081057 Smal_2267 Smal_2268     FALSE 0.013 391.000 0.000 NA   NA
 7081057 7081058 Smal_2268 Smal_2269     FALSE 0.001 199.000 0.000 1.000 N NA
 7081058 7081059 Smal_2269 Smal_2270     TRUE 0.797 22.000 0.050 NA   NA
 7081060 7081061 Smal_2271 Smal_2272   entF TRUE 0.993 -9.000 0.024 1.000 Y NA
 7081061 7081062 Smal_2272 Smal_2273 entF   TRUE 0.997 -3.000 0.200 0.002 Y NA
 7081062 7081063 Smal_2273 Smal_2274     TRUE 0.994 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 7081063 7081064 Smal_2274 Smal_2275     TRUE 0.992 0.000 0.067 0.056 Y NA
 7081064 7081065 Smal_2275 Smal_2276     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7081065 7081066 Smal_2276 Smal_2277     FALSE 0.253 -3.000 0.000 NA N NA
 7081066 7081067 Smal_2277 Smal_2278     FALSE 0.036 155.000 0.000 NA   NA
 7081067 7081068 Smal_2278 Smal_2279     FALSE 0.052 136.000 0.000 NA   NA
 7081069 7081070 Smal_2280 Smal_2281     FALSE 0.088 120.000 0.000 1.000   NA
 7081070 7081071 Smal_2281 Smal_2282     FALSE 0.001 285.000 0.000 1.000 N NA
 7081071 7081072 Smal_2282 Smal_2283     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7081072 7081073 Smal_2283 Smal_2284     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7081074 7081075 Smal_2285 Smal_2286     TRUE 0.963 13.000 0.615 1.000 N NA
 7081076 7081077 Smal_2287 Smal_2288     FALSE 0.015 363.000 0.000 1.000   NA
 7081077 7081078 Smal_2288 Smal_2289     FALSE 0.001 260.000 0.000 1.000 N NA
 7081078 7081079 Smal_2289 Smal_2290     TRUE 0.892 -10.000 0.000 1.000   NA
 7081082 7081083 Smal_2293 Smal_2294     TRUE 0.986 -28.000 0.000 1.000 Y NA
 7081083 7081084 Smal_2294 Smal_2295   nrdF TRUE 0.834 29.000 0.250 1.000 N NA
 7081084 7081085 Smal_2295 Smal_2296 nrdF   TRUE 0.843 109.000 0.079 0.001 Y NA
 7081086 7081087 Smal_2297 Smal_2298     FALSE 0.001 227.000 0.000 1.000 N NA
 7081088 7081089 Smal_2299 Smal_2300     FALSE 0.023 196.000 0.000 NA   NA
 7081090 7081091 Smal_2301 Smal_2302     FALSE 0.253 -3.000 0.000 NA N NA
 7081091 7081092 Smal_2302 Smal_2303     TRUE 0.665 70.000 0.000 NA Y NA
 7081093 7081094 Smal_2304 Smal_2305     TRUE 0.999 0.000 0.869 0.054 Y NA
 7081097 7081098 Smal_2308 Smal_2309     TRUE 0.703 63.000 0.000 1.000 Y NA
 7081098 7081099 Smal_2309 Smal_2310     FALSE 0.118 103.000 0.000 NA   NA
 7081102 7081103 Smal_2313 Smal_2314     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 7081103 7081104 Smal_2314 Smal_2315     FALSE 0.014 62.000 0.000 1.000 N NA
 7081104 7081105 Smal_2315 Smal_2316     FALSE 0.001 236.000 0.000 1.000 N NA
 7081106 7081107 Smal_2317 Smal_2318     TRUE 0.678 67.000 0.000 NA Y NA
 7081107 7081108 Smal_2318 Smal_2319     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081108 7081109 Smal_2319 Smal_2320     FALSE 0.425 24.000 0.000 NA   NA
 7081109 7081110 Smal_2320 Smal_2321     TRUE 0.985 19.000 0.468 NA Y NA
 7081110 7081111 Smal_2321 Smal_2322     TRUE 0.955 73.000 0.696 NA Y NA
 7081111 7081112 Smal_2322 Smal_2323     TRUE 0.999 -15.000 0.732 NA Y NA
 7081112 7081113 Smal_2323 Smal_2324     TRUE 0.997 3.000 0.822 NA Y NA
 7081113 7081114 Smal_2324 Smal_2325     TRUE 0.988 29.000 0.844 NA Y NA
 7081114 7081115 Smal_2325 Smal_2326     TRUE 0.997 0.000 0.620 NA Y NA
 7081115 7081116 Smal_2326 Smal_2327     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081116 7081117 Smal_2327 Smal_2328     TRUE 0.647 9.000 0.000 NA   NA
 7081117 7081118 Smal_2328 Smal_2329     FALSE 0.123 100.000 0.000 NA   NA
 7081121 7081122 Smal_2332 Smal_2333     TRUE 0.871 -6.000 0.000 NA   NA
 7081122 7081123 Smal_2333 Smal_2334     TRUE 0.876 -21.000 0.000 NA   NA
 7081123 7081124 Smal_2334 Smal_2335     TRUE 0.958 -3.000 0.033 NA   NA
 7081124 7081125 Smal_2335 Smal_2336     TRUE 0.934 3.000 0.071 NA   NA
 7081125 7081126 Smal_2336 Smal_2337     TRUE 0.960 -3.000 0.107 1.000 N NA
 7081126 7081127 Smal_2337 Smal_2338     FALSE 0.161 78.000 0.000 NA   NA
 7081128 7081129 Smal_2339 Smal_2340     TRUE 0.999 -7.000 0.600 0.030 Y NA
 7081130 7081131 Smal_2341 Smal_2342     FALSE 0.099 114.000 0.000 1.000   NA
 7081131 7081132 Smal_2342 Smal_2343     TRUE 0.985 -3.000 0.111 0.030   NA
 7081132 7081133 Smal_2343 Smal_2344     FALSE 0.059 137.000 0.000 1.000   NA
 7081133 7081134 Smal_2344 Smal_2345     FALSE 0.220 52.000 0.000 NA   NA
 7081135 7081136 Smal_2346 Smal_2347     FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 7081139 7081140 Smal_2350 Smal_2351     FALSE 0.014 287.000 0.000 NA   NA
 7081144 7081145 Smal_2355 Smal_2356     FALSE 0.173 69.000 0.000 NA   NA
 7081147 7081148 Smal_2358 Smal_2359     FALSE 0.033 163.000 0.000 NA   NA
 7081148 7081149 Smal_2359 Smal_2360     TRUE 0.992 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 7081149 7081150 Smal_2360 Smal_2361     TRUE 0.957 5.000 0.309 1.000 N NA
 7081150 7081151 Smal_2361 Smal_2362     TRUE 0.854 54.000 0.652 1.000 N NA
 7081151 7081152 Smal_2362 Smal_2363     FALSE 0.018 223.000 0.000 NA   NA
 7081152 7081153 Smal_2363 Smal_2364     FALSE 0.060 130.000 0.000 NA   NA
 7081155 7081156 Smal_2366 Smal_2367     FALSE 0.056 133.000 0.000 NA   NA
 7081156 7081157 Smal_2367 Smal_2368     FALSE 0.027 176.000 0.000 NA   NA
 7081157 7081158 Smal_2368 Smal_2369     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7081161 7081162 Smal_2372 Smal_2373     FALSE 0.014 289.000 0.000 NA   NA
 7081164 7081165 Smal_2375 Smal_2376     FALSE 0.193 93.000 0.013 1.000 N NA
 7081165 7081166 Smal_2376 Smal_2377     TRUE 0.573 36.000 0.013 NA   NA
 7081166 7081167 Smal_2377 Smal_2378     FALSE 0.014 297.000 0.000 NA   NA
 7081167 7081168 Smal_2378 Smal_2379     TRUE 0.981 10.000 0.667 NA   NA
 7081168 7081169 Smal_2379 Smal_2380   dnaE2 TRUE 0.994 7.000 0.500 1.000 Y NA
 7081169 7081170 Smal_2380 Smal_2381 dnaE2   FALSE 0.157 82.000 0.000 NA   NA
 7081172 7081173 Smal_2383 Smal_2384     TRUE 0.951 -3.000 0.022 NA   NA
 7081173 7081174 Smal_2384 Smal_2385     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081174 7081175 Smal_2385 Smal_2386     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7081175 7081176 Smal_2386 Smal_2387     FALSE 0.062 128.000 0.000 NA   NA
 7081176 7081177 Smal_2387 Smal_2388     FALSE 0.253 -3.000 0.000 NA N NA
 7081177 7081178 Smal_2388 Smal_2389     TRUE 0.684 65.000 0.000 NA Y NA
 7081178 7081179 Smal_2389 Smal_2390     TRUE 0.876 -13.000 0.000 NA   NA
 7081179 7081180 Smal_2390 Smal_2391     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7081181 7081182 Smal_2392 Smal_2393     FALSE 0.036 29.000 0.000 1.000 N NA
 7081182 7081183 Smal_2393 Smal_2394     TRUE 0.897 21.000 0.000 1.000 Y NA
 7081183 7081184 Smal_2394 Smal_2395     FALSE 0.185 77.000 0.000 1.000   NA
 7081184 7081185 Smal_2395 Smal_2396     FALSE 0.012 514.000 0.000 NA   NA
 7081185 7081186 Smal_2396 Smal_2397     TRUE 0.846 31.000 0.000 NA Y NA
 7081186 7081187 Smal_2397 Smal_2398     FALSE 0.012 81.000 0.000 1.000 N NA
 7081188 7081189 Smal_2399 Smal_R0054     FALSE 0.115 104.000 0.000 NA   NA
 7081189 7081190 Smal_R0054 Smal_R0055     FALSE 0.211 55.000 0.000 NA   NA
 7081190 7081191 Smal_R0055 Smal_R0056     FALSE 0.025 185.000 0.000 NA   NA
 7081191 7081192 Smal_R0056 Smal_R0057     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7081192 7081193 Smal_R0057 Smal_R0058     FALSE 0.258 44.000 0.000 NA   NA
 7081193 7081194 Smal_R0058 Smal_R0059     FALSE 0.238 48.000 0.000 NA   NA
 7081198 7081199 Smal_R0060 Smal_2403     FALSE 0.167 72.000 0.000 NA   NA
 7081199 7081200 Smal_2403 Smal_2404     FALSE 0.006 116.000 0.000 1.000 N NA
 7081201 7081202 Smal_2405 Smal_2406     FALSE 0.001 256.000 0.000 1.000 N NA
 7081204 7081205 Smal_2408 Smal_2409     FALSE 0.188 63.000 0.000 NA   NA
 7081205 7081206 Smal_2409 Smal_2410     FALSE 0.001 208.000 0.000 1.000 N NA
 7081206 7081207 Smal_2410 Smal_2411     FALSE 0.051 208.000 0.010 NA   NA
 7081207 7081208 Smal_2411 Smal_2412     FALSE 0.011 772.000 0.000 NA   NA
 7081208 7081209 Smal_2412 Smal_2413     TRUE 0.966 -3.000 0.065 NA   NA
 7081209 7081210 Smal_2413 Smal_2414     FALSE 0.509 65.000 0.043 NA   NA
 7081210 7081211 Smal_2414 Smal_2415     FALSE 0.448 77.000 0.032 NA   NA
 7081211 7081212 Smal_2415 Smal_2416     TRUE 0.983 -3.000 0.210 NA   NA
 7081212 7081213 Smal_2416 Smal_2417     TRUE 0.734 23.000 0.022 NA   NA
 7081215 7081216 Smal_2419 Smal_2420     TRUE 0.634 41.000 0.040 NA   NA
 7081216 7081217 Smal_2420 Smal_2421     FALSE 0.122 170.000 0.043 NA   NA
 7081218 7081219 Smal_2422 Smal_2423     FALSE 0.080 137.000 0.018 NA N NA
 7081220 7081221 Smal_2424 Smal_2425     FALSE 0.023 193.000 0.000 NA   NA
 7081221 7081222 Smal_2425 Smal_2426     FALSE 0.034 160.000 0.000 NA   NA
 7081222 7081223 Smal_2426 Smal_2427     FALSE 0.209 75.000 0.011 1.000 N NA
 7081223 7081224 Smal_2427 Smal_2428     FALSE 0.012 76.000 0.000 NA N NA
 7081225 7081226 Smal_2429 Smal_2430     FALSE 0.198 69.000 0.000 1.000   NA
 7081226 7081227 Smal_2430 Smal_2431     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 7081229 7081230 Smal_2433 Smal_2434     FALSE 0.285 40.000 0.000 NA   NA
 7081230 7081231 Smal_2434 Smal_2435     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081232 7081233 Smal_2436 Smal_2437     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7081233 7081234 Smal_2437 Smal_2438     FALSE 0.202 58.000 0.000 NA   NA
 7081234 7081235 Smal_2438 Smal_2439     FALSE 0.011 4604.000 0.000 NA   NA
 7081235 7081236 Smal_2439 Smal_2440     FALSE 0.242 47.000 0.000 NA   NA
 7081236 7081237 Smal_2440 Smal_2441     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081237 7081238 Smal_2441 Smal_2442     TRUE 0.874 82.000 0.192 NA Y NA
 7081238 7081239 Smal_2442 Smal_2443     TRUE 0.997 -7.000 1.000 NA   NA
 7081239 7081240 Smal_2443 Smal_2444     FALSE 0.165 74.000 0.000 NA   NA
 7081240 7081241 Smal_2444 Smal_2445     TRUE 0.703 4.000 0.000 NA   NA
 7081241 7081242 Smal_2445 Smal_2446     TRUE 0.992 15.000 0.714 1.000 Y NA
 7081242 7081243 Smal_2446 Smal_2447     TRUE 0.999 -3.000 0.800 NA Y NA
 7081243 7081244 Smal_2447 Smal_2448     TRUE 0.997 -3.000 0.400 NA Y NA
 7081244 7081245 Smal_2448 Smal_2449     TRUE 0.749 90.000 0.400 NA   NA
 7081245 7081246 Smal_2449 Smal_2450     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081246 7081247 Smal_2450 Smal_2451     FALSE 0.021 203.000 0.000 NA   NA
 7081247 7081248 Smal_2451 Smal_2452     TRUE 0.930 37.000 0.667 NA   NA
 7081251 7081252 Smal_2455 Smal_2456     FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 7081252 7081253 Smal_2456 Smal_2457     FALSE 0.224 51.000 0.000 NA   NA
 7081253 7081254 Smal_2457 Smal_2458     FALSE 0.063 127.000 0.000 NA   NA
 7081256 7081257 Smal_2460 Smal_2461     FALSE 0.012 74.000 0.000 1.000 N NA
 7081259 7081260 Smal_2463 Smal_2464     TRUE 0.998 0.000 1.000 1.000 Y NA
 7081260 7081261 Smal_2464 Smal_2465     FALSE 0.164 75.000 0.000 NA   NA
 7081261 7081262 Smal_2465 Smal_2466     FALSE 0.052 136.000 0.000 NA   NA
 7081262 7081263 Smal_2466 Smal_2467     TRUE 0.963 9.000 0.439 1.000 N NA
 7081263 7081264 Smal_2467 Smal_2468     FALSE 0.139 91.000 0.000 NA   NA
 7081264 7081265 Smal_2468 Smal_2469     FALSE 0.397 27.000 0.000 NA   NA
 7081265 7081266 Smal_2469 Smal_2470     FALSE 0.082 116.000 0.000 NA   NA
 7081267 7081268 Smal_2471 Smal_2473     FALSE 0.350 32.000 0.000 NA   NA
 7081268 7081269 Smal_2473 Smal_2474     FALSE 0.022 198.000 0.000 NA   NA
 7081270 7081271 Smal_2475 Smal_2476     FALSE 0.204 57.000 0.000 NA   NA
 7081276 7081277 Smal_2481 Smal_2482     FALSE 0.012 418.000 0.000 NA   NA
 7081277 7081278 Smal_2482 Smal_2483     FALSE 0.013 394.000 0.000 NA   NA
 7081278 7081279 Smal_2483 Smal_2484     FALSE 0.011 811.000 0.000 NA   NA
 7081281 7081282 Smal_2486 Smal_2487     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7081282 7081283 Smal_2487 Smal_2488     FALSE 0.220 52.000 0.000 NA   NA
 7081283 7081284 Smal_2488 Smal_2489     TRUE 0.668 7.000 0.000 NA   NA
 7081284 7081285 Smal_2489 Smal_2490     FALSE 0.012 419.000 0.000 NA   NA
 7081285 7081286 Smal_2490 Smal_2491     FALSE 0.436 23.000 0.000 NA   NA
 7081286 7081287 Smal_2491 Smal_2492     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7081287 7081288 Smal_2492 Smal_2493     FALSE 0.161 78.000 0.000 NA   NA
 7081288 7081289 Smal_2493 Smal_2494     FALSE 0.071 122.000 0.000 NA   NA
 7081289 7081290 Smal_2494 Smal_2495     FALSE 0.160 79.000 0.000 NA   NA
 7081290 7081291 Smal_2495 Smal_2496     TRUE 0.994 -3.000 0.635 NA   NA
 7081291 7081292 Smal_2496 Smal_2497     TRUE 0.982 -7.000 0.146 NA   NA
 7081292 7081293 Smal_2497 Smal_2498     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081293 7081294 Smal_2498 Smal_2499     TRUE 0.732 2.000 0.000 NA   NA
 7081294 7081295 Smal_2499 Smal_2500     TRUE 0.637 62.000 0.130 NA   NA
 7081295 7081296 Smal_2500 Smal_2501     TRUE 0.945 12.000 0.261 NA   NA
 7081296 7081297 Smal_2501 Smal_2502     TRUE 0.995 -22.000 0.667 NA   NA
 7081297 7081298 Smal_2502 Smal_2503     TRUE 0.914 9.000 0.080 NA   NA
 7081298 7081299 Smal_2503 Smal_2504     FALSE 0.375 29.000 0.000 NA   NA
 7081299 7081300 Smal_2504 Smal_2505     FALSE 0.015 278.000 0.000 NA   NA
 7081300 7081301 Smal_2505 Smal_2506     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7081301 7081302 Smal_2506 Smal_2507     FALSE 0.033 163.000 0.000 NA   NA
 7081302 7081303 Smal_2507 Smal_2508     FALSE 0.110 106.000 0.000 NA   NA
 7081303 7081304 Smal_2508 Smal_2509     FALSE 0.029 171.000 0.000 NA   NA
 7081304 7081305 Smal_2509 Smal_2510     FALSE 0.020 205.000 0.000 NA   NA
 7081305 7081306 Smal_2510 Smal_2511     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081306 7081307 Smal_2511 Smal_2512     FALSE 0.150 97.000 0.000 1.000   NA
 7081307 7081308 Smal_2512 Smal_2513     FALSE 0.169 71.000 0.000 NA   NA
 7081308 7081309 Smal_2513 Smal_2514     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081309 7081310 Smal_2514 Smal_2515     FALSE 0.024 190.000 0.000 NA   NA
 7081310 7081311 Smal_2515 Smal_2516     FALSE 0.012 527.000 0.000 NA   NA
 7081311 7081312 Smal_2516 Smal_2517     FALSE 0.012 445.000 0.000 NA   NA
 7081312 7081313 Smal_2517 Smal_2518     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081313 7081314 Smal_2518 Smal_2519     FALSE 0.096 110.000 0.000 NA   NA
 7081315 7081316 Smal_2520 Smal_2521     FALSE 0.038 152.000 0.000 NA   NA
 7081316 7081317 Smal_2521 Smal_2522     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081317 7081318 Smal_2522 Smal_2523     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081318 7081319 Smal_2523 Smal_2524     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7081319 7081320 Smal_2524 Smal_2525     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7081320 7081321 Smal_2525 Smal_2526     TRUE 0.703 4.000 0.000 NA   NA
 7081321 7081322 Smal_2526 Smal_2527     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7081322 7081323 Smal_2527 Smal_2528     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7081323 7081324 Smal_2528 Smal_2529     FALSE 0.014 299.000 0.000 NA   NA
 7081324 7081325 Smal_2529 Smal_2530     TRUE 0.876 -13.000 0.000 NA   NA
 7081329 7081330 Smal_2533 Smal_2534     FALSE 0.017 232.000 0.000 NA   NA
 7081332 7081333 Smal_2536 Smal_2537     TRUE 0.701 120.000 0.333 0.005   NA
 7081334 7081335 Smal_2538 Smal_2539     TRUE 0.804 77.000 0.035 1.000 Y NA
 7081335 7081336 Smal_2539 Smal_2540     TRUE 0.896 52.000 0.121 1.000 Y NA
 7081336 7081337 Smal_2540 Smal_2541     FALSE 0.002 181.000 0.000 NA N NA
 7081338 7081339 Smal_2542 Smal_2543     FALSE 0.541 81.000 0.095 NA   NA
 7081339 7081340 Smal_2543 Smal_2544     FALSE 0.093 237.000 0.087 NA   NA
 7081341 7081342 Smal_2545 Smal_2546     TRUE 0.928 9.000 0.118 NA   NA
 7081342 7081343 Smal_2546 Smal_2547     FALSE 0.012 74.000 0.000 NA N NA
 7081343 7081344 Smal_2547 Smal_2548     TRUE 0.574 29.000 0.027 1.000 N NA
 7081345 7081346 Smal_2549 Smal_2550     TRUE 0.984 -3.000 0.192 0.031 N NA
 7081346 7081347 Smal_2550 Smal_2551     TRUE 0.992 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 7081347 7081348 Smal_2551 Smal_2552     TRUE 0.992 -3.000 0.061 1.000 Y NA
 7081348 7081349 Smal_2552 Smal_2553     FALSE 0.002 189.000 0.000 1.000 N NA
 7081349 7081350 Smal_2553 Smal_2554     FALSE 0.001 332.000 0.000 1.000 N NA
 7081350 7081351 Smal_2554 Smal_2555     FALSE 0.005 121.000 0.000 1.000 N NA
 7081352 7081353 Smal_2556 Smal_2557     FALSE 0.080 117.000 0.000 NA   NA
 7081359 7081360 Smal_2563 Smal_2564     FALSE 0.235 49.000 0.000 NA   NA
 7081362 7081363 Smal_2566 Smal_2567     FALSE 0.019 217.000 0.000 NA   NA
 7081363 7081364 Smal_2567 Smal_2568     FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 7081365 7081366 Smal_2569 Smal_2570     FALSE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 7081366 7081367 Smal_2570 Smal_2571     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 7081367 7081368 Smal_2571 Smal_2572     TRUE 0.876 -22.000 0.000 NA   NA
 7081369 7081370 Smal_2573 Smal_2574     FALSE 0.183 65.000 0.000 NA   NA
 7081370 7081371 Smal_2574 Smal_2575     FALSE 0.220 52.000 0.000 NA   NA
 7081373 7081374 Smal_2577 Smal_2578     FALSE 0.046 132.000 0.002 1.000 N NA
 7081374 7081375 Smal_2578 Smal_2579   mtnA FALSE 0.001 220.000 0.000 1.000 N NA
 7081375 7081376 Smal_2579 Smal_2580 mtnA   FALSE 0.238 48.000 0.000 NA   NA
 7081376 7081377 Smal_2580 Smal_2581     FALSE 0.157 141.000 0.026 NA   NA
 7081377 7081378 Smal_2581 Smal_2582     TRUE 0.938 -3.000 0.009 1.000   NA
 7081378 7081379 Smal_2582 Smal_2583   ligA FALSE 0.390 51.000 0.002 1.000   NA
 7081381 7081382 Smal_2585 Smal_2586     TRUE 0.814 47.000 0.115 0.007   NA
 7081382 7081383 Smal_2586 Smal_2587   rplI FALSE 0.001 263.000 0.000 1.000 N NA
 7081383 7081384 Smal_2587 Smal_2588 rplI rpsR TRUE 0.942 105.000 0.499 0.011 Y NA
 7081384 7081385 Smal_2588 Smal_2589 rpsR rpsF TRUE 0.992 12.000 0.319 0.011 Y NA
 7081385 7081386 Smal_2589 Smal_2590 rpsF   FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 7081386 7081387 Smal_2590 Smal_2591     FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 7081388 7081389 Smal_2592 Smal_2593 asnC   FALSE 0.561 34.000 0.009 NA   NA
 7081389 7081390 Smal_2593 Smal_2594     TRUE 0.987 8.000 0.833 NA   NA
 7081390 7081391 Smal_2594 Smal_2595     TRUE 0.922 10.000 0.116 NA   NA
 7081391 7081392 Smal_2595 Smal_2596     FALSE 0.287 74.000 0.022 1.000 N NA
 7081392 7081393 Smal_2596 Smal_2597     TRUE 0.773 22.000 0.027 1.000   NA
 7081393 7081394 Smal_2597 Smal_2598     FALSE 0.191 142.000 0.043 1.000   NA
 7081394 7081395 Smal_2598 Smal_2599     TRUE 0.694 32.000 0.100 1.000 N NA
 7081395 7081396 Smal_2599 Smal_2600   sbcB TRUE 0.851 0.000 0.017 1.000 N NA
 7081396 7081397 Smal_2600 Smal_2601 sbcB   TRUE 0.959 -3.000 0.034 NA   NA
 7081397 7081398 Smal_2601 Smal_2602     TRUE 0.671 56.000 0.139 NA   NA
 7081399 7081400 Smal_2603 Smal_2604   ppnK TRUE 0.590 49.000 0.036 1.000   NA
 7081400 7081401 Smal_2604 Smal_2605 ppnK   FALSE 0.047 191.000 0.022 1.000 N NA
 7081402 7081403 Smal_2606 Smal_2607     TRUE 0.984 0.000 0.571 1.000 N NA
 7081403 7081404 Smal_2607 Smal_2608     TRUE 0.973 16.000 1.000 1.000 N NA
 7081406 7081407 Smal_2610 Smal_2611     TRUE 0.675 14.000 0.017 1.000 N NA
 7081407 7081408 Smal_2611 Smal_2612     TRUE 0.884 58.000 0.009 0.001 Y NA
 7081408 7081409 Smal_2612 Smal_2613     FALSE 0.183 79.000 0.000 1.000   NA
 7081410 7081411 Smal_2614 Smal_2615     TRUE 0.854 11.000 0.024 NA   NA
 7081411 7081412 Smal_2615 Smal_2616     TRUE 0.960 -7.000 0.020 NA   NA
 7081412 7081413 Smal_2616 Smal_2617     TRUE 0.899 24.000 0.357 1.000 N NA
 7081413 7081414 Smal_2617 Smal_2618     TRUE 0.767 97.000 0.042 1.000 Y NA
 7081415 7081416 Smal_2619 Smal_2620     TRUE 0.940 3.000 0.091 NA   NA
 7081416 7081417 Smal_2620 Smal_2621     TRUE 0.981 0.000 0.500 1.000 N NA
 7081417 7081418 Smal_2621 Smal_2622     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 7081418 7081419 Smal_2622 Smal_2623     TRUE 0.891 26.000 0.250 NA   NA
 7081419 7081420 Smal_2623 Smal_2624     TRUE 0.862 31.000 0.222 NA   NA
 7081420 7081421 Smal_2624 Smal_2625     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 7081423 7081424 Smal_2627 Smal_2628     FALSE 0.045 723.000 0.029 NA   NA
 7081424 7081425 Smal_2628 Smal_2629     TRUE 0.937 10.000 0.167 NA   NA
 7081425 7081426 Smal_2629 Smal_2630   sucA FALSE 0.029 187.000 0.000 1.000   NA
 7081426 7081427 Smal_2630 Smal_2631 sucA   TRUE 0.977 40.000 0.667 1.000 Y NA
 7081427 7081428 Smal_2631 Smal_2632     TRUE 0.914 64.000 0.253 1.000 Y NA
 7081429 7081430 Smal_2633 Smal_2634     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081430 7081431 Smal_2634 Smal_2635     FALSE 0.030 169.000 0.000 NA   NA
 7081431 7081432 Smal_2635 Smal_2636     TRUE 0.970 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7081432 7081433 Smal_2636 Smal_2637     FALSE 0.002 168.000 0.000 1.000 N NA
 7081433 7081434 Smal_2637 Smal_2638     FALSE 0.048 346.000 0.024 NA   NA
 7081434 7081435 Smal_2638 Smal_2639     FALSE 0.511 67.000 0.048 NA   NA
 7081435 7081436 Smal_2639 Smal_2640     TRUE 0.846 4.000 0.028 1.000 N NA
 7081436 7081437 Smal_2640 Smal_2641     FALSE 0.012 78.000 0.000 NA N NA
 7081437 7081438 Smal_2641 Smal_2642     FALSE 0.002 174.000 0.000 NA N NA
 7081438 7081439 Smal_2642 Smal_2643     FALSE 0.067 132.000 0.000 1.000   NA
 7081440 7081441 Smal_2644 Smal_2645     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081443 7081444 Smal_2647 Smal_2648     TRUE 0.579 137.000 0.556 1.000   NA
 7081446 7081447 Smal_2650 Smal_2651     FALSE 0.226 120.000 0.021 NA   NA
 7081447 7081448 Smal_2651 Smal_2652     TRUE 0.871 0.000 0.023 1.000 N NA
 7081449 7081450 Smal_2653 Smal_2654     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 7081450 7081451 Smal_2654 Smal_2655     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7081452 7081453 Smal_2656 Smal_2657     TRUE 0.712 37.000 0.074 NA   NA
 7081453 7081454 Smal_2657 Smal_2658     FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 7081454 7081455 Smal_2658 Smal_2659     FALSE 0.304 80.000 0.028 1.000 N NA
 7081458 7081459 Smal_2662 Smal_2663     TRUE 0.855 20.000 0.105 NA   NA
 7081459 7081460 Smal_2663 Smal_2664     TRUE 0.905 38.000 0.500 NA   NA
 7081462 7081463 Smal_2666 Smal_2667     TRUE 0.927 8.000 0.091 1.000   NA
 7081466 7081467 Smal_2670 Smal_2671     TRUE 0.930 0.000 0.031 NA   NA
 7081468 7081469 Smal_2672 Smal_2673     TRUE 0.864 11.000 0.030 NA   NA
 7081470 7081471 Smal_2674 Smal_2675 phhB   TRUE 0.957 -3.000 0.025 1.000   NA
 7081471 7081472 Smal_2675 Smal_2676     FALSE 0.434 98.000 0.050 1.000   NA
 7081475 7081476 Smal_2679 Smal_2680     TRUE 0.719 3.000 0.000 NA   NA
 7081476 7081477 Smal_2680 Smal_2681     TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000   NA
 7081477 7081478 Smal_2681 Smal_2682     TRUE 0.997 -3.000 0.160 0.038 Y NA
 7081478 7081479 Smal_2682 Smal_2683     TRUE 0.999 -3.000 0.660 0.038 Y NA
 7081479 7081480 Smal_2683 Smal_2684     TRUE 0.948 5.000 0.156 NA   NA
 7081480 7081481 Smal_2684 Smal_2685     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 7081481 7081482 Smal_2685 Smal_2686     FALSE 0.012 78.000 0.000 1.000 N NA
 7081482 7081483 Smal_2686 Smal_2687     FALSE 0.002 164.000 0.000 NA N NA
 7081483 7081484 Smal_2687 Smal_2688     TRUE 0.973 -3.000 0.103 NA   NA
 7081485 7081486 Smal_2689 Smal_2690     TRUE 0.876 14.000 0.083 NA   NA
 7081486 7081487 Smal_2690 Smal_2691     TRUE 0.979 -7.000 0.210 NA N NA
 7081492 7081493 Smal_2696 Smal_2697     FALSE 0.330 102.000 0.022 NA   NA
 7081493 7081494 Smal_2697 Smal_2698     TRUE 0.891 14.000 0.099 1.000   NA
 7081495 7081496 Smal_2699 Smal_2700     TRUE 0.996 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 7081496 7081497 Smal_2700 Smal_2701     TRUE 0.938 44.000 0.051 0.001 Y NA
 7081497 7081498 Smal_2701 Smal_2702     TRUE 0.949 -3.000 0.015 1.000   NA
 7081498 7081499 Smal_2702 Smal_2703     TRUE 0.949 -3.000 0.016 1.000   NA
 7081499 7081500 Smal_2703 Smal_2704     TRUE 0.989 1.000 0.016 0.002 Y NA
 7081500 7081501 Smal_2704 Smal_2705     TRUE 0.998 9.000 1.000 0.002 Y NA
 7081501 7081502 Smal_2705 Smal_2706     TRUE 0.997 5.000 1.000 NA Y NA
 7081502 7081503 Smal_2706 Smal_2707     TRUE 0.999 -3.000 1.000 NA Y NA
 7081503 7081504 Smal_2707 Smal_2708   metX FALSE 0.084 163.000 0.039 1.000 N NA
 7081504 7081505 Smal_2708 Smal_2709 metX   FALSE 0.423 55.000 0.011 NA   NA
 7081506 7081507 Smal_2710 Smal_2711     TRUE 0.999 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 7081508 7081509 Smal_2712 Smal_2713     TRUE 0.996 16.000 0.953 0.035 Y NA
 7081509 7081510 Smal_2713 Smal_2714     TRUE 0.766 55.000 0.256 NA   NA
 7081510 7081511 Smal_2714 Smal_R0062     FALSE 0.208 56.000 0.000 NA   NA
 7081511 7081512 Smal_R0062 Smal_R0063     FALSE 0.046 141.000 0.000 NA   NA
 7081512 7081513 Smal_R0063 Smal_2715     FALSE 0.021 203.000 0.000 NA   NA
 7081513 7081514 Smal_2715 Smal_2716     FALSE 0.013 343.000 0.000 NA   NA
 7081514 7081515 Smal_2716 Smal_2717     TRUE 0.989 2.000 0.696 1.000   NA
 7081515 7081516 Smal_2717 Smal_2718     TRUE 0.876 2.000 0.043 NA N NA
 7081516 7081517 Smal_2718 Smal_2719     TRUE 0.969 -3.000 0.077 NA   NA
 7081518 7081519 Smal_2720 Smal_2721     TRUE 0.994 -3.000 0.007 0.001 Y NA
 7081519 7081520 Smal_2721 Smal_2722     TRUE 0.905 11.000 0.091 NA   NA
 7081520 7081521 Smal_2722 Smal_2723     TRUE 0.873 0.000 0.004 NA   NA
 7081521 7081522 Smal_2723 Smal_2724   argC TRUE 0.940 21.000 0.020 1.000 Y NA
 7081522 7081523 Smal_2724 Smal_2725 argC   TRUE 0.848 -3.000 0.008 NA N NA
 7081523 7081524 Smal_2725 Smal_2726     TRUE 0.663 5.000 0.006 NA N NA
 7081524 7081525 Smal_2726 Smal_2727     TRUE 0.751 76.000 0.009 1.000 Y NA
 7081525 7081526 Smal_2727 Smal_2728     FALSE 0.452 133.000 0.004 1.000 Y NA
 7081526 7081527 Smal_2728 Smal_2729     TRUE 0.756 69.000 0.007 1.000 Y NA
 7081527 7081528 Smal_2729 Smal_2730     FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 7081529 7081530 Smal_2731 Smal_2732 cysS   FALSE 0.378 55.000 0.006 NA   NA
 7081530 7081531 Smal_2732 Smal_2733     TRUE 0.959 -3.000 0.034 NA   NA
 7081533 7081534 Smal_2735 Smal_2736     TRUE 0.879 2.000 0.010 NA   NA
 7081534 7081535 Smal_2736 Smal_2737     TRUE 0.870 0.000 0.023 1.000 N NA
 7081536 7081537 Smal_2738 Smal_2739     TRUE 0.835 12.000 0.022 NA   NA
 7081537 7081538 Smal_2739 Smal_2740     TRUE 0.986 -3.000 0.259 1.000   NA
 7081538 7081539 Smal_2740 Smal_2741     TRUE 0.761 24.000 0.104 1.000 N NA
 7081539 7081540 Smal_2741 Smal_2742     FALSE 0.027 159.000 0.002 1.000 N NA
 7081542 7081543 Smal_2744 Smal_2745     TRUE 0.972 -3.000 0.200 NA N NA
 7081543 7081544 Smal_2745 Smal_2746     FALSE 0.156 77.000 0.007 NA N NA
 7081547 7081548 Smal_2749 Smal_2750     TRUE 0.865 18.000 0.014 0.030   NA
 7081548 7081549 Smal_2750 Smal_2751     FALSE 0.096 185.000 0.031 NA   NA
 7081550 7081551 Smal_2752 Smal_2753     TRUE 0.987 2.000 0.625 NA   NA
 7081551 7081552 Smal_2753 Smal_2754   mutL TRUE 0.772 12.000 0.007 NA   NA
 7081552 7081553 Smal_2754 Smal_2755 mutL   FALSE 0.071 145.000 0.016 1.000 N NA
 7081553 7081554 Smal_2755 Smal_2756     FALSE 0.354 83.000 0.014 NA   NA
 7081554 7081555 Smal_2756 Smal_2757     TRUE 0.975 -3.000 0.118 NA   NA
 7081556 7081557 Smal_2758 Smal_2759   xseA FALSE 0.227 45.000 0.004 1.000 N NA
 7081558 7081559 Smal_2760 Smal_2761     FALSE 0.296 89.000 0.008 NA   NA
 7081560 7081561 Smal_2762 Smal_2763     FALSE 0.120 102.000 0.000 NA   NA
 7081562 7081563 Smal_2764 Smal_2765     FALSE 0.043 154.000 0.000 1.000   NA
 7081564 7081565 Smal_2766 Smal_2767     TRUE 0.967 21.000 0.750 NA   NA
 7081565 7081566 Smal_2767 Smal_2768     TRUE 0.993 -10.000 0.444 1.000   NA
 7081566 7081567 Smal_2768 Smal_R0064     FALSE 0.141 90.000 0.000 NA   NA
 7081573 7081574 Smal_R0065 Smal_R0066     FALSE 0.165 74.000 0.000 NA   NA
 7081574 7081575 Smal_R0066 Smal_2774     FALSE 0.123 100.000 0.000 NA   NA
 7081575 7081576 Smal_2774 Smal_2775     FALSE 0.132 96.000 0.000 NA   NA
 7081576 7081577 Smal_2775 Smal_2776     FALSE 0.445 163.000 0.500 1.000   NA
 7081577 7081578 Smal_2776 Smal_2777     TRUE 0.795 61.000 0.333 1.000   NA
 7081578 7081579 Smal_2777 Smal_2778     FALSE 0.001 398.000 0.000 1.000 N NA
 7081579 7081580 Smal_2778 Smal_2779     FALSE 0.132 103.000 0.007 1.000 N NA
 7081581 7081582 Smal_2780 Smal_2781     FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 7081582 7081583 Smal_2781 Smal_2782     FALSE 0.055 134.000 0.000 NA   NA
 7081584 7081585 Smal_2783 Smal_2784     FALSE 0.188 63.000 0.000 NA   NA
 7081585 7081586 Smal_2784 Smal_2785     FALSE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 7081586 7081587 Smal_2785 Smal_2786     FALSE 0.147 86.000 0.000 NA   NA
 7081587 7081588 Smal_2786 Smal_2787     TRUE 0.586 14.000 0.000 1.000   NA
 7081589 7081590 Smal_2788 Smal_2789     FALSE 0.134 95.000 0.000 NA   NA
 7081590 7081591 Smal_2789 Smal_2790   clpP FALSE 0.009 99.000 0.000 1.000 N NA
 7081591 7081592 Smal_2790 Smal_2791 clpP   TRUE 0.627 38.000 0.028 NA   NA
 7081592 7081593 Smal_2791 Smal_2792     TRUE 0.991 0.000 0.727 NA   NA
 7081596 7081597 Smal_2795 Smal_2796     FALSE 0.145 87.000 0.000 NA   NA
 7081597 7081598 Smal_2796 Smal_2797     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081599 7081600 Smal_R0067 Smal_2798     FALSE 0.173 69.000 0.000 NA   NA
 7081600 7081601 Smal_2798 Smal_2799   ihfA TRUE 0.992 -19.000 0.535 1.000 N NA
 7081601 7081602 Smal_2799 Smal_2800 ihfA pheT TRUE 0.820 28.000 0.208 1.000 N NA
 7081602 7081603 Smal_2800 Smal_2801 pheT   TRUE 0.977 57.000 0.574 0.001 Y NA
 7081603 7081604 Smal_2801 Smal_2802   rplT FALSE 0.492 193.000 0.202 1.000 Y NA
 7081604 7081605 Smal_2802 Smal_2803 rplT rpmI TRUE 0.997 12.000 0.928 0.011 Y NA
 7081605 7081606 Smal_2803 Smal_2804 rpmI infC TRUE 0.602 285.000 0.652 1.000 Y NA
 7081606 7081607 Smal_2804 Smal_2805 infC   TRUE 0.919 50.000 0.186 1.000 Y NA
 7081608 7081609 Smal_2806 Smal_2807     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7081609 7081610 Smal_2807 Smal_2808     TRUE 0.909 11.000 0.100 NA   NA
 7081613 7081614 Smal_2811 Smal_2812   rpsO TRUE 0.704 152.000 0.335 1.000 Y NA
 7081614 7081615 Smal_2812 Smal_2813 rpsO truB FALSE 0.544 174.000 0.211 1.000 Y NA
 7081615 7081616 Smal_2813 Smal_2814 truB rbfA TRUE 0.855 110.000 0.318 1.000 Y NA
 7081616 7081617 Smal_2814 Smal_2815 rbfA infB TRUE 0.747 162.000 0.530 1.000 Y NA
 7081617 7081618 Smal_2815 Smal_2816 infB nusA TRUE 0.647 93.000 0.342 1.000 N NA
 7081618 7081619 Smal_2816 Smal_2817 nusA   TRUE 0.987 5.000 0.759 NA   NA
 7081619 7081620 Smal_2817 Smal_R0068     FALSE 0.013 402.000 0.000 NA   NA
 7081620 7081621 Smal_R0068 Smal_R0069     FALSE 0.155 83.000 0.000 NA   NA
 7081621 7081622 Smal_R0069 Smal_2818     FALSE 0.062 128.000 0.000 NA   NA
 7081622 7081623 Smal_2818 Smal_2819     TRUE 0.991 16.000 0.340 0.002 Y NA
 7081623 7081624 Smal_2819 Smal_2820     TRUE 0.980 24.000 0.175 0.002 Y NA
 7081624 7081625 Smal_2820 Smal_2821     TRUE 0.996 8.000 0.451 0.005 Y NA
 7081625 7081626 Smal_2821 Smal_2822     TRUE 0.999 -3.000 0.484 0.002 Y NA
 7081626 7081627 Smal_2822 Smal_2823     TRUE 0.995 10.000 0.442 0.005 Y NA
 7081627 7081628 Smal_2823 Smal_2824     TRUE 0.997 4.000 0.500 0.005 Y NA
 7081628 7081629 Smal_2824 Smal_2825     TRUE 0.999 -3.000 0.515 0.005 Y NA
 7081629 7081630 Smal_2825 Smal_2826     TRUE 0.998 -3.000 0.395 0.005 Y NA
 7081630 7081631 Smal_2826 Smal_2827     TRUE 0.995 5.000 0.343 0.005 Y NA
 7081631 7081632 Smal_2827 Smal_2828     TRUE 0.938 98.000 0.355 0.005 Y NA
 7081632 7081633 Smal_2828 Smal_2829     TRUE 0.999 -3.000 0.483 0.005 Y NA
 7081633 7081634 Smal_2829 Smal_2830     TRUE 0.980 34.000 0.328 0.002 Y NA
 7081634 7081635 Smal_2830 Smal_2831     TRUE 0.999 -9.000 0.507 0.002 Y NA
 7081635 7081636 Smal_2831 Smal_R0070     FALSE 0.185 64.000 0.000 NA   NA
 7081636 7081637 Smal_R0070 Smal_2832   secG FALSE 0.220 52.000 0.000 NA   NA
 7081637 7081638 Smal_2832 Smal_2833 secG tpiA TRUE 0.776 32.000 0.184 1.000 N NA
 7081638 7081639 Smal_2833 Smal_2834 tpiA   FALSE 0.013 879.000 0.000 1.000   NA
 7081640 7081641 Smal_2835 Smal_2836     FALSE 0.524 19.000 0.000 1.000   NA
 7081641 7081642 Smal_2836 Smal_2837     TRUE 0.981 -7.000 0.222 1.000 N NA
 7081642 7081643 Smal_2837 Smal_2838     FALSE 0.013 69.000 0.000 1.000 N NA
 7081644 7081645 Smal_2839 Smal_2840     TRUE 0.792 0.000 0.008 1.000 N NA
 7081645 7081646 Smal_2840 Smal_2841   trpA FALSE 0.129 220.000 0.232 1.000 N NA
 7081646 7081647 Smal_2841 Smal_2842 trpA   TRUE 0.870 2.000 0.008 NA   NA
 7081647 7081648 Smal_2842 Smal_2843     TRUE 0.923 -3.000 0.005 NA   NA
 7081650 7081651 Smal_2845 Smal_2846     FALSE 0.525 44.000 0.016 NA   NA
 7081651 7081652 Smal_2846 Smal_2847     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081652 7081653 Smal_2847 Smal_2848     TRUE 0.849 86.000 0.711 NA   NA
 7081653 7081654 Smal_2848 Smal_2849     TRUE 0.994 -3.000 0.644 NA   NA
 7081654 7081655 Smal_2849 Smal_2850     FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 7081655 7081656 Smal_2850 Smal_2851   truA TRUE 0.966 -3.000 0.139 1.000 N NA
 7081656 7081657 Smal_2851 Smal_2852 truA   FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7081657 7081658 Smal_2852 Smal_2853     FALSE 0.397 27.000 0.000 NA   NA
 7081658 7081659 Smal_2853 Smal_2854     FALSE 0.028 173.000 0.008 NA N NA
 7081659 7081660 Smal_2854 Smal_2855     FALSE 0.374 93.000 0.008 0.006 N NA
 7081660 7081661 Smal_2855 Smal_2856     TRUE 0.864 -7.000 0.005 1.000 N NA
 7081661 7081662 Smal_2856 Smal_2857     TRUE 0.953 -3.000 0.081 1.000 N NA
 7081663 7081664 Smal_2858 Smal_2859   psd TRUE 0.966 -3.000 0.051 1.000   NA
 7081665 7081666 Smal_2860 Smal_2861     FALSE 0.414 25.000 0.000 NA   NA
 7081667 7081668 Smal_2862 Smal_2863   greB FALSE 0.341 90.000 0.000 0.044   NA
 7081669 7081670 Smal_2864 Smal_2865     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081671 7081672 Smal_2866 Smal_2867     TRUE 0.906 -3.000 0.017 1.000 N NA
 7081672 7081673 Smal_2867 Smal_2868     TRUE 0.788 15.000 0.017 NA   NA
 7081674 7081675 Smal_2869 Smal_2870 dcd   FALSE 0.463 79.000 0.112 1.000 N NA
 7081676 7081677 Smal_2871 Smal_2872     FALSE 0.042 394.000 0.000 0.021   NA
 7081677 7081678 Smal_2872 Smal_2873     FALSE 0.508 97.000 0.100 1.000   NA
 7081678 7081679 Smal_2873 Smal_2874     FALSE 0.254 69.000 0.000 0.028 N NA
 7081679 7081680 Smal_2874 Smal_2875     TRUE 0.690 204.000 0.333 0.001 Y NA
 7081682 7081683 Smal_2877 Smal_2878     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7081684 7081685 Smal_2879 Smal_2880     FALSE 0.443 94.000 0.046 1.000   NA
 7081685 7081686 Smal_2880 Smal_2881     FALSE 0.338 33.000 0.000 NA   NA
 7081688 7081689 Smal_2883 Smal_2884     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081689 7081690 Smal_2884 Smal_2885     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7081690 7081691 Smal_2885 Smal_2886     FALSE 0.470 100.000 0.098 NA   NA
 7081692 7081693 Smal_2887 Smal_2888     TRUE 0.765 200.000 1.000 NA Y NA
 7081695 7081696 Smal_2890 Smal_2891     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7081696 7081697 Smal_2891 Smal_2892     FALSE 0.013 391.000 0.000 NA   NA
 7081697 7081698 Smal_2892 Smal_2893     FALSE 0.310 37.000 0.006 1.000 N NA
 7081698 7081699 Smal_2893 Smal_2894     TRUE 0.978 -10.000 0.177 1.000 N NA
 7081700 7081701 Smal_2895 Smal_2896     FALSE 0.294 88.000 0.008 NA   NA
 7081703 7081704 Smal_2898 Smal_2899     FALSE 0.543 60.000 0.050 NA   NA
 7081704 7081705 Smal_2899 Smal_2900     TRUE 0.885 31.000 0.296 NA   NA
 7081705 7081706 Smal_2900 Smal_2901     TRUE 0.989 -7.000 0.417 NA N NA
 7081707 7081708 Smal_2902 Smal_2903     FALSE 0.019 218.000 0.000 NA   NA
 7081708 7081709 Smal_2903 Smal_2904     FALSE 0.001 201.000 0.000 1.000 N NA
 7081709 7081710 Smal_2904 Smal_2905     FALSE 0.003 139.000 0.000 1.000 N NA
 7081711 7081712 Smal_2906 Smal_R0071     FALSE 0.138 92.000 0.000 NA   NA
 7081712 7081713 Smal_R0071 Smal_2907     FALSE 0.436 23.000 0.000 NA   NA
 7081713 7081714 Smal_2907 Smal_2908     TRUE 0.759 65.000 0.307 NA   NA
 7081714 7081715 Smal_2908 Smal_2909   nadD FALSE 0.536 59.000 0.044 NA   NA
 7081715 7081716 Smal_2909 Smal_2910 nadD holA TRUE 0.695 5.000 0.006 1.000 N NA
 7081716 7081717 Smal_2910 Smal_2911 holA   TRUE 0.916 10.000 0.199 NA N NA
 7081717 7081718 Smal_2911 Smal_2912   leuS FALSE 0.241 137.000 0.182 NA N NA
 7081718 7081719 Smal_2912 Smal_2913 leuS   FALSE 0.211 106.000 0.005 NA   NA
 7081720 7081721 Smal_2914 Smal_2915     FALSE 0.118 108.000 0.000 1.000   NA
 7081721 7081722 Smal_2915 Smal_2916     TRUE 0.962 -3.000 0.034 1.000   NA
 7081722 7081723 Smal_2916 Smal_2917     FALSE 0.164 75.000 0.000 NA   NA
 7081723 7081724 Smal_2917 Smal_2918     FALSE 0.238 48.000 0.000 NA   NA
 7081726 7081727 Smal_2920 Smal_2921     TRUE 0.949 -3.000 0.020 NA   NA
 7081727 7081728 Smal_2921 Smal_2922     FALSE 0.389 96.000 0.032 NA   NA
 7081728 7081729 Smal_2922 Smal_2923     FALSE 0.545 14.000 0.000 NA   NA
 7081729 7081730 Smal_2923 Smal_2924     FALSE 0.253 -3.000 0.000 NA N NA
 7081730 7081731 Smal_2924 Smal_2925     FALSE 0.033 402.000 0.010 NA   NA
 7081731 7081732 Smal_2925 Smal_2926   metG FALSE 0.306 104.000 0.019 NA   NA
 7081732 7081733 Smal_2926 Smal_2927 metG   FALSE 0.374 79.000 0.055 1.000 N NA
 7081733 7081734 Smal_2927 Smal_2928     FALSE 0.517 26.000 0.014 1.000 N NA
 7081737 7081738 Smal_2931 Smal_2932     FALSE 0.110 106.000 0.000 NA   NA
 7081738 7081739 Smal_2932 Smal_2933     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081739 7081740 Smal_2933 Smal_2934     TRUE 0.708 35.000 0.056 NA   NA
 7081743 7081744 Smal_2937 Smal_2938     FALSE 0.076 120.000 0.000 NA   NA
 7081744 7081745 Smal_2938 Smal_2939     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7081746 7081747 Smal_2940 Smal_2941     FALSE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 7081747 7081748 Smal_2941 Smal_2942     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7081749 7081750 Smal_2943 Smal_2944     FALSE 0.314 36.000 0.000 NA   NA
 7081751 7081752 Smal_2945 Smal_2946     TRUE 0.985 -3.000 0.111 0.044   NA
 7081752 7081753 Smal_2946 Smal_2947     FALSE 0.033 172.000 0.000 1.000   NA
 7081753 7081754 Smal_2947 Smal_2948     FALSE 0.034 161.000 0.000 NA   NA
 7081755 7081756 Smal_2949 Smal_2950     FALSE 0.238 48.000 0.000 NA   NA
 7081756 7081757 Smal_2950 Smal_2951     FALSE 0.003 149.000 0.000 1.000 N NA
 7081761 7081762 Smal_2955 Smal_2956     FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 7081762 7081763 Smal_2956 Smal_2957     FALSE 0.035 158.000 0.000 NA   NA
 7081765 7081766 Smal_2959 Smal_2960     TRUE 0.993 -3.000 0.751 NA N NA
 7081766 7081767 Smal_2960 Smal_2961     TRUE 0.989 -3.000 0.214 0.077   NA
 7081767 7081768 Smal_2961 Smal_2962     TRUE 0.993 -10.000 0.460 1.000   NA
 7081769 7081770 Smal_2963 Smal_2964     FALSE 0.026 183.000 0.000 NA   NA
 7081770 7081771 Smal_2964 Smal_2965     FALSE 0.369 103.000 0.107 1.000 N NA
 7081771 7081772 Smal_2965 Smal_2966     FALSE 0.200 89.000 0.013 1.000 N NA
 7081772 7081773 Smal_2966 Smal_2967     TRUE 0.891 83.000 0.067 0.002 Y NA
 7081773 7081774 Smal_2967 Smal_2968     TRUE 0.892 0.000 0.034 1.000 N NA
 7081774 7081775 Smal_2968 Smal_2969     FALSE 0.034 164.000 0.006 1.000 N NA
 7081775 7081776 Smal_2969 Smal_2970     FALSE 0.264 114.000 0.021 1.000   NA
 7081776 7081777 Smal_2970 Smal_2971   rumA TRUE 0.819 10.000 0.007 1.000   NA
 7081779 7081780 Smal_2973 Smal_2974 recO era TRUE 0.743 19.000 0.012 1.000   NA
 7081780 7081781 Smal_2974 Smal_2975 era rnc TRUE 0.973 -3.000 0.017 0.039   NA
 7081781 7081782 Smal_2975 Smal_2976 rnc   TRUE 0.875 -10.000 0.000 NA   NA
 7081782 7081783 Smal_2976 Smal_2977     FALSE 0.216 53.000 0.000 NA   NA
 7081783 7081784 Smal_2977 Smal_2978     TRUE 0.637 55.000 0.187 1.000 N NA
 7081784 7081785 Smal_2978 Smal_2979     FALSE 0.034 166.000 0.007 1.000 N NA
 7081785 7081786 Smal_2979 Smal_2980     FALSE 0.315 75.000 0.035 NA N NA
 7081786 7081787 Smal_2980 Smal_2981     TRUE 0.992 -3.000 0.705 NA N NA
 7081788 7081789 Smal_2982 Smal_2983     FALSE 0.011 757.000 0.000 NA   NA
 7081789 7081790 Smal_2983 Smal_2984     FALSE 0.071 122.000 0.000 NA   NA
 7081790 7081791 Smal_2984 Smal_2985     FALSE 0.022 197.000 0.000 NA   NA
 7081793 7081794 Smal_2987 Smal_2988     TRUE 0.964 0.000 0.156 NA   NA
 7081797 7081798 Smal_2991 Smal_2992     TRUE 0.999 -13.000 0.833 1.000 Y NA
 7081799 7081800 Smal_2993 Smal_2994     FALSE 0.342 112.000 0.061 NA   NA
 7081800 7081801 Smal_2994 Smal_2995     TRUE 0.979 -3.000 0.152 1.000   NA
 7081801 7081802 Smal_2995 Smal_2996     FALSE 0.058 600.000 0.049 1.000   NA
 7081803 7081804 Smal_2997 Smal_2998     FALSE 0.170 70.000 0.000 NA   NA
 7081804 7081805 Smal_2998 Smal_2999     FALSE 0.003 143.000 0.000 NA N NA
 7081807 7081808 Smal_3001 Smal_3002     FALSE 0.106 107.000 0.000 NA   NA
 7081808 7081809 Smal_3002 Smal_3003     FALSE 0.011 83.000 0.000 1.000 N NA
 7081814 7081815 Smal_3008 Smal_3009     TRUE 0.876 -13.000 0.000 NA   NA
 7081815 7081816 Smal_3009 Smal_3010     FALSE 0.141 90.000 0.000 NA   NA
 7081816 7081817 Smal_3010 Smal_3011     TRUE 0.949 5.000 0.146 1.000   NA
 7081818 7081819 Smal_3012 Smal_3013     FALSE 0.079 118.000 0.000 NA   NA
 7081819 7081820 Smal_3013 Smal_3014     FALSE 0.056 544.000 0.051 NA   NA
 7081820 7081821 Smal_3014 Smal_3015     TRUE 0.777 68.000 0.348 NA   NA
 7081821 7081822 Smal_3015 Smal_3016     TRUE 0.999 -3.000 0.947 0.007 Y NA
 7081823 7081824 Smal_3017 Smal_3018     FALSE 0.475 89.000 0.150 1.000 N NA
 7081826 7081827 Smal_3020 Smal_3021     TRUE 0.711 30.000 0.016 0.025 N NA
 7081828 7081829 Smal_3022 Smal_3023     TRUE 0.884 65.000 0.711 1.000   NA
 7081829 7081830 Smal_3023 Smal_3024   prpD FALSE 0.024 205.000 0.000 1.000   NA
 7081830 7081831 Smal_3024 Smal_3025 prpD   FALSE 0.164 153.000 0.053 NA   NA
 7081831 7081832 Smal_3025 Smal_3026     TRUE 0.704 24.000 0.017 NA   NA
 7081832 7081833 Smal_3026 Smal_3027     TRUE 0.986 -13.000 0.207 NA   NA
 7081833 7081834 Smal_3027 Smal_3028     FALSE 0.140 101.000 0.000 1.000   NA
 7081834 7081835 Smal_3028 Smal_3029     TRUE 0.881 98.000 0.289 1.000 Y NA
 7081835 7081836 Smal_3029 Smal_3030   prpB TRUE 0.882 37.000 0.502 1.000 N NA
 7081838 7081839 Smal_3032 Smal_3033     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 7081842 7081843 Smal_3036 Smal_3037 aroK aroB TRUE 0.996 -3.000 0.208 1.000 Y NA
 7081843 7081844 Smal_3037 Smal_3038 aroB   FALSE 0.129 123.000 0.002 NA   NA
 7081844 7081845 Smal_3038 Smal_3039   hemE TRUE 0.602 27.000 0.006 NA   NA
 7081845 7081846 Smal_3039 Smal_3040 hemE   FALSE 0.010 93.000 0.000 1.000 N NA
 7081847 7081848 Smal_3041 Smal_3042     TRUE 0.721 98.000 0.000 0.014 Y NA
 7081849 7081850 Smal_3043 Smal_3044     TRUE 0.945 11.000 0.222 NA   NA
 7081850 7081851 Smal_3044 Smal_3045     TRUE 0.932 4.000 0.080 NA   NA
 7081853 7081854 Smal_3047 Smal_3048     FALSE 0.024 204.000 0.000 1.000   NA
 7081855 7081856 Smal_3049 Smal_3050     TRUE 0.992 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 7081856 7081857 Smal_3050 Smal_3051     TRUE 0.993 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 7081858 7081859 Smal_3052 Smal_3053   prfC FALSE 0.334 67.000 0.006 NA   NA
 7081859 7081860 Smal_3053 Smal_3054 prfC   FALSE 0.073 173.000 0.008 1.000   NA
 7081860 7081861 Smal_3054 Smal_3055     FALSE 0.421 80.000 0.025 NA   NA
 7081862 7081863 Smal_3056 Smal_3057     TRUE 0.981 -40.000 0.128 NA   NA
 7081863 7081864 Smal_3057 Smal_3058   mtgA FALSE 0.426 57.000 0.013 NA   NA
 7081865 7081866 Smal_3059 Smal_3060     FALSE 0.189 117.000 0.010 NA   NA
 7081867 7081868 Smal_3061 Smal_3062     FALSE 0.020 231.000 0.000 1.000   NA
 7081869 7081870 Smal_3063 Smal_3064   fadE TRUE 0.991 -3.000 0.045 NA Y NA
 7081870 7081871 Smal_3064 Smal_3065 fadE   FALSE 0.265 77.000 0.022 NA N NA
 7081872 7081873 Smal_3066 Smal_3067     FALSE 0.386 79.000 0.017 NA   NA
 7081877 7081878 Smal_3071 Smal_3072     FALSE 0.011 776.000 0.000 NA   NA
 11490791 7081876   Smal_3070     FALSE NA 143.000 0.000 NA   NA
 11633154 7081876   Smal_3070     FALSE NA 143.000 0.000 NA   NA
 11775546 7081876   Smal_3070     FALSE NA 143.000 0.000 NA   NA
 11490792 7081876   Smal_3070     FALSE NA 162.000 0.000 NA   NA
 11633155 7081876   Smal_3070     FALSE NA 162.000 0.000 NA   NA
 11775547 7081876   Smal_3070     FALSE NA 162.000 0.000 NA   NA
 11490793 7081876   Smal_3070     FALSE NA 206.000 0.000 NA   NA
 11633156 7081876   Smal_3070     FALSE NA 206.000 0.000 NA   NA
 11775548 7081876   Smal_3070     FALSE NA 206.000 0.000 NA   NA
 11490794 7081876   Smal_3070     FALSE NA 225.000 0.000 NA   NA
 11633157 7081876   Smal_3070     FALSE NA 225.000 0.000 NA   NA
 11775549 7081876   Smal_3070     FALSE NA 225.000 0.000 NA   NA
 11490795 7081876   Smal_3070     FALSE NA 278.000 0.000 NA   NA
 11633158 7081876   Smal_3070     FALSE NA 278.000 0.000 NA   NA
 11775550 7081876   Smal_3070     FALSE NA 278.000 0.000 NA   NA
 11490796 7081876   Smal_3070     FALSE NA 297.000 0.000 NA   NA
 11633159 7081876   Smal_3070     FALSE NA 297.000 0.000 NA   NA
 11775551 7081876   Smal_3070     FALSE NA 297.000 0.000 NA   NA
 11490797 7081876   Smal_3070     FALSE NA 353.000 0.000 NA   NA
 11633160 7081876   Smal_3070     FALSE NA 353.000 0.000 NA   NA
 11775552 7081876   Smal_3070     FALSE NA 353.000 0.000 NA   NA
 11490798 7081876   Smal_3070     FALSE NA 372.000 0.000 NA   NA
 11633161 7081876   Smal_3070     FALSE NA 372.000 0.000 NA   NA
 11775553 7081876   Smal_3070     FALSE NA 372.000 0.000 NA   NA
 11490799 7081876   Smal_3070     FALSE NA 428.000 0.000 NA   NA
 11633162 7081876   Smal_3070     FALSE NA 428.000 0.000 NA   NA
 11775554 7081876   Smal_3070     FALSE NA 428.000 0.000 NA   NA
 11490800 7081876   Smal_3070     FALSE NA 447.000 0.000 NA   NA
 11633163 7081876   Smal_3070     FALSE NA 447.000 0.000 NA   NA
 11775555 7081876   Smal_3070     FALSE NA 447.000 0.000 NA   NA
 11490801 7081876   Smal_3070     FALSE NA 479.000 0.000 NA   NA
 11633164 7081876   Smal_3070     FALSE NA 479.000 0.000 NA   NA
 11775556 7081876   Smal_3070     FALSE NA 479.000 0.000 NA   NA
 11490802 7081876   Smal_3070     FALSE NA 498.000 0.000 NA   NA
 11633165 7081876   Smal_3070     FALSE NA 498.000 0.000 NA   NA
 11775557 7081876   Smal_3070     FALSE NA 498.000 0.000 NA   NA
 11490803 7081876   Smal_3070     FALSE NA 518.000 0.000 NA   NA
 11633166 7081876   Smal_3070     FALSE NA 518.000 0.000 NA   NA
 11775558 7081876   Smal_3070     FALSE NA 518.000 0.000 NA   NA
 11490804 7081876   Smal_3070     FALSE NA 537.000 0.000 NA   NA
 11633167 7081876   Smal_3070     FALSE NA 537.000 0.000 NA   NA
 11775559 7081876   Smal_3070     FALSE NA 537.000 0.000 NA   NA
 11490805 7081876   Smal_3070     FALSE NA 557.000 0.000 NA   NA
 11633168 7081876   Smal_3070     FALSE NA 557.000 0.000 NA   NA
 11775560 7081876   Smal_3070     FALSE NA 557.000 0.000 NA   NA
 7081878 7081879 Smal_3072 Smal_3073   gcvT TRUE 0.940 94.000 0.317 0.001 Y NA
 7081879 7081880 Smal_3073 Smal_3074 gcvT   FALSE 0.042 145.000 0.008 NA N NA
 7081880 7081881 Smal_3074 Smal_3075     TRUE 0.993 2.000 0.313 NA Y NA
 7081881 7081882 Smal_3075 Smal_3076     FALSE 0.179 67.000 0.000 NA   NA
 7081882 7081883 Smal_3076 Smal_3077     FALSE 0.047 140.000 0.000 NA   NA
 7081883 7081884 Smal_3077 Smal_3078   mazG TRUE 0.924 -3.000 0.006 NA   NA
 7081884 7081885 Smal_3078 Smal_3079 mazG   TRUE 0.760 14.000 0.007 1.000   NA
 7081885 7081886 Smal_3079 Smal_3080   nudE TRUE 0.985 -3.000 0.373 1.000 N NA
 7081887 7081888 Smal_3081 Smal_3082     TRUE 0.969 -9.000 0.041 NA   NA
 7081889 7081890 Smal_3083 Smal_3084     TRUE 0.984 -3.000 0.071 0.008   NA
 7081890 7081891 Smal_3084 Smal_3085     TRUE 0.987 -13.000 0.054 0.008   NA
 7081891 7081892 Smal_3085 Smal_3086     TRUE 0.952 101.000 0.554 0.008 Y NA
 7081892 7081893 Smal_3086 Smal_3087     TRUE 0.987 42.000 0.795 0.008 Y NA
 7081893 7081894 Smal_3087 Smal_3088     TRUE 0.988 0.000 0.076 1.000 Y NA
 7081894 7081895 Smal_3088 Smal_3089     TRUE 0.975 19.000 0.085 0.023 Y NA
 7081896 7081897 Smal_3090 Smal_3091     TRUE 0.927 0.000 0.089 1.000 N NA
 7081898 7081899 Smal_3092 Smal_3093     TRUE 0.865 10.000 0.082 1.000 N NA
 7081899 7081900 Smal_3093 Smal_3094     FALSE 0.020 228.000 0.000 1.000   NA
 7081900 7081901 Smal_3094 Smal_3095     TRUE 0.791 0.000 0.000 1.000   NA
 7081901 7081902 Smal_3095 Smal_3096     FALSE 0.150 85.000 0.000 NA   NA
 7081902 7081903 Smal_3096 Smal_3097     FALSE 0.511 73.000 0.062 NA   NA
 7081903 7081904 Smal_3097 Smal_3098     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7081904 7081905 Smal_3098 Smal_3099     TRUE 0.750 31.000 0.065 NA   NA
 7081908 7081909 Smal_3102 Smal_3103     FALSE 0.012 564.000 0.005 1.000 N NA
 7081909 7081910 Smal_3103 Smal_3104     FALSE 0.023 193.000 0.000 NA   NA
 7081910 7081911 Smal_3104 Smal_3105     FALSE 0.163 76.000 0.000 NA   NA
 7081911 7081912 Smal_3105 Smal_3106     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.003 N NA
 7081912 7081913 Smal_3106 Smal_3107     FALSE 0.174 84.000 0.000 1.000   NA
 7081915 7081916 Smal_3109 Smal_3110     FALSE 0.134 95.000 0.000 NA   NA
 7081917 7081918 Smal_3111 Smal_3112     FALSE 0.150 85.000 0.000 NA   NA
 7081922 7081923 Smal_3115 Smal_3116     TRUE 0.717 78.000 0.270 1.000   NA
 7081923 7081924 Smal_3116 Smal_3117     FALSE 0.085 238.000 0.059 1.000   NA
 7081924 7081925 Smal_3117 Smal_3118     TRUE 0.970 4.000 0.278 1.000   NA
 7081925 7081926 Smal_3118 Smal_3119   tolB TRUE 0.813 65.000 0.592 1.000 N NA
 7081926 7081927 Smal_3119 Smal_3120 tolB   FALSE 0.132 297.000 0.215 NA   NA
 7081927 7081928 Smal_3120 Smal_3121     TRUE 0.993 -10.000 0.460 NA   NA
 7081928 7081929 Smal_3121 Smal_3122     TRUE 0.989 25.000 0.556 0.045 Y NA
 7081929 7081930 Smal_3122 Smal_3123     TRUE 0.977 11.000 0.593 1.000   NA
 7081930 7081931 Smal_3123 Smal_3124   ruvB TRUE 0.978 -10.000 0.082 1.000   NA
 7081931 7081932 Smal_3124 Smal_3125 ruvB   FALSE 0.060 128.000 0.005 1.000 N NA
 7081932 7081933 Smal_3125 Smal_3126   ruvA FALSE 0.243 50.000 0.007 1.000 N NA
 7081933 7081934 Smal_3126 Smal_3127 ruvA ruvC TRUE 0.993 14.000 0.451 0.005 Y NA
 7081934 7081935 Smal_3127 Smal_3128 ruvC   FALSE 0.448 130.000 0.277 NA   NA
 7081935 7081936 Smal_3128 Smal_3129     FALSE 0.071 163.000 0.006 NA   NA
 7081936 7081937 Smal_3129 Smal_3130     FALSE 0.523 76.000 0.075 NA   NA
 7081937 7081938 Smal_3130 Smal_3131     TRUE 0.762 33.000 0.095 NA   NA
 7081938 7081939 Smal_3131 Smal_3132   aspS TRUE 0.670 17.000 0.002 NA   NA
 7081941 7081942 Smal_3134 Smal_3135     FALSE 0.214 54.000 0.000 NA   NA
 7081942 7081943 Smal_3135 Smal_3136     FALSE 0.011 86.000 0.000 1.000 N NA
 7081946 7081947 Smal_3139 Smal_3140     FALSE 0.236 170.000 0.000 1.000 Y NA
 7081949 7081950 Smal_3142 Smal_3143     TRUE 0.982 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7081950 7081951 Smal_3143 Smal_3144     FALSE 0.377 141.000 0.400 NA N NA
 7081952 7081953 Smal_3145 Smal_3146     FALSE 0.026 182.000 0.000 NA   NA
 7081955 7081956 Smal_3148 Smal_3149     FALSE 0.012 746.000 0.000 NA   NA
 7081956 7081957 Smal_3149 Smal_3150     FALSE 0.060 130.000 0.000 NA   NA
 7081957 7081958 Smal_3150 Smal_3151     TRUE 0.693 37.000 0.057 NA   NA
 7081959 7081960 Smal_3152 Smal_3153     FALSE 0.001 572.000 0.000 1.000 N NA
 7081960 7081961 Smal_3153 Smal_3154     TRUE 0.931 42.000 0.174 1.000 Y NA
 7081961 7081962 Smal_3154 Smal_3155     TRUE 0.992 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 7081963 7081964 Smal_3156 Smal_3157     TRUE 0.972 -25.000 0.052 NA   NA
 7081964 7081965 Smal_3157 Smal_3158     TRUE 0.843 3.000 0.004 NA   NA
 7081965 7081966 Smal_3158 Smal_3159     TRUE 0.966 0.000 0.168 NA   NA
 7081967 7081968 Smal_3160 Smal_3161     FALSE 0.021 200.000 0.000 NA   NA
 7081969 7081970 Smal_3162 Smal_3163     FALSE 0.064 222.000 0.079 1.000 N NA
 7081970 7081971 Smal_3163 Smal_3164   sucC TRUE 0.995 21.000 0.806 0.001 Y NA
 7081972 7081973 Smal_3165 Smal_3166     TRUE 0.968 61.000 0.556 0.075 Y NA
 7081975 7081976 Smal_3168 Smal_3169     TRUE 0.994 -3.000 0.125 NA Y NA
 7081976 7081977 Smal_3169 Smal_3170     TRUE 0.892 -10.000 0.000 1.000   NA
 7081978 7081979 Smal_3171 Smal_3172     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7081981 7081982 Smal_3174 Smal_3175     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7081982 7081983 Smal_3175 Smal_3176     TRUE 0.750 96.000 0.000 0.002 Y NA
 7081984 7081985 Smal_3177 Smal_3178     TRUE 0.993 8.000 0.454 1.000 Y NA
 7081985 7081986 Smal_3178 Smal_3179   coaE TRUE 0.869 12.000 0.122 1.000 N NA
 7081987 7081988 Smal_3180 Smal_3181     TRUE 0.998 -37.000 0.400 1.000 Y NA
 7081988 7081989 Smal_3181 Smal_3182     TRUE 0.647 9.000 0.000 NA   NA
 7081989 7081990 Smal_3182 Smal_3183     FALSE 0.141 90.000 0.000 NA   NA
 7081990 7081991 Smal_3183 Smal_3184     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 7081993 7081994 Smal_3186 Smal_3187     FALSE 0.285 40.000 0.000 NA   NA
 7081994 7081995 Smal_3187 Smal_R0073     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 7081995 7081996 Smal_R0073 Smal_3188     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 7081997 7081998 Smal_3189 Smal_3190     TRUE 0.657 132.000 0.130 1.000 Y NA
 7081998 7081999 Smal_3190 Smal_3191   trmB TRUE 0.947 0.000 0.060 1.000   NA
 7081999 7082000 Smal_3191 Smal_3192 trmB   TRUE 0.660 28.000 0.012 1.000   NA
 7082002 7082003 Smal_3194 Smal_3195     TRUE 0.855 76.000 0.667 NA   NA
 7082003 7082004 Smal_3195 Smal_3196   mscL FALSE 0.244 56.000 0.008 1.000 N NA
 7082004 7082005 Smal_3196 Smal_3197 mscL   FALSE 0.045 225.000 0.007 1.000   NA
 7082006 7082007 Smal_3198 Smal_3199     TRUE 0.608 11.000 0.000 NA   NA
 7082007 7082008 Smal_3199 Smal_3200     FALSE 0.016 238.000 0.000 NA   NA
 7082008 7082009 Smal_3200 Smal_3201     TRUE 0.956 -7.000 0.055 1.000 N NA
 7082009 7082010 Smal_3201 Smal_3202     FALSE 0.131 179.000 0.154 1.000 N NA
 7082010 7082011 Smal_3202 Smal_3203     TRUE 0.973 -7.000 0.154 NA N NA
 7082011 7082012 Smal_3203 Smal_3204     TRUE 0.978 -3.000 0.260 NA N NA
 7082012 7082013 Smal_3204 Smal_3205     FALSE 0.001 273.000 0.000 1.000 N NA
 7082013 7082014 Smal_3205 Smal_3206     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 7082015 7082016 Smal_3207 Smal_3208     TRUE 0.985 -3.000 0.111 0.042   NA
 7082018 7082019 Smal_3210 Smal_3211     FALSE 0.014 293.000 0.000 NA   NA
 7082020 7082021 Smal_3212 Smal_3213     FALSE 0.060 130.000 0.000 NA   NA
 7082021 7082022 Smal_3213 Smal_3214     FALSE 0.392 197.000 0.010 0.004 Y NA
 7082022 7082023 Smal_3214 Smal_3215     FALSE 0.052 215.000 0.009 1.000   NA
 7082023 7082024 Smal_3215 Smal_3216   pgk TRUE 0.925 -3.000 0.004 1.000   NA
 7082024 7082025 Smal_3216 Smal_3217 pgk   FALSE 0.012 726.000 0.000 NA   NA
 7082025 7082026 Smal_3217 Smal_3218     TRUE 0.986 -3.000 0.283 NA   NA
 7082026 7082027 Smal_3218 Smal_3219     FALSE 0.065 126.000 0.000 NA   NA
 7082028 7082029 Smal_3220 Smal_3221     FALSE 0.040 567.000 0.017 1.000   NA
 7082029 7082030 Smal_3221 Smal_3222     TRUE 0.925 12.000 0.158 1.000   NA
 7082031 7082032 Smal_3223 Smal_3224     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 7082032 7082033 Smal_3224 Smal_3225     TRUE 0.999 -7.000 0.833 1.000 Y NA
 7082034 7082035 Smal_3226 Smal_3227     TRUE 0.697 35.000 0.040 1.000   NA
 7082036 7082037 Smal_3228 Smal_3229     FALSE 0.068 338.000 0.150 1.000 N NA
 7082037 7082038 Smal_3229 Smal_3230     TRUE 0.620 58.000 0.100 NA   NA
 7082038 7082039 Smal_3230 Smal_3231     TRUE 0.992 -3.000 0.500 NA   NA
 7082039 7082040 Smal_3231 Smal_3232     TRUE 0.961 -3.000 0.041 NA   NA
 7082040 7082041 Smal_3232 Smal_3233     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082041 7082042 Smal_3233 Smal_3234     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082042 7082043 Smal_3234 Smal_3235     TRUE 0.905 9.000 0.060 NA   NA
 7082043 7082044 Smal_3235 Smal_3236     FALSE 0.133 146.000 0.017 1.000   NA
 7082044 7082045 Smal_3236 Smal_3237     TRUE 0.988 22.000 0.668 NA Y NA
 7082045 7082046 Smal_3237 Smal_3238     TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA Y NA
 7082046 7082047 Smal_3238 Smal_3239     TRUE 0.998 -3.000 0.770 NA Y NA
 7082047 7082048 Smal_3239 Smal_3240     TRUE 0.997 0.000 0.616 NA Y NA
 7082049 7082050 Smal_3241 Smal_3242     FALSE 0.065 296.000 0.050 NA   NA
 7082050 7082051 Smal_3242 Smal_3243     FALSE 0.013 393.000 0.000 NA   NA
 7082052 7082053 Smal_3244 Smal_3245     FALSE 0.170 70.000 0.000 NA   NA
 7082053 7082054 Smal_3245 Smal_3246     FALSE 0.190 62.000 0.000 NA   NA
 7082054 7082055 Smal_3246 Smal_3247     FALSE 0.483 19.000 0.000 NA   NA
 7082055 7082056 Smal_3247 Smal_3248     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082056 7082057 Smal_3248 Smal_3249     TRUE 0.877 62.000 0.667 NA   NA
 7082057 7082058 Smal_3249 Smal_3250     FALSE 0.012 455.000 0.000 NA   NA
 7082058 7082059 Smal_3250 Smal_3251     FALSE 0.258 44.000 0.000 NA   NA
 7082061 7082062 Smal_3253 Smal_3254 gltA rpmE2 FALSE 0.013 297.000 0.004 1.000 N NA
 7082062 7082063 Smal_3254 Smal_3255 rpmE2   FALSE 0.145 88.000 0.008 NA N NA
 7082063 7082064 Smal_3255 Smal_3256     FALSE 0.011 542.000 0.007 NA N NA
 7082064 7082065 Smal_3256 Smal_3257     TRUE 0.866 8.000 0.076 NA N NA
 7082065 7082066 Smal_3257 Smal_3258     FALSE 0.087 333.000 0.215 NA N NA
 7082066 7082067 Smal_3258 Smal_3259     TRUE 0.857 107.000 0.291 1.000 Y NA
 7082067 7082068 Smal_3259 Smal_3260   gmk TRUE 0.613 111.000 0.471 1.000 N NA
 7082069 7082070 Smal_3261 Smal_3262     TRUE 0.995 11.000 0.410 0.001 Y NA
 7082070 7082071 Smal_3262 Smal_3263     TRUE 0.998 -3.000 0.333 0.001 Y NA
 7082071 7082072 Smal_3263 Smal_3264     FALSE 0.071 394.000 0.182 NA N NA
 7082072 7082073 Smal_3264 Smal_3265     TRUE 0.892 4.000 0.083 NA N NA
 7082073 7082074 Smal_3265 Smal_3266     TRUE 0.995 -3.000 0.569 0.001 N NA
 7082074 7082075 Smal_3266 Smal_R0074     FALSE 0.406 26.000 0.000 NA   NA
 7082075 7082076 Smal_R0074 Smal_3267     FALSE 0.397 27.000 0.000 NA   NA
 7082076 7082077 Smal_3267 Smal_3268     FALSE 0.030 183.000 0.000 1.000   NA
 7082079 7082080 Smal_3270 Smal_3271 rph   TRUE 0.922 -3.000 0.005 NA   NA
 7082080 7082081 Smal_3271 Smal_3272     TRUE 0.916 -3.000 0.003 NA   NA
 7082081 7082082 Smal_3272 Smal_3273     TRUE 0.661 57.000 0.218 1.000 N NA
 7082082 7082083 Smal_3273 Smal_3274     FALSE 0.046 204.000 0.006 NA   NA
 7082083 7082084 Smal_3274 Smal_3275     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 7082084 7082085 Smal_3275 Smal_3276     FALSE 0.518 76.000 0.072 NA   NA
 7082086 7082087 Smal_3277 Smal_3278     TRUE 0.980 0.000 0.329 NA   NA
 7082088 7082089 Smal_3279 Smal_3280     TRUE 0.964 -3.000 0.053 NA   NA
 7082089 10712404 Smal_3280 Smal_R0075     FALSE 0.037 154.000 0.000 NA   NA
 10712404 7082090 Smal_R0075 Smal_3281     FALSE 0.152 84.000 0.000 NA   NA
 7082090 7082091 Smal_3281 Smal_3282     TRUE 0.937 -3.000 0.011 NA   NA
 7082091 7082092 Smal_3282 Smal_3283     TRUE 0.675 23.000 0.011 NA   NA
 7082092 7082093 Smal_3283 Smal_3284     TRUE 0.660 21.000 0.006 NA   NA
 7082093 7082094 Smal_3284 Smal_3285     FALSE 0.108 161.000 0.020 NA   NA
 7082096 7082097 Smal_3287 Smal_3288 thiE   TRUE 0.974 17.000 0.173 1.000 Y NA
 7082102 7082103 Smal_3293 Smal_3294     FALSE 0.495 18.000 0.000 NA   NA
 7082103 7082104 Smal_3294 Smal_3295     FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 7082106 7082107 Smal_3297 Smal_3298     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082109 7082110 Smal_3300 Smal_3301     TRUE 0.948 -3.000 0.015 1.000   NA
 7082110 7082111 Smal_3301 Smal_3302   adk FALSE 0.018 328.000 0.000 0.074 N NA
 7082112 7082113 Smal_3303 Smal_3304     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 7082113 7082114 Smal_3304 Smal_3305     FALSE 0.123 100.000 0.000 NA   NA
 7082117 7082118 Smal_3308 Smal_3309     TRUE 0.871 -3.000 0.000 0.099 N NA
 7082118 7082119 Smal_3309 Smal_3310     TRUE 0.966 10.000 0.000 0.044 Y NA
 7082119 7082120 Smal_3310 Smal_3311     TRUE 0.970 -13.000 0.042 NA   NA
 7082120 7082121 Smal_3311 Smal_3312     TRUE 0.686 32.000 0.029 NA   NA
 7082123 7082124 Smal_3314 Smal_3315     FALSE 0.136 245.000 0.000 NA Y NA
 7082124 7082125 Smal_3315 Smal_3316     FALSE 0.008 105.000 0.000 NA N NA
 7082125 7082126 Smal_3316 Smal_3317     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 7082127 7082128 Smal_3318 Smal_3319     FALSE 0.048 152.000 0.009 1.000 N NA
 7082129 7082130 Smal_3320 Smal_3321     FALSE 0.026 180.000 0.000 NA   NA
 7082130 7082131 Smal_3321 Smal_3322     TRUE 0.916 50.000 0.750 1.000   NA
 7082131 7082132 Smal_3322 Smal_3323     FALSE 0.121 115.000 0.000 0.042 N NA
 7082132 7082133 Smal_3323 Smal_3324     FALSE 0.015 270.000 0.000 NA   NA
 7082133 7082134 Smal_3324 Smal_3325     FALSE 0.053 135.000 0.000 NA   NA
 7082137 7082138 Smal_3328 Smal_3329     TRUE 0.926 40.000 0.012 0.001 Y NA
 7082138 7082139 Smal_3329 Smal_3330     TRUE 0.998 -16.000 0.943 0.001   NA
 7082139 7082140 Smal_3330 Smal_3331     FALSE 0.348 97.000 0.017 1.000   NA
 7082140 7082141 Smal_3331 Smal_3332     TRUE 0.989 -3.000 0.013 1.000 Y NA
 7082141 7082142 Smal_3332 Smal_3333     TRUE 0.779 11.000 0.003 1.000   NA
 7082142 7082143 Smal_3333 Smal_3334     FALSE 0.447 61.000 0.015 1.000   NA
 7082143 7082144 Smal_3334 Smal_3335     TRUE 0.998 0.000 0.449 0.001 Y NA
 7082144 7082145 Smal_3335 Smal_3336     TRUE 0.997 -10.000 0.074 0.001 Y NA
 7082148 7082149 Smal_3339 Smal_3340     TRUE 0.977 4.000 0.354 0.099 N NA
 7082150 7082151 Smal_3341 Smal_3342     FALSE 0.101 137.000 0.023 1.000 N NA
 7082151 7082152 Smal_3342 Smal_3343     TRUE 0.702 17.000 0.028 1.000 N NA
 7082153 7082154 Smal_3344 Smal_3345     FALSE 0.019 214.000 0.000 NA   NA
 7082156 7082157 Smal_3347 Smal_3348     TRUE 0.994 -19.000 0.050 NA Y NA
 7082157 7082158 Smal_3348 Smal_3349     TRUE 0.847 16.000 0.058 NA   NA
 7082159 7082160 Smal_3350 Smal_3351     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082161 7082162 Smal_3352 Smal_3353     FALSE 0.295 230.000 0.058 1.000 Y NA
 7082163 7082164 Smal_3354 Smal_3355     FALSE 0.504 67.000 0.130 NA N NA
 7082165 7082166 Smal_3356 Smal_3357     FALSE 0.524 77.000 0.158 1.000 N NA
 7082166 7082167 Smal_3357 Smal_3358     TRUE 0.973 -3.000 0.190 1.000 N NA
 7082167 7082168 Smal_3358 Smal_3359     TRUE 0.996 -7.000 0.190 1.000 Y NA
 7082169 7082170 Smal_3360 Smal_3361     FALSE 0.349 73.000 0.048 NA N NA
 7082170 7082171 Smal_3361 Smal_3362   fabG TRUE 0.740 25.000 0.094 1.000 N NA
 7082171 7082172 Smal_3362 Smal_3363 fabG   FALSE 0.001 604.000 0.000 1.000 N NA
 7082173 7082174 Smal_3364 Smal_3365     FALSE 0.089 211.000 0.052 NA   NA
 7082175 7082176 Smal_3366 Smal_3367     TRUE 0.975 4.000 0.013 1.000 Y NA
 7082176 7082177 Smal_3367 Smal_3368     TRUE 0.920 5.000 0.050 1.000   NA
 7082180 7082181 Smal_3371 Smal_3372     FALSE 0.291 44.000 0.000 1.000   NA
 7082182 7082183 Smal_3373 Smal_3374     TRUE 0.999 0.000 0.874 0.004 Y NA
 7082183 7082184 Smal_3374 Smal_3375     TRUE 0.897 21.000 0.000 1.000 Y NA
 7082184 7082185 Smal_3375 Smal_3376     TRUE 0.774 96.000 0.500 NA   NA
 7082185 7082186 Smal_3376 Smal_3377     TRUE 0.839 78.000 0.600 NA   NA
 7082187 7082188 Smal_3378 Smal_3379     TRUE 0.991 -3.000 0.423 0.099 N NA
 7082188 7082189 Smal_3379 Smal_3380     TRUE 0.934 22.000 0.385 NA   NA
 7082189 7082190 Smal_3380 Smal_3381     FALSE 0.407 155.000 0.400 NA   NA
 7082191 7082192 Smal_3382 Smal_3383     TRUE 0.675 6.000 0.000 NA   NA
 7082193 7082194 Smal_3384 Smal_3385     FALSE 0.029 187.000 0.000 1.000   NA
 7082194 7082195 Smal_3385 Smal_3386     FALSE 0.185 64.000 0.000 NA   NA
 7082195 7082196 Smal_3386 Smal_3387     TRUE 0.647 9.000 0.000 NA   NA
 7082196 7082197 Smal_3387 Smal_3388     TRUE 0.858 58.000 0.531 NA   NA
 7082200 7082201 Smal_3391 Smal_3392     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 7082205 7082206 Smal_3396 Smal_3397     FALSE 0.035 158.000 0.000 NA   NA
 7082208 7082209 Smal_3399 Smal_3400     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082209 7082210 Smal_3400 Smal_3401     FALSE 0.014 636.000 0.000 1.000   NA
 7082212 7082213 Smal_3403 Smal_3404     TRUE 0.690 107.000 0.571 1.000 N NA
 7082213 7082214 Smal_3404 Smal_3405     TRUE 0.874 107.000 0.714 0.005   NA
 7082214 7082215 Smal_3405 Smal_3406     TRUE 0.602 54.000 0.074 NA   NA
 7082217 7082218 Smal_3408 Smal_3409     FALSE 0.161 78.000 0.000 NA   NA
 7082218 7082219 Smal_3409 Smal_3410     FALSE 0.028 174.000 0.000 NA   NA
 7082220 7082221 Smal_3411 Smal_3412     FALSE 0.037 714.000 0.000 0.035   NA
 7082222 7082223 Smal_3413 Smal_3414     FALSE 0.110 106.000 0.000 NA   NA
 7082223 7082224 Smal_3414 Smal_3415   cca FALSE 0.085 114.000 0.000 NA   NA
 7082225 7082226 Smal_3416 Smal_3417     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7082226 7082227 Smal_3417 Smal_3418     TRUE 0.703 4.000 0.000 NA   NA
 7082227 7082228 Smal_3418 Smal_3419     FALSE 0.017 282.000 0.000 1.000   NA
 7082228 7082229 Smal_3419 Smal_3420     FALSE 0.014 311.000 0.000 NA   NA
 7082229 7082230 Smal_3420 Smal_3421     TRUE 0.930 0.000 0.031 NA   NA
 7082230 7082231 Smal_3421 Smal_3422     TRUE 0.885 0.000 0.030 1.000 N NA
 7082231 7082232 Smal_3422 Smal_3423     TRUE 0.823 8.000 0.030 1.000 N NA
 7082232 7082233 Smal_3423 Smal_3424     TRUE 0.913 7.000 0.140 1.000 N NA
 7082234 7082235 Smal_3425 Smal_3426     FALSE 0.003 144.000 0.000 1.000 N NA
 7082235 7082236 Smal_3426 Smal_3427     FALSE 0.006 112.000 0.000 1.000 N NA
 7082237 7082238 Smal_3428 Smal_3429     TRUE 0.938 -3.000 0.012 NA   NA
 7082242 7082243 Smal_3433 Smal_3434     TRUE 0.990 5.000 0.116 0.022 Y NA
 7082243 7082244 Smal_3434 Smal_3435     TRUE 0.992 -3.000 0.047 1.000 Y NA
 7082244 7082245 Smal_3435 Smal_3436     FALSE 0.021 200.000 0.000 NA   NA
 7082247 7082248 Smal_3438 Smal_3439     TRUE 0.876 11.000 0.042 NA   NA
 7082248 7082249 Smal_3439 Smal_3440     FALSE 0.495 18.000 0.000 NA   NA
 7082249 7082250 Smal_3440 Smal_3441     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 7082250 7082251 Smal_3441 Smal_3442     FALSE 0.001 292.000 0.000 1.000 N NA
 7082251 7082252 Smal_3442 Smal_3443   lipB TRUE 0.990 19.000 0.319 0.001 Y NA
 7082252 7082253 Smal_3443 Smal_3444 lipB   TRUE 0.987 -12.000 0.219 NA   NA
 7082255 7082256 Smal_3446 Smal_3447     TRUE 0.775 101.000 0.080 NA Y NA
 7082256 7082257 Smal_3447 Smal_3448     TRUE 0.996 -3.000 0.298 NA Y NA
 7082257 7082258 Smal_3448 Smal_3449     FALSE 0.042 1093.000 0.096 NA N NA
 7082258 7082259 Smal_3449 Smal_3450     FALSE 0.313 246.000 0.008 0.002 Y NA
 7082259 7082260 Smal_3450 Smal_3451     TRUE 0.890 -3.000 0.013 1.000 N NA
 7082260 7082261 Smal_3451 Smal_3452     TRUE 0.975 4.000 0.013 1.000 Y NA
 7082261 7082262 Smal_3452 Smal_3453     TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 7082262 7082263 Smal_3453 Smal_3454     TRUE 0.641 122.000 0.689 1.000 N NA
 7082265 7082266 Smal_3456 Smal_3457     FALSE 0.043 286.000 0.000 0.049   NA
 7082266 7082267 Smal_3457 Smal_3458     TRUE 0.957 -3.000 0.031 NA   NA
 7082267 7082268 Smal_3458 Smal_3459     FALSE 0.280 125.000 0.070 NA   NA
 7082268 7082269 Smal_3459 Smal_3460   ubiE FALSE 0.002 180.000 0.000 1.000 N NA
 7082270 7082271 Smal_3461 Smal_3462     FALSE 0.022 199.000 0.000 NA   NA
 7082271 7082272 Smal_3462 Smal_3463     FALSE 0.164 75.000 0.000 NA   NA
 7082272 7082273 Smal_3463 Smal_3464     FALSE 0.165 74.000 0.000 NA   NA
 7082273 7082274 Smal_3464 Smal_3465     FALSE 0.076 120.000 0.000 NA   NA
 7082275 7082276 Smal_3466 Smal_3467     FALSE 0.344 126.000 0.095 0.035 N NA
 7082276 7082277 Smal_3467 Smal_3468     TRUE 0.838 13.000 0.095 1.000 N NA
 7082278 7082279 Smal_3469 Smal_3470     FALSE 0.278 46.000 0.000 1.000   NA
 7082280 7082281 Smal_3471 Smal_3472 hslU   TRUE 0.936 107.000 0.752 1.000 Y NA
 7082281 7082282 Smal_3472 Smal_3473     FALSE 0.028 174.000 0.000 NA   NA
 7082282 7082283 Smal_3473 Smal_3474   xerC FALSE 0.027 178.000 0.000 NA   NA
 7082283 7082284 Smal_3474 Smal_3475 xerC   TRUE 0.975 14.000 0.714 NA   NA
 7082284 7082285 Smal_3475 Smal_3476   dapF TRUE 0.980 -3.000 0.175 NA   NA
 7082285 7082286 Smal_3476 Smal_3477 dapF   TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7082286 7082287 Smal_3477 Smal_3478     FALSE 0.061 129.000 0.000 NA   NA
 7082287 7082288 Smal_3478 Smal_3479     TRUE 0.636 56.000 0.105 NA   NA
 7082290 7082291 Smal_3481 Smal_3482     FALSE 0.468 70.000 0.034 NA   NA
 7082293 7082294 Smal_3484 Smal_3485     TRUE 0.997 -3.000 0.312 1.000 Y NA
 7082294 7082295 Smal_3485 Smal_3486     FALSE 0.023 211.000 0.000 1.000   NA
 7082297 7082298 Smal_3488 Smal_3489     FALSE 0.023 207.000 0.000 1.000   NA
 7082298 7082299 Smal_3489 Smal_3490     TRUE 0.978 18.000 0.109 0.024 Y NA
 7082300 7082301 Smal_3491 Smal_3492     TRUE 0.948 -3.000 0.018 NA   NA
 7082305 7082306 Smal_3496 Smal_3497     TRUE 0.610 91.000 0.000 NA Y NA
 7082307 7082308 Smal_3498 Smal_3499     FALSE 0.014 446.000 0.000 1.000   NA
 7082309 7082310 Smal_3500 Smal_3501     TRUE 0.883 36.000 0.500 1.000 N NA
 7082310 7082311 Smal_3501 Smal_3502     TRUE 0.986 11.000 0.250 1.000 Y NA
 7082311 7082312 Smal_3502 Smal_3503     TRUE 0.995 21.000 1.000 0.098 Y NA
 7082312 7082313 Smal_3503 Smal_3504     TRUE 0.860 2.000 0.002 1.000   NA
 7082313 7082314 Smal_3504 Smal_3505     FALSE 0.150 121.000 0.002 1.000   NA
 7082314 7082315 Smal_3505 Smal_3506     TRUE 0.999 -3.000 0.957 0.073 Y NA
 7082316 7082317 Smal_3507 Smal_3508     TRUE 0.940 -31.000 0.002 1.000   NA
 7082319 7082320 Smal_3510 Smal_3511 atpC   TRUE 0.957 114.000 0.837 0.002 Y NA
 7082320 7082321 Smal_3511 Smal_3512     TRUE 0.988 39.000 0.724 0.002 Y NA
 7082321 7082322 Smal_3512 Smal_3513     TRUE 0.979 79.000 0.846 0.002 Y NA
 7082322 7082323 Smal_3513 Smal_3514     TRUE 0.988 45.000 0.864 0.002 Y NA
 7082323 7082324 Smal_3514 Smal_3515     TRUE 0.995 3.000 0.242 0.002 Y NA
 7082324 7082325 Smal_3515 Smal_3516     TRUE 0.868 107.000 0.666 0.002   NA
 7082325 7082326 Smal_3516 Smal_3517     TRUE 0.903 74.000 0.557 0.002   NA
 7082326 7082327 Smal_3517 Smal_3518     TRUE 0.630 31.000 0.014 NA   NA
 7082329 7082330 Smal_3520 Smal_3521     TRUE 0.893 109.000 0.463 1.000 Y NA
 7082330 7082331 Smal_3521 Smal_3522     FALSE 0.002 168.000 0.000 NA N NA
 7082332 7082333 Smal_3523 Smal_3524   glpD FALSE 0.002 188.000 0.000 1.000 N NA
 7082333 7082334 Smal_3524 Smal_3525 glpD glpK TRUE 0.860 94.000 0.032 0.001 Y NA
 7082335 7082336 Smal_3526 Smal_3527     FALSE 0.040 27.000 0.000 NA N NA
 7082337 7082338 Smal_3528 Smal_3529     FALSE 0.106 107.000 0.000 NA   NA
 7082339 7082340 Smal_3530 Smal_3531 hemC   FALSE 0.029 586.000 0.032 1.000 N NA
 7082340 7082341 Smal_3531 Smal_3532     TRUE 0.997 11.000 0.775 0.027 Y NA
 7082341 7082342 Smal_3532 Smal_3533     TRUE 0.728 31.000 0.037 1.000   NA
 7082342 7082343 Smal_3533 Smal_3534     TRUE 0.579 51.000 0.046 NA   NA
 7082344 7082345 Smal_3535 Smal_3536     FALSE 0.012 449.000 0.000 NA   NA
 7082346 7082347 Smal_3537 Smal_3538     FALSE 0.001 210.000 0.000 1.000 N NA
 7082347 7082348 Smal_3538 Smal_3539     FALSE 0.144 99.000 0.000 1.000   NA
 7082351 7082352 Smal_3542 Smal_3543     TRUE 0.990 -7.000 0.294 1.000   NA
 7082352 7082353 Smal_3543 Smal_3544     FALSE 0.050 137.000 0.000 NA   NA
 7082356 7082357 Smal_3547 Smal_3548     FALSE 0.110 106.000 0.000 NA   NA
 7082359 7082360 Smal_3550 Smal_3551     FALSE 0.001 199.000 0.000 1.000 N NA
 7082361 7082362 Smal_3552 Smal_3553     TRUE 0.874 -9.000 0.000 NA   NA
 7082362 7082363 Smal_3553 Smal_3554     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7082365 7082366 Smal_3556 Smal_3557     FALSE 0.018 258.000 0.000 1.000   NA
 7082368 7082369 Smal_3559 Smal_3560     FALSE 0.011 87.000 0.000 1.000 N NA
 7082370 7082371 Smal_3561 Smal_3562     FALSE 0.229 50.000 0.000 NA   NA
 7082373 7082374 Smal_3564 Smal_3565     FALSE 0.192 61.000 0.000 NA   NA
 7082374 7082375 Smal_3565 Smal_3566     FALSE 0.025 185.000 0.000 NA   NA
 7082375 7082376 Smal_3566 Smal_3567     FALSE 0.012 409.000 0.000 NA   NA
 7082377 7082378 Smal_3568 Smal_3569     TRUE 0.864 -3.000 0.000 1.000   NA
 7082378 7082379 Smal_3569 Smal_3570     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082380 7082381 Smal_R0076 Smal_3571     FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 7082381 7082382 Smal_3571 Smal_3572     FALSE 0.016 252.000 0.000 NA   NA
 7082382 7082383 Smal_3572 Smal_3573     FALSE 0.147 91.000 0.006 1.000 N NA
 7082384 7082385 Smal_3574 Smal_3575     FALSE 0.012 76.000 0.000 1.000 N NA
 7082385 7082386 Smal_3575 Smal_3576     TRUE 0.724 28.000 0.032 NA   NA
 7082386 7082387 Smal_3576 Smal_3577     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 7082389 7082390 Smal_3579 Smal_3580     TRUE 0.844 45.000 0.014 NA Y NA
 7082391 7082392 Smal_3581 Smal_3582     TRUE 0.656 118.000 0.053 NA Y NA
 7082392 7082393 Smal_3582 Smal_3583     FALSE 0.472 24.000 0.008 1.000 N NA
 7082393 7082394 Smal_3583 Smal_3584   fmt TRUE 0.992 4.000 0.305 1.000 Y NA
 7082394 7082395 Smal_3584 Smal_3585 fmt def TRUE 0.780 122.000 0.105 0.015 Y NA
 7082396 7082397 Smal_3586 Smal_3587     FALSE 0.220 131.000 0.033 1.000   NA
 7082397 7082398 Smal_3587 Smal_3588     TRUE 0.728 44.000 0.124 1.000   NA
 7082398 7082399 Smal_3588 Smal_3589     TRUE 0.637 40.000 0.030 1.000   NA
 7082399 7082400 Smal_3589 Smal_3590     TRUE 0.651 50.000 0.095 NA   NA
 7082400 7082401 Smal_3590 Smal_3591     FALSE 0.047 193.000 0.003 NA   NA
 7082401 7082402 Smal_3591 Smal_3592     FALSE 0.068 132.000 0.011 NA N NA
 7082402 7082403 Smal_3592 Smal_3593     FALSE 0.558 44.000 0.022 NA   NA
 7082403 7082404 Smal_3593 Smal_3594     TRUE 0.954 36.000 1.000 NA   NA
 7082407 7082408 Smal_3597 Smal_3598     FALSE 0.117 117.000 0.013 1.000 N NA
 7082408 7082409 Smal_3598 Smal_3599     FALSE 0.016 239.000 0.000 NA   NA
 7082409 7082410 Smal_3599 Smal_3600     TRUE 0.995 -7.000 0.667 NA   NA
 7082412 7082413 Smal_3602 Smal_3603     FALSE 0.126 144.000 0.016 NA   NA
 7082415 7082416 Smal_3605 Smal_3606     TRUE 0.687 5.000 0.000 NA   NA
 7082416 7082417 Smal_3606 Smal_3607     FALSE 0.170 70.000 0.000 NA   NA
 7082417 7082418 Smal_3607 Smal_3608     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 7082419 7082420 Smal_3609 Smal_3610     FALSE 0.014 286.000 0.000 NA   NA
 7082420 7082421 Smal_3610 Smal_3611     TRUE 0.976 -3.000 0.238 NA N NA
 7082421 7082422 Smal_3611 Smal_3612     TRUE 0.998 -3.000 0.741 NA Y NA
 7082423 7082424 Smal_3613 Smal_3614     FALSE 0.012 453.000 0.000 NA   NA
 7082424 7082425 Smal_3614 Smal_3615     FALSE 0.014 296.000 0.000 NA   NA
 7082425 7082426 Smal_3615 Smal_3616     FALSE 0.088 113.000 0.000 NA   NA
 7082426 7082427 Smal_3616 Smal_3617     FALSE 0.220 52.000 0.000 NA   NA
 7082427 7082428 Smal_3617 Smal_3618     FALSE 0.253 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7082428 7082429 Smal_3618 Smal_3619     FALSE 0.013 70.000 0.000 1.000 N NA
 7082429 7082430 Smal_3619 Smal_3620     TRUE 0.839 33.000 0.000 1.000 Y NA
 7082432 7082433 Smal_3622 Smal_3623     TRUE 0.935 14.000 0.250 NA   NA
 7082435 7082436 Smal_3625 Smal_3626   groEL FALSE 0.055 134.000 0.000 NA   NA
 7082436 7082437 Smal_3626 Smal_3627 groEL groES TRUE 0.929 82.000 0.269 0.072 Y NA
 7082438 7082439 Smal_3628 Smal_3629     FALSE 0.198 69.000 0.000 1.000   NA
 7082439 7082440 Smal_3629 Smal_3630     TRUE 0.897 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7082440 7082441 Smal_3630 Smal_3631     TRUE 0.991 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 7082441 7082442 Smal_3631 Smal_3632     FALSE 0.001 640.000 0.000 1.000 N NA
 7082447 7082448 Smal_3637 Smal_3638     FALSE 0.001 275.000 0.000 1.000 N NA
 7082448 7082449 Smal_3638 Smal_3639     FALSE 0.050 137.000 0.000 NA   NA
 7082451 7082452 Smal_3641 Smal_3642     TRUE 0.943 16.000 0.317 1.000   NA
 7082455 7082456 Smal_3645 Smal_3646     FALSE 0.001 315.000 0.000 NA N NA
 7082456 7082457 Smal_3646 Smal_3647     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7082457 7082458 Smal_3647 Smal_3648     FALSE 0.214 54.000 0.000 NA   NA
 7082458 7082459 Smal_3648 Smal_3649     TRUE 0.993 11.000 0.275 0.001 Y NA
 7082460 7082461 Smal_3650 Smal_3651     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082462 7082463 Smal_3652 Smal_3653 prmA   FALSE 0.092 211.000 0.058 NA   NA
 7082463 7082464 Smal_3653 Smal_3654   fis FALSE 0.284 116.000 0.037 NA   NA
 7082465 7082466 Smal_3655 Smal_3656     TRUE 0.993 -3.000 0.595 1.000   NA
 7082466 7082467 Smal_3656 Smal_3657     TRUE 0.930 10.000 0.140 NA   NA
 7082467 7082468 Smal_3657 Smal_3658     TRUE 0.971 -3.000 0.090 NA   NA
 7082468 7082469 Smal_3658 Smal_3659     TRUE 0.977 0.000 0.285 NA   NA
 7082469 7082470 Smal_3659 Smal_3660     TRUE 0.951 35.000 0.215 NA Y NA
 7082470 7082471 Smal_3660 Smal_3661     FALSE 0.242 47.000 0.000 NA   NA
 7082472 7082473 Smal_3662 Smal_3663 purH   TRUE 0.678 17.000 0.003 NA   NA
 7082473 7082474 Smal_3663 Smal_3664     FALSE 0.530 15.000 0.000 NA   NA
 7082474 7082475 Smal_3664 Smal_3665     FALSE 0.195 60.000 0.000 NA   NA
 7082477 7082478 Smal_3667 Smal_3668     TRUE 0.981 -3.000 0.000 NA Y NA
 7082478 7082479 Smal_3668 Smal_3669     FALSE 0.004 128.000 0.000 NA N NA
 7082480 7082481 Smal_3670 Smal_3671     FALSE 0.253 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7082481 7082482 Smal_3671 Smal_3672     FALSE 0.108 8.000 0.000 1.000 N NA
 7082482 7082483 Smal_3672 Smal_3673     TRUE 0.976 3.000 0.010 1.000 Y NA
 7082483 7082484 Smal_3673 Smal_3674     FALSE 0.061 197.000 0.007 0.071 N NA
 7082485 7082486 Smal_3675 Smal_3676     FALSE 0.062 233.000 0.087 1.000 N NA
 7082486 7082487 Smal_3676 Smal_3677     FALSE 0.001 215.000 0.000 1.000 N NA
 7082488 7082489 Smal_3678 Smal_3679   aceK FALSE 0.204 67.000 0.000 1.000   NA
 7082489 7082490 Smal_3679 Smal_3680 aceK   FALSE 0.041 147.000 0.000 NA   NA
 7082490 7082491 Smal_3680 Smal_3681     TRUE 0.833 54.000 0.400 NA   NA
 7082491 7082492 Smal_3681 Smal_3682     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7082492 7082493 Smal_3682 Smal_3683     TRUE 0.873 -7.000 0.000 NA   NA
 7082493 7082494 Smal_3683 Smal_3684     FALSE 0.014 315.000 0.000 NA   NA
 7082494 7082495 Smal_3684 Smal_3685     FALSE 0.013 374.000 0.000 NA   NA
 7082495 7082496 Smal_3685 Smal_3686     FALSE 0.545 43.000 0.018 NA   NA
 7082496 7082497 Smal_3686 Smal_3687   queF FALSE 0.016 298.000 0.000 1.000   NA
 7082497 7082498 Smal_3687 Smal_3688 queF   FALSE 0.035 539.000 0.011 1.000   NA
 7082499 7082500 Smal_3689 Smal_3690     TRUE 0.633 75.000 0.148 0.096 N NA
 7082500 7082501 Smal_3690 Smal_3691     TRUE 0.989 29.000 0.963 NA Y NA
 7082501 7082502 Smal_3691 Smal_3692     FALSE 0.001 389.000 0.000 NA N NA
 7082502 7082503 Smal_3692 Smal_3693     FALSE 0.033 163.000 0.000 NA   NA
 7082503 7082504 Smal_3693 Smal_3694     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7082504 7082505 Smal_3694 Smal_3695     FALSE 0.175 98.000 0.000 0.048 N NA
 7082505 7082506 Smal_3695 Smal_3696     FALSE 0.030 183.000 0.000 1.000   NA
 7082506 7082507 Smal_3696 Smal_3697     TRUE 0.688 35.000 0.000 0.000   NA
 7082507 7082508 Smal_3697 Smal_3698     FALSE 0.258 44.000 0.000 NA   NA
 7082509 7082510 Smal_3699 Smal_3700     FALSE 0.076 147.000 0.020 1.000 N NA
 7082510 7082511 Smal_3700 Smal_3701     FALSE 0.168 119.000 0.007 NA   NA
 7082511 7082512 Smal_3701 Smal_3702     TRUE 0.756 32.000 0.079 NA   NA
 7082512 7082513 Smal_3702 Smal_3703     TRUE 0.922 5.000 0.069 NA   NA
 7082514 7082515 Smal_3704 Smal_3705     TRUE 0.612 45.000 0.045 NA   NA
 7082515 7082516 Smal_3705 Smal_3706     TRUE 0.997 2.000 0.556 0.022 Y NA
 7082517 7082518 Smal_3707 Smal_3708     FALSE 0.514 145.000 0.070 NA Y NA
 7082518 7082519 Smal_3708 Smal_3709     FALSE 0.137 109.000 0.015 NA N NA
 7082520 7082521 Smal_R0077 Smal_R0078     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 7082522 7082523 Smal_3710 Smal_3711 rpsI rplM TRUE 0.998 3.000 0.601 0.010 Y NA
 7082525 7082526 Smal_3713 Smal_3714     FALSE 0.056 168.000 0.019 1.000 N NA
 7082527 7082528 Smal_3715 Smal_3716     FALSE 0.055 140.000 0.000 1.000   NA
 7082529 7082530 Smal_3717 Smal_3718   trpC TRUE 0.987 -3.000 0.005 NA Y NA
 7082530 7082531 Smal_3718 Smal_3719 trpC trpD TRUE 0.910 75.000 0.293 1.000 Y NA
 7082531 7082532 Smal_3719 Smal_3720 trpD   TRUE 0.967 17.000 0.105 1.000 Y NA
 7082532 7082533 Smal_3720 Smal_3721     TRUE 0.892 3.000 0.017 NA   NA
 7082533 7082534 Smal_3721 Smal_3722     FALSE 0.396 68.000 0.014 NA   NA
 7082534 7082535 Smal_3722 Smal_3723     FALSE 0.001 293.000 0.000 1.000 N NA
 7082535 7082536 Smal_3723 Smal_3724     FALSE 0.017 283.000 0.000 1.000   NA
 7082536 7082537 Smal_3724 Smal_3725     TRUE 0.565 59.000 0.050 1.000   NA
 7082537 7082538 Smal_3725 Smal_3726     TRUE 0.654 31.000 0.015 1.000   NA
 7082539 7082540 Smal_3727 Smal_3728     FALSE 0.018 221.000 0.000 NA   NA
 7082540 7082541 Smal_3728 Smal_3729     FALSE 0.013 334.000 0.000 NA   NA
 7082541 7082542 Smal_3729 Smal_3730     TRUE 0.999 0.000 0.881 0.004 Y NA
 7082542 7082543 Smal_3730 Smal_3731     TRUE 0.999 -3.000 0.976 0.004 Y NA
 7082543 7082544 Smal_3731 Smal_3732     TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 7082544 7082545 Smal_3732 Smal_3733     TRUE 0.999 -3.000 0.937 0.046 Y NA
 7082545 7082546 Smal_3733 Smal_3734     TRUE 0.999 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 7082547 7082548 Smal_3735 Smal_3736     TRUE 0.664 74.000 0.200 NA   NA
 7082550 7082551 Smal_3738 Smal_3739     FALSE 0.326 103.000 0.077 1.000 N NA
 7082552 7082553 Smal_3740 Smal_3741     FALSE 0.017 229.000 0.000 NA   NA
 7082554 7082555 Smal_3742 Smal_3743     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 7082555 7082556 Smal_3743 Smal_3744     TRUE 0.904 20.000 0.211 NA   NA
 7082556 7082557 Smal_3744 Smal_3745     FALSE 0.214 181.000 0.000 1.000 Y NA
 7082558 7082559 Smal_3746 Smal_3747     TRUE 0.999 -7.000 0.458 0.001 Y NA
 7082559 7082560 Smal_3747 Smal_3748     TRUE 0.926 2.000 0.042 NA   NA
 7082560 7082561 Smal_3748 Smal_3749     TRUE 0.966 -3.000 0.064 NA   NA
 7082561 7082562 Smal_3749 Smal_3750     FALSE 0.014 306.000 0.000 NA   NA
 7082563 7082564 Smal_3751 Smal_3752     FALSE 0.016 244.000 0.000 NA   NA
 7082564 7082565 Smal_3752 Smal_3753     FALSE 0.168 0.000 0.000 NA N NA
 7082568 7082569 Smal_3756 Smal_3757     FALSE 0.016 242.000 0.000 NA   NA
 7082570 7082571 Smal_3758 Smal_3759     FALSE 0.143 88.000 0.000 NA   NA
 7082572 7082573 Smal_3760 Smal_3761     FALSE 0.070 14.000 0.000 1.000 N NA
 7082573 7082574 Smal_3761 Smal_3762     FALSE 0.063 127.000 0.000 NA   NA
 7082576 7082577 Smal_3764 Smal_3765     TRUE 0.791 0.000 0.000 1.000   NA
 7082577 7082578 Smal_3765 Smal_3766     TRUE 0.993 -3.000 0.080 1.000 Y NA
 7082579 7082580 Smal_3767 Smal_3768     FALSE 0.258 44.000 0.000 NA   NA
 7082585 7082586 Smal_3773 Smal_3774     FALSE 0.065 126.000 0.000 NA   NA
 7082589 7082590 Smal_3777 Smal_3778     FALSE 0.176 68.000 0.000 NA   NA
 7082591 7082592 Smal_3779 Smal_3780     FALSE 0.021 201.000 0.000 NA   NA
 7082592 7082593 Smal_3780 Smal_3781     FALSE 0.270 42.000 0.000 NA   NA
 7082593 7082594 Smal_3781 Smal_3782     FALSE 0.020 207.000 0.000 NA   NA
 7082595 7082596 Smal_3783 Smal_3784     FALSE 0.073 121.000 0.000 NA   NA
 7082596 7082597 Smal_3784 Smal_3785     FALSE 0.014 445.000 0.000 1.000   NA
 7082599 7082600 Smal_3787 Smal_3788     TRUE 0.993 -7.000 0.488 NA   NA
 7082601 7082602 Smal_3789 Smal_3790     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7082603 7082604 Smal_3791 Smal_3792     TRUE 0.736 21.000 0.000 0.031   NA
 7082604 7082605 Smal_3792 Smal_3793     TRUE 0.992 2.000 0.100 0.031 Y NA
 7082605 7082606 Smal_3793 Smal_3794     TRUE 0.998 -3.000 0.250 0.002 Y NA
 7082606 7082607 Smal_3794 Smal_3795     TRUE 0.992 6.000 0.136 0.002 Y NA
 7082608 7082609 Smal_3796 Smal_3797     FALSE 0.166 73.000 0.000 NA   NA
 7082609 7082610 Smal_3797 Smal_3798     TRUE 0.762 0.000 0.000 NA   NA
 7082610 7082611 Smal_3798 Smal_3799     TRUE 0.630 10.000 0.000 NA   NA
 7082612 7082613 Smal_3800 Smal_3801     FALSE 0.168 0.000 0.000 1.000 N NA
 7082615 7082616 Smal_3803 Smal_3804     FALSE 0.165 74.000 0.000 NA   NA
 7082618 7082619 Smal_3806 Smal_3807     TRUE 0.740 1.000 0.000 NA   NA
 7082619 7082620 Smal_3807 Smal_3808   ubiA FALSE 0.001 476.000 0.000 1.000 N NA
 7082621 7082622 Smal_R0079 Smal_3809     FALSE 0.165 74.000 0.000 NA   NA
 7082622 7082623 Smal_3809 Smal_3810     FALSE 0.177 83.000 0.000 1.000   NA
 7082624 7082625 Smal_3811 Smal_3812     FALSE 0.036 155.000 0.000 NA   NA
 7082625 7082626 Smal_3812 Smal_3813     FALSE 0.206 66.000 0.000 1.000   NA
 7082626 7082627 Smal_3813 Smal_3814     FALSE 0.064 134.000 0.000 1.000   NA
 7082628 7082629 Smal_3815 Smal_3816     TRUE 0.956 -7.000 0.056 1.000 N NA
 7082629 7082630 Smal_3816 Smal_3817     TRUE 0.954 17.000 0.028 1.000 Y NA
 7082630 7082631 Smal_3817 Smal_3818     TRUE 0.970 35.000 0.400 1.000 Y NA
 7082631 7082632 Smal_3818 Smal_3819     TRUE 0.992 -3.000 0.049 1.000 Y NA
 7082632 7082633 Smal_3819 Smal_3820     FALSE 0.019 242.000 0.000 1.000   NA
 7082634 7082635 Smal_3821 Smal_3822     FALSE 0.224 51.000 0.000 NA   NA
 7082635 7082636 Smal_3822 Smal_3823     FALSE 0.199 59.000 0.000 NA   NA
 7082636 7082637 Smal_3823 Smal_3824     FALSE 0.127 98.000 0.000 NA   NA
 7082637 7082638 Smal_3824 Smal_3825     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082639 7082640 Smal_3826 Smal_3827     FALSE 0.034 159.000 0.000 NA   NA
 7082640 7082641 Smal_3827 Smal_3828     TRUE 0.934 68.000 0.168 0.001 Y NA
 7082641 7082642 Smal_3828 Smal_3829     TRUE 0.934 18.000 0.096 0.001   NA
 7082642 7082643 Smal_3829 Smal_3830     TRUE 0.728 30.000 0.033 1.000   NA
 7082643 7082644 Smal_3830 Smal_3831     TRUE 0.949 13.000 0.006 1.000 Y NA
 7082645 7082646 Smal_3832 Smal_3833     TRUE 0.961 -3.000 0.042 NA   NA
 7082647 7082648 Smal_3834 Smal_3835     FALSE 0.012 493.000 0.000 NA   NA
 7082649 7082650 Smal_3836 Smal_3837     TRUE 0.996 -3.000 0.900 0.034 N NA
 7082650 7082651 Smal_3837 Smal_3838     TRUE 0.926 13.000 0.300 1.000 N NA
 7082652 7082653 Smal_3839 Smal_3840     TRUE 0.998 -3.000 0.591 1.000 Y NA
 7082653 7082654 Smal_3840 Smal_3841     FALSE 0.055 134.000 0.000 NA   NA
 7082654 7082655 Smal_3841 Smal_3842     FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 7082655 7082656 Smal_3842 Smal_3843     FALSE 0.068 124.000 0.000 NA   NA
 7082656 7082657 Smal_3843 Smal_3844     TRUE 0.994 -3.000 0.708 NA   NA
 7082657 7082658 Smal_3844 Smal_3845     TRUE 0.981 -10.000 0.129 NA   NA
 7082658 7082659 Smal_3845 Smal_3846     TRUE 0.996 -3.000 0.955 NA   NA
 7082659 7082660 Smal_3846 Smal_3847     TRUE 0.993 -3.000 0.583 NA   NA
 7082660 7082661 Smal_3847 Smal_3848     TRUE 0.981 -3.000 0.182 NA   NA
 7082662 7082663 Smal_3849 Smal_3850     TRUE 0.958 8.000 0.244 NA   NA
 7082667 7082668 Smal_3854 Smal_3855 dinG   FALSE 0.030 168.000 0.000 NA   NA
 7082668 7082669 Smal_3855 Smal_3856   aroE TRUE 0.849 4.000 0.007 NA   NA
 7082671 7082672 Smal_3858 Smal_3859     FALSE 0.375 33.000 0.000 1.000   NA
 7082672 7082673 Smal_3859 Smal_3860     TRUE 0.658 20.000 0.005 NA   NA
 7082673 7082674 Smal_3860 Smal_3861     FALSE 0.069 123.000 0.000 NA   NA
 7082676 7082677 Smal_3863 Smal_3864     FALSE 0.020 206.000 0.000 NA   NA
 7082677 7082678 Smal_3864 Smal_3865     TRUE 0.735 26.000 0.029 NA   NA
 7082678 7082679 Smal_3865 Smal_3866     FALSE 0.054 171.000 0.020 1.000 N NA
 7082680 7082681 Smal_3867 Smal_3868     FALSE 0.021 201.000 0.000 NA   NA
 7082683 7082684 Smal_3870 Smal_3871     FALSE 0.172 101.000 0.000 0.040 N NA
 7082685 7082686 Smal_3872 Smal_3873     TRUE 0.996 -3.000 0.271 NA Y NA
 7082686 7082687 Smal_3873 Smal_3874     TRUE 0.987 -3.000 0.292 1.000   NA
 7082687 7082688 Smal_3874 Smal_3875     FALSE 0.198 69.000 0.000 1.000   NA
 7082689 7082690 Smal_3876 Smal_3877     FALSE 0.023 192.000 0.000 NA   NA
 7082690 7082691 Smal_3877 Smal_3878     FALSE 0.112 179.000 0.000 0.000   NA
 7082693 7082694 Smal_3880 Smal_3881     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.070 Y NA
 7082694 7082695 Smal_3881 Smal_3882     FALSE 0.013 360.000 0.000 NA   NA
 7082695 7082696 Smal_3882 Smal_3883     FALSE 0.014 307.000 0.000 NA   NA
 7082696 7082697 Smal_3883 Smal_3884     FALSE 0.103 9.000 0.000 1.000 N NA
 7082699 7082700 Smal_3886 Smal_3887     FALSE 0.057 202.000 0.012 NA   NA
 7082701 7082702 Smal_3888 Smal_3889     FALSE 0.292 39.000 0.000 NA   NA
 7082702 7082703 Smal_3889 Smal_3890     FALSE 0.120 102.000 0.000 NA   NA
 7082704 7082705 Smal_3891 Smal_R0080     FALSE 0.012 645.000 0.000 NA   NA
 7082705 7082706 Smal_R0080 Smal_3892     FALSE 0.013 358.000 0.000 NA   NA
 7082706 7082707 Smal_3892 Smal_3893     TRUE 0.680 57.000 0.155 NA   NA
 7082708 7082709 Smal_3894 Smal_3895     TRUE 0.943 -10.000 0.037 NA N NA
 7082712 7082713 Smal_3898 Smal_3899     FALSE 0.477 89.000 0.058 1.000   NA
 7082716 7082717 Smal_3902 Smal_3903     FALSE 0.458 85.000 0.028 0.047 N NA
 7082719 7082720 Smal_3905 Smal_3906     TRUE 0.969 -7.000 0.040 NA   NA
 7082720 7082721 Smal_3906 Smal_3907     FALSE 0.034 161.000 0.000 NA   NA
 7082721 7082722 Smal_3907 Smal_3908     FALSE 0.188 63.000 0.000 NA   NA
 7082722 7082723 Smal_3908 Smal_3909     TRUE 0.996 0.000 0.486 1.000 Y NA
 7082723 7082724 Smal_3909 Smal_3910     TRUE 0.997 -3.000 0.397 NA Y NA
 7082724 7082725 Smal_3910 Smal_3911     TRUE 0.998 -3.000 0.514 NA Y NA
 7082725 7082726 Smal_3911 Smal_3912     TRUE 0.990 -3.000 0.422 NA   NA
 7082726 7082727 Smal_3912 Smal_3913     TRUE 0.990 -12.000 0.297 NA   NA
 7082727 7082728 Smal_3913 Smal_3914     TRUE 0.813 54.000 0.329 1.000   NA
 7082728 7082729 Smal_3914 Smal_3915     TRUE 0.983 -7.000 0.146 1.000   NA
 7082729 7082730 Smal_3915 Smal_3916     TRUE 0.973 -3.000 0.110 NA   NA
 7082730 7082731 Smal_3916 Smal_3917     TRUE 0.992 -13.000 0.413 NA   NA
 7082731 7082732 Smal_3917 Smal_3918     TRUE 0.991 -10.000 0.333 1.000   NA
 7082732 7082733 Smal_3918 Smal_3919     TRUE 0.923 2.000 0.036 NA   NA
 7082733 7082734 Smal_3919 Smal_3920     TRUE 0.971 -10.000 0.046 NA   NA
 7082734 7082735 Smal_3920 Smal_3921     TRUE 0.996 -7.000 0.758 NA   NA
 7082735 7082736 Smal_3921 Smal_3922     TRUE 0.937 23.000 0.422 NA   NA
 7082736 7082737 Smal_3922 Smal_3923     TRUE 0.982 18.000 0.117 0.001 Y NA
 7082737 7082738 Smal_3923 Smal_3924     TRUE 0.996 -13.000 0.170 1.000 Y NA
 7082738 7082739 Smal_3924 Smal_3925     TRUE 0.995 -7.000 0.636 NA   NA
 7082739 7082740 Smal_3925 Smal_3926     FALSE 0.019 218.000 0.000 NA   NA
 7082740 7082741 Smal_3926 Smal_3927     TRUE 0.979 2.000 0.000 0.031 Y NA
 7082741 7082742 Smal_3927 Smal_3928     FALSE 0.158 129.000 0.000 0.094   NA
 7082742 7082743 Smal_3928 Smal_3929     TRUE 0.888 2.000 0.000 0.094   NA
 7082743 7082744 Smal_3929 Smal_3930     FALSE 0.014 319.000 0.000 NA   NA
 7082744 7082745 Smal_3930 Smal_3931     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082745 7082746 Smal_3931 Smal_3932     TRUE 0.810 38.000 0.200 NA   NA
 7082747 7082748 Smal_3933 Smal_3934     TRUE 0.930 -3.000 0.031 1.000 N NA
 7082748 7082749 Smal_3934 Smal_3935     TRUE 0.716 31.000 0.038 NA   NA
 7082749 7082750 Smal_3935 Smal_3936     FALSE 0.314 36.000 0.000 NA   NA
 7082750 7082751 Smal_3936 Smal_3937     FALSE 0.298 38.000 0.000 NA   NA
 7082751 7082752 Smal_3937 Smal_3938     FALSE 0.240 55.000 0.000 1.000   NA
 7082752 7082753 Smal_3938 Smal_3939     FALSE 0.135 94.000 0.000 NA   NA
 7082754 7082755 Smal_3940 Smal_3941     FALSE 0.013 331.000 0.000 NA   NA
 7082759 7082760 Smal_3945 Smal_3946     FALSE 0.026 179.000 0.000 NA   NA
 7082760 7082761 Smal_3946 Smal_3947   uvrD FALSE 0.125 99.000 0.000 NA   NA
 7082761 7082762 Smal_3947 Smal_3948 uvrD   TRUE 0.859 10.000 0.022 NA   NA
 7082762 7082763 Smal_3948 Smal_3949     TRUE 0.819 46.000 0.300 NA   NA
 7082763 7082764 Smal_3949 Smal_3950   rpmG FALSE 0.013 243.000 0.002 1.000 N NA
 7082764 7082765 Smal_3950 Smal_3951 rpmG rpmB TRUE 0.991 14.000 0.332 0.009 Y NA
 7082765 7082766 Smal_3951 Smal_3952 rpmB   FALSE 0.001 322.000 0.000 1.000 N NA
 7082766 7082767 Smal_3952 Smal_3953     FALSE 0.002 166.000 0.000 1.000 N NA
 7082768 7082769 Smal_3954 Smal_3955     FALSE 0.012 455.000 0.000 NA   NA
 7082769 7082770 Smal_3955 Smal_3956     FALSE 0.204 57.000 0.000 NA   NA
 7082770 7082771 Smal_3956 Smal_3957     TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 7082771 7082772 Smal_3957 Smal_3958     TRUE 0.977 11.000 0.800 1.000 N NA
 7082775 7082776 Smal_3961 Smal_3962     TRUE 0.986 -3.000 0.273 1.000   NA
 7082776 7082777 Smal_3962 Smal_3963     TRUE 0.877 91.000 0.227 1.000 Y NA
 7082777 7082778 Smal_3963 Smal_3964     TRUE 0.752 46.000 0.182 NA   NA
 7082778 7082779 Smal_3964 Smal_3965     FALSE 0.067 125.000 0.000 NA   NA
 7082779 7082780 Smal_3965 Smal_3966     TRUE 0.989 0.000 0.827 1.000 N NA
 7082780 7082781 Smal_3966 Smal_3967   gidB FALSE 0.524 113.000 0.339 1.000 N NA
 7082781 7082782 Smal_3967 Smal_3968 gidB   FALSE 0.251 40.000 0.003 1.000 N NA
 7082784 7082785 Smal_3970 Smal_3971     FALSE 0.002 156.000 0.000 1.000 N NA
 7082785 7082786 Smal_3971 Smal_3972     FALSE 0.002 185.000 0.000 1.000 N NA
 7082786 7082787 Smal_3972 Smal_3973     FALSE 0.414 99.000 0.051 NA   NA
 7082788 7082789 Smal_3974 Smal_3975     FALSE 0.479 122.000 0.357 1.000 N NA
 7082790 7082791 Smal_3976 Smal_3977     FALSE 0.031 167.000 0.000 NA   NA
 7082791 7082792 Smal_3977 Smal_3978     FALSE 0.031 441.000 0.008 NA   NA
 7082792 7082793 Smal_3978 Smal_3979     FALSE 0.061 136.000 0.000 1.000   NA
 7082793 7082794 Smal_3979 Smal_3980     FALSE 0.060 190.000 0.009 NA   NA
 7082794 7082795 Smal_3980 Smal_3981     TRUE 0.993 -3.000 0.575 NA   NA
 7082795 7082796 Smal_3981 Smal_3982   glyS FALSE 0.016 213.000 0.003 1.000 N NA
 7082796 7082797 Smal_3982 Smal_3983 glyS glyQ TRUE 0.975 72.000 0.651 0.000 Y NA
 7082798 7082799 Smal_3984 Smal_3985     FALSE 0.308 -28.000 0.000 1.000 N NA
 7082799 7082800 Smal_3985 Smal_3986     TRUE 0.605 52.000 0.070 NA   NA
 7082801 7082802 Smal_3987 Smal_3988     TRUE 0.996 -3.000 0.314 NA Y NA
 7082802 7082803 Smal_3988 Smal_3989   tatA TRUE 0.984 16.000 0.157 0.008 Y NA
 7082803 7082804 Smal_3989 Smal_3990 tatA   FALSE 0.519 76.000 0.073 NA   NA
 7082805 7082806 Smal_3991 Smal_3992 hemH   TRUE 0.960 -3.000 0.037 NA   NA
 7082806 7082807 Smal_3992 Smal_3993     FALSE 0.014 291.000 0.000 NA   NA
 7082808 7082809 Smal_R0081 Smal_R0082     FALSE 0.065 126.000 0.000 NA   NA
 7082809 7082810 Smal_R0082 Smal_R0083     FALSE 0.018 227.000 0.000 NA   NA
 7082810 7082811 Smal_R0083 Smal_R0084     FALSE 0.361 31.000 0.000 NA   NA
 7082811 7082812 Smal_R0084 Smal_R0085     FALSE 0.137 93.000 0.000 NA   NA
 7082812 7082813 Smal_R0085 Smal_R0086     FALSE 0.012 509.000 0.000 NA   NA
 7082813 7082814 Smal_R0086 Smal_R0087     FALSE 0.063 127.000 0.000 NA   NA
 7082814 7082815 Smal_R0087 Smal_R0088     FALSE 0.018 227.000 0.000 NA   NA
 7082815 7082816 Smal_R0088 Smal_R0089     FALSE 0.361 31.000 0.000 NA   NA
 7082816 7082817 Smal_R0089 Smal_R0090     FALSE 0.137 93.000 0.000 NA   NA
 7082819 7082820 Smal_3995 Smal_3996     FALSE 0.224 51.000 0.000 NA   NA
 7082820 7082821 Smal_3996 Smal_3997     FALSE 0.360 41.000 0.013 1.000 N NA
 7082821 7082822 Smal_3997 Smal_3998     FALSE 0.150 85.000 0.000 NA   NA
 7082822 7082823 Smal_3998 Smal_3999     TRUE 0.989 -3.000 0.354 NA   NA
 7082827 7082828 Smal_4003 Smal_4004     TRUE 0.962 17.000 0.561 NA   NA
 7082828 7082829 Smal_4004 Smal_4005     TRUE 0.990 -13.000 0.311 NA   NA
 7082829 7082830 Smal_4005 Smal_4006   folE FALSE 0.340 113.000 0.066 NA   NA
 7082831 7082832 Smal_4007 Smal_4008     FALSE 0.402 109.000 0.088 NA   NA
 7082832 7082833 Smal_4008 Smal_4009     TRUE 0.992 -3.000 0.529 NA   NA
 7082833 7082834 Smal_4009 Smal_4010     TRUE 0.995 -3.000 0.800 0.093 N NA
 7082834 7082835 Smal_4010 Smal_4011     TRUE 0.932 4.000 0.080 NA   NA
 7082835 7082836 Smal_4011 Smal_4012     FALSE 0.134 95.000 0.000 NA   NA
 7082837 7082838 Smal_4013 Smal_4014     TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 7082838 7082839 Smal_4014 Smal_4015     TRUE 0.999 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 7082840 7082841 Smal_4016 Smal_4017     TRUE 0.996 0.000 0.530 NA Y NA
 7082841 7082842 Smal_4017 Smal_4018     TRUE 0.861 59.000 0.562 NA   NA
 7082842 7082843 Smal_4018 Smal_4019     TRUE 0.954 -3.000 0.024 NA   NA
 7082843 7082844 Smal_4019 Smal_4020     TRUE 0.969 -10.000 0.041 NA   NA
 7082844 7082845 Smal_4020 Smal_4021     TRUE 0.922 2.000 0.035 NA   NA
 7082846 7082847 Smal_4022 Smal_4023     FALSE 0.150 137.000 0.018 NA   NA
 7082847 7082848 Smal_4023 Smal_4024     FALSE 0.302 72.000 0.004 NA   NA
 7082851 7082852 Smal_4027 Smal_4028     FALSE 0.063 16.000 0.000 1.000 N NA
 7082852 7082853 Smal_4028 Smal_4029     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082853 7082854 Smal_4029 Smal_4030     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082854 7082855 Smal_4030 Smal_4031     FALSE 0.027 178.000 0.000 NA   NA
 7082857 7082858 Smal_4033 Smal_4034     TRUE 0.844 -3.000 0.000 NA   NA
 7082860 7082861 Smal_4036 Smal_4037     FALSE 0.326 95.000 0.000 0.045   NA
 7082864 7082865 Smal_4040 Smal_4041   trmE FALSE 0.110 106.000 0.000 NA   NA
 7082865 7082866 Smal_4041 Smal_4042 trmE   TRUE 0.853 4.000 0.005 1.000   NA
 7082866 7082867 Smal_4042 Smal_4043     FALSE 0.091 150.000 0.005 1.000   NA
 7082867 7082868 Smal_4043 Smal_4044     TRUE 0.933 0.000 0.105 1.000 N NA
 7082868 7082869 Smal_4044 Smal_4045   rpmH TRUE 0.934 42.000 0.787 1.000   NA