MicrobesOnline Operon Predictions for Thermotoga petrophila RKU-1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3583930 3583931 Tpet_0001 Tpet_0002     FALSE 0.136 124.000 0.003 1.000   NA
 3583931 3583932 Tpet_0002 Tpet_0003     TRUE 0.962 -9.000 0.006 0.036   NA
 3583932 3583933 Tpet_0003 Tpet_0004     TRUE 0.945 -3.000 0.037 1.000   NA
 3583933 3583934 Tpet_0004 Tpet_0005     TRUE 0.897 -3.000 0.003 NA   NA
 3583934 3583935 Tpet_0005 Tpet_0006     TRUE 0.637 5.000 0.006 NA   NA
 3583935 3583936 Tpet_0006 Tpet_0007     TRUE 0.936 -3.000 0.018 NA   NA
 3583936 3583937 Tpet_0007 Tpet_0008     TRUE 0.778 11.000 0.009 1.000 N NA
 3583937 3583938 Tpet_0008 Tpet_0009     FALSE 0.593 10.000 0.000 1.000 N NA
 3583938 3583939 Tpet_0009 Tpet_0010     FALSE 0.376 35.000 0.000 1.000 N NA
 3583940 3583941 Tpet_0011 Tpet_0012     TRUE 0.676 -13.000 0.003 NA N NA
 3583941 3583942 Tpet_0012 Tpet_0013     FALSE 0.229 -49.000 0.003 NA N NA
 3583942 3583943 Tpet_0013 Tpet_0014     TRUE 0.706 2.000 0.007 NA   NA
 3583943 3583944 Tpet_0014 Tpet_0015     TRUE 0.906 -3.000 0.003 1.000   NA
 3583944 3583945 Tpet_0015 Tpet_0016     TRUE 0.889 -3.000 0.004 1.000 N NA
 3583945 3583946 Tpet_0016 Tpet_0017     FALSE 0.548 4.000 0.006 1.000 N NA
 3583946 3583947 Tpet_0017 Tpet_0018     TRUE 0.732 -69.000 0.105 1.000 Y NA
 3583947 3583948 Tpet_0018 Tpet_0019     TRUE 0.997 -3.000 0.171 0.009 Y NA
 3583948 3583949 Tpet_0019 Tpet_0020   flhF TRUE 0.992 -3.000 0.440 1.000 Y NA
 3583949 3583950 Tpet_0020 Tpet_0021 flhF   FALSE 0.419 -34.000 0.023 1.000 N NA
 3583950 3583951 Tpet_0021 Tpet_0022     TRUE 0.876 7.000 0.545 NA N NA
 3583951 3583952 Tpet_0022 Tpet_0023     TRUE 0.927 -3.000 0.074 NA N NA
 3583952 3583953 Tpet_0023 Tpet_0024     TRUE 0.993 -3.000 0.606 NA Y NA
 3583953 3583954 Tpet_0024 Tpet_0025     TRUE 0.823 18.000 0.120 1.000 N NA
 3583954 3583955 Tpet_0025 Tpet_0026     TRUE 0.750 -16.000 0.021 NA   NA
 3583955 3583956 Tpet_0026 Tpet_0027     TRUE 0.960 -3.000 0.238 NA   NA
 3583956 3583957 Tpet_0027 Tpet_0028     TRUE 0.823 -15.000 0.143 NA   NA
 3583958 3583959 Tpet_0029 Tpet_0030     TRUE 0.915 0.000 0.545 NA   NA
 3583959 3583960 Tpet_0030 Tpet_0031     FALSE 0.408 64.000 0.053 NA   NA
 3583960 3583961 Tpet_0031 Tpet_0032     TRUE 0.671 5.000 0.053 1.000 N NA
 3583961 3583962 Tpet_0032 Tpet_0033     TRUE 0.941 -3.000 0.021 1.000   NA
 3583962 3583963 Tpet_0033 Tpet_0034     TRUE 0.804 7.000 0.042 1.000   NA
 3583963 3583964 Tpet_0034 Tpet_0035     TRUE 0.780 2.000 0.043 1.000   NA
 3583964 3583965 Tpet_0035 Tpet_0036     TRUE 0.904 -3.000 0.002 1.000   NA
 3583965 3583966 Tpet_0036 Tpet_0037     TRUE 0.928 -3.000 0.029 1.000 N NA
 3583966 3583967 Tpet_0037 Tpet_0038     FALSE 0.566 -24.000 0.029 1.000 N NA
 3583967 3583968 Tpet_0038 Tpet_0039     FALSE 0.567 -21.000 0.010 1.000 N NA
 3583969 3583970 Tpet_0040 Tpet_0041     TRUE 0.929 -3.000 0.038 1.000 N NA
 3583970 3583971 Tpet_0041 Tpet_0042     TRUE 0.684 4.000 0.019 1.000   NA
 3583972 3583973 Tpet_0043 Tpet_0044     TRUE 0.918 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3583974 3583975 Tpet_0045 Tpet_0046     TRUE 0.897 5.000 0.011 1.000 Y NA
 3583975 3583976 Tpet_0046 Tpet_0047     FALSE 0.243 76.000 0.008 1.000 N NA
 3583976 3583977 Tpet_0047 Tpet_0048     TRUE 0.869 12.000 0.036 1.000   NA
 3583977 3583978 Tpet_0048 Tpet_0049     TRUE 0.976 2.000 0.469 0.007   NA
 3583978 3583979 Tpet_0049 Tpet_0050     FALSE 0.358 56.000 0.009 1.000 N NA
 3583979 3583980 Tpet_0050 Tpet_0051     FALSE 0.432 51.000 0.015 1.000 N NA
 3583980 3583981 Tpet_0051 Tpet_0052     TRUE 0.944 -3.000 0.079 NA   NA
 3583981 3583982 Tpet_0052 Tpet_0053     TRUE 0.748 10.000 0.003 NA   NA
 3583984 3583985 Tpet_0055 Tpet_0056     FALSE 0.267 68.000 0.003 NA   NA
 3583985 3583986 Tpet_0056 Tpet_0057     TRUE 0.894 10.000 0.300 NA   NA
 3583987 3583988 Tpet_0058 Tpet_0059     TRUE 0.825 7.000 0.111 1.000   NA
 3583988 3583989 Tpet_0059 Tpet_0060     TRUE 0.719 30.000 0.056 NA   NA
 3583989 3583990 Tpet_0060 Tpet_0061     TRUE 0.963 -3.000 0.278 NA   NA
 3583990 3583991 Tpet_0061 Tpet_0062     TRUE 0.971 14.000 0.036 NA Y NA
 3583991 3583992 Tpet_0062 Tpet_0063     TRUE 0.845 13.000 0.006 NA   NA
 3583992 3583993 Tpet_0063 Tpet_0064     TRUE 0.910 -3.000 0.003 1.000   NA
 3583995 3583996 Tpet_0066 Tpet_0067     TRUE 0.998 -3.000 0.046 0.002 Y NA
 3583996 3583997 Tpet_0067 Tpet_0068     TRUE 0.881 4.000 0.012 NA Y NA
 3583997 3583998 Tpet_0068 Tpet_0069     TRUE 0.843 -7.000 0.003 NA   NA
 3583998 3583999 Tpet_0069 Tpet_0070     TRUE 0.745 8.000 0.005 NA   NA
 3583999 3584000 Tpet_0070 Tpet_0071     TRUE 0.824 6.000 0.308 1.000 N NA
 3584000 3584001 Tpet_0071 Tpet_0072     TRUE 0.987 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 3584001 3584002 Tpet_0072 Tpet_0073     TRUE 0.826 13.000 0.008 1.000 N NA
 3584002 3584003 Tpet_0073 Tpet_0074     TRUE 0.820 -31.000 0.088 1.000 Y NA
 3584003 3584004 Tpet_0074 Tpet_0075     TRUE 0.728 8.000 0.012 NA N NA
 3584004 3584005 Tpet_0075 Tpet_R0001     FALSE 0.268 55.000 0.000 NA   NA
 3584006 3584007 Tpet_0076 Tpet_0077     TRUE 0.696 6.000 0.015 1.000 N NA
 3584007 3584008 Tpet_0077 Tpet_0078     TRUE 0.987 7.000 0.018 0.008 Y NA
 3584009 3584010 Tpet_0079 Tpet_0080     TRUE 0.968 12.000 0.007 0.008   NA
 3584010 3584011 Tpet_0080 Tpet_0081     TRUE 0.875 -10.000 0.077 1.000   NA
 3584011 3584012 Tpet_0081 Tpet_0082     FALSE 0.353 -61.000 0.012 1.000   NA
 3584012 3584013 Tpet_0082 Tpet_0083     TRUE 0.803 17.000 0.008 NA   NA
 3584013 3584014 Tpet_0083 Tpet_0084     TRUE 0.912 -3.000 0.004 NA   NA
 3584014 3584015 Tpet_0084 Tpet_0085     TRUE 0.935 -3.000 0.088 1.000 N NA
 3584015 3584016 Tpet_0085 Tpet_0086     TRUE 0.689 39.000 0.107 1.000   NA
 3584016 3584017 Tpet_0086 Tpet_0087     TRUE 0.913 17.000 0.400 NA   NA
 3584017 3584018 Tpet_0087 Tpet_0088     FALSE 0.445 49.000 0.005 NA   NA
 3584018 3584019 Tpet_0088 Tpet_0089     FALSE 0.221 67.000 0.003 NA N NA
 3584019 3584020 Tpet_0089 Tpet_0090     TRUE 0.936 -3.000 0.125 NA N NA
 3584020 3584021 Tpet_0090 Tpet_0091     TRUE 0.746 0.000 0.009 1.000 N NA
 3584021 3584022 Tpet_0091 Tpet_0092     TRUE 0.952 17.000 0.013 1.000 Y NA
 3584022 3584023 Tpet_0092 Tpet_0093     TRUE 0.864 2.000 0.385 NA   NA
 3584023 3584024 Tpet_0093 Tpet_0094     TRUE 0.638 3.000 0.005 NA   NA
 3584024 3584025 Tpet_0094 Tpet_0095     TRUE 0.702 -19.000 0.022 NA   NA
 3584025 3584026 Tpet_0095 Tpet_0096     TRUE 0.941 -3.000 0.042 NA   NA
 3584026 3584027 Tpet_0096 Tpet_0097     TRUE 0.674 -40.000 0.020 0.061 N NA
 3584027 3584028 Tpet_0097 Tpet_0098     TRUE 0.982 -3.000 0.018 0.061   NA
 3584028 3584029 Tpet_0098 Tpet_0099     TRUE 0.901 1.000 0.500 1.000   NA
 3584029 3584030 Tpet_0099 Tpet_0100     TRUE 0.792 30.000 0.333 1.000 N NA
 3584030 3584031 Tpet_0100 Tpet_0101     FALSE 0.569 -31.000 0.176 NA   NA
 3584032 3584033 Tpet_0102 Tpet_0103     TRUE 0.712 83.000 0.188 0.035   NA
 3584033 3584034 Tpet_0103 Tpet_0104     TRUE 0.953 16.000 0.818 1.000   NA
 3584035 3584036 Tpet_0105 Tpet_0106     TRUE 0.998 16.000 0.574 0.001 Y NA
 3584036 3584037 Tpet_0106 Tpet_R0002     FALSE 0.458 34.000 0.000 NA   NA
 3584037 3584038 Tpet_R0002 Tpet_0107     FALSE 0.531 27.000 0.000 NA   NA
 3584038 3584039 Tpet_0107 Tpet_0108     FALSE 0.528 39.000 0.008 1.000 N NA
 3584039 3584040 Tpet_0108 Tpet_0109     FALSE 0.385 52.000 0.008 1.000 N NA
 3584040 3584041 Tpet_0109 Tpet_R0003     FALSE 0.331 48.000 0.000 NA   NA
 3584041 3584042 Tpet_R0003 Tpet_0110     FALSE 0.372 44.000 0.000 NA   NA
 3584042 3584043 Tpet_0110 Tpet_0111     TRUE 0.801 2.000 0.143 NA   NA
 3584044 3584045 Tpet_0112 Tpet_0113     FALSE 0.052 209.000 0.000 NA   NA
 3584046 3584047 Tpet_0114 Tpet_0115     TRUE 0.825 11.000 0.067 1.000 N NA
 3584047 3584048 Tpet_0115 Tpet_0116     TRUE 0.874 14.000 0.033 1.000 N NA
 3584048 3584049 Tpet_0116 Tpet_0117     TRUE 0.992 -7.000 0.200 0.073 Y NA
 3584049 3584050 Tpet_0117 Tpet_0118     TRUE 0.943 50.000 0.185 0.073 Y NA
 3584050 3584051 Tpet_0118 Tpet_0119     TRUE 0.985 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 3584051 3584052 Tpet_0119 Tpet_0120     TRUE 0.958 8.000 0.194 1.000 Y NA
 3584052 3584053 Tpet_0120 Tpet_0121     FALSE 0.112 182.000 0.021 1.000 N NA
 3584053 3584054 Tpet_0121 Tpet_0122     FALSE 0.116 161.000 0.021 NA N NA
 3584054 3584055 Tpet_0122 Tpet_0123     TRUE 0.977 17.000 0.500 NA Y NA
 3584055 3584056 Tpet_0123 Tpet_0124     TRUE 0.778 5.000 0.300 1.000 N NA
 3584056 3584057 Tpet_0124 Tpet_0125     TRUE 0.893 -3.000 0.004 1.000 N NA
 3584058 3584059 Tpet_0126 Tpet_0127     TRUE 0.984 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 3584059 3584060 Tpet_0127 Tpet_0128     TRUE 0.939 -3.000 0.017 1.000   NA
 3584060 3584061 Tpet_0128 Tpet_0129     TRUE 0.941 -3.000 0.043 NA   NA
 3584061 3584062 Tpet_0129 Tpet_0130     TRUE 0.922 -3.000 0.008 NA   NA
 3584063 3584064 Tpet_0131 Tpet_0132     TRUE 0.917 -6.000 0.081 NA   NA
 3584068 3584069 Tpet_0136 Tpet_0137     TRUE 0.787 6.000 0.111 NA   NA
 3584069 3584070 Tpet_0137 Tpet_0138     TRUE 0.760 -16.000 0.028 NA   NA
 3584070 3584071 Tpet_0138 Tpet_0139     TRUE 0.666 5.000 0.008 1.000   NA
 3584071 3584072 Tpet_0139 Tpet_0140     TRUE 0.802 0.000 0.103 NA N NA
 3584072 3584073 Tpet_0140 Tpet_0141     TRUE 0.967 -3.000 0.538 NA N NA
 3584073 3584074 Tpet_0141 Tpet_0142     TRUE 0.990 5.000 0.385 0.005 Y NA
 3584075 3584076 Tpet_0143 Tpet_0144     TRUE 0.912 15.000 0.202 NA   NA
 3584077 3584078 Tpet_0145 Tpet_0146     FALSE 0.050 213.000 0.000 NA   NA
 3584078 3584079 Tpet_0146 Tpet_0147     TRUE 0.753 41.000 0.333 NA   NA
 3584079 3584080 Tpet_0147 Tpet_0148     TRUE 0.614 43.000 0.057 NA   NA
 3584081 3584082 Tpet_0149 Tpet_0150     TRUE 0.728 6.000 0.012 NA   NA
 3584082 3584083 Tpet_0150 Tpet_0151     FALSE 0.578 24.000 0.000 NA   NA
 3584083 3584084 Tpet_0151 Tpet_0152     TRUE 0.889 -15.000 0.000 1.000 Y NA
 3584085 3584086 Tpet_0153 Tpet_0154 infB   TRUE 0.970 11.000 0.223 1.000 Y NA
 3584086 3584087 Tpet_0154 Tpet_0155     TRUE 0.669 5.000 0.011 NA   NA
 3584087 3584088 Tpet_0155 Tpet_0156     TRUE 0.667 4.000 0.018 NA   NA
 3584088 3584089 Tpet_0156 Tpet_0157     TRUE 0.931 -9.000 0.372 NA   NA
 3584090 3584091 Tpet_0158 Tpet_0159     TRUE 0.917 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3584091 3584092 Tpet_0159 Tpet_0160     TRUE 0.926 -3.000 0.007 1.000   NA
 3584094 3584095 Tpet_0162 Tpet_0163     FALSE 0.576 0.000 0.000 1.000 N NA
 3584095 3584096 Tpet_0163 Tpet_0164     TRUE 0.709 -10.000 0.000 NA   NA
 3584096 3584097 Tpet_0164 Tpet_0165     TRUE 0.884 15.000 0.065 NA   NA
 3584098 3584099 Tpet_0166 Tpet_0167 rpsB   FALSE 0.113 140.000 0.003 1.000   NA
 3584099 3584100 Tpet_0167 Tpet_0168     FALSE 0.449 60.000 0.024 1.000   NA
 3584100 3584101 Tpet_0168 Tpet_0169     TRUE 0.971 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 3584102 3584103 Tpet_0170 Tpet_0171     FALSE 0.305 108.000 0.316 1.000 N NA
 3584103 3584104 Tpet_0171 Tpet_0172     TRUE 0.979 3.000 0.023 0.016 Y NA
 3584104 3584105 Tpet_0172 Tpet_0173     TRUE 0.645 0.000 0.000 NA   NA
 3584105 3584106 Tpet_0173 Tpet_0174     FALSE 0.100 112.000 0.000 NA   NA
 3584106 3584107 Tpet_0174 Tpet_0175     TRUE 0.946 7.000 0.111 0.053   NA
 3584107 3584108 Tpet_0175 Tpet_0176     TRUE 0.913 -3.000 0.003 1.000   NA
 3584108 3584109 Tpet_0176 Tpet_0177     FALSE 0.154 90.000 0.003 1.000 N NA
 3584111 3584112 Tpet_0178 Tpet_0179     TRUE 0.963 -3.000 0.286 NA   NA
 3584112 3584113 Tpet_0179 Tpet_0180     TRUE 0.960 -3.000 0.233 NA   NA
 3584113 3584114 Tpet_0180 Tpet_0181     TRUE 0.804 -15.000 0.083 NA   NA
 3584114 3584115 Tpet_0181 Tpet_0182     TRUE 0.923 -3.000 0.019 1.000 N NA
 3584115 3584116 Tpet_0182 Tpet_0183     TRUE 0.919 -3.000 0.006 NA   NA
 3584116 3584117 Tpet_0183 Tpet_0184     TRUE 0.941 0.000 1.000 NA   NA
 3584117 3584118 Tpet_0184 Tpet_0185     TRUE 0.786 7.000 0.024 NA   NA
 3584118 3584119 Tpet_0185 Tpet_0186     TRUE 0.763 6.000 0.040 NA   NA
 3584119 3584120 Tpet_0186 Tpet_0187     TRUE 0.871 0.000 0.222 NA   NA
 3584120 3584121 Tpet_0187 Tpet_0188     TRUE 0.704 2.000 0.005 1.000   NA
 3584121 3584122 Tpet_0188 Tpet_0189     TRUE 0.871 -3.000 0.002 1.000 N NA
 3584122 3584123 Tpet_0189 Tpet_0190     TRUE 0.682 3.000 0.056 1.000 N NA
 3584124 3584125 Tpet_0191 Tpet_0192     TRUE 0.840 12.000 0.013 NA   NA
 3584125 3584126 Tpet_0192 Tpet_0193     TRUE 0.731 6.000 0.013 NA   NA
 3584126 3584127 Tpet_0193 Tpet_0194     TRUE 0.978 -3.000 0.889 1.000 N NA
 3584127 3584128 Tpet_0194 Tpet_0195     TRUE 0.812 16.000 0.013 1.000 N NA
 3584128 3584129 Tpet_0195 Tpet_0196     TRUE 0.631 5.000 0.013 1.000 N NA
 3584129 3584130 Tpet_0196 Tpet_0197     TRUE 0.954 -3.000 0.172 NA   NA
 3584130 3584131 Tpet_0197 Tpet_0198     TRUE 0.811 -13.000 0.017 NA   NA
 3584131 3584132 Tpet_0198 Tpet_0199     TRUE 0.817 11.000 0.010 NA   NA
 3584132 3584133 Tpet_0199 Tpet_0200     TRUE 0.918 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3584133 3584134 Tpet_0200 Tpet_R0005     FALSE 0.253 57.000 0.000 NA   NA
 3584134 3584135 Tpet_R0005 Tpet_0201     FALSE 0.331 48.000 0.000 NA   NA
 3584135 3584136 Tpet_0201 Tpet_0202     FALSE 0.557 -16.000 0.000 NA   NA
 3584136 3584137 Tpet_0202 Tpet_0203     TRUE 0.949 -3.000 0.114 NA   NA
 3584139 3584140 Tpet_0205 Tpet_0206     TRUE 0.801 8.000 0.021 NA   NA
 3584140 3584141 Tpet_0206 Tpet_0207     TRUE 0.912 -3.000 0.004 NA   NA
 3584141 3584142 Tpet_0207 Tpet_0208     TRUE 0.785 15.000 0.004 1.000 N NA
 3584142 3584143 Tpet_0208 Tpet_0209     TRUE 0.929 -3.000 0.051 1.000 N NA
 3584143 3584144 Tpet_0209 Tpet_0210     TRUE 0.825 12.000 0.021 1.000 N NA
 3584144 3584145 Tpet_0210 Tpet_0211     TRUE 0.815 18.000 0.094 1.000 N NA
 3584145 3584146 Tpet_0211 Tpet_0212     TRUE 0.855 13.000 0.034 NA N NA
 3584146 3584147 Tpet_0212 Tpet_0213     FALSE 0.594 -24.000 0.017 NA   NA
 3584147 3584148 Tpet_0213 Tpet_0214     TRUE 0.822 10.000 0.013 1.000   NA
 3584148 3584149 Tpet_0214 Tpet_0215     TRUE 0.704 2.000 0.015 1.000 N NA
 3584149 3584150 Tpet_0215 Tpet_0216     TRUE 0.755 1.000 0.010 NA   NA
 3584150 3584151 Tpet_0216 Tpet_0217     TRUE 0.977 -3.000 0.667 NA   NA
 3584151 3584152 Tpet_0217 Tpet_0218     TRUE 0.738 45.000 0.400 NA   NA
 3584152 3584153 Tpet_0218 Tpet_0219     FALSE 0.503 3.000 0.000 NA   NA
 3584153 3584154 Tpet_0219 Tpet_0220     FALSE 0.228 61.000 0.000 NA   NA
 3584154 3584155 Tpet_0220 Tpet_0221     TRUE 0.647 5.000 0.005 1.000   NA
 3584155 3584156 Tpet_0221 Tpet_0222     TRUE 0.730 2.000 0.008 1.000   NA
 3584156 3584157 Tpet_0222 Tpet_0223     TRUE 0.899 -3.000 0.006 1.000 N NA
 3584158 3584159 Tpet_0224 Tpet_0225     TRUE 0.819 6.000 0.333 NA N NA
 3584161 3584162 Tpet_0227 Tpet_0228     TRUE 0.932 -3.000 0.011 1.000   NA
 3584162 3584163 Tpet_0228 Tpet_0229     TRUE 0.985 6.000 0.066 0.012 Y NA
 3584163 3584164 Tpet_0229 Tpet_0230     TRUE 0.913 4.000 0.125 1.000 Y NA
 3584164 3584165 Tpet_0230 Tpet_0231     TRUE 0.824 7.000 0.107 1.000   NA
 3584165 3584166 Tpet_0231 Tpet_0232   fliP TRUE 0.944 -3.000 0.032 1.000   NA
 3584166 3584167 Tpet_0232 Tpet_0233 fliP   TRUE 0.988 7.000 0.049 0.008 Y NA
 3584167 3584168 Tpet_0233 Tpet_0234     TRUE 0.914 13.000 0.200 NA   NA
 3584169 3584170 Tpet_0235 Tpet_0236     TRUE 0.893 -28.000 0.351 1.000 Y NA
 3584170 3584171 Tpet_0236 Tpet_0237     TRUE 0.632 27.000 0.003 NA   NA
 3584171 3584172 Tpet_0237 Tpet_0238     TRUE 0.686 6.000 0.005 NA   NA
 3584172 3584173 Tpet_0238 Tpet_0239     TRUE 0.921 -3.000 0.005 1.000   NA
 3584173 3584174 Tpet_0239 Tpet_0240     TRUE 0.918 -3.000 0.004 1.000   NA
 3584174 3584175 Tpet_0240 Tpet_0241     FALSE 0.456 46.000 0.003 1.000   NA
 3584175 3584176 Tpet_0241 Tpet_0242     TRUE 0.918 33.000 0.141 1.000 Y NA
 3584176 3584177 Tpet_0242 Tpet_0243     TRUE 0.946 53.000 0.009 0.007 Y NA
 3584177 3584178 Tpet_0243 Tpet_0244     TRUE 0.802 17.000 0.008 NA   NA
 3584178 3584179 Tpet_0244 Tpet_0245     TRUE 0.703 2.000 0.007 NA   NA
 3584181 3584182 Tpet_0247 Tpet_0248     TRUE 0.919 -3.000 0.007 NA   NA
 3584182 3584183 Tpet_0248 Tpet_0249     TRUE 0.881 -6.000 0.007 NA   NA
 3584185 3584186 Tpet_0251 Tpet_0252     TRUE 0.999 -3.000 0.508 0.002 Y NA
 3584186 3584187 Tpet_0252 Tpet_0253     TRUE 0.996 10.000 0.323 0.002 Y NA
 3584187 3584188 Tpet_0253 Tpet_0254     TRUE 0.954 10.000 0.043 1.000 Y NA
 3584188 3584189 Tpet_0254 Tpet_0255     TRUE 0.959 0.000 0.150 1.000 Y NA
 3584189 3584190 Tpet_0255 Tpet_0256     TRUE 0.939 5.000 0.301 NA Y NA
 3584190 3584191 Tpet_0256 Tpet_0257     TRUE 0.969 7.000 0.545 NA Y NA
 3584191 3584192 Tpet_0257 Tpet_0258     TRUE 0.966 0.000 0.298 NA Y NA
 3584192 3584193 Tpet_0258 Tpet_0259     TRUE 0.990 -3.000 0.304 NA Y NA
 3584193 3584194 Tpet_0259 Tpet_0260     TRUE 0.754 27.000 0.077 NA   NA
 3584195 3584196 Tpet_0261 Tpet_0262     TRUE 0.918 25.000 1.000 NA   NA
 3584197 3584198 Tpet_0263 Tpet_0264     TRUE 0.902 -3.000 0.009 NA N NA
 3584199 3584200 Tpet_0265 Tpet_0266     TRUE 0.959 -85.000 0.240 0.001 Y NA
 3584200 3584201 Tpet_0266 Tpet_0267     TRUE 0.943 -3.000 0.026 1.000   NA
 3584201 3584202 Tpet_0267 Tpet_0268     FALSE 0.387 -61.000 0.026 1.000   NA
 3584202 3584203 Tpet_0268 Tpet_0269     TRUE 0.699 34.000 0.048 1.000   NA
 3584204 3584205 Tpet_0270 Tpet_0271     TRUE 0.851 -9.000 0.010 NA   NA
 3584205 3584206 Tpet_0271 Tpet_0272     FALSE 0.130 160.000 0.010 NA   NA
 3584206 3584207 Tpet_0272 Tpet_0273     TRUE 0.987 11.000 0.056 0.054 Y NA
 3584207 3584208 Tpet_0273 Tpet_0274     TRUE 0.991 13.000 0.056 0.054 Y NA
 3584209 3584210 Tpet_0275 Tpet_0276     TRUE 0.730 25.000 0.051 1.000 N NA
 3584210 3584211 Tpet_0276 Tpet_0277     TRUE 0.926 5.000 0.161 1.000 Y NA
 3584211 3584212 Tpet_0277 Tpet_0278     FALSE 0.497 74.000 0.003 0.073 N NA
 3584212 3584213 Tpet_0278 Tpet_0279     TRUE 0.680 -37.000 0.003 0.058   NA
 3584213 3584214 Tpet_0279 Tpet_0280     TRUE 0.970 -13.000 0.385 0.058   NA
 3584214 3584215 Tpet_0280 Tpet_0281     FALSE 0.588 -73.000 0.636 NA   NA
 3584216 3584217 Tpet_0282 Tpet_0283     TRUE 0.676 -18.000 0.005 1.000   NA
 3584218 3584219 Tpet_0284 Tpet_0285     TRUE 0.711 27.000 0.067 1.000 N NA
 3584220 3584221 Tpet_0286 Tpet_0287     TRUE 0.785 14.000 0.000 1.000   NA
 3584221 3584222 Tpet_0287 Tpet_0288     FALSE 0.515 5.000 0.000 1.000   NA
 3584222 3584223 Tpet_0288 Tpet_0289     TRUE 0.883 -10.000 0.136 NA   NA
 3584223 3584224 Tpet_0289 Tpet_0290     TRUE 0.847 2.000 0.300 NA   NA
 3584225 3584226 Tpet_0291 Tpet_0292     TRUE 0.938 15.000 0.429 NA   NA
 3584226 3584227 Tpet_0292 Tpet_0293     TRUE 0.930 19.000 0.800 NA   NA
 3584227 3584228 Tpet_0293 Tpet_0294     TRUE 0.944 -7.000 0.400 NA   NA
 3584228 3584229 Tpet_0294 Tpet_0295     TRUE 0.688 43.000 0.182 1.000   NA
 3584229 3584230 Tpet_0295 Tpet_0296     TRUE 0.689 26.000 0.023 NA N NA
 3584230 3584231 Tpet_0296 Tpet_0297     TRUE 0.887 -21.000 0.023 NA Y NA
 3584231 3584232 Tpet_0297 Tpet_0298     FALSE 0.060 182.000 0.000 NA   NA
 3584232 3584233 Tpet_0298 Tpet_0299     FALSE 0.051 210.000 0.000 NA   NA
 3584233 3584234 Tpet_0299 Tpet_0300     FALSE 0.515 5.000 0.000 1.000   NA
 3584234 3584235 Tpet_0300 Tpet_0301     TRUE 0.653 36.000 0.022 NA   NA
 3584235 3584236 Tpet_0301 Tpet_0302     FALSE 0.330 62.000 0.005 NA   NA
 3584236 3584237 Tpet_0302 Tpet_0303     TRUE 0.749 19.000 0.005 NA   NA
 3584237 3584238 Tpet_0303 Tpet_0304     FALSE 0.547 -49.000 0.333 NA   NA
 3584239 3584240 Tpet_0305 Tpet_0306     FALSE 0.042 335.000 0.000 1.000   NA
 3584240 3584241 Tpet_0306 Tpet_0307     FALSE 0.586 2.000 0.000 1.000   NA
 3584241 3584242 Tpet_0307 Tpet_0308     TRUE 0.892 21.000 0.000 1.000 Y NA
 3584242 3584243 Tpet_0308 Tpet_0309     TRUE 0.985 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 3584243 3584244 Tpet_0309 Tpet_0310     TRUE 0.727 6.000 0.012 NA   NA
 3584244 3584245 Tpet_0310 Tpet_0311     TRUE 0.795 0.000 0.012 NA   NA
 3584247 3584248 Tpet_0313 Tpet_0314     TRUE 0.818 15.000 0.008 1.000 N NA
 3584248 3584249 Tpet_0314 Tpet_0315     TRUE 0.752 0.000 0.011 1.000 N NA
 3584249 3584250 Tpet_0315 Tpet_0316     FALSE 0.183 77.000 0.003 1.000 N NA
 3584250 3584251 Tpet_0316 Tpet_0317     TRUE 0.827 21.000 0.143 NA   NA
 3584251 3584252 Tpet_0317 Tpet_0318     TRUE 0.926 -3.000 0.010 NA   NA
 3584252 3584253 Tpet_0318 Tpet_0319     TRUE 0.634 4.000 0.010 NA   NA
 3584253 3584254 Tpet_0319 Tpet_0320     TRUE 0.785 14.000 0.000 1.000   NA
 3584254 3584255 Tpet_0320 Tpet_0321     TRUE 0.989 10.000 0.278 0.069 Y NA
 3584256 3584257 Tpet_0322 Tpet_0323     FALSE 0.486 125.000 0.107 0.069   NA
 3584257 3584258 Tpet_0323 Tpet_0324     TRUE 0.873 39.000 0.107 0.084   NA
 3584258 3584259 Tpet_0324 Tpet_0325     TRUE 0.991 15.000 0.217 0.084 Y NA
 3584259 3584260 Tpet_0325 Tpet_0326     TRUE 0.986 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 3584261 3584262 Tpet_0327 Tpet_0328     TRUE 0.941 -3.000 0.053 NA   NA
 3584262 3584263 Tpet_0328 Tpet_0329     TRUE 0.972 -3.000 0.500 NA   NA
 3584263 3584264 Tpet_0329 Tpet_0330     TRUE 0.833 0.000 0.082 NA   NA
 3584265 3584266 Tpet_0331 Tpet_0332     TRUE 0.969 -3.000 0.005 0.098 N NA
 3584266 3584267 Tpet_0332 Tpet_0333     FALSE 0.347 -70.000 0.013 1.000   NA
 3584267 3584268 Tpet_0333 Tpet_0334     TRUE 0.941 -3.000 0.020 1.000   NA
 3584269 3584270 Tpet_0335 Tpet_0336     TRUE 0.895 -6.000 0.035 1.000 N NA
 3584270 3584271 Tpet_0336 Tpet_0337     FALSE 0.430 -40.000 0.055 NA   NA
 3584271 3584272 Tpet_0337 Tpet_0338     TRUE 0.941 -3.000 0.055 NA   NA
 3584272 3584273 Tpet_0338 Tpet_0339     TRUE 0.796 -13.000 0.051 1.000 N NA
 3584273 3584274 Tpet_0339 Tpet_R0006     FALSE 0.211 64.000 0.000 NA   NA
 3584275 3584276 Tpet_0340 Tpet_0341     TRUE 0.736 1.000 0.015 1.000 N NA
 3584277 3584278 Tpet_0342 Tpet_0343     TRUE 0.945 -13.000 0.012 1.000 Y NA
 3584278 3584279 Tpet_0343 Tpet_0344     FALSE 0.183 83.000 0.005 1.000 N NA
 3584279 3584280 Tpet_0344 Tpet_0345     FALSE 0.415 -25.000 0.004 1.000 N NA
 3584280 3584281 Tpet_0345 Tpet_0346     TRUE 0.975 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 3584281 3584282 Tpet_0346 Tpet_0347     FALSE 0.238 97.000 0.091 1.000 N NA
 3584283 3584284 Tpet_0348 Tpet_0349     TRUE 0.924 -3.000 0.006 1.000   NA
 3584284 3584285 Tpet_0349 Tpet_0350     TRUE 0.825 0.000 0.022 1.000   NA
 3584285 3584286 Tpet_0350 Tpet_0351     TRUE 0.779 2.000 0.200 NA N NA
 3584287 3584288 Tpet_0352 Tpet_0353     TRUE 0.619 4.000 0.008 NA   NA
 3584288 3584289 Tpet_0353 Tpet_0354     TRUE 0.922 -3.000 0.008 NA   NA
 3584289 3584290 Tpet_0354 Tpet_0355     FALSE 0.516 -79.000 0.375 1.000   NA
 3584290 3584291 Tpet_0355 Tpet_0356     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA   NA
 3584293 3584294 Tpet_0358 Tpet_0359     FALSE 0.128 130.000 0.010 1.000 N NA
 3584294 3584295 Tpet_0359 Tpet_0360     FALSE 0.292 82.000 0.014 1.000   NA
 3584295 3584296 Tpet_0360 Tpet_0361     FALSE 0.115 98.000 0.000 NA   NA
 3584297 3584298 Tpet_0362 Tpet_0363     TRUE 0.996 0.000 0.345 0.001 Y NA
 3584299 3584300 Tpet_0364 Tpet_0365     TRUE 0.981 4.000 0.025 0.004 Y NA
 3584300 3584301 Tpet_0365 Tpet_0366     TRUE 0.985 5.000 0.031 0.003 Y NA
 3584301 3584302 Tpet_0366 Tpet_0367     TRUE 0.989 2.000 0.086 0.004 Y NA
 3584302 3584303 Tpet_0367 Tpet_0368     TRUE 0.993 -13.000 0.023 0.001 Y NA
 3584303 3584304 Tpet_0368 Tpet_0369     TRUE 0.963 13.000 0.008 1.000 Y NA
 3584304 3584305 Tpet_0369 Tpet_0370     TRUE 0.994 -10.000 0.022 0.003 Y NA
 3584305 3584306 Tpet_0370 Tpet_0371     TRUE 0.990 0.000 0.006 0.003 Y NA
 3584306 3584307 Tpet_0371 Tpet_0372     TRUE 0.998 -3.000 0.143 0.001 Y NA
 3584308 3584309 Tpet_0373 Tpet_0374     TRUE 0.936 0.000 0.006 1.000 Y NA
 3584309 3584310 Tpet_0374 Tpet_0375     TRUE 0.989 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 3584310 3584311 Tpet_0375 Tpet_0376     TRUE 0.767 12.000 0.005 1.000 N NA
 3584311 3584312 Tpet_0376 Tpet_0377     FALSE 0.532 -18.000 0.000 NA   NA
 3584313 3584314 Tpet_0379 Tpet_0380     TRUE 0.921 6.000 0.012 1.000 Y NA
 3584314 3584315 Tpet_0380 Tpet_0381     TRUE 0.995 -10.000 0.024 0.001 Y NA
 3584316 3584317 Tpet_0382 Tpet_0383     TRUE 0.888 14.000 0.014 1.000   NA
 3584318 3584319 Tpet_0384 Tpet_0385     TRUE 0.959 -3.000 0.231 NA   NA
 3584319 3584320 Tpet_0385 Tpet_0386     FALSE 0.187 184.000 0.222 NA   NA
 3584320 3584321 Tpet_0386 Tpet_0387     TRUE 0.847 7.000 0.222 NA   NA
 3584321 3584322 Tpet_0387 Tpet_0388     TRUE 0.840 2.000 0.375 1.000 N NA
 3584322 3584323 Tpet_0388 Tpet_0389     TRUE 0.990 14.000 0.065 0.069 Y NA
 3584323 3584324 Tpet_0389 Tpet_0390     TRUE 0.929 59.000 0.222 0.069 Y NA
 3584324 3584325 Tpet_0390 Tpet_0391     TRUE 0.863 16.000 0.143 1.000 N NA
 3584325 3584326 Tpet_0391 Tpet_0392     TRUE 0.848 17.000 0.154 1.000 N NA
 3584326 3584327 Tpet_0392 Tpet_0393     TRUE 0.869 -3.000 0.002 1.000 N NA
 3584327 3584328 Tpet_0393 Tpet_0394     TRUE 0.907 -3.000 0.003 1.000   NA
 3584328 3584329 Tpet_0394 Tpet_0395     TRUE 0.880 14.000 0.010 1.000   NA
 3584329 3584330 Tpet_0395 Tpet_0396     TRUE 0.675 37.000 0.040 1.000   NA
 3584330 3584331 Tpet_0396 Tpet_0397     TRUE 0.940 -3.000 0.030 NA   NA
 3584331 3584332 Tpet_0397 Tpet_0398     FALSE 0.051 210.000 0.000 NA   NA
 3584332 3584333 Tpet_0398 Tpet_0399   hslU TRUE 0.791 11.000 0.005 NA   NA
 3584333 3584334 Tpet_0399 Tpet_0400 hslU   TRUE 0.985 12.000 0.752 1.000 Y NA
 3584335 3584336 Tpet_0401 Tpet_0402     TRUE 0.885 -3.000 0.005 NA N NA
 3584337 3584338 Tpet_0403 Tpet_0404     TRUE 0.944 -3.000 0.077 NA   NA
 3584338 3584339 Tpet_0404 Tpet_0405     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA   NA
 3584339 3584340 Tpet_0405 Tpet_0407     FALSE 0.494 -19.000 0.000 NA   NA
 3584341 3584342 Tpet_0408 Tpet_0409     TRUE 0.888 -3.000 0.004 1.000 N NA
 3584344 3584345 Tpet_0411 Tpet_0412     TRUE 0.732 2.000 0.055 1.000 N NA
 3584345 3584346 Tpet_0412 Tpet_0413     TRUE 0.930 -3.000 0.064 1.000 N NA
 3584346 3584347 Tpet_0413 Tpet_0414     FALSE 0.444 -28.000 0.012 1.000 N NA
 3584348 3584349 Tpet_0415 Tpet_0416     TRUE 0.994 15.000 0.111 0.007 Y NA
 3584349 3584350 Tpet_0416 Tpet_R0007     FALSE 0.054 198.000 0.000 NA   NA
 3584351 3584352 Tpet_0417 Tpet_0418     TRUE 0.995 14.000 0.535 0.068 Y NA
 3584352 3584353 Tpet_0418 Tpet_0419     TRUE 0.978 13.000 0.224 1.000 Y NA
 3584353 3584354 Tpet_0419 Tpet_0420     TRUE 0.983 4.000 0.245 0.012 Y NA
 3584354 3584355 Tpet_0420 Tpet_0421     TRUE 0.948 -3.000 0.111 NA   NA
 3584355 3584356 Tpet_0421 Tpet_0422     TRUE 0.906 13.000 0.150 NA   NA
 3584356 3584357 Tpet_0422 Tpet_0423     TRUE 0.775 -16.000 0.036 1.000   NA
 3584357 3584358 Tpet_0423 Tpet_0424     TRUE 0.892 13.000 0.036 1.000   NA
 3584358 3584359 Tpet_0424 Tpet_0425     TRUE 0.651 5.000 0.019 1.000 N NA
 3584360 3584361 Tpet_0426 Tpet_0427     TRUE 0.810 -22.000 0.570 NA   NA
 3584361 3584362 Tpet_0427 Tpet_0428     TRUE 0.825 10.000 0.022 NA   NA
 3584363 3584364 Tpet_0429 Tpet_0430     TRUE 0.656 -28.000 0.273 NA   NA
 3584364 3584365 Tpet_0430 Tpet_0431     TRUE 0.950 -3.000 0.136 NA   NA
 3584366 3584367 Tpet_0432 Tpet_0433     FALSE 0.379 -51.000 0.022 NA   NA
 3584368 3584369 Tpet_0434 Tpet_0435     TRUE 0.689 -28.000 0.364 NA   NA
 3584369 3584370 Tpet_0435 Tpet_0436     TRUE 0.993 -3.000 0.584 NA Y NA
 3584370 3584371 Tpet_0436 Tpet_0437     TRUE 0.984 -3.000 0.040 NA Y NA
 3584373 3584374 Tpet_R0008 Tpet_R0009     FALSE 0.556 6.000 0.000 NA   NA
 3584374 3584375 Tpet_R0009 Tpet_R0010     TRUE 0.708 12.000 0.000 NA   NA
 3584375 3584376 Tpet_R0010 Tpet_0439     FALSE 0.154 79.000 0.000 NA   NA
 3584376 3584377 Tpet_0439 Tpet_0440     TRUE 0.901 -3.000 0.003 NA   NA
 3584377 3584378 Tpet_0440 Tpet_0441     TRUE 0.721 20.000 0.003 1.000   NA
 3584378 3584379 Tpet_0441 Tpet_0442     TRUE 0.682 5.000 0.011 1.000   NA
 3584379 3584380 Tpet_0442 Tpet_0443     FALSE 0.206 83.000 0.003 NA   NA
 3584380 3584381 Tpet_0443 Tpet_0444     TRUE 0.821 35.000 0.500 NA   NA
 3584381 3584382 Tpet_0444 Tpet_R0011     FALSE 0.197 68.000 0.000 NA   NA
 3584382 3584383 Tpet_R0011 Tpet_0445     FALSE 0.424 38.000 0.000 NA   NA
 3584383 3584384 Tpet_0445 Tpet_0446     TRUE 0.766 11.000 0.007 1.000 N NA
 3584384 3584385 Tpet_0446 Tpet_0447     TRUE 0.963 14.000 0.005 1.000 Y NA
 3584385 3584386 Tpet_0447 Tpet_0448     TRUE 0.893 4.000 0.024 NA Y NA
 3584386 3584387 Tpet_0448 Tpet_0449     TRUE 0.972 -3.000 0.500 NA   NA
 3584387 3584388 Tpet_0449 Tpet_0450     FALSE 0.080 134.000 0.000 NA   NA
 3584388 3584389 Tpet_0450 Tpet_0451     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA   NA
 3584389 3584390 Tpet_0451 Tpet_0452     TRUE 0.898 -7.000 0.060 NA   NA
 3584390 3584391 Tpet_0452 Tpet_0453     TRUE 0.977 -7.000 0.151 1.000 Y NA
 3584391 3584392 Tpet_0453 Tpet_0454     TRUE 0.764 0.000 0.006 NA   NA
 3584392 3584393 Tpet_0454 Tpet_0455     TRUE 0.706 9.000 0.002 NA   NA
 3584393 3584394 Tpet_0455 Tpet_0456     TRUE 0.625 38.000 0.015 NA   NA
 3584394 3584395 Tpet_0456 Tpet_0457     TRUE 0.761 1.000 0.053 1.000 N NA
 3584395 3584396 Tpet_0457 Tpet_0458     FALSE 0.273 -142.000 0.018 1.000 N NA
 3584396 3584397 Tpet_0458 Tpet_0459     TRUE 0.901 -3.000 0.007 1.000 N NA
 3584397 3584398 Tpet_0459 Tpet_0460     FALSE 0.371 61.000 0.024 1.000 N NA
 3584399 3584400 Tpet_0461 Tpet_0462     TRUE 0.998 17.000 0.851 0.002 Y NA
 3584400 3584401 Tpet_0462 Tpet_0463     FALSE 0.156 191.000 0.223 1.000 N NA
 3584401 3584402 Tpet_0463 Tpet_0464     TRUE 0.996 16.000 0.884 0.026 Y NA
 3584402 3584403 Tpet_0464 Tpet_0465   rplA TRUE 0.833 142.000 0.302 0.035 Y NA
 3584403 3584404 Tpet_0465 Tpet_0466 rplA   TRUE 0.993 24.000 0.838 0.035 Y NA
 3584404 3584405 Tpet_0466 Tpet_0467     TRUE 0.745 48.000 0.681 1.000 N NA
 3584405 3584406 Tpet_0467 Tpet_0468     TRUE 0.943 12.000 0.843 1.000 N NA
 3584406 3584407 Tpet_0468 Tpet_R0012     FALSE 0.531 27.000 0.000 NA   NA
 3584407 3584408 Tpet_R0012 Tpet_0469     FALSE 0.492 5.000 0.000 NA   NA
 3584408 3584409 Tpet_0469 Tpet_R0013     FALSE 0.544 26.000 0.000 NA   NA
 3584409 3584410 Tpet_R0013 Tpet_R0014     TRUE 0.661 10.000 0.000 NA   NA
 3584410 3584411 Tpet_R0014 Tpet_R0015     FALSE 0.578 24.000 0.000 NA   NA
 3584411 3584412 Tpet_R0015 Tpet_R0016     FALSE 0.107 107.000 0.000 NA   NA
 3584413 3584414 Tpet_0470 Tpet_0471   thyX FALSE 0.209 91.000 0.007 NA   NA
 3584414 3584415 Tpet_0471 Tpet_0472 thyX   TRUE 0.902 -3.000 0.007 1.000 N NA
 3584415 3584416 Tpet_0472 Tpet_0473     TRUE 0.848 14.000 0.011 1.000 N NA
 3584416 3584417 Tpet_0473 Tpet_0474     TRUE 0.995 -12.000 0.141 0.002 Y NA
 3584417 3584418 Tpet_0474 Tpet_0475     FALSE 0.141 121.000 0.003 1.000   NA
 3584418 3584419 Tpet_0475 Tpet_0476   aspA TRUE 0.956 -3.000 0.171 1.000   NA
 3584420 3584421 Tpet_0477 Tpet_0478     TRUE 0.946 -3.000 0.088 NA   NA
 3584421 3584422 Tpet_0478 Tpet_0479     TRUE 0.903 14.000 0.088 NA   NA
 3584422 3584423 Tpet_0479 Tpet_0480     TRUE 0.779 6.000 0.088 NA   NA
 3584423 3584424 Tpet_0480 Tpet_0481     TRUE 0.808 7.000 0.088 NA   NA
 3584424 3584425 Tpet_0481 Tpet_0482     TRUE 0.962 -3.000 0.375 1.000 N NA
 3584425 3584426 Tpet_0482 Tpet_0483     TRUE 0.879 18.000 0.333 1.000 N NA
 3584426 3584427 Tpet_0483 Tpet_0484     TRUE 0.724 3.000 0.143 1.000 N NA
 3584428 3584429 Tpet_0485 Tpet_0486     TRUE 0.815 64.000 0.000 0.067 Y NA
 3584429 3584430 Tpet_0486 Tpet_0487     TRUE 0.973 11.000 0.000 0.067 Y NA
 3584430 3584431 Tpet_0487 Tpet_0488     TRUE 0.875 2.000 0.000 1.000 Y NA
 3584431 3584432 Tpet_0488 Tpet_0489     TRUE 0.993 -13.000 0.333 0.012 Y NA
 3584432 3584433 Tpet_0489 Tpet_0490     FALSE 0.472 26.000 0.000 1.000 N NA
 3584433 3584434 Tpet_0490 Tpet_0491     FALSE 0.037 412.000 0.000 NA   NA
 3584434 3584435 Tpet_0491 Tpet_0492     FALSE 0.062 180.000 0.000 NA   NA
 3584435 3584436 Tpet_0492 Tpet_0493     TRUE 0.996 -3.000 0.062 0.050 Y NA
 3584436 3584437 Tpet_0493 Tpet_0494     TRUE 0.987 -3.000 0.143 0.050   NA
 3584437 3584438 Tpet_0494 Tpet_0495     TRUE 0.983 -6.000 0.214 0.050   NA
 3584438 3584439 Tpet_0495 Tpet_0496     TRUE 0.919 13.000 0.200 1.000   NA
 3584442 3584443 Tpet_0499 Tpet_0500     TRUE 0.948 19.000 0.079 NA Y NA
 3584443 3584444 Tpet_0500 Tpet_0501     TRUE 0.993 0.000 0.789 0.067 Y NA
 3584444 3584445 Tpet_0501 Tpet_0502     TRUE 0.993 0.000 0.775 0.067 Y NA
 3584445 3584446 Tpet_0502 Tpet_0503     TRUE 0.981 37.000 0.625 0.067 Y NA
 3584446 3584447 Tpet_0503 Tpet_0504     FALSE 0.216 210.000 0.000 NA Y NA
 3584447 3584448 Tpet_0504 Tpet_0505     TRUE 0.756 -34.000 0.011 NA Y NA
 3584448 3584449 Tpet_0505 Tpet_0506     TRUE 0.928 -3.000 0.011 NA   NA
 3584449 3584450 Tpet_0506 Tpet_0507     TRUE 0.730 5.000 0.062 1.000   NA
 3584450 3584451 Tpet_0507 Tpet_0508     TRUE 0.652 47.000 0.182 1.000   NA
 3584451 3584452 Tpet_0508 Tpet_0509     TRUE 0.894 14.000 0.136 1.000 N NA
 3584452 3584453 Tpet_0509 Tpet_0510     FALSE 0.152 143.000 0.014 NA   NA
 3584453 3584454 Tpet_0510 Tpet_0511     TRUE 0.936 -3.000 0.019 NA   NA
 3584454 3584455 Tpet_0511 Tpet_0512     TRUE 0.875 14.000 0.047 1.000 N NA
 3584455 3584456 Tpet_0512 Tpet_0513     FALSE 0.429 -37.000 0.085 1.000 N NA
 3584456 3584457 Tpet_0513 Tpet_0514     TRUE 0.741 -19.000 0.200 1.000 N NA
 3584457 3584458 Tpet_0514 Tpet_0515     TRUE 0.997 -3.000 0.105 0.007 Y NA
 3584458 3584459 Tpet_0515 Tpet_0516     TRUE 0.925 -3.000 0.022 1.000 N NA
 3584459 3584460 Tpet_0516 Tpet_0517     FALSE 0.104 144.000 0.007 1.000 N NA
 3584460 3584461 Tpet_0517 Tpet_0518     TRUE 0.888 14.000 0.103 1.000 N NA
 3584463 3584464 Tpet_0520 Tpet_0521     TRUE 0.949 -19.000 0.400 1.000 Y NA
 3584465 3584466 Tpet_R0017 Tpet_0522     FALSE 0.065 164.000 0.000 NA   NA
 3584466 3584467 Tpet_0522 Tpet_0523     TRUE 0.987 -7.000 0.588 1.000 Y NA
 3584467 3584468 Tpet_0523 Tpet_0524     TRUE 0.986 -6.000 0.268 0.016 N NA
 3584468 3584469 Tpet_0524 Tpet_0525     TRUE 0.994 -3.000 0.788 0.052   NA
 3584469 3584470 Tpet_0525 Tpet_0526     TRUE 0.970 -12.000 0.257 0.050   NA
 3584471 3584472 Tpet_0527 Tpet_0528     TRUE 0.818 5.000 0.533 NA N NA
 11490112 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3024.000 0.000 NA   NA
 11632475 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3024.000 0.000 NA   NA
 11774867 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3024.000 0.000 NA   NA
 11490113 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3054.000 0.000 NA   NA
 11632476 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3054.000 0.000 NA   NA
 11774868 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3054.000 0.000 NA   NA
 11490114 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3090.000 0.000 NA   NA
 11632477 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3090.000 0.000 NA   NA
 11774869 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3090.000 0.000 NA   NA
 11490115 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3120.000 0.000 NA   NA
 11632478 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3120.000 0.000 NA   NA
 11774870 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3120.000 0.000 NA   NA
 11490116 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3157.000 0.000 NA   NA
 11632479 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3157.000 0.000 NA   NA
 11774871 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3157.000 0.000 NA   NA
 11490117 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3187.000 0.000 NA   NA
 11632480 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3187.000 0.000 NA   NA
 11774872 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3187.000 0.000 NA   NA
 11490118 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3226.000 0.000 NA   NA
 11632481 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3226.000 0.000 NA   NA
 11774873 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3226.000 0.000 NA   NA
 11490119 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3256.000 0.000 NA   NA
 11632482 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3256.000 0.000 NA   NA
 11774874 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3256.000 0.000 NA   NA
 11490120 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3293.000 0.000 NA   NA
 11632483 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3293.000 0.000 NA   NA
 11774875 3584470   Tpet_0526     FALSE NA 3293.000 0.000 NA   NA
 3584473 3584474 Tpet_0529 Tpet_0530     FALSE 0.519 107.000 0.011 1.000 Y NA
 3584474 3584475 Tpet_0530 Tpet_0531     TRUE 0.761 25.000 0.025 NA   NA
 3584475 3584476 Tpet_0531 Tpet_0532     FALSE 0.571 46.000 0.024 NA   NA
 3584478 3584479 Tpet_0534 Tpet_0535     FALSE 0.235 132.000 0.167 1.000   NA
 3584479 3584480 Tpet_0535 Tpet_0536     TRUE 0.617 -34.000 0.282 1.000   NA
 3584480 3584481 Tpet_0536 Tpet_0537     FALSE 0.241 82.000 0.015 1.000 N NA
 3584482 3584483 Tpet_0538 Tpet_0539     TRUE 0.772 -7.000 0.000 NA   NA
 3584483 3584484 Tpet_0539 Tpet_0540     TRUE 0.986 -3.000 0.082 1.000 Y NA
 11490121 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4119.000 0.000 NA   NA
 11632484 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4119.000 0.000 NA   NA
 11774876 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4119.000 0.000 NA   NA
 11490122 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4149.000 0.000 NA   NA
 11632485 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4149.000 0.000 NA   NA
 11774877 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4149.000 0.000 NA   NA
 11490123 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4184.000 0.000 NA   NA
 11632486 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4184.000 0.000 NA   NA
 11774878 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4184.000 0.000 NA   NA
 11490124 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4214.000 0.000 NA   NA
 11632487 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4214.000 0.000 NA   NA
 11774879 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4214.000 0.000 NA   NA
 11490125 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4251.000 0.000 NA   NA
 11632488 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4251.000 0.000 NA   NA
 11774880 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4251.000 0.000 NA   NA
 11490126 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4281.000 0.000 NA   NA
 11632489 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4281.000 0.000 NA   NA
 11774881 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4281.000 0.000 NA   NA
 11490127 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4320.000 0.000 NA   NA
 11632490 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4320.000 0.000 NA   NA
 11774882 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4320.000 0.000 NA   NA
 11490128 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4350.000 0.000 NA   NA
 11632491 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4350.000 0.000 NA   NA
 11774883 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4350.000 0.000 NA   NA
 11490129 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4386.000 0.000 NA   NA
 11632492 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4386.000 0.000 NA   NA
 11774884 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4386.000 0.000 NA   NA
 11490130 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4416.000 0.000 NA   NA
 11632493 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4416.000 0.000 NA   NA
 11774885 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4416.000 0.000 NA   NA
 11490131 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4452.000 0.000 NA   NA
 11632494 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4452.000 0.000 NA   NA
 11774886 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4452.000 0.000 NA   NA
 11490132 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4482.000 0.000 NA   NA
 11632495 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4482.000 0.000 NA   NA
 11774887 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4482.000 0.000 NA   NA
 11490133 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4518.000 0.000 NA   NA
 11632496 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4518.000 0.000 NA   NA
 11774888 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4518.000 0.000 NA   NA
 11490134 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4548.000 0.000 NA   NA
 11632497 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4548.000 0.000 NA   NA
 11774889 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4548.000 0.000 NA   NA
 11490135 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4584.000 0.000 NA   NA
 11632498 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4584.000 0.000 NA   NA
 11774890 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4584.000 0.000 NA   NA
 11490136 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4614.000 0.000 NA   NA
 11632499 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4614.000 0.000 NA   NA
 11774891 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4614.000 0.000 NA   NA
 11490137 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4652.000 0.000 NA   NA
 11632500 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4652.000 0.000 NA   NA
 11774892 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4652.000 0.000 NA   NA
 11490138 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4682.000 0.000 NA   NA
 11632501 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4682.000 0.000 NA   NA
 11774893 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4682.000 0.000 NA   NA
 11490139 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4716.000 0.000 NA   NA
 11632502 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4716.000 0.000 NA   NA
 11774894 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4716.000 0.000 NA   NA
 11490140 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4746.000 0.000 NA   NA
 11632503 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4746.000 0.000 NA   NA
 11774895 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4746.000 0.000 NA   NA
 11490141 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4783.000 0.000 NA   NA
 11632504 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4783.000 0.000 NA   NA
 11774896 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4783.000 0.000 NA   NA
 11490142 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4813.000 0.000 NA   NA
 11632505 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4813.000 0.000 NA   NA
 11774897 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4813.000 0.000 NA   NA
 11490143 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4850.000 0.000 NA   NA
 11632506 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4850.000 0.000 NA   NA
 11774898 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4850.000 0.000 NA   NA
 11490144 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4880.000 0.000 NA   NA
 11632507 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4880.000 0.000 NA   NA
 11774899 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4880.000 0.000 NA   NA
 11490145 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4918.000 0.000 NA   NA
 11632508 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4918.000 0.000 NA   NA
 11774900 3584480   Tpet_0536     FALSE NA 4918.000 0.000 NA   NA
 3584485 3584486 Tpet_0541 Tpet_0542     FALSE 0.335 79.000 0.055 1.000   NA
 3584487 3584488 Tpet_0543 Tpet_0544     TRUE 0.951 16.000 0.008 NA Y NA
 3584491 3584492 Tpet_0547 Tpet_0548     TRUE 0.951 -3.000 0.227 1.000 N NA
 3584493 3584494 Tpet_0549 Tpet_0550     FALSE 0.084 140.000 0.000 1.000   NA
 3584494 3584495 Tpet_0550 Tpet_0551     FALSE 0.331 48.000 0.000 NA   NA
 3584495 3584496 Tpet_0551 Tpet_0552     FALSE 0.522 -28.000 0.018 NA   NA
 3584496 3584497 Tpet_0552 Tpet_0553     TRUE 0.797 10.000 0.024 1.000 N NA
 3584497 3584498 Tpet_0553 Tpet_0554     TRUE 0.779 0.000 0.021 1.000 N NA
 3584498 3584499 Tpet_0554 Tpet_0555     TRUE 0.898 -3.000 0.008 NA N NA
 3584499 3584500 Tpet_0555 Tpet_0556     TRUE 0.659 2.000 0.010 NA N NA
 3584502 3584503 Tpet_0558 Tpet_0559     TRUE 0.861 -6.000 0.003 1.000   NA
 3584505 3584506 Tpet_0561 Tpet_0562     TRUE 0.714 3.000 0.025 NA   NA
 3584506 3584507 Tpet_0562 Tpet_0563     FALSE 0.147 82.000 0.000 NA   NA
 3584507 3584508 Tpet_0563 Tpet_0564     FALSE 0.037 214.000 0.000 1.000 N NA
 3584509 3584510 Tpet_0565 Tpet_0566     TRUE 0.994 16.000 0.545 0.062 Y NA
 3584510 3584511 Tpet_0566 Tpet_0567     TRUE 0.991 -3.000 0.304 1.000 Y NA
 3584511 3584512 Tpet_0567 Tpet_0568     TRUE 0.958 -3.000 0.304 1.000 N NA
 3584512 3584513 Tpet_0568 Tpet_0569     TRUE 0.978 -13.000 0.636 1.000 Y NA
 3584513 3584514 Tpet_0569 Tpet_0570     FALSE 0.108 1187.000 0.000 0.088 N NA
 3584515 3584516 Tpet_0571 Tpet_0572     TRUE 0.997 -3.000 0.014 0.003 Y NA
 3584516 3584517 Tpet_0572 Tpet_0573     TRUE 0.949 -52.000 0.110 0.003 Y NA
 3584517 3584518 Tpet_0573 Tpet_0574     TRUE 0.981 -3.000 0.008 1.000 Y NA
 3584518 3584519 Tpet_0574 Tpet_0575     TRUE 0.980 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 3584519 3584520 Tpet_0575 Tpet_0576     TRUE 0.986 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 3584520 3584521 Tpet_0576 Tpet_0577     TRUE 0.980 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 3584521 3584522 Tpet_0577 Tpet_0578     FALSE 0.032 257.000 0.000 1.000 N NA
 3584522 3584523 Tpet_0578 Tpet_0579     FALSE 0.055 196.000 0.000 NA   NA
 3584523 3584524 Tpet_0579 Tpet_0580     TRUE 0.772 -7.000 0.000 NA   NA
 3584525 3584526 Tpet_0581 Tpet_0582     FALSE 0.147 82.000 0.000 NA   NA
 3584526 3584527 Tpet_0582 Tpet_0583     TRUE 0.974 -3.000 0.009 0.063 N NA
 3584527 3584528 Tpet_0583 Tpet_0584   pyrC TRUE 0.599 27.000 0.004 1.000 N NA
 3584528 3584529 Tpet_0584 Tpet_0585 pyrC   FALSE 0.409 -37.000 0.053 1.000 N NA
 3584529 3584530 Tpet_0585 Tpet_0586     TRUE 0.918 -12.000 0.592 1.000 N NA
 3584530 3584531 Tpet_0586 Tpet_0587     TRUE 0.998 -3.000 0.154 0.002 Y NA
 3584531 3584532 Tpet_0587 Tpet_0588   pyrE TRUE 0.985 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 3584532 3584533 Tpet_0588 Tpet_0589 pyrE   TRUE 0.935 -3.000 0.013 1.000   NA
 3584533 3584534 Tpet_0589 Tpet_0590     TRUE 0.681 -25.000 0.231 NA   NA
 3584535 3584536 Tpet_0591 Tpet_R0018     FALSE 0.458 34.000 0.000 NA   NA
 3584536 3584537 Tpet_R0018 Tpet_0592     FALSE 0.409 40.000 0.000 NA   NA
 3584537 3584538 Tpet_0592 Tpet_0593     FALSE 0.584 18.000 0.000 1.000 N NA
 3584538 3584539 Tpet_0593 Tpet_0594     TRUE 0.694 13.000 0.000 1.000 N NA
 3584539 3584540 Tpet_0594 Tpet_0595     TRUE 0.927 16.000 0.583 1.000 N NA
 3584540 3584541 Tpet_0595 Tpet_0596     TRUE 0.973 2.000 0.846 NA Y NA
 3584541 3584542 Tpet_0596 Tpet_0597     TRUE 0.886 63.000 0.846 NA Y NA
 3584544 3584545 Tpet_0599 Tpet_0600     TRUE 0.988 28.000 0.080 0.002 Y NA
 3584545 3584546 Tpet_0600 Tpet_0601     FALSE 0.589 -25.000 0.034 NA   NA
 3584546 3584547 Tpet_0601 Tpet_0602     TRUE 0.896 -7.000 0.037 NA   NA
 3584549 3584550 Tpet_0604 Tpet_0605     TRUE 0.976 14.000 0.120 0.045   NA
 3584550 3584551 Tpet_0605 Tpet_0606     FALSE 0.458 60.000 0.080 NA   NA
 3584551 3584552 Tpet_0606 Tpet_0607     FALSE 0.310 96.000 0.167 NA   NA
 3584552 3584553 Tpet_0607 Tpet_0608     TRUE 0.659 44.000 0.250 1.000 N NA
 3584555 3584556 Tpet_0610 Tpet_0611     TRUE 0.988 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 3584556 3584557 Tpet_0611 Tpet_0612     TRUE 0.743 15.000 0.000 NA   NA
 3584557 3584558 Tpet_0612 Tpet_0613     TRUE 0.652 18.000 0.000 NA   NA
 3584558 3584559 Tpet_0613 Tpet_0614     TRUE 0.885 14.000 0.091 1.000 N NA
 3584559 3584560 Tpet_0614 Tpet_0615     TRUE 0.970 13.000 0.150 0.045 N NA
 3584561 3584562 Tpet_0616 Tpet_0617     TRUE 0.667 99.000 0.273 1.000 Y NA
 3584563 3584564 Tpet_0618 Tpet_0619     TRUE 0.991 3.000 0.281 0.002 Y NA
 3584564 3584565 Tpet_0619 Tpet_0620   leuD TRUE 0.957 13.000 0.003 1.000 Y NA
 3584565 3584566 Tpet_0620 Tpet_0621 leuD   TRUE 0.998 14.000 0.579 0.002 Y NA
 3584566 3584567 Tpet_0621 Tpet_0622     TRUE 0.904 -7.000 0.179 1.000 N NA
 3584569 3584570 Tpet_0624 Tpet_0625     TRUE 0.997 -7.000 0.600 0.008 Y NA
 3584570 3584571 Tpet_0625 Tpet_0626     TRUE 0.929 -3.000 0.034 1.000 N NA
 3584571 3584572 Tpet_0626 Tpet_0627     FALSE 0.340 68.000 0.034 1.000 N NA
 3584572 3584573 Tpet_0627 Tpet_0628     TRUE 0.767 4.000 0.333 1.000 N NA
 3584573 3584574 Tpet_0628 Tpet_0629     TRUE 0.981 13.000 0.333 1.000 Y NA
 3584574 3584575 Tpet_0629 Tpet_0630     TRUE 0.723 77.000 0.176 1.000 Y NA
 3584575 3584576 Tpet_0630 Tpet_0631     TRUE 0.932 29.000 0.176 1.000 Y NA
 3584576 3584577 Tpet_0631 Tpet_0632     TRUE 0.957 15.000 0.000 0.015   NA
 3584577 3584578 Tpet_0632 Tpet_0633     TRUE 0.983 12.000 0.333 0.015   NA
 3584578 3584579 Tpet_0633 Tpet_0634     TRUE 0.970 -13.000 0.333 1.000 Y NA
 3584579 3584580 Tpet_0634 Tpet_0635     TRUE 0.957 2.000 0.000 0.060 Y NA
 3584580 3584581 Tpet_0635 Tpet_0636     TRUE 0.991 22.000 0.714 0.060 Y NA
 3584582 3584583 Tpet_0637 Tpet_0638     FALSE 0.485 31.000 0.000 NA   NA
 3584583 3584584 Tpet_0638 Tpet_0639     TRUE 0.661 10.000 0.000 NA   NA
 3584584 3584585 Tpet_0639 Tpet_0640     TRUE 0.678 17.000 0.000 NA   NA
 3584585 3584586 Tpet_0640 Tpet_0641     TRUE 0.710 16.000 0.000 NA   NA
 3584586 3584587 Tpet_0641 Tpet_0642     FALSE 0.556 6.000 0.000 NA   NA
 3584588 3584589 Tpet_0643 Tpet_0644     FALSE 0.298 121.000 0.250 1.000   NA
 3584589 3584590 Tpet_0644 Tpet_0645     TRUE 0.991 0.000 0.500 0.060 Y NA
 3584590 3584591 Tpet_0645 Tpet_0646     TRUE 0.993 -10.000 0.400 0.060 Y NA
 3584591 3584592 Tpet_0646 Tpet_0647     TRUE 0.968 -3.000 0.000 0.060   NA
 3584594 3584595 Tpet_0649 Tpet_0650     FALSE 0.510 117.000 0.048 0.034 N NA
 3584595 3584596 Tpet_0650 Tpet_0651     TRUE 0.879 13.000 0.106 1.000 N NA
 3584596 3584597 Tpet_0651 Tpet_0652     TRUE 0.804 48.000 0.007 1.000 Y NA
 3584597 3584598 Tpet_0652 Tpet_0653     FALSE 0.321 75.000 0.012 1.000   NA
 3584599 3584600 Tpet_0654 Tpet_0655     TRUE 0.813 -13.000 0.013 1.000   NA
 3584600 3584601 Tpet_0655 Tpet_0656     TRUE 0.964 -16.000 0.009 0.001   NA
 3584601 3584602 Tpet_0656 Tpet_0657   trmE TRUE 0.712 5.000 0.020 1.000   NA
 3584603 3584604 Tpet_0658 Tpet_0659     TRUE 0.651 181.000 0.004 0.038 Y NA
 3584604 3584605 Tpet_0659 Tpet_0660     FALSE 0.252 -40.000 0.003 1.000 N NA
 3584605 3584606 Tpet_0660 Tpet_0661     TRUE 0.884 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3584606 3584607 Tpet_0661 Tpet_0662     TRUE 0.724 11.000 0.003 1.000 N NA
 3584607 3584608 Tpet_0662 Tpet_0663     TRUE 0.846 14.000 0.003 1.000   NA
 3584608 3584609 Tpet_0663 Tpet_0664     TRUE 0.963 13.000 0.937 NA   NA
 3584609 3584610 Tpet_0664 Tpet_0665     TRUE 0.889 -3.000 0.005 NA N NA
 3584610 3584611 Tpet_0665 Tpet_0666     FALSE 0.222 -85.000 0.006 1.000 N NA
 3584611 3584612 Tpet_0666 Tpet_0667     TRUE 0.875 -7.000 0.008 1.000   NA
 3584612 3584613 Tpet_0667 Tpet_0668     TRUE 0.842 -13.000 0.100 NA   NA
 3584613 3584614 Tpet_0668 Tpet_0669     TRUE 0.657 25.000 0.003 NA   NA
 3584614 3584615 Tpet_0669 Tpet_0670   smpB TRUE 0.863 3.000 0.003 0.038 N NA
 3584615 3584616 Tpet_0670 Tpet_0671 smpB   TRUE 0.601 2.000 0.003 1.000 N NA
 3584616 3584617 Tpet_0671 Tpet_0672     TRUE 0.887 -3.000 0.003 1.000 N NA
 3584617 3584618 Tpet_0672 Tpet_0673     FALSE 0.293 -37.000 0.003 1.000 N NA
 3584618 3584619 Tpet_0673 Tpet_0674     FALSE 0.545 5.000 0.003 1.000 N NA
 3584619 3584620 Tpet_0674 Tpet_0675     TRUE 0.796 -13.000 0.009 1.000   NA
 3584620 3584621 Tpet_0675 Tpet_0676     TRUE 0.911 5.000 0.031 0.046   NA
 3584621 3584622 Tpet_0676 Tpet_0677     TRUE 0.998 -3.000 0.714 0.046 Y NA
 3584622 3584623 Tpet_0677 Tpet_0678     TRUE 0.996 -3.000 0.083 0.046 Y NA
 3584623 3584624 Tpet_0678 Tpet_0679     TRUE 0.996 -3.000 0.141 0.046 Y NA
 3584624 3584625 Tpet_0679 Tpet_0680     TRUE 0.998 -3.000 0.538 0.046 Y NA
 3584625 3584626 Tpet_0680 Tpet_0681     TRUE 0.728 5.000 0.055 1.000   NA
 3584626 3584627 Tpet_0681 Tpet_0682     TRUE 0.941 -3.000 0.036 NA   NA
 3584627 3584628 Tpet_0682 Tpet_0683     TRUE 0.676 45.000 0.222 NA   NA
 3584628 3584629 Tpet_0683 Tpet_0684   glgC TRUE 0.870 4.000 0.818 NA   NA
 3584629 3584630 Tpet_0684 Tpet_0685 glgC   TRUE 0.998 12.000 1.000 0.001 Y NA
 3584630 3584631 Tpet_0685 Tpet_0686     TRUE 0.752 13.000 0.000 NA   NA
 3584632 3584633 Tpet_0687 Tpet_0688     TRUE 0.998 -3.000 0.051 0.002 Y NA
 3584633 3584634 Tpet_0688 Tpet_0689     TRUE 0.997 -3.000 0.037 0.005 Y NA
 3584634 3584635 Tpet_0689 Tpet_0690     TRUE 0.999 -3.000 0.647 0.005 Y NA
 3584635 3584636 Tpet_0690 Tpet_0691     TRUE 0.914 -3.000 0.012 1.000 N NA
 3584636 3584637 Tpet_0691 Tpet_0692     TRUE 0.925 -3.000 0.022 1.000 N NA
 3584637 3584638 Tpet_0692 Tpet_0693     TRUE 0.990 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 3584639 3584640 Tpet_0694 Tpet_0695     TRUE 0.775 6.000 0.037 1.000   NA
 3584640 3584641 Tpet_0695 Tpet_0696     FALSE 0.500 60.000 0.125 1.000   NA
 3584641 3584642 Tpet_0696 Tpet_0697     TRUE 0.999 -3.000 0.606 0.007 Y NA
 3584642 3584643 Tpet_0697 Tpet_0698     FALSE 0.337 68.000 0.011 NA   NA
 3584643 3584644 Tpet_0698 Tpet_0699     TRUE 0.806 0.000 0.016 NA   NA
 3584646 3584647 Tpet_0701 Tpet_0702     TRUE 0.904 -3.000 0.007 1.000 N NA
 3584648 3584649 Tpet_0703 Tpet_0704   fliG TRUE 0.989 5.000 0.477 0.009 Y NA
 3584649 3584650 Tpet_0704 Tpet_0705 fliG   TRUE 0.985 2.000 0.012 0.005 Y NA
 3584650 3584651 Tpet_0705 Tpet_0706     TRUE 0.995 -7.000 0.045 0.005 Y NA
 3584652 3584653 Tpet_0707 Tpet_0708   glyQ TRUE 0.994 -19.000 0.651 0.001 Y NA
 3584653 3584654 Tpet_0708 Tpet_0709 glyQ   TRUE 0.863 4.000 0.005 NA Y NA
 3584654 3584655 Tpet_0709 Tpet_0710     TRUE 0.604 2.000 0.004 NA N NA
 3584655 3584656 Tpet_0710 Tpet_0711     TRUE 0.999 -3.000 0.316 0.001 Y NA
 3584656 3584657 Tpet_0711 Tpet_0712     TRUE 0.927 29.000 0.130 1.000 Y NA
 3584657 3584658 Tpet_0712 Tpet_0713     TRUE 0.988 3.000 0.057 0.001 Y NA
 3584658 3584659 Tpet_0713 Tpet_0714     TRUE 0.929 -3.000 0.011 NA   NA
 3584660 3584661 Tpet_0715 Tpet_0716     TRUE 0.996 14.000 0.259 0.006 Y NA
 3584661 3584662 Tpet_0716 Tpet_0717     TRUE 0.879 13.000 0.021 NA   NA
 3584662 3584663 Tpet_0717 Tpet_0718     TRUE 0.789 0.000 0.010 NA   NA
 3584663 3584664 Tpet_0718 Tpet_0719     FALSE 0.375 51.000 0.006 1.000 N NA
 3584665 3584666 Tpet_0720 Tpet_0721     TRUE 0.959 -15.000 0.270 1.000 Y NA
 3584666 3584667 Tpet_0721 Tpet_0722     TRUE 0.993 -3.000 0.646 NA Y NA
 3584667 3584668 Tpet_0722 Tpet_0723     FALSE 0.594 45.000 0.062 NA   NA
 3584668 3584669 Tpet_0723 Tpet_0724     FALSE 0.248 98.000 0.020 1.000   NA
 3584669 3584670 Tpet_0724 Tpet_0725     FALSE 0.517 -37.000 0.126 1.000   NA
 3584670 3584671 Tpet_0725 Tpet_0726     TRUE 0.996 -3.000 0.014 0.017 Y NA
 3584675 3584676 Tpet_R0019 Tpet_R0020     TRUE 0.768 14.000 0.000 NA   NA
 3584677 3584678 Tpet_0730 Tpet_0731     TRUE 0.784 0.000 0.009 NA   NA
 3584678 3584679 Tpet_0731 Tpet_R0021     FALSE 0.131 89.000 0.000 NA   NA
 3584679 3584680 Tpet_R0021 Tpet_R0022     TRUE 0.708 12.000 0.000 NA   NA
 3584680 3584681 Tpet_R0022 Tpet_R0023     TRUE 0.686 11.000 0.000 NA   NA
 3584681 3584682 Tpet_R0023 Tpet_R0024     FALSE 0.556 6.000 0.000 NA   NA
 3584682 3584683 Tpet_R0024 Tpet_0732     FALSE 0.187 71.000 0.000 NA   NA
 3584684 3584685 Tpet_0733 Tpet_0734     TRUE 0.945 6.000 0.198 1.000 Y NA
 3584685 3584686 Tpet_0734 Tpet_0735     TRUE 0.985 -6.000 0.302 1.000 Y NA
 3584686 3584687 Tpet_0735 Tpet_0736     TRUE 0.743 5.000 0.118 NA   NA
 3584687 3584688 Tpet_0736 Tpet_R0025     FALSE 0.260 56.000 0.000 NA   NA
 3584689 3584690 Tpet_0737 Tpet_0738     FALSE 0.359 -25.000 0.000 NA   NA
 3584690 3584691 Tpet_0738 Tpet_0739     TRUE 0.783 -19.000 0.222 NA   NA
 3584692 3584693 Tpet_0740 Tpet_0741     TRUE 0.917 -3.000 0.004 1.000   NA
 3584693 3584694 Tpet_0741 Tpet_0742     FALSE 0.467 -40.000 0.088 1.000   NA
 3584694 3584695 Tpet_0742 Tpet_0743     FALSE 0.357 -31.000 0.005 1.000 N NA
 3584697 3584698 Tpet_0745 Tpet_R0026     FALSE 0.318 49.000 0.000 NA   NA
 3584698 3584699 Tpet_R0026 Tpet_R0027     FALSE 0.415 39.000 0.000 NA   NA
 3584699 3584700 Tpet_R0027 Tpet_0746     FALSE 0.159 -1474.000 0.000 NA   NA
 3584700 3584701 Tpet_0746 Tpet_R0028     FALSE 0.034 2284.000 0.000 NA   NA
 3584701 3584702 Tpet_R0028 Tpet_R0029     FALSE 0.556 6.000 0.000 NA   NA
 3584702 3584703 Tpet_R0029 Tpet_R0030     FALSE 0.399 41.000 0.000 NA   NA
 3584703 3584704 Tpet_R0030 Tpet_0747     FALSE 0.046 230.000 0.000 NA   NA
 3584704 3584705 Tpet_0747 Tpet_0748     TRUE 0.671 2.000 0.003 NA   NA
 3584705 3584706 Tpet_0748 Tpet_0749     TRUE 0.758 25.000 0.024 NA   NA
 3584706 3584707 Tpet_0749 Tpet_0750     TRUE 0.715 -19.000 0.040 NA   NA
 3584707 3584708 Tpet_0750 Tpet_0751   hppA TRUE 0.682 44.000 0.188 1.000   NA
 3584708 3584709 Tpet_0751 Tpet_0752 hppA   TRUE 0.702 4.000 0.176 1.000 N NA
 3584709 3584710 Tpet_0752 Tpet_0753     TRUE 0.788 -9.000 0.004 1.000 N NA
 3584710 3584711 Tpet_0753 Tpet_0754     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA   NA
 3584711 3584712 Tpet_0754 Tpet_0755     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA   NA
 3584712 3584713 Tpet_0755 Tpet_0756     TRUE 0.820 2.000 0.200 NA   NA
 3584713 3584714 Tpet_0756 Tpet_0757     TRUE 0.934 10.000 0.004 0.054   NA
 3584715 3584716 Tpet_0758 Tpet_0759     TRUE 0.803 -9.000 0.006 1.000 N NA
 3584716 3584717 Tpet_0759 Tpet_0760     TRUE 0.905 -3.000 0.008 1.000 N NA
 3584718 3584719 Tpet_0761 Tpet_0762     FALSE 0.497 30.000 0.000 NA   NA
 3584719 3584720 Tpet_0762 Tpet_0763     FALSE 0.447 -21.000 0.000 NA   NA
 3584720 3584721 Tpet_0763 Tpet_0764     TRUE 0.963 -3.000 0.286 NA   NA
 3584721 3584722 Tpet_0764 Tpet_0765     TRUE 0.691 -19.000 0.016 NA   NA
 3584724 3584725 Tpet_0767 Tpet_0768     TRUE 0.954 -3.000 0.182 NA   NA
 3584726 3584727 Tpet_0769 Tpet_0770     FALSE 0.438 93.000 0.429 1.000   NA
 3584731 3584732 Tpet_0774 Tpet_0775     TRUE 0.841 4.000 0.599 NA   NA
 3584732 3584733 Tpet_0775 Tpet_0776     TRUE 0.844 -16.000 0.418 1.000 N NA
 3584733 3584734 Tpet_0776 Tpet_0777     FALSE 0.453 -28.000 0.013 1.000 N NA
 3584734 3584735 Tpet_0777 Tpet_0778     TRUE 0.782 18.000 0.008 NA   NA
 3584735 3584736 Tpet_0778 Tpet_0779   clpX TRUE 0.830 14.000 0.003 NA   NA
 3584736 3584737 Tpet_0779 Tpet_0780 clpX   TRUE 0.996 -3.000 0.011 0.016 Y NA
 3584738 3584739 Tpet_0781 Tpet_R0031     FALSE 0.343 47.000 0.000 NA   NA
 3584740 3584741 Tpet_0782 Tpet_0783     TRUE 0.622 29.000 0.009 1.000 N NA
 3584741 3584742 Tpet_0783 Tpet_0784     TRUE 0.998 -3.000 0.032 0.001 Y NA
 3584742 3584743 Tpet_0784 Tpet_0785     TRUE 0.905 41.000 0.216 1.000 Y NA
 3584743 3584744 Tpet_0785 Tpet_0786     TRUE 0.996 -12.000 0.264 0.002 Y NA
 3584744 3584745 Tpet_0786 Tpet_0787     TRUE 0.988 3.000 0.077 0.002 Y NA
 3584745 3584746 Tpet_0787 Tpet_0788     TRUE 0.998 -3.000 0.146 0.002 Y NA
 3584747 3584748 Tpet_0789 Tpet_0790     TRUE 0.749 6.000 0.014 1.000   NA
 3584748 3584749 Tpet_0790 Tpet_0791     TRUE 0.937 -3.000 0.014 1.000   NA
 3584749 3584750 Tpet_0791 Tpet_0792     FALSE 0.593 -39.000 0.500 1.000 N NA
 3584750 3584751 Tpet_0792 Tpet_0793     TRUE 0.808 2.000 0.130 1.000   NA
 3584751 3584752 Tpet_0793 Tpet_0794     FALSE 0.053 217.000 0.000 1.000   NA
 3584753 3584754 Tpet_0795 Tpet_0796     TRUE 0.837 -10.000 0.055 1.000 N NA
 3584755 3584756 Tpet_0797 Tpet_0798     TRUE 0.993 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 3584756 3584757 Tpet_0798 Tpet_0799     TRUE 0.982 -3.000 0.176 0.071 N NA
 3584757 3584758 Tpet_0799 Tpet_0800     TRUE 0.986 -3.000 0.088 1.000 Y NA
 3584758 3584759 Tpet_0800 Tpet_0801     TRUE 0.986 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 3584759 3584760 Tpet_0801 Tpet_0802     TRUE 0.992 -3.000 0.467 1.000 Y NA
 3584762 3584763 Tpet_0804 Tpet_0805     TRUE 0.915 3.000 0.031 1.000 Y NA
 3584763 3584764 Tpet_0805 Tpet_0806     TRUE 0.868 13.000 0.067 1.000 N NA
 3584766 3584767 Tpet_0808 Tpet_0809     TRUE 0.955 0.000 0.093 1.000 Y NA
 3584767 3584768 Tpet_0809 Tpet_0810     TRUE 0.845 49.000 0.130 NA Y NA
 3584768 3584769 Tpet_0810 Tpet_0811     TRUE 0.930 25.000 0.065 NA Y NA
 3584769 3584770 Tpet_0811 Tpet_0812     TRUE 0.971 15.000 0.094 1.000 Y NA
 3584770 3584771 Tpet_0812 Tpet_0813     TRUE 0.866 13.000 0.062 1.000 N NA
 3584771 3584772 Tpet_0813 Tpet_0814     TRUE 0.931 14.000 0.375 1.000 N NA
 3584772 3584773 Tpet_0814 Tpet_0815     FALSE 0.269 108.000 0.107 1.000   NA
 3584773 3584774 Tpet_0815 Tpet_0816     TRUE 0.791 -19.000 0.214 1.000   NA
 3584774 3584775 Tpet_0816 Tpet_0817     TRUE 0.900 1.000 0.700 1.000 N NA
 3584777 3584778 Tpet_0819 Tpet_0820     TRUE 0.993 -3.000 0.720 0.058   NA
 3584778 3584779 Tpet_0820 Tpet_0821     TRUE 0.972 -3.000 0.438 1.000   NA
 3584779 3584780 Tpet_0821 Tpet_0822     TRUE 0.682 36.000 0.055 1.000   NA
 3584780 3584781 Tpet_0822 Tpet_0823     TRUE 0.981 -3.000 0.900 NA   NA
 3584782 3584783 Tpet_0824 Tpet_0825     TRUE 0.825 -9.000 0.003 1.000   NA
 3584783 3584784 Tpet_0825 Tpet_0826   obgE TRUE 0.907 -3.000 0.003 1.000   NA
 3584784 3584785 Tpet_0826 Tpet_0827 obgE   TRUE 0.775 -16.000 0.045 1.000   NA
 3584785 3584786 Tpet_0827 Tpet_0828     TRUE 0.793 -10.000 0.008 1.000 N NA
 3584786 3584787 Tpet_0828 Tpet_0829     TRUE 0.850 3.000 0.000 0.043   NA
 3584787 3584788 Tpet_0829 Tpet_0830     FALSE 0.586 2.000 0.000 1.000   NA
 3584788 3584789 Tpet_0830 Tpet_0831     TRUE 0.927 -3.000 0.010 NA   NA
 3584789 3584790 Tpet_0831 Tpet_0832     TRUE 0.871 2.000 0.429 NA   NA
 3584790 3584791 Tpet_0832 Tpet_0833     TRUE 0.709 -28.000 0.429 NA   NA
 3584791 3584792 Tpet_0833 Tpet_0834     TRUE 0.978 -3.000 0.750 NA   NA
 3584792 3584793 Tpet_0834 Tpet_0835     TRUE 0.970 -3.000 0.429 NA   NA
 3584793 3584794 Tpet_0835 Tpet_0836     TRUE 0.870 16.000 0.080 NA   NA
 3584794 3584795 Tpet_0836 Tpet_0837     TRUE 0.939 -3.000 0.017 1.000   NA
 3584797 3584798 Tpet_0839 Tpet_0840     TRUE 0.993 -3.000 0.113 0.004   NA
 3584798 3584799 Tpet_0840 Tpet_0841     TRUE 0.955 3.000 0.038 0.003   NA
 3584799 3584800 Tpet_0841 Tpet_0842     TRUE 0.967 6.000 0.064 0.002   NA
 3584800 3584801 Tpet_0842 Tpet_0843     TRUE 0.827 5.000 0.385 NA   NA
 3584801 3584802 Tpet_0843 Tpet_0844     FALSE 0.045 243.000 0.000 NA   NA
 3584802 3584803 Tpet_0844 Tpet_0845     TRUE 0.986 -3.000 0.084 1.000 Y NA
 3584803 3584804 Tpet_0845 Tpet_0846     TRUE 0.942 2.000 0.145 1.000 Y NA
 3584805 3584806 Tpet_0847 Tpet_0848     TRUE 0.907 7.000 0.800 1.000 N NA
 3584806 3584807 Tpet_0848 Tpet_0849     TRUE 0.773 42.000 0.600 1.000 N NA
 3584807 3584808 Tpet_0849 Tpet_0850     TRUE 0.995 -13.000 0.500 0.010 Y NA
 3584808 3584809 Tpet_0850 Tpet_0851     TRUE 0.974 2.000 0.833 1.000 Y NA
 3584809 3584810 Tpet_0851 Tpet_0852     TRUE 0.995 17.000 0.833 0.058 Y NA
 3584810 3584811 Tpet_0852 Tpet_0853     TRUE 0.954 74.000 1.000 0.058 Y NA
 3584813 3584814 Tpet_0855 Tpet_0856     TRUE 0.989 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 3584814 3584815 Tpet_0856 Tpet_0857     TRUE 0.973 13.000 0.111 1.000 Y NA
 3584815 3584816 Tpet_0857 Tpet_0858     TRUE 0.985 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 3584816 3584817 Tpet_0858 Tpet_0859     FALSE 0.322 70.000 0.025 1.000 N NA
 3584818 3584819 Tpet_0860 Tpet_0861     TRUE 0.939 12.000 0.600 NA   NA
 3584820 3584821 Tpet_0862 Tpet_0863     TRUE 0.719 54.000 0.667 NA   NA
 3584822 3584823 Tpet_0864 Tpet_0865     TRUE 0.984 11.000 1.000 0.058   NA
 3584823 3584824 Tpet_0865 Tpet_0866     TRUE 0.968 14.000 1.000 1.000   NA
 3584824 3584825 Tpet_0866 Tpet_0867     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.010 Y NA
 3584825 3584826 Tpet_0867 Tpet_0868     TRUE 0.986 14.000 0.500 1.000 Y NA
 3584826 3584827 Tpet_0868 Tpet_0869     FALSE 0.444 56.000 0.083 1.000 N NA
 3584828 3584829 Tpet_0870 Tpet_0871     TRUE 0.982 -3.000 1.000 NA   NA
 3584829 3584830 Tpet_0871 Tpet_0872     TRUE 0.982 -3.000 1.000 NA   NA
 3584830 3584831 Tpet_0872 Tpet_0873     TRUE 0.941 -3.000 0.055 NA   NA
 3584831 3584832 Tpet_0873 Tpet_0874     TRUE 0.860 -25.000 0.069 1.000 Y NA
 3584832 3584833 Tpet_0874 Tpet_0875     FALSE 0.247 101.000 0.023 1.000   NA
 3584834 3584835 Tpet_0876 Tpet_0877     TRUE 0.598 -15.000 0.000 NA   NA
 3584836 3584837 Tpet_0878 Tpet_0879     TRUE 0.808 28.000 0.250 NA   NA
 3584838 3584839 Tpet_0880 Tpet_0881     TRUE 0.817 13.000 0.007 1.000 N NA
 3584840 3584841 Tpet_0882 Tpet_0883     TRUE 0.906 60.000 0.000 0.005 Y NA
 3584841 3584842 Tpet_0883 Tpet_0884     FALSE 0.484 4.000 0.000 1.000   NA
 3584842 3584843 Tpet_0884 Tpet_0885     TRUE 0.945 -3.000 0.052 1.000   NA
 3584843 3584844 Tpet_0885 Tpet_0886     TRUE 0.821 11.000 0.037 1.000 N NA
 3584844 3584845 Tpet_0886 Tpet_0887     TRUE 0.671 -19.000 0.032 1.000 N NA
 3584845 3584846 Tpet_0887 Tpet_0888     TRUE 0.941 -3.000 0.032 NA   NA
 3584846 3584847 Tpet_0888 Tpet_0889     FALSE 0.573 46.000 0.025 NA   NA
 3584847 3584848 Tpet_0889 Tpet_0890     FALSE 0.289 87.000 0.025 1.000   NA
 3584849 3584850 Tpet_0891 Tpet_0892     TRUE 0.768 31.000 0.286 1.000 N NA
 3584850 3584851 Tpet_0892 Tpet_0893     TRUE 0.947 63.000 0.500 0.058 Y NA
 3584851 3584852 Tpet_0893 Tpet_0894     TRUE 0.982 4.000 0.500 0.058 Y NA
 3584852 3584853 Tpet_0894 Tpet_0895     TRUE 0.961 4.000 0.824 1.000 Y NA
 3584853 3584854 Tpet_0895 Tpet_0896     TRUE 0.999 -3.000 0.765 0.011 Y NA
 3584854 3584855 Tpet_0896 Tpet_0897     TRUE 0.880 0.000 0.267 NA   NA
 3584855 3584856 Tpet_0897 Tpet_0898     TRUE 0.839 -19.000 0.444 NA   NA
 3584856 3584857 Tpet_0898 Tpet_0899     TRUE 0.993 16.000 0.200 0.017 Y NA
 3584857 3584858 Tpet_0899 Tpet_0900     FALSE 0.398 61.000 0.080 1.000 N NA
 3584858 3584859 Tpet_0900 Tpet_0901     FALSE 0.177 77.000 0.002 1.000 N NA
 3584860 3584861 Tpet_0902 Tpet_0903     TRUE 0.941 -3.000 0.034 NA   NA
 3584861 3584862 Tpet_0903 Tpet_0904   fabG TRUE 0.921 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3584862 3584863 Tpet_0904 Tpet_0905 fabG   FALSE 0.523 42.000 0.012 1.000 N NA
 3584863 3584864 Tpet_0905 Tpet_0906     TRUE 0.998 15.000 0.500 0.002 Y NA
 3584864 3584865 Tpet_0906 Tpet_0907     TRUE 0.992 3.000 0.364 0.002 Y NA
 3584865 3584866 Tpet_0907 Tpet_0908     TRUE 0.997 13.000 0.145 0.001 Y NA
 3584866 3584867 Tpet_0908 Tpet_0909     FALSE 0.342 67.000 0.026 1.000 N NA
 3584867 3584868 Tpet_0909 Tpet_0910     TRUE 0.898 10.000 0.455 1.000 N NA
 3584869 3584870 Tpet_0911 Tpet_0912     TRUE 0.988 3.000 0.286 0.006 Y NA
 3584870 3584871 Tpet_0912 Tpet_0913     TRUE 0.994 19.000 0.381 0.006 Y NA
 3584871 3584872 Tpet_0913 Tpet_0914     TRUE 0.947 -3.000 0.071 1.000   NA
 3584874 3584875 Tpet_0916 Tpet_0917     TRUE 0.651 4.000 0.092 NA N NA
 3584875 3584876 Tpet_0917 Tpet_0918     TRUE 0.927 -3.000 0.028 1.000 N NA
 11490161 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3445.000 0.000 NA   NA
 11632524 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3445.000 0.000 NA   NA
 11774916 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3445.000 0.000 NA   NA
 11490162 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3400.000 0.000 NA   NA
 11632525 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3400.000 0.000 NA   NA
 11774917 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3400.000 0.000 NA   NA
 11490163 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3380.000 0.000 NA   NA
 11632526 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3380.000 0.000 NA   NA
 11774918 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3380.000 0.000 NA   NA
 11490164 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3335.000 0.000 NA   NA
 11632527 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3335.000 0.000 NA   NA
 11774919 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3335.000 0.000 NA   NA
 11490165 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3315.000 0.000 NA   NA
 11632528 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3315.000 0.000 NA   NA
 11774920 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3315.000 0.000 NA   NA
 11490166 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3268.000 0.000 NA   NA
 11632529 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3268.000 0.000 NA   NA
 11774921 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3268.000 0.000 NA   NA
 11490167 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3248.000 0.000 NA   NA
 11632530 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3248.000 0.000 NA   NA
 11774922 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3248.000 0.000 NA   NA
 11490168 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3202.000 0.000 NA   NA
 11632531 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3202.000 0.000 NA   NA
 11774923 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3202.000 0.000 NA   NA
 11490169 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3182.000 0.000 NA   NA
 11632532 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3182.000 0.000 NA   NA
 11774924 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3182.000 0.000 NA   NA
 11490170 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3135.000 0.000 NA   NA
 11632533 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3135.000 0.000 NA   NA
 11774925 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3135.000 0.000 NA   NA
 11490171 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3115.000 0.000 NA   NA
 11632534 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3115.000 0.000 NA   NA
 11774926 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3115.000 0.000 NA   NA
 11490172 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3068.000 0.000 NA   NA
 11632535 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3068.000 0.000 NA   NA
 11774927 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3068.000 0.000 NA   NA
 11490173 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3048.000 0.000 NA   NA
 11632536 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3048.000 0.000 NA   NA
 11774928 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3048.000 0.000 NA   NA
 11490174 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3002.000 0.000 NA   NA
 11632537 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3002.000 0.000 NA   NA
 11774929 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 3002.000 0.000 NA   NA
 11490175 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2982.000 0.000 NA   NA
 11632538 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2982.000 0.000 NA   NA
 11774930 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2982.000 0.000 NA   NA
 11490176 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2935.000 0.000 NA   NA
 11632539 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2935.000 0.000 NA   NA
 11774931 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2935.000 0.000 NA   NA
 11490177 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2915.000 0.000 NA   NA
 11632540 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2915.000 0.000 NA   NA
 11774932 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2915.000 0.000 NA   NA
 11490178 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11632541 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11774933 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2869.000 0.000 NA   NA
 11490179 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2849.000 0.000 NA   NA
 11632542 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2849.000 0.000 NA   NA
 11774934 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2849.000 0.000 NA   NA
 11490180 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2802.000 0.000 NA   NA
 11632543 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2802.000 0.000 NA   NA
 11774935 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2802.000 0.000 NA   NA
 11490181 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2782.000 0.000 NA   NA
 11632544 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2782.000 0.000 NA   NA
 11774936 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2782.000 0.000 NA   NA
 11490182 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2735.000 0.000 NA   NA
 11632545 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2735.000 0.000 NA   NA
 11774937 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2735.000 0.000 NA   NA
 11490183 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2715.000 0.000 NA   NA
 11632546 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2715.000 0.000 NA   NA
 11774938 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2715.000 0.000 NA   NA
 11490184 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2668.000 0.000 NA   NA
 11632547 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2668.000 0.000 NA   NA
 11774939 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2668.000 0.000 NA   NA
 11490185 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2648.000 0.000 NA   NA
 11632548 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2648.000 0.000 NA   NA
 11774940 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2648.000 0.000 NA   NA
 11490186 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2602.000 0.000 NA   NA
 11632549 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2602.000 0.000 NA   NA
 11774941 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2602.000 0.000 NA   NA
 11490187 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2582.000 0.000 NA   NA
 11632550 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2582.000 0.000 NA   NA
 11774942 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2582.000 0.000 NA   NA
 11490188 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2533.000 0.000 NA   NA
 11632551 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2533.000 0.000 NA   NA
 11774943 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2533.000 0.000 NA   NA
 11490189 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2513.000 0.000 NA   NA
 11632552 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2513.000 0.000 NA   NA
 11774944 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2513.000 0.000 NA   NA
 11490190 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2467.000 0.000 NA   NA
 11632553 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2467.000 0.000 NA   NA
 11774945 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2467.000 0.000 NA   NA
 11490191 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2447.000 0.000 NA   NA
 11632554 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2447.000 0.000 NA   NA
 11774946 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2447.000 0.000 NA   NA
 11490192 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2401.000 0.000 NA   NA
 11632555 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2401.000 0.000 NA   NA
 11774947 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2401.000 0.000 NA   NA
 11490193 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2381.000 0.000 NA   NA
 11632556 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2381.000 0.000 NA   NA
 11774948 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2381.000 0.000 NA   NA
 11490194 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2335.000 0.000 NA   NA
 11632557 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2335.000 0.000 NA   NA
 11774949 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2335.000 0.000 NA   NA
 11490195 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2315.000 0.000 NA   NA
 11632558 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2315.000 0.000 NA   NA
 11774950 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2315.000 0.000 NA   NA
 11490196 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2267.000 0.000 NA   NA
 11632559 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2267.000 0.000 NA   NA
 11774951 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2267.000 0.000 NA   NA
 11490197 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2247.000 0.000 NA   NA
 11632560 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2247.000 0.000 NA   NA
 11774952 3584878   Tpet_0920     FALSE NA 2247.000 0.000 NA   NA
 3584879 3584880 Tpet_0921 Tpet_0922     TRUE 0.637 33.000 0.007 1.000   NA
 3584880 3584881 Tpet_0922 Tpet_0923     FALSE 0.148 98.000 0.004 1.000 N NA
 3584883 3584884 Tpet_0925 Tpet_0926     TRUE 0.829 16.000 0.009 NA   NA
 3584884 3584885 Tpet_0926 Tpet_0927     TRUE 0.713 5.000 0.037 NA   NA
 3584886 3584887 Tpet_0928 Tpet_0929     TRUE 0.928 -3.000 0.029 1.000 N NA
 3584889 3584890 Tpet_0931 Tpet_0932     TRUE 0.648 5.000 0.026 NA N NA
 3584890 3584891 Tpet_0932 Tpet_0933     FALSE 0.339 72.000 0.011 1.000   NA
 3584891 3584892 Tpet_0933 Tpet_0934     TRUE 0.861 -12.000 0.096 NA   NA
 3584892 3584893 Tpet_0934 Tpet_0935     TRUE 0.935 -3.000 0.017 NA   NA
 3584893 3584894 Tpet_0935 Tpet_0936     TRUE 0.940 -3.000 0.132 1.000 N NA
 3584894 3584895 Tpet_0936 Tpet_0937     FALSE 0.594 4.000 0.012 1.000 N NA
 3584895 3584896 Tpet_0937 Tpet_0938   recA TRUE 0.946 -7.000 0.588 1.000 N NA
 3584896 3584897 Tpet_0938 Tpet_0939 recA   FALSE 0.351 -70.000 0.015 1.000   NA
 3584897 3584898 Tpet_0939 Tpet_0940     TRUE 0.837 0.000 0.067 1.000   NA
 3584898 3584899 Tpet_0940 Tpet_0941     FALSE 0.058 206.000 0.000 1.000   NA
 3584899 3584900 Tpet_0941 Tpet_0942     TRUE 0.715 30.000 0.133 1.000 N NA
 3584900 3584901 Tpet_0942 Tpet_0943     TRUE 0.607 45.000 0.044 1.000   NA
 3584901 3584902 Tpet_0943 Tpet_0944     TRUE 0.750 51.000 0.667 1.000   NA
 3584902 3584903 Tpet_0944 Tpet_0945     TRUE 0.872 -3.000 0.000 1.000   NA
 3584903 3584904 Tpet_0945 Tpet_0946     TRUE 0.998 -3.000 0.711 0.054 Y NA
 3584904 3584905 Tpet_0946 Tpet_0947     TRUE 0.977 13.000 0.200 1.000 Y NA
 3584905 3584906 Tpet_0947 Tpet_0948     TRUE 0.976 16.000 0.300 1.000 Y NA
 3584906 3584907 Tpet_0948 Tpet_0949     FALSE 0.054 204.000 0.000 NA   NA
 3584909 3584910 Tpet_0951 Tpet_0952     TRUE 0.820 113.000 0.040 0.032 Y NA
 3584910 3584911 Tpet_0952 Tpet_0953     FALSE 0.571 222.000 0.000 0.013 Y NA
 3584911 3584912 Tpet_0953 Tpet_0954     TRUE 0.892 36.000 0.032 1.000 Y NA
 3584912 3584913 Tpet_0954 Tpet_0955     TRUE 0.933 58.000 0.178 0.054 Y NA
 3584913 3584914 Tpet_0955 Tpet_0956     TRUE 0.996 13.000 0.723 0.054 Y NA
 3584914 3584915 Tpet_0956 Tpet_0957     FALSE 0.482 79.000 0.000 NA Y NA
 3584916 3584917 Tpet_0958 Tpet_0959     FALSE 0.332 77.000 0.028 NA   NA
 3584917 3584918 Tpet_0959 Tpet_0960     TRUE 0.979 18.000 0.300 0.008   NA
 3584918 3584919 Tpet_0960 Tpet_0961     TRUE 0.940 16.000 0.600 NA   NA
 3584919 3584920 Tpet_0961 Tpet_0962     TRUE 0.933 11.000 0.600 NA   NA
 3584920 3584921 Tpet_0962 Tpet_0963     TRUE 0.765 5.000 0.182 NA   NA
 3584921 3584922 Tpet_0963 Tpet_0964     FALSE 0.567 53.000 0.182 NA   NA
 3584922 3584923 Tpet_0964 Tpet_0965     TRUE 0.986 13.000 0.667 0.056   NA
 3584924 3584925 Tpet_0966 Tpet_0967     TRUE 0.861 77.000 1.000 1.000 Y NA
 3584925 3584926 Tpet_0967 Tpet_0968     TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.054 Y NA
 3584926 3584927 Tpet_0968 Tpet_0969     TRUE 0.992 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 3584927 3584928 Tpet_0969 Tpet_0970     TRUE 0.838 135.000 0.273 0.032 Y NA
 3584928 3584929 Tpet_0970 Tpet_0971     FALSE 0.207 151.000 0.182 NA   NA
 3584929 3584930 Tpet_0971 Tpet_0972     TRUE 0.876 35.000 1.000 NA   NA
 3584930 3584931 Tpet_0972 Tpet_0973     TRUE 0.889 -15.000 0.000 1.000 Y NA
 3584931 3584932 Tpet_0973 Tpet_0974     TRUE 0.932 -15.000 1.000 1.000   NA
 3584933 3584934 Tpet_0975 Tpet_0976     FALSE 0.533 49.000 0.023 NA   NA
 3584934 3584935 Tpet_0976 Tpet_0977     TRUE 0.789 6.000 0.118 NA   NA
 3584935 3584936 Tpet_0977 Tpet_0978     FALSE 0.579 74.000 0.600 NA   NA
 3584937 3584938 Tpet_0979 Tpet_0980     FALSE 0.122 122.000 0.005 1.000 N NA
 3584938 3584939 Tpet_0980 Tpet_0981     TRUE 0.892 34.000 0.016 1.000 Y NA
 3584940 3584941 Tpet_0982 Tpet_0983     FALSE 0.340 -37.000 0.003 1.000   NA
 3584941 3584942 Tpet_0983 Tpet_0984     TRUE 0.743 3.000 0.192 1.000 N NA
 3584942 3584943 Tpet_0984 Tpet_0985     TRUE 0.660 -15.000 0.004 1.000 N NA
 3584943 3584944 Tpet_0985 Tpet_0986     TRUE 0.851 12.000 0.018 NA   NA
 3584944 3584945 Tpet_0986 Tpet_0987     TRUE 0.912 13.000 0.189 NA   NA
 3584945 3584946 Tpet_0987 Tpet_0988     TRUE 0.620 34.000 0.008 NA   NA
 3584946 3584947 Tpet_0988 Tpet_0989     TRUE 0.921 -3.000 0.016 1.000 N NA
 3584947 3584948 Tpet_0989 Tpet_0990     TRUE 0.918 -3.000 0.014 1.000 N NA
 3584949 3584950 Tpet_0991 Tpet_0992     TRUE 0.927 -15.000 0.008 1.000 Y NA
 3584950 3584951 Tpet_0992 Tpet_0993     TRUE 0.760 1.000 0.008 1.000   NA
 3584951 3584952 Tpet_0993 Tpet_0994     TRUE 0.761 6.000 0.020 1.000   NA
 3584952 3584953 Tpet_0994 Tpet_0995     FALSE 0.447 38.000 0.000 1.000   NA
 3584955 3584956 Tpet_0997 Tpet_0998     TRUE 0.927 12.000 0.429 NA   NA
 3584957 3584958 Tpet_0999 Tpet_1000     TRUE 0.863 2.000 0.333 1.000   NA
 3584958 3584959 Tpet_1000 Tpet_1001     TRUE 0.971 -3.000 0.421 1.000   NA
 3584959 3584960 Tpet_1001 Tpet_1002     TRUE 0.876 14.000 0.056 1.000 N NA
 3584960 3584961 Tpet_1002 Tpet_1003     TRUE 0.982 -3.000 0.013 NA Y NA
 3584961 3584962 Tpet_1003 Tpet_1004     TRUE 0.932 -3.000 0.013 NA   NA
 3584962 3584963 Tpet_1004 Tpet_1005     TRUE 0.873 6.000 0.470 NA   NA
 3584963 3584964 Tpet_1005 Tpet_1006     TRUE 0.773 4.000 0.259 NA   NA
 3584964 3584965 Tpet_1006 Tpet_1007     TRUE 0.910 -3.000 0.004 NA   NA
 3584965 3584966 Tpet_1007 Tpet_1008     TRUE 0.837 -22.000 0.750 NA   NA
 3584966 3584967 Tpet_1008 Tpet_1009     TRUE 0.743 21.000 0.007 NA   NA
 3584967 3584968 Tpet_1009 Tpet_1010     TRUE 0.646 -21.000 0.011 1.000   NA
 3584969 3584970 Tpet_1011 Tpet_1012     TRUE 0.933 -3.000 0.011 1.000   NA
 3584970 3584971 Tpet_1012 Tpet_1013     TRUE 0.937 -3.000 0.015 1.000   NA
 3584971 3584972 Tpet_1013 Tpet_1014     TRUE 0.778 0.000 0.006 1.000   NA
 3584973 3584974 Tpet_1015 Tpet_1016     TRUE 0.917 -3.000 0.004 1.000   NA
 3584975 3584976 Tpet_1017 Tpet_1018     TRUE 0.688 4.000 0.053 NA   NA
 3584976 3584977 Tpet_1018 Tpet_1019     TRUE 0.660 -22.000 0.053 1.000   NA
 3584979 3584980 Tpet_1021 Tpet_1022     TRUE 0.865 -9.000 0.012 1.000   NA
 3584980 3584981 Tpet_1022 Tpet_1023     TRUE 0.871 -10.000 0.055 1.000   NA
 3584981 3584982 Tpet_1023 Tpet_1024     TRUE 0.896 -3.000 0.002 NA   NA
 3584982 3584983 Tpet_1024 Tpet_1025   ruvB FALSE 0.155 97.000 0.002 NA   NA
 3584983 3584984 Tpet_1025 Tpet_1026 ruvB   TRUE 0.825 12.000 0.008 NA   NA
 3584984 3584985 Tpet_1026 Tpet_1027     TRUE 0.712 1.000 0.004 NA   NA
 3584985 3584986 Tpet_1027 Tpet_1028     TRUE 0.940 -3.000 0.019 1.000   NA
 3584986 3584987 Tpet_1028 Tpet_1029     TRUE 0.970 -3.000 0.643 NA N NA
 3584987 3584988 Tpet_1029 Tpet_1030     TRUE 0.824 -16.000 0.357 NA N NA
 3584988 3584989 Tpet_1030 Tpet_1031     TRUE 0.914 12.000 0.429 1.000 N NA
 3584989 3584990 Tpet_1031 Tpet_1032     TRUE 0.657 -25.000 0.273 1.000 N NA
 3584990 3584991 Tpet_1032 Tpet_1033     TRUE 0.812 10.000 0.077 1.000 N NA
 3584991 3584992 Tpet_1033 Tpet_1034     TRUE 0.781 6.000 0.071 1.000   NA
 3584992 3584993 Tpet_1034 Tpet_1035     TRUE 0.694 5.000 0.013 1.000   NA
 3584993 3584994 Tpet_1035 Tpet_1036     TRUE 0.861 -46.000 0.150 0.004   NA
 3584994 3584995 Tpet_1036 Tpet_1037     TRUE 0.737 -10.000 0.003 1.000 N NA
 3584997 3584998 Tpet_1039 Tpet_1040     FALSE 0.319 79.000 0.043 NA   NA
 3584998 3584999 Tpet_1040 Tpet_1041     FALSE 0.067 161.000 0.000 NA   NA
 3584999 3585000 Tpet_1041 Tpet_1042     TRUE 0.986 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 3585000 3585001 Tpet_1042 Tpet_1043     FALSE 0.492 5.000 0.000 NA   NA
 3585001 3585002 Tpet_1043 Tpet_1044     FALSE 0.284 -31.000 0.000 NA   NA
 3585002 3585003 Tpet_1044 Tpet_1045     TRUE 0.745 5.000 0.091 1.000   NA
 3585003 3585004 Tpet_1045 Tpet_1046     TRUE 0.994 13.000 0.034 0.005 Y NA
 3585004 3585005 Tpet_1046 Tpet_1047     TRUE 0.998 -9.000 0.822 0.005 Y NA
 3585005 3585006 Tpet_1047 Tpet_1048     TRUE 0.995 2.000 0.797 0.005 Y NA
 3585006 3585007 Tpet_1048 Tpet_R0032     FALSE 0.508 29.000 0.000 NA   NA
 3585009 3585010 Tpet_1050 Tpet_1051     FALSE 0.197 74.000 0.003 1.000 N NA
 3585010 3585011 Tpet_1051 Tpet_1052     TRUE 0.827 16.000 0.009 NA   NA
 3585011 3585012 Tpet_1052 Tpet_1053   nusB TRUE 0.921 22.000 0.833 NA   NA
 3585012 3585013 Tpet_1053 Tpet_1054 nusB   TRUE 0.917 12.000 0.462 1.000 N NA
 3585013 3585014 Tpet_1054 Tpet_1055     TRUE 0.981 14.000 0.039 0.004 N NA
 3585014 3585015 Tpet_1055 Tpet_1056     TRUE 0.929 -3.000 0.045 1.000 N NA
 3585015 3585016 Tpet_1056 Tpet_1057     TRUE 0.999 -3.000 0.412 0.001 Y NA
 3585016 3585017 Tpet_1057 Tpet_1058     FALSE 0.308 -37.000 0.005 1.000 N NA
 3585017 3585018 Tpet_1058 Tpet_1059     TRUE 0.974 -3.000 0.562 NA   NA
 3585018 3585019 Tpet_1059 Tpet_1060     TRUE 0.843 17.000 0.032 NA   NA
 3585019 3585020 Tpet_1060 Tpet_1061     TRUE 0.924 -3.000 0.006 1.000   NA
 3585020 3585021 Tpet_1061 Tpet_1062     TRUE 0.741 3.000 0.067 1.000   NA
 3585021 3585022 Tpet_1062 Tpet_1063     TRUE 0.926 -3.000 0.010 NA   NA
 3585023 3585024 Tpet_1064 Tpet_1065   nusA TRUE 0.933 20.000 0.007 0.022 N NA
 3585024 3585025 Tpet_1065 Tpet_1066 nusA   TRUE 0.957 13.000 0.759 NA   NA
 3585025 3585026 Tpet_1066 Tpet_R0033     FALSE 0.222 62.000 0.000 NA   NA
 3585027 3585028 Tpet_1067 Tpet_1068     TRUE 0.990 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 3585028 3585029 Tpet_1068 Tpet_1069   argC TRUE 0.984 -3.000 0.020 1.000 Y NA
 3585029 3585030 Tpet_1069 Tpet_1070 argC argJ TRUE 0.995 17.000 0.303 0.003 Y NA
 3585030 3585031 Tpet_1070 Tpet_1071 argJ   TRUE 0.998 -3.000 0.239 0.003 Y NA
 3585031 3585032 Tpet_1071 Tpet_1072     TRUE 0.905 3.000 0.013 1.000 Y NA
 3585033 3585034 Tpet_1073 Tpet_1074     FALSE 0.133 87.000 0.000 NA   NA
 3585035 3585036 Tpet_1075 Tpet_1076     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA   NA
 3585036 3585037 Tpet_1076 Tpet_R0034     FALSE 0.045 231.000 0.000 NA   NA
 3585038 3585039 Tpet_1077 Tpet_1078     FALSE 0.159 78.000 0.000 NA   NA
 3585040 3585041 Tpet_1079 Tpet_1080     FALSE 0.503 3.000 0.000 NA   NA
 11490275 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 466.000 0.000 NA   NA
 11632638 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 466.000 0.000 NA   NA
 11775030 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 466.000 0.000 NA   NA
 11490276 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 437.000 0.000 NA   NA
 11632639 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 437.000 0.000 NA   NA
 11775031 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 437.000 0.000 NA   NA
 11490277 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 399.000 0.000 NA   NA
 11632640 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 399.000 0.000 NA   NA
 11775032 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 399.000 0.000 NA   NA
 11490278 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 370.000 0.000 NA   NA
 11632641 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 370.000 0.000 NA   NA
 11775033 3585043   Tpet_1082     FALSE NA 370.000 0.000 NA   NA
 3585042 3585043 Tpet_1081 Tpet_1082     TRUE 0.957 10.000 0.119 NA Y NA
 3585043 3585044 Tpet_1082 Tpet_1083     TRUE 0.957 10.000 0.119 NA Y NA
 3585044 3585045 Tpet_1083 Tpet_1084     FALSE 0.503 3.000 0.000 NA   NA
 3585045 3585046 Tpet_1084 Tpet_1085     TRUE 0.723 3.000 0.050 NA   NA
 3585046 3585047 Tpet_1085 Tpet_1086     TRUE 0.970 -3.000 0.423 NA   NA
 3585047 3585048 Tpet_1086 Tpet_1087     TRUE 0.925 -7.000 0.218 NA   NA
 3585048 3585049 Tpet_1087 Tpet_1088     FALSE 0.138 339.000 0.269 NA   NA
 3585050 3585051 Tpet_1089 Tpet_1090     TRUE 0.841 -9.000 0.007 NA   NA
 3585051 3585052 Tpet_1090 Tpet_1091     TRUE 0.831 0.000 0.078 NA   NA
 3585053 3585054 Tpet_1092 Tpet_1093     FALSE 0.561 -27.000 0.026 NA   NA
 3585054 3585055 Tpet_1093 Tpet_1094     TRUE 0.993 -3.000 0.597 NA Y NA
 3585055 3585056 Tpet_1094 Tpet_1095     TRUE 0.975 18.000 0.547 NA Y NA
 3585056 3585057 Tpet_1095 Tpet_1096     TRUE 0.973 14.000 0.081 NA Y NA
 3585057 3585058 Tpet_1096 Tpet_1097     TRUE 0.883 15.000 0.061 NA   NA
 3585058 3585059 Tpet_1097 Tpet_1098     TRUE 0.941 -3.000 0.041 NA   NA
 3585059 3585060 Tpet_1098 Tpet_1099     FALSE 0.492 5.000 0.000 NA   NA
 3585061 3585062 Tpet_1100 Tpet_1101     TRUE 0.919 15.000 0.250 NA   NA
 3585063 3585064 Tpet_1102 Tpet_1103     FALSE 0.525 32.000 0.003 1.000 N NA
 3585064 3585065 Tpet_1103 Tpet_1104     TRUE 0.991 4.000 0.310 0.001 Y NA
 3585066 3585067 Tpet_1105 Tpet_1106 guaA   FALSE 0.518 5.000 0.003 1.000 N NA
 3585067 3585068 Tpet_1106 Tpet_1107     TRUE 0.786 12.000 0.007 1.000 N NA
 3585068 3585069 Tpet_1107 Tpet_1108     TRUE 0.999 -3.000 0.947 0.011 Y NA
 3585070 3585071 Tpet_1109 Tpet_1110     FALSE 0.476 -25.000 0.003 1.000   NA
 3585071 3585072 Tpet_1110 Tpet_1111     TRUE 0.998 -3.000 0.054 0.002 Y NA
 3585072 3585073 Tpet_1111 Tpet_1112     TRUE 0.858 -25.000 0.061 1.000 Y NA
 3585073 3585074 Tpet_1112 Tpet_1113     TRUE 0.935 9.000 0.007 1.000 Y NA
 3585074 3585075 Tpet_1113 Tpet_1114     FALSE 0.048 249.000 0.000 1.000   NA
 3585075 3585076 Tpet_1114 Tpet_1115     TRUE 0.620 -15.000 0.000 1.000   NA
 3585076 3585077 Tpet_1115 Tpet_1116     TRUE 0.928 -15.000 1.000 NA   NA
 3585077 3585078 Tpet_1116 Tpet_1117     TRUE 0.892 22.000 0.500 NA   NA
 3585078 3585079 Tpet_1117 Tpet_1118     FALSE 0.294 51.000 0.000 NA   NA
 3585079 3585080 Tpet_1118 Tpet_1119     TRUE 0.726 5.000 0.081 NA   NA
 3585081 3585082 Tpet_1120 Tpet_1121     TRUE 0.828 -13.000 0.062 NA   NA
 3585084 3585085 Tpet_R0036 Tpet_1122     FALSE 0.039 307.000 0.000 NA   NA
 3585086 3585087 Tpet_1123 Tpet_1124     TRUE 0.778 9.000 0.010 NA   NA
 3585088 3585089 Tpet_1125 Tpet_1126     TRUE 0.725 6.000 0.040 1.000 N NA
 3585089 3585090 Tpet_1126 Tpet_1127     TRUE 0.860 -7.000 0.014 1.000 N NA
 3585090 3585091 Tpet_1127 Tpet_1128     TRUE 0.671 -19.000 0.032 1.000 N NA
 3585091 3585092 Tpet_1128 Tpet_1129     TRUE 0.610 -22.000 0.011 1.000   NA
 3585092 3585093 Tpet_1129 Tpet_1130     TRUE 0.833 0.000 0.043 1.000   NA
 3585093 3585094 Tpet_1130 Tpet_1131     TRUE 0.901 14.000 0.045 1.000   NA
 3585094 3585095 Tpet_1131 Tpet_1132     TRUE 0.749 5.000 0.133 NA   NA
 3585095 3585096 Tpet_1132 Tpet_1133     FALSE 0.319 74.000 0.012 NA   NA
 3585096 3585097 Tpet_1133 Tpet_1134     TRUE 0.802 16.000 0.010 1.000 N NA
 3585097 3585098 Tpet_1134 Tpet_1135     FALSE 0.267 69.000 0.003 NA   NA
 3585098 3585099 Tpet_1135 Tpet_1136     FALSE 0.410 61.000 0.019 NA   NA
 3585099 3585100 Tpet_1136 Tpet_1137     TRUE 0.973 4.000 0.063 0.029 Y NA
 3585100 3585101 Tpet_1137 Tpet_1138     TRUE 0.671 5.000 0.044 1.000 N NA
 3585101 3585102 Tpet_1138 Tpet_1139     TRUE 0.941 -3.000 0.044 NA   NA
 3585102 3585103 Tpet_1139 Tpet_1140     TRUE 0.826 0.000 0.064 NA   NA
 3585103 3585104 Tpet_1140 Tpet_1141     TRUE 0.729 2.000 0.032 1.000 N NA
 3585104 3585105 Tpet_1141 Tpet_1142     TRUE 0.863 15.000 0.013 NA   NA
 3585105 3585106 Tpet_1142 Tpet_1143     TRUE 0.795 1.000 0.041 NA   NA
 3585106 3585107 Tpet_1143 Tpet_1144     TRUE 0.763 -16.000 0.037 NA   NA
 3585107 3585108 Tpet_1144 Tpet_1145     TRUE 0.937 -3.000 0.021 NA   NA
 3585109 3585110 Tpet_1146 Tpet_1147     TRUE 0.987 5.000 0.198 0.004 Y NA
 3585110 3585111 Tpet_1147 Tpet_1148     TRUE 0.888 13.000 0.024 1.000   NA
 3585111 3585112 Tpet_1148 Tpet_1149   pyrB FALSE 0.038 1593.000 0.000 1.000   NA
 3585112 3585113 Tpet_1149 Tpet_1150 pyrB   FALSE 0.472 36.000 0.003 1.000 N NA
 3585113 3585114 Tpet_1150 Tpet_1151     TRUE 0.863 -12.000 0.200 1.000 N NA
 3585114 3585115 Tpet_1151 Tpet_1152     TRUE 0.990 -3.000 0.304 0.033 N NA
 3585115 3585116 Tpet_1152 Tpet_1153     TRUE 0.730 -16.000 0.065 1.000 N NA
 3585116 3585117 Tpet_1153 Tpet_1154     TRUE 0.931 18.000 0.667 1.000   NA
 3585117 3585118 Tpet_1154 Tpet_1155     TRUE 0.861 -7.000 0.005 1.000   NA
 3585118 3585119 Tpet_1155 Tpet_1156     TRUE 0.998 -10.000 0.669 0.002 Y NA
 3585119 3585120 Tpet_1156 Tpet_1157     FALSE 0.586 2.000 0.000 1.000   NA
 3585120 3585121 Tpet_1157 Tpet_1158     TRUE 0.872 -3.000 0.000 1.000   NA
 3585121 3585122 Tpet_1158 Tpet_1159     FALSE 0.491 47.000 0.007 NA   NA
 3585123 3585124 Tpet_1160 Tpet_1161     TRUE 0.939 -3.000 0.026 NA   NA
 3585124 3585125 Tpet_1161 Tpet_1162     TRUE 0.794 12.000 0.003 NA   NA
 3585125 3585126 Tpet_1162 Tpet_1163     TRUE 0.703 2.000 0.015 1.000 N NA
 3585126 3585127 Tpet_1163 Tpet_1164     TRUE 0.636 31.000 0.015 1.000 N NA
 3585127 3585128 Tpet_1164 Tpet_1165     TRUE 0.985 4.000 0.496 0.028 Y NA
 3585128 3585129 Tpet_1165 Tpet_1166     TRUE 0.907 -3.000 0.003 1.000   NA
 3585131 3585132 Tpet_1168 Tpet_1169     TRUE 0.899 -3.000 0.003 NA   NA
 3585132 3585133 Tpet_1169 Tpet_1170     TRUE 0.974 -3.000 0.556 NA   NA
 3585133 3585134 Tpet_1170 Tpet_1171     TRUE 0.793 7.000 0.037 NA   NA
 3585134 3585135 Tpet_1171 Tpet_1172     FALSE 0.582 -22.000 0.009 NA   NA
 3585135 3585136 Tpet_1172 Tpet_1173     TRUE 0.809 14.000 0.005 NA N NA
 3585136 3585137 Tpet_1173 Tpet_1174     FALSE 0.047 223.000 0.000 NA   NA
 3585137 3585138 Tpet_1174 Tpet_1175     TRUE 0.994 -3.000 0.330 0.005   NA
 3585138 3585139 Tpet_1175 Tpet_1176     TRUE 0.996 14.000 0.085 0.004 Y NA
 3585139 3585140 Tpet_1176 Tpet_1177     TRUE 0.995 14.000 0.050 0.004 Y NA
 3585140 3585141 Tpet_1177 Tpet_1178     TRUE 0.996 -3.000 0.002 0.004 Y NA
 3585141 3585142 Tpet_1178 Tpet_1179     TRUE 0.999 -3.000 0.864 0.004 Y NA
 3585142 3585143 Tpet_1179 Tpet_1180     TRUE 0.996 7.000 0.846 0.004 Y NA
 3585143 3585144 Tpet_1180 Tpet_1181     TRUE 0.997 12.000 0.724 0.004 Y NA
 3585144 3585145 Tpet_1181 Tpet_1182     TRUE 0.994 5.000 0.837 0.004 Y NA
 3585145 3585146 Tpet_1182 Tpet_1183     FALSE 0.062 177.000 0.000 NA   NA
 3585146 3585147 Tpet_1183 Tpet_1184     FALSE 0.532 -18.000 0.000 NA   NA
 3585147 3585148 Tpet_1184 Tpet_1185     TRUE 0.768 14.000 0.000 NA   NA
 3585148 3585149 Tpet_1185 Tpet_1186     TRUE 0.683 70.000 0.017 NA Y NA
 3585149 3585150 Tpet_1186 Tpet_1187   tsf TRUE 0.900 2.000 0.003 1.000 Y NA
 3585150 3585151 Tpet_1187 Tpet_1188 tsf   FALSE 0.550 62.000 0.416 1.000 N NA
 3585152 3585153 Tpet_1189 Tpet_1190     TRUE 0.702 4.000 0.050 1.000   NA
 3585153 3585154 Tpet_1190 Tpet_1191     TRUE 0.798 21.000 0.021 1.000   NA
 3585154 3585155 Tpet_1191 Tpet_1192     TRUE 0.945 -3.000 0.086 NA   NA
 3585155 3585156 Tpet_1192 Tpet_1193     TRUE 0.846 5.000 0.500 NA   NA
 3585156 3585157 Tpet_1193 Tpet_1194     TRUE 0.850 -10.000 0.018 NA   NA
 3585157 3585158 Tpet_1194 Tpet_1195     TRUE 0.596 33.000 0.013 NA N NA
 3585159 3585160 Tpet_1196 Tpet_1197     TRUE 0.782 1.000 0.014 1.000   NA
 3585160 3585161 Tpet_1197 Tpet_1198     FALSE 0.453 -37.000 0.019 1.000   NA
 3585161 3585162 Tpet_1198 Tpet_1199     FALSE 0.470 -21.000 0.000 1.000   NA
 3585163 3585164 Tpet_1200 Tpet_1201   rplT TRUE 0.721 11.000 0.003 1.000 N NA
 3585164 3585165 Tpet_1201 Tpet_1202 rplT   TRUE 0.998 14.000 0.928 0.017 Y NA
 3585165 3585166 Tpet_1202 Tpet_1203   infC TRUE 0.986 15.000 0.652 1.000 Y NA
 3585166 3585167 Tpet_1203 Tpet_R0037 infC   FALSE 0.050 211.000 0.000 NA   NA
 3585167 3585168 Tpet_R0037 Tpet_R0038     FALSE 0.592 22.000 0.000 NA   NA
 3585168 3585169 Tpet_R0038 Tpet_R0039     TRUE 0.599 7.000 0.000 NA   NA
 3585169 3585170 Tpet_R0039 Tpet_R0040     FALSE 0.057 190.000 0.000 NA   NA
 3585170 3585171 Tpet_R0040 Tpet_R0041     TRUE 0.752 13.000 0.000 NA   NA
 3585171 3585172 Tpet_R0041 Tpet_1204     FALSE 0.458 34.000 0.000 NA   NA
 3585172 3585173 Tpet_1204 Tpet_1205     TRUE 0.851 20.000 0.200 NA   NA
 3585174 3585175 Tpet_1206 Tpet_1207     TRUE 0.699 -21.000 0.077 1.000   NA
 3585176 3585177 Tpet_1208 Tpet_1209     TRUE 0.965 -6.000 0.600 1.000   NA
 3585177 3585178 Tpet_1209 Tpet_1210     TRUE 0.886 13.000 0.044 NA   NA
 3585178 3585179 Tpet_1210 Tpet_1211     TRUE 0.849 11.000 0.040 NA   NA
 3585181 3585182 Tpet_1213 Tpet_1214 prfB secA TRUE 0.655 6.000 0.007 1.000 N NA
 3585182 3585183 Tpet_1214 Tpet_1215 secA   TRUE 0.820 2.000 0.200 NA   NA
 3585183 3585184 Tpet_1215 Tpet_1216     TRUE 0.906 -3.000 0.003 NA   NA
 3585184 3585185 Tpet_1216 Tpet_1217     TRUE 0.637 -21.000 0.013 NA   NA
 3585185 3585186 Tpet_1217 Tpet_1218     TRUE 0.940 -3.000 0.031 NA   NA
 3585188 3585189 Tpet_1220 Tpet_1221   rplS TRUE 0.749 0.000 0.010 1.000 N NA
 3585189 3585190 Tpet_1221 Tpet_1222 rplS   TRUE 0.722 3.000 0.037 NA   NA
 3585190 3585191 Tpet_1222 Tpet_1223     TRUE 0.912 -6.000 0.041 NA   NA
 3585191 3585192 Tpet_1223 Tpet_1224     TRUE 0.979 0.000 0.672 1.000 Y NA
 3585192 3585193 Tpet_1224 Tpet_1225     TRUE 0.822 5.000 0.324 1.000   NA
 3585193 3585194 Tpet_1225 Tpet_1226     TRUE 0.970 -3.000 0.385 1.000   NA
 3585194 3585195 Tpet_1226 Tpet_1227     TRUE 0.930 14.000 0.361 1.000 N NA
 3585195 3585196 Tpet_1227 Tpet_1228     FALSE 0.078 152.000 0.003 1.000 N NA
 3585196 3585197 Tpet_1228 Tpet_1229     FALSE 0.537 -25.000 0.029 1.000 N NA
 3585197 3585198 Tpet_1229 Tpet_1230     TRUE 0.717 5.000 0.062 NA   NA
 3585198 3585199 Tpet_1230 Tpet_1231     TRUE 0.948 -3.000 0.111 NA   NA
 3585199 3585200 Tpet_1231 Tpet_1232     TRUE 0.837 -15.000 0.278 1.000 N NA
 3585200 3585201 Tpet_1232 Tpet_1233     TRUE 0.915 -10.000 0.429 1.000 N NA
 3585201 3585202 Tpet_1233 Tpet_1234     TRUE 0.870 12.000 0.039 1.000   NA
 3585202 3585203 Tpet_1234 Tpet_1235     TRUE 0.834 18.000 0.026 1.000   NA
 3585203 3585204 Tpet_1235 Tpet_1236     FALSE 0.292 -73.000 0.026 NA N NA
 3585204 3585205 Tpet_1236 Tpet_1237     FALSE 0.352 -76.000 0.052 NA   NA
 3585205 3585206 Tpet_1237 Tpet_1238     TRUE 0.950 -3.000 0.131 NA   NA
 3585206 3585207 Tpet_1238 Tpet_1239     TRUE 0.784 6.000 0.103 NA   NA
 3585207 3585208 Tpet_1239 Tpet_1240     FALSE 0.469 -33.000 0.092 1.000 N NA
 3585208 3585209 Tpet_1240 Tpet_1241     TRUE 0.889 13.000 0.069 NA   NA
 3585211 3585212 Tpet_1243 Tpet_1244     TRUE 0.929 -19.000 0.182 1.000 Y NA
 3585212 3585213 Tpet_1244 Tpet_1245     TRUE 0.936 -6.000 0.182 1.000   NA
 3585214 3585215 Tpet_1246 Tpet_1247     TRUE 0.997 -3.000 0.012 0.005 Y NA
 3585215 3585216 Tpet_1247 Tpet_R0042     TRUE 0.737 -9.000 0.000 NA   NA
 3585216 3585217 Tpet_R0042 Tpet_1248     FALSE 0.206 66.000 0.000 NA   NA
 3585217 3585218 Tpet_1248 Tpet_1249     TRUE 0.763 5.000 0.257 1.000 N NA
 3585218 3585219 Tpet_1249 Tpet_1250     TRUE 0.995 18.000 0.148 0.001 Y NA
 3585219 3585220 Tpet_1250 Tpet_1251     TRUE 0.954 25.000 0.319 NA Y NA
 3585220 3585221 Tpet_1251 Tpet_1252     TRUE 0.985 -3.000 0.085 NA Y NA
 3585221 3585222 Tpet_1252 Tpet_1253   flgI TRUE 0.994 11.000 0.235 0.009 Y NA
 3585222 3585223 Tpet_1253 Tpet_1254 flgI   TRUE 0.856 11.000 0.078 NA   NA
 3585224 3585225 Tpet_1255 Tpet_1256     FALSE 0.500 58.000 0.130 NA   NA
 3585225 3585226 Tpet_1256 Tpet_1257     TRUE 0.898 13.000 0.103 NA   NA
 3585226 3585227 Tpet_1257 Tpet_1258     FALSE 0.535 -31.000 0.103 NA   NA
 3585227 3585228 Tpet_1258 Tpet_1259     TRUE 0.790 10.000 0.008 NA   NA
 3585228 3585229 Tpet_1259 Tpet_1260     TRUE 0.984 7.000 0.062 0.034 Y NA
 3585229 3585230 Tpet_1260 Tpet_1261     TRUE 0.998 -3.000 0.491 0.034 Y NA
 3585230 3585231 Tpet_1261 Tpet_1262     TRUE 0.994 -7.000 0.027 0.011 Y NA
 3585231 3585232 Tpet_1262 Tpet_1263     FALSE 0.458 102.000 0.667 NA   NA
 3585232 3585233 Tpet_1263 Tpet_1264     TRUE 0.874 0.000 0.231 NA   NA
 3585235 3585236 Tpet_1266 Tpet_1267     FALSE 0.173 151.000 0.027 1.000   NA
 3585236 3585237 Tpet_1267 Tpet_1268     TRUE 0.997 -3.000 0.750 0.001   NA
 3585238 3585239 Tpet_1269 Tpet_1270     TRUE 0.898 5.000 0.011 1.000 Y NA
 3585239 3585240 Tpet_1270 Tpet_1271     TRUE 0.927 -15.000 0.008 1.000 Y NA
 3585240 3585241 Tpet_1271 Tpet_1272     TRUE 0.984 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 3585241 3585242 Tpet_1272 Tpet_1273     TRUE 0.932 2.000 0.036 1.000 Y NA
 3585242 3585243 Tpet_1273 Tpet_1274     TRUE 0.958 16.000 0.012 1.000 Y NA
 3585243 3585244 Tpet_1274 Tpet_1275     TRUE 0.950 10.000 0.016 1.000 Y NA
 3585244 3585245 Tpet_1275 Tpet_1276     TRUE 0.743 1.000 0.006 1.000   NA
 3585245 3585246 Tpet_1276 Tpet_1277     TRUE 0.884 15.000 0.025 1.000   NA
 3585246 3585247 Tpet_1277 Tpet_1278     TRUE 0.610 -24.000 0.025 NA   NA
 3585247 3585248 Tpet_1278 Tpet_1279     TRUE 0.806 18.000 0.014 NA   NA
 3585249 3585250 Tpet_1280 Tpet_1281     TRUE 0.947 -3.000 0.076 1.000   NA
 3585250 3585251 Tpet_1281 Tpet_1282     TRUE 0.874 13.000 0.017 NA   NA
 3585251 3585252 Tpet_1282 Tpet_1283     FALSE 0.344 -45.000 0.007 NA   NA
 3585252 3585253 Tpet_1283 Tpet_1284     TRUE 0.768 -19.000 0.182 NA   NA
 3585253 3585254 Tpet_1284 Tpet_1285     TRUE 0.635 48.000 0.172 1.000   NA
 3585255 3585256 Tpet_1286 Tpet_1287   rpsL FALSE 0.176 122.000 0.012 NA   NA
 3585256 3585257 Tpet_1287 Tpet_1288 rpsL   TRUE 0.996 12.000 0.224 0.003 Y NA
 3585257 3585258 Tpet_1288 Tpet_1289     TRUE 0.924 6.000 0.015 1.000 Y NA
 3585258 3585259 Tpet_1289 Tpet_1290     TRUE 0.995 12.000 0.015 0.001 Y NA
 3585259 3585260 Tpet_1290 Tpet_1291     TRUE 0.877 51.000 0.318 1.000 Y NA
 3585260 3585261 Tpet_1291 Tpet_1292     TRUE 0.993 19.000 0.467 0.023 Y NA
 3585261 3585262 Tpet_1292 Tpet_1293   rplD TRUE 0.993 21.000 0.544 0.017 Y NA
 3585262 3585263 Tpet_1293 Tpet_1294 rplD   TRUE 0.971 -28.000 0.307 0.017 Y NA
 3585263 3585264 Tpet_1294 Tpet_1295   rplB TRUE 0.998 14.000 0.849 0.019 Y NA
 3585264 3585265 Tpet_1295 Tpet_1296 rplB   TRUE 0.997 14.000 0.820 0.023 Y NA
 3585265 3585266 Tpet_1296 Tpet_1297     TRUE 0.996 12.000 0.769 0.023 Y NA
 3585266 3585267 Tpet_1297 Tpet_1298     TRUE 0.995 10.000 0.719 0.023 Y NA
 3585267 3585268 Tpet_1298 Tpet_1299   rplP TRUE 0.997 15.000 0.828 0.023 Y NA
 3585268 3585269 Tpet_1299 Tpet_1300 rplP   TRUE 0.999 -3.000 0.802 0.017 Y NA
 3585269 3585270 Tpet_1300 Tpet_1301   rpsQ TRUE 0.992 5.000 0.828 0.017 Y NA
 3585270 3585271 Tpet_1301 Tpet_1302 rpsQ   TRUE 0.999 -3.000 0.791 0.023 Y NA
 3585271 3585272 Tpet_1302 Tpet_1303   rplX TRUE 0.997 13.000 0.810 0.023 Y NA
 3585272 3585273 Tpet_1303 Tpet_1304 rplX rplE TRUE 0.995 -13.000 0.758 0.017 Y NA
 3585273 3585274 Tpet_1304 Tpet_1305 rplE   TRUE 0.996 15.000 0.496 0.017 Y NA
 3585274 3585275 Tpet_1305 Tpet_1306     TRUE 0.995 16.000 0.473 0.017 Y NA
 3585275 3585276 Tpet_1306 Tpet_1307   rplF TRUE 0.997 14.000 0.808 0.017 Y NA
 3585276 3585277 Tpet_1307 Tpet_1308 rplF   TRUE 0.997 15.000 0.815 0.017 Y NA
 3585277 3585278 Tpet_1308 Tpet_1309     TRUE 0.997 15.000 0.814 0.023 Y NA
 3585278 3585279 Tpet_1309 Tpet_1310     TRUE 0.997 -7.000 0.789 0.023 Y NA
 3585279 3585280 Tpet_1310 Tpet_1311     TRUE 0.999 -3.000 0.653 0.003 Y NA
 3585280 3585281 Tpet_1311 Tpet_1312   secY TRUE 0.887 2.000 0.730 1.000 N NA
 3585281 3585282 Tpet_1312 Tpet_1313 secY   TRUE 0.953 -3.000 0.241 1.000 N NA
 3585282 3585283 Tpet_1313 Tpet_1314     TRUE 0.956 -3.000 0.290 1.000 N NA
 3585283 3585284 Tpet_1314 Tpet_1315     TRUE 0.943 2.000 0.160 1.000 Y NA
 3585284 3585285 Tpet_1315 Tpet_1316   rpmJ TRUE 0.888 18.000 0.257 1.000   NA
 3585285 3585286 Tpet_1316 Tpet_1317 rpmJ rpsM TRUE 0.978 16.000 0.194 0.017   NA
 3585286 3585287 Tpet_1317 Tpet_1318 rpsM   TRUE 0.995 19.000 0.810 0.017 Y NA
 3585287 3585288 Tpet_1318 Tpet_1319   rpsD TRUE 0.996 13.000 0.509 0.023 Y NA
 3585288 3585289 Tpet_1319 Tpet_1320 rpsD   TRUE 0.864 6.000 0.549 1.000 N NA
 3585289 3585290 Tpet_1320 Tpet_1321     TRUE 0.857 4.000 0.873 1.000 N NA
 3585290 3585291 Tpet_1321 Tpet_1322   rho FALSE 0.342 55.000 0.006 1.000 N NA
 3585291 3585292 Tpet_1322 Tpet_1323 rho   TRUE 0.944 17.000 0.006 1.000 Y NA
 3585292 3585293 Tpet_1323 Tpet_1324     TRUE 0.798 5.000 0.273 NA   NA
 3585294 3585295 Tpet_1325 Tpet_1326     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA   NA
 3585295 3585296 Tpet_1326 Tpet_1327     FALSE 0.045 274.000 0.000 1.000   NA
 3585297 3585298 Tpet_1328 Tpet_1329     TRUE 0.771 12.000 0.007 NA N NA
 3585298 3585299 Tpet_1329 Tpet_1330   rpmH FALSE 0.312 58.000 0.002 NA   NA
 3585299 3585300 Tpet_1330 Tpet_1331 rpmH   TRUE 0.980 -3.000 0.787 1.000   NA
 3585300 3585301 Tpet_1331 Tpet_1332     TRUE 0.973 -3.000 0.540 NA   NA
 3585301 3585302 Tpet_1332 Tpet_1333     TRUE 0.971 -3.000 0.461 NA   NA
 3585302 3585303 Tpet_1333 Tpet_1334     TRUE 0.911 12.000 0.254 1.000   NA
 3585303 3585304 Tpet_1334 Tpet_1335     TRUE 0.624 -22.000 0.019 NA   NA
 3585304 3585305 Tpet_1335 Tpet_1336     FALSE 0.122 129.000 0.003 NA   NA
 3585305 3585306 Tpet_1336 Tpet_1337     TRUE 0.957 -3.000 0.208 NA   NA
 3585306 3585307 Tpet_1337 Tpet_1338   rpmA TRUE 0.898 -10.000 0.203 NA   NA
 3585307 3585308 Tpet_1338 Tpet_1339 rpmA   TRUE 0.818 -10.000 0.007 NA   NA
 3585308 3585309 Tpet_1339 Tpet_1340   rplM TRUE 0.861 -7.000 0.007 NA   NA
 3585309 3585310 Tpet_1340 Tpet_1341 rplM   TRUE 0.994 20.000 0.601 0.017 Y NA
 3585310 3585311 Tpet_1341 Tpet_1342     FALSE 0.060 451.000 0.012 1.000 N NA
 3585311 3585312 Tpet_1342 Tpet_1343     TRUE 0.790 6.000 0.205 1.000 N NA
 3585313 3585314 Tpet_1344 Tpet_1345     TRUE 0.834 -7.000 0.002 1.000   NA
 3585314 3585315 Tpet_1345 Tpet_1346     TRUE 0.936 -13.000 0.000 0.010   NA
 3585315 3585316 Tpet_1346 Tpet_1347     TRUE 0.668 5.000 0.008 1.000   NA
 3585316 3585317 Tpet_1347 Tpet_1348     TRUE 0.698 5.000 0.014 1.000   NA
 3585317 3585318 Tpet_1348 Tpet_1349     TRUE 0.695 3.000 0.011 1.000   NA
 3585318 3585319 Tpet_1349 Tpet_1350     TRUE 0.797 -13.000 0.058 1.000 N NA
 3585319 3585320 Tpet_1350 Tpet_1351     TRUE 0.931 -3.000 0.070 1.000 N NA
 3585320 3585321 Tpet_1351 Tpet_1352     TRUE 0.675 2.000 0.009 1.000 N NA
 3585321 3585322 Tpet_1352 Tpet_1353     TRUE 0.664 2.000 0.008 1.000 N NA
 3585322 3585323 Tpet_1353 Tpet_1354     TRUE 0.965 -6.000 0.003 1.000 Y NA
 3585324 3585325 Tpet_1355 Tpet_1356     TRUE 0.720 5.000 0.070 NA   NA
 3585325 3585326 Tpet_1356 Tpet_1357     TRUE 0.902 -3.000 0.002 1.000   NA
 3585326 3585327 Tpet_1357 Tpet_1358     TRUE 0.619 -15.000 0.003 1.000 N NA
 3585328 3585329 Tpet_1359 Tpet_1360     FALSE 0.301 -49.000 0.004 NA   NA
 3585329 3585330 Tpet_1360 Tpet_1361     TRUE 0.820 2.000 0.200 NA   NA
 3585330 3585331 Tpet_1361 Tpet_1362     TRUE 0.991 -3.000 0.238 0.033   NA
 3585331 3585332 Tpet_1362 Tpet_1363     FALSE 0.334 79.000 0.048 1.000   NA
 3585332 3585333 Tpet_1363 Tpet_1364     TRUE 0.612 -19.000 0.010 1.000 N NA
 3585333 3585334 Tpet_1364 Tpet_1365     FALSE 0.171 84.000 0.004 1.000 N NA
 3585334 3585335 Tpet_1365 Tpet_1366     FALSE 0.243 109.000 0.065 1.000   NA
 3585335 3585336 Tpet_1366 Tpet_1367     TRUE 0.929 -7.000 0.217 1.000   NA
 3585336 3585337 Tpet_1367 Tpet_1368     TRUE 0.993 14.000 0.733 0.005   NA
 3585337 3585338 Tpet_1368 Tpet_1369     TRUE 0.998 -7.000 0.576 0.005 Y NA
 3585338 3585339 Tpet_1369 Tpet_1370     TRUE 0.906 13.000 0.119 1.000   NA
 3585339 3585340 Tpet_1370 Tpet_1371     TRUE 0.890 -13.000 0.278 1.000   NA
 3585340 3585341 Tpet_1371 Tpet_1372     TRUE 0.982 -7.000 0.214 0.034   NA
 3585342 3585343 Tpet_1373 Tpet_1374     FALSE 0.580 41.000 0.032 1.000 N NA
 3585343 3585344 Tpet_1374 Tpet_1375     TRUE 0.896 -6.000 0.061 1.000 N NA
 3585344 3585345 Tpet_1375 Tpet_1376     TRUE 0.648 33.000 0.028 1.000 N NA
 3585345 3585346 Tpet_1376 Tpet_1377     TRUE 0.992 -3.000 0.465 1.000 Y NA
 3585346 3585347 Tpet_1377 Tpet_R0043     FALSE 0.472 33.000 0.000 NA   NA
 3585347 3585348 Tpet_R0043 Tpet_1378     FALSE 0.307 50.000 0.000 NA   NA
 3585348 3585349 Tpet_1378 Tpet_1379     TRUE 0.958 2.000 0.333 1.000 Y NA
 3585350 3585351 Tpet_1380 Tpet_1381     TRUE 0.976 5.000 0.222 0.061 Y NA
 3585351 3585352 Tpet_1381 Tpet_1382     FALSE 0.031 273.000 0.000 1.000 N NA
 3585352 3585353 Tpet_1382 Tpet_1383     TRUE 0.946 0.000 0.060 0.036 N NA
 3585354 3585355 Tpet_1384 Tpet_1385     TRUE 0.964 -3.000 0.409 1.000 N NA
 3585355 3585356 Tpet_1385 Tpet_1386     TRUE 0.885 -7.000 0.012 1.000   NA
 3585356 3585357 Tpet_1386 Tpet_1387     TRUE 0.930 -3.000 0.009 1.000   NA
 3585357 3585358 Tpet_1387 Tpet_1388     TRUE 0.690 7.000 0.002 1.000   NA
 3585359 3585360 Tpet_1389 Tpet_1390     TRUE 0.892 -3.000 0.004 1.000 N NA
 3585360 3585361 Tpet_1390 Tpet_1391     TRUE 0.913 -3.000 0.004 NA   NA
 3585361 3585362 Tpet_1391 Tpet_1392     TRUE 0.873 7.000 0.333 NA   NA
 3585366 3585367 Tpet_1394 Tpet_1395     TRUE 0.982 -3.000 0.003 0.006 N NA
 3585367 3585368 Tpet_1395 Tpet_1396   coaE FALSE 0.546 -18.000 0.002 1.000 N NA
 3585368 3585369 Tpet_1396 Tpet_1397 coaE   TRUE 0.852 -6.000 0.003 NA   NA
 3585369 3585370 Tpet_1397 Tpet_1398     TRUE 0.920 -3.000 0.007 NA   NA
 3585370 3585371 Tpet_1398 Tpet_1399     TRUE 0.809 12.000 0.012 1.000 N NA
 3585371 3585372 Tpet_1399 Tpet_1400     TRUE 0.640 2.000 0.005 1.000 N NA
 3585372 3585373 Tpet_1400 Tpet_1401     FALSE 0.359 -54.000 0.012 1.000   NA
 3585373 3585374 Tpet_1401 Tpet_1402     TRUE 0.801 1.000 0.073 NA   NA
 3585374 3585375 Tpet_1402 Tpet_1403     TRUE 0.844 17.000 0.049 NA   NA
 3585375 3585376 Tpet_1403 Tpet_1404     TRUE 0.782 0.000 0.009 NA   NA
 3585376 3585377 Tpet_1404 Tpet_1405     FALSE 0.582 28.000 0.004 1.000 N NA
 3585377 3585378 Tpet_1405 Tpet_1406     TRUE 0.998 -3.000 0.944 0.043 Y NA
 3585378 3585379 Tpet_1406 Tpet_1407     TRUE 0.988 -3.000 0.156 1.000 Y NA
 3585379 3585380 Tpet_1407 Tpet_1408     TRUE 0.949 9.000 0.046 1.000 Y NA
 3585380 3585381 Tpet_1408 Tpet_R0046     FALSE 0.280 53.000 0.000 NA   NA
 3585381 3585382 Tpet_R0046 Tpet_1409     FALSE 0.424 38.000 0.000 NA   NA
 3585384 3585385 Tpet_1411 Tpet_1412     TRUE 0.957 -3.000 0.292 1.000 N NA
 3585385 3585386 Tpet_1412 Tpet_1413     TRUE 0.611 -22.000 0.077 1.000 N NA
 3585386 3585387 Tpet_1413 Tpet_1414     TRUE 0.996 11.000 0.266 0.002 Y NA
 3585387 3585388 Tpet_1414 Tpet_1415     TRUE 0.992 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 3585389 3585390 Tpet_R0047 Tpet_1416     FALSE 0.307 50.000 0.000 NA   NA
 3585391 3585392 Tpet_1417 Tpet_1418     TRUE 0.992 7.000 0.166 0.003 Y NA
 3585392 3585393 Tpet_1418 Tpet_1419     TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.003 Y NA
 3585393 3585394 Tpet_1419 Tpet_1420     TRUE 0.702 17.000 0.003 1.000 N NA
 3585394 3585395 Tpet_1420 Tpet_1421     TRUE 0.747 18.000 0.009 1.000 N NA
 3585395 3585396 Tpet_1421 Tpet_1422     TRUE 0.836 5.000 0.007 0.085 N NA
 3585396 3585397 Tpet_1422 Tpet_1423     TRUE 0.672 22.000 0.005 1.000 N NA
 3585397 3585398 Tpet_1423 Tpet_1424     TRUE 0.862 5.000 0.000 0.027   NA
 3585398 3585399 Tpet_1424 Tpet_1425     FALSE 0.343 47.000 0.000 NA   NA
 3585400 3585401 Tpet_1426 Tpet_1427     FALSE 0.500 50.000 0.015 NA   NA
 3585401 3585402 Tpet_1427 Tpet_1428     TRUE 0.848 12.000 0.017 NA   NA
 3585402 3585403 Tpet_1428 Tpet_1429     TRUE 0.941 -3.000 0.034 NA   NA
 3585403 3585404 Tpet_1429 Tpet_1430     TRUE 0.734 -19.000 0.091 NA   NA
 3585404 3585405 Tpet_1430 Tpet_1431     TRUE 0.978 -3.000 0.739 NA   NA
 3585405 3585406 Tpet_1431 Tpet_1432     TRUE 0.888 -6.000 0.007 1.000   NA
 3585406 3585407 Tpet_1432 Tpet_1433     TRUE 0.596 3.000 0.007 1.000 N NA
 3585407 3585408 Tpet_1433 Tpet_1434     TRUE 0.768 2.000 0.048 NA   NA
 3585408 3585409 Tpet_1434 Tpet_1435     TRUE 0.633 54.000 0.333 NA   NA
 3585410 3585411 Tpet_1436 Tpet_1437     TRUE 0.802 12.000 0.003 1.000   NA
 3585411 3585412 Tpet_1437 Tpet_1438     FALSE 0.505 -28.000 0.010 1.000   NA
 3585412 3585413 Tpet_1438 Tpet_1439     TRUE 0.794 74.000 0.335 1.000 Y NA
 3585413 3585414 Tpet_1439 Tpet_R0048     FALSE 0.109 104.000 0.000 NA   NA
 3585416 3585417 Tpet_1440 Tpet_1441     FALSE 0.280 53.000 0.000 NA   NA
 3585417 3585418 Tpet_1441 Tpet_1442     FALSE 0.563 2.000 0.000 NA   NA
 3585419 3585420 Tpet_1443 Tpet_1444     FALSE 0.038 363.000 0.000 NA   NA
 3585421 3585422 Tpet_1445 Tpet_1446     TRUE 0.940 16.000 0.600 NA   NA
 3585422 3585423 Tpet_1446 Tpet_1447     TRUE 0.916 -7.000 0.158 NA   NA
 3585423 3585424 Tpet_1447 Tpet_1448     FALSE 0.037 389.000 0.000 NA   NA
 3585426 3585427 Tpet_1450 Tpet_1451     TRUE 0.931 -3.000 0.010 1.000   NA
 3585427 3585428 Tpet_1451 Tpet_1452     FALSE 0.183 123.000 0.017 NA   NA
 3585428 3585429 Tpet_1452 Tpet_1453     FALSE 0.445 113.000 0.750 NA   NA
 3585429 3585430 Tpet_1453 Tpet_1454     TRUE 0.965 7.000 0.800 0.084 N NA
 3585430 3585431 Tpet_1454 Tpet_1455     TRUE 0.946 10.000 0.190 0.084 N NA
 3585431 3585432 Tpet_1455 Tpet_1456     FALSE 0.185 162.000 0.120 1.000   NA
 3585432 3585433 Tpet_1456 Tpet_1457     TRUE 0.929 -19.000 0.160 0.044   NA
 3585433 3585434 Tpet_1457 Tpet_1458     FALSE 0.040 296.000 0.000 NA   NA
 3585434 3585435 Tpet_1458 Tpet_1459     TRUE 0.943 12.000 0.667 NA   NA
 3585435 3585436 Tpet_1459 Tpet_1460     TRUE 0.972 -3.000 0.500 NA   NA
 3585436 3585437 Tpet_1460 Tpet_1461     FALSE 0.252 117.000 0.150 NA   NA
 3585438 3585439 Tpet_1462 Tpet_1463     FALSE 0.461 4.000 0.000 NA   NA
 3585439 3585440 Tpet_1463 Tpet_1464     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA   NA
 3585441 3585442 Tpet_1465 Tpet_1466     TRUE 0.995 20.000 0.600 0.005 Y NA
 3585442 3585443 Tpet_1466 Tpet_1467     TRUE 0.793 6.000 0.094 1.000   NA
 3585443 3585444 Tpet_1467 Tpet_1468     FALSE 0.041 274.000 0.000 NA   NA
 3585445 3585446 Tpet_1469 Tpet_1470     FALSE 0.118 97.000 0.000 NA   NA
 3585446 3585447 Tpet_1470 Tpet_1471     TRUE 0.861 -3.000 0.000 NA   NA
 3585447 3585448 Tpet_1471 Tpet_1472     TRUE 0.808 23.000 0.118 NA   NA
 3585449 3585450 Tpet_1473 Tpet_1474     FALSE 0.211 64.000 0.000 NA   NA
 3585450 3585451 Tpet_1474 Tpet_1475     FALSE 0.461 4.000 0.000 NA   NA
 3585451 3585452 Tpet_1475 Tpet_1476     TRUE 0.605 21.000 0.000 NA   NA
 3585452 3585453 Tpet_1476 Tpet_1477     TRUE 0.657 57.000 0.500 NA   NA
 3585453 3585454 Tpet_1477 Tpet_1478     TRUE 0.920 -6.000 0.094 NA   NA
 3585454 3585455 Tpet_1478 Tpet_1479     FALSE 0.429 -49.000 0.094 NA   NA
 3585455 3585456 Tpet_1479 Tpet_1480     TRUE 0.971 -3.000 0.400 1.000   NA
 3585456 3585457 Tpet_1480 Tpet_1481     FALSE 0.236 186.000 0.400 NA   NA
 3585461 3585462 Tpet_1485 Tpet_1486     TRUE 0.964 -3.000 0.273 1.000   NA
 3585466 3585467 Tpet_1490 Tpet_1491     TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA Y NA
 3585468 3585469 Tpet_1492 Tpet_1493     TRUE 0.621 4.000 0.008 NA   NA
 3585469 3585470 Tpet_1493 Tpet_1494     TRUE 0.924 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3585471 3585472 Tpet_1495 Tpet_1496     TRUE 0.662 3.000 0.030 NA N NA
 3585472 3585473 Tpet_1496 Tpet_1497     FALSE 0.471 121.000 1.000 NA   NA
 3585473 3585474 Tpet_1497 Tpet_1498   gatB TRUE 0.598 5.000 0.003 NA   NA
 3585474 3585475 Tpet_1498 Tpet_1499 gatB   TRUE 0.999 -3.000 0.492 0.001 Y NA
 3585477 3585478 Tpet_1501 Tpet_1502     TRUE 0.600 51.000 0.300 1.000 N NA
 3585478 3585479 Tpet_1502 Tpet_1503     TRUE 0.911 7.000 0.667 NA   NA
 3585479 3585480 Tpet_1503 Tpet_1504   thiH TRUE 0.837 -13.000 0.086 NA   NA
 3585480 3585481 Tpet_1504 Tpet_1505 thiH   TRUE 0.829 0.000 0.072 NA   NA
 3585481 3585482 Tpet_1505 Tpet_1506     FALSE 0.251 141.000 0.273 NA   NA
 3585483 3585484 Tpet_1507 Tpet_1508     TRUE 0.948 50.000 0.093 0.042 Y NA
 3585484 3585485 Tpet_1508 Tpet_1509     TRUE 0.996 -3.000 0.198 0.060 Y NA
 3585485 3585486 Tpet_1509 Tpet_1510     TRUE 0.989 -16.000 0.048 0.002 Y NA
 3585486 3585487 Tpet_1510 Tpet_1511     TRUE 0.978 15.000 0.290 NA Y NA
 3585487 3585488 Tpet_1511 Tpet_1512     TRUE 0.707 -25.000 0.467 NA N NA
 3585488 3585489 Tpet_1512 Tpet_1513     TRUE 0.971 -13.000 0.375 1.000 Y NA
 3585490 3585491 Tpet_1514 Tpet_1515     TRUE 0.716 5.000 0.061 NA   NA
 3585491 3585492 Tpet_1515 Tpet_1516     FALSE 0.587 -25.000 0.132 1.000 N NA
 3585494 3585495 Tpet_1518 Tpet_1519     FALSE 0.381 -34.000 0.005 NA   NA
 3585495 3585496 Tpet_1519 Tpet_1520     TRUE 0.601 3.000 0.003 NA   NA
 3585496 3585497 Tpet_1520 Tpet_1521     TRUE 0.985 -3.000 0.027 1.000 Y NA
 3585497 3585498 Tpet_1521 Tpet_1522     TRUE 0.978 13.000 0.238 1.000 Y NA
 3585498 3585499 Tpet_1522 Tpet_1523     TRUE 0.935 -19.000 0.225 1.000 Y NA
 3585499 3585500 Tpet_1523 Tpet_1524     TRUE 0.798 -30.000 0.013 1.000 Y NA
 3585500 3585501 Tpet_1524 Tpet_1525     TRUE 0.934 5.000 0.223 1.000 Y NA
 3585501 3585502 Tpet_1525 Tpet_1526     TRUE 0.994 6.000 0.346 0.001 Y NA
 3585502 3585503 Tpet_1526 Tpet_1527     TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 3585503 3585504 Tpet_1527 Tpet_1528     TRUE 0.871 -24.000 0.049 1.000 Y NA
 3585504 3585505 Tpet_1528 Tpet_R0050     FALSE 0.097 115.000 0.000 NA   NA
 3585506 3585507 Tpet_1529 Tpet_1530     TRUE 0.714 19.000 0.003 NA   NA
 3585507 3585508 Tpet_1530 Tpet_1531     TRUE 0.854 -7.000 0.005 NA   NA
 3585508 3585509 Tpet_1531 Tpet_1532     TRUE 0.819 10.000 0.017 NA   NA
 3585511 3585512 Tpet_1534 Tpet_1535     TRUE 0.980 45.000 0.674 0.042 Y NA
 3585512 3585513 Tpet_1535 Tpet_1536     TRUE 0.998 -3.000 0.897 0.042 Y NA
 3585513 3585514 Tpet_1536 Tpet_1537     TRUE 0.995 14.000 0.368 0.042 Y NA
 3585514 3585515 Tpet_1537 Tpet_1538     TRUE 0.990 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 3585515 3585516 Tpet_1538 Tpet_1539     TRUE 0.968 -3.000 0.500 1.000 N NA
 3585516 3585517 Tpet_1539 Tpet_1540     TRUE 0.987 -3.000 0.176 NA Y NA
 3585517 3585518 Tpet_1540 Tpet_1541     TRUE 0.835 -16.000 0.412 NA N NA
 3585518 3585519 Tpet_1541 Tpet_1542     FALSE 0.525 158.000 0.250 0.025 N NA
 3585519 3585520 Tpet_1542 Tpet_1543     TRUE 0.911 3.000 0.049 NA Y NA
 3585520 3585521 Tpet_1543 Tpet_1544     TRUE 0.971 14.000 0.049 NA Y NA
 3585521 3585522 Tpet_1544 Tpet_1545     FALSE 0.171 132.000 0.125 NA N NA
 3585522 3585523 Tpet_1545 Tpet_1546     TRUE 0.951 56.000 0.267 0.042 Y NA
 3585523 3585524 Tpet_1546 Tpet_1547     TRUE 0.998 -3.000 0.933 0.042 Y NA
 3585524 3585525 Tpet_1547 Tpet_1548     TRUE 0.994 -3.000 0.700 1.000 Y NA
 3585525 3585526 Tpet_1548 Tpet_1549     TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.008 Y NA
 3585526 3585527 Tpet_1549 Tpet_1550     TRUE 0.772 2.000 0.150 1.000 N NA
 3585529 3585530 Tpet_1552 Tpet_1553     TRUE 0.902 60.000 0.875 1.000 Y NA
 3585530 3585531 Tpet_1553 Tpet_1554     TRUE 0.992 0.000 0.375 0.042 Y NA
 3585531 3585532 Tpet_1554 Tpet_1555     TRUE 0.990 -3.000 0.300 1.000 Y NA
 3585532 3585533 Tpet_1555 Tpet_1556     TRUE 0.912 16.000 0.400 1.000 N NA
 3585533 3585534 Tpet_1556 Tpet_1557     FALSE 0.197 58.000 0.000 1.000 N NA
 3585534 3585535 Tpet_1557 Tpet_1558     TRUE 0.917 15.000 0.333 1.000 N NA
 3585535 3585536 Tpet_1558 Tpet_1559     FALSE 0.484 6.000 0.000 1.000 N NA
 3585536 3585537 Tpet_1559 Tpet_1560     TRUE 0.974 6.000 0.000 0.006 Y NA
 3585537 3585538 Tpet_1560 Tpet_1561     TRUE 0.927 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3585538 3585539 Tpet_1561 Tpet_1562     TRUE 0.995 -3.000 0.370 0.001 N NA
 3585539 3585540 Tpet_1562 Tpet_1563     FALSE 0.033 252.000 0.000 1.000 N NA
 3585540 3585541 Tpet_1563 Tpet_1564     FALSE 0.409 40.000 0.000 NA   NA
 3585542 3585543 Tpet_R0051 Tpet_1565     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 3585544 3585545 Tpet_1566 Tpet_1567     TRUE 0.798 5.000 0.273 NA   NA
 3585546 3585547 Tpet_1568 Tpet_1569 mgsA   TRUE 0.716 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3585547 3585548 Tpet_1569 Tpet_1570