MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus sanguinis SK36

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2059556 2059557 SSA_0001 SSA_0002 dnaA dnaN TRUE 0.894 159.000 0.328 1.000 Y NA
 2059557 2059558 SSA_0002 SSA_2390 dnaN   FALSE 0.183 128.000 0.009 NA   NA
 2059560 2059561 SSA_0005 SSA_0006   pth TRUE 0.941 73.000 0.184 1.000 Y NA
 2059561 2059562 SSA_0006 SSA_0008 pth trcF TRUE 0.978 -7.000 0.137 1.000 N NA
 2059562 2059563 SSA_0008 SSA_0009 trcF   TRUE 0.298 91.000 0.024 1.000 N NA
 2059563 2059564 SSA_0009 SSA_0010   divIC TRUE 0.967 -7.000 0.053 1.000 N NA
 2059564 2059565 SSA_0010 SSA_0011 divIC   TRUE 0.927 3.000 0.009 NA   NA
 2059565 2059566 SSA_0011 SSA_0012     TRUE 0.978 -7.000 0.105 NA   NA
 2059566 2059567 SSA_0012 SSA_0013   mesJ TRUE 0.946 -3.000 0.014 1.000 N NA
 2059567 2059568 SSA_0013 SSA_0014 mesJ hpt TRUE 0.981 -7.000 0.067 0.062 N NA
 2059568 2059569 SSA_0014 SSA_0015 hpt ftsH TRUE 0.933 18.000 0.192 1.000 N NA
 2059569 2059570 SSA_0015 SSA_2412 ftsH   FALSE 0.159 106.000 0.000 NA   NA
 2059570 2059571 SSA_2412 SSA_2413     TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2059571 2059572 SSA_2413 SSA_0016   comX FALSE 0.088 211.000 0.000 NA   NA
 2059572 2059573 SSA_0016 SSA_2400 comX   FALSE 0.064 267.000 0.000 NA   NA
 2059573 2059574 SSA_2400 SSA_2414     TRUE 0.294 62.000 0.000 NA   NA
 2059574 2059575 SSA_2414 SSA_2404     FALSE 0.123 127.000 0.000 NA   NA
 2059575 2059576 SSA_2404 SSA_2408     FALSE 0.132 119.000 0.000 NA   NA
 2059576 2059577 SSA_2408 SSA_2415     TRUE 0.881 4.000 0.000 NA   NA
 2059577 2059578 SSA_2415 SSA_2416     TRUE 0.789 17.000 0.000 NA   NA
 2059578 2059579 SSA_2416 SSA_2417     TRUE 0.542 33.000 0.000 NA   NA
 2059579 2059580 SSA_2417 SSA_2418     TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2059580 2059581 SSA_2418 SSA_2419     TRUE 0.789 17.000 0.000 NA   NA
 2059581 2059582 SSA_2419 SSA_2420     TRUE 0.809 15.000 0.000 NA   NA
 2059582 2059583 SSA_2420 SSA_2421     TRUE 0.869 8.000 0.000 NA   NA
 2059583 2059584 SSA_2421 SSA_2422     TRUE 0.560 32.000 0.000 NA   NA
 2059584 2059585 SSA_2422 SSA_2423     TRUE 0.723 20.000 0.000 NA   NA
 2059585 2059586 SSA_2423 SSA_2424     TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2059586 2059587 SSA_2424 SSA_2425     TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 2059587 2059588 SSA_2425 SSA_2426     TRUE 0.827 13.000 0.000 NA   NA
 2059588 2059589 SSA_2426 SSA_2427     TRUE 0.723 20.000 0.000 NA   NA
 2059589 2059590 SSA_2427 SSA_2428     TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2059590 2059591 SSA_2428 SSA_2429     TRUE 0.703 21.000 0.000 NA   NA
 2059591 2059592 SSA_2429 SSA_2430     TRUE 0.521 34.000 0.000 NA   NA
 2059592 2059593 SSA_2430 SSA_2431     TRUE 0.859 10.000 0.000 NA   NA
 2059593 2059594 SSA_2431 SSA_0017   mreC FALSE 0.252 73.000 0.000 NA   NA
 2059594 2059595 SSA_0017 SSA_0018 mreC mreD TRUE 0.994 2.000 0.550 0.004   NA
 2059595 2059596 SSA_0018 SSA_0019 mreD pcsB TRUE 0.301 97.000 0.021 NA   NA
 2059596 2059597 SSA_0019 SSA_0020 pcsB prsA TRUE 0.326 125.000 0.107 NA   NA
 2059597 2059598 SSA_0020 SSA_0021 prsA   FALSE 0.053 313.000 0.000 NA   NA
 2059598 2059599 SSA_0021 SSA_0022   srtB TRUE 0.695 95.000 0.500 NA   NA
 2059599 2059600 SSA_0022 SSA_0023 srtB aspC FALSE 0.103 181.000 0.000 NA   NA
 2059600 2059601 SSA_0023 SSA_0025 aspC recO TRUE 0.949 -7.000 0.012 1.000 N NA
 2059601 2059602 SSA_0025 SSA_0026 recO plsX TRUE 0.904 6.000 0.011 1.000 N NA
 2059602 2059603 SSA_0026 SSA_0027 plsX acp TRUE 0.997 3.000 0.017 0.008 Y NA
 2059603 2059604 SSA_0027 SSA_0028 acp purC FALSE 0.162 161.000 0.017 1.000 N NA
 2059604 2059605 SSA_0028 SSA_0030 purC purL TRUE 0.987 20.000 0.043 1.000 Y NA
 2059605 2059606 SSA_0030 SSA_0031 purL purF TRUE 0.858 95.000 0.024 1.000 Y NA
 2059606 2059607 SSA_0031 SSA_0032 purF purM TRUE 0.961 60.000 0.248 1.000 Y NA
 2059607 2059608 SSA_0032 SSA_0033 purM purN TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 2059608 2059609 SSA_0033 SSA_0034 purN   TRUE 0.610 27.000 0.000 NA   NA
 2059609 2059610 SSA_0034 SSA_0035   purH TRUE 0.881 4.000 0.000 NA   NA
 2059612 2059613 SSA_0037 SSA_0039 purD purE TRUE 0.628 299.000 0.044 1.000 Y NA
 2059613 2059614 SSA_0039 SSA_0040 purE purK TRUE 0.998 -13.000 0.008 0.001 Y NA
 2059614 2059615 SSA_0040 SSA_0041 purK   FALSE 0.065 263.000 0.000 NA   NA
 2059615 2059616 SSA_0041 SSA_0042     TRUE 0.924 4.000 0.011 NA   NA
 2059616 2059617 SSA_0042 SSA_0043     FALSE 0.088 210.000 0.000 NA   NA
 2059617 2059618 SSA_0043 SSA_0044     TRUE 0.827 13.000 0.000 NA   NA
 2059618 2059619 SSA_0044 SSA_0045     FALSE 0.113 156.000 0.000 NA   NA
 2059619 2059620 SSA_0045 SSA_0046   purB TRUE 0.643 25.000 0.000 1.000   NA
 2059621 2059622 SSA_0047 SSA_0048     TRUE 0.981 -3.000 0.150 1.000   NA
 2059623 2059624 SSA_0049 SSA_0050     TRUE 0.998 11.000 0.316 0.002 Y NA
 2059624 2059625 SSA_0050 SSA_0051     TRUE 0.972 0.000 0.099 1.000   NA
 2059627 2059628 SSA_0053 SSA_0054     TRUE 0.998 -3.000 0.190 1.000 Y NA
 2059628 2059629 SSA_0054 SSA_0055     TRUE 0.997 26.000 0.810 0.022 Y NA
 2059629 2059630 SSA_0055 SSA_0056     TRUE 0.997 -13.000 0.000 0.022 Y NA
 2059630 2059631 SSA_0056 SSA_0057     TRUE 0.993 12.000 0.000 0.022 Y NA
 2059631 2059632 SSA_0057 SSA_0060   agaS FALSE 0.083 311.000 0.022 1.000 N NA
 2059632 2059633 SSA_0060 SSA_0061 agaS   TRUE 0.887 15.000 0.033 1.000 N NA
 2059633 2059634 SSA_0061 SSA_0062   galM TRUE 0.967 25.000 0.000 1.000 Y NA
 2059634 2059635 SSA_0062 SSA_0063 galM ruvB FALSE 0.027 557.000 0.000 1.000 N NA
 2059635 2059636 SSA_0063 SSA_0064 ruvB   TRUE 0.947 -3.000 0.004 NA   NA
 2059636 2059637 SSA_0064 SSA_0065     FALSE 0.061 276.000 0.000 NA   NA
 2059637 2059638 SSA_0065 SSA_0066     TRUE 0.930 5.000 0.019 NA   NA
 2059638 2059639 SSA_0066 SSA_0067     TRUE 0.990 -10.000 0.351 NA   NA
 2059639 2059640 SSA_0067 SSA_0068   adhE FALSE 0.043 304.000 0.000 1.000 N NA
 2059640 2059641 SSA_0068 SSA_0069 adhE   FALSE 0.063 269.000 0.000 NA   NA
 2059641 2059642 SSA_0069 SSA_0070   axe1 FALSE 0.137 116.000 0.000 NA   NA
 2059642 2059643 SSA_0070 SSA_0071 axe1 nanE FALSE 0.034 376.000 0.000 1.000 N NA
 2059643 2059644 SSA_0071 SSA_0072 nanE   TRUE 0.987 14.000 0.000 1.000 Y NA
 2059644 2059645 SSA_0072 SSA_0073     TRUE 0.968 24.000 0.000 NA Y NA
 2059645 2059646 SSA_0073 SSA_0074     TRUE 0.991 18.000 0.060 NA Y NA
 2059646 2059647 SSA_0074 SSA_0075     TRUE 0.960 68.000 0.180 0.043 Y NA
 2059647 2059648 SSA_0075 SSA_0076     TRUE 0.999 0.000 0.300 0.043 Y NA
 2059648 2059649 SSA_0076 SSA_0077     TRUE 0.845 58.000 0.636 1.000   NA
 2059649 2059650 SSA_0077 SSA_0078     TRUE 0.653 63.000 0.182 1.000   NA
 2059650 2059651 SSA_0078 SSA_0079   glk TRUE 0.709 34.000 0.054 1.000 N NA
 2059651 2059652 SSA_0079 SSA_0080 glk blpT TRUE 0.636 46.000 0.054 NA   NA
 2059654 2059655 SSA_0083 SSA_0085   ntpI TRUE 0.966 -10.000 0.029 NA   NA
 2059655 2059656 SSA_0085 SSA_0086 ntpI ntpK TRUE 0.778 134.000 0.848 0.005   NA
 2059656 2059657 SSA_0086 SSA_0087 ntpK ntpE TRUE 0.965 11.000 0.045 0.005   NA
 2059657 2059658 SSA_0087 SSA_0088 ntpE ntpC TRUE 0.972 11.000 0.097 0.005   NA
 2059658 2059659 SSA_0088 SSA_0089 ntpC ntpG TRUE 0.999 -13.000 0.487 0.005 Y NA
 2059659 2059660 SSA_0089 SSA_0090 ntpG   TRUE 0.909 8.000 0.017 1.000 N NA
 2059660 2059661 SSA_0090 SSA_0091   ntpA TRUE 0.338 84.000 0.030 1.000 N NA
 2059661 2059662 SSA_0091 SSA_0092 ntpA ntpB TRUE 1.000 -13.000 0.776 0.005 Y NA
 2059662 2059663 SSA_0092 SSA_0093 ntpB ntpD TRUE 0.999 -3.000 0.238 0.005 Y NA
 2059663 2059664 SSA_0093 SSA_0094 ntpD   FALSE 0.041 436.000 0.000 1.000   NA
 2059664 2059665 SSA_0094 SSA_0095   thrC FALSE 0.199 113.000 0.003 1.000   NA
 2059665 2059666 SSA_0095 SSA_0097 thrC norN FALSE 0.180 109.000 0.006 1.000 N NA
 2059666 2059667 SSA_0097 SSA_0098 norN   TRUE 0.989 -3.000 0.364 1.000   NA
 2059669 2059670 SSA_0100 SSA_0101 polA   FALSE 0.090 274.000 0.005 NA   NA
 2059670 2059671 SSA_0101 SSA_0102     TRUE 0.927 2.000 0.004 NA   NA
 2059673 2059674 SSA_0104 SSA_0105 tgt   TRUE 0.557 26.000 0.000 1.000 N NA
 2059674 2059675 SSA_0105 SSA_0106   rpsJ FALSE 0.034 373.000 0.000 1.000 N NA
 2059675 2059676 SSA_0106 SSA_0107 rpsJ rplC TRUE 0.971 85.000 0.467 0.036 Y NA
 2059676 2059677 SSA_0107 SSA_0108 rplC rplD TRUE 0.996 25.000 0.544 0.027 Y NA
 2059677 2059678 SSA_0108 SSA_0109 rplD rplW TRUE 0.999 0.000 0.307 0.027 Y NA
 2059678 2059679 SSA_0109 SSA_0110 rplW rplB TRUE 0.999 18.000 0.849 0.032 Y NA
 2059679 2059680 SSA_0110 SSA_0111 rplB rpsS TRUE 0.982 86.000 0.820 0.036 Y NA
 2059680 2059681 SSA_0111 SSA_0112 rpsS rplV TRUE 0.999 12.000 0.769 0.036 Y NA
 2059681 2059682 SSA_0112 SSA_0113 rplV rpsC TRUE 0.999 13.000 0.719 0.036 Y NA
 2059682 2059683 SSA_0113 SSA_0114 rpsC rplP TRUE 0.999 4.000 0.828 0.036 Y NA
 2059683 2059684 SSA_0114 SSA_0115 rplP rpmC TRUE 0.999 10.000 0.802 0.027 Y NA
 2059684 2059685 SSA_0115 SSA_0116 rpmC rpsQ TRUE 0.997 24.000 0.828 0.027 Y NA
 2059685 2059686 SSA_0116 SSA_0117 rpsQ rplN TRUE 0.997 26.000 0.791 0.036 Y NA
 2059686 2059687 SSA_0117 SSA_0118 rplN rplX TRUE 0.983 77.000 0.810 0.036 Y NA
 2059687 2059688 SSA_0118 SSA_0119 rplX rplE TRUE 0.997 24.000 0.758 0.027 Y NA
 2059688 2059689 SSA_0119 SSA_2391 rplE rpsN TRUE 0.998 18.000 0.496 0.027 Y NA
 2059689 2059690 SSA_2391 SSA_0120 rpsN rpsH TRUE 0.935 181.000 0.473 0.027 Y NA
 2059690 2059691 SSA_0120 SSA_0121 rpsH   FALSE 0.113 167.000 0.000 NA   NA
 2059691 2059692 SSA_0121 SSA_0122   rplF TRUE 0.276 65.000 0.000 NA   NA
 2059692 2059693 SSA_0122 SSA_0123 rplF rplR TRUE 0.982 85.000 0.815 0.027 Y NA
 2059693 2059694 SSA_0123 SSA_0124 rplR rpsE TRUE 0.998 18.000 0.814 0.036 Y NA
 2059694 2059695 SSA_0124 SSA_0125 rpsE rpmD TRUE 0.999 14.000 0.789 0.036 Y NA
 2059695 2059696 SSA_0125 SSA_0126 rpmD rplO TRUE 0.960 155.000 0.653 0.004 Y NA
 2059696 2059697 SSA_0126 SSA_0127 rplO secY TRUE 0.982 13.000 0.730 1.000 N NA
 2059697 2059698 SSA_0127 SSA_0128 secY adk TRUE 0.373 174.000 0.241 1.000 N NA
 2059698 2059699 SSA_0128 SSA_0129 adk infA FALSE 0.265 118.000 0.059 1.000 N NA
 2059699 2059700 SSA_0129 SSA_2392 infA   TRUE 0.984 23.000 0.067 1.000 Y NA
 2059700 2059701 SSA_2392 SSA_0130   rpsM TRUE 0.994 18.000 0.086 0.027 Y NA
 2059701 2059702 SSA_0130 SSA_0131 rpsM rpsK TRUE 0.998 20.000 0.810 0.027 Y NA
 2059702 2059703 SSA_0131 SSA_0132 rpsK rpoA TRUE 0.791 46.000 0.308 1.000 N NA
 2059703 2059704 SSA_0132 SSA_0133 rpoA rplQ TRUE 0.986 12.000 0.873 1.000 N NA
 2059704 2059705 SSA_0133 SSA_2401 rplQ   FALSE 0.030 1741.000 0.000 NA   NA
 2059705 2059706 SSA_2401 SSA_2432     TRUE 0.294 62.000 0.000 NA   NA
 2059706 2059707 SSA_2432 SSA_2405     FALSE 0.123 127.000 0.000 NA   NA
 2059707 2059708 SSA_2405 SSA_2409     FALSE 0.132 119.000 0.000 NA   NA
 2059708 2059709 SSA_2409 SSA_2433     TRUE 0.881 4.000 0.000 NA   NA
 2059709 2059710 SSA_2433 SSA_2434     TRUE 0.869 8.000 0.000 NA   NA
 2059710 2059711 SSA_2434 SSA_2435     TRUE 0.521 34.000 0.000 NA   NA
 2059711 2059712 SSA_2435 SSA_2436     TRUE 0.801 16.000 0.000 NA   NA
 2059712 2059713 SSA_2436 SSA_2437     TRUE 0.869 8.000 0.000 NA   NA
 2059713 2059714 SSA_2437 SSA_2438     TRUE 0.723 20.000 0.000 NA   NA
 2059714 2059715 SSA_2438 SSA_2439     TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2059715 2059716 SSA_2439 SSA_2440     TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 2059716 2059717 SSA_2440 SSA_2441     TRUE 0.866 9.000 0.000 NA   NA
 2059717 2059718 SSA_2441 SSA_2442     TRUE 0.849 11.000 0.000 NA   NA
 2059718 2059719 SSA_2442 SSA_2443     TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 2059719 2059720 SSA_2443 SSA_2444     TRUE 0.827 13.000 0.000 NA   NA
 2059720 2059721 SSA_2444 SSA_0135   adcR FALSE 0.046 354.000 0.000 NA   NA
 2059721 2059722 SSA_0135 SSA_0136 adcR adcC TRUE 0.983 -3.000 0.192 1.000   NA
 2059722 2059723 SSA_0136 SSA_0137 adcC adcB TRUE 0.999 -7.000 0.673 1.000 Y NA
 2059723 2059724 SSA_0137 SSA_0138 adcB adcA TRUE 0.996 10.000 0.111 1.000 Y NA
 2059724 2059725 SSA_0138 SSA_0139 adcA   TRUE 0.338 148.000 0.188 1.000 N NA
 2059725 2059726 SSA_0139 SSA_0140   ctpA TRUE 0.939 0.000 0.016 1.000 N NA
 2059726 2059727 SSA_0140 SSA_0141 ctpA   TRUE 0.904 21.000 0.016 0.004   NA
 2059727 2059728 SSA_0141 SSA_0142     FALSE 0.132 119.000 0.000 NA   NA
 2059728 2059729 SSA_0142 SSA_0143     TRUE 0.336 56.000 0.000 NA   NA
 2059730 2059731 SSA_0144 SSA_0145     FALSE 0.197 213.000 0.000 0.004   NA
 2059732 2059733 SSA_0146 SSA_0148     FALSE 0.110 178.000 0.000 1.000   NA
 2059733 2059734 SSA_0148 SSA_0149     FALSE 0.100 187.000 0.000 NA   NA
 2059734 2059735 SSA_0149 SSA_0150     FALSE 0.101 183.000 0.000 NA   NA
 2059735 2059736 SSA_0150 SSA_0151     FALSE 0.090 207.000 0.000 NA   NA
 2059736 2059737 SSA_0151 SSA_0152     TRUE 0.869 8.000 0.000 NA   NA
 2059737 2059738 SSA_0152 SSA_0153     TRUE 0.619 26.000 0.000 NA   NA
 2059738 2059739 SSA_0153 SSA_0154     FALSE 0.041 413.000 0.000 NA   NA
 2059739 2059740 SSA_0154 SSA_0155     FALSE 0.206 91.000 0.000 NA   NA
 2059740 2059741 SSA_0155 SSA_0156     TRUE 0.912 0.000 0.000 NA   NA
 2059741 2059742 SSA_0156 SSA_0157     FALSE 0.063 271.000 0.000 NA   NA
 2059742 2059743 SSA_0157 SSA_0158     TRUE 0.881 4.000 0.000 NA   NA
 2059743 2059744 SSA_0158 SSA_0159     TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2059744 2059745 SSA_0159 SSA_0160     FALSE 0.030 1759.000 0.000 NA   NA
 2059745 2059746 SSA_0160 SSA_0161     TRUE 0.982 6.000 0.400 NA   NA
 2059746 2059747 SSA_0161 SSA_0162     TRUE 0.866 9.000 0.000 NA   NA
 2059747 2059748 SSA_0162 SSA_0163     FALSE 0.265 68.000 0.000 NA   NA
 2059748 2059749 SSA_0163 SSA_0164     TRUE 0.801 16.000 0.000 NA   NA
 2059749 2059750 SSA_0164 SSA_0165     TRUE 0.931 21.000 0.250 NA   NA
 2059750 2059751 SSA_0165 SSA_0166     FALSE 0.181 98.000 0.000 NA   NA
 2059751 2059752 SSA_0166 SSA_0167     FALSE 0.100 188.000 0.000 NA   NA
 2059752 2059753 SSA_0167 SSA_0168     FALSE 0.094 202.000 0.000 NA   NA
 2059753 2059754 SSA_0168 SSA_0169     FALSE 0.054 304.000 0.000 NA   NA
 2059755 2059756 SSA_0170 SSA_0171     TRUE 0.326 57.000 0.000 NA   NA
 2059758 2059759 SSA_0173 SSA_0174 rrmA tyrS FALSE 0.226 94.000 0.004 1.000 N NA
 2059760 2059761 SSA_0134 SSA_0175 mrcB pbp1b TRUE 0.998 -2252.000 0.044 0.002 Y NA
 2059761 2059762 SSA_0175 SSA_0176 pbp1b rpoB FALSE 0.026 577.000 0.000 1.000 N NA
 2059762 2059763 SSA_0176 SSA_0177 rpoB rpoC TRUE 0.995 41.000 0.851 0.002 Y NA
 2059763 2059764 SSA_0177 SSA_0178 rpoC epsC FALSE 0.025 764.000 0.000 1.000 N NA
 2059764 2059765 SSA_0178 SSA_0179 epsC   TRUE 0.931 -7.000 0.000 NA   NA
 2059765 2059766 SSA_0179 SSA_0180     TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 2059766 2059767 SSA_0180 SSA_0181     TRUE 0.931 -7.000 0.000 NA   NA
 2059767 2059768 SSA_0181 SSA_0182     TRUE 0.284 87.000 0.016 NA N NA
 2059768 2059769 SSA_0182 SSA_0183     FALSE 0.052 319.000 0.000 NA   NA
 2059769 2059770 SSA_0183 SSA_0184   comYA TRUE 0.291 130.000 0.083 NA   NA
 2059770 2059771 SSA_0184 SSA_0185 comYA comYB TRUE 0.999 -40.000 0.639 1.000 Y NA
 2059771 2059772 SSA_0185 SSA_0186 comYB comYC TRUE 1.000 0.000 0.861 0.002 Y NA
 2059772 2059773 SSA_0186 SSA_0187 comYC comYD TRUE 0.978 -28.000 0.110 NA   NA
 2059773 2059774 SSA_0187 SSA_0188 comYD   TRUE 0.956 26.000 0.786 NA   NA
 2059774 2059775 SSA_0188 SSA_0189     TRUE 0.987 -16.000 0.250 NA   NA
 2059775 2059776 SSA_0189 SSA_0190     TRUE 0.827 38.000 0.232 NA   NA
 2059776 2059777 SSA_0190 SSA_0191     TRUE 0.481 82.000 0.087 NA   NA
 2059777 2059778 SSA_0191 SSA_0192   ackA TRUE 0.748 37.000 0.130 1.000 N NA
 2059778 2059779 SSA_0192 SSA_0193 ackA   FALSE 0.085 216.000 0.000 NA   NA
 2059779 2059780 SSA_0193 SSA_0195     FALSE 0.135 118.000 0.000 NA   NA
 2059780 2059781 SSA_0195 SSA_0197   folP FALSE 0.097 195.000 0.000 NA   NA
 2059781 2059782 SSA_0197 SSA_0198 folP   TRUE 0.997 2.000 0.006 0.006 Y NA
 2059782 2059783 SSA_0198 SSA_0199   folE TRUE 0.997 -19.000 0.024 1.000 Y NA
 2059783 2059784 SSA_0199 SSA_0200 folE folK TRUE 0.852 88.000 0.005 1.000 Y NA
 2059784 2059785 SSA_0200 SSA_0201 folK   FALSE 0.213 95.000 0.003 1.000 N NA
 2059785 2059786 SSA_0201 SSA_0202     TRUE 0.987 2.000 0.462 NA   NA
 2059786 2059787 SSA_0202 SSA_0203     TRUE 0.986 0.000 0.333 NA   NA
 2059787 2059788 SSA_0203 SSA_0204   nisR TRUE 0.915 13.000 0.037 NA   NA
 2059788 2059789 SSA_0204 SSA_0205 nisR nisK TRUE 0.999 -33.000 0.741 1.000 Y NA
 2059789 2059790 SSA_0205 SSA_2393 nisK   FALSE 0.044 297.000 0.000 1.000 N NA
 2059790 2059791 SSA_2393 SSA_0206     TRUE 0.971 -3.000 0.062 NA   NA
 2059791 2059792 SSA_0206 SSA_0207     TRUE 0.974 10.000 0.286 NA   NA
 2059793 2059794 SSA_0208 SSA_0209   pepA FALSE 0.130 120.000 0.000 NA   NA
 2059795 2059796 SSA_0210 SSA_0211   trxA2 TRUE 0.979 -3.000 0.140 NA   NA
 2059796 2059797 SSA_0211 SSA_0212 trxA2   TRUE 0.986 -3.000 0.239 1.000   NA
 2059799 2059800 SSA_0214 SSA_0215 ssb2 rbsB FALSE 0.044 281.000 0.000 NA N NA
 2059800 2059801 SSA_0215 SSA_0216 rbsB   TRUE 0.992 0.000 0.833 NA N NA
 2059801 2059802 SSA_0216 SSA_0217     TRUE 1.000 -7.000 0.941 0.012 Y NA
 2059802 2059803 SSA_0217 SSA_0218     TRUE 0.992 -3.000 0.696 1.000 N NA
 2059803 2059804 SSA_0218 SSA_0219     TRUE 0.824 221.000 0.217 1.000 Y NA
 2059804 2059805 SSA_0219 SSA_0220     TRUE 0.992 44.000 0.643 0.015 Y NA
 2059805 2059806 SSA_0220 SSA_0221     TRUE 0.996 28.000 0.643 0.022 Y NA
 2059806 2059807 SSA_0221 SSA_0222     TRUE 0.999 2.000 0.905 0.022 Y NA
 2059807 2059808 SSA_0222 SSA_0224     TRUE 0.680 95.000 0.476 NA   NA
 2059808 2059809 SSA_0224 SSA_0225   groS FALSE 0.093 204.000 0.000 NA   NA
 2059809 2059810 SSA_0225 SSA_0226 groS groEL TRUE 0.993 24.000 0.160 0.006 Y NA
 2059810 2059811 SSA_0226 SSA_0227 groEL   FALSE 0.038 468.000 0.000 1.000   NA
 2059811 2059812 SSA_0227 SSA_0228     FALSE 0.036 473.000 0.000 NA   NA
 2059812 2059813 SSA_0228 SSA_0229     TRUE 0.443 41.000 0.000 NA   NA
 2059815 2059816 SSA_0231 SSA_0232     TRUE 0.859 10.000 0.000 NA   NA
 2059816 2059817 SSA_0232 SSA_0233     TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2059818 2059819 SSA_2472 SSA_0234     TRUE 0.287 63.000 0.000 NA   NA
 2059821 2059822 SSA_2471 SSA_0236   cshA FALSE 0.064 266.000 0.000 NA   NA
 2059823 2059824 SSA_0238 SSA_0239     TRUE 0.945 10.000 0.065 NA   NA
 2059824 2059825 SSA_0239 SSA_0240     TRUE 0.969 -3.000 0.048 1.000   NA
 2059825 2059826 SSA_0240 SSA_0241   prmA FALSE 0.163 141.000 0.004 1.000   NA
 2059826 2059827 SSA_0241 SSA_0242 prmA   TRUE 0.981 1.000 0.227 NA   NA
 2059829 2059830 SSA_0244 SSA_0245     TRUE 0.399 46.000 0.000 NA   NA
 2059830 2059831 SSA_0245 SSA_0246     FALSE 0.108 175.000 0.000 NA   NA
 2059831 2059832 SSA_0246 SSA_0247     TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2059832 2059833 SSA_0247 SSA_0248     TRUE 0.931 -15.000 0.000 NA   NA
 2059833 2059834 SSA_0248 SSA_0249     TRUE 0.932 -13.000 0.000 NA   NA
 2059834 2059835 SSA_0249 SSA_0250   relA FALSE 0.118 132.000 0.000 NA   NA
 2059835 2059836 SSA_0250 SSA_0251 relA dtd TRUE 0.578 69.000 0.177 1.000 N NA
 2059839 2059840 SSA_0254 SSA_0255     TRUE 0.975 -7.000 0.070 NA   NA
 2059840 2059841 SSA_0255 SSA_0256     TRUE 0.887 106.000 0.049 0.051 Y NA
 2059842 2059843 SSA_0257 SSA_0258     FALSE 0.222 85.000 0.000 NA   NA
 2059844 2059845 SSA_0259 SSA_0260 tpx ssaB FALSE 0.174 113.000 0.007 1.000 N NA
 2059845 2059846 SSA_0260 SSA_0261 ssaB ssaC TRUE 0.986 20.000 0.038 1.000 Y NA
 2059846 2059847 SSA_0261 SSA_0262 ssaC ssaA TRUE 0.997 -13.000 0.043 1.000 Y NA
 2059848 2059849 SSA_0263 SSA_0264 pepO   FALSE 0.079 234.000 0.000 1.000   NA
 2059849 2059850 SSA_0264 SSA_0265     FALSE 0.201 95.000 0.000 1.000   NA
 2059850 2059851 SSA_0265 SSA_0266     TRUE 0.703 207.000 0.000 0.051 Y NA
 2059853 2059854 SSA_0268 SSA_0269 ptcB   TRUE 0.999 9.000 0.429 0.013 Y NA
 2059854 2059855 SSA_0269 SSA_0270     TRUE 0.999 6.000 0.500 0.013 Y NA
 2059855 2059856 SSA_0270 SSA_0271     TRUE 0.994 1.000 0.000 1.000 Y NA
 2059856 2059857 SSA_0271 SSA_0272     TRUE 0.865 10.000 0.000 1.000   NA
 2059857 2059858 SSA_0272 SSA_0273     FALSE 0.138 119.000 0.000 1.000   NA
 2059862 2059863 SSA_0278 SSA_0279     TRUE 0.994 17.000 0.188 1.000 Y NA
 2059863 2059864 SSA_0279 SSA_0281     FALSE 0.141 114.000 0.000 NA   NA
 2059864 2059865 SSA_0281 SSA_0282     FALSE 0.049 332.000 0.000 NA   NA
 2059865 2059866 SSA_0282 SSA_0283     TRUE 0.998 21.000 0.889 0.013 Y NA
 2059866 2059867 SSA_0283 SSA_0284   ptcC TRUE 0.999 18.000 0.889 0.013 Y NA
 2059867 2059868 SSA_0284 SSA_0285 ptcC   TRUE 0.288 169.000 0.132 1.000 N NA
 2059868 2059869 SSA_0285 SSA_0286     TRUE 0.965 15.000 0.368 1.000 N NA
 2059869 2059870 SSA_0286 SSA_0287   gldA TRUE 0.745 46.000 0.211 1.000 N NA
 2059874 2059875 SSA_0291 SSA_0292     TRUE 0.758 19.000 0.000 1.000   NA
 2059876 2059877 SSA_0293 SSA_0294     TRUE 0.282 159.000 0.007 0.016   NA
 2059877 2059878 SSA_0294 SSA_0295   mleR FALSE 0.117 150.000 0.000 1.000   NA
 2059878 2059879 SSA_0295 SSA_0296 mleR   TRUE 0.587 112.000 0.429 1.000   NA
 2059880 2059881 SSA_0297 SSA_0298 mleS   TRUE 0.979 5.000 0.302 1.000   NA
 2059881 2059882 SSA_0298 SSA_0299     FALSE 0.042 392.000 0.000 NA   NA
 2059882 2059883 SSA_0299 SSA_0300     FALSE 0.113 157.000 0.000 NA   NA
 2059883 2059884 SSA_0300 SSA_0301     TRUE 0.738 35.000 0.000 0.002   NA
 2059884 2059885 SSA_0301 SSA_0302   pgk FALSE 0.088 217.000 0.000 1.000   NA
 2059885 2059886 SSA_0302 SSA_0303 pgk sspC FALSE 0.035 365.000 0.000 1.000 N NA
 2059886 2059887 SSA_0303 SSA_0304 sspC   FALSE 0.116 172.000 0.000 1.000   NA
 2059887 2059888 SSA_0304 SSA_0305     FALSE 0.252 177.000 0.067 NA   NA
 2059888 2059889 SSA_0305 SSA_0306   glnR TRUE 0.559 81.000 0.154 NA   NA
 2059889 2059890 SSA_0306 SSA_0307 glnR glnA TRUE 0.832 32.000 0.179 1.000 N NA
 2059890 2059891 SSA_0307 SSA_0308 glnA   TRUE 0.698 52.000 0.143 1.000   NA
 2059891 2059892 SSA_0308 SSA_0309     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 2059892 2059893 SSA_0309 SSA_0310     TRUE 0.983 -7.000 0.156 NA   NA
 2059893 2059894 SSA_0310 SSA_0311     TRUE 0.912 -16.000 0.000 1.000 N NA
 2059895 2059896 SSA_0312 SSA_0313     TRUE 0.987 4.000 0.576 NA   NA
 2059896 2059897 SSA_0313 SSA_0314   wcaG FALSE 0.047 348.000 0.000 NA   NA
 2059898 2059899 SSA_0315 SSA_0316     TRUE 0.871 10.000 0.002 1.000 N NA
 2059899 2059900 SSA_0316 SSA_0317   rimI TRUE 0.984 -3.000 0.209 1.000   NA
 2059900 2059901 SSA_0317 SSA_0318 rimI gcp TRUE 0.967 -10.000 0.030 1.000   NA
 2059901 2059902 SSA_0318 SSA_0319 gcp   TRUE 0.873 10.000 0.004 NA N NA
 2059902 2059903 SSA_0319 SSA_0320     TRUE 0.990 -10.000 0.338 NA   NA
 2059903 2059904 SSA_0320 SSA_0321   ubiE FALSE 0.199 123.000 0.013 NA   NA
 2059904 2059905 SSA_0321 SSA_0322 ubiE   FALSE 0.133 104.000 0.000 1.000 N NA
 2059907 2059908 SSA_0324 SSA_0325   ugpQ FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 2059912 2059913 SSA_0329 SSA_0330     TRUE 0.454 64.000 0.031 NA   NA
 2059913 2059914 SSA_0330 SSA_0331   cppA TRUE 0.466 96.000 0.133 NA   NA
 2059914 2059915 SSA_0331 SSA_0332 cppA   TRUE 0.988 -3.000 0.326 NA   NA
 2059915 2059916 SSA_0332 SSA_0333   mvaK1 FALSE 0.143 151.000 0.009 1.000 N NA
 2059916 2059917 SSA_0333 SSA_0334 mvaK1 mvaD TRUE 0.999 -18.000 0.281 0.004 Y NA
 2059917 2059918 SSA_0334 SSA_0335 mvaD mvaK2 TRUE 0.999 -10.000 0.312 0.007 Y NA
 2059918 2059919 SSA_0335 SSA_0336 mvaK2   TRUE 0.973 -19.000 0.097 1.000 N NA
 2059920 2059921 SSA_0337 SSA_0338 mvaA mvaS TRUE 0.998 -3.000 0.183 1.000 Y NA
 2059921 2059922 SSA_0338 SSA_0339 mvaS   FALSE 0.220 145.000 0.035 NA   NA
 2059922 2059923 SSA_0339 SSA_0341     TRUE 0.982 5.000 0.400 NA   NA
 2059923 2059924 SSA_0341 SSA_0342     TRUE 0.274 160.000 0.077 NA   NA
 2059925 2059926 SSA_0343 SSA_0345 dinP   FALSE 0.086 214.000 0.000 NA   NA
 2059926 2059927 SSA_0345 SSA_0346     FALSE 0.052 319.000 0.000 NA   NA
 2059927 2059928 SSA_0346 SSA_0348     TRUE 0.888 46.000 0.667 NA   NA
 2059928 2059929 SSA_0348 SSA_0349     TRUE 0.718 76.000 0.400 NA   NA
 2059930 2059931 SSA_0350 SSA_0351 recD spi TRUE 0.550 60.000 0.099 1.000 N NA
 2059931 2059932 SSA_0351 SSA_0352 spi rnhC TRUE 0.950 4.000 0.080 1.000 N NA
 2059933 2059934 SSA_0353 SSA_0354     TRUE 0.913 11.000 0.019 NA   NA
 2059934 2059935 SSA_0354 SSA_0355   mutS2 TRUE 0.611 55.000 0.070 1.000   NA
 2059935 2059936 SSA_0355 SSA_0356 mutS2   FALSE 0.195 79.000 0.000 1.000 N NA
 2059936 2059937 SSA_0356 SSA_0357     TRUE 0.541 86.000 0.200 1.000 N NA
 2059939 2059940 SSA_0359 SSA_0360     FALSE 0.171 101.000 0.000 NA   NA
 2059940 2059941 SSA_0360 SSA_0362     FALSE 0.104 179.000 0.000 NA   NA
 2059941 2059942 SSA_0362 SSA_0363   dagA FALSE 0.050 344.000 0.000 1.000   NA
 2059944 2059945 SSA_0365 SSA_0366     TRUE 0.872 22.000 0.088 1.000   NA
 2059945 2059946 SSA_0366 SSA_0367     FALSE 0.107 177.000 0.000 NA   NA
 2059946 2059947 SSA_0367 SSA_0368     TRUE 0.537 63.000 0.071 NA   NA
 2059948 2059949 SSA_0369 SSA_0370     TRUE 0.945 1.000 0.013 1.000   NA
 2059949 2059950 SSA_0370 SSA_0371   gdhA TRUE 0.969 31.000 0.013 1.000 Y NA
 2059951 2059952 SSA_0373 SSA_0374 pyrDA   FALSE 0.220 163.000 0.053 1.000 N NA
 2059952 2059953 SSA_0374 SSA_0375     FALSE 0.086 159.000 0.000 NA N NA
 2059953 2059954 SSA_0375 SSA_0376     TRUE 0.549 250.000 0.000 NA Y NA
 2059954 2059955 SSA_0376 SSA_0377     TRUE 0.999 0.000 0.938 1.000 Y NA
 2059955 2059956 SSA_0377 SSA_0378     FALSE 0.091 138.000 0.000 1.000 N NA
 2059956 2059957 SSA_0378 SSA_0379     FALSE 0.049 275.000 0.000 1.000 N NA
 2059957 2059958 SSA_0379 SSA_0380     FALSE 0.148 163.000 0.013 NA N NA
 2059958 2059959 SSA_0380 SSA_0381     FALSE 0.037 465.000 0.000 NA   NA
 2059961 2059962 SSA_0383 SSA_0384 bglA   FALSE 0.066 267.000 0.000 1.000   NA
 2059963 2059964 SSA_0385 SSA_0386 opuAb opuAa TRUE 0.996 15.000 0.177 0.087 Y NA
 2059964 2059965 SSA_0386 SSA_0387 opuAa   FALSE 0.141 247.000 0.052 1.000 N NA
 2059966 2059967 SSA_0388 SSA_0389     TRUE 0.960 4.000 0.091 1.000   NA
 2059967 2059968 SSA_0389 SSA_0390     TRUE 0.977 0.000 0.143 1.000   NA
 2059968 2059969 SSA_0390 SSA_0391   spxB TRUE 0.487 312.000 0.000 1.000 Y NA
 2059969 2059970 SSA_0391 SSA_0392 spxB   TRUE 0.278 155.000 0.083 NA   NA
 2059970 2059971 SSA_0392 SSA_0393     FALSE 0.034 543.000 0.000 NA   NA
 2059971 2059972 SSA_0393 SSA_0394     FALSE 0.076 233.000 0.000 NA   NA
 2059972 2059973 SSA_0394 SSA_0395     FALSE 0.088 210.000 0.000 NA   NA
 2059974 2059975 SSA_0396 SSA_0397     FALSE 0.042 397.000 0.000 NA   NA
 2059975 2059976 SSA_0397 SSA_0398     TRUE 0.789 17.000 0.000 NA   NA
 2059976 2059977 SSA_0398 SSA_0400     TRUE 0.995 18.000 0.077 0.007 Y NA
 2059978 2059979 SSA_0401 SSA_0402     TRUE 0.999 2.000 0.750 1.000 Y NA
 2059979 2059980 SSA_0402 SSA_0403     FALSE 0.038 456.000 0.000 NA   NA
 2059980 2059981 SSA_0403 SSA_0405     FALSE 0.148 110.000 0.000 NA   NA
 2059982 2059983 SSA_0406 SSA_0407     TRUE 0.996 -7.000 1.000 NA   NA
 2059983 2059984 SSA_0407 SSA_0408     TRUE 0.688 146.000 1.000 NA   NA
 2059984 2059985 SSA_0408 SSA_0409     TRUE 0.988 13.000 1.000 NA   NA
 2059985 2059986 SSA_0409 SSA_0410     FALSE 0.112 145.000 0.000 NA   NA
 2059986 2059987 SSA_0410 SSA_0411     TRUE 0.472 38.000 0.000 NA   NA
 2059987 2059988 SSA_0411 SSA_0412     TRUE 0.789 17.000 0.000 NA   NA
 2059988 2059989 SSA_0412 SSA_0413   pabB FALSE 0.089 152.000 0.000 1.000 N NA
 2059990 2059991 SSA_0414 SSA_0415     FALSE 0.238 79.000 0.000 NA   NA
 2059991 2059992 SSA_0415 SSA_0416   metE FALSE 0.074 240.000 0.000 NA   NA
 2059992 2059993 SSA_0416 SSA_0417 metE metF TRUE 0.876 138.000 0.050 0.002 Y NA
 2059993 2059994 SSA_0417 SSA_0418 metF   FALSE 0.146 98.000 0.000 1.000 N NA
 2059994 2059995 SSA_0418 SSA_0419     FALSE 0.121 109.000 0.000 1.000 N NA
 2059995 2059996 SSA_0419 SSA_0420     FALSE 0.117 170.000 0.000 1.000   NA
 2059996 2059997 SSA_0420 SSA_0421     TRUE 0.974 12.000 0.200 0.071   NA
 2059997 2059998 SSA_0421 SSA_0422     TRUE 0.999 -3.000 0.333 0.004 Y NA
 2059999 2060000 SSA_0423 SSA_0424     TRUE 0.988 -25.000 0.300 NA   NA
 2060000 2060001 SSA_0424 SSA_0425     TRUE 0.976 -3.000 0.100 NA   NA
 2060001 2060002 SSA_0425 SSA_0426     FALSE 0.058 286.000 0.000 NA   NA
 2060004 2060005 SSA_0428 SSA_0429 hutG hutH TRUE 0.500 897.000 0.000 0.002 Y NA
 2060005 2060006 SSA_0429 SSA_0430 hutH   TRUE 0.998 -3.000 0.143 1.000 Y NA
 2060006 2060007 SSA_0430 SSA_0431     TRUE 0.475 76.000 0.062 NA   NA
 2060007 2060008 SSA_0431 SSA_0432     TRUE 0.916 13.000 0.038 NA   NA
 2060008 2060009 SSA_0432 SSA_0433     TRUE 0.415 67.000 0.038 1.000 N NA
 2060009 2060010 SSA_0433 SSA_0434     TRUE 0.997 15.000 0.143 0.001 Y NA
 2060010 2060011 SSA_0434 SSA_0435   hutU TRUE 0.836 121.000 0.086 1.000 Y NA
 2060012 2060013 SSA_0436 SSA_0437 hutI rpsF FALSE 0.083 179.000 0.000 1.000 N NA
 2060013 2060014 SSA_0437 SSA_0438 rpsF ssb TRUE 0.876 12.000 0.012 1.000 N NA
 2060014 2060015 SSA_0438 SSA_0440 ssb rpsR TRUE 0.563 37.000 0.012 1.000 N NA
 2060015 2060016 SSA_0440 SSA_0441 rpsR   FALSE 0.203 96.000 0.002 1.000 N NA
 2060016 2060017 SSA_0441 SSA_0442     FALSE 0.266 142.000 0.103 1.000 N NA
 2060017 2060018 SSA_0442 SSA_0443     TRUE 0.991 -73.000 0.483 NA   NA
 2060018 2060019 SSA_0443 SSA_0445     TRUE 0.912 0.000 0.000 NA   NA
 2060020 2060021 SSA_0446 SSA_0447     TRUE 0.896 19.000 0.072 NA   NA
 2060022 2060023 SSA_0448 SSA_0449 uvrA pepP FALSE 0.141 153.000 0.008 1.000 N NA
 2060023 2060024 SSA_0449 SSA_0450 pepP efp TRUE 0.606 62.000 0.160 1.000 N NA
 2060024 2060025 SSA_0450 SSA_0451 efp   TRUE 0.848 20.000 0.031 NA   NA
 2060025 2060026 SSA_0451 SSA_0452   nusB TRUE 0.987 -22.000 0.265 NA   NA
 2060026 2060027 SSA_0452 SSA_0453 nusB   FALSE 0.061 232.000 0.000 1.000 N NA
 2060028 2060029 SSA_0454 SSA_0455 scrR scrB TRUE 0.992 -19.000 0.571 1.000 N NA
 2060030 2060031 SSA_0456 SSA_0457 scrA scrK TRUE 0.874 158.000 0.235 1.000 Y NA
 2060031 2060032 SSA_0457 SSA_0458 scrK   TRUE 0.525 47.000 0.028 1.000 N NA
 2060032 2060033 SSA_0458 SSA_0459     FALSE 0.247 79.000 0.000 1.000   NA
 2060033 2060034 SSA_0459 SSA_0460     FALSE 0.113 175.000 0.000 1.000   NA
 2060034 2060035 SSA_0460 SSA_0461     TRUE 0.987 -7.000 0.296 1.000 N NA
 2060035 2060036 SSA_0461 SSA_0462     TRUE 1.000 -10.000 1.000 0.011 Y NA
 2060036 2060037 SSA_0462 SSA_0463     FALSE 0.044 293.000 0.000 1.000 N NA
 2060037 2060038 SSA_0463 SSA_0464     TRUE 0.998 2.000 0.124 0.015 Y NA
 2060038 2060039 SSA_0464 SSA_0465     TRUE 0.997 10.000 0.107 0.015 Y NA
 2060039 2060040 SSA_0465 SSA_0466     TRUE 0.997 1.000 0.000 0.001 Y NA
 2060040 2060041 SSA_0466 SSA_0467     TRUE 0.999 0.000 0.168 0.015 Y NA
 2060041 2060042 SSA_0467 SSA_0468     TRUE 0.999 -9.000 0.126 0.015 Y NA
 2060042 2060043 SSA_0468 SSA_0469   cobL TRUE 0.998 -28.000 0.000 0.001 Y NA
 2060043 2060044 SSA_0469 SSA_0470 cobL cobM TRUE 0.996 0.000 0.000 0.015 Y NA
 2060044 2060045 SSA_0470 SSA_0471 cobM   TRUE 0.999 -52.000 0.397 0.015 Y NA
 2060045 2060046 SSA_0471 SSA_0472     TRUE 0.972 77.000 0.352 0.015 Y NA
 2060046 2060047 SSA_0472 SSA_0473     TRUE 0.999 -3.000 0.423 0.015 Y NA
 2060047 2060048 SSA_0473 SSA_0474     TRUE 0.988 19.000 0.042 1.000 Y NA
 2060048 2060049 SSA_0474 SSA_0475     TRUE 0.991 14.000 0.028 1.000 Y NA
 2060049 2060050 SSA_0475 SSA_0476     TRUE 0.992 10.000 0.007 1.000 Y NA
 2060050 2060051 SSA_0476 SSA_0477   cbiM TRUE 0.899 22.000 0.058 0.015 N NA
 2060051 2060052 SSA_0477 SSA_0478 cbiM cbiN TRUE 1.000 -3.000 0.861 0.015 Y NA
 2060052 2060053 SSA_0478 SSA_0479 cbiN   TRUE 0.972 118.000 0.804 0.002 Y NA
 2060053 2060054 SSA_0479 SSA_0480     TRUE 0.969 63.000 0.152 0.003 Y NA
 2060054 2060055 SSA_0480 SSA_0481     TRUE 0.961 -15.000 0.033 1.000 N NA
 2060055 2060056 SSA_0481 SSA_0482     TRUE 0.978 -3.000 0.021 0.015   NA
 2060056 2060057 SSA_0482 SSA_0483     TRUE 0.844 12.000 0.000 1.000   NA
 2060057 2060058 SSA_0483 SSA_0484     TRUE 0.992 16.000 0.048 1.000 Y NA
 2060058 2060059 SSA_0484 SSA_0485     TRUE 0.998 -13.000 0.016 0.003 Y NA
 2060059 2060060 SSA_0485 SSA_0486     TRUE 0.998 -15.000 0.020 0.003 Y NA
 2060060 2060061 SSA_0486 SSA_0487     TRUE 0.999 -13.000 0.042 0.003 Y NA
 2060061 2060062 SSA_0487 SSA_0488     TRUE 0.970 44.000 0.026 0.003 Y NA
 2060062 2060063 SSA_0488 SSA_0489   cobU TRUE 0.998 -7.000 0.058 1.000 Y NA
 2060063 2060064 SSA_0489 SSA_0490 cobU   TRUE 0.997 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 2060064 2060065 SSA_0490 SSA_0491     TRUE 0.954 -3.000 0.028 1.000 N NA
 2060065 2060066 SSA_0491 SSA_0492     TRUE 0.440 55.000 0.000 0.071 N NA
 2060066 2060067 SSA_0492 SSA_0493     FALSE 0.085 177.000 0.000 1.000 N NA
 2060067 2060068 SSA_0493 SSA_0494     TRUE 0.992 4.000 0.000 1.000 Y NA
 2060068 2060069 SSA_0494 SSA_0495     TRUE 0.997 -3.000 0.000 0.037 Y NA
 2060069 2060070 SSA_0495 SSA_0496     TRUE 0.935 -10.000 0.000 1.000   NA
 2060070 2060071 SSA_0496 SSA_0497     TRUE 0.934 -7.000 0.000 1.000   NA
 2060071 2060072 SSA_0497 SSA_0498     TRUE 0.999 -7.000 0.444 0.040 Y NA
 2060072 2060073 SSA_0498 SSA_0499     TRUE 0.722 196.000 0.000 0.040 Y NA
 2060073 2060074 SSA_0499 SSA_0500     TRUE 0.943 92.000 0.167 0.040 Y NA
 2060074 2060075 SSA_0500 SSA_0502     TRUE 0.945 110.000 0.353 0.040 Y NA
 2060075 2060076 SSA_0502 SSA_0503     TRUE 0.999 -12.000 0.353 1.000 Y NA
 2060076 2060077 SSA_0503 SSA_0504   amiF TRUE 0.999 -13.000 0.500 0.037 Y NA
 2060077 2060078 SSA_0504 SSA_0505 amiF   TRUE 0.368 53.000 0.000 1.000   NA
 2060080 2060081 SSA_0507 SSA_0508     FALSE 0.054 306.000 0.000 NA   NA
 2060081 2060082 SSA_0508 SSA_0509     TRUE 0.464 40.000 0.000 1.000   NA
 2060082 2060083 SSA_0509 SSA_0510     TRUE 0.865 65.000 0.000 1.000 Y NA
 2060083 2060084 SSA_0510 SSA_0511   pduX TRUE 0.987 -7.000 0.300 1.000 N NA
 2060084 2060085 SSA_0511 SSA_0512 pduX   TRUE 0.954 -37.000 0.023 1.000 N NA
 2060085 2060086 SSA_0512 SSA_0513     TRUE 0.915 13.000 0.000 0.015   NA
 2060086 2060087 SSA_0513 SSA_0514     FALSE 0.034 720.000 0.000 1.000   NA
 2060087 2060088 SSA_0514 SSA_0515     FALSE 0.111 115.000 0.000 1.000 N NA
 2060088 2060089 SSA_0515 SSA_0516     TRUE 0.571 25.000 0.000 1.000 N NA
 2060089 2060090 SSA_0516 SSA_0517     TRUE 0.997 0.000 0.048 1.000 Y NA
 2060090 2060091 SSA_0517 SSA_0518     FALSE 0.107 114.000 0.000 NA N NA
 2060091 2060092 SSA_0518 SSA_0519     TRUE 0.954 32.000 0.000 NA Y NA
 2060092 2060093 SSA_0519 SSA_0520     TRUE 0.995 17.000 0.048 0.001 Y NA
 2060093 2060094 SSA_0520 SSA_0521   eutL TRUE 0.998 10.000 0.617 1.000 Y NA
 2060094 2060095 SSA_0521 SSA_0522 eutL   TRUE 0.968 16.000 0.468 NA N NA
 2060095 2060096 SSA_0522 SSA_0523     TRUE 0.998 7.000 0.442 NA Y NA
 2060096 2060097 SSA_0523 SSA_0524     TRUE 0.714 35.000 0.047 NA   NA
 2060097 2060098 SSA_0524 SSA_0525     TRUE 0.336 56.000 0.000 NA   NA
 2060098 2060099 SSA_0525 SSA_0526     FALSE 0.095 198.000 0.000 NA   NA
 2060099 2060100 SSA_0526 SSA_0527   pduL TRUE 0.647 24.000 0.000 NA   NA
 2060100 2060101 SSA_0527 SSA_0528 pduL   TRUE 0.915 32.000 0.459 NA   NA
 2060101 2060102 SSA_0528 SSA_0529     TRUE 0.974 15.000 0.487 NA   NA
 2060102 2060103 SSA_0529 SSA_0530   eutH TRUE 0.911 17.000 0.103 NA N NA
 2060103 2060104 SSA_0530 SSA_0531 eutH eutQ TRUE 0.997 18.000 0.759 NA Y NA
 2060104 2060105 SSA_0531 SSA_0532 eutQ pduB TRUE 0.401 440.000 0.000 NA Y NA
 2060105 2060106 SSA_0532 SSA_0533 pduB pduC TRUE 0.622 22.000 0.000 1.000 N NA
 2060106 2060107 SSA_0533 SSA_0535 pduC   TRUE 0.934 12.000 0.000 0.002   NA
 2060107 2060108 SSA_0535 SSA_0536     TRUE 0.971 31.000 0.759 0.002   NA
 2060108 2060109 SSA_0536 SSA_0537     TRUE 0.668 100.000 0.500 NA   NA
 2060109 2060110 SSA_0537 SSA_0538   pduH TRUE 0.988 -19.000 0.295 NA   NA
 2060110 2060111 SSA_0538 SSA_0539 pduH pduO TRUE 0.311 59.000 0.000 NA   NA
 2060111 2060112 SSA_0539 SSA_0540 pduO   FALSE 0.113 168.000 0.000 NA   NA
 2060112 2060113 SSA_0540 SSA_0541     TRUE 0.463 135.000 0.375 1.000 N NA
 2060113 2060114 SSA_0541 SSA_0543   secA FALSE 0.048 277.000 0.000 1.000 N NA
 2060114 2060115 SSA_0543 SSA_0544 secA aroG TRUE 0.796 21.000 0.025 1.000 N NA
 2060115 2060116 SSA_0544 SSA_0546 aroG aro TRUE 0.999 2.000 0.750 0.001 Y NA
 2060116 2060117 SSA_0546 SSA_0547 aro acpS FALSE 0.186 108.000 0.007 1.000 N NA
 2060117 2060118 SSA_0547 SSA_0548 acpS alr TRUE 0.973 -13.000 0.093 1.000 N NA
 2060118 2060119 SSA_0548 SSA_0549 alr recG TRUE 0.319 107.000 0.078 1.000 N NA
 2060121 2060122 SSA_0552 SSA_0553     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 2060122 2060123 SSA_0553 SSA_0554     TRUE 0.881 4.000 0.000 NA   NA
 2060123 2060124 SSA_0554 SSA_0555     TRUE 0.888 3.000 0.000 NA   NA
 2060124 2060125 SSA_0555 SSA_0556     FALSE 0.178 99.000 0.000 NA   NA
 2060125 2060126 SSA_0556 SSA_0557     TRUE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 2060126 2060127 SSA_0557 SSA_0558     TRUE 0.680 22.000 0.000 NA   NA
 2060127 2060128 SSA_0558 SSA_0559     TRUE 0.827 13.000 0.000 NA   NA
 2060128 2060129 SSA_0559 SSA_0560     FALSE 0.079 227.000 0.000 NA   NA
 2060129 2060130 SSA_0560 SSA_0561     TRUE 0.931 -7.000 0.000 NA   NA
 2060130 2060131 SSA_0561 SSA_0562     FALSE 0.056 293.000 0.000 NA   NA
 2060133 2060134 SSA_0564 SSA_0565     FALSE 0.053 322.000 0.000 1.000   NA
 2060134 2060135 SSA_0565 SSA_0566   codY FALSE 0.098 202.000 0.000 1.000   NA
 2060135 2060136 SSA_0566 SSA_0567 codY   TRUE 0.964 0.000 0.083 1.000 N NA
 2060136 2060137 SSA_0567 SSA_0568     FALSE 0.042 312.000 0.000 1.000 N NA
 2060137 2060138 SSA_0568 SSA_0569   gatC TRUE 0.677 203.000 0.003 1.000 Y NA
 2060138 2060139 SSA_0569 SSA_0570 gatC gatA TRUE 0.999 0.000 0.643 0.002 Y NA
 2060139 2060140 SSA_0570 SSA_0571 gatA gatB TRUE 0.999 0.000 0.492 0.002 Y NA
 2060140 2060141 SSA_0571 SSA_0572 gatB   FALSE 0.026 612.000 0.000 1.000 N NA
 2060142 2060143 SSA_0573 SSA_0574     FALSE 0.261 69.000 0.000 NA   NA
 2060144 2060145 SSA_0575 SSA_0576     TRUE 0.988 3.000 0.555 1.000   NA
 2060145 2060146 SSA_0576 SSA_0577     TRUE 0.342 108.000 0.068 NA   NA
 2060146 2060147 SSA_0577 SSA_0578   nadD TRUE 0.843 27.000 0.150 NA N NA
 2060147 2060148 SSA_0578 SSA_0579 nadD   TRUE 0.998 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 2060148 2060149 SSA_0579 SSA_0580     TRUE 0.952 -3.000 0.024 1.000 N NA
 2060149 2060150 SSA_0580 SSA_0581     TRUE 0.906 10.000 0.008 NA   NA
 2060150 2060151 SSA_0581 SSA_0582     TRUE 0.503 75.000 0.085 NA   NA
 2060151 2060152 SSA_0582 SSA_0583     TRUE 0.965 2.000 0.094 NA   NA
 2060152 2060153 SSA_0583 SSA_0584     FALSE 0.090 207.000 0.000 NA   NA
 2060153 2060154 SSA_0584 SSA_0585     FALSE 0.050 328.000 0.000 NA   NA
 2060154 2060155 SSA_0585 SSA_0586     FALSE 0.073 241.000 0.000 NA   NA
 2060155 2060156 SSA_0586 SSA_0587   hipO1 FALSE 0.044 376.000 0.000 NA   NA
 2060156 2060157 SSA_0587 SSA_0588 hipO1   TRUE 0.732 119.000 1.000 1.000   NA
 2060157 2060158 SSA_0588 SSA_0589   dapE TRUE 0.724 118.000 0.000 1.000 Y NA
 2060158 2060159 SSA_0589 SSA_0590 dapE   TRUE 0.789 17.000 0.000 NA   NA
 2060159 2060160 SSA_0590 SSA_0591     TRUE 0.560 32.000 0.000 NA   NA
 2060160 2060161 SSA_0591 SSA_0592     TRUE 0.936 12.000 0.068 NA   NA
 2060161 2060162 SSA_0592 SSA_0593     FALSE 0.052 317.000 0.000 NA   NA
 2060162 2060163 SSA_0593 SSA_0594     FALSE 0.113 159.000 0.000 NA   NA
 2060163 2060164 SSA_0594 SSA_0595     TRUE 0.631 57.000 0.118 NA   NA
 2060164 2060165 SSA_0595 SSA_0596     TRUE 0.926 10.000 0.027 NA   NA
 2060165 2060166 SSA_0596 SSA_0597     FALSE 0.056 294.000 0.000 NA   NA
 2060166 2060167 SSA_0597 SSA_0599     FALSE 0.101 184.000 0.000 NA   NA
 2060167 2060168 SSA_0599 SSA_0601     FALSE 0.083 220.000 0.000 NA   NA
 2060168 2060169 SSA_0601 SSA_0602     TRUE 0.921 10.000 0.017 1.000   NA
 2060169 2060170 SSA_0602 SSA_0603     TRUE 0.993 -7.000 0.530 1.000   NA
 2060170 2060171 SSA_0603 SSA_0604     TRUE 0.749 19.000 0.000 NA   NA
 2060172 2060173 SSA_0605 SSA_0606 gidB   TRUE 0.371 82.000 0.000 0.008 N NA
 2060173 2060174 SSA_0606 SSA_0607     TRUE 0.699 58.000 0.250 1.000 N NA
 2060174 2060175 SSA_0607 SSA_0608   mefE TRUE 0.987 -25.000 0.250 1.000   NA
 2060175 2060176 SSA_0608 SSA_0609 mefE   TRUE 0.776 63.000 0.444 1.000   NA
 2060177 2060178 SSA_0610 SSA_0611 lemA htpX TRUE 0.978 2.000 0.222 NA   NA
 2060178 2060179 SSA_0611 SSA_0612 htpX rgg FALSE 0.039 461.000 0.000 1.000   NA
 2060179 2060180 SSA_0612 SSA_0613 rgg gtfP FALSE 0.268 70.000 0.000 1.000   NA
 2060181 2060182 SSA_0614 SSA_0615   rggD FALSE 0.047 352.000 0.000 NA   NA
 2060183 2060184 SSA_0616 SSA_0617     FALSE 0.212 105.000 0.002 NA   NA
 2060185 2060186 SSA_0618 SSA_0620     TRUE 0.994 -22.000 0.667 NA   NA
 2060186 2060187 SSA_0620 SSA_0621     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2060187 2060188 SSA_0621 SSA_0622     TRUE 0.983 5.000 0.500 1.000 N NA
 2060189 2060190 SSA_0623 SSA_0624     TRUE 0.305 79.000 0.003 NA   NA
 2060190 2060191 SSA_0624 SSA_0625   kdtB TRUE 0.989 -10.000 0.367 1.000 N NA
 2060191 2060192 SSA_0625 SSA_0626 kdtB   TRUE 0.968 -13.000 0.052 1.000 N NA
 2060192 2060193 SSA_0626 SSA_0627     FALSE 0.195 182.000 0.032 NA   NA
 2060193 2060194 SSA_0627 SSA_0628     TRUE 0.956 -3.000 0.016 NA   NA
 2060194 2060195 SSA_0628 SSA_0629     TRUE 0.958 -13.000 0.012 NA   NA
 2060195 2060196 SSA_0629 SSA_0631   trpB2 FALSE 0.033 366.000 0.000 NA N NA
 2060196 2060197 SSA_0631 SSA_0632 trpB2 trpE TRUE 0.419 405.000 0.000 1.000 Y NA
 2060197 2060198 SSA_0632 SSA_0633 trpE trpG TRUE 0.999 -3.000 0.321 0.002 Y NA
 2060198 2060199 SSA_0633 SSA_0634 trpG trpD TRUE 0.993 11.000 0.018 1.000 Y NA
 2060199 2060200 SSA_0634 SSA_0635 trpD trpC TRUE 0.998 -3.000 0.216 1.000 Y NA
 2060200 2060201 SSA_0635 SSA_0636 trpC trpF TRUE 0.993 29.000 0.264 0.003 Y NA
 2060201 2060202 SSA_0636 SSA_0637 trpF trpB TRUE 0.999 -10.000 0.375 0.003 Y NA
 2060202 2060203 SSA_0637 SSA_0638 trpB trpA TRUE 0.999 -7.000 0.248 0.002 Y NA
 2060204 2060205 SSA_0639 SSA_0640     TRUE 0.281 64.000 0.000 NA   NA
 2060207 2060208 SSA_0642 SSA_0643 pilD   TRUE 0.749 19.000 0.000 NA   NA
 2060209 2060210 SSA_0644 SSA_0646 dps   TRUE 0.404 93.000 0.058 NA   NA
 2060210 2060211 SSA_0646 SSA_0647     TRUE 0.951 2.000 0.035 NA   NA
 2060211 2060212 SSA_0647 SSA_0648     FALSE 0.210 90.000 0.000 NA   NA
 2060214 2060215 SSA_0650 SSA_0651 typA   TRUE 0.765 24.000 0.015 NA   NA
 2060215 2060216 SSA_0651 SSA_0652   murD FALSE 0.123 219.000 0.006 NA   NA
 2060216 2060217 SSA_0652 SSA_0653 murD murG TRUE 0.996 2.000 0.060 1.000 Y NA
 2060217 2060218 SSA_0653 SSA_0654 murG divIB TRUE 0.997 -3.000 0.072 NA Y NA
 2060218 2060219 SSA_0654 SSA_0655 divIB ftsA TRUE 0.487 122.000 0.389 NA N NA
 2060219 2060220 SSA_0655 SSA_0656 ftsA ftsZ TRUE 0.997 17.000 0.460 1.000 Y NA
 2060220 2060221 SSA_0656 SSA_0657 ftsZ   TRUE 0.931 9.000 0.030 NA   NA
 2060221 2060222 SSA_0657 SSA_0658     TRUE 0.967 10.000 0.194 NA   NA
 2060222 2060223 SSA_0658 SSA_0659     FALSE 0.119 278.000 0.031 NA   NA
 2060223 2060224 SSA_0659 SSA_0660   divIVA TRUE 0.985 10.000 0.579 NA   NA
 2060224 2060225 SSA_0660 SSA_0661 divIVA ileS FALSE 0.077 284.000 0.012 NA N NA
 2060228 2060229 SSA_0664 SSA_0665     TRUE 0.557 68.000 0.114 NA   NA
 2060229 2060230 SSA_0665 SSA_0666     FALSE 0.242 78.000 0.000 NA   NA
 2060231 2060232 SSA_0667 SSA_0668     TRUE 0.732 60.000 0.294 NA   NA
 2060234 2060235 SSA_0670 SSA_0671   folD FALSE 0.150 190.000 0.009 NA   NA
 2060235 2060236 SSA_0671 SSA_0672 folD   TRUE 0.951 -3.000 0.009 NA   NA
 2060236 2060237 SSA_0672 SSA_0673     FALSE 0.238 108.000 0.013 NA   NA
 2060237 2060238 SSA_0673 SSA_0674   xseA FALSE 0.129 157.000 0.005 NA N NA
 2060238 2060239 SSA_0674 SSA_0675 xseA xseB TRUE 0.999 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 2060239 2060240 SSA_0675 SSA_0676 xseB ispA TRUE 0.972 -3.000 0.100 1.000 N NA
 2060240 2060241 SSA_0676 SSA_0677 ispA hlyA TRUE 0.968 -7.000 0.058 1.000 N NA
 2060241 2060242 SSA_0677 SSA_0678 hlyA ahrC TRUE 0.966 -7.000 0.048 1.000 N NA
 2060242 2060243 SSA_0678 SSA_0679 ahrC recN TRUE 0.924 9.000 0.037 1.000 N NA
 2060243 2060244 SSA_0679 SSA_0680 recN pphA TRUE 0.462 53.000 0.005 1.000   NA
 2060244 2060245 SSA_0680 SSA_0682 pphA   FALSE 0.058 285.000 0.000 NA   NA
 2060245 2060246 SSA_0682 SSA_0683     TRUE 0.350 113.000 0.098 NA   NA
 2060246 2060247 SSA_0683 SSA_0684     FALSE 0.051 333.000 0.000 1.000   NA
 2060247 2060248 SSA_0684 SSA_0685     FALSE 0.088 219.000 0.000 1.000   NA
 2060248 2060249 SSA_0685 SSA_0686   fur FALSE 0.097 204.000 0.000 1.000   NA
 2060249 2060250 SSA_0686 SSA_0687 fur   FALSE 0.037 468.000 0.000 NA   NA
 2060250 2060251 SSA_0687 SSA_0688   gpmA FALSE 0.112 150.000 0.000 NA   NA
 2060251 2060252 SSA_0688 SSA_0689 gpmA pbp2b FALSE 0.070 210.000 0.000 1.000 N NA
 2060252 2060253 SSA_0689 SSA_0690 pbp2b recR FALSE 0.218 104.000 0.013 1.000 N NA
 2060253 2060254 SSA_0690 SSA_0691 recR ddlA FALSE 0.120 205.000 0.010 1.000 N NA
 2060254 2060255 SSA_0691 SSA_0692 ddlA murF TRUE 0.940 76.000 0.046 0.009 Y NA
 2060255 2060256 SSA_0692 SSA_0694 murF mutT TRUE 0.953 -10.000 0.016 1.000 N NA
 2060256 2060257 SSA_0694 SSA_0695 mutT   FALSE 0.246 108.000 0.016 NA   NA
 2060257 2060258 SSA_0695 SSA_0696     TRUE 0.959 19.000 0.400 NA   NA
 2060258 2060259 SSA_0696 SSA_0697     FALSE 0.073 243.000 0.000 NA   NA
 2060259 2060260 SSA_0697 SSA_0698   prfC FALSE 0.100 187.000 0.000 NA   NA
 2060260 2060261 SSA_0698 SSA_0699 prfC   FALSE 0.057 289.000 0.000 NA   NA
 2060261 2060262 SSA_0699 SSA_0700     TRUE 0.924 32.000 0.500 NA   NA
 2060262 2060263 SSA_0700 SSA_0701     FALSE 0.031 1108.000 0.000 NA   NA
 2060263 2060264 SSA_0701 SSA_0702   citB FALSE 0.069 212.000 0.000 1.000 N NA
 2060264 2060265 SSA_0702 SSA_0703 citB   TRUE 0.995 3.000 0.013 1.000 Y NA
 2060265 2060266 SSA_0703 SSA_0704     TRUE 0.997 2.000 0.140 1.000 Y NA
 2060268 2060269 SSA_0706 SSA_0707 rheA   TRUE 0.427 386.000 0.000 1.000 Y NA
 2060269 2060270 SSA_0707 SSA_0708     FALSE 0.106 183.000 0.000 1.000   NA
 2060271 2060272 SSA_0710 SSA_0709 epsH   TRUE 0.934 -7.000 0.000 1.000   NA
 2060272 2060273 SSA_0709 SSA_0711     TRUE 0.986 -10.000 0.209 1.000   NA
 2060273 2060274 SSA_0711 SSA_0712   ctpE FALSE 0.125 130.000 0.000 1.000   NA
 2060275 2060276 SSA_0713 SSA_0714 plsC   TRUE 0.310 94.000 0.017 NA   NA
 2060276 2060277 SSA_0714 SSA_0715   comEA FALSE 0.155 157.000 0.004 NA   NA
 2060277 2060278 SSA_0715 SSA_0716 comEA comEC TRUE 0.981 -16.000 0.130 1.000   NA
 2060278 2060279 SSA_0716 SSA_0718 comEC   FALSE 0.245 131.000 0.002 0.060   NA
 2060279 2060280 SSA_0718 SSA_0720   holA FALSE 0.071 251.000 0.000 1.000   NA
 2060280 2060281 SSA_0720 SSA_0721 holA sodA TRUE 0.359 63.000 0.012 1.000 N NA
 2060281 2060282 SSA_0721 SSA_0722 sodA   TRUE 0.543 55.000 0.033 1.000   NA
 2060282 2060283 SSA_0722 SSA_0723     FALSE 0.088 211.000 0.000 NA   NA
 2060283 2060284 SSA_0723 SSA_0724     FALSE 0.064 266.000 0.000 NA   NA
 2060284 2060285 SSA_0724 SSA_0725     TRUE 0.809 15.000 0.000 NA   NA
 2060285 2060286 SSA_0725 SSA_0726     FALSE 0.110 173.000 0.000 NA   NA
 2060286 2060287 SSA_0726 SSA_0727     TRUE 0.576 31.000 0.000 NA   NA
 2060287 2060288 SSA_0727 SSA_0728     FALSE 0.121 129.000 0.000 NA   NA
 2060288 2060289 SSA_0728 SSA_0729     TRUE 0.927 -46.000 0.000 NA   NA
 2060289 2060290 SSA_0729 SSA_0730     FALSE 0.082 221.000 0.000 NA   NA
 2060290 2060291 SSA_0730 SSA_0731     TRUE 0.929 -22.000 0.000 NA   NA
 2060293 2060294 SSA_0733 SSA_0734     TRUE 0.646 38.000 0.028 NA   NA
 2060294 2060295 SSA_0734 SSA_0735     TRUE 0.965 -13.000 0.028 NA   NA
 2060295 2060296 SSA_0735 SSA_0736     TRUE 0.630 48.000 0.059 NA   NA
 2060296 2060297 SSA_0736 SSA_0737   sagP FALSE 0.045 290.000 0.000 1.000 N NA
 2060297 2060298 SSA_0737 SSA_0738 sagP arc TRUE 0.962 51.000 0.146 1.000 Y NA
 2060298 2060299 SSA_0738 SSA_0739 arc arcC TRUE 0.843 167.000 0.146 1.000 Y NA
 2060299 2060300 SSA_0739 SSA_0740 arcC   FALSE 0.095 206.000 0.000 1.000   NA
 2060300 2060301 SSA_0740 SSA_0741   arcT TRUE 0.894 22.000 0.140 1.000   NA
 2060302 2060303 SSA_0743 SSA_0744 argR queA TRUE 0.807 17.000 0.002 1.000 N NA
 2060303 2060304 SSA_0744 SSA_0745 queA   TRUE 0.859 10.000 0.000 NA   NA
 2060305 2060306 SSA_0746 SSA_0747 nagB dacA FALSE 0.215 151.000 0.051 1.000 N NA
 2060306 2060307 SSA_0747 SSA_0748 dacA   TRUE 0.486 95.000 0.182 1.000 N NA
 2060307 2060308 SSA_0748 SSA_0749   coiA FALSE 0.143 113.000 0.000 NA   NA
 2060308 2060309 SSA_0749 SSA_0750 coiA   FALSE 0.111 171.000 0.000 NA   NA
 2060309 2060310 SSA_0750 SSA_0751     FALSE 0.098 192.000 0.000 NA   NA
 2060310 2060311 SSA_0751 SSA_0752     TRUE 0.946 2.000 0.024 1.000   NA
 2060311 2060312 SSA_0752 SSA_0753   prtM FALSE 0.233 114.000 0.016 1.000   NA
 2060312 2060313 SSA_0753 SSA_0755 prtM   FALSE 0.075 237.000 0.000 NA   NA
 2060313 2060314 SSA_0755 SSA_0756   alaS TRUE 0.566 39.000 0.006 NA   NA
 2060314 2060315 SSA_0756 SSA_0757 alaS argC FALSE 0.106 242.000 0.000 0.053 N NA
 2060315 2060316 SSA_0757 SSA_0758 argC argJ TRUE 0.997 18.000 0.303 0.003 Y NA
 2060316 2060317 SSA_0758 SSA_0759 argJ argB TRUE 0.997 12.000 0.067 0.003 Y NA
 2060317 2060318 SSA_0759 SSA_0760 argB   TRUE 0.998 3.000 0.322 1.000 Y NA
 2060318 2060319 SSA_0760 SSA_0761     FALSE 0.090 154.000 0.000 1.000 N NA
 2060319 2060320 SSA_0761 SSA_0762     TRUE 0.615 98.000 0.362 NA   NA
 2060320 2060321 SSA_0762 SSA_0763     TRUE 0.752 29.000 0.029 NA   NA
 2060321 2060322 SSA_0763 SSA_0765     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 2060322 2060323 SSA_0765 SSA_0766     TRUE 0.680 22.000 0.000 NA   NA
 2060323 2060324 SSA_0766 SSA_0767     FALSE 0.098 192.000 0.000 NA   NA
 2060325 2060326 SSA_0768 SSA_0769 nrdF   TRUE 0.849 11.000 0.000 NA   NA
 2060326 2060327 SSA_0769 SSA_0770   nrdE TRUE 0.494 36.000 0.000 NA   NA
 2060327 2060328 SSA_0770 SSA_0771 nrdE nrdH TRUE 0.537 161.000 0.562 1.000 N NA
 2060329 2060330 SSA_0772 SSA_0773 ptsH ptsI TRUE 0.999 2.000 0.240 0.012 Y NA
 2060330 2060331 SSA_0773 SSA_0774 ptsI gapN FALSE 0.132 235.000 0.035 1.000 N NA
 2060331 2060332 SSA_0774 SSA_0775 gapN glgB FALSE 0.033 386.000 0.000 1.000 N NA
 2060332 2060333 SSA_0775 SSA_0776 glgB glgC TRUE 0.999 7.000 0.317 0.002 Y NA
 2060333 2060334 SSA_0776 SSA_0777 glgC glgD TRUE 1.000 -10.000 0.810 0.001 Y NA
 2060334 2060335 SSA_0777 SSA_0778 glgD glgA TRUE 0.999 -3.000 0.395 1.000 Y NA
 2060335 2060336 SSA_0778 SSA_0779 glgA glgP TRUE 0.814 213.000 0.171 1.000 Y NA
 2060336 2060337 SSA_0779 SSA_0780 glgP   FALSE 0.213 143.000 0.029 1.000   NA
 2060337 2060338 SSA_0780 SSA_0781   pmi FALSE 0.130 125.000 0.000 1.000   NA
 2060338 2060339 SSA_0781 SSA_0782 pmi uncE FALSE 0.067 265.000 0.000 1.000   NA
 2060339 2060340 SSA_0782 SSA_0783 uncE uncB TRUE 0.891 36.000 0.189 0.010   NA
 2060340 2060341 SSA_0783 SSA_0784 uncB uncF TRUE 0.992 19.000 0.032 0.010 Y NA
 2060341 2060342 SSA_0784 SSA_0785 uncF uncH TRUE 0.999 0.000 0.222 0.008 Y NA
 2060342 2060343 SSA_0785 SSA_0786 uncH uncA TRUE 0.967 157.000 0.864 0.008 Y NA
 2060343 2060344 SSA_0786 SSA_0787 uncA uncG TRUE 0.999 16.000 0.846 0.008 Y NA
 2060344 2060345 SSA_0787 SSA_0788 uncG uncD TRUE 0.994 39.000 0.724 0.008 Y NA
 2060345 2060346 SSA_0788 SSA_0789 uncD uncC TRUE 0.999 8.000 0.837 0.008 Y NA
 2060346 2060347 SSA_0789 SSA_0790 uncC   FALSE 0.221 174.000 0.039 NA   NA
 2060347 2060348 SSA_0790 SSA_0791   murA TRUE 0.684 68.000 0.279 NA   NA
 2060348 2060349 SSA_0791 SSA_0792 murA   TRUE 0.979 -7.000 0.110 NA   NA
 2060349 2060350 SSA_0792 SSA_0793   endA TRUE 0.573 59.000 0.079 NA   NA
 2060350 2060351 SSA_0793 SSA_0794 endA   FALSE 0.111 177.000 0.000 1.000   NA
 2060351 2060352 SSA_0794 SSA_0795     TRUE 0.963 5.000 0.130 NA   NA
 2060352 2060353 SSA_0795 SSA_0796   uup TRUE 0.282 100.000 0.019 NA   NA
 2060353 2060354 SSA_0796 SSA_0797 uup   FALSE 0.064 541.000 0.019 1.000   NA
 2060354 2060355 SSA_0797 SSA_0798     TRUE 0.779 79.000 0.600 1.000   NA
 2060356 2060357 SSA_0799 SSA_0800   cobQ TRUE 0.828 19.000 0.010 NA   NA
 2060357 2060358 SSA_0800 SSA_0801 cobQ   TRUE 0.993 0.000 0.796 1.000   NA
 2060359 2060360 SSA_0802 SSA_0803     TRUE 0.992 -3.000 0.502 NA   NA
 2060360 2060361 SSA_0803 SSA_0804   glmM TRUE 0.495 95.000 0.150 NA   NA
 2060361 2060362 SSA_0804 SSA_0805 glmM   FALSE 0.166 129.000 0.003 1.000   NA
 2060362 2060363 SSA_0805 SSA_0806     FALSE 0.135 118.000 0.000 NA   NA
 2060363 2060364 SSA_0806 SSA_0807   obg TRUE 0.494 51.000 0.011 NA   NA
 2060364 2060365 SSA_0807 SSA_0808 obg   TRUE 0.893 12.000 0.009 NA   NA
 2060365 2060366 SSA_0808 SSA_0809     FALSE 0.086 214.000 0.000 NA   NA
 2060366 2060367 SSA_0809 SSA_0810     TRUE 0.561 56.000 0.051 NA   NA
 2060367 2060368 SSA_0810 SSA_0811     TRUE 0.984 -3.000 0.214 NA   NA
 2060368 2060369 SSA_0811 SSA_0812     TRUE 0.991 -3.000 0.470 NA   NA
 2060370 2060371 SSA_0813 SSA_0814     TRUE 0.338 113.000 0.024 0.018 N NA
 2060372 2060373 SSA_0815 SSA_0816     FALSE 0.215 114.000 0.012 NA   NA
 2060373 2060374 SSA_0816 SSA_0817     TRUE 0.998 16.000 0.625 NA Y NA
 2060374 2060375 SSA_0817 SSA_0818     FALSE 0.043 380.000 0.000 NA   NA
 2060375 2060376 SSA_0818 SSA_0819     TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 2060376 2060377 SSA_0819 SSA_0820   rpsU FALSE 0.172 148.000 0.011 NA   NA
 2060379 2060380 SSA_0824 SSA_0825 dnaG rpoD TRUE 0.972 3.000 0.209 1.000 N NA
 2060380 2060381 SSA_0825 SSA_0826 rpoD   FALSE 0.261 122.000 0.044 NA   NA
 2060381 2060382 SSA_0826 SSA_0827     FALSE 0.033 597.000 0.000 NA   NA
 2060382 2060383 SSA_0827 SSA_2445     TRUE 0.461 39.000 0.000 NA   NA
 2060383 2060384 SSA_2445 SSA_0829   srpA FALSE 0.090 207.000 0.000 NA   NA
 2060384 2060385 SSA_0829 SSA_0830 srpA   FALSE 0.050 345.000 0.000 1.000   NA
 2060385 2060386 SSA_0830 SSA_0831     TRUE 0.940 17.000 0.154 NA   NA
 2060386 2060387 SSA_0831 SSA_0832   secY2 TRUE 0.616 33.000 0.002 NA   NA
 2060387 2060388 SSA_0832 SSA_0833 secY2   TRUE 0.909 9.000 0.007 NA   NA
 2060388 2060389 SSA_0833 SSA_0834     TRUE 0.993 -10.000 0.571 NA   NA
 2060389 2060390 SSA_0834 SSA_0835     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 2060390 2060391 SSA_0835 SSA_0836   secA2 TRUE 0.993 -7.000 0.571 NA   NA
 2060391 2060392 SSA_0836 SSA_0837 secA2   TRUE 0.972 13.000 0.429 1.000 N NA
 2060392 2060393 SSA_0837 SSA_0838     TRUE 0.991 -16.000 0.400 NA   NA
 2060393 2060394 SSA_0838 SSA_0839     TRUE 0.985 2.000 0.400 NA   NA
 2060394 2060395 SSA_0839 SSA_0841     TRUE 0.993 2.000 1.000 NA   NA
 2060395 2060396 SSA_0841 SSA_0842     FALSE 0.109 174.000 0.000 NA   NA
 2060396 2060397 SSA_0842 SSA_0843     TRUE 0.980 -28.000 0.121 1.000   NA
 2060398 2060399 SSA_0844 SSA_0845     TRUE 0.974 15.000 0.471 NA   NA
 2060400 2060401 SSA_0846 SSA_0847 dnaE pfk TRUE 0.442 85.000 0.098 1.000 N NA
 2060401 2060402 SSA_0847 SSA_0848 pfk pykF TRUE 0.979 57.000 0.261 0.005 Y NA
 2060402 2060403 SSA_0848 SSA_0849 pykF sip FALSE 0.252 183.000 0.072 1.000   NA
 2060403 2060404 SSA_0849 SSA_0850 sip   FALSE 0.117 134.000 0.000 NA   NA
 2060406 2060407 SSA_0852 SSA_0854 pcrA   TRUE 0.996 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 2060407 2060408 SSA_0854 SSA_0855   cysD FALSE 0.232 99.000 0.012 1.000 N NA
 2060408 2060409 SSA_0855 SSA_0856 cysD gtrB FALSE 0.139 98.000 0.000 NA N NA
 2060409 2060410 SSA_0856 SSA_0857 gtrB   TRUE 0.683 43.000 0.075 NA   NA
 2060410 2060411 SSA_0857 SSA_0858   rmlD FALSE 0.148 110.000 0.000 NA   NA
 2060411 2060412 SSA_0858 SSA_0859 rmlD tpi FALSE 0.049 275.000 0.000 1.000 N NA
 2060412 2060413 SSA_0859 SSA_0860 tpi   FALSE 0.070 210.000 0.000 1.000 N NA
 2060414 2060415 SSA_0861 SSA_0862 murN murM TRUE 0.998 15.000 0.467 0.008 Y NA
 2060415 2060416 SSA_0862 SSA_0863 murM   TRUE 0.992 -15.000 0.500 1.000   NA
 2060416 2060417 SSA_0863 SSA_0864     TRUE 0.953 2.000 0.035 1.000   NA
 2060418 2060419 SSA_0865 SSA_0866   pacL FALSE 0.087 213.000 0.000 NA   NA
 2060419 2060420 SSA_0866 SSA_0867 pacL   FALSE 0.213 89.000 0.000 NA   NA
 2060422 2060423 SSA_0869 SSA_0870 prfB ftsE TRUE 0.605 45.000 0.053 1.000 N NA
 2060423 2060424 SSA_0870 SSA_0871 ftsE ftsX TRUE 0.999 -7.000 0.431 1.000 Y NA
 2060426 2060427 SSA_0873 SSA_0874 dinG   FALSE 0.267 100.000 0.013 NA   NA
 2060427 2060428 SSA_0874 SSA_0875   rodA TRUE 0.892 13.000 0.013 NA   NA
 2060428 2060429 SSA_0875 SSA_0876 rodA thiJ FALSE 0.252 73.000 0.000 NA   NA
 2060429 2060430 SSA_0876 SSA_0877 thiJ   FALSE 0.079 227.000 0.000 NA   NA
 2060430 2060431 SSA_0877 SSA_0878   gyrB TRUE 0.896 13.000 0.013 1.000   NA
 2060431 2060432 SSA_0878 SSA_0879 gyrB ezrA TRUE 0.273 87.000 0.011 1.000 N NA
 2060432 2060433 SSA_0879 SSA_0880 ezrA   FALSE 0.193 95.000 0.000 NA   NA
 2060433 2060434 SSA_0880 SSA_0881     FALSE 0.247 76.000 0.000 NA   NA
 2060434 2060435 SSA_0881 SSA_0882   serB TRUE 0.521 34.000 0.000 NA   NA
 2060435 2060436 SSA_0882 SSA_0883 serB grk TRUE 0.885 10.000 0.007 1.000 N NA
 2060437 2060438 SSA_0884 SSA_0885     TRUE 0.944 2.000 0.024 NA   NA
 2060442 2060443 SSA_0889 SSA_0891     TRUE 0.708 69.000 0.333 NA   NA
 2060444 2060445 SSA_0892 SSA_0893     TRUE 0.910 29.000 0.333 NA   NA
 2060445 2060446 SSA_0893 SSA_0894     TRUE 0.989 -13.000 0.385 NA N NA
 2060446 2060447 SSA_0894 SSA_0895     TRUE 0.997 13.000 0.467 1.000 Y NA
 2060447 2060448 SSA_0895 SSA_0896     TRUE 0.916 22.000 0.267 1.000 N NA
 2060448 2060449 SSA_0896 SSA_0897     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 2060451 2060452 SSA_0899 SSA_0900     TRUE 0.989 -13.000 0.324 NA   NA
 2060452 2060453 SSA_0900 SSA_0901   aldB TRUE 0.333 150.000 0.182 1.000 N NA
 2060453 2060454 SSA_0901 SSA_0903 aldB   FALSE 0.256 76.000 0.000 1.000   NA
 2060454 2060455 SSA_0903 SSA_0904   crpA FALSE 0.115 173.000 0.000 1.000   NA
 2060455 2060456 SSA_0904 SSA_0905 crpA crpB FALSE 0.183 202.000 0.000 0.020   NA
 2060456 2060457 SSA_0905 SSA_0906 crpB crpC FALSE 0.099 342.000 0.000 0.020   NA
 2060459 2060460 SSA_0908 SSA_0909     FALSE 0.104 180.000 0.000 NA   NA
 2060460 2060461 SSA_0909 SSA_0910     FALSE 0.170 278.000 0.095 NA   NA
 2060461 2060462 SSA_0910 SSA_0911     TRUE 0.987 -3.000 0.286 1.000   NA
 2060462 2060463 SSA_0911 SSA_0912   pheS FALSE 0.062 282.000 0.000 1.000   NA
 2060463 2060464 SSA_0912 SSA_0913 pheS   TRUE 0.526 46.000 0.009 1.000   NA
 2060464 2060465 SSA_0913 SSA_0914   pheT FALSE 0.108 248.000 0.007 1.000   NA
 2060465 2060466 SSA_0914 SSA_0915 pheT   FALSE 0.101 185.000 0.000 NA   NA
 2060466 2060467 SSA_0915 SSA_0916     FALSE 0.112 151.000 0.000 NA   NA
 2060469 2060470 SSA_0918 SSA_0920     TRUE 0.576 31.000 0.000 NA   NA
 2060470 2060471 SSA_0920 SSA_0921   adhB TRUE 0.336 56.000 0.000 NA   NA
 2060473 2060474 SSA_0923 SSA_0924     TRUE 0.362 120.000 0.167 1.000 N NA
 2060474 2060475 SSA_0924 SSA_0925     TRUE 0.990 1.000 0.667 1.000 N NA
 2060475 2060476 SSA_0925 SSA_0926     TRUE 0.383 51.000 0.000 1.000   NA
 2060476 2060477 SSA_0926 SSA_0927     FALSE 0.229 168.000 0.037 1.000   NA
 2060477 2060478 SSA_0927 SSA_0928     TRUE 0.972 19.000 0.750 1.000 N NA
 2060478 2060479 SSA_0928 SSA_0929     TRUE 1.000 -7.000 0.800 0.010 Y NA
 2060479 2060480 SSA_0929 SSA_0931     FALSE 0.181 98.000 0.000 NA   NA
 2060480 2060481 SSA_0931 SSA_0932     FALSE 0.095 198.000 0.000 NA   NA
 2060481 2060482 SSA_0932 SSA_0933     TRUE 0.939 10.000 0.049 NA   NA
 2060482 2060483 SSA_0933 SSA_0934     TRUE 0.587 31.000 0.000 1.000   NA
 2060483 2060484 SSA_0934 SSA_0935   truB TRUE 0.920 4.000 0.005 1.000   NA
 2060484 2060485 SSA_0935 SSA_0936 truB mreA TRUE 0.304 246.000 0.308 1.000 N NA
 2060485 2060486 SSA_0936 SSA_0937 mreA arsC FALSE 0.204 112.000 0.017 1.000 N NA
 2060486 2060487 SSA_0937 SSA_0938 arsC   TRUE 0.972 3.000 0.169 NA   NA
 2060487 2060488 SSA_0938 SSA_0939   suhB TRUE 0.989 -55.000 0.337 NA   NA
 2060488 2060489 SSA_0939 SSA_0940 suhB   TRUE 0.977 1.000 0.229 NA N NA
 2060489 2060490 SSA_0940 SSA_0941   pstS TRUE 0.425 131.000 0.303 NA N NA
 2060490 2060491 SSA_0941 SSA_0942 pstS pstC1 TRUE 0.998 -3.000 0.206 1.000 Y NA
 2060491 2060492 SSA_0942 SSA_0943 pstC1 pstC TRUE 1.000 -10.000 0.907 0.002 Y NA
 2060492 2060493 SSA_0943 SSA_0944 pstC pstB2 TRUE 0.999 11.000 0.490 0.002 Y NA
 2060493 2060494 SSA_0944 SSA_0945 pstB2 pstB1 TRUE 0.987 61.000 0.542 0.001 Y NA
 2060494 2060495 SSA_0945 SSA_0946 pstB1 phoU TRUE 0.997 15.000 0.413 NA Y NA
 2060495 2060496 SSA_0946 SSA_0947 phoU   FALSE 0.205 157.000 0.027 NA   NA
 2060496 2060497 SSA_0947 SSA_0948     TRUE 0.691 159.000 1.000 NA   NA
 2060497 2060498 SSA_0948 SSA_0949     TRUE 0.691 159.000 1.000 NA   NA
 2060498 2060499 SSA_0949 SSA_0950     TRUE 0.996 -13.000 1.000 NA   NA
 2060499 2060500 SSA_0950 SSA_0952     TRUE 0.990 11.000 1.000 NA   NA
 2060500 2060501 SSA_0952 SSA_0954     TRUE 0.991 9.000 1.000 NA   NA
 2060501 2060502 SSA_0954 SSA_0955   pepN FALSE 0.244 169.000 0.051 NA   NA
 2060502 2060503 SSA_0955 SSA_0956 pepN sspD FALSE 0.090 164.000 0.000 1.000 N NA
 2060503 2060504 SSA_0956 SSA_0957 sspD   FALSE 0.032 938.000 0.000 1.000   NA
 2060504 2060505 SSA_0957 SSA_0958     FALSE 0.102 182.000 0.000 NA   NA
 2060505 2060506 SSA_0958 SSA_0959   ciaR TRUE 0.290 105.000 0.030 NA   NA
 2060506 2060507 SSA_0959 SSA_0960 ciaR ciaH TRUE 0.999 -10.000 0.606 1.000 Y NA
 2060507 2060508 SSA_0960 SSA_0961 ciaH   TRUE 0.889 16.000 0.043 1.000 N NA
 2060508 2060509 SSA_0961 SSA_0962   lguL FALSE 0.113 114.000 0.000 1.000 N NA
 2060509 2060510 SSA_0962 SSA_0963 lguL   TRUE 0.417 62.000 0.000 0.023 N NA
 2060511 2060512 SSA_0964 SSA_0965 deaD mocA TRUE 0.984 -79.000 0.200 1.000   NA
 2060513 2060514 SSA_0966 SSA_0967 udK   FALSE 0.159 162.000 0.005 NA   NA
 2060514 2060515 SSA_0967 SSA_0968     FALSE 0.113 159.000 0.000 NA   NA
 2060515 2060516 SSA_0968 SSA_0969     FALSE 0.112 151.000 0.000 NA   NA
 2060516 2060517 SSA_0969 SSA_0970     FALSE 0.113 141.000 0.000 NA   NA
 2060517 2060518 SSA_0970 SSA_0971     TRUE 0.931 -7.000 0.000 NA   NA
 2060518 2060519 SSA_0971 SSA_0972     TRUE 0.996 -16.000 1.000 NA   NA
 2060519 2060520 SSA_0972 SSA_0973     TRUE 0.838 12.000 0.000 NA   NA
 2060520 2060521 SSA_0973 SSA_0975   leuA FALSE 0.047 364.000 0.000 1.000   NA
 2060521 2060522 SSA_0975 SSA_0977 leuA leuB TRUE 0.994 13.000 0.003 0.002 Y NA
 2060522 2060523 SSA_0977 SSA_0978 leuB   TRUE 0.950 -3.000 0.007 NA   NA
 2060523 2060524 SSA_0978 SSA_0980   leuC TRUE 0.941 2.000 0.018 NA   NA
 2060524 2060525 SSA_0980 SSA_0981 leuC leuD TRUE 0.999 10.000 0.477 0.001 Y NA
 2060525 2060526 SSA_0981 SSA_0983 leuD   FALSE 0.229 100.000 0.015 NA N NA
 2060526 2060527 SSA_0983 SSA_0984     FALSE 0.075 189.000 0.000 NA N NA
 2060527 2060528 SSA_0984 SSA_0985     TRUE 0.975 4.000 0.222 NA   NA
 2060528 2060529 SSA_0985 SSA_0986     TRUE 0.905 14.000 0.031 NA   NA
 2060529 2060530 SSA_0986 SSA_0987   proW TRUE 0.989 -7.000 0.382 1.000 N NA
 2060530 2060531 SSA_0987 SSA_0988 proW   FALSE 0.085 148.000 0.000 NA N NA
 2060531 2060532 SSA_0988 SSA_0989     FALSE 0.203 92.000 0.000 NA   NA
 2060532 2060533 SSA_0989 SSA_0990     TRUE 0.986 -3.000 0.250 NA   NA
 2060535 2060536 SSA_0992 SSA_0993     TRUE 0.966 -3.000 0.038 NA   NA
 2060536 2060537 SSA_0993 SSA_0994     TRUE 0.917 12.000 0.049 1.000 N NA
 2060537 2060538 SSA_0994 SSA_0995     FALSE 0.041 406.000 0.000 NA   NA
 2060538 2060539 SSA_0995 SSA_0996     TRUE 0.587 30.000 0.000 NA   NA
 2060539 2060540 SSA_0996 SSA_0997   dnaX TRUE 0.946 0.000 0.030 NA N NA
 2060540 2060541 SSA_0997 SSA_0998 dnaX   TRUE 0.716 38.000 0.067 NA   NA
 2060542 2060543 SSA_0999 SSA_1000 birA galR TRUE 0.929 17.000 0.051 0.045 N NA
 2060543 2060544 SSA_1000 SSA_1001 galR msmR TRUE 0.877 83.000 0.000 0.045 Y NA
 2060545 2060546 SSA_1002 SSA_1003     TRUE 0.997 13.000 0.286 1.000 Y NA
 2060546 2060547 SSA_1003 SSA_1004   msmF TRUE 0.997 14.000 0.275 0.036 Y NA
 2060547 2060548 SSA_1004 SSA_1005 msmF msmG TRUE 0.999 14.000 0.925 0.036 Y NA
 2060548 2060549 SSA_1005 SSA_1006 msmG gtfA TRUE 0.735 215.000 0.050 1.000 Y NA
 2060549 2060550 SSA_1006 SSA_1007 gtfA   TRUE 0.973 22.000 0.000 1.000 Y NA
 2060550 2060551 SSA_1007 SSA_1008   galK TRUE 0.668 177.000 0.000 1.000 Y NA
 2060551 2060552 SSA_1008 SSA_1009 galK galT TRUE 0.860 220.000 0.107 0.002 Y NA
 2060552 2060553 SSA_1009 SSA_1010 galT galE TRUE 0.966 4.000 0.024 0.002 N NA
 2060553 2060554 SSA_1010 SSA_1011 galE   FALSE 0.047 352.000 0.000 NA   NA
 2060554 2060555 SSA_1011 SSA_1012     TRUE 0.809 15.000 0.000 NA   NA
 2060555 2060556 SSA_1012 SSA_1013     TRUE 0.946 -13.000 0.007 1.000 N NA
 2060556 2060557 SSA_1013 SSA_1014     TRUE 0.999 -7.000 0.130 0.003 Y NA
 2060557 2060558 SSA_1014 SSA_1015     TRUE 0.955 -15.000 0.020 1.000 N NA
 2060558 2060559 SSA_1015 SSA_1016     TRUE 0.942 0.000 0.020 1.000 N NA
 2060559 2060560 SSA_1016 SSA_1017     TRUE 0.966 -13.000 0.029 NA   NA
 2060560 2060561 SSA_1017 SSA_1018     FALSE 0.090 207.000 0.000 NA   NA
 2060561 2060562 SSA_1018 SSA_1019     FALSE 0.099 388.000 0.000 0.005   NA
 2060562 2060563 SSA_1019 SSA_1020     FALSE 0.066 260.000 0.000 NA   NA
 2060563 2060564 SSA_1020 SSA_1021     FALSE 0.130 120.000 0.000 NA   NA
 2060564 2060565 SSA_1021 SSA_1022     FALSE 0.208 93.000 0.000 1.000   NA
 2060565 2060566 SSA_1022 SSA_1023     TRUE 0.834 13.000 0.000 1.000   NA
 2060568 2060569 SSA_1026 SSA_1027     TRUE 0.990 -10.000 0.341 NA   NA
 2060570 2060571 SSA_1028 SSA_1029     FALSE 0.166 104.000 0.000 NA   NA
 2060573 2060574 SSA_1031 SSA_1032 flaR rpsT TRUE 0.340 58.000 0.002 1.000 N NA
 2060574 2060575 SSA_1032 SSA_1033 rpsT coaA TRUE 0.333 71.000 0.014 1.000 N NA
 2060576 2060577 SSA_1034 SSA_1035   pdp TRUE 0.947 2.000 0.044 1.000 N NA
 2060577 2060578 SSA_1035 SSA_1036 pdp deoC TRUE 0.992 18.000 0.106 1.000 Y NA
 2060578 2060579 SSA_1036 SSA_1037 deoC cdd TRUE 0.998 -13.000 0.051 1.000 Y NA
 2060579 2060580 SSA_1037 SSA_1038 cdd   TRUE 0.630 72.000 0.200 1.000   NA
 2060580 2060581 SSA_1038 SSA_1039     FALSE 0.206 140.000 0.024 1.000   NA
 2060581 2060582 SSA_1039 SSA_1040     TRUE 0.991 -7.000 0.438 1.000   NA
 2060582 2060583 SSA_1040 SSA_1041     TRUE 0.994 2.000 0.720 0.036   NA
 2060585 2060586 SSA_1043 SSA_1044 hom thrB TRUE 0.996 2.000 0.036 1.000 Y NA
 2060586 2060587 SSA_1044 SSA_1045 thrB   FALSE 0.173 122.000 0.003 NA   NA
 2060587 2060588 SSA_1045 SSA_1047   murB FALSE 0.212 108.000 0.005 NA   NA
 2060588 2060589 SSA_1047 SSA_1048 murB potA FALSE 0.183 182.000 0.041 1.000 N NA
 2060589 2060590 SSA_1048 SSA_1049 potA potB TRUE 1.000 -19.000 0.928 0.036 Y NA
 2060590 2060591 SSA_1049 SSA_1050 potB potC TRUE 0.999 -3.000 0.492 0.036 Y NA
 2060591 2060592 SSA_1050 SSA_1051 potC potD TRUE 0.999 -3.000 0.253 0.036 Y NA
 2060593 2060594 SSA_1052 SSA_1053     FALSE 0.101 185.000 0.000 NA   NA
 2060595 2060596 SSA_1054 SSA_1055     TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2060596 2060597 SSA_1055 SSA_1056     TRUE 0.623 43.000 0.036 NA   NA
 2060597 2060598 SSA_1056 SSA_1057     FALSE 0.218 101.000 0.011 1.000 N NA
 2060598 2060599 SSA_1057 SSA_1058   thiI TRUE 0.979 4.000 0.349 1.000 N NA
 2060599 2060600 SSA_1058 SSA_1059 thiI   TRUE 0.708 22.000 0.005 NA N NA
 2060600 2060601 SSA_1059 SSA_1060     TRUE 0.357 91.000 0.032 NA   NA
 2060601 2060602 SSA_1060 SSA_1061   rplU FALSE 0.080 225.000 0.000 NA   NA
 2060602 2060603 SSA_1061 SSA_1062 rplU rpmA TRUE 0.884 378.000 0.667 0.023 Y NA
 2060603 2060604 SSA_1062 SSA_1063 rpmA   FALSE 0.071 251.000 0.000 1.000   NA
 2060606 2060607 SSA_1065 SSA_1066   aliB FALSE 0.046 285.000 0.000 1.000 N NA
 2060607 2060608 SSA_1066 SSA_1067 aliB   FALSE 0.174 103.000 0.000 1.000   NA
 2060608 2060609 SSA_1067 SSA_1068     FALSE 0.218 90.000 0.000 1.000   NA
 2060609 2060610 SSA_1068 SSA_1069   lspA TRUE 0.958 4.000 0.119 1.000 N NA
 2060610 2060611 SSA_1069 SSA_1070 lspA   TRUE 0.972 -16.000 0.082 1.000 N NA
 2060611 2060612 SSA_1070 SSA_1072   proB FALSE 0.209 117.000 0.000 0.027 N NA
 2060612 2060613 SSA_1072 SSA_1073 proB proA TRUE 0.996 22.000 0.281 0.002 Y NA
 2060613 2060614 SSA_1073 SSA_1074 proA proC TRUE 0.997 3.000 0.002 0.002 Y NA
 2060614 2060615 SSA_1074 SSA_1075 proC hemN FALSE 0.091 139.000 0.000 1.000 N NA
 2060615 2060616 SSA_1075 SSA_1076 hemN   TRUE 0.945 4.000 0.060 1.000 N NA
 2060616 2060617 SSA_1076 SSA_1077   nagD TRUE 0.921 12.000 0.055 1.000 N NA
 2060617 2060618 SSA_1077 SSA_1078 nagD   TRUE 0.989 -7.000 0.330 NA   NA
 2060618 2060619 SSA_1078 SSA_1079     TRUE 0.900 14.000 0.026 NA   NA
 2060619 2060620 SSA_1079 SSA_1080   fruR FALSE 0.112 170.000 0.000 NA   NA
 2060620 2060621 SSA_1080 SSA_1081 fruR fruB TRUE 0.999 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 2060621 2060622 SSA_1081 SSA_1082 fruB fruA TRUE 0.999 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 2060622 2060623 SSA_1082 SSA_1083 fruA   FALSE 0.219 127.000 0.022 1.000   NA
 2060623 2060624 SSA_1083 SSA_1084     TRUE 0.968 3.000 0.139 NA   NA
 2060624 2060625 SSA_1084 SSA_1085   dapB TRUE 0.537 41.000 0.004 NA   NA
 2060625 2060626 SSA_1085 SSA_1086 dapB papS TRUE 0.947 -3.000 0.015 1.000 N NA
 2060626 2060627 SSA_1086 SSA_1087 papS   TRUE 0.971 -3.000 0.056 1.000   NA
 2060627 2060628 SSA_1087 SSA_1088     FALSE 0.034 656.000 0.000 1.000   NA
 2060628 2060629 SSA_1088 SSA_1089     TRUE 0.928 -31.000 0.000 NA   NA
 2060629 2060630 SSA_1089 SSA_1090   glcK TRUE 0.481 37.000 0.000 NA   NA
 2060630 2060631 SSA_1090 SSA_1091 glcK thyA FALSE 0.193 105.000 0.006 1.000 N NA
 2060631 2060632 SSA_1091 SSA_1092 thyA dfrA TRUE 0.439 125.000 0.295 1.000 N NA
 2060632 2060633 SSA_1092 SSA_1093 dfrA clpX FALSE 0.064 225.000 0.000 1.000 N NA
 2060633 2060634 SSA_1093 SSA_1094 clpX   TRUE 0.933 11.000 0.043 1.000   NA
 2060634 2060635 SSA_1094 SSA_1095   mur2 FALSE 0.154 147.000 0.002 1.000   NA
 2060635 2060636 SSA_1095 SSA_1096 mur2 mmuM FALSE 0.232 64.000 0.000 1.000 N NA
 2060636 2060637 SSA_1096 SSA_1098 mmuM   FALSE 0.111 115.000 0.000 1.000 N NA
 2060637 2060638 SSA_1098 SSA_1099     FALSE 0.031 430.000 0.000 1.000 N NA
 2060638 2060639 SSA_1099 SSA_1100     FALSE 0.195 79.000 0.000 1.000 N NA
 2060639 2060640 SSA_1100 SSA_1101     TRUE 0.997 -97.000 0.000 0.004 Y NA
 2060640 2060641 SSA_1101 SSA_1102     FALSE 0.064 267.000 0.000 NA   NA
 2060641 2060642 SSA_1102 SSA_1103     FALSE 0.159 106.000 0.000 NA   NA
 2060642 2060643 SSA_1103 SSA_1104   rplJ FALSE 0.059 284.000 0.000 NA   NA
 2060643 2060644 SSA_1104 SSA_1105 rplJ rplL TRUE 0.986 74.000 0.884 0.023 Y NA
 2060644 2060645 SSA_1105 SSA_1106 rplL iga FALSE 0.060 289.000 0.000 1.000   NA
 2060645 2060646 SSA_1106 SSA_1107 iga   FALSE 0.046 370.000 0.000 1.000   NA
 2060646 2060647 SSA_1107 SSA_1109     TRUE 0.999 14.000 0.846 0.010 Y NA
 2060647 2060648 SSA_1109 SSA_1110     TRUE 0.594 55.000 0.057 1.000   NA
 2060648 2060649 SSA_1110 SSA_1111   brnQ FALSE 0.042 427.000 0.000 1.000   NA
 2060649 2060650 SSA_1111 SSA_1112 brnQ   FALSE 0.086 221.000 0.000 1.000   NA
 2060650 2060651 SSA_1112 SSA_1113     TRUE 0.568 84.000 0.167 1.000   NA
 2060651 2060652 SSA_1113 SSA_1114     TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 2060652 2060653 SSA_1114 SSA_1115     TRUE 0.342 143.000 0.091 0.077 N NA
 2060653 2060654 SSA_1115 SSA_1116     TRUE 0.912 28.000 0.333 NA   NA
 2060654 2060655 SSA_1116 SSA_1117     TRUE 0.663 71.000 0.250 NA   NA
 2060655 2060656 SSA_1117 SSA_1118     TRUE 0.998 16.000 0.875 1.000 Y NA
 2060656 2060657 SSA_1118 SSA_1119     TRUE 0.713 60.000 0.240 1.000   NA
 2060657 2060658 SSA_1119 SSA_1120     TRUE 0.995 -3.000 0.480 0.011   NA
 2060658 2060659 SSA_1120 SSA_1121     FALSE 0.064 224.000 0.000 1.000 N NA
 2060659 2060660 SSA_1121 SSA_1122     TRUE 0.986 15.000 0.000 1.000 Y NA
 2060661 2060662 SSA_1124 SSA_1125     TRUE 0.973 18.000 0.588 NA   NA
 2060662 2060663 SSA_1125 SSA_1126   apbE TRUE 0.409 173.000 0.243 NA   NA
 2060664 2060665 SSA_1127 SSA_1128 nox   FALSE 0.243 143.000 0.047 1.000   NA
 2060665 2060666 SSA_1128 SSA_1129     TRUE 0.800 119.000 0.033 NA Y NA
 2060666 2060667 SSA_1129 SSA_1130     TRUE 0.999 5.000 0.812 NA Y NA
 2060667 2060668 SSA_1130 SSA_1131     TRUE 0.824 173.000 0.119 NA Y NA
 2060668 2060669 SSA_1131 SSA_1132   tatC TRUE 0.960 -43.000 0.040 NA N NA
 2060669 2060670 SSA_1132 SSA_1133 tatC tatA TRUE 0.986 0.000 0.312 NA   NA
 2060670 2060671 SSA_1133 SSA_1134 tatA xpt TRUE 0.435 43.000 0.000 1.000   NA
 2060671 2060672 SSA_1134 SSA_1135 xpt norM FALSE 0.110 116.000 0.000 1.000 N NA
 2060672 2060673 SSA_1135 SSA_1136 norM   FALSE 0.062 229.000 0.000 1.000 N NA
 2060673 2060674 SSA_1136 SSA_1137   pdhD FALSE 0.070 208.000 0.000 1.000 N NA
 2060674 2060675 SSA_1137 SSA_1138 pdhD pdhA TRUE 0.992 16.000 0.054 1.000 Y NA
 2060675 2060676 SSA_1138 SSA_1139 pdhA pdhB TRUE 0.999 19.000 0.804 0.002 Y NA
 2060676 2060677 SSA_1139 SSA_1140 pdhB pdhC TRUE 0.997 14.000 0.295 0.064 Y NA
 2060677 2060678 SSA_1140 SSA_1141 pdhC   FALSE 0.072 244.000 0.000 NA   NA
 2060679 2060680 SSA_1143 SSA_1144 norM2   FALSE 0.117 152.000 0.000 1.000   NA
 2060680 2060681 SSA_1144 SSA_1145     FALSE 0.226 84.000 0.000 NA   NA
 2060682 2060683 SSA_1146 SSA_1147 ptcA   TRUE 0.999 -3.000 0.500 0.011 Y NA
 2060683 2060684 SSA_1147 SSA_1148     TRUE 0.999 14.000 1.000 0.011 Y NA
 2060684 2060685 SSA_1148 SSA_1149     TRUE 0.991 6.000 0.000 1.000 Y NA
 2060687 2060688 SSA_1151 SSA_1152 tdk prfA TRUE 0.685 37.000 0.062 1.000 N NA
 2060688 2060689 SSA_1152 SSA_1153 prfA hemK TRUE 0.997 0.000 0.084 1.000 Y NA
 2060689 2060690 SSA_1153 SSA_1154 hemK   TRUE 0.997 -7.000 0.029 NA Y NA
 2060690 2060691 SSA_1154 SSA_1155   glyA TRUE 0.474 47.000 0.015 NA N NA
 2060691 2060692 SSA_1155 SSA_1156 glyA   TRUE 0.967 2.000 0.103 NA   NA
 2060692 2060693 SSA_1156 SSA_1157     TRUE 0.974 0.000 0.128 NA   NA
 2060693 2060694 SSA_1157 SSA_1158     FALSE 0.139 115.000 0.000 NA   NA
 2060694 2060695 SSA_1158 SSA_1161     FALSE 0.061 276.000 0.000 NA   NA
 2060696 2060697 SSA_1162 SSA_1163   guaA FALSE 0.218 86.000 0.000 NA   NA
 2060697 2060698 SSA_1163 SSA_1164 guaA   FALSE 0.150 109.000 0.000 NA   NA
 2060699 2060700 SSA_1165 SSA_1166   ylxM TRUE 0.311 144.000 0.032 0.047   NA
 2060700 2060701 SSA_1166 SSA_1167 ylxM ffh FALSE 0.241 247.000 0.151 1.000   NA
 2060701 2060702 SSA_1167 SSA_1168 ffh   TRUE 0.315 60.000 0.000 1.000   NA
 2060702 2060703 SSA_1168 SSA_1169     FALSE 0.150 109.000 0.000 NA   NA
 2060706 2060707 SSA_1172 SSA_1173   lplA FALSE 0.113 166.000 0.000 NA   NA
 2060707 2060708 SSA_1173 SSA_1174 lplA acoL TRUE 0.608 67.000 0.200 1.000 N NA
 2060708 2060709 SSA_1174 SSA_1175 acoL acoC TRUE 0.944 79.000 0.227 1.000 Y NA
 2060709 2060710 SSA_1175 SSA_1176 acoC acoB TRUE 0.664 461.000 0.103 0.063 Y NA
 2060710 2060711 SSA_1176 SSA_1178 acoB acoA TRUE 0.994 44.000 0.769 0.002 Y NA
 2060711 2060712 SSA_1178 SSA_1179 acoA   FALSE 0.064 223.000 0.000 1.000 N NA
 2060712 2060713 SSA_1179 SSA_1180     TRUE 0.937 13.000 0.087 NA   NA
 2060713 2060714 SSA_1180 SSA_1181     TRUE 0.733 33.000 0.039 NA   NA
 2060714 2060715 SSA_1181 SSA_1182   gid FALSE 0.137 116.000 0.000 NA   NA
 2060715 2060716 SSA_1182 SSA_1183 gid   FALSE 0.239 102.000 0.005 1.000   NA
 2060716 2060717 SSA_1183 SSA_1184   topA TRUE 0.321 59.000 0.000 1.000   NA
 2060717 2060718 SSA_1184 SSA_1185 topA smf TRUE 0.940 85.000 0.238 1.000 Y NA
 2060718 2060719 SSA_1185 SSA_1186 smf   FALSE 0.185 124.000 0.005 1.000   NA
 2060719 2060720 SSA_1186 SSA_1187   licT TRUE 0.964 -24.000 0.025 1.000   NA
 2060720 2060721 SSA_1187 SSA_1188 licT rnh TRUE 0.901 18.000 0.002 0.026   NA
 2060721 2060722 SSA_1188 SSA_1189 rnh   TRUE 0.983 -13.000 0.148 1.000   NA
 2060722 2060723 SSA_1189 SSA_1190     FALSE 0.163 142.000 0.005 1.000   NA
 2060723 2060724 SSA_1190 SSA_1191     FALSE 0.222 85.000 0.000 NA   NA
 2060724 2060725 SSA_1191 SSA_1192     FALSE 0.146 112.000 0.000 NA   NA
 2060725 2060726 SSA_1192 SSA_1193   dapA TRUE 0.299 61.000 0.000 NA   NA
 2060726 2060727 SSA_1193 SSA_1194 dapA asd TRUE 0.905 83.000 0.063 1.000 Y NA
 2060727 2060728 SSA_1194 SSA_1196 asd   FALSE 0.038 339.000 0.000 1.000 N NA
 2060728 2060729 SSA_1196 SSA_1197   alkD TRUE 0.899 -3.000 0.000 NA N NA
 2060729 2060730 SSA_1197 SSA_1198 alkD   TRUE 0.936 4.000 0.024 NA   NA
 2060730 2060731 SSA_1198 SSA_1199     TRUE 0.959 -3.000 0.021 NA   NA
 2060731 2060732 SSA_1199 SSA_1200   fhs TRUE 0.953 -37.000 0.021 1.000 N NA
 2060733 2060734 SSA_1201 SSA_1202   dfp TRUE 0.903 12.000 0.013 1.000   NA
 2060734 2060735 SSA_1202 SSA_1203 dfp   TRUE 0.962 -16.000 0.019 NA   NA
 2060735 2060736 SSA_1203 SSA_1204   pgm FALSE 0.205 239.000 0.098 NA   NA
 2060736 2060737 SSA_1204 SSA_1205 pgm bta FALSE 0.263 125.000 0.049 NA   NA
 2060738 2060739 SSA_1206 SSA_1207 mutY pta TRUE 0.294 66.000 0.002 1.000 N NA
 2060739 2060740 SSA_1207 SSA_1208 pta   TRUE 0.815 24.000 0.067 1.000 N NA
 2060740 2060741 SSA_1208 SSA_1209   ppnK TRUE 0.977 -3.000 0.150 1.000 N NA
 2060741 2060742 SSA_1209 SSA_1210 ppnK   TRUE 0.994 -46.000 0.725 1.000   NA
 2060743 2060744 SSA_1211 SSA_1212   prs TRUE 0.348 137.000 0.145 1.000   NA
 2060744 2060745 SSA_1212 SSA_1213 prs   TRUE 0.998 -67.000 0.089 1.000 Y NA
 2060745 2060746 SSA_1213 SSA_1214     TRUE 0.974 2.000 0.166 NA   NA
 2060746 2060747 SSA_1214 SSA_1215     TRUE 0.295 117.000 0.056 NA   NA
 2060747 2060748 SSA_1215 SSA_1216     TRUE 0.360 125.000 0.143 NA   NA
 2060748 2060749 SSA_1216 SSA_1217     TRUE 0.956 25.000 0.714 1.000   NA
 2060750 2060751 SSA_1218 SSA_1219 radC srtA FALSE 0.193 123.000 0.028 NA N NA
 2060751 2060752 SSA_1219 SSA_1220 srtA gyrA TRUE 0.852 15.000 0.013 NA N NA
 2060754 2060755 SSA_1222 SSA_2470     TRUE 0.318 58.000 0.000 NA   NA
 2060755 2060756 SSA_2470 SSA_1223   rpsA FALSE 0.226 84.000 0.000 NA   NA
 2060756 2060757 SSA_1223 SSA_2469 rpsA   FALSE 0.113 164.000 0.000 NA   NA
 2060757 2060758 SSA_2469 SSA_2468     TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 2060758 2060759 SSA_2468 SSA_1224     TRUE 0.376 50.000 0.000 NA   NA
 2060759 2060760 SSA_1224 SSA_1225   ilvE TRUE 0.367 108.000 0.095 NA   NA
 2060760 2060761 SSA_1225 SSA_1226 ilvE parC FALSE 0.241 175.000 0.086 1.000 N NA
 2060761 2060762 SSA_1226 SSA_1227 parC   FALSE 0.071 246.000 0.000 NA   NA
 2060762 2060763 SSA_1227 SSA_1229     TRUE 0.789 17.000 0.000 NA   NA
 2060763 2060764 SSA_1229 SSA_1230     FALSE 0.098 191.000 0.000 NA   NA
 2060764 2060765 SSA_1230 SSA_1231     FALSE 0.056 291.000 0.000 NA   NA
 2060765 2060766 SSA_1231 SSA_1232   parE TRUE 0.385 48.000 0.000 NA   NA
 2060768 2060769 SSA_1234 SSA_1235   pyrC TRUE 0.730 164.000 0.005 1.000 Y NA
 2060769 2060770 SSA_1235 SSA_1236 pyrC mutX TRUE 0.854 13.000 0.005 1.000 N NA
 2060770 2060771 SSA_1236 SSA_1237 mutX ung TRUE 0.995 9.000 0.043 1.000 Y NA
 2060771 2060772 SSA_1237 SSA_1238 ung   TRUE 0.494 36.000 0.000 NA   NA
 2060772 2060773 SSA_1238 SSA_1239     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 2060773 2060774 SSA_1239 SSA_1240   pyrE FALSE 0.218 112.000 0.008 1.000   NA
 2060774 2060775 SSA_1240 SSA_1241 pyrE pyrF TRUE 0.926 79.000 0.133 1.000 Y NA
 2060775 2060776 SSA_1241 SSA_1242 pyrF pyrD TRUE 0.854 247.000 0.154 0.003 Y NA
 2060776 2060777 SSA_1242 SSA_1243 pyrD pyrK TRUE 0.988 12.000 0.592 0.007 N NA
 2060777 2060778 SSA_1243 SSA_1244 pyrK   FALSE 0.066 261.000 0.000 NA   NA
 2060780 2060781 SSA_1246 SSA_1247     TRUE 0.961 -3.000 0.026 NA   NA
 2060781 2060782 SSA_1247 SSA_1248     TRUE 0.999 -3.000 0.597 NA Y NA
 2060782 2060783 SSA_1248 SSA_1249     TRUE 0.998 12.000 0.547 NA Y NA
 2060783 2060784 SSA_1249 SSA_1250     TRUE 0.990 -3.000 0.453 NA   NA
 2060784 2060785 SSA_1250 SSA_1251     TRUE 0.989 -19.000 0.347 NA   NA
 2060785 2060786 SSA_1251 SSA_1252     TRUE 0.978 -19.000 0.102 NA   NA
 2060786 2060787 SSA_1252 SSA_1253     FALSE 0.030 3471.000 0.000 NA   NA
 11530752 2060781   SSA_1247     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11673115 2060781   SSA_1247     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11815507 2060781   SSA_1247     FALSE NA 6934.000 0.000 NA   NA
 11530753 2060781   SSA_1247     FALSE NA 6963.000 0.000 NA   NA
 11673116 2060781   SSA_1247     FALSE NA 6963.000 0.000 NA   NA
 11815508 2060781   SSA_1247     FALSE NA 6963.000 0.000 NA   NA
 11530754 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7007.000 0.000 NA   NA
 11673117 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7007.000 0.000 NA   NA
 11815509 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7007.000 0.000 NA   NA
 11530755 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7036.000 0.000 NA   NA
 11673118 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7036.000 0.000 NA   NA
 11815510 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7036.000 0.000 NA   NA
 11530756 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7079.000 0.000 NA   NA
 11673119 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7079.000 0.000 NA   NA
 11815511 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7079.000 0.000 NA   NA
 11530757 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7108.000 0.000 NA   NA
 11673120 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7108.000 0.000 NA   NA
 11815512 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7108.000 0.000 NA   NA
 11530758 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7150.000 0.000 NA   NA
 11673121 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7150.000 0.000 NA   NA
 11815513 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7150.000 0.000 NA   NA
 11530759 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7179.000 0.000 NA   NA
 11673122 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7179.000 0.000 NA   NA
 11815514 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7179.000 0.000 NA   NA
 11530760 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7223.000 0.000 NA   NA
 11673123 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7223.000 0.000 NA   NA
 11815515 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7223.000 0.000 NA   NA
 11530761 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7252.000 0.000 NA   NA
 11673124 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7252.000 0.000 NA   NA
 11815516 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7252.000 0.000 NA   NA
 11530762 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7295.000 0.000 NA   NA
 11673125 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7295.000 0.000 NA   NA
 11815517 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7295.000 0.000 NA   NA
 11530763 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7324.000 0.000 NA   NA
 11673126 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7324.000 0.000 NA   NA
 11815518 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7324.000 0.000 NA   NA
 11530743 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7365.000 0.000 NA   NA
 11530764 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7365.000 0.000 NA   NA
 11673106 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7365.000 0.000 NA   NA
 11673127 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7365.000 0.000 NA   NA
 11815498 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7365.000 0.000 NA   NA
 11815519 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7365.000 0.000 NA   NA
 11530765 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7394.000 0.000 NA   NA
 11673128 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7394.000 0.000 NA   NA
 11815520 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7394.000 0.000 NA   NA
 11530744 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7399.000 0.000 NA   NA
 11673107 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7399.000 0.000 NA   NA
 11815499 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7399.000 0.000 NA   NA
 11530745 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7439.000 0.000 NA   NA
 11530766 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7439.000 0.000 NA   NA
 11673108 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7439.000 0.000 NA   NA
 11673129 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7439.000 0.000 NA   NA
 11815500 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7439.000 0.000 NA   NA
 11815521 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7439.000 0.000 NA   NA
 11530767 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7468.000 0.000 NA   NA
 11673130 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7468.000 0.000 NA   NA
 11815522 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7468.000 0.000 NA   NA
 11530746 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7473.000 0.000 NA   NA
 11673109 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7473.000 0.000 NA   NA
 11815501 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7473.000 0.000 NA   NA
 11530747 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7513.000 0.000 NA   NA
 11530768 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7513.000 0.000 NA   NA
 11673110 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7513.000 0.000 NA   NA
 11673131 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7513.000 0.000 NA   NA
 11815502 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7513.000 0.000 NA   NA
 11815523 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7513.000 0.000 NA   NA
 11530769 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7542.000 0.000 NA   NA
 11673132 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7542.000 0.000 NA   NA
 11815524 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7542.000 0.000 NA   NA
 11530748 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7547.000 0.000 NA   NA
 11673111 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7547.000 0.000 NA   NA
 11815503 2060781   SSA_1247     FALSE NA 7547.000 0.000 NA   NA
 11530749 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1263.000 0.000 NA   NA
 11530770 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1268.000 0.000 NA   NA
 11673112 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1263.000 0.000 NA   NA
 11673133 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1268.000 0.000 NA   NA
 11815504 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1263.000 0.000 NA   NA
 11815525 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1268.000 0.000 NA   NA
 11530771 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1225.000 0.000 NA   NA
 11673134 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1225.000 0.000 NA   NA
 11815526 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1225.000 0.000 NA   NA
 11530750 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1225.000 0.000 NA   NA
 11673113 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1225.000 0.000 NA   NA
 11815505 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1225.000 0.000 NA   NA
 11530751 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1191.000 0.000 NA   NA
 11530772 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1196.000 0.000 NA   NA
 11673114 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1191.000 0.000 NA   NA
 11673135 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1196.000 0.000 NA   NA
 11815506 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1191.000 0.000 NA   NA
 11815527 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1196.000 0.000 NA   NA
 11530773 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1152.000 0.000 NA   NA
 11673136 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1152.000 0.000 NA   NA
 11815528 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1152.000 0.000 NA   NA
 11530774 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1123.000 0.000 NA   NA
 11673137 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1123.000 0.000 NA   NA
 11815529 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1123.000 0.000 NA   NA
 11530775 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1079.000 0.000 NA   NA
 11673138 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1079.000 0.000 NA   NA
 11815530 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1079.000 0.000 NA   NA
 11530776 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1050.000 0.000 NA   NA
 11673139 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1050.000 0.000 NA   NA
 11815531 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1050.000 0.000 NA   NA
 11530777 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1005.000 0.000 NA   NA
 11673140 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1005.000 0.000 NA   NA
 11815532 2060788   SSA_1254     FALSE NA 1005.000 0.000 NA   NA
 11530778 2060788   SSA_1254     FALSE NA 976.000 0.000 NA   NA
 11673141 2060788   SSA_1254     FALSE NA 976.000 0.000 NA   NA
 11815533 2060788   SSA_1254     FALSE NA 976.000 0.000 NA   NA
 11530779 2060788   SSA_1254     FALSE NA 932.000 0.000 NA   NA
 11673142 2060788   SSA_1254     FALSE NA 932.000 0.000 NA   NA
 11815534 2060788   SSA_1254     FALSE NA 932.000 0.000 NA   NA
 11530780 2060788   SSA_1254     FALSE NA 903.000 0.000 NA   NA
 11673143 2060788   SSA_1254     FALSE NA 903.000 0.000 NA   NA
 11815535 2060788   SSA_1254     FALSE NA 903.000 0.000 NA   NA
 11530781 2060788   SSA_1254     FALSE NA 860.000 0.000 NA   NA
 11673144 2060788   SSA_1254     FALSE NA 860.000 0.000 NA   NA
 11815536 2060788   SSA_1254     FALSE NA 860.000 0.000 NA   NA
 11530782 2060788   SSA_1254     FALSE NA 831.000 0.000 NA   NA
 11673145 2060788   SSA_1254     FALSE NA 831.000 0.000 NA   NA
 11815537 2060788   SSA_1254     FALSE NA 831.000 0.000 NA   NA
 11530783 2060788   SSA_1254     FALSE NA 787.000 0.000 NA   NA
 11673146 2060788   SSA_1254     FALSE NA 787.000 0.000 NA   NA
 11815538 2060788   SSA_1254     FALSE NA 787.000 0.000 NA   NA
 11530784 2060788   SSA_1254     FALSE NA 758.000 0.000 NA   NA
 11673147 2060788   SSA_1254     FALSE NA 758.000 0.000 NA   NA
 11815539 2060788   SSA_1254     FALSE NA 758.000 0.000 NA   NA
 11530785 2060788   SSA_1254     FALSE NA 717.000 0.000 NA   NA
 11673148 2060788   SSA_1254     FALSE NA 717.000 0.000 NA   NA
 11815540 2060788   SSA_1254     FALSE NA 717.000 0.000 NA   NA
 11530786 2060788   SSA_1254     FALSE NA 688.000 0.000 NA   NA
 11673149 2060788   SSA_1254     FALSE NA 688.000 0.000 NA   NA
 11815541 2060788   SSA_1254     FALSE NA 688.000 0.000 NA   NA
 11530787 2060788   SSA_1254     FALSE NA 645.000 0.000 NA   NA
 11673150 2060788   SSA_1254     FALSE NA 645.000 0.000 NA   NA
 11815542 2060788   SSA_1254     FALSE NA 645.000 0.000 NA   NA
 11530788 2060788   SSA_1254     FALSE NA 616.000 0.000 NA   NA
 11673151 2060788   SSA_1254     FALSE NA 616.000 0.000 NA   NA
 11815543 2060788   SSA_1254     FALSE NA 616.000 0.000 NA   NA
 2060787 2060788 SSA_1253 SSA_1254     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 2060788 2060789 SSA_1254 SSA_1255     TRUE 0.928 -28.000 0.000 NA   NA
 2060789 2060790 SSA_1255 SSA_1256     FALSE 0.109 113.000 0.000 NA N NA
 2060790 2060791 SSA_1256 SSA_1257     TRUE 0.913 12.000 0.027 NA   NA
 2060791 2060792 SSA_1257 SSA_1258   deoD TRUE 0.979 -9.000 0.107 NA   NA
 2060792 2060793 SSA_1258 SSA_1259 deoD punA TRUE 0.792 258.000 0.040 0.001 Y NA
 2060793 2060794 SSA_1259 SSA_1260 punA deoB TRUE 0.873 30.000 0.240 1.000 N NA
 2060794 2060795 SSA_1260 SSA_1261 deoB rpiA TRUE 0.991 14.000 0.018 1.000 Y NA
 2060797 2060798 SSA_1264 SSA_2467     TRUE 0.587 30.000 0.000 NA   NA
 2060798 2060799 SSA_2467 SSA_1265   rplS TRUE 0.443 41.000 0.000 NA   NA
 2060799 2060800 SSA_1265 SSA_1266 rplS crcB1 FALSE 0.258 83.000 0.004 1.000 N NA
 2060800 2060801 SSA_1266 SSA_1267 crcB1 crcB2 TRUE 0.999 -27.000 0.160 0.070 Y NA
 2060801 2060802 SSA_1267 SSA_1268 crcB2 aroH TRUE 0.943 0.000 0.023 1.000 N NA
 2060802 2060803 SSA_1268 SSA_1269 aroH   FALSE 0.036 360.000 0.000 1.000 N NA
 2060803 2060804 SSA_1269 SSA_1270   flaV FALSE 0.143 124.000 0.003 1.000 N NA
 2060805 2060806 SSA_1271 SSA_1272   rpmE FALSE 0.261 108.000 0.020 1.000   NA
 2060807 2060808 SSA_1274 SSA_1275     TRUE 0.353 54.000 0.000 NA   NA
 2060808 2060809 SSA_1275 SSA_1276     FALSE 0.034 550.000 0.000 NA   NA
 2060809 2060810 SSA_1276 SSA_1277     TRUE 0.755 30.000 0.030 1.000   NA
 2060810 2060811 SSA_1277 SSA_1278     FALSE 0.035 347.000 0.000 NA N NA
 2060811 2060812 SSA_1278 SSA_1279     TRUE 0.981 -7.000 0.182 NA N NA
 2060812 2060813 SSA_1279 SSA_1280     FALSE 0.061 276.000 0.000 NA   NA
 2060813 2060814 SSA_1280 SSA_1281     TRUE 0.891 12.000 0.008 NA   NA
 2060814 2060815 SSA_1281 SSA_1282   pepV TRUE 0.482 54.000 0.031 NA N NA
 2060815 2060816 SSA_1282 SSA_1283 pepV nrd TRUE 0.430 70.000 0.051 1.000 N NA
 2060816 2060817 SSA_1283 SSA_1284 nrd   FALSE 0.148 110.000 0.000 NA   NA
 2060817 2060818 SSA_1284 SSA_1285     TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 2060818 2060819 SSA_1285 SSA_1286     FALSE 0.057 290.000 0.000 NA   NA
 2060819 2060820 SSA_1286 SSA_1287     TRUE 0.849 11.000 0.000 NA   NA
 2060820 2060821 SSA_1287 SSA_1288     FALSE 0.046 359.000 0.000 NA   NA
 2060821 2060822 SSA_1288 SSA_1289     FALSE 0.050 331.000 0.000 NA   NA
 2060822 2060823 SSA_1289 SSA_1291     FALSE 0.033 606.000 0.000 NA   NA
 2060823 2060824 SSA_1291 SSA_1292     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 2060824 2060825 SSA_1292 SSA_1293     TRUE 0.996 -24.000 1.000 NA   NA
 2060825 2060826 SSA_1293 SSA_1294     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 2060826 2060827 SSA_1294 SSA_1296     TRUE 0.905 1.000 0.000 NA   NA
 2060827 2060828 SSA_1296 SSA_1297   uvrC FALSE 0.122 128.000 0.000 NA   NA
 2060829 2060830 SSA_1298 SSA_1299 malX malF TRUE 0.980 82.000 0.690 0.032 Y NA
 2060830 2060831 SSA_1299 SSA_1300 malF   TRUE 0.999 0.000 0.793 0.032 Y NA
 2060832 2060833 SSA_1301 SSA_1302   trmD FALSE 0.103 191.000 0.000 1.000   NA
 2060833 2060834 SSA_1302 SSA_1303 trmD rimM TRUE 0.999 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 2060834 2060835 SSA_1303 SSA_1304 rimM   FALSE 0.193 95.000 0.000 NA   NA
 2060835 2060836 SSA_1304 SSA_1305     FALSE 0.247 76.000 0.000 NA   NA
 2060836 2060837 SSA_1305 SSA_1306   trkA2 FALSE 0.270 166.000 0.067 1.000   NA
 2060837 2060838 SSA_1306 SSA_1307 trkA2 trkH2 TRUE 0.999 11.000 0.490 0.004 Y NA
 2060838 2060839 SSA_1307 SSA_1308 trkH2   TRUE 0.966 -3.000 0.039 NA   NA
 2060839 2060840 SSA_1308 SSA_1309     FALSE 0.066 261.000 0.000 NA   NA
 2060840 2060841 SSA_1309 SSA_1310   rpsP TRUE 0.953 20.000 0.385 1.000   NA
 2060841 2060842 SSA_1310 SSA_1311 rpsP   FALSE 0.081 232.000 0.000 1.000   NA
 2060842 2060843 SSA_1311 SSA_1312     FALSE 0.048 344.000 0.000 NA   NA
 2060843 2060844 SSA_1312 SSA_1313     TRUE 0.778 52.000 0.286 NA   NA
 2060844 2060845 SSA_1313 SSA_1314     FALSE 0.168 198.000 0.022 NA   NA
 2060845 2060846 SSA_1314 SSA_1315     FALSE 0.195 168.000 0.022 NA   NA
 2060846 2060847 SSA_1315 SSA_1316     FALSE 0.162 105.000 0.000 NA   NA
 2060847 2060848 SSA_1316 SSA_1317     FALSE 0.039 450.000 0.000 NA   NA
 2060848 2060849 SSA_1317 SSA_1318   lepA FALSE 0.039 445.000 0.000 NA   NA
 2060851 2060852 SSA_1320 SSA_1321   hemH TRUE 0.364 52.000 0.000 NA   NA
 2060852 2060853 SSA_1321 SSA_1322 hemH   FALSE 0.077 193.000 0.000 1.000 N NA
 2060853 2060854 SSA_1322 SSA_1323     TRUE 0.989 -31.000 0.333 NA   NA
 2060854 2060855 SSA_1323 SSA_1324     TRUE 0.993 -22.000 0.625 NA   NA
 2060855 2060856 SSA_1324 SSA_1325     TRUE 0.930 -45.000 0.000 1.000   NA
 2060858 2060859 SSA_1327 SSA_1328     TRUE 0.443 41.000 0.000 NA   NA
 2060859 2060860 SSA_1328 SSA_1329     FALSE 0.120 130.000 0.000 NA   NA
 2060860 2060861 SSA_1329 SSA_1330     TRUE 0.991 -3.000 0.500 NA   NA
 2060861 2060862 SSA_1330 SSA_1331     FALSE 0.162 105.000 0.000 NA   NA
 2060862 2060863 SSA_1331 SSA_1332     FALSE 0.222 85.000 0.000 NA   NA
 2060863 2060864 SSA_1332 SSA_1333     TRUE 0.385 48.000 0.000 NA   NA
 2060864 2060865 SSA_1333 SSA_1334     TRUE 0.424 43.000 0.000 NA   NA
 2060865 2060866 SSA_1334 SSA_1335     FALSE 0.185 97.000 0.000 NA   NA
 2060866 2060867 SSA_1335 SSA_1336     TRUE 0.926 -82.000 0.000 NA   NA
 2060867 2060868 SSA_1336 SSA_1337     FALSE 0.045 366.000 0.000 NA   NA
 2060868 2060869 SSA_1337 SSA_1338     FALSE 0.150 109.000 0.000 NA   NA
 2060869 2060870 SSA_1338 SSA_1339   phpA FALSE 0.112 152.000 0.000 NA   NA
 2060870 2060871 SSA_1339 SSA_1340 phpA   TRUE 0.977 10.000 0.333 NA   NA
 2060871 2060872 SSA_1340 SSA_1341   carB FALSE 0.048 276.000 0.000 1.000 N NA
 2060872 2060873 SSA_1341 SSA_1342 carB carA TRUE 0.992 24.000 0.117 0.001 Y NA
 2060873 2060874 SSA_1342 SSA_1343 carA pyrB TRUE 0.976 25.000 0.014 1.000 Y NA
 2060874 2060875 SSA_1343 SSA_1344 pyrB pyrP TRUE 0.848 110.000 0.064 1.000 Y NA
 2060875 2060876 SSA_1344 SSA_1345 pyrP pyrR TRUE 0.996 9.000 0.140 1.000 Y NA
 2060876 2060877 SSA_1345 SSA_1346 pyrR   FALSE 0.063 272.000 0.000 NA   NA
 2060877 2060878 SSA_1346 SSA_1347   phnA TRUE 0.917 8.000 0.011 NA   NA
 2060879 2060880 SSA_1348 SSA_1349     TRUE 0.744 39.000 0.107 NA   NA
 2060881 2060882 SSA_1350 SSA_1352     TRUE 0.506 83.000 0.111 NA   NA
 2060882 2060883 SSA_1352 SSA_1353     TRUE 0.542 33.000 0.000 NA   NA
 2060883 2060884 SSA_1353 SSA_1354     TRUE 0.632 36.000 0.014 NA   NA
 2060884 2060885 SSA_1354 SSA_1355     TRUE 0.705 31.000 0.014 NA   NA
 2060885 2060886 SSA_1355 SSA_1356   uvrB TRUE 0.329 68.000 0.002 NA   NA
 2060886 2060887 SSA_1356 SSA_1357 uvrB   FALSE 0.113 162.000 0.000 NA   NA
 2060887 2060888 SSA_1357 SSA_1358     FALSE 0.235 80.000 0.000 NA   NA
 2060889 2060890 SSA_1359 SSA_1360     TRUE 0.999 0.000 0.326 1.000 Y NA
 2060890 2060891 SSA_1360 SSA_1361     FALSE 0.198 78.000 0.000 1.000 N NA
 2060891 2060892 SSA_1361 SSA_1362     TRUE 0.706 207.000 0.000 0.040 Y NA
 2060893 2060894 SSA_1363 SSA_1364     TRUE 0.276 65.000 0.000 NA   NA
 2060894 2060895 SSA_1364 SSA_1365     TRUE 0.346 55.000 0.000 NA   NA
 2060895 2060896 SSA_1365 SSA_1366     TRUE 0.986 -3.000 0.077 0.005   NA
 2060898 2060899 SSA_1368 SSA_1369     TRUE 0.488 65.000 0.000 0.005   NA
 2060899 2060900 SSA_1369 SSA_1370     FALSE 0.166 104.000 0.000 NA   NA
 2060900 2060901 SSA_1370 SSA_1371     FALSE 0.229 83.000 0.000 NA   NA
 2060901 2060902 SSA_1371 SSA_1372     FALSE 0.141 114.000 0.000 NA   NA
 2060904 2060905 SSA_1374 SSA_1375     TRUE 1.000 -10.000 0.895 0.009 Y NA
 2060905 2060906 SSA_1375 SSA_1376   pmrB TRUE 0.334 97.000 0.034 NA   NA
 2060906 2060907 SSA_1376 SSA_1377 pmrB asnS FALSE 0.169 157.000 0.009 NA   NA
 2060907 2060908 SSA_1377 SSA_1378 asnS   TRUE 0.785 22.000 0.013 NA   NA
 2060908 2060909 SSA_1378 SSA_1379     FALSE 0.104 180.000 0.000 NA   NA
 2060909 2060910 SSA_1379 SSA_1380     TRUE 0.859 10.000 0.000 NA   NA
 2060910 2060911 SSA_1380 SSA_1381     TRUE 0.809 15.000 0.000 NA   NA
 2060911 2060912 SSA_1381 SSA_1382     FALSE 0.077 232.000 0.000 NA   NA
 2060912 2060913 SSA_1382 SSA_1383   aspB FALSE 0.064 267.000 0.000 NA   NA
 2060913 2060914 SSA_1383 SSA_1384 aspB   TRUE 0.984 -3.000 0.205 NA   NA
 2060915 2060916 SSA_1385 SSA_1386     TRUE 0.698 86.000 0.414 1.000   NA
 2060917 2060918 SSA_1387 SSA_1388     TRUE 0.560 32.000 0.000 NA   NA
 2060918 2060919 SSA_1388 SSA_1389     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 2060919 2060920 SSA_1389 SSA_1390     FALSE 0.032 721.000 0.000 NA   NA
 2060920 2060921 SSA_1390 SSA_1391     TRUE 0.452 40.000 0.000 NA   NA
 2060921 2060922 SSA_1391 SSA_1392     TRUE 0.897 2.000 0.000 NA   NA
 2060922 2060923 SSA_1392 SSA_1393     TRUE 0.931 -9.000 0.000 NA   NA
 2060923 2060924 SSA_1393 SSA_1394     TRUE 0.993 0.000 0.750 NA   NA
 2060924 2060925 SSA_1394 SSA_1395     TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 2060925 2060926 SSA_1395 SSA_1396     TRUE 0.789 17.000 0.000 NA   NA
 2060927 2060928 SSA_1397 SSA_1398   hlyIII TRUE 0.981 -34.000 0.146 NA   NA
 2060929 2060930 SSA_1399 SSA_1400   pdxK TRUE 0.981 -19.000 0.142 NA   NA
 2060932 2060933 SSA_1402 SSA_1403     TRUE 1.000 2.000 0.911 0.009 Y NA
 2060933 2060934 SSA_1403 SSA_1404     TRUE 0.334 88.000 0.018 NA   NA
 2060934 2060935 SSA_1404 SSA_1405   cutC TRUE 0.704 35.000 0.040 NA   NA
 2060935 2060936 SSA_1405 SSA_1406 cutC   FALSE 0.244 62.000 0.000 1.000 N NA
 2060936 2060937 SSA_1406 SSA_1408     FALSE 0.206 91.000 0.000 NA   NA
 2060937 2060938 SSA_1408 SSA_1409   rmlB FALSE 0.093 204.000 0.000 NA   NA
 2060938 2060939 SSA_1409 SSA_1410 rmlB rmlC TRUE 0.847 238.000 0.350 1.000 Y NA
 2060939 2060940 SSA_1410 SSA_1411 rmlC rmlA TRUE 0.997 5.000 0.149 1.000 Y NA
 2060940 2060941 SSA_1411 SSA_1412 rmlA   TRUE 0.521 34.000 0.000 NA   NA
 2060941 2060942 SSA_1412 SSA_1413     TRUE 0.912 0.000 0.000 NA   NA
 2060942 2060943 SSA_1413 SSA_1414     TRUE 0.601 23.000 0.000 1.000 N NA
 2060943 2060944 SSA_1414 SSA_1415     TRUE 0.938 2.000 0.028 1.000 N NA
 2060944 2060945 SSA_1415 SSA_1416     TRUE 0.908 12.000 0.021 NA   NA
 2060945 2060946 SSA_1416 SSA_1417     TRUE 0.988 -13.000 0.283 NA   NA
 2060946 2060947 SSA_1417 SSA_1418     FALSE 0.167 146.000 0.008 NA   NA
 2060947 2060948 SSA_1418 SSA_1419   dnaD TRUE 0.330 68.000 0.013 NA N NA
 2060948 2060949 SSA_1419 SSA_1420 dnaD metA TRUE 0.907 9.000 0.021 NA N NA
 2060949 2060950 SSA_1420 SSA_1421 metA apt FALSE 0.142 148.000 0.009 1.000 N NA
 2060950 2060951 SSA_1421 SSA_1422 apt   FALSE 0.185 97.000 0.000 NA   NA
 2060951 2060952 SSA_1422 SSA_1423   recJ TRUE 0.873 6.000 0.000 NA   NA
 2060952 2060953 SSA_1423 SSA_1424 recJ   FALSE 0.208 106.000 0.002 NA   NA
 2060953 2060954 SSA_1424 SSA_1425     TRUE 0.276 65.000 0.000 NA   NA
 2060954 2060955 SSA_1425 SSA_1428     TRUE 0.311 59.000 0.000 NA   NA
 2060955 2060956 SSA_1428 SSA_1429     TRUE 0.953 7.000 0.016 0.056   NA
 2060956 2060957 SSA_1429 SSA_1430   elaC TRUE 0.974 -3.000 0.074 1.000   NA
 2060957 2060958 SSA_1430 SSA_1431 elaC   TRUE 0.915 11.000 0.022 NA   NA
 2060958 2060959 SSA_1431 SSA_1432   hflX TRUE 0.956 -67.000 0.014 NA   NA
 2060959 2060960 SSA_1432 SSA_1433 hflX miaA TRUE 0.727 32.000 0.027 1.000   NA
 2060962 2060963 SSA_1435 SSA_1436     TRUE 0.991 -13.000 0.400 NA   NA
 2060963 2060964 SSA_1436 SSA_1438     TRUE 0.797 17.000 0.000 1.000   NA
 2060964 2060965 SSA_1438 SSA_1439   hisK TRUE 0.844 12.000 0.000 1.000   NA
 2060965 2060966 SSA_1439 SSA_1440 hisK   TRUE 0.975 34.000 0.005 0.005 Y NA
 2060966 2060967 SSA_1440 SSA_1441   hisI TRUE 0.920 118.000 0.152 0.005 Y NA
 2060967 2060968 SSA_1441 SSA_1442 hisI hisF TRUE 0.999 0.000 0.430 0.005 Y NA
 2060968 2060969 SSA_1442 SSA_1443 hisF hisA TRUE 0.999 3.000 0.433 0.005 Y NA
 2060969 2060970 SSA_1443 SSA_1444 hisA hisH TRUE 0.999 -28.000 0.124 0.005 Y NA
 2060970 2060971 SSA_1444 SSA_1445 hisH hisB TRUE 0.985 35.000 0.125 0.005 Y NA
 2060971 2060972 SSA_1445 SSA_1446 hisB hisD TRUE 0.997 12.000 0.096 0.005 Y NA
 2060972 2060973 SSA_1446 SSA_1447 hisD hisG TRUE 0.999 -3.000 0.254 0.005 Y NA
 2060973 2060974 SSA_1447 SSA_1448 hisG hisZ TRUE 0.999 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 2060974 2060975 SSA_1448 SSA_1449 hisZ hisC TRUE 0.920 56.000 0.012 1.000 Y NA
 2060975 2060976 SSA_1449 SSA_1450 hisC   FALSE 0.036 474.000 0.000 NA   NA
 2060976 2060977 SSA_1450 SSA_1451   rexA TRUE 0.640 34.000 0.010 NA   NA
 2060977 2060978 SSA_1451 SSA_1452 rexA rexB TRUE 0.998 -3.000 0.070 0.039 Y NA
 2060978 2060979 SSA_1452 SSA_1453 rexB   FALSE 0.094 201.000 0.000 NA   NA
 2060979 2060980 SSA_1453 SSA_1454     TRUE 0.658 47.000 0.080 NA   NA
 2060980 2060981 SSA_1454 SSA_1455     TRUE 0.719 34.000 0.042 NA   NA
 2060981 2060982 SSA_1455 SSA_2383   doc TRUE 0.587 30.000 0.000 NA   NA
 2060982 2060983 SSA_2383 SSA_1456 doc   TRUE 0.951 -3.000 0.009 NA   NA
 2060983 2060984 SSA_1456 SSA_1457   dexB FALSE 0.116 136.000 0.000 NA   NA
 2060984 2060985 SSA_1457 SSA_1458 dexB   FALSE 0.078 230.000 0.000 NA   NA
 2060985 2060986 SSA_1458 SSA_2384     FALSE 0.129 121.000 0.000 NA   NA
 2060986 2060987 SSA_2384 SSA_1459     FALSE 0.089 215.000 0.000 1.000   NA
 2060987 2060988 SSA_1459 SSA_1460     TRUE 0.428 85.000 0.093 NA N NA
 2060988 2060989 SSA_1460 SSA_1462   pheA TRUE 0.827 19.000 0.025 NA N NA
 2060989 2060990 SSA_1462 SSA_1463 pheA aroK TRUE 0.997 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 2060990 2060991 SSA_1463 SSA_1464 aroK aroA TRUE 0.997 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 2060991 2060992 SSA_1464 SSA_1465 aroA   FALSE 0.159 132.000 0.003 NA   NA
 2060992 2060993 SSA_1465 SSA_1466   tyrA TRUE 0.890 19.000 0.058 NA   NA
 2060993 2060994 SSA_1466 SSA_1467 tyrA aroC TRUE 0.989 16.000 0.010 1.000 Y NA
 2060994 2060995 SSA_1467 SSA_1468 aroC aroB TRUE 0.944 92.000 0.110 0.003 Y NA
 2060995 2060996 SSA_1468 SSA_1469 aroB aroE TRUE 0.992 11.000 0.010 1.000 Y NA
 2060996 2060997 SSA_1469 SSA_1470 aroE aroD TRUE 0.999 -10.000 0.222 1.000 Y NA
 2060997 2060998 SSA_1470 SSA_1471 aroD   TRUE 0.960 -3.000 0.025 NA   NA
 2060998 2060999 SSA_1471 SSA_1472     FALSE 0.048 341.000 0.000 NA   NA
 2060999 2061000 SSA_1472 SSA_1473     FALSE 0.250 74.000 0.000 NA   NA
 2061000 2061001 SSA_1473 SSA_1474     FALSE 0.112 147.000 0.000 NA   NA
 2061001 2061002 SSA_1474 SSA_1475     FALSE 0.076 234.000 0.000 NA   NA
 2061003 2061004 SSA_1476 SSA_1477     FALSE 0.122 128.000 0.000 NA   NA
 2061004 2061005 SSA_1477 SSA_1478     TRUE 0.863 55.000 0.667 NA   NA
 2061005 2061006 SSA_1478 SSA_1479     TRUE 0.610 136.000 0.667 NA   NA
 2061007 2061008 SSA_1480 SSA_1481     TRUE 0.817 15.000 0.000 1.000   NA
 2061008 2061009 SSA_1481 SSA_1482   pulI FALSE 0.040 327.000 0.000 1.000 N NA
 2061009 2061010 SSA_1482 SSA_1483 pulI   TRUE 0.829 24.000 0.088 1.000 N NA
 2061010 2061011 SSA_1483 SSA_1484   ligA TRUE 0.897 10.000 0.013 1.000 N NA
 2061011 2061012 SSA_1484 SSA_1485 ligA ccl FALSE 0.234 106.000 0.010 NA   NA
 2061014 2061015 SSA_1487 SSA_1488     TRUE 0.965 18.000 0.417 NA   NA
 2061015 2061016 SSA_1488 SSA_1489     FALSE 0.129 121.000 0.000 NA   NA
 2061016 2061017 SSA_1489 SSA_1490     TRUE 0.542 33.000 0.000 NA   NA
 2061017 2061018 SSA_1490 SSA_1491   map TRUE 0.826 48.000 0.373 1.000   NA
 2061018 2061019 SSA_1491 SSA_1492 map   TRUE 0.909 22.000 0.235 1.000 N NA
 2061019 2061020 SSA_1492 SSA_1493     TRUE 0.992 -25.000 0.342 0.056 N NA
 2061020 2061021 SSA_1493 SSA_1494   murZ TRUE 0.705 34.000 0.052 1.000 N NA
 2061021 2061022 SSA_1494 SSA_1495 murZ metK FALSE 0.113 246.000 0.026 1.000 N NA
 2061022 2061023 SSA_1495 SSA_1496 metK   FALSE 0.065 264.000 0.000 NA   NA
 2061023 2061024 SSA_1496 SSA_1497   comEB FALSE 0.113 164.000 0.000 NA   NA
 2061024 2061025 SSA_1497 SSA_1498 comEB rplT FALSE 0.067 218.000 0.000 1.000 N NA
 2061025 2061026 SSA_1498 SSA_1499 rplT rpmI TRUE 0.994 45.000 0.928 0.020 Y NA
 2061026 2061027 SSA_1499 SSA_1500 rpmI infC TRUE 0.992 34.000 0.652 1.000 Y NA
 2061027 2061028 SSA_1500 SSA_1501 infC cmk FALSE 0.141 174.000 0.010 1.000 N NA
 2061028 2061029 SSA_1501 SSA_1502 cmk   TRUE 0.914 10.000 0.012 1.000   NA
 2061031 2061032 SSA_1504 SSA_1505     TRUE 0.573 80.000 0.167 NA   NA
 2061032 2061033 SSA_1505 SSA_1506   rgpFc TRUE 0.999 -3.000 0.385 NA Y NA
 2061033 2061034 SSA_1506 SSA_1507 rgpFc rgpD TRUE 0.984 17.000 0.000 NA Y NA
 2061034 2061035 SSA_1507 SSA_1508 rgpD rgpC TRUE 0.999 0.000 0.500 1.000 Y NA
 2061035 2061036 SSA_1508 SSA_1509 rgpC rgpB TRUE 0.978 6.000 0.289 1.000   NA
 2061036 2061037 SSA_1509 SSA_1510 rgpB rgpA TRUE 0.987 -3.000 0.289 1.000   NA
 2061037 2061038 SSA_1510 SSA_1511 rgpA   TRUE 0.817 114.000 0.000 0.012 Y NA
 2061038 2061039 SSA_1511 SSA_1512     TRUE 0.881 4.000 0.000 NA   NA
 2061039 2061040 SSA_1512 SSA_1513   rgpF TRUE 0.311 59.000 0.000 NA   NA
 2061040 2061041 SSA_1513 SSA_1514 rgpF   TRUE 0.632 25.000 0.000 NA   NA
 2061041 2061042 SSA_1514 SSA_1515     TRUE 0.970 -10.000 0.041 NA   NA
 2061042 2061043 SSA_1515 SSA_1516     TRUE 0.991 0.000 0.568 NA   NA
 2061043 2061044 SSA_1516 SSA_1517   cpsIaJ TRUE 0.866 9.000 0.000 NA   NA
 2061044 2061045 SSA_1517 SSA_1518 cpsIaJ rgpE TRUE 0.963 27.000 0.000 NA Y NA
 2061045 2061046 SSA_1518 SSA_1519 rgpE   TRUE 0.970 8.000 0.200 NA   NA
 2061046 2061047 SSA_1519 SSA_1520   tuf FALSE 0.055 316.000 0.000 1.000   NA
 2061047 2061048 SSA_1520 SSA_1521 tuf ppc FALSE 0.053 256.000 0.000 1.000 N NA
 2061048 2061049 SSA_1521 SSA_1522 ppc ftsW TRUE 0.524 47.000 0.028 1.000 N NA
 2061050 2061051 SSA_1523 SSA_1525 basA   FALSE 0.229 206.000 0.111 1.000 N NA
 2061051 2061052 SSA_1525 SSA_1526     TRUE 0.296 119.000 0.062 NA   NA
 2061052 2061053 SSA_1526 SSA_1527   ebsC TRUE 0.957 -7.000 0.012 NA   NA
 2061053 2061054 SSA_1527 SSA_1528 ebsC gpm TRUE 0.433 63.000 0.018 1.000   NA
 2061054 2061055 SSA_1528 SSA_1529 gpm lysS FALSE 0.196 101.000 0.004 1.000 N NA
 2061056 2061057 SSA_1530 SSA_1531   salX TRUE 0.999 0.000 0.923 1.000 Y NA
 2061057 2061058 SSA_1531 SSA_1532 salX acrA TRUE 0.995 -16.000 0.923 1.000 N NA
 2061064 2061065 SSA_1540 SSA_1541     TRUE 0.546 43.000 0.008 1.000   NA
 2061065 2061066 SSA_1541 SSA_1542     TRUE 0.876 225.000 0.156 0.002 Y NA
 2061068 2061069 SSA_1544 SSA_1545     TRUE 0.952 16.000 0.206 NA   NA
 2061069 2061070 SSA_1545 SSA_1546   lgt TRUE 0.590 57.000 0.079 NA   NA
 2061070 2061071 SSA_1546 SSA_1547 lgt ptsK TRUE 0.991 -7.000 0.494 1.000 N NA
 2061071 2061072 SSA_1547 SSA_1548 ptsK   FALSE 0.091 139.000 0.000 1.000 N NA
 2061072 2061073 SSA_1548 SSA_1549     FALSE 0.068 206.000 0.000 NA N NA
 2061073 2061074 SSA_1549 SSA_1550     TRUE 0.289 116.000 0.051 NA   NA
 2061074 2061075 SSA_1550 SSA_1551   tex TRUE 0.986 -13.000 0.215 NA   NA
 2061076 2061077 SSA_1552 SSA_1553     TRUE 0.975 -3.000 0.091 NA   NA
 2061077 2061078 SSA_1553 SSA_1554     TRUE 0.994 -3.000 0.841 NA   NA
 2061078 2061079 SSA_1554 SSA_1555   gdh FALSE 0.206 175.000 0.032 NA   NA
 2061080 2061081 SSA_1557 SSA_1558 ftsY   TRUE 0.921 4.000 0.005 1.000   NA
 2061081 2061082 SSA_1558 SSA_1559     TRUE 0.984 0.000 0.103 0.018   NA
 2061082 2061083 SSA_1559 SSA_1560   smc TRUE 0.932 2.000 0.006 1.000   NA
 2061083 2061084 SSA_1560 SSA_1561 smc rncS TRUE 0.977 -9.000 0.120 1.000 N NA
 2061084 2061085 SSA_1561 SSA_1562 rncS   FALSE 0.167 122.000 0.002 NA   NA
 2061085 2061086 SSA_1562 SSA_1563   vicX TRUE 0.296 92.000 0.011 NA   NA
 2061086 2061087 SSA_1563 SSA_1564 vicX   TRUE 0.936 10.000 0.038 1.000   NA
 2061087 2061088 SSA_1564 SSA_1565     TRUE 0.999 -7.000 0.597 0.050 Y NA
 2061089 2061090 SSA_1566 SSA_1567     TRUE 0.995 15.000 0.185 1.000 Y NA
 2061090 2061091 SSA_1567 SSA_1568     TRUE 0.998 13.000 0.400 0.047 Y NA
 2061091 2061092 SSA_1568 SSA_1569     TRUE 0.999 11.000 0.947 0.008 Y NA
 2061092 2061093 SSA_1569 SSA_1570     FALSE 0.150 109.000 0.000 NA   NA
 2061094 2061095 SSA_1571 SSA_1572 thrS   TRUE 0.949 -7.000 0.002 NA   NA
 2061095 2061096 SSA_1572 SSA_1573     FALSE 0.112 146.000 0.000 NA   NA
 2061096 2061097 SSA_1573 SSA_1574     FALSE 0.255 72.000 0.000 NA   NA
 2061097 2061098 SSA_1574 SSA_1575   cpoA TRUE 0.999 2.000 0.413 0.012 Y NA
 2061098 2061099 SSA_1575 SSA_1576 cpoA ccpA TRUE 0.404 67.000 0.033 1.000 N NA
 2061100 2061101 SSA_1577 SSA_1578 pepQ   FALSE 0.031 427.000 0.000 1.000 N NA
 2061101 2061102 SSA_1578 SSA_1579     TRUE 0.998 2.000 0.250 1.000 Y NA
 2061102 2061103 SSA_1579 SSA_1581   fatB TRUE 0.969 56.000 0.300 1.000 Y NA
 2061103 2061104 SSA_1581 SSA_1582 fatB   TRUE 0.979 -19.000 0.114 NA   NA
 2061105 2061106 SSA_1583 SSA_1584 ogt   TRUE 0.505 36.000 0.000 1.000   NA
 2061106 2061107 SSA_1584 SSA_1585     TRUE 0.929 -55.000 0.000 1.000   NA
 2061107 2061108 SSA_1585 SSA_1586     FALSE 0.124 126.000 0.000 NA   NA
 2061108 2061109 SSA_1586 SSA_1587     TRUE 0.857 56.000 0.667 NA   NA
 2061109 2061110 SSA_1587 SSA_1588     FALSE 0.196 96.000 0.000 1.000   NA
 2061110 2061111 SSA_1588 SSA_1589     TRUE 0.871 2.000 0.000 1.000 N NA
 2061113 2061114 SSA_1591 SSA_1592     FALSE 0.125 125.000 0.000 NA   NA
 2061114 2061115 SSA_1592 SSA_1593     TRUE 0.990 -7.000 0.400 NA   NA
 2061115 2061116 SSA_1593 SSA_1594     FALSE 0.067 403.000 0.000 0.027 N NA
 2061116 2061117 SSA_1594 SSA_1595   tehB FALSE 0.031 425.000 0.000 1.000 N NA
 2061117 2061118 SSA_1595 SSA_1596 tehB   FALSE 0.069 261.000 0.000 1.000   NA
 2061118 2061119 SSA_1596 SSA_1597     FALSE 0.076 233.000 0.000 NA   NA
 2061119 2061120 SSA_1597 SSA_1598     TRUE 0.311 59.000 0.000 NA   NA
 2061120 2061121 SSA_1598 SSA_1599     FALSE 0.093 204.000 0.000 NA   NA
 2061121 2061122 SSA_1599 SSA_1600     FALSE 0.233 81.000 0.000 NA   NA
 2061122 2061123 SSA_1600 SSA_1601   smpB TRUE 0.924 -3.000 0.000 NA   NA
 2061123 2061124 SSA_1601 SSA_1602 smpB vacB TRUE 0.986 -37.000 0.143 0.023 N NA
 2061124 2061125 SSA_1602 SSA_1603 vacB   TRUE 0.443 41.000 0.000 NA   NA
 2061125 2061126 SSA_1603 SSA_1604   secG FALSE 0.113 164.000 0.000 NA   NA
 2061126 2061127 SSA_1604 SSA_1605 secG pmrA FALSE 0.195 192.000 0.007 0.048 N NA
 2061127 2061128 SSA_1605 SSA_1606 pmrA coaE FALSE 0.224 97.000 0.007 1.000 N NA
 2061128 2061129 SSA_1606 SSA_1607 coaE mutM TRUE 0.943 6.000 0.066 1.000 N NA
 2061129 2061130 SSA_1607 SSA_1608 mutM   TRUE 0.962 28.000 0.000 1.000 Y NA
 2061130 2061131 SSA_1608 SSA_1610     FALSE 0.071 251.000 0.000 1.000   NA
 2061131 2061132 SSA_1610 SSA_1611   era FALSE 0.085 224.000 0.000 1.000   NA
 2061132 2061133 SSA_1611 SSA_1612 era dgk TRUE 0.514 67.000 0.063 1.000   NA
 2061133 2061134 SSA_1612 SSA_1613 dgk   TRUE 0.967 -19.000 0.035 NA   NA
 2061134 2061135 SSA_1613 SSA_2466     FALSE 0.043 380.000 0.000 NA   NA
 2061135 2061136 SSA_2466 SSA_1614     TRUE 0.379 49.000 0.000 NA   NA
 2061138 2061139 SSA_1616 SSA_1617 phoH   FALSE 0.161 178.000 0.010 NA   NA
 2061139 2061140 SSA_1617 SSA_1618     TRUE 0.376 69.000 0.013 NA   NA
 2061140 2061141 SSA_1618 SSA_1619   rrf FALSE 0.244 105.000 0.012 NA   NA
 2061141 2061142 SSA_1619 SSA_1620 rrf pyrH TRUE 0.963 20.000 0.626 1.000 N NA
 2061142 2061143 SSA_1620 SSA_1621 pyrH   FALSE 0.078 191.000 0.000 1.000 N NA
 2061143 2061144 SSA_1621 SSA_1622   rplA FALSE 0.096 129.000 0.000 1.000 N NA
 2061144 2061145 SSA_1622 SSA_1623 rplA rplK TRUE 0.976 102.000 0.838 0.026 Y NA
 2061147 2061148 SSA_1625 SSA_1626   ftsK FALSE 0.179 114.000 0.010 1.000 N NA
 2061148 2061149 SSA_1626 SSA_1627 ftsK   FALSE 0.148 131.000 0.010 NA N NA
 2061150 2061151 SSA_1628 SSA_1629   ppiA TRUE 0.583 55.000 0.087 1.000 N NA
 2061151 2061152 SSA_1629 SSA_1630 ppiA   TRUE 0.751 36.000 0.087 NA   NA
 2061153 2061154 SSA_1631 SSA_1632 srtC   FALSE 0.265 68.000 0.000 NA   NA
 2061154 2061155 SSA_1632 SSA_1633     TRUE 0.484 61.000 0.000 0.017   NA
 2061155 2061156 SSA_1633 SSA_1634     TRUE 0.515 57.000 0.000 0.017   NA
 2061156 2061157 SSA_1634 SSA_1635     TRUE 0.369 90.000 0.000 0.017   NA
 2061157 2061158 SSA_1635 SSA_1636     FALSE 0.117 143.000 0.000 1.000   NA
 2061158 2061159 SSA_1636 SSA_1638     FALSE 0.146 112.000 0.000 NA   NA
 2061159 2061160 SSA_1638 SSA_1639   pfs TRUE 0.818 14.000 0.000 NA   NA
 2061160 2061161 SSA_1639 SSA_1640 pfs   TRUE 0.431 77.000 0.041 NA   NA
 2061161 2061162 SSA_1640 SSA_1641     TRUE 0.904 13.000 0.025 NA   NA
 2061162 2061163 SSA_1641 SSA_1642   glmU TRUE 0.905 9.000 0.015 1.000 N NA
 2061163 2061164 SSA_1642 SSA_1643 glmU   FALSE 0.122 128.000 0.000 NA   NA
 2061164 2061165 SSA_1643 SSA_1644     FALSE 0.094 202.000 0.000 NA   NA
 2061165 2061166 SSA_1644 SSA_1645     TRUE 0.931 -16.000 0.000 NA   NA
 2061166 2061167 SSA_1645 SSA_1646     FALSE 0.193 95.000 0.000 NA   NA
 2061167 2061168 SSA_1646 SSA_1647     TRUE 0.531 51.000 0.022 NA   NA
 2061168 2061169 SSA_1647 SSA_1648     TRUE 0.979 -3.000 0.133 NA   NA
 2061169 2061170 SSA_1648 SSA_1649     TRUE 0.928 -3.000 0.000 1.000   NA
 2061170 2061171 SSA_1649 SSA_1650     TRUE 0.826 10.000 0.000 1.000 N NA
 2061171 2061172 SSA_1650 SSA_1651     TRUE 0.994 -7.000 0.710 NA   NA
 2061172 2061173 SSA_1651 SSA_1652     FALSE 0.168 102.000 0.000 NA   NA
 2061173 2061174 SSA_1652 SSA_1653     FALSE 0.235 80.000 0.000 NA   NA
 2061174 2061175 SSA_1653 SSA_1655     TRUE 0.723 20.000 0.000 NA   NA
 2061175 2061176 SSA_1655 SSA_1656     TRUE 0.291 64.000 0.000 1.000   NA
 2061176 2061177 SSA_1656 SSA_1657     FALSE 0.255 72.000 0.000 NA   NA
 2061177 2061178 SSA_1657 SSA_1658     TRUE 0.424 43.000 0.000 NA   NA
 2061178 2061179 SSA_1658 SSA_1659     TRUE 0.309 157.000 0.032 0.066   NA
 2061179 2061180 SSA_1659 SSA_1660     TRUE 0.994 0.000 0.855 1.000   NA
 2061180 2061181 SSA_1660 SSA_1661     FALSE 0.104 179.000 0.000 NA   NA
 2061181 2061182 SSA_1661 SSA_1662     FALSE 0.078 231.000 0.000 NA   NA
 2061182 2061183 SSA_1662 SSA_1663   cpbA FALSE 0.118 164.000 0.000 1.000   NA
 2061183 2061184 SSA_1663 SSA_1664 cpbA   FALSE 0.052 328.000 0.000 1.000   NA
 2061184 2061185 SSA_1664 SSA_1665     TRUE 0.542 33.000 0.000 NA   NA
 2061185 2061186 SSA_1665 SSA_1666     TRUE 0.680 22.000 0.000 NA   NA
 2061186 2061187 SSA_1666 SSA_1667     FALSE 0.090 207.000 0.000 NA   NA
 2061187 2061188 SSA_1667 SSA_1668     TRUE 0.521 34.000 0.000 NA   NA
 2061188 2061189 SSA_1668 SSA_1669     TRUE 0.881 4.000 0.000 NA   NA
 2061189 2061190 SSA_1669 SSA_1670     FALSE 0.097 195.000 0.000 NA   NA
 2061193 2061194 SSA_1673 SSA_1675     TRUE 0.660 23.000 0.000 NA   NA
 2061195 2061196 SSA_1676 SSA_1678   cylB TRUE 0.852 23.000 0.078 NA   NA
 2061196 2061197 SSA_1678 SSA_1679 cylB cylA TRUE 0.992 2.000 0.849 NA   NA
 2061197 2061198 SSA_1679 SSA_1680 cylA   FALSE 0.220 151.000 0.032 1.000   NA
 2061198 2061199 SSA_1680 SSA_1681     TRUE 0.995 -19.000 0.855 1.000   NA
 2061199 2061200 SSA_1681 SSA_1682     FALSE 0.112 170.000 0.000 NA   NA
 2061200 2061201 SSA_1682 SSA_1683     FALSE 0.112 149.000 0.000 NA   NA
 2061201 2061202 SSA_1683 SSA_1684     TRUE 0.634 21.000 0.000 NA N NA
 2061202 2061203 SSA_1684 SSA_1685     TRUE 0.999 -16.000 0.812 1.000 Y NA
 2061204 2061205 SSA_1686 SSA_1687     FALSE 0.113 157.000 0.000 NA   NA
 2061207 2061208 SSA_1690 SSA_1691     TRUE 0.827 13.000 0.000 NA   NA
 2061209 2061210 SSA_1692 SSA_1693 lacG lacE TRUE 0.915 99.000 0.200 1.000 Y NA
 2061210 2061211 SSA_1693 SSA_1694 lacE lacF TRUE 0.999 0.000 0.600 0.009 Y NA
 2061211 2061212 SSA_1694 SSA_1695 lacF   TRUE 0.856 49.000 0.500 1.000   NA
 2061212 2061213 SSA_1695 SSA_1696   lacD TRUE 0.384 197.000 0.250 1.000   NA
 2061213 2061214 SSA_1696 SSA_1697 lacD lacC TRUE 1.000 4.000 1.000 0.001 Y NA
 2061214 2061215 SSA_1697 SSA_1698 lacC lacB TRUE 0.988 13.000 0.000 1.000 Y NA
 2061215 2061216 SSA_1698 SSA_1699 lacB lacA TRUE 0.992 17.000 0.000 0.001 Y NA
 2061216 2061217 SSA_1699 SSA_1700 lacA   FALSE 0.238 79.000 0.000 NA   NA
 2061217 2061218 SSA_1700 SSA_1701   lacR TRUE 0.849 11.000 0.000 NA   NA