MicrobesOnline Operon Predictions for Vibrio fischeri MJ11

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7069448 7069449 VFMJ11_0001 VFMJ11_0002   trmE FALSE 0.171 62.000 0.023 1.000   NA
 7069449 7069450 VFMJ11_0002 VFMJ11_0003 trmE   TRUE 0.643 98.000 0.221 1.000   NA
 7069450 7069451 VFMJ11_0003 VFMJ11_0004   rnpA FALSE 0.038 227.000 0.105 1.000 N NA
 7069451 7069452 VFMJ11_0004 VFMJ11_0005 rnpA rpmH TRUE 0.960 46.000 0.787 1.000   NA
 7069452 7069453 VFMJ11_0005 VFMJ11_0006 rpmH   FALSE 0.010 186.000 0.006 1.000   NA
 7069453 7069454 VFMJ11_0006 VFMJ11_0007     TRUE 0.996 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 7069454 7069455 VFMJ11_0007 VFMJ11_0008     TRUE 0.951 154.000 0.704 0.054 Y NA
 7069456 7069457 VFMJ11_0009 VFMJ11_0010 dnaA dnaN TRUE 0.958 33.000 0.328 1.000 Y NA
 7069457 7069458 VFMJ11_0010 VFMJ11_0011 dnaN recF TRUE 0.979 14.000 0.318 1.000 Y NA
 7069458 7069459 VFMJ11_0011 VFMJ11_0012 recF gyrB TRUE 0.987 18.000 0.249 0.005 Y NA
 7069459 7069460 VFMJ11_0012 VFMJ11_0013 gyrB   FALSE 0.000 424.000 0.000 NA N NA
 7069462 7069463 VFMJ11_0015 VFMJ11_0016 glyQ glyS TRUE 0.999 3.000 0.651 0.001 Y NA
 7069463 7069464 VFMJ11_0016 VFMJ11_0017 glyS malS FALSE 0.006 146.000 0.003 1.000 N NA
 7069464 7069465 VFMJ11_0017 VFMJ11_0018 malS   FALSE 0.084 135.000 0.029 NA   NA
 7069467 7069468 VFMJ11_0020 VFMJ11_0021     TRUE 0.674 148.000 0.423 NA   NA
 7069469 7069470 VFMJ11_0022 VFMJ11_0023   fadA FALSE 0.000 760.000 0.032 1.000 N NA
 7069470 7069471 VFMJ11_0023 VFMJ11_0024 fadA fadB TRUE 0.991 14.000 0.607 1.000 Y NA
 7069472 7069473 VFMJ11_0025 VFMJ11_0026     TRUE 0.727 57.000 0.202 1.000   NA
 7069473 7069474 VFMJ11_0026 VFMJ11_0027   hemG TRUE 0.917 33.000 0.455 1.000 N NA
 7069474 7069475 VFMJ11_0027 VFMJ11_0028 hemG   FALSE 0.119 119.000 0.000 NA   NA
 7069475 7069476 VFMJ11_0028 VFMJ11_0029     FALSE 0.005 434.000 0.000 NA   NA
 7069476 7069477 VFMJ11_0029 VFMJ11_0030     FALSE 0.192 82.000 0.000 NA   NA
 7069477 7069478 VFMJ11_0030 VFMJ11_0031     FALSE 0.009 298.000 0.000 NA   NA
 7069478 7069479 VFMJ11_0031 VFMJ11_0032     FALSE 0.225 61.000 0.000 NA   NA
 7069479 7069480 VFMJ11_0032 VFMJ11_0033   thiC FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 7069480 7069481 VFMJ11_0033 VFMJ11_0034 thiC thiE_2 TRUE 0.879 71.000 0.063 0.004 Y NA
 7069481 7069482 VFMJ11_0034 VFMJ11_0035 thiE_2   TRUE 0.990 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 7069482 7069483 VFMJ11_0035 VFMJ11_0036   thiS TRUE 0.996 -7.000 0.548 1.000 Y NA
 7069483 7069484 VFMJ11_0036 VFMJ11_0037 thiS thiG TRUE 0.979 2.000 0.087 1.000 Y NA
 7069484 7069485 VFMJ11_0037 VFMJ11_0038 thiG thiH TRUE 0.993 11.000 0.277 0.004 Y NA
 7069486 7069487 VFMJ11_0039 VFMJ11_0040     FALSE 0.159 102.000 0.074 1.000 N NA
 7069488 7069489 VFMJ11_0041 VFMJ11_0042     TRUE 0.846 122.000 0.625 NA   NA
 7069491 7069492 VFMJ11_0044 VFMJ11_0045   ubiE FALSE 0.305 57.000 0.047 NA   NA
 7069492 7069493 VFMJ11_0045 VFMJ11_0046 ubiE   TRUE 0.878 12.000 0.145 1.000   NA
 7069493 7069494 VFMJ11_0046 VFMJ11_0047   ubiB TRUE 0.991 -3.000 0.432 1.000   NA
 7069494 7069495 VFMJ11_0047 VFMJ11_0048 ubiB tatA FALSE 0.113 52.000 0.010 1.000   NA
 7069495 7069496 VFMJ11_0048 VFMJ11_0049 tatA   TRUE 0.986 4.000 0.043 0.008 Y NA
 7069496 7069497 VFMJ11_0049 VFMJ11_0050   tatC TRUE 0.994 3.000 0.333 NA Y NA
 7069500 7069501 VFMJ11_0053 VFMJ11_0054     TRUE 0.898 34.000 0.406 1.000 N NA
 7069502 7069503 VFMJ11_0055 VFMJ11_0056 trxA rho FALSE 0.044 240.000 0.087 1.000   NA
 7069503 7069504 VFMJ11_0056 VFMJ11_0057 rho   FALSE 0.013 159.000 0.002 1.000   NA
 7069504 7069505 VFMJ11_0057 VFMJ11_0058     FALSE 0.026 142.000 0.006 1.000   NA
 7069505 7069506 VFMJ11_0058 VFMJ11_0059     FALSE 0.005 179.000 0.000 1.000 N NA
 7069506 7069507 VFMJ11_0059 VFMJ11_0060   fre TRUE 0.749 98.000 0.000 0.044 Y NA
 7069508 7069509 VFMJ11_0061 VFMJ11_0062     TRUE 0.998 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 7069509 7069510 VFMJ11_0062 VFMJ11_0063   hemD TRUE 0.997 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 7069510 7069511 VFMJ11_0063 VFMJ11_0064 hemD hemC TRUE 0.997 3.000 0.205 0.002 Y NA
 7069512 7069513 VFMJ11_0065 VFMJ11_0066 cyaA uvrD FALSE 0.015 85.000 0.022 1.000 N NA
 7069515 7069516 VFMJ11_0068 VFMJ11_0069 recQ   TRUE 0.838 4.000 0.054 NA   NA
 7069518 7069519 VFMJ11_0071 VFMJ11_0072     FALSE 0.004 701.000 0.000 NA   NA
 7069521 7069522 VFMJ11_0074 VFMJ11_0075     FALSE 0.131 155.000 0.069 NA   NA
 7069522 7069523 VFMJ11_0075 VFMJ11_0076     TRUE 0.988 0.000 0.333 NA   NA
 7069523 7069524 VFMJ11_0076 VFMJ11_0077     TRUE 0.995 3.000 0.679 NA   NA
 7069524 7069525 VFMJ11_0077 VFMJ11_0078   hemN TRUE 0.634 109.000 0.244 NA   NA
 7069529 7069530 VFMJ11_0082 VFMJ11_0083     TRUE 0.630 107.000 0.235 NA   NA
 7069530 7069531 VFMJ11_0083 VFMJ11_0084     FALSE 0.230 49.000 0.028 NA   NA
 7069531 7069532 VFMJ11_0084 VFMJ11_0085     FALSE 0.121 117.000 0.000 NA   NA
 7069533 7069534 VFMJ11_0086 VFMJ11_0087     TRUE 0.992 12.000 1.000 NA   NA
 7069538 7069539 VFMJ11_0091 VFMJ11_0092 add   FALSE 0.237 165.000 0.189 1.000 N NA
 7069539 7069540 VFMJ11_0092 VFMJ11_0093   ntrC FALSE 0.510 117.000 0.046 1.000 Y NA
 7069540 7069541 VFMJ11_0093 VFMJ11_0094 ntrC glnL TRUE 0.975 39.000 0.587 1.000 Y NA
 7069541 7069542 VFMJ11_0094 VFMJ11_0095 glnL   FALSE 0.063 92.000 0.009 NA   NA
 7069542 7069543 VFMJ11_0095 VFMJ11_0096   glnA FALSE 0.015 250.000 0.000 NA   NA
 7069544 7069545 VFMJ11_0097 VFMJ11_0098 typA rbn FALSE 0.036 115.000 0.006 1.000   NA
 7069545 7069546 VFMJ11_0098 VFMJ11_0099 rbn dtd TRUE 0.799 -28.000 0.069 1.000   NA
 7069546 7069547 VFMJ11_0099 VFMJ11_0100 dtd   FALSE 0.070 183.000 0.065 1.000   NA
 7069548 7069549 VFMJ11_0101 VFMJ11_0102     FALSE 0.025 255.000 0.095 1.000 N NA
 7069549 7069550 VFMJ11_0102 VFMJ11_0103   rpoZ TRUE 0.925 52.000 0.291 1.000 Y NA
 7069550 7069551 VFMJ11_0103 VFMJ11_0104 rpoZ gmk TRUE 0.775 109.000 0.471 1.000 N NA
 7069552 7069553 VFMJ11_0105 VFMJ11_0106 psiE   FALSE 0.036 197.000 0.042 NA   NA
 7069553 7069554 VFMJ11_0106 VFMJ11_0107     FALSE 0.018 231.000 0.000 NA   NA
 7069556 7069557 VFMJ11_0109 VFMJ11_0110 rph pyrE FALSE 0.111 165.000 0.108 1.000 N NA
 7069559 7069560 VFMJ11_0112 VFMJ11_0113 ompR envZ FALSE 0.301 455.000 0.584 1.000 Y NA
 7069561 7069562 VFMJ11_0114 VFMJ11_0115     FALSE 0.004 581.000 0.000 1.000   NA
 7069563 7069564 VFMJ11_0116 VFMJ11_0117 bioH   FALSE 0.508 27.000 0.053 NA   NA
 7069565 7069566 VFMJ11_0118 VFMJ11_0119   greB FALSE 0.307 194.000 0.123 1.000 Y NA
 7069566 7069567 VFMJ11_0119 VFMJ11_0120 greB   FALSE 0.057 19.000 0.010 1.000 N NA
 7069567 7069568 VFMJ11_0120 VFMJ11_0121   slmA FALSE 0.047 25.000 0.016 1.000 N NA
 7069568 7069569 VFMJ11_0121 VFMJ11_0122 slmA coaBC FALSE 0.001 263.000 0.016 1.000 N NA
 7069570 7069571 VFMJ11_0123 VFMJ11_0124 radC rpmB FALSE 0.002 196.000 0.006 1.000 N NA
 7069571 7069572 VFMJ11_0124 VFMJ11_0125 rpmB rpmG TRUE 0.991 15.000 0.332 0.014 Y NA
 7069572 7069573 VFMJ11_0125 VFMJ11_0126 rpmG   FALSE 0.001 547.000 0.004 NA   NA
 7069576 7069577 VFMJ11_0129 VFMJ11_0130   coaD FALSE 0.526 -3.000 0.007 NA   NA
 7069577 7069578 VFMJ11_0130 VFMJ11_0131 coaD   FALSE 0.187 -7.000 0.002 1.000 N NA
 7069578 7069579 VFMJ11_0131 VFMJ11_0132     TRUE 0.955 -3.000 0.011 NA Y NA
 7069579 7069580 VFMJ11_0132 VFMJ11_0133     TRUE 0.871 21.000 0.058 NA Y NA
 7069582 7069583 VFMJ11_0135 VFMJ11_0136     TRUE 0.693 -16.000 0.000 NA   NA
 7069584 7069585 VFMJ11_0137 VFMJ11_0138     TRUE 0.845 -9.000 0.061 NA   NA
 7069585 7069586 VFMJ11_0138 VFMJ11_0139     TRUE 0.818 6.000 0.061 NA   NA
 7069586 7069587 VFMJ11_0139 VFMJ11_0140     TRUE 0.972 -31.000 0.350 NA   NA
 7069587 7069588 VFMJ11_0140 VFMJ11_0141     FALSE 0.313 37.000 0.000 NA   NA
 7069589 7069590 VFMJ11_0142 VFMJ11_0143 rfaF   TRUE 0.963 0.000 0.008 0.005   NA
 7069590 7069591 VFMJ11_0143 VFMJ11_0144     TRUE 0.873 18.000 0.000 0.005   NA
 7069591 7069592 VFMJ11_0144 VFMJ11_0145   rfaD FALSE 0.060 163.000 0.000 1.000   NA
 7069593 7069594 VFMJ11_0146 VFMJ11_0147     FALSE 0.347 176.000 0.250 NA   NA
 7069594 7069595 VFMJ11_0147 VFMJ11_0148     FALSE 0.018 235.000 0.000 NA   NA
 7069596 7069597 VFMJ11_0149 VFMJ11_0150     TRUE 0.985 4.000 0.380 NA   NA
 7069597 7069598 VFMJ11_0150 VFMJ11_0151     TRUE 0.904 43.000 0.429 NA   NA
 7069598 7069599 VFMJ11_0151 VFMJ11_0152     FALSE 0.112 124.000 0.000 NA   NA
 7069600 7069601 VFMJ11_0153 VFMJ11_0154     FALSE 0.261 162.000 0.154 NA   NA
 7069601 7069602 VFMJ11_0154 VFMJ11_0155     FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 7069602 7069603 VFMJ11_0155 VFMJ11_0156     FALSE 0.520 208.000 0.700 1.000 N NA
 7069603 7069604 VFMJ11_0156 VFMJ11_0157   rfbB TRUE 0.729 84.000 0.100 1.000 Y NA
 7069604 7069605 VFMJ11_0157 VFMJ11_0158 rfbB rfbA TRUE 0.999 0.000 0.444 0.003 Y NA
 7069605 7069606 VFMJ11_0158 VFMJ11_0159 rfbA rfbD TRUE 0.999 0.000 0.667 0.003 Y NA
 7069606 7069607 VFMJ11_0159 VFMJ11_0160 rfbD rfbC TRUE 0.997 5.000 0.667 1.000 Y NA
 7069607 7069608 VFMJ11_0160 VFMJ11_0161 rfbC   TRUE 0.949 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 7069608 7069609 VFMJ11_0161 VFMJ11_0162     TRUE 0.710 -13.000 0.000 NA   NA
 7069609 7069610 VFMJ11_0162 VFMJ11_0163     FALSE 0.036 185.000 0.000 NA   NA
 7069610 7069611 VFMJ11_0163 VFMJ11_0164     TRUE 0.777 -7.000 0.000 1.000   NA
 7069611 7069612 VFMJ11_0164 VFMJ11_0165     TRUE 0.821 1.000 0.000 1.000   NA
 7069612 7069613 VFMJ11_0165 VFMJ11_0166     TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 7069613 7069614 VFMJ11_0166 VFMJ11_0167     TRUE 0.662 -25.000 0.000 NA   NA
 7069614 7069615 VFMJ11_0167 VFMJ11_0168     TRUE 0.771 -7.000 0.000 NA   NA
 7069617 7069618 VFMJ11_0170 VFMJ11_0171 wecA pseB FALSE 0.005 463.000 0.000 1.000   NA
 7069618 7069619 VFMJ11_0171 VFMJ11_0172 pseB pseC TRUE 0.981 16.000 0.678 1.000   NA
 7069619 7069620 VFMJ11_0172 VFMJ11_0173 pseC pseF TRUE 0.994 0.000 0.296 1.000 Y NA
 7069620 7069621 VFMJ11_0173 VFMJ11_0174 pseF   TRUE 0.995 0.000 0.355 1.000 Y NA
 7069621 7069622 VFMJ11_0174 VFMJ11_0175   pseI TRUE 0.985 8.000 0.236 1.000 Y NA
 7069622 7069623 VFMJ11_0175 VFMJ11_0176 pseI   TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 7069623 7069624 VFMJ11_0176 VFMJ11_0177     TRUE 0.738 -10.000 0.000 NA   NA
 7069624 7069625 VFMJ11_0177 VFMJ11_0178     TRUE 0.828 84.000 0.000 0.005 Y NA
 7069625 7069626 VFMJ11_0178 VFMJ11_0179     TRUE 0.677 -19.000 0.000 NA   NA
 7069626 7069627 VFMJ11_0179 VFMJ11_0180     FALSE 0.328 35.000 0.000 NA   NA
 7069627 7069628 VFMJ11_0180 VFMJ11_0181     FALSE 0.183 85.000 0.000 NA   NA
 7069628 7069629 VFMJ11_0181 VFMJ11_0182     FALSE 0.037 185.000 0.000 1.000   NA
 7069629 7069630 VFMJ11_0182 VFMJ11_0183     FALSE 0.031 69.000 0.000 1.000 N NA
 7069630 7069631 VFMJ11_0183 VFMJ11_0184     FALSE 0.158 199.000 0.000 1.000 Y NA
 7069631 7069632 VFMJ11_0184 VFMJ11_0185     FALSE 0.099 240.000 0.000 1.000 Y NA
 7069632 7069633 VFMJ11_0185 VFMJ11_0186     TRUE 0.956 30.000 0.133 0.017 Y NA
 7069633 7069634 VFMJ11_0186 VFMJ11_0187     TRUE 0.966 2.000 0.000 1.000 Y NA
 7069634 7069635 VFMJ11_0187 VFMJ11_0188     TRUE 0.994 -3.000 0.297 NA Y NA
 7069635 7069636 VFMJ11_0188 VFMJ11_0189     TRUE 0.887 15.000 0.046 NA Y NA
 7069636 7069637 VFMJ11_0189 VFMJ11_0190     FALSE 0.345 177.000 0.100 1.000 Y NA
 7069637 7069638 VFMJ11_0190 VFMJ11_0191     FALSE 0.006 422.000 0.000 1.000   NA
 7069638 7069639 VFMJ11_0191 VFMJ11_0192   galE_2 FALSE 0.195 146.000 0.083 1.000   NA
 7069640 7069641 VFMJ11_0193 VFMJ11_0194 gpmI   FALSE 0.000 500.000 0.000 1.000 N NA
 7069642 7069643 VFMJ11_0195 VFMJ11_0196 groES groEL TRUE 0.964 78.000 0.631 1.000 Y NA
 7069646 7069647 VFMJ11_0199 VFMJ11_0200   glpX FALSE 0.005 427.000 0.000 NA   NA
 7069649 7069650 VFMJ11_0202 VFMJ11_0203 rraA menA TRUE 0.685 125.000 0.158 NA Y NA
 7069650 7069651 VFMJ11_0203 VFMJ11_0204 menA   FALSE 0.016 83.000 0.007 1.000 N NA
 7069651 7069652 VFMJ11_0204 VFMJ11_0205     TRUE 0.717 103.000 0.303 NA   NA
 7069652 7069653 VFMJ11_0205 VFMJ11_0206     TRUE 0.784 46.000 0.222 NA   NA
 7069653 7069654 VFMJ11_0206 VFMJ11_0207     TRUE 0.807 6.000 0.056 NA   NA
 7069654 7069655 VFMJ11_0207 VFMJ11_0208     TRUE 0.975 -16.000 0.333 NA   NA
 7069656 7069657 VFMJ11_0209 VFMJ11_0210     TRUE 0.998 0.000 0.927 1.000   NA
 7069657 7069658 VFMJ11_0210 VFMJ11_0211     TRUE 0.912 36.000 0.400 NA   NA
 7069658 7069659 VFMJ11_0211 VFMJ11_0212     TRUE 0.862 57.000 0.370 NA   NA
 7069660 7069661 VFMJ11_0213 VFMJ11_0214     TRUE 0.766 0.000 0.024 NA   NA
 7069662 7069663 VFMJ11_0215 VFMJ11_0216     FALSE 0.280 171.000 0.190 NA   NA
 7069663 7069664 VFMJ11_0216 VFMJ11_0217   tusD TRUE 0.976 -3.000 0.220 NA   NA
 7069664 7069665 VFMJ11_0217 VFMJ11_0218 tusD tusC TRUE 0.987 35.000 0.790 NA Y NA
 7069665 7069666 VFMJ11_0218 VFMJ11_0219 tusC dsrH TRUE 0.998 4.000 0.804 NA Y NA
 7069666 7069667 VFMJ11_0219 VFMJ11_0220 dsrH rpsL FALSE 0.038 164.000 0.058 NA N NA
 7069667 7069668 VFMJ11_0220 VFMJ11_0221 rpsL rpsG TRUE 0.981 95.000 0.620 0.003 Y NA
 7069668 7069669 VFMJ11_0221 VFMJ11_0222 rpsG fusA_2 TRUE 0.911 132.000 0.579 1.000 Y NA
 7069669 7069670 VFMJ11_0222 VFMJ11_0223 fusA_2 tuf_2 TRUE 0.962 109.000 0.400 0.002 Y NA
 7069670 7069671 VFMJ11_0223 VFMJ11_0224 tuf_2 rpsJ FALSE 0.185 413.000 0.318 1.000 Y NA
 7069671 7069672 VFMJ11_0224 VFMJ11_0225 rpsJ rplC TRUE 0.990 13.000 0.307 0.020 Y NA
 7069672 7069673 VFMJ11_0225 VFMJ11_0226 rplC rplD TRUE 0.993 18.000 0.486 0.014 Y NA
 7069673 7069674 VFMJ11_0226 VFMJ11_0227 rplD rplW TRUE 0.997 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 7069674 7069675 VFMJ11_0227 VFMJ11_0228 rplW rplB TRUE 0.994 16.000 0.849 1.000 Y NA
 7069675 7069676 VFMJ11_0228 VFMJ11_0229 rplB rpsS TRUE 0.997 20.000 0.820 0.020 Y NA
 7069676 7069677 VFMJ11_0229 VFMJ11_0230 rpsS rplV TRUE 0.998 11.000 0.769 0.020 Y NA
 7069677 7069678 VFMJ11_0230 VFMJ11_0231 rplV rpsC TRUE 0.996 20.000 0.719 0.020 Y NA
 7069678 7069679 VFMJ11_0231 VFMJ11_0232 rpsC rplP TRUE 0.998 12.000 0.828 0.020 Y NA
 7069679 7069680 VFMJ11_0232 VFMJ11_0233 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.014 Y NA
 7069680 7069681 VFMJ11_0233 VFMJ11_0234 rpmC rpsQ TRUE 0.997 21.000 0.828 0.014 Y NA
 7069681 7069682 VFMJ11_0234 VFMJ11_0235 rpsQ rplN TRUE 0.951 165.000 0.791 0.020 Y NA
 7069682 7069683 VFMJ11_0235 VFMJ11_0236 rplN rplX TRUE 0.997 14.000 0.810 0.020 Y NA
 7069683 7069684 VFMJ11_0236 VFMJ11_0237 rplX rplE TRUE 0.997 15.000 0.758 0.014 Y NA
 7069684 7069685 VFMJ11_0237 VFMJ11_0238 rplE rpsN TRUE 0.994 18.000 0.496 0.014 Y NA
 7069685 7069686 VFMJ11_0238 VFMJ11_0239 rpsN rpsH TRUE 0.989 30.000 0.473 0.014 Y NA
 7069686 7069687 VFMJ11_0239 VFMJ11_0240 rpsH rplF TRUE 0.998 13.000 0.808 0.014 Y NA
 7069687 7069688 VFMJ11_0240 VFMJ11_0241 rplF rplR TRUE 0.999 10.000 0.815 0.014 Y NA
 7069688 7069689 VFMJ11_0241 VFMJ11_0242 rplR rpsE TRUE 0.997 15.000 0.814 0.020 Y NA
 7069689 7069690 VFMJ11_0242 VFMJ11_0243 rpsE rpmD TRUE 0.999 6.000 0.789 0.020 Y NA
 7069690 7069691 VFMJ11_0243 VFMJ11_0244 rpmD rplO TRUE 0.999 6.000 0.653 0.003 Y NA
 7069691 7069692 VFMJ11_0244 VFMJ11_0245 rplO secY TRUE 0.974 21.000 0.730 1.000 N NA
 7069692 7069693 VFMJ11_0245 VFMJ11_0246 secY rpmJ TRUE 0.621 31.000 0.089 1.000   NA
 7069693 7069694 VFMJ11_0246 VFMJ11_0247 rpmJ rpsM TRUE 0.647 150.000 0.194 0.014   NA
 7069694 7069695 VFMJ11_0247 VFMJ11_0248 rpsM rpsK TRUE 0.997 22.000 0.810 0.014 Y NA
 7069695 7069696 VFMJ11_0248 VFMJ11_0249 rpsK rpsD TRUE 0.989 32.000 0.509 0.020 Y NA
 7069696 7069697 VFMJ11_0249 VFMJ11_0250 rpsD rpoA TRUE 0.953 24.000 0.549 1.000 N NA
 7069697 7069698 VFMJ11_0250 VFMJ11_0251 rpoA rplQ TRUE 0.966 37.000 0.873 1.000 N NA
 7069700 7069701 VFMJ11_0253 VFMJ11_0254 mpl   TRUE 0.971 2.000 0.235 1.000 N NA
 7069701 7069702 VFMJ11_0254 VFMJ11_0255   tbpA FALSE 0.135 215.000 0.000 1.000 Y NA
 7069702 7069703 VFMJ11_0255 VFMJ11_0256 tbpA thiP TRUE 0.969 43.000 0.697 0.070 N NA
 7069703 7069704 VFMJ11_0256 VFMJ11_0257 thiP thiQ TRUE 0.996 0.000 0.522 0.018 N NA
 7069704 7069705 VFMJ11_0257 VFMJ11_0258 thiQ   FALSE 0.004 194.000 0.000 1.000 N NA
 7069705 7069706 VFMJ11_0258 VFMJ11_0259     TRUE 0.753 63.000 0.294 1.000 N NA
 7069707 7069708 VFMJ11_0260 VFMJ11_0261     TRUE 0.658 52.000 0.154 NA   NA
 7069708 7069709 VFMJ11_0261 VFMJ11_0262     FALSE 0.021 297.000 0.073 NA   NA
 7069709 7069710 VFMJ11_0262 VFMJ11_0263   argR FALSE 0.008 332.000 0.000 NA   NA
 7069713 7069714 VFMJ11_0266 VFMJ11_0267 rplU rpmA TRUE 0.996 18.000 0.667 0.014 Y NA
 7069714 7069715 VFMJ11_0267 VFMJ11_0268 rpmA obgE FALSE 0.236 237.000 0.335 1.000   NA
 7069717 7069718 VFMJ11_0269 VFMJ11_0271     TRUE 0.995 -7.000 0.704 NA   NA
 7069718 7069719 VFMJ11_0271 VFMJ11_0272   folA TRUE 0.625 35.000 0.104 NA   NA
 7069720 7069721 VFMJ11_0273 VFMJ11_0274 apaH ksgA FALSE 0.018 73.000 0.025 1.000 N NA
 7069721 7069722 VFMJ11_0274 VFMJ11_0275 ksgA pdxA TRUE 0.960 -3.000 0.197 1.000 N NA
 7069722 7069723 VFMJ11_0275 VFMJ11_0276 pdxA   TRUE 0.989 -7.000 0.561 1.000 N NA
 7069723 7069724 VFMJ11_0276 VFMJ11_0277     TRUE 0.570 68.000 0.182 1.000 N NA
 7069726 7069727 VFMJ11_0279 VFMJ11_0280   leuD FALSE 0.468 127.000 0.186 NA   NA
 7069727 7069728 VFMJ11_0280 VFMJ11_0281 leuD leuC TRUE 0.993 13.000 0.309 0.001 Y NA
 7069728 7069729 VFMJ11_0281 VFMJ11_0282 leuC leuB TRUE 0.990 16.000 0.275 0.002 Y NA
 7069729 7069730 VFMJ11_0282 VFMJ11_0283 leuB leuA TRUE 0.918 82.000 0.126 0.002 Y NA
 7069731 7069732 VFMJ11_0284 VFMJ11_0285     TRUE 0.964 -13.000 0.302 NA N NA
 7069732 7069733 VFMJ11_0285 VFMJ11_0286     TRUE 0.989 -3.000 0.465 NA N NA
 7069735 7069736 VFMJ11_0288 VFMJ11_0289 dnaB alr TRUE 0.905 22.000 0.317 1.000 N NA
 7069736 7069737 VFMJ11_0289 VFMJ11_0290 alr   TRUE 0.924 12.000 0.208 1.000   NA
 7069737 7069738 VFMJ11_0290 VFMJ11_0291   pgi FALSE 0.024 215.000 0.000 1.000   NA
 7069739 7069740 VFMJ11_0292 VFMJ11_0293     TRUE 0.589 28.000 0.112 NA N NA
 7069741 7069742 VFMJ11_0294 VFMJ11_0295     FALSE 0.031 119.000 0.006 NA   NA
 7069742 7069743 VFMJ11_0295 VFMJ11_0296     FALSE 0.286 161.000 0.169 NA   NA
 7069743 7069744 VFMJ11_0296 VFMJ11_0297     FALSE 0.275 136.000 0.109 NA   NA
 7069744 7069745 VFMJ11_0297 VFMJ11_0298   cysI TRUE 1.000 0.000 0.791 0.001 Y NA
 7069745 7069746 VFMJ11_0298 VFMJ11_0299 cysI cysH TRUE 0.891 -7.000 0.116 1.000 N NA
 7069747 7069748 VFMJ11_0300 VFMJ11_0301     FALSE 0.395 124.000 0.141 NA   NA
 7069750 7069751 VFMJ11_0303 VFMJ11_0304     FALSE 0.457 20.000 0.033 NA   NA
 7069751 7069752 VFMJ11_0304 VFMJ11_0305     FALSE 0.353 66.000 0.066 NA   NA
 7069752 7069753 VFMJ11_0305 VFMJ11_0306   cpdB FALSE 0.214 117.000 0.104 NA N NA
 7069754 7069755 VFMJ11_0307 VFMJ11_0308   cysN TRUE 0.982 30.000 0.574 0.001 N NA
 7069755 7069756 VFMJ11_0308 VFMJ11_0309 cysN   TRUE 0.970 12.000 0.200 1.000 Y NA
 7069756 7069757 VFMJ11_0309 VFMJ11_0310   cysC TRUE 0.975 15.000 0.291 1.000 Y NA
 7069758 7069759 VFMJ11_0311 VFMJ11_0312     FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 7069759 7069760 VFMJ11_0312 VFMJ11_0313     TRUE 0.935 12.000 0.238 NA   NA
 7069760 7069761 VFMJ11_0313 VFMJ11_0314     TRUE 0.998 -3.000 0.605 NA Y NA
 7069761 7069762 VFMJ11_0314 VFMJ11_0315     TRUE 0.889 37.000 0.336 NA   NA
 7069762 7069763 VFMJ11_0315 VFMJ11_0316     FALSE 0.006 406.000 0.000 NA   NA
 7069766 7069767 VFMJ11_0319 VFMJ11_0320     TRUE 0.981 12.000 0.575 NA   NA
 7069767 7069768 VFMJ11_0320 VFMJ11_0321     FALSE 0.003 2149.000 0.000 NA   NA
 7069768 7069769 VFMJ11_0321 VFMJ11_2711     FALSE 0.012 275.000 0.000 NA   NA
 7069769 7069770 VFMJ11_2711 VFMJ11_0322     FALSE 0.003 1629.000 0.000 NA   NA
 7069770 7069771 VFMJ11_0322 VFMJ11_0323     FALSE 0.313 37.000 0.000 NA   NA
 7069771 7069772 VFMJ11_0323 VFMJ11_2712     FALSE 0.003 3262.000 0.000 NA   NA
 7069772 7069773 VFMJ11_2712 VFMJ11_0325     FALSE 0.274 44.000 0.000 NA   NA
 7069775 7069776 VFMJ11_0326 VFMJ11_0328   metH FALSE 0.045 175.000 0.000 NA   NA
 7069779 7069780 VFMJ11_0331 VFMJ11_0332   uvrA FALSE 0.013 97.000 0.013 NA N NA
 7069780 7069781 VFMJ11_0332 VFMJ11_0333 uvrA galU FALSE 0.003 172.000 0.002 1.000 N NA
 7069781 7069782 VFMJ11_0333 VFMJ11_0334 galU   FALSE 0.077 181.000 0.069 NA   NA
 7069782 7069783 VFMJ11_0334 VFMJ11_0335     TRUE 0.964 -13.000 0.241 NA   NA
 7069783 7069784 VFMJ11_0335 VFMJ11_0336     TRUE 0.998 5.000 0.459 0.017 Y NA
 7069784 7069785 VFMJ11_0336 VFMJ11_0337     TRUE 0.989 -3.000 0.189 NA Y NA
 7069785 7069786 VFMJ11_0337 VFMJ11_0338     TRUE 0.988 -7.000 0.438 NA   NA
 7069786 7069787 VFMJ11_0338 VFMJ11_0339     TRUE 0.993 3.000 0.600 NA   NA
 7069787 7069788 VFMJ11_0339 VFMJ11_0340     TRUE 0.943 5.000 0.161 NA   NA
 7069788 7069789 VFMJ11_0340 VFMJ11_0341     TRUE 0.986 4.000 0.194 1.000 Y NA
 7069789 7069790 VFMJ11_0341 VFMJ11_0342     TRUE 0.970 1.000 0.184 NA   NA
 7069790 7069791 VFMJ11_0342 VFMJ11_0343     TRUE 0.930 -16.000 0.158 NA   NA
 7069794 7069795 VFMJ11_0346 VFMJ11_0347     FALSE 0.157 57.000 0.020 NA   NA
 7069795 7069796 VFMJ11_0347 VFMJ11_0348     TRUE 0.767 -7.000 0.033 NA   NA
 7069796 7069797 VFMJ11_0348 VFMJ11_0349     TRUE 0.987 2.000 0.344 NA   NA
 7069797 7069798 VFMJ11_0349 VFMJ11_0350     TRUE 0.963 12.000 0.356 NA   NA
 7069798 7069799 VFMJ11_0350 VFMJ11_0351     TRUE 0.995 13.000 0.846 1.000 Y NA
 7069799 7069800 VFMJ11_0351 VFMJ11_0352     TRUE 0.987 -3.000 0.338 1.000   NA
 7069800 7069801 VFMJ11_0352 VFMJ11_0353     TRUE 0.987 0.000 0.328 1.000   NA
 7069801 7069802 VFMJ11_0353 VFMJ11_0354     TRUE 0.996 10.000 0.740 1.000 Y NA
 7069802 7069803 VFMJ11_0354 VFMJ11_0355     TRUE 0.816 3.000 0.039 NA   NA
 7069803 7069804 VFMJ11_0355 VFMJ11_0356     TRUE 0.689 87.000 0.231 NA   NA
 7069804 7069805 VFMJ11_0356 VFMJ11_0357     TRUE 0.660 165.000 0.538 NA   NA
 7069805 7069806 VFMJ11_0357 VFMJ11_0358     TRUE 0.582 127.000 0.250 NA   NA
 7069806 7069807 VFMJ11_0358 VFMJ11_0359     TRUE 0.807 -3.000 0.033 NA   NA
 7069807 7069808 VFMJ11_0359 VFMJ11_0360     TRUE 0.997 0.000 0.871 NA   NA
 7069808 7069809 VFMJ11_0360 VFMJ11_0361     TRUE 0.788 32.000 0.177 NA   NA
 7069809 7069810 VFMJ11_0361 VFMJ11_0362     TRUE 0.970 0.000 0.182 NA   NA
 7069810 7069811 VFMJ11_0362 VFMJ11_0363     FALSE 0.028 123.000 0.005 NA   NA
 7069811 7069812 VFMJ11_0363 VFMJ11_0364   mreC TRUE 0.882 99.000 0.689 1.000 N NA
 7069812 7069813 VFMJ11_0364 VFMJ11_0365 mreC mreD TRUE 0.998 -10.000 0.550 0.003 Y NA
 7069813 7069814 VFMJ11_0365 VFMJ11_0366 mreD maf_1 TRUE 0.908 11.000 0.206 NA N NA
 7069814 7069815 VFMJ11_0366 VFMJ11_0367 maf_1   TRUE 0.938 20.000 0.417 NA N NA
 7069815 7069816 VFMJ11_0367 VFMJ11_0368     TRUE 0.951 12.000 0.296 NA   NA
 7069816 7069817 VFMJ11_0368 VFMJ11_0369     TRUE 0.953 15.000 0.358 NA   NA
 7069817 7069818 VFMJ11_0369 VFMJ11_0370   tldD TRUE 0.699 94.000 0.259 NA   NA
 7069821 7069822 VFMJ11_0373 VFMJ11_0374 mgtE   FALSE 0.214 151.000 0.140 1.000 N NA
 7069822 7069823 VFMJ11_0374 VFMJ11_0375     TRUE 0.862 19.000 0.182 NA   NA
 7069823 7069824 VFMJ11_0375 VFMJ11_0376     TRUE 0.788 34.000 0.186 NA   NA
 7069824 7069825 VFMJ11_0376 VFMJ11_0377   raiA_1 TRUE 0.995 2.000 0.728 NA N NA
 7069825 7069826 VFMJ11_0377 VFMJ11_0378 raiA_1 rpoN TRUE 0.979 20.000 0.820 NA N NA
 7069826 7069827 VFMJ11_0378 VFMJ11_0379 rpoN   TRUE 0.820 24.000 0.163 1.000   NA
 7069827 7069828 VFMJ11_0379 VFMJ11_0380   lptA TRUE 0.992 3.000 0.543 NA   NA
 7069828 7069829 VFMJ11_0380 VFMJ11_0381 lptA   TRUE 0.983 -19.000 0.459 NA   NA
 7069829 7069830 VFMJ11_0381 VFMJ11_0382     TRUE 0.994 -3.000 0.617 NA   NA
 7069830 7069831 VFMJ11_0382 VFMJ11_0383     TRUE 0.994 0.000 0.598 1.000   NA
 7069831 7069832 VFMJ11_0383 VFMJ11_0384     FALSE 0.209 186.000 0.226 1.000 N NA
 7069833 7069834 VFMJ11_0385 VFMJ11_0386     TRUE 0.996 -7.000 0.530 NA Y NA
 7069834 7069835 VFMJ11_0386 VFMJ11_0387     TRUE 0.991 4.000 0.562 NA   NA
 7069835 7069836 VFMJ11_0387 VFMJ11_0388     TRUE 0.972 0.000 0.188 NA   NA
 7069836 7069837 VFMJ11_0388 VFMJ11_0389     TRUE 0.986 0.000 0.308 NA   NA
 7069837 7069838 VFMJ11_0389 VFMJ11_0390     TRUE 0.992 0.000 0.453 NA   NA
 7069838 7069839 VFMJ11_0390 VFMJ11_0391   murA TRUE 0.922 12.000 0.258 NA N NA
 7069839 7069840 VFMJ11_0391 VFMJ11_0392 murA   FALSE 0.008 148.000 0.033 1.000 N NA
 7069840 7069841 VFMJ11_0392 VFMJ11_0393   idi TRUE 0.588 72.000 0.013 1.000 Y NA
 7069842 7069843 VFMJ11_0394 VFMJ11_0395   pyrI FALSE 0.073 139.000 0.063 NA N NA
 7069843 7069844 VFMJ11_0395 VFMJ11_0396 pyrI pyrB TRUE 0.988 14.000 0.197 0.001 Y NA
 7069844 7069845 VFMJ11_0396 VFMJ11_0397 pyrB argF FALSE 0.054 246.000 0.004 0.004 N NA
 7069845 7069846 VFMJ11_0397 VFMJ11_0398 argF arcA TRUE 0.916 113.000 0.500 1.000 Y NA
 7069847 7069848 VFMJ11_0399 VFMJ11_0400     TRUE 0.599 71.000 0.151 NA   NA
 7069849 7069850 VFMJ11_0401 VFMJ11_0402 valS   FALSE 0.194 111.000 0.089 1.000 N NA
 7069850 7069851 VFMJ11_0402 VFMJ11_0403   pepA TRUE 0.849 80.000 0.494 1.000 N NA
 7069852 7069853 VFMJ11_0404 VFMJ11_0405     TRUE 0.996 -7.000 0.631 0.077   NA
 7069856 7069857 VFMJ11_0408 VFMJ11_0409     FALSE 0.365 34.000 0.038 NA   NA
 7069857 7069858 VFMJ11_0409 VFMJ11_0410     FALSE 0.131 111.000 0.000 NA   NA
 7069858 7069859 VFMJ11_0410 VFMJ11_0411     TRUE 0.702 7.000 0.000 NA   NA
 7069859 7069860 VFMJ11_0411 VFMJ11_0412     TRUE 0.690 8.000 0.000 NA   NA
 7069860 7069861 VFMJ11_0412 VFMJ11_0413     FALSE 0.209 74.000 0.000 NA   NA
 7069861 7069862 VFMJ11_0413 VFMJ11_0414     FALSE 0.337 34.000 0.000 NA   NA
 7069862 7069863 VFMJ11_0414 VFMJ11_0415     FALSE 0.282 42.000 0.000 NA   NA
 7069863 7069864 VFMJ11_0415 VFMJ11_0416     TRUE 0.702 7.000 0.000 NA   NA
 7069864 7069865 VFMJ11_0416 VFMJ11_0417     TRUE 0.690 8.000 0.000 NA   NA
 7069865 7069866 VFMJ11_0417 VFMJ11_0418     FALSE 0.206 76.000 0.000 NA   NA
 7069866 7069867 VFMJ11_0418 VFMJ11_0419     FALSE 0.133 110.000 0.000 NA   NA
 7069867 7069868 VFMJ11_0419 VFMJ11_0420     FALSE 0.099 109.000 0.060 NA N NA
 7069868 7069869 VFMJ11_0420 VFMJ11_0421   mutY TRUE 0.933 3.000 0.150 NA N NA
 7069870 7069871 VFMJ11_0422 VFMJ11_0423 trmB   FALSE 0.154 84.000 0.026 1.000   NA
 7069872 7069873 VFMJ11_0424 VFMJ11_0425   rdgB TRUE 0.957 4.000 0.218 1.000 N NA
 7069873 7069874 VFMJ11_0425 VFMJ11_0426 rdgB   TRUE 0.702 11.000 0.050 NA   NA
 7069874 7069875 VFMJ11_0426 VFMJ11_0427     FALSE 0.384 71.000 0.076 NA   NA
 7069875 7069876 VFMJ11_0427 VFMJ11_0428     TRUE 0.848 8.000 0.081 NA   NA
 7069876 7069877 VFMJ11_0428 VFMJ11_0429   proC TRUE 0.584 49.000 0.117 NA   NA
 7069877 7069878 VFMJ11_0429 VFMJ11_0430 proC   FALSE 0.506 83.000 0.125 NA   NA
 7069879 7069880 VFMJ11_0431 VFMJ11_0432     TRUE 0.998 3.000 0.436 0.049 Y NA
 7069881 7069882 VFMJ11_0433 VFMJ11_0434     TRUE 0.974 -3.000 0.263 NA N NA
 7069882 7069883 VFMJ11_0434 VFMJ11_0435   gshB FALSE 0.272 113.000 0.120 NA N NA
 7069883 7069884 VFMJ11_0435 VFMJ11_0436 gshB   TRUE 0.879 14.000 0.173 NA   NA
 7069884 7069885 VFMJ11_0436 VFMJ11_0437     TRUE 0.692 74.000 0.201 NA   NA
 7069885 7069886 VFMJ11_0437 VFMJ11_0438     TRUE 0.648 92.000 0.210 NA   NA
 7069886 7069887 VFMJ11_0438 VFMJ11_0439   metK FALSE 0.050 165.000 0.030 NA   NA
 7069888 7069889 VFMJ11_0440 VFMJ11_0441 tkt_1 epd FALSE 0.335 146.000 0.016 1.000 Y NA
 7069889 7069890 VFMJ11_0441 VFMJ11_0442 epd pgk TRUE 0.601 167.000 0.070 0.005 Y NA
 7069890 7069891 VFMJ11_0442 VFMJ11_0443 pgk fbaA TRUE 0.642 156.000 0.056 0.005 Y NA
 7069892 7069893 VFMJ11_0444 VFMJ11_0445     TRUE 0.898 89.000 0.333 0.016   NA
 7069896 7069897 VFMJ11_0448 VFMJ11_0449 xerD   FALSE 0.248 75.000 0.079 1.000 N NA
 7069897 7069898 VFMJ11_0449 VFMJ11_0450   recJ FALSE 0.267 71.000 0.082 1.000 N NA
 7069898 7069899 VFMJ11_0450 VFMJ11_0451 recJ   FALSE 0.000 622.000 0.028 1.000 N NA
 7069899 7069900 VFMJ11_0451 VFMJ11_0452   lysS TRUE 0.977 14.000 0.162 0.049 Y NA
 7069900 7069901 VFMJ11_0452 VFMJ11_0453 lysS   FALSE 0.001 388.000 0.000 1.000 N NA
 7069903 7069904 VFMJ11_0455 VFMJ11_0456   ptsP_1 FALSE 0.029 39.000 0.005 1.000 N NA
 7069904 7069905 VFMJ11_0456 VFMJ11_0457 ptsP_1   TRUE 0.857 6.000 0.077 1.000   NA
 7069905 7069906 VFMJ11_0457 VFMJ11_0458   lgt TRUE 0.583 13.000 0.038 1.000   NA
 7069906 7069907 VFMJ11_0458 VFMJ11_0459 lgt thyA FALSE 0.484 84.000 0.164 1.000 N NA
 7069909 7069910 VFMJ11_0461 VFMJ11_0462 nhaR   TRUE 0.934 64.000 0.210 0.066 Y NA
 7069912 7069913 VFMJ11_0464 VFMJ11_0465 mviN ribF TRUE 0.567 91.000 0.169 1.000   NA
 7069913 7069914 VFMJ11_0465 VFMJ11_0466 ribF ileS TRUE 0.800 37.000 0.254 1.000 N NA
 7069914 7069915 VFMJ11_0466 VFMJ11_0467 ileS lspA TRUE 0.943 0.000 0.147 1.000 N NA
 7069915 7069916 VFMJ11_0467 VFMJ11_0468 lspA   TRUE 0.828 72.000 0.417 1.000 N NA
 7069916 7069917 VFMJ11_0468 VFMJ11_0469   ispH TRUE 0.960 25.000 0.626 1.000 N NA
 7069917 7069918 VFMJ11_0469 VFMJ11_0470 ispH dapB FALSE 0.018 73.000 0.009 1.000 N NA
 7069918 7069919 VFMJ11_0470 VFMJ11_0471 dapB   FALSE 0.009 298.000 0.000 NA   NA
 7069919 7069920 VFMJ11_0471 VFMJ11_0472   carA FALSE 0.039 181.000 0.000 NA   NA
 7069920 7069921 VFMJ11_0472 VFMJ11_0473 carA carB TRUE 0.993 18.000 0.345 0.001 Y NA
 7069922 7069923 VFMJ11_0474 VFMJ11_0475 dacB   FALSE 0.370 143.000 0.025 1.000 Y NA
 7069926 7069927 VFMJ11_0478 VFMJ11_0479 rrmJ ftsH FALSE 0.448 86.000 0.152 NA N NA
 7069927 7069928 VFMJ11_0479 VFMJ11_0480 ftsH folP TRUE 0.773 69.000 0.325 1.000 N NA
 7069928 7069929 VFMJ11_0480 VFMJ11_0481 folP glmM TRUE 0.760 49.000 0.260 1.000 N NA
 7069929 7069930 VFMJ11_0481 VFMJ11_0482 glmM secG FALSE 0.005 152.000 0.016 1.000 N NA
 7069930 7069931 VFMJ11_0482 VFMJ11_0483 secG   TRUE 0.645 10.000 0.000 NA   NA
 7069931 7069932 VFMJ11_0483 VFMJ11_0484     FALSE 0.214 70.000 0.000 NA   NA
 7069932 7069933 VFMJ11_0484 VFMJ11_0485     FALSE 0.055 165.000 0.000 NA   NA
 7069933 7069934 VFMJ11_0485 VFMJ11_0486   nusA TRUE 0.983 18.000 0.759 NA   NA
 7069934 7069935 VFMJ11_0486 VFMJ11_0487 nusA infB TRUE 0.907 25.000 0.342 1.000 N NA
 7069935 7069936 VFMJ11_0487 VFMJ11_0488 infB rbfA TRUE 0.921 113.000 0.530 1.000 Y NA
 7069936 7069937 VFMJ11_0488 VFMJ11_0489 rbfA truB TRUE 0.995 0.000 0.318 1.000 Y NA
 7069937 7069938 VFMJ11_0489 VFMJ11_0490 truB rpsO TRUE 0.613 163.000 0.211 1.000 Y NA
 7069938 7069939 VFMJ11_0490 VFMJ11_0491 rpsO pnp FALSE 0.250 339.000 0.335 1.000 Y NA
 7069939 7069940 VFMJ11_0491 VFMJ11_0492 pnp   FALSE 0.223 121.000 0.071 1.000   NA
 7069941 7069942 VFMJ11_0493 VFMJ11_0494     TRUE 0.999 10.000 0.948 0.003 Y NA
 7069942 7069943 VFMJ11_0494 VFMJ11_0495     FALSE 0.047 218.000 0.112 1.000 N NA
 7069944 7069945 VFMJ11_0496 VFMJ11_0497     TRUE 0.976 -10.000 0.295 1.000   NA
 7069947 7069948 VFMJ11_0499 VFMJ11_0500   rimI TRUE 0.922 -10.000 0.121 1.000   NA
 7069948 7069949 VFMJ11_0500 VFMJ11_0501 rimI prfC FALSE 0.129 97.000 0.026 1.000   NA
 7069949 7069950 VFMJ11_0501 VFMJ11_0502 prfC   FALSE 0.027 142.000 0.008 NA   NA
 7069950 7069951 VFMJ11_0502 VFMJ11_0503     FALSE 0.437 0.000 0.003 NA   NA
 7069951 7069952 VFMJ11_0503 VFMJ11_0504     FALSE 0.003 199.000 0.000 NA N NA
 7069952 7069953 VFMJ11_0504 VFMJ11_0505     FALSE 0.010 286.000 0.000 NA   NA
 7069953 7069954 VFMJ11_0505 VFMJ11_0506   deoC FALSE 0.011 277.000 0.000 NA   NA
 7069954 7069955 VFMJ11_0506 VFMJ11_0507 deoC deoA TRUE 0.830 116.000 0.286 1.000 Y NA
 7069955 7069956 VFMJ11_0507 VFMJ11_0508 deoA deoB TRUE 0.963 11.000 0.398 1.000 N NA
 7069956 7069957 VFMJ11_0508 VFMJ11_0509 deoB deoD TRUE 0.827 71.000 0.414 1.000 N NA
 7069959 7069960 VFMJ11_0511 VFMJ11_0512 serB   FALSE 0.013 261.000 0.000 NA   NA
 7069960 7069961 VFMJ11_0512 VFMJ11_0513     FALSE 0.138 108.000 0.000 NA   NA
 7069961 7069962 VFMJ11_0513 VFMJ11_0514   cpaB_1 TRUE 0.690 8.000 0.000 NA   NA
 7069962 7069963 VFMJ11_0514 VFMJ11_0515 cpaB_1   TRUE 0.954 4.000 0.000 NA Y NA
 7069963 7069964 VFMJ11_0515 VFMJ11_0516     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 7069964 7069965 VFMJ11_0516 VFMJ11_0517     TRUE 0.944 50.000 0.667 NA   NA
 7069965 7069966 VFMJ11_0517 VFMJ11_0518     FALSE 0.173 7.000 0.000 NA N NA
 7069966 7069967 VFMJ11_0518 VFMJ11_0519     TRUE 0.962 3.000 0.000 NA Y NA
 7069967 7069968 VFMJ11_0519 VFMJ11_0520     TRUE 0.999 0.000 1.000 NA Y NA
 7069968 7069969 VFMJ11_0520 VFMJ11_0521     TRUE 0.997 -7.000 0.667 NA Y NA
 7069969 7069970 VFMJ11_0521 VFMJ11_0522     TRUE 0.673 9.000 0.000 NA   NA
 7069970 7069971 VFMJ11_0522 VFMJ11_0523     TRUE 0.662 -25.000 0.000 NA   NA
 7069971 7069972 VFMJ11_0523 VFMJ11_0524     TRUE 0.995 3.000 0.667 NA   NA
 7069972 7069973 VFMJ11_0524 VFMJ11_0525     FALSE 0.501 16.000 0.000 NA   NA
 7069974 7069975 VFMJ11_0526 VFMJ11_0527     TRUE 0.730 133.000 0.041 0.003 Y NA
 7069975 7069976 VFMJ11_0527 VFMJ11_0528     TRUE 0.999 3.000 0.940 1.000 Y NA
 7069976 7069977 VFMJ11_0528 VFMJ11_0529     FALSE 0.125 114.000 0.000 NA   NA
 7069978 7069979 VFMJ11_0530 VFMJ11_0531 radA fusA_1 FALSE 0.002 196.000 0.002 1.000 N NA
 7069980 7069981 VFMJ11_0532 VFMJ11_0533     FALSE 0.061 106.000 0.012 NA   NA
 7069981 7069982 VFMJ11_0533 VFMJ11_0534   codB TRUE 0.977 12.000 0.250 1.000 Y NA
 7069982 7069983 VFMJ11_0534 VFMJ11_0535 codB   FALSE 0.001 441.000 0.000 1.000 N NA
 7069983 7069984 VFMJ11_0535 VFMJ11_0536   mutS FALSE 0.003 209.000 0.000 1.000 N NA
 7069985 7069986 VFMJ11_0537 VFMJ11_0538   recA FALSE 0.201 141.000 0.082 NA   NA
 7069986 7069987 VFMJ11_0538 VFMJ11_0539 recA alaS FALSE 0.010 243.000 0.054 1.000 N NA
 7069987 7069988 VFMJ11_0539 VFMJ11_0540 alaS   FALSE 0.507 13.000 0.065 1.000 N NA
 7069988 7069989 VFMJ11_0540 VFMJ11_0541   csrA FALSE 0.229 82.000 0.079 1.000 N NA
 7069989 7069990 VFMJ11_0541 VFMJ11_0542 csrA   FALSE 0.022 216.000 0.000 NA   NA
 7069990 7069991 VFMJ11_0542 VFMJ11_0543     FALSE 0.246 54.000 0.000 NA   NA
 7069991 7069992 VFMJ11_0543 VFMJ11_0544     FALSE 0.216 68.000 0.000 NA   NA
 7069992 7069993 VFMJ11_0544 VFMJ11_0545     FALSE 0.216 68.000 0.000 NA   NA
 7069993 7069994 VFMJ11_0545 VFMJ11_0546     FALSE 0.216 68.000 0.000 NA   NA
 7069994 7069995 VFMJ11_0546 VFMJ11_0547     FALSE 0.295 40.000 0.000 NA   NA
 7069995 7069996 VFMJ11_0547 VFMJ11_0548     FALSE 0.257 51.000 0.000 NA   NA
 7069996 7069997 VFMJ11_0548 VFMJ11_0549     FALSE 0.219 65.000 0.000 NA   NA
 7069997 7069998 VFMJ11_0549 VFMJ11_0550     FALSE 0.008 325.000 0.000 NA   NA
 7069998 7069999 VFMJ11_0550 VFMJ11_0551   oadA TRUE 0.996 37.000 0.810 0.001 Y NA
 7069999 7070000 VFMJ11_0551 VFMJ11_0552 oadA   TRUE 0.998 16.000 0.976 0.001 Y NA
 7070000 7070001 VFMJ11_0552 VFMJ11_0553     FALSE 0.083 97.000 0.016 NA   NA
 7070001 7070002 VFMJ11_0553 VFMJ11_0554     TRUE 0.599 10.000 0.027 NA   NA
 7070002 7070003 VFMJ11_0554 VFMJ11_0555   gshA_1 FALSE 0.050 132.000 0.048 1.000 N NA
 7070003 7070004 VFMJ11_0555 VFMJ11_0556 gshA_1   FALSE 0.482 67.000 0.103 NA   NA
 7070004 7070005 VFMJ11_0556 VFMJ11_0557   luxS FALSE 0.389 32.000 0.039 NA   NA
 7070006 7070007 VFMJ11_0558 VFMJ11_0559     TRUE 0.670 134.000 0.349 NA   NA
 7070008 7070009 VFMJ11_0560 VFMJ11_0561 ffh rpsP FALSE 0.170 258.000 0.361 1.000 N NA
 7070009 7070010 VFMJ11_0561 VFMJ11_0562 rpsP rimM TRUE 0.985 28.000 0.342 0.014 Y NA
 7070010 7070011 VFMJ11_0562 VFMJ11_0563 rimM trmD TRUE 0.989 23.000 0.672 1.000 Y NA
 7070011 7070012 VFMJ11_0563 VFMJ11_0564 trmD rplS TRUE 0.972 42.000 0.567 1.000 Y NA
 7070012 7070013 VFMJ11_0564 VFMJ11_0565 rplS   FALSE 0.003 216.000 0.000 1.000 N NA
 7070013 7070014 VFMJ11_0565 VFMJ11_0566   tyrA TRUE 0.928 7.000 0.015 1.000 Y NA
 7070015 7070016 VFMJ11_0567 VFMJ11_0568     TRUE 0.670 25.000 0.088 NA   NA
 7070016 7070017 VFMJ11_0568 VFMJ11_0569     FALSE 0.117 117.000 0.033 NA   NA
 7070018 7070019 VFMJ11_0570 VFMJ11_0571   trpR FALSE 0.445 96.000 0.167 1.000 N NA
 7070020 7070021 VFMJ11_0572 VFMJ11_0573     FALSE 0.439 23.000 0.034 NA   NA
 7070021 7070022 VFMJ11_0573 VFMJ11_0574   raiA_2 FALSE 0.010 116.000 0.015 NA N NA
 7070022 7070023 VFMJ11_0574 VFMJ11_0575 raiA_2   FALSE 0.001 440.000 0.004 NA   NA
 7070024 7070025 VFMJ11_0576 VFMJ11_0577 rluD   TRUE 0.960 3.000 0.168 NA   NA
 7070025 7070026 VFMJ11_0577 VFMJ11_0578   clpB FALSE 0.368 106.000 0.108 NA   NA
 7070026 7070027 VFMJ11_0578 VFMJ11_2713 clpB   FALSE 0.003 5381.000 0.000 NA   NA
 7070027 7070028 VFMJ11_2713 VFMJ11_0580     FALSE 0.216 68.000 0.000 NA   NA
 7070028 7070029 VFMJ11_0580 VFMJ11_0581     FALSE 0.313 37.000 0.000 NA   NA
 7070031 7070032 VFMJ11_0583 VFMJ11_0584     TRUE 0.990 -19.000 0.652 NA   NA
 7070032 7070033 VFMJ11_0584 VFMJ11_0585     TRUE 0.997 -3.000 0.824 NA   NA
 7070033 7070034 VFMJ11_0585 VFMJ11_0586     TRUE 0.985 -10.000 0.410 NA   NA
 7070037 7070038 VFMJ11_0589 VFMJ11_0590   dapD FALSE 0.167 113.000 0.044 1.000   NA
 7070038 7070039 VFMJ11_0590 VFMJ11_0591 dapD   FALSE 0.021 218.000 0.000 NA   NA
 7070042 7070043 VFMJ11_0594 VFMJ11_0595   recC FALSE 0.016 82.000 0.011 1.000 N NA
 7070043 7070044 VFMJ11_0595 VFMJ11_0596 recC recB TRUE 0.707 300.000 0.542 0.001 Y NA
 7070044 7070045 VFMJ11_0596 VFMJ11_0597 recB recD TRUE 0.999 -7.000 0.688 0.001 Y NA
 7070045 7070046 VFMJ11_0597 VFMJ11_0598 recD   FALSE 0.003 211.000 0.000 1.000 N NA
 7070048 7070049 VFMJ11_0600 VFMJ11_0601   mltA TRUE 0.760 191.000 1.000 NA   NA
 7070049 7070050 VFMJ11_0601 VFMJ11_0602 mltA   FALSE 0.015 84.000 0.005 1.000 N NA
 7070051 7070052 VFMJ11_0603 VFMJ11_0604 csdE csdA FALSE 0.477 187.000 0.164 0.001   NA
 7070053 7070054 VFMJ11_0605 VFMJ11_0606     TRUE 0.894 -7.000 0.081 NA   NA
 7070054 7070055 VFMJ11_0606 VFMJ11_0607     TRUE 0.915 9.000 0.144 NA   NA
 7070056 7070057 VFMJ11_0608 VFMJ11_0609 xni   TRUE 0.570 94.000 0.178 NA   NA
 7070057 7070058 VFMJ11_0609 VFMJ11_0610     FALSE 0.167 152.000 0.082 NA   NA
 7070058 7070059 VFMJ11_0610 VFMJ11_0611     TRUE 0.549 176.000 0.450 1.000   NA
 7070059 7070060 VFMJ11_0611 VFMJ11_0612   queF FALSE 0.384 99.000 0.104 1.000   NA
 7070061 7070062 VFMJ11_0613 VFMJ11_0614     TRUE 0.859 82.000 0.443 NA   NA
 7070063 7070064 VFMJ11_0615 VFMJ11_0616     TRUE 0.787 0.000 0.027 NA   NA
 7070065 7070066 VFMJ11_0617 VFMJ11_0618     TRUE 0.983 33.000 0.333 0.009 Y NA
 7070066 7070067 VFMJ11_0618 VFMJ11_0619     TRUE 0.980 40.000 0.667 1.000 Y NA
 7070067 7070068 VFMJ11_0619 VFMJ11_0620     TRUE 0.881 27.000 0.095 NA Y NA
 7070068 7070069 VFMJ11_0620 VFMJ11_0621     TRUE 0.939 12.000 0.095 NA Y NA
 7070069 7070070 VFMJ11_0621 VFMJ11_0622     TRUE 0.912 70.000 0.667 1.000 N NA
 7070070 7070071 VFMJ11_0622 VFMJ11_0623     FALSE 0.002 260.000 0.000 1.000 N NA
 7070072 7070073 VFMJ11_0624 VFMJ11_0625     TRUE 0.986 4.000 0.402 NA   NA
 7070074 7070075 VFMJ11_0626 VFMJ11_0627     TRUE 0.993 2.000 0.518 NA   NA
 7070077 7070078 VFMJ11_0629 VFMJ11_0630     FALSE 0.202 147.000 0.126 NA N NA
 7070078 7070079 VFMJ11_0630 VFMJ11_0631   iscS TRUE 0.978 -13.000 0.424 NA N NA
 7070079 7070080 VFMJ11_0631 VFMJ11_0632 iscS iscU TRUE 0.908 35.000 0.448 1.000 N NA
 7070080 7070081 VFMJ11_0632 VFMJ11_0633 iscU iscA TRUE 0.883 125.000 0.359 0.002   NA
 7070081 7070082 VFMJ11_0633 VFMJ11_0634 iscA hscB TRUE 0.969 16.000 0.500 1.000   NA
 7070082 7070083 VFMJ11_0634 VFMJ11_0635 hscB hscA TRUE 0.978 39.000 0.634 1.000 Y NA
 7070083 7070084 VFMJ11_0635 VFMJ11_0636 hscA fdx TRUE 0.995 3.000 0.794 1.000 N NA
 7070084 7070085 VFMJ11_0636 VFMJ11_0637 fdx iscX TRUE 0.843 124.000 0.625 1.000   NA
 7070085 7070086 VFMJ11_0637 VFMJ11_0638 iscX   FALSE 0.108 230.000 0.171 1.000   NA
 7070086 7070087 VFMJ11_0638 VFMJ11_0639   ndk FALSE 0.001 284.000 0.017 1.000 N NA
 7070087 7070088 VFMJ11_0639 VFMJ11_0640 ndk   FALSE 0.085 241.000 0.156 1.000   NA
 7070088 7070089 VFMJ11_0640 VFMJ11_0641   pilF FALSE 0.534 31.000 0.067 1.000   NA
 7070089 7070090 VFMJ11_0641 VFMJ11_0642 pilF   TRUE 0.922 -19.000 0.153 1.000   NA
 7070090 7070091 VFMJ11_0642 VFMJ11_0643   ispG TRUE 0.925 13.000 0.233 1.000   NA
 7070091 7070092 VFMJ11_0643 VFMJ11_0644 ispG hisS TRUE 0.733 39.000 0.207 1.000 N NA
 7070092 7070093 VFMJ11_0644 VFMJ11_0645 hisS   TRUE 0.942 12.000 0.259 1.000   NA
 7070093 7070094 VFMJ11_0645 VFMJ11_0646   yfgL TRUE 0.979 11.000 0.492 1.000   NA
 7070094 7070095 VFMJ11_0646 VFMJ11_0647 yfgL engA FALSE 0.253 182.000 0.203 1.000   NA
 7070095 7070096 VFMJ11_0647 VFMJ11_0648 engA   FALSE 0.111 80.000 0.016 NA   NA
 7070096 7070097 VFMJ11_0648 VFMJ11_0649     FALSE 0.008 318.000 0.000 NA   NA
 7070099 7070100 VFMJ11_0651 VFMJ11_0652 guaB guaA TRUE 0.605 220.000 0.190 0.001 Y NA
 7070100 7070101 VFMJ11_0652 VFMJ11_0653 guaA   FALSE 0.001 276.000 0.000 NA N NA
 7070102 7070103 VFMJ11_0654 VFMJ11_0655     TRUE 0.682 60.000 0.186 NA   NA
 7070103 7070104 VFMJ11_0655 VFMJ11_0656     TRUE 0.832 26.000 0.186 NA   NA
 7070106 7070107 VFMJ11_0658 VFMJ11_0659 fghA   FALSE 0.129 218.000 0.179 1.000   NA
 7070108 7070109 VFMJ11_0660 VFMJ11_0661     TRUE 0.771 61.000 0.250 NA   NA
 7070110 7070111 VFMJ11_0662 VFMJ11_0663     FALSE 0.217 179.000 0.000 1.000 Y NA
 7070112 7070113 VFMJ11_0664 VFMJ11_0665     FALSE 0.233 1.000 0.008 1.000 N NA
 7070114 7070115 VFMJ11_0666 VFMJ11_0667     FALSE 0.087 144.000 0.000 NA   NA
 7070116 7070117 VFMJ11_0668 VFMJ11_0669   purL FALSE 0.092 107.000 0.021 NA   NA
 7070117 7070118 VFMJ11_0669 VFMJ11_0670 purL   FALSE 0.002 241.000 0.000 1.000 N NA
 7070118 7070119 VFMJ11_0670 VFMJ11_0671     FALSE 0.108 70.000 0.014 NA   NA
 7070119 7070120 VFMJ11_0671 VFMJ11_0672     FALSE 0.017 236.000 0.000 NA   NA
 7070123 7070124 VFMJ11_0675 VFMJ11_0676     TRUE 0.892 -13.000 0.102 1.000   NA
 7070124 7070125 VFMJ11_0676 VFMJ11_0677     TRUE 0.911 0.000 0.109 1.000 N NA
 7070127 7070128 VFMJ11_0679 VFMJ11_0680     TRUE 0.991 0.000 0.421 NA   NA
 7070128 7070129 VFMJ11_0680 VFMJ11_0681     FALSE 0.160 127.000 0.053 NA   NA
 7070132 7070133 VFMJ11_0684 VFMJ11_0685     TRUE 0.989 -3.000 0.003 0.001 Y NA
 7070133 7070134 VFMJ11_0685 VFMJ11_0686     FALSE 0.056 60.000 0.037 1.000 N NA
 7070134 7070135 VFMJ11_0686 VFMJ11_0687     FALSE 0.053 56.000 0.037 NA N NA
 7070136 7070137 VFMJ11_0688 VFMJ11_0689 ureG   TRUE 0.998 10.000 0.550 0.002 Y NA
 7070137 7070138 VFMJ11_0689 VFMJ11_0690     TRUE 0.997 12.000 0.560 0.002 Y NA
 7070138 7070139 VFMJ11_0690 VFMJ11_0691   ureC TRUE 0.925 63.000 0.315 0.001 N NA
 7070139 7070140 VFMJ11_0691 VFMJ11_0692 ureC ureB TRUE 0.999 0.000 0.486 0.001 Y NA
 7070140 7070141 VFMJ11_0692 VFMJ11_0693 ureB ureA TRUE 0.998 11.000 0.595 0.001 Y NA
 7070141 7070142 VFMJ11_0693 VFMJ11_0694 ureA ureD TRUE 0.990 17.000 0.664 0.002 N NA
 7070142 7070143 VFMJ11_0694 VFMJ11_0695 ureD   FALSE 0.001 370.000 0.000 1.000 N NA
 7070143 7070144 VFMJ11_0695 VFMJ11_0697     TRUE 0.963 2.000 0.000 0.018   NA
 7070146 7070147 VFMJ11_0698 VFMJ11_0699     TRUE 0.997 19.000 1.000 0.050 Y NA
 7070147 7070148 VFMJ11_0699 VFMJ11_0700     TRUE 0.999 -9.000 1.000 0.050 Y NA
 7070148 7070149 VFMJ11_0700 VFMJ11_0701   proS FALSE 0.001 378.000 0.000 1.000 N NA
 7070149 7070150 VFMJ11_0701 VFMJ11_0702 proS   FALSE 0.108 149.000 0.048 NA   NA
 7070150 7070151 VFMJ11_0702 VFMJ11_0703   metQ FALSE 0.094 80.000 0.013 NA   NA
 7070151 7070152 VFMJ11_0703 VFMJ11_0704 metQ   TRUE 0.947 39.000 0.321 NA Y NA
 7070152 7070153 VFMJ11_0704 VFMJ11_0705   metN TRUE 0.996 -10.000 0.584 1.000 Y NA
 7070154 7070155 VFMJ11_0706 VFMJ11_0707     FALSE 0.022 217.000 0.000 NA   NA
 7070155 7070156 VFMJ11_0707 VFMJ11_0708     FALSE 0.010 294.000 0.000 NA   NA
 7070156 7070157 VFMJ11_0708 VFMJ11_0709     TRUE 0.998 3.000 0.742 0.050   NA
 7070157 7070158 VFMJ11_0709 VFMJ11_0710     TRUE 0.825 34.000 0.097 0.050   NA
 7070158 7070159 VFMJ11_0710 VFMJ11_0711     TRUE 0.717 88.000 0.100 1.000 Y NA
 7070159 7070160 VFMJ11_0711 VFMJ11_0712     TRUE 0.997 -3.000 0.200 0.002 Y NA
 7070160 7070161 VFMJ11_0712 VFMJ11_0713     FALSE 0.203 78.000 0.000 NA   NA
 7070163 7070164 VFMJ11_0715 VFMJ11_0716 glyA   FALSE 0.009 303.000 0.000 NA   NA
 7070165 7070166 VFMJ11_0717 VFMJ11_0718     TRUE 0.651 85.000 0.200 NA   NA
 7070167 7070168 VFMJ11_0719 VFMJ11_0720 nrdR ribD TRUE 0.849 29.000 0.277 NA N NA
 7070168 7070169 VFMJ11_0720 VFMJ11_0721 ribD ribE_1 TRUE 0.995 4.000 0.456 1.000 Y NA
 7070169 7070170 VFMJ11_0721 VFMJ11_0722 ribE_1 ribBA TRUE 0.782 41.000 0.065 1.000 Y NA
 7070170 7070171 VFMJ11_0722 VFMJ11_0723 ribBA ribH TRUE 0.677 154.000 0.049 0.002 Y NA
 7070171 7070172 VFMJ11_0723 VFMJ11_0724 ribH nusB TRUE 0.985 0.000 0.347 1.000 N NA
 7070172 7070173 VFMJ11_0724 VFMJ11_0725 nusB thiL TRUE 0.617 85.000 0.225 1.000 N NA
 7070173 7070174 VFMJ11_0725 VFMJ11_0726 thiL pgpA TRUE 0.556 93.000 0.206 1.000 N NA
 7070174 7070175 VFMJ11_0726 VFMJ11_0727 pgpA   FALSE 0.291 0.000 0.000 NA N NA
 7070175 7070176 VFMJ11_0727 VFMJ11_0728     FALSE 0.254 3.000 0.000 NA N NA
 7070179 7070180 VFMJ11_0731 VFMJ11_0732 dxs   TRUE 0.960 22.000 0.246 1.000 Y NA
 7070180 7070181 VFMJ11_0732 VFMJ11_0733   xseB TRUE 0.940 -7.000 0.177 1.000 N NA
 7070182 7070183 VFMJ11_0734 VFMJ11_0735   motB TRUE 0.989 16.000 0.566 1.000 Y NA
 7070183 7070184 VFMJ11_0735 VFMJ11_0736 motB thiI FALSE 0.004 160.000 0.029 1.000 N NA
 7070185 7070186 VFMJ11_0737 VFMJ11_0738   panE TRUE 0.960 -3.000 0.155 NA   NA
 7070186 7070187 VFMJ11_0738 VFMJ11_0739 panE   FALSE 0.092 48.000 0.008 NA   NA
 7070187 7070188 VFMJ11_0739 VFMJ11_0740     FALSE 0.010 282.000 0.000 NA   NA
 7070188 7070189 VFMJ11_0740 VFMJ11_0741     TRUE 0.859 87.000 0.467 NA   NA
 7070189 7070190 VFMJ11_0741 VFMJ11_0742     TRUE 0.964 0.000 0.198 NA N NA
 7070190 7070191 VFMJ11_0742 VFMJ11_0743     TRUE 0.896 15.000 0.248 NA N NA
 7070192 7070193 VFMJ11_0744 VFMJ11_0745   nqrA FALSE 0.001 394.000 0.000 NA N NA
 7070193 7070194 VFMJ11_0745 VFMJ11_0746 nqrA nqrB TRUE 0.999 4.000 0.854 0.002 Y NA
 7070194 7070195 VFMJ11_0746 VFMJ11_0747 nqrB nqrC TRUE 0.999 -10.000 0.603 0.002 Y NA
 7070195 7070196 VFMJ11_0747 VFMJ11_0748 nqrC nqrD TRUE 0.998 0.000 0.312 0.002 Y NA
 7070196 7070197 VFMJ11_0748 VFMJ11_0749 nqrD nqrE TRUE 0.993 8.000 0.188 0.002 Y NA
 7070197 7070198 VFMJ11_0749 VFMJ11_0750 nqrE nqrF TRUE 0.993 30.000 0.551 0.002 Y NA
 7070198 7070199 VFMJ11_0750 VFMJ11_0751 nqrF   TRUE 0.635 158.000 0.519 1.000 N NA
 7070199 7070200 VFMJ11_0751 VFMJ11_0752     TRUE 0.891 63.000 0.481 NA   NA
 7070200 7070201 VFMJ11_0752 VFMJ11_0753     FALSE 0.212 113.000 0.063 NA   NA
 7070201 7070202 VFMJ11_0753 VFMJ11_0754   alr_1 FALSE 0.004 190.000 0.000 1.000 N NA
 7070204 7070205 VFMJ11_0756 VFMJ11_0757     FALSE 0.161 77.000 0.024 1.000   NA
 7070205 7070206 VFMJ11_0757 VFMJ11_0758   frsA FALSE 0.103 145.000 0.040 NA   NA
 7070206 7070207 VFMJ11_0758 VFMJ11_0759 frsA proB FALSE 0.042 253.000 0.095 NA   NA
 7070207 7070208 VFMJ11_0759 VFMJ11_0760 proB proA TRUE 0.958 15.000 0.002 0.001 Y NA
 7070209 7070210 VFMJ11_0761 VFMJ11_0762 lipA lipB TRUE 0.998 -7.000 0.319 0.001 Y NA
 7070210 7070211 VFMJ11_0762 VFMJ11_0763 lipB   FALSE 0.217 198.000 0.219 NA   NA
 7070211 7070212 VFMJ11_0763 VFMJ11_0764     FALSE 0.027 135.000 0.007 NA   NA
 7070212 7070213 VFMJ11_0764 VFMJ11_0765     FALSE 0.066 281.000 0.000 NA Y NA
 7070213 7070214 VFMJ11_0765 VFMJ11_0766   mrdB_1 TRUE 0.613 0.000 0.043 NA N NA
 7070214 7070215 VFMJ11_0766 VFMJ11_0767 mrdB_1 mrdA FALSE 0.240 0.000 0.003 1.000 N NA
 7070215 7070216 VFMJ11_0767 VFMJ11_0768 mrdA   FALSE 0.351 4.000 0.003 NA   NA
 7070216 7070217 VFMJ11_0768 VFMJ11_0769     TRUE 0.977 5.000 0.307 NA   NA
 7070217 7070218 VFMJ11_0769 VFMJ11_0770   holA FALSE 0.124 54.000 0.013 NA   NA
 7070218 7070219 VFMJ11_0770 VFMJ11_0771 holA   TRUE 0.957 3.000 0.199 NA N NA
 7070219 7070220 VFMJ11_0771 VFMJ11_0772   leuS FALSE 0.207 168.000 0.182 NA N NA
 7070222 7070223 VFMJ11_0774 VFMJ11_0775 lnt   TRUE 0.840 96.000 0.557 1.000 N NA
 7070223 7070224 VFMJ11_0775 VFMJ11_0776     TRUE 0.599 68.000 0.150 NA   NA
 7070224 7070225 VFMJ11_0776 VFMJ11_0777     TRUE 0.963 17.000 0.457 NA   NA
 7070225 7070226 VFMJ11_0777 VFMJ11_0778   miaB FALSE 0.391 146.000 0.220 1.000 N NA
 7070228 7070229 VFMJ11_0780 VFMJ11_0781     FALSE 0.406 26.000 0.000 NA   NA
 7070229 7070230 VFMJ11_0781 VFMJ11_0782     FALSE 0.180 86.000 0.000 NA   NA
 7070230 7070231 VFMJ11_0782 VFMJ11_0783     TRUE 0.612 11.000 0.000 NA   NA
 7070231 7070232 VFMJ11_0783 VFMJ11_0784     FALSE 0.195 81.000 0.000 NA   NA
 7070232 7070233 VFMJ11_0784 VFMJ11_0785     FALSE 0.406 26.000 0.000 NA   NA
 7070233 7070234 VFMJ11_0785 VFMJ11_0786     FALSE 0.183 85.000 0.000 NA   NA
 7070234 7070235 VFMJ11_0786 VFMJ11_0787     TRUE 0.612 11.000 0.000 NA   NA
 7070235 7070236 VFMJ11_0787 VFMJ11_0788     FALSE 0.195 81.000 0.000 NA   NA
 7070236 7070237 VFMJ11_0788 VFMJ11_0789     FALSE 0.368 30.000 0.000 NA   NA
 7070237 7070238 VFMJ11_0789 VFMJ11_0790     TRUE 0.612 11.000 0.000 NA   NA
 7070238 7070239 VFMJ11_0790 VFMJ11_0791     FALSE 0.195 81.000 0.000 NA   NA
 7070239 7070240 VFMJ11_0791 VFMJ11_0792     FALSE 0.406 26.000 0.000 NA   NA
 7070240 7070241 VFMJ11_0792 VFMJ11_0793     FALSE 0.195 81.000 0.000 NA   NA
 7070241 7070242 VFMJ11_0793 VFMJ11_0794     FALSE 0.406 26.000 0.000 NA   NA
 7070242 7070243 VFMJ11_0794 VFMJ11_0795     FALSE 0.195 81.000 0.000 NA   NA
 7070243 7070244 VFMJ11_0795 VFMJ11_0796     FALSE 0.406 26.000 0.000 NA   NA
 7070244 7070245 VFMJ11_0796 VFMJ11_0797     FALSE 0.201 79.000 0.000 NA   NA
 7070245 7070246 VFMJ11_0797 VFMJ11_0798   ychF FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 7070246 7070247 VFMJ11_0798 VFMJ11_0799 ychF pth TRUE 0.946 20.000 0.184 1.000 Y NA
 7070247 7070248 VFMJ11_0799 VFMJ11_0800 pth   FALSE 0.003 182.000 0.011 1.000 N NA
 7070248 7070249 VFMJ11_0800 VFMJ11_0801   ipk TRUE 0.598 -12.000 0.053 1.000 N NA
 7070249 7070250 VFMJ11_0801 VFMJ11_0802 ipk lolB TRUE 0.942 -3.000 0.157 1.000 N NA
 7070251 7070252 VFMJ11_0803 VFMJ11_0804 hemA prfA TRUE 0.832 40.000 0.171 0.047 N NA
 7070252 7070253 VFMJ11_0804 VFMJ11_0805 prfA hemK TRUE 0.996 0.000 0.229 0.047 Y NA
 7070253 7070254 VFMJ11_0805 VFMJ11_0806 hemK   TRUE 0.785 16.000 0.109 NA   NA
 7070254 7070255 VFMJ11_0806 VFMJ11_0807     TRUE 0.968 3.000 0.195 NA   NA
 7070255 7070256 VFMJ11_0807 VFMJ11_0808   kdsA TRUE 0.798 12.000 0.089 1.000   NA
 7070257 7070258 VFMJ11_0809 VFMJ11_0810 cobA   FALSE 0.078 129.000 0.059 1.000 N NA
 7070258 7070259 VFMJ11_0810 VFMJ11_0811   nirD FALSE 0.424 151.000 0.069 1.000 Y NA
 7070259 7070260 VFMJ11_0811 VFMJ11_0812 nirD nirB TRUE 0.999 3.000 0.829 0.001 N NA
 7070260 7070261 VFMJ11_0812 VFMJ11_0813 nirB   FALSE 0.001 297.000 0.000 1.000 N NA
 7070265 7070266 VFMJ11_0817 VFMJ11_0818     FALSE 0.386 103.000 0.111 NA   NA
 7070268 7070269 VFMJ11_0820 VFMJ11_0821     FALSE 0.020 329.000 0.118 1.000 N NA
 7070269 7070270 VFMJ11_0821 VFMJ11_0822   proX FALSE 0.004 184.000 0.000 1.000 N NA
 7070270 7070271 VFMJ11_0822 VFMJ11_0823 proX   TRUE 0.999 3.000 0.695 0.049 Y NA
 7070271 7070272 VFMJ11_0823 VFMJ11_0824     TRUE 0.997 4.000 0.630 1.000 Y NA
 7070272 7070273 VFMJ11_0824 VFMJ11_0825     FALSE 0.006 386.000 0.000 1.000   NA
 7070275 7070276 VFMJ11_0827 VFMJ11_0828     TRUE 0.753 -9.000 0.000 NA   NA
 7070277 7070278 VFMJ11_0829 VFMJ11_0830   adk FALSE 0.002 262.000 0.035 1.000 N NA
 7070278 7070279 VFMJ11_0830 VFMJ11_0831 adk hemH FALSE 0.338 86.000 0.113 1.000 N NA
 7070279 7070280 VFMJ11_0831 VFMJ11_0832 hemH tig FALSE 0.001 342.000 0.000 1.000 N NA
 7070280 7070281 VFMJ11_0832 VFMJ11_0833 tig clpP TRUE 0.886 106.000 0.351 1.000 Y NA
 7070281 7070282 VFMJ11_0833 VFMJ11_0834 clpP clpX TRUE 0.912 87.000 0.352 1.000 Y NA
 7070282 7070283 VFMJ11_0834 VFMJ11_0835 clpX lon FALSE 0.388 205.000 0.201 1.000 Y NA
 7070283 7070284 VFMJ11_0835 VFMJ11_0836 lon   FALSE 0.003 173.000 0.030 1.000 N NA
 7070284 7070285 VFMJ11_0836 VFMJ11_0837     FALSE 0.014 205.000 0.051 1.000 N NA
 7070290 7070291 VFMJ11_0842 VFMJ11_0843 asnB   FALSE 0.001 289.000 0.027 1.000 N NA
 7070291 7070292 VFMJ11_0843 VFMJ11_0844     TRUE 0.571 85.000 0.200 1.000 N NA
 7070292 7070293 VFMJ11_0844 VFMJ11_0845   nagA TRUE 0.997 2.000 0.571 1.000 Y NA
 7070294 7070295 VFMJ11_0846 VFMJ11_0847 nagE_1 glnS FALSE 0.003 176.000 0.018 1.000 N NA
 7070298 7070299 VFMJ11_0850 VFMJ11_0851     TRUE 0.677 60.000 0.183 NA   NA
 7070299 7070300 VFMJ11_0851 VFMJ11_0852     TRUE 0.595 88.000 0.179 NA   NA
 7070301 7070302 VFMJ11_0853 VFMJ11_0854 seqA pgm TRUE 0.571 49.000 0.151 1.000 N NA
 7070302 7070303 VFMJ11_0854 VFMJ11_0855 pgm   FALSE 0.070 65.000 0.007 NA   NA
 7070305 7070306 VFMJ11_0857 VFMJ11_0858 sdhC sdhD TRUE 0.997 -6.000 0.453 0.001   NA
 7070306 7070307 VFMJ11_0858 VFMJ11_0859 sdhD sdhA TRUE 0.999 0.000 0.705 0.003 Y NA
 7070307 7070308 VFMJ11_0859 VFMJ11_0860 sdhA sdhB TRUE 0.997 13.000 0.604 0.003 Y NA
 7070308 7070309 VFMJ11_0860 VFMJ11_0861 sdhB sucA TRUE 0.622 98.000 0.067 1.000 Y NA
 7070309 7070310 VFMJ11_0861 VFMJ11_0862 sucA sucB TRUE 0.990 20.000 0.667 1.000 Y NA
 7070310 7070311 VFMJ11_0862 VFMJ11_0863 sucB sucC TRUE 0.546 154.000 0.136 1.000 Y NA
 7070311 7070312 VFMJ11_0863 VFMJ11_0864 sucC   TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 7070312 7070313 VFMJ11_0864 VFMJ11_0865     FALSE 0.003 197.000 0.000 1.000 N NA
 7070314 7070315 VFMJ11_0866 VFMJ11_0867     TRUE 0.999 0.000 0.755 1.000 Y NA
 7070316 7070317 VFMJ11_0868 VFMJ11_0869     FALSE 0.052 153.000 0.023 1.000   NA
 7070317 7070318 VFMJ11_0869 VFMJ11_0870     FALSE 0.080 149.000 0.000 1.000   NA
 7070318 7070319 VFMJ11_0870 VFMJ11_0871     FALSE 0.000 629.000 0.000 1.000 N NA
 7070319 7070320 VFMJ11_0871 VFMJ11_0872   feoB TRUE 0.998 2.000 0.778 1.000 Y NA
 7070320 7070321 VFMJ11_0872 VFMJ11_0873 feoB   TRUE 0.983 -3.000 0.288 NA   NA
 7070322 7070323 VFMJ11_0874 VFMJ11_0875   ackA_1 TRUE 0.886 100.000 0.634 1.000   NA
 7070327 7070328 VFMJ11_0879 VFMJ11_0880     FALSE 0.309 100.000 0.081 1.000   NA
 7070328 7070329 VFMJ11_0880 VFMJ11_0881     FALSE 0.122 104.000 0.028 NA   NA
 7070330 7070331 VFMJ11_0882 VFMJ11_0883     TRUE 0.992 5.000 0.636 NA   NA
 7070331 7070332 VFMJ11_0883 VFMJ11_0884     TRUE 0.962 8.000 0.245 1.000   NA
 7070332 7070333 VFMJ11_0884 VFMJ11_0885     TRUE 0.973 12.000 0.169 0.001   NA
 7070333 7070334 VFMJ11_0885 VFMJ11_0886     TRUE 0.991 0.000 0.422 NA   NA
 7070334 7070335 VFMJ11_0886 VFMJ11_0887     TRUE 0.992 -24.000 0.758 NA   NA
 7070335 7070336 VFMJ11_0887 VFMJ11_0888     TRUE 0.982 14.000 0.368 NA Y NA
 7070336 7070337 VFMJ11_0888 VFMJ11_0889     TRUE 0.982 3.000 0.297 NA   NA
 7070337 7070338 VFMJ11_0889 VFMJ11_0890     TRUE 0.980 -10.000 0.333 1.000   NA
 7070338 7070339 VFMJ11_0890 VFMJ11_0891     TRUE 0.969 12.000 0.413 1.000   NA
 7070339 7070340 VFMJ11_0891 VFMJ11_0892     TRUE 0.991 -7.000 0.532 1.000   NA
 7070340 7070341 VFMJ11_0892 VFMJ11_0893     TRUE 0.993 -16.000 0.732 1.000   NA
 7070341 7070342 VFMJ11_0893 VFMJ11_0894     TRUE 0.841 50.000 0.305 1.000   NA
 7070342 7070343 VFMJ11_0894 VFMJ11_0895     TRUE 0.887 54.000 0.422 1.000   NA
 7070343 7070344 VFMJ11_0895 VFMJ11_0896     TRUE 0.997 0.000 0.514 NA Y NA
 7070344 7070345 VFMJ11_0896 VFMJ11_0897   fabG TRUE 0.978 20.000 0.397 NA Y NA
 7070345 7070346 VFMJ11_0897 VFMJ11_0898 fabG   TRUE 0.997 -3.000 0.486 1.000 Y NA
 7070347 7070348 VFMJ11_0899 VFMJ11_0900     FALSE 0.001 312.000 0.000 NA N NA
 7070352 7070353 VFMJ11_0904 VFMJ11_0905     TRUE 0.971 51.000 1.000 NA   NA
 7070356 7070357 VFMJ11_0908 VFMJ11_0909     FALSE 0.022 216.000 0.000 NA   NA
 7070358 7070359 VFMJ11_0910 VFMJ11_0911     TRUE 0.978 10.000 0.432 NA   NA
 7070359 7070360 VFMJ11_0911 VFMJ11_0912   secF FALSE 0.024 212.000 0.000 NA   NA
 7070360 7070361 VFMJ11_0912 VFMJ11_0913 secF secD TRUE 0.998 4.000 0.366 0.002 Y NA
 7070361 7070362 VFMJ11_0913 VFMJ11_0914 secD   FALSE 0.267 131.000 0.099 NA   NA
 7070362 7070363 VFMJ11_0914 VFMJ11_0915     FALSE 0.121 117.000 0.000 NA   NA
 7070364 7070365 VFMJ11_0916 VFMJ11_0917     TRUE 0.923 74.000 0.650 1.000   NA
 7070365 7070366 VFMJ11_0917 VFMJ11_0918     FALSE 0.229 73.000 0.036 1.000   NA
 7070366 7070367 VFMJ11_0918 VFMJ11_0919     FALSE 0.015 215.000 0.055 1.000 N NA
 7070367 7070368 VFMJ11_0919 VFMJ11_0920     TRUE 0.992 1.000 0.452 NA   NA
 7070370 7070371 VFMJ11_0922 VFMJ11_0923     TRUE 0.992 -19.000 0.842 NA N NA
 7070371 7070372 VFMJ11_0923 VFMJ11_0924     TRUE 0.983 0.000 0.271 NA   NA
 7070372 7070373 VFMJ11_0924 VFMJ11_0925   nhaA FALSE 0.052 165.000 0.031 1.000   NA
 7070373 7070374 VFMJ11_0925 VFMJ11_0926 nhaA   FALSE 0.004 555.000 0.000 1.000   NA
 7070375 7070376 VFMJ11_0927 VFMJ11_0928   grxA FALSE 0.067 147.000 0.026 1.000   NA
 7070376 7070377 VFMJ11_0928 VFMJ11_0929 grxA   FALSE 0.017 112.000 0.000 1.000 N NA
 7070377 7070378 VFMJ11_0929 VFMJ11_0930     FALSE 0.001 322.000 0.000 1.000 N NA
 7070378 7070379 VFMJ11_0930 VFMJ11_0931     FALSE 0.307 175.000 0.212 NA   NA
 7070379 7070380 VFMJ11_0931 VFMJ11_0932     FALSE 0.181 137.000 0.071 NA   NA
 7070380 7070381 VFMJ11_0932 VFMJ11_0933     FALSE 0.392 103.000 0.113 NA   NA
 7070384 7070385 VFMJ11_0936 VFMJ11_0937   serC FALSE 0.006 198.000 0.004 NA   NA
 7070386 7070387 VFMJ11_0938 VFMJ11_0939   cydD TRUE 0.999 -7.000 0.631 0.005 Y NA
 7070387 7070388 VFMJ11_0939 VFMJ11_0940 cydD trxB FALSE 0.369 154.000 0.049 1.000 Y NA
 7070388 7070389 VFMJ11_0940 VFMJ11_0941 trxB ald FALSE 0.208 147.000 0.018 0.040 N NA
 7070390 7070391 VFMJ11_0942 VFMJ11_0943     FALSE 0.215 223.000 0.345 1.000 N NA
 7070391 7070392 VFMJ11_0943 VFMJ11_0944   lolA TRUE 0.877 28.000 0.305 1.000 N NA
 7070392 7070393 VFMJ11_0944 VFMJ11_0945 lolA   TRUE 0.683 34.000 0.167 1.000 N NA
 7070393 7070394 VFMJ11_0945 VFMJ11_0946   serS FALSE 0.137 122.000 0.078 1.000 N NA
 7070395 7070396 VFMJ11_0947 VFMJ11_0948     FALSE 0.050 173.000 0.036 NA   NA
 7070398 7070399 VFMJ11_0950 VFMJ11_0951   gap_1 FALSE 0.346 195.000 0.154 1.000 Y NA
 7070402 7070403 VFMJ11_0954 VFMJ11_0955     FALSE 0.050 147.000 0.020 NA   NA
 7070406 7070407 VFMJ11_0958 VFMJ11_0959     FALSE 0.116 223.000 0.175 NA   NA
 7070407 7070408 VFMJ11_0959 VFMJ11_0960     FALSE 0.019 203.000 0.024 NA   NA
 7070410 7070411 VFMJ11_0962 VFMJ11_0963     FALSE 0.050 170.000 0.000 1.000   NA
 7070411 7070412 VFMJ11_0963 VFMJ11_0964   rnt FALSE 0.496 47.000 0.084 1.000   NA
 7070414 7070415 VFMJ11_0966 VFMJ11_0967   gloA_1 FALSE 0.120 143.000 0.047 NA   NA
 7070415 7070416 VFMJ11_0967 VFMJ11_0968 gloA_1 nth FALSE 0.047 25.000 0.013 1.000 N NA
 7070416 7070417 VFMJ11_0968 VFMJ11_0969 nth   FALSE 0.398 59.000 0.109 1.000 N NA
 7070417 7070418 VFMJ11_0969 VFMJ11_0970     TRUE 0.999 0.000 0.908 0.040 Y NA
 7070418 7070419 VFMJ11_0970 VFMJ11_0971     TRUE 0.999 5.000 0.924 0.040 Y NA
 7070419 7070420 VFMJ11_0971 VFMJ11_0972     TRUE 0.990 63.000 0.814 0.040 Y NA
 7070420 7070421 VFMJ11_0972 VFMJ11_0973     TRUE 0.998 4.000 0.537 0.040 Y NA
 7070421 7070422 VFMJ11_0973 VFMJ11_0974     TRUE 0.999 3.000 0.564 0.040 Y NA
 7070422 7070423 VFMJ11_0974 VFMJ11_0975     FALSE 0.021 218.000 0.000 NA   NA
 7070423 7070424 VFMJ11_0975 VFMJ11_0976     FALSE 0.225 61.000 0.000 NA   NA
 7070425 7070426 VFMJ11_0977 VFMJ11_0978 uvrB   FALSE 0.001 294.000 0.000 1.000 N NA
 7070426 7070427 VFMJ11_0978 VFMJ11_0979     TRUE 0.986 11.000 0.654 NA   NA
 7070429 7070430 VFMJ11_0981 VFMJ11_0982 moaA moaC TRUE 0.966 13.000 0.039 0.003 Y NA
 7070430 7070431 VFMJ11_0982 VFMJ11_0983 moaC moaD TRUE 0.996 -3.000 0.175 0.003 Y NA
 7070431 7070432 VFMJ11_0983 VFMJ11_0984 moaD moaE TRUE 0.999 2.000 0.501 0.003 Y NA
 7070433 7070434 VFMJ11_0985 VFMJ11_0986     TRUE 0.996 4.000 0.923 NA   NA
 7070434 7070435 VFMJ11_0986 VFMJ11_0987     TRUE 0.552 109.000 0.192 NA   NA
 7070435 7070436 VFMJ11_0987 VFMJ11_0988     FALSE 0.180 80.000 0.030 NA   NA
 7070436 7070437 VFMJ11_0988 VFMJ11_0989     TRUE 0.877 37.000 0.315 NA   NA
 7070438 7070439 VFMJ11_0990 VFMJ11_0991 aspS ruvC FALSE 0.207 153.000 0.015 0.015 N NA
 7070439 7070440 VFMJ11_0991 VFMJ11_0992 ruvC ruvA TRUE 0.963 106.000 0.451 0.008 Y NA
 7070440 7070441 VFMJ11_0992 VFMJ11_0993 ruvA ruvB TRUE 0.993 29.000 0.549 0.002 Y NA
 7070441 7070442 VFMJ11_0993 VFMJ11_0994 ruvB   FALSE 0.001 379.000 0.000 1.000 N NA
 7070442 7070443 VFMJ11_0994 VFMJ11_0995   cydB TRUE 0.998 18.000 1.000 0.040 Y NA
 7070443 7070444 VFMJ11_0995 VFMJ11_0996 cydB   FALSE 0.127 113.000 0.000 NA   NA
 7070444 7070445 VFMJ11_0996 VFMJ11_0997   ybgC FALSE 0.103 184.000 0.095 NA   NA
 7070445 7070446 VFMJ11_0997 VFMJ11_0998 ybgC tolQ TRUE 0.991 -10.000 0.593 1.000   NA
 7070446 7070447 VFMJ11_0998 VFMJ11_0999 tolQ   TRUE 0.999 0.000 0.556 0.065 Y NA
 7070447 7070448 VFMJ11_0999 VFMJ11_1000   tolA TRUE 0.826 17.000 0.183 NA N NA
 7070448 7070449 VFMJ11_1000 VFMJ11_1001 tolA tolB TRUE 0.713 11.000 0.089 NA N NA
 7070449 7070450 VFMJ11_1001 VFMJ11_1002 tolB   TRUE 0.934 36.000 0.592 1.000 N NA
 7070450 7070451 VFMJ11_1002 VFMJ11_1003     TRUE 0.897 26.000 0.278 1.000   NA
 7070451 7070452 VFMJ11_1003 VFMJ11_1004   nadA FALSE 0.049 132.000 0.013 1.000   NA
 7070456 7070457 VFMJ11_1008 VFMJ11_1009     TRUE 0.771 -7.000 0.000 NA   NA
 7070457 7070458 VFMJ11_1009 VFMJ11_1010     FALSE 0.005 177.000 0.000 1.000 N NA
 7070458 7070459 VFMJ11_1010 VFMJ11_1011     TRUE 0.868 59.000 0.400 NA   NA
 7070459 7070460 VFMJ11_1011 VFMJ11_1012     TRUE 0.925 18.000 0.286 NA   NA
 7070460 7070461 VFMJ11_1012 VFMJ11_1013     FALSE 0.003 198.000 0.000 1.000 N NA
 7070463 7070464 VFMJ11_1015 VFMJ11_1016     TRUE 0.953 -10.000 0.185 NA   NA
 7070464 7070465 VFMJ11_1016 VFMJ11_1017     TRUE 0.937 26.000 0.400 NA   NA
 7070465 7070466 VFMJ11_1017 VFMJ11_1018     TRUE 0.981 3.000 0.286 NA   NA
 7070467 7070468 VFMJ11_1019 VFMJ11_1020     FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 7070469 7070470 VFMJ11_1021 VFMJ11_1022     FALSE 0.040 179.000 0.000 NA   NA
 7070470 7070471 VFMJ11_1022 VFMJ11_1023     FALSE 0.043 177.000 0.000 NA   NA
 7070471 7070472 VFMJ11_1023 VFMJ11_1024     FALSE 0.537 35.000 0.077 NA   NA
 7070472 7070473 VFMJ11_1024 VFMJ11_1025   hflX_1 FALSE 0.026 207.000 0.000 1.000   NA
 7070473 7070474 VFMJ11_1025 VFMJ11_1026 hflX_1 sigZ_1 FALSE 0.044 177.000 0.000 1.000   NA
 7070474 7070475 VFMJ11_1026 VFMJ11_1027 sigZ_1 gshA_2 FALSE 0.005 157.000 0.012 1.000 N NA
 7070475 7070476 VFMJ11_1027 VFMJ11_1028 gshA_2   FALSE 0.027 41.000 0.012 1.000 N NA
 7070476 7070477 VFMJ11_1028 VFMJ11_1029     TRUE 0.999 -7.000 0.911 0.005 Y NA
 7070477 7070478 VFMJ11_1029 VFMJ11_1030     FALSE 0.301 25.000 0.018 1.000   NA
 7070478 7070479 VFMJ11_1030 VFMJ11_1031     FALSE 0.104 130.000 0.000 NA   NA
 7070479 7070480 VFMJ11_1031 VFMJ11_1032     FALSE 0.217 67.000 0.000 NA   NA
 7070481 7070482 VFMJ11_1033 VFMJ11_1034     FALSE 0.267 72.000 0.045 NA   NA
 7070482 7070483 VFMJ11_1034 VFMJ11_1035     FALSE 0.254 64.000 0.040 NA   NA
 7070485 7070486 VFMJ11_1037 VFMJ11_1038     FALSE 0.115 122.000 0.000 NA   NA
 7070486 7070487 VFMJ11_1038 VFMJ11_1039     FALSE 0.388 28.000 0.000 NA   NA
 7070489 7070490 VFMJ11_1041 VFMJ11_1042     FALSE 0.388 28.000 0.000 NA   NA
 7070492 7070493 VFMJ11_1044 VFMJ11_1045     FALSE 0.005 425.000 0.000 NA   NA
 7070493 7070494 VFMJ11_1045 VFMJ11_1046     FALSE 0.005 439.000 0.000 NA   NA
 7070495 7070496 VFMJ11_1047 VFMJ11_1048     FALSE 0.007 350.000 0.000 NA   NA
 7070496 7070497 VFMJ11_1048 VFMJ11_1049     TRUE 0.972 -3.000 0.200 NA   NA
 7070499 7070500 VFMJ11_1051 VFMJ11_1052     FALSE 0.043 177.000 0.000 NA   NA
 7070501 7070502 VFMJ11_1053 VFMJ11_1054   csy_1 FALSE 0.003 869.000 0.000 NA   NA
 7070502 7070503 VFMJ11_1054 VFMJ11_1055 csy_1 csy_2 TRUE 0.894 1.000 0.064 NA   NA
 7070503 7070504 VFMJ11_1055 VFMJ11_1056 csy_2   TRUE 0.934 10.000 0.191 NA   NA
 7070504 7070505 VFMJ11_1056 VFMJ11_1057     TRUE 0.995 4.000 0.800 NA   NA
 7070505 7070506 VFMJ11_1057 VFMJ11_1058     FALSE 0.027 201.000 0.000 NA   NA
 7070507 7070508 VFMJ11_1059 VFMJ11_1060     TRUE 0.769 0.000 0.025 NA   NA
 7070508 7070509 VFMJ11_1060 VFMJ11_1061     FALSE 0.501 16.000 0.000 NA   NA
 7070509 7070510 VFMJ11_1061 VFMJ11_1062     FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 7070510 7070511 VFMJ11_1062 VFMJ11_1063     TRUE 0.953 0.000 0.125 NA   NA
 7070511 7070512 VFMJ11_1063 VFMJ11_1064     FALSE 0.129 112.000 0.000 NA   NA
 7070514 7070515 VFMJ11_1066 VFMJ11_1067     TRUE 0.956 0.000 0.129 1.000   NA
 7070516 7070517 VFMJ11_1068 VFMJ11_1069     TRUE 0.821 0.000 0.000 NA   NA
 7070517 7070518 VFMJ11_1069 VFMJ11_1070     TRUE 0.989 3.000 0.429 NA   NA
 7070519 7070520 VFMJ11_1071 VFMJ11_1072     FALSE 0.004 188.000 0.000 1.000 N NA
 7070521 7070522 VFMJ11_1073 VFMJ11_1074     TRUE 0.994 -3.000 0.625 1.000   NA
 7070522 7070523 VFMJ11_1074 VFMJ11_1075   icmF_1 TRUE 0.948 -3.000 0.125 NA   NA
 7070523 7070524 VFMJ11_1075 VFMJ11_1076 icmF_1   TRUE 0.987 11.000 0.667 NA   NA
 7070524 7070525 VFMJ11_1076 VFMJ11_1077     TRUE 0.995 2.000 0.667 NA   NA
 7070525 7070526 VFMJ11_1077 VFMJ11_1078     TRUE 0.985 12.000 0.667 NA   NA
 7070526 7070527 VFMJ11_1078 VFMJ11_1079     TRUE 0.736 37.000 0.167 NA   NA
 7070527 7070528 VFMJ11_1079 VFMJ11_1080     TRUE 0.760 4.000 0.000 NA   NA
 7070528 7070529 VFMJ11_1080 VFMJ11_1081     TRUE 0.792 3.000 0.000 NA   NA
 7070529 7070530 VFMJ11_1081 VFMJ11_1082   clpV_1 TRUE 0.913 6.000 0.000 0.016 N NA
 7070530 7070531 VFMJ11_1082 VFMJ11_1083 clpV_1   TRUE 0.971 -3.000 0.196 NA   NA
 7070531 7070532 VFMJ11_1083 VFMJ11_1084   vasA_1 TRUE 0.761 -36.000 0.059 NA   NA
 7070532 7070533 VFMJ11_1084 VFMJ11_1085 vasA_1   TRUE 0.865 -3.000 0.052 NA   NA
 7070533 7070534 VFMJ11_1085 VFMJ11_1086     TRUE 0.899 90.000 0.627 NA   NA
 7070534 7070535 VFMJ11_1086 VFMJ11_1087     TRUE 0.739 4.000 0.030 NA   NA
 7070535 7070536 VFMJ11_1087 VFMJ11_1088     TRUE 0.548 16.000 0.040 NA   NA
 7070536 7070537 VFMJ11_1088 VFMJ11_1089     FALSE 0.019 223.000 0.000 NA   NA
 7070537 7070538 VFMJ11_1089 VFMJ11_1090     TRUE 0.990 -7.000 0.474 NA   NA
 7070538 7070539 VFMJ11_1090 VFMJ11_1091     TRUE 0.976 11.000 0.434 NA   NA
 7070539 7070540 VFMJ11_1091 VFMJ11_1092   dinG TRUE 0.677 69.000 0.189 1.000   NA
 7070541 7070542 VFMJ11_1093 VFMJ11_1094     FALSE 0.019 639.000 0.000 0.047   NA
 7070542 7070543 VFMJ11_1094 VFMJ11_1095   hisG FALSE 0.005 465.000 0.000 1.000   NA
 7070543 7070544 VFMJ11_1095 VFMJ11_1096 hisG hisD TRUE 0.993 6.000 0.171 0.004 Y NA
 7070544 7070545 VFMJ11_1096 VFMJ11_1097 hisD hisC TRUE 0.994 10.000 0.294 0.004 Y NA
 7070545 7070546 VFMJ11_1097 VFMJ11_1098 hisC   TRUE 0.672 238.000 0.341 0.004 Y NA
 7070546 7070547 VFMJ11_1098 VFMJ11_1099   hisH TRUE 0.989 9.000 0.128 0.004 Y NA
 7070547 7070548 VFMJ11_1099 VFMJ11_1100 hisH hisA TRUE 0.907 115.000 0.210 0.004 Y NA
 7070548 7070549 VFMJ11_1100 VFMJ11_1101 hisA hisF TRUE 0.997 -18.000 0.433 0.004 Y NA
 7070549 7070550 VFMJ11_1101 VFMJ11_1102 hisF   TRUE 0.998 -3.000 0.430 0.004 Y NA
 7070550 7070551 VFMJ11_1102 VFMJ11_1103     FALSE 0.018 108.000 0.000 1.000 N NA
 7070551 7070552 VFMJ11_1103 VFMJ11_1104     TRUE 0.953 0.000 0.125 NA   NA
 7070553 7070554 VFMJ11_1105 VFMJ11_1106     TRUE 0.576 26.000 0.067 NA   NA
 7070554 7070555 VFMJ11_1106 VFMJ11_1107     FALSE 0.387 105.000 0.114 NA   NA
 7070555 7070556 VFMJ11_1107 VFMJ11_1108   ispZ FALSE 0.446 94.000 0.167 NA N NA
 7070556 7070557 VFMJ11_1108 VFMJ11_1109 ispZ   FALSE 0.006 168.000 0.000 1.000 N NA
 7070557 7070558 VFMJ11_1109 VFMJ11_1110   trpA FALSE 0.001 351.000 0.000 1.000 N NA
 7070558 7070559 VFMJ11_1110 VFMJ11_1111 trpA trpB TRUE 1.000 0.000 0.947 0.001 Y NA
 7070559 7070560 VFMJ11_1111 VFMJ11_1112 trpB   TRUE 0.993 11.000 0.221 0.001 Y NA
 7070560 7070561 VFMJ11_1112 VFMJ11_1113   trpD TRUE 0.990 5.000 0.293 1.000 Y NA
 7070561 7070562 VFMJ11_1113 VFMJ11_1114 trpD   TRUE 0.984 11.000 0.083 0.001 Y NA
 7070562 7070563 VFMJ11_1114 VFMJ11_1115   trpE TRUE 0.999 0.000 0.703 0.001 Y NA
 7070564 7070565 VFMJ11_1116 VFMJ11_1117     TRUE 0.770 74.000 0.281 NA   NA
 7070566 7070567 VFMJ11_1118 VFMJ11_1119     FALSE 0.003 1053.000 0.000 NA   NA
 7070572 7070573 VFMJ11_1124 VFMJ11_1125 topA   FALSE 0.004 190.000 0.000 1.000 N NA
 7070573 7070574 VFMJ11_1125 VFMJ11_1126     TRUE 0.944 4.000 0.143 1.000   NA
 7070574 7070575 VFMJ11_1126 VFMJ11_1127     TRUE 0.949 -13.000 0.188 1.000   NA
 7070578 7070579 VFMJ11_1130 VFMJ11_1131     FALSE 0.004 170.000 0.010 1.000 N NA
 7070580 7070581 VFMJ11_1132 VFMJ11_1133   pepT_1 FALSE 0.055 166.000 0.000 1.000   NA
 7070581 7070582 VFMJ11_1133 VFMJ11_1134 pepT_1   TRUE 0.823 3.000 0.078 1.000 N NA
 7070584 7070585 VFMJ11_1136 VFMJ11_1137     FALSE 0.001 276.000 0.000 1.000 N NA
 7070585 7070586 VFMJ11_1137 VFMJ11_1138     TRUE 0.711 91.000 0.256 1.000   NA
 7070588 7070589 VFMJ11_1140 VFMJ11_1141     FALSE 0.347 10.000 0.008 NA   NA
 7070590 7070591 VFMJ11_1142 VFMJ11_1143     FALSE 0.080 148.000 0.000 NA   NA
 7070591 7070592 VFMJ11_1143 VFMJ11_1144     TRUE 0.615 26.000 0.077 NA   NA
 7070595 7070596 VFMJ11_1147 VFMJ11_1148     TRUE 0.877 19.000 0.196 NA   NA
 7070597 7070598 VFMJ11_1149 VFMJ11_1150     FALSE 0.177 90.000 0.000 1.000   NA
 7070598 7070599 VFMJ11_1150 VFMJ11_1151     FALSE 0.135 12.000 0.000 1.000 N NA
 7070599 7070600 VFMJ11_1151 VFMJ11_1152     TRUE 0.653 10.000 0.000 1.000   NA
 7070600 7070601 VFMJ11_1152 VFMJ11_1153     TRUE 0.936 14.000 0.286 NA   NA
 7070601 7070602 VFMJ11_1153 VFMJ11_1154     TRUE 0.777 6.000 0.047 NA   NA
 7070602 7070603 VFMJ11_1154 VFMJ11_1155     FALSE 0.293 -27.000 0.005 NA   NA
 7070604 7070605 VFMJ11_1156 VFMJ11_1157     FALSE 0.030 194.000 0.000 NA   NA
 7070607 7070608 VFMJ11_1159 VFMJ11_1160     TRUE 0.712 45.000 0.000 NA Y NA
 7070608 7070609 VFMJ11_1160 VFMJ11_1161   brnQ_2 FALSE 0.000 434.000 0.000 NA N NA
 7070611 7070612 VFMJ11_1163 VFMJ11_1164     TRUE 0.753 -9.000 0.000 NA   NA
 7070612 7070613 VFMJ11_1164 VFMJ11_1165     FALSE 0.012 272.000 0.000 NA   NA
 7070613 7070614 VFMJ11_1165 VFMJ11_1166     FALSE 0.014 255.000 0.000 NA   NA
 7070614 7070615 VFMJ11_1166 VFMJ11_1167     FALSE 0.008 324.000 0.000 NA   NA
 7070615 7070616 VFMJ11_1167 VFMJ11_1168     TRUE 0.647 -34.000 0.000 NA   NA
 7070617 7070618 VFMJ11_1169 VFMJ11_1170     FALSE 0.122 330.000 0.000 0.017 Y NA
 7070619 7070620 VFMJ11_1171 VFMJ11_1172     FALSE 0.179 89.000 0.000 1.000   NA
 7070620 7070621 VFMJ11_1172 VFMJ11_1173     FALSE 0.033 61.000 0.000 1.000 N NA
 7070621 7070622 VFMJ11_1173 VFMJ11_1174     FALSE 0.001 271.000 0.000 1.000 N NA
 7070623 7070624 VFMJ11_1175 VFMJ11_1176   ppiB FALSE 0.160 148.000 0.071 1.000   NA
 7070624 7070625 VFMJ11_1176 VFMJ11_1177 ppiB   TRUE 0.620 11.000 0.071 1.000 N NA
 7070625 7070626 VFMJ11_1177 VFMJ11_1178     FALSE 0.089 51.000 0.040 1.000 N NA
 7070626 7070627 VFMJ11_1178 VFMJ11_1179     FALSE 0.171 61.000 0.023 1.000   NA
 7070628 7070629 VFMJ11_1180 VFMJ11_1181     FALSE 0.136 109.000 0.000 NA   NA
 7070629 7070630 VFMJ11_1181 VFMJ11_1182     FALSE 0.127 113.000 0.000 NA   NA
 7070630 7070631 VFMJ11_1182 VFMJ11_1183     TRUE 0.978 16.000 0.649 NA   NA
 7070631 7070632 VFMJ11_1183 VFMJ11_1184     TRUE 0.998 -10.000 0.760 NA Y NA
 7070632 7070633 VFMJ11_1184 VFMJ11_1185     TRUE 0.967 10.000 0.390 NA N NA
 7070633 7070634 VFMJ11_1185 VFMJ11_1186     FALSE 0.015 123.000 0.000 1.000 N NA
 7070634 7070635 VFMJ11_1186 VFMJ11_1187     FALSE 0.301 39.000 0.000 NA   NA
 7070638 7070639 VFMJ11_1190 VFMJ11_1191     FALSE 0.125 114.000 0.000 NA   NA
 7070640 7070641 VFMJ11_1192 VFMJ11_1193 murQ murP TRUE 0.899 87.000 0.609 1.000   NA
 7070641 7070642 VFMJ11_1193 VFMJ11_1194 murP   FALSE 0.049 172.000 0.000 1.000   NA
 7070642 7070643 VFMJ11_1194 VFMJ11_1195     FALSE 0.137 110.000 0.000 1.000   NA
 7070643 7070644 VFMJ11_1195 VFMJ11_1196     FALSE 0.123 119.000 0.000 1.000   NA
 7070648 7070649 VFMJ11_1200 VFMJ11_1201     TRUE 0.734 5.000 0.000 NA   NA
 7070649 7070650 VFMJ11_1201 VFMJ11_1202     TRUE 0.951 -7.000 0.000 0.022   NA
 7070651 7070652 VFMJ11_1203 VFMJ11_1204     FALSE 0.178 35.000 0.014 NA   NA
 7070653 7070654 VFMJ11_1205 VFMJ11_1206     FALSE 0.031 164.000 0.017 NA   NA
 7070656 7070657 VFMJ11_1208 VFMJ11_1209     FALSE 0.163 67.000 0.022 1.000   NA
 7070657 7070658 VFMJ11_1209 VFMJ11_1210     TRUE 0.989 0.000 0.372 NA   NA
 7070658 7070659 VFMJ11_1210 VFMJ11_1211     TRUE 0.926 42.000 0.516 NA   NA
 7070661 7070662 VFMJ11_1212 VFMJ11_1214     FALSE 0.006 399.000 0.000 NA   NA
 7070664 7070665 VFMJ11_1216 VFMJ11_1217 thiK   FALSE 0.400 127.000 0.151 NA   NA
 7070665 7070666 VFMJ11_1217 VFMJ11_1218     FALSE 0.011 363.000 0.057 NA   NA
 7070666 7070667 VFMJ11_1218 VFMJ11_1219     FALSE 0.004 167.000 0.029 1.000 N NA
 7070667 7070668 VFMJ11_1219 VFMJ11_1220     FALSE 0.399 46.000 0.061 NA   NA
 7070668 7070669 VFMJ11_1220 VFMJ11_1221     FALSE 0.004 506.000 0.000 NA   NA
 7070669 7070670 VFMJ11_1221 VFMJ11_1222     FALSE 0.015 250.000 0.000 NA   NA
 7070670 7070671 VFMJ11_1222 VFMJ11_1223     FALSE 0.012 274.000 0.000 NA   NA
 7070671 7070672 VFMJ11_1223 VFMJ11_1224     FALSE 0.004 502.000 0.000 NA   NA
 7070673 7070674 VFMJ11_1225 VFMJ11_1226     FALSE 0.003 195.000 0.000 1.000 N NA
 7070676 7070677 VFMJ11_1228 VFMJ11_1229     TRUE 0.999 -7.000 0.877 0.024 Y NA
 7070680 7070681 VFMJ11_1232 VFMJ11_1233     FALSE 0.011 194.000 0.010 1.000   NA
 7070682 7070683 VFMJ11_1234 VFMJ11_1235     FALSE 0.200 114.000 0.059 NA   NA
 7070684 7070685 VFMJ11_1236 VFMJ11_1237     FALSE 0.131 113.000 0.000 1.000   NA
 7070685 7070686 VFMJ11_1237 VFMJ11_1238     FALSE 0.491 175.000 0.372 NA   NA
 7070690 7070691 VFMJ11_1242 VFMJ11_1243     TRUE 0.994 -3.000 0.669 1.000 N NA
 7070691 7070692 VFMJ11_1243 VFMJ11_1244     FALSE 0.035 33.000 0.005 NA N NA
 7070692 7070693 VFMJ11_1244 VFMJ11_1245     FALSE 0.001 270.000 0.000 NA N NA
 7070693 7070694 VFMJ11_1245 VFMJ11_1246     TRUE 0.668 -22.000 0.000 NA   NA
 7070694 7070695 VFMJ11_1246 VFMJ11_1247     FALSE 0.005 414.000 0.000 NA   NA
 7070695 7070696 VFMJ11_1247 VFMJ11_1248     TRUE 0.759 111.000 0.000 0.006 Y NA
 7070696 7070697 VFMJ11_1248 VFMJ11_1249     FALSE 0.212 72.000 0.000 NA   NA
 7070697 7070698 VFMJ11_1249 VFMJ11_1250     TRUE 0.867 31.000 0.250 NA   NA
 7070699 7070700 VFMJ11_1251 VFMJ11_1252     FALSE 0.023 215.000 0.000 NA   NA
 7070700 7070701 VFMJ11_1252 VFMJ11_1253     TRUE 0.943 96.000 0.567 NA Y NA
 7070701 7070702 VFMJ11_1253 VFMJ11_1254     FALSE 0.047 190.000 0.049 NA   NA
 7070702 7070703 VFMJ11_1254 VFMJ11_1255   pabB TRUE 0.860 17.000 0.169 1.000   NA
 7070704 7070705 VFMJ11_1256 VFMJ11_1257     FALSE 0.104 130.000 0.000 NA   NA
 7070705 7070706 VFMJ11_1257 VFMJ11_1258     FALSE 0.368 104.000 0.105 NA   NA
 7070706 7070707 VFMJ11_1258 VFMJ11_1259     TRUE 0.999 3.000 0.950 0.012 Y NA
 7070707 7070708 VFMJ11_1259 VFMJ11_1260     TRUE 0.886 -3.000 0.100 NA N NA
 7070708 7070709 VFMJ11_1260 VFMJ11_1261     FALSE 0.111 125.000 0.000 NA   NA
 7070710 7070711 VFMJ11_1262 VFMJ11_1263     TRUE 0.811 2.000 0.000 NA   NA
 7070711 7070712 VFMJ11_1263 VFMJ11_1264   metC FALSE 0.043 177.000 0.000 NA   NA
 7070713 7070714 VFMJ11_1265 VFMJ11_1266     FALSE 0.013 260.000 0.000 NA   NA
 7070714 7070715 VFMJ11_1266 VFMJ11_1267   ribA FALSE 0.008 159.000 0.000 1.000 N NA
 7070715 7070716 VFMJ11_1267 VFMJ11_1268 ribA   FALSE 0.034 211.000 0.086 NA N NA
 7070716 7070717 VFMJ11_1268 VFMJ11_1269     FALSE 0.447 179.000 0.436 NA N NA
 7070717 7070718 VFMJ11_1269 VFMJ11_1270     TRUE 0.989 11.000 0.713 NA   NA
 7070718 7070719 VFMJ11_1270 VFMJ11_1271     TRUE 0.738 -10.000 0.000 NA   NA
 7070719 7070720 VFMJ11_1271 VFMJ11_1272     FALSE 0.273 45.000 0.000 NA   NA
 7070720 7070721 VFMJ11_1272 VFMJ11_1273     FALSE 0.010 283.000 0.000 NA   NA
 7070722 7070723 VFMJ11_1274 VFMJ11_1275     FALSE 0.153 149.000 0.071 NA   NA
 7070725 7070726 VFMJ11_1277 VFMJ11_1278     FALSE 0.010 148.000 0.000 1.000 N NA
 7070726 7070727 VFMJ11_1278 VFMJ11_1279     FALSE 0.068 155.000 0.000 NA   NA
 7070727 7070728 VFMJ11_1279 VFMJ11_1280   nrdB FALSE 0.026 205.000 0.000 NA   NA
 7070728 7070729 VFMJ11_1280 VFMJ11_1281 nrdB   TRUE 0.919 173.000 0.500 0.001 Y NA
 7070729 7070730 VFMJ11_1281 VFMJ11_1282   ubiG FALSE 0.000 495.000 0.000 1.000 N NA
 7070732 7070733 VFMJ11_1284 VFMJ11_1285     FALSE 0.039 181.000 0.000 NA   NA
 7070733 7070734 VFMJ11_1285 VFMJ11_1287     FALSE 0.080 148.000 0.000 NA   NA
 7070735 7070736 VFMJ11_1286 VFMJ11_1288     FALSE 0.093 63.000 0.009 1.000   NA
 7070736 7070737 VFMJ11_1288 VFMJ11_1289     FALSE 0.082 72.000 0.009 NA   NA
 7070737 7070738 VFMJ11_1289 VFMJ11_1290     FALSE 0.411 19.000 0.026 NA   NA
 7070738 7070739 VFMJ11_1290 VFMJ11_1291     FALSE 0.184 63.000 0.026 NA   NA
 7070740 7070741 VFMJ11_1292 VFMJ11_1293     FALSE 0.377 22.000 0.025 1.000   NA
 7070741 7070742 VFMJ11_1293 VFMJ11_1294     FALSE 0.418 100.000 0.118 NA   NA
 7070743 7070744 VFMJ11_1295 VFMJ11_1296 thrS infC TRUE 0.825 85.000 0.186 1.000 Y NA
 7070744 7070745 VFMJ11_1296 VFMJ11_1297 infC rpmI TRUE 0.946 108.000 0.652 1.000 Y NA
 7070745 7070746 VFMJ11_1297 VFMJ11_1298 rpmI rplT TRUE 0.995 42.000 0.928 0.013 Y NA
 7070746 7070747 VFMJ11_1298 VFMJ11_1299 rplT   FALSE 0.003 215.000 0.000 1.000 N NA
 7070748 7070749 VFMJ11_1300 VFMJ11_1301 hmuV   TRUE 0.959 0.000 0.010 1.000 Y NA
 7070749 7070750 VFMJ11_1301 VFMJ11_1302     TRUE 0.997 10.000 0.852 1.000 Y NA
 7070750 7070751 VFMJ11_1302 VFMJ11_1303     TRUE 0.911 -3.000 0.117 1.000 N NA
 7070751 7070752 VFMJ11_1303 VFMJ11_1304     TRUE 0.999 -3.000 0.551 0.062 Y NA
 7070752 7070753 VFMJ11_1304 VFMJ11_1305     TRUE 0.976 22.000 0.473 0.016 N NA
 7070754 7070755 VFMJ11_1306 VFMJ11_1307     TRUE 0.787 29.000 0.203 NA N NA
 7070755 7070756 VFMJ11_1307 VFMJ11_1308     TRUE 0.941 53.000 0.355 NA Y NA
 7070756 7070757 VFMJ11_1308 VFMJ11_1309     FALSE 0.006 388.000 0.000 NA   NA
 7070757 7070758 VFMJ11_1309 VFMJ11_1310     TRUE 0.821 0.000 0.000 NA   NA
 7070758 7070759 VFMJ11_1310 VFMJ11_1311     TRUE 0.992 -3.000 0.467 NA   NA
 7070759 7070760 VFMJ11_1311 VFMJ11_1312     TRUE 0.710 -13.000 0.000 NA   NA
 7070760 7070761 VFMJ11_1312 VFMJ11_1313     FALSE 0.379 29.000 0.000 NA   NA
 7070761 7070762 VFMJ11_1313 VFMJ11_1314     TRUE 0.710 -13.000 0.000 NA   NA
 7070762 7070763 VFMJ11_1314 VFMJ11_1315     TRUE 0.983 29.000 1.000 NA   NA
 7070763 7070764 VFMJ11_1315 VFMJ11_1316     TRUE 0.983 30.000 1.000 NA   NA
 7070766 7070767 VFMJ11_1318 VFMJ11_1319 pheS pheT TRUE 0.996 18.000 0.574 0.001 Y NA
 7070767 7070768 VFMJ11_1319 VFMJ11_1320 pheT ihfA FALSE 0.024 589.000 0.208 1.000 N NA
 7070768 7070769 VFMJ11_1320 VFMJ11_1321 ihfA   FALSE 0.001 295.000 0.000 1.000 N NA
 7070769 7070770 VFMJ11_1321 VFMJ11_1322     FALSE 0.491 99.000 0.014 1.000 Y NA
 7070771 7070772 VFMJ11_1323 VFMJ11_1324     FALSE 0.525 17.000 0.038 NA   NA
 7070777 7070778 VFMJ11_1329 VFMJ11_1330     FALSE 0.203 78.000 0.000 NA   NA
 7070778 7070779 VFMJ11_1330 VFMJ11_1331     FALSE 0.014 256.000 0.000 NA   NA
 7070780 7070781 VFMJ11_1332 VFMJ11_1333   nhaC_1 TRUE 0.683 10.000 0.077 1.000 N NA
 7070781 7070782 VFMJ11_1333 VFMJ11_1334 nhaC_1   TRUE 0.627 137.000 0.385 1.000 N NA
 7070787 7070788 VFMJ11_1339 VFMJ11_1340     FALSE 0.034 34.000 0.014 NA N NA
 7070788 7070789 VFMJ11_1340 VFMJ11_1341     FALSE 0.003 177.000 0.010 NA N NA
 7070789 7070790 VFMJ11_1341 VFMJ11_1342     TRUE 0.603 2.000 0.010 NA   NA
 7070790 7070791 VFMJ11_1342 VFMJ11_1343     FALSE 0.076 150.000 0.000 NA   NA
 7070791 7070792 VFMJ11_1343 VFMJ11_1344     FALSE 0.111 125.000 0.000 NA   NA
 7070793 7070794 VFMJ11_1345 VFMJ11_1346     FALSE 0.006 174.000 0.000 1.000 N NA
 7070794 7070795 VFMJ11_1346 VFMJ11_1347     TRUE 0.992 0.000 0.462 NA   NA
 7070795 7070796 VFMJ11_1347 VFMJ11_1348     FALSE 0.165 93.000 0.000 NA   NA
 7070797 7070798 VFMJ11_1349 VFMJ11_1350     FALSE 0.190 86.000 0.034 1.000   NA
 7070799 7070800 VFMJ11_1351 VFMJ11_1352   yebU FALSE 0.022 212.000 0.030 NA   NA
 7070800 7070801 VFMJ11_1352 VFMJ11_1353 yebU   TRUE 0.596 162.000 0.420 NA   NA
 7070801 7070802 VFMJ11_1353 VFMJ11_1354     TRUE 0.993 -22.000 0.840 NA   NA
 7070802 7070803 VFMJ11_1354 VFMJ11_1355     FALSE 0.408 18.000 0.025 NA   NA
 7070804 7070805 VFMJ11_1356 VFMJ11_1357     TRUE 0.621 106.000 0.081 NA Y NA
 7070805 7070806 VFMJ11_1357 VFMJ11_1358   prc TRUE 0.911 18.000 0.304 NA N NA
 7070806 7070807 VFMJ11_1358 VFMJ11_1359 prc   FALSE 0.046 130.000 0.013 NA   NA
 7070807 7070808 VFMJ11_1359 VFMJ11_1360   pepN FALSE 0.093 138.000 0.000 NA   NA
 7070808 7070809 VFMJ11_1360 VFMJ11_1361 pepN   FALSE 0.322 112.000 0.099 NA   NA
 7070809 7070810 VFMJ11_1361 VFMJ11_1362     FALSE 0.300 159.000 0.169 NA   NA
 7070810 7070811 VFMJ11_1362 VFMJ11_1363   pyrD FALSE 0.005 270.000 0.045 1.000 N NA
 7070811 7070812 VFMJ11_1363 VFMJ11_1364 pyrD   FALSE 0.053 217.000 0.081 NA   NA
 7070812 7070813 VFMJ11_1364 VFMJ11_1365   rlmL FALSE 0.004 569.000 0.000 NA   NA
 7070813 7070814 VFMJ11_1365 VFMJ11_1366 rlmL   FALSE 0.057 85.000 0.007 NA   NA
 7070814 7070815 VFMJ11_1366 VFMJ11_1367     TRUE 0.861 -19.000 0.092 NA   NA
 7070815 7070816 VFMJ11_1367 VFMJ11_1368     TRUE 0.861 9.000 0.094 NA   NA
 7070816 7070817 VFMJ11_1368 VFMJ11_1369     FALSE 0.261 201.000 0.278 NA   NA
 7070818 7070819 VFMJ11_1370 VFMJ11_1371 fabA   TRUE 0.743 66.000 0.290 1.000 N NA
 7070821 7070822 VFMJ11_1373 VFMJ11_1374     FALSE 0.004 509.000 0.000 NA   NA
 7070822 7070823 VFMJ11_1374 VFMJ11_1375     TRUE 0.612 11.000 0.000 NA   NA
 7070823 7070824 VFMJ11_1375 VFMJ11_1376     FALSE 0.009 311.000 0.000 NA   NA
 7070825 7070826 VFMJ11_1377 VFMJ11_1378 ccoN ccoO TRUE 0.994 13.000 0.700 0.001 N NA
 7070826 7070827 VFMJ11_1378 VFMJ11_1379 ccoO ccoQ TRUE 0.995 11.000 0.667 0.001 N NA
 7070827 7070828 VFMJ11_1379 VFMJ11_1380 ccoQ ccoP TRUE 0.998 -3.000 0.636 0.001 N NA
 7070828 7070829 VFMJ11_1380 VFMJ11_1381 ccoP   TRUE 0.839 83.000 0.404 NA   NA
 7070829 7070830 VFMJ11_1381 VFMJ11_1382     TRUE 0.878 19.000 0.197 NA   NA
 7070830 7070831 VFMJ11_1382 VFMJ11_1383   ccoS TRUE 0.998 -7.000 0.713 NA Y NA
 7070831 7070832 VFMJ11_1383 VFMJ11_1384 ccoS   TRUE 0.972 -10.000 0.266 NA   NA
 7070832 7070833 VFMJ11_1384 VFMJ11_1385     FALSE 0.478 99.000 0.141 NA   NA
 7070833 7070834 VFMJ11_1385 VFMJ11_1386     TRUE 0.891 151.000 0.619 1.000 Y NA
 7070834 7070835 VFMJ11_1386 VFMJ11_1387     FALSE 0.146 135.000 0.091 NA N NA
 7070836 7070837 VFMJ11_1388 VFMJ11_1389     TRUE 0.991 2.000 0.448 NA   NA
 7070837 7070838 VFMJ11_1389 VFMJ11_1390     TRUE 0.970 9.000 0.313 NA   NA
 7070839 7070840 VFMJ11_1391 VFMJ11_1392 potA potB TRUE 0.977 68.000 0.789 1.000 Y NA
 7070840 7070841 VFMJ11_1392 VFMJ11_1393 potB potC TRUE 0.997 0.000 0.286 0.046 Y NA
 7070841 7070842 VFMJ11_1393 VFMJ11_1394 potC   TRUE 0.692 125.000 0.047 0.046 Y NA
 7070842 7070843 VFMJ11_1394 VFMJ11_1395     FALSE 0.356 202.000 0.000 0.010 Y NA
 7070845 7070846 VFMJ11_1397 VFMJ11_1398     FALSE 0.002 240.000 0.000 1.000 N NA
 7070847 7070848 VFMJ11_1399 VFMJ11_1400     FALSE 0.250 53.000 0.000 NA   NA
 7070848 7070849 VFMJ11_1400 VFMJ11_1401     FALSE 0.019 229.000 0.000 NA   NA
 7070849 7070850 VFMJ11_1401 VFMJ11_1402     FALSE 0.111 125.000 0.000 NA   NA
 7070850 7070851 VFMJ11_1402 VFMJ11_1403     FALSE 0.368 30.000 0.000 NA   NA
 7070851 7070852 VFMJ11_1403 VFMJ11_1404     FALSE 0.167 92.000 0.000 NA   NA
 7070852 7070853 VFMJ11_1404 VFMJ11_1405     FALSE 0.077 25.000 0.000 1.000 N NA
 7070855 7070856 VFMJ11_1407 VFMJ11_1408     FALSE 0.246 54.000 0.000 NA   NA
 7070858 7070859 VFMJ11_1410 VFMJ11_1411     TRUE 0.721 -12.000 0.000 NA   NA
 7070859 7070860 VFMJ11_1411 VFMJ11_1412     FALSE 0.082 147.000 0.000 NA   NA
 7070860 7070861 VFMJ11_1412 VFMJ11_1413     FALSE 0.133 112.000 0.000 1.000   NA
 7070865 7070866 VFMJ11_1417 VFMJ11_1418     FALSE 0.334 17.000 0.017 NA   NA
 7070866 7070867 VFMJ11_1418 VFMJ11_1419     FALSE 0.021 218.000 0.000 NA   NA
 7070867 7070868 VFMJ11_1419 VFMJ11_1420     FALSE 0.220 64.000 0.000 NA   NA
 7070868 7070869 VFMJ11_1420 VFMJ11_1421     TRUE 0.967 -3.000 0.000 0.008   NA
 7070869 7070870 VFMJ11_1421 VFMJ11_1422     TRUE 0.702 7.000 0.000 NA   NA
 7070870 7070871 VFMJ11_1422 VFMJ11_1423   phnA FALSE 0.418 25.000 0.000 NA   NA
 7070871 7070872 VFMJ11_1423 VFMJ11_1424 phnA   FALSE 0.089 142.000 0.000 NA   NA
 7070874 7070875 VFMJ11_1426 VFMJ11_1427     FALSE 0.006 366.000 0.000 NA   NA
 7070875 7070876 VFMJ11_1427 VFMJ11_1428     TRUE 0.981 -3.000 0.273 NA   NA
 7070876 7070877 VFMJ11_1428 VFMJ11_1429     TRUE 0.645 -43.000 0.000 NA   NA
 7070877 7070878 VFMJ11_1429 VFMJ11_1430     FALSE 0.313 37.000 0.000 NA   NA
 7070878 7070879 VFMJ11_1430 VFMJ11_1431     FALSE 0.009 307.000 0.000 NA   NA
 7070879 7070880 VFMJ11_1431 VFMJ11_1432     TRUE 0.990 -3.000 0.429 NA   NA
 7070880 7070881 VFMJ11_1432 VFMJ11_1433     FALSE 0.010 297.000 0.000 1.000   NA
 7070881 7070882 VFMJ11_1433 VFMJ11_1434     FALSE 0.016 244.000 0.000 1.000   NA
 7070882 7070883 VFMJ11_1434 VFMJ11_1435     FALSE 0.085 145.000 0.000 NA   NA
 7070883 7070884 VFMJ11_1435 VFMJ11_1436     FALSE 0.056 164.000 0.000 NA   NA
 7070884 7070885 VFMJ11_1436 VFMJ11_1437     FALSE 0.183 85.000 0.000 NA   NA
 7070885 7070886 VFMJ11_1437 VFMJ11_1438     FALSE 0.058 163.000 0.000 NA   NA
 7070886 7070887 VFMJ11_1438 VFMJ11_1439     FALSE 0.005 461.000 0.000 1.000   NA
 7070887 7070888 VFMJ11_1439 VFMJ11_1440     TRUE 0.987 17.000 0.217 0.002 Y NA
 7070888 7070889 VFMJ11_1440 VFMJ11_1441     TRUE 0.998 14.000 0.750 0.002 Y NA
 7070889 7070890 VFMJ11_1441 VFMJ11_1442     TRUE 0.985 13.000 0.708 NA   NA
 7070890 7070891 VFMJ11_1442 VFMJ11_1443     TRUE 0.651 85.000 0.200 NA   NA
 7070891 7070892 VFMJ11_1443 VFMJ11_1444     TRUE 0.981 5.000 0.347 NA   NA
 7070892 7070893 VFMJ11_1444 VFMJ11_1445     FALSE 0.177 204.000 0.195 NA   NA
 7070893 7070894 VFMJ11_1445 VFMJ11_1446     TRUE 0.994 -19.000 0.901 NA   NA
 7070896 7070897 VFMJ11_1448 VFMJ11_1449     FALSE 0.497 140.000 0.286 NA N NA
 7070897 7070898 VFMJ11_1449 VFMJ11_1450     FALSE 0.001 240.000 0.000 NA N NA
 7070898 7070899 VFMJ11_1450 VFMJ11_1451   pcp FALSE 0.001 265.000 0.000 1.000 N NA
 7070899 7070900 VFMJ11_1451 VFMJ11_1452 pcp   TRUE 0.952 12.000 0.300 NA   NA
 7070900 7070901 VFMJ11_1452 VFMJ11_1453     TRUE 0.994 10.000 0.939 NA   NA
 7070901 7070902 VFMJ11_1453 VFMJ11_1454     FALSE 0.027 203.000 0.000 NA   NA
 7070902 7070903 VFMJ11_1454 VFMJ11_1455     FALSE 0.016 82.000 0.032 NA N NA
 7070903 7070904 VFMJ11_1455 VFMJ11_1456     TRUE 0.998 -16.000 0.909 NA Y NA
 7070904 7070905 VFMJ11_1456 VFMJ11_1457     TRUE 0.997 0.000 0.909 1.000   NA
 7070905 7070906 VFMJ11_1457 VFMJ11_1458     FALSE 0.309 42.000 0.038 NA   NA
 7070908 7070909 VFMJ11_1460 VFMJ11_1461     TRUE 0.816 2.000 0.000 1.000   NA
 7070909 7070910 VFMJ11_1461 VFMJ11_1462     FALSE 0.090 141.000 0.000 NA   NA
 7070910 7070911 VFMJ11_1462 VFMJ11_1463     FALSE 0.294 63.000 0.049 NA   NA
 7070911 7070912 VFMJ11_1463 VFMJ11_1464     FALSE 0.011 145.000 0.000 1.000 N NA
 7070914 7070915 VFMJ11_1466 VFMJ11_1467     TRUE 0.595 90.000 0.000 0.008   NA
 7070915 7070916 VFMJ11_1467 VFMJ11_1468     TRUE 0.811 2.000 0.000 NA   NA
 7070916 7070917 VFMJ11_1468 VFMJ11_1469     FALSE 0.389 35.000 0.043 NA   NA
 7070917 7070918 VFMJ11_1469 VFMJ11_1470     FALSE 0.049 24.000 0.004 1.000 N NA
 7070918 7070919 VFMJ11_1470 VFMJ11_1471     FALSE 0.467 20.000 0.000 1.000   NA
 7070921 7070922 VFMJ11_1473 VFMJ11_1474     FALSE 0.034 188.000 0.000 NA   NA
 7070922 7070923 VFMJ11_1474 VFMJ11_1475     TRUE 0.610 146.000 0.333 NA   NA
 7070923 7070924 VFMJ11_1475 VFMJ11_1476     TRUE 0.632 101.000 0.222 NA   NA
 7070924 7070925 VFMJ11_1476 VFMJ11_1477     FALSE 0.136 109.000 0.000 NA   NA
 7070926 7070927 VFMJ11_1478 VFMJ11_1479     TRUE 0.855 39.000 0.287 NA   NA
 7070927 7070928 VFMJ11_1479 VFMJ11_1480     TRUE 0.941 19.000 0.160 1.000 Y NA
 7070929 7070930 VFMJ11_1481 VFMJ11_1482     TRUE 0.697 21.000 0.088 NA   NA
 7070932 7070933 VFMJ11_1484 VFMJ11_1485     TRUE 0.997 -3.000 0.312 0.099 Y NA
 7070934 7070935 VFMJ11_1486 VFMJ11_1487     TRUE 0.996 4.000 0.524 NA Y NA
 7070935 7070936 VFMJ11_1487 VFMJ11_1488     TRUE 0.727 14.000 0.115 1.000 N NA
 7070936 7070937 VFMJ11_1488 VFMJ11_1489   mobA FALSE 0.246 -22.000 0.035 1.000 N NA
 7070937 7070938 VFMJ11_1489 VFMJ11_1490 mobA   TRUE 0.992 -3.000 0.073 0.003 Y NA
 7070938 7070939 VFMJ11_1490 VFMJ11_1491     FALSE 0.021 218.000 0.000 NA   NA
 7070940 7070941 VFMJ11_1492 VFMJ11_1493     TRUE 0.892 14.000 0.188 NA   NA
 7070941 7070942 VFMJ11_1493 VFMJ11_1494     TRUE 0.985 -18.000 0.500 NA   NA
 7070942 7070943 VFMJ11_1494 VFMJ11_1495     TRUE 0.600 132.000 0.286 NA   NA
 7070943 7070944 VFMJ11_1495 VFMJ11_1496     FALSE 0.418 25.000 0.000 NA   NA
 7070946 7070947 VFMJ11_1498 VFMJ11_1499     FALSE 0.428 126.000 0.167 NA   NA
 7070952 7070953 VFMJ11_1504 VFMJ11_1505     FALSE 0.017 237.000 0.000 NA   NA
 7070956 7070957 VFMJ11_1508 VFMJ11_1509     FALSE 0.253 54.000 0.000 1.000   NA
 7070959 7070960 VFMJ11_1511 VFMJ11_1512     FALSE 0.047 172.000 0.000 NA   NA
 7070960 7070961 VFMJ11_1512 VFMJ11_1513     TRUE 0.821 0.000 0.000 NA   NA
 7070961 7070962 VFMJ11_1513 VFMJ11_1514     TRUE 0.978 -7.000 0.286 NA   NA
 7070962 7070963 VFMJ11_1514 VFMJ11_1515     TRUE 0.992 -10.000 0.636 NA   NA
 7070963 7070964 VFMJ11_1515 VFMJ11_1516     TRUE 0.995 -3.000 0.636 NA   NA
 7070964 7070965 VFMJ11_1516 VFMJ11_1517     TRUE 0.994 9.000 0.875 NA   NA
 7070965 7070966 VFMJ11_1517 VFMJ11_1518     TRUE 0.765 81.000 0.286 1.000   NA
 7070966 7070967 VFMJ11_1518 VFMJ11_1519     FALSE 0.209 202.000 0.214 1.000   NA
 7070968 7070969 VFMJ11_1520 VFMJ11_1521     TRUE 0.893 68.000 0.500 NA   NA
 7070969 7070970 VFMJ11_1521 VFMJ11_1522     TRUE 0.662 -25.000 0.000 NA   NA
 7070970 7070971 VFMJ11_1522 VFMJ11_1523     FALSE 0.183 85.000 0.000 NA   NA
 7070972 7070973 VFMJ11_1524 VFMJ11_1525     TRUE 0.690 8.000 0.000 NA   NA
 7070974 7070975 VFMJ11_1526 VFMJ11_1527     TRUE 0.937 0.000 0.100 NA   NA
 7070975 7070976 VFMJ11_1527 VFMJ11_1528     TRUE 0.985 -3.000 0.314 NA   NA
 7070977 7070978 VFMJ11_1529 VFMJ11_1530     FALSE 0.133 110.000 0.000 NA   NA
 7070978 7070979 VFMJ11_1530 VFMJ11_1531     FALSE 0.090 56.000 0.009 NA   NA
 7070981 7070982 VFMJ11_1533 VFMJ11_1534     FALSE 0.152 99.000 0.000 NA   NA
 7070982 7070983 VFMJ11_1534 VFMJ11_1535     FALSE 0.078 149.000 0.000 NA   NA
 7070983 7070984 VFMJ11_1535 VFMJ11_1536     FALSE 0.347 33.000 0.000 NA   NA
 7070984 7070985 VFMJ11_1536 VFMJ11_1537     FALSE 0.039 180.000 0.000 NA   NA
 7070985 7070986 VFMJ11_1537 VFMJ11_1538     FALSE 0.004 571.000 0.000 NA   NA
 7070986 7070987 VFMJ11_1538 VFMJ11_1539     TRUE 0.950 9.000 0.211 NA   NA
 7070988 7070989 VFMJ11_1540 VFMJ11_1541     TRUE 0.982 13.000 0.337 1.000 Y NA
 7070989 7070990 VFMJ11_1541 VFMJ11_1542   rbsC TRUE 0.997 -3.000 0.504 1.000 Y NA
 7070990 7070991 VFMJ11_1542 VFMJ11_1543 rbsC   TRUE 0.957 124.000 0.847 NA Y NA
 7070991 7070992 VFMJ11_1543 VFMJ11_1544   rbsK TRUE 0.604 191.000 0.347 NA Y NA
 7070992 7070993 VFMJ11_1544 VFMJ11_1545 rbsK   TRUE 0.868 66.000 0.500 1.000 N NA
 7070996 7070997 VFMJ11_1548 VFMJ11_1549     FALSE 0.031 193.000 0.000 NA   NA
 7070998 7070999 VFMJ11_1550 VFMJ11_1551     FALSE 0.001 365.000 0.000 NA N NA
 7071000 7071001 VFMJ11_1552 VFMJ11_1553     FALSE 0.172 90.000 0.000 NA   NA
 7071002 7071003 VFMJ11_1554 VFMJ11_1555     FALSE 0.144 165.000 0.091 NA   NA
 7071003 7071004 VFMJ11_1555 VFMJ11_1556     FALSE 0.031 192.000 0.000 NA   NA
 7071004 7071005 VFMJ11_1556 VFMJ11_1557     TRUE 0.738 -10.000 0.000 NA   NA
 7071005 7071006 VFMJ11_1557 VFMJ11_1558     TRUE 0.913 134.000 1.000 NA   NA
 7071006 7071007 VFMJ11_1558 VFMJ11_1559     FALSE 0.007 357.000 0.000 NA   NA
 7071007 7071008 VFMJ11_1559 VFMJ11_1560     TRUE 0.977 2.000 0.222 NA   NA
 7071008 7071009 VFMJ11_1560 VFMJ11_1561     FALSE 0.021 218.000 0.000 NA   NA
 7071009 7071010 VFMJ11_1561 VFMJ11_1562     TRUE 0.692 3.000 0.054 NA N NA
 7071012 7071013 VFMJ11_1564 VFMJ11_1565     TRUE 0.996 0.000 0.675 NA   NA
 7071015 7071016 VFMJ11_1567 VFMJ11_1568     TRUE 0.947 2.000 0.121 NA   NA
 7071018 7071019 VFMJ11_1570 VFMJ11_1571     FALSE 0.060 163.000 0.000 1.000   NA
 7071019 7071020 VFMJ11_1571 VFMJ11_1572     FALSE 0.063 159.000 0.000 NA   NA
 7071021 7071022 VFMJ11_1573 VFMJ11_1574     FALSE 0.010 294.000 0.000 NA   NA
 7071023 7071024 VFMJ11_1575 VFMJ11_1576 sbcB   FALSE 0.321 102.000 0.086 1.000   NA
 7071024 7071025 VFMJ11_1576 VFMJ11_1577     TRUE 0.988 0.000 0.340 NA   NA
 7071025 7071026 VFMJ11_1577 VFMJ11_1578   cdd FALSE 0.313 152.000 0.198 NA N NA
 7071028 7071029 VFMJ11_1580 VFMJ11_1581 purT   FALSE 0.002 189.000 0.024 1.000 N NA
 7071030 7071031 VFMJ11_1582 VFMJ11_1583   cysB TRUE 0.614 33.000 0.094 NA   NA
 7071035 7071036 VFMJ11_1587 VFMJ11_1588     FALSE 0.014 253.000 0.000 NA   NA
 7071036 7071037 VFMJ11_1588 VFMJ11_1589     TRUE 0.867 66.000 0.500 NA N NA
 7071037 7071038 VFMJ11_1589 VFMJ11_1590     TRUE 0.592 40.000 0.105 NA   NA
 7071040 7071041 VFMJ11_1592 VFMJ11_1593   hrpA FALSE 0.145 110.000 0.036 1.000   NA
 7071044 7071045 VFMJ11_1596 VFMJ11_1597     FALSE 0.146 300.000 0.000 0.016 Y NA
 7071045 7071046 VFMJ11_1597 VFMJ11_1598     FALSE 0.060 163.000 0.000 1.000   NA
 7071049 7071050 VFMJ11_1601 VFMJ11_1602   iadA TRUE 0.551 11.000 0.062 1.000 N NA
 7071052 7071053 VFMJ11_1604 VFMJ11_1605     FALSE 0.031 194.000 0.000 1.000   NA
 7071055 7071056 VFMJ11_1607 VFMJ11_1608     FALSE 0.279 91.000 0.063 1.000   NA
 7071057 7071058 VFMJ11_1609 VFMJ11_1610     TRUE 0.997 0.000 0.800 NA   NA
 7071058 7071059 VFMJ11_1610 VFMJ11_1611     FALSE 0.360 183.000 0.032 0.097 Y NA
 7071059 7071060 VFMJ11_1611 VFMJ11_1612     TRUE 0.860 161.000 1.000 NA   NA
 7071063 7071064 VFMJ11_1615 VFMJ11_1616 udp zntA FALSE 0.002 233.000 0.000 1.000 N NA
 7071064 7071065 VFMJ11_1616 VFMJ11_1617 zntA   FALSE 0.296 151.000 0.000 0.047   NA
 7071065 7071066 VFMJ11_1617 VFMJ11_1618     TRUE 0.920 129.000 1.000 1.000   NA
 7071066 7071067 VFMJ11_1618 VFMJ11_1619     FALSE 0.052 157.000 0.025 1.000   NA
 7071070 7071071 VFMJ11_1622 VFMJ11_1623     FALSE 0.125 114.000 0.000 NA   NA
 7071072 7071073 VFMJ11_1624 VFMJ11_1625     TRUE 0.667 9.000 0.069 1.000 N NA
 7071074 7071075 VFMJ11_1626 VFMJ11_1627     TRUE 0.972 91.000 0.548 0.044 Y NA
 7071075 7071076 VFMJ11_1627 VFMJ11_1628     TRUE 0.999 3.000 0.815 0.015 Y NA
 7071076 7071077 VFMJ11_1628 VFMJ11_1629     TRUE 0.989 28.000 0.734 1.000 Y NA
 7071077 7071078 VFMJ11_1629 VFMJ11_1630     FALSE 0.021 219.000 0.000 1.000   NA
 7071080 7071081 VFMJ11_1632 VFMJ11_1633     TRUE 0.811 2.000 0.000 NA   NA
 7071081 7071082 VFMJ11_1633 VFMJ11_1634     FALSE 0.115 139.000 0.042 NA   NA
 7071083 7071084 VFMJ11_1635 VFMJ11_1636     TRUE 0.988 8.000 0.556 1.000   NA
 7071084 7071085 VFMJ11_1636 VFMJ11_1637     FALSE 0.126 116.000 0.000 1.000   NA
 7071086 7071087 VFMJ11_1638 VFMJ11_1639     FALSE 0.112 124.000 0.000 NA   NA
 7071089 7071090 VFMJ11_1641 VFMJ11_1642     TRUE 0.917 42.000 0.467 1.000   NA
 7071091 7071092 VFMJ11_1643 VFMJ11_1644     TRUE 0.997 0.000 0.538 NA Y NA
 7071092 7071093 VFMJ11_1644 VFMJ11_1645   ccmF_1 TRUE 0.998 -3.000 0.357 0.003 Y NA
 7071093 7071094 VFMJ11_1645 VFMJ11_1646 ccmF_1 nrfD TRUE 0.815 75.000 0.400 1.000 N NA
 7071094 7071095 VFMJ11_1646 VFMJ11_1647 nrfD nrfC TRUE 0.999 2.000 0.927 0.001 N NA
 7071095 7071096 VFMJ11_1647 VFMJ11_1648 nrfC nrfB TRUE 0.994 2.000 0.244 0.001   NA
 7071098 7071099 VFMJ11_1650 VFMJ11_1651     TRUE 0.642 -49.000 0.000 NA   NA
 7071099 7071100 VFMJ11_1651 VFMJ11_1652     FALSE 0.165 93.000 0.000 NA   NA
 7071100 7071101 VFMJ11_1652 VFMJ11_1653     FALSE 0.396 97.000 0.105 1.000   NA
 7071102 7071103 VFMJ11_1654 VFMJ11_1655     FALSE 0.507 111.000 0.178 NA   NA
 7071103 7071104 VFMJ11_1655 VFMJ11_1656     FALSE 0.311 75.000 0.058 NA   NA
 7071105 7071106 VFMJ11_1657 VFMJ11_1658     FALSE 0.009 303.000 0.000 NA   NA
 7071108 7071109 VFMJ11_1660 VFMJ11_1661     TRUE 0.989 -10.000 0.530 1.000   NA
 7071109 7071110 VFMJ11_1661 VFMJ11_1662     TRUE 0.988 4.000 0.435 NA   NA
 7071110 7071111 VFMJ11_1662 VFMJ11_1663     FALSE 0.067 156.000 0.000 NA   NA
 7071111 7071112 VFMJ11_1663 VFMJ11_1664     FALSE 0.010 291.000 0.000 NA   NA
 7071112 7071113 VFMJ11_1664 VFMJ11_1665     FALSE 0.035 186.000 0.000 NA   NA
 7071113 7071114 VFMJ11_1665 VFMJ11_1666     FALSE 0.514 15.000 0.000 NA   NA
 7071114 7071115 VFMJ11_1666 VFMJ11_1667     FALSE 0.288 41.000 0.000 NA   NA
 7071115 7071116 VFMJ11_1667 VFMJ11_1668     FALSE 0.203 78.000 0.000 NA   NA
 7071116 7071117 VFMJ11_1668 VFMJ11_1669     FALSE 0.514 15.000 0.000 NA   NA
 7071117 7071118 VFMJ11_1669 VFMJ11_1671     FALSE 0.105 129.000 0.000 NA   NA
 7071120 7071121 VFMJ11_1672 VFMJ11_1673     FALSE 0.047 181.000 0.041 NA   NA
 7071122 7071123 VFMJ11_1674 VFMJ11_1675 torD   FALSE 0.011 281.000 0.000 1.000   NA
 7071123 7071124 VFMJ11_1675 VFMJ11_1676     FALSE 0.028 477.000 0.000 NA Y NA
 7071130 7071131 VFMJ11_1682 VFMJ11_1683     FALSE 0.057 130.000 0.016 1.000   NA
 7071132 7071133 VFMJ11_1684 VFMJ11_1685     FALSE 0.254 3.000 0.000 NA N NA
 7071134 7071135 VFMJ11_1686 VFMJ11_1687     FALSE 0.188 83.000 0.000 NA   NA
 7071135 7071136 VFMJ11_1687 VFMJ11_1688     FALSE 0.188 83.000 0.000 NA   NA
 7071136 7071137 VFMJ11_1688 VFMJ11_1689     FALSE 0.188 83.000 0.000 NA   NA
 7071137 7071138 VFMJ11_1689 VFMJ11_1690     FALSE 0.188 83.000 0.000 NA   NA
 7071138 7071139 VFMJ11_1690 VFMJ11_1691     FALSE 0.188 83.000 0.000 NA   NA
 7071139 7071140 VFMJ11_1691 VFMJ11_1692   xth FALSE 0.004 489.000 0.000 NA   NA
 7071140 7071141 VFMJ11_1692 VFMJ11_1693 xth grxB FALSE 0.019 75.000 0.032 1.000 N NA
 7071142 7071143 VFMJ11_1694 VFMJ11_1695     FALSE 0.082 147.000 0.000 NA   NA
 7071143 7071144 VFMJ11_1695 VFMJ11_1696     TRUE 0.999 3.000 0.903 0.015 Y NA
 7071144 7071145 VFMJ11_1696 VFMJ11_1697     TRUE 0.954 127.000 0.571 0.059 Y NA
 7071145 7071146 VFMJ11_1697 VFMJ11_1698     TRUE 0.955 74.000 0.533 1.000 Y NA
 7071147 7071148 VFMJ11_1699 VFMJ11_1700   pflB_1 FALSE 0.025 287.000 0.080 NA   NA
 7071148 7071149 VFMJ11_1700 VFMJ11_1701 pflB_1 pflA FALSE 0.099 160.000 0.092 1.000 N NA
 7071149 7071150 VFMJ11_1701 VFMJ11_1702 pflA   FALSE 0.068 66.000 0.007 NA   NA
 7071151 7071152 VFMJ11_1703 VFMJ11_1704   oppD TRUE 0.991 0.000 0.025 0.002 Y NA
 7071152 7071153 VFMJ11_1704 VFMJ11_1705 oppD   TRUE 0.967 51.000 0.554 1.000 Y NA
 7071153 7071154 VFMJ11_1705 VFMJ11_1706   oppB TRUE 0.997 15.000 0.870 0.044 Y NA
 7071154 7071155 VFMJ11_1706 VFMJ11_1707 oppB   TRUE 0.809 106.000 0.096 0.044 Y NA
 7071157 7071158 VFMJ11_1709 VFMJ11_1710 tdk cysS FALSE 0.312 82.000 0.008 0.096 N NA
 7071159 7071160 VFMJ11_1711 VFMJ11_1712   lpxH TRUE 0.758 61.000 0.237 1.000   NA
 7071160 7071161 VFMJ11_1712 VFMJ11_1713 lpxH   FALSE 0.032 114.000 0.005 NA   NA
 7071161 7071162 VFMJ11_1713 VFMJ11_1714     TRUE 0.983 13.000 0.667 NA   NA
 7071166 7071167 VFMJ11_1718 VFMJ11_1719   moeB TRUE 0.995 11.000 0.323 0.003 Y NA
 7071167 7071168 VFMJ11_1719 VFMJ11_1720 moeB   FALSE 0.002 258.000 0.000 1.000 N NA
 7071168 7071169 VFMJ11_1720 VFMJ11_1721   pstC TRUE 0.648 76.000 0.040 1.000 Y NA
 7071169 7071170 VFMJ11_1721 VFMJ11_1722 pstC pstA TRUE 0.996 5.000 0.219 0.002 Y NA
 7071170 7071171 VFMJ11_1722 VFMJ11_1723 pstA pstB_1 TRUE 0.980 65.000 0.428 0.002 Y NA
 7071172 7071173 VFMJ11_1724 VFMJ11_1725     TRUE 0.690 8.000 0.000 NA   NA
 7071173 7071174 VFMJ11_1725 VFMJ11_1726     TRUE 0.990 -3.000 0.417 NA   NA
 7071174 7071175 VFMJ11_1726 VFMJ11_1727     FALSE 0.005 448.000 0.000 NA   NA
 7071175 7071176 VFMJ11_1727 VFMJ11_1728     FALSE 0.240 56.000 0.000 NA   NA
 7071177 7071178 VFMJ11_1729 VFMJ11_1730     TRUE 0.951 92.000 1.000 NA   NA
 7071178 7071179 VFMJ11_1730 VFMJ11_1731     FALSE 0.418 25.000 0.000 NA   NA
 7071180 7071181 VFMJ11_1732 VFMJ11_1733   torS FALSE 0.425 133.000 0.033 1.000 Y NA
 7071182 7071183 VFMJ11_1734 VFMJ11_1735 torT mgsA TRUE 0.587 97.000 0.049 NA Y NA
 7071185 7071186 VFMJ11_1737 VFMJ11_1738 yccS   FALSE 0.104 130.000 0.000 NA   NA
 7071187 7071188 VFMJ11_1739 VFMJ11_1740     FALSE 0.337 34.000 0.000 NA   NA
 7071188 7071189 VFMJ11_1740 VFMJ11_1741     FALSE 0.203 78.000 0.000 NA   NA
 7071189 7071190 VFMJ11_1741 VFMJ11_1742     FALSE 0.347 33.000 0.000 NA   NA
 7071190 7071191 VFMJ11_1742 VFMJ11_1743     FALSE 0.203 78.000 0.000 NA   NA
 7071191 7071192 VFMJ11_1743 VFMJ11_1744     FALSE 0.469 19.000 0.000 NA   NA
 7071192 7071193 VFMJ11_1744 VFMJ11_1745   pgsA FALSE 0.008 316.000 0.000 NA   NA
 7071193 7071194 VFMJ11_1745 VFMJ11_1746 pgsA uvrC TRUE 0.730 46.000 0.227 1.000 N NA
 7071194 7071195 VFMJ11_1746 VFMJ11_1747 uvrC   TRUE 0.671 63.000 0.086 0.016 N NA
 7071195 7071196 VFMJ11_1747 VFMJ11_1748     FALSE 0.003 178.000 0.018 1.000 N NA
 7071196 7071197 VFMJ11_1748 VFMJ11_1749     TRUE 0.747 29.000 0.133 NA   NA
 7071197 7071198 VFMJ11_1749 VFMJ11_1750     FALSE 0.325 109.000 0.095 NA   NA
 7071200 7071201 VFMJ11_1752 VFMJ11_1753   fadR FALSE 0.001 302.000 0.000 1.000 N NA
 7071202 7071203 VFMJ11_1754 VFMJ11_1755 nhaB   TRUE 0.924 69.000 0.723 1.000 N NA
 7071205 7071206 VFMJ11_1757 VFMJ11_1758     FALSE 0.091 52.000 0.008 NA   NA
 7071207 7071208 VFMJ11_1759 VFMJ11_1760     FALSE 0.179 125.000 0.059 NA   NA
 7071208 7071209 VFMJ11_1760 VFMJ11_1761     FALSE 0.152 80.000 0.025 NA   NA
 7071209 7071210 VFMJ11_1761 VFMJ11_1762     FALSE 0.022 54.000 0.017 1.000 N NA
 7071211 7071212 VFMJ11_1763 VFMJ11_1764 sppA ansA FALSE 0.313 93.000 0.113 1.000 N NA
 7071215 7071216 VFMJ11_1767 VFMJ11_1768     FALSE 0.223 142.000 0.091 NA   NA
 7071217 7071218 VFMJ11_1769 VFMJ11_1770     TRUE 0.577 20.000 0.053 NA   NA
 7071218 7071219 VFMJ11_1770 VFMJ11_1771     FALSE 0.026 205.000 0.000 NA   NA
 7071219 7071220 VFMJ11_1771 VFMJ11_1772     FALSE 0.301 39.000 0.000 NA   NA
 7071220 7071221 VFMJ11_1772 VFMJ11_1773     FALSE 0.008 321.000 0.000 NA   NA
 7071221 7071222 VFMJ11_1773 VFMJ11_1774     FALSE 0.295 40.000 0.000 NA   NA
 7071222 7071223 VFMJ11_1774 VFMJ11_1775     FALSE 0.012 271.000 0.000 NA   NA
 7071223 7071224 VFMJ11_1775 VFMJ11_1776     FALSE 0.129 112.000 0.000 NA   NA
 7071224 7071225 VFMJ11_1776 VFMJ11_1777     FALSE 0.010 296.000 0.000 NA   NA
 7071225 7071226 VFMJ11_1777 VFMJ11_1778     FALSE 0.004 476.000 0.000 NA   NA
 7071227 7071228 VFMJ11_1779 VFMJ11_1780     FALSE 0.102 81.000 0.013 1.000   NA
 7071229 7071230 VFMJ11_1781 VFMJ11_1782     TRUE 0.567 2.000 0.042 NA N NA
 7071233 7071234 VFMJ11_1785 VFMJ11_1786     TRUE 0.821 0.000 0.000 NA   NA
 7071236 7071237 VFMJ11_1788 VFMJ11_1789     FALSE 0.025 147.000 0.007 1.000   NA
 7071238 7071239 VFMJ11_1790 VFMJ11_1791     TRUE 0.632 30.000 0.090 1.000   NA
 7071240 7071241 VFMJ11_1792 VFMJ11_1793 menE menC TRUE 0.988 -12.000 0.283 0.002 N NA
 7071241 7071242 VFMJ11_1793 VFMJ11_1794 menC menB TRUE 0.939 76.000 0.171 0.002 Y NA
 7071242 7071243 VFMJ11_1794 VFMJ11_1795 menB   TRUE 0.970 6.000 0.280 NA   NA
 7071243 7071244 VFMJ11_1795 VFMJ11_1796   menD TRUE 0.955 14.000 0.355 NA   NA
 7071244 7071245 VFMJ11_1796 VFMJ11_1797 menD   TRUE 0.993 -3.000 0.281 1.000 Y NA
 7071251 7071252 VFMJ11_1803 VFMJ11_1804     FALSE 0.040 179.000 0.000 NA   NA
 7071252 7071253 VFMJ11_1804 VFMJ11_1805     FALSE 0.208 95.000 0.083 NA N NA
 7071257 7071258 VFMJ11_1809 VFMJ11_1810 recR   TRUE 0.874 102.000 0.604 NA   NA
 7071258 7071259 VFMJ11_1810 VFMJ11_1811     TRUE 0.789 106.000 0.411 NA   NA
 7071259 7071260 VFMJ11_1811 VFMJ11_1812   apt FALSE 0.208 104.000 0.088 1.000 N NA
 7071260 7071261 VFMJ11_1812 VFMJ11_1814 apt   FALSE 0.000 561.000 0.000 1.000 N NA
 7071262 7071263 VFMJ11_1813 VFMJ11_1815     FALSE 0.075 151.000 0.000 NA   NA
 7071264 7071265 VFMJ11_1816 VFMJ11_1817 purF cvpA TRUE 0.857 35.000 0.262 1.000   NA
 7071265 7071266 VFMJ11_1817 VFMJ11_1818 cvpA   FALSE 0.529 62.000 0.116 NA   NA
 7071266 7071267 VFMJ11_1818 VFMJ11_1819     TRUE 0.945 10.000 0.216 NA   NA
 7071267 7071268 VFMJ11_1819 VFMJ11_1820   accD TRUE 0.738 101.000 0.383 1.000 N NA
 7071268 7071269 VFMJ11_1820 VFMJ11_1821 accD   TRUE 0.710 -13.000 0.000 NA   NA
 7071269 7071270 VFMJ11_1821 VFMJ11_1822   truA TRUE 0.771 -7.000 0.000 NA   NA
 7071270 7071271 VFMJ11_1822 VFMJ11_1823 truA   FALSE 0.015 87.000 0.021 NA N NA
 7071271 7071272 VFMJ11_1823 VFMJ11_1824   asd_2 FALSE 0.002 191.000 0.009 NA N NA
 7071272 7071273 VFMJ11_1824 VFMJ11_1825 asd_2   TRUE 0.993 0.000 0.097 0.007 Y NA
 7071273 7071274 VFMJ11_1825 VFMJ11_1826     FALSE 0.105 128.000 0.069 1.000 N NA
 7071276 7071277 VFMJ11_1828 VFMJ11_1829     TRUE 0.982 5.000 0.363 NA   NA
 7071278 7071279 VFMJ11_1830 VFMJ11_1831 minC minD TRUE 0.979 26.000 0.466 1.000 Y NA
 7071279 7071280 VFMJ11_1831 VFMJ11_1832 minD minE TRUE 0.997 3.000 0.618 NA Y NA
 7071281 7071282 VFMJ11_1833 VFMJ11_1834 rnd   FALSE 0.220 129.000 0.115 1.000 N NA
 7071282 7071283 VFMJ11_1834 VFMJ11_1835     FALSE 0.206 186.000 0.184 NA   NA
 7071283 7071284 VFMJ11_1835 VFMJ11_1836     FALSE 0.525 7.000 0.015 NA   NA
 7071284 7071285 VFMJ11_1836 VFMJ11_1837     FALSE 0.499 72.000 0.111 NA   NA
 7071285 7071286 VFMJ11_1837 VFMJ11_1838     FALSE 0.141 60.000 0.018 NA   NA
 7071286 7071287 VFMJ11_1838 VFMJ11_1839     TRUE 0.751 8.000 0.082 1.000 N NA
 7071289 7071290 VFMJ11_1841 VFMJ11_1842     FALSE 0.055 166.000 0.000 1.000   NA
 7071291 7071292 VFMJ11_1843 VFMJ11_1844     FALSE 0.514 15.000 0.000 NA   NA
 7071293 7071294 VFMJ11_1845 VFMJ11_1846   malX TRUE 0.766 123.000 0.531 1.000 N NA
 7071295 7071296 VFMJ11_1847 VFMJ11_1848     FALSE 0.123 119.000 0.000 1.000   NA
 7071300 7071301 VFMJ11_1852 VFMJ11_1853 dcuC   FALSE 0.041 370.000 0.000 1.000 Y NA
 7071303 7071304 VFMJ11_1855 VFMJ11_1856     FALSE 0.007 355.000 0.000 1.000   NA
 7071304 7071305 VFMJ11_1856 VFMJ11_1857     FALSE 0.006 373.000 0.000 1.000   NA
 7071305 7071306 VFMJ11_1857 VFMJ11_1858     FALSE 0.013 263.000 0.000 NA   NA
 7071307 7071308 VFMJ11_1859 VFMJ11_1860 ptsG   FALSE 0.000 450.000 0.004 NA N NA
 7071308 7071309 VFMJ11_1860 VFMJ11_1861     TRUE 0.973 -10.000 0.110 NA Y NA
 7071309 7071310 VFMJ11_1861 VFMJ11_1862   tmk TRUE 0.950 -10.000 0.211 1.000 N NA
 7071310 7071311 VFMJ11_1862 VFMJ11_1863 tmk   TRUE 0.972 3.000 0.209 NA   NA
 7071311 7071312 VFMJ11_1863 VFMJ11_1864   pabC TRUE 0.969 -6.000 0.204 NA   NA
 7071312 7071313 VFMJ11_1864 VFMJ11_1865 pabC fabF FALSE 0.430 113.000 0.187 1.000 N NA
 7071313 7071314 VFMJ11_1865 VFMJ11_1866 fabF acpP TRUE 0.903 92.000 0.346 1.000 Y NA
 7071314 7071315 VFMJ11_1866 VFMJ11_1867 acpP fabG TRUE 0.850 170.000 0.321 0.004 Y NA
 7071315 7071316 VFMJ11_1867 VFMJ11_1868 fabG fabD TRUE 0.994 17.000 0.432 0.004 Y NA
 7071316 7071317 VFMJ11_1868 VFMJ11_1869 fabD   TRUE 0.940 67.000 0.182 0.004 Y NA
 7071317 7071318 VFMJ11_1869 VFMJ11_1870   plsX TRUE 0.997 6.000 0.380 0.004 Y NA
 7071318 7071319 VFMJ11_1870 VFMJ11_1871 plsX rpmF TRUE 0.966 11.000 0.418 1.000 N NA
 7071319 7071320 VFMJ11_1871 VFMJ11_1872 rpmF   TRUE 0.974 17.000 0.599 NA   NA
 7071323 7071324 VFMJ11_1875 VFMJ11_1876     FALSE 0.007 177.000 0.034 1.000 N NA
 7071324 7071325 VFMJ11_1876 VFMJ11_1877   cobO FALSE 0.020 101.000 0.000 1.000 N NA
 7071326 7071327 VFMJ11_1878 VFMJ11_1879   udk FALSE 0.008 175.000 0.037 NA N NA
 7071327 7071328 VFMJ11_1879 VFMJ11_1880 udk   FALSE 0.438 105.000 0.073 0.095 N NA
 7071330 7071331 VFMJ11_1882 VFMJ11_1883 pyrF   FALSE 0.300 112.000 0.125 1.000 N NA
 7071331 7071332 VFMJ11_1883 VFMJ11_1884     TRUE 0.988 8.000 0.576 NA   NA
 7071332 7071333 VFMJ11_1884 VFMJ11_1885   ihfB FALSE 0.488 135.000 0.208 NA   NA
 7071333 7071334 VFMJ11_1885 VFMJ11_1886 ihfB rpsA TRUE 0.754 61.000 0.292 1.000 N NA
 7071334 7071335 VFMJ11_1886 VFMJ11_1887 rpsA cmk TRUE 0.641 96.000 0.281 1.000 N NA
 7071335 7071336 VFMJ11_1887 VFMJ11_1888 cmk aroA FALSE 0.312 158.000 0.209 1.000 N NA
 7071337 7071338 VFMJ11_1889 VFMJ11_1890 aat   TRUE 0.993 -3.000 0.285 1.000 Y NA
 7071338 7071339 VFMJ11_1890 VFMJ11_1891   infA FALSE 0.203 90.000 0.078 1.000 N NA
 7071340 7071341 VFMJ11_1892 VFMJ11_1893 clpA clpS TRUE 0.937 43.000 0.596 NA   NA
 7071342 7071343 VFMJ11_1894 VFMJ11_1895 cspD   FALSE 0.074 109.000 0.016 NA   NA
 7071344 7071345 VFMJ11_1896 VFMJ11_1897     FALSE 0.131 111.000 0.000 NA   NA
 7071346 7071347 VFMJ11_1898 VFMJ11_1899     FALSE 0.002 186.000 0.006 NA N NA
 7071347 7071348 VFMJ11_1899 VFMJ11_1900     TRUE 0.858 131.000 0.683 NA   NA
 7071348 7071349 VFMJ11_1900 VFMJ11_1901     TRUE 0.990 11.000 0.761 NA   NA
 7071351 7071352 VFMJ11_1903 VFMJ11_1904     FALSE 0.145 103.000 0.000 NA   NA
 7071355 7071356 VFMJ11_1907 VFMJ11_1908     FALSE 0.032 46.000 0.000 NA N NA
 7071356 7071357 VFMJ11_1908 VFMJ11_1909     FALSE 0.397 14.000 0.019 NA   NA
 7071357 7071358 VFMJ11_1909 VFMJ11_1910     TRUE 0.940 12.000 0.250 NA   NA
 7071359 7071360 VFMJ11_1911 VFMJ11_1912   mnmA FALSE 0.198 117.000 0.003 0.094 N NA
 7071360 7071361 VFMJ11_1912 VFMJ11_1913 mnmA   TRUE 0.903 12.000 0.180 NA   NA
 7071361 7071362 VFMJ11_1913 VFMJ11_1914   purB FALSE 0.448 70.000 0.093 NA   NA
 7071364 7071365 VFMJ11_1916 VFMJ11_1917     FALSE 0.014 258.000 0.000 1.000   NA
 7071365 7071366 VFMJ11_1917 VFMJ11_1918     TRUE 0.936 69.000 0.690 NA   NA
 7071366 7071367 VFMJ11_1918 VFMJ11_1919     TRUE 0.985 19.000 0.844 NA   NA
 7071367 7071368 VFMJ11_1919 VFMJ11_1920     FALSE 0.105 129.000 0.000 NA   NA
 7071369 7071370 VFMJ11_1921 VFMJ11_1922   ybaK FALSE 0.127 27.000 0.004 1.000   NA
 7071370 7071371 VFMJ11_1922 VFMJ11_1923 ybaK   TRUE 0.709 24.000 0.004 0.081   NA
 7071371 7071372 VFMJ11_1923 VFMJ11_1924     TRUE 0.930 30.000 0.087 0.081 Y NA
 7071373 7071374 VFMJ11_1925 VFMJ11_1926 fhs   FALSE 0.176 104.000 0.042 NA   NA
 7071376 7071377 VFMJ11_1928 VFMJ11_1929 rrmA   FALSE 0.014 261.000 0.000 1.000   NA
 7071378 7071379 VFMJ11_1930 VFMJ11_1931   msbB FALSE 0.001 316.000 0.000 1.000 N NA
 7071381 7071382 VFMJ11_1933 VFMJ11_1934     TRUE 0.982 8.000 0.425 NA   NA
 7071383 7071384 VFMJ11_1935 VFMJ11_1936     FALSE 0.070 106.000 0.014 NA   NA
 7071391 7071392 VFMJ11_1943 VFMJ11_1944 fadJ fadI TRUE 0.996 0.000 0.430 1.000 Y NA
 7071393 7071394 VFMJ11_1945 VFMJ11_1946     FALSE 0.083 461.000 0.000 0.012 Y NA
 7071394 7071395 VFMJ11_1946 VFMJ11_1947     FALSE 0.060 161.000 0.033 NA   NA
 7071396 7071397 VFMJ11_1948 VFMJ11_1949     FALSE 0.175 203.000 0.239 NA N NA
 7071397 7071398 VFMJ11_1949 VFMJ11_1950     TRUE 0.998 -3.000 0.727 NA Y NA
 7071398 7071399 VFMJ11_1950 VFMJ11_1951     TRUE 0.998 0.000 0.578 NA Y NA
 7071399 7071400 VFMJ11_1951 VFMJ11_1952   ccmF_2 TRUE 0.999 4.000 0.804 0.003 Y NA
 7071400 7071401 VFMJ11_1952 VFMJ11_1953 ccmF_2   TRUE 0.997 -3.000 0.211 0.003 Y NA
 7071401 7071402 VFMJ11_1953 VFMJ11_1954     TRUE 0.983 -3.000 0.344 1.000 N NA
 7071402 7071403 VFMJ11_1954 VFMJ11_1955     TRUE 0.948 24.000 0.501 1.000 N NA
 7071403 7071404 VFMJ11_1955 VFMJ11_1956   ccmB TRUE 0.923 44.000 0.054 0.001 Y NA
 7071404 7071405 VFMJ11_1956 VFMJ11_1957 ccmB ccmA TRUE 0.993 1.000 0.074 0.003 Y NA
 7071405 7071406 VFMJ11_1957 VFMJ11_1958 ccmA   FALSE 0.007 281.000 0.021 NA   NA
 7071406 7071407 VFMJ11_1958 VFMJ11_1959     TRUE 0.996 0.000 0.743 NA   NA
 7071407 7071408 VFMJ11_1959 VFMJ11_1960     TRUE 0.991 29.000 0.886 0.016   NA
 7071408 7071409 VFMJ11_1960 VFMJ11_1961     TRUE 0.992 0.000 0.454 1.000   NA
 7071409 7071410 VFMJ11_1961 VFMJ11_1962     TRUE 0.901 9.000 0.170 1.000 N NA
 7071410 7071411 VFMJ11_1962 VFMJ11_1963     TRUE 0.990 16.000 0.327 0.017 Y NA
 7071411 7071412 VFMJ11_1963 VFMJ11_1964     TRUE 0.988 10.000 0.341 1.000 Y NA
 7071412 7071413 VFMJ11_1964 VFMJ11_1965     TRUE 0.977 32.000 0.516 1.000 Y NA
 7071413 7071414 VFMJ11_1965 VFMJ11_1966   fliA TRUE 0.904 37.000 0.283 0.080 N NA
 7071414 7071415 VFMJ11_1966 VFMJ11_1967 fliA   TRUE 0.987 -7.000 0.482 1.000 N NA
 7071415 7071416 VFMJ11_1967 VFMJ11_1968   flhF TRUE 0.989 -3.000 0.241 0.015 N NA
 7071416 7071417 VFMJ11_1968 VFMJ11_1969 flhF flhA TRUE 0.911 34.000 0.178 1.000 Y NA
 7071419 7071420 VFMJ11_1971 VFMJ11_1972 flhB fliR TRUE 0.915 46.000 0.240 1.000 Y NA
 7071420 7071421 VFMJ11_1972 VFMJ11_1973 fliR fliQ TRUE 0.994 38.000 0.719 0.002 Y NA
 7071421 7071422 VFMJ11_1973 VFMJ11_1974 fliQ fliP TRUE 0.998 10.000 0.702 0.011 Y NA
 7071422 7071423 VFMJ11_1974 VFMJ11_1975 fliP   TRUE 0.972 -13.000 0.122 1.000 Y NA
 7071423 7071424 VFMJ11_1975 VFMJ11_1976   fliN TRUE 0.979 24.000 0.443 1.000 Y NA
 7071424 7071425 VFMJ11_1976 VFMJ11_1977 fliN fliM TRUE 0.997 23.000 0.741 0.001 Y NA
 7071425 7071426 VFMJ11_1977 VFMJ11_1978 fliM fliL TRUE 0.995 8.000 0.241 0.001 Y NA
 7071426 7071427 VFMJ11_1978 VFMJ11_1979 fliL   TRUE 0.852 65.000 0.182 1.000 Y NA
 7071427 7071428 VFMJ11_1979 VFMJ11_1980   fliJ TRUE 0.838 172.000 0.317 0.006 Y NA
 7071428 7071429 VFMJ11_1980 VFMJ11_1981 fliJ fliI TRUE 0.959 11.000 0.127 1.000 Y NA
 7071429 7071430 VFMJ11_1981 VFMJ11_1982 fliI fliH TRUE 0.993 0.000 0.248 NA Y NA
 7071430 7071431 VFMJ11_1982 VFMJ11_1983 fliH fliG TRUE 0.874 104.000 0.320 NA Y NA
 7071431 7071432 VFMJ11_1983 VFMJ11_1984 fliG fliF TRUE 0.995 -7.000 0.189 0.006 Y NA
 7071432 7071433 VFMJ11_1984 VFMJ11_1985 fliF fliE TRUE 0.998 18.000 0.910 0.006 Y NA
 7071433 7071434 VFMJ11_1985 VFMJ11_1986 fliE   TRUE 0.778 101.000 0.446 1.000 N NA
 7071434 7071435 VFMJ11_1986 VFMJ11_1987     TRUE 0.999 4.000 0.679 0.094 Y NA
 7071435 7071436 VFMJ11_1987 VFMJ11_1988     TRUE 0.869 159.000 0.377 0.094 Y NA
 7071436 7071437 VFMJ11_1988 VFMJ11_1989   fliS FALSE 0.002 189.000 0.022 1.000 N NA
 7071437 7071438 VFMJ11_1989 VFMJ11_1990 fliS   TRUE 0.971 16.000 0.533 NA   NA
 7071438 7071439 VFMJ11_1990 VFMJ11_1991   fliD TRUE 0.981 32.000 1.000 NA   NA
 7071439 7071440 VFMJ11_1991 VFMJ11_1992 fliD   FALSE 0.535 25.000 0.053 NA   NA
 7071440 7071441 VFMJ11_1992 VFMJ11_1993     FALSE 0.455 124.000 0.000 NA Y NA
 7071441 7071442 VFMJ11_1993 VFMJ11_1994     FALSE 0.275 246.000 0.000 0.002 Y NA
 7071442 7071443 VFMJ11_1994 VFMJ11_1995     FALSE 0.125 396.000 0.000 0.002 Y NA
 7071443 7071444 VFMJ11_1995 VFMJ11_1996     FALSE 0.124 399.000 0.000 0.002 Y NA
 7071444 7071445 VFMJ11_1996 VFMJ11_1997     TRUE 0.595 58.000 0.133 NA   NA
 7071445 7071446 VFMJ11_1997 VFMJ11_1998     FALSE 0.014 253.000 0.000 NA   NA
 7071446 7071447 VFMJ11_1998 VFMJ11_1999   flgL FALSE 0.086 609.000 0.000 0.002 Y NA
 7071447 7071448 VFMJ11_1999 VFMJ11_2000 flgL flgK TRUE 0.985 18.000 0.182 0.001 Y NA
 7071448 7071449 VFMJ11_2000 VFMJ11_2001 flgK flgJ TRUE 0.825 267.000 0.705 0.002 Y NA
 7071449 7071450 VFMJ11_2001 VFMJ11_2002 flgJ flgI TRUE 0.955 110.000 0.405 0.009 Y NA
 7071450 7071451 VFMJ11_2002 VFMJ11_2003 flgI flgH TRUE 0.991 27.000 0.457 0.009 Y NA
 7071451 7071452 VFMJ11_2003 VFMJ11_2004 flgH flgG TRUE 0.998 13.000 0.909 0.006 Y NA
 7071452 7071453 VFMJ11_2004 VFMJ11_2005 flgG flgF TRUE 0.982 55.000 0.446 0.003 Y NA
 7071453 7071454 VFMJ11_2005 VFMJ11_2006 flgF flgE TRUE 0.845 215.000 0.594 0.005 Y NA
 7071454 7071455 VFMJ11_2006 VFMJ11_2007 flgE flgD TRUE 0.922 161.000 0.875 NA Y NA
 7071455 7071456 VFMJ11_2007 VFMJ11_2008 flgD flgC TRUE 0.986 16.000 0.478 NA Y NA
 7071456 7071457 VFMJ11_2008 VFMJ11_2009 flgC flgB TRUE 0.999 3.000 0.889 1.000 Y NA
 7071457 7071458 VFMJ11_2009 VFMJ11_2010 flgB cheR FALSE 0.539 196.000 0.309 1.000 Y NA
 7071458 7071459 VFMJ11_2010 VFMJ11_2011 cheR   TRUE 0.975 84.000 0.838 1.000 Y NA
 7071460 7071461 VFMJ11_2012 VFMJ11_2013 flgA   FALSE 0.535 216.000 0.371 NA Y NA
 7071461 7071462 VFMJ11_2013 VFMJ11_2014     TRUE 0.981 47.000 0.361 0.002 Y NA
 7071463 7071464 VFMJ11_2015 VFMJ11_2016     TRUE 0.942 12.000 0.260 NA   NA
 7071465 7071466 VFMJ11_2017 VFMJ11_2018     FALSE 0.021 218.000 0.000 NA   NA
 7071466 7071467 VFMJ11_2018 VFMJ11_2019     FALSE 0.188 83.000 0.000 NA   NA
 7071468 7071469 VFMJ11_2020 VFMJ11_2021 gltX   FALSE 0.010 170.000 0.004 NA   NA
 7071469 7071470 VFMJ11_2021 VFMJ11_2022     TRUE 0.773 93.000 0.333 NA   NA
 7071470 7071471 VFMJ11_2022 VFMJ11_2023     FALSE 0.089 401.000 0.333 NA   NA
 7071471 7071472 VFMJ11_2023 VFMJ11_2024     TRUE 0.773 93.000 0.333 NA   NA
 7071472 7071473 VFMJ11_2024 VFMJ11_2025   ligA FALSE 0.000 528.000 0.000 1.000 N NA
 7071473 7071474 VFMJ11_2025 VFMJ11_2026 ligA zipA FALSE 0.299 92.000 0.106 1.000 N NA
 7071475 7071476 VFMJ11_2027 VFMJ11_2028   cysK TRUE 0.618 131.000 0.122 1.000 Y NA
 7071476 7071477 VFMJ11_2028 VFMJ11_2029 cysK   FALSE 0.001 321.000 0.019 1.000 N NA
 7071477 7071478 VFMJ11_2029 VFMJ11_2030   ptsP_2 TRUE 0.852 56.000 0.022 0.010 Y NA
 7071478 7071479 VFMJ11_2030 VFMJ11_2031 ptsP_2   TRUE 0.828 76.000 0.025 0.010 Y NA
 7071480 7071481 VFMJ11_2032 VFMJ11_2033     FALSE 0.248 83.000 0.048 NA   NA
 7071481 7071482 VFMJ11_2033 VFMJ11_2034     TRUE 0.684 17.000 0.074 NA   NA
 7071484 7071485 VFMJ11_2036 VFMJ11_2037     TRUE 0.989 10.000 0.667 NA   NA
 7071485 7071486 VFMJ11_2037 VFMJ11_2038   napB TRUE 0.940 33.000 0.245 NA Y NA
 7071486 7071487 VFMJ11_2038 VFMJ11_2039 napB napA TRUE 0.965 76.000 0.643 NA Y NA
 7071487 7071488 VFMJ11_2039 VFMJ11_2040 napA napD TRUE 0.983 -3.000 0.348 NA N NA
 7071488 7071489 VFMJ11_2040 VFMJ11_2041 napD napF TRUE 0.971 -6.000 0.209 NA   NA
 7071490 7071491 VFMJ11_2042 VFMJ11_2043     TRUE 0.936 21.000 0.034 0.022 Y NA
 7071491 7071492 VFMJ11_2043 VFMJ11_2044     TRUE 0.811 2.000 0.000 NA   NA
 7071493 7071494 VFMJ11_2045 VFMJ11_2046     FALSE 0.114 167.000 0.077 NA   NA
 7071495 7071496 VFMJ11_2047 VFMJ11_2048   dapE TRUE 0.843 34.000 0.292 1.000 N NA
 7071496 7071497 VFMJ11_2048 VFMJ11_2049 dapE   TRUE 0.787 59.000 0.163 0.020 N NA
 7071497 7071498 VFMJ11_2049 VFMJ11_2050     TRUE 0.979 3.000 0.273 NA   NA
 7071499 7071500 VFMJ11_2051 VFMJ11_2052   dapA TRUE 0.978 12.000 0.267 NA Y NA
 7071501 7071502 VFMJ11_2053 VFMJ11_2054   bcp FALSE 0.261 99.000 0.102 1.000 N NA
 7071503 7071504 VFMJ11_2055 VFMJ11_2056     TRUE 0.941 9.000 0.190 NA   NA
 7071505 7071506 VFMJ11_2057 VFMJ11_2058   arsC TRUE 0.924 16.000 0.259 1.000   NA
 7071506 7071507 VFMJ11_2058 VFMJ11_2059 arsC   TRUE 0.573 60.000 0.127 NA   NA
 7071511 7071512 VFMJ11_2063 VFMJ11_2064 purM purN TRUE 0.914 124.000 0.230 0.002 Y NA
 7071513 7071514 VFMJ11_2065 VFMJ11_2066   gmhA TRUE 0.732 73.000 0.229 1.000   NA
 7071516 7071517 VFMJ11_2068 VFMJ11_2069     FALSE 0.051 173.000 0.037 NA   NA
 7071517 7071518 VFMJ11_2069 VFMJ11_2070   dnaQ TRUE 0.832 11.000 0.098 NA   NA
 7071521 7071522 VFMJ11_2073 VFMJ11_2074 gloB   TRUE 0.678 92.000 0.233 1.000   NA
 7071522 7071523 VFMJ11_2074 VFMJ11_2075     TRUE 0.846 -3.000 0.043 NA   NA
 7071524 7071525 VFMJ11_2076 VFMJ11_2077     FALSE 0.332 112.000 0.103 NA   NA
 7071525 7071526 VFMJ11_2077 VFMJ11_2078     FALSE 0.060 143.000 0.056 1.000 N NA
 7071526 7071527 VFMJ11_2078 VFMJ11_2079     FALSE 0.023 52.000 0.015 1.000 N NA
 7071527 7071528 VFMJ11_2079 VFMJ11_2080   accA FALSE 0.427 71.000 0.123 1.000 N NA
 7071528 7071529 VFMJ11_2080 VFMJ11_2081 accA dnaE FALSE 0.477 52.000 0.122 1.000 N NA
 7071529 7071530 VFMJ11_2081 VFMJ11_2082 dnaE rnhB TRUE 0.982 0.000 0.104 1.000 Y NA
 7071530 7071531 VFMJ11_2082 VFMJ11_2083 rnhB lpxB TRUE 0.934 5.000 0.186 1.000 N NA
 7071531 7071532 VFMJ11_2083 VFMJ11_2084 lpxB lpxA TRUE 0.908 69.000 0.289 1.000 Y NA
 7071532 7071533 VFMJ11_2084 VFMJ11_2085 lpxA fabZ TRUE 0.996 3.000 0.850 1.000 N NA
 7071533 7071534 VFMJ11_2085 VFMJ11_2086 fabZ lpxD TRUE 0.862 128.000 0.796 1.000 N NA
 7071534 7071535 VFMJ11_2086 VFMJ11_2087 lpxD   TRUE 0.997 9.000 0.814 1.000 Y NA
 7071535 7071536 VFMJ11_2087 VFMJ11_2088   yaeT TRUE 0.553 81.000 0.009 1.000 Y NA
 7071536 7071537 VFMJ11_2088 VFMJ11_2089 yaeT rseP TRUE 0.735 30.000 0.002 1.000 Y NA
 7071537 7071538 VFMJ11_2089 VFMJ11_2090 rseP dxr TRUE 0.991 3.000 0.568 1.000 N NA
 7071538 7071539 VFMJ11_2090 VFMJ11_2091 dxr cdsA TRUE 0.893 107.000 0.372 1.000 Y NA
 7071539 7071540 VFMJ11_2091 VFMJ11_2092 cdsA uppS TRUE 0.994 4.000 0.400 1.000 Y NA
 7071540 7071541 VFMJ11_2092 VFMJ11_2093 uppS frr TRUE 0.695 122.000 0.409 1.000 N NA
 7071541 7071542 VFMJ11_2093 VFMJ11_2094 frr pyrH TRUE 0.940 36.000 0.626 1.000 N NA
 7071542 7071543 VFMJ11_2094 VFMJ11_2095 pyrH tsf TRUE 0.580 153.000 0.416 1.000 N NA
 7071543 7071544 VFMJ11_2095 VFMJ11_2096 tsf rpsB TRUE 0.940 134.000 0.748 1.000 Y NA
 7071545 7071546 VFMJ11_2097 VFMJ11_2098 map glnD TRUE 0.703 60.000 0.243 1.000 N NA
 7071546 7071547 VFMJ11_2098 VFMJ11_2099 glnD   FALSE 0.085 140.000 0.031 NA   NA
 7071548 7071549 VFMJ11_2100 VFMJ11_2101 secF secD TRUE 0.976 13.000 0.080 0.002 Y NA
 7071549 7071550 VFMJ11_2101 VFMJ11_2102 secD yajC TRUE 0.549 87.000 0.018 NA Y NA
 7071550 7071551 VFMJ11_2102 VFMJ11_2103 yajC tgt TRUE 0.702 95.000 0.325 NA N NA
 7071551 7071552 VFMJ11_2103 VFMJ11_2104 tgt queA TRUE 0.792 213.000 0.360 0.001 Y NA
 7071554 7071555 VFMJ11_2106 VFMJ11_2107 aceA aceB TRUE 0.941 15.000 0.129 1.000 Y NA
 7071555 7071556 VFMJ11_2107 VFMJ11_2108 aceB   FALSE 0.000 575.000 0.000 1.000 N NA
 7071557 7071558 VFMJ11_2109 VFMJ11_2110     FALSE 0.001 282.000 0.000 1.000 N NA
 7071559 7071560 VFMJ11_2111 VFMJ11_2112     TRUE 0.872 57.000 0.400 NA   NA
 7071561 7071562 VFMJ11_2113 VFMJ11_2114     FALSE 0.108 330.000 0.000 0.055 Y NA
 7071562 7071563 VFMJ11_2114 VFMJ11_2115     FALSE 0.035 186.000 0.000 NA   NA
 7071563 7071564 VFMJ11_2115 VFMJ11_2116     FALSE 0.185 84.000 0.000 NA   NA
 7071564 7071565 VFMJ11_2116 VFMJ11_2117     FALSE 0.008 323.000 0.000 NA   NA
 7071566 7071567 VFMJ11_2118 VFMJ11_2119   phoU FALSE 0.011 189.000 0.009 NA   NA
 7071567 7071568 VFMJ11_2119 VFMJ11_2120 phoU pstB_2 TRUE 0.947 40.000 0.330 NA Y NA
 7071568 7071569 VFMJ11_2120 VFMJ11_2121 pstB_2   TRUE 0.998 5.000 0.511 0.002 Y NA
 7071569 7071570 VFMJ11_2121 VFMJ11_2122     TRUE 0.862 89.000 0.489 1.000   NA
 7071570 7071571 VFMJ11_2122 VFMJ11_2123     TRUE 0.761 110.000 0.211 0.056   NA
 7071571 7071572 VFMJ11_2123 VFMJ11_2124   phoR TRUE 0.544 66.000 0.168 1.000 N NA
 7071572 7071573 VFMJ11_2124 VFMJ11_2125 phoR phoB TRUE 0.990 26.000 0.453 0.022 Y NA
 7071574 7071575 VFMJ11_2126 VFMJ11_2127 rdgC   FALSE 0.002 244.000 0.000 1.000 N NA
 7071575 7071576 VFMJ11_2127 VFMJ11_2128     FALSE 0.428 79.000 0.093 NA   NA
 7071577 7071578 VFMJ11_2129 VFMJ11_2130   dnaJ FALSE 0.019 227.000 0.000 NA   NA
 7071578 7071579 VFMJ11_2130 VFMJ11_2131 dnaJ dnaK FALSE 0.287 440.000 0.236 0.003 Y NA
 7071579 7071580 VFMJ11_2131 VFMJ11_2132 dnaK   FALSE 0.020 222.000 0.000 NA   NA
 7071580 7071581 VFMJ11_2132 VFMJ11_2133   grpE FALSE 0.016 243.000 0.000 NA   NA
 7071582 7071583 VFMJ11_2134 VFMJ11_2135 ppnK recN FALSE 0.375 118.000 0.170 1.000 N NA
 7071583 7071584 VFMJ11_2135 VFMJ11_2136 recN   FALSE 0.011 216.000 0.049 1.000 N NA
 7071585 7071586 VFMJ11_2137 VFMJ11_2138     TRUE 0.914 -13.000 0.124 NA   NA
 7071588 7071589 VFMJ11_2140 VFMJ11_2141     TRUE 0.821 0.000 0.000 NA   NA
 7071589 7071590 VFMJ11_2141 VFMJ11_2142     TRUE 0.986 6.000 0.040 0.001 Y NA
 7071590 7071591 VFMJ11_2142 VFMJ11_2143     TRUE 0.992 0.000 0.100 0.042 Y NA
 7071591 7071592 VFMJ11_2143 VFMJ11_2144     FALSE 0.111 125.000 0.000 NA   NA
 7071592 7071593 VFMJ11_2144 VFMJ11_2145     TRUE 0.961 0.000 0.147 NA   NA
 7071594 7071595 VFMJ11_2146 VFMJ11_2147     TRUE 0.757 113.000 0.069 0.042 Y NA
 7071595 7071596 VFMJ11_2147 VFMJ11_2148     TRUE 0.995 0.000 0.171 0.042 Y NA
 7071596 7071597 VFMJ11_2148 VFMJ11_2149     TRUE 0.989 0.000 0.057 0.042 Y NA
 7071597 7071598 VFMJ11_2149 VFMJ11_2150     TRUE 0.695 93.000 0.250 NA   NA
 7071598 7071599 VFMJ11_2150 VFMJ11_2151     FALSE 0.172 90.000 0.000 NA   NA
 7071599 7071600 VFMJ11_2151 VFMJ11_2152     FALSE 0.516 108.000 0.000 1.000 Y NA
 7071600 7071601 VFMJ11_2152 VFMJ11_2153     FALSE 0.031 70.000 0.000 1.000 N NA
 7071603 7071604 VFMJ11_2155 VFMJ11_2156     TRUE 0.996 0.000 0.700 NA   NA
 7071606 7071607 VFMJ11_2158 VFMJ11_2159     TRUE 0.894 97.000 0.652 NA   NA
 7071607 7071608 VFMJ11_2159 VFMJ11_2160   sodC_1 TRUE 0.683 14.000 0.065 NA   NA
 7071609 7071610 VFMJ11_2161 VFMJ11_2162     FALSE 0.017 77.000 0.029 1.000 N NA
 7071610 7071611 VFMJ11_2162 VFMJ11_2163   cadB TRUE 0.740 121.000 0.188 1.000 Y NA
 7071613 7071614 VFMJ11_2165 VFMJ11_2166     FALSE 0.004 523.000 0.000 NA   NA
 7071614 7071615 VFMJ11_2166 VFMJ11_2167     TRUE 0.939 9.000 0.188 NA   NA
 7071616 7071617 VFMJ11_2168 VFMJ11_2169   metA FALSE 0.415 123.000 0.000 0.040   NA
 7071617 7071618 VFMJ11_2169 VFMJ11_2170 metA   FALSE 0.013 265.000 0.000 1.000   NA
 7071621 7071622 VFMJ11_2173 VFMJ11_2174 rpoS   FALSE 0.433 55.000 0.115 1.000 N NA
 7071622 7071623 VFMJ11_2174 VFMJ11_2175   pcm FALSE 0.178 14.000 0.037 1.000 N NA
 7071623 7071624 VFMJ11_2175 VFMJ11_2176 pcm surE TRUE 0.989 0.000 0.353 1.000   NA
 7071624 7071625 VFMJ11_2176 VFMJ11_2177 surE truD TRUE 0.900 20.000 0.235 1.000   NA
 7071625 7071626 VFMJ11_2177 VFMJ11_2178 truD ispF TRUE 0.900 12.000 0.173 1.000   NA
 7071626 7071627 VFMJ11_2178 VFMJ11_2179 ispF ispD TRUE 0.996 0.000 0.419 1.000 Y NA
 7071627 7071628 VFMJ11_2179 VFMJ11_2180 ispD   TRUE 0.942 4.000 0.185 1.000 N NA
 7071628 7071629 VFMJ11_2180 VFMJ11_2181   eno FALSE 0.277 173.000 0.241 1.000 N NA
 7071629 7071630 VFMJ11_2181 VFMJ11_2182 eno pyrG FALSE 0.192 79.000 0.068 1.000 N NA
 7071630 7071631 VFMJ11_2182 VFMJ11_2183 pyrG   FALSE 0.079 132.000 0.025 1.000   NA
 7071631 7071632 VFMJ11_2183 VFMJ11_2184     FALSE 0.037 94.000 0.003 1.000   NA
 7071632 7071633 VFMJ11_2184 VFMJ11_2185     TRUE 0.703 194.000 1.000 1.000 N NA
 7071633 7071634 VFMJ11_2185 VFMJ11_2186   rumA FALSE 0.019 67.000 0.004 1.000 N NA
 7071636 7071637 VFMJ11_2188 VFMJ11_2189 acpS pdxJ TRUE 0.983 0.000 0.326 1.000 N NA
 7071637 7071638 VFMJ11_2189 VFMJ11_2190 pdxJ recO TRUE 0.945 -3.000 0.166 1.000 N NA
 7071638 7071639 VFMJ11_2190 VFMJ11_2191 recO era FALSE 0.136 178.000 0.109 1.000   NA
 7071639 7071640 VFMJ11_2191 VFMJ11_2192 era rnc TRUE 0.983