MicrobesOnline Operon Predictions for Clostridium novyi NT

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2054186 2054187 NT01CX_0868 NT01CX_0869 rpmH rnpA TRUE 0.957 58.000 0.787 1.000   NA
 2054187 2054188 NT01CX_0869 NT01CX_0870 rnpA   TRUE 0.991 0.000 0.540 NA   NA
 2054188 2054189 NT01CX_0870 NT01CX_0871     TRUE 0.985 19.000 0.461 NA   NA
 2054189 2054190 NT01CX_0871 NT01CX_0872     TRUE 0.895 64.000 0.254 1.000   NA
 2054190 2054191 NT01CX_0872 NT01CX_0873   trmE TRUE 0.836 62.000 0.116 1.000   NA
 2054191 2054192 NT01CX_0873 NT01CX_0874 trmE gidA TRUE 0.972 13.000 0.266 1.000   NA
 2054192 2054193 NT01CX_0874 NT01CX_0875 gidA gidB TRUE 0.989 1.000 0.466 1.000 N NA
 2054193 2054194 NT01CX_0875 NT01CX_0876 gidB   TRUE 0.727 93.000 0.089 1.000 N NA
 2054194 2054195 NT01CX_0876 NT01CX_0877     FALSE 0.221 206.000 0.069 1.000 N NA
 2054195 2054196 NT01CX_0877 NT01CX_0878     TRUE 0.995 -7.000 0.827 1.000 N NA
 2054196 2054197 NT01CX_0878 NT01CX_0879     TRUE 0.820 46.000 0.047 NA   NA
 2054198 2054199 NT01CX_0880 NT01CX_0881     FALSE 0.150 88.000 0.000 1.000   NA
 2054200 2054201 NT01CX_0882 NT01CX_0883   rpsF FALSE 0.358 136.000 0.028 NA   NA
 2054201 2054202 NT01CX_0883 NT01CX_0884 rpsF   TRUE 0.581 12.000 0.000 1.000 N NA
 2054202 2054203 NT01CX_0884 NT01CX_0885   rpsR FALSE 0.373 41.000 0.000 1.000 N NA
 2054203 2054204 NT01CX_0885 NT01CX_0886 rpsR   FALSE 0.238 154.000 0.015 NA   NA
 2054204 2054205 NT01CX_0886 NT01CX_0887     TRUE 0.959 16.000 0.116 NA   NA
 2054205 2054206 NT01CX_0887 NT01CX_0888     TRUE 0.979 2.000 0.210 NA   NA
 2054206 2054207 NT01CX_0888 NT01CX_0889   rplI TRUE 0.969 2.000 0.119 1.000 N NA
 2054207 2054208 NT01CX_0889 NT01CX_0890 rplI   FALSE 0.209 176.000 0.024 1.000 N NA
 2054208 2054209 NT01CX_0890 NT01CX_0891   dnaB TRUE 0.890 28.000 0.053 0.026 N NA
 2054211 2054212 NT01CX_0893 NT01CX_0894     FALSE 0.020 221.000 0.000 NA   NA
 2054212 2054213 NT01CX_0894 NT01CX_0895     TRUE 0.603 19.000 0.000 NA   NA
 2054213 2054214 NT01CX_0895 NT01CX_0896     FALSE 0.014 242.000 0.000 NA   NA
 2054214 2054215 NT01CX_0896 NT01CX_0897     TRUE 0.990 21.000 0.125 1.000 Y NA
 2054215 2054216 NT01CX_0897 NT01CX_0898     FALSE 0.159 100.000 0.000 1.000 N NA
 2054216 2054217 NT01CX_0898 NT01CX_0899     TRUE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 2054217 2054218 NT01CX_0899 NT01CX_0900     FALSE 0.030 192.000 0.000 NA   NA
 2054219 2054220 NT01CX_0901 NT01CX_0902 proA proB TRUE 0.991 13.000 0.281 0.004 Y NA
 2054221 2054222 NT01CX_0903 NT01CX_0904 proC   FALSE 0.008 337.000 0.000 NA   NA
 2054222 2054223 NT01CX_0904 NT01CX_0905   purA TRUE 0.601 88.000 0.033 NA   NA
 2054223 2054224 NT01CX_0905 NT01CX_0906 purA   FALSE 0.198 68.000 0.000 1.000   NA
 2054224 2054225 NT01CX_0906 NT01CX_0907     FALSE 0.120 104.000 0.000 1.000   NA
 2054227 2054228 NT01CX_0909 NT01CX_0910     TRUE 0.567 14.000 0.000 NA   NA
 2054228 2054229 NT01CX_0910 NT01CX_0911     TRUE 0.567 14.000 0.000 NA   NA
 2054229 2054230 NT01CX_0911 NT01CX_0912     TRUE 0.589 8.000 0.000 NA   NA
 2054230 2054231 NT01CX_0912 NT01CX_0913     TRUE 0.608 18.000 0.000 NA   NA
 2054231 2054232 NT01CX_0913 NT01CX_0914     TRUE 0.567 14.000 0.000 NA   NA
 2054232 2054233 NT01CX_0914 NT01CX_0915     TRUE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 2054233 2054234 NT01CX_0915 NT01CX_0916     TRUE 0.604 6.000 0.000 NA   NA
 2054235 2054236 NT01CX_0917 NT01CX_0918     TRUE 0.975 -7.000 0.000 NA Y NA
 2054237 2054238 NT01CX_0919 NT01CX_0920     FALSE 0.019 222.000 0.000 NA   NA
 2054238 2054239 NT01CX_0920 NT01CX_0921     TRUE 0.957 6.000 0.098 1.000 N NA
 2054239 2054240 NT01CX_0921 NT01CX_0922   acpP TRUE 0.984 34.000 0.235 0.007 Y NA
 2054240 2054241 NT01CX_0922 NT01CX_0923 acpP   TRUE 0.794 60.000 0.072 1.000   NA
 2054241 2054242 NT01CX_0923 NT01CX_0924   fabD TRUE 0.975 -7.000 0.099 1.000   NA
 2054242 2054243 NT01CX_0924 NT01CX_0925 fabD fabG TRUE 0.993 0.000 0.149 0.007 Y NA
 2054243 2054244 NT01CX_0925 NT01CX_0926 fabG   TRUE 0.993 14.000 0.236 1.000 Y NA
 2054244 2054245 NT01CX_0926 NT01CX_0927   accB TRUE 0.989 4.000 0.074 1.000 Y NA
 2054245 2054246 NT01CX_0927 NT01CX_0928 accB fabZ TRUE 0.979 13.000 0.058 0.007 Y NA
 2054246 2054247 NT01CX_0928 NT01CX_0929 fabZ accC TRUE 0.987 9.000 0.077 1.000 Y NA
 2054247 2054248 NT01CX_0929 NT01CX_0930 accC accD TRUE 0.957 46.000 0.090 0.002 Y NA
 2054248 2054249 NT01CX_0930 NT01CX_0931 accD accA TRUE 0.990 24.000 0.234 0.002 Y NA
 2054249 2054250 NT01CX_0931 NT01CX_0932 accA   FALSE 0.036 183.000 0.000 1.000 N NA
 2054250 2054251 NT01CX_0932 NT01CX_0933     TRUE 0.952 32.000 0.022 0.032 Y NA
 2054251 2054252 NT01CX_0933 NT01CX_0934     TRUE 0.998 -7.000 0.640 1.000 Y NA
 2054252 2054253 NT01CX_0934 NT01CX_0935     FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 2054253 2054254 NT01CX_0935 NT01CX_0936     FALSE 0.011 278.000 0.000 NA   NA
 2054255 2054256 NT01CX_0937 NT01CX_0938     FALSE 0.152 227.000 0.000 0.017 Y NA
 2054256 2054257 NT01CX_0938 NT01CX_0939     FALSE 0.008 181.000 0.000 0.078   NA
 2054260 2054261 NT01CX_0942 NT01CX_0943 cinA   FALSE 0.029 183.000 0.000 1.000   NA
 2054262 2054263 NT01CX_0944 NT01CX_0945     TRUE 0.760 98.000 0.129 NA   NA
 2054263 2054264 NT01CX_0945 NT01CX_0946     TRUE 0.878 69.000 0.220 NA   NA
 2054264 2054265 NT01CX_0946 NT01CX_0947     FALSE 0.063 150.000 0.000 NA   NA
 2054266 2054267 NT01CX_0948 NT01CX_0949 murA   TRUE 0.934 20.000 0.058 1.000   NA
 2054267 2054268 NT01CX_0949 NT01CX_0950     TRUE 0.878 15.000 0.016 NA   NA
 2054268 2054269 NT01CX_0950 NT01CX_0951     TRUE 0.963 34.000 0.357 NA   NA
 2054269 2054270 NT01CX_0951 NT01CX_0952     FALSE 0.054 149.000 0.000 1.000   NA
 2054270 2054271 NT01CX_0952 NT01CX_0953     TRUE 0.683 0.000 0.000 NA   NA
 2054271 2054272 NT01CX_0953 NT01CX_0954     FALSE 0.012 267.000 0.000 NA   NA
 2054272 2054273 NT01CX_0954 NT01CX_0955   panE TRUE 0.956 33.000 0.267 NA   NA
 2054273 2054274 NT01CX_0955 NT01CX_0956 panE   FALSE 0.073 144.000 0.000 1.000 N NA
 2054274 2054275 NT01CX_0956 NT01CX_0957     FALSE 0.091 119.000 0.000 1.000   NA
 2054275 2054276 NT01CX_0957 NT01CX_0958     FALSE 0.021 203.000 0.000 1.000   NA
 2054276 2054277 NT01CX_0958 NT01CX_0959     FALSE 0.061 152.000 0.000 NA   NA
 2054279 2054280 NT01CX_0961 NT01CX_0962   phnA FALSE 0.080 126.000 0.000 1.000   NA
 2054280 2054281 NT01CX_0962 NT01CX_0963 phnA   FALSE 0.012 277.000 0.000 1.000 N NA
 2054281 2054282 NT01CX_0963 NT01CX_0964     TRUE 0.581 12.000 0.000 1.000 N NA
 2054282 2054283 NT01CX_0964 NT01CX_0965     TRUE 0.900 31.000 0.000 0.032 Y NA
 2054283 2054284 NT01CX_0965 NT01CX_0966     TRUE 0.983 54.000 0.500 0.032 Y NA
 2054284 2054285 NT01CX_0966 NT01CX_0967     TRUE 0.998 0.000 0.857 0.032 Y NA
 2054285 2054286 NT01CX_0967 NT01CX_0968     TRUE 0.638 112.000 0.000 1.000 Y NA
 2054286 2054287 NT01CX_0968 NT01CX_0969   malQ TRUE 0.939 19.000 0.000 0.019 Y NA
 2054287 2054288 NT01CX_0969 NT01CX_0970 malQ   TRUE 0.977 8.000 0.038 0.019 Y NA
 2054289 2054290 NT01CX_0971 NT01CX_0972     FALSE 0.176 87.000 0.000 NA   NA
 2054290 2054291 NT01CX_0972 NT01CX_0973     FALSE 0.044 173.000 0.000 NA   NA
 2054292 2054293 NT01CX_0974 NT01CX_0975     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 2054293 2054294 NT01CX_0975 NT01CX_0976     TRUE 0.683 0.000 0.000 NA   NA
 2054294 2054295 NT01CX_0976 NT01CX_0977     TRUE 0.951 20.000 0.000 1.000 Y NA
 2054295 2054296 NT01CX_0977 NT01CX_0978     TRUE 0.581 15.000 0.000 NA   NA
 2054296 2054297 NT01CX_0978 NT01CX_0979     FALSE 0.103 121.000 0.000 NA   NA
 2054297 2054298 NT01CX_0979 NT01CX_0980     FALSE 0.060 143.000 0.000 1.000   NA
 2054298 2054299 NT01CX_0980 NT01CX_0981     TRUE 0.667 1.000 0.000 NA   NA
 2054299 2054300 NT01CX_0981 NT01CX_0982     FALSE 0.323 48.000 0.000 NA   NA
 2054300 2054301 NT01CX_0982 NT01CX_0983     TRUE 0.853 100.000 0.290 NA N NA
 2054301 2054302 NT01CX_0983 NT01CX_0984     TRUE 0.892 106.000 0.078 1.000 Y NA
 2054302 2054303 NT01CX_0984 NT01CX_0985   nifL FALSE 0.043 176.000 0.000 1.000 N NA
 2054304 2054305 NT01CX_0986 NT01CX_0987     TRUE 0.579 22.000 0.000 NA   NA
 2054305 2054306 NT01CX_0987 NT01CX_0988     TRUE 0.967 3.000 0.125 NA   NA
 2054307 2054308 NT01CX_0989 NT01CX_0990     TRUE 0.984 12.000 0.500 NA   NA
 2054308 2054309 NT01CX_0990 NT01CX_0991     TRUE 0.979 4.000 0.250 NA   NA
 2054311 2054312 NT01CX_0993 NT01CX_0994     FALSE 0.013 255.000 0.000 NA   NA
 2054312 2054313 NT01CX_0994 NT01CX_0995     FALSE 0.285 54.000 0.000 NA   NA
 2054313 2054314 NT01CX_0995 NT01CX_0996     FALSE 0.078 137.000 0.000 NA   NA
 2054314 2054315 NT01CX_0996 NT01CX_0997     FALSE 0.022 212.000 0.000 NA   NA
 2054316 2054317 NT01CX_0998 NT01CX_0999     FALSE 0.378 39.000 0.000 NA   NA
 2054319 2054320 NT01CX_1001 NT01CX_1002     TRUE 0.916 39.000 0.133 NA   NA
 2054321 2054322 NT01CX_1003 NT01CX_1004     TRUE 0.682 88.000 0.058 NA   NA
 2054323 2054324 NT01CX_1005 NT01CX_1006     TRUE 0.829 78.000 0.156 1.000   NA
 2054324 2054325 NT01CX_1006 NT01CX_1007     FALSE 0.054 160.000 0.000 NA   NA
 2054325 2054326 NT01CX_1007 NT01CX_1008     FALSE 0.078 137.000 0.000 NA   NA
 2054327 2054328 NT01CX_1009 NT01CX_1010     TRUE 0.998 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 2054330 2054331 NT01CX_1012 NT01CX_1013 purR   TRUE 0.787 78.000 0.099 1.000 N NA
 2054331 2054332 NT01CX_1013 NT01CX_1014     FALSE 0.384 208.000 0.011 1.000 Y NA
 2054332 2054333 NT01CX_1014 NT01CX_1015     TRUE 0.854 46.000 0.069 1.000 N NA
 2054333 2054334 NT01CX_1015 NT01CX_1016     FALSE 0.360 188.000 0.123 1.000 N NA
 2054334 2054335 NT01CX_1016 NT01CX_1017     TRUE 0.998 1.000 0.653 1.000 Y NA
 2054335 2054336 NT01CX_1017 NT01CX_1018     TRUE 0.900 38.000 0.095 1.000 N NA
 2054336 2054337 NT01CX_1018 NT01CX_1019     FALSE 0.259 140.000 0.009 1.000 N NA
 2054337 2054338 NT01CX_1019 NT01CX_1020     TRUE 0.960 24.000 0.137 1.000 N NA
 2054338 2054339 NT01CX_1020 NT01CX_1021     TRUE 0.650 55.000 0.016 1.000   NA
 2054339 2054340 NT01CX_1021 NT01CX_1022     FALSE 0.069 411.000 0.088 NA   NA
 2054340 2054341 NT01CX_1022 NT01CX_1023     TRUE 0.738 98.000 0.108 NA   NA
 2054341 2054342 NT01CX_1023 NT01CX_1024     TRUE 0.792 32.000 0.015 1.000   NA
 2054342 2054343 NT01CX_1024 NT01CX_1025     FALSE 0.404 108.000 0.014 1.000   NA
 2054343 2054344 NT01CX_1025 NT01CX_1026     TRUE 0.560 90.000 0.024 1.000 N NA
 2054344 2054345 NT01CX_1026 NT01CX_1027     TRUE 0.657 116.000 0.108 NA   NA
 2054345 2054346 NT01CX_1027 NT01CX_1028     TRUE 0.990 6.000 0.774 NA   NA
 2054346 2054347 NT01CX_1028 NT01CX_1029     TRUE 0.954 37.000 0.303 NA   NA
 2054347 2054348 NT01CX_1029 NT01CX_1030   eif2A TRUE 0.890 55.000 0.179 1.000   NA
 2054348 2054349 NT01CX_1030 NT01CX_1031 eif2A   FALSE 0.054 160.000 0.000 NA   NA
 2054349 2054350 NT01CX_1031 NT01CX_1032     TRUE 0.614 5.000 0.000 NA   NA
 2054350 2054351 NT01CX_1032 NT01CX_1033     TRUE 0.604 6.000 0.000 NA   NA
 2054351 2054352 NT01CX_1033 NT01CX_1034     FALSE 0.316 49.000 0.000 NA   NA
 2054352 2054353 NT01CX_1034 NT01CX_1035     TRUE 0.604 6.000 0.000 NA   NA
 2054353 2054354 NT01CX_1035 NT01CX_1036     FALSE 0.415 35.000 0.000 NA   NA
 2054354 2054355 NT01CX_1036 NT01CX_1037     FALSE 0.009 315.000 0.000 NA   NA
 2054355 2054356 NT01CX_1037 NT01CX_1038     FALSE 0.415 136.000 0.041 1.000 N NA
 2054356 2054357 NT01CX_1038 NT01CX_1039     TRUE 0.967 2.000 0.137 0.056 N NA
 2054357 2054358 NT01CX_1039 NT01CX_1040   ftsH TRUE 0.863 71.000 0.180 1.000 N NA
 2054358 2054359 NT01CX_1040 NT01CX_1041 ftsH   FALSE 0.429 143.000 0.055 NA   NA
 2054359 2054360 NT01CX_1041 NT01CX_1042     FALSE 0.477 102.000 0.018 NA   NA
 2054360 2054361 NT01CX_1042 NT01CX_1043     FALSE 0.331 124.000 0.011 1.000 N NA
 2054361 2054362 NT01CX_1043 NT01CX_1044     TRUE 0.932 9.000 0.054 1.000 N NA
 2054362 2054363 NT01CX_1044 NT01CX_1045     FALSE 0.094 229.000 0.022 1.000 N NA
 2054363 2054364 NT01CX_1045 NT01CX_1046   lysS TRUE 0.868 50.000 0.098 1.000 N NA
 2054364 2054365 NT01CX_1046 NT01CX_1047 lysS   FALSE 0.090 128.000 0.000 NA   NA
 2054365 2054366 NT01CX_1047 NT01CX_1048   glyS FALSE 0.011 283.000 0.000 NA   NA
 2054366 2054367 NT01CX_1048 NT01CX_1049 glyS murD FALSE 0.024 366.000 0.002 1.000 N NA
 2054367 2054368 NT01CX_1049 NT01CX_1050 murD rrsJ FALSE 0.004 588.000 0.000 NA   NA
 2054368 2054369 NT01CX_1050 NT01CX_1051 rrsJ rrlJ FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 2054369 2054371 NT01CX_1051 NT01CX_1053 rrlJ   FALSE 0.272 56.000 0.000 NA   NA
 2054371 2054372 NT01CX_1053 NT01CX_1054   rrfJ TRUE 0.608 18.000 0.000 NA   NA
 2054372 2054373 NT01CX_1054 NT01CX_1055 rrfJ   TRUE 0.604 6.000 0.000 NA   NA
 2054373 2054374 NT01CX_1055 NT01CX_1056   fusA FALSE 0.006 379.000 0.000 NA   NA
 2054376 2054377 NT01CX_1058 NT01CX_1059     TRUE 0.816 -43.000 0.000 NA   NA
 2054377 2054378 NT01CX_1059 NT01CX_1060   hisS FALSE 0.017 231.000 0.000 NA   NA
 2054378 2054379 NT01CX_1060 NT01CX_1061 hisS hisG TRUE 0.961 26.000 0.239 0.006 N NA
 2054379 2054380 NT01CX_1061 NT01CX_1062 hisG hisD TRUE 0.991 12.000 0.254 0.006 Y NA
 2054380 2054381 NT01CX_1062 NT01CX_1063 hisD hisC TRUE 0.993 0.000 0.165 0.006 Y NA
 2054381 2054382 NT01CX_1063 NT01CX_1064 hisC   TRUE 0.998 -19.000 0.341 0.006 Y NA
 2054382 2054383 NT01CX_1064 NT01CX_1065   hisA TRUE 0.979 20.000 0.042 0.006 Y NA
 2054383 2054384 NT01CX_1065 NT01CX_1066 hisA hisF TRUE 0.994 12.000 0.433 0.006 Y NA
 2054384 2054385 NT01CX_1066 NT01CX_1067 hisF   TRUE 0.931 74.000 0.105 0.006 Y NA
 2054387 2054388 NT01CX_1069 NT01CX_1070     FALSE 0.032 190.000 0.000 NA   NA
 2054388 2054389 NT01CX_1070 NT01CX_1071   panB TRUE 0.949 1.000 0.055 1.000   NA
 2054389 2054390 NT01CX_1071 NT01CX_1072 panB panC TRUE 0.975 60.000 0.395 0.001 Y NA
 2054390 2054391 NT01CX_1072 NT01CX_1073 panC panD TRUE 0.996 4.000 0.342 1.000 Y NA
 2054392 2054393 NT01CX_1074 NT01CX_1075     FALSE 0.028 198.000 0.000 NA   NA
 2054394 2054395 NT01CX_1076 NT01CX_1077     TRUE 0.979 21.000 0.315 1.000 N NA
 2054397 2054398 NT01CX_1079 NT01CX_1080     FALSE 0.106 122.000 0.000 1.000 N NA
 2054398 2054399 NT01CX_1080 NT01CX_1081     FALSE 0.038 179.000 0.000 NA   NA
 2054399 2054400 NT01CX_1081 NT01CX_1082     FALSE 0.398 142.000 0.044 NA   NA
 2054400 2054401 NT01CX_1082 NT01CX_1083     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA N NA
 2054401 2054402 NT01CX_1083 NT01CX_1084     FALSE 0.020 231.000 0.000 NA N NA
 2054402 2054403 NT01CX_1084 NT01CX_1085     TRUE 0.945 68.000 0.681 NA   NA
 2054403 2054404 NT01CX_1085 NT01CX_1086     TRUE 0.989 12.000 0.848 1.000   NA
 2054404 2054405 NT01CX_1086 NT01CX_1087     TRUE 0.946 29.000 0.129 1.000 N NA
 2054405 2054406 NT01CX_1087 NT01CX_1088   radA FALSE 0.511 164.000 0.009 0.025 Y NA
 2054406 2054407 NT01CX_1088 NT01CX_1089 radA   TRUE 0.928 32.000 0.126 1.000   NA
 2054409 2054410 NT01CX_1091 NT01CX_1092   ispD TRUE 0.958 23.000 0.134 1.000   NA
 2054410 2054411 NT01CX_1092 NT01CX_1093 ispD cysS FALSE 0.025 207.000 0.000 1.000 N NA
 2054411 2054412 NT01CX_1093 NT01CX_1094 cysS   TRUE 0.721 105.000 0.129 1.000   NA
 2054412 2054413 NT01CX_1094 NT01CX_1095   thyX TRUE 0.924 24.000 0.055 1.000   NA
 2054413 2054414 NT01CX_1095 NT01CX_1096 thyX   TRUE 0.843 33.000 0.032 1.000 N NA
 2054414 2054415 NT01CX_1096 NT01CX_1097     TRUE 0.955 10.000 0.109 NA   NA
 2054415 2054416 NT01CX_1097 NT01CX_1098     TRUE 0.844 108.000 0.361 NA   NA
 2054416 2054417 NT01CX_1098 NT01CX_1099     FALSE 0.085 132.000 0.000 NA   NA
 2054417 2054418 NT01CX_1099 NT01CX_1100     FALSE 0.163 94.000 0.000 NA   NA
 2054418 2054419 NT01CX_1100 NT01CX_1101   secE FALSE 0.005 488.000 0.000 1.000 N NA
 2054419 2054420 NT01CX_1101 NT01CX_1102 secE nusG FALSE 0.284 121.000 0.002 1.000 N NA
 2054420 2054421 NT01CX_1102 NT01CX_1103 nusG rplK TRUE 0.942 74.000 0.681 1.000 N NA
 2054421 2054422 NT01CX_1103 NT01CX_1104 rplK rplA TRUE 0.989 54.000 0.838 0.034 Y NA
 2054422 2054423 NT01CX_1104 NT01CX_1105 rplA rplJ TRUE 0.778 198.000 0.302 1.000 Y NA
 2054423 2054424 NT01CX_1105 NT01CX_1106 rplJ rplL TRUE 0.993 47.000 0.884 1.000 Y NA
 2054424 2054425 NT01CX_1106 NT01CX_1107 rplL rpoB FALSE 0.226 269.000 0.223 1.000 N NA
 2054425 2054426 NT01CX_1107 NT01CX_1108 rpoB rpoC TRUE 0.998 0.000 0.851 0.001 Y NA
 2054426 2054427 NT01CX_1108 NT01CX_1109 rpoC   FALSE 0.542 123.000 0.065 NA   NA
 2054427 2054428 NT01CX_1109 NT01CX_1110   rpsL TRUE 0.909 56.000 0.239 NA   NA
 2054428 2054429 NT01CX_1110 NT01CX_1111 rpsL rpsG TRUE 0.880 132.000 0.224 0.005 Y NA
 2054429 2054430 NT01CX_1111 NT01CX_1112 rpsG fusA TRUE 0.964 113.000 0.579 1.000 Y NA
 2054430 2054431 NT01CX_1112 NT01CX_1113 fusA   TRUE 0.974 65.000 0.400 0.002 Y NA
 2054431 2054432 NT01CX_1113 NT01CX_1114   rpsJ FALSE 0.423 411.000 0.318 1.000 Y NA
 2054432 2054433 NT01CX_1114 NT01CX_1115 rpsJ rplC TRUE 0.978 66.000 0.467 0.034 Y NA
 2054433 2054434 NT01CX_1115 NT01CX_1116 rplC rplD TRUE 0.995 26.000 0.544 0.025 Y NA
 2054434 2054435 NT01CX_1116 NT01CX_1117 rplD rplW TRUE 0.996 0.000 0.307 1.000 Y NA
 2054435 2054436 NT01CX_1117 NT01CX_1118 rplW rplB TRUE 0.989 61.000 0.849 1.000 Y NA
 2054436 2054437 NT01CX_1118 NT01CX_1119 rplB rpsS TRUE 0.983 73.000 0.820 0.034 Y NA
 2054437 2054438 NT01CX_1119 NT01CX_1120 rpsS rplV TRUE 0.996 22.000 0.769 0.034 Y NA
 2054438 2054439 NT01CX_1120 NT01CX_1121 rplV rpsC TRUE 0.997 16.000 0.719 0.034 Y NA
 2054439 2054440 NT01CX_1121 NT01CX_1122 rpsC rplP TRUE 0.997 18.000 0.828 0.034 Y NA
 2054440 2054441 NT01CX_1122 NT01CX_1123 rplP rpmC TRUE 0.998 -10.000 0.802 0.025 Y NA
 2054441 2054442 NT01CX_1123 NT01CX_1124 rpmC rpsQ TRUE 0.996 23.000 0.828 0.025 Y NA
 2054442 2054443 NT01CX_1124 NT01CX_1125 rpsQ rplN TRUE 0.996 28.000 0.791 0.034 Y NA
 2054443 2054444 NT01CX_1125 NT01CX_1126 rplN rplX TRUE 0.997 17.000 0.810 0.034 Y NA
 2054444 2054445 NT01CX_1126 NT01CX_1127 rplX rplE TRUE 0.996 23.000 0.758 0.025 Y NA
 2054445 2054446 NT01CX_1127 NT01CX_1128 rplE rpsN TRUE 0.995 16.000 0.496 0.025 Y NA
 2054446 2054447 NT01CX_1128 NT01CX_1129 rpsN rpsH TRUE 0.991 32.000 0.473 0.025 Y NA
 2054447 2054448 NT01CX_1129 NT01CX_1130 rpsH   TRUE 0.995 31.000 0.808 0.025 Y NA
 2054448 2054449 NT01CX_1130 NT01CX_1131   rplR TRUE 0.995 31.000 0.815 0.025 Y NA
 2054449 2054450 NT01CX_1131 NT01CX_1132 rplR rpsE TRUE 0.997 17.000 0.814 0.034 Y NA
 2054450 2054451 NT01CX_1132 NT01CX_1133 rpsE rpmD TRUE 0.996 14.000 0.789 0.034 Y NA
 2054451 2054452 NT01CX_1133 NT01CX_1134 rpmD rplO TRUE 0.992 33.000 0.653 0.004 Y NA
 2054452 2054453 NT01CX_1134 NT01CX_1135 rplO   TRUE 0.992 2.000 0.730 1.000 N NA
 2054453 2054454 NT01CX_1135 NT01CX_1136     TRUE 0.967 28.000 0.241 1.000 N NA
 2054454 2054455 NT01CX_1136 NT01CX_1137     TRUE 0.984 1.000 0.290 1.000 N NA
 2054455 2054456 NT01CX_1137 NT01CX_1138     TRUE 0.992 14.000 0.185 NA Y NA
 2054456 2054457 NT01CX_1138 NT01CX_1139   infA TRUE 0.989 8.000 0.090 NA Y NA
 2054457 2054458 NT01CX_1139 NT01CX_1140 infA rpmJ TRUE 0.975 16.000 0.257 1.000   NA
 2054458 2054459 NT01CX_1140 NT01CX_1141 rpmJ rpsM FALSE 0.514 156.000 0.194 0.025   NA
 2054459 2054460 NT01CX_1141 NT01CX_1142 rpsM rpsK TRUE 0.997 17.000 0.810 0.025 Y NA
 2054460 2054461 NT01CX_1142 NT01CX_1143 rpsK rpsD TRUE 0.994 28.000 0.509 0.033 Y NA
 2054461 2054462 NT01CX_1143 NT01CX_1144 rpsD rpoA TRUE 0.941 65.000 0.549 1.000 N NA
 2054462 2054463 NT01CX_1144 NT01CX_1145 rpoA rplQ TRUE 0.990 14.000 0.873 1.000 N NA
 2054463 2054464 NT01CX_1145 NT01CX_1146 rplQ   TRUE 0.728 85.000 0.074 1.000 N NA
 2054464 2054465 NT01CX_1146 NT01CX_1147     TRUE 0.999 -15.000 0.713 0.027 Y NA
 2054465 2054466 NT01CX_1147 NT01CX_1148   cbiQ TRUE 0.997 -7.000 0.304 1.000 Y NA
 2054466 2054467 NT01CX_1148 NT01CX_1149 cbiQ truA TRUE 0.967 35.000 0.404 1.000 N NA
 2054467 2054468 NT01CX_1149 NT01CX_1150 truA rplM TRUE 0.612 173.000 0.031 1.000 Y NA
 2054468 2054469 NT01CX_1150 NT01CX_1151 rplM rpsI TRUE 0.993 31.000 0.601 0.025 Y NA
 2054469 2054470 NT01CX_1151 NT01CX_1152 rpsI   FALSE 0.042 300.000 0.011 1.000 N NA
 2054470 2054471 NT01CX_1152 NT01CX_1153     FALSE 0.068 148.000 0.000 1.000 N NA
 2054473 2054474 NT01CX_1155 NT01CX_1156 ptsI   FALSE 0.249 196.000 0.069 NA   NA
 2054474 2054475 NT01CX_1156 NT01CX_1157     TRUE 0.975 27.000 0.333 NA   NA
 2054475 2054476 NT01CX_1157 NT01CX_1158     FALSE 0.377 219.000 0.286 1.000   NA
 2054476 2054477 NT01CX_1158 NT01CX_1159   trxB TRUE 0.930 63.000 0.429 1.000   NA
 2054478 2054479 NT01CX_1160 NT01CX_1161     TRUE 0.820 86.000 0.167 NA   NA
 2054480 2054481 NT01CX_1162 NT01CX_1163     TRUE 0.995 -27.000 0.502 NA   NA
 2054481 2054482 NT01CX_1163 NT01CX_1164     TRUE 0.950 20.000 0.083 NA   NA
 2054482 2054483 NT01CX_1164 NT01CX_1165   glmM FALSE 0.206 164.000 0.017 1.000   NA
 2054483 2054484 NT01CX_1165 NT01CX_1166 glmM glmS FALSE 0.028 531.000 0.030 1.000 N NA
 2054484 2054485 NT01CX_1166 NT01CX_1167 glmS ppdK FALSE 0.004 677.000 0.000 1.000 N NA
 2054487 2054488 NT01CX_1169 NT01CX_1170     FALSE 0.074 141.000 0.000 NA   NA
 2054488 2054489 NT01CX_1170 NT01CX_1171     FALSE 0.148 101.000 0.000 NA   NA
 2054491 2054492 NT01CX_1173 NT01CX_1174     FALSE 0.022 212.000 0.000 NA   NA
 2054492 2054493 NT01CX_1174 NT01CX_1175     TRUE 0.987 4.000 0.500 NA   NA
 2054493 2054494 NT01CX_1175 NT01CX_1176     TRUE 0.877 133.000 1.000 NA   NA
 2054494 2054495 NT01CX_1176 NT01CX_1177     TRUE 0.986 7.000 0.500 NA   NA
 2054495 2054496 NT01CX_1177 NT01CX_1178     TRUE 0.707 -3.000 0.000 NA   NA
 2054496 2054497 NT01CX_1178 NT01CX_1179     TRUE 0.979 10.000 0.333 NA   NA
 2054498 2054499 NT01CX_1180 NT01CX_1181     FALSE 0.486 30.000 0.000 NA   NA
 2054500 2054501 NT01CX_1182 NT01CX_1183     TRUE 0.608 18.000 0.000 NA   NA
 2054501 2054502 NT01CX_1183 NT01CX_1184     FALSE 0.056 157.000 0.000 NA   NA
 2054502 2054503 NT01CX_1184 NT01CX_1185     FALSE 0.197 79.000 0.000 NA   NA
 2054503 2054504 NT01CX_1185 NT01CX_1186     FALSE 0.008 347.000 0.000 NA   NA
 2054504 2054505 NT01CX_1186 NT01CX_1187     TRUE 0.597 16.000 0.000 NA   NA
 2054505 2054506 NT01CX_1187 NT01CX_1188     TRUE 0.992 5.000 1.000 NA   NA
 2054506 2054507 NT01CX_1188 NT01CX_1189     FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 2054507 2054508 NT01CX_1189 NT01CX_1190     TRUE 0.589 21.000 0.000 NA   NA
 2054508 2054509 NT01CX_1190 NT01CX_1191     FALSE 0.101 122.000 0.000 NA   NA
 2054509 2054510 NT01CX_1191 NT01CX_1192     TRUE 0.992 4.000 0.952 NA   NA
 2054510 2054511 NT01CX_1192 NT01CX_1193     FALSE 0.290 53.000 0.000 NA   NA
 2054512 2054513 NT01CX_1194 NT01CX_1195     FALSE 0.024 207.000 0.000 NA   NA
 2054514 2054515 NT01CX_1196 NT01CX_1197     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 2054515 2054516 NT01CX_1197 NT01CX_1198     FALSE 0.029 196.000 0.000 NA   NA
 2054516 2054517 NT01CX_1198 NT01CX_1199     TRUE 0.610 16.000 0.000 1.000 N NA
 2054517 2054518 NT01CX_1199 NT01CX_1200     FALSE 0.032 179.000 0.000 1.000   NA
 2054518 2054519 NT01CX_1200 NT01CX_1201     TRUE 0.978 0.000 0.167 NA   NA
 2054519 2054520 NT01CX_1201 NT01CX_1202     TRUE 0.990 4.000 0.667 NA   NA
 2054521 2054522 NT01CX_1203 NT01CX_1204     FALSE 0.234 66.000 0.000 NA   NA
 2054522 2054523 NT01CX_1204 NT01CX_1205     TRUE 0.993 13.000 0.333 0.021 Y NA
 2054523 2054524 NT01CX_1205 NT01CX_1206     TRUE 0.988 9.000 0.095 1.000 Y NA
 2054526 2054527 NT01CX_1208 NT01CX_1209 folA   FALSE 0.338 46.000 0.000 NA   NA
 2054528 2054529 NT01CX_1210 NT01CX_1211   metA TRUE 0.985 19.000 0.051 1.000 Y NA
 2054531 2054532 NT01CX_1213 NT01CX_1214     TRUE 0.985 2.000 0.333 1.000 N NA
 2054534 2054535 NT01CX_1216 NT01CX_1217     FALSE 0.197 79.000 0.000 NA   NA
 2054535 2054536 NT01CX_1217 NT01CX_1218     TRUE 0.930 14.000 0.000 0.021 Y NA
 2054536 2054537 NT01CX_1218 NT01CX_1219     FALSE 0.019 226.000 0.000 1.000 N NA
 2054537 2054538 NT01CX_1219 NT01CX_1220     TRUE 0.941 25.000 0.000 1.000 Y NA
 2054538 2054539 NT01CX_1220 NT01CX_1221   pflC TRUE 0.951 23.000 0.143 0.005 N NA
 2054539 2054540 NT01CX_1221 NT01CX_1222 pflC   FALSE 0.088 129.000 0.000 NA   NA
 2054540 2054541 NT01CX_1222 NT01CX_1223     FALSE 0.225 69.000 0.000 NA   NA
 2054541 2054542 NT01CX_1223 NT01CX_1224     FALSE 0.010 301.000 0.000 NA   NA
 2054542 2054543 NT01CX_1224 NT01CX_1225     FALSE 0.005 424.000 0.000 NA   NA
 2054543 2054544 NT01CX_1225 NT01CX_1226     TRUE 0.954 39.000 0.326 1.000 N NA
 2054544 2054545 NT01CX_1226 NT01CX_1227   potB TRUE 0.998 3.000 0.928 1.000 Y NA
 2054545 2054546 NT01CX_1227 NT01CX_1228 potB potC TRUE 0.997 -6.000 0.492 0.031 Y NA
 2054546 2054547 NT01CX_1228 NT01CX_1229 potC   TRUE 0.992 0.000 0.131 0.031 Y NA
 2054548 2054549 NT01CX_1230 NT01CX_1231     FALSE 0.431 33.000 0.000 NA   NA
 2054549 2054550 NT01CX_1231 NT01CX_1232     FALSE 0.323 48.000 0.000 NA   NA
 2054551 2054552 NT01CX_1233 NT01CX_1234 asnS   FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 2054552 2054553 NT01CX_1234 NT01CX_1235     FALSE 0.127 109.000 0.000 NA   NA
 2054553 2054554 NT01CX_1235 NT01CX_1236     TRUE 0.998 -12.000 0.408 0.007 Y NA
 2054554 2054555 NT01CX_1236 NT01CX_1237     TRUE 0.858 20.000 0.010 1.000   NA
 2054555 2054556 NT01CX_1237 NT01CX_1238     FALSE 0.004 475.000 0.000 1.000   NA
 2054556 2054557 NT01CX_1238 NT01CX_1239     FALSE 0.279 49.000 0.000 1.000   NA
 2054557 2054558 NT01CX_1239 NT01CX_1240     FALSE 0.244 66.000 0.000 1.000 N NA
 2054558 2054559 NT01CX_1240 NT01CX_1241     FALSE 0.190 85.000 0.000 1.000 N NA
 2054559 2054560 NT01CX_1241 NT01CX_1242     FALSE 0.032 194.000 0.000 1.000 N NA
 2054560 2054561 NT01CX_1242 NT01CX_1243     TRUE 0.988 28.000 0.143 1.000 Y NA
 2054563 2054564 NT01CX_1245 NT01CX_1246     FALSE 0.125 110.000 0.000 NA   NA
 2054565 2054566 NT01CX_1247 NT01CX_1248     FALSE 0.316 49.000 0.000 NA   NA
 2054567 2054568 NT01CX_1249 NT01CX_1250     FALSE 0.038 180.000 0.000 1.000 N NA
 2054568 2054569 NT01CX_1250 NT01CX_1251     TRUE 0.993 -10.000 0.669 0.004 N NA
 2054569 2054570 NT01CX_1251 NT01CX_1252     FALSE 0.095 128.000 0.000 1.000 N NA
 2054570 2054571 NT01CX_1252 NT01CX_1253     FALSE 0.053 161.000 0.000 NA   NA
 2054572 2054573 NT01CX_1254 NT01CX_1255 sdaAA sdaAB TRUE 0.990 5.000 0.146 0.001 Y NA
 2054574 2054575 NT01CX_1256 NT01CX_1257     TRUE 0.589 21.000 0.000 NA   NA
 2054575 2054576 NT01CX_1257 NT01CX_1258     TRUE 0.996 11.000 0.744 0.021 Y NA
 2054576 2054577 NT01CX_1258 NT01CX_1259     TRUE 0.828 112.000 0.033 1.000 Y NA
 2054577 2054578 NT01CX_1259 NT01CX_1260     FALSE 0.009 310.000 0.000 NA   NA
 2054578 2054579 NT01CX_1260 NT01CX_1261   acpS FALSE 0.362 127.000 0.020 NA   NA
 2054579 2054580 NT01CX_1261 NT01CX_1262 acpS   TRUE 0.964 -40.000 0.020 NA N NA
 2054580 2054581 NT01CX_1262 NT01CX_1263     TRUE 0.739 78.000 0.064 NA N NA
 2054581 2054582 NT01CX_1263 NT01CX_1264     TRUE 0.950 57.000 0.068 NA Y NA
 2054582 2054583 NT01CX_1264 NT01CX_1265     TRUE 0.789 146.000 0.571 NA   NA
 2054583 2054584 NT01CX_1265 NT01CX_1266     TRUE 0.973 -73.000 0.039 NA   NA
 2054584 2054585 NT01CX_1266 NT01CX_1267     FALSE 0.477 104.000 0.019 1.000 N NA
 2054585 2054586 NT01CX_1267 NT01CX_1268     TRUE 0.993 0.000 0.180 0.001 Y NA
 2054586 2054587 NT01CX_1268 NT01CX_1269     TRUE 0.654 133.000 0.167 NA   NA
 2054587 2054588 NT01CX_1269 NT01CX_1270   ftsE FALSE 0.449 97.000 0.010 NA   NA
 2054588 2054589 NT01CX_1270 NT01CX_1271 ftsE   TRUE 0.998 -10.000 0.431 NA Y NA
 2054589 2054590 NT01CX_1271 NT01CX_1272     FALSE 0.317 136.000 0.015 NA N NA
 2054590 2054591 NT01CX_1272 NT01CX_1273     TRUE 0.880 29.000 0.060 0.013   NA
 2054591 2054592 NT01CX_1273 NT01CX_1274   uvrB FALSE 0.262 141.000 0.013 1.000   NA
 2054592 2054593 NT01CX_1274 NT01CX_1275 uvrB uvrA TRUE 0.957 58.000 0.154 0.002 Y NA
 2054593 2054594 NT01CX_1275 NT01CX_1276 uvrA   FALSE 0.468 80.000 0.002 NA N NA
 2054594 2054595 NT01CX_1276 NT01CX_1277     TRUE 0.946 21.000 0.070 NA N NA
 2054595 2054596 NT01CX_1277 NT01CX_1278     TRUE 0.988 -7.000 0.285 1.000 N NA
 2054596 2054597 NT01CX_1278 NT01CX_1279     TRUE 0.762 -10.000 0.000 NA   NA
 2054597 2054598 NT01CX_1279 NT01CX_1280     TRUE 0.707 -3.000 0.000 NA   NA
 2054598 2054599 NT01CX_1280 NT01CX_1281   uvrC TRUE 0.839 21.000 0.005 NA   NA
 2054599 2054600 NT01CX_1281 NT01CX_1282 uvrC   TRUE 0.781 15.000 0.004 0.074 N NA
 2054600 2054601 NT01CX_1282 NT01CX_1283   murB TRUE 0.625 55.000 0.009 1.000 N NA
 2054601 2054602 NT01CX_1283 NT01CX_1284 murB   TRUE 0.583 122.000 0.080 NA   NA
 2054602 2054603 NT01CX_1284 NT01CX_1285     TRUE 0.985 -3.000 0.259 NA   NA
 2054603 2054604 NT01CX_1285 NT01CX_1286     TRUE 0.985 7.000 0.470 NA   NA
 2054604 2054605 NT01CX_1286 NT01CX_1287     TRUE 0.854 11.000 0.012 1.000   NA
 2054605 2054606 NT01CX_1287 NT01CX_1288   asnA FALSE 0.022 216.000 0.000 1.000 N NA
 2054606 2054607 NT01CX_1288 NT01CX_1289 asnA   FALSE 0.015 244.000 0.000 1.000 N NA
 2054607 2054608 NT01CX_1289 NT01CX_1290     TRUE 0.954 5.000 0.000 1.000 Y NA
 2054608 2054609 NT01CX_1290 NT01CX_1291     FALSE 0.182 85.000 0.000 NA   NA
 2054609 2054610 NT01CX_1291 NT01CX_1292     TRUE 0.971 52.000 1.000 NA   NA
 2054610 2054611 NT01CX_1292 NT01CX_1293   glpT FALSE 0.457 36.000 0.000 NA N NA
 2054611 2054612 NT01CX_1293 NT01CX_1294 glpT   FALSE 0.027 202.000 0.000 1.000 N NA
 2054612 2054613 NT01CX_1294 NT01CX_1295     FALSE 0.051 152.000 0.000 1.000   NA
 2054613 2054614 NT01CX_1295 NT01CX_1296   dnaE FALSE 0.013 236.000 0.000 1.000   NA
 2054614 2054615 NT01CX_1296 NT01CX_1297 dnaE   FALSE 0.077 260.000 0.029 1.000 N NA
 2054615 2054616 NT01CX_1297 NT01CX_1298     TRUE 0.897 48.000 0.008 0.005 Y NA
 2054616 2054617 NT01CX_1298 NT01CX_1299   rumA FALSE 0.017 232.000 0.000 1.000 N NA
 2054617 2054618 NT01CX_1299 NT01CX_1300 rumA   FALSE 0.204 66.000 0.000 1.000   NA
 2054618 2054619 NT01CX_1300 NT01CX_1301     FALSE 0.212 12.000 0.000 0.074   NA
 2054619 2054620 NT01CX_1301 NT01CX_1302     FALSE 0.008 358.000 0.000 1.000 N NA
 2054620 2054621 NT01CX_1302 NT01CX_1303     TRUE 0.762 -10.000 0.000 NA   NA
 2054621 2054622 NT01CX_1303 NT01CX_1304     FALSE 0.387 38.000 0.000 NA   NA
 2054622 2054623 NT01CX_1304 NT01CX_1305     FALSE 0.152 100.000 0.000 NA   NA
 2054623 2054624 NT01CX_1305 NT01CX_1306     FALSE 0.360 41.000 0.000 NA   NA
 2054624 2054625 NT01CX_1306 NT01CX_1307     TRUE 0.995 -28.000 0.500 NA   NA
 2054625 2054626 NT01CX_1307 NT01CX_1308     TRUE 0.965 12.000 0.167 NA   NA
 2054626 2054627 NT01CX_1308 NT01CX_1309     TRUE 0.625 4.000 0.000 NA   NA
 2054627 2054628 NT01CX_1309 NT01CX_1310     FALSE 0.016 233.000 0.000 NA   NA
 2054628 2054629 NT01CX_1310 NT01CX_1311     TRUE 0.989 10.000 0.105 NA Y NA
 2054629 2054630 NT01CX_1311 NT01CX_1312     TRUE 0.996 2.000 0.286 NA Y NA
 2054630 2054631 NT01CX_1312 NT01CX_1313     TRUE 0.987 18.000 0.500 1.000 N NA
 2054631 2054632 NT01CX_1313 NT01CX_1314     TRUE 0.999 -28.000 1.000 0.021 Y NA
 2054632 2054633 NT01CX_1314 NT01CX_1315   brnQ FALSE 0.004 636.000 0.000 1.000 N NA
 2054633 2054634 NT01CX_1315 NT01CX_1316 brnQ aroD TRUE 0.621 116.000 0.000 1.000 Y NA
 2054635 2054636 NT01CX_1317 NT01CX_1318     TRUE 0.668 165.000 0.500 0.030 N NA
 2054636 2054637 NT01CX_1318 NT01CX_1319     TRUE 0.995 -19.000 0.500 NA   NA
 2054637 2054638 NT01CX_1319 NT01CX_1320     TRUE 0.950 28.000 0.133 NA   NA
 2054638 2054639 NT01CX_1320 NT01CX_1321     TRUE 0.996 -10.000 0.133 1.000 Y NA
 2054640 2054641 NT01CX_1322 NT01CX_1323     TRUE 0.972 -7.000 0.078 NA   NA
 2054641 2054642 NT01CX_1323 NT01CX_1324     FALSE 0.542 26.000 0.000 NA   NA
 2054642 2054643 NT01CX_1324 NT01CX_1325     TRUE 0.998 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 2054643 2054644 NT01CX_1325 NT01CX_1326     TRUE 0.645 16.000 0.000 NA N NA
 2054644 2054645 NT01CX_1326 NT01CX_1327     FALSE 0.008 391.000 0.000 NA N NA
 2054645 2054646 NT01CX_1327 NT01CX_1328     FALSE 0.044 175.000 0.000 1.000 N NA
 2054646 2054647 NT01CX_1328 NT01CX_1329   cbiM FALSE 0.006 415.000 0.000 1.000 N NA
 2054647 2054648 NT01CX_1329 NT01CX_1330 cbiM cbiN TRUE 0.998 2.000 0.861 0.016 Y NA
 2054648 2054649 NT01CX_1330 NT01CX_1331 cbiN cbiQ TRUE 0.998 0.000 0.804 0.002 Y NA
 2054649 2054650 NT01CX_1331 NT01CX_1332 cbiQ   TRUE 0.958 85.000 0.335 0.002 Y NA
 2054652 2054653 NT01CX_1334 NT01CX_1335     TRUE 0.981 14.000 0.400 NA   NA
 2054653 2054654 NT01CX_1335 NT01CX_1336   algI FALSE 0.302 51.000 0.000 NA   NA
 2054655 2054656 NT01CX_1337 NT01CX_1338     TRUE 0.967 55.000 0.917 NA   NA
 2054657 2054658 NT01CX_1339 NT01CX_1340 lepB   FALSE 0.002 430.000 0.000 0.041 N NA
 2054658 2054659 NT01CX_1340 NT01CX_1341     TRUE 0.995 -19.000 0.583 1.000   NA
 2054659 2054660 NT01CX_1341 NT01CX_1342   trpB FALSE 0.004 427.000 0.000 1.000   NA
 2054660 2054661 NT01CX_1342 NT01CX_1343 trpB   FALSE 0.053 164.000 0.000 1.000 N NA
 2054662 2054663 NT01CX_1344 NT01CX_1345     FALSE 0.075 129.000 0.000 1.000   NA
 2054664 2054665 NT01CX_1346 NT01CX_1347     FALSE 0.027 189.000 0.000 1.000   NA
 2054665 2054666 NT01CX_1347 NT01CX_1348     FALSE 0.088 129.000 0.000 NA   NA
 2054666 2054667 NT01CX_1348 NT01CX_1349     FALSE 0.080 135.000 0.000 NA   NA
 2054667 2054668 NT01CX_1349 NT01CX_1350     FALSE 0.222 70.000 0.000 NA   NA
 2054668 2054669 NT01CX_1350 NT01CX_1351     FALSE 0.552 25.000 0.000 NA   NA
 2054669 2054670 NT01CX_1351 NT01CX_1352   lysA FALSE 0.005 402.000 0.000 1.000   NA
 2054670 2054671 NT01CX_1352 NT01CX_1353 lysA   FALSE 0.104 190.000 0.003 1.000 N NA
 2054671 2054672 NT01CX_1353 NT01CX_1354     FALSE 0.008 337.000 0.000 NA   NA
 2054672 2054673 NT01CX_1354 NT01CX_1355   trpS FALSE 0.085 132.000 0.000 NA   NA
 2054674 2054675 NT01CX_1356 NT01CX_1357     FALSE 0.007 360.000 0.000 NA   NA
 2054675 2054676 NT01CX_1357 NT01CX_1358     FALSE 0.076 28.000 0.000 0.005   NA
 2054677 2054678 NT01CX_1359 NT01CX_1360 prfC   FALSE 0.013 236.000 0.000 1.000   NA
 2054678 2054679 NT01CX_1360 NT01CX_1361     FALSE 0.102 112.000 0.000 1.000   NA
 2054679 2054680 NT01CX_1361 NT01CX_1362     FALSE 0.068 156.000 0.000 NA N NA
 2054680 2054681 NT01CX_1362 NT01CX_1363     TRUE 0.593 111.000 0.062 NA   NA
 2054681 2054682 NT01CX_1363 NT01CX_1364   tyrS FALSE 0.007 370.000 0.000 NA   NA
 2054682 2054683 NT01CX_1364 NT01CX_1365 tyrS   FALSE 0.132 107.000 0.000 NA   NA
 2054683 2054684 NT01CX_1365 NT01CX_1366     TRUE 0.985 22.000 0.500 NA   NA
 2054684 2054685 NT01CX_1366 NT01CX_1367     TRUE 0.944 7.000 0.077 1.000   NA
 2054688 2054689 NT01CX_1370 NT01CX_1371     FALSE 0.262 58.000 0.000 NA   NA
 2054689 2054690 NT01CX_1371 NT01CX_1372   leuS FALSE 0.486 30.000 0.000 NA   NA
 2054692 2054693 NT01CX_1374 NT01CX_1375     FALSE 0.228 68.000 0.000 NA   NA
 2054693 2054694 NT01CX_1375 NT01CX_1376     TRUE 0.608 17.000 0.000 NA   NA
 2054694 2054695 NT01CX_1376 NT01CX_1377     TRUE 0.789 -16.000 0.000 NA   NA
 2054695 2054696 NT01CX_1377 NT01CX_1378     TRUE 0.936 29.000 0.098 NA   NA
 2054698 2054699 NT01CX_1380 NT01CX_1381     FALSE 0.004 552.000 0.000 NA   NA
 2054700 2054701 NT01CX_1382 NT01CX_1383     FALSE 0.474 95.000 0.013 NA   NA
 2054703 2054704 NT01CX_1385 NT01CX_1386     FALSE 0.220 221.000 0.094 1.000 N NA
 2054704 2054705 NT01CX_1386 NT01CX_1387     TRUE 0.927 51.000 0.281 NA   NA
 2054707 2054708 NT01CX_1389 NT01CX_1390     FALSE 0.362 132.000 0.041 0.058   NA
 2054708 2054709 NT01CX_1390 NT01CX_1391     FALSE 0.005 385.000 0.000 1.000   NA
 2054709 2054710 NT01CX_1391 NT01CX_1392     TRUE 0.979 -34.000 0.064 1.000 N NA
 2054710 2054711 NT01CX_1392 NT01CX_1393     TRUE 0.864 40.000 0.064 1.000 N NA
 2054711 2054712 NT01CX_1393 NT01CX_1394     TRUE 0.854 13.000 0.011 1.000 N NA
 2054713 2054714 NT01CX_1395 NT01CX_1396     FALSE 0.044 180.000 0.000 NA N NA
 2054715 2054716 NT01CX_1397 NT01CX_1398     FALSE 0.001 224.000 0.000 0.025   NA
 2054716 2054717 NT01CX_1398 NT01CX_1399     TRUE 0.645 67.000 0.027 1.000   NA
 2054717 2054718 NT01CX_1399 NT01CX_1400     TRUE 0.668 48.000 0.008 1.000 N NA
 2054718 2054719 NT01CX_1400 NT01CX_1401     TRUE 0.868 13.000 0.016 NA   NA
 2054719 2054720 NT01CX_1401 NT01CX_1402   rpoN FALSE 0.071 143.000 0.000 NA   NA
 2054720 2054721 NT01CX_1402 NT01CX_1403 rpoN   FALSE 0.438 215.000 0.034 1.000 Y NA
 2054721 2054722 NT01CX_1403 NT01CX_1404     TRUE 0.789 62.000 0.067 1.000 N NA
 2054722 2054723 NT01CX_1404 NT01CX_1405     FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 2054723 2054724 NT01CX_1405 NT01CX_1406     FALSE 0.032 190.000 0.000 NA   NA
 2054724 2054725 NT01CX_1406 NT01CX_1407     FALSE 0.010 268.000 0.000 1.000   NA
 2054725 2054726 NT01CX_1407 NT01CX_1408     TRUE 0.636 115.000 0.097 1.000   NA
 2054726 2054727 NT01CX_1408 NT01CX_1409     TRUE 0.983 8.000 0.438 1.000   NA
 2054727 2054728 NT01CX_1409 NT01CX_1410     TRUE 0.993 -7.000 0.720 0.030   NA
 2054728 2054729 NT01CX_1410 NT01CX_1411     FALSE 0.007 317.000 0.000 1.000   NA
 2054729 2054730 NT01CX_1411 NT01CX_1412   tpiA TRUE 0.900 121.000 0.141 1.000 Y NA
 2054730 2054731 NT01CX_1412 NT01CX_1413 tpiA gpmI TRUE 0.955 73.000 0.138 1.000 Y NA
 2054731 2054732 NT01CX_1413 NT01CX_1414 gpmI   TRUE 0.785 114.000 0.016 1.000 Y NA
 2054732 2054733 NT01CX_1414 NT01CX_1415   secG FALSE 0.101 192.000 0.006 1.000   NA
 2054733 2054734 NT01CX_1415 NT01CX_1416 secG   FALSE 0.099 216.000 0.019 1.000   NA
 2054734 2054735 NT01CX_1416 NT01CX_1417     FALSE 0.046 249.000 0.003 1.000 N NA
 2054735 2054736 NT01CX_1417 NT01CX_1418   smpB TRUE 0.594 132.000 0.143 0.031 N NA
 2054736 2054737 NT01CX_1418 NT01CX_1419 smpB   FALSE 0.165 93.000 0.000 NA   NA
 2054737 2054738 NT01CX_1419 NT01CX_1420     FALSE 0.003 1417.000 0.000 NA   NA
 2054738 2054739 NT01CX_1420 NT01CX_1421     TRUE 0.562 24.000 0.000 NA   NA
 2054739 2054740 NT01CX_1421 NT01CX_1422     FALSE 0.323 48.000 0.000 NA   NA
 2054740 2054741 NT01CX_1422 NT01CX_1423     FALSE 0.003 1168.000 0.000 NA   NA
 2054741 2054742 NT01CX_1423 NT01CX_1424     FALSE 0.029 182.000 0.000 1.000   NA
 2054742 2054743 NT01CX_1424 NT01CX_1425     FALSE 0.150 88.000 0.000 1.000   NA
 2054743 2054744 NT01CX_1425 NT01CX_1426     TRUE 0.990 5.000 0.759 NA   NA
 2054744 2054745 NT01CX_1426 NT01CX_1427     FALSE 0.191 95.000 0.000 NA N NA
 2054745 2054746 NT01CX_1427 NT01CX_1428     FALSE 0.020 221.000 0.000 NA   NA
 2054746 2054747 NT01CX_1428 NT01CX_1429     FALSE 0.067 146.000 0.000 NA   NA
 2054747 2054748 NT01CX_1429 NT01CX_1430     TRUE 0.973 3.000 0.163 NA   NA
 2054748 2054749 NT01CX_1430 NT01CX_1431     TRUE 0.990 0.000 0.490 NA   NA
 2054749 2054750 NT01CX_1431 NT01CX_1432     TRUE 0.930 56.000 0.352 NA   NA
 2054750 2054751 NT01CX_1432 NT01CX_1433     TRUE 0.998 -12.000 0.741 0.020 Y NA
 2054751 2054752 NT01CX_1433 NT01CX_1434     FALSE 0.007 320.000 0.000 1.000   NA
 2054752 2054753 NT01CX_1434 NT01CX_1435     FALSE 0.028 198.000 0.000 NA   NA
 2054753 2054754 NT01CX_1435 NT01CX_1436     FALSE 0.029 196.000 0.000 NA   NA
 2054754 2054755 NT01CX_1436 NT01CX_1437   thiG FALSE 0.008 347.000 0.000 NA   NA
 2054755 2054756 NT01CX_1437 NT01CX_1438 thiG thiH TRUE 0.966 12.000 0.277 0.007   NA
 2054756 2054757 NT01CX_1438 NT01CX_1439 thiH   FALSE 0.033 190.000 0.000 1.000 N NA
 2054757 2054758 NT01CX_1439 NT01CX_1440     FALSE 0.053 164.000 0.000 1.000 N NA
 2054758 2054759 NT01CX_1440 NT01CX_1441     FALSE 0.007 368.000 0.000 NA   NA
 2054759 2054760 NT01CX_1441 NT01CX_1442     FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 2054760 2054761 NT01CX_1442 NT01CX_1443     FALSE 0.072 145.000 0.000 1.000 N NA
 2054761 2054762 NT01CX_1443 NT01CX_1444     FALSE 0.031 195.000 0.000 1.000 N NA
 2054762 2054763 NT01CX_1444 NT01CX_1445     FALSE 0.109 5.000 0.000 0.003   NA
 2054763 2054764 NT01CX_1445 NT01CX_1446     TRUE 0.689 80.000 0.055 1.000   NA
 2054764 2054765 NT01CX_1446 NT01CX_1447     TRUE 0.998 18.000 0.877 1.000 Y NA
 2054765 2054766 NT01CX_1447 NT01CX_1448     TRUE 0.989 3.000 0.070 1.000 Y NA
 2054766 2054767 NT01CX_1448 NT01CX_1449     TRUE 0.986 24.000 0.600 NA N NA
 2054767 2054768 NT01CX_1449 NT01CX_1450   cydD TRUE 0.874 28.000 0.024 NA N NA
 2054768 2054769 NT01CX_1450 NT01CX_1451 cydD   TRUE 0.996 17.000 0.576 0.004 Y NA
 2054769 2054770 NT01CX_1451 NT01CX_1452     FALSE 0.042 177.000 0.000 1.000 N NA
 2054770 2054771 NT01CX_1452 NT01CX_1453     FALSE 0.040 187.000 0.000 NA N NA
 2054771 2054772 NT01CX_1453 NT01CX_1454     TRUE 0.969 23.000 0.200 NA   NA
 2054772 2054773 NT01CX_1454 NT01CX_1455     FALSE 0.380 34.000 0.000 1.000   NA
 2054773 2054774 NT01CX_1455 NT01CX_1456   asnC FALSE 0.007 375.000 0.000 1.000 N NA
 2054774 2054775 NT01CX_1456 NT01CX_1457 asnC   TRUE 0.995 -3.000 0.894 1.000 N NA
 2054775 2054776 NT01CX_1457 NT01CX_1458     FALSE 0.033 178.000 0.000 1.000   NA
 2054776 2054777 NT01CX_1458 NT01CX_1459     FALSE 0.016 89.000 0.000 0.003   NA
 2054779 2054780 NT01CX_1461 NT01CX_1462     FALSE 0.400 38.000 0.000 1.000 N NA
 2054780 2054781 NT01CX_1462 NT01CX_1463   spsC TRUE 0.736 112.000 0.012 0.017 Y NA
 2054781 2054782 NT01CX_1463 NT01CX_1464 spsC   FALSE 0.035 182.000 0.000 NA   NA
 2054782 2054783 NT01CX_1464 NT01CX_1465     FALSE 0.009 302.000 0.000 NA   NA
 2054783 2054784 NT01CX_1465 NT01CX_1466     TRUE 0.998 -28.000 0.261 1.000 Y NA
 2054784 2054785 NT01CX_1466 NT01CX_1467     FALSE 0.044 172.000 0.000 NA   NA
 2054785 2054786 NT01CX_1467 NT01CX_1468     FALSE 0.535 116.000 0.048 NA   NA
 2054786 2054787 NT01CX_1468 NT01CX_1469   bioA TRUE 0.988 6.000 0.124 0.003 Y NA
 2054787 2054788 NT01CX_1469 NT01CX_1470 bioA bioB TRUE 0.995 -10.000 0.176 0.003 Y NA
 2054788 2054789 NT01CX_1470 NT01CX_1471 bioB   FALSE 0.017 231.000 0.000 1.000 N NA
 2054789 2054790 NT01CX_1471 NT01CX_1472     TRUE 0.969 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2054790 2054791 NT01CX_1472 NT01CX_1473     FALSE 0.003 621.000 0.000 1.000   NA
 2054793 2054794 NT01CX_1475 NT01CX_1476     TRUE 0.688 102.000 0.000 1.000 Y NA
 2054794 2054795 NT01CX_1476 NT01CX_1477     FALSE 0.040 179.000 0.000 1.000 N NA
 2054795 2054796 NT01CX_1477 NT01CX_1478     TRUE 0.945 12.000 0.000 1.000 Y NA
 2054796 2054797 NT01CX_1478 NT01CX_1479     FALSE 0.087 133.000 0.000 1.000 N NA
 2054797 2054798 NT01CX_1479 NT01CX_1480     FALSE 0.013 260.000 0.000 1.000 N NA
 2054798 2054799 NT01CX_1480 NT01CX_1481     FALSE 0.557 129.000 0.000 1.000 Y NA
 2054801 2054802 NT01CX_1483 NT01CX_1484     TRUE 0.941 4.000 0.053 NA   NA
 2054802 2054803 NT01CX_1484 NT01CX_1485     TRUE 0.993 2.000 0.237 0.002 Y NA
 2054803 2054804 NT01CX_1485 NT01CX_1486     TRUE 0.977 17.000 0.260 1.000   NA
 2054804 2054805 NT01CX_1486 NT01CX_1487     FALSE 0.040 177.000 0.000 NA   NA
 2054805 2054806 NT01CX_1487 NT01CX_1488     TRUE 0.970 9.000 0.193 NA   NA
 2054806 2054807 NT01CX_1488 NT01CX_1489     TRUE 0.999 -12.000 0.838 0.006 Y NA
 2054807 2054808 NT01CX_1489 NT01CX_1490     FALSE 0.153 233.000 0.068 NA   NA
 2054808 2054809 NT01CX_1490 NT01CX_1491     TRUE 0.562 24.000 0.000 NA   NA
 2054810 2054811 NT01CX_1492 NT01CX_1493     FALSE 0.112 119.000 0.000 1.000 N NA
 2054811 2054812 NT01CX_1493 NT01CX_1494     FALSE 0.050 167.000 0.000 1.000 N NA
 2054813 2054814 NT01CX_1495 NT01CX_1496   deoC FALSE 0.163 98.000 0.000 1.000 N NA
 2054814 2054815 NT01CX_1496 NT01CX_1497 deoC deoB FALSE 0.203 140.000 0.009 0.052 N NA
 2054815 2054816 NT01CX_1497 NT01CX_1498 deoB   TRUE 0.793 90.000 0.135 1.000 N NA
 2054816 2054817 NT01CX_1498 NT01CX_1499     TRUE 0.917 64.000 0.031 1.000 Y NA
 2054817 2054818 NT01CX_1499 NT01CX_1500     FALSE 0.374 173.000 0.000 1.000 Y NA
 2054818 2054819 NT01CX_1500 NT01CX_1501     FALSE 0.022 214.000 0.000 NA   NA
 2054819 2054820 NT01CX_1501 NT01CX_1502   thiS FALSE 0.338 46.000 0.000 NA   NA
 2054820 2054821 NT01CX_1502 NT01CX_1503 thiS thiF TRUE 0.992 3.000 0.115 1.000 Y NA
 2054821 2054822 NT01CX_1503 NT01CX_1504 thiF   TRUE 0.951 20.000 0.000 1.000 Y NA
 2054823 2054824 NT01CX_1505 NT01CX_1506     FALSE 0.338 46.000 0.000 NA   NA
 2054825 2054826 NT01CX_1507 NT01CX_1508     FALSE 0.191 81.000 0.000 NA   NA
 2054826 2054827 NT01CX_1508 NT01CX_1509     FALSE 0.154 99.000 0.000 NA   NA
 2054827 2054828 NT01CX_1509 NT01CX_1510     FALSE 0.039 168.000 0.000 1.000   NA
 2054828 2054829 NT01CX_1510 NT01CX_1511     FALSE 0.046 170.000 0.000 NA   NA
 2054831 2054832 NT01CX_1513 NT01CX_1514     TRUE 0.997 4.000 0.750 1.000 Y NA
 2054833 2054834 NT01CX_1515 NT01CX_1516     FALSE 0.154 86.000 0.000 1.000   NA
 2054835 2054836 NT01CX_1517 NT01CX_1518     FALSE 0.195 69.000 0.000 1.000   NA
 2054836 2054837 NT01CX_1518 NT01CX_1519     FALSE 0.007 360.000 0.000 NA   NA
 2054837 2054838 NT01CX_1519 NT01CX_1520     TRUE 0.994 -7.000 0.647 NA N NA
 2054838 2054839 NT01CX_1520 NT01CX_1521     FALSE 0.398 37.000 0.000 NA   NA
 2054839 2054840 NT01CX_1521 NT01CX_1522     FALSE 0.010 286.000 0.000 NA   NA
 2054840 2054841 NT01CX_1522 NT01CX_1523     TRUE 0.621 17.000 0.000 1.000 N NA
 2054841 2054842 NT01CX_1523 NT01CX_1524     TRUE 0.718 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2054842 2054843 NT01CX_1524 NT01CX_1525     TRUE 0.727 94.000 0.000 NA Y NA
 2054843 2054844 NT01CX_1525 NT01CX_1526     TRUE 0.946 13.000 0.000 NA Y NA
 2054844 2054845 NT01CX_1526 NT01CX_1527     TRUE 0.937 27.000 0.000 1.000 Y NA
 2054845 2054846 NT01CX_1527 NT01CX_1528     TRUE 0.943 13.000 0.000 1.000 Y NA
 2054846 2054847 NT01CX_1528 NT01CX_1529     FALSE 0.019 77.000 0.000 0.019   NA
 2054847 2054848 NT01CX_1529 NT01CX_1530     FALSE 0.106 17.000 0.000 0.019   NA
 2054848 2054849 NT01CX_1530 NT01CX_1531     TRUE 0.581 15.000 0.000 NA   NA
 2054849 2054850 NT01CX_1531 NT01CX_1532     TRUE 0.707 -3.000 0.000 NA   NA
 2054850 2054851 NT01CX_1532 NT01CX_1533     FALSE 0.260 59.000 0.000 NA   NA
 2054851 2054852 NT01CX_1533 NT01CX_1534     TRUE 0.789 -16.000 0.000 NA   NA
 2054852 2054853 NT01CX_1534 NT01CX_1535     TRUE 0.580 10.000 0.000 NA   NA
 2054853 2054854 NT01CX_1535 NT01CX_1536   galE FALSE 0.338 46.000 0.000 NA   NA
 2054854 2054855 NT01CX_1536 NT01CX_1537 galE   TRUE 0.581 15.000 0.000 NA   NA
 2054855 2054856 NT01CX_1537 NT01CX_1538     FALSE 0.024 207.000 0.000 NA   NA
 2054856 2054857 NT01CX_1538 NT01CX_1539     FALSE 0.052 162.000 0.000 NA   NA
 2054861 2054862 NT01CX_1543 NT01CX_1544     FALSE 0.024 206.000 0.000 NA   NA
 2054862 2054863 NT01CX_1544 NT01CX_1545     FALSE 0.060 165.000 0.000 NA N NA
 2054863 2054864 NT01CX_1545 NT01CX_1546     FALSE 0.170 79.000 0.000 1.000   NA
 2054866 2054867 NT01CX_1548 NT01CX_1549     TRUE 0.988 14.000 0.750 NA   NA
 2054867 2054868 NT01CX_1549 NT01CX_1550     TRUE 0.770 -12.000 0.000 NA   NA
 2054868 2054869 NT01CX_1550 NT01CX_1551     TRUE 0.617 6.000 0.000 1.000 N NA
 2054869 2054870 NT01CX_1551 NT01CX_1552     FALSE 0.184 0.000 0.000 0.029   NA
 2054870 2054871 NT01CX_1552 NT01CX_1553     FALSE 0.044 162.000 0.000 1.000   NA
 2054871 2054872 NT01CX_1553 NT01CX_1554   algI TRUE 0.806 66.000 0.000 NA Y NA
 2054872 2054873 NT01CX_1554 NT01CX_1555 algI   TRUE 0.597 16.000 0.000 NA   NA
 2054873 2054874 NT01CX_1555 NT01CX_1556     FALSE 0.125 110.000 0.000 NA   NA
 2054874 2054875 NT01CX_1556 NT01CX_1557     FALSE 0.034 184.000 0.000 NA   NA
 2054875 2054876 NT01CX_1557 NT01CX_1558     TRUE 0.581 15.000 0.000 NA   NA
 2054876 2054877 NT01CX_1558 NT01CX_1559     FALSE 0.532 27.000 0.000 NA   NA
 2054877 2054878 NT01CX_1559 NT01CX_1560     FALSE 0.083 133.000 0.000 NA   NA
 2054878 2054879 NT01CX_1560 NT01CX_1561     FALSE 0.225 69.000 0.000 NA   NA
 2054879 2054880 NT01CX_1561 NT01CX_1562     FALSE 0.065 151.000 0.000 1.000 N NA
 2054880 2054881 NT01CX_1562 NT01CX_1563     FALSE 0.246 63.000 0.000 NA   NA
 2054881 2054882 NT01CX_1563 NT01CX_1564   pepF TRUE 0.932 26.000 0.070 NA   NA
 2054882 2054883 NT01CX_1564 NT01CX_1565 pepF   FALSE 0.082 137.000 0.000 1.000 N NA
 2054883 2054884 NT01CX_1565 NT01CX_1566     FALSE 0.154 86.000 0.000 1.000   NA
 2054884 2054885 NT01CX_1566 NT01CX_1567     FALSE 0.537 10.000 0.000 1.000   NA
 2054887 2054888 NT01CX_1569 NT01CX_1570     FALSE 0.470 127.000 0.046 NA   NA
 2054888 2054889 NT01CX_1570 NT01CX_1571     FALSE 0.278 55.000 0.000 NA   NA
 2054889 2054890 NT01CX_1571 NT01CX_1572     FALSE 0.371 239.000 0.400 NA   NA
 2054890 2054891 NT01CX_1572 NT01CX_1573     TRUE 0.980 24.000 0.400 1.000   NA
 2054892 2054893 NT01CX_1574 NT01CX_1575     TRUE 0.989 10.000 0.796 1.000   NA
 2054895 2054896 NT01CX_1577 NT01CX_1578     FALSE 0.021 217.000 0.000 NA   NA
 2054897 2054898 NT01CX_1579 NT01CX_1580     TRUE 0.995 17.000 0.431 0.041 Y NA
 2054898 2054899 NT01CX_1580 NT01CX_1581     TRUE 0.997 1.000 0.678 0.041 Y NA
 2054899 2054900 NT01CX_1581 NT01CX_1582     TRUE 0.991 0.000 0.091 0.041 Y NA
 2054900 2054901 NT01CX_1582 NT01CX_1583     TRUE 0.988 30.000 0.237 0.041 Y NA
 2054901 2054902 NT01CX_1583 NT01CX_1584     TRUE 0.932 14.000 0.000 0.041 Y NA
 2054904 2054905 NT01CX_1586 NT01CX_1587 mgtE argS FALSE 0.007 380.000 0.000 1.000 N NA
 2054905 2054906 NT01CX_1587 NT01CX_1588 argS manA FALSE 0.011 289.000 0.000 1.000 N NA
 2054906 2054907 NT01CX_1588 NT01CX_1589 manA   FALSE 0.057 160.000 0.000 1.000 N NA
 2054908 2054909 NT01CX_1590 NT01CX_1591   feoB FALSE 0.407 36.000 0.000 NA   NA
 2054909 2054910 NT01CX_1591 NT01CX_1592 feoB feoA TRUE 0.996 2.000 0.308 1.000 Y NA
 2054911 2054912 NT01CX_1593 NT01CX_1594     FALSE 0.009 282.000 0.000 1.000   NA
 2054912 2054913 NT01CX_1594 NT01CX_1595     TRUE 0.987 29.000 0.141 1.000 Y NA
 2054913 2054914 NT01CX_1595 NT01CX_1596     FALSE 0.423 211.000 0.047 0.003 Y NA
 2054914 2054915 NT01CX_1596 NT01CX_1597     FALSE 0.228 68.000 0.000 NA   NA
 2054915 2054916 NT01CX_1597 NT01CX_1598     TRUE 0.995 -10.000 0.667 NA   NA
 2054916 2054917 NT01CX_1598 NT01CX_1599     TRUE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 2054917 2054918 NT01CX_1599 NT01CX_1600     TRUE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 2054918 2054919 NT01CX_1600 NT01CX_1601     TRUE 0.983 20.000 0.400 NA   NA
 2054919 2054920 NT01CX_1601 NT01CX_1602     TRUE 0.707 -3.000 0.000 NA   NA
 2054920 2054921 NT01CX_1602 NT01CX_1603     TRUE 0.946 43.000 0.027 1.000 Y NA
 2054921 2054922 NT01CX_1603 NT01CX_1604     TRUE 0.589 21.000 0.000 NA   NA
 2054922 2054923 NT01CX_1604 NT01CX_1605     FALSE 0.067 146.000 0.000 NA   NA
 2054924 2054925 NT01CX_1606 NT01CX_1607     TRUE 0.627 142.000 0.188 1.000   NA
 2054926 2054927 NT01CX_1608 NT01CX_1609     FALSE 0.011 289.000 0.000 1.000 N NA
 2054927 2054928 NT01CX_1609 NT01CX_1610     TRUE 0.948 84.000 0.148 1.000 Y NA
 2054928 2054929 NT01CX_1610 NT01CX_1611     TRUE 0.984 75.000 0.875 0.020 Y NA
 2054929 2054930 NT01CX_1611 NT01CX_1612     TRUE 0.991 46.000 0.875 0.011 Y NA
 2054930 2054931 NT01CX_1612 NT01CX_1613     FALSE 0.058 155.000 0.000 NA   NA
 2054933 2054934 NT01CX_1615 NT01CX_1616     FALSE 0.077 139.000 0.000 NA   NA
 2054940 2054941 NT01CX_1622 NT01CX_1623     FALSE 0.084 123.000 0.000 1.000   NA
 2054941 2054942 NT01CX_1623 NT01CX_1624     TRUE 0.589 21.000 0.000 NA   NA
 2054942 2054943 NT01CX_1624 NT01CX_1625     FALSE 0.220 71.000 0.000 NA   NA
 2054945 2054946 NT01CX_1627 NT01CX_1628     FALSE 0.046 169.000 0.000 NA   NA
 2054946 2054947 NT01CX_1628 NT01CX_1629     FALSE 0.107 119.000 0.000 NA   NA
 2054947 2054948 NT01CX_1629 NT01CX_1630     TRUE 0.947 19.000 0.079 1.000   NA
 2054948 2054949 NT01CX_1630 NT01CX_1631     FALSE 0.150 164.000 0.005 1.000   NA
 2054949 2054950 NT01CX_1631 NT01CX_1632     TRUE 0.826 13.000 0.007 1.000   NA
 2054952 2054953 NT01CX_1634 NT01CX_1635     TRUE 0.579 22.000 0.000 NA   NA
 2054955 2054956 NT01CX_1637 NT01CX_1638     TRUE 0.980 18.000 0.312 1.000   NA
 2054956 2054957 NT01CX_1638 NT01CX_1639     TRUE 0.622 156.000 0.250 NA   NA
 2054957 2054958 NT01CX_1639 NT01CX_1640     TRUE 0.979 -40.000 0.063 NA   NA
 2054958 2054959 NT01CX_1640 NT01CX_1641     FALSE 0.015 237.000 0.000 NA   NA
 2054959 2054960 NT01CX_1641 NT01CX_1642   atpI TRUE 0.965 -13.000 0.039 NA   NA
 2054960 2054961 NT01CX_1642 NT01CX_1643 atpI atpK TRUE 0.918 90.000 0.848 0.009   NA
 2054961 2054962 NT01CX_1643 NT01CX_1644 atpK   TRUE 0.958 37.000 0.489 0.009   NA
 2054962 2054963 NT01CX_1644 NT01CX_1645     TRUE 0.991 14.000 0.258 0.009 Y NA
 2054963 2054964 NT01CX_1645 NT01CX_1646     TRUE 0.997 -7.000 0.487 0.009 Y NA
 2054964 2054965 NT01CX_1646 NT01CX_1647     TRUE 0.995 19.000 0.462 0.009 Y NA
 2054965 2054966 NT01CX_1647 NT01CX_1648   atpB TRUE 0.998 -7.000 0.776 0.009 Y NA
 2054966 2054967 NT01CX_1648 NT01CX_1649 atpB   TRUE 0.993 3.000 0.238 0.009 Y NA
 2054967 2054968 NT01CX_1649 NT01CX_1650     FALSE 0.047 172.000 0.000 1.000 N NA
 2054968 2054969 NT01CX_1650 NT01CX_1651     FALSE 0.065 147.000 0.000 NA   NA
 2054969 2054970 NT01CX_1651 NT01CX_1652     FALSE 0.062 151.000 0.000 NA   NA
 2054970 2054971 NT01CX_1652 NT01CX_1653     TRUE 0.571 23.000 0.000 NA   NA
 2054971 2054972 NT01CX_1653 NT01CX_1654     FALSE 0.321 41.000 0.000 1.000   NA
 2054972 2054973 NT01CX_1654 NT01CX_1655   glpX FALSE 0.004 593.000 0.000 1.000 N NA
 2054973 2054974 NT01CX_1655 NT01CX_1656 glpX   FALSE 0.151 175.000 0.007 1.000 N NA
 2054974 2054975 NT01CX_1656 NT01CX_1657     TRUE 0.935 -16.000 0.006 1.000 N NA
 2054975 2054976 NT01CX_1657 NT01CX_1658     FALSE 0.351 46.000 0.000 1.000 N NA
 2054976 2054977 NT01CX_1658 NT01CX_1659     TRUE 0.603 91.000 0.034 1.000 N NA
 2054978 2054979 NT01CX_1660 NT01CX_1661     FALSE 0.285 54.000 0.000 NA   NA
 2054981 2054982 NT01CX_1663 NT01CX_1664   brnQ FALSE 0.187 83.000 0.000 NA   NA
 2054984 2054985 NT01CX_1666 NT01CX_1667     TRUE 0.782 -15.000 0.000 NA   NA
 2054986 2054987 NT01CX_1668 NT01CX_1669     FALSE 0.072 142.000 0.000 NA   NA
 2054987 2054988 NT01CX_1669 NT01CX_1670     FALSE 0.160 96.000 0.000 NA   NA
 2054988 2054989 NT01CX_1670 NT01CX_1671     FALSE 0.112 116.000 0.000 NA   NA
 2054991 2054992 NT01CX_1673 NT01CX_1674     FALSE 0.090 128.000 0.000 NA   NA
 2054992 2054993 NT01CX_1674 NT01CX_1675     FALSE 0.009 304.000 0.000 NA   NA
 2054995 2054996 NT01CX_1677 NT01CX_1678   coaE TRUE 0.834 50.000 0.068 1.000 N NA
 2054996 2054997 NT01CX_1678 NT01CX_1679 coaE   TRUE 0.961 -3.000 0.058 NA   NA
 2054997 2054998 NT01CX_1679 NT01CX_1680     FALSE 0.257 60.000 0.000 NA   NA
 2054998 2054999 NT01CX_1680 NT01CX_1681     FALSE 0.168 91.000 0.000 NA   NA
 2054999 2055000 NT01CX_1681 NT01CX_1682     FALSE 0.217 73.000 0.000 NA   NA
 2055000 2055001 NT01CX_1682 NT01CX_1683     FALSE 0.122 111.000 0.000 NA   NA
 2055001 2055002 NT01CX_1683 NT01CX_1684     TRUE 0.886 87.000 0.364 NA   NA
 2055002 2055003 NT01CX_1684 NT01CX_1685     TRUE 0.720 146.000 0.357 NA   NA
 2055003 2055004 NT01CX_1685 NT01CX_1686     TRUE 0.894 11.000 0.026 NA   NA
 2055004 2055005 NT01CX_1686 NT01CX_1687     TRUE 0.952 17.000 0.074 NA N NA
 2055005 2055006 NT01CX_1687 NT01CX_1688     TRUE 0.920 9.000 0.040 1.000 N NA
 2055006 2055007 NT01CX_1688 NT01CX_1689   mreC TRUE 0.988 11.000 0.689 1.000 N NA
 2055007 2055008 NT01CX_1689 NT01CX_1690 mreC mreD TRUE 0.989 -3.000 0.550 0.004   NA
 2055008 2055009 NT01CX_1690 NT01CX_1691 mreD   TRUE 0.949 16.000 0.089 1.000   NA
 2055009 2055010 NT01CX_1691 NT01CX_1692   minC FALSE 0.353 161.000 0.060 1.000   NA
 2055010 2055011 NT01CX_1692 NT01CX_1693 minC minD TRUE 0.995 16.000 0.368 1.000 Y NA
 2055011 2055012 NT01CX_1693 NT01CX_1694 minD minE TRUE 0.995 12.000 0.347 NA Y NA
 2055012 2055013 NT01CX_1694 NT01CX_1695 minE rodA TRUE 0.839 89.000 0.008 NA Y NA
 2055013 2055014 NT01CX_1695 NT01CX_1696 rodA mgsA TRUE 0.602 21.000 0.000 1.000 N NA
 2055015 2055016 NT01CX_1697 NT01CX_1698     TRUE 0.892 91.000 0.409 NA   NA
 2055016 2055017 NT01CX_1698 NT01CX_1699     FALSE 0.059 144.000 0.000 1.000   NA
 2055018 2055019 NT01CX_1700 NT01CX_1701     TRUE 0.676 117.000 0.127 NA   NA
 2055019 2055020 NT01CX_1701 NT01CX_1702     FALSE 0.078 127.000 0.000 1.000   NA
 2055020 2055021 NT01CX_1702 NT01CX_1703     TRUE 0.909 0.000 0.015 1.000   NA
 2055021 2055022 NT01CX_1703 NT01CX_1704     TRUE 0.928 -7.000 0.012 NA   NA
 2055023 2055024 NT01CX_1705 NT01CX_1706     FALSE 0.113 107.000 0.000 1.000   NA
 2055024 2055025 NT01CX_1706 NT01CX_1707     TRUE 0.999 -7.000 0.876 1.000 Y NA
 2055027 2055028 NT01CX_1709 NT01CX_1710     TRUE 0.846 -52.000 0.000 NA N NA
 2055029 2055030 NT01CX_1711 NT01CX_1712     FALSE 0.119 112.000 0.000 NA   NA
 2055030 2055031 NT01CX_1712 NT01CX_1713     FALSE 0.012 261.000 0.000 NA   NA
 2055031 2055032 NT01CX_1713 NT01CX_1714     TRUE 0.722 -6.000 0.000 NA   NA
 2055033 2055034 NT01CX_1715 NT01CX_1716     FALSE 0.026 191.000 0.000 1.000   NA
 2055034 2055035 NT01CX_1716 NT01CX_1717     TRUE 0.999 -64.000 0.667 0.004 Y NA
 2055035 2055036 NT01CX_1717 NT01CX_1718     FALSE 0.086 130.000 0.000 NA   NA
 2055036 2055037 NT01CX_1718 NT01CX_1719     FALSE 0.148 101.000 0.000 NA   NA
 2055040 2055041 NT01CX_1722 NT01CX_1723     FALSE 0.013 255.000 0.000 NA   NA
 2055041 2055042 NT01CX_1723 NT01CX_1724     FALSE 0.213 74.000 0.000 NA   NA
 2055042 2055043 NT01CX_1724 NT01CX_1725     FALSE 0.097 335.000 0.000 1.000 Y NA
 2055045 2055046 NT01CX_1727 NT01CX_1728 valS   FALSE 0.205 76.000 0.000 NA   NA
 2055046 2055047 NT01CX_1728 NT01CX_1729     FALSE 0.387 38.000 0.000 NA   NA
 2055049 2055050 NT01CX_1731 NT01CX_1732     FALSE 0.014 243.000 0.000 NA   NA
 2055054 2055055 NT01CX_1736 NT01CX_1737     FALSE 0.336 178.000 0.079 1.000 N NA
 2055057 2055058 NT01CX_1739 NT01CX_1740     FALSE 0.079 377.000 0.000 1.000 Y NA
 2055058 2055059 NT01CX_1740 NT01CX_1741     TRUE 0.758 152.000 0.093 0.028 Y NA
 2055059 2055060 NT01CX_1741 NT01CX_1742     TRUE 0.986 13.000 0.124 0.028 Y NA
 2055060 2055061 NT01CX_1742 NT01CX_1743     TRUE 0.996 13.000 0.571 1.000 Y NA
 2055061 2055062 NT01CX_1743 NT01CX_1744     TRUE 0.997 -7.000 0.444 0.001 Y NA
 2055063 2055064 NT01CX_1745 NT01CX_1746 dapB dapA TRUE 0.980 5.000 0.022 1.000 Y NA
 2055064 2055065 NT01CX_1746 NT01CX_1747 dapA   TRUE 0.979 22.000 0.029 1.000 Y NA
 2055066 2055067 NT01CX_1748 NT01CX_1749     FALSE 0.535 118.000 0.056 1.000   NA
 2055067 2055068 NT01CX_1749 NT01CX_1750     TRUE 0.930 12.000 0.063 1.000   NA
 2055068 2055069 NT01CX_1750 NT01CX_1751     FALSE 0.006 385.000 0.000 NA   NA
 2055069 2055070 NT01CX_1751 NT01CX_1752     TRUE 0.597 16.000 0.000 NA   NA
 2055070 2055071 NT01CX_1752 NT01CX_1753     TRUE 0.585 9.000 0.000 NA   NA
 2055071 2055072 NT01CX_1753 NT01CX_1754     TRUE 0.589 8.000 0.000 NA   NA
 2055072 2055073 NT01CX_1754 NT01CX_1755     TRUE 0.568 12.000 0.000 NA   NA
 2055073 2055074 NT01CX_1755 NT01CX_1756     FALSE 0.174 88.000 0.000 NA   NA
 2055074 2055075 NT01CX_1756 NT01CX_1757     FALSE 0.021 216.000 0.000 NA   NA
 2055077 2055078 NT01CX_1759 NT01CX_1760   thrS FALSE 0.006 388.000 0.000 NA   NA
 2055078 2055079 NT01CX_1760 NT01CX_1761 thrS   FALSE 0.147 358.000 0.007 1.000 Y NA
 2055079 2055080 NT01CX_1761 NT01CX_1762   rpmI TRUE 0.997 19.000 0.652 1.000 Y NA
 2055080 2055081 NT01CX_1762 NT01CX_1763 rpmI rplT TRUE 0.996 30.000 0.928 0.022 Y NA
 2055081 2055082 NT01CX_1763 NT01CX_1764 rplT   FALSE 0.393 100.000 0.004 1.000 N NA
 2055082 2055083 NT01CX_1764 NT01CX_1765     TRUE 0.990 4.000 0.137 0.004 Y NA
 2055083 2055084 NT01CX_1765 NT01CX_1766     TRUE 0.890 11.000 0.022 1.000 N NA
 2055084 2055085 NT01CX_1766 NT01CX_1767   pheS FALSE 0.152 349.000 0.006 1.000 Y NA
 2055085 2055086 NT01CX_1767 NT01CX_1768 pheS pheT TRUE 0.993 30.000 0.574 0.001 Y NA
 2055086 2055087 NT01CX_1768 NT01CX_1769 pheT   TRUE 0.656 78.000 0.038 NA   NA
 2055087 2055088 NT01CX_1769 NT01CX_1770     FALSE 0.004 625.000 0.000 NA   NA
 2055090 2055091 NT01CX_1772 NT01CX_1773     TRUE 0.958 2.000 0.078 1.000 N NA
 2055091 2055092 NT01CX_1773 NT01CX_1774     TRUE 0.839 24.000 0.008 NA   NA
 2055092 2055093 NT01CX_1774 NT01CX_1775     FALSE 0.532 27.000 0.000 NA   NA
 2055093 2055094 NT01CX_1775 NT01CX_1776     FALSE 0.237 134.000 0.002 1.000 N NA
 2055094 2055095 NT01CX_1776 NT01CX_1777     FALSE 0.472 213.000 0.417 1.000   NA
 2055095 2055096 NT01CX_1777 NT01CX_1778   galU TRUE 0.965 39.000 0.500 1.000   NA
 2055096 2055097 NT01CX_1778 NT01CX_1779 galU   TRUE 0.603 177.000 0.056 0.018 Y NA
 2055097 2055098 NT01CX_1779 NT01CX_1780     TRUE 0.590 179.000 0.035 1.000 Y NA
 2055098 2055099 NT01CX_1780 NT01CX_1781     TRUE 0.841 62.000 0.154 0.040   NA
 2055099 2055100 NT01CX_1781 NT01CX_1782     TRUE 0.887 20.000 0.020 1.000   NA
 2055100 2055101 NT01CX_1782 NT01CX_1783     FALSE 0.365 175.000 0.000 1.000 Y NA
 2055101 2055102 NT01CX_1783 NT01CX_1784     TRUE 0.994 -7.000 0.105 1.000 Y NA
 2055102 2055103 NT01CX_1784 NT01CX_1785     TRUE 0.997 19.000 0.549 1.000 Y NA
 2055103 2055104 NT01CX_1785 NT01CX_1786     FALSE 0.373 35.000 0.000 1.000   NA
 2055104 2055105 NT01CX_1786 NT01CX_1787     TRUE 0.831 8.000 0.006 1.000   NA
 2055105 2055106 NT01CX_1787 NT01CX_1788     TRUE 0.989 25.000 0.129 1.000 Y NA
 2055106 2055107 NT01CX_1788 NT01CX_1789     TRUE 0.984 15.000 0.071 0.038 Y NA
 2055107 2055108 NT01CX_1789 NT01CX_1790   mviN FALSE 0.082 125.000 0.000 1.000   NA
 2055108 2055109 NT01CX_1790 NT01CX_1791 mviN   TRUE 0.579 22.000 0.000 NA   NA
 2055109 2055110 NT01CX_1791 NT01CX_1792     FALSE 0.466 31.000 0.000 NA   NA
 2055110 2055111 NT01CX_1792 NT01CX_1793     TRUE 0.976 2.000 0.176 NA   NA
 2055111 2055112 NT01CX_1793 NT01CX_1794     FALSE 0.286 48.000 0.000 1.000   NA
 2055112 2055113 NT01CX_1794 NT01CX_1795     FALSE 0.502 29.000 0.000 NA   NA
 2055113 2055114 NT01CX_1795 NT01CX_1796     TRUE 0.855 96.000 0.020 NA Y NA
 2055114 2055115 NT01CX_1796 NT01CX_1797     TRUE 0.889 40.000 0.000 NA Y NA
 2055115 2055116 NT01CX_1797 NT01CX_1798     TRUE 0.980 7.000 0.024 NA Y NA
 2055116 2055117 NT01CX_1798 NT01CX_1799     FALSE 0.527 23.000 0.000 1.000   NA
 2055117 2055118 NT01CX_1799 NT01CX_1800     TRUE 0.943 25.000 0.095 1.000   NA
 2055118 2055119 NT01CX_1800 NT01CX_1801   noxC FALSE 0.261 62.000 0.000 1.000 N NA
 2055119 2055120 NT01CX_1801 NT01CX_1802 noxC   FALSE 0.308 175.000 0.056 1.000 N NA
 2055120 2055121 NT01CX_1802 NT01CX_1803     TRUE 0.594 15.000 0.000 1.000 N NA
 2055121 2055122 NT01CX_1803 NT01CX_1804     FALSE 0.109 121.000 0.000 1.000 N NA
 2055122 2055123 NT01CX_1804 NT01CX_1805   spoIIAB TRUE 0.983 15.000 0.088 0.002 Y NA
 2055123 2055124 NT01CX_1805 NT01CX_1806 spoIIAB   TRUE 0.973 46.000 0.842 1.000 N NA
 2055124 2055125 NT01CX_1806 NT01CX_1807     TRUE 0.570 123.000 0.078 NA   NA
 2055125 2055126 NT01CX_1807 NT01CX_1808     TRUE 0.966 34.000 0.386 NA   NA
 2055126 2055127 NT01CX_1808 NT01CX_1809     TRUE 0.986 2.000 0.386 NA   NA
 2055128 2055129 NT01CX_1810 NT01CX_1811 ponA   FALSE 0.028 199.000 0.000 1.000 N NA
 2055130 2055131 NT01CX_1812 NT01CX_1813     FALSE 0.132 107.000 0.000 NA   NA
 2055131 2055132 NT01CX_1813 NT01CX_1814   trzA TRUE 0.639 41.000 0.002 1.000   NA
 2055132 2055133 NT01CX_1814 NT01CX_1815 trzA   FALSE 0.279 49.000 0.000 1.000   NA
 2055133 2055134 NT01CX_1815 NT01CX_1816     TRUE 0.878 60.000 0.176 1.000   NA
 2055134 2055135 NT01CX_1816 NT01CX_1817     TRUE 0.669 -3.000 0.000 1.000   NA
 2055135 2055136 NT01CX_1817 NT01CX_1818     TRUE 0.894 -3.000 0.006 1.000   NA
 2055136 2055137 NT01CX_1818 NT01CX_1819     FALSE 0.410 111.000 0.015 NA   NA
 2055137 2055138 NT01CX_1819 NT01CX_1820     FALSE 0.004 505.000 0.000 NA   NA
 2055138 2055139 NT01CX_1820 NT01CX_1821     FALSE 0.004 491.000 0.000 NA   NA
 2055139 2055140 NT01CX_1821 NT01CX_1822     FALSE 0.004 526.000 0.000 NA   NA
 2055140 2055141 NT01CX_1822 NT01CX_1823     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 2055141 2055142 NT01CX_1823 NT01CX_1824     FALSE 0.026 205.000 0.000 1.000 N NA
 2055142 2055143 NT01CX_1824 NT01CX_1825     TRUE 0.998 -3.000 0.784 0.004 Y NA
 2055144 2055145 NT01CX_1826 NT01CX_1827     TRUE 0.794 65.000 0.079 NA   NA
 2055145 2055146 NT01CX_1827 NT01CX_1828     FALSE 0.099 123.000 0.000 NA   NA
 2055147 2055148 NT01CX_1829 NT01CX_1830     FALSE 0.189 82.000 0.000 NA   NA
 2055148 2055149 NT01CX_1830 NT01CX_1831     FALSE 0.101 122.000 0.000 NA   NA
 2055149 2055150 NT01CX_1831 NT01CX_1832   ruvA FALSE 0.495 77.000 0.007 NA   NA
 2055150 2055151 NT01CX_1832 NT01CX_1833 ruvA ruvB TRUE 0.995 12.000 0.549 0.004 Y NA
 2055151 2055152 NT01CX_1833 NT01CX_1834 ruvB queA TRUE 0.946 6.000 0.069 1.000 N NA
 2055152 2055153 NT01CX_1834 NT01CX_1835 queA   TRUE 0.952 29.000 0.014 0.001 Y NA
 2055153 2055154 NT01CX_1835 NT01CX_1836   yajC TRUE 0.764 53.000 0.035 NA N NA
 2055154 2055155 NT01CX_1836 NT01CX_1837 yajC   TRUE 0.792 55.000 0.055 NA   NA
 2055155 2055156 NT01CX_1837 NT01CX_1838     TRUE 0.865 75.000 0.212 NA   NA
 2055156 2055157 NT01CX_1838 NT01CX_1839   nirJ TRUE 0.789 144.000 0.540 NA   NA
 2055157 2055158 NT01CX_1839 NT01CX_1840 nirJ secD TRUE 0.632 91.000 0.048 1.000   NA
 2055158 2055159 NT01CX_1840 NT01CX_1841 secD secF TRUE 0.995 6.000 0.516 0.001 Y NA
 2055159 2055160 NT01CX_1841 NT01CX_1842 secF   FALSE 0.167 190.000 0.028 1.000   NA
 2055160 2055161 NT01CX_1842 NT01CX_1843     TRUE 0.702 40.000 0.010 1.000   NA
 2055161 2055162 NT01CX_1843 NT01CX_1844     TRUE 0.663 101.000 0.068 1.000 N NA
 2055162 2055163 NT01CX_1844 NT01CX_1845     TRUE 0.895 55.000 0.177 1.000 N NA
 2055163 2055164 NT01CX_1845 NT01CX_1846     TRUE 0.907 27.000 0.048 1.000   NA
 2055164 2055165 NT01CX_1846 NT01CX_1847     TRUE 0.916 19.000 0.035 1.000   NA
 2055165 2055166 NT01CX_1847 NT01CX_1848   hisS TRUE 0.954 14.000 0.111 1.000 N NA
 2055166 2055167 NT01CX_1848 NT01CX_1849 hisS aspS TRUE 0.977 18.000 0.028 0.049 Y NA
 2055167 2055168 NT01CX_1849 NT01CX_1850 aspS   FALSE 0.032 297.000 0.002 NA   NA
 2055169 2055170 NT01CX_1851 NT01CX_1852     TRUE 0.974 2.000 0.154 NA   NA
 2055171 2055172 NT01CX_1853 NT01CX_1854 glyA nifJ FALSE 0.005 512.000 0.000 1.000 N NA
 2055172 2055173 NT01CX_1854 NT01CX_1855 nifJ   FALSE 0.217 179.000 0.032 NA   NA
 2055173 2055174 NT01CX_1855 NT01CX_1856     TRUE 0.735 70.000 0.055 NA   NA
 2055174 2055175 NT01CX_1856 NT01CX_1857     TRUE 0.984 13.000 0.082 0.054 Y NA
 2055175 2055176 NT01CX_1857 NT01CX_1858     FALSE 0.152 102.000 0.000 1.000 N NA
 2055176 2055177 NT01CX_1858 NT01CX_1859     FALSE 0.032 201.000 0.000 NA N NA
 2055177 2055178 NT01CX_1859 NT01CX_1860   cheW TRUE 0.972 13.000 0.231 NA N NA
 2055178 2055179 NT01CX_1860 NT01CX_1861 cheW   TRUE 0.985 10.000 0.063 1.000 Y NA
 2055179 2055180 NT01CX_1861 NT01CX_1862     TRUE 0.987 16.000 0.070 1.000 Y NA
 2055180 2055181 NT01CX_1862 NT01CX_1863     TRUE 0.991 3.000 0.107 1.000 Y NA
 2055181 2055182 NT01CX_1863 NT01CX_1864   cheA TRUE 0.986 13.000 0.081 1.000 Y NA
 2055182 2055183 NT01CX_1864 NT01CX_1865 cheA   TRUE 0.992 13.000 0.176 NA Y NA
 2055183 2055184 NT01CX_1865 NT01CX_1866     TRUE 0.988 16.000 0.082 NA Y NA
 2055184 2055185 NT01CX_1866 NT01CX_1867   cheW TRUE 0.989 42.000 0.417 1.000 Y NA
 2055185 2055186 NT01CX_1867 NT01CX_1868 cheW fliM TRUE 0.978 21.000 0.039 0.015 Y NA
 2055186 2055187 NT01CX_1868 NT01CX_1869 fliM   TRUE 0.997 -7.000 0.508 0.002 Y NA
 2055187 2055188 NT01CX_1869 NT01CX_1870     FALSE 0.020 210.000 0.000 1.000   NA
 2055188 2055189 NT01CX_1870 NT01CX_1871     TRUE 0.828 105.000 0.421 0.003   NA
 2055189 2055190 NT01CX_1871 NT01CX_1872     TRUE 0.922 22.000 0.082 0.003   NA
 2055190 2055191 NT01CX_1872 NT01CX_1873     TRUE 0.869 31.000 0.071 0.002   NA
 2055191 2055192 NT01CX_1873 NT01CX_1874     TRUE 0.910 75.000 0.385 NA   NA
 2055192 2055193 NT01CX_1874 NT01CX_1875   csrA TRUE 0.968 0.000 0.096 NA   NA
 2055193 2055194 NT01CX_1875 NT01CX_1876 csrA   TRUE 0.761 50.000 0.028 NA N NA
 2055194 2055195 NT01CX_1876 NT01CX_1877     TRUE 0.882 27.000 0.028 NA   NA
 2055195 2055196 NT01CX_1877 NT01CX_1878   fliS TRUE 0.901 37.000 0.093 NA   NA
 2055196 2055197 NT01CX_1878 NT01CX_1879 fliS   TRUE 0.964 79.000 0.370 0.003 Y NA
 2055197 2055198 NT01CX_1879 NT01CX_1880     TRUE 0.933 4.000 0.043 NA   NA
 2055198 2055199 NT01CX_1880 NT01CX_1881   fliC TRUE 0.770 110.000 0.200 NA   NA
 2055199 2055200 NT01CX_1881 NT01CX_1882 fliC fliC FALSE 0.199 221.000 0.133 0.003   NA
 2055200 2055201 NT01CX_1882 NT01CX_1883 fliC   FALSE 0.119 112.000 0.000 NA   NA
 2055201 2055202 NT01CX_1883 NT01CX_1884     TRUE 0.637 3.000 0.000 NA   NA
 2055202 2055203 NT01CX_1884 NT01CX_1885     TRUE 0.762 125.000 0.286 NA   NA
 2055203 2055204 NT01CX_1885 NT01CX_1886     TRUE 0.597 16.000 0.000 NA   NA
 2055204 2055205 NT01CX_1886 NT01CX_1887     FALSE 0.422 34.000 0.000 NA   NA
 2055205 2055206 NT01CX_1887 NT01CX_1888   spsF TRUE 0.821 -16.000 0.000 NA N NA
 2055206 2055207 NT01CX_1888 NT01CX_1889 spsF   TRUE 0.565 25.000 0.000 1.000 N NA
 2055207 2055208 NT01CX_1889 NT01CX_1890     FALSE 0.452 121.000 0.032 1.000 N NA
 2055208 2055209 NT01CX_1890 NT01CX_1891     TRUE 0.989 31.000 0.236 1.000 Y NA
 2055209 2055210 NT01CX_1891 NT01CX_1892     TRUE 0.945 32.000 0.012 0.037 Y NA
 2055210 2055211 NT01CX_1892 NT01CX_1893     TRUE 0.952 19.000 0.000 1.000 Y NA
 2055211 2055212 NT01CX_1893 NT01CX_1894     TRUE 0.963 85.000 0.267 NA Y NA
 2055212 2055213 NT01CX_1894 NT01CX_1895     TRUE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 2055213 2055214 NT01CX_1895 NT01CX_1896     FALSE 0.517 13.000 0.000 1.000   NA
 2055214 2055215 NT01CX_1896 NT01CX_1897     FALSE 0.032 179.000 0.000 1.000   NA
 2055215 2055216 NT01CX_1897 NT01CX_1898     TRUE 0.890 31.000 0.000 0.003 Y NA
 2055216 2055217 NT01CX_1898 NT01CX_1899   flgB FALSE 0.075 323.000 0.000 0.007 Y NA
 2055217 2055218 NT01CX_1899 NT01CX_1900 flgB flgC TRUE 0.997 3.000 0.804 0.006 Y NA
 2055218 2055219 NT01CX_1900 NT01CX_1901 flgC fliE TRUE 0.939 63.000 0.095 0.006 Y NA
 2055219 2055220 NT01CX_1901 NT01CX_1902 fliE fliF TRUE 0.987 16.000 0.112 0.008 Y NA
 2055220 2055221 NT01CX_1902 NT01CX_1903 fliF fliG TRUE 0.995 6.000 0.477 0.008 Y NA
 2055221 2055222 NT01CX_1903 NT01CX_1904 fliG   TRUE 0.998 -16.000 0.308 NA Y NA
 2055222 2055223 NT01CX_1904 NT01CX_1905     TRUE 0.991 34.000 0.379 NA Y NA
 2055223 2055224 NT01CX_1905 NT01CX_1906     TRUE 0.992 21.000 0.241 0.011 Y NA
 2055224 2055225 NT01CX_1906 NT01CX_1907     TRUE 0.830 21.000 0.019 0.008   NA
 2055225 2055226 NT01CX_1907 NT01CX_1908   flgD TRUE 0.977 12.000 0.304 NA   NA
 2055226 2055227 NT01CX_1908 NT01CX_1909 flgD   TRUE 0.942 19.000 0.064 NA   NA
 2055227 2055228 NT01CX_1909 NT01CX_1910   flgE TRUE 0.753 69.000 0.063 NA   NA
 2055228 2055229 NT01CX_1910 NT01CX_1911 flgE   TRUE 0.917 161.000 0.545 NA Y NA
 2055229 2055230 NT01CX_1911 NT01CX_1912   motA TRUE 0.994 14.000 0.301 NA Y NA
 2055230 2055231 NT01CX_1912 NT01CX_1913 motA   TRUE 0.997 -7.000 0.350 1.000 Y NA
 2055231 2055232 NT01CX_1913 NT01CX_1914     TRUE 0.996 2.000 0.314 1.000 Y NA
 2055232 2055233 NT01CX_1914 NT01CX_1915     TRUE 0.976 12.000 0.023 1.000 Y NA
 2055233 2055234 NT01CX_1915 NT01CX_1916     TRUE 0.997 -3.000 0.386 1.000 Y NA
 2055234 2055235 NT01CX_1916 NT01CX_1917   fliQ TRUE 0.989 11.000 0.162 0.006 Y NA
 2055235 2055236 NT01CX_1917 NT01CX_1918 fliQ   TRUE 0.985 13.000 0.114 0.006 Y NA
 2055236 2055237 NT01CX_1918 NT01CX_1919   flhA TRUE 0.992 4.000 0.207 0.006 Y NA
 2055237 2055238 NT01CX_1919 NT01CX_1920 flhA   TRUE 0.998 -3.000 0.440 1.000 Y NA
 2055238 2055239 NT01CX_1920 NT01CX_1921     TRUE 0.990 -6.000 0.382 1.000 N NA
 2055239 2055240 NT01CX_1921 NT01CX_1922     TRUE 0.950 13.000 0.094 NA N NA
 2055240 2055241 NT01CX_1922 NT01CX_1923     TRUE 0.951 3.000 0.062 NA N NA
 2055241 2055242 NT01CX_1923 NT01CX_1924     TRUE 0.897 14.000 0.029 NA   NA
 2055242 2055243 NT01CX_1924 NT01CX_1925     TRUE 0.975 18.000 0.222 NA   NA
 2055243 2055244 NT01CX_1925 NT01CX_1926   flgG TRUE 0.938 -3.000 0.027 NA   NA
 2055244 2055245 NT01CX_1926 NT01CX_1927 flgG   TRUE 0.978 29.000 0.088 0.006 Y NA
 2055248 2055249 NT01CX_1930 NT01CX_1931     FALSE 0.053 161.000 0.000 NA   NA
 2055252 2055253 NT01CX_1934 NT01CX_1935 mraW   TRUE 0.815 28.000 0.008 NA   NA
 2055253 2055254 NT01CX_1935 NT01CX_1936     TRUE 0.955 16.000 0.096 NA   NA
 2055254 2055255 NT01CX_1936 NT01CX_1937     TRUE 0.972 65.000 0.265 1.000 Y NA
 2055255 2055256 NT01CX_1937 NT01CX_1938     TRUE 0.995 1.000 0.328 0.004 Y NA
 2055256 2055257 NT01CX_1938 NT01CX_1939   mraY TRUE 0.969 14.000 0.024 0.006 Y NA
 2055257 2055258 NT01CX_1939 NT01CX_1940 mraY   TRUE 0.796 25.000 0.014 0.006 N NA
 2055258 2055259 NT01CX_1940 NT01CX_1941     FALSE 0.287 145.000 0.015 NA N NA
 2055259 2055260 NT01CX_1941 NT01CX_1942     TRUE 0.865 12.000 0.014 NA   NA
 2055260 2055261 NT01CX_1942 NT01CX_1943     TRUE 0.939 11.000 0.070 NA   NA
 2055261 2055262 NT01CX_1943 NT01CX_1944     TRUE 0.940 10.000 0.070 NA   NA
 2055262 2055263 NT01CX_1944 NT01CX_1945     TRUE 0.743 42.000 0.017 NA   NA
 2055263 2055264 NT01CX_1945 NT01CX_1946     TRUE 0.926 3.000 0.032 NA   NA
 2055264 2055265 NT01CX_1946 NT01CX_1947     TRUE 0.838 26.000 0.010 NA   NA
 2055265 2055266 NT01CX_1947 NT01CX_1948     TRUE 0.988 17.000 0.579 NA   NA
 2055266 2055267 NT01CX_1948 NT01CX_1949     FALSE 0.368 136.000 0.027 NA N NA
 2055267 2055268 NT01CX_1949 NT01CX_1950     TRUE 0.575 94.000 0.031 1.000 N NA
 2055268 2055269 NT01CX_1950 NT01CX_1951   lspA TRUE 0.845 40.000 0.050 1.000 N NA
 2055269 2055270 NT01CX_1951 NT01CX_1952 lspA   TRUE 0.965 0.000 0.082 1.000 N NA
 2055270 2055271 NT01CX_1952 NT01CX_1953     TRUE 0.941 3.000 0.048 1.000 N NA
 2055273 2055274 NT01CX_1955 NT01CX_1956 dapF   FALSE 0.111 120.000 0.000 1.000 N NA
 2055274 2055275 NT01CX_1956 NT01CX_1957     TRUE 0.996 -13.000 0.135 1.000 Y NA
 2055275 2055276 NT01CX_1957 NT01CX_1958     TRUE 0.955 22.000 0.109 NA   NA
 2055276 2055277 NT01CX_1958 NT01CX_1959     TRUE 0.799 -19.000 0.000 NA   NA
 2055277 2055278 NT01CX_1959 NT01CX_1960     TRUE 0.667 1.000 0.000 NA   NA
 2055278 2055279 NT01CX_1960 NT01CX_1961     TRUE 0.653 2.000 0.000 NA   NA
 2055279 2055280 NT01CX_1961 NT01CX_1962     TRUE 0.813 -36.000 0.000 NA   NA
 2055280 2055281 NT01CX_1962 NT01CX_1963     FALSE 0.257 60.000 0.000 NA   NA
 2055281 2055282 NT01CX_1963 NT01CX_1964     TRUE 0.625 4.000 0.000 NA   NA
 2055282 2055283 NT01CX_1964 NT01CX_1965     TRUE 0.739 -7.000 0.000 NA   NA
 2055283 2055284 NT01CX_1965 NT01CX_1966     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 2055284 2055285 NT01CX_1966 NT01CX_1967     FALSE 0.518 24.000 0.000 1.000   NA
 2055287 2055288 NT01CX_1969 NT01CX_1970     TRUE 0.990 2.000 0.604 NA   NA
 2055288 2055289 NT01CX_1970 NT01CX_1971     TRUE 0.990 11.000 0.926 NA   NA
 2055289 2055290 NT01CX_1971 NT01CX_1972     TRUE 0.990 10.000 0.895 NA   NA
 2055290 2055291 NT01CX_1972 NT01CX_1973     TRUE 0.989 24.000 0.864 NA   NA
 2055291 2055292 NT01CX_1973 NT01CX_1974     TRUE 0.990 11.000 0.918 NA   NA
 2055292 2055293 NT01CX_1974 NT01CX_1975     TRUE 0.984 32.000 0.907 NA   NA
 2055293 2055294 NT01CX_1975 NT01CX_1976     TRUE 0.925 66.000 0.407 NA   NA
 2055294 2055295 NT01CX_1976 NT01CX_1977     TRUE 0.777 84.000 0.108 NA   NA
 2055295 2055296 NT01CX_1977 NT01CX_1978   nusB TRUE 0.782 110.000 0.223 NA   NA
 2055296 2055297 NT01CX_1978 NT01CX_1979 nusB   TRUE 0.904 26.000 0.039 1.000 N NA
 2055297 2055298 NT01CX_1979 NT01CX_1980   xseA TRUE 0.943 2.000 0.045 1.000 N NA
 2055298 2055299 NT01CX_1980 NT01CX_1981 xseA xseB TRUE 0.974 24.000 0.412 0.001   NA
 2055299 2055300 NT01CX_1981 NT01CX_1982 xseB   TRUE 0.951 0.000 0.053 1.000   NA
 2055300 2055301 NT01CX_1982 NT01CX_1983     TRUE 0.790 134.000 0.048 1.000 Y NA
 2055301 2055302 NT01CX_1983 NT01CX_1984     TRUE 0.945 33.000 0.189 1.000 N NA
 2055302 2055303 NT01CX_1984 NT01CX_1985     TRUE 0.956 12.000 0.120 1.000 N NA
 2055303 2055304 NT01CX_1985 NT01CX_1986   argR TRUE 0.960 20.000 0.117 1.000 N NA
 2055304 2055305 NT01CX_1986 NT01CX_1987 argR recN TRUE 0.947 11.000 0.086 1.000 N NA
 2055305 2055306 NT01CX_1987 NT01CX_1988 recN   FALSE 0.290 185.000 0.079 1.000   NA
 2055306 2055307 NT01CX_1988 NT01CX_1989     TRUE 0.585 180.000 0.393 1.000   NA
 2055307 2055308 NT01CX_1989 NT01CX_1990     FALSE 0.011 268.000 0.000 NA   NA
 2055308 2055309 NT01CX_1990 NT01CX_1991     FALSE 0.062 151.000 0.000 NA   NA
 2055309 2055310 NT01CX_1991 NT01CX_1992     FALSE 0.025 204.000 0.000 NA   NA
 2055313 2055314 NT01CX_1995 NT01CX_1996     TRUE 0.993 1.000 0.833 NA   NA
 2055317 2055318 NT01CX_1999 NT01CX_2000     FALSE 0.004 608.000 0.000 NA   NA
 2055318 2055319 NT01CX_2000 NT01CX_2001     FALSE 0.532 27.000 0.000 NA   NA
 2055319 2055320 NT01CX_2001 NT01CX_2002     FALSE 0.296 52.000 0.000 NA   NA
 2055320 2055321 NT01CX_2002 NT01CX_2003     FALSE 0.026 202.000 0.000 NA   NA
 2055321 2055322 NT01CX_2003 NT01CX_2004     FALSE 0.260 59.000 0.000 NA   NA
 2055322 2055323 NT01CX_2004 NT01CX_2005     FALSE 0.017 231.000 0.000 NA   NA
 2055323 2055324 NT01CX_2005 NT01CX_2006     FALSE 0.064 148.000 0.000 NA   NA
 2055324 2055325 NT01CX_2006 NT01CX_2007     FALSE 0.182 85.000 0.000 NA   NA
 2055325 2055326 NT01CX_2007 NT01CX_2008     FALSE 0.027 190.000 0.000 1.000   NA
 2055326 2055327 NT01CX_2008 NT01CX_2009     FALSE 0.171 90.000 0.000 NA   NA
 2055327 2055328 NT01CX_2009 NT01CX_2010     FALSE 0.290 53.000 0.000 NA   NA
 2055328 2055329 NT01CX_2010 NT01CX_2011     FALSE 0.215 20.000 0.000 0.052   NA
 2055330 2055331 NT01CX_2012 NT01CX_2013     TRUE 0.997 -40.000 1.000 NA   NA
 2055331 2055332 NT01CX_2013 NT01CX_2014     TRUE 0.989 18.000 0.667 NA   NA
 2055334 2055335 NT01CX_2016 NT01CX_2017     FALSE 0.010 299.000 0.000 NA   NA
 2055335 2055336 NT01CX_2017 NT01CX_2018     TRUE 0.603 19.000 0.000 NA   NA
 2055336 2055337 NT01CX_2018 NT01CX_2019     FALSE 0.096 125.000 0.000 NA   NA
 2055337 2055338 NT01CX_2019 NT01CX_2020     FALSE 0.007 328.000 0.000 1.000   NA
 2055339 2055340 NT01CX_2021 NT01CX_2022     FALSE 0.046 170.000 0.000 NA   NA
 2055340 2055341 NT01CX_2022 NT01CX_2023     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 2055341 2055342 NT01CX_2023 NT01CX_2024     TRUE 0.624 82.000 0.033 NA   NA
 2055342 2055343 NT01CX_2024 NT01CX_2025   xerD FALSE 0.064 263.000 0.021 NA   NA
 2055343 2055344 NT01CX_2025 NT01CX_2026 xerD   FALSE 0.334 113.000 0.006 1.000 N NA
 2055346 2055347 NT01CX_2028 NT01CX_2029 ilvC ilvB TRUE 0.914 38.000 0.006 0.002 Y NA
 2055347 2055348 NT01CX_2029 NT01CX_2030 ilvB ilvE TRUE 0.951 20.000 0.000 1.000 Y NA
 2055348 2055349 NT01CX_2030 NT01CX_2031 ilvE   FALSE 0.159 100.000 0.000 1.000 N NA
 2055349 2055350 NT01CX_2031 NT01CX_2032   scpA TRUE 0.940 -22.000 0.006 NA   NA
 2055350 2055351 NT01CX_2032 NT01CX_2033 scpA scpB TRUE 0.994 -13.000 0.570 NA   NA
 2055352 2055353 NT01CX_2034 NT01CX_2035     TRUE 0.653 2.000 0.000 NA   NA
 2055354 2055355 NT01CX_2036 NT01CX_2037     FALSE 0.085 132.000 0.000 NA   NA
 2055359 2055360 NT01CX_2041 NT01CX_2042   gidA TRUE 0.989 -3.000 0.381 1.000   NA
 2055360 2055361 NT01CX_2042 NT01CX_2043 gidA   FALSE 0.003 866.000 0.000 1.000   NA
 2055361 2055362 NT01CX_2043 NT01CX_2044     TRUE 0.739 -7.000 0.000 NA   NA
 2055362 2055363 NT01CX_2044 NT01CX_2045     FALSE 0.466 31.000 0.000 NA   NA
 2055363 2055364 NT01CX_2045 NT01CX_2046     FALSE 0.005 424.000 0.000 NA   NA
 2055364 2055365 NT01CX_2046 NT01CX_2047     FALSE 0.007 344.000 0.000 1.000   NA
 2055365 2055366 NT01CX_2047 NT01CX_2048     FALSE 0.038 179.000 0.000 NA   NA
 2055368 2055369 NT01CX_2050 NT01CX_2051     FALSE 0.051 163.000 0.000 NA   NA
 2055369 2055370 NT01CX_2051 NT01CX_2052     TRUE 0.958 3.000 0.000 1.000 Y NA
 2055370 2055371 NT01CX_2052 NT01CX_2053     TRUE 0.991 24.000 0.262 0.001 Y NA
 2055371 2055372 NT01CX_2053 NT01CX_2054     FALSE 0.005 438.000 0.000 1.000 N NA
 2055372 2055373 NT01CX_2054 NT01CX_2055     FALSE 0.037 181.000 0.000 1.000 N NA
 2055373 2055374 NT01CX_2055 NT01CX_2056     FALSE 0.017 230.000 0.000 NA   NA
 2055374 2055375 NT01CX_2056 NT01CX_2057     FALSE 0.309 50.000 0.000 NA   NA
 2055375 2055376 NT01CX_2057 NT01CX_2058     FALSE 0.016 221.000 0.000 1.000   NA
 2055376 2055377 NT01CX_2058 NT01CX_2059     FALSE 0.142 103.000 0.000 NA   NA
 2055377 2055378 NT01CX_2059 NT01CX_2060     FALSE 0.015 240.000 0.000 NA   NA
 2055378 2055379 NT01CX_2060 NT01CX_2061     TRUE 0.789 -16.000 0.000 NA   NA
 2055380 2055381 NT01CX_2062 NT01CX_2063     TRUE 0.979 -12.000 0.000 NA Y NA
 2055382 2055383 NT01CX_2064 NT01CX_2065     FALSE 0.145 102.000 0.000 NA   NA
 2055383 2055384 NT01CX_2065 NT01CX_2066     FALSE 0.073 130.000 0.000 1.000   NA
 2055384 2055385 NT01CX_2066 NT01CX_2068     TRUE 0.877 39.000 0.074 NA   NA
 2055385 2055386 NT01CX_2068 NT01CX_2067     TRUE 0.820 -99.000 0.000 NA   NA
 2055386 2055387 NT01CX_2067 NT01CX_2069     FALSE 0.005 427.000 0.000 NA   NA
 2055387 2055388 NT01CX_2069 NT01CX_2070     FALSE 0.092 127.000 0.000 NA   NA
 2055388 2055389 NT01CX_2070 NT01CX_2071     FALSE 0.039 170.000 0.000 1.000   NA
 2055389 2055390 NT01CX_2071 NT01CX_2072     FALSE 0.006 352.000 0.000 1.000   NA
 2055392 2055393 NT01CX_2074 NT01CX_2075 ilvA   FALSE 0.005 434.000 0.000 NA   NA
 2055393 2055394 NT01CX_2075 NT01CX_2076     FALSE 0.094 126.000 0.000 NA   NA
 2055394 2055395 NT01CX_2076 NT01CX_2077     FALSE 0.008 351.000 0.000 1.000 N NA
 2055395 2055396 NT01CX_2077 NT01CX_2078     TRUE 0.981 6.000 0.031 1.000 Y NA
 2055396 2055397 NT01CX_2078 NT01CX_2079   cobS TRUE 0.982 12.000 0.046 1.000 Y NA
 2055397 2055398 NT01CX_2079 NT01CX_2080 cobS   TRUE 0.718 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2055398 2055399 NT01CX_2080 NT01CX_2081   cobQ TRUE 0.594 15.000 0.000 1.000 N NA
 2055399 2055400 NT01CX_2081 NT01CX_2082 cobQ cobD TRUE 0.994 -16.000 0.092 0.015 Y NA
 2055400 2055401 NT01CX_2082 NT01CX_2083 cobD   TRUE 0.718 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2055401 2055402 NT01CX_2083 NT01CX_2084     FALSE 0.252 64.000 0.000 1.000 N NA
 2055402 2055403 NT01CX_2084 NT01CX_2085     TRUE 0.985 36.000 0.214 1.000 Y NA
 2055403 2055404 NT01CX_2085 NT01CX_2086     TRUE 0.995 4.000 0.255 1.000 Y NA
 2055404 2055405 NT01CX_2086 NT01CX_2087     FALSE 0.091 119.000 0.000 1.000   NA
 2055405 2055406 NT01CX_2087 NT01CX_2088     TRUE 0.864 27.000 0.023 1.000   NA
 2055406 2055407 NT01CX_2088 NT01CX_2089     FALSE 0.009 309.000 0.000 NA   NA
 2055407 2055408 NT01CX_2089 NT01CX_2090     FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 2055410 2055411 NT01CX_2092 NT01CX_2093     FALSE 0.370 117.000 0.013 1.000 N NA
 2055411 2055412 NT01CX_2093 NT01CX_2094     FALSE 0.558 141.000 0.124 1.000   NA
 2055412 2055413 NT01CX_2094 NT01CX_2095     TRUE 0.620 85.000 0.039 1.000   NA
 2055413 2055414 NT01CX_2095 NT01CX_2096     TRUE 0.920 13.000 0.047 1.000 N NA
 2055414 2055415 NT01CX_2096 NT01CX_2097     FALSE 0.069 134.000 0.000 1.000   NA
 2055417 2055418 NT01CX_2099 NT01CX_2100     FALSE 0.025 207.000 0.000 1.000 N NA
 2055418 2055419 NT01CX_2100 NT01CX_2101     FALSE 0.127 101.000 0.000 1.000   NA
 2055419 2055420 NT01CX_2101 NT01CX_2102     FALSE 0.020 221.000 0.000 NA   NA
 2055422 2055423 NT01CX_2104 NT01CX_2105 miaB mutS TRUE 0.779 52.000 0.041 1.000 N NA
 2055423 2055424 NT01CX_2105 NT01CX_2106 mutS   TRUE 0.991 20.000 0.220 0.002 Y NA
 2055424 2055425 NT01CX_2106 NT01CX_2107   miaA TRUE 0.949 13.000 0.097 1.000 N NA
 2055425 2055426 NT01CX_2107 NT01CX_2108 miaA   TRUE 0.967 23.000 0.192 1.000   NA
 2055426 2055427 NT01CX_2108 NT01CX_2109     FALSE 0.134 98.000 0.000 1.000   NA
 2055427 2055428 NT01CX_2109 NT01CX_2110     FALSE 0.152 102.000 0.000 1.000 N NA
 2055431 2055432 NT01CX_2113 NT01CX_2114     FALSE 0.004 743.000 0.000 NA N NA
 2055432 2055433 NT01CX_2114 NT01CX_2115     TRUE 0.950 15.000 0.000 NA Y NA
 2055433 2055434 NT01CX_2115 NT01CX_2116   lysA TRUE 0.858 49.000 0.000 1.000 Y NA
 2055434 2055435 NT01CX_2116 NT01CX_2117 lysA   FALSE 0.166 97.000 0.000 1.000 N NA
 2055435 2055436 NT01CX_2117 NT01CX_2118   purB FALSE 0.012 271.000 0.000 1.000 N NA
 2055436 2055437 NT01CX_2118 NT01CX_2119 purB   FALSE 0.164 159.000 0.002 1.000 N NA
 2055437 2055438 NT01CX_2119 NT01CX_2120     TRUE 0.660 86.000 0.047 1.000 N NA
 2055438 2055439 NT01CX_2120 NT01CX_2121     FALSE 0.247 -31.000 0.000 0.001   NA
 2055439 2055440 NT01CX_2121 NT01CX_2122     FALSE 0.228 133.000 0.004 1.000   NA
 2055440 2055441 NT01CX_2122 NT01CX_2123   recA FALSE 0.049 290.000 0.018 1.000   NA
 2055441 2055442 NT01CX_2123 NT01CX_2124 recA pgsA FALSE 0.280 151.000 0.022 1.000 N NA
 2055442 2055443 NT01CX_2124 NT01CX_2125 pgsA   TRUE 0.985 -16.000 0.132 1.000 N NA
 2055443 2055444 NT01CX_2125 NT01CX_2126     TRUE 0.583 93.000 0.031 1.000 N NA
 2055444 2055445 NT01CX_2126 NT01CX_2127     TRUE 0.634 90.000 0.042 1.000 N NA
 2055445 2055446 NT01CX_2127 NT01CX_2128     TRUE 0.821 57.000 0.080 1.000 N NA
 2055446 2055447 NT01CX_2128 NT01CX_2129     TRUE 0.962 24.000 0.148 NA   NA
 2055447 2055448 NT01CX_2129 NT01CX_2130     FALSE 0.221 140.000 0.003 NA   NA
 2055448 2055449 NT01CX_2130 NT01CX_2131   rpsO TRUE 0.947 113.000 0.335 1.000 Y NA
 2055449 2055450 NT01CX_2131 NT01CX_2132 rpsO ribF FALSE 0.533 147.000 0.119 1.000 N NA
 2055450 2055451 NT01CX_2132 NT01CX_2133 ribF   TRUE 0.977 12.000 0.308 1.000 N NA
 2055451 2055452 NT01CX_2133 NT01CX_2134     TRUE 0.981 0.000 0.221 1.000   NA
 2055452 2055453 NT01CX_2134 NT01CX_2135   rbfA TRUE 0.986 -13.000 0.173 1.000   NA
 2055453 2055454 NT01CX_2135 NT01CX_2136 rbfA infB TRUE 0.996 14.000 0.530 1.000 Y NA
 2055454 2055455 NT01CX_2136 NT01CX_2137 infB   TRUE 0.964 26.000 0.171 NA N NA
 2055455 2055456 NT01CX_2137 NT01CX_2138   nusA TRUE 0.992 30.000 0.323 NA Y NA
 2055456 2055457 NT01CX_2138 NT01CX_2139 nusA   TRUE 0.988 13.000 0.759 NA   NA
 2055457 2055458 NT01CX_2139 NT01CX_2140   polC FALSE 0.120 251.000 0.059 NA   NA
 2055458 2055459 NT01CX_2140 NT01CX_2141 polC ispG TRUE 0.696 72.000 0.040 1.000 N NA
 2055459 2055460 NT01CX_2141 NT01CX_2142 ispG   TRUE 0.954 19.000 0.092 1.000 N NA
 2055460 2055461 NT01CX_2142 NT01CX_2143     TRUE 0.980 30.000 0.568 1.000 N NA
 2055461 2055462 NT01CX_2143 NT01CX_2144   cdsA TRUE 0.743 146.000 0.044 1.000 Y NA
 2055462 2055463 NT01CX_2144 NT01CX_2145 cdsA uppS TRUE 0.984 11.000 0.055 1.000 Y NA
 2055463 2055464 NT01CX_2145 NT01CX_2146 uppS   TRUE 0.889 95.000 0.409 1.000 N NA
 2055464 2055465 NT01CX_2146 NT01CX_2147   pyrH TRUE 0.989 17.000 0.626 1.000 N NA
 2055465 2055466 NT01CX_2147 NT01CX_2148 pyrH   TRUE 0.838 117.000 0.416 1.000 N NA
 2055466 2055467 NT01CX_2148 NT01CX_2149   rpsB TRUE 0.994 35.000 0.748 1.000 Y NA
 2055467 2055468 NT01CX_2149 NT01CX_2150 rpsB   FALSE 0.073 220.000 0.006 1.000 N NA
 2055468 2055469 NT01CX_2150 NT01CX_2151   topA FALSE 0.164 193.000 0.025 1.000 N NA
 2055469 2055470 NT01CX_2151 NT01CX_2152 topA   TRUE 0.968 71.000 0.238 1.000 Y NA
 2055470 2055471 NT01CX_2152 NT01CX_2153     TRUE 0.603 19.000 0.000 NA   NA
 2055473 2055474 NT01CX_2155 NT01CX_2156     TRUE 0.981 13.000 0.410 1.000   NA
 2055474 2055475 NT01CX_2156 NT01CX_2157     FALSE 0.012 241.000 0.000 1.000   NA
 2055475 2055476 NT01CX_2157 NT01CX_2158     FALSE 0.378 39.000 0.000 NA   NA
 2055476 2055477 NT01CX_2158 NT01CX_2159     FALSE 0.242 64.000 0.000 NA   NA
 2055477 2055478 NT01CX_2159 NT01CX_2160     FALSE 0.185 84.000 0.000 NA   NA
 2055478 2055479 NT01CX_2160 NT01CX_2161     TRUE 0.996 -7.000 1.000 NA   NA
 2055479 2055480 NT01CX_2161 NT01CX_2162     TRUE 0.575 11.000 0.000 NA   NA
 2055480 2055481 NT01CX_2162 NT01CX_2163     TRUE 0.755 -9.000 0.000 NA   NA
 2055481 2055482 NT01CX_2163 NT01CX_2164     TRUE 0.976 3.000 0.200 NA   NA
 2055482 2055483 NT01CX_2164 NT01CX_2165     TRUE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 2055483 2055484 NT01CX_2165 NT01CX_2166     TRUE 0.934 66.000 0.500 NA   NA
 2055484 2055485 NT01CX_2166 NT01CX_2167     TRUE 0.608 17.000 0.000 NA   NA
 2055485 2055486 NT01CX_2167 NT01CX_2168     FALSE 0.309 50.000 0.000 NA   NA
 2055486 2055487 NT01CX_2168 NT01CX_2169     TRUE 0.653 2.000 0.000 NA   NA
 2055487 2055488 NT01CX_2169 NT01CX_2170     TRUE 0.968 5.000 0.143 NA   NA
 2055488 2055489 NT01CX_2170 NT01CX_2171     TRUE 0.982 -7.000 0.143 NA   NA
 2055489 2055490 NT01CX_2171 NT01CX_2172     TRUE 0.988 0.000 0.400 NA   NA
 2055490 2055491 NT01CX_2172 NT01CX_2173     FALSE 0.338 46.000 0.000 NA   NA
 2055491 2055492 NT01CX_2173 NT01CX_2174     FALSE 0.053 161.000 0.000 NA   NA
 2055492 2055493 NT01CX_2174 NT01CX_2175     FALSE 0.108 118.000 0.000 NA   NA
 2055493 2055494 NT01CX_2175 NT01CX_2176     FALSE 0.167 92.000 0.000 NA   NA
 2055494 2055495 NT01CX_2176 NT01CX_2177     TRUE 0.614 5.000 0.000 NA   NA
 2055495 2055496 NT01CX_2177 NT01CX_2178     TRUE 0.776 -13.000 0.000 NA   NA
 2055496 2055497 NT01CX_2178 NT01CX_2179     TRUE 0.984 4.000 0.368 NA   NA
 2055497 2055498 NT01CX_2179 NT01CX_2180     TRUE 0.984 -7.000 0.294 0.002   NA
 2055498 2055499 NT01CX_2180 NT01CX_2181     FALSE 0.004 695.000 0.000 NA   NA
 2055499 2055500 NT01CX_2181 NT01CX_2182     FALSE 0.197 79.000 0.000 NA   NA
 2055500 2055501 NT01CX_2182 NT01CX_2183     TRUE 0.575 11.000 0.000 NA   NA
 2055501 2055502 NT01CX_2183 NT01CX_2184     FALSE 0.009 305.000 0.000 NA   NA
 2055502 2055503 NT01CX_2184 NT01CX_2185     FALSE 0.165 93.000 0.000 NA   NA
 2055503 2055504 NT01CX_2185 NT01CX_2186     TRUE 0.637 3.000 0.000 NA   NA
 2055504 2055505 NT01CX_2186 NT01CX_2187     FALSE 0.202 77.000 0.000 NA   NA
 2055505 2055506 NT01CX_2187 NT01CX_2188     TRUE 0.597 16.000 0.000 NA   NA
 2055506 2055507 NT01CX_2188 NT01CX_2189     FALSE 0.445 32.000 0.000 NA   NA
 2055507 2055508 NT01CX_2189 NT01CX_2190     TRUE 0.595 7.000 0.000 NA   NA
 2055508 2055509 NT01CX_2190 NT01CX_2191     TRUE 0.580 10.000 0.000 NA   NA
 2055509 2055510 NT01CX_2191 NT01CX_2192     TRUE 0.575 11.000 0.000 NA   NA
 2055510 2055511 NT01CX_2192 NT01CX_2193     TRUE 0.924 12.000 0.051 NA   NA
 2055511 2055512 NT01CX_2193 NT01CX_2194     FALSE 0.323 48.000 0.000 NA   NA
 2055512 2055513 NT01CX_2194 NT01CX_2195     TRUE 0.581 15.000 0.000 NA   NA
 2055513 2055514 NT01CX_2195 NT01CX_2196     TRUE 0.561 13.000 0.000 NA   NA
 2055514 2055515 NT01CX_2196 NT01CX_2197     TRUE 0.597 16.000 0.000 NA   NA
 2055515 2055516 NT01CX_2197 NT01CX_2198     FALSE 0.127 109.000 0.000 NA   NA
 2055516 2055517 NT01CX_2198 NT01CX_2199     TRUE 0.568 12.000 0.000 NA   NA
 2055517 2055518 NT01CX_2199 NT01CX_2200     TRUE 0.669 -3.000 0.000 1.000   NA
 2055519 2055520 NT01CX_2201 NT01CX_2202     TRUE 0.758 -16.000 0.000 1.000   NA
 2055520 2055521 NT01CX_2202 NT01CX_2203     FALSE 0.030 181.000 0.000 1.000   NA
 2055524 2055525 NT01CX_2206 NT01CX_2207     TRUE 0.966 6.000 0.148 1.000   NA
 2055525 2055526 NT01CX_2207 NT01CX_2208   rplS TRUE 0.596 79.000 0.027 1.000   NA
 2055526 2055527 NT01CX_2208 NT01CX_2209 rplS trmD TRUE 0.923 155.000 0.567 1.000 Y NA
 2055527 2055528 NT01CX_2209 NT01CX_2210 trmD rimM TRUE 0.999 -9.000 0.672 1.000 Y NA
 2055528 2055529 NT01CX_2210 NT01CX_2211 rimM   TRUE 0.881 83.000 0.324 1.000   NA
 2055529 2055530 NT01CX_2211 NT01CX_2212   rpsP TRUE 0.982 20.000 0.385 1.000   NA
 2055530 2055531 NT01CX_2212 NT01CX_2213 rpsP   TRUE 0.975 28.000 0.361 1.000 N NA
 2055531 2055532 NT01CX_2213 NT01CX_2214     TRUE 0.963 11.000 0.151 1.000   NA
 2055532 2055533 NT01CX_2214 NT01CX_2215   ftsY TRUE 0.740 80.000 0.081 1.000   NA
 2055533 2055534 NT01CX_2215 NT01CX_2216 ftsY   TRUE 0.930 32.000 0.165 0.021 N NA
 2055534 2055535 NT01CX_2216 NT01CX_2217     FALSE 0.127 196.000 0.015 NA   NA
 2055535 2055536 NT01CX_2217 NT01CX_2218     TRUE 0.774 75.000 0.086 NA   NA
 2055536 2055537 NT01CX_2218 NT01CX_2219     TRUE 0.994 -13.000 0.064 1.000 Y NA
 2055537 2055538 NT01CX_2219 NT01CX_2220   acpP TRUE 0.770 67.000 0.068 1.000 N NA
 2055538 2055539 NT01CX_2220 NT01CX_2221 acpP plsX TRUE 0.872 79.000 0.034 0.006 Y NA
 2055539 2055540 NT01CX_2221 NT01CX_2222 plsX rpmF TRUE 0.920 74.000 0.418 1.000 N NA
 2055540 2055541 NT01CX_2222 NT01CX_2223 rpmF   TRUE 0.987 15.000 0.599 NA   NA
 2055541 2055542 NT01CX_2223 NT01CX_2224   ackA FALSE 0.557 118.000 0.061 NA   NA
 2055542 2055543 NT01CX_2224 NT01CX_2225 ackA   TRUE 0.972 50.000 0.137 1.000 Y NA
 2055547 2055548 NT01CX_2229 NT01CX_2230   coaD TRUE 0.585 9.000 0.000 NA   NA
 2055548 2055549 NT01CX_2230 NT01CX_2231 coaD   TRUE 0.887 2.000 0.008 1.000 N NA
 2055549 2055550 NT01CX_2231 NT01CX_2232   recG TRUE 0.789 102.000 0.016 0.014 Y NA
 2055550 2055551 NT01CX_2232 NT01CX_2233 recG   FALSE 0.453 129.000 0.048 1.000   NA
 2055551 2055552 NT01CX_2233 NT01CX_2234     TRUE 0.985 14.000 0.567 NA   NA
 2055554 2055555 NT01CX_2236 NT01CX_2237     TRUE 0.975 2.000 0.166 1.000 N NA
 2055555 2055556 NT01CX_2237 NT01CX_2238     TRUE 0.984 -6.000 0.213 1.000   NA
 2055556 2055557 NT01CX_2238 NT01CX_2239     TRUE 0.970 21.000 0.196 1.000   NA
 2055557 2055558 NT01CX_2239 NT01CX_2240     TRUE 0.998 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 2055558 2055559 NT01CX_2240 NT01CX_2241     TRUE 0.919 32.000 0.105 1.000   NA
 2055559 2055560 NT01CX_2241 NT01CX_2242     TRUE 0.961 9.000 0.135 1.000   NA
 2055560 2055561 NT01CX_2242 NT01CX_2243     TRUE 0.923 29.000 0.076 NA   NA
 2055561 2055562 NT01CX_2243 NT01CX_2244     TRUE 0.877 30.000 0.035 NA   NA
 2055562 2055563 NT01CX_2244 NT01CX_2245     TRUE 0.970 5.000 0.009 0.033 Y NA
 2055563 2055564 NT01CX_2245 NT01CX_2246     TRUE 0.772 33.000 0.010 1.000 N NA
 2055564 2055565 NT01CX_2246 NT01CX_2247     TRUE 0.858 53.000 0.099 1.000 N NA
 2055565 2055566 NT01CX_2247 NT01CX_2248   rpoZ TRUE 0.902 2.000 0.013 1.000 N NA
 2055566 2055567 NT01CX_2248 NT01CX_2249 rpoZ   TRUE 0.968 -19.000 0.035 1.000 N NA
 2055567 2055568 NT01CX_2249 NT01CX_2250     TRUE 0.977 0.000 0.143 NA   NA
 2055568 2055569 NT01CX_2250 NT01CX_2251     TRUE 0.972 18.000 0.189 NA   NA
 2055569 2055570 NT01CX_2251 NT01CX_2252     FALSE 0.017 228.000 0.000 NA   NA
 2055570 2055571 NT01CX_2252 NT01CX_2253     FALSE 0.008 322.000 0.000 NA   NA
 2055571 2055572 NT01CX_2253 NT01CX_2254     FALSE 0.014 247.000 0.000 NA   NA
 2055572 2055573 NT01CX_2254 NT01CX_2255     TRUE 0.946 3.000 0.061 1.000   NA
 2055573 2055574 NT01CX_2255 NT01CX_2256     FALSE 0.297 118.000 0.004 NA   NA
 2055574 2055575 NT01CX_2256 NT01CX_2257     FALSE 0.411 108.000 0.013 NA   NA
 2055575 2055576 NT01CX_2257 NT01CX_2258     FALSE 0.540 64.000 0.005 NA   NA
 2055577 2055578 NT01CX_2259 NT01CX_2260     FALSE 0.029 183.000 0.000 1.000   NA
 2055579 2055580 NT01CX_2261 NT01CX_2262     TRUE 0.978 74.000 0.602 0.007 Y NA
 2055580 2055581 NT01CX_2262 NT01CX_2263     TRUE 0.990 15.000 0.856 1.000   NA
 2055581 2055582 NT01CX_2263 NT01CX_2264   ftsZ FALSE 0.261 155.000 0.024 1.000   NA
 2055582 2055583 NT01CX_2264 NT01CX_2265 ftsZ ftsA TRUE 0.996 16.000 0.460 1.000 Y NA
 2055583 2055584 NT01CX_2265 NT01CX_2266 ftsA   FALSE 0.002 254.000 0.000 0.008 N NA
 2055584 2055585 NT01CX_2266 NT01CX_2267     FALSE 0.467 111.000 0.025 1.000 N NA
 2055585 2055586 NT01CX_2267 NT01CX_2268     TRUE 0.721 94.000 0.087 1.000 N NA
 2055586 2055587 NT01CX_2268 NT01CX_2269     TRUE 0.611 62.000 0.012 1.000 N NA
 2055587 2055588 NT01CX_2269 NT01CX_2270     TRUE 0.961 4.000 0.100 1.000 N NA
 2055588 2055589 NT01CX_2270 NT01CX_2271     TRUE 0.981 -7.000 0.146 1.000   NA
 2055589 2055590 NT01CX_2271 NT01CX_2272     TRUE 0.905 31.000 0.067 NA   NA
 2055590 2055591 NT01CX_2272 NT01CX_2273   typA TRUE 0.717 42.000 0.012 NA   NA
 2055591 2055592 NT01CX_2273 NT01CX_2274 typA   FALSE 0.209 142.000 0.002 NA   NA
 2055592 2055593 NT01CX_2274 NT01CX_2275     TRUE 0.904 25.000 0.036 NA   NA
 2055593 2055594 NT01CX_2275 NT01CX_2276     TRUE 0.947 39.000 0.289 1.000   NA
 2055594 2055595 NT01CX_2276 NT01CX_2277     TRUE 0.604 154.000 0.211 NA   NA
 2055595 2055596 NT01CX_2277 NT01CX_2278     TRUE 0.919 24.000 0.047 NA   NA
 2055596 2055597 NT01CX_2278 NT01CX_2279     TRUE 0.946 58.000 0.537 NA   NA
 2055597 2055598 NT01CX_2279 NT01CX_2280   alaS TRUE 0.768 87.000 0.110 NA   NA
 2055598 2055599 NT01CX_2280 NT01CX_2281 alaS trmU FALSE 0.056 414.000 0.000 0.046 Y NA
 2055599 2055600 NT01CX_2281 NT01CX_2282 trmU   TRUE 0.574 13.000 0.000 1.000 N NA
 2055600 2055601 NT01CX_2282 NT01CX_2283     TRUE 0.650 3.000 0.000 1.000 N NA
 2055601 2055602 NT01CX_2283 NT01CX_2284     TRUE 0.980 -7.000 0.125 NA N NA
 2055602 2055603 NT01CX_2284 NT01CX_2285     FALSE 0.526 83.000 0.010 NA N NA
 2055603 2055604 NT01CX_2285 NT01CX_2286     FALSE 0.078 141.000 0.000 1.000 N NA
 2055604 2055605 NT01CX_2286 NT01CX_2287     FALSE 0.120 104.000 0.000 1.000   NA
 2055605 2055606 NT01CX_2287 NT01CX_2288     TRUE 0.561 19.000 0.000 1.000   NA
 2055606 2055607 NT01CX_2288 NT01CX_2289   traI FALSE 0.219 62.000 0.000 1.000   NA
 2055609 2055610 NT01CX_2291 NT01CX_2292     TRUE 0.970 15.000 0.182 NA N NA
 2055610 2055611 NT01CX_2292 NT01CX_2293     FALSE 0.020 231.000 0.000 NA N NA
 2055611 2055612 NT01CX_2293 NT01CX_2294     TRUE 0.588 11.000 0.000 1.000 N NA
 2055612 2055613 NT01CX_2294 NT01CX_2295     FALSE 0.004 711.000 0.000 1.000 N NA
 2055613 2055614 NT01CX_2295 NT01CX_2296     TRUE 0.977 17.000 0.250 NA   NA
 2055614 2055615 NT01CX_2296 NT01CX_2297     FALSE 0.296 52.000 0.000 NA   NA
 2055615 2055616 NT01CX_2297 NT01CX_2298     FALSE 0.023 209.000 0.000 NA   NA
 2055618 2055619 NT01CX_2300 NT01CX_2301 mscL clpB FALSE 0.111 120.000 0.000 1.000 N NA
 2055619 2055620 NT01CX_2301 NT01CX_2302 clpB   FALSE 0.075 143.000 0.000 1.000 N NA
 2055620 2055621 NT01CX_2302 NT01CX_2303     FALSE 0.122 103.000 0.000 1.000   NA
 2055621 2055622 NT01CX_2303 NT01CX_2304     FALSE 0.047 158.000 0.000 1.000   NA
 2055622 2055623 NT01CX_2304 NT01CX_2305     FALSE 0.422 31.000 0.000 1.000   NA
 2055625 2055626 NT01CX_2307 NT01CX_2308     TRUE 0.991 29.000 0.267 1.000 Y NA
 2055628 2055629 NT01CX_2310 NT01CX_2311   murG FALSE 0.049 169.000 0.000 1.000 N NA
 2055633 2055634 NT01CX_2315 NT01CX_2316   recJ FALSE 0.078 141.000 0.000 1.000 N NA
 2055635 2055636 NT01CX_2317 NT01CX_2318     FALSE 0.356 37.000 0.000 1.000   NA
 2055637 2055638 NT01CX_2319 NT01CX_2320     TRUE 0.845 39.000 0.000 0.001 Y NA
 2055638 2055639 NT01CX_2320 NT01CX_2321     FALSE 0.061 142.000 0.000 1.000   NA
 2055639 2055640 NT01CX_2321 NT01CX_2322   etfA FALSE 0.048 156.000 0.000 1.000   NA
 2055640 2055641 NT01CX_2322 NT01CX_2323 etfA   TRUE 0.994 31.000 0.714 0.018 Y NA
 2055641 2055642 NT01CX_2323 NT01CX_2324     FALSE 0.266 28.000 0.000 0.036 N NA
 2055642 2055643 NT01CX_2324 NT01CX_2325     FALSE 0.014 250.000 0.000 1.000 N NA
 2055643 2055644 NT01CX_2325 NT01CX_2326     TRUE 0.989 40.000 0.552 0.002 Y NA
 2055644 2055645 NT01CX_2326 NT01CX_2327     FALSE 0.029 195.000 0.000 NA   NA
 2055645 2055646 NT01CX_2327 NT01CX_2328     FALSE 0.209 75.000 0.000 NA   NA
 2055646 2055647 NT01CX_2328 NT01CX_2329   deoD FALSE 0.214 76.000 0.000 1.000 N NA
 2055647 2055648 NT01CX_2329 NT01CX_2330 deoD   FALSE 0.006 407.000 0.000 1.000 N NA
 2055650 2055651 NT01CX_2332 NT01CX_2333     FALSE 0.014 245.000 0.000 NA   NA
 2055651 2055652 NT01CX_2333 NT01CX_2334     FALSE 0.166 97.000 0.000 1.000 N NA
 2055652 2055653 NT01CX_2334 NT01CX_2335     TRUE 0.997 -7.000 0.270 1.000 Y NA
 2055653 2055654 NT01CX_2335 NT01CX_2336     TRUE 0.999 -28.000 0.646 0.026 Y NA
 2055654 2055655 NT01CX_2336 NT01CX_2337     FALSE 0.060 156.000 0.000 1.000 N NA
 2055655 2055656 NT01CX_2337 NT01CX_2338     FALSE 0.033 190.000 0.000 1.000 N NA
 2055656 2055657 NT01CX_2338 NT01CX_2339   rpsD FALSE 0.041 178.000 0.000 1.000 N NA
 2055657 2055658 NT01CX_2339 NT01CX_2340 rpsD   FALSE 0.038 180.000 0.000 1.000 N NA
 2055658 2055659 NT01CX_2340 NT01CX_2341     FALSE 0.050 167.000 0.000 1.000 N NA
 2055659 2055660 NT01CX_2341 NT01CX_2342     FALSE 0.032 85.000 0.000 0.035   NA
 2055660 2055661 NT01CX_2342 NT01CX_2343     FALSE 0.098 114.000 0.000 1.000   NA
 2055661 2055662 NT01CX_2343 NT01CX_2344     FALSE 0.218 75.000 0.000 1.000 N NA
 2055664 2055665 NT01CX_2346 NT01CX_2347     FALSE 0.037 182.000 0.000 1.000 N NA
 2055665 2055666 NT01CX_2347 NT01CX_2348     TRUE 0.924 14.000 0.000 0.003 Y NA
 2055668 2055669 NT01CX_2350 NT01CX_2351     FALSE 0.013 251.000 0.000 NA   NA
 2055669 2055670 NT01CX_2351 NT01CX_2352     FALSE 0.134 106.000 0.000 NA   NA
 2055670 2055671 NT01CX_2352 NT01CX_2353     FALSE 0.094 126.000 0.000 NA   NA
 2055671 2055672 NT01CX_2353 NT01CX_2354     FALSE 0.055 159.000 0.000 NA   NA
 2055672 2055673 NT01CX_2354 NT01CX_2355     FALSE 0.006 418.000 0.000 1.000 N NA
 2055675 2055676 NT01CX_2357 NT01CX_2358     FALSE 0.069 145.000 0.000 NA   NA
 2055676 2055677 NT01CX_2358 NT01CX_2359     FALSE 0.074 141.000 0.000 NA   NA
 2055677 2055678 NT01CX_2359 NT01CX_2360     FALSE 0.188 73.000 0.000 1.000   NA
 2055682 2055683 NT01CX_2364 NT01CX_2365     FALSE 0.010 301.000 0.000 NA   NA
 2055683 2055684 NT01CX_2365 NT01CX_2366   nrdA TRUE 0.994 16.000 0.393 0.001 Y NA
 2055684 2055685 NT01CX_2366 NT01CX_2367 nrdA   FALSE 0.023 211.000 0.000 NA   NA
 2055685 2055686 NT01CX_2367 NT01CX_2368   hgdB FALSE 0.028 198.000 0.000 NA   NA
 2055686 2055687 NT01CX_2368 NT01CX_2369 hgdB hgdA TRUE 0.975 -7.000 0.000 NA Y NA
 2055687 2055688 NT01CX_2369 NT01CX_2370 hgdA hgdC TRUE 0.651 19.000 0.000 NA N NA
 2055688 2055689 NT01CX_2370 NT01CX_2371 hgdC   FALSE 0.445 32.000 0.000 NA   NA
 2055689 2055690 NT01CX_2371 NT01CX_2372     FALSE 0.160 84.000 0.000 1.000   NA
 2055690 2055691 NT01CX_2372 NT01CX_2373     FALSE 0.005 482.000 0.000 NA   NA
 2055692 2055693 NT01CX_2374 NT01CX_2375     TRUE 0.975 7.000 0.027 0.036 Y NA
 2055693 2055694 NT01CX_2375 NT01CX_2376     TRUE 0.949 21.000 0.000 1.000 Y NA
 2055695 2055696 NT01CX_2377 NT01CX_2378   argJ FALSE 0.032 179.000 0.000 1.000   NA
 2055696 2055697 NT01CX_2378 NT01CX_2379 argJ argC TRUE 0.992 25.000 0.303 0.003 Y NA
 2055698 2055699 NT01CX_2380 NT01CX_2381 argB argD TRUE 0.981 -18.000 0.000 1.000 Y NA
 2055699 2055700 NT01CX_2381 NT01CX_2382 argD hgdB FALSE 0.231 214.000 0.000 NA Y NA
 2055700 2055701 NT01CX_2382 NT01CX_2383 hgdB   TRUE 0.992 1.000 0.722 NA N NA
 2055701 2055702 NT01CX_2383 NT01CX_2384     TRUE 0.964 15.000 0.135 NA N NA
 2055702 2055703 NT01CX_2384 NT01CX_2385     TRUE 0.982 11.000 0.405 1.000 N NA
 2055703 2055704 NT01CX_2385 NT01CX_2386     TRUE 0.849 4.000 0.005 1.000   NA
 2055705 2055706 NT01CX_2387 NT01CX_2388     FALSE 0.173 89.000 0.000 NA   NA
 2055706 2055707 NT01CX_2388 NT01CX_2389     TRUE 0.978 1.000 0.182 NA   NA
 2055707 2055708 NT01CX_2389 NT01CX_2390     TRUE 0.972 11.000 0.227 NA   NA
 2055708 2055709 NT01CX_2390 NT01CX_2391     TRUE 0.957 13.000 0.132 NA   NA
 2055709 2055710 NT01CX_2391 NT01CX_2392     FALSE 0.004 532.000 0.000 NA   NA
 2055710 2055711 NT01CX_2392 NT01CX_2393     FALSE 0.205 76.000 0.000 NA   NA
 2055711 2055712 NT01CX_2393 NT01CX_2394     FALSE 0.018 225.000 0.000 NA   NA
 2055714 2055715 NT01CX_2396 NT01CX_2397     FALSE 0.070 146.000 0.000 1.000 N NA
 2055715 2055716 NT01CX_2397 NT01CX_2398   apgM FALSE 0.030 197.000 0.000 1.000 N NA
 2055716 2055717 NT01CX_2398 NT01CX_2399 apgM   TRUE 0.774 47.000 0.032 NA   NA
 2055717 2055718 NT01CX_2399 NT01CX_2400     TRUE 0.918 14.000 0.044 NA   NA
 2055720 2055721 NT01CX_2402 NT01CX_2403     TRUE 0.580 10.000 0.000 NA   NA
 2055721 2055722 NT01CX_2403 NT01CX_2404     TRUE 0.707 -3.000 0.000 NA   NA
 2055722 2055723 NT01CX_2404 NT01CX_2405     FALSE 0.029 195.000 0.000 NA   NA
 2055723 2055724 NT01CX_2405 NT01CX_2406   hsdR FALSE 0.019 222.000 0.000 NA   NA
 2055724 2055725 NT01CX_2406 NT01CX_2407 hsdR   TRUE 0.995 -3.000 0.240 0.001 Y NA
 2055725 2055726 NT01CX_2407 NT01CX_2408     TRUE 0.997 -3.000 0.383 0.062 Y NA
 2055726 2055727 NT01CX_2408 NT01CX_2409     FALSE 0.004 832.000 0.000 NA N NA
 2055727 2055728 NT01CX_2409 NT01CX_2410     FALSE 0.063 150.000 0.000 NA   NA
 2055728 2055729 NT01CX_2410 NT01CX_2411     FALSE 0.041 176.000 0.000 NA   NA
 2055729 2055730 NT01CX_2411 NT01CX_2412   rumA FALSE 0.006 355.000 0.000 1.000   NA
 2055730 2055731 NT01CX_2412 NT01CX_2413 rumA   TRUE 0.897 26.000 0.034 NA   NA
 2055733 2055734 NT01CX_2415 NT01CX_2416     FALSE 0.272 56.000 0.000 NA   NA
 2055734 2055735 NT01CX_2416 NT01CX_2417     FALSE 0.010 258.000 0.000 1.000   NA
 2055735 2055736 NT01CX_2417 NT01CX_2418     FALSE 0.004 428.000 0.000 1.000   NA
 2055736 2055737 NT01CX_2418 NT01CX_2419   purH TRUE 0.957 29.000 0.004 1.000 Y NA
 2055737 2055738 NT01CX_2419 NT01CX_2420 purH purN TRUE 0.991 27.000 0.225 1.000 Y NA
 2055738 2055739 NT01CX_2420 NT01CX_2421 purN purM TRUE 0.996 -12.000 0.238 0.001 Y NA
 2055739 2055740 NT01CX_2421 NT01CX_2422 purM purF TRUE 0.993 9.000 0.248 1.000 Y NA
 2055740 2055741 NT01CX_2422 NT01CX_2423 purF purC TRUE 0.988 18.000 0.082 1.000 Y NA
 2055741 2055742 NT01CX_2423 NT01CX_2424 purC purE TRUE 0.986 2.000 0.035 1.000 Y NA
 2055742 2055743 NT01CX_2424 NT01CX_2425 purE   FALSE 0.018 230.000 0.000 1.000 N NA
 2055743 2055744 NT01CX_2425 NT01CX_2426     FALSE 0.005 418.000 0.000 NA   NA
 2055744 2055745 NT01CX_2426 NT01CX_2427     FALSE 0.007 373.000 0.000 NA   NA
 2055747 2055748 NT01CX_2429 NT01CX_2430 feoB   TRUE 0.965 63.000 0.164 1.000 Y NA
 2055748 2055749 NT01CX_2430 NT01CX_2431     TRUE 0.991 17.000 0.195 0.008 Y NA
 2055749 2055750 NT01CX_2431 NT01CX_2432     FALSE 0.015 235.000 0.000 NA   NA
 2055750 2055751 NT01CX_2432 NT01CX_2433     FALSE 0.049 165.000 0.000 NA   NA
 2055751 2055752 NT01CX_2433 NT01CX_2434     TRUE 0.704 -7.000 0.000 1.000   NA
 2055752 2055753 NT01CX_2434 NT01CX_2435     TRUE 0.980 12.000 0.375 1.000 N NA
 2055753 2055754 NT01CX_2435 NT01CX_2436     FALSE 0.127 109.000 0.000 NA   NA
 2055756 2055757 NT01CX_0002 NT01CX_0003   crcB FALSE 0.014 248.000 0.000 NA   NA
 2055757 2055758 NT01CX_0003 NT01CX_0004 crcB   FALSE 0.010 171.000 0.000 0.089   NA
 2055762 2055763 NT01CX_0008 NT01CX_0009     FALSE 0.354 42.000 0.000 NA   NA
 2055763 2055764 NT01CX_0009 NT01CX_0010     TRUE 0.683 0.000 0.000 NA   NA
 2055764 2055765 NT01CX_0010 NT01CX_0011     TRUE 0.608 17.000 0.000 NA   NA
 2055765 2055766 NT01CX_0011 NT01CX_0012     TRUE 0.581 15.000 0.000 NA   NA
 2055766 2055767 NT01CX_0012 NT01CX_0013     FALSE 0.040 179.000 0.000 1.000 N NA
 2055767 2055768 NT01CX_0013 NT01CX_0014     FALSE 0.179 90.000 0.000 1.000 N NA
 2055769 2055770 NT01CX_0015 NT01CX_0016 pflB   TRUE 0.986 -13.000 0.163 1.000 N NA
 2055771 2055772 NT01CX_0017 NT01CX_0018     FALSE 0.023 211.000 0.000 NA   NA
 2055772 2055773 NT01CX_0018 NT01CX_0019     TRUE 0.969 -6.000 0.074 NA   NA
 2055774 2055775 NT01CX_0020 NT01CX_0021     FALSE 0.015 226.000 0.000 1.000   NA
 2055778 2055779 NT01CX_0024 NT01CX_0025     FALSE 0.028 199.000 0.000 1.000 N NA
 2055780 2055781 NT01CX_0026 NT01CX_0027     FALSE 0.122 111.000 0.000 NA   NA
 2055782 2055783 NT01CX_0028 NT01CX_0029     FALSE 0.193 80.000 0.000 NA   NA
 2055783 2055784 NT01CX_0029 NT01CX_0030     FALSE 0.047 167.000 0.000 NA   NA
 2055784 2055785 NT01CX_0030 NT01CX_0031     FALSE 0.013 257.000 0.000 NA   NA
 2055785 2055786 NT01CX_0031 NT01CX_0032     FALSE 0.010 301.000 0.000 NA   NA
 2055786 2055787 NT01CX_0032 NT01CX_0033     FALSE 0.004 580.000 0.000 NA   NA
 2055787 2055788 NT01CX_0033 NT01CX_0034     TRUE 0.989 -9.000 0.283 NA   NA
 2055788 2055789 NT01CX_0034 NT01CX_0035     TRUE 0.899 11.000 0.028 NA   NA
 2055791 2055792 NT01CX_0037 NT01CX_0038   dnaG TRUE 0.974 6.000 0.209 1.000 N NA
 2055794 2055795 NT01CX_0040 NT01CX_0041     FALSE 0.025 194.000 0.000 1.000   NA
 2055795 2055796 NT01CX_0041 NT01CX_0042   recO TRUE 0.907 -7.000 0.006 1.000   NA
 2055796 2055797 NT01CX_0042 NT01CX_0043 recO   TRUE 0.954 21.000 0.108 1.000   NA
 2055797 2055798 NT01CX_0043 NT01CX_0044     TRUE 0.941 10.000 0.077 1.000   NA
 2055798 2055799 NT01CX_0044 NT01CX_0045   dgkA FALSE 0.429 100.000 0.008 1.000 N NA
 2055799 2055800 NT01CX_0045 NT01CX_0046 dgkA   FALSE 0.449 95.000 0.009 NA   NA
 2055800 2055801 NT01CX_0046 NT01CX_0047     TRUE 0.965 25.000 0.182 NA   NA
 2055801 2055802 NT01CX_0047 NT01CX_0048     TRUE 0.735 54.000 0.032 NA   NA
 2055802 2055803 NT01CX_0048 NT01CX_0049     TRUE 0.994 -3.000 0.851 NA   NA
 2055803 2055804 NT01CX_0049 NT01CX_0050     FALSE 0.307 151.000 0.029 NA   NA
 2055804 2055805 NT01CX_0050 NT01CX_0051   rpsU TRUE 0.943 28.000 0.150 0.032   NA
 2055805 2055806 NT01CX_0051 NT01CX_0052 rpsU   FALSE 0.474 140.000 0.071 1.000   NA
 2055806 2055807 NT01CX_0052 NT01CX_0053     TRUE 0.616 87.000 0.051 0.034 N NA
 2055807 2055808 NT01CX_0053 NT01CX_0054     TRUE 0.978 0.000 0.163 NA   NA
 2055808 2055809 NT01CX_0054 NT01CX_0055   prmA TRUE 0.974 16.000 0.227 NA   NA
 2055809 2055810 NT01CX_0055 NT01CX_0056 prmA dnaJ TRUE 0.645 127.000 0.133 1.000 N NA
 2055810 2055811 NT01CX_0056 NT01CX_0057 dnaJ dnaK TRUE 0.929 99.000 0.196 0.003 Y NA
 2055811 2055812 NT01CX_0057 NT01CX_0058 dnaK grpE TRUE 0.968 56.000 0.224 0.006 Y NA
 2055812 2055813 NT01CX_0058 NT01CX_0059 grpE hrcA TRUE 0.976 12.000 0.286 1.000 N NA
 2055813 2055814 NT01CX_0059 NT01CX_0060 hrcA   FALSE 0.243 195.000 0.062 1.000 N NA
 2055814 2055815 NT01CX_0060 NT01CX_0061   lepA TRUE 0.934 28.000 0.083 1.000 N NA
 2055815 2055816 NT01CX_0061 NT01CX_0062 lepA   FALSE 0.380 98.000 0.002 NA   NA
 2055816 2055817 NT01CX_0062 NT01CX_0063     TRUE 0.764 52.000 0.038 NA   NA
 2055817 2055818 NT01CX_0063 NT01CX_0064     TRUE 0.938 64.000 0.521 1.000   NA
 2055820 2055821 NT01CX_0066 NT01CX_0067     TRUE 0.956 28.000 0.163 NA   NA
 2055821 2055822 NT01CX_0067 NT01CX_0068     FALSE 0.456 86.000 0.006 NA   NA
 2055822 2055823 NT01CX_0068 NT01CX_0069     FALSE 0.094 126.000 0.000 NA   NA
 2055823 2055824 NT01CX_0069 NT01CX_0070     FALSE 0.167 92.000 0.000 NA   NA
 2055826 2055827 NT01CX_0072 NT01CX_0073     TRUE 0.917 33.000 0.093 NA N NA
 2055827 2055828 NT01CX_0073 NT01CX_0074     TRUE 0.913 10.000 0.033 NA N NA
 2055828 2055829 NT01CX_0074 NT01CX_0075   nadD TRUE 0.992 13.000 0.199 1.000 Y NA
 2055829 2055830 NT01CX_0075 NT01CX_0076 nadD   TRUE 0.781 102.000 0.150 NA N NA
 2055830 2055831 NT01CX_0076 NT01CX_0077     TRUE 0.928 16.000 0.046 NA   NA
 2055831 2055832 NT01CX_0077 NT01CX_0078     FALSE 0.445 32.000 0.000 NA   NA
 2055832 2055833 NT01CX_0078 NT01CX_0079   rpmA FALSE 0.262 58.000 0.000 NA   NA
 2055833 2055834 NT01CX_0079 NT01CX_0080 rpmA   TRUE 0.994 4.000 0.203 NA Y NA
 2055834 2055835 NT01CX_0080 NT01CX_0081   rplU TRUE 0.994 3.000 0.208 NA Y NA
 2055835 2055836 NT01CX_0081 NT01CX_0082 rplU   TRUE 0.705 127.000 0.018 0.026 Y NA
 2055836 2055837 NT01CX_0082 NT01CX_0083     FALSE 0.508 25.000 0.000 1.000   NA
 2055837 2055838 NT01CX_0083 NT01CX_0084     FALSE 0.072 142.000 0.000 NA   NA
 2055838 2055839 NT01CX_0084 NT01CX_0085     TRUE 0.964 38.000 0.420 NA   NA
 2055839 2055840 NT01CX_0085 NT01CX_0086     TRUE 0.789 74.000 0.098 1.000   NA
 2055840 2055841 NT01CX_0086 NT01CX_0087     TRUE 0.938 27.000 0.135 0.007   NA
 2055841 2055842 NT01CX_0087 NT01CX_0088   nadC FALSE 0.034 177.000 0.000 1.000   NA
 2055842 2055843 NT01CX_0088 NT01CX_0089 nadC   TRUE 0.994 -19.000 0.046 1.000 Y NA
 2055843 2055844 NT01CX_0089 NT01CX_0090     TRUE 0.981 12.000 0.042 1.000 Y NA
 2055845 2055846 NT01CX_0091 NT01CX_0092   thiC FALSE 0.012 266.000 0.000 NA   NA
 2055846 2055847 NT01CX_0092 NT01CX_0093 thiC   FALSE 0.084 135.000 0.000 1.000 N NA
 2055848 2055849 NT01CX_0094 NT01CX_0095     TRUE 0.996 6.000 0.465 1.000 Y NA
 2055849 2055850 NT01CX_0095 NT01CX_0096     FALSE 0.154 108.000 0.000 NA N NA
 2055850 2055851 NT01CX_0096 NT01CX_0097     FALSE 0.073 153.000 0.000 NA N NA
 2055851 2055852 NT01CX_0097 NT01CX_0098     FALSE 0.025 217.000 0.000 NA N NA
 2055852 2055853 NT01CX_0098 NT01CX_0099     FALSE 0.098 134.000 0.000 NA N NA
 2055853 2055854 NT01CX_0099 NT01CX_0100     TRUE 0.934 12.000 0.093 0.016 N NA
 2055854 2055855 NT01CX_0100 NT01CX_0101     FALSE 0.068 148.000 0.000 1.000 N NA
 2055855 2055856 NT01CX_0101 NT01CX_0102     TRUE 0.989 37.000 0.313 NA Y NA
 2055860 2055861 NT01CX_0106 NT01CX_0107     TRUE 0.789 -16.000 0.000 NA   NA
 2055861 2055862 NT01CX_0107 NT01CX_0108     FALSE 0.025 203.000 0.000 NA   NA
 2055862 2055863 NT01CX_0108 NT01CX_0109     TRUE 0.589 8.000 0.000 NA   NA
 2055865 2055866 NT01CX_0111 NT01CX_0112     FALSE 0.018 224.000 0.000 NA   NA
 2055866 2055867 NT01CX_0112 NT01CX_0113     FALSE 0.010 299.000 0.000 NA   NA
 2055867 2055868 NT01CX_0113 NT01CX_0114     FALSE 0.013 255.000 0.000 NA   NA
 2055868 2055869 NT01CX_0114 NT01CX_0115     FALSE 0.542 26.000 0.000 NA   NA
 2055869 2055870 NT01CX_0115 NT01CX_0116     FALSE 0.057 156.000 0.000 NA   NA
 2055870 2055871 NT01CX_0116 NT01CX_0117     FALSE 0.006 397.000 0.000 NA   NA
 2055871 2055872 NT01CX_0117 NT01CX_0118     FALSE 0.103 121.000 0.000 NA   NA
 2055872 2055873 NT01CX_0118 NT01CX_0119     FALSE 0.163 94.000 0.000 NA   NA
 2055873 2055874 NT01CX_0119 NT01CX_0120     FALSE 0.006 404.000 0.000 NA   NA
 2055874 2055875 NT01CX_0120 NT01CX_0121     FALSE 0.009 311.000 0.000 NA   NA
 2055875 2055876 NT01CX_0121 NT01CX_0122     FALSE 0.387 38.000 0.000 NA   NA
 2055876 2055877 NT01CX_0122 NT01CX_0123     TRUE 0.595 7.000 0.000 NA   NA
 2055877 2055878 NT01CX_0123 NT01CX_0124     FALSE 0.347 45.000 0.000 NA   NA
 2055878 2055879 NT01CX_0124 NT01CX_0125     TRUE 0.567 14.000 0.000 NA   NA
 2055879 2055880 NT01CX_0125 NT01CX_0126     FALSE 0.193 80.000 0.000 NA   NA
 2055882 2055883 NT01CX_0128 NT01CX_0129     FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 2055884 2055885 NT01CX_0130 NT01CX_0131     FALSE 0.286 170.000 0.043 NA   NA
 2055885 2055886 NT01CX_0131 NT01CX_0132     FALSE 0.005 486.000 0.000 NA   NA
 2055887 2055888 NT01CX_0133 NT01CX_0134   argH FALSE 0.006 417.000 0.000 1.000 N NA
 2055888 2055889 NT01CX_0134 NT01CX_0135 argH argG TRUE 0.963 84.000 0.278 1.000 Y NA
 2055889 2055890 NT01CX_0135 NT01CX_0136 argG   TRUE 0.826 57.000 0.000 1.000 Y NA
 2055890 2055891 NT01CX_0136 NT01CX_0137     TRUE 0.988 14.000 0.105 1.000 Y NA
 2055891 2055892 NT01CX_0137 NT01CX_0138     TRUE 0.988 6.000 0.105 0.025 Y NA
 2055892 2055893 NT01CX_0138 NT01CX_0139     FALSE 0.153 247.000 0.000 1.000 Y NA
 2055893 2055894 NT01CX_0139 NT01CX_0140     TRUE 0.985 19.000 0.054 1.000 Y NA
 2055894 2055895 NT01CX_0140 NT01CX_0141     FALSE 0.011 297.000 0.000 1.000 N NA
 2055896 2055897 NT01CX_0142 NT01CX_0143     TRUE 0.572 5.000 0.000 1.000   NA
 2055898 2055899 NT01CX_0144 NT01CX_0145 porB   TRUE 0.994 13.000 0.500 0.002 Y NA
 2055899 2055900 NT01CX_0145 NT01CX_0146   porD TRUE 0.989 17.000 0.136 0.002 Y NA
 2055900 2055901 NT01CX_0146 NT01CX_0147 porD porG TRUE 0.996 -13.000 0.231 0.002 Y NA
 2055901 2055902 NT01CX_0147 NT01CX_0148 porG   TRUE 0.854 90.000 0.017 1.000 Y NA
 2055902 2055903 NT01CX_0148 NT01CX_0149   megL FALSE 0.095 229.000 0.022 1.000 N NA
 2055903 2055904 NT01CX_0149 NT01CX_0150 megL   FALSE 0.047 376.000 0.034 1.000 N NA
 2055904 2055905 NT01CX_0150 NT01CX_0151     FALSE 0.006 415.000 0.000 NA   NA
 2055905 2055906 NT01CX_0151 NT01CX_0153   rrlA FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 2055906 2055908 NT01CX_0153 NT01CX_0154 rrlA   FALSE 0.090 128.000 0.000 NA   NA
 2055908 2055909 NT01CX_0154 NT01CX_0155     TRUE 0.625 4.000 0.000 NA   NA
 2055909 2055910 NT01CX_0155 NT01CX_0156   rrsA FALSE 0.088 129.000 0.000 NA   NA
 2055910 2055911 NT01CX_0156 NT01CX_0157 rrsA   FALSE 0.005 416.000 0.000 NA   NA
 2055911 2055912 NT01CX_0157 NT01CX_0158     TRUE 0.711 146.000 0.333 NA   NA
 2055912 2055913 NT01CX_0158 NT01CX_0159     TRUE 0.905 91.000 0.500 NA   NA
 2055913 2055914 NT01CX_0159 NT01CX_0160     FALSE 0.205 76.000 0.000 NA   NA
 2055914 2055915 NT01CX_0160 NT01CX_0161     FALSE 0.051 166.000 0.000 1.000 N NA
 2055915 2055916 NT01CX_0161 NT01CX_0162     FALSE 0.497 104.000 0.021 NA N NA
 2055916 2055917 NT01CX_0162 NT01CX_0163     TRUE 0.997 22.000 0.847 NA Y NA
 2055917 2055918 NT01CX_0163 NT01CX_0164     TRUE 0.995 26.000 0.504 1.000 Y NA
 2055918 2055919 NT01CX_0164 NT01CX_0165     TRUE 0.995 11.000 0.337 1.000 Y NA
 2055919 2055920 NT01CX_0165 NT01CX_0166   rbsK TRUE 0.983 1.000 0.020 1.000 Y NA
 2055920 2055921 NT01CX_0166 NT01CX_0167 rbsK   FALSE 0.097 124.000 0.000 NA   NA
 2055921 2055922 NT01CX_0167 NT01CX_0168     FALSE 0.142 103.000 0.000 NA   NA
 2055922 2055923 NT01CX_0168 NT01CX_0169     FALSE 0.056 161.000 0.000 1.000 N NA
 2055923 2055924 NT01CX_0169 NT01CX_0170     FALSE 0.020 219.000 0.000 NA   NA
 2055924 2055925 NT01CX_0170 NT01CX_0171     FALSE 0.152 100.000 0.000 NA   NA
 2055925 2055926 NT01CX_0171 NT01CX_0172     FALSE 0.163 94.000 0.000 NA   NA
 2055926 2055927 NT01CX_0172 NT01CX_0173     FALSE 0.242 64.000 0.000 NA   NA
 2055928 2055929 NT01CX_0174 NT01CX_0175     TRUE 0.986 15.000 0.569 NA   NA
 2055930 2055931 NT01CX_0176 NT01CX_0177     FALSE 0.002 401.000 0.000 0.086 N NA
 2055931 2055932 NT01CX_0177 NT01CX_0178     FALSE 0.064 148.000 0.000 NA   NA
 2055932 2055933 NT01CX_0178 NT01CX_0179     FALSE 0.094 126.000 0.000 NA   NA
 2055933 2055934 NT01CX_0179 NT01CX_0180     FALSE 0.048 166.000 0.000 NA   NA
 2055936 2055937 NT01CX_0182 NT01CX_0183   ilvE FALSE 0.214 76.000 0.000 1.000 N NA
 2055937 2055938 NT01CX_0183 NT01CX_0184 ilvE   FALSE 0.065 160.000 0.000 NA N NA
 2055938 2055939 NT01CX_0184 NT01CX_0185     TRUE 0.896 38.000 0.000 NA Y NA
 2055939 2055940 NT01CX_0185 NT01CX_0186     TRUE 0.998 0.000 0.511 1.000 Y NA
 2055940 2055941 NT01CX_0186 NT01CX_0187     FALSE 0.012 277.000 0.000 1.000 N NA
 2055941 2055942 NT01CX_0187 NT01CX_0188     FALSE 0.028 200.000 0.000 1.000 N NA
 2055942 2055943 NT01CX_0188 NT01CX_0189     FALSE 0.164 82.000 0.000 1.000   NA
 2055943 2055944 NT01CX_0189 NT01CX_0190     FALSE 0.105 6.000 0.000 0.006   NA
 2055944 2055945 NT01CX_0190 NT01CX_0191     FALSE 0.222 -16.000 0.000 0.006   NA
 2055945 2055946 NT01CX_0191 NT01CX_0192   ncs2 FALSE 0.029 182.000 0.000 1.000   NA
 2055946 2055947 NT01CX_0192 NT01CX_0193 ncs2   FALSE 0.011 279.000 0.000 NA   NA
 2055950 2055951 NT01CX_0196 NT01CX_0197     TRUE 0.947 30.000 0.138 1.000 N NA
 2055952 2055953 NT01CX_0198 NT01CX_0199     FALSE 0.003 1777.000 0.000 1.000   NA
 2055953 2055954 NT01CX_0199 NT01CX_0200     TRUE 0.998 0.000 0.667 NA Y NA
 2055954 2055955 NT01CX_0200 NT01CX_0201     TRUE 0.994 13.000 0.324 NA Y NA
 2055955 2055956 NT01CX_0201 NT01CX_0202     TRUE 0.970 9.000 0.194 NA   NA
 2055956 2055957 NT01CX_0202 NT01CX_0203     TRUE 0.950 61.000 0.629 NA   NA
 2055957 2055958 NT01CX_0203 NT01CX_0204     TRUE 0.742 132.000 0.295 NA   NA
 2055958 2055959 NT01CX_0204 NT01CX_0205     TRUE 0.995 -10.000 0.778 NA   NA
 2055959 2055960 NT01CX_0205 NT01CX_0206     TRUE 0.977 13.000 0.318 NA   NA
 2055960 2055961 NT01CX_0206 NT01CX_0207     FALSE 0.003 2357.000 0.000 NA   NA
 2055961 2055962 NT01CX_0207 NT01CX_0208     TRUE 0.985 12.000 0.556 NA   NA
 2055962 2055963 NT01CX_0208 NT01CX_0209     FALSE 0.003 3643.000 0.000 NA   NA
 2055963 2055964 NT01CX_0209 NT01CX_0210     FALSE 0.015 235.000 0.000 NA   NA
 2055964 2055965 NT01CX_0210 NT01CX_0211     FALSE 0.222 70.000 0.000 NA   NA
 2055965 2055966 NT01CX_0211 NT01CX_0212     FALSE 0.007 352.000 0.000 NA   NA
 2055966 2055967 NT01CX_0212 NT01CX_0213     FALSE 0.497 197.000 0.333 NA   NA
 2055967 2055968 NT01CX_0213 NT01CX_0214     FALSE 0.053 150.000 0.000 1.000   NA
 2055968 2055969 NT01CX_0214 NT01CX_0215     TRUE 0.966 23.000 0.168 NA   NA
 2055969 2055970 NT01CX_0215 NT01CX_0216     FALSE 0.472 192.000 0.263 NA   NA
 2055970 2055971 NT01CX_0216 NT01CX_0217     FALSE 0.026 201.000 0.000 NA   NA
 2055971 2055972 NT01CX_0217 NT01CX_0218     TRUE 0.992 18.000 0.933 NA   NA
 2055972 2055973 NT01CX_0218 NT01CX_0219     FALSE 0.008 303.000 0.000 1.000   NA
 2055973 2055974 NT01CX_0219 NT01CX_0220     FALSE 0.088 121.000 0.000 1.000   NA
 2055976 2055977 NT01CX_0222 NT01CX_0223     TRUE 0.847 66.000 0.135 NA   NA
 2055977 2055978 NT01CX_0223 NT01CX_0224     FALSE 0.213 74.000 0.000 NA   NA
 2055978 2055979 NT01CX_0224 NT01CX_0225     FALSE 0.077 128.000 0.000 1.000   NA
 2055979 2055980 NT01CX_0225 NT01CX_0226     FALSE 0.059 154.000 0.000 NA   NA
 2055980 2055981 NT01CX_0226 NT01CX_0227     TRUE 0.982 32.000 0.828 NA   NA
 2055981 2055982 NT01CX_0227 NT01CX_0228     FALSE 0.158 97.000 0.000 NA   NA
 2055989 2055990 NT01CX_0235 NT01CX_0236     FALSE 0.004 717.000 0.000 1.000 N NA
 2055993 2055994 NT01CX_0239 NT01CX_0240     FALSE 0.005 448.000 0.000 NA   NA
 2055994 2055995 NT01CX_0240 NT01CX_0241     TRUE 0.950 0.000 0.047 NA   NA
 2055995 2055996 NT01CX_0241 NT01CX_0242     TRUE 0.597 16.000 0.000 NA   NA
 2055996 2055997 NT01CX_0242 NT01CX_0243     TRUE 0.966 -16.000 0.038 NA   NA
 2055997 2055998 NT01CX_0243 NT01CX_0244     TRUE 0.990 -3.000 0.419 1.000 N NA
 2055998 2055999 NT01CX_0244 NT01CX_0245     FALSE 0.020 210.000 0.000 1.000   NA
 2056000 2056001 NT01CX_0246 NT01CX_0247 thiD thiM TRUE 0.967 29.000 0.039 0.004 Y NA
 2056001 2056002 NT01CX_0247 NT01CX_0248 thiM thiE TRUE 0.995 -9.000 0.190 0.004 Y NA
 2056003 2056004 NT01CX_0249 NT01CX_0250   rrfB FALSE 0.027 199.000 0.000 NA   NA
 2056004 2056005 NT01CX_0250 NT01CX_0252 rrfB rrlB FALSE 0.407 36.000 0.000 NA   NA
 2056005 2056007 NT01CX_0252 NT01CX_0253 rrlB rrsB FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 2056009 2056010 NT01CX_0255 NT01CX_0256     TRUE 0.996 13.000 0.720 0.016 Y NA
 2056010 2056011 NT01CX_0256 NT01CX_0257     TRUE 0.991 0.000 0.750 0.027   NA
 2056011 2056012 NT01CX_0257 NT01CX_0258     TRUE 0.843 86.000 0.227 1.000   NA
 2056012 2056013 NT01CX_0258 NT01CX_0259   hemL TRUE 0.733 -6.000 0.000 1.000 N NA
 2056013 2056014 NT01CX_0259 NT01CX_0260 hemL hemB TRUE 0.979 6.000 0.049 0.001 Y NA
 2056014 2056015 NT01CX_0260 NT01CX_0261 hemB   TRUE 0.972 31.000 0.044 1.000 Y NA
 2056015 2056016 NT01CX_0261 NT01CX_0262   hemC TRUE 0.985 2.000 0.031 1.000 Y NA
 2056016 2056017 NT01CX_0262 NT01CX_0263 hemC   TRUE 0.946 40.000 0.022 1.000 Y NA
 2056017 2056018 NT01CX_0263 NT01CX_0264   hemA TRUE 0.981 15.000 0.039 1.000 Y NA
 2056018 2056019 NT01CX_0264 NT01CX_0265 hemA   FALSE 0.122 113.000 0.000 1.000 N NA
 2056019 2056020 NT01CX_0265 NT01CX_0266     FALSE 0.011 253.000 0.000 1.000   NA
 2056023 2056024 NT01CX_0269 NT01CX_0270     TRUE 0.863 8.000 0.013 1.000   NA
 2056025 2056026 NT01CX_0271 NT01CX_0273 rrfC rrlC FALSE 0.407 36.000 0.000 NA   NA
 2056026 2056028 NT01CX_0273 NT01CX_0274 rrlC rrsC FALSE 0.042 175.000 0.000 NA   NA
 2056028 2056029 NT01CX_0274 NT01CX_0275 rrsC glnS FALSE 0.005 461.000 0.000 NA   NA
 2056029 2056030 NT01CX_0275 NT01CX_0276 glnS   FALSE 0.008 348.000 0.000 NA   NA
 2056030 2056031 NT01CX_0276 NT01CX_0277     FALSE 0.054 160.000 0.000 NA   NA
 2056031 2056032 NT01CX_0277 NT01CX_0278     TRUE 0.996 14.000 0.909 0.001 Y NA
 2056036 2056037 NT01CX_0282 NT01CX_0283 fusA   FALSE 0.200 67.000 0.000 1.000   NA
 2056039 2056040 NT01CX_0285 NT01CX_0286     FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 2056042 2056043 NT01CX_0288 NT01CX_0289     TRUE 0.864 86.000 0.019 1.000 Y NA
 2056043 2056044 NT01CX_0289 NT01CX_0290     TRUE 0.993 11.000 0.250 1.000 Y NA
 2056044 2056045 NT01CX_0290 NT01CX_0291   nagA TRUE 0.941 25.000 0.000 1.000 Y NA
 2056045 2056046 NT01CX_0291 NT01CX_0292 nagA   TRUE 0.936 32.000 0.133 1.000 N NA
 2056046 2056047 NT01CX_0292 NT01CX_0293     FALSE 0.171 94.000 0.000 1.000 N NA
 2056048 2056049 NT01CX_0294 NT01CX_0295     FALSE 0.502 29.000 0.000 NA   NA
 2056050 2056051 NT01CX_0296 NT01CX_0297     TRUE 0.637 21.000 0.000 NA N NA
 2056051 2056052 NT01CX_0297 NT01CX_0298     TRUE 0.942 36.000 0.200 NA   NA
 2056052 2056053 NT01CX_0298 NT01CX_0299     TRUE 0.992 2.000 0.750 NA   NA
 2056053 2056054 NT01CX_0299 NT01CX_0300     FALSE 0.006 424.000 0.000 1.000 N NA
 2056054 2056055 NT01CX_0300 NT01CX_0301     FALSE 0.310 44.000 0.000 1.000   NA
 2056061 2056062 NT01CX_0307 NT01CX_0308     FALSE 0.238 65.000 0.000 NA   NA
 2056062 2056063 NT01CX_0308 NT01CX_0309     TRUE 0.704 -7.000 0.000 1.000   NA
 2056065 2056066 NT01CX_0311 NT01CX_0312     TRUE 0.910 17.000 0.028 NA   NA
 2056066 2056067 NT01CX_0312 NT01CX_0313     TRUE 0.973 22.000 0.231 NA   NA
 2056067 2056068 NT01CX_0313 NT01CX_0314     FALSE 0.033 188.000 0.000 NA   NA
 2056070 2056071 NT01CX_0316 NT01CX_0317     FALSE 0.009 314.000 0.000 NA   NA
 2056071 2056072 NT01CX_0317 NT01CX_0318     FALSE 0.047 167.000 0.000 NA   NA
 2056072 2056073 NT01CX_0318 NT01CX_0319     FALSE 0.127 109.000 0.000 NA   NA
 2056073 2056074 NT01CX_0319 NT01CX_0320     TRUE 0.982 11.000 0.400 NA   NA
 2056074 2056075 NT01CX_0320 NT01CX_0321     FALSE 0.019 224.000 0.000 1.000 N NA
 2056078 2056079 NT01CX_0324 NT01CX_0325     FALSE 0.278 55.000 0.000 NA   NA
 2056079 2056080 NT01CX_0325 NT01CX_0326     FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 2056080 2056081 NT01CX_0326 NT01CX_0327     TRUE 0.993 -3.000 0.652 1.000 N NA
 2056081 2056082 NT01CX_0327 NT01CX_0328     TRUE 0.969 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2056082 2056083 NT01CX_0328 NT01CX_0329     FALSE 0.018 225.000 0.000 NA   NA
 2056085 2056086 NT01CX_0331 NT01CX_0332 sacT   FALSE 0.208 303.000 0.273 1.000   NA
 2056086 2056087 NT01CX_0332 NT01CX_0333     TRUE 0.930 21.000 0.000 0.003 Y NA
 2056087 2056088 NT01CX_0333 NT01CX_0334   ptsI TRUE 0.854 38.000 0.000 0.003 Y NA
 2056089 2056090 NT01CX_0335 NT01CX_0336     FALSE 0.351 46.000 0.000