MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas stutzeri A1501

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3557764 3557765 PST_0001 PST_0002 dnaA dnaN TRUE 0.946 34.000 0.328 1.000 Y NA
 3557765 3557766 PST_0002 PST_0003 dnaN recF TRUE 0.992 10.000 0.318 1.000 Y NA
 3557766 3557767 PST_0003 PST_0004 recF gyrB TRUE 0.998 -3.000 0.249 0.005 Y NA
 3557767 3557768 PST_0004 PST_0005 gyrB ahpF-1 FALSE 0.044 204.000 0.000 1.000 N NA
 3557769 3557770 PST_0006 PST_0007     FALSE 0.362 48.000 0.031 1.000 N NA
 3557770 3557771 PST_0007 PST_0008     TRUE 0.989 -3.000 0.310 1.000 N NA
 3557771 3557772 PST_0008 PST_0009   glyS TRUE 0.859 -31.000 0.123 1.000 N NA
 3557772 3557773 PST_0009 PST_0010 glyS glyQ TRUE 0.999 -3.000 0.651 0.001 Y NA
 3557774 3557775 PST_0011 PST_0012 tag   FALSE 0.200 100.000 0.017 1.000 N NA
 3557776 3557777 PST_0013 PST_0014     FALSE 0.255 64.000 0.000 1.000   NA
 3557777 3557778 PST_0014 PST_0015     TRUE 0.997 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 3557778 3557779 PST_0015 PST_0016     TRUE 0.999 -3.000 0.842 0.014 Y NA
 3557779 3557780 PST_0016 PST_0017     TRUE 0.975 75.000 0.611 0.055 Y NA
 3557780 3557781 PST_0017 PST_0018   trkA FALSE 0.011 340.000 0.000 1.000 N NA
 3557781 3557782 PST_0018 PST_0019 trkA sun TRUE 0.609 75.000 0.122 1.000 N NA
 3557782 3557783 PST_0019 PST_0020 sun fmt TRUE 0.996 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 3557783 3557784 PST_0020 PST_0021 fmt def TRUE 0.918 53.000 0.105 0.022 Y NA
 3557785 3557786 PST_0022 PST_0023     FALSE 0.338 87.000 0.033 1.000   NA
 3557786 3557787 PST_0023 PST_0024     FALSE 0.141 138.000 0.023 NA N NA
 3557789 3557790 PST_0026 PST_0027 hemF aroE TRUE 0.559 73.000 0.093 1.000 N NA
 3557791 3557792 PST_0028 PST_0029     FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 3557793 3557794 PST_0030 PST_0031 pbpG   FALSE 0.005 574.000 0.000 1.000 N NA
 3557794 3557795 PST_0031 PST_0032     TRUE 0.555 -78.000 0.034 NA   NA
 3557797 3557798 PST_0034 PST_0035     TRUE 0.528 84.000 0.091 NA   NA
 3557799 3557800 PST_0036 PST_0037 metQ-2 metI-2 TRUE 0.966 59.000 0.867 NA Y NA
 3557800 3557801 PST_0037 PST_0038 metI-2 metN-2 TRUE 0.997 0.000 0.469 1.000 Y NA
 3557803 3557804 PST_0040 PST_0041     TRUE 0.870 0.000 0.011 NA   NA
 3557804 3557805 PST_0041 PST_0042   znuC TRUE 0.998 2.000 0.755 1.000 Y NA
 3557805 3557806 PST_0042 PST_0043 znuC np20 TRUE 0.909 78.000 0.309 1.000 Y NA
 3557808 3557809 PST_0045 PST_0047     FALSE 0.118 139.000 0.000 NA   NA
 3557811 3557812 PST_0048 PST_0049     TRUE 0.919 -3.000 0.033 NA   NA
 3557812 3557813 PST_0049 PST_0050     FALSE 0.004 1210.000 0.000 1.000   NA
 3557813 3557814 PST_0050 PST_0051     TRUE 0.975 -3.000 0.019 0.028   NA
 3557814 3557815 PST_0051 PST_0052     TRUE 0.932 98.000 0.222 0.028 Y NA
 3557815 3557816 PST_0052 PST_0053   cheY-1 TRUE 0.977 -7.000 0.000 0.028 Y NA
 3557816 3557817 PST_0053 PST_0054 cheY-1   TRUE 0.991 -3.000 0.000 0.035 Y NA
 3557817 3557818 PST_0054 PST_0055     TRUE 0.971 107.000 0.667 0.035 Y NA
 3557818 3557819 PST_0055 PST_0056     TRUE 0.982 50.000 0.667 0.035 Y NA
 3557820 3557821 PST_0057 PST_0058     FALSE 0.065 318.000 0.118 1.000 N NA
 3557822 3557823 PST_0059 PST_0060     TRUE 0.559 47.000 0.077 NA   NA
 3557823 3557824 PST_0060 PST_0061     TRUE 0.486 101.000 0.084 1.000   NA
 3557824 3557825 PST_0061 PST_0062     FALSE 0.249 125.000 0.032 1.000   NA
 3557825 3557826 PST_0062 PST_0063     TRUE 0.578 75.000 0.105 1.000 N NA
 3557827 3557828 PST_0064 PST_0065     TRUE 0.824 43.000 0.273 1.000   NA
 3557828 3557829 PST_0065 PST_0066     TRUE 0.757 68.000 0.239 1.000 N NA
 3557829 3557830 PST_0066 PST_0067   potF2 FALSE 0.037 217.000 0.000 1.000 N NA
 3557830 3557831 PST_0067 PST_0068 potF2 potF3 FALSE 0.240 278.000 0.000 0.019 Y NA
 3557831 3557832 PST_0068 PST_0069 potF3 potG TRUE 0.759 148.000 0.200 1.000 Y NA
 3557832 3557833 PST_0069 PST_0070 potG potH TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3557833 3557834 PST_0070 PST_0071 potH potI TRUE 0.993 -3.000 0.057 0.055 Y NA
 3557839 3557840 PST_0076 PST_0077 dctM dctQ TRUE 0.998 -3.000 0.882 NA Y NA
 3557840 3557841 PST_0077 PST_0078 dctQ dctP FALSE 0.140 266.000 0.034 NA Y NA
 3557841 3557842 PST_0078 PST_0079 dctP dctD FALSE 0.020 271.000 0.000 1.000 N NA
 3557842 3557843 PST_0079 PST_0080 dctD dctB TRUE 0.996 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 3557843 3557844 PST_0080 PST_0081 dctB   TRUE 0.695 106.000 0.259 1.000 N NA
 3557844 3557845 PST_0081 PST_0082     TRUE 0.995 -3.000 0.250 1.000 Y NA
 3557845 3557846 PST_0082 PST_0083     TRUE 0.990 -3.000 0.100 1.000 Y NA
 3557846 3557847 PST_0083 PST_0084   rfbB-2 TRUE 0.999 -3.000 0.381 0.002 Y NA
 3557847 3557848 PST_0084 PST_0085 rfbB-2   FALSE 0.018 278.000 0.000 1.000 N NA
 3557848 3557849 PST_0085 PST_0086     TRUE 0.997 2.000 0.500 0.004   NA
 3557849 3557850 PST_0086 PST_0087     TRUE 0.958 -36.000 0.500 1.000   NA
 3557850 3557851 PST_0087 PST_0088     FALSE 0.192 86.000 0.011 NA   NA
 3557851 3557852 PST_0088 PST_0089     TRUE 0.982 -3.000 0.201 NA   NA
 3557852 3557853 PST_0089 PST_0090     TRUE 0.998 2.000 0.650 NA Y NA
 3557853 3557854 PST_0090 PST_0091     TRUE 0.997 -3.000 0.491 NA Y NA
 3557854 3557855 PST_0091 PST_0092     FALSE 0.042 205.000 0.000 NA   NA
 3557855 3557856 PST_0092 PST_0093     TRUE 0.972 28.000 0.667 0.080   NA
 3557856 3557857 PST_0093 PST_0094     FALSE 0.014 302.000 0.000 NA   NA
 3557858 3557859 PST_0095 PST_0096   gabD-2 TRUE 0.879 16.000 0.000 1.000 Y NA
 3557861 3557862 PST_0098 PST_0099     FALSE 0.034 223.000 0.000 1.000 N NA
 3557862 3557863 PST_0099 PST_0100     TRUE 0.783 44.000 0.050 1.000 Y NA
 3557863 3557864 PST_0100 PST_0101     TRUE 0.987 13.000 0.100 0.005 Y NA
 3557865 3557866 PST_0102 PST_0103     FALSE 0.264 142.000 0.051 NA   NA
 3557869 3557870 PST_0106 PST_0107   rpmB FALSE 0.015 297.000 0.000 1.000 N NA
 3557870 3557871 PST_0107 PST_0108 rpmB rpmG TRUE 0.995 12.000 0.332 0.014 Y NA
 3557871 3557872 PST_0108 PST_0109 rpmG   FALSE 0.153 95.000 0.002 1.000 N NA
 3557872 3557873 PST_0109 PST_0110     TRUE 0.531 59.000 0.081 NA   NA
 3557874 3557875 PST_0111 PST_0112   thrB FALSE 0.208 50.000 0.007 NA   NA
 3557875 3557876 PST_0112 PST_0114 thrB   TRUE 0.849 25.000 0.204 NA   NA
 3557878 3557879 PST_0115 PST_0116     TRUE 0.995 -3.000 0.647 NA   NA
 3557879 3557880 PST_0116 PST_0117     TRUE 0.976 16.000 0.727 NA   NA
 3557880 3557881 PST_0117 PST_0118     TRUE 0.877 109.000 0.800 NA   NA
 3557881 3557882 PST_0118 PST_0119     FALSE 0.006 462.000 0.000 NA   NA
 3557883 3557884 PST_0120 PST_0121     FALSE 0.349 122.000 0.056 1.000   NA
 3557885 3557886 PST_0122 PST_0123 pntB pntAB TRUE 0.987 10.000 0.144 0.001   NA
 3557886 3557887 PST_0123 PST_0124 pntAB pntAA TRUE 0.995 14.000 0.829 0.001   NA
 3557888 3557889 PST_0125 PST_0126 xcpR xcpS TRUE 0.960 151.000 0.653 0.004 Y NA
 3557889 3557890 PST_0126 PST_0127 xcpS xcpT TRUE 0.999 6.000 0.599 0.004 Y NA
 3557890 3557891 PST_0127 PST_0128 xcpT xcpU TRUE 0.998 4.000 0.425 0.004 Y NA
 3557891 3557892 PST_0128 PST_0129 xcpU xcpV TRUE 0.998 -3.000 0.605 0.004   NA
 3557892 3557893 PST_0129 PST_0130 xcpV xcpW TRUE 0.998 0.000 0.569 0.004   NA
 3557893 3557894 PST_0130 PST_0131 xcpW xcpX TRUE 0.979 -3.000 0.024 1.000 Y NA
 3557894 3557895 PST_0131 PST_0132 xcpX xcpY FALSE 0.420 201.000 0.020 0.078 Y NA
 3557895 3557896 PST_0132 PST_0133 xcpY xcpZ TRUE 0.998 3.000 0.811 1.000 Y NA
 3557897 3557898 PST_0134 PST_0135   recG FALSE 0.335 76.000 0.038 NA N NA
 3557898 3557899 PST_0135 PST_0136 recG   TRUE 0.987 5.000 0.117 1.000 Y NA
 3557900 3557901 PST_0137 PST_0138     FALSE 0.053 184.000 0.004 1.000 N NA
 3557901 3557902 PST_0138 PST_0139     TRUE 0.899 60.000 0.667 NA   NA
 3557902 3557903 PST_0139 PST_0140     FALSE 0.202 119.000 0.025 NA   NA
 3557904 3557905 PST_0141 PST_0142     FALSE 0.392 24.000 0.000 NA   NA
 3557905 3557906 PST_0142 PST_0143     FALSE 0.005 519.000 0.000 NA   NA
 3557907 3557908 PST_0144 PST_0145     TRUE 0.928 -3.000 0.037 1.000 N NA
 3557909 3557910 PST_0146 PST_0147     FALSE 0.348 156.000 0.100 NA   NA
 3557911 3557912 PST_0148 PST_0149     TRUE 0.613 86.000 0.149 NA   NA
 3557912 3557913 PST_0149 PST_0150     TRUE 0.953 3.000 0.071 NA   NA
 3557914 3557915 PST_0151 PST_0153     TRUE 0.959 32.000 0.419 1.000 Y NA
 3557916 3557917 PST_0152 PST_0154     FALSE 0.015 295.000 0.000 1.000 N NA
 3557917 3557918 PST_0154 PST_0155     TRUE 0.763 15.000 0.044 1.000 N NA
 3557920 3557921 PST_0157 PST_0158     TRUE 0.983 -3.000 0.214 NA   NA
 3557924 3557925 PST_0161 PST_0162 selB selA TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.001 N NA
 3557925 3557926 PST_0162 PST_0163 selA   TRUE 0.959 -3.000 0.083 NA N NA
 3557926 3557927 PST_0163 PST_0164   fdnI-1 FALSE 0.393 127.000 0.091 NA N NA
 3557927 3557928 PST_0164 PST_0165 fdnI-1 fdnH-1 TRUE 0.980 58.000 0.538 0.002 Y NA
 3557928 3557929 PST_0165 PST_0166 fdnH-1   TRUE 0.994 0.000 0.128 0.002   NA
 3557929 3557930 PST_0166 PST_0167     TRUE 0.856 49.000 0.400 1.000   NA
 3557930 3557931 PST_0167 PST_0168     TRUE 0.560 152.000 0.222 1.000   NA
 3557932 3557933 PST_0169 PST_0170 ohr   TRUE 0.674 39.000 0.105 1.000   NA
 3557934 3557935 PST_0171 PST_0172     FALSE 0.063 186.000 0.007 1.000   NA
 3557935 3557936 PST_0172 PST_0173   uvrD TRUE 0.620 -13.000 0.000 1.000 N NA
 3557938 3557939 PST_0175 PST_0176     FALSE 0.223 43.000 0.005 NA   NA
 3557939 3557940 PST_0176 PST_0177     FALSE 0.057 185.000 0.010 NA   NA
 3557940 3557941 PST_0177 PST_0178     FALSE 0.033 285.000 0.036 1.000 N NA
 3557941 3557942 PST_0178 PST_0179   ectC TRUE 0.556 69.000 0.079 1.000   NA
 3557942 3557943 PST_0179 PST_0180 ectC ectB TRUE 0.987 11.000 0.572 1.000   NA
 3557943 3557944 PST_0180 PST_0181 ectB ectA TRUE 0.999 -3.000 0.793 0.001   NA
 3557944 3557945 PST_0181 PST_0182 ectA zwf-3 FALSE 0.006 571.000 0.000 1.000   NA
 3557946 3557947 PST_0183 PST_0184     TRUE 0.750 98.000 0.316 NA   NA
 3557949 3557950 PST_0186 PST_0187 accC-2 oadA TRUE 0.988 11.000 0.354 0.068 N NA
 3557950 3557951 PST_0187 PST_0188 oadA   FALSE 0.067 190.000 0.019 NA   NA
 3557951 3557952 PST_0188 PST_0189     TRUE 0.977 2.000 0.162 NA   NA
 3557952 3557953 PST_0189 PST_0190     FALSE 0.216 66.000 0.011 NA   NA
 3557953 3557954 PST_0190 PST_0191     FALSE 0.251 45.000 0.011 1.000 N NA
 3557955 3557956 PST_0192 PST_0193   ansA TRUE 0.518 128.000 0.017 1.000 Y NA
 3557956 3557957 PST_0193 PST_0194 ansA   TRUE 0.934 -37.000 0.095 1.000 Y NA
 3557959 3557960 PST_0196 PST_0197   aspA TRUE 0.871 35.000 0.353 1.000 N NA
 3557961 3557962 PST_0198 PST_0199     FALSE 0.226 200.000 0.133 1.000 N NA
 3557962 3557963 PST_0199 PST_0200     FALSE 0.335 68.000 0.030 1.000 N NA
 3557963 3557964 PST_0200 PST_0201     FALSE 0.360 48.000 0.030 1.000 N NA
 3557964 3557965 PST_0201 PST_0202   purE FALSE 0.049 186.000 0.002 1.000 N NA
 3557965 3557966 PST_0202 PST_0203 purE purK TRUE 0.943 77.000 0.136 0.001 Y NA
 3557966 3557967 PST_0203 PST_0204 purK   FALSE 0.426 85.000 0.050 1.000   NA
 3557967 3557968 PST_0204 PST_0205     TRUE 0.814 53.000 0.333 NA   NA
 3557968 3557969 PST_0205 PST_0206     TRUE 0.778 6.000 0.008 NA   NA
 3557970 3557971 PST_0207 PST_0208 ldhA cysA TRUE 0.818 4.000 0.008 1.000 N NA
 3557971 3557972 PST_0208 PST_0209 cysA cysW TRUE 0.998 -3.000 0.587 1.000 Y NA
 3557972 3557973 PST_0209 PST_0210 cysW cysT TRUE 0.997 11.000 0.935 0.001 N NA
 3557973 3557974 PST_0210 PST_0211 cysT cysP TRUE 0.644 140.000 0.066 0.003 N NA
 3557974 3557975 PST_0211 PST_0212 cysP   FALSE 0.139 271.000 0.188 NA   NA
 3557976 3557977 PST_0213 PST_0214   lsfA FALSE 0.257 65.000 0.000 1.000   NA
 3557980 3557981 PST_0217 PST_0218     FALSE 0.005 542.000 0.000 NA   NA
 3557983 3557984 PST_0220 PST_0221     FALSE 0.409 -64.000 0.000 NA   NA
 3557987 3557988 PST_0224 PST_0225     TRUE 0.997 3.000 1.000 1.000   NA
 3557988 3557989 PST_0225 PST_0226     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3557989 3557990 PST_0226 PST_0227     FALSE 0.215 61.000 0.000 NA   NA
 3557991 3557992 PST_0228 PST_0229     TRUE 0.862 1.000 0.000 NA   NA
 3557992 3557993 PST_0229 PST_0230     TRUE 0.720 11.000 0.000 NA   NA
 3557993 3557994 PST_0230 PST_0231     TRUE 0.776 5.000 0.000 NA N NA
 3557994 3557995 PST_0231 PST_0232     TRUE 0.687 12.000 0.000 NA   NA
 3557995 3557996 PST_0232 PST_0233     TRUE 0.907 11.000 0.073 NA   NA
 3557996 3557997 PST_0233 PST_0234     FALSE 0.377 85.000 0.045 NA   NA
 3557997 3557998 PST_0234 PST_0235     TRUE 0.960 3.000 0.087 1.000 N NA
 3557998 3557999 PST_0235 PST_0236     FALSE 0.224 63.000 0.000 1.000 N NA
 3557999 3558000 PST_0236 PST_0237     TRUE 0.861 2.000 0.000 1.000 N NA
 3558000 3558001 PST_0237 PST_0238     TRUE 0.947 16.000 0.333 1.000   NA
 3558001 3558002 PST_0238 PST_0239     TRUE 0.527 18.000 0.000 1.000   NA
 3558002 3558003 PST_0239 PST_0240   arsC-3 TRUE 0.834 25.000 0.000 0.002   NA
 3558003 3558004 PST_0240 PST_0241 arsC-3   TRUE 0.980 -3.000 0.179 1.000 N NA
 3558005 3558006 PST_0242 PST_0243     TRUE 0.970 -3.000 0.111 NA   NA
 3558006 3558007 PST_0243 PST_0244     FALSE 0.041 206.000 0.000 NA   NA
 3558007 3558008 PST_0244 PST_0245     TRUE 0.912 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 3558008 3558009 PST_0245 PST_0246     FALSE 0.110 146.000 0.000 NA   NA
 3558009 3558010 PST_0246 PST_0247     FALSE 0.006 470.000 0.000 NA   NA
 3558011 3558012 PST_0248 PST_0249     FALSE 0.039 198.000 0.000 NA N NA
 3558012 3558013 PST_0249 PST_0250     FALSE 0.148 113.000 0.000 NA   NA
 3558013 3558014 PST_0250 PST_0251     TRUE 0.912 -3.000 0.024 1.000   NA
 3558014 3558015 PST_0251 PST_0252     TRUE 0.993 -3.000 0.051 0.070 Y NA
 3558015 3558016 PST_0252 PST_0253     FALSE 0.046 199.000 0.000 NA   NA
 3558016 3558017 PST_0253 PST_0254     TRUE 0.940 49.000 1.000 NA   NA
 3558017 3558018 PST_0254 PST_0256     FALSE 0.003 968.000 0.000 NA   NA
 3558020 3558021 PST_0257 PST_0258     FALSE 0.009 374.000 0.000 NA   NA
 3558021 3558022 PST_0258 PST_0259     TRUE 0.905 -16.000 0.154 NA   NA
 3558022 3558023 PST_0259 PST_0260     FALSE 0.082 167.000 0.000 NA   NA
 3558023 3558024 PST_0260 PST_0261     FALSE 0.167 101.000 0.000 NA   NA
 3558024 3558025 PST_0261 PST_0262     FALSE 0.245 91.000 0.023 NA   NA
 3558025 3558026 PST_0262 PST_0263     TRUE 0.994 -7.000 0.524 1.000 Y NA
 3558028 3558029 PST_0265 PST_0266 osmC   FALSE 0.255 42.000 0.011 NA   NA
 3558029 3558030 PST_0266 PST_0267     FALSE 0.218 70.000 0.000 NA   NA
 3558030 3558031 PST_0267 PST_0268     FALSE 0.169 122.000 0.000 1.000   NA
 3558033 3558034 PST_0270 PST_0271     FALSE 0.449 98.000 0.068 1.000   NA
 3558035 3558036 PST_0272 PST_0273     TRUE 0.947 42.000 0.937 1.000   NA
 3558036 3558037 PST_0273 PST_0274   argE FALSE 0.329 119.000 0.048 1.000   NA
 3558037 3558038 PST_0274 PST_0275 argE argA TRUE 0.852 139.000 0.087 0.003 Y NA
 3558039 3558040 PST_0276 PST_0277 gshA   FALSE 0.221 127.000 0.036 NA N NA
 3558040 3558041 PST_0277 PST_0278     TRUE 0.909 3.000 0.036 NA N NA
 3558041 3558042 PST_0278 PST_0279     FALSE 0.178 98.000 0.000 1.000 N NA
 3558042 3558043 PST_0279 PST_0280     TRUE 0.972 7.000 0.000 0.001   NA
 3558043 3558044 PST_0280 PST_0281   bcsA TRUE 0.988 -3.000 0.045 0.001   NA
 3558044 3558045 PST_0281 PST_0282 bcsA   TRUE 0.993 2.000 0.545 NA N NA
 3558045 3558046 PST_0282 PST_0283     FALSE 0.028 238.000 0.000 NA   NA
 3558046 3558047 PST_0283 PST_0284     FALSE 0.362 176.000 0.167 NA   NA
 3558048 3558049 PST_0285 PST_0286   ompR FALSE 0.151 115.000 0.000 1.000 N NA
 3558049 3558050 PST_0286 PST_0287 ompR envZ TRUE 0.976 77.000 0.584 0.035 Y NA
 3558051 3558052 PST_0288 PST_0289 rimK   TRUE 0.968 -3.000 0.102 1.000 N NA
 3558055 3558056 PST_0292 PST_0293 hslO pckA FALSE 0.451 49.000 0.048 1.000 N NA
 3558056 3558057 PST_0293 PST_0294 pckA   FALSE 0.367 164.000 0.004 1.000 Y NA
 3558061 3558062 PST_0298 PST_0299     FALSE 0.006 451.000 0.000 1.000 N NA
 3558062 3558063 PST_0299 PST_0300     TRUE 0.993 11.000 0.500 NA Y NA
 3558063 3558064 PST_0300 PST_0301     FALSE 0.215 61.000 0.000 NA   NA
 3558064 3558065 PST_0301 PST_0302     FALSE 0.307 112.000 0.047 NA   NA
 3558065 3558066 PST_0302 PST_0303     FALSE 0.250 126.000 0.038 NA   NA
 3558067 3558068 PST_0304 PST_0305     TRUE 0.990 -10.000 0.167 0.021 Y NA
 3558068 3558069 PST_0305 PST_0306     TRUE 0.988 -7.000 0.261 1.000 Y NA
 3558069 3558070 PST_0306 PST_0307     TRUE 0.997 -3.000 0.522 NA Y NA
 3558070 3558071 PST_0307 PST_0308     TRUE 0.818 -55.000 0.000 NA Y NA
 3558071 3558072 PST_0308 PST_0309     FALSE 0.013 281.000 0.000 NA N NA
 3558073 3558074 PST_0310 PST_0311     TRUE 0.997 3.000 0.500 1.000 Y NA
 3558074 3558075 PST_0311 PST_0312     TRUE 0.742 25.000 0.094 1.000 N NA
 3558075 3558076 PST_0312 PST_0313     TRUE 0.770 39.000 0.185 1.000   NA
 3558076 3558077 PST_0313 PST_0314     FALSE 0.215 72.000 0.000 NA   NA
 3558078 3558079 PST_0315 PST_0316     FALSE 0.019 273.000 0.000 1.000 N NA
 3558079 3558080 PST_0316 PST_0317     FALSE 0.014 323.000 0.000 1.000   NA
 3558081 3558082 PST_0318 PST_0319 nudE cysQ TRUE 0.991 -3.000 0.373 1.000   NA
 3558083 3558084 PST_0320 PST_0322     FALSE 0.140 129.000 0.014 NA   NA
 3558085 3558086 PST_0321 PST_0323   glgP FALSE 0.268 40.000 0.000 NA   NA
 3558086 3558087 PST_0323 PST_0324 glgP fbp TRUE 0.597 184.000 0.032 0.014 Y NA
 3558087 3558088 PST_0324 PST_0325 fbp   TRUE 0.963 4.000 0.103 1.000   NA
 3558088 3558089 PST_0325 PST_0326     TRUE 0.609 82.000 0.119 1.000   NA
 3558089 3558090 PST_0326 PST_0327   blc TRUE 0.878 26.000 0.250 1.000   NA
 3558092 3558093 PST_0329 PST_0330 pip dtD TRUE 0.976 -3.000 0.026 0.042   NA
 3558094 3558095 PST_0331 PST_0332     FALSE 0.061 187.000 0.014 NA   NA
 3558095 3558096 PST_0332 PST_0333   tatC TRUE 0.960 -3.000 0.076 NA   NA
 3558096 3558097 PST_0333 PST_0334 tatC tatB TRUE 0.996 -3.000 0.314 NA Y NA
 3558097 3558098 PST_0334 PST_0335 tatB tatA TRUE 0.852 68.000 0.015 0.008 Y NA
 3558098 3558099 PST_0335 PST_0336 tatA hisE FALSE 0.397 21.000 0.007 1.000 N NA
 3558099 3558100 PST_0336 PST_0337 hisE hisI TRUE 0.993 -7.000 0.152 0.004 Y NA
 3558100 3558101 PST_0337 PST_0338 hisI ubiB FALSE 0.309 50.000 0.018 1.000   NA
 3558101 3558102 PST_0338 PST_0339 ubiB   TRUE 0.992 -3.000 0.432 1.000   NA
 3558102 3558103 PST_0339 PST_0340   ubiE TRUE 0.980 0.000 0.145 1.000   NA
 3558103 3558104 PST_0340 PST_0341 ubiE   FALSE 0.109 147.000 0.000 NA   NA
 3558104 3558105 PST_0341 PST_0342     FALSE 0.435 20.000 0.000 NA   NA
 3558105 3558106 PST_0342 PST_0343     FALSE 0.014 302.000 0.000 NA   NA
 3558106 3558107 PST_0343 PST_0344   hslU TRUE 0.531 49.000 0.070 NA   NA
 3558107 3558108 PST_0344 PST_0345 hslU hslV TRUE 0.981 28.000 0.752 1.000 Y NA
 3558108 3558109 PST_0345 PST_0346 hslV   FALSE 0.124 121.000 0.004 1.000 N NA
 3558109 3558110 PST_0346 PST_0347     FALSE 0.194 90.000 0.000 1.000 N NA
 3558112 3558113 PST_0349 PST_0350 ntrC ntrB TRUE 0.999 -3.000 0.587 0.092 Y NA
 3558113 3558114 PST_0350 PST_0351 ntrB   TRUE 0.791 8.000 0.014 NA   NA
 3558114 3558115 PST_0351 PST_0352     TRUE 0.996 -3.000 0.889 NA   NA
 3558115 3558116 PST_0352 PST_0353   glnA FALSE 0.071 165.000 0.005 NA   NA
 3558117 3558118 PST_0354 PST_0355 thiI typA FALSE 0.082 168.000 0.011 1.000 N NA
 3558118 3558119 PST_0355 PST_0356 typA   FALSE 0.070 328.000 0.000 1.000 Y NA
 3558121 3558122 PST_0358 PST_0359     TRUE 0.997 -3.000 0.231 0.092 Y NA
 3558124 3558125 PST_0361 PST_0362     TRUE 0.508 -31.000 0.000 NA   NA
 3558125 3558126 PST_0362 PST_0363     FALSE 0.029 235.000 0.000 NA   NA
 3558126 3558127 PST_0363 PST_0364     TRUE 0.997 -7.000 0.909 1.000 Y NA
 3558127 3558128 PST_0364 PST_0365     FALSE 0.235 64.000 0.014 NA   NA
 3558128 3558129 PST_0365 PST_0366     FALSE 0.112 153.000 0.014 NA   NA
 3558129 3558130 PST_0366 PST_0367     TRUE 0.871 57.000 0.519 1.000 N NA
 3558130 3558131 PST_0367 PST_0368     TRUE 0.583 71.000 0.105 NA   NA
 3558132 3558133 PST_0369 PST_0370     FALSE 0.439 127.000 0.105 NA   NA
 3558133 3558134 PST_0370 PST_0371     TRUE 0.977 -13.000 0.571 1.000 N NA
 3558135 3558136 PST_0372 PST_0373     TRUE 0.966 -3.000 0.085 1.000   NA
 3558136 3558137 PST_0373 PST_0374     TRUE 0.755 114.000 0.400 NA   NA
 3558138 3558139 PST_0375 PST_0376     TRUE 0.977 -9.000 0.475 NA   NA
 3558139 3558140 PST_0376 PST_0377   cstA TRUE 0.993 -3.000 0.512 NA   NA
 3558141 3558142 PST_0378 PST_0379     TRUE 0.978 0.000 0.143 NA   NA
 3558142 3558143 PST_0379 PST_0380     TRUE 0.804 -7.000 0.023 1.000   NA
 3558143 3558144 PST_0380 PST_0381     TRUE 0.776 -7.000 0.023 NA   NA
 3558144 3558145 PST_0381 PST_0382     TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 3558145 3558146 PST_0382 PST_0383     TRUE 0.983 -3.000 0.029 0.003   NA
 3558146 3558147 PST_0383 PST_0384     TRUE 0.998 -3.000 0.219 0.002 Y NA
 3558147 3558148 PST_0384 PST_0385     TRUE 0.999 -3.000 0.464 0.002 Y NA
 3558149 3558150 PST_0386 PST_0387     FALSE 0.037 213.000 0.000 NA   NA
 3558150 3558151 PST_0387 PST_0388   phoQ FALSE 0.374 77.000 0.041 NA   NA
 3558151 3558152 PST_0388 PST_0389 phoQ phoP TRUE 0.988 -66.000 0.940 1.000 Y NA
 3558152 3558153 PST_0389 PST_0390 phoP oprH TRUE 0.694 76.000 0.180 1.000   NA
 3558153 3558154 PST_0390 PST_0391 oprH   FALSE 0.018 275.000 0.000 NA   NA
 3558154 3558155 PST_0391 PST_0392     FALSE 0.248 45.000 0.000 NA   NA
 3558155 3558156 PST_0392 PST_0393     TRUE 0.882 18.000 0.000 0.002   NA
 3558156 3558157 PST_0393 PST_0394   corR TRUE 0.937 72.000 1.000 1.000   NA
 3558158 3558159 PST_0395 PST_0396     FALSE 0.415 70.000 0.047 NA   NA
 3558160 3558161 PST_0397 PST_0398   serA FALSE 0.008 401.000 0.000 NA   NA
 3558162 3558163 PST_0399 PST_0400     TRUE 0.669 28.000 0.071 1.000 N NA
 3558163 3558164 PST_0400 PST_0401     TRUE 0.503 33.000 0.041 NA   NA
 3558164 3558165 PST_0401 PST_0402     TRUE 0.638 87.000 0.167 NA   NA
 3558166 3558167 PST_0403 PST_0404   rpiA FALSE 0.118 167.000 0.025 NA   NA
 3558168 3558169 PST_0405 PST_0406 ilvA-2   TRUE 0.584 21.000 0.034 NA   NA
 3558170 3558171 PST_0407 PST_0408     FALSE 0.266 115.000 0.032 1.000   NA
 3558172 3558173 PST_0409 PST_0410   ptsP TRUE 0.737 26.000 0.097 1.000 N NA
 3558175 3558176 PST_0412 PST_0413   lgt TRUE 0.838 11.000 0.030 1.000   NA
 3558176 3558177 PST_0413 PST_0414 lgt thyA TRUE 0.649 82.000 0.164 1.000 N NA
 3558177 3558178 PST_0414 PST_0415 thyA   FALSE 0.031 231.000 0.000 1.000 N NA
 3558179 3558180 PST_0416 PST_0417     TRUE 0.999 0.000 0.902 0.053 Y NA
 3558180 3558181 PST_0417 PST_0418     TRUE 0.997 0.000 0.447 1.000 Y NA
 3558181 3558182 PST_0418 PST_0419     TRUE 0.999 -7.000 1.000 0.022 Y NA
 3558182 3558183 PST_0419 PST_0420     TRUE 0.997 -3.000 0.548 NA Y NA
 3558183 3558184 PST_0420 PST_0421     FALSE 0.006 404.000 0.000 NA N NA
 3558185 3558186 PST_0422 PST_0423     TRUE 0.638 165.000 0.412 1.000 N NA
 3558187 3558188 PST_0424 PST_0425     FALSE 0.051 194.000 0.000 NA   NA
 3558188 3558189 PST_0425 PST_0426   phoR FALSE 0.293 102.000 0.037 NA   NA
 3558189 3558190 PST_0426 PST_0427 phoR phoB TRUE 0.965 69.000 0.453 0.092 Y NA
 3558190 3558191 PST_0427 PST_0428 phoB ubiA FALSE 0.290 119.000 0.043 1.000 N NA
 3558191 3558192 PST_0428 PST_0429 ubiA   TRUE 0.909 44.000 0.248 NA Y NA
 3558192 3558193 PST_0429 PST_0430   glcC FALSE 0.120 109.000 0.010 NA N NA
 3558194 3558195 PST_0431 PST_0432 glcD glcE TRUE 0.996 0.000 0.070 0.017 Y NA
 3558195 3558196 PST_0432 PST_0433 glcE glcF TRUE 0.991 7.000 0.074 0.059 Y NA
 3558196 3558197 PST_0433 PST_0434 glcF glcG FALSE 0.443 74.000 0.057 NA   NA
 3558197 3558198 PST_0434 PST_0435 glcG   TRUE 0.810 21.000 0.125 NA   NA
 3558198 3558199 PST_0435 PST_0436     FALSE 0.194 217.000 0.000 1.000 Y NA
 3558199 3558200 PST_0436 PST_0437   rubA TRUE 0.892 115.000 0.400 1.000 Y NA
 3558200 3558201 PST_0437 PST_0438 rubA rubB TRUE 0.743 36.000 0.042 0.078   NA
 3558201 3558202 PST_0438 PST_0439 rubB hupA TRUE 0.682 105.000 0.229 1.000   NA
 3558202 3558203 PST_0439 PST_0440 hupA   TRUE 0.649 143.000 0.290 1.000   NA
 3558205 3558206 PST_0442 PST_0443 gcdH   TRUE 0.647 66.000 0.143 1.000 N NA
 3558208 3558209 PST_0445 PST_0446     TRUE 0.470 -31.000 0.007 NA   NA
 3558209 3558210 PST_0446 PST_0447     TRUE 0.986 -3.000 0.257 NA   NA
 3558210 3558211 PST_0447 PST_0448     TRUE 0.928 19.000 0.338 NA   NA
 3558216 3558217 PST_0453 PST_0454     TRUE 0.993 12.000 0.286 0.078 Y NA
 3558217 3558218 PST_0454 PST_0455     TRUE 0.998 12.000 0.571 0.001 Y NA
 3558219 3558220 PST_0456 PST_0457     TRUE 0.783 36.000 0.200 NA   NA
 3558221 3558222 PST_0458 PST_0459   spoT TRUE 0.635 105.000 0.215 NA N NA
 3558222 3558223 PST_0459 PST_0460 spoT rpoZ TRUE 0.911 61.000 0.291 1.000 Y NA
 3558223 3558224 PST_0460 PST_0461 rpoZ gmk TRUE 0.782 120.000 0.471 1.000 N NA
 3558224 3558225 PST_0461 PST_0462 gmk   TRUE 0.778 62.000 0.276 NA   NA
 3558226 3558227 PST_0463 PST_0464 rph   TRUE 0.548 17.000 0.018 NA   NA
 3558229 3558230 PST_0466 PST_0467 pyrE   TRUE 0.513 20.000 0.022 NA   NA
 3558230 3558231 PST_0467 PST_0468     FALSE 0.040 207.000 0.000 NA   NA
 3558232 3558233 PST_0469 PST_0470 argB   TRUE 0.713 17.000 0.044 1.000 N NA
 3558233 3558234 PST_0470 PST_0471   dut FALSE 0.425 45.000 0.039 1.000 N NA
 3558234 3558235 PST_0471 PST_0472 dut coaBC TRUE 0.982 2.000 0.201 1.000 N NA
 3558237 3558238 PST_0474 PST_0475     TRUE 0.974 4.000 0.182 NA   NA
 3558239 3558240 PST_0476 PST_0477 paaC   FALSE 0.204 172.000 0.059 1.000 N NA
 3558240 3558241 PST_0477 PST_0478     FALSE 0.188 102.000 0.017 NA   NA
 3558242 3558243 PST_0479 PST_0480     FALSE 0.043 203.000 0.000 NA   NA
 3558243 3558244 PST_0480 PST_0481     FALSE 0.453 91.000 0.069 1.000 N NA
 3558244 3558245 PST_0481 PST_0482   lrp FALSE 0.231 68.000 0.012 1.000 N NA
 3558246 3558247 PST_0483 PST_0484 dadA   FALSE 0.006 462.000 0.000 1.000 N NA
 3558247 3558248 PST_0484 PST_0485   cycB FALSE 0.236 160.000 0.057 1.000 N NA
 3558248 3558249 PST_0485 PST_0486 cycB   FALSE 0.243 134.000 0.035 1.000   NA
 3558250 3558251 PST_0487 PST_0488 xpt   FALSE 0.209 68.000 0.009 NA   NA
 3558251 3558252 PST_0488 PST_0489     TRUE 0.932 10.000 0.095 NA   NA
 3558252 3558253 PST_0489 PST_0490     TRUE 0.998 3.000 0.231 0.006 Y NA
 3558254 3558255 PST_0491 PST_0492     TRUE 0.986 -3.000 0.250 1.000 N NA
 3558255 3558256 PST_0492 PST_0493     TRUE 0.766 65.000 0.250 1.000 N NA
 3558256 3558257 PST_0493 PST_0494   mmsA-1 TRUE 0.977 5.000 0.043 1.000 Y NA
 3558257 3558258 PST_0494 PST_0495 mmsA-1   FALSE 0.353 92.000 0.043 1.000 N NA
 3558259 3558260 PST_0496 PST_0497   rep FALSE 0.193 97.000 0.008 1.000   NA
 3558262 3558263 PST_0499 PST_0500     FALSE 0.114 130.000 0.005 1.000 N NA
 3558263 3558264 PST_0500 PST_0501     TRUE 0.600 37.000 0.074 NA   NA
 3558265 3558266 PST_0502 PST_0503 glnK amtB1 TRUE 0.702 39.000 0.135 1.000 N NA
 3558266 3558267 PST_0503 PST_0504 amtB1 amtB2 TRUE 0.616 192.000 0.026 0.001 Y NA
 3558267 3558268 PST_0504 PST_0505 amtB2   FALSE 0.148 102.000 0.007 NA   NA
 3558268 3558269 PST_0505 PST_0506     FALSE 0.242 78.000 0.018 NA   NA
 3558270 3558271 PST_0507 PST_0508   xerC TRUE 0.991 -3.000 0.367 1.000   NA
 3558271 3558272 PST_0508 PST_0509 xerC   TRUE 0.906 57.000 0.714 NA   NA
 3558272 3558273 PST_0509 PST_0510   dapF TRUE 0.979 -3.000 0.175 NA   NA
 3558273 3558274 PST_0510 PST_0511 dapF lysA TRUE 0.992 11.000 0.104 0.002 Y NA
 3558274 3558275 PST_0511 PST_0512 lysA lppL TRUE 0.869 13.000 0.071 NA   NA
 3558276 3558277 PST_0513 PST_0514 cyaY rnk FALSE 0.069 161.000 0.008 NA N NA
 3558278 3558279 PST_0515 PST_0516   cyaA TRUE 0.562 15.000 0.000 NA   NA
 3558279 3558280 PST_0516 PST_0517 cyaA   TRUE 0.478 151.000 0.164 1.000   NA
 3558280 3558281 PST_0517 PST_0518     TRUE 0.697 79.000 0.200 NA   NA
 3558281 3558282 PST_0518 PST_0519     FALSE 0.459 71.000 0.059 NA   NA
 3558282 3558283 PST_0519 PST_0520     TRUE 0.578 78.000 0.111 NA   NA
 3558283 3558284 PST_0520 PST_0521   argH FALSE 0.185 56.000 0.000 NA N NA
 3558285 3558286 PST_0522 PST_0523   algR TRUE 0.994 -51.000 0.775 0.034 Y NA
 3558286 3558287 PST_0523 PST_0524 algR hemC FALSE 0.183 150.000 0.032 1.000 N NA
 3558287 3558288 PST_0524 PST_0525 hemC hemD TRUE 0.998 -3.000 0.205 0.002 Y NA
 3558288 3558289 PST_0525 PST_0526 hemD   TRUE 0.981 -61.000 0.600 1.000 Y NA
 3558289 3558290 PST_0526 PST_0527   hemY TRUE 0.998 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 3558290 3558291 PST_0527 PST_0528 hemY dsbH FALSE 0.290 119.000 0.042 1.000 N NA
 3558291 3558292 PST_0528 PST_0529 dsbH algQ FALSE 0.111 264.000 0.133 1.000 N NA
 3558292 3558293 PST_0529 PST_0530 algQ algP FALSE 0.159 105.000 0.000 NA   NA
 3558295 3558296 PST_0532 PST_0533     TRUE 0.969 -3.000 0.108 NA   NA
 3558296 3558297 PST_0533 PST_0534     TRUE 0.800 10.000 0.022 NA   NA
 3558297 3558298 PST_0534 PST_0535     FALSE 0.329 31.000 0.000 1.000 N NA
 3558298 3558299 PST_0535 PST_0536     TRUE 0.530 15.000 0.007 NA   NA
 3558300 3558301 PST_0537 PST_0538     FALSE 0.125 112.000 0.000 NA N NA
 3558301 3558302 PST_0538 PST_0539   elbB TRUE 0.659 69.000 0.021 NA Y NA
 3558303 3558304 PST_0540 PST_0541 hemB ppk TRUE 0.586 21.000 0.033 1.000 N NA
 3558306 3558307 PST_0543 PST_0544 rho   FALSE 0.175 124.000 0.025 NA N NA
 3558307 3558308 PST_0544 PST_0545     TRUE 0.901 -31.000 0.039 NA Y NA
 3558309 3558310 PST_0546 PST_0547   argS TRUE 0.940 1.000 0.052 NA N NA
 3558310 3558311 PST_0547 PST_0549 argS priA FALSE 0.266 115.000 0.036 1.000 N NA
 3558312 3558313 PST_0548 PST_0550   maeB FALSE 0.428 142.000 0.119 1.000 N NA
 3558314 3558315 PST_0551 PST_0552 ponA   FALSE 0.005 511.000 0.000 NA   NA
 3558316 3558317 PST_0553 PST_0554 pilM pilN TRUE 0.998 0.000 0.616 NA Y NA
 3558317 3558318 PST_0554 PST_0555 pilN pilO TRUE 0.998 -3.000 0.770 NA Y NA
 3558318 3558319 PST_0555 PST_0556 pilO pilP TRUE 0.998 -3.000 0.680 NA Y NA
 3558319 3558320 PST_0556 PST_0557 pilP pilQ TRUE 0.990 15.000 0.668 NA Y NA
 3558320 3558321 PST_0557 PST_0558 pilQ aroK TRUE 0.782 85.000 0.319 1.000 N NA
 3558321 3558322 PST_0558 PST_0559 aroK aroB TRUE 0.946 24.000 0.208 1.000 Y NA
 3558322 3558323 PST_0559 PST_0560 aroB   TRUE 0.797 11.000 0.020 1.000   NA
 3558323 3558324 PST_0560 PST_0561   gltB FALSE 0.160 174.000 0.037 1.000   NA
 3558324 3558325 PST_0561 PST_0562 gltB gltD TRUE 0.960 57.000 0.214 0.001 Y NA
 3558325 3558326 PST_0562 PST_0563 gltD hemE FALSE 0.234 101.000 0.024 1.000 N NA
 3558329 3558330 PST_0566 PST_0567   trxC FALSE 0.206 78.000 0.000 NA   NA
 3558330 3558331 PST_0567 PST_0568 trxC metY FALSE 0.227 69.000 0.000 1.000 N NA
 3558331 3558332 PST_0568 PST_0569 metY   FALSE 0.209 93.000 0.010 1.000   NA
 3558333 3558334 PST_0570 PST_0571     FALSE 0.004 650.000 0.000 NA   NA
 3558334 3558335 PST_0571 PST_0572     TRUE 0.809 5.000 0.000 NA   NA
 3558335 3558336 PST_0572 PST_0573     FALSE 0.050 206.000 0.000 1.000   NA
 3558338 3558339 PST_0575 PST_0576     FALSE 0.112 242.000 0.000 0.077   NA
 3558339 3558340 PST_0576 PST_0577     FALSE 0.078 169.000 0.000 NA   NA
 3558342 3558343 PST_0579 PST_0580     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 3558343 3558344 PST_0580 PST_0581     TRUE 0.982 18.000 0.500 1.000 Y NA
 3558344 3558345 PST_0581 PST_0582     FALSE 0.030 567.000 0.000 1.000 Y NA
 3558345 3558346 PST_0582 PST_0583     FALSE 0.244 287.000 0.012 0.005 Y NA
 3558348 3558349 PST_0585 PST_0586     TRUE 0.991 -7.000 0.462 0.067   NA
 3558349 3558350 PST_0586 PST_0587     TRUE 0.990 -3.000 0.375 NA   NA
 3558350 3558351 PST_0587 PST_0588     TRUE 0.979 3.000 0.188 NA   NA
 3558352 3558353 PST_0589 PST_0590     FALSE 0.146 116.000 0.000 NA   NA
 3558353 3558354 PST_0590 PST_0591     FALSE 0.006 441.000 0.000 NA   NA
 3558354 3558355 PST_0591 PST_0592     TRUE 0.582 51.000 0.095 NA   NA
 3558356 3558357 PST_0593 PST_0594     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558357 3558358 PST_0594 PST_0595     TRUE 0.991 -3.000 0.400 NA   NA
 3558358 3558359 PST_0595 PST_0596     FALSE 0.118 152.000 0.009 1.000   NA
 3558359 3558360 PST_0596 PST_0597     FALSE 0.076 172.000 0.000 NA   NA
 3558361 3558362 PST_0598 PST_0599     TRUE 0.941 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 3558362 3558363 PST_0599 PST_0600     FALSE 0.143 120.000 0.000 NA   NA
 3558363 3558364 PST_0600 PST_0601     FALSE 0.108 148.000 0.000 NA   NA
 3558364 3558365 PST_0601 PST_0602     FALSE 0.434 154.000 0.000 0.012   NA
 3558365 3558366 PST_0602 PST_0603     FALSE 0.420 21.000 0.000 NA   NA
 3558366 3558367 PST_0603 PST_0604   fadD FALSE 0.178 95.000 0.000 NA   NA
 3558367 3558368 PST_0604 PST_0605 fadD   FALSE 0.331 224.000 0.000 0.065 Y NA
 3558368 3558369 PST_0605 PST_0606     TRUE 0.926 73.000 0.375 1.000 Y NA
 3558369 3558370 PST_0606 PST_0607     TRUE 0.946 25.000 0.240 NA Y NA
 3558370 3558371 PST_0607 PST_0608     TRUE 0.813 79.000 0.120 NA Y NA
 3558372 3558373 PST_0609 PST_0610     FALSE 0.220 67.000 0.000 NA   NA
 3558374 3558375 PST_0611 PST_0612     FALSE 0.215 77.000 0.000 1.000 N NA
 3558378 3558379 PST_0615 PST_0616     TRUE 0.948 33.000 0.818 NA   NA
 3558379 3558380 PST_0616 PST_0617     TRUE 0.876 71.000 0.545 NA   NA
 3558380 3558381 PST_0617 PST_0618     TRUE 0.956 57.000 0.800 0.074   NA
 3558382 3558383 PST_0619 PST_0620     FALSE 0.003 893.000 0.000 NA   NA
 3558383 3558384 PST_0620 PST_0621     FALSE 0.259 68.000 0.000 1.000   NA
 3558384 3558385 PST_0621 PST_0622     TRUE 0.955 20.000 0.222 NA Y NA
 3558385 3558386 PST_0622 PST_0623     TRUE 0.565 96.000 0.000 NA Y NA
 3558387 3558388 PST_0624 PST_0625     TRUE 0.963 0.000 0.074 NA   NA
 3558389 3558390 PST_0626 PST_0627     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 3558390 3558391 PST_0627 PST_0628     FALSE 0.220 68.000 0.000 NA   NA
 3558391 3558392 PST_0628 PST_0629     FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 3558392 3558393 PST_0629 PST_0630     FALSE 0.216 62.000 0.000 NA   NA
 3558393 3558394 PST_0630 PST_0631     TRUE 0.997 -3.000 1.000 NA   NA
 3558394 3558395 PST_0631 PST_0632     TRUE 0.562 15.000 0.000 NA   NA
 3558395 3558396 PST_0632 PST_0633     TRUE 0.994 -7.000 0.267 0.067 Y NA
 3558396 3558397 PST_0633 PST_0634     TRUE 0.671 83.000 0.033 NA Y NA
 3558397 3558398 PST_0634 PST_0635   hsdR FALSE 0.050 380.000 0.000 NA Y NA
 3558399 3558400 PST_0636 PST_0637     TRUE 0.747 122.000 0.400 NA   NA
 3558400 3558401 PST_0637 PST_0638     FALSE 0.006 425.000 0.000 NA   NA
 3558401 3558402 PST_0638 PST_0639     TRUE 0.982 0.000 0.020 0.005   NA
 3558402 3558403 PST_0639 PST_0640     FALSE 0.015 1262.000 0.000 0.067   NA
 3558403 3558404 PST_0640 PST_0641     TRUE 0.708 42.000 0.154 NA   NA
 3558404 3558405 PST_0641 PST_0642     FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 3558405 3558406 PST_0642 PST_0643     TRUE 0.997 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 3558407 3558408 PST_0644 PST_0645     TRUE 0.747 122.000 0.400 NA   NA
 3558408 3558409 PST_0645 PST_0646     FALSE 0.011 335.000 0.000 NA   NA
 3558409 3558410 PST_0646 PST_0647     TRUE 0.527 90.000 0.000 0.067   NA
 3558410 3558411 PST_0647 PST_0648     FALSE 0.003 684.000 0.000 NA N NA
 3558411 3558412 PST_0648 PST_0649     TRUE 0.747 122.000 0.400 NA   NA
 3558412 3558413 PST_0649 PST_0650     FALSE 0.009 369.000 0.000 NA   NA
 3558413 3558414 PST_0650 PST_0651     TRUE 0.551 111.000 0.157 NA   NA
 3558415 3558416 PST_0652 PST_0653     FALSE 0.047 198.000 0.000 NA   NA
 3558416 3558417 PST_0653 PST_0654     FALSE 0.004 641.000 0.000 NA   NA
 3558417 3558418 PST_0654 PST_0655     TRUE 0.912 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 3558418 3558419 PST_0655 PST_0656     FALSE 0.008 417.000 0.000 1.000   NA
 3558419 3558420 PST_0656 PST_0657     FALSE 0.007 454.000 0.000 1.000   NA
 3558420 3558421 PST_0657 PST_0658     FALSE 0.005 593.000 0.000 1.000   NA
 3558421 3558422 PST_0658 PST_0659     FALSE 0.177 112.000 0.000 1.000   NA
 3558422 3558423 PST_0659 PST_0660     FALSE 0.073 174.000 0.000 NA   NA
 3558423 3558424 PST_0660 PST_0661     FALSE 0.397 -69.000 0.000 NA   NA
 3558424 3558425 PST_0661 PST_0662     FALSE 0.010 389.000 0.000 1.000   NA
 3558427 3558428 PST_0664 PST_0665 cadA-2   TRUE 0.700 17.000 0.042 NA   NA
 3558428 3558429 PST_0665 PST_0666     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558429 3558430 PST_0666 PST_0667     FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 3558431 3558432 PST_0668 PST_0669     FALSE 0.402 135.000 0.000 0.067   NA
 3558433 3558434 PST_0670 PST_0671     FALSE 0.003 1053.000 0.000 NA   NA
 3558434 3558435 PST_0671 PST_0672     FALSE 0.026 244.000 0.000 NA   NA
 3558436 3558437 PST_0673 PST_0674   arcC-1 FALSE 0.003 1002.000 0.000 1.000 N NA
 3558437 3558438 PST_0674 PST_0675 arcC-1 arcB-1 FALSE 0.369 350.000 0.483 1.000 Y NA
 3558438 3558439 PST_0675 PST_0676 arcB-1 arcA-1 TRUE 0.710 64.000 0.033 1.000 Y NA
 3558439 3558440 PST_0676 PST_0677 arcA-1 arcD-1 TRUE 0.974 52.000 1.000 1.000 Y NA
 3558440 3558441 PST_0677 PST_0678 arcD-1   FALSE 0.115 142.000 0.000 NA   NA
 3558441 3558442 PST_0678 PST_0679     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558442 3558443 PST_0679 PST_0680     FALSE 0.227 66.000 0.000 1.000 N NA
 3558443 3558444 PST_0680 PST_0681     TRUE 0.978 2.000 0.000 0.004   NA
 3558444 3558445 PST_0681 PST_0682     TRUE 0.535 -36.000 0.000 1.000   NA
 3558445 3558446 PST_0682 PST_0683   phaC FALSE 0.377 -123.000 0.000 1.000 N NA
 3558446 3558447 PST_0683 PST_0684 phaC phaA TRUE 0.466 141.000 0.000 1.000 Y NA
 3558447 3558448 PST_0684 PST_0685 phaA phaB TRUE 0.722 37.000 0.000 1.000 Y NA
 3558450 3558451 PST_0687 PST_0688 gltS   FALSE 0.225 70.000 0.000 1.000 N NA
 3558451 3558452 PST_0688 PST_0689   tdcD TRUE 0.946 -3.000 0.054 1.000 N NA
 3558452 3558453 PST_0689 PST_0690 tdcD   TRUE 0.992 -3.000 0.136 1.000 Y NA
 3558453 3558454 PST_0690 PST_0691     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558457 3558458 PST_0694 PST_0695     TRUE 0.961 -3.000 0.078 NA   NA
 3558458 3558459 PST_0695 PST_0696     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3558459 3558460 PST_0696 PST_0697     FALSE 0.004 748.000 0.000 NA   NA
 3558460 3558461 PST_0697 PST_0698     TRUE 0.914 12.000 0.000 0.066   NA
 3558461 3558462 PST_0698 PST_0699     FALSE 0.005 661.000 0.000 1.000   NA
 3558462 3558463 PST_0699 PST_0700     TRUE 0.602 14.000 0.000 NA   NA
 3558463 3558464 PST_0700 PST_0701     TRUE 0.857 2.000 0.000 NA   NA
 3558464 3558465 PST_0701 PST_0702     FALSE 0.153 108.000 0.000 NA   NA
 3558468 3558469 PST_0705 PST_0706     FALSE 0.239 48.000 0.000 NA   NA
 3558469 3558470 PST_0706 PST_0707     FALSE 0.294 35.000 0.000 NA   NA
 3558472 3558473 PST_0709 PST_0710     FALSE 0.165 102.000 0.000 NA   NA
 3558473 3558474 PST_0710 PST_0711     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3558474 3558475 PST_0711 PST_0712   rpoD FALSE 0.149 112.000 0.000 NA   NA
 3558475 3558476 PST_0712 PST_0713 rpoD dnaG FALSE 0.353 212.000 0.299 1.000 N NA
 3558476 3558477 PST_0713 PST_0714 dnaG rpsU FALSE 0.333 134.000 0.067 1.000 N NA
 3558480 3558481 PST_0717 PST_0718 folB-1 folK-1 TRUE 0.992 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 3558482 3558483 PST_0719 PST_0720 cca   TRUE 0.513 -126.000 0.032 NA   NA
 3558483 3558484 PST_0720 PST_0721     TRUE 0.990 11.000 0.761 NA   NA
 3558484 3558485 PST_0721 PST_0722   prkA TRUE 0.895 83.000 0.683 NA   NA
 3558485 3558486 PST_0722 PST_0723 prkA glpE FALSE 0.006 401.000 0.000 NA N NA
 3558486 3558487 PST_0723 PST_0724 glpE apaH TRUE 0.944 -3.000 0.045 1.000   NA
 3558487 3558488 PST_0724 PST_0725 apaH apaG TRUE 0.987 -3.000 0.267 NA   NA
 3558488 3558489 PST_0725 PST_0726 apaG ksgA TRUE 0.612 34.000 0.078 NA N NA
 3558489 3558490 PST_0726 PST_0727 ksgA pdxA TRUE 0.554 134.000 0.197 1.000 N NA
 3558490 3558491 PST_0727 PST_0728 pdxA surA TRUE 0.832 110.000 0.561 1.000   NA
 3558491 3558492 PST_0728 PST_0729 surA ostA TRUE 0.729 -67.000 0.070 1.000   NA
 3558493 3558494 PST_0730 PST_0731     TRUE 0.995 -3.000 0.642 NA   NA
 3558494 3558495 PST_0731 PST_0732   djlA TRUE 0.887 2.000 0.019 1.000 N NA
 3558497 3558498 PST_0734 PST_0735   uhpA TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.033 Y NA
 3558498 3558499 PST_0735 PST_0736 uhpA   FALSE 0.390 149.000 0.111 1.000 N NA
 3558499 3558500 PST_0736 PST_0737     TRUE 0.955 48.000 0.556 1.000 Y NA
 3558500 3558501 PST_0737 PST_0738     TRUE 0.910 64.000 0.108 0.051 Y NA
 3558501 3558502 PST_0738 PST_0739     TRUE 0.922 64.000 0.145 0.051 Y NA
 3558502 3558503 PST_0739 PST_0740   gabD-1 TRUE 0.931 13.000 0.167 1.000 N NA
 3558503 3558504 PST_0740 PST_0741 gabD-1 gabT FALSE 0.430 182.000 0.242 1.000 N NA
 3558504 3558505 PST_0741 PST_0742 gabT rpe FALSE 0.072 167.000 0.005 1.000 N NA
 3558505 3558506 PST_0742 PST_0743 rpe gph TRUE 0.974 -3.000 0.120 1.000   NA
 3558506 3558507 PST_0743 PST_0744 gph trpE TRUE 0.759 61.000 0.233 1.000   NA
 3558507 3558508 PST_0744 PST_0745 trpE trpG TRUE 0.998 3.000 0.230 0.001 Y NA
 3558508 3558509 PST_0745 PST_0746 trpG trpD TRUE 0.979 0.000 0.013 1.000 Y NA
 3558509 3558510 PST_0746 PST_0747 trpD trpC TRUE 0.975 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 3558510 3558511 PST_0747 PST_0748 trpC   TRUE 0.643 13.000 0.000 NA   NA
 3558511 3558512 PST_0748 PST_0749     FALSE 0.211 48.000 0.006 NA   NA
 3558515 3558516 PST_0752 PST_0754     FALSE 0.084 174.000 0.016 NA   NA
 3558517 3558518 PST_0753 PST_0755 argC   FALSE 0.233 114.000 0.031 NA   NA
 3558519 3558520 PST_0756 PST_0757 anmK   TRUE 0.833 24.000 0.184 NA N NA
 3558521 3558522 PST_0758 PST_0759 tyrS   FALSE 0.005 569.000 0.000 NA   NA
 3558522 3558523 PST_0759 PST_0760     FALSE 0.204 80.000 0.000 NA   NA
 3558523 3558524 PST_0760 PST_0761     TRUE 0.786 7.000 0.000 NA   NA
 3558524 3558525 PST_0761 PST_0762     FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 3558525 3558526 PST_0762 PST_0762a     FALSE 0.140 123.000 0.000 NA   NA
 3558526 3558527 PST_0762a PST_0763   birA FALSE 0.145 117.000 0.000 NA   NA
 3558527 3558528 PST_0763 PST_0764 birA   TRUE 0.976 -3.000 0.147 1.000 N NA
 3558528 3558529 PST_0764 PST_0765     FALSE 0.385 25.000 0.012 NA   NA
 3558529 3558530 PST_0765 PST_0766     FALSE 0.115 142.000 0.000 NA   NA
 3558530 3558531 PST_0766 PST_0767     FALSE 0.367 26.000 0.000 NA   NA
 3558531 3558532 PST_0767 PST_0768     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3558532 3558533 PST_0768 PST_0769   tuf FALSE 0.196 85.000 0.000 NA   NA
 3558533 3558534 PST_0769 PST_0770 tuf   FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 3558534 3558535 PST_0770 PST_0771   secE FALSE 0.257 43.000 0.000 NA   NA
 3558535 3558536 PST_0771 PST_0772 secE nusG TRUE 0.992 10.000 0.843 1.000 N NA
 3558536 3558537 PST_0772 PST_0773 nusG rplK TRUE 0.858 111.000 0.681 1.000 N NA
 3558537 3558538 PST_0773 PST_0774 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 0.018 Y NA
 3558538 3558539 PST_0774 PST_0775 rplA rplJ TRUE 0.779 210.000 0.302 0.018 Y NA
 3558539 3558540 PST_0775 PST_0776 rplJ rplL TRUE 0.985 81.000 0.884 0.013 Y NA
 3558540 3558541 PST_0776 PST_0777 rplL rpoB FALSE 0.288 213.000 0.223 1.000 N NA
 3558541 3558542 PST_0777 PST_0778 rpoB rpoC TRUE 0.989 66.000 0.851 0.001 Y NA
 3558542 3558543 PST_0778 PST_0779 rpoC rpsL FALSE 0.432 142.000 0.122 1.000 N NA
 3558543 3558544 PST_0779 PST_0780 rpsL rpsG TRUE 0.977 98.000 0.620 0.003 Y NA
 3558544 3558545 PST_0780 PST_0781 rpsG fusA1 TRUE 0.971 31.000 0.579 1.000 Y NA
 3558545 3558546 PST_0781 PST_0782 fusA1 tuf-1 TRUE 0.986 31.000 0.400 0.001 Y NA
 3558546 3558547 PST_0782 PST_0783 tuf-1 rpsJ TRUE 0.822 151.000 0.318 1.000 Y NA
 3558547 3558548 PST_0783 PST_0784 rpsJ rplC TRUE 0.956 83.000 0.307 0.018 Y NA
 3558548 3558549 PST_0784 PST_0785 rplC rplD TRUE 0.996 13.000 0.486 0.013 Y NA
 3558549 3558550 PST_0785 PST_0786 rplD rplW TRUE 0.997 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 3558550 3558551 PST_0786 PST_0787 rplW rplB TRUE 0.993 15.000 0.849 1.000 Y NA
 3558551 3558552 PST_0787 PST_0788 rplB rpsS TRUE 0.996 17.000 0.820 0.018 Y NA
 3558552 3558553 PST_0788 PST_0789 rpsS rplV TRUE 0.997 14.000 0.769 0.018 Y NA
 3558553 3558554 PST_0789 PST_0790 rplV rpsC TRUE 0.997 14.000 0.719 0.018 Y NA
 3558554 3558555 PST_0790 PST_0791 rpsC rplP TRUE 0.998 13.000 0.828 0.018 Y NA
 3558555 3558556 PST_0791 PST_0792 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.013 Y NA
 3558556 3558557 PST_0792 PST_0793 rpmC rpsQ TRUE 0.999 3.000 0.828 0.013 Y NA
 3558557 3558558 PST_0793 PST_0794 rpsQ rplN TRUE 0.993 24.000 0.791 0.018 Y NA
 3558558 3558559 PST_0794 PST_0795 rplN rplX TRUE 0.998 12.000 0.810 0.018 Y NA
 3558559 3558560 PST_0795 PST_0796 rplX rplE TRUE 0.994 20.000 0.758 0.013 Y NA
 3558560 3558561 PST_0796 PST_0797 rplE rpsN TRUE 0.993 14.000 0.309 0.013 Y NA
 3558561 3558562 PST_0797 PST_0798 rpsN rpsH TRUE 0.860 181.000 0.295 0.013 Y NA
 3558562 3558563 PST_0798 PST_0799 rpsH rplF TRUE 0.998 13.000 0.808 0.013 Y NA
 3558563 3558564 PST_0799 PST_0800 rplF rplR TRUE 0.986 65.000 0.815 0.013 Y NA
 3558564 3558565 PST_0800 PST_0801 rplR rpsE TRUE 0.999 4.000 0.814 0.018 Y NA
 3558565 3558566 PST_0801 PST_0802 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.018 Y NA
 3558566 3558567 PST_0802 PST_0803 rpmD rplO TRUE 0.999 4.000 0.653 0.002 Y NA
 3558567 3558568 PST_0803 PST_0804 rplO secY TRUE 0.996 1.000 0.730 1.000 N NA
 3558568 3558569 PST_0804 PST_0805 secY rpmJ TRUE 0.504 30.000 0.036 1.000 N NA
 3558569 3558570 PST_0805 PST_0806 rpmJ rpsM TRUE 0.848 130.000 0.086 0.013 Y NA
 3558570 3558571 PST_0806 PST_0807 rpsM rpsK TRUE 0.991 31.000 0.810 0.013 Y NA
 3558571 3558572 PST_0807 PST_0808 rpsK rpsD TRUE 0.992 18.000 0.509 0.018 Y NA
 3558572 3558573 PST_0808 PST_0809 rpsD rpoA TRUE 0.946 23.000 0.549 1.000 N NA
 3558573 3558574 PST_0809 PST_0810 rpoA rplQ TRUE 0.936 46.000 0.873 1.000 N NA
 3558574 3558575 PST_0810 PST_0811 rplQ katA FALSE 0.076 163.000 0.004 1.000 N NA
 3558577 3558578 PST_0813 PST_0814   ssb FALSE 0.072 177.000 0.011 1.000 N NA
 3558578 3558579 PST_0814 PST_0815 ssb   FALSE 0.023 257.000 0.000 1.000 N NA
 3558579 3558580 PST_0815 PST_0816     TRUE 0.993 -7.000 0.133 0.002 Y NA
 3558582 3558583 PST_0818 PST_0819     TRUE 0.993 -3.000 0.500 NA   NA
 3558583 3558584 PST_0819 PST_0820   exbB2 TRUE 0.990 -7.000 0.091 0.013 Y NA
 3558584 3558585 PST_0820 PST_0821 exbB2 exbD2 TRUE 0.986 18.000 0.333 0.071 Y NA
 3558585 3558586 PST_0821 PST_0822 exbD2   TRUE 0.985 0.000 0.214 1.000 N NA
 3558586 3558587 PST_0822 PST_0823     TRUE 0.991 2.000 0.400 1.000   NA
 3558588 3558589 PST_0824 PST_0825     TRUE 0.970 -3.000 0.114 NA   NA
 3558589 3558590 PST_0825 PST_0826     TRUE 0.997 4.000 0.605 NA Y NA
 3558590 3558591 PST_0826 PST_0827     TRUE 0.933 18.000 0.336 NA   NA
 3558594 3558595 PST_0830 PST_0831     TRUE 0.921 59.000 0.844 NA   NA
 3558596 3558597 PST_0832 PST_0833 ligT   TRUE 0.872 16.000 0.005 1.000 Y NA
 3558598 3558599 PST_0834 PST_0835   ribD TRUE 0.916 18.000 0.277 NA N NA
 3558599 3558600 PST_0835 PST_0836 ribD ribE-1 FALSE 0.211 538.000 0.456 1.000 Y NA
 3558600 3558601 PST_0836 PST_0837 ribE-1 ribBA-1 TRUE 0.965 12.000 0.065 1.000 Y NA
 3558601 3558602 PST_0837 PST_0838 ribBA-1 ribH TRUE 0.903 61.000 0.049 0.002 Y NA
 3558602 3558603 PST_0838 PST_0839 ribH nusB TRUE 0.990 -3.000 0.347 1.000 N NA
 3558603 3558604 PST_0839 PST_0840 nusB thiL TRUE 0.950 13.000 0.225 1.000 N NA
 3558604 3558605 PST_0840 PST_0841 thiL   TRUE 0.734 52.000 0.206 1.000 N NA
 3558605 3558606 PST_0841 PST_0842     FALSE 0.222 90.000 0.000 1.000   NA
 3558606 3558607 PST_0842 PST_0843   ribA TRUE 0.690 13.000 0.000 1.000   NA
 3558607 3558608 PST_0843 PST_0844 ribA   TRUE 0.943 -3.000 0.050 NA   NA
 3558608 3558609 PST_0844 PST_0845     TRUE 0.959 0.000 0.066 NA   NA
 3558610 3558611 PST_0846 PST_0847   sbcC FALSE 0.007 421.000 0.000 1.000 N NA
 3558611 3558612 PST_0847 PST_0848 sbcC sbcD TRUE 0.998 -3.000 0.669 0.002 N NA
 3558612 3558613 PST_0848 PST_0849 sbcD   FALSE 0.003 710.000 0.000 NA N NA
 3558613 3558614 PST_0849 PST_0850     FALSE 0.004 536.000 0.000 NA N NA
 3558614 3558615 PST_0850 PST_0851     TRUE 0.999 -3.000 0.882 1.000 Y NA
 3558615 3558616 PST_0851 PST_0852     TRUE 0.996 0.000 0.762 1.000   NA
 3558616 3558617 PST_0852 PST_0854     TRUE 0.997 10.000 0.619 0.001   NA
 3558620 3558621 PST_0856 PST_0857     FALSE 0.104 151.000 0.000 NA   NA
 3558621 3558622 PST_0857 PST_0858     TRUE 0.488 -46.000 0.015 1.000 N NA
 3558623 3558624 PST_0859 PST_0860     TRUE 0.996 0.000 0.314 1.000 Y NA
 3558624 3558625 PST_0860 PST_0861     FALSE 0.384 56.000 0.039 1.000 N NA
 3558625 3558626 PST_0861 PST_0862     TRUE 0.705 111.000 0.288 1.000 N NA
 3558626 3558627 PST_0862 PST_0863     FALSE 0.020 271.000 0.000 1.000 N NA
 3558630 3558631 PST_0866 PST_0867   ldh FALSE 0.179 254.000 0.059 0.056 N NA
 3558631 3558632 PST_0867 PST_0868 ldh   FALSE 0.290 129.000 0.044 1.000   NA
 3558632 3558633 PST_0868 PST_0869   hpd FALSE 0.009 411.000 0.000 1.000   NA
 3558633 3558634 PST_0869 PST_0870 hpd   FALSE 0.121 191.000 0.044 1.000 N NA
 3558634 3558635 PST_0870 PST_0871     TRUE 0.994 0.000 0.195 1.000 Y NA
 3558635 3558636 PST_0871 PST_0872     TRUE 0.976 -10.000 0.495 1.000 N NA
 3558636 3558637 PST_0872 PST_0873     FALSE 0.318 82.000 0.027 1.000   NA
 3558637 3558638 PST_0873 PST_0874   pctA FALSE 0.068 188.000 0.000 1.000   NA
 3558638 3558639 PST_0874 PST_0875 pctA   FALSE 0.158 124.000 0.016 NA   NA
 3558640 3558641 PST_0876 PST_0877     TRUE 0.883 -3.000 0.024 NA N NA
 3558643 3558644 PST_0879 PST_0880     TRUE 0.801 102.000 0.448 1.000 N NA
 3558644 3558645 PST_0880 PST_0881     FALSE 0.004 1246.000 0.000 1.000   NA
 3558645 3558646 PST_0881 PST_0882     TRUE 0.647 20.000 0.043 NA   NA
 3558647 3558648 PST_0883 PST_0884   tesB TRUE 0.478 38.000 0.042 1.000 N NA
 3558648 3558649 PST_0884 PST_0885 tesB   TRUE 0.581 33.000 0.052 1.000   NA
 3558650 3558651 PST_0886 PST_0887     FALSE 0.336 119.000 0.057 NA   NA
 3558653 3558654 PST_0889 PST_0890 dnrE   TRUE 0.720 103.000 0.286 NA   NA
 3558654 3558655 PST_0890 PST_0891   narL TRUE 0.540 167.000 0.286 NA   NA
 3558655 3558656 PST_0891 PST_0892 narL narX TRUE 0.973 -22.000 0.062 0.033 Y NA
 3558657 3558658 PST_0893 PST_0894 narK   TRUE 0.848 16.000 0.105 NA   NA
 3558658 3558659 PST_0894 PST_0895   narM TRUE 0.972 15.000 0.545 1.000   NA
 3558659 3558660 PST_0895 PST_0896 narM narG TRUE 0.617 106.000 0.182 1.000   NA
 3558660 3558661 PST_0896 PST_0897 narG narH TRUE 0.998 12.000 0.727 0.001 Y NA
 3558661 3558662 PST_0897 PST_0898 narH narJ TRUE 0.999 4.000 0.818 0.002 Y NA
 3558662 3558663 PST_0898 PST_0899 narJ narI TRUE 0.999 -7.000 0.818 0.002 Y NA
 3558663 3558664 PST_0899 PST_0900 narI   TRUE 0.956 4.000 0.091 1.000 N NA
 3558664 3558665 PST_0900 PST_0901   moaA FALSE 0.312 110.000 0.045 1.000 N NA
 3558665 3558666 PST_0901 PST_0902 moaA moaB2 FALSE 0.390 241.000 0.000 0.002 Y NA
 3558666 3558667 PST_0902 PST_0903 moaB2 moeA1 TRUE 0.996 -3.000 0.073 0.002 Y NA
 3558668 3558669 PST_0904 PST_0905     TRUE 0.832 59.000 0.400 1.000 N NA
 3558669 3558670 PST_0905 PST_0906     TRUE 0.997 -6.000 1.000 1.000 Y NA
 3558670 3558671 PST_0906 PST_0907     TRUE 0.577 16.000 0.000 1.000   NA
 3558671 3558672 PST_0907 PST_0908     TRUE 0.959 -3.000 0.068 1.000   NA
 3558672 3558673 PST_0908 PST_0909     TRUE 0.973 -13.000 0.500 NA   NA
 3558673 3558674 PST_0909 PST_0910     TRUE 0.969 16.000 0.610 NA   NA
 3558674 3558675 PST_0910 PST_0911     TRUE 0.979 -34.000 0.923 NA   NA
 3558676 3558677 PST_0912 PST_0913   colR FALSE 0.196 85.000 0.000 NA   NA
 3558677 3558678 PST_0913 PST_0914 colR colS TRUE 0.990 -10.000 0.467 1.000 Y NA
 3558678 3558679 PST_0914 PST_0915 colS   TRUE 0.839 82.000 0.429 1.000   NA
 3558679 3558680 PST_0915 PST_0916     TRUE 0.991 3.000 0.429 1.000   NA
 3558680 3558681 PST_0916 PST_0917     TRUE 0.963 -10.000 0.286 1.000   NA
 3558681 3558682 PST_0917 PST_0918     TRUE 0.977 29.000 0.667 1.000 Y NA
 3558683 3558684 PST_0919 PST_0920 trmA   FALSE 0.448 92.000 0.062 1.000   NA
 3558685 3558686 PST_0921 PST_0922     FALSE 0.202 69.000 0.008 NA   NA
 3558686 3558687 PST_0922 PST_0923     TRUE 0.838 -46.000 0.138 NA   NA
 3558687 3558688 PST_0923 PST_0924     FALSE 0.185 125.000 0.023 NA   NA
 3558688 3558689 PST_0924 PST_0925     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.074 Y NA
 3558689 3558690 PST_0925 PST_0926     TRUE 1.000 -3.000 0.943 0.001 Y NA
 3558692 3558693 PST_0928 PST_0929     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3558694 3558695 PST_0930 PST_0931     TRUE 0.708 57.000 0.183 1.000   NA
 3558695 3558696 PST_0931 PST_0932     TRUE 0.863 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3558698 3558699 PST_0934 PST_0935 gdhA   FALSE 0.010 362.000 0.000 1.000 N NA
 3558699 3558700 PST_0935 PST_0936     TRUE 0.872 13.000 0.073 NA   NA
 3558700 3558701 PST_0936 PST_0937     TRUE 0.977 18.000 0.911 NA   NA
 3558701 3558702 PST_0937 PST_0938     TRUE 0.871 16.000 0.133 NA   NA
 3558702 3558703 PST_0938 PST_0939     FALSE 0.093 162.000 0.004 1.000   NA
 3558704 3558705 PST_0940 PST_0941 glyA   FALSE 0.171 142.000 0.032 NA N NA
 3558705 3558706 PST_0941 PST_0942     FALSE 0.339 57.000 0.033 NA   NA
 3558712 3558713 PST_0948 PST_0949     TRUE 0.630 68.000 0.132 NA   NA
 3558713 3558714 PST_0949 PST_0950     FALSE 0.317 155.000 0.082 NA   NA
 3558714 3558715 PST_0950 PST_0951     FALSE 0.294 88.000 0.031 NA   NA
 3558715 3558716 PST_0951 PST_0952     FALSE 0.304 35.000 0.013 NA   NA
 3558716 3558717 PST_0952 PST_0953   fklB-1 FALSE 0.057 198.000 0.000 1.000   NA
 3558718 3558719 PST_0954 PST_0955   ispB FALSE 0.097 146.000 0.007 NA   NA
 3558720 3558721 PST_0956 PST_0957 rplU rpmA TRUE 0.988 36.000 0.667 0.013 Y NA
 3558721 3558722 PST_0957 PST_0958 rpmA obgE TRUE 0.638 158.000 0.335 1.000   NA
 3558722 3558723 PST_0958 PST_0959 obgE proB TRUE 0.649 107.000 0.206 1.000   NA
 3558723 3558724 PST_0959 PST_0960 proB creA TRUE 0.794 9.000 0.017 NA   NA
 3558726 3558727 PST_0962 PST_0963   ribF TRUE 0.667 85.000 0.169 1.000   NA
 3558727 3558728 PST_0963 PST_0964 ribF ileS TRUE 0.986 2.000 0.254 1.000 N NA
 3558728 3558729 PST_0964 PST_0965 ileS lspA TRUE 0.538 112.000 0.147 1.000 N NA
 3558729 3558730 PST_0965 PST_0966 lspA fkpB TRUE 0.979 -7.000 0.417 1.000 N NA
 3558730 3558731 PST_0966 PST_0967 fkpB ispH FALSE 0.287 306.000 0.626 1.000 N NA
 3558732 3558733 PST_0968 PST_0969 pilE pilY2 TRUE 0.982 -7.000 0.500 NA   NA
 3558733 3558734 PST_0969 PST_0970 pilY2 pilY1 TRUE 0.922 3.000 0.038 NA   NA
 3558734 3558735 PST_0970 PST_0971 pilY1 pilX TRUE 0.666 127.000 0.077 NA Y NA
 3558735 3558736 PST_0971 PST_0972 pilX pilW TRUE 0.995 -3.000 0.667 NA   NA
 3558736 3558737 PST_0972 PST_0973 pilW pilV TRUE 0.983 11.000 0.500 NA   NA
 3558737 3558738 PST_0973 PST_0974 pilV fimU TRUE 0.987 9.000 0.500 NA   NA
 3558738 3558739 PST_0974 PST_0975 fimU fimT TRUE 0.877 94.000 0.667 NA   NA
 3558740 3558741 PST_0976 PST_0977     FALSE 0.094 150.000 0.006 1.000 N NA
 3558741 3558742 PST_0977 PST_0978   speA FALSE 0.193 124.000 0.023 1.000 N NA
 3558743 3558744 PST_0979 PST_0980   dinF TRUE 0.835 3.000 0.009 NA   NA
 3558744 3558745 PST_0980 PST_0981 dinF   FALSE 0.192 97.000 0.015 NA   NA
 3558747 3558748 PST_0983 PST_0984     TRUE 0.576 85.000 0.118 NA   NA
 3558748 3558749 PST_0984 PST_0985     TRUE 0.683 74.000 0.182 NA   NA
 3558749 3558750 PST_0985 PST_0986     TRUE 0.784 19.000 0.087 NA   NA
 3558750 3558751 PST_0986 PST_0987   fruR FALSE 0.297 36.000 0.000 1.000 N NA
 3558752 3558753 PST_0988 PST_0989 fruB fruK TRUE 0.991 0.000 0.101 1.000 Y NA
 3558753 3558754 PST_0989 PST_0990 fruK fruA TRUE 0.984 18.000 0.562 1.000 Y NA
 3558754 3558755 PST_0990 PST_0991 fruA   TRUE 0.519 123.000 0.000 1.000 Y NA
 3558756 3558757 PST_0992 PST_0993   prfC FALSE 0.333 36.000 0.000 1.000   NA
 3558761 3558762 PST_0997 PST_0998     FALSE 0.443 179.000 0.062 NA Y NA
 3558762 3558763 PST_0998 PST_0999     TRUE 0.981 15.000 0.808 NA   NA
 3558763 3558764 PST_0999 PST_1000     TRUE 0.963 25.000 0.848 NA   NA
 3558764 3558765 PST_1000 PST_1001     FALSE 0.364 74.000 0.038 NA   NA
 3558765 3558766 PST_1001 PST_1002     FALSE 0.090 179.000 0.022 NA   NA
 3558767 3558768 PST_1003 PST_1004     TRUE 0.974 34.000 0.682 1.000 Y NA
 3558768 3558769 PST_1004 PST_1005     FALSE 0.269 128.000 0.038 1.000   NA
 3558769 3558770 PST_1005 PST_1006     FALSE 0.109 177.000 0.022 1.000   NA
 3558770 3558771 PST_1006 PST_1007     TRUE 0.785 -19.000 0.053 NA   NA
 3558771 3558772 PST_1007 PST_1008     TRUE 0.781 17.000 0.069 NA   NA
 3558773 3558774 PST_1009 PST_1010     TRUE 0.981 44.000 0.667 0.072 Y NA
 3558774 3558775 PST_1010 PST_1011     TRUE 0.833 71.000 0.400 NA   NA
 3558775 3558776 PST_1011 PST_1012   gatB FALSE 0.226 40.000 0.002 NA   NA
 3558776 3558777 PST_1012 PST_1013 gatB gatA TRUE 0.996 14.000 0.492 0.001 Y NA
 3558777 3558778 PST_1013 PST_1014 gatA gatC TRUE 0.999 0.000 0.643 0.001 Y NA
 3558779 3558780 PST_1015 PST_1016 mreB mreC TRUE 0.815 144.000 0.689 1.000 N NA
 3558780 3558781 PST_1016 PST_1017 mreC mreD TRUE 0.999 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 3558781 3558782 PST_1017 PST_1018 mreD   FALSE 0.065 180.000 0.000 NA   NA
 3558782 3558783 PST_1018 PST_1019   maf-2 FALSE 0.169 100.000 0.000 NA   NA
 3558783 3558784 PST_1019 PST_1020 maf-2 cafA TRUE 0.809 88.000 0.417 NA N NA
 3558784 3558785 PST_1020 PST_1021 cafA   TRUE 0.806 50.000 0.296 NA   NA
 3558785 3558786 PST_1021 PST_1022     TRUE 0.846 44.000 0.358 NA   NA
 3558786 3558787 PST_1022 PST_1023     TRUE 0.985 3.000 0.259 NA   NA
 3558789 3558790 PST_1024 PST_1026   pmbA FALSE 0.276 32.000 0.005 NA   NA
 3558791 3558792 PST_1027 PST_1028 ptsO   TRUE 0.913 15.000 0.182 NA   NA
 3558792 3558793 PST_1028 PST_1029   ptsN TRUE 0.902 16.000 0.186 NA   NA
 3558793 3558794 PST_1029 PST_1030 ptsN rpoX TRUE 0.991 9.000 0.728 NA N NA
 3558794 3558795 PST_1030 PST_1031 rpoX rpoN TRUE 0.913 75.000 0.820 NA N NA
 3558795 3558796 PST_1031 PST_1032 rpoN   FALSE 0.114 282.000 0.163 1.000   NA
 3558796 3558797 PST_1032 PST_1033     TRUE 0.994 0.000 0.543 NA   NA
 3558797 3558798 PST_1033 PST_1034     TRUE 0.970 -13.000 0.459 NA   NA
 3558798 3558799 PST_1034 PST_1035     TRUE 0.852 102.000 0.617 NA   NA
 3558799 3558800 PST_1035 PST_1036     TRUE 0.995 0.000 0.598 1.000   NA
 3558801 3558802 PST_1037 PST_1038 ttg2A ttg2B TRUE 0.993 -7.000 0.530 NA Y NA
 3558802 3558803 PST_1038 PST_1039 ttg2B ttg2C TRUE 0.994 0.000 0.562 NA   NA
 3558803 3558804 PST_1039 PST_1040 ttg2C ttg2D TRUE 0.908 12.000 0.091 NA   NA
 3558804 3558805 PST_1040 PST_1041 ttg2D ttg2E TRUE 0.975 -7.000 0.353 NA   NA
 3558805 3558806 PST_1041 PST_1042 ttg2E   TRUE 0.740 14.000 0.028 1.000   NA
 3558806 3558807 PST_1042 PST_1043   ttg2F FALSE 0.201 92.000 0.015 NA   NA
 3558807 3558808 PST_1043 PST_1044 ttg2F murA TRUE 0.685 104.000 0.258 NA N NA
 3558808 3558809 PST_1044 PST_1045 murA hisG TRUE 0.488 124.000 0.123 1.000 N NA
 3558809 3558810 PST_1045 PST_1046 hisG hisD TRUE 0.569 293.000 0.254 0.004 Y NA
 3558810 3558811 PST_1046 PST_1047 hisD hisC TRUE 0.878 113.000 0.087 0.004 Y NA
 3558813 3558814 PST_1049 PST_1050   cysD FALSE 0.091 189.000 0.030 NA   NA
 3558814 3558815 PST_1050 PST_1051 cysD cysN TRUE 0.978 12.000 0.096 0.001 N NA
 3558819 3558820 PST_1055 PST_1056 pilB pilC TRUE 0.998 2.000 0.362 0.013 Y NA
 3558820 3558821 PST_1056 PST_1057 pilC pilD TRUE 0.997 3.000 0.454 1.000 Y NA
 3558821 3558822 PST_1057 PST_1058 pilD coaE TRUE 0.806 -63.000 0.122 1.000 N NA
 3558823 3558824 PST_1059 PST_1060     FALSE 0.235 57.000 0.008 1.000   NA
 3558825 3558826 PST_1061 PST_1062 rplM rpsI TRUE 0.995 16.000 0.601 0.013 Y NA
 3558826 3558827 PST_1062 PST_1063 rpsI petA FALSE 0.021 255.000 0.006 1.000 N NA
 3558827 3558828 PST_1063 PST_1064 petA petB TRUE 0.998 0.000 0.233 0.001 Y NA
 3558828 3558829 PST_1064 PST_1065 petB petC TRUE 0.999 0.000 0.630 0.001 Y NA
 3558829 3558830 PST_1065 PST_1066 petC sspA TRUE 0.793 86.000 0.370 NA N NA
 3558830 3558831 PST_1066 PST_1067 sspA sspB TRUE 0.987 13.000 0.831 NA   NA
 3558832 3558833 PST_1068 PST_1069   gmhA TRUE 0.994 -3.000 0.613 NA   NA
 3558833 3558834 PST_1069 PST_1070 gmhA   FALSE 0.394 176.000 0.187 1.000 N NA
 3558834 3558835 PST_1070 PST_1071     TRUE 0.983 0.000 0.172 1.000   NA
 3558836 3558837 PST_1072 PST_1073     FALSE 0.004 766.000 0.000 NA   NA
 3558837 3558838 PST_1073 PST_1074   mraW TRUE 0.893 63.000 0.635 NA   NA
 3558838 3558839 PST_1074 PST_1075 mraW ftsL TRUE 0.985 -3.000 0.227 1.000 N NA
 3558839 3558840 PST_1075 PST_1076 ftsL ftsI TRUE 0.979 0.000 0.153 1.000 N NA
 3558840 3558841 PST_1076 PST_1077 ftsI murE TRUE 0.989 0.000 0.073 1.000 Y NA
 3558841 3558842 PST_1077 PST_1078 murE murF TRUE 0.998 -7.000 0.569 0.002 Y NA
 3558842 3558843 PST_1078 PST_1079 murF mraY TRUE 0.999 0.000 0.309 0.004 Y NA
 3558843 3558844 PST_1079 PST_1080 mraY murD TRUE 0.999 7.000 0.647 0.004 Y NA
 3558844 3558845 PST_1080 PST_1081 murD ftsW TRUE 0.996 0.000 0.297 0.003 N NA
 3558845 3558846 PST_1081 PST_1082 ftsW murG TRUE 0.983 -10.000 0.647 1.000 N NA
 3558846 3558847 PST_1082 PST_1083 murG murC TRUE 0.989 -7.000 0.283 1.000 Y NA
 3558847 3558848 PST_1083 PST_1084 murC ddl TRUE 0.997 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 3558848 3558849 PST_1084 PST_1085 ddl ftsQ TRUE 0.995 4.000 0.372 NA Y NA
 3558849 3558850 PST_1085 PST_1086 ftsQ ftsA TRUE 0.967 13.000 0.389 NA N NA
 3558850 3558851 PST_1086 PST_1087 ftsA ftsZ TRUE 0.944 49.000 0.460 1.000 Y NA
 3558851 3558852 PST_1087 PST_1088 ftsZ lpxC TRUE 0.516 116.000 0.134 1.000 N NA
 3558852 3558853 PST_1088 PST_1089 lpxC   FALSE 0.108 151.000 0.000 1.000 N NA
 3558854 3558855 PST_1090 PST_1091     FALSE 0.038 226.000 0.000 1.000   NA
 3558855 3558856 PST_1091 PST_1092   osmE TRUE 0.487 52.000 0.056 1.000   NA
 3558856 3558857 PST_1092 PST_1093 osmE   FALSE 0.420 58.000 0.042 1.000   NA
 3558857 3558858 PST_1093 PST_1094     TRUE 0.601 24.000 0.042 NA   NA
 3558858 3558859 PST_1094 PST_1095     FALSE 0.396 59.000 0.043 NA   NA
 3558859 3558860 PST_1095 PST_1096     FALSE 0.146 157.000 0.027 NA   NA
 3558860 3558861 PST_1096 PST_1097     FALSE 0.265 91.000 0.027 NA   NA
 3558861 3558862 PST_1097 PST_1098     FALSE 0.009 366.000 0.000 NA   NA
 3558865 3558866 PST_1101 PST_1102   mqoB FALSE 0.019 407.000 0.050 NA   NA
 3558872 3558873 PST_1107 PST_1109     TRUE 0.991 0.000 0.364 NA   NA
 3558873 3558874 PST_1109 PST_1110     TRUE 0.974 11.000 0.320 NA   NA
 3558877 3558878 PST_1114 PST_1115     FALSE 0.183 85.000 0.008 NA   NA
 3558878 3558879 PST_1115 PST_1116   rsmC FALSE 0.021 262.000 0.000 NA   NA
 3558879 3558880 PST_1116 PST_1117 rsmC hprA FALSE 0.398 72.000 0.042 1.000 N NA
 3558881 3558882 PST_1118 PST_1119   alkK-1 TRUE 0.530 98.000 0.114 1.000 N NA
 3558884 3558885 PST_1121 PST_1122     FALSE 0.175 139.000 0.021 1.000   NA
 3558885 3558886 PST_1122 PST_1123     FALSE 0.112 148.000 0.000 1.000 N NA
 3558886 3558887 PST_1123 PST_1124     TRUE 0.902 127.000 0.200 0.025 Y NA
 3558888 3558889 PST_1125 PST_1126   pta TRUE 0.723 133.000 0.170 0.062   NA
 3558889 3558890 PST_1126 PST_1127 pta   FALSE 0.234 165.000 0.057 1.000   NA
 3558891 3558892 PST_1128 PST_1129 slyD   TRUE 0.570 115.000 0.024 1.000 Y NA
 3558892 3558893 PST_1129 PST_1130     FALSE 0.056 200.000 0.018 1.000 N NA
 3558893 3558894 PST_1130 PST_1131     TRUE 0.742 20.000 0.070 1.000 N NA
 3558895 3558896 PST_1132 PST_1133 cysZ   FALSE 0.037 213.000 0.000 NA   NA
 3558896 3558897 PST_1133 PST_1134     TRUE 0.970 0.000 0.097 NA   NA
 3558897 3558898 PST_1134 PST_1135   folX TRUE 0.552 38.000 0.061 NA   NA
 3558898 3558899 PST_1135 PST_1136 folX   TRUE 0.577 18.000 0.024 1.000 N NA
 3558899 3558900 PST_1136 PST_1137     FALSE 0.387 67.000 0.040 NA   NA
 3558901 3558902 PST_1138 PST_1139     FALSE 0.254 107.000 0.032 1.000 N NA
 3558903 3558904 PST_1140 PST_1141     FALSE 0.435 39.000 0.036 NA   NA
 3558904 3558905 PST_1141 PST_1142     TRUE 0.988 1.000 0.286 NA   NA
 3558906 3558907 PST_1143 PST_1144     FALSE 0.100 258.000 0.000 0.062   NA
 3558907 3558908 PST_1144 PST_1145     TRUE 0.549 -51.000 0.021 1.000   NA
 3558908 3558909 PST_1145 PST_1146     FALSE 0.261 40.000 0.010 NA   NA
 3558911 3558912 PST_1148 PST_1149     FALSE 0.385 -94.000 0.000 1.000 N NA
 3558914 3558915 PST_1151 PST_1152     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3558915 3558916 PST_1152 PST_1153     FALSE 0.277 38.000 0.000 NA   NA
 3558917 3558918 PST_1154 PST_1155     TRUE 0.980 -3.000 0.182 NA   NA
 3558918 3558919 PST_1155 PST_1156     TRUE 0.994 -3.000 0.583 NA   NA
 3558919 3558920 PST_1156 PST_1157     TRUE 0.997 -3.000 0.955 NA   NA
 3558920 3558921 PST_1157 PST_1158     TRUE 0.904 -13.000 0.129 NA   NA
 3558921 3558922 PST_1158 PST_1159     TRUE 0.995 -3.000 0.708 NA   NA
 3558924 3558925 PST_1161 PST_1162 mvaT   FALSE 0.027 242.000 0.000 NA   NA
 3558925 3558926 PST_1162 PST_1163     FALSE 0.177 112.000 0.000 1.000   NA
 3558926 3558927 PST_1163 PST_1164     FALSE 0.005 594.000 0.000 1.000   NA
 3558928 3558929 PST_1165 PST_1166 purU   TRUE 0.885 16.000 0.157 NA   NA
 3558929 3558930 PST_1166 PST_1167     FALSE 0.378 22.000 0.007 NA   NA
 3558931 3558932 PST_1168 PST_1169   algA FALSE 0.062 183.000 0.000 NA   NA
 3558932 3558933 PST_1169 PST_1170 algA   FALSE 0.004 739.000 0.000 NA   NA
 3558934 3558935 PST_1171 PST_1172     FALSE 0.023 258.000 0.000 1.000 N NA
 3558935 3558936 PST_1172 PST_1173   moaC FALSE 0.177 103.000 0.013 1.000 N NA
 3558936 3558937 PST_1173 PST_1174 moaC moaD TRUE 0.993 -3.000 0.175 1.000 Y NA
 3558937 3558938 PST_1174 PST_1175 moaD moaE TRUE 0.997 3.000 0.501 1.000 Y NA
 3558939 3558940 PST_1176 PST_1177   rhlB FALSE 0.117 143.000 0.013 NA   NA
 3558940 3558941 PST_1177 PST_1178 rhlB   FALSE 0.131 178.000 0.031 1.000   NA
 3558942 3558943 PST_1179 PST_1180   purL FALSE 0.160 113.000 0.007 1.000   NA
 3558944 3558945 PST_1181 PST_1182     FALSE 0.137 125.000 0.000 NA   NA
 3558945 3558946 PST_1182 PST_1183     TRUE 0.518 47.000 0.065 NA   NA
 3558947 3558948 PST_1184 PST_1185     FALSE 0.433 113.000 0.078 1.000   NA
 3558948 3558949 PST_1185 PST_1186     TRUE 0.952 -3.000 0.062 NA   NA
 3558949 3558950 PST_1186 PST_1187   purT TRUE 0.682 48.000 0.154 NA   NA
 3558951 3558952 PST_1188 PST_1189     TRUE 0.935 18.000 0.349 NA   NA
 3558953 3558954 PST_1190 PST_1191 ffh rpsP TRUE 0.466 195.000 0.361 1.000 N NA
 3558954 3558955 PST_1191 PST_1192 rpsP rimM TRUE 0.998 6.000 0.342 0.013 Y NA
 3558955 3558956 PST_1192 PST_1193 rimM trmD TRUE 0.997 6.000 0.672 1.000 Y NA
 3558956 3558957 PST_1193 PST_1194 trmD rplS TRUE 0.958 46.000 0.567 1.000 Y NA
 3558957 3558958 PST_1194 PST_1195 rplS xerD FALSE 0.072 182.000 0.015 1.000 N NA
 3558958 3558959 PST_1195 PST_1196 xerD dsbC FALSE 0.164 147.000 0.026 1.000 N NA
 3558959 3558960 PST_1196 PST_1197 dsbC   FALSE 0.310 105.000 0.037 1.000   NA
 3558960 3558961 PST_1197 PST_1198   hom FALSE 0.154 112.000 0.004 1.000   NA
 3558961 3558962 PST_1198 PST_1199 hom thrC TRUE 0.835 72.000 0.125 1.000 Y NA
 3558963 3558964 PST_1200 PST_1201 rnt pyrC TRUE 0.494 60.000 0.068 1.000 N NA
 3558965 3558966 PST_1202 PST_1203   argG FALSE 0.212 85.000 0.013 1.000 N NA
 3558966 3558967 PST_1203 PST_1204 argG gloA1 TRUE 0.571 96.000 0.006 1.000 Y NA
 3558968 3558969 PST_1205 PST_1206   nth FALSE 0.152 109.000 0.012 NA   NA
 3558969 3558970 PST_1206 PST_1207 nth   TRUE 0.932 11.000 0.109 1.000 N NA
 3558970 3558971 PST_1207 PST_1208     TRUE 0.999 -3.000 0.908 0.072 Y NA
 3558971 3558972 PST_1208 PST_1209     TRUE 0.999 2.000 0.924 0.072 Y NA
 3558972 3558973 PST_1209 PST_1210     TRUE 0.972 108.000 0.814 0.072 Y NA
 3558973 3558974 PST_1210 PST_1211     TRUE 0.999 -3.000 0.537 0.027 Y NA
 3558974 3558975 PST_1211 PST_1212     TRUE 0.999 -3.000 0.564 0.072 Y NA
 3558975 3558976 PST_1212 PST_1213     FALSE 0.004 663.000 0.000 1.000 N NA
 3558976 3558977 PST_1213 PST_1214     TRUE 0.989 34.000 0.627 0.003 Y NA
 3558977 3558978 PST_1214 PST_1215     FALSE 0.232 157.000 0.059 NA N NA
 3558980 3558981 PST_1217 PST_1218     FALSE 0.235 143.000 0.043 NA   NA
 3558981 3558982 PST_1218 PST_1219     FALSE 0.257 108.000 0.034 NA   NA
 3558983 3558984 PST_1220 PST_1221     TRUE 0.686 -16.000 0.027 NA   NA
 3558986 3558987 PST_1223 PST_1224 algU mucA TRUE 0.984 -10.000 0.705 NA N NA
 3558987 3558988 PST_1224 PST_1225 mucA mucB TRUE 0.997 9.000 0.856 NA Y NA
 3558988 3558989 PST_1225 PST_1226 mucB mucC TRUE 0.998 -3.000 0.609 NA Y NA
 3558989 3558990 PST_1226 PST_1227 mucC mucD TRUE 0.780 36.000 0.206 NA N NA
 3558990 3558991 PST_1227 PST_1228 mucD lepA FALSE 0.084 180.000 0.020 1.000 N NA
 3558991 3558992 PST_1228 PST_1229 lepA lepB TRUE 0.981 2.000 0.187 1.000 N NA
 3558992 3558993 PST_1229 PST_1230 lepB   TRUE 0.572 93.000 0.133 NA   NA
 3558993 3558994 PST_1230 PST_1231   rnc FALSE 0.339 60.000 0.033 NA   NA
 3558994 3558995 PST_1231 PST_1232 rnc era TRUE 0.963 -13.000 0.127 0.042   NA
 3558995 3558996 PST_1232 PST_1233 era recO TRUE 0.751 28.000 0.109 1.000   NA
 3558996 3558997 PST_1233 PST_1234 recO pdxJ TRUE 0.947 -7.000 0.166 1.000 N NA
 3558998 3558999 PST_1235 PST_1236     TRUE 0.579 -15.000 0.009 NA   NA
 3558999 3559000 PST_1236 PST_1237     FALSE 0.006 431.000 0.000 NA   NA
 3559000 3559001 PST_1237 PST_1238     TRUE 0.931 -36.000 0.315 NA   NA
 3559001 3559002 PST_1238 PST_1239     TRUE 0.629 -21.000 0.021 NA   NA
 3559002 3559003 PST_1239 PST_1240   lon-1 FALSE 0.278 120.000 0.041 NA   NA
 3559004 3559005 PST_1241 PST_1242   putA FALSE 0.021 264.000 0.000 1.000 N NA
 3559005 3559006 PST_1242 PST_1243 putA putP-1 FALSE 0.009 424.000 0.020 1.000 N NA
 3559008 3559009 PST_1245 PST_1246   putP-2 TRUE 0.695 12.000 0.000 1.000 N NA
 3559011 3559012 PST_1248 PST_1249 pcaQ pcaH TRUE 0.820 111.000 0.153 0.001 N NA
 3559012 3559013 PST_1249 PST_1250 pcaH pcaG TRUE 0.998 13.000 0.782 0.001 Y NA
 3559013 3559014 PST_1250 PST_1251 pcaG   TRUE 0.700 -10.000 0.019 NA   NA
 3559014 3559015 PST_1251 PST_1252     FALSE 0.227 113.000 0.029 NA   NA
 3559015 3559016 PST_1252 PST_1253   pcaR FALSE 0.258 69.000 0.000 1.000   NA
 3559016 3559017 PST_1253 PST_1254 pcaR pcaI TRUE 0.468 102.000 0.087 1.000 N NA
 3559017 3559018 PST_1254 PST_1255 pcaI pcaJ TRUE 0.999 0.000 0.739 0.001 Y NA
 3559018 3559019 PST_1255 PST_1256 pcaJ pcaF TRUE 0.996 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 3559019 3559020 PST_1256 PST_1257 pcaF pcaB FALSE 0.228 223.000 0.000 0.001 N NA
 3559020 3559021 PST_1257 PST_1258 pcaB pcaD TRUE 0.923 9.000 0.063 1.000   NA
 3559021 3559022 PST_1258 PST_1259 pcaD pcaC TRUE 0.642 96.000 0.174 1.000   NA
 3559023 3559024 PST_1260 PST_1261     FALSE 0.204 80.000 0.000 NA   NA
 3559024 3559025 PST_1261 PST_1262   metG FALSE 0.118 264.000 0.000 1.000 Y NA
 3559029 3559030 PST_1266 PST_1267 napC napB TRUE 0.979 11.000 0.143 NA Y NA
 3559030 3559031 PST_1267 PST_1268 napB napA TRUE 0.994 12.000 0.643 NA Y NA
 3559031 3559032 PST_1268 PST_1269 napA napD TRUE 0.970 0.000 0.106 NA N NA
 3559032 3559033 PST_1269 PST_1270 napD napE TRUE 0.913 12.000 0.109 NA N NA
 3559035 3559036 PST_1272 PST_1273     FALSE 0.233 64.000 0.014 NA   NA
 3559036 3559037 PST_1273 PST_1274     FALSE 0.362 163.000 0.125 NA   NA
 3559037 3559038 PST_1274 PST_1275     FALSE 0.313 140.000 0.066 NA   NA
 3559039 3559040 PST_1276 PST_1277   aroF-2 FALSE 0.004 556.000 0.000 NA N NA
 3559040 3559041 PST_1277 PST_1278 aroF-2   FALSE 0.338 109.000 0.053 1.000 N NA
 3559041 3559042 PST_1278 PST_1279     FALSE 0.298 59.000 0.026 NA   NA
 3559042 3559043 PST_1279 PST_1280     TRUE 0.782 106.000 0.429 NA   NA
 3559043 3559044 PST_1280 PST_1281   cydA1 FALSE 0.005 520.000 0.000 NA   NA
 3559044 3559045 PST_1281 PST_1282 cydA1 cydB1 TRUE 0.992 -55.000 0.727 0.072 Y NA
 3559045 3559046 PST_1282 PST_1283 cydB1   TRUE 0.772 9.000 0.000 1.000 N NA
 3559046 3559047 PST_1283 PST_1284     FALSE 0.363 -139.000 0.000 NA   NA
 3559047 3559048 PST_1284 PST_1285     FALSE 0.003 1230.000 0.000 NA   NA
 3559048 3559049 PST_1285 PST_1286     TRUE 0.967 77.000 0.909 NA Y NA
 3559049 3559050 PST_1286 PST_1287     FALSE 0.167 188.000 0.071 NA N NA
 3559052 3559053 PST_1289 PST_1290     TRUE 0.592 47.000 0.091 NA   NA
 3559053 3559054 PST_1290 PST_1291   cobO TRUE 0.898 -3.000 0.024 NA   NA
 3559054 3559055 PST_1291 PST_1292 cobO cobB TRUE 0.816 133.000 0.054 0.006 Y NA
 3559055 3559056 PST_1292 PST_1293 cobB   TRUE 0.514 66.000 0.071 1.000 N NA
 3559056 3559057 PST_1293 PST_1294     TRUE 0.884 -3.000 0.018 1.000 N NA
 3559057 3559058 PST_1294 PST_1295   cobD TRUE 0.893 -3.000 0.021 1.000 N NA
 3559058 3559059 PST_1295 PST_1296 cobD cobC TRUE 0.993 -7.000 0.463 0.006 N NA
 3559059 3559060 PST_1296 PST_1297 cobC cobQ TRUE 0.981 -3.000 0.033 0.006 N NA
 3559060 3559061 PST_1297 PST_1298 cobQ cobU TRUE 0.987 3.000 0.079 1.000 Y NA
 3559061 3559062 PST_1298 PST_1299 cobU cobT TRUE 0.993 0.000 0.138 1.000 Y NA
 3559062 3559063 PST_1299 PST_1300 cobT   TRUE 0.745 -63.000 0.090 NA N NA
 3559063 3559064 PST_1300 PST_1301   cobS TRUE 0.773 10.000 0.021 NA N NA
 3559065 3559066 PST_1302 PST_1303     TRUE 0.765 5.000 0.010 NA N NA
 3559066 3559067 PST_1303 PST_1304   nifQ TRUE 0.880 -3.000 0.017 NA   NA
 3559067 3559068 PST_1304 PST_1305 nifQ   TRUE 0.957 -3.000 0.062 1.000   NA
 3559068 3559069 PST_1305 PST_1305a   fdxN TRUE 0.966 11.000 0.086 0.072   NA
 3559069 3559070 PST_1305a PST_1306 fdxN nifB TRUE 0.863 12.000 0.047 1.000   NA
 3559076 3559077 PST_1312 PST_1313 tpmA nifA FALSE 0.199 101.000 0.000 1.000   NA
 3559077 3559078 PST_1313 PST_1314 nifA nifL TRUE 0.985 15.000 0.214 0.084 Y NA
 3559079 3559080 PST_1315 PST_1316 rnfA rnfB TRUE 0.924 38.000 0.098 0.072 Y NA
 3559080 3559081 PST_1316 PST_1317 rnfB rnfC TRUE 0.926 43.000 0.092 0.027 Y NA
 3559081 3559082 PST_1317 PST_1318 rnfC rnfD TRUE 0.999 -3.000 0.905 0.072 Y NA
 3559082 3559083 PST_1318 PST_1319 rnfD rnfG TRUE 0.999 -3.000 0.900 0.072 Y NA
 3559083 3559084 PST_1319 PST_1320 rnfG rnfE TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.072 Y NA
 3559084 3559085 PST_1320 PST_1321 rnfE rnfH TRUE 0.917 26.000 0.419 NA   NA
 3559085 3559086 PST_1321 PST_1322 rnfH nifY2 FALSE 0.265 41.000 0.000 NA   NA
 3559086 3559087 PST_1322 PST_1323 nifY2   TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559088 3559089 PST_1324 PST_1325     TRUE 0.685 28.000 0.080 NA   NA
 3559090 3559091 PST_1326 PST_1327 nifH nifD TRUE 0.644 112.000 0.026 0.001 N NA
 3559091 3559092 PST_1327 PST_1328 nifD nifK TRUE 0.986 103.000 0.902 0.001 Y NA
 3559092 3559093 PST_1328 PST_1329 nifK nifT TRUE 0.789 92.000 0.100 0.004 N NA
 3559093 3559094 PST_1329 PST_1330 nifT nifY TRUE 0.910 4.000 0.038 NA   NA
 3559094 3559095 PST_1330 PST_1331 nifY   TRUE 0.974 -3.000 0.136 NA   NA
 3559095 3559096 PST_1331 PST_1332     FALSE 0.158 256.000 0.182 NA   NA
 3559096 3559097 PST_1332 PST_1333   nifE FALSE 0.009 412.000 0.000 1.000   NA
 3559097 3559098 PST_1333 PST_1334 nifE nifN TRUE 0.998 11.000 0.475 0.002 Y NA
 3559098 3559099 PST_1334 PST_1335 nifN nifX TRUE 0.926 4.000 0.048 NA   NA
 3559099 3559100 PST_1335 PST_1336 nifX   TRUE 0.764 29.000 0.143 NA   NA
 3559100 3559101 PST_1336 PST_1337     TRUE 0.950 15.000 0.321 NA   NA
 3559101 3559102 PST_1337 PST_1338     TRUE 0.505 83.000 0.080 NA   NA
 3559102 3559103 PST_1338 PST_1339     TRUE 0.836 13.000 0.053 NA   NA
 3559103 3559104 PST_1339 PST_1340     TRUE 0.826 4.000 0.000 NA   NA
 3559104 3559105 PST_1340 PST_1341     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3559105 3559106 PST_1341 PST_1342     TRUE 0.909 -7.000 0.080 NA   NA
 3559106 3559107 PST_1342 PST_1343     TRUE 0.961 -3.000 0.080 NA   NA
 3559108 3559109 PST_1344 PST_1345   modC FALSE 0.140 109.000 0.008 NA   NA
 3559109 3559110 PST_1345 PST_1346 modC modB TRUE 0.995 13.000 0.308 0.001 Y NA
 3559110 3559111 PST_1346 PST_1347 modB modA TRUE 0.999 7.000 0.660 0.001 Y NA
 3559111 3559112 PST_1347 PST_1348 modA   TRUE 0.963 12.000 0.031 0.001   NA
 3559113 3559114 PST_1349 PST_1350 hesB nifU TRUE 0.725 62.000 0.210 NA   NA
 3559114 3559115 PST_1350 PST_1351 nifU nifS TRUE 0.995 2.000 0.716 1.000 N NA
 3559115 3559116 PST_1351 PST_1352 nifS nifV TRUE 0.922 41.000 0.250 1.000 Y NA
 3559116 3559117 PST_1352 PST_1353 nifV cysE TRUE 0.994 -3.000 0.198 1.000 Y NA
 3559117 3559118 PST_1353 PST_1354 cysE   TRUE 0.962 13.000 0.286 1.000   NA
 3559118 3559119 PST_1354 PST_1355   nifW TRUE 0.964 -3.000 0.078 1.000   NA
 3559119 3559120 PST_1355 PST_1356 nifW nifZ TRUE 0.935 20.000 0.111 0.004   NA
 3559120 3559121 PST_1356 PST_1357 nifZ nifM TRUE 0.984 -10.000 0.643 1.000   NA
 3559121 3559122 PST_1357 PST_1358 nifM clpX TRUE 0.991 -3.000 0.004 0.007 Y NA
 3559122 3559123 PST_1358 PST_1359 clpX nifF FALSE 0.038 200.000 0.002 1.000 N NA
 3559123 3559124 PST_1359 PST_1360 nifF   FALSE 0.059 187.000 0.000 1.000 N NA
 3559125 3559126 PST_1361 PST_1362     FALSE 0.046 197.000 0.008 1.000 N NA
 3559127 3559128 PST_1363 PST_1364 rnd   TRUE 0.958 -3.000 0.073 NA   NA
 3559128 3559129 PST_1364 PST_1365     FALSE 0.209 91.000 0.016 NA   NA
 3559129 3559130 PST_1365 PST_1366     FALSE 0.159 97.000 0.008 NA   NA
 3559130 3559131 PST_1366 PST_1367     FALSE 0.347 73.000 0.034 NA   NA
 3559131 3559132 PST_1367 PST_1368     FALSE 0.352 43.000 0.021 1.000   NA
 3559132 3559133 PST_1368 PST_1369   alaS FALSE 0.177 93.000 0.009 1.000 N NA
 3559133 3559134 PST_1369 PST_1370 alaS lysC TRUE 0.469 80.000 0.065 1.000 N NA
 3559134 3559135 PST_1370 PST_1371 lysC csrA FALSE 0.218 181.000 0.079 1.000 N NA
 3559135 3559136 PST_1371 PST_1372 csrA   FALSE 0.217 63.000 0.000 NA   NA
 3559136 3559137 PST_1372 PST_1373     FALSE 0.150 111.000 0.000 NA   NA
 3559137 3559138 PST_1373 PST_1374     FALSE 0.218 70.000 0.000 NA   NA
 3559140 3559141 PST_1376 PST_1377 mgtE   FALSE 0.033 406.000 0.000 0.061 N NA
 3559141 3559142 PST_1377 PST_1378     TRUE 0.999 11.000 0.886 0.001 Y NA
 3559143 3559144 PST_1379 PST_1380 algZ   FALSE 0.103 152.000 0.000 NA   NA
 3559146 3559147 PST_1382 PST_1383     FALSE 0.215 60.000 0.000 NA   NA
 3559147 3559148 PST_1383 PST_1384   flgM FALSE 0.008 403.000 0.000 NA   NA
 3559148 3559149 PST_1384 PST_1385 flgM flgA TRUE 0.879 117.000 0.371 NA Y NA
 3559150 3559151 PST_1386 PST_1387 cheV-3 cheR TRUE 0.944 127.000 0.838 1.000 Y NA
 3559151 3559152 PST_1387 PST_1388 cheR flgB FALSE 0.403 189.000 0.059 1.000 Y NA
 3559152 3559153 PST_1388 PST_1389 flgB flgC TRUE 0.986 56.000 0.800 0.004 Y NA
 3559153 3559154 PST_1389 PST_1390 flgC flgD TRUE 0.979 13.000 0.207 NA Y NA
 3559154 3559155 PST_1390 PST_1391 flgD flgE TRUE 0.986 23.000 0.875 NA Y NA
 3559155 3559156 PST_1391 PST_1392 flgE flgF FALSE 0.456 327.000 0.594 1.000 Y NA
 3559156 3559157 PST_1392 PST_1393 flgF flgG TRUE 0.968 43.000 0.207 0.001 Y NA
 3559157 3559158 PST_1393 PST_1394 flgG flgH TRUE 0.981 72.000 0.632 0.006 Y NA
 3559158 3559159 PST_1394 PST_1395 flgH flgI TRUE 0.984 15.000 0.128 0.008 Y NA
 3559159 3559160 PST_1395 PST_1396 flgI flgJ TRUE 0.994 15.000 0.405 0.008 Y NA
 3559160 3559161 PST_1396 PST_1397 flgJ flgK TRUE 0.999 4.000 0.705 0.002 Y NA
 3559161 3559162 PST_1397 PST_1398 flgK flgL TRUE 0.989 12.000 0.057 0.001 Y NA
 3559162 3559163 PST_1398 PST_1399 flgL   FALSE 0.054 190.000 0.000 NA   NA
 3559163 3559164 PST_1399 PST_1400   cysC FALSE 0.006 467.000 0.000 NA   NA
 3559164 3559165 PST_1400 PST_1401 cysC   FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 3559165 3559166 PST_1401 PST_1402     FALSE 0.219 55.000 0.000 NA   NA
 3559166 3559167 PST_1402 PST_1403     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559167 3559168 PST_1403 PST_1404   fliC FALSE 0.031 226.000 0.000 NA   NA
 3559168 3559169 PST_1404 PST_1405 fliC   TRUE 0.670 67.000 0.025 NA Y NA
 3559169 3559170 PST_1405 PST_1406     TRUE 0.713 128.000 0.117 NA Y NA
 3559170 3559171 PST_1406 PST_1407     FALSE 0.134 129.000 0.000 1.000 N NA
 3559171 3559172 PST_1407 PST_1408     FALSE 0.008 398.000 0.000 NA   NA
 3559172 3559173 PST_1408 PST_1409     TRUE 0.704 159.000 0.500 NA   NA
 3559173 3559174 PST_1409 PST_1410     TRUE 0.960 18.000 0.562 NA   NA
 3559174 3559175 PST_1410 PST_1411     TRUE 0.809 51.000 0.312 NA   NA
 3559176 3559177 PST_1412 PST_1414   prc FALSE 0.010 452.000 0.029 1.000 N NA
 3559179 3559180 PST_1415 PST_1416     FALSE 0.420 21.000 0.000 NA   NA
 3559180 3559181 PST_1416 PST_1417     TRUE 0.983 -7.000 0.522 NA   NA
 3559181 3559182 PST_1417 PST_1418     FALSE 0.299 43.000 0.000 1.000   NA
 3559182 3559183 PST_1418 PST_1419     TRUE 0.995 -3.000 0.722 NA   NA
 3559183 3559184 PST_1419 PST_1420     TRUE 0.988 5.000 0.426 NA   NA
 3559184 3559185 PST_1420 PST_1421     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3559185 3559186 PST_1421 PST_1422   rluA FALSE 0.147 148.000 0.022 1.000 N NA
 3559186 3559187 PST_1422 PST_1423 rluA minE FALSE 0.119 105.000 0.008 NA N NA
 3559187 3559188 PST_1423 PST_1424 minE minD TRUE 0.998 -3.000 0.618 NA Y NA
 3559188 3559189 PST_1424 PST_1425 minD minC TRUE 0.537 263.000 0.466 1.000 Y NA
 3559191 3559192 PST_1427 PST_1428     FALSE 0.190 95.000 0.014 NA   NA
 3559192 3559193 PST_1428 PST_1429     TRUE 0.957 -7.000 0.204 NA   NA
 3559193 3559194 PST_1429 PST_1430     FALSE 0.103 193.000 0.038 NA   NA
 3559195 3559196 PST_1431 PST_1432     TRUE 0.996 0.000 0.733 NA   NA
 3559196 3559197 PST_1432 PST_1433     FALSE 0.035 236.000 0.000 1.000   NA
 3559197 3559198 PST_1433 PST_1434     TRUE 0.519 104.000 0.107 1.000   NA
 3559198 3559199 PST_1434 PST_1435     TRUE 0.683 113.000 0.267 NA   NA
 3559200 3559201 PST_1436 PST_1437     FALSE 0.405 44.000 0.036 NA   NA
 3559201 3559202 PST_1437 PST_1438     FALSE 0.217 197.000 0.125 NA N NA
 3559202 3559203 PST_1438 PST_1439     TRUE 0.759 126.000 0.471 NA N NA
 3559203 3559204 PST_1439 PST_1440   asnB TRUE 0.768 138.000 0.514 1.000 N NA
 3559206 3559207 PST_1442 PST_1443     TRUE 0.962 4.000 0.111 NA   NA
 3559207 3559208 PST_1443 PST_1444     TRUE 0.963 3.000 0.097 NA   NA
 3559210 3559211 PST_1446 PST_1448     TRUE 0.884 10.000 0.048 NA   NA
 3559213 3559214 PST_1449 PST_1450     FALSE 0.008 391.000 0.000 NA   NA
 3559214 3559215 PST_1450 PST_1451     TRUE 0.674 79.000 0.182 NA   NA
 3559215 3559216 PST_1451 PST_1452     FALSE 0.329 119.000 0.056 NA   NA
 3559216 3559217 PST_1452 PST_1453     FALSE 0.415 85.000 0.056 NA   NA
 3559218 3559219 PST_1454 PST_1455     FALSE 0.432 156.000 0.016 1.000 Y NA
 3559219 3559220 PST_1455 PST_1456     TRUE 0.525 -19.000 0.006 NA   NA
 3559221 3559222 PST_1457 PST_1458     TRUE 0.844 5.000 0.020 NA   NA
 3559223 3559224 PST_1459 PST_1460     FALSE 0.039 210.000 0.000 NA   NA
 3559224 3559225 PST_1460 PST_1461     TRUE 0.976 -3.000 0.154 NA   NA
 3559225 3559226 PST_1461 PST_1462     TRUE 0.992 -3.000 0.462 NA   NA
 3559226 3559227 PST_1462 PST_1463     FALSE 0.199 84.000 0.000 NA   NA
 3559227 3559228 PST_1463 PST_1464     FALSE 0.194 86.000 0.000 NA   NA
 3559228 3559229 PST_1464 PST_1465     FALSE 0.336 29.000 0.000 NA   NA
 3559229 3559230 PST_1465 PST_1466     FALSE 0.183 92.000 0.000 NA   NA
 3559230 3559231 PST_1466 PST_1467   hsdR FALSE 0.086 164.000 0.000 NA   NA
 3559231 3559232 PST_1467 PST_1468 hsdR   FALSE 0.220 69.000 0.000 NA   NA
 3559232 3559233 PST_1468 PST_1469     FALSE 0.109 147.000 0.000 NA   NA
 3559233 3559234 PST_1469 PST_1470     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3559234 3559235 PST_1470 PST_1471   hsdS TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3559235 3559236 PST_1471 PST_1472 hsdS   TRUE 0.500 17.000 0.000 NA   NA
 3559236 3559237 PST_1472 PST_1473     FALSE 0.369 42.000 0.029 NA   NA
 3559237 3559238 PST_1473 PST_1474     TRUE 0.991 0.000 0.360 NA   NA
 3559238 3559239 PST_1474 PST_1475     TRUE 0.975 -3.000 0.147 NA   NA
 3559239 3559240 PST_1475 PST_1476     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 3559241 3559242 PST_1477 PST_1478     TRUE 0.912 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 3559243 3559244 PST_1479 PST_1480     TRUE 0.989 0.000 0.293 NA   NA
 3559244 3559245 PST_1480 PST_1481     FALSE 0.025 250.000 0.000 NA   NA
 3559245 3559246 PST_1481 PST_1482     FALSE 0.005 523.000 0.000 NA   NA
 3559247 3559248 PST_1483 PST_1484     FALSE 0.012 318.000 0.000 NA   NA
 3559248 3559249 PST_1484 PST_1485     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3559249 3559250 PST_1485 PST_1486     FALSE 0.011 333.000 0.000 NA   NA
 3559250 3559251 PST_1486 PST_1487     TRUE 0.854 27.000 0.071 0.061   NA
 3559251 3559252 PST_1487 PST_1488     FALSE 0.236 49.000 0.000 NA   NA
 3559252 3559253 PST_1488 PST_1489     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559256 3559257 PST_1491 PST_1492     FALSE 0.004 649.000 0.000 NA   NA
 3559259 3559260 PST_1495 PST_1497     FALSE 0.054 190.000 0.000 NA   NA
 3559260 3559261 PST_1497 PST_1498     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 3559262 3559263 PST_1499 PST_1500     FALSE 0.110 178.000 0.023 1.000   NA
 3559263 3559264 PST_1500 PST_1501     TRUE 0.955 -7.000 0.182 1.000   NA
 3559264 3559265 PST_1501 PST_1502     TRUE 0.957 -3.000 0.071 NA   NA
 3559265 3559266 PST_1502 PST_1503     FALSE 0.420 88.000 0.059 NA   NA
 3559267 3559268 PST_1504 PST_1505 fdxA mutS FALSE 0.179 122.000 0.020 1.000 N NA
 3559269 3559270 PST_1506 PST_1507     TRUE 0.518 -28.000 0.011 NA   NA
 3559270 3559271 PST_1507 PST_1508   recA TRUE 0.507 84.000 0.082 NA   NA
 3559271 3559272 PST_1508 PST_1509 recA recX TRUE 0.813 51.000 0.296 1.000   NA
 3559273 3559274 PST_1510 PST_1511     FALSE 0.435 113.000 0.089 NA   NA
 3559282 3559283 PST_1519 PST_1520     TRUE 0.936 -49.000 0.407 NA   NA
 3559286 3559287 PST_1523 PST_1524 dinG estC FALSE 0.178 112.000 0.017 1.000 N NA
 3559287 3559288 PST_1524 PST_1525 estC   TRUE 0.897 76.000 0.667 1.000 N NA
 3559288 3559289 PST_1525 PST_1526   pdxH FALSE 0.075 192.000 0.023 1.000 N NA
 3559291 3559292 PST_1528 PST_1529     FALSE 0.035 221.000 0.000 1.000 N NA
 3559292 3559293 PST_1529 PST_1530     TRUE 1.000 0.000 0.881 0.003 Y NA
 3559293 3559294 PST_1530 PST_1531     TRUE 0.999 -3.000 0.976 0.003 Y NA
 3559294 3559295 PST_1531 PST_1532     TRUE 0.999 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 3559295 3559296 PST_1532 PST_1533     TRUE 0.997 -15.000 0.937 0.068 Y NA
 3559296 3559297 PST_1533 PST_1534     TRUE 0.997 10.000 0.937 1.000 Y NA
 3559298 3559299 PST_1535 PST_1536 glnD map TRUE 0.925 37.000 0.651 1.000 N NA
 3559300 3559301 PST_1537 PST_1538 rpsB tsf TRUE 0.935 128.000 0.748 1.000 Y NA
 3559301 3559302 PST_1538 PST_1539 tsf pyrH FALSE 0.055 200.000 0.017 1.000 N NA
 3559302 3559303 PST_1539 PST_1540 pyrH frr FALSE 0.439 33.000 0.030 1.000 N NA
 3559303 3559304 PST_1540 PST_1541 frr uppS TRUE 0.873 41.000 0.409 1.000 N NA
 3559304 3559305 PST_1541 PST_1542 uppS cdsA TRUE 0.880 129.000 0.400 1.000 Y NA
 3559305 3559306 PST_1542 PST_1543 cdsA dxr TRUE 0.996 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 3559306 3559307 PST_1543 PST_1544 dxr   TRUE 0.881 61.000 0.568 1.000 N NA
 3559307 3559308 PST_1544 PST_1545     TRUE 0.557 106.000 0.014 1.000 Y NA
 3559308 3559309 PST_1545 PST_1546   ompH TRUE 0.951 13.000 0.050 1.000 Y NA
 3559309 3559310 PST_1546 PST_1547 ompH lpxD TRUE 0.994 14.000 0.814 1.000 Y NA
 3559310 3559311 PST_1547 PST_1548 lpxD fabZ TRUE 0.883 105.000 0.796 1.000 N NA
 3559311 3559312 PST_1548 PST_1549 fabZ lpxA TRUE 0.996 -3.000 0.850 1.000 N NA
 3559312 3559313 PST_1549 PST_1550 lpxA lpxB TRUE 0.844 131.000 0.289 1.000 Y NA
 3559313 3559314 PST_1550 PST_1551 lpxB rnhB TRUE 0.983 0.000 0.186 1.000 N NA
 3559314 3559315 PST_1551 PST_1552 rnhB dnaE FALSE 0.206 287.000 0.104 1.000 Y NA
 3559315 3559316 PST_1552 PST_1553 dnaE accA FALSE 0.269 185.000 0.122 1.000 N NA
 3559316 3559317 PST_1553 PST_1554 accA   FALSE 0.105 267.000 0.123 1.000 N NA
 3559317 3559318 PST_1554 PST_1555   pyrG FALSE 0.093 168.000 0.016 1.000 N NA
 3559318 3559319 PST_1555 PST_1556 pyrG kdsA TRUE 0.975 -3.000 0.138 1.000 N NA
 3559319 3559320 PST_1556 PST_1557 kdsA eno TRUE 0.841 -40.000 0.125 1.000 N NA
 3559320 3559321 PST_1557 PST_1558 eno   TRUE 0.710 93.000 0.241 1.000 N NA
 3559321 3559322 PST_1558 PST_1559   ispD TRUE 0.981 -3.000 0.185 1.000 N NA
 3559323 3559324 PST_1560 PST_1561     FALSE 0.287 77.000 0.026 NA   NA
 3559324 3559325 PST_1561 PST_1562     TRUE 0.545 118.000 0.160 NA   NA
 3559326 3559327 PST_1563 PST_1564 adhC   TRUE 0.869 89.000 0.567 1.000   NA
 3559329 3559330 PST_1566 PST_1567 ispF truD TRUE 0.981 -3.000 0.173 1.000   NA
 3559330 3559331 PST_1567 PST_1568 truD surE TRUE 0.988 0.000 0.235 1.000   NA
 3559331 3559332 PST_1568 PST_1569 surE pcm TRUE 0.991 -3.000 0.353 1.000   NA
 3559332 3559333 PST_1569 PST_1570 pcm   TRUE 0.660 20.000 0.046 NA   NA
 3559333 3559334 PST_1570 PST_1571   nlpD FALSE 0.389 68.000 0.040 NA   NA
 3559334 3559335 PST_1571 PST_1572 nlpD rpoS TRUE 0.463 99.000 0.081 1.000 N NA
 3559335 3559336 PST_1572 PST_1573 rpoS   FALSE 0.005 503.000 0.000 NA   NA
 3559338 3559339 PST_1574 PST_1576     FALSE 0.013 307.000 0.000 NA   NA
 3559340 3559341 PST_1577 PST_1578     TRUE 0.749 7.000 0.004 NA   NA
 3559341 3559342 PST_1578 PST_1579     FALSE 0.065 190.000 0.000 1.000   NA
 3559344 3559345 PST_1581 PST_1582     FALSE 0.142 98.000 0.002 NA   NA
 3559346 3559347 PST_1583 PST_1584     FALSE 0.215 57.000 0.000 NA   NA
 3559348 3559349 PST_1585 PST_1586     FALSE 0.308 103.000 0.041 NA   NA
 3559349 3559350 PST_1586 PST_1587     FALSE 0.346 90.000 0.041 NA   NA
 3559351 3559352 PST_1588 PST_1589 dgt   FALSE 0.008 401.000 0.000 1.000 N NA
 3559356 3559357 PST_1593 PST_1594     FALSE 0.182 184.000 0.067 NA   NA
 3559357 3559358 PST_1594 PST_1595     FALSE 0.013 305.000 0.000 NA   NA
 3559361 3559362 PST_1598 PST_1599     FALSE 0.201 100.000 0.000 1.000   NA
 3559362 3559363 PST_1599 PST_1600     FALSE 0.023 271.000 0.000 1.000   NA
 3559363 3559364 PST_1600 PST_1601   glpD FALSE 0.065 190.000 0.000 1.000   NA
 3559364 3559365 PST_1601 PST_1602 glpD glpR FALSE 0.007 430.000 0.000 1.000 N NA
 3559365 3559366 PST_1602 PST_1603 glpR glpK FALSE 0.296 133.000 0.055 1.000 N NA
 3559366 3559367 PST_1603 PST_1604 glpK glpF TRUE 0.724 13.000 0.023 1.000 N NA
 3559367 3559368 PST_1604 PST_1605 glpF   FALSE 0.059 185.000 0.000 NA   NA
 3559368 3559369 PST_1605 PST_1606     FALSE 0.206 78.000 0.000 NA   NA
 3559369 3559370 PST_1606 PST_1607     FALSE 0.214 93.000 0.000 1.000   NA
 3559373 3559374 PST_1610 PST_1611     TRUE 0.980 20.000 0.667 0.069 N NA
 3559374 3559375 PST_1611 PST_1612     TRUE 0.705 28.000 0.100 NA N NA
 3559375 3559376 PST_1612 PST_1613     FALSE 0.011 302.000 0.000 NA N NA
 3559377 3559378 PST_1614 PST_1615     FALSE 0.388 25.000 0.000 1.000 N NA
 3559378 3559379 PST_1615 PST_1616     FALSE 0.098 157.000 0.000 NA   NA
 3559380 3559381 PST_1617 PST_1618     TRUE 0.503 -61.000 0.023 NA   NA
 3559385 3559386 PST_1622 PST_1623     TRUE 0.469 95.000 0.080 NA   NA
 3559389 3559390 PST_1626 PST_1627     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3559390 3559391 PST_1627 PST_1628     FALSE 0.010 358.000 0.000 NA   NA
 3559392 3559393 PST_1629 PST_1630 katG   FALSE 0.138 142.000 0.000 1.000   NA
 3559396 3559397 PST_1633 PST_1634     FALSE 0.003 893.000 0.000 NA   NA
 3559397 3559398 PST_1634 PST_1635     FALSE 0.148 113.000 0.000 NA   NA
 3559398 3559399 PST_1635 PST_1636   nrdB FALSE 0.083 166.000 0.000 NA   NA
 3559399 3559400 PST_1636 PST_1637 nrdB nrdA TRUE 0.748 299.000 0.564 0.001 Y NA
 3559401 3559402 PST_1638 PST_1639     TRUE 0.944 12.000 0.024 1.000 Y NA
 3559403 3559404 PST_1640 PST_1641 fadE   FALSE 0.171 113.000 0.022 NA N NA
 3559404 3559405 PST_1641 PST_1642     FALSE 0.186 127.000 0.029 NA N NA
 3559405 3559406 PST_1642 PST_1643     FALSE 0.115 142.000 0.000 NA   NA
 3559408 3559409 PST_1645 PST_1646     FALSE 0.062 183.000 0.000 NA   NA
 3559410 3559411 PST_1647 PST_1648     TRUE 0.515 130.000 0.033 0.037 N NA
 3559411 3559412 PST_1648 PST_1649   argD FALSE 0.202 142.000 0.033 1.000 N NA
 3559412 3559413 PST_1649 PST_1650 argD   TRUE 0.626 57.000 0.133 NA   NA
 3559413 3559414 PST_1650 PST_1651   astE TRUE 0.988 13.000 0.909 NA   NA
 3559414 3559415 PST_1651 PST_1652 astE   FALSE 0.058 191.000 0.013 1.000 N NA
 3559415 3559416 PST_1652 PST_1653     TRUE 0.998 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 3559416 3559417 PST_1653 PST_1654   queF TRUE 0.752 28.000 0.110 1.000   NA
 3559421 3559422 PST_1658 PST_1659     TRUE 0.996 -3.000 0.408 NA Y NA
 3559423 3559424 PST_1660 PST_1661 tal   FALSE 0.246 132.000 0.039 1.000 N NA
 3559424 3559425 PST_1661 PST_1662     FALSE 0.031 233.000 0.000 1.000 N NA
 3559425 3559426 PST_1662 PST_1663     TRUE 0.974 -3.000 0.000 NA Y NA
 3559426 3559427 PST_1663 PST_1664     TRUE 0.660 47.000 0.000 NA Y NA
 3559427 3559428 PST_1664 PST_1665     FALSE 0.444 24.000 0.000 1.000   NA
 3559429 3559430 PST_1666 PST_1667 benR benA FALSE 0.012 326.000 0.000 1.000 N NA
 3559430 3559431 PST_1667 PST_1668 benA benB TRUE 0.999 3.000 0.953 0.001 N NA
 3559431 3559432 PST_1668 PST_1669 benB benC TRUE 0.994 11.000 0.672 0.069 N NA
 3559432 3559433 PST_1669 PST_1670 benC benD TRUE 0.883 72.000 0.574 1.000 N NA
 3559433 3559434 PST_1670 PST_1671 benD benK TRUE 0.636 108.000 0.209 1.000 N NA
 3559434 3559435 PST_1671 PST_1672 benK catB TRUE 0.894 29.000 0.364 1.000 N NA
 3559435 3559436 PST_1672 PST_1673 catB catC TRUE 0.968 15.000 0.500 1.000 N NA
 3559436 3559437 PST_1673 PST_1674 catC catA TRUE 0.643 159.000 0.114 1.000 Y NA
 3559437 3559438 PST_1674 PST_1675 catA benE TRUE 0.724 128.000 0.114 1.000 Y NA
 3559438 3559439 PST_1675 PST_1676 benE benF TRUE 0.937 108.000 0.800 0.067   NA
 3559439 3559440 PST_1676 PST_1677 benF   FALSE 0.004 633.000 0.000 NA   NA
 3559440 3559441 PST_1677 PST_1678     FALSE 0.204 80.000 0.000 NA   NA
 3559441 3559442 PST_1678 PST_1679     TRUE 0.786 7.000 0.000 NA   NA
 3559442 3559443 PST_1679 PST_1680     FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 3559443 3559444 PST_1680 PST_1680a     FALSE 0.140 123.000 0.000 NA   NA
 3559448 3559449 PST_1684 PST_1685     FALSE 0.007 423.000 0.000 NA   NA
 3559449 3559450 PST_1685 PST_1686     FALSE 0.375 84.000 0.038 1.000   NA
 3559450 3559451 PST_1686 PST_1687     TRUE 0.979 -7.000 0.407 1.000 N NA
 3559451 3559452 PST_1687 PST_1688     FALSE 0.079 172.000 0.000 1.000 N NA
 3559455 3559456 PST_1691 PST_1692     FALSE 0.360 165.000 0.133 NA   NA
 3559457 3559458 PST_1693 PST_1694     TRUE 0.731 71.000 0.216 NA   NA
 3559458 3559459 PST_1694 PST_1695     FALSE 0.162 114.000 0.021 NA N NA
 3559459 3559460 PST_1695 PST_1696     TRUE 0.889 -3.000 0.021 NA   NA
 3559460 3559461 PST_1696 PST_1697     TRUE 0.960 14.000 0.324 1.000   NA
 3559461 3559462 PST_1697 PST_1698     TRUE 0.944 21.000 0.500 1.000 N NA
 3559462 3559463 PST_1698 PST_1699     TRUE 0.990 10.000 0.250 1.000 Y NA
 3559463 3559464 PST_1699 PST_1700     FALSE 0.418 81.000 0.045 1.000   NA
 3559464 3559465 PST_1700 PST_1701     FALSE 0.232 50.000 0.000 NA   NA
 3559466 3559467 PST_1702 PST_1703     TRUE 0.927 21.000 0.160 0.060   NA
 3559468 3559469 PST_1704 PST_1705     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3559470 3559471 PST_1706 PST_1707     TRUE 0.882 -3.000 0.000 1.000   NA
 3559471 3559472 PST_1707 PST_1708     TRUE 0.974 0.000 0.000 0.047   NA
 3559472 3559473 PST_1708 PST_1709     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.047   NA
 3559473 3559474 PST_1709 PST_1710     TRUE 0.777 -64.000 0.000 0.047 N NA
 3559474 3559475 PST_1710 PST_1711   exbD1 FALSE 0.376 149.000 0.000 0.047 N NA
 3559475 3559476 PST_1711 PST_1712 exbD1 exbB1 TRUE 0.999 2.000 1.000 0.065 Y NA
 3559476 3559477 PST_1712 PST_1713 exbB1   TRUE 0.954 122.000 1.000 0.012 N NA
 3559477 3559478 PST_1713 PST_1714     FALSE 0.004 593.000 0.000 NA   NA
 3559478 3559479 PST_1714 PST_1715     TRUE 0.985 -3.000 0.233 NA   NA
 3559479 3559480 PST_1715 PST_1716   mvaB FALSE 0.007 409.000 0.000 NA   NA
 3559480 3559481 PST_1716 PST_1717 mvaB   TRUE 0.964 13.000 0.115 0.037 N NA
 3559482 3559483 PST_1718 PST_1719     TRUE 0.602 14.000 0.000 NA   NA
 3559483 3559484 PST_1719 PST_1720     FALSE 0.110 146.000 0.000 NA   NA
 3559487 3559488 PST_1724 PST_1725     FALSE 0.235 88.000 0.020 NA   NA
 3559489 3559490 PST_1726 PST_1727 fadB fadA TRUE 0.984 19.000 0.607 1.000 Y NA
 3559490 3559491 PST_1727 PST_1728 fadA   TRUE 0.499 73.000 0.070 NA   NA
 3559491 3559492 PST_1728 PST_1729   topA FALSE 0.013 287.000 0.007 NA   NA
 3559492 3559493 PST_1729 PST_1730 topA   FALSE 0.121 136.000 0.011 NA   NA
 3559496 3559497 PST_1733 PST_1734   lexA-2 TRUE 0.938 11.000 0.122 1.000 N NA
 3559498 3559499 PST_1735 PST_1736 psrA   TRUE 0.678 40.000 0.121 NA   NA
 3559499 3559500 PST_1736 PST_1737   nagZ FALSE 0.073 216.000 0.038 NA   NA
 3559500 3559501 PST_1737 PST_1738 nagZ   TRUE 0.472 25.000 0.018 1.000   NA
 3559501 3559502 PST_1738 PST_1739     FALSE 0.115 147.000 0.005 1.000   NA
 3559502 3559503 PST_1739 PST_1740     FALSE 0.043 204.000 0.000 NA   NA
 3559503 3559504 PST_1740 PST_1741     TRUE 0.480 71.000 0.064 NA   NA
 3559505 3559506 PST_1742 PST_1743     FALSE 0.155 111.000 0.013 NA   NA
 3559507 3559508 PST_1744 PST_1745   betB FALSE 0.188 93.000 0.012 1.000 N NA
 3559508 3559509 PST_1745 PST_1746 betB betA TRUE 0.971 16.000 0.634 1.000 N NA
 3559510 3559511 PST_1747 PST_1748     FALSE 0.376 26.000 0.000 1.000 N NA
 3559511 3559512 PST_1748 PST_1749     TRUE 0.773 23.000 0.105 NA   NA
 3559512 3559513 PST_1749 PST_1750     FALSE 0.025 247.000 0.000 NA   NA
 3559513 3559514 PST_1750 PST_1751     TRUE 0.943 46.000 1.000 NA   NA
 3559514 3559515 PST_1751 PST_1752     TRUE 0.933 60.000 1.000 NA   NA
 3559515 3559516 PST_1752 PST_1753     TRUE 0.832 56.000 0.400 NA   NA
 3559516 3559517 PST_1753 PST_1754     TRUE 0.501 179.000 0.286 1.000   NA
 3559517 3559518 PST_1754 PST_1755     TRUE 0.894 17.000 0.188 NA   NA
 3559518 3559519 PST_1755 PST_1756     TRUE 0.873 -106.000 0.250 NA   NA
 3559519 3559520 PST_1756 PST_1757     FALSE 0.261 55.000 0.018 1.000 N NA
 3559520 3559521 PST_1757 PST_1758     FALSE 0.262 52.000 0.018 NA   NA
 3559521 3559522 PST_1758 PST_1759     FALSE 0.356 44.000 0.029 NA   NA
 3559522 3559523 PST_1759 PST_1760     TRUE 0.912 50.000 0.286 NA Y NA
 3559523 3559524 PST_1760 PST_1761     TRUE 0.829 -31.000 0.095 NA   NA
 3559524 3559525 PST_1761 PST_1762     TRUE 0.558 23.000 0.027 1.000   NA
 3559525 3559526 PST_1762 PST_1763     FALSE 0.223 76.000 0.014 NA   NA
 3559526 3559527 PST_1763 PST_1764     FALSE 0.003 846.000 0.000 NA   NA
 3559527 3559528 PST_1764 PST_1765     FALSE 0.092 160.000 0.000 NA   NA
 3559529 3559530 PST_1766 PST_1767     FALSE 0.358 27.000 0.000 NA   NA
 3559530 3559531 PST_1767 PST_1768     FALSE 0.112 144.000 0.000 NA   NA
 3559535 3559536 PST_1772 PST_1773 leuC leuD TRUE 0.997 12.000 0.463 0.001 Y NA
 3559536 3559537 PST_1773 PST_1774 leuD leuB TRUE 0.817 184.000 0.159 0.001 Y NA
 3559537 3559538 PST_1774 PST_1775 leuB asd-1 TRUE 0.940 55.000 0.196 0.037 Y NA
 3559538 3559539 PST_1775 PST_1776 asd-1 asd-2 TRUE 0.801 135.000 0.025 0.001 Y NA
 3559539 3559540 PST_1776 PST_1777 asd-2   FALSE 0.133 145.000 0.017 1.000 N NA
 3559540 3559541 PST_1777 PST_1778   truA TRUE 0.917 3.000 0.035 1.000 N NA
 3559541 3559542 PST_1778 PST_1779 truA trpF TRUE 0.615 83.000 0.139 1.000 N NA
 3559542 3559543 PST_1779 PST_1780 trpF accD FALSE 0.033 216.000 0.007 1.000 N NA
 3559543 3559544 PST_1780 PST_1781 accD folC TRUE 0.807 87.000 0.383 1.000 N NA
 3559544 3559545 PST_1781 PST_1782 folC   TRUE 0.932 -16.000 0.216 NA   NA
 3559545 3559546 PST_1782 PST_1783     TRUE 0.658 42.000 0.116 NA   NA
 3559546 3559547 PST_1783 PST_1784   purF TRUE 0.783 72.000 0.262 1.000   NA
 3559547 3559548 PST_1784 PST_1785 purF metZ TRUE 0.707 42.000 0.153 1.000 N NA
 3559549 3559550 PST_1786 PST_1787 xcpQ xcpP TRUE 0.831 4.000 0.013 NA   NA
 3559551 3559552 PST_1788 PST_1789     FALSE 0.277 38.000 0.000 NA   NA
 3559553 3559554 PST_1790 PST_1791   soxR TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559554 3559555 PST_1791 PST_1792 soxR   FALSE 0.139 127.000 0.000 1.000 N NA
 3559555 3559556 PST_1792 PST_1793     FALSE 0.095 169.000 0.000 1.000   NA
 3559556 3559557 PST_1793 PST_1794     FALSE 0.017 280.000 0.000 NA   NA
 3559557 3559558 PST_1794 PST_1795     TRUE 0.996 0.000 0.778 NA   NA
 3559558 3559559 PST_1795 PST_1796   cobN TRUE 0.901 -49.000 0.263 NA N NA
 3559559 3559560 PST_1796 PST_1797 cobN   FALSE 0.275 194.000 0.158 1.000 N NA
 3559560 3559561 PST_1797 PST_1798   rpmE2 FALSE 0.194 90.000 0.000 1.000 N NA
 3559564 3559565 PST_1801 PST_1802     TRUE 0.995 -3.000 0.600 1.000   NA
 3559568 3559569 PST_1805 PST_1806     TRUE 0.962 10.000 0.194 NA   NA
 3559570 3559571 PST_1807 PST_1808 cydA2 cydB2 TRUE 0.999 4.000 0.750 0.068 Y NA
 3559571 3559572 PST_1808 PST_1809 cydB2   TRUE 0.964 0.000 0.075 NA   NA
 3559573 3559574 PST_1810 PST_1811     TRUE 0.995 -3.000 0.615 1.000   NA
 3559575 3559576 PST_1812 PST_1813 fadH1   TRUE 0.531 33.000 0.047 NA   NA
 3559576 3559577 PST_1813 PST_1814     FALSE 0.041 206.000 0.000 NA   NA
 3559577 3559578 PST_1814 PST_1815     TRUE 0.940 9.000 0.099 NA   NA
 3559578 3559579 PST_1815 PST_1816     FALSE 0.100 138.000 0.000 NA N NA
 3559581 3559582 PST_1818 PST_1819 pdxB   FALSE 0.003 1115.000 0.000 1.000 N NA
 3559582 3559583 PST_1819 PST_1820   dnaX TRUE 0.544 108.000 0.000 1.000 Y NA
 3559583 3559584 PST_1820 PST_1821 dnaX   TRUE 0.840 65.000 0.411 NA   NA
 3559584 3559585 PST_1821 PST_1822   recR TRUE 0.878 81.000 0.604 NA   NA
 3559585 3559586 PST_1822 PST_1823 recR   FALSE 0.138 104.000 0.002 1.000 N NA
 3559586 3559587 PST_1823 PST_1824     TRUE 0.811 91.000 0.130 1.000 Y NA
 3559587 3559588 PST_1824 PST_1825     TRUE 0.987 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 3559588 3559589 PST_1825 PST_1826     TRUE 0.993 11.000 0.500 0.046   NA
 3559590 3559591 PST_1827 PST_1828   apt FALSE 0.277 39.000 0.002 1.000   NA
 3559591 3559592 PST_1828 PST_1829 apt anr FALSE 0.398 27.000 0.016 1.000 N NA
 3559592 3559593 PST_1829 PST_1830 anr   FALSE 0.431 112.000 0.084 1.000 N NA
 3559595 3559596 PST_1832 PST_1833   ccoS TRUE 0.728 95.000 0.266 NA   NA
 3559596 3559597 PST_1833 PST_1834 ccoS   TRUE 0.949 93.000 0.713 NA Y NA
 3559597 3559598 PST_1834 PST_1835     TRUE 0.968 8.000 0.197 NA   NA
 3559598 3559599 PST_1835 PST_1836     TRUE 0.487 108.000 0.111 NA   NA
 3559599 3559600 PST_1836 PST_1837     TRUE 0.931 138.000 0.364 0.025 Y NA
 3559600 3559601 PST_1837 PST_1838   ccoQ-2 TRUE 0.988 1.000 0.061 0.003 N NA
 3559601 3559602 PST_1838 PST_1839 ccoQ-2   TRUE 0.978 4.000 0.030 0.003 N NA
 3559602 3559603 PST_1839 PST_1840   ccoN-2 TRUE 0.996 13.000 1.000 0.003 N NA
 3559603 3559604 PST_1840 PST_1841 ccoN-2   FALSE 0.067 353.000 0.000 0.003 N NA
 3559604 3559605 PST_1841 PST_1842     TRUE 0.971 98.000 0.500 0.003 Y NA
 3559605 3559606 PST_1842 PST_1843   ccoN-1 TRUE 0.979 14.000 0.222 0.003 N NA
 3559608 3559609 PST_1845 PST_1846 aer-2 acnA FALSE 0.009 350.000 0.004 1.000 N NA
 3559610 3559611 PST_1847 PST_1848     FALSE 0.409 73.000 0.047 NA   NA
 3559612 3559613 PST_1849 PST_1850     TRUE 0.811 -43.000 0.105 NA   NA
 3559613 3559614 PST_1850 PST_1851     TRUE 0.999 -3.000 0.905 0.003 Y NA
 3559614 3559615 PST_1851 PST_1852     TRUE 0.816 22.000 0.143 NA   NA
 3559615 3559616 PST_1852 PST_1853     FALSE 0.158 106.000 0.012 NA   NA
 3559617 3559618 PST_1854 PST_1855 moaA2   FALSE 0.030 235.000 0.000 1.000 N NA
 3559618 3559619 PST_1855 PST_1856   zipA TRUE 0.779 175.000 0.115 0.010 Y NA
 3559619 3559620 PST_1856 PST_1857 zipA ligA FALSE 0.122 244.000 0.106 1.000 N NA
 3559620 3559621 PST_1857 PST_1858 ligA   FALSE 0.008 389.000 0.000 NA   NA
 3559622 3559623 PST_1859 PST_1860     TRUE 0.855 27.000 0.071 0.060   NA
 3559624 3559625 PST_1861 PST_1862     FALSE 0.248 58.000 0.018 NA   NA
 3559625 3559626 PST_1862 PST_1863     TRUE 0.822 66.000 0.117 NA Y NA
 3559627 3559628 PST_1864 PST_1865     TRUE 0.991 33.000 1.000 0.060 Y NA
 3559629 3559630 PST_1866 PST_1867 fliS   TRUE 0.992 -3.000 0.478 NA   NA
 3559630 3559631 PST_1867 PST_1868     TRUE 0.873 0.000 0.000 NA   NA
 3559632 3559633 PST_1869 PST_1870   gltA FALSE 0.006 426.000 0.000 NA   NA
 3559634 3559635 PST_1871 PST_1872 sdhC sdhD TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 3559635 3559636 PST_1872 PST_1873 sdhD sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 3559636 3559637 PST_1873 PST_1874 sdhA sdhB TRUE 0.998 11.000 0.604 0.001 Y NA
 3559637 3559638 PST_1874 PST_1875 sdhB kgd FALSE 0.160 293.000 0.067 1.000 Y NA
 3559638 3559639 PST_1875 PST_1876 kgd sucB TRUE 0.958 72.000 0.667 1.000 Y NA
 3559639 3559640 PST_1876 PST_1877 sucB lpdG TRUE 0.876 96.000 0.253 1.000 Y NA
 3559640 3559641 PST_1877 PST_1878 lpdG sucC FALSE 0.409 194.000 0.069 1.000 Y NA
 3559641 3559642 PST_1878 PST_1879 sucC sucD TRUE 1.000 0.000 0.806 0.001 Y NA
 3559642 3559643 PST_1879 PST_1880 sucD braB FALSE 0.009 368.000 0.000 1.000 N NA
 3559643 3559644 PST_1880 PST_1881 braB   FALSE 0.374 90.000 0.048 NA   NA
 3559644 3559645 PST_1881 PST_1882     FALSE 0.460 58.000 0.060 NA   NA
 3559645 3559646 PST_1882 PST_1883     TRUE 0.998 -3.000 0.845 NA Y NA
 3559646 3559647 PST_1883 PST_1884     FALSE 0.446 67.000 0.054 NA   NA
 3559647 3559648 PST_1884 PST_1885   htpG FALSE 0.127 121.000 0.007 NA   NA
 3559650 3559651 PST_1887 PST_1888     TRUE 0.820 65.000 0.357 NA   NA
 3559651 3559652 PST_1888 PST_1889     FALSE 0.100 155.000 0.000 NA   NA
 3559652 3559653 PST_1889 PST_1890     FALSE 0.449 206.000 0.000 0.013 Y NA
 3559653 3559654 PST_1890 PST_1891     FALSE 0.075 178.000 0.013 1.000 N NA
 3559655 3559656 PST_1892 PST_1893 fabB fabA TRUE 0.992 12.000 0.451 1.000 Y NA
 3559657 3559658 PST_1894 PST_1895 gpsA   TRUE 0.974 10.000 0.273 NA   NA
 3559658 3559659 PST_1895 PST_1896   sixA TRUE 0.559 87.000 0.114 NA   NA
 3559659 3559660 PST_1896 PST_1897 sixA   FALSE 0.371 77.000 0.045 NA N NA
 3559660 3559661 PST_1897 PST_1898     TRUE 0.813 -40.000 0.101 NA   NA
 3559661 3559662 PST_1898 PST_1899     TRUE 0.991 -3.000 0.096 0.002   NA
 3559662 3559663 PST_1899 PST_1900     FALSE 0.165 218.000 0.118 NA   NA
 3559663 3559664 PST_1900 PST_1901     TRUE 0.837 86.000 0.478 NA   NA
 3559666 3559667 PST_1903 PST_1904 selD   TRUE 0.619 120.000 0.214 NA   NA
 3559667 3559668 PST_1904 PST_1905     FALSE 0.340 29.000 0.012 NA   NA
 3559668 3559669 PST_1905 PST_1906     FALSE 0.301 34.000 0.000 NA   NA
 3559669 3559670 PST_1906 PST_1907     FALSE 0.327 30.000 0.000 NA   NA
 3559670 3559671 PST_1907 PST_1908     TRUE 0.938 35.000 0.739 NA   NA
 3559671 3559672 PST_1908 PST_1909     TRUE 0.995 -3.000 0.727 NA   NA
 3559672 3559673 PST_1909 PST_1910     FALSE 0.027 242.000 0.000 NA   NA
 3559675 3559676 PST_1912 PST_1913     FALSE 0.215 61.000 0.000 NA   NA
 3559676 3559677 PST_1913 PST_1914     FALSE 0.202 68.000 0.008 NA   NA
 3559677 3559678 PST_1914 PST_1915     FALSE 0.144 186.000 0.050 1.000 N NA
 3559678 3559679 PST_1915 PST_1916   fadAx TRUE 0.944 87.000 0.575 1.000 Y NA
 3559679 3559680 PST_1916 PST_1917 fadAx   TRUE 0.994 11.000 0.529 1.000 Y NA
 3559680 3559681 PST_1917 PST_1918   alkK-2 TRUE 0.700 114.000 0.074 1.000 Y NA
 3559681 3559682 PST_1918 PST_1919 alkK-2   TRUE 0.796 73.000 0.111 0.037 N NA
 3559682 3559683 PST_1919 PST_1920     FALSE 0.017 279.000 0.000 NA   NA
 3559683 3559684 PST_1920 PST_1921     FALSE 0.004 754.000 0.000 NA   NA
 3559685 3559686 PST_1922 PST_1923 acdA   TRUE 0.936 38.000 0.300 1.000 Y NA
 3559686 3559687 PST_1923 PST_1924   mmsB TRUE 0.998 3.000 0.600 1.000 Y NA
 3559687 3559688 PST_1924 PST_1925 mmsB fadB1x TRUE 0.843 79.000 0.154 1.000 Y NA
 3559688 3559689 PST_1925 PST_1926 fadB1x mmsA-2 TRUE 0.685 48.000 0.154 1.000 N NA
 3559690 3559691 PST_1927 PST_1928     FALSE 0.204 80.000 0.000 NA   NA
 3559692 3559693 PST_1929 PST_1930     FALSE 0.213 72.000 0.011 NA   NA
 3559693 3559694 PST_1930 PST_1931     FALSE 0.133 179.000 0.038 NA   NA
 3559695 3559696 PST_1932 PST_1933     FALSE 0.271 132.000 0.054 NA N NA
 3559698 3559699 PST_1935 PST_1936     FALSE 0.145 123.000 0.000 1.000 N NA
 3559699 3559700 PST_1936 PST_1937     TRUE 0.968 47.000 0.293 0.006 Y NA
 3559700 3559701 PST_1937 PST_1938     FALSE 0.171 120.000 0.000 1.000   NA
 3559702 3559703 PST_1939 PST_1940     TRUE 0.988 81.000 1.000 0.003 Y NA
 3559703 3559704 PST_1940 PST_1941     TRUE 0.653 108.000 0.222 1.000 N NA
 3559704 3559705 PST_1941 PST_1942     TRUE 0.880 150.000 0.222 0.047 Y NA
 3559705 3559706 PST_1942 PST_1943     TRUE 0.959 8.000 0.150 1.000 N NA
 3559707 3559708 PST_1944 PST_1945     TRUE 0.716 75.000 0.220 NA N NA
 3559708 3559709 PST_1945 PST_1946   tolQ-1 FALSE 0.253 68.000 0.023 NA N NA
 3559709 3559710 PST_1946 PST_1947 tolQ-1 tolR-1 TRUE 0.997 12.000 0.556 0.064 Y NA
 3559710 3559711 PST_1947 PST_1948 tolR-1   TRUE 0.940 0.000 0.040 1.000 N NA
 3559711 3559712 PST_1948 PST_1949   uxpB TRUE 0.907 30.000 0.444 NA   NA
 3559715 3559716 PST_1952 PST_1953     FALSE 0.251 247.000 0.275 1.000 N NA
 3559716 3559717 PST_1953 PST_1954     FALSE 0.425 167.000 0.029 1.000 Y NA
 3559717 3559718 PST_1954 PST_1955     TRUE 0.999 0.000 0.656 0.001 N NA
 3559718 3559719 PST_1955 PST_1956     FALSE 0.009 391.000 0.000 1.000 N NA
 3559721 3559722 PST_1958 PST_1959     FALSE 0.316 52.000 0.026 1.000 N NA
 3559722 3559723 PST_1959 PST_1960     TRUE 0.957 -13.000 0.311 NA   NA
 3559723 3559724 PST_1960 PST_1961     TRUE 0.995 -3.000 0.722 NA   NA
 3559724 3559725 PST_1961 PST_1962     TRUE 0.992 3.000 0.217 0.051   NA
 3559725 3559726 PST_1962 PST_1963     TRUE 0.993 -3.000 0.533 NA   NA
 3559726 3559727 PST_1963 PST_1964   phrB TRUE 0.941 -3.000 0.048 NA   NA
 3559727 3559728 PST_1964 PST_1965 phrB   TRUE 0.883 -3.000 0.017 1.000 N NA
 3559728 3559729 PST_1965 PST_1966     TRUE 0.958 3.000 0.083 NA   NA
 3559730 3559731 PST_1967 PST_1968   hemH FALSE 0.290 76.000 0.020 1.000   NA
 3559732 3559733 PST_1969 PST_1970     TRUE 0.673 177.000 0.222 0.020   NA
 3559733 3559734 PST_1970 PST_1971     FALSE 0.220 85.000 0.016 NA   NA
 3559734 3559735 PST_1971 PST_1972     TRUE 0.980 9.000 0.323 NA   NA
 3559735 3559736 PST_1972 PST_1973     TRUE 0.986 -3.000 0.247 NA   NA
 3559736 3559737 PST_1973 PST_1974   folX TRUE 0.751 10.000 0.012 NA   NA
 3559737 3559738 PST_1974 PST_1975 folX folE-1 TRUE 0.979 0.000 0.012 1.000 Y NA
 3559738 3559739 PST_1975 PST_1976 folE-1   FALSE 0.035 217.000 0.000 NA   NA
 3559740 3559741 PST_1977 PST_1978   pqqF TRUE 0.720 35.000 0.133 1.000 N NA
 3559741 3559742 PST_1978 PST_1979 pqqF   FALSE 0.027 258.000 0.000 1.000   NA
 3559742 3559743 PST_1979 PST_1980     FALSE 0.075 351.000 0.182 NA   NA
 3559743 3559744 PST_1980 PST_1981     TRUE 0.883 -70.000 0.250 NA   NA
 3559745 3559746 PST_1982 PST_1983     FALSE 0.378 85.000 0.051 NA N NA
 3559746 3559747 PST_1983 PST_1984     FALSE 0.264 159.000 0.072 NA N NA
 3559747 3559748 PST_1984 PST_1985     TRUE 0.601 137.000 0.060 NA Y NA
 3559748 3559749 PST_1985 PST_1986     TRUE 0.998 0.000 0.790 NA Y NA
 3559752 3559753 PST_1989 PST_1990     FALSE 0.018 273.000 0.000 NA   NA
 3559754 3559755 PST_1991 PST_1992 ttgR   FALSE 0.304 65.000 0.031 NA N NA
 3559755 3559756 PST_1992 PST_1993     TRUE 0.633 16.000 0.031 NA N NA
 3559758 3559759 PST_1995 PST_1996     TRUE 0.984 -3.000 0.222 NA   NA
 3559759 3559760 PST_1996 PST_1997     FALSE 0.232 50.000 0.000 NA   NA
 3559760 3559761 PST_1997 PST_1998     TRUE 0.931 -3.000 0.040 NA   NA
 3559761 3559762 PST_1998 PST_1999     TRUE 0.931 -3.000 0.040 NA   NA
 3559762 3559763 PST_1999 PST_2000     TRUE 0.694 42.000 0.143 NA   NA
 3559763 3559764 PST_2000 PST_2001     TRUE 0.999 0.000 0.500 0.051 Y NA
 3559764 3559765 PST_2001 PST_2002     TRUE 0.998 2.000 0.250 0.051 Y NA
 3559765 3559766 PST_2002 PST_2003     TRUE 0.585 46.000 0.095 NA N NA
 3559766 3559767 PST_2003 PST_2004     FALSE 0.005 449.000 0.000 NA N NA
 3559767 3559768 PST_2004 PST_2005     FALSE 0.236 133.000 0.038 1.000 N NA
 3559768 3559769 PST_2005 PST_2006     FALSE 0.128 130.000 0.000 NA   NA
 3559769 3559770 PST_2006 PST_2008     FALSE 0.094 159.000 0.000 NA   NA
 3559770 3559771 PST_2008 PST_2009     TRUE 0.986 14.000 0.931 NA   NA
 3559771 3559772 PST_2009 PST_2010     TRUE 0.973 2.000 0.118 1.000   NA
 3559772 3559773 PST_2010 PST_2011     TRUE 0.994 -3.000 0.220 1.000 Y NA
 3559773 3559774 PST_2011 PST_2012     FALSE 0.007 422.000 0.000 1.000 N NA
 3559774 3559775 PST_2012 PST_2013   mttC FALSE 0.292 161.000 0.089 NA N NA
 3559777 3559778 PST_2015 PST_2016 lipH lipC TRUE 0.611 64.000 0.109 1.000   NA
 3559778 3559779 PST_2016 PST_2017 lipC greB FALSE 0.016 313.000 0.000 1.000   NA
 3559779 3559780 PST_2017 PST_2018 greB   TRUE 0.661 20.000 0.053 NA N NA
 3559780 3559781 PST_2018 PST_2019     TRUE 0.997 -3.000 0.535 NA Y NA
 3559782 3559783 PST_2020 PST_2021 tesA   TRUE 0.826 4.000 0.000 NA   NA
 3559787 3559788 PST_2025 PST_2026 panE-1 cysB FALSE 0.089 177.000 0.019 1.000 N NA
 3559791 3559792 PST_2029 PST_2030 pabB   FALSE 0.443 51.000 0.042 1.000   NA
 3559792 3559793 PST_2030 PST_2031     TRUE 0.996 4.000 0.923 NA   NA
 3559793 3559794 PST_2031 PST_2032     TRUE 0.961 6.000 0.141 NA   NA
 3559795 3559796 PST_2033 PST_2034   prpB TRUE 0.962 -3.000 0.080 1.000 N NA
 3559796 3559797 PST_2034 PST_2035 prpB prpC TRUE 0.836 97.000 0.502 1.000 N NA
 3559797 3559798 PST_2035 PST_2036 prpC   TRUE 0.966 20.000 0.289 1.000 Y NA
 3559798 3559799 PST_2036 PST_2037     TRUE 0.968 19.000 0.733 NA   NA
 3559801 3559802 PST_2039 PST_2040 ppsA menG FALSE 0.115 145.000 0.018 NA N NA
 3559802 3559803 PST_2040 PST_2041 menG cmaX TRUE 0.779 19.000 0.093 NA N NA
 3559803 3559804 PST_2041 PST_2042 cmaX crfX TRUE 0.559 57.000 0.093 NA   NA
 3559804 3559805 PST_2042 PST_2043 crfX cmpX TRUE 0.986 -3.000 0.256 NA   NA
 3559805 3559806 PST_2043 PST_2044 cmpX sigX TRUE 0.784 67.000 0.279 NA   NA
 3559806 3559807 PST_2044 PST_2045 sigX oprF TRUE 0.637 139.000 0.280 1.000 N NA
 3559812 3559813 PST_2050 PST_2051 lpxH ppiB TRUE 0.977 7.000 0.237 1.000   NA
 3559814 3559815 PST_2052 PST_2053 glnS cysS TRUE 0.993 0.000 0.032 0.036 Y NA
 3559817 3559818 PST_2055 PST_2056     FALSE 0.301 34.000 0.000 NA   NA
 3559818 3559819 PST_2056 PST_2057     FALSE 0.226 52.000 0.000 NA   NA
 3559819 3559820 PST_2057 PST_2058     FALSE 0.023 255.000 0.000 NA   NA
 3559820 3559821 PST_2058 PST_2059     TRUE 0.918 9.000 0.059 1.000   NA
 3559821 3559822 PST_2059 PST_2060   tig FALSE 0.091 173.000 0.000 1.000   NA
 3559822 3559823 PST_2060 PST_2061 tig clpP TRUE 0.524 108.000 0.002 1.000 Y NA
 3559823 3559824 PST_2061 PST_2062 clpP clpX TRUE 0.637 53.000 0.002 1.000 Y NA
 3559824 3559825 PST_2062 PST_2063 clpX lon TRUE 0.790 133.000 0.201 1.000 Y NA
 3559825 3559826 PST_2063 PST_2064 lon hupB FALSE 0.251 131.000 0.040 1.000 N NA
 3559826 3559827 PST_2064 PST_2065 hupB ppiD FALSE 0.058 206.000 0.017 1.000   NA
 3559828 3559829 PST_2066 PST_2067     TRUE 0.523 -19.000 0.006 NA   NA
 3559829 3559830 PST_2067 PST_2068     FALSE 0.218 84.000 0.015 NA   NA
 3559830 3559831 PST_2068 PST_2069     TRUE 0.928 -31.000 0.045 0.002   NA
 3559831 3559832 PST_2069 PST_2070     TRUE 0.696 56.000 0.000 0.002   NA
 3559833 3559834 PST_2071 PST_2072   morB FALSE 0.311 241.000 0.000 0.050 Y NA
 3559834 3559835 PST_2072 PST_2073 morB pqqB FALSE 0.017 299.000 0.000 1.000   NA
 3559835 3559836 PST_2073 PST_2074 pqqB pqqC TRUE 0.921 165.000 0.825 0.002   NA
 3559836 3559837 PST_2074 PST_2075 pqqC   TRUE 0.901 86.000 0.246 0.002   NA
 3559837 3559838 PST_2075 PST_2076     TRUE 0.768 161.000 0.211 0.002   NA
 3559838 3559839 PST_2076 PST_2077     TRUE 0.967 -3.000 0.088 1.000   NA
 3559839 3559840 PST_2077 PST_2078     FALSE 0.376 79.000 0.041 1.000 N NA
 3559840 3559841 PST_2078 PST_2079     TRUE 0.879 -16.000 0.108 1.000 N NA
 3559841 3559842 PST_2079 PST_2080     TRUE 0.637 53.000 0.133 NA   NA
 3559842 3559843 PST_2080 PST_2081     TRUE 0.582 91.000 0.133 NA   NA
 3559843 3559844 PST_2081 PST_2082     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 3559844 3559845 PST_2082 PST_2083     TRUE 0.989 -3.000 0.333 1.000 N NA
 3559847 3559848 PST_2085 PST_2086 gacA uvrC TRUE 0.791 66.000 0.086 0.016 N NA
 3559848 3559849 PST_2086 PST_2087 uvrC pgsA TRUE 0.928 -22.000 0.227 1.000 N NA
 3559849 3559850 PST_2087 PST_2088 pgsA   FALSE 0.218 70.000 0.000 NA   NA
 3559850 3559851 PST_2088 PST_2090     FALSE 0.243 47.000 0.000 NA   NA
 3559851 3559852 PST_2090 PST_2089     FALSE 0.106 150.000 0.000 NA   NA
 3559853 3559854 PST_2091 PST_2092     TRUE 0.752 119.000 0.400 NA   NA
 3559854 3559855 PST_2092 PST_2093     TRUE 0.913 -3.000 0.030 NA   NA
 3559855 3559856 PST_2093 PST_2094     FALSE 0.225 79.000 0.015 NA   NA
 3559856 3559857 PST_2094 PST_2095     TRUE 0.726 49.000 0.032 1.000 Y NA
 3559858 3559859 PST_2096 PST_2097 arsR-2 arsH FALSE 0.268 40.000 0.000 NA   NA
 3559859 3559860 PST_2097 PST_2098 arsH   FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 3559860 3559861 PST_2098 PST_2099     TRUE 0.508 -31.000 0.000 NA   NA
 3559861 3559862 PST_2099 PST_2100     TRUE 0.464 27.000 0.026 NA   NA
 3559862 3559863 PST_2100 PST_2101     TRUE 0.950 91.000 0.689 NA Y NA
 3559864 3559865 PST_2102 PST_2103     TRUE 0.801 146.000 0.667 NA   NA
 3559865 3559866 PST_2103 PST_2104     TRUE 0.707 -31.000 0.042 NA   NA
 3559866 3559867 PST_2104 PST_2105     TRUE 0.966 -6.000 0.208 NA   NA
 3559867 3559868 PST_2105 PST_2106     FALSE 0.033 223.000 0.000 NA   NA
 3559868 3559869 PST_2106 PST_2107     FALSE 0.188 90.000 0.000 NA   NA
 3559869 3559870 PST_2107 PST_2108     TRUE 0.870 -150.000 0.254 NA   NA
 3559870 3559871 PST_2108 PST_2109     FALSE 0.228 135.000 0.038 NA   NA
 3559871 3559872 PST_2109 PST_2110     FALSE 0.035 221.000 0.000 1.000 N NA
 3559876 3559877 PST_2114 PST_2115     FALSE 0.119 138.000 0.000 NA   NA
 3559877 3559878 PST_2115 PST_2116     TRUE 0.859 -3.000 0.000 NA   NA
 3559878 3559879 PST_2116 PST_2117     TRUE 0.899 -3.000 0.024 NA   NA
 3559879 3559880 PST_2117 PST_2118     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 3559880 3559881 PST_2118 PST_2119   pobR FALSE 0.188 90.000 0.000 NA   NA
 3559882 3559883 PST_2120 PST_2121     TRUE 0.949 -3.000 0.059 NA   NA
 3559883 3559884 PST_2121 PST_2122     TRUE 0.964 4.000 0.118 NA   NA
 3559884 3559885 PST_2122 PST_2123     TRUE 0.972 -3.000 0.120 1.000 N NA
 3559885 3559886 PST_2123 PST_2124     TRUE 0.966 0.000 0.080 1.000 N NA
 3559886