MicrobesOnline Operon Predictions for Gemmatimonas aurantiaca T-27

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7057201 7057202 GAU_0001 GAU_0002 dnaA dnaN TRUE 0.845 234.000 0.328 1.000 Y NA
 7057203 7057204 GAU_0003 GAU_rnp001     TRUE 0.745 -52.000 0.000 NA   NA
 7057206 7057207 GAU_0005 GAU_0006     FALSE 0.102 195.000 0.000 NA   NA
 7057207 7057208 GAU_0006 GAU_0007   pyrE FALSE 0.377 73.000 0.000 1.000 N NA
 7057208 7057209 GAU_0007 GAU_0008 pyrE   FALSE 0.386 70.000 0.000 1.000 N NA
 7057210 7057211 GAU_0009 GAU_0010   polA FALSE 0.465 27.000 0.000 NA   NA
 7057211 7057212 GAU_0010 GAU_0011 polA   FALSE 0.095 250.000 0.000 1.000   NA
 7057212 7057213 GAU_0011 GAU_0012     FALSE 0.109 184.000 0.000 NA   NA
 7057214 7057215 GAU_0013 GAU_0014     FALSE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 7057216 7057217 GAU_0015 GAU_0016   tex FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 7057217 7057218 GAU_0016 GAU_0017 tex   FALSE 0.144 160.000 0.000 1.000   NA
 7057218 7057219 GAU_0017 GAU_0018     FALSE 0.062 610.000 0.000 NA   NA
 7057219 7057220 GAU_0018 GAU_0019     TRUE 0.984 0.000 0.914 NA   NA
 7057221 7057222 GAU_0020 GAU_0021     FALSE 0.094 212.000 0.000 NA   NA
 7057222 7057223 GAU_0021 GAU_0022     FALSE 0.154 150.000 0.000 1.000   NA
 7057223 7057224 GAU_0022 GAU_0023     TRUE 0.991 -3.000 0.105 0.045   NA
 7057224 7057225 GAU_0023 GAU_0024     FALSE 0.345 69.000 0.000 1.000   NA
 7057225 7057226 GAU_0024 GAU_0025     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057226 7057227 GAU_0025 GAU_0026     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7057227 7057228 GAU_0026 GAU_0027   parB TRUE 0.470 31.000 0.000 1.000   NA
 7057228 7057229 GAU_0027 GAU_0028 parB parA TRUE 0.893 65.000 0.827 1.000 N NA
 7057229 7057230 GAU_0028 GAU_0029 parA   FALSE 0.063 558.000 0.000 NA   NA
 7057230 7057231 GAU_0029 GAU_0030   gidA FALSE 0.062 572.000 0.000 NA   NA
 7057233 7057234 GAU_0032 GAU_0033     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057234 7057235 GAU_0033 GAU_0034     FALSE 0.207 107.000 0.000 NA   NA
 7057236 7057237 GAU_0035 GAU_0036   dctA FALSE 0.347 50.000 0.000 NA   NA
 7057237 7057238 GAU_0036 GAU_0037 dctA   TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057238 7057239 GAU_0037 GAU_0038     FALSE 0.354 42.000 0.000 NA   NA
 7057244 7057245 GAU_0043 GAU_0044     FALSE 0.137 147.000 0.000 NA   NA
 7057245 7057246 GAU_0044 GAU_0045     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057249 7057250 GAU_0048 GAU_0049     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7057250 7057251 GAU_0049 GAU_0050     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057251 7057252 GAU_0050 GAU_0051     FALSE 0.339 54.000 0.000 NA   NA
 7057255 7057256 GAU_0054 GAU_0055     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7057258 7057259 GAU_0057 GAU_0058     FALSE 0.135 148.000 0.000 NA   NA
 7057259 7057260 GAU_0058 GAU_0059     FALSE 0.262 86.000 0.000 NA   NA
 7057260 7057261 GAU_0059 GAU_0060     TRUE 0.950 0.000 0.000 NA Y NA
 7057261 7057262 GAU_0060 GAU_0061     TRUE 0.851 3.000 0.000 NA N NA
 7057264 7057265 GAU_0063 GAU_0064     FALSE 0.146 139.000 0.000 NA   NA
 7057265 7057266 GAU_0064 GAU_0065     FALSE 0.297 73.000 0.000 NA   NA
 7057267 7057268 GAU_0066 GAU_0067     FALSE 0.345 69.000 0.000 1.000   NA
 7057270 7057271 GAU_0069 GAU_0070     TRUE 0.909 13.000 0.000 1.000 Y NA
 7057271 7057272 GAU_0070 GAU_0071     FALSE 0.257 88.000 0.000 NA   NA
 7057273 7057274 GAU_0072 GAU_0073     TRUE 0.984 -19.000 0.318 NA   NA
 7057274 7057275 GAU_0073 GAU_0074     FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 7057275 7057276 GAU_0074 GAU_0075     FALSE 0.331 57.000 0.000 NA   NA
 7057276 7057277 GAU_0075 GAU_0076     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7057278 7057279 GAU_0077 GAU_0078     TRUE 0.990 0.000 0.286 NA   NA
 7057280 7057281 GAU_0079 GAU_0080     FALSE 0.266 85.000 0.000 NA   NA
 7057282 7057283 GAU_0081 GAU_0082     TRUE 0.987 -3.000 0.273 NA   NA
 7057284 7057285 GAU_0083 GAU_0084     TRUE 0.580 20.000 0.000 NA   NA
 7057285 7057286 GAU_0084 GAU_0085   hsdM FALSE 0.069 358.000 0.000 NA   NA
 7057286 7057287 GAU_0085 GAU_0086 hsdM   TRUE 0.987 -3.000 0.093 NA   NA
 7057287 7057288 GAU_0086 GAU_0087   hsdS TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057288 7057289 GAU_0087 GAU_0088 hsdS hsdR TRUE 0.918 17.000 0.000 0.002 Y NA
 7057289 7057290 GAU_0088 GAU_0089 hsdR   FALSE 0.299 110.000 0.000 0.053   NA
 7057290 7057291 GAU_0089 GAU_0090     TRUE 0.490 29.000 0.000 1.000   NA
 7057294 7057295 GAU_0093 GAU_0094     TRUE 0.769 8.000 0.000 NA   NA
 7057296 7057297 GAU_0095 GAU_0096     FALSE 0.178 121.000 0.000 NA   NA
 7057297 7057298 GAU_0096 GAU_0097     FALSE 0.332 74.000 0.000 1.000   NA
 7057300 7057301 GAU_0099 GAU_0100     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057301 7057302 GAU_0100 GAU_0101     FALSE 0.365 60.000 0.000 1.000   NA
 7057302 7057303 GAU_0101 GAU_0102     TRUE 0.988 11.000 0.250 0.003   NA
 7057303 7057304 GAU_0102 GAU_0103     FALSE 0.221 113.000 0.000 1.000   NA
 7057305 7057306 GAU_0104 GAU_0105     FALSE 0.337 55.000 0.000 NA   NA
 7057307 7057308 GAU_0106 GAU_0107     FALSE 0.417 32.000 0.000 NA   NA
 7057311 7057312 GAU_0110 GAU_0111 argG   FALSE 0.094 255.000 0.000 1.000   NA
 7057312 7057313 GAU_0111 GAU_0112     TRUE 0.885 0.000 0.000 0.053   NA
 7057313 7057314 GAU_0112 GAU_0113     FALSE 0.172 124.000 0.000 NA   NA
 7057316 7057317 GAU_0115 GAU_0116     FALSE 0.437 30.000 0.000 NA   NA
 7057317 7057318 GAU_0116 GAU_0117     FALSE 0.066 407.000 0.000 NA   NA
 7057318 7057319 GAU_0117 GAU_0118     TRUE 0.934 28.000 0.667 NA   NA
 7057319 7057320 GAU_0118 GAU_0119     TRUE 0.715 11.000 0.000 NA   NA
 7057323 7057324 GAU_0122 GAU_0123     FALSE 0.350 46.000 0.000 NA   NA
 7057324 7057325 GAU_0123 GAU_0124     TRUE 0.967 21.000 0.136 NA   NA
 7057327 7057328 GAU_0126 GAU_0127     FALSE 0.316 66.000 0.000 NA   NA
 7057328 7057329 GAU_0127 GAU_0128   murB FALSE 0.201 122.000 0.000 1.000   NA
 7057330 7057331 GAU_0129 GAU_0130     TRUE 0.937 51.000 0.035 0.010   NA
 7057331 7057332 GAU_0130 GAU_0131     FALSE 0.227 110.000 0.000 1.000   NA
 7057332 7057333 GAU_0131 GAU_0132     FALSE 0.104 224.000 0.000 1.000   NA
 7057334 7057335 GAU_0133 GAU_0134 hisI hisN TRUE 0.985 -3.000 0.002 1.000 N NA
 7057335 7057336 GAU_0134 GAU_0135 hisN hisF TRUE 0.985 -3.000 0.002 1.000 N NA
 7057336 7057337 GAU_0135 GAU_0136 hisF hisB TRUE 0.997 0.000 0.024 0.003 Y NA
 7057337 7057338 GAU_0136 GAU_0137 hisB hisA TRUE 0.996 -3.000 0.042 0.003 Y NA
 7057338 7057339 GAU_0137 GAU_0138 hisA hisH TRUE 0.996 -3.000 0.010 0.003 Y NA
 7057339 7057340 GAU_0138 GAU_0139 hisH hisD TRUE 0.960 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 7057340 7057341 GAU_0139 GAU_0140 hisD hisG TRUE 0.982 27.000 0.008 0.003 Y NA
 7057342 7057343 GAU_0141 GAU_0142     FALSE 0.199 110.000 0.000 NA   NA
 7057343 7057344 GAU_0142 GAU_0143     TRUE 0.496 25.000 0.000 NA   NA
 7057344 7057345 GAU_0143 GAU_0144     FALSE 0.328 59.000 0.000 NA   NA
 7057345 7057346 GAU_0144 GAU_0145     FALSE 0.364 39.000 0.000 NA   NA
 7057346 7057347 GAU_0145 GAU_0146     FALSE 0.251 90.000 0.000 NA   NA
 7057347 7057348 GAU_0146 GAU_0147     TRUE 0.769 8.000 0.000 NA   NA
 7057350 7057351 GAU_0149 GAU_0150     FALSE 0.339 54.000 0.000 NA   NA
 7057351 7057352 GAU_0150 GAU_0151     FALSE 0.170 125.000 0.000 NA   NA
 7057353 7057354 GAU_0152 GAU_0153     FALSE 0.066 417.000 0.000 NA   NA
 7057354 7057355 GAU_0153 GAU_0154     FALSE 0.132 151.000 0.000 NA   NA
 7057355 7057356 GAU_0154 GAU_0155   argH TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7057356 7057357 GAU_0155 GAU_0156 argH argR TRUE 0.980 12.000 0.012 1.000 N NA
 7057358 7057359 GAU_0157 GAU_0158 argC argB TRUE 0.971 74.000 0.097 0.002 Y NA
 7057359 7057360 GAU_0158 GAU_0159 argB argD TRUE 0.995 6.000 0.014 1.000 Y NA
 7057360 7057361 GAU_0159 GAU_0160 argD   FALSE 0.412 59.000 0.000 1.000 N NA
 7057361 7057362 GAU_0160 GAU_0161     FALSE 0.076 446.000 0.000 1.000   NA
 7057362 7057363 GAU_0161 GAU_0162     FALSE 0.377 37.000 0.000 NA   NA
 7057363 7057364 GAU_0162 GAU_0163     FALSE 0.295 74.000 0.000 NA   NA
 7057364 7057365 GAU_0163 GAU_0164     TRUE 0.605 18.000 0.000 NA   NA
 7057365 7057366 GAU_0164 GAU_0165     FALSE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 7057366 7057367 GAU_0165 GAU_0166     FALSE 0.086 300.000 0.000 1.000   NA
 7057367 7057368 GAU_0166 GAU_0167     TRUE 0.851 3.000 0.000 NA N NA
 7057368 7057369 GAU_0167 GAU_0168     FALSE 0.075 620.000 0.000 NA N NA
 7057369 7057370 GAU_0168 GAU_0169     FALSE 0.240 94.000 0.000 NA   NA
 7057371 7057372 GAU_0170 GAU_0171   ctpA FALSE 0.348 48.000 0.000 NA   NA
 7057372 7057373 GAU_0171 GAU_0172 ctpA   FALSE 0.207 122.000 0.000 NA N NA
 7057373 7057374 GAU_0172 GAU_0173     FALSE 0.125 191.000 0.000 NA N NA
 7057374 7057375 GAU_0173 GAU_0174     TRUE 0.956 3.000 0.000 1.000 Y NA
 7057375 7057376 GAU_0174 GAU_0175     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057376 7057377 GAU_0175 GAU_0176     FALSE 0.347 50.000 0.000 NA   NA
 7057379 7057380 GAU_0178 GAU_0179 hsdR   FALSE 0.144 165.000 0.000 NA N NA
 7057380 7057381 GAU_0179 GAU_0180   hsdS FALSE 0.350 70.000 0.000 NA N NA
 7057381 7057382 GAU_0180 GAU_0181 hsdS hsdM TRUE 0.995 -10.000 0.034 0.053 Y NA
 7057383 7057384 GAU_0182 GAU_0183     FALSE 0.070 338.000 0.000 NA   NA
 7057386 7057387 GAU_0185 GAU_0186     TRUE 0.990 5.000 0.171 NA   NA
 7057387 7057388 GAU_0186 GAU_0187     TRUE 0.749 -16.000 0.000 NA   NA
 7057388 7057389 GAU_0187 GAU_0188     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057392 7057393 GAU_0191 GAU_0192     FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 7057393 7057394 GAU_0192 GAU_0193     TRUE 0.797 26.000 0.000 NA Y NA
 7057394 7057395 GAU_0193 GAU_0194     TRUE 0.815 -3.000 0.000 NA N NA
 7057395 7057396 GAU_0194 GAU_0195   serA TRUE 0.867 4.000 0.000 1.000 N NA
 7057396 7057397 GAU_0195 GAU_0196 serA   FALSE 0.155 149.000 0.000 1.000   NA
 7057397 7057398 GAU_0196 GAU_0197     FALSE 0.373 56.000 0.000 1.000   NA
 7057398 7057399 GAU_0197 GAU_0198     FALSE 0.155 134.000 0.000 NA   NA
 7057399 7057400 GAU_0198 GAU_0199     FALSE 0.097 206.000 0.000 NA   NA
 7057400 7057401 GAU_0199 GAU_0200     TRUE 0.702 79.000 0.000 0.042 Y NA
 7057401 7057402 GAU_0200 GAU_0201     TRUE 0.496 25.000 0.000 NA   NA
 7057403 7057404 GAU_0202 GAU_0203 glnA sodA FALSE 0.222 127.000 0.000 1.000 N NA
 7057404 7057405 GAU_0203 GAU_0204 sodA   TRUE 0.791 -7.000 0.000 NA N NA
 7057410 7057411 GAU_0209 GAU_0210     FALSE 0.064 498.000 0.000 NA   NA
 7057411 7057412 GAU_0210 GAU_0211     FALSE 0.246 92.000 0.000 NA   NA
 7057413 7057414 GAU_0212 GAU_0213     TRUE 0.748 -19.000 0.000 NA   NA
 7057416 7057417 GAU_0215 GAU_0216     FALSE 0.237 95.000 0.000 NA   NA
 7057418 7057419 GAU_0217 GAU_0218     TRUE 0.813 5.000 0.000 NA   NA
 7057419 7057420 GAU_0218 GAU_0219     FALSE 0.259 87.000 0.000 NA   NA
 7057420 7057421 GAU_0219 GAU_0220     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057422 7057423 GAU_0221 GAU_0222     FALSE 0.152 135.000 0.000 NA   NA
 7057423 7057424 GAU_0222 GAU_0223     FALSE 0.069 357.000 0.000 NA   NA
 7057425 7057426 GAU_0224 GAU_0225   sigG TRUE 0.861 98.000 0.062 NA   NA
 7057427 7057428 GAU_0226 GAU_0227     FALSE 0.347 50.000 0.000 NA   NA
 7057430 7057431 GAU_0229 GAU_0230     FALSE 0.128 187.000 0.000 NA N NA
 7057431 7057432 GAU_0230 GAU_0231     TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 7057432 7057433 GAU_0231 GAU_0232   mog TRUE 0.556 24.000 0.000 1.000   NA
 7057433 7057434 GAU_0232 GAU_0233 mog   TRUE 0.479 26.000 0.000 NA   NA
 7057434 7057435 GAU_0233 GAU_0234     TRUE 0.646 15.000 0.000 NA   NA
 7057435 7057436 GAU_0234 GAU_0235     FALSE 0.118 239.000 0.000 1.000 N NA
 7057436 7057437 GAU_0235 GAU_0236     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057437 7057438 GAU_0236 GAU_0237     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057438 7057439 GAU_0237 GAU_0238     FALSE 0.234 122.000 0.000 1.000 N NA
 7057440 7057441 GAU_0239 GAU_0240     FALSE 0.399 34.000 0.000 NA   NA
 7057441 7057442 GAU_0240 GAU_0241   amaA FALSE 0.342 53.000 0.000 NA   NA
 7057444 7057445 GAU_0243 GAU_0244   glnN FALSE 0.133 150.000 0.000 NA   NA
 7057446 7057447 GAU_0245 GAU_0246     FALSE 0.339 54.000 0.000 NA   NA
 7057450 7057451 GAU_0249 GAU_0250     FALSE 0.385 51.000 0.000 1.000   NA
 7057454 7057455 GAU_0253 GAU_0254     FALSE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 7057455 7057456 GAU_0254 GAU_0255     FALSE 0.354 42.000 0.000 NA   NA
 7057456 7057457 GAU_0255 GAU_0256     FALSE 0.343 52.000 0.000 NA   NA
 7057457 7057458 GAU_0256 GAU_0257     TRUE 0.664 14.000 0.000 NA   NA
 7057458 7057459 GAU_0257 GAU_0258     FALSE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 7057460 7057461 GAU_0259 GAU_0260 dkg   TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7057461 7057462 GAU_0260 GAU_0261     FALSE 0.187 117.000 0.000 NA   NA
 7057463 7057464 GAU_0262 GAU_0263 paaX paaA TRUE 0.591 568.000 0.093 NA   NA
 7057464 7057465 GAU_0263 GAU_0264 paaA paaB TRUE 0.984 0.000 0.920 NA   NA
 7057465 7057466 GAU_0264 GAU_0265 paaB paaC TRUE 0.979 -3.000 0.943 NA   NA
 7057466 7057467 GAU_0265 GAU_0266 paaC paaD TRUE 0.954 18.000 0.919 NA   NA
 7057467 7057468 GAU_0266 GAU_0267 paaD paaE TRUE 0.934 30.000 0.571 NA   NA
 7057468 7057469 GAU_0267 GAU_0268 paaE   FALSE 0.338 86.000 0.000 1.000 N NA
 7057469 7057470 GAU_0268 GAU_0269     TRUE 0.980 -3.000 0.917 NA   NA
 7057470 7057471 GAU_0269 GAU_0270     TRUE 0.980 -3.000 0.875 NA   NA
 7057471 7057472 GAU_0270 GAU_0271     TRUE 0.981 -3.000 0.864 NA   NA
 7057473 7057474 GAU_0272 GAU_0273 nox   FALSE 0.338 86.000 0.000 1.000 N NA
 7057477 7057478 GAU_0275 GAU_0276     TRUE 0.970 39.000 0.167 NA Y NA
 7057479 7057480 GAU_0277 GAU_0278     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057480 7057481 GAU_0278 GAU_0279   nhaA TRUE 0.645 18.000 0.000 1.000   NA
 7057482 7057483 GAU_0280 GAU_0281     TRUE 0.567 21.000 0.000 NA   NA
 7057483 7057484 GAU_0281 GAU_0282     FALSE 0.347 50.000 0.000 NA   NA
 7057484 7057485 GAU_0282 GAU_0283     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057485 7057486 GAU_0283 GAU_0284   cysE TRUE 0.777 -34.000 0.000 1.000   NA
 7057486 7057487 GAU_0284 GAU_0285 cysE cysK TRUE 0.759 68.000 0.000 0.001 Y NA
 7057487 7057488 GAU_0285 GAU_0286 cysK   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057488 7057489 GAU_0286 GAU_0287     TRUE 0.592 19.000 0.000 NA   NA
 7057492 7057493 GAU_0290 GAU_0291     FALSE 0.318 65.000 0.000 NA   NA
 7057493 7057494 GAU_0291 GAU_0292     TRUE 0.986 4.000 0.800 NA   NA
 7057494 7057495 GAU_0292 GAU_0293     TRUE 0.715 11.000 0.000 NA   NA
 7057497 7057498 GAU_0295 GAU_0296 motB motA TRUE 0.955 4.000 0.000 1.000 Y NA
 7057500 7057501 GAU_0298 GAU_0299   flgK TRUE 0.854 6.000 0.000 1.000 N NA
 7057501 7057502 GAU_0299 GAU_0300 flgK   TRUE 0.993 2.000 0.050 0.002   NA
 7057502 7057503 GAU_0300 GAU_0301     FALSE 0.322 63.000 0.000 NA   NA
 7057503 7057504 GAU_0301 GAU_0302   flgI TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057504 7057505 GAU_0302 GAU_0303 flgI flgH TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.007 Y NA
 7057505 7057506 GAU_0303 GAU_0304 flgH   TRUE 0.715 11.000 0.000 NA   NA
 7057506 7057507 GAU_0304 GAU_0305   flgG TRUE 0.980 10.000 0.014 NA   NA
 7057507 7057508 GAU_0305 GAU_0306 flgG flgF TRUE 0.948 10.000 0.000 0.004 Y NA
 7057509 7057510 GAU_0307 GAU_0308     TRUE 0.995 -3.000 0.292 1.000 Y NA
 7057510 7057511 GAU_0308 GAU_0309     TRUE 0.992 -7.000 0.792 1.000 Y NA
 7057512 7057513 GAU_0310 GAU_0311   fliA TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7057513 7057514 GAU_0311 GAU_0312 fliA flhG TRUE 0.474 36.000 0.000 1.000 N NA
 7057514 7057515 GAU_0312 GAU_0313 flhG flhF TRUE 0.982 12.000 0.083 1.000   NA
 7057515 7057516 GAU_0313 GAU_0314 flhF flhA TRUE 0.985 -7.000 0.440 1.000   NA
 7057516 7057517 GAU_0314 GAU_0315 flhA flhB TRUE 0.994 11.000 0.012 0.012 Y NA
 7057517 7057518 GAU_0315 GAU_0316 flhB fliR TRUE 0.946 7.000 0.000 1.000 Y NA
 7057518 7057519 GAU_0316 GAU_0317 fliR fliQ TRUE 0.974 32.000 0.500 1.000 Y NA
 7057521 7057522 GAU_0319 GAU_0320 fliP fliN FALSE 0.230 1185.000 0.000 1.000 Y NA
 7057522 7057523 GAU_0320 GAU_0321 fliN fliM TRUE 0.962 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7057523 7057524 GAU_0321 GAU_0322 fliM fliL TRUE 0.975 41.000 0.016 0.001 Y NA
 7057524 7057525 GAU_0322 GAU_0323 fliL flgE FALSE 0.348 291.000 0.000 0.007 Y NA
 7057525 7057526 GAU_0323 GAU_0324 flgE flgD TRUE 0.977 30.000 0.298 NA Y NA
 7057526 7057527 GAU_0324 GAU_0325 flgD   TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057527 7057528 GAU_0325 GAU_0326     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7057528 7057529 GAU_0326 GAU_0327   fliJ TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7057529 7057530 GAU_0327 GAU_0328 fliJ fliI TRUE 0.996 0.000 0.241 1.000 Y NA
 7057530 7057531 GAU_0328 GAU_0329 fliI   TRUE 0.993 9.000 0.018 NA Y NA
 7057531 7057532 GAU_0329 GAU_0330   fliG TRUE 0.994 -16.000 0.320 NA Y NA
 7057532 7057533 GAU_0330 GAU_0331 fliG fliF TRUE 0.992 15.000 0.477 0.005 Y NA
 7057533 7057534 GAU_0331 GAU_0332 fliF fliE TRUE 0.989 19.000 0.008 0.005 Y NA
 7057534 7057535 GAU_0332 GAU_0333 fliE   FALSE 0.262 86.000 0.000 NA   NA
 7057535 7057536 GAU_0333 GAU_0334   flgC FALSE 0.144 140.000 0.000 NA   NA
 7057536 7057537 GAU_0334 GAU_0335 flgC   FALSE 0.331 57.000 0.000 NA   NA
 7057537 7057538 GAU_0335 GAU_0336     FALSE 0.090 222.000 0.000 NA   NA
 7057539 7057540 GAU_0337 GAU_0338 flgL   TRUE 0.552 22.000 0.000 NA   NA
 7057541 7057542 GAU_0339 GAU_0340     TRUE 0.769 8.000 0.000 NA   NA
 7057542 7057543 GAU_0340 GAU_0341     TRUE 0.813 5.000 0.000 NA   NA
 7057543 7057544 GAU_0341 GAU_0342     TRUE 0.978 15.000 0.153 1.000   NA
 7057544 7057545 GAU_0342 GAU_0343     FALSE 0.131 178.000 0.000 1.000   NA
 7057545 7057546 GAU_0343 GAU_0344     TRUE 0.594 22.000 0.000 1.000   NA
 7057546 7057547 GAU_0344 GAU_0345     TRUE 0.905 0.000 0.000 0.001   NA
 7057547 7057548 GAU_0345 GAU_0346     FALSE 0.370 57.000 0.000 1.000   NA
 7057548 7057549 GAU_0346 GAU_0347     TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.059 Y NA
 7057549 7057550 GAU_0347 GAU_0348     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057550 7057551 GAU_0348 GAU_0349     FALSE 0.268 84.000 0.000 NA   NA
 7057551 7057552 GAU_0349 GAU_0350     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7057552 7057553 GAU_0350 GAU_0351     FALSE 0.113 177.000 0.000 NA   NA
 7057554 7057555 GAU_0352 GAU_0353 hag fliD TRUE 0.609 91.000 0.000 1.000 Y NA
 7057555 7057556 GAU_0353 GAU_0354 fliD fliS TRUE 0.755 68.000 0.000 0.002 Y NA
 7057556 7057557 GAU_0354 GAU_0355 fliS   TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057557 7057558 GAU_0355 GAU_0356     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7057558 7057559 GAU_0356 GAU_0357     FALSE 0.292 75.000 0.000 NA   NA
 7057559 7057560 GAU_0357 GAU_0358   cheY FALSE 0.392 43.000 0.000 1.000   NA
 7057560 7057561 GAU_0358 GAU_0359 cheY   TRUE 0.982 11.000 0.125 NA   NA
 7057561 7057562 GAU_0359 GAU_0360   cheA FALSE 0.060 752.000 0.000 NA   NA
 7057562 7057563 GAU_0360 GAU_0361 cheA cheW TRUE 0.593 119.000 0.000 0.010 Y NA
 7057563 7057564 GAU_0361 GAU_0362 cheW cheR TRUE 0.730 39.000 0.000 1.000 Y NA
 7057564 7057565 GAU_0362 GAU_0363 cheR cheD TRUE 0.956 3.000 0.000 1.000 Y NA
 7057565 7057566 GAU_0363 GAU_0364 cheD cheY TRUE 0.890 16.000 0.000 1.000 Y NA
 7057566 7057567 GAU_0364 GAU_0365 cheY   TRUE 0.908 65.000 0.071 NA   NA
 7057567 7057568 GAU_0365 GAU_0366   cheB TRUE 0.882 87.000 0.083 NA   NA
 7057570 7057571 GAU_0368 GAU_0369     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057571 7057572 GAU_0369 GAU_0370     TRUE 0.499 28.000 0.000 1.000   NA
 7057572 7057573 GAU_0370 GAU_0371     FALSE 0.115 202.000 0.000 1.000   NA
 7057574 7057575 GAU_0372 GAU_0373     TRUE 0.992 -58.000 0.750 1.000 Y NA
 7057575 7057576 GAU_0373 GAU_0374     TRUE 0.783 11.000 0.000 1.000 N NA
 7057576 7057577 GAU_0374 GAU_0375     TRUE 0.664 14.000 0.000 NA   NA
 7057578 7057579 GAU_0376 GAU_0377     TRUE 0.934 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 7057579 7057580 GAU_0377 GAU_0378     TRUE 0.915 48.000 0.671 1.000 N NA
 7057582 7057583 GAU_0380 GAU_0381     TRUE 0.986 8.000 0.790 0.041   NA
 7057583 7057584 GAU_0381 GAU_0382     TRUE 0.716 13.000 0.000 1.000   NA
 7057584 7057585 GAU_0382 GAU_0383     TRUE 0.785 -19.000 0.000 NA N NA
 7057586 7057587 GAU_0384 GAU_0385     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 7057587 7057588 GAU_0385 GAU_0386     TRUE 0.995 -3.000 0.242 NA Y NA
 7057591 7057592 GAU_0389 GAU_0390   sucA FALSE 0.358 79.000 0.000 1.000 N NA
 7057592 7057593 GAU_0390 GAU_0391 sucA   FALSE 0.199 110.000 0.000 NA   NA
 7057593 7057594 GAU_0391 GAU_0392     FALSE 0.150 136.000 0.000 NA   NA
 7057595 7057596 GAU_0393 GAU_0394     FALSE 0.354 66.000 0.000 1.000   NA
 7057597 7057598 GAU_0395 GAU_0396 ndh   FALSE 0.293 100.000 0.000 1.000 N NA
 7057598 7057599 GAU_0396 GAU_0397     TRUE 0.966 4.000 0.000 0.033 Y NA
 7057601 7057602 GAU_0399 GAU_0400     TRUE 0.980 -3.000 0.914 NA   NA
 7057603 7057604 GAU_0401 GAU_0402     FALSE 0.196 111.000 0.000 NA   NA
 7057604 7057605 GAU_0402 GAU_0403   hypE TRUE 0.779 9.000 0.000 1.000   NA
 7057605 7057606 GAU_0403 GAU_0404 hypE hypD TRUE 0.995 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 7057606 7057607 GAU_0404 GAU_0405 hypD hypC TRUE 0.994 -3.000 0.025 NA Y NA
 7057607 7057608 GAU_0405 GAU_0406 hypC   TRUE 0.989 3.000 0.025 NA   NA
 7057608 7057609 GAU_0406 GAU_0407     TRUE 0.989 0.000 0.361 NA   NA
 7057609 7057610 GAU_0407 GAU_0408     TRUE 0.988 6.000 0.438 NA   NA
 7057610 7057611 GAU_0408 GAU_0409     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057611 7057612 GAU_0409 GAU_0410     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057612 7057613 GAU_0410 GAU_0411     TRUE 0.987 -3.000 0.061 NA   NA
 7057613 7057614 GAU_0411 GAU_0412     TRUE 0.986 22.000 0.347 1.000 Y NA
 7057614 7057615 GAU_0412 GAU_0413     TRUE 0.967 63.000 0.750 0.001 Y NA
 7057615 7057616 GAU_0413 GAU_0414     FALSE 0.166 164.000 0.000 1.000 N NA
 7057616 7057617 GAU_0414 GAU_0415     TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.041 Y NA
 7057617 7057618 GAU_0415 GAU_0416   hypB TRUE 0.665 20.000 0.000 1.000 N NA
 7057618 7057619 GAU_0416 GAU_0417 hypB hypA TRUE 0.991 -3.000 0.063 0.001   NA
 7057619 7057620 GAU_0417 GAU_0418 hypA   TRUE 0.680 13.000 0.000 NA   NA
 7057621 7057622 GAU_0419 GAU_0420 hypF   TRUE 0.828 6.000 0.000 1.000   NA
 7057626 7057627 GAU_0424 GAU_0425     FALSE 0.377 37.000 0.000 NA   NA
 7057628 7057629 GAU_0426 GAU_0427     FALSE 0.230 109.000 0.000 1.000   NA
 7057629 7057630 GAU_0427 GAU_0428     TRUE 0.988 -3.000 0.720 0.042   NA
 7057630 7057631 GAU_0428 GAU_0429     TRUE 0.959 21.000 0.006 1.000   NA
 7057631 7057632 GAU_0429 GAU_0430     TRUE 0.991 3.000 0.143 1.000   NA
 7057632 7057633 GAU_0430 GAU_0431     FALSE 0.329 58.000 0.000 NA   NA
 7057633 7057634 GAU_0431 GAU_0432     FALSE 0.152 135.000 0.000 NA   NA
 7057634 7057635 GAU_0432 GAU_0433     FALSE 0.354 42.000 0.000 NA   NA
 7057636 7057637 GAU_0434 GAU_0435 nadB nadA TRUE 0.976 55.000 0.210 0.002 Y NA
 7057637 7057638 GAU_0435 GAU_0436 nadA nadC TRUE 0.997 -3.000 0.198 0.002 Y NA
 7057638 7057639 GAU_0436 GAU_0437 nadC   TRUE 0.802 6.000 0.000 NA   NA
 7057639 7057640 GAU_0437 GAU_0438     TRUE 0.880 89.000 0.085 NA   NA
 7057640 7057641 GAU_0438 GAU_0439     FALSE 0.434 48.000 0.000 1.000 N NA
 7057642 7057643 GAU_0440 GAU_0441     FALSE 0.131 184.000 0.000 NA N NA
 7057644 7057645 GAU_0442 GAU_0443   crcB TRUE 0.723 13.000 0.000 NA N NA
 7057645 7057646 GAU_0443 GAU_0444 crcB   FALSE 0.214 120.000 0.000 NA N NA
 7057647 7057648 GAU_0445 GAU_0446     FALSE 0.124 223.000 0.000 1.000 N NA
 7057649 7057650 GAU_0447 GAU_0448     FALSE 0.417 32.000 0.000 NA   NA
 7057650 7057651 GAU_0448 GAU_0449     FALSE 0.337 55.000 0.000 NA   NA
 7057651 7057652 GAU_0449 GAU_0450     FALSE 0.076 288.000 0.000 NA   NA
 7057655 7057656 GAU_0453 GAU_0454     FALSE 0.385 36.000 0.000 NA   NA
 7057657 7057658 GAU_0455 GAU_0456     FALSE 0.092 218.000 0.000 NA   NA
 7057658 7057659 GAU_0456 GAU_0457     FALSE 0.063 566.000 0.000 NA   NA
 7057664 7057665 GAU_0462 GAU_0463     TRUE 0.885 0.000 0.000 0.050   NA
 7057665 7057666 GAU_0463 GAU_0464     FALSE 0.120 165.000 0.000 NA   NA
 7057666 7057667 GAU_0464 GAU_0465     TRUE 0.788 7.000 0.000 NA   NA
 7057667 7057668 GAU_0465 GAU_0466     FALSE 0.279 79.000 0.000 NA   NA
 7057668 7057669 GAU_0466 GAU_0467     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057669 7057670 GAU_0467 GAU_0468   rnhA FALSE 0.360 40.000 0.000 NA   NA
 7057670 7057671 GAU_0468 GAU_0469 rnhA   TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057671 7057672 GAU_0469 GAU_0470     FALSE 0.088 229.000 0.000 NA   NA
 7057672 7057673 GAU_0470 GAU_0471     TRUE 0.846 3.000 0.000 1.000   NA
 7057673 7057674 GAU_0471 GAU_0472     TRUE 0.731 10.000 0.000 NA   NA
 7057675 7057676 GAU_0473 GAU_0474     FALSE 0.227 125.000 0.000 1.000 N NA
 7057676 7057677 GAU_0474 GAU_0475     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057678 7057679 GAU_0476 GAU_0477 lpd   TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 7057679 7057680 GAU_0477 GAU_0478     FALSE 0.348 48.000 0.000 NA   NA
 7057683 7057684 GAU_0481 GAU_0482     TRUE 0.552 22.000 0.000 NA   NA
 7057684 7057685 GAU_0482 GAU_0483     FALSE 0.166 127.000 0.000 NA   NA
 7057685 7057686 GAU_0483 GAU_0484   gyrA FALSE 0.122 162.000 0.000 NA   NA
 7057686 7057687 GAU_0484 GAU_0485 gyrA   FALSE 0.345 84.000 0.000 1.000 N NA
 7057688 7057689 GAU_0486 GAU_0487   cobS TRUE 0.930 42.000 0.102 NA N NA
 7057689 7057690 GAU_0487 GAU_0488 cobS cobT TRUE 0.996 -3.000 0.164 0.006 Y NA
 7057690 7057691 GAU_0488 GAU_0489 cobT cobO TRUE 0.995 -3.000 0.005 0.006 Y NA
 7057691 7057692 GAU_0489 GAU_0490 cobO   TRUE 0.962 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7057692 7057693 GAU_0490 GAU_0491     TRUE 0.812 -13.000 0.000 1.000 N NA
 7057693 7057694 GAU_0491 GAU_0492   cobD TRUE 0.980 15.000 0.193 1.000 N NA
 7057694 7057695 GAU_0492 GAU_0493 cobD   TRUE 0.821 1.000 0.000 NA   NA
 7057695 7057696 GAU_0493 GAU_0494   btuB TRUE 0.620 17.000 0.000 NA   NA
 7057696 7057697 GAU_0494 GAU_0495 btuB btuC FALSE 0.308 234.000 0.000 1.000 Y NA
 7057697 7057698 GAU_0495 GAU_0496 btuC btuD TRUE 0.955 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7057698 7057699 GAU_0496 GAU_0497 btuD btuF TRUE 0.955 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7057700 7057701 GAU_0498 GAU_0499 cobQ cobU TRUE 0.988 18.000 0.031 1.000 Y NA
 7057704 7057705 GAU_0502 GAU_0503     TRUE 0.815 -3.000 0.000 NA N NA
 7057706 7057707 GAU_0504 GAU_0505 ctaC ctaD TRUE 0.984 31.000 0.122 0.002 Y NA
 7057707 7057708 GAU_0505 GAU_0506 ctaD ctaE TRUE 0.997 2.000 0.333 0.002 Y NA
 7057708 7057709 GAU_0506 GAU_0507 ctaE   TRUE 0.813 5.000 0.000 NA   NA
 7057709 7057710 GAU_0507 GAU_0508   ctaG FALSE 0.142 142.000 0.000 NA   NA
 7057710 7057711 GAU_0508 GAU_0509 ctaG   TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057713 7057714 GAU_0511 GAU_0512     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057714 7057715 GAU_0512 GAU_0513   dacC TRUE 0.813 5.000 0.000 NA   NA
 7057716 7057717 GAU_0514 GAU_0515     FALSE 0.175 122.000 0.000 NA   NA
 7057717 7057718 GAU_0515 GAU_0516   aspA FALSE 0.357 41.000 0.000 NA   NA
 7057719 7057720 GAU_0517 GAU_0518   leuS FALSE 0.098 333.000 0.000 1.000 N NA
 7057720 7057721 GAU_0518 GAU_0519 leuS   FALSE 0.452 39.000 0.000 1.000 N NA
 7057721 7057722 GAU_0519 GAU_0520     TRUE 0.815 7.000 0.000 1.000   NA
 7057722 7057723 GAU_0520 GAU_0521     FALSE 0.145 159.000 0.000 1.000   NA
 7057723 7057724 GAU_0521 GAU_0522     FALSE 0.394 51.000 0.000 NA N NA
 7057725 7057726 GAU_0523 GAU_0524 kup   FALSE 0.096 357.000 0.000 1.000 N NA
 7057726 7057727 GAU_0524 GAU_0525     FALSE 0.465 27.000 0.000 NA   NA
 7057727 7057728 GAU_0525 GAU_0526     TRUE 0.620 17.000 0.000 NA   NA
 7057728 7057729 GAU_0526 GAU_0527     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057729 7057730 GAU_0527 GAU_0528     FALSE 0.187 117.000 0.000 NA   NA
 7057730 7057731 GAU_0528 GAU_0529     FALSE 0.070 335.000 0.000 NA   NA
 7057731 7057732 GAU_0529 GAU_0530     TRUE 0.633 19.000 0.000 1.000   NA
 7057732 7057733 GAU_0530 GAU_0531     TRUE 0.465 37.000 0.000 1.000 N NA
 7057733 7057734 GAU_0531 GAU_0532     TRUE 0.621 23.000 0.000 1.000 N NA
 7057734 7057735 GAU_0532 GAU_0533     FALSE 0.068 369.000 0.000 NA   NA
 7057735 7057736 GAU_0533 GAU_0534     TRUE 0.513 24.000 0.000 NA   NA
 7057736 7057737 GAU_0534 GAU_0535   nth FALSE 0.419 56.000 0.000 1.000 N NA
 7057737 7057738 GAU_0535 GAU_0536 nth   TRUE 0.631 102.000 0.000 0.041 Y NA
 7057738 7057739 GAU_0536 GAU_0537     FALSE 0.228 98.000 0.000 NA   NA
 7057739 7057740 GAU_0537 GAU_0538     FALSE 0.399 34.000 0.000 NA   NA
 7057744 7057745 GAU_0542 GAU_0543     FALSE 0.358 64.000 0.000 1.000   NA
 7057745 7057746 GAU_0543 GAU_0544     FALSE 0.090 283.000 0.000 1.000   NA
 7057746 7057747 GAU_0544 GAU_0545     FALSE 0.093 214.000 0.000 NA   NA
 7057747 7057748 GAU_0545 GAU_0546     FALSE 0.109 184.000 0.000 NA   NA
 7057748 7057749 GAU_0546 GAU_0547     FALSE 0.148 138.000 0.000 NA   NA
 7057749 7057750 GAU_0547 GAU_0548     TRUE 0.748 9.000 0.000 NA   NA
 7057753 7057754 GAU_0551 GAU_0552     FALSE 0.456 28.000 0.000 NA   NA
 7057754 7057755 GAU_0552 GAU_0553     TRUE 0.747 -25.000 0.000 NA   NA
 7057756 7057757 GAU_0554 GAU_0555     FALSE 0.139 196.000 0.000 1.000 N NA
 7057759 7057760 GAU_0557 GAU_0558 asnB   TRUE 0.916 12.000 0.000 1.000 Y NA
 7057761 7057762 GAU_0559 GAU_0560 metH   FALSE 0.094 213.000 0.000 NA   NA
 7057762 7057763 GAU_0560 GAU_0561     TRUE 0.990 0.000 0.250 NA   NA
 7057763 7057764 GAU_0561 GAU_0562     TRUE 0.580 20.000 0.000 NA   NA
 7057764 7057765 GAU_0562 GAU_0563     TRUE 0.926 14.000 0.000 0.016 Y NA
 7057765 7057766 GAU_0563 GAU_0564     FALSE 0.100 237.000 0.000 1.000   NA
 7057766 7057767 GAU_0564 GAU_0565     TRUE 0.751 -12.000 0.000 NA   NA
 7057768 7057769 GAU_0566 GAU_0567     TRUE 0.752 -10.000 0.000 NA   NA
 7057773 7057774 GAU_0571 GAU_0572 gltA algI FALSE 0.314 83.000 0.000 NA N NA
 7057774 7057775 GAU_0572 GAU_0573 algI   TRUE 0.925 54.000 0.088 NA N NA
 7057775 7057776 GAU_0573 GAU_0574     TRUE 0.782 -10.000 0.000 1.000   NA
 7057776 7057777 GAU_0574 GAU_0575     TRUE 0.860 -3.000 0.000 0.057   NA
 7057777 7057778 GAU_0575 GAU_0576     TRUE 0.828 6.000 0.000 1.000   NA
 7057778 7057779 GAU_0576 GAU_0577     FALSE 0.187 129.000 0.000 1.000   NA
 7057779 7057780 GAU_0577 GAU_0578     TRUE 0.946 7.000 0.000 1.000 Y NA
 7057781 7057782 GAU_0579 GAU_0580     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 7057783 7057784 GAU_0581 GAU_0582     FALSE 0.074 296.000 0.000 NA   NA
 7057789 7057790 GAU_0587 GAU_0588     FALSE 0.142 142.000 0.000 NA   NA
 7057790 7057791 GAU_0588 GAU_0589   rmlB FALSE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 7057791 7057792 GAU_0589 GAU_0590 rmlB   FALSE 0.146 139.000 0.000 NA   NA
 7057795 7057796 GAU_0593 GAU_0594 chlI   TRUE 0.548 25.000 0.000 NA N NA
 7057798 7057799 GAU_0596 GAU_0597     TRUE 0.749 -16.000 0.000 NA   NA
 7057799 7057800 GAU_0597 GAU_0598   glcF TRUE 0.813 5.000 0.000 NA   NA
 7057800 7057801 GAU_0598 GAU_0599 glcF glcE TRUE 0.769 44.000 0.000 0.038 Y NA
 7057801 7057802 GAU_0599 GAU_0600 glcE glcD TRUE 0.995 9.000 0.013 0.009 Y NA
 7057802 7057803 GAU_0600 GAU_0601 glcD   FALSE 0.422 55.000 0.000 1.000 N NA
 7057803 7057804 GAU_0601 GAU_0602     FALSE 0.229 154.000 0.000 0.080 N NA
 7057804 7057805 GAU_0602 GAU_0603   aroB FALSE 0.113 251.000 0.000 1.000 N NA
 7057805 7057806 GAU_0603 GAU_0604 aroB   TRUE 0.846 3.000 0.000 1.000   NA
 7057808 7057809 GAU_0606 GAU_0607     TRUE 0.894 20.000 0.000 0.041 Y NA
 7057810 7057811 GAU_0608 GAU_0609     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7057811 7057812 GAU_0609 GAU_0610     TRUE 0.567 21.000 0.000 NA   NA
 7057812 7057813 GAU_0610 GAU_0611     FALSE 0.289 91.000 0.000 NA N NA
 7057815 7057816 GAU_0613 GAU_0614     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057816 7057817 GAU_0614 GAU_0615     FALSE 0.385 36.000 0.000 NA   NA
 7057818 7057819 GAU_0616 GAU_0617 feoB feoA FALSE 0.285 90.000 0.000 1.000   NA
 7057819 7057820 GAU_0617 GAU_0618 feoA lgt FALSE 0.253 101.000 0.000 1.000   NA
 7057820 7057821 GAU_0618 GAU_0619 lgt gcp TRUE 0.861 92.000 0.003 1.000 N NA
 7057821 7057822 GAU_0619 GAU_0620 gcp resA FALSE 0.387 170.000 0.000 1.000 Y NA
 7057822 7057823 GAU_0620 GAU_0621 resA rpe TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7057823 7057824 GAU_0621 GAU_0622 rpe   TRUE 0.479 30.000 0.000 1.000   NA
 7057824 7057825 GAU_0622 GAU_0623     TRUE 0.763 10.000 0.000 1.000   NA
 7057825 7057826 GAU_0623 GAU_0624   fmt TRUE 0.955 84.000 0.305 1.000 Y NA
 7057826 7057827 GAU_0624 GAU_0625 fmt def TRUE 0.920 15.000 0.000 0.025 Y NA
 7057827 7057828 GAU_0625 GAU_0626 def yajC TRUE 0.668 17.000 0.000 NA N NA
 7057828 7057829 GAU_0626 GAU_0627 yajC tgt TRUE 0.988 -3.000 0.325 NA N NA
 7057829 7057830 GAU_0627 GAU_0628 tgt queA TRUE 0.995 11.000 0.360 0.001 Y NA
 7057830 7057831 GAU_0628 GAU_0629 queA ruvB TRUE 0.889 94.000 0.069 1.000 N NA
 7057832 7057833 GAU_0630 GAU_0631     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057833 7057834 GAU_0631 GAU_0632     TRUE 0.985 -3.000 0.605 NA   NA
 7057835 7057836 GAU_0633 GAU_0634 ruvA ruvC TRUE 0.996 -3.000 0.451 0.008 Y NA
 7057836 7057837 GAU_0634 GAU_0635 ruvC   TRUE 0.987 -3.000 0.277 NA   NA
 7057837 7057838 GAU_0635 GAU_0636     FALSE 0.175 122.000 0.000 NA   NA
 7057838 7057839 GAU_0636 GAU_0637     TRUE 0.813 5.000 0.000 NA   NA
 7057840 7057841 GAU_0638 GAU_0639   msbA TRUE 0.537 29.000 0.000 1.000 N NA
 7057841 7057842 GAU_0639 GAU_0640 msbA   TRUE 0.821 7.000 0.000 NA N NA
 7057842 7057843 GAU_0640 GAU_0641     TRUE 0.815 -3.000 0.000 NA N NA
 7057843 7057844 GAU_0641 GAU_0642     TRUE 0.713 51.000 0.000 1.000 Y NA
 7057846 7057847 GAU_0644 GAU_0645     TRUE 0.753 13.000 0.000 1.000 N NA
 7057847 7057848 GAU_0645 GAU_0646     FALSE 0.121 230.000 0.000 1.000 N NA
 7057849 7057850 GAU_0647 GAU_0648     TRUE 0.680 13.000 0.000 NA   NA
 7057850 7057851 GAU_0648 GAU_0649     FALSE 0.112 180.000 0.000 NA   NA
 7057851 7057852 GAU_0649 GAU_0650     TRUE 0.731 10.000 0.000 NA   NA
 7057852 7057853 GAU_0650 GAU_0651     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057853 7057854 GAU_0651 GAU_0652     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057855 7057856 GAU_0653 GAU_0654     FALSE 0.162 129.000 0.000 NA   NA
 7057856 7057857 GAU_0654 GAU_0655   mgh FALSE 0.160 130.000 0.000 NA   NA
 7057858 7057859 GAU_0656 GAU_0657 kbl   TRUE 0.920 53.000 0.547 1.000 N NA
 7057861 7057862 GAU_0659 GAU_0660     FALSE 0.092 217.000 0.000 NA   NA
 7057864 7057865 GAU_0662 GAU_0663     FALSE 0.183 119.000 0.000 NA   NA
 7057865 7057866 GAU_0663 GAU_0664     FALSE 0.205 108.000 0.000 NA   NA
 7057866 7057867 GAU_0664 GAU_0665     TRUE 0.552 22.000 0.000 NA   NA
 7057867 7057868 GAU_0665 GAU_0666     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057868 7057869 GAU_0666 GAU_0667   rho TRUE 0.854 6.000 0.000 1.000 N NA
 7057869 7057870 GAU_0667 GAU_t0002 rho   FALSE 0.237 95.000 0.000 NA   NA
 7057870 7057871 GAU_t0002 GAU_0668     FALSE 0.259 87.000 0.000 NA   NA
 7057874 7057875 GAU_0671 GAU_0672     FALSE 0.456 28.000 0.000 NA   NA
 7057875 7057876 GAU_0672 GAU_0673     FALSE 0.399 34.000 0.000 NA   NA
 7057876 7057877 GAU_0673 GAU_0674     FALSE 0.088 228.000 0.000 NA   NA
 7057877 7057878 GAU_0674 GAU_0675     FALSE 0.226 99.000 0.000 NA   NA
 7057878 7057879 GAU_0675 GAU_0676     FALSE 0.162 129.000 0.000 NA   NA
 7057879 7057880 GAU_0676 GAU_0677     FALSE 0.349 47.000 0.000 NA   NA
 7057882 7057883 GAU_0679 GAU_0680     FALSE 0.120 165.000 0.000 NA   NA
 7057883 7057884 GAU_0680 GAU_0681     FALSE 0.126 158.000 0.000 NA   NA
 7057884 7057885 GAU_0681 GAU_0682     TRUE 0.586 830.000 0.176 NA   NA
 7057885 7057886 GAU_0682 GAU_0683     FALSE 0.452 39.000 0.000 1.000 N NA
 7057887 7057888 GAU_0684 GAU_0685     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7057888 7057889 GAU_0685 GAU_0686     TRUE 0.989 -3.000 0.182 1.000   NA
 7057889 7057890 GAU_0686 GAU_0687     FALSE 0.418 37.000 0.000 1.000   NA
 7057890 7057891 GAU_0687 GAU_0688     FALSE 0.205 108.000 0.000 NA   NA
 7057893 7057894 GAU_0690 GAU_0691     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7057894 7057895 GAU_0691 GAU_0692     FALSE 0.243 93.000 0.000 NA   NA
 7057896 7057897 GAU_0693 GAU_0694   polB FALSE 0.377 37.000 0.000 NA   NA
 7057897 7057898 GAU_0694 GAU_0695 polB   TRUE 0.731 10.000 0.000 NA   NA
 7057899 7057900 GAU_0696 GAU_0697     TRUE 0.995 0.000 0.500 NA Y NA
 7057902 7057903 GAU_0699 GAU_0700     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7057904 7057905 GAU_0701 GAU_0702     FALSE 0.060 951.000 0.000 NA   NA
 7057905 7057906 GAU_0702 GAU_0703     FALSE 0.427 53.000 0.000 1.000 N NA
 7057906 7057907 GAU_0703 GAU_0704     TRUE 0.733 12.000 0.000 1.000   NA
 7057907 7057908 GAU_0704 GAU_0705     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7057908 7057909 GAU_0705 GAU_0706     TRUE 0.496 25.000 0.000 NA   NA
 7057911 7057912 GAU_0708 GAU_0709     TRUE 0.844 -6.000 0.000 0.049   NA
 7057913 7057914 GAU_t0003 GAU_t0004     FALSE 0.393 35.000 0.000 NA   NA
 7057914 7057915 GAU_t0004 GAU_t0005     FALSE 0.187 117.000 0.000 NA   NA
 7057915 7057916 GAU_t0005 GAU_t0006     FALSE 0.342 53.000 0.000 NA   NA
 7057916 7057917 GAU_t0006 GAU_t0007     FALSE 0.254 89.000 0.000 NA   NA
 7057918 7057919 GAU_0710 GAU_0711     FALSE 0.141 195.000 0.000 1.000 N NA
 7057919 7057920 GAU_0711 GAU_0712     TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000 N NA
 7057920 7057921 GAU_0712 GAU_0713     TRUE 0.815 -3.000 0.000 NA N NA
 7057921 7057922 GAU_0713 GAU_0714   atpA FALSE 0.301 87.000 0.000 NA N NA
 7057922 7057923 GAU_0714 GAU_0715 atpA atpG TRUE 0.991 13.000 0.846 0.003 Y NA
 7057923 7057924 GAU_0715 GAU_0716 atpG atpD TRUE 0.981 27.000 0.724 0.003 Y NA
 7057924 7057925 GAU_0716 GAU_0717 atpD atpC TRUE 0.996 3.000 0.837 0.003 Y NA
 7057925 7057926 GAU_0717 GAU_0718 atpC   FALSE 0.125 186.000 0.000 1.000   NA
 7057926 7057927 GAU_0718 GAU_0719     FALSE 0.085 237.000 0.000 NA   NA
 7057927 7057928 GAU_0719 GAU_0720     FALSE 0.065 474.000 0.000 NA   NA
 7057928 7057929 GAU_0720 GAU_0721     TRUE 0.862 76.000 0.800 NA   NA
 7057929 7057930 GAU_0721 GAU_0722     FALSE 0.331 57.000 0.000 NA   NA
 7057930 7057931 GAU_0722 GAU_0723     TRUE 0.788 7.000 0.000 NA   NA
 7057931 7057932 GAU_0723 GAU_0724     FALSE 0.106 187.000 0.000 NA   NA
 7057933 7057934 GAU_0725 GAU_0726     TRUE 0.474 36.000 0.000 1.000 N NA
 7057935 7057936 GAU_0727 GAU_0728     TRUE 0.988 5.000 0.500 NA   NA
 7057936 7057937 GAU_0728 GAU_0729     TRUE 0.907 40.000 0.010 NA   NA
 7057938 7057939 GAU_0730 GAU_0731     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 7057939 7057940 GAU_0731 GAU_0732     FALSE 0.326 60.000 0.000 NA   NA
 7057940 7057941 GAU_0732 GAU_0733     TRUE 0.698 12.000 0.000 NA   NA
 7057941 7057942 GAU_0733 GAU_0734   metG FALSE 0.110 183.000 0.000 NA   NA
 7057942 7057943 GAU_0734 GAU_0735 metG   TRUE 0.983 10.000 0.059 NA   NA
 7057943 7057944 GAU_0735 GAU_0736   accA FALSE 0.417 32.000 0.000 NA   NA
 7057944 7057945 GAU_0736 GAU_0737 accA dnaE TRUE 0.952 31.000 0.122 1.000 N NA
 7057947 7057948 GAU_0739 GAU_0740     FALSE 0.263 97.000 0.000 1.000   NA
 7057949 7057950 GAU_0741 GAU_0742     FALSE 0.089 224.000 0.000 NA   NA
 7057951 7057952 GAU_0743 GAU_0744   lipB FALSE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 7057952 7057953 GAU_0744 GAU_0745 lipB   TRUE 0.912 50.000 0.004 1.000 N NA
 7057953 7057954 GAU_0745 GAU_0746     FALSE 0.316 66.000 0.000 NA   NA
 7057954 7057955 GAU_0746 GAU_0747     FALSE 0.428 31.000 0.000 NA   NA
 7057955 7057956 GAU_0747 GAU_0748   pdhC FALSE 0.100 198.000 0.000 NA   NA
 7057956 7057957 GAU_0748 GAU_0749 pdhC pdhB TRUE 0.994 13.000 0.254 0.056 Y NA
 7057957 7057958 GAU_0749 GAU_0750 pdhB pdhA TRUE 0.993 15.000 0.456 0.001 Y NA
 7057958 7057959 GAU_0750 GAU_0751 pdhA lipA FALSE 0.438 43.000 0.000 1.000 N NA
 7057962 7057963 GAU_0754 GAU_0755     FALSE 0.283 78.000 0.000 NA   NA
 7057964 7057965 GAU_0756 GAU_0757     TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7057965 7057966 GAU_0757 GAU_0758     TRUE 0.962 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7057966 7057967 GAU_0758 GAU_0759     TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7057967 7057968 GAU_0759 GAU_0760     TRUE 0.996 -3.000 0.049 0.040 Y NA
 7057968 7057969 GAU_0760 GAU_0761     TRUE 0.966 3.000 0.000 0.040 Y NA
 7057969 7057970 GAU_0761 GAU_0762     FALSE 0.412 59.000 0.000 1.000 N NA
 7057972 7057973 GAU_0764 GAU_0765 gcvH coaE TRUE 0.537 29.000 0.000 1.000 N NA
 7057973 7057974 GAU_0765 GAU_0766 coaE   FALSE 0.302 97.000 0.000 1.000 N NA
 7057976 7057977 GAU_0768 GAU_0769 tdk   TRUE 0.867 4.000 0.000 1.000 N NA
 7057978 7057979 GAU_0770 GAU_0771 aspC   FALSE 0.437 30.000 0.000 NA   NA
 7057981 7057982 GAU_0773 GAU_0774     FALSE 0.364 39.000 0.000 NA   NA
 7057982 7057983 GAU_0774 GAU_0775     TRUE 0.996 4.000 0.083 1.000 Y NA
 7057987 7057988 GAU_0779 GAU_0780   folE TRUE 0.994 -22.000 0.141 1.000 Y NA
 7057988 7057989 GAU_0780 GAU_0781 folE   TRUE 0.748 11.000 0.000 1.000   NA
 7057989 7057990 GAU_0781 GAU_0782     TRUE 0.620 17.000 0.000 NA   NA
 7057991 7057992 GAU_0783 GAU_0784     TRUE 0.990 -3.000 0.036 0.035   NA
 7057992 7057993 GAU_0784 GAU_0785     FALSE 0.268 84.000 0.000 NA   NA
 7057993 7057994 GAU_0785 GAU_0786   parA FALSE 0.417 32.000 0.000 NA   NA
 7057994 7057995 GAU_0786 GAU_0787 parA   TRUE 0.846 3.000 0.000 1.000   NA
 7057997 7057998 GAU_0789 GAU_0790   ligA FALSE 0.257 88.000 0.000 NA   NA
 7058001 7058002 GAU_0793 GAU_0794 pdp   FALSE 0.271 83.000 0.000 NA   NA
 7058002 7058003 GAU_0794 GAU_0795     FALSE 0.160 130.000 0.000 NA   NA
 7058007 7058008 GAU_0799 GAU_0800     FALSE 0.095 211.000 0.000 NA   NA
 7058008 7058009 GAU_0800 GAU_0801     TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000 N NA
 7058009 7058010 GAU_0801 GAU_0802     FALSE 0.396 213.000 0.000 0.020 Y NA
 7058010 7058011 GAU_0802 GAU_0803     FALSE 0.219 114.000 0.000 1.000   NA
 7058013 7058014 GAU_0805 GAU_0806     TRUE 0.676 89.000 0.000 0.039 Y NA
 7058014 7058015 GAU_0806 GAU_0807     TRUE 0.971 18.000 0.143 NA   NA
 7058016 7058017 GAU_0808 GAU_0809     FALSE 0.348 48.000 0.000 NA   NA
 7058019 7058020 GAU_0811 GAU_0812     FALSE 0.087 298.000 0.000 1.000   NA
 7058020 7058021 GAU_0812 GAU_0813   gyrB FALSE 0.394 42.000 0.000 1.000   NA
 7058021 7058022 GAU_0813 GAU_0814 gyrB   TRUE 0.779 134.000 0.028 NA   NA
 7058022 7058023 GAU_0814 GAU_0815   recF TRUE 0.987 -3.000 0.089 NA   NA
 7058023 7058024 GAU_0815 GAU_0816 recF   FALSE 0.458 38.000 0.000 1.000 N NA
 7058025 7058026 GAU_0817 GAU_0818   glpK FALSE 0.386 70.000 0.000 1.000 N NA
 7058026 7058027 GAU_0818 GAU_0819 glpK ccmE FALSE 0.222 127.000 0.000 1.000 N NA
 7058027 7058028 GAU_0819 GAU_0820 ccmE ccmF TRUE 0.981 34.000 0.086 0.003 Y NA
 7058028 7058029 GAU_0820 GAU_0821 ccmF   TRUE 0.901 72.000 0.073 NA   NA
 7058029 7058030 GAU_0821 GAU_0822     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058030 7058031 GAU_0822 GAU_0823     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058032 7058033 GAU_0824 GAU_0825     FALSE 0.122 162.000 0.000 NA   NA
 7058033 7058034 GAU_0825 GAU_0826     TRUE 0.985 -7.000 0.074 NA   NA
 7058034 7058035 GAU_0826 GAU_0827     TRUE 0.555 27.000 0.000 1.000 N NA
 7058036 7058037 GAU_0828 GAU_0829 uvrA sdaB FALSE 0.386 70.000 0.000 1.000 N NA
 7058037 7058038 GAU_0829 GAU_0830 sdaB sdaA TRUE 0.793 42.000 0.000 0.001 Y NA
 7058038 7058039 GAU_0830 GAU_0831 sdaA   TRUE 0.620 17.000 0.000 NA   NA
 7058039 7058040 GAU_0831 GAU_0832     FALSE 0.286 77.000 0.000 NA   NA
 7058040 7058041 GAU_0832 GAU_0833     TRUE 0.989 4.000 0.058 NA   NA
 7058041 7058042 GAU_0833 GAU_0834     FALSE 0.061 722.000 0.000 NA   NA
 7058042 7058043 GAU_0834 GAU_0835   cysS FALSE 0.228 98.000 0.000 NA   NA
 7058043 7058044 GAU_0835 GAU_t0008 cysS   FALSE 0.237 95.000 0.000 NA   NA
 7058044 7058045 GAU_t0008 GAU_t0009     FALSE 0.393 35.000 0.000 NA   NA
 7058045 7058046 GAU_t0009 GAU_t0010     FALSE 0.347 50.000 0.000 NA   NA
 7058046 7058047 GAU_t0010 GAU_0836     FALSE 0.168 126.000 0.000 NA   NA
 7058047 7058048 GAU_0836 GAU_0837     TRUE 0.556 24.000 0.000 1.000   NA
 7058050 7058051 GAU_t0011 GAU_0839     TRUE 0.757 -6.000 0.000 NA   NA
 7058051 7058052 GAU_0839 GAU_0840     TRUE 0.681 68.000 0.000 1.000 Y NA
 7058053 7058054 GAU_0841 GAU_0842     FALSE 0.308 69.000 0.000 NA   NA
 7058054 7058055 GAU_0842 GAU_0843     TRUE 0.565 24.000 0.000 NA N NA
 7058055 7058056 GAU_0843 GAU_0844     TRUE 0.994 -3.000 0.471 NA Y NA
 7058056 7058057 GAU_0844 GAU_0845     TRUE 0.991 12.000 0.586 1.000 Y NA
 7058058 7058059 GAU_0846 GAU_0847     TRUE 0.989 -3.000 0.500 0.038   NA
 7058059 7058060 GAU_0847 GAU_0848   rpmG FALSE 0.102 307.000 0.000 1.000 N NA
 7058060 7058061 GAU_0848 GAU_0849 rpmG secE TRUE 0.992 3.000 0.100 1.000 N NA
 7058061 7058062 GAU_0849 GAU_0850 secE nusG TRUE 0.952 23.000 0.843 1.000 N NA
 7058062 7058063 GAU_0850 GAU_0851 nusG rplK TRUE 0.855 99.000 0.681 1.000 N NA
 7058063 7058064 GAU_0851 GAU_0852 rplK rplA TRUE 0.995 6.000 0.838 0.020 Y NA
 7058064 7058065 GAU_0852 GAU_0853 rplA rplJ TRUE 0.990 16.000 0.302 1.000 Y NA
 7058065 7058066 GAU_0853 GAU_0854 rplJ rplL TRUE 0.934 82.000 0.884 1.000 Y NA
 7058066 7058067 GAU_0854 GAU_0855 rplL rpoB TRUE 0.753 177.000 0.223 1.000   NA
 7058067 7058068 GAU_0855 GAU_0856 rpoB rpoC TRUE 0.990 3.000 0.851 0.001   NA
 7058070 7058071 GAU_0858 GAU_0859   rpsL FALSE 0.097 206.000 0.000 NA   NA
 7058071 7058072 GAU_0859 GAU_0860 rpsL rpsG TRUE 0.996 -3.000 0.620 0.003 Y NA
 7058072 7058073 GAU_0860 GAU_0861 rpsG   FALSE 0.087 230.000 0.000 NA   NA
 7058073 7058074 GAU_0861 GAU_0862     TRUE 0.813 5.000 0.000 NA   NA
 7058074 7058075 GAU_0862 GAU_0863     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7058075 7058076 GAU_0863 GAU_0864     TRUE 0.715 11.000 0.000 NA   NA
 7058077 7058078 GAU_0865 GAU_0866     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058078 7058079 GAU_0866 GAU_0867     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058079 7058080 GAU_0867 GAU_0868   wecB FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 7058080 7058081 GAU_0868 GAU_0869 wecB   FALSE 0.071 329.000 0.000 NA   NA
 7058082 7058083 GAU_0870 GAU_0871 fusA tuf TRUE 0.977 42.000 0.400 0.001 Y NA
 7058083 7058084 GAU_0871 GAU_0872 tuf rpsJ TRUE 0.962 71.000 0.318 1.000 Y NA
 7058084 7058085 GAU_0872 GAU_0873 rpsJ rplC TRUE 0.917 144.000 0.467 0.020 Y NA
 7058085 7058086 GAU_0873 GAU_0874 rplC rplD TRUE 0.997 3.000 0.361 0.014 Y NA
 7058086 7058087 GAU_0874 GAU_0875 rplD rplW TRUE 0.996 4.000 0.513 1.000 Y NA
 7058087 7058088 GAU_0875 GAU_0876 rplW rplB TRUE 0.994 6.000 0.849 1.000 Y NA
 7058088 7058089 GAU_0876 GAU_0877 rplB rpsS TRUE 0.981 25.000 0.820 0.020 Y NA
 7058089 7058090 GAU_0877 GAU_0878 rpsS rplV TRUE 0.996 4.000 0.769 0.020 Y NA
 7058090 7058091 GAU_0878 GAU_0879 rplV rpsC TRUE 0.996 0.000 0.719 0.020 Y NA
 7058091 7058092 GAU_0879 GAU_0880 rpsC rplP TRUE 0.992 12.000 0.828 0.020 Y NA
 7058092 7058093 GAU_0880 GAU_0881 rplP rpmC TRUE 0.994 -10.000 0.802 0.014 Y NA
 7058093 7058094 GAU_0881 GAU_0882 rpmC rpsQ TRUE 0.990 15.000 0.828 0.014 Y NA
 7058094 7058095 GAU_0882 GAU_0883 rpsQ rplN TRUE 0.992 12.000 0.791 0.020 Y NA
 7058095 7058096 GAU_0883 GAU_0884 rplN rplX TRUE 0.952 83.000 0.810 0.020 Y NA
 7058096 7058097 GAU_0884 GAU_0885 rplX rplE TRUE 0.867 192.000 0.758 0.014 Y NA
 7058097 7058098 GAU_0885 GAU_0886 rplE rpsN TRUE 0.988 23.000 0.309 0.014 Y NA
 7058098 7058099 GAU_0886 GAU_0887 rpsN rpsH TRUE 0.974 57.000 0.295 0.014 Y NA
 7058099 7058100 GAU_0887 GAU_0888 rpsH rplF TRUE 0.991 14.000 0.808 0.014 Y NA
 7058100 7058101 GAU_0888 GAU_0889 rplF rplR TRUE 0.996 0.000 0.815 0.014 Y NA
 7058101 7058102 GAU_0889 GAU_0890 rplR rpsE TRUE 0.996 3.000 0.814 0.020 Y NA
 7058102 7058103 GAU_0890 GAU_0891 rpsE rpmD TRUE 0.956 78.000 0.789 0.020 Y NA
 7058103 7058104 GAU_0891 GAU_0892 rpmD rplO TRUE 0.996 5.000 0.653 0.003 Y NA
 7058104 7058105 GAU_0892 GAU_0893 rplO secY TRUE 0.968 18.000 0.730 1.000 N NA
 7058105 7058106 GAU_0893 GAU_0894 secY adk TRUE 0.979 11.000 0.002 1.000 N NA
 7058106 7058107 GAU_0894 GAU_0895 adk map TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000 N NA
 7058109 7058110 GAU_0897 GAU_0898     FALSE 0.337 55.000 0.000 NA   NA
 7058111 7058112 GAU_0899 GAU_0900   suhB FALSE 0.412 59.000 0.000 1.000 N NA
 7058113 7058114 GAU_0901 GAU_0902 trpS   TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058114 7058115 GAU_0902 GAU_0903   pilT FALSE 0.369 76.000 0.000 1.000 N NA
 7058115 7058116 GAU_0903 GAU_0904 pilT   FALSE 0.452 39.000 0.000 1.000 N NA
 7058118 7058119 GAU_0906 GAU_0907   purA FALSE 0.155 134.000 0.000 NA   NA
 7058119 7058120 GAU_0907 GAU_0908 purA   FALSE 0.329 89.000 0.000 1.000 N NA
 7058120 7058121 GAU_0908 GAU_0909   glyQS FALSE 0.369 76.000 0.000 1.000 N NA
 7058121 7058122 GAU_0909 GAU_0910 glyQS   FALSE 0.118 196.000 0.000 1.000   NA
 7058122 7058123 GAU_0910 GAU_0911     FALSE 0.239 106.000 0.000 1.000   NA
 7058123 7058124 GAU_0911 GAU_0912     FALSE 0.399 34.000 0.000 NA   NA
 7058124 7058125 GAU_0912 GAU_0913     FALSE 0.289 76.000 0.000 NA   NA
 7058125 7058126 GAU_0913 GAU_0914     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058126 7058127 GAU_0914 GAU_0915     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058127 7058128 GAU_0915 GAU_0916     TRUE 0.947 29.000 0.193 NA   NA
 7058128 7058129 GAU_0916 GAU_0917     TRUE 0.567 21.000 0.000 NA   NA
 7058129 7058130 GAU_0917 GAU_0918     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058130 7058131 GAU_0918 GAU_0919     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058131 7058132 GAU_0919 GAU_0920     TRUE 0.749 -16.000 0.000 NA   NA
 7058132 7058133 GAU_0920 GAU_0921     TRUE 0.496 25.000 0.000 NA   NA
 7058133 7058134 GAU_0921 GAU_0922   corA TRUE 0.815 -3.000 0.000 NA N NA
 7058134 7058135 GAU_0922 GAU_0923 corA   FALSE 0.251 115.000 0.000 1.000 N NA
 7058135 7058136 GAU_0923 GAU_0924     FALSE 0.438 43.000 0.000 1.000 N NA
 7058136 7058137 GAU_0924 GAU_0925   priA TRUE 0.812 -13.000 0.000 1.000 N NA
 7058137 7058138 GAU_0925 GAU_0926 priA   TRUE 0.537 29.000 0.000 1.000 N NA
 7058140 7058141 GAU_0928 GAU_0929     TRUE 0.802 6.000 0.000 NA   NA
 7058141 7058142 GAU_0929 GAU_0930   ccdA FALSE 0.407 62.000 0.000 1.000 N NA
 7058145 7058146 GAU_0933 GAU_0934 ggt   FALSE 0.337 55.000 0.000 NA   NA
 7058147 7058148 GAU_0935 GAU_0936     TRUE 0.984 -3.000 0.011 NA   NA
 7058148 7058149 GAU_0936 GAU_0937     TRUE 0.985 -3.000 0.004 NA N NA
 7058151 7058152 GAU_0939 GAU_0940     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058152 7058153 GAU_0940 GAU_0941     FALSE 0.354 42.000 0.000 NA   NA
 7058153 7058154 GAU_0941 GAU_0942   nrdJ FALSE 0.074 539.000 0.000 1.000   NA
 7058154 7058155 GAU_0942 GAU_0943 nrdJ   FALSE 0.083 1472.000 0.000 1.000 N NA
 7058155 7058156 GAU_0943 GAU_0944     TRUE 0.986 0.000 0.726 NA   NA
 7058156 7058157 GAU_0944 GAU_0945     FALSE 0.324 61.000 0.000 NA   NA
 7058158 7058159 GAU_0946 GAU_0947     FALSE 0.138 145.000 0.000 NA   NA
 7058160 7058161 GAU_0948 GAU_0949     FALSE 0.348 48.000 0.000 NA   NA
 7058161 7058162 GAU_0949 GAU_0950     FALSE 0.354 42.000 0.000 NA   NA
 7058162 7058163 GAU_0950 GAU_0951     FALSE 0.334 56.000 0.000 NA   NA
 7058163 7058164 GAU_0951 GAU_0952     TRUE 0.986 -10.000 0.061 NA N NA
 7058164 7058165 GAU_0952 GAU_0953     FALSE 0.337 55.000 0.000 NA   NA
 7058165 7058166 GAU_0953 GAU_0954   adh FALSE 0.152 135.000 0.000 NA   NA
 7058167 7058168 GAU_0955 GAU_0956     FALSE 0.178 121.000 0.000 NA   NA
 7058168 7058169 GAU_0956 GAU_0957     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058169 7058170 GAU_0957 GAU_0958     TRUE 0.781 -13.000 0.000 1.000   NA
 7058170 7058171 GAU_0958 GAU_0959     FALSE 0.299 72.000 0.000 NA   NA
 7058172 7058173 GAU_0960 GAU_0961     FALSE 0.170 125.000 0.000 NA   NA
 7058173 7058174 GAU_0961 GAU_0962     FALSE 0.398 46.000 0.000 NA N NA
 7058174 7058175 GAU_0962 GAU_0963     FALSE 0.377 37.000 0.000 NA   NA
 7058176 7058177 GAU_0964 GAU_0965 recQ   FALSE 0.323 62.000 0.000 NA   NA
 7058177 7058178 GAU_0965 GAU_0966     TRUE 0.567 21.000 0.000 NA   NA
 7058180 7058181 GAU_0968 GAU_0969     TRUE 0.919 51.000 0.085 NA   NA
 7058181 7058182 GAU_0969 GAU_0970     FALSE 0.166 141.000 0.000 1.000   NA
 7058182 7058183 GAU_0970 GAU_0971     FALSE 0.298 98.000 0.000 1.000 N NA
 7058183 7058184 GAU_0971 GAU_0972     FALSE 0.366 59.000 0.000 1.000   NA
 7058184 7058185 GAU_0972 GAU_0973     FALSE 0.334 56.000 0.000 NA   NA
 7058185 7058186 GAU_0973 GAU_0974     TRUE 0.496 25.000 0.000 NA   NA
 7058186 7058187 GAU_0974 GAU_0975     FALSE 0.162 129.000 0.000 NA   NA
 7058187 7058188 GAU_0975 GAU_0976     FALSE 0.183 119.000 0.000 NA   NA
 7058189 7058190 GAU_0977 GAU_0978     FALSE 0.074 303.000 0.000 NA   NA
 7058190 7058191 GAU_0978 GAU_0979     TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7058191 7058192 GAU_0979 GAU_0980     FALSE 0.299 72.000 0.000 NA   NA
 7058192 7058193 GAU_0980 GAU_0981     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7058193 7058194 GAU_0981 GAU_0982     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058196 7058197 GAU_0984 GAU_0985     TRUE 0.936 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 7058197 7058198 GAU_0985 GAU_0986     FALSE 0.229 165.000 0.000 0.020 N NA
 7058198 7058199 GAU_0986 GAU_0987     FALSE 0.131 178.000 0.000 1.000   NA
 7058204 7058205 GAU_0992 GAU_0993     FALSE 0.087 232.000 0.000 NA   NA
 7058209 7058210 GAU_0997 GAU_0998     FALSE 0.087 233.000 0.000 NA   NA
 7058212 7058213 GAU_1000 GAU_1001     TRUE 0.592 19.000 0.000 NA   NA
 7058214 7058215 GAU_1002 GAU_1003     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058216 7058217 GAU_1004 GAU_1005     TRUE 0.755 11.000 0.000 NA N NA
 7058219 7058220 GAU_1007 GAU_1008     TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7058222 7058223 GAU_1010 GAU_1011     TRUE 0.479 26.000 0.000 NA   NA
 7058223 7058224 GAU_1011 GAU_1012     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 7058224 7058225 GAU_1012 GAU_1013     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058225 7058226 GAU_1013 GAU_1014     TRUE 0.987 -3.000 0.103 NA   NA
 7058226 7058227 GAU_1014 GAU_1015     FALSE 0.393 35.000 0.000 NA   NA
 7058227 7058228 GAU_1015 GAU_1016     TRUE 0.698 12.000 0.000 NA   NA
 7058233 7058234 GAU_1021 GAU_1022     FALSE 0.123 161.000 0.000 NA   NA
 7058234 7058235 GAU_1022 GAU_1023     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7058235 7058236 GAU_1023 GAU_1024     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058236 7058237 GAU_1024 GAU_1025     TRUE 0.769 8.000 0.000 NA   NA
 7058237 7058238 GAU_1025 GAU_1026     FALSE 0.219 102.000 0.000 NA   NA
 7058240 7058241 GAU_1028 GAU_1029     FALSE 0.162 129.000 0.000 NA   NA
 7058242 7058243 GAU_1030 GAU_1031     TRUE 0.785 -7.000 0.000 1.000   NA
 7058243 7058244 GAU_1031 GAU_1032     TRUE 0.996 -3.000 0.049 0.039 Y NA
 7058244 7058245 GAU_1032 GAU_1033     TRUE 0.956 -3.000 0.000 0.039 Y NA
 7058248 7058249 GAU_1036 GAU_1037     FALSE 0.164 128.000 0.000 NA   NA
 7058249 7058250 GAU_1037 GAU_1038     FALSE 0.320 64.000 0.000 NA   NA
 7058251 7058252 GAU_1039 GAU_1040     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058252 7058253 GAU_1040 GAU_1041     TRUE 0.698 12.000 0.000 NA   NA
 7058255 7058256 GAU_1043 GAU_1044   hppA TRUE 0.665 20.000 0.000 1.000 N NA
 7058257 7058258 GAU_1045 GAU_1046     TRUE 0.716 13.000 0.000 1.000   NA
 7058261 7058262 GAU_1049 GAU_1050     FALSE 0.196 111.000 0.000 NA   NA
 7058264 7058265 GAU_1052 GAU_1053     TRUE 0.952 3.000 0.000 NA Y NA
 7058265 7058266 GAU_1053 GAU_1054     FALSE 0.394 68.000 0.000 1.000 N NA
 7058266 7058267 GAU_1054 GAU_1055     FALSE 0.169 160.000 0.000 1.000 N NA
 7058267 7058268 GAU_1055 GAU_1056     FALSE 0.118 237.000 0.000 1.000 N NA
 7058269 7058270 GAU_1057 GAU_1058 paaG paaH TRUE 0.996 7.000 0.130 1.000 Y NA
 7058270 7058271 GAU_1058 GAU_1059 paaH paaI TRUE 0.988 -3.000 0.080 NA N NA
 7058271 7058272 GAU_1059 GAU_1060 paaI paaJ TRUE 0.899 73.000 0.027 NA N NA
 7058272 7058273 GAU_1060 GAU_1061 paaJ paaY TRUE 0.988 8.000 0.100 1.000   NA
 7058273 7058274 GAU_1061 GAU_1062 paaY paaZ TRUE 0.989 0.000 0.014 1.000   NA
 7058274 7058275 GAU_1062 GAU_1063 paaZ   TRUE 0.676 19.000 0.000 1.000 N NA
 7058278 7058279 GAU_1066 GAU_1067     TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058281 7058282 GAU_1069 GAU_1070     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058282 7058283 GAU_1070 GAU_1071     FALSE 0.076 285.000 0.000 NA   NA
 7058284 7058285 GAU_1072 GAU_1073     FALSE 0.334 56.000 0.000 NA   NA
 7058285 7058286 GAU_1073 GAU_1074     FALSE 0.383 52.000 0.000 1.000   NA
 7058286 7058287 GAU_1074 GAU_1075     TRUE 0.621 23.000 0.000 1.000 N NA
 7058287 7058288 GAU_1075 GAU_1076     FALSE 0.214 120.000 0.000 NA N NA
 7058288 7058289 GAU_1076 GAU_1077     FALSE 0.400 44.000 0.000 NA N NA
 7058289 7058290 GAU_1077 GAU_1078     TRUE 0.988 0.000 0.652 1.000   NA
 7058290 7058291 GAU_1078 GAU_1079     FALSE 0.370 57.000 0.000 1.000   NA
 7058291 7058292 GAU_1079 GAU_1080     TRUE 0.575 23.000 0.000 1.000   NA
 7058292 7058293 GAU_1080 GAU_1081     FALSE 0.411 38.000 0.000 1.000   NA
 7058294 7058295 GAU_1082 GAU_1083   cutC TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058295 7058296 GAU_1083 GAU_1084 cutC   TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7058296 7058297 GAU_1084 GAU_1085     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058301 7058302 GAU_1089 GAU_1090     FALSE 0.262 86.000 0.000 NA   NA
 7058302 7058303 GAU_1090 GAU_1091   gspF FALSE 0.066 410.000 0.000 NA   NA
 7058303 7058304 GAU_1091 GAU_1092 gspF gspE TRUE 0.994 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 7058304 7058305 GAU_1092 GAU_1093 gspE gspD TRUE 0.933 -37.000 0.000 1.000 Y NA
 7058305 7058306 GAU_1093 GAU_1094 gspD   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058306 7058307 GAU_1094 GAU_1095     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058307 7058308 GAU_1095 GAU_1096     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058308 7058309 GAU_1096 GAU_1097     TRUE 0.748 -21.000 0.000 NA   NA
 7058309 7058310 GAU_1097 GAU_1098     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058310 7058311 GAU_1098 GAU_1099     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058311 7058312 GAU_1099 GAU_1100     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058312 7058313 GAU_1100 GAU_1101     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058313 7058314 GAU_1101 GAU_1102     FALSE 0.191 114.000 0.000 NA   NA
 7058315 7058316 GAU_1103 GAU_1104 tal pykA TRUE 0.579 99.000 0.000 1.000 Y NA
 7058316 7058317 GAU_1104 GAU_1105 pykA   TRUE 0.556 24.000 0.000 1.000   NA
 7058317 7058318 GAU_1105 GAU_1106   pgi TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7058318 7058319 GAU_1106 GAU_1107 pgi   TRUE 0.553 134.000 0.000 0.003 Y NA
 7058319 7058320 GAU_1107 GAU_1108     FALSE 0.231 97.000 0.000 NA   NA
 7058320 7058321 GAU_1108 GAU_1109   rbn TRUE 0.746 -40.000 0.000 NA   NA
 7058321 7058322 GAU_1109 GAU_1110 rbn   TRUE 0.522 26.000 0.000 1.000   NA
 7058324 7058325 GAU_srp001 GAU_1112   dnaX FALSE 0.196 111.000 0.000 NA   NA
 7058325 7058326 GAU_1112 GAU_1113 dnaX   TRUE 0.913 53.000 0.411 NA   NA
 7058326 7058327 GAU_1113 GAU_1114   recR TRUE 0.911 39.000 0.604 NA   NA
 7058327 7058328 GAU_1114 GAU_1115 recR   TRUE 0.541 379.000 0.005 NA   NA
 7058328 7058329 GAU_1115 GAU_1116     TRUE 0.974 13.000 0.622 NA   NA
 7058329 7058330 GAU_1116 GAU_1117   pgsA FALSE 0.234 108.000 0.000 1.000   NA
 7058332 7058333 GAU_1119 GAU_1120     FALSE 0.279 79.000 0.000 NA   NA
 7058333 7058334 GAU_1120 GAU_1121     FALSE 0.417 32.000 0.000 NA   NA
 7058334 7058335 GAU_1121 GAU_1122     FALSE 0.115 175.000 0.000 NA   NA
 7058335 7058336 GAU_1122 GAU_1123   grpE FALSE 0.250 102.000 0.000 1.000   NA
 7058336 7058337 GAU_1123 GAU_1124 grpE dnaJ TRUE 0.725 77.000 0.000 0.006 Y NA
 7058337 7058338 GAU_1124 GAU_1125 dnaJ   FALSE 0.237 95.000 0.000 NA   NA
 7058338 7058339 GAU_1125 GAU_1126     TRUE 0.819 4.000 0.000 NA   NA
 7058339 7058340 GAU_1126 GAU_1127     FALSE 0.360 40.000 0.000 NA   NA
 7058341 7058342 GAU_1128 GAU_1129     TRUE 0.977 14.000 0.077 NA   NA
 7058342 7058343 GAU_1129 GAU_1130   mnmA FALSE 0.084 241.000 0.000 NA   NA
 7058343 7058344 GAU_1130 GAU_1131 mnmA   FALSE 0.431 51.000 0.000 1.000 N NA
 7058345 7058346 GAU_1132 GAU_1133     TRUE 0.592 19.000 0.000 NA   NA
 7058347 7058348 GAU_1134 GAU_1135     TRUE 0.620 17.000 0.000 NA   NA
 7058348 7058349 GAU_1135 GAU_1136   hemF FALSE 0.316 66.000 0.000 NA   NA
 7058349 7058350 GAU_1136 GAU_1137 hemF hemE TRUE 0.997 3.000 0.011 0.001 Y NA
 7058350 7058351 GAU_1137 GAU_1138 hemE   FALSE 0.159 173.000 0.000 1.000 N NA
 7058351 7058352 GAU_1138 GAU_1139     TRUE 0.594 119.000 0.000 0.009 Y NA
 7058352 7058353 GAU_1139 GAU_1140     FALSE 0.095 270.000 0.000 NA N NA
 7058353 7058354 GAU_1140 GAU_1141     TRUE 0.874 17.000 0.000 NA Y NA
 7058354 7058355 GAU_1141 GAU_1142     TRUE 0.557 98.000 0.000 NA Y NA
 7058355 7058356 GAU_1142 GAU_1143     TRUE 0.840 22.000 0.000 NA Y NA
 7058356 7058357 GAU_1143 GAU_1144     TRUE 0.666 65.000 0.000 NA Y NA
 7058357 7058358 GAU_1144 GAU_1145     TRUE 0.951 4.000 0.000 NA Y NA
 7058358 7058359 GAU_1145 GAU_1146     TRUE 0.808 25.000 0.000 NA Y NA
 7058359 7058360 GAU_1146 GAU_1147     TRUE 0.933 48.000 0.291 1.000 N NA
 7058360 7058361 GAU_1147 GAU_1148     TRUE 0.823 25.000 0.000 1.000 Y NA
 7058361 7058362 GAU_1148 GAU_1149     FALSE 0.224 100.000 0.000 NA   NA
 7058363 7058364 GAU_1150 GAU_1151     TRUE 0.956 3.000 0.000 1.000 Y NA
 7058365 7058366 GAU_1152 GAU_1153     FALSE 0.080 362.000 0.000 1.000   NA
 7058366 7058367 GAU_1153 GAU_1154     TRUE 0.984 -3.000 0.656 NA   NA
 7058369 7058370 GAU_1156 GAU_1157     TRUE 0.731 10.000 0.000 NA   NA
 7058370 7058371 GAU_1157 GAU_1158     TRUE 0.788 7.000 0.000 NA   NA
 7058372 7058373 GAU_1159 GAU_1160     TRUE 0.841 0.000 0.000 1.000   NA
 7058373 7058374 GAU_1160 GAU_1161     FALSE 0.145 189.000 0.000 1.000 N NA
 7058376 7058377 GAU_1163 GAU_1164     FALSE 0.256 140.000 0.000 0.046 N NA
 7058377 7058378 GAU_1164 GAU_1165     FALSE 0.194 112.000 0.000 NA   NA
 7058378 7058379 GAU_1165 GAU_1166     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058379 7058380 GAU_1166 GAU_1167     TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 7058380 7058381 GAU_1167 GAU_1168     FALSE 0.134 149.000 0.000 NA   NA
 7058381 7058382 GAU_1168 GAU_1169     FALSE 0.325 90.000 0.000 1.000 N NA
 7058382 7058383 GAU_1169 GAU_1170     FALSE 0.121 230.000 0.000 1.000 N NA
 7058383 7058384 GAU_1170 GAU_1171     TRUE 0.731 10.000 0.000 NA   NA
 7058384 7058385 GAU_1171 GAU_1172     TRUE 0.813 5.000 0.000 NA   NA
 7058387 7058388 GAU_1174 GAU_1175   hemL TRUE 0.867 4.000 0.000 1.000 N NA
 7058388 7058389 GAU_1175 GAU_1176 hemL   TRUE 0.854 6.000 0.000 1.000 N NA
 7058389 7058390 GAU_1176 GAU_1177     FALSE 0.342 70.000 0.000 1.000   NA
 7058390 7058391 GAU_1177 GAU_1178     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058391 7058392 GAU_1178 GAU_1179   hyuA TRUE 0.715 11.000 0.000 NA   NA
 7058392 7058393 GAU_1179 GAU_1180 hyuA   TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058393 7058394 GAU_1180 GAU_1181   hyuB TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058395 7058396 GAU_1182 GAU_1183     FALSE 0.376 55.000 0.000 1.000   NA
 7058397 7058398 GAU_1184 GAU_1185 prfA   TRUE 0.985 23.000 0.006 0.038 Y NA
 7058398 7058399 GAU_1185 GAU_1186     FALSE 0.299 72.000 0.000 NA   NA
 7058399 7058400 GAU_1186 GAU_1187   tmk FALSE 0.399 34.000 0.000 NA   NA
 7058400 7058401 GAU_1187 GAU_1188 tmk ctpA TRUE 0.870 86.000 0.002 1.000 N NA
 7058401 7058402 GAU_1188 GAU_1189 ctpA   TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058403 7058404 GAU_1190 GAU_1191 lolA   TRUE 0.496 33.000 0.000 1.000 N NA
 7058404 7058405 GAU_1191 GAU_1192     TRUE 0.763 10.000 0.000 1.000   NA
 7058405 7058406 GAU_1192 GAU_1193     TRUE 0.580 20.000 0.000 NA   NA
 7058406 7058407 GAU_1193 GAU_1194     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058407 7058408 GAU_1194 GAU_1195     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058408 7058409 GAU_1195 GAU_1196     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058410 7058411 GAU_1197 GAU_1198     FALSE 0.447 139.000 0.000 1.000 Y NA
 7058411 7058412 GAU_1198 GAU_1199     FALSE 0.181 120.000 0.000 NA   NA
 7058413 7058414 GAU_1200 GAU_1201     TRUE 0.748 -19.000 0.000 NA   NA
 7058414 7058415 GAU_1201 GAU_1202     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7058415 7058416 GAU_1202 GAU_1203   rplI FALSE 0.095 209.000 0.000 NA   NA
 7058416 7058417 GAU_1203 GAU_1204 rplI   FALSE 0.326 60.000 0.000 NA   NA
 7058417 7058418 GAU_1204 GAU_1205   rpsR TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7058418 7058419 GAU_1205 GAU_1206 rpsR rpsF TRUE 0.997 3.000 0.319 0.014 Y NA
 7058419 7058420 GAU_1206 GAU_1207 rpsF   FALSE 0.104 191.000 0.000 NA   NA
 7058420 7058421 GAU_1207 GAU_1208     FALSE 0.322 63.000 0.000 NA   NA
 7058421 7058422 GAU_1208 GAU_1209     FALSE 0.234 108.000 0.000 1.000   NA
 7058422 7058423 GAU_1209 GAU_1210     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058424 7058425 GAU_1211 GAU_1212     FALSE 0.149 154.000 0.000 1.000   NA
 7058426 7058427 GAU_1213 GAU_1214     FALSE 0.373 56.000 0.000 1.000   NA
 7058427 7058428 GAU_1214 GAU_1215     TRUE 0.867 4.000 0.000 1.000 N NA
 7058428 7058429 GAU_1215 GAU_1216     FALSE 0.205 135.000 0.000 1.000 N NA
 7058429 7058430 GAU_1216 GAU_1217   pth FALSE 0.172 157.000 0.000 1.000 N NA
 7058430 7058431 GAU_1217 GAU_1218 pth rplY TRUE 0.947 106.000 0.496 0.023 Y NA
 7058431 7058432 GAU_1218 GAU_1219 rplY prs TRUE 0.759 148.000 0.006 1.000 N NA
 7058432 7058433 GAU_1219 GAU_t0012 prs   FALSE 0.085 237.000 0.000 NA   NA
 7058433 7058434 GAU_t0012 GAU_1220     FALSE 0.331 57.000 0.000 NA   NA
 7058436 7058437 GAU_1222 GAU_1223 kgtP   TRUE 0.605 18.000 0.000 NA   NA
 7058439 7058440 GAU_1225 GAU_1226     FALSE 0.227 125.000 0.000 1.000 N NA
 7058440 7058441 GAU_1226 GAU_1227     FALSE 0.316 66.000 0.000 NA   NA
 7058441 7058442 GAU_1227 GAU_1228     FALSE 0.334 56.000 0.000 NA   NA
 7058442 7058443 GAU_1228 GAU_1229     FALSE 0.282 91.000 0.000 1.000   NA
 7058443 7058444 GAU_1229 GAU_1230     FALSE 0.079 268.000 0.000 NA   NA
 7058444 7058445 GAU_1230 GAU_1231     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058446 7058447 GAU_1232 GAU_1233 tesB   TRUE 0.513 24.000 0.000 NA   NA
 7058448 7058449 GAU_1234 GAU_1235     TRUE 0.869 2.000 0.000 1.000 N NA
 7058449 7058450 GAU_1235 GAU_1236     FALSE 0.103 193.000 0.000 NA   NA
 7058450 7058451 GAU_1236 GAU_1237     FALSE 0.155 134.000 0.000 NA   NA
 7058451 7058452 GAU_1237 GAU_1238     TRUE 0.819 4.000 0.000 NA   NA
 7058452 7058453 GAU_1238 GAU_1239     TRUE 0.980 -3.000 0.914 NA   NA
 7058453 7058454 GAU_1239 GAU_1240     FALSE 0.320 64.000 0.000 NA   NA
 7058454 7058455 GAU_1240 GAU_1241     TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058455 7058456 GAU_1241 GAU_1242     TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000 N NA
 7058456 7058457 GAU_1242 GAU_1243     FALSE 0.325 76.000 0.000 1.000   NA
 7058457 7058458 GAU_1243 GAU_1244   ispE FALSE 0.370 57.000 0.000 1.000   NA
 7058458 7058459 GAU_1244 GAU_1245 ispE   TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058459 7058460 GAU_1245 GAU_1246     TRUE 0.664 14.000 0.000 NA   NA
 7058460 7058461 GAU_1246 GAU_1247   pdxJ FALSE 0.342 53.000 0.000 NA   NA
 7058464 7058465 GAU_1250 GAU_1251 trxA   FALSE 0.354 66.000 0.000 1.000   NA
 7058465 7058466 GAU_1251 GAU_1252     TRUE 0.605 18.000 0.000 NA   NA
 7058466 7058467 GAU_1252 GAU_1253     FALSE 0.417 32.000 0.000 NA   NA
 7058467 7058468 GAU_1253 GAU_1254     TRUE 0.748 -19.000 0.000 NA   NA
 7058468 7058469 GAU_1254 GAU_1255     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058469 7058470 GAU_1255 GAU_1256   dinG FALSE 0.067 392.000 0.000 NA   NA
 7058470 7058471 GAU_1256 GAU_1257 dinG   FALSE 0.345 84.000 0.000 1.000 N NA
 7058471 7058472 GAU_1257 GAU_1258     FALSE 0.318 65.000 0.000 NA   NA
 7058477 7058478 GAU_1262 GAU_1263     FALSE 0.349 47.000 0.000 NA   NA
 7058478 7058479 GAU_1263 GAU_1264     FALSE 0.134 149.000 0.000 NA   NA
 7058479 7058480 GAU_1264 GAU_t0014     FALSE 0.234 96.000 0.000 NA   NA
 7058480 7058481 GAU_t0014 GAU_1265     FALSE 0.099 200.000 0.000 NA   NA
 7058481 7058482 GAU_1265 GAU_1266     FALSE 0.254 89.000 0.000 NA   NA
 7058482 7058483 GAU_1266 GAU_1267     FALSE 0.157 148.000 0.000 1.000   NA
 7058483 7058484 GAU_1267 GAU_1268     TRUE 0.815 7.000 0.000 1.000   NA
 7058484 7058485 GAU_1268 GAU_1269     TRUE 0.917 68.000 0.046 1.000 N NA
 7058486 7058487 GAU_1270 GAU_1271     FALSE 0.117 173.000 0.000 NA   NA
 7058489 7058490 GAU_1273 GAU_1274     FALSE 0.339 54.000 0.000 NA   NA
 7058490 7058491 GAU_1274 GAU_1275     FALSE 0.304 70.000 0.000 NA   NA
 7058492 7058493 GAU_1276 GAU_1277     FALSE 0.352 43.000 0.000 NA   NA
 7058495 7058496 GAU_1279 GAU_1280 purH purN TRUE 0.969 53.000 0.225 1.000 Y NA
 7058496 7058497 GAU_1280 GAU_1281 purN gmhB FALSE 0.194 141.000 0.000 1.000 N NA
 7058497 7058498 GAU_1281 GAU_1282 gmhB   TRUE 0.798 8.000 0.000 1.000   NA
 7058498 7058499 GAU_1282 GAU_1283   valS TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7058499 7058500 GAU_1283 GAU_1284 valS   FALSE 0.334 56.000 0.000 NA   NA
 7058501 7058502 GAU_1285 GAU_1286 thrS   TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058504 7058505 GAU_1288 GAU_1289     FALSE 0.088 229.000 0.000 NA   NA
 7058505 7058506 GAU_1289 GAU_1290     FALSE 0.262 86.000 0.000 NA   NA
 7058506 7058507 GAU_1290 GAU_1291     TRUE 0.646 15.000 0.000 NA   NA
 7058507 7058508 GAU_1291 GAU_1292     TRUE 0.940 8.000 0.000 1.000 Y NA
 7058508 7058509 GAU_1292 GAU_1293     TRUE 0.665 20.000 0.000 1.000 N NA
 7058509 7058510 GAU_1293 GAU_1294   rpiB TRUE 0.569 26.000 0.000 1.000 N NA
 7058510 7058511 GAU_1294 GAU_1295 rpiB glyA TRUE 0.987 -3.000 0.015 1.000 N NA
 7058511 7058512 GAU_1295 GAU_1296 glyA   FALSE 0.196 111.000 0.000 NA   NA
 7058512 7058513 GAU_1296 GAU_1297     FALSE 0.286 77.000 0.000 NA   NA
 7058513 7058514 GAU_1297 GAU_1298     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7058514 7058515 GAU_1298 GAU_1299   thiL TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058515 7058516 GAU_1299 GAU_1300 thiL   FALSE 0.427 53.000 0.000 1.000 N NA
 7058516 7058517 GAU_1300 GAU_1301   eno TRUE 0.753 13.000 0.000 1.000 N NA
 7058517 7058518 GAU_1301 GAU_1302 eno   TRUE 0.933 50.000 0.241 1.000 N NA
 7058518 7058519 GAU_1302 GAU_t0015     TRUE 0.747 -22.000 0.000 NA   NA
 7058519 7058520 GAU_t0015 GAU_t0016     FALSE 0.273 82.000 0.000 NA   NA
 7058521 7058522 GAU_1303 GAU_1304     FALSE 0.273 82.000 0.000 NA   NA
 7058523 7058524 GAU_1305 GAU_1306     FALSE 0.283 78.000 0.000 NA   NA
 7058525 7058526 GAU_1307 GAU_1308     FALSE 0.317 329.000 0.000 0.047 Y NA
 7058526 7058527 GAU_1308 GAU_1309     TRUE 0.862 5.000 0.000 1.000 N NA
 7058527 7058528 GAU_1309 GAU_1310     TRUE 0.955 4.000 0.000 1.000 Y NA
 7058529 7058530 GAU_1311 GAU_1312     FALSE 0.111 258.000 0.000 1.000 N NA
 7058531 7058532 GAU_1313 GAU_1314   cusA FALSE 0.070 337.000 0.000 NA   NA
 7058532 7058533 GAU_1314 GAU_1315 cusA   TRUE 0.783 11.000 0.000 1.000 N NA
 7058533 7058534 GAU_1315 GAU_1316     TRUE 0.716 48.000 0.000 1.000 Y NA
 7058534 7058535 GAU_1316 GAU_1317     FALSE 0.122 164.000 0.000 NA   NA
 7058535 7058536 GAU_1317 GAU_1318     TRUE 0.769 8.000 0.000 NA   NA
 7058536 7058537 GAU_1318 GAU_1319     FALSE 0.212 105.000 0.000 NA   NA
 7058537 7058538 GAU_1319 GAU_1320     FALSE 0.350 45.000 0.000 NA   NA
 7058538 7058539 GAU_1320 GAU_1321     FALSE 0.158 132.000 0.000 NA   NA
 7058539 7058540 GAU_1321 GAU_1322     TRUE 0.987 -7.000 0.054 1.000 N NA
 7058540 7058541 GAU_1322 GAU_1323     TRUE 0.555 27.000 0.000 1.000 N NA
 7058541 7058542 GAU_1323 GAU_1324     TRUE 0.724 15.000 0.000 1.000 N NA
 7058542 7058543 GAU_1324 GAU_1325     FALSE 0.353 81.000 0.000 1.000 N NA
 7058548 7058549 GAU_1330 GAU_1331     FALSE 0.101 196.000 0.000 NA   NA
 7058549 7058550 GAU_1331 GAU_t0017     FALSE 0.237 95.000 0.000 NA   NA
 7058550 7058551 GAU_t0017 GAU_1332     FALSE 0.077 276.000 0.000 NA   NA
 7058553 7058554 GAU_1334 GAU_1335 cheW   TRUE 0.995 -3.000 0.383 1.000 Y NA
 7058554 7058555 GAU_1335 GAU_1336   cheW TRUE 0.995 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 7058555 7058556 GAU_1336 GAU_1337 cheW   TRUE 0.967 0.000 0.000 0.009 Y NA
 7058556 7058557 GAU_1337 GAU_1338   cheA TRUE 0.996 -3.000 0.400 0.010 Y NA
 7058557 7058558 GAU_1338 GAU_1339 cheA cheB TRUE 0.996 -3.000 0.625 0.010 Y NA
 7058558 7058559 GAU_1339 GAU_1340 cheB   TRUE 0.957 -3.000 0.000 0.029 Y NA
 7058559 7058560 GAU_1340 GAU_1341     FALSE 0.448 33.000 0.000 1.000   NA
 7058561 7058562 GAU_1342 GAU_1343     FALSE 0.120 165.000 0.000 NA   NA
 7058562 7058563 GAU_1343 GAU_1344     FALSE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 7058563 7058564 GAU_1344 GAU_1345     FALSE 0.387 49.000 0.000 1.000   NA
 7058565 7058566 GAU_1346 GAU_1347     FALSE 0.112 207.000 0.000 1.000   NA
 7058566 7058567 GAU_1347 GAU_1348     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7058567 7058568 GAU_1348 GAU_1349   ilvD FALSE 0.371 38.000 0.000 NA   NA
 7058568 7058569 GAU_1349 GAU_1350 ilvD   FALSE 0.077 511.000 0.000 NA N NA
 7058569 7058570 GAU_1350 GAU_1351     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058572 7058573 GAU_1353 GAU_1354     FALSE 0.234 108.000 0.000 1.000   NA
 7058573 7058574 GAU_1354 GAU_1355     TRUE 0.870 -3.000 0.000 0.019   NA
 7058578 7058579 GAU_1359 GAU_1360     TRUE 0.819 4.000 0.000 NA   NA
 7058579 7058580 GAU_1360 GAU_1361     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058580 7058581 GAU_1361 GAU_1362     TRUE 0.845 1.000 0.000 1.000   NA
 7058581 7058582 GAU_1362 GAU_1363     FALSE 0.124 160.000 0.000 NA   NA
 7058583 7058584 GAU_1364 GAU_1365   glgA TRUE 0.779 9.000 0.000 1.000   NA
 7058584 7058585 GAU_1365 GAU_1366 glgA   TRUE 0.758 34.000 0.000 1.000 Y NA
 7058586 7058587 GAU_1367 GAU_1368   thrC TRUE 0.995 -3.000 0.034 1.000 Y NA
 7058587 7058588 GAU_1368 GAU_1369 thrC   FALSE 0.413 58.000 0.000 1.000 N NA
 7058590 7058591 GAU_1371 GAU_1372     FALSE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 7058591 7058592 GAU_1372 GAU_1373     FALSE 0.105 523.000 0.000 0.052   NA
 7058593 7058594 GAU_1374 GAU_1375     FALSE 0.334 56.000 0.000 NA   NA
 7058594 7058595 GAU_1375 GAU_1376     TRUE 0.594 22.000 0.000 1.000   NA
 7058595 7058596 GAU_1376 GAU_1377     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058598 7058599 GAU_1379 GAU_1380   nosY FALSE 0.326 60.000 0.000 NA   NA
 7058599 7058600 GAU_1380 GAU_1381 nosY nosF TRUE 0.985 -3.000 0.590 NA   NA
 7058600 7058601 GAU_1381 GAU_1382 nosF nosD TRUE 0.982 -3.000 0.867 NA N NA
 7058601 7058602 GAU_1382 GAU_1383 nosD nosL TRUE 0.984 -16.000 0.406 NA   NA
 7058602 7058603 GAU_1383 GAU_1384 nosL   TRUE 0.987 -3.000 0.254 NA   NA
 7058603 7058604 GAU_1384 GAU_1385   nosZ TRUE 0.961 23.000 0.281 NA   NA
 7058606 7058607 GAU_1387 GAU_1388   pfpI FALSE 0.127 156.000 0.000 NA   NA
 7058608 7058609 GAU_1389 GAU_1390 glnK nrgA TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000 N NA
 7058609 7058610 GAU_1390 GAU_1391 nrgA tilS FALSE 0.088 539.000 0.000 1.000 N NA
 7058610 7058611 GAU_1391 GAU_1392 tilS hpt TRUE 0.947 44.000 0.137 0.037 N NA
 7058611 7058612 GAU_1392 GAU_1393 hpt ftsH TRUE 0.956 25.000 0.019 1.000 N NA
 7058612 7058613 GAU_1393 GAU_1394 ftsH   TRUE 0.923 31.000 0.004 NA   NA
 7058613 7058614 GAU_1394 GAU_1395     TRUE 0.513 24.000 0.000 NA   NA
 7058614 7058615 GAU_1395 GAU_1396     FALSE 0.354 42.000 0.000 NA   NA
 7058615 7058616 GAU_1396 GAU_1397   divIVA TRUE 0.698 12.000 0.000 NA   NA
 7058616 7058617 GAU_1397 GAU_1398 divIVA punA FALSE 0.275 81.000 0.000 NA   NA
 7058617 7058618 GAU_1398 GAU_1399 punA ileS FALSE 0.390 69.000 0.000 1.000 N NA
 7058618 7058619 GAU_1399 GAU_1400 ileS   TRUE 0.933 51.000 0.135 1.000 N NA
 7058619 7058620 GAU_1400 GAU_1401   lspA TRUE 0.809 -25.000 0.000 1.000 N NA
 7058620 7058621 GAU_1401 GAU_1402 lspA lspA TRUE 0.955 103.000 0.053 0.001 Y NA
 7058621 7058622 GAU_1402 GAU_1403 lspA rluD TRUE 0.985 -3.000 0.003 1.000 N NA
 7058622 7058623 GAU_1403 GAU_1404 rluD   FALSE 0.297 86.000 0.000 1.000   NA
 7058623 7058624 GAU_1404 GAU_1405     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7058624 7058625 GAU_1405 GAU_1406   cheA TRUE 0.980 35.000 0.154 0.036 Y NA
 7058625 7058626 GAU_1406 GAU_1407 cheA cheC TRUE 0.964 59.000 0.176 NA Y NA
 7058626 7058627 GAU_1407 GAU_1408 cheC   TRUE 0.605 18.000 0.000 NA   NA
 7058627 7058628 GAU_1408 GAU_1409     TRUE 0.605 18.000 0.000 NA   NA
 7058628 7058629 GAU_1409 GAU_1410     FALSE 0.339 54.000 0.000 NA   NA
 7058629 7058630 GAU_1410 GAU_1411     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7058630 7058631 GAU_1411 GAU_1412     TRUE 0.684 15.000 0.000 1.000   NA
 7058631 7058632 GAU_1412 GAU_1413   cheD FALSE 0.460 32.000 0.000 1.000   NA
 7058632 7058633 GAU_1413 GAU_1414 cheD cheB TRUE 0.993 11.000 0.070 1.000 Y NA
 7058633 7058634 GAU_1414 GAU_1415 cheB   TRUE 0.959 -3.000 0.000 0.010 Y NA
 7058634 7058635 GAU_1415 GAU_1416     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7058635 7058636 GAU_1416 GAU_1417     FALSE 0.437 30.000 0.000 NA   NA
 7058636 7058637 GAU_1417 GAU_1418     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058637 7058638 GAU_1418 GAU_t0018     FALSE 0.135 148.000 0.000 NA   NA
 7058638 7058639 GAU_t0018 GAU_1419     TRUE 0.552 22.000 0.000 NA   NA
 7058639 7058640 GAU_1419 GAU_1420   mraW FALSE 0.094 253.000 0.000 1.000   NA
 7058640 7058641 GAU_1420 GAU_1421 mraW   TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 7058641 7058642 GAU_1421 GAU_1422   ftsI TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058642 7058643 GAU_1422 GAU_1423 ftsI murE TRUE 0.970 50.000 0.198 1.000 Y NA
 7058643 7058644 GAU_1423 GAU_1424 murE murF TRUE 0.996 -3.000 0.011 0.002 Y NA
 7058644 7058645 GAU_1424 GAU_1425 murF mraY TRUE 0.997 0.000 0.309 0.004 Y NA
 7058645 7058646 GAU_1425 GAU_1426 mraY murD TRUE 0.950 97.000 0.647 0.004 Y NA
 7058646 7058647 GAU_1426 GAU_1427 murD ftsW TRUE 0.988 -3.000 0.016 1.000 N NA
 7058647 7058648 GAU_1427 GAU_1428 ftsW murG TRUE 0.979 14.000 0.035 1.000 N NA
 7058648 7058649 GAU_1428 GAU_1429 murG murC TRUE 0.995 -3.000 0.270 1.000 Y NA
 7058649 7058650 GAU_1429 GAU_1430 murC ftsQ TRUE 0.990 0.000 0.134 NA   NA
 7058650 7058651 GAU_1430 GAU_1431 ftsQ ftsA TRUE 0.987 -3.000 0.389 NA   NA
 7058651 7058652 GAU_1431 GAU_1432 ftsA   FALSE 0.198 139.000 0.000 1.000 N NA
 7058653 7058654 GAU_1433 GAU_1434     FALSE 0.292 75.000 0.000 NA   NA
 7058654 7058655 GAU_1434 GAU_1435     TRUE 0.955 0.000 0.000 1.000 Y NA
 7058658 7058659 GAU_1438 GAU_1439   ftsZ FALSE 0.074 531.000 0.000 1.000   NA
 7058659 7058660 GAU_1439 GAU_1440 ftsZ   TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058660 7058661 GAU_1440 GAU_1441     FALSE 0.209 106.000 0.000 NA   NA
 7058661 7058662 GAU_1441 GAU_1442   ftsY FALSE 0.407 33.000 0.000 NA   NA
 7058662 7058663 GAU_1442 GAU_1443 ftsY recG FALSE 0.452 39.000 0.000 1.000 N NA
 7058663 7058664 GAU_1443 GAU_1444 recG   FALSE 0.135 205.000 0.000 1.000 N NA
 7058665 7058666 GAU_1445 GAU_1446     TRUE 0.818 122.000 0.067 NA   NA
 7058669 7058670 GAU_1449 GAU_1450 alr deoB TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058670 7058671 GAU_1450 GAU_1451 deoB cdd TRUE 0.527 30.000 0.000 1.000 N NA
 7058671 7058672 GAU_1451 GAU_1452 cdd   FALSE 0.371 38.000 0.000 NA   NA
 7058672 7058673 GAU_1452 GAU_1453     FALSE 0.308 69.000 0.000 NA   NA
 7058673 7058674 GAU_1453 GAU_1454     FALSE 0.371 38.000 0.000 NA   NA
 7058674 7058675 GAU_1454 GAU_1455     TRUE 0.800 113.000 0.002 1.000   NA
 7058675 7058676 GAU_1455 GAU_1456   fbp FALSE 0.124 187.000 0.000 1.000   NA
 7058676 7058677 GAU_1456 GAU_1457 fbp   FALSE 0.369 76.000 0.000 1.000 N NA
 7058679 7058680 GAU_1459 GAU_1460   tyrA FALSE 0.234 96.000 0.000 NA   NA
 7058680 7058681 GAU_1460 GAU_1461 tyrA   FALSE 0.389 46.000 0.000 1.000   NA
 7058681 7058682 GAU_1461 GAU_1462     FALSE 0.297 86.000 0.000 1.000   NA
 7058683 7058684 GAU_1463 GAU_1464     TRUE 0.884 38.000 1.000 NA   NA
 7058685 7058686 GAU_1465 GAU_1466     FALSE 0.268 84.000 0.000 NA   NA
 7058686 7058687 GAU_1466 GAU_1467   argS TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058687 7058688 GAU_1467 GAU_1468 argS   TRUE 0.981 9.000 0.002 NA N NA
 7058688 7058689 GAU_1468 GAU_1469   purM TRUE 0.984 -3.000 0.002 NA N NA
 7058689 7058690 GAU_1469 GAU_1470 purM   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058690 7058691 GAU_1470 GAU_1471   ribD TRUE 0.664 14.000 0.000 NA   NA
 7058691 7058692 GAU_1471 GAU_1472 ribD ribE TRUE 0.995 8.000 0.456 1.000 Y NA
 7058692 7058693 GAU_1472 GAU_1473 ribE ribBA TRUE 0.995 0.000 0.011 1.000 Y NA
 7058693 7058694 GAU_1473 GAU_1474 ribBA ribH TRUE 0.958 8.000 0.000 0.002 Y NA
 7058694 7058695 GAU_1474 GAU_1475 ribH nusB TRUE 0.924 39.000 0.011 1.000 N NA
 7058695 7058696 GAU_1475 GAU_1476 nusB   TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058696 7058697 GAU_1476 GAU_1477   hprK FALSE 0.099 329.000 0.000 1.000 N NA
 7058697 7058698 GAU_1477 GAU_1478 hprK   FALSE 0.444 41.000 0.000 1.000 N NA
 7058698 7058699 GAU_1478 GAU_1479     TRUE 0.646 107.000 0.000 0.001 Y NA
 7058699 7058700 GAU_1479 GAU_1480     TRUE 0.904 3.000 0.000 0.003   NA
 7058700 7058701 GAU_1480 GAU_1481     TRUE 0.859 -10.000 0.000 0.003   NA
 7058701 7058702 GAU_1481 GAU_1482   ptsH TRUE 0.996 -7.000 0.036 0.003 Y NA
 7058702 7058703 GAU_1482 GAU_1483 ptsH ptsI TRUE 0.997 0.000 0.163 0.001 Y NA
 7058703 7058704 GAU_1483 GAU_1484 ptsI metK TRUE 0.903 69.000 0.010 1.000 N NA
 7058704 7058705 GAU_1484 GAU_1485 metK   FALSE 0.194 112.000 0.000 NA   NA
 7058705 7058706 GAU_1485 GAU_1486     FALSE 0.102 195.000 0.000 NA   NA
 7058706 7058707 GAU_1486 GAU_1487     FALSE 0.428 31.000 0.000 NA   NA
 7058707 7058708 GAU_1487 GAU_1488     TRUE 0.953 5.000 0.000 1.000 Y NA
 7058708 7058709 GAU_1488 GAU_1489     TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7058709 7058710 GAU_1489 GAU_1490   recO TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058710 7058711 GAU_1490 GAU_1491 recO   FALSE 0.089 223.000 0.000 NA   NA
 7058711 7058712 GAU_1491 GAU_1492   clpB FALSE 0.101 196.000 0.000 NA   NA
 7058712 7058713 GAU_1492 GAU_1493 clpB   FALSE 0.133 176.000 0.000 1.000   NA
 7058713 7058714 GAU_1493 GAU_1494     FALSE 0.389 47.000 0.000 1.000   NA
 7058714 7058715 GAU_1494 GAU_1495     FALSE 0.212 118.000 0.000 1.000   NA
 7058716 7058717 GAU_1496 GAU_1497     FALSE 0.191 114.000 0.000 NA   NA
 7058717 7058718 GAU_1497 GAU_1498     TRUE 0.989 2.000 0.500 NA   NA
 7058719 7058720 GAU_t0019 GAU_1499     FALSE 0.059 2133.000 0.000 NA   NA
 7058720 7058721 GAU_1499 GAU_1500     TRUE 0.996 -3.000 0.091 0.044 Y NA
 7058722 7058723 GAU_1501 GAU_1502     TRUE 0.837 -22.000 0.000 0.044   NA
 7058723 7058724 GAU_1502 GAU_1503     FALSE 0.085 240.000 0.000 NA   NA
 7058726 7058727 GAU_1504 GAU_1505     FALSE 0.081 252.000 0.000 NA   NA
 7058729 7058730 GAU_1507 GAU_1508     TRUE 0.815 -3.000 0.000 NA N NA
 7058731 7058732 GAU_1509 GAU_1510     FALSE 0.239 106.000 0.000 1.000   NA
 7058732 7058733 GAU_1510 GAU_1511     TRUE 0.846 3.000 0.000 1.000   NA
 7058733 7058734 GAU_1511 GAU_1512     FALSE 0.357 65.000 0.000 1.000   NA
 7058734 7058735 GAU_1512 GAU_1513     FALSE 0.082 248.000 0.000 NA   NA
 7058735 7058736 GAU_1513 GAU_1514   pyrR FALSE 0.262 86.000 0.000 NA   NA
 7058736 7058737 GAU_1514 GAU_1515 pyrR pyrB TRUE 0.996 5.000 0.247 1.000 Y NA
 7058737 7058738 GAU_1515 GAU_1516 pyrB pyrC TRUE 0.996 0.000 0.452 1.000 Y NA
 7058738 7058739 GAU_1516 GAU_1517 pyrC   TRUE 0.665 20.000 0.000 1.000 N NA
 7058739 7058740 GAU_1517 GAU_1518     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058742 7058743 GAU_1520 GAU_1521   scpA TRUE 0.989 6.000 0.092 NA   NA
 7058743 7058744 GAU_1521 GAU_1522 scpA scpB TRUE 0.982 -25.000 0.570 NA   NA
 7058744 7058745 GAU_1522 GAU_1523 scpB   FALSE 0.080 408.000 0.000 NA N NA
 7058745 7058746 GAU_1523 GAU_1524     FALSE 0.360 63.000 0.000 1.000   NA
 7058746 7058747 GAU_1524 GAU_1525     TRUE 0.983 -3.000 0.764 NA   NA
 7058747 7058748 GAU_1525 GAU_1526     TRUE 0.982 -10.000 0.541 NA   NA
 7058748 7058749 GAU_1526 GAU_1527     TRUE 0.885 75.000 0.538 NA   NA
 7058749 7058750 GAU_1527 GAU_1528     TRUE 0.987 -3.000 0.404 NA   NA
 7058750 7058751 GAU_1528 GAU_1529     TRUE 0.990 -3.000 0.041 0.018   NA
 7058751 7058752 GAU_1529 GAU_1530   mutL TRUE 0.779 9.000 0.000 1.000   NA
 7058752 7058753 GAU_1530 GAU_1531 mutL miaA TRUE 0.990 4.000 0.010 1.000 N NA
 7058753 7058754 GAU_1531 GAU_1532 miaA   TRUE 0.888 -3.000 0.000 0.014 N NA
 7058754 7058755 GAU_1532 GAU_1533   uppP TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058755 7058756 GAU_1533 GAU_1534 uppP   TRUE 0.465 37.000 0.000 1.000 N NA
 7058756 7058757 GAU_1534 GAU_1535   groES FALSE 0.109 269.000 0.000 1.000 N NA
 7058757 7058758 GAU_1535 GAU_1536 groES groEL TRUE 0.978 28.000 0.039 1.000 Y NA
 7058759 7058760 GAU_1537 GAU_1538     TRUE 0.556 24.000 0.000 1.000   NA
 7058760 7058761 GAU_1538 GAU_1539   manC TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7058761 7058762 GAU_1539 GAU_1540 manC   TRUE 0.827 8.000 0.000 1.000 N NA
 7058762 7058763 GAU_1540 GAU_1541     FALSE 0.350 45.000 0.000 NA   NA
 7058764 7058765 GAU_1542 GAU_1543   serS TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 7058765 7058766 GAU_1543 GAU_1544 serS   FALSE 0.444 41.000 0.000 1.000 N NA
 7058766 7058767 GAU_1544 GAU_1545     TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058767 7058768 GAU_1545 GAU_1546   gatC TRUE 0.989 0.000 0.005 1.000 N NA
 7058768 7058769 GAU_1546 GAU_1547 gatC gatA TRUE 0.996 -3.000 0.643 0.001 Y NA
 7058769 7058770 GAU_1547 GAU_1548 gatA gatB TRUE 0.996 -3.000 0.492 0.001 Y NA
 7058771 7058772 GAU_1549 GAU_1550     FALSE 0.262 86.000 0.000 NA   NA
 7058773 7058774 GAU_1551 GAU_1552 murA   TRUE 0.752 -10.000 0.000 NA   NA
 7058774 7058775 GAU_1552 GAU_1553     FALSE 0.128 155.000 0.000 NA   NA
 7058775 7058776 GAU_1553 GAU_1554   nusA TRUE 0.977 10.000 0.759 NA   NA
 7058776 7058777 GAU_1554 GAU_1555 nusA   TRUE 0.953 27.000 0.075 NA N NA
 7058777 7058778 GAU_1555 GAU_1556   infB TRUE 0.993 10.000 0.223 NA Y NA
 7058778 7058779 GAU_1556 GAU_1557 infB rbfA TRUE 0.993 10.000 0.530 1.000 Y NA
 7058779 7058780 GAU_1557 GAU_1558 rbfA truB TRUE 0.996 1.000 0.318 1.000 Y NA
 7058780 7058781 GAU_1558 GAU_1559 truB ribF TRUE 0.991 0.000 0.083 1.000 N NA
 7058781 7058782 GAU_1559 GAU_1560 ribF secD FALSE 0.316 93.000 0.000 1.000 N NA
 7058782 7058783 GAU_1560 GAU_1561 secD secF TRUE 0.959 8.000 0.000 0.001 Y NA
 7058783 7058784 GAU_1561 GAU_1562 secF   TRUE 0.469 32.000 0.000 NA N NA
 7058784 7058785 GAU_1562 GAU_1563     TRUE 0.692 15.000 0.000 NA N NA
 7058785 7058786 GAU_1563 GAU_1564     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058788 7058789 GAU_1566 GAU_1567     FALSE 0.070 1376.000 0.000 1.000   NA
 7058789 7058790 GAU_1567 GAU_1568     FALSE 0.302 71.000 0.000 NA   NA
 7058790 7058791 GAU_1568 GAU_1569     FALSE 0.371 38.000 0.000 NA   NA
 7058791 7058792 GAU_1569 GAU_1570     TRUE 0.757 -6.000 0.000 NA   NA
 7058792 7058793 GAU_1570 GAU_1571   rph TRUE 0.785 -7.000 0.000 1.000   NA
 7058793 7058794 GAU_1571 GAU_1572 rph   TRUE 0.989 -3.000 0.262 1.000 N NA
 7058794 7058795 GAU_1572 GAU_t0021     FALSE 0.137 146.000 0.000 NA   NA
 7058795 7058796 GAU_t0021 GAU_t0022     FALSE 0.205 108.000 0.000 NA   NA
 7058796 7058797 GAU_t0022 GAU_t0023     TRUE 0.496 25.000 0.000 NA   NA
 7058797 7058798 GAU_t0023 GAU_1573     FALSE 0.149 137.000 0.000 NA   NA
 7058798 7058799 GAU_1573 GAU_r0001     FALSE 0.062 569.000 0.000 NA   NA
 7058799 7058800 GAU_r0001 GAU_r0002     FALSE 0.072 320.000 0.000 NA   NA
 7058800 7058801 GAU_r0002 GAU_r0003     FALSE 0.122 162.000 0.000 NA   NA
 7058801 7058802 GAU_r0003 GAU_1574     FALSE 0.216 103.000 0.000 NA   NA
 7058802 7058803 GAU_1574 GAU_1575     FALSE 0.292 75.000 0.000 NA   NA
 7058803 7058804 GAU_1575 GAU_1576     FALSE 0.126 157.000 0.000 NA   NA
 7058804 7058805 GAU_1576 GAU_1577     FALSE 0.062 609.000 0.000 NA   NA
 7058805 7058806 GAU_1577 GAU_1578   prfB FALSE 0.077 280.000 0.000 NA   NA
 7058806 7058807 GAU_1578 GAU_1579 prfB lysS TRUE 0.996 -3.000 0.162 0.036 Y NA
 7058807 7058808 GAU_1579 GAU_1580 lysS lolC TRUE 0.569 26.000 0.000 1.000 N NA
 7058808 7058809 GAU_1580 GAU_1581 lolC lolD TRUE 0.816 -7.000 0.000 1.000 N NA
 7058809 7058810 GAU_1581 GAU_1582 lolD   TRUE 0.841 0.000 0.000 1.000   NA
 7058810 7058811 GAU_1582 GAU_1583     TRUE 0.982 -3.000 0.848 1.000   NA
 7058811 7058812 GAU_1583 GAU_1584   clpC TRUE 0.955 29.000 0.111 1.000 N NA
 7058812 7058813 GAU_1584 GAU_1585 clpC   TRUE 0.714 184.000 0.008 1.000 N NA
 7058813 7058814 GAU_1585 GAU_1586     TRUE 0.990 16.000 0.113 1.000 Y NA
 7058814 7058815 GAU_1586 GAU_1587   lpxD TRUE 0.994 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 7058815 7058816 GAU_1587 GAU_1588 lpxD lpxC/fabZ TRUE 0.978 51.000 0.148 0.001 Y NA
 7058816 7058817 GAU_1588 GAU_1589 lpxC/fabZ lpxA TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7058817 7058818 GAU_1589 GAU_1590 lpxA   TRUE 0.920 48.000 0.037 1.000   NA
 7058818 7058819 GAU_1590 GAU_1591   lpxB TRUE 0.985 -7.000 0.044 1.000   NA
 7058819 7058820 GAU_1591 GAU_1592 lpxB   TRUE 0.980 -10.000 0.003 NA   NA
 7058820 7058821 GAU_1592 GAU_1593   lpxK TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058821 7058822 GAU_1593 GAU_1594 lpxK gdhA TRUE 0.555 27.000 0.000 1.000 N NA
 7058822 7058823 GAU_1594 GAU_1595 gdhA   FALSE 0.456 28.000 0.000 NA   NA
 7058823 7058824 GAU_1595 GAU_1596     TRUE 0.479 26.000 0.000 NA   NA
 7058824 7058825 GAU_1596 GAU_1597     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058825 7058826 GAU_1597 GAU_1598   uvrC TRUE 0.838 97.000 0.003 1.000   NA
 7058826 7058827 GAU_1598 GAU_1599 uvrC   TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058827 7058828 GAU_1599 GAU_1600     FALSE 0.162 169.000 0.000 1.000 N NA
 7058828 7058829 GAU_1600 GAU_1601   engA TRUE 0.975 16.000 0.061 1.000   NA
 7058829 7058830 GAU_1601 GAU_1602 engA   TRUE 0.984 -3.000 0.003 1.000   NA
 7058830 7058831 GAU_1602 GAU_1603   gpsA TRUE 0.841 0.000 0.000 1.000   NA
 7058831 7058832 GAU_1603 GAU_1604 gpsA   TRUE 0.869 2.000 0.000 1.000 N NA
 7058832 7058833 GAU_1604 GAU_1605   surE TRUE 0.988 0.000 0.010 1.000   NA
 7058833 7058834 GAU_1605 GAU_1606 surE pcm TRUE 0.985 -18.000 0.353 1.000   NA
 7058834 7058835 GAU_1606 GAU_1607 pcm   FALSE 0.243 93.000 0.000 NA   NA
 7058835 7058836 GAU_1607 GAU_1608   apt FALSE 0.447 29.000 0.000 NA   NA
 7058836 7058837 GAU_1608 GAU_1609 apt   FALSE 0.075 291.000 0.000 NA   NA
 7058837 7058838 GAU_1609 GAU_t0024     FALSE 0.066 402.000 0.000 NA   NA
 7058838 7058839 GAU_t0024 GAU_1610     FALSE 0.127 156.000 0.000 NA   NA
 7058840 7058841 GAU_1611 GAU_1612 dapE   FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 7058841 7058842 GAU_1612 GAU_1613     TRUE 0.802 6.000 0.000 NA   NA
 7058842 7058843 GAU_1613 GAU_1614     TRUE 0.533 23.000 0.000 NA   NA
 7058843 7058844 GAU_1614 GAU_1615     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058844 7058845 GAU_1615 GAU_1616     TRUE 0.728 36.000 0.000 NA Y NA
 7058845 7058846 GAU_1616 GAU_1617   rpoN FALSE 0.301 87.000 0.000 NA N NA
 7058846 7058847 GAU_1617 GAU_1618 rpoN   TRUE 0.988 -3.000 0.059 1.000   NA
 7058847 7058848 GAU_1618 GAU_1619     FALSE 0.065 444.000 0.000 NA   NA
 7058848 7058849 GAU_1619 GAU_1620     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058849 7058850 GAU_1620 GAU_1621   kdsD TRUE 0.989 0.000 0.057 NA   NA
 7058850 7058851 GAU_1621 GAU_1622 kdsD kdsC TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7058851 7058852 GAU_1622 GAU_1623 kdsC kdsA TRUE 0.987 -3.000 0.032 1.000   NA
 7058852 7058853 GAU_1623 GAU_1624 kdsA pyrG TRUE 0.990 -3.000 0.138 1.000 N NA
 7058853 7058854 GAU_1624 GAU_1625 pyrG kdsB TRUE 0.922 49.000 0.019 1.000 N NA
 7058856 7058857 GAU_1627 GAU_1628   trpG FALSE 0.237 95.000 0.000 NA   NA
 7058857 7058858 GAU_1628 GAU_1629 trpG xerD FALSE 0.085 669.000 0.000 1.000 N NA
 7058858 7058859 GAU_1629 GAU_1630 xerD   TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 7058859 7058860 GAU_1630 GAU_1631   ispF TRUE 0.890 61.000 0.006 NA   NA
 7058860 7058861 GAU_1631 GAU_1632 ispF   TRUE 0.862 5.000 0.000 1.000 N NA
 7058861 7058862 GAU_1632 GAU_1633     TRUE 0.943 31.000 0.170 NA   NA
 7058862 7058863 GAU_1633 GAU_1634     TRUE 0.990 3.000 0.205 NA   NA
 7058863 7058864 GAU_1634 GAU_1635   fabF FALSE 0.451 79.000 0.000 0.031 N NA
 7058864 7058865 GAU_1635 GAU_1636 fabF acpP TRUE 0.995 0.000 0.004 1.000 Y NA
 7058865 7058866 GAU_1636 GAU_1637 acpP fabG TRUE 0.943 106.000 0.008 0.004 Y NA
 7058866 7058867 GAU_1637 GAU_1638 fabG fabD TRUE 0.996 0.000 0.006 0.004 Y NA
 7058867 7058868 GAU_1638 GAU_1639 fabD fabH TRUE 0.833 31.000 0.000 0.004 Y NA
 7058868 7058869 GAU_1639 GAU_1640 fabH plsX TRUE 0.960 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 7058869 7058870 GAU_1640 GAU_1641 plsX rpmF TRUE 0.991 3.000 0.418 1.000 N NA
 7058870 7058871 GAU_1641 GAU_1642 rpmF   TRUE 0.913 38.000 0.599 NA   NA
 7058871 7058872 GAU_1642 GAU_1643   ndk FALSE 0.166 127.000 0.000 NA   NA
 7058872 7058873 GAU_1643 GAU_1644 ndk   TRUE 0.867 4.000 0.000 1.000 N NA
 7058873 7058874 GAU_1644 GAU_1645   sucD FALSE 0.449 77.000 0.000 0.050 N NA
 7058874 7058875 GAU_1645 GAU_1646 sucD sucC TRUE 0.997 -3.000 0.235 0.001 Y NA
 7058875 7058876 GAU_1646 GAU_1647 sucC   FALSE 0.179 134.000 0.000 1.000   NA
 7058876 7058877 GAU_1647 GAU_1648   manB FALSE 0.398 41.000 0.000 1.000   NA
 7058877 7058878 GAU_1648 GAU_1649 manB nuoN FALSE 0.413 58.000 0.000 1.000 N NA
 7058878 7058879 GAU_1649 GAU_1650 nuoN nuoM TRUE 0.997 3.000 0.033 0.003 Y NA
 7058879 7058880 GAU_1650 GAU_1651 nuoM nuoL TRUE 0.994 12.000 0.048 0.003 Y NA
 7058880 7058881 GAU_1651 GAU_1652 nuoL nuoK TRUE 0.995 -3.000 0.790 0.010 Y NA
 7058881 7058882 GAU_1652 GAU_1653 nuoK nuoJ TRUE 0.996 -3.000 0.306 0.005 Y NA
 7058882 7058883 GAU_1653 GAU_1654 nuoJ nuoI TRUE 0.996 -3.000 0.210 0.010 Y NA
 7058883 7058884 GAU_1654 GAU_1655 nuoI nuoH TRUE 0.977 42.000 0.221 0.010 Y NA
 7058884 7058885 GAU_1655 GAU_1656 nuoH nuoG FALSE 0.350 102.000 0.000 0.010   NA
 7058885 7058886 GAU_1656 GAU_1657 nuoG nuoF TRUE 0.687 23.000 0.000 0.010   NA
 7058886 7058887 GAU_1657 GAU_1658 nuoF nuoE TRUE 0.997 0.000 0.061 0.009 Y NA
 7058887 7058888 GAU_1658 GAU_1659 nuoE nuoD TRUE 0.967 81.000 0.097 0.009 Y NA
 7058888 7058889 GAU_1659 GAU_1660 nuoD nuoC TRUE 0.942 120.000 0.057 0.010 Y NA
 7058889 7058890 GAU_1660 GAU_1661 nuoC nuoB TRUE 0.933 117.000 0.691 0.005 Y NA
 7058890 7058891 GAU_1661 GAU_1662 nuoB nuoA TRUE 0.995 -9.000 0.498 0.005 Y NA
 7058892 7058893 GAU_1663 GAU_1664 dcd   TRUE 0.680 13.000 0.000 NA   NA
 7058894 7058895 GAU_1665 GAU_1666     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058895 7058896 GAU_1666 GAU_1667   sdhB TRUE 0.710 81.000 0.000 0.012 Y NA
 7058896 7058897 GAU_1667 GAU_1668 sdhB sdhA TRUE 0.997 0.000 0.470 0.001 Y NA
 7058897 7058898 GAU_1668 GAU_1669 sdhA sdhC TRUE 0.992 2.000 0.598 0.001   NA
 7058898 7058899 GAU_1669 GAU_1670 sdhC mdh FALSE 0.365 60.000 0.000 1.000   NA
 7058899 7058900 GAU_1670 GAU_1671 mdh moaA FALSE 0.160 172.000 0.000 1.000 N NA
 7058900 7058901 GAU_1671 GAU_1672 moaA   TRUE 0.996 0.000 0.006 0.003 Y NA
 7058901 7058902 GAU_1672 GAU_1673     TRUE 0.996 4.000 0.501 1.000 Y NA
 7058902 7058903 GAU_1673 GAU_1674     FALSE 0.312 94.000 0.000 1.000 N NA
 7058903 7058904 GAU_1674 GAU_1675   carA FALSE 0.325 90.000 0.000 1.000 N NA
 7058904 7058905 GAU_1675 GAU_1676 carA secG TRUE 0.827 8.000 0.000 1.000 N NA
 7058905 7058906 GAU_1676 GAU_1677 secG tpiA TRUE 0.800 142.000 0.044 1.000 N NA
 7058906 7058907 GAU_1677 GAU_1678 tpiA pgk TRUE 0.974 36.000 0.141 1.000 Y NA
 7058907 7058908 GAU_1678 GAU_1679 pgk gapA TRUE 0.641 106.000 0.000 0.003 Y NA
 7058908 7058909 GAU_1679 GAU_1680 gapA   TRUE 0.828 6.000 0.000 1.000   NA
 7058909 7058910 GAU_1680 GAU_1681   aroE TRUE 0.684 15.000 0.000 1.000   NA
 7058910 7058911 GAU_1681 GAU_1682 aroE   TRUE 0.842 7.000 0.000 1.000 N NA
 7058911 7058912 GAU_1682 GAU_1683     TRUE 0.846 0.000 0.000 NA N NA
 7058912 7058913 GAU_1683 GAU_1684   ispD TRUE 0.469 32.000 0.000 NA N NA
 7058913 7058914 GAU_1684 GAU_1685 ispD radA TRUE 0.482 35.000 0.000 1.000 N NA
 7058914 7058915 GAU_1685 GAU_1686 radA dnaB TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000 N NA
 7058915 7058916 GAU_1686 GAU_1687 dnaB   TRUE 0.717 46.000 0.000 1.000 Y NA
 7058916 7058917 GAU_1687 GAU_1688   rpoZ FALSE 0.077 441.000 0.000 1.000   NA
 7058917 7058918 GAU_1688 GAU_1689 rpoZ gmk TRUE 0.990 4.000 0.471 1.000   NA
 7058918 7058919 GAU_1689 GAU_1690 gmk   TRUE 0.987 -3.000 0.276 NA   NA
 7058919 7058920 GAU_1690 GAU_1691     FALSE 0.246 92.000 0.000 NA   NA
 7058920 7058921 GAU_1691 GAU_1692   pepA FALSE 0.390 45.000 0.000 1.000   NA
 7058921 7058922 GAU_1692 GAU_t0025 pepA   FALSE 0.108 185.000 0.000 NA   NA
 7058924 7058925 GAU_1693 GAU_1694     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058925 7058926 GAU_1694 GAU_1695     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 7058928 7058929 GAU_1697 GAU_1698   rpmA FALSE 0.137 147.000 0.000 NA   NA
 7058929 7058930 GAU_1698 GAU_1699 rpmA rplU TRUE 0.969 53.000 0.667 0.013 Y NA
 7058930 7058931 GAU_1699 GAU_1700 rplU cafA TRUE 0.926 124.000 0.007 0.013 Y NA
 7058931 7058932 GAU_1700 GAU_1701 cafA   FALSE 0.087 570.000 0.000 1.000 N NA
 7058932 7058933 GAU_1701 GAU_1702   recQ TRUE 0.465 37.000 0.000 1.000 N NA
 7058933 7058934 GAU_1702 GAU_1703 recQ   FALSE 0.111 261.000 0.000 1.000 N NA
 7058934 7058935 GAU_1703 GAU_1704     FALSE 0.299 72.000 0.000 NA   NA
 7058935 7058936 GAU_1704 GAU_1705     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058936 7058937 GAU_1705 GAU_1706     TRUE 0.989 5.000 0.333 NA   NA
 7058937 7058938 GAU_1706 GAU_1707     TRUE 0.990 0.000 0.143 NA   NA
 7058938 7058939 GAU_1707 GAU_1708     TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7058939 7058940 GAU_1708 GAU_1709     FALSE 0.263 97.000 0.000 1.000   NA
 7058940 7058941 GAU_1709 GAU_1710     TRUE 0.837 5.000 0.000 1.000   NA
 7058941 7058942 GAU_1710 GAU_1711     TRUE 0.747 -25.000 0.000 NA   NA
 7058942 7058943 GAU_1711 GAU_1712     TRUE 0.985 6.000 0.006 NA   NA
 7058943 7058944 GAU_1712 GAU_1713     TRUE 0.987 -3.000 0.222 NA   NA
 7058944 7058945 GAU_1713 GAU_1714     TRUE 0.989 0.000 0.457 NA   NA
 7058945 7058946 GAU_1714 GAU_1715   aspS TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058947 7058948 GAU_1716 GAU_1717     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058949 7058950 GAU_1718 GAU_1719     TRUE 0.731 10.000 0.000 NA   NA
 7058950 7058951 GAU_1719 GAU_1720   trpA FALSE 0.395 50.000 0.000 NA N NA
 7058951 7058952 GAU_1720 GAU_1721 trpA   TRUE 0.808 -31.000 0.000 1.000 N NA
 7058952 7058953 GAU_1721 GAU_1722     TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000 N NA
 7058953 7058954 GAU_1722 GAU_1723   trpB FALSE 0.325 90.000 0.000 1.000 N NA
 7058954 7058955 GAU_1723 GAU_1724 trpB trpF TRUE 0.962 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 7058955 7058956 GAU_1724 GAU_1725 trpF trpC TRUE 0.910 19.000 0.000 0.001 Y NA
 7058958 7058959 GAU_1727 GAU_1728 trpD   TRUE 0.752 -10.000 0.000 NA   NA
 7058960 7058961 GAU_1729 GAU_1730 truA   FALSE 0.437 44.000 0.000 1.000 N NA
 7058961 7058962 GAU_1730 GAU_1731   purB TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7058962 7058963 GAU_1731 GAU_1732 purB purC TRUE 0.995 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 7058963 7058964 GAU_1732 GAU_1733 purC psd TRUE 0.865 0.000 0.000 1.000 N NA
 7058964 7058965 GAU_1733 GAU_1734 psd pssA TRUE 0.996 2.000 0.466 1.000 Y NA
 7058965 7058966 GAU_1734 GAU_1735 pssA purS TRUE 0.988 -3.000 0.040 1.000 N NA
 7058966 7058967 GAU_1735 GAU_1736 purS purQ TRUE 0.996 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 7058967 7058968 GAU_1736 GAU_1737 purQ purL TRUE 0.990 21.000 0.346 0.001 Y NA
 7058968 7058969 GAU_1737 GAU_1738 purL purF TRUE 0.991 15.000 0.223 1.000 Y NA
 7058969 7058970 GAU_1738 GAU_1739 purF   TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7058971 7058972 GAU_tm0001 GAU_1740     FALSE 0.254 89.000 0.000 NA   NA
 7058974 7058975 GAU_1742 GAU_1743   mdtK TRUE 0.496 57.000 0.000 0.098 N NA
 7058975 7058976 GAU_1743 GAU_1744 mdtK   TRUE 0.594 22.000 0.000 1.000   NA
 7058978 7058979 GAU_1746 GAU_1747   coaA TRUE 0.664 14.000 0.000 NA   NA
 7058979 7058980 GAU_1747 GAU_1748 coaA nrdB FALSE 0.132 208.000 0.000 1.000 N NA
 7058980 7058981 GAU_1748 GAU_1749 nrdB nrdA TRUE 0.996 -3.000 0.564 0.001 Y NA
 7058981 7058982 GAU_1749 GAU_1750 nrdA guaA FALSE 0.247 443.000 0.000 1.000 Y NA
 7058982 7058983 GAU_1750 GAU_1751 guaA   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058983 7058984 GAU_1751 GAU_1752   lysA TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7058984 7058985 GAU_1752 GAU_1753 lysA proS TRUE 0.688 18.000 0.000 1.000 N NA
 7058985 7058986 GAU_1753 GAU_1754 proS hisS TRUE 0.957 -3.000 0.000 0.036 Y NA
 7058986 7058987 GAU_1754 GAU_1755 hisS folC TRUE 0.796 10.000 0.000 1.000 N NA
 7058987 7058988 GAU_1755 GAU_1756 folC accD TRUE 0.904 66.000 0.007 1.000 N NA
 7058988 7058989 GAU_1756 GAU_1757 accD mrdB FALSE 0.342 85.000 0.000 1.000 N NA
 7058989 7058990 GAU_1757 GAU_1758 mrdB mrdA TRUE 0.739 14.000 0.000 1.000 N NA
 7058990 7058991 GAU_1758 GAU_1759 mrdA   TRUE 0.748 11.000 0.000 1.000   NA
 7058991 7058992 GAU_1759 GAU_1760     TRUE 0.990 -3.000 0.550 0.002   NA
 7058992 7058993 GAU_1760 GAU_1761   mreB TRUE 0.972 16.000 0.689 1.000 N NA
 7058993 7058994 GAU_1761 GAU_1762 mreB   FALSE 0.135 205.000 0.000 1.000 N NA
 7058994 7058995 GAU_1762 GAU_1763     FALSE 0.394 42.000 0.000 1.000   NA
 7058995 7058996 GAU_1763 GAU_1764   pnp TRUE 0.985 -25.000 0.057 1.000   NA
 7058996 7058997 GAU_1764 GAU_1765 pnp rpsO TRUE 0.956 82.000 0.335 1.000 Y NA
 7058998 7058999 GAU_1766 GAU_1767     FALSE 0.182 132.000 0.000 1.000   NA
 7059000 7059001 GAU_1768 GAU_1769     TRUE 0.802 6.000 0.000 NA   NA
 7059001 7059002 GAU_1769 GAU_1770   dxr TRUE 0.989 6.000 0.568 1.000 N NA
 7059002 7059003 GAU_1770 GAU_1771 dxr cdsA TRUE 0.995 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 7059003 7059004 GAU_1771 GAU_1772 cdsA uppS TRUE 0.966 56.000 0.400 1.000 Y NA
 7059004 7059005 GAU_1772 GAU_1773 uppS frr TRUE 0.960 25.000 0.409 1.000 N NA
 7059005 7059006 GAU_1773 GAU_1774 frr pyrH TRUE 0.986 8.000 0.626 1.000 N NA
 7059006 7059007 GAU_1774 GAU_1775 pyrH tsf TRUE 0.990 6.000 0.416 1.000 N NA
 7059007 7059008 GAU_1775 GAU_1776 tsf rpsB TRUE 0.848 181.000 0.748 1.000 Y NA
 7059008 7059009 GAU_1776 GAU_1777 rpsB rpsI TRUE 0.899 148.000 0.004 0.018 Y NA
 7059009 7059010 GAU_1777 GAU_1778 rpsI rplM TRUE 0.997 0.000 0.022 0.013 Y NA
 7059012 7059013 GAU_1780 GAU_1781     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7059013 7059014 GAU_1781 GAU_1782     TRUE 0.870 3.000 0.000 1.000 N NA
 7059014 7059015 GAU_1782 GAU_1783     TRUE 0.933 9.000 0.000 1.000 Y NA
 7059015 7059016 GAU_1783 GAU_1784     FALSE 0.137 176.000 0.000 NA N NA
 7059016 7059017 GAU_1784 GAU_1785     FALSE 0.168 126.000 0.000 NA   NA
 7059018 7059019 GAU_1786 GAU_1787     FALSE 0.069 349.000 0.000 NA   NA
 7059019 7059020 GAU_1787 GAU_1788     FALSE 0.155 134.000 0.000 NA   NA
 7059021 7059022 GAU_1789 GAU_1790 rpsA aroA/cmk TRUE 0.680 229.000 0.015 1.000 N NA
 7059022 7059023 GAU_1790 GAU_1791 aroA/cmk dapD TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7059023 7059024 GAU_1791 GAU_1792 dapD dapA TRUE 0.963 41.000 0.007 1.000 Y NA
 7059024 7059025 GAU_1792 GAU_1793 dapA dapB TRUE 0.994 8.000 0.013 1.000 Y NA
 7059025 7059026 GAU_1793 GAU_1794 dapB   TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7059026 7059027 GAU_1794 GAU_1795   asd TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7059027 7059028 GAU_1795 GAU_1796 asd   TRUE 0.996 -3.000 0.009 0.008 Y NA
 7059029 7059030 GAU_1797 GAU_1798     TRUE 0.646 15.000 0.000 NA   NA
 7059030 7059031 GAU_1798 GAU_1799     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7059031 7059032 GAU_1799 GAU_1800     TRUE 0.753 -9.000 0.000 NA   NA
 7059032 7059033 GAU_1800 GAU_1801     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 7059033 7059034 GAU_1801 GAU_1802     FALSE 0.091 221.000 0.000 NA   NA
 7059034 7059035 GAU_1802 GAU_1803     TRUE 0.580 20.000 0.000 NA   NA
 7059035 7059036 GAU_1803 GAU_1804     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059036 7059037 GAU_1804 GAU_1805     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059037 7059038 GAU_1805 GAU_1806     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 7059038 7059039 GAU_1806 GAU_1807     FALSE 0.101 196.000 0.000 NA   NA
 7059039 7059040 GAU_1807 GAU_1808     FALSE 0.122 164.000 0.000 NA   NA
 7059040 7059041 GAU_1808 GAU_1809     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7059041 7059042 GAU_1809 GAU_1810     FALSE 0.080 262.000 0.000 NA   NA
 7059042 7059043 GAU_1810 GAU_1811     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 7059043 7059044 GAU_1811 GAU_1812     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7059044 7059045 GAU_1812 GAU_1813     FALSE 0.170 125.000 0.000 NA   NA
 7059045 7059046 GAU_1813 GAU_1814   ssb TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059046 7059047 GAU_1814 GAU_1815 ssb   TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7059047 7059048 GAU_1815 GAU_1816     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7059048 7059049 GAU_1816 GAU_1817     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7059049 7059050 GAU_1817 GAU_1818     FALSE 0.205 108.000 0.000 NA   NA
 7059050 7059051 GAU_1818 GAU_1819     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059051 7059052 GAU_1819 GAU_1820     FALSE 0.173 123.000 0.000 NA   NA
 7059052 7059053 GAU_1820 GAU_1821     FALSE 0.160 130.000 0.000 NA   NA
 7059053 7059054 GAU_1821 GAU_1822     FALSE 0.345 51.000 0.000 NA   NA
 7059054 7059055 GAU_1822 GAU_1823     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 7059055 7059056 GAU_1823 GAU_1824     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7059056 7059057 GAU_1824 GAU_1825     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059057 7059058 GAU_1825 GAU_1826     TRUE 0.479 26.000 0.000 NA   NA
 7059058 7059059 GAU_1826 GAU_1827     FALSE 0.240 94.000 0.000 NA   NA
 7059059 7059060 GAU_1827 GAU_1828     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059060 7059061 GAU_1828 GAU_1829     TRUE 0.769 8.000 0.000 NA   NA
 7059061 7059062 GAU_1829 GAU_1830     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059062 7059063 GAU_1830 GAU_1831     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7059063 7059064 GAU_1831 GAU_1832     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7059064 7059065 GAU_1832 GAU_1833     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059065 7059066 GAU_1833 GAU_1834     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059066 7059067 GAU_1834 GAU_1835     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059067 7059068 GAU_1835 GAU_1836     FALSE 0.127 156.000 0.000 NA   NA
 7059068 7059069 GAU_1836 GAU_1837     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7059069 7059070 GAU_1837 GAU_1838     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7059070 7059071 GAU_1838 GAU_1839     FALSE 0.175 122.000 0.000 NA   NA
 7059071 7059072 GAU_1839 GAU_1840     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7059072 7059073 GAU_1840 GAU_1841     TRUE 0.769 8.000 0.000 NA   NA
 7059073 7059074 GAU_1841 GAU_1842     TRUE 0.755 -7.000 0.000 NA   NA
 7059074 7059075 GAU_1842 GAU_1843     TRUE 0.752 -10.000 0.000 NA   NA
 7059075 7059076 GAU_1843 GAU_1844     FALSE 0.178 121.000 0.000 NA   NA
 7059076 7059077 GAU_1844 GAU_1845     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059077 7059078 GAU_1845 GAU_1846     TRUE 0.731 10.000 0.000 NA   NA
 7059078 7059079 GAU_1846 GAU_1847     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059080 7059081 GAU_1848 GAU_1849     FALSE 0.091 220.000 0.000 NA   NA
 7059082 7059083 GAU_1850 GAU_1851     FALSE 0.166 127.000 0.000 NA   NA
 7059083 7059084 GAU_1851 GAU_1852     FALSE 0.246 92.000 0.000 NA   NA
 7059084 7059085 GAU_1852 GAU_1853     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059085 7059086 GAU_1853 GAU_1854     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059086 7059087 GAU_1854 GAU_1855     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059087 7059088 GAU_1855 GAU_1856     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059088 7059089 GAU_1856 GAU_1857     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059089 7059090 GAU_1857 GAU_1858     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059091 7059092 GAU_t0027 GAU_1859     FALSE 0.364 39.000 0.000 NA   NA
 7059092 7059093 GAU_1859 GAU_1860     TRUE 0.992 12.000 0.833 0.027 Y NA
 7059093 7059094 GAU_1860 GAU_1861     TRUE 0.994 -55.000 0.118 NA Y NA
 7059094 7059095 GAU_1861 GAU_t0028     FALSE 0.073 313.000 0.000 NA   NA
 7059095 7059096 GAU_t0028 GAU_1862     FALSE 0.155 134.000 0.000 NA   NA
 7059098 7059099 GAU_1864 GAU_1865 recN ppnK TRUE 0.906 85.000 0.170 1.000 N NA
 7059099 7059100 GAU_1865 GAU_1866 ppnK dxs TRUE 0.989 0.000 0.004 1.000 N NA
 7059100 7059101 GAU_1866 GAU_1867 dxs   TRUE 0.958 76.000 0.048 1.000 Y NA
 7059101 7059102 GAU_1867 GAU_1868   xseB TRUE 0.987 -7.000 0.053 1.000 N NA
 7059102 7059103 GAU_1868 GAU_1869 xseB xseA TRUE 0.996 9.000 0.412 0.001 Y NA
 7059103 7059104 GAU_1869 GAU_1870 xseA folD TRUE 0.901 61.000 0.002 1.000 N NA
 7059104 7059105 GAU_1870 GAU_1871 folD   TRUE 0.782 -10.000 0.000 1.000   NA
 7059105 7059106 GAU_1871 GAU_1872     TRUE 0.661 239.000 0.064 NA   NA
 7059106 7059107 GAU_1872 GAU_1873     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7059107 7059108 GAU_1873 GAU_1874   pheT TRUE 0.752 -10.000 0.000 NA   NA
 7059108 7059109 GAU_1874 GAU_1875 pheT pheS TRUE 0.996 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 7059109 7059110 GAU_1875 GAU_1876 pheS rplT TRUE 0.913 138.000 0.202 1.000 Y NA
 7059110 7059111 GAU_1876 GAU_1877 rplT rpmI TRUE 0.990 13.000 0.928 0.013 Y NA
 7059111 7059112 GAU_1877 GAU_1878 rpmI infC TRUE 0.942 88.000 0.652 1.000 Y NA
 7059112 7059113 GAU_1878 GAU_1879 infC   FALSE 0.096 247.000 0.000 1.000   NA
 7059113 7059114 GAU_1879 GAU_1880   dnaQ TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7059116 7059117 GAU_1882 GAU_1883 ksgA   FALSE 0.434 48.000 0.000 1.000 N NA
 7059117 7059118 GAU_1883 GAU_1884     TRUE 0.944 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 7059118 7059119 GAU_1884 GAU_1885     TRUE 0.543 109.000 0.000 1.000 Y NA
 7059119 7059120 GAU_1885 GAU_1886   pta TRUE 0.569 26.000 0.000 1.000 N NA
 7059120 7059121 GAU_1886 GAU_1887 pta coaD TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7059121 7059122 GAU_1887 GAU_1888 coaD   TRUE 0.989 -3.000 0.367 1.000 N NA
 7059122 7059123 GAU_1888 GAU_1889   recJ TRUE 0.968 3.000 0.000 0.010 Y NA
 7059123 7059124 GAU_1889 GAU_1890 recJ   FALSE 0.181 120.000 0.000 NA   NA
 7059124 7059125 GAU_1890 GAU_1891   dnaG FALSE 0.302 71.000 0.000 NA   NA
 7059125 7059126 GAU_1891 GAU_1892 dnaG   TRUE 0.963 49.000 0.015 1.000 Y NA
 7059126 7059127 GAU_1892 GAU_1893     TRUE 0.870 91.000 0.021 1.000   NA
 7059127 7059128 GAU_1893 GAU_1894   rpsU TRUE 0.988 9.000 0.031 0.021   NA
 7059128 7059129 GAU_1894 GAU_1895 rpsU   TRUE 0.770 129.000 0.003 1.000   NA
 7059129 7059130 GAU_1895 GAU_1896     TRUE 0.984 -7.000 0.034 NA   NA
 7059130 7059131 GAU_1896 GAU_1897   prmA TRUE 0.959 21.000 0.012 NA   NA
 7059131 7059132 GAU_1897 GAU_1898 prmA dnaJ TRUE 0.985 -7.000 0.009 1.000 N NA
 7059132 7059133 GAU_1898 GAU_1899 dnaJ hrcA TRUE 0.827 130.000 0.059 1.000 N NA
 7059133 7059134 GAU_1899 GAU_1900 hrcA hemZ TRUE 0.984 11.000 0.062 1.000 N NA
 7059134 7059135 GAU_1900 GAU_1901 hemZ   TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7059135 7059136 GAU_1901 GAU_1902   obg TRUE 0.981 -19.000 0.005 1.000   NA
 7059136 7059137 GAU_1902 GAU_1903 obg   FALSE 0.279 79.000 0.000 NA   NA
 7059137 7059138 GAU_1903 GAU_1904     FALSE 0.417 32.000 0.000 NA   NA
 7059138 7059139 GAU_1904 GAU_1905     FALSE 0.266 85.000 0.000 NA   NA
 7059140 7059141 GAU_1906 GAU_t0029 rfaE   FALSE 0.234 96.000 0.000 NA   NA
 7059141 7059142 GAU_t0029 GAU_t0030     FALSE 0.138 145.000 0.000 NA   NA
 7059143 7059144 GAU_1907 GAU_1908     FALSE 0.111 209.000 0.000 1.000   NA
 7059144 7059145 GAU_1908 GAU_1909     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7059145 7059146 GAU_1909 GAU_1910     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059146 7059147 GAU_1910 GAU_1911     TRUE 0.745 -49.000 0.000 NA   NA
 7059147 7059148 GAU_1911 GAU_1912     TRUE 0.837 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7059148 7059149 GAU_1912 GAU_1913     FALSE 0.329 89.000 0.000 1.000 N NA
 7059149 7059150 GAU_1913 GAU_1914     FALSE 0.393 35.000 0.000 NA   NA
 7059150 7059151 GAU_1914 GAU_1915   alaS TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059151 7059152 GAU_1915 GAU_1916 alaS recX TRUE 0.864 104.000 0.085 1.000   NA
 7059152 7059153 GAU_1916 GAU_1917 recX recA TRUE 0.675 251.000 0.296 1.000   NA
 7059153 7059154 GAU_1917 GAU_1918 recA   TRUE 0.496 144.000 0.000 0.042 Y NA
 7059154 7059155 GAU_1918 GAU_1919     FALSE 0.316 93.000 0.000 1.000 N NA
 7059155 7059156 GAU_1919 GAU_1920     FALSE 0.198 139.000 0.000 1.000 N NA
 7059156 7059157 GAU_1920 GAU_1921   ftsK FALSE 0.145 189.000 0.000 1.000 N NA
 7059157 7059158 GAU_1921 GAU_1922 ftsK comB TRUE 0.928 40.000 0.028 1.000 N NA
 7059158 7059159 GAU_1922 GAU_1923 comB accC TRUE 0.868 1.000 0.000 1.000 N NA
 7059159 7059160 GAU_1923 GAU_1924 accC pilT FALSE 0.342 85.000 0.000 1.000 N NA
 7059160 7059161 GAU_1924 GAU_1925 pilT accB TRUE 0.769 12.000 0.000 1.000 N NA
 7059161 7059162 GAU_1925 GAU_1926 accB   TRUE 0.924 50.000 0.026 1.000 N NA
 7059162 7059163 GAU_1926 GAU_1927   aroQ TRUE 0.985 21.000 0.023 1.000 Y NA
 7059163 7059164 GAU_1927 GAU_1928 aroQ   TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7059166 7059167 GAU_1930 GAU_1931 tatA   TRUE 0.680 13.000 0.000 NA   NA
 7059167 7059168 GAU_1931 GAU_1932     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7059168 7059169 GAU_1932 GAU_1933     TRUE 0.810 -3.000 0.000 1.000   NA
 7059169 7059170 GAU_1933 GAU_1934   hutI FALSE 0.138 167.000 0.000 1.000   NA
 7059170 7059171 GAU_1934 GAU_1935 hutI   FALSE 0.426 36.000 0.000 1.000   NA
 7059171 7059172 GAU_1935 GAU_1936   hutU TRUE 0.841 0.000 0.000 1.000   NA
 7059172 7059173 GAU_1936 GAU_1937 hutU hutH TRUE 0.997 -3.000 0.315 0.001 Y NA
 7059173 7059174 GAU_1937 GAU_1938 hutH   FALSE 0.222 101.000 0.000 NA   NA
 7059174 7059175 GAU_1938 GAU_1939   tatC TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059175 7059176 GAU_1939 GAU_1940 tatC   FALSE 0.393 35.000 0.000 NA   NA
 7059176 7059177 GAU_1940 GAU_1941   pal TRUE 0.479 30.000 0.000 1.000   NA
 7059177 7059178 GAU_1941 GAU_1942 pal   FALSE 0.444 41.000 0.000 1.000 N NA
 7059178 7059179 GAU_1942 GAU_1943     FALSE 0.362 66.000 0.000 NA N NA
 7059179 7059180 GAU_1943 GAU_1944     TRUE 0.815 -3.000 0.000 NA N NA
 7059180 7059181 GAU_1944 GAU_1945     TRUE 0.997 4.000 0.125 0.044 Y NA
 7059181 7059182 GAU_1945 GAU_1946     FALSE 0.452 39.000 0.000 1.000 N NA
 7059182 7059183 GAU_1946 GAU_1947     FALSE 0.148 156.000 0.000 1.000   NA
 7059183 7059184 GAU_1947 GAU_1948   ssb FALSE 0.121 191.000 0.000 1.000   NA
 7059184 7059185 GAU_1948 GAU_1949 ssb   FALSE 0.133 176.000 0.000 1.000   NA
 7059185 7059186 GAU_1949 GAU_1950     TRUE 0.906 77.000 0.209 1.000   NA
 7059186 7059187 GAU_1950 GAU_1951     FALSE 0.391 44.000 0.000 1.000   NA
 7059187 7059188 GAU_1951 GAU_1952     FALSE 0.137 147.000 0.000 NA   NA
 7059188 7059189 GAU_1952 GAU_1953   uvrB TRUE 0.752 -10.000 0.000 NA   NA
 7059191 7059192 GAU_1955 GAU_1956 relA radC FALSE 0.129 214.000 0.000 1.000 N NA
 7059194 7059195 GAU_1958 GAU_1959     TRUE 0.479 26.000 0.000 NA   NA
 7059197 7059198 GAU_1961 GAU_1962 secA nadD FALSE 0.424 54.000 0.000 1.000 N NA
 7059198 7059199 GAU_1962 GAU_1963 nadD   TRUE 0.987 7.000 0.020 1.000   NA
 7059199 7059200 GAU_1963 GAU_1964     FALSE 0.332 74.000 0.000 1.000   NA
 7059200 7059201 GAU_1964 GAU_1965     TRUE 0.995 7.000 0.027 1.000 Y NA
 7059201 7059202 GAU_1965 GAU_1966     TRUE 0.934 34.000 0.033 1.000   NA
 7059202 7059203 GAU_1966 GAU_1967     TRUE 0.988 -3.000 0.107 1.000   NA
 7059203 7059204 GAU_1967 GAU_1968   carB FALSE 0.398 66.000 0.000 1.000 N NA
 7059204 7059205 GAU_1968 GAU_1969 carB   TRUE 0.811 -16.000 0.000 1.000 N NA
 7059205 7059206 GAU_1969 GAU_1970   gmd TRUE 0.923 15.000 0.000 0.006 Y NA
 7059206 7059207 GAU_1970 GAU_1971 gmd rpmB FALSE 0.302 97.000 0.000 1.000 N NA
 7059207 7059208 GAU_1971 GAU_1972 rpmB rplQ TRUE 0.937 12.000 0.000 0.012 Y NA
 7059208 7059209 GAU_1972 GAU_1973 rplQ rpoA TRUE 0.984 7.000 0.873 1.000 N NA
 7059209 7059210 GAU_1973 GAU_1974 rpoA rpsD TRUE 0.842 112.000 0.549 1.000 N NA
 7059210 7059211 GAU_1974 GAU_1975 rpsD rpsK TRUE 0.997 3.000 0.509 0.017 Y NA
 7059211 7059212 GAU_1975 GAU_1976 rpsK rpsM TRUE 0.996 4.000 0.810 0.012 Y NA
 7059212 7059213 GAU_1976 GAU_1977 rpsM rpmJ TRUE 0.983 15.000 0.194 0.012   NA
 7059213 7059214 GAU_1977 GAU_1978 rpmJ pyrF FALSE 0.091 272.000 0.000 1.000   NA
 7059214 7059215 GAU_1978 GAU_1979 pyrF pyrD TRUE 0.997 -3.000 0.154 0.001 Y NA
 7059215 7059216 GAU_1979 GAU_1980 pyrD   TRUE 0.602 24.000 0.000 1.000 N NA
 7059216 7059217 GAU_1980 GAU_1981   smpB TRUE 0.989 3.000 0.002 1.000 N NA
 7059219 7059220 GAU_1982 GAU_1983     TRUE 0.748 9.000 0.000 NA   NA
 7059220 7059221 GAU_1983 GAU_1984   aspA FALSE 0.375 59.000 0.000 NA N NA
 7059221 7059222 GAU_1984 GAU_1985 aspA   FALSE 0.377 37.000 0.000 NA   NA
 7059222 7059223 GAU_1985 GAU_1986     FALSE 0.199 110.000 0.000 NA   NA
 7059223 7059224 GAU_1986 GAU_1987   trxB TRUE 0.828 6.000 0.000 1.000   NA
 7059224 7059225 GAU_1987 GAU_1988 trxB   FALSE 0.465 27.000 0.000 NA   NA
 7059225 7059226 GAU_1988 GAU_1989     TRUE 0.605 18.000 0.000 NA   NA
 7059226 7059227 GAU_1989 GAU_1990     TRUE 0.843 4.000 0.000 1.000   NA
 7059227 7059228 GAU_1990 GAU_1991     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059228 7059229 GAU_1991 GAU_1992     TRUE 0.823 3.000 0.000 NA   NA
 7059229 7059230 GAU_1992 GAU_1993     FALSE 0.331 57.000 0.000 NA   NA
 7059230 7059231 GAU_1993 GAU_1994     TRUE 0.813 5.000 0.000 NA   NA
 7059231 7059232 GAU_1994 GAU_1995     FALSE 0.302 71.000 0.000 NA   NA
 7059232 7059233 GAU_1995 GAU_1996     TRUE 0.715 11.000 0.000 NA   NA
 7059233 7059234 GAU_1996 GAU_1997     TRUE 0.782 -3.000 0.000 NA   NA
 7059234 7059235 GAU_1997 GAU_1998     TRUE 0.965 6.000 0.000 0.002 Y NA
 7059235 7059236 GAU_1998 GAU_1999     FALSE 0.268 84.000 0.000 NA   NA
 7059237 7059238 GAU_2000 GAU_2001   erpA FALSE 0.097 206.000 0.000 NA   NA
 7059238 7059239 GAU_2001 GAU_2002 erpA   FALSE 0.316 66.000 0.000 NA   NA
 7059239 7059240 GAU_2002 GAU_2003     TRUE 0.465 37.000 0.000 1.000 N NA
 7059240 7059241 GAU_2003 GAU_2004     TRUE 0.988 -3.000 0.059 NA N NA
 7059242 7059243 GAU_2005 GAU_2006 gltP   TRUE 0.822 12.000 0.000 0.095 N NA
 7059243 7059244