MicrobesOnline Operon Predictions for Baumannia cicadellinicola str. Hc

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2022994 2022995 BCI_0001 BCI_0002 mqo purL FALSE 0.019 213.000 0.000 1.000   NA
 2022995 2022996 BCI_0002 BCI_0003 purL   TRUE 0.819 54.000 0.014 1.000 Y NA
 2022996 2022997 BCI_0003 BCI_0004   glyA FALSE 0.040 213.000 0.000 1.000 N NA
 2022999 2023000 BCI_0006 BCI_0007 iscS ndk TRUE 0.724 33.000 0.006 1.000 N NA
 2023000 2023001 BCI_0007 BCI_0008 ndk ispG FALSE 0.047 348.000 0.000 1.000 N NA
 2023001 2023002 BCI_0008 BCI_0009 ispG hisS TRUE 0.989 23.000 0.207 1.000 N NA
 2023002 2023003 BCI_0009 BCI_0010 hisS   FALSE 0.134 71.000 0.003 1.000   NA
 2023003 2023004 BCI_0010 BCI_0011   engA TRUE 0.989 19.000 0.203 1.000   NA
 2023004 2023005 BCI_0011 BCI_0012 engA pgi FALSE 0.046 98.000 0.000 1.000   NA
 2023007 2023008 BCI_0014 BCI_0015 nudE metK FALSE 0.019 184.000 0.000 1.000   NA
 2023010 2023011 BCI_0017 BCI_0018 metE   FALSE 0.023 275.000 0.000 NA   NA
 2023012 2023013 BCI_0019 BCI_0020 metA plsB FALSE 0.042 254.000 0.000 1.000 N NA
 2023013 2023014 BCI_0020 BCI_0021 plsB trpS FALSE 0.042 178.000 0.000 1.000 N NA
 2023014 2023015 BCI_0021 BCI_0022 trpS rpe TRUE 0.481 80.000 0.022 1.000 N NA
 2023015 2023016 BCI_0022 BCI_0023 rpe aroB FALSE 0.123 94.000 0.003 1.000 N NA
 2023016 2023017 BCI_0023 BCI_0024 aroB aroK TRUE 0.997 5.000 0.208 1.000 Y NA
 2023017 2023018 BCI_0024 BCI_0025 aroK pssA FALSE 0.044 287.000 0.000 1.000 N NA
 2023018 2023019 BCI_0025 BCI_0026 pssA   FALSE 0.022 181.000 0.000 NA   NA
 2023020 2023021 BCI_0027 BCI_0028   murA TRUE 0.947 68.000 0.258 NA N NA
 2023022 2023023 BCI_0029 BCI_0030 degQ   TRUE 0.645 95.000 0.154 NA   NA
 2023024 2023025 BCI_0031 BCI_0032 rplM rpsI TRUE 0.999 20.000 0.601 0.071 Y NA
 2023025 2023026 BCI_0032 BCI_0033 rpsI   FALSE 0.027 460.000 0.000 NA   NA
 2023026 1394421 BCI_0033 BCI_0034     FALSE 0.028 511.000 0.000 NA   NA
 1394421 2023027 BCI_0034 BCI_0035   purH FALSE 0.026 143.000 0.000 NA   NA
 2023027 2023028 BCI_0035 BCI_0036 purH purD TRUE 0.996 21.000 0.238 1.000 Y NA
 2023029 2023030 BCI_0037 BCI_0038     FALSE 0.165 117.000 0.000 NA Y NA
 2023030 2023031 BCI_0038 BCI_0039   nuc TRUE 0.560 23.000 0.000 1.000   NA
 2023031 2023032 BCI_0039 BCI_0040 nuc hup FALSE 0.041 102.000 0.000 1.000   NA
 2023033 2023034 BCI_0041 BCI_0042 thiC thiE TRUE 0.989 -13.000 0.063 0.013 Y NA
 2023034 2023035 BCI_0042 BCI_0043 thiE thiF TRUE 0.998 -7.000 0.242 1.000 Y NA
 2023035 2023036 BCI_0043 BCI_0044 thiF thiS TRUE 0.952 0.000 0.000 1.000 Y NA
 2023036 2023037 BCI_0044 BCI_0045 thiS thiG TRUE 0.949 4.000 0.000 1.000 Y NA
 2023037 2023038 BCI_0045 BCI_0046 thiG thiH TRUE 0.998 -3.000 0.277 0.013 Y NA
 2023039 2023040 BCI_0047 BCI_0048 mreD mreC TRUE 0.912 159.000 0.550 0.013 Y NA
 2023040 2023041 BCI_0048 BCI_0049 mreC mreB TRUE 0.997 35.000 0.689 1.000 N NA
 2023042 2023043 BCI_0050 BCI_0051 aroQ accB TRUE 0.992 22.000 0.254 1.000 N NA
 2023043 2023044 BCI_0051 BCI_0052 accB accC TRUE 0.998 9.000 0.275 0.007 Y NA
 2023048 2023049 BCI_0056 BCI_0057 ftsY ftsE TRUE 0.985 13.000 0.117 1.000 N NA
 2023049 2023050 BCI_0057 BCI_0058 ftsE ftsX TRUE 0.989 20.000 0.121 1.000 Y NA
 2023050 2023051 BCI_0058 BCI_0059 ftsX rpoH TRUE 0.762 63.000 0.051 1.000 N NA
 2023051 2023052 BCI_0059 BCI_0060 rpoH ubiB FALSE 0.057 173.000 0.005 1.000 N NA
 2023052 2023053 BCI_0060 BCI_0061 ubiB hemC FALSE 0.145 135.000 0.000 1.000 Y NA
 2023053 2023054 BCI_0061 BCI_0062 hemC hemD TRUE 0.996 8.000 0.205 0.004 Y NA
 2023055 2023056 BCI_0063 BCI_0064 lnt   TRUE 0.382 46.000 0.003 NA   NA
 2023056 2023057 BCI_0064 BCI_0065   miaB TRUE 0.607 40.000 0.007 NA   NA
 2023057 2023058 BCI_0065 BCI_0066 miaB ligA FALSE 0.041 188.000 0.000 1.000 N NA
 2023058 2023059 BCI_0066 BCI_0067 ligA zipA TRUE 0.445 64.000 0.013 1.000   NA
 2023060 2023061 BCI_0068 BCI_0069 cysK ptsH FALSE 0.146 174.000 0.019 1.000 N NA
 2023061 2023062 BCI_0069 BCI_0070 ptsH ptsI TRUE 0.850 53.000 0.022 0.004 Y NA
 2023064 2023065 BCI_0072 BCI_0073 purM purN TRUE 0.997 -9.000 0.230 0.009 Y NA
 2023065 2023066 BCI_0073 BCI_0074 purN ppk FALSE 0.129 211.000 0.017 1.000 N NA
 2023067 2023068 BCI_0075 BCI_0076 tktA talB TRUE 0.999 21.000 0.739 1.000 Y NA
 2023069 2023070 BCI_0077 BCI_0078 cysT cysW TRUE 0.999 9.000 0.583 0.004 N NA
 2023070 2023071 BCI_0078 BCI_0079 cysW cysA TRUE 0.996 3.000 0.180 1.000 Y NA
 2023071 2023072 BCI_0079 BCI_0080 cysA rnfB FALSE 0.020 273.000 0.000 1.000   NA
 2023073 2023074 BCI_0081 BCI_0082 tyrS pdxH TRUE 0.922 36.000 0.054 1.000 N NA
 2023074 2023075 BCI_0082 BCI_0083 pdxH slyA FALSE 0.041 234.000 0.000 1.000 N NA
 2023075 2023076 BCI_0083 BCI_0084 slyA   FALSE 0.064 92.000 0.000 NA   NA
 2023078 2023079 BCI_0086 BCI_0087   ribE FALSE 0.044 206.000 0.003 1.000 N NA
 1394475 2023080 BCI_0088 BCI_0089     FALSE 0.023 168.000 0.000 NA   NA
 1394477 1394478 BCI_0090 BCI_0091     TRUE 0.710 13.000 0.000 NA   NA
 1394478 1394479 BCI_0091 BCI_0092     TRUE 0.737 9.000 0.000 NA   NA
 1394479 1394480 BCI_0092 BCI_0093     TRUE 0.288 52.000 0.000 NA   NA
 2023083 2023084 BCI_0096 BCI_0097   sucC FALSE 0.025 355.000 0.000 NA   NA
 2023084 2023085 BCI_0097 BCI_0098 sucC sucD TRUE 1.000 -12.000 0.806 0.004 Y NA
 2023085 1394486 BCI_0098 BCI_0099 sucD   FALSE 0.029 1071.000 0.000 NA   NA
 1394486 2023086 BCI_0099 BCI_0100   pal TRUE 0.421 41.000 0.000 NA   NA
 2023086 2023087 BCI_0100 BCI_0101 pal   TRUE 0.974 15.000 0.088 NA   NA
 2023087 2023088 BCI_0101 BCI_0102   nadA FALSE 0.237 58.000 0.000 NA   NA
 2023089 2023090 BCI_0103 BCI_0104 tilS   TRUE 0.845 9.000 0.000 1.000 N NA
 2023090 2023091 BCI_0104 BCI_0105     FALSE 0.136 380.000 0.000 1.000 Y NA
 2023091 2023092 BCI_0105 BCI_0106   troB TRUE 0.999 2.000 0.465 1.000 Y NA
 2023092 2023093 BCI_0106 BCI_0107 troB ssb FALSE 0.158 85.000 0.000 1.000 N NA
 1394495 2023094 BCI_0108 BCI_0109 gltP   FALSE 0.029 640.000 0.000 NA   NA
 2023094 2023095 BCI_0109 BCI_0110   gmk FALSE 0.041 247.000 0.000 1.000 N NA
 2023095 2023096 BCI_0110 BCI_0111 gmk rpoZ TRUE 0.972 73.000 0.471 1.000 N NA
 2023096 2023097 BCI_0111 BCI_0112 rpoZ recG FALSE 0.115 297.000 0.003 0.053 Y NA
 2023097 2023098 BCI_0112 BCI_0113 recG   FALSE 0.216 58.000 0.000 1.000   NA
 2023100 2023101 BCI_0115 BCI_0116 dnaX   TRUE 0.768 275.000 0.411 NA   NA
 2023101 2023102 BCI_0116 BCI_0117   htpG FALSE 0.041 178.000 0.007 NA   NA
 2023102 2023103 BCI_0117 BCI_0118 htpG adk TRUE 0.370 97.000 0.035 1.000 N NA
 2023104 2023105 BCI_0119 BCI_0120 purK purE TRUE 0.995 -3.000 0.136 0.004 Y NA
 1394510 1394511 BCI_0123 BCI_0124   cyaA FALSE 0.030 126.000 0.000 NA   NA
 1394511 2023108 BCI_0124 BCI_0125 cyaA dapF FALSE 0.114 79.000 0.000 NA   NA
 2023108 2023109 BCI_0125 BCI_0126 dapF   FALSE 0.042 113.000 0.004 1.000   NA
 2023109 2023110 BCI_0126 BCI_0127   uvrD TRUE 0.614 55.000 0.017 1.000   NA
 2023110 2023111 BCI_0127 BCI_0128 uvrD corA FALSE 0.051 447.000 0.000 1.000 N NA
 2023114 2023115 BCI_0131 BCI_0132 gyrB dnaN TRUE 0.524 158.000 0.114 1.000 Y NA
 2023116 2023117 BCI_0133 BCI_0134 rpmH rnpA TRUE 0.999 12.000 0.787 1.000   NA
 2023117 2023118 BCI_0134 BCI_0135 rnpA   TRUE 0.998 -24.000 0.540 NA   NA
 2023118 2023119 BCI_0135 BCI_0136     TRUE 0.998 3.000 0.461 NA   NA
 2023119 2023120 BCI_0136 BCI_0137   trmE TRUE 0.995 -3.000 0.221 0.081   NA
 2023121 2023122 BCI_0138 BCI_0139 glmS glmU TRUE 0.946 43.000 0.055 1.000 Y NA
 2023122 2023123 BCI_0139 BCI_0140 glmU atpC TRUE 0.860 54.000 0.067 1.000 N NA
 2023123 2023124 BCI_0140 BCI_0141 atpC atpD TRUE 1.000 14.000 0.837 0.014 Y NA
 2023124 2023125 BCI_0141 BCI_0142 atpD atpG TRUE 0.997 46.000 0.724 0.014 Y NA
 2023125 2023126 BCI_0142 BCI_0143 atpG atpA TRUE 0.998 47.000 0.846 0.014 Y NA
 2023126 2023127 BCI_0143 BCI_0144 atpA atpH TRUE 0.999 22.000 0.864 0.014 Y NA
 2023127 2023128 BCI_0144 BCI_0145 atpH atpF TRUE 0.995 23.000 0.242 0.014 Y NA
 2023128 2023129 BCI_0145 BCI_0146 atpF atpE TRUE 0.998 29.000 0.666 0.014 Y NA
 2023129 2023130 BCI_0146 BCI_0147 atpE atpB TRUE 0.997 37.000 0.557 0.014 Y NA
 2023130 2023131 BCI_0147 BCI_0148 atpB gidA FALSE 0.158 88.000 0.004 1.000 N NA
 2023131 2023132 BCI_0148 BCI_0149 gidA gcvT TRUE 0.320 47.000 0.000 1.000   NA
 2023133 1394538 BCI_0150 BCI_0151 recJ prfB TRUE 0.505 31.000 0.000 NA   NA
 1394538 2023134 BCI_0151 BCI_0152 prfB lysS TRUE 0.737 9.000 0.000 NA   NA
 2023134 2023135 BCI_0152 BCI_0153 lysS murI TRUE 0.417 54.000 0.000 1.000 N NA
 2023135 1394541 BCI_0153 BCI_0509 murI rrsB FALSE 0.022 271.000 0.000 NA   NA
 1394541 1394542 BCI_0509 BCI_0508 rrsB   FALSE 0.033 114.000 0.000 NA   NA
 1394542 1394543 BCI_0508 BCI_0507   rrlB FALSE 0.088 85.000 0.000 NA   NA
 1394543 1394544 BCI_0507 BCI_0506 rrlB rrfB TRUE 0.483 33.000 0.000 NA   NA
 1394544 1394545 BCI_0506 BCI_0158 rrfB   TRUE 0.625 21.000 0.000 NA   NA
 1394545 1394546 BCI_0158 BCI_0159     TRUE 0.573 24.000 0.000 NA   NA
 2023136 2023137 BCI_0160 BCI_0161 glyS glyQ TRUE 0.999 6.000 0.651 0.003 Y NA
 2023137 2023138 BCI_0161 BCI_0162 glyQ metF FALSE 0.055 731.000 0.000 1.000 N NA
 2023138 2023139 BCI_0162 BCI_0163 metF metB FALSE 0.151 181.000 0.007 1.000 Y NA
 2023141 2023142 BCI_0166 BCI_0167 priA hslV FALSE 0.040 225.000 0.000 1.000 N NA
 2023142 2023143 BCI_0167 BCI_0168 hslV hslU TRUE 1.000 4.000 0.752 1.000 Y NA
 2023143 2023144 BCI_0168 BCI_0169 hslU tpiA FALSE 0.042 263.000 0.000 1.000 N NA
 2023145 2023146 BCI_0170 BCI_0171   pfkA TRUE 0.694 71.000 0.049 1.000 N NA
 2023146 2023147 BCI_0171 BCI_0172 pfkA cysE FALSE 0.041 247.000 0.000 1.000 N NA
 2023147 2023148 BCI_0172 BCI_0173 cysE gpsA TRUE 0.987 51.000 0.429 1.000 N NA
 2023148 2023149 BCI_0173 BCI_0174 gpsA   FALSE 0.052 386.000 0.000 NA N NA
 2023150 2023151 BCI_0175 BCI_0176   coaD FALSE 0.043 272.000 0.000 1.000 N NA
 2023152 2023153 BCI_0177 BCI_0178 mutM rpmG TRUE 0.723 61.000 0.034 1.000 N NA
 2023153 2023154 BCI_0178 BCI_0179 rpmG rpmB TRUE 0.990 50.000 0.332 0.068 Y NA
 2023154 2023155 BCI_0179 BCI_0180 rpmB   FALSE 0.049 99.000 0.000 NA   NA
 2023157 2023158 BCI_0182 BCI_0183 dut dfp TRUE 0.994 -19.000 0.201 1.000 N NA
 2023158 1394571 BCI_0183 BCI_0184 dfp   FALSE 0.021 208.000 0.000 NA   NA
 1394571 1394572 BCI_0184 BCI_0185     FALSE 0.065 91.000 0.000 NA   NA
 1394572 1394573 BCI_0185 BCI_0186     TRUE 0.588 23.000 0.000 NA   NA
 1394573 1394574 BCI_0186 BCI_0187     TRUE 0.663 18.000 0.000 NA   NA
 1394574 2023159 BCI_0187 BCI_0188   rho FALSE 0.022 250.000 0.000 NA   NA
 2023159 2023160 BCI_0188 BCI_0189 rho trxA TRUE 0.501 94.000 0.087 1.000   NA
 2023160 2023161 BCI_0189 BCI_0190 trxA   FALSE 0.030 124.000 0.000 NA   NA
 2023164 2023165 BCI_0193 BCI_0194 rluD clpB FALSE 0.051 139.000 0.003 1.000 N NA
 2023166 2023167 BCI_0195 BCI_0196 rplS trmD TRUE 0.999 17.000 0.567 1.000 Y NA
 2023167 2023168 BCI_0196 BCI_0197 trmD rimM TRUE 0.999 25.000 0.672 1.000 Y NA
 2023168 2023169 BCI_0197 BCI_0198 rimM rpsP TRUE 0.999 -10.000 0.342 0.067 Y NA
 2023169 2023170 BCI_0198 BCI_0199 rpsP ffh TRUE 0.896 97.000 0.361 1.000 N NA
 2023172 1394589 BCI_0201 BCI_0202 gshA   FALSE 0.023 172.000 0.000 NA   NA
 1394589 1394590 BCI_0202 BCI_0203     TRUE 0.744 8.000 0.000 NA   NA
 1394590 2023173 BCI_0203 BCI_0204   csrA FALSE 0.021 198.000 0.000 NA   NA
 2023173 2023174 BCI_0204 BCI_0205 csrA alaS FALSE 0.145 182.000 0.020 1.000 N NA
 2023174 2023175 BCI_0205 BCI_0206 alaS recA FALSE 0.234 248.000 0.054 1.000 N NA
 2023176 2023177 BCI_0207 BCI_0208     TRUE 0.998 27.000 0.594 0.012 Y NA
 2023177 2023178 BCI_0208 BCI_0209   mutS FALSE 0.144 87.000 0.000 1.000 N NA
 2023179 2023180 BCI_0210 BCI_0211 ispF ispD TRUE 0.999 10.000 0.419 1.000 Y NA
 2023180 2023181 BCI_0211 BCI_0212 ispD cysC FALSE 0.045 315.000 0.000 1.000 N NA
 2023181 2023182 BCI_0212 BCI_0213 cysC cysN TRUE 0.952 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 2023182 2023183 BCI_0213 BCI_0214 cysN cysD TRUE 0.998 13.000 0.574 0.003 N NA
 2023183 2023184 BCI_0214 BCI_0215 cysD cysG TRUE 0.995 44.000 0.417 1.000 Y NA
 2023184 2023185 BCI_0215 BCI_0216 cysG cysH FALSE 0.199 168.000 0.011 1.000 Y NA
 2023185 2023186 BCI_0216 BCI_0217 cysH cysI TRUE 0.983 14.000 0.116 1.000 N NA
 2023186 2023187 BCI_0217 BCI_0218 cysI cysJ TRUE 1.000 0.000 0.791 0.003 Y NA
 2023189 2023190 BCI_0220 BCI_0221   eno TRUE 0.754 41.000 0.010 1.000 N NA
 2023190 2023191 BCI_0221 BCI_0222 eno pyrG TRUE 0.772 68.000 0.068 1.000 N NA
 2023191 1394610 BCI_0222 BCI_0223 pyrG relA FALSE 0.038 109.000 0.000 NA   NA
 2023193 1394613 BCI_0225 BCI_0226   mrcB FALSE 0.029 831.000 0.000 NA   NA
 2023194 2023195 BCI_0227 BCI_0228 dksA pcnB FALSE 0.188 510.000 0.023 1.000 N NA
 2023195 2023196 BCI_0228 BCI_0229 pcnB folK TRUE 0.990 26.000 0.234 1.000 N NA
 2023196 2023197 BCI_0229 BCI_0230 folK panB TRUE 0.938 57.000 0.117 1.000 Y NA
 2023197 2023198 BCI_0230 BCI_0231 panB panC TRUE 0.998 19.000 0.395 0.003 Y NA
 2023198 2023199 BCI_0231 BCI_0232 panC leuS FALSE 0.041 199.000 0.000 1.000 N NA
 2023199 2023200 BCI_0232 BCI_0233 leuS holA FALSE 0.097 217.000 0.012 1.000 N NA
 2023200 2023201 BCI_0233 BCI_0234 holA nadD TRUE 0.975 -7.000 0.045 1.000 N NA
 2023201 2023202 BCI_0234 BCI_0235 nadD mrdA TRUE 0.656 71.000 0.038 1.000 N NA
 2023202 2023203 BCI_0235 BCI_0236 mrdA mrdB TRUE 0.968 14.000 0.046 1.000 N NA
 2023203 2023204 BCI_0236 BCI_0237 mrdB lipB FALSE 0.055 128.000 0.000 1.000 N NA
 2023204 2023205 BCI_0237 BCI_0238 lipB lipA TRUE 0.993 36.000 0.319 0.003 Y NA
 2023205 2023206 BCI_0238 BCI_0239 lipA   FALSE 0.041 230.000 0.000 1.000 N NA
 2023206 2023207 BCI_0239 BCI_0240   pgsA FALSE 0.035 200.000 0.000 0.078 N NA
 2023207 1394628 BCI_0240 BCI_0241 pgsA   TRUE 0.409 42.000 0.000 NA   NA
 1394628 1394629 BCI_0241 BCI_0242     FALSE 0.026 144.000 0.000 NA   NA
 1394629 1394630 BCI_0242 BCI_0243     TRUE 0.702 14.000 0.000 NA   NA
 1394630 2023208 BCI_0243 BCI_0244   pgl FALSE 0.055 96.000 0.000 NA   NA
 2023210 2023211 BCI_0246 BCI_0247 bioB bioF TRUE 0.996 -3.000 0.168 1.000 Y NA
 2023211 2023212 BCI_0247 BCI_0248 bioF bioC TRUE 0.988 -13.000 0.133 1.000   NA
 2023212 2023213 BCI_0248 BCI_0249 bioC bioD TRUE 0.968 -7.000 0.054 0.010   NA
 2023213 2023214 BCI_0249 BCI_0250 bioD   FALSE 0.052 464.000 0.000 1.000 N NA
 2023214 2023215 BCI_0250 BCI_0251   gpmA TRUE 0.347 60.000 0.000 1.000 N NA
 2023215 2023216 BCI_0251 BCI_0252 gpmA serC TRUE 0.852 7.000 0.000 1.000 N NA
 2023216 2023217 BCI_0252 BCI_0253 serC aroA TRUE 0.535 95.000 0.033 1.000 Y NA
 2023217 2023218 BCI_0253 BCI_0254 aroA cmk TRUE 0.942 62.000 0.209 1.000 N NA
 2023218 2023219 BCI_0254 BCI_0255 cmk rpsA TRUE 0.739 133.000 0.281 1.000 N NA
 2023219 2023220 BCI_0255 BCI_0256 rpsA   FALSE 0.021 196.000 0.000 NA   NA
 2023222 2023223 BCI_0258 BCI_0259 pyrB pyrI TRUE 0.995 14.000 0.197 0.003 Y NA
 2023223 2023224 BCI_0259 BCI_0260 pyrI   TRUE 0.749 46.000 0.013 NA N NA
 2023227 2023228 BCI_0263 BCI_0264 lon clpX TRUE 0.677 209.000 0.201 1.000 Y NA
 2023228 2023229 BCI_0264 BCI_0265 clpX clpP TRUE 0.876 137.000 0.352 1.000 Y NA
 2023229 2023230 BCI_0265 BCI_0266 clpP tig TRUE 0.844 222.000 0.351 1.000 Y NA
 2023231 2023232 BCI_0267 BCI_0268 cyoA cyoB TRUE 0.995 31.000 0.327 0.005 Y NA
 2023232 2023233 BCI_0268 BCI_0269 cyoB cyoC TRUE 1.000 -13.000 0.697 0.029 Y NA
 2023233 2023234 BCI_0269 BCI_0270 cyoC cyoE FALSE 0.047 352.000 0.000 1.000 N NA
 2023234 2023235 BCI_0270 BCI_0271 cyoE   TRUE 0.942 29.000 0.061 0.077 N NA
 2023235 2023236 BCI_0271 BCI_0272   panE TRUE 0.680 29.000 0.000 1.000 N NA
 2023238 2023239 BCI_0274 BCI_0275 ispA dxs TRUE 0.958 39.000 0.060 1.000 Y NA
 2023239 2023240 BCI_0275 BCI_0276 dxs argS FALSE 0.263 70.000 0.000 1.000 N NA
 2023241 2023242 BCI_0277 BCI_0278 mviN acpS TRUE 0.746 -3.000 0.000 1.000   NA
 2023242 2023243 BCI_0278 BCI_0279 acpS pdxJ TRUE 0.998 0.000 0.326 1.000 N NA
 2023243 2023244 BCI_0279 BCI_0280 pdxJ era FALSE 0.025 134.000 0.000 1.000   NA
 2023244 2023245 BCI_0280 BCI_0281 era rnc TRUE 0.986 3.000 0.127 0.037   NA
 2023245 2023246 BCI_0281 BCI_0282 rnc lepB TRUE 0.953 40.000 0.117 1.000 N NA
 2023246 2023247 BCI_0282 BCI_0283 lepB lepA TRUE 0.993 9.000 0.187 1.000 N NA
 2023248 2023249 BCI_0285 BCI_0286 valS holC TRUE 0.983 10.000 0.089 1.000 N NA
 2023249 2023250 BCI_0286 BCI_0287 holC pepA TRUE 0.997 24.000 0.494 1.000 N NA
 2023252 2023253 BCI_0289 BCI_0290 hemK prfA TRUE 0.998 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 2023254 2023255 BCI_0291 BCI_0292 lolB ispE TRUE 0.928 -3.000 0.010 1.000 N NA
 2023255 2023256 BCI_0292 BCI_0293 ispE prsA TRUE 0.587 53.000 0.009 1.000 N NA
 2023256 2023257 BCI_0293 BCI_0294 prsA pth FALSE 0.148 110.000 0.011 1.000 N NA
 2023257 2023258 BCI_0294 BCI_0295 pth ychF TRUE 0.974 50.000 0.184 1.000 Y NA
 2023258 2023259 BCI_0295 BCI_0296 ychF fabI FALSE 0.184 78.000 0.000 0.037 N NA
 2023259 2023260 BCI_0296 BCI_0297 fabI rnb TRUE 0.325 153.000 0.085 1.000 N NA
 2023261 2023262 BCI_0298 BCI_0299 pyrF   TRUE 0.687 35.000 0.009 NA   NA
 2023264 2023265 BCI_0301 BCI_0302 cysB topA FALSE 0.071 249.000 0.008 1.000 N NA
 2023266 2023267 BCI_0303 BCI_0304     FALSE 0.021 195.000 0.000 NA   NA
 2023267 2023268 BCI_0304 BCI_0305   cls FALSE 0.023 162.000 0.000 NA   NA
 2023268 2023269 BCI_0305 BCI_0306 cls hns FALSE 0.024 455.000 0.000 1.000   NA
 2023270 2023271 BCI_0307 BCI_0308 htpX ftn FALSE 0.041 205.000 0.000 1.000 N NA
 2023271 2023272 BCI_0308 BCI_0309 ftn zwf FALSE 0.136 88.000 0.000 1.000 N NA
 2023273 2023274 BCI_0310 BCI_0311 pykA   FALSE 0.050 420.000 0.000 1.000 N NA
 2023275 2023276 BCI_0312 BCI_0313 ruvB ruvA TRUE 0.999 9.000 0.549 0.007 Y NA
 2023276 2023277 BCI_0313 BCI_0314 ruvA ruvC TRUE 0.995 42.000 0.451 0.012 Y NA
 2023277 2023278 BCI_0314 BCI_0315 ruvC aspS FALSE 0.132 494.000 0.015 0.022 N NA
 2023278 2023279 BCI_0315 BCI_0316 aspS   FALSE 0.040 225.000 0.000 1.000 N NA
 2023280 2023281 BCI_0318 BCI_0319 serS lolA FALSE 0.062 150.000 0.005 1.000 N NA
 2023281 2023282 BCI_0319 BCI_0320 lolA ftsK TRUE 0.807 102.000 0.305 1.000   NA
 2023283 2023284 BCI_0321 BCI_0322 trxB infA FALSE 0.227 115.000 0.028 1.000 N NA
 2023284 2023285 BCI_0322 BCI_0323 infA artP FALSE 0.042 176.000 0.000 1.000 N NA
 2023285 2023286 BCI_0323 BCI_0324 artP artI TRUE 0.997 21.000 0.323 1.000 Y NA
 2023286 2023287 BCI_0324 BCI_0325 artI artQ TRUE 0.998 -3.000 0.260 0.023 Y NA
 2023287 2023288 BCI_0325 BCI_0326 artQ artM TRUE 0.999 22.000 0.714 0.012 Y NA
 2023288 2023289 BCI_0326 BCI_0327 artM rpsJ FALSE 0.046 336.000 0.000 1.000 N NA
 2023289 2023290 BCI_0327 BCI_0328 rpsJ rplC TRUE 0.996 26.000 0.307 0.088 Y NA
 2023290 2023291 BCI_0328 BCI_0329 rplC rplD TRUE 0.999 12.000 0.486 0.065 Y NA
 2023291 2023292 BCI_0329 BCI_0330 rplD rplW TRUE 0.999 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 2023292 2023293 BCI_0330 BCI_0331 rplW rplB TRUE 0.999 20.000 0.849 1.000 Y NA
 2023293 2023294 BCI_0331 BCI_0332 rplB rpsS TRUE 0.999 22.000 0.820 0.088 Y NA
 2023294 2023295 BCI_0332 BCI_0333 rpsS rplV TRUE 0.999 31.000 0.769 0.088 Y NA
 2023295 2023296 BCI_0333 BCI_0334 rplV rpsC TRUE 0.999 17.000 0.719 0.088 Y NA
 2023296 2023297 BCI_0334 BCI_0335 rpsC rplP TRUE 1.000 12.000 0.828 0.088 Y NA
 2023297 2023298 BCI_0335 BCI_0336 rplP rpmC TRUE 1.000 -3.000 0.802 0.065 Y NA
 2023298 2023299 BCI_0336 BCI_0337 rpmC rpsQ TRUE 1.000 -7.000 0.828 0.065 Y NA
 2023299 2023300 BCI_0337 BCI_0338 rpsQ rplN TRUE 0.998 41.000 0.791 0.088 Y NA
 2023300 2023301 BCI_0338 BCI_0339 rplN rplX TRUE 1.000 12.000 0.810 0.088 Y NA
 2023301 2023302 BCI_0339 BCI_0340 rplX rplE TRUE 0.999 24.000 0.758 0.065 Y NA
 2023302 2023303 BCI_0340 BCI_0341 rplE rpsN TRUE 0.998 23.000 0.496 0.065 Y NA
 2023303 2023304 BCI_0341 BCI_0342 rpsN rpsH TRUE 0.997 33.000 0.473 0.065 Y NA
 2023304 2023305 BCI_0342 BCI_0343 rpsH rp1F TRUE 0.999 15.000 0.808 0.065 Y NA
 2023305 2023306 BCI_0343 BCI_0344 rp1F rplR TRUE 1.000 14.000 0.815 0.065 Y NA
 2023306 2023307 BCI_0344 BCI_0345 rplR rpsE TRUE 1.000 12.000 0.814 0.088 Y NA
 2023307 2023308 BCI_0345 BCI_0346 rpsE rpmD TRUE 1.000 4.000 0.789 0.088 Y NA
 2023308 2023309 BCI_0346 BCI_0347 rpmD rplO TRUE 0.999 1.000 0.653 0.012 Y NA
 2023309 2023310 BCI_0347 BCI_0348 rplO secY TRUE 0.999 16.000 0.730 1.000 N NA
 2023310 2023311 BCI_0348 BCI_0349 secY rpmJ TRUE 0.895 38.000 0.036 1.000 N NA
 2023311 2023312 BCI_0349 BCI_0350 rpmJ rpsM TRUE 0.977 26.000 0.086 0.065 Y NA
 2023312 2023313 BCI_0350 BCI_0351 rpsM rpsK TRUE 0.999 25.000 0.810 0.065 Y NA
 2023313 2023314 BCI_0351 BCI_0352 rpsK rpsD TRUE 0.995 47.000 0.509 0.088 Y NA
 2023314 2023315 BCI_0352 BCI_0353 rpsD rpoA TRUE 0.998 21.000 0.549 1.000 N NA
 2023315 2023316 BCI_0353 BCI_0354 rpoA rplQ TRUE 0.993 64.000 0.873 1.000 N NA
 1394742 1394743 BCI_0355 BCI_0356     TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 1394743 1394744 BCI_0356 BCI_0357     TRUE 0.672 17.000 0.000 NA   NA
 1394744 1394745 BCI_0357 BCI_0358     TRUE 0.655 19.000 0.000 NA   NA
 2023317 2023318 BCI_0359 BCI_0360 coaA prmB TRUE 0.327 62.000 0.000 1.000 N NA
 2023318 2023319 BCI_0360 BCI_0361 prmB aroC TRUE 0.976 15.000 0.081 1.000 N NA
 2023319 2023320 BCI_0361 BCI_0362 aroC fabB FALSE 0.042 251.000 0.000 1.000 N NA
 2023320 2023321 BCI_0362 BCI_0363 fabB pdxB TRUE 0.727 74.000 0.069 1.000 N NA
 2023321 2023322 BCI_0363 BCI_0364 pdxB truA TRUE 0.879 8.000 0.005 1.000 N NA
 2023322 2023323 BCI_0364 BCI_0365 truA accD TRUE 0.298 112.000 0.044 1.000 N NA
 2023323 2023324 BCI_0365 BCI_0366 accD folC TRUE 0.990 43.000 0.383 1.000 N NA
 2023324 2023325 BCI_0366 BCI_0367 folC cvpA FALSE 0.051 394.000 0.007 1.000   NA
 2023325 2023326 BCI_0367 BCI_0368 cvpA purF TRUE 0.983 40.000 0.262 1.000   NA
 2023327 2023328 BCI_0369 BCI_0370 nuoN nuoM TRUE 0.998 25.000 0.437 0.007 Y NA
 2023328 2023329 BCI_0370 BCI_0371 nuoM nuoL TRUE 0.997 50.000 0.713 0.007 Y NA
 2023329 2023330 BCI_0371 BCI_0372 nuoL nuoK TRUE 0.997 -3.000 0.211 0.021 Y NA
 2023330 2023331 BCI_0372 BCI_0373 nuoK nuoJ TRUE 0.987 48.000 0.269 0.010 Y NA
 2023331 2023332 BCI_0373 BCI_0374 nuoJ nuoI TRUE 0.998 24.000 0.428 0.021 Y NA
 2023332 2023333 BCI_0374 BCI_0375 nuoI nuoH TRUE 0.997 24.000 0.423 0.021 Y NA
 2023333 2023334 BCI_0375 BCI_0376 nuoH nuoG TRUE 0.999 9.000 0.664 0.021 Y NA
 2023334 2023335 BCI_0376 BCI_0377 nuoG nuoF TRUE 0.888 82.000 0.180 0.021 Y NA
 2023335 2023336 BCI_0377 BCI_0378 nuoF nuoE TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.017 Y NA
 2023336 2023337 BCI_0378 BCI_0379 nuoE nuoCD TRUE 0.999 3.000 0.407 0.017 Y NA
 2023337 2023338 BCI_0379 BCI_0380 nuoCD nuoB TRUE 0.961 109.000 0.691 0.010 Y NA
 2023338 2023339 BCI_0380 BCI_0381 nuoB nuoA TRUE 0.983 64.000 0.377 0.010 Y NA
 2023340 2023341 BCI_0382 BCI_0383 ackA pta TRUE 0.990 54.000 0.634 1.000   NA
 2023342 2023343 BCI_0384 BCI_0385   nrdB TRUE 0.976 2.000 0.046 1.000 N NA
 2023343 2023344 BCI_0385 BCI_0386 nrdB   TRUE 0.991 51.000 0.400 0.003 Y NA
 2023345 2023346 BCI_0387 BCI_0388 gyrA ddlA FALSE 0.046 329.000 0.000 1.000 N NA
 1394776 2023347 BCI_0389 BCI_0390   rplY FALSE 0.053 97.000 0.000 NA   NA
 2023347 2023348 BCI_0390 BCI_0391 rplY   FALSE 0.028 133.000 0.000 NA   NA
 2023348 2023349 BCI_0391 BCI_0392   nfo TRUE 0.617 32.000 0.006 NA   NA
 2023350 2023351 BCI_0393 BCI_0394 lysP folE FALSE 0.048 144.000 0.000 1.000 N NA
 2023354 2023355 BCI_0397 BCI_0398 gnd hisI FALSE 0.063 203.000 0.007 1.000 N NA
 2023355 2023356 BCI_0398 BCI_0399 hisI hisF TRUE 0.999 -6.000 0.430 0.013 Y NA
 2023356 2023357 BCI_0399 BCI_0400 hisF hisA TRUE 0.999 -18.000 0.433 0.013 Y NA
 2023357 2023358 BCI_0400 BCI_0401 hisA hisH TRUE 0.997 3.000 0.210 0.013 Y NA
 2023358 2023359 BCI_0401 BCI_0402 hisH hisB TRUE 0.994 -3.000 0.128 0.013 Y NA
 2023359 2023360 BCI_0402 BCI_0403 hisB hisC TRUE 0.998 6.000 0.341 0.013 Y NA
 2023360 2023361 BCI_0403 BCI_0404 hisC hisD TRUE 0.998 -3.000 0.294 0.013 Y NA
 2023361 2023362 BCI_0404 BCI_0405 hisD hisG TRUE 0.995 4.000 0.171 0.013 Y NA
 2023364 2023365 BCI_0407 BCI_0408 aspC asnS FALSE 0.221 81.000 0.005 1.000 N NA
 2023367 2023368 BCI_0410 BCI_0411 fabA   TRUE 0.982 47.000 0.290 1.000 N NA
 2023368 2023369 BCI_0411 BCI_0412     FALSE 0.022 267.000 0.000 NA   NA
 2023369 2023370 BCI_0412 BCI_0413   dsvC FALSE 0.041 106.000 0.000 NA   NA
 2023371 2023372 BCI_0415 BCI_0416 fmt def TRUE 0.926 50.000 0.058 0.097 Y NA
 2023373 2023374 BCI_0417 BCI_0418   aroE TRUE 0.685 84.000 0.087 NA N NA
 2023375 2023376 BCI_0419 BCI_0420   fumC TRUE 0.865 30.000 0.000 1.000 Y NA
 1394808 2023377 BCI_0421 BCI_0422   trmU FALSE 0.025 151.000 0.000 NA   NA
 2023377 2023378 BCI_0422 BCI_0423 trmU purB FALSE 0.066 327.000 0.006 1.000 N NA
 2023379 2023380 BCI_0424 BCI_0425 lolE lolD TRUE 0.999 -3.000 0.620 0.023 N NA
 2023380 2023381 BCI_0425 BCI_0426 lolD lolC TRUE 0.992 -7.000 0.175 0.023 N NA
 2023381 2023382 BCI_0426 BCI_0427 lolC   FALSE 0.160 108.000 0.016 NA   NA
 2023382 2023383 BCI_0427 BCI_0428     TRUE 0.856 15.000 0.010 NA   NA
 2023383 2023384 BCI_0428 BCI_0429     TRUE 0.948 -3.000 0.013 NA N NA
 2023384 2023385 BCI_0429 BCI_0430   holB TRUE 0.964 45.000 0.110 NA Y NA
 2023385 2023386 BCI_0430 BCI_0431 holB tmk TRUE 0.995 3.000 0.211 1.000 N NA
 2023386 2023387 BCI_0431 BCI_0432 tmk pabC TRUE 0.378 55.000 0.002 1.000 N NA
 2023387 2023388 BCI_0432 BCI_0433 pabC acpP FALSE 0.150 101.000 0.008 1.000 N NA
 2023388 2023389 BCI_0433 BCI_0434 acpP fabG TRUE 0.824 156.000 0.321 0.016 Y NA
 2023389 2023390 BCI_0434 BCI_0435 fabG fabD TRUE 0.999 -16.000 0.432 0.016 Y NA
 2023390 2023391 BCI_0435 BCI_0436 fabD fabH TRUE 0.992 20.000 0.182 0.016 Y NA
 2023393 2023394 BCI_0438 BCI_0439 rpmF rluC FALSE 0.149 143.000 0.004 1.000 Y NA
 2023395 2023396 BCI_0440 BCI_0441 rne pyrC FALSE 0.070 356.000 0.007 1.000 N NA
 2023396 2023397 BCI_0441 BCI_0442 pyrC sppA FALSE 0.059 116.000 0.000 1.000 N NA
 2023397 2023398 BCI_0442 BCI_0443 sppA gapA TRUE 0.573 46.000 0.004 1.000 N NA
 2023398 2023399 BCI_0443 BCI_0444 gapA minC FALSE 0.041 243.000 0.000 1.000 N NA
 2023399 2023400 BCI_0444 BCI_0445 minC minD TRUE 0.999 17.000 0.466 1.000 Y NA
 2023400 2023401 BCI_0445 BCI_0446 minD minE TRUE 0.999 4.000 0.618 NA Y NA
 2023402 2023403 BCI_0447 BCI_0448     FALSE 0.175 67.000 0.000 NA   NA
 2023403 2023404 BCI_0448 BCI_0449     FALSE 0.075 88.000 0.000 NA   NA
 2023404 2023405 BCI_0449 BCI_0450     TRUE 0.999 22.000 0.939 0.008 Y NA
 2023405 2023406 BCI_0450 BCI_0451     TRUE 0.969 37.000 0.106 0.008 Y NA
 1394842 2023410 BCI_0455 BCI_0456   gltX TRUE 0.625 21.000 0.000 NA   NA
 1394844 1394845 BCI_0457 BCI_0458     TRUE 0.439 39.000 0.000 NA   NA
 2023411 2023412 BCI_0459 BCI_0460   emrA TRUE 0.998 35.000 0.900 1.000   NA
 2023412 2023413 BCI_0460 BCI_0461 emrA sufE FALSE 0.023 297.000 0.000 NA   NA
 2023413 2023414 BCI_0461 BCI_0462 sufE sufS TRUE 0.987 16.000 0.183 NA   NA
 2023414 2023415 BCI_0462 BCI_0463 sufS sufD TRUE 0.994 -3.000 0.193 1.000 N NA
 2023415 2023416 BCI_0463 BCI_0464 sufD sufC TRUE 0.999 -19.000 0.482 1.000 Y NA
 2023416 2023417 BCI_0464 BCI_0465 sufC sufB TRUE 0.982 75.000 0.466 1.000 Y NA
 2023417 2023418 BCI_0465 BCI_0466 sufB sufA TRUE 0.952 15.000 0.041 NA   NA
 2023418 2023419 BCI_0466 BCI_0467 sufA pheT FALSE 0.025 147.000 0.000 NA   NA
 2023419 2023420 BCI_0467 BCI_0468 pheT pheS TRUE 0.999 17.000 0.574 0.003 Y NA
 2023420 2023421 BCI_0468 BCI_0469 pheS rplT TRUE 0.952 68.000 0.202 1.000 Y NA
 2023421 2023422 BCI_0469 BCI_0470 rplT rpmI TRUE 0.999 28.000 0.928 0.063 Y NA
 2023422 2023423 BCI_0470 BCI_0471 rpmI infC TRUE 0.997 46.000 0.652 1.000 Y NA
 2023423 2023424 BCI_0471 BCI_0472 infC thrS TRUE 0.988 32.000 0.186 1.000 Y NA
 2023424 2023425 BCI_0472 BCI_0473 thrS dnaQ FALSE 0.042 250.000 0.000 1.000 N NA
 2023426 2023427 BCI_0474 BCI_0475 rnhA gloB FALSE 0.189 85.000 0.009 1.000   NA
 2023428 2023429 BCI_0476 BCI_0477   mltC FALSE 0.099 82.000 0.000 NA   NA
 2023429 2023430 BCI_0477 BCI_0478 mltC   TRUE 0.569 106.000 0.128 NA N NA
 2023430 2023431 BCI_0478 BCI_0479     FALSE 0.167 85.000 0.000 NA N NA
 2023431 1394867 BCI_0479 BCI_0480     TRUE 0.767 -3.000 0.000 NA   NA
 1394867 2023432 BCI_0480 BCI_0481     TRUE 0.766 0.000 0.000 NA   NA
 2023432 2023433 BCI_0481 BCI_0482   gshB TRUE 0.933 48.000 0.120 NA N NA
 2023433 2023434 BCI_0482 BCI_0483 gshB sodA TRUE 0.360 59.000 0.000 1.000 N NA
 2023434 2023435 BCI_0483 BCI_0484 sodA   TRUE 0.454 33.000 0.000 1.000   NA
 2023436 1394873 BCI_0485 BCI_0486 bioH   FALSE 0.036 110.000 0.000 NA   NA
 1394873 1394874 BCI_0486 BCI_0487     TRUE 0.533 28.000 0.000 NA   NA
 1394874 2023437 BCI_0487 BCI_0488     TRUE 0.314 50.000 0.000 NA   NA
 2023437 2023438 BCI_0488 BCI_0489   dsrE FALSE 0.169 116.000 0.000 NA Y NA
 2023438 2023439 BCI_0489 BCI_0490 dsrE dsrF TRUE 1.000 12.000 0.790 NA Y NA
 2023439 2023440 BCI_0490 BCI_0491 dsrF dsrH TRUE 1.000 10.000 0.804 NA Y NA
 2023440 2023441 BCI_0491 BCI_0492 dsrH rpsL TRUE 0.830 58.000 0.058 NA N NA
 2023441 2023442 BCI_0492 BCI_0493 rpsL rpsG TRUE 0.993 59.000 0.620 0.013 Y NA
 2023442 2023443 BCI_0493 BCI_0494 rpsG fusA TRUE 0.958 105.000 0.579 1.000 Y NA
 2023443 2023444 BCI_0494 BCI_0495 fusA tuf FALSE 0.225 116.000 0.011 0.003 Y NA
 2023444 2023445 BCI_0495 BCI_0496 tuf secE TRUE 0.371 66.000 0.006 1.000 N NA
 2023445 2023446 BCI_0496 BCI_0497 secE nusG TRUE 0.999 1.000 0.843 1.000 N NA
 2023446 2023447 BCI_0497 BCI_0498 nusG rplK TRUE 0.992 56.000 0.681 1.000 N NA
 2023447 2023448 BCI_0498 BCI_0499 rplK rplA TRUE 1.000 4.000 0.838 0.084 Y NA
 2023448 2023449 BCI_0499 BCI_0500 rplA rplJ TRUE 0.798 180.000 0.302 0.084 Y NA
 2023449 2023450 BCI_0500 BCI_0501 rplJ rplL TRUE 0.999 36.000 0.884 0.062 Y NA
 2023450 2023451 BCI_0501 BCI_0502 rplL rpoB TRUE 0.575 174.000 0.223 1.000   NA
 2023451 2023452 BCI_0502 BCI_0503 rpoB rpoC TRUE 0.971 89.000 0.851 0.003   NA
 2023452 2023453 BCI_0503 BCI_0504 rpoC murB TRUE 0.793 18.000 0.000 1.000 N NA
 2023453 2023454 BCI_0504 BCI_0505 murB birA TRUE 0.995 2.000 0.211 1.000 N NA
 1394893 1394894 BCI_0157 BCI_0156 rrfA rrlA TRUE 0.483 33.000 0.000 NA   NA
 1394894 1394895 BCI_0156 BCI_0155 rrlA   FALSE 0.088 85.000 0.000 NA   NA
 1394895 1394896 BCI_0155 BCI_0154   rrsA FALSE 0.033 114.000 0.000 NA   NA
 1394896 2023455 BCI_0154 BCI_0510 rrsA lpdA FALSE 0.026 409.000 0.000 NA   NA
 2023455 2023456 BCI_0510 BCI_0511 lpdA aceF TRUE 0.990 59.000 0.463 1.000 Y NA
 2023456 2023457 BCI_0511 BCI_0512 aceF aceE TRUE 0.717 224.000 0.220 0.035 Y NA
 2023458 2023459 BCI_0513 BCI_0514 nadC coaE TRUE 0.718 51.000 0.003 1.000 Y NA
 2023461 2023462 BCI_0517 BCI_0518 ftsZ murC FALSE 0.039 312.000 0.000 0.088 N NA
 2023462 2023463 BCI_0518 BCI_0519 murC murG TRUE 0.966 72.000 0.283 1.000 Y NA
 2023463 2023464 BCI_0519 BCI_0520 murG murD FALSE 0.123 318.000 0.002 1.000 Y NA
 2023464 2023465 BCI_0520 BCI_0521 murD mraY TRUE 0.999 2.000 0.647 0.013 Y NA
 2023465 2023466 BCI_0521 BCI_0522 mraY murF TRUE 0.998 -6.000 0.309 0.013 Y NA
 2023466 2023467 BCI_0522 BCI_0523 murF murE TRUE 0.999 3.000 0.569 0.008 Y NA
 2023467 2023468 BCI_0523 BCI_0524 murE mraW FALSE 0.118 187.000 0.000 1.000 Y NA
 2023468 2023469 BCI_0524 BCI_0525 mraW   FALSE 0.043 101.000 0.000 1.000   NA
 2023469 2023470 BCI_0525 BCI_0526   map FALSE 0.019 185.000 0.000 1.000   NA
 2023471 2023472 BCI_0527 BCI_0528 rpsB tsf TRUE 0.998 43.000 0.748 1.000 Y NA
 2023472 2023473 BCI_0528 BCI_0529 tsf pyrH TRUE 0.979 60.000 0.416 1.000 N NA
 2023473 2023474 BCI_0529 BCI_0530 pyrH frr TRUE 0.994 49.000 0.626 1.000 N NA
 2023474 2023475 BCI_0530 BCI_0531 frr dxr FALSE 0.188 154.000 0.032 1.000 N NA
 2023475 2023476 BCI_0531 BCI_0532 dxr uppS TRUE 0.332 130.000 0.025 1.000 Y NA
 2023476 2023477 BCI_0532 BCI_0533 uppS cdsA TRUE 0.999 10.000 0.400 1.000 Y NA
 2023477 2023478 BCI_0533 BCI_0534 cdsA   TRUE 0.970 20.000 0.080 1.000 N NA
 2023478 2023479 BCI_0534 BCI_0535     TRUE 0.997 5.000 0.204 1.000 Y NA
 2023479 2023480 BCI_0535 BCI_0536   ompH TRUE 0.971 79.000 0.354 1.000 Y NA
 2023480 2023481 BCI_0536 BCI_0537 ompH fabZ FALSE 0.163 256.000 0.027 1.000 N NA
 2023481 2023482 BCI_0537 BCI_0538 fabZ dnaE FALSE 0.039 225.000 0.003 0.088 N NA
 2023482 2023483 BCI_0538 BCI_0539 dnaE accA TRUE 0.983 17.000 0.122 1.000 N NA
 2023485 2023486 BCI_0541 BCI_0542 mutH nudH TRUE 0.264 158.000 0.017 1.000 Y NA
 2023486 2023487 BCI_0542 BCI_0543 nudH lgt FALSE 0.043 208.000 0.003 1.000 N NA
 2023487 2023488 BCI_0543 BCI_0544 lgt thyA TRUE 0.975 31.000 0.164 1.000 N NA
 2023488 2023489 BCI_0544 BCI_0545 thyA recC FALSE 0.240 72.000 0.000 1.000 N NA
 2023489 2023490 BCI_0545 BCI_0546 recC recB TRUE 0.996 44.000 0.542 0.005 Y NA
 2023490 2023491 BCI_0546 BCI_0547 recB recD TRUE 0.997 48.000 0.688 0.005 Y NA
 2023491 2023492 BCI_0547 BCI_0548 recD crp FALSE 0.041 199.000 0.000 1.000 N NA
 2023494 1394938 BCI_0550 BCI_0551 dnaB   FALSE 0.114 79.000 0.000 NA   NA
 1394938 2023495 BCI_0551 BCI_0552   dnaK FALSE 0.022 266.000 0.000 NA   NA
 2023495 2023496 BCI_0552 BCI_0553 dnaK dnaJ TRUE 0.868 99.000 0.236 0.006 Y NA
 2023498 2023499 BCI_0555 BCI_0556 ribF ileS TRUE 0.995 12.000 0.254 1.000 N NA
 2023499 2023500 BCI_0556 BCI_0557 ileS lspA TRUE 0.976 0.000 0.045 1.000 N NA
 2023500 2023501 BCI_0557 BCI_0558 lspA ispH TRUE 0.954 29.000 0.033 1.000 Y NA
 2023501 2023502 BCI_0558 BCI_0559 ispH carA FALSE 0.044 150.000 0.002 1.000 N NA
 2023502 2023503 BCI_0559 BCI_0560 carA carB TRUE 0.998 19.000 0.345 0.003 Y NA
 2023503 2023504 BCI_0560 BCI_0561 carB folA TRUE 0.735 43.000 0.010 1.000 N NA
 2023505 2023506 BCI_0562 BCI_0563   ksgA FALSE 0.151 230.000 0.025 1.000 N NA
 2023506 2023507 BCI_0563 BCI_0564 ksgA pdxA TRUE 0.994 -7.000 0.197 1.000 N NA
 2023507 2023508 BCI_0564 BCI_0565 pdxA surA TRUE 0.999 -13.000 0.561 1.000   NA
 2023511 1394956 BCI_0568 BCI_0569 smpB   FALSE 0.114 79.000 0.000 NA   NA
 2023512 2023513 BCI_0570 BCI_0571 cysQ rplI TRUE 0.771 21.000 0.003 1.000 N NA
 2023513 2023514 BCI_0571 BCI_0572 rplI rpsR TRUE 0.972 86.000 0.499 0.061 Y NA
 2023514 2023515 BCI_0572 BCI_0573 rpsR priN TRUE 0.989 4.000 0.128 1.000 N NA
 2023515 2023516 BCI_0573 BCI_0574 priN rpsF TRUE 0.989 4.000 0.122 1.000 N NA
 2023516 2023517 BCI_0574 BCI_0575 rpsF   TRUE 0.271 154.000 0.017 1.000 Y NA
 2023517 2023518 BCI_0575 BCI_0576   rnr TRUE 0.708 89.000 0.147 0.047 N NA
 2023518 2023519 BCI_0576 BCI_0577 rnr purA FALSE 0.160 103.000 0.010 1.000 N NA
 2023519 2023520 BCI_0577 BCI_0578 purA hflC FALSE 0.249 104.000 0.019 1.000 N NA
 2023520 2023521 BCI_0578 BCI_0579 hflC hflK TRUE 1.000 7.000 0.947 0.022 Y NA
 2023521 2023522 BCI_0579 BCI_0580 hflK hflX TRUE 0.957 43.000 0.184 0.072   NA
 2023522 2023523 BCI_0580 BCI_0581 hflX hfq TRUE 0.531 108.000 0.141 1.000   NA
 2023525 2023526 BCI_0583 BCI_0584 miaA mutL TRUE 0.993 10.000 0.188 1.000 N NA
 2023526 2023527 BCI_0584 BCI_0585 mutL   TRUE 0.757 77.000 0.092 1.000 N NA
 2023527 2023528 BCI_0585 BCI_0586   orn FALSE 0.050 438.000 0.000 1.000 N NA
 2023530 2023531 BCI_0588 BCI_0589   efp TRUE 0.728 88.000 0.082 0.087 Y NA
 2023533 2023534 BCI_0591 BCI_0592 groEL groES TRUE 0.997 42.000 0.631 0.012 Y NA
 2023535 1394981 BCI_0593 BCI_0594 aspA   FALSE 0.123 78.000 0.000 NA   NA
 2023537 2023538 BCI_0596 BCI_0597 queA tgt TRUE 0.983 62.000 0.360 0.003 Y NA
 2023538 2023539 BCI_0597 BCI_0598 tgt   TRUE 0.995 22.000 0.325 NA N NA
 2023539 2023540 BCI_0598 BCI_0599   secD TRUE 0.956 34.000 0.045 NA Y NA
 2023540 2023541 BCI_0599 BCI_0600 secD secF TRUE 0.996 11.000 0.206 0.003 Y NA
 2023541 2023542 BCI_0600 BCI_0601 secF ribD FALSE 0.044 276.000 0.000 1.000 N NA
 2023542 2023543 BCI_0601 BCI_0602 ribD ribH TRUE 0.770 70.000 0.034 0.008 Y NA
 2023543 2023544 BCI_0602 BCI_0603 ribH nusB TRUE 0.994 27.000 0.347 1.000 N NA
 2023544 2023545 BCI_0603 BCI_0604 nusB thiL TRUE 0.891 82.000 0.225 1.000 N NA
 2023545 2023546 BCI_0604 BCI_0605 thiL pgpA TRUE 0.994 8.000 0.206 1.000 N NA
 2023546 2023547 BCI_0605 BCI_0606 pgpA   TRUE 0.399 55.000 0.000 1.000 N NA
 2023547 2023548 BCI_0606 BCI_0607     TRUE 0.999 -3.000 0.575 NA   NA
 2023549 2023550 BCI_0608 BCI_0609 ppa proS FALSE 0.039 160.000 0.000 0.087 N NA
 2023550 1394997 BCI_0609 BCI_0610 proS   FALSE 0.069 89.000 0.000 NA   NA
 1394997 2023551 BCI_0610 BCI_0611   nadK FALSE 0.029 129.000 0.000 NA   NA
 2023553 2023554 BCI_0613 BCI_0614 ung nadB TRUE 0.417 54.000 0.000 1.000 N NA
 2023554 1395002 BCI_0614 BCI_0615 nadB   FALSE 0.023 168.000 0.000 NA   NA
 1395002 2023555 BCI_0615 BCI_0616   rpoD FALSE 0.175 67.000 0.000 NA   NA
 2023555 2023556 BCI_0616 BCI_0617 rpoD dnaG TRUE 0.920 82.000 0.299 1.000 N NA
 2023556 2023557 BCI_0617 BCI_0618 dnaG rpsU TRUE 0.516 94.000 0.067 1.000 N NA
 2023558 2023559 BCI_0619 BCI_0620 gcp folB TRUE 0.790 42.000 0.014 1.000 N NA
 2023559 2023560 BCI_0620 BCI_0621 folB   TRUE 0.460 139.000 0.128 1.000 N NA
 2023563 2023564 BCI_0624 BCI_0625 plsC holD FALSE 0.041 246.000 0.000 1.000 N NA
 2023564 2023565 BCI_0625 BCI_0626 holD deaD TRUE 0.955 -7.000 0.004 1.000 Y NA
 2023565 2023566 BCI_0626 BCI_0627 deaD pnp FALSE 0.140 414.000 0.000 1.000 Y NA
 2023566 2023567 BCI_0627 BCI_0628 pnp rpsO TRUE 0.893 111.000 0.335 1.000 Y NA
 2023567 2023568 BCI_0628 BCI_0629 rpsO truB TRUE 0.922 85.000 0.211 1.000 Y NA
 2023568 2023569 BCI_0629 BCI_0630 truB rbfA TRUE 0.998 3.000 0.318 1.000 Y NA
 2023569 2023570 BCI_0630 BCI_0631 rbfA infB TRUE 0.988 69.000 0.530 1.000 Y NA
 2023570 2023571 BCI_0631 BCI_0632 infB nusA TRUE 0.994 27.000 0.342 1.000 N NA
 2023571 1395020 BCI_0632 BCI_0633 nusA   FALSE 0.021 206.000 0.000 NA   NA
 1395020 1395021 BCI_0633 BCI_0634     FALSE 0.208 61.000 0.000 NA   NA
 1395021 2023572 BCI_0634 BCI_0635   secG FALSE 0.175 67.000 0.000 NA   NA
 2023572 2023573 BCI_0635 BCI_0636 secG glmM FALSE 0.223 102.000 0.016 1.000 N NA
 2023573 2023574 BCI_0636 BCI_0637 glmM folP TRUE 0.997 -3.000 0.260 1.000 N NA
 2023574 2023575 BCI_0637 BCI_0638 folP ftsH TRUE 0.828 109.000 0.325 1.000 N NA
 2023575 2023576 BCI_0638 BCI_0639 ftsH rrmJ TRUE 0.914 59.000 0.152 NA N NA
 2023576 2023577 BCI_0639 BCI_0640 rrmJ greA FALSE 0.084 277.000 0.009 NA N NA
 2023579 2023580 BCI_0642 BCI_0643   rpmA TRUE 0.977 52.000 0.335 1.000   NA
 2023580 2023581 BCI_0643 BCI_0644 rpmA rplU TRUE 0.999 15.000 0.667 0.060 Y NA
 2023582 2023583 BCI_0645 BCI_0646 pgk fbaA TRUE 0.768 79.000 0.056 0.012 Y NA
 2023583 2023584 BCI_0646 BCI_0647 fbaA rpiA FALSE 0.140 142.000 0.000 1.000 Y NA
 2023585 2023586 BCI_0648 BCI_0649   thiD FALSE 0.128 159.000 0.000 1.000 Y NA
 2023586 2023587 BCI_0649 BCI_0650 thiD guaA FALSE 0.044 170.000 0.000 1.000 N NA
 2023587 2023588 BCI_0650 BCI_0651 guaA guaB TRUE 0.974 50.000 0.190 0.003 Y NA