MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus pyogenes MGAS2096

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

<
 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2012727 2012728 MGAS2096_Spy0001 MGAS2096_Spy0002 dnaA dnaN TRUE 0.685 155.000 0.328 1.000 Y NA
 2012728 2012729 MGAS2096_Spy0002 MGAS2096_Spy0003 dnaN   FALSE 0.354 75.000 0.009 NA   NA
 2012729 2012730 MGAS2096_Spy0003 MGAS2096_Spy0004     FALSE 0.094 330.000 0.064 NA   NA
 2012730 2012731 MGAS2096_Spy0004 MGAS2096_Spy0005   pth TRUE 0.969 25.000 0.184 1.000 Y NA
 2012731 2012732 MGAS2096_Spy0005 MGAS2096_Spy0006 pth trcF TRUE 0.927 3.000 0.137 1.000 N NA
 2012732 2012733 MGAS2096_Spy0006 MGAS2096_Spy0007 trcF   FALSE 0.216 162.000 0.024 1.000 N NA
 2012733 2012734 MGAS2096_Spy0007 MGAS2096_Spy0008   divIC TRUE 0.924 -13.000 0.053 1.000 N NA
 2012734 2012735 MGAS2096_Spy0008 MGAS2096_Spy0009 divIC   TRUE 0.893 -3.000 0.011 NA   NA
 2012735 2012736 MGAS2096_Spy0009 MGAS2096_Spy0010     TRUE 0.914 13.000 0.132 NA   NA
 2012736 2012737 MGAS2096_Spy0010 MGAS2096_Spy0011   tilS TRUE 0.906 -3.000 0.014 1.000 N NA
 2012737 2012738 MGAS2096_Spy0011 MGAS2096_Spy0012 tilS   TRUE 0.978 5.000 0.067 0.063 N NA
 2012738 2012739 MGAS2096_Spy0012 MGAS2096_Spy0013     TRUE 0.876 22.000 0.021 1.000   NA
 2012739 2012740 MGAS2096_Spy0013 MGAS2096_Spy0014   ftsH TRUE 0.984 -22.000 0.000 0.007   NA
 2012740 2012741 MGAS2096_Spy0014 MGAS2096_Spy0015 ftsH   FALSE 0.342 258.000 0.009 0.095 N NA
 1624889 1624890 MGAS2096_SPYR02218 MGAS2096_SPYR02219     FALSE 0.106 125.000 0.000 NA   NA
 1624890 1624891 MGAS2096_SPYR02219 MGAS2096_SPYR02220     FALSE 0.144 85.000 0.000 NA   NA
 1624891 1624892 MGAS2096_SPYR02220 MGAS2096_SPYR02221     TRUE 0.705 18.000 0.000 NA   NA
 1624892 1624893 MGAS2096_SPYR02221 MGAS2096_SPYR02222     TRUE 0.705 18.000 0.000 NA   NA
 1624893 1624894 MGAS2096_SPYR02222 MGAS2096_SPYR02223     TRUE 0.563 32.000 0.000 NA   NA
 1624894 1624895 MGAS2096_SPYR02223 MGAS2096_SPYR02224     TRUE 0.689 6.000 0.000 NA   NA
 1624895 1624896 MGAS2096_SPYR02224 MGAS2096_SPYR02225     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 1624896 1624897 MGAS2096_SPYR02225 MGAS2096_SPYR02226     TRUE 0.691 13.000 0.000 NA   NA
 1624897 1624898 MGAS2096_SPYR02226 MGAS2096_SPYR02227     TRUE 0.691 9.000 0.000 NA   NA
 1624898 1624899 MGAS2096_SPYR02227 MGAS2096_SPYR02228     TRUE 0.705 17.000 0.000 NA   NA
 1624899 1624900 MGAS2096_SPYR02228 MGAS2096_SPYR02229     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 1624900 1624901 MGAS2096_SPYR02229 MGAS2096_SPYR02230     FALSE 0.093 144.000 0.000 NA   NA
 1624901 1624902 MGAS2096_SPYR02230 MGAS2096_SPYR02231     FALSE 0.106 125.000 0.000 NA   NA
 1624902 1624903 MGAS2096_SPYR02231 MGAS2096_SPYR02232     FALSE 0.144 85.000 0.000 NA   NA
 1624903 1624904 MGAS2096_SPYR02232 MGAS2096_SPYR02233     TRUE 0.705 18.000 0.000 NA   NA
 1624904 1624905 MGAS2096_SPYR02233 MGAS2096_SPYR02234     TRUE 0.705 18.000 0.000 NA   NA
 1624905 1624906 MGAS2096_SPYR02234 MGAS2096_SPYR02235     TRUE 0.563 32.000 0.000 NA   NA
 1624906 1624907 MGAS2096_SPYR02235 MGAS2096_SPYR02236     TRUE 0.689 6.000 0.000 NA   NA
 1624907 1624908 MGAS2096_SPYR02236 MGAS2096_SPYR02237     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 1624908 1624909 MGAS2096_SPYR02237 MGAS2096_SPYR02238     TRUE 0.691 13.000 0.000 NA   NA
 1624909 1624910 MGAS2096_SPYR02238 MGAS2096_SPYR02239     TRUE 0.691 9.000 0.000 NA   NA
 1624910 1624911 MGAS2096_SPYR02239 MGAS2096_SPYR02240     TRUE 0.705 17.000 0.000 NA   NA
 1624911 1624912 MGAS2096_SPYR02240 MGAS2096_SPYR02241     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 1624912 1624913 MGAS2096_SPYR02241 MGAS2096_SPYR02242     TRUE 0.689 6.000 0.000 NA   NA
 1624913 1624914 MGAS2096_SPYR02242 MGAS2096_SPYR02243     TRUE 0.683 21.000 0.000 NA   NA
 1624914 1624916 MGAS2096_SPYR02243 MGAS2096_SPYR02244     TRUE 0.618 26.000 0.000 NA   NA
 1624916 1624917 MGAS2096_SPYR02244 MGAS2096_SPYR02245     TRUE 0.695 14.000 0.000 NA   NA
 1624917 1624918 MGAS2096_SPYR02245 MGAS2096_SPYR02246     TRUE 0.683 21.000 0.000 NA   NA
 1624918 1624919 MGAS2096_SPYR02246 MGAS2096_SPYR02247     TRUE 0.691 13.000 0.000 NA   NA
 1624919 1624920 MGAS2096_SPYR02247 MGAS2096_SPYR02248     TRUE 0.538 35.000 0.000 NA   NA
 1624920 1624921 MGAS2096_SPYR02248 MGAS2096_SPYR02249     TRUE 0.694 10.000 0.000 NA   NA
 2012744 2012745 MGAS2096_Spy0018 MGAS2096_Spy0019 sibA prsA2 FALSE 0.158 241.000 0.107 NA   NA
 2012745 2012746 MGAS2096_Spy0019 MGAS2096_Spy0020 prsA2 recO FALSE 0.069 186.000 0.000 1.000 N NA
 2012746 2012747 MGAS2096_Spy0020 MGAS2096_Spy0021 recO plsX TRUE 0.828 25.000 0.011 1.000 N NA
 2012747 2012748 MGAS2096_Spy0021 MGAS2096_Spy0022 plsX acpP2 TRUE 0.996 -7.000 0.017 0.008 Y NA
 2012748 2012749 MGAS2096_Spy0022 MGAS2096_Spy0023 acpP2   FALSE 0.271 121.000 0.017 1.000 N NA
 2012749 2012750 MGAS2096_Spy0023 MGAS2096_Spy0024     TRUE 0.717 76.000 0.043 1.000 Y NA
 2012750 2012751 MGAS2096_Spy0024 MGAS2096_Spy0025   purF TRUE 0.598 104.000 0.024 1.000 Y NA
 2012751 2012752 MGAS2096_Spy0025 MGAS2096_Spy0026 purF purM TRUE 0.969 28.000 0.248 1.000 Y NA
 2012752 2012753 MGAS2096_Spy0026 MGAS2096_Spy0027 purM purN TRUE 0.938 168.000 0.238 0.003 Y NA
 2012753 2012754 MGAS2096_Spy0027 MGAS2096_Spy0028 purN   TRUE 0.578 184.000 0.225 1.000 Y NA
 2012756 2012757 MGAS2096_Spy0030 MGAS2096_Spy0031 purD purE FALSE 0.285 278.000 0.044 1.000 Y NA
 2012757 2012758 MGAS2096_Spy0031 MGAS2096_Spy0032 purE purK TRUE 0.996 -49.000 0.002 0.001 Y NA
 2012758 2012759 MGAS2096_Spy0032 MGAS2096_Spy0033 purK   TRUE 0.683 21.000 0.000 NA   NA
 2012761 2012762 MGAS2096_Spy0035 MGAS2096_Spy0036 purB   FALSE 0.227 133.000 0.005 1.000   NA
 2012762 2012763 MGAS2096_Spy0036 MGAS2096_Spy0037   ruvB FALSE 0.183 154.000 0.002 1.000   NA
 2012763 2012764 MGAS2096_Spy0037 MGAS2096_Spy0038 ruvB   FALSE 0.209 138.000 0.005 1.000 N NA
 2012764 2012765 MGAS2096_Spy0038 MGAS2096_Spy0039     TRUE 0.844 24.000 0.019 NA   NA
 2012765 2012766 MGAS2096_Spy0039 MGAS2096_Spy0040     TRUE 0.966 -3.000 0.351 NA   NA
 2012766 2012767 MGAS2096_Spy0040 MGAS2096_Spy0041     FALSE 0.032 310.000 0.000 1.000 N NA
 2012767 2012768 MGAS2096_Spy0041 MGAS2096_Spy0042   adhA TRUE 0.701 195.000 0.012 0.004   NA
 2012768 2012769 MGAS2096_Spy0042 MGAS2096_Spy0043 adhA   TRUE 0.754 169.000 0.012 0.004   NA
 2012769 2012770 MGAS2096_Spy0043 MGAS2096_Spy0044     TRUE 0.988 -70.000 0.012 0.004   NA
 2012770 2012771 MGAS2096_Spy0044 MGAS2096_Spy0045     FALSE 0.028 388.000 0.000 1.000   NA
 2012771 2012772 MGAS2096_Spy0045 MGAS2096_Spy0046   rpsJ FALSE 0.062 199.000 0.000 1.000 N NA
 2012772 2012773 MGAS2096_Spy0046 MGAS2096_Spy0047 rpsJ rplC TRUE 0.829 248.000 0.467 0.043 Y NA
 2012773 2012774 MGAS2096_Spy0047 MGAS2096_Spy0048 rplC   TRUE 0.992 24.000 0.544 0.032   NA
 2012774 2012775 MGAS2096_Spy0048 MGAS2096_Spy0049   rplD TRUE 0.977 -3.000 0.000 0.032   NA
 2012775 2012776 MGAS2096_Spy0049 MGAS2096_Spy0050 rplD rplW TRUE 0.993 0.000 0.307 0.032   NA
 2012776 2012777 MGAS2096_Spy0050 MGAS2096_Spy0051 rplW rplB TRUE 0.998 18.000 0.849 0.037 Y NA
 2012777 2012778 MGAS2096_Spy0051 MGAS2096_Spy0052 rplB rpsS TRUE 0.952 140.000 0.820 0.043 Y NA
 2012778 2012779 MGAS2096_Spy0052 MGAS2096_Spy0053 rpsS rplV TRUE 0.998 16.000 0.769 0.043 Y NA
 2012779 2012780 MGAS2096_Spy0053 MGAS2096_Spy0054 rplV rpsC TRUE 0.997 13.000 0.719 0.043 Y NA
 2012780 2012781 MGAS2096_Spy0054 MGAS2096_Spy0055 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.043 Y NA
 2012781 2012782 MGAS2096_Spy0055 MGAS2096_Spy0056 rplP rpmC TRUE 0.998 10.000 0.802 0.032 Y NA
 2012782 2012783 MGAS2096_Spy0056 MGAS2096_Spy0057 rpmC rpsQ TRUE 0.997 26.000 0.828 0.032 Y NA
 2012783 2012784 MGAS2096_Spy0057 MGAS2096_Spy0058 rpsQ rplN TRUE 0.997 25.000 0.791 0.043 Y NA
 2012784 2012785 MGAS2096_Spy0058 MGAS2096_Spy0059 rplN rplX TRUE 0.970 82.000 0.810 0.043 Y NA
 2012785 2012786 MGAS2096_Spy0059 MGAS2096_Spy0060 rplX rplE TRUE 0.997 24.000 0.758 0.032 Y NA
 2012786 2012787 MGAS2096_Spy0060 MGAS2096_Spy0061 rplE rpsH TRUE 0.621 351.000 0.059 0.032 Y NA
 2012787 2012788 MGAS2096_Spy0061 MGAS2096_Spy0062 rpsH rplF TRUE 0.922 203.000 0.808 0.032 Y NA
 2012788 2012789 MGAS2096_Spy0062 MGAS2096_Spy0063 rplF rplR TRUE 0.969 96.000 0.815 0.032 Y NA
 2012789 2012790 MGAS2096_Spy0063 MGAS2096_Spy0064 rplR rpsE TRUE 0.998 19.000 0.814 0.043 Y NA
 2012790 2012791 MGAS2096_Spy0064 MGAS2096_Spy0065 rpsE rpmD TRUE 0.998 15.000 0.789 0.043 Y NA
 2012791 2012792 MGAS2096_Spy0065 MGAS2096_Spy0066 rpmD rplO TRUE 0.939 215.000 0.653 0.005 Y NA
 2012792 2012793 MGAS2096_Spy0066 MGAS2096_Spy0067 rplO secY TRUE 0.975 17.000 0.730 1.000 N NA
 2012793 2012794 MGAS2096_Spy0067 MGAS2096_Spy0068 secY adk FALSE 0.426 150.000 0.241 1.000 N NA
 2012794 2012795 MGAS2096_Spy0068 MGAS2096_Spy0069 adk infA FALSE 0.460 64.000 0.007 1.000 N NA
 2012795 2012796 MGAS2096_Spy0069 MGAS2096_Spy0070 infA rpmJ TRUE 0.945 26.000 0.020 1.000 Y NA
 2012796 2012797 MGAS2096_Spy0070 MGAS2096_Spy0071 rpmJ rpsM TRUE 0.994 18.000 0.086 0.032 Y NA
 2012797 2012798 MGAS2096_Spy0071 MGAS2096_Spy0072 rpsM rpsK TRUE 0.998 18.000 0.810 0.032 Y NA
 2012798 2012799 MGAS2096_Spy0072 MGAS2096_Spy0073 rpsK rpoA TRUE 0.850 46.000 0.308 1.000 N NA
 2012799 2012800 MGAS2096_Spy0073 MGAS2096_Spy0074 rpoA rplQ TRUE 0.978 15.000 0.873 1.000 N NA
 1624981 1624982 MGAS2096_SPYR02250 MGAS2096_SPYR02251     FALSE 0.106 125.000 0.000 NA   NA
 1624982 1624983 MGAS2096_SPYR02251 MGAS2096_SPYR02252     FALSE 0.144 85.000 0.000 NA   NA
 1624983 1624984 MGAS2096_SPYR02252 MGAS2096_SPYR02253     TRUE 0.705 18.000 0.000 NA   NA
 1624984 1624985 MGAS2096_SPYR02253 MGAS2096_SPYR02254     TRUE 0.689 6.000 0.000 NA   NA
 1624985 1624986 MGAS2096_SPYR02254 MGAS2096_SPYR02255     TRUE 0.538 35.000 0.000 NA   NA
 1624986 1624987 MGAS2096_SPYR02255 MGAS2096_SPYR02256     TRUE 0.660 23.000 0.000 NA   NA
 1624987 1624989 MGAS2096_SPYR02256 MGAS2096_SPYR02257     TRUE 0.695 14.000 0.000 NA   NA
 1624989 1624990 MGAS2096_SPYR02257 MGAS2096_SPYR02258     TRUE 0.695 14.000 0.000 NA   NA
 1624990 1624991 MGAS2096_SPYR02258 MGAS2096_SPYR02259     TRUE 0.683 21.000 0.000 NA   NA
 1624991 1624992 MGAS2096_SPYR02259 MGAS2096_SPYR02260     TRUE 0.695 20.000 0.000 NA   NA
 1624992 1624993 MGAS2096_SPYR02260 MGAS2096_SPYR02261     TRUE 0.688 7.000 0.000 NA   NA
 1624993 1624994 MGAS2096_SPYR02261 MGAS2096_SPYR02262     TRUE 0.693 12.000 0.000 NA   NA
 1624994 1624995 MGAS2096_SPYR02262 MGAS2096_SPYR02263     TRUE 0.691 9.000 0.000 NA   NA
 1624995 1624996 MGAS2096_SPYR02263 MGAS2096_SPYR02264     TRUE 0.695 20.000 0.000 NA   NA
 1624996 2012802 MGAS2096_SPYR02264 MGAS2096_Spy0076     FALSE 0.037 260.000 0.000 NA   NA
 2012802 2012803 MGAS2096_Spy0076 MGAS2096_Spy0077     FALSE 0.018 504.000 0.000 NA   NA
 2012803 2012804 MGAS2096_Spy0077 MGAS2096_Spy0078     TRUE 0.975 31.000 0.000 0.002   NA
 2012804 2012805 MGAS2096_Spy0078 MGAS2096_Spy0079     TRUE 0.980 40.000 0.009 0.001   NA
 2012805 2012806 MGAS2096_Spy0079 MGAS2096_Spy0080   adcR FALSE 0.267 110.000 0.008 1.000   NA
 2012806 2012807 MGAS2096_Spy0080 MGAS2096_Spy0081 adcR adcC TRUE 0.936 4.000 0.192 1.000 N NA
 2012807 2012808 MGAS2096_Spy0081 MGAS2096_Spy0082 adcC adcB TRUE 0.990 -46.000 0.673 1.000 Y NA
 2012809 2012810 MGAS2096_Spy0083 MGAS2096_Spy0084   tyrS TRUE 0.531 52.000 0.004 1.000 N NA
 2012811 2012812 MGAS2096_Spy0085 MGAS2096_Spy0086 pbp1b rpoB FALSE 0.041 264.000 0.000 1.000 N NA
 2012812 2012813 MGAS2096_Spy0086 MGAS2096_Spy0087 rpoB rpoC TRUE 0.987 91.000 0.851 0.002 Y NA
 2012813 2012814 MGAS2096_Spy0087 MGAS2096_Spy0088 rpoC   FALSE 0.185 152.000 0.007 NA   NA
 2012814 2012815 MGAS2096_Spy0088 MGAS2096_Spy0089   comYA FALSE 0.381 93.000 0.083 NA   NA
 2012815 2012816 MGAS2096_Spy0089 MGAS2096_Spy0090 comYA comYB TRUE 0.987 -121.000 0.639 1.000 Y NA
 2012816 2012817 MGAS2096_Spy0090 MGAS2096_Spy0091 comYB comYC TRUE 0.999 2.000 0.861 0.001 Y NA
 2012817 2012818 MGAS2096_Spy0091 MGAS2096_Spy0092 comYC   TRUE 0.974 -25.000 0.110 NA Y NA
 2012818 2012819 MGAS2096_Spy0092 MGAS2096_Spy0093     TRUE 0.977 -43.000 0.786 NA   NA
 2012819 2012820 MGAS2096_Spy0093 MGAS2096_Spy0094   comYD TRUE 0.959 -7.000 0.250 NA   NA
 2012820 2012821 MGAS2096_Spy0094 MGAS2096_Spy0095 comYD   TRUE 0.955 -16.000 0.232 NA   NA
 2012821 2012822 MGAS2096_Spy0095 MGAS2096_Spy0096     TRUE 0.650 53.000 0.087 NA   NA
 2012822 2012823 MGAS2096_Spy0096 MGAS2096_Spy0097   ackA TRUE 0.651 59.000 0.130 1.000 N NA
 2012823 2012824 MGAS2096_Spy0097 MGAS2096_Spy0098 ackA   FALSE 0.060 187.000 0.000 NA   NA
 2012825 2012826 MGAS2096_Spy0099 MGAS2096_Spy0100 proC pepA TRUE 0.679 48.000 0.041 1.000 N NA
 2012826 2012827 MGAS2096_Spy0100 MGAS2096_Spy0101 pepA   FALSE 0.355 110.000 0.100 NA   NA
 2012828 2012829 MGAS2096_Spy0102 MGAS2096_Spy0103     TRUE 0.941 -3.000 0.140 NA   NA
 2012829 2012830 MGAS2096_Spy0103 MGAS2096_Spy0104     TRUE 0.949 18.000 0.239 1.000   NA
 2012830 2012831 MGAS2096_Spy0104 MGAS2096_Spy0105     FALSE 0.263 152.000 0.034 1.000   NA
 2012832 2012833 MGAS2096_Spy0106 MGAS2096_Spy0107     TRUE 0.872 -28.000 0.005 1.000 N NA
 2012833 2012834 MGAS2096_Spy0107 MGAS2096_Spy0108     TRUE 0.878 -85.000 0.034 1.000 N NA
 2012834 2012835 MGAS2096_Spy0108 MGAS2096_Spy0109   rofA FALSE 0.178 147.000 0.003 NA   NA
 2012836 2012837 MGAS2096_Spy0110 MGAS2096_Spy0111     FALSE 0.045 224.000 0.000 NA   NA
 2012837 2012838 MGAS2096_Spy0111 MGAS2096_Spy0112     TRUE 0.688 7.000 0.000 NA   NA
 2012838 2012839 MGAS2096_Spy0112 MGAS2096_Spy0113     FALSE 0.031 286.000 0.000 NA   NA
 2012839 2012840 MGAS2096_Spy0113 MGAS2096_Spy0114     TRUE 0.925 -7.000 0.061 NA   NA
 2012840 2012841 MGAS2096_Spy0114 MGAS2096_Spy0115     TRUE 0.893 7.000 0.061 NA   NA
 2012841 2012842 MGAS2096_Spy0115 MGAS2096_Spy0116   eftLSL-B TRUE 0.969 1.000 0.500 NA   NA
 2012842 2012843 MGAS2096_Spy0116 MGAS2096_Spy0117 eftLSL-B   TRUE 0.980 -55.000 1.000 NA   NA
 2012849 2012850 MGAS2096_Spy0123 MGAS2096_Spy0124   atoD2 TRUE 0.973 -45.000 0.100 1.000 Y NA
 2012850 2012851 MGAS2096_Spy0124 MGAS2096_Spy0125 atoD2   TRUE 0.998 3.000 0.200 0.003 Y NA
 2012852 2012853 MGAS2096_Spy0126 MGAS2096_Spy0127     TRUE 0.757 -16.000 0.000 NA   NA
 2012854 2012855 MGAS2096_Spy0128 MGAS2096_Spy0129   sloR TRUE 0.731 37.000 0.016 NA N NA
 2012855 2012856 MGAS2096_Spy0129 MGAS2096_Spy0130 sloR   FALSE 0.019 451.000 0.000 NA   NA
 2012856 2012857 MGAS2096_Spy0130 MGAS2096_Spy0131   ntpI TRUE 0.911 -10.000 0.029 NA   NA
 2012857 2012858 MGAS2096_Spy0131 MGAS2096_Spy0132 ntpI ntpK TRUE 0.998 2.000 0.848 0.006   NA
 2012858 2012859 MGAS2096_Spy0132 MGAS2096_Spy0133 ntpK ntpE TRUE 0.917 69.000 0.045 0.006   NA
 2012859 2012860 MGAS2096_Spy0133 MGAS2096_Spy0134 ntpE ntpC TRUE 0.991 16.000 0.097 0.006   NA
 2012860 2012861 MGAS2096_Spy0134 MGAS2096_Spy0135 ntpC ntpF TRUE 0.999 -3.000 0.487 0.001 Y NA
 2012861 2012862 MGAS2096_Spy0135 MGAS2096_Spy0136 ntpF ntpA TRUE 0.927 201.000 0.462 0.006 Y NA
 2012862 2012863 MGAS2096_Spy0136 MGAS2096_Spy0137 ntpA ntpB TRUE 0.999 1.000 0.776 0.006 Y NA
 2012863 2012864 MGAS2096_Spy0137 MGAS2096_Spy0138 ntpB ntpD TRUE 0.997 24.000 0.238 0.006 Y NA
 2012865 2012866 MGAS2096_Spy0139 MGAS2096_Spy0140     TRUE 0.975 13.000 0.818 NA   NA
 2012867 2012868 MGAS2096_Spy0141 MGAS2096_Spy0142   purA TRUE 0.863 125.000 0.008 0.001   NA
 2012868 2012869 MGAS2096_Spy0142 MGAS2096_Spy0143 purA   FALSE 0.279 327.000 0.000 0.024   NA
 2012871 2012872 MGAS2096_Spy0145 MGAS2096_Spy0146 nusG nga FALSE 0.030 362.000 0.000 1.000   NA
 2012872 2012873 MGAS2096_Spy0146 MGAS2096_Spy0147 nga ifs TRUE 0.950 5.000 0.286 1.000   NA
 2012873 2012874 MGAS2096_Spy0147 MGAS2096_Spy0148 ifs slo TRUE 0.925 15.000 0.125 1.000   NA
 2012874 2012875 MGAS2096_Spy0148 MGAS2096_Spy0149 slo   FALSE 0.038 255.000 0.000 NA   NA
 2012876 2012877 MGAS2096_Spy0150 MGAS2096_Spy0151     FALSE 0.070 175.000 0.000 NA   NA
 2012878 2012879 MGAS2096_Spy0152 MGAS2096_Spy0153 metB   TRUE 0.877 79.000 0.000 0.001   NA
 2012879 2012880 MGAS2096_Spy0153 MGAS2096_Spy0154   leuS FALSE 0.063 211.000 0.000 1.000   NA
 2012880 2012881 MGAS2096_Spy0154 MGAS2096_Spy0155 leuS   FALSE 0.030 363.000 0.000 1.000   NA
 2012881 2012882 MGAS2096_Spy0155 MGAS2096_Spy0156     FALSE 0.420 49.000 0.000 1.000   NA
 2012882 2012883 MGAS2096_Spy0156 MGAS2096_Spy0157     TRUE 0.940 71.000 0.431 0.024   NA
 2012883 2012884 MGAS2096_Spy0157 MGAS2096_Spy0158     TRUE 0.939 123.000 0.279 0.017 Y NA
 2012884 2012885 MGAS2096_Spy0158 MGAS2096_Spy0159     TRUE 0.790 91.000 0.328 1.000 Y NA
 2012885 2012886 MGAS2096_Spy0159 MGAS2096_Spy0160     TRUE 0.989 -37.000 0.536 1.000 Y NA
 2012886 2012887 MGAS2096_Spy0160 MGAS2096_Spy0161   araD TRUE 0.992 -22.000 0.700 1.000 Y NA
 2012887 2012888 MGAS2096_Spy0161 MGAS2096_Spy0162 araD   FALSE 0.278 58.000 0.000 NA   NA
 2012888 2012889 MGAS2096_Spy0162 MGAS2096_Spy0163     FALSE 0.108 121.000 0.000 NA   NA
 2012889 2012890 MGAS2096_Spy0163 MGAS2096_Spy0164     FALSE 0.214 253.000 0.231 NA   NA
 2012890 2012891 MGAS2096_Spy0164 MGAS2096_Spy0165     FALSE 0.018 488.000 0.000 NA   NA
 2012891 2012892 MGAS2096_Spy0165 MGAS2096_Spy0166     TRUE 0.908 -6.000 0.021 NA   NA
 2012892 2012893 MGAS2096_Spy0166 MGAS2096_Spy0167   opuAA TRUE 0.875 -96.000 0.042 NA   NA
 2012893 2012894 MGAS2096_Spy0167 MGAS2096_Spy0168 opuAA opuABC TRUE 0.977 16.000 0.177 1.000 Y NA
 2012894 2012895 MGAS2096_Spy0168 MGAS2096_Spy0169 opuABC   TRUE 0.994 -36.000 0.118 0.043 Y NA
 2012895 2012896 MGAS2096_Spy0169 MGAS2096_Spy0170   polA FALSE 0.055 352.000 0.003 1.000 N NA
 2012896 2012897 MGAS2096_Spy0170 MGAS2096_Spy0171 polA   FALSE 0.125 187.000 0.005 NA   NA
 2012897 2012898 MGAS2096_Spy0171 MGAS2096_Spy0172   perR TRUE 0.546 52.000 0.010 NA   NA
 2012898 2012899 MGAS2096_Spy0172 MGAS2096_Spy0173 perR vlg FALSE 0.081 157.000 0.000 NA   NA
 2012899 2012900 MGAS2096_Spy0173 MGAS2096_Spy0174 vlg   FALSE 0.045 222.000 0.000 NA   NA
 2012900 2012901 MGAS2096_Spy0174 MGAS2096_Spy0175     TRUE 0.810 -7.000 0.000 1.000   NA
 2012902 2012903 MGAS2096_Spy0176 MGAS2096_Spy0177     FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2012903 2012904 MGAS2096_Spy0177 MGAS2096_Spy0178     TRUE 0.983 -3.000 0.000 0.012   NA
 2012904 2012905 MGAS2096_Spy0178 MGAS2096_Spy0179     TRUE 0.919 33.000 0.000 0.086   NA
 2012905 2012906 MGAS2096_Spy0179 MGAS2096_Spy0180     FALSE 0.082 156.000 0.000 NA   NA
 2012908 2012909 MGAS2096_Spy0182 MGAS2096_Spy0183     TRUE 0.981 21.000 0.000 0.086 Y NA
 2012909 2012910 MGAS2096_Spy0183 MGAS2096_Spy0184     FALSE 0.223 68.000 0.000 NA   NA
 2012911 2012912 MGAS2096_Spy0185 MGAS2096_Spy0186   tgt TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2012912 2012913 MGAS2096_Spy0186 MGAS2096_Spy0187 tgt   FALSE 0.113 218.000 0.004 1.000   NA
 2012913 2012914 MGAS2096_Spy0187 MGAS2096_Spy0188     TRUE 0.884 4.000 0.039 NA   NA
 2012914 2012915 MGAS2096_Spy0188 MGAS2096_Spy0189     FALSE 0.080 159.000 0.000 NA   NA
 2012915 2012916 MGAS2096_Spy0189 MGAS2096_Spy0190     TRUE 0.757 -16.000 0.000 NA   NA
 2012916 2012917 MGAS2096_Spy0190 MGAS2096_Spy0191     FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 2012917 2012918 MGAS2096_Spy0191 MGAS2096_Spy0192     TRUE 0.986 -24.000 0.013 0.020   NA
 2012920 2012921 MGAS2096_Spy0194 MGAS2096_Spy0195   speG FALSE 0.039 251.000 0.000 NA   NA
 2012921 2012922 MGAS2096_Spy0195 MGAS2096_Spy0196 speG   FALSE 0.138 88.000 0.000 NA   NA
 2012922 2012923 MGAS2096_Spy0196 MGAS2096_Spy0197     TRUE 0.522 36.000 0.000 NA   NA
 2012923 2012924 MGAS2096_Spy0197 MGAS2096_Spy0198   pgi FALSE 0.125 97.000 0.000 NA   NA
 2012926 2012927 MGAS2096_Spy0200 MGAS2096_Spy0201     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.016   NA
 2012927 2012928 MGAS2096_Spy0201 MGAS2096_Spy0202     TRUE 0.757 -16.000 0.000 NA   NA
 2012928 2012929 MGAS2096_Spy0202 MGAS2096_Spy0203     FALSE 0.155 81.000 0.000 NA   NA
 2012929 2012930 MGAS2096_Spy0203 MGAS2096_Spy0204     TRUE 0.599 28.000 0.000 NA   NA
 2012931 2012932 MGAS2096_Spy0205 MGAS2096_Spy0206 hasC2 gpsA TRUE 0.799 27.000 0.007 1.000 N NA
 2012933 2012934 MGAS2096_Spy0207 MGAS2096_Spy0208     TRUE 0.934 -7.000 0.080 1.000 N NA
 2012934 2012935 MGAS2096_Spy0208 MGAS2096_Spy0209     TRUE 0.999 0.000 0.720 0.009 Y NA
 2012935 2012936 MGAS2096_Spy0209 MGAS2096_Spy0210     FALSE 0.239 118.000 0.010 NA   NA
 2012936 2012937 MGAS2096_Spy0210 MGAS2096_Spy0211     FALSE 0.219 110.000 0.005 NA   NA
 2012937 2012938 MGAS2096_Spy0211 MGAS2096_Spy0212     TRUE 0.988 16.000 0.000 0.001   NA
 2012938 2012939 MGAS2096_Spy0212 MGAS2096_Spy0213   radA FALSE 0.396 81.000 0.028 1.000   NA
 2012939 2012940 MGAS2096_Spy0213 MGAS2096_Spy0214 radA   FALSE 0.159 186.000 0.009 1.000   NA
 2012940 2012941 MGAS2096_Spy0214 MGAS2096_Spy0215     TRUE 0.987 -67.000 0.000 0.001   NA
 2012941 2012942 MGAS2096_Spy0215 MGAS2096_Spy0216     TRUE 0.525 95.000 0.278 NA   NA
 2012942 2012943 MGAS2096_Spy0216 MGAS2096_Spy0217     FALSE 0.126 198.000 0.008 NA   NA
 2012943 2012944 MGAS2096_Spy0217 MGAS2096_Spy0218   gltX TRUE 0.994 -3.000 0.008 0.001   NA
 2012944 2012945 MGAS2096_Spy0218 MGAS2096_Spy0219 gltX fasB FALSE 0.027 396.000 0.000 1.000   NA
 2012945 2012946 MGAS2096_Spy0219 MGAS2096_Spy0220 fasB fasC TRUE 0.992 -3.000 0.750 NA Y NA
 2012946 2012947 MGAS2096_Spy0220 MGAS2096_Spy0221 fasC fasA TRUE 0.987 4.000 0.571 NA Y NA
 2012947 2012948 MGAS2096_Spy0221 MGAS2096_Spy0222 fasA fasX FALSE 0.019 540.000 0.000 1.000 N NA
 2012948 2012949 MGAS2096_Spy0222 MGAS2096_Spy0223 fasX   TRUE 0.910 -34.000 0.052 1.000 N NA
 2012949 2012950 MGAS2096_Spy0223 MGAS2096_Spy0224     TRUE 0.908 12.000 0.106 NA   NA
 2012950 2012951 MGAS2096_Spy0224 MGAS2096_Spy0225     FALSE 0.426 44.000 0.000 NA   NA
 2012951 2012952 MGAS2096_Spy0225 MGAS2096_Spy0226     TRUE 0.777 -31.000 0.000 1.000   NA
 2012952 2012953 MGAS2096_Spy0226 MGAS2096_Spy0227     FALSE 0.148 83.000 0.000 NA   NA
 2012953 2012954 MGAS2096_Spy0227 MGAS2096_Spy0228   rpmH FALSE 0.115 108.000 0.000 NA   NA
 2012954 2012955 MGAS2096_Spy0228 MGAS2096_Spy0229 rpmH   FALSE 0.042 274.000 0.000 1.000   NA
 2012955 2012956 MGAS2096_Spy0229 MGAS2096_Spy0230     FALSE 0.360 49.000 0.000 NA   NA
 2012956 2012957 MGAS2096_Spy0230 MGAS2096_Spy0231     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 2012957 2012958 MGAS2096_Spy0231 MGAS2096_Spy0232     TRUE 0.900 104.000 0.133 0.042 Y NA
 2012958 2012959 MGAS2096_Spy0232 MGAS2096_Spy0233     TRUE 0.998 13.000 1.000 0.042 Y NA
 2012959 2012960 MGAS2096_Spy0233 MGAS2096_Spy0234     FALSE 0.081 157.000 0.000 NA   NA
 2012960 2012961 MGAS2096_Spy0234 MGAS2096_Spy0235   nanH TRUE 0.693 12.000 0.000 NA   NA
 2012961 2012962 MGAS2096_Spy0235 MGAS2096_Spy0236 nanH   TRUE 0.906 22.000 0.108 1.000 N NA
 2012964 2012965 MGAS2096_Spy0238 MGAS2096_Spy0239 tatD   TRUE 0.965 -49.000 0.058 NA Y NA
 2012965 2012966 MGAS2096_Spy0239 MGAS2096_Spy0240   ksgA FALSE 0.412 90.000 0.093 1.000 N NA
 2012966 2012967 MGAS2096_Spy0240 MGAS2096_Spy0241 ksgA   FALSE 0.048 424.000 0.003 1.000   NA
 2012967 2012968 MGAS2096_Spy0241 MGAS2096_Spy0242   rpe TRUE 0.943 10.000 0.213 1.000   NA
 2012968 2012969 MGAS2096_Spy0242 MGAS2096_Spy0243 rpe   TRUE 0.950 -7.000 0.166 1.000 N NA
 2012969 2012970 MGAS2096_Spy0243 MGAS2096_Spy0244     TRUE 0.893 2.000 0.030 NA   NA
 2012970 2012971 MGAS2096_Spy0244 MGAS2096_Spy0245   cbf TRUE 0.912 -10.000 0.030 NA   NA
 2012971 2012972 MGAS2096_Spy0245 MGAS2096_Spy0246 cbf purR FALSE 0.128 267.000 0.052 1.000   NA
 2012972 2012973 MGAS2096_Spy0246 MGAS2096_Spy0247 purR prgA TRUE 0.891 -27.000 0.017 NA   NA
 2012973 2012974 MGAS2096_Spy0247 MGAS2096_Spy0248 prgA rpsL FALSE 0.125 208.000 0.012 NA   NA
 2012974 2012975 MGAS2096_Spy0248 MGAS2096_Spy0249 rpsL rpsG TRUE 0.998 -10.000 0.224 0.006 Y NA
 2012975 2012976 MGAS2096_Spy0249 MGAS2096_Spy0250 rpsG   FALSE 0.059 367.000 0.006 1.000   NA
 2012976 2012977 MGAS2096_Spy0250 MGAS2096_Spy0251   fus TRUE 0.983 -54.000 0.003 0.011   NA
 2012977 2012978 MGAS2096_Spy0251 MGAS2096_Spy0252 fus plr FALSE 0.031 321.000 0.000 1.000 N NA
 2012979 2012980 MGAS2096_Spy0253 MGAS2096_Spy0254     TRUE 0.989 -76.000 0.758 1.000 Y NA
 2012980 2012981 MGAS2096_Spy0254 MGAS2096_Spy0255     TRUE 0.995 -40.000 0.339 0.009   NA
 2012982 2012983 MGAS2096_Spy0256 MGAS2096_Spy0257   bacA TRUE 0.584 66.000 0.118 NA   NA
 2012983 2012984 MGAS2096_Spy0257 MGAS2096_Spy0258 bacA mecA FALSE 0.322 140.000 0.132 NA N NA
 2012984 2012985 MGAS2096_Spy0258 MGAS2096_Spy0259 mecA   TRUE 0.939 7.000 0.267 NA N NA
 2012985 2012986 MGAS2096_Spy0259 MGAS2096_Spy0260   rgpG TRUE 0.733 -30.000 0.000 NA   NA
 2012986 2012987 MGAS2096_Spy0260 MGAS2096_Spy0261 rgpG   TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 2012987 2012988 MGAS2096_Spy0261 MGAS2096_Spy0262     TRUE 0.698 95.000 0.139 1.000 Y NA
 2012988 2012989 MGAS2096_Spy0262 MGAS2096_Spy0263   nifS3 TRUE 0.950 31.000 0.606 1.000 N NA
 2012989 2012990 MGAS2096_Spy0263 MGAS2096_Spy0264 nifS3 nifU TRUE 0.963 -13.000 0.292 1.000 N NA
 2012990 2012991 MGAS2096_Spy0264 MGAS2096_Spy0265 nifU   TRUE 0.996 -7.000 0.152 0.002 N NA
 2012992 2012993 MGAS2096_Spy0266 MGAS2096_Spy0267     TRUE 0.995 -15.000 0.182 0.006   NA
 2012993 2012994 MGAS2096_Spy0267 MGAS2096_Spy0268     TRUE 0.635 169.000 0.000 0.006   NA
 2012994 2012995 MGAS2096_Spy0268 MGAS2096_Spy0269   dacA2 TRUE 0.976 24.000 0.000 0.006   NA
 2012996 2012997 MGAS2096_Spy0270 MGAS2096_Spy0271 oppA oppB TRUE 0.977 53.000 0.273 0.042 Y NA
 2012997 2012998 MGAS2096_Spy0271 MGAS2096_Spy0272 oppB oppC TRUE 0.998 0.000 0.556 0.042 Y NA
 2012998 2012999 MGAS2096_Spy0272 MGAS2096_Spy0273 oppC oppD TRUE 0.988 9.000 0.650 1.000 Y NA
 2012999 2013000 MGAS2096_Spy0273 MGAS2096_Spy0274 oppD oppF TRUE 0.998 -7.000 0.095 0.001 Y NA
 2013001 2013002 MGAS2096_Spy0275 MGAS2096_Spy0276     FALSE 0.022 375.000 0.000 NA   NA
 1625198 1625199 MGAS2096_SPYR02265 MGAS2096_SPYR02266     FALSE 0.106 125.000 0.000 NA   NA
 1625199 1625200 MGAS2096_SPYR02266 MGAS2096_SPYR02267     FALSE 0.144 85.000 0.000 NA   NA
 1625200 1625201 MGAS2096_SPYR02267 MGAS2096_SPYR02268     TRUE 0.689 6.000 0.000 NA   NA
 1625201 1625202 MGAS2096_SPYR02268 MGAS2096_SPYR02269     FALSE 0.161 80.000 0.000 NA   NA
 1625202 2013003 MGAS2096_SPYR02269 MGAS2096_Spy0277   comX2 FALSE 0.133 92.000 0.000 NA   NA
 2013003 2013004 MGAS2096_Spy0277 MGAS2096_Spy0278 comX2   FALSE 0.023 502.000 0.000 1.000   NA
 2013004 2013005 MGAS2096_Spy0278 MGAS2096_Spy0279     TRUE 0.976 0.000 0.555 1.000   NA
 2013005 2013006 MGAS2096_Spy0279 MGAS2096_Spy0280     TRUE 0.870 25.000 0.068 NA   NA
 2013006 2013007 MGAS2096_Spy0280 MGAS2096_Spy0281   nadD TRUE 0.570 69.000 0.150 NA N NA
 2013007 2013008 MGAS2096_Spy0281 MGAS2096_Spy0282 nadD   TRUE 0.984 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 2013008 2013009 MGAS2096_Spy0282 MGAS2096_Spy0283     TRUE 0.937 -24.000 0.149 NA   NA
 2013009 2013010 MGAS2096_Spy0283 MGAS2096_Spy0284     TRUE 0.924 0.000 0.085 NA   NA
 2013010 2013011 MGAS2096_Spy0284 MGAS2096_Spy0285     FALSE 0.167 222.000 0.094 NA   NA
 2013011 2013012 MGAS2096_Spy0285 MGAS2096_Spy0286     FALSE 0.025 352.000 0.000 NA   NA
 2013012 2013013 MGAS2096_Spy0286 MGAS2096_Spy0287     TRUE 0.766 -10.000 0.000 NA   NA
 2013013 2013014 MGAS2096_Spy0287 MGAS2096_Spy0288     FALSE 0.052 203.000 0.000 NA   NA
 2013014 2013015 MGAS2096_Spy0288 MGAS2096_Spy0289     FALSE 0.018 389.000 0.000 NA N NA
 2013015 2013016 MGAS2096_Spy0289 MGAS2096_Spy0290     FALSE 0.168 255.000 0.000 NA Y NA
 2013016 2013017 MGAS2096_Spy0290 MGAS2096_Spy0291     TRUE 0.993 1.000 0.938 1.000 Y NA
 2013017 2013018 MGAS2096_Spy0291 MGAS2096_Spy0292     FALSE 0.119 1661.000 0.000 0.086 N NA
 2013019 2013020 MGAS2096_Spy0293 MGAS2096_Spy0294     TRUE 0.998 10.000 0.490 0.005 Y NA
 2013020 2013021 MGAS2096_Spy0294 MGAS2096_Spy0295   gidB FALSE 0.394 70.000 0.006 1.000 N NA
 2013022 2013023 MGAS2096_Spy0296 MGAS2096_Spy0297 lemA   TRUE 0.802 47.000 0.222 NA   NA
 2013023 2013024 MGAS2096_Spy0297 MGAS2096_Spy0298     TRUE 0.913 52.000 0.000 0.006   NA
 2013024 2013025 MGAS2096_Spy0298 MGAS2096_Spy0299     FALSE 0.085 231.000 0.002 NA   NA
 2013025 2013026 MGAS2096_Spy0299 MGAS2096_Spy0300   covR FALSE 0.091 266.000 0.014 NA   NA
 2013026 2013027 MGAS2096_Spy0300 MGAS2096_Spy0301 covR covS TRUE 0.996 6.000 0.438 0.086 Y NA
 2013027 2013028 MGAS2096_Spy0301 MGAS2096_Spy0302 covS   FALSE 0.098 215.000 0.007 NA N NA
 2013028 2013029 MGAS2096_Spy0302 MGAS2096_Spy0303   dnaB TRUE 0.928 -16.000 0.109 NA N NA
 2013029 2013030 MGAS2096_Spy0303 MGAS2096_Spy0304 dnaB dnaI TRUE 0.992 1.000 0.817 NA Y NA
 2013030 2013031 MGAS2096_Spy0304 MGAS2096_Spy0305 dnaI pgdA TRUE 0.495 63.000 0.008 1.000   NA
 2013031 2013032 MGAS2096_Spy0305 MGAS2096_Spy0306 pgdA snf FALSE 0.122 207.000 0.004 1.000   NA
 2013032 2013033 MGAS2096_Spy0306 MGAS2096_Spy0307 snf   FALSE 0.180 243.000 0.151 NA   NA
 2013033 2013034 MGAS2096_Spy0307 MGAS2096_Spy0308   murC TRUE 0.712 40.000 0.013 NA   NA
 2013034 2013035 MGAS2096_Spy0308 MGAS2096_Spy0309 murC   TRUE 0.684 46.000 0.014 1.000   NA
 2013035 2013036 MGAS2096_Spy0309 MGAS2096_Spy0310     FALSE 0.367 112.000 0.120 NA   NA
 2013036 2013037 MGAS2096_Spy0310 MGAS2096_Spy0311   greA TRUE 0.873 25.000 0.079 NA   NA
 2013038 2013039 MGAS2096_Spy0312 MGAS2096_Spy0313     FALSE 0.035 266.000 0.000 NA   NA
 2013039 2013040 MGAS2096_Spy0313 MGAS2096_Spy0314     TRUE 0.499 82.000 0.154 1.000 N NA
 2013041 2013042 MGAS2096_Spy0315 MGAS2096_Spy0316     TRUE 0.789 39.000 0.043 1.000   NA
 2013042 2013043 MGAS2096_Spy0316 MGAS2096_Spy0317     TRUE 0.915 15.000 0.123 NA   NA
 2013043 2013044 MGAS2096_Spy0317 MGAS2096_Spy0318     FALSE 0.068 178.000 0.000 NA   NA
 2013046 2013047 MGAS2096_Spy0320 MGAS2096_Spy0321 glr   TRUE 0.898 -42.000 0.034 1.000 N NA
 2013047 2013048 MGAS2096_Spy0321 MGAS2096_Spy0322     TRUE 0.934 -21.000 0.085 1.000   NA
 2013048 2013049 MGAS2096_Spy0322 MGAS2096_Spy0323     TRUE 0.934 -3.000 0.065 1.000   NA
 2013049 2013050 MGAS2096_Spy0323 MGAS2096_Spy0324     TRUE 0.943 -3.000 0.111 1.000   NA
 2013050 2013051 MGAS2096_Spy0324 MGAS2096_Spy0325     TRUE 0.895 0.000 0.017 NA   NA
 2013051 2013052 MGAS2096_Spy0325 MGAS2096_Spy0326     TRUE 0.976 -3.000 0.570 NA   NA
 2013052 2013053 MGAS2096_Spy0326 MGAS2096_Spy0327     FALSE 0.307 181.000 0.224 NA N NA
 2013053 2013054 MGAS2096_Spy0327 MGAS2096_Spy0328     TRUE 0.900 -3.000 0.014 NA   NA
 2013054 2013055 MGAS2096_Spy0328 MGAS2096_Spy0329     FALSE 0.178 142.000 0.002 NA   NA
 2013055 2013056 MGAS2096_Spy0329 MGAS2096_Spy0330     FALSE 0.028 312.000 0.000 NA   NA
 2013056 2013057 MGAS2096_Spy0330 MGAS2096_Spy0331     TRUE 0.972 2.000 0.600 NA   NA
 2013057 2013058 MGAS2096_Spy0331 MGAS2096_Spy0332     FALSE 0.121 275.000 0.050 1.000   NA
 2013058 2013059 MGAS2096_Spy0332 MGAS2096_Spy0333     TRUE 0.956 12.000 0.408 NA   NA
 2013059 2013060 MGAS2096_Spy0333 MGAS2096_Spy0334   hlyX FALSE 0.311 94.000 0.023 NA   NA
 2013060 2013061 MGAS2096_Spy0334 MGAS2096_Spy0335 hlyX pflC TRUE 0.873 6.000 0.028 NA   NA
 2013061 2013062 MGAS2096_Spy0335 MGAS2096_Spy0336 pflC ppaC FALSE 0.277 125.000 0.023 1.000 N NA
 2013062 2013063 MGAS2096_Spy0336 MGAS2096_Spy0337 ppaC   FALSE 0.376 76.000 0.015 NA   NA
 2013064 2013065 MGAS2096_Spy0338 MGAS2096_Spy0339 fhuG fhuB TRUE 0.998 -39.000 0.857 0.041 Y NA
 2013065 2013066 MGAS2096_Spy0339 MGAS2096_Spy0340 fhuB fhuD TRUE 0.983 -10.000 0.179 1.000 Y NA
 2013066 2013067 MGAS2096_Spy0340 MGAS2096_Spy0341 fhuD fhuA TRUE 0.988 26.000 0.889 1.000 Y NA
 2013067 2013068 MGAS2096_Spy0341 MGAS2096_Spy0342 fhuA   FALSE 0.152 246.000 0.062 1.000   NA
 2013068 2013069 MGAS2096_Spy0342 MGAS2096_Spy0343   murE TRUE 0.994 18.000 0.062 0.001   NA
 2013070 2013071 MGAS2096_Spy0344 MGAS2096_Spy0345     FALSE 0.167 168.000 0.002 1.000   NA
 2013071 2013072 MGAS2096_Spy0345 MGAS2096_Spy0346   upp TRUE 0.853 100.000 0.005 0.002   NA
 2013072 2013073 MGAS2096_Spy0346 MGAS2096_Spy0347 upp clpP FALSE 0.113 224.000 0.010 1.000 N NA
 2013073 2013074 MGAS2096_Spy0347 MGAS2096_Spy0348 clpP   FALSE 0.018 1041.000 0.000 1.000 N NA
 2013074 2013075 MGAS2096_Spy0348 MGAS2096_Spy0349     TRUE 0.691 5.000 0.000 NA   NA
 2013075 2013076 MGAS2096_Spy0349 MGAS2096_Spy0350   tmk TRUE 0.704 -51.000 0.000 NA   NA
 2013076 2013077 MGAS2096_Spy0350 MGAS2096_Spy0351 tmk dnaX TRUE 0.948 18.000 0.254 1.000 N NA
 2013077 2013078 MGAS2096_Spy0351 MGAS2096_Spy0352 dnaX   TRUE 0.523 122.000 0.372 NA   NA
 2013080 2013081 MGAS2096_Spy0354 MGAS2096_Spy0355     TRUE 0.883 5.000 0.043 NA   NA
 2013081 2013082 MGAS2096_Spy0355 MGAS2096_Spy0356     FALSE 0.291 81.000 0.005 NA   NA
 2013086 2013087 MGAS2096_Spy0360 MGAS2096_Spy0361 lctO spyCEP FALSE 0.045 265.000 0.000 1.000   NA
 2013087 2013088 MGAS2096_Spy0361 MGAS2096_Spy0362 spyCEP   FALSE 0.018 491.000 0.000 NA   NA
 2013088 2013089 MGAS2096_Spy0362 MGAS2096_Spy0363     FALSE 0.169 78.000 0.000 NA   NA
 2013089 2013090 MGAS2096_Spy0363 MGAS2096_Spy0364   metS FALSE 0.041 241.000 0.000 NA   NA
 2013090 2013091 MGAS2096_Spy0364 MGAS2096_Spy0365 metS   FALSE 0.026 328.000 0.000 NA   NA
 2013091 2013092 MGAS2096_Spy0365 MGAS2096_Spy0366   nrdF1 TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2013092 2013093 MGAS2096_Spy0366 MGAS2096_Spy0367 nrdF1 nrdI TRUE 0.988 4.000 0.643 NA Y NA
 2013093 2013094 MGAS2096_Spy0367 MGAS2096_Spy0368 nrdI nrdE1 TRUE 0.993 -33.000 1.000 NA Y NA
 2013094 2013095 MGAS2096_Spy0368 MGAS2096_Spy0369 nrdE1   TRUE 0.695 20.000 0.000 NA   NA
 2013097 2013098 MGAS2096_Spy0371 MGAS2096_Spy0372     FALSE 0.018 478.000 0.000 NA   NA
 2013098 2013099 MGAS2096_Spy0372 MGAS2096_Spy0373     FALSE 0.019 444.000 0.000 NA   NA
 2013099 2013100 MGAS2096_Spy0373 MGAS2096_Spy0374     FALSE 0.059 193.000 0.000 NA   NA
 2013101 2013102 MGAS2096_Spy0375 MGAS2096_Spy0376     FALSE 0.017 512.000 0.000 NA   NA
 2013103 2013104 MGAS2096_Spy0377 MGAS2096_Spy0378     TRUE 0.980 -7.000 0.710 NA   NA
 2013104 2013105 MGAS2096_Spy0378 MGAS2096_Spy0379     TRUE 0.777 43.000 0.067 1.000   NA
 2013105 2013106 MGAS2096_Spy0379 MGAS2096_Spy0380     FALSE 0.034 327.000 0.000 1.000   NA
 2013106 2013107 MGAS2096_Spy0380 MGAS2096_Spy0381   gcaD FALSE 0.147 173.000 0.002 1.000 N NA
 2013107 2013108 MGAS2096_Spy0381 MGAS2096_Spy0382 gcaD   FALSE 0.198 167.000 0.015 1.000 N NA
 2013108 2013109 MGAS2096_Spy0382 MGAS2096_Spy0383     TRUE 0.908 -3.000 0.025 NA   NA
 2013109 2013110 MGAS2096_Spy0383 MGAS2096_Spy0384   pfs TRUE 0.885 20.000 0.041 NA   NA
 2013110 2013111 MGAS2096_Spy0384 MGAS2096_Spy0385 pfs   FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 2013112 2013113 MGAS2096_Spy0386 MGAS2096_Spy0387 scaR   TRUE 0.987 -3.000 0.000 0.005   NA
 2013114 2013115 MGAS2096_Spy0388 MGAS2096_Spy0389 mtsA mtsB TRUE 0.941 37.000 0.135 1.000 Y NA
 2013115 2013116 MGAS2096_Spy0389 MGAS2096_Spy0390 mtsB mtsC TRUE 0.977 1.000 0.130 1.000 Y NA
 2013118 2013119 MGAS2096_Spy0392 MGAS2096_Spy0393 ftsK   TRUE 0.767 -9.000 0.000 NA   NA
 2013121 2013122 MGAS2096_Spy0395 MGAS2096_Spy0396 rplK rplA TRUE 0.964 106.000 0.838 0.039 Y NA
 2013122 2013123 MGAS2096_Spy0396 MGAS2096_Spy0397 rplA pyrH FALSE 0.057 322.000 0.002 1.000 N NA
 2013123 2013124 MGAS2096_Spy0397 MGAS2096_Spy0398 pyrH rrf TRUE 0.953 29.000 0.626 1.000 N NA
 2013124 2013125 MGAS2096_Spy0398 MGAS2096_Spy0399 rrf   FALSE 0.251 109.000 0.012 NA   NA
 2013125 2013126 MGAS2096_Spy0399 MGAS2096_Spy0400   msrA2 FALSE 0.391 73.000 0.016 NA   NA
 2013126 2013127 MGAS2096_Spy0400 MGAS2096_Spy0401 msrA2   TRUE 0.937 -3.000 0.080 1.000   NA
 2013127 2013128 MGAS2096_Spy0401 MGAS2096_Spy0402     FALSE 0.196 181.000 0.023 1.000   NA
 2013128 2013129 MGAS2096_Spy0402 MGAS2096_Spy0403     FALSE 0.034 273.000 0.000 NA   NA
 2013129 2013130 MGAS2096_Spy0403 MGAS2096_Spy0404     TRUE 0.722 -39.000 0.000 NA   NA
 2013130 2013131 MGAS2096_Spy0404 MGAS2096_Spy0405     FALSE 0.157 159.000 0.004 NA   NA
 2013131 2013132 MGAS2096_Spy0405 MGAS2096_Spy0406   phoH TRUE 0.993 -28.000 0.010 0.001   NA
 2013132 2013133 MGAS2096_Spy0406 MGAS2096_Spy0407 phoH   TRUE 0.598 46.000 0.005 NA   NA
 2013133 2013134 MGAS2096_Spy0407 MGAS2096_Spy0408     FALSE 0.216 108.000 0.003 NA   NA
 2013134 2013135 MGAS2096_Spy0408 MGAS2096_Spy0409   dgk TRUE 0.908 -19.000 0.035 NA   NA
 2013135 2013136 MGAS2096_Spy0409 MGAS2096_Spy0410 dgk era FALSE 0.346 120.000 0.063 1.000   NA
 2013136 2013137 MGAS2096_Spy0410 MGAS2096_Spy0411 era   TRUE 0.889 -25.000 0.007 1.000   NA
 2013138 2013139 MGAS2096_Spy0412 MGAS2096_Spy0413     FALSE 0.044 228.000 0.000 NA   NA
 2013140 2013141 MGAS2096_Spy0414 MGAS2096_Spy0415     TRUE 0.950 13.000 0.333 NA   NA
 2013141 2013142 MGAS2096_Spy0415 MGAS2096_Spy0416   silD FALSE 0.030 294.000 0.000 NA   NA
 2013142 2013143 MGAS2096_Spy0416 MGAS2096_Spy0417 silD   TRUE 0.884 50.000 0.667 NA   NA
 2013143 2013144 MGAS2096_Spy0417 MGAS2096_Spy0418     FALSE 0.067 179.000 0.000 NA   NA
 2013146 2013147 MGAS2096_Spy0420 MGAS2096_Spy0421     FALSE 0.132 93.000 0.000 NA   NA
 2013150 2013151 MGAS2096_Spy0424 MGAS2096_Spy0425     TRUE 0.704 -51.000 0.000 NA   NA
 2013152 2013153 MGAS2096_Spy0426 MGAS2096_Spy0427 mutR fpg FALSE 0.167 172.000 0.004 1.000   NA
 2013153 2013154 MGAS2096_Spy0427 MGAS2096_Spy0428 fpg   TRUE 0.918 -30.000 0.066 1.000 N NA
 2013154 2013155 MGAS2096_Spy0428 MGAS2096_Spy0429     FALSE 0.076 190.000 0.000 1.000   NA
 2013155 2013156 MGAS2096_Spy0429 MGAS2096_Spy0430     FALSE 0.252 122.000 0.007 1.000   NA
 2013156 2013157 MGAS2096_Spy0430 MGAS2096_Spy0431     TRUE 0.903 -3.000 0.012 1.000 N NA
 2013157 2013158 MGAS2096_Spy0431 MGAS2096_Spy0432   secG TRUE 0.654 46.000 0.012 1.000 N NA
 2013158 2013159 MGAS2096_Spy0432 MGAS2096_Spy0433 secG   FALSE 0.380 94.000 0.064 1.000 N NA
 2013159 2013160 MGAS2096_Spy0433 MGAS2096_Spy0434     TRUE 0.986 3.000 0.143 0.034 N NA
 2013160 2013161 MGAS2096_Spy0434 MGAS2096_Spy0435     TRUE 0.927 6.000 0.000 1.000 Y NA
 2013162 2013163 MGAS2096_Spy0436 MGAS2096_Spy0437 pcp   TRUE 0.806 50.000 0.300 NA   NA
 2013163 2013164 MGAS2096_Spy0437 MGAS2096_Spy0438     TRUE 0.983 0.000 0.939 NA   NA
 2013164 2013165 MGAS2096_Spy0438 MGAS2096_Spy0439     FALSE 0.084 154.000 0.000 NA   NA
 2013165 2013166 MGAS2096_Spy0439 MGAS2096_Spy0440   gloA FALSE 0.295 85.000 0.012 NA N NA
 2013166 2013167 MGAS2096_Spy0440 MGAS2096_Spy0441 gloA   TRUE 0.878 11.000 0.019 1.000 N NA
 2013167 2013168 MGAS2096_Spy0441 MGAS2096_Spy0442   pepQ TRUE 0.682 49.000 0.053 1.000 N NA
 2013169 2013170 MGAS2096_Spy0443 MGAS2096_Spy0444 ccpA   FALSE 0.283 131.000 0.033 1.000 N NA
 2013170 2013171 MGAS2096_Spy0444 MGAS2096_Spy0445     TRUE 0.998 2.000 0.413 0.013 Y NA
 2013171 2013172 MGAS2096_Spy0445 MGAS2096_Spy0446   thrS FALSE 0.023 422.000 0.000 1.000 N NA
 2013172 2013173 MGAS2096_Spy0446 MGAS2096_Spy0447 thrS drrA FALSE 0.246 141.000 0.012 1.000   NA
 2013173 2013174 MGAS2096_Spy0447 MGAS2096_Spy0448 drrA   TRUE 0.707 -49.000 0.000 NA   NA
 2013174 2013175 MGAS2096_Spy0448 MGAS2096_Spy0449     TRUE 0.899 2.000 0.042 NA   NA
 2013175 2013176 MGAS2096_Spy0449 MGAS2096_Spy0450     FALSE 0.141 86.000 0.000 NA   NA
 2013176 2013177 MGAS2096_Spy0450 MGAS2096_Spy0451     FALSE 0.027 395.000 0.000 1.000   NA
 2013177 2013178 MGAS2096_Spy0451 MGAS2096_Spy0452     TRUE 0.989 -43.000 0.576 1.000 Y NA
 2013178 2013179 MGAS2096_Spy0452 MGAS2096_Spy0453     TRUE 0.561 56.000 0.030 NA   NA
 2013179 2013180 MGAS2096_Spy0453 MGAS2096_Spy0454   vicR FALSE 0.188 162.000 0.013 NA   NA
 2013180 2013181 MGAS2096_Spy0454 MGAS2096_Spy0455 vicR vicK TRUE 0.998 -7.000 0.597 0.059 Y NA
 2013181 2013182 MGAS2096_Spy0455 MGAS2096_Spy0456 vicK vicX TRUE 0.897 4.000 0.038 1.000   NA
 2013182 2013183 MGAS2096_Spy0456 MGAS2096_Spy0457 vicX acpA FALSE 0.046 432.000 0.002 1.000   NA
 2013183 2013184 MGAS2096_Spy0457 MGAS2096_Spy0458 acpA smc TRUE 0.932 1.000 0.120 1.000 N NA
 2013186 2013187 MGAS2096_Spy0460 MGAS2096_Spy0461 aroE2   TRUE 0.734 -3.000 0.000 NA N NA
 2013187 2013188 MGAS2096_Spy0461 MGAS2096_Spy0462     TRUE 0.748 -22.000 0.000 NA   NA
 2013188 2013189 MGAS2096_Spy0462 MGAS2096_Spy0463     TRUE 0.767 -7.000 0.000 NA   NA
 2013189 2013190 MGAS2096_Spy0463 MGAS2096_Spy0464   metK1 TRUE 0.694 10.000 0.000 NA   NA
 2013190 2013191 MGAS2096_Spy0464 MGAS2096_Spy0465 metK1   TRUE 0.757 -16.000 0.000 NA   NA
 2013191 2013192 MGAS2096_Spy0465 MGAS2096_Spy0466     FALSE 0.293 55.000 0.000 NA   NA
 2013192 2013193 MGAS2096_Spy0466 MGAS2096_Spy0467     FALSE 0.017 509.000 0.000 NA   NA
 2013193 2013194 MGAS2096_Spy0467 MGAS2096_Spy0468     TRUE 0.647 24.000 0.000 NA   NA
 2013194 2013195 MGAS2096_Spy0468 MGAS2096_Spy0469   mefE FALSE 0.179 85.000 0.000 1.000   NA
 2013196 2013197 MGAS2096_Spy0470 MGAS2096_Spy0471     TRUE 0.969 -10.000 0.400 NA   NA
 2013197 2013198 MGAS2096_Spy0471 MGAS2096_Spy0472     TRUE 0.691 13.000 0.000 NA   NA
 2013198 2013199 MGAS2096_Spy0472 MGAS2096_Spy0473     TRUE 0.767 -9.000 0.000 NA   NA
 2013199 2013200 MGAS2096_Spy0473 MGAS2096_Spy0474     TRUE 0.887 43.000 0.429 NA   NA
 2013201 2013202 MGAS2096_Spy0475 MGAS2096_Spy0476     TRUE 0.957 0.000 0.273 NA   NA
 2013202 2013203 MGAS2096_Spy0476 MGAS2096_Spy0477     TRUE 0.520 133.000 0.400 NA   NA
 2013203 2013204 MGAS2096_Spy0477 MGAS2096_Spy0478     FALSE 0.118 105.000 0.000 NA   NA
 2013205 2013206 MGAS2096_Spy0479 MGAS2096_Spy0481     TRUE 0.915 120.000 0.333 0.080 Y NA
 2013209 2013210 MGAS2096_Spy0483 MGAS2096_Spy0484     TRUE 0.993 4.000 0.375 0.019   NA
 2013210 2013211 MGAS2096_Spy0484 MGAS2096_Spy0485   ftsY TRUE 0.977 0.000 0.007 0.082   NA
 2013213 2013214 MGAS2096_Spy0487 MGAS2096_Spy0488 licT   TRUE 0.956 2.000 0.259 1.000   NA
 2013214 2013215 MGAS2096_Spy0488 MGAS2096_Spy0489   bglA TRUE 0.982 19.000 0.318 1.000 Y NA
 2013216 2013217 MGAS2096_Spy0490 MGAS2096_Spy0491     TRUE 0.981 -24.000 0.841 NA   NA
 2013218 2013219 MGAS2096_Spy0492 MGAS2096_Spy0493     FALSE 0.062 185.000 0.000 NA   NA
 2013219 2013220 MGAS2096_Spy0493 MGAS2096_Spy0494     TRUE 0.937 -58.000 0.215 NA   NA
 2013220 2013221 MGAS2096_Spy0494 MGAS2096_Spy0495     TRUE 0.538 64.000 0.051 NA   NA
 2013221 2013222 MGAS2096_Spy0495 MGAS2096_Spy0496   ptsK FALSE 0.220 305.000 0.017 NA Y NA
 2013222 2013223 MGAS2096_Spy0496 MGAS2096_Spy0497 ptsK lgt TRUE 0.974 -3.000 0.494 1.000 N NA
 2013223 2013224 MGAS2096_Spy0497 MGAS2096_Spy0498 lgt   TRUE 0.891 22.000 0.079 NA   NA
 2013224 2013225 MGAS2096_Spy0498 MGAS2096_Spy0499     TRUE 0.947 -28.000 0.206 NA   NA
 2013227 2013228 MGAS2096_Spy0501 MGAS2096_Spy0502     TRUE 0.955 102.000 0.156 0.003 Y NA
 2013231 2013232 MGAS2096_Spy0505 MGAS2096_Spy0506   lysS FALSE 0.100 136.000 0.000 NA   NA
 2013234 2013235 MGAS2096_Spy0508 MGAS2096_Spy0509     FALSE 0.071 341.000 0.018 NA   NA
 2013235 2013236 MGAS2096_Spy0509 MGAS2096_Spy0510     FALSE 0.285 91.000 0.010 NA   NA
 2013236 2013237 MGAS2096_Spy0510 MGAS2096_Spy0511     FALSE 0.117 224.000 0.016 NA   NA
 2013238 2013239 MGAS2096_Spy0512 MGAS2096_Spy0513     TRUE 0.966 -16.000 0.375 NA   NA
 2013240 2013241 MGAS2096_Spy0514 MGAS2096_Spy0515   pepF TRUE 0.904 -52.000 0.059 1.000 N NA
 2013242 2013243 MGAS2096_Spy0516 MGAS2096_Spy0517 ppc ftsW FALSE 0.261 140.000 0.028 1.000 N NA
 2013245 2013246 MGAS2096_Spy0519 MGAS2096_Spy0520     TRUE 0.990 -55.000 0.010 0.002   NA
 2013246 2013247 MGAS2096_Spy0520 MGAS2096_Spy0521   tpi FALSE 0.089 241.000 0.003 1.000 N NA
 2013248 2013249 MGAS2096_Spy0522 MGAS2096_Spy0523   murM TRUE 0.998 -13.000 0.200 0.010 Y NA
 2013249 2013250 MGAS2096_Spy0523 MGAS2096_Spy0524 murM   TRUE 0.976 -15.000 0.500 1.000   NA
 2013250 2013251 MGAS2096_Spy0524 MGAS2096_Spy0525     FALSE 0.089 151.000 0.000 NA   NA
 2013251 2013252 MGAS2096_Spy0525 MGAS2096_Spy0527     FALSE 0.192 72.000 0.000 NA   NA
 2013253 2013254 MGAS2096_Spy0526 MGAS2096_Spy0528   pacL FALSE 0.043 230.000 0.000 NA   NA
 2013255 2013256 MGAS2096_Spy0529 MGAS2096_Spy0530 regR   TRUE 0.836 55.000 0.562 NA   NA
 2013256 2013257 MGAS2096_Spy0530 MGAS2096_Spy0531   agaD TRUE 0.715 69.000 0.375 NA   NA
 2013257 2013258 MGAS2096_Spy0531 MGAS2096_Spy0532 agaD   TRUE 0.998 -73.000 0.933 0.022 Y NA
 2013258 2013259 MGAS2096_Spy0532 MGAS2096_Spy0533   agaV TRUE 0.998 19.000 0.933 0.022 Y NA
 2013259 2013260 MGAS2096_Spy0533 MGAS2096_Spy0534 agaV   TRUE 0.884 36.000 0.200 1.000   NA
 2013260 2013261 MGAS2096_Spy0534 MGAS2096_Spy0535     TRUE 0.939 0.000 0.120 1.000   NA
 2013262 2013263 MGAS2096_Spy0536 MGAS2096_Spy0537 idnO   TRUE 0.918 25.000 0.197 1.000 N NA
 2013263 2013264 MGAS2096_Spy0537 MGAS2096_Spy0538     TRUE 0.979 -10.000 0.094 1.000 Y NA
 2013264 2013265 MGAS2096_Spy0538 MGAS2096_Spy0539   kgdA TRUE 0.982 -13.000 0.167 1.000 Y NA
 2013265 2013266 MGAS2096_Spy0539 MGAS2096_Spy0540 kgdA   FALSE 0.244 291.000 0.000 0.048   NA
 2013266 2013267 MGAS2096_Spy0540 MGAS2096_Spy0541     FALSE 0.021 646.000 0.000 1.000   NA
 2013267 2013268 MGAS2096_Spy0541 MGAS2096_Spy0542   prfB FALSE 0.193 152.000 0.006 1.000 N NA
 2013268 2013269 MGAS2096_Spy0542 MGAS2096_Spy0543 prfB ftsE TRUE 0.900 19.000 0.053 1.000 N NA
 2013269 2013270 MGAS2096_Spy0543 MGAS2096_Spy0544 ftsE ftsX TRUE 0.987 -37.000 0.431 1.000 Y NA
 2013272 2013273 MGAS2096_Spy0546 MGAS2096_Spy0547   dinG FALSE 0.128 108.000 0.000 1.000 N NA
 2013273 2013274 MGAS2096_Spy0547 MGAS2096_Spy0548 dinG aspC FALSE 0.029 335.000 0.000 1.000 N NA
 2013274 2013275 MGAS2096_Spy0548 MGAS2096_Spy0549 aspC asnS TRUE 0.899 21.000 0.068 1.000 N NA
 2013275 2013276 MGAS2096_Spy0549 MGAS2096_Spy0550 asnS   FALSE 0.020 415.000 0.000 NA   NA
 2013276 2013277 MGAS2096_Spy0550 MGAS2096_Spy0551     TRUE 0.955 -3.000 0.214 NA   NA
 2013277 2013278 MGAS2096_Spy0551 MGAS2096_Spy0552     TRUE 0.972 -3.000 0.470 NA   NA
 2013279 2013280 MGAS2096_Spy0553 MGAS2096_Spy0554     FALSE 0.108 121.000 0.000 NA   NA
 2013280 2013281 MGAS2096_Spy0554 MGAS2096_Spy0555     TRUE 0.608 27.000 0.000 NA   NA
 2013282 2013283 MGAS2096_Spy0556 MGAS2096_Spy0557     FALSE 0.214 69.000 0.000 NA   NA
 2013283 2013284 MGAS2096_Spy0557 MGAS2096_Spy0558     TRUE 0.725 2.000 0.000 NA   NA
 2013284 2013285 MGAS2096_Spy0558 MGAS2096_Spy0559     TRUE 0.973 -3.000 0.500 NA   NA
 2013285 2013286 MGAS2096_Spy0559 MGAS2096_Spy0560     TRUE 0.750 -21.000 0.000 NA   NA
 2013286 2013287 MGAS2096_Spy0560 MGAS2096_Spy0561     TRUE 0.699 15.000 0.000 NA   NA
 2013287 2013288 MGAS2096_Spy0561 MGAS2096_Spy0562     FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2013288 2013289 MGAS2096_Spy0562 MGAS2096_Spy0563     TRUE 0.975 2.000 0.708 NA   NA
 2013289 2013290 MGAS2096_Spy0563 MGAS2096_Spy0564     TRUE 0.671 22.000 0.000 NA   NA
 2013290 2013291 MGAS2096_Spy0564 MGAS2096_Spy0565     TRUE 0.760 -15.000 0.000 NA   NA
 2013291 2013292 MGAS2096_Spy0565 MGAS2096_Spy0566     TRUE 0.694 10.000 0.000 NA   NA
 2013292 2013293 MGAS2096_Spy0566 MGAS2096_Spy0567     TRUE 0.936 -10.000 0.111 NA   NA
 2013293 2013294 MGAS2096_Spy0567 MGAS2096_Spy0568     FALSE 0.032 278.000 0.000 NA   NA
 2013294 2013295 MGAS2096_Spy0568 MGAS2096_Spy0569     TRUE 0.894 -25.000 0.018 NA   NA
 2013295 2013296 MGAS2096_Spy0569 MGAS2096_Spy0570     TRUE 0.914 -3.000 0.037 NA   NA
 2013296 2013297 MGAS2096_Spy0570 MGAS2096_Spy0571     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 2013297 2013298 MGAS2096_Spy0571 MGAS2096_Spy0572     TRUE 0.689 -64.000 0.000 NA   NA
 2013298 2013299 MGAS2096_Spy0572 MGAS2096_Spy0573     FALSE 0.034 273.000 0.000 NA   NA
 2013299 2013300 MGAS2096_Spy0573 MGAS2096_Spy0574     FALSE 0.028 310.000 0.000 NA   NA
 2013300 2013301 MGAS2096_Spy0574 MGAS2096_Spy0575     FALSE 0.107 343.000 0.118 NA   NA
 2013301 2013302 MGAS2096_Spy0575 MGAS2096_Spy0576     TRUE 0.505 83.000 0.182 NA   NA
 2013302 2013303 MGAS2096_Spy0576 MGAS2096_Spy0577     TRUE 0.927 14.000 0.167 NA   NA
 2013303 2013304 MGAS2096_Spy0577 MGAS2096_Spy0578     TRUE 0.965 5.000 0.567 NA   NA
 2013304 2013305 MGAS2096_Spy0578 MGAS2096_Spy0579     TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2013305 2013306 MGAS2096_Spy0579 MGAS2096_Spy0580     FALSE 0.140 87.000 0.000 NA   NA
 2013306 2013307 MGAS2096_Spy0580 MGAS2096_Spy0581     FALSE 0.106 126.000 0.000 NA   NA
 2013307 2013308 MGAS2096_Spy0581 MGAS2096_Spy0582     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 2013308 2013309 MGAS2096_Spy0582 MGAS2096_Spy0583     FALSE 0.299 54.000 0.000 NA   NA
 2013309 2013310 MGAS2096_Spy0583 MGAS2096_Spy0584     TRUE 0.957 -37.000 0.333 NA   NA
 2013310 2013311 MGAS2096_Spy0584 MGAS2096_Spy0585     TRUE 0.968 0.000 0.438 NA   NA
 2013311 2013312 MGAS2096_Spy0585 MGAS2096_Spy0586     TRUE 0.951 -3.000 0.188 NA   NA
 2013312 2013313 MGAS2096_Spy0586 MGAS2096_Spy0587     TRUE 0.984 0.000 1.000 NA   NA
 2013313 2013314 MGAS2096_Spy0587 MGAS2096_Spy0588     TRUE 0.903 53.000 1.000 NA   NA
 2013314 2013315 MGAS2096_Spy0588 MGAS2096_Spy0589     TRUE 0.922 4.000 0.150 NA   NA
 2013315 2013316 MGAS2096_Spy0589 MGAS2096_Spy0590     TRUE 0.730 -31.000 0.000 NA   NA
 2013316 2013317 MGAS2096_Spy0590 MGAS2096_Spy0591     TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2013317 2013318 MGAS2096_Spy0591 MGAS2096_Spy0592     TRUE 0.953 -3.000 0.200 NA   NA
 2013318 2013319 MGAS2096_Spy0592 MGAS2096_Spy0593     TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2013319 2013320 MGAS2096_Spy0593 MGAS2096_Spy0594     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 2013320 2013321 MGAS2096_Spy0594 MGAS2096_Spy0595     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 2013321 2013322 MGAS2096_Spy0595 MGAS2096_Spy0596     TRUE 0.691 9.000 0.000 NA   NA
 2013322 2013323 MGAS2096_Spy0596 MGAS2096_Spy0597     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 2013323 2013324 MGAS2096_Spy0597 MGAS2096_Spy0598     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 2013324 2013325 MGAS2096_Spy0598 MGAS2096_Spy0599     TRUE 0.979 -3.000 0.667 NA   NA
 2013325 2013326 MGAS2096_Spy0599 MGAS2096_Spy0600     FALSE 0.112 111.000 0.000 NA   NA
 2013327 2013328 MGAS2096_Spy0601 MGAS2096_Spy0602 speA2 spd3 FALSE 0.139 111.000 0.000 1.000   NA
 2013329 2013330 MGAS2096_Spy0603 MGAS2096_Spy0604 pepD   FALSE 0.419 152.000 0.250 1.000 N NA
 2013330 2013331 MGAS2096_Spy0604 MGAS2096_Spy0605     FALSE 0.324 139.000 0.091 1.000 N NA
 2013331 2013332 MGAS2096_Spy0605 MGAS2096_Spy0606   agaS TRUE 0.933 20.000 0.178 1.000 N NA
 2013333 2013334 MGAS2096_Spy0607 MGAS2096_Spy0608 rpmE   FALSE 0.297 115.000 0.020 1.000   NA
 2013335 2013336 MGAS2096_Spy0609 MGAS2096_Spy0610     FALSE 0.307 175.000 0.167 1.000 N NA
 2013336 2013337 MGAS2096_Spy0610 MGAS2096_Spy0611     TRUE 0.932 -19.000 0.094 1.000 N NA
 2013337 2013338 MGAS2096_Spy0611 MGAS2096_Spy0612   rplS FALSE 0.234 115.000 0.006 1.000 N NA
 2013338 1625539 MGAS2096_Spy0612 MGAS2096_SPYR02270 rplS   FALSE 0.039 247.000 0.000 NA   NA
 2013340 2013341 MGAS2096_Spy0614 MGAS2096_Spy0615   gyrB TRUE 0.899 1.000 0.013 1.000   NA
 2013341 2013342 MGAS2096_Spy0615 MGAS2096_Spy0616 gyrB   FALSE 0.057 392.000 0.011 1.000 N NA
 2013345 2013346 MGAS2096_Spy0619 MGAS2096_Spy0620     FALSE 0.141 86.000 0.000 NA   NA
 2013346 2013347 MGAS2096_Spy0620 MGAS2096_Spy0621     FALSE 0.023 362.000 0.000 NA   NA
 2013348 2013349 MGAS2096_Spy0622 MGAS2096_Spy0623 epf sagA FALSE 0.016 864.000 0.000 NA   NA
 2013349 2013350 MGAS2096_Spy0623 MGAS2096_Spy0624 sagA sagB FALSE 0.045 222.000 0.000 NA   NA
 2013350 2013351 MGAS2096_Spy0624 MGAS2096_Spy0625 sagB sagC TRUE 0.953 -3.000 0.200 NA   NA
 2013351 2013352 MGAS2096_Spy0625 MGAS2096_Spy0626 sagC sagD TRUE 0.949 20.000 0.318 NA   NA
 2013352 2013353 MGAS2096_Spy0626 MGAS2096_Spy0627 sagD sagE TRUE 0.933 -25.000 0.136 NA   NA
 2013353 2013354 MGAS2096_Spy0627 MGAS2096_Spy0628 sagE sagF TRUE 0.981 -3.000 0.750 NA   NA
 2013354 2013355 MGAS2096_Spy0628 MGAS2096_Spy0629 sagF sagG TRUE 0.968 23.000 0.750 NA   NA
 2013355 2013356 MGAS2096_Spy0629 MGAS2096_Spy0630 sagG sagH TRUE 0.964 9.000 0.500 1.000 N NA
 2013356 2013357 MGAS2096_Spy0630 MGAS2096_Spy0631 sagH sagI TRUE 0.997 -3.000 0.160 0.008 Y NA
 2013359 2013360 MGAS2096_Spy0633 MGAS2096_Spy0634     FALSE 0.032 278.000 0.000 NA   NA
 2013360 2013361 MGAS2096_Spy0634 MGAS2096_Spy0635   lig FALSE 0.135 194.000 0.010 NA   NA
 2013361 2013362 MGAS2096_Spy0635 MGAS2096_Spy0636 lig   TRUE 0.870 14.000 0.013 1.000 N NA
 2013362 2013363 MGAS2096_Spy0636 MGAS2096_Spy0637   atpE FALSE 0.027 392.000 0.000 1.000   NA
 2013363 2013364 MGAS2096_Spy0637 MGAS2096_Spy0638 atpE atpB TRUE 0.984 35.000 0.189 0.010   NA
 2013364 2013365 MGAS2096_Spy0638 MGAS2096_Spy0639 atpB atpF TRUE 0.995 18.000 0.032 0.010 Y NA
 2013365 2013366 MGAS2096_Spy0639 MGAS2096_Spy0640 atpF atpH TRUE 0.998 0.000 0.222 0.008 Y NA
 2013366 2013367 MGAS2096_Spy0640 MGAS2096_Spy0641 atpH atpA TRUE 0.999 16.000 0.864 0.008 Y NA
 2013367 2013368 MGAS2096_Spy0641 MGAS2096_Spy0642 atpA atpG TRUE 0.999 16.000 0.846 0.008 Y NA
 2013368 2013369 MGAS2096_Spy0642 MGAS2096_Spy0643 atpG atpD TRUE 0.961 162.000 0.724 0.008 Y NA
 2013369 2013370 MGAS2096_Spy0643 MGAS2096_Spy0644 atpD atpC TRUE 0.999 13.000 0.837 0.008 Y NA
 2013370 2013371 MGAS2096_Spy0644 MGAS2096_Spy0645 atpC   FALSE 0.108 266.000 0.039 NA   NA
 2013371 2013372 MGAS2096_Spy0645 MGAS2096_Spy0646   murA TRUE 0.705 65.000 0.279 NA   NA
 2013372 2013373 MGAS2096_Spy0646 MGAS2096_Spy0647 murA epuA TRUE 0.911 4.000 0.110 NA   NA
 2013373 2013374 MGAS2096_Spy0647 MGAS2096_Spy0648 epuA endA TRUE 0.883 36.000 0.237 NA   NA
 2013374 2013375 MGAS2096_Spy0648 MGAS2096_Spy0649 endA pheS FALSE 0.041 283.000 0.000 1.000   NA
 2013375 2013376 MGAS2096_Spy0649 MGAS2096_Spy0650 pheS pheT TRUE 0.962 195.000 0.574 0.001 Y NA
 2013376 2013377 MGAS2096_Spy0650 MGAS2096_Spy0651 pheT   FALSE 0.330 74.000 0.002 1.000 N NA
 2013377 2013378 MGAS2096_Spy0651 MGAS2096_Spy0652     TRUE 0.883 -7.000 0.006 NA   NA
 2013378 2013379 MGAS2096_Spy0652 MGAS2096_Spy0653     FALSE 0.185 73.000 0.000 NA   NA
 2013379 2013380 MGAS2096_Spy0653 MGAS2096_Spy0654     FALSE 0.113 110.000 0.000 NA   NA
 2013380 2013381 MGAS2096_Spy0654 MGAS2096_Spy0655     TRUE 0.740 7.000 0.000 1.000   NA
 2013383 2013384 MGAS2096_Spy0657 MGAS2096_Spy0658 rexB rexA TRUE 0.992 -39.000 0.070 0.076 Y NA
 2013384 2013385 MGAS2096_Spy0658 MGAS2096_Spy0659 rexA   TRUE 0.991 3.000 0.030 0.003   NA
 2013385 2013386 MGAS2096_Spy0659 MGAS2096_Spy0660     FALSE 0.136 116.000 0.000 1.000   NA
 2013386 2013387 MGAS2096_Spy0660 MGAS2096_Spy0661   rpsU FALSE 0.273 141.000 0.027 1.000   NA
 2013389 2013390 MGAS2096_Spy0663 MGAS2096_Spy0664 dnaG rpoD TRUE 0.938 9.000 0.209 1.000 N NA
 2013390 2013391 MGAS2096_Spy0664 MGAS2096_Spy0665 rpoD   FALSE 0.130 236.000 0.044 NA   NA
 2013391 2013392 MGAS2096_Spy0665 MGAS2096_Spy0666   rmlD TRUE 0.516 78.000 0.152 NA   NA
 2013392 2013393 MGAS2096_Spy0666 MGAS2096_Spy0667 rmlD   TRUE 0.709 -48.000 0.000 NA   NA
 2013393 2013394 MGAS2096_Spy0667 MGAS2096_Spy0668   rgpAc FALSE 0.371 48.000 0.000 NA   NA
 2013394 2013395 MGAS2096_Spy0668 MGAS2096_Spy0669 rgpAc rgpBc TRUE 0.962 -10.000 0.289 NA   NA
 2013395 2013396 MGAS2096_Spy0669 MGAS2096_Spy0670 rgpBc rgpCc TRUE 0.950 3.000 0.289 NA   NA
 2013396 2013397 MGAS2096_Spy0670 MGAS2096_Spy0671 rgpCc rgpDc TRUE 0.770 0.000 0.000 1.000 N NA
 2013397 2013398 MGAS2096_Spy0671 MGAS2096_Spy0672 rgpDc rgpEc TRUE 0.632 25.000 0.000 NA   NA
 2013398 2013399 MGAS2096_Spy0672 MGAS2096_Spy0673 rgpEc rgpFc TRUE 0.968 -3.000 0.385 NA   NA
 2013399 2013400 MGAS2096_Spy0673 MGAS2096_Spy0674 rgpFc   TRUE 0.943 -3.000 0.000 NA Y NA
 2013400 2013401 MGAS2096_Spy0674 MGAS2096_Spy0675     FALSE 0.268 179.000 0.000 NA Y NA
 2013401 2013402 MGAS2096_Spy0675 MGAS2096_Spy0676     TRUE 0.970 2.000 0.568 NA   NA
 2013402 2013403 MGAS2096_Spy0676 MGAS2096_Spy0677   amrA TRUE 0.911 -7.000 0.027 NA   NA
 2013403 2013404 MGAS2096_Spy0677 MGAS2096_Spy0678 amrA   TRUE 0.947 -19.000 0.182 NA   NA
 2013404 2013405 MGAS2096_Spy0678 MGAS2096_Spy0679   pepT FALSE 0.150 82.000 0.000 NA   NA
 2013405 2013406 MGAS2096_Spy0679 MGAS2096_Spy0680 pepT ebsA TRUE 0.750 41.000 0.051 NA   NA
 2013408 2013409 MGAS2096_Spy0682 MGAS2096_Spy0683   cmk TRUE 0.877 15.000 0.012 1.000   NA
 2013409 2013410 MGAS2096_Spy0683 MGAS2096_Spy0684 cmk infC FALSE 0.190 162.000 0.010 1.000 N NA
 2013410 2013411 MGAS2096_Spy0684 MGAS2096_Spy0685 infC rpl36 TRUE 0.970 42.000 0.652 1.000 Y NA
 2013411 2013412 MGAS2096_Spy0685 MGAS2096_Spy0686 rpl36 rplT TRUE 0.990 59.000 0.928 0.027 Y NA
 2013414 2013415 MGAS2096_Spy0688 MGAS2096_Spy0689   aroD TRUE 0.945 -3.000 0.125 1.000   NA
 2013415 2013416 MGAS2096_Spy0689 MGAS2096_Spy0690 aroD aroF TRUE 0.928 94.000 0.004 0.003 Y NA
 2013416 2013417 MGAS2096_Spy0690 MGAS2096_Spy0691 aroF   FALSE 0.443 61.000 0.005 NA   NA
 2013417 2013418 MGAS2096_Spy0691 MGAS2096_Spy0692   gor FALSE 0.115 212.000 0.010 NA   NA
 2013419 2013420 MGAS2096_Spy0693 MGAS2096_Spy0694 folC2   TRUE 0.946 6.000 0.308 NA   NA
 2013421 2013422 MGAS2096_Spy0695 MGAS2096_Spy0696 nifS1 thiI TRUE 0.954 12.000 0.349 1.000 N NA
 2013422 2013423 MGAS2096_Spy0696 MGAS2096_Spy0697 thiI capA TRUE 0.717 38.000 0.014 NA N NA
 2013423 2013424 MGAS2096_Spy0697 MGAS2096_Spy0698 capA   TRUE 0.908 -3.000 0.026 NA   NA
 2013424 2013425 MGAS2096_Spy0698 MGAS2096_Spy0699   rplU FALSE 0.049 214.000 0.000 NA   NA
 2013425 2013426 MGAS2096_Spy0699 MGAS2096_Spy0700 rplU   TRUE 0.975 12.000 0.208 NA Y NA
 2013426 2013427 MGAS2096_Spy0700 MGAS2096_Spy0701   rpmA TRUE 0.963 28.000 0.203 NA Y NA
 2013427 2013428 MGAS2096_Spy0701 MGAS2096_Spy0702 rpmA   FALSE 0.028 348.000 0.000 1.000 N NA
 2013428 2013429 MGAS2096_Spy0702 MGAS2096_Spy0703   lsp TRUE 0.940 -3.000 0.119 1.000 N NA
 2013429 2013430 MGAS2096_Spy0703 MGAS2096_Spy0704 lsp   TRUE 0.932 -10.000 0.056 1.000   NA
 2013430 2013431 MGAS2096_Spy0704 MGAS2096_Spy0705     TRUE 0.982 24.000 0.002 0.006   NA
 2013431 2013432 MGAS2096_Spy0705 MGAS2096_Spy0706   pyrR FALSE 0.073 396.000 0.048 1.000 N NA
 2013432 2013433 MGAS2096_Spy0706 MGAS2096_Spy0707 pyrR pyrP TRUE 0.974 16.000 0.140 1.000 Y NA
 2013433 2013434 MGAS2096_Spy0707 MGAS2096_Spy0708 pyrP pyrB TRUE 0.966 7.000 0.064 1.000 Y NA
 2013434 2013435 MGAS2096_Spy0708 MGAS2096_Spy0709 pyrB carA TRUE 0.884 44.000 0.014 1.000 Y NA
 2013435 2013436 MGAS2096_Spy0709 MGAS2096_Spy0710 carA   TRUE 0.737 -28.000 0.000 NA   NA
 2013436 2013437 MGAS2096_Spy0710 MGAS2096_Spy0711   carB FALSE 0.173 77.000 0.000 NA   NA
 2013437 2013438 MGAS2096_Spy0711 MGAS2096_Spy0712 carB   FALSE 0.144 206.000 0.017 1.000 N NA
 2013438 2013439 MGAS2096_Spy0712 MGAS2096_Spy0713     TRUE 0.984 0.000 0.923 1.000 N NA
 2013439 2013440 MGAS2096_Spy0713 MGAS2096_Spy0714     TRUE 0.992 12.000 0.923 1.000 Y NA
 2013440 2013441 MGAS2096_Spy0714 MGAS2096_Spy0715     FALSE 0.055 212.000 0.000 1.000 N NA
 2013441 2013442 MGAS2096_Spy0715 MGAS2096_Spy0716   rpsP FALSE 0.212 127.000 0.003 1.000 N NA
 2013442 2013443 MGAS2096_Spy0716 MGAS2096_Spy0717 rpsP   TRUE 0.960 10.000 0.385 1.000   NA
 2013443 2013444 MGAS2096_Spy0717 MGAS2096_Spy0718     TRUE 0.691 9.000 0.000 NA   NA
 2013444 2013445 MGAS2096_Spy0718 MGAS2096_Spy0719     FALSE 0.016 816.000 0.000 NA   NA
 2013445 2013446 MGAS2096_Spy0719 MGAS2096_Spy0720     TRUE 0.941 20.000 0.200 1.000   NA
 2013448 2013449 MGAS2096_Spy0722 MGAS2096_Spy0723     FALSE 0.061 215.000 0.000 1.000   NA
 2013449 2013450 MGAS2096_Spy0723 MGAS2096_Spy0724   rimM TRUE 0.990 -45.000 0.008 0.003   NA
 2013450 2013451 MGAS2096_Spy0724 MGAS2096_Spy0725 rimM trmD TRUE 0.981 -10.000 0.672 1.000   NA
 2013451 2013452 MGAS2096_Spy0725 MGAS2096_Spy0726 trmD   TRUE 0.994 -16.000 0.007 0.001   NA
 2013452 2013453 MGAS2096_Spy0726 MGAS2096_Spy0727   trxB TRUE 0.862 12.000 0.007 1.000   NA
 2013453 2013454 MGAS2096_Spy0727 MGAS2096_Spy0728 trxB   FALSE 0.216 176.000 0.059 NA   NA
 2013454 2013455 MGAS2096_Spy0728 MGAS2096_Spy0729   apbA TRUE 0.950 13.000 0.333 NA   NA
 2013455 2013456 MGAS2096_Spy0729 MGAS2096_Spy0730 apbA fruR FALSE 0.042 256.000 0.000 1.000 N NA
 2013456 2013457 MGAS2096_Spy0730 MGAS2096_Spy0731 fruR fruB TRUE 0.982 -3.000 0.721 1.000   NA
 2013457 2013458 MGAS2096_Spy0731 MGAS2096_Spy0732 fruB   TRUE 0.995 -19.000 0.022 0.001   NA
 2013458 2013459 MGAS2096_Spy0732 MGAS2096_Spy0733   fruA TRUE 0.984 -3.000 0.816 1.000   NA
 2013459 2013460 MGAS2096_Spy0733 MGAS2096_Spy0734 fruA mur1-1 FALSE 0.328 93.000 0.022 1.000 N NA
 2013460 2013461 MGAS2096_Spy0734 MGAS2096_Spy0735 mur1-1 mur1-2 TRUE 0.959 152.000 0.333 0.002 Y NA
 2013462 2013463 MGAS2096_Spy0736 MGAS2096_Spy0737     FALSE 0.052 203.000 0.000 NA   NA
 2013463 2013464 MGAS2096_Spy0737 MGAS2096_Spy0738     TRUE 0.742 -25.000 0.000 NA   NA
 2013464 2013465 MGAS2096_Spy0738 MGAS2096_Spy0739   mac FALSE 0.071 173.000 0.000 NA   NA
 2013466 2013467 MGAS2096_Spy0740 MGAS2096_Spy0741     FALSE 0.044 225.000 0.000 NA   NA
 2013467 2013468 MGAS2096_Spy0741 MGAS2096_Spy0742     FALSE 0.055 228.000 0.000 1.000   NA
 2013468 2013469 MGAS2096_Spy0742 MGAS2096_Spy0743     TRUE 0.935 0.000 0.139 NA   NA
 2013469 2013470 MGAS2096_Spy0743 MGAS2096_Spy0744   papS FALSE 0.227 125.000 0.009 NA   NA
 2013470 2013471 MGAS2096_Spy0744 MGAS2096_Spy0745 papS   TRUE 0.931 -3.000 0.056 1.000   NA
 2013471 2013472 MGAS2096_Spy0745 MGAS2096_Spy0746     FALSE 0.021 397.000 0.000 NA   NA
 2013472 2013473 MGAS2096_Spy0746 MGAS2096_Spy0747     TRUE 0.673 -106.000 0.000 NA   NA
 2013473 2013474 MGAS2096_Spy0747 MGAS2096_Spy0748   fms FALSE 0.038 256.000 0.000 NA   NA
 2013476 2013477 MGAS2096_Spy0750 MGAS2096_Spy0751   sptR TRUE 0.978 3.000 0.800 1.000   NA
 2013477 2013478 MGAS2096_Spy0751 MGAS2096_Spy0752 sptR sptS TRUE 0.990 -18.000 0.533 1.000 Y NA
 2013478 2013479 MGAS2096_Spy0752 MGAS2096_Spy0753 sptS mvaK1 FALSE 0.033 304.000 0.000 1.000 N NA
 2013479 2013480 MGAS2096_Spy0753 MGAS2096_Spy0754 mvaK1 mvaD TRUE 0.998 -18.000 0.281 0.003 Y NA
 2013480 2013481 MGAS2096_Spy0754 MGAS2096_Spy0755 mvaD mvaK2 TRUE 0.998 -55.000 0.312 0.005 Y NA
 2013481 2013482 MGAS2096_Spy0755 MGAS2096_Spy0756 mvaK2   TRUE 0.904 -103.000 0.097 1.000 N NA
 2013482 2013483 MGAS2096_Spy0756 MGAS2096_Spy0757     FALSE 0.097 163.000 0.000 1.000   NA
 2013484 2013485 MGAS2096_Spy0758 MGAS2096_Spy0759   mvaS1 TRUE 0.983 -13.000 0.183 1.000 Y NA
 2013486 2013487 MGAS2096_Spy0760 MGAS2096_Spy0761 thyA dyr TRUE 0.611 80.000 0.295 1.000 N NA
 2013487 2013488 MGAS2096_Spy0761 MGAS2096_Spy0762 dyr   TRUE 0.877 20.000 0.030 NA   NA
 2013488 2013489 MGAS2096_Spy0762 MGAS2096_Spy0763   clpX FALSE 0.235 130.000 0.012 NA   NA
 2013489 2013490 MGAS2096_Spy0763 MGAS2096_Spy0764 clpX   TRUE 0.899 10.000 0.043 1.000   NA
 2013490 2013491 MGAS2096_Spy0764 MGAS2096_Spy0765     FALSE 0.178 148.000 0.004 NA   NA
 2013493 2013494 MGAS2096_Spy0767 MGAS2096_Spy0768 rpiA deoB TRUE 0.689 77.000 0.018 1.000 Y NA
 2013494 2013495 MGAS2096_Spy0768 MGAS2096_Spy0769 deoB arsC TRUE 0.913 13.000 0.108 1.000 N NA
 2013495 2013496 MGAS2096_Spy0769 MGAS2096_Spy0770 arsC punA TRUE 0.936 -16.000 0.108 1.000 N NA
 2013496 2013497 MGAS2096_Spy0770 MGAS2096_Spy0771 punA deoD2 TRUE 0.715 663.000 0.040 0.001 Y NA
 2013497 2013498 MGAS2096_Spy0771 MGAS2096_Spy0772 deoD2 cpsX TRUE 0.933 -13.000 0.107 NA   NA
 2013500 2013501 MGAS2096_Spy0774 MGAS2096_Spy0775   pyrF FALSE 0.033 277.000 0.000 NA   NA
 2013501 2013502 MGAS2096_Spy0775 MGAS2096_Spy0776 pyrF pyrE TRUE 0.856 58.000 0.133 1.000 Y NA
 2013502 2013503 MGAS2096_Spy0776 MGAS2096_Spy0777 pyrE amiC FALSE 0.063 197.000 0.000 1.000 N NA
 2013503 2013504 MGAS2096_Spy0777 MGAS2096_Spy0778 amiC   TRUE 0.524 82.000 0.182 1.000 N NA
 2013504 2013505 MGAS2096_Spy0778 MGAS2096_Spy0779     TRUE 0.990 29.000 0.125 0.037 Y NA
 2013505 2013506 MGAS2096_Spy0779 MGAS2096_Spy0780   ung FALSE 0.270 133.000 0.025 1.000 N NA
 2013506 2013507 MGAS2096_Spy0780 MGAS2096_Spy0781 ung pyrC FALSE 0.236 132.000 0.009 1.000 N NA
 2013509 2013510 MGAS2096_Spy0783 MGAS2096_Spy0784 parE parC TRUE 0.982 85.000 0.552 0.002 Y NA
 2013510 2013511 MGAS2096_Spy0784 MGAS2096_Spy0785 parC bcaT FALSE 0.472 78.000 0.086 1.000 N NA
 2013511 2013512 MGAS2096_Spy0785 MGAS2096_Spy0786 bcaT   TRUE 0.503 72.000 0.095 NA   NA
 2013512 1625714 MGAS2096_Spy0786 MGAS2096_SPYR02271     FALSE 0.214 69.000 0.000 NA   NA
 1625714 1625715 MGAS2096_SPYR02271 MGAS2096_SPYR02272     FALSE 0.323 52.000 0.000 NA   NA
 1625715 2013513 MGAS2096_SPYR02272 MGAS2096_Spy0787     FALSE 0.107 124.000 0.000 NA   NA
 2013513 1625717 MGAS2096_Spy0787 MGAS2096_SPYR02273     FALSE 0.110 113.000 0.000 NA   NA
 2013515 2013516 MGAS2096_Spy0789 MGAS2096_Spy0790     FALSE 0.201 71.000 0.000 NA   NA
 2013516 2013517 MGAS2096_Spy0790 MGAS2096_Spy0791     FALSE 0.102 133.000 0.000 NA   NA
 2013517 2013518 MGAS2096_Spy0791 MGAS2096_Spy0792     FALSE 0.112 300.000 0.056 1.000   NA
 2013520 2013521 MGAS2096_Spy0794 MGAS2096_Spy0795 miaA hflX TRUE 0.563 61.000 0.027 1.000   NA
 2013521 2013522 MGAS2096_Spy0795 MGAS2096_Spy0796 hflX   TRUE 0.908 -19.000 0.014 1.000   NA
 2013522 2013523 MGAS2096_Spy0796 MGAS2096_Spy0797   elaC TRUE 0.890 15.000 0.022 1.000   NA
 2013523 2013524 MGAS2096_Spy0797 MGAS2096_Spy0798 elaC   TRUE 0.931 0.000 0.074 1.000   NA
 2013524 2013525 MGAS2096_Spy0798 MGAS2096_Spy0799   recJ TRUE 0.914 -3.000 0.016 1.000   NA
 2013525 2013526 MGAS2096_Spy0799 MGAS2096_Spy0800 recJ apt FALSE 0.329 151.000 0.128 1.000 N NA
 2013526 2013527 MGAS2096_Spy0800 MGAS2096_Spy0801 apt dnaD FALSE 0.270 81.000 0.005 NA N NA
 2013527 2013528 MGAS2096_Spy0801 MGAS2096_Spy0802 dnaD nth TRUE 0.964 -3.000 0.007 NA Y NA
 2013528 2013529 MGAS2096_Spy0802 MGAS2096_Spy0803 nth   FALSE 0.356 72.000 0.006 NA   NA
 2013529 2013530 MGAS2096_Spy0803 MGAS2096_Spy0804     TRUE 0.960 -16.000 0.283 NA   NA
 2013530 2013531 MGAS2096_Spy0804 MGAS2096_Spy0805     FALSE 0.278 89.000 0.008 NA   NA
 2013531 2013532 MGAS2096_Spy0805 MGAS2096_Spy0806     TRUE 0.843 -66.000 0.008 NA   NA
 2013532 2013533 MGAS2096_Spy0806 MGAS2096_Spy0807     TRUE 0.777 35.000 0.021 NA   NA
 2013533 2013534 MGAS2096_Spy0807 MGAS2096_Spy0808   cpsFO TRUE 0.605 58.000 0.059 1.000 N NA
 2013534 2013535 MGAS2096_Spy0808 MGAS2096_Spy0809 cpsFO   TRUE 0.945 0.000 0.149 1.000   NA
 2013535 2013536 MGAS2096_Spy0809 MGAS2096_Spy0810   cpsFP TRUE 0.987 -67.000 0.000 0.001   NA
 2013536 2013537 MGAS2096_Spy0810 MGAS2096_Spy0811 cpsFP cpsFQ TRUE 0.518 244.000 0.350 1.000 Y NA
 2013537 2013538 MGAS2096_Spy0811 MGAS2096_Spy0812 cpsFQ   FALSE 0.052 221.000 0.000 1.000 N NA
 2013538 2013539 MGAS2096_Spy0812 MGAS2096_Spy0813     TRUE 0.605 58.000 0.074 NA   NA
 2013539 2013540 MGAS2096_Spy0813 MGAS2096_Spy0814     TRUE 0.958 -28.000 0.324 NA   NA
 2013542 2013543 MGAS2096_Spy0816 MGAS2096_Spy0817     FALSE 0.064 182.000 0.000 NA   NA
 2013543 2013544 MGAS2096_Spy0817 MGAS2096_Spy0818     FALSE 0.195 333.000 0.368 NA   NA
 2013544 2013545 MGAS2096_Spy0818 MGAS2096_Spy0819     TRUE 0.986 -3.000 0.895 1.000   NA
 2013545 2013546 MGAS2096_Spy0819 MGAS2096_Spy0820     FALSE 0.162 204.000 0.026 1.000   NA
 2013546 2013547 MGAS2096_Spy0820 MGAS2096_Spy0821   estA FALSE 0.361 133.000 0.143 NA   NA
 2013547 2013548 MGAS2096_Spy0821 MGAS2096_Spy0822 estA   FALSE 0.340 150.000 0.150 NA   NA
 2013548 2013549 MGAS2096_Spy0822 MGAS2096_Spy0823     TRUE 0.676 46.000 0.029 NA   NA
 2013549 2013550 MGAS2096_Spy0823 MGAS2096_Spy0824   acoA FALSE 0.042 275.000 0.000 1.000   NA
 2013550 2013551 MGAS2096_Spy0824 MGAS2096_Spy0825 acoA acoB TRUE 0.995 56.000 0.769 0.001 Y NA
 2013551 2013552 MGAS2096_Spy0825 MGAS2096_Spy0826 acoB acoC TRUE 0.784 185.000 0.077 0.045 Y NA
 2013555 2013556 MGAS2096_Spy0829 MGAS2096_Spy0830   hylA FALSE 0.019 431.000 0.000 NA   NA
 2013556 2013557 MGAS2096_Spy0830 MGAS2096_Spy0831 hylA   TRUE 0.964 72.000 0.250 0.001   NA
 2013559 2013560 MGAS2096_Spy0833 MGAS2096_Spy0834     TRUE 0.982 0.000 0.796 1.000   NA
 2013561 2013562 MGAS2096_Spy0835 MGAS2096_Spy0836     TRUE 0.974 -3.000 0.502 NA   NA
 2013562 2013563 MGAS2096_Spy0836 MGAS2096_Spy0837   femD TRUE 0.689 54.000 0.150 NA   NA
 2013563 2013564 MGAS2096_Spy0837 MGAS2096_Spy0838 femD   FALSE 0.200 124.000 0.003 NA   NA
 2013564 2013565 MGAS2096_Spy0838 MGAS2096_Spy0839   hemN TRUE 0.889 -33.000 0.021 NA   NA
 2013565 2013566 MGAS2096_Spy0839 MGAS2096_Spy0840 hemN   TRUE 0.901 10.000 0.060 1.000 N NA
 2013566 2013567 MGAS2096_Spy0840 MGAS2096_Spy0841     TRUE 0.919 0.000 0.055 1.000 N NA
 2013567 2013568 MGAS2096_Spy0841 MGAS2096_Spy0842     TRUE 0.964 -12.000 0.330 NA   NA
 2013568 2013569 MGAS2096_Spy0842 MGAS2096_Spy0843     FALSE 0.019 445.000 0.000 NA   NA
 2013569 2013570 MGAS2096_Spy0843 MGAS2096_Spy0844     TRUE 0.973 0.000 0.546 NA   NA
 2013570 2013571 MGAS2096_Spy0844 MGAS2096_Spy0845     TRUE 0.984 -3.000 0.876 NA   NA
 2013571 2013572 MGAS2096_Spy0845 MGAS2096_Spy0846     TRUE 0.939 -76.000 0.253 NA   NA
 2013572 2013573 MGAS2096_Spy0846 MGAS2096_Spy0847     FALSE 0.020 402.000 0.000 NA   NA
 11477485 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 7909.000 0.000 NA   NA
 11619848 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 7909.000 0.000 NA   NA
 11762240 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 7909.000 0.000 NA   NA
 11477486 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 7938.000 0.000 NA   NA
 11619849 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 7938.000 0.000 NA   NA
 11762241 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 7938.000 0.000 NA   NA
 11477487 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 7976.000 0.000 NA   NA
 11619850 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 7976.000 0.000 NA   NA
 11762242 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 7976.000 0.000 NA   NA
 11477488 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 8005.000 0.000 NA   NA
 11619851 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 8005.000 0.000 NA   NA
 11762243 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 8005.000 0.000 NA   NA
 11477489 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 8042.000 0.000 NA   NA
 11619852 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 8042.000 0.000 NA   NA
 11762244 2013566   MGAS2096_Spy0840     FALSE NA 8042.000 0.000 NA   NA
 2013573 2013574 MGAS2096_Spy0847 MGAS2096_Spy0848     TRUE 0.906 64.000 0.000 0.002   NA
 2013574 2013575 MGAS2096_Spy0848 MGAS2096_Spy0849     TRUE 0.572 37.000 0.000 1.000   NA
 2013575 2013576 MGAS2096_Spy0849 MGAS2096_Spy0850   lepA FALSE 0.083 169.000 0.000 1.000 N NA
 2013576 2013577 MGAS2096_Spy0850 MGAS2096_Spy0851 lepA   FALSE 0.051 245.000 0.000 1.000   NA
 2013577 2013578 MGAS2096_Spy0851 MGAS2096_Spy0852   msrB FALSE 0.077 186.000 0.000 1.000   NA
 2013578 2013579 MGAS2096_Spy0852 MGAS2096_Spy0853 msrB   FALSE 0.130 130.000 0.000 1.000   NA
 2013579 2013580 MGAS2096_Spy0853 MGAS2096_Spy0854     FALSE 0.065 207.000 0.000 1.000   NA
 2013580 2013581 MGAS2096_Spy0854 MGAS2096_Spy0855   ptsB TRUE 0.998 19.000 0.786 0.020 Y NA
 2013581 2013582 MGAS2096_Spy0855 MGAS2096_Spy0856 ptsB ptsC TRUE 0.998 17.000 0.778 0.024 Y NA
 2013582 2013583 MGAS2096_Spy0856 MGAS2096_Spy0857 ptsC ptsD TRUE 0.999 -3.000 0.778 0.024 Y NA
 2013583 2013584 MGAS2096_Spy0857 MGAS2096_Spy0858 ptsD   TRUE 0.772 136.000 0.222 0.056 N NA
 2013584 2013585 MGAS2096_Spy0858 MGAS2096_Spy0859     TRUE 0.998 4.000 0.500 0.013 Y NA
 2013585 2013586 MGAS2096_Spy0859 MGAS2096_Spy0860     TRUE 0.978 -6.000 0.571 1.000 N NA
 2013586 2013587 MGAS2096_Spy0860 MGAS2096_Spy0861   gabD FALSE 0.124 112.000 0.000 1.000 N NA
 2013587 2013588 MGAS2096_Spy0861 MGAS2096_Spy0862 gabD uvrC FALSE 0.135 102.000 0.000 1.000 N NA
 2013588 2013589 MGAS2096_Spy0862 MGAS2096_Spy0863 uvrC   FALSE 0.137 184.000 0.004 1.000 N NA
 2013589 2013590 MGAS2096_Spy0863 MGAS2096_Spy0864     FALSE 0.422 125.000 0.179 1.000 N NA
 2013591 2013592 MGAS2096_Spy0865 MGAS2096_Spy0866 thdF   TRUE 0.928 -55.000 0.167 NA   NA
 2013593 2013594 MGAS2096_Spy0867 MGAS2096_Spy0868 rplJ rplL TRUE 0.993 50.000 0.884 0.026 Y NA
 2013594 2013595 MGAS2096_Spy0868 MGAS2096_Spy0869 rplL   FALSE 0.024 356.000 0.000 NA   NA
 2013595 2013596 MGAS2096_Spy0869 MGAS2096_Spy0870     TRUE 0.768 -6.000 0.000 NA   NA
 2013596 2013597 MGAS2096_Spy0870 MGAS2096_Spy0871     TRUE 0.750 -21.000 0.000 NA   NA
 2013597 2013598 MGAS2096_Spy0871 MGAS2096_Spy0872     FALSE 0.346 50.000 0.000 NA   NA
 2013598 2013599 MGAS2096_Spy0872 MGAS2096_Spy0873     FALSE 0.278 58.000 0.000 NA   NA
 2013599 2013600 MGAS2096_Spy0873 MGAS2096_Spy0874     FALSE 0.440 43.000 0.000 NA   NA
 2013600 2013601 MGAS2096_Spy0874 MGAS2096_Spy0875     FALSE 0.036 265.000 0.000 NA   NA
 2013601 2013602 MGAS2096_Spy0875 MGAS2096_Spy0876   srtI FALSE 0.214 69.000 0.000 NA   NA
 2013602 2013603 MGAS2096_Spy0876 MGAS2096_Spy0877 srtI srtR FALSE 0.089 151.000 0.000 NA   NA
 2013603 2013604 MGAS2096_Spy0877 MGAS2096_Spy0878 srtR srtK TRUE 0.999 -22.000 0.741 0.013 Y NA
 2013604 2013605 MGAS2096_Spy0878 MGAS2096_Spy0879 srtK srtT FALSE 0.023 412.000 0.000 1.000 N NA
 2013605 2013606 MGAS2096_Spy0879 MGAS2096_Spy0880 srtT   TRUE 0.783 -28.000 0.000 1.000   NA
 2013606 2013607 MGAS2096_Spy0880 MGAS2096_Spy0881     TRUE 0.701 19.000 0.000 NA   NA
 2013607 2013608 MGAS2096_Spy0881 MGAS2096_Spy0882   srtF TRUE 0.704 -51.000 0.000 NA   NA
 2013608 2013609 MGAS2096_Spy0882 MGAS2096_Spy0883 srtF srtE TRUE 0.689 6.000 0.000 NA   NA
 2013609 2013610 MGAS2096_Spy0883 MGAS2096_Spy0884 srtE srtG TRUE 0.963 3.000 0.490 NA   NA
 2013610 2013611 MGAS2096_Spy0884 MGAS2096_Spy0885 srtG   FALSE 0.059 191.000 0.000 NA   NA
 2013613 2013614 MGAS2096_Spy0887 MGAS2096_Spy0888     TRUE 0.671 22.000 0.000 NA   NA
 2013614 2013615 MGAS2096_Spy0888 MGAS2096_Spy0889     FALSE 0.185 73.000 0.000 NA   NA
 2013615 2013616 MGAS2096_Spy0889 MGAS2096_Spy0890     TRUE 0.927 31.000 0.000 0.072   NA
 2013616 2013617 MGAS2096_Spy0890 MGAS2096_Spy0891   dacA1 FALSE 0.118 143.000 0.000 1.000   NA
 2013619 2013620 MGAS2096_Spy0893 MGAS2096_Spy0894   folC1 TRUE 0.766 -10.000 0.000 NA   NA
 2013620 2013621 MGAS2096_Spy0894 MGAS2096_Spy0895 folC1 folE TRUE 0.966 11.000 0.057 1.000 Y NA
 2013621 2013622 MGAS2096_Spy0895 MGAS2096_Spy0896 folE folP TRUE 0.967 9.000 0.073 1.000 Y NA
 2013622 2013623 MGAS2096_Spy0896 MGAS2096_Spy0897 folP folQ TRUE 0.969 7.000 0.094 1.000 Y NA
 2013623 2013624 MGAS2096_Spy0897 MGAS2096_Spy0898 folQ folK TRUE 0.981 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 2013624 2013625 MGAS2096_Spy0898 MGAS2096_Spy0899 folK murB FALSE 0.216 150.000 0.010 1.000 N NA
 2013625 2013626 MGAS2096_Spy0899 MGAS2096_Spy0900 murB potA TRUE 0.706 46.000 0.041 1.000 N NA
 2013626 2013627 MGAS2096_Spy0900 MGAS2096_Spy0901 potA potB TRUE 0.998 -37.000 0.928 0.036 Y NA
 2013627 2013628 MGAS2096_Spy0901 MGAS2096_Spy0902 potB potC TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.036 Y NA
 2013628 2013629 MGAS2096_Spy0902 MGAS2096_Spy0903 potC   TRUE 0.997 -7.000 0.253 0.036 Y NA
 2013630 2013631 MGAS2096_Spy0904 MGAS2096_Spy0905 dpiA   TRUE 0.948 -19.000 0.154 1.000   NA
 2013631 2013632 MGAS2096_Spy0905 MGAS2096_Spy0906   dpiB TRUE 0.988 -30.000 0.000 0.002   NA
 2013633 2013634 MGAS2096_Spy0907 MGAS2096_Spy0908 malP   TRUE 0.772 129.000 0.432 1.000 Y NA
 2013636 2013637 MGAS2096_Spy0910 MGAS2096_Spy0911     FALSE 0.119 142.000 0.000 1.000   NA
 2013637 2013638 MGAS2096_Spy0911 MGAS2096_Spy0912     FALSE 0.259 163.000 0.071 1.000 N NA
 2013638 2013639 MGAS2096_Spy0912 MGAS2096_Spy0913     FALSE 0.401 46.000 0.000 NA   NA
 2013639 2013640 MGAS2096_Spy0913 MGAS2096_Spy0914     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 2013640 2013641 MGAS2096_Spy0914 MGAS2096_Spy0915   radC TRUE 0.660 49.000 0.046 NA   NA
 2013642 2013643 MGAS2096_Spy0916 MGAS2096_Spy0917     TRUE 0.974 10.000 0.714 1.000   NA
 2013643 2013644 MGAS2096_Spy0917 MGAS2096_Spy0918     FALSE 0.141 252.000 0.083 NA   NA
 2013644 2013645 MGAS2096_Spy0918 MGAS2096_Spy0919   nifS2 TRUE 0.947 -10.000 0.166 NA   NA
 2013645 2013646 MGAS2096_Spy0919 MGAS2096_Spy0920 nifS2   TRUE 0.978 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 2013646 2013647 MGAS2096_Spy0920 MGAS2096_Spy0921     FALSE 0.379 140.000 0.145 1.000   NA
 2013648 2013649 MGAS2096_Spy0922 MGAS2096_Spy0923     TRUE 0.981 36.000 0.017 0.002   NA
 2013649 2013650 MGAS2096_Spy0923 MGAS2096_Spy0924     TRUE 0.979 -28.000 0.725 1.000   NA
 2013650 2013651 MGAS2096_Spy0924 MGAS2096_Spy0925     TRUE 0.539 76.000 0.150 1.000 N NA
 2013651 2013652 MGAS2096_Spy0925 MGAS2096_Spy0926   pta TRUE 0.905 4.000 0.067 1.000 N NA
 2013652 2013653 MGAS2096_Spy0926 MGAS2096_Spy0927 pta   TRUE 0.854 66.000 0.031 0.044   NA
 2013655 2013656 MGAS2096_Spy0929 MGAS2096_Spy0930 proV   TRUE 0.961 -43.000 0.382 1.000 N NA
 2013656 2013657 MGAS2096_Spy0930 MGAS2096_Spy0931   guaC FALSE 0.042 257.000 0.000 1.000 N NA
 2013657 2013658 MGAS2096_Spy0931 MGAS2096_Spy0932 guaC xpt FALSE 0.223 305.000 0.009 1.000 Y NA
 2013658 2013659 MGAS2096_Spy0932 MGAS2096_Spy0933 xpt   TRUE 0.973 0.000 0.046 1.000 Y NA
 2013660 2013661 MGAS2096_Spy0934 MGAS2096_Spy0935 apbE   TRUE 0.752 53.000 0.189 1.000   NA
 2013662 2013663 MGAS2096_Spy0936 MGAS2096_Spy0937 tdk2 prfA TRUE 0.824 35.000 0.062 1.000 N NA
 2013663 2013664 MGAS2096_Spy0937 MGAS2096_Spy0938 prfA hemK TRUE 0.976 0.000 0.084 1.000 Y NA
 2013664 2013665 MGAS2096_Spy0938 MGAS2096_Spy0939 hemK   TRUE 0.961 -46.000 0.029 NA Y NA
 2013665 2013666 MGAS2096_Spy0939 MGAS2096_Spy0940     TRUE 0.866 18.000 0.012 NA   NA
 2013666 2013667 MGAS2096_Spy0940 MGAS2096_Spy0941   glyA TRUE 0.929 -16.000 0.056 1.000   NA
 2013667 2013668 MGAS2096_Spy0941 MGAS2096_Spy0942 glyA   TRUE 0.688 7.000 0.000 NA   NA
 2013668 2013669 MGAS2096_Spy0942 MGAS2096_Spy0943     TRUE 0.736 1.000 0.000 NA   NA
 2013669 2013670 MGAS2096_Spy0943 MGAS2096_Spy0944     TRUE 0.881 10.000 0.035 NA   NA
 2013670 2013671 MGAS2096_Spy0944 MGAS2096_Spy0945     TRUE 0.999 3.000 0.895 0.007 Y NA
 2013671 2013672 MGAS2096_Spy0945 MGAS2096_Spy0946   nox FALSE 0.052 241.000 0.000 1.000   NA
 2013674 2013675 MGAS2096_Spy0948 MGAS2096_Spy0949 gyrA   TRUE 0.851 20.000 0.013 NA N NA
 2013675 2013676 MGAS2096_Spy0949 MGAS2096_Spy0950     FALSE 0.369 80.000 0.039 NA N NA
 2013676 2013677 MGAS2096_Spy0950 MGAS2096_Spy0951     FALSE 0.018 475.000 0.000 NA   NA
 2013677 2013678 MGAS2096_Spy0951 MGAS2096_Spy0952     TRUE 0.707 -49.000 0.000 NA   NA
 2013679 2013680 MGAS2096_Spy0953 MGAS2096_Spy0954     FALSE 0.401 117.000 0.135 1.000   NA
 2013680 2013681 MGAS2096_Spy0954 MGAS2096_Spy0955     TRUE 0.949 -3.000 0.146 1.000   NA
 2013682 2013683 MGAS2096_Spy0956 MGAS2096_Spy0957     TRUE 0.950 -10.000 0.148 1.000   NA
 2013683 2013684 MGAS2096_Spy0957 MGAS2096_Spy0958   smf TRUE 0.786 65.000 0.037 1.000 Y NA
 2013684 2013685 MGAS2096_Spy0958 MGAS2096_Spy0959 smf   TRUE 0.732 107.000 0.238 1.000 Y NA
 2013686 2013687 MGAS2096_Spy0960 MGAS2096_Spy0961     TRUE 0.688 7.000 0.000 NA   NA
 2013688 2013689 MGAS2096_Spy0962 MGAS2096_Spy0963   ddh TRUE 0.924 12.000 0.158 NA   NA
 2013689 2013690 MGAS2096_Spy0963 MGAS2096_Spy0964 ddh satD FALSE 0.328 105.000 0.056 NA   NA
 2013690 2013691 MGAS2096_Spy0964 MGAS2096_Spy0965 satD satE TRUE 0.959 -7.000 0.250 NA   NA
 2013691 2013692 MGAS2096_Spy0965 MGAS2096_Spy0966 satE gid TRUE 0.871 1.000 0.008 NA   NA
 2013692 2013693 MGAS2096_Spy0966 MGAS2096_Spy0967 gid   FALSE 0.198 153.000 0.005 1.000   NA
 2013693 2013694 MGAS2096_Spy0967 MGAS2096_Spy0968   oadA1 TRUE 0.717 180.000 0.000 0.001   NA
 2013695 2013696 MGAS2096_Spy0969 MGAS2096_Spy0970 citC   FALSE 0.169 89.000 0.000 1.000   NA
 2013700 2013701 MGAS2096_Spy0974 MGAS2096_Spy0975 ffh ylxM TRUE 0.930 9.000 0.151 1.000   NA
 2013701 2013702 MGAS2096_Spy0975 MGAS2096_Spy0976 ylxM   TRUE 0.746 100.000 0.032 0.041   NA
 2013702 2013703 MGAS2096_Spy0976 MGAS2096_Spy0977     TRUE 0.597 56.000 0.057 NA   NA
 2013705 2013706 MGAS2096_Spy0979 MGAS2096_Spy0980     FALSE 0.029 364.000 0.000 1.000   NA
 2013706 2013707 MGAS2096_Spy0980 MGAS2096_Spy0981   pdxK FALSE 0.321 98.000 0.040 NA   NA
 2013707 2013708 MGAS2096_Spy0981 MGAS2096_Spy0982 pdxK   TRUE 0.936 -22.000 0.142 NA   NA
 2013710 2013711 MGAS2096_Spy0984 MGAS2096_Spy0985 rnhB   FALSE 0.035 322.000 0.000 1.000   NA
 2013711 2013712 MGAS2096_Spy0985 MGAS2096_Spy0986   fhs1 FALSE 0.431 85.000 0.094 1.000 N NA
 2013712 2013713 MGAS2096_Spy0986 MGAS2096_Spy0987 fhs1 lplA FALSE 0.435 128.000 0.200 1.000 N NA
 2013713 2013714 MGAS2096_Spy0987 MGAS2096_Spy0988 lplA   TRUE 0.823 47.000 0.250 1.000 N NA
 2013714 2013715 MGAS2096_Spy0988 MGAS2096_Spy0989     TRUE 0.962 -7.000 0.286 NA   NA
 2013715 2013716 MGAS2096_Spy0989 MGAS2096_Spy0990     TRUE 0.936 -7.000 0.107 NA   NA
 2013716 2013717 MGAS2096_Spy0990 MGAS2096_Spy0991     TRUE 0.909 42.000 0.571 NA N NA
 2013717 2013718 MGAS2096_Spy0991 MGAS2096_Spy0992     TRUE 0.977 -3.000 0.100 NA Y NA
 2013718 2013719 MGAS2096_Spy0992 MGAS2096_Spy0993     TRUE 0.910 -3.000 0.019 1.000 N NA
 2013720 2013721 MGAS2096_Spy0994 MGAS2096_Spy0995 dpfB dfp TRUE 0.888 -7.000 0.002 1.000   NA
 2013721 2013722 MGAS2096_Spy0995 MGAS2096_Spy0996 dfp   TRUE 0.663 46.000 0.019 NA   NA
 2013722 2013723 MGAS2096_Spy0996 MGAS2096_Spy0997   pgmA FALSE 0.118 294.000 0.098 NA   NA
 2013724 2013725 MGAS2096_Spy0998 MGAS2096_Spy0999     TRUE 0.996 -10.000 0.720 0.035   NA
 2013725 2013726 MGAS2096_Spy0999 MGAS2096_Spy1000     TRUE 0.968 -34.000 0.438 1.000   NA
 2013726 2013727 MGAS2096_Spy1000 MGAS2096_Spy1001     FALSE 0.313 121.000 0.036 1.000   NA
 2013727 2013728 MGAS2096_Spy1001 MGAS2096_Spy1002   cdd TRUE 0.568 94.000 0.300 1.000   NA
 2013728 2013729 MGAS2096_Spy1002 MGAS2096_Spy1003 cdd   FALSE 0.018 651.000 0.000 1.000 N NA
 2013730 2013731 MGAS2096_Spy1004 MGAS2096_Spy1005 coaA rpsT FALSE 0.448 69.000 0.014 1.000 N NA
 2013732 2013733 MGAS2096_Spy1006 MGAS2096_Spy1007 ciaH ciaR TRUE 0.992 -7.000 0.606 1.000 Y NA
 2013733 2013734 MGAS2096_Spy1007 MGAS2096_Spy1008 ciaR pepN FALSE 0.094 346.000 0.061 1.000 N NA
 2013734 2013735 MGAS2096_Spy1008 MGAS2096_Spy1009 pepN   TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2013735 2013736 MGAS2096_Spy1009 MGAS2096_Spy1010   phoU TRUE 0.711 -46.000 0.000 NA   NA
 2013736 2013737 MGAS2096_Spy1010 MGAS2096_Spy1011 phoU pstB TRUE 0.880 68.000 0.413 NA Y NA
 2013737 2013738 MGAS2096_Spy1011 MGAS2096_Spy1012 pstB pstB2 TRUE 0.999 10.000 0.542 0.001 Y NA
 2013738 2013739 MGAS2096_Spy1012 MGAS2096_Spy1013 pstB2 pstA TRUE 0.999 16.000 0.490 0.002 Y NA
 2013739 2013740 MGAS2096_Spy1013 MGAS2096_Spy1014 pstA pstC TRUE 0.999 -10.000 0.907 0.002 Y NA
 2013740 2013741 MGAS2096_Spy1014 MGAS2096_Spy1015 pstC pstS TRUE 0.978 11.000 0.206 1.000 Y NA
 2013741 2013742 MGAS2096_Spy1015 MGAS2096_Spy1016 pstS   FALSE 0.446 139.000 0.303 NA N NA
 2013742 2013743 MGAS2096_Spy1016 MGAS2096_Spy1017     TRUE 0.940 3.000 0.229 NA N NA
 2013743 2013744 MGAS2096_Spy1017 MGAS2096_Spy1018     TRUE 0.959 -31.000 0.337 NA   NA
 2013744 2013745 MGAS2096_Spy1018 MGAS2096_Spy1019     TRUE 0.948 -10.000 0.169 NA   NA
 2013745 2013746 MGAS2096_Spy1019 MGAS2096_Spy1020   mreA TRUE 0.707 43.000 0.017 1.000 N NA
 2013746 2013747 MGAS2096_Spy1020 MGAS2096_Spy1021 mreA truB TRUE 0.924 29.000 0.308 1.000 N NA
 2013747 2013748 MGAS2096_Spy1021 MGAS2096_Spy1022 truB   FALSE 0.255 116.000 0.014 NA   NA
 2013748 2013749 MGAS2096_Spy1022 MGAS2096_Spy1023     FALSE 0.330 97.000 0.045 NA   NA
 2013749 2013750 MGAS2096_Spy1023 MGAS2096_Spy1024     TRUE 0.887 11.000 0.045 NA   NA
 2013750 2013751 MGAS2096_Spy1024 MGAS2096_Spy1025     FALSE 0.447 92.000 0.121 1.000   NA
 2013751 2013752 MGAS2096_Spy1025 MGAS2096_Spy1026     TRUE 0.986 15.000 0.438 1.000 Y NA
 2013754 2013755 MGAS2096_Spy1028 MGAS2096_Spy1029     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 2013755 2013756 MGAS2096_Spy1029 MGAS2096_Spy1030     FALSE 0.368 163.000 0.238 NA   NA
 2013756 2013757 MGAS2096_Spy1030 MGAS2096_Spy1031     TRUE 0.967 8.000 0.600 NA   NA
 2013757 2013758 MGAS2096_Spy1031 MGAS2096_Spy1032     TRUE 0.918 41.000 0.600 NA   NA
 2013758 2013759 MGAS2096_Spy1032 MGAS2096_Spy1033     TRUE 0.893 13.000 0.060 NA   NA
 2013759 2013760 MGAS2096_Spy1033 MGAS2096_Spy1034     TRUE 0.920 11.000 0.143 NA   NA
 2013760 2013761 MGAS2096_Spy1034 MGAS2096_Spy1035     TRUE 0.902 37.000 0.357 NA   NA
 2013761 2013762 MGAS2096_Spy1035 MGAS2096_Spy1036   pcrA FALSE 0.029 364.000 0.000 1.000   NA
 2013762 2013763 MGAS2096_Spy1036 MGAS2096_Spy1038 pcrA   FALSE 0.023 366.000 0.000 NA   NA
 2013764 2013765 MGAS2096_Spy1037 MGAS2096_Spy1039     TRUE 0.704 120.000 0.060 0.073   NA
 2013765 2013766 MGAS2096_Spy1039 MGAS2096_Spy1040     TRUE 0.990 -12.000 0.000 0.002   NA
 2013767 2013768 MGAS2096_Spy1041 MGAS2096_Spy1042 cfa   FALSE 0.022 370.000 0.000 NA   NA
 2013768 2013769 MGAS2096_Spy1042 MGAS2096_Spy1043     TRUE 0.975 16.000 0.154 1.000 Y NA
 2013769 2013770 MGAS2096_Spy1043 MGAS2096_Spy1044     TRUE 0.972 10.000 0.130 1.000 Y NA
 2013770 2013771 MGAS2096_Spy1044 MGAS2096_Spy1045     FALSE 0.293 106.000 0.018 1.000 N NA
 2013771 2013772 MGAS2096_Spy1045 MGAS2096_Spy1046   glmS FALSE 0.152 182.000 0.008 1.000 N NA
 2013772 2013773 MGAS2096_Spy1046 MGAS2096_Spy1047 glmS sipC FALSE 0.172 176.000 0.011 1.000 N NA
 2013773 2013774 MGAS2096_Spy1047 MGAS2096_Spy1048 sipC pyk FALSE 0.172 218.000 0.072 1.000 N NA
 2013774 2013775 MGAS2096_Spy1048 MGAS2096_Spy1049 pyk pfk TRUE 0.984 63.000 0.261 0.005 Y NA
 2013775 2013776 MGAS2096_Spy1049 MGAS2096_Spy1050 pfk dnaE FALSE 0.467 80.000 0.098 1.000 N NA
 2013777 2013778 MGAS2096_Spy1051 MGAS2096_Spy1052     TRUE 0.968 0.000 0.412 1.000 N NA
 2013778 2013779 MGAS2096_Spy1052 MGAS2096_Spy1053     TRUE 0.960 10.000 0.471 NA   NA
 2013781 2013782 MGAS2096_Spy1055 MGAS2096_Spy1056     FALSE 0.109 118.000 0.000 NA   NA
 2013783 2013784 MGAS2096_Spy1057 MGAS2096_Spy1058 glgP malM TRUE 0.971 35.000 0.053 0.022   NA
 2013784 2013785 MGAS2096_Spy1058 MGAS2096_Spy1059 malM   TRUE 0.988 -58.000 0.000 0.001   NA
 2013785 2013786 MGAS2096_Spy1059 MGAS2096_Spy1060   malR FALSE 0.033 336.000 0.000 1.000   NA
 2013787 2013788 MGAS2096_Spy1061 MGAS2096_Spy1062 malX malC TRUE 0.862 273.000 0.690 0.035 Y NA
 2013788 2013789 MGAS2096_Spy1062 MGAS2096_Spy1063 malC malD TRUE 0.998 0.000 0.793 0.035 Y NA
 2013791 2013792 MGAS2096_Spy1065 MGAS2096_Spy1066     TRUE 0.680 -76.000 0.000 NA   NA
 2013792 2013793 MGAS2096_Spy1066 MGAS2096_Spy1067     FALSE 0.044 225.000 0.000 NA   NA
 2013794 2013795 MGAS2096_Spy1068 MGAS2096_Spy1069   dltD TRUE 0.808 31.000 0.042 NA N NA
 2013795 2013796 MGAS2096_Spy1069 MGAS2096_Spy1070 dltD   TRUE 0.970 -7.000 0.409 NA   NA
 2013796 2013797 MGAS2096_Spy1070 MGAS2096_Spy1071     TRUE 0.958 18.000 0.387 NA   NA
 2013797 2013798 MGAS2096_Spy1071 MGAS2096_Spy1072     TRUE 0.971 -3.000 0.435 NA   NA
 2013798 2013799 MGAS2096_Spy1072 MGAS2096_Spy1073   dltA TRUE 0.855 86.000 0.000 0.001   NA
 2013799 2013800 MGAS2096_Spy1073 MGAS2096_Spy1074 dltA   TRUE 0.965 12.000 0.549 NA   NA
 2013800 2013801 MGAS2096_Spy1074 MGAS2096_Spy1075   uvrB FALSE 0.036 264.000 0.000 NA   NA
 2013802 2013803 MGAS2096_Spy1076 MGAS2096_Spy1077 glnH glnQ2 TRUE 0.986 0.000 0.326 1.000 Y NA
 2013803 2013804 MGAS2096_Spy1077 MGAS2096_Spy1078 glnQ2   FALSE 0.090 158.000 0.000 1.000 N NA
 2013805 2013806 MGAS2096_Spy1079 MGAS2096_Spy1080     TRUE 0.950 -3.000 0.182 NA   NA
 2013806 2013807 MGAS2096_Spy1080 MGAS2096_Spy1081     FALSE 0.352 178.000 0.273 NA   NA
 2013807 2013808 MGAS2096_Spy1081 MGAS2096_Spy1082     TRUE 0.973 -3.000 0.500 NA   NA
 2013808 2013809 MGAS2096_Spy1082 MGAS2096_Spy1083     TRUE 0.998 3.000 0.500 0.013 Y NA
 2013809 2013810 MGAS2096_Spy1083 MGAS2096_Spy1084     TRUE 0.991 -7.000 0.064 0.013 N NA
 2013810 2013811 MGAS2096_Spy1084 MGAS2096_Spy1085     FALSE 0.368 106.000 0.064 1.000   NA
 2013811 2013812 MGAS2096_Spy1085 MGAS2096_Spy1086   bglA2 TRUE 0.894 46.000 0.500 1.000   NA
 2013814 2013815 MGAS2096_Spy1088 MGAS2096_Spy1089   obgE FALSE 0.405 69.000 0.009 NA   NA
 2013815 2013816 MGAS2096_Spy1089 MGAS2096_Spy1090 obgE   FALSE 0.471 63.000 0.011 NA   NA
 2013817 2013818 MGAS2096_Spy1091 MGAS2096_Spy1092     TRUE 0.954 21.000 0.000 0.070   NA
 2013818 2013819 MGAS2096_Spy1092 MGAS2096_Spy1093     TRUE 0.977 15.000 0.000 0.010   NA
 2013822 2013823 MGAS2096_Spy1096 MGAS2096_Spy1097     TRUE 0.879 48.000 0.000 0.035   NA
 2013823 2013824 MGAS2096_Spy1097 MGAS2096_Spy1098     TRUE 0.678 -82.000 0.000 NA   NA
 2013826 2013827 MGAS2096_Spy1100 MGAS2096_Spy1101     FALSE 0.144 85.000 0.000 NA   NA
 2013827 2013828 MGAS2096_Spy1101 MGAS2096_Spy1102     TRUE 0.825 72.000 0.000 0.008   NA
 2013828 2013829 MGAS2096_Spy1102 MGAS2096_Spy1103     FALSE 0.035 317.000 0.000 1.000   NA
 2013829 2013830 MGAS2096_Spy1103 MGAS2096_Spy1104     FALSE 0.380 183.000 0.000 0.070 N NA
 2013830 2013831 MGAS2096_Spy1104 MGAS2096_Spy1105     FALSE 0.021 603.000 0.000 1.000   NA
 2013831 2013832 MGAS2096_Spy1105 MGAS2096_Spy1106     FALSE 0.018 476.000 0.000 NA   NA
 2013832 2013833 MGAS2096_Spy1106 MGAS2096_Spy1107     FALSE 0.128 95.000 0.000 NA   NA
 2013833 2013834 MGAS2096_Spy1107 MGAS2096_Spy1108     TRUE 0.806 -3.000 0.000 1.000   NA
 2013834 2013835 MGAS2096_Spy1108 MGAS2096_Spy1109     TRUE 0.983 0.000 0.000 0.009   NA
 2013835 2013836 MGAS2096_Spy1109 MGAS2096_Spy1110     TRUE 0.935 26.000 0.333 1.000 N NA
 2013836 2013837 MGAS2096_Spy1110 MGAS2096_Spy1111     TRUE 0.945 -46.000 0.222 1.000 N NA
 2013837 2013838 MGAS2096_Spy1111 MGAS2096_Spy1112     FALSE 0.094 121.000 0.000 NA N NA
 2013840 2013841 MGAS2096_Spy1114 MGAS2096_Spy1115     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 2013841 2013842 MGAS2096_Spy1115 MGAS2096_Spy1116     TRUE 0.742 9.000 0.000 1.000   NA
 2013842 2013843 MGAS2096_Spy1116 MGAS2096_Spy1117     FALSE 0.107 122.000 0.000 NA   NA
 2013843 2013844 MGAS2096_Spy1117 MGAS2096_Spy1118     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 2013844 2013845 MGAS2096_Spy1118 MGAS2096_Spy1119     FALSE 0.105 127.000 0.000 NA   NA
 2013847 2013848 MGAS2096_Spy1121 MGAS2096_Spy1122     TRUE 0.813 36.000 0.077 NA   NA
 2013848 2013849 MGAS2096_Spy1122 MGAS2096_Spy1123     TRUE 0.550 68.000 0.096 NA   NA
 2013849 2013850 MGAS2096_Spy1123 MGAS2096_Spy1124     TRUE 0.953 -19.000 0.222 NA   NA
 2013850 2013851 MGAS2096_Spy1124 MGAS2096_Spy1125     TRUE 0.962 -13.000 0.333 NA N NA
 2013851 2013852 MGAS2096_Spy1125 MGAS2096_Spy1126     FALSE 0.027 327.000 0.000 NA   NA
 2013852 2013853 MGAS2096_Spy1126 MGAS2096_Spy1127     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 2013853 2013854 MGAS2096_Spy1127 MGAS2096_Spy1128     TRUE 0.767 -9.000 0.000 NA   NA
 2013854 2013855 MGAS2096_Spy1128 MGAS2096_Spy1129     TRUE 0.590 29.000 0.000 NA   NA
 2013855 2013856 MGAS2096_Spy1129 MGAS2096_Spy1130     TRUE 0.957 15.000 0.400 NA   NA
 2013856 2013857 MGAS2096_Spy1130 MGAS2096_Spy1131     FALSE 0.054 200.000 0.000 NA   NA
 2013857 2013858 MGAS2096_Spy1131 MGAS2096_Spy1132     TRUE 0.977 0.000 0.667 NA   NA
 2013858 2013859 MGAS2096_Spy1132 MGAS2096_Spy1133     TRUE 0.965 -58.000 0.556 NA   NA
 2013859 2013860 MGAS2096_Spy1133 MGAS2096_Spy1134     TRUE 0.950 -63.000 0.333 NA   NA
 2013860 2013861 MGAS2096_Spy1134 MGAS2096_Spy1135     FALSE 0.017 603.000 0.000 NA   NA
 2013861 2013862 MGAS2096_Spy1135 MGAS2096_Spy1136     FALSE 0.161 80.000 0.000 NA   NA
 2013862 2013863 MGAS2096_Spy1136 MGAS2096_Spy1137     FALSE 0.098 138.000 0.000 NA   NA
 2013863 2013864 MGAS2096_Spy1137 MGAS2096_Spy1138     FALSE 0.109 118.000 0.000 NA   NA
 2013864 2013865 MGAS2096_Spy1138 MGAS2096_Spy1139     TRUE 0.681 76.000 0.429 NA   NA
 2013865 2013866 MGAS2096_Spy1139 MGAS2096_Spy1140     TRUE 0.937 -72.000 0.235 NA   NA
 2013866 2013867 MGAS2096_Spy1140 MGAS2096_Spy1141     FALSE 0.028 317.000 0.000 NA   NA
 2013867 2013868 MGAS2096_Spy1141 MGAS2096_Spy1142     TRUE 0.813 77.000 1.000 NA   NA
 2013868 2013869 MGAS2096_Spy1142 MGAS2096_Spy1143     TRUE 0.995 8.000 1.000 0.069   NA
 2013869 2013870 MGAS2096_Spy1143 MGAS2096_Spy1144     FALSE 0.018 478.000 0.000 NA   NA
 2013870 2013871 MGAS2096_Spy1144 MGAS2096_Spy1145     FALSE 0.463 155.000 0.400 NA   NA
 2013871 2013872 MGAS2096_Spy1145 MGAS2096_Spy1146     TRUE 0.994 29.000 0.583 0.005   NA
 2013872 2013873 MGAS2096_Spy1146 MGAS2096_Spy1147     TRUE 0.960 95.000 0.833 0.005   NA
 2013873 2013874 MGAS2096_Spy1147 MGAS2096_Spy1148     FALSE 0.020 425.000 0.000 NA   NA
 2013874 2013875 MGAS2096_Spy1148 MGAS2096_Spy1149     FALSE 0.323 52.000 0.000 NA   NA
 2013875 2013876 MGAS2096_Spy1149 MGAS2096_Spy1150     FALSE 0.023 367.000 0.000 NA   NA
 2013876 2013877 MGAS2096_Spy1150 MGAS2096_Spy1151     TRUE 0.753 -19.000 0.000 NA   NA
 2013877 2013878 MGAS2096_Spy1151 MGAS2096_Spy1152     TRUE 0.538 35.000 0.000 NA   NA
 2013878 2013879 MGAS2096_Spy1152 MGAS2096_Spy1154     FALSE 0.048 216.000 0.000 NA   NA
 2013881 2013882 MGAS2096_Spy1155 MGAS2096_Spy1156     FALSE 0.019 465.000 0.000 NA   NA
 2013882 2013883 MGAS2096_Spy1156 MGAS2096_Spy1157     FALSE 0.343 186.000 0.250 1.000   NA
 2013883 2013884 MGAS2096_Spy1157 MGAS2096_Spy1158     TRUE 0.968 -76.000 0.625 1.000 N NA
 2013884 2013885 MGAS2096_Spy1158 MGAS2096_Spy1159     FALSE 0.108 120.000 0.000 NA   NA
 2013885 2013886 MGAS2096_Spy1159 MGAS2096_Spy1160     FALSE 0.017 513.000 0.000 NA   NA
 2013886 2013887 MGAS2096_Spy1160 MGAS2096_Spy1161     FALSE 0.305 151.000 0.093 1.000 N NA
 2013887 2013888 MGAS2096_Spy1161 MGAS2096_Spy1162   aroK FALSE 0.202 208.000 0.111 1.000 N NA
 2013888 2013889 MGAS2096_Spy1162 MGAS2096_Spy1163 aroK   TRUE 0.971 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 2013889 2013890 MGAS2096_Spy1163 MGAS2096_Spy1164     FALSE 0.256 102.000 0.003 1.000   NA
 2013890 2013891 MGAS2096_Spy1164 MGAS2096_Spy1165   map TRUE 0.964 2.000 0.373 1.000   NA
 2013891 2013892 MGAS2096_Spy1165 MGAS2096_Spy1166 map   TRUE 0.945 16.000 0.235 1.000 N NA
 2013892 2013893 MGAS2096_Spy1166 MGAS2096_Spy1167     TRUE 0.968 -3.000 0.342 1.000 N NA
 2013893 2013894 MGAS2096_Spy1167 MGAS2096_Spy1168   grab FALSE 0.053 238.000 0.000 1.000   NA
 2013894 2013895 MGAS2096_Spy1168 MGAS2096_Spy1169 grab murZ FALSE 0.031 358.000 0.000 1.000   NA
 2013895 2013896 MGAS2096_Spy1169 MGAS2096_Spy1170 murZ metK2 FALSE 0.199 174.000 0.026 1.000 N NA
 2013896 2013897 MGAS2096_Spy1170 MGAS2096_Spy1171 metK2 inlA FALSE 0.022 536.000 0.000 1.000   NA
 2013899 2013900 MGAS2096_Spy1173 MGAS2096_Spy1174     FALSE 0.144 85.000 0.000 NA   NA
 2013900 2013901 MGAS2096_Spy1174 MGAS2096_Spy1175     TRUE 0.490 261.000 0.000 0.069 Y NA
 2013901 2013902 MGAS2096_Spy1175 MGAS2096_Spy1176     FALSE 0.056 422.000 0.030 NA N NA
 2013904 2013905 MGAS2096_Spy1178 MGAS2096_Spy1179     FALSE 0.328 80.000 0.010 NA   NA
 2013905 2013906 MGAS2096_Spy1179 MGAS2096_Spy1180   udk TRUE 0.985 35.000 0.012 0.001   NA
 2013908 2013909 MGAS2096_Spy1182 MGAS2096_Spy1183     TRUE 0.773 51.000 0.231 NA   NA
 2013909 2013910 MGAS2096_Spy1183 MGAS2096_Spy1184   gapN FALSE 0.310 96.000 0.028 NA   NA
 2013910 2013911 MGAS2096_Spy1184 MGAS2096_Spy1185 gapN pstI FALSE 0.188 185.000 0.035 1.000 N NA
 2013911 2013912 MGAS2096_Spy1185 MGAS2096_Spy1186 pstI ptsH TRUE 0.996 5.000 0.240 0.013 Y NA
 2013913 2013914 MGAS2096_Spy1187 MGAS2096_Spy1188 nrdH nrdE2 TRUE 0.967 20.000 0.562 1.000 N NA
 2013914 2013915 MGAS2096_Spy1188 MGAS2096_Spy1189 nrdE2 nrdF2 TRUE 0.897 322.000 0.500 0.002 Y NA
 2013915 2013916 MGAS2096_Spy1189 MGAS2096_Spy1190 nrdF2   TRUE 0.926 -25.000 0.083 1.000 N NA
 2013916 2013917 MGAS2096_Spy1190 MGAS2096_Spy1191     FALSE 0.141 96.000 0.000 1.000 N NA
 2013917 2013918 MGAS2096_Spy1191 MGAS2096_Spy1192     TRUE 0.969 33.000 0.000 0.069 Y NA
 2013918 2013919 MGAS2096_Spy1192 MGAS2096_Spy1193     TRUE 0.943 40.000 0.000 0.010   NA
 2013920 2013921 MGAS2096_Spy1194 MGAS2096_Spy1195     TRUE 0.904 19.000 0.077 NA   NA
 2013921 2013922 MGAS2096_Spy1195 MGAS2096_Spy1196     TRUE 0.967 -3.000 0.362 NA   NA
 2013922 2013923 MGAS2096_Spy1196 MGAS2096_Spy1197     TRUE 0.618 26.000 0.000 NA   NA
 2013923 2013924 MGAS2096_Spy1197 MGAS2096_Spy1198   alaS FALSE 0.067 179.000 0.000 NA   NA
 2013924 2013925 MGAS2096_Spy1198 MGAS2096_Spy1199 alaS surA FALSE 0.025 387.000 0.000 1.000 N NA
 2013925 2013926 MGAS2096_Spy1199 MGAS2096_Spy1200 surA   TRUE 0.514 63.000 0.012 1.000   NA
 2013926 2013927 MGAS2096_Spy1200 MGAS2096_Spy1201     TRUE 0.485 66.000 0.012 1.000   NA
 2013927 2013928 MGAS2096_Spy1201 MGAS2096_Spy1202   pepB FALSE 0.025 376.000 0.000 1.000 N NA
 2013928 2013929 MGAS2096_Spy1202 MGAS2096_Spy1203 pepB   TRUE 0.934 13.000 0.204 NA   NA
 2013929 2013930 MGAS2096_Spy1203 MGAS2096_Spy1204     FALSE 0.084 295.000 0.020 NA   NA
 2013930 2013931 MGAS2096_Spy1204 MGAS2096_Spy1205   nagB FALSE 0.313 119.000 0.051 1.000 N NA
 2013932 2013933 MGAS2096_Spy1206 MGAS2096_Spy1207 queA   TRUE 0.826 7.000 0.004 NA   NA
 2013934 2013935 MGAS2096_Spy1208 MGAS2096_Spy1209     TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2013935 2013936 MGAS2096_Spy1209 MGAS2096_Spy1210     FALSE 0.288 56.000 0.000 NA   NA
 2013936 2013937 MGAS2096_Spy1210 MGAS2096_Spy1211   sodA FALSE 0.076 167.000 0.000 NA   NA
 2013937 2013938 MGAS2096_Spy1211 MGAS2096_Spy1212 sodA   FALSE 0.293 97.000 0.012 1.000 N NA
 2013938 2013939 MGAS2096_Spy1212 MGAS2096_Spy1213     FALSE 0.201 71.000 0.000 NA   NA
 2013939 2013940 MGAS2096_Spy1213 MGAS2096_Spy1214   comEC FALSE 0.104 130.000 0.000 NA   NA
 2013940 2013941 MGAS2096_Spy1214 MGAS2096_Spy1215 comEC   FALSE 0.212 201.000 0.130 NA   NA
 2013941 2013942 MGAS2096_Spy1215 MGAS2096_Spy1217     FALSE 0.137 200.000 0.014 NA   NA
 2013943 2013944 MGAS2096_Spy1216 MGAS2096_Spy1218     TRUE 0.959 -10.000 0.209 1.000   NA
 2013945 2013946 MGAS2096_Spy1219 MGAS2096_Spy1220     TRUE 0.987 -39.000 0.000 0.002   NA
 2013946 2013947 MGAS2096_Spy1220 MGAS2096_Spy1221     TRUE 0.989 -22.000 0.000 0.002   NA
 2013947 2013948 MGAS2096_Spy1221 MGAS2096_Spy1222     FALSE 0.105 127.000 0.000 NA   NA
 2013948 2013949 MGAS2096_Spy1222 MGAS2096_Spy1223     TRUE 0.678 -82.000 0.000 NA   NA
 2013949 2013950 MGAS2096_Spy1223 MGAS2096_Spy1224   deaD TRUE 0.733 -30.000 0.000 NA   NA
 2013950 2013951 MGAS2096_Spy1224 MGAS2096_Spy1226 deaD prfC FALSE 0.146 307.000 0.000 1.000 Y NA
 2013953 2013954 MGAS2096_Spy1227 MGAS2096_Spy1228   murF FALSE 0.423 81.000 0.078 NA   NA
 2013954 2013955 MGAS2096_Spy1228 MGAS2096_Spy1229 murF ddlA TRUE 0.833 199.000 0.046 0.009 Y NA
 2013955 2013956 MGAS2096_Spy1229 MGAS2096_Spy1230 ddlA recR FALSE 0.279 101.000 0.010 1.000 N NA
 2013956 2013957 MGAS2096_Spy1230 MGAS2096_Spy1231 recR   FALSE 0.442 47.000 0.000 1.000   NA
 2013957 2013958 MGAS2096_Spy1231 MGAS2096_Spy1232     FALSE 0.022 559.000 0.000 1.000   NA
 2013958 2013959 MGAS2096_Spy1232 MGAS2096_Spy1233     TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.034   NA
 2013959 2013960 MGAS2096_Spy1233 MGAS2096_Spy1234     TRUE 0.899 22.000 0.105 NA   NA
 2013960 2013961 MGAS2096_Spy1234 MGAS2096_Spy1235     FALSE 0.275 161.000 0.107 NA   NA
 2013961 2013962 MGAS2096_Spy1235 MGAS2096_Spy1236   gpmA FALSE 0.285 108.000 0.012 1.000   NA
 2013964 2013965 MGAS2096_Spy1238 MGAS2096_Spy1239     FALSE 0.408 72.000 0.018 NA   NA
 2013965 2013966 MGAS2096_Spy1239 MGAS2096_Spy1240     TRUE 0.990 -61.000 0.027 0.003   NA
 2013966 2013967 MGAS2096_Spy1240 MGAS2096_Spy1241     FALSE 0.031 359.000 0.000 1.000   NA
 2013967 2013968 MGAS2096_Spy1241 MGAS2096_Spy1242     FALSE 0.431 99.000 0.156 NA   NA
 2013968 2013969 MGAS2096_Spy1242 MGAS2096_Spy1243     TRUE 0.981 -22.000 0.828 NA   NA
 2013969 2013970 MGAS2096_Spy1243 MGAS2096_Spy1244     TRUE 0.948 -25.000 0.203 NA   NA
 2013970 2013971 MGAS2096_Spy1244 MGAS2096_Spy1245     FALSE 0.035 266.000 0.000 NA   NA
 2013971 2013972 MGAS2096_Spy1245 MGAS2096_Spy1246   recN FALSE 0.072 171.000 0.000 NA   NA
 2013972 2013973 MGAS2096_Spy1246 MGAS2096_Spy1247 recN argR1 TRUE 0.913 -21.000 0.037 1.000 N NA
 2013973 2013974 MGAS2096_Spy1247 MGAS2096_Spy1248 argR1   TRUE 0.902 -46.000 0.048 1.000 N NA
 2013974 2013975 MGAS2096_Spy1248 MGAS2096_Spy1249   fps TRUE 0.929 -7.000 0.058 1.000 N NA
 2013975 2013976 MGAS2096_Spy1249 MGAS2096_Spy1250 fps xseB TRUE 0.931 0.000 0.100 1.000 N NA
 2013976 2013977 MGAS2096_Spy1250 MGAS2096_Spy1251 xseB   TRUE 0.999 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 2013977 2013978 MGAS2096_Spy1251 MGAS2096_Spy1252   folD FALSE 0.286 138.000 0.045 1.000 N NA
 2013978 2013979 MGAS2096_Spy1252 MGAS2096_Spy1253 folD   FALSE 0.141 202.000 0.013 1.000 N NA
 2013979 2013980 MGAS2096_Spy1253 MGAS2096_Spy1254   phr FALSE 0.157 169.000 0.004 1.000 N NA
 2013980 2013981 MGAS2096_Spy1254 MGAS2096_Spy1255 phr artP FALSE 0.122 116.000 0.000 1.000 N NA
 2013981 2013982 MGAS2096_Spy1255 MGAS2096_Spy1256 artP artQ TRUE 0.992 -3.000 0.640 1.000 Y NA
 2013982 2013983 MGAS2096_Spy1256 MGAS2096_Spy1257 artQ   FALSE 0.287 127.000 0.044 NA   NA
 2013984 2013985 MGAS2096_Spy1258 MGAS2096_Spy1259 clpE mutT FALSE 0.334 128.000 0.079 1.000 N NA
 2013985 2013986 MGAS2096_Spy1259 MGAS2096_Spy1260 mutT   TRUE 0.695 51.000 0.114 NA   NA
 2013987 2013988 MGAS2096_Spy1261 MGAS2096_Spy1262 ileS divIVAS FALSE 0.079 273.000 0.012 NA N NA
 2013988 2013989 MGAS2096_Spy1262 MGAS2096_Spy1263 divIVAS   TRUE 0.967 10.000 0.579 NA   NA
 2013989 2013990 MGAS2096_Spy1263 MGAS2096_Spy1264     TRUE 0.962 0.000 0.287 1.000   NA
 2013990 2013991 MGAS2096_Spy1264 MGAS2096_Spy1265     TRUE 0.953 5.000 0.370 NA   NA
 2013991 2013992 MGAS2096_Spy1265 MGAS2096_Spy1266     TRUE 0.947 0.000 0.194 NA   NA
 2013992 2013993 MGAS2096_Spy1266 MGAS2096_Spy1267   ftsZ TRUE 0.884 3.000 0.030 NA   NA
 2013993 2013994 MGAS2096_Spy1267 MGAS2096_Spy1269 ftsZ ftsA TRUE 0.982 24.000 0.460 1.000 Y NA
 2013996 2013997 MGAS2096_Spy1270 MGAS2096_Spy1271 divIB murG TRUE 0.971 1.000 0.072 NA Y NA
 2013997 2013998 MGAS2096_Spy1271 MGAS2096_Spy1272 murG murD TRUE 0.975 -21.000 0.060 1.000 Y NA
 2013998 2013999 MGAS2096_Spy1272 MGAS2096_Spy1273 murD   FALSE 0.055 356.000 0.006 NA   NA
 2013999 2014000 MGAS2096_Spy1273 MGAS2096_Spy1274   typA FALSE 0.252 122.000 0.015 NA   NA
 2014000 2014001 MGAS2096_Spy1274 MGAS2096_Spy1275 typA   TRUE 0.983 23.000 0.012 0.009   NA
 2014001 2014002 MGAS2096_Spy1275 MGAS2096_Spy1276     FALSE 0.128 182.000 0.003 NA   NA
 2014002 2014003 MGAS2096_Spy1276 MGAS2096_Spy1277   glcK TRUE 0.890 10.000 0.064 NA N NA
 2014003 2014004 MGAS2096_Spy1277 MGAS2096_Spy1278 glcK   TRUE 0.961 5.000 0.496 NA   NA
 2014004 2014005 MGAS2096_Spy1278 MGAS2096_Spy1279   dpr FALSE 0.308 124.000 0.058 NA   NA
 2014007 2014008 MGAS2096_Spy1281 MGAS2096_Spy1282     TRUE 0.867 4.000 0.016 NA   NA
 2014008 2014009 MGAS2096_Spy1282 MGAS2096_Spy1283     FALSE 0.034 271.000 0.000 NA   NA
 2014009 2014010 MGAS2096_Spy1283 MGAS2096_Spy1284     TRUE 0.574 31.000 0.000 NA   NA
 2014010 2014011 MGAS2096_Spy1284 MGAS2096_Spy1285     FALSE 0.027 357.000 0.000 1.000 N NA
 2014011 2014012 MGAS2096_Spy1285 MGAS2096_Spy1286     TRUE 0.924 -13.000 0.052 1.000 N NA
 2014012 2014013 MGAS2096_Spy1286 MGAS2096_Spy1287     TRUE 0.969 -10.000 0.367 1.000 N NA
 2014013 2014014 MGAS2096_Spy1287 MGAS2096_Spy1288   asnA FALSE 0.232 123.000 0.006 1.000 N NA
 2014014 2014015 MGAS2096_Spy1288 MGAS2096_Spy1289 asnA arcC FALSE 0.142 314.000 0.000 1.000 Y NA
 2014015 2014016 MGAS2096_Spy1289 MGAS2096_Spy1290 arcC   TRUE 0.963 20.000 0.035 1.000 Y NA
 2014016 2014017 MGAS2096_Spy1290 MGAS2096_Spy1291     TRUE 0.930 17.000 0.140 1.000   NA
 2014017 2014018 MGAS2096_Spy1291 MGAS2096_Spy1292   arcB FALSE 0.280 170.000 0.104 1.000   NA
 2014018 2014019 MGAS2096_Spy1292 MGAS2096_Spy1293 arcB   TRUE 0.818 40.000 0.104 1.000   NA
 2014019 2014020 MGAS2096_Spy1293 MGAS2096_Spy1294   arcA FALSE 0.434 81.000 0.056 1.000   NA
 2014020 2014021 MGAS2096_Spy1294 MGAS2096_Spy1295 arcA   FALSE 0.037 274.000 0.000 1.000 N NA
 2014023 2014024 MGAS2096_Spy1297 MGAS2096_Spy1298     TRUE 0.830 23.000 0.009 NA   NA
 2014024 2014025 MGAS2096_Spy1298 MGAS2096_Spy1299     FALSE 0.388 73.000 0.007 1.000   NA
 2014025 2014026 MGAS2096_Spy1299 MGAS2096_Spy1300     TRUE 0.996 -3.000 0.480 0.012   NA
 2014026 2014027 MGAS2096_Spy1300 MGAS2096_Spy1301   msrA TRUE 0.558 88.000 0.240 1.000   NA
 2014027 2014028 MGAS2096_Spy1301 MGAS2096_Spy1302 msrA tlpA TRUE 0.976 43.000 0.875 1.000 Y NA
 2014028 2014029 MGAS2096_Spy1302 MGAS2096_Spy1303 tlpA ccdA TRUE 0.986 13.000 0.500 1.000 Y NA
 2014029 2014030 MGAS2096_Spy1303 MGAS2096_Spy1304 ccdA   FALSE 0.018 740.000 0.000 1.000 N NA
 2014030 2014031 MGAS2096_Spy1304 MGAS2096_Spy1305     TRUE 0.992 11.000 0.882 1.000 Y NA
 2014031 2014032 MGAS2096_Spy1305 MGAS2096_Spy1306     TRUE 0.992 -3.000 0.773 NA Y NA
 2014032 2014033 MGAS2096_Spy1306 MGAS2096_Spy1307     TRUE 0.990 2.000 0.711 NA Y NA
 2014033 2014034 MGAS2096_Spy1307 MGAS2096_Spy1308     TRUE 0.985 -10.000 0.948 NA   NA
 2014034 2014035 MGAS2096_Spy1308 MGAS2096_Spy1309     TRUE 0.983 0.000 0.891 NA   NA
 2014035 2014036 MGAS2096_Spy1309 MGAS2096_Spy1310     TRUE 0.614 133.000 0.664 NA   NA
 2014036 2014037 MGAS2096_Spy1310 MGAS2096_Spy1311   valS FALSE 0.106 154.000 0.000 1.000   NA
 2014037 2014038 MGAS2096_Spy1311 MGAS2096_Spy1312 valS   TRUE 0.867 2.000 0.008 NA   NA
 2014038 2014039 MGAS2096_Spy1312 MGAS2096_Spy1313     TRUE 0.904 -24.000 0.033 NA   NA
 2014039 2014040 MGAS2096_Spy1313 MGAS2096_Spy1314     FALSE 0.020 425.000 0.000 NA   NA
 2014040 2014041 MGAS2096_Spy1314 MGAS2096_Spy1315     TRUE 0.683 21.000 0.000 NA   NA
 1626246 2014042 MGAS2096_SPYR02274 MGAS2096_Spy1316     FALSE 0.041 240.000 0.000 NA   NA
 2014042 2014043 MGAS2096_Spy1316 MGAS2096_Spy1317   aroB TRUE 0.987 41.000 0.003 0.003 Y NA
 2014044 2014045 MGAS2096_Spy1318 MGAS2096_Spy1319     TRUE 0.689 8.000 0.000 NA   NA
 2014045 2014046 MGAS2096_Spy1319 MGAS2096_Spy1320     TRUE 0.725 2.000 0.000 NA   NA
 2014046 2014047 MGAS2096_Spy1320 MGAS2096_Spy1321     TRUE 0.578 53.000 0.026 NA   NA
 2014049 2014050 MGAS2096_Spy1323 MGAS2096_Spy1324 aroE lacZ FALSE 0.305 138.000 0.061 1.000 N NA
 2014050 2014051 MGAS2096_Spy1324 MGAS2096_Spy1325 lacZ   TRUE 0.928 -70.000 0.167 1.000 N NA
 2014051 2014052 MGAS2096_Spy1325 MGAS2096_Spy1326     TRUE 0.997 -3.000 0.167 0.012 Y NA
 2014052 2014053 MGAS2096_Spy1326 MGAS2096_Spy1327     TRUE 0.979 -13.000 0.667 NA   NA
 2014053 2014054 MGAS2096_Spy1327 MGAS2096_Spy1328     FALSE 0.029 305.000 0.000 NA   NA
 2014054 2014055 MGAS2096_Spy1328 MGAS2096_Spy1329     TRUE 0.956 81.000 0.333 0.032 Y NA
 2014055 2014056 MGAS2096_Spy1329 MGAS2096_Spy1330     TRUE 0.998 10.000 0.917 0.032 Y NA
 2014057 2014058 MGAS2096_Spy1331 MGAS2096_Spy1332     FALSE 0.094 143.000 0.000 NA   NA
 2014059 2014060 MGAS2096_Spy1333 MGAS2096_Spy1334   hyl TRUE 0.919 25.000 0.182 1.000   NA
 2014060 2014061 MGAS2096_Spy1334 MGAS2096_Spy1335 hyl   TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2014061 2014062 MGAS2096_Spy1335 MGAS2096_Spy1336     FALSE 0.334 51.000 0.000 NA   NA
 2014063 2014064 MGAS2096_Spy1337 MGAS2096_Spy1338     TRUE 0.941 15.000 0.194 1.000   NA
 2014065 2014066 MGAS2096_Spy1339 MGAS2096_Spy1340 rocA   FALSE 0.014 722.000 0.000 NA N NA
 2014067 2014068 MGAS2096_Spy1341 MGAS2096_Spy1342 recX   FALSE 0.368 80.000 0.025 NA   NA
 2014068 2014069 MGAS2096_Spy1342 MGAS2096_Spy1343     FALSE 0.103 132.000 0.000 NA   NA
 2014069 2014070 MGAS2096_Spy1343 MGAS2096_Spy1344     FALSE 0.110 115.000 0.000 NA   NA
 1626276 1626277 MGAS2096_SPYR02275 MGAS2096_SPYR02276     TRUE 0.660 23.000 0.000 NA   NA
 1626277 1626278 MGAS2096_SPYR02276 MGAS2096_SPYR02277     TRUE 0.522 36.000 0.000 NA   NA
 1626278 1626279 MGAS2096_SPYR02277 MGAS2096_SPYR02278     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 1626279 1626280 MGAS2096_SPYR02278 MGAS2096_SPYR02279     TRUE 0.689 6.000 0.000 NA   NA
 1626280 1626281 MGAS2096_SPYR02279 MGAS2096_SPYR02280     TRUE 0.563 32.000 0.000 NA   NA
 1626281 1626282 MGAS2096_SPYR02280 MGAS2096_SPYR02281     TRUE 0.705 18.000 0.000 NA   NA
 1626282 1626283 MGAS2096_SPYR02281 MGAS2096_SPYR02282     TRUE 0.660 23.000 0.000 NA   NA
 1626283 1626284 MGAS2096_SPYR02282 MGAS2096_SPYR02283     FALSE 0.133 92.000 0.000 NA   NA
 1626284 1626285 MGAS2096_SPYR02283 MGAS2096_SPYR02284     FALSE 0.030 298.000 0.000 NA   NA
 1626285 1626286 MGAS2096_SPYR02284 MGAS2096_SPYR02285     FALSE 0.310 53.000 0.000 NA   NA
 2014072 2014073 MGAS2096_Spy1346 MGAS2096_Spy1347   comFC FALSE 0.436 80.000 0.080 NA   NA
 2014073 2014074 MGAS2096_Spy1347 MGAS2096_Spy1348 comFC comFA TRUE 0.930 -28.000 0.130 NA   NA
 2014075 2014076 MGAS2096_Spy1349 MGAS2096_Spy1350   cysM FALSE 0.302 128.000 0.033 1.000   NA
 2014077 2014078 MGAS2096_Spy1351 MGAS2096_Spy1352     TRUE 0.946 0.000 0.151 1.000   NA
 2014078 2014079 MGAS2096_Spy1352 MGAS2096_Spy1353   yvqC TRUE 0.914 25.000 0.164 1.000   NA
 2014079 2014080 MGAS2096_Spy1353 MGAS2096_Spy1354 yvqC yvqE TRUE 0.999 -13.000 0.853 0.012 Y NA
 2014080 2014081 MGAS2096_Spy1354 MGAS2096_Spy1355 yvqE yvqF TRUE 0.979 -3.000 0.679 NA   NA
 2014081 2014082 MGAS2096_Spy1355 MGAS2096_Spy1356 yvqF   FALSE 0.441 72.000 0.039 NA   NA
 2014082 2014083 MGAS2096_Spy1356 MGAS2096_Spy1357   pppL TRUE 0.993 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 2014083 2014084 MGAS2096_Spy1357 MGAS2096_Spy1358 pppL sunL TRUE 0.807 38.000 0.074 1.000 N NA
 2014084 2014085 MGAS2096_Spy1358 MGAS2096_Spy1359 sunL   TRUE 0.987 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 2014085 2014086 MGAS2096_Spy1359 MGAS2096_Spy1360   priA TRUE 0.572 62.000 0.052 1.000 N NA
 2014086 2014087 MGAS2096_Spy1360 MGAS2096_Spy1361 priA   TRUE 0.945 38.000 0.032 0.065 N NA
 2014087 2014088 MGAS2096_Spy1361 MGAS2096_Spy1362   gmk TRUE 0.964 16.000 0.471 1.000 N NA
 2014088 2014089 MGAS2096_Spy1362 MGAS2096_Spy1363 gmk   FALSE 0.274 110.000 0.010 1.000   NA
 2014089 2014090 MGAS2096_Spy1363 MGAS2096_Spy1364     FALSE 0.238 130.000 0.006 1.000   NA
 2014091 2014092 MGAS2096_Spy1365 MGAS2096_Spy1366 atoB atoD1 TRUE 0.974 12.000 0.150 1.000 Y NA
 2014092 2014093 MGAS2096_Spy1366 MGAS2096_Spy1367 atoD1 atoA TRUE 0.998 2.000 0.200 0.002 Y NA
 2014093 2014094 MGAS2096_Spy1367 MGAS2096_Spy1368 atoA   TRUE 0.969 52.000 0.111 0.039 Y NA
 2014094 2014095 MGAS2096_Spy1368 MGAS2096_Spy1369     TRUE 0.704 71.000 0.333 1.000   NA
 2014095 2014096 MGAS2096_Spy1369 MGAS2096_Spy1370     TRUE 0.960 46.000 0.000 0.001   NA
 2014096 2014097 MGAS2096_Spy1370 MGAS2096_Spy1371   luxS TRUE 0.887 -16.000 0.006 1.000 N NA
 2014098 2014099 MGAS2096_Spy1372 MGAS2096_Spy1373     TRUE 0.876 14.000 0.029 NA   NA
 2014099 2014100 MGAS2096_Spy1373 MGAS2096_Spy1374     FALSE 0.019 445.000 0.000 NA   NA
 2014100 2014101 MGAS2096_Spy1374 MGAS2096_Spy1375     TRUE 0.609 122.000 0.579 NA   NA
 2014102 2014103 MGAS2096_Spy1376 MGAS2096_Spy1377 recU pbp1A TRUE 0.967 -13.000 0.319 1.000   NA
 2014104 2014105 MGAS2096_Spy1378 MGAS2096_Spy1379 pepC   FALSE 0.170 185.000 0.017 1.000 N NA
 2014105 2014106 MGAS2096_Spy1379 MGAS2096_Spy1380   nadE TRUE 0.998 -40.000 0.194 0.003 Y NA
 2014106 2014107 MGAS2096_Spy1380 MGAS2096_Spy1381 nadE   FALSE 0.209 171.000 0.032 1.000 N NA
 2014107 2014108 MGAS2096_Spy1381 MGAS2096_Spy1382     FALSE 0.233 157.000 0.033 1.000 N NA
 2014108 2014109 MGAS2096_Spy1382 MGAS2096_Spy1383   aapA TRUE 0.602 64.000 0.117 NA   NA
 2014109 2014110 MGAS2096_Spy1383 MGAS2096_Spy1384 aapA   TRUE 0.550 104.000 0.364 NA   NA
 2014110 2014111 MGAS2096_Spy1384 MGAS2096_Spy1385     TRUE 0.987 -3.000 0.310 1.000 Y NA
 2014111 2014112 MGAS2096_Spy1385 MGAS2096_Spy1387     FALSE 0.296 105.000 0.018 1.000 N NA
 2014114 2014115 MGAS2096_Spy1388 MGAS2096_Spy1389     TRUE 0.968 2.000 0.038 1.000 Y NA
 2014115 2014116 MGAS2096_Spy1389 MGAS2096_Spy1390   ftsL TRUE 0.962 4.000 0.456 1.000 N NA
 2014116 2014117 MGAS2096_Spy1390 MGAS2096_Spy1391 ftsL mraW TRUE 0.924 -25.000 0.077 1.000 N NA
 2014117 2014118 MGAS2096_Spy1391 MGAS2096_Spy1392 mraW   FALSE 0.043 230.000 0.000 NA   NA
 2014118 2014119 MGAS2096_Spy1392 MGAS2096_Spy1393   proA TRUE 0.742 -25.000 0.000 NA   NA
 2014119 2014120 MGAS2096_Spy1393 MGAS2096_Spy1394 proA   TRUE 0.999 -7.000 0.281 0.002 Y NA
 2014120 2014121 MGAS2096_Spy1394 MGAS2096_Spy1395   proB FALSE 0.470 58.000 0.006 NA   NA
 2014121 2014122 MGAS2096_Spy1395 MGAS2096_Spy1396 proB   TRUE 0.958 -37.000 0.341 NA   NA
 2014122 2014123 MGAS2096_Spy1396 MGAS2096_Spy1397     TRUE 0.855 34.000 0.136 NA   NA
 2014123 2014124 MGAS2096_Spy1397 MGAS2096_Spy1398   tkt FALSE 0.329 193.000 0.300 NA   NA
 2014124 2014125 MGAS2096_Spy1398 MGAS2096_Spy1399 tkt   FALSE 0.223 218.000 0.000 1.000 Y NA
 2014125 2014126 MGAS2096_Spy1399 MGAS2096_Spy1400     FALSE 0.106 126.000 0.000 NA   NA
 2014126 2014127 MGAS2096_Spy1400 MGAS2096_Spy1401     TRUE 0.958 -70.000 0.462 NA   NA
 2014127 2014128 MGAS2096_Spy1401 MGAS2096_Spy1402   glpF TRUE 0.960 16.000 0.364 1.000   NA
 2014128 2014129 MGAS2096_Spy1402 MGAS2096_Spy1403 glpF glpO TRUE 0.969 2.000 0.500 1.000 N NA
 2014129 2014130 MGAS2096_Spy1403 MGAS2096_Spy1404 glpO glpK TRUE 0.999 16.000 0.500 0.001 Y NA
 2014130 2014131 MGAS2096_Spy1404 MGAS2096_Spy1405 glpK   FALSE 0.030 360.000 0.000 1.000   NA
 2014131 2014132 MGAS2096_Spy1405 MGAS2096_Spy1406     TRUE 0.479 67.000 0.029 NA   NA
 2014132 2014133 MGAS2096_Spy1406 MGAS2096_Spy1407   glyS FALSE 0.215 154.000 0.020 NA   NA
 2014133 2014134 MGAS2096_Spy1407 MGAS2096_Spy1408 glyS glyQ TRUE 0.896 464.000 0.651 0.001 Y NA
 2014134 2014135 MGAS2096_Spy1408 MGAS2096_Spy1409 glyQ   TRUE 0.727 -36.000 0.000 NA   NA
 2014135 2014136 MGAS2096_Spy1409 MGAS2096_Spy1410     FALSE 0.054 201.000 0.000 NA   NA
 2014136 2014137 MGAS2096_Spy1410 MGAS2096_Spy1411     FALSE 0.362 111.000 0.074 1.000   NA
 2014137 2014138 MGAS2096_Spy1411 MGAS2096_Spy1412   nagA FALSE 0.324 119.000 0.045 1.000   NA
 2014138 2014139 MGAS2096_Spy1412 MGAS2096_Spy1413 nagA   FALSE 0.350 118.000 0.090 1.000 N NA
 2014139 2014140 MGAS2096_Spy1413 MGAS2096_Spy1415     FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2014144 2014145 MGAS2096_Spy1418 MGAS2096_Spy1419     TRUE 0.889 -55.000 0.047 NA   NA
 2014145 2014146 MGAS2096_Spy1419 MGAS2096_Spy1420   lacD1 FALSE 0.148 197.000 0.019 NA   NA
 2014146 2014147 MGAS2096_Spy1420 MGAS2096_Spy1421 lacD1   TRUE 0.838 82.000 0.000 0.002   NA
 2014147 2014148 MGAS2096_Spy1421 MGAS2096_Spy1422   lacB1 FALSE 0.106 154.000 0.000 1.000   NA
 2014148 2014149 MGAS2096_Spy1422 MGAS2096_Spy1423 lacB1 lacA1 TRUE 0.993 15.000 0.000 0.003 Y NA
 2014151 2014152 MGAS2096_Spy1425 MGAS2096_Spy1426     TRUE 0.981 -3.000 0.000 0.018   NA
 2014152 2014153 MGAS2096_Spy1426 MGAS2096_Spy1427     TRUE 0.984 26.000 0.000 0.018 Y NA
 2014153 2014154 MGAS2096_Spy1427 MGAS2096_Spy1428     TRUE 0.998 -7.000 0.429 0.012 Y NA
 2014156 2014157 MGAS2096_Spy1430 MGAS2096_Spy1431 copZ copA TRUE 0.997 14.000 0.048 0.002 Y NA
 2014157 2014158 MGAS2096_Spy1431 MGAS2096_Spy1432 copA copY TRUE 0.911 -45.000 0.064 1.000 N NA
 2014160 2014161 MGAS2096_Spy1434 MGAS2096_Spy1435 rbfA infB TRUE 0.656 200.000 0.530 1.000 Y NA
 2014161 2014162 MGAS2096_Spy1435 MGAS2096_Spy1436 infB   TRUE 0.977 20.000 0.223 NA Y NA
 2014162 2014163 MGAS2096_Spy1436 MGAS2096_Spy1437     TRUE 0.968 -7.000 0.408 NA N NA
 2014163 2014164 MGAS2096_Spy1437 MGAS2096_Spy1438   nusA TRUE 0.980 13.000 0.323 NA Y NA
 2014164 2014165 MGAS2096_Spy1438 MGAS2096_Spy1439 nusA   TRUE 0.547 175.000 0.759 NA   NA
 2014165 2014166 MGAS2096_Spy1439 MGAS2096_Spy1440     FALSE 0.040 245.000 0.000 NA   NA
 2014168 2014169 MGAS2096_Spy1442 MGAS2096_Spy1443     FALSE 0.112 111.000 0.000 NA   NA
 2014169 2014170 MGAS2096_Spy1443 MGAS2096_Spy1444     TRUE 0.979 -3.000 0.667 NA   NA
 2014170 2014171 MGAS2096_Spy1444 MGAS2096_Spy1445     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 2014171 2014172 MGAS2096_Spy1445 MGAS2096_Spy1446     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 2014172 2014173 MGAS2096_Spy1446 MGAS2096_Spy1447     TRUE 0.691 9.000 0.000 NA   NA
 2014173 2014174 MGAS2096_Spy1447 MGAS2096_Spy1448     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 2014174 2014175 MGAS2096_Spy1448 MGAS2096_Spy1449     TRUE 0.747 0.000 0.000 NA   NA
 2014175 2014176 MGAS2096_Spy1449 MGAS2096_Spy1450     TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2014176 2014177 MGAS2096_Spy1450 MGAS2096_Spy1451     TRUE 0.694 10.000 0.000 NA   NA
 2014177 2014178 MGAS2096_Spy1451 MGAS2096_Spy1452     TRUE 0.956 12.000 0.400 NA   NA
 2014178 2014179 MGAS2096_Spy1452 MGAS2096_Spy1453     TRUE 0.957 15.000 0.400 NA   NA
 2014179 2014180 MGAS2096_Spy1453 MGAS2096_Spy1454     TRUE 0.600 75.000 0.235 NA   NA
 2014180 2014181 MGAS2096_Spy1454 MGAS2096_Spy1455     TRUE 0.618 54.000 0.062 NA   NA
 2014181 2014182 MGAS2096_Spy1455 MGAS2096_Spy1456     TRUE 0.884 12.000 0.041 NA   NA
 2014182 2014183 MGAS2096_Spy1456 MGAS2096_Spy1457     TRUE 0.975 4.000 0.800 NA   NA
 2014183 2014184 MGAS2096_Spy1457 MGAS2096_Spy1458     TRUE 0.981 -3.000 0.750 NA   NA
 2014184 2014185 MGAS2096_Spy1458 MGAS2096_Spy1459     TRUE 0.970 11.000 0.667 NA   NA
 2014185 2014186 MGAS2096_Spy1459 MGAS2096_Spy1460     TRUE 0.962 12.000 0.500 NA   NA
 2014186 2014187 MGAS2096_Spy1460 MGAS2096_Spy1461     TRUE 0.931 13.000 0.192 NA   NA
 2014187 2014188 MGAS2096_Spy1461 MGAS2096_Spy1462     FALSE 0.082 156.000 0.000 NA   NA
 2014188 2014189 MGAS2096_Spy1462 MGAS2096_Spy1463     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 2014189 2014190 MGAS2096_Spy1463 MGAS2096_Spy1464     TRUE 0.882 31.000 0.167 NA   NA
 2014190 2014191 MGAS2096_Spy1464 MGAS2096_Spy1465     TRUE 0.948 -43.000 0.250 NA   NA
 2014191 2014192 MGAS2096_Spy1465 MGAS2096_Spy1466     TRUE 0.959 16.000 0.429 NA   NA
 2014192 2014193 MGAS2096_Spy1466 MGAS2096_Spy1467     TRUE 0.996 -19.000 0.176 0.002   NA
 2014193 2014194 MGAS2096_Spy1467 MGAS2096_Spy1468     TRUE 0.792 48.000 0.176 1.000   NA
 2014194 2014195 MGAS2096_Spy1468 MGAS2096_Spy1469     TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2014195 2014196 MGAS2096_Spy1469 MGAS2096_Spy1470     TRUE 0.766 -10.000 0.000 NA   NA
 2014196 2014197 MGAS2096_Spy1470 MGAS2096_Spy1471     TRUE 0.691 9.000 0.000 NA   NA
 2014197 2014198 MGAS2096_Spy1471 MGAS2096_Spy1472     TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2014198 2014199 MGAS2096_Spy1472 MGAS2096_Spy1473     TRUE 0.969 1.000 0.500 NA   NA
 2014199 2014200 MGAS2096_Spy1473 MGAS2096_Spy1474     TRUE 0.961 -3.000 0.286 NA   NA
 2014200 2014201 MGAS2096_Spy1474 MGAS2096_Spy1475     FALSE 0.022 369.000 0.000 NA   NA
 2014201 2014202 MGAS2096_Spy1475 MGAS2096_Spy1476     TRUE 0.909 5.000 0.111 NA   NA
 2014202 2014203 MGAS2096_Spy1476 MGAS2096_Spy1477     TRUE 0.849 43.000 0.250 NA   NA
 2014203 2014204 MGAS2096_Spy1477 MGAS2096_Spy1478     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 2014204 2014205 MGAS2096_Spy1478 MGAS2096_Spy1479     TRUE 0.697 4.000 0.000 NA   NA
 2014205 2014206 MGAS2096_Spy1479 MGAS2096_Spy1480     TRUE 0.937 0.000 0.143 NA   NA
 2014206 2014207 MGAS2096_Spy1480 MGAS2096_Spy1481     TRUE 0.770 88.000 1.000 NA   NA
 2014207 2014208 MGAS2096_Spy1481 MGAS2096_Spy1482     FALSE 0.092 147.000 0.000 NA   NA
 2014208 2014209 MGAS2096_Spy1482 MGAS2096_Spy1483     TRUE 0.979 -3.000 0.667 NA   NA
 2014209 2014210 MGAS2096_Spy1483 MGAS2096_Spy1484     TRUE 0.984 -19.000 1.000 NA   NA
 2014210 2014211 MGAS2096_Spy1484 MGAS2096_Spy1485     TRUE 0.733 -30.000 0.000 NA   NA
 2014211 2014212 MGAS2096_Spy1485 MGAS2096_Spy1486     FALSE 0.261 62.000 0.000 NA   NA
 2014215 2014216 MGAS2096_Spy1489 MGAS2096_Spy1490     TRUE 0.979 14.000 1.000 NA   NA
 2014216 2014217 MGAS2096_Spy1490 MGAS2096_Spy1491     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 2014217 2014218 MGAS2096_Spy1491 MGAS2096_Spy1492   int3 FALSE 0.115 108.000 0.000 NA   NA
 1626435 2014219 MGAS2096_SPYR02286 MGAS2096_Spy1493     FALSE 0.241 65.000 0.000 NA   NA
 2014219 2014220 MGAS2096_Spy1493 MGAS2096_Spy1494     TRUE 0.940 0.000 0.154 NA   NA
 2014220 2014221 MGAS2096_Spy1494 MGAS2096_Spy1495     TRUE 0.575 64.000 0.107 NA N NA
 2014221 2014222 MGAS2096_Spy1495 MGAS2096_Spy1496     TRUE 0.927 3.000 0.167 NA N NA
 2014223 2014224 MGAS2096_Spy1497 MGAS2096_Spy1498 hit   TRUE 0.925 -3.000 0.063 NA   NA
 2014225 2014226 MGAS2096_Spy1499 MGAS2096_Spy1500 lytR   TRUE 0.941 9.000 0.283 NA N NA
 2014226 2014227 MGAS2096_Spy1500 MGAS2096_Spy1501     TRUE 0.902 -25.000 0.033 NA   NA
 2014227 2014228 MGAS2096_Spy1501 MGAS2096_Spy1502     FALSE 0.184 154.000 0.008 NA   NA
 2014229 2014230 MGAS2096_Spy1503 MGAS2096_Spy1504     TRUE 0.987 8.000 0.111 0.019   NA
 2014230 2014231 MGAS2096_Spy1504 MGAS2096_Spy1505   manL FALSE 0.032 352.000 0.000 1.000   NA
 2014231 2014232 MGAS2096_Spy1505 MGAS2096_Spy1506 manL   TRUE 0.990 32.000 0.057 0.017 Y NA
 2014232 2014233 MGAS2096_Spy1506 MGAS2096_Spy1507   manM TRUE 0.979 89.000 0.943 0.017 Y NA
 2014233 2014234 MGAS2096_Spy1507 MGAS2096_Spy1508 manM manN TRUE 0.998 17.000 0.812 0.017 Y NA
 2014234 2014235 MGAS2096_Spy1508 MGAS2096_Spy1509 manN manO TRUE 0.966 21.000 0.583 NA   NA
 2014235 2014236 MGAS2096_Spy1509 MGAS2096_Spy1510 manO serS FALSE 0.044 391.000 0.003 NA   NA
 2014237 2014238 MGAS2096_Spy1511 MGAS2096_Spy1512 accD accA TRUE 0.999 -3.000 0.234 0.001 Y NA
 2014238 2014239 MGAS2096_Spy1512 MGAS2096_Spy1513 accA accC TRUE 0.997 9.000 0.090 0.002 Y NA
 2014239 2014240 MGAS2096_Spy1513 MGAS2096_Spy1514 accC fabZ TRUE 0.939 32.000 0.045 1.000 Y NA
 2014240 2014241 MGAS2096_Spy1514 MGAS2096_Spy1515 fabZ accB TRUE 0.904 -3.000 0.009 1.000   NA
 2014241 2014242 MGAS2096_Spy1515 MGAS2096_Spy1516 accB   FALSE 0.108 119.000 0.000 NA   NA
 2014242 2014243 MGAS2096_Spy1516 MGAS2096_Spy1517   fabF TRUE 0.725 2.000 0.000 NA   NA
 2014243 2014244 MGAS2096_Spy1517 MGAS2096_Spy1518 fabF   TRUE 0.967 15.000 0.056 1.000 Y NA
 2014244 2014245 MGAS2096_Spy1518 MGAS2096_Spy1519   fabD TRUE 0.999 -10.000 0.432 0.006 Y NA
 2014245 2014246 MGAS2096_Spy1519 MGAS2096_Spy1520 fabD fabK TRUE 0.920 19.000 0.099 1.000   NA
 2014246 2014247 MGAS2096_Spy1520 MGAS2096_Spy1521 fabK acpP FALSE 0.291 202.000 0.216 1.000   NA
 2014247 2014248 MGAS2096_Spy1521 MGAS2096_Spy1522 acpP fabH TRUE 0.941 61.000 0.065 0.006   NA
 2014248 2014249 MGAS2096_Spy1522 MGAS2096_Spy1523 fabH   TRUE 0.921 1.000 0.070 1.000 N NA
 2014249 2014250 MGAS2096_Spy1523 MGAS2096_Spy1524   phaB TRUE 0.820 38.000 0.098 1.000 N NA
 2014250 2014251 MGAS2096_Spy1524 MGAS2096_Spy1525 phaB dnaJ FALSE 0.051 222.000 0.000 1.000 N NA
 2014251 2014252 MGAS2096_Spy1525 MGAS2096_Spy1526 dnaJ dnaK TRUE 0.886 227.000 0.196 0.003 Y NA
 2014252 2014253 MGAS2096_Spy1526 MGAS2096_Spy1527 dnaK grpE TRUE 0.857 181.000 0.026 0.007 Y NA
 2014253 2014254 MGAS2096_Spy1527 MGAS2096_Spy1528 grpE hrcA TRUE 0.902 3.000 0.051 1.000 N NA
 2014254 2014255 MGAS2096_Spy1528 MGAS2096_Spy1529 hrcA   FALSE 0.230 135.000 0.009 1.000 N NA
 2014255 2014256 MGAS2096_Spy1529 MGAS2096_Spy1530     TRUE 0.951 -3.000 0.174 1.000 N NA
 2014256 2014257 MGAS2096_Spy1530 MGAS2096_Spy1531     TRUE 0.951 -10.000 0.174 1.000 N NA
 2014257 2014258 MGAS2096_Spy1531 MGAS2096_Spy1532     FALSE 0.027 392.000 0.000 1.000   NA
 2014258 2014259 MGAS2096_Spy1532 MGAS2096_Spy1533     FALSE 0.050 210.000 0.000 NA   NA
 2014259 2014260 MGAS2096_Spy1533 MGAS2096_Spy1534   gatB TRUE 0.764 -3.000 0.000 NA   NA
 2014260 2014261 MGAS2096_Spy1534 MGAS2096_Spy1535 gatB gatA TRUE 0.999 0.000 0.492 0.002 Y NA
 2014261 2014262 MGAS2096_Spy1535 MGAS2096_Spy1536 gatA gatC TRUE 0.999 0.000 0.643 0.002 Y NA
 2014262 2014263 MGAS2096_Spy1536 MGAS2096_Spy1537 gatC   FALSE 0.098 233.000 0.002 1.000   NA
 2014263 2014264 MGAS2096_Spy1537 MGAS2096_Spy1538     FALSE 0.022 515.000 0.000 1.000   NA
 2014264 2014265 MGAS2096_Spy1538 MGAS2096_Spy1539   codY FALSE 0.308 144.000 0.083 1.000 N NA
 2014265 2014266 MGAS2096_Spy1539 MGAS2096_Spy1540 codY   FALSE 0.214 155.000 0.015 1.000 N NA
 2014270 2014271 MGAS2096_Spy1544 MGAS2096_Spy1545     TRUE 0.691 13.000 0.000 NA   NA
 2014271 2014272 MGAS2096_Spy1545 MGAS2096_Spy1546   recG FALSE 0.034 293.000 0.000 1.000 N NA
 2014274 2014275 MGAS2096_Spy1548 MGAS2096_Spy1549     TRUE 0.961 -63.000 0.429 1.000   NA
 2014275 2014276 MGAS2096_Spy1549 MGAS2096_Spy1550     TRUE 0.975 -3.000 0.562 NA   NA
 2014276 2014277 MGAS2096_Spy1550 MGAS2096_Spy1551     TRUE 0.929 -3.000 0.081 NA   NA
 2014277 2014278 MGAS2096_Spy1551 MGAS2096_Spy1552     TRUE 0.996 -40.000 0.576 0.006 N NA
 2014278 2014279 MGAS2096_Spy1552 MGAS2096_Spy1553   fhuC TRUE 0.923 -3.000 0.047 1.000 N NA
 2014279 2014280 MGAS2096_Spy1553 MGAS2096_Spy1554 fhuC   TRUE 0.992 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 2014280 2014281 MGAS2096_Spy1554 MGAS2096_Spy1555     TRUE 0.993 -25.000 0.877 1.000 Y NA
 2014281 2014282 MGAS2096_Spy1555 MGAS2096_Spy1556   shp TRUE 0.941 -30.000 0.182 NA   NA
 2014282 2014283 MGAS2096_Spy1556 MGAS2096_Spy1557 shp   FALSE 0.307 197.000 0.273 NA   NA
 2014283 2014284 MGAS2096_Spy1557 MGAS2096_Spy1558   isp2 FALSE 0.018 484.000 0.000 NA   NA
 2014284 2014285 MGAS2096_Spy1558 MGAS2096_Spy1559 isp2 acpS FALSE 0.327 87.000 0.022 NA   NA
 2014285 2014286 MGAS2096_Spy1559 MGAS2096_Spy1560 acpS alr TRUE 0.935 -3.000 0.093 1.000 N NA
 2014286 2014287 MGAS2096_Spy1560 MGAS2096_Spy1561 alr secA FALSE 0.246 116.000 0.008 1.000 N NA
 2014287 2014288 MGAS2096_Spy1561 MGAS2096_Spy1562 secA   FALSE 0.086 165.000 0.000 1.000 N NA
 2014288 2014289 MGAS2096_Spy1562 MGAS2096_Spy1563   pmi FALSE 0.098 152.000 0.000 1.000 N NA
 2014289 2014290 MGAS2096_Spy1563 MGAS2096_Spy1564 pmi scrK TRUE 0.785 95.000 0.333 1.000 Y NA
 2014290 2014291 MGAS2096_Spy1564 MGAS2096_Spy1565 scrK endoS FALSE 0.046 264.000 0.000 1.000   NA
 2014291 2014292 MGAS2096_Spy1565 MGAS2096_Spy1566 endoS   TRUE 0.733 -30.000 0.000 NA   NA
 2014292 2014293 MGAS2096_Spy1566 MGAS2096_Spy1567   scrA FALSE 0.440 43.000 0.000 NA   NA
 2014294 2014295 MGAS2096_Spy1568 MGAS2096_Spy1569 scrB scrR TRUE 0.967 5.000 0.571 1.000 N NA
 2014296 2014297 MGAS2096_Spy1570 MGAS2096_Spy1571 nusB   TRUE 0.955 -25.000 0.265 NA   NA
 2014297 2014298 MGAS2096_Spy1571 MGAS2096_Spy1572   efp TRUE 0.680 46.000 0.031 NA   NA
 2014298 2014299 MGAS2096_Spy1572 MGAS2096_Spy1573 efp comEB FALSE 0.258 96.000 0.005 1.000 N NA
 2014299 2014300 MGAS2096_Spy1573 MGAS2096_Spy1574 comEB   TRUE 0.910 -10.000 0.018 1.000 N NA
 2014300 2014301 MGAS2096_Spy1574 MGAS2096_Spy1575   uvrA FALSE 0.113 219.000 0.008 1.000 N NA
 2014302 2014303 MGAS2096_Spy1576 MGAS2096_Spy1577 corA   FALSE 0.311 132.000 0.072 NA   NA
 2014304 2014305 MGAS2096_Spy1578 MGAS2096_Spy1579 rpsR ssb2 FALSE 0.192 165.000 0.012 1.000 N NA
 2014305 2014306 MGAS2096_Spy1579 MGAS2096_Spy1580 ssb2 rpsF TRUE 0.852 22.000 0.012 1.000 N NA
 2014306 2014307 MGAS2096_Spy1580 MGAS2096_Spy1581 rpsF   FALSE 0.071 173.000 0.000 NA   NA
 2014308 2014309 MGAS2096_Spy1582 MGAS2096_Spy1583 mutY   FALSE 0.399 67.000 0.002 1.000 N NA
 2014310 2014311 MGAS2096_Spy1584 MGAS2096_Spy1585 trx   TRUE 0.797 39.000 0.053 1.000   NA
 2014311 2014312 MGAS2096_Spy1585 MGAS2096_Spy1586   mutS2 TRUE 0.859 4.000 0.005 1.000   NA
 2014312 2014313 MGAS2096_Spy1586 MGAS2096_Spy1587 mutS2   TRUE 0.852 32.000 0.070 1.000   NA
 2014313 2014314 MGAS2096_Spy1587 MGAS2096_Spy1588     TRUE 0.878 3.000 0.019 NA   NA
 2014315 2014316 MGAS2096_Spy1589 MGAS2096_Spy1590   spi TRUE 0.909 -55.000 0.080 1.000 N NA
 2014316 2014317 MGAS2096_Spy1590 MGAS2096_Spy1591 spi recD TRUE 0.638 58.000 0.099 1.000 N NA
 2014317 2014318 MGAS2096_Spy1591 MGAS2096_Spy1592 recD   FALSE 0.353 91.000 0.050 NA   NA
 2014321 2014322 MGAS2096_Spy1595 MGAS2096_Spy1596     TRUE 0.963 -15.000 0.326 NA   NA
 2014324 2014325 MGAS2096_Spy1598 MGAS2096_Spy1599 glpF2   FALSE 0.201 71.000 0.000 NA   NA
 2014325 2014326 MGAS2096_Spy1599 MGAS2096_Spy1600   norA FALSE 0.061 186.000 0.000 NA   NA
 2014327 2014328 MGAS2096_Spy1601 MGAS2096_Spy1602 srv pepXP TRUE 0.904 22.000 0.081 1.000   NA
 2014330 2014331 MGAS2096_Spy1604 MGAS2096_Spy1605     FALSE 0.114 193.000 0.002 NA   NA
 2014332 2014333 MGAS2096_Spy1606 MGAS2096_Spy1607   dnaQ FALSE 0.368 146.000 0.158 1.000 N NA
 2014333 2014334 MGAS2096_Spy1607 MGAS2096_Spy1608 dnaQ   TRUE 0.894 10.000 0.057 NA   NA
 2014336 2014337 MGAS2096_Spy1610 MGAS2096_Spy1611 deoC nupC TRUE 0.972 30.000 0.333 1.000 Y NA
 2014337 2014338 MGAS2096_Spy1611 MGAS2096_Spy1612 nupC udp TRUE 0.959 9.000 0.015 1.000 Y NA
 2014338 2014339 MGAS2096_Spy1612 MGAS2096_Spy1613 udp   FALSE 0.241 65.000 0.000 NA   NA
 2014340 2014341 MGAS2096_Spy1614 MGAS2096_Spy1615 crgR rpsN2 FALSE 0.052 220.000 0.000 1.000 N NA
 2014342 2014343 MGAS2096_Spy1616 MGAS2096_Spy1617     TRUE 0.989 -87.000 0.009 0.002   NA
 2014343 2014344 MGAS2096_Spy1617 MGAS2096_Spy1618     TRUE 0.808 -10.000 0.000 1.000   NA
 2014344 2014345 MGAS2096_Spy1618 MGAS2096_Spy1619     TRUE 0.783 -28.000 0.000 1.000   NA
 2014346 2014347 MGAS2096_Spy1620 MGAS2096_Spy1621     TRUE 0.971 2.000 0.576 NA   NA
 2014348 2014349 MGAS2096_Spy1622 MGAS2096_Spy1623 glnA   TRUE 0.859 38.000 0.179 1.000 N NA
 2014349 2014350 MGAS2096_Spy1623 MGAS2096_Spy1624     TRUE 0.610 67.000 0.154 NA   NA
 2014350 2014351 MGAS2096_Spy1624 MGAS2096_Spy1625   pgk FALSE 0.070 263.000 0.002 NA   NA
 2014351 2014352 MGAS2096_Spy1625 MGAS2096_Spy1626 pgk lppC FALSE 0.134 193.000 0.003 1.000   NA
 2014352 2014353 MGAS2096_Spy1626 MGAS2096_Spy1627 lppC   FALSE 0.055 229.000 0.000 1.000   NA
 2014353 2014354 MGAS2096_Spy1627 MGAS2096_Spy1628     FALSE 0.107 237.000 0.006 1.000   NA
 2014354 2014355 MGAS2096_Spy1628 MGAS2096_Spy1629   asp TRUE 0.974 0.000 0.567 NA   NA
 2014355 2014356 MGAS2096_Spy1629 MGAS2096_Spy1630 asp rpmB FALSE 0.245 152.000 0.044 NA   NA
 2014356 2014357 MGAS2096_Spy1630 MGAS2096_Spy1631 rpmB fba FALSE 0.025 382.000 0.000 1.000 N NA
 2014357 1626575 MGAS2096_Spy1631 MGAS2096_SPYR02287 fba   FALSE 0.051 207.000 0.000 NA   NA
 1626575 2014358 MGAS2096_SPYR02287 MGAS2096_Spy1632     FALSE 0.299 54.000 0.000 NA   NA
 2014358 2014359 MGAS2096_Spy1632 MGAS2096_Spy1633   pyrG FALSE 0.162 168.000 0.002 1.000   NA
 2014359 2014360 MGAS2096_Spy1633 MGAS2096_Spy1634 pyrG rpoE FALSE 0.115 257.000 0.029 1.000 N NA
 2014360 2014361 MGAS2096_Spy1634 MGAS2096_Spy1635 rpoE   FALSE 0.160 179.000 0.005 1.000   NA
 2014361 2014362 MGAS2096_Spy1635 MGAS2096_Spy1636   ropA TRUE 0.992 -3.000 0.010 0.003   NA
 2014364 2014365 MGAS2096_Spy1638 MGAS2096_Spy1639     TRUE 0.921 14.000 0.149 NA   NA
 2014365 2014366 MGAS2096_Spy1639 MGAS2096_Spy1640   thiD TRUE 0.961 -10.000 0.276 NA   NA
 2014366 2014367 MGAS2096_Spy1640 MGAS2096_Spy1641 thiD   TRUE 0.928 -10.000 0.058 1.000 N NA
 2014367 2014368 MGAS2096_Spy1641 MGAS2096_Spy1642     FALSE 0.077 186.000 0.000 1.000   NA
 2014368 1626587 MGAS2096_Spy1642 MGAS2096_SPYR02288     FALSE 0.074 169.000 0.000 NA   NA
 1626587 1626588 MGAS2096_SPYR02288 MGAS2096_SPYR02289     FALSE 0.161 80.000 0.000 NA   NA
 1626588 1626589 MGAS2096_SPYR02289 MGAS2096_SPYR02290     TRUE 0.696 11.000 0.000 NA   NA
 1626589 1626590 MGAS2096_SPYR02290 MGAS2096_SPYR02291     FALSE 0.133 92.000 0.000 NA   NA
 1626590 1626591 MGAS2096_SPYR02291 MGAS2096_SPYR02292     FALSE 0.030 298.000 0.000 NA   NA
 1626591 1626592 MGAS2096_SPYR02292 MGAS2096_SPYR02293     FALSE 0.310 53.000 0.000 NA   NA
 2014371 2014372 MGAS2096_Spy1645 MGAS2096_Spy1646 hsdR hsdS TRUE 0.995 13.000 0.000 0.001 Y NA
 2014372 2014373 MGAS2096_Spy1646 MGAS2096_Spy1647 hsdS hsdM TRUE 0.983 13.000 0.000 0.062 Y NA
 2014376 2014377 MGAS2096_Spy1650 MGAS2096_Spy1651 salR   TRUE 0.991 -19.000 0.704 NA Y NA
 2014377 2014378 MGAS2096_Spy1651 MGAS2096_Spy1652   salY FALSE 0.475 40.000 0.000 NA   NA
 2014378 2014379 MGAS2096_Spy1652 MGAS2096_Spy1653 salY   TRUE 0.772 2.000 0.000 1.000   NA
 2014379 2014380 MGAS2096_Spy1653 MGAS2096_Spy1654   salX TRUE 0.979 -3.000 0.000 0.023   NA
 2014380 2014381 MGAS2096_Spy1654 MGAS2096_Spy1655 salX salB FALSE 0.201 71.000 0.000 NA   NA
 2014381 2014382 MGAS2096_Spy1655 MGAS2096_Spy1656 salB salA FALSE 0.150 82.000 0.000 NA   NA
 2014382 2014383 MGAS2096_Spy1656 MGAS2096_Spy1657 salA lacG FALSE 0.023 503.000 0.000 1.000   NA
 2014383 2014384 MGAS2096_Spy1657 MGAS2096_Spy1658 lacG lacE TRUE 0.567 73.000 0.000 1.000 Y NA
 2014384 2014385 MGAS2096_Spy1658 MGAS2096_Spy1659 lacE lacF TRUE 0.997 0.000 0.150 0.012 Y NA
 2014385 2014386 MGAS2096_Spy1659 MGAS2096_Spy1660 lacF lacD2 TRUE 0.986 24.000 0.667 1.000 Y NA
 2014386 2014387 MGAS2096_Spy1660 MGAS2096_Spy1661 lacD2 lacC2 TRUE 0.994 4.000 0.000 0.002 Y NA
 2014387 2014388 MGAS2096_Spy1661 MGAS2096_Spy1662 lacC2 lacB2 TRUE 0.795 46.000 0.000 1.000 Y NA
 2014388 2014389 MGAS2096_Spy1662 MGAS2096_Spy1663 lacB2 lacA2 TRUE 0.988 35.000 0.000 0.002 Y NA
 2014390 2014391 MGAS2096_Spy1664 MGAS2096_Spy1665 lacR2   FALSE 0.016 650.000 0.000 NA   NA
 2014391 2014392 MGAS2096_Spy1665 MGAS2096_Spy1666     TRUE 0.766 -10.000 0.000 NA   NA
 2014392 2014393 MGAS2096_Spy1666 MGAS2096_Spy1667     FALSE 0.087 152.000 0.000 NA   NA
 2014393 2014394 MGAS2096_Spy1667 MGAS2096_Spy1668     FALSE 0.194 361.000 0.000 0.061   NA
 2014395 2014396 MGAS2096_Spy1669 MGAS2096_Spy1670 rpsI rplM TRUE 0.998 21.000 0.601 0.022 Y NA
 2014396 2014397 MGAS2096_Spy1670 MGAS2096_Spy1671 rplM   FALSE 0.053 218.000 0.000 1.000 N NA
 2014397 2014398 MGAS2096_Spy1671 MGAS2096_Spy1672     TRUE 0.919 -3.000 0.051 NA   NA
 2014398 2014399 MGAS2096_Spy1672 MGAS2096_Spy1673     FALSE 0.120 103.000 0.000 NA   NA
 2014399 2014400 MGAS2096_Spy1673 MGAS2096_Spy1674     FALSE 0.319 97.000 0.036 NA   NA
 2014400 2014401 MGAS2096_Spy1674 MGAS2096_Spy1675     TRUE 0.911 4.000 0.109 NA   NA
 2014401 2014402 MGAS2096_Spy1675 MGAS2096_Spy1676     TRUE 0.828 20.000 0.003 NA   NA
 2014402 2014403 MGAS2096_Spy1676 MGAS2096_Spy1677     FALSE 0.057 196.000 0.000 NA   NA
 2014403 2014404 MGAS2096_Spy1677 MGAS2096_Spy1678   cysS TRUE 0.946 -7.000 0.129 1.000   NA
 2014404 2014405 MGAS2096_Spy1678 MGAS2096_Spy1679 cysS   TRUE 0.752 28.000 0.002 NA   NA
 2014405 2014406 MGAS2096_Spy1679 MGAS2096_Spy1680     TRUE 0.691 13.000 0.000 NA   NA
 2014406 2014407 MGAS2096_Spy1680 MGAS2096_Spy1681   cysE FALSE 0.058 194.000 0.000 NA   NA
 2014407 2014408 MGAS2096_Spy1681 MGAS2096_Spy1682 cysE   TRUE 0.905 9.000 0.097 NA   NA
 2014408 2014409 MGAS2096_Spy1682 MGAS2096_Spy1683     TRUE 0.892 -7.000 0.009 NA   NA
 2014409 2014410 MGAS2096_Spy1683 MGAS2096_Spy1684     FALSE 0.032 309.000 0.000 1.000 N NA
 2014410 2014411 MGAS2096_Spy1684 MGAS2096_Spy1685     TRUE 0.904 10.000 0.056 1.000   NA
 2014411 2014412 MGAS2096_Spy1685 MGAS2096_Spy1686     TRUE 0.987 27.000 0.241 0.020   NA
 2014412 2014413 MGAS2096_Spy1686 MGAS2096_Spy1687     TRUE 0.989 -28.000 0.048 0.012 N NA
 2014413 2014414 MGAS2096_Spy1687 MGAS2096_Spy1688     FALSE 0.375 123.000 0.143 NA   NA
 2014414 2014415 MGAS2096_Spy1688 MGAS2096_Spy1689     TRUE 0.864 -16.000 0.002 NA   NA
 2014415 2014416 MGAS2096_Spy1689 MGAS2096_Spy1690     FALSE 0.069 176.000 0.000 NA   NA
 2014417 2014418 MGAS2096_Spy1691 MGAS2096_Spy1692   def FALSE 0.105 127.000 0.000 NA   NA
 2014419 2014420 MGAS2096_Spy1693 MGAS2096_Spy1694     TRUE 0.558 132.000 0.414 1.000   NA
 2014420 2014421 MGAS2096_Spy1694 MGAS2096_Spy1695   polC FALSE 0.378 80.000 0.020 1.000 N NA
 2014421 2014422 MGAS2096_Spy1695 MGAS2096_Spy1696 polC proS FALSE 0.472 254.000 0.070 0.042 N NA
 2014422 2014423 MGAS2096_Spy1696 MGAS2096_Spy1697 proS   FALSE 0.209 198.000 0.095 1.000 N NA
 2014423 2014424 MGAS2096_Spy1697 MGAS2096_Spy1698   cdsA FALSE 0.446 73.000 0.040 1.000 N NA
 2014424 2014425 MGAS2096_Spy1698 MGAS2096_Spy1699 cdsA uppS TRUE 0.970 13.000 0.113 1.000 Y NA
 2014425 2014426 MGAS2096_Spy1699 MGAS2096_Spy1700 uppS yajC FALSE 0.097 219.000 0.007 NA N NA
 2014426 2014427 MGAS2096_Spy1700 MGAS2096_Spy1701 yajC   FALSE 0.254 86.000 0.006 NA N NA
 2014427 2014428 MGAS2096_Spy1701 MGAS2096_Spy1703   pulA FALSE 0.096 115.000 0.000 NA N NA
 2014430 2014431 MGAS2096_Spy1704 MGAS2096_Spy1705 dexB msmK TRUE 0.695 108.000 0.171 1.000 Y NA
 2014431 2014432 MGAS2096_Spy1705 MGAS2096_Spy1706 msmK lrp FALSE 0.113 298.000 0.071 1.000 N NA
 2014434 2014435 MGAS2096_Spy1708 MGAS2096_Spy1709   relA TRUE 0.934 15.000 0.177 1.000 N NA
 2014435 2014436 MGAS2096_Spy1709 MGAS2096_Spy1710 relA sclA FALSE 0.053 240.000 0.000 1.000   NA
 2014437 2014438 MGAS2096_Spy1711 MGAS2096_Spy1712     TRUE 0.702 -54.000 0.000 NA   NA
 2014439 2014440 MGAS2096_Spy1713 MGAS2096_Spy1714     TRUE 0.840 62.000 0.610 1.000   NA
 2014440 2014441 MGAS2096_Spy1714 MGAS2096_Spy1715     FALSE 0.024 356.000 0.000 NA   NA
 2014441 2014442 MGAS2096_Spy1715 MGAS2096_Spy1716     TRUE 0.952 0.000 0.227 NA   NA
 2014442 2014443 MGAS2096_Spy1716 MGAS2096_Spy1717     FALSE 0.409 71.000 0.013 NA   NA
 2014443 2014444 MGAS2096_Spy1717 MGAS2096_Spy1718     FALSE 0.241 65.000 0.000 NA   NA
 2014445 2014446 MGAS2096_Spy1719 MGAS2096_Spy1720     FALSE 0.121 102.000 0.000 NA   NA
 2014446 2014447 MGAS2096_Spy1720 MGAS2096_Spy1721     TRUE 0.762 -13.000 0.000 NA   NA
 2014449 2014450 MGAS2096_Spy1723 MGAS2096_Spy1724     FALSE 0.116 107.000 0.000 NA   NA
 2014450 2014451 MGAS2096_Spy1724 MGAS2096_Spy1725   trpG TRUE 0.994 33.000 0.009 0.001 Y NA
 2014451 2014452 MGAS2096_Spy1725 MGAS2096_Spy1726 trpG   TRUE 0.812 33.000 0.035 1.000 N NA
 2014452 1626677 MGAS2096_Spy1726 MGAS2096_SPYR02294     FALSE 0.031 286.000 0.000 NA   NA
 1626677 2014453 MGAS2096_SPYR02294 MGAS2096_Spy1727     FALSE 0.124 99.000 0.000 NA   NA
 2014453 2014454 MGAS2096_Spy1727 MGAS2096_Spy1728   flaR FALSE 0.348 55.000 0.000 1.000   NA
 2014458 2014459 MGAS2096_Spy1732 MGAS2096_Spy1733 dppA dppB TRUE 0.810 113.000 0.000 0.030 Y NA
 2014459 2014460 MGAS2096_Spy1733 MGAS2096_Spy1734 dppB dppC TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.030 Y NA
 2014460 2014461 MGAS2096_Spy1734 MGAS2096_Spy1735 dppC dppD TRUE 0.982 12.000 0.333 1.000 Y NA
 2014461 2014462 MGAS2096_Spy1735 MGAS2096_Spy1736 dppD dppE TRUE 0.999 -16.000 0.750 0.022 Y NA
 2014463 2014464 MGAS2096_Spy1737 MGAS2096_Spy1738     FALSE 0.074 169.000 0.000 NA   NA
 2014464 2014465 MGAS2096_Spy1738 MGAS2096_Spy1739     TRUE 0.692 -61.000 0.000 NA   NA
 2014465 2014466 MGAS2096_Spy1739 MGAS2096_Spy1740   lmb TRUE 0.974 13.000 0.800 NA   NA
 2014466 2014467 MGAS2096_Spy1740 MGAS2096_Spy1741 lmb   FALSE 0.169 78.000 0.000 NA   NA
 2014467 2014468 MGAS2096_Spy1741 MGAS2096_Spy1742     TRUE 0.757 -16.000 0.000 NA   NA
 2014468 2014469 MGAS2096_Spy1742 MGAS2096_Spy1743     FALSE 0.421 45.000 0.000 NA   NA
 2014469 2014470 MGAS2096_Spy1743 MGAS2096_Spy1744   scpA TRUE 0.912 45.000 0.667 NA   NA
 2014471 2014472 MGAS2096_Spy1745 MGAS2096_Spy1746     TRUE 0.748 -22.000 0.000 NA   NA
 2014473 2014474 MGAS2096_Spy1747 MGAS2096_Spy1748 sic1-01 mga FALSE 0.060 190.000 0.000 NA   NA
 2014476 2014477 MGAS2096_Spy1750 MGAS2096_Spy1751   isp TRUE 0.809 78.000 1.000 NA   NA
 2014477 2014478 MGAS2096_Spy1751 MGAS2096_Spy1752 isp ihk TRUE 0.492 102.000 0.200 1.000   NA
 2014478 2014479 MGAS2096_Spy1752 MGAS2096_Spy1753 ihk irr TRUE 0.990 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 2014479 2014480 MGAS2096_Spy1753 MGAS2096_Spy1754 irr   TRUE 0.538 94.000 0.267 1.000 N NA
 2014480 2014481 MGAS2096_Spy1754 MGAS2096_Spy1755     TRUE 0.985 13.000 0.467 1.000 Y NA
 2014481 2014482 MGAS2096_Spy1755 MGAS2096_Spy1756     TRUE 0.966 -13.000 0.385 NA N NA
 2014482 2014483 MGAS2096_Spy1756 MGAS2096_Spy1758     FALSE 0.147 424.000 0.333 NA   NA
 2014485 2014486 MGAS2096_Spy1759 MGAS2096_Spy1760     FALSE 0.095 142.000 0.000 NA   NA
 2014486