MicrobesOnline Operon Predictions for Streptococcus pyogenes MGAS9429

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2008863 2008864 MGAS9429_Spy0001 MGAS9429_Spy0002 dnaA dnaN TRUE 0.674 155.000 0.328 1.000 Y NA
 2008864 2008865 MGAS9429_Spy0002 MGAS9429_Spy0003 dnaN   FALSE 0.335 75.000 0.009 NA   NA
 2008865 2008866 MGAS9429_Spy0003 MGAS9429_Spy0004     FALSE 0.066 330.000 0.064 NA   NA
 2008866 2008867 MGAS9429_Spy0004 MGAS9429_Spy0005   pth TRUE 0.955 25.000 0.184 1.000 Y NA
 2008867 2008868 MGAS9429_Spy0005 MGAS9429_Spy0006 pth trcF TRUE 0.940 3.000 0.137 1.000 N NA
 2008868 2008869 MGAS9429_Spy0006 MGAS9429_Spy0007 trcF   FALSE 0.224 138.000 0.024 1.000 N NA
 2008869 2008870 MGAS9429_Spy0007 MGAS9429_Spy0008   divIC TRUE 0.919 -13.000 0.053 1.000 N NA
 2008870 2008871 MGAS9429_Spy0008 MGAS9429_Spy0009 divIC   TRUE 0.918 -3.000 0.011 NA   NA
 2008871 2008872 MGAS9429_Spy0009 MGAS9429_Spy0010     TRUE 0.878 13.000 0.132 NA   NA
 2008872 2008873 MGAS9429_Spy0010 MGAS9429_Spy0011   tilS TRUE 0.937 -3.000 0.014 1.000 N NA
 2008873 2008874 MGAS9429_Spy0011 MGAS9429_Spy0012 tilS   TRUE 0.970 5.000 0.067 0.066 N NA
 2008874 2008875 MGAS9429_Spy0012 MGAS9429_Spy0013   ftsH TRUE 0.904 22.000 0.192 1.000 N NA
 2008875 2008876 MGAS9429_Spy0013 MGAS9429_Spy0014 ftsH   FALSE 0.085 258.000 0.009 1.000 N NA
 2008876 2008877 MGAS9429_Spy0014 MGAS9429_Spy0015     FALSE 0.035 248.000 0.000 NA   NA
 2008877 1626869 MGAS9429_Spy0015 MGAS9429_SpyR0001     FALSE 0.059 181.000 0.000 NA   NA
 1626869 1626870 MGAS9429_SpyR0001 MGAS9429_SpyT0001     FALSE 0.395 -246.000 0.000 NA   NA
 1626870 1626871 MGAS9429_SpyT0001 MGAS9429_SpyR0002     FALSE 0.026 296.000 0.000 NA   NA
 1626871 1626872 MGAS9429_SpyR0002 MGAS9429_SpyR0003     FALSE 0.149 85.000 0.000 NA   NA
 1626872 1626873 MGAS9429_SpyR0003 MGAS9429_SpyT0002     TRUE 0.636 18.000 0.000 NA   NA
 1626873 1626874 MGAS9429_SpyT0002 MGAS9429_SpyT0003     TRUE 0.636 18.000 0.000 NA   NA
 1626874 1626875 MGAS9429_SpyT0003 MGAS9429_SpyT0004     TRUE 0.511 32.000 0.000 NA   NA
 1626875 1626876 MGAS9429_SpyT0004 MGAS9429_SpyT0005     TRUE 0.718 6.000 0.000 NA   NA
 1626876 1626877 MGAS9429_SpyT0005 MGAS9429_SpyT0006     TRUE 0.674 11.000 0.000 NA   NA
 1626877 1626878 MGAS9429_SpyT0006 MGAS9429_SpyT0007     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 1626878 1626879 MGAS9429_SpyT0007 MGAS9429_SpyT0008     TRUE 0.702 9.000 0.000 NA   NA
 1626879 1626880 MGAS9429_SpyT0008 MGAS9429_SpyT0009     TRUE 0.643 17.000 0.000 NA   NA
 1626880 1626881 MGAS9429_SpyT0009 MGAS9429_SpyT0010     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 1626881 1626882 MGAS9429_SpyT0010 MGAS9429_SpyR0004     FALSE 0.079 144.000 0.000 NA   NA
 1626882 1626883 MGAS9429_SpyR0004 MGAS9429_SpyT0011     FALSE 0.395 -246.000 0.000 NA   NA
 1626883 1626884 MGAS9429_SpyT0011 MGAS9429_SpyR0005     FALSE 0.026 296.000 0.000 NA   NA
 1626884 1626885 MGAS9429_SpyR0005 MGAS9429_SpyR0006     FALSE 0.149 85.000 0.000 NA   NA
 1626885 1626886 MGAS9429_SpyR0006 MGAS9429_SpyT0012     TRUE 0.636 18.000 0.000 NA   NA
 1626886 1626887 MGAS9429_SpyT0012 MGAS9429_SpyT0013     TRUE 0.636 18.000 0.000 NA   NA
 1626887 1626888 MGAS9429_SpyT0013 MGAS9429_SpyT0014     TRUE 0.511 32.000 0.000 NA   NA
 1626888 1626889 MGAS9429_SpyT0014 MGAS9429_SpyT0015     TRUE 0.718 6.000 0.000 NA   NA
 1626889 1626890 MGAS9429_SpyT0015 MGAS9429_SpyT0016     TRUE 0.674 11.000 0.000 NA   NA
 1626890 1626891 MGAS9429_SpyT0016 MGAS9429_SpyT0017     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 1626891 1626892 MGAS9429_SpyT0017 MGAS9429_SpyT0018     TRUE 0.702 9.000 0.000 NA   NA
 1626892 1626893 MGAS9429_SpyT0018 MGAS9429_SpyT0019     TRUE 0.643 17.000 0.000 NA   NA
 1626893 1626894 MGAS9429_SpyT0019 MGAS9429_SpyT0020     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 1626894 1626895 MGAS9429_SpyT0020 MGAS9429_SpyT0021     TRUE 0.718 6.000 0.000 NA   NA
 1626895 1626896 MGAS9429_SpyT0021 MGAS9429_SpyT0022     TRUE 0.601 21.000 0.000 NA   NA
 1626896 1626898 MGAS9429_SpyT0022 MGAS9429_SpyT0023     TRUE 0.555 26.000 0.000 NA   NA
 1626898 1626899 MGAS9429_SpyT0023 MGAS9429_SpyT0024     TRUE 0.650 14.000 0.000 NA   NA
 1626899 1626900 MGAS9429_SpyT0024 MGAS9429_SpyT0025     TRUE 0.601 21.000 0.000 NA   NA
 1626900 1626901 MGAS9429_SpyT0025 MGAS9429_SpyT0026     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 1626901 1626902 MGAS9429_SpyT0026 MGAS9429_SpyT0027     FALSE 0.479 35.000 0.000 NA   NA
 1626902 1626903 MGAS9429_SpyT0027 MGAS9429_SpyT0028     TRUE 0.688 10.000 0.000 NA   NA
 2008879 2008880 MGAS9429_Spy0017 MGAS9429_Spy0018 sibA prsA2 FALSE 0.119 241.000 0.107 NA   NA
 2008880 2008881 MGAS9429_Spy0018 MGAS9429_Spy0019 prsA2 recO FALSE 0.077 186.000 0.000 1.000 N NA
 2008881 2008882 MGAS9429_Spy0019 MGAS9429_Spy0020 recO plsX TRUE 0.788 25.000 0.011 1.000 N NA
 2008882 2008883 MGAS9429_Spy0020 MGAS9429_Spy0021 plsX acpP2 TRUE 0.994 -7.000 0.017 0.009 Y NA
 2008883 2008884 MGAS9429_Spy0021 MGAS9429_Spy0022 acpP2   FALSE 0.245 121.000 0.017 1.000 N NA
 2008884 2008885 MGAS9429_Spy0022 MGAS9429_Spy0023     TRUE 0.695 76.000 0.043 1.000 Y NA
 2008885 2008886 MGAS9429_Spy0023 MGAS9429_Spy0024   purF TRUE 0.532 104.000 0.024 1.000 Y NA
 2008886 2008887 MGAS9429_Spy0024 MGAS9429_Spy0025 purF purM TRUE 0.960 28.000 0.248 1.000 Y NA
 2008887 2008888 MGAS9429_Spy0025 MGAS9429_Spy0026 purM purN TRUE 0.862 168.000 0.238 0.003 Y NA
 2008888 2008889 MGAS9429_Spy0026 MGAS9429_Spy0027 purN   TRUE 0.539 184.000 0.225 1.000 Y NA
 2008891 2008892 MGAS9429_Spy0029 MGAS9429_Spy0030 purD purE FALSE 0.229 278.000 0.044 1.000 Y NA
 2008892 2008893 MGAS9429_Spy0030 MGAS9429_Spy0031 purE purK TRUE 0.977 -49.000 0.002 0.002 Y NA
 2008893 2008894 MGAS9429_Spy0031 MGAS9429_Spy0032 purK   TRUE 0.601 21.000 0.000 NA   NA
 2008896 2008897 MGAS9429_Spy0034 MGAS9429_Spy0035 purB   FALSE 0.187 134.000 0.005 1.000   NA
 2008897 2008898 MGAS9429_Spy0035 MGAS9429_Spy0036   ruvB FALSE 0.156 154.000 0.002 1.000   NA
 2008898 2008899 MGAS9429_Spy0036 MGAS9429_Spy0037 ruvB   FALSE 0.188 138.000 0.005 1.000 N NA
 2008899 2008900 MGAS9429_Spy0037 MGAS9429_Spy0038     TRUE 0.772 24.000 0.019 NA   NA
 2008900 2008901 MGAS9429_Spy0038 MGAS9429_Spy0039     TRUE 0.981 -3.000 0.351 NA   NA
 2008901 2008902 MGAS9429_Spy0039 MGAS9429_Spy0040   adh2 FALSE 0.033 310.000 0.000 1.000 N NA
 2008902 2008903 MGAS9429_Spy0040 MGAS9429_Spy0041 adh2 adhA TRUE 0.515 195.000 0.012 0.002   NA
 2008903 2008904 MGAS9429_Spy0041 MGAS9429_Spy0042 adhA   FALSE 0.024 388.000 0.000 1.000   NA
 2008904 2008905 MGAS9429_Spy0042 MGAS9429_Spy0043   rpsJ FALSE 0.070 199.000 0.000 1.000 N NA
 2008905 2008906 MGAS9429_Spy0043 MGAS9429_Spy0044 rpsJ rplC TRUE 0.779 248.000 0.467 0.045 Y NA
 2008906 2008907 MGAS9429_Spy0044 MGAS9429_Spy0045 rplC rplD TRUE 0.994 24.000 0.544 0.034 Y NA
 2008907 2008908 MGAS9429_Spy0045 MGAS9429_Spy0046 rplD rplW TRUE 0.997 0.000 0.307 0.034 Y NA
 2008908 2008909 MGAS9429_Spy0046 MGAS9429_Spy0047 rplW rplB TRUE 0.998 18.000 0.849 0.038 Y NA
 2008909 2008910 MGAS9429_Spy0047 MGAS9429_Spy0048 rplB rpsS TRUE 0.951 140.000 0.820 0.045 Y NA
 2008910 2008911 MGAS9429_Spy0048 MGAS9429_Spy0049 rpsS rplV TRUE 0.997 16.000 0.769 0.045 Y NA
 2008911 2008912 MGAS9429_Spy0049 MGAS9429_Spy0050 rplV rpsC TRUE 0.997 13.000 0.719 0.045 Y NA
 2008912 2008913 MGAS9429_Spy0050 MGAS9429_Spy0051 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.045 Y NA
 2008913 2008914 MGAS9429_Spy0051 MGAS9429_Spy0052 rplP rpmC TRUE 0.998 10.000 0.802 0.034 Y NA
 2008914 2008915 MGAS9429_Spy0052 MGAS9429_Spy0053 rpmC rpsQ TRUE 0.997 26.000 0.828 0.034 Y NA
 2008915 2008916 MGAS9429_Spy0053 MGAS9429_Spy0054 rpsQ rplN TRUE 0.996 25.000 0.791 0.045 Y NA
 2008916 2008917 MGAS9429_Spy0054 MGAS9429_Spy0055 rplN rplX TRUE 0.978 79.000 0.810 0.045 Y NA
 2008917 2008918 MGAS9429_Spy0055 MGAS9429_Spy0056 rplX rplE TRUE 0.996 24.000 0.758 0.034 Y NA
 2008918 2008919 MGAS9429_Spy0056 MGAS9429_Spy0057 rplE rpsN TRUE 0.995 16.000 0.496 0.034 Y NA
 2008919 2008920 MGAS9429_Spy0057 MGAS9429_Spy0058 rpsN rpsH TRUE 0.900 151.000 0.473 0.034 Y NA
 2008920 2008921 MGAS9429_Spy0058 MGAS9429_Spy0059 rpsH rplF TRUE 0.920 203.000 0.808 0.034 Y NA
 2008921 2008922 MGAS9429_Spy0059 MGAS9429_Spy0060 rplF rplR TRUE 0.969 96.000 0.815 0.034 Y NA
 2008922 2008923 MGAS9429_Spy0060 MGAS9429_Spy0061 rplR rpsE TRUE 0.997 19.000 0.814 0.045 Y NA
 2008923 2008924 MGAS9429_Spy0061 MGAS9429_Spy0062 rpsE rpmD TRUE 0.997 15.000 0.789 0.045 Y NA
 2008924 2008925 MGAS9429_Spy0062 MGAS9429_Spy0063 rpmD rplO TRUE 0.912 215.000 0.653 0.005 Y NA
 2008925 2008926 MGAS9429_Spy0063 MGAS9429_Spy0064 rplO secY TRUE 0.982 17.000 0.730 1.000 N NA
 2008926 2008927 MGAS9429_Spy0064 MGAS9429_Spy0065 secY adk FALSE 0.408 150.000 0.241 1.000 N NA
 2008927 2008928 MGAS9429_Spy0065 MGAS9429_Spy0066 adk infA FALSE 0.464 64.000 0.007 1.000 N NA
 2008928 2008929 MGAS9429_Spy0066 MGAS9429_Spy0067 infA rpmJ TRUE 0.921 26.000 0.020 1.000 Y NA
 2008929 2008930 MGAS9429_Spy0067 MGAS9429_Spy0068 rpmJ rpsM TRUE 0.984 18.000 0.086 0.034 Y NA
 2008930 2008931 MGAS9429_Spy0068 MGAS9429_Spy0069 rpsM rpsK TRUE 0.997 18.000 0.810 0.034 Y NA
 2008931 2008932 MGAS9429_Spy0069 MGAS9429_Spy0070 rpsK rpoA TRUE 0.851 46.000 0.308 1.000 N NA
 2008932 2008933 MGAS9429_Spy0070 MGAS9429_Spy0071 rpoA rplQ TRUE 0.987 15.000 0.873 1.000 N NA
 1626961 1626962 MGAS9429_SpyR0007 MGAS9429_SpyT0029     FALSE 0.395 -246.000 0.000 NA   NA
 1626962 1626963 MGAS9429_SpyT0029 MGAS9429_SpyR0008     FALSE 0.026 296.000 0.000 NA   NA
 1626963 1626964 MGAS9429_SpyR0008 MGAS9429_SpyR0009     FALSE 0.149 85.000 0.000 NA   NA
 1626964 1626965 MGAS9429_SpyR0009 MGAS9429_SpyT0030     TRUE 0.636 18.000 0.000 NA   NA
 1626965 1626966 MGAS9429_SpyT0030 MGAS9429_SpyT0031     TRUE 0.718 6.000 0.000 NA   NA
 1626966 1626967 MGAS9429_SpyT0031 MGAS9429_SpyT0032     FALSE 0.479 35.000 0.000 NA   NA
 1626967 1626968 MGAS9429_SpyT0032 MGAS9429_SpyT0033     TRUE 0.583 23.000 0.000 NA   NA
 1626968 1626970 MGAS9429_SpyT0033 MGAS9429_SpyT0034     TRUE 0.650 14.000 0.000 NA   NA
 1626970 1626971 MGAS9429_SpyT0034 MGAS9429_SpyT0035     TRUE 0.650 14.000 0.000 NA   NA
 1626971 1626972 MGAS9429_SpyT0035 MGAS9429_SpyT0036     TRUE 0.601 21.000 0.000 NA   NA
 1626972 1626973 MGAS9429_SpyT0036 MGAS9429_SpyT0037     TRUE 0.615 20.000 0.000 NA   NA
 1626973 1626974 MGAS9429_SpyT0037 MGAS9429_SpyT0038     TRUE 0.711 7.000 0.000 NA   NA
 1626974 1626975 MGAS9429_SpyT0038 MGAS9429_SpyT0039     TRUE 0.661 12.000 0.000 NA   NA
 1626975 1626976 MGAS9429_SpyT0039 MGAS9429_SpyT0040     TRUE 0.702 9.000 0.000 NA   NA
 1626976 1626977 MGAS9429_SpyT0040 MGAS9429_SpyT0041     TRUE 0.615 20.000 0.000 NA   NA
 1626977 2008935 MGAS9429_SpyT0041 MGAS9429_Spy0073     FALSE 0.033 260.000 0.000 NA   NA
 2008935 2008936 MGAS9429_Spy0073 MGAS9429_Spy0074     FALSE 0.014 503.000 0.000 NA   NA
 2008936 2008937 MGAS9429_Spy0074 MGAS9429_Spy0075     TRUE 0.934 31.000 0.000 0.002   NA
 2008937 2008938 MGAS9429_Spy0075 MGAS9429_Spy0076     TRUE 0.932 40.000 0.009 0.002   NA
 2008938 2008939 MGAS9429_Spy0076 MGAS9429_Spy0077   adcR FALSE 0.232 110.000 0.008 1.000   NA
 2008939 2008940 MGAS9429_Spy0077 MGAS9429_Spy0078 adcR adcC TRUE 0.949 4.000 0.192 1.000 N NA
 2008940 2008941 MGAS9429_Spy0078 MGAS9429_Spy0079 adcC adcB TRUE 0.986 -46.000 0.673 1.000 Y NA
 2008942 2008943 MGAS9429_Spy0080 MGAS9429_Spy0081   tyrS TRUE 0.535 51.000 0.004 1.000 N NA
 2008944 2008945 MGAS9429_Spy0082 MGAS9429_Spy0083 pbp1b rpoB FALSE 0.043 264.000 0.000 1.000   NA
 2008945 2008946 MGAS9429_Spy0083 MGAS9429_Spy0084 rpoB   TRUE 0.957 -42.000 0.016 0.003   NA
 2008946 2008947 MGAS9429_Spy0084 MGAS9429_Spy0085   rpoC TRUE 0.962 91.000 0.851 0.003   NA
 2008947 2008948 MGAS9429_Spy0085 MGAS9429_Spy0086 rpoC   FALSE 0.147 152.000 0.007 NA   NA
 2008948 2008949 MGAS9429_Spy0086 MGAS9429_Spy0087   comYA FALSE 0.321 93.000 0.083 NA   NA
 2008949 2008950 MGAS9429_Spy0087 MGAS9429_Spy0088 comYA comYB TRUE 0.973 -121.000 0.639 1.000 Y NA
 2008950 2008951 MGAS9429_Spy0088 MGAS9429_Spy0089 comYB comYC TRUE 0.999 2.000 0.861 0.002 Y NA
 2008951 2008952 MGAS9429_Spy0089 MGAS9429_Spy0090 comYC   TRUE 0.951 -25.000 0.110 NA Y NA
 2008952 2008953 MGAS9429_Spy0090 MGAS9429_Spy0091     TRUE 0.972 -43.000 0.786 NA   NA
 2008953 2008954 MGAS9429_Spy0091 MGAS9429_Spy0092   comYD TRUE 0.968 -7.000 0.250 NA   NA
 2008954 2008955 MGAS9429_Spy0092 MGAS9429_Spy0093 comYD   TRUE 0.949 -16.000 0.232 NA   NA
 2008955 2008956 MGAS9429_Spy0093 MGAS9429_Spy0094     TRUE 0.592 53.000 0.087 NA   NA
 2008956 2008957 MGAS9429_Spy0094 MGAS9429_Spy0095   ackA TRUE 0.630 59.000 0.130 1.000 N NA
 2008957 2008958 MGAS9429_Spy0095 MGAS9429_Spy0096 ackA   FALSE 0.054 187.000 0.000 NA   NA
 2008959 2008960 MGAS9429_Spy0097 MGAS9429_Spy0098 proC pepA TRUE 0.634 48.000 0.041 1.000 N NA
 2008960 2008961 MGAS9429_Spy0098 MGAS9429_Spy0099 pepA   FALSE 0.283 110.000 0.100 NA   NA
 2008962 2008963 MGAS9429_Spy0100 MGAS9429_Spy0101     TRUE 0.952 -3.000 0.140 NA   NA
 2008963 2008964 MGAS9429_Spy0101 MGAS9429_Spy0102     TRUE 0.933 18.000 0.239 1.000   NA
 2008964 2008965 MGAS9429_Spy0102 MGAS9429_Spy0103     FALSE 0.211 152.000 0.034 1.000   NA
 2008966 2008967 MGAS9429_Spy0104 MGAS9429_Spy0105     TRUE 0.810 -28.000 0.005 1.000 N NA
 2008967 2008968 MGAS9429_Spy0105 MGAS9429_Spy0106     TRUE 0.714 -85.000 0.034 1.000 N NA
 2008968 2008969 MGAS9429_Spy0106 MGAS9429_Spy0107   rofA FALSE 0.140 147.000 0.003 NA   NA
 2008970 2008971 MGAS9429_Spy0108 MGAS9429_Spy0109     FALSE 0.041 224.000 0.000 NA   NA
 2008971 2008972 MGAS9429_Spy0109 MGAS9429_Spy0110     TRUE 0.711 7.000 0.000 NA   NA
 2008972 2008973 MGAS9429_Spy0110 MGAS9429_Spy0111     FALSE 0.027 286.000 0.000 NA   NA
 2008973 2008974 MGAS9429_Spy0111 MGAS9429_Spy0112     TRUE 0.929 -7.000 0.061 NA   NA
 2008974 2008975 MGAS9429_Spy0112 MGAS9429_Spy0113     TRUE 0.883 7.000 0.061 NA   NA
 2008975 2008976 MGAS9429_Spy0113 MGAS9429_Spy0114   eftLSL-B TRUE 0.984 1.000 0.500 NA   NA
 2008976 2008977 MGAS9429_Spy0114 MGAS9429_Spy0115 eftLSL-B   TRUE 0.976 -55.000 1.000 NA   NA
 2008983 2008984 MGAS9429_Spy0121 MGAS9429_Spy0122   atoD2 TRUE 0.930 -45.000 0.100 1.000 Y NA
 2008984 2008985 MGAS9429_Spy0122 MGAS9429_Spy0123 atoD2   TRUE 0.996 3.000 0.200 0.003 Y NA
 2008987 2008988 MGAS9429_Spy0125 MGAS9429_Spy0126   sloR TRUE 0.674 37.000 0.016 NA N NA
 2008988 2008989 MGAS9429_Spy0126 MGAS9429_Spy0127 sloR   FALSE 0.015 451.000 0.000 NA   NA
 2008989 2008990 MGAS9429_Spy0127 MGAS9429_Spy0128   ntpI TRUE 0.905 -10.000 0.029 NA   NA
 2008990 2008991 MGAS9429_Spy0128 MGAS9429_Spy0129 ntpI ntpK TRUE 0.998 2.000 0.848 0.006   NA
 2008991 2008992 MGAS9429_Spy0129 MGAS9429_Spy0130 ntpK ntpE TRUE 0.835 69.000 0.045 0.006   NA
 2008992 2008993 MGAS9429_Spy0130 MGAS9429_Spy0131 ntpE ntpC TRUE 0.975 16.000 0.097 0.006   NA
 2008993 2008994 MGAS9429_Spy0131 MGAS9429_Spy0132 ntpC ntpF TRUE 0.999 -3.000 0.487 0.002 Y NA
 2008994 2008995 MGAS9429_Spy0132 MGAS9429_Spy0133 ntpF ntpA TRUE 0.880 201.000 0.462 0.006 Y NA
 2008995 2008996 MGAS9429_Spy0133 MGAS9429_Spy0134 ntpA ntpB TRUE 0.999 1.000 0.776 0.006 Y NA
 2008996 2008997 MGAS9429_Spy0134 MGAS9429_Spy0135 ntpB ntpD TRUE 0.991 24.000 0.238 0.006 Y NA
 2008998 2008999 MGAS9429_Spy0136 MGAS9429_Spy0137     TRUE 0.984 13.000 0.818 NA   NA
 2009000 2009001 MGAS9429_Spy0138 MGAS9429_Spy0139 purA   FALSE 0.160 327.000 0.000 0.022   NA
 2009001 2009002 MGAS9429_Spy0139 MGAS9429_Spy0140   nusG FALSE 0.096 158.000 0.000 1.000   NA
 2009002 2009003 MGAS9429_Spy0140 MGAS9429_Spy0141 nusG nga FALSE 0.027 362.000 0.000 1.000   NA
 2009003 2009004 MGAS9429_Spy0141 MGAS9429_Spy0142 nga ifs TRUE 0.961 5.000 0.286 1.000   NA
 2009004 2009005 MGAS9429_Spy0142 MGAS9429_Spy0143 ifs slo TRUE 0.893 15.000 0.125 1.000   NA
 2009005 2009006 MGAS9429_Spy0143 MGAS9429_Spy0144 slo   FALSE 0.034 255.000 0.000 NA   NA
 2009007 2009008 MGAS9429_Spy0145 MGAS9429_Spy0146     FALSE 0.016 410.000 0.000 NA   NA
 2009008 2009009 MGAS9429_Spy0146 MGAS9429_Spy0147     FALSE 0.063 175.000 0.000 NA   NA
 2009010 2009011 MGAS9429_Spy0148 MGAS9429_Spy0149 metB leuS FALSE 0.063 211.000 0.000 1.000 N NA
 2009011 2009012 MGAS9429_Spy0149 MGAS9429_Spy0150 leuS   FALSE 0.033 307.000 0.000 1.000   NA
 2009012 2009013 MGAS9429_Spy0150 MGAS9429_Spy0151     TRUE 0.924 71.000 0.431 0.023   NA
 2009013 2009014 MGAS9429_Spy0151 MGAS9429_Spy0152     TRUE 0.887 123.000 0.279 0.017 Y NA
 2009014 2009015 MGAS9429_Spy0152 MGAS9429_Spy0153     TRUE 0.802 91.000 0.328 1.000 Y NA
 2009015 2009016 MGAS9429_Spy0153 MGAS9429_Spy0154     TRUE 0.983 -37.000 0.536 1.000 Y NA
 2009016 2009017 MGAS9429_Spy0154 MGAS9429_Spy0155   araD TRUE 0.993 -22.000 0.700 1.000 Y NA
 2009017 2009018 MGAS9429_Spy0155 MGAS9429_Spy0156 araD   FALSE 0.276 58.000 0.000 NA   NA
 2009018 2009019 MGAS9429_Spy0156 MGAS9429_Spy0157     FALSE 0.095 121.000 0.000 NA   NA
 2009019 2009020 MGAS9429_Spy0157 MGAS9429_Spy0158     FALSE 0.192 253.000 0.231 NA   NA
 2009020 2009021 MGAS9429_Spy0158 MGAS9429_Spy0159   opuAA FALSE 0.014 488.000 0.000 NA   NA
 2009021 2009022 MGAS9429_Spy0159 MGAS9429_Spy0160 opuAA opuABC TRUE 0.986 16.000 0.177 0.085 Y NA
 2009022 2009023 MGAS9429_Spy0160 MGAS9429_Spy0161 opuABC polA FALSE 0.191 131.000 0.003 1.000 N NA
 2009023 2009024 MGAS9429_Spy0161 MGAS9429_Spy0162 polA   FALSE 0.103 187.000 0.005 NA   NA
 2009024 2009025 MGAS9429_Spy0162 MGAS9429_Spy0163   perR TRUE 0.498 52.000 0.010 NA   NA
 2009025 2009026 MGAS9429_Spy0163 MGAS9429_Spy0164 perR vlg FALSE 0.072 157.000 0.000 NA   NA
 2009026 2009027 MGAS9429_Spy0164 MGAS9429_Spy0165 vlg   FALSE 0.042 222.000 0.000 NA   NA
 2009027 2009028 MGAS9429_Spy0165 MGAS9429_Spy0166     TRUE 0.853 -7.000 0.000 1.000   NA
 2009029 2009030 MGAS9429_Spy0167 MGAS9429_Spy0168     FALSE 0.419 40.000 0.000 NA   NA
 2009030 2009031 MGAS9429_Spy0168 MGAS9429_Spy0169     TRUE 0.873 40.000 0.000 0.011   NA
 2009031 2009032 MGAS9429_Spy0169 MGAS9429_Spy0170     TRUE 0.859 33.000 0.000 0.081   NA
 2009032 2009033 MGAS9429_Spy0170 MGAS9429_Spy0171     FALSE 0.073 156.000 0.000 NA   NA
 2009035 2009036 MGAS9429_Spy0173 MGAS9429_Spy0174     TRUE 0.960 21.000 0.000 0.081 Y NA
 2009036 2009037 MGAS9429_Spy0174 MGAS9429_Spy0175     FALSE 0.222 68.000 0.000 NA   NA
 2009038 2009039 MGAS9429_Spy0176 MGAS9429_Spy0177   tgt TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009039 2009040 MGAS9429_Spy0177 MGAS9429_Spy0178 tgt   FALSE 0.099 218.000 0.004 1.000   NA
 2009040 2009041 MGAS9429_Spy0178 MGAS9429_Spy0179     TRUE 0.887 4.000 0.039 NA   NA
 2009041 2009042 MGAS9429_Spy0179 MGAS9429_Spy0180     FALSE 0.071 159.000 0.000 NA   NA
 2009042 2009043 MGAS9429_Spy0180 MGAS9429_Spy0181     FALSE 0.091 165.000 0.000 1.000   NA
 2009043 2009044 MGAS9429_Spy0181 MGAS9429_Spy0182     TRUE 0.963 -24.000 0.013 0.022   NA
 2009046 2009047 MGAS9429_Spy0184 MGAS9429_Spy0185 speG   FALSE 0.141 88.000 0.000 NA   NA
 2009047 2009048 MGAS9429_Spy0185 MGAS9429_Spy0186     FALSE 0.465 36.000 0.000 NA   NA
 2009048 2009049 MGAS9429_Spy0186 MGAS9429_Spy0187   pgi FALSE 0.115 97.000 0.000 NA   NA
 2009051 2009052 MGAS9429_Spy0189 MGAS9429_Spy0190     TRUE 0.734 -16.000 0.000 NA   NA
 2009052 2009053 MGAS9429_Spy0190 MGAS9429_Spy0191     TRUE 0.668 -24.000 0.000 NA   NA
 2009053 2009054 MGAS9429_Spy0191 MGAS9429_Spy0192     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 2009054 2009055 MGAS9429_Spy0192 MGAS9429_Spy0193     TRUE 0.541 28.000 0.000 NA   NA
 2009056 2009057 MGAS9429_Spy0194 MGAS9429_Spy0195 hasC2 gpsA TRUE 0.764 27.000 0.007 1.000 N NA
 2009058 2009059 MGAS9429_Spy0196 MGAS9429_Spy0197     TRUE 0.944 -7.000 0.080 1.000 N NA
 2009059 2009060 MGAS9429_Spy0197 MGAS9429_Spy0198     TRUE 0.999 0.000 0.720 0.009 Y NA
 2009060 2009061 MGAS9429_Spy0198 MGAS9429_Spy0199     FALSE 0.195 118.000 0.010 NA   NA
 2009061 2009062 MGAS9429_Spy0199 MGAS9429_Spy0200     FALSE 0.183 110.000 0.005 NA   NA
 2009062 2009063 MGAS9429_Spy0200 MGAS9429_Spy0201   radA FALSE 0.386 81.000 0.028 1.000 N NA
 2009063 2009064 MGAS9429_Spy0201 MGAS9429_Spy0202 radA   FALSE 0.139 186.000 0.009 1.000 N NA
 2009064 2009065 MGAS9429_Spy0202 MGAS9429_Spy0203     TRUE 0.515 95.000 0.278 NA   NA
 2009065 2009066 MGAS9429_Spy0203 MGAS9429_Spy0204   gltX FALSE 0.117 182.000 0.008 NA   NA
 2009066 2009067 MGAS9429_Spy0204 MGAS9429_Spy0205 gltX fasB FALSE 0.024 395.000 0.000 1.000 N NA
 2009067 2009068 MGAS9429_Spy0205 MGAS9429_Spy0206 fasB fasC TRUE 0.997 -3.000 0.750 NA Y NA
 2009068 2009069 MGAS9429_Spy0206 MGAS9429_Spy0207 fasC fasA TRUE 0.992 4.000 0.571 NA Y NA
 2009069 2009070 MGAS9429_Spy0207 MGAS9429_Spy0208 fasA fasX FALSE 0.019 540.000 0.000 1.000 N NA
 2009070 2009071 MGAS9429_Spy0208 MGAS9429_Spy0209 fasX   TRUE 0.833 -34.000 0.052 1.000 N NA
 2009071 2009072 MGAS9429_Spy0209 MGAS9429_Spy0210     TRUE 0.891 12.000 0.106 1.000   NA
 2009072 2009073 MGAS9429_Spy0210 MGAS9429_Spy0211     FALSE 0.154 84.000 0.000 NA   NA
 2009073 2009074 MGAS9429_Spy0211 MGAS9429_Spy0212   rpmH FALSE 0.103 108.000 0.000 NA   NA
 2009074 2009075 MGAS9429_Spy0212 MGAS9429_Spy0213 rpmH   FALSE 0.040 274.000 0.000 1.000   NA
 2009075 2009076 MGAS9429_Spy0213 MGAS9429_Spy0214     TRUE 0.953 49.000 0.500 1.000 Y NA
 2009076 2009077 MGAS9429_Spy0214 MGAS9429_Spy0215     TRUE 0.816 104.000 0.133 0.041 Y NA
 2009077 2009078 MGAS9429_Spy0215 MGAS9429_Spy0216     TRUE 0.998 13.000 1.000 0.041 Y NA
 2009078 2009079 MGAS9429_Spy0216 MGAS9429_Spy0217     FALSE 0.072 157.000 0.000 NA   NA
 2009079 2009080 MGAS9429_Spy0217 MGAS9429_Spy0218   nanH TRUE 0.661 12.000 0.000 NA   NA
 2009080 2009081 MGAS9429_Spy0218 MGAS9429_Spy0219 nanH   TRUE 0.862 22.000 0.108 1.000 N NA
 2009083 2009084 MGAS9429_Spy0221 MGAS9429_Spy0222 tatD   TRUE 0.906 -49.000 0.058 NA Y NA
 2009084 2009085 MGAS9429_Spy0222 MGAS9429_Spy0223   ksgA FALSE 0.390 90.000 0.093 1.000 N NA
 2009085 2009086 MGAS9429_Spy0223 MGAS9429_Spy0224 ksgA   FALSE 0.036 424.000 0.003 1.000   NA
 2009086 2009087 MGAS9429_Spy0224 MGAS9429_Spy0225     TRUE 0.959 -28.000 0.007 0.010   NA
 2009087 2009088 MGAS9429_Spy0225 MGAS9429_Spy0226   rpe TRUE 0.941 10.000 0.213 1.000   NA
 2009088 2009089 MGAS9429_Spy0226 MGAS9429_Spy0227 rpe   TRUE 0.960 -7.000 0.166 1.000 N NA
 2009089 2009090 MGAS9429_Spy0227 MGAS9429_Spy0228     TRUE 0.908 2.000 0.030 NA   NA
 2009090 2009091 MGAS9429_Spy0228 MGAS9429_Spy0229   cbf TRUE 0.905 -10.000 0.030 NA   NA
 2009091 2009092 MGAS9429_Spy0229 MGAS9429_Spy0230 cbf purR FALSE 0.101 267.000 0.052 1.000   NA
 2009092 2009093 MGAS9429_Spy0230 MGAS9429_Spy0231 purR prgA TRUE 0.813 -27.000 0.017 NA   NA
 2009093 2009094 MGAS9429_Spy0231 MGAS9429_Spy0232 prgA rpsL FALSE 0.102 208.000 0.012 NA   NA
 2009094 2009095 MGAS9429_Spy0232 MGAS9429_Spy0233 rpsL rpsG TRUE 0.991 21.000 0.224 0.006 Y NA
 2009095 2009096 MGAS9429_Spy0233 MGAS9429_Spy0234 rpsG fus FALSE 0.494 367.000 0.579 1.000 Y NA
 2009096 2009097 MGAS9429_Spy0234 MGAS9429_Spy0235 fus plr FALSE 0.032 321.000 0.000 1.000 N NA
 2009098 2009099 MGAS9429_Spy0236 MGAS9429_Spy0237     FALSE 0.188 142.000 0.032 NA   NA
 2009099 2009100 MGAS9429_Spy0237 MGAS9429_Spy0238     TRUE 0.982 -76.000 0.758 1.000 Y NA
 2009101 2009102 MGAS9429_Spy0239 MGAS9429_Spy0240   bacA TRUE 0.527 66.000 0.118 NA   NA
 2009102 2009103 MGAS9429_Spy0240 MGAS9429_Spy0241 bacA mecA FALSE 0.259 140.000 0.132 NA N NA
 2009103 2009104 MGAS9429_Spy0241 MGAS9429_Spy0242 mecA   TRUE 0.950 7.000 0.267 NA N NA
 2009104 2009105 MGAS9429_Spy0242 MGAS9429_Spy0243   rgpG TRUE 0.607 -30.000 0.000 NA   NA
 2009105 2009106 MGAS9429_Spy0243 MGAS9429_Spy0244 rgpG   TRUE 0.548 27.000 0.000 NA   NA
 2009106 2009107 MGAS9429_Spy0244 MGAS9429_Spy0245     TRUE 0.641 95.000 0.139 1.000 Y NA
 2009107 2009108 MGAS9429_Spy0245 MGAS9429_Spy0246   nifS3 TRUE 0.962 31.000 0.606 1.000 N NA
 2009108 2009109 MGAS9429_Spy0246 MGAS9429_Spy0247 nifS3 nifU TRUE 0.969 -13.000 0.292 1.000 N NA
 2009109 2009110 MGAS9429_Spy0247 MGAS9429_Spy0248 nifU   TRUE 0.992 -7.000 0.152 0.002 N NA
 2009111 2009112 MGAS9429_Spy0249 MGAS9429_Spy0250   dacA2 TRUE 0.854 168.000 0.231 0.005 Y NA
 2009113 2009114 MGAS9429_Spy0251 MGAS9429_Spy0252 oppA oppB TRUE 0.964 53.000 0.273 0.041 Y NA
 2009114 2009115 MGAS9429_Spy0252 MGAS9429_Spy0253 oppB oppC TRUE 0.998 0.000 0.556 0.041 Y NA
 2009115 2009116 MGAS9429_Spy0253 MGAS9429_Spy0254 oppC oppD TRUE 0.992 9.000 0.650 1.000 Y NA
 2009116 2009117 MGAS9429_Spy0254 MGAS9429_Spy0255 oppD oppF TRUE 0.996 -7.000 0.095 0.001 Y NA
 2009118 2009119 MGAS9429_Spy0256 MGAS9429_Spy0257     FALSE 0.018 375.000 0.000 NA   NA
 1627163 1627164 MGAS9429_SpyR0010 MGAS9429_SpyT0042     FALSE 0.395 -246.000 0.000 NA   NA
 1627164 1627165 MGAS9429_SpyT0042 MGAS9429_SpyR0011     FALSE 0.026 296.000 0.000 NA   NA
 1627165 1627166 MGAS9429_SpyR0011 MGAS9429_SpyR0012     FALSE 0.149 85.000 0.000 NA   NA
 1627166 1627167 MGAS9429_SpyR0012 MGAS9429_SpyT0043     TRUE 0.718 6.000 0.000 NA   NA
 1627167 1627168 MGAS9429_SpyT0043 MGAS9429_SpyT0044     FALSE 0.170 80.000 0.000 NA   NA
 1627168 2009120 MGAS9429_SpyT0044 MGAS9429_Spy0258   comX1-1 FALSE 0.129 92.000 0.000 NA   NA
 2009120 2009121 MGAS9429_Spy0258 MGAS9429_Spy0259 comX1-1   FALSE 0.019 502.000 0.000 1.000   NA
 2009121 2009122 MGAS9429_Spy0259 MGAS9429_Spy0260     TRUE 0.989 0.000 0.555 1.000   NA
 2009122 2009123 MGAS9429_Spy0260 MGAS9429_Spy0261     TRUE 0.804 25.000 0.068 NA   NA
 2009123 2009124 MGAS9429_Spy0261 MGAS9429_Spy0262   nadD TRUE 0.550 69.000 0.150 NA N NA
 2009124 2009125 MGAS9429_Spy0262 MGAS9429_Spy0263 nadD   TRUE 0.988 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 2009125 2009126 MGAS9429_Spy0263 MGAS9429_Spy0264     TRUE 0.896 -24.000 0.149 NA   NA
 2009126 2009127 MGAS9429_Spy0264 MGAS9429_Spy0265     TRUE 0.936 0.000 0.085 NA   NA
 2009127 2009128 MGAS9429_Spy0265 MGAS9429_Spy0266     FALSE 0.129 222.000 0.094 NA   NA
 2009128 2009129 MGAS9429_Spy0266 MGAS9429_Spy0267     FALSE 0.022 337.000 0.000 NA   NA
 2009129 2009130 MGAS9429_Spy0267 MGAS9429_Spy0268     TRUE 0.784 -10.000 0.000 NA   NA
 2009130 2009131 MGAS9429_Spy0268 MGAS9429_Spy0269     FALSE 0.048 203.000 0.000 NA   NA
 2009131 2009132 MGAS9429_Spy0269 MGAS9429_Spy0270     FALSE 0.023 327.000 0.000 NA N NA
 2009132 2009133 MGAS9429_Spy0270 MGAS9429_Spy0271     FALSE 0.143 255.000 0.000 NA Y NA
 2009133 2009134 MGAS9429_Spy0271 MGAS9429_Spy0272     TRUE 0.998 1.000 0.938 1.000 Y NA
 2009137 2009138 MGAS9429_Spy0275 MGAS9429_Spy0276     TRUE 0.997 10.000 0.490 0.004 Y NA
 2009138 2009139 MGAS9429_Spy0276 MGAS9429_Spy0277   gidB FALSE 0.410 70.000 0.006 1.000 N NA
 2009140 2009141 MGAS9429_Spy0278 MGAS9429_Spy0279 lemA   TRUE 0.766 47.000 0.222 NA   NA
 2009141 2009142 MGAS9429_Spy0279 MGAS9429_Spy0280     FALSE 0.071 231.000 0.002 NA   NA
 2009142 2009143 MGAS9429_Spy0280 MGAS9429_Spy0281     TRUE 0.502 33.000 0.000 NA   NA
 2009143 2009144 MGAS9429_Spy0281 MGAS9429_Spy0282   covR FALSE 0.089 130.000 0.000 NA   NA
 2009144 2009145 MGAS9429_Spy0282 MGAS9429_Spy0283 covR covS TRUE 0.995 6.000 0.438 0.082 Y NA
 2009145 2009146 MGAS9429_Spy0283 MGAS9429_Spy0284 covS   FALSE 0.090 215.000 0.007 NA N NA
 2009146 2009147 MGAS9429_Spy0284 MGAS9429_Spy0285   dnaB TRUE 0.909 -16.000 0.109 NA N NA
 2009147 2009148 MGAS9429_Spy0285 MGAS9429_Spy0286 dnaB dnaI TRUE 0.997 1.000 0.817 NA Y NA
 2009148 2009149 MGAS9429_Spy0286 MGAS9429_Spy0287 dnaI pgdA FALSE 0.470 63.000 0.008 1.000   NA
 2009149 2009150 MGAS9429_Spy0287 MGAS9429_Spy0288 pgdA snf FALSE 0.108 207.000 0.004 1.000   NA
 2009150 2009151 MGAS9429_Spy0288 MGAS9429_Spy0289 snf   FALSE 0.143 243.000 0.151 NA   NA
 2009151 2009152 MGAS9429_Spy0289 MGAS9429_Spy0290   murC TRUE 0.630 40.000 0.013 NA   NA
 2009152 2009153 MGAS9429_Spy0290 MGAS9429_Spy0291 murC   TRUE 0.619 46.000 0.014 1.000   NA
 2009153 2009154 MGAS9429_Spy0291 MGAS9429_Spy0292     FALSE 0.295 112.000 0.120 NA   NA
 2009154 2009155 MGAS9429_Spy0292 MGAS9429_Spy0293   greA TRUE 0.808 25.000 0.079 NA   NA
 2009156 2009157 MGAS9429_Spy0294 MGAS9429_Spy0295     FALSE 0.031 266.000 0.000 NA   NA
 2009157 2009158 MGAS9429_Spy0295 MGAS9429_Spy0296     TRUE 0.502 82.000 0.154 1.000 N NA
 2009159 2009160 MGAS9429_Spy0297 MGAS9429_Spy0298     TRUE 0.720 39.000 0.043 1.000   NA
 2009160 2009161 MGAS9429_Spy0298 MGAS9429_Spy0299     TRUE 0.875 15.000 0.123 NA   NA
 2009161 2009162 MGAS9429_Spy0299 MGAS9429_Spy0300     FALSE 0.061 178.000 0.000 NA   NA
 2009164 2009165 MGAS9429_Spy0302 MGAS9429_Spy0303 glr   TRUE 0.801 -42.000 0.034 1.000 N NA
 2009165 2009166 MGAS9429_Spy0303 MGAS9429_Spy0304     TRUE 0.900 -21.000 0.085 1.000   NA
 2009166 2009167 MGAS9429_Spy0304 MGAS9429_Spy0305     TRUE 0.950 -3.000 0.065 1.000   NA
 2009167 2009168 MGAS9429_Spy0305 MGAS9429_Spy0306     TRUE 0.955 -3.000 0.111 1.000   NA
 2009168 2009169 MGAS9429_Spy0306 MGAS9429_Spy0307     TRUE 0.915 0.000 0.017 NA   NA
 2009169 2009170 MGAS9429_Spy0307 MGAS9429_Spy0308     TRUE 0.989 -3.000 0.570 NA   NA
 2009170 2009171 MGAS9429_Spy0308 MGAS9429_Spy0309     FALSE 0.457 98.000 0.224 NA N NA
 2009171 2009172 MGAS9429_Spy0309 MGAS9429_Spy0310     TRUE 0.923 -3.000 0.014 NA   NA
 2009172 2009173 MGAS9429_Spy0310 MGAS9429_Spy0311     FALSE 0.140 142.000 0.002 NA   NA
 2009173 2009174 MGAS9429_Spy0311 MGAS9429_Spy0312     FALSE 0.024 312.000 0.000 NA   NA
 2009174 2009175 MGAS9429_Spy0312 MGAS9429_Spy0313     TRUE 0.987 2.000 0.600 NA   NA
 2009175 2009176 MGAS9429_Spy0313 MGAS9429_Spy0314     FALSE 0.095 275.000 0.050 1.000   NA
 2009176 2009177 MGAS9429_Spy0314 MGAS9429_Spy0315     TRUE 0.959 12.000 0.408 NA   NA
 2009177 2009178 MGAS9429_Spy0315 MGAS9429_Spy0316   hlyX FALSE 0.263 94.000 0.023 NA   NA
 2009178 2009179 MGAS9429_Spy0316 MGAS9429_Spy0317 hlyX pflC TRUE 0.868 6.000 0.028 NA   NA
 2009179 2009180 MGAS9429_Spy0317 MGAS9429_Spy0318 pflC ppaC FALSE 0.244 125.000 0.023 1.000 N NA
 2009180 2009181 MGAS9429_Spy0318 MGAS9429_Spy0319 ppaC   FALSE 0.354 76.000 0.015 NA   NA
 2009182 2009183 MGAS9429_Spy0320 MGAS9429_Spy0321 fhuG fhuB TRUE 0.997 -39.000 0.857 0.040 Y NA
 2009183 2009184 MGAS9429_Spy0321 MGAS9429_Spy0322 fhuB fhuD TRUE 0.983 -10.000 0.179 1.000 Y NA
 2009184 2009185 MGAS9429_Spy0322 MGAS9429_Spy0323 fhuD fhuA TRUE 0.992 26.000 0.889 1.000 Y NA
 2009185 2009186 MGAS9429_Spy0323 MGAS9429_Spy0324 fhuA murE FALSE 0.125 246.000 0.062 1.000 N NA
 2009187 2009188 MGAS9429_Spy0325 MGAS9429_Spy0326   upp FALSE 0.144 168.000 0.002 1.000   NA
 2009188 2009189 MGAS9429_Spy0326 MGAS9429_Spy0327 upp   TRUE 0.596 -31.000 0.000 NA   NA
 2009189 2009190 MGAS9429_Spy0327 MGAS9429_Spy0328   clpP FALSE 0.095 121.000 0.000 NA   NA
 2009190 2009191 MGAS9429_Spy0328 MGAS9429_Spy0329 clpP   FALSE 0.043 495.000 0.065 NA   NA
 2009191 2009192 MGAS9429_Spy0329 MGAS9429_Spy0330     FALSE 0.035 251.000 0.000 NA   NA
 2009192 2009193 MGAS9429_Spy0330 MGAS9429_Spy0331     TRUE 0.734 -16.000 0.000 NA   NA
 2009193 2009194 MGAS9429_Spy0331 MGAS9429_Spy0332   tmk FALSE 0.495 -51.000 0.000 NA   NA
 2009194 2009195 MGAS9429_Spy0332 MGAS9429_Spy0333 tmk dnaX TRUE 0.938 18.000 0.254 1.000 N NA
 2009195 2009196 MGAS9429_Spy0333 MGAS9429_Spy0334 dnaX   TRUE 0.529 122.000 0.372 NA   NA
 2009196 2009197 MGAS9429_Spy0334 MGAS9429_Spy0335     FALSE 0.137 89.000 0.000 NA   NA
 2009197 2009198 MGAS9429_Spy0335 MGAS9429_Spy0336     FALSE 0.115 97.000 0.000 NA   NA
 2009198 2009199 MGAS9429_Spy0336 MGAS9429_Spy0337     TRUE 0.808 -7.000 0.000 NA   NA
 2009199 2009200 MGAS9429_Spy0337 MGAS9429_Spy0338     TRUE 0.881 5.000 0.043 NA   NA
 2009200 2009201 MGAS9429_Spy0338 MGAS9429_Spy0339     TRUE 0.708 27.000 0.005 NA   NA
 2009205 2009206 MGAS9429_Spy0343 MGAS9429_Spy0344 lctO spyCEP FALSE 0.043 265.000 0.000 1.000   NA
 2009206 2009207 MGAS9429_Spy0344 MGAS9429_Spy0345 spyCEP   FALSE 0.019 368.000 0.000 NA   NA
 2009207 2009208 MGAS9429_Spy0345 MGAS9429_Spy0346     TRUE 0.541 28.000 0.000 NA   NA
 2009208 2009209 MGAS9429_Spy0346 MGAS9429_Spy0347     FALSE 0.178 78.000 0.000 NA   NA
 2009209 2009210 MGAS9429_Spy0347 MGAS9429_Spy0348   metS FALSE 0.038 240.000 0.000 NA   NA
 2009210 2009211 MGAS9429_Spy0348 MGAS9429_Spy0349 metS   FALSE 0.019 363.000 0.000 NA   NA
 2009211 2009212 MGAS9429_Spy0349 MGAS9429_Spy0350   nrdF1 TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009212 2009213 MGAS9429_Spy0350 MGAS9429_Spy0351 nrdF1 nrdI TRUE 0.993 4.000 0.643 NA Y NA
 2009213 2009214 MGAS9429_Spy0351 MGAS9429_Spy0352 nrdI nrdE1 TRUE 0.993 -33.000 1.000 NA Y NA
 2009214 2009215 MGAS9429_Spy0352 MGAS9429_Spy0353 nrdE1   TRUE 0.615 20.000 0.000 NA   NA
 2009217 2009218 MGAS9429_Spy0355 MGAS9429_Spy0356     FALSE 0.015 443.000 0.000 NA   NA
 2009221 2009222 MGAS9429_Spy0359 MGAS9429_Spy0360     FALSE 0.014 512.000 0.000 NA   NA
 2009223 2009224 MGAS9429_Spy0361 MGAS9429_Spy0362     TRUE 0.991 -7.000 0.710 NA   NA
 2009224 2009225 MGAS9429_Spy0362 MGAS9429_Spy0363     TRUE 0.703 43.000 0.067 1.000   NA
 2009225 2009226 MGAS9429_Spy0363 MGAS9429_Spy0364     FALSE 0.030 327.000 0.000 1.000   NA
 2009226 2009227 MGAS9429_Spy0364 MGAS9429_Spy0365   gcaD FALSE 0.140 174.000 0.002 1.000 N NA
 2009227 2009228 MGAS9429_Spy0365 MGAS9429_Spy0366 gcaD   TRUE 0.746 34.000 0.015 1.000 N NA
 2009228 2009229 MGAS9429_Spy0366 MGAS9429_Spy0367     TRUE 0.927 -3.000 0.025 NA   NA
 2009229 2009230 MGAS9429_Spy0367 MGAS9429_Spy0368   pfs TRUE 0.816 20.000 0.041 NA   NA
 2009230 2009231 MGAS9429_Spy0368 MGAS9429_Spy0369 pfs   FALSE 0.100 113.000 0.000 NA   NA
 2009233 2009234 MGAS9429_Spy0371 MGAS9429_Spy0372 mtsA mtsB TRUE 0.914 37.000 0.135 1.000 Y NA
 2009234 2009235 MGAS9429_Spy0372 MGAS9429_Spy0373 mtsB mtsC TRUE 0.981 1.000 0.130 1.000 Y NA
 2009239 2009240 MGAS9429_Spy0377 MGAS9429_Spy0378 rplK rplA TRUE 0.965 106.000 0.838 0.041 Y NA
 2009240 2009241 MGAS9429_Spy0378 MGAS9429_Spy0379 rplA pyrH FALSE 0.051 322.000 0.002 1.000 N NA
 2009241 2009242 MGAS9429_Spy0379 MGAS9429_Spy0380 pyrH rrf TRUE 0.964 29.000 0.626 1.000 N NA
 2009242 2009243 MGAS9429_Spy0380 MGAS9429_Spy0381 rrf   FALSE 0.207 109.000 0.012 NA   NA
 2009243 2009244 MGAS9429_Spy0381 MGAS9429_Spy0382   msrA2 FALSE 0.366 73.000 0.016 NA   NA
 2009244 2009245 MGAS9429_Spy0382 MGAS9429_Spy0383 msrA2   TRUE 0.951 -3.000 0.080 1.000   NA
 2009245 2009246 MGAS9429_Spy0383 MGAS9429_Spy0384     FALSE 0.194 157.000 0.023 1.000   NA
 2009246 2009247 MGAS9429_Spy0384 MGAS9429_Spy0385     FALSE 0.030 273.000 0.000 NA   NA
 2009247 2009248 MGAS9429_Spy0385 MGAS9429_Spy0386   phoH FALSE 0.128 159.000 0.004 NA   NA
 2009248 2009249 MGAS9429_Spy0386 MGAS9429_Spy0387 phoH   TRUE 0.528 46.000 0.005 NA N NA
 2009249 2009250 MGAS9429_Spy0387 MGAS9429_Spy0388     FALSE 0.180 108.000 0.003 NA   NA
 2009250 2009251 MGAS9429_Spy0388 MGAS9429_Spy0389   dgk TRUE 0.867 -19.000 0.035 NA   NA
 2009251 2009252 MGAS9429_Spy0389 MGAS9429_Spy0390 dgk era FALSE 0.286 120.000 0.063 1.000   NA
 2009252 2009253 MGAS9429_Spy0390 MGAS9429_Spy0391 era   TRUE 0.829 -25.000 0.007 1.000   NA
 2009254 2009255 MGAS9429_Spy0392 MGAS9429_Spy0393     FALSE 0.040 228.000 0.000 NA   NA
 2009256 2009257 MGAS9429_Spy0394 MGAS9429_Spy0395     TRUE 0.948 13.000 0.333 NA   NA
 2009257 2009258 MGAS9429_Spy0395 MGAS9429_Spy0396   silD FALSE 0.026 294.000 0.000 NA   NA
 2009258 2009259 MGAS9429_Spy0396 MGAS9429_Spy0397 silD   TRUE 0.916 50.000 0.667 NA   NA
 2009259 2009260 MGAS9429_Spy0397 MGAS9429_Spy0398     FALSE 0.060 179.000 0.000 NA   NA
 2009262 2009263 MGAS9429_Spy0400 MGAS9429_Spy0401     FALSE 0.126 93.000 0.000 NA   NA
 2009265 2009266 MGAS9429_Spy0403 MGAS9429_Spy0404     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 2009268 2009269 MGAS9429_Spy0406 MGAS9429_Spy0407 mutR fpg FALSE 0.146 172.000 0.004 1.000   NA
 2009269 2009270 MGAS9429_Spy0407 MGAS9429_Spy0408 fpg   TRUE 0.736 -90.000 0.066 1.000 N NA
 2009270 2009271 MGAS9429_Spy0408 MGAS9429_Spy0409     FALSE 0.072 190.000 0.000 1.000   NA
 2009271 2009272 MGAS9429_Spy0409 MGAS9429_Spy0410     FALSE 0.215 122.000 0.007 1.000   NA
 2009272 2009273 MGAS9429_Spy0410 MGAS9429_Spy0411     TRUE 0.936 -3.000 0.012 1.000 N NA
 2009273 2009274 MGAS9429_Spy0411 MGAS9429_Spy0412   secG TRUE 0.614 46.000 0.012 1.000 N NA
 2009274 2009275 MGAS9429_Spy0412 MGAS9429_Spy0413 secG   FALSE 0.350 94.000 0.064 1.000 N NA
 2009275 2009276 MGAS9429_Spy0413 MGAS9429_Spy0414     TRUE 0.983 3.000 0.143 0.034 N NA
 2009276 2009277 MGAS9429_Spy0414 MGAS9429_Spy0415     TRUE 0.934 6.000 0.000 1.000 Y NA
 2009278 2009279 MGAS9429_Spy0416 MGAS9429_Spy0417 pcp   TRUE 0.803 50.000 0.300 NA   NA
 2009279 2009280 MGAS9429_Spy0417 MGAS9429_Spy0418     TRUE 0.995 0.000 0.939 NA   NA
 2009280 2009281 MGAS9429_Spy0418 MGAS9429_Spy0419     FALSE 0.074 154.000 0.000 NA   NA
 2009281 2009282 MGAS9429_Spy0419 MGAS9429_Spy0420   gloA FALSE 0.296 85.000 0.012 NA N NA
 2009282 2009283 MGAS9429_Spy0420 MGAS9429_Spy0421 gloA   TRUE 0.866 11.000 0.019 1.000 N NA
 2009283 2009284 MGAS9429_Spy0421 MGAS9429_Spy0422   pepQ TRUE 0.641 49.000 0.053 1.000 N NA
 2009285 2009286 MGAS9429_Spy0423 MGAS9429_Spy0424 ccpA   FALSE 0.242 131.000 0.033 1.000 N NA
 2009286 2009287 MGAS9429_Spy0424 MGAS9429_Spy0425     TRUE 0.998 2.000 0.413 0.011 Y NA
 2009287 2009288 MGAS9429_Spy0425 MGAS9429_Spy0426   thrS FALSE 0.022 422.000 0.000 1.000 N NA
 2009288 2009289 MGAS9429_Spy0426 MGAS9429_Spy0427 thrS drrA FALSE 0.201 141.000 0.012 1.000   NA
 2009289 2009290 MGAS9429_Spy0427 MGAS9429_Spy0428 drrA   TRUE 0.508 -49.000 0.000 NA   NA
 2009290 2009291 MGAS9429_Spy0428 MGAS9429_Spy0429     TRUE 0.913 2.000 0.042 NA   NA
 2009291 2009292 MGAS9429_Spy0429 MGAS9429_Spy0430     FALSE 0.144 86.000 0.000 NA   NA
 2009292 2009293 MGAS9429_Spy0430 MGAS9429_Spy0431     FALSE 0.023 395.000 0.000 1.000   NA
 2009293 2009294 MGAS9429_Spy0431 MGAS9429_Spy0432     TRUE 0.983 -43.000 0.576 1.000 Y NA
 2009294 2009295 MGAS9429_Spy0432 MGAS9429_Spy0433     FALSE 0.105 219.000 0.030 NA   NA
 2009295 2009296 MGAS9429_Spy0433 MGAS9429_Spy0434   vicR FALSE 0.150 162.000 0.013 NA   NA
 2009296 2009297 MGAS9429_Spy0434 MGAS9429_Spy0435 vicR vicK TRUE 0.998 -7.000 0.597 0.055 Y NA
 2009297 2009298 MGAS9429_Spy0435 MGAS9429_Spy0436 vicK vicX TRUE 0.905 4.000 0.038 1.000   NA
 2009298 2009299 MGAS9429_Spy0436 MGAS9429_Spy0437 vicX acpA FALSE 0.035 432.000 0.002 1.000   NA
 2009299 2009300 MGAS9429_Spy0437 MGAS9429_Spy0438 acpA smc TRUE 0.948 1.000 0.120 1.000 N NA
 2009302 2009303 MGAS9429_Spy0440 MGAS9429_Spy0441 aroE2   TRUE 0.837 -3.000 0.000 NA N NA
 2009303 2009304 MGAS9429_Spy0441 MGAS9429_Spy0442     TRUE 0.682 -22.000 0.000 NA   NA
 2009304 2009305 MGAS9429_Spy0442 MGAS9429_Spy0443     TRUE 0.808 -7.000 0.000 NA   NA
 2009305 2009306 MGAS9429_Spy0443 MGAS9429_Spy0444   metK1 TRUE 0.688 10.000 0.000 NA   NA
 2009306 2009307 MGAS9429_Spy0444 MGAS9429_Spy0445 metK1   TRUE 0.734 -16.000 0.000 NA   NA
 2009307 2009308 MGAS9429_Spy0445 MGAS9429_Spy0446     FALSE 0.291 55.000 0.000 NA   NA
 2009308 2009309 MGAS9429_Spy0446 MGAS9429_Spy0447     FALSE 0.014 508.000 0.000 NA   NA
 2009309 2009310 MGAS9429_Spy0447 MGAS9429_Spy0448     TRUE 0.575 24.000 0.000 NA   NA
 2009310 2009311 MGAS9429_Spy0448 MGAS9429_Spy0449   mefE FALSE 0.195 85.000 0.000 1.000   NA
 2009312 2009313 MGAS9429_Spy0450 MGAS9429_Spy0451     TRUE 0.977 -10.000 0.400 NA   NA
 2009313 2009314 MGAS9429_Spy0451 MGAS9429_Spy0452     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 2009314 2009315 MGAS9429_Spy0452 MGAS9429_Spy0453     TRUE 0.796 -9.000 0.000 NA   NA
 2009315 2009316 MGAS9429_Spy0453 MGAS9429_Spy0454     TRUE 0.982 0.000 0.429 NA   NA
 2009317 2009318 MGAS9429_Spy0455 MGAS9429_Spy0456     TRUE 0.971 0.000 0.273 NA   NA
 2009318 2009319 MGAS9429_Spy0456 MGAS9429_Spy0457     TRUE 0.524 133.000 0.400 NA   NA
 2009319 2009320 MGAS9429_Spy0457 MGAS9429_Spy0458     FALSE 0.106 105.000 0.000 NA   NA
 2009321 2009322 MGAS9429_Spy0459 MGAS9429_Spy0461     TRUE 0.878 120.000 0.333 0.074 Y NA
 2009323 2009324 MGAS9429_Spy0460 MGAS9429_Spy0462     FALSE 0.071 159.000 0.000 NA   NA
 2009324 2009325 MGAS9429_Spy0462 MGAS9429_Spy0463     TRUE 0.992 4.000 0.375 0.020   NA
 2009325 2009326 MGAS9429_Spy0463 MGAS9429_Spy0464   ftsY TRUE 0.976 0.000 0.007 0.078   NA
 2009328 2009329 MGAS9429_Spy0466 MGAS9429_Spy0467 licT   TRUE 0.970 2.000 0.259 1.000   NA
 2009329 2009330 MGAS9429_Spy0467 MGAS9429_Spy0468   bglA TRUE 0.977 19.000 0.318 1.000 Y NA
 2009331 2009332 MGAS9429_Spy0469 MGAS9429_Spy0470     TRUE 0.986 -24.000 0.841 NA   NA
 2009332 2009333 MGAS9429_Spy0470 MGAS9429_Spy0471     FALSE 0.235 148.000 0.114 NA   NA
 2009334 2009335 MGAS9429_Spy0472 MGAS9429_Spy0473     TRUE 0.847 -58.000 0.215 NA   NA
 2009335 2009336 MGAS9429_Spy0473 MGAS9429_Spy0474     FALSE 0.484 64.000 0.051 NA   NA
 2009336 2009337 MGAS9429_Spy0474 MGAS9429_Spy0475   ptsK FALSE 0.167 305.000 0.017 NA Y NA
 2009337 2009338 MGAS9429_Spy0475 MGAS9429_Spy0476 ptsK lgt TRUE 0.988 -3.000 0.494 1.000 N NA
 2009338 2009339 MGAS9429_Spy0476 MGAS9429_Spy0477 lgt   TRUE 0.824 22.000 0.079 NA   NA
 2009339 2009340 MGAS9429_Spy0477 MGAS9429_Spy0478     TRUE 0.908 -28.000 0.206 NA   NA
 2009342 2009343 MGAS9429_Spy0480 MGAS9429_Spy0481     TRUE 0.887 102.000 0.156 0.003 Y NA
 2009346 2009347 MGAS9429_Spy0484 MGAS9429_Spy0485   lysS FALSE 0.084 136.000 0.000 NA   NA
 2009349 2009350 MGAS9429_Spy0487 MGAS9429_Spy0488     FALSE 0.051 341.000 0.018 NA   NA
 2009350 2009351 MGAS9429_Spy0488 MGAS9429_Spy0489     FALSE 0.255 91.000 0.010 NA   NA
 2009351 2009352 MGAS9429_Spy0489 MGAS9429_Spy0490     FALSE 0.095 224.000 0.016 NA   NA
 2009353 2009354 MGAS9429_Spy0491 MGAS9429_Spy0492     TRUE 0.968 -16.000 0.375 NA   NA
 2009355 2009356 MGAS9429_Spy0493 MGAS9429_Spy0494   pepF TRUE 0.783 -52.000 0.059 1.000 N NA
 2009357 2009358 MGAS9429_Spy0495 MGAS9429_Spy0496 ppc ftsW FALSE 0.223 140.000 0.028 1.000 N NA
 2009360 2009361 MGAS9429_Spy0498 MGAS9429_Spy0499   tpi FALSE 0.086 241.000 0.003 1.000 N NA
 2009362 2009363 MGAS9429_Spy0500 MGAS9429_Spy0501   murM TRUE 0.995 -13.000 0.200 0.010 Y NA
 2009363 2009364 MGAS9429_Spy0501 MGAS9429_Spy0502 murM   TRUE 0.981 -15.000 0.500 1.000   NA
 2009366 2009367 MGAS9429_Spy0504 MGAS9429_Spy0506     FALSE 0.199 72.000 0.000 NA   NA
 2009368 2009369 MGAS9429_Spy0505 MGAS9429_Spy0507   pacL FALSE 0.040 230.000 0.000 NA   NA
 2009370 2009371 MGAS9429_Spy0508 MGAS9429_Spy0509 regR   TRUE 0.879 55.000 0.562 NA   NA
 2009371 2009372 MGAS9429_Spy0509 MGAS9429_Spy0510   agaD TRUE 0.750 69.000 0.375 NA   NA
 2009372 2009373 MGAS9429_Spy0510 MGAS9429_Spy0511 agaD   TRUE 0.996 -73.000 0.933 0.021 Y NA
 2009373 2009374 MGAS9429_Spy0511 MGAS9429_Spy0512   agaV TRUE 0.998 19.000 0.933 0.021 Y NA
 2009374 2009375 MGAS9429_Spy0512 MGAS9429_Spy0513 agaV   TRUE 0.854 36.000 0.200 1.000   NA
 2009375 2009376 MGAS9429_Spy0513 MGAS9429_Spy0514     TRUE 0.951 0.000 0.120 1.000   NA
 2009377 2009378 MGAS9429_Spy0515 MGAS9429_Spy0516 idnO   TRUE 0.896 25.000 0.197 1.000 N NA
 2009378 2009379 MGAS9429_Spy0516 MGAS9429_Spy0517     TRUE 0.977 -10.000 0.094 1.000 Y NA
 2009379 2009380 MGAS9429_Spy0517 MGAS9429_Spy0518   kgdA TRUE 0.979 -13.000 0.167 1.000 Y NA
 2009380 2009381 MGAS9429_Spy0518 MGAS9429_Spy0519 kgdA   FALSE 0.151 291.000 0.000 0.047   NA
 2009381 2009382 MGAS9429_Spy0519 MGAS9429_Spy0520     FALSE 0.018 646.000 0.000 1.000   NA
 2009382 2009383 MGAS9429_Spy0520 MGAS9429_Spy0521   prfB FALSE 0.173 154.000 0.006 1.000 N NA
 2009383 2009384 MGAS9429_Spy0521 MGAS9429_Spy0522 prfB ftsE TRUE 0.859 19.000 0.053 1.000 N NA
 2009384 2009385 MGAS9429_Spy0522 MGAS9429_Spy0523 ftsE ftsX TRUE 0.979 -37.000 0.431 1.000 Y NA
 2009387 2009388 MGAS9429_Spy0525 MGAS9429_Spy0526   dinG FALSE 0.140 108.000 0.000 1.000 N NA
 2009388 2009389 MGAS9429_Spy0526 MGAS9429_Spy0527 dinG aspC FALSE 0.030 335.000 0.000 1.000 N NA
 2009389 2009390 MGAS9429_Spy0527 MGAS9429_Spy0528 aspC asnS TRUE 0.854 21.000 0.068 1.000 N NA
 2009390 2009391 MGAS9429_Spy0528 MGAS9429_Spy0529 asnS   FALSE 0.016 415.000 0.000 NA   NA
 2009391 2009392 MGAS9429_Spy0529 MGAS9429_Spy0530     TRUE 0.969 -3.000 0.214 NA   NA
 2009392 2009393 MGAS9429_Spy0530 MGAS9429_Spy0531     TRUE 0.985 -3.000 0.470 NA   NA
 2009394 2009395 MGAS9429_Spy0532 MGAS9429_Spy0533     FALSE 0.112 99.000 0.000 NA   NA
 2009395 2009396 MGAS9429_Spy0533 MGAS9429_Spy0534     FALSE 0.077 151.000 0.000 NA   NA
 2009396 2009397 MGAS9429_Spy0534 MGAS9429_Spy0535     TRUE 0.581 -34.000 0.000 NA   NA
 2009401 2009402 MGAS9429_Spy0539 MGAS9429_Spy0540     FALSE 0.069 163.000 0.000 NA   NA
 2009403 2009404 MGAS9429_Spy0541 MGAS9429_Spy0542     FALSE 0.192 73.000 0.000 NA   NA
 2009404 2009405 MGAS9429_Spy0542 MGAS9429_Spy0543     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009405 2009406 MGAS9429_Spy0543 MGAS9429_Spy0544     TRUE 0.972 10.000 0.500 NA   NA
 2009406 2009407 MGAS9429_Spy0544 MGAS9429_Spy0545     TRUE 0.769 -12.000 0.000 NA   NA
 2009407 2009408 MGAS9429_Spy0545 MGAS9429_Spy0546     FALSE 0.102 110.000 0.000 NA   NA
 2009408 2009409 MGAS9429_Spy0546 MGAS9429_Spy0547     TRUE 0.948 -13.000 0.200 NA   NA
 2009409 2009410 MGAS9429_Spy0547 MGAS9429_Spy0548     FALSE 0.118 96.000 0.000 NA   NA
 2009410 2009411 MGAS9429_Spy0548 MGAS9429_Spy0549     TRUE 0.647 16.000 0.000 NA   NA
 2009411 2009412 MGAS9429_Spy0549 MGAS9429_Spy0550     TRUE 0.919 3.000 0.100 NA   NA
 2009412 2009413 MGAS9429_Spy0550 MGAS9429_Spy0551     TRUE 0.946 -10.000 0.167 NA   NA
 2009413 2009414 MGAS9429_Spy0551 MGAS9429_Spy0552     FALSE 0.032 262.000 0.000 NA   NA
 2009414 2009415 MGAS9429_Spy0552 MGAS9429_Spy0553     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009415 2009416 MGAS9429_Spy0553 MGAS9429_Spy0554     TRUE 0.734 -16.000 0.000 NA   NA
 2009416 2009417 MGAS9429_Spy0554 MGAS9429_Spy0555     FALSE 0.092 125.000 0.000 NA   NA
 2009417 2009418 MGAS9429_Spy0555 MGAS9429_Spy0556     TRUE 0.808 -7.000 0.000 NA   NA
 2009418 2009419 MGAS9429_Spy0556 MGAS9429_Spy0557     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 2009419 2009420 MGAS9429_Spy0557 MGAS9429_Spy0558     TRUE 0.688 10.000 0.000 NA   NA
 2009420 2009421 MGAS9429_Spy0558 MGAS9429_Spy0559     TRUE 0.688 10.000 0.000 NA   NA
 2009421 2009422 MGAS9429_Spy0559 MGAS9429_Spy0560     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009422 2009423 MGAS9429_Spy0560 MGAS9429_Spy0561     FALSE 0.015 443.000 0.000 NA   NA
 2009426 2009427 MGAS9429_Spy0564 MGAS9429_Spy0565     TRUE 0.940 13.000 0.294 NA   NA
 2009428 2009429 MGAS9429_Spy0566 MGAS9429_Spy0567     FALSE 0.202 171.000 0.111 NA   NA
 2009429 2009430 MGAS9429_Spy0567 MGAS9429_Spy0568     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 2009430 2009431 MGAS9429_Spy0568 MGAS9429_Spy0569     TRUE 0.802 1.000 0.000 NA   NA
 2009431 2009432 MGAS9429_Spy0569 MGAS9429_Spy0570     TRUE 0.983 -3.000 0.400 NA   NA
 2009432 2009433 MGAS9429_Spy0570 MGAS9429_Spy0571     TRUE 0.808 -7.000 0.000 NA   NA
 2009433 2009434 MGAS9429_Spy0571 MGAS9429_Spy0572     FALSE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 2009434 2009435 MGAS9429_Spy0572 MGAS9429_Spy0573     TRUE 0.682 -22.000 0.000 NA   NA
 2009435 2009436 MGAS9429_Spy0573 MGAS9429_Spy0574     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 2009436 2009437 MGAS9429_Spy0574 MGAS9429_Spy0575     TRUE 0.650 14.000 0.000 NA   NA
 2009437 2009438 MGAS9429_Spy0575 MGAS9429_Spy0576     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 2009438 2009439 MGAS9429_Spy0576 MGAS9429_Spy0577     TRUE 0.976 -3.000 0.286 NA   NA
 2009439 2009440 MGAS9429_Spy0577 MGAS9429_Spy0578     TRUE 0.956 -3.000 0.150 NA   NA
 2009440 2009441 MGAS9429_Spy0578 MGAS9429_Spy0579     TRUE 0.973 -3.000 0.250 NA   NA
 2009441 2009442 MGAS9429_Spy0579 MGAS9429_Spy0580     TRUE 0.977 16.000 0.667 NA   NA
 2009442 2009443 MGAS9429_Spy0580 MGAS9429_Spy0581     TRUE 0.809 53.000 0.333 NA   NA
 2009443 2009444 MGAS9429_Spy0581 MGAS9429_Spy0582     TRUE 0.980 30.000 1.000 NA   NA
 2009444 2009445 MGAS9429_Spy0582 MGAS9429_Spy0583     TRUE 0.977 13.000 0.667 NA   NA
 2009445 2009446 MGAS9429_Spy0583 MGAS9429_Spy0584     TRUE 0.990 0.000 0.667 NA   NA
 2009446 2009447 MGAS9429_Spy0584 MGAS9429_Spy0585     TRUE 0.966 -3.000 0.200 NA   NA
 2009447 2009448 MGAS9429_Spy0585 MGAS9429_Spy0586     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009448 2009449 MGAS9429_Spy0586 MGAS9429_Spy0587     TRUE 0.989 13.000 1.000 1.000   NA
 2009449 2009450 MGAS9429_Spy0587 MGAS9429_Spy0588     TRUE 0.661 12.000 0.000 NA   NA
 2009450 2009451 MGAS9429_Spy0588 MGAS9429_Spy0589     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 2009451 2009452 MGAS9429_Spy0589 MGAS9429_Spy0590     TRUE 0.688 10.000 0.000 NA   NA
 2009452 2009453 MGAS9429_Spy0590 MGAS9429_Spy0591     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009453 2009454 MGAS9429_Spy0591 MGAS9429_Spy0592     FALSE 0.098 116.000 0.000 NA   NA
 2009455 2009456 MGAS9429_Spy0593 MGAS9429_Spy0594 speC spd1 FALSE 0.134 111.000 0.000 1.000   NA
 2009457 2009458 MGAS9429_Spy0595 MGAS9429_Spy0596 pepD   FALSE 0.409 152.000 0.250 1.000 N NA
 2009458 2009459 MGAS9429_Spy0596 MGAS9429_Spy0597     FALSE 0.269 139.000 0.091 1.000 N NA
 2009459 2009460 MGAS9429_Spy0597 MGAS9429_Spy0598   agaS TRUE 0.907 20.000 0.178 1.000 N NA
 2009461 2009462 MGAS9429_Spy0599 MGAS9429_Spy0600 rpmE   FALSE 0.252 115.000 0.020 1.000   NA
 2009463 2009464 MGAS9429_Spy0601 MGAS9429_Spy0602     FALSE 0.280 175.000 0.167 1.000 N NA
 2009464 2009465 MGAS9429_Spy0602 MGAS9429_Spy0603     TRUE 0.909 -19.000 0.094 1.000 N NA
 2009465 2009466 MGAS9429_Spy0603 MGAS9429_Spy0604   rplS FALSE 0.222 115.000 0.006 1.000 N NA
 2009466 1627516 MGAS9429_Spy0604 MGAS9429_SpyT0045 rplS   FALSE 0.036 247.000 0.000 NA   NA
 1627516 2009467 MGAS9429_SpyT0045 MGAS9429_Spy0605     FALSE 0.012 685.000 0.000 NA   NA
 2009467 2009468 MGAS9429_Spy0605 MGAS9429_Spy0606   gyrB TRUE 0.922 1.000 0.013 1.000   NA
 2009468 2009469 MGAS9429_Spy0606 MGAS9429_Spy0607 gyrB   FALSE 0.047 392.000 0.011 1.000 N NA
 2009472 2009473 MGAS9429_Spy0610 MGAS9429_Spy0611     FALSE 0.144 86.000 0.000 NA   NA
 2009473 2009474 MGAS9429_Spy0611 MGAS9429_Spy0612     FALSE 0.020 362.000 0.000 NA   NA
 2009475 2009476 MGAS9429_Spy0613 MGAS9429_Spy0614 epf sagA FALSE 0.012 865.000 0.000 NA   NA
 2009476 2009477 MGAS9429_Spy0614 MGAS9429_Spy0615 sagA sagB FALSE 0.042 222.000 0.000 NA   NA
 2009477 2009478 MGAS9429_Spy0615 MGAS9429_Spy0616 sagB sagC TRUE 0.966 -3.000 0.200 NA   NA
 2009478 2009479 MGAS9429_Spy0616 MGAS9429_Spy0617 sagC sagD TRUE 0.935 20.000 0.318 NA   NA
 2009479 2009480 MGAS9429_Spy0617 MGAS9429_Spy0618 sagD sagE TRUE 0.881 -25.000 0.136 NA   NA
 2009480 2009481 MGAS9429_Spy0618 MGAS9429_Spy0619 sagE sagF TRUE 0.993 -3.000 0.750 NA   NA
 2009481 2009482 MGAS9429_Spy0619 MGAS9429_Spy0620 sagF sagG TRUE 0.974 23.000 0.750 NA   NA
 2009482 2009483 MGAS9429_Spy0620 MGAS9429_Spy0621 sagG   TRUE 0.973 9.000 0.500 NA   NA
 2009483 2009484 MGAS9429_Spy0621 MGAS9429_Spy0622   sagH FALSE 0.479 35.000 0.000 NA   NA
 2009484 2009485 MGAS9429_Spy0622 MGAS9429_Spy0623 sagH sagI TRUE 0.992 -3.000 0.160 0.008   NA
 2009487 2009488 MGAS9429_Spy0625 MGAS9429_Spy0626     FALSE 0.029 278.000 0.000 NA   NA
 2009488 2009489 MGAS9429_Spy0626 MGAS9429_Spy0627   lig FALSE 0.108 194.000 0.010 NA   NA
 2009489 2009490 MGAS9429_Spy0627 MGAS9429_Spy0628 lig   TRUE 0.846 14.000 0.013 1.000 N NA
 2009490 2009491 MGAS9429_Spy0628 MGAS9429_Spy0629   atpE FALSE 0.023 392.000 0.000 1.000   NA
 2009491 2009492 MGAS9429_Spy0629 MGAS9429_Spy0630 atpE atpB TRUE 0.961 35.000 0.189 0.010   NA
 2009492 2009493 MGAS9429_Spy0630 MGAS9429_Spy0631 atpB atpF TRUE 0.985 18.000 0.032 0.010 Y NA
 2009493 2009494 MGAS9429_Spy0631 MGAS9429_Spy0632 atpF atpH TRUE 0.997 0.000 0.222 0.009 Y NA
 2009494 2009495 MGAS9429_Spy0632 MGAS9429_Spy0633 atpH atpA TRUE 0.998 16.000 0.864 0.009 Y NA
 2009495 2009496 MGAS9429_Spy0633 MGAS9429_Spy0634 atpA atpG TRUE 0.998 16.000 0.846 0.009 Y NA
 2009496 2009497 MGAS9429_Spy0634 MGAS9429_Spy0635 atpG atpD TRUE 0.948 162.000 0.724 0.009 Y NA
 2009497 2009498 MGAS9429_Spy0635 MGAS9429_Spy0636 atpD atpC TRUE 0.998 13.000 0.837 0.009 Y NA
 2009498 2009499 MGAS9429_Spy0636 MGAS9429_Spy0637 atpC   FALSE 0.081 266.000 0.039 NA   NA
 2009499 2009500 MGAS9429_Spy0637 MGAS9429_Spy0638   murA TRUE 0.709 65.000 0.279 NA   NA
 2009500 2009501 MGAS9429_Spy0638 MGAS9429_Spy0639 murA epuA TRUE 0.911 4.000 0.110 NA   NA
 2009501 2009502 MGAS9429_Spy0639 MGAS9429_Spy0640 epuA endA TRUE 0.855 36.000 0.237 NA   NA
 2009502 2009503 MGAS9429_Spy0640 MGAS9429_Spy0641 endA pheS FALSE 0.038 283.000 0.000 1.000   NA
 2009503 2009504 MGAS9429_Spy0641 MGAS9429_Spy0642 pheS pheT TRUE 0.929 195.000 0.574 0.001 Y NA
 2009504 2009505 MGAS9429_Spy0642 MGAS9429_Spy0643 pheT   FALSE 0.354 74.000 0.002 1.000 N NA
 2009505 2009506 MGAS9429_Spy0643 MGAS9429_Spy0644     TRUE 0.896 -7.000 0.006 NA   NA
 2009506 2009507 MGAS9429_Spy0644 MGAS9429_Spy0645     FALSE 0.192 73.000 0.000 NA   NA
 2009507 2009508 MGAS9429_Spy0645 MGAS9429_Spy0646     TRUE 0.979 7.000 0.222 1.000 Y NA
 2009510 2009511 MGAS9429_Spy0648 MGAS9429_Spy0649 rexB rexA TRUE 0.974 -39.000 0.070 0.070 Y NA
 2009511 2009512 MGAS9429_Spy0649 MGAS9429_Spy0650 rexA   FALSE 0.133 116.000 0.000 1.000 N NA
 2009512 2009513 MGAS9429_Spy0650 MGAS9429_Spy0651   rpsU FALSE 0.218 141.000 0.027 1.000   NA
 2009515 2009516 MGAS9429_Spy0653 MGAS9429_Spy0654 dnaG rpoD TRUE 0.944 9.000 0.209 1.000 N NA
 2009516 2009517 MGAS9429_Spy0654 MGAS9429_Spy0655 rpoD   FALSE 0.101 236.000 0.044 NA   NA
 2009517 2009518 MGAS9429_Spy0655 MGAS9429_Spy0656   rmlD FALSE 0.490 78.000 0.152 NA   NA
 2009518 2009519 MGAS9429_Spy0656 MGAS9429_Spy0657 rmlD rgpAc TRUE 0.663 119.000 0.212 1.000 Y NA
 2009519 2009520 MGAS9429_Spy0657 MGAS9429_Spy0658 rgpAc rgpBc TRUE 0.968 -10.000 0.289 NA   NA
 2009520 2009521 MGAS9429_Spy0658 MGAS9429_Spy0659 rgpBc   TRUE 0.596 -31.000 0.000 NA   NA
 2009521 2009522 MGAS9429_Spy0659 MGAS9429_Spy0660   rgpCc FALSE 0.460 -61.000 0.000 NA   NA
 2009522 2009523 MGAS9429_Spy0660 MGAS9429_Spy0661 rgpCc rgpDc TRUE 0.862 0.000 0.000 1.000 N NA
 2009523 2009524 MGAS9429_Spy0661 MGAS9429_Spy0662 rgpDc rgpEc TRUE 0.564 25.000 0.000 NA   NA
 2009524 2009525 MGAS9429_Spy0662 MGAS9429_Spy0663 rgpEc rgpFc TRUE 0.982 -3.000 0.385 NA   NA
 2009525 2009526 MGAS9429_Spy0663 MGAS9429_Spy0664 rgpFc   TRUE 0.960 -3.000 0.000 NA Y NA
 2009526 2009527 MGAS9429_Spy0664 MGAS9429_Spy0665     FALSE 0.233 179.000 0.000 NA Y NA
 2009527 2009528 MGAS9429_Spy0665 MGAS9429_Spy0666     TRUE 0.985 2.000 0.568 NA   NA
 2009528 2009529 MGAS9429_Spy0666 MGAS9429_Spy0667   amrA TRUE 0.916 -7.000 0.027 NA   NA
 2009529 2009530 MGAS9429_Spy0667 MGAS9429_Spy0668 amrA   TRUE 0.927 -19.000 0.182 NA   NA
 2009530 2009531 MGAS9429_Spy0668 MGAS9429_Spy0669   pepT FALSE 0.158 82.000 0.000 NA   NA
 2009531 2009532 MGAS9429_Spy0669 MGAS9429_Spy0670 pepT ebsA TRUE 0.663 41.000 0.051 NA   NA
 2009534 2009535 MGAS9429_Spy0672 MGAS9429_Spy0673   cmk TRUE 0.840 15.000 0.012 1.000   NA
 2009535 2009536 MGAS9429_Spy0673 MGAS9429_Spy0674 cmk infC FALSE 0.175 162.000 0.010 1.000 N NA
 2009536 2009537 MGAS9429_Spy0674 MGAS9429_Spy0675 infC rpl36 TRUE 0.974 42.000 0.652 1.000 Y NA
 2009537 2009538 MGAS9429_Spy0675 MGAS9429_Spy0676 rpl36 rplT TRUE 0.991 59.000 0.928 0.028 Y NA
 2009540 2009541 MGAS9429_Spy0678 MGAS9429_Spy0679   aroD TRUE 0.957 -3.000 0.125 1.000   NA
 2009541 2009542 MGAS9429_Spy0679 MGAS9429_Spy0680 aroD aroF TRUE 0.842 94.000 0.004 0.003 Y NA
 2009542 2009543 MGAS9429_Spy0680 MGAS9429_Spy0681 aroF   FALSE 0.409 61.000 0.005 NA   NA
 2009543 2009544 MGAS9429_Spy0681 MGAS9429_Spy0682   gor FALSE 0.095 212.000 0.010 NA   NA
 2009545 2009546 MGAS9429_Spy0683 MGAS9429_Spy0684 folC2   TRUE 0.957 6.000 0.308 NA   NA
 2009547 2009548 MGAS9429_Spy0685 MGAS9429_Spy0686 nifS1 thiI TRUE 0.959 12.000 0.349 1.000 N NA
 2009548 2009549 MGAS9429_Spy0686 MGAS9429_Spy0687 thiI capA TRUE 0.702 38.000 0.014 1.000 N NA
 2009549 2009550 MGAS9429_Spy0687 MGAS9429_Spy0688 capA rplU FALSE 0.062 214.000 0.000 1.000 N NA
 2009550 2009551 MGAS9429_Spy0688 MGAS9429_Spy0689 rplU   TRUE 0.969 12.000 0.208 NA Y NA
 2009551 2009552 MGAS9429_Spy0689 MGAS9429_Spy0690   rpmA TRUE 0.948 28.000 0.203 NA Y NA
 2009552 2009553 MGAS9429_Spy0690 MGAS9429_Spy0691 rpmA   FALSE 0.029 348.000 0.000 1.000 N NA
 2009553 2009554 MGAS9429_Spy0691 MGAS9429_Spy0692   lsp TRUE 0.957 -3.000 0.119 1.000 N NA
 2009554 2009555 MGAS9429_Spy0692 MGAS9429_Spy0693 lsp   TRUE 0.936 -10.000 0.082 1.000 N NA
 2009555 2009556 MGAS9429_Spy0693 MGAS9429_Spy0694   pyrR FALSE 0.056 396.000 0.048 1.000 N NA
 2009556 2009557 MGAS9429_Spy0694 MGAS9429_Spy0695 pyrR pyrP TRUE 0.960 16.000 0.140 1.000 Y NA
 2009557 2009558 MGAS9429_Spy0695 MGAS9429_Spy0696 pyrP pyrB TRUE 0.964 7.000 0.064 1.000 Y NA
 2009558 2009559 MGAS9429_Spy0696 MGAS9429_Spy0697 pyrB carA TRUE 0.844 44.000 0.014 1.000 Y NA
 2009559 2009560 MGAS9429_Spy0697 MGAS9429_Spy0698 carA   TRUE 0.624 -28.000 0.000 NA   NA
 2009560 2009561 MGAS9429_Spy0698 MGAS9429_Spy0699   carB FALSE 0.182 77.000 0.000 NA   NA
 2009561 2009562 MGAS9429_Spy0699 MGAS9429_Spy0700 carB   FALSE 0.133 206.000 0.017 1.000 N NA
 2009562 2009563 MGAS9429_Spy0700 MGAS9429_Spy0701     TRUE 0.995 0.000 0.923 1.000 N NA
 2009563 2009564 MGAS9429_Spy0701 MGAS9429_Spy0702     TRUE 0.995 12.000 0.923 1.000 Y NA
 2009564 2009565 MGAS9429_Spy0702 MGAS9429_Spy0703     FALSE 0.063 212.000 0.000 1.000 N NA
 2009565 2009566 MGAS9429_Spy0703 MGAS9429_Spy0704   rpsP FALSE 0.196 127.000 0.003 1.000 N NA
 2009566 2009567 MGAS9429_Spy0704 MGAS9429_Spy0705 rpsP   TRUE 0.966 10.000 0.385 1.000   NA
 2009567 2009568 MGAS9429_Spy0705 MGAS9429_Spy0706     FALSE 0.016 932.000 0.000 1.000   NA
 2009568 2009569 MGAS9429_Spy0706 MGAS9429_Spy0707     TRUE 0.915 20.000 0.200 1.000   NA
 2009571 2009572 MGAS9429_Spy0709 MGAS9429_Spy0710   rimM FALSE 0.061 215.000 0.000 1.000 N NA
 2009572 2009573 MGAS9429_Spy0710 MGAS9429_Spy0711 rimM trmD TRUE 0.996 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 2009573 2009574 MGAS9429_Spy0711 MGAS9429_Spy0712 trmD trxB TRUE 0.838 12.000 0.007 1.000 N NA
 2009574 2009575 MGAS9429_Spy0712 MGAS9429_Spy0713 trxB   FALSE 0.165 178.000 0.059 NA   NA
 2009575 2009576 MGAS9429_Spy0713 MGAS9429_Spy0714   apbA TRUE 0.948 13.000 0.333 NA   NA
 2009576 2009577 MGAS9429_Spy0714 MGAS9429_Spy0715 apbA fruR FALSE 0.047 256.000 0.000 1.000 N NA
 2009577 2009578 MGAS9429_Spy0715 MGAS9429_Spy0716 fruR fruB TRUE 0.997 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 2009578 2009579 MGAS9429_Spy0716 MGAS9429_Spy0717 fruB fruA TRUE 0.998 -3.000 0.816 1.000 Y NA
 2009579 2009580 MGAS9429_Spy0717 MGAS9429_Spy0718 fruA mur1-1 FALSE 0.312 93.000 0.022 1.000 N NA
 2009580 2009581 MGAS9429_Spy0718 MGAS9429_Spy0719 mur1-1 mur1-2 TRUE 0.905 152.000 0.333 0.003 Y NA
 2009582 2009583 MGAS9429_Spy0720 MGAS9429_Spy0721     FALSE 0.048 203.000 0.000 NA   NA
 2009583 2009584 MGAS9429_Spy0721 MGAS9429_Spy0722     TRUE 0.650 -25.000 0.000 NA   NA
 2009584 2009585 MGAS9429_Spy0722 MGAS9429_Spy0723   mac FALSE 0.064 173.000 0.000 NA   NA
 2009586 2009587 MGAS9429_Spy0724 MGAS9429_Spy0725     FALSE 0.041 225.000 0.000 NA   NA
 2009587 2009588 MGAS9429_Spy0725 MGAS9429_Spy0726     FALSE 0.054 228.000 0.000 1.000   NA
 2009588 2009589 MGAS9429_Spy0726 MGAS9429_Spy0727     TRUE 0.946 0.000 0.139 NA   NA
 2009589 2009590 MGAS9429_Spy0727 MGAS9429_Spy0728   papS FALSE 0.181 125.000 0.009 NA   NA
 2009590 2009591 MGAS9429_Spy0728 MGAS9429_Spy0729 papS   TRUE 0.947 -3.000 0.056 1.000   NA
 2009591 2009592 MGAS9429_Spy0729 MGAS9429_Spy0730     FALSE 0.017 396.000 0.000 NA   NA
 2009592 2009593 MGAS9429_Spy0730 MGAS9429_Spy0731     FALSE 0.408 -106.000 0.000 NA   NA
 2009593 2009594 MGAS9429_Spy0731 MGAS9429_Spy0732   fms FALSE 0.033 256.000 0.000 NA   NA
 2009596 2009597 MGAS9429_Spy0734 MGAS9429_Spy0735   sptR TRUE 0.991 3.000 0.800 1.000   NA
 2009597 2009598 MGAS9429_Spy0735 MGAS9429_Spy0736 sptR sptS TRUE 0.991 -18.000 0.533 1.000 Y NA
 2009598 2009599 MGAS9429_Spy0736 MGAS9429_Spy0737 sptS mvaK1 FALSE 0.035 304.000 0.000 1.000 N NA
 2009599 2009600 MGAS9429_Spy0737 MGAS9429_Spy0738 mvaK1 mvaD TRUE 0.996 -18.000 0.281 0.003 Y NA
 2009600 2009601 MGAS9429_Spy0738 MGAS9429_Spy0739 mvaD mvaK2 TRUE 0.990 -55.000 0.312 0.005 Y NA
 2009601 2009602 MGAS9429_Spy0739 MGAS9429_Spy0740 mvaK2   TRUE 0.746 -103.000 0.097 1.000 N NA
 2009602 2009603 MGAS9429_Spy0740 MGAS9429_Spy0741     FALSE 0.093 163.000 0.000 1.000   NA
 2009604 2009605 MGAS9429_Spy0742 MGAS9429_Spy0743   mvaS1 TRUE 0.981 -13.000 0.183 1.000 Y NA
 2009606 2009607 MGAS9429_Spy0744 MGAS9429_Spy0745 thyA dyr TRUE 0.669 80.000 0.295 1.000 N NA
 2009607 2009608 MGAS9429_Spy0745 MGAS9429_Spy0746 dyr   TRUE 0.807 20.000 0.030 NA   NA
 2009608 2009609 MGAS9429_Spy0746 MGAS9429_Spy0747   clpX FALSE 0.185 130.000 0.012 NA   NA
 2009609 2009610 MGAS9429_Spy0747 MGAS9429_Spy0748 clpX   TRUE 0.882 10.000 0.043 1.000   NA
 2009610 2009611 MGAS9429_Spy0748 MGAS9429_Spy0749     FALSE 0.140 148.000 0.004 NA   NA
 2009613 2009614 MGAS9429_Spy0751 MGAS9429_Spy0752 rpiA deoB TRUE 0.674 77.000 0.018 1.000 Y NA
 2009614 2009615 MGAS9429_Spy0752 MGAS9429_Spy0753 deoB arsC TRUE 0.889 13.000 0.108 1.000 N NA
 2009615 2009616 MGAS9429_Spy0753 MGAS9429_Spy0754 arsC punA TRUE 0.923 -16.000 0.108 1.000 N NA
 2009616 2009617 MGAS9429_Spy0754 MGAS9429_Spy0755 punA deoD2 FALSE 0.413 663.000 0.040 0.001 Y NA
 2009617 2009618 MGAS9429_Spy0755 MGAS9429_Spy0756 deoD2 cpsX TRUE 0.917 -13.000 0.107 NA   NA
 2009620 2009621 MGAS9429_Spy0758 MGAS9429_Spy0759   pyrF FALSE 0.029 277.000 0.000 NA   NA
 2009621 2009622 MGAS9429_Spy0759 MGAS9429_Spy0760 pyrF pyrE TRUE 0.829 58.000 0.133 1.000 Y NA
 2009622 2009623 MGAS9429_Spy0760 MGAS9429_Spy0761 pyrE amiC FALSE 0.071 197.000 0.000 1.000 N NA
 2009623 2009624 MGAS9429_Spy0761 MGAS9429_Spy0762 amiC   TRUE 0.540 82.000 0.182 1.000 N NA
 2009624 2009625 MGAS9429_Spy0762 MGAS9429_Spy0763     TRUE 0.977 29.000 0.125 0.035 Y NA
 2009625 2009626 MGAS9429_Spy0763 MGAS9429_Spy0764   ung FALSE 0.232 133.000 0.025 1.000 N NA
 2009626 2009627 MGAS9429_Spy0764 MGAS9429_Spy0765 ung pyrC FALSE 0.210 132.000 0.009 1.000 N NA
 2009629 2009630 MGAS9429_Spy0767 MGAS9429_Spy0768 parE parC TRUE 0.971 85.000 0.552 0.003 Y NA
 2009630 2009631 MGAS9429_Spy0768 MGAS9429_Spy0769 parC bcaT FALSE 0.468 78.000 0.086 1.000 N NA
 2009631 2009632 MGAS9429_Spy0769 MGAS9429_Spy0770 bcaT   TRUE 0.546 61.000 0.095 NA   NA
 2009632 1627683 MGAS9429_Spy0770 MGAS9429_SpyT0046     FALSE 0.260 61.000 0.000 NA   NA
 1627683 1627684 MGAS9429_SpyT0046 MGAS9429_SpyT0047     FALSE 0.310 52.000 0.000 NA   NA
 1627684 2009633 MGAS9429_SpyT0047 MGAS9429_Spy0771     FALSE 0.093 124.000 0.000 NA   NA
 2009633 1627686 MGAS9429_Spy0771 MGAS9429_SpyT0048     FALSE 0.100 113.000 0.000 NA   NA
 2009635 2009636 MGAS9429_Spy0773 MGAS9429_Spy0774     FALSE 0.205 71.000 0.000 NA   NA
 2009636 2009637 MGAS9429_Spy0774 MGAS9429_Spy0775     FALSE 0.086 133.000 0.000 NA   NA
 2009637 2009638 MGAS9429_Spy0775 MGAS9429_Spy0776     TRUE 0.533 37.000 0.000 1.000   NA
 2009638 2009639 MGAS9429_Spy0776 MGAS9429_Spy0777     TRUE 0.797 -16.000 0.000 1.000 N NA
 2009641 2009642 MGAS9429_Spy0779 MGAS9429_Spy0780 miaA hflX TRUE 0.526 61.000 0.027 1.000   NA
 2009642 2009643 MGAS9429_Spy0780 MGAS9429_Spy0781 hflX   TRUE 0.877 -19.000 0.014 1.000   NA
 2009643 2009644 MGAS9429_Spy0781 MGAS9429_Spy0782   elaC TRUE 0.852 15.000 0.022 1.000   NA
 2009644 2009645 MGAS9429_Spy0782 MGAS9429_Spy0783 elaC   TRUE 0.945 0.000 0.074 1.000   NA
 2009645 2009646 MGAS9429_Spy0783 MGAS9429_Spy0784     TRUE 0.873 -3.000 0.000 1.000   NA
 2009646 2009647 MGAS9429_Spy0784 MGAS9429_Spy0785   recJ TRUE 0.631 -40.000 0.000 1.000   NA
 2009647 2009648 MGAS9429_Spy0785 MGAS9429_Spy0786 recJ apt FALSE 0.103 151.000 0.000 1.000   NA
 2009648 2009649 MGAS9429_Spy0786 MGAS9429_Spy0787 apt dnaD FALSE 0.283 81.000 0.005 NA N NA
 2009649 2009650 MGAS9429_Spy0787 MGAS9429_Spy0788 dnaD nth TRUE 0.973 -3.000 0.007 NA Y NA
 2009650 2009651 MGAS9429_Spy0788 MGAS9429_Spy0789 nth   FALSE 0.339 72.000 0.006 NA   NA
 2009651 2009652 MGAS9429_Spy0789 MGAS9429_Spy0790     TRUE 0.957 -16.000 0.283 NA   NA
 2009652 2009653 MGAS9429_Spy0790 MGAS9429_Spy0791     TRUE 0.700 35.000 0.021 NA   NA
 2009653 2009654 MGAS9429_Spy0791 MGAS9429_Spy0792   cpsFO TRUE 0.589 58.000 0.059 1.000 N NA
 2009654 2009655 MGAS9429_Spy0792 MGAS9429_Spy0793 cpsFO cpsFP TRUE 0.984 0.000 0.149 1.000 Y NA
 2009655 2009656 MGAS9429_Spy0793 MGAS9429_Spy0794 cpsFP cpsFQ TRUE 0.520 244.000 0.350 1.000 Y NA
 2009657 2009658 MGAS9429_Spy0795 MGAS9429_Spy0796 int2   FALSE 0.084 136.000 0.000 NA   NA
 2009658 2009659 MGAS9429_Spy0796 MGAS9429_Spy0797     FALSE 0.441 38.000 0.000 NA   NA
 2009660 2009661 MGAS9429_Spy0798 MGAS9429_Spy0799     TRUE 0.882 27.000 0.000 0.068   NA
 2009662 2009663 MGAS9429_Spy0800 MGAS9429_Spy0802     FALSE 0.080 142.000 0.000 NA   NA
 2009664 2009665 MGAS9429_Spy0801 MGAS9429_Spy0803   xis FALSE 0.178 78.000 0.000 NA   NA
 2009665 2009666 MGAS9429_Spy0803 MGAS9429_Spy0804 xis   TRUE 0.790 2.000 0.000 NA   NA
 2009666 2009667 MGAS9429_Spy0804 MGAS9429_Spy0805     FALSE 0.111 100.000 0.000 NA   NA
 2009667 2009668 MGAS9429_Spy0805 MGAS9429_Spy0806     FALSE 0.176 144.000 0.018 NA   NA
 2009668 2009669 MGAS9429_Spy0806 MGAS9429_Spy0807     TRUE 0.857 -19.000 0.018 NA   NA
 2009669 2009670 MGAS9429_Spy0807 MGAS9429_Spy0808     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009670 2009671 MGAS9429_Spy0808 MGAS9429_Spy0809     TRUE 0.702 9.000 0.000 NA   NA
 2009671 2009672 MGAS9429_Spy0809 MGAS9429_Spy0810     FALSE 0.286 56.000 0.000 NA   NA
 2009672 2009673 MGAS9429_Spy0810 MGAS9429_Spy0811     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 2009673 2009674 MGAS9429_Spy0811 MGAS9429_Spy0812     TRUE 0.885 10.000 0.100 NA   NA
 2009674 2009675 MGAS9429_Spy0812 MGAS9429_Spy0813     FALSE 0.054 187.000 0.000 NA   NA
 2009675 2009676 MGAS9429_Spy0813 MGAS9429_Spy0814     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009676 2009677 MGAS9429_Spy0814 MGAS9429_Spy0815     TRUE 0.758 -13.000 0.000 NA   NA
 2009677 2009678 MGAS9429_Spy0815 MGAS9429_Spy0816     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009678 2009679 MGAS9429_Spy0816 MGAS9429_Spy0817     FALSE 0.424 -88.000 0.000 NA   NA
 2009679 2009680 MGAS9429_Spy0817 MGAS9429_Spy0818     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009680 2009681 MGAS9429_Spy0818 MGAS9429_Spy0819     FALSE 0.028 285.000 0.000 NA   NA
 2009681 2009682 MGAS9429_Spy0819 MGAS9429_Spy0820     FALSE 0.405 41.000 0.000 NA   NA
 2009682 2009683 MGAS9429_Spy0820 MGAS9429_Spy0821     FALSE 0.023 315.000 0.000 NA   NA
 2009685 2009686 MGAS9429_Spy0823 MGAS9429_Spy0824     TRUE 0.952 -28.000 0.000 0.003   NA
 2009686 2009687 MGAS9429_Spy0824 MGAS9429_Spy0825     TRUE 0.934 12.000 0.250 NA   NA
 2009687 2009688 MGAS9429_Spy0825 MGAS9429_Spy0826     TRUE 0.708 -19.000 0.000 NA   NA
 2009688 2009689 MGAS9429_Spy0826 MGAS9429_Spy0827     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 2009689 2009690 MGAS9429_Spy0827 MGAS9429_Spy0828     FALSE 0.018 386.000 0.000 NA   NA
 2009690 2009691 MGAS9429_Spy0828 MGAS9429_Spy0829     FALSE 0.085 135.000 0.000 NA   NA
 2009691 2009692 MGAS9429_Spy0829 MGAS9429_Spy0830     TRUE 0.877 10.000 0.077 NA   NA
 2009692 2009693 MGAS9429_Spy0830 MGAS9429_Spy0831     TRUE 0.964 3.000 0.286 NA   NA
 2009693 2009694 MGAS9429_Spy0831 MGAS9429_Spy0832     TRUE 0.661 12.000 0.000 NA   NA
 2009694 2009695 MGAS9429_Spy0832 MGAS9429_Spy0833     TRUE 0.954 6.000 0.286 NA   NA
 2009695 2009696 MGAS9429_Spy0833 MGAS9429_Spy0834     TRUE 0.976 -3.000 0.286 NA   NA
 2009696 2009697 MGAS9429_Spy0834 MGAS9429_Spy0835     TRUE 0.922 -19.000 0.167 NA   NA
 2009697 2009698 MGAS9429_Spy0835 MGAS9429_Spy0836     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 2009698 2009699 MGAS9429_Spy0836 MGAS9429_Spy0837     TRUE 0.873 10.000 0.062 NA   NA
 2009699 2009700 MGAS9429_Spy0837 MGAS9429_Spy0838     TRUE 0.548 60.000 0.093 NA   NA
 2009700 2009701 MGAS9429_Spy0838 MGAS9429_Spy0839     TRUE 0.855 42.000 0.312 NA   NA
 2009701 2009702 MGAS9429_Spy0839 MGAS9429_Spy0840     TRUE 0.650 15.000 0.000 NA   NA
 2009702 2009703 MGAS9429_Spy0840 MGAS9429_Spy0841     TRUE 0.502 33.000 0.000 NA   NA
 2009703 2009704 MGAS9429_Spy0841 MGAS9429_Spy0842     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 2009704 2009705 MGAS9429_Spy0842 MGAS9429_Spy0843     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009705 2009706 MGAS9429_Spy0843 MGAS9429_Spy0844     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 2009706 2009707 MGAS9429_Spy0844 MGAS9429_Spy0845     TRUE 0.650 14.000 0.000 NA   NA
 2009707 2009708 MGAS9429_Spy0845 MGAS9429_Spy0846     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 2009708 2009709 MGAS9429_Spy0846 MGAS9429_Spy0847     TRUE 0.674 11.000 0.000 NA   NA
 2009709 2009710 MGAS9429_Spy0847 MGAS9429_Spy0848     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 2009710 2009711 MGAS9429_Spy0848 MGAS9429_Spy0849     FALSE 0.034 254.000 0.000 NA   NA
 2009711 2009712 MGAS9429_Spy0849 MGAS9429_Spy0850   speA2 TRUE 0.643 172.000 0.667 1.000   NA
 2009712 2009713 MGAS9429_Spy0850 MGAS9429_Spy0851 speA2   TRUE 0.996 26.000 1.000 0.006   NA
 2009713 2009714 MGAS9429_Spy0851 MGAS9429_Spy0852     FALSE 0.018 604.000 0.000 1.000   NA
 2009714 2009715 MGAS9429_Spy0852 MGAS9429_Spy0853     TRUE 0.552 58.000 0.074 NA   NA
 2009715 2009716 MGAS9429_Spy0853 MGAS9429_Spy0854     TRUE 0.939 -28.000 0.324 NA   NA
 2009718 2009719 MGAS9429_Spy0856 MGAS9429_Spy0857     FALSE 0.058 182.000 0.000 NA   NA
 2009719 2009720 MGAS9429_Spy0857 MGAS9429_Spy0858     TRUE 0.508 -49.000 0.000 NA   NA
 2009720 2009721 MGAS9429_Spy0858 MGAS9429_Spy0859     FALSE 0.068 164.000 0.000 NA   NA
 2009721 2009722 MGAS9429_Spy0859 MGAS9429_Spy0860     TRUE 0.995 -3.000 0.895 1.000   NA
 2009722 2009723 MGAS9429_Spy0860 MGAS9429_Spy0861     FALSE 0.136 204.000 0.026 1.000   NA
 2009723 2009724 MGAS9429_Spy0861 MGAS9429_Spy0862   estA FALSE 0.280 133.000 0.143 NA   NA
 2009724 2009725 MGAS9429_Spy0862 MGAS9429_Spy0863 estA   TRUE 0.828 30.000 0.150 NA   NA
 2009725 2009726 MGAS9429_Spy0863 MGAS9429_Spy0864     TRUE 0.590 46.000 0.029 NA   NA
 2009726 2009727 MGAS9429_Spy0864 MGAS9429_Spy0865   acoA FALSE 0.040 275.000 0.000 1.000   NA
 2009727 2009728 MGAS9429_Spy0865 MGAS9429_Spy0866 acoA acoB TRUE 0.993 56.000 0.769 0.001 Y NA
 2009728 2009729 MGAS9429_Spy0866 MGAS9429_Spy0867 acoB acoC TRUE 0.656 185.000 0.077 0.042 Y NA
 2009732 2009733 MGAS9429_Spy0870 MGAS9429_Spy0871   hylA FALSE 0.015 431.000 0.000 NA   NA
 2009735 2009736 MGAS9429_Spy0873 MGAS9429_Spy0874     TRUE 0.993 0.000 0.796 1.000   NA
 2009739 2009740 MGAS9429_Spy0876 MGAS9429_Spy0878   femD TRUE 0.646 54.000 0.150 NA   NA
 2009740 2009741 MGAS9429_Spy0878 MGAS9429_Spy0879 femD   FALSE 0.162 124.000 0.003 NA   NA
 2009741 2009742 MGAS9429_Spy0879 MGAS9429_Spy0880   hemN TRUE 0.783 -33.000 0.021 NA   NA
 2009742 2009743 MGAS9429_Spy0880 MGAS9429_Spy0881 hemN   TRUE 0.893 10.000 0.060 1.000 N NA
 2009743 2009744 MGAS9429_Spy0881 MGAS9429_Spy0882     TRUE 0.942 0.000 0.055 1.000 N NA
 2009744 2009745 MGAS9429_Spy0882 MGAS9429_Spy0883     TRUE 0.969 -12.000 0.330 NA   NA
 2009745 2009746 MGAS9429_Spy0883 MGAS9429_Spy0884     FALSE 0.023 317.000 0.000 NA   NA
 2009746 2009747 MGAS9429_Spy0884 MGAS9429_Spy0885     TRUE 0.781 24.000 0.030 NA   NA
 2009747 2009748 MGAS9429_Spy0885 MGAS9429_Spy0886     TRUE 0.987 0.000 0.546 NA   NA
 2009748 2009749 MGAS9429_Spy0886 MGAS9429_Spy0887     TRUE 0.995 -3.000 0.876 NA   NA
 2009749 2009750 MGAS9429_Spy0887 MGAS9429_Spy0888     TRUE 0.851 -76.000 0.253 NA   NA
 2009750 2009751 MGAS9429_Spy0888 MGAS9429_Spy0889     FALSE 0.016 402.000 0.000 NA   NA
 11412333 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7145.000 0.000 NA   NA
 11554696 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7145.000 0.000 NA   NA
 11697088 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7145.000 0.000 NA   NA
 11412334 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11554697 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11697089 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7174.000 0.000 NA   NA
 11412335 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7212.000 0.000 NA   NA
 11554698 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7212.000 0.000 NA   NA
 11697090 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7212.000 0.000 NA   NA
 11412336 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7241.000 0.000 NA   NA
 11554699 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7241.000 0.000 NA   NA
 11697091 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7241.000 0.000 NA   NA
 11412337 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7278.000 0.000 NA   NA
 11554700 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7278.000 0.000 NA   NA
 11697092 2009744   MGAS9429_Spy0882     FALSE NA 7278.000 0.000 NA   NA
 2009751 2009752 MGAS9429_Spy0889 MGAS9429_Spy0890     TRUE 0.807 64.000 0.000 0.002   NA
 2009752 2009753 MGAS9429_Spy0890 MGAS9429_Spy0891     FALSE 0.453 37.000 0.000 NA   NA
 2009753 2009754 MGAS9429_Spy0891 MGAS9429_Spy0892     TRUE 0.615 20.000 0.000 NA   NA
 2009754 2009755 MGAS9429_Spy0892 MGAS9429_Spy0893   lepA FALSE 0.091 169.000 0.000 1.000 N NA
 2009755 2009756 MGAS9429_Spy0893 MGAS9429_Spy0894 lepA   FALSE 0.073 188.000 0.000 1.000   NA
 2009756 2009757 MGAS9429_Spy0894 MGAS9429_Spy0895   msrB FALSE 0.075 186.000 0.000 1.000   NA
 2009757 2009758 MGAS9429_Spy0895 MGAS9429_Spy0896 msrB   FALSE 0.119 130.000 0.000 1.000   NA
 2009758 2009759 MGAS9429_Spy0896 MGAS9429_Spy0897     FALSE 0.064 207.000 0.000 1.000   NA
 2009759 2009760 MGAS9429_Spy0897 MGAS9429_Spy0898   ptsB TRUE 0.998 19.000 0.786 0.019 Y NA
 2009760 2009761 MGAS9429_Spy0898 MGAS9429_Spy0899 ptsB ptsC TRUE 0.998 17.000 0.778 0.022 Y NA
 2009761 2009762 MGAS9429_Spy0899 MGAS9429_Spy0900 ptsC ptsD TRUE 0.999 -3.000 0.778 0.022 Y NA
 2009762 2009763 MGAS9429_Spy0900 MGAS9429_Spy0901 ptsD   TRUE 0.665 136.000 0.222 0.055 N NA
 2009763 2009764 MGAS9429_Spy0901 MGAS9429_Spy0902     TRUE 0.998 4.000 0.500 0.012 Y NA
 2009764 2009765 MGAS9429_Spy0902 MGAS9429_Spy0903     TRUE 0.990 -6.000 0.571 1.000 N NA
 2009765 2009766 MGAS9429_Spy0903 MGAS9429_Spy0904   gabD FALSE 0.137 112.000 0.000 1.000 N NA
 2009766 2009767 MGAS9429_Spy0904 MGAS9429_Spy0905 gabD uvrC FALSE 0.148 102.000 0.000 1.000 N NA
 2009767 2009768 MGAS9429_Spy0905 MGAS9429_Spy0906 uvrC   FALSE 0.130 184.000 0.004 1.000 N NA
 2009768 2009769 MGAS9429_Spy0906 MGAS9429_Spy0907     FALSE 0.386 125.000 0.179 1.000 N NA
 2009771 2009772 MGAS9429_Spy0909 MGAS9429_Spy0910 rplJ rplL TRUE 0.993 50.000 0.884 0.026 Y NA
 2009772 2009773 MGAS9429_Spy0910 MGAS9429_Spy0911 rplL   FALSE 0.020 356.000 0.000 NA   NA
 2009773 2009774 MGAS9429_Spy0911 MGAS9429_Spy0912     TRUE 0.817 -6.000 0.000 NA   NA
 2009774 2009775 MGAS9429_Spy0912 MGAS9429_Spy0913     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 2009775 2009776 MGAS9429_Spy0913 MGAS9429_Spy0914     TRUE 0.693 -21.000 0.000 NA   NA
 2009776 2009777 MGAS9429_Spy0914 MGAS9429_Spy0915     FALSE 0.322 50.000 0.000 NA   NA
 2009777 2009778 MGAS9429_Spy0915 MGAS9429_Spy0916     FALSE 0.276 58.000 0.000 NA   NA
 2009778 2009779 MGAS9429_Spy0916 MGAS9429_Spy0917     FALSE 0.384 43.000 0.000 NA   NA
 2009779 2009780 MGAS9429_Spy0917 MGAS9429_Spy0918     FALSE 0.031 265.000 0.000 NA   NA
 2009780 2009781 MGAS9429_Spy0918 MGAS9429_Spy0919   srtI FALSE 0.216 69.000 0.000 NA   NA
 2009781 2009782 MGAS9429_Spy0919 MGAS9429_Spy0920 srtI srtR FALSE 0.077 151.000 0.000 NA   NA
 2009782 2009783 MGAS9429_Spy0920 MGAS9429_Spy0921 srtR srtK TRUE 0.998 -22.000 0.741 0.012 Y NA
 2009783 2009784 MGAS9429_Spy0921 MGAS9429_Spy0922 srtK   FALSE 0.016 412.000 0.000 NA   NA
 2009784 2009785 MGAS9429_Spy0922 MGAS9429_Spy0923   srtT TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009785 2009786 MGAS9429_Spy0923 MGAS9429_Spy0924 srtT   TRUE 0.792 -16.000 0.000 1.000   NA
 2009786 2009787 MGAS9429_Spy0924 MGAS9429_Spy0926     TRUE 0.626 19.000 0.000 NA   NA
 2009787 2009788 MGAS9429_Spy0926 MGAS9429_Spy0927   srtF FALSE 0.495 -51.000 0.000 NA   NA
 2009788 2009789 MGAS9429_Spy0927 MGAS9429_Spy0928 srtF srtE TRUE 0.718 6.000 0.000 NA   NA
 2009789 2009790 MGAS9429_Spy0928 MGAS9429_Spy0929 srtE srtG TRUE 0.979 3.000 0.490 NA   NA
 2009790 2009791 MGAS9429_Spy0929 MGAS9429_Spy0930 srtG   FALSE 0.053 191.000 0.000 NA   NA
 2009793 2009794 MGAS9429_Spy0932 MGAS9429_Spy0933     TRUE 0.591 22.000 0.000 NA   NA
 2009794 2009795 MGAS9429_Spy0933 MGAS9429_Spy0934     FALSE 0.192 73.000 0.000 NA   NA
 2009795 2009796 MGAS9429_Spy0934 MGAS9429_Spy0935     TRUE 0.872 31.000 0.000 0.064   NA
 2009796 2009797 MGAS9429_Spy0935 MGAS9429_Spy0936   dacA1 FALSE 0.106 143.000 0.000 1.000   NA
 2009799 2009800 MGAS9429_Spy0938 MGAS9429_Spy0939   folC1 TRUE 0.784 -10.000 0.000 NA   NA
 2009800 2009801 MGAS9429_Spy0939 MGAS9429_Spy0940 folC1 folE TRUE 0.957 11.000 0.057 1.000 Y NA
 2009801 2009802 MGAS9429_Spy0940 MGAS9429_Spy0941 folE folP TRUE 0.963 9.000 0.073 1.000 Y NA
 2009802 2009803 MGAS9429_Spy0941 MGAS9429_Spy0942 folP folQ TRUE 0.966 7.000 0.094 1.000 Y NA
 2009803 2009804 MGAS9429_Spy0942 MGAS9429_Spy0943 folQ folK TRUE 0.985 -3.000 0.142 1.000 Y NA
 2009804 2009805 MGAS9429_Spy0943 MGAS9429_Spy0944 folK murB FALSE 0.192 150.000 0.010 1.000 N NA
 2009805 2009806 MGAS9429_Spy0944 MGAS9429_Spy0945 murB potA TRUE 0.654 46.000 0.041 1.000 N NA
 2009806 2009807 MGAS9429_Spy0945 MGAS9429_Spy0946 potA potB TRUE 0.997 -37.000 0.928 0.033 Y NA
 2009807 2009808 MGAS9429_Spy0946 MGAS9429_Spy0947 potB potC TRUE 0.998 -3.000 0.492 0.033 Y NA
 2009808 2009809 MGAS9429_Spy0947 MGAS9429_Spy0948 potC   TRUE 0.996 -7.000 0.253 0.033 Y NA
 2009810 2009811 MGAS9429_Spy0949 MGAS9429_Spy0950 dpiA dpiB TRUE 0.972 -19.000 0.154 1.000 Y NA
 2009812 2009813 MGAS9429_Spy0951 MGAS9429_Spy0952 malP   TRUE 0.973 32.000 0.432 1.000 Y NA
 2009815 2009816 MGAS9429_Spy0954 MGAS9429_Spy0955     FALSE 0.107 142.000 0.000 1.000   NA
 2009816 2009817 MGAS9429_Spy0955 MGAS9429_Spy0956     FALSE 0.225 163.000 0.071 1.000 N NA
 2009817 2009818 MGAS9429_Spy0956 MGAS9429_Spy0957     FALSE 0.356 46.000 0.000 NA   NA
 2009818 2009819 MGAS9429_Spy0957 MGAS9429_Spy0958     TRUE 0.815 0.000 0.000 NA   NA
 2009819 2009820 MGAS9429_Spy0958 MGAS9429_Spy0959   radC TRUE 0.583 49.000 0.046 NA   NA
 2009821 2009822 MGAS9429_Spy0960 MGAS9429_Spy0961     TRUE 0.985 10.000 0.714 1.000   NA
 2009822 2009823 MGAS9429_Spy0961 MGAS9429_Spy0962     FALSE 0.106 252.000 0.083 NA   NA
 2009823 2009824 MGAS9429_Spy0962 MGAS9429_Spy0963   nifS2 TRUE 0.945 -10.000 0.166 NA   NA
 2009824 2009825 MGAS9429_Spy0963 MGAS9429_Spy0964 nifS2   TRUE 0.983 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 2009825 2009826 MGAS9429_Spy0964 MGAS9429_Spy0965     FALSE 0.306 140.000 0.145 1.000   NA
 2009827 2009828 MGAS9429_Spy0966 MGAS9429_Spy0967     TRUE 0.980 -28.000 0.725 1.000   NA
 2009828 2009829 MGAS9429_Spy0967 MGAS9429_Spy0968     TRUE 0.963 -3.000 0.150 1.000 N NA
 2009829 2009830 MGAS9429_Spy0968 MGAS9429_Spy0969   pta TRUE 0.917 4.000 0.067 1.000 N NA
 2009830 2009831 MGAS9429_Spy0969 MGAS9429_Spy0970 pta   TRUE 0.780 66.000 0.031 0.041   NA
 2009833 2009834 MGAS9429_Spy0972 MGAS9429_Spy0973 proV   TRUE 0.937 -43.000 0.382 1.000 N NA
 2009834 2009835 MGAS9429_Spy0973 MGAS9429_Spy0974   guaC FALSE 0.046 257.000 0.000 1.000 N NA
 2009835 2009836 MGAS9429_Spy0974 MGAS9429_Spy0975 guaC xpt FALSE 0.177 305.000 0.009 1.000 Y NA
 2009836 2009837 MGAS9429_Spy0975 MGAS9429_Spy0976 xpt   TRUE 0.978 0.000 0.046 1.000 Y NA
 2009838 2009839 MGAS9429_Spy0977 MGAS9429_Spy0978 apbE   TRUE 0.734 53.000 0.189 1.000   NA
 2009840 2009841 MGAS9429_Spy0979 MGAS9429_Spy0980 tdk2 prfA TRUE 0.778 35.000 0.062 1.000 N NA
 2009841 2009842 MGAS9429_Spy0980 MGAS9429_Spy0981 prfA hemK TRUE 0.980 0.000 0.084 1.000 Y NA
 2009842 2009843 MGAS9429_Spy0981 MGAS9429_Spy0982 hemK   TRUE 0.901 -46.000 0.029 NA Y NA
 2009843 2009844 MGAS9429_Spy0982 MGAS9429_Spy0983     TRUE 0.804 18.000 0.012 NA   NA
 2009844 2009845 MGAS9429_Spy0983 MGAS9429_Spy0984   glyA TRUE 0.909 -16.000 0.056 1.000   NA
 2009845 2009846 MGAS9429_Spy0984 MGAS9429_Spy0985 glyA   TRUE 0.711 7.000 0.000 NA   NA
 2009846 2009847 MGAS9429_Spy0985 MGAS9429_Spy0986     TRUE 0.596 -31.000 0.000 NA   NA
 2009847 2009848 MGAS9429_Spy0986 MGAS9429_Spy0987     TRUE 0.802 1.000 0.000 NA   NA
 2009848 2009849 MGAS9429_Spy0987 MGAS9429_Spy0988     TRUE 0.857 10.000 0.035 NA   NA
 2009849 2009850 MGAS9429_Spy0988 MGAS9429_Spy0989     TRUE 0.999 3.000 0.895 0.007 Y NA
 2009850 2009851 MGAS9429_Spy0989 MGAS9429_Spy0990   nox FALSE 0.050 241.000 0.000 1.000   NA
 2009853 2009854 MGAS9429_Spy0992 MGAS9429_Spy0993 gyrA   TRUE 0.793 20.000 0.013 NA N NA
 2009854 2009855 MGAS9429_Spy0993 MGAS9429_Spy0994     FALSE 0.363 80.000 0.039 NA N NA
 2009855 2009856 MGAS9429_Spy0994 MGAS9429_Spy0995     FALSE 0.014 487.000 0.000 NA   NA
 2009856 2009857 MGAS9429_Spy0995 MGAS9429_Spy0996     TRUE 0.508 -49.000 0.000 NA   NA
 2009858 2009859 MGAS9429_Spy0997 MGAS9429_Spy0998     FALSE 0.335 117.000 0.135 1.000   NA
 2009859 2009860 MGAS9429_Spy0998 MGAS9429_Spy0999     TRUE 0.961 -3.000 0.146 1.000   NA
 2009861 2009862 MGAS9429_Spy1000 MGAS9429_Spy1001     TRUE 0.948 -10.000 0.148 1.000   NA
 2009862 2009863 MGAS9429_Spy1001 MGAS9429_Spy1002   smf TRUE 0.754 65.000 0.037 1.000 Y NA
 2009863 2009864 MGAS9429_Spy1002 MGAS9429_Spy1003 smf   TRUE 0.701 107.000 0.238 1.000 Y NA
 2009865 2009866 MGAS9429_Spy1004 MGAS9429_Spy1005     TRUE 0.711 7.000 0.000 NA   NA
 2009867 2009868 MGAS9429_Spy1006 MGAS9429_Spy1007   ddh TRUE 0.900 12.000 0.158 NA   NA
 2009868 2009869 MGAS9429_Spy1007 MGAS9429_Spy1008 ddh satD FALSE 0.262 105.000 0.056 NA   NA
 2009869 2009870 MGAS9429_Spy1008 MGAS9429_Spy1009 satD satE TRUE 0.968 -7.000 0.250 NA   NA
 2009870 2009871 MGAS9429_Spy1009 MGAS9429_Spy1010 satE gid TRUE 0.897 1.000 0.008 NA   NA
 2009871 2009872 MGAS9429_Spy1010 MGAS9429_Spy1011 gid oadA1 FALSE 0.103 153.000 0.000 1.000 N NA
 2009873 2009874 MGAS9429_Spy1012 MGAS9429_Spy1013 citC   FALSE 0.180 89.000 0.000 1.000   NA
 2009878 2009879 MGAS9429_Spy1017 MGAS9429_Spy1018 ffh ylxM TRUE 0.924 9.000 0.151 1.000   NA
 2009879 2009880 MGAS9429_Spy1018 MGAS9429_Spy1019 ylxM   TRUE 0.658 89.000 0.032 0.038   NA
 2009880 2009881 MGAS9429_Spy1019 MGAS9429_Spy1020     TRUE 0.547 56.000 0.057 NA   NA
 2009883 2009884 MGAS9429_Spy1022 MGAS9429_Spy1023     FALSE 0.026 364.000 0.000 1.000   NA
 2009884 2009885 MGAS9429_Spy1023 MGAS9429_Spy1024   pdxK FALSE 0.259 98.000 0.040 NA   NA
 2009885 2009886 MGAS9429_Spy1024 MGAS9429_Spy1025 pdxK   TRUE 0.897 -22.000 0.142 NA   NA
 2009887 2009888 MGAS9429_Spy1026 MGAS9429_Spy1027     FALSE 0.083 139.000 0.000 NA   NA
 2009889 2009890 MGAS9429_Spy1028 MGAS9429_Spy1029 rnhB   FALSE 0.031 322.000 0.000 1.000   NA
 2009890 2009891 MGAS9429_Spy1029 MGAS9429_Spy1030   fhs1 FALSE 0.421 85.000 0.094 1.000 N NA
 2009891 2009892 MGAS9429_Spy1030 MGAS9429_Spy1031 fhs1 lplA FALSE 0.404 128.000 0.200 1.000 N NA
 2009892 2009893 MGAS9429_Spy1031 MGAS9429_Spy1032 lplA   TRUE 0.814 47.000 0.250 1.000 N NA
 2009893 2009894 MGAS9429_Spy1032 MGAS9429_Spy1033     TRUE 0.972 -7.000 0.286 NA   NA
 2009894 2009895 MGAS9429_Spy1033 MGAS9429_Spy1034     TRUE 0.937 -7.000 0.107 NA   NA
 2009895 2009896 MGAS9429_Spy1034 MGAS9429_Spy1035     TRUE 0.924 42.000 0.571 NA N NA
 2009896 2009897 MGAS9429_Spy1035 MGAS9429_Spy1036     TRUE 0.981 -3.000 0.100 NA Y NA
 2009897 2009898 MGAS9429_Spy1036 MGAS9429_Spy1037     TRUE 0.939 -3.000 0.019 1.000 N NA
 2009899 2009900 MGAS9429_Spy1038 MGAS9429_Spy1039 dpfB dfp TRUE 0.907 -7.000 0.002 1.000   NA
 2009900 2009901 MGAS9429_Spy1039 MGAS9429_Spy1040 dfp   TRUE 0.580 46.000 0.019 NA   NA
 2009901 2009902 MGAS9429_Spy1040 MGAS9429_Spy1041   pgmA FALSE 0.186 176.000 0.098 NA   NA
 2009903 2009904 MGAS9429_Spy1042 MGAS9429_Spy1043     TRUE 0.997 -10.000 0.720 0.033   NA
 2009904 2009905 MGAS9429_Spy1043 MGAS9429_Spy1044     TRUE 0.954 -34.000 0.438 1.000   NA
 2009905 2009906 MGAS9429_Spy1044 MGAS9429_Spy1045     FALSE 0.258 121.000 0.036 1.000   NA
 2009906 2009907 MGAS9429_Spy1045 MGAS9429_Spy1046   cdd TRUE 0.581 94.000 0.300 1.000   NA
 2009907 2009908 MGAS9429_Spy1046 MGAS9429_Spy1047 cdd   FALSE 0.018 651.000 0.000 1.000 N NA
 2009909 2009910 MGAS9429_Spy1048 MGAS9429_Spy1049 coaA rpsT FALSE 0.452 69.000 0.014 1.000 N NA
 2009911 2009912 MGAS9429_Spy1050 MGAS9429_Spy1051 ciaH ciaR TRUE 0.996 -7.000 0.606 1.000 Y NA
 2009912 2009913 MGAS9429_Spy1051 MGAS9429_Spy1052 ciaR pepN FALSE 0.075 346.000 0.061 1.000 N NA
 2009913 2009914 MGAS9429_Spy1052 MGAS9429_Spy1053 pepN   TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009914 2009915 MGAS9429_Spy1053 MGAS9429_Spy1054   phoU FALSE 0.460 -61.000 0.000 NA   NA
 2009915 2009916 MGAS9429_Spy1054 MGAS9429_Spy1055 phoU pstB TRUE 0.894 68.000 0.413 NA Y NA
 2009916 2009917 MGAS9429_Spy1055 MGAS9429_Spy1056 pstB pstB2 TRUE 0.998 10.000 0.542 0.001 Y NA
 2009917 2009918 MGAS9429_Spy1056 MGAS9429_Spy1057 pstB2 pstA TRUE 0.997 16.000 0.490 0.002 Y NA
 2009918 2009919 MGAS9429_Spy1057 MGAS9429_Spy1058 pstA pstC TRUE 0.999 -10.000 0.907 0.002 Y NA
 2009919 2009920 MGAS9429_Spy1058 MGAS9429_Spy1059 pstC pstS TRUE 0.974 11.000 0.206 1.000 Y NA
 2009920 2009921 MGAS9429_Spy1059 MGAS9429_Spy1060 pstS   FALSE 0.442 139.000 0.303 NA N NA
 2009921 2009922 MGAS9429_Spy1060 MGAS9429_Spy1061     TRUE 0.956 3.000 0.229 NA N NA
 2009922 2009923 MGAS9429_Spy1061 MGAS9429_Spy1062     TRUE 0.937 -31.000 0.337 NA   NA
 2009923 2009924 MGAS9429_Spy1062 MGAS9429_Spy1063     TRUE 0.947 -10.000 0.169 NA   NA
 2009924 2009925 MGAS9429_Spy1063 MGAS9429_Spy1064   mreA TRUE 0.656 43.000 0.017 1.000 N NA
 2009925 2009926 MGAS9429_Spy1064 MGAS9429_Spy1065 mreA truB TRUE 0.922 29.000 0.308 1.000 N NA
 2009926 2009927 MGAS9429_Spy1065 MGAS9429_Spy1066 truB   FALSE 0.207 116.000 0.014 NA   NA
 2009927 2009928 MGAS9429_Spy1066 MGAS9429_Spy1067     FALSE 0.269 97.000 0.045 NA   NA
 2009928 2009929 MGAS9429_Spy1067 MGAS9429_Spy1068     TRUE 0.854 11.000 0.045 NA   NA
 2009929 2009930 MGAS9429_Spy1068 MGAS9429_Spy1069     FALSE 0.398 92.000 0.121 1.000   NA
 2009930 2009931 MGAS9429_Spy1069 MGAS9429_Spy1070     TRUE 0.985 15.000 0.438 1.000 Y NA
 2009933 2009934 MGAS9429_Spy1072 MGAS9429_Spy1073     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2009934 2009935 MGAS9429_Spy1073 MGAS9429_Spy1074     FALSE 0.337 163.000 0.238 NA   NA
 2009935 2009936 MGAS9429_Spy1074 MGAS9429_Spy1075     TRUE 0.979 8.000 0.600 NA   NA
 2009936 2009937 MGAS9429_Spy1075 MGAS9429_Spy1076     TRUE 0.931 41.000 0.600 NA   NA
 2009937 2009938 MGAS9429_Spy1076 MGAS9429_Spy1077     TRUE 0.851 13.000 0.060 NA   NA
 2009938 2009939 MGAS9429_Spy1077 MGAS9429_Spy1078     TRUE 0.895 11.000 0.143 NA   NA
 2009939 2009940 MGAS9429_Spy1078 MGAS9429_Spy1079     TRUE 0.896 37.000 0.357 NA   NA
 2009940 2009941 MGAS9429_Spy1079 MGAS9429_Spy1080   pcrA FALSE 0.026 364.000 0.000 1.000   NA
 2009944 2009945 MGAS9429_Spy1082 MGAS9429_Spy1084     TRUE 0.560 120.000 0.060 0.066 N NA
 2009946 2009947 MGAS9429_Spy1085 MGAS9429_Spy1086 cfa   FALSE 0.019 370.000 0.000 NA   NA
 2009947 2009948 MGAS9429_Spy1086 MGAS9429_Spy1087     TRUE 0.963 16.000 0.154 1.000 Y NA
 2009948 2009949 MGAS9429_Spy1087 MGAS9429_Spy1088     TRUE 0.965 10.000 0.130 1.000 Y NA
 2009949 2009950 MGAS9429_Spy1088 MGAS9429_Spy1089     FALSE 0.266 107.000 0.018 1.000 N NA
 2009950 2009951 MGAS9429_Spy1089 MGAS9429_Spy1090   glmS FALSE 0.143 182.000 0.008 1.000 N NA
 2009951 2009952 MGAS9429_Spy1090 MGAS9429_Spy1091 glmS sipC FALSE 0.159 176.000 0.011 1.000 N NA
 2009952 2009953 MGAS9429_Spy1091 MGAS9429_Spy1092 sipC pyk FALSE 0.151 218.000 0.072 1.000 N NA
 2009953 2009954 MGAS9429_Spy1092 MGAS9429_Spy1093 pyk pfk TRUE 0.968 63.000 0.261 0.005 Y NA
 2009954 2009955 MGAS9429_Spy1093 MGAS9429_Spy1094 pfk dnaE FALSE 0.461 80.000 0.098 1.000 N NA
 2009956 2009957 MGAS9429_Spy1095 MGAS9429_Spy1096     TRUE 0.984 0.000 0.412 1.000 N NA
 2009957 2009958 MGAS9429_Spy1096 MGAS9429_Spy1097     TRUE 0.968 10.000 0.471 NA   NA
 2009960 2009961 MGAS9429_Spy1099 MGAS9429_Spy1100     FALSE 0.097 118.000 0.000 NA   NA
 2009962 2009963 MGAS9429_Spy1101 MGAS9429_Spy1102 glgP malM TRUE 0.986 35.000 0.289 0.021 Y NA
 2009963 2009964 MGAS9429_Spy1102 MGAS9429_Spy1103 malM malR TRUE 0.679 115.000 0.538 1.000 N NA
 2009965 2009966 MGAS9429_Spy1104 MGAS9429_Spy1105 malX malC TRUE 0.851 274.000 0.690 0.032 Y NA
 2009966 2009967 MGAS9429_Spy1105 MGAS9429_Spy1106 malC malD TRUE 0.999 0.000 0.793 0.032 Y NA
 2009969 2009970 MGAS9429_Spy1108 MGAS9429_Spy1109     FALSE 0.436 -76.000 0.000 NA   NA
 2009970 2009971 MGAS9429_Spy1109 MGAS9429_Spy1110     FALSE 0.041 225.000 0.000 NA   NA
 2009972 2009973 MGAS9429_Spy1111 MGAS9429_Spy1112   dltD TRUE 0.755 31.000 0.042 NA N NA
 2009973 2009974 MGAS9429_Spy1112 MGAS9429_Spy1113 dltD   TRUE 0.981 -7.000 0.409 NA   NA
 2009974 2009975 MGAS9429_Spy1113 MGAS9429_Spy1114     TRUE 0.952 18.000 0.387 NA   NA
 2009975 2009976 MGAS9429_Spy1114 MGAS9429_Spy1115   dltA TRUE 0.985 -3.000 0.435 NA N NA
 2009976 2009977 MGAS9429_Spy1115 MGAS9429_Spy1116 dltA   TRUE 0.971 12.000 0.549 NA   NA
 2009977 2009978 MGAS9429_Spy1116 MGAS9429_Spy1117   uvrB FALSE 0.032 264.000 0.000 NA   NA
 2009979 2009980 MGAS9429_Spy1118 MGAS9429_Spy1119 glnH glnQ2 TRUE 0.991 0.000 0.326 1.000 Y NA
 2009980 2009981 MGAS9429_Spy1119 MGAS9429_Spy1120 glnQ2   FALSE 0.098 158.000 0.000 1.000 N NA
 2009982 2009983 MGAS9429_Spy1121 MGAS9429_Spy1122     TRUE 0.963 -3.000 0.182 NA   NA
 2009983 2009984 MGAS9429_Spy1122 MGAS9429_Spy1123     FALSE 0.332 178.000 0.273 NA   NA
 2009984 2009985 MGAS9429_Spy1123 MGAS9429_Spy1124     TRUE 0.987 -3.000 0.500 NA   NA
 2009985 2009986 MGAS9429_Spy1124 MGAS9429_Spy1125     TRUE 0.998 3.000 0.500 0.013 Y NA
 2009986 2009987 MGAS9429_Spy1125 MGAS9429_Spy1126     TRUE 0.986 -7.000 0.064 0.013 N NA
 2009987 2009988 MGAS9429_Spy1126 MGAS9429_Spy1127     FALSE 0.308 106.000 0.064 1.000   NA
 2009988 2009989 MGAS9429_Spy1127 MGAS9429_Spy1128   bglA2 TRUE 0.976 9.000 0.500 1.000   NA
 2009991 2009992 MGAS9429_Spy1130 MGAS9429_Spy1131   obgE FALSE 0.376 69.000 0.009 NA   NA
 2009992 2009993 MGAS9429_Spy1131 MGAS9429_Spy1132 obgE   FALSE 0.429 63.000 0.011 NA   NA
 2009994 2009995 MGAS9429_Spy1133 MGAS9429_Spy1134     TRUE 0.961 21.000 0.000 0.062 Y NA
 2010000 2010001 MGAS9429_Spy1139 MGAS9429_Spy1140     FALSE 0.149 85.000 0.000 NA   NA
 2010001 2010002 MGAS9429_Spy1140 MGAS9429_Spy1141     TRUE 0.719 72.000 0.000 0.008   NA
 2010002 2010003 MGAS9429_Spy1141 MGAS9429_Spy1142     FALSE 0.031 322.000 0.000 1.000   NA
 2010003 2010004 MGAS9429_Spy1142 MGAS9429_Spy1143     TRUE 0.670 49.000 0.093 1.000 N NA
 2010004 2010005 MGAS9429_Spy1143 MGAS9429_Spy1144   aroK FALSE 0.176 208.000 0.111 1.000 N NA
 2010005 2010006 MGAS9429_Spy1144 MGAS9429_Spy1145 aroK   TRUE 0.974 -7.000 0.012 1.000 Y NA
 2010006 2010007 MGAS9429_Spy1145 MGAS9429_Spy1146     FALSE 0.226 102.000 0.003 1.000   NA
 2010007 2010008 MGAS9429_Spy1146 MGAS9429_Spy1147   map TRUE 0.979 2.000 0.373 1.000   NA
 2010008 2010009 MGAS9429_Spy1147 MGAS9429_Spy1148 map   TRUE 0.936 16.000 0.235 1.000 N NA
 2010009 2010010 MGAS9429_Spy1148 MGAS9429_Spy1149     TRUE 0.983 -3.000 0.342 1.000 N NA
 2010010 2010011 MGAS9429_Spy1149 MGAS9429_Spy1150   grab FALSE 0.052 238.000 0.000 1.000   NA
 2010011 2010012 MGAS9429_Spy1150 MGAS9429_Spy1151 grab murZ FALSE 0.027 358.000 0.000 1.000   NA
 2010012 2010013 MGAS9429_Spy1151 MGAS9429_Spy1152 murZ metK2 FALSE 0.179 174.000 0.026 1.000 N NA
 2010013 2010014 MGAS9429_Spy1152 MGAS9429_Spy1153 metK2 inlA FALSE 0.018 536.000 0.000 1.000   NA
 2010016 2010017 MGAS9429_Spy1155 MGAS9429_Spy1156     FALSE 0.465 -60.000 0.000 NA   NA
 2010017 2010018 MGAS9429_Spy1156 MGAS9429_Spy1157     TRUE 0.734 -16.000 0.000 NA   NA
 2010018 2010019 MGAS9429_Spy1157 MGAS9429_Spy1158     FALSE 0.370 45.000 0.000 NA   NA
 2010019 2010020 MGAS9429_Spy1158 MGAS9429_Spy1159     FALSE 0.095 121.000 0.000 NA   NA
 2010020 2010021 MGAS9429_Spy1159 MGAS9429_Spy1160     TRUE 0.922 0.000 0.030 NA N NA
 2010023 2010024 MGAS9429_Spy1162 MGAS9429_Spy1163   udk FALSE 0.312 80.000 0.010 NA   NA
 2010026 2010027 MGAS9429_Spy1165 MGAS9429_Spy1166   gapN FALSE 0.300 96.000 0.028 1.000 N NA
 2010027 2010028 MGAS9429_Spy1166 MGAS9429_Spy1167 gapN pstI FALSE 0.166 185.000 0.035 1.000 N NA
 2010028 2010029 MGAS9429_Spy1167 MGAS9429_Spy1168 pstI ptsH TRUE 0.995 5.000 0.240 0.013 Y NA
 2010030 2010031 MGAS9429_Spy1169 MGAS9429_Spy1170 nrdH nrdE2 TRUE 0.970 20.000 0.562 1.000 N NA
 2010031 2010032 MGAS9429_Spy1170 MGAS9429_Spy1171 nrdE2 nrdF2 TRUE 0.912 193.000 0.500 0.002 Y NA
 2010032 2010033 MGAS9429_Spy1171 MGAS9429_Spy1172 nrdF2   TRUE 0.882 -25.000 0.083 1.000 N NA
 2010033 2010034 MGAS9429_Spy1172 MGAS9429_Spy1173     FALSE 0.159 96.000 0.000 1.000 N NA
 2010034 2010035 MGAS9429_Spy1173 MGAS9429_Spy1174     TRUE 0.943 33.000 0.000 0.062 Y NA
 2010035 2010036 MGAS9429_Spy1174 MGAS9429_Spy1175     TRUE 0.879 40.000 0.000 0.009   NA
 2010037 2010038 MGAS9429_Spy1176 MGAS9429_Spy1177     TRUE 0.844 19.000 0.077 NA   NA
 2010038 2010039 MGAS9429_Spy1177 MGAS9429_Spy1178     TRUE 0.981 -3.000 0.362 NA   NA
 2010039 2010040 MGAS9429_Spy1178 MGAS9429_Spy1179   alaS FALSE 0.030 345.000 0.000 1.000 N NA
 2010040 2010041 MGAS9429_Spy1179 MGAS9429_Spy1180 alaS surA FALSE 0.025 387.000 0.000 1.000 N NA
 2010041 2010042 MGAS9429_Spy1180 MGAS9429_Spy1181 surA   FALSE 0.486 63.000 0.012 1.000   NA
 2010042 2010043 MGAS9429_Spy1181 MGAS9429_Spy1182     FALSE 0.460 66.000 0.012 1.000   NA
 2010043 2010044 MGAS9429_Spy1182 MGAS9429_Spy1183   pepB FALSE 0.025 376.000 0.000 1.000 N NA
 2010044 2010045 MGAS9429_Spy1183 MGAS9429_Spy1184 pepB   TRUE 0.917 13.000 0.204 NA   NA
 2010045 2010046 MGAS9429_Spy1184 MGAS9429_Spy1185     FALSE 0.063 295.000 0.020 NA   NA
 2010046 2010047 MGAS9429_Spy1185 MGAS9429_Spy1186   nagB FALSE 0.276 119.000 0.051 1.000 N NA
 2010048 2010049 MGAS9429_Spy1187 MGAS9429_Spy1188 queA   TRUE 0.825 7.000 0.004 NA   NA
 2010050 2010051 MGAS9429_Spy1189 MGAS9429_Spy1190     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2010051 2010052 MGAS9429_Spy1190 MGAS9429_Spy1191     FALSE 0.286 56.000 0.000 NA   NA
 2010052 2010053 MGAS9429_Spy1191 MGAS9429_Spy1192   sodA FALSE 0.067 167.000 0.000 NA   NA
 2010053 2010054 MGAS9429_Spy1192 MGAS9429_Spy1193 sodA   FALSE 0.275 97.000 0.012 1.000 N NA
 2010054 2010055 MGAS9429_Spy1193 MGAS9429_Spy1194   comEC TRUE 0.588 71.000 0.163 1.000   NA
 2010055 2010056 MGAS9429_Spy1194 MGAS9429_Spy1195 comEC   TRUE 0.917 -19.000 0.130 1.000   NA
 2010056 2010057 MGAS9429_Spy1195 MGAS9429_Spy1197     FALSE 0.135 200.000 0.014 1.000 N NA
 2010058 2010059 MGAS9429_Spy1196 MGAS9429_Spy1198     TRUE 0.963 -10.000 0.209 1.000   NA
 2010060 2010061 MGAS9429_Spy1199 MGAS9429_Spy1200   deaD FALSE 0.213 127.000 0.007 1.000 N NA
 2010061 2010062 MGAS9429_Spy1200 MGAS9429_Spy1202 deaD prfC FALSE 0.121 307.000 0.000 1.000 Y NA
 2010064 2010065 MGAS9429_Spy1203 MGAS9429_Spy1204   murF FALSE 0.387 81.000 0.078 NA   NA
 2010065 2010066 MGAS9429_Spy1204 MGAS9429_Spy1205 murF ddlA TRUE 0.683 199.000 0.046 0.009 Y NA
 2010066 2010067 MGAS9429_Spy1205 MGAS9429_Spy1206 ddlA recR FALSE 0.260 101.000 0.010 1.000 N NA
 2010067 2010068 MGAS9429_Spy1206 MGAS9429_Spy1207 recR   FALSE 0.417 47.000 0.000 1.000   NA
 2010068 2010069 MGAS9429_Spy1207 MGAS9429_Spy1208     FALSE 0.018 559.000 0.000 1.000   NA
 2010069 2010070 MGAS9429_Spy1208 MGAS9429_Spy1209     TRUE 0.835 22.000 0.105 NA   NA
 2010070 2010071 MGAS9429_Spy1209 MGAS9429_Spy1210     TRUE 0.534 29.000 0.000 NA   NA
 2010071 2010072 MGAS9429_Spy1210 MGAS9429_Spy1211     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 2010072 2010073 MGAS9429_Spy1211 MGAS9429_Spy1212   gpmA FALSE 0.246 108.000 0.012 1.000   NA
 2010074 2010075 MGAS9429_Spy1213 MGAS9429_Spy1214   pyrD FALSE 0.158 82.000 0.000 NA   NA
 2010076 2010077 MGAS9429_Spy1215 MGAS9429_Spy1216     FALSE 0.380 72.000 0.018 NA   NA
 2010077 2010078 MGAS9429_Spy1216 MGAS9429_Spy1217     FALSE 0.030 345.000 0.000 1.000 N NA
 2010078 2010079 MGAS9429_Spy1217 MGAS9429_Spy1218     FALSE 0.366 99.000 0.156 NA   NA
 2010079 2010080 MGAS9429_Spy1218 MGAS9429_Spy1219     TRUE 0.986 -22.000 0.828 NA   NA
 2010080 2010081 MGAS9429_Spy1219 MGAS9429_Spy1220     TRUE 0.917 -25.000 0.203 NA   NA
 2010081 2010082 MGAS9429_Spy1220 MGAS9429_Spy1221     FALSE 0.044 216.000 0.000 NA   NA
 2010082 2010083 MGAS9429_Spy1221 MGAS9429_Spy1222   recN FALSE 0.087 172.000 0.000 1.000   NA
 2010083 2010084 MGAS9429_Spy1222 MGAS9429_Spy1223 recN argR1 TRUE 0.884 -21.000 0.037 1.000 N NA
 2010084 2010085 MGAS9429_Spy1223 MGAS9429_Spy1224 argR1   TRUE 0.794 -46.000 0.048 1.000 N NA
 2010085 2010086 MGAS9429_Spy1224 MGAS9429_Spy1225   fps TRUE 0.940 -7.000 0.058 1.000 N NA
 2010086 2010087 MGAS9429_Spy1225 MGAS9429_Spy1226 fps xseB TRUE 0.949 0.000 0.100 1.000 N NA
 2010087 2010088 MGAS9429_Spy1226 MGAS9429_Spy1227 xseB   TRUE 0.997 -22.000 0.412 0.001 Y NA
 2010088 2010089 MGAS9429_Spy1227 MGAS9429_Spy1228   folD FALSE 0.241 138.000 0.045 1.000 N NA
 2010089 2010090 MGAS9429_Spy1228 MGAS9429_Spy1229 folD   FALSE 0.133 202.000 0.013 1.000 N NA
 2010090 2010091 MGAS9429_Spy1229 MGAS9429_Spy1230     TRUE 0.790 2.000 0.000 NA   NA
 2010091 2010092 MGAS9429_Spy1230 MGAS9429_Spy1231   phr FALSE 0.216 69.000 0.000 NA   NA
 2010092 2010093 MGAS9429_Spy1231 MGAS9429_Spy1232 phr artP FALSE 0.133 116.000 0.000 1.000 N NA
 2010093 2010094 MGAS9429_Spy1232 MGAS9429_Spy1233 artP artQ TRUE 0.996 -3.000 0.640 1.000 Y NA
 2010094 2010095 MGAS9429_Spy1233 MGAS9429_Spy1234 artQ   FALSE 0.220 127.000 0.044 NA   NA
 2010096 2010097 MGAS9429_Spy1235 MGAS9429_Spy1236 clpE mutT FALSE 0.283 128.000 0.079 1.000 N NA
 2010097 2010098 MGAS9429_Spy1236 MGAS9429_Spy1237 mutT   TRUE 0.627 51.000 0.114 NA   NA
 2010099 2010100 MGAS9429_Spy1238 MGAS9429_Spy1239 ileS divIVAS FALSE 0.069 273.000 0.012 NA N NA
 2010100 2010101 MGAS9429_Spy1239 MGAS9429_Spy1240 divIVAS   TRUE 0.977 10.000 0.579 NA   NA
 2010101 2010102 MGAS9429_Spy1240 MGAS9429_Spy1241     TRUE 0.977 0.000 0.287 1.000   NA
 2010102 2010103 MGAS9429_Spy1241 MGAS9429_Spy1242     TRUE 0.966 5.000 0.370 NA   NA
 2010103 2010104 MGAS9429_Spy1242 MGAS9429_Spy1243     TRUE 0.961 0.000 0.194 NA   NA
 2010104 2010105 MGAS9429_Spy1243 MGAS9429_Spy1244   ftsZ TRUE 0.895 3.000 0.030 NA   NA
 2010105 2010106 MGAS9429_Spy1244 MGAS9429_Spy1245 ftsZ ftsA TRUE 0.980 24.000 0.460 1.000 Y NA
 2010106 2010107 MGAS9429_Spy1245 MGAS9429_Spy1246 ftsA divIB FALSE 0.353 212.000 0.389 NA N NA
 2010107 2010108 MGAS9429_Spy1246 MGAS9429_Spy1247 divIB murG TRUE 0.975 1.000 0.072 NA Y NA
 2010108 2010109 MGAS9429_Spy1247 MGAS9429_Spy1248 murG murD TRUE 0.960 -21.000 0.060 1.000 Y NA
 2010109 2010110 MGAS9429_Spy1248 MGAS9429_Spy1249 murD   FALSE 0.041 356.000 0.006 NA   NA
 2010110 2010111 MGAS9429_Spy1249 MGAS9429_Spy1250   typA FALSE 0.201 122.000 0.015 NA   NA
 2010111 2010112 MGAS9429_Spy1250 MGAS9429_Spy1251 typA   FALSE 0.108 182.000 0.003 NA N NA
 2010112 2010113 MGAS9429_Spy1251 MGAS9429_Spy1252   glcK TRUE 0.876 10.000 0.064 NA N NA
 2010113 2010114 MGAS9429_Spy1252 MGAS9429_Spy1253 glcK   TRUE 0.975 5.000 0.496 NA   NA
 2010114 2010115 MGAS9429_Spy1253 MGAS9429_Spy1254   dpr FALSE 0.239 124.000 0.058 NA   NA
 2010117 2010118 MGAS9429_Spy1256 MGAS9429_Spy1257     TRUE 0.874 4.000 0.016 NA   NA
 2010118 2010119 MGAS9429_Spy1257 MGAS9429_Spy1258     FALSE 0.030 271.000 0.000 NA   NA
 2010119 2010120 MGAS9429_Spy1258 MGAS9429_Spy1259     FALSE 0.492 34.000 0.000 NA   NA
 2010120 2010121 MGAS9429_Spy1259 MGAS9429_Spy1260     FALSE 0.028 357.000 0.000 1.000 N NA
 2010121 2010122 MGAS9429_Spy1260 MGAS9429_Spy1261     TRUE 0.919 -13.000 0.052 1.000 N NA
 2010122 2010123 MGAS9429_Spy1261 MGAS9429_Spy1262     TRUE 0.978 -10.000 0.367 1.000 N NA
 2010123 2010124 MGAS9429_Spy1262 MGAS9429_Spy1263   asnA FALSE 0.215 123.000 0.006 1.000 N NA
 2010124 2010125 MGAS9429_Spy1263 MGAS9429_Spy1264 asnA arcC FALSE 0.118 314.000 0.000 1.000 Y NA
 2010125 2010126 MGAS9429_Spy1264 MGAS9429_Spy1265 arcC   TRUE 0.940 20.000 0.035 1.000 Y NA
 2010126 2010127 MGAS9429_Spy1265 MGAS9429_Spy1266     TRUE 0.896 17.000 0.140 1.000   NA
 2010127 2010128 MGAS9429_Spy1266 MGAS9429_Spy1267   arcB FALSE 0.228 170.000 0.104 1.000   NA
 2010128 2010129 MGAS9429_Spy1267 MGAS9429_Spy1268 arcB   TRUE 0.751 40.000 0.104 1.000   NA
 2010129 2010130 MGAS9429_Spy1268 MGAS9429_Spy1269   arcA FALSE 0.415 81.000 0.056 1.000   NA
 2010130 2010131 MGAS9429_Spy1269 MGAS9429_Spy1270 arcA   FALSE 0.041 274.000 0.000 1.000 N NA
 2010133 2010134 MGAS9429_Spy1272 MGAS9429_Spy1273     TRUE 0.755 23.000 0.009 NA   NA
 2010134 2010135 MGAS9429_Spy1273 MGAS9429_Spy1274     FALSE 0.384 73.000 0.007 1.000   NA
 2010135 2010136 MGAS9429_Spy1274 MGAS9429_Spy1275     TRUE 0.997 -3.000 0.480 0.011   NA
 2010136 2010137 MGAS9429_Spy1275 MGAS9429_Spy1276   msrA TRUE 0.568 88.000 0.240 1.000   NA
 2010137 2010138 MGAS9429_Spy1276 MGAS9429_Spy1277 msrA tlpA TRUE 0.983 43.000 0.875 1.000 Y NA
 2010138 2010139 MGAS9429_Spy1277 MGAS9429_Spy1278 tlpA ccdA TRUE 0.987 13.000 0.500 1.000 Y NA
 2010139 2010140 MGAS9429_Spy1278 MGAS9429_Spy1279 ccdA   FALSE 0.017 808.000 0.000 1.000 N NA
 11412338 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2742.000 0.000 NA   NA
 11554701 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2742.000 0.000 NA   NA
 11697093 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2742.000 0.000 NA   NA
 11412339 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2775.000 0.000 NA   NA
 11554702 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2775.000 0.000 NA   NA
 11697094 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2775.000 0.000 NA   NA
 11412340 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2807.000 0.000 NA   NA
 11554703 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2807.000 0.000 NA   NA
 11697095 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2807.000 0.000 NA   NA
 11412341 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2840.000 0.000 NA   NA
 11554704 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2840.000 0.000 NA   NA
 11697096 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2840.000 0.000 NA   NA
 11412342 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2874.000 0.000 NA   NA
 11554705 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2874.000 0.000 NA   NA
 11697097 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2874.000 0.000 NA   NA
 11412343 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2907.000 0.000 NA   NA
 11554706 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2907.000 0.000 NA   NA
 11697098 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2907.000 0.000 NA   NA
 11412344 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2941.000 0.000 NA   NA
 11554707 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2941.000 0.000 NA   NA
 11697099 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2941.000 0.000 NA   NA
 11412345 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2974.000 0.000 NA   NA
 11554708 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2974.000 0.000 NA   NA
 11697100 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 2974.000 0.000 NA   NA
 11412346 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3008.000 0.000 NA   NA
 11554709 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3008.000 0.000 NA   NA
 11697101 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3008.000 0.000 NA   NA
 11412347 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3041.000 0.000 NA   NA
 11554710 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3041.000 0.000 NA   NA
 11697102 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3041.000 0.000 NA   NA
 11412348 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3076.000 0.000 NA   NA
 11554711 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3076.000 0.000 NA   NA
 11697103 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3076.000 0.000 NA   NA
 11412349 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3109.000 0.000 NA   NA
 11554712 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3109.000 0.000 NA   NA
 11697104 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3109.000 0.000 NA   NA
 11412350 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3144.000 0.000 NA   NA
 11554713 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3144.000 0.000 NA   NA
 11697105 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3144.000 0.000 NA   NA
 11412351 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3177.000 0.000 NA   NA
 11554714 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3177.000 0.000 NA   NA
 11697106 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3177.000 0.000 NA   NA
 11412352 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3210.000 0.000 NA   NA
 11554715 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3210.000 0.000 NA   NA
 11697107 2010136   MGAS9429_Spy1275     FALSE NA 3210.000 0.000 NA   NA
 2010140 2010141 MGAS9429_Spy1279 MGAS9429_Spy1280     TRUE 0.995 11.000 0.882 1.000 Y NA
 2010141 2010142 MGAS9429_Spy1280 MGAS9429_Spy1281     TRUE 0.997 -3.000 0.773 NA Y NA
 2010142 2010143 MGAS9429_Spy1281 MGAS9429_Spy1282     TRUE 0.995 2.000 0.711 NA Y NA
 2010143 2010144 MGAS9429_Spy1282 MGAS9429_Spy1283     TRUE 0.993 -10.000 0.948 NA   NA
 2010144 2010145 MGAS9429_Spy1283 MGAS9429_Spy1284     TRUE 0.994 0.000 0.891 NA   NA
 2010145 2010146 MGAS9429_Spy1284 MGAS9429_Spy1285     TRUE 0.674 133.000 0.664 NA   NA
 2010146 2010147 MGAS9429_Spy1285 MGAS9429_Spy1286   valS FALSE 0.099 154.000 0.000 1.000   NA
 2010147 2010148 MGAS9429_Spy1286 MGAS9429_Spy1287 valS   TRUE 0.891 2.000 0.008 NA   NA
 2010148 2010149 MGAS9429_Spy1287 MGAS9429_Spy1288     TRUE 0.843 -24.000 0.033 NA   NA
 2010149 2010150 MGAS9429_Spy1288 MGAS9429_Spy1289     FALSE 0.015 425.000 0.000 NA   NA
 2010150 2010151 MGAS9429_Spy1289 MGAS9429_Spy1290     TRUE 0.601 21.000 0.000 NA   NA
 1628205 2010152 MGAS9429_SpyT0049 MGAS9429_Spy1291     FALSE 0.038 240.000 0.000 NA   NA
 2010152 2010153 MGAS9429_Spy1291 MGAS9429_Spy1292   aroB TRUE 0.963 41.000 0.003 0.003 Y NA
 2010154 2010155 MGAS9429_Spy1293 MGAS9429_Spy1294     FALSE 0.315 51.000 0.000 NA   NA
 2010155 2010156 MGAS9429_Spy1294 MGAS9429_Spy1295     TRUE 0.790 2.000 0.000 NA   NA
 2010156 2010157 MGAS9429_Spy1295 MGAS9429_Spy1296     TRUE 0.527 53.000 0.026 NA   NA
 2010157 2010158 MGAS9429_Spy1296 MGAS9429_Spy1297   aroE FALSE 0.054 235.000 0.000 1.000 N NA
 2010158 2010159 MGAS9429_Spy1297 MGAS9429_Spy1298 aroE lacZ FALSE 0.256 138.000 0.061 1.000 N NA
 2010159 2010160 MGAS9429_Spy1298 MGAS9429_Spy1299 lacZ   TRUE 0.826 -70.000 0.167 1.000 N NA
 2010160 2010161 MGAS9429_Spy1299 MGAS9429_Spy1300     TRUE 0.996 -3.000 0.167 0.011 Y NA
 2010161 2010162 MGAS9429_Spy1300 MGAS9429_Spy1301     TRUE 0.986 -13.000 0.667 NA   NA
 2010162 2010163 MGAS9429_Spy1301 MGAS9429_Spy1302     FALSE 0.024 306.000 0.000 NA   NA
 2010163 2010164 MGAS9429_Spy1302 MGAS9429_Spy1303     TRUE 0.942 81.000 0.333 0.030 Y NA
 2010164 2010165 MGAS9429_Spy1303 MGAS9429_Spy1304     TRUE 0.998 10.000 0.917 0.030 Y NA
 2010166 2010167 MGAS9429_Spy1305 MGAS9429_Spy1306     FALSE 0.080 143.000 0.000 NA   NA
 2010168 2010169 MGAS9429_Spy1307 MGAS9429_Spy1308   hyl TRUE 0.889 25.000 0.182 1.000   NA
 2010169 2010170 MGAS9429_Spy1308 MGAS9429_Spy1309 hyl   TRUE 0.812 51.000 0.286 1.000   NA
 2010171 2010172 MGAS9429_Spy1310 MGAS9429_Spy1311     TRUE 0.924 15.000 0.194 1.000   NA
 2010173 2010174 MGAS9429_Spy1312 MGAS9429_Spy1313 rocA   FALSE 0.013 664.000 0.000 NA N NA
 2010175 2010176 MGAS9429_Spy1314 MGAS9429_Spy1315 recX   FALSE 0.343 80.000 0.025 NA   NA
 2010178 2010179 MGAS9429_Spy1316 MGAS9429_Spy1318     FALSE 0.099 115.000 0.000 NA   NA
 1628234 1628235 MGAS9429_SpyT0050 MGAS9429_SpyT0051     TRUE 0.583 23.000 0.000 NA   NA
 1628235 1628236 MGAS9429_SpyT0051 MGAS9429_SpyT0052     FALSE 0.465 36.000 0.000 NA   NA
 1628236 1628237 MGAS9429_SpyT0052 MGAS9429_SpyT0053     TRUE 0.674 11.000 0.000 NA   NA
 1628237 1628238 MGAS9429_SpyT0053 MGAS9429_SpyT0054     TRUE 0.718 6.000 0.000 NA   NA
 1628238 1628239 MGAS9429_SpyT0054 MGAS9429_SpyT0055     TRUE 0.511 32.000 0.000 NA   NA
 1628239 1628240 MGAS9429_SpyT0055 MGAS9429_SpyT0056     TRUE 0.636 18.000 0.000 NA   NA
 1628240 1628241 MGAS9429_SpyT0056 MGAS9429_SpyR0013     TRUE 0.583 23.000 0.000 NA   NA
 1628241 1628242 MGAS9429_SpyR0013 MGAS9429_SpyR0014     FALSE 0.129 92.000 0.000 NA   NA
 1628242 1628243 MGAS9429_SpyR0014 MGAS9429_SpyT0057     FALSE 0.025 298.000 0.000 NA   NA
 1628243 1628244 MGAS9429_SpyT0057 MGAS9429_SpyR0015     FALSE 0.303 53.000 0.000 NA   NA
 2010181 2010182 MGAS9429_Spy1320 MGAS9429_Spy1321   comFC FALSE 0.400 80.000 0.080 NA   NA
 2010182 2010183 MGAS9429_Spy1321 MGAS9429_Spy1322 comFC comFA TRUE 0.864 -28.000 0.130 NA   NA
 2010184 2010185 MGAS9429_Spy1323 MGAS9429_Spy1324   cysM FALSE 0.244 128.000 0.033 1.000   NA
 2010186 2010187 MGAS9429_Spy1325 MGAS9429_Spy1326     TRUE 0.958 0.000 0.151 1.000   NA
 2010187 2010188 MGAS9429_Spy1326 MGAS9429_Spy1327   yvqC TRUE 0.878 25.000 0.164 1.000   NA
 2010188 2010189 MGAS9429_Spy1327 MGAS9429_Spy1328 yvqC yvqE TRUE 0.999 -13.000 0.853 0.011 Y NA
 2010189 2010190 MGAS9429_Spy1328 MGAS9429_Spy1329 yvqE yvqF TRUE 0.992 -3.000 0.679 NA   NA
 2010190 2010191 MGAS9429_Spy1329 MGAS9429_Spy1330 yvqF   FALSE 0.405 72.000 0.039 NA   NA
 2010191 2010192 MGAS9429_Spy1330 MGAS9429_Spy1331   pppL TRUE 0.997 -3.000 0.704 1.000 Y NA
 2010192 2010193 MGAS9429_Spy1331 MGAS9429_Spy1332 pppL sunL TRUE 0.757 38.000 0.074 1.000 N NA
 2010193 2010194 MGAS9429_Spy1332 MGAS9429_Spy1333 sunL   TRUE 0.989 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 2010194 2010195 MGAS9429_Spy1333 MGAS9429_Spy1334   priA TRUE 0.551 62.000 0.052 1.000 N NA
 2010195 2010196 MGAS9429_Spy1334 MGAS9429_Spy1335 priA   TRUE 0.897 38.000 0.032 0.059 N NA
 2010196 2010197 MGAS9429_Spy1335 MGAS9429_Spy1336   gmk TRUE 0.967 16.000 0.471 1.000 N NA
 2010197 2010198 MGAS9429_Spy1336 MGAS9429_Spy1337 gmk   FALSE 0.237 110.000 0.010 1.000   NA
 2010198 2010199 MGAS9429_Spy1337 MGAS9429_Spy1338     FALSE 0.199 130.000 0.006 1.000   NA
 2010200 2010201 MGAS9429_Spy1339 MGAS9429_Spy1340 atoB atoD1 TRUE 0.964 12.000 0.150 1.000 Y NA
 2010201 2010202 MGAS9429_Spy1340 MGAS9429_Spy1341 atoD1 atoA TRUE 0.997 2.000 0.200 0.002 Y NA
 2010202 2010203 MGAS9429_Spy1341 MGAS9429_Spy1342 atoA   TRUE 0.942 52.000 0.111 0.037 Y NA
 2010203 2010204 MGAS9429_Spy1342 MGAS9429_Spy1343     TRUE 0.743 71.000 0.333 1.000   NA
 2010204 2010205 MGAS9429_Spy1343 MGAS9429_Spy1344     TRUE 0.887 46.000 0.000 0.001   NA
 2010205 2010206 MGAS9429_Spy1344 MGAS9429_Spy1345   luxS TRUE 0.879 -16.000 0.006 1.000 N NA
 2010207 2010208 MGAS9429_Spy1346 MGAS9429_Spy1347     TRUE 0.828 14.000 0.029 NA   NA
 2010208 2010209 MGAS9429_Spy1347 MGAS9429_Spy1348     FALSE 0.015 445.000 0.000 NA   NA
 2010209 2010210 MGAS9429_Spy1348 MGAS9429_Spy1349     TRUE 0.666 122.000 0.579 NA   NA
 2010211 2010212 MGAS9429_Spy1350 MGAS9429_Spy1351 recU pbp1A TRUE 0.970 -13.000 0.319 1.000   NA
 2010213 2010214 MGAS9429_Spy1352 MGAS9429_Spy1353 pepC   FALSE 0.155 185.000 0.017 1.000 N NA
 2010214 2010215 MGAS9429_Spy1353 MGAS9429_Spy1354   nadE TRUE 0.989 -40.000 0.194 0.003 Y NA
 2010215 2010216 MGAS9429_Spy1354 MGAS9429_Spy1355 nadE   FALSE 0.188 171.000 0.032 1.000 N NA
 2010216 2010217 MGAS9429_Spy1355 MGAS9429_Spy1356     FALSE 0.204 157.000 0.033 1.000 N NA
 2010217 2010218 MGAS9429_Spy1356 MGAS9429_Spy1357   aapA TRUE 0.543 64.000 0.117 NA   NA
 2010218 2010219 MGAS9429_Spy1357 MGAS9429_Spy1358 aapA   TRUE 0.559 104.000 0.364 NA   NA
 2010219 2010220 MGAS9429_Spy1358 MGAS9429_Spy1359     TRUE 0.992 -3.000 0.310 1.000 Y NA
 2010220 2010221 MGAS9429_Spy1359 MGAS9429_Spy1361     FALSE 0.270 105.000 0.018 1.000 N NA
 2010223 2010224 MGAS9429_Spy1362 MGAS9429_Spy1363     TRUE 0.974 2.000 0.038 1.000 Y NA
 2010224 2010225 MGAS9429_Spy1363 MGAS9429_Spy1364   ftsL TRUE 0.978 4.000 0.456 1.000 N NA
 2010225 2010226 MGAS9429_Spy1364 MGAS9429_Spy1365 ftsL mraW TRUE 0.880 -25.000 0.077 1.000 N NA
 2010226 2010227 MGAS9429_Spy1365 MGAS9429_Spy1366 mraW   TRUE 0.651 24.000 0.000 1.000   NA
 2010227 2010228 MGAS9429_Spy1366 MGAS9429_Spy1367     FALSE 0.384 43.000 0.000 NA   NA
 2010228 2010229 MGAS9429_Spy1367 MGAS9429_Spy1368   proA TRUE 0.650 -25.000 0.000 NA   NA
 2010229 2010230 MGAS9429_Spy1368 MGAS9429_Spy1369 proA   TRUE 0.998 -7.000 0.281 0.002 Y NA
 2010230 2010231 MGAS9429_Spy1369 MGAS9429_Spy1370   proB FALSE 0.438 58.000 0.006 NA   NA
 2010231 2010232 MGAS9429_Spy1370 MGAS9429_Spy1371 proB   TRUE 0.931 -37.000 0.341 NA   NA
 2010232 2010233 MGAS9429_Spy1371 MGAS9429_Spy1372     TRUE 0.794 34.000 0.136 NA   NA
 2010233 2010234 MGAS9429_Spy1372 MGAS9429_Spy1373   tkt FALSE 0.323 193.000 0.300 NA   NA
 2010234 2010235 MGAS9429_Spy1373 MGAS9429_Spy1374 tkt   FALSE 0.202 218.000 0.000 1.000 Y NA
 2010235 2010236 MGAS9429_Spy1374 MGAS9429_Spy1375     FALSE 0.092 126.000 0.000 NA   NA
 2010236 2010237 MGAS9429_Spy1375 MGAS9429_Spy1376     TRUE 0.916 -70.000 0.462 NA   NA
 2010237 2010238 MGAS9429_Spy1376 MGAS9429_Spy1377   glpF TRUE 0.957 16.000 0.364 1.000   NA
 2010238 2010239 MGAS9429_Spy1377 MGAS9429_Spy1378 glpF glpO TRUE 0.985 2.000 0.500 1.000 N NA
 2010239 2010240 MGAS9429_Spy1378 MGAS9429_Spy1379 glpO glpK TRUE 0.997 16.000 0.500 0.001 Y NA
 2010240 2010241 MGAS9429_Spy1379 MGAS9429_Spy1380 glpK   FALSE 0.027 360.000 0.000 1.000   NA
 2010241 2010242 MGAS9429_Spy1380 MGAS9429_Spy1381     FALSE 0.432 67.000 0.029 NA   NA
 2010242 2010243 MGAS9429_Spy1381 MGAS9429_Spy1382   glyS FALSE 0.168 154.000 0.020 NA   NA
 2010243 2010244 MGAS9429_Spy1382 MGAS9429_Spy1383 glyS glyQ TRUE 0.832 378.000 0.651 0.001 Y NA
 2010246 2010247 MGAS9429_Spy1385 MGAS9429_Spy1386     FALSE 0.444 -73.000 0.000 NA   NA
 2010247 2010248 MGAS9429_Spy1386 MGAS9429_Spy1387     FALSE 0.120 95.000 0.000 NA   NA
 2010248 2010249 MGAS9429_Spy1387 MGAS9429_Spy1388   nagA FALSE 0.268 119.000 0.045 1.000   NA
 2010249 2010250 MGAS9429_Spy1388 MGAS9429_Spy1389 nagA   FALSE 0.305 118.000 0.090 1.000 N NA
 2010250 2010251 MGAS9429_Spy1389 MGAS9429_Spy1391     FALSE 0.419 40.000 0.000 NA   NA
 2010255 2010256 MGAS9429_Spy1394 MGAS9429_Spy1395     TRUE 0.726 -55.000 0.047 NA   NA
 2010256 2010257 MGAS9429_Spy1395 MGAS9429_Spy1396     TRUE 0.626 19.000 0.000 NA   NA
 2010257 2010258 MGAS9429_Spy1396 MGAS9429_Spy1397   lacD1 FALSE 0.268 59.000 0.000 NA   NA
 2010258 2010259 MGAS9429_Spy1397 MGAS9429_Spy1398 lacD1   TRUE 0.709 82.000 0.000 0.002   NA
 2010259 2010260 MGAS9429_Spy1398 MGAS9429_Spy1399     FALSE 0.099 154.000 0.000 1.000   NA
 2010260 2010261 MGAS9429_Spy1399 MGAS9429_Spy1400   lacA1 TRUE 0.982 15.000 0.000 0.003 Y NA
 2010263 2010264 MGAS9429_Spy1402 MGAS9429_Spy1403     TRUE 0.965 26.000 0.000 0.017 Y NA
 2010264 2010265 MGAS9429_Spy1403 MGAS9429_Spy1404     TRUE 0.998 -7.000 0.429 0.012 Y NA
 2010267 2010268 MGAS9429_Spy1406 MGAS9429_Spy1407 copZ copA TRUE 0.990 14.000 0.048 0.002 Y NA
 2010268 2010269 MGAS9429_Spy1407 MGAS9429_Spy1408 copA copY TRUE 0.812 -45.000 0.064 1.000 N NA
 2010271 2010272 MGAS9429_Spy1410 MGAS9429_Spy1411 rbfA infB TRUE 0.697 200.000 0.530 1.000 Y NA
 2010272 2010273 MGAS9429_Spy1411 MGAS9429_Spy1412 infB   TRUE 0.964 20.000 0.223 NA Y NA
 2010273 2010274 MGAS9429_Spy1412 MGAS9429_Spy1413     TRUE 0.981 -7.000 0.408 NA N NA
 2010274 2010275 MGAS9429_Spy1413 MGAS9429_Spy1414   nusA TRUE 0.977 13.000 0.323 NA Y NA
 2010275 2010276 MGAS9429_Spy1414 MGAS9429_Spy1415 nusA   TRUE 0.653 175.000 0.759 NA   NA
 2010276 2010277 MGAS9429_Spy1415 MGAS9429_Spy1416     FALSE 0.036 245.000 0.000 NA   NA
 2010279 2010280 MGAS9429_Spy1418 MGAS9429_Spy1419     FALSE 0.101 111.000 0.000 NA   NA
 2010280 2010281 MGAS9429_Spy1419 MGAS9429_Spy1420     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 2010281 2010282 MGAS9429_Spy1420 MGAS9429_Spy1421     TRUE 0.674 11.000 0.000 NA   NA
 2010282 2010283 MGAS9429_Spy1421 MGAS9429_Spy1422     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 2010283 2010284 MGAS9429_Spy1422 MGAS9429_Spy1423     TRUE 0.702 9.000 0.000 NA   NA
 2010284 2010285 MGAS9429_Spy1423 MGAS9429_Spy1424     TRUE 0.674 11.000 0.000 NA   NA
 2010285 2010286 MGAS9429_Spy1424 MGAS9429_Spy1425     TRUE 0.815 0.000 0.000 NA   NA
 2010286 2010287 MGAS9429_Spy1425 MGAS9429_Spy1426     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2010287 2010288 MGAS9429_Spy1426 MGAS9429_Spy1427     TRUE 0.688 10.000 0.000 NA   NA
 2010288 2010289 MGAS9429_Spy1427 MGAS9429_Spy1428     TRUE 0.958 12.000 0.400 NA   NA
 2010289 2010290 MGAS9429_Spy1428 MGAS9429_Spy1429     TRUE 0.956 15.000 0.400 NA   NA
 2010290 2010291 MGAS9429_Spy1429 MGAS9429_Spy1430     TRUE 0.607 75.000 0.235 NA   NA
 2010291 2010292 MGAS9429_Spy1430 MGAS9429_Spy1431     TRUE 0.565 54.000 0.062 NA   NA
 2010292 2010293 MGAS9429_Spy1431 MGAS9429_Spy1432     TRUE 0.844 12.000 0.041 NA   NA
 2010293 2010294 MGAS9429_Spy1432 MGAS9429_Spy1433     TRUE 0.989 4.000 0.800 NA   NA
 2010294 2010295 MGAS9429_Spy1433 MGAS9429_Spy1434     TRUE 0.981 15.000 0.750 NA   NA
 2010295 2010296 MGAS9429_Spy1434 MGAS9429_Spy1435     TRUE 0.979 11.000 0.667 NA   NA
 2010296 2010297 MGAS9429_Spy1435 MGAS9429_Spy1436     TRUE 0.968 12.000 0.500 NA   NA
 2010297 2010298 MGAS9429_Spy1436 MGAS9429_Spy1437     TRUE 0.911 13.000 0.192 NA   NA
 2010298 2010299 MGAS9429_Spy1437 MGAS9429_Spy1438     FALSE 0.073 156.000 0.000 NA   NA
 2010299 2010300 MGAS9429_Spy1438 MGAS9429_Spy1439     TRUE 0.766 3.000 0.000 NA   NA
 2010300 2010301 MGAS9429_Spy1439 MGAS9429_Spy1440     TRUE 0.840 31.000 0.167 NA   NA
 2010301 2010302 MGAS9429_Spy1440 MGAS9429_Spy1441     TRUE 0.893 -43.000 0.250 NA   NA
 2010302 2010303 MGAS9429_Spy1441 MGAS9429_Spy1442     TRUE 0.958 16.000 0.429 NA   NA
 2010303 2010304 MGAS9429_Spy1442 MGAS9429_Spy1443     TRUE 0.988 -19.000 0.176 0.002   NA
 2010304 2010305 MGAS9429_Spy1443 MGAS9429_Spy1444     TRUE 0.750 48.000 0.176 1.000   NA
 2010305 2010306 MGAS9429_Spy1444 MGAS9429_Spy1445     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2010306 2010307 MGAS9429_Spy1445 MGAS9429_Spy1446     TRUE 0.784 -10.000 0.000 NA   NA
 2010307 2010308 MGAS9429_Spy1446 MGAS9429_Spy1447     TRUE 0.702 9.000 0.000 NA   NA
 2010308 2010309 MGAS9429_Spy1447 MGAS9429_Spy1448     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2010309 2010310 MGAS9429_Spy1448 MGAS9429_Spy1449     TRUE 0.984 1.000 0.500 NA   NA
 2010310 2010311 MGAS9429_Spy1449 MGAS9429_Spy1450     TRUE 0.976 -3.000 0.286 NA   NA
 2010311 2010312 MGAS9429_Spy1450 MGAS9429_Spy1451     FALSE 0.019 369.000 0.000 NA   NA
 2010312 2010313 MGAS9429_Spy1451 MGAS9429_Spy1452     TRUE 0.905 5.000 0.111 NA   NA
 2010313 2010314 MGAS9429_Spy1452 MGAS9429_Spy1453     TRUE 0.818 43.000 0.250 NA   NA
 2010314 2010315 MGAS9429_Spy1453 MGAS9429_Spy1454     TRUE 0.674 11.000 0.000 NA   NA
 2010315 2010316 MGAS9429_Spy1454 MGAS9429_Spy1455     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 2010316 2010317 MGAS9429_Spy1455 MGAS9429_Spy1456     TRUE 0.948 0.000 0.143 NA   NA
 2010317 2010318 MGAS9429_Spy1456 MGAS9429_Spy1457     TRUE 0.877 88.000 1.000 NA   NA
 2010318 2010319 MGAS9429_Spy1457 MGAS9429_Spy1458     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2010319 2010320 MGAS9429_Spy1458 MGAS9429_Spy1459     TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2010320 2010321 MGAS9429_Spy1459 MGAS9429_Spy1460     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 2010321 2010322 MGAS9429_Spy1460 MGAS9429_Spy1461     TRUE 0.991 -19.000 1.000 NA   NA
 2010322 2010323 MGAS9429_Spy1461 MGAS9429_Spy1462     TRUE 0.607 -30.000 0.000 NA   NA
 2010323 2010324 MGAS9429_Spy1462 MGAS9429_Spy1463     FALSE 0.255 62.000 0.000 NA   NA
 2010327 2010328 MGAS9429_Spy1466 MGAS9429_Spy1467     TRUE 0.988 14.000 1.000 NA   NA
 2010328 2010329 MGAS9429_Spy1467 MGAS9429_Spy1468     TRUE 0.674 11.000 0.000 NA   NA
 2010329 2010330 MGAS9429_Spy1468 MGAS9429_Spy1469   int3 FALSE 0.103 108.000 0.000 NA   NA
 1628396 2010331 MGAS9429_SpyT0058 MGAS9429_Spy1470     FALSE 0.237 65.000 0.000 NA   NA
 2010331 2010332 MGAS9429_Spy1470 MGAS9429_Spy1471     TRUE 0.952 0.000 0.154 NA   NA
 2010332 2010333 MGAS9429_Spy1471 MGAS9429_Spy1472     TRUE 0.536 64.000 0.107 NA N NA
 2010333 2010334 MGAS9429_Spy1472 MGAS9429_Spy1473     TRUE 0.942 3.000 0.167 NA N NA
 2010335 2010336 MGAS9429_Spy1474 MGAS9429_Spy1475 hit   TRUE 0.940 -3.000 0.063 NA   NA
 2010337 2010338 MGAS9429_Spy1476 MGAS9429_Spy1477 lytR   TRUE 0.950 9.000 0.283 NA N NA
 2010338 2010339 MGAS9429_Spy1477 MGAS9429_Spy1478     TRUE 0.832 -25.000 0.033 NA   NA
 2010339 2010340 MGAS9429_Spy1478 MGAS9429_Spy1479     FALSE 0.147 154.000 0.008 NA   NA
 2010341 2010342 MGAS9429_Spy1480 MGAS9429_Spy1481   manL FALSE 0.028 352.000 0.000 1.000   NA
 2010342 2010343 MGAS9429_Spy1481 MGAS9429_Spy1482 manL manM TRUE 0.982 89.000 0.943 0.016 Y NA
 2010343 2010344 MGAS9429_Spy1482 MGAS9429_Spy1483 manM manN TRUE 0.998 17.000 0.812 0.016 Y NA
 2010344 2010345 MGAS9429_Spy1483 MGAS9429_Spy1484 manN manO TRUE 0.967 21.000 0.583 NA   NA
 2010345 2010346 MGAS9429_Spy1484 MGAS9429_Spy1485 manO serS FALSE 0.032 391.000 0.003 NA   NA
 2010347 2010348 MGAS9429_Spy1486 MGAS9429_Spy1487 accD accA TRUE 0.998 -3.000 0.234 0.002 Y NA
 2010348 2010349 MGAS9429_Spy1487 MGAS9429_Spy1488 accA accC TRUE 0.993 9.000 0.090 0.002 Y NA
 2010349 2010350 MGAS9429_Spy1488 MGAS9429_Spy1489 accC fabZ TRUE 0.914 32.000 0.045 1.000 Y NA
 2010350 2010351 MGAS9429_Spy1489 MGAS9429_Spy1490 fabZ accB TRUE 0.995 -3.000 0.047 0.006 Y NA
 2010351 2010352 MGAS9429_Spy1490 MGAS9429_Spy1491 accB fabF TRUE 0.977 2.000 0.074 1.000 Y NA
 2010352 2010353 MGAS9429_Spy1491 MGAS9429_Spy1492 fabF   TRUE 0.951 15.000 0.056 1.000 Y NA
 2010353 2010354 MGAS9429_Spy1492 MGAS9429_Spy1493   fabD TRUE 0.998 -10.000 0.432 0.006 Y NA
 2010354 2010355 MGAS9429_Spy1493 MGAS9429_Spy1494 fabD fabK TRUE 0.874 19.000 0.099 1.000   NA
 2010355 2010356 MGAS9429_Spy1494 MGAS9429_Spy1495 fabK acpP FALSE 0.273 202.000 0.216 1.000   NA
 2010356 2010357 MGAS9429_Spy1495 MGAS9429_Spy1496 acpP fabH TRUE 0.874 61.000 0.065 0.006   NA
 2010357 2010358 MGAS9429_Spy1496 MGAS9429_Spy1497 fabH   TRUE 0.941 1.000 0.070 1.000 N NA
 2010358 2010359 MGAS9429_Spy1497 MGAS9429_Spy1498   phaB TRUE 0.768 38.000 0.098 1.000 N NA
 2010359 2010360 MGAS9429_Spy1498 MGAS9429_Spy1499 phaB dnaJ FALSE 0.058 222.000 0.000 1.000 N NA
 2010360 2010361 MGAS9429_Spy1499 MGAS9429_Spy1500 dnaJ dnaK TRUE 0.759 227.000 0.196 0.003 Y NA
 2010361 2010362 MGAS9429_Spy1500 MGAS9429_Spy1501 dnaK grpE TRUE 0.720 181.000 0.026 0.006 Y NA
 2010362 2010363 MGAS9429_Spy1501 MGAS9429_Spy1502 grpE hrcA TRUE 0.921 3.000 0.051 1.000 N NA
 2010363 2010364 MGAS9429_Spy1502 MGAS9429_Spy1503 hrcA   FALSE 0.204 135.000 0.009 1.000 N NA
 2010364 2010365 MGAS9429_Spy1503 MGAS9429_Spy1504     TRUE 0.967 -3.000 0.174 1.000 N NA
 2010365 2010366 MGAS9429_Spy1504 MGAS9429_Spy1505     TRUE 0.956 -10.000 0.174 1.000 N NA
 2010366 2010367 MGAS9429_Spy1505 MGAS9429_Spy1506     FALSE 0.023 392.000 0.000 1.000   NA
 2010367 2010368 MGAS9429_Spy1506 MGAS9429_Spy1507     FALSE 0.046 210.000 0.000 NA   NA
 2010368 2010369 MGAS9429_Spy1507 MGAS9429_Spy1508   gatB TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2010369 2010370 MGAS9429_Spy1508 MGAS9429_Spy1509 gatB gatA TRUE 0.999 0.000 0.492 0.002 Y NA
 2010370 2010371 MGAS9429_Spy1509 MGAS9429_Spy1510 gatA gatC TRUE 0.999 0.000 0.643 0.002 Y NA
 2010371 2010372 MGAS9429_Spy1510 MGAS9429_Spy1511 gatC   FALSE 0.087 232.000 0.002 1.000   NA
 2010372 2010373 MGAS9429_Spy1511 MGAS9429_Spy1512     FALSE 0.019 515.000 0.000 1.000   NA
 2010373 2010374 MGAS9429_Spy1512 MGAS9429_Spy1513   codY FALSE 0.257 144.000 0.083 1.000 N NA
 2010374 2010375 MGAS9429_Spy1513 MGAS9429_Spy1514 codY   FALSE 0.193 155.000 0.015 1.000 N NA
 2010379 2010380 MGAS9429_Spy1518 MGAS9429_Spy1519     TRUE 0.647 16.000 0.000 NA   NA
 2010380 2010381 MGAS9429_Spy1519 MGAS9429_Spy1520     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 2010381 2010382 MGAS9429_Spy1520 MGAS9429_Spy1521   recG FALSE 0.037 293.000 0.000 1.000 N NA
 2010383 2010384 MGAS9429_Spy1522 MGAS9429_Spy1523     FALSE 0.416 -96.000 0.000 NA   NA
 2010385 2010386 MGAS9429_Spy1524 MGAS9429_Spy1525     TRUE 0.922 -63.000 0.429 1.000   NA
 2010386 2010387 MGAS9429_Spy1525 MGAS9429_Spy1526     TRUE 0.989 -3.000 0.562 NA   NA
 2010387 2010388 MGAS9429_Spy1526 MGAS9429_Spy1527     TRUE 0.942 -3.000 0.081 NA   NA
 2010388 2010389 MGAS9429_Spy1527 MGAS9429_Spy1528     TRUE 0.991 -40.000 0.576 0.006 N NA
 2010389 2010390 MGAS9429_Spy1528 MGAS9429_Spy1529   fhuC TRUE 0.946 -3.000 0.047 1.000 N NA
 2010390 2010391 MGAS9429_Spy1529 MGAS9429_Spy1530 fhuC   FALSE 0.341 47.000 0.000 NA   NA
 2010391 2010392 MGAS9429_Spy1530 MGAS9429_Spy1531     TRUE 0.991 -3.000 0.657 NA   NA
 2010392 2010393 MGAS9429_Spy1531 MGAS9429_Spy1532     TRUE 0.994 -25.000 0.877 1.000 Y NA
 2010393 2010394 MGAS9429_Spy1532 MGAS9429_Spy1533   shp TRUE 0.891 -30.000 0.182 NA   NA
 2010394 2010395 MGAS9429_Spy1533 MGAS9429_Spy1534 shp   FALSE 0.292 197.000 0.273 NA   NA
 2010395 2010396 MGAS9429_Spy1534 MGAS9429_Spy1535   isp2 FALSE 0.015 484.000 0.000 NA   NA
 2010396 2010397 MGAS9429_Spy1535 MGAS9429_Spy1536 isp2 acpS FALSE 0.296 87.000 0.022 NA   NA
 2010397 2010398 MGAS9429_Spy1536 MGAS9429_Spy1537 acpS alr TRUE 0.953 -3.000 0.093 1.000 N NA
 2010398 2010399 MGAS9429_Spy1537 MGAS9429_Spy1538 alr secA FALSE 0.229 116.000 0.008 1.000 N NA
 2010399 2010400 MGAS9429_Spy1538 MGAS9429_Spy1539 secA   FALSE 0.094 165.000 0.000 1.000 N NA
 2010400 2010401 MGAS9429_Spy1539 MGAS9429_Spy1540     TRUE 0.520 31.000 0.000 NA   NA
 2010401 2010402 MGAS9429_Spy1540 MGAS9429_Spy1541   pmi FALSE 0.076 152.000 0.000 NA   NA
 2010402 2010403 MGAS9429_Spy1541 MGAS9429_Spy1543 pmi scrK TRUE 0.789 95.000 0.333 1.000 Y NA
 2010405 2010406 MGAS9429_Spy1544 MGAS9429_Spy1545 endoS   TRUE 0.607 -30.000 0.000 NA   NA
 2010406 2010407 MGAS9429_Spy1545 MGAS9429_Spy1546   scrA FALSE 0.384 43.000 0.000 NA   NA
 2010408 2010409 MGAS9429_Spy1547 MGAS9429_Spy1548 scrB scrR TRUE 0.982 5.000 0.571 1.000 N NA
 2010410 2010411 MGAS9429_Spy1549 MGAS9429_Spy1550 nusB   TRUE 0.933 -25.000 0.265 NA   NA
 2010411 2010412 MGAS9429_Spy1550 MGAS9429_Spy1551   efp TRUE 0.593 46.000 0.031 NA   NA
 2010412 2010413 MGAS9429_Spy1551 MGAS9429_Spy1552 efp comEB FALSE 0.252 96.000 0.005 1.000 N NA
 2010413 2010414 MGAS9429_Spy1552 MGAS9429_Spy1553 comEB   TRUE 0.918 -10.000 0.018 1.000 N NA
 2010414 2010415 MGAS9429_Spy1553 MGAS9429_Spy1554   uvrA FALSE 0.376 77.000 0.008 1.000 N NA
 2010416 2010417 MGAS9429_Spy1555 MGAS9429_Spy1556   corA TRUE 0.833 -3.000 0.000 NA   NA
 2010417 2010418 MGAS9429_Spy1556 MGAS9429_Spy1557 corA   FALSE 0.235 132.000 0.072 NA   NA
 2010419 2010420 MGAS9429_Spy1558 MGAS9429_Spy1559 rpsR ssb3 FALSE 0.175 165.000 0.012 1.000 N NA
 2010420 2010421 MGAS9429_Spy1559 MGAS9429_Spy1560 ssb3 rpsF TRUE 0.806 22.000 0.012 1.000 N NA
 2010421 2010422 MGAS9429_Spy1560 MGAS9429_Spy1561 rpsF   FALSE 0.064 173.000 0.000 NA   NA
 2010423 2010424 MGAS9429_Spy1562 MGAS9429_Spy1563 mutY   FALSE 0.411 67.000 0.002 1.000 N NA
 2010425 2010426 MGAS9429_Spy1564 MGAS9429_Spy1565 trx   TRUE 0.730 39.000 0.053 1.000   NA
 2010426 2010427 MGAS9429_Spy1565 MGAS9429_Spy1566   mutS2 TRUE 0.877 4.000 0.005 1.000   NA
 2010427 2010428 MGAS9429_Spy1566 MGAS9429_Spy1567 mutS2   TRUE 0.801 32.000 0.070 1.000   NA
 2010428 2010429 MGAS9429_Spy1567 MGAS9429_Spy1568     TRUE 0.891 3.000 0.019 NA   NA
 2010430 2010431 MGAS9429_Spy1569 MGAS9429_Spy1570   spi TRUE 0.787 -55.000 0.080 1.000 N NA
 2010431 2010432 MGAS9429_Spy1570 MGAS9429_Spy1571 spi recD TRUE 0.616 58.000 0.099 1.000 N NA
 2010432 2010433 MGAS9429_Spy1571 MGAS9429_Spy1572 recD   FALSE 0.306 91.000 0.050 NA   NA
 2010436 2010437 MGAS9429_Spy1575 MGAS9429_Spy1576     TRUE 0.965 -15.000 0.326 NA   NA
 2010439 2010440 MGAS9429_Spy1578 MGAS9429_Spy1579 glpF2   FALSE 0.205 71.000 0.000 NA   NA
 2010440 2010441 MGAS9429_Spy1579 MGAS9429_Spy1580   norA FALSE 0.055 186.000 0.000 NA   NA
 2010442 2010443 MGAS9429_Spy1581 MGAS9429_Spy1582 srv pepXP TRUE 0.850 22.000 0.081 1.000   NA
 2010445 2010446 MGAS9429_Spy1584 MGAS9429_Spy1585     FALSE 0.093 193.000 0.002 NA   NA
 2010447 2010448 MGAS9429_Spy1586 MGAS9429_Spy1587   dnaQ FALSE 0.320 146.000 0.158 1.000 N NA
 2010448 2010449 MGAS9429_Spy1587 MGAS9429_Spy1588 dnaQ   TRUE 0.870 10.000 0.057 NA   NA
 2010451 2010452 MGAS9429_Spy1590 MGAS9429_Spy1591 deoC nupC TRUE 0.968 30.000 0.333 1.000 Y NA
 2010452 2010453 MGAS9429_Spy1591 MGAS9429_Spy1592 nupC udp TRUE 0.955 9.000 0.015 1.000 Y NA
 2010453 2010454 MGAS9429_Spy1592 MGAS9429_Spy1593 udp   FALSE 0.237 65.000 0.000 NA   NA
 2010455 2010456 MGAS9429_Spy1594 MGAS9429_Spy1595 crgR rpsN2 FALSE 0.059 220.000 0.000 1.000 N NA
 2010457 2010458 MGAS9429_Spy1596 MGAS9429_Spy1597     TRUE 0.833 -10.000 0.000 1.000   NA
 2010458 2010459 MGAS9429_Spy1597 MGAS9429_Spy1598     TRUE 0.696 -28.000 0.000 1.000   NA
 2010460 2010461 MGAS9429_Spy1599 MGAS9429_Spy1600     TRUE 0.986 2.000 0.576 NA   NA
 2010462 2010463 MGAS9429_Spy1601 MGAS9429_Spy1602 glnA   TRUE 0.830 38.000 0.179 1.000 N NA
 2010463 2010464 MGAS9429_Spy1602 MGAS9429_Spy1603     TRUE 0.568 67.000 0.154 NA   NA
 2010464 2010465 MGAS9429_Spy1603 MGAS9429_Spy1604   pgk FALSE 0.057 263.000 0.002 NA   NA
 2010465 2010466 MGAS9429_Spy1604 MGAS9429_Spy1605 pgk lppC FALSE 0.116 193.000 0.003 1.000   NA
 2010466 2010467 MGAS9429_Spy1605 MGAS9429_Spy1606 lppC   FALSE 0.054 229.000 0.000 1.000   NA
 2010467 2010468 MGAS9429_Spy1606 MGAS9429_Spy1607     FALSE 0.093 237.000 0.006 1.000   NA
 2010468 2010469 MGAS9429_Spy1607 MGAS9429_Spy1608   asp TRUE 0.987 0.000 0.567 NA   NA
 2010469 2010470 MGAS9429_Spy1608 MGAS9429_Spy1609 asp rpmB FALSE 0.187 152.000 0.044 NA   NA
 2010470 2010471 MGAS9429_Spy1609 MGAS9429_Spy1610 rpmB fba FALSE 0.025 382.000 0.000 1.000 N NA
 2010471 1628538 MGAS9429_Spy1610 MGAS9429_SpyT0059 fba   FALSE 0.047 207.000 0.000 NA   NA
 1628538 2010472 MGAS9429_SpyT0059 MGAS9429_Spy1611     FALSE 0.295 54.000 0.000 NA   NA
 2010474 2010475 MGAS9429_Spy1613 MGAS9429_Spy1614 pyrG rpoE FALSE 0.100 257.000 0.029 1.000 N NA
 2010475 2010476 MGAS9429_Spy1614 MGAS9429_Spy1615 rpoE ropA FALSE 0.140 179.000 0.005 1.000 N NA
 2010478 2010479 MGAS9429_Spy1617 MGAS9429_Spy1618     TRUE 0.887 14.000 0.149 NA   NA
 2010479 2010480 MGAS9429_Spy1618 MGAS9429_Spy1619   thiD TRUE 0.966 -10.000 0.276 NA   NA
 2010480 2010481 MGAS9429_Spy1619 MGAS9429_Spy1620 thiD   TRUE 0.931 -10.000 0.058 1.000 N NA
 2010481 2010482 MGAS9429_Spy1620 MGAS9429_Spy1621   comX2 FALSE 0.075 186.000 0.000 1.000   NA
 2010482 1628550 MGAS9429_Spy1621 MGAS9429_SpyT0060 comX2   FALSE 0.129 92.000 0.000 NA   NA
 1628550 1628551 MGAS9429_SpyT0060 MGAS9429_SpyT0061     FALSE 0.170 80.000 0.000 NA   NA
 1628551 1628552 MGAS9429_SpyT0061 MGAS9429_SpyR0016     TRUE 0.674 11.000 0.000 NA   NA
 1628552 1628553 MGAS9429_SpyR0016 MGAS9429_SpyR0017     FALSE 0.129 92.000 0.000 NA   NA
 1628553 1628554 MGAS9429_SpyR0017 MGAS9429_SpyT0062     FALSE 0.025 298.000 0.000 NA   NA
 1628554 1628555 MGAS9429_SpyT0062 MGAS9429_SpyR0018     FALSE 0.303 53.000 0.000 NA   NA
 2010485 2010486 MGAS9429_Spy1624 MGAS9429_Spy1625 hsdR hsdS TRUE 0.985 13.000 0.000 0.001 Y NA
 2010486 2010487 MGAS9429_Spy1625 MGAS9429_Spy1626 hsdS hsdM TRUE 0.969 13.000 0.000 0.055 Y NA
 2010488 2010489 MGAS9429_Spy1627 MGAS9429_Spy1628   salR FALSE 0.080 142.000 0.000 NA   NA
 2010489 2010490 MGAS9429_Spy1628 MGAS9429_Spy1629 salR   TRUE 0.993 -19.000 0.704 NA Y NA
 2010490 2010491 MGAS9429_Spy1629 MGAS9429_Spy1630   salY FALSE 0.419 40.000 0.000 NA   NA
 2010491 2010492 MGAS9429_Spy1630 MGAS9429_Spy1631 salY   TRUE 0.838 2.000 0.000 1.000   NA
 2010492 2010493 MGAS9429_Spy1631 MGAS9429_Spy1632   salX TRUE 0.976 -3.000 0.000 0.023   NA
 2010493 2010494 MGAS9429_Spy1632 MGAS9429_Spy1633 salX salB FALSE 0.205 71.000 0.000 NA   NA
 2010494 2010495 MGAS9429_Spy1633 MGAS9429_Spy1634 salB salA FALSE 0.158 82.000 0.000 NA   NA
 2010495 2010496 MGAS9429_Spy1634 MGAS9429_Spy1635 salA lacG FALSE 0.019 503.000 0.000 1.000   NA
 2010496 2010497 MGAS9429_Spy1635 MGAS9429_Spy1636 lacG lacE TRUE 0.571 73.000 0.000 1.000 Y NA
 2010497 2010498 MGAS9429_Spy1636 MGAS9429_Spy1637 lacE lacF TRUE 0.995 0.000 0.150 0.012 Y NA
 2010498 2010499 MGAS9429_Spy1637 MGAS9429_Spy1638 lacF lacD2 TRUE 0.988 24.000 0.667 1.000 Y NA
 2010499 2010500 MGAS9429_Spy1638 MGAS9429_Spy1639 lacD2 lacC2 TRUE 0.989 4.000 0.000 0.002 Y NA
 2010500 2010501 MGAS9429_Spy1639 MGAS9429_Spy1640 lacC2 lacB2 TRUE 0.756 46.000 0.000 1.000 Y NA
 2010501 2010502 MGAS9429_Spy1640 MGAS9429_Spy1641 lacB2 lacA2 TRUE 0.967 35.000 0.000 0.002 Y NA
 2010503 2010504 MGAS9429_Spy1642 MGAS9429_Spy1643 lacR2   FALSE 0.013 650.000 0.000 NA   NA
 2010504 2010505 MGAS9429_Spy1643 MGAS9429_Spy1644     TRUE 0.784 -10.000 0.000 NA   NA
 2010505 2010506 MGAS9429_Spy1644 MGAS9429_Spy1645     FALSE 0.076 152.000 0.000 NA   NA
 2010506 2010507 MGAS9429_Spy1645 MGAS9429_Spy1646     FALSE 0.115 361.000 0.000 0.055   NA
 2010508 2010509 MGAS9429_Spy1647 MGAS9429_Spy1648 rpsI rplM TRUE 0.996 21.000 0.601 0.022 Y NA
 2010509 2010510 MGAS9429_Spy1648 MGAS9429_Spy1649 rplM   FALSE 0.047 253.000 0.000 1.000   NA
 2010510 2010511 MGAS9429_Spy1649 MGAS9429_Spy1650     TRUE 0.935 -3.000 0.051 NA   NA
 2010511 2010512 MGAS9429_Spy1650 MGAS9429_Spy1651     FALSE 0.108 103.000 0.000 NA   NA
 2010512 2010513 MGAS9429_Spy1651 MGAS9429_Spy1652     FALSE 0.260 97.000 0.036 NA   NA
 2010513 2010514 MGAS9429_Spy1652 MGAS9429_Spy1653     TRUE 0.911 4.000 0.109 NA   NA
 2010514 2010515 MGAS9429_Spy1653 MGAS9429_Spy1654     TRUE 0.752 20.000 0.003 NA   NA
 2010515 2010516 MGAS9429_Spy1654 MGAS9429_Spy1655     FALSE 0.051 196.000 0.000 NA   NA
 2010516 2010517 MGAS9429_Spy1655 MGAS9429_Spy1656   cysS TRUE 0.950 -7.000 0.129 1.000   NA
 2010517 2010518 MGAS9429_Spy1656 MGAS9429_Spy1657 cysS   TRUE 0.682 28.000 0.002 NA   NA
 2010518 2010519 MGAS9429_Spy1657 MGAS9429_Spy1658     TRUE 0.651 13.000 0.000 NA   NA
 2010519 2010520 MGAS9429_Spy1658 MGAS9429_Spy1659   cysE FALSE 0.038 236.000 0.000 NA   NA
 2010520 2010521 MGAS9429_Spy1659 MGAS9429_Spy1660 cysE   TRUE 0.890 9.000 0.097 NA   NA
 2010521 2010522 MGAS9429_Spy1660 MGAS9429_Spy1661     TRUE 0.902 -7.000 0.009 NA   NA
 2010522 2010523 MGAS9429_Spy1661 MGAS9429_Spy1662     FALSE 0.040 281.000 0.000 1.000 N NA
 2010523 2010524 MGAS9429_Spy1662 MGAS9429_Spy1663     TRUE 0.889 10.000 0.056 1.000   NA
 2010524 2010525 MGAS9429_Spy1663 MGAS9429_Spy1664     TRUE 0.973 27.000 0.241 0.019   NA
 2010525 2010526 MGAS9429_Spy1664 MGAS9429_Spy1665     TRUE 0.964 -28.000 0.048 0.012 N NA
 2010526 2010527 MGAS9429_Spy1665 MGAS9429_Spy1666     FALSE 0.299 123.000 0.143 NA   NA
 2010527 2010528 MGAS9429_Spy1666 MGAS9429_Spy1667     TRUE 0.835 -16.000 0.002 NA   NA
 2010528 2010529 MGAS9429_Spy1667 MGAS9429_Spy1668     FALSE 0.062 176.000 0.000 NA   NA
 2010530 2010531 MGAS9429_Spy1669 MGAS9429_Spy1670   def FALSE 0.091 127.000 0.000 NA   NA
 2010532 2010533 MGAS9429_Spy1671 MGAS9429_Spy1672     FALSE 0.288 264.000 0.414 NA   NA
 2010533 2010534 MGAS9429_Spy1672 MGAS9429_Spy1673   polC FALSE 0.390 80.000 0.020 1.000 N NA
 2010534 2010535 MGAS9429_Spy1673 MGAS9429_Spy1674 polC proS FALSE 0.320 254.000 0.070 0.042 N NA
 2010535 2010536 MGAS9429_Spy1674 MGAS9429_Spy1675 proS   FALSE 0.181 198.000 0.095 1.000 N NA
 2010536 2010537 MGAS9429_Spy1675 MGAS9429_Spy1676   cdsA FALSE 0.447 73.000 0.040 1.000 N NA
 2010537 2010538 MGAS9429_Spy1676 MGAS9429_Spy1677 cdsA uppS TRUE 0.958 13.000 0.113 1.000 Y NA
 2010538 2010539 MGAS9429_Spy1677 MGAS9429_Spy1678 uppS   FALSE 0.088 131.000 0.000 NA   NA
 2010539 2010540 MGAS9429_Spy1678 MGAS9429_Spy1679   yajC TRUE 0.708 -19.000 0.000 NA   NA
 2010540 2010541 MGAS9429_Spy1679 MGAS9429_Spy1680 yajC   FALSE 0.259 86.000 0.006 NA N NA
 2010541 2010542 MGAS9429_Spy1680 MGAS9429_Spy1681   pulA FALSE 0.102 115.000 0.000 NA N NA
 2010542 2010543 MGAS9429_Spy1681 MGAS9429_Spy1683 pulA   TRUE 0.952 -34.000 0.000 0.001   NA
 2010545 2010546 MGAS9429_Spy1684 MGAS9429_Spy1685 dexB msmK TRUE 0.640 108.000 0.171 1.000 Y NA
 2010546 2010547 MGAS9429_Spy1685 MGAS9429_Spy1686 msmK lrp FALSE 0.091 298.000 0.071 1.000 N NA
 2010549 2010550 MGAS9429_Spy1688 MGAS9429_Spy1689   relA TRUE 0.919 15.000 0.177 1.000 N NA
 2010550 2010551 MGAS9429_Spy1689 MGAS9429_Spy1690 relA sclA FALSE 0.051 240.000 0.000 1.000   NA
 2010553 2010554 MGAS9429_Spy1692 MGAS9429_Spy1693     TRUE 0.887 62.000 0.610 1.000   NA
 2010554 2010555 MGAS9429_Spy1693 MGAS9429_Spy1694     FALSE 0.020 357.000 0.000 NA   NA
 2010555 2010556 MGAS9429_Spy1694 MGAS9429_Spy1695     TRUE 0.967 0.000 0.227 NA   NA
 2010556 2010557 MGAS9429_Spy1695 MGAS9429_Spy1696     FALSE 0.380 71.000 0.013 NA   NA
 2010557 2010558 MGAS9429_Spy1696 MGAS9429_Spy1697     FALSE 0.237 65.000 0.000 NA   NA
 2010559 2010560 MGAS9429_Spy1698 MGAS9429_Spy1699     FALSE 0.109 102.000 0.000 NA   NA
 2010560 2010561 MGAS9429_Spy1699 MGAS9429_Spy1700     TRUE 0.758 -13.000 0.000 NA   NA
 2010561 2010562 MGAS9429_Spy1700 MGAS9429_Spy1701     FALSE 0.012 836.000 0.000 NA   NA
 2010562 2010563 MGAS9429_Spy1701 MGAS9429_Spy1702     FALSE 0.105 107.000 0.000 NA   NA
 2010563 2010564 MGAS9429_Spy1702 MGAS9429_Spy1703   trpG TRUE 0.980 33.000 0.009 0.001 Y NA
 2010564 2010565 MGAS9429_Spy1703 MGAS9429_Spy1704 trpG   TRUE 0.771 33.000 0.035 1.000 N NA
 2010565 1628639 MGAS9429_Spy1704 MGAS9429_SpyT0063     FALSE 0.027 286.000 0.000 NA   NA
 1628639 2010566 MGAS9429_SpyT0063 MGAS9429_Spy1705     FALSE 0.112 99.000 0.000 NA   NA
 2010566 2010567 MGAS9429_Spy1705 MGAS9429_Spy1706   flaR FALSE 0.361 55.000 0.000 1.000   NA
 2010571 2010572 MGAS9429_Spy1710 MGAS9429_Spy1711 dppA dppB TRUE 0.694 113.000 0.000 0.028 Y NA
 2010572 2010573 MGAS9429_Spy1711 MGAS9429_Spy1712 dppB dppC TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.028 Y NA
 2010573 2010574 MGAS9429_Spy1712 MGAS9429_Spy1713 dppC dppD TRUE 0.982 12.000 0.333 1.000 Y NA
 2010574 2010575 MGAS9429_Spy1713 MGAS9429_Spy1714 dppD dppE TRUE 0.998 -16.000 0.750 0.022 Y NA
 2010576 2010577 MGAS9429_Spy1715 MGAS9429_Spy1716     FALSE 0.129 92.000 0.000 NA   NA
 2010577 2010578 MGAS9429_Spy1716 MGAS9429_Spy1717   lmb TRUE 0.983 13.000 0.800 NA   NA
 2010578 2010579 MGAS9429_Spy1717 MGAS9429_Spy1718 lmb   FALSE 0.084 178.000 0.000 1.000 N NA
 2010579 2010580 MGAS9429_Spy1718 MGAS9429_Spy1719     FALSE 0.370 45.000 0.000 NA   NA
 2010580 2010581 MGAS9429_Spy1719