MicrobesOnline Operon Predictions for Pelotomaculum thermopropionicum SI

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5526244 5526245 PTH_0001 PTH_0002 dnaA DnaN TRUE 0.984 150.000 0.328 1.000 Y NA
 5526245 5526246 PTH_0002 PTH_0003 DnaN RecF TRUE 0.998 25.000 0.318 1.000 Y NA
 5526246 5526247 PTH_0003 PTH_0004 RecF   TRUE 0.984 19.000 0.047 NA   NA
 5526247 5526248 PTH_0004 PTH_0005   GyrB TRUE 0.853 60.000 0.034 NA   NA
 5526250 5526251 PTH_0007 PTH_0008   GyrA FALSE 0.004 538.000 0.000 NA   NA
 5526251 5526252 PTH_0008 PTH_0009 GyrA SNZ1 FALSE 0.294 314.000 0.009 1.000 N NA
 5526252 5526253 PTH_0009 PTH_0010 SNZ1 PDX2 TRUE 0.987 142.000 0.488 NA Y NA
 5526253 5526254 PTH_0010 PTH_0011 PDX2   FALSE 0.014 448.000 0.000 NA N NA
 5526254 5526255 PTH_0011 PTH_0012   SerA TRUE 0.998 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 5526255 5526256 PTH_0012 PTH_0013 SerA SerS TRUE 0.832 136.000 0.016 1.000 N NA
 5526256 5526257 PTH_0013 PTH_0014 SerS   TRUE 0.689 32.000 0.000 1.000   NA
 5526257 5155917 PTH_0014       FALSE 0.090 189.000 0.000 NA   NA
 5155917 5155918         TRUE 0.578 27.000 0.000 NA   NA
 5155918 5526258   PTH_0015   CaiA FALSE 0.022 296.000 0.000 NA   NA
 5526258 5526259 PTH_0015 PTH_0016 CaiA FixA TRUE 0.987 172.000 0.500 0.069 N NA
 5526259 5526260 PTH_0016 PTH_0017 FixA FixB TRUE 1.000 18.000 0.600 0.020 Y NA
 5526260 5526261 PTH_0017 PTH_0018 FixB FixC TRUE 0.957 23.000 0.000 0.069 Y NA
 5526261 5526262 PTH_0018 PTH_0019 FixC FixX TRUE 0.998 -3.000 0.039 0.069 Y NA
 5155927 5155928         TRUE 0.743 15.000 0.000 NA   NA
 5155928 5526266   PTH_0023     FALSE 0.132 159.000 0.000 NA   NA
 5526266 5526267 PTH_0023 PTH_0024     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 5526267 5526268 PTH_0024 PTH_0025   CumB FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 5526268 5155932 PTH_0025   CumB   FALSE 0.332 44.000 0.000 NA   NA
 5526270 5526271 PTH_0027 PTH_0028     TRUE 0.834 -22.000 0.000 1.000   NA
 5526271 5526272 PTH_0028 PTH_0029     TRUE 0.997 18.000 0.278 1.000   NA
 5526272 5526273 PTH_0029 PTH_0030   IclR FALSE 0.251 161.000 0.000 1.000   NA
 5526273 5526274 PTH_0030 PTH_0031 IclR   FALSE 0.304 79.000 0.000 1.000   NA
 5526274 5526275 PTH_0031 PTH_0032   UhpC TRUE 0.859 -15.000 0.000 1.000   NA
 5526276 5526277 PTH_0033 PTH_0034     TRUE 0.996 0.000 0.111 NA   NA
 5526278 5526279 PTH_0035 PTH_0036 OmpR   TRUE 0.999 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 5526279 5526280 PTH_0036 PTH_0037   AcrA FALSE 0.218 247.000 0.000 0.074 N NA
 5526280 5526281 PTH_0037 PTH_0038 AcrA SalX TRUE 0.509 57.000 0.000 1.000 N NA
 5526281 5526282 PTH_0038 PTH_0039 SalX SalY TRUE 1.000 -12.000 1.000 1.000 Y NA
 5526282 5526283 PTH_0039 PTH_0040 SalY   FALSE 0.152 93.000 0.000 NA   NA
 5526283 5526284 PTH_0040 PTH_0041     FALSE 0.049 227.000 0.000 NA   NA
 5526284 5526285 PTH_0041 PTH_0042     TRUE 0.774 11.000 0.000 NA   NA
 5526285 5526286 PTH_0042 PTH_0043     TRUE 0.653 -33.000 0.000 NA   NA
 5526286 5526287 PTH_0043 PTH_0044     FALSE 0.030 267.000 0.000 NA   NA
 5526287 5526288 PTH_0044 PTH_0045   Fur FALSE 0.189 66.000 0.000 NA   NA
 5526288 5526289 PTH_0045 PTH_0046 Fur   TRUE 0.980 46.000 0.139 1.000 N NA
 5526289 5526290 PTH_0046 PTH_0047     FALSE 0.031 353.000 0.000 1.000   NA
 5526290 5526291 PTH_0047 PTH_0048   OmpR TRUE 1.000 10.000 1.000 1.000   NA
 5526291 5526292 PTH_0048 PTH_0049 OmpR GlnA FALSE 0.292 179.000 0.000 1.000 N NA
 5526292 5526293 PTH_0049 PTH_0050 GlnA GdhA TRUE 0.447 180.000 0.000 1.000 Y NA
 5526293 5155958 PTH_0050   GdhA   FALSE 0.004 538.000 0.000 NA   NA
 5155958 5526294   PTH_0051   XerD FALSE 0.006 465.000 0.000 NA   NA
 5526294 5526295 PTH_0051 PTH_0052 XerD   TRUE 0.970 35.000 0.071 NA   NA
 5526295 5526296 PTH_0052 PTH_0053   RecR TRUE 0.999 4.000 0.604 NA   NA
 5526296 5526297 PTH_0053 PTH_0054 RecR   TRUE 0.825 51.000 0.014 NA   NA
 5526297 5526298 PTH_0054 PTH_0055     TRUE 0.812 83.000 0.037 NA   NA
 5526298 5526299 PTH_0055 PTH_0056   PorA TRUE 0.999 9.000 0.455 NA   NA
 5526299 5526300 PTH_0056 PTH_0057 PorA PorB TRUE 0.997 100.000 0.846 0.005 Y NA
 5526300 5526301 PTH_0057 PTH_0058 PorB PorG TRUE 1.000 -19.000 0.846 1.000 Y NA
 5526301 5526302 PTH_0058 PTH_0059 PorG   TRUE 0.946 48.000 0.081 NA   NA
 5526302 5526303 PTH_0059 PTH_0060     FALSE 0.189 66.000 0.000 NA   NA
 5526303 5526304 PTH_0060 PTH_0061   LdcC TRUE 0.824 104.000 0.043 NA   NA
 5526304 5526305 PTH_0061 PTH_0062 LdcC Tmk TRUE 0.957 33.000 0.012 1.000 N NA
 5526305 5526306 PTH_0062 PTH_0063 Tmk DnaX TRUE 0.997 -31.000 0.254 1.000 N NA
 5526306 5526307 PTH_0063 PTH_0064 DnaX   TRUE 0.997 18.000 0.372 NA   NA
 5526307 5526308 PTH_0064 PTH_0065     TRUE 0.995 -21.000 0.183 NA   NA
 5526308 5526309 PTH_0065 PTH_0066     TRUE 0.938 41.000 0.043 NA   NA
 5526311 5526312 PTH_0068 PTH_0069   MetG FALSE 0.150 97.000 0.000 NA   NA
 5526312 5526313 PTH_0069 PTH_0070 MetG TatD TRUE 0.996 22.000 0.221 NA N NA
 5526313 5526314 PTH_0070 PTH_0071 TatD BtuR TRUE 0.792 58.000 0.005 NA N NA
 5526314 5526315 PTH_0071 PTH_0072 BtuR   FALSE 0.213 59.000 0.000 NA   NA
 5526316 5526317 PTH_0073 PTH_0074 LivF LivG TRUE 0.997 0.000 0.018 0.025 Y NA
 5526317 5526318 PTH_0074 PTH_0075 LivG LivM TRUE 0.999 -19.000 0.229 1.000 Y NA
 5526318 5526319 PTH_0075 PTH_0076 LivM LivH TRUE 0.999 10.000 0.239 0.022 Y NA
 5526319 5526320 PTH_0076 PTH_0077 LivH LivK TRUE 0.898 114.000 0.035 NA Y NA
 5526320 5526321 PTH_0077 PTH_0079 LivK   FALSE 0.054 218.000 0.000 NA   NA
 5526322 5526323 PTH_0078 PTH_0080   KsgA FALSE 0.292 117.000 0.000 1.000   NA
 5526323 5526324 PTH_0080 PTH_0081 KsgA   TRUE 0.953 25.000 0.013 NA   NA
 5526326 5526327 PTH_0083 PTH_0084     TRUE 0.825 102.000 0.045 NA   NA
 5526327 5526328 PTH_0084 PTH_0085     FALSE 0.150 97.000 0.000 NA   NA
 5526328 5526329 PTH_0085 PTH_0086     FALSE 0.170 73.000 0.000 NA   NA
 5526329 5526330 PTH_0086 PTH_0087     FALSE 0.010 392.000 0.000 NA   NA
 5526330 5526331 PTH_0087 PTH_0088     FALSE 0.176 192.000 0.000 1.000   NA
 5526331 5526332 PTH_0088 PTH_0089     TRUE 0.802 132.000 0.036 NA   NA
 5526332 5526333 PTH_0089 PTH_0090     FALSE 0.150 124.000 0.000 NA   NA
 5526333 5526334 PTH_0090 PTH_0091     TRUE 0.763 13.000 0.000 NA   NA
 5526334 5526335 PTH_0091 PTH_0092     FALSE 0.003 755.000 0.000 NA   NA
 5526335 5526336 PTH_0092 PTH_0093     TRUE 0.663 -30.000 0.000 NA   NA
 5526337 5526338 PTH_0094 PTH_0095     TRUE 0.979 45.000 0.167 1.000   NA
 5526339 5526340 PTH_0096 PTH_0097 IspE GntR TRUE 0.917 85.000 0.057 1.000 N NA
 5526340 5526341 PTH_0097 PTH_0098 GntR   TRUE 0.998 0.000 0.288 NA   NA
 5526341 5526342 PTH_0098 PTH_0099     TRUE 0.880 82.000 0.069 NA   NA
 5526342 5526343 PTH_0099 PTH_0100   NtrB FALSE 0.288 100.000 0.000 1.000   NA
 5526343 5526344 PTH_0100 PTH_0101 NtrB LytR FALSE 0.172 72.000 0.000 NA   NA
 5526344 5526345 PTH_0101 PTH_0102 LytR IlvA FALSE 0.007 438.000 0.000 NA   NA
 5526345 5526346 PTH_0102 PTH_0103 IlvA SpoVG TRUE 0.797 105.000 0.009 1.000 N NA
 5526346 5526347 PTH_0103 PTH_0104 SpoVG GlmU TRUE 0.616 224.000 0.003 1.000 Y NA
 5526347 5526348 PTH_0104 PTH_0105 GlmU PrsA TRUE 0.969 45.000 0.069 1.000 N NA
 5526348 5526349 PTH_0105 PTH_0106 PrsA AraJ FALSE 0.329 169.000 0.000 1.000 N NA
 5526349 5526350 PTH_0106 PTH_0107 AraJ AraJ TRUE 0.895 -3.000 0.000 NA N NA
 5526353 5526354 PTH_0110 PTH_0111 HtpG   FALSE 0.032 259.000 0.000 NA   NA
 5526355 5526356 PTH_0112 PTH_0113 RplY PTH TRUE 0.994 150.000 0.496 0.031 Y NA
 5526356 5526357 PTH_0113 PTH_0114 PTH   TRUE 0.738 68.000 0.011 NA   NA
 5526357 5526358 PTH_0114 PTH_0115     TRUE 0.988 28.000 0.133 NA   NA
 5526358 5526359 PTH_0115 PTH_0116   UvrB TRUE 0.613 98.000 0.002 NA   NA
 5526359 5526360 PTH_0116 PTH_0117 UvrB   TRUE 0.638 200.000 0.018 1.000   NA
 5526360 5526361 PTH_0117 PTH_0118   SurA TRUE 0.857 56.000 0.016 1.000   NA
 5526361 5526362 PTH_0118 PTH_0119 SurA AbrB TRUE 0.912 145.000 0.088 NA N NA
 5526362 5526363 PTH_0119 PTH_0120 AbrB   TRUE 0.982 6.000 0.014 NA   NA
 5526363 5526364 PTH_0120 PTH_0121   HimA TRUE 0.764 81.000 0.010 1.000   NA
 5526364 5526365 PTH_0121 PTH_0122 HimA   TRUE 0.825 68.000 0.008 1.000 N NA
 5526365 5526366 PTH_0122 PTH_0123   SpoIID TRUE 0.906 51.000 0.016 1.000 N NA
 5526366 5526367 PTH_0123 PTH_0124 SpoIID   TRUE 0.426 358.000 0.113 NA   NA
 5526367 5526368 PTH_0124 PTH_0125     TRUE 0.997 31.000 0.774 NA   NA
 5526368 5526369 PTH_0125 PTH_0126     FALSE 0.149 144.000 0.000 NA   NA
 5526369 5526370 PTH_0126 PTH_0127     TRUE 0.754 14.000 0.000 NA   NA
 5526374 5526375 PTH_0130 PTH_0131     TRUE 0.994 16.000 0.144 NA   NA
 5526375 5526376 PTH_0131 PTH_0133     TRUE 0.519 31.000 0.000 NA   NA
 5526376 5526377 PTH_0133 PTH_0134     TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 5526377 5526378 PTH_0134 PTH_0135   SseA FALSE 0.150 125.000 0.000 NA   NA
 5526379 5526380 PTH_0136 PTH_0137     TRUE 0.658 -31.000 0.000 NA   NA
 5526380 5526381 PTH_0137 PTH_0138     FALSE 0.017 323.000 0.000 NA   NA
 5526382 5526383 PTH_0139 PTH_0140     TRUE 0.569 -150.000 0.000 NA   NA
 5526387 5526388 PTH_0144 PTH_0145     FALSE 0.157 85.000 0.000 NA   NA
 5526390 5526391 PTH_0147 PTH_0148     FALSE 0.151 130.000 0.000 NA   NA
 5526391 5526392 PTH_0148 PTH_0149     FALSE 0.045 305.000 0.000 1.000   NA
 5526392 5526393 PTH_0149 PTH_0150     FALSE 0.067 351.000 0.000 0.098   NA
 5526393 5526394 PTH_0150 PTH_0151   Mod TRUE 0.493 79.000 0.000 0.098   NA
 5526394 5526395 PTH_0151 PTH_0152 Mod   TRUE 0.995 15.000 0.045 0.098 N NA
 5526395 5526396 PTH_0152 PTH_0153     FALSE 0.170 73.000 0.000 NA   NA
 5526396 5526397 PTH_0153 PTH_0154     TRUE 0.999 -3.000 0.396 NA   NA
 5526397 5526398 PTH_0154 PTH_0155     TRUE 0.996 0.000 0.104 NA   NA
 5526398 5526399 PTH_0155 PTH_0156     FALSE 0.145 148.000 0.000 NA   NA
 5526399 5526400 PTH_0156 PTH_0157     TRUE 0.997 -10.000 0.294 NA   NA
 5526400 5526401 PTH_0157 PTH_0158     TRUE 0.997 6.000 0.174 NA   NA
 5526405 5526406 PTH_0162 PTH_0163     FALSE 0.012 366.000 0.000 NA   NA
 5526408 5526409 PTH_0165 PTH_0166     FALSE 0.189 66.000 0.000 NA   NA
 5526409 5526410 PTH_0166 PTH_0167     TRUE 0.642 -40.000 0.000 NA   NA
 5526412 5526413 PTH_0168 PTH_0170     TRUE 0.660 21.000 0.000 NA   NA
 5526413 5526414 PTH_0170 PTH_0171     FALSE 0.279 49.000 0.000 NA   NA
 5526414 5526415 PTH_0171 PTH_0172     FALSE 0.155 113.000 0.000 NA   NA
 5526415 5526416 PTH_0172 PTH_0173     FALSE 0.157 86.000 0.000 NA   NA
 5526416 5526417 PTH_0173 PTH_0174     FALSE 0.174 71.000 0.000 NA   NA
 5526417 5526418 PTH_0174 PTH_0175     TRUE 0.786 8.000 0.000 NA   NA
 5526418 5526419 PTH_0175 PTH_0176     FALSE 0.299 47.000 0.000 NA   NA
 5526419 5526420 PTH_0176 PTH_0177     FALSE 0.008 427.000 0.000 NA   NA
 5526420 5526421 PTH_0177 PTH_0178     FALSE 0.004 1056.000 0.000 1.000   NA
 5526423 5526424 PTH_0180 PTH_0181   PinR FALSE 0.027 275.000 0.000 NA   NA
 5526425 5526426 PTH_0182 PTH_0183     TRUE 0.727 16.000 0.000 NA   NA
 5526426 5526427 PTH_0183 PTH_0184     TRUE 0.998 22.000 0.516 NA   NA
 5526427 5526428 PTH_0184 PTH_0185     FALSE 0.136 156.000 0.000 NA   NA
 5526429 5526430 PTH_0186 PTH_0187   CsgD FALSE 0.103 178.000 0.000 NA   NA
 5526430 5526431 PTH_0187 PTH_0188 CsgD   TRUE 0.986 -3.000 0.011 1.000   NA
 5526431 5526432 PTH_0188 PTH_0189   VacB TRUE 0.952 110.000 0.134 1.000 N NA
 5526432 5526433 PTH_0189 PTH_0190 VacB   TRUE 0.911 90.000 0.083 NA N NA
 5526433 5526434 PTH_0190 PTH_0191     TRUE 0.898 76.000 0.085 NA   NA
 5526434 5526435 PTH_0191 PTH_0192     FALSE 0.013 484.000 0.000 1.000   NA
 5526435 5526436 PTH_0192 PTH_0193     FALSE 0.154 116.000 0.000 NA   NA
 5526436 5526437 PTH_0193 PTH_0194     FALSE 0.103 178.000 0.000 NA   NA
 5526437 5526438 PTH_0194 PTH_0195     FALSE 0.003 650.000 0.000 NA   NA
 5526438 5526439 PTH_0195 PTH_0196   BenE FALSE 0.043 233.000 0.000 NA   NA
 5526439 5526440 PTH_0196 PTH_0197 BenE MesJ FALSE 0.050 349.000 0.000 1.000 N NA
 5526440 5526441 PTH_0197 PTH_0198 MesJ HflB TRUE 0.904 129.000 0.051 1.000 N NA
 5526441 5526442 PTH_0198 PTH_0199 HflB Ndk TRUE 0.819 83.000 0.012 1.000 N NA
 5526442 5526443 PTH_0199 PTH_0200 Ndk MIS1 TRUE 0.829 39.000 0.000 1.000 Y NA
 5526443 5526444 PTH_0200 PTH_0201 MIS1   FALSE 0.060 325.000 0.000 1.000 N NA
 5526444 5526445 PTH_0201 PTH_0202     FALSE 0.238 311.000 0.000 0.011 Y NA
 5526445 5526446 PTH_0202 PTH_0203     FALSE 0.008 816.000 0.000 1.000 N NA
 5526446 5526447 PTH_0203 PTH_0204   FolB TRUE 0.995 9.000 0.031 1.000 Y NA
 5526450 5526451 PTH_0207 PTH_0208 ThiH   TRUE 0.993 -31.000 0.170 NA   NA
 5526451 5526452 PTH_0208 PTH_0209   ThiH TRUE 0.998 2.000 0.205 NA   NA
 5526452 5526453 PTH_0209 PTH_0210 ThiH Pnp TRUE 0.986 -10.000 0.011 1.000 N NA
 5526453 5526454 PTH_0210 PTH_0211 Pnp AcrR TRUE 0.927 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5526455 5526456 PTH_0212 PTH_0213 SplB   FALSE 0.204 225.000 0.000 NA Y NA
 5526456 5526457 PTH_0213 PTH_0214   XerD TRUE 1.000 -3.000 0.333 0.018 Y NA
 5526457 5526458 PTH_0214 PTH_0215 XerD   TRUE 0.999 -22.000 0.714 NA   NA
 5526458 5526459 PTH_0215 PTH_0216   Mod FALSE 0.003 703.000 0.000 NA   NA
 5526459 5526460 PTH_0216 PTH_0217 Mod   TRUE 0.955 5.000 0.000 0.097   NA
 5526460 5526461 PTH_0217 PTH_0218     FALSE 0.397 56.000 0.000 1.000   NA
 5526461 5526462 PTH_0218 PTH_0219     FALSE 0.041 317.000 0.000 1.000   NA
 5526462 5526463 PTH_0219 PTH_0220   PanB TRUE 0.985 -82.000 0.055 1.000   NA
 5526463 5526464 PTH_0220 PTH_0221 PanB PanC TRUE 0.995 106.000 0.395 0.001 Y NA
 5526464 5526465 PTH_0221 PTH_0222 PanC PanD TRUE 0.986 103.000 0.342 1.000 Y NA
 5526465 5526466 PTH_0222 PTH_0223 PanD NadB TRUE 0.649 255.000 0.023 1.000 Y NA
 5526466 5526467 PTH_0223 PTH_0224 NadB   TRUE 0.821 1.000 0.000 NA   NA
 5526467 5526468 PTH_0224 PTH_0225     TRUE 0.519 31.000 0.000 NA   NA
 5526470 5526471 PTH_0226 PTH_0228 NadC NifS FALSE 0.396 133.000 0.000 1.000 N NA
 5526471 5526472 PTH_0228 PTH_0229 NifS NadA TRUE 0.545 53.000 0.000 1.000 N NA
 5526472 5526473 PTH_0229 PTH_0230 NadA   FALSE 0.155 89.000 0.000 NA   NA
 5526473 5526474 PTH_0230 PTH_0231   ZntA FALSE 0.054 218.000 0.000 NA   NA
 5526475 5526476 PTH_0232 PTH_0233 ArsR ZntA TRUE 0.998 16.000 0.286 1.000 N NA
 5526477 5526478 PTH_0234 PTH_0235   TauA FALSE 0.020 396.000 0.000 NA N NA
 5526478 5526479 PTH_0235 PTH_0236 TauA TauB TRUE 0.983 111.000 0.271 1.000 Y NA
 5526479 5526480 PTH_0236 PTH_0237 TauB TauC TRUE 0.999 -88.000 0.446 1.000 Y NA
 5526480 5526481 PTH_0237 PTH_0238 TauC CysC TRUE 0.805 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5526481 5526482 PTH_0238 PTH_0239 CysC SdhA TRUE 0.994 -3.000 0.031 1.000 N NA
 5526482 5526483 PTH_0239 PTH_0240 SdhA   TRUE 0.998 2.000 0.097 NA Y NA
 5526483 5526484 PTH_0240 PTH_0241   MET3 TRUE 0.984 4.000 0.006 NA N NA
 5526484 5526485 PTH_0241 PTH_0242 MET3 DsrA TRUE 0.791 84.000 0.006 1.000 N NA
 5526485 5526486 PTH_0242 PTH_0243 DsrA SirA TRUE 0.966 51.000 0.088 1.000 N NA
 5526486 5526487 PTH_0243 PTH_0244 SirA ThiF TRUE 0.799 31.000 0.000 1.000 N NA
 5526487 5526488 PTH_0244 PTH_0245 ThiF   TRUE 0.836 -106.000 0.000 1.000 N NA
 5526488 5526489 PTH_0245 PTH_0246     TRUE 0.969 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5526489 5526490 PTH_0246 PTH_0247   CysK FALSE 0.034 403.000 0.000 1.000 N NA
 5526490 5526491 PTH_0247 PTH_0248 CysK   TRUE 0.901 6.000 0.000 1.000   NA
 5526491 5526492 PTH_0248 PTH_0249   BioB FALSE 0.031 539.000 0.000 0.003   NA
 5526492 5526493 PTH_0249 PTH_0250 BioB MET2 FALSE 0.033 408.000 0.000 1.000 N NA
 5526493 5526494 PTH_0250 PTH_0251 MET2   TRUE 0.999 -3.000 0.509 NA   NA
 5526494 5526495 PTH_0251 PTH_0252     FALSE 0.154 90.000 0.000 NA   NA
 5526495 5526496 PTH_0252 PTH_0253   MET17 FALSE 0.331 69.000 0.000 1.000   NA
 5526496 5526497 PTH_0253 PTH_0254 MET17   FALSE 0.028 274.000 0.000 NA   NA
 5526497 5526498 PTH_0254 PTH_0255   BirA FALSE 0.201 62.000 0.000 NA   NA
 5526498 5526499 PTH_0255 PTH_0256 BirA   TRUE 0.457 210.000 0.012 NA   NA
 5526499 5526500 PTH_0256 PTH_0257     FALSE 0.109 175.000 0.000 NA   NA
 5526500 5526501 PTH_0257 PTH_0258     FALSE 0.156 87.000 0.000 NA   NA
 5526501 5526502 PTH_0258 PTH_0259     TRUE 0.996 -3.000 0.054 1.000 N NA
 5526502 5526503 PTH_0259 PTH_0260     TRUE 0.670 165.000 0.005 1.000   NA
 5526503 5526504 PTH_0260 PTH_0261     TRUE 0.992 11.000 0.043 1.000   NA
 5526504 5526505 PTH_0261 PTH_0262   GreA TRUE 0.575 280.000 0.065 1.000   NA
 5526505 5526506 PTH_0262 PTH_0263 GreA LysU TRUE 0.993 24.000 0.098 1.000 N NA
 5526506 5156172 PTH_0263   LysU   FALSE 0.004 546.000 0.000 NA   NA
 5156172 5156173         FALSE 0.064 209.000 0.000 NA   NA
 5156173 5156174         FALSE 0.155 110.000 0.000 NA   NA
 5156174 5156175   PTH_r002     FALSE 0.245 53.000 0.000 NA   NA
 5156175 5156176 PTH_r002       FALSE 0.151 131.000 0.000 NA   NA
 5526507 5526508 PTH_0264 PTH_0265     TRUE 0.708 -19.000 0.000 NA   NA
 5526508 5526509 PTH_0265 PTH_0266     FALSE 0.047 229.000 0.000 NA   NA
 5526510 5526511 PTH_0267 PTH_0268   AtoD TRUE 0.422 76.000 0.000 1.000 N NA
 5526511 5526512 PTH_0268 PTH_0269 AtoD AtoA TRUE 1.000 16.000 1.000 0.005 Y NA
 5526512 5526513 PTH_0269 PTH_0270 AtoA PaaJ TRUE 0.970 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5526515 5526516 PTH_0271 PTH_0272 Tdh FadB TRUE 0.919 14.000 0.000 1.000 N NA
 5526516 5526517 PTH_0272 PTH_0274 FadB AtoE TRUE 0.864 34.000 0.000 1.000 Y NA
 5526517 5526518 PTH_0274 PTH_0275 AtoE AtoE TRUE 0.913 30.000 0.000 0.001   NA
 5526518 5526519 PTH_0275 PTH_0276 AtoE   FALSE 0.224 56.000 0.000 NA   NA
 5526520 5526521 PTH_0277 PTH_0278   CcmA TRUE 0.993 -18.000 0.125 NA   NA
 5526521 5526522 PTH_0278 PTH_0279 CcmA   TRUE 0.944 2.000 0.000 1.000 N NA
 5156193 5526523   PTH_0280   CtsR FALSE 0.133 158.000 0.000 NA   NA
 5526523 5526524 PTH_0280 PTH_0281 CtsR   TRUE 0.989 55.000 0.681 NA   NA
 5526524 5526525 PTH_0281 PTH_0282     TRUE 1.000 0.000 0.848 1.000   NA
 5526525 5526526 PTH_0282 PTH_0283   ClpA TRUE 0.998 28.000 0.425 1.000 N NA
 5526528 5526529 PTH_0285 PTH_0286 Sms   TRUE 0.996 11.000 0.126 1.000   NA
 5526529 5526530 PTH_0286 PTH_0287     TRUE 0.814 187.000 0.053 1.000   NA
 5526530 5526531 PTH_0287 PTH_0288     TRUE 0.910 148.000 0.126 NA   NA
 5526531 5526532 PTH_0288 PTH_0289   IspD TRUE 0.995 -7.000 0.134 NA   NA
 5526532 5526533 PTH_0289 PTH_0290 IspD IspF TRUE 0.996 6.000 0.041 1.000 Y NA
 5526534 5526535 PTH_0291 PTH_0292     TRUE 0.628 -48.000 0.000 NA   NA
 5526536 5526537 PTH_0293 PTH_0294 GlnS CysE TRUE 0.979 23.000 0.017 1.000 N NA
 5526537 5526538 PTH_0294 PTH_0295 CysE CysS TRUE 0.999 -13.000 0.483 0.046 N NA
 5526540 5526541 PTH_0296 PTH_0298   thyX TRUE 0.977 32.000 0.055 1.000   NA
 5526541 5526542 PTH_0298 PTH_0299 thyX SpoU TRUE 0.994 -3.000 0.032 1.000 N NA
 5526542 5526543 PTH_0299 PTH_0300 SpoU   TRUE 0.996 0.000 0.109 NA   NA
 5526543 5526544 PTH_0300 PTH_0301   RpoE TRUE 0.905 213.000 0.361 NA   NA
 5526544 5156216 PTH_0301   RpoE   FALSE 0.031 262.000 0.000 NA   NA
 5156216 5156217         FALSE 0.155 111.000 0.000 NA   NA
 5156217 5156218         TRUE 0.604 25.000 0.000 NA   NA
 5156218 5156219         TRUE 0.807 5.000 0.000 NA   NA
 5156219 5156220         TRUE 0.683 19.000 0.000 NA   NA
 5156220 5526545   PTH_0302   TufB FALSE 0.021 301.000 0.000 NA   NA
 5526545 5526546 PTH_0302 PTH_0303 TufB RpmG TRUE 0.944 175.000 0.099 1.000 Y NA
 5526546 5526547 PTH_0303 PTH_0304 RpmG secE TRUE 0.853 210.000 0.100 1.000 N NA
 5526547 5526548 PTH_0304 PTH_0305 secE NusG TRUE 0.995 54.000 0.843 1.000 N NA
 5526548 5526549 PTH_0305 PTH_0306 NusG rplK TRUE 0.999 21.000 0.681 1.000 N NA
 5526549 5526550 PTH_0306 PTH_0307 rplK RplA TRUE 0.997 74.000 0.838 0.025 Y NA
 5526550 5526551 PTH_0307 PTH_0308 RplA rplJ TRUE 0.966 230.000 0.302 0.025 Y NA
 5526551 5526552 PTH_0308 PTH_0309 rplJ rplL TRUE 0.999 36.000 0.884 0.019 Y NA
 5526553 5526554 PTH_0310 PTH_0311     TRUE 0.807 5.000 0.000 NA   NA
 5526555 5526556 PTH_0312 PTH_0313 RpoB RpoC TRUE 0.998 93.000 0.851 0.002 Y NA
 5526556 5526557 PTH_0313 PTH_0314 RpoC RPL8A TRUE 0.765 115.000 0.003 1.000 N NA
 5526557 5526558 PTH_0314 PTH_0315 RPL8A rpsL TRUE 0.999 21.000 0.444 0.025 Y NA
 5526558 5526559 PTH_0315 PTH_0316 rpsL RpsG TRUE 0.976 42.000 0.009 0.004 Y NA
 5526559 5526560 PTH_0316 PTH_0317 RpsG FusA TRUE 0.999 17.000 0.579 1.000 Y NA
 5526560 5526561 PTH_0317 PTH_0318 FusA TufB TRUE 0.990 189.000 0.400 0.002 Y NA
 5526561 5526562 PTH_0318 PTH_0319 TufB RpsJ TRUE 0.986 88.000 0.318 1.000 Y NA
 5526562 5526563 PTH_0319 PTH_0320 RpsJ rplC TRUE 0.994 96.000 0.467 0.025 Y NA
 5526563 5526564 PTH_0320 PTH_0321 rplC RplD TRUE 0.999 30.000 0.544 0.019 Y NA
 5526564 5526565 PTH_0321 PTH_0322 RplD rplW TRUE 0.999 0.000 0.307 1.000 Y NA
 5526565 5526566 PTH_0322 PTH_0323 rplW rplB TRUE 0.999 31.000 0.849 1.000 Y NA
 5526566 5526567 PTH_0323 PTH_0324 rplB rpsS TRUE 0.997 115.000 0.820 0.025 Y NA
 5526567 5526568 PTH_0324 PTH_0325 rpsS RplV TRUE 1.000 23.000 0.769 0.025 Y NA
 5526568 5526569 PTH_0325 PTH_0326 RplV rpsC TRUE 1.000 7.000 0.719 0.025 Y NA
 5526569 5526570 PTH_0326 PTH_0327 rpsC rplP TRUE 1.000 6.000 0.828 0.025 Y NA
 5526570 5526571 PTH_0327 PTH_0328 rplP RpmC TRUE 1.000 -10.000 0.802 0.019 Y NA
 5526571 5526572 PTH_0328 PTH_0329 RpmC RpsQ TRUE 0.999 44.000 0.828 0.019 Y NA
 5526572 5526573 PTH_0329 PTH_0330 RpsQ RplN TRUE 0.998 51.000 0.791 0.025 Y NA
 5526573 5526574 PTH_0330 PTH_0331 RplN RplX TRUE 0.998 15.000 0.071 0.025 Y NA
 5526574 5526575 PTH_0331 PTH_0332 RplX rplE TRUE 0.969 109.000 0.057 0.019 Y NA
 5526575 10712398 PTH_0332 PTH_3000 rplE   TRUE 0.994 138.000 0.496 0.019 Y NA
 10712398 5526576 PTH_3000 PTH_0333   rpsH TRUE 0.999 22.000 0.473 0.019 Y NA
 5526576 5526577 PTH_0333 PTH_0334 rpsH RplF TRUE 0.997 117.000 0.808 0.019 Y NA
 5526577 5526578 PTH_0334 PTH_0335 RplF RplR TRUE 1.000 20.000 0.815 0.019 Y NA
 5526578 5526579 PTH_0335 PTH_0336 RplR rpsE TRUE 1.000 21.000 0.814 0.025 Y NA
 5526581 5526582 PTH_0337 PTH_0338 RpmD RplO TRUE 1.000 14.000 0.653 0.003 Y NA
 5526582 5526583 PTH_0338 PTH_0340 RplO secY TRUE 1.000 1.000 0.730 1.000 N NA
 5526583 5526584 PTH_0340 PTH_0341 secY Map TRUE 0.997 9.000 0.087 1.000 N NA
 5526584 5526585 PTH_0341 PTH_0342 Map RPL14A TRUE 0.936 140.000 0.185 NA   NA
 5526585 5526586 PTH_0342 PTH_0343 RPL14A InfA TRUE 0.970 38.000 0.090 NA   NA
 5526586 5526587 PTH_0343 PTH_0344 InfA RpmJ TRUE 0.964 126.000 0.257 1.000   NA
 5526587 5526588 PTH_0344 PTH_0345 RpmJ rpsM TRUE 0.997 25.000 0.194 0.019   NA
 5526588 5526589 PTH_0345 PTH_0346 rpsM RpsK TRUE 1.000 19.000 0.810 0.019 Y NA
 5526591 5526592 PTH_0347 PTH_0349 rpsD RpoA TRUE 0.991 59.000 0.549 1.000 N NA
 5526592 5526593 PTH_0349 PTH_0350 RpoA RplQ TRUE 0.999 16.000 0.873 1.000 N NA
 5526593 5526594 PTH_0350 PTH_0351 RplQ CbiO TRUE 0.990 26.000 0.074 1.000 N NA
 5526596 5526597 PTH_0352 PTH_0354 CbiO CbiQ TRUE 0.997 32.000 0.304 1.000 Y NA
 5526597 5526598 PTH_0354 PTH_0355 CbiQ TruA TRUE 0.994 44.000 0.404 1.000 N NA
 5526598 5526599 PTH_0355 PTH_0356 TruA rplM TRUE 0.919 87.000 0.031 1.000 Y NA
 5526599 5526600 PTH_0356 PTH_0357 rplM RpsI TRUE 1.000 19.000 0.601 0.019 Y NA
 5526600 5526601 PTH_0357 PTH_0358 RpsI   FALSE 0.287 97.000 0.000 1.000   NA
 5526601 5526602 PTH_0358 PTH_0359     FALSE 0.156 87.000 0.000 NA   NA
 5526602 5526603 PTH_0359 PTH_0360     FALSE 0.008 429.000 0.000 NA   NA
 5526605 5526606 PTH_0361 PTH_0363 AmiC   FALSE 0.183 180.000 0.000 NA N NA
 5526606 5526607 PTH_0363 PTH_0364     TRUE 0.997 -10.000 0.222 NA   NA
 5526607 5526608 PTH_0364 PTH_0365     FALSE 0.092 188.000 0.000 NA   NA
 5526608 5526609 PTH_0365 PTH_0366     TRUE 0.688 -22.000 0.000 NA   NA
 5526609 5526610 PTH_0366 PTH_0367     TRUE 0.913 -49.000 0.000 0.017   NA
 5526610 5526611 PTH_0367 PTH_0368     FALSE 0.020 306.000 0.000 NA   NA
 5526611 5526612 PTH_0368 PTH_0369     FALSE 0.159 82.000 0.000 NA   NA
 5526612 5526613 PTH_0369 PTH_0370     TRUE 0.922 -75.000 0.000 0.002   NA
 5526613 5526614 PTH_0370 PTH_0371     FALSE 0.011 386.000 0.000 NA   NA
 5526614 5526615 PTH_0371 PTH_0372     FALSE 0.238 54.000 0.000 NA   NA
 5526615 5526616 PTH_0372 PTH_0373     FALSE 0.299 47.000 0.000 NA   NA
 5526616 5526617 PTH_0373 PTH_0374   Uma2 FALSE 0.008 424.000 0.000 NA   NA
 5526617 5526618 PTH_0374 PTH_0375 Uma2   FALSE 0.049 227.000 0.000 NA   NA
 5526618 5526619 PTH_0375 PTH_0376     TRUE 0.494 32.000 0.000 NA   NA
 5526619 5526620 PTH_0376 PTH_0377     TRUE 0.775 -7.000 0.000 NA   NA
 5526620 5526621 PTH_0377 PTH_0378   FixC FALSE 0.055 217.000 0.000 NA   NA
 5526621 5526622 PTH_0378 PTH_0379 FixC MviM FALSE 0.023 390.000 0.000 1.000   NA
 5526622 5526623 PTH_0379 PTH_0380 MviM   TRUE 0.767 -85.000 0.000 1.000   NA
 5526623 5526624 PTH_0380 PTH_0381   WecC TRUE 0.904 -3.000 0.000 1.000   NA
 5526624 5526625 PTH_0381 PTH_0382 WecC WcaA TRUE 0.812 4.000 0.000 NA   NA
 5526625 5526626 PTH_0382 PTH_0383 WcaA   TRUE 0.643 22.000 0.000 NA   NA
 5526626 5526627 PTH_0383 PTH_0384   WecB TRUE 0.988 7.000 0.033 NA   NA
 5526627 5526628 PTH_0384 PTH_0385 WecB   TRUE 0.983 17.000 0.022 1.000   NA
 5526628 5526629 PTH_0385 PTH_0386   PaaK FALSE 0.217 58.000 0.000 NA   NA
 5526629 5526630 PTH_0386 PTH_0387 PaaK RfaG TRUE 0.805 -28.000 0.000 NA N NA
 5526631 5526632 PTH_0388 PTH_0389     FALSE 0.106 177.000 0.000 NA   NA
 5526633 5526634 PTH_0390 PTH_0391 RfaG   TRUE 0.699 -21.000 0.000 NA   NA
 5526634 5526635 PTH_0391 PTH_0392     FALSE 0.037 244.000 0.000 NA   NA
 5526635 5526636 PTH_0392 PTH_0393   WecE FALSE 0.030 355.000 0.000 1.000   NA
 5526636 5526637 PTH_0393 PTH_0394 WecE RfbX TRUE 0.838 18.000 0.000 1.000   NA
 5526637 5526638 PTH_0394 PTH_0395 RfbX   FALSE 0.153 105.000 0.000 NA   NA
 5526638 5526639 PTH_0395 PTH_0396     FALSE 0.025 285.000 0.000 NA   NA
 5526639 5526640 PTH_0396 PTH_0397   RelE TRUE 0.997 -3.000 0.182 NA   NA
 5526640 5526641 PTH_0397 PTH_0398 RelE ManB FALSE 0.395 39.000 0.000 NA   NA
 5526643 5526644 PTH_0399 PTH_0401     FALSE 0.107 176.000 0.000 NA   NA
 5526644 5526645 PTH_0401 PTH_0402     FALSE 0.002 814.000 0.000 NA   NA
 5526645 5526646 PTH_0402 PTH_0403     TRUE 0.999 -12.000 0.583 NA   NA
 5526646 5526647 PTH_0403 PTH_0404   Uma2 TRUE 0.545 30.000 0.000 NA   NA
 5526648 5526649 PTH_0405 PTH_0406     TRUE 0.626 66.000 0.000 0.004   NA
 5526650 5526651 PTH_0407 PTH_0408     FALSE 0.002 895.000 0.000 NA   NA
 5526651 5526652 PTH_0408 PTH_0409     FALSE 0.162 78.000 0.000 NA   NA
 5526653 5526654 PTH_0410 PTH_0411   VapC FALSE 0.002 846.000 0.000 NA   NA
 5526654 5526655 PTH_0411 PTH_0412 VapC AbrB TRUE 0.775 -7.000 0.000 NA   NA
 5526656 5526657 PTH_0413 PTH_0414 LolE SalX TRUE 0.995 30.000 0.111 1.000 Y NA
 5526658 5526659 PTH_0415 PTH_0416     FALSE 0.224 56.000 0.000 NA   NA
 5526662 5526663 PTH_0419 PTH_0420     FALSE 0.036 249.000 0.000 NA   NA
 5526663 5526664 PTH_0420 PTH_0421     FALSE 0.026 281.000 0.000 NA   NA
 5526664 5526665 PTH_0421 PTH_0422     FALSE 0.209 60.000 0.000 NA   NA
 5526665 5526666 PTH_0422 PTH_0423     FALSE 0.002 2210.000 0.000 NA   NA
 5526667 5526668 PTH_0424 PTH_0425     TRUE 0.874 14.000 0.000 1.000   NA
 5526668 5526669 PTH_0425 PTH_0426     TRUE 0.999 -22.000 0.600 0.003   NA
 5526669 5526670 PTH_0426 PTH_0427     TRUE 0.999 -3.000 0.286 1.000   NA
 5526670 5526671 PTH_0427 PTH_0428     TRUE 0.904 -3.000 0.000 1.000   NA
 5526671 5526672 PTH_0428 PTH_0429     TRUE 0.820 2.000 0.000 NA   NA
 5526672 5526673 PTH_0429 PTH_0430     TRUE 0.995 7.000 0.105 NA   NA
 5526673 5526674 PTH_0430 PTH_0431   SpoVK TRUE 0.904 76.000 0.061 1.000   NA
 5526674 5526675 PTH_0431 PTH_0432 SpoVK   TRUE 0.765 26.000 0.000 1.000   NA
 5526675 5526676 PTH_0432 PTH_0433     TRUE 0.947 76.000 0.054 0.003   NA
 5526676 5526677 PTH_0433 PTH_0434     TRUE 0.727 16.000 0.000 NA   NA
 5526677 5526678 PTH_0434 PTH_0435     FALSE 0.150 99.000 0.000 NA   NA
 5526679 5526680 PTH_0436 PTH_0437     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 5526680 5526681 PTH_0437 PTH_0438   AmiC FALSE 0.181 68.000 0.000 NA   NA
 5526681 5526682 PTH_0438 PTH_0439 AmiC ArsR FALSE 0.410 83.000 0.000 1.000 N NA
 5526682 5526683 PTH_0439 PTH_0440 ArsR arsM TRUE 0.929 51.000 0.046 1.000   NA
 5526683 5526684 PTH_0440 PTH_0441 arsM GalE FALSE 0.283 145.000 0.000 1.000   NA
 5526684 5526685 PTH_0441 PTH_0442 GalE   TRUE 0.774 11.000 0.000 NA   NA
 5526687 5526688 PTH_0444 PTH_0445 GltD   TRUE 0.831 -142.000 0.000 1.000 N NA
 5526690 5526691 PTH_0447 PTH_0448   CorA FALSE 0.009 414.000 0.000 NA   NA
 5526691 5526692 PTH_0448 PTH_0449 CorA DegQ FALSE 0.035 398.000 0.000 1.000 N NA
 5526692 5526693 PTH_0449 PTH_0450 DegQ OmpR TRUE 0.971 140.000 0.250 1.000 N NA
 5526693 5526694 PTH_0450 PTH_0451 OmpR BaeS TRUE 0.999 29.000 0.538 0.022 Y NA
 5526695 5526696 PTH_0452 PTH_0453 ArsB   FALSE 0.042 236.000 0.000 NA   NA
 5526699 5526700 PTH_0456 PTH_0457   TrkG FALSE 0.261 157.000 0.000 1.000   NA
 5526700 5526701 PTH_0457 PTH_0458 TrkG LivK FALSE 0.011 499.000 0.000 NA N NA
 5526701 5526702 PTH_0458 PTH_0459 LivK LivH TRUE 0.965 120.000 0.167 NA Y NA
 5526702 5526703 PTH_0459 PTH_0460 LivH LivM TRUE 1.000 8.000 0.917 0.020 Y NA
 5526703 5526704 PTH_0460 PTH_0461 LivM LivG TRUE 1.000 2.000 0.562 1.000 Y NA
 5526704 5526705 PTH_0461 PTH_0462 LivG LivF TRUE 0.980 -7.000 0.000 0.023 Y NA
 5526706 5526707 PTH_0463 PTH_0465     TRUE 0.874 14.000 0.000 1.000   NA
 5526708 5526709 PTH_0464 PTH_0466   RhtB TRUE 0.728 -15.000 0.000 NA   NA
 5526709 5526710 PTH_0466 PTH_0467 RhtB   TRUE 0.889 71.000 0.047 1.000   NA
 5526710 5526711 PTH_0467 PTH_0468   PflA TRUE 0.995 26.000 0.217 1.000   NA
 5526711 5526712 PTH_0468 PTH_0469 PflA   FALSE 0.291 105.000 0.000 1.000   NA
 5526712 5526713 PTH_0469 PTH_0470     FALSE 0.003 731.000 0.000 NA   NA
 5526715 5526716 PTH_0472 PTH_0473 PaaK   FALSE 0.187 212.000 0.000 1.000 N NA
 5526716 5526717 PTH_0473 PTH_0474   NfnB FALSE 0.111 258.000 0.000 1.000 N NA
 5526717 5526718 PTH_0474 PTH_0475 NfnB   FALSE 0.004 607.000 0.000 NA   NA
 5526720 5526721 PTH_0477 PTH_0478 IclR   TRUE 0.938 99.000 0.143 NA N NA
 5526721 5526722 PTH_0478 PTH_0479     TRUE 0.997 -3.000 0.214 NA   NA
 5526722 5526723 PTH_0479 PTH_0480   NadC TRUE 0.963 23.000 0.017 NA   NA
 5526723 5526724 PTH_0480 PTH_0481 NadC   TRUE 0.437 71.000 0.000 1.000 N NA
 5526724 5526725 PTH_0481 PTH_0482   MhpF TRUE 0.998 35.000 0.542 1.000 Y NA
 5526725 5526726 PTH_0482 PTH_0483 MhpF LeuA TRUE 0.998 -16.000 0.208 1.000 N NA
 5526726 5526727 PTH_0483 PTH_0484 LeuA EutG FALSE 0.347 163.000 0.000 1.000 N NA
 5526727 5526728 PTH_0484 PTH_0485 EutG   FALSE 0.364 62.000 0.000 1.000   NA
 5526728 5526729 PTH_0485 PTH_0486   HycB TRUE 0.689 32.000 0.000 1.000   NA
 5526729 5526730 PTH_0486 PTH_0487 HycB   TRUE 0.999 16.000 0.200 0.045 Y NA
 5526730 5526731 PTH_0487 PTH_0488   EutG TRUE 0.429 188.000 0.000 1.000 Y NA
 5526731 5526732 PTH_0488 PTH_0489 EutG   FALSE 0.172 72.000 0.000 NA   NA
 5526732 5526733 PTH_0489 PTH_0490     FALSE 0.145 148.000 0.000 NA   NA
 5526733 5526734 PTH_0490 PTH_0491   Pta TRUE 0.993 -22.000 0.086 1.000   NA
 5526734 5526735 PTH_0491 PTH_0492 Pta PutP TRUE 0.776 25.000 0.000 1.000   NA
 5526735 5526736 PTH_0492 PTH_0493 PutP   FALSE 0.026 278.000 0.000 NA   NA
 5526736 5526737 PTH_0493 PTH_0494     TRUE 0.448 35.000 0.000 NA   NA
 5526737 5526738 PTH_0494 PTH_0495   EutG TRUE 0.805 42.000 0.000 1.000 Y NA
 5526738 5526739 PTH_0495 PTH_0496 EutG UbiD TRUE 0.788 22.000 0.000 NA N NA
 5526739 5526740 PTH_0496 PTH_0497 UbiD ThiS FALSE 0.189 66.000 0.000 NA   NA
 5526740 5526741 PTH_0497 PTH_0498 ThiS ThiF FALSE 0.288 94.000 0.000 1.000   NA
 5526742 5526743 PTH_0499 PTH_0500   AbrB TRUE 0.996 -3.000 0.143 NA   NA
 5526744 5526745 PTH_0501 PTH_0502 ArgC ArgJ TRUE 0.993 77.000 0.303 0.003 Y NA
 5526745 5526746 PTH_0502 PTH_0503 ArgJ ArgB TRUE 0.996 48.000 0.239 0.003 Y NA
 5526746 5526747 PTH_0503 PTH_0504 ArgB ArgD TRUE 0.957 61.000 0.052 1.000 Y NA
 5526747 5526748 PTH_0504 PTH_0505 ArgD CarB TRUE 0.952 60.000 0.045 1.000 Y NA
 5526748 5526749 PTH_0505 PTH_0506 CarB ArgF TRUE 0.983 -42.000 0.006 1.000 Y NA
 5526749 5526750 PTH_0506 PTH_0507 ArgF ArgG TRUE 0.954 155.000 0.088 1.000 Y NA
 5526750 5526751 PTH_0507 PTH_0508 ArgG TyrR FALSE 0.044 361.000 0.000 1.000 N NA
 5526751 5526752 PTH_0508 PTH_0509 TyrR   FALSE 0.011 675.000 0.000 1.000 N NA
 5526752 5526753 PTH_0509 PTH_0510   EutG FALSE 0.047 458.000 0.000 1.000 Y NA
 5526753 5526754 PTH_0510 PTH_0511 EutG   FALSE 0.128 161.000 0.000 NA   NA
 5526754 5526755 PTH_0511 PTH_0512     FALSE 0.016 333.000 0.000 NA   NA
 5526755 5526756 PTH_0512 PTH_0513   CaiA TRUE 0.539 156.000 0.000 1.000 Y NA
 5526756 5526757 PTH_0513 PTH_0514 CaiA Etf TRUE 0.987 172.000 0.500 0.063 N NA
 5526757 5526758 PTH_0514 PTH_0515 Etf CaiD TRUE 0.693 40.000 0.000 1.000 N NA
 5526758 5526759 PTH_0515 PTH_0516 CaiD   FALSE 0.128 161.000 0.000 NA   NA
 5526759 5526760 PTH_0516 PTH_0517   ArgH FALSE 0.044 232.000 0.000 NA   NA
 5526761 5526762 PTH_0518 PTH_0519 PheA AroA TRUE 0.992 -7.000 0.010 1.000 Y NA
 5526763 5526764 PTH_0520 PTH_0521   BioB TRUE 0.999 3.000 0.176 0.003   NA
 5526765 5526766 PTH_0522 PTH_0523     TRUE 0.589 26.000 0.000 NA   NA
 5526766 5526767 PTH_0523 PTH_0524     FALSE 0.041 238.000 0.000 NA   NA
 5526768 5526769 PTH_0525 PTH_0526 IlvE IlvD TRUE 0.894 119.000 0.017 1.000 Y NA
 5526769 5526770 PTH_0526 PTH_0527 IlvD IlvB TRUE 0.999 0.000 0.089 0.003 Y NA
 5526770 5526771 PTH_0527 PTH_0528 IlvB ilvH TRUE 0.999 17.000 0.249 0.002 Y NA
 5526771 5526772 PTH_0528 PTH_0529 ilvH IlvC TRUE 0.999 -10.000 0.130 0.003 Y NA
 5526772 5526773 PTH_0529 PTH_0530 IlvC IlvB TRUE 0.940 66.000 0.005 0.003 Y NA
 5526773 5526774 PTH_0530 PTH_0531 IlvB LeuA TRUE 0.987 21.000 0.011 1.000 Y NA
 5526774 5526775 PTH_0531 PTH_0532 LeuA LeuC TRUE 0.981 74.000 0.086 0.003 Y NA
 5526775 5526776 PTH_0532 PTH_0533 LeuC LeuD TRUE 1.000 2.000 0.615 0.002 Y NA
 5526776 5526777 PTH_0533 PTH_0534 LeuD LeuB TRUE 0.998 -7.000 0.051 0.003 Y NA
 5526777 5526778 PTH_0534 PTH_0535 LeuB LeuA TRUE 0.994 9.000 0.016 1.000 Y NA
 5526778 5526779 PTH_0535 PTH_0536 LeuA   FALSE 0.170 73.000 0.000 NA   NA
 5526779 5526780 PTH_0536 PTH_0537     TRUE 0.999 5.000 0.502 NA   NA
 5526780 5526781 PTH_0537 PTH_0538   ManB TRUE 0.924 97.000 0.150 NA   NA
 5526781 5526782 PTH_0538 PTH_0539 ManB GlmS FALSE 0.213 439.000 0.030 1.000 N NA
 5526782 5526783 PTH_0539 PTH_0540 GlmS   FALSE 0.151 94.000 0.000 NA   NA
 5526783 5526784 PTH_0540 PTH_0541     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA   NA
 5526784 5526785 PTH_0541 PTH_0542   AzlC FALSE 0.150 197.000 0.000 NA N NA
 5526785 5526786 PTH_0542 PTH_0543 AzlC   TRUE 0.736 -13.000 0.000 NA   NA
 5526787 5526788 PTH_0544 PTH_0545   ArsR FALSE 0.005 529.000 0.000 NA   NA
 5526789 5526790 PTH_0546 PTH_0547     FALSE 0.016 450.000 0.000 1.000   NA
 5526790 5526791 PTH_0547 PTH_0548   CoxE TRUE 0.998 -73.000 0.857 NA   NA
 5526791 5526792 PTH_0548 PTH_0549 CoxE   TRUE 0.660 21.000 0.000 NA   NA
 5526792 5526793 PTH_0549 PTH_0550     TRUE 0.604 25.000 0.000 NA   NA
 5526794 5526795 PTH_0551 PTH_0552 SirA   TRUE 0.997 -16.000 0.352 NA   NA
 5526795 5526796 PTH_0552 PTH_0553     FALSE 0.035 252.000 0.000 NA   NA
 5526801 5526802 PTH_0558 PTH_0559 RfaG GDB1 TRUE 0.997 -18.000 0.206 1.000 N NA
 5526802 5526803 PTH_0559 PTH_0560 GDB1 OtsA TRUE 0.998 13.000 0.088 1.000 Y NA
 5526803 5526804 PTH_0560 PTH_0561 OtsA OtsB TRUE 0.999 -88.000 0.276 0.001 Y NA
 5526804 5526805 PTH_0561 PTH_0562 OtsB   FALSE 0.100 179.000 0.000 NA   NA
 5526805 5526806 PTH_0562 PTH_0563     FALSE 0.090 189.000 0.000 NA   NA
 5526806 5526807 PTH_0563 PTH_0564     FALSE 0.086 192.000 0.000 NA   NA
 5526807 5526808 PTH_0564 PTH_0565     FALSE 0.151 134.000 0.000 NA   NA
 5526808 5526809 PTH_0565 PTH_0566     TRUE 0.820 2.000 0.000 NA   NA
 5526809 5526810 PTH_0566 PTH_0567   ComEC TRUE 0.990 37.000 0.333 NA   NA
 5526810 5526811 PTH_0567 PTH_0568 ComEC   FALSE 0.048 297.000 0.000 1.000   NA
 5526811 5526812 PTH_0568 PTH_0569     TRUE 0.643 22.000 0.000 NA   NA
 5526812 5526813 PTH_0569 PTH_0570     TRUE 0.821 1.000 0.000 NA   NA
 5526813 5526814 PTH_0570 PTH_0571     TRUE 0.993 -3.000 0.056 NA   NA
 5526814 5526815 PTH_0571 PTH_0572   TauA TRUE 0.939 169.000 0.263 NA   NA
 5526815 5526816 PTH_0572 PTH_0573 TauA   TRUE 0.995 9.000 0.105 NA   NA
 5526816 5526817 PTH_0573 PTH_0574   TauC TRUE 0.995 -48.000 0.240 NA   NA
 5526817 5526818 PTH_0574 PTH_0575 TauC TauC TRUE 0.982 40.000 0.200 NA   NA
 5526818 5526819 PTH_0575 PTH_0576 TauC TauB TRUE 0.997 0.000 0.135 NA   NA
 5526819 5526820 PTH_0576 PTH_0577 TauB   TRUE 0.959 46.000 0.105 NA   NA
 5526820 5526821 PTH_0577 PTH_0578   HgdB FALSE 0.150 97.000 0.000 NA   NA
 5526821 5526822 PTH_0578 PTH_0579 HgdB BisC FALSE 0.183 180.000 0.000 NA N NA
 5526822 5526823 PTH_0579 PTH_0580 BisC   FALSE 0.043 471.000 0.000 0.003   NA
 5526823 5526824 PTH_0580 PTH_0581   IscU FALSE 0.317 73.000 0.000 1.000   NA
 5526824 5526825 PTH_0581 PTH_0582 IscU   FALSE 0.033 257.000 0.000 NA   NA
 5526825 5526826 PTH_0582 PTH_0583     FALSE 0.017 325.000 0.000 NA   NA
 5526826 5526827 PTH_0583 PTH_0584   MinD TRUE 0.960 31.000 0.035 NA   NA
 5526827 5526828 PTH_0584 PTH_0585 MinD MinD TRUE 1.000 0.000 0.838 0.009 Y NA
 5526828 5526829 PTH_0585 PTH_0586 MinD   TRUE 0.988 16.000 0.051 NA   NA
 5526829 5526830 PTH_0586 PTH_0587   Mrp FALSE 0.156 87.000 0.000 NA   NA
 5526830 5526831 PTH_0587 PTH_0588 Mrp   TRUE 0.819 200.000 0.077 1.000   NA
 5526831 5526832 PTH_0588 PTH_0589     FALSE 0.018 322.000 0.000 NA   NA
 5526832 5526833 PTH_0589 PTH_0590     FALSE 0.150 143.000 0.000 NA   NA
 5526833 5526834 PTH_0590 PTH_0591     TRUE 0.658 -31.000 0.000 NA   NA
 5526834 5526835 PTH_0591 PTH_0592   FabG TRUE 0.545 30.000 0.000 NA   NA
 5526835 5526836 PTH_0592 PTH_0593 FabG   FALSE 0.155 89.000 0.000 NA   NA
 5526836 5526837 PTH_0593 PTH_0594     TRUE 0.987 -73.000 0.097 NA   NA
 5526837 5526838 PTH_0594 PTH_0595   NemA TRUE 0.846 -19.000 0.000 1.000   NA
 5526838 5526839 PTH_0595 PTH_0596 NemA NemA TRUE 0.999 17.000 0.200 0.004 Y NA
 5526839 5526840 PTH_0596 PTH_0597 NemA FixB FALSE 0.158 353.000 0.000 0.062 Y NA
 5526840 5526841 PTH_0597 PTH_0598 FixB FixC TRUE 0.974 -13.000 0.000 0.062 Y NA
 5526841 5526842 PTH_0598 PTH_0599 FixC FixX TRUE 0.998 -6.000 0.039 0.062 Y NA
 5526842 5526843 PTH_0599 PTH_0600 FixX   TRUE 0.990 33.000 0.039 0.062 Y NA
 5526843 5526844 PTH_0600 PTH_0601     TRUE 0.926 195.000 0.250 NA N NA
 5526845 5526846 PTH_0602 PTH_0603 TupB TupB TRUE 0.955 45.000 0.031 NA Y NA
 5526847 5526848 PTH_0604 PTH_0605 THI80 AtoC FALSE 0.087 282.000 0.000 1.000 N NA
 5526848 5526849 PTH_0605 PTH_0606 AtoC EutG FALSE 0.029 427.000 0.000 1.000 N NA
 5526849 5526850 PTH_0606 PTH_0607 EutG   FALSE 0.005 786.000 0.000 1.000   NA
 5526850 5526851 PTH_0607 PTH_0608     FALSE 0.029 358.000 0.000 1.000   NA
 5526851 5526852 PTH_0608 PTH_0609   HycB FALSE 0.103 178.000 0.000 NA   NA
 5526852 5526853 PTH_0609 PTH_0610 HycB   TRUE 0.994 38.000 0.250 NA Y NA
 5526853 5526854 PTH_0610 PTH_0611   MoaD TRUE 0.971 96.000 0.250 1.000 N NA
 5526854 5526855 PTH_0611 PTH_0612 MoaD ThiF TRUE 0.864 34.000 0.000 1.000 Y NA
 5526855 5526856 PTH_0612 PTH_0613 ThiF   FALSE 0.140 153.000 0.000 NA   NA
 5526856 5526857 PTH_0613 PTH_0614     FALSE 0.106 177.000 0.000 NA   NA
 5526859 5526860 PTH_0616 PTH_0617 KamA RfaG TRUE 0.943 3.000 0.000 1.000 N NA
 5526860 5526861 PTH_0617 PTH_0618 RfaG Cof TRUE 0.991 -54.000 0.105 1.000   NA
 5526865 5526866 PTH_0622 PTH_0623   TrpF TRUE 0.688 -22.000 0.000 NA   NA
 5526866 5526867 PTH_0623 PTH_0624 TrpF AdhP TRUE 0.920 -66.000 0.000 1.000 Y NA
 5526867 5526868 PTH_0624 PTH_0625 AdhP FbaB TRUE 1.000 1.000 0.667 1.000 N NA
 5526870 5526871 PTH_0626 PTH_0628   AraJ FALSE 0.164 77.000 0.000 NA   NA
 5526871 5526872 PTH_0628 PTH_0629 AraJ Bfr FALSE 0.285 78.000 0.000 NA N NA
 5526873 5526874 PTH_0630 PTH_0631     FALSE 0.155 113.000 0.000 NA   NA
 5526876 5526877 PTH_0633 PTH_0634     FALSE 0.151 138.000 0.000 NA   NA
 5526877 5526878 PTH_0634 PTH_0635     FALSE 0.056 215.000 0.000 NA   NA
 5526879 5526880 PTH_0636 PTH_0637     FALSE 0.140 153.000 0.000 NA   NA
 5526880 5526881 PTH_0637 PTH_0638     FALSE 0.074 200.000 0.000 NA   NA
 5526881 5526882 PTH_0638 PTH_0639   ThiS FALSE 0.025 361.000 0.000 NA N NA
 5526882 5526883 PTH_0639 PTH_0640 ThiS ThiG TRUE 0.997 3.000 0.037 1.000 Y NA
 5526883 5526884 PTH_0640 PTH_0641 ThiG ThiH TRUE 0.999 31.000 0.277 0.006 Y NA
 5526884 5526885 PTH_0641 PTH_0642 ThiH   TRUE 0.995 10.000 0.083 1.000   NA
 5526885 5526886 PTH_0642 PTH_0643   ThiE TRUE 0.996 -7.000 0.102 1.000   NA
 5526886 5526887 PTH_0643 PTH_0644 ThiE ThiC TRUE 0.998 3.000 0.018 0.006 Y NA
 5526887 5526888 PTH_0644 PTH_0645 ThiC   FALSE 0.086 241.000 0.000 1.000   NA
 5526888 5526889 PTH_0645 PTH_0646     TRUE 0.576 -112.000 0.000 NA   NA
 5526889 5526890 PTH_0646 PTH_0647   ArsR FALSE 0.150 128.000 0.000 NA   NA
 5526891 5526892 PTH_0648 PTH_0649     TRUE 0.792 60.000 0.015 NA   NA
 5526892 5526893 PTH_0649 PTH_0650     FALSE 0.143 150.000 0.000 NA   NA
 5526894 5526895 PTH_0651 PTH_0652 ArsR ACR3 TRUE 0.989 42.000 0.214 1.000 N NA
 5526895 5526896 PTH_0652 PTH_0653 ACR3 GloB FALSE 0.012 488.000 0.000 1.000   NA
 5526896 5526897 PTH_0653 PTH_0654 GloB   FALSE 0.142 206.000 0.000 1.000   NA
 5526897 5526898 PTH_0654 PTH_0655   LytT TRUE 1.000 -28.000 0.778 0.021 Y NA
 5526898 5526899 PTH_0655 PTH_0656 LytT AcpS TRUE 0.843 189.000 0.053 1.000 N NA
 5526899 5526900 PTH_0656 PTH_0657 AcpS   TRUE 0.992 4.000 0.037 NA N NA
 5526900 5526901 PTH_0657 PTH_0658   Ald TRUE 0.892 6.000 0.000 NA N NA
 5526901 5526902 PTH_0658 PTH_0659 Ald   TRUE 0.819 0.000 0.000 NA   NA
 5526902 5526903 PTH_0659 PTH_0660   Alr FALSE 0.008 434.000 0.000 NA   NA
 5526903 5526904 PTH_0660 PTH_0661 Alr   FALSE 0.407 38.000 0.000 NA   NA
 5526904 5526905 PTH_0661 PTH_0662   NfnB TRUE 0.812 4.000 0.000 NA   NA
 5526905 5526906 PTH_0662 PTH_0663 NfnB   TRUE 0.545 30.000 0.000 NA   NA
 5526906 5526907 PTH_0663 PTH_0664   AmtB FALSE 0.016 334.000 0.000 NA   NA
 5526907 5526908 PTH_0664 PTH_0665 AmtB GlnK TRUE 0.985 125.000 0.500 1.000 N NA
 5526908 5526909 PTH_0665 PTH_0666 GlnK   FALSE 0.269 134.000 0.000 NA N NA
 5526909 5526910 PTH_0666 PTH_0667   Tar FALSE 0.397 168.000 0.000 NA Y NA
 5526910 5526911 PTH_0667 PTH_0668 Tar   FALSE 0.004 933.000 0.000 1.000   NA
 5526911 5526912 PTH_0668 PTH_0669   HybA TRUE 0.995 66.000 0.778 0.017   NA
 5526912 5526913 PTH_0669 PTH_0670 HybA   TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 5526913 5526914 PTH_0670 PTH_0671   RpoE FALSE 0.012 367.000 0.000 NA   NA
 5526914 5526915 PTH_0671 PTH_0672 RpoE   TRUE 0.756 -10.000 0.000 NA   NA
 5526915 5526916 PTH_0672 PTH_0673   AsnB FALSE 0.146 147.000 0.000 NA   NA
 5526918 5526919 PTH_0675 PTH_0676 ModA ModC TRUE 0.990 33.000 0.019 0.001 Y NA
 5526919 5526920 PTH_0676 PTH_0677 ModC ModC TRUE 0.999 10.000 0.342 1.000 Y NA
 5526920 5526921 PTH_0677 PTH_0678 ModC AtoC FALSE 0.025 451.000 0.000 1.000 N NA
 5526921 5526922 PTH_0678 PTH_0679 AtoC   FALSE 0.016 536.000 0.000 1.000 N NA
 5526922 5526923 PTH_0679 PTH_0680     TRUE 0.993 174.000 0.607 0.044 Y NA
 5526923 5526924 PTH_0680 PTH_0681     TRUE 0.997 -3.000 0.130 1.000   NA
 5526924 5526925 PTH_0681 PTH_0682     TRUE 0.468 49.000 0.000 1.000   NA
 5526925 5526926 PTH_0682 PTH_0683     TRUE 0.792 7.000 0.000 NA   NA
 5526926 5526927 PTH_0683 PTH_0684     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 5526927 5526928 PTH_0684 PTH_0685   PaaK TRUE 0.999 -24.000 0.358 0.050   NA
 5526928 5526929 PTH_0685 PTH_0686 PaaK XdhC TRUE 0.999 6.000 0.531 NA N NA
 5526929 5526930 PTH_0686 PTH_0687 XdhC   FALSE 0.181 68.000 0.000 NA   NA
 5526930 5526931 PTH_0687 PTH_0688     TRUE 0.732 30.000 0.000 1.000   NA
 5526931 5526932 PTH_0688 PTH_0689   GpmB TRUE 0.453 50.000 0.000 1.000   NA
 5526932 5526933 PTH_0689 PTH_0690 GpmB   FALSE 0.175 218.000 0.000 1.000 N NA
 5526933 5526934 PTH_0690 PTH_0691     TRUE 0.998 5.000 0.062 1.000 Y NA
 5526935 5526936 PTH_0692 PTH_0693   PinR TRUE 0.756 -10.000 0.000 NA   NA
 5526936 5526937 PTH_0693 PTH_0694 PinR   FALSE 0.014 348.000 0.000 NA   NA
 5526937 5526938 PTH_0694 PTH_0695     TRUE 0.723 -16.000 0.000 NA   NA
 5526939 5526940 PTH_0696 PTH_0697     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 5526941 5526942 PTH_0698 PTH_0699 YSH1   TRUE 0.992 -3.000 0.048 NA   NA
 5526942 5526943 PTH_0699 PTH_0700     FALSE 0.320 45.000 0.000 NA   NA
 5526944 5526945 PTH_0701 PTH_0702     FALSE 0.155 88.000 0.000 NA   NA
 5526945 5526946 PTH_0702 PTH_0703     TRUE 0.995 -28.000 0.222 NA   NA
 5526946 5526947 PTH_0703 PTH_0704     TRUE 0.743 15.000 0.000 NA   NA
 5526949 5526950 PTH_0706 PTH_0707     FALSE 0.332 44.000 0.000 NA   NA
 5526950 5526951 PTH_0707 PTH_0708     TRUE 0.756 -10.000 0.000 NA   NA
 5526951 5526952 PTH_0708 PTH_0709     TRUE 0.998 -3.000 0.286 NA   NA
 5526953 5526954 PTH_0710 PTH_0711     FALSE 0.155 114.000 0.000 NA   NA
 5526955 5526956 PTH_0712 PTH_0713     TRUE 0.997 -25.000 0.364 NA   NA
 5526956 5526957 PTH_0713 PTH_0714     TRUE 0.998 14.000 0.364 NA   NA
 5526957 5526958 PTH_0714 PTH_0715     FALSE 0.189 66.000 0.000 NA   NA
 5526958 5526959 PTH_0715 PTH_0716     TRUE 0.992 26.000 0.078 0.089   NA
 5526959 5526960 PTH_0716 PTH_0717     TRUE 0.997 -3.000 0.203 NA   NA
 5526961 5526962 PTH_0718 PTH_0719 Tra5   FALSE 0.113 173.000 0.000 NA   NA
 5526962 5526963 PTH_0719 PTH_0720     FALSE 0.027 275.000 0.000 NA   NA
 5526963 5526964 PTH_0720 PTH_0721     FALSE 0.045 230.000 0.000 NA   NA
 5526964 5526965 PTH_0721 PTH_0722     FALSE 0.198 63.000 0.000 NA   NA
 5526965 5526966 PTH_0722 PTH_0723     TRUE 0.996 -54.000 0.364 NA   NA
 5526966 5526967 PTH_0723 PTH_0724     FALSE 0.002 878.000 0.000 NA   NA
 5526967 5526968 PTH_0724 PTH_0725     TRUE 0.989 -31.000 0.087 NA   NA
 5526968 5526969 PTH_0725 PTH_0726     FALSE 0.004 994.000 0.000 1.000   NA
 5526970 5526971 PTH_0727 PTH_0728 AmiR GlnA TRUE 0.978 116.000 0.333 1.000 N NA
 5526971 5526972 PTH_0728 PTH_0729 GlnA GltB TRUE 0.887 164.000 0.025 1.000 Y NA
 5526972 5526973 PTH_0729 PTH_0730 GltB AmiR TRUE 0.852 166.000 0.037 1.000 N NA
 5526973 5526974 PTH_0730 PTH_0731 AmiR GlnA TRUE 0.997 35.000 0.556 1.000 N NA
 5526974 5526975 PTH_0731 PTH_0732 GlnA   TRUE 0.482 48.000 0.000 1.000   NA
 5526975 5526976 PTH_0732 PTH_0733   GlnA FALSE 0.046 303.000 0.000 1.000   NA
 5526976 5526977 PTH_0733 PTH_0734 GlnA GltB TRUE 0.817 190.000 0.017 1.000 Y NA
 5526977 5526978 PTH_0734 PTH_0735 GltB GltD TRUE 0.999 20.000 0.222 0.001 Y NA
 5526978 5526979 PTH_0735 PTH_0736 GltD IlvH TRUE 0.437 186.000 0.000 1.000 Y NA
 5526979 5526980 PTH_0736 PTH_0737 IlvH   TRUE 0.743 95.000 0.009 1.000   NA
 5526980 5526981 PTH_0737 PTH_0738   MazF TRUE 0.999 3.000 0.221 0.088   NA
 5526981 5526982 PTH_0738 PTH_0739 MazF HutI TRUE 0.813 123.000 0.013 1.000 N NA
 5526982 5526983 PTH_0739 PTH_0740 HutI CheY TRUE 0.950 157.000 0.154 1.000 N NA
 5526983 5526984 PTH_0740 PTH_0741 CheY   FALSE 0.054 220.000 0.000 NA   NA
 5526984 5526985 PTH_0741 PTH_0742     TRUE 0.996 -19.000 0.217 NA   NA
 5526985 5526986 PTH_0742 PTH_0743   RimI TRUE 0.922 161.000 0.127 1.000   NA
 5526986 5526987 PTH_0743 PTH_0744 RimI   TRUE 0.769 126.000 0.014 1.000   NA
 5526987 5526988 PTH_0744 PTH_0745     TRUE 0.626 23.000 0.000 NA   NA
 5526988 5526989 PTH_0745 PTH_0746     TRUE 0.683 19.000 0.000 NA   NA
 5526989 5526990 PTH_0746 PTH_0747   Mdh FALSE 0.107 176.000 0.000 NA   NA
 5526990 5526991 PTH_0747 PTH_0748 Mdh RAD55 FALSE 0.190 211.000 0.000 1.000 N NA
 5526991 5526992 PTH_0748 PTH_0749 RAD55 RAD55 TRUE 0.966 7.000 0.000 1.000 Y NA
 5526992 5526993 PTH_0749 PTH_0750 RAD55   TRUE 0.904 -3.000 0.000 1.000   NA
 5526993 5526994 PTH_0750 PTH_0751     TRUE 0.603 -70.000 0.000 NA   NA
 5526994 5526995 PTH_0751 PTH_0752   NtrB TRUE 0.754 14.000 0.000 NA   NA
 5526995 5156672 PTH_0752   NtrB   FALSE 0.179 69.000 0.000 NA   NA
 5156672 5526996   PTH_0753   MazF FALSE 0.004 559.000 0.000 NA   NA
 5526996 5526997 PTH_0753 PTH_0754 MazF   FALSE 0.150 125.000 0.000 NA   NA
 5526997 5526998 PTH_0754 PTH_0755     FALSE 0.122 166.000 0.000 NA   NA
 5526998 5526999 PTH_0755 PTH_0756     FALSE 0.174 71.000 0.000 NA   NA
 5526999 5527000 PTH_0756 PTH_0757     FALSE 0.193 185.000 0.000 1.000   NA
 5527000 5527001 PTH_0757 PTH_0758     TRUE 0.821 1.000 0.000 NA   NA
 5527001 5527002 PTH_0758 PTH_0759     TRUE 0.754 14.000 0.000 NA   NA
 5527006 5527007 PTH_0763 PTH_0764     FALSE 0.164 77.000 0.000 NA   NA
 5527009 5527010 PTH_0766 PTH_0767     TRUE 0.764 -9.000 0.000 NA   NA
 5527010 5527011 PTH_0767 PTH_0768   RpoE FALSE 0.035 252.000 0.000 NA   NA
 5527011 5527012 PTH_0768 PTH_0769 RpoE   TRUE 0.688 -22.000 0.000 NA   NA
 5527012 5527013 PTH_0769 PTH_0770     TRUE 0.819 0.000 0.000 NA   NA
 5527013 5527014 PTH_0770 PTH_0771   CcmA TRUE 0.997 0.000 0.200 NA   NA
 5527014 5527015 PTH_0771 PTH_0772 CcmA   TRUE 0.996 -13.000 0.200 NA   NA
 5527015 5527016 PTH_0772 PTH_0773     FALSE 0.073 201.000 0.000 NA   NA
 5527016 5527017 PTH_0773 PTH_0774     TRUE 0.819 0.000 0.000 NA   NA
 5527017 5527018 PTH_0774 PTH_0775     FALSE 0.034 255.000 0.000 NA   NA
 5527019 5527020 PTH_0776 PTH_0777 TagG CcmA TRUE 0.999 5.000 0.185 1.000 Y NA
 5527020 5527021 PTH_0777 PTH_0778 CcmA MarR TRUE 0.943 0.000 0.000 1.000 N NA
 5527021 5527022 PTH_0778 PTH_0779 MarR   FALSE 0.271 188.000 0.000 1.000 N NA
 5527022 5527023 PTH_0779 PTH_0780     TRUE 0.977 50.000 0.039 0.043 Y NA
 5527024 5527025 PTH_0781 PTH_0782 Crp   FALSE 0.320 72.000 0.000 1.000   NA
 5527025 5527026 PTH_0782 PTH_0783     FALSE 0.090 189.000 0.000 NA   NA
 5527026 5527027 PTH_0783 PTH_0784     TRUE 0.987 15.000 0.045 NA   NA
 5527027 5527028 PTH_0784 PTH_0785   PotE TRUE 1.000 2.000 1.000 1.000   NA
 5527028 5527029 PTH_0785 PTH_0786 PotE   FALSE 0.153 229.000 0.000 1.000 N NA
 5527029 5527030 PTH_0786 PTH_0787   MurI TRUE 0.695 201.000 0.002 1.000 Y NA
 5527030 5527031 PTH_0787 PTH_0788 MurI HgdB TRUE 0.798 58.000 0.006 NA N NA
 5527031 5527032 PTH_0788 PTH_0789 HgdB   TRUE 0.999 5.000 0.722 NA N NA
 5527032 5527033 PTH_0789 PTH_0790   ElaC TRUE 0.983 21.000 0.050 NA   NA
 5527033 5527034 PTH_0790 PTH_0791 ElaC Rph TRUE 0.785 61.000 0.005 1.000   NA
 5527034 5527035 PTH_0791 PTH_0792 Rph   TRUE 0.997 -31.000 0.262 1.000 N NA
 5527035 5527036 PTH_0792 PTH_0793     TRUE 0.995 8.000 0.085 1.000   NA
 5527036 5156714 PTH_0793       FALSE 0.035 254.000 0.000 NA   NA
 5156714 5156715         TRUE 0.786 8.000 0.000 NA   NA
 5156715 5156716         TRUE 0.545 30.000 0.000 NA   NA
 5156716 5156717         FALSE 0.100 179.000 0.000 NA   NA
 5527037 5527038 PTH_0794 PTH_0795 CaiD Hit FALSE 0.063 322.000 0.000 1.000 N NA
 5527039 5527040 PTH_0796 PTH_0797     FALSE 0.095 186.000 0.000 NA   NA
 5527042 5527043 PTH_0799 PTH_0800     TRUE 0.613 -61.000 0.000 NA   NA
 5527043 5527044 PTH_0800 PTH_0801     TRUE 0.998 0.000 0.267 NA   NA
 5527044 5527045 PTH_0801 PTH_0802     FALSE 0.081 195.000 0.000 NA   NA
 5156727 5156728         TRUE 0.786 8.000 0.000 NA   NA
 5527046 5527047 PTH_0803 PTH_0804 Tig ClpP TRUE 0.986 99.000 0.351 1.000 Y NA
 5527047 5527048 PTH_0804 PTH_0805 ClpP clpX TRUE 0.999 -13.000 0.352 1.000 Y NA
 5527048 5527049 PTH_0805 PTH_0806 clpX LonB TRUE 0.905 204.000 0.042 0.022 Y NA
 5527049 5527050 PTH_0806 PTH_0807 LonB Lon TRUE 0.988 206.000 0.435 0.002 Y NA
 5527050 5527051 PTH_0807 PTH_0808 Lon   TRUE 0.995 -3.000 0.055 1.000   NA
 5527053 5527054 PTH_0809 PTH_0811     FALSE 0.159 82.000 0.000 NA   NA
 5527054 5527055 PTH_0811 PTH_0812   valS FALSE 0.010 389.000 0.000 NA   NA
 5527055 5527056 PTH_0812 PTH_0813 valS FolC TRUE 0.971 29.000 0.015 1.000 N NA
 5527056 5527057 PTH_0813 PTH_0814 FolC   FALSE 0.125 164.000 0.000 NA   NA
 5527057 5527058 PTH_0814 PTH_0815   Maf TRUE 0.977 8.000 0.009 NA   NA
 5527058 5527059 PTH_0815 PTH_0816 Maf RadC TRUE 0.778 81.000 0.014 NA N NA
 5527059 5527060 PTH_0816 PTH_0817 RadC MreB TRUE 0.653 195.000 0.008 1.000 N NA
 5527060 5527061 PTH_0817 PTH_0818 MreB MreC TRUE 0.989 121.000 0.689 1.000 N NA
 5527061 5527062 PTH_0818 PTH_0819 MreC MreD TRUE 0.998 34.000 0.550 0.003   NA
 5527062 5527063 PTH_0819 PTH_0820 MreD FtsI TRUE 0.968 50.000 0.133 1.000   NA
 5527063 5527064 PTH_0820 PTH_0821 FtsI MinC TRUE 0.875 127.000 0.049 1.000   NA
 5527064 5527065 PTH_0821 PTH_0822 MinC MinD TRUE 0.988 49.000 0.368 1.000   NA
 5527065 5527066 PTH_0822 PTH_0823 MinD MinE TRUE 0.998 23.000 0.347 NA Y NA
 5527066 5527067 PTH_0823 PTH_0824 MinE FtsW TRUE 0.922 105.000 0.053 NA Y NA
 5527067 5527068 PTH_0824 PTH_0825 FtsW NlpD FALSE 0.293 108.000 0.000 1.000   NA
 5527068 5527069 PTH_0825 PTH_0826 NlpD SpoIVFB TRUE 0.953 118.000 0.081 0.005   NA
 5527069 5527070 PTH_0826 PTH_0827 SpoIVFB   TRUE 0.534 328.000 0.098 1.000   NA
 5527070 5527071 PTH_0827 PTH_0828     TRUE 0.999 4.000 0.420 NA   NA
 5527071 5527072 PTH_0828 PTH_0829   CafA TRUE 0.992 21.000 0.143 NA   NA
 5527072 5527073 PTH_0829 PTH_0830 CafA RplU TRUE 0.756 232.000 0.011 0.022 Y NA
 5527073 5527074 PTH_0830 PTH_0831 RplU rpmA TRUE 0.999 35.000 0.667 0.017 Y NA
 5527074 5527075 PTH_0831 PTH_0832 rpmA   TRUE 0.630 115.000 0.003 NA   NA
 5527075 5527076 PTH_0832 PTH_0833   Obg FALSE 0.168 74.000 0.000 NA   NA
 5527076 5527077 PTH_0833 PTH_0834 Obg ProB FALSE 0.293 90.000 0.000 1.000   NA
 5527077 5527078 PTH_0834 PTH_0835 ProB nadD TRUE 0.831 60.000 0.005 1.000 N NA
 5527078 5527079 PTH_0835 PTH_0836 nadD   TRUE 0.775 106.000 0.014 1.000   NA
 5527079 5527080 PTH_0836 PTH_0837     TRUE 0.630 116.000 0.003 NA   NA
 5527080 5156764 PTH_0837       FALSE 0.057 214.000 0.000 NA   NA
 5156764 5527081   PTH_0838   CaiC FALSE 0.153 118.000 0.000 NA   NA
 5527081 5527082 PTH_0838 PTH_0839 CaiC leuS TRUE 0.758 110.000 0.002 1.000 N NA
 5527082 5527083 PTH_0839 PTH_0840 leuS ModE FALSE 0.055 284.000 0.000 1.000   NA
 5527083 5527084 PTH_0840 PTH_0841 ModE ModA TRUE 0.516 45.000 0.000 1.000   NA
 5527084 5527085 PTH_0841 PTH_0842 ModA CysU TRUE 0.999 10.000 0.667 1.000 N NA
 5527085 5527086 PTH_0842 PTH_0843 CysU CysA TRUE 1.000 0.000 0.556 0.019 N NA
 5527087 5527088 PTH_0844 PTH_0845 RocR PorG FALSE 0.233 199.000 0.000 1.000 N NA
 5527088 5527089 PTH_0845 PTH_0846 PorG PorB TRUE 1.000 8.000 0.505 0.005 Y NA
 5527089 5527090 PTH_0846 PTH_0847 PorB PorA TRUE 1.000 23.000 0.771 0.005 Y NA
 5527090 5527091 PTH_0847 PTH_0848 PorA   TRUE 0.983 -7.000 0.000 0.005 Y NA
 5527092 5527093 PTH_0849 PTH_0850   RocR FALSE 0.084 193.000 0.000 NA   NA
 5527093 5527094 PTH_0850 PTH_0851 RocR EutG FALSE 0.161 226.000 0.000 1.000 N NA
 5527094 5527095 PTH_0851 PTH_0852 EutG   TRUE 0.931 22.000 0.000 1.000 Y NA
 5527095 5527096 PTH_0852 PTH_0853     FALSE 0.286 126.000 0.000 1.000   NA
 5527096 5527097 PTH_0853 PTH_0854     FALSE 0.229 171.000 0.000 1.000   NA
 5527097 5527098 PTH_0854 PTH_0855     FALSE 0.150 129.000 0.000 NA   NA
 5527098 5527099 PTH_0855 PTH_0856     TRUE 0.800 6.000 0.000 NA   NA
 5527099 5527100 PTH_0856 PTH_0857   ComEC TRUE 0.942 22.000 0.002 NA   NA
 5527100 5527101 PTH_0857 PTH_0858 ComEC   FALSE 0.092 234.000 0.000 1.000   NA
 5527101 5527102 PTH_0858 PTH_0859     TRUE 0.775 -7.000 0.000 NA   NA
 5527102 5527103 PTH_0859 PTH_0860     FALSE 0.004 539.000 0.000 NA   NA
 5527103 5527104 PTH_0860 PTH_0861     TRUE 0.578 27.000 0.000 NA   NA
 5527104 5527105 PTH_0861 PTH_0862     TRUE 0.651 -34.000 0.000 NA   NA
 5527105 5527106 PTH_0862 PTH_0863     TRUE 0.604 25.000 0.000 NA   NA
 5527108 5527109 PTH_0865 PTH_0866     FALSE 0.290 48.000 0.000 NA   NA
 5527109 5527110 PTH_0866 PTH_0867   HolA TRUE 0.969 14.000 0.005 NA   NA
 5527110 5527111 PTH_0867 PTH_0868 HolA UraA TRUE 0.919 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5527113 5527114 PTH_0870 PTH_0871     TRUE 0.938 73.000 0.167 NA   NA
 5527114 5527115 PTH_0871 PTH_0872     FALSE 0.150 126.000 0.000 NA   NA
 5527115 5527116 PTH_0872 PTH_0873   LepA FALSE 0.238 54.000 0.000 NA   NA
 5527116 5527117 PTH_0873 PTH_0874 LepA HemN TRUE 0.997 3.000 0.083 1.000 N NA
 5527117 5527118 PTH_0874 PTH_0875 HemN HrcA TRUE 0.902 161.000 0.062 1.000 N NA
 5527118 5527119 PTH_0875 PTH_0876 HrcA GroL TRUE 0.988 14.000 0.016 1.000 N NA
 5527119 5527120 PTH_0876 PTH_0877 GroL GrpE TRUE 0.989 23.000 0.026 1.000 Y NA
 5527120 5527121 PTH_0877 PTH_0878 GrpE DnaK TRUE 0.998 32.000 0.224 0.005 Y NA
 5527121 5527122 PTH_0878 PTH_0879 DnaK DnaJ TRUE 0.967 217.000 0.196 0.002 Y NA
 5527122 5527123 PTH_0879 PTH_0880 DnaJ PrmA TRUE 0.996 18.000 0.133 1.000 N NA
 5527123 5527124 PTH_0880 PTH_0881 PrmA   TRUE 0.970 53.000 0.227 NA   NA
 5527124 5527125 PTH_0881 PTH_0882     TRUE 0.997 0.000 0.163 NA   NA
 5527125 5527126 PTH_0882 PTH_0883     TRUE 0.935 -118.000 0.006 NA   NA
 5527126 5527127 PTH_0883 PTH_0884   Hit TRUE 0.853 80.000 0.051 NA   NA
 5527128 5527129 PTH_0885 PTH_0886 AslB   TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 5527130 5527131 PTH_0887 PTH_0888     FALSE 0.002 1031.000 0.000 NA   NA
 5527131 5527132 PTH_0888 PTH_0889     TRUE 0.999 16.000 0.851 NA   NA
 5527132 5527133 PTH_0889 PTH_0890   PhoH TRUE 0.931 65.000 0.114 NA   NA
 5527133 5527134 PTH_0890 PTH_0891 PhoH   TRUE 0.998 6.000 0.172 1.000   NA
 5527134 5527135 PTH_0891 PTH_0892     TRUE 0.993 -46.000 0.182 NA   NA
 5527135 5527136 PTH_0892 PTH_0893     TRUE 0.849 54.000 0.023 NA   NA
 5527136 5527137 PTH_0893 PTH_0894   Cdd TRUE 0.993 13.000 0.040 1.000 N NA
 5527137 5527138 PTH_0894 PTH_0895 Cdd Era TRUE 0.967 43.000 0.077 1.000   NA
 5527140 5527141 PTH_0897 PTH_0898 RecO   TRUE 0.645 78.000 0.003 NA   NA
 5527141 5527142 PTH_0898 PTH_0899   glyQ FALSE 0.008 423.000 0.000 NA   NA
 5527142 5527143 PTH_0899 PTH_0900 glyQ GlyS TRUE 1.000 7.000 0.651 0.001 Y NA
 5527143 5527144 PTH_0900 PTH_0901 GlyS   TRUE 0.830 107.000 0.027 1.000   NA
 5527144 5527145 PTH_0901 PTH_0902     TRUE 0.944 88.000 0.207 NA   NA
 5527145 5527146 PTH_0902 PTH_0903   PpsA TRUE 0.986 -10.000 0.035 NA   NA
 5527146 5527147 PTH_0903 PTH_0904 PpsA LigT TRUE 0.760 34.000 0.000 1.000 N NA
 5527147 5527148 PTH_0904 PTH_0905 LigT Dgt FALSE 0.356 160.000 0.000 1.000 N NA
 5527148 5527149 PTH_0905 PTH_0906 Dgt DnaG TRUE 0.842 194.000 0.056 1.000 N NA
 5527149 5527150 PTH_0906 PTH_0907 DnaG RpoD TRUE 0.998 -3.000 0.209 1.000 N NA
 5527150 5156835 PTH_0907   RpoD   FALSE 0.198 63.000 0.000 NA   NA
 5156835 5156836         TRUE 0.792 7.000 0.000 NA   NA
 5156836 5156837         FALSE 0.160 81.000 0.000 NA   NA
 5156837 5156838         TRUE 0.807 5.000 0.000 NA   NA
 5156838 5527151   PTH_0908     FALSE 0.031 264.000 0.000 NA   NA
 5527151 5527152 PTH_0908 PTH_0909   GlnA FALSE 0.042 313.000 0.000 1.000   NA
 5527152 5527153 PTH_0909 PTH_0910 GlnA   TRUE 0.615 -60.000 0.000 NA   NA
 5527155 5527156 PTH_0912 PTH_0913     FALSE 0.151 100.000 0.000 NA   NA
 5527156 5527157 PTH_0913 PTH_0914     TRUE 0.991 -9.000 0.061 NA   NA
 5527157 5527158 PTH_0914 PTH_0915     TRUE 0.746 98.000 0.020 NA   NA
 5527160 5527161 PTH_0917 PTH_0918 MutT   FALSE 0.298 85.000 0.000 1.000   NA
 5527162 5527163 PTH_0919 PTH_0920   AraD TRUE 0.585 -102.000 0.000 NA   NA
 5527163 5527164 PTH_0920 PTH_0921 AraD   TRUE 0.996 -6.000 0.065 1.000 N NA
 5527167 5527168 PTH_0924 PTH_0925   ThiD FALSE 0.287 123.000 0.000 1.000   NA
 5527168 5527169 PTH_0925 PTH_0926 ThiD   TRUE 0.981 25.000 0.025 1.000 N NA
 5527169 5527170 PTH_0926 PTH_0927     TRUE 0.693 40.000 0.000 1.000 N NA
 5527170 5527171 PTH_0927 PTH_0928   PflX FALSE 0.320 72.000 0.000 1.000   NA
 5527171 5527172 PTH_0928 PTH_0929 PflX   TRUE 0.756 -10.000 0.000 NA   NA
 5527172 5527173 PTH_0929 PTH_0930     TRUE 0.699 -21.000 0.000 NA   NA
 5527173 5527174 PTH_0930 PTH_0931   CobT FALSE 0.017 328.000 0.000 NA   NA
 5527176 5527177 PTH_0933 PTH_0934   YSH1 FALSE 0.194 65.000 0.000 NA   NA
 5527178 5527179 PTH_0935 PTH_0936     TRUE 0.997 7.000 0.231 NA   NA
 5527179 5156868 PTH_0936       FALSE 0.018 322.000 0.000 NA   NA
 5527181 5527182 PTH_0938 PTH_0939 AcrB   FALSE 0.083 194.000 0.000 NA   NA
 5527182 5527183 PTH_0939 PTH_0940     TRUE 0.977 153.000 0.600 NA   NA
 5527183 5527184 PTH_0940 PTH_0941   DdpA FALSE 0.152 120.000 0.000 NA   NA
 5527187 5527188 PTH_0944 PTH_0945   SpeE TRUE 0.985 26.000 0.056 1.000   NA
 5527188 5527189 PTH_0945 PTH_0946 SpeE SpeB TRUE 0.992 39.000 0.141 1.000 Y NA
 5527189 5156879 PTH_0946   SpeB   FALSE 0.113 173.000 0.000 NA   NA
 5156879 5156880         TRUE 0.786 8.000 0.000 NA   NA
 5156880 5156881         FALSE 0.224 56.000 0.000 NA   NA
 5156881 5156882         TRUE 0.781 9.000 0.000 NA   NA
 5527191 5527192 PTH_0948 PTH_0949   CbiM FALSE 0.004 553.000 0.000 NA   NA
 5527192 5527193 PTH_0949 PTH_0950 CbiM CbiQ TRUE 0.615 301.000 0.013 0.017 Y NA
 5527193 5527194 PTH_0950 PTH_0951 CbiQ   TRUE 0.971 35.000 0.005 0.004 N NA
 5527194 5527195 PTH_0951 PTH_0952     TRUE 0.974 40.000 0.005 0.017 Y NA
 5527195 5527196 PTH_0952 PTH_0953   CobF TRUE 0.980 -10.000 0.000 0.017 Y NA
 5527196 5527197 PTH_0953 PTH_0954 CobF CobM TRUE 0.992 84.000 0.291 0.017 Y NA
 5527197 5527198 PTH_0954 PTH_0955 CobM CbiG TRUE 1.000 5.000 0.397 0.017 Y NA
 5527198 5527199 PTH_0955 PTH_0956 CbiG   TRUE 1.000 -3.000 0.352 0.017 Y NA
 5527199 5527200 PTH_0956 PTH_0957   CobH TRUE 0.999 -3.000 0.096 0.017 Y NA
 5527200 5527201 PTH_0957 PTH_0958 CobH CobQ TRUE 0.968 21.000 0.000 0.017 Y NA
 5527201 5527202 PTH_0958 PTH_0959 CobQ CobB TRUE 0.996 -3.000 0.003 0.008 Y NA
 5527202 5527203 PTH_0959 PTH_0960 CobB hisG FALSE 0.403 111.000 0.000 1.000 N NA
 5527205 5527206 PTH_0962 PTH_0963 TrxB   FALSE 0.213 59.000 0.000 NA   NA
 5527207 5527208 PTH_0964 PTH_0965   Lgt FALSE 0.220 57.000 0.000 NA   NA
 5527210 5527211 PTH_0967 PTH_0968     FALSE 0.156 87.000 0.000 NA   NA
 5527211 5156905 PTH_0968       FALSE 0.003 694.000 0.000 NA   NA
 5527212 5527213 PTH_0969 PTH_0970 IspA CysG TRUE 0.993 23.000 0.050 1.000 Y NA
 5527213 5527214 PTH_0970 PTH_0971 CysG HemA TRUE 0.992 -46.000 0.039 1.000 Y NA
 5527214 5527215 PTH_0971 PTH_0972 HemA HemC TRUE 0.999 9.000 0.178 0.002 Y NA
 5527215 5527216 PTH_0972 PTH_0973 HemC   TRUE 0.997 -7.000 0.056 1.000 Y NA
 5527216 5527217 PTH_0973 PTH_0974     TRUE 0.996 4.000 0.086 1.000   NA
 5527217 5527218 PTH_0974 PTH_0975   HemB TRUE 0.993 14.000 0.056 1.000   NA
 5527218 5527219 PTH_0975 PTH_0976 HemB   TRUE 0.969 41.000 0.070 1.000   NA
 5527219 5527220 PTH_0976 PTH_0977   Lrp TRUE 0.983 -84.000 0.073 NA   NA
 5527220 5527221 PTH_0977 PTH_0978 Lrp Lrp TRUE 0.996 10.000 0.056 NA Y NA
 5527221 5527222 PTH_0978 PTH_0979 Lrp HemL TRUE 0.994 21.000 0.137 NA N NA
 5527222 5527223 PTH_0979 PTH_0980 HemL   FALSE 0.081 195.000 0.000 NA   NA
 5527223 5527224 PTH_0980 PTH_0981   aspA TRUE 0.991 16.000 0.071 NA   NA
 5527224 5527225 PTH_0981 PTH_0982 aspA   TRUE 0.998 5.000 0.171 1.000   NA
 5527225 5527226 PTH_0982 PTH_0983   BioB TRUE 0.837 65.000 0.017 1.000   NA
 5527226 5527227 PTH_0983 PTH_0984 BioB thiH TRUE 0.981 49.000 0.036 0.003 Y NA
 5527227 5527228 PTH_0984 PTH_0985 thiH   FALSE 0.092 234.000 0.000 1.000   NA
 5527228 5527229 PTH_0985 PTH_0986     TRUE 0.971 10.000 0.004 NA   NA
 5527230 5527231 PTH_0987 PTH_0988     TRUE 0.998 16.000 0.569 NA   NA
 5527231 5527232 PTH_0988 PTH_0989   RssA FALSE 0.292 117.000 0.000 1.000   NA
 5527232 5527233 PTH_0989 PTH_0990 RssA   FALSE 0.157 86.000 0.000 NA   NA
 5156931 5156932         TRUE 0.519 31.000 0.000 NA   NA
 5156932 5156933         TRUE 0.743 15.000 0.000 NA   NA
 5527237 5527238 PTH_0994 PTH_0995     FALSE 0.117 217.000 0.000 1.000   NA
 5527239 5527240 PTH_0996 PTH_0997 CysI   TRUE 0.998 11.000 0.300 NA   NA
 5527240 5527241 PTH_0997 PTH_0998     FALSE 0.196 64.000 0.000 NA   NA
 5527241 5527242 PTH_0998 PTH_0999     FALSE 0.021 299.000 0.000 NA   NA
 5527242 5527243 PTH_0999 PTH_1000   CooC TRUE 0.800 6.000 0.000 NA   NA
 5527243 5527244 PTH_1000 PTH_1001 CooC CdhE TRUE 0.815 30.000 0.000 1.000 N NA
 5527244 5527245 PTH_1001 PTH_1002 CdhE   TRUE 0.997 46.000 0.800 0.041   NA
 5527245 5527246 PTH_1002 PTH_1003   CdhD TRUE 0.868 15.000 0.000 1.000   NA
 5527246 5527247 PTH_1003 PTH_1004 CdhD MetH TRUE 0.977 57.000 0.259 1.000   NA
 5527247 5527248 PTH_1004 PTH_1005 MetH   FALSE 0.267 50.000 0.000 NA   NA
 5527248 5527249 PTH_1005 PTH_1006   MetF TRUE 0.998 -3.000 0.333 NA   NA
 5527251 5527252 PTH_1008 PTH_1009 PckA DnaD FALSE 0.057 271.000 0.000 NA N NA
 5527252 5527253 PTH_1009 PTH_1010 DnaD   TRUE 0.991 29.000 0.081 NA Y NA
 5527253 5527254 PTH_1010 PTH_1011   SleB TRUE 0.957 83.000 0.150 1.000 N NA
 5527256 5527257 PTH_1013 PTH_1014 MrcB   FALSE 0.005 517.000 0.000 NA   NA
 5527259 5527260 PTH_1016 PTH_1017 SdhC SdhA TRUE 0.996 0.000 0.020 0.002   NA
 5527260 5527261 PTH_1017 PTH_1018 SdhA sdhB TRUE 0.998 30.000 0.153 0.002 Y NA
 5527261 5527262 PTH_1018 PTH_1019 sdhB DppA FALSE 0.058 270.000 0.000 NA N NA
 5527262 5527263 PTH_1019 PTH_1020 DppA TyrS FALSE 0.270 119.000 0.000 NA N NA
 5527263 5527264 PTH_1020 PTH_1021 TyrS   TRUE 0.755 142.000 0.022 NA   NA
 5527264 5156963 PTH_1021       FALSE 0.004 633.000 0.000 NA   NA
 5156963 5156964   PTH_r005     FALSE 0.032 259.000 0.000 NA   NA
 5156964 5156965 PTH_r005       FALSE 0.151 131.000 0.000 NA   NA
 5156965 5527265   PTH_1022   PaaI FALSE 0.251 52.000 0.000 NA   NA
 5527267 5527268 PTH_1024 PTH_1025   RuvC TRUE 0.964 68.000 0.277 NA   NA
 5527268 5527269 PTH_1025 PTH_1026 RuvC RuvA TRUE 0.999 -48.000 0.451 0.015 Y NA
 5527269 5527270 PTH_1026 PTH_1027 RuvA ruvB TRUE 0.996 119.000 0.549 0.003 Y NA
 5527270 5527271 PTH_1027 PTH_1028 ruvB   TRUE 0.418 244.000 0.024 NA   NA
 5527271 5527272 PTH_1028 PTH_1029     TRUE 0.994 -3.000 0.069 NA   NA
 5527272 5527273 PTH_1029 PTH_1030   SpoIID TRUE 0.806 141.000 0.038 NA   NA
 5527273 5527274 PTH_1030 PTH_1031 SpoIID QueA TRUE 0.863 66.000 0.016 1.000 N NA
 5527274 5527275 PTH_1031 PTH_1032 QueA Tgt TRUE 0.994 151.000 0.360 0.001 Y NA
 5527275 5527276 PTH_1032 PTH_1033 Tgt YajC TRUE 0.971 86.000 0.325 NA N NA
 5527276 5527277 PTH_1033 PTH_1034 YajC   TRUE 0.680 137.000 0.009 NA   NA
 5527277 5527278 PTH_1034 PTH_1035   secD TRUE 0.972 39.000 0.071 1.000   NA
 5527278 5527279 PTH_1035 PTH_1036 secD secF TRUE 1.000 17.000 0.516 0.001 Y NA
 5527279 5527280 PTH_1036 PTH_1037 secF   FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 5527280 5527281 PTH_1037 PTH_1038     TRUE 0.998 7.000 0.314 NA   NA
 5527281 5527282 PTH_1038 PTH_1039   UspA TRUE 0.570 101.000 0.000 1.000 Y NA
 5527284 5527285 PTH_1041 PTH_1042 MMT1 ArsR FALSE 0.161 79.000 0.000 NA   NA
 5527285 5527286 PTH_1042 PTH_1043 ArsR   TRUE 0.620 -54.000 0.000 NA   NA
 5527286 5527287 PTH_1043 PTH_1044   Apt TRUE 0.997 7.000 0.128 1.000 N NA
 5527287 5527288 PTH_1044 PTH_1045 Apt SpoT TRUE 0.994 17.000 0.068 1.000 N NA
 5527288 5527289 PTH_1045 PTH_1046 SpoT Dtd TRUE 0.997 16.000 0.177 1.000 N NA
 5527289 5527290 PTH_1046 PTH_1047 Dtd GloB TRUE 0.986 22.000 0.048 1.000   NA
 5527290 5527291 PTH_1047 PTH_1048 GloB HisS FALSE 0.014 460.000 0.000 1.000   NA
 5527291 5527292 PTH_1048 PTH_1049 HisS aspS TRUE 0.998 26.000 0.161 0.040 Y NA
 5527292 5527293 PTH_1049 PTH_1050 aspS   FALSE 0.331 294.000 0.008 1.000 N NA
 5527293 5527294 PTH_1050 PTH_1051   TrxA FALSE 0.322 258.000 0.005 1.000   NA
 5527294 5527295 PTH_1051 PTH_1052 TrxA   FALSE 0.286 143.000 0.000 1.000   NA
 5527295 5527296 PTH_1052 PTH_1053     FALSE 0.040 741.000 0.010 NA N NA
 5527296 5527297 PTH_1053 PTH_1054   NifS TRUE 0.995 16.000 0.108 NA N NA
 5527297 5527298 PTH_1054 PTH_1055 NifS IscU TRUE 0.991 -18.000 0.043 1.000 N NA
 5527298 5527299 PTH_1055 PTH_1056 IscU TrmU TRUE 0.963 50.000 0.073 1.000 N NA
 5527299 5527300 PTH_1056 PTH_1057 TrmU   TRUE 0.630 153.000 0.006 NA   NA
 5527300 5527301 PTH_1057 PTH_1058     TRUE 0.973 24.000 0.036 NA   NA
 5527301 5527302 PTH_1058 PTH_1059   PerM FALSE 0.172 72.000 0.000 NA   NA
 5527302 5527303 PTH_1059 PTH_1060 PerM AlaS TRUE 0.690 159.000 0.015 NA   NA
 5527303 5527304 PTH_1060 PTH_1061 AlaS AlaS TRUE 0.983 27.000 0.010 0.001   NA
 5527306 5527307 PTH_1063 PTH_1064   Tas TRUE 0.980 26.000 0.059 NA   NA
 5527307 5527308 PTH_1064 PTH_1065 Tas   TRUE 0.995 6.000 0.070 1.000   NA
 5527308 5527309 PTH_1065 PTH_1066     TRUE 0.957 66.000 0.217 NA   NA
 5527309 5527310 PTH_1066 PTH_1067     TRUE 0.907 77.000 0.098 NA   NA
 5527310 5527311 PTH_1067 PTH_1068     TRUE 0.895 119.000 0.091 NA   NA
 5527311 5527312 PTH_1068 PTH_1069     TRUE 0.987 -3.000 0.025 NA   NA
 5527312 5527313 PTH_1069 PTH_1070   FtsI TRUE 0.871 68.000 0.020 1.000 N NA
 5527313 5527314 PTH_1070 PTH_1071 FtsI   TRUE 0.524 55.000 0.000 1.000 N NA
 5527314 5527315 PTH_1071 PTH_1072     TRUE 0.709 17.000 0.000 NA   NA
 5527316 5527317 PTH_1073 PTH_1074     FALSE 0.395 128.000 0.000 1.000 N NA
 5527318 5527319 PTH_1075 PTH_1076   WecC TRUE 0.987 26.000 0.023 1.000 Y NA
 5527319 5527320 PTH_1076 PTH_1077 WecC   TRUE 0.563 -180.000 0.000 NA   NA
 5527320 5527321 PTH_1077 PTH_1078   RfbA FALSE 0.160 80.000 0.000 NA   NA
 5527321 5527322 PTH_1078 PTH_1079 RfbA RfbC TRUE 0.981 36.000 0.038 1.000 Y NA
 5527322 5527323 PTH_1079 PTH_1080 RfbC RfbD TRUE 0.969 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5527323 5527324 PTH_1080 PTH_1081 RfbD RfbB TRUE 0.994 33.000 0.056 0.004 Y NA
 5527324 5527325 PTH_1081 PTH_1082 RfbB   TRUE 0.969 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5527325 5527326 PTH_1082 PTH_1083     TRUE 0.699 -21.000 0.000 NA   NA
 5527327 5527328 PTH_1084 PTH_1085     TRUE 0.820 2.000 0.000 NA   NA
 5527332 5527333 PTH_1089 PTH_1090 DltB SseA FALSE 0.287 77.000 0.000 NA N NA
 5527333 5527334 PTH_1090 PTH_1091 SseA SseA TRUE 0.957 0.000 0.000 NA Y NA
 5527335 5527336 PTH_1092 PTH_1093     FALSE 0.147 146.000 0.000 NA   NA
 5527336 5527337 PTH_1093 PTH_1094   Mrp TRUE 0.927 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5527337 5527338 PTH_1094 PTH_1095 Mrp WcaG TRUE 0.760 34.000 0.000 1.000 N NA
 5527338 5527339 PTH_1095 PTH_1096 WcaG RfaG TRUE 0.988 -27.000 0.012 1.000 Y NA
 5527339 5527340 PTH_1096 PTH_1097 RfaG RfaG TRUE 0.953 -169.000 0.000 0.015 Y NA
 5527340 5527341 PTH_1097 PTH_1098 RfaG   FALSE 0.098 180.000 0.000 NA   NA
 5527341 5527342 PTH_1098 PTH_1099     FALSE 0.174 71.000 0.000 NA   NA
 5527342 5527343 PTH_1099 PTH_1100   WcaJ TRUE 0.995 2.000 0.077 NA   NA
 5527343 5527344 PTH_1100 PTH_1101 WcaJ WcaG TRUE 0.994 20.000 0.077 NA Y NA
 5527344 5527345 PTH_1101 PTH_1102 WcaG   FALSE 0.093 187.000 0.000 NA   NA
 5527345 5527346 PTH_1102 PTH_1103   WecB FALSE 0.103 178.000 0.000 NA   NA
 5527346 5527347 PTH_1103 PTH_1104 WecB RfaG TRUE 0.971 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5527347 5527348 PTH_1104 PTH_1105 RfaG   TRUE 0.646 -37.000 0.000 NA   NA
 5527348 5527349 PTH_1105 PTH_1106   RfaG TRUE 0.745 -12.000 0.000 NA   NA
 5527349 5527350 PTH_1106 PTH_1107 RfaG RfaG TRUE 0.985 -3.000 0.000 0.015 Y NA
 5527350 5527351 PTH_1107 PTH_1108 RfaG MviN TRUE 0.886 11.000 0.000 1.000   NA
 5527351 5527352 PTH_1108 PTH_1109 MviN RfaG TRUE 0.743 -249.000 0.000 1.000   NA
 5527352 5527353 PTH_1109 PTH_1110 RfaG   FALSE 0.235 168.000 0.000 1.000   NA
 5527353 5527354 PTH_1110 PTH_1111   LpxD FALSE 0.036 329.000 0.000 1.000   NA
 5527354 5527355 PTH_1111 PTH_1112 LpxD   TRUE 0.939 -25.000 0.000 1.000 Y NA
 5527355 5527356 PTH_1112 PTH_1113   MviM TRUE 0.746 -174.000 0.000 1.000   NA
 5527356 5527357 PTH_1113 PTH_1114 MviM WecE TRUE 0.958 36.000 0.033 1.000   NA
 5527357 5527358 PTH_1114 PTH_1115 WecE WecE TRUE 0.742 89.000 0.000 0.015 Y NA
 5527359 5527360 PTH_1116 PTH_1117     FALSE 0.002 981.000 0.000 NA   NA
 5527361 5527362 PTH_1118 PTH_1119     TRUE 0.987 0.000 0.000 0.006 Y NA
 5527362 5527363 PTH_1119 PTH_1120     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.006   NA
 5527363 5527364 PTH_1120 PTH_1121     FALSE 0.134 157.000 0.000 NA   NA
 5527366 5527367 PTH_1123 PTH_1124     TRUE 0.792 7.000 0.000 NA   NA
 5527367 5527368 PTH_1124 PTH_1125     FALSE 0.011 384.000 0.000 NA   NA
 5527370 5527371 PTH_1127 PTH_1128 MobA   TRUE 0.775 -7.000 0.000 NA   NA
 5527371 5527372 PTH_1128 PTH_1129   AroE TRUE 0.983 -16.000 0.036 NA   NA
 5527372 5527373 PTH_1129 PTH_1130 AroE AroC TRUE 0.964 37.000 0.009 1.000 Y NA
 5527373 5527374 PTH_1130 PTH_1131 AroC AroK TRUE 0.993 5.000 0.008 1.000 Y NA
 5527374 5527375 PTH_1131 PTH_1132 AroK AroB TRUE 0.982 70.000 0.208 1.000 Y NA
 5527377 5527378 PTH_1134 PTH_1135 PulE PilT TRUE 0.994 25.000 0.028 0.005 Y NA
 5527378 5527379 PTH_1135 PTH_1136 PilT PulF TRUE 0.990 138.000 0.493 1.000 Y NA
 5527379 5527380 PTH_1136 PTH_1137 PulF FimT TRUE 0.870 27.000 0.000 NA Y NA
 5527380 5527381 PTH_1137 PTH_1138 FimT PulG TRUE 0.769 12.000 0.000 NA   NA
 5527381 5527382 PTH_1138 PTH_1139 PulG   TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 5527382 5527383 PTH_1139 PTH_1140     TRUE 0.519 31.000 0.000 NA   NA
 5527383 5527384 PTH_1140 PTH_1141   PilM TRUE 0.571 28.000 0.000 NA   NA
 5527384 5527385 PTH_1141 PTH_1142 PilM   TRUE 0.989 -3.000 0.036 NA   NA
 5527385 5527386 PTH_1142 PTH_1143   PilO TRUE 0.786 8.000 0.000 NA   NA
 5527386 5527387 PTH_1143 PTH_1144 PilO PulO TRUE 0.817 3.000 0.000 NA   NA
 5527387 5527388 PTH_1144 PTH_1145 PulO PulE FALSE 0.070 396.000 0.000 1.000 Y NA
 5527388 5527389 PTH_1145 PTH_1146 PulE PilT TRUE 1.000 -3.000 0.385 0.005 Y NA
 5527389 5527390 PTH_1146 PTH_1147 PilT PulF TRUE 0.977 43.000 0.048 1.000 Y NA
 5527390 5527391 PTH_1147 PTH_1148 PulF FliA TRUE 0.992 5.000 0.017 1.000 N NA
 5527391 5527392 PTH_1148 PTH_1149 FliA PilM TRUE 0.921 43.000 0.009 1.000 N NA
 5527392 5527393 PTH_1149 PTH_1150 PilM   TRUE 0.987 3.000 0.023 NA   NA
 5527393 5527394 PTH_1150 PTH_1151   PilO TRUE 0.988 0.000 0.023 NA   NA
 5527398 5527399 PTH_1155 PTH_1156     TRUE 0.433 36.000 0.000 NA   NA
 5527399 5527400 PTH_1156 PTH_1157     FALSE 0.155 89.000 0.000 NA   NA
 5527400 5527401 PTH_1157 PTH_1158   TldD TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 5527401 5527402 PTH_1158 PTH_1159 TldD TldD FALSE 0.278 486.000 0.146 NA   NA
 5527402 5527403 PTH_1159 PTH_1160 TldD AroQ TRUE 0.720 80.000 0.014 NA   NA
 5527403 5527404 PTH_1160 PTH_1161 AroQ PepP TRUE 0.998 13.000 0.168 1.000 Y NA
 5527404 5527405 PTH_1161 PTH_1162 PepP Efp TRUE 0.990 36.000 0.160 1.000 N NA
 5527405 5527406 PTH_1162 PTH_1163 Efp   TRUE 0.809 114.000 0.037 NA   NA
 5527406 5527407 PTH_1163 PTH_1164   HcaD TRUE 0.810 103.000 0.038 NA   NA
 5527407 5527408 PTH_1164 PTH_1165 HcaD   FALSE 0.070 205.000 0.000 NA   NA
 5527408 5527409 PTH_1165 PTH_1166   SpoIIIAA TRUE 0.775 -7.000 0.000 NA   NA
 5527409 5527410 PTH_1166 PTH_1167 SpoIIIAA   TRUE 0.999 -6.000 0.604 NA   NA
 5527410 5527411 PTH_1167 PTH_1168     TRUE 0.999 -25.000 0.926 NA   NA
 5527411 5527412 PTH_1168 PTH_1169     TRUE 0.998 28.000 0.895 NA   NA
 5527412 5527413 PTH_1169 PTH_1170     TRUE 0.987 95.000 0.864 NA   NA
 5527413 5527414 PTH_1170 PTH_1171     TRUE 0.998 25.000 0.918 NA   NA
 5527414 5527415 PTH_1171 PTH_1172     TRUE 0.999 20.000 0.907 NA   NA
 5527415 5527416 PTH_1172 PTH_1173     TRUE 0.999 6.000 0.407 NA   NA
 5527416 5527417 PTH_1173 PTH_1174     TRUE 0.649 206.000 0.043 NA   NA
 5527417 5527418 PTH_1174 PTH_1175     TRUE 0.997 26.000 0.109 0.002 N NA
 5527418 5527419 PTH_1175 PTH_1176     TRUE 0.967 131.000 0.373 NA   NA
 5527419 5527420 PTH_1176 PTH_1177     TRUE 0.865 51.000 0.024 NA   NA
 5527420 5527421 PTH_1177 PTH_1178     TRUE 0.974 23.000 0.036 NA   NA
 5527421 5527422 PTH_1178 PTH_1179   NusB TRUE 0.913 46.000 0.038 NA   NA
 5527422 5527423 PTH_1179 PTH_1180 NusB UbiB TRUE 0.768 103.000 0.004 1.000 N NA
 5527423 5527424 PTH_1180 PTH_1181 UbiB GltD TRUE 1.000 0.000 0.692 0.055 N NA
 5527424 5527425 PTH_1181 PTH_1182 GltD XseA TRUE 0.899 46.000 0.006 1.000 N NA
 5527425 5527426 PTH_1182 PTH_1183 XseA FolD TRUE 0.973 21.000 0.004 1.000 N NA
 5527426 5527427 PTH_1183 PTH_1184 FolD   TRUE 0.998 -3.000 0.149 1.000 N NA
 5527429 5527430 PTH_1186 PTH_1187 DUR1   TRUE 0.999 30.000 0.400 0.001 Y NA
 5527430 5527431 PTH_1187 PTH_1188     TRUE 0.570 41.000 0.000 1.000   NA
 5527431 5527432 PTH_1188 PTH_1189   PycA TRUE 0.562 29.000 0.000 NA   NA
 5527432 5527433 PTH_1189 PTH_1190 PycA AccC TRUE 0.604 25.000 0.000 NA   NA
 5527433 5527434 PTH_1190 PTH_1191 AccC   FALSE 0.357 42.000 0.000 NA   NA
 5527434 5527435 PTH_1191 PTH_1192   RocR FALSE 0.090 189.000 0.000 NA   NA
 5527435 5527436 PTH_1192 PTH_1193 RocR XseB FALSE 0.402 108.000 0.000 1.000 N NA
 5527436 5527437 PTH_1193 PTH_1194 XseB IspA TRUE 0.992 -13.000 0.041 1.000 N NA
 5527437 5527438 PTH_1194 PTH_1195 IspA   FALSE 0.002 875.000 0.000 NA   NA
 5527438 5527439 PTH_1195 PTH_1196   Dxs TRUE 0.997 4.000 0.167 NA   NA
 5527439 5527440 PTH_1196 PTH_1197 Dxs   TRUE 0.920 61.000 0.042 1.000 N NA
 5527440 5527441 PTH_1197 PTH_1198     TRUE 0.993 26.000 0.120 1.000 N NA
 5527441 5527442 PTH_1198 PTH_1199   GCD14 TRUE 0.974 -19.000 0.006 1.000   NA
 5527442 5527443 PTH_1199 PTH_1200 GCD14 ArgR TRUE 0.993 -3.000 0.038 1.000   NA
 5527443 5527444 PTH_1200 PTH_1201 ArgR RecN TRUE 0.997 6.000 0.086 1.000 N NA
 5527444 5527445 PTH_1201 PTH_1202 RecN   TRUE 0.664 257.000 0.079 1.000   NA
 5527445 5527446 PTH_1202 PTH_1203   CitB TRUE 0.972 160.000 0.393 1.000   NA
 5527446 5527447 PTH_1203 PTH_1204 CitB   FALSE 0.221 174.000 0.000 1.000   NA
 5527447 5527448 PTH_1204 PTH_1205   PorA TRUE 0.997 -3.000 0.048 0.004   NA
 5527448 5527449 PTH_1205 PTH_1206 PorA PorB TRUE 1.000 -3.000 0.822 0.004 Y NA
 5527449 5527450 PTH_1206 PTH_1207 PorB PorG TRUE 1.000 3.000 0.797 0.004 Y NA
 5527450 5527451 PTH_1207 PTH_1208 PorG PepD TRUE 0.990 8.000 0.015 1.000 N NA
 5527451 5527452 PTH_1208 PTH_1209 PepD SpoIIM FALSE 0.150 142.000 0.000 NA   NA
 5527452 5527453 PTH_1209 PTH_1210 SpoIIM XerD FALSE 0.154 117.000 0.000 NA   NA
 5527453 5527454 PTH_1210 PTH_1211 XerD DeoB TRUE 0.911 116.000 0.054 1.000 N NA
 5527454 5527455 PTH_1211 PTH_1212 DeoB DeoA TRUE 0.915 80.000 0.054 1.000 N NA
 5527456 5527457 PTH_1213 PTH_1214   DltB FALSE 0.011 373.000 0.000 NA   NA
 5527457 5527458 PTH_1214 PTH_1215 DltB   TRUE 0.800 6.000 0.000 NA   NA
 5527459 5527460 PTH_1216 PTH_1217     FALSE 0.034 255.000 0.000 NA   NA
 5527460 5527461 PTH_1217 PTH_1218     FALSE 0.153 106.000 0.000 NA   NA
 5527461 5527462 PTH_1218 PTH_1219     TRUE 0.944 80.000 0.200 NA   NA
 5527462 5527463 PTH_1219 PTH_1220     FALSE 0.134 157.000 0.000 NA   NA
 5527463 5527464 PTH_1220 PTH_1221   ExeA TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 5527466 5527467 PTH_1223 PTH_1224 DacC SpoIIAA TRUE 0.974 117.000 0.276 1.000 N NA
 5527467 5527468 PTH_1224 PTH_1225 SpoIIAA RsbW TRUE 1.000 3.000 0.669 0.003 Y NA
 5527468 5527469 PTH_1225 PTH_1226 RsbW FliA TRUE 0.999 17.000 0.842 1.000 N NA
 5527469 5527470 PTH_1226 PTH_1227 FliA   TRUE 0.786 173.000 0.049 NA   NA
 5527470 5527471 PTH_1227 PTH_1228     TRUE 0.927 131.000 0.157 NA   NA
 5527471 5527472 PTH_1228 PTH_1229     TRUE 0.998 13.000 0.386 NA   NA
 5527472 5527473 PTH_1229 PTH_1230     TRUE 0.997 19.000 0.386 NA   NA
 5527473 5527474 PTH_1230 PTH_1231   GerA TRUE 0.994 6.000 0.071 NA   NA
 5527474 5527475 PTH_1231 PTH_1232 GerA   FALSE 0.151 136.000 0.000 NA   NA
 5527475 5527476 PTH_1232 PTH_1233     TRUE 0.995 29.000 0.364 NA   NA
 5527476 5527477 PTH_1233 PTH_1234     TRUE 0.998 -3.000 0.273 NA   NA
 5527477 5527478 PTH_1234 PTH_1235   LysA FALSE 0.101 222.000 0.000 NA N NA
 5527478 5527479 PTH_1235 PTH_1236 LysA   TRUE 0.807 128.000 0.011 1.000 N NA
 5527479 5527480 PTH_1236 PTH_1237   SpoIVFB TRUE 0.997 2.000 0.094 1.000   NA
 5527480 5527481 PTH_1237 PTH_1238 SpoIVFB TrpS TRUE 0.919 47.000 0.026 1.000   NA
 5527483 5527484 PTH_1240 PTH_1241     TRUE 0.988 27.000 0.133 NA   NA
 5527484 5527485 PTH_1241 PTH_1242     FALSE 0.148 145.000 0.000 NA   NA
 5527485 5527486 PTH_1242 PTH_1243   CDC9 TRUE 0.985 41.000 0.190 1.000   NA
 5527486 5527487 PTH_1243 PTH_1244 CDC9   TRUE 0.978 19.000 0.000 0.001 Y NA
 5527487 5527488 PTH_1244 PTH_1245   Smf TRUE 0.979 25.000 0.004 1.000 Y NA
 5527488 5527489 PTH_1245 PTH_1246 Smf TopA TRUE 0.982 82.000 0.238 1.000 Y NA
 5527489 5527490 PTH_1246 PTH_1247 TopA Gid TRUE 0.965 63.000 0.137 1.000 N NA
 5527490 5527491 PTH_1247 PTH_1248 Gid XerD TRUE 0.976 46.000 0.105 1.000 N NA
 5527491 5527492 PTH_1248 PTH_1249 XerD HslV TRUE 0.946 92.000 0.113 1.000 N NA
 5527492 5527493 PTH_1249 PTH_1250 HslV hslU TRUE 0.999 25.000 0.752 1.000 Y NA
 5527493 5527494 PTH_1250 PTH_1251 hslU CodY TRUE 0.995 20.000 0.131 1.000 N NA
 5527494 5527495 PTH_1251 PTH_1252 CodY RpsB TRUE 0.552 213.000 0.006 1.000 N NA
 5527495 5527496 PTH_1252 PTH_1253 RpsB tsf TRUE 0.986 155.000 0.748 1.000   NA
 5527496 5527497 PTH_1253 PTH_1254 tsf PyrH TRUE 0.984 63.000 0.416 1.000   NA
 5527497 5527498 PTH_1254 PTH_1255 PyrH Frr TRUE 0.999 -10.000 0.626 1.000 N NA
 5527498 5527499 PTH_1255 PTH_1256 Frr   FALSE 0.142 206.000 0.000 1.000   NA
 5527499 5527500 PTH_1256 PTH_1257   UppS FALSE 0.381 59.000 0.000 1.000   NA
 5527500 5527501 PTH_1257 PTH_1258 UppS CdsA TRUE 0.997 26.000 0.400 1.000   NA
 5527501 5527502 PTH_1258 PTH_1259 CdsA PerM TRUE 0.976 15.000 0.015 NA   NA
 5527502 5527503 PTH_1259 PTH_1260 PerM Dxr TRUE 0.903 43.000 0.023 NA   NA
 5527503 5527504 PTH_1260 PTH_1261 Dxr   TRUE 0.999 19.000 0.568 1.000 N NA
 5527504 5527505 PTH_1261 PTH_1262   GcpE TRUE 0.937 96.000 0.092 1.000 N NA
 5527505 5527506 PTH_1262 PTH_1263 GcpE ProS TRUE 0.983 34.000 0.066 1.000 N NA
 5527506 5527507 PTH_1263 PTH_1264 ProS MurG TRUE 0.761 116.000 0.002 1.000 N NA
 5527507 5527508 PTH_1264 PTH_1265 MurG   FALSE 0.048 228.000 0.000 NA   NA
 5527508 5527509 PTH_1265 PTH_1266   nusA TRUE 0.998 22.000 0.759 NA   NA
 5527509 5527510 PTH_1266 PTH_1267 nusA   TRUE 0.999 12.000 0.323 NA Y NA
 5527510 5527511 PTH_1267 PTH_1268   RPL8A TRUE 0.991 45.000 0.408 NA N NA
 5527511 5527512 PTH_1268 PTH_1269 RPL8A InfB TRUE 0.999 6.000 0.223 NA Y NA
 5527512 5527513 PTH_1269 PTH_1270 InfB RbfA TRUE 0.991 145.000 0.530 1.000 Y NA
 5527513 5527514 PTH_1270 PTH_1271 RbfA   TRUE 0.997 -7.000 0.173 1.000   NA
 5527514 5527515 PTH_1271 PTH_1272   TruB TRUE 0.998 -3.000 0.221 1.000   NA
 5527515 5527516 PTH_1272 PTH_1273 TruB RibF TRUE 0.999 -3.000 0.308 1.000 N NA
 5527516 5527517 PTH_1273 PTH_1274 RibF RpsO FALSE 0.203 741.000 0.119 1.000 N NA
 5527517 5527518 PTH_1274 PTH_1275 RpsO Pnp TRUE 0.985 151.000 0.335 1.000 Y NA
 5527518 5527519 PTH_1275 PTH_1276 Pnp CDA1 TRUE 0.901 112.000 0.048 1.000 N NA
 5527519 5527520 PTH_1276 PTH_1277 CDA1 DacC TRUE 0.939 109.000 0.094 1.000 N NA
 5527520 5527521 PTH_1277 PTH_1278 DacC PqqL TRUE 0.888 99.000 0.023 0.020   NA
 5527521 5527522 PTH_1278 PTH_1279 PqqL Dut TRUE 0.868 107.000 0.045 1.000   NA
 5527522 5527523 PTH_1279 PTH_1280 Dut   TRUE 0.669 131.000 0.008 NA   NA
 5527523 5527524 PTH_1280 PTH_1281     TRUE 0.987 33.000 0.185 NA   NA
 5527524 5527525 PTH_1281 PTH_1282     FALSE 0.123 165.000 0.000 NA   NA
 5527525 5527526 PTH_1282 PTH_1283   DapB FALSE 0.003 732.000 0.000 NA   NA
 5527526 5527527 PTH_1283 PTH_1284 DapB   TRUE 0.751 87.000 0.009 1.000   NA
 5527527 5527528 PTH_1284 PTH_1285   spoVFB TRUE 0.997 -105.000 0.373 1.000   NA
 5527528 5527529 PTH_1285 PTH_1286 spoVFB Asd TRUE 0.871 119.000 0.031 1.000 N NA
 5527529 5527530 PTH_1286 PTH_1287 Asd LysC TRUE 0.952 81.000 0.065 1.000 Y NA
 5527530 5527531 PTH_1287 PTH_1288 LysC DapA TRUE 0.999 6.000 0.182 1.000 Y NA
 5527531 5527532 PTH_1288 PTH_1289 DapA   TRUE 0.672 251.000 0.074 1.000   NA
 5527532 5527533 PTH_1289 PTH_1290   ClpP TRUE 0.834 107.000 0.029 1.000   NA
 5527533 5527534 PTH_1290 PTH_1291 ClpP   TRUE 0.993 -28.000 0.157 NA   NA
 5527534 5527535 PTH_1291 PTH_1292   BacA FALSE 0.107 176.000 0.000 NA   NA
 5527535 5527536 PTH_1292 PTH_1293 BacA FtsK TRUE 0.832 104.000 0.016 1.000 N NA
 5527536 5527537 PTH_1293 PTH_1294 FtsK   TRUE 0.779 100.000 0.028 NA   NA
 5527537 5527538 PTH_1294 PTH_1295     TRUE 0.982 -9.000 0.020 NA   NA
 5527538 5527539 PTH_1295 PTH_1296   MiaB FALSE 0.074 532.000 0.009 1.000   NA
 5527539 5527540 PTH_1296 PTH_1297 MiaB PgsA TRUE 0.998 -3.000 0.132 1.000 N NA
 5527540 5527541 PTH_1297 PTH_1298 PgsA   TRUE 0.662 133.000 0.007 NA   NA
 5527541 5527542 PTH_1298 PTH_1299   HflB TRUE 0.998 -91.000 0.938 NA   NA
 5527542 5527543 PTH_1299 PTH_1300 HflB   TRUE 0.791 107.000 0.016 1.000   NA
 5527543 5527544 PTH_1300 PTH_1301   RecA TRUE 0.712 239.000 0.083 1.000   NA
 5527544 5527545 PTH_1301 PTH_1302 RecA   FALSE 0.213 362.000 0.018 1.000   NA
 5527545 5527546 PTH_1302 PTH_1303     TRUE 0.762 87.000 0.022 NA   NA
 5527546 5527547 PTH_1303 PTH_1304     TRUE 0.981 17.000 0.031 NA   NA
 5527547 5527548 PTH_1304 PTH_1305   SpoVS TRUE 0.918 146.000 0.139 NA   NA
 5527548 5527549 PTH_1305 PTH_1306 SpoVS   TRUE 0.837 95.000 0.049 NA   NA
 5527549 5527550 PTH_1306 PTH_1307     TRUE 0.939 32.000 0.007 1.000   NA
 5527550 5527551 PTH_1307 PTH_1308     TRUE 0.763 73.000 0.007 1.000   NA
 5527551 5527552 PTH_1308 PTH_1309     TRUE 0.915 87.000 0.120 NA   NA
 5527552 5527553 PTH_1309 PTH_1310     TRUE 0.916 184.000 0.231 NA   NA
 5527553 5527554 PTH_1310 PTH_1311   CobU FALSE 0.150 99.000 0.000 NA   NA
 5527554 5527555 PTH_1311 PTH_1312 CobU CbiB TRUE 0.822 178.000 0.013 1.000 Y NA
 5527555 5527556 PTH_1312 PTH_1313 CbiB CobS TRUE 0.955 66.000 0.020 0.017 Y NA
 5527556 5527557 PTH_1313 PTH_1314 CobS HisC TRUE 0.925 58.000 0.011 0.017 N NA
 5527557 5527558 PTH_1314 PTH_1315 HisC GpmB TRUE 0.998 1.000 0.189 1.000 N NA
 5527558 5527559 PTH_1315 PTH_1316 GpmB   FALSE 0.023 294.000 0.000 NA   NA
 5527559 5527560 PTH_1316 PTH_1317     FALSE 0.152 93.000 0.000 NA   NA
 5527560 5527561 PTH_1317 PTH_1318     TRUE 0.922 137.000 0.143 NA   NA
 5527563 5527564 PTH_1320 PTH_1321 PspA   FALSE 0.002 852.000 0.000 NA   NA
 5527564 5527565 PTH_1321 PTH_1322     FALSE 0.003 705.000 0.000 NA   NA
 5527565 5527566 PTH_1322 PTH_1323   CsdB FALSE 0.072 202.000 0.000 NA   NA
 5527567 5527568 PTH_1324 PTH_1325 BtuR   TRUE 0.943 0.000 0.000 1.000 N NA
 5527568 5527569 PTH_1325 PTH_1326     TRUE 0.989 28.000 0.143 NA   NA
 5527569 5527570 PTH_1326 PTH_1327     TRUE 0.999 -12.000 0.800 NA   NA
 5527570 5527571 PTH_1327 PTH_1328   IbpA FALSE 0.045 231.000 0.000 NA   NA
 5527574 5527575 PTH_1331 PTH_1332 GalT GlgA FALSE 0.267 50.000 0.000 NA   NA
 5527576 5527577 PTH_1333 PTH_1334     TRUE 0.821 1.000 0.000 NA   NA
 5527578 5527579 PTH_1335 PTH_1336 CitE UspA FALSE 0.384 148.000 0.000 1.000 N NA
 5527581 5527582 PTH_1338 PTH_1339 MiaB MutS TRUE 0.993 12.000 0.041 1.000 N NA
 5527582 5527583 PTH_1339 PTH_1340 MutS HyuA TRUE 0.976 22.000 0.010 1.000 N NA
 5527583 5527584 PTH_1340 PTH_1341 HyuA AcuC TRUE 0.998 -27.000 0.255 NA Y NA
 5527584 5527585 PTH_1341 PTH_1342 AcuC MutL TRUE 0.980 14.000 0.009 NA N NA
 5527585 5527586 PTH_1342 PTH_1343 MutL   FALSE 0.352 282.000 0.031 NA   NA
 5527586 5527587 PTH_1343 PTH_1344   MiaA TRUE 0.992 8.000 0.060 NA   NA
 5527587 5527588 PTH_1344 PTH_1345 MiaA Hfq TRUE 0.967 61.000 0.192 1.000   NA
 5527588 5527589 PTH_1345 PTH_1346 Hfq SpoVK FALSE 0.288 100.000 0.000 1.000   NA
 5527589 5527590 PTH_1346 PTH_1347 SpoVK   TRUE 0.882 46.000 0.009 1.000   NA
 5527590 5527591 PTH_1347 PTH_1348   LysR FALSE 0.400 106.000 0.000 1.000 N NA
 5527591 5527592 PTH_1348 PTH_1349 LysR CitA TRUE 0.576 106.000 0.000 0.057 N NA
 5527592 5527593 PTH_1349 PTH_1350 CitA CitB TRUE 0.999 32.000 0.500 0.057 Y NA
 5527593 5527594 PTH_1350 PTH_1351 CitB DctP TRUE 0.999 17.000 0.500 1.000 N NA
 5527595 5527596 PTH_1352 PTH_1353   LexA TRUE 0.493 60.000 0.000 1.000 N NA
 5527597 5527598 PTH_1354 PTH_1355   MmcA FALSE 0.287 129.000 0.000 1.000   NA
 5527598 5527599 PTH_1355 PTH_1356 MmcA MmcB FALSE 0.093 275.000 0.000 1.000 N NA
 5527599 5527600 PTH_1356 PTH_1357 MmcB MmcC TRUE 0.995 56.000 0.262 0.001 Y NA
 5527600 5527601 PTH_1357 PTH_1358 MmcC MmcD1 FALSE 0.048 453.000 0.000 1.000 Y NA
 5527601 5527602 PTH_1358 PTH_1359 MmcD1 MmcD2 TRUE 0.671 66.000 0.000 0.001   NA
 5527602 5527603 PTH_1359 PTH_1360 MmcD2 MmcD2 TRUE 0.836 41.000 0.000 0.001   NA
 5527603 5527604 PTH_1360 PTH_1361 MmcD2 MmcE TRUE 0.854 31.000 0.000 0.045   NA
 5527604 5527605 PTH_1361 PTH_1362 MmcE MmcF TRUE 0.999 17.000 0.183 0.001 Y NA
 5527605 5527606 PTH_1362 PTH_1363 MmcF MmcG TRUE 0.842 134.000 0.019 1.000 N NA
 5527606 5527607 PTH_1363 PTH_1364 MmcG MmcH TRUE 0.996 16.000 0.108 1.000 N NA
 5527607 5527608 PTH_1364 PTH_1365 MmcH MmcI TRUE 0.462 34.000 0.000 NA   NA
 5527608 5527609 PTH_1365 PTH_1366 MmcI MmcJ FALSE 0.290 48.000 0.000 NA   NA
 5527609 5527610 PTH_1366 PTH_1367 MmcJ MmcK FALSE 0.402 90.000 0.000 1.000 N NA
 5527610 5527611 PTH_1367 PTH_1368 MmcK MmcL TRUE 0.836 38.000 0.000 1.000 Y NA
 5527611 5527612 PTH_1368 PTH_1369 MmcL MmcM TRUE 0.568 127.000 0.000 1.000 Y NA
 5527612 5527613 PTH_1369 PTH_1370 MmcM   FALSE 0.107 225.000 0.000 1.000   NA
 5527616 5527617 PTH_1373 PTH_1374   TagG TRUE 0.643 22.000 0.000 NA   NA
 5527617 5527618 PTH_1374 PTH_1375 TagG CcmA TRUE 0.998 3.000 0.169 1.000   NA
 5527620 5527621 PTH_1377 PTH_1378   NuoF TRUE 0.997 -58.000 0.143 0.003   NA
 5527621 5527622 PTH_1378 PTH_1379 NuoF NuoE TRUE 0.999 -19.000 0.154 0.009 Y NA
 5527622 5527623 PTH_1379 PTH_1380 NuoE ZnuB FALSE 0.396 121.000 0.000 1.000 N NA
 5527623 5527624 PTH_1380 PTH_1381 ZnuB ZnuC TRUE 0.999 16.000 0.286 1.000 Y NA
 5527624 5527625 PTH_1381 PTH_1382 ZnuC LraI TRUE 1.000 -3.000 0.600 1.000 Y NA
 5527625 5527626 PTH_1382 PTH_1383 LraI Fur TRUE 0.938 62.000 0.031 1.000 Y NA
 5527626 5527627 PTH_1383 PTH_1384 Fur RfaG FALSE 0.315 174.000 0.000 1.000 N NA
 5527627 5527628 PTH_1384 PTH_1385 RfaG   FALSE 0.059 276.000 0.000 1.000   NA
 5527628 5527629 PTH_1385 PTH_1386   PfkA TRUE 0.453 50.000 0.000 1.000   NA
 5527629 5527630 PTH_1386 PTH_1387 PfkA   TRUE 0.637 198.000 0.016 1.000   NA
 5527630 5527631 PTH_1387 PTH_1388     FALSE 0.009 546.000 0.000 1.000   NA
 5527631 5527632 PTH_1388 PTH_1389   DeoC FALSE 0.130 242.000 0.000 1.000 N NA
 5527632 5527633 PTH_1389 PTH_1390 DeoC DdlA TRUE 0.934 22.000 0.000 0.038 N NA
 5157335 5527634   PTH_1391   XerD FALSE 0.150 124.000 0.000 NA   NA
 5527635 5527636 PTH_1392 PTH_1393     FALSE 0.009 418.000 0.000 NA   NA
 5527636 5527637 PTH_1393 PTH_1394     FALSE 0.002 787.000 0.000 NA   NA
 5527640 5527641 PTH_1397 PTH_1398 SurE   TRUE 0.988 12.000 0.043 NA   NA
 5527641 5527642 PTH_1398 PTH_1399   FolE TRUE 0.925 52.000 0.065 NA   NA
 5527642 5527643 PTH_1399 PTH_1400 FolE NrdG TRUE 0.984 24.000 0.033 1.000 N NA
 5527643 5527644 PTH_1400 PTH_1401 NrdG   TRUE 0.998 2.000 0.207 NA   NA
 5527644 5527645 PTH_1401 PTH_1402     TRUE 0.970 22.000 0.023 NA   NA
 5527645 5527646 PTH_1402 PTH_1403     TRUE 0.979 3.000 0.005 NA   NA
 5527648 5527649 PTH_1405 PTH_1406 UbiB   TRUE 0.998 -7.000 0.167 0.031   NA
 5527649 5527650 PTH_1406 PTH_1407   RnfC TRUE 0.999 16.000 0.333 0.031   NA
 5527650 5527651 PTH_1407 PTH_1408 RnfC FlpD TRUE 0.999 -3.000 0.500 1.000   NA
 5527651 5527652 PTH_1408 PTH_1409 FlpD FrhD TRUE 0.652 70.000 0.000 0.001   NA
 5527652 5527653 PTH_1409 PTH_1410 FrhD HdrA TRUE 0.880 -9.000 0.000 1.000   NA
 5527653 5527654 PTH_1410 PTH_1411 HdrA HdrA TRUE 0.934 16.000 0.000 0.054   NA
 5527654 5527655 PTH_1411 PTH_1412 HdrA HdrB TRUE 0.999 27.000 0.833 1.000   NA
 5527655 5527656 PTH_1412 PTH_1413 HdrB GlpC TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.001   NA
 5527656 5527657 PTH_1413 PTH_1414 GlpC   FALSE 0.008 593.000 0.000 1.000   NA
 5527657 5527658 PTH_1414 PTH_1415     FALSE 0.012 490.000 0.000 1.000   NA
 5527658 5527659 PTH_1415 PTH_1416   ArgK FALSE 0.288 121.000 0.000 1.000   NA
 5527659 5527660 PTH_1416 PTH_1417 ArgK TrxB FALSE 0.239 197.000 0.000 1.000 N NA
 5527660 5527661 PTH_1417 PTH_1418 TrxB adk FALSE 0.168 222.000 0.000 1.000 N NA
 5527661 5157365 PTH_1418   adk   FALSE 0.002 1256.000 0.000 NA   NA
 5157365 5527662   PTH_1419     FALSE 0.068 206.000 0.000 NA   NA
 5527662 5527663 PTH_1419 PTH_1420   AsnS FALSE 0.137 155.000 0.000 NA   NA
 5527664 5527665 PTH_1421 PTH_1422     FALSE 0.341 165.000 0.000 1.000 N NA
 5527666 5527667 PTH_1423 PTH_1424     FALSE 0.008 437.000 0.000 NA   NA
 5527667 5527668 PTH_1424 PTH_1425   AmiC FALSE 0.293 108.000 0.000 1.000   NA
 5527668 5527669 PTH_1425 PTH_1426 AmiC   FALSE 0.127 162.000 0.000 NA   NA
 5527669 5527670 PTH_1426 PTH_1427   SelB FALSE 0.174 71.000 0.000 NA   NA
 5527670 5527671 PTH_1427 PTH_1428 SelB SelA TRUE 1.000 -3.000 0.569 0.001 N NA
 5527672 5527673 PTH_1429 PTH_1430 PurL PurL TRUE 1.000 0.000 0.346 0.001 Y NA
 5527673 5527674 PTH_1430 PTH_1431 PurL   FALSE 0.269 153.000 0.000 1.000   NA
 5527674 5527675 PTH_1431 PTH_1432     FALSE 0.091 235.000 0.000 1.000   NA
 5527675 5527676 PTH_1432 PTH_1433   XerD TRUE 1.000 -3.000 0.333 0.015 Y NA
 5527676 5527677 PTH_1433 PTH_1434 XerD   TRUE 0.999 -22.000 0.714 NA   NA
 5527677 5527678 PTH_1434 PTH_1435     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 5527679 5527680 PTH_1436 PTH_1437   UbiA TRUE 0.724 82.000 0.014 NA   NA
 5527680 5527681 PTH_1437 PTH_1438 UbiA UbiD TRUE 0.998 -10.000 0.177 NA Y NA
 5527681 5527682 PTH_1438 PTH_1439 UbiD UbiE TRUE 0.847 99.000 0.015 NA Y NA
 5527682 5527683 PTH_1439 PTH_1440 UbiE   TRUE 0.970 19.000 0.006 1.000   NA
 5527683 5527684 PTH_1440 PTH_1441   SpeD FALSE 0.196 183.000 0.000 1.000   NA
 5527684 5527685 PTH_1441 PTH_1442 SpeD Fer FALSE 0.013 616.000 0.000 1.000 N NA
 5527686 5527687 PTH_1443 PTH_1444   CitB TRUE 0.999 37.000 0.519 0.018 Y NA
 5527687 5527688 PTH_1444 PTH_1445 CitB Flp FALSE 0.023 379.000 0.000 NA N NA
 5527688 5527689 PTH_1445 PTH_1446 Flp PulO TRUE 0.927 134.000 0.057 NA Y NA
 5527689 5527690 PTH_1446 PTH_1447 PulO TadG TRUE 0.994 -3.000 0.071 NA   NA
 5527690 5527691 PTH_1447 PTH_1448 TadG TadD TRUE 0.992 4.000 0.048 NA   NA
 5527691 5527692 PTH_1448 PTH_1449 TadD CpaB TRUE 0.894 55.000 0.048 NA   NA
 5527692 5527693 PTH_1449 PTH_1450 CpaB CitB TRUE 0.999 15.000 0.364 NA Y NA
 5527693 5527694 PTH_1450 PTH_1451 CitB VirB11 TRUE 0.999 16.000 0.385 1.000 Y NA
 5527694 5527695 PTH_1451 PTH_1452 VirB11 TadC TRUE 0.995 29.000 0.190 NA Y NA
 5527695 5527696 PTH_1452 PTH_1453 TadC TadC TRUE 0.997 14.000 0.095 NA Y NA
 5527696 5527697 PTH_1453 PTH_1454 TadC   TRUE 0.967 31.000 0.046 NA   NA
 5527697 5527698 PTH_1454 PTH_1455   Tar TRUE 0.727 16.000 0.000 NA   NA
 5527699 5527700 PTH_1456 PTH_1457 SalY SalX TRUE 0.996 69.000 1.000 1.000 Y NA
 5527700 5527701 PTH_1457 PTH_1458 SalX AcrA TRUE 0.417 78.000 0.000 1.000 N NA
 5527703 5157408 PTH_1460   Spo0M   FALSE 0.002 785.000 0.000 NA   NA
 5157408 5157409         FALSE 0.357 42.000 0.000 NA   NA
 5157409 5157410         TRUE 0.763 13.000 0.000 NA   NA
 5157410 5527704   PTH_1461   SmtA FALSE 0.153 92.000 0.000 NA   NA
 5527704 5527705 PTH_1461 PTH_1462 SmtA Kch FALSE 0.288 94.000 0.000 1.000   NA
 5527705 5527706 PTH_1462 PTH_1463 Kch Kch TRUE 0.957 -18.000 0.000 0.001   NA
 5527706 5527707 PTH_1463 PTH_1464 Kch   FALSE 0.238 54.000 0.000 NA   NA
 5527707 5527708 PTH_1464 PTH_1465     TRUE 0.812 4.000 0.000 NA   NA
 5527708 5527709 PTH_1465 PTH_1466   WcaA TRUE 0.836 75.000 0.043 NA   NA
 5527709 5527710 PTH_1466 PTH_1467 WcaA   FALSE 0.014 449.000 0.000 NA N NA
 5527711 5527712 PTH_1468 PTH_1469     TRUE 0.603 -70.000 0.000 NA   NA
 5527712 5527713 PTH_1469 PTH_1470     FALSE 0.007 452.000 0.000 NA   NA
 5527715 5527716 PTH_1472 PTH_1473   NapF TRUE 0.842 60.000 0.029 NA   NA
 5527716 5527717 PTH_1473 PTH_1474 NapF   TRUE 0.992 1.000 0.026 1.000   NA
 5527718 5527719 PTH_1475 PTH_1476   CcmA TRUE 0.973 33.000 0.049 1.000   NA
 5527719 5527720 PTH_1476 PTH_1477 CcmA   TRUE 0.615 24.000 0.000 NA   NA
 5527720 5527721 PTH_1477 PTH_1478     FALSE 0.161 79.000 0.000 NA   NA
 5527721 5527722 PTH_1478 PTH_1479   CbiO TRUE 0.992 19.000 0.118 NA   NA
 5527722 5527723 PTH_1479 PTH_1480 CbiO CbiQ TRUE 0.987 112.000 0.673 1.000   NA
 5527723 5527724 PTH_1480 PTH_1481 CbiQ   TRUE 0.889 76.000 0.073 NA   NA
 5527724 5527725 PTH_1481 PTH_1482     TRUE 0.991 40.000 0.400 NA   NA
 5527725 5527726 PTH_1482 PTH_1483     FALSE 0.158 84.000 0.000 NA   NA
 5527726 5527727 PTH_1483 PTH_1484     FALSE 0.003 663.000 0.000 NA   NA
 5527727 5527728 PTH_1484 PTH_1485     FALSE 0.347 66.000 0.000 1.000   NA
 5527728 5527729 PTH_1485 PTH_1486   DppC TRUE 0.999 -13.000 0.545 1.000   NA
 5527729 5527730 PTH_1486 PTH_1487 DppC DppB TRUE 1.000 -10.000 0.846 0.017 Y NA
 5527730 5527731 PTH_1487 PTH_1488 DppB DdpA TRUE 0.996 57.000 0.385 0.017 Y NA
 5527731 5527732 PTH_1488 PTH_1489 DdpA SmtA TRUE 0.587 49.000 0.000 1.000 N NA
 5527732 5527733 PTH_1489 PTH_1490 SmtA SdhB FALSE 0.023 465.000 0.000 1.000 N NA
 5527733 5527734 PTH_1490 PTH_1491 SdhB SdhA TRUE 0.999 4.000 0.047 0.002 Y NA
 5527734 5527735 PTH_1491 PTH_1492 SdhA FrhB TRUE 0.648 63.000 0.000 1.000 Y NA
 5527735 5527736 PTH_1492 PTH_1493 FrhB PrpD FALSE 0.381 59.000 0.000 1.000   NA
 5527736 5527737 PTH_1493 PTH_1494 PrpD   FALSE 0.151 132.000 0.000 NA   NA
 5527737 5527738 PTH_1494 PTH_1495     TRUE 0.990 53.000 0.689 NA   NA
 5527740 5527741 PTH_1497 PTH_1498   DinP TRUE 0.999 -7.000 0.800 NA   NA
 5527741 5527742 PTH_1498 PTH_1499 DinP   FALSE 0.157 86.000 0.000 NA   NA
 5527742 5527743 PTH_1499 PTH_1500   ArsR TRUE 0.944 34.000 0.028 NA   NA
 5527743 5527744 PTH_1500 PTH_1501 ArsR   FALSE 0.289 103.000 0.000 1.000   NA
 5527744 5527745 PTH_1501 PTH_1502     FALSE 0.151 122.000 0.000 NA   NA
 5527745 5527746 PTH_1502 PTH_1503     TRUE 0.672 20.000 0.000 NA   NA
 5527746 5527747 PTH_1503 PTH_1504   SirA FALSE 0.247 163.000 0.000 1.000   NA
 5527748 5527749 PTH_1505 PTH_1506   NirB TRUE 0.743 15.000 0.000 NA   NA
 5527749 5527750 PTH_1506 PTH_1507 NirB   FALSE 0.278 148.000 0.000 1.000   NA
 5527750 5527751 PTH_1507 PTH_1508   Pta TRUE 0.993 17.000 0.086 1.000   NA
 5527752 5527753 PTH_1509 PTH_1510 PaaI   TRUE 0.443 49.000 0.000 NA N NA
 5527754 5527755 PTH_1511 PTH_1512 NfnB   TRUE 0.582 40.000 0.000 1.000   NA
 5527756 5527757 PTH_1513 PTH_1514 AcrR   TRUE 0.990 14.000 0.024 1.000 N NA
 5527757 5527758 PTH_1514 PTH_1515   CcmA TRUE 1.000 4.000 0.671 1.000 N NA
 5527758 5527759 PTH_1515 PTH_1516 CcmA CcmA TRUE 0.998 1.000 0.041 0.019 Y NA
 5527759 5527760 PTH_1516 PTH_1517 CcmA AcrA TRUE 1.000 16.000 0.714 1.000 Y NA
 5527763 5527764 PTH_1520 PTH_1521 Uup   FALSE 0.013 480.000 0.000 1.000   NA
 5527764 5527765 PTH_1521 PTH_1522     FALSE 0.014 719.000 0.000 0.078   NA
 5527765 5527766 PTH_1522 PTH_1523     TRUE 0.959 1.000 0.000 0.078   NA
 5527766 5527767 PTH_1523 PTH_1524   CaiA FALSE 0.287 201.000 0.000 0.078   NA
 5527767 5527768 PTH_1524 PTH_1525 CaiA DnaC TRUE 0.944 -7.000 0.000 NA Y NA
 5527768 5527769 PTH_1525 PTH_1526 DnaC   FALSE 0.022 296.000 0.000 NA   NA
 5527769 5527770 PTH_1526 PTH_1527     FALSE 0.151 136.000 0.000 NA   NA
 5527770 5527771 PTH_1527 PTH_1528     TRUE 0.820 2.000 0.000 NA   NA
 5527771 5527772 PTH_1528 PTH_1529     FALSE 0.056 215.000 0.000 NA   NA
 5527772 5527773 PTH_1529 PTH_1530     FALSE 0.155 89.000 0.000 NA   NA
 5527773 5527774 PTH_1530 PTH_1531     TRUE 0.545 30.000 0.000 NA   NA
 5527775 5527776 PTH_1532 PTH_1533     TRUE 0.936 37.000 0.030 NA   NA
 5527776 5527777 PTH_1533 PTH_1534     TRUE 0.997 7.000 0.209 NA   NA
 5527777 5527778 PTH_1534 PTH_1535   XdhC TRUE 0.995 0.000 0.091 NA   NA
 5527778 5527779 PTH_1535 PTH_1536 XdhC MoeA TRUE 0.974 31.000 0.026 1.000 N NA
 5527779 5527780 PTH_1536 PTH_1537 MoeA CitT FALSE 0.108 259.000 0.000 1.000 N NA
 5527780 5527781 PTH_1537 PTH_1538 CitT CoxL FALSE 0.315 174.000 0.000 1.000 N NA
 5527781 5527782 PTH_1538 PTH_1539 CoxL CoxS TRUE 0.999 16.000 0.286 0.053 Y NA
 5527782 5527783 PTH_1539 PTH_1540 CoxS CoxM TRUE 1.000 19.000 0.875 0.053 Y NA
 5527783 5527784 PTH_1540 PTH_1541 CoxM   FALSE 0.137 237.000 0.000 1.000 N NA
 5527784 5527785 PTH_1541 PTH_1542   CitT FALSE 0.043 365.000 0.000 1.000 N NA
 5527785 5527786 PTH_1542 PTH_1543 CitT   FALSE 0.003 660.000 0.000 NA   NA
 5527786 5527787 PTH_1543 PTH_1544     FALSE 0.380 40.000 0.000 NA   NA
 5527788 5527789 PTH_1545 PTH_1546 Acs LysR FALSE 0.344 164.000 0.000 1.000 N NA
 5527790 5527791 PTH_1547 PTH_1548   CaiC FALSE 0.395 39.000 0.000 NA   NA
 5527791 5527792 PTH_1548 PTH_1549 CaiC   FALSE 0.003 674.000 0.000 NA   NA
 5527792 5527793 PTH_1549 PTH_1550   MoeA FALSE 0.164 77.000 0.000 NA   NA
 5527793 5527794 PTH_1550 PTH_1551 MoeA   FALSE 0.018 414.000 0.000 NA N NA
 5527795 5527796 PTH_1552 PTH_1553 FixA FixB TRUE 0.999 18.000 0.373 0.015 Y NA
 5527796 5527797 PTH_1553 PTH_1554 FixB GlpC TRUE 0.714 52.000 0.000 1.000 Y NA
 5527797 5527798 PTH_1554 PTH_1555 GlpC   TRUE 0.622 55.000 0.000 0.038   NA
 5527798 5527799 PTH_1555 PTH_1556     FALSE 0.189 66.000 0.000 NA   NA
 5527801 5527802 PTH_1558 PTH_1559 RpoE   TRUE 0.999 3.000 0.429 NA   NA
 5527802 5527803 PTH_1559 PTH_1560     FALSE 0.003 663.000 0.000 NA   NA
 5527803 5527804 PTH_1560 PTH_1561     TRUE 0.519 31.000 0.000 NA   NA
 5527807 5527808 PTH_1564 PTH_1565     FALSE 0.007 444.000 0.000 NA   NA
 5527808 5527809 PTH_1565 PTH_1566     FALSE 0.056 215.000 0.000 NA   NA
 5527809 5527810 PTH_1566 PTH_1567     TRUE 0.761 -103.000 0.000 1.000   NA
 5527810 5527811 PTH_1567 PTH_1568   Tra5 FALSE 0.021 407.000 0.000 1.000   NA
 5527811 5527812 PTH_1568 PTH_1569 Tra5   TRUE 0.899 210.000 0.135 0.078   NA
 5527813 5527814 PTH_1570 PTH_1571 TolB   FALSE 0.079 197.000 0.000 NA   NA
 5527814 5527815 PTH_1571 PTH_1572   Tra5 TRUE 0.899 210.000 0.135 0.078   NA
 5527816 5527817 PTH_1573 PTH_1574 CaiA NarK FALSE 0.284 79.000 0.000 NA N NA
 5527817 5527818 PTH_1574 PTH_1575 NarK CaiA FALSE 0.103 221.000 0.000 NA N NA
 5527818 5527819 PTH_1575 PTH_1576 CaiA CaiA TRUE 0.890 45.000 0.000 0.004 Y NA
 5527819 5527820 PTH_1576 PTH_1577 CaiA   TRUE 0.568 142.000 0.000 1.000 Y NA
 5527820 5527821 PTH_1577 PTH_1578   CoxL FALSE 0.012 666.000 0.000 1.000 N NA
 5527821 5527822 PTH_1578 PTH_1579 CoxL CoxS TRUE 0.984 1.000 0.000 0.053 Y NA
 5527822 5527823 PTH_1579 PTH_1580 CoxS XdhA TRUE 0.983 4.000 0.000 0.053 Y NA
 5527828 5527829 PTH_1585 PTH_1586 MalQ GlgB TRUE 0.949 32.000 0.000 0.002 Y NA
 5527829 5527830 PTH_1586 PTH_1587 GlgB   TRUE 0.998 9.000 0.286 1.000   NA
 5527830 5527831 PTH_1587 PTH_1588   TreY TRUE 0.997 2.000 0.046 0.010   NA
 5527831 5527832 PTH_1588 PTH_1589 TreY RfaG TRUE 0.799 83.000 0.008 1.000 N NA
 5527835 5527838 PTH_1592 PTH_1595     TRUE 0.806 -3.000 0.000 NA   NA
 5527836 5527837 PTH_1593 PTH_1594 OmpR   FALSE 0.292 91.000 0.000 1.000   NA
 5527838 5527836 PTH_1595 PTH_1593   OmpR TRUE 0.567 -152.000 0.000 NA   NA
 5527837 5527839 PTH_1594 PTH_1596     FALSE 0.034 401.000 0.000 1.000 N NA
 5527839 5527840 PTH_1596 PTH_1597     TRUE 0.657 61.000 0.000 1.000 Y NA
 5527842 5527843 PTH_1599 PTH_1600 LysC ThrB TRUE 0.942 61.000 0.033 1.000 Y NA
 5527843 5527844 PTH_1600 PTH_1601 ThrB ThrA TRUE 0.979 33.000 0.022 1.000 Y NA
 5527844 5527845 PTH_1601 PTH_1602 ThrA PheB TRUE 0.997 20.000 0.109 0.005   NA
 5527846 5527847 PTH_1603 PTH_1604     TRUE 0.998 3.000 0.300 NA   NA
 5527848 5527849 PTH_1605 PTH_1606   GrxC FALSE 0.014 354.000 0.000 NA   NA
 5527849 5527850 PTH_1606 PTH_1607 GrxC GpsA FALSE 0.400 106.000 0.000 1.000 N NA
 5527850 5527851 PTH_1607 PTH_1608 GpsA   TRUE 0.998 5.000 0.168 1.000   NA
 5527851 5527852 PTH_1608 PTH_1609     TRUE 0.995 12.000 0.073 1.000   NA
 5527852 5527853 PTH_1609 PTH_1610     TRUE 0.985 -37.000 0.061 NA   NA
 5527853 5527854 PTH_1610 PTH_1611     TRUE 0.743 142.000 0.019 NA   NA
 5527854 5527855 PTH_1611 PTH_1612     TRUE 0.993 -3.000 0.062 NA   NA
 5527855 5527856 PTH_1612 PTH_1613     TRUE 0.986 32.000 0.156 NA   NA
 5527856 5527857 PTH_1613 PTH_1614     TRUE 0.998 -3.000 0.300 NA   NA
 5527857 5527858 PTH_1614 PTH_1615     TRUE 0.988 31.000 0.167 NA   NA
 5527858 5527859 PTH_1615 PTH_1616     TRUE 0.999 -13.000 0.550 NA   NA
 5527860 5527861 PTH_1617 PTH_1618 Cmk PlsC TRUE 0.989 1.000 0.005 1.000 N NA
 5527861 5527862 PTH_1618 PTH_1619 PlsC   TRUE 0.830 72.000 0.011 1.000 N NA
 5527863 5527864 PTH_1620 PTH_1621 AroA TyrA TRUE 0.981 31.000 0.018 1.000 Y NA
 5527864 5527865 PTH_1621 PTH_1622 TyrA AroA TRUE 0.997 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 5527865 5527866 PTH_1622 PTH_1623 AroA TrpA FALSE 0.129 310.000 0.000 1.000 Y NA
 5527866 5527867 PTH_1623 PTH_1624 TrpA TrpB TRUE 0.998 -3.000 0.015 0.001 Y NA
 5527867 5527868 PTH_1624 PTH_1625 TrpB TrpC TRUE 0.971 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5527868 5527869 PTH_1625 PTH_1626 TrpC TrpD TRUE 0.994 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 5527869 5527870 PTH_1626 PTH_1627 TrpD PabA TRUE 0.977 55.000 0.105 1.000 Y NA
 5527870 5527871 PTH_1627 PTH_1628 PabA TrpE TRUE 0.812 71.000 0.000 0.001 Y NA
 5527871 5527872 PTH_1628 PTH_1629 TrpE   FALSE 0.064 209.000 0.000 NA   NA
 5527872 5527873 PTH_1629 PTH_1630   AroH FALSE 0.068 206.000 0.000 NA   NA
 5527873 5527874 PTH_1630 PTH_1631 AroH   TRUE 0.980 21.000 0.042 NA   NA
 5527874 5527875 PTH_1631 PTH_1632     TRUE 0.828 115.000 0.044 NA   NA
 5527875 5527876 PTH_1632 PTH_1633     FALSE 0.161 79.000 0.000 NA   NA
 5527876 5527877 PTH_1633 PTH_1634   RsuA TRUE 0.685 103.000 0.010 NA   NA
 5527877 5527878 PTH_1634 PTH_1635 RsuA   FALSE 0.002 1192.000 0.000 NA   NA
 5527880 5527881 PTH_1637 PTH_1638     FALSE 0.062 210.000 0.000 NA   NA
 5527881 5527882 PTH_1638 PTH_1639     FALSE 0.076 199.000 0.000 NA   NA
 5527882 5527883 PTH_1639 PTH_1640   SpmB TRUE 0.732 30.000 0.000 1.000   NA
 5527883 5527884 PTH_1640 PTH_1641 SpmB SpmA TRUE 1.000 3.000 0.655 0.002   NA
 5527884 5527885 PTH_1641 PTH_1642 SpmA   TRUE 0.778 104.000 0.014 1.000   NA
 5527885 5527886 PTH_1642 PTH_1643   SpoVR FALSE 0.162 78.000 0.000 NA   NA
 5527886 5527887 PTH_1643 PTH_1644 SpoVR   TRUE 0.994 45.000 0.761 NA   NA
 5527887 5527888 PTH_1644 PTH_1645   PrkA TRUE 0.986 12.000 0.033 NA   NA
 5527888 5527889 PTH_1645 PTH_1646 PrkA   FALSE 0.029 270.000 0.000 NA   NA
 5527889 5527890 PTH_1646 PTH_1647     FALSE 0.086 192.000 0.000 NA   NA
 5527890 5527891 PTH_1647 PTH_1649     FALSE 0.086 192.000 0.000 NA   NA
 5527893 5527894 PTH_1650 PTH_1651 MurE PncB FALSE 0.367 156.000 0.000 1.000 N NA
 5527894 5527895 PTH_1651 PTH_1652 PncB PncA TRUE 0.927 41.000 0.009 1.000 N NA
 5527895 5527896 PTH_1652 PTH_1653 PncA AcyP TRUE 0.836 57.000 0.004 1.000 N NA
 5527896 5527897 PTH_1653 PTH_1654 AcyP CbiO FALSE 0.409 84.000 0.000 1.000 N NA
 5527897 5527898 PTH_1654 PTH_1655 CbiO CbiQ TRUE 1.000 -21.000 0.489 0.004 Y NA
 5527899 5527900 PTH_1656 PTH_1657   CbiO TRUE 0.643 22.000 0.000 NA   NA
 5527900 5527901 PTH_1657 PTH_1658 CbiO CbiO TRUE 0.997 -3.000 0.017 0.019 Y NA
 5527901 5527902 PTH_1658 PTH_1659 CbiO CbiQ TRUE 0.993 -51.000 0.052 1.000 Y NA
 5527902 5527903 PTH_1659 PTH_1660 CbiQ   TRUE 0.477 63.000 0.000 1.000 N NA
 5527903 5527904 PTH_1660 PTH_1661   PorG TRUE 0.966 99.000 0.062 0.052 Y NA
 5527904 5527905 PTH_1661 PTH_1662 PorG PaaK TRUE 0.999 -13.000 0.569 1.000 N NA
 5527905 5527906 PTH_1662 PTH_1663 PaaK   FALSE 0.228 200.000 0.000 1.000 N NA
 5527907 5527908 PTH_1664 PTH_1665 RecB AddB TRUE 0.999 -45.000 0.408 0.002 Y NA
 5527908 5527909 PTH_1665 PTH_1666 AddB SbcD TRUE 0.829 39.000 0.000 1.000 Y NA
 5527909 5527910 PTH_1666 PTH_1667 SbcD   FALSE 0.152 103.000 0.000 NA   NA
 5527910 5527911 PTH_1667 PTH_1669     FALSE 0.151 131.000 0.000 NA   NA
 5527912 5527913 PTH_1668 PTH_1670   OmpR FALSE 0.031 260.000 0.000 NA   NA
 5527915 5527916 PTH_1671 PTH_1673 PstS PstC TRUE 0.934 71.000 0.037 1.000 Y NA
 5527916 5527917 PTH_1673 PTH_1674 PstC PstA TRUE 1.000 -3.000 0.907 0.002 Y NA
 5527918 5527919 PTH_1675 PTH_1676   PhoU FALSE 0.344 43.000 0.000 NA   NA
 5527921 5527922 PTH_1678 PTH_1679   FliA TRUE 0.999 3.000 0.571 NA   NA
 5527923 5527924 PTH_1680 PTH_1681 HisD Tdh TRUE 0.979 15.000 0.000 0.012 Y NA
 5527924 5527925 PTH_1681 PTH_1682 Tdh MglA FALSE 0.415 79.000 0.000 1.000 N NA
 5527925 5527926 PTH_1682 PTH_1683 MglA AraH TRUE 0.914 26.000 0.000 1.000 Y NA
 5527926 5527927 PTH_1683 PTH_1684 AraH RbsB TRUE 0.569 59.000 0.000 NA Y NA
 5527927 5527928 PTH_1684 PTH_1685 RbsB   FALSE 0.150 142.000 0.000 NA   NA
 5527928 5527929 PTH_1685 PTH_1686     FALSE 0.380 40.000 0.000 NA   NA
 5527929 5527930 PTH_1686 PTH_1687     FALSE 0.147 146.000 0.000 NA   NA
 5527930 5527931 PTH_1687 PTH_1688     TRUE 0.803 -40.000 0.000 1.000   NA
 5527931 5527932 PTH_1688 PTH_1689     FALSE 0.156 87.000 0.000 NA   NA
 5527932 5527933 PTH_1689 PTH_1690     FALSE 0.160 80.000 0.000 NA   NA
 5527935 5527936 PTH_1692 PTH_1693     FALSE 0.149 144.000 0.000 NA   NA
 5527936 5527937 PTH_1693 PTH_1694   hypA FALSE 0.022 295.000 0.000 NA   NA
 5527937 5527938 PTH_1694 PTH_1695 hypA Mrp TRUE 0.999 1.000 0.667 1.000   NA
 5527938 5527939 PTH_1695 PTH_1696 Mrp HypF TRUE 0.895 46.000 0.005 1.000 N NA
 5527939 5527940 PTH_1696 PTH_1697 HypF HypC TRUE 0.995 -9.000 0.046 NA Y NA
 5527940 5527941 PTH_1697 PTH_1698 HypC HypD TRUE 0.996 -19.000 0.084 NA Y NA
 5527941 5527942 PTH_1698 PTH_1699 HypD HypE TRUE 0.999 1.000 0.353 1.000 Y NA
 5527942 5527943 PTH_1699 PTH_1700 HypE HyaD TRUE 0.535 54.000 0.000 1.000 N NA
 5527943 5527944 PTH_1700 PTH_1701 HyaD HyaA FALSE 0.033 536.000 0.000 1.000 Y NA
 5527944 5527945 PTH_1701 PTH_1702 HyaA HyaB TRUE 0.999 20.000 0.286 0.002 Y NA
 5527945 5527946 PTH_1702 PTH_1703 HyaB HybA TRUE 0.524 67.000 0.000 NA Y NA
 5527946 5527947 PTH_1703 PTH_1704 HybA NrfD TRUE 0.991 43.000 0.222 NA Y NA
 5527950 5527951 PTH_1707 PTH_1708   RnhB TRUE 0.998 6.000 0.111 1.000 Y NA
 5527952 5527953 PTH_1709 PTH_1710 TatA TatC TRUE 0.465 133.000 0.000 NA Y NA
 5527953 5527954 PTH_1710 PTH_1711 TatC   FALSE 0.150 124.000 0.000 NA   NA
 5527954 5527955 PTH_1711 PTH_1712   BisC TRUE 0.998 49.000 0.833 0.002   NA
 5527955 5527956 PTH_1712 PTH_1713 BisC HybA TRUE 0.994 61.000 0.500 0.002   NA
 5527956 5527957 PTH_1713 PTH_1714 HybA NrfD TRUE 0.997 23.000 0.222 NA Y NA
 5527958 5527959 PTH_1715 PTH_1716 TatA   TRUE 0.757 42.000 0.000 0.031   NA
 5527959 5527960 PTH_1716 PTH_1717   LepB TRUE 0.896 50.000 0.021 1.000   NA
 5527960 5527961 PTH_1717 PTH_1718 LepB RplS TRUE 0.796 101.000 0.009 1.000 N NA
 5527961 5527962 PTH_1718 PTH_1719 RplS TrmD TRUE 0.986 184.000 0.567 1.000 Y NA
 5527962 5527963 PTH_1719 PTH_1720 TrmD RimM TRUE 1.000 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 5527963 5527964 PTH_1720 PTH_1721 RimM   TRUE 0.988 -7.000 0.041 NA   NA
 5527964 5527965 PTH_1721 PTH_1722     TRUE 0.956 40.000 0.061 NA   NA
 5527965 5527966 PTH_1722 PTH_1723   RpsP TRUE 0.998 21.000 0.385 1.000   NA
 5527966 5527967 PTH_1723 PTH_1724 RpsP Ffh TRUE 0.985 62.000 0.361 1.000 N NA
 5527967 5527968 PTH_1724 PTH_1725 Ffh   TRUE 0.959 62.000 0.151 1.000   NA
 5527970 5527971 PTH_1727 PTH_1728   SsnA FALSE 0.396 121.000 0.000 1.000 N NA
 5527971 5527972 PTH_1728 PTH_1729 SsnA SAM1 TRUE 0.895 62.000 0.024 1.000 N NA
 5527972 5527973 PTH_1729 PTH_1730 SAM1   TRUE 0.991 10.000 0.019 1.000 N NA
 5527973 5527974 PTH_1730 PTH_1731   Pnp TRUE 0.891 68.000 0.030 1.000 N NA
 5527974 5527975 PTH_1731 PTH_1732 Pnp   FALSE 0.151 131.000 0.000 NA   NA
 5527976 5527977 PTH_1733 PTH_1734 ArsR   TRUE 0.777 -69.000 0.000 1.000   NA
 5527977 5527978 PTH_1734 PTH_1735   SirA TRUE 0.936 16.000 0.000 0.036   NA
 5527978 5527979 PTH_1735 PTH_1736 SirA   TRUE 0.986 18.000 0.053 NA   NA
 5527980 5527981 PTH_1737 PTH_1738 FtsY Rnc TRUE 0.763 95.000 0.004 1.000 N NA
 5527981 5527982 PTH_1738 PTH_1739 Rnc FabB TRUE 0.909 97.000 0.054 1.000 N NA
 5527982 5527983 PTH_1739 PTH_1740 FabB AcpP TRUE 0.990 66.000 0.346 1.000 Y NA
 5527983 5527984 PTH_1740 PTH_1741 AcpP AcpP TRUE 0.717 -18.000 0.000 NA   NA
 5527984 5527985 PTH_1741 PTH_1742 AcpP FabG TRUE 0.978 34.000 0.100 NA   NA
 5527985 5527986 PTH_1742 PTH_1743 FabG FabD TRUE 0.985 94.000 0.149 0.004 Y NA
 5527986 5527987 PTH_1743 PTH_1744 FabD   TRUE 0.996 -3.000 0.099 1.000   NA
 5527987 5527988 PTH_1744 PTH_1745   FabH TRUE 0.982 47.000 0.216 1.000   NA
 5527988 5527989 PTH_1745 PTH_1746 FabH PlsX TRUE 0.998 -19.000 0.054 0.004 Y NA
 5527989 5527990 PTH_1746 PTH_1747 PlsX PaaI TRUE 0.982 -3.000 0.012 NA   NA
 5527990 5527991 PTH_1747 PTH_1748 PaaI   FALSE 0.008 423.000 0.000 NA   NA
 5527992 5527993 PTH_1749 PTH_1750     TRUE 0.747 139.000 0.019 NA   NA
 5527993 5527994 PTH_1750 PTH_1751   Pta TRUE 0.732 30.000 0.000 1.000   NA
 5527995 5527996 PTH_1752 PTH_1753   CoaD TRUE 0.983 -22.000 0.044 NA   NA
 5527996 5527997 PTH_1753 PTH_1754 CoaD   TRUE 0.998 23.000 0.367 1.000 N NA
 5527999 5528000 PTH_1756 PTH_1757   RecG FALSE 0.037 328.000 0.000 1.000   NA
 5528000 5528001 PTH_1757 PTH_1758 RecG RibH FALSE 0.053 340.000 0.000 1.000 N NA
 5528001 5528002 PTH_1758 PTH_1759 RibH   TRUE 0.985 40.000 0.019 0.002 Y NA
 5528002 5528003 PTH_1759 PTH_1760   RibC TRUE 0.979 33.000 0.022 1.000 Y NA
 5528003 5528004 PTH_1760 PTH_1761 RibC   TRUE 0.999 17.000 0.456 1.000 Y NA
 5528004 5528005 PTH_1761 PTH_1762     FALSE 0.025 380.000 0.000 1.000   NA
 5528005 5528006 PTH_1762 PTH_1763   CoaD TRUE 0.910 3.000 0.000 1.000   NA
 5528006 5528007 PTH_1763 PTH_1764 CoaD UhpC FALSE 0.011 507.000 0.000 NA N NA
 5528007 5528008 PTH_1764 PTH_1765 UhpC FixX FALSE 0.033 330.000 0.000 NA N NA
 5528008 5528009 PTH_1765 PTH_1766 FixX FixC TRUE 0.998 -3.000 0.039 0.052 Y NA
 5528009 5528010 PTH_1766 PTH_1767 FixC FixB TRUE 0.958 23.000 0.000 0.052 Y NA
 5528010 5528011 PTH_1767 PTH_1768 FixB FixA TRUE 1.000 18.000 0.600 0.015 Y NA
 5528011 5528012 PTH_1768 PTH_1769 FixA CaiA TRUE 0.988 167.000 0.500 0.052 N NA
 5528012 5528013 PTH_1769 PTH_1770 CaiA   TRUE 0.988 132.000 0.333 0.004 N NA
 5528013 5528014 PTH_1770 PTH_1771     TRUE 0.992 65.000 0.667 1.000 N NA
 5528014 5528015 PTH_1771 PTH_1772   RocR FALSE 0.013 637.000 0.000 1.000 N NA
 5528017 5528018 PTH_1774 PTH_1775     FALSE 0.286 143.000 0.000 1.000   NA
 5528019 5528020 PTH_1776 PTH_1777     TRUE 0.999 -3.000 0.667 NA   NA
 5528020 5528021 PTH_1777 PTH_1778     TRUE 0.481 208.000 0.000 0.055 Y NA
 5528022 5528023 PTH_1779 PTH_1780 Rpe   TRUE 0.998 6.000 0.213 1.000   NA
 5528023 5528024 PTH_1780 PTH_1781     TRUE 0.998 -7.000 0.196 1.000   NA
 5528024 5528025 PTH_1781 PTH_1782   FtsI TRUE 0.932 107.000 0.044 0.003   NA
 5528025 5528026 PTH_1782 PTH_1783 FtsI FtsW TRUE 0.998 -10.000 0.285 1.000 N NA
 5528026 5528027 PTH_1783 PTH_1784 FtsW PTC1 TRUE 0.705 235.000 0.052 1.000 N NA
 5528027 5528028 PTH_1784 PTH_1785 PTC1   TRUE 0.688 -22.000 0.000 NA   NA
 5528028 5528029 PTH_1785 PTH_1786     TRUE 0.987 3.000 0.021 NA   NA
 5528029 5528030 PTH_1786 PTH_1787     TRUE 0.979 7.000 0.011 NA   NA
 5528030 5528031 PTH_1787 PTH_1788   Sun TRUE 0.997 2.000 0.135 1.000   NA
 5528031 5528032 PTH_1788 PTH_1789 Sun   TRUE 0.974 -43.000 0.031 NA   NA
 5528032 5528033 PTH_1789 PTH_1790   Fmt TRUE 0.836 101.000 0.048 NA   NA
 5528033 5528034 PTH_1790 PTH_1791 Fmt Def TRUE 0.973 49.000 0.025 0.024 Y NA
 5528034 5528035 PTH_1791 PTH_1792 Def PriA TRUE 0.975 31.000 0.029 1.000 N NA
 5528035 5528036 PTH_1792 PTH_1793 PriA Dfp TRUE 0.940 138.000 0.099 1.000 N NA
 5528036 5528037 PTH_1793 PTH_1794 Dfp RpoZ TRUE 0.964 110.000 0.192 1.000 N NA
 5528037 5528038 PTH_1794 PTH_1795 RpoZ Gmk TRUE 0.996 38.000 0.471 1.000 N NA
 5528038 5528039 PTH_1795 PTH_1796 Gmk   TRUE 0.994 16.000 0.143 NA   NA
 5528039 5528040 PTH_1796 PTH_1797     TRUE 0.993 23.000 0.189 NA   NA
 5528040 5528041 PTH_1797 PTH_1798     TRUE 0.614 154.000 0.005 NA   NA
 5528041 5528042 PTH_1798 PTH_1799     TRUE 0.858 280.000 0.060 0.001 Y NA
 5528042 5528043 PTH_1799 PTH_1800   DapF TRUE 0.526 285.000 0.016 1.000 Y NA
 5528043 5528044 PTH_1800 PTH_1801 DapF MgtA TRUE 0.819 86.000 0.012 1.000 N NA
 5528045 5528046 PTH_1802 PTH_1803     TRUE 0.957 -67.000 0.015 NA   NA
 5528047 5528048 PTH_1804 PTH_1805 pyrE PyrF TRUE 0.943 118.000 0.054 1.000 Y NA
 5528048 5528049 PTH_1805 PTH_1806 PyrF PyrD TRUE 0.999 -7.000 0.154 0.001 Y NA
 5528049 5528050 PTH_1806 PTH_1807 PyrD UbiB TRUE 0.999 -9.000 0.592 1.000 N NA
 5528050 5528051 PTH_1807 PTH_1808 UbiB   FALSE 0.324 71.000 0.000 1.000   NA
 5528051 5528052 PTH_1808 PTH_1809   CarB FALSE 0.288 138.000 0.000 1.000   NA
 5528052 5528053 PTH_1809 PTH_1810 CarB CarA TRUE 1.000 2.000 0.188 0.001 Y NA
 5528053 5528054 PTH_1810 PTH_1811 CarA PyrC TRUE 0.964 36.000 0.008 1.000 Y NA
 5528054 5528055 PTH_1811 PTH_1812 PyrC PyrB TRUE 1.000 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 5528055 5528056 PTH_1812 PTH_1813 PyrB PyrR TRUE 0.957 203.000 0.247 1.000 Y NA
 5528056 5528057 PTH_1813 PTH_1814 PyrR   FALSE 0.124 212.000 0.000 1.000   NA
 5528057 5528058 PTH_1814 PTH_1815     FALSE 0.127 162.000 0.000 NA   NA
 5528059 5528060 PTH_1816 PTH_1817     TRUE 0.796 78.000 0.029 NA   NA
 5528061 5528062 PTH_1818 PTH_1819 RluA LspA TRUE 0.994 3.000 0.026 1.000 N NA
 5528062 5528063 PTH_1819 PTH_1820 LspA ileS TRUE 0.894 51.000 0.012 1.000 N NA
 5528063 5528064 PTH_1820 PTH_1821 ileS   FALSE 0.004 546.000 0.000 NA   NA
 5528064 5528065 PTH_1821 PTH_1822     TRUE 0.821 1.000 0.000 NA   NA
 5528065 5528066 PTH_1822 PTH_1823     FALSE 0.251 52.000 0.000 NA   NA
 5528066 5528067 PTH_1823 PTH_1824   DivIVA TRUE 0.856 15.000 0.000 NA N NA
 5528067 5528068 PTH_1824 PTH_1825 DivIVA   TRUE 0.606 174.000 0.011 NA   NA
 5528068 5528069 PTH_1825 PTH_1826   ProC TRUE 0.989 16.000 0.043 1.000   NA
 5528069 5528070 PTH_1826 PTH_1827 ProC   TRUE 0.987 20.000 0.067 NA   NA
 5528070 5528071 PTH_1827 PTH_1828     TRUE 0.996 -16.000 0.194 NA   NA
 5528071 5528072 PTH_1828 PTH_1829     TRUE 0.962 16.000 0.004 NA   NA
 5528072 5528073 PTH_1829 PTH_1830   VicK TRUE 0.709 94.000 0.014 NA   NA
 5528073 5528074 PTH_1830 PTH_1831 VicK OmpR TRUE 0.998 -6.000 0.034 0.017 Y NA
 5528074 5528075 PTH_1831 PTH_1832 OmpR   TRUE 0.977 6.000 0.006 NA   NA
 5528075 5528076 PTH_1832 PTH_1833   YSH1 TRUE 0.695 71.000 0.006 NA   NA
 5528080 5528081 PTH_1837 PTH_1838     FALSE 0.395 39.000 0.000 NA   NA
 5528081 5528082 PTH_1838 PTH_1839     TRUE 0.998 -7.000 0.091 0.004   NA
 5528082 5528083 PTH_1839 PTH_1840     TRUE 0.999 12.000 0.318 0.004   NA
 5528083 5528084 PTH_1840 PTH_1841   NrdG FALSE 0.303 80.000 0.000 1.000   NA
 5528084 5528085 PTH_1841 PTH_1842 NrdG NrdD TRUE 0.740 312.000 0.192 1.000 N NA
 5528085 5528086 PTH_1842 PTH_1843 NrdD   TRUE 0.978 -16.000 0.012 NA N NA
 5528086 5528087 PTH_1843 PTH_1844     FALSE 0.274 244.000 0.004 NA   NA
 5528087 5528088 PTH_1844 PTH_1845   FliA TRUE 0.822 94.000 0.043 NA   NA
 5528088 5528089 PTH_1845 PTH_1846 FliA FliA TRUE 0.996 148.000 0.602 0.011 Y NA
 5528089 5528090 PTH_1846 PTH_1847 FliA   TRUE 0.991 77.000 0.856 1.000   NA
 5528090 5528091 PTH_1847 PTH_1848   SelD FALSE 0.069 259.000 0.000 1.000   NA
 5528091 5528092 PTH_1848 PTH_1849 SelD   FALSE 0.154 116.000 0.000 NA   NA
 5528092 5528093