MicrobesOnline Operon Predictions for Bifidobacterium adolescentis ATCC 15703

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2002665 2002666 BAD_0001 BAD_0002 dnaA dnaN FALSE 0.165 497.000 0.328 1.000 Y NA
 2002666 2002667 BAD_0002 BAD_0003 dnaN recF TRUE 0.928 79.000 0.318 1.000 Y NA
 2002667 2002668 BAD_0003 BAD_0004 recF   TRUE 0.952 0.000 0.099 NA   NA
 2002668 2002669 BAD_0004 BAD_0005   gyrB FALSE 0.034 281.000 0.022 NA   NA
 2002669 2002670 BAD_0005 BAD_0006 gyrB gyrA TRUE 0.889 96.000 0.306 0.003 Y NA
 2002670 2002671 BAD_0006 BAD_0007 gyrA   TRUE 0.554 75.000 0.053 NA   NA
 2002674 2002675 BAD_t0001 BAD_t0002 alaW alaV TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 2002675 2002676 BAD_t0002 BAD_t0003 alaV ileU FALSE 0.355 43.000 0.000 NA   NA
 2002678 2002679 BAD_0011 BAD_0012   icfA TRUE 0.572 68.000 0.038 NA   NA
 2002679 2002680 BAD_0012 BAD_0013 icfA ribAB FALSE 0.004 464.000 0.000 NA   NA
 2002680 2002681 BAD_0013 BAD_0014 ribAB pra FALSE 0.257 70.000 0.000 NA   NA
 2002681 2002682 BAD_0014 BAD_0015 pra rps8E FALSE 0.015 256.000 0.000 NA   NA
 2002682 2002683 BAD_0015 BAD_0016 rps8E   FALSE 0.003 1207.000 0.000 NA   NA
 2002683 2002684 BAD_0016 BAD_0017     FALSE 0.150 101.000 0.000 NA   NA
 2002684 2002685 BAD_0017 BAD_0018     TRUE 0.747 -3.000 0.000 NA   NA
 2002685 2002686 BAD_0018 BAD_0019     FALSE 0.009 309.000 0.000 NA   NA
 2002690 2002691 BAD_0023 BAD_0024     FALSE 0.189 145.000 0.006 NA   NA
 2002692 2002693 BAD_0025 BAD_0026   opuE TRUE 0.676 58.000 0.074 1.000   NA
 2002697 2002698 BAD_0030 BAD_0031 glgP pbp1A FALSE 0.146 105.000 0.000 NA   NA
 2002698 2002699 BAD_0031 BAD_0032 pbp1A   TRUE 0.550 22.000 0.000 NA   NA
 2002699 2002700 BAD_0032 BAD_0033     FALSE 0.014 264.000 0.000 NA   NA
 2002702 2002703 BAD_0035 BAD_0036     TRUE 0.963 7.000 0.216 NA   NA
 2002703 2002704 BAD_0036 BAD_0037   pabA TRUE 0.529 79.000 0.046 NA N NA
 2002705 2002706 BAD_0038 BAD_0039 pknB pknA TRUE 0.993 -3.000 0.368 0.002 Y NA
 2002706 2002707 BAD_0039 BAD_0040 pknA pbpA TRUE 0.960 -3.000 0.162 1.000 N NA
 2002707 2002708 BAD_0040 BAD_0041 pbpA rodA TRUE 0.902 -7.000 0.064 1.000 N NA
 2002708 2002709 BAD_0041 BAD_0042 rodA   TRUE 0.962 -3.000 0.180 1.000 N NA
 2002709 2002710 BAD_0042 BAD_0043     TRUE 0.992 -3.000 0.267 NA Y NA
 2002710 2002711 BAD_0043 BAD_0044     TRUE 0.945 29.000 0.629 NA   NA
 2002713 2002714 BAD_0046 BAD_0047     TRUE 0.996 -10.000 1.000 NA Y NA
 2002715 2002716 BAD_0048 BAD_0049     FALSE 0.239 74.000 0.000 NA   NA
 2002716 2002717 BAD_0049 BAD_0050     FALSE 0.121 123.000 0.000 NA   NA
 2002717 2002718 BAD_0050 BAD_0051     FALSE 0.424 31.000 0.000 NA   NA
 2002719 2002720 BAD_t0004 BAD_0052 leuX   FALSE 0.005 421.000 0.000 NA   NA
 2002720 2002721 BAD_0052 BAD_0053   ygaT FALSE 0.437 30.000 0.000 NA   NA
 2002722 2002723 BAD_0054 BAD_0055 recD   FALSE 0.252 71.000 0.000 NA   NA
 2002725 2002726 BAD_0057 BAD_0058 degP   FALSE 0.007 356.000 0.000 1.000 N NA
 2002728 2002729 BAD_0060 BAD_0061   fprA TRUE 0.678 73.000 0.118 NA   NA
 2002729 2002730 BAD_0061 BAD_0062 fprA htpX FALSE 0.055 233.000 0.010 1.000 N NA
 2002730 2002731 BAD_0062 BAD_t0005 htpX glyT FALSE 0.007 334.000 0.000 NA   NA
 2002731 2002732 BAD_t0005 BAD_0063 glyT   FALSE 0.005 433.000 0.000 NA   NA
 2002733 2002734 BAD_0064 BAD_0065 pip   TRUE 0.986 3.000 0.650 NA   NA
 2002735 2002736 BAD_0066 BAD_0067 fba purA FALSE 0.129 186.000 0.016 1.000 N NA
 2002736 2002737 BAD_0067 BAD_0068 purA   TRUE 0.655 48.000 0.041 1.000 N NA
 2002737 2002738 BAD_0068 BAD_0069   crcB2 TRUE 0.588 141.000 0.333 NA N NA
 2002738 2002739 BAD_0069 BAD_0070 crcB2   FALSE 0.005 493.000 0.000 NA N NA
 2002739 2002740 BAD_0070 BAD_0071     TRUE 0.995 4.000 0.528 0.071 Y NA
 2002740 2002741 BAD_0071 BAD_0072     TRUE 0.942 74.000 0.361 1.000 Y NA
 2002741 2002742 BAD_0072 BAD_0073   LivF TRUE 0.996 2.000 0.582 0.044 Y NA
 2002742 2002743 BAD_0073 BAD_0074 LivF LivF FALSE 0.075 359.000 0.000 NA Y NA
 2002743 2002744 BAD_0074 BAD_0075 LivF   FALSE 0.059 382.000 0.250 NA N NA
 2002746 2002747 BAD_0077 BAD_0078   spl FALSE 0.003 807.000 0.000 NA   NA
 2002747 2002748 BAD_0078 BAD_0079 spl   FALSE 0.108 292.000 0.000 1.000 Y NA
 2002748 2002749 BAD_0079 BAD_0080   shiA FALSE 0.048 479.000 0.000 0.071 Y NA
 2002749 2002750 BAD_0080 BAD_0081 shiA ilvC2 FALSE 0.012 286.000 0.000 1.000 N NA
 2002756 2002757 BAD_0087 BAD_0088   aapA FALSE 0.133 113.000 0.000 NA   NA
 2002758 2002759 BAD_0089 BAD_0090 thiG   TRUE 0.666 151.000 0.054 0.038 Y NA
 2002760 2002761 BAD_0091 BAD_0092     FALSE 0.286 184.000 0.167 1.000 N NA
 2002761 2002762 BAD_0092 BAD_0093     TRUE 0.653 127.000 0.370 1.000 N NA
 2002762 2002763 BAD_0093 BAD_0094     TRUE 0.996 12.000 1.000 0.008 Y NA
 2002763 2002764 BAD_0094 BAD_0095     FALSE 0.062 171.000 0.000 1.000   NA
 2002766 2002767 BAD_0097 BAD_0098     TRUE 0.945 62.000 0.238 NA Y NA
 2002767 2002768 BAD_0098 BAD_0099     FALSE 0.161 267.000 0.386 NA   NA
 2002768 2002769 BAD_0099 BAD_0100     TRUE 0.951 26.000 0.625 NA   NA
 2002769 2002770 BAD_0100 BAD_0101     TRUE 0.961 31.000 0.878 NA N NA
 2002770 2002771 BAD_0101 BAD_0102     TRUE 0.982 18.000 0.175 NA Y NA
 2002771 2002772 BAD_0102 BAD_0103     TRUE 0.915 -3.000 0.041 1.000   NA
 2002773 2002774 BAD_0104 BAD_0105     TRUE 0.964 0.000 0.154 1.000   NA
 2002774 2002775 BAD_0105 BAD_0106     TRUE 0.990 -3.000 0.929 NA   NA
 2002779 2002780 BAD_0109 BAD_0110     FALSE 0.193 184.000 0.076 NA   NA
 2002783 2002784 BAD_0113 BAD_0114 amtP glnB TRUE 0.974 2.000 0.257 1.000 N NA
 2002784 2002785 BAD_0114 BAD_0115 glnB glnD FALSE 0.287 157.000 0.065 1.000 N NA
 2002785 2002786 BAD_0115 BAD_0116 glnD dnaB FALSE 0.006 386.000 0.000 1.000 N NA
 2002786 2002787 BAD_0116 BAD_0117 dnaB   TRUE 0.934 2.000 0.049 1.000 N NA
 2002787 2002788 BAD_0117 BAD_0118     TRUE 0.915 66.000 0.796 1.000   NA
 2002788 2002789 BAD_0118 BAD_0119     TRUE 0.558 68.000 0.030 NA   NA
 2002789 2002790 BAD_0119 BAD_0120     FALSE 0.034 515.000 0.205 NA   NA
 2002790 2002791 BAD_0120 BAD_0121     FALSE 0.026 214.000 0.000 NA   NA
 2002791 2002792 BAD_0121 BAD_0122     FALSE 0.113 134.000 0.000 NA   NA
 2002792 2002793 BAD_0122 BAD_0123     FALSE 0.005 504.000 0.000 NA N NA
 2002794 2002795 BAD_0124 BAD_0125 upp   FALSE 0.007 355.000 0.000 NA   NA
 2002795 2002796 BAD_0125 BAD_0126   mutT1 TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 2002796 2002797 BAD_0126 BAD_0127 mutT1 ppk FALSE 0.153 108.000 0.000 1.000 N NA
 2002798 2002799 BAD_0128 BAD_0129     TRUE 0.978 -19.000 0.776 NA   NA
 2002799 2002800 BAD_0129 BAD_0130     TRUE 0.988 0.000 0.659 NA   NA
 2002800 2002801 BAD_0130 BAD_0131     TRUE 0.926 -3.000 0.062 NA   NA
 2002801 2002802 BAD_0131 BAD_0132     FALSE 0.090 267.000 0.143 NA   NA
 2002802 2002803 BAD_0132 BAD_0133     TRUE 0.959 3.000 0.143 NA   NA
 2002803 2002804 BAD_0133 BAD_0134     TRUE 0.657 53.000 0.059 NA   NA
 2002804 2002805 BAD_0134 BAD_0135     TRUE 0.858 23.000 0.088 NA   NA
 2002807 2002808 BAD_0137 BAD_0138 dnaX recR TRUE 0.738 117.000 0.028 1.000 Y NA
 2002808 2002809 BAD_0138 BAD_0139 recR askA FALSE 0.283 120.000 0.010 1.000 N NA
 2002809 2002810 BAD_0139 BAD_0140 askA askB FALSE 0.255 117.000 0.014 0.002   NA
 2002812 2002813 BAD_0142 BAD_0143   pknB FALSE 0.264 69.000 0.000 NA   NA
 2002815 2002816 BAD_0145 BAD_0146     FALSE 0.015 259.000 0.000 NA   NA
 2002817 2002818 BAD_0147 BAD_0148     TRUE 0.996 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 2002819 2002820 BAD_0149 BAD_0150     TRUE 0.989 10.000 1.000 1.000   NA
 2002820 2002821 BAD_0150 BAD_0151     TRUE 0.747 -3.000 0.000 NA   NA
 2002821 2002822 BAD_0151 BAD_0152     FALSE 0.408 33.000 0.000 NA   NA
 2002822 2002823 BAD_0152 BAD_0153     FALSE 0.009 301.000 0.000 1.000   NA
 2002823 2002824 BAD_0153 BAD_0154     TRUE 0.964 88.000 1.000 0.070 Y NA
 2002824 2002825 BAD_0154 BAD_0155     TRUE 0.995 0.000 0.500 0.070 Y NA
 2002825 2002826 BAD_0155 BAD_0156     TRUE 0.991 8.000 0.250 1.000 Y NA
 2002830 2002831 BAD_0160 BAD_0161   topA FALSE 0.316 106.000 0.012 1.000   NA
 2002831 2002832 BAD_0161 BAD_0162 topA   FALSE 0.300 122.000 0.015 1.000 N NA
 2002832 2002833 BAD_0162 BAD_0163     TRUE 0.917 -3.000 0.037 1.000 N NA
 2002834 2002835 BAD_0164 BAD_0165 rbsR   FALSE 0.029 208.000 0.000 NA   NA
 2002836 2002837 BAD_0166 BAD_0167 ptsI   FALSE 0.392 138.000 0.095 NA   NA
 2002837 2002838 BAD_0167 BAD_0168   pepD FALSE 0.431 109.000 0.071 NA   NA
 2002838 2002839 BAD_0168 BAD_0169 pepD fhs FALSE 0.382 190.000 0.400 1.000 N NA
 2002843 2002844 BAD_0173 BAD_0174     FALSE 0.493 84.000 0.044 NA   NA
 2002846 2002847 BAD_0176 BAD_t0007 gltX gluT FALSE 0.032 199.000 0.000 NA   NA
 2002847 2002848 BAD_t0007 BAD_t0008 gluT glnT FALSE 0.390 36.000 0.000 NA   NA
 2002848 2002849 BAD_t0008 BAD_0177 glnT   FALSE 0.067 168.000 0.000 NA   NA
 2002851 2002852 BAD_0179 BAD_0180 leuC leuD TRUE 0.923 90.000 0.477 0.002 Y NA
 2002852 2002853 BAD_0180 BAD_0181 leuD   FALSE 0.006 402.000 0.000 NA N NA
 2002853 2002854 BAD_0181 BAD_0182     FALSE 0.080 193.000 0.003 NA N NA
 2002854 2002855 BAD_0182 BAD_0183   murA FALSE 0.298 96.000 0.005 1.000 N NA
 2002855 2002856 BAD_0183 BAD_0184 murA   FALSE 0.027 331.000 0.036 1.000 N NA
 2002856 2002857 BAD_0184 BAD_0185     FALSE 0.262 172.000 0.083 1.000 N NA
 2002857 2002858 BAD_0185 BAD_0186   ddlA TRUE 0.626 75.000 0.088 1.000 N NA
 2002858 2002859 BAD_0186 BAD_0187 ddlA   FALSE 0.023 232.000 0.000 1.000 N NA
 2002859 2002860 BAD_0187 BAD_0188     TRUE 0.974 2.000 0.301 0.070   NA
 2002860 2002861 BAD_0188 BAD_0189     TRUE 0.926 48.000 0.774 0.070   NA
 2002861 2002862 BAD_0189 BAD_0190   msiK TRUE 0.994 -3.000 0.461 0.070 Y NA
 2002862 2002863 BAD_0190 BAD_0191 msiK   FALSE 0.117 196.000 0.040 NA   NA
 2002865 2002866 BAD_0193 BAD_0194     FALSE 0.007 337.000 0.000 NA   NA
 2002866 2002867 BAD_0194 BAD_0195     TRUE 0.643 156.000 0.600 1.000   NA
 2002867 2002868 BAD_0195 BAD_0196     FALSE 0.369 105.000 0.026 1.000 N NA
 2002869 2002870 BAD_0197 BAD_0198     FALSE 0.480 187.000 0.032 1.000 Y NA
 2002870 2002871 BAD_0198 BAD_0199     TRUE 0.931 83.000 0.353 1.000 Y NA
 2002873 2002874 BAD_0201 BAD_0202     FALSE 0.024 217.000 0.000 1.000   NA
 2002875 2002876 BAD_0203 BAD_0204 rpmB recG FALSE 0.216 143.000 0.010 1.000   NA
 2002876 2002877 BAD_0204 BAD_0205 recG   TRUE 0.906 6.000 0.044 0.018   NA
 2002878 2002879 BAD_0206 BAD_0207 trmD   TRUE 0.943 93.000 0.672 1.000 Y NA
 2002879 2002880 BAD_0207 BAD_0208     TRUE 0.936 22.000 0.324 1.000   NA
 2002880 2002881 BAD_0208 BAD_0209   rpsP TRUE 0.978 3.000 0.385 1.000   NA
 2002883 2002884 BAD_0211 BAD_0212 ffh cysS FALSE 0.489 56.000 0.003 1.000 N NA
 2002885 2002886 BAD_0213 BAD_0214     FALSE 0.022 312.000 0.011 1.000   NA
 2002886 2002887 BAD_0214 BAD_0215     FALSE 0.022 288.000 0.006 NA   NA
 2002888 2002889 BAD_0216 BAD_0217     TRUE 0.994 3.000 0.400 NA Y NA
 2002890 2002891 BAD_0218 BAD_0219     FALSE 0.210 78.000 0.000 1.000   NA
 2002892 2002893 BAD_0220 BAD_0221 ilvN ilvB1 TRUE 0.972 33.000 0.380 0.002 Y NA
 2002893 2002894 BAD_0221 BCD_0222 ilvB1 rncS FALSE 0.020 302.000 0.003 1.000 N NA
 2002894 2002895 BCD_0222 BAD_0223 rncS   TRUE 0.747 -3.000 0.000 NA   NA
 2002895 2002896 BAD_0223 BAD_0224   rpmF FALSE 0.023 224.000 0.000 NA   NA
 2002896 2002897 BAD_0224 BAD_0225 rpmF   TRUE 0.790 96.000 0.599 NA   NA
 2002897 2002898 BAD_0225 BAD_0226     TRUE 0.598 56.000 0.027 NA   NA
 2002900 2002901 BAD_0228 BAD_0229     TRUE 0.751 5.000 0.000 NA   NA
 2002902 2002903 BAD_t0009 BAD_t0010 thrU leuT FALSE 0.164 93.000 0.000 NA   NA
 2002903 2002904 BAD_t0010 BAD_0230 leuT   TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 2002904 2002905 BAD_0230 BAD_0231   pgi FALSE 0.012 273.000 0.000 1.000   NA
 2002905 2002906 BAD_0231 BAD_0232 pgi   FALSE 0.007 362.000 0.000 1.000 N NA
 2002906 2002907 BAD_0232 BAD_0233     FALSE 0.276 67.000 0.000 NA   NA
 2002907 2002908 BAD_0233 BAD_0234     FALSE 0.017 247.000 0.000 NA   NA
 2002908 2002909 BAD_0234 BAD_0235     FALSE 0.219 129.000 0.002 1.000 N NA
 2002909 2002910 BAD_0235 BAD_0236     TRUE 0.989 -3.000 0.811 NA   NA
 2002912 2002913 BAD_0238 BAD_0239 dapE   FALSE 0.005 435.000 0.000 1.000 N NA
 2002913 2002914 BAD_0239 BAD_0240   rplU TRUE 0.659 145.000 0.027 0.029 Y NA
 2002914 2002915 BAD_0240 BAD_0241 rplU rpmA TRUE 0.979 40.000 0.667 0.034 Y NA
 2002915 2002916 BAD_0241 BAD_0242 rpmA obg TRUE 0.781 77.000 0.335 1.000   NA
 2002916 2002917 BAD_0242 BAD_0243 obg proB TRUE 0.699 83.000 0.206 1.000   NA
 2002917 2002918 BAD_0243 BAD_0244 proB aspC TRUE 0.714 124.000 0.014 1.000 Y NA
 2002920 2002921 BAD_0245 BAD_0246 secE nusG TRUE 0.968 25.000 0.843 1.000   NA
 2002921 2002922 BAD_0246 BAD_0247 nusG rplK FALSE 0.144 345.000 0.681 1.000 N NA
 2002922 2002923 BAD_0247 BAD_0248 rplK rplA TRUE 0.995 15.000 0.838 0.045 Y NA
 2002925 2002926 BAD_0250 BAD_0251     FALSE 0.489 72.000 0.014 NA   NA
 2002927 2002928 BAD_0252 BAD_0253 xerD   FALSE 0.229 76.000 0.000 NA   NA
 2002929 2002930 BAD_0254 BAD_0255   pccB TRUE 0.995 -3.000 0.579 1.000 Y NA
 2002930 2002931 BAD_0255 BAD_0256 pccB fas TRUE 0.928 75.000 0.250 1.000 Y NA
 2002931 2002932 BAD_0256 BAD_0257 fas   TRUE 0.712 159.000 0.138 0.002 Y NA
 2002932 2002933 BAD_0257 BAD_t0012   glyU FALSE 0.194 86.000 0.000 NA   NA
 2002933 2002934 BAD_t0012 BAD_0258 glyU   FALSE 0.089 150.000 0.000 NA   NA
 2002934 2002935 BAD_0258 BAD_0259   rpsO FALSE 0.161 155.000 0.004 NA   NA
 2002935 2002936 BAD_0259 BAD_0260 rpsO pnpA FALSE 0.279 230.000 0.011 1.000 Y NA
 2002936 2002937 BAD_0260 BAD_0261 pnpA lemA FALSE 0.009 303.000 0.000 NA   NA
 2002937 2002938 BAD_0261 BAD_0262 lemA   FALSE 0.102 139.000 0.000 NA   NA
 2002938 2002939 BAD_0262 BAD_0263     FALSE 0.269 68.000 0.000 NA   NA
 2002939 2002940 BAD_0263 BAD_0264     FALSE 0.019 238.000 0.000 NA   NA
 2002942 2002943 BAD_0266 BAD_0267 yisV   TRUE 0.613 19.000 0.000 1.000 N NA
 2002943 2002944 BAD_0267 BAD_0268     TRUE 0.544 55.000 0.010 NA   NA
 2002944 2002945 BAD_0268 BAD_0269   ispD TRUE 0.589 44.000 0.010 NA   NA
 2002945 2002946 BAD_0269 BAD_0270 ispD pcp TRUE 0.739 68.000 0.150 1.000 N NA
 2002946 2002947 BAD_0270 BAD_0271 pcp   FALSE 0.214 235.000 0.368 NA   NA
 2002947 2002948 BAD_0271 BAD_0272   pepC2 TRUE 0.957 23.000 0.571 NA   NA
 2002948 2002949 BAD_0272 BAD_0273 pepC2 aroG2 FALSE 0.163 430.000 0.214 1.000 Y NA
 2002949 2002950 BAD_0273 BAD_0274 aroG2 aroG TRUE 0.964 58.000 0.500 0.002 Y NA
 2002950 2002951 BAD_0274 BAD_0275 aroG pfs TRUE 0.563 104.000 0.141 1.000 N NA
 2002951 2002952 BAD_0275 BAD_0276 pfs   FALSE 0.020 244.000 0.000 1.000 N NA
 2002952 2002953 BAD_0276 BAD_0277     TRUE 0.982 -3.000 0.020 1.000 Y NA
 2002953 2002954 BAD_0277 BAD_0278   pstS FALSE 0.228 167.000 0.046 1.000 N NA
 2002954 2002955 BAD_0278 BAD_0279 pstS pstC TRUE 0.828 163.000 0.529 0.004 Y NA
 2002955 2002956 BAD_0279 BAD_0280 pstC pstA TRUE 0.990 -3.000 0.172 0.004 Y NA
 2002956 2002957 BAD_0280 BAD_0281 pstA pstB TRUE 0.963 45.000 0.373 0.004 Y NA
 2002957 2002958 BAD_0281 BAD_0282 pstB   FALSE 0.204 232.000 0.000 1.000 Y NA
 2002960 2002961 BAD_0284 BAD_0285 rplJ rplL TRUE 0.942 114.000 0.884 0.034 Y NA
 2002961 2002962 BAD_0285 BAD_0286 rplL   FALSE 0.050 215.000 0.002 NA   NA
 2002962 2002963 BAD_0286 BAD_0287     TRUE 0.931 -3.000 0.070 NA   NA
 2002964 2002965 BAD_0288 BAD_0289     FALSE 0.006 381.000 0.000 NA   NA
 2002966 2002967 BAD_0290 BAD_0291     TRUE 0.607 60.000 0.037 NA   NA
 2002967 2002968 BAD_0291 BAD_0292   groES FALSE 0.024 223.000 0.000 NA   NA
 2002968 2002969 BAD_0292 BAD_t0013 groES tyrT FALSE 0.024 223.000 0.000 NA   NA
 2002969 2002970 BAD_t0013 BAD_t0014 tyrT thrV TRUE 0.774 2.000 0.000 NA   NA
 2002970 2002971 BAD_t0014 BAD_t0015 thrV metU TRUE 0.743 6.000 0.000 NA   NA
 2002971 2002972 BAD_t0015 BAD_0293 metU rpmG FALSE 0.324 49.000 0.000 NA   NA
 2002972 2002973 BAD_0293 BAD_0294 rpmG murB FALSE 0.118 191.000 0.022 1.000 N NA
 2002973 2002974 BAD_0294 BAD_0295 murB   TRUE 0.571 61.000 0.017 1.000 N NA
 2002974 2002975 BAD_0295 BAD_0296   fdxC TRUE 0.912 37.000 0.471 1.000 N NA
 2002975 2002976 BAD_0296 BAD_0297 fdxC   FALSE 0.119 201.000 0.052 1.000 N NA
 2002978 2002979 BAD_0299 BAD_0300     TRUE 0.959 2.000 0.125 NA   NA
 2002979 2002980 BAD_0300 BAD_0301     TRUE 0.990 0.000 0.118 0.018 Y NA
 2002980 2002981 BAD_0301 BAD_0302     TRUE 0.953 -3.000 0.118 NA N NA
 2002983 2002984 BAD_0303 BAD_0304     TRUE 0.899 6.000 0.013 NA N NA
 2002984 2002985 BAD_0304 BAD_0305     FALSE 0.514 79.000 0.038 NA N NA
 2002985 2002986 BAD_0305 BAD_0306     TRUE 0.554 60.000 0.015 1.000   NA
 2002986 2002987 BAD_0306 BAD_0307     TRUE 0.581 46.000 0.012 1.000   NA
 2002987 2002988 BAD_0307 BAD_0308   malQ1 TRUE 0.911 61.000 0.700 1.000   NA
 2002988 2002989 BAD_0308 BAD_0309 malQ1   FALSE 0.014 272.000 0.000 1.000 N NA
 2002989 2002990 BAD_0309 BAD_0310   rpsI TRUE 0.989 21.000 0.601 0.033 Y NA
 2002991 2002992 BAD_0311 BAD_0312     FALSE 0.229 76.000 0.000 NA   NA
 2002993 2002994 BAD_0313 BAD_0314   ywbC FALSE 0.010 286.000 0.000 NA   NA
 2002996 2002997 BAD_0316 BAD_0317 rbtT   TRUE 0.956 7.000 0.160 1.000 N NA
 2002997 2002998 BAD_0317 BAD_0318     TRUE 0.841 40.000 0.200 1.000 N NA
 2002998 2002999 BAD_0318 BAD_0319     FALSE 0.007 354.000 0.000 1.000 N NA
 2002999 2003000 BAD_0319 BAD_0320   rpsJ FALSE 0.005 460.000 0.000 1.000 N NA
 2003000 2003001 BAD_0320 BAD_0321 rpsJ rplC TRUE 0.989 18.000 0.467 0.044 Y NA
 2003001 2003002 BAD_0321 BAD_0322 rplC rplD TRUE 0.993 7.000 0.361 0.033 Y NA
 2003002 2003003 BAD_0322 BAD_0323 rplD rplW TRUE 0.995 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 2003003 2003004 BAD_0323 BAD_0324 rplW rplB TRUE 0.986 37.000 0.849 1.000 Y NA
 2003004 2003005 BAD_0324 BAD_0325 rplB rpsS TRUE 0.994 16.000 0.820 0.044 Y NA
 2003005 2003006 BAD_0325 BAD_0326 rpsS rplV TRUE 0.993 17.000 0.769 0.044 Y NA
 2003006 2003007 BAD_0326 BAD_0327 rplV rpsC TRUE 0.996 3.000 0.719 0.044 Y NA
 2003007 2003008 BAD_0327 BAD_0328 rpsC rplP TRUE 0.996 8.000 0.828 0.044 Y NA
 2003008 2003009 BAD_0328 BAD_0329 rplP rpmC TRUE 0.997 0.000 0.802 0.033 Y NA
 2003009 2003010 BAD_0329 BAD_0330 rpmC rpsQ TRUE 0.997 0.000 0.828 0.033 Y NA
 2003010 2003011 BAD_0330 BAD_0331 rpsQ rplN TRUE 0.949 92.000 0.791 0.044 Y NA
 2003011 2003012 BAD_0331 BAD_0332 rplN rplX TRUE 0.997 2.000 0.810 0.044 Y NA
 2003012 2003013 BAD_0332 BAD_0333 rplX rplE TRUE 0.996 -3.000 0.758 0.033 Y NA
 2003013 2003014 BAD_0333 BAD_0334 rplE rpsN TRUE 0.995 2.000 0.496 0.033 Y NA
 2003014 2003015 BAD_0334 BAD_0335 rpsN rpsH TRUE 0.935 85.000 0.473 0.033 Y NA
 2003015 2003016 BAD_0335 BAD_0336 rpsH rplF TRUE 0.993 18.000 0.808 0.033 Y NA
 2003016 2003017 BAD_0336 BAD_0337 rplF rplR TRUE 0.997 0.000 0.815 0.033 Y NA
 2003017 2003018 BAD_0337 BAD_0338 rplR rpsE TRUE 0.997 -3.000 0.814 0.044 Y NA
 2003018 2003019 BAD_0338 BAD_0339 rpsE rpmD TRUE 0.996 -3.000 0.789 0.044 Y NA
 2003019 2003020 BAD_0339 BAD_0340 rpmD rplO TRUE 0.996 3.000 0.653 0.006 Y NA
 2003020 2003021 BAD_0340 BAD_0341 rplO secY FALSE 0.501 193.000 0.730 1.000 N NA
 2003021 2003022 BAD_0341 BAD_0342 secY adk FALSE 0.381 118.000 0.057 1.000 N NA
 2003022 2003023 BAD_0342 BAD_0343 adk infA FALSE 0.204 148.000 0.008 1.000 N NA
 2003023 2003024 BAD_0343 BAD_0344 infA rpmJ TRUE 0.916 24.000 0.257 1.000   NA
 2003024 2003025 BAD_0344 BAD_0345 rpmJ rpsM FALSE 0.487 137.000 0.194 0.033   NA
 2003025 2003026 BAD_0345 BAD_0346 rpsM rpsK TRUE 0.960 85.000 0.810 0.033 Y NA
 2003026 2003027 BAD_0346 BAD_0347 rpsK rpoA TRUE 0.863 45.000 0.308 1.000 N NA
 2003027 2003028 BAD_0347 BAD_0348 rpoA rplQ TRUE 0.876 89.000 0.873 1.000 N NA
 2003028 2003029 BAD_0348 BAD_0349 rplQ truA TRUE 0.819 107.000 0.102 1.000 Y NA
 2003029 2003030 BAD_0349 BAD_0350 truA   FALSE 0.117 177.000 0.006 NA   NA
 2003030 2003031 BAD_0350 BAD_0351     FALSE 0.341 105.000 0.018 NA   NA
 2003032 2003033 BAD_t0017 BAD_0352 serU   FALSE 0.122 121.000 0.000 NA   NA
 2003034 2003035 BAD_0353 BAD_0354 nusA infB FALSE 0.267 213.000 0.342 1.000 N NA
 2003035 2003036 BAD_0354 BAD_0355 infB rbfA TRUE 0.915 110.000 0.530 1.000 Y NA
 11524336 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3181.000 0.000 NA   NA
 11666699 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3181.000 0.000 NA   NA
 11809091 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3181.000 0.000 NA   NA
 11524337 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3200.000 0.000 NA   NA
 11666700 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3200.000 0.000 NA   NA
 11809092 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3200.000 0.000 NA   NA
 11524338 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3223.000 0.000 NA   NA
 11666701 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3223.000 0.000 NA   NA
 11809093 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3223.000 0.000 NA   NA
 11524339 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3242.000 0.000 NA   NA
 11666702 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3242.000 0.000 NA   NA
 11809094 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3242.000 0.000 NA   NA
 11524340 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3268.000 0.000 NA   NA
 11666703 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3268.000 0.000 NA   NA
 11809095 2003031   BAD_0351     FALSE NA 3268.000 0.000 NA   NA
 2003036 2003037 BAD_0355 BAD_0356 rbfA truB TRUE 0.988 -16.000 0.318 1.000 Y NA
 2003037 2003038 BAD_0356 BAD_0357 truB ribF TRUE 0.527 70.000 0.019 1.000 N NA
 2003041 2003042 BAD_0360 BAD_0361     FALSE 0.060 174.000 0.000 NA   NA
 2003042 2003043 BAD_0361 BAD_0362   rnh FALSE 0.072 222.000 0.014 1.000 N NA
 2003043 2003044 BAD_0362 BAD_0363 rnh   TRUE 0.599 105.000 0.200 NA   NA
 2003044 2003045 BAD_0363 BAD_0364     TRUE 0.992 2.000 1.000 NA   NA
 2003045 2003046 BAD_0364 BAD_0365   pgm FALSE 0.014 270.000 0.000 1.000 N NA
 2003047 2003048 BAD_0366 BAD_0367 ptsG   TRUE 0.976 2.000 0.310 1.000   NA
 2003050 2003051 BAD_0369 BAD_t0018   serT FALSE 0.021 230.000 0.000 NA   NA
 2003052 2003053 BAD_0370 BAD_0371     TRUE 0.978 54.000 0.797 NA Y NA
 2003054 2003055 BAD_0372 BAD_0373     TRUE 0.986 -3.000 0.667 NA   NA
 2003056 2003057 BAD_0374 BAD_0375     FALSE 0.008 312.000 0.000 1.000   NA
 2003057 2003058 BAD_0375 BAD_t0019   proV FALSE 0.077 159.000 0.000 NA   NA
 2003059 2003060 BAD_0376 BAD_0377 lysS   TRUE 0.565 55.000 0.011 1.000 N NA
 2003060 2003061 BAD_0377 BAD_0378   gpm TRUE 0.878 14.000 0.033 1.000 N NA
 2003062 2003063 BAD_0379 BAD_0380     FALSE 0.015 256.000 0.000 NA   NA
 2003065 2003066 BAD_0382 BAD_0383   serC TRUE 0.805 27.000 0.071 NA   NA
 2003067 2003068 BAD_0384 BAD_0385     TRUE 0.817 63.000 0.273 NA   NA
 2003068 2003069 BAD_0385 BAD_0386     TRUE 0.576 141.000 0.318 1.000 N NA
 2003071 2003072 BAD_0388 BAD_0389 thyA dfrA TRUE 0.801 70.000 0.295 1.000 N NA
 2003072 2003073 BAD_0389 BAD_0390 dfrA ptpA TRUE 0.895 7.000 0.015 1.000 N NA
 2003074 2003075 BAD_t0020 BAD_0391 aspT galE2 FALSE 0.118 128.000 0.000 NA   NA
 2003076 2003077 BAD_0392 BAD_t0021   gluU FALSE 0.094 146.000 0.000 NA   NA
 2003077 2003078 BAD_t0021 BAD_t0022 gluU aspT FALSE 0.479 26.000 0.000 NA   NA
 2003078 2003079 BAD_t0022 BAD_t0023 aspT pheT FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 2003079 2003080 BAD_t0023 BAD_0393 pheT   FALSE 0.017 247.000 0.000 NA   NA
 2003080 2003081 BAD_0393 BAD_0394     TRUE 0.987 0.000 0.636 1.000   NA
 2003081 2003082 BAD_0394 BAD_0395     TRUE 0.861 69.000 0.500 1.000   NA
 2003082 2003083 BAD_0395 BAD_0396     TRUE 0.983 -3.000 0.577 1.000   NA
 2003083 2003084 BAD_0396 BAD_0397     TRUE 0.983 2.000 0.474 NA   NA
 2003084 2003085 BAD_0397 BAD_0398   cotH TRUE 0.968 18.000 0.583 NA   NA
 2003085 2003086 BAD_0398 BAD_0399 cotH   TRUE 0.977 -10.000 0.667 NA   NA
 2003087 2003088 BAD_0400 BAD_0401 vrrB   FALSE 0.194 86.000 0.000 NA   NA
 2003088 2003089 BAD_0401 BAD_0402     FALSE 0.004 496.000 0.000 NA   NA
 2003092 2003093 BAD_0405 BAD_0406     TRUE 0.977 0.000 0.321 NA   NA
 2003093 2003094 BAD_0406 BAD_0407     TRUE 0.930 33.000 0.024 NA Y NA
 2003094 2003095 BAD_0407 BAD_0408   hprT TRUE 0.526 72.000 0.024 1.000 N NA
 2003095 2003096 BAD_0408 BAD_0409 hprT   TRUE 0.911 -3.000 0.026 1.000 N NA
 2003096 2003097 BAD_0409 BAD_0410   folE TRUE 0.971 0.000 0.212 1.000 N NA
 2003097 2003098 BAD_0410 BAD_0411 folE folP TRUE 0.974 48.000 0.609 1.000 Y NA
 2003098 2003099 BAD_0411 BAD_0412 folP sulD TRUE 0.852 85.000 0.080 0.006 Y NA
 2003099 2003100 BAD_0412 BAD_0413 sulD   TRUE 0.699 63.000 0.100 NA   NA
 2003101 2003102 BAD_0414 BAD_0415 tesB   FALSE 0.054 225.000 0.009 1.000   NA
 2003103 2003104 BAD_0416 BAD_0417   cpxR FALSE 0.018 243.000 0.000 NA   NA
 2003104 2003105 BAD_0417 BAD_0418 cpxR ribD FALSE 0.336 46.000 0.000 NA   NA
 2003109 2003110 BAD_0422 BAD_0423 xylA   FALSE 0.004 390.000 0.000 0.046   NA
 2003112 2003113 BAD_0425 BAD_0426     TRUE 0.981 17.000 0.154 0.065 Y NA
 2003113 2003114 BAD_0426 BAD_0427     TRUE 0.997 0.000 0.833 0.065 Y NA
 2003114 2003115 BAD_0427 BAD_0428   xynB TRUE 0.903 77.000 0.143 1.000 Y NA
 2003115 2003116 BAD_0428 BAD_0429 xynB   TRUE 0.772 54.000 0.154 1.000   NA
 2003116 2003117 BAD_0429 BAD_0430     FALSE 0.371 40.000 0.000 NA   NA
 2003117 2003118 BAD_0430 BAD_0431     FALSE 0.408 33.000 0.000 NA   NA
 2003120 2003121 BAD_0433 BAD_0434   ggtA FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 2003121 2003122 BAD_0434 BAD_0435 ggtA   FALSE 0.004 546.000 0.000 NA   NA
 2003122 2003123 BAD_0435 BAD_0436     FALSE 0.430 123.000 0.095 NA   NA
 2003124 2003125 BAD_0437 BAD_0438     FALSE 0.168 97.000 0.000 1.000 N NA
 2003125 2003126 BAD_0438 BAD_0439     FALSE 0.008 324.000 0.000 1.000   NA
 2003127 2003128 BAD_t0024 BAD_0440 ileT rpmE FALSE 0.049 182.000 0.000 NA   NA
 2003128 2003129 BAD_0440 BAD_0441 rpmE prfA TRUE 0.595 182.000 0.110 1.000 Y NA
 2003129 2003130 BAD_0441 BAD_0442 prfA   TRUE 0.983 10.000 0.069 1.000 Y NA
 2003130 2003131 BAD_0442 BAD_0443     FALSE 0.285 141.000 0.031 1.000 N NA
 2003131 2003132 BAD_0443 BAD_0444     TRUE 0.733 133.000 0.044 1.000 Y NA
 2003132 2003133 BAD_0444 BAD_0445     TRUE 0.993 5.000 0.345 0.065 Y NA
 2003133 2003134 BAD_0445 BAD_0446     TRUE 0.993 -3.000 0.349 1.000 Y NA
 2003134 2003135 BAD_0446 BAD_0447     TRUE 0.995 0.000 0.440 0.040 Y NA
 2003135 2003136 BAD_0447 BAD_0448     FALSE 0.258 158.000 0.043 NA N NA
 2003136 2003137 BAD_0448 BAD_0449   rfe TRUE 0.933 -3.000 0.065 NA N NA
 2003137 2003138 BAD_0449 BAD_0450 rfe guaB FALSE 0.227 138.000 0.008 1.000 N NA
 2003140 2003141 BAD_0452 BAD_0453 aglA orn FALSE 0.021 239.000 0.000 1.000 N NA
 2003141 2003142 BAD_0453 BAD_0454 orn   TRUE 0.714 28.000 0.019 1.000   NA
 2003142 2003143 BAD_0454 BAD_0455     TRUE 0.678 45.000 0.056 1.000   NA
 2003143 2003144 BAD_0455 BAD_0456   proS FALSE 0.007 582.000 0.002 1.000   NA
 2003144 2003145 BAD_0456 BAD_0457 proS   FALSE 0.005 394.000 0.000 1.000   NA
 2003147 2003148 BAD_0459 BAD_0460 map gltA2 FALSE 0.330 141.000 0.061 1.000 N NA
 2003148 2003149 BAD_0460 BAD_0461 gltA2   FALSE 0.299 142.000 0.042 1.000 N NA
 2003149 2003150 BAD_0461 BAD_0462     TRUE 0.856 8.000 0.007 NA   NA
 2003150 2003151 BAD_0462 BAD_0463   prfB FALSE 0.006 374.000 0.000 NA   NA
 2003151 2003152 BAD_0463 BAD_0464 prfB ftsE TRUE 0.818 24.000 0.053 1.000 N NA
 2003152 2003153 BAD_0464 BAD_0465 ftsE ftsX TRUE 0.979 -3.000 0.431 1.000 N NA
 2003153 2003154 BAD_0465 BAD_0466 ftsX   TRUE 0.849 10.000 0.007 NA   NA
 2003154 2003155 BAD_0466 BAD_0467   smpB FALSE 0.218 129.000 0.004 NA   NA
 2003155 2003156 BAD_0467 BAD_0468 smpB   FALSE 0.221 127.000 0.002 1.000 N NA
 2003156 2003157 BAD_0468 BAD_0469     TRUE 0.637 111.000 0.000 0.008 Y NA
 2003157 2003158 BAD_0469 BAD_0470     TRUE 0.956 50.000 0.333 0.008 Y NA
 2003158 2003159 BAD_0470 BAD_0471     TRUE 0.942 35.000 0.094 0.065 Y NA
 2003159 2003160 BAD_0471 BAD_0472     TRUE 0.993 -3.000 0.344 1.000 Y NA
 2003160 2003161 BAD_0472 BAD_0473   glmS FALSE 0.024 230.000 0.000 1.000 N NA
 2003161 2003162 BAD_0473 BAD_0474 glmS   TRUE 0.556 59.000 0.011 1.000 N NA
 2003162 2003163 BAD_0474 BAD_0475     FALSE 0.358 109.000 0.026 1.000 N NA
 2003163 2003164 BAD_0475 BAD_0476     FALSE 0.044 190.000 0.000 1.000 N NA
 2003165 2003166 BAD_0477 BAD_0478     FALSE 0.404 92.000 0.025 1.000 N NA
 2003167 2003168 BAD_0479 BAD_0480     TRUE 0.979 16.000 0.114 0.065 Y NA
 2003168 2003169 BAD_0480 BAD_0481     TRUE 0.966 78.000 0.829 0.065 Y NA
 2003169 2003170 BAD_0481 BAD_0482   oppD TRUE 0.988 -3.000 0.110 1.000 Y NA
 2003170 2003171 BAD_0482 BAD_0483 oppD oppF TRUE 0.995 14.000 0.889 0.040 Y NA
 2003171 2003172 BAD_0483 BAD_0484 oppF   FALSE 0.033 198.000 0.000 NA   NA
 2003172 2003173 BAD_0484 BAD_0485     TRUE 0.638 -15.000 0.000 NA   NA
 2003173 2003174 BAD_0485 BAD_0486     TRUE 0.747 -3.000 0.000 NA   NA
 2003174 2003175 BAD_0486 BAD_0487     TRUE 0.747 -3.000 0.000 NA   NA
 2003175 2003176 BAD_0487 BAD_0488     FALSE 0.005 440.000 0.000 NA   NA
 2003176 2003177 BAD_0488 BAD_0489   ytfF TRUE 0.747 -3.000 0.000 NA   NA
 2003177 2003178 BAD_0489 BAD_0490 ytfF cbsSV FALSE 0.019 241.000 0.000 NA   NA
 2003178 2003179 BAD_0490 BAD_0491 cbsSV metB TRUE 0.969 16.000 0.032 0.018 Y NA
 2003179 2003180 BAD_0491 BAD_0492 metB recQ TRUE 0.671 37.000 0.023 1.000 N NA
 2003180 2003181 BAD_0492 BAD_0493 recQ   FALSE 0.386 95.000 0.023 1.000 N NA
 2003181 2003182 BAD_0493 BAD_0494     FALSE 0.479 78.000 0.026 NA   NA
 2003184 2003185 BAD_0496 BAD_0497 alr   TRUE 0.644 51.000 0.041 1.000 N NA
 2003185 2003186 BAD_0497 BAD_0498   dnaG TRUE 0.799 24.000 0.037 1.000 N NA
 2003186 2003187 BAD_0498 BAD_0499 dnaG   FALSE 0.011 296.000 0.000 1.000 N NA
 2003187 2003188 BAD_0499 BAD_0500     FALSE 0.105 138.000 0.000 NA   NA
 2003188 2003189 BAD_0500 BAD_t0025   argT FALSE 0.311 54.000 0.000 NA   NA
 2003189 2003190 BAD_t0025 BAD_0501 argT   FALSE 0.190 87.000 0.000 NA   NA
 2003191 2003192 BAD_t0026 BAD_t0027 glyV valX FALSE 0.401 34.000 0.000 NA   NA
 2003192 2003193 BAD_t0027 BAD_t0028 valX valU FALSE 0.336 46.000 0.000 NA   NA
 2003193 2003194 BAD_t0028 BAD_0502 valU   FALSE 0.182 88.000 0.000 NA   NA
 2003195 2003196 BAD_0503 BAD_0504     TRUE 0.995 -13.000 0.841 0.012 Y NA
 2003196 2003197 BAD_0504 BAD_0505   gltL TRUE 0.995 -7.000 0.773 1.000 Y NA
 2003197 2003198 BAD_0505 BAD_0506 gltL   TRUE 0.978 45.000 0.671 1.000 Y NA
 2003198 2003199 BAD_0506 BAD_0507   metC FALSE 0.085 329.000 0.000 1.000 Y NA
 2003199 2003200 BAD_0507 BAD_0508 metC   FALSE 0.012 280.000 0.000 1.000 N NA
 2003202 2003203 BAD_0510 BAD_0511     TRUE 0.885 28.000 0.214 1.000   NA
 2003203 2003204 BAD_0511 BAD_0512     TRUE 0.959 3.000 0.143 1.000   NA
 2003206 2003207 BAD_0514 BAD_0515 badC purE FALSE 0.496 54.000 0.006 1.000   NA
 2003207 2003208 BAD_0515 BAD_0516 purE purK TRUE 0.935 29.000 0.024 0.002 Y NA
 2003208 2003209 BAD_0516 BAD_0517 purK fur TRUE 0.937 12.000 0.122 1.000 N NA
 2003209 2003210 BAD_0517 BAD_0518 fur   FALSE 0.089 210.000 0.024 1.000 N NA
 2003211 2003212 BAD_0519 BAD_0520 purD purM TRUE 0.799 91.000 0.027 1.000 Y NA
 2003212 2003213 BAD_0520 BAD_0521 purM purF TRUE 0.983 20.000 0.248 1.000 Y NA
 2003215 2003216 BAD_0523 BAD_0524 purQ_purL purC TRUE 0.748 119.000 0.043 1.000 Y NA
 2003216 2003217 BAD_0524 BAD_0525 purC purT TRUE 0.687 136.000 0.011 1.000 Y NA
 2003219 2003220 BAD_0527 BAD_t0029 tal hisT FALSE 0.144 106.000 0.000 NA   NA
 2003223 2003224 BAD_0530 BAD_0531 rpsL rpsG TRUE 0.995 6.000 0.620 0.006 Y NA
 2003224 2003225 BAD_0531 BAD_0532 rpsG fusA1 TRUE 0.981 31.000 0.579 1.000 Y NA
 2003225 2003226 BAD_0532 BAD_0533 fusA1 tuf TRUE 0.785 169.000 0.400 0.002 Y NA
 10712379 2003228 BAD_1700 BAD_0535   carA FALSE 0.004 580.000 0.000 1.000 N NA
 2003228 2003229 BAD_0535 BAD_0536 carA carB TRUE 0.990 -7.000 0.345 0.002 Y NA
 2003229 2003230 BAD_0536 BAD_0537 carB   TRUE 0.989 0.000 0.075 1.000 Y NA
 2003230 2003231 BAD_0537 BAD_0538     TRUE 0.885 61.000 0.013 1.000 Y NA
 2003233 2003234 BAD_0540 BAD_0541 rpoZ metK FALSE 0.135 174.000 0.007 1.000 N NA
 2003234 2003235 BAD_0541 BAD_0542 metK priA TRUE 0.676 59.000 0.068 NA N NA
 2003235 2003236 BAD_0542 BAD_0543 priA   TRUE 0.565 67.000 0.030 NA   NA
 2003236 2003237 BAD_0543 BAD_0544   fmt FALSE 0.248 106.000 0.003 1.000   NA
 2003239 2003240 BAD_0546 BAD_0547     TRUE 0.829 72.000 0.416 NA   NA
 2003240 2003241 BAD_0547 BAD_0548     FALSE 0.427 135.000 0.106 NA   NA
 2003241 2003242 BAD_0548 BAD_0549     FALSE 0.011 285.000 0.000 NA   NA
 2003243 2003244 BAD_0550 BAD_0551     TRUE 0.877 -3.000 0.008 NA   NA
 2003244 2003245 BAD_0551 BAD_0552   hup FALSE 0.286 145.000 0.043 NA   NA
 2003245 2003246 BAD_0552 BAD_0553 hup   FALSE 0.441 155.000 0.196 NA   NA
 2003246 2003247 BAD_0553 BAD_0554   purB FALSE 0.196 148.000 0.008 NA   NA
 2003247 2003248 BAD_0554 BAD_0555 purB   TRUE 0.528 40.000 0.002 1.000   NA
 2003248 2003249 BAD_0555 BAD_0556     TRUE 0.936 -3.000 0.080 NA   NA
 2003249 2003250 BAD_0556 BAD_0557   ebpS FALSE 0.470 147.000 0.200 NA   NA
 2003250 2003251 BAD_0557 BAD_0558 ebpS   TRUE 0.934 -3.000 0.074 NA   NA
 2003251 2003252 BAD_0558 BAD_0559     TRUE 0.929 -3.000 0.066 NA   NA
 2003252 2003253 BAD_0559 BAD_0560     TRUE 0.988 1.000 0.700 NA   NA
 2003253 2003254 BAD_0560 BAD_0561     TRUE 0.988 0.000 0.692 NA   NA
 2003254 2003255 BAD_0561 BAD_0562     TRUE 0.974 -3.000 0.345 NA   NA
 2003255 2003256 BAD_0562 BAD_0563   ung TRUE 0.898 19.000 0.113 1.000   NA
 2003257 2003258 BAD_0564 BAD_0565   groEL FALSE 0.012 275.000 0.000 NA   NA
 2003260 2003261 BAD_0567 BAD_0568     TRUE 0.956 4.000 0.132 NA   NA
 2003261 2003262 BAD_0568 BAD_0569     TRUE 0.969 75.000 0.824 0.092 Y NA
 2003262 2003263 BAD_0569 BAD_0570   cspB FALSE 0.371 152.000 0.107 1.000 N NA
 2003263 2003264 BAD_0570 BAD_0571 cspB   TRUE 0.733 7.000 0.000 NA   NA
 2003268 2003269 BAD_0575 BAD_0576 hisS aspS TRUE 0.898 48.000 0.020 0.049 Y NA
 2003269 2003270 BAD_0576 BAD_0577 aspS   FALSE 0.073 194.000 0.002 1.000 N NA
 2003270 2003271 BAD_0577 BAD_0578     TRUE 0.991 -3.000 0.209 1.000 Y NA
 2003271 2003272 BAD_0578 BAD_0579   gluA TRUE 0.589 135.000 0.000 0.039 Y NA
 2003272 2003273 BAD_0579 BAD_0580 gluA gluB TRUE 0.944 67.000 0.276 1.000 Y NA
 2003273 2003274 BAD_0580 BAD_0581 gluB gluC TRUE 0.994 0.000 0.370 0.077 Y NA
 2003274 2003275 BAD_0581 BAD_0582 gluC gluD TRUE 0.985 7.000 0.087 0.012 Y NA
 2003275 2003276 BAD_0582 BAD_0583 gluD   FALSE 0.163 161.000 0.008 NA   NA
 2003278 2003279 BAD_0585 BAD_0586     FALSE 0.197 139.000 0.006 1.000   NA
 2003279 2003280 BAD_0586 BAD_0587   clp1 FALSE 0.138 106.000 0.000 1.000   NA
 2003280 2003281 BAD_0587 BAD_0588 clp1 clpP2 TRUE 0.995 3.000 0.512 0.001 Y NA
 2003281 2003282 BAD_0588 BAD_0589 clpP2 clpX TRUE 0.984 -3.000 0.039 1.000 Y NA
 2003282 2003283 BAD_0589 BAD_t0030 clpX argU FALSE 0.182 88.000 0.000 NA   NA
 2003283 2003284 BAD_t0030 BAD_t0031 argU argV FALSE 0.359 42.000 0.000 NA   NA
 2003284 2003285 BAD_t0031 BAD_0590 argV nhaA FALSE 0.042 188.000 0.000 NA   NA
 2003286 2003287 BAD_0591 BAD_0592 safC   TRUE 0.935 2.000 0.062 1.000   NA
 2003287 2003288 BAD_0592 BAD_0593   sdhA TRUE 0.879 59.000 0.012 0.001 Y NA
 2003288 2003289 BAD_0593 BAD_0594 sdhA   FALSE 0.466 69.000 0.007 1.000 N NA
 2003289 2003290 BAD_0594 BAD_0595     TRUE 0.894 -3.000 0.011 1.000 N NA
 2003290 2003291 BAD_0595 BAD_0596     TRUE 0.906 0.000 0.013 0.060 N NA
 2003291 2003292 BAD_0596 BAD_0597     FALSE 0.072 170.000 0.000 1.000 N NA
 2003293 2003294 BAD_0598 BAD_0599 cysD   FALSE 0.030 204.000 0.000 NA   NA
 2003294 2003295 BAD_0599 BAD_0600   cbiO2 FALSE 0.342 158.000 0.108 NA   NA
 2003295 2003296 BAD_0600 BAD_0601 cbiO2   TRUE 0.969 0.000 0.204 1.000   NA
 2003296 2003297 BAD_0601 BAD_0602     TRUE 0.897 10.000 0.032 1.000 N NA
 2003297 2003298 BAD_0602 BAD_0603     FALSE 0.417 133.000 0.091 1.000 N NA
 2003298 2003299 BAD_0603 BAD_0604     TRUE 0.903 58.000 0.606 1.000 N NA
 2003300 2003301 BAD_0605 BAD_0606     TRUE 0.928 77.000 0.323 0.014 Y NA
 2003302 2003303 BAD_0607 BAD_0608 pap proC TRUE 0.550 61.000 0.015 1.000   NA
 2003303 2003304 BAD_0608 BAD_0609 proC   TRUE 0.782 18.000 0.006 1.000 N NA
 2003304 2003305 BAD_0609 BAD_0610     TRUE 0.537 22.000 0.000 1.000   NA
 2003305 2003306 BAD_0610 BAD_0611     FALSE 0.478 138.000 0.167 1.000   NA
 2003306 2003307 BAD_0611 BAD_0612     TRUE 0.944 6.000 0.104 NA   NA
 2003307 2003308 BAD_0612 BAD_0613     TRUE 0.648 15.000 0.000 NA   NA
 2003308 2003309 BAD_0613 BAD_0614     TRUE 0.650 69.000 0.087 NA   NA
 2003310 2003311 BAD_0615 BAD_0616     FALSE 0.154 97.000 0.000 NA   NA
 2003311 2003312 BAD_0616 BAD_0617     FALSE 0.007 340.000 0.000 NA   NA
 2003313 2003314 BAD_0618 BAD_0619   trrA FALSE 0.298 56.000 0.000 1.000   NA
 2003314 2003315 BAD_0619 BAD_0620 trrA   FALSE 0.026 224.000 0.000 1.000 N NA
 2003315 2003316 BAD_0620 BAD_0621   pyrP FALSE 0.387 161.000 0.159 1.000 N NA
 2003316 2003317 BAD_0621 BAD_0622 pyrP   FALSE 0.220 158.000 0.027 1.000   NA
 2003317 2003318 BAD_0622 BAD_0623     FALSE 0.394 98.000 0.041 1.000   NA
 2003319 2003320 BAD_0624 BAD_0625     TRUE 0.908 -3.000 0.028 NA   NA
 2003321 2003322 BAD_0626 BAD_0627     TRUE 0.911 51.000 0.647 NA   NA
 2003322 2003323 BAD_0627 BAD_0628   gnt FALSE 0.265 106.000 0.005 NA   NA
 2003324 2003325 BAD_0629 BAD_0630     TRUE 0.979 30.000 0.463 NA Y NA
 2003325 2003326 BAD_0630 BAD_0631   zwf2 TRUE 0.995 -3.000 0.583 NA Y NA
 2003327 2003328 BAD_0632 BAD_0633     FALSE 0.021 231.000 0.000 NA   NA
 2003328 2003329 BAD_0633 BAD_0634     FALSE 0.194 86.000 0.000 NA   NA
 2003330 2003331 BAD_0635 BAD_0636     TRUE 0.949 21.000 0.386 NA   NA
 2003331 2003332 BAD_0636 BAD_0637     FALSE 0.383 123.000 0.068 NA   NA
 2003333 2003334 BAD_0638 BAD_0639   alzD TRUE 0.997 -3.000 0.915 NA Y NA
 2003336 2003337 BAD_0641 BAD_0642     FALSE 0.412 95.000 0.042 1.000   NA
 2003337 2003338 BAD_0642 BAD_0643   pth FALSE 0.435 74.000 0.007 1.000 N NA
 2003338 2003339 BAD_0643 BAD_0644 pth mfd TRUE 0.932 -10.000 0.137 1.000 N NA
 2003339 2003340 BAD_0644 BAD_0645 mfd eno FALSE 0.234 124.000 0.004 1.000 N NA
 2003340 2003341 BAD_0645 BAD_0646 eno   FALSE 0.464 83.000 0.028 1.000   NA
 2003341 2003342 BAD_0646 BAD_0647     TRUE 0.962 2.000 0.148 NA   NA
 2003342 2003343 BAD_0647 BAD_0648     TRUE 0.954 13.000 0.243 NA   NA
 2003343 2003344 BAD_0648 BAD_t0032   leuU FALSE 0.329 48.000 0.000 NA   NA
 2003344 2003345 BAD_t0032 BAD_0649 leuU   FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 2003345 2003346 BAD_0649 BAD_0650   sdaA TRUE 0.857 34.000 0.206 NA   NA
 2003346 2003347 BAD_0650 BAD_0651 sdaA fkbP TRUE 0.792 53.000 0.189 1.000   NA
 2003347 2003348 BAD_0651 BAD_0652 fkbP greA TRUE 0.848 39.000 0.216 1.000   NA
 2003351 2003352 BAD_0655 BAD_0656 wblE   FALSE 0.464 104.000 0.083 1.000   NA
 2003352 2003353 BAD_0656 BAD_0657     FALSE 0.400 94.000 0.032 NA   NA
 2003353 2003354 BAD_0657 BAD_0658     TRUE 0.895 66.000 0.048 NA Y NA
 2003355 2003356 BAD_0659 BAD_0660 whiB2   TRUE 0.861 34.000 0.214 NA   NA
 2003356 2003357 BAD_0660 BAD_0661     TRUE 0.984 -3.000 0.606 NA   NA
 2003359 2003360 BAD_0663 BAD_0664     TRUE 0.744 41.000 0.087 1.000   NA
 2003361 2003362 BAD_0665 BAD_0666     TRUE 0.980 53.000 0.842 1.000 Y NA
 2003362 2003363 BAD_0666 BAD_0667   glgB TRUE 0.886 16.000 0.065 1.000 N NA
 2003364 2003365 BAD_0668 BAD_0669   ispF TRUE 0.882 11.000 0.022 1.000 N NA
 2003366 2003367 BAD_0670 BAD_0671   troB TRUE 0.990 3.000 0.136 1.000 Y NA
 2003367 2003368 BAD_0671 BAD_0672 troB   FALSE 0.442 201.000 0.078 1.000 Y NA
 2003369 2003370 BAD_0673 BAD_0674 folD rpsA FALSE 0.257 154.000 0.034 1.000 N NA
 2003370 2003371 BAD_0674 BAD_0675 rpsA   FALSE 0.353 108.000 0.024 1.000 N NA
 2003371 2003372 BAD_0675 BAD_0676   uvrB TRUE 0.912 5.000 0.026 1.000 N NA
 2003372 2003373 BAD_0676 BAD_0677 uvrB   TRUE 0.639 40.000 0.013 1.000 N NA
 2003373 2003374 BAD_0677 BAD_0678   pyk TRUE 0.585 99.000 0.158 1.000 N NA
 2003374 2003375 BAD_0678 BAD_t0033 pyk leuV FALSE 0.084 155.000 0.000 NA   NA
 2003375 2003376 BAD_t0033 BAD_0679 leuV   FALSE 0.211 81.000 0.000 NA   NA
 2003376 2003377 BAD_0679 BAD_0680   polA TRUE 0.850 -10.000 0.013 1.000 N NA
 2003377 2003378 BAD_0680 BAD_0681 polA   TRUE 0.546 53.000 0.010 NA   NA
 2003378 2003379 BAD_0681 BAD_0682     TRUE 0.929 7.000 0.073 NA   NA
 2003379 2003380 BAD_0682 BAD_0683   treX TRUE 0.696 87.000 0.220 1.000 N NA
 2003382 2003383 BAD_t0034 BAD_0685 proT   FALSE 0.003 838.000 0.000 NA   NA
 2003385 2003386 BAD_0687 BAD_0688   pta FALSE 0.175 203.000 0.136 0.054 N NA
 2003386 2003387 BAD_0688 BAD_0689 pta ackA TRUE 0.900 90.000 0.271 1.000 Y NA
 2003387 2003388 BAD_0689 BAD_0690 ackA   FALSE 0.028 216.000 0.000 1.000 N NA
 2003389 2003390 BAD_0691 BAD_0692 pbuX xpt TRUE 0.920 45.000 0.056 1.000 Y NA
 2003391 2003392 BAD_0693 BAD_0694 uvrD1   FALSE 0.242 137.000 0.010 NA   NA
 2003392 2003393 BAD_0694 BAD_0695     TRUE 0.964 -7.000 0.346 NA   NA
 2003393 2003394 BAD_0695 BAD_0696     TRUE 0.986 0.000 0.615 1.000   NA
 2003394 2003395 BAD_0696 BAD_0697   rpsD FALSE 0.027 270.000 0.002 1.000 N NA
 2003395 2003396 BAD_0697 BAD_0698 rpsD   FALSE 0.208 135.000 0.002 1.000 N NA
 2003396 2003397 BAD_0698 BAD_0699     TRUE 0.679 87.000 0.208 NA   NA
 2003397 2003398 BAD_0699 BAD_0700   alaS FALSE 0.008 325.000 0.000 NA   NA
 2003398 2003399 BAD_0700 BAD_0701 alaS   TRUE 0.931 11.000 0.103 1.000 N NA
 2003399 2003400 BAD_0701 BAD_0702     TRUE 0.870 15.000 0.039 NA   NA
 2003400 2003401 BAD_0702 BAD_0703   rne FALSE 0.396 35.000 0.000 NA   NA
 2003401 2003402 BAD_0703 BAD_0704 rne aroC FALSE 0.381 37.000 0.000 NA   NA
 2003402 2003403 BAD_0704 BAD_0705 aroC aroB TRUE 0.985 9.000 0.110 0.004 Y NA
 2003403 2003404 BAD_0705 BAD_0706 aroB aroQ TRUE 0.926 37.000 0.052 0.004 Y NA
 2003404 2003405 BAD_0706 BAD_0707 aroQ amyA4 FALSE 0.079 162.000 0.000 1.000 N NA
 2003405 2003406 BAD_0707 BAD_0708 amyA4 pulA FALSE 0.042 551.000 0.000 0.022 Y NA
 2003406 2003407 BAD_0708 BAD_0709 pulA pyrG FALSE 0.226 124.000 0.003 1.000 N NA
 2003407 2003408 BAD_0709 BAD_0710 pyrG   FALSE 0.152 159.000 0.003 1.000 N NA
 2003408 2003409 BAD_0710 BAD_0711     TRUE 0.992 -3.000 0.266 0.002 Y NA
 2003409 2003410 BAD_0711 BAD_0712     TRUE 0.991 16.000 0.482 1.000 Y NA
 2003410 2003411 BAD_0712 BAD_0713     TRUE 0.943 -3.000 0.093 1.000 N NA
 2003411 2003412 BAD_0713 BAD_0714     TRUE 0.967 7.000 0.249 1.000 N NA
 2003412 2003413 BAD_0714 BAD_0715     TRUE 0.562 105.000 0.152 NA   NA
 2003414 2003415 BAD_0716 BAD_0717 glgC tnsR FALSE 0.161 180.000 0.029 1.000 N NA
 2003415 2003416 BAD_0717 BAD_t0035 tnsR leuW FALSE 0.285 65.000 0.000 NA   NA
 2003417 2003418 BAD_0718 BAD_0719     FALSE 0.400 95.000 0.034 NA   NA
 2003418 2003419 BAD_0719 BAD_0720     TRUE 0.653 45.000 0.032 1.000 N NA
 2003419 2003420 BAD_0720 BAD_0721     TRUE 0.982 1.000 0.457 NA   NA
 2003420 2003421 BAD_0721 BAD_0722     TRUE 0.821 49.000 0.222 NA   NA
 2003421 2003422 BAD_0722 BAD_0723   era TRUE 0.913 -7.000 0.089 1.000   NA
 2003424 2003425 BAD_0725 BAD_0726 pntA pntB FALSE 0.087 311.000 0.000 0.001 Y NA
 2003425 2003426 BAD_0726 BAD_0727 pntB   FALSE 0.031 201.000 0.000 NA   NA
 2003426 2003427 BAD_0727 BAD_0728     FALSE 0.123 119.000 0.000 NA   NA
 2003427 2003428 BAD_0728 BAD_0729   ydfL TRUE 0.766 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2003430 2003431 BAD_0731 BAD_0732     FALSE 0.144 101.000 0.000 1.000   NA
 2003431 2003432 BAD_0732 BAD_0733     TRUE 0.738 -3.000 0.000 1.000   NA
 2003432 2003433 BAD_0733 BAD_0734   crcB2 FALSE 0.094 142.000 0.000 1.000   NA
 2003433 2003434 BAD_0734 BAD_0735 crcB2 crcB3 TRUE 0.998 0.000 1.000 0.090 Y NA
 2003434 2003435 BAD_0735 BAD_0736 crcB3   FALSE 0.057 175.000 0.000 NA   NA
 2003435 2003436 BAD_0736 BAD_0737     TRUE 0.985 0.000 0.562 NA   NA
 2003436 2003437 BAD_0737 BAD_0738     TRUE 0.948 -6.000 0.200 1.000   NA
 2003437 2003438 BAD_0738 BAD_0739     TRUE 0.638 -15.000 0.000 NA   NA
 2003439 2003440 BAD_0740 BAD_0741     FALSE 0.005 541.000 0.000 NA N NA
 2003441 2003442 BAD_0742 BAD_0743 rplY ilvE FALSE 0.019 248.000 0.000 1.000 N NA
 2003442 2003443 BAD_0743 BAD_0744 ilvE   FALSE 0.218 156.000 0.021 NA   NA
 2003445 2003446 BAD_0746 BAD_0747 lepA hemN TRUE 0.931 8.000 0.083 1.000 N NA
 2003446 2003447 BAD_0747 BAD_0748 hemN gltB FALSE 0.119 137.000 0.000 1.000 N NA
 2003447 2003448 BAD_0748 BAD_0749 gltB gltD TRUE 0.982 2.000 0.010 0.001 Y NA
 2003448 2003449 BAD_0749 BAD_0750 gltD   FALSE 0.265 122.000 0.010 NA   NA
 2003449 2003450 BAD_0750 BAD_0751   glgA TRUE 0.707 41.000 0.060 NA   NA
 2003450 2003451 BAD_0751 BAD_0752 glgA   TRUE 0.642 83.000 0.119 1.000 N NA
 2003451 2003452 BAD_0752 BAD_0753     FALSE 0.227 161.000 0.035 1.000 N NA
 2003452 2003453 BAD_0753 BAD_0754     TRUE 0.899 15.000 0.069 NA N NA
 2003453 2003454 BAD_0754 BAD_0755     FALSE 0.208 83.000 0.000 NA   NA
 2003454 2003455 BAD_0755 BAD_0756   metE FALSE 0.049 182.000 0.000 NA   NA
 2003455 2003456 BAD_0756 BAD_0757 metE metF TRUE 0.918 43.000 0.050 0.003 Y NA
 2003456 2003457 BAD_0757 BAD_0758 metF glnE FALSE 0.368 92.000 0.012 1.000 N NA
 2003457 2003458 BAD_0758 BAD_0759 glnE pyrB FALSE 0.270 109.000 0.005 1.000 N NA
 2003458 2003459 BAD_0759 BAD_0760 pyrB pyrI TRUE 0.990 -3.000 0.197 0.001 Y NA
 2003459 2003460 BAD_0760 BAD_0761 pyrI pyrC TRUE 0.984 5.000 0.032 1.000 Y NA
 2003460 2003461 BAD_0761 BAD_0762 pyrC pyrF TRUE 0.988 0.000 0.064 1.000 Y NA
 2003461 2003462 BAD_0762 BAD_0763 pyrF pyrK TRUE 0.775 40.000 0.112 0.004 N NA
 2003462 2003463 BAD_0763 BAD_0764 pyrK pyrD TRUE 0.985 3.000 0.592 1.000 N NA
 2003463 2003464 BAD_0764 BAD_0765 pyrD pyrE TRUE 0.928 37.000 0.041 1.000 Y NA
 2003465 2003466 BAD_0766 BAD_0767 cpsY cpsY TRUE 0.610 -51.000 0.000 NA   NA
 2003466 2003467 BAD_0767 BAD_0768 cpsY   TRUE 0.523 162.000 0.400 1.000   NA
 2003467 2003468 BAD_0768 BAD_0769     FALSE 0.016 251.000 0.000 NA   NA
 2003471 2003472 BAD_0772 BAD_t0036   asnT FALSE 0.151 99.000 0.000 NA   NA
 2003472 2003473 BAD_t0036 BAD_t0037 asnT asnU FALSE 0.457 28.000 0.000 NA   NA
 2003473 2003474 BAD_t0037 BAD_0773 asnU   FALSE 0.004 608.000 0.000 NA   NA
 2003474 2003475 BAD_0773 BAD_0774   fadD4 FALSE 0.462 114.000 0.103 NA   NA
 2003476 2003477 BAD_0775 BAD_0776   icd1 FALSE 0.264 122.000 0.008 NA N NA
 2003478 2003479 BAD_0777 BAD_0778     FALSE 0.265 148.000 0.038 NA   NA
 2003479 2003480 BAD_0778 BAD_0779   fadD3 TRUE 0.775 118.000 0.700 NA   NA
 2003480 2003481 BAD_0779 BAD_0780 fadD3 def2 FALSE 0.477 168.000 0.345 1.000   NA
 2003481 2003482 BAD_0780 BAD_0781 def2 rpsB FALSE 0.033 187.000 0.000 0.046   NA
 2003482 2003483 BAD_0781 BAD_0782 rpsB tsf TRUE 0.964 76.000 0.748 1.000 Y NA
 2003483 2003484 BAD_0782 BAD_0783 tsf pyrH FALSE 0.451 180.000 0.416 1.000 N NA
 2003484 2003485 BAD_0783 BAD_0784 pyrH frr TRUE 0.909 53.000 0.626 1.000 N NA
 2003485 2003486 BAD_0784 BAD_0785 frr cdsA FALSE 0.028 387.000 0.076 1.000 N NA
 2003486 2003487 BAD_0785 BAD_0786 cdsA   TRUE 0.758 26.000 0.033 1.000   NA
 2003487 2003488 BAD_0786 BAD_0787   hisF FALSE 0.232 115.000 0.004 1.000   NA
 2003488 2003489 BAD_0787 BAD_0788 hisF hisI TRUE 0.956 64.000 0.430 0.006 Y NA
 2003489 2003490 BAD_0788 BAD_0789 hisI trpE TRUE 0.985 -3.000 0.050 1.000 Y NA
 2003490 2003491 BAD_0789 BAD_0790 trpE trpBC TRUE 0.922 44.000 0.051 1.000 Y NA
 2003491 2003492 BAD_0790 BAD_0791 trpBC trpA TRUE 0.979 18.000 0.153 0.001 Y NA
 2003492 2003493 BAD_0791 BAD_0792 trpA lgt TRUE 0.523 70.000 0.017 1.000 N NA
 2003493 2003494 BAD_0792 BAD_0793 lgt rpe TRUE 0.854 26.000 0.111 1.000 N NA
 2003494 2003495 BAD_0793 BAD_0794 rpe hisE TRUE 0.910 -3.000 0.026 1.000 N NA
 2003495 2003496 BAD_0794 BAD_0795 hisE hisG TRUE 0.916 52.000 0.081 0.006 Y NA
 2003496 2003497 BAD_0795 BAD_0796 hisG pgsA TRUE 0.842 14.000 0.009 1.000 N NA
 2003497 2003498 BAD_0796 BAD_0797 pgsA   TRUE 0.942 8.000 0.114 NA   NA
 2003498 2003499 BAD_0797 BAD_0798     TRUE 0.981 0.000 0.409 NA   NA
 2003499 2003500 BAD_0798 BAD_0799     TRUE 0.976 7.000 0.409 NA   NA
 2003500 2003501 BAD_0799 BAD_0800   thrS TRUE 0.568 60.000 0.018 NA   NA
 2003501 2003502 BAD_0800 BAD_0801 thrS   FALSE 0.348 114.000 0.030 1.000 N NA
 2003502 2003503 BAD_0801 BAD_0802     FALSE 0.230 116.000 0.003 NA   NA
 2003503 2003504 BAD_0802 BAD_0803   ruvC TRUE 0.968 7.000 0.277 NA   NA
 2003504 2003505 BAD_0803 BAD_0804 ruvC ruvA TRUE 0.965 48.000 0.451 0.010 Y NA
 2003505 2003506 BAD_0804 BAD_0805 ruvA ruvB TRUE 0.995 -3.000 0.549 0.003 Y NA
 2003506 2003507 BAD_0805 BAD_0806 ruvB   TRUE 0.667 57.000 0.063 1.000 N NA
 2003507 2003508 BAD_0806 BAD_0807   apt FALSE 0.302 116.000 0.013 1.000 N NA
 2003508 2003509 BAD_0807 BAD_0808 apt sucC TRUE 0.572 52.000 0.011 1.000 N NA
 2003509 2003510 BAD_0808 BAD_0809 sucC sucD TRUE 0.997 2.000 0.900 0.001 Y NA
 2003510 2003511 BAD_0809 BAD_0810 sucD   TRUE 0.983 0.000 0.462 NA   NA
 2003511 2003512 BAD_0810 BAD_0811   purH TRUE 0.766 -52.000 0.004 NA   NA
 2003513 2003514 BAD_0812 BAD_0813     TRUE 0.628 89.000 0.167 NA   NA
 2003514 2003515 BAD_0813 BAD_0814     FALSE 0.098 142.000 0.000 NA   NA
 2003518 2003519 BAD_0816 BAD_0817 ugpA   TRUE 0.542 143.000 0.265 NA N NA
 2003519 2003520 BAD_0817 BAD_0818     FALSE 0.009 301.000 0.000 NA   NA
 2003520 2003521 BAD_0818 BAD_0819     FALSE 0.486 109.000 0.105 NA   NA
 2003521 2003522 BAD_0819 BAD_0820     FALSE 0.397 106.000 0.047 NA   NA
 2003523 2003524 BAD_0821 BAD_0822     FALSE 0.343 139.000 0.070 NA   NA
 2003524 2003525 BAD_0822 BAD_0823   garA FALSE 0.404 134.000 0.081 NA N NA
 2003525 2003526 BAD_0823 BAD_t0039 garA valX FALSE 0.003 783.000 0.000 NA   NA
 2003526 2003527 BAD_t0039 BAD_t0040 valX valU FALSE 0.424 31.000 0.000 NA   NA
 2003527 2003528 BAD_t0040 BAD_t0041 valU cysT FALSE 0.364 41.000 0.000 NA   NA
 2003528 2003529 BAD_t0041 BAD_t0042 cysT glyW FALSE 0.457 28.000 0.000 NA   NA
 2003533 2003534 BAD_0827 BAD_0828 dnaJ hrcA TRUE 0.675 53.000 0.064 1.000 N NA
 2003535 2003536 BAD_0829 BAD_0830 tkt tal TRUE 0.831 90.000 0.071 1.000 Y NA
 2003537 2003538 BAD_0831 BAD_0832     FALSE 0.217 155.000 0.018 NA   NA
 2003538 2003539 BAD_0832 BAD_0833   secG FALSE 0.336 88.000 0.006 NA   NA
 2003539 2003540 BAD_0833 BAD_0834 secG tpi TRUE 0.703 45.000 0.064 1.000 N NA
 2003540 2003541 BAD_0834 BAD_0835 tpi pgk TRUE 0.768 126.000 0.075 1.000 Y NA
 2003541 2003542 BAD_0835 BAD_0836 pgk   FALSE 0.239 132.000 0.008 NA   NA
 2003542 2003543 BAD_0836 BAD_0837     FALSE 0.311 155.000 0.076 NA   NA
 2003543 2003544 BAD_0837 BAD_0838   aroE TRUE 0.915 0.000 0.019 NA   NA
 2003544 2003545 BAD_0838 BAD_0839 aroE uvrC FALSE 0.455 66.000 0.009 0.047   NA
 2003545 2003546 BAD_0839 BAD_0840 uvrC uvrA FALSE 0.361 102.000 0.043 0.002   NA
 2003546 2003547 BAD_0840 BAD_0841 uvrA   FALSE 0.370 76.000 0.002 NA   NA
 2003547 2003548 BAD_0841 BAD_0842     FALSE 0.061 370.000 0.257 NA   NA
 2003548 2003549 BAD_0842 BAD_0843     TRUE 0.960 12.000 0.293 NA   NA
 2003549 2003550 BAD_0843 BAD_0844     TRUE 0.989 3.000 0.786 NA   NA
 2003551 2003552 BAD_0845 BAD_0846 recJ   TRUE 0.621 -27.000 0.000 NA   NA
 2003552 2003553 BAD_0846 BAD_0847     FALSE 0.169 91.000 0.000 NA   NA
 2003554 2003555 BAD_t0043 BAD_0848 glyV   FALSE 0.127 116.000 0.000 NA   NA
 2003561 2003562 BAD_0854 BAD_0855   merR FALSE 0.317 52.000 0.000 NA   NA
 2003562 2003563 BAD_0855 BAD_0856 merR   FALSE 0.017 257.000 0.000 1.000 N NA
 2003563 2003564 BAD_0856 BAD_t0044   asnV FALSE 0.069 166.000 0.000 NA   NA
 2003564 2003565 BAD_t0044 BAD_0857 asnV gcp FALSE 0.175 89.000 0.000 NA   NA
 2003565 2003566 BAD_0857 BAD_0858 gcp rimI TRUE 0.923 -3.000 0.056 1.000   NA
 2003566 2003567 BAD_0858 BAD_0859 rimI   TRUE 0.905 11.000 0.062 1.000   NA
 2003567 2003568 BAD_0859 BAD_0860     TRUE 0.618 105.000 0.217 NA   NA
 2003568 2003569 BAD_0860 BAD_0861     TRUE 0.870 -3.000 0.006 NA   NA
 2003569 2003570 BAD_0861 BAD_0862     TRUE 0.960 4.000 0.163 NA   NA
 2003570 2003571 BAD_0862 BAD_0863     TRUE 0.953 -3.000 0.130 NA   NA
 2003571 2003572 BAD_0863 BAD_0864   leuS FALSE 0.193 146.000 0.008 1.000   NA
 2003572 2003573 BAD_0864 BAD_0865 leuS   FALSE 0.448 73.000 0.008 1.000 N NA
 2003573 2003574 BAD_0865 BAD_0866   corA TRUE 0.927 6.000 0.059 1.000 N NA
 2003574 2003575 BAD_0866 BAD_0867 corA   FALSE 0.088 214.000 0.026 NA N NA
 2003575 2003576 BAD_0867 BAD_t0045   alaU FALSE 0.068 167.000 0.000 NA   NA
 2003576 2003577 BAD_t0045 BAD_0868 alaU   FALSE 0.137 110.000 0.000 NA   NA
 2003577 2003578 BAD_0868 BAD_0869     TRUE 0.695 108.000 0.375 NA   NA
 2003578 2003579 BAD_0869 BAD_0870     FALSE 0.132 174.000 0.008 NA   NA
 2003579 2003580 BAD_0870 BAD_0871     TRUE 0.898 3.000 0.011 NA   NA
 2003580 2003581 BAD_0871 BAD_0872     FALSE 0.215 135.000 0.002 NA N NA
 2003584 2003585 BAD_0875 BAD_0876     FALSE 0.162 94.000 0.000 NA   NA
 2003587 2003588 BAD_0878 BAD_0879     TRUE 0.996 -7.000 1.000 1.000 Y NA
 2003589 2003590 BAD_0880 BAD_0881     FALSE 0.008 327.000 0.000 NA   NA
 2003590 2003591 BAD_0881 BAD_0882     FALSE 0.016 250.000 0.000 NA   NA
 2003591 2003592 BAD_0882 BAD_0883     FALSE 0.092 147.000 0.000 NA   NA
 2003592 2003593 BAD_0883 BAD_0884     FALSE 0.008 330.000 0.000 NA   NA
 2003594 2003595 BAD_0885 BAD_t0046   glnU FALSE 0.135 111.000 0.000 NA   NA
 2003595 2003596 BAD_t0046 BAD_0886 glnU   FALSE 0.008 330.000 0.000 NA   NA
 2003597 2003598 BAD_0887 BAD_0888     FALSE 0.390 36.000 0.000 NA   NA
 2003599 2003600 BAD_0889 BAD_0890     TRUE 0.780 0.000 0.000 NA   NA
 2003600 2003601 BAD_0890 BAD_0891     TRUE 0.993 6.000 0.333 0.086 Y NA
 2003601 2003602 BAD_0891 BAD_0892     TRUE 0.996 13.000 0.917 1.000 Y NA
 2003602 2003603 BAD_0892 BAD_0893     FALSE 0.229 76.000 0.000 NA   NA
 2003604 2003605 BAD_0894 BAD_0895     TRUE 0.907 12.000 0.069 NA   NA
 2003606 2003607 BAD_0896 BAD_0897 yoaP yoaP TRUE 0.596 -220.000 0.000 NA   NA
 2003608 2003609 BAD_0898 BAD_0899 prsA2 nadD FALSE 0.266 115.000 0.007 1.000 N NA
 2003609 2003610 BAD_0899 BAD_0900 nadD   TRUE 0.836 15.000 0.011 NA   NA
 2003610 2003611 BAD_0900 BAD_0901   proA TRUE 0.746 24.000 0.011 NA   NA
 2003611 2003612 BAD_0901 BAD_0902 proA glyA TRUE 0.665 135.000 0.005 1.000 Y NA
 2003613 2003614 BAD_0903 BAD_0904 thrC   FALSE 0.264 114.000 0.006 1.000 N NA
 2003614 2003615 BAD_0904 BAD_0905     FALSE 0.449 31.000 0.000 1.000 N NA
 2003616 2003617 BAD_0906 BAD_0907   recN TRUE 0.575 48.000 0.012 1.000   NA
 2003617 2003618 BAD_0907 BAD_0908 recN ppnK TRUE 0.939 7.000 0.094 1.000 N NA
 2003619 2003620 BAD_0909 BAD_0910     TRUE 0.946 84.000 0.585 0.003 Y NA
 2003621 2003622 BAD_0911 BAD_0912     TRUE 0.757 25.000 0.019 1.000 N NA
 2003622 2003623 BAD_0912 BAD_0913     TRUE 0.970 15.000 0.500 1.000   NA
 2003623 2003624 BAD_0913 BAD_0914   tyrS TRUE 0.613 60.000 0.042 1.000   NA
 2003624 2003625 BAD_0914 BAD_0915 tyrS   FALSE 0.004 511.000 0.000 NA   NA
 2003625 2003626 BAD_0915 BAD_0916     FALSE 0.057 175.000 0.000 NA   NA
 2003626 2003627 BAD_0916 BAD_0917     TRUE 0.960 0.000 0.123 NA   NA
 2003627 2003628 BAD_0917 BAD_0918   argH TRUE 0.633 28.000 0.004 1.000   NA
 2003628 2003629 BAD_0918 BAD_0919 argH argG TRUE 0.939 70.000 0.278 1.000 Y NA
 2003629 2003630 BAD_0919 BAD_0920 argG argR TRUE 0.544 78.000 0.054 1.000 N NA
 2003630 2003631 BAD_0920 BAD_0921 argR argF TRUE 0.951 0.000 0.088 1.000 N NA
 2003631 2003632 BAD_0921 BAD_0922 argF argD TRUE 0.935 43.000 0.091 1.000 Y NA
 2003632 2003633 BAD_0922 BAD_0923 argD argB TRUE 0.921 62.000 0.105 1.000 Y NA
 2003633 2003634 BAD_0923 BAD_0924 argB argJ TRUE 0.989 11.000 0.239 0.003 Y NA
 2003634 2003635 BAD_0924 BAD_0925 argJ argC TRUE 0.992 -3.000 0.303 0.003 Y NA
 2003635 2003636 BAD_0925 BAD_0926 argC   FALSE 0.311 102.000 0.009 NA   NA
 2003636 2003637 BAD_0926 BAD_0927   pheT TRUE 0.884 -3.000 0.009 NA   NA
 2003637 2003638 BAD_0927 BAD_0928 pheT pheS TRUE 0.992 14.000 0.574 0.001 Y NA
 2003638 2003639 BAD_0928 BAD_0929 pheS   TRUE 0.881 67.000 0.026 1.000 Y NA
 2003640 2003641 BAD_0930 BAD_0931     TRUE 0.613 -43.000 0.000 NA   NA
 2003641 2003642 BAD_0931 BAD_0932     FALSE 0.012 284.000 0.000 1.000 N NA
 2003642 2003643 BAD_0932 BAD_0933     TRUE 0.636 50.000 0.043 1.000   NA
 2003643 2003644 BAD_0933 BAD_0934     TRUE 0.965 -3.000 0.250 0.001   NA
 2003644 2003645 BAD_0934 BAD_0935     TRUE 0.746 55.000 0.119 1.000   NA
 2003645 2003646 BAD_0935 BAD_0936     TRUE 0.777 21.000 0.010 NA   NA
 2003648 2003649 BAD_0938 BAD_0939     FALSE 0.157 96.000 0.000 NA   NA
 2003652 2003653 BAD_0942 BAD_0943   glnA1 FALSE 0.005 397.000 0.000 1.000   NA
 2003653 2003654 BAD_0943 BAD_0944 glnA1   FALSE 0.014 263.000 0.000 NA   NA
 2003654 2003655 BAD_0944 BAD_0945   pdhD FALSE 0.505 96.000 0.095 NA   NA
 2003655 2003656 BAD_0945 BAD_0946 pdhD   FALSE 0.435 108.000 0.071 NA   NA
 2003658 2003659 BAD_0948 BAD_0949     TRUE 0.979 2.000 0.372 1.000   NA
 2003659 2003660 BAD_0949 BAD_0950     FALSE 0.351 121.000 0.047 NA   NA
 2003660 2003661 BAD_0950 BAD_0951   mrp FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 2003661 2003662 BAD_0951 BAD_0952 mrp ligA FALSE 0.487 66.000 0.006 1.000 N NA
 2003662 2003663 BAD_0952 BAD_0953 ligA   FALSE 0.411 79.000 0.010 1.000   NA
 2003664 2003665 BAD_0954 BAD_0955     FALSE 0.058 398.000 0.300 NA   NA
 2003666 2003667 BAD_0956 BAD_0957   ppgK TRUE 0.879 76.000 0.075 1.000 Y NA
 2003667 2003668 BAD_0957 BAD_0958 ppgK   FALSE 0.046 255.000 0.019 NA   NA
 2003668 2003669 BAD_0958 BAD_0959     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 2003669 2003670 BAD_0959 BAD_0960     FALSE 0.016 251.000 0.000 NA   NA
 2003670 2003671 BAD_0960 BAD_0961   cbiO TRUE 0.777 19.000 0.008 NA   NA
 2003671 2003672 BAD_0961 BAD_0962 cbiO   TRUE 0.636 113.000 0.300 NA   NA
 2003672 2003673 BAD_0962 BAD_0963     FALSE 0.008 321.000 0.000 NA   NA
 2003673 2003674 BAD_0963 BAD_0964   pepC1 TRUE 0.675 77.000 0.133 1.000 N NA
 2003676 2003677 BAD_0966 BAD_0967     FALSE 0.060 235.000 0.025 1.000   NA
 2003677 2003678 BAD_0967 BAD_0968     TRUE 0.549 41.000 0.003 1.000 N NA
 2003678 2003679 BAD_0968 BAD_0969     TRUE 0.603 18.000 0.000 NA   NA
 2003679 2003680 BAD_0969 BAD_0970     FALSE 0.079 158.000 0.000 NA   NA
 2003681 2003682 BAD_0971 BAD_0972 aglA   TRUE 0.974 54.000 0.667 1.000 Y NA
 2003682 2003683 BAD_0972 BAD_0973     FALSE 0.149 110.000 0.000 1.000 N NA
 2003685 2003686 BAD_0975 BAD_0976     FALSE 0.414 32.000 0.000 NA   NA
 2003687 2003688 BAD_0977 BAD_0978     TRUE 0.738 -3.000 0.000 1.000   NA
 2003689 2003690 BAD_0979 BAD_0980     FALSE 0.009 308.000 0.000 NA   NA
 2003691 2003692 BAD_0981 BAD_0982   murG TRUE 0.875 29.000 0.200 NA   NA
 2003692 2003693 BAD_0982 BAD_0983 murG   FALSE 0.305 59.000 0.000 NA   NA
 2003695 2003696 BAD_0985 BAD_0986 dnaQ1 mmuM FALSE 0.297 57.000 0.000 1.000   NA
 2003696 2003697 BAD_0986 BAD_0987 mmuM hutM FALSE 0.121 116.000 0.000 1.000   NA
 2003697 2003698 BAD_0987 BAD_0988 hutM tig FALSE 0.004 512.000 0.000 1.000   NA
 2003698 2003699 BAD_0988 BAD_0989 tig   TRUE 0.549 53.000 0.009 1.000 N NA
 2003699 2003700 BAD_0989 BAD_0990     TRUE 0.929 -7.000 0.115 NA   NA
 2003700 2003701 BAD_0990 BAD_0991   pflA FALSE 0.115 188.000 0.014 NA   NA
 2003701 2003702 BAD_0991 BAD_0992 pflA pfl FALSE 0.362 138.000 0.071 1.000 N NA
 2003702 2003703 BAD_0992 BAD_0993 pfl   FALSE 0.339 149.000 0.088 NA   NA
 2003703 2003704 BAD_0993 BAD_0994   nadE TRUE 0.855 -40.000 0.040 NA   NA
 2003704 2003705 BAD_0994 BAD_0995 nadE   FALSE 0.012 800.000 0.034 1.000   NA
 2003706 2003707 BAD_0996 BAD_0997     FALSE 0.367 136.000 0.071 NA   NA
 2003707 2003708 BAD_0997 BAD_0998     TRUE 0.897 88.000 0.214 NA Y NA
 2003708 2003709 BAD_0998 BAD_0999     TRUE 0.997 2.000 0.800 1.000 Y NA
 2003712 2003713 BAD_1002 BAD_1003 relA dut FALSE 0.281 129.000 0.012 1.000 N NA
 2003713 2003714 BAD_1003 BAD_1004 dut   TRUE 0.811 -81.000 0.012 NA   NA
 2003718 2003719 BAD_1008 BAD_1009 lhr   FALSE 0.369 94.000 0.020 1.000   NA
 2003719 2003720 BAD_1009 BAD_1010   gyrB2 FALSE 0.145 194.000 0.062 1.000 N NA
 2003720 2003721 BAD_1010 BAD_1011 gyrB2 hrdB TRUE 0.569 95.000 0.122 1.000 N NA
 2003721 2003722 BAD_1011 BAD_1012 hrdB   FALSE 0.309 122.000 0.024 NA   NA
 2003723 2003724 BAD_1013 BAD_1014 idsA pknA2 TRUE 0.516 96.000 0.096 1.000 N NA
 2003727 2003728 BAD_1017 BAD_1018   t150 TRUE 0.587 -117.000 0.000 1.000   NA
 2003728 2003729 BAD_1018 BAD_1019 t150 trpD FALSE 0.129 111.000 0.000 1.000   NA
 2003729 2003730 BAD_1019 BAD_1020 trpD secA1 FALSE 0.249 113.000 0.003 1.000 N NA
 2003730 2003731 BAD_1020 BAD_1021 secA1   FALSE 0.242 179.000 0.094 NA N NA
 2003731 2003732 BAD_1021 BAD_1022     FALSE 0.143 163.000 0.006 NA   NA
 2003732 2003733 BAD_1022 BAD_1023     FALSE 0.376 76.000 0.003 NA   NA
 2003733 2003734 BAD_1023 BAD_1024   recA TRUE 0.972 4.000 0.296 1.000   NA
 2003736 2003737 BAD_1026 BAD_1027     TRUE 0.579 72.000 0.057 NA   NA
 2003737 2003738 BAD_1027 BAD_1028   pgsA3 TRUE 0.963 1.000 0.151 NA   NA
 2003738 2003739 BAD_1028 BAD_1029 pgsA3 ftsK TRUE 0.574 60.000 0.025 0.060 N NA
 2003741 2003742 BAD_1031 BAD_1032 miaA   TRUE 0.971 -16.000 0.028 1.000 Y NA
 2003744 2003745 BAD_1034 BAD_1035     FALSE 0.400 127.000 0.078 NA   NA
 2003745 2003746 BAD_1035 BAD_1036     FALSE 0.125 117.000 0.000 NA   NA
 2003747 2003748 BAD_1037 BAD_1038     TRUE 0.964 60.000 0.500 0.013 Y NA
 2003748 2003749 BAD_1038 BAD_1039     FALSE 0.124 118.000 0.000 NA   NA
 2003750 2003751 BAD_1040 BAD_1041     TRUE 0.997 0.000 0.821 0.013 Y NA
 2003752 2003753 BAD_1042 BAD_1043     TRUE 0.978 45.000 0.682 NA Y NA
 2003753 2003754 BAD_1043 BAD_1044     TRUE 0.890 -13.000 0.068 NA   NA
 2003754 2003755 BAD_1044 BAD_1045     FALSE 0.127 116.000 0.000 NA   NA
 2003756 2003757 BAD_1046 BAD_1047     FALSE 0.182 88.000 0.000 NA   NA
 2003759 2003760 BAD_1049 BAD_1050 pstX   FALSE 0.040 190.000 0.000 NA   NA
 2003760 2003761 BAD_1050 BAD_1051     FALSE 0.493 25.000 0.000 NA   NA
 2003761 2003762 BAD_1051 BAD_1052   acn FALSE 0.110 133.000 0.000 1.000   NA
 2003762 2003763 BAD_1052 BAD_1053 acn ctpE FALSE 0.442 79.000 0.019 0.049 N NA
 2003763 2003764 BAD_1053 BAD_1054 ctpE   FALSE 0.436 138.000 0.119 NA   NA
 2003764 2003765 BAD_1054 BAD_1055     TRUE 0.894 -3.000 0.013 NA   NA
 2003765 2003766 BAD_1055 BAD_1056     TRUE 0.916 0.000 0.020 NA   NA
 2003766 2003767 BAD_1056 BAD_1057     TRUE 0.862 30.000 0.169 NA   NA
 2003767 2003768 BAD_1057 BAD_1058     FALSE 0.288 123.000 0.015 NA   NA
 2003768 2003769 BAD_1058 BAD_1059   dppD FALSE 0.445 74.000 0.010 1.000   NA
 2003769 2003770 BAD_1059 BAD_1060 dppD dppC TRUE 0.967 22.000 0.725 0.083   NA
 2003770 2003771 BAD_1060 BAD_1061 dppC dppB TRUE 0.992 21.000 0.811 0.057 Y NA
 2003771 2003772 BAD_1061 BAD_1062 dppB dppA2 FALSE 0.082 328.000 0.000 0.057 Y NA
 2003772 2003773 BAD_1062 BAD_1063 dppA2   FALSE 0.013 279.000 0.000 1.000 N NA
 2003774 2003775 BAD_1064 BAD_1065     TRUE 0.995 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 2003776 2003777 BAD_1066 BAD_1067 tyrA pheA TRUE 0.979 -6.000 0.054 1.000 Y NA
 2003777 2003778 BAD_1067 BAD_1068 pheA   TRUE 0.544 70.000 0.032 NA   NA
 2003778 2003779 BAD_1068 BAD_1069     FALSE 0.192 151.000 0.009 NA   NA
 2003779 2003780 BAD_1069 BAD_1070     FALSE 0.042 192.000 0.000 1.000 N NA
 2003780 2003781 BAD_1070 BAD_1071     TRUE 0.568 68.000 0.029 1.000 N NA
 2003781 2003782 BAD_1071 BAD_1072     FALSE 0.333 134.000 0.042 1.000 N NA
 2003782 2003783 BAD_1072 BAD_1073   xerD FALSE 0.437 99.000 0.058 1.000 N NA
 2003783 2003784 BAD_1073 BAD_1074 xerD rplT FALSE 0.041 246.000 0.006 1.000 N NA
 2003784 2003785 BAD_1074 BAD_1075 rplT rpmI TRUE 0.981 53.000 0.928 0.028 Y NA
 2003785 2003786 BAD_1075 BAD_1076 rpmI infC TRUE 0.991 19.000 0.652 1.000 Y NA
 2003786 2003787 BAD_1076 BAD_1077 infC asnH FALSE 0.296 67.000 0.000 1.000 N NA
 2003788 2003789 BAD_1078 BAD_1079   gap FALSE 0.143 172.000 0.007 1.000 N NA
 2003789 2003790 BAD_1079 BAD_1080 gap   FALSE 0.289 119.000 0.016 1.000   NA
 2003793 2003794 BAD_1083 BAD_1084   sigH TRUE 0.987 -3.000 0.750 NA   NA
 2003795 2003796 BAD_1085 BAD_1086 murE   TRUE 0.870 20.000 0.080 1.000   NA
 2003796 2003797 BAD_1086 BAD_1087   racD TRUE 0.944 -3.000 0.104 1.000   NA
 2003799 2003800 BAD_1089 BAD_1090 pepP   TRUE 0.950 10.000 0.160 1.000 N NA
 2003801 2003802 BAD_1091 BAD_1092 dppD   TRUE 0.961 5.000 0.185 1.000   NA
 2003802 2003803 BAD_1092 BAD_1093     TRUE 0.995 2.000 0.435 0.057 Y NA
 2003803 2003804 BAD_1093 BAD_1094     TRUE 0.811 89.000 0.044 0.057 Y NA
 2003805 2003806 BAD_1095 BAD_1096     TRUE 0.972 31.000 0.308 1.000 Y NA
 2003809 2003810 BAD_1099 BAD_1100 ftsQ murC TRUE 0.991 0.000 0.134 NA Y NA
 2003810 2003811 BAD_1100 BAD_1101 murC murG TRUE 0.900 90.000 0.270 1.000 Y NA
 2003811 2003812 BAD_1101 BAD_1102 murG fstW TRUE 0.531 122.000 0.167 1.000 N NA
 2003812 2003813 BAD_1102 BAD_1103 fstW murD TRUE 0.750 41.000 0.081 1.000 N NA
 2003813 2003814 BAD_1103 BAD_1104 murD murX TRUE 0.955 77.000 0.647 0.007 Y NA
 2003814 2003815 BAD_1104 BAD_1105 murX murF TRUE 0.913 50.000 0.071 0.007 Y NA
 2003815 2003816 BAD_1105 BAD_1106 murF   TRUE 0.659 76.000 0.118 NA   NA
 2003816 2003817 BAD_1106 BAD_1107   ftsI TRUE 0.652 56.000 0.059 NA   NA
 2003817 2003818 BAD_1107 BAD_1108 ftsI   TRUE 0.933 -3.000 0.072 NA   NA
 2003818 2003819 BAD_1108 BAD_1109   mraW TRUE 0.904 2.000 0.011 NA   NA
 2003819 2003820 BAD_1109 BAD_1110 mraW mraZ TRUE 0.987 0.000 0.635 NA   NA
 2003821 2003822 BAD_1111 BAD_1112   serA TRUE 0.831 -19.000 0.018 1.000   NA
 2003823 2003824 BAD_1113 BAD_1114 nrdR   TRUE 0.652 -10.000 0.000 NA   NA
 2003826 2003827 BAD_1116 BAD_1117   ldh2 FALSE 0.165 175.000 0.021 1.000 N NA
 2003827 2003828 BAD_1117 BAD_1118 ldh2 hflX FALSE 0.263 116.000 0.009 1.000   NA
 2003829 2003830 BAD_1119 BAD_1120   hrpA TRUE 0.912 -3.000 0.027 1.000 N NA
 2003830 2003831 BAD_1120 BAD_1121 hrpA   FALSE 0.239 74.000 0.000 NA   NA
 2003831 2003832 BAD_1121 BAD_1122     FALSE 0.314 53.000 0.000 NA   NA
 2003833 2003834 BAD_1123 BAD_1124 glnA2 hisA TRUE 0.888 63.000 0.038 0.044 Y NA
 2003834 2003835 BAD_1124 BAD_1125 hisA hisH TRUE 0.901 112.000 0.491 0.006 Y NA
 2003835 2003836 BAD_1125 BAD_1126 hisH   TRUE 0.763 52.000 0.132 NA   NA
 2003836 2003837 BAD_1126 BAD_1127   hisB TRUE 0.913 0.000 0.016 NA   NA
 2003837 2003838 BAD_1127 BAD_1128 hisB hisC TRUE 0.763 171.000 0.341 0.006 Y NA
 2003838 2003839 BAD_1128 BAD_1129 hisC hisD TRUE 0.988 -3.000 0.112 0.006 Y NA
 2003839 2003840 BAD_1129 BAD_1130 hisD dnaE1 FALSE 0.501 58.000 0.005 1.000 N NA
 2003840 2003841 BAD_1130 BAD_1131 dnaE1   TRUE 0.554 64.000 0.014 1.000 N NA
 2003841 2003842 BAD_1131 BAD_1132   lspA TRUE 0.936 -3.000 0.073 1.000 N NA
 2003842 2003843 BAD_1132 BAD_1133 lspA   TRUE 0.550 22.000 0.000 NA   NA
 2003843 2003844 BAD_1133 BAD_1134     FALSE 0.137 110.000 0.000 NA   NA
 2003844 2003845 BAD_1134 BAD_1135     TRUE 0.610 92.000 0.165 NA   NA
 2003845 2003846 BAD_1135 BAD_1136   ftsZ TRUE 0.672 31.000 0.012 NA   NA
 2003846 2003847 BAD_1136 BAD_1137 ftsZ   FALSE 0.130 177.000 0.008 1.000 N NA
 2003847 2003848 BAD_1137 BAD_1138   glyS TRUE 0.910 42.000 0.013 1.000 Y NA
 2003850 2003851 BAD_1140 BAD_1141   pstC TRUE 0.985 8.000 0.750 NA   NA
 2003851 2003852 BAD_1141 BAD_1142 pstC   FALSE 0.003 710.000 0.000 NA   NA
 2003853 2003854 BAD_1143 BAD_1144   thiM FALSE 0.012 282.000 0.000 1.000 N NA
 2003854 2003855 BAD_1144 BAD_1145 thiM   TRUE 0.764 144.000 0.146 0.005 Y NA
 2003855 2003856 BAD_1145 BAD_1146   thiD TRUE 0.598 129.000 0.000 0.005 Y NA
 2003856 2003857 BAD_1146 BAD_1147 thiD   FALSE 0.399 89.000 0.021 NA   NA
 2003857 2003858 BAD_1147 BAD_1148     FALSE 0.339 103.000 0.015 NA   NA
 2003858 2003859 BAD_1148 BAD_1149   cscB FALSE 0.017 257.000 0.000 1.000 N NA
 2003859 2003860 BAD_1149 BAD_1150 cscB cscA FALSE 0.212 203.000 0.188 1.000 N NA
 2003860 2003861 BAD_1150 BAD_1151 cscA   FALSE 0.009 327.000 0.000 1.000 N NA
 2003861 2003862 BAD_1151 BAD_1152     FALSE 0.485 271.000 0.584 NA Y NA
 2003862 2003863 BAD_1152 BAD_1153     FALSE 0.451 94.000 0.050 NA N NA
 2003864 2003865 BAD_1154 BAD_1155 uppS recO TRUE 0.936 6.000 0.076 1.000 N NA
 2003865 2003866 BAD_1155 BAD_1156 recO   FALSE 0.401 84.000 0.010 NA   NA
 2003866 2003867 BAD_1156 BAD_1157   ispG FALSE 0.506 65.000 0.009 NA   NA
 2003867 2003868 BAD_1157 BAD_1158 ispG ispC TRUE 0.877 65.000 0.012 1.000 Y NA
 2003868 2003869 BAD_1158 BAD_1159 ispC   FALSE 0.182 153.000 0.007 NA   NA
 2003871 2003872 BAD_1160 BAD_1161     FALSE 0.336 119.000 0.037 NA   NA
 2003879 2003880 BAD_1168 BAD_1169 murI   FALSE 0.312 98.000 0.009 1.000   NA
 2003880 2003881 BAD_1169 BAD_1170     FALSE 0.145 99.000 0.000 1.000   NA
 2003881 2003882 BAD_1170 BAD_1171     FALSE 0.029 201.000 0.000 1.000   NA
 2003882 2003883 BAD_1171 BAD_1172   dppA2 FALSE 0.073 159.000 0.000 1.000   NA
 2003886 2003887 BAD_1175 BAD_1176 topA   TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 2003888 2003889 BAD_1177 BAD_1178     FALSE 0.389 34.000 0.000 1.000   NA
 11524341 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3663.000 0.000 NA   NA
 11666704 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3663.000 0.000 NA   NA
 11809096 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3663.000 0.000 NA   NA
 11524342 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3696.000 0.000 NA   NA
 11666705 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3696.000 0.000 NA   NA
 11809097 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3696.000 0.000 NA   NA
 11524343 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3730.000 0.000 NA   NA
 11666706 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3730.000 0.000 NA   NA
 11809098 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3730.000 0.000 NA   NA
 11524344 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3763.000 0.000 NA   NA
 11666707 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3763.000 0.000 NA   NA
 11809099 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3763.000 0.000 NA   NA
 11524345 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3798.000 0.000 NA   NA
 11666708 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3798.000 0.000 NA   NA
 11809100 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3798.000 0.000 NA   NA
 11524346 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3831.000 0.000 NA   NA
 11666709 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3831.000 0.000 NA   NA
 11809101 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3831.000 0.000 NA   NA
 11524347 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3866.000 0.000 NA   NA
 11666710 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3866.000 0.000 NA   NA
 11809102 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3866.000 0.000 NA   NA
 11524348 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3899.000 0.000 NA   NA
 11666711 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3899.000 0.000 NA   NA
 11809103 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3899.000 0.000 NA   NA
 11524349 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3934.000 0.000 NA   NA
 11666712 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3934.000 0.000 NA   NA
 11809104 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3934.000 0.000 NA   NA
 11524350 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3967.000 0.000 NA   NA
 11666713 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3967.000 0.000 NA   NA
 11809105 2003884   BAD_1173     FALSE NA 3967.000 0.000 NA   NA
 11524351 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4001.000 0.000 NA   NA
 11666714 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4001.000 0.000 NA   NA
 11809106 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4001.000 0.000 NA   NA
 11524352 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4034.000 0.000 NA   NA
 11666715 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4034.000 0.000 NA   NA
 11809107 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4034.000 0.000 NA   NA
 11524353 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4067.000 0.000 NA   NA
 11666716 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4067.000 0.000 NA   NA
 11809108 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4067.000 0.000 NA   NA
 11524354 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4100.000 0.000 NA   NA
 11666717 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4100.000 0.000 NA   NA
 11809109 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4100.000 0.000 NA   NA
 11524355 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4134.000 0.000 NA   NA
 11666718 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4134.000 0.000 NA   NA
 11809110 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4134.000 0.000 NA   NA
 11524356 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4167.000 0.000 NA   NA
 11666719 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4167.000 0.000 NA   NA
 11809111 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4167.000 0.000 NA   NA
 11524357 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4202.000 0.000 NA   NA
 11666720 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4202.000 0.000 NA   NA
 11809112 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4202.000 0.000 NA   NA
 11524358 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4235.000 0.000 NA   NA
 11666721 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4235.000 0.000 NA   NA
 11809113 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4235.000 0.000 NA   NA
 11524359 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4269.000 0.000 NA   NA
 11666722 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4269.000 0.000 NA   NA
 11809114 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4269.000 0.000 NA   NA
 11524360 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4302.000 0.000 NA   NA
 11666723 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4302.000 0.000 NA   NA
 11809115 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4302.000 0.000 NA   NA
 11524361 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4335.000 0.000 NA   NA
 11666724 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4335.000 0.000 NA   NA
 11809116 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4335.000 0.000 NA   NA
 11524362 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4368.000 0.000 NA   NA
 11666725 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4368.000 0.000 NA   NA
 11809117 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4368.000 0.000 NA   NA
 11524363 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4402.000 0.000 NA   NA
 11666726 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4402.000 0.000 NA   NA
 11809118 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4402.000 0.000 NA   NA
 11524364 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4435.000 0.000 NA   NA
 11666727 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4435.000 0.000 NA   NA
 11809119 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4435.000 0.000 NA   NA
 11524365 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4470.000 0.000 NA   NA
 11666728 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4470.000 0.000 NA   NA
 11809120 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4470.000 0.000 NA   NA
 11524366 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4503.000 0.000 NA   NA
 11666729 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4503.000 0.000 NA   NA
 11809121 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4503.000 0.000 NA   NA
 11524367 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4537.000 0.000 NA   NA
 11666730 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4537.000 0.000 NA   NA
 11809122 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4537.000 0.000 NA   NA
 11524368 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4570.000 0.000 NA   NA
 11666731 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4570.000 0.000 NA   NA
 11809123 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4570.000 0.000 NA   NA
 11524369 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4605.000 0.000 NA   NA
 11666732 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4605.000 0.000 NA   NA
 11809124 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4605.000 0.000 NA   NA
 11524370 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4638.000 0.000 NA   NA
 11666733 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4638.000 0.000 NA   NA
 11809125 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4638.000 0.000 NA   NA
 11524371 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4672.000 0.000 NA   NA
 11666734 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4672.000 0.000 NA   NA
 11809126 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4672.000 0.000 NA   NA
 11524372 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4705.000 0.000 NA   NA
 11666735 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4705.000 0.000 NA   NA
 11809127 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4705.000 0.000 NA   NA
 11524373 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4739.000 0.000 NA   NA
 11666736 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4739.000 0.000 NA   NA
 11809128 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4739.000 0.000 NA   NA
 11524374 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4772.000 0.000 NA   NA
 11666737 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4772.000 0.000 NA   NA
 11809129 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4772.000 0.000 NA   NA
 11524375 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11666738 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11809130 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4806.000 0.000 NA   NA
 11524376 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4839.000 0.000 NA   NA
 11666739 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4839.000 0.000 NA   NA
 11809131 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4839.000 0.000 NA   NA
 11524377 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4873.000 0.000 NA   NA
 11666740 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4873.000 0.000 NA   NA
 11809132 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4873.000 0.000 NA   NA
 11524378 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4906.000 0.000 NA   NA
 11666741 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4906.000 0.000 NA   NA
 11809133 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4906.000 0.000 NA   NA
 11524379 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4940.000 0.000 NA   NA
 11666742 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4940.000 0.000 NA   NA
 11809134 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4940.000 0.000 NA   NA
 11524380 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4973.000 0.000 NA   NA
 11666743 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4973.000 0.000 NA   NA
 11809135 2003884   BAD_1173     FALSE NA 4973.000 0.000 NA   NA
 11524381 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5006.000 0.000 NA   NA
 11666744 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5006.000 0.000 NA   NA
 11809136 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5006.000 0.000 NA   NA
 11524382 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5039.000 0.000 NA   NA
 11666745 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5039.000 0.000 NA   NA
 11809137 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5039.000 0.000 NA   NA
 11524383 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5073.000 0.000 NA   NA
 11666746 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5073.000 0.000 NA   NA
 11809138 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5073.000 0.000 NA   NA
 11524384 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5106.000 0.000 NA   NA
 11666747 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5106.000 0.000 NA   NA
 11809139 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5106.000 0.000 NA   NA
 11524385 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5140.000 0.000 NA   NA
 11666748 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5140.000 0.000 NA   NA
 11809140 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5140.000 0.000 NA   NA
 11524386 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11666749 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11809141 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5173.000 0.000 NA   NA
 11524387 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5206.000 0.000 NA   NA
 11666750 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5206.000 0.000 NA   NA
 11809142 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5206.000 0.000 NA   NA
 11524388 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5239.000 0.000 NA   NA
 11666751 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5239.000 0.000 NA   NA
 11809143 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5239.000 0.000 NA   NA
 11524389 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5276.000 0.000 NA   NA
 11666752 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5276.000 0.000 NA   NA
 11809144 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5276.000 0.000 NA   NA
 11524390 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5309.000 0.000 NA   NA
 11666753 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5309.000 0.000 NA   NA
 11809145 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5309.000 0.000 NA   NA
 11524391 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5344.000 0.000 NA   NA
 11666754 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5344.000 0.000 NA   NA
 11809146 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5344.000 0.000 NA   NA
 11524392 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5377.000 0.000 NA   NA
 11666755 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5377.000 0.000 NA   NA
 11809147 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5377.000 0.000 NA   NA
 11524393 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5411.000 0.000 NA   NA
 11666756 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5411.000 0.000 NA   NA
 11809148 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5411.000 0.000 NA   NA
 11524394 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5444.000 0.000 NA   NA
 11666757 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5444.000 0.000 NA   NA
 11809149 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5444.000 0.000 NA   NA
 11524395 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5478.000 0.000 NA   NA
 11666758 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5478.000 0.000 NA   NA
 11809150 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5478.000 0.000 NA   NA
 11524396 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5511.000 0.000 NA   NA
 11666759 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5511.000 0.000 NA   NA
 11809151 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5511.000 0.000 NA   NA
 11524397 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5544.000 0.000 NA   NA
 11666760 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5544.000 0.000 NA   NA
 11809152 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5544.000 0.000 NA   NA
 11524398 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5577.000 0.000 NA   NA
 11666761 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5577.000 0.000 NA   NA
 11809153 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5577.000 0.000 NA   NA
 11524399 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5610.000 0.000 NA   NA
 11666762 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5610.000 0.000 NA   NA
 11809154 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5610.000 0.000 NA   NA
 11524400 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5643.000 0.000 NA   NA
 11666763 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5643.000 0.000 NA   NA
 11809155 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5643.000 0.000 NA   NA
 11524401 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5678.000 0.000 NA   NA
 11666764 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5678.000 0.000 NA   NA
 11809156 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5678.000 0.000 NA   NA
 11524402 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5711.000 0.000 NA   NA
 11666765 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5711.000 0.000 NA   NA
 11809157 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5711.000 0.000 NA   NA
 11524403 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5746.000 0.000 NA   NA
 11666766 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5746.000 0.000 NA   NA
 11809158 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5746.000 0.000 NA   NA
 11524404 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5779.000 0.000 NA   NA
 11666767 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5779.000 0.000 NA   NA
 11809159 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5779.000 0.000 NA   NA
 11524405 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5812.000 0.000 NA   NA
 11666768 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5812.000 0.000 NA   NA
 11809160 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5812.000 0.000 NA   NA
 11524406 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5845.000 0.000 NA   NA
 11666769 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5845.000 0.000 NA   NA
 11809161 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5845.000 0.000 NA   NA
 11524407 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5877.000 0.000 NA   NA
 11666770 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5877.000 0.000 NA   NA
 11809162 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5877.000 0.000 NA   NA
 11524408 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5910.000 0.000 NA   NA
 11666771 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5910.000 0.000 NA   NA
 11809163 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5910.000 0.000 NA   NA
 11524409 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5944.000 0.000 NA   NA
 11666772 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5944.000 0.000 NA   NA
 11809164 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5944.000 0.000 NA   NA
 11524410 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5977.000 0.000 NA   NA
 11666773 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5977.000 0.000 NA   NA
 11809165 2003884   BAD_1173     FALSE NA 5977.000 0.000 NA   NA
 11524411 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6011.000 0.000 NA   NA
 11666774 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6011.000 0.000 NA   NA
 11809166 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6011.000 0.000 NA   NA
 11524412 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6044.000 0.000 NA   NA
 11666775 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6044.000 0.000 NA   NA
 11809167 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6044.000 0.000 NA   NA
 11524413 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6078.000 0.000 NA   NA
 11666776 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6078.000 0.000 NA   NA
 11809168 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6078.000 0.000 NA   NA
 11524414 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6111.000 0.000 NA   NA
 11666777 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6111.000 0.000 NA   NA
 11809169 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6111.000 0.000 NA   NA
 11524415 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6146.000 0.000 NA   NA
 11666778 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6146.000 0.000 NA   NA
 11809170 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6146.000 0.000 NA   NA
 11524416 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6179.000 0.000 NA   NA
 11666779 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6179.000 0.000 NA   NA
 11809171 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6179.000 0.000 NA   NA
 11524417 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6212.000 0.000 NA   NA
 11666780 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6212.000 0.000 NA   NA
 11809172 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6212.000 0.000 NA   NA
 11524418 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6245.000 0.000 NA   NA
 11666781 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6245.000 0.000 NA   NA
 11809173 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6245.000 0.000 NA   NA
 11524419 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6277.000 0.000 NA   NA
 11666782 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6277.000 0.000 NA   NA
 11809174 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6277.000 0.000 NA   NA
 11524420 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6310.000 0.000 NA   NA
 11666783 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6310.000 0.000 NA   NA
 11809175 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6310.000 0.000 NA   NA
 11524421 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6346.000 0.000 NA   NA
 11666784 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6346.000 0.000 NA   NA
 11809176 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6346.000 0.000 NA   NA
 11524422 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6379.000 0.000 NA   NA
 11666785 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6379.000 0.000 NA   NA
 11809177 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6379.000 0.000 NA   NA
 11524423 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6412.000 0.000 NA   NA
 11666786 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6412.000 0.000 NA   NA
 11809178 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6412.000 0.000 NA   NA
 11524424 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6445.000 0.000 NA   NA
 11666787 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6445.000 0.000 NA   NA
 11809179 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6445.000 0.000 NA   NA
 11524425 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6479.000 0.000 NA   NA
 11666788 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6479.000 0.000 NA   NA
 11809180 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6479.000 0.000 NA   NA
 11524426 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6512.000 0.000 NA   NA
 11666789 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6512.000 0.000 NA   NA
 11809181 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6512.000 0.000 NA   NA
 11524427 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6546.000 0.000 NA   NA
 11666790 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6546.000 0.000 NA   NA
 11809182 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6546.000 0.000 NA   NA
 11524428 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6579.000 0.000 NA   NA
 11666791 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6579.000 0.000 NA   NA
 11809183 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6579.000 0.000 NA   NA
 11524429 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6615.000 0.000 NA   NA
 11666792 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6615.000 0.000 NA   NA
 11809184 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6615.000 0.000 NA   NA
 11524430 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6648.000 0.000 NA   NA
 11666793 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6648.000 0.000 NA   NA
 11809185 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6648.000 0.000 NA   NA
 11524431 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6684.000 0.000 NA   NA
 11666794 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6684.000 0.000 NA   NA
 11809186 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6684.000 0.000 NA   NA
 11524432 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6717.000 0.000 NA   NA
 11666795 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6717.000 0.000 NA   NA
 11809187 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6717.000 0.000 NA   NA
 11524433 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6752.000 0.000 NA   NA
 11666796 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6752.000 0.000 NA   NA
 11809188 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6752.000 0.000 NA   NA
 11524434 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6785.000 0.000 NA   NA
 11666797 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6785.000 0.000 NA   NA
 11809189 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6785.000 0.000 NA   NA
 11524435 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6819.000 0.000 NA   NA
 11666798 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6819.000 0.000 NA   NA
 11809190 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6819.000 0.000 NA   NA
 11524436 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6852.000 0.000 NA   NA
 11666799 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6852.000 0.000 NA   NA
 11809191 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6852.000 0.000 NA   NA
 11524437 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6886.000 0.000 NA   NA
 11666800 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6886.000 0.000 NA   NA
 11809192 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6886.000 0.000 NA   NA
 11524438 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6919.000 0.000 NA   NA
 11666801 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6919.000 0.000 NA   NA
 11809193 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6919.000 0.000 NA   NA
 11524439 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6953.000 0.000 NA   NA
 11666802 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6953.000 0.000 NA   NA
 11809194 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6953.000 0.000 NA   NA
 11524440 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6986.000 0.000 NA   NA
 11666803 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6986.000 0.000 NA   NA
 11809195 2003884   BAD_1173     FALSE NA 6986.000 0.000 NA   NA
 11524441 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7020.000 0.000 NA   NA
 11666804 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7020.000 0.000 NA   NA
 11809196 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7020.000 0.000 NA   NA
 11524442 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7053.000 0.000 NA   NA
 11666805 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7053.000 0.000 NA   NA
 11809197 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7053.000 0.000 NA   NA
 11524443 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7087.000 0.000 NA   NA
 11666806 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7087.000 0.000 NA   NA
 11809198 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7087.000 0.000 NA   NA
 11524444 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7120.000 0.000 NA   NA
 11666807 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7120.000 0.000 NA   NA
 11809199 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7120.000 0.000 NA   NA
 11524445 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7154.000 0.000 NA   NA
 11666808 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7154.000 0.000 NA   NA
 11809200 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7154.000 0.000 NA   NA
 11524446 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7187.000 0.000 NA   NA
 11666809 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7187.000 0.000 NA   NA
 11809201 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7187.000 0.000 NA   NA
 11524447 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7221.000 0.000 NA   NA
 11666810 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7221.000 0.000 NA   NA
 11809202 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7221.000 0.000 NA   NA
 11524448 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7254.000 0.000 NA   NA
 11666811 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7254.000 0.000 NA   NA
 11809203 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7254.000 0.000 NA   NA
 11524449 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7289.000 0.000 NA   NA
 11666812 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7289.000 0.000 NA   NA
 11809204 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7289.000 0.000 NA   NA
 11524450 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7322.000 0.000 NA   NA
 11666813 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7322.000 0.000 NA   NA
 11809205 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7322.000 0.000 NA   NA
 11524451 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7357.000 0.000 NA   NA
 11666814 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7357.000 0.000 NA   NA
 11809206 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7357.000 0.000 NA   NA
 11524452 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7390.000 0.000 NA   NA
 11666815 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7390.000 0.000 NA   NA
 11809207 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7390.000 0.000 NA   NA
 11524453 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7424.000 0.000 NA   NA
 11666816 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7424.000 0.000 NA   NA
 11809208 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7424.000 0.000 NA   NA
 11524454 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7457.000 0.000 NA   NA
 11666817 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7457.000 0.000 NA   NA
 11809209 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7457.000 0.000 NA   NA
 11524455 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7491.000 0.000 NA   NA
 11666818 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7491.000 0.000 NA   NA
 11809210 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7491.000 0.000 NA   NA
 11524456 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7524.000 0.000 NA   NA
 11666819 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7524.000 0.000 NA   NA
 11809211 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7524.000 0.000 NA   NA
 11524457 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7557.000 0.000 NA   NA
 11666820 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7557.000 0.000 NA   NA
 11809212 2003884   BAD_1173     FALSE NA 7557.000 0.000 NA   NA
 11524458 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2537.000 0.000 NA   NA
 11666821 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2537.000 0.000 NA   NA
 11809213 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2537.000 0.000 NA   NA
 11524459 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2504.000 0.000 NA   NA
 11666822 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2504.000 0.000 NA   NA
 11809214 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2504.000 0.000 NA   NA
 11524460 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2470.000 0.000 NA   NA
 11666823 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2470.000 0.000 NA   NA
 11809215 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2470.000 0.000 NA   NA
 11524461 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2437.000 0.000 NA   NA
 11666824 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2437.000 0.000 NA   NA
 11809216 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2437.000 0.000 NA   NA
 11524462 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2404.000 0.000 NA   NA
 11666825 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2404.000 0.000 NA   NA
 11809217 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2404.000 0.000 NA   NA
 11524463 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2371.000 0.000 NA   NA
 11666826 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2371.000 0.000 NA   NA
 11809218 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2371.000 0.000 NA   NA
 11524464 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2337.000 0.000 NA   NA
 11666827 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2337.000 0.000 NA   NA
 11809219 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2337.000 0.000 NA   NA
 11524465 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2304.000 0.000 NA   NA
 11666828 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2304.000 0.000 NA   NA
 11809220 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2304.000 0.000 NA   NA
 11524466 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2270.000 0.000 NA   NA
 11666829 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2270.000 0.000 NA   NA
 11809221 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2270.000 0.000 NA   NA
 11524467 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2237.000 0.000 NA   NA
 11666830 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2237.000 0.000 NA   NA
 11809222 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2237.000 0.000 NA   NA
 11524468 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2203.000 0.000 NA   NA
 11666831 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2203.000 0.000 NA   NA
 11809223 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2203.000 0.000 NA   NA
 11524469 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2170.000 0.000 NA   NA
 11666832 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2170.000 0.000 NA   NA
 11809224 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2170.000 0.000 NA   NA
 11524470 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2136.000 0.000 NA   NA
 11666833 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2136.000 0.000 NA   NA
 11809225 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2136.000 0.000 NA   NA
 11524471 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2103.000 0.000 NA   NA
 11666834 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2103.000 0.000 NA   NA
 11809226 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2103.000 0.000 NA   NA
 11524472 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2069.000 0.000 NA   NA
 11666835 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2069.000 0.000 NA   NA
 11809227 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2069.000 0.000 NA   NA
 11524473 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2036.000 0.000 NA   NA
 11666836 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2036.000 0.000 NA   NA
 11809228 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2036.000 0.000 NA   NA
 11524474 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2002.000 0.000 NA   NA
 11666837 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2002.000 0.000 NA   NA
 11809229 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 2002.000 0.000 NA   NA
 11524475 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1969.000 0.000 NA   NA
 11666838 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1969.000 0.000 NA   NA
 11809230 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1969.000 0.000 NA   NA
 11524476 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1935.000 0.000 NA   NA
 11666839 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1935.000 0.000 NA   NA
 11809231 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1935.000 0.000 NA   NA
 11524477 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1902.000 0.000 NA   NA
 11666840 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1902.000 0.000 NA   NA
 11809232 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1902.000 0.000 NA   NA
 11524478 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1868.000 0.000 NA   NA
 11666841 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1868.000 0.000 NA   NA
 11809233 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1868.000 0.000 NA   NA
 11524479 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1835.000 0.000 NA   NA
 11666842 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1835.000 0.000 NA   NA
 11809234 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1835.000 0.000 NA   NA
 11524480 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1800.000 0.000 NA   NA
 11666843 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1800.000 0.000 NA   NA
 11809235 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1800.000 0.000 NA   NA
 11524481 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1767.000 0.000 NA   NA
 11666844 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1767.000 0.000 NA   NA
 11809236 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1767.000 0.000 NA   NA
 11524482 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1733.000 0.000 NA   NA
 11666845 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1733.000 0.000 NA   NA
 11809237 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1733.000 0.000 NA   NA
 11524483 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1700.000 0.000 NA   NA
 11666846 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1700.000 0.000 NA   NA
 11809238 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1700.000 0.000 NA   NA
 11524484 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1666.000 0.000 NA   NA
 11666847 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1666.000 0.000 NA   NA
 11809239 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1666.000 0.000 NA   NA
 11524485 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1633.000 0.000 NA   NA
 11666848 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1633.000 0.000 NA   NA
 11809240 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1633.000 0.000 NA   NA
 11524486 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1598.000 0.000 NA   NA
 11666849 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1598.000 0.000 NA   NA
 11809241 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1598.000 0.000 NA   NA
 11524487 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1565.000 0.000 NA   NA
 11666850 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1565.000 0.000 NA   NA
 11809242 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1565.000 0.000 NA   NA
 11524488 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1531.000 0.000 NA   NA
 11666851 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1531.000 0.000 NA   NA
 11809243 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1531.000 0.000 NA   NA
 11524489 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1498.000 0.000 NA   NA
 11666852 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1498.000 0.000 NA   NA
 11809244 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1498.000 0.000 NA   NA
 11524490 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1462.000 0.000 NA   NA
 11666853 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1462.000 0.000 NA   NA
 11809245 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1462.000 0.000 NA   NA
 11524491 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1429.000 0.000 NA   NA
 11666854 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1429.000 0.000 NA   NA
 11809246 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1429.000 0.000 NA   NA
 11524492 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1395.000 0.000 NA   NA
 11666855 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1395.000 0.000 NA   NA
 11809247 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1395.000 0.000 NA   NA
 11524493 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1362.000 0.000 NA   NA
 11666856 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1362.000 0.000 NA   NA
 11809248 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1362.000 0.000 NA   NA
 11524494 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1327.000 0.000 NA   NA
 11666857 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1327.000 0.000 NA   NA
 11809249 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1327.000 0.000 NA   NA
 11524495 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1294.000 0.000 NA   NA
 11666858 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1294.000 0.000 NA   NA
 11809250 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1294.000 0.000 NA   NA
 11524496 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1261.000 0.000 NA   NA
 11666859 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1261.000 0.000 NA   NA
 11809251 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1261.000 0.000 NA   NA
 11524497 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1228.000 0.000 NA   NA
 11666860 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1228.000 0.000 NA   NA
 11809252 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1228.000 0.000 NA   NA
 11524498 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1193.000 0.000 NA   NA
 11666861 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1193.000 0.000 NA   NA
 11809253 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1193.000 0.000 NA   NA
 11524499 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1160.000 0.000 NA   NA
 11666862 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1160.000 0.000 NA   NA
 11809254 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1160.000 0.000 NA   NA
 11524500 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1126.000 0.000 NA   NA
 11666863 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1126.000 0.000 NA   NA
 11809255 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1126.000 0.000 NA   NA
 11524501 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1093.000 0.000 NA   NA
 11666864 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1093.000 0.000 NA   NA
 11809256 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1093.000 0.000 NA   NA
 11524502 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11666865 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11809257 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11524503 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1025.000 0.000 NA   NA
 11666866 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1025.000 0.000 NA   NA
 11809258 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 1025.000 0.000 NA   NA
 11524504 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 990.000 0.000 NA   NA
 11666867 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 990.000 0.000 NA   NA
 11809259 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 990.000 0.000 NA   NA
 11524505 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 957.000 0.000 NA   NA
 11666868 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 957.000 0.000 NA   NA
 11809260 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 957.000 0.000 NA   NA
 11524506 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 920.000 0.000 NA   NA
 11666869 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 920.000 0.000 NA   NA
 11809261 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 920.000 0.000 NA   NA
 11524507 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 887.000 0.000 NA   NA
 11666870 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 887.000 0.000 NA   NA
 11809262 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 887.000 0.000 NA   NA
 11524508 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11666871 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11809263 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 851.000 0.000 NA   NA
 11524509 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 818.000 0.000 NA   NA
 11666872 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 818.000 0.000 NA   NA
 11809264 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 818.000 0.000 NA   NA
 11524510 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 784.000 0.000 NA   NA
 11666873 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 784.000 0.000 NA   NA
 11809265 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 784.000 0.000 NA   NA
 11524511 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 751.000 0.000 NA   NA
 11666874 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 751.000 0.000 NA   NA
 11809266 2003891   BAD_1180   cas1 FALSE NA 751.000 0.000 NA   NA
 2003890 2003891 BAD_1179 BAD_1180 cas2 cas1 TRUE 0.977 68.000 0.882 NA Y NA
 2003891 2003892 BAD_1180 BAD_1181 cas1 cas4 TRUE 0.997 0.000 0.773 NA Y NA
 2003892 2003893 BAD_1181 BAD_1182 cas4   TRUE 0.983 35.000 0.711 NA Y NA
 2003893 2003894 BAD_1182 BAD_1183     TRUE 0.940 54.000 0.948 NA   NA
 2003894 2003895 BAD_1183 BAD_1184     TRUE 0.914 5.000 0.035 NA   NA
 2003895 2003896 BAD_1184 BAD_1185     TRUE 0.990 4.000 0.891 NA   NA
 2003896 2003897 BAD_1185 BAD_1186   cas3 FALSE 0.241 266.000 0.664 NA   NA
 2003897 2003898 BAD_1186 BAD_1187 cas3 ileS FALSE 0.013 249.000 0.000 0.099   NA
 2003898 2003899 BAD_1187 BAD_1188 ileS lacS FALSE 0.006 390.000 0.000 1.000 N NA
 2003899 2003900 BAD_1188 BAD_1189 lacS   FALSE 0.014 270.000 0.000 1.000 N NA
 2003902 2003903 BAD_1191 BAD_1192     TRUE 0.767 108.000 0.048 0.005 Y NA
 2003903 2003904 BAD_1192 BAD_1193     TRUE 0.970 1.000 0.205 1.000 N NA
 2003904 2003905 BAD_1193 BAD_1194     FALSE 0.028 219.000 0.000 1.000 N NA
 2003906 2003907 BAD_1195 BAD_1196   glxK TRUE 0.850 56.000 0.333 1.000 N NA
 2003908 2003909 BAD_1197 BAD_1198 bglX   TRUE 0.592 88.000 0.118 NA   NA
 2003910 2003911 BAD_1199 BAD_1200     TRUE 0.777 40.000 0.105 NA   NA
 2003912 2003913 BAD_1201 BAD_1202     TRUE 0.822 48.000 0.222 1.000   NA
 2003913 2003914 BAD_1202 BAD_1203   xynB FALSE 0.017 223.000 0.000 0.011   NA
 2003914 2003915 BAD_1203 BAD_1204 xynB   TRUE 0.908 63.000 0.750 0.011   NA
 2003915 2003916 BAD_1204 BAD_1205   xsa FALSE 0.011 275.000 0.000 1.000   NA
 2003916 2003917 BAD_1205 BAD_1206 xsa   FALSE 0.214 157.000 0.023 1.000   NA
 2003919 2003920 BAD_1208 BAD_1209     FALSE 0.006 385.000 0.000 1.000 N NA
 2003922 2003923 BAD_1211 BAD_1212 bga   FALSE 0.027 223.000 0.000 1.000 N NA
 2003923 2003924 BAD_1212 BAD_1213     TRUE 0.669 37.000 0.021 1.000 N NA
 2003924 2003925 BAD_1213 BAD_1214   yxcA FALSE 0.107 200.000 0.042 1.000   NA
 2003925 2003926 BAD_1214 BAD_1215 yxcA nrdG FALSE 0.040 188.000 0.000 1.000   NA
 2003926 2003927 BAD_1215 BAD_1216 nrdG nrdD TRUE 0.838 46.000 0.240 1.000 N NA
 2003928 2003929 BAD_1217 BAD_t0048 xseA argW FALSE 0.005 426.000 0.000 NA   NA
 2003929 2003930 BAD_t0048 BAD_1218 argW   FALSE 0.075 160.000 0.000 NA   NA
 2003931 2003932 BAD_1219 BAD_1220     FALSE 0.139 109.000 0.000 NA   NA
 2003932 2003933 BAD_1220 BAD_1221     TRUE 0.780 0.000 0.000 NA   NA
 2003933 3543147 BAD_1221 BAD_1221a     FALSE 0.036 194.000 0.000 NA   NA
 2003935 2003936 BAD_1223 BAD_1224     FALSE 0.129 186.000 0.014 NA N NA
 2003936 2003937 BAD_1224 BAD_1225   vsr TRUE 0.622 45.000 0.017 1.000 N NA
 2003938 2003939 BAD_1226 BAD_1227     TRUE 0.603 17.000 0.000 1.000   NA
 2003939 2003940 BAD_1227 BAD_1228     FALSE 0.009 303.000 0.000 NA   NA
 2003940 2003941 BAD_1228 BAD_1229     FALSE 0.311 54.000 0.000 NA   NA
 2003942 2003943 BAD_1230 BAD_1231     TRUE 0.981 -3.000 0.529 0.039   NA
 2003943 2003944 BAD_1231 BAD_1232     FALSE 0.136 175.000 0.017 0.039   NA
 2003946 2003947 BAD_1234 BAD_1235   orf137 FALSE 0.010 291.000 0.000 NA   NA
 2003947 2003948 BAD_1235 BAD_1236 orf137   FALSE 0.008 319.000 0.000 NA   NA
 2003948 2003949 BAD_1236 BAD_1237     FALSE 0.182 88.000 0.000 NA   NA
 2003949 2003950 BAD_1237 BAD_1238     FALSE 0.424 31.000 0.000 NA   NA
 2003950 2003951 BAD_1238 BAD_r0001   rrfE FALSE 0.011 285.000 0.000 NA   NA
 2003951 2003952 BAD_r0001 BAD_r0002 rrfE rrlE FALSE 0.035 195.000 0.000 NA   NA
 2003952 2003953 BAD_r0002 BAD_r0003 rrlE rrsE FALSE 0.005 440.000 0.000 NA   NA
 2003957 2003958 BAD_1242 BAD_1243     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 2003958 2003959 BAD_1243 BAD_1244     TRUE 0.966 2.000 0.182 NA   NA
 2003959 2003960 BAD_1244 BAD_1245     FALSE 0.133 113.000 0.000 NA   NA
 2003960 2003961 BAD_1245 BAD_1246     TRUE 0.747 -3.000 0.000 NA   NA
 2003961 2003962 BAD_1246 BAD_1247   cheA FALSE 0.182 88.000 0.000 NA   NA
 2003962 2003963 BAD_1247 BAD_1248 cheA   FALSE 0.005 410.000 0.000 NA   NA
 2003963 2003964 BAD_1248 BAD_1249     TRUE 0.911 57.000 0.667 NA   NA
 2003964 2003965 BAD_1249 BAD_1250     TRUE 0.981 1.000 0.429 NA   NA
 2003966 2003967 BAD_1251 BAD_1252     FALSE 0.276 67.000 0.000 NA   NA
 11524512 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2635.000 0.000 NA   NA
 11666875 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2635.000 0.000 NA   NA
 11809267 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2635.000 0.000 NA   NA
 11524513 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2655.000 0.000 NA   NA
 11666876 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2655.000 0.000 NA   NA
 11809268 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2655.000 0.000 NA   NA
 11524514 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2699.000 0.000 NA   NA
 11666877 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2699.000 0.000 NA   NA
 11809269 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2699.000 0.000 NA   NA
 11524515 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2719.000 0.000 NA   NA
 11666878 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2719.000 0.000 NA   NA
 11809270 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2719.000 0.000 NA   NA
 11524516 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2753.000 0.000 NA   NA
 11666879 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2753.000 0.000 NA   NA
 11809271 2003966   BAD_1251     FALSE NA 2753.000 0.000 NA   NA
 2003971 2003972 BAD_1256 BAD_1257     FALSE 0.060 174.000 0.000 NA   NA
 2003972 2003973 BAD_1257 BAD_1258     TRUE 0.628 16.000 0.000 NA   NA
 2003973 2003974 BAD_1258 BAD_1259     TRUE 0.640 54.000 0.048 NA   NA
 2003974 2003975 BAD_1259 BAD_1260   yckI TRUE 0.967 16.000 0.500 NA   NA
 2003976 2003977 BAD_1261 BAD_1262     FALSE 0.509 -90.000 0.000 0.012   NA
 2003977 2003978 BAD_1262 BAD_1263     FALSE 0.004 640.000 0.000 NA   NA
 2003980 2003981 BAD_1265 BAD_1266     FALSE 0.024 223.000 0.000 NA   NA
 2003981 2003982 BAD_1266 BAD_1267     FALSE 0.515 24.000 0.000 NA   NA
 2003982 2003983 BAD_1267 BAD_1268     FALSE 0.074 161.000 0.000 NA   NA
 2003984 2003985 BAD_1269 BAD_1270     FALSE 0.029 207.000 0.000 NA   NA
 2003985 2003986 BAD_1270 BAD_1271   speE TRUE 0.706 10.000 0.000 NA   NA
 2003986 2003987 BAD_1271 BAD_1272 speE   TRUE 0.683 12.000 0.000 NA   NA
 2003987 2003988 BAD_1272 BAD_1273     FALSE 0.003 690.000 0.000 NA   NA
 2003988 2003989 BAD_1273 BAD_1274   ptsG TRUE 0.738 -3.000 0.000 1.000   NA
 2003991 2003992 BAD_1276 BAD_1277     FALSE 0.006 364.000 0.000 NA   NA
 2003992 2003993 BAD_1277 BAD_1278   fhaB FALSE 0.249 72.000 0.000 NA   NA
 2003995 2003996 BAD_1280 BAD_1281     TRUE 0.982 -3.000 0.552 NA   NA
 2003996 2003997 BAD_1281 BAD_1282   kpn2kIR TRUE 0.747 -3.000 0.000 NA   NA
 2003998 2003999 BAD_1283 BAD_1284 kpn2kIM invA TRUE 0.675 105.000 0.000 1.000 Y NA
 2004000 2004001 BAD_1285 BAD_1286     FALSE 0.007 342.000 0.000 NA   NA
 2004002 2004003 BAD_1287 BAD_1288     TRUE 0.989 12.000 0.241 1.000 Y NA
 2004003 2004004 BAD_1288 BAD_1289   malF TRUE 0.993 2.000 0.240 0.040 Y NA
 2004004 2004005 BAD_1289 BAD_1290 malF   TRUE 0.996 5.000 0.660 0.040 Y NA
 2004005 2004006 BAD_1290 BAD_1291   rbsR FALSE 0.514 107.000 0.111 1.000 N NA
 2004006 2004007 BAD_1291 BAD_r0004 rbsR   FALSE 0.006 360.000 0.000 NA   NA
 2004007 2004008 BAD_r0004 BAD_r0005   rrlD FALSE 0.035 196.000 0.000 NA   NA
 2004008 2004009 BAD_r0005 BAD_r0006 rrlD rrsD FALSE 0.005 454.000 0.000 NA   NA
 2004009 2004010 BAD_r0006 BAD_1292 rrsD   FALSE 0.006 371.000 0.000 NA   NA
 2004010 2004011 BAD_1292 BAD_1293   def1 FALSE 0.063 237.000 0.025 1.000 N NA
 2004011 2004012 BAD_1293 BAD_1294 def1 mrsA TRUE 0.774 24.000 0.019 1.000 N NA
 2004012 2004013 BAD_1294 BAD_1295 mrsA pepN FALSE 0.004 604.000 0.000 1.000 N NA
 2004013 2004014 BAD_1295 BAD_1296 pepN   TRUE 0.568 88.000 0.107 1.000   NA
 2004014 2004015 BAD_1296 BAD_1297   dapA TRUE 0.674 110.000 0.353 1.000   NA
 2004015 2004016 BAD_1297 BAD_1298 dapA   FALSE 0.341 56.000 0.000 NA N NA
 2004016 2004017 BAD_1298 BAD_1299     TRUE 0.665 -16.000 0.000 NA N NA
 2004021 2004022 BAD_1303 BAD_1304 dapB   FALSE 0.490 60.000 0.006 1.000   NA
 2004022 2004023 BAD_1304 BAD_1305     FALSE 0.057 174.000 0.000 1.000   NA
 2004023 2004024 BAD_1305 BAD_1306     TRUE 0.808 27.000 0.074 NA   NA
 2004024 2004025 BAD_1306 BAD_1307     TRUE 0.664 14.000 0.000 NA   NA
 2004025 2004026 BAD_1307 BAD_1308     FALSE 0.004 521.000 0.000 NA   NA
 2004026 2004027 BAD_1308 BAD_1309     TRUE 0.706 10.000 0.000 NA   NA
 2004028 2004029 BAD_1310 BAD_1311     TRUE 0.782 80.000 0.364 NA   NA
 2004029 2004030 BAD_1311 BAD_1312   moxR TRUE 0.891 73.000 0.731 NA   NA
 2004030 2004031 BAD_1312 BAD_1313 moxR   TRUE 0.931 50.000 0.808 NA   NA
 2004031 2004032 BAD_1313 BAD_1314     TRUE 0.990 -3.000 0.880 NA   NA
 2004032 2004033 BAD_1314 BAD_1315   ppp TRUE 0.963 -3.000 0.208 1.000   NA
 2004033 2004034 BAD_1315 BAD_1316 ppp   TRUE 0.940 31.000 0.625 NA   NA
 2004035 2004036 BAD_1317 BAD_1318   rpoC FALSE 0.011 430.000 0.004 NA   NA
 2004036 2004037 BAD_1318 BAD_1319 rpoC rpoB TRUE 0.950 97.000 0.851 0.001 Y NA
 2004037 2004038 BAD_1319 BAD_1320 rpoB   FALSE 0.045 225.000 0.003 NA   NA
 2004038 2004039 BAD_1320 BAD_1321   mutY FALSE 0.474 69.000 0.009 NA   NA
 2004041 2004042 BAD_1323 BAD_1324     TRUE 0.878 67.000 0.569 NA   NA
 2004042 2004043 BAD_1324 BAD_1325     FALSE 0.006 374.000 0.000 1.000   NA
 2004043 2004044 BAD_1325 BAD_1326     TRUE 0.831 69.000 0.375 1.000   NA
 2004044 2004045 BAD_1326 BAD_1327   yteU TRUE 0.959 36.000 1.000 NA   NA
 2004045 2004046 BAD_1327 BAD_1328 yteU   TRUE 0.976 17.000 0.750 NA   NA
 2004046 2004047 BAD_1328 BAD_1329     TRUE 0.994 13.000 0.750 0.040 Y NA
 2004047 2004048 BAD_1329 BAD_1330     TRUE 0.954 50.000 0.300 0.040 Y NA
 2004048 2004049 BAD_1330 BAD_1331   galK FALSE 0.043 606.000 0.000 1.000 Y NA
 2004049 2004050 BAD_1331 BAD_1332 galK galT1 TRUE 0.901 32.000 0.370 0.001 N NA
 2004050 2004051 BAD_1332 BAD_1333 galT1   TRUE 0.909 5.000 0.023 1.000 N NA
 2004053 2004054 BAD_1335 BAD_1336 baiC   FALSE 0.132 226.000 0.114 1.000 N NA
 2004054 2004055 BAD_1336 BAD_1337     FALSE 0.434 125.000 0.095 1.000 N NA
 2004055 2004056 BAD_1337 BAD_1338   snoP TRUE 0.729 44.000 0.074 1.000 N NA
 2004056 2004057 BAD_1338 BAD_1339 snoP   TRUE 0.928 0.000 0.039 NA   NA
 2004057