MicrobesOnline Operon Predictions for Arcobacter butzleri RM4018

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column	Description
Gene1	VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1	Systematic name of 1st gene in pair
Name1	Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2	VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2	Systematic name of 2nd gene in pair
Name2	Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp	Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp	Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep	Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore	Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore	Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim	Whether the genes share a COG category or not
ExprSim	Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

Gene1	Gene2	SysName1	SysName2	Name1	Name2	bOp	pOp	Sep	MOGScore	GOScore	COGSim	ExprSim
3540814	3540815	Abu_0001	Abu_0002	dnaA	dnaN	TRUE	0.863	158.000	0.328	1.000	Y	NA
3540815	3540816	Abu_0002	Abu_0003	dnaN	gyrB	TRUE	0.955	22.000	0.114	1.000	Y	NA
3540818	3540819	Abu_0005	Abu_0006	queF		TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3540819	3540820	Abu_0006	Abu_0007			FALSE	0.094	209.000	0.000	NA		NA
3540821	3540822	Abu_0008	Abu_0009		modD	TRUE	0.880	2.000	0.000	1.000		NA
3540822	3540823	Abu_0009	Abu_0010	modD	modB	TRUE	0.990	-13.000	0.286	1.000	N	NA
3540823	3540824	Abu_0010	Abu_0011	modB		TRUE	0.949	-7.000	0.011	1.000		NA
3540824	3540825	Abu_0011	Abu_0012		modA	TRUE	0.951	-3.000	0.010	1.000		NA
3540825	3540826	Abu_0012	Abu_0013	modA	modE	TRUE	0.979	10.000	0.010	0.002		NA
3540829	3540830	Abu_0016	Abu_0017			FALSE	0.098	83.000	0.000	1.000		NA
3540832	3540833	Abu_0019	Abu_0020	purB	nrdA	TRUE	0.960	11.000	0.012	1.000	Y	NA
3540833	3540834	Abu_0020	Abu_0021	nrdA	nrdB	TRUE	0.896	130.000	0.057	0.001	Y	NA
3540834	3540835	Abu_0021	Abu_0022	nrdB		FALSE	0.086	158.000	0.000	NA		NA
3540835	3540836	Abu_0022	Abu_0023			FALSE	0.086	58.000	0.000	NA		NA
3540836	3540837	Abu_0023	Abu_0024			FALSE	0.447	17.000	0.000	NA		NA
3540837	3540838	Abu_0024	Abu_0025			FALSE	0.078	62.000	0.000	NA		NA
3540838	3540839	Abu_0025	Abu_0026			TRUE	0.871	4.000	0.000	1.000		NA
3540842	3540843	Abu_0029	Abu_0030	gpsA	gatB	TRUE	0.964	2.000	0.011	1.000	N	NA
3540843	3540844	Abu_0030	Abu_0031	gatB		TRUE	0.780	10.000	0.000	1.000		NA
3540844	3540845	Abu_0031	Abu_0032			FALSE	0.100	77.000	0.000	1.000		NA
3540845	3540846	Abu_0032	Abu_0033		lctP	FALSE	0.260	119.000	0.000	1.000	Y	NA
3540846	3540847	Abu_0033	Abu_0034	lctP		FALSE	0.092	91.000	0.000	1.000	N	NA
3540847	3540848	Abu_0034	Abu_0035			TRUE	0.981	2.000	0.000	0.077	Y	NA
3540848	3540849	Abu_0035	Abu_0036			FALSE	0.337	25.000	0.000	1.000		NA
3540849	3540850	Abu_0036	Abu_0037			TRUE	0.998	-7.000	0.508	0.002		NA
3540850	3540851	Abu_0037	Abu_0038			TRUE	0.996	-3.000	0.508	NA	Y	NA
3540851	3540852	Abu_0038	Abu_0039			FALSE	0.069	93.000	0.000	NA	N	NA
3540853	3540854	Abu_0040	Abu_0041	accB	accC1	TRUE	0.996	10.000	0.071	0.003	Y	NA
3540854	3540855	Abu_0041	Abu_0042	accC1		FALSE	0.119	222.000	0.000	1.000	N	NA
3540855	3540856	Abu_0042	Abu_0043			FALSE	0.123	208.000	0.000	1.000		NA
3540856	3540857	Abu_0043	Abu_0044			FALSE	0.128	241.000	0.000	1.000		NA
3540857	3540858	Abu_0044	Abu_0045		asnB1	TRUE	0.857	5.000	0.000	1.000		NA
3540859	3540860	Abu_0046	Abu_0047			FALSE	0.101	297.000	0.000	NA		NA
3540860	3540861	Abu_0047	Abu_0048			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3540861	3540862	Abu_0048	Abu_0049			TRUE	0.774	-30.000	0.000	NA		NA
3540862	3540863	Abu_0049	Abu_0050		rluB	TRUE	0.937	-16.000	0.006	1.000	N	NA
3540863	3540864	Abu_0050	Abu_0051	rluB		TRUE	0.989	-3.000	0.167	1.000	N	NA
3540864	3540865	Abu_0051	Abu_0052			TRUE	0.972	13.000	0.222	1.000		NA
3540865	3540866	Abu_0052	Abu_0053		ksgA	TRUE	0.968	-16.000	0.028	1.000		NA
3540867	3540868	Abu_0054	Abu_0055	hisF1		TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3540868	3540869	Abu_0055	Abu_0056			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3540869	3540870	Abu_0056	Abu_0057			TRUE	0.898	11.000	0.000	0.045		NA
3540870	3540871	Abu_0057	Abu_0058		gltX1	FALSE	0.098	89.000	0.000	1.000		NA
3540871	3540872	Abu_0058	Abu_0059	gltX1	rbpA	FALSE	0.356	24.000	0.000	1.000		NA
3540872	3540873	Abu_0059	Abu_0060	rbpA		FALSE	0.102	110.000	0.000	1.000		NA
3540873	3540874	Abu_0060	Abu_0061			TRUE	0.994	-25.000	0.154	1.000	Y	NA
3540874	3540875	Abu_0061	Abu_0062			FALSE	0.076	64.000	0.000	NA		NA
3540875	3540876	Abu_0062	Abu_0063			TRUE	0.993	0.000	0.625	NA		NA
3540876	3540877	Abu_0063	Abu_0064		czcB	TRUE	0.992	-3.000	0.312	1.000		NA
3540877	3540878	Abu_0064	Abu_0065	czcB	czcA	TRUE	0.987	7.000	0.105	1.000	N	NA
3540878	3540879	Abu_0065	Abu_0066	czcA		FALSE	0.112	49.000	0.000	NA		NA
3540881	3540882	Abu_0068	Abu_0069			FALSE	0.074	67.000	0.000	NA		NA
3540884	3540885	Abu_0071	Abu_0072	thrS	infC	TRUE	0.992	-3.000	0.060	1.000	Y	NA
3540885	3540886	Abu_0072	Abu_0073	infC	rpmI	TRUE	0.886	139.000	0.652	1.000	Y	NA
3540886	3540887	Abu_0073	Abu_0074	rpmI	rplT	TRUE	0.952	99.000	0.928	0.025	Y	NA
3540888	3540889	Abu_0075	Abu_0076			TRUE	0.776	-16.000	0.000	NA		NA
3540889	3540890	Abu_0076	Abu_0077			TRUE	0.974	10.000	0.071	NA		NA
3540890	3540891	Abu_0077	Abu_0078		mobA	FALSE	0.074	81.000	0.000	NA		NA
3540891	3540892	Abu_0078	Abu_0079	mobA	leuC	TRUE	0.946	0.000	0.007	1.000	N	NA
3540892	3540893	Abu_0079	Abu_0080	leuC	lspA	FALSE	0.092	69.000	0.000	1.000	N	NA
3540893	3540894	Abu_0080	Abu_0081	lspA	glmM	TRUE	0.978	-3.000	0.042	1.000	N	NA
3540895	3540896	Abu_0082	Abu_0083	rpsT	prfA	TRUE	0.990	4.000	0.029	1.000	Y	NA
3540896	3540897	Abu_0083	Abu_0084	prfA		FALSE	0.347	21.000	0.000	NA		NA
3540897	3540898	Abu_0084	Abu_0085		pstS	FALSE	0.075	76.000	0.000	NA		NA
3540898	3540899	Abu_0085	Abu_0086	pstS		FALSE	0.068	70.000	0.000	NA	N	NA
3540899	3540900	Abu_0086	Abu_0087		pstC	FALSE	0.241	32.000	0.000	1.000	N	NA
3540900	3540901	Abu_0087	Abu_0088	pstC	pstA	TRUE	0.999	-3.000	0.485	0.003	Y	NA
3540901	3540902	Abu_0088	Abu_0089	pstA	pstB	TRUE	0.995	16.000	0.402	0.003	Y	NA
3540902	3540903	Abu_0089	Abu_0090	pstB		TRUE	0.932	0.000	0.000	NA	Y	NA
3540903	3540904	Abu_0090	Abu_0091			FALSE	0.288	24.000	0.000	NA		NA
3540904	3540905	Abu_0091	Abu_0092			TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3540905	3540906	Abu_0092	Abu_0093			TRUE	0.995	-6.000	0.231	1.000	Y	NA
3540906	3540907	Abu_0093	Abu_0094		rplM	FALSE	0.094	76.000	0.000	1.000	N	NA
3540907	3540908	Abu_0094	Abu_0095	rplM	rpsI	TRUE	0.998	6.000	0.231	0.025	Y	NA
3540908	3540909	Abu_0095	Abu_0096	rpsI	appA	FALSE	0.339	53.000	0.008	1.000	N	NA
3540909	3540910	Abu_0096	Abu_0097	appA		TRUE	0.974	10.000	0.058	1.000		NA
3540910	3540911	Abu_0097	Abu_0098			FALSE	0.133	314.000	0.000	1.000		NA
3540911	3540912	Abu_0098	Abu_0099			TRUE	0.878	37.000	0.690	NA		NA
3540912	3540913	Abu_0099	Abu_0100			TRUE	0.994	-3.000	0.844	NA		NA
3540913	3540914	Abu_0100	Abu_0101			FALSE	0.235	28.000	0.000	NA		NA
3540914	3540915	Abu_0101	Abu_0102			TRUE	0.936	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
3540915	3540916	Abu_0102	Abu_0103		cynT1	FALSE	0.154	44.000	0.000	1.000	N	NA
3540916	3540917	Abu_0103	Abu_0104	cynT1		TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3540918	3540919	Abu_0105	Abu_0106			TRUE	0.986	-3.000	0.120	NA		NA
3540919	3540920	Abu_0106	Abu_0107		iamA	TRUE	0.997	0.000	0.912	NA	Y	NA
3540920	3540921	Abu_0107	Abu_0108	iamA	iamB	TRUE	0.998	1.000	0.912	NA	Y	NA
3540921	3540922	Abu_0108	Abu_0109	iamB		FALSE	0.075	79.000	0.000	NA		NA
3540922	3540923	Abu_0109	Abu_0110			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3540924	3540925	Abu_0111	Abu_0112	luxS		TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3540925	3540926	Abu_0112	Abu_0113			TRUE	0.923	-18.000	0.004	NA		NA
3540926	3540927	Abu_0113	Abu_0114		dacA	FALSE	0.194	39.000	0.000	1.000		NA
3540931	3540932	Abu_0118	Abu_0119	ilvE		TRUE	0.692	45.000	0.098	NA	N	NA
3540932	3540933	Abu_0119	Abu_0120			FALSE	0.136	41.000	0.000	NA		NA
3540933	3540934	Abu_0120	Abu_0121		hisI	TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3540934	3540935	Abu_0121	Abu_0122	hisI		FALSE	0.074	93.000	0.000	NA		NA
3540936	3540937	Abu_0123	Abu_0124	mrp	thiC	FALSE	0.354	67.000	0.021	1.000	N	NA
3540938	3540939	Abu_0125	Abu_0126		ispDF	FALSE	0.140	39.000	0.000	NA	N	NA
3540939	3540940	Abu_0126	Abu_0127	ispDF		TRUE	0.966	-15.000	0.027	1.000	N	NA
3540940	3540941	Abu_0127	Abu_0128		pgpA	TRUE	0.898	11.000	0.008	1.000	N	NA
3540941	3540942	Abu_0128	Abu_0129	pgpA		FALSE	0.447	17.000	0.000	NA		NA
3540943	3540944	Abu_0130	Abu_0131	carA		TRUE	0.976	0.000	0.041	NA		NA
3540944	3540945	Abu_0131	Abu_0132		purA	TRUE	0.939	5.000	0.004	NA		NA
3540945	3540946	Abu_0132	Abu_0133	purA		TRUE	0.992	2.000	0.161	1.000	N	NA
3540946	3540947	Abu_0133	Abu_0134			TRUE	0.973	0.000	0.030	1.000	N	NA
3540948	3540949	Abu_0135	Abu_0136			FALSE	0.086	156.000	0.000	NA		NA
3540949	3540950	Abu_0136	Abu_0137			FALSE	0.092	56.000	0.000	NA		NA
3540950	3540951	Abu_0137	Abu_0138			FALSE	0.288	24.000	0.000	NA		NA
3540951	3540952	Abu_0138	Abu_0139		pirA	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3540952	3540953	Abu_0139	Abu_0140	pirA	gapB	FALSE	0.089	57.000	0.000	NA		NA
3540955	3540956	Abu_0142	Abu_0143	speE	coaE	TRUE	0.460	44.000	0.016	1.000	N	NA
3540956	3540957	Abu_0143	Abu_0144	coaE	dapF	TRUE	0.958	-3.000	0.016	1.000	N	NA
3540957	3540958	Abu_0144	Abu_0145	dapF	purT	FALSE	0.323	25.000	0.000	1.000	N	NA
3540958	3540959	Abu_0145	Abu_0146	purT		TRUE	0.813	9.000	0.000	1.000		NA
3540960	3540961	Abu_0147	Abu_0148			FALSE	0.074	84.000	0.000	NA		NA
3540961	3540962	Abu_0148	Abu_0149			FALSE	0.089	170.000	0.000	NA		NA
3540962	3540963	Abu_0149	Abu_0150		ubiA	FALSE	0.130	43.000	0.000	NA		NA
3540964	3540965	Abu_0151	Abu_0152		miaA	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3540965	3540966	Abu_0152	Abu_0153	miaA	rpmE	FALSE	0.250	81.000	0.000	1.000	Y	NA
3540966	3540967	Abu_0153	Abu_0154	rpmE		TRUE	0.922	13.000	0.031	1.000		NA
3540967	3540968	Abu_0154	Abu_0155			TRUE	0.972	-3.000	0.031	1.000		NA
3540968	3540969	Abu_0155	Abu_0156			TRUE	0.558	13.000	0.000	NA		NA
3540969	3540970	Abu_0156	Abu_0157		aspB1	TRUE	0.988	4.000	0.098	NA		NA
3540970	3540971	Abu_0157	Abu_0158	aspB1	hom	TRUE	0.825	125.000	0.202	1.000	Y	NA
3540971	3540972	Abu_0158	Abu_0159	hom	traT	FALSE	0.098	96.000	0.000	1.000		NA
3540972	3540973	Abu_0159	Abu_0160	traT	cdsA	FALSE	0.108	134.000	0.000	1.000		NA
3540973	3540974	Abu_0160	Abu_0161	cdsA	dxr	TRUE	0.996	-3.000	0.372	1.000	Y	NA
3540974	3540975	Abu_0161	Abu_0162	dxr		TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3540975	3540976	Abu_0162	Abu_0163			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3540976	3540977	Abu_0163	Abu_0164		gcp	TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3540977	3540978	Abu_0164	Abu_0165	gcp		TRUE	0.861	1.000	0.000	1.000	N	NA
3540978	3540979	Abu_0165	Abu_0166			FALSE	0.187	32.000	0.000	NA	N	NA
3540979	3540980	Abu_0166	Abu_0167			TRUE	0.778	-3.000	0.000	NA	N	NA
3540980	3540981	Abu_0167	Abu_0168		thiG	TRUE	0.829	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3540981	3540982	Abu_0168	Abu_0169	thiG		FALSE	0.077	114.000	0.000	NA		NA
3540982	3540983	Abu_0169	Abu_0170			FALSE	0.394	19.000	0.000	NA		NA
3540983	3540984	Abu_0170	Abu_0171			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3540984	3540985	Abu_0171	Abu_0172			TRUE	0.815	5.000	0.000	NA		NA
3540985	3540986	Abu_0172	Abu_0173			TRUE	0.776	8.000	0.000	NA		NA
3540986	3540987	Abu_0173	Abu_0174			FALSE	0.073	69.000	0.000	NA		NA
3540987	3540988	Abu_0174	Abu_0175			TRUE	0.789	7.000	0.000	NA		NA
3540989	3540990	Abu_0176	Abu_0177	pycB1		TRUE	0.984	7.000	0.075	1.000		NA
3540991	3540992	Abu_0178	Abu_0179			FALSE	0.145	47.000	0.000	1.000	N	NA
3540994	3540995	Abu_0181	Abu_0182		tkt	FALSE	0.094	78.000	0.000	1.000	N	NA
3540995	3540996	Abu_0182	Abu_0183	tkt	lrgA	FALSE	0.104	118.000	0.000	1.000		NA
3540996	3540997	Abu_0183	Abu_0184	lrgA	lrgB	TRUE	0.986	-10.000	0.143	NA		NA
3540997	3540998	Abu_0184	Abu_0185	lrgB		TRUE	0.494	15.000	0.000	NA		NA
3540999	3541000	Abu_0186	Abu_0187		dctA	FALSE	0.076	64.000	0.000	NA		NA
3541001	3541002	Abu_0188	Abu_0189			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541002	3541003	Abu_0189	Abu_0190			TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3541003	3541004	Abu_0190	Abu_0191			TRUE	0.996	0.000	0.155	0.005		NA
3541004	3541005	Abu_0191	Abu_0192			TRUE	0.994	2.000	0.238	1.000		NA
3541005	3541006	Abu_0192	Abu_0193		aas	TRUE	0.955	12.000	0.000	0.005	Y	NA
3541007	3541008	Abu_0194	Abu_0195	glnD		TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3541008	3541009	Abu_0195	Abu_0196			FALSE	0.078	62.000	0.000	NA		NA
3541009	3541010	Abu_0196	Abu_0197			FALSE	0.073	70.000	0.000	NA		NA
3541011	3541012	Abu_0198	Abu_0199	glnB1	pyrC	TRUE	0.861	1.000	0.000	1.000	N	NA
3541013	3541014	Abu_0200	Abu_0201	fliM	flgI	TRUE	0.984	4.000	0.000	0.013	Y	NA
3541015	3541016	Abu_0202	Abu_0203		fliQ	TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3541016	3541017	Abu_0203	Abu_0204	fliQ		TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3541017	3541018	Abu_0204	Abu_0205			TRUE	0.761	9.000	0.000	NA		NA
3541018	3541019	Abu_0205	Abu_0206		fliL	TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3541019	3541020	Abu_0206	Abu_0207	fliL		TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541020	3541021	Abu_0207	Abu_0208		flgH	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541021	3541022	Abu_0208	Abu_0209	flgH	flgK	FALSE	0.380	54.000	0.000	0.010		NA
3541022	3541023	Abu_0209	Abu_0210	flgK	fliD	TRUE	0.783	21.000	0.000	0.002		NA
3541023	3541024	Abu_0210	Abu_0211	fliD	fliS	TRUE	0.953	72.000	0.608	0.002	Y	NA
3541024	3541025	Abu_0211	Abu_0212	fliS		TRUE	0.775	-24.000	0.000	NA		NA
3541026	3541027	Abu_0213	Abu_0214	tilS	yliG	TRUE	0.972	3.000	0.019	1.000	N	NA
3541027	3541028	Abu_0214	Abu_0215	yliG	panC	FALSE	0.265	68.000	0.008	1.000	N	NA
3541028	3541029	Abu_0215	Abu_0216	panC		FALSE	0.430	20.000	0.000	1.000	N	NA
3541031	3541032	Abu_0218	Abu_0219	gltS		FALSE	0.341	24.000	0.000	1.000	N	NA
3541032	3541033	Abu_0219	Abu_0220		metF	TRUE	0.829	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3541034	3541035	Abu_0221	Abu_0222	serB	tal	TRUE	0.979	3.000	0.029	1.000	N	NA
3541035	3541036	Abu_0222	Abu_0223	tal	dhs	FALSE	0.092	68.000	0.000	1.000	N	NA
3541036	3541037	Abu_0223	Abu_0224	dhs	tsx	FALSE	0.093	66.000	0.000	1.000	N	NA
3541037	3541038	Abu_0224	Abu_0225	tsx		FALSE	0.073	69.000	0.000	NA		NA
3541038	3541039	Abu_0225	Abu_0227			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3541040	3541041	Abu_0228	Abu_0229		gatC	FALSE	0.276	151.000	0.005	1.000	N	NA
3541041	3541042	Abu_0229	Abu_0230	gatC	tgt	FALSE	0.371	44.000	0.000	1.000	Y	NA
3541043	3541044	Abu_0231	Abu_0232		aspB2	TRUE	0.780	10.000	0.000	1.000		NA
3541044	3541045	Abu_0232	Abu_0233	aspB2		TRUE	0.970	-7.000	0.035	NA		NA
3541045	3541046	Abu_0233	Abu_0234		murC	TRUE	0.939	0.000	0.007	NA		NA
3541047	3541048	Abu_0235	Abu_0236	dprA		TRUE	0.530	43.000	0.022	1.000		NA
3541048	3541049	Abu_0236	Abu_0237		ilvC	TRUE	0.465	42.000	0.013	1.000		NA
3541052	3541053	Abu_0240	Abu_0241		rpsF	FALSE	0.349	88.000	0.020	1.000	N	NA
3541053	3541054	Abu_0241	Abu_0242	rpsF	ssb	TRUE	0.838	21.000	0.033	1.000	N	NA
3541054	3541055	Abu_0242	Abu_0243	ssb	rpsR	TRUE	0.908	15.000	0.034	1.000	N	NA
3541055	3541056	Abu_0243	Abu_0244	rpsR		FALSE	0.074	73.000	0.000	NA		NA
3541057	3541058	Abu_0245	Abu_0246	cysS	nusA	TRUE	0.849	5.000	0.000	1.000	N	NA
3541059	3541060	Abu_0247	Abu_0248		miaB	TRUE	0.807	22.000	0.033	NA		NA
3541060	3541061	Abu_0248	Abu_0249	miaB		TRUE	0.976	3.000	0.029	NA		NA
3541061	3541062	Abu_0249	Abu_0250			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3541063	3541064	Abu_0251	Abu_0252			TRUE	0.802	6.000	0.000	NA		NA
3541064	3541065	Abu_0252	Abu_0253		cynT2	TRUE	0.815	5.000	0.000	NA		NA
3541065	3541066	Abu_0253	Abu_0254	cynT2	bioF	TRUE	0.816	-13.000	0.000	1.000	N	NA
3541066	3541067	Abu_0254	Abu_0255	bioF		FALSE	0.112	178.000	0.000	1.000	N	NA
3541067	3541068	Abu_0255	Abu_0256			TRUE	0.849	5.000	0.000	1.000	N	NA
3541068	3541069	Abu_0256	Abu_0257			FALSE	0.098	62.000	0.000	1.000	N	NA
3541071	3541072	Abu_0259	Abu_0260	argD1	cti	FALSE	0.081	60.000	0.000	NA		NA
3541073	3541074	Abu_0261	Abu_0262	pyrB	pabB	TRUE	0.947	-3.000	0.009	1.000	N	NA
3541074	3541075	Abu_0262	Abu_0263	pabB		FALSE	0.096	63.000	0.000	1.000	N	NA
3541075	3541076	Abu_0263	Abu_0264			TRUE	0.849	5.000	0.000	1.000	N	NA
3541076	3541077	Abu_0264	Abu_0265			TRUE	0.508	17.000	0.000	1.000	N	NA
3541079	3541080	Abu_0267	Abu_0268			FALSE	0.347	21.000	0.000	NA		NA
3541080	3541081	Abu_0268	Abu_0269			FALSE	0.074	73.000	0.000	NA		NA
3541083	3541084	Abu_0271	Abu_0272			TRUE	0.988	7.000	0.133	1.000		NA
3541084	3541085	Abu_0272	Abu_0273			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541086	3541087	Abu_0274	Abu_0275			TRUE	0.469	16.000	0.000	NA		NA
3541088	3541089	Abu_0276	Abu_0277	prpB	prpC	TRUE	0.785	57.000	0.502	1.000	N	NA
3541089	3541090	Abu_0277	Abu_0278	prpC	acnA	TRUE	0.840	102.000	0.289	1.000	Y	NA
3541090	3541091	Abu_0278	Abu_0279	acnA		TRUE	0.755	90.000	0.733	NA		NA
3541091	3541092	Abu_0279	Abu_0280			FALSE	0.074	74.000	0.000	NA		NA
3541093	3541094	Abu_0281	Abu_0282			FALSE	0.081	60.000	0.000	NA		NA
3541094	3541095	Abu_0282	Abu_0283		hemC	FALSE	0.258	26.000	0.000	NA		NA
3541095	3541096	Abu_0283	Abu_0284	hemC		TRUE	0.797	16.000	0.007	1.000	N	NA
3541096	3541097	Abu_0284	Abu_0285		dnaX	FALSE	0.098	62.000	0.000	1.000	N	NA
3541097	3541098	Abu_0285	Abu_0286	dnaX	murI	TRUE	0.937	-3.000	0.004	1.000	N	NA
3541098	3541099	Abu_0286	Abu_0287	murI	gdhA	FALSE	0.119	225.000	0.000	1.000	N	NA
3541099	3541100	Abu_0287	Abu_0288	gdhA	rho	FALSE	0.104	140.000	0.000	1.000	N	NA
3541100	3541101	Abu_0288	Abu_0289	rho	tsaA	FALSE	0.110	160.000	0.000	1.000	N	NA
3541102	3541103	Abu_0290	Abu_0291	fdxA	ndk	FALSE	0.331	112.000	0.015	1.000		NA
3541103	3541104	Abu_0291	Abu_0292	ndk		TRUE	0.727	28.000	0.033	NA		NA
3541104	3541105	Abu_0292	Abu_0293		rpmF	TRUE	0.928	12.000	0.032	NA		NA
3541105	3541106	Abu_0293	Abu_0294	rpmF	plsX	TRUE	0.993	0.000	0.418	1.000	N	NA
3541106	3541107	Abu_0294	Abu_0295	plsX	fabH	TRUE	0.965	27.000	0.058	0.006	Y	NA
3541108	3541109	Abu_0296	Abu_0297			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3541109	3541110	Abu_0297	Abu_0298			TRUE	0.998	0.000	0.750	0.008		NA
3541110	3541111	Abu_0298	Abu_0299		frdB	FALSE	0.379	100.000	0.022	1.000		NA
3541111	3541112	Abu_0299	Abu_0300	frdB	frdA	TRUE	0.998	0.000	0.153	0.002	Y	NA
3541112	3541113	Abu_0300	Abu_0301	frdA	frdC	TRUE	0.998	0.000	0.128	0.002	Y	NA
3541113	3541114	Abu_0301	Abu_0302	frdC	nuoN	FALSE	0.297	198.000	0.000	1.000	Y	NA
3541114	3541115	Abu_0302	Abu_0303	nuoN	nuoM	TRUE	0.996	-3.000	0.033	0.002	Y	NA
3541115	3541116	Abu_0303	Abu_0304	nuoM	nuoL	TRUE	0.999	2.000	0.198	0.002	Y	NA
3541116	3541117	Abu_0304	Abu_0305	nuoL	nuoK	TRUE	0.999	2.000	0.790	0.010	Y	NA
3541117	3541118	Abu_0305	Abu_0306	nuoK	nuoJ	TRUE	0.999	4.000	0.306	0.005	Y	NA
3541118	3541119	Abu_0306	Abu_0307	nuoJ	nuoI	TRUE	0.996	0.000	0.034	0.010	Y	NA
3541119	3541120	Abu_0307	Abu_0308	nuoI	nuoH	TRUE	0.998	2.000	0.053	0.010	Y	NA
3541120	3541121	Abu_0308	Abu_0309	nuoH	nuoG	TRUE	0.997	-3.000	0.515	0.010		NA
3541121	3541122	Abu_0309	Abu_0310	nuoG	gltA	FALSE	0.206	37.000	0.000	1.000		NA
3541122	3541123	Abu_0310	Abu_0311	gltA	nuoF	TRUE	0.607	25.000	0.000	1.000	Y	NA
3541123	3541124	Abu_0311	Abu_0312	nuoF	nuoE	TRUE	0.997	-10.000	0.061	0.010	Y	NA
3541124	3541125	Abu_0312	Abu_0313	nuoE	nuoCD	TRUE	0.998	0.000	0.097	0.010	Y	NA
3541125	3541126	Abu_0313	Abu_0314	nuoCD	nuoB	TRUE	0.980	-7.000	0.000	0.005	Y	NA
3541126	3541127	Abu_0314	Abu_0315	nuoB	nuoA	TRUE	0.980	-9.000	0.000	0.005	Y	NA
3541127	3541128	Abu_0315	Abu_0316	nuoA		FALSE	0.102	133.000	0.000	1.000	N	NA
3541130	3541131	Abu_0318	Abu_0319			TRUE	0.995	2.000	0.704	NA		NA
3541132	3541133	Abu_0320	Abu_0321			TRUE	0.954	-31.000	0.021	NA		NA
3541133	3541134	Abu_0321	Abu_0322		hisG	TRUE	0.963	-22.000	0.023	1.000	N	NA
3541134	3541135	Abu_0322	Abu_0323	hisG		TRUE	0.948	0.000	0.006	1.000		NA
3541135	3541136	Abu_0323	Abu_0324			FALSE	0.105	123.000	0.000	1.000		NA
3541136	3541137	Abu_0324	Abu_0325			TRUE	0.774	-25.000	0.000	NA		NA
3541137	3541138	Abu_0325	Abu_0326			FALSE	0.074	96.000	0.000	NA		NA
3541139	3541140	Abu_0327	Abu_0328	trpS		FALSE	0.175	40.000	0.000	1.000	N	NA
3541140	3541141	Abu_0328	Abu_0329			FALSE	0.105	122.000	0.000	1.000		NA
3541141	3541142	Abu_0329	Abu_0330			FALSE	0.098	84.000	0.000	1.000		NA
3541142	3541143	Abu_0330	Abu_0331			TRUE	0.863	4.000	0.000	1.000	N	NA
3541143	3541144	Abu_0331	Abu_0332			TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3541144	3541145	Abu_0332	Abu_0333			TRUE	0.761	9.000	0.000	NA		NA
3541147	3541148	Abu_0335	Abu_0336			TRUE	0.936	-6.000	0.008	NA		NA
3541148	3541149	Abu_0336	Abu_0337			TRUE	0.993	-3.000	0.083	0.068		NA
3541149	3541150	Abu_0337	Abu_0338			TRUE	0.995	-3.000	0.174	0.050		NA
3541150	3541151	Abu_0338	Abu_0339			TRUE	0.999	-7.000	0.913	0.006	Y	NA
3541151	3541152	Abu_0339	Abu_0340			TRUE	0.768	103.000	0.095	0.050	N	NA
3541155	3541156	Abu_0343	Abu_0344			TRUE	0.939	12.000	0.039	NA		NA
3541156	3541157	Abu_0344	Abu_0345		serS	FALSE	0.118	55.000	0.000	1.000	N	NA
3541158	3541159	Abu_0346	Abu_0347	nrfI	nrfA	FALSE	0.135	50.000	0.000	1.000	N	NA
3541159	3541160	Abu_0347	Abu_0348	nrfA	nrfH	TRUE	0.984	14.000	0.087	0.001	N	NA
3541160	3541161	Abu_0348	Abu_0349	nrfH		FALSE	0.079	125.000	0.000	NA		NA
3541161	3541162	Abu_0349	Abu_0350			TRUE	0.789	7.000	0.000	NA		NA
3541162	3541163	Abu_0350	Abu_0351			FALSE	0.247	92.000	0.000	0.073		NA
3541163	3541164	Abu_0351	Abu_0352		napD	TRUE	0.991	2.000	0.139	NA		NA
3541164	3541165	Abu_0352	Abu_0353	napD	napL	TRUE	0.990	2.000	0.111	NA		NA
3541165	3541166	Abu_0353	Abu_0354	napL	napF	TRUE	0.972	9.000	0.047	NA		NA
3541166	3541167	Abu_0354	Abu_0355	napF	napB	TRUE	0.996	0.000	0.174	0.030		NA
3541167	3541168	Abu_0355	Abu_0356	napB	napH	TRUE	0.999	2.000	0.385	0.030	Y	NA
3541168	3541169	Abu_0356	Abu_0357	napH	napG	TRUE	0.996	-3.000	0.167	0.025		NA
3541169	3541170	Abu_0357	Abu_0358	napG	napA	TRUE	0.978	18.000	0.258	0.065		NA
3541171	3541172	Abu_0359	Abu_0360	dctP	dctQ	TRUE	0.978	14.000	0.134	NA	Y	NA
3541172	3541173	Abu_0360	Abu_0361	dctQ	dctM	TRUE	0.998	3.000	0.882	NA	Y	NA
3541176	3541177	Abu_0364	Abu_0365	menG	cysG	FALSE	0.242	156.000	0.000	NA	Y	NA
3541177	3541178	Abu_0365	Abu_0366	cysG		FALSE	0.092	56.000	0.000	NA		NA
3541178	3541179	Abu_0366	Abu_0367			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541180	3541181	Abu_0368	Abu_0369		moaA	TRUE	0.531	16.000	0.000	1.000	N	NA
3541181	3541182	Abu_0369	Abu_0370	moaA	rpsO	FALSE	0.093	97.000	0.000	1.000	N	NA
3541182	3541183	Abu_0370	Abu_0371	rpsO		FALSE	0.295	129.000	0.016	NA	N	NA
3541183	3541184	Abu_0371	Abu_0372			TRUE	0.978	0.000	0.048	NA		NA
3541184	3541185	Abu_0372	Abu_0373			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3541186	3541187	Abu_0374	Abu_0375			TRUE	0.963	25.000	0.375	1.000	Y	NA
3541188	3541189	Abu_0376	Abu_0377	ppiC	fba	TRUE	0.953	11.000	0.036	1.000	N	NA
3541189	3541190	Abu_0377	Abu_0378	fba	ald	FALSE	0.106	152.000	0.000	1.000	N	NA
3541190	3541191	Abu_0378	Abu_0379	ald		TRUE	0.674	54.000	0.125	NA		NA
3541192	3541193	Abu_0380	Abu_0381	exbD1	exbB1	TRUE	0.947	0.000	0.000	0.049		NA
3541194	3541195	Abu_0382	Abu_0383		aroK	FALSE	0.247	87.000	0.000	1.000	Y	NA
3541195	3541196	Abu_0383	Abu_0384	aroK	hisD	TRUE	0.957	2.000	0.000	1.000	Y	NA
3541196	3541197	Abu_0384	Abu_0385	hisD		TRUE	0.925	10.000	0.013	NA		NA
3541197	3541198	Abu_0385	Abu_0386		ispB	TRUE	0.887	11.000	0.009	NA		NA
3541198	3541199	Abu_0386	Abu_0387	ispB	hemA	TRUE	0.991	0.000	0.051	1.000	Y	NA
3541199	3541200	Abu_0387	Abu_0388	hemA	proS	TRUE	0.954	17.000	0.040	0.048	N	NA
3541200	3541201	Abu_0388	Abu_0389	proS	mscS	TRUE	0.590	12.000	0.000	NA	N	NA
3541201	3541202	Abu_0389	Abu_0390	mscS		FALSE	0.088	212.000	0.000	NA	N	NA
3541202	3541203	Abu_0390	Abu_0391			FALSE	0.089	57.000	0.000	NA		NA
3541203	3541204	Abu_0391	Abu_0392			TRUE	0.992	-16.000	0.519	NA		NA
3541206	3541207	Abu_0394	Abu_0395	yajC	secD	TRUE	0.699	67.000	0.068	NA	Y	NA
3541207	3541208	Abu_0395	Abu_0396	secD	secF	TRUE	0.999	0.000	0.436	0.001	Y	NA
3541208	3541209	Abu_0396	Abu_0397	secF		FALSE	0.073	69.000	0.000	NA		NA
3541210	3541211	Abu_0398	Abu_0399		motB	TRUE	0.802	6.000	0.000	NA		NA
3541211	3541212	Abu_0399	Abu_0400	motB	motA	TRUE	0.996	4.000	0.119	1.000	Y	NA
3541213	3541214	Abu_0401	Abu_0402		leuS	TRUE	0.961	0.000	0.021	NA		NA
3541214	3541215	Abu_0402	Abu_0403	leuS		TRUE	0.977	3.000	0.031	NA		NA
3541215	3541216	Abu_0403	Abu_0404		folC	TRUE	0.988	3.000	0.084	NA		NA
3541216	3541217	Abu_0404	Abu_0405	folC		TRUE	0.816	-13.000	0.000	1.000	N	NA
3541221	3541222	Abu_0409	Abu_0410		mfd	TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541222	3541223	Abu_0410	Abu_0411	mfd		TRUE	0.680	12.000	0.000	1.000		NA
3541225	3541226	Abu_0413	Abu_0414		ompR	FALSE	0.182	34.000	0.000	NA		NA
3541226	3541227	Abu_0414	Abu_0415	ompR		TRUE	0.940	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3541227	3541228	Abu_0415	Abu_0416			FALSE	0.120	46.000	0.000	NA		NA
3541228	3541229	Abu_0416	Abu_0417			FALSE	0.105	51.000	0.000	NA		NA
3541229	3541230	Abu_0417	Abu_0418			TRUE	0.830	-7.000	0.000	1.000		NA
3541230	3541231	Abu_0418	Abu_0419			TRUE	0.979	1.000	0.000	0.072	Y	NA
3541231	3541232	Abu_0419	Abu_0420			TRUE	0.976	-3.000	0.000	0.042	Y	NA
3541232	3541233	Abu_0420	Abu_0421			TRUE	0.869	1.000	0.000	1.000		NA
3541233	3541234	Abu_0421	Abu_0422			FALSE	0.153	47.000	0.000	1.000		NA
3541234	3541235	Abu_0422	Abu_0423			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541235	3541236	Abu_0423	Abu_0424		ubiE	FALSE	0.082	138.000	0.000	NA		NA
3541236	3541237	Abu_0424	Abu_0425	ubiE	xseA	TRUE	0.685	25.000	0.016	1.000	N	NA
3541237	3541238	Abu_0425	Abu_0426	xseA	cheW	FALSE	0.093	74.000	0.000	1.000	N	NA
3541240	3541241	Abu_0428	Abu_0429	panD		TRUE	0.965	-7.000	0.029	NA		NA
3541241	3541242	Abu_0429	Abu_0430		ispA	TRUE	0.936	5.000	0.003	NA		NA
3541242	3541243	Abu_0430	Abu_0431	ispA	groES	FALSE	0.103	137.000	0.000	1.000	N	NA
3541243	3541244	Abu_0431	Abu_0432	groES	groEL	TRUE	0.999	0.000	0.356	0.011	Y	NA
3541245	3541246	Abu_0433	Abu_0434			TRUE	0.998	-10.000	0.500	0.033	Y	NA
3541246	3541247	Abu_0434	Abu_0435			TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3541247	3541248	Abu_0435	Abu_0436			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541248	3541249	Abu_0436	Abu_0437			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3541249	3541250	Abu_0437	Abu_0438			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3541250	3541251	Abu_0438	Abu_0439			TRUE	0.777	-12.000	0.000	NA		NA
3541251	3541252	Abu_0439	Abu_0440			TRUE	0.992	-16.000	0.400	1.000		NA
3541252	3541253	Abu_0440	Abu_0441			TRUE	0.989	-3.000	0.250	NA	N	NA
3541253	3541254	Abu_0441	Abu_0442			FALSE	0.074	92.000	0.000	NA		NA
3541255	3541256	Abu_0443	Abu_0444	suhB	glmS	FALSE	0.135	50.000	0.000	1.000	N	NA
3541256	3541257	Abu_0444	Abu_0445	glmS	metK	FALSE	0.100	129.000	0.000	1.000	N	NA
3541257	3541258	Abu_0445	Abu_0446	metK	accD	FALSE	0.094	102.000	0.000	1.000	N	NA
3541258	3541259	Abu_0446	Abu_0447	accD	thiE	TRUE	0.960	4.000	0.010	1.000	N	NA
3541259	3541260	Abu_0447	Abu_0448	thiE		TRUE	0.931	-34.000	0.008	NA		NA
3541260	3541261	Abu_0448	Abu_0449			FALSE	0.295	60.000	0.013	NA		NA
3541261	3541262	Abu_0449	Abu_0450			TRUE	0.968	1.000	0.021	NA		NA
3541262	3541263	Abu_0450	Abu_0451		prmA	FALSE	0.249	82.000	0.000	1.000	Y	NA
3541263	3541264	Abu_0451	Abu_0452	prmA	ftsH1	TRUE	0.991	5.000	0.217	1.000	N	NA
3541264	3541265	Abu_0452	Abu_0453	ftsH1		FALSE	0.098	119.000	0.000	1.000	N	NA
3541265	3541266	Abu_0453	Abu_0454			TRUE	0.976	-13.000	0.000	0.027	Y	NA
3541266	3541267	Abu_0454	Abu_0455			TRUE	0.957	2.000	0.000	1.000	Y	NA
3541267	3541268	Abu_0455	Abu_0456		leuA1	FALSE	0.124	277.000	0.000	1.000	N	NA
3541268	3541269	Abu_0456	Abu_0457	leuA1		FALSE	0.184	40.000	0.000	1.000		NA
3541269	3541270	Abu_0457	Abu_0458			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541270	3541271	Abu_0458	Abu_0459		mutS1	TRUE	0.775	-21.000	0.000	NA		NA
3541272	3541273	Abu_0460	Abu_0461			TRUE	0.996	2.000	0.844	1.000		NA
3541273	3541274	Abu_0461	Abu_0462			TRUE	0.996	2.000	0.655	1.000		NA
3541274	3541275	Abu_0462	Abu_0463			TRUE	0.713	11.000	0.000	1.000	N	NA
3541275	3541276	Abu_0463	Abu_0464			TRUE	0.470	91.000	0.000	0.030	Y	NA
3541277	3541278	Abu_0465	Abu_0466			TRUE	0.989	10.000	0.400	1.000		NA
3541278	3541279	Abu_0466	Abu_0467			TRUE	0.726	11.000	0.000	1.000		NA
3541279	3541280	Abu_0467	Abu_0468			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3541280	3541281	Abu_0468	Abu_0469			TRUE	0.949	15.000	0.125	NA		NA
3541281	3541282	Abu_0469	Abu_0470			TRUE	0.830	-7.000	0.000	1.000		NA
3541282	3541283	Abu_0470	Abu_0471			TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3541284	3541285	Abu_0472	Abu_0473		hisA	FALSE	0.092	71.000	0.000	1.000	N	NA
3541285	3541286	Abu_0473	Abu_0474	hisA		TRUE	0.680	12.000	0.000	1.000		NA
3541286	3541287	Abu_0474	Abu_0475		hisH1	FALSE	0.420	21.000	0.000	1.000		NA
3541287	3541288	Abu_0475	Abu_0476	hisH1	ctsW	FALSE	0.169	43.000	0.000	1.000		NA
3541291	3541292	Abu_0479	Abu_0480			TRUE	0.977	12.000	0.287	NA		NA
3541293	3541294	Abu_0481	Abu_0482	cadF	prsA	FALSE	0.094	80.000	0.000	1.000	N	NA
3541296	3541297	Abu_0484	Abu_0485	trmU1	trmU2	TRUE	0.985	12.000	0.014	0.002	Y	NA
3541297	3541298	Abu_0485	Abu_0486	trmU2	folK	FALSE	0.141	48.000	0.000	1.000	N	NA
3541298	3541299	Abu_0486	Abu_0487	folK	pepQ	TRUE	0.721	31.000	0.033	1.000	N	NA
3541300	3541301	Abu_0488	Abu_0489	aroQ		TRUE	0.971	-52.000	0.033	1.000	N	NA
3541301	3541302	Abu_0489	Abu_0490		pspA	TRUE	0.974	-7.000	0.035	1.000	N	NA
3541303	3541304	Abu_0491	Abu_0492		ackA1	FALSE	0.097	237.000	0.000	NA		NA
3541304	3541305	Abu_0492	Abu_0493	ackA1	pta	TRUE	0.578	27.000	0.000	1.000	Y	NA
3541305	3541306	Abu_0493	Abu_0494	pta	ackA2	FALSE	0.310	244.000	0.000	1.000	Y	NA
3541306	3541307	Abu_0494	Abu_0495	ackA2		FALSE	0.095	104.000	0.000	1.000	N	NA
3541307	3541308	Abu_0495	Abu_0496		ackA3	FALSE	0.107	58.000	0.000	1.000	N	NA
3541308	3541309	Abu_0496	Abu_0497	ackA3	dnaQ1	TRUE	0.702	21.000	0.000	0.037	N	NA
3541309	3541310	Abu_0497	Abu_0498	dnaQ1		TRUE	0.993	-7.000	0.588	1.000	N	NA
3541310	3541311	Abu_0498	Abu_0499			TRUE	0.731	51.000	0.138	1.000		NA
3541311	3541312	Abu_0499	Abu_0500			TRUE	0.994	0.000	0.826	NA		NA
3541312	3541313	Abu_0500	Abu_0501			TRUE	0.815	227.000	0.826	NA		NA
3541313	3541314	Abu_0501	Abu_0502			TRUE	0.994	0.000	0.826	NA		NA
3541314	3541315	Abu_0502	Abu_0503		dnaQ2	FALSE	0.074	72.000	0.000	NA		NA
3541315	3541316	Abu_0503	Abu_0504	dnaQ2		TRUE	0.994	0.000	0.588	1.000	N	NA
3541316	3541317	Abu_0504	Abu_0505			TRUE	0.834	20.000	0.026	1.000		NA
3541317	3541318	Abu_0505	Abu_0506			TRUE	0.994	6.000	0.916	NA		NA
3541318	3541319	Abu_0506	Abu_0507			FALSE	0.075	76.000	0.000	NA		NA
3541319	3541320	Abu_0507	Abu_0508			TRUE	0.935	-19.000	0.000	1.000	Y	NA
3541320	3541321	Abu_0508	Abu_0509			FALSE	0.075	77.000	0.000	NA		NA
3541321	3541322	Abu_0509	Abu_0510			FALSE	0.347	21.000	0.000	NA		NA
3541322	3541323	Abu_0510	Abu_0511			FALSE	0.371	20.000	0.000	NA		NA
3541323	3541324	Abu_0511	Abu_0512			FALSE	0.305	23.000	0.000	NA		NA
3541324	3541325	Abu_0512	Abu_0513			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3541325	3541326	Abu_0513	Abu_0514			FALSE	0.076	64.000	0.000	NA		NA
3541326	3541327	Abu_0514	Abu_0515			FALSE	0.371	20.000	0.000	NA		NA
3541327	3541328	Abu_0515	Abu_0516			FALSE	0.305	23.000	0.000	NA		NA
3541328	3541329	Abu_0516	Abu_0517			FALSE	0.076	64.000	0.000	NA		NA
3541329	3541330	Abu_0517	Abu_0518		mqo	FALSE	0.074	97.000	0.000	NA		NA
3541331	3541332	Abu_0519	Abu_0520	ileS		FALSE	0.099	124.000	0.000	1.000	N	NA
3541332	3541333	Abu_0520	Abu_0521			TRUE	0.991	3.000	0.107	1.000		NA
3541333	3541334	Abu_0521	Abu_0522		murE	TRUE	0.980	-22.000	0.057	1.000		NA
3541334	3541335	Abu_0522	Abu_0523	murE		FALSE	0.126	332.000	0.000	1.000	N	NA
3541335	3541336	Abu_0523	Abu_0524		tas	FALSE	0.175	40.000	0.000	1.000	N	NA
3541336	3541337	Abu_0524	Abu_0525	tas	pitA	FALSE	0.092	70.000	0.000	1.000	N	NA
3541337	3541338	Abu_0525	Abu_0526	pitA		FALSE	0.124	287.000	0.000	1.000	N	NA
3541339	3541340	Abu_0527	Abu_0528			FALSE	0.084	143.000	0.000	NA		NA
3541341	3541342	Abu_0529	Abu_0530			TRUE	0.780	10.000	0.000	1.000		NA
3541342	3541343	Abu_0530	Abu_0531			FALSE	0.184	40.000	0.000	1.000		NA
3541343	3541344	Abu_0531	Abu_0532			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541345	3541346	Abu_0533	Abu_0534		moeA2	TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541346	3541347	Abu_0534	Abu_0535	moeA2		TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3541348	3541349	Abu_0536	Abu_0537			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541350	3541351	Abu_0538	Abu_0539			TRUE	0.776	-16.000	0.000	NA		NA
3541352	3541353	Abu_0540	Abu_0541	rpsB	tsf	TRUE	0.997	0.000	0.748	1.000	Y	NA
3541353	3541354	Abu_0541	Abu_0542	tsf		TRUE	0.470	46.000	0.019	1.000	N	NA
3541354	3541355	Abu_0542	Abu_0543			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541355	3541356	Abu_0543	Abu_0544		gmk	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541358	3541359	Abu_0546	Abu_0547			TRUE	0.984	17.000	0.713	NA	Y	NA
3541361	3541362	Abu_0549	Abu_0550		hemH	TRUE	0.816	-13.000	0.000	1.000	N	NA
3541363	3541364	Abu_0551	Abu_0552	feoB1		TRUE	0.995	-10.000	0.219	1.000	Y	NA
3541365	3541366	Abu_0553	Abu_0554			FALSE	0.089	57.000	0.000	NA		NA
3541366	3541367	Abu_0554	Abu_0555			TRUE	0.989	14.000	0.616	1.000	Y	NA
3541367	3541368	Abu_0555	Abu_0556			FALSE	0.356	24.000	0.000	1.000		NA
3541368	3541369	Abu_0556	Abu_0557		tpx	FALSE	0.099	81.000	0.000	1.000		NA
3541369	3541370	Abu_0557	Abu_0558	tpx		FALSE	0.102	112.000	0.000	1.000		NA
3541372	3541373	Abu_0560	Abu_0561			FALSE	0.098	251.000	0.000	NA		NA
3541373	3541374	Abu_0561	Abu_0562			TRUE	0.997	0.000	0.790	0.063		NA
3541374	3541375	Abu_0562	Abu_0563		rep	FALSE	0.129	250.000	0.000	1.000		NA
3541375	3541376	Abu_0563	Abu_0564	rep		FALSE	0.145	47.000	0.000	1.000	N	NA
3541376	3541377	Abu_0564	Abu_0565		soxC	FALSE	0.129	242.000	0.000	1.000		NA
3541377	3541378	Abu_0565	Abu_0566	soxC	soxD	TRUE	0.994	-31.000	0.143	0.063		NA
3541378	3541379	Abu_0566	Abu_0567	soxD	soxX	TRUE	0.986	15.000	0.250	0.020		NA
3541379	3541380	Abu_0567	Abu_0568	soxX	soxY	TRUE	0.877	16.000	0.031	NA		NA
3541380	3541381	Abu_0568	Abu_0569	soxY	soxZ	TRUE	0.582	58.000	0.078	NA		NA
3541381	3541382	Abu_0569	Abu_0570	soxZ	soxA	TRUE	0.744	38.000	0.091	NA		NA
3541382	3541383	Abu_0570	Abu_0571	soxA		TRUE	0.945	14.000	0.091	NA		NA
3541383	3541384	Abu_0571	Abu_0572		soxB	TRUE	0.585	132.000	0.091	NA		NA
3541384	3541385	Abu_0572	Abu_0573	soxB		FALSE	0.092	87.000	0.000	1.000	N	NA
3541385	3541386	Abu_0573	Abu_0574			TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3541386	3541387	Abu_0574	Abu_0575			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3541387	3541388	Abu_0575	Abu_0576			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3541389	3541390	Abu_0577	Abu_0578	pfpI		FALSE	0.099	75.000	0.000	1.000		NA
3541393	3541394	Abu_0581	Abu_0582	valS		FALSE	0.296	28.000	0.000	1.000		NA
3541394	3541395	Abu_0582	Abu_0583			FALSE	0.088	161.000	0.000	NA		NA
3541396	3541397	Abu_0584	Abu_0585			TRUE	0.789	7.000	0.000	NA		NA
3541399	3541400	Abu_0587	Abu_0588			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541400	3541401	Abu_0588	Abu_0589			TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3541401	3541402	Abu_0589	Abu_0590		proC	TRUE	0.777	-13.000	0.000	NA		NA
3541403	3541404	Abu_0591	Abu_0592		lon	TRUE	0.664	43.000	0.062	NA		NA
3541404	3541405	Abu_0592	Abu_0593	lon		TRUE	0.871	4.000	0.000	1.000		NA
3541405	3541406	Abu_0593	Abu_0594			TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3541406	3541407	Abu_0594	Abu_0595			FALSE	0.142	40.000	0.000	NA		NA
3541407	3541408	Abu_0595	Abu_0596			TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3541414	3541415	Abu_0603	Abu_0604			FALSE	0.235	28.000	0.000	NA		NA
3541416	3541417	Abu_0605	Abu_0606	accC2		FALSE	0.098	249.000	0.000	NA		NA
3541417	3541418	Abu_0606	Abu_0607		sufE	TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3541418	3541419	Abu_0607	Abu_0608	sufE	sufS	TRUE	0.990	2.000	0.116	NA		NA
3541419	3541420	Abu_0608	Abu_0609	sufS	sufD	TRUE	0.820	-7.000	0.000	1.000	N	NA
3541420	3541421	Abu_0609	Abu_0610	sufD	sufC	TRUE	0.996	-13.000	0.482	1.000	Y	NA
3541421	3541422	Abu_0610	Abu_0611	sufC	sufB	TRUE	0.997	4.000	0.466	1.000	Y	NA
3541423	3541424	Abu_0612	Abu_0613	iscS	iscU	TRUE	0.783	31.000	0.056	1.000	N	NA
3541424	3541425	Abu_0613	Abu_0614	iscU		FALSE	0.101	131.000	0.000	1.000	N	NA
3541428	3541429	Abu_0617	Abu_0618	cheV		FALSE	0.131	51.000	0.000	1.000	N	NA
3541430	3541431	Abu_0619	Abu_0620	greA		TRUE	0.873	13.000	0.012	1.000		NA
3541431	3541432	Abu_0620	Abu_0621		uvrB	TRUE	0.680	12.000	0.000	1.000		NA
3541432	3541433	Abu_0621	Abu_0622	uvrB		FALSE	0.092	91.000	0.000	1.000	N	NA
3541434	3541435	Abu_0623	Abu_0624	nth		TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541436	3541437	Abu_0625	Abu_0626			TRUE	0.760	103.000	0.017	0.012	Y	NA
3541438	3541439	Abu_0627	Abu_0628			FALSE	0.098	93.000	0.000	1.000		NA
3541440	3541441	Abu_0629	Abu_0630			FALSE	0.077	113.000	0.000	NA		NA
3541441	3541442	Abu_0630	Abu_0631			TRUE	0.980	5.000	0.000	0.032	Y	NA
3541442	3541443	Abu_0631	Abu_0632			FALSE	0.294	189.000	0.000	1.000	Y	NA
3541443	3541444	Abu_0632	Abu_0633			TRUE	0.503	114.000	0.000	0.022	Y	NA
3541445	3541446	Abu_0634	Abu_0635		rpiB	FALSE	0.099	262.000	0.000	NA		NA
3541446	3541447	Abu_0635	Abu_0636	rpiB	lepP	TRUE	0.978	0.000	0.037	1.000	N	NA
3541447	3541448	Abu_0636	Abu_0637	lepP	folD	TRUE	0.987	-6.000	0.117	1.000	N	NA
3541449	3541450	Abu_0638	Abu_0639	rplY	pth	TRUE	0.998	9.000	0.496	0.036	Y	NA
3541450	3541451	Abu_0639	Abu_0640	pth		TRUE	0.980	3.000	0.031	1.000		NA
3541451	3541452	Abu_0640	Abu_0641			TRUE	0.597	14.000	0.000	1.000		NA
3541453	3541454	Abu_0642	Abu_0643	amiA	npd	TRUE	0.985	6.000	0.068	1.000		NA
3541454	3541455	Abu_0643	Abu_0644	npd	tyrS	TRUE	0.513	61.000	0.043	1.000		NA
3541455	3541456	Abu_0644	Abu_0645	tyrS	spoT	TRUE	0.886	19.000	0.045	1.000	N	NA
3541456	3541457	Abu_0645	Abu_0646	spoT	rpoZ	TRUE	0.720	34.000	0.039	1.000		NA
3541457	3541458	Abu_0646	Abu_0647	rpoZ	pyrH	TRUE	0.813	23.000	0.033	1.000		NA
3541458	3541459	Abu_0647	Abu_0648	pyrH		FALSE	0.089	57.000	0.000	NA		NA
3541459	3541460	Abu_0648	Abu_0649		pdxA	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541460	3541461	Abu_0649	Abu_0650	pdxA	pdxJ	TRUE	0.997	-7.000	0.048	0.002	Y	NA
3541461	3541462	Abu_0650	Abu_0651	pdxJ	trpE	TRUE	0.915	10.000	0.000	1.000	Y	NA
3541462	3541463	Abu_0651	Abu_0652	trpE		TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3541463	3541464	Abu_0652	Abu_0653		glyA1	FALSE	0.258	26.000	0.000	NA		NA
3541464	3541465	Abu_0653	Abu_0654	glyA1	lysS	TRUE	0.927	14.000	0.044	1.000	N	NA
3541465	3541466	Abu_0654	Abu_0655	lysS		TRUE	0.910	13.000	0.023	1.000		NA
3541467	3541468	Abu_0656	Abu_0657	ispG		TRUE	0.837	0.000	0.000	1.000	N	NA
3541468	3541469	Abu_0657	Abu_0658		dnaB	FALSE	0.096	63.000	0.000	1.000	N	NA
3541469	3541470	Abu_0658	Abu_0659	dnaB	ugd	FALSE	0.093	66.000	0.000	1.000	N	NA
3541470	3541471	Abu_0659	Abu_0660	ugd		TRUE	0.890	11.000	0.000	1.000	Y	NA
3541471	3541472	Abu_0660	Abu_0661			TRUE	0.976	-3.000	0.008	1.000	Y	NA
3541472	3541473	Abu_0661	Abu_0662			TRUE	0.995	3.000	0.070	0.062		NA
3541473	3541474	Abu_0662	Abu_0663			TRUE	0.989	5.000	0.114	1.000		NA
3541474	3541475	Abu_0663	Abu_0664			TRUE	0.986	3.000	0.048	1.000		NA
3541475	3541476	Abu_0664	Abu_0665			TRUE	0.845	0.000	0.000	1.000		NA
3541476	3541477	Abu_0665	Abu_0666			TRUE	0.824	-34.000	0.000	1.000		NA
3541477	3541478	Abu_0666	Abu_0667			TRUE	0.997	5.000	0.511	1.000	Y	NA
3541478	3541479	Abu_0667	Abu_0668		asnB2	TRUE	0.993	2.000	0.178	1.000	N	NA
3541479	3541480	Abu_0668	Abu_0669	asnB2		TRUE	0.934	-49.000	0.000	1.000	Y	NA
3541480	3541481	Abu_0669	Abu_0670		wbpG1	TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541481	3541482	Abu_0670	Abu_0671	wbpG1	hisH2	TRUE	0.991	-3.000	0.379	NA		NA
3541482	3541483	Abu_0671	Abu_0672	hisH2	hisF2	TRUE	0.998	3.000	0.103	0.008	Y	NA
3541483	3541484	Abu_0672	Abu_0673	hisF2		TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541484	3541485	Abu_0673	Abu_0674			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541485	3541486	Abu_0674	Abu_0675			FALSE	0.092	85.000	0.000	1.000	N	NA
3541486	3541487	Abu_0675	Abu_0676			TRUE	0.863	4.000	0.000	1.000	N	NA
3541487	3541488	Abu_0676	Abu_0677		pglJ	TRUE	0.829	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3541488	3541489	Abu_0677	Abu_0678	pglJ	asnB	TRUE	0.984	-12.000	0.083	1.000	N	NA
3541489	3541490	Abu_0678	Abu_0679	asnB		TRUE	0.948	-7.000	0.011	1.000	N	NA
3541490	3541491	Abu_0679	Abu_0680			FALSE	0.272	59.000	0.000	1.000	Y	NA
3541491	3541492	Abu_0680	Abu_0681			FALSE	0.074	91.000	0.000	NA		NA
3541492	3541493	Abu_0681	Abu_0682			FALSE	0.288	24.000	0.000	NA		NA
3541493	3541494	Abu_0682	Abu_0683		wbpG2	TRUE	0.971	0.000	0.026	1.000		NA
3541494	3541495	Abu_0683	Abu_0684	wbpG2		TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3541495	3541496	Abu_0684	Abu_0685			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541496	3541497	Abu_0685	Abu_0686			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3541497	3541498	Abu_0686	Abu_0687			TRUE	0.802	6.000	0.000	NA		NA
3541498	3541499	Abu_0687	Abu_0688		wbpG3	TRUE	0.980	-10.000	0.056	1.000	N	NA
3541499	3541500	Abu_0688	Abu_0689	wbpG3	hisH3	TRUE	0.996	9.000	0.379	0.046	N	NA
3541500	3541501	Abu_0689	Abu_0690	hisH3	hisF3	TRUE	0.999	-3.000	0.517	0.008	Y	NA
3541501	3541502	Abu_0690	Abu_0691	hisF3		TRUE	0.837	0.000	0.000	1.000	N	NA
3541502	3541503	Abu_0691	Abu_0692			TRUE	0.994	-3.000	0.099	1.000	Y	NA
3541503	3541504	Abu_0692	Abu_0693			TRUE	0.980	-7.000	0.020	NA	Y	NA
3541504	3541505	Abu_0693	Abu_0694			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA	Y	NA
3541505	3541506	Abu_0694	Abu_0695			TRUE	0.981	0.000	0.014	1.000	Y	NA
3541506	3541507	Abu_0695	Abu_0696		pglF	TRUE	0.990	10.000	0.087	1.000	Y	NA
3541507	3541508	Abu_0696	Abu_0697	pglF		FALSE	0.104	62.000	0.000	1.000		NA
3541510	3541511	Abu_0699	Abu_0700	apt	trpB1	TRUE	0.804	17.000	0.011	1.000	N	NA
3541511	3541512	Abu_0700	Abu_0701	trpB1		TRUE	0.768	18.000	0.013	NA		NA
3541512	3541513	Abu_0701	Abu_0702		pepA	TRUE	0.989	-10.000	0.250	NA		NA
3541514	3541515	Abu_0703	Abu_0704		exbD2	TRUE	0.816	8.000	0.000	1.000	N	NA
3541515	3541516	Abu_0704	Abu_0705	exbD2	exbB2	TRUE	0.973	-19.000	0.000	0.047	Y	NA
3541517	3541518	Abu_0706	Abu_0707			TRUE	0.992	7.000	0.071	1.000	Y	NA
3541518	3541519	Abu_0707	Abu_0708			TRUE	0.994	-13.000	0.929	1.000	N	NA
3541519	3541520	Abu_0708	Abu_0709			TRUE	0.997	0.000	0.459	1.000	Y	NA
3541521	3541522	Abu_0710	Abu_0711			FALSE	0.105	485.000	0.000	NA		NA
3541522	3541523	Abu_0711	Abu_0712			TRUE	0.992	2.000	0.176	NA		NA
3541523	3541524	Abu_0712	Abu_0713			TRUE	0.990	1.000	0.150	NA		NA
3541524	3541525	Abu_0713	Abu_0714			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541525	3541526	Abu_0714	Abu_0715			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3541526	3541527	Abu_0715	Abu_0716			TRUE	0.990	-3.000	0.250	NA		NA
3541527	3541528	Abu_0716	Abu_0717		fur1	TRUE	0.685	61.000	0.250	NA		NA
3541529	3541530	Abu_0718	Abu_0719		fumC	FALSE	0.305	23.000	0.000	NA		NA
3541530	3541531	Abu_0719	Abu_0720	fumC		FALSE	0.324	22.000	0.000	NA		NA
3541532	3541533	Abu_0721	Abu_0722			TRUE	0.935	-16.000	0.000	1.000	Y	NA
3541534	3541535	Abu_0723	Abu_0724	bfrE		TRUE	0.635	84.000	0.122	1.000		NA
3541535	3541536	Abu_0724	Abu_0725			TRUE	0.990	-3.000	0.214	1.000		NA
3541536	3541537	Abu_0725	Abu_0726		irgA	FALSE	0.117	215.000	0.000	1.000	N	NA
3541537	3541538	Abu_0726	Abu_0727	irgA		FALSE	0.099	79.000	0.000	1.000		NA
3541538	3541539	Abu_0727	Abu_0728			TRUE	0.633	13.000	0.000	1.000		NA
3541539	3541540	Abu_0728	Abu_0729			FALSE	0.075	99.000	0.000	NA		NA
3541540	3541541	Abu_0729	Abu_0730		cysJ	TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3541542	3541543	Abu_0731	Abu_0732		cstA	TRUE	0.992	3.000	0.229	NA		NA
3541544	3541545	Abu_0733	Abu_0734			TRUE	0.706	10.000	0.000	NA	N	NA
3541546	3541547	Abu_0735	Abu_0736			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541549	3541550	Abu_0738	Abu_0739			FALSE	0.116	44.000	0.000	NA	N	NA
3541551	3541552	Abu_0740	Abu_0741	thiL	truD	FALSE	0.406	134.000	0.022	1.000		NA
3541552	3541553	Abu_0741	Abu_0742	truD		FALSE	0.101	53.000	0.000	NA		NA
3541555	3541556	Abu_0744	Abu_0745	ruvA	ddlA	TRUE	0.785	19.000	0.014	1.000	N	NA
3541556	3541557	Abu_0745	Abu_0746	ddlA		TRUE	0.983	3.000	0.046	NA		NA
3541557	3541558	Abu_0746	Abu_0747		murF	TRUE	0.985	-13.000	0.129	NA		NA
3541558	3541559	Abu_0747	Abu_0748	murF		TRUE	0.966	11.000	0.061	1.000	N	NA
3541559	3541560	Abu_0748	Abu_0749			FALSE	0.076	108.000	0.000	NA		NA
3541560	3541561	Abu_0749	Abu_0750			FALSE	0.077	111.000	0.000	NA		NA
3541561	3541562	Abu_0750	Abu_0751		rpsJ	FALSE	0.093	207.000	0.000	NA		NA
3541562	3541563	Abu_0751	Abu_0752	rpsJ	rplC	TRUE	0.991	19.000	0.467	0.030	Y	NA
3541563	3541564	Abu_0752	Abu_0753	rplC	rplD	TRUE	0.998	-3.000	0.361	0.023	Y	NA
3541564	3541565	Abu_0753	Abu_0754	rplD	rplW	TRUE	0.998	2.000	0.513	1.000	Y	NA
3541565	3541566	Abu_0754	Abu_0755	rplW	rplB	TRUE	0.995	11.000	0.849	1.000	Y	NA
3541566	3541567	Abu_0755	Abu_0756	rplB	rpsS	TRUE	0.998	10.000	0.820	0.030	Y	NA
3541567	3541568	Abu_0756	Abu_0757	rpsS	rplV	TRUE	0.999	3.000	0.769	0.030	Y	NA
3541568	3541569	Abu_0757	Abu_0758	rplV	rpsC	TRUE	0.999	0.000	0.719	0.030	Y	NA
3541569	3541570	Abu_0758	Abu_0759	rpsC	rplP	TRUE	0.999	3.000	0.828	0.030	Y	NA
3541570	3541571	Abu_0759	Abu_0760	rplP	rpmC	TRUE	0.997	-13.000	0.802	0.023		NA
3541571	3541572	Abu_0760	Abu_0761	rpmC	rpsQ	TRUE	0.996	11.000	0.828	0.023		NA
3541572	3541573	Abu_0761	Abu_0762	rpsQ	rplN	TRUE	0.999	0.000	0.791	0.030	Y	NA
3541573	3541574	Abu_0762	Abu_0763	rplN	rplX	TRUE	0.999	0.000	0.810	0.030	Y	NA
3541574	3541575	Abu_0763	Abu_0764	rplX	rplE	TRUE	0.999	-7.000	0.758	0.023	Y	NA
3541575	3541576	Abu_0764	Abu_0765	rplE	rpsN	TRUE	0.999	0.000	0.496	0.023	Y	NA
3541576	3541577	Abu_0765	Abu_0766	rpsN	rpsH	TRUE	0.996	13.000	0.473	0.023	Y	NA
3541577	3541578	Abu_0766	Abu_0767	rpsH	rplF	TRUE	0.998	10.000	0.808	0.023	Y	NA
3541578	3541579	Abu_0767	Abu_0768	rplF	rplR	TRUE	0.998	10.000	0.815	0.023	Y	NA
3541579	3541580	Abu_0768	Abu_0769	rplR	rpsE	TRUE	0.998	10.000	0.814	0.030	Y	NA
3541580	3541581	Abu_0769	Abu_0770	rpsE	rplO	TRUE	0.998	4.000	0.148	0.030	Y	NA
3541581	3541582	Abu_0770	Abu_0771	rplO	secY	TRUE	0.996	3.000	0.730	1.000	N	NA
3541582	3541583	Abu_0771	Abu_0772	secY	map	TRUE	0.978	2.000	0.026	1.000	N	NA
3541583	3541584	Abu_0772	Abu_0773	map	infA	TRUE	0.987	10.000	0.051	1.000	Y	NA
3541584	3541585	Abu_0773	Abu_0774	infA		FALSE	0.092	89.000	0.000	1.000	N	NA
3541585	3541586	Abu_0774	Abu_0775			TRUE	0.983	-3.000	0.087	NA		NA
3541586	3541587	Abu_0775	Abu_0776		aspS	FALSE	0.125	44.000	0.000	NA		NA
3541587	3541588	Abu_0776	Abu_0777	aspS		FALSE	0.104	141.000	0.000	1.000	N	NA
3541588	3541589	Abu_0777	Abu_0778			FALSE	0.100	61.000	0.000	1.000	N	NA
3541591	3541592	Abu_0780	Abu_0781	adk2		TRUE	0.961	0.000	0.016	1.000		NA
3541592	3541593	Abu_0781	Abu_0782		cat	FALSE	0.322	26.000	0.000	1.000		NA
3541593	3541594	Abu_0782	Abu_0783	cat		FALSE	0.105	125.000	0.000	1.000		NA
3541594	3541595	Abu_0783	Abu_0784			TRUE	0.464	38.000	0.000	0.031		NA
3541596	3541597	Abu_0785	Abu_0786		alr	FALSE	0.099	125.000	0.000	1.000	N	NA
3541597	3541598	Abu_0786	Abu_0787	alr	uvrC	TRUE	0.872	3.000	0.000	1.000	N	NA
3541599	3541600	Abu_0788	Abu_0789			TRUE	0.585	434.000	0.000	0.022	Y	NA
3541600	3541601	Abu_0789	Abu_0790			TRUE	0.649	42.000	0.000	0.022	Y	NA
3541601	3541602	Abu_0790	Abu_0791			TRUE	0.578	351.000	0.000	0.022	Y	NA
3541603	3541604	Abu_0792	Abu_0793			TRUE	0.999	-3.000	0.500	0.026	Y	NA
3541606	3541607	Abu_0795	Abu_0796			FALSE	0.075	77.000	0.000	NA		NA
3541607	3541608	Abu_0796	Abu_0797			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3541608	3541609	Abu_0797	Abu_0798			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3541610	3541611	Abu_0799	Abu_0800			TRUE	0.880	57.000	0.654	NA	Y	NA
3541611	3541612	Abu_0800	Abu_0801			TRUE	0.999	4.000	0.758	0.037	Y	NA
3541612	3541613	Abu_0801	Abu_0802			TRUE	0.996	2.000	0.823	1.000		NA
3541613	3541614	Abu_0802	Abu_0803			TRUE	0.909	130.000	0.731	0.017		NA
3541614	3541615	Abu_0803	Abu_0804			FALSE	0.080	127.000	0.000	NA		NA
3541615	3541616	Abu_0804	Abu_0805		ureD	FALSE	0.090	172.000	0.000	NA		NA
3541616	3541617	Abu_0805	Abu_0806	ureD	ureAB	TRUE	0.941	10.000	0.000	0.004	N	NA
3541617	3541618	Abu_0806	Abu_0807	ureAB	ureC	TRUE	0.988	2.000	0.000	0.001	Y	NA
3541618	3541619	Abu_0807	Abu_0808	ureC	ureE	TRUE	0.987	10.000	0.029	0.002	N	NA
3541619	3541620	Abu_0808	Abu_0809	ureE	ureF	TRUE	0.999	-55.000	0.460	0.006	Y	NA
3541620	3541621	Abu_0809	Abu_0810	ureF	ureG	TRUE	0.946	136.000	0.439	0.006	Y	NA
3541624	3541625	Abu_0813	Abu_0814			TRUE	0.996	3.000	0.945	1.000	N	NA
3541625	3541626	Abu_0814	Abu_0815			TRUE	0.989	-3.000	0.036	1.000	Y	NA
3541627	3541628	Abu_0816	Abu_0817			FALSE	0.074	81.000	0.000	NA		NA
3541629	3541630	Abu_0818	Abu_0819			TRUE	0.558	13.000	0.000	NA		NA
3541632	3541633	Abu_0821	Abu_0822	xth		TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541635	3541636	Abu_0824	Abu_0825			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3541637	3541638	Abu_0826	Abu_0827			TRUE	0.993	-3.000	0.748	NA		NA
3541639	3541640	Abu_0828	Abu_0829			TRUE	0.738	225.000	0.286	NA		NA
3541640	3541641	Abu_0829	Abu_0830			TRUE	0.773	-73.000	0.000	NA		NA
3541641	3541642	Abu_0830	Abu_0831			FALSE	0.216	65.000	0.000	NA	Y	NA
3541642	3541643	Abu_0831	Abu_0832			TRUE	0.998	-3.000	0.286	0.031	Y	NA
3541643	3541644	Abu_0832	Abu_0833			TRUE	0.727	28.000	0.034	NA	N	NA
3541644	3541645	Abu_0833	Abu_0834		phrB	TRUE	0.925	-13.000	0.006	NA	N	NA
3541645	3541646	Abu_0834	Abu_0835	phrB		TRUE	0.945	-3.000	0.012	NA		NA
3541646	3541647	Abu_0835	Abu_0836			FALSE	0.080	126.000	0.000	NA		NA
3541647	3541648	Abu_0836	Abu_0837			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3541648	3541649	Abu_0837	Abu_0838		pgi	TRUE	0.916	9.000	0.000	NA	Y	NA
3541649	3541650	Abu_0838	Abu_0839	pgi	galU	TRUE	0.837	0.000	0.000	1.000	N	NA
3541650	3541651	Abu_0839	Abu_0840	galU		TRUE	0.873	2.000	0.000	1.000	N	NA
3541652	3541653	Abu_0841	Abu_0842			FALSE	0.076	108.000	0.000	NA		NA
3541653	3541654	Abu_0842	Abu_0843			FALSE	0.094	55.000	0.000	NA		NA
3541654	3541655	Abu_0843	Abu_0844			FALSE	0.103	391.000	0.000	NA		NA
3541655	3541656	Abu_0844	Abu_0845			FALSE	0.086	158.000	0.000	NA		NA
3541656	3541657	Abu_0845	Abu_0846			FALSE	0.104	423.000	0.000	NA		NA
3541657	3541658	Abu_0846	Abu_0847			TRUE	0.924	10.000	0.000	0.033		NA
3541661	3541662	Abu_0850	Abu_0851	trpC		TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3541662	3541663	Abu_0851	Abu_0852			TRUE	0.775	-24.000	0.000	NA		NA
3541663	3541664	Abu_0852	Abu_0853			TRUE	0.980	-7.000	0.064	NA		NA
3541665	3541666	Abu_0854	Abu_0855	oorD	oorA	TRUE	0.998	9.000	0.316	0.002	Y	NA
3541666	3541667	Abu_0855	Abu_0856	oorA	oorB	TRUE	0.999	2.000	0.771	0.002	Y	NA
3541667	3541668	Abu_0856	Abu_0857	oorB	oorC	TRUE	0.999	8.000	0.324	0.002	Y	NA
3541669	3541670	Abu_0858	Abu_0859	dnaQ3	trpF	TRUE	0.947	-13.000	0.011	1.000	N	NA
3541670	3541671	Abu_0859	Abu_0860	trpF	rpe	TRUE	0.948	-3.000	0.010	1.000	N	NA
3541673	3541674	Abu_0862	Abu_0863			TRUE	0.879	3.000	0.000	1.000		NA
3541674	3541675	Abu_0863	Abu_0864			TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3541675	3541676	Abu_0864	Abu_0865			FALSE	0.109	50.000	0.000	NA		NA
3541676	3541677	Abu_0865	Abu_0866			TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3541677	3541678	Abu_0866	Abu_0867			TRUE	0.558	13.000	0.000	NA		NA
3541680	3541681	Abu_0869	Abu_0870			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3541681	3541682	Abu_0870	Abu_0871			TRUE	0.907	12.000	0.021	NA		NA
3541682	3541683	Abu_0871	Abu_0872		pgsA	TRUE	0.978	10.000	0.023	0.062	N	NA
3541683	3541684	Abu_0872	Abu_0873	pgsA		TRUE	0.983	0.000	0.017	1.000	Y	NA
3541684	3541685	Abu_0873	Abu_0874		dapA	TRUE	0.991	0.000	0.238	1.000	N	NA
3541685	3541686	Abu_0874	Abu_0875	dapA		TRUE	0.916	24.000	0.217	1.000		NA
3541686	3541687	Abu_0875	Abu_0876		pyrD	TRUE	0.981	0.000	0.048	1.000		NA
3541687	3541688	Abu_0876	Abu_0877	pyrD	msbA	TRUE	0.470	44.000	0.017	1.000	N	NA
3541688	3541689	Abu_0877	Abu_0878	msbA	mviN	FALSE	0.284	58.000	0.000	0.062		NA
3541689	3541690	Abu_0878	Abu_0879	mviN		TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541694	3541695	Abu_0883	Abu_0884		radA	TRUE	0.820	16.000	0.000	0.021	N	NA
3541696	3541697	Abu_0885	Abu_0886			FALSE	0.075	100.000	0.000	NA		NA
3541697	3541698	Abu_0886	Abu_0887			TRUE	0.989	-22.000	0.222	1.000	N	NA
3541699	3541700	Abu_0888	Abu_0889		ftsY	FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3541700	3541701	Abu_0889	Abu_0890	ftsY		TRUE	0.826	13.000	0.002	1.000	N	NA
3541702	3541703	Abu_0891	Abu_0892			TRUE	0.949	13.000	0.059	1.000		NA
3541703	3541704	Abu_0892	Abu_0893			TRUE	0.470	19.000	0.000	1.000		NA
3541704	3541705	Abu_0893	Abu_0894			TRUE	0.932	-40.000	0.004	1.000	N	NA
3541705	3541706	Abu_0894	Abu_0895			FALSE	0.142	40.000	0.000	NA		NA
3541708	3541709	Abu_0897	Abu_0898			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3541711	3541712	Abu_0900	Abu_0901			FALSE	0.288	24.000	0.000	NA		NA
3541712	3541713	Abu_0901	Abu_0902			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3541713	3541714	Abu_0902	Abu_0903			TRUE	0.967	16.000	0.500	NA		NA
3541714	3541715	Abu_0903	Abu_0904			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541715	3541716	Abu_0904	Abu_0905			TRUE	0.997	-13.000	0.857	1.000	Y	NA
3541716	3541717	Abu_0905	Abu_0906			FALSE	0.107	58.000	0.000	1.000	N	NA
3541718	3541719	Abu_0907	Abu_0908			FALSE	0.396	22.000	0.000	1.000		NA
3541719	3541720	Abu_0908	Abu_0909			FALSE	0.194	39.000	0.000	1.000		NA
3541722	3541723	Abu_0911	Abu_0912			FALSE	0.099	82.000	0.000	1.000		NA
3541723	3541724	Abu_0912	Abu_0913			FALSE	0.103	382.000	0.000	NA		NA
3541724	3541725	Abu_0913	Abu_0914			FALSE	0.074	88.000	0.000	NA		NA
3541725	3541726	Abu_0914	Abu_0915			TRUE	0.761	9.000	0.000	NA		NA
3541728	3541729	Abu_0917	Abu_0918			FALSE	0.252	78.000	0.000	0.067		NA
3541729	3541730	Abu_0918	Abu_0919			TRUE	0.469	16.000	0.000	NA		NA
3541730	3541731	Abu_0919	Abu_0920			FALSE	0.102	348.000	0.000	NA		NA
3541731	3541732	Abu_0920	Abu_0921		guaA	FALSE	0.172	35.000	0.000	NA		NA
3541732	3541733	Abu_0921	Abu_0922	guaA	nadB	FALSE	0.094	65.000	0.000	1.000	N	NA
3541736	3541737	Abu_0925	Abu_0926	aspB3		TRUE	0.863	4.000	0.000	1.000	N	NA
3541737	3541738	Abu_0926	Abu_0927			FALSE	0.110	59.000	0.000	1.000		NA
3541738	3541739	Abu_0927	Abu_0928		cyaA	TRUE	0.988	-13.000	0.146	1.000		NA
3541740	3541741	Abu_0929	Abu_0930			TRUE	0.761	9.000	0.000	NA		NA
3541742	3541743	Abu_0931	Abu_0932			FALSE	0.117	47.000	0.000	NA		NA
3541743	3541744	Abu_0932	Abu_0933			FALSE	0.142	40.000	0.000	NA		NA
3541744	3541745	Abu_0933	Abu_0934			FALSE	0.069	98.000	0.000	NA	N	NA
3541745	3541746	Abu_0934	Abu_0935		cbiM	TRUE	0.997	2.000	0.388	NA	Y	NA
3541746	3541747	Abu_0935	Abu_0936	cbiM		TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541747	3541748	Abu_0936	Abu_0937			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541748	3541749	Abu_0937	Abu_0938			TRUE	0.995	-3.000	0.153	1.000	Y	NA
3541749	3541750	Abu_0938	Abu_0939			FALSE	0.070	101.000	0.000	NA	N	NA
3541750	3541751	Abu_0939	Abu_0940			TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3541751	3541752	Abu_0940	Abu_0941			TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3541752	3541753	Abu_0941	Abu_0942			FALSE	0.324	22.000	0.000	NA		NA
3541753	3541754	Abu_0942	Abu_0943			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3541754	3541755	Abu_0943	Abu_0944			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3541755	3541756	Abu_0944	Abu_0945			FALSE	0.166	36.000	0.000	NA		NA
3541756	3541757	Abu_0945	Abu_0946			TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3541757	3541758	Abu_0946	Abu_0947			FALSE	0.394	19.000	0.000	NA		NA
3541758	3541759	Abu_0947	Abu_0948			FALSE	0.075	76.000	0.000	NA		NA
3541760	3541761	Abu_0949	Abu_0950			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3541761	3541762	Abu_0950	Abu_0951			FALSE	0.095	220.000	0.000	NA		NA
3541763	3541764	Abu_0952	Abu_0953			FALSE	0.172	35.000	0.000	NA		NA
3541764	3541765	Abu_0953	Abu_0954			FALSE	0.208	31.000	0.000	NA		NA
3541765	3541766	Abu_0954	Abu_0955			TRUE	0.980	9.000	0.083	NA		NA
3541769	3541770	Abu_0958	Abu_0959	uvrA		FALSE	0.075	102.000	0.000	NA		NA
3541772	3541773	Abu_0961	Abu_0962	ggt		FALSE	0.120	184.000	0.000	1.000		NA
3541773	3541774	Abu_0962	Abu_0963		cysE	FALSE	0.110	141.000	0.000	1.000		NA
3541774	3541775	Abu_0963	Abu_0964	cysE	speA	TRUE	0.991	-10.000	0.055	1.000	Y	NA
3541775	3541776	Abu_0964	Abu_0965	speA	hisS	TRUE	0.971	1.000	0.021	1.000	N	NA
3541776	3541777	Abu_0965	Abu_0966	hisS	tmk	TRUE	0.958	-10.000	0.018	1.000	N	NA
3541777	3541778	Abu_0966	Abu_0967	tmk	coaD	TRUE	0.973	-9.000	0.034	1.000	N	NA
3541778	3541779	Abu_0967	Abu_0968	coaD	ubiD	TRUE	0.989	5.000	0.032	1.000	Y	NA
3541780	3541781	Abu_0969	Abu_0970		rplI	FALSE	0.093	74.000	0.000	1.000	N	NA
3541781	3541782	Abu_0970	Abu_0971	rplI	hslV	TRUE	0.976	6.000	0.034	1.000	N	NA
3541782	3541783	Abu_0971	Abu_0972	hslV	hslU	TRUE	0.997	8.000	0.752	1.000	Y	NA
3541783	3541784	Abu_0972	Abu_0973	hslU		FALSE	0.101	53.000	0.000	NA		NA
3541784	3541785	Abu_0973	Abu_0974			FALSE	0.086	158.000	0.000	NA		NA
3541785	3541786	Abu_0974	Abu_0975			TRUE	0.496	36.000	0.015	NA		NA
3541786	3541787	Abu_0975	Abu_0976		rlpA	TRUE	0.979	-16.000	0.062	NA		NA
3541787	3541788	Abu_0976	Abu_0977	rlpA	hisB	TRUE	0.942	10.000	0.022	NA	N	NA
3541788	3541789	Abu_0977	Abu_0978	hisB		TRUE	0.962	-3.000	0.018	1.000		NA
3541789	3541790	Abu_0978	Abu_0979			TRUE	0.992	-9.000	0.617	NA		NA
3541790	3541791	Abu_0979	Abu_0980			TRUE	0.992	0.000	0.459	NA		NA
3541791	3541792	Abu_0980	Abu_0981			TRUE	0.976	0.000	0.041	NA		NA
3541792	3541793	Abu_0981	Abu_0982			TRUE	0.965	-10.000	0.023	1.000		NA
3541793	3541794	Abu_0982	Abu_0983			FALSE	0.093	66.000	0.000	1.000	N	NA
3541794	3541795	Abu_0983	Abu_0984			TRUE	0.818	1.000	0.000	NA	N	NA
3541795	3541796	Abu_0984	Abu_0985			FALSE	0.235	139.000	0.000	NA	Y	NA
3541797	3541798	Abu_0986	Abu_0987	argC		FALSE	0.295	56.000	0.000	1.000	Y	NA
3541799	3541800	Abu_0988	Abu_0989			TRUE	0.885	13.000	0.000	0.005		NA
3541801	3541802	Abu_0990	Abu_0991			TRUE	0.994	-3.000	1.000	NA		NA
3541802	3541803	Abu_0991	Abu_0992			TRUE	0.777	-13.000	0.000	NA		NA
3541803	3541804	Abu_0992	Abu_0993			TRUE	0.994	-3.000	0.098	1.000	Y	NA
3541804	3541805	Abu_0993	Abu_0994			FALSE	0.100	129.000	0.000	1.000	N	NA
3541805	3541806	Abu_0994	Abu_0995		fliP	FALSE	0.266	29.000	0.000	1.000	N	NA
3541806	3541807	Abu_0995	Abu_0996	fliP	pbpC	FALSE	0.094	76.000	0.000	1.000	N	NA
3541807	3541808	Abu_0996	Abu_0997	pbpC		TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541808	3541809	Abu_0997	Abu_0998			TRUE	0.761	9.000	0.000	NA		NA
3541809	3541810	Abu_0998	Abu_0999		ftsX	TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3541810	3541811	Abu_0999	Abu_1000	ftsX	ftsE	TRUE	0.960	-13.000	0.024	NA		NA
3541811	3541812	Abu_1000	Abu_1001	ftsE		TRUE	0.979	-3.000	0.044	1.000		NA
3541812	3541813	Abu_1001	Abu_1002			TRUE	0.981	8.000	0.060	1.000		NA
3541813	3541814	Abu_1002	Abu_1003		rluD	TRUE	0.970	-52.000	0.031	1.000		NA
3541817	3541818	Abu_1006	Abu_1007	hemL		TRUE	0.521	14.000	0.000	NA		NA
3541818	3541819	Abu_1007	Abu_1008			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3541819	3541820	Abu_1008	Abu_1009			TRUE	0.989	-61.000	0.269	NA		NA
3541821	3541822	Abu_1010	Abu_1011		rpoD	TRUE	0.961	3.000	0.013	NA		NA
3541823	3541824	Abu_1012	Abu_1013	leuD	leuB	TRUE	0.998	1.000	0.089	0.003	Y	NA
3541824	3541825	Abu_1013	Abu_1014	leuB		FALSE	0.324	22.000	0.000	NA		NA
3541827	3541828	Abu_1016	Abu_1017	rpmJ	rpsM	TRUE	0.996	6.000	0.194	0.022		NA
3541828	3541829	Abu_1017	Abu_1018	rpsM	rpsK	TRUE	0.998	11.000	0.810	0.022	Y	NA
3541829	3541830	Abu_1018	Abu_1019	rpsK	rpsD	TRUE	0.997	11.000	0.509	0.029	Y	NA
3541830	3541831	Abu_1019	Abu_1020	rpsD	rpoA	TRUE	0.965	18.000	0.549	1.000	N	NA
3541831	3541832	Abu_1020	Abu_1021	rpoA	rplQ	TRUE	0.979	15.000	0.873	1.000	N	NA
3541832	3541833	Abu_1021	Abu_1022	rplQ	gatA	TRUE	0.503	154.000	0.000	0.034	Y	NA
3541833	3541834	Abu_1022	Abu_1023	gatA	guaB	TRUE	0.846	20.000	0.032	1.000	N	NA
3541834	3541835	Abu_1023	Abu_1024	guaB		FALSE	0.085	150.000	0.000	NA		NA
3541836	3541837	Abu_1025	Abu_1026			FALSE	0.098	54.000	0.000	NA		NA
3541837	3541838	Abu_1026	Abu_1027			TRUE	0.890	11.000	0.000	1.000	Y	NA
3541839	3541840	Abu_1028	Abu_1029			TRUE	0.995	10.000	0.600	1.000	Y	NA
3541840	3541841	Abu_1029	Abu_1030			TRUE	0.524	17.000	0.000	1.000		NA
3541841	3541842	Abu_1030	Abu_1031			FALSE	0.371	20.000	0.000	NA		NA
3541842	3541843	Abu_1031	Abu_1032			TRUE	0.991	0.000	0.286	NA		NA
3541845	3541846	Abu_1034	Abu_1035			TRUE	0.633	13.000	0.000	1.000		NA
3541847	3541848	Abu_1036	Abu_1037			TRUE	0.998	3.000	1.000	1.000	Y	NA
3541848	3541849	Abu_1037	Abu_1038			FALSE	0.104	119.000	0.000	1.000		NA
3541849	3541850	Abu_1038	Abu_1039			FALSE	0.104	120.000	0.000	1.000		NA
3541851	3541852	Abu_1040	Abu_1041			TRUE	0.778	-3.000	0.000	NA	N	NA
3541852	3541853	Abu_1041	Abu_1042			FALSE	0.070	76.000	0.000	NA	N	NA
3541853	3541854	Abu_1042	Abu_1043			FALSE	0.258	26.000	0.000	NA		NA
3541859	3541860	Abu_1048	Abu_1049		sugE	TRUE	0.479	34.000	0.000	1.000	Y	NA
3541861	3541862	Abu_1050	Abu_1051			TRUE	0.494	15.000	0.000	NA		NA
3541862	3541863	Abu_1051	Abu_1052			FALSE	0.075	65.000	0.000	NA		NA
3541866	3541867	Abu_1055	Abu_1056			FALSE	0.098	87.000	0.000	1.000		NA
3541867	3541868	Abu_1056	Abu_1057			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3541869	3541870	Abu_1058	Abu_1059			TRUE	0.927	10.000	0.000	0.030		NA
3541870	3541871	Abu_1059	Abu_1060			TRUE	0.860	13.000	0.000	0.030		NA
3541871	3541872	Abu_1060	Abu_1061			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3541872	3541873	Abu_1061	Abu_1062			FALSE	0.235	28.000	0.000	NA		NA
3541873	3541874	Abu_1062	Abu_1063			FALSE	0.102	113.000	0.000	1.000		NA
3541874	3541875	Abu_1063	Abu_1064			FALSE	0.099	82.000	0.000	1.000		NA
3541876	3541877	Abu_1065	Abu_1066			FALSE	0.068	90.000	0.000	NA	N	NA
3541877	3541878	Abu_1066	Abu_1067		lig	FALSE	0.093	96.000	0.000	1.000	N	NA
3541878	3541879	Abu_1067	Abu_1068	lig		TRUE	0.531	16.000	0.000	1.000	N	NA
3541879	3541880	Abu_1068	Abu_1069			TRUE	0.995	4.000	0.763	NA		NA
3541881	3541882	Abu_1070	Abu_1071	dgt	mloA	FALSE	0.131	273.000	0.000	1.000		NA
3541882	3541883	Abu_1071	Abu_1072	mloA		FALSE	0.365	92.000	0.000	0.001		NA
3541884	3541885	Abu_1073	Abu_1074	aroE		TRUE	0.872	3.000	0.000	1.000	N	NA
3541886	3541887	Abu_1075	Abu_1076		maeA	FALSE	0.074	95.000	0.000	NA		NA
3541887	3541888	Abu_1076	Abu_1077	maeA	purU	FALSE	0.092	68.000	0.000	1.000	N	NA
3541888	3541889	Abu_1077	Abu_1078	purU		TRUE	0.977	2.000	0.025	1.000	N	NA
3541890	3541891	Abu_1079	Abu_1080			TRUE	0.777	-13.000	0.000	NA		NA
3541892	3541893	Abu_1081	Abu_1082			TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3541893	3541894	Abu_1082	Abu_1083			TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3541894	3541895	Abu_1083	Abu_1084			TRUE	0.936	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
3541895	3541896	Abu_1084	Abu_1085			FALSE	0.116	44.000	0.000	NA	N	NA
3541896	3541897	Abu_1085	Abu_1086			TRUE	0.995	-22.000	0.313	NA	Y	NA
3541898	3541899	Abu_1087	Abu_1088		cydB	FALSE	0.077	111.000	0.000	NA		NA
3541899	3541900	Abu_1088	Abu_1089	cydB	cydA	TRUE	0.999	2.000	0.962	0.058	Y	NA
3541900	3541901	Abu_1089	Abu_1090	cydA		TRUE	0.974	16.000	0.887	NA		NA
3541901	3541902	Abu_1090	Abu_1091			FALSE	0.087	159.000	0.000	NA		NA
3541902	3541903	Abu_1091	Abu_1092			FALSE	0.305	23.000	0.000	NA		NA
3541903	3541904	Abu_1092	Abu_1093			FALSE	0.076	103.000	0.000	NA		NA
3541909	3541910	Abu_1098	Abu_1099			TRUE	0.946	0.000	0.011	NA		NA
3541910	3541911	Abu_1099	Abu_1100			FALSE	0.235	28.000	0.000	NA		NA
3541911	3541912	Abu_1100	Abu_1101			FALSE	0.371	20.000	0.000	NA		NA
3541912	3541913	Abu_1101	Abu_1102			TRUE	0.995	2.000	0.080	1.000	Y	NA
3541913	3541914	Abu_1102	Abu_1103			TRUE	0.991	-22.000	0.060	1.000	Y	NA
3541914	3541915	Abu_1103	Abu_1104			TRUE	0.992	-3.000	0.060	1.000	Y	NA
3541916	3541917	Abu_1105	Abu_1106			TRUE	0.539	13.000	0.000	NA	N	NA
3541918	3541919	Abu_1107	Abu_1108			TRUE	0.987	-10.000	0.154	NA		NA
3541919	3541920	Abu_1108	Abu_1109			TRUE	0.997	-43.000	0.625	1.000	Y	NA
3541920	3541921	Abu_1109	Abu_1110			TRUE	0.992	-6.000	0.333	1.000		NA
3541921	3541922	Abu_1110	Abu_1111			FALSE	0.098	71.000	0.000	1.000		NA
3541928	3541929	Abu_1117	Abu_1118			TRUE	0.974	-3.000	0.000	0.065	Y	NA
3541929	3541930	Abu_1118	Abu_1119			FALSE	0.125	303.000	0.000	1.000	N	NA
3541930	3541931	Abu_1119	Abu_1120			FALSE	0.308	26.000	0.000	1.000	N	NA
3541931	3541932	Abu_1120	Abu_1121			TRUE	0.996	-7.000	0.447	0.060	N	NA
3541932	3541933	Abu_1121	Abu_1122			TRUE	0.827	7.000	0.000	1.000	N	NA
3541933	3541934	Abu_1122	Abu_1123			FALSE	0.073	70.000	0.000	NA		NA
3541934	3541935	Abu_1123	Abu_1124			TRUE	0.987	-3.000	0.152	NA		NA
3541935	3541936	Abu_1124	Abu_1125		aroB	FALSE	0.093	74.000	0.000	1.000	N	NA
3541936	3541937	Abu_1125	Abu_1126	aroB		TRUE	0.981	2.000	0.041	NA	N	NA
3541937	3541938	Abu_1126	Abu_1127			TRUE	0.985	4.000	0.063	NA	N	NA
3541938	3541939	Abu_1127	Abu_1128		ftsH2	TRUE	0.982	-19.000	0.067	1.000	N	NA
3541939	3541940	Abu_1128	Abu_1129	ftsH2		TRUE	0.988	-13.000	0.237	NA		NA
3541940	3541941	Abu_1129	Abu_1130		mog	TRUE	0.944	-3.000	0.011	NA		NA
3541943	3541944	Abu_1132	Abu_1133			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3541944	3541945	Abu_1133	Abu_1134			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3541945	3541946	Abu_1134	Abu_1135			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3541946	3541947	Abu_1135	Abu_1136			TRUE	0.815	5.000	0.000	NA		NA
3541949	3541950	Abu_1138	Abu_1139			FALSE	0.103	52.000	0.000	NA		NA
3541950	3541951	Abu_1139	Abu_1140			FALSE	0.102	110.000	0.000	1.000		NA
3541951	3541952	Abu_1140	Abu_1141			FALSE	0.076	64.000	0.000	NA		NA
3541952	3541953	Abu_1141	Abu_1142		torC	FALSE	0.088	160.000	0.000	NA		NA
3541953	3541954	Abu_1142	Abu_1143	torC	bisC	TRUE	0.942	-3.000	0.000	0.057		NA
3541956	3541957	Abu_1145	Abu_1146		mutS2	FALSE	0.145	47.000	0.000	1.000	N	NA
3541958	3541959	Abu_1147	Abu_1148			FALSE	0.074	91.000	0.000	NA		NA
3541959	3541960	Abu_1148	Abu_1149			FALSE	0.074	87.000	0.000	NA		NA
3541961	3541962	Abu_1150	Abu_1151	dapE	amtB	FALSE	0.096	109.000	0.000	1.000	N	NA
3541962	3541963	Abu_1151	Abu_1152	amtB	glnB2	TRUE	0.899	20.000	0.063	1.000	N	NA
3541963	3541964	Abu_1152	Abu_1153	glnB2	pssA	FALSE	0.111	163.000	0.000	1.000	N	NA
3541964	3541965	Abu_1153	Abu_1154	pssA		TRUE	0.825	8.000	0.000	1.000		NA
3541967	3541968	Abu_1156	Abu_1157	ilvI	ilvH	TRUE	0.999	0.000	0.249	0.002	Y	NA
3541968	3541969	Abu_1157	Abu_1158	ilvH	lpxD	TRUE	0.896	19.000	0.052	1.000	N	NA
3541969	3541970	Abu_1158	Abu_1159	lpxD		FALSE	0.114	158.000	0.000	1.000		NA
3541970	3541971	Abu_1159	Abu_1160			FALSE	0.261	65.000	0.000	0.052		NA
3541971	3541972	Abu_1160	Abu_1161			TRUE	0.780	116.000	0.103	1.000	Y	NA
3541972	3541973	Abu_1161	Abu_1162			FALSE	0.104	62.000	0.000	1.000		NA
3541973	3541974	Abu_1162	Abu_1163			FALSE	0.098	70.000	0.000	1.000		NA
3541974	3541975	Abu_1163	Abu_1164			TRUE	0.937	-7.000	0.000	1.000	Y	NA
3541975	3541976	Abu_1164	Abu_1165			FALSE	0.074	72.000	0.000	NA		NA
3541976	3541977	Abu_1165	Abu_1166			FALSE	0.074	66.000	0.000	NA		NA
3541977	3541978	Abu_1166	Abu_1167			FALSE	0.221	29.000	0.000	NA		NA
3541978	3541979	Abu_1167	Abu_1168			FALSE	0.074	98.000	0.000	NA		NA
3541979	3541980	Abu_1168	Abu_1169			FALSE	0.208	31.000	0.000	NA		NA
3541982	3541983	Abu_1171	Abu_1172			TRUE	0.777	-13.000	0.000	NA		NA
3541983	3541984	Abu_1172	Abu_1173			FALSE	0.074	91.000	0.000	NA		NA
3541984	3541985	Abu_1173	Abu_1174			FALSE	0.092	195.000	0.000	NA		NA
3541985	3541986	Abu_1174	Abu_1175		engA	FALSE	0.074	85.000	0.000	NA		NA
3541986	3541987	Abu_1175	Abu_1176	engA		TRUE	0.585	27.000	0.000	0.059		NA
3541987	3541988	Abu_1176	Abu_1177		hemD	TRUE	0.829	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3541988	3541989	Abu_1177	Abu_1178	hemD		FALSE	0.083	59.000	0.000	NA		NA
3541989	3541990	Abu_1178	Abu_1179		purD	TRUE	0.774	-31.000	0.000	NA		NA
3541990	3541991	Abu_1179	Abu_1180	purD		TRUE	0.952	7.000	0.017	NA		NA
3541991	3541992	Abu_1180	Abu_1181			TRUE	0.987	-7.000	0.149	NA		NA
3541992	3541993	Abu_1181	Abu_1182			TRUE	0.990	0.000	0.165	1.000		NA
3541993	3541994	Abu_1182	Abu_1183		pnp	TRUE	0.971	7.000	0.028	1.000		NA
3541994	3541995	Abu_1183	Abu_1184	pnp	cheY1	FALSE	0.101	130.000	0.000	1.000	N	NA
3541995	3541996	Abu_1184	Abu_1185	cheY1	cheA	TRUE	0.839	13.000	0.000	1.000	Y	NA
3541996	3541997	Abu_1185	Abu_1186	cheA	cheR	TRUE	0.944	6.000	0.000	1.000	Y	NA
3541997	3541998	Abu_1186	Abu_1187	cheR	cheD	TRUE	0.940	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3541998	3541999	Abu_1187	Abu_1188	cheD	cheB	TRUE	0.496	33.000	0.000	1.000	Y	NA
3541999	3542000	Abu_1188	Abu_1189	cheB		TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3542000	3542001	Abu_1189	Abu_1190		fsr	TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542001	3542002	Abu_1190	Abu_1191	fsr	xerD	FALSE	0.096	109.000	0.000	1.000	N	NA
3542002	3542003	Abu_1191	Abu_1192	xerD		TRUE	0.880	2.000	0.000	1.000		NA
3542004	3542005	Abu_1193	Abu_1194			FALSE	0.394	19.000	0.000	NA		NA
3542005	3542006	Abu_1194	Abu_1195		prlC	FALSE	0.101	53.000	0.000	NA		NA
3542006	3542007	Abu_1195	Abu_1196	prlC	hemK	TRUE	0.872	3.000	0.000	1.000	N	NA
3542007	3542008	Abu_1196	Abu_1197	hemK	hemN1	FALSE	0.160	43.000	0.000	1.000	N	NA
3542009	3542010	Abu_1198	Abu_1199	nudH	lysC	TRUE	0.904	18.000	0.051	1.000	N	NA
3542010	3542011	Abu_1199	Abu_1200	lysC		TRUE	0.984	3.000	0.050	NA		NA
3542011	3542012	Abu_1200	Abu_1201		holB	TRUE	0.978	-3.000	0.053	NA		NA
3542012	3542013	Abu_1201	Abu_1202	holB	folP	TRUE	0.956	12.000	0.054	1.000		NA
3542014	3542015	Abu_1203	Abu_1204		cfa	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542015	3542016	Abu_1204	Abu_1205	cfa		TRUE	0.967	3.000	0.018	NA		NA
3542016	3542017	Abu_1205	Abu_1206			TRUE	0.995	2.000	0.722	NA		NA
3542017	3542018	Abu_1206	Abu_1207			TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3542018	3542019	Abu_1207	Abu_1208			FALSE	0.080	58.000	0.000	NA	N	NA
3542019	3542020	Abu_1208	Abu_1209			TRUE	0.479	41.000	0.020	NA		NA
3542020	3542021	Abu_1209	Abu_1210		tyrA	FALSE	0.099	100.000	0.000	1.000		NA
3542022	3542023	Abu_1211	Abu_1212			TRUE	0.975	0.000	0.033	1.000	N	NA
3542023	3542024	Abu_1212	Abu_1213			TRUE	0.991	4.000	0.130	1.000		NA
3542024	3542025	Abu_1213	Abu_1214		gltX2	TRUE	0.879	3.000	0.000	1.000		NA
3542025	3542026	Abu_1214	Abu_1215	gltX2		TRUE	0.983	-3.000	0.088	NA		NA
3542026	3542027	Abu_1215	Abu_1216		slt	TRUE	0.975	10.000	0.080	NA		NA
3542029	3542030	Abu_1218	Abu_1219	mobB	fbp	TRUE	0.953	4.000	0.005	1.000	N	NA
3542030	3542031	Abu_1219	Abu_1220	fbp		TRUE	0.993	-7.000	0.778	NA		NA
3542031	3542032	Abu_1220	Abu_1221		metS	TRUE	0.870	15.000	0.024	NA		NA
3542032	3542033	Abu_1221	Abu_1222	metS		TRUE	0.981	0.000	0.046	1.000		NA
3542035	3542036	Abu_1224	Abu_1225			FALSE	0.079	121.000	0.000	NA		NA
3542036	3542037	Abu_1225	Abu_1226		pycB2	TRUE	0.984	7.000	0.075	1.000		NA
3542037	3542038	Abu_1226	Abu_1227	pycB2	pckA	TRUE	0.524	74.000	0.016	1.000	Y	NA
3542040	3542041	Abu_1229	Abu_1230			FALSE	0.272	25.000	0.000	NA		NA
3542041	3542042	Abu_1230	Abu_1231			FALSE	0.075	77.000	0.000	NA		NA
3542043	3542044	Abu_1232	Abu_1233	glyS		TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3542044	3542045	Abu_1233	Abu_1234			FALSE	0.221	29.000	0.000	NA		NA
3542045	3542046	Abu_1234	Abu_1235			TRUE	0.990	7.000	0.281	NA		NA
3542046	3542047	Abu_1235	Abu_1236		gidB	TRUE	0.949	-3.000	0.009	1.000		NA
3542047	3542048	Abu_1236	Abu_1237	gidB	ribA	TRUE	0.961	0.000	0.017	1.000	N	NA
3542049	3542050	Abu_1238	Abu_1239	hemB		TRUE	0.803	9.000	0.000	1.000	N	NA
3542050	3542051	Abu_1239	Abu_1240			TRUE	0.978	-3.000	0.000	0.029	Y	NA
3542052	3542053	Abu_1241	Abu_1242			TRUE	0.981	-49.000	0.076	NA		NA
3542053	3542054	Abu_1242	Abu_1243		nrdD	TRUE	0.985	-22.000	0.133	NA		NA
3542055	3542056	Abu_1244	Abu_1245	argF	hemN2	TRUE	0.951	1.000	0.004	1.000	N	NA
3542057	3542058	Abu_1246	Abu_1247			TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3542058	3542059	Abu_1247	Abu_1248		lpxK	TRUE	0.761	9.000	0.000	NA		NA
3542059	3542060	Abu_1248	Abu_1249	lpxK		TRUE	0.985	7.000	0.024	1.000	Y	NA
3542060	3542061	Abu_1249	Abu_1250		nadE	TRUE	0.944	-3.000	0.008	1.000	N	NA
3542061	3542062	Abu_1250	Abu_1251	nadE		FALSE	0.296	28.000	0.000	1.000		NA
3542062	3542063	Abu_1251	Abu_1252			TRUE	0.776	8.000	0.000	NA		NA
3542063	3542064	Abu_1252	Abu_1253			TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3542065	3542066	Abu_1254	Abu_1255			FALSE	0.099	272.000	0.000	NA		NA
3542066	3542067	Abu_1255	Abu_1256		tatC	TRUE	0.996	0.000	0.535	NA	Y	NA
3542067	3542068	Abu_1256	Abu_1257	tatC	queA	TRUE	0.978	4.000	0.036	NA	N	NA
3542068	3542069	Abu_1257	Abu_1258	queA	dnaQ4	TRUE	0.713	11.000	0.000	1.000	N	NA
3542069	3542070	Abu_1258	Abu_1259	dnaQ4		TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3542073	3542074	Abu_1262	Abu_1263			TRUE	0.726	11.000	0.000	1.000		NA
3542074	3542075	Abu_1263	Abu_1264			TRUE	0.777	-13.000	0.000	NA		NA
3542076	3542077	Abu_1265	Abu_1266		glpC	FALSE	0.075	99.000	0.000	NA		NA
3542077	3542078	Abu_1266	Abu_1267	glpC	lgt	TRUE	0.951	5.000	0.006	1.000	N	NA
3542079	3542080	Abu_1268	Abu_1269			FALSE	0.182	34.000	0.000	NA		NA
3542080	3542081	Abu_1269	Abu_1270		polA	FALSE	0.250	72.000	0.000	0.051	N	NA
3542082	3542083	Abu_1271	Abu_1272		kdsB	FALSE	0.359	23.000	0.000	1.000	N	NA
3542083	3542084	Abu_1272	Abu_1273	kdsB		TRUE	0.863	4.000	0.000	1.000	N	NA
3542085	3542086	Abu_1274	Abu_1275			TRUE	0.972	-7.000	0.039	NA		NA
3542086	3542087	Abu_1275	Abu_1276		trpD	TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3542091	3542092	Abu_1280	Abu_1281	dltA	dltB	TRUE	0.991	-3.000	0.435	NA	N	NA
3542092	3542093	Abu_1281	Abu_1282	dltB		TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542093	3542094	Abu_1282	Abu_1283		dltD	TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3542094	3542095	Abu_1283	Abu_1284	dltD	dltC	TRUE	0.974	0.000	0.036	NA		NA
3542096	3542097	Abu_1285	Abu_1286			FALSE	0.135	380.000	0.000	1.000		NA
3542097	3542098	Abu_1286	Abu_1287		uspA	TRUE	0.872	3.000	0.000	1.000	N	NA
3542099	3542100	Abu_1288	Abu_1289	ktrA	ktrB	TRUE	0.999	-3.000	0.647	0.005	Y	NA
3542100	3542101	Abu_1289	Abu_1290	ktrB	kdpE	TRUE	0.988	7.000	0.125	1.000	N	NA
3542101	3542102	Abu_1290	Abu_1291	kdpE	kdpD	TRUE	0.940	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3542102	3542103	Abu_1291	Abu_1292	kdpD	dut	FALSE	0.091	184.000	0.000	NA		NA
3542103	3542104	Abu_1292	Abu_1293	dut	recR	FALSE	0.092	192.000	0.000	NA		NA
3542105	3542106	Abu_1294	Abu_1295	dnaJ	trpB2	FALSE	0.241	32.000	0.000	1.000	N	NA
3542106	3542107	Abu_1295	Abu_1296	trpB2		TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3542108	3542109	Abu_1297	Abu_1298			TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3542110	3542111	Abu_1299	Abu_1300			TRUE	0.845	0.000	0.000	1.000		NA
3542111	3542112	Abu_1300	Abu_1301			TRUE	0.977	8.000	0.000	0.012	Y	NA
3542114	3542115	Abu_1303	Abu_1304			FALSE	0.101	104.000	0.000	1.000		NA
3542115	3542116	Abu_1304	Abu_1305		pepD	FALSE	0.184	39.000	0.000	1.000	N	NA
3542117	3542118	Abu_1306	Abu_1307			FALSE	0.077	63.000	0.000	NA		NA
3542121	3542122	Abu_1310	Abu_1311	secA		TRUE	0.992	2.000	0.201	NA	N	NA
3542124	3542125	Abu_1313	Abu_1314		icd	FALSE	0.301	119.000	0.016	NA		NA
3542125	3542126	Abu_1314	Abu_1315	icd	mdh	TRUE	0.631	100.000	0.032	1.000	Y	NA
3542126	3542127	Abu_1315	Abu_1316	mdh		FALSE	0.259	100.000	0.000	0.056		NA
3542130	3542131	Abu_1319	Abu_1320		mraW	TRUE	0.966	-7.000	0.031	NA		NA
3542132	3542133	Abu_1321	Abu_1322		hup	FALSE	0.097	114.000	0.000	1.000	N	NA
3542133	3542134	Abu_1322	Abu_1323	hup		FALSE	0.074	67.000	0.000	NA		NA
3542134	3542135	Abu_1323	Abu_1324			FALSE	0.090	178.000	0.000	NA		NA
3542136	3542137	Abu_1325	Abu_1326			FALSE	0.073	70.000	0.000	NA		NA
3542137	3542138	Abu_1326	Abu_1327			FALSE	0.074	85.000	0.000	NA		NA
3542138	3542139	Abu_1327	Abu_1328			FALSE	0.084	146.000	0.000	NA		NA
3542140	3542141	Abu_1329	Abu_1330			FALSE	0.076	106.000	0.000	NA		NA
3542142	3542143	Abu_1331	Abu_1332			TRUE	0.990	-7.000	0.286	NA		NA
3542143	3542144	Abu_1332	Abu_1333			FALSE	0.105	424.000	0.000	NA		NA
3542145	3542146	Abu_1334	Abu_1335			FALSE	0.074	74.000	0.000	NA		NA
3542147	3542148	Abu_1336	Abu_1337			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542148	3542149	Abu_1337	Abu_1338			FALSE	0.305	23.000	0.000	NA		NA
3542149	3542150	Abu_1338	Abu_1339			TRUE	0.774	-28.000	0.000	NA		NA
3542150	3542151	Abu_1339	Abu_1340			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542151	3542152	Abu_1340	Abu_1341			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542152	3542153	Abu_1341	Abu_1342			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542153	3542154	Abu_1342	Abu_1343			TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3542154	3542155	Abu_1343	Abu_1344			FALSE	0.084	144.000	0.000	NA		NA
3542155	3542156	Abu_1344	Abu_1345			TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3542156	3542157	Abu_1345	Abu_1346			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542157	3542158	Abu_1346	Abu_1347			FALSE	0.091	180.000	0.000	NA		NA
3542158	3542159	Abu_1347	Abu_1348			FALSE	0.075	78.000	0.000	NA		NA
3542159	3542160	Abu_1348	Abu_1349			TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3542160	3542161	Abu_1349	Abu_1350			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542161	3542162	Abu_1350	Abu_1351			FALSE	0.150	39.000	0.000	NA		NA
3542166	3542167	Abu_1355	Abu_1356			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542167	3542168	Abu_1356	Abu_1357			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542169	3542170	Abu_1358	Abu_1359			TRUE	0.997	0.000	0.667	NA	Y	NA
3542170	3542171	Abu_1359	Abu_1360			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA	Y	NA
3542171	3542172	Abu_1360	Abu_1361		cbpA	FALSE	0.094	77.000	0.000	1.000	N	NA
3542172	3542173	Abu_1361	Abu_1362	cbpA		TRUE	0.976	12.000	0.211	1.000		NA
3542173	3542174	Abu_1362	Abu_1363			FALSE	0.098	73.000	0.000	1.000		NA
3542174	3542175	Abu_1363	Abu_1364			TRUE	0.993	-13.000	0.545	1.000		NA
3542175	3542176	Abu_1364	Abu_1365			TRUE	0.995	1.000	0.547	1.000		NA
3542176	3542177	Abu_1365	Abu_1366			TRUE	0.982	0.000	0.000	0.005	Y	NA
3542178	3542179	Abu_1367	Abu_1368		brnQ	FALSE	0.254	89.000	0.000	0.057		NA
3542179	3542180	Abu_1368	Abu_1369	brnQ		FALSE	0.105	51.000	0.000	NA		NA
3542180	3542181	Abu_1369	Abu_1370			FALSE	0.166	36.000	0.000	NA		NA
3542181	3542182	Abu_1370	Abu_1371			FALSE	0.073	70.000	0.000	NA		NA
3542182	3542183	Abu_1371	Abu_1372		carB	TRUE	0.959	0.000	0.020	NA		NA
3542185	3542186	Abu_1374	Abu_1375	nhaA1		FALSE	0.375	23.000	0.000	1.000		NA
3542186	3542187	Abu_1375	Abu_1376		metX	TRUE	0.962	-3.000	0.019	1.000		NA
3542187	3542188	Abu_1376	Abu_1377	metX		FALSE	0.096	111.000	0.000	1.000	N	NA
3542190	3542191	Abu_1379	Abu_1380	ftsZ	ftsA	TRUE	0.994	0.000	0.114	1.000	Y	NA
3542191	3542192	Abu_1380	Abu_1381	ftsA		TRUE	0.991	5.000	0.184	1.000		NA
3542192	3542193	Abu_1381	Abu_1382		recD	FALSE	0.102	63.000	0.000	1.000		NA
3542193	3542194	Abu_1382	Abu_1383	recD		TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542194	3542195	Abu_1383	Abu_1384			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542195	3542196	Abu_1384	Abu_1385			FALSE	0.078	115.000	0.000	NA		NA
3542196	3542197	Abu_1385	Abu_1386			FALSE	0.089	57.000	0.000	NA		NA
3542197	3542198	Abu_1386	Abu_1387			TRUE	0.777	-13.000	0.000	NA		NA
3542199	3542200	Abu_1388	Abu_1389			TRUE	0.989	3.000	0.104	NA		NA
3542203	3542204	Abu_1392	Abu_1393	dapD		FALSE	0.094	102.000	0.000	1.000	N	NA
3542206	3542207	Abu_1395	Abu_1396	priA		TRUE	0.931	0.000	0.003	NA		NA
3542207	3542208	Abu_1396	Abu_1397			FALSE	0.172	35.000	0.000	NA		NA
3542208	3542209	Abu_1397	Abu_1398			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542209	3542210	Abu_1398	Abu_1399			FALSE	0.109	50.000	0.000	NA		NA
3542210	3542211	Abu_1399	Abu_1400		hypA	FALSE	0.074	74.000	0.000	NA		NA
3542211	3542212	Abu_1400	Abu_1401	hypA	hypE	TRUE	0.588	104.000	0.080	1.000		NA
3542212	3542213	Abu_1401	Abu_1402	hypE		TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3542213	3542214	Abu_1402	Abu_1403			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542214	3542215	Abu_1403	Abu_1404			TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3542215	3542216	Abu_1404	Abu_1405			TRUE	0.993	-7.000	0.759	NA		NA
3542216	3542217	Abu_1405	Abu_1406		hypD	TRUE	0.747	9.000	0.000	NA	N	NA
3542217	3542218	Abu_1406	Abu_1407	hypD	hypC	TRUE	0.987	14.000	0.342	1.000	Y	NA
3542218	3542219	Abu_1407	Abu_1408	hypC	hypB	TRUE	0.867	126.000	0.463	1.000	Y	NA
3542220	3542221	Abu_1409	Abu_1410			FALSE	0.074	88.000	0.000	NA		NA
3542222	3542223	Abu_1411	Abu_1412			TRUE	0.494	15.000	0.000	NA		NA
3542225	3542226	Abu_1414	Abu_1415			FALSE	0.192	33.000	0.000	NA		NA
3542226	3542227	Abu_1415	Abu_1416			FALSE	0.076	107.000	0.000	NA		NA
3542229	3542230	Abu_1418	Abu_1419		thiI	FALSE	0.074	85.000	0.000	NA		NA
3542232	3542233	Abu_1421	Abu_1422			FALSE	0.258	26.000	0.000	NA		NA
3542233	3542234	Abu_1422	Abu_1423		hypF	FALSE	0.103	390.000	0.000	NA		NA
3542234	3542235	Abu_1423	Abu_1424	hypF		TRUE	0.594	31.000	0.018	NA		NA
3542235	3542236	Abu_1424	Abu_1425		hydD	TRUE	0.975	-16.000	0.049	NA		NA
3542236	3542237	Abu_1425	Abu_1426	hydD	hydC	TRUE	0.995	-18.000	0.277	1.000	Y	NA
3542237	3542238	Abu_1426	Abu_1427	hydC	hydB	TRUE	0.984	22.000	0.270	0.054	Y	NA
3542238	3542239	Abu_1427	Abu_1428	hydB	hydA	TRUE	0.999	-10.000	0.951	0.002	Y	NA
3542239	3542240	Abu_1428	Abu_1429	hydA		FALSE	0.090	238.000	0.000	NA	N	NA
3542240	3542241	Abu_1429	Abu_1430			TRUE	0.996	3.000	1.000	NA	N	NA
3542241	3542242	Abu_1430	Abu_1431			FALSE	0.075	100.000	0.000	NA		NA
3542242	3542243	Abu_1431	Abu_1432		hyaD	TRUE	0.984	-34.000	0.111	NA		NA
3542243	3542244	Abu_1432	Abu_1433	hyaD	hyaC	TRUE	0.866	89.000	0.545	1.000	Y	NA
3542244	3542245	Abu_1433	Abu_1434	hyaC	hyaB	TRUE	0.998	-22.000	0.700	0.054	Y	NA
3542245	3542246	Abu_1434	Abu_1435	hyaB	hyaA	TRUE	0.999	0.000	0.900	0.002	Y	NA
3542246	3542247	Abu_1435	Abu_1436	hyaA	hupL	TRUE	0.954	234.000	0.333	0.003	Y	NA
3542247	3542248	Abu_1436	Abu_1437	hupL	hupS	TRUE	0.999	3.000	0.800	0.001	Y	NA
3542248	3542249	Abu_1437	Abu_1438	hupS		TRUE	0.993	-10.000	0.562	1.000		NA
3542249	3542250	Abu_1438	Abu_1439		acnB	FALSE	0.128	238.000	0.000	1.000		NA
3542252	3542253	Abu_1441	Abu_1442			FALSE	0.095	219.000	0.000	NA		NA
3542254	3542255	Abu_1443	Abu_1444			TRUE	0.994	4.000	0.684	NA	N	NA
3542255	3542256	Abu_1444	Abu_1445			TRUE	0.990	0.000	0.263	NA		NA
3542256	3542257	Abu_1445	Abu_1446			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542257	3542258	Abu_1446	Abu_1447			FALSE	0.090	177.000	0.000	NA		NA
3542259	3542260	Abu_1448	Abu_1449		dsbA	TRUE	0.885	13.000	0.000	0.005		NA
3542260	3542261	Abu_1449	Abu_1450	dsbA	dsbB	TRUE	0.998	-10.000	0.286	0.005	Y	NA
3542262	3542263	Abu_1451	Abu_1452			FALSE	0.094	102.000	0.000	1.000	N	NA
3542263	3542264	Abu_1452	Abu_1453			TRUE	0.994	0.000	1.000	NA	N	NA
3542264	3542265	Abu_1453	Abu_1454			FALSE	0.216	99.000	0.000	NA	Y	NA
3542265	3542266	Abu_1454	Abu_1455			FALSE	0.113	179.000	0.000	1.000	N	NA
3542266	3542267	Abu_1455	Abu_1456			TRUE	0.823	-55.000	0.000	1.000		NA
3542268	3542269	Abu_1457	Abu_1458	betT	kefB	FALSE	0.102	134.000	0.000	1.000	N	NA
3542270	3542271	Abu_1459	Abu_1460		glyA2	FALSE	0.074	74.000	0.000	NA		NA
3542271	3542272	Abu_1460	Abu_1461	glyA2	ada	TRUE	0.666	27.000	0.016	1.000	N	NA
3542272	3542273	Abu_1461	Abu_1462	ada		TRUE	0.953	1.000	0.000	1.000	Y	NA
3542274	3542275	Abu_1463	Abu_1464			FALSE	0.160	37.000	0.000	NA		NA
3542275	3542276	Abu_1464	Abu_1465			TRUE	0.986	-3.000	0.118	NA		NA
3542276	3542277	Abu_1465	Abu_1466			FALSE	0.076	107.000	0.000	NA		NA
3542279	3542280	Abu_1468	Abu_1469	argD2		TRUE	0.976	13.000	0.044	0.020		NA
3542280	3542281	Abu_1469	Abu_1470		lipA	FALSE	0.273	81.000	0.000	0.036		NA
3542281	3542282	Abu_1470	Abu_1471	lipA		TRUE	0.990	12.000	0.051	0.036	Y	NA
3542283	3542284	Abu_1472	Abu_1473	aceE	aceF	TRUE	0.992	11.000	0.053	0.045	Y	NA
3542284	3542285	Abu_1473	Abu_1474	aceF	lpdA	TRUE	0.995	10.000	0.463	1.000	Y	NA
3542285	3542286	Abu_1474	Abu_1475	lpdA		FALSE	0.094	102.000	0.000	1.000	N	NA
3542287	3542288	Abu_1476	Abu_1477			FALSE	0.123	270.000	0.000	1.000	N	NA
3542288	3542289	Abu_1477	Abu_1478			TRUE	0.829	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3542289	3542290	Abu_1478	Abu_1479		rhlE	FALSE	0.131	51.000	0.000	1.000	N	NA
3542291	3542292	Abu_1480	Abu_1481			FALSE	0.118	175.000	0.000	1.000		NA
3542292	3542293	Abu_1481	Abu_1482			TRUE	0.989	8.000	0.250	NA		NA
3542295	3542296	Abu_1484	Abu_1485			FALSE	0.172	35.000	0.000	NA		NA
3542296	3542297	Abu_1485	Abu_1486			TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3542299	3542300	Abu_1488	Abu_1489	rnhA		FALSE	0.135	52.000	0.000	1.000		NA
3542301	3542302	Abu_1490	Abu_1491			FALSE	0.142	40.000	0.000	NA		NA
3542302	3542303	Abu_1491	Abu_1492		dinP	FALSE	0.106	126.000	0.000	1.000		NA
3542303	3542304	Abu_1492	Abu_1493	dinP	moeA1	FALSE	0.093	75.000	0.000	1.000	N	NA
3542304	3542305	Abu_1493	Abu_1494	moeA1		TRUE	0.768	10.000	0.000	1.000	N	NA
3542305	3542306	Abu_1494	Abu_1495		fdhD	TRUE	0.820	-7.000	0.000	1.000	N	NA
3542306	3542307	Abu_1495	Abu_1496	fdhD	fdhC	TRUE	0.996	-3.000	0.034	0.003	Y	NA
3542307	3542308	Abu_1496	Abu_1497	fdhC	fdhB1	TRUE	0.999	9.000	0.667	0.003	Y	NA
3542308	3542309	Abu_1497	Abu_1498	fdhB1		TRUE	0.998	11.000	0.500	0.003	Y	NA
3542309	3542310	Abu_1498	Abu_1499			FALSE	0.258	26.000	0.000	NA		NA
3542310	3542311	Abu_1499	Abu_1500			FALSE	0.074	83.000	0.000	NA		NA
3542311	3542312	Abu_1500	Abu_1501			TRUE	0.994	-7.000	0.118	0.054		NA
3542313	3542314	Abu_1502	Abu_1503	livJ		TRUE	0.778	-3.000	0.000	NA	N	NA
3542314	3542315	Abu_1503	Abu_1504			TRUE	0.935	8.000	0.000	1.000	Y	NA
3542315	3542316	Abu_1504	Abu_1505			TRUE	0.820	-7.000	0.000	1.000	N	NA
3542317	3542318	Abu_1506	Abu_1507			TRUE	0.998	4.000	0.200	0.001		NA
3542318	3542319	Abu_1507	Abu_1508			TRUE	0.984	-3.000	0.092	NA		NA
3542319	3542320	Abu_1508	Abu_1509			FALSE	0.087	204.000	0.000	NA	N	NA
3542320	3542321	Abu_1509	Abu_1510		fdhB2	TRUE	0.999	9.000	0.667	0.003	Y	NA
3542321	3542322	Abu_1510	Abu_1511	fdhB2	fdhA2	TRUE	0.927	11.000	0.000	0.003		NA
3542322	3542323	Abu_1511	Abu_1512	fdhA2		FALSE	0.324	22.000	0.000	NA		NA
3542326	3542327	Abu_1515	Abu_1516			TRUE	0.794	51.000	0.500	NA		NA
3542327	3542328	Abu_1516	Abu_1517			TRUE	0.984	12.000	0.750	NA		NA
3542328	3542329	Abu_1517	Abu_1518			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542329	3542330	Abu_1518	Abu_1519			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3542330	3542331	Abu_1519	Abu_1520			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542332	3542333	Abu_1521	Abu_1522			FALSE	0.083	59.000	0.000	NA		NA
3542333	3542334	Abu_1522	Abu_1523			FALSE	0.083	139.000	0.000	NA		NA
3542335	3542336	Abu_1524	Abu_1525	selA	selB	TRUE	0.998	0.000	0.569	0.001	N	NA
3542336	3542337	Abu_1525	Abu_1526	selB		TRUE	0.871	4.000	0.000	1.000		NA
3542337	3542338	Abu_1526	Abu_1527			TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3542338	3542339	Abu_1527	Abu_1528			TRUE	0.994	-3.000	0.857	NA		NA
3542339	3542340	Abu_1528	Abu_1529			TRUE	0.849	47.000	0.857	NA		NA
3542340	3542341	Abu_1529	Abu_1530			TRUE	0.772	85.000	0.857	NA		NA
3542341	3542342	Abu_1530	Abu_1531			FALSE	0.142	40.000	0.000	NA		NA
3542342	3542343	Abu_1531	Abu_1532			FALSE	0.074	87.000	0.000	NA		NA
3542343	3542344	Abu_1532	Abu_1533			FALSE	0.324	22.000	0.000	NA		NA
3542344	3542345	Abu_1533	Abu_1534			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3542345	3542346	Abu_1534	Abu_1535			FALSE	0.272	25.000	0.000	NA		NA
3542348	3542349	Abu_1537	Abu_1538			FALSE	0.086	58.000	0.000	NA		NA
3542349	3542350	Abu_1538	Abu_1539			FALSE	0.097	69.000	0.000	1.000		NA
3542353	3542354	Abu_1542	Abu_1543		dbpA	FALSE	0.189	38.000	0.000	1.000	N	NA
3542354	3542355	Abu_1543	Abu_1544	dbpA		TRUE	0.879	3.000	0.000	1.000		NA
3542357	3542358	Abu_1546	Abu_1547		htpG	FALSE	0.082	137.000	0.000	NA		NA
3542359	3542360	Abu_1548	Abu_1549	katG	ciaB	FALSE	0.102	111.000	0.000	1.000		NA
3542361	3542362	Abu_1550	Abu_1551		pqiB	FALSE	0.324	22.000	0.000	NA		NA
3542362	3542363	Abu_1551	Abu_1552	pqiB	pqiA	TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3542364	3542365	Abu_1553	Abu_1554			FALSE	0.098	73.000	0.000	1.000		NA
3542370	3542371	Abu_1559	Abu_1560			TRUE	0.761	9.000	0.000	NA		NA
3542371	3542372	Abu_1560	Abu_1561			FALSE	0.073	68.000	0.000	NA		NA
3542372	3542373	Abu_1561	Abu_1562			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3542376	3542377	Abu_1565	Abu_1566	hicA	hicB	TRUE	0.925	24.000	0.424	NA		NA
3542378	3542379	Abu_1567	Abu_1568			TRUE	0.818	1.000	0.000	NA	N	NA
3542381	3542382	Abu_1570	Abu_1571	leuA2		FALSE	0.113	181.000	0.000	1.000	N	NA
3542382	3542383	Abu_1571	Abu_1572			TRUE	0.917	10.000	0.000	0.048	N	NA
3542383	3542384	Abu_1572	Abu_1573			TRUE	0.981	-6.000	0.075	NA		NA
3542384	3542385	Abu_1573	Abu_1574			FALSE	0.073	69.000	0.000	NA		NA
3542387	3542388	Abu_1576	Abu_1577	sodB		FALSE	0.094	78.000	0.000	1.000	N	NA
3542388	3542389	Abu_1577	Abu_1578		ppa	FALSE	0.092	72.000	0.000	1.000	N	NA
3542389	3542390	Abu_1578	Abu_1579	ppa		FALSE	0.104	120.000	0.000	1.000		NA
3542390	3542391	Abu_1579	Abu_1580			TRUE	0.847	6.000	0.000	1.000		NA
3542391	3542392	Abu_1580	Abu_1581		aspA	TRUE	0.823	-49.000	0.000	1.000		NA
3542392	3542393	Abu_1581	Abu_1582	aspA		FALSE	0.093	66.000	0.000	1.000	N	NA
3542393	3542394	Abu_1582	Abu_1583			TRUE	0.957	3.000	0.000	1.000	Y	NA
3542394	3542395	Abu_1583	Abu_1584			FALSE	0.092	72.000	0.000	1.000	N	NA
3542395	3542396	Abu_1584	Abu_1585		pfs	FALSE	0.102	133.000	0.000	1.000	N	NA
3542396	3542397	Abu_1585	Abu_1586	pfs	fabD	TRUE	0.975	-7.000	0.037	1.000	N	NA
3542397	3542398	Abu_1586	Abu_1587	fabD	slyD	FALSE	0.262	135.000	0.004	1.000	N	NA
3542398	3542399	Abu_1587	Abu_1588	slyD		TRUE	0.931	22.000	0.233	1.000		NA
3542399	3542400	Abu_1588	Abu_1589			TRUE	0.996	2.000	0.794	1.000		NA
3542400	3542401	Abu_1589	Abu_1590		tolB	TRUE	0.810	161.000	0.702	1.000		NA
3542401	3542402	Abu_1590	Abu_1591	tolB		TRUE	0.990	5.000	0.213	NA		NA
3542402	3542403	Abu_1591	Abu_1592		exbD3	TRUE	0.991	6.000	0.343	NA		NA
3542403	3542404	Abu_1592	Abu_1593	exbD3	exbB3	TRUE	0.998	5.000	0.944	0.040		NA
3542404	3542405	Abu_1593	Abu_1594	exbB3	atpC	TRUE	0.976	7.000	0.036	1.000		NA
3542405	3542406	Abu_1594	Abu_1595	atpC	atpD	TRUE	0.991	24.000	0.837	0.005	Y	NA
3542406	3542407	Abu_1595	Abu_1596	atpD	atpG	TRUE	0.993	20.000	0.724	0.005	Y	NA
3542407	3542408	Abu_1596	Abu_1597	atpG	atpA	TRUE	0.998	11.000	0.846	0.005	Y	NA
3542408	3542409	Abu_1597	Abu_1598	atpA	atpH	TRUE	0.993	22.000	0.864	0.005	Y	NA
3542409	3542410	Abu_1598	Abu_1599	atpH	atpF	TRUE	0.998	0.000	0.132	0.005	Y	NA
3542410	3542411	Abu_1599	Abu_1600	atpF	atpF'	TRUE	0.992	14.000	0.110	0.005	Y	NA
3542411	3542412	Abu_1600	Abu_1601	atpF'	parB	TRUE	0.480	119.000	0.037	1.000	N	NA
3542412	3542413	Abu_1601	Abu_1602	parB	parA	TRUE	0.961	21.000	0.827	1.000	N	NA
3542413	3542414	Abu_1602	Abu_1603	parA	birA	TRUE	0.977	-3.000	0.040	1.000	N	NA
3542414	3542415	Abu_1603	Abu_1604	birA		FALSE	0.074	94.000	0.000	NA		NA
3542417	3542418	Abu_1606	Abu_1607	fmt	proB	TRUE	0.936	10.000	0.014	1.000	N	NA
3542418	3542419	Abu_1607	Abu_1608	proB	obg	TRUE	0.990	-3.000	0.206	1.000		NA
3542419	3542420	Abu_1608	Abu_1609	obg	rpmA	TRUE	0.743	130.000	0.335	1.000		NA
3542420	3542421	Abu_1609	Abu_1610	rpmA	rplU	TRUE	0.988	25.000	0.667	0.020	Y	NA
3542421	3542422	Abu_1610	Abu_1611	rplU	dnaG	FALSE	0.102	134.000	0.000	1.000	N	NA
3542423	3542424	Abu_1612	Abu_1613		rnc	FALSE	0.149	48.000	0.000	1.000		NA
3542424	3542425	Abu_1613	Abu_1614	rnc	aroC	TRUE	0.978	4.000	0.030	1.000	N	NA
3542425	3542426	Abu_1614	Abu_1615	aroC		TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3542427	3542428	Abu_1616	Abu_1617			FALSE	0.098	54.000	0.000	NA		NA
3542430	3542431	Abu_1619	Abu_1620		trmE	TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542431	3542432	Abu_1620	Abu_1621	trmE		TRUE	0.986	3.000	0.049	1.000		NA
3542432	3542433	Abu_1621	Abu_1622		oxaA	TRUE	0.891	21.000	0.061	1.000		NA
3542433	3542434	Abu_1622	Abu_1623	oxaA		TRUE	0.991	-7.000	0.461	NA		NA
3542434	3542435	Abu_1623	Abu_1624		rnpA	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542435	3542436	Abu_1624	Abu_1625	rnpA	rpmH	TRUE	0.777	-12.000	0.000	NA		NA
3542436	3542437	Abu_1625	Abu_1626	rpmH	clpB	FALSE	0.244	75.000	0.002	1.000		NA
3542439	3542440	Abu_1628	Abu_1629			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542442	3542443	Abu_1631	Abu_1632	msrA	msrB	TRUE	0.997	3.000	0.031	0.001	Y	NA
3542443	3542444	Abu_1632	Abu_1633	msrB		TRUE	0.665	12.000	0.000	1.000	N	NA
3542446	3542447	Abu_1635	Abu_1636		bioA	TRUE	0.869	1.000	0.000	1.000		NA
3542447	3542448	Abu_1636	Abu_1637	bioA		FALSE	0.141	48.000	0.000	1.000	N	NA
3542448	3542449	Abu_1637	Abu_1638		purH	FALSE	0.097	116.000	0.000	1.000	N	NA
3542449	3542450	Abu_1638	Abu_1639	purH	purL	FALSE	0.298	200.000	0.000	1.000	Y	NA
3542450	3542451	Abu_1639	Abu_1640	purL		FALSE	0.075	65.000	0.000	NA		NA
3542453	3542454	Abu_1642	Abu_1643	folE	corA	FALSE	0.359	23.000	0.000	1.000	N	NA
3542454	3542455	Abu_1643	Abu_1644	corA	ctsF	TRUE	0.774	16.000	0.000	0.099	N	NA
3542455	3542456	Abu_1644	Abu_1645	ctsF	ctsE	TRUE	0.957	2.000	0.000	1.000	Y	NA
3542456	3542457	Abu_1645	Abu_1646	ctsE		FALSE	0.099	272.000	0.000	NA		NA
3542457	3542458	Abu_1646	Abu_1647			TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3542460	3542461	Abu_1649	Abu_1650			FALSE	0.074	85.000	0.000	NA		NA
3542461	3542462	Abu_1650	Abu_1651			FALSE	0.076	108.000	0.000	NA		NA
3542462	3542463	Abu_1651	Abu_1652			TRUE	0.992	-6.000	0.600	NA		NA
3542463	3542464	Abu_1652	Abu_1653			TRUE	0.988	-3.000	0.158	NA		NA
3542464	3542465	Abu_1653	Abu_1654			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542465	3542466	Abu_1654	Abu_1655			FALSE	0.084	146.000	0.000	NA		NA
3542466	3542467	Abu_1655	Abu_1656			TRUE	0.521	14.000	0.000	NA		NA
3542467	3542468	Abu_1656	Abu_1657			TRUE	0.992	2.000	0.217	NA		NA
3542468	3542469	Abu_1657	Abu_1658			FALSE	0.235	28.000	0.000	NA		NA
3542469	3542470	Abu_1658	Abu_1659			TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3542470	3542471	Abu_1659	Abu_1660			TRUE	0.558	13.000	0.000	NA		NA
3542471	3542472	Abu_1660	Abu_1661			TRUE	0.993	-3.000	0.600	NA		NA
3542472	3542473	Abu_1661	Abu_1662			TRUE	0.774	-28.000	0.000	NA		NA
3542473	3542474	Abu_1662	Abu_1663			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542474	3542475	Abu_1663	Abu_1664			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542475	3542476	Abu_1664	Abu_1665			TRUE	0.991	-3.000	0.429	NA		NA
3542476	3542477	Abu_1665	Abu_1666			FALSE	0.074	98.000	0.000	NA		NA
3542477	3542478	Abu_1666	Abu_1667			TRUE	0.992	-7.000	0.500	NA		NA
3542479	3542480	Abu_1668	Abu_1669			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3542480	3542481	Abu_1669	Abu_1670			TRUE	0.558	13.000	0.000	NA		NA
3542481	3542482	Abu_1670	Abu_1671			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542482	3542483	Abu_1671	Abu_1672			FALSE	0.079	123.000	0.000	NA		NA
3542483	3542484	Abu_1672	Abu_1673			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542484	3542485	Abu_1673	Abu_1674			TRUE	0.984	-13.000	0.103	NA		NA
3542485	3542486	Abu_1674	Abu_1675			TRUE	0.995	1.000	0.750	NA		NA
3542486	3542487	Abu_1675	Abu_1676			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3542487	3542488	Abu_1676	Abu_1677			FALSE	0.075	100.000	0.000	NA		NA
3542490	3542491	Abu_1679	Abu_1680			FALSE	0.084	145.000	0.000	NA		NA
3542492	3542493	Abu_1681	Abu_1682			TRUE	0.782	-7.000	0.000	NA		NA
3542493	3542494	Abu_1682	Abu_1683			TRUE	0.775	-19.000	0.000	NA		NA
3542494	3542495	Abu_1683	Abu_1684			FALSE	0.102	370.000	0.000	NA		NA
3542495	3542496	Abu_1684	Abu_1685			TRUE	0.777	-13.000	0.000	NA		NA
3542496	3542497	Abu_1685	Abu_1686			FALSE	0.077	63.000	0.000	NA		NA
3542497	3542498	Abu_1686	Abu_1687			FALSE	0.076	104.000	0.000	NA		NA
3542498	3542499	Abu_1687	Abu_1688			TRUE	0.774	-30.000	0.000	NA		NA
3542499	3542500	Abu_1688	Abu_1689			TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3542500	3542501	Abu_1689	Abu_1690			TRUE	0.751	72.000	0.500	1.000		NA
3542501	3542502	Abu_1690	Abu_1691			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542503	3542504	Abu_1692	Abu_1693			FALSE	0.447	17.000	0.000	NA		NA
3542505	3542506	Abu_1694	Abu_1695			TRUE	0.775	-19.000	0.000	NA		NA
3542506	3542507	Abu_1695	Abu_1696		era	FALSE	0.074	73.000	0.000	NA		NA
3542507	3542508	Abu_1696	Abu_1697	era		FALSE	0.075	76.000	0.000	NA		NA
3542508	3542509	Abu_1697	Abu_1698			TRUE	0.789	7.000	0.000	NA		NA
3542511	3542512	Abu_1700	Abu_1701	def	clpP	TRUE	0.966	9.000	0.030	1.000	N	NA
3542512	3542513	Abu_1701	Abu_1702	clpP	tig	TRUE	0.985	15.000	0.351	1.000	Y	NA
3542513	3542514	Abu_1702	Abu_1703	tig		FALSE	0.112	148.000	0.000	1.000		NA
3542514	3542515	Abu_1703	Abu_1704			TRUE	0.972	1.000	0.000	0.001		NA
3542515	3542516	Abu_1704	Abu_1705		nspC	FALSE	0.356	24.000	0.000	1.000		NA
3542516	3542517	Abu_1705	Abu_1706	nspC		TRUE	0.997	4.000	0.444	1.000	Y	NA
3542518	3542519	Abu_1707	Abu_1708			FALSE	0.324	22.000	0.000	NA		NA
3542519	3542520	Abu_1708	Abu_1709			FALSE	0.102	349.000	0.000	NA		NA
3542520	3542521	Abu_1709	Abu_1710			TRUE	0.773	-76.000	0.000	NA		NA
3542521	3542522	Abu_1710	Abu_1711			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542522	3542523	Abu_1711	Abu_1712			TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542523	3542524	Abu_1712	Abu_1713			TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3542525	3542526	Abu_1714	Abu_1715			TRUE	0.939	-3.000	0.000	0.098		NA
3542526	3542527	Abu_1715	Abu_1716		hsdS	TRUE	0.938	-10.000	0.000	0.047	N	NA
3542527	3542528	Abu_1716	Abu_1717	hsdS	hsdM	TRUE	0.975	-3.000	0.000	0.047	Y	NA
3542530	3542531	Abu_1719	Abu_1720			FALSE	0.106	626.000	0.000	NA		NA
3542531	3542532	Abu_1720	Abu_1721			TRUE	0.521	14.000	0.000	NA		NA
3542532	3542533	Abu_1721	Abu_1722			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542534	3542535	Abu_1723	Abu_1724	metC1	metC2	TRUE	0.988	2.000	0.000	0.001	Y	NA
3542537	3542538	Abu_1726	Abu_1727			FALSE	0.371	20.000	0.000	NA		NA
3542538	3542539	Abu_1727	Abu_1728			FALSE	0.447	17.000	0.000	NA		NA
3542539	3542540	Abu_1728	Abu_1729			FALSE	0.273	140.000	0.000	1.000	Y	NA
3542540	3542541	Abu_1729	Abu_1730			TRUE	0.487	105.000	0.000	0.028	Y	NA
3542542	3542543	Abu_1731	Abu_1732			FALSE	0.123	200.000	0.000	1.000		NA
3542543	3542544	Abu_1732	Abu_1733			TRUE	0.824	-21.000	0.000	1.000		NA
3542544	3542545	Abu_1733	Abu_1734			TRUE	0.845	0.000	0.000	1.000		NA
3542545	3542546	Abu_1734	Abu_1735			TRUE	0.996	-3.000	0.188	0.016		NA
3542546	3542547	Abu_1735	Abu_1736			FALSE	0.099	82.000	0.000	1.000		NA
3542549	3542550	Abu_1738	Abu_1739			TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3542551	3542552	Abu_1740	Abu_1741		nhaA2	TRUE	0.936	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
3542553	3542554	Abu_1742	Abu_1743			TRUE	0.837	0.000	0.000	1.000	N	NA
3542554	3542555	Abu_1743	Abu_1744			TRUE	0.959	8.000	0.023	NA		NA
3542555	3542556	Abu_1744	Abu_1745			TRUE	0.993	-3.000	0.713	NA		NA
3542556	3542557	Abu_1745	Abu_1746			TRUE	0.990	-34.000	0.436	NA	N	NA
3542557	3542558	Abu_1746	Abu_1747			FALSE	0.074	98.000	0.000	NA		NA
3542559	3542560	Abu_1748	Abu_1749	atpE		FALSE	0.110	139.000	0.000	1.000		NA
3542560	3542561	Abu_1749	Abu_1750			FALSE	0.075	75.000	0.000	NA		NA
3542562	3542563	Abu_1751	Abu_1752			FALSE	0.074	87.000	0.000	NA		NA
3542563	3542564	Abu_1752	Abu_1753			FALSE	0.081	60.000	0.000	NA		NA
3542564	3542565	Abu_1753	Abu_1754			TRUE	0.986	10.000	0.286	NA		NA
3542566	3542567	Abu_1755	Abu_1756		thiD	TRUE	0.680	12.000	0.000	1.000		NA
3542567	3542568	Abu_1756	Abu_1757	thiD	proA	FALSE	0.093	75.000	0.000	1.000	N	NA
3542568	3542569	Abu_1757	Abu_1758	proA		TRUE	0.872	3.000	0.000	1.000	N	NA
3542572	3542573	Abu_1761	Abu_1762			TRUE	0.936	-10.000	0.000	1.000	Y	NA
3542574	3542575	Abu_1763	Abu_1764	ogt		TRUE	0.818	-10.000	0.000	1.000	N	NA
3542575	3542576	Abu_1764	Abu_1765			TRUE	0.824	-25.000	0.000	1.000		NA
3542576	3542577	Abu_1765	Abu_1766			FALSE	0.075	77.000	0.000	NA		NA
3542577	3542578	Abu_1766	Abu_1767			FALSE	0.097	238.000	0.000	NA		NA
3542578	3542579	Abu_1767	Abu_1768			TRUE	0.983	-6.000	0.094	NA		NA
3542579	3542580	Abu_1768	Abu_1769		fldA	TRUE	0.558	13.000	0.000	NA		NA
3542581	3542582	Abu_1770	Abu_1771	fur2		FALSE	0.074	86.000	0.000	NA		NA
3542582	3542583	Abu_1771	Abu_1772		ate	FALSE	0.075	75.000	0.000	NA		NA
3542583	3542584	Abu_1772	Abu_1773	ate	trpA	TRUE	0.872	3.000	0.000	1.000	N	NA
3542584	3542585	Abu_1773	Abu_1774	trpA		FALSE	0.122	54.000	0.000	1.000	N	NA
3542586	3542587	Abu_1775	Abu_1776	panB	ruvB	TRUE	0.976	4.000	0.027	1.000	N	NA
3542587	3542588	Abu_1776	Abu_1777	ruvB	amaA	TRUE	0.956	-3.000	0.019	NA		NA
3542589	3542590	Abu_1778	Abu_1779			FALSE	0.091	185.000	0.000	NA		NA
3542590	3542591	Abu_1779	Abu_1780			FALSE	0.087	159.000	0.000	NA		NA
3542591	3542592	Abu_1780	Abu_1781			FALSE	0.104	392.000	0.000	NA		NA
3542592	3542593	Abu_1781	Abu_1782			FALSE	0.094	55.000	0.000	NA		NA
3542593	3542594	Abu_1782	Abu_1783			FALSE	0.076	106.000	0.000	NA		NA
3542594	3542595	Abu_1783	Abu_1784			FALSE	0.095	221.000	0.000	NA		NA
3542595	3542596	Abu_1784	Abu_1785			FALSE	0.074	73.000	0.000	NA		NA
3542596	3542597	Abu_1785	Abu_1786		hemE	FALSE	0.334	78.000	0.017	1.000	N	NA
3542597	3542598	Abu_1786	Abu_1787	hemE		TRUE	0.558	13.000	0.000	NA		NA
3542598	3542599	Abu_1787	Abu_1788		asd	TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542599	3542600	Abu_1788	Abu_1789	asd	gyrA	TRUE	0.957	3.000	0.005	1.000	N	NA
3542600	3542601	Abu_1789	Abu_1790	gyrA		FALSE	0.083	139.000	0.000	NA		NA
3542601	3542602	Abu_1790	Abu_1791		argJ	FALSE	0.283	84.000	0.015	NA		NA
3542602	3542603	Abu_1791	Abu_1792	argJ		TRUE	0.972	2.000	0.019	1.000	N	NA
3542603	3542604	Abu_1792	Abu_1793		rpmB	TRUE	0.763	24.000	0.025	1.000	N	NA
3542604	3542605	Abu_1793	Abu_1794	rpmB		FALSE	0.093	66.000	0.000	1.000	N	NA
3542606	3542607	Abu_1795	Abu_1796		waaD	TRUE	0.983	9.000	0.093	1.000	N	NA
3542607	3542608	Abu_1796	Abu_1797	waaD	waaE	TRUE	0.998	1.000	0.096	0.012	Y	NA
3542608	3542609	Abu_1797	Abu_1798	waaE	gmhA	TRUE	0.987	-19.000	0.142	1.000	N	NA
3542609	3542610	Abu_1798	Abu_1799	gmhA		FALSE	0.092	90.000	0.000	1.000	N	NA
3542611	3542612	Abu_1800	Abu_1801	waaF		TRUE	0.963	-7.000	0.021	1.000		NA
3542612	3542613	Abu_1801	Abu_1802			TRUE	0.982	-7.000	0.059	1.000		NA
3542613	3542614	Abu_1802	Abu_1803			TRUE	0.957	0.000	0.013	1.000		NA
3542616	3542617	Abu_1805	Abu_1806			TRUE	0.813	9.000	0.000	1.000		NA
3542617	3542618	Abu_1806	Abu_1807			TRUE	0.761	9.000	0.000	NA		NA
3542618	3542619	Abu_1807	Abu_1808			TRUE	0.932	6.000	0.000	NA	Y	NA
3542619	3542620	Abu_1808	Abu_1809			TRUE	0.991	-37.000	0.083	NA	Y	NA
3542621	3542622	Abu_1810	Abu_1811			TRUE	0.599	23.000	0.000	NA	Y	NA
3542623	3542624	Abu_1812	Abu_1813			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542624	3542625	Abu_1813	Abu_1814			TRUE	0.928	-3.000	0.000	NA	Y	NA
3542625	3542626	Abu_1814	Abu_1815			TRUE	0.841	12.000	0.000	NA	Y	NA
3542626	3542627	Abu_1815	Abu_1816			TRUE	0.986	2.000	0.014	1.000	Y	NA
3542627	3542628	Abu_1816	Abu_1817			TRUE	0.998	-10.000	0.286	0.003	Y	NA
3542628	3542629	Abu_1817	Abu_1818			TRUE	0.943	0.000	0.000	1.000	Y	NA
3542629	3542630	Abu_1818	Abu_1819		dgkA	TRUE	0.818	14.000	0.000	1.000	Y	NA
3542630	3542631	Abu_1819	Abu_1820	dgkA		TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542631	3542632	Abu_1820	Abu_1821		waaM	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542632	3542633	Abu_1821	Abu_1822	waaM	waaC	TRUE	0.995	-7.000	0.231	1.000	Y	NA
3542633	3542634	Abu_1822	Abu_1823	waaC	gppA	TRUE	0.992	-3.000	0.429	1.000	N	NA
3542634	3542635	Abu_1823	Abu_1824	gppA	fdxB	TRUE	0.995	0.000	0.806	1.000		NA
3542635	3542636	Abu_1824	Abu_1825	fdxB		FALSE	0.163	44.000	0.000	1.000		NA
3542636	3542637	Abu_1825	Abu_1826		gltD	TRUE	0.988	3.000	0.070	1.000	N	NA
3542637	3542638	Abu_1826	Abu_1827	gltD	gltB	TRUE	0.999	6.000	0.188	0.001	Y	NA
3542638	3542639	Abu_1827	Abu_1828	gltB		FALSE	0.122	195.000	0.000	1.000		NA
3542639	3542640	Abu_1828	Abu_1829			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3542640	3542641	Abu_1829	Abu_1830			FALSE	0.093	196.000	0.000	NA		NA
3542641	3542642	Abu_1830	Abu_1831			TRUE	0.592	614.000	0.000	0.018	Y	NA
3542642	3542643	Abu_1831	Abu_1832			TRUE	0.558	13.000	0.000	NA		NA
3542643	3542644	Abu_1832	Abu_1833		gspD	FALSE	0.102	351.000	0.000	NA		NA
3542644	3542645	Abu_1833	Abu_1834	gspD		FALSE	0.272	30.000	0.000	1.000		NA
3542646	3542647	Abu_1835	Abu_1836	tlyA	ribF	TRUE	0.956	-31.000	0.018	1.000	N	NA
3542647	3542648	Abu_1836	Abu_1837	ribF		TRUE	0.703	32.000	0.003	1.000	Y	NA
3542648	3542649	Abu_1837	Abu_1838		bcp	TRUE	0.617	13.000	0.000	1.000	N	NA
3542649	3542650	Abu_1838	Abu_1839	bcp		TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3542650	3542651	Abu_1839	Abu_1840		glcD	TRUE	0.992	0.000	0.404	NA		NA
3542651	3542652	Abu_1840	Abu_1841	glcD	rbn	TRUE	0.971	8.000	0.031	1.000		NA
3542653	3542654	Abu_1842	Abu_1843		murA	TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3542655	3542656	Abu_1844	Abu_1845		kdsA	TRUE	0.633	13.000	0.000	1.000		NA
3542656	3542657	Abu_1845	Abu_1846	kdsA	ribH	TRUE	0.649	34.000	0.027	1.000	N	NA
3542657	3542658	Abu_1846	Abu_1847	ribH	nusB	TRUE	0.984	3.000	0.045	1.000	N	NA
3542658	3542659	Abu_1847	Abu_1848	nusB	pyrF	TRUE	0.976	2.000	0.023	1.000	N	NA
3542659	3542660	Abu_1848	Abu_1849	pyrF		FALSE	0.074	96.000	0.000	NA		NA
3542660	3542661	Abu_1849	Abu_1850			TRUE	0.815	5.000	0.000	NA		NA
3542661	3542662	Abu_1850	Abu_1851			FALSE	0.100	290.000	0.000	NA		NA
3542662	3542663	Abu_1851	Abu_1852			TRUE	0.978	0.000	0.047	NA		NA
3542663	3542664	Abu_1852	Abu_1853		feoA	TRUE	0.521	14.000	0.000	NA		NA
3542664	3542665	Abu_1853	Abu_1854	feoA	feoB2	TRUE	0.997	-3.000	0.692	1.000	Y	NA
3542665	3542666	Abu_1854	Abu_1855	feoB2		FALSE	0.125	44.000	0.000	NA		NA
3542667	3542668	Abu_1856	Abu_1857			TRUE	0.971	11.000	0.100	NA		NA
3542668	3542669	Abu_1857	Abu_1858			TRUE	0.982	9.000	0.100	NA		NA
3542669	3542670	Abu_1858	Abu_1859			FALSE	0.080	129.000	0.000	NA		NA
3542670	3542671	Abu_1859	Abu_1860			TRUE	0.849	5.000	0.000	1.000	N	NA
3542671	3542672	Abu_1860	Abu_1861			FALSE	0.097	115.000	0.000	1.000	N	NA
3542673	3542674	Abu_1862	Abu_1863			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542674	3542675	Abu_1863	Abu_1864			TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3542675	3542676	Abu_1864	Abu_1865			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542676	3542677	Abu_1865	Abu_1866		cspA	FALSE	0.116	207.000	0.000	1.000	N	NA
3542677	3542678	Abu_1866	Abu_1867	cspA		FALSE	0.182	34.000	0.000	NA		NA
3542680	3542681	Abu_1869	Abu_1870			FALSE	0.079	120.000	0.000	NA		NA
3542681	3542682	Abu_1870	Abu_1871			FALSE	0.182	34.000	0.000	NA		NA
3542682	3542683	Abu_1871	Abu_1872			FALSE	0.086	154.000	0.000	NA		NA
3542683	3542684	Abu_1872	Abu_1873			FALSE	0.138	531.000	0.000	1.000		NA
3542686	3542687	Abu_1875	Abu_1876			FALSE	0.097	236.000	0.000	NA		NA
3542687	3542688	Abu_1876	Abu_1877			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3542688	3542689	Abu_1877	Abu_1878			FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3542689	3542690	Abu_1878	Abu_1879		ahpC	FALSE	0.089	165.000	0.000	NA		NA
3542690	3542691	Abu_1879	Abu_1880	ahpC	trx1	TRUE	0.866	12.000	0.000	1.000	Y	NA
3542692	3542693	Abu_1881	Abu_1882			FALSE	0.130	43.000	0.000	NA		NA
3542693	3542694	Abu_1882	Abu_1883		rpoC	FALSE	0.166	36.000	0.000	NA		NA
3542694	3542695	Abu_1883	Abu_1884	rpoC	rpoB	TRUE	0.998	-10.000	0.851	0.001		NA
3542695	3542696	Abu_1884	Abu_1885	rpoB	rplL	TRUE	0.722	157.000	0.223	1.000		NA
3542696	3542697	Abu_1885	Abu_1886	rplL	rplJ	TRUE	0.921	52.000	0.884	1.000	Y	NA
3542697	3542698	Abu_1886	Abu_1887	rplJ	rplA	TRUE	0.863	161.000	0.302	1.000	Y	NA
3542698	3542699	Abu_1887	Abu_1888	rplA	rplK	TRUE	0.950	76.000	0.838	0.025	Y	NA
3542699	3542700	Abu_1888	Abu_1889	rplK	nusG	TRUE	0.771	95.000	0.681	1.000	N	NA
3542700	3542701	Abu_1889	Abu_1890	nusG	secE	TRUE	0.992	10.000	0.843	1.000		NA
3542701	3542702	Abu_1890	Abu_1891	secE		FALSE	0.075	80.000	0.000	NA		NA
3542702	3542703	Abu_1891	Abu_1892		rpmG	FALSE	0.142	40.000	0.000	NA		NA
3542703	3542704	Abu_1892	Abu_1893	rpmG	tufA	TRUE	0.981	13.000	0.099	1.000	Y	NA
3542704	3542705	Abu_1893	Abu_1894	tufA		FALSE	0.094	211.000	0.000	NA		NA
3542705	3542706	Abu_1894	Abu_1895			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542706	3542707	Abu_1895	Abu_1896			FALSE	0.086	58.000	0.000	NA		NA
3542707	3542708	Abu_1896	Abu_1897			TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3542708	3542709	Abu_1897	Abu_1898		murD	FALSE	0.160	37.000	0.000	NA		NA
3542709	3542710	Abu_1898	Abu_1899	murD	mraY	TRUE	0.998	10.000	0.647	0.005	Y	NA
3542711	3542712	Abu_1900	Abu_1901	pgm		TRUE	0.837	0.000	0.000	1.000	N	NA
3542712	3542713	Abu_1901	Abu_1902		pbpA	TRUE	0.979	4.000	0.032	1.000	N	NA
3542714	3542715	Abu_1903	Abu_1904	glnA	hisJ	TRUE	0.534	98.000	0.017	1.000	Y	NA
3542715	3542716	Abu_1904	Abu_1905	hisJ	moaE	TRUE	0.829	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3542716	3542717	Abu_1905	Abu_1906	moaE	moaD	TRUE	0.998	3.000	0.501	1.000	Y	NA
3542718	3542719	Abu_1907	Abu_1908		uppP	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542720	3542721	Abu_1909	Abu_1910	murG	pbpB	TRUE	0.990	-3.000	0.200	1.000	N	NA
3542722	3542723	Abu_1911	Abu_1912	ftsW	ppi	FALSE	0.404	21.000	0.000	1.000	N	NA
3542724	3542725	Abu_1913	Abu_1914			FALSE	0.087	159.000	0.000	NA		NA
3542725	3542726	Abu_1914	Abu_1915			FALSE	0.104	392.000	0.000	NA		NA
3542726	3542727	Abu_1915	Abu_1916			FALSE	0.094	55.000	0.000	NA		NA
3542727	3542728	Abu_1916	Abu_1917			FALSE	0.076	106.000	0.000	NA		NA
3542728	3542729	Abu_1917	Abu_1918			FALSE	0.095	220.000	0.000	NA		NA
3542729	3542730	Abu_1918	Abu_1919			FALSE	0.084	144.000	0.000	NA		NA
3542730	3542731	Abu_1919	Abu_1920		clpA	FALSE	0.092	69.000	0.000	1.000	N	NA
3542731	3542732	Abu_1920	Abu_1921	clpA	clpS	TRUE	0.995	2.000	0.596	NA		NA
3542735	3542736	Abu_1924	Abu_1925			TRUE	0.973	17.000	0.052	0.001	N	NA
3542736	3542737	Abu_1925	Abu_1926			TRUE	0.915	10.000	0.000	1.000	Y	NA
3542737	3542738	Abu_1926	Abu_1927			TRUE	0.786	33.000	0.067	1.000	N	NA
3542738	3542739	Abu_1927	Abu_1928		fumA	FALSE	0.112	177.000	0.000	1.000	N	NA
3542739	3542740	Abu_1928	Abu_1929	fumA		FALSE	0.088	160.000	0.000	NA		NA
3542741	3542742	Abu_1930	Abu_1931		arsB	FALSE	0.113	181.000	0.000	1.000	N	NA
3542742	3542743	Abu_1931	Abu_1932	arsB	arsR	TRUE	0.981	-6.000	0.057	1.000		NA
3542743	3542744	Abu_1932	Abu_1933	arsR		TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542744	3542745	Abu_1933	Abu_1934			TRUE	0.986	5.000	0.090	NA		NA
3542745	3542746	Abu_1934	Abu_1935		arsC	TRUE	0.963	1.000	0.017	NA		NA
3542746	3542747	Abu_1935	Abu_1936	arsC		FALSE	0.101	109.000	0.000	1.000		NA
3542747	3542748	Abu_1936	Abu_1937			FALSE	0.074	81.000	0.000	NA		NA
3542748	3542749	Abu_1937	Abu_1938		flhA	FALSE	0.182	34.000	0.000	NA		NA
3542749	3542750	Abu_1938	Abu_1939	flhA	flgL	TRUE	0.710	20.000	0.000	1.000	Y	NA
3542750	3542751	Abu_1939	Abu_1940	flgL	fliI	TRUE	0.940	-3.000	0.000	1.000	Y	NA
3542751	3542752	Abu_1940	Abu_1941	fliI	pflA	TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3542752	3542753	Abu_1941	Abu_1942	pflA	flhB	TRUE	0.871	4.000	0.000	1.000		NA
3542753	3542754	Abu_1942	Abu_1943	flhB	fliR	TRUE	0.995	12.000	0.353	0.094	Y	NA
3542754	3542755	Abu_1943	Abu_1944	fliR		TRUE	0.845	0.000	0.000	1.000		NA
3542755	3542756	Abu_1944	Abu_1945		flgC	TRUE	0.879	13.000	0.000	0.008		NA
3542756	3542757	Abu_1945	Abu_1946	flgC	fliE	TRUE	0.994	15.000	0.271	0.005	Y	NA
3542757	3542758	Abu_1946	Abu_1947	fliE		TRUE	0.558	13.000	0.000	NA		NA
3542758	3542759	Abu_1947	Abu_1948			FALSE	0.076	64.000	0.000	NA		NA
3542759	3542760	Abu_1948	Abu_1949		flhF	TRUE	0.998	3.000	0.382	0.013	N	NA
3542760	3542761	Abu_1949	Abu_1950	flhF		TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542761	3542762	Abu_1950	Abu_1951			TRUE	0.776	-16.000	0.000	NA		NA
3542762	3542763	Abu_1951	Abu_1952			TRUE	0.469	16.000	0.000	NA		NA
3542763	3542764	Abu_1952	Abu_1953		fliY	TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542764	3542765	Abu_1953	Abu_1954	fliY	flaG	FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3542765	3542766	Abu_1954	Abu_1955	flaG		FALSE	0.113	48.000	0.000	NA		NA
3542766	3542767	Abu_1955	Abu_1956			TRUE	0.774	-37.000	0.000	NA		NA
3542767	3542768	Abu_1956	Abu_1957		flgE1	FALSE	0.098	54.000	0.000	NA		NA
3542768	3542769	Abu_1957	Abu_1958	flgE1	flgE2	TRUE	0.521	94.000	0.000	0.005	Y	NA
3542769	3542770	Abu_1958	Abu_1959	flgE2	flgD	FALSE	0.371	20.000	0.000	NA		NA
3542770	3542771	Abu_1959	Abu_1960	flgD	fliN	TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3542771	3542772	Abu_1960	Abu_1961	fliN	fliH	FALSE	0.414	50.000	0.000	0.008		NA
3542772	3542773	Abu_1961	Abu_1962	fliH	fliG	TRUE	0.999	3.000	0.308	0.005	Y	NA
3542773	3542774	Abu_1962	Abu_1963	fliG	fliF	TRUE	0.996	13.000	0.477	0.008	Y	NA
3542774	3542775	Abu_1963	Abu_1964	fliF	flgB	TRUE	0.904	18.000	0.000	0.008	Y	NA
3542775	3542776	Abu_1964	Abu_1965	flgB	flgG1	TRUE	0.982	0.000	0.000	0.005	Y	NA
3542776	3542777	Abu_1965	Abu_1966	flgG1		TRUE	0.494	15.000	0.000	NA		NA
3542777	3542778	Abu_1966	Abu_1967		cheY2	TRUE	0.949	15.000	0.125	NA		NA
3542779	3542780	Abu_1968	Abu_1969	flgG2		FALSE	0.371	20.000	0.000	NA		NA
3542780	3542781	Abu_1969	Abu_1970			TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3542782	3542783	Abu_1971	Abu_1972	rimM		TRUE	0.994	1.000	0.324	1.000		NA
3542783	3542784	Abu_1972	Abu_1973		rpsP	TRUE	0.974	14.000	0.385	1.000		NA
3542784	3542785	Abu_1973	Abu_1974	rpsP	ffh	TRUE	0.724	81.000	0.361	1.000	N	NA
3542785	3542786	Abu_1974	Abu_1975	ffh		FALSE	0.333	151.000	0.013	1.000	N	NA
3542786	3542787	Abu_1975	Abu_1976		kdtA	TRUE	0.987	-9.000	0.133	1.000	N	NA
3542787	3542788	Abu_1976	Abu_1977	kdtA		TRUE	0.990	3.000	0.122	NA		NA
3542788	3542789	Abu_1977	Abu_1978			TRUE	0.990	-7.000	0.342	NA		NA
3542789	3542790	Abu_1978	Abu_1979		glyQ	TRUE	0.982	3.000	0.041	NA		NA
3542790	3542791	Abu_1979	Abu_1980	glyQ		TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3542791	3542792	Abu_1980	Abu_1981		purE	TRUE	0.845	0.000	0.000	1.000		NA
3542792	3542793	Abu_1981	Abu_1982	purE		FALSE	0.127	41.000	0.000	NA	N	NA
3542793	3542794	Abu_1982	Abu_1983			FALSE	0.289	23.000	0.000	NA	N	NA
3542794	3542795	Abu_1983	Abu_1984			FALSE	0.096	111.000	0.000	1.000	N	NA
3542795	3542796	Abu_1984	Abu_1985		recN	FALSE	0.118	55.000	0.000	1.000	N	NA
3542796	3542797	Abu_1985	Abu_1986	recN		TRUE	0.987	4.000	0.066	1.000	N	NA
3542797	3542798	Abu_1986	Abu_1987		fus	FALSE	0.115	194.000	0.000	1.000	N	NA
3542798	3542799	Abu_1987	Abu_1988	fus	rpsG	TRUE	0.995	10.000	0.579	1.000	Y	NA
3542799	3542800	Abu_1988	Abu_1989	rpsG	rpsL	TRUE	0.995	17.000	0.620	0.004	Y	NA
3542801	3542802	Abu_1990	Abu_1991		araJ	FALSE	0.074	74.000	0.000	NA		NA
3542803	3542804	Abu_1992	Abu_1993			TRUE	0.756	89.000	0.120	NA	Y	NA
3542804	3542805	Abu_1993	Abu_1994			TRUE	0.644	21.000	0.000	NA	Y	NA
3542805	3542806	Abu_1994	Abu_1995			TRUE	0.996	-3.000	0.500	NA	Y	NA
3542806	3542807	Abu_1995	Abu_1996			TRUE	0.997	-12.000	0.625	1.000	Y	NA
3542807	3542808	Abu_1996	Abu_1997			FALSE	0.098	246.000	0.000	NA		NA
3542808	3542809	Abu_1997	Abu_1998			FALSE	0.087	159.000	0.000	NA		NA
3542809	3542810	Abu_1998	Abu_1999			FALSE	0.104	392.000	0.000	NA		NA
3542810	3542811	Abu_1999	Abu_2000			FALSE	0.094	55.000	0.000	NA		NA
3542811	3542812	Abu_2000	Abu_2001			FALSE	0.076	106.000	0.000	NA		NA
3542812	3542813	Abu_2001	Abu_2002			FALSE	0.101	317.000	0.000	NA		NA
3542813	3542814	Abu_2002	Abu_2003			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542814	3542815	Abu_2003	Abu_2004		trpG	TRUE	0.989	8.000	0.263	NA		NA
3542816	3542817	Abu_2005	Abu_2006	fbpA	fbpB	TRUE	0.999	-9.000	0.618	0.030	Y	NA
3542817	3542818	Abu_2006	Abu_2007	fbpB		TRUE	0.997	-3.000	0.529	0.030	N	NA
3542818	3542819	Abu_2007	Abu_2008			TRUE	0.453	19.000	0.000	1.000	N	NA
3542819	3542820	Abu_2008	Abu_2009			FALSE	0.094	103.000	0.000	1.000	N	NA
3542820	3542821	Abu_2009	Abu_2010			TRUE	0.609	12.000	0.000	NA		NA
3542821	3542822	Abu_2010	Abu_2011			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542822	3542823	Abu_2011	Abu_2012			TRUE	0.983	-16.000	0.100	NA		NA
3542825	3542826	Abu_2014	Abu_2015			FALSE	0.221	29.000	0.000	NA		NA
3542826	3542827	Abu_2015	Abu_2016			TRUE	0.776	-16.000	0.000	NA		NA
3542827	3542828	Abu_2016	Abu_2017			FALSE	0.075	76.000	0.000	NA		NA
3542829	3542830	Abu_2018	Abu_2019			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542830	3542831	Abu_2019	Abu_2020			FALSE	0.127	41.000	0.000	NA	N	NA
3542831	3542832	Abu_2020	Abu_2021			TRUE	0.839	13.000	0.000	1.000	Y	NA
3542834	3542835	Abu_2023	Abu_2024			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3542835	3542836	Abu_2024	Abu_2025		rplS	FALSE	0.075	102.000	0.000	NA		NA
3542836	3542837	Abu_2025	Abu_2026	rplS	trmD	TRUE	0.892	56.000	0.567	1.000	Y	NA
3542838	3542839	Abu_2027	Abu_2028		metE	FALSE	0.265	165.000	0.006	NA		NA
3542839	3542840	Abu_2028	Abu_2029	metE	ilvA	FALSE	0.254	106.000	0.000	1.000	Y	NA
3542840	3542841	Abu_2029	Abu_2030	ilvA	atpB	FALSE	0.092	91.000	0.000	1.000	N	NA
3542841	3542842	Abu_2030	Abu_2031	atpB		FALSE	0.098	62.000	0.000	1.000	N	NA
3542843	3542844	Abu_2032	Abu_2033	porA	folB	FALSE	0.132	292.000	0.000	1.000		NA
3542844	3542845	Abu_2033	Abu_2034	folB		TRUE	0.986	-3.000	0.096	1.000		NA
3542846	3542847	Abu_2035	Abu_2036	nadA	nadC	TRUE	0.998	-3.000	0.198	0.004	Y	NA
3542847	3542848	Abu_2036	Abu_2037	nadC		FALSE	0.129	54.000	0.000	1.000		NA
3542848	3542849	Abu_2037	Abu_2038			TRUE	0.825	-16.000	0.000	1.000		NA
3542849	3542850	Abu_2038	Abu_2039		lpxC	TRUE	0.974	4.000	0.022	1.000		NA
3542850	3542851	Abu_2039	Abu_2040	lpxC		TRUE	0.972	7.000	0.035	NA		NA
3542851	3542852	Abu_2040	Abu_2041		thrB	TRUE	0.891	15.000	0.032	NA		NA
3542852	3542853	Abu_2041	Abu_2042	thrB		TRUE	0.664	37.000	0.044	NA		NA
3542853	3542854	Abu_2042	Abu_2043		infB	TRUE	0.987	-25.000	0.171	NA		NA
3542854	3542855	Abu_2043	Abu_2044	infB	rbfA	TRUE	0.998	2.000	0.530	1.000	Y	NA
3542855	3542856	Abu_2044	Abu_2045	rbfA		TRUE	0.970	-3.000	0.033	NA		NA
3542856	3542857	Abu_2045	Abu_2046		ribD	TRUE	0.831	15.000	0.016	NA		NA
3542858	3542859	Abu_2047	Abu_2048	efp	serA	TRUE	0.827	14.000	0.007	1.000	N	NA
3542859	3542860	Abu_2048	Abu_2049	serA	rpsA	TRUE	0.905	11.000	0.010	1.000	N	NA
3542860	3542861	Abu_2049	Abu_2050	rpsA	ispH	TRUE	0.623	67.000	0.118	1.000	N	NA
3542861	3542862	Abu_2050	Abu_2051	ispH	aroA	FALSE	0.430	79.000	0.032	1.000	N	NA
3542862	3542863	Abu_2051	Abu_2052	aroA	pheT	TRUE	0.902	14.000	0.028	1.000	N	NA
3542863	3542864	Abu_2052	Abu_2053	pheT	pheS	TRUE	0.999	-3.000	0.574	0.001	Y	NA
3542866	3542867	Abu_2055	Abu_2056	accA	fabF	TRUE	0.715	58.000	0.046	1.000	Y	NA
3542867	3542868	Abu_2056	Abu_2057	fabF	acpP	TRUE	0.738	117.000	0.066	1.000	Y	NA
3542868	3542869	Abu_2057	Abu_2058	acpP	fabG	TRUE	0.938	97.000	0.321	0.004	Y	NA
3542869	3542870	Abu_2058	Abu_2059	fabG		FALSE	0.107	58.000	0.000	1.000	N	NA
3542870	3542871	Abu_2059	Abu_2060			TRUE	0.988	-7.000	0.139	1.000	N	NA
3542871	3542872	Abu_2060	Abu_2061		exsB	TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542873	3542874	Abu_2062	Abu_2063			TRUE	0.961	0.000	0.021	NA		NA
3542875	3542876	Abu_2064	Abu_2065	petC	petB	TRUE	0.998	-3.000	0.103	0.001	Y	NA
3542876	3542877	Abu_2065	Abu_2066	petB	petA	TRUE	0.996	11.000	0.093	0.001	Y	NA
3542877	3542878	Abu_2066	Abu_2067	petA	thrC	FALSE	0.108	158.000	0.000	1.000	N	NA
3542878	3542879	Abu_2067	Abu_2068	thrC	argB	TRUE	0.868	19.000	0.005	1.000	Y	NA
3542880	3542881	Abu_2069	Abu_2070			FALSE	0.206	37.000	0.000	1.000		NA
3542881	3542882	Abu_2070	Abu_2071		prfB	FALSE	0.099	79.000	0.000	1.000		NA
3542883	3542884	Abu_2072	Abu_2073			TRUE	0.833	2.000	0.000	NA	N	NA
3542884	3542885	Abu_2073	Abu_2074			TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3542885	3542886	Abu_2074	Abu_2075			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3542886	3542887	Abu_2075	Abu_2076			TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3542887	3542888	Abu_2076	Abu_2077			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3542888	3542889	Abu_2077	Abu_2078		ccoP	TRUE	0.843	2.000	0.000	NA		NA
3542889	3542890	Abu_2078	Abu_2079	ccoP	ccoQ	TRUE	0.973	2.000	0.000	0.002		NA
3542890	3542891	Abu_2079	Abu_2080	ccoQ	ccoO	TRUE	0.996	11.000	0.738	0.002		NA
3542891	3542892	Abu_2080	Abu_2081	ccoO	ccoN	TRUE	0.989	15.000	0.283	0.002	N	NA
3542892	3542893	Abu_2081	Abu_2082	ccoN	smpB	FALSE	0.287	162.000	0.000	1.000	Y	NA
3542893	3542894	Abu_2082	Abu_2083	smpB	ispE	TRUE	0.968	-10.000	0.028	1.000	N	NA
3542894	3542895	Abu_2083	Abu_2084	ispE	truB	TRUE	0.958	2.000	0.005	1.000	N	NA
3542895	3542896	Abu_2084	Abu_2085	truB		TRUE	0.907	17.000	0.046	1.000	N	NA
3542898	3542899	Abu_2087	Abu_2088		purF	TRUE	0.970	0.000	0.024	1.000		NA
3542899	3542900	Abu_2088	Abu_2089	purF	dapB	TRUE	0.921	12.000	0.022	1.000	N	NA
3542900	3542901	Abu_2089	Abu_2090	dapB	trxB	TRUE	0.936	14.000	0.013	0.036	N	NA
3542901	3542902	Abu_2090	Abu_2091	trxB	trx2	TRUE	0.707	217.000	0.035	1.000	Y	NA
3542904	3542905	Abu_2093	Abu_2094			FALSE	0.215	30.000	0.000	NA		NA
3542905	3542906	Abu_2094	Abu_2095			TRUE	0.778	-10.000	0.000	NA		NA
3542908	3542909	Abu_2097	Abu_2098			TRUE	0.995	-3.000	0.176	1.000	Y	NA
3542909	3542910	Abu_2098	Abu_2099		htrA	TRUE	0.904	28.000	0.294	1.000	N	NA
3542910	3542911	Abu_2099	Abu_2100	htrA	ilvD	FALSE	0.097	115.000	0.000	1.000	N	NA
3542912	3542913	Abu_2101	Abu_2102			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3542913	3542914	Abu_2102	Abu_2103			FALSE	0.074	66.000	0.000	NA		NA
3542914	3542915	Abu_2103	Abu_2104		int	FALSE	0.096	222.000	0.000	NA		NA
3542916	3542917	Abu_2105	Abu_2106			FALSE	0.100	292.000	0.000	NA		NA
3542917	3542918	Abu_2106	Abu_2107			FALSE	0.120	46.000	0.000	NA		NA
3542918	3542919	Abu_2107	Abu_2108			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542919	3542920	Abu_2108	Abu_2109			FALSE	0.089	163.000	0.000	NA		NA
3542920	3542921	Abu_2109	Abu_2110			TRUE	0.775	-22.000	0.000	NA		NA
3542921	3542922	Abu_2110	Abu_2111			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542924	3542925	Abu_2113	Abu_2114			TRUE	0.993	-19.000	0.857	NA		NA
3542925	3542926	Abu_2114	Abu_2115			TRUE	0.994	-3.000	0.857	1.000	N	NA
3542927	3542928	Abu_2116	Abu_2117	dksA		TRUE	0.838	-3.000	0.000	1.000		NA
3542929	3542930	Abu_2118	Abu_2119			TRUE	0.970	10.000	0.057	NA		NA
3542931	3542932	Abu_2120	Abu_2121	ctpA	purC	TRUE	0.665	12.000	0.000	1.000	N	NA
3542932	3542933	Abu_2121	Abu_2122	purC	purS	TRUE	0.734	57.000	0.049	1.000	Y	NA
3542933	3542934	Abu_2122	Abu_2123	purS	purQ	TRUE	0.999	2.000	0.656	0.001	Y	NA
3542934	3542935	Abu_2123	Abu_2124	purQ		TRUE	0.735	29.000	0.038	NA		NA
3542935	3542936	Abu_2124	Abu_2125		plsC	TRUE	0.993	-13.000	0.846	NA		NA
3542936	3542937	Abu_2125	Abu_2126	plsC	crcB	TRUE	0.988	-28.000	0.038	0.091	N	NA
3542937	3542938	Abu_2126	Abu_2127	crcB		FALSE	0.092	67.000	0.000	1.000	N	NA
3542938	3542939	Abu_2127	Abu_2128			TRUE	0.962	21.000	0.022	0.007	Y	NA
3542939	3542940	Abu_2128	Abu_2129		argS	TRUE	0.945	10.000	0.020	1.000	N	NA
3542941	3542942	Abu_2130	Abu_2131		nadD	TRUE	0.989	-3.000	0.221	NA		NA
3542943	3542944	Abu_2132	Abu_2133	gapA	pgk	TRUE	0.954	18.000	0.002	0.004	Y	NA
3542944	3542945	Abu_2133	Abu_2134	pgk	tpiA	TRUE	0.985	0.000	0.022	1.000	Y	NA
3542945	3542946	Abu_2134	Abu_2135	tpiA	fabI	TRUE	0.995	2.000	0.071	0.041	N	NA
3542946	3542947	Abu_2135	Abu_2136	fabI	lysA	FALSE	0.093	96.000	0.000	1.000	N	NA
3542947	3542948	Abu_2136	Abu_2137	lysA	pheA	TRUE	0.951	12.000	0.013	1.000	Y	NA
3542948	3542949	Abu_2137	Abu_2138	pheA	hisC	TRUE	0.967	12.000	0.028	1.000	Y	NA
3542949	3542950	Abu_2138	Abu_2139	hisC	dxs	TRUE	0.869	12.000	0.006	1.000	N	NA
3542950	3542951	Abu_2139	Abu_2140	dxs		FALSE	0.106	151.000	0.000	1.000	N	NA
3542953	3542954	Abu_2142	Abu_2143			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3542955	3542956	Abu_2144	Abu_2145			FALSE	0.069	75.000	0.000	NA	N	NA
3542958	3542959	Abu_2147	Abu_2148	ung		FALSE	0.097	117.000	0.000	1.000	N	NA
3542959	3542960	Abu_2148	Abu_2149		ilvB	TRUE	0.922	21.000	0.134	1.000	N	NA
3542961	3542962	Abu_2150	Abu_2151	lemA		TRUE	0.989	0.000	0.169	NA		NA
3542962	3542963	Abu_2151	Abu_2152			TRUE	0.991	-3.000	0.338	NA		NA
3542963	3542964	Abu_2152	Abu_2153		gph	TRUE	0.774	-31.000	0.000	NA		NA
3542964	3542965	Abu_2153	Abu_2154	gph		FALSE	0.098	89.000	0.000	1.000		NA
3542966	3542967	Abu_2155	Abu_2156			TRUE	0.830	1.000	0.000	NA		NA
3542970	3542971	Abu_2159	Abu_2160			FALSE	0.238	67.000	0.000	0.091	N	NA
3542971	3542972	Abu_2160	Abu_2161			TRUE	0.863	4.000	0.000	1.000	N	NA
3542972	3542973	Abu_2161	Abu_2162			TRUE	0.945	-7.000	0.000	0.029	N	NA
3542974	3542975	Abu_2163	Abu_2164			FALSE	0.241	152.000	0.000	NA	Y	NA
3542975	3542976	Abu_2164	Abu_2165			TRUE	0.765	-10.000	0.000	NA	N	NA
3542976	3542977	Abu_2165	Abu_2166			FALSE	0.084	142.000	0.000	NA		NA
3542977	3542978	Abu_2166	Abu_2167			TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542978	3542979	Abu_2167	Abu_2168			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3542980	3542981	Abu_2169	Abu_2170	metY	iscR	TRUE	0.939	7.000	0.010	NA	N	NA
3542981	3542982	Abu_2170	Abu_2171	iscR	cysK1	TRUE	0.721	31.000	0.042	NA	N	NA
3542982	3542983	Abu_2171	Abu_2172	cysK1		TRUE	0.746	34.000	0.061	NA		NA
3542983	3542984	Abu_2172	Abu_2173		cysH	TRUE	0.965	9.000	0.033	NA		NA
3542984	3542985	Abu_2173	Abu_2174	cysH	cysD	TRUE	0.890	17.000	0.005	1.000	Y	NA
3542985	3542986	Abu_2174	Abu_2175	cysD	cysNC	TRUE	0.999	2.000	0.667	0.001	N	NA
3542986	3542987	Abu_2175	Abu_2176	cysNC	cysI	TRUE	0.996	10.000	0.667	1.000	Y	NA
3542987	3542988	Abu_2176	Abu_2177	cysI		TRUE	0.617	13.000	0.000	1.000	N	NA
3542988	3542989	Abu_2177	Abu_2178			TRUE	0.458	86.000	0.000	0.040	Y	NA
3542990	3542991	Abu_2179	Abu_2180			FALSE	0.076	104.000	0.000	NA		NA
3542991	3542992	Abu_2180	Abu_2181		cobS	TRUE	0.800	0.000	0.000	NA		NA
3542992	3542993	Abu_2181	Abu_2182	cobS	cobP	TRUE	0.993	-3.000	0.092	1.000	Y	NA
3542993	3542994	Abu_2182	Abu_2183	cobP		FALSE	0.282	28.000	0.000	1.000	N	NA
3542994	3542995	Abu_2183	Abu_2184			TRUE	0.873	2.000	0.000	1.000	N	NA
3542997	3542998	Abu_2186	Abu_2187		dsbD	FALSE	0.163	44.000	0.000	1.000		NA
3542998	3542999	Abu_2187	Abu_2188	dsbD	rimK	TRUE	0.837	0.000	0.000	1.000	N	NA
3542999	3543000	Abu_2188	Abu_2189	rimK		TRUE	0.934	12.000	0.031	1.000	N	NA
3543000	3543001	Abu_2189	Abu_2190			FALSE	0.109	50.000	0.000	NA		NA
3543001	3543002	Abu_2190	Abu_2191			FALSE	0.078	62.000	0.000	NA		NA
3543002	3543003	Abu_2191	Abu_2192		psd	TRUE	0.814	-25.000	0.000	1.000	N	NA
3543005	3543006	Abu_2194	Abu_2195	mltA	dnaK	FALSE	0.096	63.000	0.000	1.000	N	NA
3543006	3543007	Abu_2195	Abu_2196	dnaK	grpE	TRUE	0.841	189.000	0.029	0.008	Y	NA
3543007	3543008	Abu_2196	Abu_2197	grpE	hrcA	TRUE	0.962	10.000	0.038	NA		NA
3543008	3543009	Abu_2197	Abu_2198	hrcA		FALSE	0.078	116.000	0.000	NA		NA
3543009	3543010	Abu_2198	Abu_2199		truA	TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3543010	3543011	Abu_2199	Abu_2200	truA		TRUE	0.982	7.000	0.059	1.000		NA
3543011	3543012	Abu_2200	Abu_2201			TRUE	0.951	0.000	0.009	1.000		NA
3543012	3543013	Abu_2201	Abu_2202		uppS	TRUE	0.932	-40.000	0.002	1.000		NA
3543013	3543014	Abu_2202	Abu_2203	uppS	dfp	TRUE	0.942	-13.000	0.009	1.000	N	NA
3543014	3543015	Abu_2203	Abu_2204	dfp	glmU	TRUE	0.970	3.000	0.016	1.000	N	NA
3543015	3543016	Abu_2204	Abu_2205	glmU		TRUE	0.842	3.000	0.000	NA		NA
3543016	3543017	Abu_2205	Abu_2206			FALSE	0.133	42.000	0.000	NA		NA
3543019	3543020	Abu_2208	Abu_2209			FALSE	0.080	128.000	0.000	NA		NA
3543020	3543021	Abu_2209	Abu_2210		gidA	FALSE	0.094	216.000	0.000	NA		NA
3543023	3543024	Abu_2212	Abu_2213	mreC	mreB	TRUE	0.995	5.000	0.689	1.000	N	NA
3543024	3543025	Abu_2213	Abu_2214	mreB	clpX	TRUE	0.991	4.000	0.034	0.092	N	NA
3543025	3543026	Abu_2214	Abu_2215	clpX	lpxA	TRUE	0.941	11.000	0.027	1.000	N	NA
3543026	3543027	Abu_2215	Abu_2216	lpxA	fabZ	TRUE	0.987	10.000	0.264	1.000	N	NA
3543027	3543028	Abu_2216	Abu_2217	fabZ	lpxB	FALSE	0.093	98.000	0.000	1.000	N	NA
3543028	3543029	Abu_2217	Abu_2218	lpxB		TRUE	0.927	-3.000	0.003	NA		NA
3543033	3543034	Abu_2222	Abu_2223			TRUE	0.945	-7.000	0.000	0.029	N	NA
3543034	3543035	Abu_2223	Abu_2224			TRUE	0.829	-3.000	0.000	1.000	N	NA
3543036	3543037	Abu_2225	Abu_2226			FALSE	0.099	75.000	0.000	1.000		NA
3543038	3543039	Abu_2227	Abu_2228			FALSE	0.312	59.000	0.010	1.000		NA
3543039	3543040	Abu_2228	Abu_2229			TRUE	0.995	1.000	0.053	0.010		NA
3543041	3543042	Abu_2230	Abu_2231			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3543042	3543043	Abu_2231	Abu_2232			TRUE	0.780	10.000	0.000	1.000		NA
3543043	3543044	Abu_2232	Abu_2233			TRUE	0.832	4.000	0.000	NA		NA
3543044	3543045	Abu_2233	Abu_2234		murB	TRUE	0.939	-3.000	0.009	NA		NA
3543045	3543046	Abu_2234	Abu_2235	murB	topA	FALSE	0.118	216.000	0.000	1.000	N	NA
3543046	3543047	Abu_2235	Abu_2236	topA		TRUE	0.845	0.000	0.000	1.000		NA
3543047	3543048	Abu_2236	Abu_2237		bioB	TRUE	0.827	-10.000	0.000	1.000		NA
3543049	3543050	Abu_2238	Abu_2239			TRUE	0.993	-3.000	0.788	NA		NA
3543050	3543051	Abu_2239	Abu_2240		eno	TRUE	0.987	4.000	0.080	NA		NA
3543051	3543052	Abu_2240	Abu_2241	eno	recA	TRUE	0.461	121.000	0.033	1.000	N	NA
3543052	3543053	Abu_2241	Abu_2242	recA		FALSE	0.075	101.000	0.000	NA		NA
3543054	3543055	Abu_2243	Abu_2244	pseB		TRUE	0.994	-3.000	0.678	1.000		NA
3543055	3543056	Abu_2244	Abu_2245		neuA	TRUE	0.996	-7.000	0.296	1.000	Y	NA
3543056	3543057	Abu_2245	Abu_2246	neuA	neuB	TRUE	0.991	-3.000	0.056	1.000	Y	NA
3543057	3543058	Abu_2246	Abu_2247	neuB		TRUE	0.995	-3.000	0.236	1.000	Y	NA
3543058	3543059	Abu_2247	Abu_2248			TRUE	0.955	-13.000	0.016	1.000		NA
3543059	3543060	Abu_2248	Abu_2249		flmE	TRUE	0.879	3.000	0.000	1.000		NA
3543060	3543061	Abu_2249	Abu_2250	flmE		TRUE	0.825	-18.000	0.000	1.000		NA
3543061	3543062	Abu_2250	Abu_2251			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3543062	3543063	Abu_2251	Abu_2252			FALSE	0.347	21.000	0.000	NA		NA
3543063	3543064	Abu_2252	Abu_2253			TRUE	0.494	15.000	0.000	NA		NA
3543065	3543066	Abu_2254	Abu_2255	flaA	flaB	TRUE	0.605	160.000	0.000	0.001	Y	NA
3543067	3543068	Abu_2256	Abu_2257		pyrG	FALSE	0.097	114.000	0.000	1.000	N	NA
3543068	3543069	Abu_2257	Abu_2258	pyrG	recJ	TRUE	0.970	0.000	0.026	1.000	N	NA
3543070	3543071	Abu_2259	Abu_2260			TRUE	0.815	5.000	0.000	NA		NA
3543072	3543073	Abu_2261	Abu_2262	thiJ	dnaE	FALSE	0.074	74.000	0.000	NA		NA
3543073	3543074	Abu_2262	Abu_2263	dnaE	surE	TRUE	0.824	-25.000	0.000	1.000		NA
3543074	3543075	Abu_2263	Abu_2264	surE		FALSE	0.419	18.000	0.000	NA		NA
3543076	3543077	Abu_2265	Abu_2266		moaC	TRUE	0.985	3.000	0.057	NA		NA
3543079	3543080	Abu_2268	Abu_2269			FALSE	0.087	159.000	0.000	NA		NA
3543080	3543081	Abu_2269	Abu_2270			FALSE	0.104	392.000	0.000	NA		NA
3543081	3543082	Abu_2270	Abu_2271			FALSE	0.094	55.000	0.000	NA		NA
3543082	3543083	Abu_2271	Abu_2272			FALSE	0.076	106.000	0.000	NA		NA
3543084	3543085	Abu_2273	Abu_2274			TRUE	0.762	34.000	0.072	NA		NA
3543087	3543088	Abu_2276	Abu_2277	secG	frr	FALSE	0.352	61.000	0.017	1.000	N	NA
3543088	3543089	Abu_2277	Abu_2278	frr	pyrE	TRUE	0.968	-3.000	0.026	1.000	N	NA
3543089	3543090	Abu_2278	Abu_2279	pyrE		TRUE	0.965	0.000	0.025	NA		NA
3543090	3543091	Abu_2279	Abu_2280			TRUE	0.963	0.000	0.022	NA		NA
3543092	3543093	Abu_2281	Abu_2282			TRUE	0.661	11.000	0.000	NA		NA
3543093	3543094	Abu_2282	Abu_2283			FALSE	0.074	84.000	0.000	NA		NA
3543094	3543095	Abu_2283	Abu_2284			FALSE	0.074	67.000	0.000	NA		NA
3543097	3543098	Abu_2286	Abu_2287			TRUE	0.560	25.000	0.000	NA	Y	NA
3543100	3543101	Abu_2289	Abu_2290			FALSE	0.083	162.000	0.000	NA	N	NA
3543101	3543102	Abu_2290	Abu_2291			FALSE	0.093	97.000	0.000	1.000	N	NA
3543102	3543103	Abu_2291	Abu_2292		moeB	FALSE	0.115	194.000	0.000	1.000	N	NA
3543104	3543105	Abu_2293	Abu_2294			TRUE	0.994	1.000	0.667	NA		NA
3543105	3543106	Abu_2294	Abu_2295			TRUE	0.995	3.000	0.734	NA		NA
3543107	3543108	Abu_2296	Abu_2297	cysA	cysW	TRUE	0.972	16.000	0.587	1.000	N	NA
3543108	3543109	Abu_2297	Abu_2298	cysW	cysT	TRUE	0.998	-3.000	0.935	0.001	N	NA
3543109	3543110	Abu_2298	Abu_2299	cysT	cysK2	FALSE	0.114	192.000	0.000	1.000	N	NA
3543110	3543111	Abu_2299	Abu_2300	cysK2		TRUE	0.531	16.000	0.000	1.000	N	NA
3543111	3543112	Abu_2300	Abu_2301			FALSE	0.101	107.000	0.000	1.000		NA
3543112	3543113	Abu_2301	Abu_2302		sbp	FALSE	0.253	32.000	0.000	1.000		NA
3543113	3543114	Abu_2302	Abu_2303	sbp		FALSE	0.093	275.000	0.000	NA	N	NA
3543114	3543115	Abu_2303	Abu_2304			FALSE	0.074	92.000	0.000	NA		NA
3543115	3543116	Abu_2304	Abu_2305			TRUE	0.998	-13.000	0.667	0.002		NA
3543116	3543117	Abu_2305	Abu_2306			TRUE	0.991	-3.000	0.333	NA		NA
3543117	3543118	Abu_2306	Abu_2307			TRUE	0.971	2.000	0.021	NA		NA
3543118	3543119	Abu_2307	Abu_2308		typA	FALSE	0.095	219.000	0.000	NA		NA
3543120	3543121	Abu_2309	Abu_2310			TRUE	0.988	11.000	0.844	NA		NA
3543122	3543123	Abu_2311	Abu_2312			TRUE	0.722	10.000	0.000	NA		NA
3543123	3543124	Abu_2312	Abu_2313			TRUE	0.791	-3.000	0.000	NA		NA
3543124	3543125	Abu_2313	Abu_2314			FALSE	0.109	50.000	0.000	NA		NA
3543125	3543126	Abu_2314	Abu_2315			FALSE	0.216	99.000	0.000	NA	Y	NA
3543126	3543127	Abu_2315	Abu_2316			TRUE	0.765	-10.000	0.000	NA	N	NA
3543128	3543129	Abu_2317	Abu_2318			FALSE	0.100	77.000	0.000	1.000		NA
3543129	3543130	Abu_2318	Abu_2319			TRUE	0.977	-22.000	0.045	1.000		NA
3543130	3543131	Abu_2319	Abu_2320			FALSE	0.098	96.000	0.000	1.000		NA
3543131	3543132	Abu_2320	Abu_2321			TRUE	0.997	10.000	0.686	0.015		NA
3543132	3543133	Abu_2321	Abu_2322			TRUE	0.994	10.000	0.286	0.047		NA
3543133	3543134	Abu_2322	Abu_2323			FALSE	0.371	20.000	0.000	NA		NA
3543134	3543135	Abu_2323	Abu_2324			TRUE	0.774	-40.000	0.000	NA		NA
3543135	3543136	Abu_2324	Abu_2325			TRUE	0.992	-7.000	0.429	1.000		NA
3543136	3543137	Abu_2325	Abu_2326			TRUE	0.998	2.000	0.571	1.000	Y	NA
3543138	3543139	Abu_2327	Abu_2328			FALSE	0.095	64.000	0.000	1.000	N	NA
3543139	3543140	Abu_2328	Abu_2329			TRUE	0.665	12.000	0.000	1.000	N	NA
3543141	3543142	Abu_2330	Abu_2331	thyX	glsA	TRUE	0.845	0.000	0.000	1.000		NA
3543142	3543143	Abu_2331	Abu_2332	glsA		FALSE	0.394	19.000	0.000	NA		NA
3543143	3543144	Abu_2332	Abu_2333			FALSE	0.083	59.000	0.000	NA		NA
3543145	3543146	Abu_2334	Abu_2335	purN	ruvC	FALSE	0.331	48.000	0.002	1.000	N	NA