MicrobesOnline Operon Predictions for Sinorhizobium medicae WSM419

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7036430 7036431 Smed_0001 Smed_0002 rpsT dnaA FALSE 0.004 1004.000 0.000 1.000 N NA
 7036431 7036432 Smed_0002 Smed_0003 dnaA   FALSE 0.024 235.000 0.002 NA   NA
 7036432 7036433 Smed_0003 Smed_0004     TRUE 0.993 -3.000 0.867 NA   NA
 7036433 7036434 Smed_0004 Smed_0005     FALSE 0.058 287.000 0.152 NA   NA
 7036434 7036435 Smed_0005 Smed_0006     TRUE 0.693 24.000 0.030 NA   NA
 7036436 7036437 Smed_0007 Smed_0008     TRUE 0.826 48.000 0.218 1.000 N NA
 7036437 7036438 Smed_0008 Smed_0009     TRUE 0.566 31.000 0.013 NA N NA
 7036438 7036439 Smed_0009 Smed_0010   rph TRUE 0.615 29.000 0.019 NA N NA
 7036440 7036441 Smed_0011 Smed_0012 hrcA   FALSE 0.255 159.000 0.120 NA N NA
 7036442 7036443 Smed_0013 Smed_0014     FALSE 0.406 174.000 0.353 NA N NA
 7036443 7036444 Smed_0014 Smed_0015     FALSE 0.012 255.000 0.000 NA N NA
 7036444 7036445 Smed_0015 Smed_0016     FALSE 0.046 189.000 0.000 1.000   NA
 7036445 7036446 Smed_0016 Smed_0017     TRUE 0.974 13.000 0.543 NA   NA
 7036446 7036447 Smed_0017 Smed_0018     TRUE 0.809 32.000 0.144 NA   NA
 7036448 7036449 Smed_0019 Smed_0020     FALSE 0.171 78.000 0.000 NA   NA
 7036449 7036450 Smed_0020 Smed_0021   ihfB TRUE 0.535 103.000 0.142 1.000 N NA
 7036450 7036451 Smed_0021 Smed_0022 ihfB   FALSE 0.152 180.000 0.085 NA   NA
 7036453 7036454 Smed_0024 Smed_0025     TRUE 0.845 -3.000 0.011 NA   NA
 7036454 7036455 Smed_0025 Smed_0026     TRUE 0.942 0.000 0.104 1.000 N NA
 7036455 7036456 Smed_0026 Smed_0027     FALSE 0.280 75.000 0.000 1.000 N NA
 7036456 7036457 Smed_0027 Smed_0028     FALSE 0.211 117.000 0.026 NA   NA
 7036459 7036460 Smed_0030 Smed_0031     FALSE 0.076 201.000 0.021 1.000 N NA
 7036460 7036461 Smed_0031 Smed_0032     TRUE 0.943 -3.000 0.081 1.000   NA
 7036461 7036462 Smed_0032 Smed_0033     TRUE 0.839 -3.000 0.008 NA   NA
 7036462 7036463 Smed_0033 Smed_0034     FALSE 0.266 91.000 0.016 NA   NA
 7036463 7036464 Smed_0034 Smed_0035     TRUE 0.590 53.000 0.042 1.000   NA
 7036464 7036465 Smed_0035 Smed_0036     FALSE 0.173 204.000 0.151 1.000   NA
 7036465 7036466 Smed_0036 Smed_0037     FALSE 0.288 220.000 0.061 1.000 Y NA
 7036466 7036467 Smed_0037 Smed_0038     TRUE 0.725 76.000 0.209 1.000   NA
 7036467 7036468 Smed_0038 Smed_0039     TRUE 0.755 40.000 0.022 0.098   NA
 7036468 7036469 Smed_0039 Smed_0040     FALSE 0.291 114.000 0.030 1.000 N NA
 7036469 7036470 Smed_0040 Smed_0041     TRUE 0.959 5.000 0.220 1.000 N NA
 7036470 7036471 Smed_0041 Smed_0042     TRUE 0.863 64.000 0.457 NA   NA
 7036471 7036472 Smed_0042 Smed_0043     TRUE 0.935 13.000 0.222 NA   NA
 7036472 7036473 Smed_0043 Smed_0044   lnt FALSE 0.160 218.000 0.213 NA   NA
 7036473 7036474 Smed_0044 Smed_0045 lnt   FALSE 0.499 138.000 0.231 1.000 N NA
 7036474 7036475 Smed_0045 Smed_0046     FALSE 0.033 394.000 0.113 1.000 N NA
 7036475 7036476 Smed_0046 Smed_0047   trmB FALSE 0.122 217.000 0.112 1.000   NA
 7036477 7036478 Smed_0048 Smed_0049     TRUE 0.950 51.000 0.955 NA   NA
 7036480 7036481 Smed_0051 Smed_0052     FALSE 0.020 252.000 0.000 1.000 N NA
 7036481 7036482 Smed_0052 Smed_0053     FALSE 0.255 101.000 0.024 NA   NA
 7036483 7036484 Smed_0054 Smed_0055 def fmt TRUE 0.902 76.000 0.050 0.016 Y NA
 7036484 7036485 Smed_0055 Smed_0056 fmt truA TRUE 0.982 0.000 0.069 1.000 Y NA
 7036486 7036487 Smed_0057 Smed_0058     TRUE 0.949 0.000 0.125 1.000 N NA
 7036489 7036490 Smed_0060 Smed_0061     TRUE 0.924 -13.000 0.050 NA   NA
 7036490 7036491 Smed_0061 Smed_0062     FALSE 0.280 96.000 0.005 1.000 N NA
 7036491 7036492 Smed_0062 Smed_0063     TRUE 0.633 128.000 0.361 1.000 N NA
 7036492 7036493 Smed_0063 Smed_0064     TRUE 0.816 67.000 0.298 1.000 N NA
 7036495 7036496 Smed_0066 Smed_0067     FALSE 0.112 103.000 0.000 NA   NA
 7036496 7036497 Smed_0067 Smed_0068     FALSE 0.151 153.000 0.017 1.000   NA
 7036497 7036498 Smed_0068 Smed_0069   dapD TRUE 0.840 3.000 0.009 1.000   NA
 7036501 7036502 Smed_0072 Smed_0073     FALSE 0.176 76.000 0.000 NA   NA
 7036502 7036503 Smed_0073 Smed_0074     TRUE 0.825 38.000 0.160 1.000 N NA
 7036506 7036507 Smed_0077 Smed_0078   engB FALSE 0.103 143.000 0.002 NA   NA
 7036507 7036508 Smed_0078 Smed_0079 engB   FALSE 0.457 148.000 0.082 0.049   NA
 7036508 7036509 Smed_0079 Smed_0080   rnpA TRUE 0.953 -3.000 0.105 1.000 N NA
 7036509 7036510 Smed_0080 Smed_0081 rnpA rpmH TRUE 0.977 22.000 0.787 1.000   NA
 7036511 7036512 Smed_0082 Smed_0083     FALSE 0.008 287.000 0.000 NA   NA
 7036512 7036513 Smed_0083 Smed_0084     TRUE 0.918 26.000 0.320 NA   NA
 7036513 7036514 Smed_0084 Smed_0085     TRUE 0.935 22.000 0.287 1.000 N NA
 7036514 7036515 Smed_0085 Smed_R0001     FALSE 0.070 133.000 0.000 NA   NA
 7036515 7036516 Smed_R0001 Smed_0086     FALSE 0.003 487.000 0.000 NA   NA
 7036516 7036517 Smed_0086 Smed_0087     TRUE 0.666 2.000 0.000 NA   NA
 7036517 7036518 Smed_0087 Smed_0088     TRUE 0.543 14.000 0.000 NA   NA
 7036519 7036520 Smed_0089 Smed_0090     FALSE 0.006 324.000 0.000 NA   NA
 7036520 7036521 Smed_0090 Smed_0091     FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 7036521 7036522 Smed_0091 Smed_0092     FALSE 0.367 74.000 0.005 1.000   NA
 7036522 7036523 Smed_0092 Smed_0093     FALSE 0.105 178.000 0.038 NA   NA
 7036523 7036524 Smed_0093 Smed_0094     FALSE 0.491 59.000 0.038 NA   NA
 7036524 7036525 Smed_0094 Smed_0095     FALSE 0.154 110.000 0.000 1.000   NA
 7036527 7036528 Smed_0097 Smed_0098     TRUE 0.794 89.000 0.062 1.000 Y NA
 7036530 7036531 Smed_0100 Smed_0101     TRUE 0.986 5.000 0.188 1.000 Y NA
 7036532 7036533 Smed_0102 Smed_0103     FALSE 0.508 277.000 0.676 NA Y NA
 7036533 7036534 Smed_0103 Smed_0104     TRUE 0.991 0.000 0.797 1.000   NA
 7036534 7036535 Smed_0104 Smed_0105   frcK TRUE 0.955 -3.000 0.121 1.000   NA
 7036535 7036536 Smed_0105 Smed_0106 frcK   FALSE 0.076 191.000 0.009 1.000 N NA
 7036536 7036537 Smed_0106 Smed_0107   pyrE TRUE 0.849 74.000 0.072 1.000 Y NA
 7036537 7036538 Smed_0107 Smed_0108 pyrE   TRUE 0.619 48.000 0.039 1.000 N NA
 7036539 7036540 Smed_0109 Smed_0110 pgi   FALSE 0.085 192.000 0.018 1.000 N NA
 7036541 7036542 Smed_0111 Smed_0112     FALSE 0.125 96.000 0.000 NA   NA
 7036542 7036543 Smed_0112 Smed_0113     TRUE 0.992 -3.000 0.246 1.000 Y NA
 7036543 7036544 Smed_0113 Smed_0114     TRUE 0.984 8.000 0.595 1.000   NA
 7036545 7036546 Smed_R0002 Smed_0115     FALSE 0.173 77.000 0.000 NA   NA
 7036549 7036550 Smed_0118 Smed_0119     FALSE 0.103 193.000 0.056 NA N NA
 7036550 7036551 Smed_0119 Smed_0120     TRUE 0.788 95.000 0.107 NA Y NA
 7036551 7036552 Smed_0120 Smed_0121     TRUE 0.998 -3.000 0.485 0.001 Y NA
 7036552 7036553 Smed_0121 Smed_0122     TRUE 0.995 14.000 0.402 0.001 Y NA
 7036553 7036554 Smed_0122 Smed_0123     TRUE 0.859 89.000 0.203 NA Y NA
 7036554 7036555 Smed_0123 Smed_0124     FALSE 0.522 92.000 0.128 NA N NA
 7036556 7036557 Smed_0125 Smed_0126     FALSE 0.181 75.000 0.000 NA   NA
 7036558 7036559 Smed_0127 Smed_0128 argD   TRUE 0.908 41.000 0.058 1.000 Y NA
 7036559 7036560 Smed_0128 Smed_0129   hslO FALSE 0.021 409.000 0.052 1.000 N NA
 7036561 7036562 Smed_0130 Smed_0131 apaG   FALSE 0.028 195.000 0.000 NA N NA
 7036565 7036566 Smed_0134 Smed_R0003     FALSE 0.251 51.000 0.000 NA   NA
 7036566 7036567 Smed_R0003 Smed_0135     FALSE 0.084 121.000 0.000 NA   NA
 7036568 7036569 Smed_0136 Smed_0137     FALSE 0.447 61.000 0.029 NA   NA
 7036569 7036570 Smed_0137 Smed_0138     TRUE 0.658 66.000 0.143 NA   NA
 7036570 7036571 Smed_0138 Smed_0139     TRUE 0.950 1.000 0.185 NA   NA
 7036575 7036576 Smed_0143 Smed_0144     FALSE 0.065 140.000 0.000 NA   NA
 7036576 7036577 Smed_0144 Smed_0145     TRUE 0.989 22.000 0.562 1.000 Y NA
 7036577 7036578 Smed_0145 Smed_0146     TRUE 0.859 104.000 0.247 1.000 Y NA
 7036579 7036580 Smed_0147 Smed_0148     FALSE 0.010 319.000 0.000 1.000   NA
 7036580 7036581 Smed_0148 Smed_0149     TRUE 0.967 0.000 0.274 NA   NA
 7036581 7036582 Smed_0149 Smed_0150     FALSE 0.020 211.000 0.000 NA   NA
 7036582 7036583 Smed_0150 Smed_0151     FALSE 0.105 107.000 0.000 NA   NA
 7036584 7036585 Smed_0152 Smed_0153     TRUE 0.752 110.000 0.460 1.000   NA
 7036586 7036587 Smed_0154 Smed_0155     TRUE 0.889 29.000 0.262 NA   NA
 7036588 7036589 Smed_0156 Smed_0157     FALSE 0.497 106.000 0.162 NA   NA
 7036590 7036591 Smed_0158 Smed_0159     TRUE 0.963 3.000 0.275 NA   NA
 7036591 7036592 Smed_0159 Smed_0160     TRUE 0.529 46.000 0.030 NA   NA
 7036593 7036594 Smed_0161 Smed_0162     TRUE 0.942 -3.000 0.108 NA   NA
 7036595 7036596 Smed_0163 Smed_0164     TRUE 0.569 136.000 0.367 NA   NA
 7036598 7036599 Smed_0166 Smed_0167 mscL   FALSE 0.197 128.000 0.012 1.000 N NA
 7036599 7036600 Smed_0167 Smed_0168     FALSE 0.205 171.000 0.080 1.000 N NA
 7036601 7036602 Smed_0169 Smed_0170     FALSE 0.029 222.000 0.000 1.000 N NA
 7036602 7036603 Smed_0170 Smed_0171     TRUE 0.992 -10.000 0.041 0.058 Y NA
 7036603 7036604 Smed_0171 Smed_0172     FALSE 0.109 311.000 0.333 1.000   NA
 7036604 7036605 Smed_0172 Smed_0173     TRUE 0.957 2.000 0.188 1.000   NA
 7036605 7036606 Smed_0173 Smed_0174     TRUE 0.999 -3.000 0.938 0.011 Y NA
 7036606 7036607 Smed_0174 Smed_0175     TRUE 0.958 106.000 0.933 1.000 Y NA
 7036607 7036608 Smed_0175 Smed_0176     TRUE 0.990 35.000 0.933 1.000 Y NA
 7036609 7036610 Smed_0177 Smed_0178     TRUE 0.808 13.000 0.016 1.000 N NA
 7036610 7036611 Smed_0178 Smed_0179     TRUE 0.997 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 7036611 7036612 Smed_0179 Smed_0180     FALSE 0.213 181.000 0.154 NA   NA
 7036612 7036613 Smed_0180 Smed_0181     FALSE 0.413 96.000 0.077 NA   NA
 7036613 7036614 Smed_0181 Smed_0182     FALSE 0.003 518.000 0.000 NA   NA
 7036616 7036617 Smed_0184 Smed_0185     TRUE 0.938 -3.000 0.062 1.000 N NA
 7036617 7036618 Smed_0185 Smed_0186     TRUE 0.779 24.000 0.062 NA N NA
 7036618 7036619 Smed_0186 Smed_0187     TRUE 0.918 106.000 0.556 NA Y NA
 7036619 7036620 Smed_0187 Smed_0188     TRUE 0.997 -3.000 0.667 NA Y NA
 7036620 7036621 Smed_0188 Smed_0189     TRUE 0.977 24.000 0.333 NA Y NA
 7036621 7036622 Smed_0189 Smed_0190     TRUE 0.876 -3.000 0.025 NA   NA
 7036622 7036623 Smed_0190 Smed_0191     FALSE 0.047 160.000 0.000 NA   NA
 7036623 7036624 Smed_0191 Smed_0192     FALSE 0.078 132.000 0.000 NA N NA
 7036625 7036626 Smed_0193 Smed_0194     TRUE 0.952 16.000 0.028 1.000 Y NA
 7036626 7036627 Smed_0194 Smed_0195     FALSE 0.144 211.000 0.039 0.097   NA
 7036627 7036628 Smed_0195 Smed_0196     TRUE 0.884 40.000 0.300 1.000   NA
 7036628 7036629 Smed_0196 Smed_0197     TRUE 0.996 -3.000 0.714 0.016 N NA
 7036630 7036631 Smed_0198 Smed_0199     FALSE 0.061 175.000 0.000 1.000 N NA
 7036631 7036632 Smed_0199 Smed_0200     FALSE 0.386 105.000 0.053 1.000 N NA
 7036632 7036633 Smed_0200 Smed_0201     FALSE 0.067 137.000 0.000 NA   NA
 7036635 7036636 Smed_0203 Smed_0204     FALSE 0.020 209.000 0.000 NA   NA
 7036638 7036639 Smed_0205 Smed_0206     FALSE 0.125 159.000 0.028 NA   NA
 7036639 7036640 Smed_0206 Smed_0207     TRUE 0.532 91.000 0.138 NA   NA
 7036640 7036641 Smed_0207 Smed_0208   hisD TRUE 0.651 52.000 0.096 NA   NA
 7036641 7036642 Smed_0208 Smed_0209 hisD   TRUE 0.956 -3.000 0.157 NA   NA
 7036642 7036643 Smed_0209 Smed_0210     TRUE 0.981 14.000 0.768 NA   NA
 7036643 7036644 Smed_0210 Smed_0211     TRUE 0.609 113.000 0.293 NA N NA
 7036644 7036645 Smed_0211 Smed_0212     TRUE 0.770 54.000 0.207 NA N NA
 7036645 7036646 Smed_0212 Smed_0213     TRUE 0.913 5.000 0.102 NA   NA
 7036646 7036647 Smed_0213 Smed_R0005     FALSE 0.017 220.000 0.000 NA   NA
 7036649 7036650 Smed_0215 Smed_0216     TRUE 0.759 -13.000 0.000 NA   NA
 7036650 7036651 Smed_0216 Smed_0217     FALSE 0.021 208.000 0.000 NA   NA
 7036652 7036653 Smed_0218 Smed_0219     FALSE 0.055 151.000 0.000 NA   NA
 7036653 7036654 Smed_0219 Smed_0220     FALSE 0.303 75.000 0.008 NA   NA
 7036654 7036655 Smed_0220 Smed_0221     TRUE 0.878 63.000 0.500 NA   NA
 7036655 7036656 Smed_0221 Smed_0222     FALSE 0.052 154.000 0.000 NA   NA
 7036656 7036657 Smed_0222 Smed_0223     TRUE 0.901 14.000 0.147 NA   NA
 7036658 7036659 Smed_0224 Smed_0225     TRUE 0.862 113.000 0.357 NA Y NA
 7036659 7036660 Smed_0225 Smed_0226     FALSE 0.346 299.000 0.446 NA Y NA
 7036660 7036661 Smed_0226 Smed_0227     TRUE 0.999 -3.000 0.794 0.016 Y NA
 7036661 7036662 Smed_0227 Smed_0228     TRUE 0.998 0.000 0.515 0.016 Y NA
 7036662 7036663 Smed_0228 Smed_0229     TRUE 0.938 11.000 0.168 1.000   NA
 7036663 7036664 Smed_0229 Smed_0230     TRUE 0.961 -3.000 0.147 1.000   NA
 7036666 7036667 Smed_0232 Smed_0233     TRUE 0.884 26.000 0.217 NA   NA
 7036667 7036668 Smed_0233 Smed_0234     TRUE 0.981 4.000 0.525 NA   NA
 7036668 7036669 Smed_0234 Smed_0235     TRUE 0.992 20.000 0.711 1.000 Y NA
 7036669 7036670 Smed_0235 Smed_0236     TRUE 0.992 -3.000 0.044 0.005 Y NA
 7036670 7036671 Smed_0236 Smed_0237     TRUE 0.981 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 7036671 7036672 Smed_0237 Smed_0238     TRUE 0.995 -3.000 0.439 1.000 Y NA
 7036672 7036673 Smed_0238 Smed_0239     TRUE 0.995 0.000 0.258 0.019 Y NA
 7036673 7036674 Smed_0239 Smed_0240     TRUE 0.994 -3.000 0.320 1.000 Y NA
 7036674 7036675 Smed_0240 Smed_0241     TRUE 0.754 55.000 0.200 NA   NA
 7036675 7036676 Smed_0241 Smed_0242   fliF FALSE 0.094 244.000 0.158 NA   NA
 7036676 7036677 Smed_0242 Smed_0243 fliF   FALSE 0.004 821.000 0.000 1.000 N NA
 7036677 7036678 Smed_0243 Smed_0244     TRUE 0.997 11.000 0.667 0.032 Y NA
 7036679 7036680 Smed_0245 Smed_0246   flhB TRUE 0.984 3.000 0.595 NA   NA
 7036680 7036681 Smed_0246 Smed_0247 flhB fliG TRUE 0.809 173.000 0.571 1.000 Y NA
 7036681 7036682 Smed_0247 Smed_0248 fliG   TRUE 0.984 88.000 0.875 0.003 Y NA
 7036682 7036683 Smed_0248 Smed_0249     TRUE 0.986 20.000 0.485 NA Y NA
 7036683 7036684 Smed_0249 Smed_0250     TRUE 0.997 2.000 0.879 NA Y NA
 7036685 7036686 Smed_0251 Smed_0252   flgF TRUE 0.965 2.000 0.279 NA   NA
 7036686 7036687 Smed_0252 Smed_0253 flgF fliI TRUE 0.977 43.000 0.529 1.000 Y NA
 7036687 7036688 Smed_0253 Smed_0254 fliI   TRUE 0.963 3.000 0.275 NA   NA
 7036688 7036689 Smed_0254 Smed_0255   flgB FALSE 0.223 126.000 0.040 NA   NA
 7036689 7036690 Smed_0255 Smed_0256 flgB flgC TRUE 0.998 6.000 0.804 0.002 Y NA
 7036690 7036691 Smed_0256 Smed_0257 flgC fliE TRUE 0.993 0.000 0.115 0.002 Y NA
 7036691 7036692 Smed_0257 Smed_0258 fliE flgG TRUE 0.998 12.000 0.771 0.003 Y NA
 7036692 7036693 Smed_0258 Smed_0259 flgG flgA TRUE 0.977 19.000 0.252 NA Y NA
 7036693 7036694 Smed_0259 Smed_0260 flgA flgI TRUE 0.992 -3.000 0.261 NA Y NA
 7036694 7036695 Smed_0260 Smed_0261 flgI   TRUE 0.987 -3.000 0.531 NA   NA
 7036695 7036696 Smed_0261 Smed_0262   flgH TRUE 0.988 -3.000 0.592 NA   NA
 7036696 7036697 Smed_0262 Smed_0263 flgH   TRUE 0.987 17.000 0.576 0.005   NA
 7036697 7036698 Smed_0263 Smed_0264   fliP TRUE 0.984 8.000 0.605 1.000   NA
 7036698 7036699 Smed_0264 Smed_0265 fliP   FALSE 0.105 271.000 0.000 1.000 Y NA
 7036699 7036700 Smed_0265 Smed_0266     FALSE 0.151 338.000 0.000 0.001 Y NA
 7036700 7036701 Smed_0266 Smed_0267     FALSE 0.242 264.000 0.000 0.001 Y NA
 7036701 7036702 Smed_0267 Smed_0268     FALSE 0.181 301.000 0.000 0.001 Y NA
 7036702 7036703 Smed_0268 Smed_0269     FALSE 0.300 41.000 0.000 NA   NA
 7036703 7036704 Smed_0269 Smed_0270     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7036704 7036705 Smed_0270 Smed_0271   motB TRUE 0.982 -3.000 0.421 NA   NA
 7036705 7036706 Smed_0271 Smed_0272 motB   TRUE 0.987 4.000 0.737 NA   NA
 7036706 7036707 Smed_0272 Smed_0273     TRUE 0.980 -3.000 0.379 NA   NA
 7036707 7036708 Smed_0273 Smed_0274     TRUE 0.974 -22.000 0.229 NA   NA
 7036708 7036709 Smed_0274 Smed_0275     FALSE 0.010 272.000 0.000 NA N NA
 7036709 7036710 Smed_0275 Smed_0276   flgE TRUE 0.734 90.000 0.294 1.000 N NA
 7036710 7036711 Smed_0276 Smed_0277 flgE flgK TRUE 0.992 23.000 0.400 0.003 Y NA
 7036711 7036712 Smed_0277 Smed_0278 flgK flgL TRUE 0.998 3.000 0.667 0.003 Y NA
 7036712 7036713 Smed_0278 Smed_0279 flgL flaF TRUE 0.915 38.000 0.086 NA Y NA
 7036713 7036714 Smed_0279 Smed_0280 flaF flbT TRUE 0.997 -3.000 0.829 NA Y NA
 7036714 7036715 Smed_0280 Smed_0281 flbT flgD TRUE 0.996 -9.000 0.528 NA Y NA
 7036715 7036716 Smed_0281 Smed_0282 flgD fliQ TRUE 0.993 7.000 0.509 NA Y NA
 7036716 7036717 Smed_0282 Smed_0283 fliQ flhA TRUE 0.910 142.000 0.349 0.001 Y NA
 7036717 7036718 Smed_0283 Smed_0284 flhA fliR TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.001 Y NA
 7036718 7036719 Smed_0284 Smed_0285 fliR   TRUE 0.969 5.000 0.350 NA   NA
 7036719 7036720 Smed_0285 Smed_0286     TRUE 0.708 99.000 0.360 NA   NA
 7036720 7036721 Smed_0286 Smed_0287     FALSE 0.492 166.000 0.440 NA   NA
 7036721 7036722 Smed_0287 Smed_0288     TRUE 0.980 0.000 0.438 NA   NA
 7036726 7036727 Smed_0292 Smed_0293     TRUE 0.959 80.000 0.670 NA Y NA
 7036727 7036728 Smed_0293 Smed_0294     TRUE 0.996 2.000 0.693 NA Y NA
 7036728 7036729 Smed_0294 Smed_0295     TRUE 0.975 29.000 0.387 NA Y NA
 7036729 7036730 Smed_0295 Smed_0296     TRUE 0.992 20.000 0.697 1.000 Y NA
 7036730 7036731 Smed_0296 Smed_0297     TRUE 0.714 88.000 0.303 NA   NA
 7036732 7036733 Smed_0298 Smed_0299     TRUE 0.849 101.000 0.202 1.000 Y NA
 7036733 7036734 Smed_0299 Smed_0300     TRUE 0.962 9.000 0.007 1.000 Y NA
 7036734 7036735 Smed_0300 Smed_0301     FALSE 0.079 206.000 0.029 1.000 N NA
 7036735 7036736 Smed_0301 Smed_0302     TRUE 0.998 -7.000 0.706 1.000 Y NA
 7036737 7036738 Smed_0303 Smed_0304     FALSE 0.009 272.000 0.000 NA   NA
 7036738 7036739 Smed_0304 Smed_0305     FALSE 0.007 304.000 0.000 NA   NA
 7036739 7036740 Smed_0305 Smed_0306     FALSE 0.009 349.000 0.000 1.000 N NA
 7036741 7036742 Smed_0307 Smed_0308     FALSE 0.309 111.000 0.056 NA   NA
 7036743 7036744 Smed_0309 Smed_0310     FALSE 0.278 173.000 0.164 1.000   NA
 7036744 7036745 Smed_0310 Smed_0311     TRUE 0.846 156.000 0.541 1.000 Y NA
 7036745 7036746 Smed_0311 Smed_0312     TRUE 0.994 5.000 0.545 NA Y NA
 7036746 7036747 Smed_0312 Smed_0313     TRUE 0.996 4.000 0.758 NA Y NA
 7036749 7036750 Smed_0315 Smed_0316     FALSE 0.045 162.000 0.000 NA   NA
 7036751 7036752 Smed_0317 Smed_0318     FALSE 0.060 258.000 0.095 NA N NA
 7036753 7036754 Smed_0319 Smed_R0006     FALSE 0.045 162.000 0.000 NA   NA
 7036756 7036757 Smed_0321 Smed_0322     TRUE 0.974 11.000 0.417 1.000 N NA
 7036759 7036760 Smed_0324 Smed_0325     FALSE 0.046 210.000 0.018 NA   NA
 7036760 7036761 Smed_0325 Smed_0326     TRUE 0.991 -10.000 0.637 NA   NA
 7036763 7036764 Smed_0328 Smed_0329 rirA   FALSE 0.004 435.000 0.000 NA N NA
 7036764 7036765 Smed_0329 Smed_0330     TRUE 0.748 105.000 0.097 NA Y NA
 7036765 7036766 Smed_0330 Smed_0331     TRUE 0.995 11.000 0.779 NA Y NA
 7036766 7036767 Smed_0331 Smed_0332     TRUE 0.995 2.000 0.560 NA Y NA
 7036767 7036768 Smed_0332 Smed_0333     TRUE 0.994 -3.000 0.500 0.007   NA
 7036768 7036769 Smed_0333 Smed_0334     FALSE 0.391 67.000 0.022 NA   NA
 7036769 7036770 Smed_0334 Smed_0335     FALSE 0.190 152.000 0.056 NA   NA
 7036770 7036771 Smed_0335 Smed_0336     FALSE 0.323 102.000 0.047 NA   NA
 7036775 7036776 Smed_0340 Smed_0341     FALSE 0.090 116.000 0.000 NA   NA
 7036776 7036777 Smed_0341 Smed_0342     FALSE 0.028 191.000 0.000 NA   NA
 7036778 7036779 Smed_0343 Smed_0344     TRUE 0.983 30.000 0.562 NA Y NA
 7036779 7036780 Smed_0344 Smed_0345     TRUE 0.955 -3.000 0.121 1.000   NA
 7036780 7036781 Smed_0345 Smed_0346     FALSE 0.390 45.000 0.000 1.000   NA
 7036783 7036784 Smed_0348 Smed_0349     FALSE 0.347 112.000 0.080 NA   NA
 7036785 7036786 Smed_0350 Smed_0351     FALSE 0.323 37.000 0.000 NA   NA
 7036787 7036788 Smed_0352 Smed_0353     TRUE 0.962 7.000 0.300 NA   NA
 7036789 7036790 Smed_0354 Smed_0355     TRUE 0.668 36.000 0.055 NA   NA
 7036790 7036791 Smed_0355 Smed_0356     FALSE 0.009 271.000 0.000 NA   NA
 7036793 7036794 Smed_0358 Smed_0359     TRUE 0.948 4.000 0.200 NA   NA
 7036794 7036795 Smed_0359 Smed_0360     FALSE 0.006 310.000 0.000 NA   NA
 7036795 7036796 Smed_0360 Smed_0361     FALSE 0.004 391.000 0.000 NA   NA
 7036796 7036797 Smed_0361 Smed_0362     TRUE 0.932 56.000 0.800 NA   NA
 7036797 7036798 Smed_0362 Smed_0363     TRUE 0.985 11.000 0.800 NA   NA
 7036798 7036799 Smed_0363 Smed_0364     FALSE 0.495 150.000 0.333 NA   NA
 7036799 7036800 Smed_0364 Smed_0365   acnA TRUE 0.698 134.000 0.500 1.000 N NA
 7036802 7036803 Smed_0367 Smed_0368     TRUE 0.980 0.000 0.440 NA   NA
 7036805 7036806 Smed_0370 Smed_0371     FALSE 0.242 206.000 0.300 NA   NA
 7036808 7036809 Smed_0372 Smed_0373     TRUE 0.977 -3.000 0.316 NA N NA
 7036809 7036810 Smed_0373 Smed_0374     TRUE 0.852 4.000 0.035 NA   NA
 7036814 7036815 Smed_0378 Smed_0379     FALSE 0.065 191.000 0.002 1.000   NA
 7036815 7036816 Smed_0379 Smed_0380     FALSE 0.276 78.000 0.005 NA   NA
 7036816 7036817 Smed_0380 Smed_0381     FALSE 0.147 86.000 0.000 NA   NA
 7036822 7036823 Smed_0386 Smed_0387     FALSE 0.336 110.000 0.066 NA   NA
 7036823 7036824 Smed_0387 Smed_0388     FALSE 0.208 160.000 0.087 NA   NA
 7036824 7036825 Smed_0388 Smed_0389     TRUE 0.694 19.000 0.019 NA   NA
 7036825 7036826 Smed_0389 Smed_0390     FALSE 0.115 203.000 0.069 1.000   NA
 7036826 7036827 Smed_0390 Smed_0391     FALSE 0.014 274.000 0.000 1.000   NA
 7036830 7036831 Smed_0394 Smed_0395     TRUE 0.996 -3.000 0.266 0.014 Y NA
 7036831 7036832 Smed_0395 Smed_0396     TRUE 0.877 125.000 0.227 0.059 Y NA
 7036833 7036834 Smed_0397 Smed_0398     FALSE 0.202 190.000 0.172 NA   NA
 7036836 7036837 Smed_0400 Smed_0401     FALSE 0.018 256.000 0.000 1.000   NA
 7036837 7036838 Smed_0401 Smed_0402     FALSE 0.003 536.000 0.000 NA   NA
 7036839 7036840 Smed_0403 Smed_0404 hisS hisZ TRUE 0.973 6.000 0.097 0.000 N NA
 7036840 7036841 Smed_0404 Smed_0405 hisZ hisG TRUE 0.992 -3.000 0.239 1.000 Y NA
 7036841 7036842 Smed_0405 Smed_0406 hisG   FALSE 0.144 121.000 0.002 NA N NA
 7036842 7036843 Smed_0406 Smed_0407     TRUE 0.855 28.000 0.182 NA   NA
 7036844 7036845 Smed_0408 Smed_0409 groEL groES TRUE 0.957 78.000 0.565 1.000 Y NA
 7036846 7036847 Smed_0410 Smed_0411     TRUE 0.855 14.000 0.049 1.000 N NA
 7036847 7036848 Smed_0411 Smed_0412   ileS FALSE 0.031 282.000 0.029 1.000 N NA
 7036848 7036849 Smed_0412 Smed_0413 ileS   FALSE 0.154 134.000 0.019 NA   NA
 7036849 7036850 Smed_0413 Smed_0414     FALSE 0.427 73.000 0.037 NA   NA
 7036852 7036853 Smed_0416 Smed_0417     TRUE 0.915 7.000 0.079 1.000 N NA
 7036853 7036854 Smed_0417 Smed_0418     FALSE 0.318 90.000 0.013 1.000   NA
 7036855 7036856 Smed_0419 Smed_0420     FALSE 0.017 594.000 0.000 0.048 N NA
 7036857 7036858 Smed_0421 Smed_0422     FALSE 0.321 157.000 0.182 NA   NA
 7036858 7036859 Smed_0422 Smed_0423     TRUE 0.886 61.000 0.515 NA   NA
 7036859 7036860 Smed_0423 Smed_0424     TRUE 0.729 38.000 0.099 NA   NA
 7036860 7036861 Smed_0424 Smed_0425     TRUE 0.800 25.000 0.062 1.000   NA
 7036861 7036862 Smed_0425 Smed_0426   lpxK FALSE 0.171 141.000 0.015 1.000   NA
 7036863 7036864 Smed_0427 Smed_0428   mutL FALSE 0.274 91.000 0.019 NA   NA
 7036865 7036866 Smed_0429 Smed_0430     TRUE 0.996 -3.000 0.538 1.000 Y NA
 7036869 7036870 Smed_0433 Smed_0434     FALSE 0.005 354.000 0.000 NA   NA
 7036870 7036871 Smed_0434 Smed_0435     FALSE 0.449 157.000 0.026 NA Y NA
 7036871 7036872 Smed_0435 Smed_0436     TRUE 0.977 -3.000 0.026 NA Y NA
 7036872 7036873 Smed_0436 Smed_0437     TRUE 0.968 15.000 0.091 1.000 Y NA
 7036873 7036874 Smed_0437 Smed_0438     TRUE 0.983 -3.000 0.367 1.000 N NA
 7036875 7036876 Smed_0439 Smed_0440     FALSE 0.118 260.000 0.000 1.000 Y NA
 7036876 7036877 Smed_0440 Smed_0441     TRUE 0.832 141.000 0.182 0.031 Y NA
 7036877 7036878 Smed_0441 Smed_0442     FALSE 0.007 405.000 0.000 1.000 N NA
 7036878 7036879 Smed_0442 Smed_0443     FALSE 0.016 269.000 0.000 1.000 N NA
 7036879 7036880 Smed_0443 Smed_0444     TRUE 0.972 16.000 0.133 1.000 Y NA
 7036880 7036881 Smed_0444 Smed_0445     FALSE 0.030 219.000 0.000 1.000 N NA
 7036881 7036882 Smed_0445 Smed_0446     FALSE 0.008 287.000 0.000 NA   NA
 7036882 7036883 Smed_0446 Smed_0447     TRUE 0.730 61.000 0.195 NA   NA
 7036883 7036884 Smed_0447 Smed_0448     TRUE 0.941 82.000 0.628 0.002   NA
 7036884 7036885 Smed_0448 Smed_0449     TRUE 0.893 75.000 0.278 0.002   NA
 7036885 7036886 Smed_0449 Smed_0450     TRUE 0.979 14.000 0.016 0.002 Y NA
 7036887 7036888 Smed_0451 Smed_0452 rnhB   TRUE 0.548 140.000 0.022 1.000 Y NA
 7036890 7036891 Smed_0454 Smed_0455     FALSE 0.004 450.000 0.000 NA   NA
 7036891 7036892 Smed_0455 Smed_0456     TRUE 0.845 9.000 0.018 1.000 N NA
 7036892 7036893 Smed_0456 Smed_0457     TRUE 0.929 7.000 0.107 1.000 N NA
 7036893 7036894 Smed_0457 Smed_0458     FALSE 0.087 198.000 0.028 1.000 N NA
 7036895 7036896 Smed_0459 Smed_0460     TRUE 0.942 35.000 0.525 1.000   NA
 7036896 7036897 Smed_0460 Smed_0461     FALSE 0.513 80.000 0.061 1.000   NA
 7036897 7036898 Smed_0461 Smed_0462     FALSE 0.155 147.000 0.030 NA   NA
 7036898 7036899 Smed_0462 Smed_0463   glyQ FALSE 0.242 87.000 0.006 NA   NA
 7036899 7036900 Smed_0463 Smed_0464 glyQ   FALSE 0.006 464.000 0.003 NA   NA
 7036900 7036901 Smed_0464 Smed_0465     FALSE 0.342 111.000 0.074 NA   NA
 7036901 7036902 Smed_0465 Smed_0466   glyS FALSE 0.049 191.000 0.005 NA   NA
 7036902 7036903 Smed_0466 Smed_0467 glyS   FALSE 0.334 64.000 0.006 NA   NA
 7036903 7036904 Smed_0467 Smed_0468     FALSE 0.071 132.000 0.000 NA   NA
 7036904 7036905 Smed_0468 Smed_0469     TRUE 0.983 -3.000 0.429 NA   NA
 7036906 7036907 Smed_0470 Smed_0471     FALSE 0.165 117.000 0.010 NA   NA
 7036907 7036908 Smed_0471 Smed_0472     FALSE 0.361 75.000 0.002 1.000 N NA
 7036908 7036909 Smed_0472 Smed_0473     TRUE 0.713 139.000 0.571 1.000 N NA
 7036909 7036910 Smed_0473 Smed_0474     FALSE 0.237 101.000 0.015 NA N NA
 7036911 7036912 Smed_0475 Smed_0476     FALSE 0.005 379.000 0.000 NA N NA
 7036912 7036913 Smed_0476 Smed_0477   ubiA FALSE 0.214 69.000 0.000 NA N NA
 7036916 7036917 Smed_0480 Smed_0481     TRUE 0.753 48.000 0.158 NA N NA
 7036917 7036918 Smed_0481 Smed_0482     FALSE 0.354 98.000 0.053 NA   NA
 7036919 7036920 Smed_0483 Smed_0484     TRUE 0.992 3.000 0.455 0.001 N NA
 7036922 7036923 Smed_0486 Smed_0487     FALSE 0.005 350.000 0.000 NA   NA
 7036923 7036924 Smed_0487 Smed_0488     TRUE 0.989 11.000 0.303 1.000 Y NA
 7036924 7036925 Smed_0488 Smed_0489     FALSE 0.006 509.000 0.000 1.000 N NA
 7036926 7036927 Smed_0490 Smed_0491     TRUE 0.984 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 7036927 7036928 Smed_0491 Smed_0492     TRUE 0.540 114.000 0.189 1.000 N NA
 7036928 7036929 Smed_0492 Smed_0493     FALSE 0.042 214.000 0.017 NA   NA
 7036931 7036932 Smed_0495 Smed_0496     TRUE 0.823 4.000 0.019 NA N NA
 7036932 7036933 Smed_0496 Smed_0497     FALSE 0.506 64.000 0.045 NA N NA
 7036935 7036936 Smed_0499 Smed_0500     TRUE 0.997 -16.000 0.576 1.000 Y NA
 7036936 7036937 Smed_0500 Smed_0501     TRUE 0.931 5.000 0.144 NA   NA
 7036937 7036938 Smed_0501 Smed_0502     TRUE 0.855 32.000 0.211 NA   NA
 7036938 7036939 Smed_0502 Smed_0503     TRUE 0.998 -6.000 0.729 1.000 Y NA
 7036940 7036941 Smed_0504 Smed_0505     FALSE 0.185 103.000 0.005 NA   NA
 7036943 7036944 Smed_0507 Smed_0508     FALSE 0.035 176.000 0.000 NA   NA
 7036946 7036947 Smed_0510 Smed_0511     FALSE 0.109 202.000 0.087 NA   NA
 7036947 7036948 Smed_0511 Smed_0512     FALSE 0.364 200.000 0.404 1.000 N NA
 7036948 7036949 Smed_0512 Smed_0513     FALSE 0.400 217.000 0.397 0.094 N NA
 7036951 7036952 Smed_0515 Smed_0516     TRUE 0.577 46.000 0.023 1.000 N NA
 7036954 7036955 Smed_0518 Smed_0519     TRUE 0.996 20.000 0.741 0.006 Y NA
 7036955 7036956 Smed_0519 Smed_0520     TRUE 0.729 99.000 0.153 0.048 N NA
 7036956 7036957 Smed_0520 Smed_0521     TRUE 0.871 0.000 0.033 NA   NA
 7036957 7036958 Smed_0521 Smed_0522     TRUE 0.838 12.000 0.046 NA   NA
 7036958 7036959 Smed_0522 Smed_0523     TRUE 0.902 62.000 0.536 1.000 N NA
 7036959 7036960 Smed_0523 Smed_0524     FALSE 0.484 39.000 0.011 NA   NA
 7036960 7036961 Smed_0524 Smed_0525     TRUE 0.816 17.000 0.060 NA   NA
 7036961 7036962 Smed_0525 Smed_0526     TRUE 0.981 -7.000 0.340 NA   NA
 7036962 7036963 Smed_0526 Smed_0527   ispH FALSE 0.484 91.000 0.105 NA   NA
 7036963 7036964 Smed_0527 Smed_0528 ispH   TRUE 0.646 104.000 0.251 1.000   NA
 7036964 7036965 Smed_0528 Smed_0529   rnhA TRUE 0.951 -3.000 0.104 1.000   NA
 7036966 7036967 Smed_0530 Smed_0531     TRUE 0.951 52.000 0.357 NA Y NA
 7036969 7036970 Smed_0533 Smed_0534     TRUE 0.974 0.000 0.293 1.000 N NA
 7036970 7036971 Smed_0534 Smed_0535     FALSE 0.278 275.000 0.674 1.000   NA
 7036971 7036972 Smed_0535 Smed_0536     TRUE 0.903 15.000 0.129 1.000   NA
 7036974 7036975 Smed_0538 Smed_0539     FALSE 0.098 143.000 0.000 1.000   NA
 7036975 7036976 Smed_0539 Smed_0540     FALSE 0.042 193.000 0.000 1.000   NA
 7036978 7036979 Smed_0542 Smed_0543     FALSE 0.463 62.000 0.016 1.000   NA
 7036980 7036981 Smed_0544 Smed_0545     TRUE 0.641 111.000 0.333 NA   NA
 7036981 7036982 Smed_0545 Smed_0546     FALSE 0.358 80.000 0.029 NA   NA
 7036982 7036983 Smed_0546 Smed_0547     FALSE 0.015 269.000 0.000 1.000   NA
 7036983 7036984 Smed_0547 Smed_0548     FALSE 0.014 345.000 0.003 1.000 N NA
 7036985 7036986 Smed_0549 Smed_0550     FALSE 0.324 173.000 0.250 NA   NA
 7036989 7036990 Smed_R0008 Smed_0553     FALSE 0.013 237.000 0.000 NA   NA
 7036992 7036993 Smed_R0009 Smed_0555     FALSE 0.014 234.000 0.000 NA   NA
 7036994 7036995 Smed_0556 Smed_0557   cysN FALSE 0.020 244.000 0.000 1.000   NA
 7036995 7036996 Smed_0557 Smed_0558 cysN   TRUE 0.978 0.000 0.100 0.001 N NA
 7036996 7036997 Smed_0558 Smed_0559     TRUE 0.860 48.000 0.017 1.000 Y NA
 7036998 7036999 Smed_0560 Smed_0561     TRUE 0.977 0.000 0.393 NA   NA
 7037000 7037001 Smed_0562 Smed_0563     FALSE 0.495 198.000 0.634 1.000 N NA
 7037001 7037002 Smed_0563 Smed_0564     TRUE 0.928 2.000 0.081 1.000 N NA
 7037002 7037003 Smed_0564 Smed_0565     TRUE 0.670 74.000 0.138 1.000 N NA
 7037004 7037005 Smed_0566 Smed_0567     FALSE 0.349 109.000 0.071 NA   NA
 7037005 7037006 Smed_0567 Smed_0568     TRUE 0.712 81.000 0.214 1.000 N NA
 7037008 7037009 Smed_0570 Smed_0571     FALSE 0.338 86.000 0.028 NA N NA
 7037009 7037010 Smed_0571 Smed_0572     FALSE 0.008 384.000 0.000 1.000 N NA
 7037012 7037013 Smed_0574 Smed_0575     FALSE 0.005 363.000 0.000 NA   NA
 7037018 7037019 Smed_0580 Smed_0581     FALSE 0.168 104.000 0.000 1.000   NA
 7037019 7037020 Smed_0581 Smed_0582     TRUE 0.841 14.000 0.000 0.093   NA
 7037020 7037021 Smed_0582 Smed_0583     FALSE 0.008 285.000 0.000 NA   NA
 7037021 7037022 Smed_0583 Smed_0584     FALSE 0.127 95.000 0.000 NA   NA
 7037027 7037028 Smed_0589 Smed_0590     FALSE 0.194 198.000 0.154 1.000 N NA
 7037028 7037029 Smed_0590 Smed_0591     TRUE 0.684 128.000 0.000 0.012 Y NA
 7037030 7037031 Smed_0592 Smed_0593     FALSE 0.043 192.000 0.000 1.000   NA
 7037033 7037034 Smed_0595 Smed_0596     FALSE 0.018 280.000 0.014 NA   NA
 7037034 7037035 Smed_0596 Smed_0597     FALSE 0.271 79.000 0.006 NA   NA
 7037035 7037036 Smed_0597 Smed_0598     FALSE 0.059 147.000 0.000 NA   NA
 7037036 7037037 Smed_0598 Smed_0599     TRUE 0.848 13.000 0.061 NA   NA
 7037037 7037038 Smed_0599 Smed_0600     FALSE 0.065 172.000 0.000 1.000 N NA
 7037041 7037042 Smed_0603 Smed_0604     TRUE 0.864 56.000 0.043 1.000 Y NA
 7037042 7037043 Smed_0604 Smed_0605     FALSE 0.011 300.000 0.000 1.000   NA
 7037045 7037046 Smed_0607 Smed_0608     TRUE 0.985 -3.000 0.493 NA   NA
 7037046 7037047 Smed_0608 Smed_0609     TRUE 0.983 0.000 0.500 NA   NA
 7037047 7037048 Smed_0609 Smed_0610     TRUE 0.998 7.000 0.896 0.009 Y NA
 7037048 7037049 Smed_0610 Smed_0611     TRUE 0.998 -3.000 0.810 1.000 Y NA
 7037049 7037050 Smed_0611 Smed_0612     TRUE 0.998 -3.000 0.644 0.047 Y NA
 7037050 7037051 Smed_0612 Smed_0613     TRUE 0.996 0.000 0.614 1.000 Y NA
 7037051 7037052 Smed_0613 Smed_0614     FALSE 0.007 406.000 0.000 1.000 N NA
 7037053 7037054 Smed_0615 Smed_0616     FALSE 0.166 143.000 0.032 NA   NA
 7037055 7037056 Smed_0617 Smed_0618     TRUE 0.980 -28.000 0.259 1.000 N NA
 7037056 7037057 Smed_0618 Smed_0619     TRUE 0.531 71.000 0.071 NA   NA
 7037059 7037060 Smed_0621 Smed_0622     FALSE 0.070 134.000 0.000 NA   NA
 7037060 7037061 Smed_0622 Smed_0623     FALSE 0.037 174.000 0.000 NA   NA
 7037062 7037063 Smed_0624 Smed_0625     TRUE 0.994 -7.000 0.941 NA   NA
 7037063 7037064 Smed_0625 Smed_0626     TRUE 0.812 97.000 0.582 NA   NA
 7037067 7037068 Smed_0629 Smed_0630     TRUE 0.823 43.000 0.223 NA   NA
 7037068 7037069 Smed_0630 Smed_0631     TRUE 0.998 -10.000 0.713 1.000 Y NA
 7037069 7037070 Smed_0631 Smed_0632     FALSE 0.051 257.000 0.069 NA N NA
 7037070 7037071 Smed_0632 Smed_0633     FALSE 0.497 108.000 0.163 NA N NA
 7037071 7037072 Smed_0633 Smed_0634     TRUE 0.987 -3.000 0.096 1.000 Y NA
 7037072 7037073 Smed_0634 Smed_0635     TRUE 0.995 -3.000 0.125 0.002 Y NA
 7037073 7037074 Smed_0635 Smed_0636     TRUE 0.997 -3.000 0.644 NA Y NA
 7037074 7037075 Smed_0636 Smed_0637     FALSE 0.385 221.000 0.200 NA Y NA
 7037075 7037076 Smed_0637 Smed_0638     FALSE 0.467 144.000 0.222 1.000 N NA
 7037076 7037077 Smed_0638 Smed_0639     TRUE 0.997 -3.000 0.733 1.000 Y NA
 7037077 7037078 Smed_0639 Smed_0640     TRUE 0.776 100.000 0.081 1.000 Y NA
 7037079 7037080 Smed_0641 Smed_0642   pepN FALSE 0.026 297.000 0.025 1.000 N NA
 7037082 7037083 Smed_0644 Smed_0645     FALSE 0.010 267.000 0.000 NA   NA
 7037083 7037084 Smed_0645 Smed_0646     TRUE 0.852 38.000 0.250 NA   NA
 7037084 7037085 Smed_0646 Smed_0647     FALSE 0.209 119.000 0.027 NA   NA
 7037085 7037086 Smed_0647 Smed_0648     FALSE 0.346 89.000 0.034 NA N NA
 7037087 7037088 Smed_0649 Smed_0650     FALSE 0.008 388.000 0.000 1.000 N NA
 7037088 7037089 Smed_0650 Smed_0651     FALSE 0.202 200.000 0.000 NA Y NA
 7037091 7037092 Smed_0653 Smed_0654     FALSE 0.099 116.000 0.000 NA N NA
 7037093 7037094 Smed_0655 Smed_0656     TRUE 0.978 -7.000 0.019 NA Y NA
 7037096 7037097 Smed_0658 Smed_0659     FALSE 0.142 128.000 0.011 NA   NA
 7037097 7037098 Smed_0659 Smed_0660     TRUE 0.930 75.000 1.000 NA   NA
 7037098 7037099 Smed_0660 Smed_0661     TRUE 0.986 14.000 1.000 NA   NA
 7037103 7037104 Smed_0665 Smed_R0010     FALSE 0.010 263.000 0.000 NA   NA
 7037105 7037106 Smed_0666 Smed_0667     FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 7037106 7037107 Smed_0667 Smed_0668     FALSE 0.003 526.000 0.000 NA   NA
 7037108 7037109 Smed_0669 Smed_0670     TRUE 0.737 76.000 0.222 1.000   NA
 7037109 7037110 Smed_0670 Smed_0671     FALSE 0.020 211.000 0.000 NA   NA
 7037110 7037111 Smed_0671 Smed_0672     FALSE 0.039 171.000 0.000 NA   NA
 7037112 7037113 Smed_0673 Smed_0674   smpB TRUE 0.923 0.000 0.058 1.000 N NA
 7037115 7037116 Smed_0676 Smed_0677     TRUE 0.879 102.000 0.291 1.000 Y NA
 7037116 7037117 Smed_0677 Smed_0678     FALSE 0.043 215.000 0.018 NA   NA
 7037117 7037118 Smed_0678 Smed_0679     FALSE 0.177 126.000 0.022 NA   NA
 7037118 7037119 Smed_0679 Smed_0680   acpS TRUE 0.889 -3.000 0.032 NA   NA
 7037119 7037120 Smed_0680 Smed_0681 acpS   FALSE 0.126 161.000 0.012 1.000 N NA
 7037120 7037121 Smed_0681 Smed_0682     TRUE 0.865 0.000 0.010 1.000 N NA
 7037121 7037122 Smed_0682 Smed_0683   era TRUE 0.960 9.000 0.098 0.062   NA
 7037124 7037125 Smed_0685 Smed_0686     FALSE 0.014 286.000 0.000 1.000 N NA
 7037125 7037126 Smed_0686 Smed_0687     FALSE 0.074 168.000 0.007 NA   NA
 7037127 7037128 Smed_0688 Smed_0689     TRUE 0.833 131.000 0.333 1.000 Y NA
 7037128 7037129 Smed_0689 Smed_0690     TRUE 0.678 71.000 0.133 1.000 N NA
 7037130 7037131 Smed_0691 Smed_0692     TRUE 0.822 12.000 0.038 NA   NA
 7037131 7037132 Smed_0692 Smed_0693   recO FALSE 0.015 227.000 0.000 NA   NA
 7037134 7037135 Smed_0695 Smed_0696     TRUE 0.910 -3.000 0.049 NA   NA
 7037135 7037136 Smed_0696 Smed_0697     TRUE 0.780 79.000 0.123 0.028   NA
 7037136 7037137 Smed_0697 Smed_0698     FALSE 0.218 128.000 0.040 NA   NA
 7037137 7037138 Smed_0698 Smed_0699     FALSE 0.058 182.000 0.003 NA N NA
 7037138 7037139 Smed_0699 Smed_0700     TRUE 0.903 118.000 0.210 0.002 Y NA
 7037139 7037140 Smed_0700 Smed_0701     TRUE 0.972 50.000 0.223 0.002 Y NA
 7037140 7037141 Smed_0701 Smed_0702     FALSE 0.244 104.000 0.002 1.000 N NA
 7037142 7037143 Smed_0703 Smed_0704     TRUE 0.960 -10.000 0.147 NA   NA
 7037143 7037144 Smed_0704 Smed_0705     TRUE 0.960 3.000 0.258 NA   NA
 7037144 7037145 Smed_0705 Smed_0706     TRUE 0.881 0.000 0.039 NA   NA
 7037145 7037146 Smed_0706 Smed_0707     FALSE 0.216 110.000 0.021 NA   NA
 7037146 7037147 Smed_0707 Smed_0708     TRUE 0.964 16.000 0.484 NA   NA
 7037147 7037148 Smed_0708 Smed_0709     TRUE 0.549 158.000 0.462 NA   NA
 7037148 7037149 Smed_0709 Smed_0710     TRUE 0.972 -3.000 0.259 NA   NA
 7037152 7037153 Smed_0713 Smed_0714 cysS   TRUE 0.551 37.000 0.005 1.000   NA
 7037153 7037154 Smed_0714 Smed_0715     TRUE 0.989 -3.000 0.263 0.003   NA
 7037154 7037155 Smed_0715 Smed_0716     TRUE 0.995 -3.000 0.600 0.003   NA
 7037155 7037156 Smed_0716 Smed_0717     TRUE 0.929 -3.000 0.052 1.000   NA
 7037156 7037157 Smed_0717 Smed_0718     TRUE 0.540 57.000 0.032 1.000   NA
 7037157 7037158 Smed_0718 Smed_0719     FALSE 0.028 259.000 0.026 NA   NA
 7037160 7037161 Smed_0721 Smed_0722     FALSE 0.109 294.000 0.290 1.000   NA
 7037161 7037162 Smed_0722 Smed_0723     FALSE 0.422 107.000 0.075 1.000 N NA
 7037162 7037163 Smed_0723 Smed_0724     TRUE 0.993 10.000 0.466 1.000 Y NA
 7037163 7037164 Smed_0724 Smed_0725     FALSE 0.009 275.000 0.000 NA   NA
 7037165 7037166 Smed_0726 Smed_0727     TRUE 0.941 0.000 0.100 1.000 N NA
 7037166 7037167 Smed_0727 Smed_0728     FALSE 0.312 146.000 0.101 1.000   NA
 7037167 7037168 Smed_0728 Smed_0729     TRUE 0.788 33.000 0.094 1.000   NA
 7037168 7037169 Smed_0729 Smed_0730     FALSE 0.192 121.000 0.002 1.000 N NA
 7037170 7037171 Smed_0731 Smed_0732     TRUE 0.763 120.000 0.625 NA N NA
 7037171 7037172 Smed_0732 Smed_0733     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 7037174 7037175 Smed_0735 Smed_0736     TRUE 0.979 -3.000 0.357 NA   NA
 7037175 7037176 Smed_0736 Smed_0737     TRUE 0.941 17.000 0.311 NA   NA
 7037177 7037178 Smed_0738 Smed_0739 rplI   TRUE 0.646 35.000 0.043 NA   NA
 7037178 7037179 Smed_0739 Smed_0740   rpsR FALSE 0.082 190.000 0.033 NA   NA
 7037179 7037180 Smed_0740 Smed_0741 rpsR rpsF TRUE 0.988 26.000 0.319 0.009 Y NA
 7037183 7037184 Smed_0744 Smed_0745     TRUE 0.992 25.000 0.432 0.004 Y NA
 7037184 7037185 Smed_0745 Smed_0746   acpP FALSE 0.435 320.000 0.321 0.004 Y NA
 7037185 7037186 Smed_0746 Smed_0747 acpP   FALSE 0.160 309.000 0.106 1.000 Y NA
 7037186 7037187 Smed_0747 Smed_0748     FALSE 0.053 288.000 0.134 NA   NA
 7037188 7037189 Smed_0749 Smed_0750     TRUE 0.666 2.000 0.000 NA   NA
 7037189 7037190 Smed_0750 Smed_0751     TRUE 0.976 -6.000 0.273 NA   NA
 7037190 7037191 Smed_0751 Smed_0752     FALSE 0.456 35.000 0.000 1.000   NA
 7037192 7037193 Smed_0753 Smed_0754     TRUE 0.590 102.000 0.185 1.000 N NA
 7037193 7037194 Smed_0754 Smed_0755     TRUE 0.950 55.000 0.370 NA Y NA
 7037194 7037195 Smed_0755 Smed_0756     TRUE 0.996 8.000 0.917 NA Y NA
 7037195 7037196 Smed_0756 Smed_0757     TRUE 0.997 3.000 1.000 NA Y NA
 7037196 7037197 Smed_0757 Smed_0758     FALSE 0.041 167.000 0.000 NA   NA
 7037197 7037198 Smed_0758 Smed_0759   gmk TRUE 0.961 4.000 0.276 NA   NA
 7037199 7037200 Smed_0760 Smed_0761 ksgA pdxA TRUE 0.963 0.000 0.197 1.000 N NA
 7037200 7037201 Smed_0761 Smed_0762 pdxA   TRUE 0.982 10.000 0.561 1.000 N NA
 7037201 7037202 Smed_0762 Smed_0763     FALSE 0.201 184.000 0.112 1.000 N NA
 7037202 7037203 Smed_0763 Smed_0764     TRUE 0.954 0.000 0.153 1.000   NA
 7037203 7037204 Smed_0764 Smed_0765     TRUE 0.995 -3.000 0.631 0.047   NA
 7037205 7037206 Smed_0766 Smed_0767     TRUE 0.926 20.000 0.230 1.000 N NA
 7037210 7037211 Smed_0771 Smed_0772     FALSE 0.009 269.000 0.000 NA   NA
 7037213 7037214 Smed_0774 Smed_0775   ndk FALSE 0.219 101.000 0.010 NA N NA
 7037215 7037216 Smed_0776 Smed_0777     TRUE 0.991 -3.000 0.714 NA   NA
 7037218 7037219 Smed_0779 Smed_0780     TRUE 0.997 5.000 0.501 0.003 Y NA
 7037219 7037220 Smed_0780 Smed_0781     TRUE 0.945 -3.000 0.082 1.000 N NA
 7037220 7037221 Smed_0781 Smed_0782   uvrC FALSE 0.137 253.000 0.227 1.000 N NA
 7037221 7037222 Smed_0782 Smed_0783 uvrC   TRUE 0.893 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7037224 7037225 Smed_0785 Smed_0786     TRUE 0.899 -3.000 0.036 NA N NA
 7037225 7037226 Smed_0786 Smed_0787     TRUE 0.695 54.000 0.137 NA   NA
 7037226 7037227 Smed_0787 Smed_0788     FALSE 0.418 52.000 0.014 NA   NA
 7037228 7037229 Smed_0789 Smed_0790     TRUE 0.841 28.000 0.123 1.000   NA
 7037230 7037231 Smed_0791 Smed_0792 purN   TRUE 0.983 31.000 0.230 0.002 Y NA
 7037232 7037233 Smed_0793 Smed_0794     FALSE 0.202 235.000 0.362 NA   NA
 7037233 7037234 Smed_0794 Smed_0795     TRUE 0.698 65.000 0.134 1.000 N NA
 7037234 7037235 Smed_0795 Smed_0796     TRUE 0.981 11.000 0.149 1.000 Y NA
 7037236 7037237 Smed_0797 Smed_0798     TRUE 0.700 70.000 0.195 NA   NA
 7037237 7037238 Smed_0798 Smed_0799     FALSE 0.517 51.000 0.015 1.000 N NA
 7037238 7037239 Smed_0799 Smed_0800     FALSE 0.290 104.000 0.017 1.000 N NA
 7037239 7037240 Smed_0800 Smed_0801     FALSE 0.270 134.000 0.071 NA N NA
 7037241 7037242 Smed_0802 Smed_0803 aspS   FALSE 0.020 252.000 0.000 1.000 N NA
 7037243 7037244 Smed_0804 Smed_0805 groEL   FALSE 0.420 110.000 0.118 NA   NA
 7037244 7037245 Smed_0805 Smed_0806     FALSE 0.164 188.000 0.118 NA   NA
 7037246 7037247 Smed_0807 Smed_0808     FALSE 0.106 142.000 0.000 1.000 N NA
 7037248 7037249 Smed_0809 Smed_0810     TRUE 0.828 4.000 0.024 NA   NA
 7037249 7037250 Smed_0810 Smed_0811     FALSE 0.496 96.000 0.128 NA   NA
 7037250 7037251 Smed_0811 Smed_0812     FALSE 0.265 123.000 0.055 NA   NA
 7037252 7037253 Smed_0813 Smed_0814     FALSE 0.425 131.000 0.192 NA   NA
 7037253 7037254 Smed_0814 Smed_0815     FALSE 0.006 428.000 0.000 1.000   NA
 7037254 7037255 Smed_0815 Smed_0816   glyA FALSE 0.212 182.000 0.123 1.000   NA
 7037255 7037256 Smed_0816 Smed_0817 glyA nrdR TRUE 0.841 13.000 0.052 NA N NA
 7037256 7037257 Smed_0817 Smed_0818 nrdR   TRUE 0.935 17.000 0.277 NA N NA
 7037257 7037258 Smed_0818 Smed_0819     TRUE 0.995 0.000 0.456 1.000 Y NA
 7037260 7037261 Smed_0821 Smed_0822 ribH nusB TRUE 0.982 -3.000 0.347 1.000 N NA
 7037261 7037262 Smed_0822 Smed_0823 nusB   TRUE 0.788 7.000 0.011 NA N NA
 7037262 7037263 Smed_0823 Smed_0824   hppA FALSE 0.026 199.000 0.000 NA N NA
 7037265 7037266 Smed_0826 Smed_0827     FALSE 0.457 84.000 0.071 NA   NA
 7037266 7037267 Smed_0827 Smed_0828     FALSE 0.084 196.000 0.044 NA   NA
 7037267 7037268 Smed_0828 Smed_0829     TRUE 0.993 19.000 0.380 0.004 Y NA
 7037268 7037269 Smed_0829 Smed_0830   ihfA TRUE 0.649 94.000 0.207 1.000 N NA
 7037269 7037270 Smed_0830 Smed_0831 ihfA   TRUE 0.724 130.000 0.535 1.000 N NA
 7037272 7037273 Smed_R0011 Smed_0833     FALSE 0.116 101.000 0.000 NA   NA
 7037273 7037274 Smed_0833 Smed_0834     FALSE 0.003 539.000 0.000 NA   NA
 7037274 7037275 Smed_0834 Smed_0835     FALSE 0.135 91.000 0.000 NA   NA
 7037275 7037276 Smed_0835 Smed_0836     TRUE 0.613 10.000 0.000 NA   NA
 7037277 7037278 Smed_0837 Smed_0838     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037278 7037279 Smed_0838 Smed_0839     FALSE 0.007 305.000 0.000 NA   NA
 7037280 7037281 Smed_0840 Smed_0841     TRUE 0.801 36.000 0.000 0.001   NA
 7037281 7037282 Smed_0841 Smed_0842     TRUE 0.834 20.000 0.000 0.057   NA
 7037282 7037283 Smed_0842 Smed_0843     FALSE 0.181 75.000 0.000 NA   NA
 7037283 7037284 Smed_0843 Smed_0844     FALSE 0.052 154.000 0.000 NA   NA
 7037284 7037285 Smed_0844 Smed_0845     TRUE 0.599 11.000 0.000 NA   NA
 7037285 7037286 Smed_0845 Smed_0846     FALSE 0.235 55.000 0.000 NA   NA
 7037286 7037287 Smed_0846 Smed_0847     FALSE 0.210 89.000 0.000 1.000   NA
 7037290 7037291 Smed_0850 Smed_0851     TRUE 0.994 -3.000 0.357 NA Y NA
 7037291 7037292 Smed_0851 Smed_0852     TRUE 0.997 -22.000 0.500 1.000 Y NA
 7037292 7037293 Smed_0852 Smed_0853     TRUE 0.995 6.000 0.571 1.000 Y NA
 7037295 7037296 Smed_0855 Smed_0856     FALSE 0.055 151.000 0.000 NA   NA
 7037296 7037297 Smed_0856 Smed_0857     TRUE 0.700 20.000 0.024 NA   NA
 7037299 7037300 Smed_0859 Smed_0860     TRUE 0.823 94.000 0.124 1.000 Y NA
 7037300 7037301 Smed_0860 Smed_0861   rpsI FALSE 0.170 153.000 0.024 1.000 N NA
 7037301 7037302 Smed_0861 Smed_0862 rpsI rplM TRUE 0.994 3.000 0.231 0.009 Y NA
 7037302 7037303 Smed_0862 Smed_0863 rplM   FALSE 0.049 206.000 0.015 NA N NA
 7037306 7037307 Smed_0866 Smed_0867     TRUE 0.613 38.000 0.040 NA   NA
 7037307 7037308 Smed_0867 Smed_0868     TRUE 0.833 27.000 0.140 NA   NA
 7037310 7037311 Smed_0870 Smed_0871     FALSE 0.331 105.000 0.055 NA   NA
 7037311 7037312 Smed_0871 Smed_0872   clpP FALSE 0.016 273.000 0.000 1.000 N NA
 7037312 7037313 Smed_0872 Smed_0873 clpP clpX FALSE 0.330 294.000 0.352 1.000 Y NA
 7037313 7037314 Smed_0873 Smed_0874 clpX   FALSE 0.135 443.000 0.201 1.000 Y NA
 7037314 7037315 Smed_0874 Smed_0875     FALSE 0.074 222.000 0.043 1.000 N NA
 7037315 7037316 Smed_0875 Smed_0876     FALSE 0.012 245.000 0.000 NA   NA
 7037318 7037319 Smed_0878 Smed_0879     TRUE 0.944 0.000 0.115 1.000   NA
 7037319 7037320 Smed_0879 Smed_0880     FALSE 0.514 76.000 0.077 NA   NA
 7037320 7037321 Smed_0880 Smed_0881     FALSE 0.167 79.000 0.000 NA   NA
 7037321 7037322 Smed_0881 Smed_0882     FALSE 0.393 28.000 0.000 NA   NA
 7037323 7037324 Smed_0883 Smed_0884     TRUE 0.998 -3.000 0.571 0.005 Y NA
 7037324 7037325 Smed_0884 Smed_0885     FALSE 0.088 118.000 0.000 NA   NA
 7037325 7037326 Smed_0885 Smed_0886     TRUE 0.764 -174.000 0.000 NA   NA
 7037326 7037327 Smed_0886 Smed_0887     FALSE 0.338 35.000 0.000 NA   NA
 7037327 7037328 Smed_0887 Smed_R0012     FALSE 0.005 352.000 0.000 NA   NA
 7037329 7037330 Smed_R0013 Smed_R0014     FALSE 0.195 70.000 0.000 NA   NA
 7037330 7037331 Smed_R0014 Smed_0888     FALSE 0.007 305.000 0.000 NA   NA
 7037331 7037332 Smed_0888 Smed_0889     TRUE 0.998 -9.000 0.396 0.003 Y NA
 7037332 7037333 Smed_0889 Smed_0890     TRUE 0.990 19.000 0.262 0.003 Y NA
 7037333 7037334 Smed_0890 Smed_0891     TRUE 0.982 57.000 0.483 0.009 Y NA
 7037334 7037335 Smed_0891 Smed_0892     TRUE 0.874 0.000 0.035 NA   NA
 7037335 7037336 Smed_0892 Smed_0893     TRUE 0.724 17.000 0.022 NA   NA
 7037336 7037337 Smed_0893 Smed_0894     TRUE 0.993 15.000 0.343 0.009 Y NA
 7037337 7037338 Smed_0894 Smed_0895     TRUE 0.819 6.000 0.024 NA   NA
 7037338 7037339 Smed_0895 Smed_0896     FALSE 0.142 123.000 0.006 NA   NA
 7037339 7037340 Smed_0896 Smed_0897     TRUE 0.994 21.000 0.515 0.009 Y NA
 7037340 7037341 Smed_0897 Smed_0898     TRUE 0.980 65.000 0.500 0.009 Y NA
 7037341 7037342 Smed_0898 Smed_0899     TRUE 0.958 97.000 0.442 0.009 Y NA
 7037342 7037343 Smed_0899 Smed_0900     TRUE 0.991 30.000 0.484 0.003 Y NA
 7037343 7037344 Smed_0900 Smed_0901     TRUE 0.996 8.000 0.451 0.009 Y NA
 7037344 7037345 Smed_0901 Smed_0902     TRUE 0.996 0.000 0.251 0.003 Y NA
 7037345 7037346 Smed_0902 Smed_0903     TRUE 0.994 20.000 0.453 0.003 Y NA
 7037346 7037347 Smed_0903 Smed_0904     TRUE 0.983 -3.000 0.372 1.000 N NA
 7037347 7037348 Smed_0904 Smed_0905     TRUE 0.925 26.000 0.307 1.000   NA
 7037348 7037349 Smed_0905 Smed_0906     TRUE 0.687 57.000 0.105 1.000   NA
 7037349 7037350 Smed_0906 Smed_0907     FALSE 0.398 133.000 0.172 NA   NA
 7037350 7037351 Smed_0907 Smed_0908     FALSE 0.003 679.000 0.000 NA   NA
 7037352 7037353 Smed_0909 Smed_0910     FALSE 0.113 102.000 0.000 NA   NA
 7037353 7037354 Smed_0910 Smed_0911     FALSE 0.047 160.000 0.000 NA   NA
 7037354 7037355 Smed_0911 Smed_0912     TRUE 0.754 -7.000 0.000 NA   NA
 7037355 7037356 Smed_0912 Smed_0913     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037356 7037357 Smed_0913 Smed_0914     FALSE 0.135 91.000 0.000 NA   NA
 7037357 7037358 Smed_0914 Smed_0915     TRUE 0.992 -3.000 0.400 0.015   NA
 7037358 7037359 Smed_0915 Smed_0916     FALSE 0.207 65.000 0.000 NA   NA
 7037359 7037360 Smed_0916 Smed_0917     FALSE 0.006 333.000 0.000 NA N NA
 7037361 7037362 Smed_0918 Smed_0919     TRUE 0.853 19.000 0.076 1.000 N NA
 7037362 7037363 Smed_0919 Smed_0920     TRUE 0.975 18.000 0.620 1.000 N NA
 7037363 7037364 Smed_0920 Smed_0921   dnaE FALSE 0.010 424.000 0.005 1.000 N NA
 7037365 7037366 Smed_0922 Smed_0923     FALSE 0.238 126.000 0.025 1.000 N NA
 7037366 7037367 Smed_0923 Smed_0924     FALSE 0.303 174.000 0.228 NA   NA
 7037368 7037369 Smed_0925 Smed_0926   pleD TRUE 0.994 18.000 0.461 0.018 Y NA
 7037370 7037371 Smed_0927 Smed_0928 rpmG   FALSE 0.296 96.000 0.028 NA N NA
 7037371 7037372 Smed_0928 Smed_0929     TRUE 0.920 12.000 0.159 NA   NA
 7037372 7037373 Smed_0929 Smed_0930     TRUE 0.982 -3.000 0.406 NA   NA
 7037373 7037374 Smed_0930 Smed_0931     TRUE 0.664 35.000 0.050 NA   NA
 7037374 7037375 Smed_0931 Smed_0932     TRUE 0.901 3.000 0.045 1.000 N NA
 7037375 7037376 Smed_0932 Smed_0933     TRUE 0.737 151.000 0.238 1.000 Y NA
 7037376 7037377 Smed_0933 Smed_0934     TRUE 0.927 0.000 0.070 1.000   NA
 7037377 7037378 Smed_0934 Smed_0935     TRUE 0.816 30.000 0.108 1.000   NA
 7037378 7037379 Smed_0935 Smed_0936   pyrB TRUE 0.996 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 7037382 7037383 Smed_0939 Smed_0940     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037385 7037386 Smed_0942 Smed_0943   gatC FALSE 0.332 96.000 0.024 1.000   NA
 7037386 7037387 Smed_0943 Smed_0944 gatC gatA TRUE 0.989 50.000 0.643 0.001 Y NA
 7037389 7037390 Smed_0946 Smed_0947 gatB   TRUE 0.888 -3.000 0.014 1.000   NA
 7037390 7037391 Smed_0947 Smed_0948     FALSE 0.149 153.000 0.017 1.000   NA
 7037391 7037392 Smed_0948 Smed_0949     FALSE 0.295 183.000 0.260 NA   NA
 7037393 7037394 Smed_0950 Smed_0951   aat FALSE 0.100 110.000 0.000 NA   NA
 7037394 7037395 Smed_0951 Smed_0952 aat   TRUE 0.926 10.000 0.114 1.000 N NA
 7037395 7037396 Smed_0952 Smed_0953     TRUE 0.991 13.000 0.153 0.001 Y NA
 7037396 7037397 Smed_0953 Smed_0954     TRUE 0.668 24.000 0.003 1.000 N NA
 7037397 7037398 Smed_0954 Smed_0955     FALSE 0.248 157.000 0.080 1.000 N NA
 7037401 7037402 Smed_0958 Smed_0959     FALSE 0.112 157.000 0.019 NA   NA
 7037402 7037403 Smed_0959 Smed_0960     FALSE 0.215 436.000 0.396 1.000 Y NA
 7037403 7037404 Smed_0960 Smed_0961     FALSE 0.049 257.000 0.041 1.000 N NA
 7037405 7037406 Smed_0962 Smed_0963   ppnK FALSE 0.460 87.000 0.080 NA   NA
 7037407 7037408 Smed_R0015 Smed_0964     FALSE 0.005 343.000 0.000 NA   NA
 7037410 7037411 Smed_0966 Smed_0967     FALSE 0.115 202.000 0.095 NA   NA
 7037413 7037414 Smed_R0016 Smed_R0017     FALSE 0.433 24.000 0.000 NA   NA
 7037414 7037415 Smed_R0017 Smed_0969     FALSE 0.010 264.000 0.000 NA   NA
 7037415 7037416 Smed_0969 Smed_0970     FALSE 0.008 278.000 0.000 NA   NA
 7037416 7037417 Smed_0970 Smed_0971     FALSE 0.116 101.000 0.000 NA   NA
 7037417 7037418 Smed_0971 Smed_R0018     FALSE 0.045 162.000 0.000 NA   NA
 7037418 7037419 Smed_R0018 Smed_0972   secE FALSE 0.025 196.000 0.000 NA   NA
 7037419 7037420 Smed_0972 Smed_0973 secE nusG TRUE 0.983 17.000 0.843 1.000 N NA
 7037420 7037421 Smed_0973 Smed_0974 nusG rplK FALSE 0.448 217.000 0.681 1.000 N NA
 7037421 7037422 Smed_0974 Smed_0975 rplK rplA TRUE 0.998 5.000 0.838 0.012 Y NA
 7037422 7037423 Smed_0975 Smed_0976 rplA rplJ FALSE 0.526 265.000 0.302 0.012 Y NA
 7037423 7037424 Smed_0976 Smed_0977 rplJ rplL TRUE 0.990 59.000 0.884 0.009 Y NA
 7037424 7037425 Smed_0977 Smed_0978 rplL rpoB FALSE 0.116 265.000 0.223 1.000   NA
 7037425 7037426 Smed_0978 Smed_0979 rpoB   TRUE 0.806 184.000 0.851 0.000   NA
 7037428 7037429 Smed_0981 Smed_0982 rpsL   TRUE 0.987 58.000 0.620 0.002 Y NA
 7037429 7037430 Smed_0982 Smed_0983     TRUE 0.947 30.000 0.114 1.000 Y NA
 7037430 7037431 Smed_0983 Smed_0984     TRUE 0.940 72.000 0.102 0.001 Y NA
 7037431 7037432 Smed_0984 Smed_0985   rpsJ TRUE 0.806 142.000 0.318 1.000 Y NA
 7037432 7037433 Smed_0985 Smed_0986 rpsJ rplC TRUE 0.910 123.000 0.307 0.012 Y NA
 7037433 7037434 Smed_0986 Smed_0987 rplC rplD TRUE 0.996 13.000 0.486 0.009 Y NA
 7037434 7037435 Smed_0987 Smed_0988 rplD rplW TRUE 0.996 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 7037435 7037436 Smed_0988 Smed_0989 rplW rplB TRUE 0.985 45.000 0.849 1.000 Y NA
 7037436 7037437 Smed_0989 Smed_0990 rplB rpsS TRUE 0.997 16.000 0.820 0.012 Y NA
 7037437 7037438 Smed_0990 Smed_0991 rpsS rplV TRUE 0.991 3.000 0.119 0.012 Y NA
 7037438 7037439 Smed_0991 Smed_0992 rplV rpsC TRUE 0.992 0.000 0.109 0.012 Y NA
 7037439 7037440 Smed_0992 Smed_0993 rpsC rplP TRUE 0.993 39.000 0.828 0.012 Y NA
 7037440 7037441 Smed_0993 Smed_0994 rplP   TRUE 0.997 13.000 0.802 0.009 Y NA
 7037441 7037442 Smed_0994 Smed_0995   rpsQ TRUE 0.997 14.000 0.828 0.009 Y NA
 7037442 7037443 Smed_0995 Smed_0996 rpsQ rplN TRUE 0.911 179.000 0.791 0.012 Y NA
 7037443 7037444 Smed_0996 Smed_0997 rplN rplX TRUE 0.997 15.000 0.810 0.012 Y NA
 7037444 7037445 Smed_0997 Smed_0998 rplX rplE TRUE 0.999 -7.000 0.758 0.009 Y NA
 7037445 7037446 Smed_0998 Smed_0999 rplE rpsN TRUE 0.984 35.000 0.309 0.009 Y NA
 7037446 7037447 Smed_0999 Smed_1000 rpsN rpsH TRUE 0.993 13.000 0.295 0.009 Y NA
 7037447 7037448 Smed_1000 Smed_1001 rpsH rplF TRUE 0.993 41.000 0.808 0.009 Y NA
 7037448 7037449 Smed_1001 Smed_1002 rplF rplR TRUE 0.998 13.000 0.815 0.009 Y NA
 7037449 7037450 Smed_1002 Smed_1003 rplR rpsE TRUE 0.958 134.000 0.814 0.012 Y NA
 7037450 7037451 Smed_1003 Smed_1004 rpsE rpmD TRUE 0.997 13.000 0.789 0.012 Y NA
 7037451 7037452 Smed_1004 Smed_1005 rpmD rplO TRUE 0.997 14.000 0.653 0.002 Y NA
 7037452 7037453 Smed_1005 Smed_1006 rplO secY FALSE 0.397 236.000 0.730 1.000 N NA
 7037453 7037454 Smed_1006 Smed_1007 secY adk TRUE 0.887 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7037454 7037455 Smed_1007 Smed_1008 adk rpsM FALSE 0.039 232.000 0.006 1.000 N NA
 7037455 7037456 Smed_1008 Smed_1009 rpsM   TRUE 0.821 233.000 0.810 0.009 Y NA
 7037456 7037457 Smed_1009 Smed_1010     TRUE 0.693 104.000 0.308 1.000 N NA
 7037457 7037458 Smed_1010 Smed_1011   rplQ TRUE 0.957 47.000 0.873 1.000 N NA
 7037459 7037460 Smed_1012 Smed_1013     TRUE 0.994 3.000 0.790 0.054   NA
 7037461 7037462 Smed_1014 Smed_1015     TRUE 0.931 -3.000 0.051 1.000 N NA
 7037462 7037463 Smed_1015 Smed_1016     FALSE 0.113 160.000 0.002 1.000 N NA
 7037464 7037465 Smed_1017 Smed_1018     TRUE 0.976 -7.000 0.269 NA   NA
 7037465 7037466 Smed_1018 Smed_1019     TRUE 0.980 0.000 0.389 1.000   NA
 7037466 7037467 Smed_1019 Smed_1020     TRUE 0.708 39.000 0.083 NA N NA
 7037467 7037468 Smed_1020 Smed_1021     TRUE 0.666 2.000 0.000 NA   NA
 7037468 7037469 Smed_1021 Smed_1022     TRUE 0.792 17.000 0.046 NA   NA
 7037469 7037470 Smed_1022 Smed_1023     TRUE 0.628 23.000 0.012 NA   NA
 7037470 7037471 Smed_1023 Smed_1024     FALSE 0.176 76.000 0.000 NA   NA
 7037471 7037472 Smed_1024 Smed_1025     FALSE 0.224 85.000 0.000 1.000   NA
 7037472 7037473 Smed_1025 Smed_1026   lipB FALSE 0.050 209.000 0.004 1.000   NA
 7037474 7037475 Smed_R0019 Smed_1027     FALSE 0.003 577.000 0.000 NA   NA
 7037475 7037476 Smed_1027 Smed_1028     TRUE 0.966 25.000 0.683 NA   NA
 7037476 7037477 Smed_1028 Smed_1029     TRUE 0.982 13.000 0.761 NA   NA
 7037478 7037479 Smed_1030 Smed_1031     FALSE 0.222 60.000 0.000 NA   NA
 7037479 7037480 Smed_1031 Smed_1032     FALSE 0.036 175.000 0.000 NA   NA
 7037481 7037482 Smed_1033 Smed_1034     FALSE 0.233 175.000 0.118 1.000 N NA
 7037483 7037484 Smed_1035 Smed_1036     TRUE 0.678 53.000 0.118 NA   NA
 7037485 7037486 Smed_1037 Smed_1038     FALSE 0.379 127.000 0.140 NA   NA
 7037487 7037488 Smed_1039 Smed_1040     FALSE 0.403 158.000 0.271 NA   NA
 7037488 7037489 Smed_1040 Smed_1041     FALSE 0.088 244.000 0.146 NA   NA
 7037489 7037490 Smed_1041 Smed_1042     FALSE 0.023 201.000 0.000 NA   NA
 7037490 7037491 Smed_1042 Smed_1043     FALSE 0.003 495.000 0.000 NA   NA
 7037491 7037492 Smed_1043 Smed_1044     TRUE 0.714 91.000 0.320 NA   NA
 7037493 7037494 Smed_1045 Smed_1046     FALSE 0.088 288.000 0.211 1.000   NA
 7037495 7037496 Smed_1047 Smed_1048   hisI FALSE 0.017 346.000 0.017 1.000   NA
 7037496 7037497 Smed_1048 Smed_1049 hisI folE FALSE 0.335 108.000 0.038 1.000 N NA
 7037498 7037499 Smed_1050 Smed_1051     TRUE 0.586 43.000 0.041 NA   NA
 7037499 7037500 Smed_1051 Smed_1052     TRUE 0.641 17.000 0.002 NA   NA
 7037500 7037501 Smed_1052 Smed_1053     TRUE 0.956 6.000 0.250 NA   NA
 7037501 7037502 Smed_1053 Smed_1054   thrS FALSE 0.194 120.000 0.023 NA   NA
 7037504 7037505 Smed_1056 Smed_1057     TRUE 0.955 0.000 0.033 0.054   NA
 7037511 7037512 Smed_1063 Smed_1064     FALSE 0.358 32.000 0.000 NA   NA
 7037513 7037514 Smed_1065 Smed_1066     TRUE 0.923 -3.000 0.064 NA   NA
 7037515 7037516 Smed_1067 Smed_1068   secG FALSE 0.498 123.000 0.184 1.000 N NA
 7037516 7037517 Smed_1068 Smed_1069 secG pyrG FALSE 0.300 144.000 0.083 1.000 N NA
 7037517 7037518 Smed_1069 Smed_1070 pyrG   FALSE 0.111 135.000 0.002 NA   NA
 7037518 7037519 Smed_1070 Smed_1071     TRUE 0.831 3.000 0.023 NA   NA
 7037519 7037520 Smed_1071 Smed_1072   eno FALSE 0.327 113.000 0.041 1.000 N NA
 7037520 7037521 Smed_1072 Smed_1073 eno   FALSE 0.003 633.000 0.000 NA   NA
 7037521 7037522 Smed_1073 Smed_1074     FALSE 0.011 260.000 0.000 NA   NA
 7037522 7037523 Smed_1074 Smed_1075     FALSE 0.004 453.000 0.000 NA   NA
 7037523 7037524 Smed_1075 Smed_1076     FALSE 0.350 137.000 0.104 1.000 N NA
 7037524 7037525 Smed_1076 Smed_1077     TRUE 0.995 18.000 0.456 0.001 Y NA
 7037525 7037526 Smed_1077 Smed_1078     TRUE 0.983 15.000 0.254 1.000 Y NA
 7037526 7037527 Smed_1078 Smed_1079     TRUE 0.555 59.000 0.036 1.000 N NA
 7037527 7037528 Smed_1079 Smed_1080     TRUE 0.967 3.000 0.273 1.000   NA
 7037528 7037529 Smed_1080 Smed_1081     TRUE 0.776 19.000 0.028 1.000   NA
 7037529 7037530 Smed_1081 Smed_1082     FALSE 0.349 79.000 0.007 1.000   NA
 7037530 7037531 Smed_1082 Smed_1083     FALSE 0.052 182.000 0.000 1.000   NA
 7037531 7037532 Smed_1083 Smed_1084     FALSE 0.075 128.000 0.000 NA   NA
 7037532 7037533 Smed_1084 Smed_1085     TRUE 0.613 10.000 0.000 NA   NA
 7037534 7037535 Smed_1086 Smed_1087   ispDF TRUE 0.905 0.000 0.061 NA   NA
 7037536 7037537 Smed_1088 Smed_1089     TRUE 0.949 -3.000 0.094 1.000 N NA
 7037537 7037538 Smed_1089 Smed_1090     TRUE 0.994 -3.000 0.297 1.000 Y NA
 7037538 7037539 Smed_1090 Smed_1091     FALSE 0.439 217.000 0.205 1.000 Y NA
 7037539 7037540 Smed_1091 Smed_1092     TRUE 0.997 -10.000 0.533 1.000 Y NA
 7037540 7037541 Smed_1092 Smed_1093   trkA TRUE 0.633 65.000 0.085 1.000 N NA
 7037541 7037542 Smed_1093 Smed_1094 trkA   TRUE 0.799 12.000 0.008 1.000 N NA
 7037542 7037543 Smed_1094 Smed_1095   hfq TRUE 0.639 103.000 0.243 1.000   NA
 7037543 7037544 Smed_1095 Smed_1096 hfq   TRUE 0.930 7.000 0.115 1.000   NA
 7037545 7037546 Smed_1097 Smed_1098 mazG   TRUE 0.848 4.000 0.015 1.000   NA
 7037547 7037548 Smed_1099 Smed_1100     TRUE 0.933 11.000 0.188 NA   NA
 7037548 7037549 Smed_1100 Smed_1101     TRUE 0.984 15.000 0.919 NA   NA
 7037549 7037550 Smed_1101 Smed_1102     TRUE 0.938 18.000 0.309 NA   NA
 7037550 7037551 Smed_1102 Smed_1103     FALSE 0.139 145.000 0.022 NA   NA
 7037552 7037553 Smed_1104 Smed_1105     FALSE 0.037 205.000 0.000 1.000 N NA
 7037553 7037554 Smed_1105 Smed_1106     TRUE 0.993 17.000 0.734 1.000 Y NA
 7037554 7037555 Smed_1106 Smed_1107     TRUE 0.998 5.000 0.815 0.010 Y NA
 7037555 7037556 Smed_1107 Smed_1108     TRUE 0.955 100.000 0.548 0.099 Y NA
 7037558 7037559 Smed_1110 Smed_1111     TRUE 0.964 28.000 0.745 NA   NA
 7037560 7037561 Smed_1112 Smed_1113     FALSE 0.237 187.000 0.200 NA N NA
 7037561 7037562 Smed_1113 Smed_1114     FALSE 0.511 154.000 0.386 NA   NA
 7037562 7037563 Smed_1114 Smed_1115     FALSE 0.012 248.000 0.000 NA   NA
 7037563 7037564 Smed_1115 Smed_1116   clpS FALSE 0.019 270.000 0.011 NA   NA
 7037564 7037565 Smed_1116 Smed_1117 clpS   TRUE 0.981 10.000 0.596 NA   NA
 7037565 7037566 Smed_1117 Smed_1118     FALSE 0.325 75.000 0.014 NA   NA
 7037566 7037567 Smed_1118 Smed_1119     TRUE 0.959 6.000 0.275 NA   NA
 7037568 7037569 Smed_1120 Smed_1121     TRUE 0.733 45.000 0.131 NA   NA
 7037569 7037570 Smed_1121 Smed_1122     TRUE 0.961 5.000 0.280 NA   NA
 7037570 7037571 Smed_1122 Smed_1123     TRUE 0.979 14.000 0.696 NA N NA
 7037574 7037575 Smed_1126 Smed_1127     TRUE 0.955 -3.000 0.150 NA N NA
 7037575 7037576 Smed_1127 Smed_1128     TRUE 0.998 -3.000 0.900 1.000 Y NA
 7037576 7037577 Smed_1128 Smed_1129     TRUE 0.992 8.000 0.389 1.000 Y NA
 7037577 7037578 Smed_1129 Smed_1130     TRUE 0.944 57.000 0.286 1.000 Y NA
 7037578 7037579 Smed_1130 Smed_1131   rpsB FALSE 0.043 196.000 0.000 1.000 N NA
 7037579 7037580 Smed_1131 Smed_1132 rpsB tsf TRUE 0.640 248.000 0.748 1.000 Y NA
 7037580 7037581 Smed_1132 Smed_1133 tsf pyrH FALSE 0.439 184.000 0.416 1.000 N NA
 7037581 7037582 Smed_1133 Smed_1134 pyrH frr TRUE 0.929 52.000 0.626 1.000 N NA
 7037582 7037583 Smed_1134 Smed_1135 frr   TRUE 0.953 22.000 0.409 1.000 N NA
 7037583 7037584 Smed_1135 Smed_1136     TRUE 0.994 0.000 0.400 1.000 Y NA
 7037584 7037585 Smed_1136 Smed_1137     FALSE 0.331 131.000 0.080 1.000 N NA
 7037585 7037586 Smed_1137 Smed_1138     FALSE 0.339 249.000 0.204 1.000 Y NA
 7037586 7037587 Smed_1138 Smed_1139   lpxD TRUE 0.905 44.000 0.063 1.000 Y NA
 7037587 7037588 Smed_1139 Smed_1140 lpxD fabZ TRUE 0.975 -7.000 0.212 1.000 N NA
 7037588 7037589 Smed_1140 Smed_1141 fabZ   TRUE 0.968 3.000 0.264 1.000 N NA
 7037589 7037590 Smed_1141 Smed_1142     TRUE 0.985 0.000 0.552 NA   NA
 7037590 7037591 Smed_1142 Smed_1143   lpxB TRUE 0.959 -3.000 0.173 NA   NA
 7037593 7037594 Smed_1145 Smed_1146     FALSE 0.016 226.000 0.000 NA   NA
 7037594 7037595 Smed_1146 Smed_1147     TRUE 0.996 8.000 0.810 1.000 Y NA
 7037595 7037596 Smed_1147 Smed_1148     FALSE 0.013 289.000 0.000 1.000 N NA
 7037596 7037597 Smed_1148 Smed_1149     FALSE 0.038 284.000 0.047 1.000 N NA
 7037597 7037598 Smed_1149 Smed_1150     FALSE 0.030 251.000 0.024 NA   NA
 7037598 7037599 Smed_1150 Smed_1151   valS FALSE 0.020 307.000 0.033 NA   NA
 7037599 7037600 Smed_1151 Smed_1152 valS   FALSE 0.007 431.000 0.000 1.000 N NA
 7037600 7037601 Smed_1152 Smed_1153     FALSE 0.006 458.000 0.000 1.000   NA
 7037605 7037606 Smed_1157 Smed_1158   argS FALSE 0.436 99.000 0.062 1.000 N NA
 7037606 7037607 Smed_1158 Smed_1159 argS   FALSE 0.424 64.000 0.027 NA   NA
 7037607 7037608 Smed_1159 Smed_1160     FALSE 0.275 121.000 0.056 NA   NA
 7037608 7037609 Smed_1160 Smed_1161     FALSE 0.432 102.000 0.103 NA   NA
 7037609 7037610 Smed_1161 Smed_1162     TRUE 0.989 -7.000 0.570 NA   NA
 7037610 7037611 Smed_1162 Smed_1163     FALSE 0.352 68.000 0.011 NA N NA
 7037611 7037612 Smed_1163 Smed_1164   tatA FALSE 0.126 239.000 0.176 1.000 N NA
 7037612 7037613 Smed_1164 Smed_1165 tatA   TRUE 0.868 73.000 0.000 0.005 Y NA
 7037613 7037614 Smed_1165 Smed_1166     TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 7037614 7037615 Smed_1166 Smed_1167     FALSE 0.267 132.000 0.065 NA N NA
 7037615 7037616 Smed_1167 Smed_1168   surE FALSE 0.402 102.000 0.058 1.000   NA
 7037616 7037617 Smed_1168 Smed_1169 surE pcm TRUE 0.961 -3.000 0.147 1.000   NA
 7037617 7037618 Smed_1169 Smed_1170 pcm   FALSE 0.077 163.000 0.005 NA   NA
 7037618 7037619 Smed_1170 Smed_1171     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 7037621 7037622 Smed_1173 Smed_1174     FALSE 0.217 161.000 0.099 NA   NA
 7037622 7037623 Smed_1174 Smed_1175     TRUE 0.891 3.000 0.060 NA   NA
 7037623 7037624 Smed_1175 Smed_1176     TRUE 0.875 22.000 0.165 NA   NA
 7037624 7037625 Smed_1176 Smed_1177     FALSE 0.444 82.000 0.059 NA   NA
 7037626 7037627 Smed_1178 Smed_1179     FALSE 0.284 92.000 0.023 NA   NA
 7037627 7037628 Smed_1179 Smed_1180     FALSE 0.007 296.000 0.000 NA   NA
 7037629 7037630 Smed_R0020 Smed_1181   tig FALSE 0.035 176.000 0.000 NA   NA
 7037631 7037632 Smed_1182 Smed_1183     TRUE 0.986 0.000 0.130 1.000 Y NA
 7037632 7037633 Smed_1183 Smed_1184   gcvT TRUE 0.990 17.000 0.202 0.003 Y NA
 7037634 7037635 Smed_1185 Smed_1186     TRUE 0.729 89.000 0.333 NA   NA
 7037636 7037637 Smed_1187 Smed_1188     FALSE 0.002 1099.000 0.000 NA   NA
 7037639 7037640 Smed_1190 Smed_1191     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037640 7037641 Smed_1191 Smed_1192     FALSE 0.494 18.000 0.000 NA   NA
 7037641 7037642 Smed_1192 Smed_1193     TRUE 0.875 16.000 0.118 NA   NA
 7037642 7037643 Smed_1193 Smed_1194     TRUE 0.763 -37.000 0.000 NA   NA
 7037643 7037644 Smed_1194 Smed_1195     FALSE 0.171 78.000 0.000 NA   NA
 7037646 7037647 Smed_1197 Smed_1198     FALSE 0.004 452.000 0.000 NA   NA
 7037647 7037648 Smed_1198 Smed_1199     TRUE 0.625 8.000 0.000 NA   NA
 7037649 7037650 Smed_1200 Smed_1201     FALSE 0.060 145.000 0.000 NA   NA
 7037650 7037651 Smed_1201 Smed_1202     TRUE 0.599 11.000 0.000 NA   NA
 7037651 7037652 Smed_1202 Smed_1203     TRUE 0.613 10.000 0.000 NA   NA
 7037652 7037653 Smed_1203 Smed_1204     FALSE 0.011 260.000 0.000 NA   NA
 7037657 7037658 Smed_1208 Smed_1209     TRUE 0.742 36.000 0.100 NA   NA
 7037658 7037659 Smed_1209 Smed_1210     FALSE 0.522 82.000 0.100 NA   NA
 7037659 7037660 Smed_1210 Smed_1211     TRUE 0.714 28.000 0.050 NA   NA
 7037660 7037661 Smed_1211 Smed_1212     FALSE 0.076 159.000 0.000 1.000   NA
 7037661 7037662 Smed_1212 Smed_1213     TRUE 0.612 20.000 0.000 1.000 N NA
 7037662 7037663 Smed_1213 Smed_1214     FALSE 0.134 97.000 0.000 NA N NA
 7037664 7037665 Smed_1215 Smed_1216     FALSE 0.002 856.000 0.000 NA   NA
 7037665 7037666 Smed_1216 Smed_1217     FALSE 0.110 104.000 0.000 NA   NA
 7037666 7037667 Smed_1217 Smed_1218     FALSE 0.444 23.000 0.000 NA   NA
 7037667 7037668 Smed_1218 Smed_1219     FALSE 0.507 17.000 0.000 NA   NA
 7037669 7037670 Smed_1220 Smed_1221     TRUE 0.966 -3.000 0.000 NA Y NA
 7037670 7037671 Smed_1221 Smed_1222     TRUE 0.790 49.000 0.000 NA Y NA
 7037671 7037672 Smed_1222 Smed_1223     FALSE 0.032 513.000 0.000 NA Y NA
 7037672 7037673 Smed_1223 Smed_1224     FALSE 0.239 54.000 0.000 NA   NA
 7037673 7037674 Smed_1224 Smed_1225     TRUE 0.945 -3.000 0.116 NA   NA
 7037675 7037676 Smed_1226 Smed_1227     TRUE 0.759 -13.000 0.000 NA   NA
 7037676 7037677 Smed_1227 Smed_1228     TRUE 0.990 -3.000 0.667 NA   NA
 7037677 7037678 Smed_1228 Smed_1229     FALSE 0.003 543.000 0.000 NA   NA
 7037678 7037679 Smed_1229 Smed_1230     FALSE 0.068 136.000 0.000 NA   NA
 7037679 7037680 Smed_1230 Smed_1231     TRUE 0.918 -43.000 0.041 NA   NA
 7037680 7037681 Smed_1231 Smed_1232     TRUE 0.934 -19.000 0.062 NA   NA
 7037681 7037682 Smed_1232 Smed_1233     FALSE 0.028 190.000 0.000 NA   NA
 7037682 7037683 Smed_1233 Smed_1234     FALSE 0.003 701.000 0.000 NA   NA
 7037683 7037684 Smed_1234 Smed_1235   uvrA FALSE 0.124 132.000 0.005 NA   NA
 7037686 7037687 Smed_1237 Smed_1238     TRUE 0.689 44.000 0.094 NA   NA
 7037687 7037688 Smed_1238 Smed_1239     FALSE 0.125 96.000 0.000 NA   NA
 7037688 7037689 Smed_1239 Smed_1240     FALSE 0.006 334.000 0.000 NA N NA
 7037691 7037692 Smed_1242 Smed_1243     TRUE 0.709 73.000 0.000 NA Y NA
 7037692 7037693 Smed_1243 Smed_1244     FALSE 0.464 36.000 0.000 1.000 N NA
 7037693 7037694 Smed_1244 Smed_1245     TRUE 0.771 58.000 0.189 1.000 N NA
 7037694 7037695 Smed_1245 Smed_1246     TRUE 0.821 51.000 0.224 1.000 N NA
 7037695 7037696 Smed_1246 Smed_1247     FALSE 0.055 639.000 0.000 0.086 Y NA
 7037696 7037697 Smed_1247 Smed_1248     FALSE 0.080 232.000 0.065 1.000 N NA
 7037698 7037699 Smed_1249 Smed_1250     FALSE 0.220 98.000 0.007 NA N NA
 7037699 7037700 Smed_1250 Smed_1251     TRUE 0.925 19.000 0.007 NA Y NA
 7037700 7037701 Smed_1251 Smed_1252     TRUE 0.999 -3.000 0.667 0.001 Y NA
 7037702 7037703 Smed_1253 Smed_1254   greA FALSE 0.424 86.000 0.036 1.000 N NA
 7037705 7037706 Smed_1256 Smed_1257   carB FALSE 0.119 132.000 0.003 NA   NA
 7037706 7037707 Smed_1257 Smed_1258 carB   FALSE 0.202 210.000 0.000 1.000 Y NA
 7037710 7037711 Smed_1261 Smed_1262     FALSE 0.197 157.000 0.043 1.000 N NA
 7037711 7037712 Smed_1262 Smed_1263     FALSE 0.140 158.000 0.015 1.000 N NA
 7037712 7037713 Smed_1263 Smed_1264   coaD FALSE 0.005 553.000 0.000 1.000 N NA
 7037713 7037714 Smed_1264 Smed_1265 coaD   TRUE 0.726 25.000 0.024 1.000 N NA
 7037714 7037715 Smed_1265 Smed_1266     TRUE 0.992 25.000 0.420 0.001 Y NA
 7037715 7037716 Smed_1266 Smed_1267   queA FALSE 0.455 78.000 0.031 1.000 N NA
 7037716 7037717 Smed_1267 Smed_1268 queA tgt TRUE 0.997 1.000 0.360 0.000 Y NA
 7037718 7037719 Smed_1269 Smed_1270     TRUE 0.891 -3.000 0.033 NA   NA
 7037719 7037720 Smed_1270 Smed_1271     TRUE 0.827 11.000 0.036 NA   NA
 7037720 7037721 Smed_1271 Smed_1272     FALSE 0.116 170.000 0.036 NA   NA
 7037721 7037722 Smed_1272 Smed_1273     FALSE 0.003 491.000 0.000 NA   NA
 7037727 7037728 Smed_1278 Smed_1279     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037728 7037729 Smed_1279 Smed_1280     FALSE 0.015 231.000 0.000 NA   NA
 7037730 7037731 Smed_1281 Smed_1282 groEL   TRUE 0.826 46.000 0.000 1.000 Y NA
 7037732 7037733 Smed_1283 Smed_1284     TRUE 0.736 97.000 0.400 NA   NA
 7037734 7037735 Smed_1285 Smed_1286     FALSE 0.004 639.000 0.000 1.000   NA
 7037735 7037736 Smed_1286 Smed_1287     FALSE 0.366 126.000 0.000 0.008   NA
 7037736 7037737 Smed_1287 Smed_1288     FALSE 0.074 160.000 0.000 1.000   NA
 7037737 7037738 Smed_1288 Smed_1289     TRUE 0.930 4.000 0.139 NA   NA
 7037738 7037739 Smed_1289 Smed_1290     TRUE 0.927 15.000 0.221 NA N NA
 7037739 7037740 Smed_1290 Smed_1291     FALSE 0.121 204.000 0.075 1.000 N NA
 7037740 7037741 Smed_1291 Smed_1292     TRUE 0.976 -3.000 0.254 1.000 N NA
 7037741 7037742 Smed_1292 Smed_1293     TRUE 0.682 58.000 0.099 1.000 N NA
 7037742 7037743 Smed_1293 Smed_1294     TRUE 0.916 57.000 0.198 NA Y NA
 7037744 7037745 Smed_R0021 Smed_1295     FALSE 0.131 93.000 0.000 NA   NA
 7037745 7037746 Smed_1295 Smed_1296     FALSE 0.227 58.000 0.000 NA   NA
 7037748 7037749 Smed_1298 Smed_1299     FALSE 0.029 189.000 0.000 NA   NA
 7037749 7037750 Smed_1299 Smed_1300     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7037750 7037751 Smed_1300 Smed_1301     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037751 7037752 Smed_1301 Smed_1302     FALSE 0.118 100.000 0.000 NA   NA
 7037752 7037753 Smed_1302 Smed_1303     FALSE 0.291 43.000 0.000 NA   NA
 7037753 7037754 Smed_1303 Smed_1304     FALSE 0.135 91.000 0.000 NA   NA
 7037756 7037757 Smed_1306 Smed_1307     TRUE 0.754 -7.000 0.000 NA   NA
 7037760 7037761 Smed_1310 Smed_1311     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037761 7037762 Smed_1311 Smed_1312     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037762 7037763 Smed_1312 Smed_1313     FALSE 0.037 173.000 0.000 NA   NA
 7037763 7037764 Smed_1313 Smed_1314     FALSE 0.045 162.000 0.000 NA   NA
 7037764 7037765 Smed_1314 Smed_1315     FALSE 0.187 73.000 0.000 NA   NA
 7037765 7037766 Smed_1315 Smed_1316     TRUE 0.673 1.000 0.000 NA   NA
 7037768 7037769 Smed_1318 Smed_1319     TRUE 0.757 -10.000 0.000 NA   NA
 7037769 7037770 Smed_1319 Smed_1320     TRUE 0.613 10.000 0.000 NA   NA
 7037770 7037771 Smed_1320 Smed_1321     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037773 7037774 Smed_1323 Smed_1324     TRUE 0.967 0.000 0.273 NA   NA
 7037774 7037775 Smed_1324 Smed_1325     TRUE 0.651 41.000 0.061 NA   NA
 7037775 7037776 Smed_1325 Smed_1326     TRUE 0.905 0.000 0.061 NA   NA
 7037776 7037777 Smed_1326 Smed_1327     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037777 7037778 Smed_1327 Smed_1328     FALSE 0.055 151.000 0.000 NA   NA
 7037778 7037779 Smed_1328 Smed_1329     TRUE 0.666 2.000 0.000 NA   NA
 7037779 7037780 Smed_1329 Smed_1330     TRUE 0.613 10.000 0.000 NA   NA
 7037780 7037781 Smed_1330 Smed_1331     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7037781 7037782 Smed_1331 Smed_1332     FALSE 0.482 19.000 0.000 NA   NA
 7037782 7037783 Smed_1332 Smed_1333     FALSE 0.018 216.000 0.000 NA   NA
 7037783 7037784 Smed_1333 Smed_1334     FALSE 0.215 63.000 0.000 NA   NA
 7037784 7037785 Smed_1334 Smed_1335     FALSE 0.275 46.000 0.000 NA   NA
 7037785 7037786 Smed_1335 Smed_1336     TRUE 0.983 -13.000 0.375 NA   NA
 7037786 7037787 Smed_1336 Smed_1337     FALSE 0.494 18.000 0.000 NA   NA
 7037787 7037788 Smed_1337 Smed_1338     FALSE 0.085 120.000 0.000 NA   NA
 7037788 7037789 Smed_1338 Smed_1339     FALSE 0.255 113.000 0.038 NA   NA
 7037790 7037791 Smed_1340 Smed_1341     FALSE 0.444 23.000 0.000 NA   NA
 7037792 7037793 Smed_1342 Smed_1343     TRUE 0.673 1.000 0.000 NA   NA
 7037793 7037794 Smed_1343 Smed_1344     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7037794 7037795 Smed_1344 Smed_1345     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7037795 7037796 Smed_1345 Smed_1346     FALSE 0.010 268.000 0.000 NA   NA
 7037796 7037797 Smed_1346 Smed_1347     FALSE 0.015 232.000 0.000 NA   NA
 7037797 7037798 Smed_1347 Smed_1348     FALSE 0.003 647.000 0.000 NA   NA
 7037798 7037799 Smed_1348 Smed_1349     FALSE 0.018 215.000 0.000 NA   NA
 7037800 7037801 Smed_1350 Smed_1351     FALSE 0.059 147.000 0.000 NA   NA
 7037801 7037802 Smed_1351 Smed_R0022     FALSE 0.072 131.000 0.000 NA   NA
 7037802 7037803 Smed_R0022 Smed_1352     FALSE 0.024 198.000 0.000 NA   NA
 7037803 7037804 Smed_1352 Smed_1353     FALSE 0.014 233.000 0.000 NA   NA
 7037804 7037805 Smed_1353 Smed_R0023     FALSE 0.095 113.000 0.000 NA   NA
 7037813 7037814 Smed_1360 Smed_1361     TRUE 0.999 -3.000 0.869 0.044 Y NA
 7037816 7037817 Smed_1363 Smed_1364     TRUE 0.895 8.000 0.082 NA   NA
 7037817 7037818 Smed_1364 Smed_1365     TRUE 0.851 35.000 0.222 NA   NA
 7037818 7037819 Smed_1365 Smed_1366     TRUE 0.945 6.000 0.200 NA   NA
 7037819 7037820 Smed_1366 Smed_1367     FALSE 0.287 115.000 0.053 NA   NA
 7037822 7037823 Smed_1369 Smed_1370     FALSE 0.096 112.000 0.000 NA   NA
 7037824 7037825 Smed_1372 Smed_1373     FALSE 0.517 65.000 0.056 NA   NA
 7037826 7037827 Smed_1374 Smed_1375     FALSE 0.163 80.000 0.000 NA   NA
 7037828 7037829 Smed_R0025 Smed_1376     FALSE 0.045 162.000 0.000 NA   NA
 7037830 7037831 Smed_1377 Smed_1378     FALSE 0.090 116.000 0.000 NA   NA
 7037832 7037833 Smed_1379 Smed_1380     FALSE 0.045 162.000 0.000 NA   NA
 7037835 7037836 Smed_1382 Smed_1383     FALSE 0.149 85.000 0.000 NA   NA
 7037836 7037837 Smed_1383 Smed_1384     FALSE 0.006 316.000 0.000 NA   NA
 7037838 7037839 Smed_1385 Smed_1386     FALSE 0.125 190.000 0.052 1.000   NA
 7037841 7037842 Smed_1388 Smed_1389     TRUE 0.865 82.000 0.145 1.000 Y NA
 7037842 7037843 Smed_1389 Smed_1390     FALSE 0.066 181.000 0.012 NA   NA
 7037844 7037845 Smed_1391 Smed_1392     TRUE 0.994 10.000 0.545 1.000 Y NA
 7037845 7037846 Smed_1392 Smed_1393     TRUE 0.998 0.000 0.727 0.096 Y NA
 7037846 7037847 Smed_1393 Smed_1394     TRUE 0.990 21.000 0.571 1.000 Y NA
 7037850 7037851 Smed_1397 Smed_1398     TRUE 0.634 83.000 0.147 1.000 N NA
 7037852 7037853 Smed_1399 Smed_1400     TRUE 0.930 -3.000 0.078 NA   NA
 7037855 7037856 Smed_1402 Smed_1403     TRUE 0.661 19.000 0.012 NA   NA
 7037856 7037857 Smed_1403 Smed_1404     TRUE 0.907 -3.000 0.027 1.000   NA
 7037857 7037858 Smed_1404 Smed_1405     FALSE 0.480 178.000 0.083 1.000 Y NA
 7037858 7037859 Smed_1405 Smed_1406     FALSE 0.099 168.000 0.002 1.000 N NA
 7037860 7037861 Smed_1407 Smed_1408   trpD TRUE 0.744 19.000 0.014 1.000 N NA
 7037861 7037862 Smed_1408 Smed_1409 trpD trpC TRUE 0.989 10.000 0.293 1.000 Y NA
 7037862 7037863 Smed_1409 Smed_1410 trpC moaC TRUE 0.945 0.000 0.113 1.000 N NA
 7037863 7037864 Smed_1410 Smed_1411 moaC   TRUE 0.992 0.000 0.093 0.003 Y NA
 7037865 7037866 Smed_1412 Smed_1413     FALSE 0.243 53.000 0.000 NA   NA
 7037866 7037867 Smed_1413 Smed_1414     FALSE 0.249 114.000 0.036 NA   NA
 7037867 7037868 Smed_1414 Smed_1415     FALSE 0.018 255.000 0.000 1.000   NA
 7037868 7037869 Smed_1415 Smed_1416     TRUE 0.887 41.000 0.318 1.000   NA
 7037869 7037870 Smed_1416 Smed_1417     TRUE 0.995 0.000 0.923 0.095   NA
 7037870 7037871 Smed_1417 Smed_1418     TRUE 0.987 -10.000 0.418 1.000   NA
 7037871 7037872 Smed_1418 Smed_1419     TRUE 0.799 47.000 0.182 1.000   NA
 7037872 7037873 Smed_1419 Smed_1420     TRUE 0.798 35.000 0.108 1.000 N NA
 7037875 7037876 Smed_1422 Smed_1423     TRUE 0.781 30.000 0.075 1.000   NA
 7037877 7037878 Smed_R0026 Smed_1424     FALSE 0.011 258.000 0.000 NA   NA
 7037878 7037879 Smed_1424 Smed_1425     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7037879 7037880 Smed_1425 Smed_1426     FALSE 0.087 119.000 0.000 NA   NA
 7037880 7037881 Smed_1426 Smed_1427     TRUE 0.913 13.000 0.000 0.001   NA
 7037881 7037882 Smed_1427 Smed_1428     FALSE 0.017 261.000 0.000 1.000   NA
 7037884 7037885 Smed_1430 Smed_1431     FALSE 0.002 870.000 0.000 NA   NA
 7037885 7037886 Smed_1431 Smed_1432     FALSE 0.014 235.000 0.000 NA   NA
 7037888 7037889 Smed_1434 Smed_1435     FALSE 0.016 223.000 0.000 NA   NA
 7037890 7037891 Smed_1436 Smed_1437     TRUE 0.959 3.000 0.250 NA   NA
 7037891 7037892 Smed_1437 Smed_1438     TRUE 0.998 -3.000 0.600 0.087 Y NA
 7037892 7037893 Smed_1438 Smed_1439     TRUE 0.988 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 7037893 7037894 Smed_1439 Smed_1440     TRUE 0.978 -3.000 0.278 1.000 N NA
 7037894 7037895 Smed_1440 Smed_1441     TRUE 0.940 4.000 0.130 1.000 N NA
 7037895 7037896 Smed_1441 Smed_1442     TRUE 0.688 101.000 0.286 1.000 N NA
 7037896 7037897 Smed_1442 Smed_1443     TRUE 0.952 49.000 0.286 1.000 Y NA
 7037898 7037899 Smed_1444 Smed_1445     FALSE 0.003 625.000 0.000 NA   NA
 7037899 7037900 Smed_1445 Smed_1446     FALSE 0.190 72.000 0.000 NA   NA
 7037901 7037902 Smed_R0027 Smed_1447     FALSE 0.364 31.000 0.000 NA   NA
 7037902 7037903 Smed_1447 Smed_R0028     FALSE 0.239 54.000 0.000 NA   NA
 7037903 7037904 Smed_R0028 Smed_1448     FALSE 0.128 94.000 0.000 NA   NA
 7037904 7037905 Smed_1448 Smed_1449     TRUE 0.961 0.000 0.226 NA   NA
 7037906 7037907 Smed_1450 Smed_1451     FALSE 0.004 411.000 0.000 NA   NA
 7037907 7037908 Smed_1451 Smed_R0029     FALSE 0.035 177.000 0.000 NA   NA
 7037908 7037909 Smed_R0029 Smed_R0030     FALSE 0.018 217.000 0.000 NA   NA
 7037909 7037910 Smed_R0030 Smed_R0031     FALSE 0.230 57.000 0.000 NA   NA
 7037910 7037911 Smed_R0031 Smed_R0032     FALSE 0.030 186.000 0.000 NA   NA
 7037912 7037913 Smed_1452 Smed_1453     FALSE 0.190 128.000 0.009 1.000 N NA
 7037913 7037914 Smed_1453 Smed_1454     TRUE 0.896 79.000 0.202 1.000 Y NA
 7037914 7037915 Smed_1454 Smed_1455     FALSE 0.146 125.000 0.009 NA   NA
 7037916 7037917 Smed_1456 Smed_1457     FALSE 0.460 44.000 0.013 NA   NA
 7037917 7037918 Smed_1457 Smed_1458     TRUE 0.750 30.000 0.080 NA   NA
 7037918 7037919 Smed_1458 Smed_1459   radC TRUE 0.966 -3.000 0.169 1.000 N NA
 7037921 7037922 Smed_1461 Smed_1462     FALSE 0.072 165.000 0.000 1.000 N NA
 7037923 7037924 Smed_1463 Smed_1464     FALSE 0.389 104.000 0.083 NA   NA
 7037924 7037925 Smed_1464 Smed_1465     TRUE 0.958 11.000 0.309 NA   NA
 7037925 7037926 Smed_1465 Smed_1466     TRUE 0.937 13.000 0.193 1.000 N NA
 7037926 7037927 Smed_1466 Smed_1467     TRUE 0.986 23.000 0.482 1.000 Y NA
 7037927 7037928 Smed_1467 Smed_1468     TRUE 0.910 109.000 0.466 1.000 Y NA
 7037928 7037929 Smed_1468 Smed_1469     FALSE 0.295 155.000 0.109 1.000 N NA
 7037931 7037932 Smed_1471 Smed_1472   anmK FALSE 0.231 91.000 0.004 NA N NA
 7037935 7037936 Smed_1475 Smed_1476     TRUE 0.830 18.000 0.052 1.000   NA
 7037936 7037937 Smed_1476 Smed_1477     FALSE 0.254 142.000 0.054 1.000   NA
 7037937 7037938 Smed_1477 Smed_1478     FALSE 0.115 197.000 0.058 1.000   NA
 7037938 7037939 Smed_1478 Smed_1479     TRUE 0.909 11.000 0.087 1.000 N NA
 7037940 7037941 Smed_1480 Smed_1481     TRUE 0.866 4.000 0.039 NA N NA
 7037941 7037942 Smed_1481 Smed_1482     TRUE 0.984 -3.000 0.447 NA N NA
 7037942 7037943 Smed_1482 Smed_1483     TRUE 0.981 4.000 0.533 NA   NA
 7037943 7037944 Smed_1483 Smed_1484     TRUE 0.841 57.000 0.355 NA   NA
 7037944 7037945 Smed_1484 Smed_1485     TRUE 0.984 6.000 0.645 NA   NA
 7037945 7037946 Smed_1485 Smed_1486     TRUE 0.857 24.000 0.117 1.000   NA
 7037947 7037948 Smed_1487 Smed_1488     TRUE 0.977 -3.000 0.027 NA Y NA
 7037948 7037949 Smed_1488 Smed_1489     FALSE 0.089 157.000 0.003 NA N NA
 7037949 7037950 Smed_1489 Smed_1490     TRUE 0.856 -3.000 0.015 NA   NA
 7037950 7037951 Smed_1490 Smed_1491     TRUE 0.959 0.000 0.212 NA   NA
 7037951 7037952 Smed_1491 Smed_1492     FALSE 0.339 65.000 0.008 NA   NA
 7037952 7037953 Smed_1492 Smed_1493     FALSE 0.116 131.000 0.002 NA   NA
 7037956 7037957 Smed_1496 Smed_1497     FALSE 0.078 126.000 0.000 NA   NA
 7037958 7037959 Smed_1498 Smed_1499     TRUE 0.988 19.000 0.460 1.000 Y NA
 7037959 7037960 Smed_1499 Smed_1500     TRUE 0.981 81.000 0.656 0.001 Y NA
 7037960 7037961 Smed_1500 Smed_1501     FALSE 0.172 126.000 0.020 NA   NA
 7037963 7037964 Smed_1503 Smed_1504     FALSE 0.415 96.000 0.078 NA   NA
 7037964 7037965 Smed_1504 Smed_1505     FALSE 0.075 171.000 0.009 NA   NA
 7037965 7037966 Smed_1505 Smed_1506     FALSE 0.330 125.000 0.093 NA N NA
 7037966 7037967 Smed_1506 Smed_1507     TRUE 0.634 6.000 0.000 NA   NA
 7037967 7037968 Smed_1507 Smed_1508     FALSE 0.114 163.000 0.028 NA   NA
 7037968 7037969 Smed_1508 Smed_1509     FALSE 0.048 344.000 0.147 1.000 N NA
 7037969 7037970 Smed_1509 Smed_1510     TRUE 0.881 43.000 0.042 NA Y NA
 7037971 7037972 Smed_1511 Smed_1512     TRUE 0.788 3.000 0.005 NA N NA
 7037972 7037973 Smed_1512 Smed_1513     FALSE 0.158 142.000 0.025 NA N NA
 7037973 7037974 Smed_1513 Smed_1514   rpsD FALSE 0.299 96.000 0.011 1.000 N NA
 7037974 7037975 Smed_1514 Smed_1515 rpsD   FALSE 0.019 253.000 0.000 1.000   NA
 7037975 7037976 Smed_1515 Smed_1516     FALSE 0.171 129.000 0.005 1.000   NA
 7037976 7037977 Smed_1516 Smed_1517     TRUE 0.921 -13.000 0.025 1.000 N NA
 7037977 7037978 Smed_1517 Smed_1518     FALSE 0.427 51.000 0.014 NA   NA
 7037979 7037980 Smed_1519 Smed_1520     FALSE 0.011 257.000 0.000 NA   NA
 7037981 7037982 Smed_1521 Smed_1522 alaS recA FALSE 0.146 219.000 0.054 0.098 N NA
 7037983 7037984 Smed_1523 Smed_1524     FALSE 0.064 141.000 0.000 NA   NA
 7037988 7037989 Smed_1528 Smed_1529     FALSE 0.170 167.000 0.072 NA   NA
 7037989 7037990 Smed_1529 Smed_1530     TRUE 0.992 -3.000 0.791 NA   NA
 7037990 7037991 Smed_1530 Smed_1531     FALSE 0.284 120.000 0.059 NA   NA
 7037992 7037993 Smed_1532 Smed_1533     TRUE 0.991 -13.000 0.142 1.000 Y NA
 7037993 7037994 Smed_1533 Smed_1534     TRUE 0.987 -3.000 0.094 1.000 Y NA
 7037996 7037997 Smed_1536 Smed_1537     FALSE 0.148 290.000 0.451 NA   NA
 7037999 7038000 Smed_1539 Smed_1540     TRUE 0.993 32.000 0.630 0.001 Y NA
 7038000 7038001 Smed_1540 Smed_1541     TRUE 0.981 15.000 0.029 0.001 Y NA
 7038001 7038002 Smed_1541 Smed_1542     FALSE 0.011 317.000 0.000 1.000 N NA
 7038002 7038003 Smed_1542 Smed_1543     TRUE 0.934 117.000 0.385 0.006 Y NA
 7038007 7038008 Smed_1547 Smed_1548     FALSE 0.059 147.000 0.000 NA   NA
 7038009 7038010 Smed_1549 Smed_1550     FALSE 0.240 85.000 0.004 NA   NA
 7038011 7038012 Smed_1551 Smed_1552     TRUE 0.546 80.000 0.109 NA   NA
 7038012 7038013 Smed_1552 Smed_1553     TRUE 0.963 87.000 0.850 NA Y NA
 7038013 7038014 Smed_1553 Smed_1554     TRUE 0.996 11.000 0.889 NA Y NA
 7038016 7038017 Smed_1556 Smed_1557     FALSE 0.211 138.000 0.029 1.000   NA
 7038018 7038019 Smed_1558 Smed_1559     FALSE 0.037 205.000 0.000 1.000 N NA
 7038019 7038020 Smed_1559 Smed_1560     TRUE 0.702 154.000 0.667 1.000 N NA
 7038020 7038021 Smed_1560 Smed_1561     FALSE 0.157 186.000 0.105 NA   NA
 7038022 7038023 Smed_1562 Smed_1563     FALSE 0.012 299.000 0.000 1.000 N NA
 7038023 7038024 Smed_1563 Smed_1564     FALSE 0.062 143.000 0.000 NA   NA
 7038024 7038025 Smed_1564 Smed_1565     FALSE 0.045 162.000 0.000 NA   NA
 7038025 7038026 Smed_1565 Smed_1566   nadE TRUE 0.655 3.000 0.000 NA   NA
 7038027 7038028 Smed_1567 Smed_1568     FALSE 0.005 375.000 0.000 NA   NA
 7038029 7038030 Smed_1569 Smed_1570     FALSE 0.071 200.000 0.018 1.000   NA
 7038030 7038031 Smed_1570 Smed_1571     FALSE 0.084 234.000 0.079 1.000 N NA
 7038031 7038032 Smed_1571 Smed_1572     FALSE 0.256 179.000 0.200 NA   NA
 7038032 7038033 Smed_1572 Smed_1573     FALSE 0.325 112.000 0.065 NA   NA
 7038037 7038038 Smed_1577 Smed_1578     FALSE 0.480 94.000 0.111 NA   NA
 7038040 7038041 Smed_1580 Smed_1581     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038042 7038043 Smed_1582 Smed_1583 moaA   FALSE 0.085 240.000 0.125 NA N NA
 7038043 7038044 Smed_1583 Smed_1584   mobA TRUE 0.567 14.000 0.000 NA N NA
 7038044 7038045 Smed_1584 Smed_1585 mobA   TRUE 0.990 -3.000 0.013 0.003 Y NA
 7038046 7038047 Smed_1586 Smed_1587     FALSE 0.131 121.000 0.000 1.000   NA
 7038048 7038049 Smed_1588 Smed_1589     FALSE 0.505 195.000 0.185 1.000 Y NA
 7038049 7038050 Smed_1589 Smed_1590     TRUE 0.999 -3.000 0.833 0.010 Y NA
 7038050 7038051 Smed_1590 Smed_1591     TRUE 0.655 171.000 0.273 NA Y NA
 7038052 7038053 Smed_1592 Smed_1593     FALSE 0.095 113.000 0.000 NA   NA
 7038054 7038055 Smed_1594 Smed_1595     FALSE 0.349 52.000 0.000 1.000   NA
 7038055 7038056 Smed_1595 Smed_1596     TRUE 0.924 -3.000 0.061 NA N NA
 7038057 7038058 Smed_1597 Smed_1598     TRUE 0.572 67.000 0.081 NA N NA
 7038058 7038059 Smed_1598 Smed_1599     TRUE 0.984 -31.000 0.050 NA Y NA
 7038060 7038061 Smed_1600 Smed_1601     FALSE 0.015 279.000 0.000 1.000 N NA
 7038062 7038063 Smed_1602 Smed_1603   cobT TRUE 0.544 67.000 0.042 1.000 N NA
 7038064 7038065 Smed_1604 Smed_1605 cobS   FALSE 0.519 46.000 0.028 NA   NA
 7038065 7038066 Smed_1605 Smed_1606     TRUE 0.976 -3.000 0.305 NA   NA
 7038067 7038068 Smed_1607 Smed_1608     TRUE 0.996 -3.000 0.303 0.098 Y NA
 7038068 7038069 Smed_1608 Smed_1609     FALSE 0.112 173.000 0.016 1.000 N NA
 7038069 7038070 Smed_1609 Smed_1610     TRUE 0.991 10.000 1.000 1.000   NA
 7038070 7038071 Smed_1610 Smed_1611     FALSE 0.043 164.000 0.000 NA   NA
 7038071 7038072 Smed_1611 Smed_1612     FALSE 0.008 283.000 0.000 NA   NA
 7038072 7038073 Smed_1612 Smed_1613     FALSE 0.016 226.000 0.000 NA   NA
 7038074 7038075 Smed_1614 Smed_1615     TRUE 0.926 12.000 0.182 NA   NA
 7038077 7038078 Smed_1617 Smed_1618     FALSE 0.018 216.000 0.000 NA   NA
 7038083 7038084 Smed_1623 Smed_1624     FALSE 0.110 104.000 0.000 NA   NA
 7038084 7038085 Smed_1624 Smed_1625     FALSE 0.106 106.000 0.000 NA   NA
 7038086 7038087 Smed_1626 Smed_1627     FALSE 0.070 133.000 0.000 NA   NA
 7038088 7038089 Smed_1628 Smed_1629     FALSE 0.009 270.000 0.000 NA   NA
 7038089 7038090 Smed_1629 Smed_1630     FALSE 0.023 200.000 0.000 NA   NA
 7038090 7038091 Smed_1630 Smed_1631     FALSE 0.215 63.000 0.000 NA   NA
 7038092 7038093 Smed_1632 Smed_1633     FALSE 0.002 995.000 0.000 NA   NA
 7038094 7038095 Smed_1634 Smed_1635     FALSE 0.338 35.000 0.000 NA   NA
 7038095 7038096 Smed_1635 Smed_1636     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038096 7038097 Smed_1636 Smed_1637     FALSE 0.010 262.000 0.000 NA   NA
 7038097 7038098 Smed_1637 Smed_1638     TRUE 0.759 -13.000 0.000 NA   NA
 7038098 7038099 Smed_1638 Smed_1639     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038099 7038100 Smed_1639 Smed_1640     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7038100 7038101 Smed_1640 Smed_1641     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038101 7038102 Smed_1641 Smed_1642     TRUE 0.630 7.000 0.000 NA   NA
 7038104 7038105 Smed_1644 Smed_1645     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038105 7038106 Smed_1645 Smed_1646     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038106 7038107 Smed_1646 Smed_1647     FALSE 0.009 274.000 0.000 NA   NA
 7038107 7038108 Smed_1647 Smed_1648     TRUE 0.940 -3.000 0.100 NA   NA
 7038108 7038109 Smed_1648 Smed_1649     TRUE 0.562 13.000 0.000 NA   NA
 7038109 7038110 Smed_1649 Smed_1650     FALSE 0.128 94.000 0.000 NA   NA
 7038110 7038111 Smed_1650 Smed_1651     TRUE 0.666 2.000 0.000 NA   NA
 7038111 7038112 Smed_1651 Smed_1652     TRUE 0.655 3.000 0.000 NA   NA
 7038112 7038113 Smed_1652 Smed_1653     TRUE 0.813 -3.000 0.000 1.000   NA
 7038113 7038114 Smed_1653 Smed_1654     FALSE 0.181 75.000 0.000 NA   NA
 7038114 7038115 Smed_1654 Smed_1655     TRUE 0.906 28.000 0.300 NA   NA
 7038115 7038116 Smed_1655 Smed_1656     TRUE 0.655 3.000 0.000 NA   NA
 7038116 7038117 Smed_1656 Smed_1657     FALSE 0.412 26.000 0.000 NA   NA
 7038117 7038118 Smed_1657 Smed_1658     TRUE 0.813 -3.000 0.000 1.000   NA
 7038118 7038119 Smed_1658 Smed_1659     TRUE 0.813 -3.000 0.000 1.000   NA
 7038119 7038120 Smed_1659 Smed_1660     TRUE 0.599 11.000 0.000 NA   NA
 7038120 7038121 Smed_1660 Smed_1661     TRUE 0.942 -3.000 0.105 NA   NA
 7038121 7038122 Smed_1661 Smed_1662     FALSE 0.056 150.000 0.000 NA   NA
 7038122 7038123 Smed_1662 Smed_1663     FALSE 0.015 229.000 0.000 NA   NA
 7038123 7038124 Smed_1663 Smed_1664     TRUE 0.986 -16.000 0.444 NA   NA
 7038126 7038127 Smed_1666 Smed_1667     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038127 7038128 Smed_1667 Smed_1668     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038128 7038129 Smed_1668 Smed_1669     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038129 7038130 Smed_1669 Smed_1670     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038130 7038131 Smed_1670 Smed_1671     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038131 7038132 Smed_1671 Smed_1672     FALSE 0.017 220.000 0.000 NA   NA
 7038133 7038134 Smed_1673 Smed_1674     FALSE 0.101 109.000 0.000 NA   NA
 7038134 7038135 Smed_1674 Smed_1675     FALSE 0.081 123.000 0.000 NA   NA
 7038135 7038136 Smed_1675 Smed_1676     TRUE 0.599 11.000 0.000 NA   NA
 7038136 7038137 Smed_1676 Smed_1677     FALSE 0.038 172.000 0.000 NA   NA
 7038137 7038138 Smed_1677 Smed_1678     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038138 7038139 Smed_1678 Smed_1679     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038139 7038140 Smed_1679 Smed_1680     TRUE 0.655 3.000 0.000 NA   NA
 7038140 7038141 Smed_1680 Smed_1681     FALSE 0.022 203.000 0.000 NA   NA
 7038141 7038142 Smed_1681 Smed_1682     FALSE 0.040 169.000 0.000 NA   NA
 7038142 7038143 Smed_1682 Smed_1683     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 7038143 7038144 Smed_1683 Smed_1684     FALSE 0.002 887.000 0.000 NA   NA
 7038150 7038151 Smed_1690 Smed_1691     FALSE 0.003 473.000 0.000 NA   NA
 7038151 7038152 Smed_1691 Smed_1692     FALSE 0.029 189.000 0.000 NA   NA
 7038152 7038153 Smed_1692 Smed_1693     FALSE 0.522 64.000 0.035 1.000   NA
 7038154 7038155 Smed_1694 Smed_1695     TRUE 0.983 0.000 0.086 1.000 Y NA
 7038155 7038156 Smed_1695 Smed_1696     TRUE 0.999 -7.000 0.755 0.096 Y NA
 7038158 7038159 Smed_1698 Smed_1699     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7038159 7038160 Smed_1699 Smed_1700     TRUE 0.966 12.000 0.000 0.093 Y NA
 7038160 7038161 Smed_1700 Smed_1701     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.093 Y NA
 7038161 7038162 Smed_1701 Smed_1702     TRUE 0.974 4.000 0.000 0.093 Y NA
 7038162 7038163 Smed_1702 Smed_1703     FALSE 0.063 142.000 0.000 NA   NA
 7038163 7038164 Smed_1703 Smed_1704     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7038164 7038165 Smed_1704 Smed_1705     TRUE 0.764 -1653.000 0.000 NA   NA
 7038165 7038166 Smed_1705 Smed_1706     TRUE 0.996 0.000 0.625 1.000 Y NA
 7038166 7038167 Smed_1706 Smed_1707     FALSE 0.006 494.000 0.000 1.000 N NA
 7038169 7038170 Smed_1709 Smed_1710     FALSE 0.233 129.000 0.049 NA   NA
 7038171 7038172 Smed_1711 Smed_1712     TRUE 0.995 -3.000 0.465 NA Y NA
 7038174 7038175 Smed_1714 Smed_1715     FALSE 0.143 119.000 0.000 1.000 N NA
 7038175 7038176 Smed_1715 Smed_1716     TRUE 0.920 97.000 0.438 1.000 Y NA
 7038176 7038177 Smed_1716 Smed_1717     TRUE 0.998 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 7038177 7038178 Smed_1717 Smed_1718     TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.093 Y NA
 7038179 7038180 Smed_1719 Smed_1720     FALSE 0.295 42.000 0.000 NA   NA
 7038180 7038181 Smed_1720 Smed_1721     FALSE 0.074 129.000 0.000 NA   NA
 7038181 7038182 Smed_1721 Smed_1722     TRUE 0.606 88.000 0.029 0.053   NA
 7038182 7038183 Smed_1722 Smed_1723     TRUE 0.978 16.000 0.722 NA   NA
 7038183 7038184 Smed_1723 Smed_1724     TRUE 0.954 50.000 0.357 NA Y NA
 7038184 7038185 Smed_1724 Smed_1725     TRUE 0.887 91.000 0.250 1.000 Y NA
 7038185 7038186 Smed_1725 Smed_1726     TRUE 0.998 7.000 0.889 0.093 Y NA
 7038186 7038187 Smed_1726 Smed_1727     TRUE 0.998 -7.000 0.500 0.093 Y NA
 7038187 7038188 Smed_1727 Smed_1728     TRUE 0.726 193.000 0.333 0.093 Y NA
 7038189 7038190 Smed_1729 Smed_1730     FALSE 0.073 130.000 0.000 NA   NA
 7038191 7038192 Smed_1731 Smed_1732     FALSE 0.176 107.000 0.005 NA   NA
 7038193 7038194 Smed_1733 Smed_1734     FALSE 0.313 119.000 0.073 NA   NA
 7038194 7038195 Smed_1734 Smed_1735     TRUE 0.969 -19.000 0.195 NA   NA
 7038196 7038197 Smed_1736 Smed_1737     TRUE 0.956 11.000 0.248 1.000 N NA
 7038197 7038198 Smed_1737 Smed_1738     TRUE 0.916 44.000 0.453 1.000 N NA
 7038198 7038199 Smed_1738 Smed_1739     TRUE 0.998 13.000 0.784 0.001 Y NA
 7038199 7038200 Smed_1739 Smed_1740     TRUE 0.994 3.000 0.490 NA Y NA
 7038200 7038201 Smed_1740 Smed_1741     TRUE 0.540 217.000 0.394 NA Y NA
 7038203 7038204 Smed_1743 Smed_1744 cobD   TRUE 0.962 31.000 0.344 0.006 N NA
 7038204 7038205 Smed_1744 Smed_1745     TRUE 0.967 3.000 0.067 0.006 N NA
 7038205 7038206 Smed_1745 Smed_1746     TRUE 0.989 -3.000 0.139 1.000 Y NA
 7038206 7038207 Smed_1746 Smed_1747     FALSE 0.289 131.000 0.057 1.000   NA
 7038209 7038210 Smed_1749 Smed_1750     TRUE 0.899 44.000 0.389 1.000   NA
 7038210 7038211 Smed_1750 Smed_1751     TRUE 0.986 -10.000 0.389 1.000 N NA
 7038211 7038212 Smed_1751 Smed_1752     TRUE 0.968 41.000 0.222 0.092 Y NA
 7038212 7038213 Smed_1752 Smed_1753     TRUE 0.978 0.000 0.000 0.092 Y NA
 7038213 7038214 Smed_1753 Smed_1754     TRUE 0.921 35.000 0.438 NA N NA
 7038214 7038215 Smed_1754 Smed_1755     TRUE 0.993 -3.000 0.938 NA N NA
 7038217 7038218 Smed_1757 Smed_1758     TRUE 0.814 0.000 0.009 NA   NA
 7038218 7038219 Smed_1758 Smed_1759   cobN TRUE 0.971 11.000 0.054 1.000 Y NA
 7038219 7038220 Smed_1759 Smed_1760 cobN   TRUE 0.875 40.000 0.274 1.000   NA
 7038220 7038221 Smed_1760 Smed_1761   cobU TRUE 0.910 4.000 0.063 1.000   NA
 7038223 7038224 Smed_1763 Smed_1764     FALSE 0.017 225.000 0.000 NA N NA
 7038224 7038225 Smed_1764 Smed_1765     FALSE 0.144 92.000 0.000 NA N NA
 7038226 7038227 Smed_1766 Smed_1767     FALSE 0.004 451.000 0.000 NA   NA
 7038227 7038228 Smed_1767 Smed_1768     FALSE 0.331 172.000 0.000 1.000 Y NA
 7038230 7038231 Smed_1770 Smed_1771     FALSE 0.274 76.000 0.000 1.000 N NA
 7038232 7038233 Smed_1772 Smed_1773     FALSE 0.051 155.000 0.000 NA   NA
 7038233 7038234 Smed_1773 Smed_1774     FALSE 0.378 81.000 0.036 NA   NA
 7038234 7038235 Smed_1774 Smed_1775     FALSE 0.463 108.000 0.143 NA   NA
 7038236 7038237 Smed_1776 Smed_1777     FALSE 0.128 305.000 0.436 NA   NA
 7038241 7038242 Smed_1781 Smed_1782     TRUE 0.952 -7.000 0.118 NA   NA
 7038242 7038243 Smed_1782 Smed_1783     TRUE 0.993 -3.000 0.875 NA   NA
 7038243 7038244 Smed_1783 Smed_1784     FALSE 0.225 146.000 0.045 1.000   NA
 7038244 7038245 Smed_1784 Smed_1785     TRUE 0.827 2.000 0.018 NA   NA
 7038245 7038246 Smed_1785 Smed_1786     FALSE 0.472 20.000 0.000 NA   NA
 7038246 7038247 Smed_1786 Smed_1787     FALSE 0.128 94.000 0.000 NA   NA
 7038252 7038253 Smed_1792 Smed_1793     TRUE 0.957 -3.000 0.163 NA   NA
 7038255 7038256 Smed_1795 Smed_1796     FALSE 0.058 175.000 0.000 1.000   NA
 7038260 7038261 Smed_1800 Smed_1801     FALSE 0.073 130.000 0.000 NA   NA
 7038261 7038262 Smed_1801 Smed_1802     FALSE 0.041 194.000 0.000 1.000   NA
 7038262 7038263 Smed_1802 Smed_1803     FALSE 0.098 143.000 0.000 1.000   NA
 7038264 7038265 Smed_1804 Smed_1805     FALSE 0.317 38.000 0.000 NA   NA
 7038266 7038267 Smed_1806 Smed_1807     TRUE 0.754 -7.000 0.000 NA   NA
 7038267 7038268 Smed_1807 Smed_1808     FALSE 0.171 78.000 0.000 NA   NA
 7038268 7038269 Smed_1808 Smed_1809     FALSE 0.005 363.000 0.000 NA   NA
 7038269 7038270 Smed_1809 Smed_1810     FALSE 0.163 80.000 0.000 NA   NA
 7038270 7038271 Smed_1810 Smed_1811     TRUE 0.759 -13.000 0.000 NA   NA
 7038273 7038274 Smed_1813 Smed_1814     TRUE 0.673 1.000 0.000 NA   NA
 7038274 7038275 Smed_1814 Smed_1815     FALSE 0.160 81.000 0.000 NA   NA
 7038275 7038276 Smed_1815 Smed_1816     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038276 7038277 Smed_1816 Smed_1817     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038277 7038278 Smed_1817 Smed_1818     TRUE 0.646 4.000 0.000 NA   NA
 7038278 7038279 Smed_1818 Smed_1819     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038279 7038280 Smed_1819 Smed_1820     TRUE 0.970 -3.000 0.250 NA   NA
 7038280 7038281 Smed_1820 Smed_1821     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038281 7038282 Smed_1821 Smed_1822     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038282 7038283 Smed_1822 Smed_1823     TRUE 0.978 -3.000 0.333 NA   NA
 7038283 7038284 Smed_1823 Smed_1824     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038285 7038286 Smed_1825 Smed_1826     FALSE 0.003 492.000 0.000 NA   NA
 7038287 7038288 Smed_1827 Smed_1828     FALSE 0.066 138.000 0.000 NA   NA
 7038288 7038289 Smed_1828 Smed_1829     FALSE 0.008 288.000 0.000 NA   NA
 7038289 7038290 Smed_1829 Smed_1830     FALSE 0.010 266.000 0.000 NA   NA
 7038290 7038291 Smed_1830 Smed_1831     TRUE 0.685 85.000 0.250 NA   NA
 7038291 7038292 Smed_1831 Smed_1832     TRUE 0.759 125.000 0.667 NA   NA
 7038292 7038293 Smed_1832 Smed_1833     FALSE 0.100 110.000 0.000 NA   NA
 7038293 7038294 Smed_1833 Smed_1834     FALSE 0.011 254.000 0.000 NA   NA
 7038294 7038295 Smed_1834 Smed_1835     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038295 7038296 Smed_1835 Smed_1836     FALSE 0.181 75.000 0.000 NA   NA
 7038296 7038297 Smed_1836 Smed_1837     FALSE 0.005 360.000 0.000 NA   NA
 7038297 7038298 Smed_1837 Smed_1838     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038298 7038299 Smed_1838 Smed_1839     TRUE 0.988 0.000 0.667 NA   NA
 7038305 7038306 Smed_1845 Smed_1846     FALSE 0.003 462.000 0.000 NA   NA
 7038306 7038307 Smed_1846 Smed_1847     TRUE 0.996 0.000 0.625 1.000 Y NA
 7038308 7038309 Smed_1848 Smed_1849     FALSE 0.002 884.000 0.000 NA   NA
 7038309 7038310 Smed_1849 Smed_1850     TRUE 0.562 13.000 0.000 NA   NA
 7038311 7038312 Smed_1851 Smed_1852     FALSE 0.021 205.000 0.000 NA   NA
 7038312 7038313 Smed_1852 Smed_1853     FALSE 0.269 140.000 0.087 NA   NA
 7038314 7038315 Smed_1854 Smed_1855     FALSE 0.017 219.000 0.000 NA   NA
 7038315 7038316 Smed_1855 Smed_1856     TRUE 0.992 0.000 1.000 NA   NA
 7038317 7038318 Smed_1857 Smed_1858     FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 7038318 7038319 Smed_1858 Smed_1859     FALSE 0.181 189.000 0.143 NA   NA
 7038319 7038320 Smed_1859 Smed_1860     FALSE 0.029 187.000 0.000 NA   NA
 7038320 7038321 Smed_1860 Smed_1861     FALSE 0.006 331.000 0.000 NA   NA
 7038322 7038323 Smed_1862 Smed_1863     FALSE 0.002 985.000 0.000 NA   NA
 7038323 7038324 Smed_1863 Smed_1864     FALSE 0.004 428.000 0.000 NA   NA
 7038325 7038326 Smed_1865 Smed_1866     FALSE 0.016 226.000 0.000 NA   NA
 7038326 7038327 Smed_1866 Smed_1867     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038328 7038329 Smed_1868 Smed_1869     FALSE 0.019 213.000 0.000 NA   NA
 7038330 7038331 Smed_1870 Smed_1871     TRUE 0.759 -13.000 0.000 NA   NA
 7038331 7038332 Smed_1871 Smed_1872     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038332 7038333 Smed_1872 Smed_1873     TRUE 0.581 12.000 0.000 NA   NA
 7038333 7038334 Smed_1873 Smed_1874     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038334 7038335 Smed_1874 Smed_1875     TRUE 0.630 7.000 0.000 NA   NA
 7038337 7038338 Smed_1877 Smed_1878     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038342 7038343 Smed_1882 Smed_1883     TRUE 0.548 96.000 0.167 NA   NA
 7038343 7038344 Smed_1883 Smed_1884     TRUE 0.985 15.000 1.000 NA   NA
 7038344 7038345 Smed_1884 Smed_1885     TRUE 0.666 2.000 0.000 NA   NA
 7038345 7038346 Smed_1885 Smed_1886     FALSE 0.021 207.000 0.000 NA   NA
 7038346 7038347 Smed_1886 Smed_1887     TRUE 0.979 0.000 0.429 NA   NA
 7038347 7038348 Smed_1887 Smed_1888     FALSE 0.007 301.000 0.000 NA   NA
 7038350 7038351 Smed_1890 Smed_1891     TRUE 0.877 31.000 0.250 NA   NA
 7038351 7038352 Smed_1891 Smed_1892     TRUE 0.866 14.000 0.091 NA   NA
 7038352 7038353 Smed_1892 Smed_1893     TRUE 0.938 15.000 0.273 NA   NA
 7038353 7038354 Smed_1893 Smed_1894     TRUE 0.949 0.000 0.167 NA   NA
 7038354 7038355 Smed_1894 Smed_1895     FALSE 0.017 396.000 0.056 NA   NA
 7038355 7038356 Smed_1895 Smed_1896     TRUE 0.620 9.000 0.000 NA   NA
 7038356 7038357 Smed_1896 Smed_1897     TRUE 0.940 4.000 0.000 0.000   NA
 7038359 7038360 Smed_1899 Smed_1900     FALSE 0.004 387.000 0.000 NA   NA
 7038360 7038361 Smed_1900 Smed_1901     FALSE 0.131 93.000 0.000 NA   NA
 7038361 7038362 Smed_1901 Smed_1902     FALSE 0.176 76.000 0.000 NA   NA
 7038364 7038365 Smed_1904 Smed_1905     TRUE 0.813 -3.000 0.000 1.000   NA
 7038365 7038366 Smed_1905 Smed_1906     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038366 7038367 Smed_1906 Smed_1907     FALSE 0.358 32.000 0.000 NA   NA
 7038367 7038368 Smed_1907 Smed_1908     TRUE 0.686 0.000 0.000 NA   NA
 7038368 7038369 Smed_1908 Smed_1909     TRUE 0.928 -3.000 0.074 NA   NA
 7038369 7038370 Smed_1909 Smed_1910     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038370 7038371 Smed_1910 Smed_1911     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038373 7038374 Smed_1913 Smed_1914     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038374 7038375 Smed_1914 Smed_1915     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038375 7038376 Smed_1915 Smed_1916     FALSE 0.003 610.000 0.000 NA   NA
 7038376 7038377 Smed_1916 Smed_1917     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038378 7038379 Smed_1918 Smed_1919     FALSE 0.103 108.000 0.000 NA   NA
 7038379 7038380 Smed_1919 Smed_1920     FALSE 0.215 63.000 0.000 NA   NA
 7038382 7038383 Smed_1922 Smed_1923     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038383 7038384 Smed_1923 Smed_1924     FALSE 0.013 236.000 0.000 NA   NA
 7038384 7038385 Smed_1924 Smed_1925     TRUE 0.887 4.000 0.060 NA   NA
 7038385 7038386 Smed_1925 Smed_1926     TRUE 0.666 2.000 0.000 NA   NA
 7038386 7038387 Smed_1926 Smed_1927     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038387 7038388 Smed_1927 Smed_1928     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038388 7038389 Smed_1928 Smed_1929     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038389 7038390 Smed_1929 Smed_1930     TRUE 0.726 -3.000 0.000 NA   NA
 7038390 7038391 Smed_1930 Smed_1931     TRUE 0.639 5.000 0.000 NA   NA
 7038392 7038393 Smed_R0033 Smed_1932     FALSE 0.139 89.000 0.000 NA   NA
 7038393 7038394 Smed_1932 Smed_1933     FALSE 0.508 172.000 0.444 1.000   NA
 7038394 7038395 Smed_1933 Smed_1934     TRUE 0.907 3.000 0.056 1.000   NA
 7038395 7038396 Smed_1934 Smed_1935     FALSE 0.093 114.000 0.000 NA   NA
 7038396 7038397 Smed_1935 Smed_1936     TRUE 0.543 14.000 0.000 NA   NA
 7038397 7038398 Smed_1936 Smed_1937     FALSE 0.005 377.000 0.000 NA   NA
 7038398 7038399 Smed_1937 Smed_1938     TRUE 0.599 11.000 0.000 NA   NA
 7038399 7038400 Smed_1938 Smed_1939     FALSE 0.003 511.000 0.000 NA   NA
 7038400 7038401 Smed_1939 Smed_1940     TRUE 0.997 -7.000 0.600 NA Y NA
 7038401 7038402 Smed_1940 Smed_1941     TRUE 0.965 76.000 0.743 NA Y NA
 7038406 7038407 Smed_1945 Smed_1946     FALSE 0.011 304.000 0.000 1.000   NA
 7038407 7038408 Smed_1946 Smed_1947     TRUE 0.991 -12.000 0.590 1.000 N NA
 7038408 7038409 Smed_1947 Smed_1948     FALSE 0.470 365.000 0.607 0.090 Y NA
 7038410 7038411 Smed_1949 Smed_1950     FALSE 0.485 169.000 0.444 NA   NA
 7038411 7038412 Smed_1950 Smed_1951     TRUE 0.956 43.000 0.889 NA   NA
 7038414 7038415 Smed_1953 Smed_1954     FALSE 0.345 37.000 0.000 NA N NA
 7038418 7038419 Smed_1957 Smed_1958     TRUE 0.957 47.000 1.000 NA   NA
 7038419 7038420 Smed_1958 Smed_1959     TRUE 0.983 -3.000 0.429 NA   NA
 7038420 7038421 Smed_1959 Smed_1960     FALSE 0.089 153.000 0.000 1.000 N NA
 7038423 7038424 Smed_1962 Smed_1963     FALSE 0.492 60.000 0.019 1.000 N NA
 7038424 7038425 Smed_1963 Smed_1964     FALSE 0.004 422.000 0.000 NA   NA
 7038426 7038427 Smed_1965 Smed_1966     FALSE 0.004 388.000 0.000 NA   NA
 7038428 7038429 Smed_1967 Smed_1968     FALSE 0.111 184.000 0.051 NA   NA
 7038429 7038430 Smed_1968 Smed_1969     TRUE 0.861 26.000 0.133 1.000 N NA
 7038434 7038435 Smed_1973 Smed_1974     FALSE 0.023 202.000 0.000 NA   NA
 7038437 7038438 Smed_1976 Smed_1977     TRUE 0.932 13.000 0.214 NA   NA
 7038438 7038439 Smed_1977 Smed_1978     TRUE 0.782 43.000 0.172 NA   NA
 7038441 7038442 Smed_1980 Smed_1981     FALSE 0.055 182.000 0.000 1.000 N NA
 7038442 7038443 Smed_1981 Smed_1982     FALSE 0.027 228.000 0.000 1.000 N NA
 7038444 7038445 Smed_1983 Smed_1984     FALSE 0.015 230.000 0.000 NA   NA
 7038445 7038446 Smed_1984 Smed_1985     FALSE 0.006 310.000 0.000 NA   NA
 7038446 7038447 Smed_1985 Smed_1986     FALSE 0.528 15.000 0.000 NA   NA
 7038448 7038449 Smed_1987 Smed_1988     TRUE 0.905 22.000 0.227 NA   NA
 7038449 7038450 Smed_1988 Smed_1989     TRUE 0.854 35.000 0.227 NA   NA
 7038450 7038451 Smed_1989 Smed_1990     TRUE 0.968 8.000 0.368 NA   NA
 7038451 7038452 Smed_1990 Smed_1991     TRUE 0.977 -16.000 0.263 NA   NA
 7038453 7038454 Smed_1992 Smed_1993     FALSE 0.112 103.000 0.000 NA   NA
 7038456 7038457 Smed_1995 Smed_1996     FALSE 0.077 173.000 0.013 NA   NA
 7038457 7038458 Smed_1996 Smed_1997     TRUE 0.993 -16.000 0.818 NA   NA
 7038458 7038459 Smed_1997 Smed_1998     TRUE 0.998 -3.000 0.909 NA Y NA
 7038460 7038461 Smed_1999 Smed_2000     FALSE 0.285 44.000 0.000 NA   NA
 7038461 7038462 Smed_2000 Smed_2001     TRUE 0.997 -3.000 0.761 0.000   NA
 7038462 7038463 Smed_2001 Smed_2002     FALSE 0.391 83.000 0.025 1.000   NA
 7038465 7038466 Smed_2004 Smed_2005     FALSE 0.048 158.000 0.000 NA   NA
 7038468 7038469 Smed_2007 Smed_2008 ilvH   TRUE 0.984 23.000 0.146 0.001 Y NA
 7038470 7038471 Smed_2009 Smed_2010     FALSE 0.097 111.000 0.000 NA   NA
 7038473 7038474 Smed_2012 Smed_2013     TRUE 0.892 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7038475 7038476 Smed_2014 Smed_2015     FALSE 0.021 208.000 0.000 NA   NA
 7038476 7038477 Smed_2015 Smed_2016     TRUE 0.775 7.000 0.010 NA   NA
 7038477 7038478 Smed_2016 Smed_2017     TRUE 0.967 8.000 0.348 NA   NA
 7038478 7038479 Smed_2017 Smed_2018     TRUE 0.999 -3.000 0.947 0.006 Y NA
 7038479 7038480 Smed_2018 Smed_2019     FALSE 0.109 195.000 0.044 1.000 N NA
 7038480 7038481 Smed_2019 Smed_2020     TRUE 0.893 -7.000 0.005 1.000 N NA
 7038481 7038482 Smed_2020 Smed_2021   thyA FALSE 0.145 118.000 0.000 1.000 N NA
 7038482 7038483 Smed_2021 Smed_2022 thyA   FALSE 0.110 104.000 0.000 NA   NA
 7038483 7038484 Smed_2022 Smed_2023     TRUE 0.734 50.000 0.154 NA   NA
 7038484 7038485 Smed_2023 Smed_2024     TRUE 0.949 11.000 0.250 NA   NA
 7038485 7038486 Smed_2024 Smed_2025     FALSE 0.027 192.000 0.000 NA   NA
 7038486 7038487 Smed_2025 Smed_2026     FALSE 0.507 17.000 0.000 NA   NA
 7038488 7038489 Smed_2027 Smed_2028     TRUE 0.745 40.000 0.118 NA   NA
 7038489 7038490 Smed_2028 Smed_2029     TRUE 0.835 71.000 0.425 NA   NA
 7038491 7038492 Smed_2030 Smed_2031     TRUE 0.678 65.000 0.156 NA   NA
 7038494 7038495 Smed_2033 Smed_2034     TRUE 0.984 -3.000 0.442 NA N NA
 7038496 7038497 Smed_2035 Smed_2036     TRUE 0.875 20.000 0.150 NA   NA
 7038497 7038498 Smed_2036 Smed_2037     FALSE 0.196 105.000 0.010 NA   NA
 7038500 7038501 Smed_2039 Smed_2040     FALSE 0.444 23.000 0.000 NA   NA
 7038501 7038502 Smed_2040 Smed_2041     FALSE 0.010 263.000 0.000 NA   NA
 7038502 7038503 Smed_2041 Smed_2042     TRUE 0.962 69.000 0.600 NA Y NA
 7038503 7038504 Smed_2042 Smed_2043     TRUE 0.996 3.000 1.000 0.013   NA
 7038505 7038506 Smed_2044 Smed_2045     FALSE 0.483 78.000 0.043 1.000   NA
 7038507 7038508 Smed_2046 Smed_2047     FALSE 0.100 110.000 0.000 NA   NA
 7038509 7038510 Smed_2048 Smed_2049     FALSE 0.013 242.000 0.000 NA   NA
 7038510 7038511 Smed_2049 Smed_2050     FALSE 0.006 324.000 0.000 NA   NA
 7038511 7038512 Smed_2050 Smed_2051     TRUE 0.998 3.000 0.636 0.004 Y NA
 7038513 7038514 Smed_2052 Smed_2053     FALSE 0.295 148.000 0.125 NA   NA
 7038514 7038515 Smed_2053 Smed_2054   prmA FALSE 0.187 144.000 0.025 1.000   NA
 7038515 7038516 Smed_2054 Smed_2055 prmA   FALSE 0.011 543.000 0.027 1.000 N NA
 7038517 7038518 Smed_2056 Smed_2057     FALSE 0.418 115.000 0.133 NA   NA
 7038518 7038519 Smed_2057 Smed_2058     TRUE 0.991 4.000 1.000 NA   NA
 7038519 7038520 Smed_2058 Smed_2059   panB FALSE 0.019 218.000 0.000 NA N NA
 7038520 7038521 Smed_2059 Smed_2060 panB panC TRUE 0.997 3.000 0.395 0.001 Y NA
 7038522 7038523 Smed_2061 Smed_2062     FALSE 0.008 285.000 0.000 NA   NA
 7038523 7038524 Smed_2062 Smed_2063     TRUE 0.982 -3.000 0.000 0.089 Y NA
 7038524 7038525 Smed_2063 Smed_2064     TRUE 0.921 32.000 0.000 0.089 Y NA
 7038525 7038526 Smed_2064 Smed_2065     FALSE 0.094 150.000 0.000 1.000 N NA
 7038526 7038527 Smed_2065 Smed_2066     FALSE 0.296 71.000 0.000 1.000 N NA
 7038527 7038528 Smed_2066 Smed_2067     TRUE 0.840 -19.000 0.000 1.000   NA
 7038531 7038532 Smed_2070 Smed_2071 ligA   TRUE 0.650 166.000 0.039 0.008 Y NA
 7038532 7038533 Smed_2071 Smed_2072     TRUE 0.794 36.000 0.117 1.000   NA
 7038533 7038534 Smed_2072 Smed_2073   lpxC FALSE 0.045 279.000 0.064 1.000   NA
 7038534 7038535 Smed_2073 Smed_2074 lpxC   FALSE 0.033 426.000 0.134 1.000 N NA
 7038535 7038536 Smed_2074 Smed_2075     TRUE 0.814 95.000 0.114 1.000 Y NA
 7038536 7038537 Smed_2075 Smed_2076     TRUE 0.952 -3.000 0.137 NA N NA
 7038537 7038538 Smed_2076 Smed_2077   ddl TRUE 0.995 -12.000 0.372 NA Y NA
 7038538 7038539 Smed_2077 Smed_2078 ddl   FALSE 0.011 314.000 0.000 1.000 N NA
 7038541 7038542 Smed_2080 Smed_2081 murB murC TRUE 0.994 -3.000 0.108 0.003 Y NA
 7038542 7038543 Smed_2081 Smed_2082 murC murG TRUE 0.993 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 7038543 7038544 Smed_2082 Smed_2083 murG   TRUE 0.976 18.000 0.647 1.000 N NA
 7038544 7038545 Smed_2083 Smed_2084   murD TRUE 0.924 57.000 0.297 0.002 N NA
 7038545 7038546 Smed_2084 Smed_2085 murD mraY TRUE 0.998 6.000 0.647 0.003 Y NA
 7038546 7038547 Smed_2085 Smed_2086 mraY   TRUE 0.658 231.000 0.309 0.003 Y NA
 7038547 7038548 Smed_2086 Smed_2087   murE TRUE 0.998 2.000 0.569 0.001 Y NA
 7038548 7038549 Smed_2087 Smed_2088 murE   FALSE 0.383 170.000 0.004 1.000 Y NA
 7038549 7038550 Smed_2088 Smed_2089     TRUE 0.870 0.000 0.033 NA   NA
 7038550 7038551 Smed_2089 Smed_2090   mraW TRUE 0.902 7.000 0.089 NA   NA
 7038551 7038552 Smed_2090 Smed_2091 mraW   TRUE 0.915 54.000 0.635 NA   NA
 7038552 7038553 Smed_2091 Smed_R0034     FALSE 0.004 452.000 0.000 NA   NA
 7038553 7038554 Smed_R0034 Smed_2092     FALSE 0.103 108.000 0.000 NA   NA
 7038554 7038555 Smed_2092 Smed_2093     TRUE 0.807 51.000 0.000 1.000 Y NA
 7038555 7038556 Smed_2093 Smed_2094   purU FALSE 0.335 60.000 0.000 1.000 N NA
 7038556 7038557 Smed_2094 Smed_2095 purU   TRUE 0.813 22.000 0.054 1.000 N NA
 7038557 7038558 Smed_2095 Smed_2096     FALSE 0.313 124.000 0.054 1.000 N NA
 7038559 7038560 Smed_2097 Smed_2098     FALSE 0.015 275.000 0.000 1.000 N NA
 7038560 7038561 Smed_2098 Smed_2099     TRUE 0.885 70.000 0.034 0.089 Y NA
 7038561 7038562 Smed_2099 Smed_2100     TRUE 0.984 0.000 0.000 0.009 Y NA
 7038562 7038563 Smed_2100 Smed_2101     TRUE 0.881 30.000 0.000 1.000 Y NA
 7038564 7038565 Smed_2102 Smed_2103     FALSE 0.075 135.000 0.000 NA N NA
 7038565 7038566 Smed_2103 Smed_2104     FALSE 0.043 227.000 0.026 NA N NA
 7038566 7038567 Smed_2104 Smed_2105     TRUE 0.951 -3.000 0.098 1.000 N NA
 7038568 7038569 Smed_2106 Smed_2107     FALSE 0.422 136.000 0.158 1.000 N NA
 7038569 7038570 Smed_2107 Smed_2108     FALSE 0.398 119.000 0.123 NA N NA
 7038572 7038573 Smed_2110 Smed_2111     TRUE 0.979 -3.000 0.347 NA N NA
 7038573 7038574 Smed_2111 Smed_2112     FALSE 0.114 201.000 0.058 1.000 N NA
 7038574 7038575 Smed_2112 Smed_2113     TRUE 0.785 133.000 0.235 1.000 Y NA
 7038575 7038576 Smed_2113 Smed_2114     FALSE 0.113 219.000 0.137 NA   NA
 7038577 7038578 Smed_2115 Smed_2116     TRUE 0.950 3.000 0.160 1.000 N NA
 7038578 7038579 Smed_2116 Smed_2117     FALSE 0.009 480.000 0.009 1.000   NA
 7038579 7038580 Smed_2117 Smed_2118     FALSE 0.212 125.000 0.016 1.000   NA
 7038581 7038582 Smed_2119 Smed_2120     TRUE 0.968 -3.000 0.227 NA   NA
 7038582 7038583 Smed_2120 Smed_2121     FALSE 0.323 37.000 0.000 NA   NA
 7038583 7038584 Smed_2121 Smed_2122     FALSE 0.010 338.000 0.000 1.000 N NA
 7038585 7038586 Smed_2123 Smed_2124     TRUE 0.732 72.000 0.231 NA   NA
 7038587 7038588 Smed_2125 Smed_2126     FALSE 0.190 154.000 0.038 1.000   NA
 7038589 7038590 Smed_2127 Smed_2128     FALSE 0.076 209.000 0.029 1.000 N NA
 7038590 7038591 Smed_2128 Smed_2129     TRUE 0.998 -3.000 0.706 0.051 Y NA
 7038591 7038592 Smed_2129 Smed_2130     TRUE 0.802 81.000 0.361 1.000 N NA
 7038592 7038593 Smed_2130 Smed_2131     TRUE 0.827 89.000 0.108 1.000 Y NA
 7038593 7038594 Smed_2131 Smed_2132     TRUE 0.886 107.000 0.346 1.000 Y NA
 7038595 7038596 Smed_2133 Smed_2134     FALSE 0.199 191.000 0.132 1.000 N NA
 7038596 7038597 Smed_2134 Smed_2135     TRUE 0.859 76.000 0.301 0.089   NA
 7038597 7038598 Smed_2135 Smed_2136     TRUE 0.995 -3.000 0.774 0.089   NA
 7038598 7038599 Smed_2136 Smed_2137     TRUE 0.996 5.000 0.461 0.089 Y NA
 7038599 7038600 Smed_2137 Smed_2138     FALSE 0.011 315.000 0.000 1.000 N NA
 7038600 7038601 Smed_2138 Smed_2139     FALSE 0.072 165.000 0.000 1.000 N NA
 7038601 7038602 Smed_2139 Smed_2140     FALSE 0.378 162.000 0.214 1.000 N NA
 7038602 7038603 Smed_2140 Smed_2141     FALSE 0.137 122.000 0.000 1.000 N NA
 7038604 7038605 Smed_2142 Smed_2143     TRUE 0.958 10.000 0.250 1.000   NA
 7038605 7038606 Smed_2143 Smed_2144     TRUE 0.965 28.000 0.667 1.000   NA
 7038606 7038607 Smed_2144 Smed_2145     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.089 Y NA
 7038607 7038608 Smed_2145 Smed_2146     TRUE 0.999 -37.000 1.000 0.089 Y NA
 7038609 7038610 Smed_2147 Smed_2148     FALSE 0.364 31.000 0.000 NA   NA
 7038611 7038612 Smed_2149 Smed_2150   tpiA TRUE 0.973 41.000 0.438 1.000 Y NA
 7038612 7038613 Smed_2150 Smed_2151 tpiA   TRUE 0.987 -3.000 0.094 1.000 Y NA
 7038613 7038614 Smed_2151 Smed_2152     FALSE 0.432 105.000 0.111 NA   NA
 7038614 7038615 Smed_2152 Smed_2153     TRUE 0.930 14.000 0.222 NA   NA
 7038615 7038616 Smed_2153 Smed_2154     TRUE 0.986 -3.000 0.107 NA Y NA
 7038616 7038617 Smed_2154 Smed_2155     TRUE 0.943 -3.000 0.080 1.000   NA
 7038617 7038618 Smed_2155 Smed_2156     TRUE 0.956 14.000 0.318 1.000   NA
 7038618 7038619 Smed_2156 Smed_2157     TRUE 0.951 5.000 0.176 1.000 N NA
 7038619 7038620 Smed_2157 Smed_2158     TRUE 0.936 10.000 0.143 1.000 N NA
 7038620 7038621 Smed_2158 Smed_2159     TRUE 0.987 -3.000 0.476 1.000 N NA
 7038621 7038622 Smed_2159 Smed_2160     TRUE 0.996 0.000 0.550 1.000 Y NA
 7038622 7038623 Smed_2160 Smed_2161     TRUE 0.999 -3.000 0.846 0.009 Y NA
 7038623 7038624 Smed_2161 Smed_2162     TRUE 0.997 5.000 0.550 0.089 Y NA
 7038624 7038625 Smed_2162 Smed_2163     TRUE 0.998 12.000 0.950 0.089 Y NA
 7038625 7038626 Smed_2163 Smed_2164     TRUE 0.885 183.000 0.783 0.089 Y NA
 7038626 7038627 Smed_2164 Smed_2165     TRUE 0.698 115.000 0.391 1.000 N NA
 7038627 7038628 Smed_2165 Smed_2166     TRUE 0.626 100.000 0.000 1.000 Y NA
 7038629 7038630 Smed_2167 Smed_2168     TRUE 0.971 50.000 0.500 1.000 Y NA
 7038630 7038631 Smed_2168 Smed_2169     TRUE 0.954 63.000 0.238 0.089 Y NA
 7038631 7038632 Smed_2169 Smed_2170     TRUE 0.998 0.000 0.738 0.089 Y NA
 7038632 7038633 Smed_2170 Smed_2171     TRUE 0.962 5.000 0.235 1.000 N NA
 7038635 7038636 Smed_2173 Smed_2174     FALSE 0.510 192.000 0.608 1.000   NA
 7038636 7038637 Smed_2174 Smed_2175     TRUE 0.812 88.000 0.081 1.000 Y NA
 7038637 7038638 Smed_2175 Smed_2176     TRUE 0.647 104.000 0.250 1.000 N NA
 7038638 7038639 Smed_2176 Smed_2177     TRUE 0.961 5.000 0.069 0.024 N NA
 7038639 7038640 Smed_2177 Smed_2178     FALSE 0.010 339.000 0.000 1.000 N NA
 7038640 7038641 Smed_2178 Smed_2179     TRUE 0.990 0.000 0.091 0.089 Y NA
 7038641 7038642 Smed_2179 Smed_2180     TRUE 0.996 -3.000 0.318 0.089 Y NA
 7038642 7038643 Smed_2180 Smed_2181     TRUE 0.981 -7.000 0.286 1.000   NA
 7038645 7038646 Smed_2183 Smed_2184     FALSE 0.230 83.000 0.000 1.000   NA
 7038648 7038649 Smed_2186 Smed_2187     FALSE 0.528 119.000 0.196 1.000 N NA
 7038649 7038650 Smed_2187 Smed_2188     TRUE 0.858 182.000 0.609 0.089 Y NA
 7038650 7038651 Smed_2188 Smed_2189     TRUE 0.998 -3.000 0.643 0.089 Y NA
 7038651 7038652 Smed_2189 Smed_2190     TRUE 0.999 -10.000 0.821 0.089 Y NA
 7038652 7038653 Smed_2190 Smed_2191     TRUE 0.942 27.000 0.405 1.000 N NA
 7038653 7038654 Smed_2191 Smed_2192     FALSE 0.034 211.000 0.000 1.000 N NA
 7038654 7038655 Smed_2192 Smed_2193     TRUE 0.865 6.000 0.046 NA   NA
 7038655 7038656 Smed_2193 Smed_2194     TRUE 0.875 3.000 0.046 NA   NA