MicrobesOnline Operon Predictions for Escherichia coli UTI89

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1233756 1233757 UTI89_C0001 UTI89_C0002 thrL thrA FALSE 0.212 81.000 0.043 1.000   NA
 1233757 1233758 UTI89_C0002 UTI89_C0003 thrA thrB TRUE 0.968 2.000 0.133 1.000 Y NA
 1233758 1233759 UTI89_C0003 UTI89_C0004 thrB thrC TRUE 0.980 1.000 0.233 1.000 Y NA
 1233759 1233760 UTI89_C0004 UTI89_C0005 thrC yaaX FALSE 0.001 214.000 0.003 NA   NA
 1233761 1233762 UTI89_C0006 UTI89_C0007   yaaA FALSE 0.267 12.000 0.000 NA   NA
 1233762 1233763 UTI89_C0007 UTI89_C0008 yaaA yaaJ FALSE 0.034 70.000 0.028 NA   NA
 1233764 1233765 UTI89_C0009 UTI89_C0010 talB mog FALSE 0.239 112.000 0.042 1.000 N NA
 1233766 1233767 UTI89_C0011 UTI89_C0012 yaaH yaaW FALSE 0.036 149.000 0.043 NA   NA
 1233767 1233769 UTI89_C0012 UTI89_C0014 yaaW yaaI TRUE 0.896 26.000 0.500 NA   NA
 1233769 1233770 UTI89_C0014 UTI89_C0015 yaaI   FALSE 0.002 330.000 0.000 NA   NA
 1233771 1233772 UTI89_C0016 UTI89_C0017 dnaK dnaJ TRUE 0.939 89.000 0.236 0.004 Y NA
 1233774 1233775 UTI89_C0019 UTI89_C0020     TRUE 0.924 -16.000 0.571 NA   NA
 1233775 1233776 UTI89_C0020 UTI89_C0021     FALSE 0.037 129.000 0.000 NA   NA
 1233776 1233777 UTI89_C0021 UTI89_C0022   nhaA FALSE 0.005 235.000 0.000 NA   NA
 1233777 1233778 UTI89_C0022 UTI89_C0023 nhaA nhaR TRUE 0.730 66.000 0.292 1.000 N NA
 1233778 1233779 UTI89_C0023 UTI89_C0024 nhaR   TRUE 0.538 12.000 0.065 NA   NA
 1233781 1233782 UTI89_C0026 UTI89_C0027 yaaY ribF FALSE 0.072 8.000 0.019 NA   NA
 1233782 1233783 UTI89_C0027 UTI89_C0028 ribF ileS TRUE 0.783 43.000 0.254 1.000 N NA
 1233783 1233784 UTI89_C0028 UTI89_C0029 ileS lspA TRUE 0.741 0.000 0.045 1.000 N NA
 1233784 1233785 UTI89_C0029 UTI89_C0030 lspA slpA TRUE 0.538 108.000 0.154 1.000 N NA
 1233785 1233786 UTI89_C0030 UTI89_C0031 slpA lytB TRUE 0.976 2.000 0.626 1.000 N NA
 1233786 1233787 UTI89_C0031 UTI89_C0032 lytB yaaF FALSE 0.242 66.000 0.028 1.000 N NA
 1233787 1233788 UTI89_C0032 UTI89_C0033 yaaF   TRUE 0.717 23.000 0.167 NA   NA
 1233788 1233789 UTI89_C0033 UTI89_C0034   dapB FALSE 0.019 161.000 0.000 NA   NA
 1233791 1233792 UTI89_C0036 UTI89_C0037 carA carB TRUE 0.989 18.000 0.345 0.001 Y NA
 1233792 1233793 UTI89_C0037 UTI89_C0038 carB   FALSE 0.069 173.000 0.000 1.000 N NA
 1233796 1233797 UTI89_C0041 UTI89_C0042 caiE caiD FALSE 0.431 -15.000 0.000 1.000   NA
 1233797 1233798 UTI89_C0042 UTI89_C0043 caiD caiC TRUE 0.968 1.000 0.000 0.026 Y NA
 1233798 1233799 UTI89_C0043 UTI89_C0044 caiC caiB TRUE 0.764 58.000 0.154 0.026 N NA
 1233799 1233800 UTI89_C0044 UTI89_C0045 caiB caiA TRUE 0.734 128.000 0.529 1.000 N NA
 1233800 1233801 UTI89_C0045 UTI89_C0046 caiA caiT TRUE 0.703 31.000 0.118 1.000 N NA
 1233802 1233803 UTI89_C0047 UTI89_C0048 fixA fixB TRUE 0.983 15.000 0.231 0.021 Y NA
 1233803 1233804 UTI89_C0048 UTI89_C0049 fixB fixC TRUE 0.849 51.000 0.000 0.062 Y NA
 1233804 1233805 UTI89_C0049 UTI89_C0050 fixC fixX TRUE 0.982 -3.000 0.167 0.062 Y NA
 1233805 1233806 UTI89_C0050 UTI89_C0051 fixX yaaU FALSE 0.286 59.000 0.000 1.000 N NA
 1233806 1233807 UTI89_C0051 UTI89_C0052 yaaU yabF FALSE 0.166 108.000 0.000 1.000   NA
 1233807 1233808 UTI89_C0052 UTI89_C0053 yabF kefC TRUE 0.952 -7.000 0.560 1.000   NA
 1233808 1233809 UTI89_C0053 UTI89_C0054 kefC folA FALSE 0.211 57.000 0.012 1.000 N NA
 1233809 1233810 UTI89_C0054 UTI89_C0055 folA   FALSE 0.182 86.000 0.000 1.000   NA
 1233811 1233812 UTI89_C0056 UTI89_C0057 apaH apaG TRUE 0.916 7.000 0.267 NA N NA
 1233812 1233813 UTI89_C0057 UTI89_C0058 apaG ksgA TRUE 0.747 3.000 0.078 NA N NA
 1233813 1233814 UTI89_C0058 UTI89_C0059 ksgA pdxA TRUE 0.910 -3.000 0.197 1.000 N NA
 1233814 1233815 UTI89_C0059 UTI89_C0060 pdxA surA TRUE 0.973 0.000 0.561 1.000 N NA
 1233815 1233816 UTI89_C0060 UTI89_C0061 surA imp TRUE 0.667 53.000 0.182 1.000 N NA
 1233818 1233819 UTI89_C0063 UTI89_C0064 rluA hepA TRUE 0.930 12.000 0.294 1.000 N NA
 1233819 1233820 UTI89_C0064 UTI89_C0065 hepA polB TRUE 0.625 164.000 0.098 0.070 Y NA
 1233820 1233821 UTI89_C0065 UTI89_C0066 polB araD FALSE 0.205 75.000 0.018 1.000 N NA
 1233821 1233822 UTI89_C0066 UTI89_C0067 araD araA FALSE 0.068 285.000 0.017 1.000 Y NA
 1233822 1233823 UTI89_C0067 UTI89_C0068 araA araB TRUE 0.863 11.000 0.138 1.000 N NA
 1233824 1233825 UTI89_C0069 UTI89_C0070 araC   FALSE 0.003 265.000 0.000 NA   NA
 1233825 1233826 UTI89_C0070 UTI89_C0071     FALSE 0.041 125.000 0.000 NA   NA
 1233826 1233827 UTI89_C0071 UTI89_C0072     FALSE 0.004 246.000 0.000 NA   NA
 1233827 1233828 UTI89_C0072 UTI89_C0073   yabI FALSE 0.021 155.000 0.000 NA   NA
 1233829 1233830 UTI89_C0074 UTI89_C0075 thiQ thiP TRUE 0.955 -37.000 0.522 0.018 N NA
 1233830 1233831 UTI89_C0075 UTI89_C0076 thiP tbpA TRUE 0.971 -24.000 0.697 0.086 N NA
 1233831 1233832 UTI89_C0076 UTI89_C0077 tbpA yabN FALSE 0.121 164.000 0.010 0.086   NA
 1233832 1233833 UTI89_C0077 UTI89_C0078 yabN leuD FALSE 0.007 307.000 0.000 1.000   NA
 1233833 1233834 UTI89_C0078 UTI89_C0079 leuD leuC TRUE 0.992 11.000 0.309 0.001 Y NA
 1233834 1233835 UTI89_C0079 UTI89_C0080 leuC leuB TRUE 0.992 3.000 0.275 0.001 Y NA
 1233835 1233836 UTI89_C0080 UTI89_C0081 leuB leuA TRUE 0.985 -3.000 0.126 0.001 Y NA
 1233836 1233837 UTI89_C0081 UTI89_C0082 leuA leuL TRUE 0.518 92.000 0.010 0.001   NA
 1233838 1233839 UTI89_C0083 UTI89_C0084   leuO FALSE 0.069 77.000 0.000 NA   NA
 1233839 1233840 UTI89_C0084 UTI89_C0085 leuO ilvI FALSE 0.009 318.000 0.000 1.000 N NA
 1233840 1233841 UTI89_C0085 UTI89_C0086 ilvI ilvH TRUE 0.994 3.000 0.371 0.002 Y NA
 1233841 1233842 UTI89_C0086 UTI89_C0087 ilvH fruL FALSE 0.317 3.000 0.000 NA   NA
 1233842 1233843 UTI89_C0087 UTI89_C0088 fruL   FALSE 0.130 -46.000 0.000 NA   NA
 1233843 1233844 UTI89_C0088 UTI89_C0089   fruR FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1233844 1233845 UTI89_C0089 UTI89_C0090 fruR mraZ FALSE 0.001 566.000 0.000 NA   NA
 1233845 1233846 UTI89_C0090 UTI89_C0091 mraZ mraW TRUE 0.967 2.000 0.635 NA   NA
 1233846 1233847 UTI89_C0091 UTI89_C0092 mraW ftsL TRUE 0.923 -3.000 0.227 1.000 N NA
 1233847 1233848 UTI89_C0092 UTI89_C0093 ftsL ftsI TRUE 0.814 16.000 0.124 1.000 N NA
 1233848 1233849 UTI89_C0093 UTI89_C0094 ftsI murE TRUE 0.908 -13.000 0.059 1.000 Y NA
 1233849 1233850 UTI89_C0094 UTI89_C0095 murE murF TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 1233850 1233851 UTI89_C0095 UTI89_C0096 murF mraY TRUE 0.989 -6.000 0.309 0.004 Y NA
 1233851 1233852 UTI89_C0096 UTI89_C0097 mraY murD TRUE 0.996 3.000 0.647 0.004 Y NA
 1233852 1233853 UTI89_C0097 UTI89_C0098 murD ftsW TRUE 0.974 -3.000 0.297 0.003 N NA
 1233853 1233854 UTI89_C0098 UTI89_C0099 ftsW murG TRUE 0.975 -3.000 0.647 1.000 N NA
 1233854 1233855 UTI89_C0099 UTI89_C0100 murG murC TRUE 0.913 54.000 0.283 1.000 Y NA
 1233855 1233856 UTI89_C0100 UTI89_C0101 murC ddlB TRUE 0.979 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 1233856 1233857 UTI89_C0101 UTI89_C0102 ddlB ftsQ TRUE 0.984 2.000 0.372 NA Y NA
 1233857 1233858 UTI89_C0102 UTI89_C0103 ftsQ ftsA TRUE 0.945 -3.000 0.389 NA N NA
 1233858 1233859 UTI89_C0103 UTI89_C0104 ftsA ftsZ TRUE 0.937 61.000 0.460 1.000 Y NA
 1233859 1233860 UTI89_C0104 UTI89_C0105 ftsZ lpxC TRUE 0.533 101.000 0.134 1.000 N NA
 1233860 1233861 UTI89_C0105 UTI89_C0106 lpxC secM FALSE 0.016 231.000 0.000 1.000   NA
 1233861 1233862 UTI89_C0106 UTI89_C0107 secM secA FALSE 0.312 62.000 0.065 1.000   NA
 1233862 1233863 UTI89_C0107 UTI89_C0108 secA mutT TRUE 0.614 60.000 0.168 1.000 N NA
 1233864 1233865 UTI89_C0109 UTI89_C0110 yacG yacF TRUE 0.925 10.000 0.356 NA   NA
 1233865 1233866 UTI89_C0110 UTI89_C0111 yacF coaE TRUE 0.774 0.000 0.110 NA   NA
 1233868 1233869 UTI89_C0113 UTI89_C0114 hofC hofB TRUE 0.985 -10.000 0.571 1.000 Y NA
 1233869 1233870 UTI89_C0114 UTI89_C0115 hofB ppdD TRUE 0.987 10.000 0.556 NA Y NA
 1233873 1233874 UTI89_C0118 UTI89_C0119 ampD ampE TRUE 0.978 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 1233876 1233877 UTI89_C0121 UTI89_C0122 usp   TRUE 0.593 3.000 0.000 1.000   NA
 1233877 1233878 UTI89_C0122 UTI89_C0123     FALSE 0.017 408.000 0.000 0.001   NA
 1233878 1233879 UTI89_C0123 UTI89_C0124     FALSE 0.017 409.000 0.000 0.001   NA
 1233879 1233880 UTI89_C0124 UTI89_C0125   pdhR FALSE 0.002 456.000 0.000 1.000   NA
 1233882 1233883 UTI89_C0127 UTI89_C0128 aceE aceF TRUE 0.967 15.000 0.220 1.000 Y NA
 1233883 1233884 UTI89_C0128 UTI89_C0129 aceF lpdA TRUE 0.599 208.000 0.463 1.000 Y NA
 1233886 1233887 UTI89_C0131 UTI89_C0132 acnB yacL FALSE 0.049 175.000 0.068 NA   NA
 1233888 1233889 UTI89_C0133 UTI89_C0134 speD speE TRUE 0.956 16.000 0.162 1.000 Y NA
 1233889 1233890 UTI89_C0134 UTI89_C0135 speE yacC TRUE 0.666 106.000 0.354 NA   NA
 1233895 1233896 UTI89_C0140 UTI89_C0141 yadG yadH TRUE 0.993 -3.000 0.688 1.000 Y NA
 1233896 1233897 UTI89_C0141 UTI89_C0142 yadH yadI FALSE 0.254 105.000 0.037 1.000 N NA
 1233897 1233898 UTI89_C0142 UTI89_C0143 yadI yadE TRUE 0.879 64.000 0.222 1.000 Y NA
 1233900 1233901 UTI89_C0145 UTI89_C0146   yadD FALSE 0.044 121.000 0.000 NA   NA
 1233902 1233903 UTI89_C0147 UTI89_C0148 panC panB TRUE 0.993 12.000 0.395 0.001 Y NA
 1233903 1233904 UTI89_C0148 UTI89_C0149 panB yadC FALSE 0.220 112.000 0.000 1.000 N NA
 1233904 1233905 UTI89_C0149 UTI89_C0150 yadC yadK TRUE 0.929 26.000 0.000 0.012 Y NA
 1233905 1233906 UTI89_C0150 UTI89_C0151 yadK yadL TRUE 0.961 27.000 0.571 0.012   NA
 1233906 1233907 UTI89_C0151 UTI89_C0152 yadL yadM TRUE 0.982 6.000 0.571 0.012   NA
 1233907 1233908 UTI89_C0152 UTI89_C0153 yadM htrE TRUE 0.949 17.000 0.571 1.000   NA
 1233908 1233909 UTI89_C0153 UTI89_C0154 htrE ecpD TRUE 0.984 35.000 1.000 1.000 Y NA
 1233909 1233910 UTI89_C0154 UTI89_C0155 ecpD yadN TRUE 0.927 109.000 0.500 1.000 Y NA
 1233910 1233911 UTI89_C0155 UTI89_C0156 yadN folK FALSE 0.007 338.000 0.000 1.000 N NA
 1233911 1233912 UTI89_C0156 UTI89_C0157 folK pcnB TRUE 0.926 -3.000 0.234 1.000 N NA
 1233912 1233913 UTI89_C0157 UTI89_C0158 pcnB yadB TRUE 0.889 39.000 0.131 1.000 Y NA
 1233913 1233914 UTI89_C0158 UTI89_C0159 yadB dksA TRUE 0.682 67.000 0.231 1.000 N NA
 1233914 1233915 UTI89_C0159 UTI89_C0160 dksA sfsA FALSE 0.123 178.000 0.151 NA   NA
 1233915 1233916 UTI89_C0160 UTI89_C0161 sfsA ligT FALSE 0.330 15.000 0.045 NA   NA
 1233921 1233922 UTI89_C0166 UTI89_C0167 fhuA fhuC TRUE 0.874 51.000 0.156 1.000 Y NA
 1233922 1233923 UTI89_C0167 UTI89_C0168 fhuC fhuD TRUE 0.929 -3.000 0.031 1.000 Y NA
 1233923 1233924 UTI89_C0168 UTI89_C0169 fhuD fhuB TRUE 0.932 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1233926 1233927 UTI89_C0171 UTI89_C0172 yadQ yadR FALSE 0.060 49.000 0.031 NA   NA
 1233928 1233929 UTI89_C0173 UTI89_C0174 yadS yadT TRUE 0.672 38.000 0.213 NA   NA
 1233929 1233930 UTI89_C0174 UTI89_C0175 yadT mtn TRUE 0.739 -7.000 0.073 1.000 N NA
 1233931 1233932 UTI89_C0176 UTI89_C0177 dgt degP FALSE 0.318 130.000 0.101 1.000 N NA
 1233932 1233933 UTI89_C0177 UTI89_C0178 degP cdaR FALSE 0.082 178.000 0.080 NA N NA
 1233934 1233935 UTI89_C0179 UTI89_C0180 yaeH dapD FALSE 0.002 312.000 0.035 NA   NA
 1233935 1233936 UTI89_C0180 UTI89_C0181 dapD glnD TRUE 0.671 31.000 0.097 1.000 N NA
 1233936 1233937 UTI89_C0181 UTI89_C0182 glnD map TRUE 0.695 62.000 0.243 1.000 N NA
 1233940 1233941 UTI89_C0185 UTI89_C0186 tsf pyrH TRUE 0.589 147.000 0.416 1.000 N NA
 1233941 1233942 UTI89_C0186 UTI89_C0187 pyrH rrf TRUE 0.680 150.000 0.626 1.000 N NA
 1233942 1233943 UTI89_C0187 UTI89_C0188 rrf dxr FALSE 0.243 92.000 0.032 1.000 N NA
 1233943 1233944 UTI89_C0188 UTI89_C0189 dxr uppS FALSE 0.251 186.000 0.025 1.000 Y NA
 1233944 1233945 UTI89_C0189 UTI89_C0190 uppS cdsA TRUE 0.983 13.000 0.400 1.000 Y NA
 1233945 1233946 UTI89_C0190 UTI89_C0191 cdsA ecfE TRUE 0.632 -33.000 0.080 1.000 N NA
 1233946 1233947 UTI89_C0191 UTI89_C0192 ecfE ecfK TRUE 0.939 30.000 0.204 1.000 Y NA
 1233947 1233948 UTI89_C0192 UTI89_C0193 ecfK hlpA TRUE 0.871 122.000 0.354 1.000 Y NA
 1233948 1233949 UTI89_C0193 UTI89_C0194 hlpA lpxD TRUE 0.994 4.000 0.814 1.000 Y NA
 1233949 1233950 UTI89_C0194 UTI89_C0195 lpxD fabZ TRUE 0.976 12.000 0.796 1.000 N NA
 1233950 1233951 UTI89_C0195 UTI89_C0196 fabZ lpxA TRUE 0.982 4.000 0.850 1.000 N NA
 1233951 1233952 UTI89_C0196 UTI89_C0197 lpxA lpxB TRUE 0.983 0.000 0.289 1.000 Y NA
 1233952 1233953 UTI89_C0197 UTI89_C0198 lpxB rnhB TRUE 0.908 -3.000 0.186 1.000 N NA
 1233953 1233954 UTI89_C0198 UTI89_C0199 rnhB dnaE TRUE 0.881 37.000 0.104 1.000 Y NA
 1233954 1233955 UTI89_C0199 UTI89_C0200 dnaE accA TRUE 0.833 13.000 0.122 1.000 N NA
 1233955 1233956 UTI89_C0200 UTI89_C0201 accA ldcC FALSE 0.180 98.000 0.010 1.000 N NA
 1233956 1233957 UTI89_C0201 UTI89_C0202 ldcC yaeR TRUE 0.680 57.000 0.039 NA Y NA
 1233957 1233958 UTI89_C0202 UTI89_C0203 yaeR mesJ FALSE 0.076 65.000 0.015 NA N NA
 1233959 1233960 UTI89_C0204 UTI89_C0205 rof yaeP TRUE 0.764 -13.000 0.179 NA   NA
 1233961 1233962 UTI89_C0206 UTI89_C0207 yaeQ yaeJ TRUE 0.553 -3.000 0.034 1.000   NA
 1233962 1233963 UTI89_C0207 UTI89_C0208 yaeJ cutF FALSE 0.112 14.000 0.027 NA   NA
 1233964 1233965 UTI89_C0209 UTI89_C0210 yaeF proS FALSE 0.017 53.000 0.002 NA   NA
 1233965 1233966 UTI89_C0210 UTI89_C0211 proS yaeB FALSE 0.098 111.000 0.048 NA   NA
 1233966 1233967 UTI89_C0211 UTI89_C0212 yaeB rcsF TRUE 0.890 -3.000 0.247 NA   NA
 1233967 1233968 UTI89_C0212 UTI89_C0213 rcsF metQ TRUE 0.685 118.000 0.500 NA   NA
 1233968 1233969 UTI89_C0213 UTI89_C0214 metQ metI TRUE 0.972 40.000 0.411 0.069 Y NA
 1233969 1233970 UTI89_C0214 UTI89_C0215 metI metN TRUE 0.987 -7.000 0.584 1.000 Y NA
 1233971 1233972 UTI89_C0216 UTI89_C0217 yaeD rrsH FALSE 0.001 366.000 0.000 NA   NA
 1233972 1233974 UTI89_C0217 UTI89_C0219 rrsH ileV FALSE 0.070 69.000 0.000 NA   NA
 1233974 1233975 UTI89_C0219 UTI89_C0220 ileV alaV FALSE 0.099 46.000 0.000 NA   NA
 1233975 1233976 UTI89_C0220 UTI89_C0221 alaV rrlH FALSE 0.013 178.000 0.000 NA   NA
 1233976 1233979 UTI89_C0221 UTI89_C0224 rrlH rrfH FALSE 0.067 99.000 0.000 NA   NA
 1233979 1233980 UTI89_C0224 UTI89_C0225 rrfH aspU FALSE 0.086 52.000 0.000 NA   NA
 1233980 1233981 UTI89_C0225 UTI89_C0226 aspU dkgB FALSE 0.017 166.000 0.000 NA   NA
 1233983 1233984 UTI89_C0228 UTI89_C0229 yafD yafE FALSE 0.199 78.000 0.066 NA   NA
 1233985 1233986 UTI89_C0230 UTI89_C0231 dniR gloB TRUE 0.642 72.000 0.233 1.000   NA
 1233989 1233990 UTI89_C0234 UTI89_C0235 dnaQ aspV FALSE 0.034 133.000 0.000 NA   NA
 1233990 1233991 UTI89_C0235 UTI89_C0236 aspV yafT FALSE 0.002 332.000 0.000 NA   NA
 1233992 1233993 UTI89_C0237 UTI89_C0238     TRUE 0.782 18.000 0.182 NA   NA
 1233993 1233994 UTI89_C0238 UTI89_C0239     TRUE 0.760 -73.000 0.312 NA   NA
 1233994 1233995 UTI89_C0239 UTI89_C0240     TRUE 0.844 80.000 0.750 NA   NA
 1233995 1233996 UTI89_C0240 UTI89_C0241     TRUE 0.969 5.000 0.711 NA   NA
 1233996 1233997 UTI89_C0241 UTI89_C0242     FALSE 0.337 -3.000 0.039 NA   NA
 1233997 1233998 UTI89_C0242 UTI89_C0243     TRUE 0.943 10.000 0.471 NA   NA
 1233998 1233999 UTI89_C0243 UTI89_C0244     TRUE 0.967 5.000 0.673 NA   NA
 1233999 1234000 UTI89_C0244 UTI89_C0245     TRUE 0.972 3.000 0.765 NA   NA
 1234000 1234001 UTI89_C0245 UTI89_C0246     TRUE 0.974 -3.000 0.862 NA   NA
 1234001 1234002 UTI89_C0246 UTI89_C0247     TRUE 0.953 5.000 0.510 NA   NA
 1234002 1234003 UTI89_C0247 UTI89_C0248     TRUE 0.936 -36.000 0.863 NA   NA
 1234003 1234004 UTI89_C0248 UTI89_C0249     TRUE 0.956 6.000 0.552 NA   NA
 1234004 1234005 UTI89_C0249 UTI89_C0250     TRUE 0.963 5.000 0.627 NA   NA
 1234005 1234006 UTI89_C0250 UTI89_C0251     TRUE 0.947 23.000 0.821 NA   NA
 1234007 1234008 UTI89_C0252 UTI89_C0253     FALSE 0.006 221.000 0.000 NA   NA
 1234008 1234009 UTI89_C0253 UTI89_C0254     FALSE 0.061 107.000 0.000 NA   NA
 1234009 1234010 UTI89_C0254 UTI89_C0255     FALSE 0.237 -7.000 0.000 NA   NA
 1234010 1234011 UTI89_C0255 UTI89_C0256     FALSE 0.167 -25.000 0.000 NA   NA
 1234011 1234012 UTI89_C0256 UTI89_C0257     FALSE 0.000 1251.000 0.000 NA   NA
 1234012 1234013 UTI89_C0257 UTI89_C0258     FALSE 0.070 70.000 0.000 NA   NA
 1234017 1234018 UTI89_C0262 UTI89_C0263 gmhA yafJ FALSE 0.203 190.000 0.229 1.000   NA
 1234019 1234020 UTI89_C0264 UTI89_C0265 yafK   FALSE 0.004 257.000 0.000 NA   NA
 1234021 1234022 UTI89_C0266 UTI89_C0267 yafL yafM FALSE 0.034 176.000 0.000 NA N NA
 1234023 1234024 UTI89_C0268 UTI89_C0269   fhiA FALSE 0.155 28.000 0.000 NA   NA
 1234025 1234026 UTI89_C0270 UTI89_C0271 mbhA dinP FALSE 0.273 71.000 0.000 1.000 N NA
 1234026 1234027 UTI89_C0271 UTI89_C0272 dinP yafN FALSE 0.193 52.000 0.000 NA N NA
 1234027 1234028 UTI89_C0272 UTI89_C0273 yafN yafO TRUE 0.953 3.000 0.500 NA   NA
 1234028 1234029 UTI89_C0273 UTI89_C0274 yafO yafP FALSE 0.289 10.000 0.000 NA   NA
 1234029 1234030 UTI89_C0274 UTI89_C0275 yafP   FALSE 0.013 178.000 0.000 NA   NA
 1234030 1234031 UTI89_C0275 UTI89_C0276   prfH TRUE 0.586 111.000 0.303 NA   NA
 1234035 1234036 UTI89_C0280 UTI89_C0281 yafA crl FALSE 0.129 58.000 0.048 NA   NA
 1234038 1234039 UTI89_C0283 UTI89_C0284 proB proA TRUE 0.966 12.000 0.026 0.001 Y NA
 1234039 1234040 UTI89_C0284 UTI89_C0285 proA thrW FALSE 0.050 115.000 0.000 NA   NA
 1234040 1234041 UTI89_C0285 UTI89_C0286 thrW   FALSE 0.067 91.000 0.000 NA   NA
 1234042 1234043 UTI89_C0287 UTI89_C0288     FALSE 0.018 163.000 0.000 NA   NA
 1234043 1234044 UTI89_C0288 UTI89_C0289     TRUE 0.995 -3.000 0.649 0.068 Y NA
 1234049 1234050 UTI89_C0294 UTI89_C0295     FALSE 0.020 158.000 0.000 NA   NA
 1234051 1234052 UTI89_C0296 UTI89_C0297     FALSE 0.002 331.000 0.000 NA   NA
 1234053 1234054 UTI89_C0298 UTI89_C0299   insA FALSE 0.066 83.000 0.000 NA   NA
 1234056 1234057 UTI89_C0301 UTI89_C0302     FALSE 0.001 379.000 0.000 NA   NA
 1234057 1234058 UTI89_C0302 UTI89_C0303   yagU FALSE 0.007 215.000 0.000 NA   NA
 1234059 1234060 UTI89_C0304 UTI89_C0305 ykgJ yagV FALSE 0.002 307.000 0.000 NA   NA
 1234060 1234061 UTI89_C0305 UTI89_C0306 yagV yagW TRUE 0.867 -76.000 0.571 NA   NA
 1234061 1234062 UTI89_C0306 UTI89_C0307 yagW yagX TRUE 0.911 -10.000 0.429 NA   NA
 1234062 1234063 UTI89_C0307 UTI89_C0308 yagX yagY TRUE 0.829 26.000 0.308 NA   NA
 1234063 1234064 UTI89_C0308 UTI89_C0309 yagY matB TRUE 0.932 9.000 0.385 NA   NA
 1234064 1234065 UTI89_C0309 UTI89_C0310 matB matA TRUE 0.797 43.000 0.400 NA   NA
 1234065 1234066 UTI89_C0310 UTI89_C0311 matA   FALSE 0.001 405.000 0.000 NA   NA
 1234068 1234069 UTI89_C0313 UTI89_C0314   rpmE2 TRUE 0.804 -3.000 0.004 0.014   NA
 1234069 1234070 UTI89_C0314 UTI89_C0315 rpmE2   FALSE 0.002 940.000 0.000 1.000 N NA
 1234070 1234071 UTI89_C0315 UTI89_C0316   ycjY FALSE 0.046 172.000 0.000 1.000   NA
 1234072 1234073 UTI89_C0317 UTI89_C0318   ycjZ TRUE 0.713 125.000 0.000 0.062 Y NA
 1234074 1234075 UTI89_C0319 UTI89_C0320     TRUE 0.901 27.000 0.438 1.000   NA
 1234079 1234081 UTI89_C0324 UTI89_C0326 ykgB ykgI FALSE 0.416 3.000 0.043 NA   NA
 1234081 1234082 UTI89_C0326 UTI89_C0327 ykgI ykgC TRUE 0.825 94.000 0.667 NA   NA
 1234083 1234084 UTI89_C0328 UTI89_C0329 ykgD ykgE FALSE 0.002 527.000 0.000 NA N NA
 1234084 1234085 UTI89_C0329 UTI89_C0330 ykgE ykgF TRUE 0.974 11.000 0.286 NA Y NA
 1234085 1234086 UTI89_C0330 UTI89_C0331 ykgF ykgG TRUE 0.888 -160.000 0.286 0.001   NA
 1234087 1234088 UTI89_C0332 UTI89_C0333   ykgH FALSE 0.070 75.000 0.000 NA   NA
 1234088 1234089 UTI89_C0333 UTI89_C0334 ykgH   FALSE 0.012 184.000 0.000 NA   NA
 1234089 1234090 UTI89_C0334 UTI89_C0335     FALSE 0.295 9.000 0.000 NA   NA
 1234090 1234091 UTI89_C0335 UTI89_C0336     FALSE 0.022 154.000 0.000 NA   NA
 1234091 1234092 UTI89_C0336 UTI89_C0337     FALSE 0.160 -28.000 0.000 NA   NA
 1234092 1234093 UTI89_C0337 UTI89_C0338   fimX FALSE 0.002 293.000 0.000 NA   NA
 1234095 1234096 UTI89_C0340 UTI89_C0341 betA betB TRUE 0.966 14.000 0.634 1.000 N NA
 1234096 1234097 UTI89_C0341 UTI89_C0342 betB betI TRUE 0.958 11.000 0.459 1.000 N NA
 1234098 1234099 UTI89_C0343 UTI89_C0344 betT yahA FALSE 0.002 872.000 0.000 1.000 N NA
 1234100 1234101 UTI89_C0345 UTI89_C0346 yahB yahC FALSE 0.067 92.000 0.000 NA   NA
 1234102 1234103 UTI89_C0347 UTI89_C0348   yahD FALSE 0.118 -61.000 0.000 NA   NA
 1234103 1234104 UTI89_C0348 UTI89_C0349 yahD yahE TRUE 0.890 40.000 0.667 NA   NA
 1234104 1234105 UTI89_C0349 UTI89_C0350 yahE yahF TRUE 0.911 -10.000 0.429 NA   NA
 1234105 1234106 UTI89_C0350 UTI89_C0351 yahF yahG TRUE 0.972 0.000 0.714 NA   NA
 1234106 1234107 UTI89_C0351 UTI89_C0352 yahG yahI FALSE 0.153 154.000 0.125 NA   NA
 1234107 1234108 UTI89_C0352 UTI89_C0353 yahI yahJ TRUE 0.932 10.000 0.278 1.000 N NA
 1234108 1234109 UTI89_C0353 UTI89_C0354 yahJ   FALSE 0.003 268.000 0.000 NA   NA
 1234109 1234110 UTI89_C0354 UTI89_C0355     FALSE 0.004 251.000 0.000 NA   NA
 1234110 1234111 UTI89_C0355 UTI89_C0356     TRUE 0.967 34.000 0.571 NA Y NA
 1234111 1234112 UTI89_C0356 UTI89_C0357     TRUE 0.989 -7.000 0.667 1.000 Y NA
 1234112 1234113 UTI89_C0357 UTI89_C0358     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.067 Y NA
 1234113 1234114 UTI89_C0358 UTI89_C0359   yahK FALSE 0.182 87.000 0.000 1.000   NA
 1234114 1234115 UTI89_C0359 UTI89_C0360 yahK yahM FALSE 0.001 592.000 0.000 NA   NA
 1234117 1234118 UTI89_C0362 UTI89_C0363 yahO prpB FALSE 0.000 1926.000 0.000 NA   NA
 1234118 1234119 UTI89_C0363 UTI89_C0364 prpB prpC TRUE 0.882 45.000 0.502 1.000 N NA
 1234119 1234120 UTI89_C0364 UTI89_C0365 prpC prpD TRUE 0.764 34.000 0.216 1.000   NA
 1234120 1234121 UTI89_C0365 UTI89_C0366 prpD prpE TRUE 0.704 40.000 0.038 0.001   NA
 1234121 1234122 UTI89_C0366 UTI89_C0367 prpE codB FALSE 0.009 325.000 0.000 1.000 N NA
 1234122 1234123 UTI89_C0367 UTI89_C0368 codB codA TRUE 0.955 -25.000 0.250 1.000 Y NA
 1234124 1234125 UTI89_C0369 UTI89_C0370 lacA lacY TRUE 0.873 15.000 0.222 1.000   NA
 1234125 1234126 UTI89_C0370 UTI89_C0371 lacY lacZ TRUE 0.714 52.000 0.261 1.000   NA
 1234126 1234127 UTI89_C0371 UTI89_C0372 lacZ lacI FALSE 0.482 123.000 0.174 1.000 N NA
 1234127 1234128 UTI89_C0372 UTI89_C0373 lacI   TRUE 0.683 28.000 0.000 0.050   NA
 1234130 1234131 UTI89_C0375 UTI89_C0376 yaiM adhC TRUE 0.711 93.000 0.327 1.000   NA
 1234131 1234132 UTI89_C0376 UTI89_C0377 adhC yaiN TRUE 0.874 35.000 0.531 NA   NA
 1234134 1234135 UTI89_C0379 UTI89_C0380 yaiO   FALSE 0.323 2.000 0.000 NA   NA
 1234135 1234136 UTI89_C0380 UTI89_C0381   yaiP FALSE 0.128 35.000 0.000 NA   NA
 1234136 1234137 UTI89_C0381 UTI89_C0382 yaiP   TRUE 0.866 10.000 0.214 NA   NA
 1234137 1234138 UTI89_C0382 UTI89_C0383     FALSE 0.001 445.000 0.000 NA   NA
 1234139 1234140 UTI89_C0384 UTI89_C0385 tauA tauB TRUE 0.922 13.000 0.047 1.000 Y NA
 1234140 1234141 UTI89_C0385 UTI89_C0386 tauB tauC TRUE 0.993 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 1234141 1234142 UTI89_C0386 UTI89_C0387 tauC tauD TRUE 0.917 -3.000 0.214 1.000 N NA
 1234144 1234145 UTI89_C0389 UTI89_C0390   yaiV TRUE 0.887 41.000 0.667 NA   NA
 1234147 1234148 UTI89_C0392 UTI89_C0393   sbmA FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 1234148 1234149 UTI89_C0393 UTI89_C0394 sbmA yaiW TRUE 0.517 13.000 0.000 1.000   NA
 1234151 1234152 UTI89_C0396 UTI89_C0397   yaiZ FALSE 0.070 64.000 0.000 NA   NA
 1234156 1234157 UTI89_C0401 UTI89_C0402 yaiB phoA FALSE 0.095 32.000 0.032 NA   NA
 1234157 1234158 UTI89_C0402 UTI89_C0403 phoA psiF FALSE 0.044 101.000 0.032 NA   NA
 1234158 1234159 UTI89_C0403 UTI89_C0404 psiF yaiC TRUE 0.578 102.000 0.250 NA   NA
 1234161 1234162 UTI89_C0406 UTI89_C0407 yaiI aroL FALSE 0.002 183.000 0.007 NA   NA
 1234164 1234165 UTI89_C0409 UTI89_C0410 yaiA aroM FALSE 0.004 258.000 0.000 NA   NA
 1234165 1234166 UTI89_C0410 UTI89_C0411 aroM yaiE FALSE 0.124 72.000 0.049 NA   NA
 1234171 1234172 UTI89_C0416 UTI89_C0417 araJ sbcC FALSE 0.339 42.000 0.030 1.000 N NA
 1234172 1234173 UTI89_C0417 UTI89_C0418 sbcC sbcD TRUE 0.970 -3.000 0.021 0.001 Y NA
 1234174 1234175 UTI89_C0419 UTI89_C0420   phoB FALSE 0.070 73.000 0.000 NA   NA
 1234175 1234176 UTI89_C0420 UTI89_C0421 phoB phoR TRUE 0.966 58.000 0.453 0.015 Y NA
 1234178 1234179 UTI89_C0423 UTI89_C0424 brnQ proY TRUE 0.946 73.000 0.348 0.099 Y NA
 1234179 1234180 UTI89_C0424 UTI89_C0425 proY malZ FALSE 0.239 156.000 0.123 1.000 N NA
 1234182 1234183 UTI89_C0427 UTI89_C0428 queA tgt TRUE 0.969 55.000 0.360 0.001 Y NA
 1234183 1234184 UTI89_C0428 UTI89_C0429 tgt yajC TRUE 0.873 23.000 0.325 NA N NA
 1234184 1234185 UTI89_C0429 UTI89_C0430 yajC secD TRUE 0.831 28.000 0.045 NA Y NA
 1234185 1234186 UTI89_C0430 UTI89_C0431 secD secF TRUE 0.973 -34.000 0.206 0.001 Y NA
 1234186 1234187 UTI89_C0431 UTI89_C0432 secF yajD FALSE 0.114 61.000 0.015 1.000   NA
 1234188 1234189 UTI89_C0433 UTI89_C0434 tsx yajI FALSE 0.004 250.000 0.000 NA   NA
 1234190 1234191 UTI89_C0435 UTI89_C0436 ybaD ribD TRUE 0.922 4.000 0.277 NA N NA
 1234191 1234192 UTI89_C0436 UTI89_C0437 ribD ribH TRUE 0.854 89.000 0.034 0.001 Y NA
 1234194 1234195 UTI89_C0439 UTI89_C0440 nusB thiL TRUE 0.670 78.000 0.225 1.000 N NA
 1234195 1234196 UTI89_C0440 UTI89_C0441 thiL pgpA TRUE 0.838 -22.000 0.206 1.000 N NA
 1234197 1234198 UTI89_C0442 UTI89_C0443 yajO dxs FALSE 0.208 55.000 0.009 1.000 N NA
 1234198 1234199 UTI89_C0443 UTI89_C0444 dxs ispA TRUE 0.888 25.000 0.060 1.000 Y NA
 1234199 1234200 UTI89_C0444 UTI89_C0445 ispA xseB TRUE 0.700 0.000 0.035 1.000 N NA
 1234202 1234203 UTI89_C0447 UTI89_C0448 thiJ apbA TRUE 0.624 -43.000 0.155 NA   NA
 1234205 1234206 UTI89_C0450 UTI89_C0451 yajR cyoE TRUE 0.713 -49.000 0.061 0.099 N NA
 1234206 1234207 UTI89_C0451 UTI89_C0452 cyoE cyoD TRUE 0.827 -33.000 0.118 0.099 N NA
 1234209 1234210 UTI89_C0454 UTI89_C0455 cyoC cyoB TRUE 0.993 -10.000 0.697 0.059 Y NA
 1234210 1234211 UTI89_C0455 UTI89_C0456 cyoB cyoA TRUE 0.945 22.000 0.041 0.004 Y NA
 1234211 1234212 UTI89_C0456 UTI89_C0457 cyoA ampG FALSE 0.008 459.000 0.000 0.099   NA
 1234212 1234213 UTI89_C0457 UTI89_C0458 ampG yajG TRUE 0.693 44.000 0.256 NA   NA
 1234213 1234214 UTI89_C0458 UTI89_C0459 yajG   FALSE 0.072 62.000 0.000 NA   NA
 1234217 1234218 UTI89_C0462 UTI89_C0463   tig FALSE 0.026 147.000 0.000 NA   NA
 1234220 1234221 UTI89_C0465 UTI89_C0466 clpP clpX TRUE 0.861 126.000 0.352 1.000 Y NA
 1234221 1234222 UTI89_C0466 UTI89_C0467 clpX lon TRUE 0.801 143.000 0.201 0.098 Y NA
 1234222 1234223 UTI89_C0467 UTI89_C0468 lon hupB FALSE 0.037 209.000 0.000 1.000 N NA
 1234223 1234224 UTI89_C0468 UTI89_C0469 hupB ybaU FALSE 0.049 192.000 0.000 1.000 N NA
 1234224 1234225 UTI89_C0469 UTI89_C0470 ybaU ybaV FALSE 0.098 151.000 0.033 1.000 N NA
 1234225 1234226 UTI89_C0470 UTI89_C0471 ybaV ybaW FALSE 0.137 106.000 0.027 1.000   NA
 1234227 1234228 UTI89_C0472 UTI89_C0473 ybaX ybaE FALSE 0.122 65.000 0.019 1.000   NA
 1234229 1234230 UTI89_C0474 UTI89_C0475 cof ybaO FALSE 0.176 45.000 0.020 1.000   NA
 1234230 1234231 UTI89_C0475 UTI89_C0476 ybaO mdlA TRUE 0.790 30.000 0.179 1.000 N NA
 1234231 1234232 UTI89_C0476 UTI89_C0477 mdlA mdlB TRUE 0.988 -121.000 0.911 0.007 Y NA
 1234232 1234233 UTI89_C0477 UTI89_C0478 mdlB glnK FALSE 0.052 181.000 0.028 1.000 N NA
 1234233 1234234 UTI89_C0478 UTI89_C0479 glnK amtB TRUE 0.766 30.000 0.156 1.000 N NA
 1234239 1234240 UTI89_C0484 UTI89_C0485 ylaB ylaC FALSE 0.020 158.000 0.000 NA   NA
 1234240 1234241 UTI89_C0485 UTI89_C0486 ylaC maa FALSE 0.418 77.000 0.101 1.000   NA
 1234241 1234242 UTI89_C0486 UTI89_C0487 maa hha FALSE 0.057 174.000 0.076 NA   NA
 1234242 1234243 UTI89_C0487 UTI89_C0488 hha ybaJ TRUE 0.595 14.000 0.080 NA   NA
 1234243 1234244 UTI89_C0488 UTI89_C0489 ybaJ acrB FALSE 0.001 545.000 0.000 NA   NA
 1234244 1234245 UTI89_C0489 UTI89_C0490 acrB acrA TRUE 0.928 23.000 0.458 1.000 N NA
 1234246 1234247 UTI89_C0491 UTI89_C0492 acrR kefA FALSE 0.092 128.000 0.000 NA N NA
 1234248 1234249 UTI89_C0493 UTI89_C0494 ybaM priC TRUE 0.930 14.000 0.474 NA   NA
 1234250 1234251 UTI89_C0495 UTI89_C0496 ybaN apt FALSE 0.096 99.000 0.043 NA   NA
 1234251 1234252 UTI89_C0496 UTI89_C0497 apt dnaX FALSE 0.300 129.000 0.088 1.000 N NA
 1234254 1234255 UTI89_C0499 UTI89_C0500 ybaB recR TRUE 0.965 0.000 0.604 NA   NA
 1234255 1234256 UTI89_C0500 UTI89_C0501 recR htpG FALSE 0.205 110.000 0.028 1.000 N NA
 1234256 1234257 UTI89_C0501 UTI89_C0502 htpG adk FALSE 0.369 121.000 0.035 0.098 N NA
 1234257 1234258 UTI89_C0502 UTI89_C0503 adk hemH FALSE 0.104 132.000 0.013 1.000 N NA
 1234261 1234262 UTI89_C0506 UTI89_C0507 ybaL fsr FALSE 0.055 239.000 0.000 0.099 N NA
 1234264 1234265 UTI89_C0509 UTI89_C0510     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1234265 1234266 UTI89_C0510 UTI89_C0511   ybaK FALSE 0.016 168.000 0.000 NA   NA
 1234266 1234267 UTI89_C0511 UTI89_C0512 ybaK ybaP FALSE 0.002 204.000 0.022 NA   NA
 1234268 1234269 UTI89_C0513 UTI89_C0514     TRUE 0.762 36.000 0.286 NA   NA
 1234271 1234272 UTI89_C0516 UTI89_C0517 ybaS ybaT TRUE 0.932 3.000 0.028 1.000 Y NA
 1234272 1234273 UTI89_C0517 UTI89_C0518 ybaT cueR FALSE 0.176 125.000 0.000 1.000 N NA
 1234274 1234275 UTI89_C0519 UTI89_C0520     FALSE 0.135 33.000 0.000 NA   NA
 1234275 1234276 UTI89_C0520 UTI89_C0521     FALSE 0.066 86.000 0.000 NA   NA
 1234278 1234279 UTI89_C0523 UTI89_C0524 ybbJ ybbK TRUE 0.979 -3.000 0.313 NA Y NA
 1234280 1234281 UTI89_C0525 UTI89_C0526 ybbL ybbM TRUE 0.571 -40.000 0.127 NA   NA
 1234282 1234283 UTI89_C0527 UTI89_C0528 ybbN ybbO TRUE 0.694 25.000 0.118 1.000   NA
 1234283 1234284 UTI89_C0528 UTI89_C0529 ybbO tesA TRUE 0.647 -10.000 0.072 1.000   NA
 1234285 1234286 UTI89_C0530 UTI89_C0531 ybbA ybbP TRUE 0.987 -3.000 0.535 NA Y NA
 1234287 1234288 UTI89_C0532 UTI89_C0533 ybbB ybbS FALSE 0.014 69.000 0.012 NA   NA
 1234289 1234290 UTI89_C0534 UTI89_C0535 ybbT ybbU TRUE 0.864 78.000 0.625 1.000 N NA
 1234290 1234291 UTI89_C0535 UTI89_C0536 ybbU gcl FALSE 0.251 90.000 0.054 1.000   NA
 1234291 1234292 UTI89_C0536 UTI89_C0537 gcl hyi TRUE 0.664 13.000 0.065 1.000   NA
 1234292 1234293 UTI89_C0537 UTI89_C0538 hyi ybbQ TRUE 0.569 100.000 0.154 1.000 N NA
 1234293 1234294 UTI89_C0538 UTI89_C0539 ybbQ ybbW FALSE 0.073 170.000 0.000 1.000 N NA
 1234294 1234295 UTI89_C0539 UTI89_C0540 ybbW ybbX TRUE 0.853 60.000 0.161 1.000 Y NA
 1234295 1234296 UTI89_C0540 UTI89_C0541 ybbX ybbY TRUE 0.879 50.000 0.161 1.000 Y NA
 1234296 1234297 UTI89_C0541 UTI89_C0542 ybbY ybbZ TRUE 0.823 16.000 0.133 1.000 N NA
 1234298 1234299 UTI89_C0543 UTI89_C0544 ylbA ylbB TRUE 0.517 11.000 0.059 NA   NA
 1234299 1234300 UTI89_C0544 UTI89_C0545 ylbB allD TRUE 0.904 4.000 0.174 1.000 N NA
 1234301 1234302 UTI89_C0546 UTI89_C0547 fdrA ylbE TRUE 0.935 10.000 0.412 NA   NA
 1234302 1234303 UTI89_C0547 UTI89_C0548 ylbE ylbF TRUE 0.714 -82.000 0.265 NA   NA
 1234303 1234304 UTI89_C0548 UTI89_C0549 ylbF arcC TRUE 0.932 -3.000 0.375 NA   NA
 1234305 1234306 UTI89_C0550 UTI89_C0551 purK purE TRUE 0.986 -3.000 0.136 0.001 Y NA
 1234306 1234307 UTI89_C0551 UTI89_C0552 purE   FALSE 0.014 69.000 0.002 NA   NA
 1234307 1234308 UTI89_C0552 UTI89_C0553   ybbF FALSE 0.011 111.000 0.005 NA   NA
 1234308 1234309 UTI89_C0553 UTI89_C0554 ybbF ppiB TRUE 0.919 3.000 0.237 1.000   NA
 1234313 1234314 UTI89_C0558 UTI89_C0559 ybcJ folD TRUE 0.698 2.000 0.055 1.000   NA
 1234315 1234316 UTI89_C0560 UTI89_C0561   argU FALSE 0.135 33.000 0.000 NA   NA
 1234317 1234318 UTI89_C0562 UTI89_C0563 intD   TRUE 0.742 -25.000 0.000 0.009   NA
 1234320 1234321 UTI89_C0565 UTI89_C0566   ompT FALSE 0.015 235.000 0.000 1.000   NA
 1234321 1234322 UTI89_C0566 UTI89_C0567 ompT ybcH FALSE 0.001 658.000 0.000 NA   NA
 1234322 1234323 UTI89_C0567 UTI89_C0568 ybcH nfrA TRUE 0.955 1.000 0.500 NA   NA
 1234323 1234324 UTI89_C0568 UTI89_C0569 nfrA nfrB TRUE 0.724 -34.000 0.159 1.000   NA
 1234324 1234325 UTI89_C0569 UTI89_C0570 nfrB cusS FALSE 0.240 150.000 0.000 0.097 N NA
 1234325 1234326 UTI89_C0570 UTI89_C0571 cusS ylcA TRUE 0.994 -10.000 0.600 0.001 Y NA
 1234327 1234328 UTI89_C0572 UTI89_C0573 cusC ylcC TRUE 0.902 24.000 0.500 NA   NA
 1234328 1234329 UTI89_C0573 UTI89_C0574 ylcC   FALSE 0.227 16.000 0.000 NA   NA
 1234329 1234330 UTI89_C0574 UTI89_C0575   cusA TRUE 0.959 12.000 0.500 1.000 N NA
 1234330 1234331 UTI89_C0575 UTI89_C0576 cusA pheP FALSE 0.492 66.000 0.000 0.098 N NA
 1234332 1234333 UTI89_C0577 UTI89_C0578 ybdG nfnB FALSE 0.059 108.000 0.012 NA N NA
 1234333 1234334 UTI89_C0578 UTI89_C0579 nfnB ybdF TRUE 0.763 79.000 0.500 NA   NA
 1234334 1234335 UTI89_C0579 UTI89_C0580 ybdF ybdJ FALSE 0.070 65.000 0.000 NA   NA
 1234335 1234336 UTI89_C0580 UTI89_C0581 ybdJ ybdK FALSE 0.070 66.000 0.000 NA   NA
 1234336 1234337 UTI89_C0581 UTI89_C0582 ybdK   FALSE 0.007 216.000 0.000 NA   NA
 1234337 1234338 UTI89_C0582 UTI89_C0583   entD FALSE 0.004 243.000 0.000 NA   NA
 1234338 1234339 UTI89_C0583 UTI89_C0584 entD fepA TRUE 0.953 25.000 0.700 1.000 N NA
 1234340 1234341 UTI89_C0585 UTI89_C0586   fes FALSE 0.046 119.000 0.000 NA   NA
 1234341 1234342 UTI89_C0586 UTI89_C0587 fes   TRUE 0.918 -3.000 0.320 NA   NA
 1234342 1234343 UTI89_C0587 UTI89_C0588   entF TRUE 0.663 -3.000 0.080 NA   NA
 1234343 1234344 UTI89_C0588 UTI89_C0589 entF fepE FALSE 0.033 216.000 0.000 1.000 N NA
 1234345 1234346 UTI89_C0590 UTI89_C0591 fepC fepG TRUE 0.933 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1234346 1234347 UTI89_C0591 UTI89_C0592 fepG fepD TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.066 Y NA
 1234350 1234351 UTI89_C0595 UTI89_C0596 entC entE TRUE 0.992 10.000 0.667 1.000 Y NA
 1234351 1234352 UTI89_C0596 UTI89_C0597 entE entB TRUE 0.989 14.000 0.667 1.000 Y NA
 1234352 1234353 UTI89_C0597 UTI89_C0598 entB entA TRUE 0.933 0.000 0.024 1.000 Y NA
 1234353 1234354 UTI89_C0598 UTI89_C0599 entA ybdB TRUE 0.937 3.000 0.065 NA Y NA
 1234354 1234355 UTI89_C0599 UTI89_C0600 ybdB cstA FALSE 0.212 181.000 0.222 NA N NA
 1234355 1234356 UTI89_C0600 UTI89_C0601 cstA ybdD TRUE 0.602 113.000 0.333 NA   NA
 1234359 1234360 UTI89_C0604 UTI89_C0605 ybdM ybdN FALSE 0.380 -27.000 0.000 1.000   NA
 1234360 1234361 UTI89_C0605 UTI89_C0606 ybdN ybdO FALSE 0.486 147.000 0.333 1.000   NA
 1234361 1234362 UTI89_C0606 UTI89_C0607 ybdO dsbG FALSE 0.119 169.000 0.067 1.000 N NA
 1234363 1234364 UTI89_C0608 UTI89_C0609 ahpC ahpF TRUE 0.872 141.000 0.551 1.000 Y NA
 1234367 1234368 UTI89_C0612 UTI89_C0613 rnk rna FALSE 0.018 230.000 0.018 1.000 N NA
 1234368 1234369 UTI89_C0613 UTI89_C0614 rna citT FALSE 0.219 96.000 0.024 1.000 N NA
 1234369 1234370 UTI89_C0614 UTI89_C0615 citT citG TRUE 0.693 51.000 0.194 1.000 N NA
 1234370 1234371 UTI89_C0615 UTI89_C0616 citG citX TRUE 0.971 -25.000 0.400 1.000 Y NA
 1234375 1234376 UTI89_C0620 UTI89_C0621 citE citD TRUE 0.974 -18.000 0.537 0.001 N NA
 1234376 1234377 UTI89_C0621 UTI89_C0622 citD citC TRUE 0.907 15.000 0.000 1.000 Y NA
 1234378 1234379 UTI89_C0623 UTI89_C0624 dpiB dpiA TRUE 0.909 -31.000 0.000 0.082 Y NA
 1234381 1234382 UTI89_C0626 UTI89_C0627 crcA cspE TRUE 0.717 91.000 0.333 1.000   NA
 1234384 1234385 UTI89_C0629 UTI89_C0630 ybeM   FALSE 0.426 129.000 0.196 1.000   NA
 1234386 1234387 UTI89_C0631 UTI89_C0632 lipA lipB FALSE 0.129 820.000 0.319 0.001 Y NA
 1234387 1234388 UTI89_C0632 UTI89_C0633 lipB ybeD TRUE 0.538 101.000 0.219 NA   NA
 1234388 1234389 UTI89_C0633 UTI89_C0634 ybeD dacA FALSE 0.225 110.000 0.081 NA   NA
 1234389 1234390 UTI89_C0634 UTI89_C0635 dacA rlpA TRUE 0.830 140.000 0.475 NA Y NA
 1234390 1234391 UTI89_C0635 UTI89_C0636 rlpA mrdB FALSE 0.480 11.000 0.035 NA N NA
 1234391 1234392 UTI89_C0636 UTI89_C0637 mrdB mrdA TRUE 0.735 3.000 0.046 1.000 N NA
 1234392 1234393 UTI89_C0637 UTI89_C0638 mrdA ybeA FALSE 0.090 31.000 0.031 NA   NA
 1234393 1234394 UTI89_C0638 UTI89_C0639 ybeA ybeB TRUE 0.917 4.000 0.307 NA   NA
 1234396 1234397 UTI89_C0641 UTI89_C0642 phpB ybeN TRUE 0.632 21.000 0.057 1.000 N NA
 1234397 1234398 UTI89_C0642 UTI89_C0643 ybeN holA FALSE 0.439 -61.000 0.045 1.000 N NA
 1234398 1234399 UTI89_C0643 UTI89_C0644 holA rlpB TRUE 0.897 0.000 0.199 NA N NA
 1234399 1234400 UTI89_C0644 UTI89_C0645 rlpB leuS TRUE 0.838 15.000 0.182 NA N NA
 1234402 1234403 UTI89_C0647 UTI89_C0648 rihA gltL FALSE 0.468 118.000 0.195 NA N NA
 1234403 1234404 UTI89_C0648 UTI89_C0649 gltL gltK TRUE 0.987 0.000 0.379 1.000 Y NA
 1234404 1234405 UTI89_C0649 UTI89_C0650 gltK gltJ TRUE 0.997 0.000 0.933 0.017 Y NA
 1234405 1234406 UTI89_C0650 UTI89_C0651 gltJ ybeJ TRUE 0.536 170.000 0.067 0.066 Y NA
 1234407 1234408 UTI89_C0652 UTI89_C0653     FALSE 0.009 197.000 0.000 NA   NA
 1234408 1234409 UTI89_C0653 UTI89_C0654     FALSE 0.153 -31.000 0.000 NA   NA
 1234410 1234411 UTI89_C0655 UTI89_C0656 cutE ybeX TRUE 0.938 25.000 0.557 1.000 N NA
 1234411 1234412 UTI89_C0656 UTI89_C0657 ybeX ybeY FALSE 0.421 90.000 0.150 NA   NA
 1234412 1234413 UTI89_C0657 UTI89_C0658 ybeY ybeZ TRUE 0.945 -3.000 0.457 NA   NA
 1234413 1234414 UTI89_C0658 UTI89_C0659 ybeZ   TRUE 0.587 114.000 0.220 1.000 N NA
 1234416 1234417 UTI89_C0661 UTI89_C0662 glnX glnV FALSE 0.108 41.000 0.000 NA   NA
 1234417 1234418 UTI89_C0662 UTI89_C0663 glnV metU FALSE 0.086 52.000 0.000 NA   NA
 1234418 1234419 UTI89_C0663 UTI89_C0664 metU glnW FALSE 0.205 19.000 0.000 NA   NA
 1234419 1234420 UTI89_C0664 UTI89_C0665 glnW glnU FALSE 0.116 38.000 0.000 NA   NA
 1234420 1234421 UTI89_C0665 UTI89_C0666 glnU leuW FALSE 0.160 27.000 0.000 NA   NA
 1234421 1234422 UTI89_C0666 UTI89_C0667 leuW metT FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 1234422 1234423 UTI89_C0667 UTI89_C0668 metT asnB FALSE 0.001 381.000 0.000 NA   NA
 1234423 1234424 UTI89_C0668 UTI89_C0669 asnB nagD TRUE 0.532 22.000 0.000 1.000 N NA
 1234424 1234425 UTI89_C0669 UTI89_C0670 nagD nagC TRUE 0.818 48.000 0.070 1.000 Y NA
 1234425 1234426 UTI89_C0670 UTI89_C0671 nagC nagA TRUE 0.990 9.000 0.571 1.000 Y NA
 1234426 1234427 UTI89_C0671 UTI89_C0672 nagA nagB TRUE 0.977 60.000 0.557 0.001 Y NA
 1234427 1234428 UTI89_C0672 UTI89_C0673 nagB   FALSE 0.070 49.000 0.033 NA   NA
 1234430 1234431 UTI89_C0675 UTI89_C0676     FALSE 0.149 -33.000 0.000 NA   NA
 1234431 1234432 UTI89_C0676 UTI89_C0677     FALSE 0.450 14.000 0.000 NA N NA
 1234432 1234433 UTI89_C0677 UTI89_C0678     TRUE 0.946 -3.000 0.092 NA Y NA
 1234433 1234434 UTI89_C0678 UTI89_C0679     FALSE 0.002 846.000 0.000 1.000 N NA
 1234434 1234435 UTI89_C0679 UTI89_C0680     TRUE 0.954 4.000 0.208 0.062 N NA
 1234436 1234437 UTI89_C0681 UTI89_C0682     TRUE 0.905 -7.000 0.361 NA   NA
 1234437 1234438 UTI89_C0682 UTI89_C0683     TRUE 0.971 2.000 0.533 1.000 N NA
 1234438 1234439 UTI89_C0683 UTI89_C0684   glnS FALSE 0.031 220.000 0.000 1.000 N NA
 1234439 1234440 UTI89_C0684 UTI89_C0685 glnS ybfM FALSE 0.002 449.000 0.000 1.000   NA
 1234440 1234441 UTI89_C0685 UTI89_C0686 ybfM ybfN FALSE 0.091 50.000 0.000 NA   NA
 1234444 1234445 UTI89_C0689 UTI89_C0690 fldA ybfE TRUE 0.919 23.000 0.473 1.000   NA
 1234445 1234446 UTI89_C0690 UTI89_C0691 ybfE ybfF TRUE 0.618 71.000 0.276 NA   NA
 1234447 1234448 UTI89_C0692 UTI89_C0693 seqA pgm TRUE 0.784 -25.000 0.151 1.000 N NA
 1234449 1234450 UTI89_C0694 UTI89_C0695 potE speF TRUE 0.955 -3.000 0.087 1.000 Y NA
 1234450 1234451 UTI89_C0695 UTI89_C0696 speF   FALSE 0.305 5.000 0.000 NA   NA
 1234453 1234454 UTI89_C0698 UTI89_C0699 kdpE kdpD TRUE 0.986 -3.000 0.385 1.000 Y NA
 1234454 1234455 UTI89_C0699 UTI89_C0700 kdpD kdpC TRUE 0.774 -10.000 0.100 1.000 N NA
 1234455 1234456 UTI89_C0700 UTI89_C0701 kdpC kdpB TRUE 0.995 -15.000 0.877 0.001 Y NA
 1234456 1234457 UTI89_C0701 UTI89_C0702 kdpB kdpA TRUE 0.979 23.000 0.201 0.001 Y NA
 1234457 1234458 UTI89_C0702 UTI89_C0703 kdpA   TRUE 0.888 0.000 0.022 0.001   NA
 1234459 1234460 UTI89_C0704 UTI89_C0705 ybfA ybgA TRUE 0.560 101.000 0.231 NA   NA
 1234460 1234461 UTI89_C0705 UTI89_C0706 ybgA phrB FALSE 0.074 -3.000 0.019 NA   NA
 1234463 1234464 UTI89_C0708 UTI89_C0709 ybgI ybgJ FALSE 0.304 23.000 0.050 NA   NA
 1234464 1234465 UTI89_C0709 UTI89_C0710 ybgJ ybgK TRUE 0.977 -6.000 0.379 NA Y NA
 1234465 1234466 UTI89_C0710 UTI89_C0711 ybgK ybgL TRUE 0.811 -10.000 0.211 NA   NA
 1234466 1234467 UTI89_C0711 UTI89_C0712 ybgL nei FALSE 0.308 36.000 0.037 1.000   NA
 1234468 1234469 UTI89_C0713 UTI89_C0714 abrB ybgO FALSE 0.061 107.000 0.000 NA   NA
 1234469 1234470 UTI89_C0714 UTI89_C0715 ybgO gltA FALSE 0.076 148.000 0.000 1.000   NA
 1234471 1234472 UTI89_C0716 UTI89_C0717   sdhC FALSE 0.002 521.000 0.000 1.000   NA
 1234472 1234473 UTI89_C0717 UTI89_C0718 sdhC sdhD TRUE 0.993 -6.000 0.453 0.001 Y NA
 1234473 1234474 UTI89_C0718 UTI89_C0719 sdhD sdhA TRUE 0.994 -12.000 0.705 0.003 Y NA
 1234474 1234475 UTI89_C0719 UTI89_C0720 sdhA sdhB TRUE 0.994 16.000 0.604 0.003 Y NA
 1234475 1234476 UTI89_C0720 UTI89_C0721 sdhB sucA FALSE 0.053 361.000 0.067 1.000 Y NA
 1234476 1234477 UTI89_C0721 UTI89_C0722 sucA sucB TRUE 0.989 15.000 0.667 1.000 Y NA
 1234477 1234478 UTI89_C0722 UTI89_C0723 sucB sucC TRUE 0.823 94.000 0.136 1.000 Y NA
 1234478 1234479 UTI89_C0723 UTI89_C0724 sucC sucD TRUE 0.997 0.000 0.806 0.001 Y NA
 1234479 1234480 UTI89_C0724 UTI89_C0725 sucD   FALSE 0.014 240.000 0.000 1.000   NA
 1234480 1234481 UTI89_C0725 UTI89_C0726     FALSE 0.097 -118.000 0.000 NA   NA
 1234481 1234482 UTI89_C0726 UTI89_C0727   cydA FALSE 0.000 1101.000 0.000 NA   NA
 1234484 1234485 UTI89_C0729 UTI89_C0730 cydB   TRUE 0.758 15.000 0.149 NA   NA
 1234485 1234486 UTI89_C0730 UTI89_C0731   ybgE TRUE 0.924 0.000 0.310 NA   NA
 1234486 1234487 UTI89_C0731 UTI89_C0732 ybgE ybgC FALSE 0.127 150.000 0.095 NA   NA
 1234487 1234488 UTI89_C0732 UTI89_C0733 ybgC tolQ TRUE 0.967 -3.000 0.593 1.000   NA
 1234488 1234489 UTI89_C0733 UTI89_C0734 tolQ tolR TRUE 0.994 4.000 0.556 0.080 Y NA
 1234489 1234490 UTI89_C0734 UTI89_C0735 tolR tolA TRUE 0.509 65.000 0.114 1.000 N NA
 1234490 1234491 UTI89_C0735 UTI89_C0736 tolA tolB FALSE 0.194 130.000 0.051 1.000 N NA
 1234493 1234494 UTI89_C0738 UTI89_C0739 pal ybgF TRUE 0.775 10.000 0.088 1.000   NA
 1234494 1234495 UTI89_C0739 UTI89_C0740 ybgF lysT FALSE 0.017 165.000 0.000 NA   NA
 1234495 1234496 UTI89_C0740 UTI89_C0741 lysT valT FALSE 0.113 39.000 0.000 NA   NA
 1234496 1234497 UTI89_C0741 UTI89_C0742 valT lysW FALSE 0.303 6.000 0.000 NA   NA
 1234497 1234498 UTI89_C0742 UTI89_C0743 lysW valZ FALSE 0.080 55.000 0.000 NA   NA
 1234498 1234499 UTI89_C0743 UTI89_C0744 valZ lysY FALSE 0.300 7.000 0.000 NA   NA
 1234499 1234500 UTI89_C0744 UTI89_C0745 lysY lysZ FALSE 0.086 52.000 0.000 NA   NA
 1234500 1234501 UTI89_C0745 UTI89_C0746 lysZ lysQ FALSE 0.120 37.000 0.000 NA   NA
 1234501 1234502 UTI89_C0746 UTI89_C0747 lysQ nadA FALSE 0.003 281.000 0.000 NA   NA
 1234502 1234503 UTI89_C0747 UTI89_C0748 nadA pnuC TRUE 0.788 38.000 0.023 1.000 Y NA
 1234504 1234505 UTI89_C0749 UTI89_C0750     FALSE 0.216 114.000 0.057 1.000   NA
 1234507 1234508 UTI89_C0752 UTI89_C0753 gpmA galM FALSE 0.226 188.000 0.009 1.000 Y NA
 1234508 1234509 UTI89_C0753 UTI89_C0754 galM galK TRUE 0.976 -6.000 0.083 0.001 Y NA
 1234509 1234510 UTI89_C0754 UTI89_C0755 galK galT TRUE 0.982 4.000 0.370 0.001 N NA
 1234510 1234511 UTI89_C0755 UTI89_C0756 galT   TRUE 0.916 10.000 0.053 0.001 N NA
 1234511 1234512 UTI89_C0756 UTI89_C0757   modF FALSE 0.007 263.000 0.023 1.000   NA
 1234512 1234513 UTI89_C0757 UTI89_C0758 modF modE FALSE 0.356 68.000 0.009 0.095   NA
 1234514 1234515 UTI89_C0759 UTI89_C0760 ybhT   FALSE 0.117 -64.000 0.000 NA   NA
 1234515 1234516 UTI89_C0760 UTI89_C0761   modA FALSE 0.186 22.000 0.000 NA   NA
 1234516 1234517 UTI89_C0761 UTI89_C0762 modA modB TRUE 0.997 0.000 0.627 0.001 Y NA
 1234517 1234518 UTI89_C0762 UTI89_C0763 modB modC TRUE 0.996 3.000 0.537 0.001 Y NA
 1234522 1234523 UTI89_C0767 UTI89_C0768 ybhH ybhI FALSE 0.070 76.000 0.000 NA   NA
 1234523 1234524 UTI89_C0768 UTI89_C0769 ybhI ybhJ FALSE 0.315 183.000 0.300 1.000 N NA
 1234525 1234526 UTI89_C0770 UTI89_C0771 ybhC ybhB FALSE 0.022 152.000 0.000 NA   NA
 1234526 1234527 UTI89_C0771 UTI89_C0772 ybhB bioA FALSE 0.015 59.000 0.003 NA   NA
 1234528 1234529 UTI89_C0773 UTI89_C0774 bioB bioF TRUE 0.987 -3.000 0.168 0.002 Y NA
 1234529 1234530 UTI89_C0774 UTI89_C0775 bioF bioC TRUE 0.862 -52.000 0.133 0.002 N NA
 1234530 1234531 UTI89_C0775 UTI89_C0776 bioC bioD TRUE 0.886 -7.000 0.054 0.002 N NA
 1234531 1234532 UTI89_C0776 UTI89_C0777 bioD uvrB FALSE 0.008 579.000 0.000 0.095 N NA
 1234533 1234534 UTI89_C0778 UTI89_C0779 ybhK   FALSE 0.012 183.000 0.000 NA   NA
 1234535 1234536 UTI89_C0780 UTI89_C0781 moaA moaB TRUE 0.966 22.000 0.108 0.003 Y NA
 1234538 1234539 UTI89_C0783 UTI89_C0784 moaC moaD TRUE 0.982 -7.000 0.175 0.003 Y NA
 1234539 1234540 UTI89_C0784 UTI89_C0785 moaD moaE TRUE 0.995 2.000 0.501 0.003 Y NA
 1234540 1234541 UTI89_C0785 UTI89_C0786 moaE ybhL FALSE 0.008 137.000 0.025 NA   NA
 1234544 1234545 UTI89_C0789 UTI89_C0790 ybhN ybhO TRUE 0.652 0.000 0.071 NA   NA
 1234545 1234546 UTI89_C0790 UTI89_C0791 ybhO ybhP TRUE 0.923 -3.000 0.333 NA   NA
 1234548 1234549 UTI89_C0793 UTI89_C0794 ybhR ybhS TRUE 0.995 11.000 0.609 0.006 Y NA
 1234549 1234550 UTI89_C0794 UTI89_C0795 ybhS ybhF TRUE 0.969 -7.000 0.547 0.095   NA
 1234550 1234551 UTI89_C0795 UTI89_C0796 ybhF ybhG TRUE 0.928 -22.000 0.545 1.000   NA
 1234551 1234552 UTI89_C0796 UTI89_C0797 ybhG ybiH TRUE 0.935 0.000 0.236 1.000 N NA
 1234557 1234558 UTI89_C0802 UTI89_C0803 dinG ybiB FALSE 0.500 28.000 0.041 1.000 N NA
 1234558 1234559 UTI89_C0803 UTI89_C0804 ybiB ybiC FALSE 0.294 141.000 0.000 0.062 N NA
 1234560 1234561 UTI89_C0805 UTI89_C0806 ybiJ   FALSE 0.001 265.000 0.027 NA   NA
 1234561 1234562 UTI89_C0806 UTI89_C0807   ybiX FALSE 0.191 74.000 0.000 1.000   NA
 1234562 1234563 UTI89_C0807 UTI89_C0808 ybiX ybiL FALSE 0.180 180.000 0.171 1.000   NA
 1234563 1234564 UTI89_C0808 UTI89_C0809 ybiL ybiM FALSE 0.003 265.000 0.000 NA   NA
 1234566 1234567 UTI89_C0811 UTI89_C0812 ybiO glnQ FALSE 0.115 117.000 0.000 NA N NA
 1234567 1234568 UTI89_C0812 UTI89_C0813 glnQ glnP TRUE 0.933 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1234568 1234569 UTI89_C0813 UTI89_C0814 glnP glnH TRUE 0.663 139.000 0.051 0.080 Y NA
 1234569 1234570 UTI89_C0814 UTI89_C0815 glnH   FALSE 0.099 46.000 0.000 NA   NA
 1234570 1234571 UTI89_C0815 UTI89_C0816   dps FALSE 0.070 65.000 0.000 NA   NA
 1234571 1234572 UTI89_C0816 UTI89_C0817 dps ybiF FALSE 0.013 206.000 0.044 NA   NA
 1234574 1234575 UTI89_C0819 UTI89_C0820 ybiP   FALSE 0.003 272.000 0.000 NA   NA
 1234576 1234577 UTI89_C0821 UTI89_C0822 mntR ybiR TRUE 0.584 -3.000 0.014 1.000 N NA
 1234580 1234581 UTI89_C0825 UTI89_C0826 ybiV ybiW FALSE 0.080 146.000 0.000 1.000   NA
 1234581 1234582 UTI89_C0826 UTI89_C0827 ybiW   TRUE 0.974 6.000 0.316 0.004 N NA
 1234584 1234585 UTI89_C0829 UTI89_C0830 moeB moeA TRUE 0.993 0.000 0.323 0.003 Y NA
 1234586 1234587 UTI89_C0831 UTI89_C0832 ybiK   TRUE 0.514 -121.000 0.104 1.000   NA
 1234587 1234588 UTI89_C0832 UTI89_C0833     FALSE 0.446 -238.000 0.083 1.000   NA
 1234588 1234589 UTI89_C0833 UTI89_C0834   yliC TRUE 0.994 18.000 0.803 0.065 Y NA
 1234589 1234590 UTI89_C0834 UTI89_C0835 yliC   TRUE 0.996 3.000 0.689 0.065 Y NA
 1234590 1234591 UTI89_C0835 UTI89_C0836   yliE FALSE 0.034 177.000 0.000 NA N NA
 1234591 1234592 UTI89_C0836 UTI89_C0837 yliE yliF TRUE 0.913 8.000 0.000 NA Y NA
 1234594 1234595 UTI89_C0839 UTI89_C0840 bssR yliI FALSE 0.094 111.000 0.047 NA   NA
 1234598 1234599 UTI89_C0843 UTI89_C0844 deoR ybjG TRUE 0.665 58.000 0.235 1.000   NA
 1234601 1234602 UTI89_C0846 UTI89_C0847 ybjH ybjI FALSE 0.066 85.000 0.000 NA   NA
 1234602 1234603 UTI89_C0847 UTI89_C0848 ybjI ybjJ TRUE 0.575 -3.000 0.000 1.000   NA
 1234608 1234609 UTI89_C0853 UTI89_C0854 ybjC nfsA TRUE 0.719 -16.000 0.159 NA   NA
 1234609 1234610 UTI89_C0854 UTI89_C0855 nfsA rimK FALSE 0.280 61.000 0.000 1.000 N NA
 1234610 1234611 UTI89_C0855 UTI89_C0856 rimK ybjN FALSE 0.284 40.000 0.065 NA   NA
 1234611 1234612 UTI89_C0856 UTI89_C0857 ybjN potF FALSE 0.008 206.000 0.000 NA   NA
 1234612 1234613 UTI89_C0857 UTI89_C0858 potF potG TRUE 0.956 95.000 0.679 1.000 Y NA
 1234613 1234614 UTI89_C0858 UTI89_C0859 potG potH TRUE 0.993 10.000 0.857 1.000 Y NA
 1234614 1234615 UTI89_C0859 UTI89_C0860 potH potI TRUE 0.982 -45.000 0.528 0.064 Y NA
 1234615 1234616 UTI89_C0860 UTI89_C0861 potI ybjO TRUE 0.620 60.000 0.264 NA   NA
 1234616 1234617 UTI89_C0861 UTI89_C0862 ybjO ybjF TRUE 0.678 41.000 0.226 NA   NA
 1234618 1234619 UTI89_C0863 UTI89_C0864 artJ artM TRUE 0.615 175.000 0.143 0.080 Y NA
 1234619 1234620 UTI89_C0864 UTI89_C0865 artM artQ TRUE 0.996 0.000 0.714 0.017 Y NA
 1234620 1234621 UTI89_C0865 UTI89_C0866 artQ artI TRUE 0.988 7.000 0.260 0.064 Y NA
 1234621 1234622 UTI89_C0866 UTI89_C0867 artI artP TRUE 0.973 18.000 0.323 1.000 Y NA
 1234622 1234623 UTI89_C0867 UTI89_C0868 artP ybjP FALSE 0.048 218.000 0.081 1.000   NA
 1234624 1234625 UTI89_C0869 UTI89_C0870 ybjQ ybjR FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1234626 1234627 UTI89_C0871 UTI89_C0872 ybjS ybjT TRUE 0.907 36.000 0.022 0.003 Y NA
 1234627 1234628 UTI89_C0872 UTI89_C0873 ybjT ybjU TRUE 0.546 -64.000 0.074 1.000 N NA
 1234628 1234629 UTI89_C0873 UTI89_C0874 ybjU poxB TRUE 0.820 37.000 0.041 1.000 Y NA
 1234629 1234630 UTI89_C0874 UTI89_C0875 poxB hcr FALSE 0.124 133.000 0.025 1.000 N NA
 1234630 1234631 UTI89_C0875 UTI89_C0876 hcr ybjW TRUE 0.965 6.000 0.000 0.018 Y NA
 1234631 1234632 UTI89_C0876 UTI89_C0877 ybjW ybjE FALSE 0.091 138.000 0.000 1.000   NA
 1234632 1234633 UTI89_C0877 UTI89_C0878 ybjE aqpZ FALSE 0.004 321.000 0.025 1.000   NA
 1234633 1234634 UTI89_C0878 UTI89_C0879 aqpZ   FALSE 0.008 207.000 0.000 NA   NA
 1234637 1234638 UTI89_C0882 UTI89_C0883   macA FALSE 0.104 -88.000 0.000 NA   NA
 1234638 1234639 UTI89_C0883 UTI89_C0884 macA ybjZ TRUE 0.980 -3.000 0.789 1.000 N NA
 1234640 1234641 UTI89_C0885 UTI89_C0886 cspD   FALSE 0.093 -156.000 0.000 NA   NA
 1234642 1234643 UTI89_C0887 UTI89_C0888 clpS clpA TRUE 0.902 31.000 0.596 NA   NA
 11486530 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5403.000 0.000 NA   NA
 11628893 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5403.000 0.000 NA   NA
 11771285 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5403.000 0.000 NA   NA
 11486531 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5431.000 0.000 NA   NA
 11628894 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5431.000 0.000 NA   NA
 11771286 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5431.000 0.000 NA   NA
 11486532 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5463.000 0.000 NA   NA
 11628895 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5463.000 0.000 NA   NA
 11771287 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5463.000 0.000 NA   NA
 11486533 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5491.000 0.000 NA   NA
 11628896 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5491.000 0.000 NA   NA
 11771288 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5491.000 0.000 NA   NA
 11486534 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5523.000 0.000 NA   NA
 11628897 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5523.000 0.000 NA   NA
 11771289 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5523.000 0.000 NA   NA
 11486535 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5551.000 0.000 NA   NA
 11628898 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5551.000 0.000 NA   NA
 11771290 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5551.000 0.000 NA   NA
 11486536 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5583.000 0.000 NA   NA
 11628899 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5583.000 0.000 NA   NA
 11771291 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5583.000 0.000 NA   NA
 11486537 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5611.000 0.000 NA   NA
 11628900 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5611.000 0.000 NA   NA
 11771292 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5611.000 0.000 NA   NA
 11486538 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5643.000 0.000 NA   NA
 11628901 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5643.000 0.000 NA   NA
 11771293 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5643.000 0.000 NA   NA
 11486539 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5671.000 0.000 NA   NA
 11628902 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5671.000 0.000 NA   NA
 11771294 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5671.000 0.000 NA   NA
 11486540 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5703.000 0.000 NA   NA
 11628903 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5703.000 0.000 NA   NA
 11771295 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5703.000 0.000 NA   NA
 11486541 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5731.000 0.000 NA   NA
 11628904 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5731.000 0.000 NA   NA
 11771296 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5731.000 0.000 NA   NA
 11486542 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5763.000 0.000 NA   NA
 11628905 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5763.000 0.000 NA   NA
 11771297 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5763.000 0.000 NA   NA
 11486543 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5791.000 0.000 NA   NA
 11628906 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5791.000 0.000 NA   NA
 11771298 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5791.000 0.000 NA   NA
 11486544 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5823.000 0.000 NA   NA
 11628907 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5823.000 0.000 NA   NA
 11771299 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5823.000 0.000 NA   NA
 11486545 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5851.000 0.000 NA   NA
 11628908 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5851.000 0.000 NA   NA
 11771300 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5851.000 0.000 NA   NA
 11486546 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5883.000 0.000 NA   NA
 11628909 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5883.000 0.000 NA   NA
 11771301 1234638   UTI89_C0883   macA FALSE NA 5883.000 0.000 NA   NA
 1234645 1234646 UTI89_C0890 UTI89_C0891     TRUE 0.968 -3.000 0.707 NA   NA
 1234646 1234647 UTI89_C0891 UTI89_C0892     FALSE 0.071 330.000 0.528 NA   NA
 1234647 1234648 UTI89_C0892 UTI89_C0893     TRUE 0.975 -3.000 0.895 NA   NA
 1234648 1234649 UTI89_C0893 UTI89_C0894     FALSE 0.141 67.000 0.053 NA   NA
 1234649 1234650 UTI89_C0894 UTI89_C0895     TRUE 0.967 11.000 0.787 NA   NA
 1234650 1234651 UTI89_C0895 UTI89_C0896     TRUE 0.940 11.000 0.468 NA   NA
 11486547 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3038.000 0.000 NA   NA
 11628910 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3038.000 0.000 NA   NA
 11771302 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3038.000 0.000 NA   NA
 11486548 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3066.000 0.000 NA   NA
 11628911 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3066.000 0.000 NA   NA
 11771303 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3066.000 0.000 NA   NA
 11486549 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3099.000 0.000 NA   NA
 11628912 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3099.000 0.000 NA   NA
 11771304 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3099.000 0.000 NA   NA
 11486550 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3127.000 0.000 NA   NA
 11628913 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3127.000 0.000 NA   NA
 11771305 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3127.000 0.000 NA   NA
 11486551 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3159.000 0.000 NA   NA
 11628914 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3159.000 0.000 NA   NA
 11771306 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3159.000 0.000 NA   NA
 11486552 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3187.000 0.000 NA   NA
 11628915 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3187.000 0.000 NA   NA
 11771307 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3187.000 0.000 NA   NA
 11486553 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3219.000 0.000 NA   NA
 11628916 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3219.000 0.000 NA   NA
 11771308 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3219.000 0.000 NA   NA
 11486554 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3247.000 0.000 NA   NA
 11628917 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3247.000 0.000 NA   NA
 11771309 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3247.000 0.000 NA   NA
 11486555 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3279.000 0.000 NA   NA
 11628918 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3279.000 0.000 NA   NA
 11771310 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3279.000 0.000 NA   NA
 11486556 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3307.000 0.000 NA   NA
 11628919 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3307.000 0.000 NA   NA
 11771311 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3307.000 0.000 NA   NA
 11486557 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3339.000 0.000 NA   NA
 11628920 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3339.000 0.000 NA   NA
 11771312 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3339.000 0.000 NA   NA
 11486558 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3367.000 0.000 NA   NA
 11628921 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3367.000 0.000 NA   NA
 11771313 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3367.000 0.000 NA   NA
 11486559 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3399.000 0.000 NA   NA
 11628922 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3399.000 0.000 NA   NA
 11771314 1234647   UTI89_C0892     FALSE NA 3399.000 0.000 NA   NA
 1234654 1234655 UTI89_C0899 UTI89_C0900 infA aat FALSE 0.010 285.000 0.020 1.000 N NA
 1234655 1234656 UTI89_C0900 UTI89_C0901 aat cydC TRUE 0.808 42.000 0.049 1.000 Y NA
 1234656 1234657 UTI89_C0901 UTI89_C0902 cydC cydD TRUE 0.996 1.000 0.631 0.006 Y NA
 1234657 1234658 UTI89_C0902 UTI89_C0903 cydD trxB TRUE 0.611 123.000 0.049 1.000 Y NA
 1234659 1234660 UTI89_C0904 UTI89_C0905 lrp ftsK TRUE 0.601 135.000 0.345 1.000 N NA
 1234660 1234661 UTI89_C0905 UTI89_C0906 ftsK lolA FALSE 0.444 156.000 0.305 1.000 N NA
 1234661 1234662 UTI89_C0906 UTI89_C0907 lolA ycaJ TRUE 0.886 11.000 0.167 1.000 N NA
 1234662 1234663 UTI89_C0907 UTI89_C0908 ycaJ serS TRUE 0.593 91.000 0.078 0.092 N NA
 1234663 1234664 UTI89_C0908 UTI89_C0909 serS   FALSE 0.052 113.000 0.000 NA   NA
 1234667 1234668 UTI89_C0912 UTI89_C0913     FALSE 0.103 43.000 0.000 NA   NA
 1234669 1234670 UTI89_C0914 UTI89_C0915     FALSE 0.327 0.000 0.000 NA   NA
 1234670 1234671 UTI89_C0915 UTI89_C0916     FALSE 0.079 56.000 0.000 NA   NA
 1234671 1234672 UTI89_C0916 UTI89_C0917     FALSE 0.113 -72.000 0.000 NA   NA
 1234672 1234673 UTI89_C0917 UTI89_C0918     FALSE 0.201 -13.000 0.000 NA   NA
 1234673 1234674 UTI89_C0918 UTI89_C0919     FALSE 0.300 7.000 0.000 NA   NA
 1234676 1234677 UTI89_C0921 UTI89_C0922     FALSE 0.310 4.000 0.000 NA   NA
 1234678 1234679 UTI89_C0923 UTI89_C0924     FALSE 0.317 3.000 0.000 NA   NA
 1234679 1234680 UTI89_C0924 UTI89_C0925     FALSE 0.317 3.000 0.000 NA   NA
 1234680 1234681 UTI89_C0925 UTI89_C0926     FALSE 0.237 -7.000 0.000 NA   NA
 1234681 1234682 UTI89_C0926 UTI89_C0927     FALSE 0.310 4.000 0.000 NA   NA
 1234682 1234683 UTI89_C0927 UTI89_C0928     TRUE 0.966 -3.000 0.667 NA   NA
 1234683 1234684 UTI89_C0928 UTI89_C0929     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1234684 1234685 UTI89_C0929 UTI89_C0930     FALSE 0.188 -16.000 0.000 NA   NA
 1234685 1234686 UTI89_C0930 UTI89_C0931     TRUE 0.676 138.000 0.667 NA   NA
 1234686 1234687 UTI89_C0931 UTI89_C0932     FALSE 0.094 -147.000 0.000 NA   NA
 1234687 1234688 UTI89_C0932 UTI89_C0933     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1234688 1234689 UTI89_C0933 UTI89_C0934     FALSE 0.317 3.000 0.000 NA   NA
 1234689 1234690 UTI89_C0934 UTI89_C0935     TRUE 0.931 0.000 0.333 NA   NA
 1234690 1234691 UTI89_C0935 UTI89_C0936     TRUE 0.932 102.000 0.667 0.001   NA
 1234691 1234692 UTI89_C0936 UTI89_C0937     FALSE 0.255 46.000 0.000 1.000   NA
 1234692 1234693 UTI89_C0937 UTI89_C0938     TRUE 0.962 24.000 1.000 1.000   NA
 1234694 1234695 UTI89_C0939 UTI89_C0940     TRUE 0.807 0.000 0.130 NA   NA
 1234695 1234696 UTI89_C0940 UTI89_C0941     FALSE 0.269 103.000 0.087 NA   NA
 1234697 1234698 UTI89_C0942 UTI89_C0943     FALSE 0.279 11.000 0.000 NA   NA
 1234698 1234699 UTI89_C0943 UTI89_C0944     FALSE 0.323 2.000 0.000 NA   NA
 1234699 1234700 UTI89_C0944 UTI89_C0945     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1234700 1234701 UTI89_C0945 UTI89_C0946     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1234701 1234702 UTI89_C0946 UTI89_C0947     FALSE 0.070 64.000 0.000 NA   NA
 1234702 1234703 UTI89_C0947 UTI89_C0948     TRUE 0.977 5.000 1.000 NA   NA
 1234703 1234704 UTI89_C0948 UTI89_C0949     FALSE 0.069 77.000 0.000 NA   NA
 1234704 1234705 UTI89_C0949 UTI89_C0950     FALSE 0.300 7.000 0.000 NA   NA
 1234705 1234706 UTI89_C0950 UTI89_C0951     FALSE 0.070 73.000 0.000 NA   NA
 1234708 1234709 UTI89_C0953 UTI89_C0954     TRUE 0.977 -3.000 1.000 NA   NA
 1234709 1234711 UTI89_C0954 UTI89_C0956     FALSE 0.267 12.000 0.000 NA   NA
 1234711 1234712 UTI89_C0956 UTI89_C0957     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1234712 1234713 UTI89_C0957 UTI89_C0958     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1234713 1234714 UTI89_C0958 UTI89_C0959     FALSE 0.174 24.000 0.000 NA   NA
 1234714 1234715 UTI89_C0959 UTI89_C0960     FALSE 0.008 204.000 0.000 NA   NA
 1234715 1234716 UTI89_C0960 UTI89_C0961     FALSE 0.267 12.000 0.000 NA   NA
 1234716 1234717 UTI89_C0961 UTI89_C0962     FALSE 0.279 11.000 0.000 NA   NA
 1234717 1234718 UTI89_C0962 UTI89_C0963     FALSE 0.002 334.000 0.000 NA   NA
 1234718 1234719 UTI89_C0963 UTI89_C0964     FALSE 0.305 5.000 0.000 NA   NA
 1234720 1234721 UTI89_C0965 UTI89_C0966     FALSE 0.191 70.000 0.000 1.000   NA
 1234721 1234722 UTI89_C0966 UTI89_C0967   dmsA FALSE 0.011 300.000 0.000 1.000 N NA
 1234722 1234723 UTI89_C0967 UTI89_C0968 dmsA dmsB TRUE 0.981 11.000 0.172 0.055 Y NA
 1234723 1234724 UTI89_C0968 UTI89_C0969 dmsB dmsC TRUE 0.944 2.000 0.333 1.000   NA
 1234725 1234726 UTI89_C0970 UTI89_C0971 ycaC   FALSE 0.079 56.000 0.000 NA   NA
 1234728 1234729 UTI89_C0973 UTI89_C0974 pflA pflB FALSE 0.107 192.000 0.092 1.000 N NA
 1234729 1234730 UTI89_C0974 UTI89_C0975 pflB focA TRUE 0.794 55.000 0.345 1.000 N NA
 1234730 1234731 UTI89_C0975 UTI89_C0976 focA ycaO FALSE 0.070 67.000 0.000 NA   NA
 1234732 1234733 UTI89_C0977 UTI89_C0978 ycaP serC FALSE 0.002 199.000 0.014 NA   NA
 1234733 1234734 UTI89_C0978 UTI89_C0979 serC aroA TRUE 0.697 71.000 0.033 1.000 Y NA
 1234734 1234735 UTI89_C0979 UTI89_C0980 aroA ycaL FALSE 0.048 161.000 0.003 1.000 N NA
 1234735 1234736 UTI89_C0980 UTI89_C0981 ycaL cmk FALSE 0.038 173.000 0.004 1.000 N NA
 1234736 1234737 UTI89_C0981 UTI89_C0982 cmk rpsA TRUE 0.668 111.000 0.281 1.000 N NA
 1234737 1234738 UTI89_C0982 UTI89_C0983 rpsA himD FALSE 0.413 160.000 0.292 1.000 N NA
 1234738 1234739 UTI89_C0983 UTI89_C0984 himD ycaI FALSE 0.009 206.000 0.003 1.000   NA
 1234739 1234740 UTI89_C0984 UTI89_C0985 ycaI msbA TRUE 0.686 37.000 0.075 0.092   NA
 1234740 1234741 UTI89_C0985 UTI89_C0986 msbA lpxK TRUE 0.914 -3.000 0.205 1.000 N NA
 1234741 1234742 UTI89_C0986 UTI89_C0987 lpxK ycaQ FALSE 0.025 37.000 0.017 NA   NA
 1234742 1234743 UTI89_C0987 UTI89_C0988 ycaQ ycaR FALSE 0.017 52.000 0.016 NA   NA
 1234743 1234744 UTI89_C0988 UTI89_C0989 ycaR kdsB TRUE 0.900 -3.000 0.265 NA   NA
 1234744 1234745 UTI89_C0989 UTI89_C0990 kdsB ycbJ FALSE 0.004 154.000 0.023 NA   NA
 1234746 1234747 UTI89_C0991 UTI89_C0992 ycbC   FALSE 0.097 -97.000 0.036 NA   NA
 1234748 1234749 UTI89_C0993 UTI89_C0994 smtA mukF TRUE 0.932 -3.000 0.325 NA N NA
 1234749 1234750 UTI89_C0994 UTI89_C0995 mukF mukE TRUE 0.785 -46.000 0.036 NA Y NA
 1234750 1234751 UTI89_C0995 UTI89_C0996 mukE mukB TRUE 0.976 0.000 0.000 0.001 Y NA
 1234751 1234752 UTI89_C0996 UTI89_C0997 mukB ycbB FALSE 0.011 261.000 0.000 1.000   NA
 1234752 1234753 UTI89_C0997 UTI89_C0998 ycbB ycbK FALSE 0.324 172.000 0.372 NA   NA
 1234753 1234754 UTI89_C0998 UTI89_C0999 ycbK ycbL TRUE 0.513 27.000 0.089 NA   NA
 1234755 1234756 UTI89_C1000 UTI89_C1001 aspC ompF FALSE 0.054 185.000 0.036 1.000 N NA
 1234756 1234757 UTI89_C1001 UTI89_C1002 ompF asnS FALSE 0.003 602.000 0.000 1.000 N NA
 1234757 1234758 UTI89_C1002 UTI89_C1003 asnS pncB FALSE 0.071 169.000 0.034 1.000 N NA
 1234760 1234761 UTI89_C1005 UTI89_C1006 ycbE ycbM TRUE 0.988 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 1234761 1234762 UTI89_C1006 UTI89_C1007 ycbM ycbN TRUE 0.921 9.000 0.226 1.000 N NA
 1234762 1234763 UTI89_C1007 UTI89_C1008 ycbN ycbO TRUE 0.950 -3.000 0.341 1.000 N NA
 1234763 1234764 UTI89_C1008 UTI89_C1009 ycbO ycbP TRUE 0.837 -7.000 0.169 1.000   NA
 1234765 1234766 UTI89_C1010 UTI89_C1011 pyrD ycbW FALSE 0.133 138.000 0.081 NA   NA
 1234768 1234769 UTI89_C1013 UTI89_C1014 ycbY uup TRUE 0.666 12.000 0.061 1.000   NA
 1234769 1234770 UTI89_C1014 UTI89_C1015 uup pqiA FALSE 0.081 130.000 0.054 NA   NA
 1234770 1234771 UTI89_C1015 UTI89_C1016 pqiA pqiB TRUE 0.919 -55.000 0.819 NA   NA
 1234771 1234772 UTI89_C1016 UTI89_C1017 pqiB ymbA TRUE 0.954 -3.000 0.531 NA   NA
 1234772 1234773 UTI89_C1017 UTI89_C1018 ymbA rmf FALSE 0.004 256.000 0.000 NA   NA
 1234774 1234775 UTI89_C1019 UTI89_C1020 fabA   TRUE 0.728 69.000 0.290 1.000 N NA
 1234781 1234782 UTI89_C1026 UTI89_C1027 yccS yccF TRUE 0.694 10.000 0.090 NA   NA
 1234784 1234785 UTI89_C1029 UTI89_C1030 mgsA yccT FALSE 0.145 87.000 0.055 NA   NA
 1234786 1234787 UTI89_C1031 UTI89_C1032     FALSE 0.153 -31.000 0.000 NA   NA
 1234788 1234789 UTI89_C1033 UTI89_C1034 yccV yccW TRUE 0.717 7.000 0.094 NA   NA
 1234791 1234792 UTI89_C1036 UTI89_C1037 yccK yccA FALSE 0.487 92.000 0.140 1.000   NA
 1234792 1234794 UTI89_C1037 UTI89_C1039 yccA serT FALSE 0.008 210.000 0.000 NA   NA
 1234795 1234796 UTI89_C1040 UTI89_C1041 hyaA hyaB TRUE 0.973 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 1234796 1234797 UTI89_C1041 UTI89_C1042 hyaB hyaC TRUE 0.985 19.000 0.355 0.055 Y NA
 1234797 1234798 UTI89_C1042 UTI89_C1043 hyaC hyaD TRUE 0.972 -3.000 0.177 1.000 Y NA
 1234798 1234799 UTI89_C1043 UTI89_C1044 hyaD hyaE TRUE 0.724 -3.000 0.096 NA   NA
 1234799 1234800 UTI89_C1044 UTI89_C1045 hyaE hyaF TRUE 0.970 -3.000 0.769 NA   NA
 1234800 1234801 UTI89_C1045 UTI89_C1046 hyaF appC FALSE 0.159 134.000 0.061 1.000   NA
 1234801 1234802 UTI89_C1046 UTI89_C1047 appC appB TRUE 0.979 12.000 0.158 0.055 Y NA
 1234802 1234803 UTI89_C1047 UTI89_C1048 appB yccB TRUE 0.695 13.000 0.105 NA   NA
 1234803 1234804 UTI89_C1048 UTI89_C1049 yccB appA FALSE 0.091 50.000 0.000 NA   NA
 1234806 1234807 UTI89_C1051 UTI89_C1052 cspG sfa FALSE 0.029 141.000 0.000 NA   NA
 1234807 1234808 UTI89_C1052 UTI89_C1053 sfa gnsB FALSE 0.216 -10.000 0.000 NA   NA
 1234809 1234810 UTI89_C1054 UTI89_C1055   yccM FALSE 0.131 34.000 0.000 NA   NA
 1234810 1234811 UTI89_C1055 UTI89_C1056 yccM torS FALSE 0.262 83.000 0.000 1.000 N NA
 1234815 1234816 UTI89_C1060 UTI89_C1061 torC torA TRUE 0.967 0.000 0.000 0.055 Y NA
 1234816 1234817 UTI89_C1061 UTI89_C1062 torA torD TRUE 0.751 -36.000 0.077 0.055   NA
 1234818 1234819 UTI89_C1063 UTI89_C1064 yccD cbpA TRUE 0.957 0.000 0.512 NA   NA
 1234821 1234822 UTI89_C1066 UTI89_C1067 yccJ wrbA TRUE 0.846 21.000 0.290 NA   NA
 1234823 1234824 UTI89_C1068 UTI89_C1069     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1234825 1234826 UTI89_C1070 UTI89_C1071 nmoB   TRUE 0.946 -70.000 0.625 0.032   NA
 1234826 1234827 UTI89_C1071 UTI89_C1072   ycdJ TRUE 0.914 10.000 0.256 1.000   NA
 1234827 1234828 UTI89_C1072 UTI89_C1073 ycdJ ycdK TRUE 0.870 -19.000 0.365 NA   NA
 1234828 1234829 UTI89_C1073 UTI89_C1074 ycdK ycdL TRUE 0.943 12.000 0.442 NA N NA
 1234829 1234830 UTI89_C1074 UTI89_C1075 ycdL ycdM TRUE 0.915 -42.000 0.621 NA N NA
 1234833 1234834 UTI89_C1078 UTI89_C1079   putP FALSE 0.004 159.000 0.020 NA   NA
 1234834 1234835 UTI89_C1079 UTI89_C1080 putP   FALSE 0.018 211.000 0.000 NA N NA
 1234835 1234836 UTI89_C1080 UTI89_C1081   ycdO TRUE 0.910 58.000 0.356 NA Y NA
 1234836 1234837 UTI89_C1081 UTI89_C1082 ycdO ycdB TRUE 0.982 6.000 0.378 NA Y NA
 1234837 1234838 UTI89_C1082 UTI89_C1083 ycdB phoH FALSE 0.002 491.000 0.000 NA N NA
 1234839 1234840 UTI89_C1084 UTI89_C1085 ycdP ycdQ TRUE 0.950 2.000 0.462 NA   NA
 1234840 1234841 UTI89_C1085 UTI89_C1086 ycdQ ycdR TRUE 0.946 -7.000 0.435 1.000 N NA
 1234841 1234842 UTI89_C1086 UTI89_C1087 ycdR ycdS TRUE 0.973 9.000 0.696 1.000   NA
 1234843 1234844 UTI89_C1088 UTI89_C1089 ycdT   FALSE 0.015 279.000 0.000 1.000 N NA
 1234846 1234847 UTI89_C1091 UTI89_C1092     TRUE 0.604 48.000 0.000 0.008   NA
 1234847 1234848 UTI89_C1092 UTI89_C1093     FALSE 0.101 153.000 0.000 1.000 N NA
 1234848 1234849 UTI89_C1093 UTI89_C1094   yfjI FALSE 0.001 625.000 0.000 NA   NA
 1234849 1234850 UTI89_C1094 UTI89_C1095 yfjI   FALSE 0.000 956.000 0.000 NA   NA
 1234853 1234854 UTI89_C1098 UTI89_C1099     FALSE 0.270 -85.000 0.000 1.000   NA
 1234854 1234855 UTI89_C1099 UTI89_C1100     FALSE 0.098 134.000 0.000 1.000   NA
 1234855 1234856 UTI89_C1100 UTI89_C1101     FALSE 0.417 22.000 0.000 1.000   NA
 1234856 1234857 UTI89_C1101 UTI89_C1102     FALSE 0.084 53.000 0.000 NA   NA
 1234858 1234859 UTI89_C1103 UTI89_C1104     FALSE 0.113 39.000 0.000 NA   NA
 1234863 1234864 UTI89_C1108 UTI89_C1109 sfaB sfaA FALSE 0.004 375.000 0.000 1.000   NA
 1234864 1234865 UTI89_C1109 UTI89_C1110 sfaA sfaD TRUE 0.840 62.000 0.000 0.010 Y NA
 1234865 1234866 UTI89_C1110 UTI89_C1111 sfaD sfaE TRUE 0.794 41.000 0.000 1.000 Y NA
 1234866 1234867 UTI89_C1111 UTI89_C1112 sfaE sfaF TRUE 0.879 22.000 0.000 1.000 Y NA
 1234867 1234868 UTI89_C1112 UTI89_C1113 sfaF sfaG TRUE 0.916 13.000 0.000 1.000 Y NA
 1234868 1234869 UTI89_C1113 UTI89_C1114 sfaG sfaS TRUE 0.940 22.000 0.000 0.010 Y NA
 1234869 1234870 UTI89_C1114 UTI89_C1115 sfaS sfaH TRUE 0.814 -7.000 0.000 0.010   NA
 1234870 1234871 UTI89_C1115 UTI89_C1116 sfaH   FALSE 0.002 304.000 0.000 NA   NA
 1234871 1234872 UTI89_C1116 UTI89_C1117   focX FALSE 0.064 147.000 0.000 NA N NA
 1234872 1234873 UTI89_C1117 UTI89_C1118 focX iroN FALSE 0.003 494.000 0.000 1.000 N NA
 1234874 1234875 UTI89_C1119 UTI89_C1120 iroE iroD FALSE 0.185 85.000 0.065 NA   NA
 1234875 1234876 UTI89_C1120 UTI89_C1121 iroD iroC TRUE 0.841 104.000 0.667 NA N NA
 1234876 1234877 UTI89_C1121 UTI89_C1122 iroC iroB TRUE 0.978 14.000 1.000 1.000 N NA
 1234880 1234881 UTI89_C1125 UTI89_C1126     FALSE 0.008 208.000 0.000 NA   NA
 1234882 1234883 UTI89_C1127 UTI89_C1128     TRUE 0.826 12.000 0.000 0.014   NA
 1234884 1234885 UTI89_C1129 UTI89_C1130     TRUE 0.864 19.000 0.000 NA Y NA
 1234885 1234886 UTI89_C1130 UTI89_C1131     FALSE 0.009 201.000 0.000 NA   NA
 1234889 1234890 UTI89_C1134 UTI89_C1135     FALSE 0.001 388.000 0.000 NA   NA
 1234890 1234891 UTI89_C1135 UTI89_C1136     FALSE 0.008 209.000 0.000 NA   NA
 1234891 1234892 UTI89_C1136 UTI89_C1137     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 1234893 1234894 UTI89_C1138 UTI89_C1139     FALSE 0.004 373.000 0.000 1.000   NA
 1234894 1234895 UTI89_C1139 UTI89_C1140   yafZ1 FALSE 0.002 331.000 0.000 NA   NA
 1234897 1234898 UTI89_C1142 UTI89_C1143   yafX1 FALSE 0.186 22.000 0.000 NA   NA
 1234900 1234901 UTI89_C1145 UTI89_C1146 yeeS3 yeeT3 FALSE 0.071 63.000 0.000 NA   NA
 1234901 1234902 UTI89_C1146 UTI89_C1147 yeeT3   TRUE 0.944 19.000 0.667 NA   NA
 1234902 1234903 UTI89_C1147 UTI89_C1148     FALSE 0.137 -40.000 0.000 NA   NA
 1234903 1234904 UTI89_C1148 UTI89_C1149     FALSE 0.097 47.000 0.000 NA   NA
 1234904 1234905 UTI89_C1149 UTI89_C1150     FALSE 0.327 0.000 0.000 NA   NA
 1234905 1234906 UTI89_C1150 UTI89_C1151     FALSE 0.267 12.000 0.000 NA   NA
 1234906 1234907 UTI89_C1151 UTI89_C1152     FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 1234909 1234910 UTI89_C1154 UTI89_C1155 ycdW ycdX TRUE 0.870 55.000 0.169 1.000 Y NA
 1234910 1234911 UTI89_C1155 UTI89_C1156 ycdX ycdY TRUE 0.905 24.000 0.417 1.000   NA
 1234911 1234912 UTI89_C1156 UTI89_C1157 ycdY ycdZ FALSE 0.470 54.000 0.145 NA   NA
 1234913 1234914 UTI89_C1158 UTI89_C1159 csgG csgF FALSE 0.215 27.000 0.043 NA   NA
 1234914 1234915 UTI89_C1159 UTI89_C1160 csgF csgE TRUE 0.936 25.000 0.723 NA   NA
 1234915 1234916 UTI89_C1160 UTI89_C1161 csgE csgD TRUE 0.848 5.000 0.176 NA   NA
 1234919 1234920 UTI89_C1164 UTI89_C1165 csgB csgA TRUE 0.901 41.000 0.333 0.010   NA
 1234920 1234921 UTI89_C1165 UTI89_C1166 csgA csgC TRUE 0.839 59.000 0.667 NA   NA
 1234921 1234922 UTI89_C1166 UTI89_C1167 csgC   TRUE 0.631 121.000 0.429 NA   NA
 1234922 1234923 UTI89_C1167 UTI89_C1168   ymdB FALSE 0.030 95.000 0.028 NA   NA
 1234923 1234924 UTI89_C1168 UTI89_C1169 ymdB ymdC FALSE 0.187 -58.000 0.046 NA   NA
 1234925 1234926 UTI89_C1170 UTI89_C1171 mdoC   FALSE 0.101 45.000 0.000 NA   NA
 1234927 1234928 UTI89_C1172 UTI89_C1173 mdoG mdoH TRUE 0.909 -37.000 0.469 1.000 N NA
 1234928 1234929 UTI89_C1173 UTI89_C1174 mdoH   FALSE 0.295 9.000 0.000 NA   NA
 1234929 1234930 UTI89_C1174 UTI89_C1175   yceK FALSE 0.124 -52.000 0.000 NA   NA
 1234931 1234932 UTI89_C1176 UTI89_C1177 msyB yceE TRUE 0.667 80.000 0.333 NA   NA
 1234932 1234933 UTI89_C1177 UTI89_C1178 yceE htrB TRUE 0.753 172.000 0.857 0.090 N NA
 1234935 1234936 UTI89_C1180 UTI89_C1181 yceI   TRUE 0.974 4.000 0.676 1.000   NA
 1234938 1234939 UTI89_C1183 UTI89_C1184 yceO solA TRUE 0.834 21.000 0.269 NA   NA
 1234939 1234940 UTI89_C1184 UTI89_C1185 solA bssS TRUE 0.657 115.000 0.423 NA   NA
 1234940 1234941 UTI89_C1185 UTI89_C1186 bssS   FALSE 0.003 290.000 0.000 NA   NA
 1234941 1234942 UTI89_C1186 UTI89_C1187   pyrC FALSE 0.139 17.000 0.031 NA   NA
 1234942 1234943 UTI89_C1187 UTI89_C1188 pyrC yceB FALSE 0.012 106.000 0.022 NA   NA
 1234943 1234944 UTI89_C1188 UTI89_C1189 yceB grxB FALSE 0.245 77.000 0.078 NA   NA
 1234944 1234945 UTI89_C1189 UTI89_C1190 grxB yceL FALSE 0.487 64.000 0.103 1.000 N NA
 1234946 1234947 UTI89_C1191 UTI89_C1192 rimJ yceH TRUE 0.742 11.000 0.116 NA   NA
 1234947 1234948 UTI89_C1192 UTI89_C1193 yceH mviM TRUE 0.755 2.000 0.103 NA   NA
 1234948 1234949 UTI89_C1193 UTI89_C1194 mviM mviN FALSE 0.112 110.000 0.022 1.000   NA
 1234950 1234951 UTI89_C1195 UTI89_C1196 flgN flgM TRUE 0.993 5.000 0.361 0.002 Y NA
 1234951 1234952 UTI89_C1196 UTI89_C1197 flgM flgA TRUE 0.892 76.000 0.330 NA Y NA
 1234953 1234954 UTI89_C1198 UTI89_C1199 flgB flgC TRUE 0.997 4.000 0.824 0.003 Y NA
 1234954 1234955 UTI89_C1199 UTI89_C1200 flgC flgD TRUE 0.961 12.000 0.186 NA Y NA
 1234955 1234956 UTI89_C1200 UTI89_C1201 flgD flgE TRUE 0.904 25.000 0.116 NA Y NA
 1234956 1234957 UTI89_C1201 UTI89_C1202 flgE flgF TRUE 0.990 20.000 0.476 0.003 Y NA
 1234957 1234958 UTI89_C1202 UTI89_C1203 flgF flgG TRUE 0.861 172.000 0.420 0.001 Y NA
 1234958 1234959 UTI89_C1203 UTI89_C1204 flgG flgH TRUE 0.968 38.000 0.268 0.005 Y NA
 1234959 1234960 UTI89_C1204 UTI89_C1205 flgH flgI TRUE 0.975 9.000 0.073 0.006 Y NA
 1234960 1234961 UTI89_C1205 UTI89_C1206 flgI flgJ TRUE 0.972 0.000 0.036 0.006 Y NA
 1234961 1234962 UTI89_C1206 UTI89_C1207 flgJ flgK TRUE 0.981 66.000 0.705 0.002 Y NA
 1234962 1234963 UTI89_C1207 UTI89_C1208 flgK flgL TRUE 0.983 12.000 0.142 0.001 Y NA
 1234965 1234966 UTI89_C1210 UTI89_C1211   yceC FALSE 0.009 118.000 0.005 NA   NA
 1234968 1234969 UTI89_C1213 UTI89_C1214 yceD rpmF TRUE 0.838 52.000 0.599 NA   NA
 1234969 1234970 UTI89_C1214 UTI89_C1215 rpmF plsX TRUE 0.794 81.000 0.418 1.000 N NA
 1234970 1234971 UTI89_C1215 UTI89_C1216 plsX fabH TRUE 0.962 68.000 0.380 0.003 Y NA
 1234971 1234972 UTI89_C1216 UTI89_C1217 fabH fabD TRUE 0.981 16.000 0.182 0.003 Y NA
 1234972 1234973 UTI89_C1217 UTI89_C1218 fabD fabG TRUE 0.992 13.000 0.432 0.003 Y NA
 1234975 1234976 UTI89_C1220 UTI89_C1221 acpP fabF TRUE 0.912 87.000 0.346 1.000 Y NA
 1234976 1234977 UTI89_C1221 UTI89_C1222 fabF pabC TRUE 0.516 120.000 0.187 1.000 N NA
 1234977 1234979 UTI89_C1222 UTI89_C1224 pabC yceG TRUE 0.874 3.000 0.204 NA   NA
 1234979 1234980 UTI89_C1224 UTI89_C1225 yceG tmk TRUE 0.808 -10.000 0.209 NA   NA
 1234980 1234981 UTI89_C1225 UTI89_C1226 tmk holB TRUE 0.916 -3.000 0.211 1.000 N NA
 1234981 1234982 UTI89_C1226 UTI89_C1227 holB ycfH TRUE 0.867 -49.000 0.110 NA Y NA
 1234982 1234983 UTI89_C1227 UTI89_C1228 ycfH   FALSE 0.002 295.000 0.004 NA N NA
 1234984 1234985 UTI89_C1229 UTI89_C1230 fhuE   FALSE 0.135 33.000 0.000 NA   NA
 1234986 1234987 UTI89_C1231 UTI89_C1232 ycfF ycfL FALSE 0.496 3.000 0.051 NA   NA
 1234987 1234988 UTI89_C1232 UTI89_C1233 ycfL   TRUE 0.947 11.000 0.516 NA   NA
 1234988 1234989 UTI89_C1233 UTI89_C1234   ycfN TRUE 0.843 -19.000 0.310 NA   NA
 1234989 1234990 UTI89_C1234 UTI89_C1235 ycfN ycfO TRUE 0.769 11.000 0.069 1.000 N NA
 1234990 1234991 UTI89_C1235 UTI89_C1236 ycfO ycfP FALSE 0.492 -34.000 0.091 NA   NA
 1234991 1234992 UTI89_C1236 UTI89_C1237 ycfP ndh FALSE 0.003 372.000 0.057 NA   NA
 1234992 1234993 UTI89_C1237 UTI89_C1238 ndh ycfJ FALSE 0.069 188.000 0.071 1.000   NA
 1234996 1234997 UTI89_C1241 UTI89_C1242 ycfS mfd FALSE 0.034 145.000 0.006 1.000   NA
 1234997 1234998 UTI89_C1242 UTI89_C1243 mfd ycfT FALSE 0.078 65.000 0.003 1.000   NA
 1234999 1235000 UTI89_C1244 UTI89_C1245 ycfU lolD TRUE 0.924 -7.000 0.175 0.074 N NA
 1235000 1235001 UTI89_C1245 UTI89_C1246 lolD lolE TRUE 0.935 0.000 0.125 0.074 N NA
 1235001 1235002 UTI89_C1246 UTI89_C1247 lolE ycfX TRUE 0.831 29.000 0.225 1.000 N NA
 1235002 1235003 UTI89_C1247 UTI89_C1248 ycfX cobB TRUE 0.945 16.000 0.119 1.000 Y NA
 1235004 1235005 UTI89_C1249 UTI89_C1250 ycfZ ymfA FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235005 1235006 UTI89_C1250 UTI89_C1251 ymfA potD FALSE 0.227 16.000 0.000 NA   NA
 1235006 1235007 UTI89_C1251 UTI89_C1252 potD potC TRUE 0.962 -3.000 0.000 0.060 Y NA
 1235007 1235008 UTI89_C1252 UTI89_C1253 potC potB TRUE 0.989 -3.000 0.286 0.060 Y NA
 1235008 1235009 UTI89_C1253 UTI89_C1254 potB potA TRUE 0.987 -16.000 0.789 1.000 Y NA
 1235009 1235010 UTI89_C1254 UTI89_C1255 potA   FALSE 0.176 -21.000 0.000 NA   NA
 1235012 1235013 UTI89_C1257 UTI89_C1258   phoQ TRUE 0.725 67.000 0.408 NA   NA
 1235013 1235014 UTI89_C1258 UTI89_C1259 phoQ phoP TRUE 0.995 0.000 0.940 1.000 Y NA
 1235014 1235015 UTI89_C1259 UTI89_C1260 phoP purB FALSE 0.047 169.000 0.011 1.000 N NA
 1235015 1235016 UTI89_C1260 UTI89_C1261 purB ycfC TRUE 0.725 4.000 0.093 NA   NA
 1235016 1235017 UTI89_C1261 UTI89_C1262 ycfC   TRUE 0.693 30.000 0.180 NA   NA
 1235017 1235018 UTI89_C1262 UTI89_C1263   ymfB TRUE 0.888 9.000 0.158 1.000 N NA
 1235018 1235019 UTI89_C1263 UTI89_C1264 ymfB rluE TRUE 0.900 10.000 0.182 1.000 N NA
 1235019 1235020 UTI89_C1264 UTI89_C1265 rluE   FALSE 0.009 118.000 0.008 NA   NA
 1235022 1235023 UTI89_C1267 UTI89_C1268     TRUE 0.979 -10.000 0.714 0.012   NA
 1235023 1235024 UTI89_C1268 UTI89_C1269     FALSE 0.030 140.000 0.000 NA   NA
 1235026 1235027 UTI89_C1271 UTI89_C1272     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235027 1235028 UTI89_C1272 UTI89_C1273     FALSE 0.001 387.000 0.000 NA   NA
 1235030 1235031 UTI89_C1275 UTI89_C1276   bet TRUE 0.827 -3.000 0.000 0.060   NA
 1235031 1235032 UTI89_C1276 UTI89_C1277 bet gamW FALSE 0.350 6.000 0.040 NA   NA
 1235032 1235033 UTI89_C1277 UTI89_C1278 gamW   FALSE 0.153 -31.000 0.000 NA   NA
 1235033 1235034 UTI89_C1278 UTI89_C1279   kil1 FALSE 0.132 -45.000 0.000 NA   NA
 1235034 1235035 UTI89_C1279 UTI89_C1280 kil1   FALSE 0.093 -157.000 0.000 NA   NA
 1235035 1235036 UTI89_C1280 UTI89_C1281     FALSE 0.070 73.000 0.000 NA   NA
 1235036 1235037 UTI89_C1281 UTI89_C1282     FALSE 0.012 183.000 0.000 NA   NA
 1235039 1235040 UTI89_C1284 UTI89_C1285     FALSE 0.102 -94.000 0.000 NA   NA
 1235040 1235041 UTI89_C1285 UTI89_C1286     FALSE 0.003 277.000 0.000 NA   NA
 1235041 1235042 UTI89_C1286 UTI89_C1287     TRUE 0.966 -3.000 0.667 NA   NA
 1235042 1235043 UTI89_C1287 UTI89_C1288     FALSE 0.111 40.000 0.000 NA   NA
 1235044 1235045 UTI89_C1289 UTI89_C1290     FALSE 0.328 33.000 0.000 1.000   NA
 1235045 1235046 UTI89_C1290 UTI89_C1291     TRUE 0.938 -3.000 0.333 1.000   NA
 1235046 1235047 UTI89_C1291 UTI89_C1292     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235047 1235048 UTI89_C1292 UTI89_C1293   ninB1 FALSE 0.070 74.000 0.000 NA   NA
 1235048 1235049 UTI89_C1293 UTI89_C1294 ninB1   FALSE 0.149 -33.000 0.000 NA   NA
 1235049 1235050 UTI89_C1294 UTI89_C1295   ninE1 FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235050 1235051 UTI89_C1295 UTI89_C1296 ninE1   TRUE 0.968 3.000 0.667 NA   NA
 1235051 1235052 UTI89_C1296 UTI89_C1297     TRUE 0.953 -7.000 0.667 NA   NA
 1235052 1235053 UTI89_C1297 UTI89_C1298   rusA FALSE 0.199 20.000 0.000 NA   NA
 1235053 1235054 UTI89_C1298 UTI89_C1299 rusA   FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235054 1235055 UTI89_C1299 UTI89_C1300   ybcQ1 FALSE 0.070 71.000 0.000 NA   NA
 1235057 1235058 UTI89_C1302 UTI89_C1303 ybcR1 ybcS1 FALSE 0.327 0.000 0.000 NA   NA
 1235058 1235059 UTI89_C1303 UTI89_C1304 ybcS1   FALSE 0.431 -15.000 0.000 1.000   NA
 1235062 1235063 UTI89_C1307 UTI89_C1308     FALSE 0.002 323.000 0.000 NA   NA
 1235064 1235065 UTI89_C1309 UTI89_C1310     FALSE 0.005 230.000 0.000 NA   NA
 1235065 1235066 UTI89_C1310 UTI89_C1311   nohA1 FALSE 0.216 -10.000 0.000 NA   NA
 1235066 1235067 UTI89_C1311 UTI89_C1312 nohA1   FALSE 0.124 -52.000 0.000 NA   NA
 1235067 1235068 UTI89_C1312 UTI89_C1313     FALSE 0.188 -16.000 0.000 NA   NA
 1235068 1235069 UTI89_C1313 UTI89_C1314     TRUE 0.575 -3.000 0.000 1.000   NA
 1235069 1235070 UTI89_C1314 UTI89_C1315     TRUE 0.798 -10.000 0.150 1.000   NA
 1235070 1235071 UTI89_C1315 UTI89_C1316     FALSE 0.300 37.000 0.000 1.000   NA
 1235071 1235072 UTI89_C1316 UTI89_C1317     FALSE 0.076 58.000 0.000 NA   NA
 1235072 1235073 UTI89_C1317 UTI89_C1318     FALSE 0.310 4.000 0.000 NA   NA
 1235073 1235074 UTI89_C1318 UTI89_C1319     FALSE 0.160 -28.000 0.000 NA   NA
 1235074 1235075 UTI89_C1319 UTI89_C1320     FALSE 0.267 12.000 0.000 NA   NA
 1235075 1235076 UTI89_C1320 UTI89_C1321     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235076 1235077 UTI89_C1321 UTI89_C1322     FALSE 0.174 -22.000 0.000 NA   NA
 1235077 1235078 UTI89_C1322 UTI89_C1323     FALSE 0.227 16.000 0.000 NA   NA
 1235078 1235079 UTI89_C1323 UTI89_C1324     TRUE 0.935 -18.000 0.667 NA   NA
 1235079 1235080 UTI89_C1324 UTI89_C1325     FALSE 0.237 -7.000 0.000 NA   NA
 1235080 1235081 UTI89_C1325 UTI89_C1326     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235083 1235084 UTI89_C1328 UTI89_C1329     FALSE 0.303 6.000 0.000 NA   NA
 1235084 1235085 UTI89_C1329 UTI89_C1330     FALSE 0.117 -63.000 0.000 NA   NA
 1235085 1235086 UTI89_C1330 UTI89_C1331     FALSE 0.072 61.000 0.000 NA   NA
 1235086 1235087 UTI89_C1331 UTI89_C1332     FALSE 0.084 53.000 0.000 NA   NA
 1235087 1235088 UTI89_C1332 UTI89_C1333     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235088 1235089 UTI89_C1333 UTI89_C1334     FALSE 0.254 13.000 0.000 NA   NA
 1235090 1235091 UTI89_C1335 UTI89_C1336   sitD FALSE 0.114 -70.000 0.000 NA   NA
 1235091 1235092 UTI89_C1336 UTI89_C1337 sitD sitC TRUE 0.995 -3.000 0.525 0.006 Y NA
 1235092 1235093 UTI89_C1337 UTI89_C1338 sitC sitB TRUE 0.996 -3.000 0.857 0.087 Y NA
 1235093 1235094 UTI89_C1338 UTI89_C1339 sitB sitA TRUE 0.995 0.000 0.894 1.000 Y NA
 1235095 1235096 UTI89_C1340 UTI89_C1341     FALSE 0.042 124.000 0.000 NA   NA
 1235096 1235097 UTI89_C1341 UTI89_C1342     FALSE 0.001 472.000 0.000 NA   NA
 1235098 1235099 UTI89_C1343 UTI89_C1344 ycgX ycgE FALSE 0.006 221.000 0.000 NA   NA
 1235099 1235100 UTI89_C1344 UTI89_C1345 ycgE   FALSE 0.104 -90.000 0.000 NA   NA
 1235100 1235101 UTI89_C1345 UTI89_C1346   ycgF FALSE 0.028 143.000 0.000 NA   NA
 1235105 1235106 UTI89_C1350 UTI89_C1351     FALSE 0.279 11.000 0.000 NA   NA
 1235107 1235108 UTI89_C1352 UTI89_C1353     FALSE 0.000 1390.000 0.000 NA   NA
 1235109 1235110 UTI89_C1354 UTI89_C1355 ymgD   FALSE 0.310 4.000 0.000 NA   NA
 1235110 1235111 UTI89_C1355 UTI89_C1356     FALSE 0.323 2.000 0.000 NA   NA
 1235112 1235113 UTI89_C1357 UTI89_C1358     FALSE 0.099 46.000 0.000 NA   NA
 1235114 1235115 UTI89_C1359 UTI89_C1360 minE minD TRUE 0.990 4.000 0.618 NA Y NA
 1235115 1235116 UTI89_C1360 UTI89_C1361 minD minC TRUE 0.976 24.000 0.466 1.000 Y NA
 1235117 1235118 UTI89_C1362 UTI89_C1363   ycgJ FALSE 0.022 153.000 0.000 NA   NA
 1235120 1235121 UTI89_C1365 UTI89_C1366 ycgL ycgM FALSE 0.160 72.000 0.056 NA   NA
 1235121 1235122 UTI89_C1366 UTI89_C1367 ycgM ycgN FALSE 0.280 92.000 0.088 NA   NA
 1235124 1235125 UTI89_C1369 UTI89_C1370 umuD umuC TRUE 0.708 0.000 0.000 1.000 N NA
 1235126 1235127 UTI89_C1371 UTI89_C1372 dsbB nhaB TRUE 0.760 140.000 0.723 1.000 N NA
 1235130 1235131 UTI89_C1375 UTI89_C1376 dadA dadX TRUE 0.892 10.000 0.168 1.000 N NA
 1235132 1235133 UTI89_C1377 UTI89_C1378 ycgO ldcA FALSE 0.392 95.000 0.103 NA N NA
 1235138 1235139 UTI89_C1383 UTI89_C1384 prrA modD TRUE 0.674 5.000 0.034 1.000 N NA
 1235139 1235140 UTI89_C1384 UTI89_C1385 modD   TRUE 0.555 -3.000 0.034 1.000   NA
 1235140 1235141 UTI89_C1385 UTI89_C1386     TRUE 0.825 10.000 0.123 1.000   NA
 1235141 1235142 UTI89_C1386 UTI89_C1387     TRUE 0.994 -3.000 0.862 1.000 Y NA
 1235142 1235143 UTI89_C1387 UTI89_C1388     TRUE 0.988 0.000 0.422 1.000 Y NA
 1235143 1235144 UTI89_C1388 UTI89_C1389   treA FALSE 0.007 337.000 0.000 1.000 N NA
 1235146 1235147 UTI89_C1391 UTI89_C1392 ycgC ycgS TRUE 0.829 5.000 0.118 1.000   NA
 1235147 1235148 UTI89_C1392 UTI89_C1393 ycgS ycgT TRUE 0.968 -67.000 0.226 0.001 Y NA
 1235149 1235150 UTI89_C1394 UTI89_C1395     FALSE 0.289 10.000 0.000 NA   NA
 1235151 1235152 UTI89_C1396 UTI89_C1397   ychF FALSE 0.032 136.000 0.000 NA   NA
 1235152 1235153 UTI89_C1397 UTI89_C1398 ychF pth TRUE 0.809 117.000 0.184 1.000 Y NA
 1235155 1235156 UTI89_C1400 UTI89_C1401 ychM prsA FALSE 0.150 125.000 0.027 1.000 N NA
 1235156 1235157 UTI89_C1401 UTI89_C1402 prsA ychB FALSE 0.321 85.000 0.053 1.000 N NA
 1235157 1235158 UTI89_C1402 UTI89_C1403 ychB hemM TRUE 0.901 0.000 0.157 1.000 N NA
 1235159 1235160 UTI89_C1404 UTI89_C1405 hemA prfA TRUE 0.835 42.000 0.171 0.042 N NA
 1235160 1235161 UTI89_C1405 UTI89_C1406 prfA hemK TRUE 0.989 0.000 0.229 0.042 Y NA
 1235161 1235162 UTI89_C1406 UTI89_C1407 hemK sirB2 TRUE 0.752 -3.000 0.109 NA   NA
 1235162 1235163 UTI89_C1407 UTI89_C1408 sirB2 ychA TRUE 0.865 4.000 0.195 NA   NA
 1235163 1235164 UTI89_C1408 UTI89_C1409 ychA kdsA TRUE 0.551 36.000 0.089 1.000   NA
 1235164 1235165 UTI89_C1409 UTI89_C1410 kdsA   FALSE 0.289 10.000 0.000 NA   NA
 1235166 1235167 UTI89_C1411 UTI89_C1412 chaA   FALSE 0.014 177.000 0.000 NA   NA
 1235168 1235169 UTI89_C1413 UTI89_C1414 chaB chaC FALSE 0.294 122.000 0.140 NA   NA
 1235172 1235173 UTI89_C1417 UTI89_C1418 narL narX TRUE 0.980 -73.000 0.521 0.013 Y NA
 1235174 1235175 UTI89_C1419 UTI89_C1420   narK FALSE 0.066 89.000 0.000 NA   NA
 1235175 1235176 UTI89_C1420 UTI89_C1421 narK narG FALSE 0.005 393.000 0.000 1.000 N NA
 1235176 1235177 UTI89_C1421 UTI89_C1422 narG narH TRUE 0.995 -3.000 0.471 0.001 Y NA
 1235177 1235178 UTI89_C1422 UTI89_C1423 narH narJ TRUE 0.995 -3.000 0.588 0.004 Y NA
 1235178 1235179 UTI89_C1423 UTI89_C1424 narJ narI TRUE 0.995 0.000 0.500 0.004 Y NA
 1235180 1235181 UTI89_C1425 UTI89_C1426   tyrV FALSE 0.001 404.000 0.000 NA   NA
 1235181 1235182 UTI89_C1426 UTI89_C1427 tyrV tyrT FALSE 0.120 37.000 0.000 NA   NA
 1235182 1235183 UTI89_C1427 UTI89_C1428 tyrT purU FALSE 0.019 160.000 0.000 NA   NA
 1235183 1235184 UTI89_C1428 UTI89_C1429 purU ychJ TRUE 0.591 50.000 0.200 NA   NA
 1235185 1235186 UTI89_C1430 UTI89_C1431 ychK rssB FALSE 0.228 92.000 0.048 1.000   NA
 1235186 1235187 UTI89_C1431 UTI89_C1432 rssB galU FALSE 0.203 202.000 0.235 1.000 N NA
 1235187 1235188 UTI89_C1432 UTI89_C1433 galU   FALSE 0.069 108.000 0.039 NA   NA
 1235189 1235190 UTI89_C1434 UTI89_C1435 hns   FALSE 0.067 92.000 0.000 NA   NA
 1235192 1235193 UTI89_C1437 UTI89_C1438   adhE FALSE 0.172 126.000 0.000 1.000 N NA
 1235196 1235197 UTI89_C1441 UTI89_C1442 oppA oppB TRUE 0.895 86.000 0.151 0.059 Y NA
 1235197 1235198 UTI89_C1442 UTI89_C1443 oppB oppC TRUE 0.995 15.000 0.870 0.059 Y NA
 1235198 1235199 UTI89_C1443 UTI89_C1444 oppC oppD TRUE 0.988 12.000 0.554 1.000 Y NA
 1235199 1235200 UTI89_C1444 UTI89_C1445 oppD oppF TRUE 0.994 -3.000 0.420 0.002 Y NA
 1235201 1235202 UTI89_C1446 UTI89_C1447 yciU cls TRUE 0.733 -43.000 0.231 NA   NA
 1235204 1235205 UTI89_C1449 UTI89_C1450 kch yciI FALSE 0.003 282.000 0.000 NA   NA
 1235207 1235208 UTI89_C1452 UTI89_C1453   yciA FALSE 0.002 329.000 0.000 NA   NA
 1235208 1235209 UTI89_C1453 UTI89_C1454 yciA ispZ FALSE 0.495 106.000 0.167 NA N NA
 1235209 1235210 UTI89_C1454 UTI89_C1455 ispZ yciC FALSE 0.337 30.000 0.061 NA   NA
 1235212 1235213 UTI89_C1457 UTI89_C1458 intO   TRUE 0.740 -22.000 0.000 0.012   NA
 1235213 1235214 UTI89_C1458 UTI89_C1459   exoO FALSE 0.191 65.000 0.000 1.000   NA
 1235214 1235215 UTI89_C1459 UTI89_C1460 exoO   FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 1235215 1235216 UTI89_C1460 UTI89_C1461     FALSE 0.207 -12.000 0.000 NA   NA
 1235218 1235219 UTI89_C1463 UTI89_C1464 ydfC ydfB FALSE 0.148 30.000 0.000 NA   NA
 1235219 1235220 UTI89_C1464 UTI89_C1465 ydfB ydfA FALSE 0.137 -40.000 0.000 NA   NA
 1235220 1235221 UTI89_C1465 UTI89_C1466 ydfA   FALSE 0.007 212.000 0.000 NA   NA
 1235222 1235223 UTI89_C1467 UTI89_C1468     FALSE 0.188 -16.000 0.000 NA   NA
 1235223 1235224 UTI89_C1468 UTI89_C1469     FALSE 0.029 141.000 0.000 NA   NA
 1235224 1235225 UTI89_C1469 UTI89_C1470     FALSE 0.108 41.000 0.000 NA   NA
 1235225 1235226 UTI89_C1470 UTI89_C1471     FALSE 0.071 63.000 0.000 NA   NA
 1235226 1235227 UTI89_C1471 UTI89_C1472     TRUE 0.677 16.000 0.111 NA   NA
 1235227 1235228 UTI89_C1472 UTI89_C1473     FALSE 0.054 112.000 0.000 NA   NA
 1235228 1235229 UTI89_C1473 UTI89_C1474     FALSE 0.020 159.000 0.000 NA   NA
 1235229 1235230 UTI89_C1474 UTI89_C1475     FALSE 0.016 168.000 0.000 NA   NA
 1235230 1235231 UTI89_C1475 UTI89_C1476     FALSE 0.323 2.000 0.000 NA   NA
 1235231 1235233 UTI89_C1476 UTI89_C1478     FALSE 0.254 13.000 0.000 NA   NA
 1235233 1235234 UTI89_C1478 UTI89_C1479     TRUE 0.575 -3.000 0.000 1.000   NA
 1235234 1235235 UTI89_C1479 UTI89_C1480     FALSE 0.006 225.000 0.000 NA   NA
 1235235 1235236 UTI89_C1480 UTI89_C1481     FALSE 0.394 151.000 0.333 NA   NA
 1235236 1235237 UTI89_C1481 UTI89_C1482   ileY FALSE 0.091 50.000 0.000 NA   NA
 1235237 1235238 UTI89_C1482 UTI89_C1483 ileY   FALSE 0.067 101.000 0.000 NA   NA
 1235238 1235239 UTI89_C1483 UTI89_C1484     FALSE 0.014 175.000 0.000 NA   NA
 1235239 1235240 UTI89_C1484 UTI89_C1485     FALSE 0.001 541.000 0.000 NA   NA
 1235240 1235241 UTI89_C1485 UTI89_C1486     FALSE 0.135 -42.000 0.000 NA   NA
 1235241 1235242 UTI89_C1486 UTI89_C1487     FALSE 0.101 45.000 0.000 NA   NA
 1235242 1235243 UTI89_C1487 UTI89_C1488   ydfR FALSE 0.305 5.000 0.000 NA   NA
 1235245 1235246 UTI89_C1490 UTI89_C1491     FALSE 0.042 124.000 0.000 NA   NA
 1235246 1235247 UTI89_C1491 UTI89_C1492     FALSE 0.323 2.000 0.000 NA   NA
 1235248 1235249 UTI89_C1493 UTI89_C1494 ydfO   FALSE 0.103 43.000 0.000 NA   NA
 1235250 1235251 UTI89_C1495 UTI89_C1496   nohA2 FALSE 0.067 81.000 0.000 NA   NA
 1235251 1235252 UTI89_C1496 UTI89_C1497 nohA2   FALSE 0.124 -52.000 0.000 NA   NA
 1235252 1235253 UTI89_C1497 UTI89_C1498     FALSE 0.188 -16.000 0.000 NA   NA
 1235253 1235254 UTI89_C1498 UTI89_C1499     TRUE 0.575 -3.000 0.000 1.000   NA
 1235254 1235255 UTI89_C1499 UTI89_C1500     TRUE 0.798 -10.000 0.150 1.000   NA
 1235255 1235256 UTI89_C1500 UTI89_C1501     FALSE 0.300 37.000 0.000 1.000   NA
 1235256 1235257 UTI89_C1501 UTI89_C1502     FALSE 0.076 58.000 0.000 NA   NA
 1235257 1235258 UTI89_C1502 UTI89_C1503     FALSE 0.310 4.000 0.000 NA   NA
 1235258 1235259 UTI89_C1503 UTI89_C1504     FALSE 0.237 -7.000 0.000 NA   NA
 1235259 1235260 UTI89_C1504 UTI89_C1505     FALSE 0.227 16.000 0.000 NA   NA
 1235260 1235261 UTI89_C1505 UTI89_C1506     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235261 1235262 UTI89_C1506 UTI89_C1507     FALSE 0.297 8.000 0.000 NA   NA
 1235262 1235263 UTI89_C1507 UTI89_C1508     FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 1235263 1235264 UTI89_C1508 UTI89_C1509     TRUE 0.925 27.000 0.667 NA   NA
 1235264 1235265 UTI89_C1509 UTI89_C1510     FALSE 0.178 -19.000 0.000 NA   NA
 1235265 1235266 UTI89_C1510 UTI89_C1511     FALSE 0.302 -3.000 0.000 NA   NA
 1235268 1235269 UTI89_C1513 UTI89_C1514     FALSE 0.141 -37.000 0.000 NA   NA
 1235269 1235270 UTI89_C1514 UTI89_C1515     FALSE 0.100 -102.000 0.000 NA   NA
 1235270 1235271 UTI89_C1515 UTI89_C1516     FALSE 0.070 74.000 0.000 NA   NA
 1235271 1235272 UTI89_C1516 UTI89_C1517     FALSE 0.070 67.000 0.000 NA   NA
 1235272 1235273 UTI89_C1517 UTI89_C1518     FALSE 0.070 68.000 0.000 NA   NA
 1235273 1235274 UTI89_C1518 UTI89_C1519     FALSE 0.067 152.000 0.000 1.000   NA
 1235281 1235282 UTI89_C1526 UTI89_C1527 yciE yciF TRUE 0.799 46.000 0.115 0.001   NA
 1235282 1235283 UTI89_C1527 UTI89_C1528 yciF yciG FALSE 0.066 86.000 0.000 NA   NA
 1235283 1235284 UTI89_C1528 UTI89_C1529 yciG trpA FALSE 0.002 324.000 0.000 NA   NA
 1235284 1235285 UTI89_C1529 UTI89_C1530 trpA trpB TRUE 0.998 0.000 0.947 0.000 Y NA
 1235285 1235286 UTI89_C1530 UTI89_C1531 trpB trpC TRUE 0.988 12.000 0.221 0.001 Y NA
 1235286 1235287 UTI89_C1531 UTI89_C1532 trpC trpD TRUE 0.982 4.000 0.293 1.000 Y NA
 1235287 1235288 UTI89_C1532 UTI89_C1533 trpD trpE TRUE 0.972 0.000 0.010 0.001 Y NA
 1235289 1235290 UTI89_C1534 UTI89_C1535 trpH yciO TRUE 0.779 -39.000 0.281 NA   NA
 1235290 1235291 UTI89_C1535 UTI89_C1536 yciO yciQ FALSE 0.169 25.000 0.000 NA   NA
 1235291 1235292 UTI89_C1536 UTI89_C1537 yciQ yciL FALSE 0.007 213.000 0.000 NA   NA
 1235293 1235294 UTI89_C1538 UTI89_C1539 btuR yciK TRUE 0.733 -3.000 0.050 1.000 N NA
 1235297 1235298 UTI89_C1542 UTI89_C1543   topA FALSE 0.011 190.000 0.000 NA   NA
 1235298 1235299 UTI89_C1543 UTI89_C1544 topA cysB FALSE 0.021 210.000 0.008 1.000 N NA
 1235299 1235300 UTI89_C1544 UTI89_C1545 cysB   FALSE 0.002 295.000 0.000 NA   NA
 1235300 1235301 UTI89_C1545 UTI89_C1546     TRUE 0.918 -18.000 0.556 NA   NA
 1235301 1235302 UTI89_C1546 UTI89_C1547   acnA FALSE 0.001 359.000 0.000 NA   NA
 1235304 1235305 UTI89_C1549 UTI89_C1550 pgpB yciS FALSE 0.196 149.000 0.143 NA   NA
 1235305 1235306 UTI89_C1550 UTI89_C1551 yciS yciM TRUE 0.958 7.000 0.576 NA   NA
 1235306 1235307 UTI89_C1551 UTI89_C1552 yciM pyrF FALSE 0.138 191.000 0.125 1.000 N NA
 1235307 1235308 UTI89_C1552 UTI89_C1553 pyrF yciH TRUE 0.742 0.000 0.045 1.000 N NA
 1235308 1235309 UTI89_C1553 UTI89_C1554 yciH   FALSE 0.174 24.000 0.000 NA   NA
 1235310 1235311 UTI89_C1555 UTI89_C1556 osmB   FALSE 0.003 269.000 0.000 NA   NA
 1235311 1235312 UTI89_C1556 UTI89_C1557     FALSE 0.415 90.000 0.146 NA   NA
 1235312 1235313 UTI89_C1557 UTI89_C1558   yciR FALSE 0.115 148.000 0.083 NA   NA
 1235313 1235314 UTI89_C1558 UTI89_C1559 yciR rnb FALSE 0.024 234.000 0.000 1.000 N NA
 1235314 1235315 UTI89_C1559 UTI89_C1560 rnb yciW FALSE 0.334 68.000 0.105 NA   NA
 1235315 1235316 UTI89_C1560 UTI89_C1561 yciW fabI FALSE 0.163 67.000 0.057 NA   NA
 1235317 1235318 UTI89_C1562 UTI89_C1563     TRUE 0.645 116.000 0.286 1.000 N NA
 1235318 1235319 UTI89_C1563 UTI89_C1564     TRUE 0.906 0.000 0.167 1.000 N NA
 1235319 1235320 UTI89_C1564 UTI89_C1565     TRUE 0.974 4.000 0.367 0.058 N NA
 1235320 1235321 UTI89_C1565 UTI89_C1566     TRUE 0.935 9.000 0.143 0.058 N NA
 1235322 1235323 UTI89_C1567 UTI89_C1568 sapF sapD TRUE 0.996 2.000 0.684 0.014 Y NA
 1235323 1235324 UTI89_C1568 UTI89_C1569 sapD sapC TRUE 0.993 0.000 0.667 1.000 Y NA
 1235324 1235325 UTI89_C1569 UTI89_C1570 sapC sapB TRUE 0.981 -13.000 0.284 0.058 Y NA
 1235325 1235326 UTI89_C1570 UTI89_C1571 sapB sapA TRUE 0.963 -3.000 0.264 0.058 N NA
 1235326 1235327 UTI89_C1571 UTI89_C1572 sapA ymjA FALSE 0.002 313.000 0.000 NA   NA
 1235327 1235328 UTI89_C1572 UTI89_C1573 ymjA pspF FALSE 0.001 427.000 0.000 NA   NA
 1235329 1235330 UTI89_C1574 UTI89_C1575 pspA pspB TRUE 0.868 54.000 0.739 NA   NA
 1235330 1235331 UTI89_C1575 UTI89_C1576 pspB pspC TRUE 0.978 0.000 0.913 NA   NA
 1235331 1235332 UTI89_C1576 UTI89_C1577 pspC pspD TRUE 0.829 9.000 0.167 NA   NA
 1235332 1235333 UTI89_C1577 UTI89_C1578 pspD pspE FALSE 0.399 75.000 0.133 NA   NA
 1235333 1235334 UTI89_C1578 UTI89_C1579 pspE ycjM FALSE 0.059 183.000 0.000 1.000 N NA
 1235336 1235337 UTI89_C1581 UTI89_C1582 ycjN ycjO TRUE 0.991 21.000 0.620 0.058 Y NA
 1235337 1235338 UTI89_C1582 UTI89_C1583 ycjO ycjP TRUE 0.993 -13.000 0.805 0.058 Y NA
 1235338 1235339 UTI89_C1583 UTI89_C1584 ycjP ycjQ TRUE 0.804 31.000 0.205 1.000 N NA
 1235339 1235340 UTI89_C1584 UTI89_C1585 ycjQ ycjR TRUE 0.910 10.000 0.261 NA N NA
 1235340 1235341 UTI89_C1585 UTI89_C1586 ycjR ycjS TRUE 0.922 10.000 0.347 NA   NA
 1235341 1235342 UTI89_C1586 UTI89_C1587 ycjS ycjT TRUE 0.575 -3.000 0.000 1.000   NA
 1235342 1235343 UTI89_C1587 UTI89_C1588 ycjT ycjU TRUE 0.575 -3.000 0.000 1.000   NA
 1235343 1235344 UTI89_C1588 UTI89_C1589 ycjU ycjV TRUE 0.758 14.000 0.103 1.000   NA
 1235344 1235345 UTI89_C1589 UTI89_C1590 ycjV ompG TRUE 0.935 -6.000 0.222 0.058   NA
 1235347 1235348 UTI89_C1592 UTI89_C1593 ycjX ycjF TRUE 0.971 -3.000 0.791 NA   NA
 1235348 1235349 UTI89_C1593 UTI89_C1594 ycjF tyrR FALSE 0.295 121.000 0.137 NA   NA
 1235352 1235353 UTI89_C1597 UTI89_C1598 ycjI   FALSE 0.025 231.000 0.000 1.000 N NA
 1235353 1235354 UTI89_C1598 UTI89_C1599     FALSE 0.191 71.000 0.000 1.000   NA
 1235355 1235356 UTI89_C1600 UTI89_C1601   mppA FALSE 0.010 316.000 0.000 1.000 N NA
 1235359 1235360 UTI89_C1604 UTI89_C1605 ydaA fnr TRUE 0.857 152.000 0.619 1.000 Y NA
 1235360 1235361 UTI89_C1605 UTI89_C1606 fnr ogt FALSE 0.047 195.000 0.000 1.000 N NA
 1235361 1235362 UTI89_C1606 UTI89_C1607 ogt   FALSE 0.279 11.000 0.000 NA   NA
 1235362 1235363 UTI89_C1607 UTI89_C1608     FALSE 0.002 330.000 0.000 NA   NA
 1235364 1235365 UTI89_C1609 UTI89_C1610     TRUE 0.929 -3.000 0.293 1.000   NA
 1235365 1235366 UTI89_C1610 UTI89_C1611   ydaL FALSE 0.010 195.000 0.000 NA   NA
 1235368 1235369 UTI89_C1613 UTI89_C1614 ydaN dbpA FALSE 0.004 478.000 0.000 1.000 N NA
 1235370 1235371 UTI89_C1615 UTI89_C1616 ydaO   FALSE 0.017 52.000 0.012 NA   NA
 1235371 1235372 UTI89_C1616 UTI89_C1617   ynaF FALSE 0.001 1967.000 0.000 1.000   NA
 1235372 1235373 UTI89_C1617 UTI89_C1618 ynaF ompN FALSE 0.272 69.000 0.000 1.000 N NA
 1235373 1235374 UTI89_C1618 UTI89_C1619 ompN ydbK FALSE 0.006 366.000 0.000 1.000 N NA
 1235374 1235375 UTI89_C1619 UTI89_C1620 ydbK   FALSE 0.194 71.000 0.065 NA   NA
 1235377 1235378 UTI89_C1622 UTI89_C1623 hslJ ldhA FALSE 0.155 99.000 0.000 NA N NA
 1235379 1235380 UTI89_C1624 UTI89_C1625 ydbH ynbE TRUE 0.604 -3.000 0.068 NA   NA
 1235380 1235381 UTI89_C1625 UTI89_C1626 ynbE ydbL TRUE 0.936 -25.000 0.726 NA   NA
 1235381 1235382 UTI89_C1626 UTI89_C1627 ydbL entS FALSE 0.001 376.000 0.000 NA   NA
 1235382 1235383 UTI89_C1627 UTI89_C1628 entS   FALSE 0.020 220.000 0.000 1.000   NA
 1235385 1235386 UTI89_C1630 UTI89_C1631 ynbA ynbB TRUE 0.959 0.000 0.179 0.002   NA
 1235386 1235387 UTI89_C1631 UTI89_C1632 ynbB ynbC FALSE 0.227 16.000 0.000 NA   NA
 1235387 1235388 UTI89_C1632 UTI89_C1633 ynbC ynbD TRUE 0.918 -85.000 0.285 NA Y NA
 1235390 1235391 UTI89_C1635 UTI89_C1636 hrpA ydcF FALSE 0.003 273.000 0.000 NA   NA
 1235391 1235392 UTI89_C1636 UTI89_C1637 ydcF aldA FALSE 0.011 197.000 0.040 NA   NA
 1235394 1235395 UTI89_C1639 UTI89_C1640 cybB ydcA FALSE 0.004 245.000 0.000 NA   NA
 1235399 1235400 UTI89_C1644 UTI89_C1645 ydcJ ydcG FALSE 0.006 225.000 0.000 NA   NA
 1235400 1235401 UTI89_C1645 UTI89_C1646 ydcG ydcH FALSE 0.010 134.000 0.026 NA   NA
 1235401 1235402 UTI89_C1646 UTI89_C1647 ydcH rimL FALSE 0.029 48.000 0.026 NA   NA
 1235404 1235405 UTI89_C1649 UTI89_C1650 tehA tehB TRUE 0.881 -3.000 0.175 1.000   NA
 1235405 1235406 UTI89_C1650 UTI89_C1651 tehB   FALSE 0.012 303.000 0.088 NA   NA
 1235408 1235409 UTI89_C1653 UTI89_C1654 ydcN ydcP FALSE 0.455 31.000 0.000 1.000 N NA
 1235410 1235411 UTI89_C1655 UTI89_C1656 yncJ   FALSE 0.078 57.000 0.000 NA   NA
 1235412 1235413 UTI89_C1657 UTI89_C1658   ydcR FALSE 0.187 79.000 0.000 1.000   NA
 1235413 1235414 UTI89_C1658 UTI89_C1659 ydcR ydcS FALSE 0.120 245.000 0.000 1.000 Y NA
 1235414 1235415 UTI89_C1659 UTI89_C1660 ydcS ydcT TRUE 0.992 18.000 0.609 0.057 Y NA
 1235415 1235416 UTI89_C1660 UTI89_C1661 ydcT ydcU TRUE 0.996 1.000 0.643 0.057 Y NA
 1235416 1235417 UTI89_C1661 UTI89_C1662 ydcU   TRUE 0.994 -10.000 0.821 0.057 Y NA
 1235417 1235418 UTI89_C1662 UTI89_C1663   ydcW TRUE 0.856 22.000 0.216 1.000 N NA
 1235420 1235421 UTI89_C1665 UTI89_C1666 ydcX ydcY FALSE 0.066 86.000 0.000 NA   NA
 1235422 1235423 UTI89_C1667 UTI89_C1668 ydcZ yncA TRUE 0.619 -3.000 0.070 NA   NA
 1235428 1235429 UTI89_C1673 UTI89_C1674     FALSE 0.484 113.000 0.000 0.002   NA
 1235429 1235430 UTI89_C1674 UTI89_C1675     FALSE 0.001 541.000 0.000 NA   NA
 1235430 1235431 UTI89_C1675 UTI89_C1676     FALSE 0.205 19.000 0.000 NA   NA
 1235431 1235432 UTI89_C1676 UTI89_C1677     FALSE 0.130 -46.000 0.000 NA   NA
 1235432 1235433 UTI89_C1677 UTI89_C1678     FALSE 0.001 371.000 0.000 NA   NA
 1235433 1235434 UTI89_C1678 UTI89_C1679     FALSE 0.052 113.000 0.000 NA   NA
 1235437 1235438 UTI89_C1682 UTI89_C1683 yddE narV FALSE 0.185 80.000 0.000 1.000   NA
 1235438 1235439 UTI89_C1683 UTI89_C1684 narV narW TRUE 0.996 -3.000 0.714 0.004 Y NA
 1235439 1235440 UTI89_C1684 UTI89_C1685 narW narY TRUE 0.997 0.000 0.714 0.004 Y NA
 1235440 1235441 UTI89_C1685 UTI89_C1686 narY narZ TRUE 0.997 -3.000 0.833 0.001 Y NA
 1235441 1235442 UTI89_C1686 UTI89_C1687 narZ narU TRUE 0.933 -28.000 0.556 1.000 N NA
 1235442 1235443 UTI89_C1687 UTI89_C1688 narU yddG FALSE 0.010 273.000 0.000 1.000   NA
 1235446 1235447 UTI89_C1691 UTI89_C1692 fdnH fdnI TRUE 0.990 -7.000 0.333 0.001 Y NA
 1235447 1235448 UTI89_C1692 UTI89_C1693 fdnI   FALSE 0.009 203.000 0.000 NA   NA
 1235449 1235450 UTI89_C1694 UTI89_C1695     TRUE 0.955 0.000 0.500 NA   NA
 1235450 1235451 UTI89_C1695 UTI89_C1696   adhP FALSE 0.010 192.000 0.000 NA   NA
 1235451 1235452 UTI89_C1696 UTI89_C1697 adhP sfcA FALSE 0.178 104.000 0.000 1.000   NA
 1235452 1235453 UTI89_C1697 UTI89_C1698 sfcA rpsV TRUE 0.781 129.000 0.750 1.000   NA
 1235453 1235454 UTI89_C1698 UTI89_C1699 rpsV bdm TRUE 0.788 102.000 0.571 NA   NA
 1235455 1235456 UTI89_C1700 UTI89_C1701   osmC FALSE 0.116 38.000 0.000 NA   NA
 1235457 1235458 UTI89_C1702 UTI89_C1703     TRUE 0.943 1.000 0.130 0.004   NA
 1235458 1235459 UTI89_C1703 UTI89_C1704     FALSE 0.094 -147.000 0.000 NA   NA
 1235459 1235460 UTI89_C1704 UTI89_C1705   yddW FALSE 0.002 298.000 0.000 NA   NA
 1235460 1235461 UTI89_C1705 UTI89_C1706 yddW xasA FALSE 0.103 131.000 0.000 1.000   NA
 1235461 1235462 UTI89_C1706 UTI89_C1707 xasA gadB TRUE 0.534 156.000 0.103 1.000 Y NA
 1235462 1235463 UTI89_C1707 UTI89_C1708 gadB pqqL FALSE 0.008 292.000 0.000 1.000   NA
 1235463 1235464 UTI89_C1708 UTI89_C1709 pqqL yddB TRUE 0.641 45.000 0.167 1.000   NA
 1235464 1235465 UTI89_C1709 UTI89_C1710 yddB yddA TRUE 0.581 38.000 0.000 0.071   NA
 1235465 1235466 UTI89_C1710 UTI89_C1711 yddA ydeM FALSE 0.008 291.000 0.000 1.000   NA
 1235466 1235467 UTI89_C1711 UTI89_C1712 ydeM ydeN TRUE 0.944 37.000 0.600 0.054   NA
 1235467 1235468 UTI89_C1712 UTI89_C1713 ydeN   FALSE 0.006 369.000 0.000 1.000 N NA
 1235468 1235469 UTI89_C1713 UTI89_C1714     FALSE 0.070 75.000 0.000 NA   NA
 1235469 1235470 UTI89_C1714 UTI89_C1715   ydeP FALSE 0.004 248.000 0.000 NA   NA
 1235470 1235471 UTI89_C1715 UTI89_C1716 ydeP fmlD FALSE 0.005 339.000 0.000 1.000   NA
 1235471 1235472 UTI89_C1716 UTI89_C1717 fmlD fmlC FALSE 0.005 325.000 0.000 1.000   NA
 1235472 1235473 UTI89_C1717 UTI89_C1718 fmlC fmlB FALSE 0.270 42.000 0.000 1.000   NA
 1235473 1235474 UTI89_C1718 UTI89_C1719 fmlB fmlA FALSE 0.040 362.000 0.000 1.000 Y NA
 1235474 1235475 UTI89_C1719 UTI89_C1720 fmlA   FALSE 0.001 480.000 0.000 NA   NA
 1235475 1235476 UTI89_C1720 UTI89_C1721     TRUE 0.834 6.000 0.167 NA   NA
 1235480 1235481 UTI89_C1725 UTI89_C1726     TRUE 0.966 0.000 0.625 NA   NA
 1235483 1235484 UTI89_C1728 UTI89_C1729     TRUE 0.960 13.000 0.714 NA   NA
 1235484 1235485 UTI89_C1729 UTI89_C1730     TRUE 0.719 65.000 0.400 NA   NA
 1235485 1235486 UTI89_C1730 UTI89_C1731     TRUE 0.866 35.000 0.500 NA   NA
 1235486 1235487 UTI89_C1731 UTI89_C1732     TRUE 0.940 3.000 0.400 NA   NA
 1235487 1235488 UTI89_C1732 UTI89_C1733     TRUE 0.860 12.000 0.222 NA   NA
 1235489 1235490 UTI89_C1734 UTI89_C1735     FALSE 0.067 100.000 0.000 NA   NA
 1235490 1235491 UTI89_C1735 UTI89_C1736     FALSE 0.060 108.000 0.000 NA   NA
 1235494 1235495 UTI89_C1739 UTI89_C1740 yneE uxaB FALSE 0.210 146.000 0.143 NA   NA
 1235495 1235496 UTI89_C1740 UTI89_C1741 uxaB yneF FALSE 0.028 227.000 0.000 1.000 N NA
 1235496 1235497 UTI89_C1741 UTI89_C1742 yneF yneG FALSE 0.163 139.000 0.098 NA   NA
 1235497 1235498 UTI89_C1742 UTI89_C1743 yneG yneH FALSE 0.333 0.000 0.037 NA   NA
 1235498 1235499 UTI89_C1743 UTI89_C1744 yneH yneI FALSE 0.274 64.000 0.000 1.000 N NA
 1235500 1235501 UTI89_C1745 UTI89_C1746 yneJ yneK FALSE 0.069 78.000 0.000 NA   NA
 1235501 1235502 UTI89_C1746 UTI89_C1747 yneK sotB FALSE 0.028 142.000 0.000 NA   NA
 1235504 1235505 UTI89_C1749 UTI89_C1750 marR marA TRUE 0.992 21.000 0.667 0.043 Y NA
 1235505 1235506 UTI89_C1750 UTI89_C1751 marA marB FALSE 0.139 32.000 0.000 NA   NA
 1235507 1235508 UTI89_C1752 UTI89_C1753     TRUE 0.896 18.000 0.000 1.000 Y NA
 1235508 1235509 UTI89_C1753 UTI89_C1754     TRUE 0.947 55.000 0.250 0.012 Y NA
 1235509 1235510 UTI89_C1754 UTI89_C1755     TRUE 0.957 25.000 0.105 0.012 Y NA
 1235510 1235511 UTI89_C1755 UTI89_C1756     TRUE 0.979 76.000 0.789 0.012 Y NA
 1235515 1235516 UTI89_C1760 UTI89_C1761 ydeH dcp FALSE 0.003 502.000 0.000 1.000 N NA
 1235517 1235518 UTI89_C1762 UTI89_C1763 ydfG ydfH FALSE 0.182 89.000 0.000 1.000   NA
 1235521 1235522 UTI89_C1766 UTI89_C1767 ydfI rspB FALSE 0.011 501.000 0.000 0.030 N NA
 1235522 1235523 UTI89_C1767 UTI89_C1768 rspB rspA TRUE 0.619 -12.000 0.049 1.000 N NA
 1235523 1235524 UTI89_C1768 UTI89_C1769 rspA ynfA FALSE 0.027 173.000 0.020 1.000   NA
 1235525 1235526 UTI89_C1770 UTI89_C1771 ynfB speG FALSE 0.260 35.000 0.055 NA   NA
 1235528 1235529 UTI89_C1773 UTI89_C1774 ynfD ynfE FALSE 0.181 199.000 0.304 NA   NA
 1235529 1235530 UTI89_C1774 UTI89_C1775 ynfE ynfF TRUE 0.952 58.000 0.231 0.001 Y NA
 1235530 1235531 UTI89_C1775 UTI89_C1776 ynfF ynfG TRUE 0.995 11.000 0.667 0.051 Y NA
 1235531 1235532 UTI89_C1776 UTI89_C1777 ynfG ynfH TRUE 0.944 2.000 0.333 1.000   NA
 1235532 1235533 UTI89_C1777 UTI89_C1778 ynfH ynfI TRUE 0.576 43.000 0.125 1.000   NA
 1235533 1235534 UTI89_C1778 UTI89_C1779 ynfI ynfJ FALSE 0.065 197.000 0.079 1.000   NA
 1235535 1235536 UTI89_C1780 UTI89_C1781 ynfK mlc TRUE 0.762 113.000 0.455 1.000 N NA
 1235536 1235537 UTI89_C1781 UTI89_C1782 mlc ynfL TRUE 0.852 135.000 0.408 1.000 Y NA
 1235538 1235539 UTI89_C1783 UTI89_C1784 ynfM   FALSE 0.001 398.000 0.000 NA   NA
 1235539 1235541 UTI89_C1784 UTI89_C1786     FALSE 0.003 276.000 0.000 NA   NA
 1235542 1235543 UTI89_C1787 UTI89_C1788 ydgE ydgF TRUE 0.994 -13.000 0.869 0.085 Y NA
 1235545 1235546 UTI89_C1790 UTI89_C1791 pntB pntA TRUE 0.997 11.000 0.745 0.000 Y NA
 1235547 1235548 UTI89_C1792 UTI89_C1793   ydgI FALSE 0.100 186.000 0.143 NA   NA
 1235548 1235549 UTI89_C1793 UTI89_C1794 ydgI ydgB TRUE 0.693 37.000 0.140 1.000 N NA
 1235551 1235552 UTI89_C1796 UTI89_C1797 rstA rstB TRUE 0.973 4.000 0.181 1.000 Y NA
 1235552 1235553 UTI89_C1797 UTI89_C1798 rstB tus TRUE 0.596 64.000 0.200 1.000   NA
 1235554 1235555 UTI89_C1799 UTI89_C1800 fumC fumA TRUE 0.705 143.000 0.000 0.001 Y NA
 1235556 1235557 UTI89_C1801 UTI89_C1802 manA ydgA TRUE 0.845 101.000 0.778 NA   NA
 1235558 1235559 UTI89_C1803 UTI89_C1804 uidC uidB TRUE 0.837 39.000 0.375 1.000   NA
 1235559 1235560 UTI89_C1804 UTI89_C1805 uidB uidA TRUE 0.978 -3.000 0.235 1.000 Y NA
 1235560 1235561 UTI89_C1805 UTI89_C1806 uidA uidR FALSE 0.005 390.000 0.000 1.000 N NA
 1235561 1235562 UTI89_C1806 UTI89_C1807 uidR hdhA FALSE 0.027 229.000 0.000 1.000 N NA
 1235562 1235563 UTI89_C1807 UTI89_C1808 hdhA malI FALSE 0.220 112.000 0.000 1.000 N NA
 1235564 1235565 UTI89_C1809 UTI89_C1810 malX malY TRUE 0.966 10.000 0.531 1.000 N NA
 1235565 1235566 UTI89_C1810 UTI89_C1811 malY add TRUE 0.522 104.000 0.132 1.000 N NA
 1235568 1235569 UTI89_C1813 UTI89_C1814     FALSE 0.066 89.000 0.000 NA   NA
 1235569 1235570 UTI89_C1814 UTI89_C1815   ydgT FALSE 0.109 -79.000 0.000 NA   NA
 1235570 1235571 UTI89_C1815 UTI89_C1816 ydgT ydgK FALSE 0.373 62.000 0.120 NA   NA
 1235571 1235572 UTI89_C1816 UTI89_C1817 ydgK rnfA FALSE 0.431 77.000 0.148 NA   NA
 1235572 1235573 UTI89_C1817 UTI89_C1818 rnfA rnfB TRUE 0.995 0.000 0.564 0.051 Y NA
 1235573 1235574 UTI89_C1818 UTI89_C1819 rnfB rnfC TRUE 0.992 -7.000 0.537 0.017 Y NA
 1235574 1235575 UTI89_C1819 UTI89_C1820 rnfC ydgO TRUE 0.997 1.000 0.814 0.051 Y NA
 1235575 1235576 UTI89_C1820 UTI89_C1821 ydgO rnfG TRUE 0.997 4.000 0.924 0.051 Y NA
 1235576 1235577 UTI89_C1821 UTI89_C1822 rnfG ydgQ TRUE 0.997 4.000 0.908 0.051 Y NA
 1235577 1235578 UTI89_C1822 UTI89_C1823 ydgQ nth TRUE 0.866 0.000 0.109 1.000 N NA
 1235578 1235579 UTI89_C1823 UTI89_C1824 nth   FALSE 0.038 128.000 0.000 NA   NA
 1235579 1235580 UTI89_C1824 UTI89_C1825   ydgR FALSE 0.003 283.000 0.000 NA   NA
 1235580 1235581 UTI89_C1825 UTI89_C1826 ydgR gst TRUE 0.750 105.000 0.344 1.000 N NA
 1235582 1235583 UTI89_C1827 UTI89_C1828 pdxY tyrS FALSE 0.306 59.000 0.041 1.000 N NA
 1235583 1235584 UTI89_C1828 UTI89_C1829 tyrS pdxH FALSE 0.259 117.000 0.054 1.000 N NA
 1235584 1235585 UTI89_C1829 UTI89_C1830 pdxH ydhA FALSE 0.186 59.000 0.034 1.000   NA
 1235585 1235586 UTI89_C1830 UTI89_C1831 ydhA ydhH FALSE 0.056 98.000 0.034 NA   NA
 1235589 1235590 UTI89_C1834 UTI89_C1835 ydhI ydhJ TRUE 0.851 -39.000 0.412 NA   NA
 1235590 1235591 UTI89_C1835 UTI89_C1836 ydhJ ydhK FALSE 0.327 0.000 0.000 NA   NA
 1235592 1235593 UTI89_C1837 UTI89_C1838 sodC ydhF FALSE 0.326 30.000 0.033 1.000   NA
 1235593 1235594 UTI89_C1838 UTI89_C1839 ydhF ydhL FALSE 0.144 49.000 0.045 NA   NA
 1235595 1235596 UTI89_C1840 UTI89_C1841 ydhM nemA TRUE 0.864 37.000 0.362 1.000 N NA
 1235596 1235597 UTI89_C1841 UTI89_C1842 nemA gloA FALSE 0.341 81.000 0.057 1.000 N NA
 1235597 1235598 UTI89_C1842 UTI89_C1843 gloA rnt TRUE 0.530 103.000 0.136 1.000 N NA
 1235598 1235599 UTI89_C1843 UTI89_C1844 rnt   FALSE 0.067 93.000 0.000 NA   NA
 1235601 1235602 UTI89_C1846 UTI89_C1847 ydhO sodB FALSE 0.043 128.000 0.015 NA N NA
 1235606 1235607 UTI89_C1851 UTI89_C1852 ydhC cfa FALSE 0.012 291.000 0.000 1.000 N NA
 1235611 1235612 UTI89_C1856 UTI89_C1857 valV valW FALSE 0.297 8.000 0.000 NA   NA
 1235612 1235614 UTI89_C1857 UTI89_C1859 valW   FALSE 0.056 111.000 0.000 NA   NA
 1235614 1235615 UTI89_C1859 UTI89_C1860   ydhS FALSE 0.040 126.000 0.000 NA   NA
 1235616 1235617 UTI89_C1861 UTI89_C1862 ydhT ydhU TRUE 0.883 4.000 0.222 NA   NA
 1235617 1235618 UTI89_C1862 UTI89_C1863 ydhU   TRUE 0.993 -3.000 0.444 0.050 Y NA
 1235618 1235619 UTI89_C1863 UTI89_C1864   ydhW TRUE 0.862 13.000 0.235 NA   NA
 1235619 1235620 UTI89_C1864 UTI89_C1865 ydhW ydhV TRUE 0.947 4.000 0.458 NA   NA
 1235620 1235621 UTI89_C1865 UTI89_C1866 ydhV ydhY TRUE 0.991 21.000 0.600 0.016 Y NA
 1235621 1235622 UTI89_C1866 UTI89_C1867 ydhY ydhZ FALSE 0.001 456.000 0.000 NA   NA
 1235623 1235624 UTI89_C1868 UTI89_C1869 pykF lpp FALSE 0.010 311.000 0.000 1.000 N NA
 1235625 1235626 UTI89_C1870 UTI89_C1871 ynhG sufE FALSE 0.084 149.000 0.069 NA   NA
 1235626 1235627 UTI89_C1871 UTI89_C1872 sufE sufS TRUE 0.820 13.000 0.183 NA   NA
 1235627 1235628 UTI89_C1872 UTI89_C1873 sufS sufD TRUE 0.910 -3.000 0.193 1.000 N NA
 1235628 1235629 UTI89_C1873 UTI89_C1874 sufD sufC TRUE 0.975 -25.000 0.482 1.000 Y NA
 1235629 1235630 UTI89_C1874 UTI89_C1875 sufC sufB TRUE 0.987 10.000 0.466 1.000 Y NA
 1235630 1235631 UTI89_C1875 UTI89_C1876 sufB sufA FALSE 0.201 -30.000 0.041 NA   NA
 1235631 1235632 UTI89_C1876 UTI89_C1877 sufA ydiH FALSE 0.001 549.000 0.000 NA   NA
 1235632 1235633 UTI89_C1877 UTI89_C1878 ydiH ydiI FALSE 0.147 19.000 0.032 NA   NA
 1235633 1235634 UTI89_C1878 UTI89_C1879 ydiI ydiJ TRUE 0.828 -3.000 0.129 NA N NA
 1235635 1235636 UTI89_C1880 UTI89_C1881 ydiK ydiL FALSE 0.001 402.000 0.000 NA   NA
 1235636 1235637 UTI89_C1881 UTI89_C1882 ydiL ydiM FALSE 0.398 100.000 0.095 1.000   NA
 1235637 1235638 UTI89_C1882 UTI89_C1883 ydiM ydiN FALSE 0.065 221.000 0.000 0.056   NA
 1235638 1235639 UTI89_C1883 UTI89_C1884 ydiN ydiB TRUE 0.790 12.000 0.082 1.000 N NA
 1235639 1235640 UTI89_C1884 UTI89_C1885 ydiB aroD TRUE 0.905 31.000 0.113 1.000 Y NA
 1235640 1235641 UTI89_C1885 UTI89_C1886 aroD ydiF FALSE 0.088 146.000 0.019 1.000 N NA
 1235641 1235642 UTI89_C1886 UTI89_C1887 ydiF ydiO TRUE 0.985 14.000 0.500 1.000 Y NA
 1235643 1235644 UTI89_C1888 UTI89_C1889 ydiP   FALSE 0.065 103.000 0.000 NA   NA
 1235645 1235646 UTI89_C1890 UTI89_C1891 ydiQ ydiR TRUE 0.995 20.000 1.000 0.017 Y NA
 1235646 1235647 UTI89_C1891 UTI89_C1892 ydiR ydiS TRUE 0.984 55.000 1.000 0.050 Y NA
 1235647 1235648 UTI89_C1892 UTI89_C1893 ydiS ydiT TRUE 0.992 -3.000 0.400 0.050 Y NA
 1235648 1235649 UTI89_C1893 UTI89_C1894 ydiT ydiD TRUE 0.822 3.000 0.080 1.000 N NA
 1235651 1235652 UTI89_C1896 UTI89_C1897 ydiA aroH FALSE 0.246 157.000 0.165 1.000   NA
 1235652 1235653 UTI89_C1897 UTI89_C1898 aroH ydiE FALSE 0.216 105.000 0.054 NA N NA
 1235654 1235655 UTI89_C1899 UTI89_C1900 ydiU ydiV FALSE 0.042 63.000 0.031 NA   NA
 1235655 1235656 UTI89_C1900 UTI89_C1901 ydiV nlpC FALSE 0.010 247.000 0.000 NA N NA
 1235656 1235657 UTI89_C1901 UTI89_C1902 nlpC btuD FALSE 0.158 78.000 0.000 NA N NA
 1235657 1235658 UTI89_C1902 UTI89_C1903 btuD btuE TRUE 0.708 0.000 0.000 1.000 N NA
 1235658 1235659 UTI89_C1903 UTI89_C1904 btuE btuC FALSE 0.452 62.000 0.084 1.000 N NA
 1235659 1235660 UTI89_C1904 UTI89_C1905 btuC himA FALSE 0.215 101.000 0.023 1.000 N NA
 1235660 1235661 UTI89_C1905 UTI89_C1906 himA pheT TRUE 0.916 5.000 0.208 1.000 N NA
 1235661 1235662 UTI89_C1906 UTI89_C1907 pheT pheS TRUE 0.995 15.000 0.574 0.000 Y NA
 1235664 1235665 UTI89_C1909 UTI89_C1910 rplT rpmI TRUE 0.986 53.000 0.928 0.011 Y NA
 1235665 1235666 UTI89_C1910 UTI89_C1911 rpmI   TRUE 0.953 97.000 0.652 1.000 Y NA
 1235666 1235667 UTI89_C1911 UTI89_C1912   thrS TRUE 0.825 112.000 0.186 1.000 Y NA
 1235668 1235669 UTI89_C1913 UTI89_C1914     FALSE 0.054 112.000 0.000 NA   NA
 1235673 1235674 UTI89_C1918 UTI89_C1919 ydiZ yniA FALSE 0.063 106.000 0.000 NA   NA
 1235676 1235677 UTI89_C1921 UTI89_C1922 yniC   FALSE 0.061 164.000 0.068 NA   NA
 1235677 1235678 UTI89_C1922 UTI89_C1923   ydjN FALSE 0.186 133.000 0.102 NA   NA
 1235681 1235682 UTI89_C1926 UTI89_C1927 ydjC celF TRUE 0.969 13.000 0.429 0.018   NA
 1235682 1235683 UTI89_C1927 UTI89_C1928 celF celD TRUE 0.926 35.000 0.625 1.000 N NA
 1235683 1235684 UTI89_C1928 UTI89_C1929 celD celC TRUE 0.978 8.000 0.727 1.000 N NA
 1235684 1235685 UTI89_C1929 UTI89_C1930 celC celB TRUE 0.985 51.000 0.833 0.012 Y NA
 1235685 1235686 UTI89_C1930 UTI89_C1931 celB celA TRUE 0.965 85.000 0.500 0.012 Y NA
 1235686 1235687 UTI89_C1931 UTI89_C1932 celA   FALSE 0.193 21.000 0.000 NA   NA
 1235687 1235688 UTI89_C1932 UTI89_C1933   osmE FALSE 0.214 18.000 0.000 NA   NA
 1235689 1235690 UTI89_C1934 UTI89_C1935 nadE ydjQ FALSE 0.016 230.000 0.010 1.000 N NA
 1235693 1235694 UTI89_C1938 UTI89_C1939 spy ydjS FALSE 0.004 330.000 0.000 NA N NA
 1235694 1235695 UTI89_C1939 UTI89_C1940 ydjS astB TRUE 0.950 -7.000 0.126 1.000 Y NA
 1235695 1235696 UTI89_C1940 UTI89_C1941 astB   TRUE 0.942 -3.000 0.306 1.000 N NA
 1235696 1235697 UTI89_C1941 UTI89_C1942   astA TRUE 0.903 -3.000 0.179 1.000 N NA
 1235697 1235698 UTI89_C1942 UTI89_C1943 astA astC TRUE 0.991 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 1235699 1235700 UTI89_C1944 UTI89_C1945   xthA FALSE 0.254 13.000 0.000 NA   NA
 1235700 1235701 UTI89_C1945 UTI89_C1946 xthA ydjX FALSE 0.009 119.000 0.016 NA   NA
 1235701 1235702 UTI89_C1946 UTI89_C1947 ydjX ydjY FALSE 0.337 -157.000 0.083 NA   NA
 1235702 1235703 UTI89_C1947 UTI89_C1948 ydjY ydjZ TRUE 0.800 14.000 0.174 NA   NA
 1235703 1235704 UTI89_C1948 UTI89_C1949 ydjZ ynjA TRUE 0.719 0.000 0.087 NA   NA
 1235704 1235705 UTI89_C1949 UTI89_C1950 ynjA ynjB FALSE 0.205 10.000 0.032 NA   NA
 1235705 1235706 UTI89_C1950 UTI89_C1951 ynjB ynjC TRUE 0.950 -51.000 0.627 0.056   NA
 1235706 1235707 UTI89_C1951 UTI89_C1952 ynjC ynjD TRUE 0.925 -33.000 0.602 1.000   NA
 1235707 1235708 UTI89_C1952 UTI89_C1953 ynjD   FALSE 0.499 52.000 0.111 1.000   NA
 1235713 1235714 UTI89_C1958 UTI89_C1959 topB selD TRUE 0.706 5.000 0.041 1.000 N NA
 1235714 1235715 UTI89_C1959 UTI89_C1960 selD ydjA FALSE 0.214 111.000 0.033 1.000 N NA
 1235716 1235717 UTI89_C1961 UTI89_C1962   sppA FALSE 0.121 -57.000 0.000 NA   NA
 1235717 1235718 UTI89_C1962 UTI89_C1963 sppA ansA FALSE 0.188 167.000 0.113 1.000 N NA
 1235718 1235719 UTI89_C1963 UTI89_C1964 ansA ydjB TRUE 0.671 11.000 0.040 1.000 N NA
 1235720 1235721 UTI89_C1965 UTI89_C1966 ydjE ydjF TRUE 0.861 49.000 0.125 1.000 Y NA
 1235721 1235722 UTI89_C1966 UTI89_C1967 ydjF ydjG TRUE 0.521 137.000 0.269 1.000 N NA
 1235722 1235723 UTI89_C1967 UTI89_C1968 ydjG ydjH TRUE 0.930 10.000 0.269 1.000 N NA
 1235723 1235724 UTI89_C1968 UTI89_C1969 ydjH ydjI TRUE 0.973 -16.000 0.368 1.000 Y NA
 1235724 1235725 UTI89_C1969 UTI89_C1970 ydjI ydjJ TRUE 0.921 21.000 0.194 0.018 N NA
 1235725 1235726 UTI89_C1970 UTI89_C1971 ydjJ ydjK TRUE 0.848 17.000 0.167 1.000 N NA
 1235726 1235727 UTI89_C1971 UTI89_C1972 ydjK ydjL TRUE 0.854 27.000 0.250 1.000 N NA
 1235727 1235728 UTI89_C1972 UTI89_C1973 ydjL yeaC FALSE 0.001 370.000 0.000 NA   NA
 1235728 1235729 UTI89_C1973 UTI89_C1974 yeaC msrB TRUE 0.874 -3.000 0.216 NA   NA
 1235730 1235731 UTI89_C1975 UTI89_C1976 gapA yeaD TRUE 0.844 63.000 0.154 1.000 Y NA
 1235732 1235733 UTI89_C1977 UTI89_C1978 yeaE yeaF FALSE 0.280 45.000 0.067 NA   NA
 1235734 1235735 UTI89_C1979 UTI89_C1980 yeaG yeaH TRUE 0.789 113.000 0.683 NA   NA
 1235735 1235736 UTI89_C1980 UTI89_C1981 yeaH yeaI FALSE 0.026 147.000 0.000 NA   NA
 1235736 1235737 UTI89_C1981 UTI89_C1982 yeaI yeaJ TRUE 0.973 1.000 0.000 0.004 Y NA
 1235737 1235738 UTI89_C1982 UTI89_C1983 yeaJ   FALSE 0.365 43.000 0.083 NA   NA
 1235742 1235743 UTI89_C1987 UTI89_C1988   yeaO FALSE 0.016 55.000 0.007 NA   NA
 1235747 1235748 UTI89_C1992 UTI89_C1993 yeaQ   FALSE 0.267 12.000 0.000 NA   NA
 1235748 1235749 UTI89_C1993 UTI89_C1994   yoaG FALSE 0.244 14.000 0.000 NA   NA
 1235749 1235750 UTI89_C1994 UTI89_C1995 yoaG yeaR FALSE 0.310 4.000 0.000 NA   NA
 1235750 1235751 UTI89_C1995 UTI89_C1996 yeaR yeaS FALSE 0.036 173.000 0.000 NA N NA
 1235753 1235754 UTI89_C1998 UTI89_C1999 rnd fadD TRUE 0.511 70.000 0.115 1.000 N NA
 1235754 1235755 UTI89_C1999 UTI89_C2000 fadD yeaY FALSE 0.389 139.000 0.169 1.000 N NA
 1235755 1235756 UTI89_C2000 UTI89_C2001 yeaY yeaZ FALSE 0.325 40.000 0.024 1.000 N NA
 1235756 1235757 UTI89_C2001 UTI89_C2002 yeaZ   FALSE 0.460 58.000 0.082 1.000 N NA
 1235757 1235758 UTI89_C2002 UTI89_C2003     FALSE 0.135 33.000 0.000 NA   NA
 1235759 1235760 UTI89_C2004 UTI89_C2005   yoaC FALSE 0.001 362.000 0.000 NA   NA
 1235760 1235761 UTI89_C2005 UTI89_C2006 yoaC   FALSE 0.049 117.000 0.000 NA   NA
 1235763 1235764 UTI89_C2008 UTI89_C2009 pabB yeaB TRUE 0.831 4.000 0.116 1.000   NA
 1235764 1235765 UTI89_C2009 UTI89_C2010 yeaB sdaA FALSE 0.350 184.000 0.409 1.000   NA
 1235765 1235766 UTI89_C2010 UTI89_C2011 sdaA   TRUE 0.738 101.000 0.389 NA N NA
 1235767 1235768 UTI89_C2012 UTI89_C2013 yoaE   FALSE 0.179 -12.000 0.034 NA   NA
 1235769 1235770 UTI89_C2014 UTI89_C2015 manX manY TRUE 0.832 63.000 0.000 0.014 Y NA
 1235772 1235773 UTI89_C2017 UTI89_C2018 manZ yobD TRUE 0.868 55.000 0.755 NA   NA
 1235773 1235774 UTI89_C2018 UTI89_C2019 yobD   FALSE 0.001 375.000 0.000 NA   NA
 1235775 1235776 UTI89_C2020 UTI89_C2021 yebH cspC FALSE 0.052 166.000 0.038 1.000   NA
 1235776 1235777 UTI89_C2021 UTI89_C2022 cspC yobF TRUE 0.844 13.000 0.214 NA   NA
 1235780 1235781 UTI89_C2025 UTI89_C2026 yebO mgrB TRUE 0.767 75.000 0.500 NA   NA
 1235785 1235786 UTI89_C2030 UTI89_C2031 htpX prc FALSE 0.147 192.000 0.042 0.022 N NA
 1235786 1235787 UTI89_C2031 UTI89_C2032 prc proQ TRUE 0.879 20.000 0.304 NA N NA
 1235787 1235788 UTI89_C2032 UTI89_C2033 proQ   TRUE 0.729 97.000 0.081 NA Y NA
 1235789 1235790 UTI89_C2034 UTI89_C2035 yebS yebT TRUE 0.914 -73.000 0.840 NA   NA
 1235790 1235791 UTI89_C2035 UTI89_C2036 yebT yebU TRUE 0.731 74.000 0.420 NA   NA
 1235791 1235792 UTI89_C2036 UTI89_C2037 yebU yebV FALSE 0.354 103.000 0.121 NA   NA
 1235792 1235793 UTI89_C2037 UTI89_C2038 yebV yebW TRUE 0.877 21.000 0.353 NA   NA
 1235794 1235795 UTI89_C2039 UTI89_C2040 pphA   FALSE 0.006 222.000 0.000 NA   NA
 1235795 1235796 UTI89_C2040 UTI89_C2041   yebY FALSE 0.214 18.000 0.000 NA   NA
 1235796 1235797 UTI89_C2041 UTI89_C2042 yebY yebZ TRUE 0.960 13.000 0.704 NA   NA
 1235797 1235798 UTI89_C2042 UTI89_C2043 yebZ yobA TRUE 0.970 4.000 0.613 1.000   NA
 1235799 1235800 UTI89_C2044 UTI89_C2045 holE   TRUE 0.612 102.000 0.222 1.000   NA
 1235800 1235801 UTI89_C2045 UTI89_C2046   exoX TRUE 0.923 23.000 0.500 1.000   NA
 1235804 1235805 UTI89_C2049 UTI89_C2050 yebE yebF FALSE 0.001 327.000 0.028 NA   NA
 1235805 1235806 UTI89_C2050 UTI89_C2051 yebF yebG FALSE 0.029 55.000 0.027 NA   NA
 1235808 1235809 UTI89_C2053 UTI89_C2054 eda edd TRUE 0.967 37.000 0.523 1.000 Y NA
 1235809 1235810 UTI89_C2054 UTI89_C2055 edd zwf FALSE 0.350 169.000 0.041 1.000 Y NA
 1235810 1235811 UTI89_C2055 UTI89_C2056 zwf   FALSE 0.017 166.000 0.000 NA   NA
 1235812 1235813 UTI89_C2057 UTI89_C2058 yebK pykA TRUE 0.691 -13.000 0.071 1.000 N NA
 1235814 1235815 UTI89_C2059 UTI89_C2060 msbB yebA TRUE 0.856 119.000 0.299 1.000 Y NA
 1235815 1235816 UTI89_C2060 UTI89_C2061 yebA znuA TRUE 0.821 16.000 0.131 1.000 N NA
 1235817 1235818 UTI89_C2062 UTI89_C2063 znuC znuB TRUE 0.996 -3.000 0.755 0.082 Y NA
 1235819 1235820 UTI89_C2064 UTI89_C2065 ruvB ruvA TRUE 0.996 9.000 0.549 0.001 Y NA
 1235822 1235823 UTI89_C2067 UTI89_C2068 ruvC yebC TRUE 0.760 35.000 0.277 NA   NA
 1235823 1235824 UTI89_C2068 UTI89_C2069 yebC ntpA FALSE 0.132 29.000 0.035 NA   NA
 1235824 1235825 UTI89_C2069 UTI89_C2070 ntpA aspS TRUE 0.753 2.000 0.050 1.000 N NA
 1235826 1235827 UTI89_C2071 UTI89_C2072 yecD yecE TRUE 0.704 -3.000 0.089 NA   NA
 1235827 1235828 UTI89_C2072 UTI89_C2073 yecE yecN TRUE 0.643 23.000 0.126 NA   NA
 1235828 1235829 UTI89_C2073 UTI89_C2074 yecN yecO FALSE 0.399 41.000 0.089 NA   NA
 1235829 1235830 UTI89_C2074 UTI89_C2075 yecO yecP TRUE 0.916 -3.000 0.315 NA   NA
 1235831 1235832 UTI89_C2076 UTI89_C2077 bisZ yecK TRUE 0.993 7.000 0.481 0.050 Y NA
 1235832 1235833 UTI89_C2077 UTI89_C2078 yecK   FALSE 0.005 388.000 0.000 1.000 N NA
 1235833 1235834 UTI89_C2078 UTI89_C2079   yecM FALSE 0.455 14.000 0.057 NA   NA
 1235836 1235837 UTI89_C2081 UTI89_C2082 flhE flhA TRUE 0.954 0.000 0.158 0.002   NA
 1235837 1235838 UTI89_C2082 UTI89_C2083 flhA flhB TRUE 0.987 -7.000 0.287 0.007 Y NA
 1235840 1235841 UTI89_C2085 UTI89_C2086 cheZ cheY TRUE 0.925 11.000 0.000 1.000 Y NA
 1235841 1235842 UTI89_C2086 UTI89_C2087 cheY cheB TRUE 0.955 15.000 0.000 0.009 Y NA
 1235842 1235843 UTI89_C2087 UTI89_C2088 cheB cheR TRUE 0.937 3.000 0.000 1.000 Y NA
 1235843 1235844 UTI89_C2088 UTI89_C2089 cheR tar FALSE 0.075 291.000 0.037 1.000 Y NA
 1235844 1235845 UTI89_C2089 UTI89_C2090 tar cheW TRUE 0.776 124.000 0.043 0.003 Y NA
 1235845 1235846 UTI89_C2090 UTI89_C2091 cheW cheA TRUE 0.989 21.000 0.447 0.003 Y NA
 1235846 1235847 UTI89_C2091 UTI89_C2092 cheA motB TRUE 0.983 -49.000 0.913 1.000 Y NA
 1235847 1235848 UTI89_C2092 UTI89_C2093 motB motA TRUE 0.987 -3.000 0.429 1.000 Y NA
 1235848 1235849 UTI89_C2093 UTI89_C2094 motA flhC TRUE 0.644 127.000 0.408 1.000   NA
 1235849 1235850 UTI89_C2094 UTI89_C2095 flhC flhD TRUE 0.897 3.000 0.000 0.001   NA
 1235852 1235853 UTI89_C2097 UTI89_C2098 otsA otsB TRUE 0.951 -34.000 0.068 0.000 Y NA
 1235853 1235854 UTI89_C2098 UTI89_C2099 otsB araH TRUE 0.660 110.000 0.037 1.000 Y NA
 1235854 1235855 UTI89_C2099 UTI89_C2100 araH araG TRUE 0.993 12.000 0.451 0.003 Y NA
 1235855 1235856 UTI89_C2100 UTI89_C2101 araG araF TRUE 0.984 70.000 0.917 0.003 Y NA
 1235860 1235861 UTI89_C2105 UTI89_C2106 yecR ftnA FALSE 0.020 157.000 0.000 NA   NA
 1235864 1235865 UTI89_C2109 UTI89_C2110 yecA leuZ FALSE 0.009 199.000 0.000 NA   NA
 1235865 1235866 UTI89_C2110 UTI89_C2111 leuZ cysT FALSE 0.227 16.000 0.000 NA   NA
 1235866 1235867 UTI89_C2111 UTI89_C2112 cysT glyW FALSE 0.078 57.000 0.000 NA   NA
 1235867 1235868 UTI89_C2112 UTI89_C2113 glyW pgsA FALSE 0.022 152.000 0.000 NA   NA
 1235868 1235869 UTI89_C2113 UTI89_C2114 pgsA uvrC TRUE 0.701 57.000 0.227 1.000 N NA
 1235869 1235870 UTI89_C2114 UTI89_C2115 uvrC uvrY TRUE 0.919 -3.000 0.086 0.020 N NA
 1235872 1235873 UTI89_C2117 UTI89_C2118 sdiA yecC FALSE 0.045 230.000 0.071 1.000 N NA
 1235873 1235874 UTI89_C2118 UTI89_C2119 yecC yecS TRUE 0.968 -3.000 0.150 1.000 Y NA
 1235874 1235875 UTI89_C2119 UTI89_C2120 yecS   TRUE 0.917 15.000 0.050 1.000 Y NA
 1235875 1235876 UTI89_C2120 UTI89_C2121   fliY TRUE 0.929 105.000 0.469 1.000 Y NA
 1235876 1235877 UTI89_C2121 UTI89_C2122 fliY fliZ TRUE 0.826 31.000 0.280 1.000   NA
 1235877 1235878 UTI89_C2122 UTI89_C2123 fliZ fliA TRUE 0.807 10.000 0.108 1.000   NA
 1235878 1235879 UTI89_C2123 UTI89_C2124 fliA fliC FALSE 0.006 320.000 0.012 1.000 N NA
 1235880 1235881 UTI89_C2125 UTI89_C2126 fliD fliS TRUE 0.981 25.000 0.284 0.002 Y NA
 1235881 1235882 UTI89_C2126 UTI89_C2127 fliS fliT TRUE 0.942 0.000 0.324 1.000   NA
 1235882 1235883 UTI89_C2127 UTI89_C2128 fliT amyA FALSE 0.445 78.000 0.115 1.000   NA
 1235885 1235886 UTI89_C2130 UTI89_C2131 yedE yedF TRUE 0.973 -3.000 0.844 NA   NA
 1235886 1235887 UTI89_C2131 UTI89_C2132 yedF yedK FALSE 0.058 109.000 0.000 NA   NA
 1235887 1235888 UTI89_C2132 UTI89_C2133 yedK   FALSE 0.001 567.000 0.000 NA   NA
 1235889 1235890 UTI89_C2134 UTI89_C2135 ybcM ybcL TRUE 0.960 10.000 0.625 NA   NA
 1235890 1235891 UTI89_C2135 UTI89_C2136 ybcL emrE FALSE 0.016 169.000 0.000 NA   NA
 1235891 1235892 UTI89_C2136 UTI89_C2137 emrE fliE FALSE 0.081 165.000 0.000 1.000 N NA
 1235893 1235894 UTI89_C2138 UTI89_C2139 fliF fliG TRUE 0.984 -7.000 0.220 0.004 Y NA
 1235894 1235895 UTI89_C2139 UTI89_C2140 fliG fliH TRUE 0.935 -28.000 0.000 0.003 Y NA
 1235895 1235896 UTI89_C2140 UTI89_C2141 fliH fliI TRUE 0.974 0.000 0.000 0.003 Y NA
 1235896 1235897 UTI89_C2141 UTI89_C2142 fliI fliJ TRUE 0.939 19.000 0.006 0.005 Y NA
 1235897 1235898 UTI89_C2142 UTI89_C2143 fliJ fliK TRUE 0.992 -3.000 0.317 0.004 Y NA
 1235898 1235899 UTI89_C2143 UTI89_C2144 fliK fliL TRUE 0.801 105.000 0.119 1.000 Y NA
 1235899 1235900 UTI89_C2144 UTI89_C2145 fliL fliM TRUE 0.993 -40.000 0.957 0.001 Y NA
 1235900 1235901 UTI89_C2145 UTI89_C2146 fliM fliN TRUE 0.986 -3.000 0.137 0.001 Y NA
 1235901 1235902 UTI89_C2146 UTI89_C2147 fliN fliO TRUE 0.989 0.000 0.443 1.000 Y NA
 1235902 1235903 UTI89_C2147 UTI89_C2148 fliO fliP TRUE 0.977 0.000 0.203 1.000 Y NA
 1235903 1235904 UTI89_C2148 UTI89_C2149 fliP fliQ TRUE 0.997 10.000 0.827 0.007 Y NA
 1235904 1235905 UTI89_C2149 UTI89_C2150 fliQ fliR TRUE 0.970 9.000 0.000 0.002 Y NA
 1235905 1235906 UTI89_C2150 UTI89_C2151 fliR rcsA FALSE 0.013 290.000 0.000 1.000 N NA
 1235910 1235911 UTI89_C2155 UTI89_C2156 yodD   FALSE 0.002 298.000 0.000 NA   NA
 1235912 1235913 UTI89_C2157 UTI89_C2158     FALSE 0.102 -94.000 0.000 NA   NA
 1235913 1235914 UTI89_C2158 UTI89_C2159     FALSE 0.002 323.000 0.000 NA   NA
 1235916 1235917 UTI89_C2161 UTI89_C2162 vsr dcm TRUE 0.933 -19.000 0.048 0.056 Y NA
 1235917 1235918 UTI89_C2162 UTI89_C2163 dcm yedJ FALSE 0.337 67.000 0.074 1.000   NA
 1235918 1235919 UTI89_C2163 UTI89_C2164 yedJ   FALSE 0.503 13.000 0.062 NA   NA
 1235920 1235921 UTI89_C2165 UTI89_C2166   hchA FALSE 0.001 597.000 0.000 NA   NA
 1235922 1235923 UTI89_C2167 UTI89_C2168 yedV yedW TRUE 0.998 0.000 0.857 0.001 Y NA
 1235924 1235925 UTI89_C2169 UTI89_C2170   yedY FALSE 0.163 109.000 0.000 1.000   NA
 1235925 1235926 UTI89_C2170 UTI89_C2171 yedY yedZ TRUE 0.988 1.000 0.790 0.049   NA
 1235926 1235927 UTI89_C2171 UTI89_C2172 yedZ yodA FALSE 0.012 257.000 0.000 1.000   NA
 1235927 1235928 UTI89_C2172 UTI89_C2173 yodA   FALSE 0.125 36.000 0.000 NA   NA
 1235930 1235931 UTI89_C2175 UTI89_C2176   asnT FALSE 0.067 101.000 0.000 NA   NA
 1235931 1235932 UTI89_C2176 UTI89_C2177 asnT   FALSE 0.001 384.000 0.000 NA   NA
 1235933 1235934 UTI89_C2178 UTI89_C2179 ybtS ybtX TRUE 0.746 28.000 0.176 NA N NA
 1235934 1235935 UTI89_C2179 UTI89_C2180 ybtX   TRUE 0.545 -130.000 0.130 NA N NA
 1235935 1235936 UTI89_C2180 UTI89_C2181   ybtP TRUE 0.992 -40.000 0.913 0.005 Y NA
 1235937 1235938 UTI89_C2182 UTI89_C2183   irp2 FALSE 0.385 173.000 0.333 1.000 N NA
 1235938 1235939 UTI89_C2183 UTI89_C2184 irp2 irp1 TRUE 0.921 88.000 0.158 0.002 Y NA
 1235939 1235940 UTI89_C2184 UTI89_C2185 irp1 ybtU TRUE 0.991 -3.000 0.333 0.029 Y NA
 1235940 1235941 UTI89_C2185 UTI89_C2186 ybtU ybtT TRUE 0.984 12.000 0.406 1.000 Y NA
 1235941 1235942 UTI89_C2186 UTI89_C2187 ybtT ybtE TRUE 0.959 4.000 0.094 1.000 Y NA
 1235942 1235943 UTI89_C2187 UTI89_C2188 ybtE fyuA FALSE 0.352 132.000 0.125 1.000 N NA
 1235943 1235944 UTI89_C2188 UTI89_C2189 fyuA   FALSE 0.001 594.000 0.000 NA   NA
 1235944 1235945 UTI89_C2189 UTI89_C2190</