MicrobesOnline Operon Predictions for Lactobacillus salivarius saliv. UCC118

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1254544 1254545 LSL_0001 LSL_0002 dnaA dnaN TRUE 0.666 167.000 0.328 1.000 Y NA
 1254545 1254546 LSL_0002 LSL_0003 dnaN   FALSE 0.084 417.000 0.103 1.000   NA
 1254546 1254547 LSL_0003 LSL_0004   recF TRUE 0.976 0.000 0.209 1.000   NA
 1254547 1254548 LSL_0004 LSL_0005 recF gyrB TRUE 0.988 3.000 0.249 0.010 Y NA
 1254548 1254549 LSL_0005 LSL_0006 gyrB gyrA TRUE 0.981 37.000 0.306 0.003 Y NA
 1254549 1254550 LSL_0006 LSL_0007 gyrA rpsF FALSE 0.059 219.000 0.003 1.000 N NA
 1254550 1254551 LSL_0007 LSL_0008 rpsF ssb FALSE 0.577 41.000 0.003 1.000 N NA
 1254551 1254552 LSL_0008 LSL_0009 ssb rpsR TRUE 0.866 22.000 0.003 1.000 N NA
 1254554 1254555 LSL_0011 LSL_0011b rfaG   FALSE 0.052 205.000 0.000 NA   NA
 1254555 1254556 LSL_0011b LSL_0012   asnB FALSE 0.038 240.000 0.000 NA   NA
 1254556 1254557 LSL_0012 LSL_0014b asnB   FALSE 0.162 101.000 0.000 NA   NA
 1254557 1254558 LSL_0014b LSL_0013   mscL FALSE 0.068 179.000 0.000 NA   NA
 1254560 1254561 LSL_0015 LSL_0016   murE FALSE 0.113 144.000 0.000 NA   NA
 1254561 1254562 LSL_0016 LSL_0017 murE   TRUE 0.953 0.000 0.104 1.000   NA
 1254562 1254563 LSL_0017 LSL_0018   racX TRUE 0.920 10.000 0.104 1.000   NA
 1254565 1254566 LSL_0020 LSL_0021     FALSE 0.133 120.000 0.000 1.000 N NA
 1254566 1254567 LSL_0021 LSL_0022     FALSE 0.041 230.000 0.000 NA   NA
 1254567 1254568 LSL_0022 LSL_0023     TRUE 0.761 15.000 0.000 NA   NA
 1254568 1254569 LSL_0023 LSL_0024     FALSE 0.050 199.000 0.000 1.000   NA
 1254571 1254572 LSL_0026 LSL_0027 cysK metC TRUE 0.996 16.000 0.690 0.015 Y NA
 1254572 1254573 LSL_0027 LSL_0028 metC gldA FALSE 0.082 155.000 0.000 1.000 N NA
 1254573 1254574 LSL_0028 LSL_0029 gldA   FALSE 0.138 103.000 0.000 1.000 N NA
 1254574 1254575 LSL_0029 LSL_0030     FALSE 0.153 116.000 0.000 NA   NA
 1254575 1254576 LSL_0030 LSL_0030b     TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 1254578 1254579 LSL_0031 LSL_0032     TRUE 0.930 12.000 0.120 1.000   NA
 1254579 1254580 LSL_0032 LSL_0033     TRUE 0.997 -7.000 0.720 0.006 Y NA
 1254580 1254581 LSL_0033 LSL_0034     FALSE 0.270 109.000 0.000 0.053   NA
 1254581 1254582 LSL_0034 LSL_0035     FALSE 0.069 173.000 0.000 1.000   NA
 1254582 1254583 LSL_0035 LSL_0036     TRUE 0.992 29.000 0.597 0.069 Y NA
 1254583 1254584 LSL_0036 LSL_0037     TRUE 0.992 -10.000 0.575 NA   NA
 1254584 1254585 LSL_0037 LSL_0038     TRUE 0.990 12.000 0.890 NA   NA
 1254585 1254586 LSL_0038 LSL_0040     FALSE 0.233 72.000 0.000 NA   NA
 1254586 1254587 LSL_0040 LSL_0041   phnP FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 1254587 1254588 LSL_0041 LSL_0042 phnP degP FALSE 0.348 99.000 0.030 1.000   NA
 1254588 1254589 LSL_0042 LSL_0043 degP   FALSE 0.016 397.000 0.000 NA   NA
 1254589 1254590 LSL_0043 LSL_0044     FALSE 0.084 166.000 0.000 NA   NA
 1254590 1254591 LSL_0044 LSL_0045     TRUE 0.639 12.000 0.000 1.000   NA
 1254591 1254592 LSL_0045 LSL_0046     TRUE 0.784 -7.000 0.000 1.000   NA
 1254592 1254593 LSL_0046 LSL_0047     FALSE 0.124 136.000 0.000 NA   NA
 1254595 1254596 LSL_0049 LSL_0049b     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 1254602 1254603 LSL_0054 LSL_0055   ppiB FALSE 0.161 86.000 0.000 1.000   NA
 1254603 1254604 LSL_0055 LSL_0056 ppiB   FALSE 0.093 151.000 0.000 1.000   NA
 1254606 1254607 LSL_0058 LSL_0059   clpL FALSE 0.611 126.000 0.163 NA   NA
 1254607 1254608 LSL_0059 LSL_0060 clpL   FALSE 0.041 212.000 0.000 1.000 N NA
 1254609 1254610 LSL_0061 LSL_0062   glnP FALSE 0.157 103.000 0.000 NA   NA
 1254610 1254611 LSL_0062 LSL_0063 glnP ilvE FALSE 0.053 240.000 0.000 1.000 Y NA
 1254612 1254613 LSL_RNA001 LSL_RNA002     TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1254613 1254614 LSL_RNA002 LSL_RNA003     FALSE 0.035 245.000 0.000 NA   NA
 1254615 1254616 LSL_0064 LSL_0065 scrR scrB TRUE 0.984 19.000 0.222 1.000 N NA
 1254617 1254618 LSL_0066 LSL_0067 scrA amyB FALSE 0.205 115.000 0.000 1.000 Y NA
 1254618 1254619 LSL_0067 LSL_0068 amyB ktrB FALSE 0.134 115.000 0.000 1.000 N NA
 1254619 1254620 LSL_0068 LSL_0069 ktrB ktrA TRUE 0.996 20.000 0.490 0.004 Y NA
 1254620 1254621 LSL_0069 LSL_0070 ktrA   FALSE 0.168 77.000 0.000 1.000 N NA
 1254621 1254622 LSL_0070 LSL_0071     TRUE 0.721 27.000 0.000 NA N NA
 1254624 1254625 LSL_0073 LSL_0074     FALSE 0.122 137.000 0.000 NA   NA
 1254625 1254626 LSL_0074 LSL_0075   dacC FALSE 0.036 243.000 0.000 NA   NA
 1254626 1254627 LSL_0075 LSL_0076 dacC   FALSE 0.041 213.000 0.000 1.000 N NA
 1254627 1254628 LSL_0076 LSL_0076b     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1254629 1254630 LSL_0076c LSL_0077     FALSE 0.169 93.000 0.000 NA   NA
 1254630 1254631 LSL_0077 LSL_0078     TRUE 0.973 0.000 0.182 NA   NA
 1254632 1254633 LSL_0079 LSL_0080   gloA TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1254634 1254635 LSL_0081 LSL_0082     FALSE 0.092 158.000 0.000 NA   NA
 1254635 1254636 LSL_0082 LSL_0083     TRUE 0.985 10.000 0.696 1.000 N NA
 1254636 1254637 LSL_0083 LSL_0084   baeS TRUE 0.998 16.000 0.941 0.010 Y NA
 1254637 1254638 LSL_0084 LSL_0085 baeS rbsB TRUE 0.994 -3.000 0.833 NA N NA
 1254639 1254640 LSL_0086 LSL_0087 manX   TRUE 0.998 19.000 0.943 0.018 Y NA
 1254640 1254641 LSL_0087 LSL_0088     TRUE 0.998 19.000 0.812 0.018 Y NA
 1254641 1254642 LSL_0088 LSL_0089     TRUE 0.993 22.000 0.583 NA   NA
 1254644 1254645 LSL_0091 LSL_0092 serC serA TRUE 0.971 8.000 0.238 1.000 Y NA
 1254645 1254646 LSL_0092 LSL_0093 serA   TRUE 0.741 2.000 0.000 NA N NA
 1254646 1254647 LSL_0093 LSL_0094     FALSE 0.167 96.000 0.000 NA   NA
 1254647 1254648 LSL_0094 LSL_0095     FALSE 0.073 174.000 0.000 NA   NA
 1254648 1254649 LSL_0095 LSL_0096     FALSE 0.135 129.000 0.000 NA   NA
 1254651 1254652 LSL_0098 LSL_0099 cas1 cas2 TRUE 0.995 -22.000 0.876 NA   NA
 1254652 1254653 LSL_0099 LSL_0100 cas2   TRUE 0.982 -3.000 0.253 NA   NA
 1254653 1254654 LSL_0100 LSL_0105     FALSE 0.010 2133.000 0.000 NA   NA
 11478589 1254653   LSL_0100     FALSE NA 32.000 0.000 NA   NA
 11620952 1254653   LSL_0100     FALSE NA 32.000 0.000 NA   NA
 11763344 1254653   LSL_0100     FALSE NA 32.000 0.000 NA   NA
 11478590 1254653   LSL_0100     FALSE NA 68.000 0.000 NA   NA
 11620953 1254653   LSL_0100     FALSE NA 68.000 0.000 NA   NA
 11763345 1254653   LSL_0100     FALSE NA 68.000 0.000 NA   NA
 11478591 1254653   LSL_0100     FALSE NA 98.000 0.000 NA   NA
 11620954 1254653   LSL_0100     FALSE NA 98.000 0.000 NA   NA
 11763346 1254653   LSL_0100     FALSE NA 98.000 0.000 NA   NA
 11478592 1254653   LSL_0100     FALSE NA 134.000 0.000 NA   NA
 11620955 1254653   LSL_0100     FALSE NA 134.000 0.000 NA   NA
 11763347 1254653   LSL_0100     FALSE NA 134.000 0.000 NA   NA
 11478593 1254653   LSL_0100     FALSE NA 164.000 0.000 NA   NA
 11620956 1254653   LSL_0100     FALSE NA 164.000 0.000 NA   NA
 11763348 1254653   LSL_0100     FALSE NA 164.000 0.000 NA   NA
 11478594 1254653   LSL_0100     FALSE NA 200.000 0.000 NA   NA
 11620957 1254653   LSL_0100     FALSE NA 200.000 0.000 NA   NA
 11763349 1254653   LSL_0100     FALSE NA 200.000 0.000 NA   NA
 11478595 1254653   LSL_0100     FALSE NA 230.000 0.000 NA   NA
 11620958 1254653   LSL_0100     FALSE NA 230.000 0.000 NA   NA
 11763350 1254653   LSL_0100     FALSE NA 230.000 0.000 NA   NA
 11478596 1254653   LSL_0100     FALSE NA 266.000 0.000 NA   NA
 11620959 1254653   LSL_0100     FALSE NA 266.000 0.000 NA   NA
 11763351 1254653   LSL_0100     FALSE NA 266.000 0.000 NA   NA
 11478597 1254653   LSL_0100     FALSE NA 296.000 0.000 NA   NA
 11620960 1254653   LSL_0100     FALSE NA 296.000 0.000 NA   NA
 11763352 1254653   LSL_0100     FALSE NA 296.000 0.000 NA   NA
 11478598 1254653   LSL_0100     FALSE NA 332.000 0.000 NA   NA
 11620961 1254653   LSL_0100     FALSE NA 332.000 0.000 NA   NA
 11763353 1254653   LSL_0100     FALSE NA 332.000 0.000 NA   NA
 11478599 1254653   LSL_0100     FALSE NA 362.000 0.000 NA   NA
 11620962 1254653   LSL_0100     FALSE NA 362.000 0.000 NA   NA
 11763354 1254653   LSL_0100     FALSE NA 362.000 0.000 NA   NA
 11478600 1254653   LSL_0100     FALSE NA 398.000 0.000 NA   NA
 11620963 1254653   LSL_0100     FALSE NA 398.000 0.000 NA   NA
 11763355 1254653   LSL_0100     FALSE NA 398.000 0.000 NA   NA
 11478601 1254653   LSL_0100     FALSE NA 428.000 0.000 NA   NA
 11620964 1254653   LSL_0100     FALSE NA 428.000 0.000 NA   NA
 11763356 1254653   LSL_0100     FALSE NA 428.000 0.000 NA   NA
 11478602 1254653   LSL_0100     FALSE NA 464.000 0.000 NA   NA
 11620965 1254653   LSL_0100     FALSE NA 464.000 0.000 NA   NA
 11763357 1254653   LSL_0100     FALSE NA 464.000 0.000 NA   NA
 11478603 1254653   LSL_0100     FALSE NA 494.000 0.000 NA   NA
 11620966 1254653   LSL_0100     FALSE NA 494.000 0.000 NA   NA
 11763358 1254653   LSL_0100     FALSE NA 494.000 0.000 NA   NA
 11478604 1254653   LSL_0100     FALSE NA 530.000 0.000 NA   NA
 11620967 1254653   LSL_0100     FALSE NA 530.000 0.000 NA   NA
 11763359 1254653   LSL_0100     FALSE NA 530.000 0.000 NA   NA
 11478605 1254653   LSL_0100     FALSE NA 560.000 0.000 NA   NA
 11620968 1254653   LSL_0100     FALSE NA 560.000 0.000 NA   NA
 11763360 1254653   LSL_0100     FALSE NA 560.000 0.000 NA   NA
 11478606 1254653   LSL_0100     FALSE NA 596.000 0.000 NA   NA
 11620969 1254653   LSL_0100     FALSE NA 596.000 0.000 NA   NA
 11763361 1254653   LSL_0100     FALSE NA 596.000 0.000 NA   NA
 11478607 1254653   LSL_0100     FALSE NA 626.000 0.000 NA   NA
 11620970 1254653   LSL_0100     FALSE NA 626.000 0.000 NA   NA
 11763362 1254653   LSL_0100     FALSE NA 626.000 0.000 NA   NA
 11478608 1254653   LSL_0100     FALSE NA 662.000 0.000 NA   NA
 11620971 1254653   LSL_0100     FALSE NA 662.000 0.000 NA   NA
 11763363 1254653   LSL_0100     FALSE NA 662.000 0.000 NA   NA
 11478609 1254653   LSL_0100     FALSE NA 692.000 0.000 NA   NA
 11620972 1254653   LSL_0100     FALSE NA 692.000 0.000 NA   NA
 11763364 1254653   LSL_0100     FALSE NA 692.000 0.000 NA   NA
 11478610 1254653   LSL_0100     FALSE NA 728.000 0.000 NA   NA
 11620973 1254653   LSL_0100     FALSE NA 728.000 0.000 NA   NA
 11763365 1254653   LSL_0100     FALSE NA 728.000 0.000 NA   NA
 11478611 1254653   LSL_0100     FALSE NA 758.000 0.000 NA   NA
 11620974 1254653   LSL_0100     FALSE NA 758.000 0.000 NA   NA
 11763366 1254653   LSL_0100     FALSE NA 758.000 0.000 NA   NA
 11478612 1254653   LSL_0100     FALSE NA 794.000 0.000 NA   NA
 11620975 1254653   LSL_0100     FALSE NA 794.000 0.000 NA   NA
 11763367 1254653   LSL_0100     FALSE NA 794.000 0.000 NA   NA
 11478613 1254653   LSL_0100     FALSE NA 824.000 0.000 NA   NA
 11620976 1254653   LSL_0100     FALSE NA 824.000 0.000 NA   NA
 11763368 1254653   LSL_0100     FALSE NA 824.000 0.000 NA   NA
 11478614 1254653   LSL_0100     FALSE NA 860.000 0.000 NA   NA
 11620977 1254653   LSL_0100     FALSE NA 860.000 0.000 NA   NA
 11763369 1254653   LSL_0100     FALSE NA 860.000 0.000 NA   NA
 11478615 1254653   LSL_0100     FALSE NA 890.000 0.000 NA   NA
 11620978 1254653   LSL_0100     FALSE NA 890.000 0.000 NA   NA
 11763370 1254653   LSL_0100     FALSE NA 890.000 0.000 NA   NA
 11478616 1254653   LSL_0100     FALSE NA 926.000 0.000 NA   NA
 11620979 1254653   LSL_0100     FALSE NA 926.000 0.000 NA   NA
 11763371 1254653   LSL_0100     FALSE NA 926.000 0.000 NA   NA
 11478617 1254653   LSL_0100     FALSE NA 956.000 0.000 NA   NA
 11620980 1254653   LSL_0100     FALSE NA 956.000 0.000 NA   NA
 11763372 1254653   LSL_0100     FALSE NA 956.000 0.000 NA   NA
 11478618 1254653   LSL_0100     FALSE NA 992.000 0.000 NA   NA
 11620981 1254653   LSL_0100     FALSE NA 992.000 0.000 NA   NA
 11763373 1254653   LSL_0100     FALSE NA 992.000 0.000 NA   NA
 11478619 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1022.000 0.000 NA   NA
 11620982 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1022.000 0.000 NA   NA
 11763374 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1022.000 0.000 NA   NA
 11478620 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11620983 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11763375 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1058.000 0.000 NA   NA
 11478621 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1088.000 0.000 NA   NA
 11620984 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1088.000 0.000 NA   NA
 11763376 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1088.000 0.000 NA   NA
 11478622 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1124.000 0.000 NA   NA
 11620985 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1124.000 0.000 NA   NA
 11763377 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1124.000 0.000 NA   NA
 11478623 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1154.000 0.000 NA   NA
 11620986 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1154.000 0.000 NA   NA
 11763378 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1154.000 0.000 NA   NA
 11478624 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1190.000 0.000 NA   NA
 11620987 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1190.000 0.000 NA   NA
 11763379 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1190.000 0.000 NA   NA
 11478625 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1220.000 0.000 NA   NA
 11620988 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1220.000 0.000 NA   NA
 11763380 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1220.000 0.000 NA   NA
 11478626 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1256.000 0.000 NA   NA
 11620989 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1256.000 0.000 NA   NA
 11763381 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1256.000 0.000 NA   NA
 11478627 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1286.000 0.000 NA   NA
 11620990 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1286.000 0.000 NA   NA
 11763382 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1286.000 0.000 NA   NA
 11478628 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1322.000 0.000 NA   NA
 11620991 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1322.000 0.000 NA   NA
 11763383 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1322.000 0.000 NA   NA
 11478629 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1352.000 0.000 NA   NA
 11620992 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1352.000 0.000 NA   NA
 11763384 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1352.000 0.000 NA   NA
 11478630 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1388.000 0.000 NA   NA
 11620993 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1388.000 0.000 NA   NA
 11763385 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1388.000 0.000 NA   NA
 11478631 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1418.000 0.000 NA   NA
 11620994 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1418.000 0.000 NA   NA
 11763386 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1418.000 0.000 NA   NA
 11478632 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11620995 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11763387 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1454.000 0.000 NA   NA
 11478633 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1484.000 0.000 NA   NA
 11620996 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1484.000 0.000 NA   NA
 11763388 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1484.000 0.000 NA   NA
 11478634 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1520.000 0.000 NA   NA
 11620997 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1520.000 0.000 NA   NA
 11763389 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1520.000 0.000 NA   NA
 11478635 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1550.000 0.000 NA   NA
 11620998 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1550.000 0.000 NA   NA
 11763390 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1550.000 0.000 NA   NA
 11478636 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1586.000 0.000 NA   NA
 11620999 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1586.000 0.000 NA   NA
 11763391 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1586.000 0.000 NA   NA
 11478637 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1616.000 0.000 NA   NA
 11621000 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1616.000 0.000 NA   NA
 11763392 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1616.000 0.000 NA   NA
 11478638 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1652.000 0.000 NA   NA
 11621001 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1652.000 0.000 NA   NA
 11763393 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1652.000 0.000 NA   NA
 11478639 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1682.000 0.000 NA   NA
 11621002 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1682.000 0.000 NA   NA
 11763394 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1682.000 0.000 NA   NA
 11478640 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1718.000 0.000 NA   NA
 11621003 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1718.000 0.000 NA   NA
 11763395 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1718.000 0.000 NA   NA
 11478641 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1748.000 0.000 NA   NA
 11621004 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1748.000 0.000 NA   NA
 11763396 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1748.000 0.000 NA   NA
 11478642 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1784.000 0.000 NA   NA
 11621005 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1784.000 0.000 NA   NA
 11763397 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1784.000 0.000 NA   NA
 11478643 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1814.000 0.000 NA   NA
 11621006 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1814.000 0.000 NA   NA
 11763398 1254653   LSL_0100     FALSE NA 1814.000 0.000 NA   NA
 1254654 1254655 LSL_0105 LSL_0106     TRUE 0.990 3.000 0.692 NA   NA
 1254655 1254656 LSL_0106 LSL_0107     TRUE 0.985 3.000 0.455 NA   NA
 1254656 1254657 LSL_0107 LSL_0108     TRUE 0.838 19.000 0.000 NA   NA
 1254657 1254658 LSL_0108 LSL_0109     FALSE 0.021 340.000 0.000 NA   NA
 1254658 1254659 LSL_0109 LSL_0110   glpK FALSE 0.016 402.000 0.000 NA   NA
 1254659 1254660 LSL_0110 LSL_0111 glpK glpO TRUE 0.924 13.000 0.010 0.001 Y NA
 1254660 1254661 LSL_0111 LSL_0112 glpO glpF FALSE 0.561 36.000 0.000 1.000 N NA
 1254661 1254662 LSL_0112 LSL_0113 glpF   FALSE 0.272 119.000 0.000 0.033 N NA
 1254662 1254663 LSL_0113 LSL_0114   potB TRUE 0.997 16.000 0.928 0.033 Y NA
 1254663 1254664 LSL_0114 LSL_0115 potB potC TRUE 0.993 1.000 0.492 0.033 Y NA
 1254664 1254665 LSL_0115 LSL_0116 potC potD TRUE 0.989 0.000 0.253 0.033 Y NA
 1254665 1254666 LSL_0116 LSL_0117 potD   FALSE 0.011 808.000 0.000 NA   NA
 1254666 1254667 LSL_0117 LSL_0118     TRUE 0.959 -3.000 0.105 NA   NA
 1254667 1254668 LSL_0118 LSL_0119     TRUE 0.994 -3.000 0.895 1.000   NA
 1254669 1254670 LSL_0120 LSL_0121   greA FALSE 0.068 179.000 0.000 NA   NA
 1254671 1254672 LSL_0122 LSL_0123     FALSE 0.052 207.000 0.000 NA   NA
 1254672 1254673 LSL_0123 LSL_0124   gidA TRUE 0.983 24.000 0.266 1.000   NA
 1254674 1254675 LSL_0125 LSL_0126 gpmB   FALSE 0.332 56.000 0.000 NA   NA
 1254676 1254677 LSL_0127 LSL_0128 fldA   TRUE 0.744 15.000 0.000 1.000   NA
 1254677 1254678 LSL_0128 LSL_0128b     TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1254678 1254679 LSL_0128b LSL_0129   metE FALSE 0.014 442.000 0.000 NA   NA
 1254679 1254680 LSL_0129 LSL_0130 metE   FALSE 0.267 66.000 0.000 NA N NA
 1254680 1254681 LSL_0130 LSL_0131     TRUE 0.954 22.000 0.042 NA Y NA
 1254681 1254682 LSL_0131 LSL_0132     TRUE 0.996 -7.000 0.938 1.000 Y NA
 1254682 1254683 LSL_0132 LSL_0133     TRUE 0.750 42.000 0.042 1.000 N NA
 1254685 1254686 LSL_0135 LSL_0136     TRUE 0.796 17.000 0.000 1.000 N NA
 1254690 1254691 LSL_0139b LSL_0140     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1254691 1254692 LSL_0140 LSL_0141     TRUE 0.809 70.000 0.181 NA Y NA
 1254694 1254695 LSL_0143 LSL_0144   gdh FALSE 0.056 197.000 0.000 NA   NA
 1254695 1254696 LSL_0144 LSL_0145 gdh   TRUE 0.771 24.000 0.000 1.000 N NA
 1254698 1254699 LSL_0147 LSL_0148     TRUE 0.782 24.000 0.000 1.000   NA
 1254701 1254702 LSL_0150 LSL_0152   mbp1 FALSE 0.430 47.000 0.000 NA   NA
 1254702 1254703 LSL_0152 LSL_0153 mbp1 acoA FALSE 0.021 339.000 0.000 NA   NA
 1254703 1254704 LSL_0153 LSL_0154 acoA acoB TRUE 0.994 3.000 0.484 0.001 Y NA
 1254704 1254705 LSL_0154 LSL_0155 acoB aceF TRUE 0.997 17.000 0.883 0.058 Y NA
 1254705 1254706 LSL_0155 LSL_0156 aceF lpd TRUE 0.992 8.000 0.948 1.000 Y NA
 1254706 1254707 LSL_0156 LSL_0157 lpd lplA FALSE 0.339 87.000 0.026 1.000 N NA
 1254707 1254708 LSL_0157 LSL_0158 lplA   FALSE 0.153 113.000 0.000 NA   NA
 1254708 1254709 LSL_0158 LSL_0159     FALSE 0.248 70.000 0.000 NA   NA
 1254711 1254712 LSL_0161 LSL_0162     TRUE 0.992 17.000 0.569 NA   NA
 1254712 1254713 LSL_0162 LSL_0163     FALSE 0.029 266.000 0.000 NA   NA
 1254713 1254714 LSL_0163 LSL_0164   fruK TRUE 0.994 -3.000 0.721 1.000 Y NA
 1254714 1254715 LSL_0164 LSL_0165 fruK fruA TRUE 0.992 28.000 0.816 1.000 Y NA
 1254715 1254716 LSL_0165 LSL_0166 fruA   FALSE 0.147 124.000 0.000 NA   NA
 1254716 1254717 LSL_0166 LSL_0167     TRUE 0.804 -19.000 0.000 NA   NA
 1254718 1254719 LSL_0168 LSL_0169     FALSE 0.028 253.000 0.000 1.000 N NA
 1254719 1254720 LSL_0169 LSL_0170     FALSE 0.132 132.000 0.000 NA   NA
 1254721 1254722 LSL_0171 LSL_0172 rfaG guaA TRUE 0.687 29.000 0.000 NA N NA
 1254724 1254725 LSL_0174 LSL_0175 menB menE TRUE 0.986 0.000 0.193 0.001 N NA
 1254725 1254726 LSL_0175 LSL_0176 menE   FALSE 0.205 75.000 0.000 NA   NA
 1254726 1254727 LSL_0176 LSL_0177     FALSE 0.128 134.000 0.000 NA   NA
 1254727 1254728 LSL_0177 LSL_0178     TRUE 0.678 5.000 0.000 1.000 N NA
 1254728 1254729 LSL_0178 LSL_0179     FALSE 0.147 96.000 0.000 1.000 N NA
 1254730 1254731 LSL_0180 LSL_0181     TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1254731 1254732 LSL_0181 LSL_0182     TRUE 0.993 2.000 0.903 NA   NA
 1254733 1254734 LSL_0183 LSL_0184     TRUE 0.815 18.000 0.000 1.000   NA
 1254734 1254735 LSL_0184 LSL_0185   wecD TRUE 0.744 15.000 0.000 1.000   NA
 1254735 1254736 LSL_0185 LSL_0186 wecD   FALSE 0.037 223.000 0.000 1.000 N NA
 1254736 1254737 LSL_0186 LSL_0187   alsD TRUE 0.945 22.000 0.056 1.000 N NA
 1254737 1254738 LSL_0187 LSL_0188 alsD   FALSE 0.017 344.000 0.000 1.000 N NA
 1254738 1254739 LSL_0188 LSL_0189   serS FALSE 0.023 294.000 0.000 1.000 N NA
 1254739 1254740 LSL_0189 LSL_RNA004 serS   FALSE 0.012 528.000 0.000 NA   NA
 1254740 1254741 LSL_RNA004 LSL_RNA119     FALSE 0.155 104.000 0.000 NA   NA
 1254741 1254742 LSL_RNA119 LSL_RNA120     TRUE 0.661 32.000 0.000 NA   NA
 1254742 1254743 LSL_RNA120 LSL_RNA007     FALSE 0.139 127.000 0.000 NA   NA
 1254743 1254744 LSL_RNA007 LSL_RNA008     FALSE 0.035 245.000 0.000 NA   NA
 1254744 1254745 LSL_RNA008 LSL_RNA009     TRUE 0.688 6.000 0.000 NA   NA
 1254745 1254746 LSL_RNA009 LSL_RNA010     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1254746 1254747 LSL_RNA010 LSL_RNA011     TRUE 0.803 16.000 0.000 NA   NA
 1254747 1254748 LSL_RNA011 LSL_RNA012     TRUE 0.665 9.000 0.000 NA   NA
 1254748 1254749 LSL_RNA012 LSL_RNA013     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1254749 1254750 LSL_RNA013 LSL_RNA014     TRUE 0.659 10.000 0.000 NA   NA
 1254750 1254751 LSL_RNA014 LSL_RNA015     TRUE 0.665 9.000 0.000 NA   NA
 1254751 1254752 LSL_RNA015 LSL_RNA016     FALSE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 1254752 1254753 LSL_RNA016 LSL_RNA017     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1254753 1254754 LSL_RNA017 LSL_0190   pyrB FALSE 0.016 404.000 0.000 NA   NA
 1254754 1254755 LSL_0190 LSL_0191 pyrB pyrC TRUE 0.990 0.000 0.452 1.000 Y NA
 1254755 1254756 LSL_0191 LSL_0192 pyrC carA TRUE 0.974 0.000 0.155 1.000 Y NA
 1254756 1254757 LSL_0192 LSL_0193 carA carB TRUE 0.985 -7.000 0.117 0.002 Y NA
 1254757 1254758 LSL_0193 LSL_0194 carB pyrD TRUE 0.963 19.000 0.018 0.054 Y NA
 1254758 1254759 LSL_0194 LSL_RNA018 pyrD   FALSE 0.579 37.000 0.000 NA   NA
 1254759 1254760 LSL_RNA018 LSL_0195     FALSE 0.059 193.000 0.000 NA   NA
 1254760 1254761 LSL_0195 LSL_0196   clpC TRUE 0.977 16.000 0.188 NA N NA
 1254761 1254762 LSL_0196 LSL_0197 clpC rpoB FALSE 0.064 244.000 0.000 0.085 N NA
 1254762 1254763 LSL_0197 LSL_0198 rpoB rpoC TRUE 0.996 29.000 0.851 0.002 Y NA
 1254765 1254766 LSL_0200 LSL_0201 rpsL rpsG TRUE 0.978 35.000 0.224 0.005 Y NA
 1254766 1254767 LSL_0201 LSL_0202 rpsG efg TRUE 0.861 121.000 0.579 1.000 Y NA
 1254767 1254768 LSL_0202 LSL_0203 efg sir2 FALSE 0.136 104.000 0.000 1.000 N NA
 1254768 1254769 LSL_0203 LSL_0204 sir2   TRUE 0.805 18.000 0.000 1.000 N NA
 1254769 1254770 LSL_0204 LSL_0205     FALSE 0.082 155.000 0.000 1.000 N NA
 1254770 1254771 LSL_0205 LSL_0206   baeS TRUE 0.996 28.000 0.932 0.008 Y NA
 1254772 1254773 LSL_0206b LSL_0206c     FALSE 0.043 223.000 0.000 NA   NA
 1254774 1254775 LSL_0207 LSL_0208     FALSE 0.202 121.000 0.000 1.000 Y NA
 1254775 1254776 LSL_0208 LSL_0209   dxs FALSE 0.132 121.000 0.000 1.000 N NA
 1254776 1254777 LSL_0209 LSL_0210 dxs   FALSE 0.133 120.000 0.000 1.000 N NA
 1254777 1254778 LSL_0210 LSL_0211     TRUE 0.840 11.000 0.031 1.000   NA
 1254778 1254779 LSL_0211 LSL_0212     TRUE 0.992 22.000 0.533 1.000   NA
 1254779 1254780 LSL_0212 LSL_0212b     TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1254780 1254781 LSL_0212b LSL_0212c     FALSE 0.024 309.000 0.000 NA   NA
 1254781 1254782 LSL_0212c LSL_0213     FALSE 0.031 259.000 0.000 NA   NA
 1254782 1254783 LSL_0213 LSL_0214     FALSE 0.164 100.000 0.000 NA   NA
 1254783 1254784 LSL_0214 LSL_0215   htpX TRUE 0.961 12.000 0.222 NA   NA
 1254785 1254786 LSL_RNA019 LSL_0216   rep FALSE 0.257 69.000 0.000 NA   NA
 1254786 1254787 LSL_0216 LSL_0217 rep czcD FALSE 0.136 124.000 0.000 1.000   NA
 1254788 1254789 LSL_0218 LSL_0219 trpS gppA FALSE 0.388 89.000 0.039 1.000 N NA
 1254789 1254790 LSL_0219 LSL_0220 gppA   FALSE 0.125 125.000 0.000 1.000 N NA
 1254790 1254791 LSL_0220 LSL_0221     TRUE 0.990 3.000 0.713 1.000 N NA
 1254791 1254792 LSL_0221 LSL_0222     TRUE 0.912 13.000 0.085 1.000 N NA
 1254794 1254795 LSL_0224 LSL_0225     TRUE 0.936 0.000 0.065 1.000   NA
 1254795 1254796 LSL_0225 LSL_0226   metG FALSE 0.143 104.000 0.000 1.000   NA
 1254796 1254797 LSL_0226 LSL_0227 metG tatD TRUE 0.647 134.000 0.221 NA N NA
 1254797 1254798 LSL_0227 LSL_0228 tatD   TRUE 0.909 11.000 0.058 NA Y NA
 1254798 1254799 LSL_0228 LSL_0229   ksgA TRUE 0.912 12.000 0.093 1.000 N NA
 1254799 1254800 LSL_0229 LSL_0230 ksgA   FALSE 0.390 88.000 0.035 NA   NA
 1254800 1254801 LSL_0230 LSL_0231     FALSE 0.167 96.000 0.000 NA   NA
 1254801 1254802 LSL_0231 LSL_0232   avtA TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1254802 1254803 LSL_0232 LSL_0233 avtA argR TRUE 0.624 44.000 0.015 1.000 N NA
 1254806 1254807 LSL_0236 LSL_0237 xerC   FALSE 0.096 149.000 0.000 1.000   NA
 1254807 1254808 LSL_0237 LSL_0238     TRUE 0.804 -120.000 0.000 NA   NA
 1254808 1254809 LSL_0238 LSL_0239     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1254809 1254810 LSL_0239 LSL_0240     TRUE 0.927 -7.000 0.038 NA   NA
 1254810 1254811 LSL_0240 LSL_0241     FALSE 0.176 85.000 0.000 NA   NA
 1254811 1254812 LSL_0241 LSL_0242     FALSE 0.154 106.000 0.000 NA   NA
 1254813 1254814 LSL_0243 LSL_0244     FALSE 0.022 322.000 0.000 NA   NA
 1254814 1254815 LSL_0244 LSL_0245     FALSE 0.561 38.000 0.000 NA   NA
 1254817 1254818 LSL_0247 LSL_0248     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 1254820 1254821 LSL_0250 LSL_0251 cro   FALSE 0.522 39.000 0.000 1.000   NA
 1254821 1254822 LSL_0251 LSL_0252     TRUE 0.733 27.000 0.000 NA   NA
 1254822 1254823 LSL_0252 LSL_0253     FALSE 0.026 299.000 0.000 NA   NA
 1254823 1254824 LSL_0253 LSL_0254     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1254824 1254825 LSL_0254 LSL_0255     TRUE 0.803 -13.000 0.000 NA   NA
 1254825 1254826 LSL_0255 LSL_0256     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1254826 1254827 LSL_0256 LSL_0257     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1254827 1254828 LSL_0257 LSL_0258     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1254828 1254829 LSL_0258 LSL_0259     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1254829 1254830 LSL_0259 LSL_0260     TRUE 0.804 -19.000 0.000 NA   NA
 1254830 1254831 LSL_0260 LSL_0261     TRUE 0.989 5.000 0.708 NA   NA
 1254831 1254832 LSL_0261 LSL_0262     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1254832 1254833 LSL_0262 LSL_0263     TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 1254833 1254834 LSL_0263 LSL_0264     TRUE 0.688 6.000 0.000 NA   NA
 1254834 1254835 LSL_0264 LSL_0265     TRUE 0.761 1.000 0.000 NA   NA
 1254835 1254836 LSL_0265 LSL_0266     FALSE 0.268 67.000 0.000 NA   NA
 1254836 1254837 LSL_0266 LSL_0267     TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 1254837 1254838 LSL_0267 LSL_0268     TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1254838 1254839 LSL_0268 LSL_0270     FALSE 0.013 485.000 0.000 NA   NA
 1254839 1254840 LSL_0270 LSL_0271     TRUE 0.761 15.000 0.000 NA   NA
 1254840 1254841 LSL_0271 LSL_0272     TRUE 0.657 11.000 0.000 NA   NA
 1254841 1254842 LSL_0272 LSL_0273     TRUE 0.828 18.000 0.000 NA   NA
 1254842 1254843 LSL_0273 LSL_0274     FALSE 0.205 75.000 0.000 NA   NA
 1254843 1254844 LSL_0274 LSL_0275     FALSE 0.166 97.000 0.000 NA   NA
 1254844 1254845 LSL_0275 LSL_0276     TRUE 0.803 -13.000 0.000 NA   NA
 1254845 1254846 LSL_0276 LSL_0277     FALSE 0.032 257.000 0.000 NA   NA
 1254846 1254847 LSL_0277 LSL_0278     FALSE 0.500 41.000 0.000 NA   NA
 1254847 1254848 LSL_0278 LSL_0279   mcrA TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 1254848 1254849 LSL_0279 LSL_0280 mcrA   FALSE 0.068 179.000 0.000 NA   NA
 1254849 1254850 LSL_0280 LSL_0281     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 1254850 1254851 LSL_0281 LSL_0282     TRUE 0.983 -10.000 0.250 NA   NA
 1254851 1254852 LSL_0282 LSL_0283     TRUE 0.987 0.000 0.429 NA   NA
 1254852 1254853 LSL_0283 LSL_0284   clpP TRUE 0.987 -19.000 0.333 NA   NA
 1254853 1254854 LSL_0284 LSL_0285 clpP   TRUE 0.986 -10.000 0.316 NA   NA
 1254854 1254855 LSL_0285 LSL_0286     TRUE 0.967 12.000 0.263 NA   NA
 1254855 1254856 LSL_0286 LSL_0287     TRUE 0.987 -7.000 0.333 NA   NA
 1254856 1254857 LSL_0287 LSL_0288     TRUE 0.979 -7.000 0.200 NA   NA
 1254857 1254858 LSL_0288 LSL_0289     TRUE 0.983 0.000 0.300 NA   NA
 1254858 1254859 LSL_0289 LSL_0290     TRUE 0.993 2.000 0.833 NA   NA
 1254859 1254860 LSL_0290 LSL_0291     TRUE 0.960 50.000 0.750 NA   NA
 1254860 1254861 LSL_0291 LSL_0292     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 1254861 1254862 LSL_0292 LSL_0293     FALSE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 1254862 1254863 LSL_0293 LSL_0294     FALSE 0.338 55.000 0.000 NA   NA
 1254863 1254864 LSL_0294 LSL_0295     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1254864 1254865 LSL_0295 LSL_0296     TRUE 0.803 16.000 0.000 NA   NA
 1254865 1254866 LSL_0296 LSL_0297     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1254866 1254867 LSL_0297 LSL_0298     FALSE 0.153 109.000 0.000 NA   NA
 1254867 1254868 LSL_0298 LSL_0299     FALSE 0.066 181.000 0.000 NA   NA
 1254868 1254869 LSL_0299 LSL_0300     TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1254869 1254870 LSL_0300 LSL_0301     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 1254870 1254871 LSL_0301 LSL_0302     FALSE 0.355 53.000 0.000 NA   NA
 1254871 1254872 LSL_0302 LSL_0303     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1254872 1254873 LSL_0303 LSL_0304     TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1254874 1254875 LSL_0305 LSL_0306 argH argG TRUE 0.987 24.000 0.278 1.000 Y NA
 1254876 1254877 LSL_0307 LSL_0308 araT ldhA TRUE 0.987 16.000 0.364 1.000 N NA
 1254877 1254878 LSL_0308 LSL_0309 ldhA   TRUE 0.987 19.000 0.263 NA   NA
 1254878 1254879 LSL_0309 LSL_0311   mbp2 FALSE 0.013 476.000 0.000 NA   NA
 1254880 1254881 LSL_0312 LSL_0313   asd FALSE 0.069 169.000 0.000 1.000 N NA
 1254882 1254883 LSL_0314 LSL_0315   purR FALSE 0.019 322.000 0.000 1.000 N NA
 1254883 1254884 LSL_0315 LSL_0316 purR   FALSE 0.117 131.000 0.000 1.000 N NA
 1254884 1254885 LSL_0316 LSL_0317   glmU FALSE 0.100 143.000 0.000 1.000 N NA
 1254885 1254886 LSL_0317 LSL_0318 glmU prsA FALSE 0.465 91.000 0.069 1.000 N NA
 1254886 1254887 LSL_0318 LSL_0319 prsA rimL FALSE 0.187 74.000 0.000 1.000 N NA
 1254888 1254889 LSL_0320 LSL_0321     TRUE 0.688 6.000 0.000 NA   NA
 1254890 1254891 LSL_0322 LSL_0323 udp   FALSE 0.190 75.000 0.000 1.000   NA
 1254891 1254892 LSL_0323 LSL_0324     FALSE 0.197 74.000 0.000 1.000   NA
 1254894 1254895 LSL_0326 LSL_0327     TRUE 0.995 -3.000 0.957 NA   NA
 1254895 1254896 LSL_0327 LSL_0328     FALSE 0.048 211.000 0.000 NA   NA
 1254896 1254897 LSL_0328 LSL_0329   spoVK TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1254897 1254898 LSL_0329 LSL_0330 spoVK   TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1254898 1254899 LSL_0330 LSL_0331     TRUE 0.804 -37.000 0.000 NA   NA
 1254899 1254900 LSL_0331 LSL_0332     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1254900 1254901 LSL_0332 LSL_0333     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1254901 1254902 LSL_0333 LSL_0334     FALSE 0.345 54.000 0.000 NA   NA
 1254902 1254903 LSL_0334 LSL_0335     TRUE 0.828 18.000 0.000 NA   NA
 1254904 1254905 LSL_0336 LSL_0337     FALSE 0.287 64.000 0.000 NA   NA
 1254905 1254906 LSL_0337 LSL_0338     TRUE 0.788 16.000 0.000 1.000   NA
 1254907 1254908 LSL_0339 LSL_0340 guaA   FALSE 0.157 103.000 0.000 NA   NA
 1254908 1254909 LSL_0340 LSL_0341   rpoE TRUE 0.853 46.000 0.122 NA   NA
 1254909 1254910 LSL_0341 LSL_0342 rpoE pyrG FALSE 0.167 175.000 0.029 1.000 N NA
 1254910 1254911 LSL_0342 LSL_0343 pyrG   FALSE 0.239 71.000 0.000 NA   NA
 1254911 1254912 LSL_0343 LSL_0344     FALSE 0.268 67.000 0.000 NA   NA
 1254912 1254913 LSL_0344 LSL_0345   murA FALSE 0.044 221.000 0.000 NA   NA
 1254913 1254914 LSL_0345 LSL_0346 murA rho TRUE 0.810 11.000 0.022 1.000 N NA
 1254914 1254915 LSL_0346 LSL_0347 rho rpmE FALSE 0.377 107.000 0.049 1.000 N NA
 1254915 1254916 LSL_0347 LSL_0348 rpmE   FALSE 0.174 86.000 0.000 NA   NA
 1254918 1254919 LSL_0350 LSL_0351     TRUE 0.828 18.000 0.000 NA   NA
 1254919 1254920 LSL_0351 LSL_0352     TRUE 0.657 11.000 0.000 NA   NA
 1254920 1254921 LSL_0352 LSL_0353     FALSE 0.085 165.000 0.000 NA   NA
 1254921 1254922 LSL_0353 LSL_0354     FALSE 0.108 147.000 0.000 NA   NA
 1254922 1254923 LSL_0354 LSL_0355   murF FALSE 0.121 138.000 0.000 NA   NA
 1254923 1254924 LSL_0355 LSL_0356 murF srmB FALSE 0.233 136.000 0.021 1.000 N NA
 1254924 1254925 LSL_0356 LSL_0357 srmB acpS FALSE 0.271 130.000 0.025 1.000 N NA
 1254925 1254926 LSL_0357 LSL_0358 acpS alr TRUE 0.965 19.000 0.093 1.000 N NA
 1254926 1254927 LSL_0358 LSL_0359 alr   TRUE 0.745 47.000 0.054 NA   NA
 1254927 1254928 LSL_0359 LSL_0360     TRUE 0.931 16.000 0.039 NA   NA
 1254929 1254930 LSL_0361 LSL_0362     TRUE 0.828 18.000 0.000 NA   NA
 1254930 1254931 LSL_0362 LSL_0363   def FALSE 0.141 113.000 0.000 1.000   NA
 1254935 1254936 LSL_0367 LSL_0368     FALSE 0.240 69.000 0.000 1.000   NA
 1254937 1254938 LSL_0369 LSL_0370 trmA   FALSE 0.196 128.000 0.000 NA Y NA
 1254938 1254939 LSL_0370 LSL_0371     FALSE 0.319 101.000 0.022 NA   NA
 1254939 1254940 LSL_0371 LSL_0372   gpsA FALSE 0.176 85.000 0.000 NA   NA
 1254940 1254941 LSL_0372 LSL_0373 gpsA tagH FALSE 0.112 134.000 0.000 1.000 N NA
 1254941 1254942 LSL_0373 LSL_0374 tagH   FALSE 0.151 89.000 0.000 1.000 N NA
 1254942 1254943 LSL_0374 LSL_0375     FALSE 0.023 316.000 0.000 NA   NA
 1254943 1254944 LSL_0375 LSL_0376   lacZ FALSE 0.040 235.000 0.000 NA   NA
 1254944 1254945 LSL_0376 LSL_0377 lacZ   FALSE 0.053 204.000 0.000 NA   NA
 1254945 1254946 LSL_0377 LSL_0378     TRUE 0.804 -1797.000 0.000 NA   NA
 1254948 1254949 LSL_0381 LSL_0382 galK galE TRUE 0.877 28.000 0.000 0.002 N NA
 1254949 1254950 LSL_0382 LSL_0383 galE   TRUE 0.991 19.000 0.204 0.002 N NA
 1254950 1254951 LSL_0383 LSL_0383b     TRUE 0.661 32.000 0.000 NA   NA
 1254952 1254953 LSL_0384 LSL_0385     FALSE 0.105 149.000 0.000 NA   NA
 1254953 1254954 LSL_0385 LSL_0386   clpE FALSE 0.577 126.000 0.141 NA   NA
 1254955 1254956 LSL_0387 LSL_0388   ptsH FALSE 0.099 259.000 0.047 NA   NA
 1254956 1254957 LSL_0388 LSL_0389 ptsH ptsI TRUE 0.990 0.000 0.240 0.006 Y NA
 1254957 1254958 LSL_0389 LSL_0390 ptsI rfaG FALSE 0.126 177.000 0.016 1.000 N NA
 1254958 1254959 LSL_0390 LSL_0391 rfaG rfaG TRUE 0.992 3.000 0.413 0.017 Y NA
 1254959 1254960 LSL_0391 LSL_0392 rfaG   TRUE 0.979 5.000 0.336 NA   NA
 1254960 1254961 LSL_0392 LSL_0393     FALSE 0.532 128.000 0.121 NA   NA
 1254961 1254962 LSL_0393 LSL_0394     FALSE 0.527 112.000 0.103 NA   NA
 1254962 1254963 LSL_0394 LSL_RNA021     FALSE 0.021 332.000 0.000 NA   NA
 1254963 1254964 LSL_RNA021 LSL_RNA121     FALSE 0.155 104.000 0.000 NA   NA
 1254964 1254965 LSL_RNA121 LSL_RNA122     TRUE 0.661 32.000 0.000 NA   NA
 1254965 1254966 LSL_RNA122 LSL_RNA025     FALSE 0.139 127.000 0.000 NA   NA
 1254966 1254967 LSL_RNA025 LSL_RNA108     FALSE 0.035 245.000 0.000 NA   NA
 1254967 1254968 LSL_RNA108 LSL_RNA123     TRUE 0.688 6.000 0.000 NA   NA
 1254968 1254969 LSL_RNA123 LSL_RNA030     TRUE 0.761 15.000 0.000 NA   NA
 1254969 1254970 LSL_RNA030 LSL_RNA124     TRUE 0.761 15.000 0.000 NA   NA
 1254970 1254971 LSL_RNA124 LSL_RNA032     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 1254971 1254972 LSL_RNA032 LSL_RNA125     TRUE 0.659 10.000 0.000 NA   NA
 1254972 1254973 LSL_RNA125 LSL_RNA126     TRUE 0.753 26.000 0.000 NA   NA
 1254973 1254974 LSL_RNA126 LSL_RNA035     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1254974 1254975 LSL_RNA035 LSL_RNA036     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1254975 1254976 LSL_RNA036 LSL_RNA037     TRUE 0.675 7.000 0.000 NA   NA
 1254976 1254977 LSL_RNA037 LSL_RNA038     TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1254977 1254978 LSL_RNA038 LSL_RNA039     TRUE 0.659 10.000 0.000 NA   NA
 1254978 1254979 LSL_RNA039 LSL_RNA040     TRUE 0.673 31.000 0.000 NA   NA
 1254979 1254980 LSL_RNA040 LSL_0395   pckA FALSE 0.103 150.000 0.000 NA   NA
 1254980 1254981 LSL_0395 LSL_0396 pckA   FALSE 0.147 104.000 0.000 NA N NA
 1254981 1254982 LSL_0396 LSL_0397     TRUE 0.872 49.000 0.178 NA   NA
 1254982 1254983 LSL_0397 LSL_0398     TRUE 0.704 98.000 0.204 NA   NA
 1254985 1254986 LSL_0400 LSL_0401 pstS pstC TRUE 0.943 11.000 0.121 1.000 Y NA
 1254986 1254987 LSL_0401 LSL_0402 pstC pstA TRUE 0.997 0.000 0.907 0.003 Y NA
 1254987 1254988 LSL_0402 LSL_0403 pstA pstB TRUE 0.993 5.000 0.490 0.003 Y NA
 1254988 1254989 LSL_0403 LSL_0404 pstB pstB TRUE 0.992 10.000 0.542 0.001 Y NA
 1254989 1254990 LSL_0404 LSL_0405 pstB phoU TRUE 0.983 13.000 0.413 NA Y NA
 1254990 1254991 LSL_0405 LSL_0406 phoU fba FALSE 0.132 127.000 0.000 NA N NA
 1254993 1254994 LSL_0408 LSL_0409     TRUE 0.838 19.000 0.000 NA   NA
 1254994 1254995 LSL_0409 LSL_0410     TRUE 0.994 18.000 0.650 NA   NA
 1254997 1254998 LSL_0412 LSL_0413     FALSE 0.141 119.000 0.000 1.000   NA
 1255002 1255003 LSL_0417 LSL_0418     TRUE 0.811 23.000 0.000 NA   NA
 1255005 1255006 LSL_0420 LSL_0421 ccpA   FALSE 0.169 94.000 0.000 NA   NA
 1255006 1255007 LSL_0421 LSL_0422     FALSE 0.263 107.000 0.013 NA   NA
 1255007 1255008 LSL_0422 LSL_0423   rbsK FALSE 0.147 124.000 0.000 NA   NA
 1255008 1255009 LSL_0423 LSL_0424 rbsK   FALSE 0.143 104.000 0.000 1.000   NA
 1255009 1255010 LSL_0424 LSL_0425     TRUE 0.992 -64.000 0.639 1.000   NA
 1255010 1255011 LSL_0425 LSL_0426     TRUE 0.995 0.000 0.861 NA Y NA
 1255011 1255012 LSL_0426 LSL_0427     TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 1255012 1255013 LSL_0427 LSL_0428     TRUE 0.804 -19.000 0.000 NA   NA
 1255013 1255014 LSL_0428 LSL_0429     TRUE 0.804 -34.000 0.000 NA   NA
 1255014 1255015 LSL_0429 LSL_0430     TRUE 0.633 34.000 0.000 NA   NA
 1255015 1255016 LSL_0430 LSL_0431     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255016 1255017 LSL_0431 LSL_0432     FALSE 0.205 75.000 0.000 NA   NA
 1255019 1255020 LSL_0433 LSL_0434     TRUE 0.615 99.000 0.143 1.000   NA
 1255020 1255021 LSL_0434 LSL_0435     FALSE 0.498 78.000 0.063 NA   NA
 1255021 1255022 LSL_0435 LSL_0436   nagD TRUE 0.972 11.000 0.320 NA   NA
 1255022 1255023 LSL_0436 LSL_0437 nagD   TRUE 0.985 0.000 0.330 NA   NA
 1255024 1255025 LSL_0438 LSL_0439 dedA trxB FALSE 0.525 61.000 0.024 NA   NA
 1255026 1255027 LSL_0440 LSL_RNA041     FALSE 0.019 357.000 0.000 NA   NA
 1255027 1255028 LSL_RNA041 LSL_RNA042     TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1255028 1255029 LSL_RNA042 LSL_RNA044     FALSE 0.035 245.000 0.000 NA   NA
 1255029 1255030 LSL_RNA044 LSL_RNA045     TRUE 0.688 6.000 0.000 NA   NA
 1255030 1255031 LSL_RNA045 LSL_RNA046     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1255031 1255032 LSL_RNA046 LSL_RNA047     FALSE 0.279 66.000 0.000 NA   NA
 1255032 1255033 LSL_RNA047 LSL_RNA048     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1255033 1255034 LSL_RNA048 LSL_RNA049     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1255034 1255035 LSL_RNA049 LSL_RNA050     TRUE 0.665 9.000 0.000 NA   NA
 1255035 1255036 LSL_RNA050 LSL_RNA051     TRUE 0.675 7.000 0.000 NA   NA
 1255036 1255037 LSL_RNA051 LSL_RNA052     TRUE 0.777 25.000 0.000 NA   NA
 1255037 1255038 LSL_RNA052 LSL_RNA053     TRUE 0.820 17.000 0.000 NA   NA
 1255038 1255039 LSL_RNA053 LSL_RNA054     FALSE 0.500 41.000 0.000 NA   NA
 1255039 1255040 LSL_RNA054 LSL_RNA055     TRUE 0.657 11.000 0.000 NA   NA
 1255040 1255041 LSL_RNA055 LSL_RNA056     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1255041 1255042 LSL_RNA056 LSL_RNA057     TRUE 0.659 10.000 0.000 NA   NA
 1255042 1255043 LSL_RNA057 LSL_RNA058     TRUE 0.840 20.000 0.000 NA   NA
 1255043 1255044 LSL_RNA058 LSL_RNA059     TRUE 0.665 9.000 0.000 NA   NA
 1255044 1255045 LSL_RNA059 LSL_RNA060     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1255045 1255046 LSL_RNA060 LSL_RNA061     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1255046 1255047 LSL_RNA061 LSL_RNA062     TRUE 0.811 23.000 0.000 NA   NA
 1255047 1255048 LSL_RNA062 LSL_RNA063     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1255048 1255049 LSL_RNA063 LSL_0441   metK FALSE 0.054 202.000 0.000 NA   NA
 1255049 1255050 LSL_0441 LSL_0442 metK leuS FALSE 0.018 331.000 0.000 1.000 N NA
 1255050 1255051 LSL_0442 LSL_0443 leuS   FALSE 0.033 240.000 0.000 1.000 N NA
 1255051 1255052 LSL_0443 LSL_0444     FALSE 0.260 120.000 0.000 0.065   NA
 1255052 1255053 LSL_0444 LSL_0445   rsuA TRUE 0.947 5.000 0.128 1.000   NA
 1255056 1255057 LSL_RNA064 LSL_0448     FALSE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 1255058 1255059 LSL_0449 LSL_0450 fabA   FALSE 0.530 77.000 0.078 1.000 N NA
 1255059 1255060 LSL_0450 LSL_0451   fabH TRUE 0.951 17.000 0.070 1.000 N NA
 1255060 1255061 LSL_0451 LSL_0452 fabH acpP TRUE 0.977 20.000 0.065 0.007   NA
 1255061 1255062 LSL_0452 LSL_0453 acpP fabD TRUE 0.815 14.000 0.010 1.000   NA
 1255062 1255063 LSL_0453 LSL_0454 fabD fabG TRUE 0.989 1.000 0.432 1.000 Y NA
 1255063 1255064 LSL_0454 LSL_0455 fabG fabB TRUE 0.909 13.000 0.056 1.000 Y NA
 1255064 1255065 LSL_0455 LSL_0456 fabB accB TRUE 0.944 3.000 0.074 1.000 Y NA
 1255065 1255066 LSL_0456 LSL_0457 accB fabA TRUE 0.927 5.000 0.009 0.007 Y NA
 1255066 1255067 LSL_0457 LSL_0458 fabA accC TRUE 0.958 25.000 0.085 1.000 Y NA
 1255067 1255068 LSL_0458 LSL_0459 accC accD TRUE 0.982 -13.000 0.090 0.002 Y NA
 1255068 1255069 LSL_0459 LSL_0460 accD accA TRUE 0.990 1.000 0.234 0.002 Y NA
 1255069 1255070 LSL_0460 LSL_0461 accA fabI TRUE 0.916 16.000 0.015 1.000 Y NA
 1255070 1255071 LSL_0461 LSL_0462 fabI zwf FALSE 0.094 147.000 0.000 1.000 N NA
 1255071 1255072 LSL_0462 LSL_0463 zwf   FALSE 0.059 193.000 0.000 NA   NA
 1255076 1255077 LSL_0467 LSL_0468     TRUE 0.736 26.000 0.000 1.000   NA
 1255077 1255078 LSL_0468 LSL_0469     TRUE 0.780 117.000 0.372 1.000   NA
 1255080 1255081 LSL_0471 LSL_0472   mrcA FALSE 0.162 80.000 0.000 1.000 N NA
 1255081 1255082 LSL_0472 LSL_0473 mrcA   TRUE 0.887 46.000 0.168 NA   NA
 1255082 1255083 LSL_0473 LSL_0474     FALSE 0.294 93.000 0.015 NA   NA
 1255084 1255085 LSL_0475 LSL_0476 surA   FALSE 0.152 120.000 0.000 NA   NA
 1255085 1255086 LSL_0476 LSL_0477     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1255087 1255088 LSL_0478 LSL_0479     TRUE 0.968 -7.000 0.135 NA N NA
 1255088 1255089 LSL_0479 LSL_0480     FALSE 0.591 63.000 0.049 NA N NA
 1255089 1255090 LSL_0480 LSL_0481     TRUE 0.693 76.000 0.154 NA   NA
 1255092 1255093 LSL_0483 LSL_0484 trxA   TRUE 0.714 27.000 0.000 1.000   NA
 1255093 1255094 LSL_0484 LSL_0484b     FALSE 0.169 94.000 0.000 NA   NA
 1255094 1255095 LSL_0484b LSL_0485   murC FALSE 0.197 76.000 0.000 NA   NA
 1255095 1255096 LSL_0485 LSL_0486 murC maoC FALSE 0.194 109.000 0.002 1.000 N NA
 1255096 1255097 LSL_0486 LSL_0487 maoC   TRUE 0.824 22.000 0.000 NA   NA
 1255097 1255098 LSL_0487 LSL_0488   polA FALSE 0.150 121.000 0.000 NA   NA
 1255098 1255099 LSL_0488 LSL_0489 polA nei TRUE 0.938 13.000 0.101 1.000 Y NA
 1255099 1255100 LSL_0489 LSL_0490 nei coaE TRUE 0.939 -3.000 0.066 1.000 N NA
 1255100 1255101 LSL_0490 LSL_0491 coaE   TRUE 0.889 15.000 0.024 NA N NA
 1255101 1255102 LSL_0491 LSL_0492   dnaB TRUE 0.923 10.000 0.109 NA N NA
 1255102 1255103 LSL_0492 LSL_0493 dnaB dnaI TRUE 0.990 10.000 0.817 NA Y NA
 1255103 1255104 LSL_0493 LSL_0494 dnaI thrS FALSE 0.021 308.000 0.000 1.000 N NA
 1255104 1255105 LSL_0494 LSL_0495 thrS infC FALSE 0.071 208.000 0.000 1.000 Y NA
 1255105 1255106 LSL_0495 LSL_0496 infC rpmI TRUE 0.982 37.000 0.652 1.000 Y NA
 1255106 1255107 LSL_0496 LSL_0497 rpmI rplT TRUE 0.950 93.000 0.928 0.024 Y NA
 1255109 1255110 LSL_0499 LSL_0500     TRUE 0.888 -13.000 0.015 1.000   NA
 1255110 1255111 LSL_0500 LSL_0501     TRUE 0.902 13.000 0.068 NA   NA
 1255111 1255112 LSL_0501 LSL_0502   nadD TRUE 0.978 19.000 0.150 NA N NA
 1255112 1255113 LSL_0502 LSL_0503 nadD   TRUE 0.982 -7.000 0.199 1.000 Y NA
 1255113 1255114 LSL_0503 LSL_0504     TRUE 0.974 23.000 0.149 NA   NA
 1255114 1255115 LSL_0504 LSL_0504b     TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 1255115 1255116 LSL_0504b LSL_0505     TRUE 0.803 16.000 0.000 NA   NA
 1255116 1255117 LSL_0505 LSL_0506     FALSE 0.526 77.000 0.070 NA   NA
 1255117 1255118 LSL_0506 LSL_0507   rpmF TRUE 0.869 83.000 0.599 NA   NA
 1255120 1255121 LSL_0509 LSL_0510     TRUE 0.980 -16.000 0.209 1.000   NA
 1255121 1255122 LSL_0510 LSL_0511   rpsB FALSE 0.123 164.000 0.005 1.000 N NA
 1255122 1255123 LSL_0511 LSL_0512 rpsB tsf TRUE 0.901 94.000 0.748 1.000 Y NA
 1255123 1255124 LSL_0512 LSL_0513 tsf   FALSE 0.027 288.000 0.000 NA   NA
 1255126 1255127 LSL_0515 LSL_0516 purE purK TRUE 0.967 -7.000 0.024 0.001 Y NA
 1255127 1255128 LSL_0516 LSL_0517 purK purB TRUE 0.808 12.000 0.005 1.000 Y NA
 1255128 1255129 LSL_0517 LSL_0518 purB   FALSE 0.134 114.000 0.000 1.000 N NA
 1255129 1255130 LSL_0518 LSL_0519     FALSE 0.019 354.000 0.000 NA   NA
 1255130 1255131 LSL_0519 LSL_0520     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1255131 1255132 LSL_0520 LSL_0521     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1255134 1255135 LSL_0522 LSL_0523   csrS TRUE 0.995 20.000 0.438 0.064 Y NA
 1255136 1255137 LSL_0524 LSL_0525 yidC acyP FALSE 0.134 108.000 0.000 1.000 N NA
 1255138 1255139 LSL_0526 LSL_0527     FALSE 0.153 111.000 0.000 NA   NA
 1255139 1255140 LSL_0527 LSL_0528     TRUE 0.992 2.000 0.786 NA   NA
 1255140 1255141 LSL_0528 LSL_0529     TRUE 0.979 31.000 0.417 NA   NA
 1255141 1255142 LSL_0529 LSL_0530   efp FALSE 0.128 134.000 0.000 NA   NA
 1255142 1255143 LSL_0530 LSL_0531 efp   TRUE 0.930 17.000 0.031 NA   NA
 1255143 1255144 LSL_0531 LSL_0532   nusB TRUE 0.981 0.000 0.265 NA   NA
 1255144 1255145 LSL_0532 LSL_0533 nusB folD FALSE 0.379 145.000 0.082 1.000 N NA
 1255145 1255146 LSL_0533 LSL_0534 folD xseA TRUE 0.927 -7.000 0.045 1.000 N NA
 1255146 1255147 LSL_0534 LSL_0535 xseA xseB TRUE 0.994 0.000 0.412 0.002 Y NA
 1255147 1255148 LSL_0535 LSL_0536 xseB ispA TRUE 0.958 -10.000 0.100 1.000 N NA
 1255148 1255149 LSL_0536 LSL_0537 ispA   TRUE 0.913 3.000 0.058 1.000 N NA
 1255149 1255150 LSL_0537 LSL_0538   argR TRUE 0.920 25.000 0.048 1.000 N NA
 1255150 1255151 LSL_0538 LSL_0539 argR recN TRUE 0.876 5.000 0.037 1.000 N NA
 1255153 1255154 LSL_0541 LSL_0542     FALSE 0.581 127.000 0.145 NA   NA
 1255154 1255155 LSL_0542 LSL_0543     FALSE 0.261 83.000 0.007 1.000   NA
 1255155 1255156 LSL_0543 LSL_0544     TRUE 0.903 18.000 0.011 NA   NA
 1255156 1255157 LSL_0544 LSL_0545     FALSE 0.168 95.000 0.000 NA   NA
 1255157 1255158 LSL_0545 LSL_0546     FALSE 0.287 64.000 0.000 NA   NA
 1255158 1255159 LSL_0546 LSL_0547     FALSE 0.053 204.000 0.000 NA   NA
 1255159 1255160 LSL_0547 LSL_0548   rpmG FALSE 0.106 148.000 0.000 NA   NA
 1255160 1255161 LSL_0548 LSL_0549 rpmG   TRUE 0.618 55.000 0.045 1.000 N NA
 1255161 1255162 LSL_0549 LSL_0550     TRUE 0.880 14.000 0.037 1.000   NA
 1255162 1255163 LSL_0550 LSL_0551     TRUE 0.955 40.000 0.347 NA   NA
 1255163 1255164 LSL_0551 LSL_0552     TRUE 0.990 -3.000 0.496 NA   NA
 1255164 1255165 LSL_0552 LSL_0553     TRUE 0.797 43.000 0.064 NA N NA
 1255167 1255168 LSL_0555 LSL_0556 miaA   TRUE 0.950 22.000 0.065 1.000 N NA
 1255168 1255169 LSL_0556 LSL_0557   glnR FALSE 0.396 91.000 0.046 1.000 N NA
 1255169 1255170 LSL_0557 LSL_0558 glnR glnA TRUE 0.919 30.000 0.090 1.000 N NA
 1255170 1255171 LSL_0558 LSL_0559 glnA ada FALSE 0.013 413.000 0.000 1.000 N NA
 1255171 1255172 LSL_0559 LSL_0560 ada   FALSE 0.173 87.000 0.000 NA   NA
 1255172 1255173 LSL_0560 LSL_0561   pyrH FALSE 0.153 113.000 0.000 NA   NA
 1255173 1255174 LSL_0561 LSL_0562 pyrH frr TRUE 0.988 3.000 0.626 1.000 N NA
 1255174 1255175 LSL_0562 LSL_0563 frr uppS TRUE 0.752 135.000 0.409 1.000 N NA
 1255175 1255176 LSL_0563 LSL_0564 uppS cdsA TRUE 0.959 3.000 0.113 1.000 Y NA
 1255176 1255177 LSL_0564 LSL_0565 cdsA   TRUE 0.914 25.000 0.040 1.000 N NA
 1255177 1255178 LSL_0565 LSL_0566   proS TRUE 0.761 51.000 0.095 1.000 N NA
 1255178 1255179 LSL_0566 LSL_0567 proS dnaE FALSE 0.587 97.000 0.070 0.048 N NA
 1255179 1255180 LSL_0567 LSL_0568 dnaE   FALSE 0.177 209.000 0.059 NA   NA
 1255180 1255181 LSL_0568 LSL_0569   nusA TRUE 0.992 26.000 0.759 NA   NA
 1255181 1255182 LSL_0569 LSL_0570 nusA   TRUE 0.984 3.000 0.323 NA Y NA
 1255182 1255183 LSL_0570 LSL_0571   rPL TRUE 0.989 -10.000 0.408 NA N NA
 1255183 1255184 LSL_0571 LSL_0572 rPL infB TRUE 0.829 72.000 0.223 NA Y NA
 1255184 1255185 LSL_0572 LSL_0573 infB rbfA TRUE 0.992 24.000 0.530 1.000 Y NA
 1255185 1255186 LSL_0573 LSL_0574 rbfA truB TRUE 0.725 70.000 0.111 1.000 Y NA
 1255186 1255187 LSL_0574 LSL_0575 truB ribF TRUE 0.971 13.000 0.308 1.000 N NA
 1255187 1255188 LSL_0575 LSL_0576 ribF hrcA FALSE 0.225 121.000 0.009 1.000 N NA
 1255188 1255189 LSL_0576 LSL_0577 hrcA grpE TRUE 0.928 -3.000 0.051 1.000 N NA
 1255189 1255190 LSL_0577 LSL_0578 grpE dnaK TRUE 0.893 39.000 0.026 0.005 Y NA
 1255190 1255191 LSL_0578 LSL_0579 dnaK dnaJ TRUE 0.776 141.000 0.196 0.002 Y NA
 1255191 1255192 LSL_0579 LSL_0580 dnaJ lepA FALSE 0.174 145.000 0.009 1.000 N NA
 1255192 1255193 LSL_0580 LSL_RNA066 lepA   FALSE 0.078 170.000 0.000 NA   NA
 1255193 1255194 LSL_RNA066 LSL_0581   glnP FALSE 0.017 377.000 0.000 NA   NA
 1255194 1255195 LSL_0581 LSL_0582 glnP glnQ TRUE 0.951 0.000 0.070 1.000 Y NA
 1255198 1255199 LSL_0585 LSL_0586     FALSE 0.259 117.000 0.000 0.076   NA
 1255199 1255200 LSL_0586 LSL_0587     FALSE 0.143 105.000 0.000 1.000   NA
 1255200 1255201 LSL_0587 LSL_0588   murE TRUE 0.991 3.000 0.796 1.000   NA
 1255202 1255203 LSL_0589 LSL_0590 tdk prfA TRUE 0.939 -7.000 0.062 1.000 N NA
 1255203 1255204 LSL_0590 LSL_0591 prfA   TRUE 0.976 -7.000 0.084 0.048 Y NA
 1255204 1255205 LSL_0591 LSL_0592     TRUE 0.986 18.000 0.204 NA Y NA
 1255205 1255206 LSL_0592 LSL_0593   upp FALSE 0.298 94.000 0.017 NA N NA
 1255206 1255207 LSL_0593 LSL_0594 upp atpB FALSE 0.062 231.000 0.007 1.000 N NA
 1255207 1255208 LSL_0594 LSL_0595 atpB atpE TRUE 0.990 19.000 0.189 0.005   NA
 1255208 1255209 LSL_0595 LSL_0596 atpE atpF TRUE 0.954 53.000 0.402 0.005   NA
 1255209 1255210 LSL_0596 LSL_0597 atpF atpH TRUE 0.991 -13.000 0.222 0.005 Y NA
 1255210 1255211 LSL_0597 LSL_0598 atpH atpA TRUE 0.998 21.000 0.864 0.005 Y NA
 1255211 1255212 LSL_0598 LSL_0599 atpA atpG TRUE 0.998 20.000 0.846 0.005 Y NA
 1255212 1255213 LSL_0599 LSL_0600 atpG atpD TRUE 0.996 25.000 0.724 0.005 Y NA
 1255213 1255214 LSL_0600 LSL_0601 atpD atpC TRUE 0.997 15.000 0.837 0.005 Y NA
 1255214 1255215 LSL_0601 LSL_0602 atpC   FALSE 0.313 137.000 0.039 NA   NA
 1255215 1255216 LSL_0602 LSL_0603   murA TRUE 0.988 20.000 0.279 NA   NA
 1255216 1255217 LSL_0603 LSL_0604 murA mreB FALSE 0.412 158.000 0.126 1.000 N NA
 1255217 1255218 LSL_0604 LSL_0605 mreB   TRUE 0.890 -25.000 0.013 NA   NA
 1255218 1255219 LSL_0605 LSL_0606     TRUE 0.813 12.000 0.018 NA   NA
 1255219 1255220 LSL_0606 LSL_0607   ftsW TRUE 0.811 72.000 0.243 NA   NA
 1255220 1255221 LSL_0607 LSL_0608 ftsW arsC TRUE 0.749 25.000 0.000 1.000 N NA
 1255223 1255224 LSL_0610 LSL_0611   gmk FALSE 0.149 122.000 0.000 NA   NA
 1255224 1255225 LSL_0611 LSL_0612 gmk   TRUE 0.986 2.000 0.471 1.000 N NA
 1255225 1255226 LSL_0612 LSL_0613     FALSE 0.565 145.000 0.192 1.000 N NA
 1255226 1255227 LSL_0613 LSL_0613b     TRUE 0.786 49.000 0.099 1.000 N NA
 1255227 1255228 LSL_0613b LSL_0614   fmt TRUE 0.944 18.000 0.052 1.000 N NA
 1255228 1255229 LSL_0614 LSL_0615 fmt   TRUE 0.988 -10.000 0.305 1.000 Y NA
 1255229 1255230 LSL_0615 LSL_0616     TRUE 0.903 13.000 0.074 1.000 N NA
 1255230 1255231 LSL_0616 LSL_0616b     TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1255231 1255232 LSL_0616b LSL_0617     FALSE 0.239 71.000 0.000 NA   NA
 1255232 1255233 LSL_0617 LSL_0618     TRUE 0.773 -3.000 0.000 1.000   NA
 1255235 1255236 LSL_0620 LSL_0621     TRUE 0.964 43.000 0.567 NA   NA
 1255236 1255237 LSL_0621 LSL_0622   recG FALSE 0.510 81.000 0.074 1.000   NA
 1255237 1255238 LSL_0622 LSL_0623 recG plsX TRUE 0.846 13.000 0.033 1.000 N NA
 1255238 1255239 LSL_0623 LSL_0624 plsX acpP TRUE 0.622 77.000 0.029 0.007 Y NA
 1255239 1255240 LSL_0624 LSL_0625 acpP rnc FALSE 0.147 154.000 0.009 1.000 N NA
 1255240 1255241 LSL_0625 LSL_0626 rnc smc TRUE 0.955 15.000 0.120 1.000 N NA
 1255241 1255242 LSL_0626 LSL_0627 smc ftsY TRUE 0.968 12.000 0.165 0.014 N NA
 1255242 1255243 LSL_0627 LSL_0628 ftsY   TRUE 0.963 19.000 0.081 1.000   NA
 1255243 1255244 LSL_0628 LSL_0629   ffh TRUE 0.947 7.000 0.151 1.000   NA
 1255244 1255245 LSL_0629 LSL_0630 ffh rpsP TRUE 0.792 95.000 0.361 1.000 N NA
 1255245 1255246 LSL_0630 LSL_0631 rpsP   TRUE 0.975 10.000 0.385 1.000   NA
 1255246 1255247 LSL_0631 LSL_0632   rimM TRUE 0.790 85.000 0.324 1.000   NA
 1255247 1255248 LSL_0632 LSL_0633 rimM trmD TRUE 0.991 3.000 0.672 1.000 Y NA
 1255248 1255249 LSL_0633 LSL_0634 trmD   TRUE 0.778 -13.000 0.000 1.000 N NA
 1255249 1255250 LSL_0634 LSL_0635     TRUE 0.761 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1255250 1255251 LSL_0635 LSL_0636   rplS FALSE 0.205 117.000 0.004 1.000 N NA
 1255253 1255254 LSL_0638 LSL_0639 rpsO dapA FALSE 0.104 140.000 0.000 1.000 N NA
 1255254 1255255 LSL_0639 LSL_0640 dapA   TRUE 0.937 19.000 0.035 1.000   NA
 1255255 1255256 LSL_0640 LSL_0641     TRUE 0.857 52.000 0.182 NA   NA
 1255256 1255257 LSL_0641 LSL_0642   tufB FALSE 0.033 348.000 0.006 NA   NA
 1255257 1255258 LSL_0642 LSL_0643 tufB tig FALSE 0.091 200.000 0.011 1.000 N NA
 1255258 1255259 LSL_0643 LSL_0644 tig clpX FALSE 0.281 215.000 0.033 0.002 Y NA
 1255259 1255260 LSL_0644 LSL_0645 clpX gnd FALSE 0.134 109.000 0.000 1.000 N NA
 1255261 1255262 LSL_0646 LSL_0647     TRUE 0.986 5.000 0.576 NA   NA
 1255265 1255266 LSL_0650 LSL_0651     TRUE 0.888 11.000 0.060 NA   NA
 1255266 1255267 LSL_0651 LSL_0652     TRUE 0.974 10.000 0.337 NA   NA
 1255267 1255268 LSL_0652 LSL_0653   typA FALSE 0.270 127.000 0.024 1.000 N NA
 1255268 1255269 LSL_0653 LSL_0654 typA manX FALSE 0.014 403.000 0.000 1.000 N NA
 1255269 1255270 LSL_0654 LSL_0655 manX   TRUE 0.998 21.000 0.943 0.014 Y NA
 1255270 1255271 LSL_0655 LSL_0656     TRUE 0.998 21.000 0.812 0.014 Y NA
 1255271 1255272 LSL_0656 LSL_0657   ftsW FALSE 0.048 299.000 0.000 0.062 N NA
 1255272 1255273 LSL_0657 LSL_0658 ftsW pycA TRUE 0.852 31.000 0.035 1.000 N NA
 1255273 1255274 LSL_0658 LSL_0659 pycA   FALSE 0.165 160.000 0.014 NA   NA
 1255274 1255275 LSL_0659 LSL_0660     TRUE 0.872 11.000 0.048 NA   NA
 1255275 1255276 LSL_0660 LSL_0661   coaD TRUE 0.982 3.000 0.367 1.000 N NA
 1255276 1255277 LSL_0661 LSL_0662 coaD lon TRUE 0.929 -3.000 0.052 1.000 N NA
 1255277 1255278 LSL_0662 LSL_0663 lon purC FALSE 0.020 313.000 0.000 1.000 N NA
 1255278 1255279 LSL_0663 LSL_0664 purC purS TRUE 0.993 19.000 0.460 1.000 Y NA
 1255279 1255280 LSL_0664 LSL_0665 purS purQ TRUE 0.996 0.000 0.656 0.002 Y NA
 1255280 1255281 LSL_0665 LSL_0666 purQ purL TRUE 0.992 2.000 0.346 0.002 Y NA
 1255281 1255282 LSL_0666 LSL_0667 purL purF TRUE 0.984 -24.000 0.223 1.000 Y NA
 1255282 1255283 LSL_0667 LSL_0668 purF purM TRUE 0.982 1.000 0.248 1.000 Y NA
 1255283 1255284 LSL_0668 LSL_0669 purM purN TRUE 0.984 13.000 0.238 0.003 Y NA
 1255284 1255285 LSL_0669 LSL_0670 purN purH TRUE 0.968 12.000 0.225 1.000 Y NA
 1255285 1255286 LSL_0670 LSL_0671 purH purD TRUE 0.987 17.000 0.238 1.000 Y NA
 1255286 1255287 LSL_0671 LSL_0672 purD   FALSE 0.067 174.000 0.000 1.000   NA
 1255290 1255291 LSL_RNA067 LSL_0675     FALSE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 1255291 1255292 LSL_0675 LSL_0676     FALSE 0.259 68.000 0.000 NA   NA
 1255293 1255294 LSL_0677 LSL_0678 argS comEA FALSE 0.134 112.000 0.000 1.000 N NA
 1255294 1255295 LSL_0678 LSL_0679 comEA comEB TRUE 0.826 44.000 0.095 1.000 N NA
 1255295 1255296 LSL_0679 LSL_0680 comEB   TRUE 0.883 13.000 0.055 1.000   NA
 1255296 1255297 LSL_0680 LSL_0681   holA TRUE 0.947 10.000 0.163 1.000   NA
 1255298 1255299 LSL_0682 LSL_0683     TRUE 0.915 16.000 0.000 0.004 N NA
 1255299 1255300 LSL_0683 LSL_0684     TRUE 0.992 25.000 0.312 0.004 Y NA
 1255300 1255301 LSL_0684 LSL_0685   eRG TRUE 0.986 13.000 0.281 0.004 Y NA
 1255302 1255303 LSL_0686 LSL_0687 dinG   TRUE 0.733 124.000 0.296 1.000   NA
 1255303 1255304 LSL_0687 LSL_0688     TRUE 0.982 18.000 0.205 1.000   NA
 1255304 1255305 LSL_0688 LSL_0689   asnS TRUE 0.894 13.000 0.068 1.000 N NA
 1255305 1255306 LSL_0689 LSL_0690 asnS   TRUE 0.704 108.000 0.234 NA N NA
 1255306 1255307 LSL_0690 LSL_0691   nth TRUE 0.953 15.000 0.075 NA Y NA
 1255307 1255308 LSL_0691 LSL_0692 nth msrA FALSE 0.298 56.000 0.000 1.000 N NA
 1255308 1255309 LSL_0692 LSL_0693 msrA   TRUE 0.943 24.000 0.062 NA   NA
 1255309 1255310 LSL_0693 LSL_0694     FALSE 0.239 71.000 0.000 NA   NA
 1255310 1255311 LSL_0694 LSL_0695   rfaG TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255311 1255312 LSL_0695 LSL_0696 rfaG rfaG TRUE 0.803 -13.000 0.000 NA   NA
 1255312 1255313 LSL_0696 LSL_0697 rfaG   TRUE 0.803 16.000 0.000 NA   NA
 1255313 1255314 LSL_0697 LSL_0698     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 1255316 1255317 LSL_0700 LSL_0701 rpsU   TRUE 0.986 19.000 0.150 0.037   NA
 1255317 1255318 LSL_0701 LSL_0702     FALSE 0.160 102.000 0.000 NA   NA
 1255319 1255320 LSL_0703 LSL_0704     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1255321 1255322 LSL_0705 LSL_0706 dapB pcnB TRUE 0.873 -3.000 0.015 1.000 N NA
 1255322 1255323 LSL_0706 LSL_0707 pcnB   TRUE 0.933 -3.000 0.056 1.000   NA
 1255323 1255324 LSL_0707 LSL_0708   thyA TRUE 0.934 18.000 0.036 1.000   NA
 1255324 1255325 LSL_0708 LSL_0709 thyA folA TRUE 0.987 18.000 0.295 1.000 N NA
 1255325 1255326 LSL_0709 LSL_0710 folA   FALSE 0.065 177.000 0.000 1.000   NA
 1255326 1255327 LSL_0710 LSL_0711     TRUE 0.951 2.000 0.111 1.000   NA
 1255327 1255328 LSL_0711 LSL_0712     TRUE 0.709 4.000 0.000 1.000   NA
 1255330 1255331 LSL_0714 LSL_0715     TRUE 0.991 5.000 0.828 NA   NA
 1255331 1255332 LSL_0715 LSL_0716     TRUE 0.939 12.000 0.136 NA   NA
 1255332 1255333 LSL_0716 LSL_0717     FALSE 0.521 59.000 0.021 NA   NA
 1255333 1255334 LSL_0717 LSL_0718   rnhB TRUE 0.941 10.000 0.148 1.000   NA
 1255334 1255335 LSL_0718 LSL_0719 rnhB   FALSE 0.609 65.000 0.037 1.000 Y NA
 1255335 1255336 LSL_0719 LSL_0720   topA FALSE 0.517 188.000 0.238 1.000 Y NA
 1255336 1255337 LSL_0720 LSL_0721 topA   TRUE 0.970 23.000 0.137 1.000 N NA
 1255337 1255338 LSL_0721 LSL_0722     FALSE 0.131 122.000 0.000 1.000 N NA
 1255340 1255341 LSL_0724 LSL_0725     TRUE 0.996 20.000 0.821 NA N NA
 1255341 1255342 LSL_0725 LSL_0726   gpmB FALSE 0.086 159.000 0.000 NA N NA
 1255342 1255343 LSL_0726 LSL_0727 gpmB   TRUE 0.976 16.000 0.183 1.000 N NA
 1255343 1255344 LSL_0727 LSL_0728   recD TRUE 0.984 -7.000 0.281 1.000 N NA
 1255345 1255346 LSL_0729 LSL_0730 xerC   TRUE 0.838 19.000 0.000 NA   NA
 1255346 1255347 LSL_0730 LSL_0731     FALSE 0.113 144.000 0.000 NA   NA
 1255347 1255348 LSL_0731 LSL_0732     FALSE 0.010 948.000 0.000 NA   NA
 1255349 1255350 LSL_0733 LSL_0734     FALSE 0.023 319.000 0.000 NA   NA
 1255351 1255352 LSL_0735 LSL_0736     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1255352 1255353 LSL_0736 LSL_0737     FALSE 0.182 81.000 0.000 NA   NA
 1255353 1255354 LSL_0737 LSL_0738     FALSE 0.128 134.000 0.000 NA   NA
 1255354 1255355 LSL_0738 LSL_0739     TRUE 0.716 28.000 0.000 NA   NA
 1255355 1255356 LSL_0739 LSL_0740     TRUE 0.835 21.000 0.000 NA   NA
 1255356 1255357 LSL_0740 LSL_0741     TRUE 0.648 33.000 0.000 NA   NA
 1255357 1255358 LSL_0741 LSL_0742     FALSE 0.113 137.000 0.000 1.000   NA
 1255359 1255360 LSL_0743 LSL_0744     TRUE 0.804 -21.000 0.000 NA   NA
 1255360 1255361 LSL_0744 LSL_0745     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1255361 1255362 LSL_0745 LSL_0746     TRUE 0.803 16.000 0.000 NA   NA
 1255362 1255363 LSL_0746 LSL_0747     FALSE 0.170 91.000 0.000 NA   NA
 1255363 1255364 LSL_0747 LSL_0748     TRUE 0.804 -25.000 0.000 NA   NA
 1255364 1255365 LSL_0748 LSL_0749     FALSE 0.153 107.000 0.000 NA   NA
 1255365 1255366 LSL_0749 LSL_0750     FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 1255366 1255367 LSL_0750 LSL_0751     TRUE 0.803 -13.000 0.000 NA   NA
 1255367 1255368 LSL_0751 LSL_0752     FALSE 0.212 74.000 0.000 NA   NA
 1255368 1255369 LSL_0752 LSL_0753     TRUE 0.804 -28.000 0.000 NA   NA
 1255369 1255370 LSL_0753 LSL_0754     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255370 1255371 LSL_0754 LSL_0755     TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1255371 1255372 LSL_0755 LSL_0756     FALSE 0.373 51.000 0.000 NA   NA
 1255372 1255373 LSL_0756 LSL_0757     TRUE 0.993 21.000 0.500 NA   NA
 1255373 1255374 LSL_0757 LSL_0758     FALSE 0.245 181.000 0.070 NA   NA
 1255374 1255375 LSL_0758 LSL_0759     TRUE 0.761 1.000 0.000 NA   NA
 1255375 1255376 LSL_0759 LSL_0760     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1255376 1255377 LSL_0760 LSL_0761     TRUE 0.803 16.000 0.000 NA   NA
 1255377 1255378 LSL_0761 LSL_0762     TRUE 0.840 20.000 0.000 NA   NA
 1255378 1255379 LSL_0762 LSL_RNA127     FALSE 0.561 38.000 0.000 NA   NA
 1255379 1255380 LSL_RNA127 LSL_0763     FALSE 0.521 40.000 0.000 NA   NA
 1255380 1255381 LSL_0763 LSL_0764     TRUE 0.988 -31.000 0.375 NA   NA
 1255381 1255382 LSL_0764 LSL_0765   xerC TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 1255382 1255383 LSL_0765 LSL_0766 xerC   TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255383 1255384 LSL_0766 LSL_0767     TRUE 0.811 23.000 0.000 NA   NA
 1255384 1255385 LSL_0767 LSL_0768     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1255385 1255386 LSL_0768 LSL_0769     TRUE 0.820 17.000 0.000 NA   NA
 1255386 1255387 LSL_0769 LSL_0770     FALSE 0.162 101.000 0.000 NA   NA
 1255387 1255388 LSL_0770 LSL_0771     FALSE 0.561 38.000 0.000 NA   NA
 1255388 1255389 LSL_0771 LSL_0772     TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 1255389 1255390 LSL_0772 LSL_0773     TRUE 0.659 10.000 0.000 NA   NA
 1255390 1255391 LSL_0773 LSL_0774     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1255391 1255392 LSL_0774 LSL_0775     FALSE 0.013 461.000 0.000 NA   NA
 1255392 1255393 LSL_0775 LSL_0776     TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1255393 1255394 LSL_0776 LSL_0777     FALSE 0.283 65.000 0.000 NA   NA
 1255394 1255395 LSL_0777 LSL_0778     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1255395 1255396 LSL_0778 LSL_0779     FALSE 0.011 637.000 0.000 NA   NA
 1255396 1255397 LSL_0779 LSL_0780     FALSE 0.031 259.000 0.000 NA   NA
 1255397 1255398 LSL_0780 LSL_0781   mcrA TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 1255398 1255399 LSL_0781 LSL_0782 mcrA   TRUE 0.761 125.000 0.333 NA   NA
 1255399 1255400 LSL_0782 LSL_0783     TRUE 0.984 -10.000 0.267 NA   NA
 1255400 1255401 LSL_0783 LSL_0784     TRUE 0.986 13.000 0.692 NA   NA
 1255401 1255402 LSL_0784 LSL_0785   clpP TRUE 0.995 -64.000 0.846 NA   NA
 1255402 1255403 LSL_0785 LSL_0786 clpP   TRUE 0.994 -3.000 0.846 NA   NA
 1255403 1255404 LSL_0786 LSL_0787     FALSE 0.060 192.000 0.000 NA   NA
 1255404 1255405 LSL_0787 LSL_0788     TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 1255405 1255406 LSL_0788 LSL_0789     TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1255406 1255407 LSL_0789 LSL_0790     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255407 1255408 LSL_0790 LSL_0791     TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1255408 1255409 LSL_0791 LSL_0792     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255409 1255410 LSL_0792 LSL_0793     FALSE 0.415 48.000 0.000 NA   NA
 1255410 1255411 LSL_0793 LSL_0794     TRUE 0.803 16.000 0.000 NA   NA
 1255411 1255412 LSL_0794 LSL_0795     TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1255412 1255413 LSL_0795 LSL_0796     TRUE 0.989 0.000 0.500 NA   NA
 1255413 1255414 LSL_0796 LSL_0797     TRUE 0.804 4.000 0.000 NA Y NA
 1255414 1255415 LSL_0797 LSL_0798     FALSE 0.098 152.000 0.000 NA   NA
 1255415 1255416 LSL_0798 LSL_0799     TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1255416 1255417 LSL_0799 LSL_0800     FALSE 0.182 81.000 0.000 NA   NA
 1255417 1255418 LSL_0800 LSL_0801     TRUE 0.761 15.000 0.000 NA   NA
 1255418 1255419 LSL_0801 LSL_0802     TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 1255419 1255420 LSL_0802 LSL_0803     FALSE 0.355 53.000 0.000 NA   NA
 1255420 1255421 LSL_0803 LSL_0804     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255421 1255422 LSL_0804 LSL_0805     TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1255425 1255426 LSL_0807 LSL_0808     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1255427 1255428 LSL_0809 LSL_0810   spoU TRUE 0.802 -9.000 0.000 NA   NA
 1255428 1255429 LSL_0810 LSL_0811 spoU   FALSE 0.231 109.000 0.007 1.000   NA
 1255429 1255430 LSL_0811 LSL_0812     FALSE 0.300 125.000 0.024 NA   NA
 1255430 1255431 LSL_0812 LSL_0813   pheS FALSE 0.019 346.000 0.000 NA N NA
 1255431 1255432 LSL_0813 LSL_0814 pheS pheT TRUE 0.993 7.000 0.574 0.001 Y NA
 1255432 1255433 LSL_0814 LSL_0815 pheT   FALSE 0.159 153.000 0.007 NA   NA
 1255433 1255434 LSL_0815 LSL_0816   udk TRUE 0.904 23.000 0.017 NA   NA
 1255434 1255435 LSL_0816 LSL_0817 udk greA TRUE 0.961 17.000 0.095 1.000 N NA
 1255436 1255437 LSL_0818 LSL_0819   uRH TRUE 0.797 24.000 0.000 NA   NA
 1255438 1255439 LSL_0820 LSL_0820b     TRUE 0.820 17.000 0.000 NA   NA
 1255439 1255440 LSL_0820b LSL_0821     TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1255440 1255441 LSL_0821 LSL_0822   relA TRUE 0.638 40.000 0.004 NA   NA
 1255441 1255442 LSL_0822 LSL_0823 relA dtd TRUE 0.968 15.000 0.177 1.000 N NA
 1255442 1255443 LSL_0823 LSL_0824 dtd   TRUE 0.812 5.000 0.009 1.000   NA
 1255443 1255444 LSL_0824 LSL_0825   lspA FALSE 0.251 67.000 0.000 1.000   NA
 1255444 1255445 LSL_0825 LSL_0826 lspA rluD TRUE 0.952 -7.000 0.082 1.000 N NA
 1255445 1255446 LSL_0826 LSL_0827 rluD pyrR FALSE 0.148 208.000 0.048 1.000 N NA
 1255446 1255447 LSL_0827 LSL_0828 pyrR uraA TRUE 0.964 27.000 0.140 1.000 Y NA
 1255447 1255448 LSL_0828 LSL_0829 uraA carA FALSE 0.378 62.000 0.000 1.000 Y NA
 1255448 1255449 LSL_0829 LSL_0829b carA   TRUE 0.804 -22.000 0.000 NA   NA
 1255449 1255450 LSL_0829b LSL_0830   pyrF TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255450 1255451 LSL_0830 LSL_0831 pyrF pyrE TRUE 0.969 0.000 0.133 1.000 Y NA
 1255451 1255452 LSL_0831 LSL_0832 pyrE   FALSE 0.134 115.000 0.000 1.000 N NA
 1255452 1255453 LSL_0832 LSL_0833   ppa TRUE 0.884 26.000 0.028 1.000 N NA
 1255453 1255454 LSL_0833 LSL_0834 ppa   FALSE 0.054 187.000 0.000 1.000 N NA
 1255454 1255455 LSL_0834 LSL_0835   araT FALSE 0.275 60.000 0.000 1.000 N NA
 1255455 1255456 LSL_0835 LSL_0836 araT murI FALSE 0.221 70.000 0.000 1.000 N NA
 1255456 1255457 LSL_0836 LSL_0837 murI   FALSE 0.050 209.000 0.000 NA   NA
 1255457 1255458 LSL_0837 LSL_0838   divIVA FALSE 0.152 120.000 0.000 NA   NA
 1255458 1255459 LSL_0838 LSL_0839 divIVA   FALSE 0.013 482.000 0.000 NA   NA
 1255461 1255462 LSL_0841 LSL_0842   fhs FALSE 0.152 120.000 0.000 NA   NA
 1255462 1255463 LSL_0842 LSL_0843 fhs   TRUE 0.838 19.000 0.000 NA   NA
 1255463 1255464 LSL_0843 LSL_0844     FALSE 0.153 107.000 0.000 NA   NA
 1255464 1255465 LSL_0844 LSL_0845     FALSE 0.028 276.000 0.000 NA   NA
 1255465 1255466 LSL_0845 LSL_0844b     TRUE 0.804 -31.000 0.000 NA   NA
 1255466 1255467 LSL_0844b LSL_0846     FALSE 0.131 133.000 0.000 NA   NA
 1255467 1255468 LSL_0846 LSL_0847     TRUE 0.985 -7.000 0.283 NA   NA
 1255468 1255469 LSL_0847 LSL_0848   pepD TRUE 0.950 19.000 0.051 NA   NA
 1255469 1255470 LSL_0848 LSL_0849 pepD   FALSE 0.319 56.000 0.000 NA N NA
 1255470 1255471 LSL_0849 LSL_0850     FALSE 0.154 101.000 0.000 NA N NA
 1255471 1255472 LSL_0850 LSL_0851     FALSE 0.238 82.000 0.000 1.000 Y NA
 1255472 1255473 LSL_0851 LSL_0852   hisS FALSE 0.014 383.000 0.000 1.000 N NA
 1255473 1255474 LSL_0852 LSL_0853 hisS aspS TRUE 0.980 3.000 0.161 0.045 Y NA
 1255474 1255475 LSL_0853 LSL_0854 aspS corA FALSE 0.115 132.000 0.000 1.000 N NA
 1255475 1255476 LSL_0854 LSL_0855 corA nhaC FALSE 0.016 360.000 0.000 1.000 N NA
 1255476 1255477 LSL_0855 LSL_0856 nhaC dapF FALSE 0.121 127.000 0.000 1.000 N NA
 1255477 1255478 LSL_0856 LSL_0857 dapF nudF TRUE 0.723 12.000 0.002 1.000 N NA
 1255478 1255479 LSL_0857 LSL_0858 nudF   TRUE 0.659 10.000 0.000 NA   NA
 1255479 1255480 LSL_0858 LSL_0859   pfs TRUE 0.835 21.000 0.000 NA   NA
 1255480 1255481 LSL_0859 LSL_0860 pfs nifS TRUE 0.911 16.000 0.029 1.000 N NA
 1255481 1255482 LSL_0860 LSL_0861 nifS   TRUE 0.952 13.000 0.166 NA   NA
 1255482 1255483 LSL_0861 LSL_0862   trmU FALSE 0.301 113.000 0.021 NA   NA
 1255483 1255484 LSL_0862 LSL_0863 trmU clpB FALSE 0.125 125.000 0.000 1.000 N NA
 1255486 1255487 LSL_0865 LSL_0866 dnaE pfkA FALSE 0.334 167.000 0.098 1.000 N NA
 1255487 1255488 LSL_0866 LSL_0867 pfkA pykF TRUE 0.866 90.000 0.261 0.006 Y NA
 1255488 1255489 LSL_0867 LSL_0868 pykF   FALSE 0.068 179.000 0.000 NA   NA
 1255490 1255491 LSL_0869 LSL_0870     FALSE 0.153 107.000 0.000 NA   NA
 1255492 1255493 LSL_0871 LSL_0872 gyrB gyrA TRUE 0.995 25.000 0.552 0.002 Y NA
 1255495 1255496 LSL_0874 LSL_0875     TRUE 0.924 39.000 0.176 NA   NA
 1255496 1255497 LSL_0875 LSL_0876   lepB FALSE 0.117 142.000 0.000 NA   NA
 1255498 1255499 LSL_0877 LSL_0878   glyA FALSE 0.314 59.000 0.000 NA   NA
 1255500 1255501 LSL_0879 LSL_0880     FALSE 0.108 142.000 0.000 1.000   NA
 1255502 1255503 LSL_0881 LSL_0882     TRUE 0.943 -16.000 0.059 NA   NA
 1255503 1255504 LSL_0882 LSL_0883     FALSE 0.157 92.000 0.000 1.000   NA
 1255506 1255507 LSL_0885 LSL_0886     FALSE 0.230 121.000 0.008 1.000   NA
 1255507 1255508 LSL_0886 LSL_0887   rpsA FALSE 0.372 85.000 0.032 1.000   NA
 1255508 1255509 LSL_0887 LSL_0888 rpsA arsC FALSE 0.028 253.000 0.000 1.000 N NA
 1255509 1255510 LSL_0888 LSL_0889 arsC dltD FALSE 0.170 82.000 0.000 NA N NA
 1255510 1255511 LSL_0889 LSL_0890 dltD   TRUE 0.984 3.000 0.409 NA   NA
 1255511 1255512 LSL_0890 LSL_0891   dltB TRUE 0.991 21.000 0.387 NA   NA
 1255512 1255513 LSL_0891 LSL_0892 dltB   TRUE 0.987 0.000 0.435 NA N NA
 1255513 1255514 LSL_0892 LSL_0893     TRUE 0.991 16.000 0.549 NA   NA
 1255514 1255515 LSL_0893 LSL_0894   recO FALSE 0.088 161.000 0.000 NA   NA
 1255515 1255516 LSL_0894 LSL_0895 recO era TRUE 0.690 67.000 0.108 1.000   NA
 1255516 1255517 LSL_0895 LSL_0896 era dgkA TRUE 0.943 16.000 0.063 1.000   NA
 1255517 1255518 LSL_0896 LSL_0897 dgkA   TRUE 0.925 -22.000 0.035 NA   NA
 1255518 1255519 LSL_0897 LSL_0898   phoH TRUE 0.990 16.000 0.457 NA   NA
 1255521 1255522 LSL_0900 LSL_0901 cmk   TRUE 0.760 32.000 0.007 1.000   NA
 1255522 1255523 LSL_0901 LSL_0902   recQ TRUE 0.704 62.000 0.095 1.000   NA
 1255523 1255524 LSL_0902 LSL_0903 recQ   TRUE 0.972 -13.000 0.143 NA   NA
 1255526 1255527 LSL_0905 LSL_0905b     TRUE 0.804 -16.000 0.000 NA   NA
 1255527 1255528 LSL_0905b LSL_0906     TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1255528 1255529 LSL_0906 LSL_0907     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1255529 1255530 LSL_0907 LSL_0908     FALSE 0.268 67.000 0.000 NA   NA
 1255530 1255531 LSL_0908 LSL_0909   rpoD FALSE 0.019 358.000 0.000 NA   NA
 1255531 1255532 LSL_0909 LSL_0910 rpoD dnaG TRUE 0.959 13.000 0.209 1.000 N NA
 1255532 1255533 LSL_0910 LSL_0911 dnaG glyS FALSE 0.122 181.000 0.017 1.000 N NA
 1255533 1255534 LSL_0911 LSL_0912 glyS glyQ TRUE 0.996 0.000 0.651 0.001 Y NA
 1255534 1255535 LSL_0912 LSL_0913 glyQ   FALSE 0.015 435.000 0.000 NA   NA
 1255535 1255536 LSL_0913 LSL_0914   celB TRUE 0.992 1.000 0.769 NA   NA
 1255537 1255538 LSL_0915 LSL_0916 hsdS hsdS FALSE 0.119 247.000 0.000 0.002 Y NA
 1255539 1255540 LSL_0917 LSL_0918 xerC hsdS TRUE 0.887 54.000 0.188 0.071 N NA
 1255540 1255541 LSL_0918 LSL_0919 hsdS hsdM TRUE 0.969 0.000 0.072 0.071 Y NA
 1255541 1255542 LSL_0919 LSL_0920 hsdM hsdR TRUE 0.969 18.000 0.039 0.071 Y NA
 1255542 1255543 LSL_0920 LSL_0921 hsdR   FALSE 0.088 161.000 0.000 NA   NA
 1255543 1255544 LSL_0921 LSL_0922     FALSE 0.444 46.000 0.000 NA   NA
 1255544 1255545 LSL_0922 LSL_0923   pgpB FALSE 0.065 177.000 0.000 1.000   NA
 1255545 1255546 LSL_0923 LSL_0924 pgpB   TRUE 0.720 3.000 0.000 1.000   NA
 1255546 1255547 LSL_0924 LSL_0925     FALSE 0.052 207.000 0.000 NA   NA
 1255548 1255549 LSL_0926 LSL_0927     FALSE 0.113 144.000 0.000 NA   NA
 1255550 1255551 LSL_0928 LSL_RNA069     FALSE 0.117 142.000 0.000 NA   NA
 1255551 1255552 LSL_RNA069 LSL_0929   adeC FALSE 0.268 67.000 0.000 NA   NA
 1255552 1255553 LSL_0929 LSL_0930 adeC   FALSE 0.153 113.000 0.000 NA   NA
 1255554 1255555 LSL_0931 LSL_0932 nhaC recU FALSE 0.075 168.000 0.000 1.000   NA
 1255555 1255556 LSL_0932 LSL_0933 recU mrcA TRUE 0.974 30.000 0.319 1.000   NA
 1255557 1255558 LSL_0934 LSL_0935     TRUE 0.767 7.000 0.006 1.000   NA
 1255558 1255559 LSL_0935 LSL_0936     TRUE 0.880 15.000 0.019 NA   NA
 1255559 1255560 LSL_0936 LSL_0937     FALSE 0.139 127.000 0.000 NA   NA
 1255560 1255561 LSL_0937 LSL_0938   rluB FALSE 0.025 303.000 0.000 NA   NA
 1255561 1255562 LSL_0938 LSL_0939 rluB   TRUE 0.978 0.000 0.224 NA N NA
 1255562 1255563 LSL_0939 LSL_0940     TRUE 0.992 -10.000 0.570 NA   NA
 1255563 1255564 LSL_0940 LSL_0941     TRUE 0.892 -16.000 0.014 NA   NA
 1255564 1255565 LSL_0941 LSL_0942     FALSE 0.080 169.000 0.000 NA   NA
 1255565 1255566 LSL_0942 LSL_0943     FALSE 0.579 37.000 0.000 NA   NA
 1255566 1255567 LSL_0943 LSL_0944     FALSE 0.087 162.000 0.000 NA   NA
 1255567 1255568 LSL_0944 LSL_0945     FALSE 0.205 75.000 0.000 NA   NA
 1255568 1255569 LSL_0945 LSL_0946   hslU FALSE 0.153 107.000 0.000 NA   NA
 1255569 1255570 LSL_0946 LSL_0947 hslU   TRUE 0.996 19.000 0.752 1.000 Y NA
 1255570 1255571 LSL_0947 LSL_0948     TRUE 0.945 27.000 0.113 1.000 N NA
 1255571 1255572 LSL_0948 LSL_0949   cfa FALSE 0.052 192.000 0.000 1.000 N NA
 1255574 1255575 LSL_0951 LSL_0952     TRUE 0.777 25.000 0.000 NA   NA
 1255577 1255578 LSL_0954 LSL_0955 rpmA   TRUE 0.985 22.000 0.203 NA Y NA
 1255578 1255579 LSL_0955 LSL_0956   rplU TRUE 0.981 25.000 0.208 NA Y NA
 1255579 1255580 LSL_0956 LSL_0957 rplU   FALSE 0.094 156.000 0.000 NA   NA
 1255580 1255581 LSL_0957 LSL_0958     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255581 1255582 LSL_0958 LSL_0959     TRUE 0.804 -18.000 0.000 NA   NA
 1255582 1255583 LSL_0959 LSL_0960     FALSE 0.152 120.000 0.000 NA   NA
 1255583 1255584 LSL_0960 LSL_0961     TRUE 0.820 17.000 0.000 NA   NA
 1255584 1255585 LSL_0961 LSL_0962     FALSE 0.170 91.000 0.000 NA   NA
 1255586 1255587 LSL_0963 LSL_0964     FALSE 0.177 84.000 0.000 NA   NA
 1255588 1255589 LSL_0965 LSL_0966 gAlE wecD FALSE 0.445 44.000 0.000 1.000   NA
 1255589 1255590 LSL_0966 LSL_0967 wecD   FALSE 0.022 325.000 0.000 NA   NA
 1255590 1255591 LSL_0967 LSL_0968     FALSE 0.166 98.000 0.000 NA   NA
 1255593 1255594 LSL_0970 LSL_0971 qor   FALSE 0.095 225.000 0.000 0.017   NA
 1255594 1255595 LSL_0971 LSL_0972     TRUE 0.804 -19.000 0.000 NA   NA
 1255595 1255596 LSL_0972 LSL_0973     TRUE 0.726 63.000 0.111 NA N NA
 1255596 1255597 LSL_0973 LSL_0975     FALSE 0.120 140.000 0.000 NA   NA
 1255597 1255598 LSL_0975 LSL_0977   rfaG FALSE 0.071 176.000 0.000 NA   NA
 1255598 1255599 LSL_0977 LSL_0978 rfaG rfaG FALSE 0.403 93.000 0.000 0.015 Y NA
 1255599 1255600 LSL_0978 LSL_0979 rfaG ugd TRUE 0.735 12.000 0.000 1.000 Y NA
 1255600 1255601 LSL_0979 LSL_0980 ugd   TRUE 0.759 6.000 0.000 1.000 Y NA
 1255601 1255602 LSL_0980 LSL_0981     TRUE 0.653 6.000 0.000 1.000 N NA
 1255602 1255603 LSL_0981 LSL_0982   rfaG TRUE 0.812 21.000 0.000 1.000 N NA
 1255603 1255604 LSL_0982 LSL_0983 rfaG rfaG TRUE 0.777 25.000 0.000 NA   NA
 1255604 1255605 LSL_0983 LSL_0984 rfaG rfaG FALSE 0.166 97.000 0.000 NA   NA
 1255605 1255606 LSL_0984 LSL_0985 rfaG   TRUE 0.685 30.000 0.000 NA   NA
 1255606 1255607 LSL_0985 LSL_0986   rfaG TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1255607 1255608 LSL_0986 LSL_0987 rfaG rfaG TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1255608 1255609 LSL_0987 LSL_0988 rfaG rfaG TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1255609 1255610 LSL_0988 LSL_0989 rfaG rfaG TRUE 0.872 31.000 0.000 0.015 Y NA
 1255610 1255611 LSL_0989 LSL_0990 rfaG rfaG TRUE 0.808 38.000 0.000 0.015 Y NA
 1255611 1255612 LSL_0990 LSL_0991 rfaG rfaG TRUE 0.871 13.000 0.000 0.015 Y NA
 1255612 1255613 LSL_0991 LSL_0992 rfaG wecD TRUE 0.852 14.000 0.022 1.000   NA
 1255613 1255614 LSL_0992 LSL_0993 wecD   TRUE 0.932 -3.000 0.049 NA   NA
 1255614 1255615 LSL_0993 LSL_0994     TRUE 0.895 50.000 0.190 NA Y NA
 1255615 1255616 LSL_0994 LSL_0995     TRUE 0.923 -3.000 0.023 1.000 Y NA
 1255616 1255617 LSL_0995 LSL_0996     TRUE 0.818 20.000 0.000 1.000 N NA
 1255617 1255618 LSL_0996 LSL_0997     TRUE 0.981 5.000 0.400 1.000 N NA
 1255618 1255619 LSL_0997 LSL_0998   wecD FALSE 0.023 303.000 0.000 1.000   NA
 1255619 1255620 LSL_0998 LSL_0999 wecD   TRUE 0.840 20.000 0.000 NA   NA
 1255620 1255621 LSL_0999 LSL_1000     TRUE 0.968 10.000 0.273 NA   NA
 1255621 1255622 LSL_1000 LSL_1001     TRUE 0.665 9.000 0.000 NA   NA
 1255624 1255625 LSL_1003 LSL_1004 wecD lysA TRUE 0.818 20.000 0.000 1.000 N NA
 1255625 1255626 LSL_1004 LSL_1005 lysA   FALSE 0.150 145.000 0.002 1.000   NA
 1255627 1255628 LSL_1006 LSL_1007     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1255628 1255629 LSL_1007 LSL_1008     FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 1255630 1255631 LSL_1009 LSL_1010   galA TRUE 0.930 -7.000 0.048 1.000   NA
 1255631 1255632 LSL_1010 LSL_1011 galA   TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 1255632 1255633 LSL_1011 LSL_1012   wecD FALSE 0.268 67.000 0.000 NA   NA
 1255633 1255634 LSL_1012 LSL_1013 wecD ssl TRUE 0.822 21.000 0.000 1.000   NA
 1255634 1255635 LSL_1013 LSL_1014 ssl mutT TRUE 0.993 -13.000 0.327 0.015 Y NA
 1255637 1255638 LSL_1016 LSL_1017     FALSE 0.233 99.000 0.000 NA Y NA
 1255638 1255639 LSL_1017 LSL_1018     TRUE 0.987 -13.000 0.333 1.000   NA
 1255639 1255640 LSL_1018 LSL_1019     TRUE 0.976 2.000 0.230 NA   NA
 1255640 1255641 LSL_1019 LSL_1020     TRUE 0.953 9.000 0.180 NA   NA
 1255641 1255642 LSL_1020 LSL_1021     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255642 1255643 LSL_1021 LSL_1022     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255643 1255644 LSL_1022 LSL_1023     TRUE 0.922 12.000 0.100 NA   NA
 1255644 1255645 LSL_1023 LSL_1024     TRUE 0.789 -55.000 0.000 1.000   NA
 1255645 1255646 LSL_1024 LSL_1025     FALSE 0.015 386.000 0.000 1.000   NA
 1255646 1255647 LSL_1025 LSL_1026   ndh FALSE 0.136 124.000 0.000 1.000   NA
 1255647 1255648 LSL_1026 LSL_1027 ndh menA TRUE 0.972 14.000 0.261 1.000 N NA
 1255650 1255651 LSL_1029 LSL_1030 cydC cydD TRUE 0.989 -7.000 0.168 0.004 Y NA
 1255651 1255652 LSL_1030 LSL_1031 cydD cydB TRUE 0.946 0.000 0.061 1.000 Y NA
 1255652 1255653 LSL_1031 LSL_1032 cydB cydA TRUE 0.997 1.000 0.950 0.017 Y NA
 1255653 1255654 LSL_1032 LSL_1033 cydA asnA FALSE 0.024 283.000 0.000 1.000 N NA
 1255655 1255656 LSL_1034 LSL_1035     FALSE 0.153 111.000 0.000 NA   NA
 1255656 1255657 LSL_1035 LSL_1036     FALSE 0.011 608.000 0.000 NA   NA
 1255658 1255659 LSL_1037 LSL_1038     TRUE 0.645 9.000 0.000 1.000   NA
 1255659 1255660 LSL_1038 LSL_1039     FALSE 0.101 151.000 0.000 NA   NA
 1255661 1255662 LSL_1040 LSL_1041 draG   FALSE 0.058 194.000 0.000 NA   NA
 1255663 1255664 LSL_1042 LSL_1043 ileS divIVA FALSE 0.053 272.000 0.012 NA N NA
 1255664 1255665 LSL_1043 LSL_1044 divIVA   TRUE 0.992 23.000 0.579 NA   NA
 1255665 1255666 LSL_1044 LSL_1045     TRUE 0.978 3.000 0.287 1.000   NA
 1255666 1255667 LSL_1045 LSL_1046     TRUE 0.981 28.000 0.370 NA   NA
 1255667 1255668 LSL_1046 LSL_1047   ftsZ TRUE 0.890 25.000 0.020 NA   NA
 1255668 1255669 LSL_1047 LSL_1048 ftsZ ftsA TRUE 0.989 26.000 0.460 1.000 Y NA
 1255669 1255670 LSL_1048 LSL_1049 ftsA ftsQ TRUE 0.747 136.000 0.389 NA N NA
 1255670 1255671 LSL_1049 LSL_1050 ftsQ murG TRUE 0.712 35.000 0.000 NA Y NA
 1255671 1255672 LSL_1050 LSL_1051 murG murD TRUE 0.820 1.000 0.000 1.000 Y NA
 1255672 1255673 LSL_1051 LSL_1052 murD mraY TRUE 0.993 29.000 0.647 0.006 Y NA
 1255673 1255674 LSL_1052 LSL_1053 mraY   TRUE 0.884 11.000 0.038 1.000 Y NA
 1255674 1255675 LSL_1053 LSL_1054     TRUE 0.988 -3.000 0.456 1.000 N NA
 1255675 1255676 LSL_1054 LSL_1055   mraW TRUE 0.960 21.000 0.077 1.000 N NA
 1255676 1255677 LSL_1055 LSL_1056 mraW   TRUE 0.984 11.000 0.635 NA   NA
 1255677 1255678 LSL_1056 LSL_1057     FALSE 0.079 217.000 0.008 NA   NA
 1255678 1255679 LSL_1057 LSL_1058   lysC TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1255681 1255682 LSL_1060 LSL_1061     TRUE 0.744 15.000 0.000 1.000   NA
 1255682 1255683 LSL_1061 LSL_1062     TRUE 0.978 18.000 0.131 1.000 Y NA
 1255683 1255684 LSL_1062 LSL_1063     TRUE 0.951 13.000 0.136 1.000 Y NA
 1255684 1255685 LSL_1063 LSL_1064   minD FALSE 0.013 405.000 0.000 1.000 N NA
 1255685 1255686 LSL_1064 LSL_1065 minD minC TRUE 0.986 2.000 0.368 1.000 Y NA
 1255686 1255687 LSL_1065 LSL_1066 minC mreD TRUE 0.966 18.000 0.106 1.000 N NA
 1255687 1255688 LSL_1066 LSL_1067 mreD mreC TRUE 0.991 12.000 0.550 0.003 Y NA
 1255688 1255689 LSL_1067 LSL_1068 mreC mreB FALSE 0.295 115.000 0.024 1.000 N NA
 1255689 1255690 LSL_1068 LSL_1069 mreB cspC FALSE 0.066 172.000 0.000 1.000 N NA
 1255690 1255691 LSL_1069 LSL_1070 cspC radC TRUE 0.678 14.000 0.000 1.000 N NA
 1255691 1255692 LSL_1070 LSL_1071 radC folC TRUE 0.707 54.000 0.074 1.000 N NA
 1255692 1255693 LSL_1071 LSL_1072 folC valS FALSE 0.242 95.000 0.007 1.000 N NA
 1255693 1255694 LSL_1072 LSL_1073 valS thiI FALSE 0.021 306.000 0.000 1.000 N NA
 1255694 1255695 LSL_1073 LSL_1074 thiI nifS TRUE 0.988 17.000 0.349 1.000 N NA
 1255695 1255696 LSL_1074 LSL_1075 nifS   TRUE 0.612 135.000 0.201 1.000 N NA
 1255697 1255698 LSL_1076 LSL_1077   rpsD FALSE 0.070 216.000 0.005 NA N NA
 1255698 1255699 LSL_1077 LSL_1078 rpsD   FALSE 0.167 149.000 0.007 NA   NA
 1255699 1255700 LSL_1078 LSL_1079     TRUE 0.977 22.000 0.153 NA   NA
 1255700 1255701 LSL_1079 LSL_1080     FALSE 0.027 285.000 0.000 NA   NA
 1255701 1255702 LSL_1080 LSL_1081     FALSE 0.153 117.000 0.000 NA   NA
 1255703 1255704 LSL_1082 LSL_1083   ddlA FALSE 0.090 150.000 0.000 1.000 N NA
 1255704 1255705 LSL_1083 LSL_1084 ddlA pepQ FALSE 0.128 124.000 0.000 1.000 N NA
 1255705 1255706 LSL_1084 LSL_1085 pepQ   FALSE 0.016 379.000 0.000 1.000   NA
 1255706 1255707 LSL_1085 LSL_1086     FALSE 0.028 283.000 0.000 NA   NA
 1255707 1255708 LSL_1086 LSL_1087     TRUE 0.954 3.000 0.125 NA   NA
 1255708 1255709 LSL_1087 LSL_1088     FALSE 0.071 176.000 0.000 NA   NA
 1255711 1255712 LSL_1090 LSL_1091 apt recJ TRUE 0.971 22.000 0.128 1.000 N NA
 1255712 1255713 LSL_1091 LSL_1092 recJ   TRUE 0.793 11.000 0.016 1.000   NA
 1255713 1255714 LSL_1092 LSL_1093     TRUE 0.947 -3.000 0.074 1.000   NA
 1255715 1255716 LSL_1094 LSL_1095     FALSE 0.187 79.000 0.000 NA   NA
 1255717 1255718 LSL_1096 LSL_1097   cgtA TRUE 0.786 31.000 0.010 1.000   NA
 1255718 1255719 LSL_1097 LSL_1098 cgtA uvrC FALSE 0.253 124.000 0.016 1.000   NA
 1255720 1255721 LSL_1099 LSL_1100 serA   FALSE 0.182 81.000 0.000 NA   NA
 1255722 1255723 LSL_RNA070 LSL_1101     FALSE 0.205 75.000 0.000 NA   NA
 1255723 1255724 LSL_1101 LSL_1102     TRUE 0.826 0.000 0.002 1.000   NA
 1255726 1255727 LSL_1104 LSL_1105 trxA mutS FALSE 0.311 72.000 0.005 1.000 N NA
 1255727 1255728 LSL_1105 LSL_1106 mutS   TRUE 0.954 17.000 0.070 1.000   NA
 1255728 1255729 LSL_1106 LSL_1107     TRUE 0.920 13.000 0.091 NA   NA
 1255729 1255730 LSL_1107 LSL_1108     FALSE 0.261 91.000 0.007 NA   NA
 1255730 1255731 LSL_1108 LSL_1109     TRUE 0.985 12.000 0.651 NA   NA
 1255731 1255732 LSL_1109 LSL_1110     TRUE 0.982 12.000 0.537 NA   NA
 1255732 1255733 LSL_1110 LSL_1111   alaS FALSE 0.364 168.000 0.110 NA   NA
 1255733 1255734 LSL_1111 LSL_1112 alaS srmB FALSE 0.075 307.000 0.000 0.017 Y NA
 1255734 1255735 LSL_1112 LSL_1113 srmB   TRUE 0.986 23.000 0.182 0.017   NA
 1255735 1255736 LSL_1113 LSL_1114   ackA FALSE 0.010 623.000 0.000 1.000   NA
 1255736 1255737 LSL_1114 LSL_1115 ackA   FALSE 0.059 185.000 0.000 1.000   NA
 1255737 1255738 LSL_1115 LSL_1116     TRUE 0.995 -7.000 0.500 0.002   NA
 1255738 1255739 LSL_1116 LSL_1117     TRUE 0.995 1.000 0.947 NA Y NA
 1255739 1255740 LSL_1117 LSL_1118     FALSE 0.021 323.000 0.000 NA N NA
 1255740 1255741 LSL_1118 LSL_1119     FALSE 0.063 187.000 0.000 NA   NA
 1255741 1255742 LSL_1119 LSL_1120     FALSE 0.080 169.000 0.000 NA   NA
 1255742 1255743 LSL_1120 LSL_1121     FALSE 0.157 103.000 0.000 NA   NA
 1255743 1255744 LSL_1121 LSL_1122   yajC FALSE 0.096 153.000 0.000 NA   NA
 1255744 1255745 LSL_1122 LSL_1123 yajC tgt TRUE 0.868 67.000 0.325 NA N NA
 1255745 1255746 LSL_1123 LSL_1124 tgt queA TRUE 0.995 16.000 0.360 0.001 Y NA
 1255746 1255747 LSL_1124 LSL_1125 queA ruvB TRUE 0.904 6.000 0.069 1.000 N NA
 1255747 1255748 LSL_1125 LSL_1126 ruvB ruvA TRUE 0.986 39.000 0.549 0.003 Y NA
 1255748 1255749 LSL_1126 LSL_1127 ruvA mutL TRUE 0.926 17.000 0.016 1.000 Y NA
 1255749 1255750 LSL_1127 LSL_1128 mutL mutS TRUE 0.982 10.000 0.220 0.002 Y NA
 1255750 1255751 LSL_1128 LSL_1129 mutS   FALSE 0.135 168.000 0.009 1.000   NA
 1255751 1255752 LSL_1129 LSL_1130   recA FALSE 0.142 175.000 0.018 1.000   NA
 1255752 1255753 LSL_1130 LSL_1131 recA pgsA FALSE 0.123 193.000 0.022 1.000 N NA
 1255753 1255754 LSL_1131 LSL_1132 pgsA   TRUE 0.728 53.000 0.077 1.000   NA
 1255754 1255755 LSL_1132 LSL_1133   fabG TRUE 0.723 82.000 0.213 1.000   NA
 1255755 1255756 LSL_1133 LSL_1134 fabG   TRUE 0.979 6.000 0.397 1.000   NA
 1255756 1255757 LSL_1134 LSL_1134b     TRUE 0.671 13.000 0.000 NA   NA
 1255757 1255758 LSL_1134b LSL_1135   ftsK FALSE 0.117 142.000 0.000 NA   NA
 1255758 1255759 LSL_1135 LSL_1136 ftsK   TRUE 0.726 37.000 0.016 1.000 N NA
 1255759 1255760 LSL_1136 LSL_1137     FALSE 0.065 241.000 0.012 1.000   NA
 1255760 1255761 LSL_1137 LSL_1138     TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1255762 1255763 LSL_1139 LSL_1140 guaC gltP FALSE 0.046 204.000 0.000 1.000 N NA
 1255764 1255765 LSL_1141 LSL_1142     TRUE 0.678 14.000 0.000 1.000 N NA
 1255767 1255768 LSL_1144 LSL_1145 glmM   TRUE 0.972 24.000 0.150 NA   NA
 1255768 1255769 LSL_1145 LSL_1146     TRUE 0.990 -3.000 0.502 NA   NA
 1255773 1255774 LSL_1150 LSL_1151   pta TRUE 0.870 4.000 0.023 NA   NA
 1255774 1255775 LSL_1151 LSL_1152 pta ung TRUE 0.901 34.000 0.092 1.000 N NA
 1255776 1255777 LSL_1153 LSL_1154     TRUE 0.958 30.000 0.182 NA   NA
 1255778 1255779 LSL_1155 LSL_1156 smpB   TRUE 0.976 26.000 0.143 0.024 N NA
 1255779 1255780 LSL_1156 LSL_1157   secG FALSE 0.532 73.000 0.064 1.000 N NA
 1255780 1255781 LSL_1157 LSL_1158 secG eriC FALSE 0.383 60.000 0.003 1.000 N NA
 1255781 1255782 LSL_1158 LSL_1159 eriC   FALSE 0.061 180.000 0.000 1.000   NA
 1255782 1255783 LSL_1159 LSL_1160   baeS FALSE 0.251 67.000 0.000 1.000   NA
 1255783 1255784 LSL_1160 LSL_1161 baeS   TRUE 0.992 0.000 0.586 1.000 Y NA
 1255784 1255785 LSL_1161 LSL_1162   dinP FALSE 0.304 55.000 0.000 1.000 N NA
 1255785 1255786 LSL_1162 LSL_1163 dinP eno FALSE 0.075 162.000 0.000 1.000 N NA
 1255786 1255787 LSL_1163 LSL_1164 eno tpiA FALSE 0.345 114.000 0.018 1.000 Y NA
 1255787 1255788 LSL_1164 LSL_1165 tpiA pgk TRUE 0.845 53.000 0.141 1.000 Y NA
 1255788 1255789 LSL_1165 LSL_1166 pgk gapA FALSE 0.499 106.000 0.013 0.006 Y NA
 1255789 1255790 LSL_1166 LSL_1167 gapA   TRUE 0.709 63.000 0.109 1.000 N NA
 1255790 1255791 LSL_1167 LSL_RNA071     FALSE 0.019 354.000 0.000 NA   NA
 1255794 1255795 LSL_1169 LSL_1170     TRUE 0.991 23.000 0.470 NA   NA
 1255795 1255796 LSL_1170 LSL_1171     TRUE 0.979 -3.000 0.214 NA   NA
 1255796 1255797 LSL_1171 LSL_1172     FALSE 0.070 178.000 0.000 NA   NA
 1255797 1255798 LSL_1172 LSL_1173   luxS TRUE 0.771 24.000 0.000 1.000 N NA
 1255798 1255799 LSL_1173 LSL_1174 luxS uvrA FALSE 0.246 76.000 0.002 1.000 N NA
 1255799 1255800 LSL_1174 LSL_1175 uvrA uvrB TRUE 0.991 19.000 0.154 0.002 Y NA
 1255800 1255801 LSL_1175 LSL_1176 uvrB glmM FALSE 0.152 148.000 0.006 1.000 N NA
 1255801 1255802 LSL_1176 LSL_1177 glmM lgt FALSE 0.221 70.000 0.000 1.000 N NA
 1255802 1255803 LSL_1177 LSL_1178 lgt hprK TRUE 0.987 15.000 0.494 1.000 N NA
 1255803 1255804 LSL_1178 LSL_1179 hprK   TRUE 0.782 73.000 0.215 NA   NA
 1255804 1255805 LSL_1179 LSL_1180     TRUE 0.967 4.000 0.190 NA   NA
 1255805 1255806 LSL_1180 LSL_1181   baeS TRUE 0.758 13.000 0.000 NA Y NA
 1255806 1255807 LSL_1181 LSL_1182 baeS   TRUE 0.975 0.000 0.164 1.000 Y NA
 1255807 1255808 LSL_1182 LSL_1183     TRUE 0.977 16.000 0.188 1.000   NA
 1255810 1255811 LSL_1185 LSL_1186 prfB secA FALSE 0.324 139.000 0.052 1.000 N NA
 1255811 1255812 LSL_1186 LSL_1187 secA   FALSE 0.125 125.000 0.000 1.000 N NA
 1255812 1255813 LSL_1187 LSL_1188     FALSE 0.139 124.000 0.000 NA N NA
 1255813 1255814 LSL_1188 LSL_1189   xerC FALSE 0.034 243.000 0.000 NA N NA
 1255814 1255815 LSL_1189 LSL_1190 xerC   FALSE 0.015 392.000 0.000 1.000   NA
 1255815 1255816 LSL_1190 LSL_1191     TRUE 0.789 -22.000 0.000 1.000   NA
 1255817 1255818 LSL_1192 LSL_1193     TRUE 0.925 21.000 0.000 0.016   NA
 1255818 1255819 LSL_1193 LSL_1194     FALSE 0.445 44.000 0.000 1.000   NA
 1255819 1255820 LSL_1194 LSL_1195     TRUE 0.761 15.000 0.000 NA   NA
 1255820 1255821 LSL_1195 LSL_1196     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1255821 1255822 LSL_1196 LSL_1197     TRUE 0.795 -6.000 0.000 NA   NA
 1255822 1255823 LSL_1197 LSL_1198     FALSE 0.098 152.000 0.000 NA   NA
 1255825 1255826 LSL_1200 LSL_1201     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1255826 1255827 LSL_1201 LSL_1202     TRUE 0.761 15.000 0.000 NA   NA
 1255827 1255828 LSL_1202 LSL_1203     FALSE 0.024 311.000 0.000 NA   NA
 1255828 1255829 LSL_1203 LSL_1204     FALSE 0.314 59.000 0.000 NA   NA
 1255829 1255830 LSL_1204 LSL_1205     TRUE 0.675 7.000 0.000 NA   NA
 1255831 1255832 LSL_1206 LSL_1207 comFC   TRUE 0.965 -3.000 0.130 1.000   NA
 1255832 1255833 LSL_1207 LSL_1208     FALSE 0.162 80.000 0.000 1.000 N NA
 1255833 1255834 LSL_1208 LSL_1209     FALSE 0.190 151.000 0.019 1.000 N NA
 1255834 1255835 LSL_1209 LSL_1210     FALSE 0.119 184.000 0.000 0.057 N NA
 1255835 1255836 LSL_1210 LSL_1211   groL FALSE 0.048 196.000 0.000 1.000 N NA
 1255836 1255837 LSL_1211 LSL_1212 groL groS TRUE 0.978 30.000 0.160 0.004 Y NA
 1255841 1255842 LSL_1216 LSL_1217 gcp rimI TRUE 0.892 24.000 0.018 1.000   NA
 1255842 1255843 LSL_1217 LSL_1218 rimI   TRUE 0.862 5.000 0.026 1.000   NA
 1255845 1255846 LSL_1220 LSL_1221     TRUE 0.811 12.000 0.021 1.000   NA
 1255846 1255847 LSL_1221 LSL_1222     TRUE 0.921 0.000 0.043 NA   NA
 1255847 1255848 LSL_1222 LSL_1223   holB TRUE 0.911 15.000 0.038 NA   NA
 1255848 1255849 LSL_1223 LSL_1224 holB tmk TRUE 0.957 35.000 0.254 1.000 N NA
 1255849 1255850 LSL_1224 LSL_1225 tmk   FALSE 0.274 120.000 0.016 NA   NA
 1255850 1255851 LSL_1225 LSL_1226   recR TRUE 0.922 14.000 0.071 NA   NA
 1255851 1255852 LSL_1226 LSL_1227 recR   TRUE 0.988 27.000 0.604 NA   NA
 1255852 1255853 LSL_1227 LSL_1228   dnaX TRUE 0.967 18.000 0.100 NA   NA
 1255853 1255854 LSL_1228 LSL_1229 dnaX   FALSE 0.100 207.000 0.018 1.000 N NA
 1255854 1255855 LSL_1229 LSL_1229b     TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1255856 1255857 LSL_1230 LSL_1231 grxC nrdI TRUE 0.778 -3.000 0.000 NA N NA
 1255857 1255858 LSL_1231 LSL_1232 nrdI nrdA TRUE 0.974 -19.000 0.125 NA Y NA
 1255858 1255859 LSL_1232 LSL_1233 nrdA nrdB TRUE 0.997 18.000 0.500 0.001 Y NA
 1255860 1255861 LSL_1234 LSL_1236     FALSE 0.174 86.000 0.000 NA   NA
 1255861 1255862 LSL_1236 LSL_1237   rplL FALSE 0.141 113.000 0.000 1.000   NA
 1255862 1255863 LSL_1237 LSL_1238 rplL rplJ TRUE 0.965 72.000 0.884 0.020 Y NA
 1255863 1255864 LSL_1238 LSL_1239 rplJ rplA FALSE 0.530 245.000 0.302 0.027 Y NA
 1255864 1255865 LSL_1239 LSL_1240 rplA rplK TRUE 0.938 103.000 0.838 0.027 Y NA
 1255865 1255866 LSL_1240 LSL_1241 rplK nusG TRUE 0.852 123.000 0.681 1.000 N NA
 1255866 1255867 LSL_1241 LSL_1242 nusG   TRUE 0.888 115.000 0.843 1.000   NA
 1255867 1255868 LSL_1242 LSL_1243   rpmG TRUE 0.886 20.000 0.003 1.000   NA
 1255868 1255869 LSL_1243 LSL_1244 rpmG   FALSE 0.283 65.000 0.000 NA   NA
 1255869 1255870 LSL_1244 LSL_1245   spoU TRUE 0.951 2.000 0.109 NA   NA
 1255870 1255871 LSL_1245 LSL_1246 spoU   TRUE 0.982 0.000 0.150 0.004   NA
 1255871 1255872 LSL_1246 LSL_1247   cysS TRUE 0.967 -7.000 0.129 1.000   NA
 1255872 1255873 LSL_1247 LSL_1248 cysS glnS FALSE 0.215 154.000 0.013 1.000 Y NA
 1255873 1255874 LSL_1248 LSL_1249 glnS   FALSE 0.267 131.000 0.021 NA   NA
 1255874 1255875 LSL_1249 LSL_1250   radA TRUE 0.924 26.000 0.056 NA   NA
 1255875 1255876 LSL_1250 LSL_1251 radA dut TRUE 0.924 18.000 0.028 1.000 N NA
 1255877 1255878 LSL_1252 LSL_1253 wecD pepC FALSE 0.159 89.000 0.000 1.000   NA
 1255878 1255879 LSL_1253 LSL_1254 pepC   FALSE 0.049 210.000 0.000 NA   NA
 1255880 1255881 LSL_1255 LSL_1256 gpmA   TRUE 0.811 22.000 0.000 1.000   NA
 1255881 1255882 LSL_1256 LSL_1257   fabH FALSE 0.295 59.000 0.000 1.000   NA
 1255882 1255883 LSL_1257 LSL_RNA072 fabH   FALSE 0.170 91.000 0.000 NA   NA
 1255883 1255884 LSL_RNA072 LSL_1258     FALSE 0.430 47.000 0.000 NA   NA
 1255884 1255885 LSL_1258 LSL_1259     TRUE 0.981 -7.000 0.215 NA   NA
 1255885 1255886 LSL_1259 LSL_1260   nadE FALSE 0.395 70.000 0.017 1.000 N NA
 1255886 1255887 LSL_1260 LSL_1261 nadE pncB TRUE 0.992 20.000 0.194 0.003 Y NA
 1255889 1255890 LSL_1263 LSL_1264   proC TRUE 0.777 16.000 0.000 1.000 N NA
 1255890 1255891 LSL_1264 LSL_RNA073 proC   FALSE 0.185 80.000 0.000 NA   NA
 1255891 1255892 LSL_RNA073 LSL_RNA074     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1255892 1255893 LSL_RNA074 LSL_1265     FALSE 0.098 152.000 0.000 NA   NA
 1255893 1255894 LSL_1265 LSL_RNA075     FALSE 0.033 249.000 0.000 NA   NA
 1255894 1255895 LSL_RNA075 LSL_RNA076     FALSE 0.599 36.000 0.000 NA   NA
 1255895 1255896 LSL_RNA076 LSL_RNA077     TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1255896 1255897 LSL_RNA077 LSL_1266     FALSE 0.014 443.000 0.000 NA   NA
 1255897 1255898 LSL_1266 LSL_1267     TRUE 0.815 18.000 0.000 1.000   NA
 1255898 1255899 LSL_1267 LSL_1268   galU FALSE 0.141 117.000 0.000 1.000   NA
 1255899 1255900 LSL_1268 LSL_1269 galU map FALSE 0.068 170.000 0.000 1.000 N NA
 1255901 1255902 LSL_1270 LSL_1271 fldA   TRUE 0.757 0.000 0.000 1.000   NA
 1255902 1255903 LSL_1271 LSL_1272     FALSE 0.170 91.000 0.000 NA   NA
 1255904 1255905 LSL_1273 LSL_1274     TRUE 0.923 14.000 0.078 1.000   NA
 1255905 1255906 LSL_1274 LSL_1275     TRUE 0.985 18.000 0.235 NA   NA
 1255906 1255907 LSL_1275 LSL_1276   wecB FALSE 0.071 173.000 0.000 NA N NA
 1255908 1255909 LSL_1277 LSL_1278 ampS   FALSE 0.034 312.000 0.000 1.000 Y NA
 1255910 1255911 LSL_1279 LSL_1280   mapA TRUE 0.638 10.000 0.000 1.000   NA
 1255911 1255912 LSL_1280 LSL_1281 mapA galM TRUE 0.923 15.000 0.000 0.003 Y NA
 1255912 1255913 LSL_1281 LSL_1282 galM   TRUE 0.979 4.000 0.250 1.000 Y NA
 1255913 1255914 LSL_1282 LSL_1283   malR FALSE 0.388 156.000 0.111 1.000 N NA
 1255914 1255915 LSL_1283 LSL_1284 malR kup FALSE 0.104 140.000 0.000 1.000 N NA
 1255915 1255916 LSL_1284 LSL_RNA078 kup   FALSE 0.164 100.000 0.000 NA   NA
 1255916 1255917 LSL_RNA078 LSL_1285     FALSE 0.174 86.000 0.000 NA   NA
 1255917 1255918 LSL_1285 LSL_1286   srmB TRUE 0.648 33.000 0.000 NA   NA
 1255918 1255919 LSL_1286 LSL_1287 srmB   TRUE 0.983 19.000 0.200 1.000   NA
 1255921 1255922 LSL_1289 LSL_1290 amyA glgP TRUE 0.989 -19.000 0.186 0.013 Y NA
 1255922 1255923 LSL_1290 LSL_1291 glgP glgA TRUE 0.965 29.000 0.171 1.000 Y NA
 1255923 1255924 LSL_1291 LSL_1292 glgA glgC TRUE 0.989 0.000 0.395 1.000 Y NA
 1255924 1255925 LSL_1292 LSL_1293 glgC glgC TRUE 0.997 -10.000 0.810 0.001 Y NA
 1255925 1255926 LSL_1293 LSL_1294 glgC glgB TRUE 0.885 102.000 0.317 0.001 Y NA
 1255926 1255927 LSL_1294 LSL_1295 glgB   FALSE 0.176 205.000 0.000 0.002 Y NA
 1255927 1255928 LSL_1295 LSL_1296     FALSE 0.521 40.000 0.000 NA   NA
 1255928 1255929 LSL_1296 LSL_1297   gdhA FALSE 0.101 151.000 0.000 NA   NA
 1255929 1255930 LSL_1297 LSL_1298 gdhA   FALSE 0.054 187.000 0.000 1.000 N NA
 1255930 1255931 LSL_1298 LSL_1299   wecD FALSE 0.133 179.000 0.000 0.044   NA
 1255931 1255932 LSL_1299 LSL_1300 wecD   TRUE 0.828 18.000 0.000 NA   NA
 1255932 1255933 LSL_1300 LSL_1301     FALSE 0.011 633.000 0.000 NA   NA
 1255933 1255934 LSL_1301 LSL_1302   mgtE FALSE 0.056 185.000 0.000 1.000 N NA
 1255934 1255935 LSL_1302 LSL_1303 mgtE rluD TRUE 0.951 18.000 0.065 1.000 N NA
 1255935 1255936 LSL_1303 LSL_1304 rluD   TRUE 0.951 -10.000 0.080 1.000 N NA
 1255936 1255937 LSL_1304 LSL_1305     TRUE 0.995 21.000 0.725 1.000   NA
 1255937 1255938 LSL_1305 LSL_1306   topB FALSE 0.150 101.000 0.000 1.000   NA
 1255940 1255941 LSL_1308 LSL_1309   xpt TRUE 0.917 3.000 0.037 1.000 Y NA
 1255941 1255942 LSL_1309 LSL_1310 xpt   FALSE 0.106 209.000 0.023 1.000 N NA
 1255942 1255943 LSL_1310 LSL_1311     TRUE 0.937 33.000 0.138 NA   NA
 1255943 1255944 LSL_1311 LSL_1312     FALSE 0.117 142.000 0.000 NA   NA
 1255944 1255945 LSL_1312 LSL_1313     TRUE 0.935 44.000 0.302 1.000   NA
 1255947 1255948 LSL_1315 LSL_1316     FALSE 0.043 342.000 0.000 0.036   NA
 1255948 1255949 LSL_1316 LSL_1317     TRUE 0.680 29.000 0.000 1.000   NA
 1255949 1255950 LSL_1317 LSL_1318     FALSE 0.128 124.000 0.000 1.000 N NA
 1255950 1255951 LSL_1318 LSL_1319   rlpA FALSE 0.117 142.000 0.000 NA   NA
 1255952 1255953 LSL_1321 LSL_1322     TRUE 0.660 12.000 0.000 NA   NA
 1255954 1255955 LSL_1323 LSL_1324 ackA wecD FALSE 0.166 82.000 0.000 1.000   NA
 1255955 1255956 LSL_1324 LSL_1325 wecD   FALSE 0.142 106.000 0.000 1.000   NA
 1255956 1255957 LSL_1325 LSL_1326   frdA FALSE 0.573 93.000 0.119 1.000 N NA
 1255957 1255958 LSL_1326 LSL_1327 frdA fumC TRUE 0.937 20.000 0.017 1.000 Y NA
 1255960 1255961 LSL_1329 LSL_1330   arsC FALSE 0.205 157.000 0.000 0.007 N NA
 1255961 1255962 LSL_1330 LSL_1331 arsC nrdG FALSE 0.036 228.000 0.000 1.000 N NA
 1255962 1255963 LSL_1331 LSL_1332 nrdG nrdD TRUE 0.982 -10.000 0.240 1.000 N NA
 1255965 1255966 LSL_1334 LSL_1335 wecD mbp3 FALSE 0.055 192.000 0.000 1.000   NA
 1255966 1255967 LSL_1335 LSL_1336 mbp3 wecD FALSE 0.016 377.000 0.000 1.000   NA
 1255967 1255968 LSL_1336 LSL_1337 wecD   FALSE 0.167 96.000 0.000 NA   NA
 1255968 1255969 LSL_1337 LSL_1338     FALSE 0.172 89.000 0.000 NA   NA
 1255969 1255970 LSL_1338 LSL_1339     FALSE 0.010 546.000 0.000 1.000 N NA
 1255970 1255971 LSL_1339 LSL_1340     FALSE 0.017 380.000 0.000 NA   NA
 1255971 1255972 LSL_1340 LSL_1341   trmA FALSE 0.039 239.000 0.000 NA   NA
 1255974 1255975 LSL_1343 LSL_1344   gatB TRUE 0.835 33.000 0.034 1.000 N NA
 1255975 1255976 LSL_1344 LSL_1345 gatB gatA TRUE 0.995 0.000 0.492 0.001 Y NA
 1255976 1255977 LSL_1345 LSL_1346 gatA gatC TRUE 0.995 3.000 0.643 0.001 Y NA
 1255977 1255978 LSL_1346 LSL_1347 gatC   FALSE 0.194 152.000 0.017 NA   NA
 1255978 1255979 LSL_1347 LSL_1348   lig TRUE 0.914 -3.000 0.030 NA   NA
 1255979 1255980 LSL_1348 LSL_1349 lig pcrA TRUE 0.984 17.000 0.103 0.014 Y NA
 1255980 1255981 LSL_1349 LSL_1350 pcrA purK FALSE 0.241 108.000 0.012 1.000 N NA
 1255981 1255982 LSL_1350 LSL_RNA079 purK   FALSE 0.023 318.000 0.000 NA   NA
 1255982 1255983 LSL_RNA079 LSL_RNA080     TRUE 0.803 16.000 0.000 NA   NA
 1255983 1255984 LSL_RNA080 LSL_RNA081     TRUE 0.711 5.000 0.000 NA   NA
 1255984 1255985 LSL_RNA081 LSL_RNA082     TRUE 0.688 6.000 0.000 NA   NA
 1255985 1255986 LSL_RNA082 LSL_RNA083     FALSE 0.037 241.000 0.000 NA   NA
 1255986 1255987 LSL_RNA083 LSL_RNA084     TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1255987 1255988 LSL_RNA084 LSL_1351   lysS FALSE 0.020 351.000 0.000 NA   NA
 1255988 1255989 LSL_1351 LSL_1352 lysS   FALSE 0.427 94.000 0.032 1.000 Y NA
 1255989 1255990 LSL_1352 LSL_1352b     TRUE 0.828 18.000 0.000 NA   NA
 1255990 1255991 LSL_1352b LSL_1353   ftsH FALSE 0.131 133.000 0.000 NA   NA
 1255991 1255992 LSL_1353 LSL_1354 ftsH hpt FALSE 0.191 141.000 0.012 1.000 N NA
 1255992 1255993 LSL_1354 LSL_1355 hpt   TRUE 0.929 17.000 0.004 0.042 N NA
 1255993 1255994 LSL_1355 LSL_1356     FALSE 0.555 58.000 0.031 1.000 N NA
 1255994 1255995 LSL_1356 LSL_1357     FALSE 0.599 89.000 0.134 1.000 N NA
 1255995 1255996 LSL_1357 LSL_1358     TRUE 0.810 39.000 0.053 1.000 N NA
 1255996 1255997 LSL_1358 LSL_1359     TRUE 0.907 0.000 0.034 1.000   NA
 1255997 1255998 LSL_1359 LSL_1360   mfd TRUE 0.845 10.000 0.033 1.000   NA
 1255998 1255999 LSL_1360 LSL_1361 mfd pth TRUE 0.972 22.000 0.137 1.000 N NA
 1256002 1256003 LSL_1364 LSL_1365   apbA FALSE 0.015 418.000 0.000 NA   NA
 1256004 1256005 LSL_1366 LSL_1367 tyrS fur FALSE 0.024 283.000 0.000 1.000 N NA
 1256005 1256006 LSL_1367 LSL_1368 fur   FALSE 0.160 102.000 0.000 NA   NA
 1256006 1256007 LSL_1368 LSL_1369   sbcC TRUE 0.716 28.000 0.000 NA   NA
 1256007 1256008 LSL_1369 LSL_1370 sbcC sbcD TRUE 0.996 -3.000 0.669 0.003 Y NA
 1256010 1256011 LSL_1372 LSL_1373   ddpX FALSE 0.134 116.000 0.000 1.000 N NA
 1256012 1256013 LSL_1373b LSL_1374     TRUE 0.803 16.000 0.000 NA   NA
 1256013 1256014 LSL_1374 LSL_1375     TRUE 0.990 4.000 0.765 1.000 N NA
 1256014 1256015 LSL_1375 LSL_1376     FALSE 0.145 99.000 0.000 1.000 N NA
 1256019 1256020 LSL_1380b LSL_1381     FALSE 0.399 49.000 0.000 NA   NA
 1256021 1256022 LSL_1382 LSL_1383     TRUE 0.956 -3.000 0.095 NA   NA
 1256022 1256023 LSL_1383 LSL_1384     TRUE 0.958 0.000 0.111 NA   NA
 1256025 1256026 LSL_1386 LSL_1387     FALSE 0.032 245.000 0.000 1.000   NA
 1256028 1256029 LSL_1388 LSL_1389 doc   TRUE 0.975 -3.000 0.186 NA   NA
 1256029 1256030 LSL_1389 LSL_1390     FALSE 0.010 1021.000 0.000 NA   NA
 1256030 1256031 LSL_1390 LSL_1391     FALSE 0.063 186.000 0.000 NA   NA
 1256031 1256032 LSL_1391 LSL_1392     TRUE 0.761 1.000 0.000 NA   NA
 1256032 1256033 LSL_1392 LSL_1393     TRUE 0.995 -16.000 1.000 NA   NA
 1256033 1256034 LSL_1393 LSL_1394     FALSE 0.323 58.000 0.000 NA   NA
 1256034 1256035 LSL_1394 LSL_1395     FALSE 0.160 102.000 0.000 NA   NA
 1256035 1256036 LSL_1395 LSL_1396     FALSE 0.197 76.000 0.000 NA   NA
 1256038 1256039 LSL_1397 LSL_1398     TRUE 0.804 12.000 0.020 1.000 N NA
 1256039 1256040 LSL_1398 LSL_1399     TRUE 0.761 15.000 0.000 NA   NA
 1256040 1256041 LSL_1399 LSL_1399b     TRUE 0.800 -7.000 0.000 NA   NA
 1256041 1256042 LSL_1399b LSL_1400     FALSE 0.044 221.000 0.000 NA   NA
 1256042 1256043 LSL_1400 LSL_1401     TRUE 0.820 17.000 0.000 NA   NA
 1256043 1256044 LSL_1401 LSL_1401b     FALSE 0.020 346.000 0.000 NA   NA
 1256044 1256045 LSL_1401b LSL_1402   rpsI FALSE 0.010 1570.000 0.000 NA   NA
 1256045 1256046 LSL_1402 LSL_1403 rpsI rplM TRUE 0.993 14.000 0.601 0.020 Y NA
 1256046 1256047 LSL_1403 LSL_1404 rplM truA FALSE 0.404 135.000 0.052 1.000 Y NA
 1256047 1256048 LSL_1404 LSL_1405 truA cbiQ TRUE 0.954 16.000 0.085 1.000 N NA
 1256048 1256049 LSL_1405 LSL_1406 cbiQ cbiO TRUE 0.974 -7.000 0.136 1.000 Y NA
 1256049 1256050 LSL_1406 LSL_1407 cbiO cbiO TRUE 0.997 -24.000 0.713 0.016 Y NA
 1256050 1256051 LSL_1407 LSL_1408 cbiO rplQ FALSE 0.099 315.000 0.074 1.000 N NA
 1256051 1256052 LSL_1408 LSL_1409 rplQ rpoA TRUE 0.987 34.000 0.873 1.000 N NA
 1256052 1256053 LSL_1409 LSL_1410 rpoA rpsK TRUE 0.776 85.000 0.308 1.000 N NA
 1256053 1256054 LSL_1410 LSL_1411 rpsK rpsM TRUE 0.995 28.000 0.810 0.020 Y NA
 1256054 1256055 LSL_1411 LSL_1412 rpsM rpmJ TRUE 0.982 26.000 0.194 0.020   NA
 1256055 1256056 LSL_1412 LSL_1413 rpmJ infA TRUE 0.955 36.000 0.257 1.000   NA
 1256056 1256057 LSL_1413 LSL_1414 infA adk FALSE 0.156 215.000 0.059 1.000 N NA
 1256057 1256058 LSL_1414 LSL_1415 adk secY TRUE 0.721 100.000 0.241 1.000 N NA
 1256058 1256059 LSL_1415 LSL_1416 secY rplO TRUE 0.990 3.000 0.730 1.000 N NA
 1256059 1256060 LSL_1416 LSL_1417 rplO rpmD TRUE 0.991 36.000 0.653 0.003 Y NA
 1256060 1256061 LSL_1417 LSL_1418 rpmD rpsE TRUE 0.994 14.000 0.789 0.027 Y NA
 1256061 1256062 LSL_1418 LSL_1419 rpsE rplR TRUE 0.997 22.000 0.814 0.027 Y NA
 1256062 1256063 LSL_1419 LSL_1420 rplR rplF TRUE 0.985 45.000 0.815 0.020 Y NA
 1256063 1256064 LSL_1420 LSL_1421 rplF rpsH TRUE 0.993 33.000 0.808 0.020 Y NA
 1256064 1256065 LSL_1421 LSL_1422 rpsH rpsN TRUE 0.987 35.000 0.473 0.020 Y NA
 1256065 1256066 LSL_1422 LSL_1423 rpsN rplE TRUE 0.990 13.000 0.496 0.020 Y NA
 1256066 1256067 LSL_1423 LSL_1424 rplE rplX TRUE 0.996 25.000 0.758 0.020 Y NA
 1256067 1256068 LSL_1424 LSL_1425 rplX rplN TRUE 0.992 35.000 0.810 0.027 Y NA
 1256068 1256069 LSL_1425 LSL_1426 rplN rpsQ TRUE 0.971 59.000 0.791 0.027 Y NA
 1256069 1256070 LSL_1426 LSL_1427 rpsQ rpmC TRUE 0.996 27.000 0.828 0.020 Y NA
 1256070 1256071 LSL_1427 LSL_1428 rpmC rplP TRUE 0.997 -10.000 0.802 0.020 Y NA
 1256071 1256072 LSL_1428 LSL_1429 rplP rpsC TRUE 0.995 4.000 0.828 0.027 Y NA
 1256072 1256073 LSL_1429 LSL_1430 rpsC rplV TRUE 0.994 14.000 0.719 0.027 Y NA
 1256073 1256074 LSL_1430 LSL_1431 rplV rpsS TRUE 0.997 18.000 0.769 0.027 Y NA
 1256074 1256075 LSL_1431 LSL_1432 rpsS rplB TRUE 0.982 48.000 0.820 0.027 Y NA
 1256075 1256076 LSL_1432 LSL_1433 rplB rplW TRUE 0.996 26.000 0.849 0.023 Y NA
 1256076 1256077 LSL_1433 LSL_1434 rplW rplD TRUE 0.991 0.000 0.307 0.020 Y NA
 1256077 1256078 LSL_1434 LSL_1435 rplD rplC TRUE 0.995 25.000 0.544 0.020 Y NA
 1256078 1256079 LSL_1435 LSL_1436 rplC rpsJ TRUE 0.975 44.000 0.467 0.027 Y NA
 1256082 1256083 LSL_1439 LSL_1440 rpiA   TRUE 0.885 -7.000 0.015 1.000   NA
 1256086 1256087 LSL_1443 LSL_1444 glnP glnM TRUE 0.998 21.000 0.947 0.008 Y NA
 1256087 1256088 LSL_1444 LSL_1445 glnM glnH TRUE 0.974 -3.000 0.080 0.035 Y NA
 1256088 1256089 LSL_1445 LSL_1446 glnH glnQ TRUE 0.970 16.000 0.111 1.000 Y NA
 1256089 1256090 LSL_1446 LSL_1447 glnQ   FALSE 0.045 217.000 0.000 NA   NA
 1256090 1256091 LSL_1447 LSL_1448     FALSE 0.109 146.000 0.000 NA   NA
 1256091 1256092 LSL_1448 LSL_1449     TRUE 0.993 16.000 0.667 NA   NA
 1256092 1256093 LSL_1449 LSL_1450   fur FALSE 0.488 99.000 0.071 NA   NA
 1256095 1256096 LSL_1452 LSL_1453 guaB ssl FALSE 0.072 167.000 0.000 1.000 N NA
 1256096 1256097 LSL_1453 LSL_1454 ssl   TRUE 0.723 26.000 0.000 1.000 N NA
 1256097 1256098 LSL_1454 LSL_1455     FALSE 0.171 80.000 0.000 1.000   NA
 1256098 1256099 LSL_1455 LSL_1456     FALSE 0.141 126.000 0.000 NA   NA
 1256099 1256100 LSL_1456 LSL_1457   rluD FALSE 0.182 81.000 0.000 NA   NA
 1256100 1256101 LSL_1457 LSL_1458 rluD   FALSE 0.128 124.000 0.000 1.000 N NA
 1256101 1256102 LSL_1458 LSL_1459     TRUE 0.988 0.000 0.372 1.000 Y NA
 1256102 1256103 LSL_1459 LSL_1460     TRUE 0.992 -7.000 0.652 1.000 N NA
 1256103 1256104 LSL_1460 LSL_1461     FALSE 0.060 186.000 0.000 NA N NA
 1256105 1256106 LSL_1462 LSL_1463     TRUE 0.788 -3.000 0.000 NA   NA
 1256107 1256108 LSL_1464 LSL_1465   nagB FALSE 0.027 262.000 0.000 1.000   NA
 1256110 1256111 LSL_1467 LSL_1468     FALSE 0.094 147.000 0.000 1.000 N NA
 1256111 1256112 LSL_1468 LSL_1469     TRUE 0.992 0.000 0.710 NA   NA
 1256112 1256113 LSL_1469 LSL_1470     TRUE 0.915 14.000 0.065 NA   NA
 1256113 1256114 LSL_1470 LSL_1471     FALSE 0.012 590.000 0.000 NA   NA
 1256114 1256115 LSL_1471 LSL_1472     FALSE 0.122 137.000 0.000 NA   NA
 1256115 1256116 LSL_1472 LSL_1473   crcB FALSE 0.233 72.000 0.000 NA   NA
 1256116 1256117 LSL_1473 LSL_1474 crcB crcB TRUE 0.984 -3.000 0.160 0.055 Y NA
 1256117 1256118 LSL_1474 LSL_1475 crcB trxA FALSE 0.290 58.000 0.000 1.000 N NA
 1256118 1256119 LSL_1475 LSL_1476 trxA   FALSE 0.197 74.000 0.000 1.000   NA
 1256119 1256120 LSL_1476 LSL_1477     FALSE 0.292 100.000 0.000 0.043   NA
 1256120 1256121 LSL_1477 LSL_1478     FALSE 0.055 199.000 0.000 NA   NA
 1256121 1256122 LSL_1478 LSL_1479     TRUE 0.761 15.000 0.000 NA   NA
 1256122 1256123 LSL_1479 LSL_1480   cspC TRUE 0.628 114.000 0.167 1.000   NA
 1256123 1256124 LSL_1480 LSL_1481 cspC troR TRUE 0.617 148.000 0.122 0.045 Y NA
 1256124 1256125 LSL_1481 LSL_1482 troR rluD FALSE 0.121 127.000 0.000 1.000 N NA
 1256125 1256126 LSL_1482 LSL_1483 rluD   TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 1256128 1256129 LSL_1485 LSL_1486   aes FALSE 0.364 50.000 0.000 1.000   NA
 1256129 1256130 LSL_1486 LSL_1487 aes   FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 1256130 1256131 LSL_1487 LSL_1488   azlC TRUE 0.978 0.000 0.225 NA   NA
 1256131 1256132 LSL_1488 LSL_1489 azlC   FALSE 0.171 90.000 0.000 NA   NA
 1256134 1256135 LSL_1491 LSL_1492     FALSE 0.078 170.000 0.000 NA   NA
 1256135 1256136 LSL_1492 LSL_1493     FALSE 0.058 194.000 0.000 NA   NA
 1256136 1256137 LSL_1493 LSL_1494     FALSE 0.014 457.000 0.000 NA   NA
 1256137 1256138 LSL_1494 LSL_1495     TRUE 0.711 14.000 0.000 NA   NA
 1256138 1256139 LSL_1495 LSL_1496     FALSE 0.068 179.000 0.000 NA   NA
 1256139 1256140 LSL_1496 LSL_1497     TRUE 0.803 -10.000 0.000 NA   NA
 1256140 1256141 LSL_1497 LSL_1498   gpmA FALSE 0.104 144.000 0.000 1.000   NA
 1256141 1256142 LSL_1498 LSL_1499 gpmA   FALSE 0.148 94.000 0.000 1.000 N NA
 1256142 1256143 LSL_1499 LSL_1500     TRUE 0.761 1.000 0.000 NA   NA
 1256145 1256146 LSL_1502 LSL_1503   galM FALSE 0.164 83.000 0.000 1.000   NA
 1256146 1256147 LSL_1503 LSL_1504 galM   FALSE 0.121 133.000 0.000 1.000   NA
 1256147 1256148 LSL_1504 LSL_1505     TRUE 0.978 2.000 0.259 NA   NA
 1256151 1256152 LSL_1508 LSL_1509     TRUE 0.760 160.000 0.667 1.000 N NA
 1256156 1256157 LSL_1513 LSL_1514 treR treC TRUE 0.989 19.000 0.336 1.000 N NA
 1256158 1256159 LSL_1515 LSL_1515b     FALSE 0.013 477.000 0.000 NA   NA
 1256159 1256160 LSL_1515b LSL_1516     FALSE 0.039 238.000 0.000 NA   NA
 1256160 1256161 LSL_1516 LSL_1517     FALSE 0.365 52.000 0.000 NA   NA
 1256161 1256162 LSL_1517 LSL_1518   thrB FALSE 0.191 77.000 0.000 NA   NA
 1256162 1256163 LSL_1518 LSL_1519 thrB thrA TRUE 0.905 5.000 0.036 1.000 Y NA
 1256164 1256165 LSL_1520 LSL_1521 apbE thrC FALSE 0.221 70.000 0.000 1.000 N NA
 1256165 1256166 LSL_1521 LSL_1522 thrC   FALSE 0.101 146.000 0.000 1.000   NA
 1256167 1256168 LSL_1523 LSL_1524   rfaG TRUE 0.835 21.000 0.000 NA   NA
 1256169 1256170 LSL_1525 LSL_1526     TRUE 0.773 0.000 0.000 NA   NA
 1256171 1256172 LSL_1526b LSL_1526c     FALSE 0.485 43.000 0.000 NA   NA
 1256173 1256174 LSL_1527 LSL_1528   uRH FALSE 0.068 170.000 0.000 1.000 N NA
 1256174 1256175 LSL_1528 LSL_1529 uRH   TRUE 0.976 4.000 0.262 NA   NA
 1256176 1256177 LSL_1530 LSL_1531     TRUE 0.976 18.000 0.143 NA   NA
 1256177 1256178 LSL_1531 LSL_1532   dacC FALSE 0.081 168.000 0.000 NA   NA
 1256178 1256179 LSL_1532 LSL_1533 dacC napA FALSE 0.016 371.000 0.000 1.000 N NA
 1256181 1256182 LSL_1535 LSL_1536     FALSE 0.119 141.000 0.000 NA   NA
 1256182 1256183 LSL_1536 LSL_1537   guaA FALSE 0.205 75.000 0.000 NA   NA
 1256183 1256184 LSL_1537 LSL_1538 guaA coaA FALSE 0.377 97.000 0.006 0.041 N NA
 1256186 1256187 LSL_1540 LSL_1541     TRUE 0.991 -7.000 0.410 1.000 Y NA
 1256187 1256188 LSL_1541 LSL_1542     FALSE 0.057 230.000 0.000 1.000 Y NA
 1256189 1256190 LSL_1543 LSL_1544     TRUE 0.727 4.000 0.000 NA   NA
 1256191 1256192 LSL_1545 LSL_1546     TRUE 0.648 33.000 0.000 NA   NA
 1256192 1256193 LSL_1546 LSL_1547     FALSE 0.042 216.000 0.000 1.000   NA
 1256193 1256194 LSL_1547 LSL_1548   glf TRUE 0.887 3.000 0.032 1.000   NA
 1256196 1256197 LSL_1550 LSL_1551     FALSE 0.176 80.000 0.000 NA N NA
 1256197 1256198 LSL_1551 LSL_1552     TRUE 0.831 20.000 0.000 NA N NA
 1256198 1256199 LSL_1552 LSL_1553     FALSE 0.087 352.000 0.080 1.000 N NA
 1256199 1256200 LSL_1553 LSL_1554     TRUE 0.993 18.000 0.615 1.000 N NA
 1256200 1256201 LSL_1554 LSL_1554b     FALSE 0.373 51.000 0.000 NA   NA
 1256201 1256202 LSL_1554b LSL_1554c     FALSE 0.042 225.000 0.000 NA   NA
 1256202 1256203 LSL_1554c LSL_1555   rfbX TRUE 0.835 21.000 0.000 NA   NA
 1256203 1256204 LSL_1555 LSL_1556 rfbX rfaG FALSE 0.576 36.000 0.000 1.000   NA
 1256204 1256205 LSL_1556 LSL_1557 rfaG   TRUE 0.840 20.000 0.000 NA   NA
 1256205 1256206 LSL_1557 LSL_1558     TRUE 0.840 20.000 0.000 NA   NA
 1256206 1256207 LSL_1558 LSL_1559   rfaG TRUE 0.804 -25.000 0.000 NA   NA
 1256207 1256208 LSL_1559 LSL_1560 rfaG rfaG TRUE 0.812 3.000 0.000 NA Y NA
 1256208 1256209 LSL_1560 LSL_1561 rfaG rfaG TRUE 0.625 40.000 0.000 NA Y NA
 1256209 1256210 LSL_1561 LSL_1562 rfaG   FALSE 0.012 522.000 0.000 NA   NA
 1256210 1256211 LSL_1562 LSL_1563     FALSE 0.222 73.000 0.000 NA   NA
 1256211 1256212 LSL_1563 LSL_1564     FALSE 0.328 116.000 0.000 0.064 Y NA
 1256212 1256213 LSL_1564 LSL_1565     TRUE 0.994 -15.000 0.649 NA Y NA
 1256213 1256214 LSL_1565 LSL_1566     FALSE 0.058 194.000 0.000 NA   NA
 1256214 1256215 LSL_1566 LSL_1567     TRUE 0.777 25.000 0.000 NA   NA
 1256215 1256216 LSL_1567 LSL_1568     FALSE 0.303 61.000 0.000 NA   NA
 1256216 1256217 LSL_1568 LSL_1569   rfbD FALSE 0.038 219.000 0.000 1.000 N NA
 1256217 1256218 LSL_1569 LSL_1570 rfbD rfbB TRUE 0.909 56.000 0.152 0.003 Y NA
 1256218 1256219 LSL_1570 LSL_1571 rfbB rfbC TRUE 0.872 12.000 0.029 1.000 Y NA
 1256219 1256220 LSL_1571 LSL_1572 rfbC rfbA TRUE 0.963 3.000 0.135 1.000 Y NA
 1256220 1256221 LSL_1572 LSL_1573 rfbA rfaG FALSE 0.141 126.000 0.000 NA   NA
 1256221 1256222 LSL_1573 LSL_1574 rfaG rfaG FALSE 0.446 82.000 0.050 NA   NA
 1256224 1256225 LSL_1576 LSL_1577     TRUE 0.788 16.000 0.000 1.000   NA
 1256225 1256226 LSL_1577 LSL_1578     FALSE 0.159 90.000 0.000 1.000   NA
 1256227 1256228 LSL_1579 LSL_1580     FALSE 0.191 77.000 0.000 NA   NA
 1256228 1256229 LSL_1580 LSL_1581     FALSE 0.026 268.000 0.000 1.000   NA
 1256230 1256231 LSL_1582 LSL_1583   thiD FALSE 0.279 62.000 0.000 1.000   NA
 1256231 1256232 LSL_1583 LSL_1584 thiD   FALSE 0.248 70.000 0.000 NA   NA
 1256232 1256233 LSL_1584 LSL_1585     FALSE 0.038 240.000 0.000 NA   NA
 1256233 1256234 LSL_1585 LSL_1586     TRUE 0.993 -7.000 0.379 0.099 Y NA
 1256234 1256235 LSL_1586 LSL_1587     TRUE 0.909 3.000 0.029 1.000 Y NA
 1256235 1256236 LSL_1587 LSL_1588     FALSE 0.040 234.000 0.000 NA   NA
 1256236 1256237 LSL_1588 LSL_1590     FALSE 0.013 479.000 0.000 NA   NA
 1256239 1256240 LSL_1592 LSL_1593     TRUE 0.685 30.000 0.000 NA   NA
 1256240 1256241 LSL_1593 LSL_1594     TRUE 0.842 30.000 0.022 NA   NA
 1256241 1256242 LSL_1594 LSL_1595     TRUE 0.954 18.000 0.064 NA   NA
 1256242 1256243 LSL_1595 LSL_1596   parB TRUE 0.937 17.000 0.039 NA   NA
 1256243 1256244 LSL_1596 LSL_1597 parB   TRUE 0.994 -10.000 0.827 1.000 N NA
 1256244 1256245 LSL_1597 LSL_1598   parB TRUE 0.953 18.000 0.069 1.000 N NA
 1256245 1256246 LSL_1598 LSL_1599 parB gidB TRUE 0.914 31.000 0.089 1.000 N NA
 1256246 1256247 LSL_1599 LSL_1600 gidB   FALSE 0.075 163.000 0.000 1.000 N NA
 1256251 1256252 LSL_1604 LSL_1605 thiJ   TRUE 0.752 2.000 0.000 NA   NA
 1256252 1256253 LSL_1605 LSL_1606     FALSE 0.128 134.000 0.000 NA   NA
 1256253 1256254 LSL_1606 LSL_1607     FALSE 0.385 49.000 0.000 NA N NA
 1256254 1256255 LSL_1607 LSL_1608     TRUE 0.985 5.000 0.276 0.063 Y NA
 1256257 1256258 LSL_1610 LSL_1611 prsA proA FALSE 0.225 94.000 0.000 1.000 Y NA
 1256258 1256259 LSL_1611 LSL_1612 proA proB TRUE 0.986 12.000 0.281 0.001 Y NA
 1256259 1256260 LSL_1612 LSL_1613 proB manA FALSE 0.112 134.000 0.000 1.000 N NA
 1256260 1256261 LSL_1613 LSL_1614 manA   FALSE 0.032 255.000 0.000 NA   NA
 1256261 1256262 LSL_1614 LSL_1615     TRUE 0.738 3.000 0.000 NA   NA
 1256262 1256263 LSL_1615 LSL_1616     TRUE 0.803 -13.000 0.000 NA   NA
 1256263 1256264 LSL_1616 LSL_1617     TRUE 0.992 3.000 0.833 1.000 N NA
 1256264 1256265 LSL_1617 LSL_1618   mtlD FALSE 0.107 137.000 0.000 1.000 N NA
 1256265 1256266 LSL_1618 LSL_1619 mtlD   TRUE 0.925 0.000 0.031 1.000 Y NA
 1256266 1256267 LSL_1619 LSL_1620   mtlA TRUE 0.949 15.000 0.016 0.005 Y NA
 1256267 1256268 LSL_1620 LSL_1621 mtlA terC FALSE 0.057 264.000 0.000 0.052 N NA
 1256268 1256269 LSL_1621 LSL_1622 terC   FALSE 0.145 103.000 0.000 1.000   NA
 1256269 1256270 LSL_1622 LSL_1623     FALSE 0.125 129.000 0.000 1.000   NA
 1256270 1256271 LSL_1623 LSL_1624     FALSE 0.135 106.000 0.000 1.000 N NA
 1256271 1256272 LSL_1624 LSL_1625     FALSE 0.110 135.000 0.000 1.000 N NA
 1256272 1256273 LSL_1625 LSL_1626     TRUE 0.960 23.000 0.069 1.000 Y NA
 1256273 1256274 LSL_1626 LSL_1627   glmS FALSE 0.014 387.000 0.000 1.000 N NA
 1256274 1256275 LSL_1627 LSL_1628 glmS   FALSE 0.148 145.000 0.003 1.000 N NA
 1256275 1256276 LSL_1628 LSL_1629   nhaP FALSE 0.298 86.000 0.000 0.043 N NA
 1256276 1256277 LSL_1629 LSL_1630 nhaP glpF FALSE 0.022 301.000 0.000 1.000 N NA
 1256277