MicrobesOnline Operon Predictions for Mycobacterium ulcerans Agy99

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1983853 1983854 MUL_0001 MUL_0002 dnaA dnaN FALSE 0.180 539.000 0.328 1.000 Y NA
 1983854 1983855 MUL_0002 MUL_0003 dnaN recF TRUE 0.974 21.000 0.318 1.000 Y NA
 1983855 1983856 MUL_0003 MUL_0004 recF   TRUE 0.971 -3.000 0.099 NA   NA
 1983856 1983857 MUL_0004 MUL_0005   gyrB FALSE 0.045 210.000 0.022 NA   NA
 1983857 1983858 MUL_0005 MUL_0006 gyrB gyrA TRUE 0.956 40.000 0.306 0.001 Y NA
 1983858 1983859 MUL_0006 MUL_0007 gyrA   FALSE 0.221 84.000 0.009 NA   NA
 1983859 1983860 MUL_0007 MUL_0008   ileT FALSE 0.385 -35.000 0.000 NA   NA
 1983860 1983861 MUL_0008 MUL_0009 ileT alaT FALSE 0.056 161.000 0.000 NA   NA
 1983861 1983862 MUL_0009 MUL_0010 alaT   FALSE 0.082 137.000 0.000 NA   NA
 1983863 1983864 MUL_0011 MUL_0012     FALSE 0.120 111.000 0.000 NA   NA
 1983866 1983867 MUL_0014 MUL_0015     FALSE 0.184 156.000 0.181 NA   NA
 1983868 1983869 MUL_0016 MUL_0017   trpG TRUE 0.610 38.000 0.098 NA   NA
 1983870 1983871 MUL_0018 MUL_0019 pknB pknA TRUE 0.998 -3.000 0.426 0.003 Y NA
 1983871 1983872 MUL_0019 MUL_0020 pknA pbpA TRUE 0.992 -3.000 0.574 1.000 N NA
 1983872 1983873 MUL_0020 MUL_0021 pbpA rodA TRUE 0.983 -3.000 0.250 1.000 N NA
 1983873 1983874 MUL_0021 MUL_0022 rodA pstP TRUE 0.976 -3.000 0.145 1.000 N NA
 1983874 1983875 MUL_0022 MUL_0023 pstP   TRUE 0.996 -3.000 0.216 NA Y NA
 1983875 1983876 MUL_0023 MUL_0024     FALSE 0.171 134.000 0.069 NA   NA
 1983877 1983878 MUL_0025 MUL_0026   leuT FALSE 0.115 113.000 0.000 NA   NA
 1983878 1983879 MUL_0026 MUL_0027 leuT   FALSE 0.022 240.000 0.000 NA   NA
 1983882 1983883 MUL_0030 MUL_0032     TRUE 0.823 6.000 0.000 NA   NA
 1983883 1983884 MUL_0032 MUL_0033   proV_1 FALSE 0.409 101.000 0.115 0.053   NA
 1983884 1983885 MUL_0033 MUL_0034 proV_1   TRUE 0.975 -7.000 0.138 0.053 Y NA
 1983889 1983890 MUL_0038 MUL_0039     TRUE 0.960 -3.000 0.042 NA   NA
 1983890 1983891 MUL_0039 MUL_0040   whiB5 FALSE 0.050 167.000 0.000 NA   NA
 1983892 1983893 MUL_0041 MUL_0042     TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 1983893 1983894 MUL_0042 MUL_0043     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 1983894 1983895 MUL_0043 MUL_0044     TRUE 0.804 75.000 1.000 NA   NA
 1983895 1983896 MUL_0044 MUL_0045     TRUE 0.841 43.000 0.600 NA   NA
 1983896 1983897 MUL_0045 MUL_0046     TRUE 0.994 -3.000 0.800 NA   NA
 1983897 1983898 MUL_0046 MUL_0047     FALSE 0.091 128.000 0.000 NA   NA
 1983898 1983899 MUL_0047 MUL_0048     TRUE 0.766 88.000 1.000 NA   NA
 1983899 1983900 MUL_0048 MUL_0049     FALSE 0.095 125.000 0.000 NA   NA
 1983901 1983902 MUL_0050 MUL_0051     TRUE 0.961 3.000 0.174 NA   NA
 1983904 1983905 MUL_0053 MUL_0054     FALSE 0.366 53.000 0.016 NA   NA
 1983905 1983906 MUL_0054 MUL_0055   mtc28 TRUE 0.762 85.000 0.875 NA   NA
 1983908 1983909 MUL_0057 MUL_0058     FALSE 0.546 41.000 0.039 1.000   NA
 1983909 1983910 MUL_0058 MUL_0059     FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 1983910 1983911 MUL_0059 MUL_0060   glnQ TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1983911 1983912 MUL_0060 MUL_0061 glnQ   FALSE 0.183 82.000 0.000 NA   NA
 1983912 1983913 MUL_0061 MUL_0062     FALSE 0.500 111.000 0.412 1.000 N NA
 1983913 1983914 MUL_0062 MUL_0063     TRUE 0.776 32.000 0.235 1.000   NA
 1983914 1983915 MUL_0063 MUL_0064   ino1 FALSE 0.543 46.000 0.059 1.000   NA
 1983915 1983916 MUL_0064 MUL_0065 ino1   TRUE 0.753 62.000 0.608 NA N NA
 1983916 1983917 MUL_0065 MUL_0066     FALSE 0.155 156.000 0.122 NA   NA
 1983918 1983919 MUL_0067 MUL_0068   ponA1 FALSE 0.029 488.000 0.200 NA   NA
 1983919 1983920 MUL_0068 MUL_0069 ponA1   TRUE 0.980 -3.000 0.204 NA   NA
 1983920 1983921 MUL_0069 MUL_0070     TRUE 0.960 0.000 0.061 NA   NA
 1983921 1983922 MUL_0070 MUL_0071   rpsF FALSE 0.113 124.000 0.002 NA   NA
 1983922 1983923 MUL_0071 MUL_0072 rpsF ssb FALSE 0.246 92.000 0.029 1.000 N NA
 1983923 1983924 MUL_0072 MUL_0073 ssb rpsR1 FALSE 0.463 46.000 0.030 1.000 N NA
 1983924 1983925 MUL_0073 MUL_0074 rpsR1 rplI TRUE 0.958 47.000 0.499 0.018 Y NA
 1983925 1983926 MUL_0074 MUL_0075 rplI dnaB FALSE 0.011 531.000 0.012 1.000 N NA
 1983926 1983927 MUL_0075 MUL_0076 dnaB   FALSE 0.007 565.000 0.000 NA   NA
 1983932 1983933 MUL_0082 MUL_0083 emrB mmpL5_3 FALSE 0.162 90.000 0.000 NA   NA
 1983936 1983937 MUL_0086 MUL_0087     TRUE 0.984 -3.000 0.286 NA N NA
 1983940 1983941 MUL_0090 MUL_0091 rfbD   TRUE 0.622 -129.000 0.220 NA   NA
 1983941 1983942 MUL_0091 MUL_0092   rfbE TRUE 0.758 -52.000 0.303 NA   NA
 1983942 1983943 MUL_0092 MUL_0093 rfbE   TRUE 0.948 4.000 0.136 NA   NA
 1983943 1983944 MUL_0093 MUL_0094     TRUE 0.855 13.000 0.093 NA   NA
 1983947 1983948 MUL_0097 MUL_0098 serU   FALSE 0.008 500.000 0.000 NA   NA
 1983948 1983949 MUL_0098 MUL_0099     FALSE 0.027 218.000 0.000 NA   NA
 1983951 1983952 MUL_0101 MUL_0102   mgtE FALSE 0.147 99.000 0.000 NA   NA
 1983955 1983956 MUL_0105 MUL_0106   cya_1 FALSE 0.200 75.000 0.000 NA   NA
 1983957 1983958 MUL_0107 MUL_0108     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1983958 1983959 MUL_0108 MUL_0109   eutC TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1983960 1983961 MUL_0110 MUL_0111     TRUE 0.942 7.000 0.208 NA   NA
 1983961 1983962 MUL_0111 MUL_0112     TRUE 0.905 14.000 0.250 NA   NA
 1983962 1983963 MUL_0112 MUL_0113     TRUE 0.972 1.000 0.200 NA   NA
 1983963 1983964 MUL_0113 MUL_0114     FALSE 0.464 107.000 0.333 NA   NA
 1983964 1983965 MUL_0114 MUL_0115   coxL TRUE 0.986 4.000 0.750 NA N NA
 1983965 1983966 MUL_0115 MUL_0116 coxL coxS TRUE 0.999 -3.000 0.818 0.001 Y NA
 1983966 1983967 MUL_0116 MUL_0117 coxS coxM TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 1983967 1983968 MUL_0117 MUL_0118 coxM   FALSE 0.506 25.000 0.000 NA   NA
 1983969 1983970 MUL_0119 MUL_0120   secE2 TRUE 0.600 18.000 0.000 NA   NA
 1983971 1983972 MUL_0121 MUL_0122     TRUE 0.654 -15.000 0.055 NA   NA
 1983972 1983973 MUL_0122 MUL_0123   pyrE TRUE 0.785 12.000 0.012 NA   NA
 1983973 1983974 MUL_0123 MUL_0124 pyrE   TRUE 0.657 -13.000 0.028 1.000   NA
 1983974 1983975 MUL_0124 MUL_0125     TRUE 0.645 45.000 0.188 NA   NA
 1983978 1983979 MUL_0128 MUL_0129     TRUE 0.739 75.000 0.667 1.000 N NA
 1983979 1983980 MUL_0129 MUL_0130     FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   NA
 1983980 1983981 MUL_0130 MUL_0131     FALSE 0.011 358.000 0.000 NA   NA
 1983985 1983986 MUL_0135 MUL_0136     FALSE 0.068 348.000 0.333 1.000 N NA
 1983986 1983987 MUL_0136 MUL_0137     TRUE 0.851 17.000 0.077 0.009 N NA
 1983987 1983988 MUL_0137 MUL_0138   metE FALSE 0.014 333.000 0.000 1.000 N NA
 1983989 1983990 MUL_0139 MUL_0140     TRUE 0.630 72.000 0.375 NA   NA
 1983991 1983992 MUL_0141 MUL_0142 ppdK   TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 1983993 1983994 MUL_0143 MUL_0144   ephC TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1983998 1983999 MUL_0148 MUL_0149 gnd2 zwf1 TRUE 0.968 15.000 0.062 1.000 Y NA
 1984000 1984001 MUL_0150 MUL_0151     FALSE 0.416 33.000 0.000 NA   NA
 1984001 1984002 MUL_0151 MUL_5079     FALSE 0.449 -18.000 0.000 NA   NA
 1984003 1984004 MUL_0152 MUL_0153     FALSE 0.235 76.000 0.000 1.000   NA
 1984004 1984005 MUL_0153 MUL_0154     FALSE 0.218 69.000 0.000 NA   NA
 1984006 1984007 MUL_0155 MUL_0156     FALSE 0.359 -55.000 0.000 NA   NA
 1984008 1984009 MUL_0157 MUL_0158     FALSE 0.378 71.000 0.071 NA   NA
 1984011 1984012 MUL_0160 MUL_0161     TRUE 0.963 5.000 0.273 NA   NA
 1984012 1984013 MUL_0161 MUL_0162     FALSE 0.140 102.000 0.000 NA   NA
 1984014 1984015 MUL_0163 MUL_0164     FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 1984016 1984017 MUL_0165 MUL_0166     FALSE 0.009 405.000 0.000 NA   NA
 1984020 1984021 MUL_0169 MUL_0170   xseA TRUE 0.953 -3.000 0.024 NA   NA
 1984021 1984022 MUL_0170 MUL_0171 xseA xseB TRUE 0.976 -16.000 0.412 0.001 Y NA
 1984022 1984023 MUL_0171 MUL_0172 xseB   FALSE 0.346 55.000 0.009 1.000 N NA
 1984023 1984024 MUL_0172 MUL_0173     FALSE 0.056 175.000 0.000 1.000   NA
 1984025 1984026 MUL_0174 MUL_0175     FALSE 0.150 97.000 0.000 NA   NA
 1984026 1984027 MUL_0175 MUL_0176     FALSE 0.012 349.000 0.000 NA   NA
 1984029 1984030 MUL_0178 MUL_0179     TRUE 0.746 28.000 0.167 NA   NA
 1984031 1984032 MUL_0180 MUL_0181 glpX fum TRUE 0.588 38.000 0.071 1.000 N NA
 1984032 1984033 MUL_0181 MUL_0182 fum   FALSE 0.201 97.000 0.014 NA   NA
 1984034 1984035 MUL_0183 MUL_0184     TRUE 0.621 -7.000 0.000 NA   NA
 1984035 1984036 MUL_0184 MUL_0185   phoH2 FALSE 0.208 72.000 0.000 NA   NA
 1984036 1984037 MUL_0185 MUL_0186 phoH2   TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984037 1984038 MUL_0186 MUL_0187   desA2 FALSE 0.111 115.000 0.000 NA   NA
 1984038 1984039 MUL_0187 MUL_0188 desA2 glyA1 TRUE 0.558 57.000 0.143 1.000   NA
 1984041 1984042 MUL_0190 MUL_0191     FALSE 0.031 206.000 0.000 NA   NA
 1984042 1984043 MUL_0191 MUL_0192     FALSE 0.176 85.000 0.000 NA   NA
 1984043 1984044 MUL_0192 MUL_0193   uppS FALSE 0.046 239.000 0.058 NA   NA
 1984046 1984047 MUL_0195 MUL_0196     TRUE 0.810 14.000 0.034 1.000   NA
 1984047 1984048 MUL_0196 MUL_0197     TRUE 0.642 -13.000 0.039 NA   NA
 1984048 1984049 MUL_0197 MUL_0198   mca TRUE 0.975 -3.000 0.141 NA   NA
 1984050 1984051 MUL_0199 MUL_0200   greA FALSE 0.100 232.000 0.250 NA   NA
 1984052 1984053 MUL_0201 MUL_0202 metB pra FALSE 0.217 100.000 0.028 NA   NA
 1984053 1984054 MUL_0202 MUL_0203 pra cbs FALSE 0.060 196.000 0.034 NA   NA
 1984054 1984055 MUL_0203 MUL_0204 cbs lipU FALSE 0.349 59.000 0.017 1.000 N NA
 1984056 1984057 MUL_0206 MUL_0207   fadA3 FALSE 0.414 110.000 0.275 1.000 N NA
 1984059 1984060 MUL_0209 MUL_0210 echA9 echA8 TRUE 0.984 12.000 0.128 0.009 Y NA
 1984060 1984061 MUL_0210 MUL_0211 echA8   TRUE 0.925 12.000 0.259 NA   NA
 1984061 1984062 MUL_0211 MUL_0212     FALSE 0.034 200.000 0.000 NA   NA
 1984062 1984063 MUL_0212 MUL_0213     FALSE 0.026 220.000 0.000 NA   NA
 1984063 1984064 MUL_0213 MUL_0214     FALSE 0.201 -1890.000 0.000 NA   NA
 1984065 1984066 MUL_0215 MUL_0216     TRUE 0.989 0.000 0.429 1.000   NA
 1984067 1984068 MUL_0217 MUL_0218 lpqV   FALSE 0.188 103.000 0.016 NA   NA
 1984069 1984070 MUL_0219 MUL_0220     FALSE 0.532 24.000 0.000 NA   NA
 1984070 1984071 MUL_0220 MUL_0221     TRUE 0.808 33.000 0.333 NA   NA
 1984071 1984072 MUL_0221 MUL_0222     FALSE 0.068 149.000 0.000 NA   NA
 1984073 1984074 MUL_0223 MUL_0224     FALSE 0.506 25.000 0.000 NA   NA
 1984075 1984076 MUL_0225 MUL_0226     TRUE 0.810 -7.000 0.100 NA   NA
 1984076 1984077 MUL_0226 MUL_0227   aslA TRUE 0.904 1.000 0.000 NA   NA
 1984077 1984078 MUL_0227 MUL_0228 aslA   FALSE 0.115 113.000 0.000 NA   NA
 1984078 1984079 MUL_0228 MUL_0229   fadD14 FALSE 0.012 352.000 0.000 NA   NA
 1984079 1984080 MUL_0229 MUL_0230 fadD14   FALSE 0.243 122.000 0.125 NA   NA
 1984080 1984081 MUL_0230 MUL_0231     FALSE 0.010 396.000 0.000 NA   NA
 1984081 1984082 MUL_0231 MUL_0232     FALSE 0.532 24.000 0.000 NA   NA
 1984082 1984083 MUL_0232 MUL_0233   ctpE FALSE 0.007 573.000 0.000 NA   NA
 1984083 1984084 MUL_0233 MUL_0234 ctpE   TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984084 1984085 MUL_0234 MUL_0235     FALSE 0.023 239.000 0.000 NA   NA
 1984085 1984086 MUL_0235 MUL_0236   echA6 TRUE 0.959 7.000 0.314 NA   NA
 1984087 1984088 MUL_0237 MUL_0240 accD3   FALSE 0.007 1058.000 0.000 1.000   NA
 1984088 1984089 MUL_0240 MUL_0241   bioF2_1 TRUE 0.607 22.000 0.000 1.000   NA
 1984089 1984090 MUL_0241 MUL_0242 bioF2_1 cysM FALSE 0.079 176.000 0.000 0.016 N NA
 1984090 1984091 MUL_0242 MUL_0244 cysM erg3_1 FALSE 0.022 245.000 0.000 NA   NA
 1984093 1984094 MUL_0247 MUL_0248   prrA FALSE 0.082 151.000 0.000 1.000   NA
 1984094 1984095 MUL_0248 MUL_0249 prrA prrB TRUE 0.983 15.000 0.333 1.000 Y NA
 1984096 1984097 MUL_0250 MUL_0251     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984097 1984098 MUL_0251 MUL_0252   ompA TRUE 0.922 13.000 0.286 NA   NA
 1984099 1984100 MUL_0253 MUL_0254     TRUE 0.741 24.000 0.091 NA   NA
 1984101 1984102 MUL_0255 MUL_0256 gltA2   FALSE 0.011 388.000 0.000 1.000 N NA
 1984102 1984103 MUL_0256 MUL_0257   pdxH FALSE 0.020 264.000 0.000 1.000 N NA
 1984103 1984104 MUL_0257 MUL_0258 pdxH   FALSE 0.090 129.000 0.000 NA   NA
 1984106 1984107 MUL_0260 MUL_0261     FALSE 0.234 -1467.000 0.000 NA   NA
 1984108 1984109 MUL_0262 MUL_0263     FALSE 0.005 2316.000 0.000 NA   NA
 1984110 1984111 MUL_0264 MUL_0265 fprB   TRUE 0.957 19.000 0.846 1.000   NA
 1984112 1984113 MUL_0266 MUL_0267 serC   FALSE 0.306 122.000 0.214 NA   NA
 1984114 1984115 MUL_0268 MUL_0269     TRUE 0.967 -3.000 0.075 NA   NA
 1984115 1984116 MUL_0269 MUL_0270     TRUE 0.582 30.000 0.029 1.000 N NA
 1984117 1984118 MUL_0271 MUL_0272     TRUE 0.846 24.000 0.269 NA   NA
 1984120 1984121 MUL_0274 MUL_0275     TRUE 0.990 -3.000 0.432 NA   NA
 1984121 1984122 MUL_0275 MUL_0276     FALSE 0.243 108.000 0.069 NA   NA
 1984123 1984124 MUL_0277 MUL_0278   fadE10 FALSE 0.185 105.000 0.030 NA N NA
 1984124 1984125 MUL_0278 MUL_0279 fadE10 cspB FALSE 0.065 187.000 0.027 1.000 N NA
 1984126 1984127 MUL_0280 MUL_0281   moaA2 TRUE 0.954 -3.000 0.026 NA   NA
 1984127 1984128 MUL_0281 MUL_0282 moaA2 moaD2 TRUE 0.943 14.000 0.410 1.000   NA
 1984128 1984129 MUL_0282 MUL_0283 moaD2 rpfA FALSE 0.011 413.000 0.000 1.000   NA
 1984130 1984131 MUL_0284 MUL_0285 moaE2 mog TRUE 0.996 -3.000 0.015 0.003 Y NA
 1984131 1984132 MUL_0285 MUL_0286 mog moaC2 TRUE 0.996 -3.000 0.016 0.003 Y NA
 1984132 1984133 MUL_0286 MUL_0287 moaC2   TRUE 0.893 4.000 0.012 NA   NA
 1984134 1984135 MUL_0288 MUL_0289   ercc3 FALSE 0.376 104.000 0.206 NA   NA
 1984138 1984139 MUL_0292 MUL_0293     FALSE 0.245 106.000 0.083 NA N NA
 1984141 1984142 MUL_0295 MUL_0296 fadB fadA TRUE 0.997 5.000 0.750 1.000 Y NA
 1984144 1984145 MUL_0298 MUL_0299     FALSE 0.484 26.000 0.000 NA   NA
 1984145 1984146 MUL_0299 MUL_0300   far FALSE 0.258 59.000 0.000 NA   NA
 1984146 1984147 MUL_0300 MUL_0301 far   FALSE 0.008 453.000 0.000 NA   NA
 1984149 1984150 MUL_0303 MUL_0304   fadD16 TRUE 0.679 14.000 0.000 NA   NA
 1984150 1984151 MUL_0304 MUL_0305 fadD16   FALSE 0.061 156.000 0.000 NA   NA
 1984151 1984152 MUL_0305 MUL_0306     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984152 1984153 MUL_0306 MUL_0307   fadD3_2 FALSE 0.011 355.000 0.000 NA   NA
 1984153 1984154 MUL_0307 MUL_0308 fadD3_2   FALSE 0.089 130.000 0.000 NA   NA
 1984154 1984155 MUL_0308 MUL_0309     FALSE 0.506 94.000 0.286 1.000   NA
 1984156 1984157 MUL_0310 MUL_0311 echA8_2   TRUE 0.966 -3.000 0.069 NA   NA
 1984159 1984160 MUL_0312 MUL_0313     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984162 1984163 MUL_0315 MUL_0316 fabG2   FALSE 0.426 109.000 0.286 1.000 N NA
 1984163 1984164 MUL_0316 MUL_0317   cyp188A3 TRUE 0.975 15.000 1.000 0.014 N NA
 1984165 1984166 MUL_0318 MUL_0319     FALSE 0.463 -16.000 0.000 NA   NA
 1984168 1984169 MUL_0321 MUL_0322     FALSE 0.010 406.000 0.000 1.000 N NA
 1984170 1984171 MUL_0323 MUL_0324   cyp189A7 FALSE 0.029 234.000 0.000 1.000   NA
 1984171 1984172 MUL_0324 MUL_0325 cyp189A7   FALSE 0.432 31.000 0.000 NA   NA
 1984172 1984173 MUL_0325 MUL_0326     TRUE 0.725 12.000 0.000 NA   NA
 1984174 1984175 MUL_0327 MUL_0328     TRUE 0.982 9.000 0.857 1.000 N NA
 1984175 1984176 MUL_0328 MUL_0329   echA4_1 TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1984176 1984177 MUL_0329 MUL_0330 echA4_1   FALSE 0.416 33.000 0.000 NA   NA
 1984177 1984178 MUL_0330 MUL_0331     TRUE 0.991 -10.000 1.000 0.001 Y NA
 1984178 1984179 MUL_0331 MUL_0332     FALSE 0.197 76.000 0.000 NA   NA
 1984179 1984180 MUL_0332 MUL_0333   cyp105Q4 FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 1984180 1984181 MUL_0333 MUL_0334 cyp105Q4   TRUE 0.930 3.000 0.000 0.014 N NA
 1984181 1984182 MUL_0334 MUL_0335     TRUE 0.914 13.000 0.222 1.000   NA
 1984182 1984183 MUL_0335 MUL_0336     FALSE 0.520 90.000 0.286 1.000   NA
 1984185 1984186 MUL_0338 MUL_0339   cysK2 TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1984186 1984187 MUL_0339 MUL_0340 cysK2 lpqS FALSE 0.033 202.000 0.000 NA   NA
 1984189 1984190 MUL_0342 MUL_0343     TRUE 0.985 0.000 0.333 NA   NA
 1984190 1984191 MUL_0343 MUL_0344     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 1984191 1984192 MUL_0344 MUL_0345     TRUE 0.859 35.000 0.600 NA N NA
 1984192 1984193 MUL_0345 MUL_0346     TRUE 0.986 3.000 0.600 NA   NA
 1984193 1984194 MUL_0346 MUL_0347   mhpB TRUE 0.995 -3.000 0.750 0.068   NA
 1984195 1984196 MUL_0348 MUL_0349     TRUE 0.933 18.000 0.500 1.000   NA
 1984199 1984200 MUL_0352 MUL_0353     FALSE 0.299 -115.000 0.000 NA   NA
 1984200 1984201 MUL_0353 MUL_0354     FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 1984201 1984202 MUL_0354 MUL_0355     FALSE 0.115 113.000 0.000 NA   NA
 1984202 1984203 MUL_0355 MUL_0356     FALSE 0.164 89.000 0.000 NA   NA
 1984203 1984204 MUL_0356 MUL_0357     TRUE 0.701 18.000 0.019 1.000 N NA
 1984206 1984207 MUL_0359 MUL_0360     TRUE 0.998 2.000 0.857 1.000 Y NA
 1984207 1984208 MUL_0360 MUL_0361     FALSE 0.206 194.000 0.286 0.081   NA
 1984208 1984209 MUL_0361 MUL_0362     TRUE 0.915 15.000 0.286 1.000   NA
 1984211 1984212 MUL_0364 MUL_0365     TRUE 0.999 -3.000 0.875 NA Y NA
 1984212 1984213 MUL_0365 MUL_0366   mcmA2b TRUE 0.635 -15.000 0.061 NA N NA
 1984213 1984214 MUL_0366 MUL_0367 mcmA2b mcmA2a TRUE 0.996 1.000 0.122 0.001 Y NA
 1984214 1984215 MUL_0367 MUL_0368 mcmA2a   FALSE 0.100 126.000 0.000 1.000 N NA
 1984215 1984216 MUL_0368 MUL_0369   lpqR FALSE 0.373 61.000 0.033 1.000 N NA
 1984216 1984217 MUL_0369 MUL_0370 lpqR   FALSE 0.120 111.000 0.000 NA   NA
 1984218 1984219 MUL_5104 MUL_0371     FALSE 0.553 22.000 0.000 NA   NA
 1984221 1984222 MUL_0373 MUL_0374 crtE crtI FALSE 0.024 232.000 0.000 NA   NA
 1984222 1984223 MUL_0374 MUL_0375 crtI crtB TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984223 1984224 MUL_0375 MUL_0376 crtB crtYc TRUE 0.958 -3.000 0.036 NA   NA
 1984224 1984225 MUL_0376 MUL_0377 crtYc crtYd TRUE 0.986 -3.000 0.303 NA   NA
 1984225 1984226 MUL_0377 MUL_0378 crtYd mmpL13_1 FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 1984226 1984227 MUL_0378 MUL_0379 mmpL13_1   FALSE 0.328 46.000 0.000 NA   NA
 1984228 1984229 MUL_0380 MUL_0381 idi2   FALSE 0.111 115.000 0.000 NA   NA
 1984229 1984230 MUL_0381 MUL_0382     TRUE 0.915 -6.000 0.286 NA   NA
 1984230 1984231 MUL_0382 MUL_0383   ansP1 FALSE 0.183 82.000 0.000 NA   NA
 1984231 1984232 MUL_0383 MUL_0384 ansP1   FALSE 0.342 44.000 0.000 NA   NA
 1984232 1984233 MUL_0384 MUL_0385     FALSE 0.014 316.000 0.000 NA   NA
 1984234 1984235 MUL_0386 MUL_0387     FALSE 0.232 -1471.000 0.000 NA   NA
 1984235 1984236 MUL_0387 MUL_0388     FALSE 0.009 422.000 0.000 NA   NA
 1984236 1984237 MUL_0388 MUL_0389     TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 1984237 1984238 MUL_0389 MUL_0390     TRUE 0.655 15.000 0.000 NA   NA
 1984238 1984239 MUL_0390 MUL_0391     FALSE 0.015 298.000 0.000 NA   NA
 1984240 1984241 MUL_0392 MUL_0393 cspA rhlE1 TRUE 0.682 93.000 0.000 1.000 Y NA
 1984242 1984243 MUL_0394 MUL_0395   metH FALSE 0.010 390.000 0.000 NA   NA
 1984243 1984244 MUL_0395 MUL_0396 metH   FALSE 0.012 406.000 0.000 1.000   NA
 1984244 1984245 MUL_0396 MUL_0397     TRUE 0.817 -61.000 0.500 NA   NA
 1984245 1984246 MUL_0397 MUL_0398     FALSE 0.017 280.000 0.000 NA   NA
 1984248 1984249 MUL_0400 MUL_0401   purQ TRUE 0.999 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 1984250 1984251 MUL_0402 MUL_0403     FALSE 0.142 101.000 0.000 NA   NA
 1984251 1984252 MUL_0403 MUL_0404   lpdB FALSE 0.499 26.000 0.000 1.000 N NA
 1984252 1984253 MUL_0404 MUL_0405 lpdB cfp29 FALSE 0.008 511.000 0.000 NA   NA
 1984253 1984254 MUL_0405 MUL_0406 cfp29   TRUE 0.984 -3.000 0.267 NA   NA
 1984255 1984256 MUL_0407 MUL_0408 pepC   FALSE 0.506 25.000 0.000 NA   NA
 1984258 1984259 MUL_0410 MUL_0411 purL   FALSE 0.416 33.000 0.000 NA   NA
 1984259 1984260 MUL_0411 MUL_0412     FALSE 0.364 40.000 0.000 NA   NA
 1984261 1984262 MUL_0413 MUL_0414 cpsY   FALSE 0.026 223.000 0.000 NA   NA
 1984262 1984263 MUL_0414 MUL_0415   mce2A FALSE 0.364 40.000 0.000 NA   NA
 1984264 1984265 MUL_0416 MUL_0417   purF TRUE 0.641 25.000 0.034 NA   NA
 1984265 1984266 MUL_0417 MUL_0418 purF purM TRUE 0.993 4.000 0.248 1.000 Y NA
 1984267 1984268 MUL_0419 MUL_0420     FALSE 0.081 159.000 0.017 NA   NA
 1984268 1984269 MUL_0420 MUL_0421     FALSE 0.415 -22.000 0.000 NA   NA
 1984269 1984270 MUL_0421 MUL_0423   ctpV FALSE 0.385 37.000 0.000 NA   NA
 1984270 1984271 MUL_0423 MUL_0424 ctpV   TRUE 0.760 56.000 0.500 NA   NA
 1984271 1984272 MUL_0424 MUL_0425     FALSE 0.182 102.000 0.012 NA   NA
 1984274 1984275 MUL_0428 MUL_0429     FALSE 0.093 127.000 0.000 NA   NA
 1984275 1984276 MUL_0429 MUL_0430     FALSE 0.447 83.000 0.194 NA   NA
 1984276 1984277 MUL_0430 MUL_0431   sseC2 FALSE 0.471 57.000 0.087 NA   NA
 1984277 1984278 MUL_0431 MUL_0432 sseC2 cysA2 TRUE 0.989 2.000 0.557 1.000   NA
 1984278 1984279 MUL_0432 MUL_0433 cysA2   TRUE 0.612 38.000 0.100 NA   NA
 1984279 1984280 MUL_0433 MUL_0434     FALSE 0.015 300.000 0.000 NA   NA
 1984281 1984282 MUL_0435 MUL_0436   mshD TRUE 0.981 -3.000 0.196 1.000   NA
 1984282 1984283 MUL_0436 MUL_0437 mshD phoS3 FALSE 0.176 137.000 0.054 1.000   NA
 1984283 1984284 MUL_0437 MUL_0438 phoS3 pstC2_1 FALSE 0.186 81.000 0.000 NA   NA
 1984284 1984285 MUL_0438 MUL_0439 pstC2_1 pstA TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984285 1984286 MUL_0439 MUL_0440 pstA phoT TRUE 0.982 20.000 0.373 0.004 Y NA
 1984287 1984288 MUL_0441 MUL_0442 phoY2   FALSE 0.262 58.000 0.000 NA   NA
 1984288 1984289 MUL_0442 MUL_0444     FALSE 0.046 174.000 0.000 NA   NA
 1984289 1984290 MUL_0444 MUL_0445   desA1 TRUE 0.845 9.000 0.004 1.000   NA
 1984290 1984291 MUL_0445 MUL_0446 desA1   FALSE 0.271 168.000 0.375 1.000   NA
 1984293 1984294 MUL_5103 MUL_0448     FALSE 0.258 59.000 0.000 NA   NA
 1984294 1984295 MUL_0448 MUL_0449     TRUE 0.651 58.000 0.286 1.000 N NA
 1984300 1984301 MUL_0454 MUL_0455 atsD   FALSE 0.186 81.000 0.000 NA   NA
 1984301 1984302 MUL_0455 MUL_0456     TRUE 0.904 1.000 0.000 NA   NA
 1984302 1984303 MUL_0456 MUL_0457     TRUE 0.868 -13.000 0.389 NA   NA
 1984303 1984304 MUL_0457 MUL_0458     FALSE 0.327 -184.000 0.000 1.000   NA
 1984304 1984305 MUL_0458 MUL_0459     TRUE 0.999 -3.000 0.750 0.080 Y NA
 1984306 1984307 MUL_0460 MUL_0461   thrV FALSE 0.033 202.000 0.000 NA   NA
 1984307 1984308 MUL_0461 MUL_0462 thrV   FALSE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 1984309 1984310 MUL_0463 MUL_0464 phoP phoR TRUE 0.977 41.000 0.824 0.008 Y NA
 1984311 1984312 MUL_0465 MUL_0466     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1984314 1984315 MUL_0468 MUL_0469     TRUE 0.900 3.000 0.000 1.000   NA
 1984315 1984316 MUL_0469 MUL_0470   adhB FALSE 0.500 30.000 0.000 1.000   NA
 1984316 1984317 MUL_0470 MUL_0471 adhB   FALSE 0.282 163.000 0.400 NA   NA
 1984317 1984318 MUL_0471 MUL_0472     TRUE 0.984 6.000 0.800 NA   NA
 1984318 1984319 MUL_0472 MUL_0473   cyp51B1 TRUE 0.992 0.000 0.733 NA N NA
 1984319 1984320 MUL_0473 MUL_0474 cyp51B1   TRUE 0.982 -3.000 0.212 1.000   NA
 1984320 1984321 MUL_0474 MUL_0475   cyp123A3 TRUE 0.981 0.000 0.231 1.000   NA
 1984321 1984322 MUL_0475 MUL_0476 cyp123A3   TRUE 0.992 -3.000 0.571 1.000   NA
 1984323 1984324 MUL_0477 MUL_0478 aldA   TRUE 0.981 11.000 0.812 0.067 N NA
 1984324 1984325 MUL_0478 MUL_0479     FALSE 0.321 47.000 0.000 NA   NA
 1984325 1984326 MUL_0479 MUL_0480     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1984326 1984327 MUL_0480 MUL_0481   purD FALSE 0.463 39.000 0.003 1.000   NA
 1984332 1984333 MUL_0486 MUL_0487 ggtA   FALSE 0.519 52.000 0.073 1.000   NA
 1984336 1984337 MUL_0490 MUL_0491 purB cyp126A3 TRUE 0.944 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1984337 1984338 MUL_0491 MUL_0492 cyp126A3   FALSE 0.016 287.000 0.000 NA   NA
 1984338 1984339 MUL_0492 MUL_0493     FALSE 0.032 204.000 0.000 NA   NA
 1984339 1984340 MUL_0493 MUL_0494     FALSE 0.106 132.000 0.000 1.000   NA
 1984340 1984341 MUL_0494 MUL_0495   adhX FALSE 0.339 52.000 0.000 1.000   NA
 1984343 1984344 MUL_0497 MUL_0498 purC ptrB TRUE 0.576 -21.000 0.035 1.000 N NA
 1984349 1984350 MUL_0503 MUL_0504     FALSE 0.290 52.000 0.000 NA   NA
 1984350 1984351 MUL_0504 MUL_0505     FALSE 0.405 -25.000 0.000 NA   NA
 1984352 1984353 MUL_0506 MUL_0507     FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 1984353 1984354 MUL_0507 MUL_0508     FALSE 0.030 210.000 0.000 NA   NA
 1984354 1984355 MUL_0508 MUL_0509     FALSE 0.111 115.000 0.000 NA   NA
 1984355 1984356 MUL_0509 MUL_0510     FALSE 0.432 31.000 0.000 NA   NA
 1984356 1984357 MUL_0510 MUL_0511     FALSE 0.035 197.000 0.000 NA   NA
 1984357 1984358 MUL_0511 MUL_0512     FALSE 0.014 302.000 0.000 NA   NA
 1984360 1984361 MUL_0514 MUL_0515     FALSE 0.037 192.000 0.000 NA   NA
 1984361 1984362 MUL_0515 MUL_0516     FALSE 0.038 189.000 0.000 NA   NA
 1984362 1984363 MUL_0516 MUL_0517     TRUE 0.699 13.000 0.000 NA   NA
 1984363 1984364 MUL_0517 MUL_0518     TRUE 0.894 2.000 0.000 NA   NA
 1984364 1984365 MUL_0518 MUL_0519     FALSE 0.400 -30.000 0.000 NA   NA
 1984365 1984366 MUL_0519 MUL_0520     FALSE 0.296 51.000 0.000 NA   NA
 1984366 1984367 MUL_0520 MUL_0521     FALSE 0.011 369.000 0.000 NA   NA
 1984367 1984368 MUL_0521 MUL_0522     TRUE 0.575 20.000 0.000 NA   NA
 1984368 1984369 MUL_0522 MUL_0523     FALSE 0.224 67.000 0.000 NA   NA
 1984371 1984372 MUL_0525 MUL_0526     FALSE 0.144 100.000 0.000 NA   NA
 1984372 1984373 MUL_0526 MUL_0527     FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 1984373 1984374 MUL_0527 MUL_0528     TRUE 0.820 9.000 0.000 1.000   NA
 1984374 1984375 MUL_0528 MUL_0529     TRUE 0.934 0.000 0.000 1.000   NA
 1984376 1984377 MUL_0530 MUL_0531 pheU aspT FALSE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 1984377 1984378 MUL_0531 MUL_0532 aspT gluT FALSE 0.398 35.000 0.000 NA   NA
 1984379 1984380 MUL_0533 MUL_0534 lysT   FALSE 0.033 202.000 0.000 NA   NA
 1984381 1984382 MUL_0535 MUL_0536   echA8_3 FALSE 0.008 462.000 0.000 NA   NA
 1984382 1984383 MUL_0536 MUL_0537 echA8_3   FALSE 0.484 26.000 0.000 NA   NA
 1984384 1984385 MUL_0538 MUL_0540   amiC_2 FALSE 0.005 1488.000 0.000 NA   NA
 1984387 1984388 MUL_0542 MUL_0543   aroB_1 FALSE 0.532 24.000 0.000 NA   NA
 1984388 1984389 MUL_0543 MUL_0544 aroB_1   TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984389 1984390 MUL_0544 MUL_0545     TRUE 0.790 11.000 0.000 1.000   NA
 1984390 1984391 MUL_0545 MUL_0546     TRUE 0.841 7.000 0.000 1.000   NA
 1984391 1984392 MUL_0546 MUL_0547     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 1984392 1984393 MUL_0547 MUL_0548     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984393 1984394 MUL_0548 MUL_0549     FALSE 0.133 105.000 0.000 NA   NA
 1984395 1984396 MUL_5123 MUL_5124     FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 1984398 1984399 MUL_0551 MUL_0552     TRUE 0.904 1.000 0.000 NA   NA
 1984399 1984400 MUL_0552 MUL_0553   glyU FALSE 0.047 172.000 0.000 NA   NA
 1984400 1984401 MUL_0553 MUL_0554 glyU   FALSE 0.271 56.000 0.000 NA   NA
 1984402 1984403 MUL_0555 MUL_0556     FALSE 0.099 123.000 0.000 NA   NA
 1984403 1984404 MUL_0556 MUL_0558   pcp FALSE 0.532 24.000 0.000 NA   NA
 1984404 1984405 MUL_0558 MUL_0559 pcp   FALSE 0.033 203.000 0.000 NA   NA
 1984405 1984406 MUL_0559 MUL_0560   dcd FALSE 0.387 46.000 0.007 NA   NA
 1984406 1984407 MUL_0560 MUL_0561 dcd   FALSE 0.113 114.000 0.000 NA   NA
 1984409 1984410 MUL_0564 MUL_0565   udgA FALSE 0.195 77.000 0.000 NA   NA
 1984410 1984411 MUL_0565 MUL_0566 udgA   FALSE 0.244 62.000 0.000 NA   NA
 1984411 1984412 MUL_0566 MUL_0567     TRUE 0.853 27.000 0.368 NA   NA
 1984412 1984413 MUL_0567 MUL_0568   rmlA TRUE 0.796 30.000 0.273 NA   NA
 1984414 1984415 MUL_0569 MUL_0570     FALSE 0.041 182.000 0.000 NA   NA
 1984415 1984416 MUL_0570 MUL_0571     FALSE 0.087 132.000 0.000 NA   NA
 1984418 1984419 MUL_0573 MUL_0574 aspC   FALSE 0.551 31.000 0.023 1.000 N NA
 1984419 1984420 MUL_0574 MUL_0575     FALSE 0.016 262.000 0.000 NA N NA
 1984423 1984424 MUL_0578 MUL_0579   iniB FALSE 0.077 282.000 0.286 NA   NA
 1984424 1984425 MUL_0579 MUL_0580 iniB iniA TRUE 0.584 101.000 0.500 NA   NA
 1984425 1984426 MUL_0580 MUL_0581 iniA iniC TRUE 0.994 -3.000 0.583 0.005   NA
 1984427 1984428 MUL_0582 MUL_0583     FALSE 0.180 83.000 0.000 NA   NA
 1984428 1984429 MUL_0583 MUL_0584     FALSE 0.126 108.000 0.000 NA   NA
 1984429 1984430 MUL_0584 MUL_0585   lpqJ FALSE 0.385 37.000 0.000 NA   NA
 1984430 1984431 MUL_0585 MUL_0586 lpqJ   FALSE 0.157 92.000 0.000 NA   NA
 1984431 1984432 MUL_0586 MUL_0587   coxM_2 TRUE 0.621 -7.000 0.000 NA   NA
 1984432 1984433 MUL_0587 MUL_0588 coxM_2 coxL_2 TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 1984435 1984436 MUL_0590 MUL_0591   aroP2 FALSE 0.035 197.000 0.000 NA   NA
 1984437 1984438 MUL_0593 MUL_0594 dnaK grpE TRUE 0.996 -3.000 0.074 0.005 Y NA
 1984438 1984439 MUL_0594 MUL_0595 grpE dnaJ TRUE 0.882 58.000 0.068 0.005 Y NA
 1984439 1984440 MUL_0595 MUL_0596 dnaJ hspR TRUE 0.958 1.000 0.074 1.000 N NA
 1984443 1984444 MUL_0600 MUL_0601     FALSE 0.192 -2021.000 0.000 NA   NA
 1984444 1984445 MUL_0601 MUL_0604   cyp185A4 FALSE 0.004 1951.000 0.000 NA N NA
 1984445 1984446 MUL_0604 MUL_0605 cyp185A4   FALSE 0.005 962.000 0.000 NA N NA
 1984447 1984448 MUL_0606 MUL_0607     FALSE 0.452 85.000 0.200 1.000 N NA
 1984449 1984450 MUL_0608 MUL_0609     FALSE 0.333 112.000 0.200 NA   NA
 1984450 1984451 MUL_0609 MUL_0610     FALSE 0.140 167.000 0.167 NA N NA
 1984452 1984453 MUL_0611 MUL_0612   ctpF FALSE 0.303 52.000 0.000 1.000 N NA
 1984453 1984454 MUL_0612 MUL_0613 ctpF   FALSE 0.018 272.000 0.000 NA   NA
 1984457 1984458 MUL_0617 MUL_0618 apbA   TRUE 0.632 16.000 0.000 NA   NA
 1984460 1984461 MUL_0620 MUL_0621     FALSE 0.138 103.000 0.000 NA   NA
 1984462 1984463 MUL_0622 MUL_0623   hemL FALSE 0.202 74.000 0.000 NA   NA
 1984463 1984464 MUL_0623 MUL_0624 hemL   TRUE 0.975 0.000 0.204 NA N NA
 1984464 1984465 MUL_0624 MUL_0625     TRUE 0.952 -3.000 0.035 NA N NA
 1984465 1984466 MUL_0625 MUL_0626   ccsA TRUE 0.998 -3.000 0.500 1.000 Y NA
 1984466 1984467 MUL_0626 MUL_0627 ccsA   TRUE 0.996 -3.000 0.131 NA Y NA
 1984467 1984468 MUL_0627 MUL_0628   ccsB TRUE 0.995 -3.000 0.082 NA Y NA
 1984468 1984469 MUL_0628 MUL_0629 ccsB   FALSE 0.355 42.000 0.000 NA   NA
 1984472 1984473 MUL_0632 MUL_0633 fabH menA FALSE 0.196 99.000 0.011 1.000 N NA
 1984474 1984475 MUL_0634 MUL_0635 pnp galE3 TRUE 0.932 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1984477 1984478 MUL_0637 MUL_0638     TRUE 0.610 30.000 0.048 NA   NA
 1984478 1984479 MUL_0638 MUL_0639     TRUE 0.972 -3.000 0.109 NA   NA
 1984480 1984481 MUL_0640 MUL_0641   menE TRUE 0.774 12.000 0.008 NA   NA
 1984481 1984482 MUL_0641 MUL_0642 menE   FALSE 0.442 45.000 0.024 NA   NA
 1984482 1984483 MUL_0642 MUL_0643     FALSE 0.518 60.000 0.150 NA   NA
 1984483 1984484 MUL_0643 MUL_0644   pitA TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984484 1984485 MUL_0644 MUL_0645 pitA   FALSE 0.148 98.000 0.000 NA   NA
 1984485 1984486 MUL_0645 MUL_0646     TRUE 0.679 14.000 0.000 NA   NA
 1984486 1984487 MUL_0646 MUL_0647     TRUE 0.586 19.000 0.000 NA   NA
 1984487 1984488 MUL_0647 MUL_0648   menB FALSE 0.442 44.000 0.005 1.000   NA
 1984488 1984489 MUL_0648 MUL_0649 menB   TRUE 0.941 -3.000 0.005 NA   NA
 1984489 1984490 MUL_0649 MUL_0650   fadD8 FALSE 0.008 477.000 0.000 NA   NA
 1984491 1984492 MUL_0651 MUL_0652   menC TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000   NA
 1984492 1984493 MUL_0652 MUL_0653 menC bpoC TRUE 0.621 -7.000 0.000 NA   NA
 1984493 1984494 MUL_0653 MUL_0654 bpoC menD FALSE 0.323 64.000 0.022 NA   NA
 1984494 1984495 MUL_0654 MUL_0655 menD   TRUE 0.963 -3.000 0.055 NA   NA
 1984495 1984496 MUL_0655 MUL_0656   pimB FALSE 0.535 76.000 0.259 NA   NA
 1984498 1984499 MUL_0658 MUL_0659     FALSE 0.536 -10.000 0.000 NA   NA
 1984499 1984500 MUL_0659 MUL_0660   menH FALSE 0.457 29.000 0.000 NA   NA
 1984501 1984502 MUL_0661 MUL_0662     TRUE 0.826 -10.000 0.222 NA   NA
 1984502 1984503 MUL_0662 MUL_0663     FALSE 0.339 66.000 0.029 1.000 N NA
 1984504 1984505 MUL_0664 MUL_0665 grcC1 hspX FALSE 0.269 91.000 0.042 1.000 N NA
 1984506 1984507 MUL_5080 MUL_0666 sulP sulP_1 FALSE 0.180 293.000 0.000 0.025 Y NA
 1984507 1984508 MUL_0666 MUL_0667 sulP_1 gpdA1 FALSE 0.025 233.000 0.000 1.000 N NA
 1984510 1984511 MUL_0669 MUL_0670   rimL FALSE 0.085 134.000 0.000 NA   NA
 1984511 1984512 MUL_0670 MUL_0671 rimL   FALSE 0.031 208.000 0.000 NA   NA
 1984514 1984515 MUL_0673 MUL_0674     FALSE 0.240 93.000 0.028 1.000 N NA
 1984515 1984516 MUL_0674 MUL_0675     TRUE 0.941 -3.000 0.000 1.000   NA
 1984516 1984517 MUL_0675 MUL_0676     FALSE 0.121 123.000 0.000 1.000   NA
 1984517 1984518 MUL_0676 MUL_0677   nhaP FALSE 0.106 122.000 0.000 1.000 N NA
 1984518 1984519 MUL_0677 MUL_0678 nhaP   FALSE 0.057 159.000 0.000 NA   NA
 1984523 1984524 MUL_0682 MUL_0683 embr_2   FALSE 0.110 116.000 0.000 NA   NA
 1984525 1984526 MUL_0684 MUL_0685     FALSE 0.028 214.000 0.000 NA   NA
 1984526 1984527 MUL_0685 MUL_0686     FALSE 0.097 124.000 0.000 NA   NA
 1984527 1984528 MUL_0686 MUL_0687     FALSE 0.096 141.000 0.000 1.000   NA
 1984528 1984529 MUL_0687 MUL_0688   atsA_1 FALSE 0.095 125.000 0.000 NA   NA
 1984529 1984530 MUL_0688 MUL_0689 atsA_1 gatA_1 FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 1984532 1984533 MUL_0691 MUL_0692 galT galK TRUE 0.992 -3.000 0.370 0.001 N NA
 1984533 1984534 MUL_0692 MUL_0693 galK   TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984539 1984540 MUL_0698 MUL_0699     FALSE 0.319 -72.000 0.000 NA   NA
 1984540 1984541 MUL_0699 MUL_0700   lppF FALSE 0.113 114.000 0.000 NA   NA
 1984541 1984542 MUL_0700 MUL_0701 lppF lpqN FALSE 0.032 204.000 0.000 NA   NA
 1984543 1984544 MUL_0702 MUL_0703     FALSE 0.344 -61.000 0.000 NA   NA
 1984545 1984546 MUL_0704 MUL_0705     FALSE 0.008 498.000 0.000 NA   NA
 1984548 1984549 MUL_0707 MUL_0708 recD recB TRUE 0.999 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 1984549 1984550 MUL_0708 MUL_0709 recB recC TRUE 0.998 0.000 0.542 0.001 Y NA
 1984551 1984552 MUL_0710 MUL_0711   cynS FALSE 0.074 147.000 0.000 1.000 N NA
 1984552 1984553 MUL_0711 MUL_0712 cynS   FALSE 0.544 23.000 0.000 NA   NA
 1984554 1984555 MUL_0713 MUL_0714 echA3   FALSE 0.329 82.000 0.067 NA   NA
 1984555 1984556 MUL_0714 MUL_0715   gloB FALSE 0.082 152.000 0.006 NA   NA
 1984557 1984558 MUL_0716 MUL_0717   thrT FALSE 0.076 142.000 0.000 NA   NA
 1984558 1984559 MUL_0717 MUL_0718 thrT metT FALSE 0.303 50.000 0.000 NA   NA
 1984559 1984560 MUL_0718 MUL_0719 metT rpmG2 FALSE 0.335 45.000 0.000 NA   NA
 1984560 1984561 MUL_0719 MUL_0720 rpmG2   FALSE 0.499 51.000 0.079 NA   NA
 1984561 1984562 MUL_0720 MUL_0721     TRUE 0.932 -13.000 0.818 NA   NA
 1984562 1984563 MUL_0721 MUL_0722     TRUE 0.995 11.000 0.818 0.064 Y NA
 1984563 1984564 MUL_0722 MUL_0723   trpT FALSE 0.069 148.000 0.000 NA   NA
 1984564 1984565 MUL_0723 MUL_0724 trpT secE FALSE 0.071 146.000 0.000 NA   NA
 1984565 1984566 MUL_0724 MUL_0725 secE nusG FALSE 0.497 32.000 0.006 1.000 N NA
 1984566 1984567 MUL_0725 MUL_0726 nusG rplK TRUE 0.848 47.000 0.681 1.000 N NA
 1984567 1984568 MUL_0726 MUL_0727 rplK rplA TRUE 0.938 88.000 0.838 0.021 Y NA
 1984569 1984570 MUL_0728 MUL_5083     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1984570 1984571 MUL_5083 MUL_0729   mmaA4 FALSE 0.047 172.000 0.000 NA   NA
 1984571 1984572 MUL_0729 MUL_0730 mmaA4 mmaA3 TRUE 0.846 104.000 0.286 0.004 Y NA
 1984572 1984573 MUL_0730 MUL_0731 mmaA3 mmaA2 FALSE 0.506 284.000 0.667 0.004 Y NA
 1984573 1984574 MUL_0731 MUL_0732 mmaA2 mmaA1 FALSE 0.070 147.000 0.000 NA   NA
 1984574 1984575 MUL_0732 MUL_0733 mmaA1 lipG1 FALSE 0.167 88.000 0.000 NA   NA
 1984575 1984576 MUL_0733 MUL_0734 lipG1   TRUE 0.936 10.000 0.243 NA   NA
 1984576 1984577 MUL_0734 MUL_0735   lipG2 FALSE 0.282 90.000 0.054 NA   NA
 1984577 1984578 MUL_0735 MUL_0736 lipG2 amiD FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 1984579 1984580 MUL_0737 MUL_0738   fabD2 TRUE 0.951 22.000 0.857 1.000   NA
 1984580 1984581 MUL_0738 MUL_0739 fabD2   TRUE 0.841 7.000 0.000 1.000   NA
 1984581 1984582 MUL_0739 MUL_0740     FALSE 0.009 420.000 0.000 NA   NA
 1984582 1984583 MUL_0740 MUL_0741   rplJ FALSE 0.010 375.000 0.000 NA   NA
 1984583 1984584 MUL_0741 MUL_0742 rplJ rplL TRUE 0.958 68.000 0.884 0.016 Y NA
 1984586 1984587 MUL_0744 MUL_0745   mkl FALSE 0.066 179.000 0.038 NA N NA
 1984587 1984588 MUL_0745 MUL_0746 mkl rpoB FALSE 0.007 593.000 0.000 1.000 N NA
 1984588 1984589 MUL_0746 MUL_0747 rpoB rpoC TRUE 0.970 53.000 0.851 0.001 Y NA
 1984589 1984590 MUL_0747 MUL_0748 rpoC   FALSE 0.007 664.000 0.000 NA   NA
 1984592 1984593 MUL_0750 MUL_0751   end FALSE 0.186 81.000 0.000 NA   NA
 1984593 1984594 MUL_0751 MUL_0752 end lpqP FALSE 0.312 65.000 0.004 1.000   NA
 1984594 1984595 MUL_0752 MUL_0753 lpqP   FALSE 0.084 200.000 0.071 1.000   NA
 1984595 1984596 MUL_0753 MUL_0754   echA4 TRUE 0.990 9.000 0.286 1.000 Y NA
 1984596 1984597 MUL_0754 MUL_0755 echA4   TRUE 0.911 14.000 0.292 NA N NA
 1984597 1984598 MUL_0755 MUL_0756   echA5 TRUE 0.965 -3.000 0.083 NA N NA
 1984599 1984600 MUL_0757 MUL_0758 mmpL5 mmpS5 TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 1984602 1984603 MUL_0760 MUL_0761     FALSE 0.538 138.000 0.778 NA   NA
 1984604 1984605 MUL_0762 MUL_0763   rpsL FALSE 0.013 376.000 0.000 1.000   NA
 1984605 1984606 MUL_0763 MUL_0764 rpsL rpsG TRUE 0.999 0.000 0.620 0.003 Y NA
 1984606 1984607 MUL_0764 MUL_0765 rpsG fusA1 TRUE 0.911 81.000 0.579 1.000 Y NA
 1984607 1984608 MUL_0765 MUL_0766 fusA1 tuf TRUE 0.652 187.000 0.400 0.001 Y NA
 1984608 1984609 MUL_0766 MUL_0767 tuf   FALSE 0.021 250.000 0.000 NA   NA
 1984609 1984610 MUL_0767 MUL_0768     FALSE 0.148 213.000 0.333 NA   NA
 1984610 1984611 MUL_0768 MUL_0769     TRUE 0.949 10.000 0.214 0.064   NA
 1984612 1984613 MUL_0770 MUL_0771     TRUE 0.965 0.000 0.088 NA   NA
 1984614 1984615 MUL_0772 MUL_0773   pqqE TRUE 0.990 -3.000 0.484 NA   NA
 1984615 1984616 MUL_0773 MUL_0774 pqqE lldD1 TRUE 0.728 71.000 0.548 1.000   NA
 1984616 1984617 MUL_0774 MUL_0775 lldD1   FALSE 0.342 155.000 0.464 NA   NA
 1984617 1984618 MUL_0775 MUL_0776     TRUE 0.990 -3.000 0.440 NA   NA
 1984618 1984619 MUL_0776 MUL_0777     TRUE 0.974 9.000 0.667 NA N NA
 1984620 1984621 MUL_0778 MUL_0779     FALSE 0.108 117.000 0.000 NA   NA
 1984621 1984622 MUL_0779 MUL_0780     FALSE 0.020 252.000 0.000 NA   NA
 1984623 1984624 MUL_0781 MUL_0782     FALSE 0.007 543.000 0.000 NA   NA
 1984624 1984625 MUL_0782 MUL_0783     FALSE 0.197 76.000 0.000 NA   NA
 1984626 1984627 MUL_0784 MUL_0785     FALSE 0.506 25.000 0.000 NA   NA
 1984628 1984629 MUL_0786 MUL_0787     FALSE 0.007 520.000 0.000 NA   NA
 1984629 1984630 MUL_0787 MUL_0788     FALSE 0.325 -67.000 0.000 NA   NA
 1984630 1984631 MUL_0788 MUL_0789   rpsJ FALSE 0.015 291.000 0.000 NA   NA
 1984631 1984632 MUL_0789 MUL_0790 rpsJ rplC TRUE 0.989 15.000 0.467 0.021 Y NA
 1984632 1984633 MUL_0790 MUL_0791 rplC rplD TRUE 0.998 0.000 0.361 0.016 Y NA
 1984633 1984634 MUL_0791 MUL_0792 rplD rplW TRUE 0.998 0.000 0.513 0.016 Y NA
 1984634 1984635 MUL_0792 MUL_0793 rplW rplB TRUE 0.984 30.000 0.849 0.013 Y NA
 1984635 1984636 MUL_0793 MUL_0794 rplB rpsS TRUE 0.989 22.000 0.820 0.021 Y NA
 1984636 1984637 MUL_0794 MUL_0795 rpsS rplV TRUE 0.983 29.000 0.769 0.021 Y NA
 1984637 1984638 MUL_0795 MUL_0796 rplV rpsC TRUE 0.999 0.000 0.719 0.021 Y NA
 1984638 1984639 MUL_0796 MUL_0797 rpsC rplP TRUE 0.998 4.000 0.828 0.021 Y NA
 1984639 1984640 MUL_0797 MUL_0798 rplP rpmC TRUE 0.999 0.000 0.802 0.016 Y NA
 1984640 1984641 MUL_0798 MUL_0799 rpmC rpsQ TRUE 0.999 -3.000 0.828 0.016 Y NA
 1984641 1984642 MUL_0799 MUL_0800 rpsQ atsA FALSE 0.074 144.000 0.000 NA   NA
 1984642 1984643 MUL_0800 MUL_0801 atsA   FALSE 0.321 47.000 0.000 NA   NA
 1984643 1984644 MUL_0801 MUL_0802     FALSE 0.437 -19.000 0.000 NA   NA
 1984644 1984645 MUL_0802 MUL_0803     FALSE 0.014 313.000 0.000 NA   NA
 1984645 1984646 MUL_0803 MUL_0804   rplN FALSE 0.021 251.000 0.000 NA   NA
 1984646 1984647 MUL_0804 MUL_0805 rplN rplX TRUE 0.999 1.000 0.810 0.021 Y NA
 1984647 1984648 MUL_0805 MUL_0806 rplX rplE TRUE 0.999 -3.000 0.758 0.016 Y NA
 1984648 1984649 MUL_0806 MUL_0807 rplE rpsN TRUE 0.996 5.000 0.496 0.016 Y NA
 1984649 1984650 MUL_0807 MUL_0808 rpsN rpsH TRUE 0.920 77.000 0.473 0.016 Y NA
 1984650 1984651 MUL_0808 MUL_0809 rpsH rplF TRUE 0.995 11.000 0.808 0.016 Y NA
 1984651 1984652 MUL_0809 MUL_0810 rplF rplR TRUE 0.976 42.000 0.815 0.016 Y NA
 1984652 1984653 MUL_0810 MUL_0811 rplR rpsE TRUE 0.978 38.000 0.814 0.021 Y NA
 1984653 1984654 MUL_0811 MUL_0812 rpsE rpmD TRUE 0.999 -3.000 0.789 0.021 Y NA
 1984654 1984655 MUL_0812 MUL_0813 rpmD rplO TRUE 0.999 -3.000 0.653 0.002 Y NA
 1984658 1984659 MUL_0816 MUL_0817     TRUE 0.936 20.000 0.000 NA Y NA
 1984659 1984660 MUL_0817 MUL_0818     TRUE 0.998 -3.000 0.400 NA Y NA
 1984664 1984665 MUL_0822 MUL_0823 fucA serA2 TRUE 0.965 -3.000 0.058 1.000 N NA
 1984666 1984667 MUL_0824 MUL_0825 xylB   FALSE 0.053 208.000 0.018 1.000   NA
 1984668 1984669 MUL_0826 MUL_0827     TRUE 0.614 17.000 0.000 NA   NA
 1984670 1984671 MUL_0828 MUL_0829 secY adk TRUE 0.965 -3.000 0.057 1.000 N NA
 1984671 1984672 MUL_0829 MUL_0830 adk mapA TRUE 0.987 3.000 0.606 1.000 N NA
 1984672 1984673 MUL_0830 MUL_0831 mapA sigL FALSE 0.515 53.000 0.099 1.000 N NA
 1984673 1984674 MUL_0831 MUL_0832 sigL   TRUE 0.921 79.000 0.697 NA Y NA
 1984674 1984675 MUL_0832 MUL_0833     TRUE 0.755 87.000 0.065 NA Y NA
 1984675 1984676 MUL_0833 MUL_0834     FALSE 0.532 24.000 0.000 NA   NA
 1984677 1984678 MUL_0835 MUL_0836 mmsB fadE9 TRUE 0.973 13.000 0.051 1.000 Y NA
 1984678 1984679 MUL_0836 MUL_0837 fadE9 mmsA TRUE 0.947 6.000 0.197 1.000 N NA
 1984679 1984680 MUL_0837 MUL_0838 mmsA   FALSE 0.045 180.000 0.000 1.000 N NA
 1984680 1984681 MUL_0838 MUL_0839   rmlC FALSE 0.078 144.000 0.000 1.000 N NA
 1984681 1984682 MUL_0839 MUL_0840 rmlC rmlB TRUE 0.995 2.000 0.250 1.000 Y NA
 1984682 1984683 MUL_0840 MUL_0841 rmlB   TRUE 0.916 10.000 0.188 NA N NA
 1984683 1984684 MUL_0841 MUL_0842     TRUE 0.907 27.000 0.000 NA Y NA
 1984685 1984686 MUL_0843 MUL_0844 infA rpmJ TRUE 0.918 34.000 0.067 1.000 Y NA
 1984686 1984687 MUL_0844 MUL_0845 rpmJ rpsM FALSE 0.455 191.000 0.086 0.016 Y NA
 1984687 1984688 MUL_0845 MUL_0846 rpsM rpsK TRUE 0.998 4.000 0.810 0.016 Y NA
 1984688 1984689 MUL_0846 MUL_0847 rpsK rpsD TRUE 0.986 19.000 0.509 0.021 Y NA
 1984689 1984690 MUL_0847 MUL_0848 rpsD rpoA TRUE 0.665 86.000 0.549 1.000 N NA
 1984690 1984691 MUL_0848 MUL_0849 rpoA rplQ TRUE 0.835 61.000 0.873 1.000 N NA
 1984691 1984692 MUL_0849 MUL_0850 rplQ truA TRUE 0.853 62.000 0.102 1.000 Y NA
 1984693 1984694 MUL_0851 MUL_5078 cycA   FALSE 0.015 268.000 0.000 NA N NA
 1984694 1984695 MUL_5078 MUL_0852     FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 1984695 1984696 MUL_0852 MUL_0853     FALSE 0.090 129.000 0.000 NA   NA
 1984696 1984697 MUL_0853 MUL_0855   cut4 FALSE 0.022 242.000 0.000 NA   NA
 1984697 1984698 MUL_0855 MUL_0856 cut4 cut3 TRUE 0.903 32.000 0.500 0.001   NA
 1984700 1984701 MUL_0858 MUL_0859 mycP4   TRUE 0.994 -3.000 0.727 NA   NA
 1984702 1984703 MUL_0860 MUL_0861     TRUE 0.987 -3.000 0.333 NA   NA
 1984703 1984704 MUL_0861 MUL_0862   esxU TRUE 0.636 63.000 0.310 NA   NA
 1984704 1984705 MUL_0862 MUL_0863 esxU esxT TRUE 0.862 16.000 0.190 NA   NA
 1984705 1984706 MUL_0863 MUL_0864 esxT rplM FALSE 0.023 239.000 0.000 NA   NA
 1984706 1984707 MUL_0864 MUL_0865 rplM rpsI TRUE 0.999 -3.000 0.601 0.016 Y NA
 1984707 1984708 MUL_0865 MUL_0866 rpsI mrsA FALSE 0.141 151.000 0.068 1.000 N NA
 1984708 1984709 MUL_0866 MUL_0867 mrsA   FALSE 0.168 105.000 0.009 NA   NA
 1984709 1984710 MUL_0867 MUL_0868     TRUE 0.991 3.000 0.875 NA   NA
 1984711 1984712 MUL_0869 MUL_0870     TRUE 0.699 13.000 0.000 NA   NA
 1984712 1984713 MUL_0870 MUL_0871     TRUE 0.769 10.000 0.000 NA   NA
 1984714 1984715 MUL_0872 MUL_0875 glmS   FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 1984717 1984718 MUL_0876 MUL_0877     FALSE 0.482 31.000 0.004 NA   NA
 1984718 1984719 MUL_0877 MUL_0878   gadB FALSE 0.413 37.000 0.009 NA N NA
 1984719 1984720 MUL_0878 MUL_0879 gadB alr FALSE 0.285 87.000 0.041 1.000 N NA
 1984720 1984721 MUL_0879 MUL_0880 alr   TRUE 0.734 -10.000 0.055 1.000   NA
 1984721 1984722 MUL_0880 MUL_0881     TRUE 0.690 -7.000 0.011 NA   NA
 1984722 1984723 MUL_0881 MUL_0882     TRUE 0.981 -3.000 0.217 NA   NA
 1984723 1984724 MUL_0882 MUL_0883   rimI TRUE 0.969 -3.000 0.062 1.000   NA
 1984724 1984725 MUL_0883 MUL_0884 rimI gcp TRUE 0.958 1.000 0.056 1.000   NA
 1984725 1984726 MUL_0884 MUL_0885 gcp groES FALSE 0.148 314.000 0.004 1.000 Y NA
 1984726 1984727 MUL_0885 MUL_0886 groES groEL1 TRUE 0.913 93.000 0.592 0.004 Y NA
 1984727 1984728 MUL_0886 MUL_0887 groEL1   FALSE 0.021 251.000 0.000 NA   NA
 1984729 1984730 MUL_0888 MUL_0889     FALSE 0.006 695.000 0.000 NA   NA
 1984730 1984731 MUL_0889 MUL_0890     FALSE 0.019 267.000 0.000 NA   NA
 1984736 1984737 MUL_0896 MUL_0897   sigD FALSE 0.321 47.000 0.000 NA   NA
 1984737 1984738 MUL_0897 MUL_0898 sigD   TRUE 0.943 -7.000 0.615 NA   NA
 1984740 1984741 MUL_0900 MUL_0901 guaB2 guaB3 TRUE 0.986 10.000 0.056 0.001 Y NA
 1984741 1984742 MUL_0901 MUL_0902 guaB3   FALSE 0.035 181.000 0.000 NA N NA
 1984742 1984743 MUL_0902 MUL_0903   choD FALSE 0.139 89.000 0.000 NA N NA
 1984749 1984750 MUL_0909 MUL_0910     FALSE 0.424 39.000 0.000 1.000   NA
 1984752 1984753 MUL_0912 MUL_0913   guaA FALSE 0.175 73.000 0.000 NA N NA
 1984755 1984756 MUL_0915 MUL_0916     TRUE 0.978 7.000 0.636 NA   NA
 1984757 1984758 MUL_0917 MUL_0918 iunH acrA1 FALSE 0.335 45.000 0.000 NA   NA
 1984758 1984759 MUL_0918 MUL_0919 acrA1 lpqD FALSE 0.547 40.000 0.077 NA N NA
 1984761 1984762 MUL_0921 MUL_0922 otsB2   FALSE 0.290 52.000 0.000 NA   NA
 1984764 1984765 MUL_0924 MUL_5096     TRUE 0.894 2.000 0.000 NA   NA
 1984767 1984768 MUL_0926 MUL_0927   narK3_3 FALSE 0.013 331.000 0.000 NA   NA
 1984768 1984769 MUL_0927 MUL_0928 narK3_3   FALSE 0.415 -22.000 0.000 NA   NA
 1984769 1984770 MUL_0928 MUL_0929     FALSE 0.144 100.000 0.000 NA   NA
 1984770 1984771 MUL_0929 MUL_0930     FALSE 0.290 52.000 0.000 NA   NA
 1984771 1984772 MUL_0930 MUL_0931     FALSE 0.167 88.000 0.000 NA   NA
 1984773 1984774 MUL_0932 MUL_0933 rocA putA TRUE 0.976 0.000 0.181 1.000 N NA
 1984775 1984776 MUL_0934 MUL_0935   ltp2 TRUE 0.783 -16.000 0.250 NA N NA
 1984776 1984777 MUL_0935 MUL_0936 ltp2   TRUE 0.983 -3.000 0.250 NA   NA
 1984777 1984778 MUL_0936 MUL_0937     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984778 1984779 MUL_0937 MUL_0938     TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 1984780 1984781 MUL_0939 MUL_0940 aldA_1   FALSE 0.101 122.000 0.000 NA   NA
 1984781 1984782 MUL_0940 MUL_0942     FALSE 0.506 25.000 0.000 NA   NA
 1984782 1984783 MUL_0942 MUL_0943   fadD36 FALSE 0.500 45.000 0.000 0.049   NA
 1984785 1984786 MUL_0946 MUL_0947     TRUE 0.904 40.000 1.000 NA   NA
 1984788 1984789 MUL_0949 MUL_0950     FALSE 0.008 658.000 0.000 1.000   NA
 1984795 1984796 MUL_0956 MUL_0957   fadD6 TRUE 0.626 71.000 0.324 1.000   NA
 1984796 1984797 MUL_0957 MUL_0958 fadD6 folP2 FALSE 0.404 90.000 0.172 1.000 N NA
 1984797 1984798 MUL_0958 MUL_0959 folP2   TRUE 0.975 -3.000 0.136 NA   NA
 1984798 1984799 MUL_0959 MUL_0960     FALSE 0.465 49.000 0.045 NA   NA
 1984799 1984800 MUL_0960 MUL_0961   tagA TRUE 0.947 -3.000 0.013 NA   NA
 1984800 1984801 MUL_0961 MUL_0962 tagA   FALSE 0.189 105.000 0.021 NA   NA
 1984803 1984804 MUL_0964 MUL_0965     FALSE 0.080 478.000 0.000 NA Y NA
 1984805 1984806 MUL_0966 MUL_0967     FALSE 0.020 252.000 0.000 NA   NA
 1984806 1984807 MUL_0967 MUL_0969   aldA_2 FALSE 0.008 492.000 0.000 NA   NA
 1984807 1984808 MUL_0969 MUL_0970 aldA_2   FALSE 0.117 112.000 0.000 NA   NA
 1984809 1984810 MUL_0971 MUL_0972 fadA6_3 echA1_1 TRUE 0.993 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1984810 1984811 MUL_0972 MUL_0973 echA1_1   FALSE 0.009 428.000 0.000 NA   NA
 1984812 1984813 MUL_0974 MUL_0975     FALSE 0.349 43.000 0.000 NA   NA
 1984813 1984814 MUL_0975 MUL_0976     FALSE 0.021 249.000 0.000 NA   NA
 1984816 1984817 MUL_0978 MUL_0979     FALSE 0.331 -66.000 0.000 NA   NA
 1984817 1984818 MUL_0979 MUL_0980     TRUE 0.980 -3.000 0.176 1.000   NA
 1984818 1984819 MUL_0980 MUL_0981   pks10_1 TRUE 0.680 -6.000 0.000 NA   NA
 1984820 1984821 MUL_0982 MUL_0983     FALSE 0.308 64.000 0.015 NA   NA
 1984822 1984823 MUL_0984 MUL_0985   echA10 FALSE 0.167 88.000 0.000 NA   NA
 1984824 1984825 MUL_0986 MUL_0987 mcr   TRUE 0.792 58.000 0.636 1.000 N NA
 1984827 1984828 MUL_0989 MUL_0990 mmpL13   TRUE 0.666 17.000 0.000 1.000   NA
 1984828 1984829 MUL_0990 MUL_0991     TRUE 0.979 -3.000 0.160 1.000   NA
 1984832 1984833 MUL_0994 MUL_0995 omt_2   TRUE 0.655 15.000 0.000 NA   NA
 1984834 1984835 MUL_0996 MUL_0997     TRUE 0.903 23.000 0.455 NA   NA
 1984835 1984836 MUL_0997 MUL_0998     FALSE 0.006 922.000 0.000 NA   NA
 1984837 1984838 MUL_0999 MUL_1000     FALSE 0.284 53.000 0.000 NA   NA
 1984838 1984839 MUL_1000 MUL_1001     FALSE 0.007 559.000 0.000 NA   NA
 1984840 1984841 MUL_1002 MUL_1003     TRUE 0.714 25.000 0.085 NA   NA
 1984842 1984843 MUL_1004 MUL_1005     TRUE 0.641 50.000 0.222 NA   NA
 1984846 1984847 MUL_1008 MUL_1009 mutT2 typA FALSE 0.027 252.000 0.004 1.000 N NA
 1984847 1984848 MUL_1009 MUL_1010 typA lpqW FALSE 0.206 104.000 0.025 1.000 N NA
 1984848 1984849 MUL_1010 MUL_1011 lpqW   FALSE 0.018 305.000 0.000 1.000   NA
 1984849 1984850 MUL_1011 MUL_1012     FALSE 0.041 234.000 0.000 0.099   NA
 1984850 1984851 MUL_1012 MUL_1013     FALSE 0.108 117.000 0.000 NA   NA
 1984851 1984852 MUL_1013 MUL_1015     FALSE 0.039 188.000 0.000 NA   NA
 1984854 1984855 MUL_1017 MUL_1018 mshB   FALSE 0.167 211.000 0.387 NA   NA
 1984857 1984858 MUL_1020 MUL_1021 fbiC   FALSE 0.009 572.000 0.000 1.000   NA
 1984859 1984860 MUL_1022 MUL_1023   fadH FALSE 0.029 212.000 0.000 NA   NA
 1984860 1984861 MUL_1023 MUL_1024 fadH   TRUE 0.963 0.000 0.093 NA N NA
 1984862 1984863 MUL_1025 MUL_1026 fdxC   TRUE 0.583 30.000 0.029 1.000 N NA
 1984865 1984866 MUL_1028 MUL_1030     FALSE 0.006 957.000 0.000 NA   NA
 1984866 1984867 MUL_1030 MUL_1031   narK3_1 FALSE 0.258 59.000 0.000 NA   NA
 1984867 1984868 MUL_1031 MUL_1032 narK3_1   FALSE 0.006 978.000 0.000 NA   NA
 1984869 1984870 MUL_1033 MUL_1034     FALSE 0.066 152.000 0.000 NA   NA
 1984870 1984871 MUL_1034 MUL_1035     FALSE 0.091 128.000 0.000 NA   NA
 1984872 1984873 MUL_1036 MUL_1037   fabG3 TRUE 0.575 20.000 0.000 NA   NA
 1984873 1984874 MUL_1037 MUL_1038 fabG3   TRUE 0.860 21.000 0.182 0.061 N NA
 1984875 1984876 MUL_1039 MUL_1040     FALSE 0.258 59.000 0.000 NA   NA
 1984876 1984877 MUL_1040 MUL_1041     FALSE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 1984878 1984879 MUL_1042 MUL_1043     FALSE 0.370 39.000 0.000 NA   NA
 1984880 1984881 MUL_1044 MUL_1045     FALSE 0.287 -135.000 0.000 NA   NA
 1984882 1984883 MUL_1046 MUL_1047     FALSE 0.073 242.000 0.182 NA   NA
 1984883 1984884 MUL_1047 MUL_1048     FALSE 0.105 119.000 0.000 NA   NA
 1984884 1984885 MUL_1048 MUL_1049   cyp191A3 TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984885 1984886 MUL_1049 MUL_1050 cyp191A3   TRUE 0.894 2.000 0.000 NA   NA
 1984886 1984887 MUL_1050 MUL_1051     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984887 1984888 MUL_1051 MUL_1052     TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000 N NA
 1984888 1984889 MUL_1052 MUL_1053     TRUE 0.992 -3.000 0.600 1.000 N NA
 1984889 1984890 MUL_1053 MUL_1054   lipW TRUE 0.965 15.000 0.833 1.000 N NA
 1984892 1984893 MUL_1056 MUL_1057     FALSE 0.381 52.000 0.020 NA   NA
 1984895 1984896 MUL_1059 MUL_1060 fadD5 yrbE1A FALSE 0.010 401.000 0.000 NA   NA
 1984896 1984897 MUL_1060 MUL_1061 yrbE1A yrbE1B TRUE 0.998 2.000 1.000 NA Y NA
 1984897 1984898 MUL_1061 MUL_1062 yrbE1B mce1A TRUE 0.997 5.000 1.000 NA Y NA
 1984898 1984899 MUL_1062 MUL_1063 mce1A mce1B TRUE 0.998 -3.000 0.500 0.009 Y NA
 1984899 1984900 MUL_1063 MUL_1064 mce1B mce1C TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.009 Y NA
 1984900 1984901 MUL_1064 MUL_1065 mce1C mce1D TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.009 Y NA
 1984901 1984902 MUL_1065 MUL_1066 mce1D lprK TRUE 0.987 18.000 0.500 0.009 Y NA
 1984902 1984903 MUL_1066 MUL_1067 lprK mce1F TRUE 0.994 -6.000 0.800 0.009 Y NA
 1984903 1984904 MUL_1067 MUL_1068 mce1F   TRUE 0.853 24.000 0.286 NA   NA
 1984904 1984905 MUL_1068 MUL_1069     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 1984905 1984906 MUL_1069 MUL_1070     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 1984906 1984907 MUL_1070 MUL_1071     TRUE 0.913 -33.000 1.000 NA   NA
 1984908 1984909 MUL_1072 MUL_1073 lprO   FALSE 0.385 37.000 0.000 NA   NA
 1984909 1984910 MUL_1073 MUL_1074     FALSE 0.303 50.000 0.000 NA   NA
 1984910 1984911 MUL_1074 MUL_1075     FALSE 0.034 200.000 0.000 NA   NA
 1984911 1984912 MUL_1075 MUL_1076   sigG TRUE 0.974 -3.000 0.095 1.000   NA
 1984913 1984914 MUL_1077 MUL_1078     FALSE 0.512 47.000 0.068 NA   NA
 1984914 1984915 MUL_1078 MUL_1079     TRUE 0.992 -3.000 0.600 NA   NA
 1984915 1984916 MUL_1079 MUL_1080   bglS TRUE 0.663 57.000 0.273 1.000   NA
 1984917 1984918 MUL_1081 MUL_1082   ilvD FALSE 0.025 226.000 0.000 NA   NA
 1984919 1984920 MUL_1083 MUL_1084     FALSE 0.254 118.000 0.125 NA   NA
 1984920 1984921 MUL_1084 MUL_1085     FALSE 0.428 120.000 0.375 NA   NA
 1984921 1984922 MUL_1085 MUL_1086     FALSE 0.110 219.000 0.250 NA   NA
 1984922 1984923 MUL_1086 MUL_1087     FALSE 0.496 -13.000 0.000 NA   NA
 1984925 1984926 MUL_1089 MUL_1090     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 1984927 1984928 MUL_1091 MUL_1092   mmpL11 TRUE 0.994 -3.000 0.750 1.000   NA
 1984932 1984933 MUL_1096 MUL_1097 mmpL3   FALSE 0.374 106.000 0.217 NA   NA
 1984933 1984934 MUL_1097 MUL_1098     FALSE 0.526 38.000 0.040 NA   NA
 1984935 1984936 MUL_1099 MUL_1100     TRUE 0.795 -102.000 0.529 NA   NA
 1984936 1984937 MUL_1100 MUL_1101   pckA FALSE 0.051 203.000 0.026 NA   NA
 1984937 1984938 MUL_1101 MUL_1102 pckA fadD4 TRUE 0.769 10.000 0.000 NA   NA
 1984938 1984939 MUL_1102 MUL_1103 fadD4 echA8_4 TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 1984940 1984941 MUL_1104 MUL_1105   fadE3_2 FALSE 0.020 252.000 0.000 NA   NA
 1984942 1984943 MUL_1106 MUL_1107     FALSE 0.029 211.000 0.000 NA   NA
 1984943 1984944 MUL_1107 MUL_1108     FALSE 0.218 69.000 0.000 NA   NA
 1984944 1984945 MUL_1108 MUL_1109     FALSE 0.296 51.000 0.000 NA   NA
 1984945 1984946 MUL_1109 MUL_5097     FALSE 0.017 277.000 0.000 NA   NA
 1984946 1984947 MUL_5097 MUL_1110     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984947 1984948 MUL_1110 MUL_1111     TRUE 0.894 2.000 0.000 NA   NA
 1984948 1984949 MUL_1111 MUL_1112   lipC FALSE 0.185 156.000 0.182 NA   NA
 1984949 1984950 MUL_1112 MUL_1113 lipC   FALSE 0.335 45.000 0.000 NA   NA
 1984950 1984951 MUL_1113 MUL_1114   echA1 TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1984951 1984952 MUL_1114 MUL_1115 echA1   TRUE 0.802 99.000 0.222 1.000 Y NA
 1984952 1984953 MUL_1115 MUL_1116     TRUE 0.934 30.000 1.000 1.000   NA
 1984953 1984954 MUL_1116 MUL_1117     FALSE 0.009 577.000 0.000 1.000   NA
 1984954 1984955 MUL_1117 MUL_1118     FALSE 0.117 112.000 0.000 NA   NA
 1984958 1984959 MUL_1122 MUL_1123     TRUE 0.604 45.000 0.104 1.000   NA
 1984961 1984962 MUL_1125 MUL_1126     TRUE 0.849 23.000 0.265 NA   NA
 1984966 1984967 MUL_1130 MUL_1131     FALSE 0.344 -61.000 0.000 NA   NA
 1984967 1984968 MUL_1131 MUL_1132     FALSE 0.012 351.000 0.000 NA   NA
 1984968 1984969 MUL_1132 MUL_1133     FALSE 0.478 -15.000 0.000 NA   NA
 1984969 1984970 MUL_1133 MUL_1134     FALSE 0.046 174.000 0.000 NA   NA
 1984974 1984975 MUL_1138 MUL_1139     FALSE 0.017 280.000 0.000 NA   NA
 1984976 1984977 MUL_1140 MUL_1141     TRUE 0.952 10.000 0.333 NA   NA
 1984977 1984978 MUL_1141 MUL_1142     TRUE 0.623 74.000 0.375 NA   NA
 1984979 1984980 MUL_1143 MUL_1144     FALSE 0.067 150.000 0.000 NA   NA
 1984981 1984982 MUL_1145 MUL_1146     FALSE 0.052 165.000 0.000 NA   NA
 1984985 1984986 MUL_1149 MUL_1150   php FALSE 0.042 181.000 0.000 NA   NA
 1984987 1984988 MUL_1151 MUL_1152 fadE4   FALSE 0.444 99.000 0.250 1.000 N NA
 1984990 1984991 MUL_1154 MUL_1155     FALSE 0.038 190.000 0.000 NA   NA
 1984992 1984993 MUL_1156 MUL_1157   glpQ2 FALSE 0.095 125.000 0.000 NA   NA
 1984995 1984996 MUL_1159 MUL_1160     TRUE 0.637 89.000 0.526 NA   NA
 1984996 1984997 MUL_1160 MUL_1161     FALSE 0.218 69.000 0.000 NA   NA
 1984998 1984999 MUL_1162 MUL_1163 lpqI   FALSE 0.429 87.000 0.185 1.000 N NA
 1984999 1985000 MUL_1163 MUL_1164     TRUE 0.763 19.000 0.067 1.000 N NA
 1985001 1985002 MUL_1165 MUL_1166   fabG4 TRUE 0.981 19.000 0.412 1.000 Y NA
 1985005 1985006 MUL_1169 MUL_1170     FALSE 0.054 163.000 0.000 NA   NA
 1985007 1985008 MUL_5125 MUL_1171   sdhB_1 FALSE 0.530 48.000 0.087 NA   NA
 1985008 1985009 MUL_1171 MUL_1172 sdhB_1 sdhA_1 TRUE 0.999 0.000 0.826 0.002 Y NA
 1985009 1985010 MUL_1172 MUL_1173 sdhA_1   TRUE 0.875 47.000 0.860 NA   NA
 1985010 1985011 MUL_1173 MUL_1174     FALSE 0.191 79.000 0.000 NA   NA
 1985012 1985013 MUL_1175 MUL_1176     TRUE 0.647 25.000 0.000 0.096   NA
 1985013 1985014 MUL_1176 MUL_1177     FALSE 0.014 355.000 0.000 1.000   NA
 1985016 1985017 MUL_1179 MUL_1180 nirB nirD FALSE 0.484 26.000 0.000 NA   NA
 1985018 1985019 MUL_1181 MUL_1182     FALSE 0.487 57.000 0.071 1.000   NA
 1985019 1985020 MUL_1182 MUL_1183     TRUE 0.830 -9.000 0.173 1.000   NA
 1985020 1985021 MUL_1183 MUL_1184   narK3_2 FALSE 0.191 79.000 0.000 NA   NA
 1985021 1985022 MUL_1184 MUL_1185 narK3_2 aac FALSE 0.007 520.000 0.000 NA   NA
 1985022 1985023 MUL_1185 MUL_1186 aac   TRUE 0.704 27.000 0.101 NA   NA
 1985023 1985024 MUL_1186 MUL_1187     TRUE 0.986 16.000 0.551 NA Y NA
 1985024 1985025 MUL_1187 MUL_1188     FALSE 0.211 113.000 0.050 1.000 N NA
 1985029 1985030 MUL_1193 MUL_1194   fadE6 FALSE 0.023 236.000 0.000 NA   NA
 1985030 1985031 MUL_1194 MUL_1195 fadE6 serA3 FALSE 0.509 57.000 0.114 1.000 N NA
 1985031 1985032 MUL_1195 MUL_1196 serA3   TRUE 0.972 -3.000 0.114 NA   NA
 1985032 1985033 MUL_1196 MUL_1197     TRUE 0.992 2.000 0.833 NA   NA
 1985034 1985035 MUL_1198 MUL_1199     TRUE 0.892 7.000 0.048 NA   NA
 1985037 1985038 MUL_1201 MUL_1202     FALSE 0.018 273.000 0.000 NA   NA
 1985038 1985039 MUL_1202 MUL_1203     TRUE 0.586 19.000 0.000 NA   NA
 1985039 1985040 MUL_1203 MUL_5109     FALSE 0.091 128.000 0.000 NA   NA
 1985040 1985041 MUL_5109 MUL_1204     FALSE 0.128 107.000 0.000 NA   NA
 1985041 1985042 MUL_1204 MUL_1205     TRUE 0.995 -3.000 1.000 NA   NA
 1985042 1985043 MUL_1205 MUL_1206     TRUE 0.994 -3.000 0.750 NA   NA
 1985043 1985044 MUL_1206 MUL_1207     TRUE 0.858 25.000 0.333 NA   NA
 1985044 1985045 MUL_1207 MUL_1208     TRUE 0.984 3.000 0.500 NA   NA
 1985045 1985046 MUL_1208 MUL_1209   esxG FALSE 0.385 37.000 0.000 NA   NA
 1985046 1985047 MUL_1209 MUL_1210 esxG esxH FALSE 0.457 29.000 0.000 NA   NA
 1985047 1985048 MUL_1210 MUL_1211 esxH   TRUE 0.928 9.000 0.182 NA   NA
 1985048 1985049 MUL_1211 MUL_1212     TRUE 0.785 72.000 0.818 NA   NA
 1985049 1985050 MUL_1212 MUL_1213   mycP3 TRUE 0.992 -3.000 0.556 NA   NA
 1985050 1985051 MUL_1213 MUL_1214 mycP3   TRUE 0.787 53.000 0.556 NA   NA
 1985054 1985055 MUL_1217 MUL_1218     FALSE 0.164 109.000 0.009 1.000 N NA
 1985055 1985056 MUL_1218 MUL_1219     TRUE 0.621 -7.000 0.000 NA   NA
 1985059 1985060 MUL_1222 MUL_1223     FALSE 0.247 106.000 0.067 NA   NA
 1985062 1985063 MUL_1225 MUL_1226     FALSE 0.288 153.000 0.333 NA   NA
 1985063 1985064 MUL_1226 MUL_1227     FALSE 0.026 222.000 0.000 NA   NA
 1985066 1985067 MUL_1231 MUL_1232     TRUE 0.823 6.000 0.000 NA   NA
 1985069 1985070 MUL_1234 MUL_1235     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985070 1985071 MUL_1235 MUL_1236     FALSE 0.239 -1456.000 0.000 NA   NA
 1985072 1985073 MUL_1237 MUL_1238     FALSE 0.070 152.000 0.000 1.000 N NA
 1985074 1985075 MUL_1239 MUL_1240     TRUE 0.984 -3.000 0.240 1.000   NA
 1985077 1985078 MUL_1242 MUL_1243   rocD TRUE 0.995 -3.000 0.038 1.000 Y NA
 1985078 1985079 MUL_1243 MUL_1244 rocD rocE TRUE 0.915 30.000 0.015 1.000 Y NA
 1985079 1985080 MUL_1244 MUL_1245 rocE   TRUE 0.990 -3.000 0.444 1.000 N NA
 1985081 1985082 MUL_1246 MUL_1247 uspC uspB TRUE 0.999 -3.000 0.727 0.023 Y NA
 1985082 1985083 MUL_1247 MUL_1248 uspB uspA TRUE 0.990 20.000 0.818 0.023 Y NA
 1985084 1985085 MUL_1249 MUL_1250     TRUE 0.995 -3.000 0.914 NA   NA
 1985085 1985086 MUL_1250 MUL_1251     FALSE 0.360 41.000 0.000 NA   NA
 1985086 1985087 MUL_1251 MUL_1252     TRUE 0.823 6.000 0.000 NA   NA
 1985087 1985088 MUL_1252 MUL_1253     FALSE 0.050 168.000 0.000 NA   NA
 1985091 1985092 MUL_1256 MUL_1258     FALSE 0.010 374.000 0.000 NA   NA
 1985093 1985094 MUL_1259 MUL_1260     FALSE 0.010 385.000 0.000 NA   NA
 1985094 1985095 MUL_1260 MUL_1261     FALSE 0.008 470.000 0.000 NA   NA
 1985095 1985096 MUL_1261 MUL_1262     TRUE 0.647 25.000 0.000 0.095   NA
 1985096 1985097 MUL_1262 MUL_1263     FALSE 0.112 152.000 0.000 0.095   NA
 1985097 1985098 MUL_1263 MUL_1264     FALSE 0.030 215.000 0.000 1.000 N NA
 1985098 1985099 MUL_1264 MUL_1265     FALSE 0.005 750.000 0.000 NA N NA
 1985099 1985100 MUL_1265 MUL_1266     FALSE 0.532 24.000 0.000 NA   NA
 1985102 1985103 MUL_1268 MUL_1269     FALSE 0.158 106.000 0.000 1.000   NA
 1985104 1985105 MUL_1270 MUL_1271     TRUE 0.979 -3.000 0.190 NA   NA
 1985105 1985106 MUL_1271 MUL_1273     FALSE 0.034 199.000 0.000 NA   NA
 1985106 1985107 MUL_1273 MUL_1274   lppN TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985107 1985108 MUL_1274 MUL_1275 lppN   TRUE 0.688 37.000 0.182 NA   NA
 1985110 1985111 MUL_1277 MUL_1278     TRUE 0.647 25.000 0.000 0.095   NA
 1985113 1985114 MUL_1281 MUL_1282 aofH_1 cyp124A1 FALSE 0.535 34.000 0.000 0.071 N NA
 1985114 1985115 MUL_1282 MUL_1283 cyp124A1 mmpS5_2 FALSE 0.061 156.000 0.000 NA   NA
 1985116 1985117 MUL_1284 MUL_1285     FALSE 0.102 121.000 0.000 NA   NA
 1985118 1985119 MUL_1286 MUL_1287     FALSE 0.303 95.000 0.083 NA   NA
 1985119 1985120 MUL_1287 MUL_1288     FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 1985121 1985122 MUL_1289 MUL_1290     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985123 1985124 MUL_1291 MUL_1292   adhE2 TRUE 0.936 18.000 0.538 1.000   NA
 1985125 1985126 MUL_1293 MUL_1294     TRUE 0.896 13.000 0.163 1.000   NA
 1985126 1985127 MUL_1294 MUL_1295     FALSE 0.201 154.000 0.200 NA   NA
 1985128 1985129 MUL_1296 MUL_1297     FALSE 0.011 364.000 0.000 NA   NA
 1985129 1985130 MUL_1297 MUL_1298     TRUE 0.817 24.000 0.204 1.000 N NA
 1985131 1985132 MUL_1299 MUL_1300   glpD1 TRUE 0.993 0.000 0.727 1.000 N NA
 1985133 1985134 MUL_1301 MUL_1302   accD6 FALSE 0.089 198.000 0.111 NA   NA
 1985134 1985135 MUL_1302 MUL_1303 accD6 kasB TRUE 0.935 38.000 0.222 1.000 Y NA
 1985135 1985136 MUL_1303 MUL_1304 kasB kasA TRUE 0.904 82.000 0.400 0.019 Y NA
 1985136 1985137 MUL_1304 MUL_1305 kasA acpM TRUE 0.996 -3.000 0.089 1.000 Y NA
 1985137 1985138 MUL_1305 MUL_1306 acpM fabD TRUE 0.830 73.000 0.127 1.000 Y NA
 1985138 1985139 MUL_1306 MUL_1307 fabD   FALSE 0.292 162.000 0.441 NA N NA
 1985139 1985140 MUL_1307 MUL_1308   aceE FALSE 0.223 134.000 0.169 NA N NA
 1985141 1985142 MUL_1309 MUL_1310     FALSE 0.499 57.000 0.113 NA   NA
 1985142 1985143 MUL_1310 MUL_1311   ahpE TRUE 0.991 0.000 0.575 NA   NA
 1985143 1985144 MUL_1311 MUL_1312 ahpE valV FALSE 0.267 57.000 0.000 NA   NA
 1985145 1985146 MUL_1313 MUL_1314     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985150 1985151 MUL_1318 MUL_1319   ptpA TRUE 0.941 0.000 0.013 NA   NA
 1985151 1985152 MUL_1319 MUL_1320 ptpA   TRUE 0.764 -7.000 0.029 1.000   NA
 1985153 1985154 MUL_1321 MUL_1322 cobC   TRUE 0.973 -3.000 0.121 NA   NA
 1985154 1985155 MUL_1322 MUL_1323     TRUE 0.904 23.000 0.468 NA   NA
 1985155 1985156 MUL_1323 MUL_1324     TRUE 0.989 -3.000 0.422 NA   NA
 1985156 1985157 MUL_1324 MUL_1325   rnpB FALSE 0.064 153.000 0.000 NA   NA
 1985157 1985158 MUL_1325 MUL_1326 rnpB   FALSE 0.008 492.000 0.000 NA   NA
 1985159 1985160 MUL_1327 MUL_1328     FALSE 0.007 595.000 0.000 NA   NA
 1985163 1985164 MUL_1331 MUL_1332     FALSE 0.254 60.000 0.000 NA   NA
 1985164 1985165 MUL_1332 MUL_1333   ctaD_1 FALSE 0.074 144.000 0.000 NA   NA
 1985165 1985166 MUL_1333 MUL_1334 ctaD_1   FALSE 0.249 61.000 0.000 NA   NA
 1985166 1985167 MUL_1334 MUL_1335   glnA2 FALSE 0.265 90.000 0.042 NA   NA
 1985167 1985168 MUL_1335 MUL_1336 glnA2 glnE FALSE 0.351 71.000 0.046 1.000 N NA
 1985168 1985169 MUL_1336 MUL_1337 glnE   FALSE 0.152 95.000 0.000 NA   NA
 1985169 1985170 MUL_1337 MUL_1338     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985171 1985172 MUL_1339 MUL_1340   glnA1 FALSE 0.019 264.000 0.000 NA   NA
 1985174 1985175 MUL_1342 MUL_1343   lipA TRUE 0.649 28.000 0.059 NA   NA
 1985175 1985176 MUL_1343 MUL_1344 lipA lipB TRUE 0.998 -3.000 0.319 0.001 Y NA
 1985177 1985178 MUL_1345 MUL_1346     FALSE 0.046 174.000 0.000 NA   NA
 1985178 1985179 MUL_1346 MUL_1347     FALSE 0.115 113.000 0.000 NA   NA
 1985180 1985181 MUL_1348 MUL_1349 ilvB1_2   TRUE 0.992 0.000 0.000 NA Y NA
 1985181 1985182 MUL_1349 MUL_1350     FALSE 0.423 32.000 0.000 NA   NA
 1985182 1985183 MUL_1350 MUL_1351   wrbA FALSE 0.416 33.000 0.000 NA   NA
 1985183 1985184 MUL_1351 MUL_1352 wrbA   FALSE 0.007 551.000 0.000 NA   NA
 1985184 1985185 MUL_1352 MUL_1353     FALSE 0.321 47.000 0.000 NA   NA
 1985187 1985188 MUL_1355 MUL_1356     FALSE 0.006 797.000 0.000 NA   NA
 1985191 1985192 MUL_1359 MUL_1361     FALSE 0.005 1706.000 0.000 NA   NA
 1985195 1985196 MUL_1364 MUL_1365 add deoA TRUE 0.995 -3.000 0.062 1.000 Y NA
 1985196 1985197 MUL_1365 MUL_1366 deoA cdd TRUE 0.997 -3.000 0.221 1.000 Y NA
 1985198 1985199 MUL_1367 MUL_1368 sdhC sdhD TRUE 0.937 42.000 0.157 0.001 Y NA
 1985199 1985200 MUL_1368 MUL_1369 sdhD sdhA TRUE 0.983 29.000 0.705 0.002 Y NA
 1985200 1985201 MUL_1369 MUL_1370 sdhA sdhB TRUE 0.996 6.000 0.604 0.002 Y NA
 1985202 1985203 MUL_1371 MUL_1372     TRUE 0.648 25.000 0.000 0.094   NA
 1985203 1985204 MUL_1372 MUL_1373     FALSE 0.008 494.000 0.000 NA   NA
 1985204 1985205 MUL_1373 MUL_1374   xthA FALSE 0.102 144.000 0.015 NA   NA
 1985205 1985206 MUL_1374 MUL_1375 xthA   FALSE 0.370 39.000 0.000 NA   NA
 1985206 1985207 MUL_1375 MUL_1376   def TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1985208 1985209 MUL_1377 MUL_1378     TRUE 0.562 56.000 0.176 NA   NA
 1985209 1985210 MUL_1378 MUL_1379   sodC TRUE 0.686 73.000 0.500 NA   NA
 1985210 1985211 MUL_1379 MUL_1380 sodC   TRUE 0.660 -46.000 0.128 1.000   NA
 1985213 1985214 MUL_1382 MUL_1383     FALSE 0.100 138.000 0.000 1.000   NA
 1985215 1985216 MUL_1384 MUL_1385   pssA TRUE 0.955 -3.000 0.025 1.000 N NA
 1985216 1985217 MUL_1385 MUL_1386 pssA psd TRUE 0.998 -3.000 0.466 1.000 Y NA
 1985217 1985218 MUL_1386 MUL_1387 psd   FALSE 0.174 86.000 0.000 NA   NA
 1985218 1985219 MUL_1387 MUL_1388     FALSE 0.242 -1447.000 0.000 NA   NA
 1985219 1985220 MUL_1388 MUL_1390   moeA2 FALSE 0.008 715.000 0.000 1.000   NA
 1985220 1985221 MUL_1390 MUL_1391 moeA2   TRUE 0.840 19.000 0.188 1.000 N NA
 1985221 1985222 MUL_1391 MUL_1392     TRUE 0.741 47.000 0.333 1.000 N NA
 1985224 1985225 MUL_1394 MUL_1395     FALSE 0.385 37.000 0.000 NA   NA
 1985225 1985226 MUL_1395 MUL_1396     FALSE 0.426 96.000 0.250 NA N NA
 1985227 1985228 MUL_1397 MUL_1398     FALSE 0.337 64.000 0.027 NA   NA
 1985229 1985230 MUL_1399 MUL_1400   sigK TRUE 0.994 -3.000 0.778 NA   NA
 1985230 1985231 MUL_1400 MUL_1401 sigK   FALSE 0.549 46.000 0.065 1.000   NA
 1985231 1985232 MUL_1401 MUL_1402   ufaA1 TRUE 0.803 18.000 0.081 1.000   NA
 1985232 1985233 MUL_1402 MUL_1403 ufaA1   TRUE 0.966 -3.000 0.067 NA   NA
 1985233 1985234 MUL_1403 MUL_1404     TRUE 0.779 66.000 0.722 NA   NA
 1985234 1985235 MUL_1404 MUL_1405   mmpL4 FALSE 0.258 59.000 0.000 NA   NA
 1985236 1985237 MUL_1406 MUL_1407     FALSE 0.020 360.000 0.000 0.093   NA
 1985237 1985238 MUL_1407 MUL_1408     TRUE 0.648 25.000 0.000 0.093   NA
 1985238 1985239 MUL_1408 MUL_1409     FALSE 0.364 40.000 0.000 NA   NA
 1985240 1985241 MUL_1410 MUL_1411     FALSE 0.006 799.000 0.000 NA   NA
 1985241 1985242 MUL_1411 MUL_1413     FALSE 0.018 276.000 0.000 NA   NA
 1985242 1985243 MUL_1413 MUL_1414   echA2 FALSE 0.344 67.000 0.039 NA   NA
 1985243 1985244 MUL_1414 MUL_1415 echA2   FALSE 0.157 92.000 0.000 NA   NA
 1985245 1985246 MUL_1416 MUL_1417     TRUE 0.945 0.000 0.021 NA   NA
 1985246 1985247 MUL_1417 MUL_1418     FALSE 0.389 60.000 0.042 NA   NA
 1985247 1985248 MUL_1418 MUL_1419     TRUE 0.964 -7.000 1.000 NA   NA
 1985250 1985251 MUL_1421 MUL_1422   bioF1_1 FALSE 0.014 309.000 0.000 NA   NA
 1985251 1985252 MUL_1422 MUL_1423 bioF1_1   FALSE 0.360 41.000 0.000 NA   NA
 1985253 1985254 MUL_1424 MUL_1425     FALSE 0.553 22.000 0.000 NA   NA
 1985254 1985255 MUL_1425 MUL_1427     FALSE 0.010 377.000 0.000 NA   NA
 1985256 1985257 MUL_1428 MUL_1429 folD   TRUE 0.990 -3.000 0.453 NA   NA
 1985259 1985260 MUL_1431 MUL_1432   fadD28_1 FALSE 0.023 248.000 0.000 1.000 N NA
 1985260 1985261 MUL_1432 MUL_1433 fadD28_1   TRUE 0.632 16.000 0.000 NA   NA
 1985262 1985263 MUL_1434 MUL_1435     FALSE 0.244 62.000 0.000 NA   NA
 1985263 1985264 MUL_1435 MUL_1436     FALSE 0.079 140.000 0.000 NA   NA
 1985264 1985265 MUL_1436 MUL_1437   metA TRUE 0.867 -6.000 0.136 1.000 N NA
 1985265 1985266 MUL_1437 MUL_1438 metA metC TRUE 0.991 12.000 0.542 1.000 Y NA
 1985269 1985270 MUL_1441 MUL_1442 trpS   TRUE 0.922 5.000 0.045 1.000   NA
 1985271 1985272 MUL_1443 MUL_1444 nagA sugI TRUE 0.995 -3.000 0.054 1.000 Y NA
 1985272 1985273 MUL_1444 MUL_1445 sugI dacC FALSE 0.076 202.000 0.074 1.000 N NA
 1985274 1985275 MUL_1446 MUL_1447     FALSE 0.128 107.000 0.000 NA   NA
 1985277 1985278 MUL_1449 MUL_1450 sigJ   FALSE 0.072 145.000 0.000 NA   NA
 1985280 1985281 MUL_1452 MUL_1453     FALSE 0.028 214.000 0.000 NA   NA
 1985283 1985284 MUL_1455 MUL_1456 esxP_1 esxN_1 FALSE 0.240 63.000 0.000 NA   NA
 1985286 1985287 MUL_1458 MUL_1459 dgt dnaG TRUE 0.620 42.000 0.037 0.004 N NA
 1985290 1985291 MUL_1462 MUL_1463   thiX FALSE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 1985291 1985292 MUL_1463 MUL_1464 thiX cysE TRUE 0.761 11.000 0.000 1.000 N NA
 1985292 1985293 MUL_1464 MUL_1465 cysE cysK1 TRUE 0.995 3.000 0.133 0.001 Y NA
 1985293 1985294 MUL_1465 MUL_1466 cysK1   TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985294 1985295 MUL_1466 MUL_1467   mez FALSE 0.014 308.000 0.000 NA   NA
 1985296 1985297 MUL_1468 MUL_1469     FALSE 0.022 276.000 0.000 1.000   NA
 1985300 1985301 MUL_1472 MUL_1474   fdhF FALSE 0.008 652.000 0.000 1.000   NA
 1985302 1985303 MUL_1475 MUL_1476 lppP narK1 FALSE 0.026 224.000 0.000 NA   NA
 1985303 1985304 MUL_1476 MUL_1477 narK1 ctpD FALSE 0.027 218.000 0.000 NA   NA
 1985304 1985305 MUL_1477 MUL_1478 ctpD trxA FALSE 0.241 95.000 0.018 1.000   NA
 1985305 1985306 MUL_1478 MUL_1479 trxA trxB1 TRUE 0.576 86.000 0.222 0.002   NA
 1985306 1985307 MUL_1479 MUL_1480 trxB1 echA12 TRUE 0.699 84.000 0.636 1.000 N NA
 1985307 1985308 MUL_1480 MUL_1481 echA12   TRUE 0.745 25.000 0.090 1.000   NA
 1985308 1985309 MUL_1481 MUL_1482     FALSE 0.438 85.000 0.191 NA   NA
 1985310 1985311 MUL_1483 MUL_1484   acn TRUE 0.941 10.000 0.256 1.000 N NA
 1985312 1985313 MUL_1485 MUL_1486     FALSE 0.024 232.000 0.000 NA   NA
 1985313 1985314 MUL_1486 MUL_1487   inv2 TRUE 0.809 26.000 0.250 NA   NA
 1985314 1985315 MUL_1487 MUL_1488 inv2 moxR1 FALSE 0.092 199.000 0.120 NA   NA
 1985315 1985316 MUL_1488 MUL_1489 moxR1   TRUE 0.967 15.000 0.920 NA   NA
 1985316 1985317 MUL_1489 MUL_1490     TRUE 0.896 35.000 0.760 NA   NA
 1985317 1985318 MUL_1490 MUL_1491   fabG1 FALSE 0.141 115.000 0.020 NA N NA
 1985318 1985319 MUL_1491 MUL_1492 fabG1 inhA TRUE 0.800 79.000 0.078 1.000 Y NA
 1985319 1985320 MUL_1492 MUL_1493 inhA hemZ TRUE 0.888 7.000 0.038 1.000 N NA
 1985322 1985323 MUL_1495 MUL_1496     FALSE 0.048 158.000 0.000 NA N NA
 1985323 1985324 MUL_1496 MUL_1497     TRUE 0.632 16.000 0.000 NA   NA
 1985324 1985325 MUL_1497 MUL_1498     TRUE 0.750 11.000 0.000 NA   NA
 1985326 1985327 MUL_1499 MUL_1500     FALSE 0.270 66.000 0.000 1.000   NA
 1985328 1985329 MUL_1501 MUL_1502     TRUE 0.998 0.000 0.545 1.000 Y NA
 1985330 1985331 MUL_1503 MUL_1504     FALSE 0.052 224.000 0.057 NA   NA
 1985332 1985333 MUL_1505 MUL_1506 mutA mutB TRUE 0.991 6.000 0.115 0.001 Y NA
 1985333 1985334 MUL_1506 MUL_1507 mutB   TRUE 0.562 89.000 0.366 1.000 N NA
 1985334 1985335 MUL_1507 MUL_1508   lipL FALSE 0.237 64.000 0.000 NA   NA
 1985336 1985337 MUL_1509 MUL_1510     FALSE 0.091 128.000 0.000 NA   NA
 1985338 1985339 MUL_1511 MUL_1512     TRUE 0.998 -3.000 0.364 1.000 Y NA
 1985339 1985340 MUL_1512 MUL_1514     FALSE 0.444 30.000 0.000 NA   NA
 1985340 1985341 MUL_1514 MUL_1515     FALSE 0.174 86.000 0.000 NA   NA
 1985341 1985342 MUL_1515 MUL_1517   losA FALSE 0.015 294.000 0.000 NA   NA
 1985342 1985343 MUL_1517 MUL_1518 losA   FALSE 0.218 -1672.000 0.000 NA   NA
 1985343 1985344 MUL_1518 MUL_1519     TRUE 0.578 31.000 0.000 0.092   NA
 1985344 1985345 MUL_1519 MUL_1520     FALSE 0.054 208.000 0.000 0.092   NA
 1985345 1985346 MUL_1520 MUL_1521     FALSE 0.014 310.000 0.000 NA   NA
 1985346 1985347 MUL_1521 MUL_5113     FALSE 0.017 277.000 0.000 NA   NA
 1985347 1985348 MUL_5113 MUL_1522     FALSE 0.038 189.000 0.000 NA   NA
 1985348 1985349 MUL_1522 MUL_1523   wbbL2 FALSE 0.020 258.000 0.000 NA   NA
 1985354 1985355 MUL_1529 MUL_1530     FALSE 0.142 101.000 0.000 NA   NA
 1985355 1985356 MUL_1530 MUL_1531   papA3 TRUE 0.655 15.000 0.000 NA   NA
 1985358 1985359 MUL_1533 MUL_1534     FALSE 0.271 56.000 0.000 NA   NA
 1985362 1985363 MUL_1537 MUL_1538 lspA   TRUE 0.968 -3.000 0.073 1.000 N NA
 1985364 1985365 MUL_1539 MUL_1540   lprL FALSE 0.011 359.000 0.000 NA   NA
 1985365 1985366 MUL_1540 MUL_1541 lprL glbN FALSE 0.300 84.000 0.050 NA   NA
 1985367 1985368 MUL_1542 MUL_1543     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1985368 1985369 MUL_1543 MUL_1544     FALSE 0.342 120.000 0.250 NA   NA
 1985369 1985370 MUL_1544 MUL_1545   dnaE1 FALSE 0.259 67.000 0.003 NA   NA
 1985370 1985371 MUL_1545 MUL_1546 dnaE1 fadD11 FALSE 0.098 127.000 0.000 1.000 N NA
 1985371 1985372 MUL_1546 MUL_1547 fadD11 plsB1 TRUE 0.983 15.000 0.333 1.000 Y NA
 1985374 1985375 MUL_1549 MUL_1550   ilvA FALSE 0.473 44.000 0.033 NA   NA
 1985378 1985379 MUL_1553 MUL_1554 treZ treY TRUE 0.998 -3.000 0.263 0.003 Y NA
 1985379 1985380 MUL_1554 MUL_1555 treY treX TRUE 0.992 4.000 0.061 0.003 Y NA
 1985380 1985381 MUL_1555 MUL_1556 treX   FALSE 0.288 100.000 0.073 1.000 N NA
 1985381 1985382 MUL_1556 MUL_1557     FALSE 0.499 108.000 0.400 NA   NA
 1985382 1985383 MUL_1557 MUL_1558     FALSE 0.012 346.000 0.000 NA   NA
 1985384 1985385 MUL_1559 MUL_1560 bioA bioF1 TRUE 0.988 7.000 0.033 0.001 Y NA
 1985385 1985386 MUL_1560 MUL_1561 bioF1 bioD TRUE 0.997 -3.000 0.214 0.001 Y NA
 1985386 1985387 MUL_1561 MUL_1562 bioD   TRUE 0.946 2.000 0.036 1.000   NA
 1985387 1985388 MUL_1562 MUL_1563   bioB FALSE 0.083 150.000 0.000 1.000   NA
 1985388 1985389 MUL_1563 MUL_1564 bioB   TRUE 0.761 16.000 0.041 NA   NA
 1985389 1985390 MUL_1564 MUL_1565     TRUE 0.943 12.000 0.361 NA   NA
 1985391 1985392 MUL_1566 MUL_1567     FALSE 0.053 357.000 0.273 NA   NA
 1985393 1985394 MUL_1568 MUL_1569 nadA nadB TRUE 0.997 -3.000 0.210 0.002 Y NA
 1985394 1985395 MUL_1569 MUL_1570 nadB nadC TRUE 0.997 0.000 0.223 0.002 Y NA
 1985397 1985398 MUL_1572 MUL_1573 hisD hisC1 TRUE 0.997 -3.000 0.112 0.003 Y NA
 1985398 1985399 MUL_1573 MUL_1574 hisC1 hisB TRUE 0.998 -3.000 0.341 0.003 Y NA
 1985399 1985400 MUL_1574 MUL_1575 hisB hisH TRUE 0.958 24.000 0.046 0.003 Y NA
 1985400 1985401 MUL_1575 MUL_1576 hisH hisA TRUE 0.992 12.000 0.491 0.003 Y NA
 1985401 1985402 MUL_1576 MUL_1577 hisA impA TRUE 0.954 7.000 0.266 1.000 N NA
 1985402 1985403 MUL_1577 MUL_1578 impA hisF TRUE 0.931 2.000 0.021 1.000 N NA
 1985403 1985404 MUL_1578 MUL_1579 hisF hisI TRUE 0.998 -3.000 0.430 0.003 Y NA
 1985405 1985406 MUL_1580 MUL_1581     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1985410 1985411 MUL_1585 MUL_1586   pknF_1 FALSE 0.126 108.000 0.000 NA   NA
 1985414 1985415 MUL_1589 MUL_1590 trpE   TRUE 0.950 -7.000 0.690 NA   NA
 1985415 1985416 MUL_1590 MUL_1591   trpC FALSE 0.302 90.000 0.070 NA   NA
 1985416 1985417 MUL_1591 MUL_1592 trpC trpB TRUE 0.934 36.000 0.070 0.001 Y NA
 1985417 1985418 MUL_1592 MUL_1593 trpB trpA TRUE 0.995 3.000 0.153 0.001 Y NA
 1985418 1985419 MUL_1593 MUL_1594 trpA lgt TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985419 1985420 MUL_1594 MUL_1595 lgt   FALSE 0.224 67.000 0.000 NA   NA
 1985420 1985421 MUL_1595 MUL_1596     TRUE 0.759 -10.000 0.111 NA   NA
 1985423 1985424 MUL_1598 MUL_1599 pykA tesB1 FALSE 0.410 124.000 0.361 1.000 N NA
 1985424 1985425 MUL_1599 MUL_1600 tesB1   FALSE 0.272 132.000 0.214 NA   NA
 1985426 1985427 MUL_1601 MUL_1602 cydC cydD TRUE 0.983 26.000 0.631 0.003 Y NA
 1985427 1985428 MUL_1602 MUL_1603 cydD cydB TRUE 0.879 -487.000 0.151 1.000 Y NA
 1985428 1985429 MUL_1603 MUL_1604 cydB cydA FALSE 0.316 48.000 0.000 NA   NA
 1985429 1985430 MUL_1604 MUL_1605 cydA   FALSE 0.136 104.000 0.000 NA   NA
 1985430 1985431 MUL_1605 MUL_1606   cya FALSE 0.240 63.000 0.000 NA   NA
 1985431 1985432 MUL_1606 MUL_1607 cya leuV FALSE 0.061 156.000 0.000 NA   NA
 1985434 1985435 MUL_1609 MUL_1610     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1985436 1985437 MUL_1611 MUL_1612 polA rpsA FALSE 0.013 381.000 0.005 1.000 N NA
 1985437 1985438 MUL_1612 MUL_1613 rpsA coaE TRUE 0.791 13.000 0.024 1.000 N NA
 1985439 1985440 MUL_1614 MUL_1615     FALSE 0.328 46.000 0.000 NA   NA
 1985441 1985442 MUL_1616 MUL_1617 uvrB   FALSE 0.490 37.000 0.006 1.000   NA
 1985444 1985445 MUL_1619 MUL_1620     FALSE 0.011 369.000 0.000 NA   NA
 1985448 1985449 MUL_1623 MUL_1624     TRUE 0.621 -7.000 0.000 NA   NA
 1985449 1985450 MUL_1624 MUL_1625     FALSE 0.167 88.000 0.000 NA   NA
 1985450 1985451 MUL_1625 MUL_1626   lysX FALSE 0.521 44.000 0.057 NA   NA
 1985452 1985453 MUL_1627 MUL_1628 infC rpmL TRUE 0.974 31.000 0.652 1.000 Y NA
 1985453 1985454 MUL_1628 MUL_1629 rpmL rplT TRUE 0.957 71.000 0.928 0.015 Y NA
 1985454 1985455 MUL_1629 MUL_1630 rplT tsnR TRUE 0.827 78.000 0.057 0.012 Y NA
 1985457 1985458 MUL_1632 MUL_1633     FALSE 0.296 111.000 0.143 NA   NA
 1985458 1985459 MUL_1633 MUL_1634     TRUE 0.929 10.000 0.214 NA   NA
 1985459 1985460 MUL_1634 MUL_1635   pheS FALSE 0.023 258.000 0.002 NA   NA
 1985460 1985461 MUL_1635 MUL_1636 pheS pheT TRUE 0.998 0.000 0.574 0.001 Y NA
 1985461 1985462 MUL_1636 MUL_1637 pheT   FALSE 0.023 236.000 0.000 NA   NA
 1985462 1985463 MUL_1637 MUL_1638     FALSE 0.190 -2091.000 0.000 NA   NA
 1985463 1985464 MUL_1638 MUL_1639     FALSE 0.007 1459.000 0.000 1.000   NA
 1985464 1985465 MUL_1639 MUL_1640     FALSE 0.020 257.000 0.000 NA   NA
 1985465 1985466 MUL_1640 MUL_1641     FALSE 0.006 946.000 0.000 NA   NA
 1985466 1985467 MUL_1641 MUL_1642     FALSE 0.227 -1531.000 0.000 NA   NA
 1985469 1985470 MUL_1644 MUL_1645 argC argJ TRUE 0.906 73.000 0.303 0.001 Y NA
 1985470 1985471 MUL_1645 MUL_1646 argJ argB TRUE 0.998 -3.000 0.239 0.001 Y NA
 1985471 1985472 MUL_1646 MUL_1647 argB argD TRUE 0.996 -3.000 0.105 1.000 Y NA
 1985472 1985473 MUL_1647 MUL_1648 argD argF TRUE 0.996 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 1985473 1985474 MUL_1648 MUL_1649 argF argR TRUE 0.970 -3.000 0.088 1.000 N NA
 1985474 1985475 MUL_1649 MUL_1650 argR argG FALSE 0.488 49.000 0.054 1.000 N NA
 1985475 1985476 MUL_1650 MUL_1651 argG argH TRUE 0.829 95.000 0.278 1.000 Y NA
 1985476 1985477 MUL_1651 MUL_1652 argH pks10 FALSE 0.152 95.000 0.000 NA   NA
 1985477 1985478 MUL_1652 MUL_1653 pks10 pks7 FALSE 0.084 135.000 0.000 NA   NA
 1985478 1985479 MUL_1653 MUL_1654 pks7 pks8 TRUE 0.563 21.000 0.000 NA   NA
 1985479 1985480 MUL_1654 MUL_1655 pks8 pks9 TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 1985480 1985481 MUL_1655 MUL_1656 pks9 pks11 TRUE 0.819 155.000 0.750 0.018 Y NA
 1985482 1985483 MUL_1657 MUL_1658 cyp139A3P   FALSE 0.276 -198.000 0.000 NA   NA
 1985484 1985485 MUL_1659 MUL_1660 aao_1   FALSE 0.074 147.000 0.000 1.000 N NA
 1985485 1985486 MUL_1660 MUL_1661     TRUE 0.694 -7.000 0.013 NA   NA
 1985486 1985487 MUL_1661 MUL_1662   gloA FALSE 0.142 101.000 0.000 NA   NA
 1985488 1985489 MUL_1663 MUL_1664     FALSE 0.009 421.000 0.000 NA   NA
 1985489 1985490 MUL_1664 MUL_1665     TRUE 0.985 2.000 0.400 1.000   NA
 1985490 1985491 MUL_1665 MUL_1666     TRUE 0.844 72.000 0.089 0.070 Y NA
 1985492 1985493 MUL_1667 MUL_1668 mpg tyrS TRUE 0.857 12.000 0.067 1.000 N NA
 1985493 1985494 MUL_1668 MUL_1669 tyrS   FALSE 0.014 306.000 0.000 NA   NA
 1985495 1985496 MUL_1670 MUL_1671     TRUE 0.649 25.000 0.000 0.091   NA
 1985496 1985497 MUL_1671 MUL_1672     FALSE 0.010 387.000 0.000 NA   NA
 1985497 1985498 MUL_1672 MUL_1674     FALSE 0.012 343.000 0.000 NA   NA
 1985498 1985499 MUL_1674 MUL_1675     FALSE 0.009 421.000 0.000 NA   NA
 1985499 1985500 MUL_1675 MUL_1676     FALSE 0.218 -1672.000 0.000 NA   NA
 1985500 1985501 MUL_1676 MUL_1677     FALSE 0.006 802.000 0.000 NA   NA
 1985501 1985502 MUL_1677 MUL_1678     FALSE 0.052 165.000 0.000 NA   NA
 1985503 1985504 MUL_1679 MUL_1680 lprJ   FALSE 0.249 61.000 0.000 NA   NA
 1985504 1985505 MUL_1680 MUL_1681     TRUE 0.985 3.000 0.500 1.000   NA
 1985505 1985506 MUL_1681 MUL_1682     TRUE 0.712 25.000 0.083 NA   NA
 1985506 1985507 MUL_1682 MUL_1683   tlyA TRUE 0.848 8.000 0.014 NA   NA
 1985507 1985508 MUL_1683 MUL_1684 tlyA ppnK TRUE 0.974 -3.000 0.120 1.000 N NA
 1985508 1985509 MUL_1684 MUL_1685 ppnK recN TRUE 0.860 13.000 0.094 1.000 N NA
 1985509 1985510 MUL_1685 MUL_1686 recN   FALSE 0.144 166.000 0.049 0.070   NA
 1985510 1985511 MUL_1686 MUL_1687     TRUE 0.942 22.000 0.798 NA   NA
 1985511 1985512 MUL_1687 MUL_1688   pyrG FALSE 0.112 138.000 0.014 NA   NA
 1985512 1985513 MUL_1688 MUL_1689 pyrG   TRUE 0.796 -7.000 0.055 1.000   NA
 1985513 1985514 MUL_1689 MUL_1690   xerD TRUE 0.970 -3.000 0.063 1.000   NA
 1985516 1985517 MUL_1692 MUL_1693     TRUE 0.964 -3.000 0.051 1.000 N NA
 1985517 1985518 MUL_1693 MUL_1694     TRUE 0.951 0.000 0.045 NA N NA
 1985518 1985519 MUL_1694 MUL_1695     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985519 1985520 MUL_1695 MUL_1696     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985520 1985521 MUL_1696 MUL_1697     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985521 1985522 MUL_1697 MUL_1698     FALSE 0.071 146.000 0.000 NA   NA
 1985523 1985524 MUL_1699 MUL_1700   emrB_2 FALSE 0.012 347.000 0.000 NA   NA
 1985524 1985525 MUL_1700 MUL_1701 emrB_2   FALSE 0.130 106.000 0.000 NA   NA
 1985525 1985526 MUL_1701 MUL_1702     FALSE 0.210 232.000 0.000 NA Y NA
 1985526 1985527 MUL_1702 MUL_1703     FALSE 0.007 623.000 0.000 NA   NA
 1985527 1985528 MUL_1703 MUL_1704   mbtH_2 FALSE 0.310 49.000 0.000 NA   NA
 1985528 1985529 MUL_1704 MUL_1705 mbtH_2   TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985529 1985530 MUL_1705 MUL_1706     TRUE 0.808 7.000 0.000 NA   NA
 1985530 1985531 MUL_1706 MUL_1707     FALSE 0.064 153.000 0.000 NA   NA
 1985531 1985532 MUL_1707 MUL_1708   speE FALSE 0.021 280.000 0.000 1.000   NA
 1985532 1985533 MUL_1708 MUL_1709 speE   TRUE 0.965 -3.000 0.065 NA   NA
 1985533 1985534 MUL_1709 MUL_1710     TRUE 0.840 34.000 0.444 NA   NA
 1985536 1985537 MUL_1712 MUL_1713     TRUE 0.963 10.000 0.455 NA   NA
 1985538 1985539 MUL_1714 MUL_1715 ruvC ruvA TRUE 0.998 -3.000 0.451 0.006 Y NA
 1985539 1985540 MUL_1715 MUL_1716 ruvA ruvB TRUE 0.997 4.000 0.549 0.001 Y NA
 1985541 1985542 MUL_1717 MUL_1718     FALSE 0.026 221.000 0.000 NA   NA
 1985543 1985544 MUL_1719 MUL_1720     FALSE 0.162 90.000 0.000 NA   NA
 1985545 1985546 MUL_1721 MUL_1722     FALSE 0.063 154.000 0.000 NA   NA
 1985546 1985547 MUL_1722 MUL_1723   gabT FALSE 0.255 181.000 0.444 1.000 N NA
 1985548 1985549 MUL_1724 MUL_1725 yajC secD TRUE 0.660 113.000 0.062 NA Y NA
 1985549 1985550 MUL_1725 MUL_1726 secD secF TRUE 0.995 5.000 0.336 0.001 Y NA
 1985550 1985551 MUL_1726 MUL_1727 secF   TRUE 0.921 6.000 0.083 1.000 N NA
 1985551 1985552 MUL_1727 MUL_1728   apt TRUE 0.954 -3.000 0.023 1.000 N NA
 1985552 1985553 MUL_1728 MUL_1729 apt relA FALSE 0.371 68.000 0.051 1.000 N NA
 1985555 1985556 MUL_1731 MUL_1732   hisS TRUE 0.968 -3.000 0.051 1.000   NA
 1985556 1985557 MUL_1732 MUL_1733 hisS   FALSE 0.398 35.000 0.000 NA   NA
 1985557 1985558 MUL_1733 MUL_1734     FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 1985559 1985560 MUL_1735 MUL_1736     FALSE 0.476 27.000 0.000 NA   NA
 1985560 1985561 MUL_1736 MUL_1737     FALSE 0.010 465.000 0.000 1.000   NA
 1985562 1985563 MUL_1738 MUL_1739   dapA_1 FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 1985564 1985565 MUL_1740 MUL_1741     FALSE 0.329 62.000 0.021 NA   NA
 1985565 1985566 MUL_1741 MUL_1742   apbA_1 TRUE 0.786 19.000 0.098 NA   NA
 1985567 1985568 MUL_1743 MUL_5095 aspS   TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985568 1985569 MUL_5095 MUL_1744     FALSE 0.103 120.000 0.000 NA   NA
 1985571 1985572 MUL_1746 MUL_1747     TRUE 0.761 -7.000 0.046 NA   NA
 1985573 1985574 MUL_1748 MUL_1749     TRUE 0.884 34.000 0.667 NA   NA
 1985574 1985575 MUL_1749 MUL_1750     FALSE 0.083 136.000 0.000 NA   NA
 1985578 1985579 MUL_1753 MUL_1754   alaS FALSE 0.137 119.000 0.011 NA   NA
 1985579 1985580 MUL_1754 MUL_1755 alaS   TRUE 0.963 1.000 0.103 1.000 N NA
 1985580 1985581 MUL_1755 MUL_1756     TRUE 0.748 -7.000 0.039 NA   NA
 1985581 1985582 MUL_1756 MUL_1757   aroE TRUE 0.993 -3.000 0.667 NA   NA
 1985582 1985583 MUL_1757 MUL_1758 aroE   TRUE 0.725 12.000 0.000 NA   NA
 1985583 1985584 MUL_1758 MUL_1759   aroF FALSE 0.195 77.000 0.000 NA   NA
 1985584 1985585 MUL_1759 MUL_1760 aroF aroK TRUE 0.982 9.000 0.041 1.000 Y NA
 1985585 1985586 MUL_1760 MUL_1761 aroK aroB TRUE 0.996 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 1985586 1985587 MUL_1761 MUL_1762 aroB aroD TRUE 0.996 -3.000 0.052 0.002 Y NA
 1985589 1985590 MUL_1764 MUL_1765 pepQ efp TRUE 0.865 15.000 0.160 1.000 N NA
 1985590 1985591 MUL_1765 MUL_1766 efp nusB TRUE 0.946 3.000 0.078 1.000 N NA
 1985591 1985592 MUL_1766 MUL_1767 nusB   TRUE 0.723 -6.000 0.004 NA   NA
 1985592 1985593 MUL_1767 MUL_1769     FALSE 0.041 182.000 0.000 NA   NA
 1985594 1985595 MUL_1770 MUL_1771     FALSE 0.342 46.000 0.000 1.000 N NA
 1985595 1985596 MUL_1771 MUL_1772     TRUE 0.879 16.000 0.222 1.000 N NA
 1985597 1985598 MUL_1773 MUL_1774 lprF   FALSE 0.546 48.000 0.100 NA   NA
 1985598 1985599 MUL_1774 MUL_1775     TRUE 0.957 -3.000 0.028 1.000 N NA
 1985599 1985600 MUL_1775 MUL_1776     FALSE 0.299 60.000 0.000 1.000   NA
 1985600 1985601 MUL_1776 MUL_1777     FALSE 0.499 -118.000 0.000 0.001   NA
 1985603 1985604 MUL_1779 MUL_1780 pyrR pyrB TRUE 0.997 -3.000 0.247 1.000 Y NA
 1985604 1985605 MUL_1780 MUL_1781 pyrB pyrC TRUE 0.998 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 1985605 1985606 MUL_1781 MUL_1782 pyrC   TRUE 0.964 -3.000 0.057 NA   NA
 1985606 1985607 MUL_1782 MUL_1783   carA TRUE 0.962 -3.000 0.050 NA   NA
 1985607 1985608 MUL_1783 MUL_1784 carA carB TRUE 0.885 92.000 0.345 0.001 Y NA
 1985608 1985609 MUL_1784 MUL_1785 carB pyrF TRUE 0.995 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 1985609 1985610 MUL_1785 MUL_1787 pyrF mihF FALSE 0.011 965.000 0.029 1.000   NA
 1985610 1985611 MUL_1787 MUL_1788 mihF gmk FALSE 0.295 97.000 0.054 1.000   NA
 1985611 1985612 MUL_1788 MUL_1789 gmk rpoZ TRUE 0.626 87.000 0.471 1.000 N NA
 1985612 1985613 MUL_1789 MUL_1790 rpoZ dfp TRUE 0.866 16.000 0.192 1.000 N NA
 1985613 1985614 MUL_1790 MUL_1791 dfp metK TRUE 0.612 129.000 0.059 1.000 Y NA
 1985615 1985616 MUL_1792 MUL_1793     FALSE 0.299 60.000 0.000 1.000   NA
 1985616 1985617 MUL_1793 MUL_1794   lipH FALSE 0.050 172.000 0.000 1.000 N NA
 1985617 1985618 MUL_1794 MUL_1795 lipH lipI TRUE 0.966 27.000 0.250 0.020 Y NA
 1985619 1985620 MUL_1796 MUL_1797   priA FALSE 0.239 111.000 0.050 1.000   NA
 1985621 1985622 MUL_1798 MUL_1799     FALSE 0.029 237.000 0.000 1.000   NA
 1985625 1985626 MUL_1802 MUL_1803 fmt fmu TRUE 0.890 69.000 0.305 1.000 Y NA
 1985626 1985627 MUL_1803 MUL_1804 fmu rpe FALSE 0.434 58.000 0.056 1.000 N NA
 1985627 1985628 MUL_1804 MUL_1805 rpe ribG TRUE 0.871 8.000 0.028 1.000 N NA
 1985629 1985630 MUL_1806 MUL_1807   lprG TRUE 0.972 0.000 0.143 NA   NA
 1985631 1985632 MUL_1808 MUL_1809 ribC ribA2 TRUE 0.555 139.000 0.029 1.000 Y NA
 1985632 1985633 MUL_1809 MUL_1810 ribA2 ribH TRUE 0.996 -3.000 0.041 0.002 Y NA
 1985633 1985634 MUL_1810 MUL_1811 ribH   TRUE 0.948 -3.000 0.014 NA   NA
 1985634 1985635 MUL_1811 MUL_1812   lprH TRUE 0.572 50.000 0.143 NA   NA
 1985635 1985636 MUL_1812 MUL_1813 lprH   FALSE 0.150 97.000 0.000 NA   NA
 1985636 1985637 MUL_1813 MUL_1814   uvrC FALSE 0.370 -72.000 0.000 1.000   NA
 1985637 1985638 MUL_1814 MUL_1815 uvrC   TRUE 0.967 -3.000 0.073 NA   NA
 1985638 1985639 MUL_1815 MUL_1816     TRUE 0.984 -3.000 0.259 NA   NA
 1985639 1985640 MUL_1816 MUL_1817   whiA TRUE 0.990 -3.000 0.470 NA   NA
 1985640 1985641 MUL_1817 MUL_1818 whiA   FALSE 0.138 103.000 0.000 NA   NA
 1985642 1985643 MUL_1819 MUL_1820 lipO fadD12 TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985643 1985644 MUL_1820 MUL_1821 fadD12   TRUE 0.859 4.000 0.000 NA   NA
 1985645 1985646 MUL_1822 MUL_1823     FALSE 0.215 -1759.000 0.000 NA   NA
 1985646 1985647 MUL_1823 MUL_1824     TRUE 0.650 25.000 0.000 0.089   NA
 1985647 1985648 MUL_1824 MUL_1825     FALSE 0.006 1317.000 0.000 NA   NA
 1985648 1985649 MUL_1825 MUL_1826     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985651 1985652 MUL_1828 MUL_1829 gap pgk TRUE 0.979 13.000 0.055 0.003 Y NA
 1985652 1985653 MUL_1829 MUL_1830 pgk tpi TRUE 0.995 -3.000 0.075 1.000 Y NA
 1985654 1985655 MUL_1831 MUL_1832 gabT_1   TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985657 1985658 MUL_1834 MUL_1835   secG FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 1985660 1985661 MUL_1837 MUL_1838     TRUE 0.904 1.000 0.000 NA   NA
 1985661 1985662 MUL_1838 MUL_1839     FALSE 0.151 96.000 0.000 NA   NA
 1985662 1985663 MUL_1839 MUL_1840   devB FALSE 0.303 50.000 0.000 NA   NA
 1985663 1985664 MUL_1840 MUL_1841 devB opcA TRUE 0.996 -3.000 0.179 NA Y NA
 1985664 1985665 MUL_1841 MUL_1842 opcA zwf2 TRUE 0.880 50.000 0.104 NA Y NA
 1985665 1985666 MUL_1842 MUL_1843 zwf2 tal TRUE 0.995 -3.000 0.067 1.000 Y NA
 1985666 1985667 MUL_1843 MUL_1844 tal tkt TRUE 0.968 16.000 0.090 1.000 Y NA
 1985669 1985670 MUL_1846 MUL_1847     FALSE 0.258 -1192.000 0.000 NA   NA
 1985671 1985672 MUL_1848 MUL_1849     FALSE 0.149 131.000 0.000 0.089   NA
 1985672 1985673 MUL_1849 MUL_1850     FALSE 0.008 452.000 0.000 NA   NA
 1985673 1985674 MUL_1850 MUL_1852   otsB1 FALSE 0.006 830.000 0.000 NA   NA
 1985679 1985680 MUL_1857 MUL_1858     FALSE 0.418 71.000 0.022 0.041   NA
 1985680 1985681 MUL_1858 MUL_1859     TRUE 0.981 -3.000 0.186 1.000   NA
 1985681 1985682 MUL_1859 MUL_1860     TRUE 0.776 45.000 0.357 1.000   NA
 1985683 1985684 MUL_1861 MUL_1862     TRUE 0.972 -3.000 0.100 1.000 N NA
 1985684 1985685 MUL_1862 MUL_1863     TRUE 0.998 -3.000 0.266 0.001 Y NA
 1985685 1985686 MUL_1863 MUL_1864     TRUE 0.998 -3.000 0.482 1.000 Y NA
 1985686 1985687 MUL_1864 MUL_1865   csd TRUE 0.950 3.000 0.093 1.000 N NA
 1985687 1985688 MUL_1865 MUL_1866 csd   TRUE 0.970 3.000 0.249 1.000 N NA
 1985688 1985689 MUL_1866 MUL_1867     TRUE 0.839 -7.000 0.152 NA   NA
 1985689 1985690 MUL_1867 MUL_1868     FALSE 0.040 184.000 0.000 NA   NA
 1985691 1985692 MUL_1869 MUL_1870 fadE15   FALSE 0.380 106.000 0.222 NA   NA
 1985692 1985693 MUL_1870 MUL_1871     FALSE 0.513 -12.000 0.000 NA   NA
 1985693 1985694 MUL_1871 MUL_1872     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985694 1985695 MUL_1872 MUL_1873     TRUE 0.563 21.000 0.000 NA   NA
 1985695 1985696 MUL_1873 MUL_1874     TRUE 0.650 25.000 0.000 0.089   NA
 1985697 1985698 MUL_1875 MUL_1876   nrdH FALSE 0.013 333.000 0.000 NA   NA
 1985698 1985699 MUL_1876 MUL_1877 nrdH nrdI TRUE 0.806 44.000 0.500 NA N NA
 1985699 1985700 MUL_1877 MUL_1878 nrdI nrdE TRUE 0.911 54.000 0.300 NA Y NA
 1985700 1985701 MUL_1878 MUL_1879 nrdE   FALSE 0.253 115.000 0.100 1.000 N NA
 1985701 1985702 MUL_1879 MUL_1880     FALSE 0.453 119.000 0.400 1.000 N NA
 1985703 1985704 MUL_1881 MUL_1882     TRUE 0.836 -16.000 0.333 NA   NA
 1985705 1985706 MUL_1883 MUL_1884 nrdF2   FALSE 0.122 167.000 0.100 NA   NA
 1985707 1985708 MUL_1885 MUL_1886 adh fecB FALSE 0.191 134.000 0.068 1.000   NA
 1985709 1985710 MUL_1887 MUL_1888 ctaD serB2 FALSE 0.320 59.000 0.007 1.000 N NA
 1985710 1985711 MUL_1888 MUL_1889 serB2   FALSE 0.108 117.000 0.000 NA   NA
 1985713 1985714 MUL_1891 MUL_1892     TRUE 0.870 65.000 0.085 0.005 Y NA
 1985714 1985715 MUL_1892 MUL_1893   hycD TRUE 0.994 6.000 0.398 1.000 Y NA
 1985715 1985716 MUL_1893 MUL_1894 hycD hycP TRUE 0.996 5.000 0.679 NA Y NA
 1985716 1985717 MUL_1894 MUL_1895 hycP hycQ TRUE 0.999 0.000 0.864 NA Y NA
 1985717 1985718 MUL_1895 MUL_1896 hycQ hycE TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1985718 1985719 MUL_1896 MUL_1897 hycE   FALSE 0.148 98.000 0.000 NA   NA
 1985719 1985720 MUL_1897 MUL_1898     TRUE 0.960 -3.000 0.024 1.000   NA
 1985720 1985721 MUL_1898 MUL_1899   echA17 TRUE 0.966 -3.000 0.043 1.000   NA
 1985721 1985722 MUL_1899 MUL_1900 echA17   TRUE 0.942 11.000 0.292 1.000 N NA
 1985722 1985723 MUL_1900 MUL_1901     FALSE 0.131 165.000 0.112 NA   NA
 1985723 1985724 MUL_1901 MUL_1902     FALSE 0.302 75.000 0.034 NA   NA
 1985725 1985726 MUL_5115 MUL_1903     TRUE 0.614 17.000 0.000 NA   NA
 1985728 1985729 MUL_1905 MUL_1906     FALSE 0.506 25.000 0.000 NA   NA
 1985729 1985730 MUL_1906 MUL_1907   phrI FALSE 0.093 127.000 0.000 NA   NA
 1985730 1985731 MUL_1907 MUL_1908 phrI   TRUE 0.832 9.000 0.008 1.000 N NA
 1985731 1985732 MUL_1908 MUL_1909     TRUE 0.973 -3.000 0.027 0.038   NA
 1985733 1985734 MUL_1910 MUL_1911     FALSE 0.035 197.000 0.000 NA   NA
 1985734 1985735 MUL_1911 MUL_1912     FALSE 0.255 -1241.000 0.000 NA   NA
 1985735 1985736 MUL_1912 MUL_1913     TRUE 0.650 25.000 0.000 0.088   NA
 1985738 1985739 MUL_1915 MUL_1916     FALSE 0.038 189.000 0.000 NA   NA
 1985742 1985743 MUL_1919 MUL_1920     FALSE 0.338 92.000 0.082 1.000   NA
 1985743 1985744 MUL_1920 MUL_1921     TRUE 0.974 -3.000 0.095 1.000   NA
 1985745 1985746 MUL_1922 MUL_1923 fixA fixB TRUE 0.974 48.000 0.877 0.011 Y NA
 1985746 1985747 MUL_1923 MUL_1924 fixB   FALSE 0.261 101.000 0.062 NA   NA
 1985747 1985748 MUL_1924 MUL_1925     TRUE 0.983 0.000 0.286 NA   NA
 1985748 1985749 MUL_1925 MUL_1926     FALSE 0.233 65.000 0.000 NA   NA
 1985749 1985750 MUL_1926 MUL_1927   iscS FALSE 0.249 61.000 0.000 NA   NA
 1985750 1985751 MUL_1927 MUL_1928 iscS trmU TRUE 0.971 -3.000 0.094 1.000 N NA
 1985753 1985754 MUL_1930 MUL_1931     FALSE 0.009 446.000 0.000 NA   NA
 1985754 1985755 MUL_1931 MUL_1932     FALSE 0.237 -1458.000 0.000 NA   NA
 1985755 1985756 MUL_1932 MUL_1933   ligA FALSE 0.008 714.000 0.000 1.000   NA
 1985756 1985757 MUL_1933 MUL_1934 ligA   FALSE 0.293 61.000 0.002 1.000 N NA
 1985757 1985758 MUL_1934 MUL_1935     FALSE 0.212 197.000 0.429 NA   NA
 1985758 1985759 MUL_1935 MUL_1936   mmpL4_9 TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985761 1985762 MUL_1938 MUL_1939 gatC gatA TRUE 0.999 -3.000 0.643 0.001 Y NA
 1985762 1985763 MUL_1939 MUL_1940 gatA pfkA FALSE 0.187 100.000 0.007 1.000 N NA
 1985763 1985764 MUL_1940 MUL_1941 pfkA gatB FALSE 0.330 59.000 0.011 1.000 N NA
 1985764 1985765 MUL_1941 MUL_1942 gatB   FALSE 0.037 192.000 0.000 NA   NA
 1985769 1985770 MUL_1946 MUL_1947   ilvB1 FALSE 0.074 144.000 0.000 NA   NA
 1985770 1985771 MUL_1947 MUL_1948 ilvB1 ilvN TRUE 0.998 0.000 0.380 0.001 Y NA
 1985771 1985772 MUL_1948 MUL_1949 ilvN ilvC TRUE 0.850 73.000 0.071 0.001 Y NA
 1985773 1985774 MUL_1950 MUL_1951     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985775 1985776 MUL_1952 MUL_1953 serA1 leuB TRUE 0.847 56.000 0.039 1.000 Y NA
 1985778 1985779 MUL_1956 MUL_1957   gltS FALSE 0.442 60.000 0.070 1.000 N NA
 1985779 1985780 MUL_1957 MUL_1958 gltS glnU FALSE 0.074 144.000 0.000 NA   NA
 1985780 1985781 MUL_1958 MUL_1959 glnU gluU FALSE 0.215 70.000 0.000 NA   NA
 1985786 1985787 MUL_1964 MUL_1965   mmpS1 FALSE 0.162 90.000 0.000 NA   NA
 1985787 1985788 MUL_1965 MUL_1966 mmpS1 bioF2_2 FALSE 0.022 240.000 0.000 NA   NA
 1985788 1985789 MUL_1966 MUL_1967 bioF2_2   FALSE 0.008 544.000 0.000 1.000 N NA
 1985790 1985791 MUL_1968 MUL_1969 leuC leuD TRUE 0.981 25.000 0.477 0.001 Y NA
 1985791 1985792 MUL_1969 MUL_1970 leuD hupB FALSE 0.048 225.000 0.066 NA N NA
 1985793 1985794 MUL_1971 MUL_1972 mutT1 ppk FALSE 0.198 80.000 0.000 1.000 N NA
 1985794 1985795 MUL_1972 MUL_1973 ppk   FALSE 0.275 79.000 0.026 NA   NA
 1985796 1985797 MUL_1975 MUL_1976 gpdA2 ddlA FALSE 0.323 92.000 0.088 1.000 N NA
 1985799 1985800 MUL_1978 MUL_1979 thiL   FALSE 0.484 26.000 0.000 NA   NA
 1985800 1985801 MUL_1979 MUL_1980   ung TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985801 1985802 MUL_1980 MUL_1981 ung   TRUE 0.823 6.000 0.000 NA   NA
 1985802 1985803 MUL_1981 MUL_1982     FALSE 0.017 277.000 0.000 NA   NA
 1985805 1985806 MUL_1984 MUL_1985   recG TRUE 0.878 3.000 0.000 NA   NA
 1985806 1985807 MUL_1985 MUL_1986 recG   TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1985808 1985809 MUL_1987 MUL_1988     FALSE 0.039 187.000 0.000 NA   NA
 1985810 1985811 MUL_1989 MUL_1990 lipN   FALSE 0.217 187.000 0.421 NA N NA
 1985811 1985812 MUL_1990 MUL_1991     TRUE 0.956 6.000 0.257 NA   NA
 1985812 1985813 MUL_1991 MUL_1992   pca FALSE 0.449 43.000 0.021 NA   NA
 1985813 1985814 MUL_1992 MUL_1993 pca   FALSE 0.193 78.000 0.000 NA   NA
 1985814 1985815 MUL_1993 MUL_1994   kdtB FALSE 0.202 74.000 0.000 NA   NA
 1985816 1985817 MUL_1995 MUL_1996   purU FALSE 0.059 157.000 0.000 NA   NA
 1985817 1985818 MUL_1996 MUL_1997 purU   FALSE 0.011 359.000 0.000 NA   NA
 1985819 1985820 MUL_1998 MUL_1999     FALSE 0.056 161.000 0.000 NA   NA
 1985822 1985823 MUL_2001 MUL_2002   fadD29 FALSE 0.006 834.000 0.000 NA   NA
 1985823 1985824 MUL_2002 MUL_2003 fadD29   TRUE 0.858 5.000 0.010 NA N NA
 1985824 1985825 MUL_2003 MUL_2004   fadD22 FALSE 0.118 119.000 0.010 NA N NA
 1985825 1985826 MUL_2004 MUL_2005 fadD22 pks15/1 TRUE 0.991 17.000 0.750 0.006 Y NA
 1985826 1985827 MUL_2005 MUL_2006 pks15/1 lppX FALSE 0.072 415.000 0.500 NA   NA
 1985828 1985829 MUL_2007 MUL_2008 mmpL7 fadD28 TRUE 0.989 2.000 0.600 1.000   NA
 1985830 1985831 MUL_2009 MUL_2010   mas FALSE 0.008 621.000 0.000 1.000   NA
 1985832 1985833 MUL_2011 MUL_2012 papA5 drrC TRUE 0.813 34.000 0.364 NA   NA
 1985833 1985834 MUL_2012 MUL_2013 drrC drrB TRUE 0.999 -3.000 0.857 0.001 Y NA
 1985834 1985835 MUL_2013 MUL_2014 drrB drrA TRUE 0.999 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 1985835 1985836 MUL_2014 MUL_2015 drrA ppsE TRUE 0.963 11.000 0.500 1.000 N NA
 1985836 1985837 MUL_2015 MUL_2016 ppsE ppsD TRUE 0.995 6.000 0.417 0.006 Y NA
 1985837 1985838 MUL_2016 MUL_2017 ppsD ppsC TRUE 0.999 0.000 0.833 0.005 Y NA
 1985838 1985839 MUL_2017 MUL_2018 ppsC ppsB TRUE 0.998 0.000 0.500 0.006 Y NA
 1985839 1985840 MUL_2018 MUL_2019 ppsB ppsA TRUE 0.923 30.000 0.000 0.006 Y NA
 1985840 1985841 MUL_2019 MUL_2020 ppsA fadD26 TRUE 0.993 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1985841 1985842 MUL_2020 MUL_2022 fadD26   FALSE 0.020 257.000 0.000 NA   NA
 1985842 1985843 MUL_2022 MUL_2023     FALSE 0.263 -711.000 0.000 NA   NA
 1985843 1985844 MUL_2023 MUL_2024     TRUE 0.651 25.000 0.000 0.087   NA
 1985844 1985845 MUL_2024 MUL_2025   tesA FALSE 0.012 395.000 0.000 1.000   NA
 1985845 1985846 MUL_2025 MUL_2026 tesA   FALSE 0.194 90.000 0.000 1.000   NA
 1985846 1985847 MUL_2026 MUL_2027     TRUE 0.651 25.000 0.000 0.087   NA
 1985848 1985849 MUL_2028 MUL_2029     FALSE 0.296 75.000 0.029 NA   NA
 1985849 1985850 MUL_2029 MUL_2030   rnc TRUE 0.954 -3.000 0.026 NA   NA
 1985850 1985851 MUL_2030 MUL_2031 rnc fpg TRUE 0.956 1.000 0.068 1.000 N NA
 1985851 1985852 MUL_2031 MUL_2032 fpg   FALSE 0.208 92.000 0.010 1.000 N NA
 1985852 1985853 MUL_2032 MUL_2033   smc FALSE 0.154 99.000 0.000 1.000 N NA
 1985853 1985854 MUL_2033 MUL_2034 smc ftsY TRUE 0.616 60.000 0.165 0.011 N NA
 1985854 1985855 MUL_2034 MUL_2035 ftsY amt FALSE 0.055 162.000 0.000 NA   NA
 1985855 1985856 MUL_2035 MUL_2036 amt glnB TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985856 1985857 MUL_2036 MUL_2037 glnB glnD FALSE 0.154 94.000 0.000 NA   NA
 1985858 1985859 MUL_2038 MUL_2039     FALSE 0.028 216.000 0.000 NA   NA
 1985860 1985861 MUL_2040 MUL_2041 ffh   TRUE 0.876 7.000 0.025 1.000 N NA
 1985861 1985862 MUL_2041 MUL_2042   pknI FALSE 0.324 49.000 0.000 1.000 N NA
 1985862 1985863 MUL_2042 MUL_2043 pknI   FALSE 0.137 106.000 0.000 1.000 N NA
 1985863 1985864 MUL_2043 MUL_2044     TRUE 0.979 2.000 0.278 1.000   NA
 1985866 1985867 MUL_2046 MUL_2047   rpsP FALSE 0.037 206.000 0.002 NA   NA
 1985867 1985868 MUL_2047 MUL_2048 rpsP   TRUE 0.963 9.000 0.385 1.000   NA
 1985868 1985869 MUL_2048 MUL_2049   rimM TRUE 0.865 25.000 0.324 1.000   NA
 1985869 1985870 MUL_2049 MUL_2050 rimM trmD TRUE 0.995 9.000 0.672 1.000 Y NA
 1985872 1985873 MUL_2052 MUL_2053 rplS lepB FALSE 0.172 112.000 0.018 1.000 N NA
 1985873 1985874 MUL_2053 MUL_2054 lepB rnhB TRUE 0.921 3.000 0.024 1.000 N NA
 1985874 1985875 MUL_2054 MUL_2055 rnhB   FALSE 0.201 120.000 0.067 NA   NA
 1985876 1985877 MUL_2056 MUL_2057     FALSE 0.193 78.000 0.000 NA   NA
 1985878 1985879 MUL_2058 MUL_2059   fdhD FALSE 0.225 135.000 0.143 1.000 N NA
 1985879 1985880 MUL_2059 MUL_2060 fdhD   FALSE 0.132 117.000 0.003 1.000 N NA
 1985880 1985881 MUL_2060 MUL_2061     TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1985881 1985882 MUL_2061 MUL_2062     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985882 1985883 MUL_2062 MUL_2063   viuB FALSE 0.438 33.000 0.007 NA N NA
 1985883 1985884 MUL_2063 MUL_2064 viuB lldD1_1 FALSE 0.532 24.000 0.000 NA   NA
 1985884 1985885 MUL_2064 MUL_2065 lldD1_1 xerC FALSE 0.423 32.000 0.000 NA   NA
 1985887 1985888 MUL_2067 MUL_2068 rpsB tsf TRUE 0.998 2.000 0.748 1.000 Y NA
 1985888 1985889 MUL_2068 MUL_2069 tsf amiC TRUE 0.943 21.000 0.006 1.000 Y NA
 1985891 1985892 MUL_2071 MUL_2072     FALSE 0.160 288.000 0.667 1.000   NA
 1985894 1985895 MUL_2074 MUL_2075 pyrH frr TRUE 0.762 65.000 0.626 1.000 N NA
 1985895 1985896 MUL_2075 MUL_2076 frr cdsA TRUE 0.632 33.000 0.076 1.000 N NA
 1985898 1985899 MUL_2078 MUL_2079   mpt53 FALSE 0.061 180.000 0.003 1.000   NA
 1985899 1985900 MUL_2079 MUL_2080 mpt53   TRUE 0.993 14.000 1.000 1.000 Y NA
 1985900 1985901 MUL_2080 MUL_2081     TRUE 0.922 16.000 0.400 NA   NA
 1985905 1985906 MUL_2085 MUL_2086 dxr   TRUE 0.775 20.000 0.088 1.000 N NA
 1985906 1985907 MUL_2086 MUL_2087   ispG FALSE 0.298 95.000 0.072 1.000 N NA
 1985907 1985908 MUL_2087 MUL_2088 ispG   FALSE 0.419 52.000 0.018 1.000   NA
 1985908 1985909 MUL_2088 MUL_2089     FALSE 0.441 111.000 0.292 1.000   NA
 1985909 1985910 MUL_2089 MUL_2090     FALSE 0.376 112.000 0.250 NA   NA
 1985910 1985911 MUL_2090 MUL_2091   mapB FALSE 0.123 147.000 0.042 NA   NA
 1985911 1985912 MUL_2091 MUL_2092 mapB   FALSE 0.031 207.000 0.000 NA   NA
 1985912 1985913 MUL_2092 MUL_2093     FALSE 0.086 133.000 0.000 NA   NA
 1985914 1985915 MUL_2094 MUL_2095     FALSE 0.016 282.000 0.000 NA   NA
 1985915 1985916 MUL_2095 MUL_2096     FALSE 0.275 55.000 0.000 NA   NA
 1985916 1985917 MUL_2096 MUL_2097     FALSE 0.022 240.000 0.000 NA   NA
 1985917 1985918 MUL_2097 MUL_2098     FALSE 0.124 109.000 0.000 NA   NA
 1985918 1985919 MUL_2098 MUL_2099     FALSE 0.006 761.000 0.000 NA   NA
 1985920 1985921 MUL_2100 MUL_2101 aroG   FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   NA
 1985921 1985922 MUL_2101 MUL_2102     FALSE 0.249 61.000 0.000 NA   NA
 1985924 1985925 MUL_2106 MUL_2107     TRUE 0.563 21.000 0.000 NA   NA
 1985927 1985928 MUL_2109 MUL_2110 mqo elaA TRUE 0.570 -123.000 0.119 1.000   NA
 1985928 1985929 MUL_2110 MUL_2111 elaA   TRUE 0.987 -3.000 0.314 1.000   NA
 1985929 1985930 MUL_2111 MUL_2112   cobO TRUE 0.959 22.000 0.057 0.067 Y NA
 1985930 1985931 MUL_2112 MUL_2113 cobO cobB TRUE 0.807 95.000 0.114 0.007 Y NA
 1985931 1985932 MUL_2113 MUL_2114 cobB cysG FALSE 0.476 178.000 0.145 1.000 Y NA
 1985932 1985933 MUL_2114 MUL_2115 cysG efpA TRUE 0.770 34.000 0.156 0.021   NA
 1985933 1985934 MUL_2115 MUL_2116 efpA proS FALSE 0.179 107.000 0.004 1.000   NA
 1985935 1985936 MUL_2117 MUL_2118     TRUE 0.975 -3.000 0.139 NA   NA
 1985937 1985938 MUL_2119 MUL_2120   nusA TRUE 0.994 -3.000 0.759 NA   NA
 1985938 1985939 MUL_2120 MUL_2121 nusA   TRUE 0.554 179.000 0.323 NA Y NA
 1985939 1985940 MUL_2121 MUL_2122   infB FALSE 0.487 65.000 0.171 NA N NA
 1985940 1985941 MUL_2122 MUL_2123 infB rbfA TRUE 0.990 13.000 0.530 1.000 Y NA
 1985941 1985942 MUL_2123 MUL_2124 rbfA   TRUE 0.839 20.000 0.173 1.000   NA
 1985942 1985943 MUL_2124 MUL_2125   dinF TRUE 0.803 16.000 0.054 1.000   NA
 1985943 1985944 MUL_2125 MUL_2126 dinF ugpA FALSE 0.390 65.000 0.006 0.040 N NA
 1985944 1985945 MUL_2126 MUL_2127 ugpA ugpE TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1985947 1985948 MUL_2129 MUL_2130     FALSE 0.377 38.000 0.000 NA   NA
 1985948 1985949 MUL_2130 MUL_2131     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985950 1985951 MUL_2132 MUL_2133     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985951 1985952 MUL_2133 MUL_2134     FALSE 0.013 327.000 0.000 NA   NA
 1985952 1985953 MUL_2134 MUL_2135     TRUE 0.827 32.000 0.375 NA   NA
 1985954 1985955 MUL_2136 MUL_2137     TRUE 0.561 -9.000 0.000 NA   NA
 1985955 1985956 MUL_2137 MUL_2138   lppV_1 TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985956 1985957 MUL_2138 MUL_2139 lppV_1 lppV FALSE 0.262 58.000 0.000 NA   NA
 1985957 1985958 MUL_2139 MUL_2140 lppV   FALSE 0.210 130.000 0.111 NA   NA
 1985958 1985959 MUL_2140 MUL_2141   pptII TRUE 0.982 -3.000 0.203 1.000   NA
 1985959 1985960 MUL_2141 MUL_2142 pptII truB TRUE 0.959 -3.000 0.034 1.000 N NA
 1985960 1985961 MUL_2142 MUL_2143 truB ltp1 FALSE 0.157 107.000 0.003 1.000 N NA
 1985961 1985962 MUL_2143 MUL_2144 ltp1 fadE21 TRUE 0.917 29.000 0.011 1.000 Y NA
 1985964 1985965 MUL_2146 MUL_2147 ribF rpsO FALSE 0.229 127.000 0.119 1.000 N NA
 1985965 1985966 MUL_2147 MUL_2148 rpsO lppU TRUE 0.764 12.000 0.004 NA   NA
 1985966 1985967 MUL_2148 MUL_2149 lppU   FALSE 0.398 35.000 0.000 NA   NA
 1985967 1985968 MUL_2149 MUL_2150   gpsI FALSE 0.010 398.000 0.000 NA   NA
 1985968 1985969 MUL_2150 MUL_2151 gpsI pepR FALSE 0.415 -22.000 0.000 NA   NA
 1985973 1985974 MUL_2155 MUL_2156     TRUE 0.660 29.000 0.074 NA   NA
 1985974 1985975 MUL_2156 MUL_2157     FALSE 0.531 105.000 0.429 NA   NA
 1985975 1985976 MUL_2157 MUL_2158   ephD_1 TRUE 0.823 6.000 0.000 NA   NA
 1985976 1985977 MUL_2158 MUL_2159 ephD_1   TRUE 0.679 14.000 0.000 NA   NA
 1985979 1985980 MUL_2161 MUL_2162     TRUE 0.816 71.000 0.900 1.000   NA
 1985982 1985983 MUL_2164 MUL_2165 dapB   TRUE 0.883 8.000 0.027 1.000   NA
 1985983 1985984 MUL_2165 MUL_2166     TRUE 0.966 -3.000 0.069 NA   NA
 1985984 1985985 MUL_2166 MUL_5098     FALSE 0.218 69.000 0.000 NA   NA
 1985985 1985986 MUL_5098 MUL_2167     FALSE 0.048 171.000 0.000 NA   NA
 1985986 1985987 MUL_2167 MUL_2168   fadD13_1 FALSE 0.144 100.000 0.000 NA   NA
 1985987 1985988 MUL_2168 MUL_2169 fadD13_1   FALSE 0.015 299.000 0.000 NA   NA
 1985992 1985993 MUL_2173 MUL_2174   fadE34_1 TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1985997 1985998 MUL_2178 MUL_2179 thyA dfrA TRUE 0.955 8.000 0.295 1.000 N NA
 1985998 1985999 MUL_2179 MUL_2180 dfrA   TRUE 0.947 -3.000 0.012 NA   NA
 1985999 1986000 MUL_2180 MUL_2181   hsdM TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1986000 1986001 MUL_2181 MUL_2182 hsdM hsdS TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1986001 1986002 MUL_2182 MUL_2183 hsdS thyX TRUE 0.894 2.000 0.000 NA   NA
 1986002 1986003 MUL_2183 MUL_2184 thyX dapA FALSE 0.181 118.000 0.037 1.000 N NA
 1986004 1986005 MUL_2185 MUL_2186     TRUE 0.651 25.000 0.000 0.086   NA
 1986005 1986006 MUL_2186 MUL_2187     FALSE 0.027 218.000 0.000 NA   NA
 1986006 1986007 MUL_2187 MUL_2188     FALSE 0.019 267.000 0.000 NA   NA
 1986008 1986009 MUL_2189 MUL_2190 furA katG TRUE 0.770 142.000 0.500 1.000 Y NA
 1986010 1986011 MUL_2191 MUL_2192 betP   FALSE 0.015 347.000 0.000 1.000   NA
 1986011 1986012 MUL_2192 MUL_2193     FALSE 0.017 280.000 0.000 NA   NA
 1986013 1986014 MUL_2195 MUL_2196 fadD9   FALSE 0.187 -2192.000 0.000 NA   NA
 1986015 1986016 MUL_2197 MUL_2198     FALSE 0.196 110.000 0.000 0.054 N NA
 1986017 1986018 MUL_2199 MUL_2200     FALSE 0.078 141.000 0.000 NA   NA
 1986024 1986025 MUL_2206 MUL_2207     FALSE 0.105 119.000 0.000 NA   NA
 1986027 1986028 MUL_2209 MUL_2210     FALSE 0.045 194.000 0.000 1.000   NA
 1986028 1986029 MUL_2210 MUL_2211     FALSE 0.019 268.000 0.000 NA   NA
 1986030 1986031 MUL_2212 MUL_2213     FALSE 0.398 35.000 0.000 NA   NA
 1986032 1986033 MUL_2214 MUL_2215 lpd   TRUE 0.922 3.000 0.028 NA   NA
 1986034 1986035 MUL_2216 MUL_2217     FALSE 0.186 81.000 0.000 NA   NA
 1986036 1986037 MUL_2218 MUL_2219     FALSE 0.224 -1548.000 0.000 NA   NA
 1986038 1986039 MUL_2220 MUL_2221     FALSE 0.013 329.000 0.000 NA   NA
 1986040 1986041 MUL_2222 MUL_2223     FALSE 0.278 54.000 0.000 NA   NA
 1986042 1986043 MUL_2224 MUL_2226     FALSE 0.468 28.000 0.000 NA   NA
 1986046 1986047 MUL_2230 MUL_2231     TRUE 0.651 25.000 0.000 0.085   NA
 1986047 1986048 MUL_2231 MUL_2232     FALSE 0.042 181.000 0.000 NA   NA
 1986048 1986049 MUL_2232 MUL_2233   folE_1 FALSE 0.005 708.000 0.000 NA N NA
 1986050 1986051 MUL_2234 MUL_2235   fdxA TRUE 0.614 17.000 0.000 NA   NA
 1986051 1986052 MUL_2235 MUL_2236 fdxA   FALSE 0.029 213.000 0.000 NA   NA
 1986052 1986053 MUL_2236 MUL_2237     FALSE 0.049 169.000 0.000 NA   NA
 1986053 1986054 MUL_2237 MUL_2238     TRUE 0.959 -3.000 0.040 NA   NA
 1986054 1986055 MUL_2238 MUL_2239     FALSE 0.080 183.000 0.048 1.000 N NA
 1986055 1986056 MUL_2239 MUL_2241     FALSE 0.129 172.000 0.129 1.000 N NA
 1986058 1986059 MUL_2243 MUL_2244 esxR esxS FALSE 0.392 36.000 0.000 NA   NA
 1986059 1986060 MUL_2244 MUL_2245 esxS   FALSE 0.385 37.000 0.000 NA   NA
 1986060 1986061 MUL_2245 MUL_2246     TRUE 0.750 11.000 0.000 NA   NA
 1986061 1986062 MUL_2246 MUL_2247     FALSE 0.007 575.000 0.000 NA   NA
 1986062 1986063 MUL_2247 MUL_2248     FALSE 0.008 460.000 0.000 NA   NA
 1986063 1986064 MUL_2248 MUL_2249     FALSE 0.012 342.000 0.000 NA   NA
 1986064 1986065 MUL_2249 MUL_2250     FALSE 0.031 207.000 0.000 NA   NA
 1986065 1986066 MUL_2250 MUL_2251     FALSE 0.054 163.000 0.000 NA   NA
 1986066 1986067 MUL_2251 MUL_2252     TRUE 0.572 103.000 0.444 1.000   NA
 1986067 1986068 MUL_2252 MUL_2253     TRUE 0.992 6.000 0.211 0.021 Y NA
 1986068 1986069 MUL_2253 MUL_2254     TRUE 0.965 -13.000 0.211 0.021 Y NA
 1986069 1986070 MUL_2254 MUL_2255     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1986070 1986071 MUL_2255 MUL_2256     FALSE 0.183 82.000 0.000 NA   NA
 1986071 1986072 MUL_2256 MUL_2257   pncA TRUE 0.919 0.000 0.000 NA   NA
 1986074 1986075 MUL_2259 MUL_2260     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1986075 1986076 MUL_2260 MUL_2261   lipT TRUE 0.823 6.000 0.000 NA   NA
 1986077 1986078 MUL_2262 MUL_2263 lppI   FALSE 0.013 330.000 0.000 NA   NA
 1986078 1986079 MUL_2263 MUL_2264     FALSE 0.008 489.000 0.000 NA   NA
 1986080 1986081 MUL_2265 MUL_2266   pks12 TRUE 0.811 73.000 1.000 1.000 N NA
 1986081 1986082 MUL_2266 MUL_2267 pks12   FALSE 0.013 331.000 0.000 NA   NA
 1986084 1986085 MUL_2269 MUL_5127 ppm1B ppm1A TRUE 0.557 26.000 0.010 NA   NA
 1986085 1986086 MUL_5127 MUL_2270 ppm1A   FALSE 0.049 290.000 0.041 0.004   NA
 1986086 1986087 MUL_2270 MUL_2271     TRUE 0.613 31.000 0.037 1.000   NA
 1986088 1986089 MUL_2272 MUL_2273     FALSE 0.018 275.000 0.000 NA   NA
 1986090 1986091 MUL_2274 MUL_2275     FALSE 0.095 125.000 0.000 NA   NA
 1986091 1986092 MUL_2275 MUL_2276     TRUE 0.750 11.000 0.000 NA   NA
 1986092 1986093 MUL_2276 MUL_2277   cobN FALSE 0.484 51.000 0.045 1.000   NA
 1986093 1986094 MUL_2277 MUL_2278 cobN   TRUE 0.621 -7.000 0.000 NA   NA
 1986094 1986095 MUL_2278 MUL_2279     FALSE 0.228 66.000 0.000 NA   NA
 1986095 1986096 MUL_2279 MUL_2280     FALSE 0.241 74.000 0.000 1.000   NA
 1986096 1986097 MUL_2280 MUL_2281     TRUE 0.651 25.000 0.000 0.085   NA
 1986098 1986099 MUL_2282 MUL_2283     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1986101 1986102 MUL_2285 MUL_2288     FALSE 0.174 86.000 0.000 NA   NA
 1986102 1986103 MUL_2288 MUL_2289   cobH TRUE 0.877 18.000 0.255 1.000 N NA
 1986103 1986104 MUL_2289 MUL_2290 cobH cobI TRUE 0.997 -3.000 0.096 0.006 Y NA
 1986105 1986106 MUL_2291 MUL_2292   mmpL4_7 FALSE 0.416 33.000 0.000 NA   NA
 1986106 1986107 MUL_2292 MUL_2293 mmpL4_7 mmpS4_1 TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1986107 1986108 MUL_2293 MUL_2294 mmpS4_1 blaC FALSE 0.012 352.000 0.000 NA   NA
 1986110 1986111 MUL_2296 MUL_2297 cobK cobM TRUE 0.996 -3.000 0.076 0.006 Y NA
 1986111 1986112 MUL_2297 MUL_2298 cobM cobL TRUE 0.996 -3.000 0.065 0.006 Y NA
 1986112 1986113 MUL_2298 MUL_2299 cobL   TRUE 0.989 -3.000 0.364 1.000   NA
 1986114 1986115 MUL_2300 MUL_2301     FALSE 0.011 357.000 0.000 NA   NA
 1986118 1986119 MUL_2304 MUL_2305     TRUE 0.985 -3.000 0.286 NA   NA
 1986120 1986121 MUL_2306 MUL_2307     FALSE 0.015 291.000 0.000 NA   NA
 1986121 1986122 MUL_2307 MUL_2308     FALSE 0.278 54.000 0.000 NA   NA
 1986122 1986123 MUL_2308 MUL_2309     FALSE 0.007 676.000 0.000 NA   NA
 1986123 1986124 MUL_2309 MUL_2311     TRUE 0.621 -7.000 0.000 NA   NA
 1986124 1986125 MUL_2311 MUL_2312     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1986126 1986127 MUL_2313 MUL_2314     TRUE 0.939 -7.000 0.561 NA   NA
 1986127 1986128 MUL_2314 MUL_2315     TRUE 0.710 41.000 0.241 NA   NA
 1986128 1986129 MUL_2315 MUL_2317     FALSE 0.007 660.000 0.000 NA   NA
 1986129 1986130 MUL_2317 MUL_2318     TRUE 0.808 7.000 0.000 NA   NA
 1986130 1986131 MUL_2318 MUL_2320     FALSE 0.035 197.000 0.000 NA   NA
 1986131 1986132 MUL_2320 MUL_2321   pepE FALSE 0.385 37.000 0.000 NA   NA
 1986134 1986135 MUL_2323 MUL_2324   helY FALSE 0.307 107.000 0.105 1.000   NA
 1986135 1986136 MUL_2324 MUL_2325 helY tatC FALSE 0.376 88.000 0.166 NA N NA
 1986136 1986137 MUL_2325 MUL_2326 tatC tatA TRUE 0.867 46.000 0.031 NA Y NA
 1986137 1986138 MUL_2326 MUL_2327 tatA   FALSE 0.200 127.000 0.110 NA N NA
 1986138 1986139 MUL_2327 MUL_2328     TRUE 0.959 50.000 0.767 NA Y NA
 1986139 1986140 MUL_2328 MUL_2329     TRUE 0.582 54.000 0.188 NA   NA
 1986140 1986141 MUL_2329 MUL_2330   prcA TRUE 0.633 58.000 0.271 NA   NA
 1986141 1986142 MUL_2330 MUL_2331 prcA prcB TRUE 0.995 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 1986142 1986143 MUL_2331 MUL_2332 prcB   TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1986143 1986144 MUL_2332 MUL_2333     FALSE 0.367 172.000 0.706 NA   NA
 1986145 1986146 MUL_2334 MUL_2335     FALSE 0.031 208.000 0.000 NA   NA
 1986146 1986147 MUL_2335 MUL_2336     FALSE 0.554 61.000 0.200 NA   NA
 1986149 1986150 MUL_2338 MUL_2339 lppK   TRUE 0.785 9.000 0.000 NA   NA
 1986152 1986153 MUL_2341 MUL_2342     TRUE 0.970 -3.000 0.094 NA   NA
 1986156 1986157 MUL_2347 MUL_2348     FALSE 0.296 51.000 0.000 NA   NA
 1986157 1986158 MUL_2348 MUL_2349     FALSE 0.282 -177.000 0.000 NA   NA
 1986159 1986160 MUL_2350 MUL_2351     FALSE 0.015 453.000 0.000 0.084   NA
 1986161 1986162 MUL_2352 MUL_2353 hisG hisE TRUE 0.996 -3.000 0.081 0.003 Y NA
 1986162 1986163 MUL_2353 MUL_2354 hisE   FALSE 0.105 119.000 0.000 NA   NA
 1986167 1986168 MUL_2358 MUL_2359     FALSE 0.462 34.000 0.000 1.000   NA
 1986168 1986169 MUL_2359 MUL_2360   mshC TRUE 0.770 24.000 0.096 1.000   NA
 1986171 1986172 MUL_2362 MUL_2363 cysQ   FALSE 0.298 112.000 0.119 1.000   NA
 1986172 1986173 MUL_2363 MUL_2364     TRUE 0.966 14.000 0.810 NA   NA
 1986173 1986174 MUL_2364 MUL_2365     TRUE 0.664 89.000 0.608 NA   NA
 1986174 1986175 MUL_2365 MUL_2366     TRUE 0.963 -3.000 0.071 NA N NA
 1986175 1986176 MUL_2366 MUL_2367     FALSE 0.420 49.000 0.026 NA   NA
 1986177 1986178 MUL_2368 MUL_2369 lppL   TRUE 0.965 -3.000 0.062 NA   NA
 1986178 1986179 MUL_2369 MUL_2370   pyrD TRUE 0.752 33.000 0.236 NA   NA
 1986180 1986181 MUL_2371 MUL_2372     FALSE 0.093 127.000 0.000 NA   NA
 1986181 1986182 MUL_2372 MUL_2373     TRUE 0.791 27.000 0.224 NA   NA
 1986186 1986187 MUL_2377 MUL_2378     FALSE 0.012 338.000 0.000 NA   NA
 1986187 1986188 MUL_2378 MUL_2379     FALSE 0.407 34.000 0.000 NA   NA
 1986190 1986191 MUL_2381 MUL_2382 mbtH mmpL4_5 FALSE 0.015 292.000 0.000 NA   NA
 1986191 1986192 MUL_2382 MUL_2383 mmpL4_5 mmpS4 TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1986197 1986198 MUL_2388 MUL_2389     TRUE 0.859 4.000 0.000 NA   NA
 1986198 1986199 MUL_2389 MUL_2390     FALSE 0.224 67.000 0.000 NA   NA
 1986203 1986204 MUL_2394 MUL_2395     FALSE 0.015 290.000 0.000 NA   NA
 1986205 1986206 MUL_2396 MUL_2397 ssr   TRUE 0.680 -6.000 0.000 NA   NA
 1986206 1986207 MUL_2397 MUL_2398     FALSE 0.415 -22.000 0.000 NA   NA
 1986207 1986208 MUL_2398 MUL_2399     TRUE 0.960 -3.000 0.025 1.000   NA
 1986211 1986212 MUL_2403 MUL_2404     FALSE 0.198 -1955.000 0.000 NA   NA
 1986213 1986214 MUL_2405 MUL_2407   smpB FALSE 0.008 642.000 0.000 1.000   NA
 1986214 1986215 MUL_2407 MUL_2408 smpB ftsX TRUE 0.931 3.000 0.038 1.000 N NA
 1986215 1986216 MUL_2408 MUL_2409 ftsX ftsE TRUE 0.997 1.000 0.431 1.000 Y NA
 1986216 1986217 MUL_2409 MUL_2410 ftsE   FALSE 0.403 45.000 0.010 NA   NA
 1986217 1986218 MUL_2410 MUL_2411     TRUE 0.949 3.000 0.096 NA   NA
 1986218 1986219 MUL_2411 MUL_2412   prfB TRUE 0.629 -10.000 0.013 1.000 N NA
 1986220 1986221 MUL_2413 MUL_2414 fprA_1   FALSE 0.009 585.000 0.000 1.000   NA
 1986222 1986223 MUL_2415 MUL_2416 agpS   TRUE 0.750 11.000 0.000 NA   NA
 1986224 1986225 MUL_2417 MUL_2418     TRUE 0.869 5.000 0.000 1.000   NA
 1986226 1986227 MUL_2419 MUL_2420     TRUE 0.928 -3.000 0.000 NA   NA
 1986229 1986230 MUL_2422 MUL_2423 devS devR TRUE 0.983 12.000 0.091 0.006 Y NA
 1986230 1986231 MUL_2423 MUL_2424 devR   TRUE 0.953 24.000 1.000 1.000   NA
 1986231 1986232 MUL_2424 MUL_2425     FALSE 0.055 176.000 0.000 1.000   NA
 1986232 1986233 MUL_2425 MUL_2426     FALSE 0.172 121.000 0.000 0.083   NA
 1986234 1986235 MUL_2427 MUL_2428     FALSE 0.073 541.000 0.000 NA Y NA
 1986237 1986238 MUL_2430 MUL_2431   fadE24 FALSE 0.374 82.000 0.096 1.000 N NA
 1986238 1986239 MUL_2431 MUL_2432 fadE24 fadE23 TRUE 0.956 55.000 0.604 0.013 Y NA
 1986240