MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter jejuni subsp. jejuni CF93-6

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 2733434 2733435 CJJCF936_0309 CJJCF936_0310     FALSE 0.135 122.000 0.000 NA   NA
 2733435 2733436 CJJCF936_0310 CJJCF936_0311     TRUE 0.720 -27.000 0.000 1.000   NA
 2733436 2733437 CJJCF936_0311 CJJCF936_0312     FALSE 0.170 97.000 0.000 1.000   NA
 2733437 2733438 CJJCF936_0312 CJJCF936_0313     TRUE 0.632 142.000 0.182 0.052   NA
 2733438 2733439 CJJCF936_0313 CJJCF936_0314     TRUE 0.740 -9.000 0.000 NA   NA
 2733440 2733441 CJJCF936_0315 CJJCF936_0316 surE   TRUE 0.838 -7.000 0.051 1.000   NA
 2733441 2733442 CJJCF936_0316 CJJCF936_0317     TRUE 0.666 -16.000 0.007 1.000   NA
 2733443 2733444 CJJCF936_0318 CJJCF936_0319 panD panC TRUE 0.955 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 2733444 2733445 CJJCF936_0319 CJJCF936_0320 panC panB TRUE 0.995 11.000 0.395 0.002 Y NA
 2733447 2733448 CJJCF936_0322 CJJCF936_0323   modB TRUE 0.952 -3.000 0.286 1.000 Y NA
 2733448 2733449 CJJCF936_0323 CJJCF936_0324 modB   TRUE 0.889 -7.000 0.122 1.000   NA
 2733449 2733450 CJJCF936_0324 CJJCF936_0325   modA TRUE 0.868 -3.000 0.098 1.000   NA
 2733450 2733451 CJJCF936_0325 CJJCF936_0326 modA bioC FALSE 0.317 51.000 0.008 1.000   NA
 2733451 2733452 CJJCF936_0326 CJJCF936_0327 bioC   TRUE 0.842 -3.000 0.065 NA   NA
 2733452 2733453 CJJCF936_0327 CJJCF936_0328   bioF TRUE 0.923 -3.000 0.389 NA   NA
 2733455 2733456 CJJCF936_0329 CJJCF936_0331 bioD   TRUE 0.814 10.000 0.030 1.000 N NA
 2733456 2733457 CJJCF936_0331 CJJCF936_0332     TRUE 0.994 4.000 0.444 0.082 Y NA
 2733458 2733459 CJJCF936_0333 CJJCF936_0334 rplY pth TRUE 0.988 -3.000 0.496 0.051 Y NA
 2733459 2733460 CJJCF936_0334 CJJCF936_0335 pth   TRUE 0.878 2.000 0.031 1.000   NA
 2733460 2733461 CJJCF936_0335 CJJCF936_0336   lysA FALSE 0.413 44.000 0.021 1.000   NA
 2733461 2733462 CJJCF936_0336 CJJCF936_0337 lysA   TRUE 0.817 2.000 0.015 1.000 N NA
 2733462 2733463 CJJCF936_0337 CJJCF936_0338   pheA TRUE 0.732 -12.000 0.021 1.000 N NA
 2733463 2733464 CJJCF936_0338 CJJCF936_0339 pheA hisC TRUE 0.877 -10.000 0.028 1.000 Y NA
 2733464 2733465 CJJCF936_0339 CJJCF936_0340 hisC fliF FALSE 0.576 52.000 0.084 1.000 N NA
 2733465 2733466 CJJCF936_0340 CJJCF936_0341 fliF fliG TRUE 0.995 0.000 0.477 0.013 Y NA
 2733466 2733467 CJJCF936_0341 CJJCF936_0342 fliG   TRUE 0.994 8.000 0.308 0.009 Y NA
 2733467 2733468 CJJCF936_0342 CJJCF936_0343   dxs TRUE 0.839 -7.000 0.052 1.000 N NA
 2733468 2733469 CJJCF936_0343 CJJCF936_0344 dxs   FALSE 0.162 86.000 0.017 1.000 N NA
 2733469 2733470 CJJCF936_0344 CJJCF936_0345     FALSE 0.477 46.000 0.033 NA   NA
 2733470 2733471 CJJCF936_0345 CJJCF936_0346   ubiE TRUE 0.797 3.000 0.008 NA   NA
 2733471 2733472 CJJCF936_0346 CJJCF936_0347 ubiE xseA TRUE 0.686 -3.000 0.016 1.000 N NA
 2733472 2733473 CJJCF936_0347 CJJCF936_0348 xseA serC TRUE 0.723 10.000 0.010 1.000 N NA
 2733473 2733474 CJJCF936_0348 CJJCF936_0350 serC   TRUE 0.654 -3.000 0.004 NA N NA
 2733475 2733476 CJJCF936_0349 CJJCF936_0351 fabH plsX TRUE 0.984 -7.000 0.058 0.008 Y NA
 2733476 2733477 CJJCF936_0351 CJJCF936_0352 plsX rpmF TRUE 0.957 6.000 0.418 1.000   NA
 2733477 2733478 CJJCF936_0352 CJJCF936_0353 rpmF   TRUE 0.627 24.000 0.032 NA   NA
 2733478 2733479 CJJCF936_0353 CJJCF936_0354   ndk TRUE 0.876 1.000 0.033 NA   NA
 2733479 2733480 CJJCF936_0354 CJJCF936_0355 ndk   FALSE 0.123 113.000 0.015 1.000   NA
 2733481 2733482 CJJCF936_0356 CJJCF936_0357   flhB FALSE 0.106 119.000 0.006 1.000 N NA
 2733483 2733484 CJJCF936_0358 CJJCF936_0359     TRUE 0.966 3.000 0.119 1.000 Y NA
 2733484 2733485 CJJCF936_0359 CJJCF936_0360   polA FALSE 0.567 16.000 0.006 1.000 N NA
 2733486 2733487 CJJCF936_0361 CJJCF936_0363     TRUE 0.861 -3.000 0.097 NA N NA
 2733488 2733489 CJJCF936_0362 CJJCF936_0364   uvrA FALSE 0.332 50.000 0.002 NA   NA
 2733489 2733490 CJJCF936_0364 CJJCF936_0365 uvrA   FALSE 0.193 73.000 0.003 1.000   NA
 2733491 2733492 CJJCF936_0366 CJJCF936_0367   trpE FALSE 0.101 165.000 0.016 NA   NA
 2733492 2733493 CJJCF936_0367 CJJCF936_0368 trpE trpD TRUE 0.981 -3.000 0.019 0.002 Y NA
 2733493 2733494 CJJCF936_0368 CJJCF936_0369 trpD trpF TRUE 0.908 -13.000 0.052 1.000 Y NA
 2733494 2733495 CJJCF936_0369 CJJCF936_0370 trpF trpB TRUE 0.993 -3.000 0.375 0.003 Y NA
 2733495 2733496 CJJCF936_0370 CJJCF936_0371 trpB trpA TRUE 0.994 -7.000 0.248 0.002 Y NA
 2733496 2733497 CJJCF936_0371 CJJCF936_0372 trpA   FALSE 0.212 71.000 0.017 NA   NA
 2733497 2733498 CJJCF936_0372 CJJCF936_0373   fliN TRUE 0.964 0.000 0.625 NA   NA
 2733498 2733499 CJJCF936_0373 CJJCF936_0375 fliN   FALSE 0.518 97.000 0.531 NA   NA
 2733500 2733501 CJJCF936_0374 CJJCF936_0376     TRUE 0.969 0.000 0.806 1.000   NA
 2733501 2733502 CJJCF936_0376 CJJCF936_0377     FALSE 0.364 113.000 0.200 1.000   NA
 2733502 2733503 CJJCF936_0377 CJJCF936_0378     FALSE 0.300 79.000 0.043 1.000 N NA
 2733503 2733504 CJJCF936_0378 CJJCF936_0379     TRUE 0.805 -15.000 0.040 1.000   NA
 2733505 2733506 CJJCF936_0380 CJJCF936_0381 ccpA-2 glmM FALSE 0.136 94.000 0.004 1.000 N NA
 2733506 2733507 CJJCF936_0381 CJJCF936_0382 glmM lspA TRUE 0.818 -7.000 0.042 1.000 N NA
 2733507 2733508 CJJCF936_0382 CJJCF936_0384 lspA   TRUE 0.719 -16.000 0.020 1.000   NA
 2733511 2733512 CJJCF936_0386 CJJCF936_0387 cmeC cmeB TRUE 0.984 6.000 0.241 0.051 N NA
 2733512 2733513 CJJCF936_0387 CJJCF936_0388 cmeB cmeA TRUE 0.972 0.000 0.945 1.000 N NA
 2733513 2733514 CJJCF936_0388 CJJCF936_0389 cmeA   FALSE 0.382 95.000 0.145 1.000   NA
 2733514 2733515 CJJCF936_0389 CJJCF936_0390     TRUE 0.952 -13.000 0.818 1.000   NA
 2733516 2733517 CJJCF936_0391 CJJCF936_0392 rpsU   FALSE 0.108 120.000 0.012 NA   NA
 2733517 2733518 CJJCF936_0392 CJJCF936_0393     TRUE 0.958 10.000 0.763 NA   NA
 2733518 2733519 CJJCF936_0393 CJJCF936_0394     TRUE 0.936 3.000 0.118 1.000 N NA
 2733519 2733520 CJJCF936_0394 CJJCF936_0395     TRUE 0.729 -10.000 0.021 NA   NA
 2733520 2733521 CJJCF936_0395 CJJCF936_0396     TRUE 0.744 9.000 0.005 NA   NA
 2733521 2733522 CJJCF936_0396 CJJCF936_0397     TRUE 0.876 11.000 0.105 NA   NA
 2733522 2733523 CJJCF936_0397 CJJCF936_0399     TRUE 0.914 0.000 0.097 NA   NA
 2733524 2733525 CJJCF936_0398 CJJCF936_0400     TRUE 0.991 0.000 0.790 0.056   NA
 2733525 2733526 CJJCF936_0400 CJJCF936_0401     FALSE 0.289 56.000 0.013 NA   NA
 2733526 2733527 CJJCF936_0401 CJJCF936_0402   pyrF TRUE 0.654 -18.000 0.005 NA   NA
 2733527 2733528 CJJCF936_0402 CJJCF936_0403 pyrF nusB TRUE 0.730 -3.000 0.023 1.000 N NA
 2733528 2733529 CJJCF936_0403 CJJCF936_0404 nusB ribE TRUE 0.879 0.000 0.045 1.000 N NA
 2733529 2733530 CJJCF936_0404 CJJCF936_0405 ribE kdsA TRUE 0.754 -3.000 0.027 1.000 N NA
 2733530 2733531 CJJCF936_0405 CJJCF936_0406 kdsA   TRUE 0.653 -3.000 0.005 NA   NA
 2733532 2733533 CJJCF936_0407 CJJCF936_0408   aroK TRUE 0.700 -10.000 0.002 1.000   NA
 2733533 2733534 CJJCF936_0408 CJJCF936_0409 aroK trpS TRUE 0.678 -3.000 0.002 1.000 N NA
 2733534 2733535 CJJCF936_0409 CJJCF936_0410 trpS serS TRUE 0.952 11.000 0.010 0.062 Y NA
 2733535 2733536 CJJCF936_0410 CJJCF936_0411 serS   TRUE 0.739 10.000 0.014 1.000   NA
 2733537 2733538 CJJCF936_0412 CJJCF936_0413   pyk FALSE 0.215 98.000 0.037 NA   NA
 2733538 2733539 CJJCF936_0413 CJJCF936_0414 pyk   TRUE 0.931 49.000 0.073 0.002   NA
 2733539 2733540 CJJCF936_0414 CJJCF936_0415     FALSE 0.108 119.000 0.007 1.000   NA
 2733540 2733541 CJJCF936_0415 CJJCF936_0416     TRUE 0.677 -13.000 0.003 NA   NA
 2733541 2733542 CJJCF936_0416 CJJCF936_0417     TRUE 0.725 -3.000 0.000 NA   NA
 2733542 2733543 CJJCF936_0417 CJJCF936_0418     TRUE 0.725 -3.000 0.000 NA   NA
 2733544 2733545 CJJCF936_0419 CJJCF936_0420 gatC   FALSE 0.221 68.000 0.003 1.000   NA
 2733545 2733546 CJJCF936_0420 CJJCF936_0421   fur TRUE 0.853 2.000 0.023 1.000   NA
 2733546 2733547 CJJCF936_0421 CJJCF936_0422 fur lysS TRUE 0.841 1.000 0.022 1.000 N NA
 2733547 2733548 CJJCF936_0422 CJJCF936_0423 lysS glyA TRUE 0.810 -3.000 0.044 1.000 N NA
 2733548 2733549 CJJCF936_0423 CJJCF936_0424 glyA   TRUE 0.939 9.000 0.271 NA   NA
 2733549 2733550 CJJCF936_0424 CJJCF936_0425     TRUE 0.900 14.000 0.387 NA   NA
 2733550 2733551 CJJCF936_0425 CJJCF936_0426   aroE TRUE 0.707 -3.000 0.020 NA   NA
 2733553 2733554 CJJCF936_0428 CJJCF936_0429 lgt frdC FALSE 0.200 70.000 0.010 1.000 N NA
 2733554 2733555 CJJCF936_0429 CJJCF936_0430 frdC frdA TRUE 0.988 -16.000 0.128 0.005 Y NA
 2733555 2733556 CJJCF936_0430 CJJCF936_0431 frdA frdB TRUE 0.990 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 2733556 2733557 CJJCF936_0431 CJJCF936_0432 frdB   FALSE 0.537 28.000 0.022 1.000   NA
 2733557 2733558 CJJCF936_0432 CJJCF936_0433     TRUE 0.988 -10.000 0.750 0.018   NA
 2733558 2733559 CJJCF936_0433 CJJCF936_0434     TRUE 0.941 0.000 0.222 1.000   NA
 2733559 2733560 CJJCF936_0434 CJJCF936_0435     FALSE 0.324 136.000 0.182 1.000   NA
 2733560 2733561 CJJCF936_0435 CJJCF936_0436     TRUE 0.996 2.000 0.500 0.002   NA
 2733561 2733562 CJJCF936_0436 CJJCF936_0437     FALSE 0.116 289.000 0.000 NA   NA
 2733564 2733565 CJJCF936_0439 CJJCF936_0440     FALSE 0.198 74.000 0.017 NA   NA
 2733566 2733567 CJJCF936_0441 CJJCF936_0442     TRUE 0.649 62.000 0.333 NA   NA
 2733568 2733569 CJJCF936_0443 CJJCF936_0444     TRUE 0.950 9.000 0.400 NA   NA
 2733569 2733570 CJJCF936_0444 CJJCF936_0445     TRUE 0.909 13.000 0.400 NA   NA
 2733570 2733571 CJJCF936_0445 CJJCF936_0446     FALSE 0.097 130.000 0.007 NA   NA
 2733571 2733572 CJJCF936_0446 CJJCF936_0447     TRUE 0.678 -7.000 0.010 NA   NA
 2733572 2733573 CJJCF936_0447 CJJCF936_0448     TRUE 0.694 75.000 1.000 NA   NA
 2733575 2733576 CJJCF936_0450 CJJCF936_0451     TRUE 0.875 14.000 0.237 NA   NA
 2733576 2733577 CJJCF936_0451 CJJCF936_0452   rrsA FALSE 0.115 462.000 0.000 NA   NA
 2733577 2733578 CJJCF936_0452 CJJCF936_0453 rrsA   FALSE 0.155 105.000 0.000 NA   NA
 2733578 2733579 CJJCF936_0453 CJJCF936_0454     TRUE 0.802 9.000 0.000 NA   NA
 2733579 2733580 CJJCF936_0454 CJJCF936_0456   rrlA FALSE 0.115 644.000 0.000 NA   NA
 2733580 2733581 CJJCF936_0456 CJJCF936_0455 rrlA   TRUE 0.704 -1333.000 0.000 NA   NA
 2733581 2733582 CJJCF936_0455 CJJCF936_0457   rrfA FALSE 0.115 1867.000 0.000 NA   NA
 2733583 2733584 CJJCF936_0458 CJJCF936_0459 murD mraY TRUE 0.996 0.000 0.647 0.008 Y NA
 2733585 2733586 CJJCF936_0460 CJJCF936_0461 pgm fabG FALSE 0.215 72.000 0.018 1.000 N NA
 2733586 2733587 CJJCF936_0461 CJJCF936_0462 fabG   TRUE 0.722 10.000 0.005 1.000   NA
 2733587 2733588 CJJCF936_0462 CJJCF936_0463   sdhA FALSE 0.120 338.000 0.000 1.000   NA
 2733588 2733589 CJJCF936_0463 CJJCF936_0464 sdhA sdhB TRUE 0.991 -3.000 0.279 0.005 Y NA
 2733589 2733590 CJJCF936_0464 CJJCF936_0465 sdhB sdhC TRUE 0.995 4.000 0.175 0.005 Y NA
 2733592 2733593 CJJCF936_0467 CJJCF936_0468 acpP fabF TRUE 0.831 27.000 0.066 1.000 Y NA
 2733593 2733594 CJJCF936_0468 CJJCF936_0469 fabF accA TRUE 0.949 2.000 0.046 1.000 Y NA
 2733594 2733595 CJJCF936_0469 CJJCF936_0470 accA   FALSE 0.133 134.000 0.000 1.000   NA
 2733595 2733596 CJJCF936_0470 CJJCF936_0471     TRUE 0.972 9.000 0.000 0.005   NA
 2733596 2733597 CJJCF936_0471 CJJCF936_0472     TRUE 0.720 73.000 0.000 0.005   NA
 2733597 2733598 CJJCF936_0472 CJJCF936_0473     FALSE 0.357 83.000 0.083 1.000   NA
 2733599 2733600 CJJCF936_0474 CJJCF936_0475     TRUE 0.882 10.000 0.077 NA   NA
 2733600 2733601 CJJCF936_0475 CJJCF936_0476   rpmB FALSE 0.089 185.000 0.004 NA   NA
 2733602 2733603 CJJCF936_0477 CJJCF936_0478 rpe   TRUE 0.912 -3.000 0.279 1.000 N NA
 2733603 2733604 CJJCF936_0478 CJJCF936_0480   thiC FALSE 0.090 183.000 0.007 1.000 N NA
 2733605 2733606 CJJCF936_0479 CJJCF936_0481     TRUE 0.934 -10.000 0.448 NA   NA
 2733606 2733607 CJJCF936_0481 CJJCF936_0482     TRUE 0.954 -3.000 1.000 NA   NA
 2733607 2733608 CJJCF936_0482 CJJCF936_0483     TRUE 0.965 2.000 0.462 NA   NA
 2733608 2733609 CJJCF936_0483 CJJCF936_0484   miaB FALSE 0.151 134.000 0.029 NA   NA
 2733609 2733610 CJJCF936_0484 CJJCF936_0485 miaB   TRUE 0.779 -3.000 0.033 NA   NA
 2733613 2733614 CJJCF936_0488 CJJCF936_0489     TRUE 0.928 0.000 0.130 1.000   NA
 2733614 2733615 CJJCF936_0489 CJJCF936_0491   recG TRUE 0.868 -10.000 0.084 1.000   NA
 2733617 2733618 CJJCF936_0492 CJJCF936_0493     TRUE 0.744 16.000 0.048 NA N NA
 2733618 2733619 CJJCF936_0493 CJJCF936_0494     TRUE 0.995 -7.000 0.841 0.005 Y NA
 2733619 2733620 CJJCF936_0494 CJJCF936_0495     TRUE 0.985 2.000 0.773 1.000 Y NA
 2733620 2733621 CJJCF936_0495 CJJCF936_0496     FALSE 0.178 92.000 0.000 NA   NA
 2733621 2733622 CJJCF936_0496 CJJCF936_0497     FALSE 0.387 50.000 0.000 NA   NA
 2733622 2733623 CJJCF936_0497 CJJCF936_0498     TRUE 0.813 7.000 0.000 NA   NA
 2733623 2733624 CJJCF936_0498 CJJCF936_0499     FALSE 0.155 105.000 0.000 NA   NA
 2733624 2733625 CJJCF936_0499 CJJCF936_0500   tuf FALSE 0.256 69.000 0.000 NA   NA
 2733625 2733626 CJJCF936_0500 CJJCF936_0501 tuf rpmG TRUE 0.732 53.000 0.099 1.000 Y NA
 2733626 2733627 CJJCF936_0501 CJJCF936_0502 rpmG   TRUE 0.682 13.000 0.000 NA   NA
 2733627 2733628 CJJCF936_0502 CJJCF936_0503   secE TRUE 0.607 19.000 0.000 NA   NA
 2733628 2733629 CJJCF936_0503 CJJCF936_0504 secE nusG TRUE 0.962 10.000 0.843 1.000   NA
 2733629 2733630 CJJCF936_0504 CJJCF936_0505 nusG rplK TRUE 0.888 26.000 0.681 1.000 N NA
 2733630 2733631 CJJCF936_0505 CJJCF936_0506 rplK rplA TRUE 0.962 55.000 0.838 0.039 Y NA
 2733631 2733632 CJJCF936_0506 CJJCF936_0507 rplA rplJ TRUE 0.797 152.000 0.302 0.039 Y NA
 2733632 2733633 CJJCF936_0507 CJJCF936_0508 rplJ rplL TRUE 0.987 21.000 0.884 0.030 Y NA
 2733633 2733634 CJJCF936_0508 CJJCF936_0509 rplL rpoB FALSE 0.368 118.000 0.223 1.000   NA
 2733634 2733635 CJJCF936_0509 CJJCF936_0510 rpoB rpoC TRUE 0.994 -7.000 0.851 0.002   NA
 2733637 2733638 CJJCF936_0512 CJJCF936_0513     TRUE 0.864 -3.000 0.091 1.000   NA
 2733638 2733639 CJJCF936_0513 CJJCF936_0514     TRUE 0.995 3.000 0.318 0.002   NA
 2733639 2733640 CJJCF936_0514 CJJCF936_0515     TRUE 0.717 12.000 0.000 1.000   NA
 2733640 2733641 CJJCF936_0515 CJJCF936_0516     TRUE 0.922 12.000 0.000 0.050   NA
 2733641 2733642 CJJCF936_0516 CJJCF936_0517     TRUE 0.847 1.000 0.000 1.000   NA
 2733642 2733643 CJJCF936_0517 CJJCF936_0518   fucP TRUE 0.926 11.000 0.364 1.000 N NA
 2733643 2733644 CJJCF936_0518 CJJCF936_0519 fucP   TRUE 0.913 -16.000 0.273 1.000   NA
 2733644 2733645 CJJCF936_0519 CJJCF936_0520     TRUE 0.905 1.000 0.053 NA   NA
 2733645 2733646 CJJCF936_0520 CJJCF936_0521     TRUE 0.780 14.000 0.053 NA   NA
 2733646 2733647 CJJCF936_0521 CJJCF936_0522   aldA TRUE 0.939 36.000 0.044 0.002   NA
 2733647 2733648 CJJCF936_0522 CJJCF936_0523 aldA rpsL FALSE 0.118 328.000 0.000 1.000 N NA
 2733648 2733649 CJJCF936_0523 CJJCF936_0524 rpsL rpsG TRUE 0.953 70.000 0.620 0.005 Y NA
 2733649 2733650 CJJCF936_0524 CJJCF936_0525 rpsG fusA TRUE 0.957 13.000 0.579 1.000 Y NA
 2733650 2733651 CJJCF936_0525 CJJCF936_0526 fusA   FALSE 0.524 29.000 0.000 NA   NA
 2733651 2733652 CJJCF936_0526 CJJCF936_0527     TRUE 0.623 18.000 0.000 NA   NA
 2733652 2733653 CJJCF936_0527 CJJCF936_0528     TRUE 0.762 6.000 0.006 NA   NA
 2733653 2733654 CJJCF936_0528 CJJCF936_0529     TRUE 0.851 -10.000 0.064 NA   NA
 2733654 2733655 CJJCF936_0529 CJJCF936_0530     TRUE 0.896 -27.000 0.228 NA   NA
 2733655 2733656 CJJCF936_0530 CJJCF936_0531   trpC TRUE 0.813 -3.000 0.044 1.000   NA
 2733656 2733657 CJJCF936_0531 CJJCF936_0532 trpC   TRUE 0.795 10.000 0.026 1.000 N NA
 2733657 2733658 CJJCF936_0532 CJJCF936_0533     TRUE 0.778 -10.000 0.030 NA   NA
 2733658 2733659 CJJCF936_0533 CJJCF936_0534     FALSE 0.115 449.000 0.000 NA   NA
 2733659 2733660 CJJCF936_0534 CJJCF936_0535     FALSE 0.123 149.000 0.000 NA   NA
 2733661 2733662 CJJCF936_0536 CJJCF936_0537 hemH   TRUE 0.665 -3.000 0.005 1.000   NA
 2733662 2733663 CJJCF936_0537 CJJCF936_0538     TRUE 0.928 5.000 0.117 1.000   NA
 2733664 2733665 CJJCF936_0539 CJJCF936_0540 alaS   TRUE 0.778 0.000 0.015 NA N NA
 2733665 2733666 CJJCF936_0540 CJJCF936_0541   pbpA TRUE 0.737 -3.000 0.026 NA N NA
 2733667 2733668 CJJCF936_0542 CJJCF936_0543 clpB   FALSE 0.302 112.000 0.108 NA   NA
 2733669 2733670 CJJCF936_0544 CJJCF936_0545 ctpA purC TRUE 0.900 2.000 0.045 1.000 N NA
 2733670 2733671 CJJCF936_0545 CJJCF936_0546 purC purS TRUE 0.974 9.000 0.460 1.000 Y NA
 2733671 2733672 CJJCF936_0546 CJJCF936_0547 purS purQ TRUE 0.998 2.000 0.656 0.002 Y NA
 2733672 2733673 CJJCF936_0547 CJJCF936_0548 purQ   TRUE 0.792 -3.000 0.038 NA   NA
 2733673 2733674 CJJCF936_0548 CJJCF936_0549     TRUE 0.949 -19.000 0.846 NA   NA
 2733674 2733675 CJJCF936_0549 CJJCF936_0550     TRUE 0.803 -6.000 0.038 NA N NA
 2733675 2733676 CJJCF936_0550 CJJCF936_0551   htpG FALSE 0.178 72.000 0.007 NA N NA
 2733676 2733677 CJJCF936_0551 CJJCF936_0552 htpG   TRUE 0.648 -3.000 0.007 NA N NA
 2733677 2733678 CJJCF936_0552 CJJCF936_0553     TRUE 0.954 0.000 0.400 NA   NA
 2733678 2733679 CJJCF936_0553 CJJCF936_0554     FALSE 0.320 142.000 0.200 NA   NA
 2733679 2733680 CJJCF936_0554 CJJCF936_0555     TRUE 0.970 12.000 0.000 0.001   NA
 2733680 2733681 CJJCF936_0555 CJJCF936_0557     FALSE 0.122 154.000 0.000 NA   NA
 2733682 2733683 CJJCF936_0556 CJJCF936_0558   fliE TRUE 0.947 7.000 0.303 1.000 N NA
 2733683 2733684 CJJCF936_0558 CJJCF936_0559 fliE flgC TRUE 0.994 7.000 0.271 0.008 Y NA
 2733684 2733685 CJJCF936_0559 CJJCF936_0560 flgC flgB TRUE 0.977 10.000 0.804 1.000 Y NA
 2733685 2733686 CJJCF936_0560 CJJCF936_0561 flgB   FALSE 0.160 81.000 0.005 1.000   NA
 2733687 2733688 CJJCF936_0562 CJJCF936_0563   icd FALSE 0.108 117.000 0.011 NA   NA
 2733688 2733689 CJJCF936_0563 CJJCF936_0564 icd mdh TRUE 0.861 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 2733689 2733690 CJJCF936_0564 CJJCF936_0565 mdh sucC TRUE 0.922 1.000 0.022 1.000 Y NA
 2733690 2733691 CJJCF936_0565 CJJCF936_0566 sucC sucD TRUE 0.994 10.000 0.169 0.002 Y NA
 2733691 2733692 CJJCF936_0566 CJJCF936_0567 sucD oorD TRUE 0.899 15.000 0.097 1.000 Y NA
 2733692 2733693 CJJCF936_0567 CJJCF936_0568 oorD oorA TRUE 0.995 9.000 0.316 0.003 Y NA
 2733693 2733694 CJJCF936_0568 CJJCF936_0569 oorA oorB TRUE 0.998 1.000 0.771 0.003 Y NA
 2733694 2733695 CJJCF936_0569 CJJCF936_0570 oorB oorC TRUE 0.993 -3.000 0.324 0.003 Y NA
 2733695 2733696 CJJCF936_0570 CJJCF936_0571 oorC   FALSE 0.240 139.000 0.083 NA   NA
 2733696 2733697 CJJCF936_0571 CJJCF936_0572     TRUE 0.967 3.000 0.514 NA   NA
 2733697 2733698 CJJCF936_0572 CJJCF936_0573     TRUE 0.708 14.000 0.030 NA   NA
 2733698 2733699 CJJCF936_0573 CJJCF936_0574   hemA TRUE 0.941 0.000 0.051 1.000 Y NA
 2733699 2733700 CJJCF936_0574 CJJCF936_0575 hemA proS TRUE 0.943 -16.000 0.040 0.060 N NA
 2733700 2733701 CJJCF936_0575 CJJCF936_0576 proS   TRUE 0.727 -3.000 0.022 1.000   NA
 2733701 2733702 CJJCF936_0576 CJJCF936_0577   hemC TRUE 0.681 -3.000 0.013 1.000   NA
 2733702 2733703 CJJCF936_0577 CJJCF936_0578 hemC   TRUE 0.820 -3.000 0.009 NA Y NA
 2733703 2733704 CJJCF936_0578 CJJCF936_0579   flaG FALSE 0.100 185.000 0.018 NA N NA
 2733704 2733705 CJJCF936_0579 CJJCF936_0580 flaG fliD TRUE 0.961 3.000 0.092 NA Y NA
 2733705 2733706 CJJCF936_0580 CJJCF936_0581 fliD fliS TRUE 0.993 12.000 0.608 0.005 Y NA
 2733706 2733707 CJJCF936_0581 CJJCF936_0582 fliS   TRUE 0.817 -19.000 0.051 NA   NA
 2733707 2733708 CJJCF936_0582 CJJCF936_0583   efp FALSE 0.115 432.000 0.000 NA   NA
 2733708 2733709 CJJCF936_0583 CJJCF936_0584 efp   FALSE 0.098 160.000 0.002 NA   NA
 2733709 2733710 CJJCF936_0584 CJJCF936_0585     TRUE 0.954 -13.000 0.939 NA   NA
 2733710 2733711 CJJCF936_0585 CJJCF936_0586     TRUE 0.920 10.000 0.202 NA   NA
 2733711 2733712 CJJCF936_0586 CJJCF936_0587     FALSE 0.108 125.000 0.014 NA   NA
 2733712 2733713 CJJCF936_0587 CJJCF936_0589     TRUE 0.772 11.000 0.029 NA   NA
 2733714 2733715 CJJCF936_0588 CJJCF936_0590   proA TRUE 0.662 -3.000 0.003 NA   NA
 2733716 2733717 CJJCF936_0591 CJJCF936_0592     FALSE 0.094 181.000 0.011 1.000 N NA
 2733719 2733720 CJJCF936_0594 CJJCF936_0595 dnaB   FALSE 0.122 105.000 0.012 NA   NA
 2733720 2733721 CJJCF936_0595 CJJCF936_0596     TRUE 0.957 -9.000 1.000 NA   NA
 2733721 2733722 CJJCF936_0596 CJJCF936_0597     FALSE 0.115 528.000 0.000 NA   NA
 2733722 2733723 CJJCF936_0597 CJJCF936_0598     TRUE 0.607 19.000 0.000 NA   NA
 2733723 2733724 CJJCF936_0598 CJJCF936_0599     TRUE 0.737 11.000 0.000 NA   NA
 2733726 2733727 CJJCF936_0601 CJJCF936_0602     FALSE 0.203 81.000 0.000 NA   NA
 2733727 2733728 CJJCF936_0602 CJJCF936_0603     TRUE 0.775 10.000 0.000 NA   NA
 2733728 2733729 CJJCF936_0603 CJJCF936_0604     FALSE 0.208 80.000 0.000 NA   NA
 2733730 2733731 CJJCF936_0605 CJJCF936_0606 dam   FALSE 0.477 37.000 0.000 NA   NA
 2733731 2733732 CJJCF936_0606 CJJCF936_0607     TRUE 0.838 4.000 0.000 NA   NA
 2733734 2733735 CJJCF936_0609 CJJCF936_0610     FALSE 0.122 154.000 0.000 NA   NA
 2733735 2733736 CJJCF936_0610 CJJCF936_0611     TRUE 0.805 27.000 0.217 NA   NA
 2733736 2733737 CJJCF936_0611 CJJCF936_0612     TRUE 0.779 19.000 0.087 NA   NA
 2733737 2733738 CJJCF936_0612 CJJCF936_0613     FALSE 0.427 101.000 0.286 NA   NA
 2733738 2733739 CJJCF936_0613 CJJCF936_0614     TRUE 0.912 -3.000 0.286 NA   NA
 2733739 2733740 CJJCF936_0614 CJJCF936_0615     TRUE 0.843 25.000 0.333 NA   NA
 2733740 2733741 CJJCF936_0615 CJJCF936_0616     TRUE 0.963 0.000 0.600 NA   NA
 2733741 2733742 CJJCF936_0616 CJJCF936_0617     TRUE 0.925 -3.000 0.400 NA   NA
 2733742 2733743 CJJCF936_0617 CJJCF936_0618     TRUE 0.933 -3.000 0.500 NA   NA
 2733743 2733744 CJJCF936_0618 CJJCF936_0619     TRUE 0.959 6.000 0.500 NA   NA
 2733744 2733745 CJJCF936_0619 CJJCF936_0620     TRUE 0.941 9.000 0.286 NA   NA
 2733745 2733746 CJJCF936_0620 CJJCF936_0621     TRUE 0.956 0.000 0.429 NA   NA
 2733746 2733747 CJJCF936_0621 CJJCF936_0622     TRUE 0.971 3.000 0.667 NA   NA
 2733747 2733748 CJJCF936_0622 CJJCF936_0623     TRUE 0.909 -13.000 0.250 NA   NA
 2733748 2733749 CJJCF936_0623 CJJCF936_0624     TRUE 0.933 -3.000 0.500 NA   NA
 2733749 2733750 CJJCF936_0624 CJJCF936_0625     TRUE 0.914 10.000 0.167 NA   NA
 2733751 2733752 CJJCF936_0626 CJJCF936_0627     TRUE 0.898 2.000 0.045 NA   NA
 2733752 2733753 CJJCF936_0627 CJJCF936_0628     TRUE 0.898 3.000 0.045 NA   NA
 2733753 2733754 CJJCF936_0628 CJJCF936_0629     TRUE 0.927 3.000 0.091 NA   NA
 2733754 2733755 CJJCF936_0629 CJJCF936_0630     FALSE 0.277 115.000 0.091 NA   NA
 2733755 2733756 CJJCF936_0630 CJJCF936_0631     TRUE 0.742 -7.000 0.000 NA   NA
 2733756 2733757 CJJCF936_0631 CJJCF936_0632     TRUE 0.917 0.000 0.103 NA   NA
 2733757 2733758 CJJCF936_0632 CJJCF936_0633     TRUE 0.957 10.000 0.750 NA   NA
 2733758 2733759 CJJCF936_0633 CJJCF936_0634     TRUE 0.846 2.000 0.000 NA   NA
 2733760 2733761 CJJCF936_1805 CJJCF936_1804 rplD rplW TRUE 0.982 3.000 0.513 1.000 Y NA
 2733761 2733762 CJJCF936_1804 CJJCF936_1803 rplW rplB TRUE 0.986 2.000 0.849 1.000 Y NA
 2733762 2733763 CJJCF936_1803 CJJCF936_1802 rplB rpsS TRUE 0.996 2.000 0.820 0.037 Y NA
 2733763 2733764 CJJCF936_1802 CJJCF936_1801 rpsS rplV TRUE 0.992 11.000 0.769 0.037 Y NA
 2733764 2733765 CJJCF936_1801 CJJCF936_1800 rplV rpsC TRUE 0.995 0.000 0.719 0.037 Y NA
 2733765 2733766 CJJCF936_1800 CJJCF936_1799 rpsC rplP TRUE 0.996 3.000 0.828 0.037 Y NA
 2733766 2733767 CJJCF936_1799 CJJCF936_1798 rplP rpmC TRUE 0.987 -13.000 0.802 0.029   NA
 2733767 2733768 CJJCF936_1798 CJJCF936_1797 rpmC rpsQ TRUE 0.990 10.000 0.828 0.029   NA
 2733768 2733769 CJJCF936_1797 CJJCF936_1796 rpsQ rplN TRUE 0.995 0.000 0.791 0.037 Y NA
 2733769 2733770 CJJCF936_1796 CJJCF936_1795 rplN rplX TRUE 0.995 0.000 0.810 0.037 Y NA
 2733770 2733771 CJJCF936_1795 CJJCF936_1794 rplX rplE TRUE 0.996 4.000 0.758 0.029 Y NA
 2733771 2733772 CJJCF936_1794 CJJCF936_1793 rplE rpsN TRUE 0.995 2.000 0.496 0.029 Y NA
 2733772 2733773 CJJCF936_1793 CJJCF936_1792 rpsN rpsH TRUE 0.992 10.000 0.473 0.029 Y NA
 2733773 2733774 CJJCF936_1792 CJJCF936_1791 rpsH rplF TRUE 0.932 79.000 0.808 0.029 Y NA
 2733774 2733775 CJJCF936_1791 CJJCF936_1790 rplF rplR TRUE 0.994 10.000 0.815 0.029 Y NA
 2733775 2733776 CJJCF936_1790 CJJCF936_1789 rplR rpsE TRUE 0.991 12.000 0.814 0.037 Y NA
 2733776 2733777 CJJCF936_1789 CJJCF936_1788 rpsE rplO TRUE 0.991 5.000 0.148 0.037 Y NA
 2733777 2733778 CJJCF936_1788 CJJCF936_1787 rplO secY TRUE 0.941 12.000 0.730 1.000 N NA
 2733780 2733781 CJJCF936_1785 CJJCF936_1784 topA bioB TRUE 0.804 2.000 0.009 1.000 N NA
 2733781 2733782 CJJCF936_1784 CJJCF936_1783 bioB   TRUE 0.689 -19.000 0.017 1.000 N NA
 2733782 2733783 CJJCF936_1783 CJJCF936_1782   gltA FALSE 0.131 115.000 0.019 1.000 N NA
 2733783 2733784 CJJCF936_1782 CJJCF936_1781 gltA cysQ FALSE 0.209 80.000 0.022 1.000 N NA
 2733784 2733785 CJJCF936_1781 CJJCF936_1780 cysQ   FALSE 0.368 64.000 0.039 NA   NA
 2733786 2733787 CJJCF936_1779 CJJCF936_1778     FALSE 0.117 202.000 0.000 NA   NA
 2733787 2733788 CJJCF936_1778 CJJCF936_1777     TRUE 0.725 -3.000 0.000 NA   NA
 2733788 2733789 CJJCF936_1777 CJJCF936_1776     FALSE 0.298 63.000 0.000 NA   NA
 2733789 2733790 CJJCF936_1776 CJJCF936_1775   murB FALSE 0.118 192.000 0.000 NA   NA
 2733790 2733791 CJJCF936_1775 CJJCF936_1774 murB fliQ TRUE 0.846 -3.000 0.066 1.000 N NA
 2733791 2733792 CJJCF936_1774 CJJCF936_1773 fliQ   TRUE 0.838 12.000 0.068 1.000   NA
 2733793 2733794 CJJCF936_1772 CJJCF936_1771 recA eno TRUE 0.860 0.000 0.033 1.000 N NA
 2733794 2733795 CJJCF936_1771 CJJCF936_1770 eno   FALSE 0.451 66.000 0.080 NA   NA
 2733795 2733796 CJJCF936_1770 CJJCF936_1769     TRUE 0.950 -10.000 0.788 NA   NA
 2733796 2733797 CJJCF936_1769 CJJCF936_1768     TRUE 0.830 0.000 0.026 NA   NA
 2733797 2733798 CJJCF936_1768 CJJCF936_1767     FALSE 0.426 43.000 0.000 NA   NA
 2733798 2733799 CJJCF936_1767 CJJCF936_1766     FALSE 0.560 25.000 0.000 NA   NA
 2733799 2733800 CJJCF936_1766 CJJCF936_1765     TRUE 0.838 4.000 0.000 NA   NA
 2733800 2733801 CJJCF936_1765 CJJCF936_1764     TRUE 0.653 15.000 0.000 NA   NA
 2733801 2733802 CJJCF936_1764 CJJCF936_1763     TRUE 0.826 5.000 0.000 NA   NA
 2733802 2733803 CJJCF936_1763 CJJCF936_1762     FALSE 0.119 175.000 0.000 NA   NA
 2733803 2733804 CJJCF936_1762 CJJCF936_1761     FALSE 0.272 66.000 0.000 NA   NA
 2733804 2733805 CJJCF936_1761 CJJCF936_1760     FALSE 0.481 81.000 0.250 NA   NA
 2733806 2733807 CJJCF936_1759 CJJCF936_1758     TRUE 0.981 -39.000 0.147 0.004   NA
 2733807 2733808 CJJCF936_1758 CJJCF936_1757     TRUE 0.856 -3.000 0.078 1.000   NA
 2733808 2733809 CJJCF936_1757 CJJCF936_1756     TRUE 0.933 0.000 0.175 NA N NA
 2733809 2733810 CJJCF936_1756 CJJCF936_1755     TRUE 0.954 -10.000 0.878 NA N NA
 2733810 2733811 CJJCF936_1755 CJJCF936_1754     TRUE 0.944 -10.000 0.625 NA   NA
 2733811 2733812 CJJCF936_1754 CJJCF936_1753     FALSE 0.523 83.000 0.386 NA   NA
 2733812 2733813 CJJCF936_1753 CJJCF936_1752     TRUE 0.946 -3.000 0.238 NA Y NA
 2733814 2733815 CJJCF936_1751 CJJCF936_1750   nhaA-2 FALSE 0.450 143.000 0.600 NA   NA
 2733815 2733816 CJJCF936_1750 CJJCF936_1749 nhaA-2 nhaA-1 TRUE 0.994 -3.000 0.571 0.004 Y NA
 2733816 2733817 CJJCF936_1749 CJJCF936_1748 nhaA-1 nlpC TRUE 0.931 9.000 0.211 NA N NA
 2733817 2733818 CJJCF936_1748 CJJCF936_1747 nlpC murI TRUE 0.904 2.000 0.005 NA Y NA
 2733818 2733819 CJJCF936_1747 CJJCF936_1746 murI map TRUE 0.803 2.000 0.005 1.000 N NA
 2733820 2733821 CJJCF936_1745 CJJCF936_1744     FALSE 0.374 56.000 0.027 NA   NA
 2733821 2733822 CJJCF936_1744 CJJCF936_1743     TRUE 0.922 0.000 0.120 NA   NA
 2733822 2733823 CJJCF936_1743 CJJCF936_1742     TRUE 0.986 3.000 0.912 NA Y NA
 2733823 2733824 CJJCF936_1742 CJJCF936_1741     TRUE 0.986 1.000 0.912 1.000 Y NA
 2733824 2733825 CJJCF936_1741 CJJCF936_1740   tkt TRUE 0.940 2.000 0.132 1.000 N NA
 2733825 2733826 CJJCF936_1740 CJJCF936_1739 tkt ispA TRUE 0.927 11.000 0.375 1.000 N NA
 2733826 2733827 CJJCF936_1739 CJJCF936_1738 ispA   TRUE 0.894 -3.000 0.167 1.000   NA
 2733827 2733828 CJJCF936_1738 CJJCF936_1737     TRUE 0.660 -3.000 0.010 NA   NA
 2733828 2733829 CJJCF936_1737 CJJCF936_1736   murE TRUE 0.787 4.000 0.006 NA   NA
 2733829 2733830 CJJCF936_1736 CJJCF936_1735 murE   FALSE 0.528 53.000 0.057 1.000   NA
 2733830 2733831 CJJCF936_1735 CJJCF936_1734     TRUE 0.878 -13.000 0.107 1.000   NA
 2733831 2733832 CJJCF936_1734 CJJCF936_1733   dnaG FALSE 0.152 85.000 0.011 1.000 N NA
 2733833 2733834 CJJCF936_1732 CJJCF936_1731   rnhA TRUE 0.678 -13.000 0.009 1.000   NA
 2733834 2733835 CJJCF936_1731 CJJCF936_1730 rnhA rnc TRUE 0.784 -13.000 0.032 1.000 N NA
 2733835 2733836 CJJCF936_1730 CJJCF936_1729 rnc aroC TRUE 0.849 0.000 0.030 1.000 N NA
 2733838 2733839 CJJCF936_1727 CJJCF936_1726     TRUE 0.968 4.000 0.600 NA   NA
 2733840 2733841 CJJCF936_1725 CJJCF936_1724   exbD TRUE 0.889 -3.000 0.148 1.000 N NA
 2733841 2733842 CJJCF936_1724 CJJCF936_1723 exbD exbB-2 TRUE 0.992 -7.000 0.815 0.053 Y NA
 2733843 2733844 CJJCF936_1722 CJJCF936_1721     TRUE 0.719 -21.000 0.000 NA   NA
 2733844 2733845 CJJCF936_1721 CJJCF936_1720     TRUE 0.653 64.000 0.400 NA   NA
 2733845 2733846 CJJCF936_1720 CJJCF936_1719   sdaC FALSE 0.116 260.000 0.000 NA   NA
 2733846 2733847 CJJCF936_1719 CJJCF936_1718 sdaC sdaA TRUE 0.912 15.000 0.133 1.000 Y NA
 2733848 2733849 CJJCF936_1717 CJJCF936_1716   ribD TRUE 0.651 -19.000 0.005 NA   NA
 2733849 2733850 CJJCF936_1716 CJJCF936_1715 ribD   FALSE 0.116 235.000 0.000 NA   NA
 2733850 2733851 CJJCF936_1715 CJJCF936_1714     TRUE 0.585 22.000 0.000 NA   NA
 2733851 2733852 CJJCF936_1714 CJJCF936_1713     TRUE 0.607 19.000 0.000 NA   NA
 2733852 2733853 CJJCF936_1713 CJJCF936_1712     TRUE 0.775 10.000 0.000 NA   NA
 2733853 2733854 CJJCF936_1712 CJJCF936_1711     FALSE 0.237 72.000 0.000 NA   NA
 2733858 2733859 CJJCF936_1708 CJJCF936_1706     TRUE 0.930 -3.000 0.113 1.000 Y NA
 2733859 2733860 CJJCF936_1706 CJJCF936_1705     TRUE 0.968 0.000 0.226 1.000 Y NA
 2733860 2733861 CJJCF936_1705 CJJCF936_1704   chuA TRUE 0.984 -25.000 0.250 0.047 Y NA
 2733863 2733864 CJJCF936_1702 CJJCF936_1701 prfA rpsT TRUE 0.804 19.000 0.029 1.000 Y NA
 2733864 2733865 CJJCF936_1701 CJJCF936_1700 rpsT pgpA FALSE 0.170 79.000 0.004 1.000 N NA
 2733865 2733866 CJJCF936_1700 CJJCF936_1699 pgpA   TRUE 0.896 5.000 0.052 1.000 N NA
 2733866 2733867 CJJCF936_1699 CJJCF936_1698     TRUE 0.732 -22.000 0.025 1.000 N NA
 2733867 2733868 CJJCF936_1698 CJJCF936_1697     TRUE 0.753 -3.000 0.027 1.000 N NA
 2733869 2733870 CJJCF936_1696 CJJCF936_1695 mrp   TRUE 0.639 26.000 0.036 1.000 N NA
 2733871 2733872 CJJCF936_1694 CJJCF936_1693 hisI hisF-2 TRUE 0.996 2.000 0.430 0.008 Y NA
 2733872 2733873 CJJCF936_1693 CJJCF936_1692 hisF-2   TRUE 0.798 1.000 0.003 NA   NA
 2733873 2733874 CJJCF936_1692 CJJCF936_1691   hisA TRUE 0.662 -15.000 0.004 NA   NA
 2733874 2733875 CJJCF936_1691 CJJCF936_1690 hisA hisH-2 TRUE 0.989 -3.000 0.210 0.008 Y NA
 2733875 2733876 CJJCF936_1690 CJJCF936_1689 hisH-2 hisB TRUE 0.987 -3.000 0.128 0.008 Y NA
 2733876 2733877 CJJCF936_1689 CJJCF936_1688 hisB hisD TRUE 0.967 -3.000 0.010 0.008 Y NA
 2733877 2733878 CJJCF936_1688 CJJCF936_1687 hisD hisG TRUE 0.993 8.000 0.171 0.008 Y NA
 2733878 2733879 CJJCF936_1687 CJJCF936_1686 hisG rplQ FALSE 0.093 173.000 0.004 1.000 N NA
 2733879 2733880 CJJCF936_1686 CJJCF936_1685 rplQ rpoA TRUE 0.975 4.000 0.873 1.000 N NA
 2733880 2733881 CJJCF936_1685 CJJCF936_1684 rpoA rpsD TRUE 0.924 13.000 0.549 1.000 N NA
 2733881 2733882 CJJCF936_1684 CJJCF936_1683 rpsD rpsK TRUE 0.977 28.000 0.509 0.037 Y NA
 2733882 2733883 CJJCF936_1683 CJJCF936_1682 rpsK rpsM TRUE 0.994 10.000 0.810 0.028 Y NA
 2733883 2733884 CJJCF936_1682 CJJCF936_1681 rpsM rpmJ TRUE 0.988 3.000 0.194 0.028   NA
 2733884 2733885 CJJCF936_1681 CJJCF936_1680 rpmJ infA FALSE 0.260 172.000 0.104 1.000   NA
 2733885 2733886 CJJCF936_1680 CJJCF936_1679 infA   FALSE 0.153 88.000 0.002 1.000   NA
 2733887 2733888 CJJCF936_1678 CJJCF936_1677     TRUE 0.801 50.000 0.043 0.074 N NA
 2733890 2733891 CJJCF936_1675 CJJCF936_1674     FALSE 0.395 110.000 0.250 1.000 N NA
 2733891 2733892 CJJCF936_1674 CJJCF936_1673     TRUE 0.993 0.000 0.412 0.047 Y NA
 2733892 2733893 CJJCF936_1673 CJJCF936_1672     TRUE 0.991 -7.000 0.647 0.047 Y NA
 2733893 2733894 CJJCF936_1672 CJJCF936_1671     TRUE 0.863 39.000 0.278 1.000 Y NA
 2733894 2733895 CJJCF936_1671 CJJCF936_1670     TRUE 0.976 -7.000 0.039 0.023 Y NA
 2733895 2733896 CJJCF936_1670 CJJCF936_1669   nuoA FALSE 0.235 113.000 0.053 1.000 N NA
 2733896 2733897 CJJCF936_1669 CJJCF936_1668 nuoA nuoB TRUE 0.994 -18.000 0.571 0.005 Y NA
 2733897 2733898 CJJCF936_1668 CJJCF936_1667 nuoB nuoC TRUE 0.997 0.000 0.703 0.005 Y NA
 2733898 2733899 CJJCF936_1667 CJJCF936_1666 nuoC nuoD TRUE 0.996 2.000 0.650 0.012 Y NA
 2733899 2733900 CJJCF936_1666 CJJCF936_1665 nuoD   TRUE 0.987 -3.000 0.650 0.012   NA
 2733900 2733901 CJJCF936_1665 CJJCF936_1664     TRUE 0.985 -3.000 0.464 0.012   NA
 2733901 2733902 CJJCF936_1664 CJJCF936_1663   nuoG TRUE 0.985 -3.000 0.444 0.012   NA
 2733902 2733903 CJJCF936_1663 CJJCF936_1662 nuoG nuoH TRUE 0.983 -7.000 0.065 0.012 Y NA
 2733903 2733904 CJJCF936_1662 CJJCF936_1661 nuoH nuoI TRUE 0.994 10.000 0.500 0.012 Y NA
 2733904 2733905 CJJCF936_1661 CJJCF936_1660 nuoI nuoJ TRUE 0.991 -3.000 0.442 0.012 Y NA
 2733905 2733906 CJJCF936_1660 CJJCF936_1659 nuoJ nuoK TRUE 0.985 -3.000 0.064 0.005 Y NA
 2733906 2733907 CJJCF936_1659 CJJCF936_1658 nuoK nuoL TRUE 0.990 2.000 0.056 0.012 Y NA
 2733907 2733908 CJJCF936_1658 CJJCF936_1657 nuoL nuoM TRUE 0.994 2.000 0.056 0.002 Y NA
 2733908 2733909 CJJCF936_1657 CJJCF936_1656 nuoM nuoN TRUE 0.984 -10.000 0.024 0.002 Y NA
 2733909 2733910 CJJCF936_1656 CJJCF936_1655 nuoN pflA FALSE 0.575 22.000 0.020 1.000   NA
 2733913 2733914 CJJCF936_1652 CJJCF936_1651     TRUE 0.867 10.000 0.057 NA   NA
 2733914 2733915 CJJCF936_1651 CJJCF936_1650     FALSE 0.385 184.000 0.400 NA   NA
 2733915 2733916 CJJCF936_1650 CJJCF936_1649     FALSE 0.266 85.000 0.043 NA   NA
 2733919 2733920 CJJCF936_1646 CJJCF936_1645     TRUE 0.716 12.000 0.025 NA N NA
 2733922 2733923 CJJCF936_1643 CJJCF936_1642     TRUE 0.789 11.000 0.032 1.000 N NA
 2733923 2733924 CJJCF936_1642 CJJCF936_1641     TRUE 0.922 3.000 0.071 1.000 N NA
 2733924 2733925 CJJCF936_1641 CJJCF936_1640     FALSE 0.121 228.000 0.000 1.000   NA
 2733926 2733927 CJJCF936_1639 CJJCF936_1638     TRUE 0.880 -12.000 0.120 NA N NA
 2733928 2733929 CJJCF936_1637 CJJCF936_1635     FALSE 0.392 60.000 0.034 1.000   NA
 2733930 2733931 CJJCF936_1636 CJJCF936_1634     TRUE 0.992 -19.000 0.122 0.001 Y NA
 2733931 2733932 CJJCF936_1634 CJJCF936_1633     TRUE 0.865 10.000 0.053 1.000   NA
 2733932 2733933 CJJCF936_1633 CJJCF936_1632     FALSE 0.095 142.000 0.010 NA   NA
 2733934 2733935 CJJCF936_1631 CJJCF936_1630     TRUE 0.962 2.000 0.389 1.000 N NA
 2733935 2733936 CJJCF936_1630 CJJCF936_1629   acs FALSE 0.160 138.000 0.032 1.000 N NA
 2733936 2733937 CJJCF936_1629 CJJCF936_1628 acs galU FALSE 0.247 82.000 0.032 1.000 N NA
 2733937 2733938 CJJCF936_1628 CJJCF936_1627 galU pgi TRUE 0.748 -6.000 0.023 1.000 N NA
 2733938 2733939 CJJCF936_1627 CJJCF936_1626 pgi   FALSE 0.105 130.000 0.011 1.000 N NA
 2733939 2733940 CJJCF936_1626 CJJCF936_1624     FALSE 0.322 65.000 0.030 NA   NA
 2733941 2733942 CJJCF936_1625 CJJCF936_1623   dapF TRUE 0.658 -25.000 0.010 1.000   NA
 2733942 2733943 CJJCF936_1623 CJJCF936_1622 dapF   TRUE 0.690 -3.000 0.016 1.000 N NA
 2733945 2733946 CJJCF936_1620 CJJCF936_1619     FALSE 0.517 30.000 0.000 NA   NA
 2733946 2733947 CJJCF936_1619 CJJCF936_1618     FALSE 0.357 145.000 0.286 NA   NA
 2733948 2733949 CJJCF936_1617 CJJCF936_1616 csn cas1 TRUE 0.938 -13.000 0.546 NA   NA
 2733949 2733950 CJJCF936_1616 CJJCF936_1615 cas1 cas2 TRUE 0.955 -7.000 0.876 NA   NA
 11401315 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 569.000 0.000 NA   NA
 11543678 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 569.000 0.000 NA   NA
 11686070 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 569.000 0.000 NA   NA
 11401316 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 605.000 0.000 NA   NA
 11543679 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 605.000 0.000 NA   NA
 11686071 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 605.000 0.000 NA   NA
 11401317 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 635.000 0.000 NA   NA
 11543680 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 635.000 0.000 NA   NA
 11686072 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 635.000 0.000 NA   NA
 11401318 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 671.000 0.000 NA   NA
 11543681 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 671.000 0.000 NA   NA
 11686073 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 671.000 0.000 NA   NA
 11401319 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11543682 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11686074 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 701.000 0.000 NA   NA
 11401320 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 737.000 0.000 NA   NA
 11543683 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 737.000 0.000 NA   NA
 11686075 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 737.000 0.000 NA   NA
 11401321 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11543684 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11686076 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 766.000 0.000 NA   NA
 11401322 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11543685 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11686077 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 802.000 0.000 NA   NA
 11401323 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 832.000 0.000 NA   NA
 11543686 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 832.000 0.000 NA   NA
 11686078 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 832.000 0.000 NA   NA
 11401324 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 868.000 0.000 NA   NA
 11543687 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 868.000 0.000 NA   NA
 11686079 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 868.000 0.000 NA   NA
 11401325 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 897.000 0.000 NA   NA
 11543688 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 897.000 0.000 NA   NA
 11686080 2733949   CJJCF936_1616   cas1 FALSE NA 897.000 0.000 NA   NA
 2733951 2733952 CJJCF936_1614 CJJCF936_1613     TRUE 0.986 4.000 0.018 0.005 Y NA
 2733952 2733953 CJJCF936_1613 CJJCF936_1612     TRUE 0.981 1.000 0.501 1.000 Y NA
 2733953 2733954 CJJCF936_1612 CJJCF936_1611     TRUE 0.806 2.000 0.010 1.000 N NA
 2733955 2733956 CJJCF936_1610 CJJCF936_1609 nspC   FALSE 0.120 304.000 0.000 1.000   NA
 2733956 2733957 CJJCF936_1609 CJJCF936_1608     TRUE 0.917 -25.000 0.375 NA   NA
 2733957 2733958 CJJCF936_1608 CJJCF936_1607     TRUE 0.942 0.000 0.250 NA   NA
 2733958 2733959 CJJCF936_1607 CJJCF936_1606   fdhA TRUE 0.859 49.000 0.000 0.004   NA
 2733959 2733960 CJJCF936_1606 CJJCF936_1605 fdhA fdhB TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.004   NA
 2733960 2733961 CJJCF936_1605 CJJCF936_1604 fdhB fdhC TRUE 0.991 -3.000 0.200 0.004 Y NA
 2733961 2733962 CJJCF936_1604 CJJCF936_1603 fdhC fdhD TRUE 0.829 167.000 0.138 0.004 Y NA
 2733962 2733963 CJJCF936_1603 CJJCF936_1602 fdhD   TRUE 0.900 -7.000 0.172 NA   NA
 2733963 2733964 CJJCF936_1602 CJJCF936_1601     FALSE 0.275 110.000 0.077 NA   NA
 2733964 2733965 CJJCF936_1601 CJJCF936_1600     FALSE 0.124 111.000 0.015 1.000 N NA
 2733965 2733966 CJJCF936_1600 CJJCF936_1599   selD FALSE 0.317 106.000 0.104 1.000 N NA
 2733966 2733967 CJJCF936_1599 CJJCF936_1598 selD   FALSE 0.103 131.000 0.011 1.000 N NA
 2733967 2733968 CJJCF936_1598 CJJCF936_1597   putP TRUE 0.830 18.000 0.141 1.000 N NA
 2733969 2733970 CJJCF936_1596 CJJCF936_1595     TRUE 0.974 4.000 0.844 NA   NA
 2733971 2733972 CJJCF936_1594 CJJCF936_1593   purA FALSE 0.535 28.000 0.000 NA   NA
 2733972 2733973 CJJCF936_1593 CJJCF936_1592 purA   TRUE 0.675 -3.000 0.014 NA   NA
 2733973 2733974 CJJCF936_1592 CJJCF936_1591     TRUE 0.894 -7.000 0.147 NA   NA
 2733974 2733975 CJJCF936_1591 CJJCF936_1590     FALSE 0.361 93.000 0.120 NA   NA
 2733975 2733976 CJJCF936_1590 CJJCF936_1589   carA TRUE 0.869 0.000 0.041 NA   NA
 2733976 2733977 CJJCF936_1589 CJJCF936_1588 carA   TRUE 0.661 -3.000 0.011 NA   NA
 2733977 2733978 CJJCF936_1588 CJJCF936_1587     TRUE 0.663 -3.000 0.011 NA   NA
 2733978 2733979 CJJCF936_1587 CJJCF936_1586     TRUE 0.914 69.000 0.200 0.010 Y NA
 2733979 2733980 CJJCF936_1586 CJJCF936_1585   ccoN FALSE 0.234 126.000 0.062 1.000 N NA
 2733980 2733981 CJJCF936_1585 CJJCF936_1584 ccoN ccoO TRUE 0.984 13.000 0.283 0.003 N NA
 2733981 2733982 CJJCF936_1584 CJJCF936_1583 ccoO ccoQ TRUE 0.995 5.000 0.738 0.003 N NA
 2733982 2733983 CJJCF936_1583 CJJCF936_1582 ccoQ ccoP TRUE 0.992 0.000 0.286 0.003 N NA
 2733983 2733984 CJJCF936_1582 CJJCF936_1581 ccoP   TRUE 0.962 0.000 0.579 NA   NA
 2733984 2733985 CJJCF936_1581 CJJCF936_1580     FALSE 0.525 95.000 0.526 NA   NA
 2733985 2733986 CJJCF936_1580 CJJCF936_1579     TRUE 0.871 -13.000 0.102 NA   NA
 2733986 2733987 CJJCF936_1579 CJJCF936_1578     TRUE 0.864 -3.000 0.091 1.000   NA
 2733987 2733988 CJJCF936_1578 CJJCF936_1577     TRUE 0.981 -3.000 0.117 0.041 Y NA
 2733988 2733989 CJJCF936_1577 CJJCF936_1576   rplM FALSE 0.149 84.000 0.009 1.000 N NA
 2733989 2733990 CJJCF936_1576 CJJCF936_1575 rplM rpsI TRUE 0.994 3.000 0.231 0.027 Y NA
 2733990 2733991 CJJCF936_1575 CJJCF936_1574 rpsI cadF FALSE 0.141 125.000 0.024 1.000 N NA
 2733991 2733992 CJJCF936_1574 CJJCF936_1573 cadF   TRUE 0.905 0.000 0.068 1.000   NA
 2733992 2733993 CJJCF936_1573 CJJCF936_1572     FALSE 0.293 93.000 0.056 1.000   NA
 2733993 2733994 CJJCF936_1572 CJJCF936_1571   ctsR FALSE 0.514 24.000 0.016 NA   NA
 2733994 2733995 CJJCF936_1571 CJJCF936_1570 ctsR ctsD TRUE 0.845 -28.000 0.083 NA   NA
 2733995 2733996 CJJCF936_1570 CJJCF936_1569 ctsD ctsP TRUE 0.902 -7.000 0.167 1.000   NA
 2733996 2733997 CJJCF936_1569 CJJCF936_1568 ctsP ctsX TRUE 0.970 4.000 0.667 1.000   NA
 2733997 2733998 CJJCF936_1568 CJJCF936_1567 ctsX ctsE TRUE 0.960 2.000 0.333 1.000   NA
 2733998 2733999 CJJCF936_1567 CJJCF936_1565 ctsE ctsF TRUE 0.944 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 2734000 2734001 CJJCF936_1566 CJJCF936_1564     TRUE 0.881 4.000 0.035 1.000   NA
 2734001 2734002 CJJCF936_1564 CJJCF936_1563     TRUE 0.799 17.000 0.084 1.000   NA
 2734002 2734003 CJJCF936_1563 CJJCF936_1562     TRUE 0.992 10.000 0.558 0.005   NA
 2734003 2734004 CJJCF936_1562 CJJCF936_1561     TRUE 0.968 43.000 0.677 0.004   NA
 2734004 2734005 CJJCF936_1561 CJJCF936_1560     TRUE 0.685 63.000 0.469 NA   NA
 2734005 2734006 CJJCF936_1560 CJJCF936_1559   flgI TRUE 0.962 0.000 0.569 NA   NA
 2734008 2734009 CJJCF936_1558 CJJCF936_1556     TRUE 0.823 -7.000 0.043 1.000   NA
 2734009 2734010 CJJCF936_1556 CJJCF936_1555     TRUE 0.888 -3.000 0.143 1.000   NA
 2734011 2734012 CJJCF936_1554 CJJCF936_1553     TRUE 0.716 -31.000 0.022 1.000   NA
 2734012 2734013 CJJCF936_1553 CJJCF936_1552     FALSE 0.101 122.000 0.008 NA   NA
 2734015 2734016 CJJCF936_1550 CJJCF936_1548 yliG tilS TRUE 0.722 -10.000 0.019 1.000 N NA
 2734017 2734018 CJJCF936_1549 CJJCF936_1547     TRUE 0.930 2.000 0.092 1.000   NA
 2734018 2734019 CJJCF936_1547 CJJCF936_1546     TRUE 0.709 37.000 0.120 NA   NA
 2734020 2734021 CJJCF936_1545 CJJCF936_1544   kpsM FALSE 0.351 72.000 0.048 1.000   NA
 2734021 2734022 CJJCF936_1544 CJJCF936_1543 kpsM kpsT TRUE 0.953 -3.000 0.306 1.000 Y NA
 2734022 2734023 CJJCF936_1543 CJJCF936_1542 kpsT kpsE TRUE 0.969 0.000 0.257 1.000 Y NA
 2734023 2734024 CJJCF936_1542 CJJCF936_1541 kpsE kpsD TRUE 0.991 2.000 0.200 0.096 Y NA
 2734024 2734025 CJJCF936_1541 CJJCF936_1540 kpsD kpsF TRUE 0.914 11.000 0.056 1.000 Y NA
 2734025 2734026 CJJCF936_1540 CJJCF936_1539 kpsF   TRUE 0.925 0.000 0.033 NA Y NA
 2734026 2734027 CJJCF936_1539 CJJCF936_1538     TRUE 0.925 -3.000 0.100 NA Y NA
 2734027 2734028 CJJCF936_1538 CJJCF936_1537     TRUE 0.883 10.000 0.000 NA Y NA
 2734029 2734030 CJJCF936_0054 CJJCF936_0055 rrfC   FALSE 0.155 105.000 0.000 NA   NA
 2734030 2734031 CJJCF936_0055 CJJCF936_0056     FALSE 0.310 61.000 0.000 NA   NA
 2734031 2734032 CJJCF936_0056 CJJCF936_0057     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 2734032 2734033 CJJCF936_0057 CJJCF936_0058     FALSE 0.316 59.000 0.000 NA   NA
 2734034 2734035 CJJCF936_0059 CJJCF936_0060     TRUE 0.702 -3.000 0.019 NA   NA
 2734037 2734038 CJJCF936_0062 CJJCF936_0063     FALSE 0.302 178.000 0.182 NA   NA
 2734038 2734039 CJJCF936_0063 CJJCF936_0064   typA TRUE 0.761 0.000 0.006 NA   NA
 2734040 2734041 CJJCF936_0065 CJJCF936_0066     TRUE 0.925 19.000 1.000 1.000   NA
 2734041 2734042 CJJCF936_0066 CJJCF936_0067   flgD FALSE 0.499 54.000 0.053 NA   NA
 2734042 2734043 CJJCF936_0067 CJJCF936_0068 flgD   TRUE 0.976 4.000 0.341 NA Y NA
 2734044 2734045 CJJCF936_0069 CJJCF936_0070     TRUE 0.944 -3.000 0.714 NA   NA
 2734046 2734047 CJJCF936_0071 CJJCF936_0072     FALSE 0.117 223.000 0.000 NA   NA
 2734047 2734048 CJJCF936_0072 CJJCF936_0073     TRUE 0.991 -27.000 1.000 0.007   NA
 2734048 2734049 CJJCF936_0073 CJJCF936_0075     TRUE 0.992 11.000 1.000 0.007   NA
 2734052 2734053 CJJCF936_0077 CJJCF936_0078 trmU   TRUE 0.773 0.000 0.012 NA   NA
 2734053 2734054 CJJCF936_0078 CJJCF936_0079     FALSE 0.388 121.000 0.300 NA   NA
 2734054 2734055 CJJCF936_0079 CJJCF936_0080     TRUE 0.623 93.000 1.000 NA   NA
 2734056 2734057 CJJCF936_0081 CJJCF936_0082     TRUE 0.719 -21.000 0.000 NA   NA
 2734057 2734058 CJJCF936_0082 CJJCF936_0083     TRUE 0.729 -15.000 0.000 NA   NA
 2734059 2734060 CJJCF936_0084 CJJCF936_0085 fliY fliM TRUE 0.991 -3.000 0.142 0.003 Y NA
 2734060 2734061 CJJCF936_0085 CJJCF936_0086 fliM fliA TRUE 0.923 0.000 0.118 1.000 N NA
 2734061 2734062 CJJCF936_0086 CJJCF936_0087 fliA   TRUE 0.869 -19.000 0.112 NA   NA
 2734062 2734063 CJJCF936_0087 CJJCF936_0088     TRUE 0.826 19.000 0.159 NA   NA
 2734063 2734064 CJJCF936_0088 CJJCF936_0089   flhF TRUE 0.930 -7.000 0.382 1.000 N NA
 2734064 2734065 CJJCF936_0089 CJJCF936_0090 flhF folK TRUE 0.827 10.000 0.035 1.000 N NA
 2734065 2734066 CJJCF936_0090 CJJCF936_0091 folK aroQ TRUE 0.804 3.000 0.009 1.000 N NA
 2734067 2734068 CJJCF936_0092 CJJCF936_0093   sppA TRUE 0.796 -12.000 0.035 1.000 N NA
 2734068 2734069 CJJCF936_0093 CJJCF936_0094 sppA   FALSE 0.164 79.000 0.009 NA   NA
 2734070 2734071 CJJCF936_0095 CJJCF936_0096     TRUE 0.939 -24.000 0.667 NA   NA
 2734071 2734072 CJJCF936_0096 CJJCF936_0097     FALSE 0.121 230.000 0.000 1.000   NA
 2734072 2734073 CJJCF936_0097 CJJCF936_0098     TRUE 0.990 -7.000 0.209 0.001   NA
 2734073 2734074 CJJCF936_0098 CJJCF936_0099     TRUE 0.967 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 2734074 2734075 CJJCF936_0099 CJJCF936_0100   lctP FALSE 0.400 124.000 0.075 1.000 Y NA
 2734075 2734076 CJJCF936_0100 CJJCF936_0101 lctP cdtC FALSE 0.277 172.000 0.125 1.000   NA
 2734076 2734077 CJJCF936_0101 CJJCF936_0102 cdtC cdtB TRUE 0.991 11.000 0.500 0.003   NA
 2734077 2734078 CJJCF936_0102 CJJCF936_0103 cdtB cdtA TRUE 0.990 -3.000 0.421 0.003   NA
 2734079 2734080 CJJCF936_0104 CJJCF936_0105   cydA TRUE 0.975 1.000 0.887 NA   NA
 2734080 2734081 CJJCF936_0105 CJJCF936_0106 cydA cydB TRUE 0.995 0.000 0.962 0.048 Y NA
 2734082 2734083 CJJCF936_0107 CJJCF936_0108   ung FALSE 0.112 116.000 0.011 1.000 N NA
 2734084 2734085 CJJCF936_0109 CJJCF936_0110 aspA dcuA TRUE 0.835 16.000 0.127 1.000   NA
 2734085 2734086 CJJCF936_0110 CJJCF936_0111 dcuA   FALSE 0.171 108.000 0.027 1.000   NA
 2734086 2734087 CJJCF936_0111 CJJCF936_0112     TRUE 0.938 10.000 0.372 NA   NA
 2734087 2734088 CJJCF936_0112 CJJCF936_0113     TRUE 0.876 24.000 0.516 NA   NA
 2734088 2734089 CJJCF936_0113 CJJCF936_0114     FALSE 0.356 83.000 0.087 NA   NA
 2734089 2734090 CJJCF936_0114 CJJCF936_0115     TRUE 0.943 10.000 0.414 NA   NA
 2734090 2734091 CJJCF936_0115 CJJCF936_0116   rplU FALSE 0.090 159.000 0.005 NA   NA
 2734091 2734092 CJJCF936_0116 CJJCF936_0117 rplU rpmA TRUE 0.992 11.000 0.667 0.027 Y NA
 2734092 2734093 CJJCF936_0117 CJJCF936_0118 rpmA   FALSE 0.441 107.000 0.335 1.000   NA
 2734093 2734094 CJJCF936_0118 CJJCF936_0119   proB FALSE 0.390 105.000 0.206 1.000   NA
 2734094 2734095 CJJCF936_0119 CJJCF936_0120 proB fmt FALSE 0.193 74.000 0.014 1.000 N NA
 2734095 2734096 CJJCF936_0120 CJJCF936_0121 fmt   TRUE 0.748 -37.000 0.029 1.000 N NA
 2734096 2734097 CJJCF936_0121 CJJCF936_0122     TRUE 0.800 -3.000 0.040 1.000 N NA
 2734097 2734098 CJJCF936_0122 CJJCF936_0123     TRUE 0.970 6.000 0.827 1.000 N NA
 2734098 2734099 CJJCF936_0123 CJJCF936_0124     FALSE 0.397 61.000 0.037 1.000 N NA
 2734099 2734100 CJJCF936_0124 CJJCF936_0125     TRUE 0.987 11.000 0.110 0.007 Y NA
 2734100 2734101 CJJCF936_0125 CJJCF936_0126   atpH TRUE 0.994 3.000 0.132 0.007 Y NA
 2734101 2734102 CJJCF936_0126 CJJCF936_0127 atpH atpA TRUE 0.993 14.000 0.864 0.007 Y NA
 2734102 2734103 CJJCF936_0127 CJJCF936_0128 atpA atpG TRUE 0.996 9.000 0.846 0.007 Y NA
 2734103 2734104 CJJCF936_0128 CJJCF936_0129 atpG atpD TRUE 0.987 26.000 0.724 0.007 Y NA
 2734104 2734105 CJJCF936_0129 CJJCF936_0130 atpD atpC TRUE 0.997 4.000 0.837 0.007 Y NA
 2734105 2734106 CJJCF936_0130 CJJCF936_0131 atpC   TRUE 0.864 0.000 0.036 1.000 N NA
 2734106 2734107 CJJCF936_0131 CJJCF936_0132     TRUE 0.995 9.000 0.944 0.049 Y NA
 2734107 2734108 CJJCF936_0132 CJJCF936_0133     TRUE 0.959 3.000 0.343 NA   NA
 2734108 2734109 CJJCF936_0133 CJJCF936_0134     TRUE 0.921 10.000 0.213 NA   NA
 2734109 2734110 CJJCF936_0134 CJJCF936_0135     TRUE 0.647 77.000 0.702 1.000 N NA
 2734110 2734111 CJJCF936_0135 CJJCF936_0136     TRUE 0.973 4.000 0.794 1.000   NA
 2734111 2734112 CJJCF936_0136 CJJCF936_0137   slyD TRUE 0.914 15.000 0.543 1.000   NA
 2734112 2734113 CJJCF936_0137 CJJCF936_0138 slyD fabD TRUE 0.781 0.000 0.013 1.000 N NA
 2734113 2734114 CJJCF936_0138 CJJCF936_0139 fabD mtnA TRUE 0.866 0.000 0.037 1.000 N NA
 2734114 2734115 CJJCF936_0139 CJJCF936_0140 mtnA   TRUE 0.797 -3.000 0.042 NA N NA
 2734115 2734116 CJJCF936_0140 CJJCF936_0141     TRUE 0.771 5.000 0.009 NA N NA
 2734116 2734117 CJJCF936_0141 CJJCF936_0142     TRUE 0.761 0.000 0.007 NA   NA
 2734117 2734118 CJJCF936_0142 CJJCF936_0143     TRUE 0.665 -3.000 0.003 NA   NA
 2734118 2734119 CJJCF936_0143 CJJCF936_0144     FALSE 0.105 124.000 0.003 NA   NA
 2734120 2734121 CJJCF936_0145 CJJCF936_0146 dusB   TRUE 0.713 -3.000 0.021 NA   NA
 2734121 2734122 CJJCF936_0146 CJJCF936_0147     TRUE 0.939 -10.000 0.523 NA   NA
 2734122 2734123 CJJCF936_0147 CJJCF936_0148     TRUE 0.746 12.000 0.029 NA   NA
 2734123 2734124 CJJCF936_0148 CJJCF936_0149   accD TRUE 0.882 2.000 0.035 NA   NA
 2734124 2734125 CJJCF936_0149 CJJCF936_0150 accD   TRUE 0.771 9.000 0.016 1.000 N NA
 2734125 2734126 CJJCF936_0150 CJJCF936_0151     TRUE 0.768 0.000 0.008 1.000 N NA
 2734127 2734128 CJJCF936_0152 CJJCF936_0153 tyrA   FALSE 0.173 80.000 0.013 1.000 N NA
 2734128 2734129 CJJCF936_0153 CJJCF936_0154   lpxC TRUE 0.909 0.000 0.022 1.000 Y NA
 2734129 2734130 CJJCF936_0154 CJJCF936_0155 lpxC   FALSE 0.550 39.000 0.035 1.000 N NA
 2734130 2734131 CJJCF936_0155 CJJCF936_0156   thrB TRUE 0.844 9.000 0.032 1.000 N NA
 2734131 2734132 CJJCF936_0156 CJJCF936_0157 thrB   FALSE 0.268 85.000 0.044 NA   NA
 2734132 2734133 CJJCF936_0157 CJJCF936_0158   infB TRUE 0.896 -13.000 0.171 NA   NA
 2734133 2734134 CJJCF936_0158 CJJCF936_0159 infB rbfA TRUE 0.964 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 2734134 2734135 CJJCF936_0159 CJJCF936_0160 rbfA   TRUE 0.788 -10.000 0.033 NA   NA
 2734135 2734136 CJJCF936_0160 CJJCF936_0161     FALSE 0.333 57.000 0.000 NA   NA
 2734136 2734137 CJJCF936_0161 CJJCF936_0162     TRUE 0.633 18.000 0.000 1.000   NA
 2734137 2734138 CJJCF936_0162 CJJCF936_0163     TRUE 0.950 -7.000 0.759 NA   NA
 2734139 2734140 CJJCF936_0164 CJJCF936_0165     TRUE 0.969 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 2734140 2734141 CJJCF936_0165 CJJCF936_0166     TRUE 0.955 13.000 0.509 1.000 Y NA
 2734142 2734143 CJJCF936_0167 CJJCF936_0168     FALSE 0.205 135.000 0.050 1.000   NA
 2734144 2734145 CJJCF936_0169 CJJCF936_0170 trxB trx FALSE 0.301 134.000 0.035 1.000 Y NA
 2734145 2734146 CJJCF936_0170 CJJCF936_0171 trx   FALSE 0.365 57.000 0.027 1.000 N NA
 2734146 2734147 CJJCF936_0171 CJJCF936_0172   hom TRUE 0.779 0.000 0.003 1.000 N NA
 2734147 2734148 CJJCF936_0172 CJJCF936_0173 hom   TRUE 0.903 4.000 0.009 1.000 Y NA
 2734148 2734149 CJJCF936_0173 CJJCF936_0174     TRUE 0.853 12.000 0.098 NA   NA
 2734149 2734150 CJJCF936_0174 CJJCF936_0175     TRUE 0.955 -6.000 0.882 NA   NA
 2734150 2734151 CJJCF936_0175 CJJCF936_0176     TRUE 0.791 -7.000 0.033 NA   NA
 2734151 2734152 CJJCF936_0176 CJJCF936_0177     TRUE 0.720 14.000 0.031 1.000   NA
 2734152 2734153 CJJCF936_0177 CJJCF936_0178   rpmE TRUE 0.878 3.000 0.031 1.000   NA
 2734153 2734154 CJJCF936_0178 CJJCF936_0179 rpmE   FALSE 0.214 79.000 0.023 NA   NA
 2734154 2734155 CJJCF936_0179 CJJCF936_0180     TRUE 0.920 3.000 0.070 NA   NA
 2734155 2734156 CJJCF936_0180 CJJCF936_0181     TRUE 0.947 0.000 0.300 NA   NA
 2734156 2734157 CJJCF936_0181 CJJCF936_0182     TRUE 0.780 0.000 0.011 1.000   NA
 2734157 2734158 CJJCF936_0182 CJJCF936_0183     TRUE 0.886 -3.000 0.139 1.000 N NA
 2734158 2734159 CJJCF936_0183 CJJCF936_0184     TRUE 0.866 3.000 0.028 1.000 N NA
 2734159 2734160 CJJCF936_0184 CJJCF936_0185     FALSE 0.238 97.000 0.042 1.000   NA
 2734160 2734161 CJJCF936_0185 CJJCF936_0186     TRUE 0.931 -3.000 0.476 NA   NA
 2734161 2734162 CJJCF936_0186 CJJCF936_0187     TRUE 0.875 -9.000 0.100 NA   NA
 2734167 2734168 CJJCF936_0192 CJJCF936_0193 sodB   FALSE 0.200 69.000 0.004 NA   NA
 2734168 2734169 CJJCF936_0193 CJJCF936_0194     FALSE 0.484 126.000 0.667 NA   NA
 2734170 2734171 CJJCF936_0195 CJJCF936_0196     TRUE 0.595 42.000 0.014 1.000 Y NA
 2734171 2734172 CJJCF936_0196 CJJCF936_0197     TRUE 0.938 -13.000 0.529 1.000 N NA
 2734172 2734173 CJJCF936_0197 CJJCF936_0198     TRUE 0.994 0.000 0.618 0.043 Y NA
 2734173 2734174 CJJCF936_0198 CJJCF936_0199     TRUE 0.880 -3.000 0.130 NA   NA
 2734175 2734176 CJJCF936_0200 CJJCF936_0201     TRUE 0.746 -3.000 0.027 NA   NA
 2734176 2734177 CJJCF936_0201 CJJCF936_0202   exbB-1 TRUE 0.985 12.000 1.000 0.048 N NA
 2734177 2734178 CJJCF936_0202 CJJCF936_0203 exbB-1   TRUE 0.993 -13.000 1.000 0.048 Y NA
 2734178 2734179 CJJCF936_0203 CJJCF936_0204     TRUE 0.984 2.000 0.217 0.093 N NA
 2734179 2734180 CJJCF936_0204 CJJCF936_0205     TRUE 0.657 52.000 0.174 1.000 N NA
 2734180 2734181 CJJCF936_0205 CJJCF936_0206     FALSE 0.330 99.000 0.103 1.000   NA
 2734182 2734183 CJJCF936_0207 CJJCF936_0208     TRUE 0.725 10.000 0.009 1.000   NA
 2734183 2734184 CJJCF936_0208 CJJCF936_0209     TRUE 0.837 -7.000 0.009 1.000 Y NA
 2734184 2734185 CJJCF936_0209 CJJCF936_0210   purN FALSE 0.188 72.000 0.009 1.000 N NA
 2734185 2734186 CJJCF936_0210 CJJCF936_0211 purN   TRUE 0.687 -9.000 0.014 NA N NA
 2734186 2734187 CJJCF936_0211 CJJCF936_0212     TRUE 0.661 -16.000 0.004 NA   NA
 2734187 2734188 CJJCF936_0212 CJJCF936_0213     TRUE 0.796 2.000 0.007 NA   NA
 2734188 2734189 CJJCF936_0213 CJJCF936_0214   def TRUE 0.832 -3.000 0.054 1.000 N NA
 2734189 2734190 CJJCF936_0214 CJJCF936_0215 def clpP FALSE 0.541 36.000 0.030 1.000 N NA
 2734190 2734191 CJJCF936_0215 CJJCF936_0216 clpP tig TRUE 0.973 0.000 0.351 1.000 Y NA
 2734192 2734193 CJJCF936_0217 CJJCF936_0218 folE fliI TRUE 0.986 0.000 0.378 0.052 N NA
 2734194 2734195 CJJCF936_0219 CJJCF936_0220 purF dapB TRUE 0.848 2.000 0.022 1.000 N NA
 2734195 2734196 CJJCF936_0220 CJJCF936_0221 dapB   FALSE 0.247 63.000 0.003 1.000 N NA
 2734196 2734197 CJJCF936_0221 CJJCF936_0222     TRUE 0.763 0.000 0.005 NA   NA
 2734197 2734198 CJJCF936_0222 CJJCF936_0223     FALSE 0.487 135.000 0.750 NA   NA
 2734198 2734199 CJJCF936_0223 CJJCF936_0224     FALSE 0.495 64.000 0.100 NA   NA
 2734199 2734200 CJJCF936_0224 CJJCF936_0225     TRUE 0.866 -16.000 0.100 NA   NA
 2734201 2734202 CJJCF936_0226 CJJCF936_0227     FALSE 0.137 186.000 0.029 NA   NA
 2734202 2734203 CJJCF936_0227 CJJCF936_0228     FALSE 0.313 74.000 0.043 NA   NA
 2734203 2734204 CJJCF936_0228 CJJCF936_0229   thrS FALSE 0.233 131.000 0.063 1.000 N NA
 2734204 2734205 CJJCF936_0229 CJJCF936_0230 thrS infC TRUE 0.912 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 2734205 2734206 CJJCF936_0230 CJJCF936_0231 infC   FALSE 0.395 39.000 0.004 1.000 N NA
 2734206 2734207 CJJCF936_0231 CJJCF936_0232     FALSE 0.151 112.000 0.000 1.000   NA
 2734207 2734208 CJJCF936_0232 CJJCF936_0233     TRUE 0.598 138.000 0.000 0.003   NA
 2734208 2734209 CJJCF936_0233 CJJCF936_0234     FALSE 0.117 203.000 0.000 NA   NA
 2734209 2734210 CJJCF936_0234 CJJCF936_0235     FALSE 0.298 63.000 0.000 NA   NA
 2734210 2734211 CJJCF936_0235 CJJCF936_0236     TRUE 0.718 -22.000 0.000 NA   NA
 2734211 2734212 CJJCF936_0236 CJJCF936_0237     FALSE 0.214 79.000 0.000 NA   NA
 2734212 2734213 CJJCF936_0237 CJJCF936_0238     FALSE 0.115 351.000 0.000 NA   NA
 2734213 2734214 CJJCF936_0238 CJJCF936_0239     FALSE 0.116 272.000 0.000 NA   NA
 2734214 2734215 CJJCF936_0239 CJJCF936_0240     FALSE 0.121 162.000 0.000 NA   NA
 2734215 2734216 CJJCF936_0240 CJJCF936_0241     FALSE 0.565 114.000 1.000 NA   NA
 2734216 2734217 CJJCF936_0241 CJJCF936_0242   argC FALSE 0.170 81.000 0.003 1.000   NA
 2734217 2734218 CJJCF936_0242 CJJCF936_0243 argC   TRUE 0.760 10.000 0.019 1.000   NA
 2734218 2734219 CJJCF936_0243 CJJCF936_0244   argB TRUE 0.721 10.000 0.006 1.000   NA
 2734219 2734220 CJJCF936_0244 CJJCF936_0245 argB argD TRUE 0.902 10.000 0.030 1.000 Y NA
 2734223 2734224 CJJCF936_0247 CJJCF936_0249   nrdB TRUE 0.824 -13.000 0.048 1.000 N NA
 2734224 2734225 CJJCF936_0249 CJJCF936_0250 nrdB   TRUE 0.640 14.000 0.019 NA   NA
 2734225 2734226 CJJCF936_0250 CJJCF936_0251   pyrE TRUE 0.850 1.000 0.025 NA   NA
 2734226 2734227 CJJCF936_0251 CJJCF936_0252 pyrE frr TRUE 0.860 3.000 0.026 1.000 N NA
 2734227 2734228 CJJCF936_0252 CJJCF936_0253 frr secG TRUE 0.606 16.000 0.017 1.000 N NA
 2734228 2734229 CJJCF936_0253 CJJCF936_0254 secG   FALSE 0.118 104.000 0.007 NA   NA
 2734230 2734231 CJJCF936_0255 CJJCF936_0256 cynT   TRUE 0.871 -3.000 0.105 1.000 N NA
 2734232 2734233 CJJCF936_0257 CJJCF936_0258     TRUE 0.868 10.000 0.056 1.000 N NA
 2734233 2734234 CJJCF936_0258 CJJCF936_0259     FALSE 0.192 211.000 0.052 1.000 N NA
 2734234 2734235 CJJCF936_0259 CJJCF936_0260     FALSE 0.413 137.000 0.429 NA   NA
 2734235 2734236 CJJCF936_0260 CJJCF936_0261     FALSE 0.558 71.000 0.286 NA   NA
 2734237 2734238 CJJCF936_0262 CJJCF936_0263 rpmI rplT TRUE 0.921 94.000 0.928 0.026 Y NA
 2734239 2734240 CJJCF936_0264 CJJCF936_0265     TRUE 0.864 -24.000 0.105 NA   NA
 2734241 2734242 CJJCF936_0266 CJJCF936_0268     TRUE 0.829 28.000 0.333 NA   NA
 2734243 2734244 CJJCF936_0267 CJJCF936_0269     TRUE 0.958 3.000 0.333 NA   NA
 2734245 2734246 CJJCF936_0270 CJJCF936_0271 moaC   TRUE 0.828 -22.000 0.057 NA   NA
 2734246 2734247 CJJCF936_0271 CJJCF936_0272     TRUE 0.766 14.000 0.047 NA   NA
 2734249 2734250 CJJCF936_0274 CJJCF936_0275   dgkA TRUE 0.886 -3.000 0.136 1.000   NA
 2734250 2734251 CJJCF936_0275 CJJCF936_0276 dgkA   TRUE 0.912 -3.000 0.273 1.000   NA
 2734251 2734252 CJJCF936_0276 CJJCF936_0277   pyrC TRUE 0.683 -10.000 0.009 1.000   NA
 2734253 2734254 CJJCF936_0278 CJJCF936_0279     TRUE 0.616 56.000 0.154 NA   NA
 2734254 2734255 CJJCF936_0279 CJJCF936_0280     FALSE 0.444 81.000 0.154 1.000   NA
 2734257 2734258 CJJCF936_0282 CJJCF936_0283     TRUE 0.970 -36.000 0.000 0.001   NA
 2734258 2734259 CJJCF936_0283 CJJCF936_0284     TRUE 0.746 11.000 0.000 1.000   NA
 2734259 2734260 CJJCF936_0284 CJJCF936_0285     FALSE 0.115 481.000 0.000 NA   NA
 2734260 2734261 CJJCF936_0285 CJJCF936_0286     TRUE 0.970 0.000 0.867 NA   NA
 2734261 2734262 CJJCF936_0286 CJJCF936_0287     TRUE 0.838 12.000 0.075 NA   NA
 2734262 2734263 CJJCF936_0287 CJJCF936_0288   ilvE TRUE 0.841 13.000 0.098 1.000 N NA
 2734264 2734265 CJJCF936_0289 CJJCF936_0290     TRUE 0.666 -3.000 0.008 1.000   NA
 2734265 2734266 CJJCF936_0290 CJJCF936_0291     TRUE 0.761 0.000 0.006 NA   NA
 2734266 2734267 CJJCF936_0291 CJJCF936_0292   fabZ FALSE 0.220 94.000 0.035 NA   NA
 2734267 2734268 CJJCF936_0292 CJJCF936_0293 fabZ lpxA TRUE 0.945 0.000 0.264 1.000 N NA
 2734268 2734269 CJJCF936_0293 CJJCF936_0294 lpxA clpX TRUE 0.767 -7.000 0.027 1.000 N NA
 2734269 2734270 CJJCF936_0294 CJJCF936_0295 clpX mreB TRUE 0.769 12.000 0.034 1.000 N NA
 2734270 2734271 CJJCF936_0295 CJJCF936_0296 mreB   TRUE 0.877 29.000 0.689 1.000 N NA
 2734271 2734272 CJJCF936_0296 CJJCF936_0297   carB FALSE 0.100 261.000 0.016 1.000 N NA
 2734272 2734273 CJJCF936_0297 CJJCF936_0298 carB   TRUE 0.676 -3.000 0.016 NA N NA
 2734274 2734275 CJJCF936_0299 CJJCF936_0300 tal serB TRUE 0.847 0.000 0.029 1.000 N NA
 2734275 2734276 CJJCF936_0300 CJJCF936_0301 serB cheW TRUE 0.786 0.000 0.015 1.000 N NA
 2734276 2734277 CJJCF936_0301 CJJCF936_0302 cheW cheA TRUE 0.992 5.000 0.137 0.013 Y NA
 2734277 2734278 CJJCF936_0302 CJJCF936_0303 cheA cheV TRUE 0.994 4.000 0.147 0.008 Y NA
 2734278 2734279 CJJCF936_0303 CJJCF936_0304 cheV   TRUE 0.854 -7.000 0.065 NA   NA
 2734279 2734280 CJJCF936_0304 CJJCF936_0305   greA FALSE 0.102 133.000 0.012 NA   NA
 2734280 2734281 CJJCF936_0305 CJJCF936_0306 greA lpxB TRUE 0.790 12.000 0.042 1.000 N NA
 2734281 2734282 CJJCF936_0306 CJJCF936_0307 lpxB   TRUE 0.674 -3.000 0.003 1.000   NA
 2734282 2734283 CJJCF936_0307 CJJCF936_0308     FALSE 0.144 113.000 0.000 NA   NA
 2734284 2734285 CJJCF936_0831 CJJCF936_0830     FALSE 0.223 76.000 0.000 NA   NA
 2734285 2734286 CJJCF936_0830 CJJCF936_0829     FALSE 0.115 481.000 0.000 NA   NA
 2734286 2734287 CJJCF936_0829 CJJCF936_0828     FALSE 0.575 23.000 0.000 NA   NA
 2734287 2734288 CJJCF936_0828 CJJCF936_0827     FALSE 0.436 97.000 0.286 NA   NA
 2734288 2734289 CJJCF936_0827 CJJCF936_0826     TRUE 0.707 12.000 0.000 NA   NA
 2734289 2734290 CJJCF936_0826 CJJCF936_0825     TRUE 0.949 -46.000 1.000 NA   NA
 2734292 2734293 CJJCF936_0823 CJJCF936_0822     TRUE 0.930 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 2734293 2734294 CJJCF936_0822 CJJCF936_0821     TRUE 0.993 4.000 0.360 0.042 Y NA
 2734294 2734295 CJJCF936_0821 CJJCF936_0820     TRUE 0.992 1.000 0.774 0.042   NA
 2734295 2734296 CJJCF936_0820 CJJCF936_0819     TRUE 0.916 -3.000 0.290 1.000   NA
 2734296 2734297 CJJCF936_0819 CJJCF936_0818     TRUE 0.900 0.000 0.065 NA   NA
 2734297 2734298 CJJCF936_0818 CJJCF936_0817     TRUE 0.856 11.000 0.073 NA   NA
 2734299 2734300 CJJCF936_0816 CJJCF936_0814 corA mog FALSE 0.529 21.000 0.011 1.000 N NA
 2734302 2734303 CJJCF936_0813 CJJCF936_0812     TRUE 0.847 -3.000 0.068 1.000 N NA
 2734303 2734304 CJJCF936_0812 CJJCF936_0811     TRUE 0.737 13.000 0.033 NA   NA
 2734304 2734305 CJJCF936_0811 CJJCF936_0810   flaC TRUE 0.731 39.000 0.172 NA   NA
 2734305 2734306 CJJCF936_0810 CJJCF936_0809 flaC   FALSE 0.413 35.000 0.009 NA   NA
 2734307 2734308 CJJCF936_0808 CJJCF936_0807 dnaE   FALSE 0.094 448.000 0.002 1.000 N NA
 2734308 2734309 CJJCF936_0807 CJJCF936_0806     FALSE 0.384 42.000 0.014 1.000 N NA
 2734309 2734310 CJJCF936_0806 CJJCF936_0805     FALSE 0.543 24.000 0.018 1.000   NA
 2734310 2734311 CJJCF936_0805 CJJCF936_0804   rplS FALSE 0.105 133.000 0.003 1.000   NA
 2734311 2734312 CJJCF936_0804 CJJCF936_0803 rplS trmD TRUE 0.967 11.000 0.567 1.000 Y NA
 2734312 2734313 CJJCF936_0803 CJJCF936_0802 trmD rimM TRUE 0.921 33.000 0.672 1.000 Y NA
 2734313 2734314 CJJCF936_0802 CJJCF936_0801 rimM   TRUE 0.925 -7.000 0.324 1.000   NA
 2734314 2734315 CJJCF936_0801 CJJCF936_0800   rpsP TRUE 0.962 3.000 0.385 1.000   NA
 2734315 2734316 CJJCF936_0800 CJJCF936_0799 rpsP ffh TRUE 0.632 65.000 0.361 1.000 N NA
 2734316 2734317 CJJCF936_0799 CJJCF936_0798 ffh   FALSE 0.221 68.000 0.013 1.000 N NA
 2734317 2734318 CJJCF936_0798 CJJCF936_0797   waaA TRUE 0.882 -19.000 0.133 1.000 N NA
 2734318 2734319 CJJCF936_0797 CJJCF936_0796 waaA   TRUE 0.877 -3.000 0.122 NA   NA
 2734319 2734320 CJJCF936_0796 CJJCF936_0795     TRUE 0.937 10.000 0.342 NA   NA
 2734320 2734321 CJJCF936_0795 CJJCF936_0794   glyQ TRUE 0.804 -13.000 0.041 NA   NA
 2734321 2734322 CJJCF936_0794 CJJCF936_0793 glyQ   TRUE 0.644 12.000 0.011 NA   NA
 2734322 2734323 CJJCF936_0793 CJJCF936_0792   purE TRUE 0.752 10.000 0.019 NA   NA
 2734323 2734324 CJJCF936_0792 CJJCF936_0791 purE   TRUE 0.825 1.000 0.018 1.000 N NA
 2734324 2734325 CJJCF936_0791 CJJCF936_0790     TRUE 0.845 -3.000 0.068 NA   NA
 2734327 2734328 CJJCF936_0788 CJJCF936_0787 flgG   TRUE 0.979 29.000 0.377 0.008 Y NA
 2734328 2734329 CJJCF936_0787 CJJCF936_0786   ftsZ FALSE 0.101 156.000 0.002 1.000 N NA
 2734329 2734330 CJJCF936_0786 CJJCF936_0785 ftsZ ftsA TRUE 0.900 16.000 0.114 1.000 Y NA
 2734330 2734331 CJJCF936_0785 CJJCF936_0784 ftsA   TRUE 0.948 3.000 0.184 1.000   NA
 2734332 2734333 CJJCF936_0783 CJJCF936_0781 mraW   TRUE 0.850 0.000 0.031 NA   NA
 2734335 2734336 CJJCF936_0780 CJJCF936_0779     FALSE 0.122 157.000 0.000 NA   NA
 2734337 2734338 CJJCF936_0778 CJJCF936_0777 ackA pta TRUE 0.906 14.000 0.103 1.000 Y NA
 2734341 2734342 CJJCF936_0774 CJJCF936_0773     FALSE 0.116 327.000 0.000 NA   NA
 2734343 2734344 CJJCF936_0772 CJJCF936_0771 priA   TRUE 0.675 -18.000 0.016 NA N NA
 2734344 2734345 CJJCF936_0771 CJJCF936_0770     TRUE 0.915 -3.000 0.316 NA   NA
 2734345 2734346 CJJCF936_0770 CJJCF936_0769     TRUE 0.948 -10.000 0.714 NA   NA
 2734348 2734349 CJJCF936_0767 CJJCF936_0766     TRUE 0.846 3.000 0.000 NA   NA
 2734349 2734350 CJJCF936_0766 CJJCF936_0765     FALSE 0.373 195.000 0.000 0.090   NA
 2734350 2734351 CJJCF936_0765 CJJCF936_0764     TRUE 0.989 15.000 0.877 0.004   NA
 2734351 2734352 CJJCF936_0764 CJJCF936_0763     TRUE 0.970 -42.000 0.009 0.004 Y NA
 2734352 2734353 CJJCF936_0763 CJJCF936_0762     TRUE 0.723 78.000 0.000 0.004   NA
 2734353 2734354 CJJCF936_0762 CJJCF936_0761     TRUE 0.902 34.000 0.000 0.004   NA
 2734354 2734355 CJJCF936_0761 CJJCF936_0760     TRUE 0.970 10.000 0.000 0.004   NA
 2734355 2734356 CJJCF936_0760 CJJCF936_0759   dcuB FALSE 0.124 160.000 0.022 1.000   NA
 2734356 2734357 CJJCF936_0759 CJJCF936_0758 dcuB rpoN FALSE 0.159 164.000 0.033 1.000   NA
 2734357 2734358 CJJCF936_0758 CJJCF936_0757 rpoN   TRUE 0.880 0.000 0.044 1.000   NA
 2734358 2734359 CJJCF936_0757 CJJCF936_0756     TRUE 0.779 -31.000 0.039 NA   NA
 2734359 2734360 CJJCF936_0756 CJJCF936_0755     TRUE 0.663 -3.000 0.011 NA   NA
 2734361 2734362 CJJCF936_0754 CJJCF936_0753   argG TRUE 0.674 -3.000 0.002 NA   NA
 2734362 2734363 CJJCF936_0753 CJJCF936_0752 argG rplI TRUE 0.615 13.000 0.009 1.000 N NA
 2734363 2734364 CJJCF936_0752 CJJCF936_0751 rplI hslV TRUE 0.860 0.000 0.034 1.000 N NA
 2734364 2734365 CJJCF936_0751 CJJCF936_0750 hslV hslU TRUE 0.970 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 2734365 2734366 CJJCF936_0750 CJJCF936_0749 hslU era TRUE 0.826 -3.000 0.051 1.000   NA
 2734366 2734367 CJJCF936_0749 CJJCF936_0748 era   TRUE 0.691 -10.000 0.015 NA   NA
 2734367 2734368 CJJCF936_0748 CJJCF936_0747     TRUE 0.946 -7.000 0.667 NA   NA
 2734368 2734369 CJJCF936_0747 CJJCF936_0746     FALSE 0.230 129.000 0.062 NA   NA
 2734369 2734370 CJJCF936_0746 CJJCF936_0745     TRUE 0.726 171.000 0.062 0.002   NA
 2734370 2734371 CJJCF936_0745 CJJCF936_0744     TRUE 0.720 200.000 0.062 0.002   NA
 2734371 2734372 CJJCF936_0744 CJJCF936_0743     TRUE 0.864 16.000 0.051 1.000 Y NA
 2734373 2734374 CJJCF936_0742 CJJCF936_0741 pbpC   TRUE 0.892 1.000 0.043 NA   NA
 2734374 2734375 CJJCF936_0741 CJJCF936_0740     TRUE 0.653 -3.000 0.007 NA   NA
 2734375 2734376 CJJCF936_0740 CJJCF936_0739     TRUE 0.797 -3.000 0.041 NA   NA
 2734376 2734377 CJJCF936_0739 CJJCF936_0738     TRUE 0.670 -18.000 0.013 NA   NA
 2734377 2734378 CJJCF936_0738 CJJCF936_0737     TRUE 0.599 20.000 0.023 NA   NA
 2734378 2734379 CJJCF936_0737 CJJCF936_0736   rlpA TRUE 0.802 6.000 0.020 NA   NA
 2734379 2734380 CJJCF936_0736 CJJCF936_0735 rlpA   TRUE 0.922 -40.000 0.115 NA Y NA
 2734380 2734381 CJJCF936_0735 CJJCF936_0734     TRUE 0.835 0.000 0.028 NA N NA
 2734381 2734382 CJJCF936_0734 CJJCF936_0733     TRUE 0.684 -9.000 0.013 NA N NA
 2734382 2734383 CJJCF936_0733 CJJCF936_0732   recN FALSE 0.348 106.000 0.141 1.000 N NA
 2734383 2734384 CJJCF936_0732 CJJCF936_0731 recN   TRUE 0.775 18.000 0.066 1.000 N NA
 2734385 2734386 CJJCF936_0730 CJJCF936_0729 aspS   TRUE 0.740 -3.000 0.025 1.000 N NA
 2734386 2734387 CJJCF936_0729 CJJCF936_0728   ppa TRUE 0.738 10.000 0.015 1.000 N NA
 2734387 2734388 CJJCF936_0728 CJJCF936_0727 ppa msrA FALSE 0.363 42.000 0.006 1.000 N NA
 2734389 2734390 CJJCF936_0726 CJJCF936_0725     TRUE 0.666 -10.000 0.008 NA N NA
 2734390 2734391 CJJCF936_0725 CJJCF936_0724   dprA TRUE 0.866 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 2734391 2734392 CJJCF936_0724 CJJCF936_0723 dprA   TRUE 0.741 -10.000 0.022 1.000   NA
 2734392 2734393 CJJCF936_0723 CJJCF936_0722   ilvC TRUE 0.809 4.000 0.013 1.000   NA
 2734394 2734395 CJJCF936_0721 CJJCF936_0720     TRUE 0.754 -7.000 0.024 1.000 N NA
 2734396 2734397 CJJCF936_0719 CJJCF936_0718     FALSE 0.116 261.000 0.000 NA   NA
 2734397 2734398 CJJCF936_0718 CJJCF936_0717   hypA FALSE 0.115 360.000 0.000 NA   NA
 2734398 2734399 CJJCF936_0717 CJJCF936_0716 hypA hypE TRUE 0.910 0.000 0.080 1.000   NA
 2734399 2734400 CJJCF936_0716 CJJCF936_0715 hypE hypD TRUE 0.844 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 2734400 2734401 CJJCF936_0715 CJJCF936_0714 hypD hypC TRUE 0.931 -16.000 0.123 NA Y NA
 2734401 2734402 CJJCF936_0714 CJJCF936_0713 hypC hypB TRUE 0.976 0.000 0.463 NA Y NA
 2734402 2734403 CJJCF936_0713 CJJCF936_0712 hypB hypF TRUE 0.843 78.000 0.064 0.014 Y NA
 2734403 2734404 CJJCF936_0712 CJJCF936_0711 hypF   TRUE 0.688 -19.000 0.018 NA   NA
 2734404 2734405 CJJCF936_0711 CJJCF936_0710     TRUE 0.725 42.000 0.211 NA   NA
 2734405 2734406 CJJCF936_0710 CJJCF936_0709     TRUE 0.850 -24.000 0.085 NA   NA
 2734406 2734407 CJJCF936_0709 CJJCF936_0708     FALSE 0.189 89.000 0.000 1.000   NA
 2734407 2734408 CJJCF936_0708 CJJCF936_0707   pstB FALSE 0.315 62.000 0.000 1.000   NA
 2734408 2734409 CJJCF936_0707 CJJCF936_0706 pstB   TRUE 0.994 -3.000 0.402 0.003 Y NA
 2734409 2734410 CJJCF936_0706 CJJCF936_0705     TRUE 0.994 -3.000 0.485 0.003 Y NA
 2734410 2734411 CJJCF936_0705 CJJCF936_0704     TRUE 0.936 10.000 0.079 NA Y NA
 2734412 2734413 CJJCF936_0703 CJJCF936_0702 ftn algI FALSE 0.545 43.000 0.047 NA N NA
 2734413 2734414 CJJCF936_0702 CJJCF936_0701 algI   TRUE 0.950 1.000 0.244 NA   NA
 2734414 2734415 CJJCF936_0701 CJJCF936_0700     TRUE 0.916 -13.000 0.280 1.000   NA
 2734416 2734417 CJJCF936_0699 CJJCF936_0698     TRUE 0.983 2.000 0.152 0.089 N NA
 2734417 2734418 CJJCF936_0698 CJJCF936_0697     TRUE 0.983 0.000 0.258 0.089 N NA
 2734418 2734419 CJJCF936_0697 CJJCF936_0696     FALSE 0.464 79.000 0.158 1.000   NA
 2734419 2734420 CJJCF936_0696 CJJCF936_0695     TRUE 0.809 9.000 0.000 1.000   NA
 2734421 2734422 CJJCF936_0694 CJJCF936_0693 dsbD   TRUE 0.898 -3.000 0.185 1.000   NA
 2734422 2734423 CJJCF936_0693 CJJCF936_0691     TRUE 0.663 51.000 0.160 1.000   NA
 2734424 2734425 CJJCF936_0692 CJJCF936_0690     TRUE 0.845 -13.000 0.060 1.000 N NA
 2734425 2734426 CJJCF936_0690 CJJCF936_0689     TRUE 0.909 -3.000 0.250 1.000   NA
 2734426 2734427 CJJCF936_0689 CJJCF936_0688   fbaA FALSE 0.194 95.000 0.027 1.000   NA
 2734427 2734428 CJJCF936_0688 CJJCF936_0687 fbaA   TRUE 0.864 0.000 0.036 1.000 N NA
 2734429 2734430 CJJCF936_0686 CJJCF936_0685 nth   TRUE 0.957 -3.000 0.004 0.003 N NA
 2734430 2734431 CJJCF936_0685 CJJCF936_0684     TRUE 0.789 11.000 0.033 NA   NA
 2734431 2734432 CJJCF936_0684 CJJCF936_0683     FALSE 0.281 58.000 0.017 NA   NA
 2734432 2734433 CJJCF936_0683 CJJCF936_0681     TRUE 0.966 3.000 0.500 NA   NA
 2734434 2734435 CJJCF936_0682 CJJCF936_0680     TRUE 0.910 -10.000 0.051 1.000 Y NA
 2734435 2734436 CJJCF936_0680 CJJCF936_0679   tlyA TRUE 0.749 -34.000 0.029 1.000 N NA
 2734436 2734437 CJJCF936_0679 CJJCF936_0678 tlyA   TRUE 0.654 -3.000 0.005 NA   NA
 2734437 2734438 CJJCF936_0678 CJJCF936_0677   ligA TRUE 0.658 -19.000 0.003 NA   NA
 2734438 2734439 CJJCF936_0677 CJJCF936_0676 ligA folP TRUE 0.796 1.000 0.006 1.000 N NA
 2734439 2734440 CJJCF936_0676 CJJCF936_0675 folP   TRUE 0.912 2.000 0.054 1.000   NA
 2734440 2734441 CJJCF936_0675 CJJCF936_0674     TRUE 0.891 6.000 0.053 NA   NA
 2734441 2734442 CJJCF936_0674 CJJCF936_0673     TRUE 0.900 1.000 0.050 NA   NA
 2734442 2734443 CJJCF936_0673 CJJCF936_0672   nidH TRUE 0.907 3.000 0.051 1.000 N NA
 2734444 2734445 CJJCF936_0671 CJJCF936_0670   tatB FALSE 0.267 58.000 0.011 1.000 N NA
 2734445 2734446 CJJCF936_0670 CJJCF936_0669 tatB tatC TRUE 0.966 -7.000 0.535 NA Y NA
 2734446 2734447 CJJCF936_0669 CJJCF936_0667 tatC queA TRUE 0.798 -7.000 0.036 NA N NA
 2734448 2734449 CJJCF936_0668 CJJCF936_0666 lpxD ilvH TRUE 0.827 -3.000 0.052 1.000 N NA
 2734449 2734450 CJJCF936_0666 CJJCF936_0665 ilvH ilvB TRUE 0.993 -3.000 0.249 0.002 Y NA
 2734450 2734451 CJJCF936_0665 CJJCF936_0664 ilvB   FALSE 0.559 18.000 0.004 1.000   NA
 2734451 2734452 CJJCF936_0664 CJJCF936_0663   ribB TRUE 0.650 12.000 0.004 1.000   NA
 2734453 2734454 CJJCF936_0662 CJJCF936_0661     FALSE 0.498 34.000 0.000 NA   NA
 2734455 2734456 CJJCF936_0660 CJJCF936_0659     TRUE 0.882 -3.000 0.133 NA   NA
 2734456 2734457 CJJCF936_0659 CJJCF936_0658     TRUE 0.802 9.000 0.000 NA   NA
 2734457 2734458 CJJCF936_0658 CJJCF936_0657     TRUE 0.819 6.000 0.000 NA   NA
 2734458 2734459 CJJCF936_0657 CJJCF936_0656     FALSE 0.116 301.000 0.000 NA   NA
 2734459 2734460 CJJCF936_0656 CJJCF936_0655     FALSE 0.237 72.000 0.000 NA   NA
 2734461 2734462 CJJCF936_0654 CJJCF936_0653     TRUE 0.865 -3.000 0.100 NA   NA
 2734462 2734463 CJJCF936_0653 CJJCF936_0652     TRUE 0.756 71.000 0.083 0.038   NA
 2734463 2734464 CJJCF936_0652 CJJCF936_0651     TRUE 0.890 3.000 0.037 1.000   NA
 2734464 2734465 CJJCF936_0651 CJJCF936_0650     TRUE 0.789 -3.000 0.037 NA   NA
 2734465 2734466 CJJCF936_0650 CJJCF936_0649     TRUE 0.754 57.000 0.667 NA   NA
 2734466 2734467 CJJCF936_0649 CJJCF936_0648     FALSE 0.152 107.000 0.000 NA   NA
 2734467 2734468 CJJCF936_0648 CJJCF936_0647     TRUE 0.725 -3.000 0.000 NA   NA
 2734468 2734469 CJJCF936_0647 CJJCF936_0646     FALSE 0.287 64.000 0.000 NA   NA
 2734469 2734470 CJJCF936_0646 CJJCF936_0645     TRUE 0.725 -3.000 0.000 NA   NA
 2734470 2734471 CJJCF936_0645 CJJCF936_0644     FALSE 0.146 112.000 0.000 NA   NA
 2734471 2734472 CJJCF936_0644 CJJCF936_0643     TRUE 0.756 -3.000 0.028 NA   NA
 2734472 2734473 CJJCF936_0643 CJJCF936_0642     TRUE 0.840 0.000 0.028 NA   NA
 2734473 2734474 CJJCF936_0642 CJJCF936_0641     TRUE 0.925 -3.000 0.400 NA   NA
 2734474 2734475 CJJCF936_0641 CJJCF936_0639     TRUE 0.592 72.000 0.400 NA   NA
 2734478 2734479 CJJCF936_0638 CJJCF936_0636     TRUE 0.943 -6.000 0.600 NA   NA
 2734479 2734480 CJJCF936_0636 CJJCF936_0635     TRUE 0.898 -7.000 0.158 NA   NA
 2734481 2734482 CJJCF936_1534 CJJCF936_1533     TRUE 0.729 -13.000 0.000 NA N NA
 2734482 2734483 CJJCF936_1533 CJJCF936_1532     TRUE 0.940 12.000 0.000 0.017   NA
 2734483 2734484 CJJCF936_1532 CJJCF936_1531     TRUE 0.949 -7.000 0.000 0.017   NA
 2734484 2734485 CJJCF936_1531 CJJCF936_1530     TRUE 0.922 4.000 0.000 1.000 Y NA
 2734485 2734486 CJJCF936_1530 CJJCF936_1529     FALSE 0.116 192.000 0.000 NA N NA
 2734486 2734487 CJJCF936_1529 CJJCF936_1528     FALSE 0.498 34.000 0.000 NA   NA
 2734487 2734488 CJJCF936_1528 CJJCF936_1527     TRUE 0.783 10.000 0.000 1.000   NA
 2734488 2734489 CJJCF936_1527 CJJCF936_1526     TRUE 0.851 3.000 0.000 1.000   NA
 2734489 2734490 CJJCF936_1526 CJJCF936_1525     TRUE 0.824 0.000 0.000 1.000   NA
 2734490 2734491 CJJCF936_1525 CJJCF936_1524     TRUE 0.838 4.000 0.000 NA   NA
 2734491 2734492 CJJCF936_1524 CJJCF936_1523     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 2734492 2734493 CJJCF936_1523 CJJCF936_1522     TRUE 0.956 24.000 0.000 0.004 Y NA
 2734493 2734494 CJJCF936_1522 CJJCF936_1521     TRUE 0.767 19.000 0.074 NA   NA
 2734494 2734495 CJJCF936_1521 CJJCF936_1520     TRUE 0.717 20.000 0.050 NA   NA
 2734495 2734496 CJJCF936_1520 CJJCF936_1519   gmhA TRUE 0.896 -12.000 0.148 1.000   NA
 2734496 2734497 CJJCF936_1519 CJJCF936_1518 gmhA   TRUE 0.897 -12.000 0.154 1.000 N NA
 2734497 2734498 CJJCF936_1518 CJJCF936_1517     FALSE 0.381 51.000 0.000 NA   NA
 2734498 2734499 CJJCF936_1517 CJJCF936_1516     FALSE 0.267 67.000 0.000 NA   NA
 2734499 2734500 CJJCF936_1516 CJJCF936_1515     TRUE 0.919 53.000 0.263 0.009 N NA
 2734500 2734501 CJJCF936_1515 CJJCF936_1514     TRUE 0.877 15.000 0.261 1.000 N NA
 2734501 2734502 CJJCF936_1514 CJJCF936_1513     TRUE 0.947 -9.000 0.667 1.000   NA
 2734502 2734503 CJJCF936_1513 CJJCF936_1512     TRUE 0.973 2.000 0.679 1.000   NA
 2734503 2734504 CJJCF936_1512 CJJCF936_1511     TRUE 0.808 -10.000 0.039 1.000 N NA
 2734504 2734505 CJJCF936_1511 CJJCF936_1510     TRUE 0.797 -3.000 0.039 1.000 N NA
 2734505 2734506 CJJCF936_1510 CJJCF936_1509   kpsS TRUE 0.988 -3.000 0.056 0.002 Y NA
 2734506 2734507 CJJCF936_1509 CJJCF936_1508 kpsS   FALSE 0.329 73.000 0.046 NA   NA
 2734507 2734508 CJJCF936_1508 CJJCF936_1507     TRUE 0.881 -3.000 0.132 NA   NA
 2734508 2734509 CJJCF936_1507 CJJCF936_1506     TRUE 0.940 -3.000 0.600 1.000   NA
 2734510 2734511 CJJCF936_1505 CJJCF936_1504 acpS fliL TRUE 0.882 0.000 0.047 1.000 N NA
 2734512 2734513 CJJCF936_1503 CJJCF936_1502 algC   FALSE 0.324 48.000 0.007 NA   NA
 2734514 2734515 CJJCF936_1501 CJJCF936_1500   nadD TRUE 0.799 28.000 0.221 NA   NA
 2734516 2734517 CJJCF936_1499 CJJCF936_1498 gapA pgk TRUE 0.987 3.000 0.020 0.006 Y NA
 2734517 2734518 CJJCF936_1498 CJJCF936_1497 pgk tpiA TRUE 0.854 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 2734518 2734519 CJJCF936_1497 CJJCF936_1496 tpiA fabI TRUE 0.980 4.000 0.071 0.037 N NA
 2734519 2734520 CJJCF936_1496 CJJCF936_1494 fabI   TRUE 0.924 4.000 0.088 1.000 N NA
 2734521 2734522 CJJCF936_1495 CJJCF936_1493     TRUE 0.975 0.000 0.019 0.004   NA
 2734522 2734523 CJJCF936_1493 CJJCF936_1492     TRUE 0.734 -3.000 0.000 1.000   NA
 2734523 2734524 CJJCF936_1492 CJJCF936_1491     FALSE 0.376 82.000 0.094 1.000   NA
 2734524 2734525 CJJCF936_1491 CJJCF936_1490     TRUE 0.971 -12.000 0.000 0.002   NA
 2734525 2734526 CJJCF936_1490 CJJCF936_1489     TRUE 0.981 7.000 0.000 0.002   NA
 2734526 2734527 CJJCF936_1489 CJJCF936_1488   purB-2 TRUE 0.809 9.000 0.000 1.000   NA
 2734527 2734528 CJJCF936_1488 CJJCF936_1487 purB-2 metC FALSE 0.201 70.000 0.004 1.000 N NA
 2734528 2734529 CJJCF936_1487 CJJCF936_1486 metC   TRUE 0.719 -21.000 0.000 NA   NA
 2734529 2734530 CJJCF936_1486 CJJCF936_1485     TRUE 0.682 13.000 0.000 NA   NA
 2734530 2734531 CJJCF936_1485 CJJCF936_1484     TRUE 0.962 -34.000 0.000 0.003   NA
 2734531 2734532 CJJCF936_1484 CJJCF936_1483     TRUE 0.838 57.000 0.000 0.003   NA
 2734532 2734533 CJJCF936_1483 CJJCF936_1482     TRUE 0.949 4.000 0.238 NA   NA
 2734535 2734536 CJJCF936_1480 CJJCF936_1479   katA FALSE 0.537 57.000 0.091 NA   NA
 2734537 2734538 CJJCF936_1478 CJJCF936_1477     TRUE 0.928 3.000 0.094 NA   NA
 2734538 2734539 CJJCF936_1477 CJJCF936_1476   fldA TRUE 0.953 0.000 0.391 NA   NA
 2734540 2734541 CJJCF936_1475 CJJCF936_1474     FALSE 0.437 42.000 0.000 NA   NA
 2734541 2734542 CJJCF936_1474 CJJCF936_1473     TRUE 0.819 6.000 0.000 NA   NA
 2734542 2734543 CJJCF936_1473 CJJCF936_1472   selB FALSE 0.455 49.000 0.031 1.000 N NA
 2734543 2734544 CJJCF936_1472 CJJCF936_1471 selB selA TRUE 0.993 -3.000 0.569 0.001 N NA
 2734546 2734547 CJJCF936_1470 CJJCF936_1468     TRUE 0.653 -3.000 0.007 NA   NA
 2734549 2734550 CJJCF936_1466 CJJCF936_1465     TRUE 0.943 0.000 0.263 NA   NA
 2734550 2734551 CJJCF936_1465 CJJCF936_1464     TRUE 0.956 10.000 0.684 NA N NA
 2734551 2734552 CJJCF936_1464 CJJCF936_1463     FALSE 0.377 45.000 0.016 1.000   NA
 2734552 2734553 CJJCF936_1463 CJJCF936_1462     TRUE 0.775 14.000 0.048 1.000   NA
 2734553 2734554 CJJCF936_1462 CJJCF936_1461     TRUE 0.867 10.000 0.053 1.000   NA
 2734555 2734556 CJJCF936_1460 CJJCF936_1459   glmS TRUE 0.952 5.000 0.312 1.000   NA
 2734556 2734557 CJJCF936_1459 CJJCF936_1458 glmS   TRUE 0.896 3.000 0.042 1.000   NA
 2734557 2734558 CJJCF936_1458 CJJCF936_1457   fumC FALSE 0.292 56.000 0.003 1.000   NA
 2734559 2734560 CJJCF936_1456 CJJCF936_1455   ruvB TRUE 0.822 4.000 0.019 NA   NA
 2734561 2734562 CJJCF936_1454 CJJCF936_1453   ssrA TRUE 0.841 1.000 0.000 NA   NA
 2734564 2734565 CJJCF936_1451 CJJCF936_1450 nrfH nrfA TRUE 0.971 15.000 0.043 0.001 N NA
 2734565 2734566 CJJCF936_1450 CJJCF936_1449 nrfA   FALSE 0.391 136.000 0.375 NA   NA
 2734566 2734567 CJJCF936_1449 CJJCF936_1448     FALSE 0.287 64.000 0.000 NA   NA
 2734568 2734569 CJJCF936_1447 CJJCF936_1446   ceuD TRUE 0.889 13.000 0.055 1.000 Y NA
 2734569 2734570 CJJCF936_1446 CJJCF936_1445 ceuD ceuC TRUE 0.972 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 2734570 2734571 CJJCF936_1445 CJJCF936_1444 ceuC ceuB TRUE 0.993 -7.000 0.870 0.040 Y NA
 2734571 2734572 CJJCF936_1444 CJJCF936_1443 ceuB pldA FALSE 0.484 86.000 0.019 0.086 N NA
 2734572 2734573 CJJCF936_1443 CJJCF936_1442 pldA   TRUE 0.681 -3.000 0.014 1.000 N NA
 2734574 2734575 CJJCF936_1441 CJJCF936_1440     TRUE 0.862 2.000 0.028 NA   NA
 2734575 2734576 CJJCF936_1440 CJJCF936_1439   cdsA TRUE 0.742 9.000 0.007 NA   NA
 2734576 2734577 CJJCF936_1439 CJJCF936_1438 cdsA dxr TRUE 0.956 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 2734577 2734578 CJJCF936_1438 CJJCF936_1437 dxr   TRUE 0.804 2.000 0.006 1.000   NA
 2734578 2734579 CJJCF936_1437 CJJCF936_1436     TRUE 0.907 3.000 0.053 NA   NA
 2734579 2734580 CJJCF936_1436 CJJCF936_1435   gcp TRUE 0.654 -3.000 0.008 NA   NA
 2734580 2734581 CJJCF936_1435 CJJCF936_1434 gcp ctsG TRUE 0.800 1.000 0.005 1.000   NA
 2734581 2734582 CJJCF936_1434 CJJCF936_1433 ctsG   TRUE 0.963 0.000 0.600 NA   NA
 2734582 2734583 CJJCF936_1433 CJJCF936_1432     TRUE 0.942 -3.000 0.667 NA   NA
 2734583 2734584 CJJCF936_1432 CJJCF936_1431   maf-6 TRUE 0.775 10.000 0.000 NA   NA
 2734584 2734585 CJJCF936_1431 CJJCF936_1430 maf-6 maf-5 TRUE 0.993 -3.000 0.667 0.001   NA
 2734585 2734586 CJJCF936_1430 CJJCF936_1429 maf-5 flaA FALSE 0.554 97.000 0.667 1.000   NA
 2734586 2734587 CJJCF936_1429 CJJCF936_1428 flaA flaB TRUE 0.939 146.000 1.000 0.002 Y NA
 2734588 2734589 CJJCF936_1427 CJJCF936_1426 maf-4   TRUE 0.715 -24.000 0.000 NA   NA
 2734589 2734590 CJJCF936_1426 CJJCF936_1425     TRUE 0.727 -16.000 0.000 NA   NA
 2734590 2734591 CJJCF936_1425 CJJCF936_1424   maf-2 TRUE 0.682 13.000 0.000 NA   NA
 2734591 2734592 CJJCF936_1424 CJJCF936_1423 maf-2 maf-1 TRUE 0.715 -24.000 0.000 NA   NA
 2734592 2734593 CJJCF936_1423 CJJCF936_1422 maf-1 ptmA TRUE 0.725 -3.000 0.000 NA   NA
 2734593 2734594 CJJCF936_1422 CJJCF936_1421 ptmA ptmB TRUE 0.927 0.000 0.131 1.000 N NA
 2734594 2734595 CJJCF936_1421 CJJCF936_1420 ptmB   TRUE 0.897 -7.000 0.144 1.000   NA
 2734595 2734596 CJJCF936_1420 CJJCF936_1419     TRUE 0.863 -3.000 0.088 1.000   NA
 2734596 2734597 CJJCF936_1419 CJJCF936_1418   neuC TRUE 0.956 9.000 0.131 1.000 Y NA
 2734597 2734598 CJJCF936_1418 CJJCF936_1417 neuC ptmC TRUE 0.967 -7.000 0.549 1.000 Y NA
 2734598 2734599 CJJCF936_1417 CJJCF936_1416 ptmC   FALSE 0.451 40.000 0.000 NA   NA
 2734599 2734600 CJJCF936_1416 CJJCF936_1415     FALSE 0.463 39.000 0.000 NA   NA
 2734600 2734601 CJJCF936_1415 CJJCF936_1414     TRUE 0.623 18.000 0.000 NA   NA
 2734601 2734602 CJJCF936_1414 CJJCF936_1413     FALSE 0.140 117.000 0.000 NA   NA
 2734602 2734603 CJJCF936_1413 CJJCF936_1412     FALSE 0.553 26.000 0.000 NA   NA
 2734603 2734604 CJJCF936_1412 CJJCF936_1411     FALSE 0.133 134.000 0.000 1.000   NA
 2734604 2734605 CJJCF936_1411 CJJCF936_1410     FALSE 0.188 90.000 0.000 1.000   NA
 2734605 2734606 CJJCF936_1410 CJJCF936_1409     FALSE 0.509 112.000 0.000 0.027   NA
 2734606 2734607 CJJCF936_1409 CJJCF936_1408     TRUE 0.963 -7.000 0.418 1.000 Y NA
 2734607 2734608 CJJCF936_1408 CJJCF936_1407     TRUE 0.715 -24.000 0.000 NA   NA
 2734608 2734609 CJJCF936_1407 CJJCF936_1406     TRUE 0.727 -16.000 0.000 NA   NA
 2734609 2734610 CJJCF936_1406 CJJCF936_1405   neuB TRUE 0.725 -3.000 0.000 NA   NA
 2734611 2734612 CJJCF936_1404 CJJCF936_1403   hisH-1 TRUE 0.939 -3.000 0.625 NA N NA
 2734612 2734613 CJJCF936_1403 CJJCF936_1401 hisH-1 hisF-1 TRUE 0.984 1.000 0.011 0.007 Y NA
 2734614 2734615 CJJCF936_1402 CJJCF936_1400     TRUE 0.881 -3.000 0.137 NA N NA
 2734615 2734616 CJJCF936_1400 CJJCF936_1399   neuA TRUE 0.957 -10.000 0.355 NA Y NA
 2734617 2734618 CJJCF936_1398 CJJCF936_1396     TRUE 0.868 22.000 0.400 NA   NA
 2734619 2734620 CJJCF936_1397 CJJCF936_1395     FALSE 0.539 40.000 0.037 NA   NA
 2734621 2734622 CJJCF936_1394 CJJCF936_1393     TRUE 0.682 13.000 0.000 NA   NA
 2734622 2734623 CJJCF936_1393 CJJCF936_1392     TRUE 0.742 -7.000 0.000 NA   NA
 2734624 2734625 CJJCF936_1391 CJJCF936_1390     TRUE 0.938 0.000 0.188 1.000   NA
 2734625 2734626 CJJCF936_1390 CJJCF936_1389     TRUE 0.911 -10.000 0.250 NA N NA
 2734626 2734627 CJJCF936_1389 CJJCF936_1388     TRUE 0.655 -3.000 0.005 NA   NA
 2734627 2734628 CJJCF936_1388 CJJCF936_1387     TRUE 0.672 -7.000 0.007 NA   NA
 2734628 2734629 CJJCF936_1387 CJJCF936_1386     TRUE 0.667 -3.000 0.012 NA   NA
 2734629 2734630 CJJCF936_1386 CJJCF936_1385     TRUE 0.859 31.000 0.600 NA   NA
 2734630 2734631 CJJCF936_1385 CJJCF936_1384     TRUE 0.946 21.000 0.000 0.002   NA
 2734631 2734632 CJJCF936_1384 CJJCF936_1383     TRUE 0.969 -3.000 0.000 0.002   NA
 2734632 2734633 CJJCF936_1383 CJJCF936_1382     TRUE 0.725 -3.000 0.000 NA   NA
 2734633 2734634 CJJCF936_1382 CJJCF936_1381     TRUE 0.690 -7.000 0.013 NA   NA
 2734634 2734635 CJJCF936_1381 CJJCF936_1380   flmA TRUE 0.973 2.000 0.678 1.000   NA
 2734635 2734636 CJJCF936_1380 CJJCF936_1379 flmA   FALSE 0.350 49.000 0.014 1.000   NA
 2734637 2734638 CJJCF936_1378 CJJCF936_1377 accB accC-2 TRUE 0.994 2.000 0.071 0.003 Y NA
 2734640 2734641 CJJCF936_1375 CJJCF936_1374 gltX-2   TRUE 0.843 2.000 0.021 1.000 N NA
 2734641 2734642 CJJCF936_1374 CJJCF936_1373   upp TRUE 0.662 -3.000 0.008 1.000 N NA
 2734642 2734643 CJJCF936_1373 CJJCF936_1371 upp   TRUE 0.764 6.000 0.005 NA   NA
 2734644 2734645 CJJCF936_1372 CJJCF936_1370     TRUE 0.994 11.000 0.647 0.005 Y NA
 2734647 2734648 CJJCF936_1368 CJJCF936_1367     FALSE 0.357 54.000 0.000 NA   NA
 2734649 2734650 CJJCF936_1366 CJJCF936_1365     TRUE 0.785 -7.000 0.031 NA   NA
 2734650 2734651 CJJCF936_1365 CJJCF936_1364   trmB TRUE 0.896 0.000 0.060 NA   NA
 2734651 2734652 CJJCF936_1364 CJJCF936_1363 trmB lolD FALSE 0.353 70.000 0.044 1.000   NA
 2734652 2734653 CJJCF936_1363 CJJCF936_1362 lolD   TRUE 0.962 -13.000 0.431 1.000 Y NA
 2734653 2734654 CJJCF936_1362 CJJCF936_1361     TRUE 0.824 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 2734654 2734655 CJJCF936_1361 CJJCF936_1360   pyrH FALSE 0.323 52.000 0.002 1.000 N NA
 2734655 2734656 CJJCF936_1360 CJJCF936_1359 pyrH rpoZ TRUE 0.677 11.000 0.004 1.000 N NA
 2734656 2734657 CJJCF936_1359 CJJCF936_1358 rpoZ   TRUE 0.844 -16.000 0.018 1.000 Y NA
 2734657 2734658 CJJCF936_1358 CJJCF936_1357   tyrS TRUE 0.798 12.000 0.045 1.000 N NA
 2734658 2734659 CJJCF936_1357 CJJCF936_1356 tyrS   TRUE 0.809 -3.000 0.043 1.000   NA
 2734661 2734662 CJJCF936_0986 CJJCF936_0985     TRUE 0.896 -3.000 0.192 NA   NA
 2734662 2734663 CJJCF936_0985 CJJCF936_0984     TRUE 0.915 4.000 0.069 NA   NA
 2734663 2734664 CJJCF936_0984 CJJCF936_0983     FALSE 0.256 86.000 0.042 NA   NA
 2734665 2734666 CJJCF936_0982 CJJCF936_0981     FALSE 0.197 80.000 0.021 NA   NA
 2734666 2734667 CJJCF936_0981 CJJCF936_0980   alr TRUE 0.832 1.000 0.021 NA   NA
 2734667 2734668 CJJCF936_0980 CJJCF936_0979 alr   TRUE 0.803 3.000 0.005 1.000 N NA
 2734668 2734669 CJJCF936_0979 CJJCF936_0978     FALSE 0.123 104.000 0.009 1.000 N NA
 2734670 2734671 CJJCF936_0977 CJJCF936_0976     TRUE 0.931 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 2734672 2734673 CJJCF936_0975 CJJCF936_0974   thiJ TRUE 0.686 -7.000 0.012 NA   NA
 2734675 2734676 CJJCF936_0972 CJJCF936_0971 pheS pheT TRUE 0.996 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 2734676 2734677 CJJCF936_0971 CJJCF936_0970 pheT aroA TRUE 0.758 -3.000 0.028 1.000 N NA
 2734677 2734678 CJJCF936_0970 CJJCF936_0969 aroA ispH TRUE 0.788 -10.000 0.032 1.000 N NA
 2734678 2734679 CJJCF936_0969 CJJCF936_0968 ispH rpsA FALSE 0.287 132.000 0.118 1.000 N NA
 2734679 2734680 CJJCF936_0968 CJJCF936_0967 rpsA   TRUE 0.951 0.000 0.343 NA   NA
 2734680 2734681 CJJCF936_0967 CJJCF936_0966   serA TRUE 0.735 -3.000 0.025 NA   NA
 2734681 2734682 CJJCF936_0966 CJJCF936_0965 serA   TRUE 0.675 -10.000 0.006 1.000 N NA
 2734682 2734683 CJJCF936_0965 CJJCF936_0964     TRUE 0.951 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 2734683 2734684 CJJCF936_0964 CJJCF936_0963     TRUE 0.947 4.000 0.007 0.095   NA
 2734685 2734686 CJJCF936_0962 CJJCF936_0961     TRUE 0.737 11.000 0.000 NA   NA
 2734687 2734688 CJJCF936_0960 CJJCF936_0959     FALSE 0.347 110.000 0.145 1.000   NA
 2734690 2734691 CJJCF936_0957 CJJCF936_0956   flhA TRUE 0.830 -13.000 0.053 NA N NA
 2734691 2734692 CJJCF936_0956 CJJCF936_0955 flhA   TRUE 0.914 9.000 0.106 1.000   NA
 2734692 2734693 CJJCF936_0955 CJJCF936_0954     TRUE 0.890 -16.000 0.154 NA   NA
 2734693 2734694 CJJCF936_0954 CJJCF936_0952     TRUE 0.913 -3.000 0.294 NA   NA
 2734696 2734697 CJJCF936_0951 CJJCF936_0950     TRUE 0.705 -49.000 0.000 NA   NA
 2734697 2734698 CJJCF936_0950 CJJCF936_0949     TRUE 0.715 -24.000 0.000 NA   NA
 2734699 2734700 CJJCF936_0948 CJJCF936_0947     FALSE 0.191 84.000 0.000 NA   NA
 2734700 2734701 CJJCF936_0947 CJJCF936_0946     FALSE 0.169 95.000 0.000 NA   NA
 2734701 2734702 CJJCF936_0946 CJJCF936_0945     FALSE 0.115 472.000 0.000 NA   NA
 2734702 2734703 CJJCF936_0945 CJJCF936_0944     FALSE 0.402 48.000 0.000 NA   NA
 2734703 2734704 CJJCF936_0944 CJJCF936_0943     TRUE 0.732 36.000 0.143 NA   NA
 2734704 2734705 CJJCF936_0943 CJJCF936_0942     TRUE 0.911 12.000 0.333 NA   NA
 2734706 2734707 CJJCF936_0941 CJJCF936_0940   pabB TRUE 0.680 -10.000 0.009 1.000 N NA
 2734707 2734708 CJJCF936_0940 CJJCF936_0939 pabB   TRUE 0.989 -3.000 0.048 0.001 Y NA
 2734708 2734709 CJJCF936_0939 CJJCF936_0938     FALSE 0.126 127.000 0.021 NA   NA
 2734709 2734710 CJJCF936_0938 CJJCF936_0937   murA FALSE 0.213 66.000 0.004 NA   NA
 2734710 2734711 CJJCF936_0937 CJJCF936_0936 murA   TRUE 0.736 -3.000 0.024 1.000 N NA
 2734712 2734713 CJJCF936_0935 CJJCF936_0934 lepB folD TRUE 0.902 10.000 0.117 1.000 N NA
 2734714 2734715 CJJCF936_0933 CJJCF936_0932   hemL TRUE 0.903 -3.000 0.212 1.000   NA
 2734715 2734716 CJJCF936_0932 CJJCF936_0931 hemL   TRUE 0.932 -3.000 0.462 1.000   NA
 2734716 2734717 CJJCF936_0931 CJJCF936_0930     TRUE 0.944 0.000 0.269 NA   NA
 2734717 2734718 CJJCF936_0930 CJJCF936_0929     TRUE 0.951 5.000 0.318 NA   NA
 2734718 2734719 CJJCF936_0929 CJJCF936_0928     TRUE 0.873 -7.000 0.091 1.000   NA
 2734719 2734720 CJJCF936_0928 CJJCF936_0926     TRUE 0.734 -3.000 0.000 1.000   NA
 2734721 2734722 CJJCF936_0927 CJJCF936_0925 psd   TRUE 0.764 -3.000 0.028 1.000   NA
 2734723 2734724 CJJCF936_0924 CJJCF936_0923 gltX-1   TRUE 0.929 3.000 0.088 1.000   NA
 2734724 2734725 CJJCF936_0923 CJJCF936_0922     TRUE 0.853 -3.000 0.080 NA   NA
 2734725 2734726 CJJCF936_0922 CJJCF936_0921   mobB FALSE 0.113 478.000 0.000 NA N NA
 2734726 2734727 CJJCF936_0921 CJJCF936_0920 mobB fbp TRUE 0.803 2.000 0.005 1.000 N NA
 2734727 2734728 CJJCF936_0920 CJJCF936_0919 fbp   TRUE 0.950 -7.000 0.778 NA   NA
 2734728 2734729 CJJCF936_0919 CJJCF936_0918   metS TRUE 0.779 10.000 0.024 NA   NA
 2734729 2734730 CJJCF936_0918 CJJCF936_0916 metS   TRUE 0.898 4.000 0.046 1.000   NA
 2734732 2734733 CJJCF936_0915 CJJCF936_0914 acnB   FALSE 0.143 92.000 0.010 1.000   NA
 2734733 2734734 CJJCF936_0914 CJJCF936_0913     TRUE 0.701 -3.000 0.018 1.000   NA
 2734734 2734735 CJJCF936_0913 CJJCF936_0912     TRUE 0.819 -3.000 0.047 1.000   NA
 2734735 2734736 CJJCF936_0912 CJJCF936_0910   trmA TRUE 0.833 -3.000 0.056 1.000 N NA
 2734738 2734739 CJJCF936_0909 CJJCF936_0907   ilvA FALSE 0.315 68.000 0.030 1.000   NA
 2734740 2734741 CJJCF936_0908 CJJCF936_0906 truA   TRUE 0.839 -3.000 0.059 1.000   NA
 2734741 2734742 CJJCF936_0906 CJJCF936_0905     TRUE 0.872 0.000 0.039 1.000   NA
 2734742 2734743 CJJCF936_0905 CJJCF936_0904   uppS TRUE 0.693 -3.000 0.017 1.000 N NA
 2734743 2734744 CJJCF936_0904 CJJCF936_0903 uppS   TRUE 0.796 4.000 0.012 NA   NA
 2734744 2734745 CJJCF936_0903 CJJCF936_0902   coaBC TRUE 0.731 -3.000 0.024 NA   NA
 2734745 2734746 CJJCF936_0902 CJJCF936_0901 coaBC glmU TRUE 0.690 -3.000 0.016 1.000 N NA
 2734748 2734749 CJJCF936_0900 CJJCF936_0898     TRUE 0.906 26.000 1.000 NA   NA
 2734749 2734750 CJJCF936_0898 CJJCF936_0897     FALSE 0.366 93.000 0.125 NA   NA
 2734750 2734751 CJJCF936_0897 CJJCF936_0896     FALSE 0.356 95.000 0.125 NA   NA
 2734751 2734752 CJJCF936_0896 CJJCF936_0895     TRUE 0.641 16.000 0.000 NA   NA
 2734752 2734753 CJJCF936_0895 CJJCF936_0894   kdsB FALSE 0.138 120.000 0.000 NA   NA
 2734753 2734754 CJJCF936_0894 CJJCF936_0893 kdsB thrC TRUE 0.693 -3.000 0.017 1.000 N NA
 2734754 2734755 CJJCF936_0893 CJJCF936_0892 thrC lpxK TRUE 0.665 -3.000 0.009 1.000 N NA
 2734755 2734756 CJJCF936_0892 CJJCF936_0891 lpxK nadE TRUE 0.845 4.000 0.024 1.000 N NA
 2734757 2734758 CJJCF936_0890 CJJCF936_0889     TRUE 0.769 12.000 0.035 NA   NA
 2734759 2734760 CJJCF936_0888 CJJCF936_0887   dapA TRUE 0.942 0.000 0.238 1.000 N NA
 2734760 2734761 CJJCF936_0887 CJJCF936_0886 dapA   TRUE 0.910 -7.000 0.217 1.000   NA
 2734761 2734762 CJJCF936_0886 CJJCF936_0885   pyrD TRUE 0.822 -3.000 0.048 1.000   NA
 2734762 2734763 CJJCF936_0885 CJJCF936_0884 pyrD   FALSE 0.471 32.000 0.017 1.000 N NA
 2734763 2734764 CJJCF936_0884 CJJCF936_0883   cysS TRUE 0.912 -7.000 0.013 0.093 N NA
 2734764 2734765 CJJCF936_0883 CJJCF936_0882 cysS mviN TRUE 0.839 0.000 0.027 1.000   NA
 2734766 2734767 CJJCF936_0881 CJJCF936_0880   ruvA TRUE 0.658 -24.000 0.004 1.000   NA
 2734767 2734768 CJJCF936_0880 CJJCF936_0879 ruvA ddlA TRUE 0.926 10.000 0.014 0.093 N NA
 2734768 2734769 CJJCF936_0879 CJJCF936_0878 ddlA   FALSE 0.279 60.000 0.018 NA   NA
 2734769 2734770 CJJCF936_0878 CJJCF936_0877     TRUE 0.906 2.000 0.052 NA   NA
 2734770 2734771 CJJCF936_0877 CJJCF936_0876     TRUE 0.936 1.000 0.129 NA   NA
 2734772 2734773 CJJCF936_0875 CJJCF936_0874     FALSE 0.386 132.000 0.333 NA   NA
 2734773 2734774 CJJCF936_0874 CJJCF936_0873     TRUE 0.958 4.000 0.333 1.000   NA
 2734776 2734777 CJJCF936_0872 CJJCF936_0870 purU   TRUE 0.844 -3.000 0.064 1.000 N NA
 2734777 2734778 CJJCF936_0870 CJJCF936_0869     TRUE 0.687 56.000 0.325 NA   NA
 2734778 2734779 CJJCF936_0869 CJJCF936_0868     TRUE 0.882 -3.000 0.133 NA   NA
 2734779 2734780 CJJCF936_0868 CJJCF936_0867     FALSE 0.564 82.000 0.500 NA   NA
 2734780 2734781 CJJCF936_0867 CJJCF936_0866   napD TRUE 0.845 13.000 0.111 NA   NA
 2734781 2734782 CJJCF936_0866 CJJCF936_0865 napD napL TRUE 0.892 -7.000 0.139 NA   NA
 2734782 2734783 CJJCF936_0865 CJJCF936_0864 napL napB TRUE 0.930 5.000 0.132 NA   NA
 2734783 2734784 CJJCF936_0864 CJJCF936_0863 napB   TRUE 0.996 0.000 0.385 0.003 Y NA
 2734784 2734785 CJJCF936_0863 CJJCF936_0862   napG TRUE 0.995 0.000 0.795 0.003   NA
 2734785 2734786 CJJCF936_0862 CJJCF936_0861 napG napA TRUE 0.979 18.000 0.270 0.003   NA
 2734786 2734787 CJJCF936_0861 CJJCF936_0860 napA tpx FALSE 0.119 247.000 0.000 1.000 N NA
 2734787 2734788 CJJCF936_0860 CJJCF936_0859 tpx   FALSE 0.122 99.000 0.004 NA   NA
 2734788 2734789 CJJCF936_0859 CJJCF936_0858     FALSE 0.396 39.000 0.012 NA   NA
 2734790 2734791 CJJCF936_0857 CJJCF936_0856   valS FALSE 0.492 23.000 0.005 NA   NA
 2734791 2734792 CJJCF936_0856 CJJCF936_0855 valS   TRUE 0.942 5.000 0.007 0.093 N NA
 2734792 2734793 CJJCF936_0855 CJJCF936_0854     TRUE 0.963 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 2734793 2734794 CJJCF936_0854 CJJCF936_0853     FALSE 0.431 190.000 0.154 NA Y NA
 2734794 2734795 CJJCF936_0853 CJJCF936_0852     TRUE 0.888 49.000 0.800 NA Y NA
 2734795 2734796 CJJCF936_0852 CJJCF936_0851     TRUE 0.979 10.000 1.000 NA Y NA
 2734796 2734797 CJJCF936_0851 CJJCF936_0850     FALSE 0.216 84.000 0.028 NA N NA
 2734797 2734798 CJJCF936_0850 CJJCF936_0849     TRUE 0.895 -3.000 0.191 NA N NA
 2734798 2734799 CJJCF936_0849 CJJCF936_0848   coaD TRUE 0.696 40.000 0.032 1.000 Y NA
 2734799 2734800 CJJCF936_0848 CJJCF936_0847 coaD tmk TRUE 0.798 -9.000 0.034 1.000 N NA
 2734800 2734801 CJJCF936_0847 CJJCF936_0846 tmk hisS TRUE 0.911 -3.000 0.018 0.093 N NA
 2734801 2734802 CJJCF936_0846 CJJCF936_0845 hisS speA TRUE 0.812 0.000 0.021 1.000 N NA
 2734802 2734803 CJJCF936_0845 CJJCF936_0844 speA cysE TRUE 0.952 1.000 0.055 1.000 Y NA
 2734803 2734804 CJJCF936_0844 CJJCF936_0843 cysE aspC FALSE 0.397 172.000 0.102 1.000 Y NA
 2734805 2734806 CJJCF936_0842 CJJCF936_0841     FALSE 0.347 70.000 0.045 NA   NA
 2734806 2734807 CJJCF936_0841 CJJCF936_0840   dnaK FALSE 0.116 260.000 0.000 NA   NA
 2734807 2734808 CJJCF936_0840 CJJCF936_0839 dnaK grpE TRUE 0.955 22.000 0.029 0.008 Y NA
 2734808 2734809 CJJCF936_0839 CJJCF936_0838 grpE hrcA TRUE 0.789 -3.000 0.038 NA N NA
 2734809 2734810 CJJCF936_0838 CJJCF936_0837 hrcA cfrA FALSE 0.114 303.000 0.000 NA N NA
 2734812 2734813 CJJCF936_0835 CJJCF936_0834     TRUE 0.967 5.000 0.667 NA   NA
 2734813 2734814 CJJCF936_0834 CJJCF936_0833     FALSE 0.116 238.000 0.000 NA   NA
 2734814 2734815 CJJCF936_0833 CJJCF936_0832   rrfD FALSE 0.115 1242.000 0.000 NA   NA
 2734816 2734817 CJJCF936_1302 CJJCF936_1301   ribE TRUE 0.746 9.000 0.004 NA   NA
 2734817 2734818 CJJCF936_1301 CJJCF936_1300 ribE   TRUE 0.642 -36.000 0.011 NA   NA
 2734818 2734819 CJJCF936_1300 CJJCF936_1298     TRUE 0.797 2.000 0.005 NA   NA
 2734821 2734822 CJJCF936_1297 CJJCF936_1296   glcD TRUE 0.963 3.000 0.404 NA   NA
 2734822 2734823 CJJCF936_1296 CJJCF936_1295 glcD yihY TRUE 0.873 4.000 0.031 1.000   NA
 2734824 2734825 CJJCF936_1294 CJJCF936_1293     TRUE 0.758 9.000 0.010 1.000   NA
 2734826 2734827 CJJCF936_1292 CJJCF936_1291   ftsY TRUE 0.779 0.000 0.003 1.000 N NA
 2734827 2734828 CJJCF936_1291 CJJCF936_1290 ftsY radA TRUE 0.961 0.000 0.015 0.017 N NA
 2734828 2734829 CJJCF936_1290 CJJCF936_1289 radA atpB FALSE 0.209 69.000 0.003 1.000 N NA
 2734829 2734830 CJJCF936_1289 CJJCF936_1288 atpB   TRUE 0.656 -3.000 0.009 NA   NA
 2734831 2734832 CJJCF936_1287 CJJCF936_1286 metF metE TRUE 0.991 10.000 0.050 0.002 Y NA
 2734832 2734833 CJJCF936_1286 CJJCF936_1285 metE   TRUE 0.628 12.000 0.006 NA N NA
 2734833 2734834 CJJCF936_1285 CJJCF936_1284     TRUE 0.814 11.000 0.043 NA   NA
 2734834 2734835 CJJCF936_1284 CJJCF936_1283   luxS FALSE 0.459 312.000 0.000 0.017   NA
 2734836 2734837 CJJCF936_1282 CJJCF936_1281 gatB gpsA TRUE 0.773 0.000 0.011 1.000 N NA
 2734837 2734838 CJJCF936_1281 CJJCF936_1280 gpsA   TRUE 0.717 10.000 0.007 1.000 N NA
 2734842 2734843 CJJCF936_1276 CJJCF936_1275     TRUE 0.811 120.000 0.444 0.008   NA
 2734843 2734844 CJJCF936_1275 CJJCF936_1274     TRUE 0.980 18.000 0.556 0.008   NA
 2734844 2734845 CJJCF936_1274 CJJCF936_1273   gidA FALSE 0.146 88.000 0.004 1.000   NA
 2734845 2734846 CJJCF936_1273 CJJCF936_1272 gidA arsB TRUE 0.803 1.000 0.003 1.000 N NA
 2734846 2734847 CJJCF936_1272 CJJCF936_1271 arsB petA FALSE 0.332 91.000 0.083 1.000 N NA
 2734847 2734848 CJJCF936_1271 CJJCF936_1270 petA petB TRUE 0.995 2.000 0.093 0.002 Y NA
 2734848 2734849 CJJCF936_1270 CJJCF936_1269 petB petC TRUE 0.991 -3.000 0.103 0.002 Y NA
 2734849 2734850 CJJCF936_1269 CJJCF936_1268 petC   FALSE 0.261 128.000 0.087 1.000 N NA
 2734850 2734851 CJJCF936_1268 CJJCF936_1267   rpsB FALSE 0.111 116.000 0.003 1.000 N NA
 2734851 2734852 CJJCF936_1267 CJJCF936_1266 rpsB tsf TRUE 0.982 0.000 0.748 1.000 Y NA
 2734852 2734853 CJJCF936_1266 CJJCF936_1265 tsf   TRUE 0.660 13.000 0.019 1.000 N NA
 2734853 2734854 CJJCF936_1265 CJJCF936_1264   fliR TRUE 0.783 -13.000 0.032 1.000 N NA
 2734854 2734855 CJJCF936_1264 CJJCF936_1263 fliR   FALSE 0.295 57.000 0.017 NA   NA
 2734855 2734856 CJJCF936_1263 CJJCF936_1262     TRUE 0.810 3.000 0.002 NA   NA
 2734856 2734857 CJJCF936_1262 CJJCF936_1261     TRUE 0.803 2.000 0.009 1.000 N NA
 2734857 2734858 CJJCF936_1261 CJJCF936_1260   argS TRUE 0.650 12.000 0.011 1.000 N NA
 2734859 2734860 CJJCF936_1259 CJJCF936_1258     TRUE 0.960 54.000 0.869 0.061 Y NA
 2734861 2734862 CJJCF936_1257 CJJCF936_1256   ppiB TRUE 0.728 10.000 0.010 1.000   NA
 2734862 2734863 CJJCF936_1256 CJJCF936_1255 ppiB   FALSE 0.098 164.000 0.015 NA   NA
 2734863 2734864 CJJCF936_1255 CJJCF936_1254     TRUE 0.854 11.000 0.070 NA   NA
 2734864 2734865 CJJCF936_1254 CJJCF936_1252     FALSE 0.280 81.000 0.043 NA   NA
 2734867 2734868 CJJCF936_1251 CJJCF936_1250     TRUE 0.854 -3.000 0.083 NA   NA
 2734868 2734869 CJJCF936_1250 CJJCF936_1249     FALSE 0.320 70.000 0.037 NA   NA
 2734869 2734870 CJJCF936_1249 CJJCF936_1248     FALSE 0.355 76.000 0.059 NA   NA
 2734870 2734871 CJJCF936_1248 CJJCF936_1247     TRUE 0.842 -10.000 0.053 1.000   NA
 2734871 2734872 CJJCF936_1247 CJJCF936_1246     TRUE 0.987 0.000 0.067 0.003   NA
 2734872 2734873 CJJCF936_1246 CJJCF936_1245     FALSE 0.165 265.000 0.042 NA   NA
 2734874 2734875 CJJCF936_1244 CJJCF936_1243 dnaX rho TRUE 0.949 4.000 0.009 0.091 N NA
 2734876 2734877 CJJCF936_1242 CJJCF936_1241     TRUE 0.968 -3.000 0.713 NA Y NA
 2734879 2734880 CJJCF936_1239 CJJCF936_1238   waaD TRUE 0.927 1.000 0.093 1.000 N NA
 2734880 2734881 CJJCF936_1238 CJJCF936_1237 waaD hldE TRUE 0.986 -7.000 0.096 0.008 Y NA
 2734881 2734882 CJJCF936_1237 CJJCF936_1235 hldE gmhA-1 TRUE 0.887 -3.000 0.142 1.000 N NA
 2734885 2734886 CJJCF936_1234 CJJCF936_1232     TRUE 0.859 45.000 0.000 0.005   NA
 2734886 2734887 CJJCF936_1232 CJJCF936_1231     TRUE 0.745 -12.000 0.000 1.000   NA
 2734887 2734888 CJJCF936_1231 CJJCF936_1230     TRUE 0.975 -3.000 0.026 0.007 Y NA
 2734888 2734889 CJJCF936_1230 CJJCF936_1229     TRUE 0.933 -3.000 0.124 1.000 Y NA
 2734889 2734890 CJJCF936_1229 CJJCF936_1228     TRUE 0.908 1.000 0.056 NA   NA
 2734892 2734893 CJJCF936_1227 CJJCF936_1225     FALSE 0.117 211.000 0.000 NA   NA
 2734893 2734894 CJJCF936_1225 CJJCF936_1224     TRUE 0.970 4.000 0.667 NA   NA
 2734894 2734895 CJJCF936_1224 CJJCF936_1223     FALSE 0.310 50.000 0.007 NA   NA
 2734895 2734896 CJJCF936_1223 CJJCF936_1222   waaM TRUE 0.901 -3.000 0.050 NA Y NA
 2734896 2734897 CJJCF936_1222 CJJCF936_1221 waaM waaC TRUE 0.950 -10.000 0.231 1.000 Y NA
 2734898 2734899 CJJCF936_1220 CJJCF936_1219 wlaX galE FALSE 0.523 58.000 0.086 1.000 N NA
 2734899 2734900 CJJCF936_1219 CJJCF936_1218 galE wlaB TRUE 0.858 -18.000 0.086 1.000 N NA
 2734900 2734901 CJJCF936_1218 CJJCF936_1217 wlaB   TRUE 0.936 0.000 0.179 1.000 N NA
 2734901 2734902 CJJCF936_1217 CJJCF936_1216   pglI TRUE 0.952 -7.000 0.267 NA Y NA
 2734902 2734903 CJJCF936_1216 CJJCF936_1215 pglI pglJ TRUE 0.946 -12.000 0.208 NA Y NA
 2734903 2734904 CJJCF936_1215 CJJCF936_1214 pglJ pglB TRUE 0.960 4.000 0.375 1.000   NA
 2734904 2734905 CJJCF936_1214 CJJCF936_1213 pglB pglA TRUE 0.851 10.000 0.045 1.000   NA
 2734905 2734906 CJJCF936_1213 CJJCF936_1212 pglA pglC TRUE 0.939 -7.000 0.128 1.000 Y NA
 2734906 2734907 CJJCF936_1212 CJJCF936_1211 pglC   TRUE 0.858 -13.000 0.074 1.000   NA
 2734907 2734908 CJJCF936_1211 CJJCF936_1210     FALSE 0.306 110.000 0.105 NA   NA
 2734908 2734909 CJJCF936_1210 CJJCF936_1209   pglE FALSE 0.138 96.000 0.016 NA   NA
 2734909 2734910 CJJCF936_1209 CJJCF936_1208 pglE pglF TRUE 0.968 2.000 0.133 1.000 Y NA
 2734910 2734911 CJJCF936_1208 CJJCF936_1207 pglF pglG TRUE 0.943 0.000 0.242 1.000   NA
 2734911 2734912 CJJCF936_1207 CJJCF936_1206 pglG cheY FALSE 0.223 146.000 0.062 1.000   NA
 2734912 2734913 CJJCF936_1206 CJJCF936_1205 cheY   TRUE 0.803 23.000 0.146 1.000 N NA
 2734913 2734914 CJJCF936_1205 CJJCF936_1204   ftsH TRUE 0.948 4.000 0.217 1.000 N NA
 2734914 2734915 CJJCF936_1204 CJJCF936_1203 ftsH   TRUE 0.806 -3.000 0.043 1.000 N NA
 2734915 2734916 CJJCF936_1203 CJJCF936_1201   pssA TRUE 0.970 10.000 0.466 1.000 Y NA
 2734918 2734919 CJJCF936_1200 CJJCF936_1199 msrB   TRUE 0.890 3.000 0.041 NA N NA
 2734919 2734920 CJJCF936_1199 CJJCF936_1198     FALSE 0.497 81.000 0.286 NA N NA
 2734921 2734922 CJJCF936_1197 CJJCF936_1196 aat clpA TRUE 0.918 -25.000 0.087 1.000 Y NA
 2734922 2734923 CJJCF936_1196 CJJCF936_1195 clpA   TRUE 0.938 -3.000 0.596 NA   NA
 2734923 2734924 CJJCF936_1195 CJJCF936_1194     TRUE 0.820 0.000 0.024 NA   NA
 2734924 2734925 CJJCF936_1194 CJJCF936_1193   smpB TRUE 0.682 11.000 0.009 1.000   NA
 2734925 2734926 CJJCF936_1193 CJJCF936_1192 smpB ispE TRUE 0.762 -3.000 0.028 1.000 N NA
 2734926 2734927 CJJCF936_1192 CJJCF936_1191 ispE csrA TRUE 0.792 -3.000 0.036 1.000 N NA
 2734927 2734928 CJJCF936_1191 CJJCF936_1190 csrA truB TRUE 0.962 -6.000 0.046 0.021 N NA
 2734928 2734929 CJJCF936_1190 CJJCF936_1189 truB   TRUE 0.814 -3.000 0.046 1.000 N NA
 2734929 2734930 CJJCF936_1189 CJJCF936_1188     TRUE 0.745 -3.000 0.026 NA   NA
 2734930 2734931 CJJCF936_1188 CJJCF936_1187   pepF TRUE 0.883 -6.000 0.115 NA   NA
 2734931 2734932 CJJCF936_1187 CJJCF936_1186 pepF pyrB TRUE 0.793 4.000 0.005 1.000 N NA
 2734932 2734933 CJJCF936_1186 CJJCF936_1185 pyrB   TRUE 0.718 10.000 0.005 1.000 N NA
 2734936 2734937 CJJCF936_1182 CJJCF936_1181 yajC secD TRUE 0.920 -7.000 0.068 NA Y NA
 2734937 2734938 CJJCF936_1181 CJJCF936_1180 secD secF TRUE 0.997 0.000 0.436 0.002 Y NA
 2734938 2734939 CJJCF936_1180 CJJCF936_1179 secF leuS FALSE 0.115 110.000 0.008 1.000 N NA
 2734939 2734940 CJJCF936_1179 CJJCF936_1178 leuS   TRUE 0.770 -3.000 0.031 NA   NA
 2734940 2734941 CJJCF936_1178 CJJCF936_1177     TRUE 0.930 -16.000 0.455 NA   NA
 2734941 2734942 CJJCF936_1177 CJJCF936_1176   folC TRUE 0.880 -10.000 0.104 1.000   NA
 2734942 2734943 CJJCF936_1176 CJJCF936_1175 folC   TRUE 0.787 -13.000 0.032 1.000 N NA
 2734943 2734944 CJJCF936_1175 CJJCF936_1174     TRUE 0.808 45.000 0.178 NA Y NA
 2734944 2734945 CJJCF936_1174 CJJCF936_1173   mfd TRUE 0.816 0.000 0.023 NA N NA
 2734945 2734946 CJJCF936_1173 CJJCF936_1172 mfd   TRUE 0.804 2.000 0.006 1.000   NA
 2734946 2734947 CJJCF936_1172 CJJCF936_1171     TRUE 0.704 -3.000 0.018 1.000   NA
 2734947 2734948 CJJCF936_1171 CJJCF936_1170   thiD TRUE 0.686 -3.000 0.016 1.000 N NA
 2734948 2734949 CJJCF936_1170 CJJCF936_1169 thiD thiE TRUE 0.989 -10.000 0.079 0.003 Y NA
 2734949 2734950 CJJCF936_1169 CJJCF936_1167 thiE hemD TRUE 0.876 -22.000 0.032 1.000 Y NA
 2734952 2734953 CJJCF936_1074 CJJCF936_1075 argF hemB TRUE 0.715 -3.000 0.020 1.000   NA
 2734954 2734955 CJJCF936_1076 CJJCF936_1077 ribA gidB TRUE 0.818 1.000 0.017 1.000 N NA
 2734956 2734957 CJJCF936_1078 CJJCF936_1079     FALSE 0.156 95.000 0.020 NA   NA
 2734958 2734959 CJJCF936_1080 CJJCF936_1081   rpoD TRUE 0.731 80.000 0.006 0.010 Y NA
 2734960 2734961 CJJCF936_1082 CJJCF936_1083 sixA   TRUE 0.795 -3.000 0.040 NA   NA
 2734963 2734964 CJJCF936_1085 CJJCF936_1086     TRUE 0.914 4.000 0.067 NA   NA
 2734964 2734965 CJJCF936_1086 CJJCF936_1087     TRUE 0.761 0.000 0.006 NA   NA
 2734965 2734966 CJJCF936_1087 CJJCF936_1088     TRUE 0.843 -3.000 0.063 1.000 N NA
 2734966 2734967 CJJCF936_1088 CJJCF936_1089   aroB TRUE 0.802 -3.000 0.041 1.000 N NA
 2734967 2734968 CJJCF936_1089 CJJCF936_1090 aroB   FALSE 0.476 46.000 0.031 1.000   NA
 2734969 2734970 CJJCF936_1091 CJJCF936_1092 tgt   TRUE 0.965 2.000 0.444 1.000 N NA
 2734970 2734971 CJJCF936_1092 CJJCF936_1093     FALSE 0.364 53.000 0.000 NA   NA
 2734972 2734973 CJJCF936_1094 CJJCF936_1095     TRUE 0.893 16.000 0.400 NA   NA
 2734973 2734974 CJJCF936_1095 CJJCF936_1096   livF TRUE 0.867 18.000 0.280 1.000 N NA
 2734974 2734975 CJJCF936_1096 CJJCF936_1097 livF livG TRUE 0.990 -13.000 0.381 0.018 Y NA
 2734975 2734976 CJJCF936_1097 CJJCF936_1098 livG livM TRUE 0.944 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 2734976 2734977 CJJCF936_1098 CJJCF936_1099 livM livH TRUE 0.995 0.000 0.771 0.037 Y NA
 2734977 2734978 CJJCF936_1099 CJJCF936_1100 livH   TRUE 0.870 19.000 0.085 NA Y NA
 2734978 2734979 CJJCF936_1100 CJJCF936_1101     TRUE 0.951 22.000 1.000 NA Y NA
 2734979 2734980 CJJCF936_1101 CJJCF936_1102     TRUE 0.809 31.000 0.312 NA N NA
 2734980 2734981 CJJCF936_1102 CJJCF936_1103     TRUE 0.937 9.000 0.250 NA   NA
 2734981 2734982 CJJCF936_1103 CJJCF936_1104     FALSE 0.537 52.000 0.062 NA   NA
 2734982 2734983 CJJCF936_1104 CJJCF936_1105   asd TRUE 0.809 9.000 0.025 NA   NA
 2734983 2734984 CJJCF936_1105 CJJCF936_1106 asd   TRUE 0.828 0.000 0.025 1.000 N NA
 2734984 2734985 CJJCF936_1106 CJJCF936_1107     TRUE 0.626 57.000 0.205 NA   NA
 2734985 2734986 CJJCF936_1107 CJJCF936_1108     TRUE 0.949 -24.000 0.900 NA   NA
 2734986 2734987 CJJCF936_1108 CJJCF936_1109   gyrA FALSE 0.224 64.000 0.008 NA   NA
 2734987 2734988 CJJCF936_1109 CJJCF936_1110 gyrA ctsW FALSE 0.376 41.000 0.007 1.000   NA
 2734988 2734989 CJJCF936_1110 CJJCF936_1111 ctsW mapA TRUE 0.888 -3.000 0.152 NA   NA
 2734989 2734990 CJJCF936_1111 CJJCF936_1112 mapA lepA FALSE 0.177 77.000 0.003 NA   NA
 2734991 2734992 CJJCF936_1113 CJJCF936_1114     TRUE 0.901 -3.000 0.207 1.000 N NA
 2734992 2734993 CJJCF936_1114 CJJCF936_1115     TRUE 0.908 42.000 0.844 NA Y NA
 2734994 2734995 CJJCF936_1116 CJJCF936_1117     TRUE 0.842 1.000 0.022 1.000   NA
 2734995 2734996 CJJCF936_1117 CJJCF936_1118     TRUE 0.785 0.000 0.016 NA   NA
 2734996 2734997 CJJCF936_1118 CJJCF936_1119   accC-1 TRUE 0.960 4.000 0.400 NA   NA
 2734998 2734999 CJJCF936_1120 CJJCF936_1122   murG TRUE 0.941 -3.000 0.647 1.000 N NA
 2735000 2735001 CJJCF936_1121 CJJCF936_1123     FALSE 0.272 66.000 0.000 NA   NA
 2735001 2735002 CJJCF936_1123 CJJCF936_1124     TRUE 0.811 8.000 0.000 NA   NA
 2735002 2735003 CJJCF936_1124 CJJCF936_1125     TRUE 0.649 63.000 0.357 NA   NA
 2735003 2735004 CJJCF936_1125 CJJCF936_1126     TRUE 0.772 -3.000 0.031 1.000 N NA
 2735004 2735005 CJJCF936_1126 CJJCF936_1127   thiH TRUE 0.991 -10.000 0.128 0.003 Y NA
 2735005 2735006 CJJCF936_1127 CJJCF936_1128 thiH thiG TRUE 0.994 3.000 0.277 0.003   NA
 2735006 2735007 CJJCF936_1128 CJJCF936_1129 thiG thiF FALSE 0.555 331.000 0.054 0.025   NA
 2735007 2735008 CJJCF936_1129 CJJCF936_1130 thiF thiS TRUE 0.922 -3.000 0.346 1.000   NA
 2735008 2735009 CJJCF936_1130 CJJCF936_1131 thiS   TRUE 0.731 -3.000 0.000 1.000 N NA
 2735009 2735010 CJJCF936_1131 CJJCF936_1132     TRUE 0.742 -7.000 0.000 NA   NA
 2735010 2735011 CJJCF936_1132 CJJCF936_1133     FALSE 0.352 173.000 0.300 NA   NA
 2735011 2735012 CJJCF936_1133 CJJCF936_1134     FALSE 0.116 237.000 0.000 NA   NA
 2735012 2735013 CJJCF936_1134 CJJCF936_1135   dapE TRUE 0.718 10.000 0.005 1.000 N NA
 2735013 2735014 CJJCF936_1135 CJJCF936_1136 dapE   TRUE 0.912 4.000 0.018 1.000 Y NA
 2735014 2735015 CJJCF936_1136 CJJCF936_1137     TRUE 0.934 -7.000 0.417 1.000 N NA
 2735015 2735016 CJJCF936_1137 CJJCF936_1138     TRUE 0.807 43.000 0.000 0.034 N NA
 2735016 2735017 CJJCF936_1138 CJJCF936_1139     FALSE 0.497 111.000 0.000 0.034   NA
 2735017 2735018 CJJCF936_1139 CJJCF936_1140     TRUE 0.623 18.000 0.000 NA   NA
 2735018 2735019 CJJCF936_1140 CJJCF936_1141     FALSE 0.158 102.000 0.000 NA   NA
 2735019 2735020 CJJCF936_1141 CJJCF936_1142   mutS TRUE 0.802 9.000 0.000 NA   NA
 2735020 2735021 CJJCF936_1142 CJJCF936_1143 mutS   TRUE 0.908 -7.000 0.217 NA   NA
 2735021 2735022 CJJCF936_1143 CJJCF936_1144   murC TRUE 0.691 -7.000 0.014 NA   NA
 2735022 2735023 CJJCF936_1144 CJJCF936_1145 murC   FALSE 0.407 67.000 0.002 1.000 Y NA
 2735023 2735024 CJJCF936_1145 CJJCF936_1146     TRUE 0.809 12.000 0.049 1.000   NA
 2735024 2735025 CJJCF936_1146 CJJCF936_1147     TRUE 0.796 -7.000 0.032 1.000   NA
 2735025 2735026 CJJCF936_1147 CJJCF936_1148   guaB TRUE 0.665 -3.000 0.007 1.000   NA
 2735026 2735027 CJJCF936_1148 CJJCF936_1149 guaB gatA TRUE 0.819 10.000 0.032 1.000 N NA
 2735027 2735028 CJJCF936_1149 CJJCF936_1150 gatA ileS FALSE 0.251 102.000 0.008 1.000 Y NA
 2735029 2735030 CJJCF936_1151 CJJCF936_1152     TRUE 0.865 12.000 0.111 1.000   NA
 2735030 2735031 CJJCF936_1152 CJJCF936_1153     FALSE 0.516 64.000 0.111 1.000   NA
 2735031 2735032 CJJCF936_1153 CJJCF936_1154     TRUE 0.994 0.000 0.333 0.020 Y NA
 2735032 2735033 CJJCF936_1154 CJJCF936_1155   pgsA FALSE 0.106 125.000 0.003 1.000 N NA
 2735033 2735034 CJJCF936_1155 CJJCF936_1156 pgsA   TRUE 0.925 -3.000 0.023 0.059 N NA
 2735034 2735035 CJJCF936_1156 CJJCF936_1157     TRUE 0.688 -7.000 0.002 NA   NA
 2735035 2735036 CJJCF936_1157 CJJCF936_1158   rpsF FALSE 0.160 83.000 0.002 NA   NA
 2735036 2735037 CJJCF936_1158 CJJCF936_1159 rpsF ssb TRUE 0.846 9.000 0.033 1.000 N NA
 2735037 2735038 CJJCF936_1159 CJJCF936_1160 ssb rpsR TRUE 0.795 11.000 0.034 1.000 N NA
 2735039 2735040 CJJCF936_1161 CJJCF936_1162 lon   TRUE 0.777 17.000 0.062 1.000   NA
 2735041 2735042 CJJCF936_1163 CJJCF936_1164   proC TRUE 0.720 27.000 0.075 NA   NA
 2735042 2735043 CJJCF936_1164 CJJCF936_1165 proC ctsT TRUE 0.850 -3.000 0.075 NA   NA
 2735043 2735044 CJJCF936_1165 CJJCF936_1166 ctsT   TRUE 0.947 -3.000 0.800 NA   NA
 2735045 2735046 CJJCF936_0001 CJJCF936_0002     TRUE 0.719 36.000 0.118 1.000   NA
 2735046 2735047 CJJCF936_0002 CJJCF936_0003   ksgA TRUE 0.748 -25.000 0.028 1.000   NA
 2735048 2735049 CJJCF936_0004 CJJCF936_0005     TRUE 0.875 23.000 0.011 0.025   NA
 2735051 2735052 CJJCF936_0007 CJJCF936_0008     FALSE 0.405 47.000 0.000 NA   NA
 2735052 2735053 CJJCF936_0008 CJJCF936_0009     TRUE 0.838 4.000 0.000 NA   NA
 2735053 2735054 CJJCF936_0009 CJJCF936_0011     FALSE 0.535 28.000 0.000 NA   NA
 2735055 2735056 CJJCF936_0010 CJJCF936_0012 leuD leuC TRUE 0.997 2.000 0.309 0.001 Y NA
 2735056 2735057 CJJCF936_0012 CJJCF936_0013 leuC leuB TRUE 0.994 -7.000 0.275 0.002 Y NA
 2735057 2735058 CJJCF936_0013 CJJCF936_0014 leuB leuA TRUE 0.991 -3.000 0.126 0.002 Y NA
 2735060 2735061 CJJCF936_0016 CJJCF936_0017     FALSE 0.115 350.000 0.000 NA   NA
 2735061 2735062 CJJCF936_0017 CJJCF936_0018     FALSE 0.088 177.000 0.005 NA   NA
 2735064 2735065 CJJCF936_0020 CJJCF936_0021 metA metX FALSE 0.422 83.000 0.037 1.000 Y NA
 2735065 2735066 CJJCF936_0021 CJJCF936_0022 metX flgE FALSE 0.120 425.000 0.000 1.000   NA
 2735069 2735070 CJJCF936_0025 CJJCF936_0026 dnaA dnaN FALSE 0.520 160.000 0.328 1.000 Y NA
 2735070 2735071 CJJCF936_0026 CJJCF936_0027 dnaN gyrB TRUE 0.848 29.000 0.114 1.000 Y NA
 2735072 2735073 CJJCF936_0028 CJJCF936_0029     TRUE 0.969 3.000 0.027 0.040   NA
 2735074 2735075 CJJCF936_0030 CJJCF936_0031   gltB FALSE 0.141 134.000 0.025 1.000   NA
 2735075 2735076 CJJCF936_0031 CJJCF936_0032 gltB   TRUE 0.775 10.000 0.000 NA   NA
 2735076 2735077 CJJCF936_0032 CJJCF936_0033   gltD TRUE 0.846 3.000 0.000 NA   NA
 2735078 2735079 CJJCF936_0034 CJJCF936_0035 rnhB comEA FALSE 0.453 33.000 0.002 1.000   NA
 2735079 2735080 CJJCF936_0035 CJJCF936_0036 comEA rbr FALSE 0.230 65.000 0.004 1.000   NA
 2735082 2735083 CJJCF936_0038 CJJCF936_0039     FALSE 0.143 92.000 0.010 1.000   NA
 2735085 2735086 CJJCF936_0041 CJJCF936_0042     TRUE 0.937 12.000 0.667 NA   NA
 2735086 2735087 CJJCF936_0042 CJJCF936_0043     FALSE 0.345 106.000 0.143 NA   NA
 2735087 2735088 CJJCF936_0043 CJJCF936_0044   ccpA-1 TRUE 0.952 -10.000 0.800 1.000 N NA
 2735088 2735089 CJJCF936_0044 CJJCF936_0045 ccpA-1   FALSE 0.327 64.000 0.028 1.000 N NA
 2735089 2735090 CJJCF936_0045 CJJCF936_0046     FALSE 0.198 121.000 0.042 1.000 N NA
 2735091 2735092 CJJCF936_0047 CJJCF936_0048 purB-1 nrdA TRUE 0.777 15.000 0.012 1.000 Y NA
 2735093 2735094 CJJCF936_0049 CJJCF936_0050   thyX FALSE 0.109 120.000 0.009 1.000   NA
 2735095 2735096 CJJCF936_0051 CJJCF936_0052 pyrG recJ TRUE 0.754 -13.000 0.026 1.000 N NA
 2735096 2735097 CJJCF936_0052 CJJCF936_0053 recJ ansA FALSE 0.132 96.000 0.004 1.000 N NA
 2735099 2735100 CJJCF936_1306 CJJCF936_1307     TRUE 0.974 -7.000 0.846 1.000 Y NA
 2735101 2735102 CJJCF936_1308 CJJCF936_1309     TRUE 0.788 11.000 0.031 1.000   NA
 2735103 2735104 CJJCF936_1310 CJJCF936_1311     FALSE 0.175 93.000 0.000 NA   NA
 2735104 2735105 CJJCF936_1311 CJJCF936_1312     TRUE 0.971 -3.000 0.824 1.000 Y NA
 2735105 2735106 CJJCF936_1312 CJJCF936_1313   htrA FALSE 0.540 76.000 0.294 1.000 N NA
 2735107 2735108 CJJCF936_1314 CJJCF936_1315 dnaJ-1   TRUE 0.876 16.000 0.282 1.000 N NA
 2735108 2735109 CJJCF936_1315 CJJCF936_1316     TRUE 0.845 6.000 0.028 1.000 N NA
 2735109 2735110 CJJCF936_1316 CJJCF936_1317     TRUE 0.926 10.000 0.250 NA   NA
 2735110 2735111 CJJCF936_1317 CJJCF936_1318     TRUE 0.920 -3.000 0.364 NA   NA
 2735111 2735112 CJJCF936_1318 CJJCF936_1319   glyS FALSE 0.284 56.000 0.006 1.000   NA
 2735112 2735113 CJJCF936_1319 CJJCF936_1320 glyS   TRUE 0.661 -3.000 0.008 1.000 N NA
 2735113 2735114 CJJCF936_1320 CJJCF936_1322     TRUE 0.677 -3.000 0.012 1.000   NA
 2735116 2735117 CJJCF936_1323 CJJCF936_1325 pdxJ pdxA TRUE 0.989 -3.000 0.048 0.001 Y NA
 2735119 2735120 CJJCF936_1326 CJJCF936_1327     TRUE 0.712 56.000 0.400 NA   NA
 2735120 2735121 CJJCF936_1327 CJJCF936_1328   hemE FALSE 0.090 184.000 0.004 NA   NA
 2735121 2735122 CJJCF936_1328 CJJCF936_1330 hemE   TRUE 0.694 -3.000 0.017 1.000 N NA
 2735123 2735124 CJJCF936_1329 CJJCF936_1331   uvrC TRUE 0.797 2.000 0.005 NA   NA
 2735124 2735125 CJJCF936_1331 CJJCF936_1332 uvrC   TRUE 0.711 -7.000 0.018 NA   NA
 2735126 2735127 CJJCF936_1333 CJJCF936_1334   guaA TRUE 0.804 4.000 0.002 NA   NA
 2735127 2735128 CJJCF936_1334 CJJCF936_1335 guaA   FALSE 0.153 86.000 0.002 NA   NA
 2735128 2735129 CJJCF936_1335 CJJCF936_1336   purD FALSE 0.116 240.000 0.000 NA   NA
 2735129 2735130 CJJCF936_1336 CJJCF936_1337 purD   TRUE 0.686 -3.000 0.017 NA   NA
 2735130 2735131 CJJCF936_1337 CJJCF936_1338     TRUE 0.894 -10.000 0.149 NA   NA
 2735131 2735132 CJJCF936_1338 CJJCF936_1339   pnp FALSE 0.196 70.000 0.007 1.000 N NA
 2735132 2735133 CJJCF936_1339 CJJCF936_1340 pnp   TRUE 0.666 -3.000 0.002 NA N NA
 2735133 2735134 CJJCF936_1340 CJJCF936_1342     FALSE 0.252 58.000 0.006 NA   NA
 2735135 2735136 CJJCF936_1341 CJJCF936_1343     TRUE 0.890 18.000 0.429 NA   NA
 2735137 2735138 CJJCF936_1344 CJJCF936_1345     FALSE 0.116 252.000 0.000 NA   NA
 2735140 2735141 CJJCF936_1347 CJJCF936_1348 racR racS TRUE 0.961 -3.000 0.448 1.000 Y NA
 2735141 2735142 CJJCF936_1348 CJJCF936_1350 racS recR TRUE 0.777 0.000 0.011 1.000 N NA
 2735143 2735144 CJJCF936_1349 CJJCF936_1351 hydD hydC TRUE 0.886 30.000 0.277 1.000 Y NA
 2735144 2735145 CJJCF936_1351 CJJCF936_1352 hydC hydB TRUE 0.994 11.000 0.270 0.002 Y NA
 2735145 2735146 CJJCF936_1352 CJJCF936_1353 hydB hydA TRUE 0.998 3.000 0.951 0.001 Y NA
 2735146 2735147 CJJCF936_1353 CJJCF936_1354 hydA   FALSE 0.105 121.000 0.009 1.000 N NA
 2735147 2735148 CJJCF936_1354 CJJCF936_1355     TRUE 0.711 -3.000 0.020 1.000 N NA
 2735149 2735150 CJJCF936_1033 CJJCF936_1032     TRUE 0.950 10.000 0.556 NA   NA
 2735150 2735151 CJJCF936_1032 CJJCF936_1031     FALSE 0.172 99.000 0.026 NA N NA
 2735151 2735152 CJJCF936_1031 CJJCF936_1030     TRUE 0.745 -3.000 0.025 1.000 N NA
 2735152 2735153 CJJCF936_1030 CJJCF936_1029     TRUE 0.716 -3.000 0.020 1.000   NA
 2735155 2735156 CJJCF936_1027 CJJCF936_1025     TRUE 0.949 10.000 0.529 NA   NA
 2735158 2735159 CJJCF936_1024 CJJCF936_1023 secA   TRUE 0.969 -3.000 0.201 0.079 N NA
 2735159 2735160 CJJCF936_1023 CJJCF936_1022     FALSE 0.525 23.000 0.015 1.000 N NA
 2735160 2735161 CJJCF936_1022 CJJCF936_1021     FALSE 0.305 62.000 0.000 NA   NA
 2735161 2735162 CJJCF936_1021 CJJCF936_1020     TRUE 0.811 8.000 0.000 NA   NA
 2735162 2735163 CJJCF936_1020 CJJCF936_1019     FALSE 0.373 52.000 0.000 NA   NA
 2735163 2735164 CJJCF936_1019 CJJCF936_1018     TRUE 0.826 5.000 0.000 NA   NA
 2735164 2735165 CJJCF936_1018 CJJCF936_1017     TRUE 0.597 20.000 0.000 NA   NA
 2735165 2735166 CJJCF936_1017 CJJCF936_1016     TRUE 0.813 7.000 0.000 NA   NA
 2735166 2735167 CJJCF936_1016 CJJCF936_1015     FALSE 0.373 52.000 0.000 NA   NA
 2735167 2735168 CJJCF936_1015 CJJCF936_1014     FALSE 0.262 68.000 0.000 NA   NA
 2735168 2735169 CJJCF936_1014 CJJCF936_1013   aas FALSE 0.345 45.000 0.011 NA   NA
 2735170 2735171 CJJCF936_1012 CJJCF936_1011     FALSE 0.117 197.000 0.000 NA   NA
 2735171 2735172 CJJCF936_1011 CJJCF936_1010   atpE FALSE 0.492 35.000 0.000 NA   NA
 2735173 2735174 CJJCF936_1009 CJJCF936_1008     TRUE 0.989 13.000 0.444 0.002   NA
 2735174 2735175 CJJCF936_1008 CJJCF936_1007     TRUE 0.722 32.000 0.100 1.000   NA
 2735175 2735176 CJJCF936_1007 CJJCF936_1006   pckA TRUE 0.806 13.000 0.016 1.000 Y NA
 2735176 2735177 CJJCF936_1006 CJJCF936_1005 pckA argH TRUE 0.717 10.000 0.006 1.000 N NA
 2735178 2735179 CJJCF936_1004 CJJCF936_1003     TRUE 0.748 -3.000 0.026 1.000 N NA
 2735179 2735180 CJJCF936_1003 CJJCF936_1002     TRUE 0.906 -3.000 0.250 NA   NA
 2735180 2735181 CJJCF936_1002 CJJCF936_1001   apt TRUE 0.625 19.000 0.026 NA   NA
 2735181 2735182 CJJCF936_1001 CJJCF936_1000 apt   TRUE 0.754 -3.000 0.028 NA   NA
 2735182 2735183 CJJCF936_1000 CJJCF936_0999   rpiB TRUE 0.917 0.000 0.103 NA   NA
 2735184 2735185 CJJCF936_0998 CJJCF936_0997 cheB cheR TRUE 0.848 16.000 0.154 1.000   NA
 2735185 2735186 CJJCF936_0997 CJJCF936_0996 cheR pebC FALSE 0.301 136.000 0.143 1.000 N NA
 2735186 2735187 CJJCF936_0996 CJJCF936_0995 pebC pebA TRUE 0.937 22.000 0.594 1.000 Y NA
 2735187 2735188 CJJCF936_0995 CJJCF936_0994 pebA   TRUE 0.995 2.000 0.400 0.036 Y NA
 2735188 2735189 CJJCF936_0994 CJJCF936_0993     TRUE 0.994 11.000 0.947 0.011 Y NA
 2735189 2735190 CJJCF936_0993 CJJCF936_0992   prsA FALSE 0.319 108.000 0.029 1.000 Y NA
 2735190 2735191 CJJCF936_0992 CJJCF936_0991 prsA cstA FALSE 0.100 167.000 0.014 1.000 N NA
 2735191 2735192 CJJCF936_0991 CJJCF936_0990 cstA   TRUE 0.758 38.000 0.229 NA   NA
 2735195 2735196 CJJCF936_1073 CJJCF936_1072     TRUE 0.747 -3.000 0.025 1.000   NA
 2735196 2735197 CJJCF936_1072 CJJCF936_1071   hemN TRUE 0.932 -13.000 0.419 1.000   NA
 2735197 2735198 CJJCF936_1071 CJJCF936_1070 hemN   TRUE 0.992 2.000 0.419 0.020 N NA
 2735198 2735199 CJJCF936_1070 CJJCF936_1069     TRUE 0.892 0.000 0.056 NA   NA
 2735201 2735202 CJJCF936_1067 CJJCF936_1066     FALSE 0.267 67.000 0.000 NA   NA
 2735202 2735203 CJJCF936_1066 CJJCF936_1065   hipO TRUE 0.846 2.000 0.000 NA   NA
 2735204 2735205 CJJCF936_1064 CJJCF936_1063   jlpA FALSE 0.135 92.000 0.009 NA   NA
 2735206 2735207 CJJCF936_1062 CJJCF936_1060   cjaB TRUE 0.870 40.000 0.049 0.036 N NA
 2735209 2735210 CJJCF936_1059 CJJCF936_1058     TRUE 0.947 9.000 0.375 NA   NA
 2735211 2735212 CJJCF936_1057 CJJCF936_1056     FALSE 0.353 73.000 0.053 NA   NA
 2735212 2735213 CJJCF936_1056 CJJCF936_1055     FALSE 0.109 111.000 0.006 NA   NA
 2735213 2735214 CJJCF936_1055 CJJCF936_1054     FALSE 0.322 58.000 0.000 NA   NA
 2735214 2735215 CJJCF936_1054 CJJCF936_1053     FALSE 0.116 272.000 0.000 NA   NA
 2735215 2735216 CJJCF936_1053 CJJCF936_1052     TRUE 0.846 2.000 0.000 NA   NA
 2735216 2735217 CJJCF936_1052 CJJCF936_1051     TRUE 0.846 3.000 0.000 NA   NA
 2735217 2735218 CJJCF936_1051 CJJCF936_1050     TRUE 0.707 12.000 0.000 NA   NA
 2735218 2735219 CJJCF936_1050 CJJCF936_1049     TRUE 0.945 -40.000 0.000 0.010   NA
 2735219 2735220 CJJCF936_1049 CJJCF936_1048     FALSE 0.120 369.000 0.000 1.000   NA
 2735222 2735223 CJJCF936_1047 CJJCF936_1045     TRUE 0.916 -3.000 0.323 NA   NA
 2735223 2735224 CJJCF936_1045 CJJCF936_1044     TRUE 0.870 -3.000 0.102 1.000   NA
 2735225 2735226 CJJCF936_1043 CJJCF936_1042 rpmH rnpA TRUE 0.994 -3.000 0.787 0.001   NA
 2735226 2735227 CJJCF936_1042 CJJCF936_1041 rnpA   TRUE 0.936 -3.000 0.540 NA   NA
 2735227 2735228 CJJCF936_1041 CJJCF936_1040     TRUE 0.930 -3.000 0.461 NA   NA
 2735228 2735229 CJJCF936_1040 CJJCF936_1039     TRUE 0.910 4.000 0.061 NA   NA
 2735229 2735230 CJJCF936_1039 CJJCF936_1038   trmE TRUE 0.829 -7.000 0.049 NA   NA
 2735230 2735231 CJJCF936_1038 CJJCF936_1037 trmE purL TRUE 0.679 11.000 0.008 1.000   NA
 2735231 2735232 CJJCF936_1037 CJJCF936_1036 purL   TRUE 0.671 -3.000 0.011 1.000 N NA
 2735232 2735233 CJJCF936_1036 CJJCF936_1035   purH TRUE 0.801 3.000 0.005 1.000 N NA
 2735233 2735234 CJJCF936_1035 CJJCF936_1034 purH   FALSE 0.161 99.000 0.000 NA   NA
 2735235 2735236 CJJCF936_1536 CJJCF936_1535   glf FALSE 0.472 38.000 0.000 NA   NA