MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7008331 7008332 JJD26997_0001 JJD26997_0002 dnaA dnaN TRUE 0.521 160.000 0.328 1.000 Y NA
 7008332 7008333 JJD26997_0002 JJD26997_0003 dnaN gyrB TRUE 0.800 29.000 0.114 1.000 Y NA
 7008334 7008335 JJD26997_0004 JJD26997_0005 actP   TRUE 0.950 -3.000 0.067 NA   NA
 7008336 7008337 JJD26997_0006 JJD26997_0007     FALSE 0.122 135.000 0.025 1.000   NA
 7008337 7008338 JJD26997_0007 JJD26997_0008     TRUE 0.460 22.000 0.000 NA   NA
 7008338 7008339 JJD26997_0008 JJD26997_0009   gltD TRUE 0.540 17.000 0.000 NA   NA
 7008340 7008341 JJD26997_0010 JJD26997_0011 rnhB comEA FALSE 0.275 33.000 0.002 1.000   NA
 7008341 7008342 JJD26997_0011 JJD26997_0012 comEA rbr FALSE 0.163 66.000 0.004 1.000   NA
 7008344 7008345 JJD26997_0014 JJD26997_0015     FALSE 0.030 337.000 0.000 NA   NA
 7008347 7008348 JJD26997_0017 JJD26997_0018     TRUE 0.975 12.000 0.667 NA   NA
 7008348 7008349 JJD26997_0018 JJD26997_0019     FALSE 0.022 493.000 0.000 NA   NA
 7008349 7008350 JJD26997_0019 JJD26997_0022     FALSE 0.041 252.000 0.000 NA   NA
 7008350 7008351 JJD26997_0022 JJD26997_0023     FALSE 0.115 111.000 0.000 NA   NA
 7008351 7008352 JJD26997_0023 JJD26997_0024     FALSE 0.241 111.000 0.042 1.000 N NA
 7008353 7008354 JJD26997_0025 JJD26997_0026 purB-1 nrdA TRUE 0.721 16.000 0.012 1.000 Y NA
 7008355 7008356 JJD26997_0027 JJD26997_0028   thyX FALSE 0.094 120.000 0.009 1.000   NA
 7008357 7008358 JJD26997_0029 JJD26997_0030 pyrG recJ TRUE 0.917 -13.000 0.026 1.000 N NA
 7008358 7008359 JJD26997_0030 JJD26997_0031 recJ ansA FALSE 0.142 86.000 0.004 1.000 N NA
 7008359 7008360 JJD26997_0031 JJD26997_0032 ansA rrsA FALSE 0.020 661.000 0.000 NA   NA
 7008360 7008361 JJD26997_0032 JJD26997_0033 rrsA   FALSE 0.126 105.000 0.000 NA   NA
 7008361 7008362 JJD26997_0033 JJD26997_0034     TRUE 0.850 9.000 0.000 NA   NA
 7008362 7008363 JJD26997_0034 JJD26997_0035   rhtC FALSE 0.032 314.000 0.000 NA   NA
 7008363 7008364 JJD26997_0035 JJD26997_0036 rhtC   TRUE 0.850 9.000 0.000 NA   NA
 7008364 7008365 JJD26997_0036 JJD26997_0037     TRUE 0.413 25.000 0.000 NA   NA
 7008365 7008366 JJD26997_0037 JJD26997_0038     FALSE 0.223 56.000 0.000 NA   NA
 7008366 7008367 JJD26997_0038 JJD26997_0039     FALSE 0.063 175.000 0.000 NA   NA
 7008367 7008368 JJD26997_0039 JJD26997_0040   rrlG FALSE 0.056 189.000 0.000 NA   NA
 7008368 7008369 JJD26997_0040 JJD26997_0041 rrlG rrfE FALSE 0.036 280.000 0.000 NA   NA
 7008371 7008372 JJD26997_0043 JJD26997_0044     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7008372 7008373 JJD26997_0044 JJD26997_0046     FALSE 0.031 322.000 0.000 NA   NA
 7008374 7008375 JJD26997_0045 JJD26997_0047   mraY FALSE 0.102 111.000 0.002 1.000 N NA
 7008375 7008376 JJD26997_0047 JJD26997_0048 mraY   FALSE 0.050 206.000 0.000 NA   NA
 7008376 7008377 JJD26997_0048 JJD26997_0049     FALSE 0.027 372.000 0.000 NA   NA
 7008379 7008380 JJD26997_0051 JJD26997_0052     FALSE 0.255 178.000 0.182 NA   NA
 7008380 7008381 JJD26997_0052 JJD26997_0053   typA TRUE 0.861 0.000 0.006 NA   NA
 7008382 7008383 JJD26997_0054 JJD26997_0055     TRUE 0.863 -15.000 0.000 NA   NA
 7008383 7008384 JJD26997_0055 JJD26997_0056     FALSE 0.267 43.000 0.000 NA   NA
 7008384 7008385 JJD26997_0056 JJD26997_0057   flgD TRUE 0.382 59.000 0.053 NA   NA
 7008385 7008386 JJD26997_0057 JJD26997_0058 flgD flgE-1 TRUE 0.990 4.000 0.341 NA Y NA
 7008387 7008388 JJD26997_0059 JJD26997_0060     TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 7008390 7008391 JJD26997_0062 JJD26997_0063 mnmA   TRUE 0.849 -3.000 0.012 NA   NA
 7008391 7008392 JJD26997_0063 JJD26997_0064     FALSE 0.102 119.000 0.000 NA   NA
 7008392 7008393 JJD26997_0064 JJD26997_0065     FALSE 0.030 330.000 0.000 NA   NA
 7008393 7008394 JJD26997_0065 JJD26997_0066     FALSE 0.029 352.000 0.000 NA   NA
 7008395 7008396 JJD26997_0067 JJD26997_0068     TRUE 0.863 -15.000 0.000 NA   NA
 7008397 7008398 JJD26997_0069 JJD26997_0070 fliY fliM TRUE 0.953 18.000 0.142 0.003 Y NA
 7008398 7008399 JJD26997_0070 JJD26997_0071 fliM fliA TRUE 0.979 0.000 0.118 1.000 N NA
 7008399 7008400 JJD26997_0071 JJD26997_0072 fliA   TRUE 0.954 -43.000 0.112 NA   NA
 7008400 7008401 JJD26997_0072 JJD26997_0073     TRUE 0.830 19.000 0.159 NA   NA
 7008401 7008402 JJD26997_0073 JJD26997_0074   flhF TRUE 0.990 0.000 0.382 1.000 N NA
 7008402 7008403 JJD26997_0074 JJD26997_0075 flhF folK TRUE 0.871 11.000 0.035 1.000 N NA
 7008403 7008404 JJD26997_0075 JJD26997_0076 folK aroQ TRUE 0.893 3.000 0.009 1.000 N NA
 7008405 7008406 JJD26997_0077 JJD26997_0078   sppA TRUE 0.935 -12.000 0.035 1.000 N NA
 7008406 7008407 JJD26997_0078 JJD26997_0079 sppA   FALSE 0.047 223.000 0.000 NA   NA
 7008408 7008409 JJD26997_0081 JJD26997_0083     FALSE 0.067 162.000 0.000 NA   NA
 7008409 7008410 JJD26997_0083 JJD26997_0084     FALSE 0.060 180.000 0.000 NA   NA
 7008410 7008411 JJD26997_0084 JJD26997_0085     TRUE 0.991 -7.000 0.209 0.002   NA
 7008411 7008412 JJD26997_0085 JJD26997_0086     TRUE 0.995 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 7008412 7008413 JJD26997_0086 JJD26997_0087   lctP TRUE 0.382 124.000 0.075 1.000 Y NA
 7008413 7008414 JJD26997_0087 JJD26997_0088 lctP   FALSE 0.027 364.000 0.000 NA   NA
 7008415 7008416 JJD26997_0089 JJD26997_0090   cydA TRUE 0.995 1.000 0.887 NA   NA
 7008416 7008417 JJD26997_0090 JJD26997_0091 cydA cydB TRUE 0.999 0.000 0.962 0.041 Y NA
 7008418 7008419 JJD26997_0092 JJD26997_0093   ung FALSE 0.112 116.000 0.011 1.000 N NA
 7008420 7008421 JJD26997_0094 JJD26997_0095 aspA dcuA TRUE 0.759 26.000 0.127 1.000   NA
 7008421 7008422 JJD26997_0095 JJD26997_0096 dcuA   FALSE 0.020 661.000 0.000 NA   NA
 7008422 7008423 JJD26997_0096 JJD26997_0097     FALSE 0.040 253.000 0.000 NA   NA
 7008423 7008424 JJD26997_0097 JJD26997_0098   rplU FALSE 0.069 159.000 0.000 NA   NA
 7008424 7008425 JJD26997_0098 JJD26997_0099 rplU rpmA TRUE 0.994 11.000 0.667 0.032 Y NA
 7008425 7008426 JJD26997_0099 JJD26997_0100 rpmA obgE TRUE 0.564 107.000 0.335 1.000   NA
 7008426 7008427 JJD26997_0100 JJD26997_0102 obgE   FALSE 0.084 134.000 0.000 NA   NA
 7008429 7008430 JJD26997_0105 JJD26997_0106 fmt   TRUE 0.912 -37.000 0.029 1.000 N NA
 7008430 7008431 JJD26997_0106 JJD26997_0107     TRUE 0.943 -3.000 0.040 1.000 N NA
 7008431 7008432 JJD26997_0107 JJD26997_0108     TRUE 0.994 6.000 0.827 1.000 N NA
 7008432 7008433 JJD26997_0108 JJD26997_0109     TRUE 0.365 64.000 0.037 1.000 N NA
 7008433 7008434 JJD26997_0109 JJD26997_0110     TRUE 0.978 11.000 0.110 0.008 Y NA
 7008434 7008435 JJD26997_0110 JJD26997_0111   atpH TRUE 0.993 3.000 0.132 0.008 Y NA
 7008435 7008436 JJD26997_0111 JJD26997_0112 atpH atpA TRUE 0.992 14.000 0.864 0.008 Y NA
 7008436 7008437 JJD26997_0112 JJD26997_0113 atpA atpG TRUE 0.998 9.000 0.846 0.008 Y NA
 7008437 7008438 JJD26997_0113 JJD26997_0114 atpG atpD TRUE 0.978 25.000 0.724 0.008 Y NA
 7008438 7008439 JJD26997_0114 JJD26997_0115 atpD atpC TRUE 0.999 0.000 0.837 0.008 Y NA
 7008439 7008440 JJD26997_0115 JJD26997_0116 atpC   TRUE 0.955 0.000 0.036 1.000 N NA
 7008440 7008441 JJD26997_0116 JJD26997_0117     TRUE 0.998 9.000 0.944 0.041 Y NA
 7008441 7008442 JJD26997_0117 JJD26997_0118     TRUE 0.985 3.000 0.343 NA   NA
 7008442 7008443 JJD26997_0118 JJD26997_0119   tolB TRUE 0.961 10.000 0.213 NA   NA
 7008443 7008444 JJD26997_0119 JJD26997_0120 tolB   TRUE 0.811 77.000 0.702 1.000 N NA
 7008444 7008445 JJD26997_0120 JJD26997_0121     TRUE 0.994 4.000 0.794 1.000   NA
 7008445 7008446 JJD26997_0121 JJD26997_0122   slyD TRUE 0.954 15.000 0.543 1.000   NA
 7008446 7008447 JJD26997_0122 JJD26997_0123 slyD fabD TRUE 0.915 0.000 0.013 1.000 N NA
 7008447 7008448 JJD26997_0123 JJD26997_0124 fabD mtnA TRUE 0.956 0.000 0.037 1.000 N NA
 7008448 7008449 JJD26997_0124 JJD26997_0125 mtnA   TRUE 0.934 -3.000 0.042 NA N NA
 7008449 7008450 JJD26997_0125 JJD26997_0126     TRUE 0.849 -3.000 0.009 NA N NA
 7008450 7008451 JJD26997_0126 JJD26997_0127     TRUE 0.867 0.000 0.007 NA   NA
 7008451 7008452 JJD26997_0127 JJD26997_0128     TRUE 0.811 -3.000 0.003 NA   NA
 7008455 7008456 JJD26997_0131 JJD26997_0132     TRUE 0.362 28.000 0.000 NA   NA
 7008456 7008457 JJD26997_0132 JJD26997_0133     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 7008457 7008458 JJD26997_0133 JJD26997_0134     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 7008460 7008461 JJD26997_0136 JJD26997_0137 dusB   TRUE 0.885 -3.000 0.021 NA   NA
 7008461 7008462 JJD26997_0137 JJD26997_0138     TRUE 0.988 -10.000 0.523 NA   NA
 7008462 7008463 JJD26997_0138 JJD26997_0139     TRUE 0.783 12.000 0.029 NA   NA
 7008463 7008464 JJD26997_0139 JJD26997_0140   accD TRUE 0.940 2.000 0.035 NA   NA
 7008464 7008465 JJD26997_0140 JJD26997_0141 accD   TRUE 0.874 9.000 0.016 1.000 N NA
 7008465 7008466 JJD26997_0141 JJD26997_0142     TRUE 0.903 0.000 0.008 1.000 N NA
 7008467 7008468 JJD26997_0143 JJD26997_0144 tyrA   FALSE 0.184 81.000 0.013 1.000 N NA
 7008468 7008469 JJD26997_0144 JJD26997_0145   lpxC TRUE 0.962 0.000 0.022 1.000 Y NA
 7008469 7008470 JJD26997_0145 JJD26997_0146 lpxC   TRUE 0.427 39.000 0.035 NA N NA
 7008470 7008471 JJD26997_0146 JJD26997_0147   thrB TRUE 0.905 9.000 0.032 NA N NA
 7008471 7008472 JJD26997_0147 JJD26997_0148 thrB   TRUE 0.597 25.000 0.044 NA N NA
 7008472 7008473 JJD26997_0148 JJD26997_0149   infB TRUE 0.972 -13.000 0.171 NA N NA
 7008473 7008474 JJD26997_0149 JJD26997_0150 infB rbfA TRUE 0.994 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 7008474 7008475 JJD26997_0150 JJD26997_0151 rbfA   TRUE 0.914 -10.000 0.033 NA   NA
 7008475 7008476 JJD26997_0151 JJD26997_0152     TRUE 0.816 4.000 0.002 NA   NA
 7008476 7008477 JJD26997_0152 JJD26997_0154     TRUE 0.996 0.000 0.759 NA Y NA
 7008478 7008479 JJD26997_0153 JJD26997_0155     TRUE 0.995 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 7008479 7008480 JJD26997_0155 JJD26997_0156     TRUE 0.978 13.000 0.509 1.000 Y NA
 7008481 7008482 JJD26997_0157 JJD26997_0158     FALSE 0.058 184.000 0.000 NA   NA
 7008482 7008483 JJD26997_0158 JJD26997_0159     FALSE 0.042 239.000 0.000 NA   NA
 7008483 7008484 JJD26997_0159 JJD26997_0160     FALSE 0.084 134.000 0.000 NA   NA
 7008485 7008486 JJD26997_0161 JJD26997_0162 trxB trx FALSE 0.254 134.000 0.035 1.000 Y NA
 7008486 7008487 JJD26997_0162 JJD26997_0163 trx   TRUE 0.331 57.000 0.027 1.000 N NA
 7008487 7008488 JJD26997_0163 JJD26997_0164   hom TRUE 0.893 0.000 0.003 1.000 N NA
 7008488 7008489 JJD26997_0164 JJD26997_0165 hom   TRUE 0.932 4.000 0.009 1.000 Y NA
 7008489 7008490 JJD26997_0165 JJD26997_0166     TRUE 0.936 10.000 0.098 NA   NA
 7008490 7008491 JJD26997_0166 JJD26997_0167     TRUE 0.994 -6.000 0.882 NA   NA
 7008491 7008492 JJD26997_0167 JJD26997_0168     TRUE 0.917 -7.000 0.033 NA   NA
 7008492 7008493 JJD26997_0168 JJD26997_0169     TRUE 0.740 14.000 0.031 1.000   NA
 7008493 7008494 JJD26997_0169 JJD26997_0170   rpmE TRUE 0.922 6.000 0.031 1.000   NA
 7008494 7008495 JJD26997_0170 JJD26997_0171 rpmE   FALSE 0.193 79.000 0.023 NA   NA
 7008495 7008496 JJD26997_0171 JJD26997_0172     TRUE 0.963 2.000 0.070 NA   NA
 7008496 7008497 JJD26997_0172 JJD26997_0173     TRUE 0.986 0.000 0.300 NA   NA
 7008497 7008498 JJD26997_0173 JJD26997_0174     TRUE 0.905 0.000 0.011 1.000   NA
 7008498 7008499 JJD26997_0174 JJD26997_0175     TRUE 0.975 -3.000 0.139 1.000 N NA
 7008499 7008500 JJD26997_0175 JJD26997_0176   moaA TRUE 0.937 3.000 0.028 1.000 N NA
 7008500 7008501 JJD26997_0176 JJD26997_0177 moaA   TRUE 0.786 13.000 0.042 NA   NA
 7008501 7008502 JJD26997_0177 JJD26997_0178     TRUE 0.987 -3.000 0.476 NA   NA
 7008502 7008503 JJD26997_0178 JJD26997_0179   ubiA FALSE 0.113 288.000 0.100 NA   NA
 7008508 7008509 JJD26997_0184 JJD26997_0185 sodB   FALSE 0.158 69.000 0.004 1.000   NA
 7008510 7008511 JJD26997_0186 JJD26997_0187     TRUE 0.483 36.000 0.014 1.000 Y NA
 7008511 7008512 JJD26997_0187 JJD26997_0188     TRUE 0.990 -16.000 0.529 1.000 N NA
 7008512 7008513 JJD26997_0188 JJD26997_0189     TRUE 0.998 0.000 0.618 0.030 Y NA
 7008514 7008515 JJD26997_0190 JJD26997_0191     FALSE 0.224 171.000 0.103 1.000   NA
 7008516 7008517 JJD26997_0193 JJD26997_0195     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7008517 7008518 JJD26997_0195 JJD26997_0196     TRUE 0.921 -16.000 0.009 1.000 Y NA
 7008518 7008519 JJD26997_0196 JJD26997_0197   purN FALSE 0.182 72.000 0.009 1.000 N NA
 7008519 7008520 JJD26997_0197 JJD26997_0198 purN   TRUE 0.864 -9.000 0.014 NA N NA
 7008520 7008521 JJD26997_0198 JJD26997_0199     TRUE 0.793 -16.000 0.004 NA   NA
 7008521 7008522 JJD26997_0199 JJD26997_0200     TRUE 0.864 2.000 0.007 NA   NA
 7008522 7008523 JJD26997_0200 JJD26997_0201   def TRUE 0.954 -3.000 0.054 1.000 N NA
 7008523 7008524 JJD26997_0201 JJD26997_0202 def clpP TRUE 0.457 36.000 0.030 1.000 N NA
 7008524 7008525 JJD26997_0202 JJD26997_0203 clpP tig TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7008526 7008527 JJD26997_0204 JJD26997_0205 folE fliI TRUE 0.994 0.000 0.378 0.060 N NA
 7008528 7008529 JJD26997_0206 JJD26997_0207 purF dapB TRUE 0.907 -15.000 0.022 1.000 N NA
 7008529 7008530 JJD26997_0207 JJD26997_0208 dapB   FALSE 0.185 63.000 0.003 1.000 N NA
 7008530 7008531 JJD26997_0208 JJD26997_0209     TRUE 0.857 0.000 0.005 NA   NA
 7008531 7008532 JJD26997_0209 JJD26997_0210     TRUE 0.608 135.000 0.750 NA   NA
 7008533 7008534 JJD26997_0211 JJD26997_0213     TRUE 0.612 14.000 0.000 NA   NA
 7008534 7008535 JJD26997_0213 JJD26997_0214     FALSE 0.057 187.000 0.000 NA   NA
 7008535 7008536 JJD26997_0214 JJD26997_0215     TRUE 0.292 74.000 0.043 NA   NA
 7008536 7008537 JJD26997_0215 JJD26997_0216   thrS FALSE 0.237 131.000 0.063 1.000 N NA
 7008537 7008538 JJD26997_0216 JJD26997_0217 thrS infC TRUE 0.973 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 7008538 7008539 JJD26997_0217 JJD26997_0218 infC   FALSE 0.267 39.000 0.004 1.000 N NA
 7008539 7008540 JJD26997_0218 JJD26997_0219     FALSE 0.283 40.000 0.000 NA   NA
 7008540 7008541 JJD26997_0219 JJD26997_0220     FALSE 0.042 239.000 0.000 NA   NA
 7008541 7008542 JJD26997_0220 JJD26997_0221     FALSE 0.095 124.000 0.000 NA   NA
 7008542 7008543 JJD26997_0221 JJD26997_0222   argC FALSE 0.162 82.000 0.000 NA   NA
 7008543 7008544 JJD26997_0222 JJD26997_0223 argC   TRUE 0.844 10.000 0.019 1.000   NA
 7008544 7008545 JJD26997_0223 JJD26997_0224   argB TRUE 0.788 10.000 0.006 1.000   NA
 7008545 7008546 JJD26997_0224 JJD26997_0225 argB argD TRUE 0.933 10.000 0.030 1.000 Y NA
 7008549 7008550 JJD26997_0227 JJD26997_0229   nrdF TRUE 0.947 -10.000 0.048 1.000 N NA
 7008550 7008551 JJD26997_0229 JJD26997_0230 nrdF   TRUE 0.619 14.000 0.019 NA   NA
 7008551 7008552 JJD26997_0230 JJD26997_0231   pyrE TRUE 0.926 1.000 0.025 NA   NA
 7008552 7008553 JJD26997_0231 JJD26997_0232 pyrE frr TRUE 0.934 3.000 0.026 1.000 N NA
 7008553 7008554 JJD26997_0232 JJD26997_0233 frr secG TRUE 0.624 16.000 0.017 1.000 N NA
 7008554 7008555 JJD26997_0233 JJD26997_0234 secG   FALSE 0.091 104.000 0.007 NA   NA
 7008556 7008557 JJD26997_0235 JJD26997_0236 cynT   TRUE 0.970 -3.000 0.105 1.000 N NA
 7008558 7008559 JJD26997_0237 JJD26997_0238     TRUE 0.928 10.000 0.056 1.000 N NA
 7008559 7008560 JJD26997_0238 JJD26997_0239     FALSE 0.057 185.000 0.000 NA   NA
 7008560 7008561 JJD26997_0239 JJD26997_0240     FALSE 0.086 132.000 0.000 NA   NA
 7008562 7008563 JJD26997_0241 JJD26997_0242 rpmI rplT TRUE 0.924 94.000 0.928 0.031 Y NA
 7008564 7008565 JJD26997_0243 JJD26997_0244     FALSE 0.176 76.000 0.000 NA   NA
 7008565 7008566 JJD26997_0244 JJD26997_0246     TRUE 0.519 18.000 0.000 NA   NA
 7008567 7008568 JJD26997_0247 JJD26997_0249     TRUE 0.798 30.000 0.333 NA   NA
 7008569 7008570 JJD26997_0248 JJD26997_0250     TRUE 0.980 -16.000 0.333 NA   NA
 7008571 7008572 JJD26997_0251 JJD26997_0252 moaC   TRUE 0.934 -22.000 0.057 NA   NA
 7008572 7008573 JJD26997_0252 JJD26997_0253     TRUE 0.764 14.000 0.047 NA   NA
 7008574 7008575 JJD26997_0254 JJD26997_0255 xth   FALSE 0.073 154.000 0.000 NA   NA
 7008577 7008578 JJD26997_0257 JJD26997_0258     FALSE 0.032 314.000 0.000 NA   NA
 7008578 7008579 JJD26997_0258 JJD26997_0259   metC FALSE 0.049 211.000 0.000 NA   NA
 7008579 7008580 JJD26997_0259 JJD26997_0261 metC   FALSE 0.167 80.000 0.000 NA   NA
 7008580 7008581 JJD26997_0261 JJD26997_0262     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 7008583 7008584 JJD26997_0264 JJD26997_0265   katA TRUE 0.480 57.000 0.091 NA   NA
 7008585 7008586 JJD26997_0266 JJD26997_0267     TRUE 0.965 3.000 0.094 NA   NA
 7008586 7008587 JJD26997_0267 JJD26997_0268   fldA TRUE 0.988 0.000 0.391 NA   NA
 7008588 7008589 JJD26997_0270 JJD26997_0271     FALSE 0.239 51.000 0.000 NA   NA
 7008589 7008590 JJD26997_0271 JJD26997_0272   selB TRUE 0.389 49.000 0.031 1.000 N NA
 7008590 7008591 JJD26997_0272 JJD26997_0273 selB selA TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.002 N NA
 7008595 7008596 JJD26997_0277 JJD26997_0278     TRUE 0.984 0.000 0.263 NA   NA
 7008596 7008597 JJD26997_0278 JJD26997_0279     TRUE 0.994 0.000 0.684 NA N NA
 7008597 7008598 JJD26997_0279 JJD26997_0280     TRUE 0.283 45.000 0.016 1.000   NA
 7008598 7008599 JJD26997_0280 JJD26997_0281     TRUE 0.799 14.000 0.048 1.000   NA
 7008599 7008600 JJD26997_0281 JJD26997_0282     TRUE 0.939 9.000 0.053 1.000   NA
 7008601 7008602 JJD26997_0283 JJD26997_0284   glmS TRUE 0.985 4.000 0.312 1.000 N NA
 7008602 7008603 JJD26997_0284 JJD26997_0285 glmS fumC FALSE 0.081 134.000 0.007 1.000 N NA
 7008604 7008605 JJD26997_0286 JJD26997_0287   ruvB TRUE 0.883 4.000 0.019 NA   NA
 7008606 7008607 JJD26997_0288 JJD26997_0290   ssrA TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 7008607 7008608 JJD26997_0290 JJD26997_0292 ssrA   FALSE 0.059 182.000 0.000 NA   NA
 7008609 7008610 JJD26997_0291 JJD26997_0293     FALSE 0.207 62.000 0.000 NA   NA
 7008610 7008611 JJD26997_0293 JJD26997_0294     TRUE 0.868 -12.000 0.000 NA   NA
 7008611 7008612 JJD26997_0294 JJD26997_0295     TRUE 0.306 36.000 0.000 NA   NA
 7008612 7008613 JJD26997_0295 JJD26997_0296     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 7008613 7008614 JJD26997_0296 JJD26997_0297     TRUE 0.429 24.000 0.000 NA   NA
 7008614 7008615 JJD26997_0297 JJD26997_0298     FALSE 0.174 77.000 0.000 NA   NA
 7008615 7008616 JJD26997_0298 JJD26997_0299     FALSE 0.025 413.000 0.000 NA   NA
 7008616 7008617 JJD26997_0299 JJD26997_0300     TRUE 0.903 2.000 0.000 NA   NA
 7008617 7008618 JJD26997_0300 JJD26997_0301     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7008618 7008619 JJD26997_0301 JJD26997_0302     FALSE 0.078 142.000 0.000 NA   NA
 7008619 7008620 JJD26997_0302 JJD26997_0303     TRUE 0.993 -19.000 1.000 NA   NA
 7008620 7008621 JJD26997_0303 JJD26997_0304     TRUE 0.993 0.000 0.667 NA   NA
 7008621 7008622 JJD26997_0304 JJD26997_0305     TRUE 0.966 -3.000 0.125 NA   NA
 7008622 7008623 JJD26997_0305 JJD26997_0306     TRUE 0.943 -10.000 0.000 0.051   NA
 7008623 7008624 JJD26997_0306 JJD26997_0307     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7008624 7008625 JJD26997_0307 JJD26997_0308     FALSE 0.076 146.000 0.000 NA   NA
 7008625 7008626 JJD26997_0308 JJD26997_0309     TRUE 0.757 11.000 0.000 NA   NA
 7008626 7008627 JJD26997_0309 JJD26997_0310     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7008627 7008628 JJD26997_0310 JJD26997_0311     TRUE 0.299 37.000 0.000 NA   NA
 7008628 7008629 JJD26997_0311 JJD26997_0312     TRUE 0.994 -9.000 1.000 NA   NA
 7008629 7008630 JJD26997_0312 JJD26997_0313     FALSE 0.041 248.000 0.000 NA   NA
 7008630 7008631 JJD26997_0313 JJD26997_0314     FALSE 0.025 412.000 0.000 NA   NA
 7008634 7008635 JJD26997_0317 JJD26997_0319     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008637 7008638 JJD26997_0320 JJD26997_0321     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 7008638 7008639 JJD26997_0321 JJD26997_0322     FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 7008639 7008640 JJD26997_0322 JJD26997_0323     TRUE 0.963 -7.000 0.111 NA   NA
 7008640 7008641 JJD26997_0323 JJD26997_0324     TRUE 0.982 -3.000 0.333 NA   NA
 7008641 7008642 JJD26997_0324 JJD26997_0325     TRUE 0.984 -10.000 0.400 NA   NA
 7008642 7008643 JJD26997_0325 JJD26997_0326     TRUE 0.986 -19.000 0.500 NA   NA
 7008643 7008644 JJD26997_0326 JJD26997_0327     TRUE 0.987 -13.000 0.500 NA   NA
 7008644 7008645 JJD26997_0327 JJD26997_0328     TRUE 0.994 -10.000 1.000 NA   NA
 7008645 7008646 JJD26997_0328 JJD26997_0329     TRUE 0.979 11.000 0.667 NA   NA
 7008646 7008647 JJD26997_0329 JJD26997_0330     FALSE 0.156 86.000 0.000 NA   NA
 7008647 7008648 JJD26997_0330 JJD26997_0331     TRUE 0.394 26.000 0.000 NA   NA
 7008648 7008649 JJD26997_0331 JJD26997_0332     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008650 7008651 JJD26997_0333 JJD26997_0334     TRUE 0.846 -46.000 0.000 NA   NA
 7008656 7008657 JJD26997_0340 JJD26997_0341 nrfH nrfA TRUE 0.896 15.000 0.043 0.002 N NA
 7008657 7008658 JJD26997_0341 JJD26997_0342 nrfA   TRUE 0.423 137.000 0.375 NA   NA
 7008658 7008659 JJD26997_0342 JJD26997_0343     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7008660 7008661 JJD26997_0344 JJD26997_0345     TRUE 0.870 -10.000 0.000 NA   NA
 7008661 7008662 JJD26997_0345 JJD26997_0346     FALSE 0.044 231.000 0.000 NA   NA
 7008662 7008663 JJD26997_0346 JJD26997_0347     TRUE 0.499 19.000 0.000 NA   NA
 7008663 7008664 JJD26997_0347 JJD26997_0348     TRUE 0.966 -37.000 0.133 1.000   NA
 7008664 7008665 JJD26997_0348 JJD26997_0349     TRUE 0.967 5.000 0.133 NA   NA
 7008665 7008666 JJD26997_0349 JJD26997_0350     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7008666 7008667 JJD26997_0350 JJD26997_0351     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008667 7008668 JJD26997_0351 JJD26997_0352     FALSE 0.027 363.000 0.000 NA   NA
 7008668 7008669 JJD26997_0352 JJD26997_0353     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7008669 7008670 JJD26997_0353 JJD26997_0354     FALSE 0.127 104.000 0.000 NA   NA
 7008671 7008672 JJD26997_0355 JJD26997_0356     FALSE 0.179 91.000 0.000 1.000   NA
 7008673 7008674 JJD26997_0357 JJD26997_0358     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7008674 7008675 JJD26997_0358 JJD26997_0359     FALSE 0.030 329.000 0.000 NA   NA
 7008675 7008676 JJD26997_0359 JJD26997_0360     FALSE 0.036 283.000 0.000 NA   NA
 7008677 7008678 JJD26997_0361 JJD26997_0362     TRUE 0.926 2.000 0.028 NA   NA
 7008678 7008679 JJD26997_0362 JJD26997_0363   cdsA TRUE 0.742 10.000 0.007 NA   NA
 7008679 7008680 JJD26997_0363 JJD26997_0364 cdsA dxr TRUE 0.991 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 7008680 7008681 JJD26997_0364 JJD26997_0365 dxr   TRUE 0.859 2.000 0.006 NA   NA
 7008681 7008682 JJD26997_0365 JJD26997_0366   gcp TRUE 0.830 -3.000 0.008 NA   NA
 7008682 7008683 JJD26997_0366 JJD26997_0367 gcp ctsG TRUE 0.892 1.000 0.005 1.000   NA
 7008683 7008684 JJD26997_0367 JJD26997_0368 ctsG   TRUE 0.867 6.000 0.000 NA   NA
 7008684 7008685 JJD26997_0368 JJD26997_0370   maf-6 TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7008685 7008686 JJD26997_0370 JJD26997_0371 maf-6   TRUE 0.996 -3.000 0.667 0.002   NA
 7008686 7008687 JJD26997_0371 JJD26997_0372     FALSE 0.211 76.000 0.000 1.000   NA
 7008688 7008689 JJD26997_0373 JJD26997_0374 maf-4 maf-3 TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008689 7008690 JJD26997_0374 JJD26997_0375 maf-3   TRUE 0.413 25.000 0.000 NA   NA
 7008690 7008691 JJD26997_0375 JJD26997_0376   maf-1 TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008691 7008692 JJD26997_0376 JJD26997_0377 maf-1 ptmA TRUE 0.927 -12.000 0.043 NA   NA
 7008692 7008693 JJD26997_0377 JJD26997_0378 ptmA ptmB TRUE 0.981 0.000 0.131 1.000 N NA
 7008693 7008694 JJD26997_0378 JJD26997_0379 ptmB   TRUE 0.974 -7.000 0.144 1.000   NA
 7008694 7008695 JJD26997_0379 JJD26997_0380     TRUE 0.964 -3.000 0.088 1.000   NA
 7008695 7008696 JJD26997_0380 JJD26997_0381     TRUE 0.979 9.000 0.131 1.000 Y NA
 7008696 7008697 JJD26997_0381 JJD26997_0382     TRUE 0.876 -6.000 0.000 NA   NA
 7008697 7008698 JJD26997_0382 JJD26997_0383     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 7008698 7008699 JJD26997_0383 JJD26997_0384     TRUE 0.942 -3.000 0.039 1.000 N NA
 7008699 7008700 JJD26997_0384 JJD26997_0385   ptmC TRUE 0.994 -7.000 0.549 1.000 Y NA
 7008700 7008701 JJD26997_0385 JJD26997_0386 ptmC   FALSE 0.283 40.000 0.000 NA   NA
 7008701 7008702 JJD26997_0386 JJD26997_0387     TRUE 0.850 -30.000 0.000 NA   NA
 7008702 7008703 JJD26997_0387 JJD26997_0389     TRUE 0.519 18.000 0.000 NA   NA
 7008703 7008704 JJD26997_0389 JJD26997_0390     FALSE 0.150 89.000 0.000 NA   NA
 7008704 7008705 JJD26997_0390 JJD26997_0391     FALSE 0.213 60.000 0.000 NA   NA
 7008705 7008706 JJD26997_0391 JJD26997_0392     TRUE 0.953 -3.000 0.000 0.011   NA
 7008706 7008707 JJD26997_0392 JJD26997_0393     TRUE 0.309 44.000 0.000 1.000   NA
 7008707 7008708 JJD26997_0393 JJD26997_0394     TRUE 0.992 -7.000 0.418 1.000 Y NA
 7008708 7008709 JJD26997_0394 JJD26997_0395     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008709 7008710 JJD26997_0395 JJD26997_0396     TRUE 0.861 -16.000 0.000 NA   NA
 7008710 7008711 JJD26997_0396 JJD26997_0397     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008712 7008713 JJD26997_0398 JJD26997_0399   hisH TRUE 0.989 -15.000 0.625 NA N NA
 7008713 7008714 JJD26997_0399 JJD26997_0401 hisH hisF-1 TRUE 0.977 1.000 0.011 0.008 Y NA
 7008715 7008716 JJD26997_0400 JJD26997_0402     TRUE 0.970 -3.000 0.137 NA N NA
 7008716 7008717 JJD26997_0402 JJD26997_0403     FALSE 0.177 75.000 0.000 NA   NA
 7008717 7008718 JJD26997_0403 JJD26997_0404     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008718 7008719 JJD26997_0404 JJD26997_0405     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7008719 7008720 JJD26997_0405 JJD26997_0406     TRUE 0.338 30.000 0.000 NA   NA
 7008721 7008722 JJD26997_0407 JJD26997_0408     TRUE 0.872 -9.000 0.000 NA   NA
 7008722 7008723 JJD26997_0408 JJD26997_0410     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7008723 7008724 JJD26997_0410 JJD26997_0412     TRUE 0.887 22.000 0.400 NA   NA
 7008725 7008726 JJD26997_0411 JJD26997_0414     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7008726 7008727 JJD26997_0414 JJD26997_0415     TRUE 0.865 -13.000 0.000 NA   NA
 7008728 7008729 JJD26997_0416 JJD26997_0417     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7008730 7008731 JJD26997_0419 JJD26997_0420     TRUE 0.983 0.000 0.188 1.000   NA
 7008731 7008732 JJD26997_0420 JJD26997_0421     TRUE 0.978 -10.000 0.250 NA N NA
 7008732 7008733 JJD26997_0421 JJD26997_0422     TRUE 0.816 -3.000 0.005 NA   NA
 7008733 7008734 JJD26997_0422 JJD26997_0423     TRUE 0.826 -7.000 0.007 NA   NA
 7008734 7008735 JJD26997_0423 JJD26997_0424     TRUE 0.848 -3.000 0.012 NA   NA
 7008735 7008736 JJD26997_0424 JJD26997_0425     FALSE 0.093 126.000 0.000 NA   NA
 7008736 7008737 JJD26997_0425 JJD26997_0426     TRUE 0.477 21.000 0.000 NA   NA
 7008737 7008738 JJD26997_0426 JJD26997_0427     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 7008738 7008739 JJD26997_0427 JJD26997_0428     TRUE 0.852 -7.000 0.013 NA   NA
 7008739 7008740 JJD26997_0428 JJD26997_0429   flmA TRUE 0.994 2.000 0.678 1.000   NA
 7008740 7008741 JJD26997_0429 JJD26997_0430 flmA dcd FALSE 0.255 50.000 0.014 1.000   NA
 7008742 7008743 JJD26997_0431 JJD26997_0432 accB accC-2 TRUE 0.991 2.000 0.071 0.004 Y NA
 7008745 7008746 JJD26997_0434 JJD26997_0435 gltX   TRUE 0.932 2.000 0.021 1.000 N NA
 7008746 7008747 JJD26997_0435 JJD26997_0436   upp TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008747 7008748 JJD26997_0436 JJD26997_0440 upp   FALSE 0.162 82.000 0.000 NA   NA
 7008749 7008750 JJD26997_0439 JJD26997_0441     TRUE 0.994 11.000 0.647 0.005 Y NA
 7008752 7008753 JJD26997_0443 JJD26997_0444     FALSE 0.230 54.000 0.000 NA   NA
 7008754 7008755 JJD26997_0445 JJD26997_0446     TRUE 0.893 -52.000 0.031 NA   NA
 7008755 7008756 JJD26997_0446 JJD26997_0447   trmB TRUE 0.959 0.000 0.060 NA   NA
 7008756 7008757 JJD26997_0447 JJD26997_0448 trmB lolD TRUE 0.381 62.000 0.044 1.000   NA
 7008757 7008758 JJD26997_0448 JJD26997_0449 lolD   TRUE 0.926 26.000 0.431 1.000 Y NA
 7008758 7008759 JJD26997_0449 JJD26997_0450     TRUE 0.923 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 7008759 7008760 JJD26997_0450 JJD26997_0451   pyrH FALSE 0.213 52.000 0.002 1.000 N NA
 7008760 7008761 JJD26997_0451 JJD26997_0452 pyrH rpoZ TRUE 0.738 11.000 0.004 1.000 N NA
 7008761 7008762 JJD26997_0452 JJD26997_0453 rpoZ   TRUE 0.936 8.000 0.018 1.000 Y NA
 7008762 7008763 JJD26997_0453 JJD26997_0454   tyrS TRUE 0.865 12.000 0.045 1.000 N NA
 7008763 7008764 JJD26997_0454 JJD26997_0455 tyrS   TRUE 0.942 -3.000 0.043 1.000   NA
 7008764 7008765 JJD26997_0455 JJD26997_0456     TRUE 0.961 0.000 0.050 1.000   NA
 7008765 7008766 JJD26997_0456 JJD26997_0457   mnmC TRUE 0.909 -3.000 0.020 1.000 N NA
 7008766 7008767 JJD26997_0457 JJD26997_0458 mnmC hydA FALSE 0.100 120.000 0.009 1.000 N NA
 7008767 7008768 JJD26997_0458 JJD26997_0459 hydA hydB TRUE 0.999 3.000 0.951 0.002 Y NA
 7008768 7008769 JJD26997_0459 JJD26997_0460 hydB hydC TRUE 0.994 -13.000 0.270 0.003 Y NA
 7008769 7008770 JJD26997_0460 JJD26997_0462 hydC hydD TRUE 0.989 -3.000 0.277 1.000 Y NA
 7008771 7008772 JJD26997_0461 JJD26997_0463 recR racS TRUE 0.912 0.000 0.011 1.000 N NA
 7008772 7008773 JJD26997_0463 JJD26997_0464 racS racR TRUE 0.827 66.000 0.448 1.000 Y NA
 7008775 7008776 JJD26997_0466 JJD26997_0467 porA   FALSE 0.041 252.000 0.000 NA   NA
 7008777 7008778 JJD26997_0468 JJD26997_0470     TRUE 0.908 19.000 0.429 NA   NA
 7008779 7008780 JJD26997_0469 JJD26997_0471     FALSE 0.155 58.000 0.006 NA   NA
 7008780 7008781 JJD26997_0471 JJD26997_0472   pnp TRUE 0.826 -3.000 0.002 NA N NA
 7008781 7008782 JJD26997_0472 JJD26997_0473 pnp   FALSE 0.178 70.000 0.007 1.000 N NA
 7008782 7008783 JJD26997_0473 JJD26997_0474     TRUE 0.936 11.000 0.149 NA   NA
 7008783 7008784 JJD26997_0474 JJD26997_0475   purD TRUE 0.867 -3.000 0.017 NA   NA
 7008784 7008785 JJD26997_0475 JJD26997_0476 purD   FALSE 0.042 239.000 0.000 NA   NA
 7008785 7008786 JJD26997_0476 JJD26997_0477   guaA FALSE 0.100 86.000 0.002 NA   NA
 7008786 7008787 JJD26997_0477 JJD26997_0478 guaA   TRUE 0.815 4.000 0.002 NA   NA
 7008788 7008789 JJD26997_0479 JJD26997_0480   uvrC TRUE 0.872 -7.000 0.018 NA   NA
 7008789 7008790 JJD26997_0480 JJD26997_0481 uvrC   TRUE 0.856 2.000 0.005 NA   NA
 7008791 7008792 JJD26997_0482 JJD26997_0483   hemE TRUE 0.901 -3.000 0.017 1.000 N NA
 7008792 7008793 JJD26997_0483 JJD26997_0484 hemE   FALSE 0.043 238.000 0.000 NA   NA
 7008793 7008794 JJD26997_0484 JJD26997_0485     FALSE 0.223 56.000 0.000 NA   NA
 7008794 7008795 JJD26997_0485 JJD26997_0486   pdxA FALSE 0.273 46.000 0.000 NA N NA
 7008795 7008796 JJD26997_0486 JJD26997_0487 pdxA pdxJ TRUE 0.987 -3.000 0.048 0.001 Y NA
 7008798 7008799 JJD26997_0488 JJD26997_0490     TRUE 0.846 -3.000 0.012 NA   NA
 7008799 7008800 JJD26997_0490 JJD26997_0491   glyS TRUE 0.517 18.000 0.008 1.000 N NA
 7008800 7008801 JJD26997_0491 JJD26997_0492 glyS   FALSE 0.198 56.000 0.006 1.000   NA
 7008801 7008802 JJD26997_0492 JJD26997_0493     TRUE 0.983 -3.000 0.364 NA   NA
 7008802 7008803 JJD26997_0493 JJD26997_0494     TRUE 0.965 10.000 0.250 NA   NA
 7008803 7008804 JJD26997_0494 JJD26997_0495     TRUE 0.920 7.000 0.028 1.000 N NA
 7008804 7008805 JJD26997_0495 JJD26997_0496   dnaJ-1 TRUE 0.918 16.000 0.282 1.000 N NA
 7008806 7008807 JJD26997_0497 JJD26997_0498 htrA   TRUE 0.654 76.000 0.294 1.000 N NA
 7008807 7008808 JJD26997_0498 JJD26997_0499     TRUE 0.893 72.000 0.824 1.000 Y NA
 7008808 7008809 JJD26997_0499 JJD26997_0500     FALSE 0.141 95.000 0.000 NA   NA
 7008810 7008811 JJD26997_0501 JJD26997_0502     TRUE 0.757 11.000 0.000 NA   NA
 7008812 7008813 JJD26997_0503 JJD26997_0504     FALSE 0.057 188.000 0.000 NA   NA
 7008813 7008814 JJD26997_0504 JJD26997_0505     FALSE 0.135 98.000 0.000 NA   NA
 7008814 7008815 JJD26997_0505 JJD26997_0507     FALSE 0.021 629.000 0.000 NA   NA
 7008815 7008816 JJD26997_0507 JJD26997_0508     TRUE 0.817 87.000 1.000 NA   NA
 7008817 7008818 JJD26997_0509 JJD26997_0510 groEL groES TRUE 0.934 21.000 0.356 1.000 Y NA
 7008819 7008820 JJD26997_0511 JJD26997_0512   ribE TRUE 0.779 9.000 0.004 NA   NA
 7008820 7008821 JJD26997_0512 JJD26997_0513 ribE   TRUE 0.809 -36.000 0.011 NA   NA
 7008821 7008822 JJD26997_0513 JJD26997_0515     TRUE 0.856 2.000 0.005 NA   NA
 7008824 7008825 JJD26997_0516 JJD26997_0517   glcD TRUE 0.987 3.000 0.404 NA   NA
 7008825 7008826 JJD26997_0517 JJD26997_0518 glcD   TRUE 0.931 4.000 0.031 1.000   NA
 7008827 7008828 JJD26997_0519 JJD26997_0520     TRUE 0.807 9.000 0.010 NA   NA
 7008829 7008830 JJD26997_0521 JJD26997_0522   ftsY TRUE 0.893 0.000 0.003 1.000 N NA
 7008830 7008831 JJD26997_0522 JJD26997_0523 ftsY   FALSE 0.176 76.000 0.000 NA   NA
 7008831 7008832 JJD26997_0523 JJD26997_0524     TRUE 0.294 38.000 0.000 NA   NA
 7008832 7008833 JJD26997_0524 JJD26997_0525   radA FALSE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 7008833 7008834 JJD26997_0525 JJD26997_0526 radA atpB FALSE 0.167 70.000 0.003 1.000 N NA
 7008835 7008836 JJD26997_0527 JJD26997_0528 metF metE TRUE 0.978 10.000 0.050 0.002 Y NA
 7008836 7008837 JJD26997_0528 JJD26997_0529 metE   TRUE 0.365 23.000 0.006 NA N NA
 7008837 7008838 JJD26997_0529 JJD26997_0530     TRUE 0.892 10.000 0.043 NA   NA
 7008838 7008839 JJD26997_0530 JJD26997_0531   luxS FALSE 0.087 311.000 0.000 0.017   NA
 7008840 7008841 JJD26997_0532 JJD26997_0533 gatB gpsA TRUE 0.910 0.000 0.011 1.000 N NA
 7008841 7008842 JJD26997_0533 JJD26997_0534 gpsA   TRUE 0.804 10.000 0.007 1.000 N NA
 7008846 7008847 JJD26997_0538 JJD26997_0539     FALSE 0.026 387.000 0.000 NA   NA
 7008847 7008848 JJD26997_0539 JJD26997_0540     TRUE 0.768 18.000 0.000 0.006   NA
 7008848 7008849 JJD26997_0540 JJD26997_0541   gidA FALSE 0.184 88.000 0.000 1.000   NA
 7008849 7008850 JJD26997_0541 JJD26997_0542 gidA   TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 7008850 7008851 JJD26997_0542 JJD26997_0543   petA FALSE 0.052 198.000 0.000 NA   NA
 7008851 7008852 JJD26997_0543 JJD26997_0544 petA petB TRUE 0.993 2.000 0.093 0.002 Y NA
 7008852 7008853 JJD26997_0544 JJD26997_0545 petB petC TRUE 0.991 -3.000 0.103 0.002 Y NA
 7008853 7008854 JJD26997_0545 JJD26997_0546 petC   TRUE 0.286 128.000 0.087 1.000 N NA
 7008854 7008855 JJD26997_0546 JJD26997_0547   rpsB FALSE 0.095 116.000 0.003 1.000 N NA
 7008855 7008856 JJD26997_0547 JJD26997_0548 rpsB tsf TRUE 0.997 0.000 0.748 1.000 Y NA
 7008856 7008857 JJD26997_0548 JJD26997_0549 tsf   TRUE 0.728 13.000 0.019 1.000 N NA
 7008857 7008858 JJD26997_0549 JJD26997_0550   fliR TRUE 0.928 -13.000 0.032 1.000 N NA
 7008858 7008859 JJD26997_0550 JJD26997_0551 fliR   FALSE 0.211 57.000 0.017 NA   NA
 7008859 7008860 JJD26997_0551 JJD26997_0552   gmk TRUE 0.834 3.000 0.003 NA   NA
 7008860 7008861 JJD26997_0552 JJD26997_0553 gmk   TRUE 0.903 2.000 0.009 1.000 N NA
 7008861 7008862 JJD26997_0553 JJD26997_0554   argS TRUE 0.730 12.000 0.011 1.000 N NA
 7008863 7008864 JJD26997_0555 JJD26997_0556     TRUE 0.998 0.000 0.869 0.053 Y NA
 7008865 7008866 JJD26997_0557 JJD26997_0558   ppiB TRUE 0.762 10.000 0.010 NA   NA
 7008866 7008867 JJD26997_0558 JJD26997_0559 ppiB   FALSE 0.077 145.000 0.000 NA   NA
 7008867 7008868 JJD26997_0559 JJD26997_0561     TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 7008868 7008869 JJD26997_0561 JJD26997_0562     FALSE 0.255 46.000 0.000 NA   NA
 7008869 7008870 JJD26997_0562 JJD26997_0563     TRUE 0.757 11.000 0.000 NA   NA
 7008870 7008871 JJD26997_0563 JJD26997_0564     FALSE 0.100 120.000 0.000 NA   NA
 7008873 7008874 JJD26997_0566 JJD26997_0567     TRUE 0.283 96.000 0.059 NA   NA
 7008874 7008875 JJD26997_0567 JJD26997_0568     TRUE 0.487 20.000 0.000 NA   NA
 7008875 7008876 JJD26997_0568 JJD26997_0569     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7008876 7008877 JJD26997_0569 JJD26997_0570     FALSE 0.031 327.000 0.000 NA   NA
 7008878 7008879 JJD26997_0571 JJD26997_0572 dnaX rho TRUE 0.883 4.000 0.009 1.000 N NA
 7008880 7008881 JJD26997_0573 JJD26997_0574     TRUE 0.995 -3.000 0.713 NA Y NA
 7008883 7008884 JJD26997_0576 JJD26997_0577   waaD TRUE 0.977 1.000 0.093 1.000 N NA
 7008884 7008885 JJD26997_0577 JJD26997_0578 waaD hldE TRUE 0.980 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 7008885 7008886 JJD26997_0578 JJD26997_0579 hldE gmhA-1 TRUE 0.975 -3.000 0.142 1.000 N NA
 7008886 7008887 JJD26997_0579 JJD26997_0581 gmhA-1   TRUE 0.928 0.000 0.019 1.000 N NA
 7008889 7008890 JJD26997_0582 JJD26997_0583     FALSE 0.283 40.000 0.000 NA   NA
 7008890 7008891 JJD26997_0583 JJD26997_0585     TRUE 0.546 27.000 0.000 NA Y NA
 7008892 7008893 JJD26997_0584 JJD26997_0586     TRUE 0.928 -13.000 0.000 NA Y NA
 7008893 7008894 JJD26997_0586 JJD26997_0587   waaM TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA Y NA
 7008894 7008895 JJD26997_0587 JJD26997_0588 waaM waaC TRUE 0.987 -10.000 0.231 1.000 Y NA
 7008896 7008897 JJD26997_0589 JJD26997_0590 wlaX galE TRUE 0.523 59.000 0.086 1.000 N NA
 7008897 7008898 JJD26997_0590 JJD26997_0591 galE wlaB TRUE 0.966 -6.000 0.086 1.000 N NA
 7008898 7008899 JJD26997_0591 JJD26997_0592 wlaB pglH TRUE 0.979 -3.000 0.179 1.000 N NA
 7008899 7008900 JJD26997_0592 JJD26997_0593 pglH pglI TRUE 0.979 -7.000 0.267 NA   NA
 7008900 7008901 JJD26997_0593 JJD26997_0594 pglI pglJ TRUE 0.974 -12.000 0.208 NA   NA
 7008901 7008902 JJD26997_0594 JJD26997_0595 pglJ pglB TRUE 0.986 4.000 0.375 1.000   NA
 7008902 7008903 JJD26997_0595 JJD26997_0596 pglB pglA TRUE 0.882 11.000 0.045 1.000   NA
 7008903 7008904 JJD26997_0596 JJD26997_0597 pglA pglC TRUE 0.980 -7.000 0.128 NA Y NA
 7008904 7008905 JJD26997_0597 JJD26997_0598 pglC pglD TRUE 0.942 -34.000 0.074 NA   NA
 7008905 7008906 JJD26997_0598 JJD26997_0599 pglD pglE TRUE 0.345 97.000 0.070 1.000   NA
 7008906 7008907 JJD26997_0599 JJD26997_0600 pglE pglF TRUE 0.903 2.000 0.000 NA   NA
 7008907 7008908 JJD26997_0600 JJD26997_0602 pglF pglG TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7008908 7008909 JJD26997_0602 JJD26997_0603 pglG cheY FALSE 0.275 113.000 0.062 1.000   NA
 7008909 7008910 JJD26997_0603 JJD26997_0604 cheY prmA TRUE 0.820 23.000 0.146 1.000 N NA
 7008910 7008911 JJD26997_0604 JJD26997_0605 prmA ftsH TRUE 0.986 0.000 0.217 1.000 N NA
 7008911 7008912 JJD26997_0605 JJD26997_0606 ftsH   TRUE 0.945 -3.000 0.043 1.000 N NA
 7008912 7008913 JJD26997_0606 JJD26997_0608   pssA TRUE 0.989 10.000 0.466 1.000 Y NA
 7008915 7008916 JJD26997_0609 JJD26997_0610 msrB   TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7008916 7008917 JJD26997_0610 JJD26997_0611     TRUE 0.323 33.000 0.000 NA   NA
 7008917 7008918 JJD26997_0611 JJD26997_0612     FALSE 0.150 89.000 0.000 NA   NA
 7008919 7008920 JJD26997_0613 JJD26997_0614 aat clpA TRUE 0.974 -25.000 0.087 1.000 Y NA
 7008920 7008921 JJD26997_0614 JJD26997_0615 clpA   TRUE 0.990 -3.000 0.596 NA   NA
 7008921 7008922 JJD26997_0615 JJD26997_0616     TRUE 0.919 0.000 0.024 NA   NA
 7008922 7008923 JJD26997_0616 JJD26997_0617   smpB TRUE 0.645 12.000 0.009 NA   NA
 7008923 7008924 JJD26997_0617 JJD26997_0618 smpB ispE TRUE 0.928 -3.000 0.028 1.000 N NA
 7008924 7008925 JJD26997_0618 JJD26997_0619 ispE csrA TRUE 0.941 -3.000 0.036 1.000 N NA
 7008925 7008926 JJD26997_0619 JJD26997_0620 csrA truB TRUE 0.972 -6.000 0.046 0.025 N NA
 7008926 7008927 JJD26997_0620 JJD26997_0621 truB   TRUE 0.948 -3.000 0.046 1.000 N NA
 7008927 7008928 JJD26997_0621 JJD26997_0622     TRUE 0.902 -3.000 0.026 NA   NA
 7008928 7008929 JJD26997_0622 JJD26997_0623   pepF TRUE 0.626 36.000 0.115 NA   NA
 7008929 7008930 JJD26997_0623 JJD26997_0624 pepF pyrB TRUE 0.871 4.000 0.005 1.000 N NA
 7008930 7008931 JJD26997_0624 JJD26997_0625 pyrB   TRUE 0.797 10.000 0.005 1.000 N NA
 7008932 7008933 JJD26997_0626 JJD26997_0628 metK   FALSE 0.055 193.000 0.000 NA   NA
 7008935 7008936 JJD26997_0629 JJD26997_0630 yajC secD TRUE 0.971 -7.000 0.068 NA Y NA
 7008936 7008937 JJD26997_0630 JJD26997_0631 secD secF TRUE 0.998 0.000 0.436 0.001 Y NA
 7008937 7008938 JJD26997_0631 JJD26997_0632 secF leuS TRUE 0.808 10.000 0.008 1.000 N NA
 7008938 7008939 JJD26997_0632 JJD26997_0633 leuS   FALSE 0.096 165.000 0.031 NA   NA
 7008939 7008940 JJD26997_0633 JJD26997_0634     TRUE 0.861 -16.000 0.000 NA   NA
 7008940 7008941 JJD26997_0634 JJD26997_0635   folC TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 7008941 7008942 JJD26997_0635 JJD26997_0636 folC   FALSE 0.061 178.000 0.000 NA   NA
 7008942 7008943 JJD26997_0636 JJD26997_0637     TRUE 0.845 -63.000 0.000 NA   NA
 7008943 7008944 JJD26997_0637 JJD26997_0638   mfd TRUE 0.924 0.000 0.023 NA N NA
 7008944 7008945 JJD26997_0638 JJD26997_0639 mfd   TRUE 0.889 2.000 0.006 1.000   NA
 7008945 7008946 JJD26997_0639 JJD26997_0640     TRUE 0.897 -3.000 0.018 1.000   NA
 7008946 7008947 JJD26997_0640 JJD26997_0641   thiD TRUE 0.895 -3.000 0.016 1.000 N NA
 7008947 7008948 JJD26997_0641 JJD26997_0642 thiD thiE TRUE 0.870 -10.000 0.000 NA   NA
 7008948 7008949 JJD26997_0642 JJD26997_0644 thiE hemD TRUE 0.854 -22.000 0.000 NA   NA
 7008950 7008951 JJD26997_0643 JJD26997_0645     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 7008951 7008952 JJD26997_0645 JJD26997_0646   ctsT TRUE 0.993 -3.000 0.800 NA   NA
 7008952 7008953 JJD26997_0646 JJD26997_0647 ctsT proC TRUE 0.543 39.000 0.075 NA   NA
 7008953 7008954 JJD26997_0647 JJD26997_0648 proC   TRUE 0.965 0.000 0.075 NA   NA
 7008955 7008956 JJD26997_0649 JJD26997_0650   lon TRUE 0.747 17.000 0.062 NA   NA
 7008957 7008958 JJD26997_0651 JJD26997_0652 rpsR ssb TRUE 0.870 11.000 0.034 1.000 N NA
 7008958 7008959 JJD26997_0652 JJD26997_0653 ssb rpsF TRUE 0.922 9.000 0.033 1.000 N NA
 7008959 7008960 JJD26997_0653 JJD26997_0654 rpsF   FALSE 0.099 87.000 0.002 NA   NA
 7008960 7008961 JJD26997_0654 JJD26997_0655     TRUE 0.808 -7.000 0.002 NA   NA
 7008961 7008962 JJD26997_0655 JJD26997_0656   pgsA TRUE 0.954 -3.000 0.023 0.052 N NA
 7008962 7008963 JJD26997_0656 JJD26997_0657 pgsA   FALSE 0.249 42.000 0.003 1.000 N NA
 7008963 7008964 JJD26997_0657 JJD26997_0658     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7008964 7008965 JJD26997_0658 JJD26997_0660     FALSE 0.230 54.000 0.000 NA   NA
 7008965 7008966 JJD26997_0660 JJD26997_0661     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 7008967 7008968 JJD26997_0662 JJD26997_0663 ileS gatA FALSE 0.221 101.000 0.008 1.000 Y NA
 7008968 7008969 JJD26997_0663 JJD26997_0664 gatA guaB TRUE 0.896 10.000 0.032 1.000 N NA
 7008969 7008970 JJD26997_0664 JJD26997_0665 guaB   TRUE 0.861 -3.000 0.007 1.000   NA
 7008970 7008971 JJD26997_0665 JJD26997_0666     TRUE 0.930 -7.000 0.032 1.000   NA
 7008971 7008972 JJD26997_0666 JJD26997_0667     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 7008972 7008973 JJD26997_0667 JJD26997_0669     TRUE 0.871 5.000 0.000 NA   NA
 7008973 7008974 JJD26997_0669 JJD26997_0671     FALSE 0.026 376.000 0.000 NA   NA
 7008974 7008975 JJD26997_0671 JJD26997_0672     TRUE 0.916 17.000 0.103 0.004   NA
 7008975 7008976 JJD26997_0672 JJD26997_0673     TRUE 0.548 128.000 0.517 NA   NA
 7008976 7008977 JJD26997_0673 JJD26997_0674     TRUE 0.992 -7.000 0.788 NA   NA
 7008977 7008978 JJD26997_0674 JJD26997_0675     FALSE 0.019 880.000 0.000 NA   NA
 7008979 7008980 JJD26997_0676 JJD26997_0677     FALSE 0.028 359.000 0.000 NA   NA
 7008980 7008981 JJD26997_0677 JJD26997_0678     FALSE 0.067 164.000 0.000 NA   NA
 7008981 7008982 JJD26997_0678 JJD26997_0679     FALSE 0.024 435.000 0.000 NA   NA
 7008983 7008984 JJD26997_0680 JJD26997_0681 murC   TRUE 0.853 -7.000 0.014 NA   NA
 7008984 7008985 JJD26997_0681 JJD26997_0683   mutS TRUE 0.976 -7.000 0.217 NA   NA
 7008986 7008987 JJD26997_0682 JJD26997_0684     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 7008988 7008989 JJD26997_0686 JJD26997_0687     TRUE 0.987 -7.000 0.417 1.000   NA
 7008989 7008990 JJD26997_0687 JJD26997_0688   dapE TRUE 0.944 4.000 0.018 1.000 Y NA
 7008990 7008991 JJD26997_0688 JJD26997_0689 dapE   TRUE 0.798 10.000 0.005 1.000 N NA
 7008991 7008992 JJD26997_0689 JJD26997_0690     TRUE 0.871 5.000 0.000 NA   NA
 7008992 7008993 JJD26997_0690 JJD26997_0691     TRUE 0.982 0.000 0.208 NA   NA
 7008994 7008995 JJD26997_0692 JJD26997_0693     FALSE 0.097 122.000 0.000 NA   NA
 7008995 7008996 JJD26997_0693 JJD26997_0694     TRUE 0.376 27.000 0.000 NA   NA
 7008996 7008997 JJD26997_0694 JJD26997_0695     FALSE 0.044 231.000 0.000 NA   NA
 7008997 7008998 JJD26997_0695 JJD26997_0696     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7008998 7008999 JJD26997_0696 JJD26997_0697     FALSE 0.092 127.000 0.000 NA   NA
 7008999 7009000 JJD26997_0697 JJD26997_0698     FALSE 0.129 103.000 0.000 NA   NA
 7009000 7009001 JJD26997_0698 JJD26997_0699     TRUE 0.460 22.000 0.000 NA   NA
 7009001 7009002 JJD26997_0699 JJD26997_0700     FALSE 0.131 102.000 0.000 NA   NA
 7009002 7009003 JJD26997_0700 JJD26997_0701     FALSE 0.186 69.000 0.000 NA   NA
 7009003 7009004 JJD26997_0701 JJD26997_0703     FALSE 0.075 148.000 0.000 NA   NA
 7009004 7009005 JJD26997_0703 JJD26997_0704     TRUE 0.903 2.000 0.000 NA   NA
 7009005 7009006 JJD26997_0704 JJD26997_0705     TRUE 0.872 52.000 0.500 1.000 Y NA
 7009006 7009007 JJD26997_0705 JJD26997_0706     TRUE 0.997 -7.000 0.500 0.007 Y NA
 7009007 7009008 JJD26997_0706 JJD26997_0707     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 7009008 7009009 JJD26997_0707 JJD26997_0708     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 7009009 7009010 JJD26997_0708 JJD26997_0709     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7009010 7009011 JJD26997_0709 JJD26997_0710     TRUE 0.957 0.000 0.018 1.000 Y NA
 7009011 7009012 JJD26997_0710 JJD26997_0711     TRUE 0.324 79.000 0.018 1.000 Y NA
 7009012 7009013 JJD26997_0711 JJD26997_0712     TRUE 0.996 2.000 1.000 NA   NA
 7009013 7009014 JJD26997_0712 JJD26997_0713     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 7009014 7009015 JJD26997_0713 JJD26997_0714     TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 7009015 7009016 JJD26997_0714 JJD26997_0715     TRUE 0.876 -6.000 0.000 NA   NA
 7009016 7009017 JJD26997_0715 JJD26997_0716     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA Y NA
 7009017 7009018 JJD26997_0716 JJD26997_0717   glf TRUE 0.934 2.000 0.008 NA Y NA
 7009018 7009019 JJD26997_0717 JJD26997_0718 glf   TRUE 0.462 28.000 0.008 NA Y NA
 7009019 7009020 JJD26997_0718 JJD26997_0719     TRUE 0.933 -3.000 0.000 NA Y NA
 7009021 7009022 JJD26997_0720 JJD26997_0721     FALSE 0.159 102.000 0.000 1.000   NA
 7009022 7009023 JJD26997_0721 JJD26997_0722     TRUE 0.898 -3.000 0.000 1.000   NA
 7009023 7009024 JJD26997_0722 JJD26997_0723     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7009024 7009025 JJD26997_0723 JJD26997_0724     TRUE 0.850 -30.000 0.000 NA   NA
 7009025 7009026 JJD26997_0724 JJD26997_0725     TRUE 0.864 1.000 0.005 NA   NA
 7009026 7009027 JJD26997_0725 JJD26997_0726     FALSE 0.201 80.000 0.000 1.000   NA
 7009027 7009028 JJD26997_0726 JJD26997_0727     TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7009029 7009030 JJD26997_0728 JJD26997_0729     FALSE 0.159 84.000 0.000 NA   NA
 7009030 7009031 JJD26997_0729 JJD26997_0731     TRUE 0.868 -12.000 0.000 NA   NA
 7009031 7009032 JJD26997_0731 JJD26997_0732     FALSE 0.146 92.000 0.000 NA   NA
 7009033 7009034 JJD26997_0733 JJD26997_0734   thiS TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009034 7009035 JJD26997_0734 JJD26997_0735 thiS thiF TRUE 0.967 -3.000 0.043 1.000 Y NA
 7009035 7009036 JJD26997_0735 JJD26997_0736 thiF thiG TRUE 0.964 3.000 0.003 0.032 Y NA
 7009036 7009037 JJD26997_0736 JJD26997_0737 thiG thiH TRUE 0.996 3.000 0.277 0.003 Y NA
 7009037 7009038 JJD26997_0737 JJD26997_0738 thiH   TRUE 0.992 -10.000 0.128 0.003 Y NA
 7009038 7009039 JJD26997_0738 JJD26997_0739     FALSE 0.137 97.000 0.000 NA   NA
 7009039 7009040 JJD26997_0739 JJD26997_0742     FALSE 0.086 132.000 0.000 NA   NA
 7009041 7009042 JJD26997_0743 JJD26997_0744 murG   TRUE 0.992 -3.000 0.647 1.000 N NA
 7009043 7009044 JJD26997_0745 JJD26997_0746 accC-1   TRUE 0.987 4.000 0.400 1.000   NA
 7009044 7009045 JJD26997_0746 JJD26997_0747     TRUE 0.916 0.000 0.016 1.000   NA
 7009045 7009046 JJD26997_0747 JJD26997_0748     TRUE 0.932 1.000 0.022 1.000   NA
 7009047 7009048 JJD26997_0749 JJD26997_0750     TRUE 0.996 3.000 0.844 NA Y NA
 7009048 7009049 JJD26997_0750 JJD26997_0751     TRUE 0.980 -3.000 0.207 1.000 N NA
 7009049 7009050 JJD26997_0751 JJD26997_0752     TRUE 0.483 48.000 0.000 0.025 N NA
 7009051 7009052 JJD26997_0753 JJD26997_0754     TRUE 0.985 2.000 0.100 1.000 Y NA
 7009052 7009053 JJD26997_0754 JJD26997_0755     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009053 7009054 JJD26997_0755 JJD26997_0757     TRUE 0.858 -18.000 0.000 NA   NA
 7009054 7009055 JJD26997_0757 JJD26997_0758   lepA FALSE 0.020 762.000 0.000 NA   NA
 7009055 7009056 JJD26997_0758 JJD26997_0759 lepA mapA FALSE 0.113 77.000 0.003 NA   NA
 7009056 7009057 JJD26997_0759 JJD26997_0760 mapA ctsW TRUE 0.971 -3.000 0.152 NA   NA
 7009057 7009058 JJD26997_0760 JJD26997_0761 ctsW gyrA FALSE 0.251 41.000 0.007 1.000   NA
 7009058 7009059 JJD26997_0761 JJD26997_0762 gyrA   FALSE 0.139 68.000 0.008 NA   NA
 7009059 7009060 JJD26997_0762 JJD26997_0763     TRUE 0.754 108.000 0.900 NA   NA
 7009060 7009061 JJD26997_0763 JJD26997_0764     TRUE 0.609 58.000 0.205 NA   NA
 7009061 7009062 JJD26997_0764 JJD26997_0765   asd TRUE 0.940 0.000 0.025 1.000 N NA
 7009062 7009063 JJD26997_0765 JJD26997_0766 asd   TRUE 0.875 9.000 0.025 NA   NA
 7009063 7009064 JJD26997_0766 JJD26997_0767     TRUE 0.436 52.000 0.062 NA   NA
 7009064 7009065 JJD26997_0767 JJD26997_0768     TRUE 0.973 9.000 0.250 NA   NA
 7009065 7009066 JJD26997_0768 JJD26997_0769     TRUE 0.797 31.000 0.312 NA N NA
 7009066 7009067 JJD26997_0769 JJD26997_0770     TRUE 0.971 22.000 1.000 NA Y NA
 7009067 7009068 JJD26997_0770 JJD26997_0771   livH TRUE 0.837 20.000 0.085 NA Y NA
 7009068 7009069 JJD26997_0771 JJD26997_0772 livH livM TRUE 0.998 0.000 0.771 0.025 Y NA
 7009069 7009070 JJD26997_0772 JJD26997_0773 livM livG TRUE 0.987 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 7009070 7009071 JJD26997_0773 JJD26997_0774 livG livF TRUE 0.995 -16.000 0.381 0.018 Y NA
 7009071 7009072 JJD26997_0774 JJD26997_0775 livF   TRUE 0.904 18.000 0.280 1.000 N NA
 7009072 7009073 JJD26997_0775 JJD26997_0776     TRUE 0.989 1.000 0.400 NA   NA
 7009074 7009075 JJD26997_0777 JJD26997_0778     FALSE 0.234 53.000 0.000 NA   NA
 7009075 7009076 JJD26997_0778 JJD26997_0779   tgt TRUE 0.992 2.000 0.444 1.000 N NA
 7009077 7009078 JJD26997_0780 JJD26997_0781   aroB TRUE 0.386 46.000 0.031 1.000   NA
 7009078 7009079 JJD26997_0781 JJD26997_0782 aroB   TRUE 0.944 -3.000 0.041 1.000 N NA
 7009079 7009080 JJD26997_0782 JJD26997_0783     TRUE 0.958 -3.000 0.063 1.000 N NA
 7009080 7009081 JJD26997_0783 JJD26997_0784     TRUE 0.962 4.000 0.067 1.000 N NA
 7009083 7009084 JJD26997_0786 JJD26997_0787   sixA TRUE 0.927 -3.000 0.040 NA   NA
 7009085 7009086 JJD26997_0788 JJD26997_0789 rpoD   FALSE 0.167 80.000 0.000 NA   NA
 7009087 7009088 JJD26997_0790 JJD26997_0791     FALSE 0.102 119.000 0.000 NA   NA
 7009089 7009090 JJD26997_0792 JJD26997_0793 gidB ribA TRUE 0.926 1.000 0.017 1.000 N NA
 7009091 7009092 JJD26997_0794 JJD26997_0795 hemB argF TRUE 0.909 -3.000 0.020 1.000 N NA
 7009092 7009093 JJD26997_0795 JJD26997_0796 argF   TRUE 0.899 -3.000 0.025 NA   NA
 7009093 7009094 JJD26997_0796 JJD26997_0797   hemN TRUE 0.984 -13.000 0.419 NA   NA
 7009094 7009095 JJD26997_0797 JJD26997_0798 hemN   TRUE 0.995 2.000 0.419 0.016 N NA
 7009097 7009098 JJD26997_0800 JJD26997_0801   pepT TRUE 0.962 4.000 0.089 NA N NA
 7009098 7009099 JJD26997_0801 JJD26997_0802 pepT   FALSE 0.020 779.000 0.000 NA   NA
 7009099 7009100 JJD26997_0802 JJD26997_0803   hipO TRUE 0.323 33.000 0.000 NA   NA
 7009101 7009102 JJD26997_0804 JJD26997_0805   jlpA FALSE 0.109 92.000 0.009 NA   NA
 7009103 7009104 JJD26997_0806 JJD26997_0807 cjaA   FALSE 0.283 40.000 0.000 NA   NA
 7009104 7009105 JJD26997_0807 JJD26997_0808     TRUE 0.872 -9.000 0.000 NA   NA
 7009107 7009108 JJD26997_0811 JJD26997_0812     TRUE 0.979 9.000 0.375 NA   NA
 7009109 7009110 JJD26997_0813 JJD26997_0814     FALSE 0.157 73.000 0.015 NA   NA
 7009110 7009111 JJD26997_0814 JJD26997_0815     FALSE 0.021 603.000 0.000 NA   NA
 7009113 7009114 JJD26997_0816 JJD26997_0818     TRUE 0.768 36.000 0.323 NA   NA
 7009114 7009115 JJD26997_0818 JJD26997_0819     TRUE 0.715 27.000 0.102 1.000   NA
 7009116 7009117 JJD26997_0820 JJD26997_0821 rpmH rnpA TRUE 0.993 -3.000 0.787 1.000   NA
 7009117 7009118 JJD26997_0821 JJD26997_0822 rnpA   TRUE 0.989 -3.000 0.540 NA   NA
 7009118 7009119 JJD26997_0822 JJD26997_0823     TRUE 0.987 -3.000 0.461 NA   NA
 7009119 7009120 JJD26997_0823 JJD26997_0824     TRUE 0.946 -3.000 0.061 NA   NA
 7009120 7009121 JJD26997_0824 JJD26997_0825   trmE TRUE 0.936 -7.000 0.049 NA   NA
 7009121 7009122 JJD26997_0825 JJD26997_0826 trmE purL TRUE 0.737 11.000 0.008 1.000   NA
 7009122 7009123 JJD26997_0826 JJD26997_0827 purL   FALSE 0.095 129.000 0.011 1.000 N NA
 7009123 7009124 JJD26997_0827 JJD26997_0828   purH TRUE 0.884 3.000 0.005 1.000 N NA
 7009124 7009125 JJD26997_0828 JJD26997_0829 purH   FALSE 0.137 97.000 0.000 NA   NA
 7009125 7009126 JJD26997_0829 JJD26997_0830     FALSE 0.252 47.000 0.000 NA   NA
 7009127 7009128 JJD26997_0831 JJD26997_0832     TRUE 0.987 -10.000 0.500 NA   NA
 7009128 7009129 JJD26997_0832 JJD26997_0833     FALSE 0.100 120.000 0.000 NA   NA
 7009129 7009130 JJD26997_0833 JJD26997_0834     TRUE 0.499 19.000 0.000 NA   NA
 7009130 7009131 JJD26997_0834 JJD26997_0835     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7009131 7009132 JJD26997_0835 JJD26997_0836     TRUE 0.991 -3.000 0.667 NA   NA
 7009132 7009133 JJD26997_0836 JJD26997_0837     TRUE 0.988 -7.000 0.500 NA   NA
 7009133 7009134 JJD26997_0837 JJD26997_0838     TRUE 0.585 15.000 0.000 NA   NA
 7009134 7009135 JJD26997_0838 JJD26997_0839     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009135 7009136 JJD26997_0839 JJD26997_0840     TRUE 0.519 18.000 0.000 NA   NA
 7009136 7009137 JJD26997_0840 JJD26997_0841     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7009137 7009138 JJD26997_0841 JJD26997_0843     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7009138 7009139 JJD26997_0843 JJD26997_0844     FALSE 0.084 134.000 0.000 NA   NA
 7009140 7009141 JJD26997_0845 JJD26997_0846     FALSE 0.032 317.000 0.000 NA   NA
 7009141 7009142 JJD26997_0846 JJD26997_0847     FALSE 0.019 856.000 0.000 NA   NA
 7009142 7009143 JJD26997_0847 JJD26997_0848     FALSE 0.022 537.000 0.000 NA   NA
 7009143 7009144 JJD26997_0848 JJD26997_0849     FALSE 0.148 91.000 0.000 NA   NA
 7009144 7009145 JJD26997_0849 JJD26997_0850     TRUE 0.394 26.000 0.000 NA   NA
 7009145 7009146 JJD26997_0850 JJD26997_0851     FALSE 0.104 117.000 0.000 NA   NA
 7009146 7009147 JJD26997_0851 JJD26997_0852     FALSE 0.276 41.000 0.000 NA   NA
 7009147 7009148 JJD26997_0852 JJD26997_0853     FALSE 0.049 208.000 0.000 NA   NA
 7009148 7009149 JJD26997_0853 JJD26997_0854     FALSE 0.047 222.000 0.000 NA   NA
 7009149 7009150 JJD26997_0854 JJD26997_0855     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7009150 7009151 JJD26997_0855 JJD26997_0856   tdk TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7009151 7009152 JJD26997_0856 JJD26997_0857 tdk   FALSE 0.251 61.000 0.000 1.000   NA
 7009152 7009153 JJD26997_0857 JJD26997_0858     FALSE 0.170 79.000 0.000 NA   NA
 7009153 7009154 JJD26997_0858 JJD26997_0859     FALSE 0.067 162.000 0.000 NA   NA
 7009154 7009155 JJD26997_0859 JJD26997_0860     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7009155 7009156 JJD26997_0860 JJD26997_0861     FALSE 0.134 100.000 0.000 NA   NA
 7009156 7009157 JJD26997_0861 JJD26997_0862     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7009157 7009158 JJD26997_0862 JJD26997_0863     TRUE 0.585 15.000 0.000 NA   NA
 7009158 7009159 JJD26997_0863 JJD26997_0864     FALSE 0.137 97.000 0.000 NA   NA
 7009159 7009160 JJD26997_0864 JJD26997_0865     FALSE 0.156 86.000 0.000 NA   NA
 7009160 7009161 JJD26997_0865 JJD26997_0866     FALSE 0.263 44.000 0.000 NA   NA
 7009161 7009162 JJD26997_0866 JJD26997_0867     FALSE 0.211 61.000 0.000 NA   NA
 7009162 7009163 JJD26997_0867 JJD26997_0868     TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 7009163 7009164 JJD26997_0868 JJD26997_0869     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 7009165 7009166 JJD26997_0870 JJD26997_0871     TRUE 0.941 12.000 0.250 NA   NA
 7009168 7009169 JJD26997_0873 JJD26997_0874     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7009169 7009170 JJD26997_0874 JJD26997_0875     FALSE 0.207 62.000 0.000 NA   NA
 7009170 7009171 JJD26997_0875 JJD26997_0876     FALSE 0.034 303.000 0.000 NA   NA
 7009171 7009172 JJD26997_0876 JJD26997_0877     FALSE 0.054 195.000 0.000 NA   NA
 7009172 7009173 JJD26997_0877 JJD26997_0878   atpE TRUE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 7009174 7009175 JJD26997_0879 JJD26997_0880     TRUE 0.981 13.000 0.444 0.002   NA
 7009175 7009176 JJD26997_0880 JJD26997_0881     TRUE 0.663 33.000 0.100 1.000   NA
 7009176 7009177 JJD26997_0881 JJD26997_0882   pckA TRUE 0.812 13.000 0.016 1.000 Y NA
 7009177 7009178 JJD26997_0882 JJD26997_0883 pckA argH TRUE 0.803 10.000 0.006 1.000 N NA
 7009179 7009180 JJD26997_0884 JJD26997_0885     TRUE 0.924 -3.000 0.026 1.000 N NA
 7009180 7009181 JJD26997_0885 JJD26997_0886     TRUE 0.978 -3.000 0.250 NA   NA
 7009181 7009182 JJD26997_0886 JJD26997_0887   apt TRUE 0.560 19.000 0.026 NA   NA
 7009182 7009183 JJD26997_0887 JJD26997_0888 apt   TRUE 0.906 -3.000 0.028 NA   NA
 7009183 7009184 JJD26997_0888 JJD26997_0889   rpiB TRUE 0.971 0.000 0.103 NA   NA
 7009185 7009186 JJD26997_0890 JJD26997_0891 cheB cheR TRUE 0.562 16.000 0.000 NA   NA
 7009186 7009187 JJD26997_0891 JJD26997_0892 cheR pebC FALSE 0.081 136.000 0.000 NA   NA
 7009187 7009188 JJD26997_0892 JJD26997_0893 pebC pebA TRUE 0.953 23.000 0.594 1.000 Y NA
 7009188 7009189 JJD26997_0893 JJD26997_0894 pebA   TRUE 0.996 2.000 0.400 0.032 Y NA
 7009189 7009190 JJD26997_0894 JJD26997_0895     TRUE 0.996 11.000 0.947 0.012 Y NA
 7009190 7009191 JJD26997_0895 JJD26997_0896   prsA TRUE 0.303 108.000 0.029 1.000 Y NA
 7009191 7009192 JJD26997_0896 JJD26997_0897 prsA cstA FALSE 0.076 167.000 0.014 1.000 N NA
 7009192 7009193 JJD26997_0897 JJD26997_0898 cstA   TRUE 0.972 -22.000 0.229 NA   NA
 7009195 7009196 JJD26997_0900 JJD26997_0901 ciaB hup TRUE 0.388 112.000 0.167 NA   NA
 7009196 7009197 JJD26997_0901 JJD26997_0902 hup cysK FALSE 0.139 127.000 0.024 1.000 N NA
 7009198 7009199 JJD26997_0903 JJD26997_0904     TRUE 0.974 -3.000 0.192 NA   NA
 7009199 7009200 JJD26997_0904 JJD26997_0905     TRUE 0.953 4.000 0.069 NA   NA
 7009201 7009202 JJD26997_0906 JJD26997_0907   alr TRUE 0.915 1.000 0.021 NA   NA
 7009202 7009203 JJD26997_0907 JJD26997_0908 alr   TRUE 0.882 3.000 0.005 1.000 N NA
 7009203 7009204 JJD26997_0908 JJD26997_0909     FALSE 0.090 128.000 0.000 NA   NA
 7009205 7009206 JJD26997_0911 JJD26997_0912     TRUE 0.979 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 7009207 7009208 JJD26997_0913 JJD26997_0914   thiJ TRUE 0.848 -7.000 0.012 NA   NA
 7009210 7009211 JJD26997_0916 JJD26997_0917 pheS pheT TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 7009211 7009212 JJD26997_0917 JJD26997_0918 pheT aroA TRUE 0.820 12.000 0.028 1.000 N NA
 7009212 7009213 JJD26997_0918 JJD26997_0919 aroA ispH TRUE 0.931 -10.000 0.032 1.000 N NA
 7009213 7009214 JJD26997_0919 JJD26997_0920 ispH rpsA TRUE 0.322 130.000 0.118 1.000 N NA
 7009214 7009215 JJD26997_0920 JJD26997_0921 rpsA   TRUE 0.987 0.000 0.343 NA   NA
 7009215 7009216 JJD26997_0921 JJD26997_0922   serA TRUE 0.898 -3.000 0.025 NA   NA
 7009216 7009217 JJD26997_0922 JJD26997_0923 serA   TRUE 0.859 -13.000 0.006 1.000 N NA
 7009217 7009218 JJD26997_0923 JJD26997_0924     TRUE 0.988 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 7009218 7009219 JJD26997_0924 JJD26997_0925     TRUE 0.928 4.000 0.007 0.097   NA
 7009220 7009221 JJD26997_0926 JJD26997_0927     TRUE 0.853 -25.000 0.000 NA   NA
 7009222 7009223 JJD26997_0928 JJD26997_0929     TRUE 0.426 80.000 0.111 NA   NA
 7009223 7009224 JJD26997_0929 JJD26997_0930     TRUE 0.990 4.000 0.167 0.002   NA
 7009224 7009225 JJD26997_0930 JJD26997_0931     TRUE 0.998 -3.000 1.000 0.002   NA
 7009225 7009226 JJD26997_0931 JJD26997_0932     TRUE 0.995 -3.000 1.000 1.000   NA
 7009226 7009227 JJD26997_0932 JJD26997_0933     TRUE 0.957 13.000 0.429 1.000   NA
 7009227 7009228 JJD26997_0933 JJD26997_0934     TRUE 0.986 -3.000 0.429 NA   NA
 7009228 7009229 JJD26997_0934 JJD26997_0935     TRUE 0.989 -31.000 0.667 NA   NA
 7009229 7009230 JJD26997_0935 JJD26997_0936     FALSE 0.028 359.000 0.000 NA   NA
 7009230 7009231 JJD26997_0936 JJD26997_0937     TRUE 0.890 -13.000 0.000 1.000   NA
 7009231 7009232 JJD26997_0937 JJD26997_0938     TRUE 0.978 -12.000 0.273 NA   NA
 7009232 7009233 JJD26997_0938 JJD26997_0939     TRUE 0.850 9.000 0.000 NA   NA
 7009233 7009234 JJD26997_0939 JJD26997_0940     TRUE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 7009234 7009235 JJD26997_0940 JJD26997_0941     FALSE 0.038 266.000 0.000 NA   NA
 7009236 7009237 JJD26997_0942 JJD26997_0943     FALSE 0.047 220.000 0.000 NA   NA
 7009237 7009238 JJD26997_0943 JJD26997_0944     TRUE 0.993 1.000 0.667 NA   NA
 7009238 7009239 JJD26997_0944 JJD26997_0945     FALSE 0.111 113.000 0.000 NA   NA
 7009239 7009240 JJD26997_0945 JJD26997_0946     TRUE 0.996 1.000 1.000 NA   NA
 7009240 7009241 JJD26997_0946 JJD26997_0947     FALSE 0.072 156.000 0.000 NA   NA
 7009241 7009242 JJD26997_0947 JJD26997_0948     TRUE 0.988 -7.000 0.500 NA   NA
 7009242 7009243 JJD26997_0948 JJD26997_0949     TRUE 0.519 18.000 0.000 NA   NA
 7009243 7009244 JJD26997_0949 JJD26997_0950     TRUE 0.971 -16.000 0.200 NA   NA
 7009245 7009246 JJD26997_0951 JJD26997_0952     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7009247 7009248 JJD26997_0953 JJD26997_0954     FALSE 0.031 325.000 0.000 NA   NA
 7009249 7009250 JJD26997_0955 JJD26997_0956     FALSE 0.198 65.000 0.000 NA   NA
 7009250 7009251 JJD26997_0956 JJD26997_0957     TRUE 0.978 3.000 0.200 NA   NA
 7009251 7009252 JJD26997_0957 JJD26997_0958     FALSE 0.072 156.000 0.000 NA   NA
 7009252 7009253 JJD26997_0958 JJD26997_0959     TRUE 0.833 -3.000 0.009 NA   NA
 7009253 7009254 JJD26997_0959 JJD26997_0960     FALSE 0.207 62.000 0.000 NA   NA
 7009254 7009255 JJD26997_0960 JJD26997_0961     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009255 7009256 JJD26997_0961 JJD26997_0962     FALSE 0.019 901.000 0.000 NA   NA
 7009256 7009257 JJD26997_0962 JJD26997_0963     TRUE 0.870 -10.000 0.000 NA   NA
 7009258 7009259 JJD26997_0964 JJD26997_0965     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7009259 7009260 JJD26997_0965 JJD26997_0966     TRUE 0.865 -13.000 0.000 NA   NA
 7009260 7009261 JJD26997_0966 JJD26997_0967     TRUE 0.846 -45.000 0.000 NA   NA
 7009261 7009262 JJD26997_0967 JJD26997_0968     FALSE 0.230 54.000 0.000 NA   NA
 7009262 7009263 JJD26997_0968 JJD26997_0969     TRUE 0.562 16.000 0.000 NA   NA
 7009263 7009264 JJD26997_0969 JJD26997_0970     FALSE 0.109 114.000 0.000 NA   NA
 7009264 7009265 JJD26997_0970 JJD26997_0971     TRUE 0.443 23.000 0.000 NA   NA
 7009265 7009266 JJD26997_0971 JJD26997_0972     TRUE 0.757 11.000 0.000 NA   NA
 7009266 7009267 JJD26997_0972 JJD26997_0973     TRUE 0.540 17.000 0.000 NA   NA
 7009267 7009268 JJD26997_0973 JJD26997_0974     TRUE 0.947 13.000 0.400 NA   NA
 7009268 7009269 JJD26997_0974 JJD26997_0975     FALSE 0.022 504.000 0.000 NA   NA
 7009269 7009270 JJD26997_0975 JJD26997_0976     FALSE 0.039 263.000 0.000 NA   NA
 7009273 7009274 JJD26997_0979 JJD26997_0980     FALSE 0.276 41.000 0.000 NA   NA
 7009274 7009275 JJD26997_0980 JJD26997_0981     TRUE 0.861 -16.000 0.000 NA   NA
 7009275 7009276 JJD26997_0981 JJD26997_0982     FALSE 0.226 55.000 0.000 NA   NA
 7009276 7009277 JJD26997_0982 JJD26997_0983     TRUE 0.857 -19.000 0.000 NA   NA
 7009278 7009279 JJD26997_0984 JJD26997_0985   acnB FALSE 0.100 102.000 0.010 NA   NA
 7009281 7009282 JJD26997_0986 JJD26997_0988   metS TRUE 0.947 4.000 0.046 1.000   NA
 7009282 7009283 JJD26997_0988 JJD26997_0989 metS   TRUE 0.838 10.000 0.024 NA   NA
 7009283 7009284 JJD26997_0989 JJD26997_0990   fbp TRUE 0.922 26.000 0.778 NA   NA
 7009284 7009285 JJD26997_0990 JJD26997_0991 fbp mobB TRUE 0.894 2.000 0.005 1.000 N NA
 7009285 7009286 JJD26997_0991 JJD26997_0992 mobB   FALSE 0.025 478.000 0.000 NA N NA
 7009286 7009287 JJD26997_0992 JJD26997_0993     TRUE 0.955 -3.000 0.080 NA   NA
 7009287 7009288 JJD26997_0993 JJD26997_0994   gltX-1 TRUE 0.969 3.000 0.088 1.000   NA
 7009289 7009290 JJD26997_0995 JJD26997_0997   psd TRUE 0.964 -3.000 0.089 1.000   NA
 7009291 7009292 JJD26997_0996 JJD26997_0998     TRUE 0.940 -3.000 0.042 1.000   NA
 7009292 7009293 JJD26997_0998 JJD26997_0999     TRUE 0.964 -7.000 0.091 1.000   NA
 7009293 7009294 JJD26997_0999 JJD26997_1000     TRUE 0.978 -22.000 0.318 NA   NA
 7009294 7009295 JJD26997_1000 JJD26997_1001     TRUE 0.985 0.000 0.269 NA   NA
 7009295 7009296 JJD26997_1001 JJD26997_1002   hemL TRUE 0.580 111.000 0.462 NA   NA
 7009296 7009297 JJD26997_1002 JJD26997_1003 hemL   TRUE 0.979 -3.000 0.212 1.000   NA
 7009298 7009299 JJD26997_1004 JJD26997_1005 folD lepB TRUE 0.954 10.000 0.117 1.000 N NA
 7009300 7009301 JJD26997_1006 JJD26997_1007   murA TRUE 0.919 -3.000 0.024 1.000 N NA
 7009301 7009302 JJD26997_1007 JJD26997_1008 murA   FALSE 0.194 66.000 0.000 NA   NA
 7009304 7009305 JJD26997_1009 JJD26997_1011 pabA pabB TRUE 0.984 -3.000 0.048 0.016 Y NA
 7009305 7009306 JJD26997_1011 JJD26997_1012 pabB   TRUE 0.872 -10.000 0.009 1.000 N NA
 7009307 7009308 JJD26997_1013 JJD26997_1014 dsbA dsbB TRUE 0.951 12.000 0.333 NA   NA
 7009308 7009309 JJD26997_1014 JJD26997_1015 dsbB   FALSE 0.152 88.000 0.000 NA   NA
 7009309 7009310 JJD26997_1015 JJD26997_1017     FALSE 0.028 357.000 0.000 NA   NA
 7009310 7009311 JJD26997_1017 JJD26997_1019     TRUE 0.868 -12.000 0.000 NA   NA
 7009311 7009312 JJD26997_1019 JJD26997_1020     TRUE 0.852 -27.000 0.000 NA   NA
 7009312 7009313 JJD26997_1020 JJD26997_1021     FALSE 0.223 56.000 0.000 NA   NA
 7009314 7009315 JJD26997_1022 JJD26997_1024     FALSE 0.152 88.000 0.000 NA   NA
 7009315 7009316 JJD26997_1024 JJD26997_1025     TRUE 0.981 -3.000 0.294 NA   NA
 7009316 7009317 JJD26997_1025 JJD26997_1026     TRUE 0.967 -16.000 0.154 NA   NA
 7009317 7009318 JJD26997_1026 JJD26997_1027   flhA TRUE 0.960 9.000 0.106 1.000   NA
 7009318 7009319 JJD26997_1027 JJD26997_1028 flhA   TRUE 0.614 26.000 0.053 NA N NA
 7009321 7009322 JJD26997_1030 JJD26997_1031     TRUE 0.416 110.000 0.145 1.000   NA
 7009323 7009324 JJD26997_1032 JJD26997_1033     TRUE 0.757 11.000 0.000 NA   NA
 7009324 7009325 JJD26997_1033 JJD26997_1034     FALSE 0.054 195.000 0.000 NA   NA
 7009325 7009326 JJD26997_1034 JJD26997_1035     FALSE 0.034 303.000 0.000 NA   NA
 7009326 7009327 JJD26997_1035 JJD26997_1036     FALSE 0.207 62.000 0.000 NA   NA
 7009329 7009330 JJD26997_1038 JJD26997_1039     FALSE 0.019 1108.000 0.000 NA   NA
 7009330 7009331 JJD26997_1039 JJD26997_1040     FALSE 0.060 180.000 0.000 NA   NA
 7009332 7009333 JJD26997_1041 JJD26997_1042   hypA FALSE 0.060 181.000 0.000 NA   NA
 7009333 7009334 JJD26997_1042 JJD26997_1043 hypA hypE TRUE 0.971 0.000 0.080 1.000   NA
 7009334 7009335 JJD26997_1043 JJD26997_1044 hypE hypD TRUE 0.944 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 7009335 7009336 JJD26997_1044 JJD26997_1045 hypD hypC TRUE 0.977 -16.000 0.123 NA Y NA
 7009336 7009337 JJD26997_1045 JJD26997_1046 hypC hypB TRUE 0.994 0.000 0.463 NA Y NA
 7009337 7009338 JJD26997_1046 JJD26997_1047 hypB hypF TRUE 0.529 77.000 0.064 1.000 Y NA
 7009338 7009339 JJD26997_1047 JJD26997_1048 hypF   TRUE 0.854 -19.000 0.018 NA   NA
 7009339 7009340 JJD26997_1048 JJD26997_1049     TRUE 0.686 41.000 0.211 NA   NA
 7009340 7009341 JJD26997_1049 JJD26997_1050     TRUE 0.948 -24.000 0.085 NA   NA
 7009341 7009342 JJD26997_1050 JJD26997_1051     FALSE 0.152 88.000 0.000 NA   NA
 7009342 7009343 JJD26997_1051 JJD26997_1053   pstB FALSE 0.211 61.000 0.000 NA   NA
 7009343 7009344 JJD26997_1053 JJD26997_1054 pstB   TRUE 0.996 -3.000 0.402 0.002 Y NA
 7009344 7009345 JJD26997_1054 JJD26997_1055     TRUE 0.997 -3.000 0.485 0.002 Y NA
 7009345 7009346 JJD26997_1055 JJD26997_1056     TRUE 0.957 10.000 0.079 NA Y NA
 7009346 7009347 JJD26997_1056 JJD26997_1057     TRUE 0.562 16.000 0.000 NA   NA
 7009348 7009349 JJD26997_1058 JJD26997_1059 ftn algI TRUE 0.445 43.000 0.047 NA N NA
 7009349 7009350 JJD26997_1059 JJD26997_1060 algI   TRUE 0.984 1.000 0.244 NA   NA
 7009350 7009351 JJD26997_1060 JJD26997_1061     TRUE 0.981 -13.000 0.280 1.000   NA
 7009352 7009353 JJD26997_1062 JJD26997_1063     TRUE 0.982 2.000 0.152 1.000 N NA
 7009353 7009354 JJD26997_1063 JJD26997_1064     TRUE 0.992 0.000 0.258 0.068 N NA
 7009354 7009355 JJD26997_1064 JJD26997_1065     TRUE 0.541 79.000 0.158 1.000   NA
 7009355 7009356 JJD26997_1065 JJD26997_1066     TRUE 0.850 9.000 0.000 NA   NA
 7009357 7009358 JJD26997_1067 JJD26997_1069 dsbD   FALSE 0.079 168.000 0.000 1.000   NA
 7009359 7009360 JJD26997_1068 JJD26997_1070     TRUE 0.964 -13.000 0.093 1.000 N NA
 7009360 7009361 JJD26997_1070 JJD26997_1071     TRUE 0.972 -10.000 0.133 1.000   NA
 7009361 7009362 JJD26997_1071 JJD26997_1072   fbaA FALSE 0.213 95.000 0.027 1.000   NA
 7009362 7009363 JJD26997_1072 JJD26997_1073 fbaA   TRUE 0.955 0.000 0.036 1.000 N NA
 7009364 7009365 JJD26997_1074 JJD26997_1075 nth   TRUE 0.947 -3.000 0.004 0.003 N NA
 7009365 7009366 JJD26997_1075 JJD26997_1076     TRUE 0.834 11.000 0.033 NA   NA
 7009366 7009367 JJD26997_1076 JJD26997_1077     FALSE 0.205 58.000 0.017 NA   NA
 7009367 7009368 JJD26997_1077 JJD26997_1079     TRUE 0.988 -3.000 0.500 NA   NA
 7009369 7009370 JJD26997_1078 JJD26997_1080     TRUE 0.968 -10.000 0.051 1.000 Y NA
 7009370 7009371 JJD26997_1080 JJD26997_1081   tlyA TRUE 0.912 -34.000 0.029 1.000 N NA
 7009371 7009372 JJD26997_1081 JJD26997_1082 tlyA   FALSE 0.170 79.000 0.000 NA   NA
 7009372 7009373 JJD26997_1082 JJD26997_1083   ligA TRUE 0.294 38.000 0.000 NA   NA
 7009373 7009374 JJD26997_1083 JJD26997_1084 ligA folP TRUE 0.905 1.000 0.006 1.000 N NA
 7009374 7009375 JJD26997_1084 JJD26997_1085 folP   TRUE 0.962 2.000 0.054 1.000   NA
 7009375 7009376 JJD26997_1085 JJD26997_1086     TRUE 0.937 6.000 0.053 NA   NA
 7009376 7009377 JJD26997_1086 JJD26997_1087     TRUE 0.955 1.000 0.050 NA   NA
 7009377 7009378 JJD26997_1087 JJD26997_1088   nidH TRUE 0.963 2.000 0.051 1.000 N NA
 7009379 7009380 JJD26997_1089 JJD26997_1090   tatB FALSE 0.213 60.000 0.000 NA   NA
 7009380 7009381 JJD26997_1090 JJD26997_1091 tatB tatC TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 7009381 7009382 JJD26997_1091 JJD26997_1092 tatC queA TRUE 0.926 -10.000 0.036 NA N NA
 7009382 7009383 JJD26997_1092 JJD26997_1094 queA   FALSE 0.046 227.000 0.000 NA   NA
 7009384 7009385 JJD26997_1093 JJD26997_1095 lpxD ilvH TRUE 0.952 -3.000 0.052 1.000 N NA
 7009385 7009386 JJD26997_1095 JJD26997_1096 ilvH ilvB TRUE 0.995 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 7009386 7009387 JJD26997_1096 JJD26997_1097 ilvB   TRUE 0.460 22.000 0.000 NA   NA
 7009387 7009388 JJD26997_1097 JJD26997_1098   ribB TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7009389 7009390 JJD26997_1099 JJD26997_1100     TRUE 0.314 35.000 0.000 NA   NA
 7009390 7009391 JJD26997_1100 JJD26997_1101     FALSE 0.052 199.000 0.000 NA   NA
 7009392 7009393 JJD26997_1102 JJD26997_1103     TRUE 0.868 -12.000 0.000 NA   NA
 7009393 7009394 JJD26997_1103 JJD26997_1104     TRUE 0.306 36.000 0.000 NA   NA
 7009394 7009395 JJD26997_1104 JJD26997_1105     TRUE 0.376 27.000 0.000 NA   NA
 7009395 7009396 JJD26997_1105 JJD26997_1106     FALSE 0.252 47.000 0.000 NA   NA
 7009396 7009397 JJD26997_1106 JJD26997_1107     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 7009397 7009398 JJD26997_1107 JJD26997_1108     TRUE 0.540 17.000 0.000 NA   NA
 7009398 7009399 JJD26997_1108 JJD26997_1109     TRUE 0.993 -19.000 1.000 NA   NA
 7009399 7009400 JJD26997_1109 JJD26997_1110     TRUE 0.993 0.000 0.667 NA   NA
 7009400 7009401 JJD26997_1110 JJD26997_1111     TRUE 0.966 -3.000 0.125 NA   NA
 7009401 7009402 JJD26997_1111 JJD26997_1112     TRUE 0.943 -10.000 0.000 0.040   NA
 7009402 7009403 JJD26997_1112 JJD26997_1113     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7009403 7009404 JJD26997_1113 JJD26997_1114     FALSE 0.259 45.000 0.000 NA   NA
 7009404 7009405 JJD26997_1114 JJD26997_1115     TRUE 0.851 -28.000 0.000 NA   NA
 7009405 7009406 JJD26997_1115 JJD26997_1116     FALSE 0.045 228.000 0.000 NA   NA
 7009406 7009407 JJD26997_1116 JJD26997_1117     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7009407 7009408 JJD26997_1117 JJD26997_1118     TRUE 0.294 38.000 0.000 NA   NA
 7009408 7009409 JJD26997_1118 JJD26997_1119     TRUE 0.994 -9.000 1.000 NA   NA
 7009409 7009410 JJD26997_1119 JJD26997_1120     FALSE 0.041 248.000 0.000 NA   NA
 7009410 7009411 JJD26997_1120 JJD26997_1121     FALSE 0.025 399.000 0.000 NA   NA
 7009413 7009414 JJD26997_1123 JJD26997_1124     FALSE 0.098 121.000 0.000 NA   NA
 7009415 7009416 JJD26997_1125 JJD26997_1126     FALSE 0.094 125.000 0.000 NA   NA
 7009416 7009417 JJD26997_1126 JJD26997_1127     FALSE 0.215 59.000 0.000 NA   NA
 7009417 7009418 JJD26997_1127 JJD26997_1128     TRUE 0.850 9.000 0.000 NA   NA
 7009418 7009419 JJD26997_1128 JJD26997_1129     TRUE 0.723 25.000 0.111 NA   NA
 7009419 7009420 JJD26997_1129 JJD26997_1130     TRUE 0.963 -7.000 0.111 NA   NA
 7009420 7009421 JJD26997_1130 JJD26997_1131     TRUE 0.982 -3.000 0.333 NA   NA
 7009421 7009422 JJD26997_1131 JJD26997_1132     TRUE 0.984 -10.000 0.400 NA   NA
 7009422 7009423 JJD26997_1132 JJD26997_1133     TRUE 0.986 -19.000 0.500 NA   NA
 7009423 7009424 JJD26997_1133 JJD26997_1134     TRUE 0.987 -13.000 0.500 NA   NA
 7009424 7009425 JJD26997_1134 JJD26997_1135     TRUE 0.994 -10.000 1.000 NA   NA
 7009425 7009426 JJD26997_1135 JJD26997_1136     TRUE 0.979 11.000 0.667 NA   NA
 7009426 7009427 JJD26997_1136 JJD26997_1137     TRUE 0.739 86.000 0.667 NA   NA
 7009427 7009428 JJD26997_1137 JJD26997_1138     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7009430 7009431 JJD26997_1140 JJD26997_1141     TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 7009431 7009432 JJD26997_1141 JJD26997_1142     TRUE 0.989 -22.000 0.667 NA   NA
 7009432 7009433 JJD26997_1142 JJD26997_1143     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7009433 7009434 JJD26997_1143 JJD26997_1144     FALSE 0.031 319.000 0.000 NA   NA
 7009434 7009435 JJD26997_1144 JJD26997_1145     TRUE 0.487 20.000 0.000 NA   NA
 7009435 7009436 JJD26997_1145 JJD26997_1146     TRUE 0.661 13.000 0.000 NA   NA
 7009436 7009437 JJD26997_1146 JJD26997_1147     TRUE 0.808 43.000 0.500 NA   NA
 7009437 7009438 JJD26997_1147 JJD26997_1148     TRUE 0.988 3.000 0.429 NA   NA
 7009438 7009439 JJD26997_1148 JJD26997_1149     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009439 7009440 JJD26997_1149 JJD26997_1150     FALSE 0.044 232.000 0.000 NA   NA
 7009440 7009441 JJD26997_1150 JJD26997_1151     TRUE 0.846 -46.000 0.000 NA   NA
 7009441 7009442 JJD26997_1151 JJD26997_1152     TRUE 0.991 -7.000 0.667 NA   NA
 7009442 7009443 JJD26997_1152 JJD26997_1153     TRUE 0.984 12.000 1.000 NA   NA
 7009444 7009445 JJD26997_1154 JJD26997_1155     FALSE 0.019 797.000 0.000 NA   NA
 7009445 7009446 JJD26997_1155 JJD26997_1156     FALSE 0.190 67.000 0.000 NA   NA
 7009446 7009447 JJD26997_1156 JJD26997_1157     FALSE 0.236 52.000 0.000 NA   NA
 7009447 7009448 JJD26997_1157 JJD26997_1158     TRUE 0.863 7.000 0.000 NA   NA
 7009448 7009449 JJD26997_1158 JJD26997_1159     TRUE 0.477 21.000 0.000 NA   NA
 7009449 7009450 JJD26997_1159 JJD26997_1160     TRUE 0.871 5.000 0.000 NA   NA
 7009450 7009451 JJD26997_1160 JJD26997_1161     FALSE 0.234 53.000 0.000 NA   NA
 7009451 7009452 JJD26997_1161 JJD26997_1162     TRUE 0.859 8.000 0.000 NA   NA
 7009452 7009453 JJD26997_1162 JJD26997_1163     FALSE 0.207 62.000 0.000 NA   NA
 7009453 7009454 JJD26997_1163 JJD26997_1164     TRUE 0.485 23.000 0.015 1.000 N NA
 7009454 7009455 JJD26997_1164 JJD26997_1165   secA TRUE 0.988 -3.000 0.201 0.065 N NA
 7009457 7009458 JJD26997_1166 JJD26997_1168     TRUE 0.413 25.000 0.000 NA   NA
 7009460 7009461 JJD26997_1170 JJD26997_1171     TRUE 0.902 -3.000 0.020 1.000   NA
 7009461 7009462 JJD26997_1171 JJD26997_1172     TRUE 0.907 -3.000 0.025 NA N NA
 7009462 7009463 JJD26997_1172 JJD26997_1173     FALSE 0.181 99.000 0.026 NA N NA
 7009463 7009464 JJD26997_1173 JJD26997_1174     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7009464 7009465 JJD26997_1174 JJD26997_1175     TRUE 0.853 -25.000 0.000 NA   NA
 7009465 7009466 JJD26997_1175 JJD26997_1176     FALSE 0.190 67.000 0.000 NA   NA
 7009466 7009467 JJD26997_1176 JJD26997_1177     FALSE 0.035 284.000 0.000 NA   NA
 7009467 7009468 JJD26997_1177 JJD26997_1178     FALSE 0.271 42.000 0.000 NA   NA
 7009469 7009470 JJD26997_1179 JJD26997_1180 acnB   FALSE 0.125 102.000 0.010 1.000   NA
 7009470 7009471 JJD26997_1180 JJD26997_1181     TRUE 0.895 -3.000 0.018 1.000   NA
 7009471 7009472 JJD26997_1181 JJD26997_1182     TRUE 0.935 -3.000 0.047 NA   NA
 7009472 7009473 JJD26997_1182 JJD26997_1184   trmA TRUE 0.946 -3.000 0.056 NA N NA
 7009475 7009476 JJD26997_1185 JJD26997_1187   ilvA TRUE 0.933 0.000 0.030 NA   NA
 7009477 7009478 JJD26997_1186 JJD26997_1188 truA   TRUE 0.953 -3.000 0.059 1.000   NA
 7009478 7009479 JJD26997_1188 JJD26997_1189     TRUE 0.954 0.000 0.039 1.000   NA
 7009479 7009480 JJD26997_1189 JJD26997_1190   uppS TRUE 0.900 -3.000 0.017 1.000 N NA
 7009480 7009481 JJD26997_1190 JJD26997_1191 uppS   TRUE 0.851 4.000 0.012 NA   NA
 7009481 7009482 JJD26997_1191 JJD26997_1192   coaBC TRUE 0.909 3.000 0.024 NA   NA
 7009482 7009483 JJD26997_1192 JJD26997_1193 coaBC glmU TRUE 0.898 -3.000 0.016 1.000 N NA
 7009485 7009486 JJD26997_1194 JJD26997_1196     FALSE 0.028 356.000 0.000 NA   NA
 7009486 7009487 JJD26997_1196 JJD26997_1197   kdsB FALSE 0.213 54.000 0.005 1.000 N NA
 7009487 7009488 JJD26997_1197 JJD26997_1198 kdsB thrC TRUE 0.900 -3.000 0.017 1.000 N NA
 7009488 7009489 JJD26997_1198 JJD26997_1199 thrC lpxK TRUE 0.878 -3.000 0.009 1.000 N NA
 7009489 7009490 JJD26997_1199 JJD26997_1200 lpxK nadE TRUE 0.922 4.000 0.024 1.000 N NA
 7009491 7009492 JJD26997_1201 JJD26997_1202     TRUE 0.768 13.000 0.035 NA   NA
 7009493 7009494 JJD26997_1203 JJD26997_1204   dapA TRUE 0.986 0.000 0.238 1.000 N NA
 7009494 7009495 JJD26997_1204 JJD26997_1205 dapA   TRUE 0.979 -7.000 0.217 1.000   NA
 7009495 7009496 JJD26997_1205 JJD26997_1206   pyrD TRUE 0.947 -3.000 0.048 1.000   NA
 7009496 7009497 JJD26997_1206 JJD26997_1207 pyrD   TRUE 0.390 32.000 0.017 1.000 N NA
 7009497 7009498 JJD26997_1207 JJD26997_1208   cysS TRUE 0.937 -7.000 0.013 0.088 N NA
 7009498 7009499 JJD26997_1208 JJD26997_1209 cysS mviN TRUE 0.939 0.000 0.027 1.000   NA
 7009500 7009501 JJD26997_1210 JJD26997_1211   ruvA TRUE 0.785 -24.000 0.004 NA   NA
 7009501 7009502 JJD26997_1211 JJD26997_1212 ruvA ddl TRUE 0.905 10.000 0.014 0.088 N NA
 7009502 7009503 JJD26997_1212 JJD26997_1213 ddl   FALSE 0.207 60.000 0.018 NA   NA
 7009503 7009504 JJD26997_1213 JJD26997_1214     TRUE 0.953 2.000 0.052 NA   NA
 7009504 7009505 JJD26997_1214 JJD26997_1216     TRUE 0.977 1.000 0.129 NA   NA
 7009506 7009507 JJD26997_1217 JJD26997_1218     FALSE 0.133 101.000 0.000 NA   NA
 7009507 7009508 JJD26997_1218 JJD26997_1219     TRUE 0.985 4.000 0.333 1.000   NA
 7009510 7009511 JJD26997_1220 JJD26997_1222 purU   TRUE 0.959 -3.000 0.064 1.000 N NA
 7009511 7009512 JJD26997_1222 JJD26997_1223     TRUE 0.977 -31.000 0.325 NA   NA
 7009512 7009513 JJD26997_1223 JJD26997_1224     TRUE 0.968 -3.000 0.133 NA   NA
 7009513 7009514 JJD26997_1224 JJD26997_1225     TRUE 0.691 82.000 0.500 NA   NA
 7009514 7009515 JJD26997_1225 JJD26997_1226   napD TRUE 0.854 14.000 0.111 NA   NA
 7009515 7009516 JJD26997_1226 JJD26997_1228 napD   TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 7009516 7009517 JJD26997_1228 JJD26997_1229     FALSE 0.022 479.000 0.000 NA   NA
 7009517 7009518 JJD26997_1229 JJD26997_1230     TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 7009518 7009519 JJD26997_1230 JJD26997_1231     FALSE 0.223 56.000 0.000 NA   NA
 7009519 7009520 JJD26997_1231 JJD26997_1232   tpx FALSE 0.027 373.000 0.000 NA   NA
 7009520 7009521 JJD26997_1232 JJD26997_1233 tpx   FALSE 0.177 75.000 0.000 NA   NA
 7009521 7009522 JJD26997_1233 JJD26997_1234     TRUE 0.585 15.000 0.000 NA   NA
 7009522 7009523 JJD26997_1234 JJD26997_1235     FALSE 0.024 432.000 0.000 NA   NA
 7009524 7009525 JJD26997_1236 JJD26997_1237   valS TRUE 0.387 24.000 0.005 1.000   NA
 7009525 7009526 JJD26997_1237 JJD26997_1238 valS   TRUE 0.928 5.000 0.007 0.087 N NA
 7009526 7009527 JJD26997_1238 JJD26997_1239     TRUE 0.994 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 7009527 7009528 JJD26997_1239 JJD26997_1240     TRUE 0.321 193.000 0.154 NA Y NA
 7009528 7009529 JJD26997_1240 JJD26997_1241     TRUE 0.910 49.000 0.800 NA Y NA
 7009529 7009530 JJD26997_1241 JJD26997_1242     TRUE 0.994 10.000 1.000 NA Y NA
 7009530 7009531 JJD26997_1242 JJD26997_1243   flgA FALSE 0.222 84.000 0.028 NA N NA
 7009531 7009532 JJD26997_1243 JJD26997_1244 flgA   TRUE 0.976 -3.000 0.191 NA N NA
 7009532 7009533 JJD26997_1244 JJD26997_1245   coaD TRUE 0.574 40.000 0.032 1.000 Y NA
 7009533 7009534 JJD26997_1245 JJD26997_1246 coaD tmk TRUE 0.936 -9.000 0.034 1.000 N NA
 7009534 7009535 JJD26997_1246 JJD26997_1247 tmk hisS TRUE 0.946 -3.000 0.018 0.087 N NA
 7009535 7009536 JJD26997_1247 JJD26997_1248 hisS speA TRUE 0.933 0.000 0.021 1.000 N NA
 7009536 7009537 JJD26997_1248 JJD26997_1249 speA cysE TRUE 0.980 1.000 0.055 1.000 Y NA
 7009537 7009538 JJD26997_1249 JJD26997_1250 cysE   TRUE 0.341 161.000 0.102 1.000 Y NA
 7009538 7009539 JJD26997_1250 JJD26997_1251     TRUE 0.867 6.000 0.000 NA   NA
 7009540 7009541 JJD26997_1252 JJD26997_1253     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009541 7009542 JJD26997_1253 JJD26997_1254     FALSE 0.051 204.000 0.000 NA   NA
 7009544 7009545 JJD26997_1257 JJD26997_1258   dnaK FALSE 0.029 353.000 0.000 NA   NA
 7009545 7009546 JJD26997_1258 JJD26997_1259 dnaK grpE TRUE 0.850 22.000 0.029 0.008 Y NA
 7009546 7009547 JJD26997_1259 JJD26997_1260 grpE   TRUE 0.930 -3.000 0.038 NA N NA
 7009547 7009548 JJD26997_1260 JJD26997_1261   cfrA FALSE 0.038 294.000 0.000 NA N NA
 7009550 7009551 JJD26997_1263 JJD26997_1264 rrfF rrlH FALSE 0.036 280.000 0.000 NA   NA
 7009551 7009552 JJD26997_1264 JJD26997_1265 rrlH   FALSE 0.048 213.000 0.000 NA   NA
 7009552 7009553 JJD26997_1265 JJD26997_1266     FALSE 0.123 107.000 0.000 NA   NA
 7009553 7009554 JJD26997_1266 JJD26997_1267   pgi TRUE 0.986 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 7009554 7009555 JJD26997_1267 JJD26997_1268 pgi glk TRUE 0.957 10.000 0.017 0.006 Y NA
 7009555 7009556 JJD26997_1268 JJD26997_1269 glk pgl TRUE 0.979 -19.000 0.117 1.000 Y NA
 7009556 7009557 JJD26997_1269 JJD26997_1270 pgl zwf FALSE 0.122 164.000 0.011 1.000 Y NA
 7009558 7009559 JJD26997_1271 JJD26997_1272 edd   TRUE 0.990 10.000 0.523 1.000 Y NA
 7009560 7009561 JJD26997_1273 JJD26997_1274     TRUE 0.850 9.000 0.000 NA   NA
 7009561 7009562 JJD26997_1274 JJD26997_1275   rrsB FALSE 0.126 105.000 0.000 NA   NA
 7009563 7009564 JJD26997_1276 JJD26997_1277   cjaC TRUE 0.861 -16.000 0.000 NA   NA
 7009564 7009565 JJD26997_1277 JJD26997_1278 cjaC   FALSE 0.039 260.000 0.000 NA   NA
 7009565 7009566 JJD26997_1278 JJD26997_1279     FALSE 0.058 184.000 0.000 NA   NA
 7009566 7009567 JJD26997_1279 JJD26997_1280   corA FALSE 0.133 114.000 0.000 1.000   NA
 7009567 7009568 JJD26997_1280 JJD26997_1282 corA mogA TRUE 0.498 21.000 0.011 1.000 N NA
 7009570 7009571 JJD26997_1283 JJD26997_1284     TRUE 0.960 -3.000 0.068 1.000 N NA
 7009571 7009572 JJD26997_1284 JJD26997_1285     TRUE 0.754 13.000 0.033 NA   NA
 7009572 7009573 JJD26997_1285 JJD26997_1286   flaC TRUE 0.675 39.000 0.172 NA   NA
 7009573 7009574 JJD26997_1286 JJD26997_1287 flaC   FALSE 0.236 37.000 0.009 NA   NA
 7009575 7009576 JJD26997_1288 JJD26997_1289 dnaE   FALSE 0.020 450.000 0.002 1.000 N NA
 7009576 7009577 JJD26997_1289 JJD26997_1290     TRUE 0.891 -3.000 0.014 1.000 N NA
 7009577 7009578 JJD26997_1290 JJD26997_1291     TRUE 0.429 24.000 0.000 NA   NA
 7009578 7009579 JJD26997_1291 JJD26997_1292   rplS FALSE 0.039 260.000 0.000 NA   NA
 7009579 7009580 JJD26997_1292 JJD26997_1293 rplS trmD TRUE 0.987 11.000 0.567 1.000 Y NA
 7009580 7009581 JJD26997_1293 JJD26997_1294 trmD rimM TRUE 0.995 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 7009581 7009582 JJD26997_1294 JJD26997_1295 rimM   TRUE 0.984 -7.000 0.324 1.000   NA
 7009582 7009583 JJD26997_1295 JJD26997_1296   rpsP TRUE 0.988 3.000 0.385 1.000   NA
 7009583 7009584 JJD26997_1296 JJD26997_1297 rpsP ffh TRUE 0.714 65.000 0.361 1.000 N NA
 7009584 7009585 JJD26997_1297 JJD26997_1298 ffh   FALSE 0.210 68.000 0.013 1.000 N NA
 7009585 7009586 JJD26997_1298 JJD26997_1299   waaA TRUE 0.970 -19.000 0.133 1.000 N NA
 7009586 7009587 JJD26997_1299 JJD26997_1300 waaA   TRUE 0.966 -3.000 0.122 NA   NA
 7009587 7009588 JJD26997_1300 JJD26997_1301     TRUE 0.972 10.000 0.342 NA   NA
 7009588 7009589 JJD26997_1301 JJD26997_1302   glyQ TRUE 0.922 -13.000 0.041 NA   NA
 7009589 7009590 JJD26997_1302 JJD26997_1303 glyQ   TRUE 0.660 12.000 0.011 NA   NA
 7009590 7009591 JJD26997_1303 JJD26997_1304   purE TRUE 0.814 10.000 0.019 NA   NA
 7009591 7009592 JJD26997_1304 JJD26997_1305 purE   TRUE 0.931 1.000 0.018 1.000 N NA
 7009592 7009593 JJD26997_1305 JJD26997_1306     TRUE 0.951 -3.000 0.068 NA   NA
 7009595 7009596 JJD26997_1308 JJD26997_1309 flgG   TRUE 0.946 29.000 0.377 0.007 Y NA
 7009596 7009597 JJD26997_1309 JJD26997_1310   ftsZ FALSE 0.064 156.000 0.002 1.000 N NA
 7009597 7009598 JJD26997_1310 JJD26997_1311 ftsZ ftsA TRUE 0.906 16.000 0.114 1.000 Y NA
 7009598 7009599 JJD26997_1311 JJD26997_1312 ftsA   TRUE 0.981 3.000 0.184 1.000   NA
 7009600 7009601 JJD26997_1313 JJD26997_1315 mraW   TRUE 0.935 0.000 0.031 NA   NA
 7009604 7009605 JJD26997_1318 JJD26997_1319 ackA pta TRUE 0.918 14.000 0.103 1.000 Y NA
 7009607 7009608 JJD26997_1321 JJD26997_1322 ispG priA FALSE 0.184 66.000 0.006 1.000 N NA
 7009608 7009609 JJD26997_1322 JJD26997_1323 priA   TRUE 0.856 -18.000 0.016 NA N NA
 7009609 7009610 JJD26997_1323 JJD26997_1324     TRUE 0.981 -3.000 0.316 NA   NA
 7009610 7009611 JJD26997_1324 JJD26997_1325     TRUE 0.991 -10.000 0.714 NA   NA
 7009613 7009614 JJD26997_1326 JJD26997_1328     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 7009614 7009615 JJD26997_1328 JJD26997_1329   rpoN FALSE 0.113 112.000 0.000 NA   NA
 7009615 7009616 JJD26997_1329 JJD26997_1330 rpoN   TRUE 0.957 0.000 0.044 1.000   NA
 7009616 7009617 JJD26997_1330 JJD26997_1331     TRUE 0.916 -16.000 0.039 NA   NA
 7009617 7009618 JJD26997_1331 JJD26997_1332     TRUE 0.844 -3.000 0.011 NA   NA
 7009619 7009620 JJD26997_1333 JJD26997_1334   argG TRUE 0.809 -3.000 0.002 NA   NA
 7009620 7009621 JJD26997_1334 JJD26997_1335 argG rplI TRUE 0.665 13.000 0.009 1.000 N NA
 7009621 7009622 JJD26997_1335 JJD26997_1336 rplI hslV TRUE 0.953 0.000 0.034 1.000 N NA
 7009622 7009623 JJD26997_1336 JJD26997_1337 hslV hslU TRUE 0.996 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 7009623 7009624 JJD26997_1337 JJD26997_1338 hslU era TRUE 0.948 -3.000 0.051 1.000   NA
 7009624 7009625 JJD26997_1338 JJD26997_1339 era   TRUE 0.884 -10.000 0.022 NA   NA
 7009625 7009626 JJD26997_1339 JJD26997_1340     TRUE 0.991 -7.000 0.667 NA   NA
 7009628 7009629 JJD26997_1342 JJD26997_1344     FALSE 0.046 224.000 0.000 NA   NA
 7009629 7009630 JJD26997_1344 JJD26997_1345     TRUE 0.991 3.000 0.062 0.001 Y NA
 7009630 7009631 JJD26997_1345 JJD26997_1346     TRUE 0.855 16.000 0.051 1.000 Y NA
 7009632 7009633 JJD26997_1347 JJD26997_1348 pbpC   TRUE 0.950 1.000 0.043 NA   NA
 7009633 7009634 JJD26997_1348 JJD26997_1349   engB TRUE 0.828 -3.000 0.007 NA   NA
 7009634 7009635 JJD26997_1349 JJD26997_1350 engB   TRUE 0.928 -3.000 0.041 NA   NA
 7009635 7009636 JJD26997_1350 JJD26997_1351     TRUE 0.834 -18.000 0.013 NA   NA
 7009636 7009637 JJD26997_1351 JJD26997_1352     FALSE 0.207 72.000 0.023 NA   NA
 7009637 7009638 JJD26997_1352 JJD26997_1353   rlpA TRUE 0.871 6.000 0.020 NA   NA
 7009638 7009639 JJD26997_1353 JJD26997_1354 rlpA   TRUE 0.973 -40.000 0.115 NA Y NA
 7009639 7009640 JJD26997_1354 JJD26997_1355     TRUE 0.934 0.000 0.028 NA N NA
 7009640 7009641 JJD26997_1355 JJD26997_1356     TRUE 0.861 -9.000 0.013 NA N NA
 7009641 7009642 JJD26997_1356 JJD26997_1357   recN TRUE 0.452 103.000 0.141 1.000 N NA
 7009642 7009643 JJD26997_1357 JJD26997_1358 recN pnk TRUE 0.970 0.000 0.066 1.000 N NA
 7009644 7009645 JJD26997_1359 JJD26997_1360 aspS adk TRUE 0.955 -3.000 0.025 0.085 N NA
 7009645 7009646 JJD26997_1360 JJD26997_1361 adk ppa TRUE 0.836 10.000 0.015 1.000 N NA
 7009646 7009647 JJD26997_1361 JJD26997_1362 ppa msrA FALSE 0.253 44.000 0.006 1.000 N NA
 7009648 7009649 JJD26997_1363 JJD26997_1364     FALSE 0.071 157.000 0.000 NA   NA
 7009649 7009650 JJD26997_1364 JJD26997_1365   dprA TRUE 0.954 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 7009650 7009651 JJD26997_1365 JJD26997_1366 dprA   TRUE 0.903 -10.000 0.022 1.000   NA
 7009651 7009652 JJD26997_1366 JJD26997_1367   ilvC TRUE 0.886 4.000 0.013 1.000   NA
 7009653 7009654 JJD26997_1368 JJD26997_1369     TRUE 0.919 -7.000 0.024 1.000 N NA
 7009655 7009656 JJD26997_1370 JJD26997_1371   dnaB FALSE 0.020 634.000 0.000 NA   NA
 7009656 7009657 JJD26997_1371 JJD26997_1372 dnaB   FALSE 0.191 91.000 0.000 1.000 N NA
 7009657 7009658 JJD26997_1372 JJD26997_1373     TRUE 0.863 7.000 0.000 NA   NA
 7009660 7009661 JJD26997_1374 JJD26997_1376     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 7009661 7009662 JJD26997_1376 JJD26997_1377     TRUE 0.960 10.000 0.202 NA   NA
 7009662 7009663 JJD26997_1377 JJD26997_1378     TRUE 0.993 -13.000 0.939 NA   NA
 7009663 7009664 JJD26997_1378 JJD26997_1379   efp FALSE 0.044 157.000 0.002 NA   NA
 7009664 7009665 JJD26997_1379 JJD26997_1380 efp   FALSE 0.024 432.000 0.000 NA   NA
 7009665 7009666 JJD26997_1380 JJD26997_1381   fliS TRUE 0.348 65.000 0.051 NA   NA
 7009666 7009667 JJD26997_1381 JJD26997_1382 fliS fliD TRUE 0.993 12.000 0.608 0.003 Y NA
 7009667 7009668 JJD26997_1382 JJD26997_1383 fliD flaG TRUE 0.979 3.000 0.092 NA Y NA
 7009668 7009669 JJD26997_1383 JJD26997_1384 flaG   FALSE 0.079 148.000 0.018 NA N NA
 7009669 7009670 JJD26997_1384 JJD26997_1385   hemC TRUE 0.917 -3.000 0.009 NA Y NA
 7009670 7009671 JJD26997_1385 JJD26997_1386 hemC   TRUE 0.879 -3.000 0.013 1.000   NA
 7009671 7009672 JJD26997_1386 JJD26997_1387   proS TRUE 0.907 -3.000 0.022 1.000   NA
 7009672 7009673 JJD26997_1387 JJD26997_1388 proS hemA TRUE 0.964 -16.000 0.040 0.041 N NA
 7009673 7009674 JJD26997_1388 JJD26997_1389 hemA   TRUE 0.978 0.000 0.051 1.000 Y NA
 7009674 7009675 JJD26997_1389 JJD26997_1390     TRUE 0.738 13.000 0.030 NA   NA
 7009675 7009676 JJD26997_1390 JJD26997_1391     TRUE 0.990 3.000 0.514 NA   NA
 7009676 7009677 JJD26997_1391 JJD26997_1392   oorC FALSE 0.208 138.000 0.083 NA   NA
 7009677 7009678 JJD26997_1392 JJD26997_1393 oorC oorB TRUE 0.996 -3.000 0.324 0.002 Y NA
 7009678 7009679 JJD26997_1393 JJD26997_1394 oorB oorA TRUE 0.999 1.000 0.771 0.002 Y NA
 7009679 7009680 JJD26997_1394 JJD26997_1395 oorA oorD TRUE 0.994 9.000 0.316 0.002 Y NA
 7009680 7009681 JJD26997_1395 JJD26997_1396 oorD sucD TRUE 0.931 13.000 0.097 1.000 Y NA
 7009681 7009682 JJD26997_1396 JJD26997_1397 sucD sucC TRUE 0.990 10.000 0.169 0.001 Y NA
 7009682 7009683 JJD26997_1397 JJD26997_1398 sucC mdh TRUE 0.964 1.000 0.022 1.000 Y NA
 7009683 7009684 JJD26997_1398 JJD26997_1399 mdh icd TRUE 0.952 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 7009684 7009685 JJD26997_1399 JJD26997_1400 icd   TRUE 0.451 18.000 0.011 NA   NA
 7009686 7009687 JJD26997_1401 JJD26997_1402   flgB FALSE 0.113 81.000 0.005 NA   NA
 7009687 7009688 JJD26997_1402 JJD26997_1403 flgB flgC TRUE 0.994 10.000 0.804 1.000 Y NA
 7009688 7009689 JJD26997_1403 JJD26997_1404 flgC fliE TRUE 0.994 7.000 0.271 0.005 Y NA
 7009689 7009690 JJD26997_1404 JJD26997_1406 fliE   TRUE 0.983 7.000 0.303 1.000 N NA
 7009691 7009692 JJD26997_1405 JJD26997_1408     FALSE 0.038 264.000 0.000 NA   NA
 7009692 7009693 JJD26997_1408 JJD26997_1409     FALSE 0.201 64.000 0.000 NA   NA
 7009693 7009694 JJD26997_1409 JJD26997_1411     FALSE 0.249 48.000 0.000 NA   NA
 7009694 7009695 JJD26997_1411 JJD26997_1412     TRUE 0.989 0.000 0.400 NA   NA
 7009695 7009696 JJD26997_1412 JJD26997_1413   htpG TRUE 0.841 -3.000 0.007 NA N NA
 7009696 7009697 JJD26997_1413 JJD26997_1414 htpG   FALSE 0.179 73.000 0.000 NA   NA
 7009697 7009698 JJD26997_1414 JJD26997_1415     FALSE 0.056 190.000 0.000 NA   NA
 7009698 7009699 JJD26997_1415 JJD26997_1416     TRUE 0.857 -19.000 0.000 NA   NA
 7009699 7009700 JJD26997_1416 JJD26997_1417   purQ FALSE 0.250 84.000 0.038 NA   NA
 7009700 7009701 JJD26997_1417 JJD26997_1418 purQ purS TRUE 0.998 2.000 0.656 0.002 Y NA
 7009701 7009702 JJD26997_1418 JJD26997_1419 purS purC TRUE 0.991 9.000 0.460 1.000 Y NA
 7009702 7009703 JJD26997_1419 JJD26997_1420 purC ctpA TRUE 0.960 2.000 0.045 1.000 N NA
 7009704 7009705 JJD26997_1421 JJD26997_1422   clpB TRUE 0.318 112.000 0.108 NA   NA
 7009707 7009708 JJD26997_1424 JJD26997_1425     TRUE 0.995 2.000 0.895 NA   NA
 7009708 7009709 JJD26997_1425 JJD26997_1426     TRUE 0.994 -7.000 0.278 0.034 Y NA
 7009710 7009711 JJD26997_1427 JJD26997_1428     TRUE 0.907 -3.000 0.026 NA N NA
 7009711 7009712 JJD26997_1428 JJD26997_1429   alaS TRUE 0.901 0.000 0.015 NA N NA
 7009713 7009714 JJD26997_1430 JJD26997_1431     TRUE 0.969 5.000 0.117 1.000   NA
 7009714 7009715 JJD26997_1431 JJD26997_1433   hemH TRUE 0.856 -3.000 0.005 1.000   NA
 7009716 7009717 JJD26997_1432 JJD26997_1434   ybbB FALSE 0.086 158.000 0.000 1.000   NA
 7009717 7009718 JJD26997_1434 JJD26997_1435 ybbB   TRUE 0.923 -10.000 0.030 1.000   NA
 7009718 7009719 JJD26997_1435 JJD26997_1436   trpC TRUE 0.881 10.000 0.026 1.000 N NA
 7009719 7009720 JJD26997_1436 JJD26997_1437 trpC   TRUE 0.939 -13.000 0.044 1.000   NA
 7009720 7009721 JJD26997_1437 JJD26997_1438     TRUE 0.974 -15.000 0.228 NA   NA
 7009721 7009722 JJD26997_1438 JJD26997_1439     TRUE 0.946 -10.000 0.064 NA   NA
 7009722 7009723 JJD26997_1439 JJD26997_1440     TRUE 0.812 6.000 0.006 NA   NA
 7009723 7009724 JJD26997_1440 JJD26997_1441     TRUE 0.519 18.000 0.000 NA   NA
 7009724 7009725 JJD26997_1441 JJD26997_1442   fusA TRUE 0.347 29.000 0.000 NA   NA
 7009725 7009726 JJD26997_1442 JJD26997_1443 fusA rpsG TRUE 0.980 13.000 0.579 1.000 Y NA
 7009726 7009727 JJD26997_1443 JJD26997_1444 rpsG rpsL TRUE 0.925 70.000 0.620 0.004 Y NA
 7009727 7009728 JJD26997_1444 JJD26997_1445 rpsL aldA FALSE 0.041 328.000 0.000 1.000 N NA
 7009728 7009729 JJD26997_1445 JJD26997_1446 aldA   TRUE 0.780 14.000 0.053 NA   NA
 7009729 7009730 JJD26997_1446 JJD26997_1447     TRUE 0.957 1.000 0.053 NA   NA
 7009730 7009731 JJD26997_1447 JJD26997_1448   fucP TRUE 0.977 -16.000 0.273 NA   NA
 7009731 7009732 JJD26997_1448 JJD26997_1449 fucP   TRUE 0.965 11.000 0.364 NA N NA
 7009732 7009733 JJD26997_1449 JJD26997_1450     FALSE 0.271 42.000 0.000 NA   NA
 7009733 7009734 JJD26997_1450 JJD26997_1451   uxaA TRUE 0.715 12.000 0.000 NA   NA
 7009734 7009735 JJD26997_1451 JJD26997_1452 uxaA   TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7009735 7009736 JJD26997_1452 JJD26997_1453     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009738 7009739 JJD26997_1455 JJD26997_1456 rpoC rpoB TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 7009739 7009740 JJD26997_1456 JJD26997_1457 rpoB rplL FALSE 0.119 109.000 0.000 NA   NA
 7009740 7009741 JJD26997_1457 JJD26997_1458 rplL rplJ TRUE 0.984 22.000 0.884 0.021 Y NA
 7009741 7009742 JJD26997_1458 JJD26997_1459 rplJ rplA TRUE 0.657 152.000 0.302 0.028 Y NA
 7009742 7009743 JJD26997_1459 JJD26997_1460 rplA rplK TRUE 0.951 55.000 0.838 0.028 Y NA
 7009743 7009744 JJD26997_1460 JJD26997_1461 rplK nusG TRUE 0.929 26.000 0.681 1.000 N NA
 7009744 7009745 JJD26997_1461 JJD26997_1462 nusG secE TRUE 0.990 10.000 0.843 1.000   NA
 7009745 7009746 JJD26997_1462 JJD26997_1463 secE   TRUE 0.499 19.000 0.000 NA   NA
 7009746 7009747 JJD26997_1463 JJD26997_1464   rpmG TRUE 0.612 14.000 0.000 NA   NA
 7009747 7009748 JJD26997_1464 JJD26997_1465 rpmG tuf TRUE 0.680 53.000 0.099 1.000 Y NA
 7009748 7009749 JJD26997_1465 JJD26997_1466 tuf   FALSE 0.186 69.000 0.000 NA   NA
 7009749 7009750 JJD26997_1466 JJD26997_1467     FALSE 0.123 107.000 0.000 NA   NA
 7009750 7009751 JJD26997_1467 JJD26997_1468     TRUE 0.863 7.000 0.000 NA   NA
 7009751 7009752 JJD26997_1468 JJD26997_1469     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 7009752 7009753 JJD26997_1469 JJD26997_1470     FALSE 0.107 115.000 0.000 NA   NA
 7009753 7009754 JJD26997_1470 JJD26997_1471     TRUE 0.997 2.000 0.773 1.000 Y NA
 7009754 7009755 JJD26997_1471 JJD26997_1472     TRUE 0.998 -7.000 0.841 0.010 Y NA
 7009755 7009756 JJD26997_1472 JJD26997_1473     TRUE 0.773 16.000 0.048 1.000 N NA
 7009758 7009759 JJD26997_1474 JJD26997_1476 recG   TRUE 0.961 -10.000 0.084 1.000   NA
 7009759 7009760 JJD26997_1476 JJD26997_1477     TRUE 0.979 0.000 0.130 1.000   NA
 7009763 7009764 JJD26997_1480 JJD26997_1481   miaB TRUE 0.919 -3.000 0.033 NA   NA
 7009764 7009765 JJD26997_1481 JJD26997_1482 miaB   TRUE 0.888 -37.000 0.029 NA   NA
 7009765 7009766 JJD26997_1482 JJD26997_1483     TRUE 0.990 2.000 0.462 NA   NA
 7009766 7009767 JJD26997_1483 JJD26997_1484     TRUE 0.994 -3.000 1.000 NA   NA
 7009767 7009768 JJD26997_1484 JJD26997_1486     TRUE 0.986 -10.000 0.448 NA   NA
 7009769 7009770 JJD26997_1485 JJD26997_1487 thiC   FALSE 0.059 183.000 0.000 NA   NA
 7009770 7009771 JJD26997_1487 JJD26997_1488   rpe TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009772 7009773 JJD26997_1489 JJD26997_1490 rpmB   FALSE 0.037 185.000 0.004 NA   NA
 7009773 7009774 JJD26997_1490 JJD26997_1491     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 7009775 7009776 JJD26997_1492 JJD26997_1493     TRUE 0.418 81.000 0.083 1.000   NA
 7009776 7009777 JJD26997_1493 JJD26997_1494   accA FALSE 0.108 135.000 0.000 1.000 N NA
 7009777 7009778 JJD26997_1494 JJD26997_1495 accA fabF TRUE 0.976 2.000 0.046 1.000 Y NA
 7009778 7009779 JJD26997_1495 JJD26997_1496 fabF acpP TRUE 0.781 26.000 0.066 1.000 Y NA
 7009781 7009782 JJD26997_1499 JJD26997_1501 sdhC   TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 7009782 7009783 JJD26997_1501 JJD26997_1503     TRUE 0.585 15.000 0.000 NA   NA
 7009783 7009784 JJD26997_1503 JJD26997_1505     FALSE 0.076 147.000 0.000 NA   NA
 7009784 7009785 JJD26997_1505 JJD26997_1507     TRUE 0.868 -12.000 0.000 NA   NA
 7009785 7009786 JJD26997_1507 JJD26997_1508     FALSE 0.029 341.000 0.000 NA   NA
 7009786 7009787 JJD26997_1508 JJD26997_1509   fabG TRUE 0.782 10.000 0.005 1.000   NA
 7009787 7009788 JJD26997_1509 JJD26997_1510 fabG pgm FALSE 0.228 72.000 0.018 1.000 N NA
 7009789 7009790 JJD26997_1511 JJD26997_1512 mraY murD TRUE 0.998 0.000 0.647 0.006 Y NA
 7009791 7009792 JJD26997_1513 JJD26997_1514     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7009792 7009793 JJD26997_1514 JJD26997_1515     TRUE 0.902 4.000 0.000 1.000   NA
 7009793 7009794 JJD26997_1515 JJD26997_1516     TRUE 0.861 -16.000 0.000 NA   NA
 7009794 7009795 JJD26997_1516 JJD26997_1517     TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 7009795 7009796 JJD26997_1517 JJD26997_1518     FALSE 0.048 219.000 0.000 NA   NA
 7009796 7009797 JJD26997_1518 JJD26997_1519   rrfC FALSE 0.021 603.000 0.000 NA   NA
 7009797 7009798 JJD26997_1519 JJD26997_1520 rrfC rrlC FALSE 0.036 280.000 0.000 NA   NA
 7009798 7009799 JJD26997_1520 JJD26997_1521 rrlC   FALSE 0.048 213.000 0.000 NA   NA
 7009799 7009800 JJD26997_1521 JJD26997_1522     FALSE 0.045 230.000 0.000 NA   NA
 7009800 7009801 JJD26997_1522 JJD26997_1523     TRUE 0.850 9.000 0.000 NA   NA
 7009801 7009802 JJD26997_1523 JJD26997_1524   rrsC FALSE 0.126 105.000 0.000 NA   NA
 7009802 7009803 JJD26997_1524 JJD26997_1525 rrsC   FALSE 0.021 546.000 0.000 NA   NA
 7009803 7009804 JJD26997_1525 JJD26997_1526     TRUE 0.977 -7.000 0.237 NA   NA
 7009806 7009807 JJD26997_1528 JJD26997_1529     TRUE 0.838 -7.000 0.010 NA   NA
 7009807 7009808 JJD26997_1529 JJD26997_1530     FALSE 0.066 123.000 0.007 NA   NA
 7009808 7009809 JJD26997_1530 JJD26997_1531     TRUE 0.996 0.000 1.000 NA   NA
 7009809 7009810 JJD26997_1531 JJD26997_1532     FALSE 0.037 278.000 0.000 NA   NA
 7009814 7009815 JJD26997_1536 JJD26997_1537     FALSE 0.194 64.000 0.017 NA   NA
 7009817 7009818 JJD26997_1540 JJD26997_1542     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7009818 7009819 JJD26997_1542 JJD26997_1543     FALSE 0.049 212.000 0.000 NA   NA
 7009819 7009820 JJD26997_1543 JJD26997_1544     FALSE 0.080 137.000 0.000 NA   NA
 7009820 7009821 JJD26997_1544 JJD26997_1545     TRUE 0.985 0.000 0.222 1.000   NA
 7009821 7009822 JJD26997_1545 JJD26997_1546     TRUE 0.842 110.000 0.750 0.007   NA
 7009822 7009823 JJD26997_1546 JJD26997_1547   frdB TRUE 0.440 28.000 0.022 1.000   NA
 7009823 7009824 JJD26997_1547 JJD26997_1548 frdB frdA TRUE 0.993 -7.000 0.153 0.002 Y NA
 7009824 7009825 JJD26997_1548 JJD26997_1549 frdA frdC TRUE 0.991 -16.000 0.128 0.002 Y NA
 7009825 7009826 JJD26997_1549 JJD26997_1550 frdC lgt FALSE 0.192 69.000 0.010 1.000 N NA
 7009828 7009829 JJD26997_1552 JJD26997_1553 aroE   TRUE 0.882 -3.000 0.020 NA   NA
 7009829 7009830 JJD26997_1553 JJD26997_1554     TRUE 0.933 14.000 0.387 NA   NA
 7009830 7009831 JJD26997_1554 JJD26997_1555   glyA TRUE 0.979 -3.000 0.271 NA   NA
 7009831 7009832 JJD26997_1555 JJD26997_1556 glyA lysS TRUE 0.947 -3.000 0.044 1.000 N NA
 7009832 7009833 JJD26997_1556 JJD26997_1557 lysS fur TRUE 0.938 1.000 0.022 1.000 N NA
 7009833 7009834 JJD26997_1557 JJD26997_1558 fur   TRUE 0.912 -6.000 0.023 1.000   NA
 7009834 7009835 JJD26997_1558 JJD26997_1559   gatC FALSE 0.161 66.000 0.003 1.000   NA
 7009836 7009837 JJD26997_1560 JJD26997_1561     TRUE 0.944 -3.000 0.057 NA   NA
 7009837 7009838 JJD26997_1561 JJD26997_1562     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009838 7009839 JJD26997_1562 JJD26997_1563     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7009839 7009840 JJD26997_1563 JJD26997_1564     TRUE 0.865 -13.000 0.000 NA   NA
 7009840 7009841 JJD26997_1564 JJD26997_1565     FALSE 0.091 119.000 0.007 1.000   NA
 7009841 7009842 JJD26997_1565 JJD26997_1566   pyk TRUE 0.527 49.000 0.073 1.000   NA
 7009842 7009843 JJD26997_1566 JJD26997_1567 pyk   FALSE 0.214 98.000 0.037 NA   NA
 7009844 7009845 JJD26997_1568 JJD26997_1569   serS TRUE 0.821 10.000 0.014 1.000   NA
 7009845 7009846 JJD26997_1569 JJD26997_1570 serS trpS TRUE 0.918 11.000 0.010 0.040 Y NA
 7009846 7009847 JJD26997_1570 JJD26997_1571 trpS aroK TRUE 0.963 -3.000 0.033 0.081 N NA
 7009847 7009848 JJD26997_1571 JJD26997_1572 aroK engA TRUE 0.920 -13.000 0.007 0.081   NA
 7009849 7009850 JJD26997_1573 JJD26997_1574   kdsA TRUE 0.855 -3.000 0.005 1.000   NA
 7009850 7009851 JJD26997_1574 JJD26997_1575 kdsA ribH TRUE 0.884 10.000 0.027 1.000 N NA
 7009851 7009852 JJD26997_1575 JJD26997_1576 ribH nusB TRUE 0.960 0.000 0.045 1.000 N NA
 7009852 7009853 JJD26997_1576 JJD26997_1577 nusB pyrF TRUE 0.916 -3.000 0.023 1.000 N NA
 7009853 7009854 JJD26997_1577 JJD26997_1578 pyrF   FALSE 0.190 55.000 0.003 1.000   NA
 7009854 7009855 JJD26997_1578 JJD26997_1580     TRUE 0.997 0.000 0.790 0.027   NA
 7009856 7009857 JJD26997_1579 JJD26997_1581     TRUE 0.970 0.000 0.097 NA   NA
 7009857 7009858 JJD26997_1581 JJD26997_1582     TRUE 0.942 11.000 0.176 NA   NA
 7009858 7009859 JJD26997_1582 JJD26997_1583     TRUE 0.818 9.000 0.012 NA   NA
 7009859 7009860 JJD26997_1583 JJD26997_1584     TRUE 0.881 -10.000 0.021 NA   NA
 7009860 7009861 JJD26997_1584 JJD26997_1585     TRUE 0.973 4.000 0.118 1.000 N NA
 7009861 7009862 JJD26997_1585 JJD26997_1586     TRUE 0.987 10.000 0.763 NA   NA
 7009862 7009863 JJD26997_1586 JJD26997_1587   rpsU FALSE 0.086 116.000 0.012 NA   NA
 7009864 7009865 JJD26997_1588 JJD26997_1589     TRUE 0.993 -13.000 0.818 1.000   NA
 7009865 7009866 JJD26997_1589 JJD26997_1590   cmeA TRUE 0.469 95.000 0.145 1.000   NA
 7009866 7009867 JJD26997_1590 JJD26997_1591 cmeA cmeB TRUE 0.996 0.000 0.945 1.000 N NA
 7009867 7009868 JJD26997_1591 JJD26997_1592 cmeB cmeC TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 7009871 7009872 JJD26997_1594 JJD26997_1596   lspA TRUE 0.868 -16.000 0.020 NA   NA
 7009872 7009873 JJD26997_1596 JJD26997_1597 lspA glmM TRUE 0.945 -7.000 0.042 1.000 N NA
 7009873 7009874 JJD26997_1597 JJD26997_1598 glmM ccpA-2 FALSE 0.143 94.000 0.000 NA   NA
 7009874 7009875 JJD26997_1598 JJD26997_1599 ccpA-2   FALSE 0.104 117.000 0.000 NA   NA
 7009875 7009876 JJD26997_1599 JJD26997_1600     FALSE 0.249 48.000 0.000 NA   NA
 7009877 7009878 JJD26997_1601 JJD26997_1602     TRUE 0.932 -15.000 0.040 1.000   NA
 7009878 7009879 JJD26997_1602 JJD26997_1603     TRUE 0.338 78.000 0.043 1.000 N NA
 7009879 7009880 JJD26997_1603 JJD26997_1604     TRUE 0.400 114.000 0.200 NA   NA
 7009880 7009881 JJD26997_1604 JJD26997_1606     TRUE 0.995 0.000 0.806 NA   NA
 7009882 7009883 JJD26997_1605 JJD26997_1607   fliN TRUE 0.988 7.000 0.531 NA   NA
 7009883 7009884 JJD26997_1607 JJD26997_1608 fliN   TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7009884 7009885 JJD26997_1608 JJD26997_1609     FALSE 0.276 41.000 0.000 NA   NA
 7009885 7009886 JJD26997_1609 JJD26997_1610   trpA FALSE 0.183 71.000 0.000 NA   NA
 7009886 7009887 JJD26997_1610 JJD26997_1611 trpA trpB TRUE 0.995 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 7009887 7009888 JJD26997_1611 JJD26997_1612 trpB trpF TRUE 0.996 -3.000 0.375 0.002 Y NA
 7009888 7009889 JJD26997_1612 JJD26997_1613 trpF trpD TRUE 0.968 -13.000 0.052 1.000 Y NA
 7009889 7009890 JJD26997_1613 JJD26997_1614 trpD trpE TRUE 0.978 -3.000 0.019 0.001 Y NA
 7009890 7009891 JJD26997_1614 JJD26997_1615 trpE   FALSE 0.063 159.000 0.016 NA   NA
 7009892 7009893 JJD26997_1616 JJD26997_1617   uvrA FALSE 0.148 73.000 0.003 1.000   NA
 7009893 7009894 JJD26997_1617 JJD26997_1618 uvrA   TRUE 0.802 5.000 0.002 NA   NA
 7009894 7009895 JJD26997_1618 JJD26997_1619     FALSE 0.076 147.000 0.000 NA   NA
 7009895 7009896 JJD26997_1619 JJD26997_1620   polA TRUE 0.376 27.000 0.000 NA   NA
 7009896 7009897 JJD26997_1620 JJD26997_1621 polA   TRUE 0.546 16.000 0.006 1.000 N NA
 7009897 7009898 JJD26997_1621 JJD26997_1622   motB TRUE 0.985 3.000 0.119 1.000 Y NA
 7009899 7009900 JJD26997_1623 JJD26997_1624 flhB   FALSE 0.099 117.000 0.006 1.000 N NA
 7009901 7009902 JJD26997_1625 JJD26997_1626   ndk FALSE 0.095 114.000 0.015 NA   NA
 7009902 7009903 JJD26997_1626 JJD26997_1627 ndk   TRUE 0.941 1.000 0.033 NA   NA
 7009903 7009904 JJD26997_1627 JJD26997_1628   rpmF TRUE 0.520 25.000 0.032 NA   NA
 7009904 7009905 JJD26997_1628 JJD26997_1629 rpmF plsX TRUE 0.986 6.000 0.418 1.000   NA
 7009905 7009906 JJD26997_1629 JJD26997_1630 plsX fabH TRUE 0.987 -7.000 0.058 0.005 Y NA
 7009909 7009910 JJD26997_1632 JJD26997_1634 serC xseA TRUE 0.817 10.000 0.010 1.000 N NA
 7009910 7009911 JJD26997_1634 JJD26997_1635 xseA   TRUE 0.850 9.000 0.000 NA   NA
 7009912 7009913 JJD26997_1636 JJD26997_1637     TRUE 0.984 7.000 0.426 NA   NA
 7009913 7009914 JJD26997_1637 JJD26997_1639     TRUE 0.956 9.000 0.115 NA   NA
 7009915 7009916 JJD26997_1638 JJD26997_1640 ubiE   TRUE 0.852 3.000 0.008 NA   NA
 7009916 7009917 JJD26997_1640 JJD26997_1641     TRUE 0.357 45.000 0.033 NA   NA
 7009917 7009918 JJD26997_1641 JJD26997_1642   dxs FALSE 0.191 86.000 0.017 1.000 N NA
 7009918 7009919 JJD26997_1642 JJD26997_1643 dxs fliH TRUE 0.943 -7.000 0.052 NA N NA
 7009919 7009920 JJD26997_1643 JJD26997_1644 fliH fliG TRUE 0.987 8.000 0.308 NA Y NA
 7009920 7009921 JJD26997_1644 JJD26997_1645 fliG fliF TRUE 0.997 0.000 0.477 0.009 Y NA
 7009921 7009922 JJD26997_1645 JJD26997_1646 fliF hisC TRUE 0.535 55.000 0.084 1.000 N NA
 7009922 7009923 JJD26997_1646 JJD26997_1647 hisC pheA TRUE 0.953 -10.000 0.028 1.000 Y NA
 7009923 7009924 JJD26997_1647 JJD26997_1648 pheA   TRUE 0.907 -12.000 0.021 1.000 N NA
 7009924 7009925 JJD26997_1648 JJD26997_1649     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7009925 7009926 JJD26997_1649 JJD26997_1650     TRUE 0.976 -3.000 0.222 NA   NA
 7009926 7009927 JJD26997_1650 JJD26997_1651   lysA TRUE 0.927 2.000 0.000 1.000 N NA
 7009927 7009928 JJD26997_1651 JJD26997_1652 lysA   TRUE 0.324 44.000 0.021 1.000   NA
 7009928 7009929 JJD26997_1652 JJD26997_1653   pth TRUE 0.944 2.000 0.031 1.000   NA
 7009929 7009930 JJD26997_1653 JJD26997_1654 pth rplY TRUE 0.996 -3.000 0.496 0.032 Y NA
 7009931 7009932 JJD26997_1655 JJD26997_1656     TRUE 0.997 2.000 0.444 0.039 Y NA
 7009932 7009933 JJD26997_1656 JJD26997_1658   bioD TRUE 0.892 10.000 0.030 1.000 N NA
 7009935 7009936 JJD26997_1659 JJD26997_1660 bioF   TRUE 0.984 -3.000 0.389 NA   NA
 7009936 7009937 JJD26997_1660 JJD26997_1661     TRUE 0.949 -3.000 0.065 NA   NA
 7009937 7009938 JJD26997_1661 JJD26997_1662   modA FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 7009940 7009941 JJD26997_1664 JJD26997_1665     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7009941 7009942 JJD26997_1665 JJD26997_1666   panB FALSE 0.054 195.000 0.000 NA   NA
 7009942 7009943 JJD26997_1666 JJD26997_1667 panB panC TRUE 0.992 11.000 0.395 0.001 Y NA
 7009943 7009944 JJD26997_1667 JJD26997_1668 panC panD TRUE 0.991 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 7009945 7009946 JJD26997_1669 JJD26997_1670   surE TRUE 0.948 -7.000 0.051 1.000   NA
 7009947 7009948 JJD26997_1671 JJD26997_1673     TRUE 0.846 -45.000 0.000 NA   NA
 7009948 7009949 JJD26997_1673 JJD26997_1674     TRUE 0.858 -18.000 0.000 NA   NA
 7009949 7009950 JJD26997_1674 JJD26997_1675     FALSE 0.092 127.000 0.000 NA   NA
 7009950 7009951 JJD26997_1675 JJD26997_1677     TRUE 0.863 7.000 0.000 NA   NA
 7009951 7009952 JJD26997_1677 JJD26997_1678     FALSE 0.026 374.000 0.000 NA   NA
 7009952 7009953 JJD26997_1678 JJD26997_1679     TRUE 0.849 -33.000 0.000 NA   NA
 7009953 7009954 JJD26997_1679 JJD26997_1680     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7009954 7009955 JJD26997_1680 JJD26997_1681     TRUE 0.996 2.000 1.000 NA   NA
 7009955 7009956 JJD26997_1681 JJD26997_1682     FALSE 0.097 122.000 0.000 NA   NA
 7009956 7009957 JJD26997_1682 JJD26997_1683   lpxB TRUE 0.850 -3.000 0.003 1.000   NA
 7009957 7009958 JJD26997_1683 JJD26997_1684 lpxB greA TRUE 0.859 12.000 0.042 1.000 N NA
 7009958 7009959 JJD26997_1684 JJD26997_1685 greA   FALSE 0.069 134.000 0.012 NA   NA
 7009959 7009960 JJD26997_1685 JJD26997_1686   cheV TRUE 0.949 -7.000 0.065 NA   NA
 7009960 7009961 JJD26997_1686 JJD26997_1687 cheV cheA TRUE 0.993 4.000 0.147 0.006 Y NA
 7009961 7009962 JJD26997_1687 JJD26997_1688 cheA cheW TRUE 0.991 5.000 0.137 0.008 Y NA
 7009962 7009963 JJD26997_1688 JJD26997_1689 cheW serB TRUE 0.919 0.000 0.015 1.000 N NA
 7009963 7009964 JJD26997_1689 JJD26997_1690 serB tal TRUE 0.947 0.000 0.029 1.000 N NA
 7009965 7009966 JJD26997_1691 JJD26997_1692   carB TRUE 0.881 -3.000 0.020 NA   NA
 7009966 7009967 JJD26997_1692 JJD26997_1693 carB   FALSE 0.048 261.000 0.016 1.000 N NA
 7009967 7009968 JJD26997_1693 JJD26997_1694   mreB TRUE 0.993 -10.000 0.689 1.000 N NA
 7009968 7009969 JJD26997_1694 JJD26997_1695 mreB clpX TRUE 0.905 12.000 0.034 0.079 N NA
 7009969 7009970 JJD26997_1695 JJD26997_1696 clpX lpxA TRUE 0.924 -7.000 0.027 1.000 N NA
 7009970 7009971 JJD26997_1696 JJD26997_1697 lpxA fabZ TRUE 0.987 0.000 0.264 1.000 N NA
 7009971 7009972 JJD26997_1697 JJD26997_1698 fabZ   FALSE 0.225 91.000 0.035 NA   NA
 7009972 7009973 JJD26997_1698 JJD26997_1699     TRUE 0.862 0.000 0.006 NA   NA
 7009973 7009974 JJD26997_1699 JJD26997_1700     TRUE 0.865 -3.000 0.008 1.000   NA
 7009975 7009976 JJD26997_1701 JJD26997_1702     TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.002 Y NA
 7009976 7009977 JJD26997_1702 JJD26997_1703     TRUE 0.986 -10.000 0.182 1.000 Y NA
 7009977 7009978 JJD26997_1703 JJD26997_1704     TRUE 0.995 -13.000 0.692 1.000 Y NA
 7009978 7009979 JJD26997_1704 JJD26997_1705     TRUE 0.974 -16.000 0.154 1.000 N NA
 7009979 7009980 JJD26997_1705 JJD26997_1706     TRUE 0.934 0.000 0.022 1.000 N NA
 7009980 7009981 JJD26997_1706 JJD26997_1707   ilvE TRUE 0.385 46.000 0.008 1.000 Y NA
 7009981 7009982 JJD26997_1707 JJD26997_1708 ilvE   TRUE 0.873 14.000 0.098 1.000 N NA
 7009982 7009983 JJD26997_1708 JJD26997_1709     TRUE 0.579 33.000 0.075 NA   NA
 7009983 7009984 JJD26997_1709 JJD26997_1710     TRUE 0.995 0.000 0.867 NA   NA
 7009984 7009985 JJD26997_1710 JJD26997_1712     FALSE 0.022 482.000 0.000 NA   NA
 7009987 7009988 JJD26997_1713 JJD26997_1715     FALSE 0.109 114.000 0.000 NA   NA
 7009988 7009989 JJD26997_1715 JJD26997_1716     FALSE 0.170 79.000 0.000 NA   NA
 7009991 7009992 JJD26997_1719 JJD26997_1720     FALSE 0.062 176.000 0.000 NA   NA
 7009992 7009993 JJD26997_1720 JJD26997_1721     TRUE 0.532 80.000 0.154 1.000   NA
 7009994 7009995 JJD26997_1722 JJD26997_1723 pyrC   TRUE 0.861 -10.000 0.009 1.000   NA
 7009995 7009996 JJD26997_1723 JJD26997_1724   dgkA TRUE 0.982 -3.000 0.273 1.000   NA
 7009996 7009997 JJD26997_1724 JJD26997_1725 dgkA   TRUE 0.973 -3.000 0.136 1.000   NA
 7009997 7009998 JJD26997_1725 JJD26997_1726     TRUE 0.334 31.000 0.000 NA   NA
 7009999 7010000 JJD26997_1727 JJD26997_1728     FALSE 0.100 120.000 0.000 NA   NA
 7010000 7010001 JJD26997_1728 JJD26997_1729     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7010001 7010002 JJD26997_1729 JJD26997_1731     TRUE 0.849 -34.000 0.000 NA   NA
 7010002 7010003 JJD26997_1731 JJD26997_1732     TRUE 0.848 -37.000 0.000 NA   NA
 7010004 7010005 JJD26997_1733 JJD26997_1734   fabI TRUE 0.968 4.000 0.088 1.000 N NA
 7010005 7010006 JJD26997_1734 JJD26997_1735 fabI tpiA TRUE 0.979 4.000 0.071 0.032 N NA
 7010006 7010007 JJD26997_1735 JJD26997_1736 tpiA pgk TRUE 0.949 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 7010007 7010008 JJD26997_1736 JJD26997_1737 pgk gapA TRUE 0.960 10.000 0.020 0.005 Y NA
 7010009 7010010 JJD26997_1738 JJD26997_1739 nadD   TRUE 0.362 28.000 0.000 NA   NA
 7010012 7010013 JJD26997_1741 JJD26997_1742 fliL acpS TRUE 0.962 0.000 0.047 1.000 N NA
 7010014 7010015 JJD26997_1743 JJD26997_1744     TRUE 0.990 -3.000 0.600 NA   NA
 7010015 7010016 JJD26997_1744 JJD26997_1745     TRUE 0.968 -3.000 0.132 NA   NA
 7010016 7010017 JJD26997_1745 JJD26997_1746     TRUE 0.382 53.000 0.046 NA   NA
 7010017 7010018 JJD26997_1746 JJD26997_1747     TRUE 0.864 29.000 0.056 0.001 Y NA
 7010018 7010019 JJD26997_1747 JJD26997_1748     TRUE 0.942 -3.000 0.039 1.000 N NA
 7010019 7010020 JJD26997_1748 JJD26997_1749     TRUE 0.939 -10.000 0.039 1.000 N NA
 7010020 7010021 JJD26997_1749 JJD26997_1750     TRUE 0.994 2.000 0.679 1.000   NA
 7010021 7010022 JJD26997_1750 JJD26997_1751     TRUE 0.842 54.000 0.667 1.000   NA
 7010022 7010023 JJD26997_1751 JJD26997_1752     TRUE 0.919 15.000 0.261 1.000 N NA
 7010023 7010024 JJD26997_1752 JJD26997_1753     TRUE 0.719 51.000 0.263 1.000 N NA
 7010024 7010025 JJD26997_1753 JJD26997_1754     FALSE 0.226 55.000 0.000 NA   NA
 7010025 7010026 JJD26997_1754 JJD26997_1755     FALSE 0.033 306.000 0.000 NA   NA
 7010026 7010027 JJD26997_1755 JJD26997_1756   gmhA TRUE 0.976 -12.000 0.154 1.000 N NA
 7010027 7010028 JJD26997_1756 JJD26997_1757 gmhA   TRUE 0.875 -7.000 0.000 NA   NA
 7010028 7010029 JJD26997_1757 JJD26997_1758     FALSE 0.127 104.000 0.000 NA   NA
 7010029 7010030 JJD26997_1758 JJD26997_1759     TRUE 0.892 3.000 0.000 NA   NA
 7010030 7010031 JJD26997_1759 JJD26997_1760     TRUE 0.429 24.000 0.000 NA   NA
 7010031 7010032 JJD26997_1760 JJD26997_1761     FALSE 0.072 156.000 0.000 NA   NA
 7010032 7010033 JJD26997_1761 JJD26997_1762     TRUE 0.487 20.000 0.000 NA   NA
 7010033 7010034 JJD26997_1762 JJD26997_1763     TRUE 0.898 24.000 0.067 0.005 Y NA
 7010034 7010035 JJD26997_1763 JJD26997_1764     TRUE 0.968 9.000 0.000 0.005 Y NA
 7010035 7010036 JJD26997_1764 JJD26997_1765     TRUE 0.539 81.000 0.000 0.002 Y NA
 7010036 7010037 JJD26997_1765 JJD26997_1766     TRUE 0.993 0.000 0.667 NA   NA
 7010037 7010038 JJD26997_1766 JJD26997_1767     FALSE 0.188 68.000 0.000 NA   NA
 7010038 7010039 JJD26997_1767 JJD26997_1769     FALSE 0.194 66.000 0.000 NA   NA
 7010039 7010040 JJD26997_1769 JJD26997_1770     TRUE 0.880 4.000 0.000 NA   NA
 7010040 7010041 JJD26997_1770 JJD26997_1771     FALSE 0.121 108.000 0.000 NA   NA
 7010041 7010042 JJD26997_1771 JJD26997_1773     TRUE 0.585 15.000 0.000 NA   NA
 7010042 7010043 JJD26997_1773 JJD26997_1774     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7010043 7010044 JJD26997_1774 JJD26997_1775     FALSE 0.064 168.000 0.000 NA   NA
 7010044 7010045 JJD26997_1775 JJD26997_1776     FALSE 0.074 149.000 0.000 NA   NA
 7010045 7010046 JJD26997_1776 JJD26997_1777     TRUE 0.909 1.000 0.000 NA   NA
 7010046 7010047 JJD26997_1777 JJD26997_1778   kpsF TRUE 0.954 -3.000 0.033 NA Y NA
 7010047 7010048 JJD26997_1778 JJD26997_1779 kpsF kpsD TRUE 0.954 10.000 0.056 1.000 Y NA
 7010048 7010049 JJD26997_1779 JJD26997_1780 kpsD kpsE TRUE 0.994 2.000 0.200 0.057 Y NA
 7010049 7010050 JJD26997_1780 JJD26997_1781 kpsE kpsT TRUE 0.992 0.000 0.257 1.000 Y NA
 7010050 7010051 JJD26997_1781 JJD26997_1782 kpsT kpsM TRUE 0.994 -3.000 0.306 0.078 Y NA
 7010051 7010052 JJD26997_1782 JJD26997_1783 kpsM   TRUE 0.346 77.000 0.048 1.000   NA
 7010053 7010054 JJD26997_1784 JJD26997_1785     TRUE 0.630 37.000 0.120 NA   NA
 7010054 7010055 JJD26997_1785 JJD26997_1787     TRUE 0.968 2.000 0.092 NA   NA
 7010056 7010057 JJD26997_1786 JJD26997_1788 tilS yliG TRUE 0.903 -10.000 0.019 1.000 N NA
 7010058 7010059 JJD26997_1789 JJD26997_1790   prfB FALSE 0.118 110.000 0.000 NA   NA
 7010059 7010060 JJD26997_1790 JJD26997_1791 prfB   FALSE 0.071 196.000 0.000 1.000 N NA
 7010061 7010062 JJD26997_1792 JJD26997_1793 truD   TRUE 0.890 -31.000 0.022 1.000   NA
 7010063 7010064 JJD26997_1794 JJD26997_1795     TRUE 0.969 -3.000 0.143 NA   NA
 7010064 7010065 JJD26997_1795 JJD26997_1796     TRUE 0.916 -7.000 0.032 NA   NA
 7010066 7010067 JJD26997_1797 JJD26997_1798     TRUE 0.852 -27.000 0.000 NA   NA
 7010067 7010068 JJD26997_1798 JJD26997_1799     FALSE 0.050 205.000 0.000 NA   NA
 7010068 7010069 JJD26997_1799 JJD26997_1800     TRUE 0.865 -13.000 0.000 NA   NA
 7010069 7010070 JJD26997_1800 JJD26997_1801     TRUE 0.946 -3.000 0.061 NA   NA
 7010070 7010071 JJD26997_1801 JJD26997_1802     TRUE 0.946 -3.000 0.061 NA   NA
 7010071 7010072 JJD26997_1802 JJD26997_1803     FALSE 0.226 55.000 0.000 NA   NA
 7010072 7010073 JJD26997_1803 JJD26997_1804     TRUE 0.987 -3.000 0.467 NA   NA
 7010073 7010074 JJD26997_1804 JJD26997_1805     TRUE 0.960 3.000 0.077 NA   NA
 7010074 7010075 JJD26997_1805 JJD26997_1806     TRUE 0.964 -7.000 0.115 NA   NA
 7010075 7010076 JJD26997_1806 JJD26997_1807     TRUE 0.957 -6.000 0.065 1.000   NA
 7010076 7010077 JJD26997_1807 JJD26997_1808     TRUE 0.846 -7.000 0.012 NA   NA
 7010078 7010079 JJD26997_1809 JJD26997_1810   flgI FALSE 0.139 96.000 0.000 NA   NA
 7010079 7010080 JJD26997_1810 JJD26997_1811 flgI   TRUE 0.992 0.000 0.569 NA   NA
 7010080 7010081 JJD26997_1811 JJD26997_1812     TRUE 0.723 66.000 0.469 NA   NA
 7010081 7010082 JJD26997_1812 JJD26997_1813     TRUE 0.860 41.000 0.677 NA   NA
 7010082 7010083 JJD26997_1813 JJD26997_1814   flgK TRUE 0.993 10.000 0.558 0.003   NA
 7010083 7010084 JJD26997_1814 JJD26997_1815 flgK   TRUE 0.812 17.000 0.084 1.000   NA
 7010084 7010085 JJD26997_1815 JJD26997_1817     TRUE 0.937 4.000 0.035 1.000   NA
 7010086 7010087 JJD26997_1816 JJD26997_1818 ctsF ctsE TRUE 0.987 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 7010087 7010088 JJD26997_1818 JJD26997_1819 ctsE ctsX TRUE 0.984 -10.000 0.333 1.000   NA
 7010088 7010089 JJD26997_1819 JJD26997_1820 ctsX ctsP TRUE 0.992 4.000 0.667 1.000   NA
 7010089 7010090 JJD26997_1820 JJD26997_1821 ctsP ctsD TRUE 0.976 -7.000 0.167 1.000   NA
 7010090 7010091 JJD26997_1821 JJD26997_1822 ctsD ctsR TRUE 0.947 -22.000 0.083 NA   NA
 7010091 7010092 JJD26997_1822 JJD26997_1823 ctsR   TRUE 0.403 24.000 0.016 NA   NA
 7010092 7010093 JJD26997_1823 JJD26997_1824     TRUE 0.325 93.000 0.056 1.000   NA
 7010093 7010094 JJD26997_1824 JJD26997_1825   cadF TRUE 0.969 0.000 0.068 1.000   NA
 7010094 7010095 JJD26997_1825 JJD26997_1826 cadF rpsI FALSE 0.147 123.000 0.024 1.000 N NA
 7010095 7010096 JJD26997_1826 JJD26997_1827 rpsI rplM TRUE 0.994 3.000 0.231 0.020 Y NA
 7010096 7010097 JJD26997_1827 JJD26997_1828 rplM   FALSE 0.194 66.000 0.009 1.000 N NA
 7010097 7010098 JJD26997_1828 JJD26997_1829     TRUE 0.989 -3.000 0.117 0.034 Y NA
 7010098 7010099 JJD26997_1829 JJD26997_1830     TRUE 0.958 -3.000 0.091 NA   NA
 7010099 7010100 JJD26997_1830 JJD26997_1831     TRUE 0.958 -13.000 0.102 NA   NA
 7010100 7010101 JJD26997_1831 JJD26997_1832     TRUE 0.672 95.000 0.526 NA   NA
 7010101 7010102 JJD26997_1832 JJD26997_1833   ccoP TRUE 0.992 0.000 0.579 NA   NA
 7010102 7010103 JJD26997_1833 JJD26997_1834 ccoP ccoQ TRUE 0.995 0.000 0.286 0.002 N NA
 7010103 7010104 JJD26997_1834 JJD26997_1835 ccoQ ccoO TRUE 0.998 2.000 0.738 0.002 N NA
 7010104 7010105 JJD26997_1835 JJD26997_1836 ccoO ccoN TRUE 0.975 13.000 0.283 0.002 N NA
 7010105 7010106 JJD26997_1836 JJD26997_1837 ccoN   FALSE 0.241 128.000 0.062 1.000 N NA
 7010106 7010107 JJD26997_1837 JJD26997_1839     FALSE 0.050 205.000 0.000 NA   NA
 7010107 7010108 JJD26997_1839 JJD26997_1840     FALSE 0.043 237.000 0.000 NA   NA
 7010108 7010109 JJD26997_1840 JJD26997_1841     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7010109 7010110 JJD26997_1841 JJD26997_1842   carA TRUE 0.842 -3.000 0.011 NA   NA
 7010110 7010111 JJD26997_1842 JJD26997_1843 carA   TRUE 0.946 0.000 0.041 NA   NA
 7010111 7010112 JJD26997_1843 JJD26997_1844     TRUE 0.403 93.000 0.120 NA   NA
 7010112 7010113 JJD26997_1844 JJD26997_1845     TRUE 0.970 -7.000 0.147 NA   NA
 7010113 7010114 JJD26997_1845 JJD26997_1846   purA FALSE 0.067 144.000 0.014 NA   NA
 7010114 7010115 JJD26997_1846 JJD26997_1847 purA   TRUE 0.347 29.000 0.000 NA   NA
 7010116 7010117 JJD26997_1848 JJD26997_1849     TRUE 0.994 4.000 0.844 NA   NA
 7010118 7010119 JJD26997_1850 JJD26997_1851 hsdM   TRUE 0.624 59.000 0.072 0.033   NA
 7010119 7010120 JJD26997_1851 JJD26997_1852     TRUE 0.447 67.000 0.000 0.002   NA
 7010120 7010121 JJD26997_1852 JJD26997_1853     TRUE 0.960 -7.000 0.000 0.002   NA
 7010121 7010122 JJD26997_1853 JJD26997_1854   putP FALSE 0.226 75.000 0.000 1.000 N NA
 7010122 7010123 JJD26997_1854 JJD26997_1855 putP   TRUE 0.858 18.000 0.141 1.000 N NA
 7010123 7010124 JJD26997_1855 JJD26997_1856   selD FALSE 0.088 129.000 0.000 NA   NA
 7010124 7010125 JJD26997_1856 JJD26997_1857 selD   FALSE 0.124 106.000 0.000 NA   NA
 7010125 7010126 JJD26997_1857 JJD26997_1858     FALSE 0.133 112.000 0.015 1.000 N NA
 7010126 7010127 JJD26997_1858 JJD26997_1859     FALSE 0.283 110.000 0.077 NA   NA
 7010127 7010128 JJD26997_1859 JJD26997_1860   fdhD TRUE 0.731 29.000 0.172 NA   NA
 7010128 7010129 JJD26997_1860 JJD26997_1861 fdhD fdhC TRUE 0.580 166.000 0.138 0.002 Y NA
 7010129 7010130 JJD26997_1861 JJD26997_1862 fdhC fdhB TRUE 0.994 -3.000 0.200 0.002 Y NA
 7010130 7010131 JJD26997_1862 JJD26997_1863 fdhB fdhA TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7010131 7010132 JJD26997_1863 JJD26997_1864 fdhA   TRUE 0.460 22.000 0.000 NA   NA
 7010132 7010133 JJD26997_1864 JJD26997_1865     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7010133 7010134 JJD26997_1865 JJD26997_1866     TRUE 0.980 -25.000 0.375 NA   NA
 7010134 7010135 JJD26997_1866 JJD26997_1867   nspC FALSE 0.040 315.000 0.000 1.000   NA
 7010136 7010137 JJD26997_1868 JJD26997_1869     FALSE 0.037 278.000 0.000 NA   NA
 7010137 7010138 JJD26997_1869 JJD26997_1870     TRUE 0.907 2.000 0.010 1.000 N NA
 7010138 7010139 JJD26997_1870 JJD26997_1871     TRUE 0.996 1.000 0.501 1.000 Y NA
 7010139 7010140 JJD26997_1871 JJD26997_1872     TRUE 0.976 4.000 0.018 0.004 Y NA
 7010141 7010142 JJD26997_1873 JJD26997_1874 cas2 cas1 TRUE 0.993 -7.000 0.876 NA   NA
 7010142 7010143 JJD26997_1874 JJD26997_1875 cas1   TRUE 0.988 -13.000 0.546 NA   NA
 7010144 7010145 JJD26997_1876 JJD26997_1877     TRUE 0.362 28.000 0.000 NA   NA
 7010145 7010146 JJD26997_1877 JJD26997_1878     TRUE 0.347 29.000 0.000 NA   NA
 7010146 7010147 JJD26997_1878 JJD26997_1879     TRUE 0.851 -28.000 0.000 NA   NA
 7010147 7010148 JJD26997_1879 JJD26997_1880     FALSE 0.102 119.000 0.000 NA   NA
 7010150 7010151 JJD26997_1882 JJD26997_1883 coaE dapF TRUE 0.898 -3.000 0.016 1.000 N NA
 7010151 7010152 JJD26997_1883 JJD26997_1885 dapF   TRUE 0.847 -25.000 0.010 1.000   NA
 7010153 7010154 JJD26997_1884 JJD26997_1886     FALSE 0.161 83.000 0.000 NA   NA
 7010154 7010155 JJD26997_1886 JJD26997_1887   pgi FALSE 0.207 62.000 0.000 NA   NA
 7010155 7010156 JJD26997_1887 JJD26997_1888 pgi galU TRUE 0.940 1.000 0.023 1.000 N NA
 7010156 7010157 JJD26997_1888 JJD26997_1889 galU acs TRUE 0.286 81.000 0.032 1.000 N NA
 7010157 7010158 JJD26997_1889 JJD26997_1890 acs   FALSE 0.150 137.000 0.032 1.000 N NA
 7010158 7010159 JJD26997_1890 JJD26997_1891     TRUE 0.990 2.000 0.389 1.000 N NA
 7010161 7010162 JJD26997_1894 JJD26997_1895     TRUE 0.857 -19.000 0.000 NA   NA
 7010162 7010163 JJD26997_1895 JJD26997_1897     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7010163 7010164 JJD26997_1897 JJD26997_1898     FALSE 0.040 256.000 0.000 NA   NA
 7010165 7010166 JJD26997_1899 JJD26997_1900     TRUE 0.920 10.000 0.053 1.000   NA
 7010166 7010167 JJD26997_1900 JJD26997_1902     TRUE 0.976 -19.000 0.122 NA Y NA
 7010168 7010169 JJD26997_1901 JJD26997_1903     TRUE 0.489 33.000 0.034 1.000   NA
 7010172 7010173 JJD26997_1906 JJD26997_1908     TRUE 0.540 17.000 0.000 NA   NA
 7010173 7010174 JJD26997_1908 JJD26997_1909     FALSE 0.090 128.000 0.000 NA   NA
 7010174 7010175 JJD26997_1909 JJD26997_1910     TRUE 0.865 -13.000 0.000 NA   NA
 7010175 7010176 JJD26997_1910 JJD26997_1911     FALSE 0.044 231.000 0.000 NA   NA
 7010176 7010177 JJD26997_1911 JJD26997_1912     FALSE 0.248 121.000 0.062 1.000   NA
 7010177 7010178 JJD26997_1912 JJD26997_1913     TRUE 0.905 0.000 0.000 NA   NA
 7010178 7010179 JJD26997_1913 JJD26997_1914     FALSE 0.038 266.000 0.000 NA   NA
 7010179 7010180 JJD26997_1914 JJD26997_1915     FALSE 0.022 537.000 0.000 NA   NA
 7010181 7010182 JJD26997_1916 JJD26997_1917 pflA nuoN TRUE 0.531 22.000 0.020 1.000   NA
 7010182 7010183 JJD26997_1917 JJD26997_1918 nuoN nuoM TRUE 0.980 -10.000 0.024 0.001 Y NA
 7010183 7010184 JJD26997_1918 JJD26997_1919 nuoM nuoL TRUE 0.991 2.000 0.056 0.001 Y NA
 7010184 7010185 JJD26997_1919 JJD26997_1920 nuoL nuoK TRUE 0.989 2.000 0.056 0.008 Y NA
 7010185 7010186 JJD26997_1920 JJD26997_1921 nuoK nuoJ TRUE 0.988 -3.000 0.064 0.003 Y NA
 7010186 7010187 JJD26997_1921 JJD26997_1922 nuoJ nuoI TRUE 0.996 -3.000 0.442 0.008 Y NA
 7010187 7010188 JJD26997_1922 JJD26997_1923 nuoI nuoH TRUE 0.995 10.000 0.500 0.008 Y NA
 7010188 7010189 JJD26997_1923 JJD26997_1924 nuoH nuoG TRUE 0.987 -7.000 0.065 0.008 Y NA
 7010189 7010190 JJD26997_1924 JJD26997_1925 nuoG   TRUE 0.994 -3.000 0.444 0.008   NA
 7010190 7010191 JJD26997_1925 JJD26997_1926     TRUE 0.994 -3.000 0.464 0.008   NA
 7010191 7010192 JJD26997_1926 JJD26997_1927   nuoD TRUE 0.860 84.000 0.650 0.008   NA
 7010192 7010193 JJD26997_1927 JJD26997_1928 nuoD nuoC TRUE 0.998 2.000 0.650 0.008 Y NA
 7010193 7010194 JJD26997_1928 JJD26997_1929 nuoC nuoB TRUE 0.998 0.000 0.703 0.003 Y NA
 7010194 7010195 JJD26997_1929 JJD26997_1930 nuoB nuoA TRUE 0.997 -18.000 0.571 0.003 Y NA
 7010195 7010196 JJD26997_1930 JJD26997_1931 nuoA   FALSE 0.265 113.000 0.053 1.000 N NA
 7010196 7010197 JJD26997_1931 JJD26997_1932     TRUE 0.982 -7.000 0.039 0.013 Y NA
 7010197 7010198 JJD26997_1932 JJD26997_1933     TRUE 0.990 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 7010198 7010199 JJD26997_1933 JJD26997_1934     TRUE 0.997 -7.000 0.647 0.018 Y NA
 7010199 7010200 JJD26997_1934 JJD26997_1935     TRUE 0.997 0.000 0.412 0.018 Y NA
 7010200 7010201 JJD26997_1935 JJD26997_1936     TRUE 0.517 109.000 0.250 1.000 N NA
 7010203 7010204 JJD26997_1938 JJD26997_1939     FALSE 0.243 50.000 0.000 NA   NA
 7010204 7010205 JJD26997_1939 JJD26997_1940     TRUE 0.868 -12.000 0.000 NA   NA
 7010206 7010207 JJD26997_1941 JJD26997_1943     TRUE 0.875 -3.000 0.000 NA   NA
 7010209 7010210 JJD26997_1944 JJD26997_1945 infA rpsM TRUE 0.292 288.000 0.075 0.017 Y NA
 7010210 7010211 JJD26997_1945 JJD26997_1946 rpsM rpsK TRUE 0.996 10.000 0.810 0.019 Y NA
 7010211 7010212 JJD26997_1946 JJD26997_1947 rpsK rpsD TRUE 0.958 28.000 0.509 0.025 Y NA
 7010212 7010213 JJD26997_1947 JJD26997_1948 rpsD rpoA TRUE 0.969 13.000 0.549 1.000 N NA
 7010213 7010214 JJD26997_1948 JJD26997_1949 rpoA rplQ TRUE 0.995 4.000 0.873 1.000 N NA
 7010214 7010215 JJD26997_1949 JJD26997_1950 rplQ hisG FALSE 0.057 174.000 0.004 1.000 N NA
 7010215 7010216 JJD26997_1950 JJD26997_1951 hisG hisD TRUE 0.992 8.000 0.171 0.005 Y NA
 7010216 7010217 JJD26997_1951 JJD26997_1952 hisD hisB TRUE 0.969 -3.000 0.010 0.005 Y NA
 7010217 7010218 JJD26997_1952 JJD26997_1953 hisB   TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7010218 7010219 JJD26997_1953 JJD26997_1954     TRUE 0.928 -3.000 0.041 NA   NA
 7010219 7010220 JJD26997_1954 JJD26997_1955   hisH TRUE 0.905 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7010220 7010221 JJD26997_1955 JJD26997_1956 hisH   TRUE 0.994 -3.000 0.210 0.005 Y NA
 7010221 7010222 JJD26997_1956 JJD26997_1957   hisF-2 TRUE 0.996 -18.000 0.433 0.005 Y NA
 7010222 7010223 JJD26997_1957 JJD26997_1958 hisF-2 hisI TRUE 0.997 3.000 0.430 0.005 Y NA
 7010224 7010225 JJD26997_1959 JJD26997_1960   mrp TRUE 0.593 26.000 0.036 1.000 N NA
 7010226 7010227 JJD26997_1961 JJD26997_1962 ispDF   TRUE 0.925 -3.000 0.027 1.000 N NA
 7010227 7010228 JJD26997_1962 JJD26997_1963     TRUE 0.906 -22.000 0.025 1.000 N NA
 7010228 7010229 JJD26997_1963 JJD26997_1964   pgpA TRUE 0.951 5.000 0.052 1.000 N NA
 7010229 7010230 JJD26997_1964 JJD26997_1965 pgpA rpsT FALSE 0.156 79.000 0.004 1.000 N NA
 7010230 7010231 JJD26997_1965 JJD26997_1966 rpsT prfA TRUE 0.761 19.000 0.029 1.000 Y NA
 7010233 7010234 JJD26997_1968 JJD26997_1969 chuA   TRUE 0.992 -25.000 0.250 0.018 Y NA
 7010234 7010235 JJD26997_1969 JJD26997_1970     TRUE 0.991 0.000 0.226 1.000 Y NA
 7010235 7010236 JJD26997_1970 JJD26997_1972     TRUE 0.974 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 7010240 7010241 JJD26997_1976 JJD26997_1977     FALSE 0.034 294.000 0.000 NA   NA
 7010241 7010242 JJD26997_1977 JJD26997_1978     FALSE 0.181 72.000 0.000 NA   NA
 7010242 7010243 JJD26997_1978 JJD26997_1979     TRUE 0.811 10.000 0.000 NA   NA
 7010243 7010244 JJD26997_1979 JJD26997_1980     TRUE 0.499 19.000 0.000 NA   NA
 7010244 7010245 JJD26997_1980 JJD26997_1981     TRUE 0.460 22.000 0.000 NA   NA
 7010245 7010246 JJD26997_1981 JJD26997_1982   ribD FALSE 0.043 236.000 0.000 NA   NA
 7010246 7010247 JJD26997_1982 JJD26997_1983 ribD   TRUE 0.857 -19.000 0.000 NA   NA
 7010248 7010249 JJD26997_1984 JJD26997_1985 sdaA   TRUE 0.988 9.000 0.400 NA Y NA
 7010249