MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter curvus 525.92

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7006223 7006224 CCV52592_2056 CCV52592_2055 dnaA dnaN TRUE 0.634 154.000 0.328 1.000 Y NA
 7006224 7006225 CCV52592_2055 CCV52592_2054 dnaN gyrB TRUE 0.987 10.000 0.114 1.000 Y NA
 7006225 7006226 CCV52592_2054 CCV52592_2053 gyrB fccA FALSE 0.394 19.000 0.000 NA   NA
 7006226 7006227 CCV52592_2053 CCV52592_2052 fccA   TRUE 0.815 1.000 0.000 NA   NA
 7006229 7006230 CCV52592_2051 CCV52592_2050     FALSE 0.084 108.000 0.000 NA   NA
 7006231 7006232 CCV52592_2049 CCV52592_2048   flgD TRUE 0.990 9.000 0.341 NA Y NA
 7006232 7006233 CCV52592_2048 CCV52592_2047 flgD   TRUE 0.970 10.000 0.184 NA   NA
 7006234 7006235 CCV52592_2046 CCV52592_2045 typA   FALSE 0.070 153.000 0.000 1.000   NA
 7006235 7006236 CCV52592_2045 CCV52592_2044     FALSE 0.105 117.000 0.000 1.000   NA
 7006236 7006237 CCV52592_2044 CCV52592_2043     FALSE 0.074 208.000 0.000 1.000 N NA
 7006238 7006239 CCV52592_2042 CCV52592_2041     TRUE 0.634 -13.000 0.000 NA   NA
 7006239 7006240 CCV52592_2041 CCV52592_2040   flgE FALSE 0.117 90.000 0.000 NA   NA
 7006240 7006241 CCV52592_2040 CCV52592_2039 flgE   FALSE 0.008 460.000 0.000 NA   NA
 7006241 7006242 CCV52592_2039 CCV52592_2038     TRUE 0.578 92.000 0.074 NA   NA
 7006243 7006244 CCV52592_2037 CCV52592_2036   ilvD FALSE 0.026 236.000 0.000 NA   NA
 7006244 7006245 CCV52592_2036 CCV52592_2035 ilvD   FALSE 0.400 31.000 0.000 1.000 N NA
 7006245 7006246 CCV52592_2035 CCV52592_2034     TRUE 0.537 14.000 0.000 NA   NA
 7006246 7006247 CCV52592_2034 CCV52592_2033     FALSE 0.331 23.000 0.000 NA   NA
 7006248 7006249 CCV52592_2032 CCV52592_2031     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7006249 7006250 CCV52592_2031 CCV52592_2030     TRUE 0.576 -19.000 0.000 NA   NA
 7006250 7006251 CCV52592_2030 CCV52592_2029     TRUE 0.794 3.000 0.000 NA   NA
 7006251 7006252 CCV52592_2029 CCV52592_2028     TRUE 0.798 7.000 0.000 NA   NA
 7006252 7006253 CCV52592_2028 CCV52592_2027     FALSE 0.022 261.000 0.000 NA   NA
 7006253 7006254 CCV52592_2027 CCV52592_2026     FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 7006254 7006255 CCV52592_2026 CCV52592_2025     TRUE 0.503 -49.000 0.000 NA   NA
 7006255 7006256 CCV52592_2025 CCV52592_2024     FALSE 0.020 270.000 0.000 NA   NA
 7006256 7006257 CCV52592_2024 CCV52592_2023     FALSE 0.045 170.000 0.000 NA   NA
 7006257 7006258 CCV52592_2023 CCV52592_2022     FALSE 0.259 84.000 0.000 0.037   NA
 7006260 7006261 CCV52592_2021 CCV52592_2020     TRUE 0.558 -22.000 0.000 NA   NA
 7006261 7006262 CCV52592_2020 CCV52592_2019     FALSE 0.019 274.000 0.000 NA   NA
 7006262 7006263 CCV52592_2019 CCV52592_2018     FALSE 0.045 168.000 0.000 NA   NA
 7006263 7006264 CCV52592_2018 CCV52592_2017     FALSE 0.183 41.000 0.000 NA   NA
 7006264 7006265 CCV52592_2017 CCV52592_2016     FALSE 0.392 24.000 0.000 1.000   NA
 7006265 7006266 CCV52592_2016 CCV52592_2015     FALSE 0.394 19.000 0.000 NA   NA
 7006266 7006267 CCV52592_2015 CCV52592_1131   cooS FALSE 0.012 363.000 0.000 NA   NA
 7006268 7006269 CCV52592_2128 CCV52592_1130     FALSE 0.174 45.000 0.000 NA   NA
 7006269 7006270 CCV52592_1130 CCV52592_1129     TRUE 0.995 -3.000 0.652 0.041 Y NA
 7006270 7006271 CCV52592_1129 CCV52592_1128     TRUE 0.992 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 7006272 7006273 CCV52592_1127 CCV52592_1126     FALSE 0.206 60.000 0.000 1.000   NA
 7006273 7006274 CCV52592_1126 CCV52592_1125     FALSE 0.160 55.000 0.000 NA   NA
 7006274 7006275 CCV52592_1125 CCV52592_1124   nrdD TRUE 0.500 15.000 0.000 NA   NA
 7006275 7006276 CCV52592_1124 CCV52592_1123 nrdD   FALSE 0.092 103.000 0.000 NA   NA
 7006276 7006277 CCV52592_1123 CCV52592_1122     FALSE 0.216 32.000 0.000 NA   NA
 7006277 7006278 CCV52592_1122 CCV52592_1121   purB TRUE 0.473 123.000 0.012 1.000 Y NA
 7006280 7006281 CCV52592_1119 CCV52592_1118     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006281 7006282 CCV52592_1118 CCV52592_1117   hisF FALSE 0.195 38.000 0.000 NA   NA
 7006283 7006284 CCV52592_1116 CCV52592_1115 ksgA   FALSE 0.103 359.000 0.028 1.000   NA
 7006284 7006285 CCV52592_1115 CCV52592_1114     TRUE 0.956 12.000 0.222 1.000   NA
 7006285 7006286 CCV52592_1114 CCV52592_1113     TRUE 0.988 2.000 0.167 1.000 N NA
 7006288 7006289 CCV52592_1111 CCV52592_1110 ung   FALSE 0.015 931.000 0.000 1.000 N NA
 7006289 7006290 CCV52592_1110 CCV52592_1109   tktA FALSE 0.124 83.000 0.000 NA   NA
 7006290 7006291 CCV52592_1109 CCV52592_0354 tktA tktA FALSE 0.119 89.000 0.000 NA   NA
 7006292 7006293 CCV52592_0353 CCV52592_0352     FALSE 0.007 668.000 0.000 NA   NA
 7006293 7006294 CCV52592_0352 CCV52592_0351   purM FALSE 0.195 38.000 0.000 NA   NA
 7006295 7006296 CCV52592_0349 CCV52592_0348 coaE dapF TRUE 0.920 -19.000 0.016 1.000 N NA
 7006297 7006298 CCV52592_0347 CCV52592_0346 rplT rpmI TRUE 0.869 91.000 0.928 0.027 Y NA
 7006300 7006301 CCV52592_0345 CCV52592_2129     TRUE 0.523 -34.000 0.000 NA   NA
 7006302 7006303 CCV52592_0343 CCV52592_0342   metE TRUE 0.642 11.000 0.000 NA   NA
 7006304 7006305 CCV52592_0341 CCV52592_0340     FALSE 0.244 41.000 0.000 1.000   NA
 7006305 7006306 CCV52592_0340 CCV52592_0339     FALSE 0.020 270.000 0.000 NA   NA
 7006306 7006307 CCV52592_0339 CCV52592_0338     TRUE 0.971 -3.000 0.035 NA   NA
 7006307 7006308 CCV52592_0338 CCV52592_0337     FALSE 0.121 87.000 0.000 NA   NA
 7006308 7006309 CCV52592_0337 CCV52592_0336     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7006309 7006310 CCV52592_0336 CCV52592_0335     TRUE 0.508 -45.000 0.000 NA   NA
 7006310 7006311 CCV52592_0335 CCV52592_0334   gidA FALSE 0.041 181.000 0.000 NA   NA
 7006314 7006315 CCV52592_0331 CCV52592_0330   thrS FALSE 0.020 321.000 0.000 1.000   NA
 7006315 7006316 CCV52592_0330 CCV52592_0329 thrS infC TRUE 0.990 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 7006316 7006317 CCV52592_0329 CCV52592_2131 infC   FALSE 0.127 103.000 0.000 1.000   NA
 7006319 7006320 CCV52592_0755 CCV52592_0754 proB proA TRUE 0.989 11.000 0.281 0.003 Y NA
 7006320 7006321 CCV52592_0754 CCV52592_0753 proA mrr FALSE 0.068 220.000 0.000 1.000 N NA
 7006321 7006322 CCV52592_0753 CCV52592_0752 mrr proC FALSE 0.263 69.000 0.000 1.000 N NA
 7006322 7006323 CCV52592_0752 CCV52592_2132 proC   TRUE 0.798 7.000 0.000 NA   NA
 7006323 7006324 CCV52592_2132 CCV52592_0751     FALSE 0.011 372.000 0.000 NA   NA
 7006324 7006325 CCV52592_0751 CCV52592_0750     FALSE 0.376 20.000 0.000 NA   NA
 7006326 7006327 CCV52592_0749 CCV52592_0748     FALSE 0.126 79.000 0.000 NA   NA
 7006327 7006328 CCV52592_0748 CCV52592_0747     FALSE 0.092 103.000 0.000 NA   NA
 7006328 7006329 CCV52592_0747 CCV52592_0746     FALSE 0.331 23.000 0.000 NA   NA
 7006329 7006330 CCV52592_0746 CCV52592_0745     FALSE 0.216 32.000 0.000 NA   NA
 7006330 7006331 CCV52592_0745 CCV52592_0744     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7006331 7006332 CCV52592_0744 CCV52592_0743   lspA TRUE 0.537 36.000 0.015 NA   NA
 7006332 7006333 CCV52592_0743 CCV52592_0742 lspA glmM TRUE 0.975 -7.000 0.042 1.000 N NA
 7006334 7006335 CCV52592_0741 CCV52592_0740 rpsT prfA TRUE 0.981 10.000 0.029 1.000 Y NA
 7006336 7006337 CCV52592_0739 CCV52592_2133     TRUE 0.802 5.000 0.000 NA   NA
 7006339 7006340 CCV52592_0737 CCV52592_0736     TRUE 0.984 -3.000 0.273 1.000   NA
 7006341 7006342 CCV52592_0735 CCV52592_0734     FALSE 0.110 95.000 0.000 NA   NA
 7006345 7006346 CCV52592_0090 CCV52592_0091     FALSE 0.248 28.000 0.000 NA   NA
 7006349 7006350 CCV52592_0094 CCV52592_0096     TRUE 0.983 4.000 0.174 1.000   NA
 7006350 7006351 CCV52592_0096 CCV52592_0097     TRUE 0.972 -3.000 0.025 1.000   NA
 7006351 7006352 CCV52592_0097 CCV52592_0098     TRUE 0.990 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 7006353 7006354 CCV52592_0099 CCV52592_0100     FALSE 0.084 108.000 0.000 NA   NA
 7006354 7006355 CCV52592_0100 CCV52592_1480     FALSE 0.106 97.000 0.000 NA   NA
 7006355 7006356 CCV52592_1480 CCV52592_1481     FALSE 0.100 99.000 0.000 NA   NA
 7006356 7006357 CCV52592_1481 CCV52592_1482     TRUE 0.957 1.000 0.017 NA   NA
 7006358 7006359 CCV52592_1483 CCV52592_1484     TRUE 0.967 -19.000 0.308 1.000 N NA
 7006361 7006362 CCV52592_1486 CCV52592_1487     TRUE 0.946 -3.000 0.013 NA   NA
 7006362 7006363 CCV52592_1487 CCV52592_1488     TRUE 0.959 -3.000 0.008 1.000 N NA
 7006363 7006364 CCV52592_1488 CCV52592_1489     TRUE 0.990 9.000 0.111 1.000 Y NA
 7006364 7006365 CCV52592_1489 CCV52592_1490   sfcA TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7006367 7006368 CCV52592_1493 CCV52592_1494     FALSE 0.165 51.000 0.000 NA   NA
 7006369 7006370 CCV52592_1495 CCV52592_1496 fliI folE TRUE 0.992 -3.000 0.378 0.058 N NA
 7006371 7006372 CCV52592_1497 CCV52592_1498   tig TRUE 0.535 -28.000 0.000 NA   NA
 7006372 7006373 CCV52592_1498 CCV52592_1499 tig clpP TRUE 0.993 0.000 0.351 1.000 Y NA
 7006373 7006374 CCV52592_1499 CCV52592_1500 clpP   TRUE 0.804 19.000 0.009 1.000 N NA
 7006374 7006375 CCV52592_1500 CCV52592_1501   def TRUE 0.986 6.000 0.076 1.000 N NA
 7006375 7006376 CCV52592_1501 CCV52592_1502 def   TRUE 0.984 -3.000 0.054 1.000 N NA
 7006376 7006377 CCV52592_1502 CCV52592_1503     TRUE 0.950 2.000 0.006 NA N NA
 7006377 7006378 CCV52592_1503 CCV52592_1504   purN TRUE 0.901 -18.000 0.014 NA N NA
 7006378 7006379 CCV52592_1504 CCV52592_1505 purN   TRUE 0.722 25.000 0.009 1.000 N NA
 7006379 7006380 CCV52592_1505 CCV52592_1506     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006380 7006381 CCV52592_1506 CCV52592_1507     FALSE 0.158 57.000 0.000 NA   NA
 7006381 7006382 CCV52592_1507 CCV52592_1508     TRUE 0.909 -25.000 0.034 NA   NA
 7006382 7006383 CCV52592_1508 CCV52592_2135     FALSE 0.108 96.000 0.000 NA   NA
 7006383 7006384 CCV52592_2135 CCV52592_2136     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7006384 7006385 CCV52592_2136 CCV52592_2137     TRUE 0.801 6.000 0.000 NA   NA
 7006385 7006386 CCV52592_2137 CCV52592_2138     TRUE 0.642 11.000 0.000 NA   NA
 7006386 7006387 CCV52592_2138 CCV52592_2139     TRUE 0.537 14.000 0.000 NA   NA
 7006388 7006389 CCV52592_1514 CCV52592_1515     FALSE 0.051 150.000 0.000 NA   NA
 7006389 7006390 CCV52592_1515 CCV52592_1516     TRUE 0.839 30.000 0.586 1.000   NA
 7006390 7006391 CCV52592_1516 CCV52592_1517     TRUE 0.995 -3.000 0.389 0.004 Y NA
 7006391 7006392 CCV52592_1517 CCV52592_1518     TRUE 0.994 0.000 0.056 0.004 Y NA
 7006392 7006393 CCV52592_1518 CCV52592_1519     TRUE 0.994 2.000 0.056 0.015 Y NA
 7006393 7006394 CCV52592_1519 CCV52592_1520     TRUE 0.994 -3.000 0.064 0.007 Y NA
 7006394 7006395 CCV52592_1520 CCV52592_1521     TRUE 0.993 -7.000 0.442 0.015 Y NA
 7006395 7006396 CCV52592_1521 CCV52592_1522     TRUE 0.995 8.000 0.500 0.015 Y NA
 7006396 7006397 CCV52592_1522 CCV52592_1523     TRUE 0.990 -7.000 0.065 0.015 Y NA
 7006397 7006398 CCV52592_1523 CCV52592_1524     TRUE 0.991 1.000 0.444 0.015   NA
 7006398 7006399 CCV52592_1524 CCV52592_1525     TRUE 0.990 -3.000 0.464 0.015   NA
 7006399 7006400 CCV52592_1525 CCV52592_1526   nuoD TRUE 0.990 -3.000 0.650 0.015   NA
 7006400 7006401 CCV52592_1526 CCV52592_1527 nuoD   TRUE 0.995 -3.000 0.650 0.015 Y NA
 7006401 7006402 CCV52592_1527 CCV52592_1528     TRUE 0.995 -3.000 0.703 0.007 Y NA
 7006402 7006403 CCV52592_1528 CCV52592_1529     TRUE 0.987 -18.000 0.571 0.007 Y NA
 7006403 7006404 CCV52592_1529 CCV52592_1530     TRUE 0.586 105.000 0.041 1.000 N NA
 7006404 7006405 CCV52592_1530 CCV52592_1532     TRUE 0.802 5.000 0.000 NA   NA
 7006407 7006408 CCV52592_1535 CCV52592_1536 nhaC   TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006408 7006409 CCV52592_1536 CCV52592_1537     TRUE 0.794 3.000 0.000 NA   NA
 7006409 7006410 CCV52592_1537 CCV52592_1538     FALSE 0.015 308.000 0.000 NA   NA
 7006410 7006411 CCV52592_1538 CCV52592_1539     FALSE 0.064 133.000 0.000 NA   NA
 7006411 7006412 CCV52592_1539 CCV52592_1540     TRUE 0.966 0.000 0.021 NA   NA
 7006412 7006413 CCV52592_1540 CCV52592_1541     TRUE 0.987 -3.000 0.118 1.000 N NA
 7006413 7006414 CCV52592_1541 CCV52592_1542     TRUE 0.984 2.000 0.763 NA   NA
 7006414 7006415 CCV52592_1542 CCV52592_1543     TRUE 0.982 1.000 0.161 NA   NA
 7006415 7006416 CCV52592_1543 CCV52592_1544   rpsU FALSE 0.279 109.000 0.008 1.000   NA
 7006416 7006417 CCV52592_1544 CCV52592_1545 rpsU   FALSE 0.342 41.000 0.000 1.000 N NA
 7006417 7006418 CCV52592_1545 CCV52592_1546     TRUE 0.889 9.000 0.000 1.000 N NA
 7006418 7006419 CCV52592_1546 CCV52592_1547   ycf TRUE 0.919 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 7006419 7006420 CCV52592_1547 CCV52592_1548 ycf   FALSE 0.261 70.000 0.000 1.000 N NA
 7006421 7006422 CCV52592_1549 CCV52592_1551 ccoG   TRUE 0.968 13.000 0.818 1.000 N NA
 7006422 7006423 CCV52592_1551 CCV52592_1776     FALSE 0.303 260.000 0.145 1.000 N NA
 7006423 7006424 CCV52592_1776 CCV52592_1775     TRUE 0.991 0.000 0.945 1.000 N NA
 7006424 7006425 CCV52592_1775 CCV52592_1774     TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7006425 7006426 CCV52592_1774 CCV52592_1773   mpr FALSE 0.364 21.000 0.000 NA   NA
 7006426 7006427 CCV52592_1773 CCV52592_1772 mpr   FALSE 0.160 55.000 0.000 NA   NA
 7006428 7006429 CCV52592_1771 CCV52592_1770   nifS TRUE 0.641 99.000 0.056 1.000 N NA
 7006430 7006431 CCV52592_0811 CCV52592_0812     FALSE 0.037 195.000 0.000 NA   NA
 7006431 7006432 CCV52592_0812 CCV52592_0813     TRUE 0.866 26.000 0.667 1.000   NA
 7006432 7006433 CCV52592_0813 CCV52592_0814     TRUE 0.989 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 7006433 7006434 CCV52592_0814 CCV52592_0815     FALSE 0.407 216.000 0.031 1.000 Y NA
 7006435 7006436 CCV52592_0816 CCV52592_0817 miaA   TRUE 0.975 3.000 0.021 1.000 N NA
 7006437 7006438 CCV52592_0818 CCV52592_0819 ubiA   TRUE 0.942 12.000 0.100 NA   NA
 7006438 7006439 CCV52592_0819 CCV52592_0820     TRUE 0.973 10.000 0.476 NA   NA
 7006441 7006442 CCV52592_0822 CCV52592_0823 moaA   TRUE 0.980 -3.000 0.028 1.000 N NA
 7006442 7006443 CCV52592_0823 CCV52592_0824     TRUE 0.989 0.000 0.139 1.000 N NA
 7006443 7006444 CCV52592_0824 CCV52592_0825     TRUE 0.937 0.000 0.008 NA   NA
 7006444 7006445 CCV52592_0825 CCV52592_0826     TRUE 0.978 9.000 0.200 NA   NA
 7006445 7006446 CCV52592_0826 CCV52592_0827     TRUE 0.978 2.000 0.070 NA   NA
 7006446 7006447 CCV52592_0827 CCV52592_0828   rpmE TRUE 0.493 82.000 0.023 NA   NA
 7006447 7006448 CCV52592_0828 CCV52592_0829 rpmE   TRUE 0.975 4.000 0.031 1.000   NA
 7006448 7006449 CCV52592_0829 CCV52592_0830     TRUE 0.547 95.000 0.031 1.000   NA
 7006449 7006450 CCV52592_0830 CCV52592_0831     TRUE 0.957 -7.000 0.033 NA   NA
 7006450 7006451 CCV52592_0831 CCV52592_0832     TRUE 0.978 -6.000 0.882 NA   NA
 7006451 7006452 CCV52592_0832 CCV52592_0833     TRUE 0.967 10.000 0.098 NA   NA
 7006452 7006453 CCV52592_0833 CCV52592_0834     TRUE 0.985 0.000 0.018 1.000 Y NA
 7006453 7006454 CCV52592_0834 CCV52592_0835     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7006454 7006455 CCV52592_0835 CCV52592_0836   trx FALSE 0.131 72.000 0.000 NA   NA
 7006455 7006456 CCV52592_0836 CCV52592_0837 trx   TRUE 0.475 69.000 0.020 NA   NA
 7006456 7006457 CCV52592_0837 CCV52592_0838   trxB TRUE 0.836 11.000 0.004 NA   NA
 7006460 7006461 CCV52592_0840 CCV52592_0842     FALSE 0.079 112.000 0.000 NA   NA
 7006461 7006462 CCV52592_0842 CCV52592_0843     TRUE 0.500 15.000 0.000 NA   NA
 7006462 7006463 CCV52592_0843 CCV52592_0844     FALSE 0.123 85.000 0.000 NA   NA
 7006463 7006464 CCV52592_0844 CCV52592_2140     FALSE 0.130 73.000 0.000 NA   NA
 7006465 7006466 CCV52592_0845 CCV52592_0846 purF   TRUE 0.917 -3.000 0.003 NA   NA
 7006467 7006468 CCV52592_0847 CCV52592_0848     TRUE 0.902 3.000 0.000 0.055   NA
 7006469 7006470 CCV52592_0849 CCV52592_0851     TRUE 0.929 -10.000 0.000 0.041 Y NA
 7006471 7006472 CCV52592_0850 CCV52592_0852     TRUE 0.985 0.000 0.867 NA   NA
 7006472 7006473 CCV52592_0852 CCV52592_0853     TRUE 0.889 -10.000 0.010 NA   NA
 7006473 7006474 CCV52592_0853 CCV52592_0854   copA TRUE 0.911 14.000 0.022 NA N NA
 7006474 7006475 CCV52592_0854 CCV52592_0855 copA ilvE TRUE 0.921 17.000 0.098 NA N NA
 7006475 7006476 CCV52592_0855 CCV52592_0856 ilvE   FALSE 0.238 107.000 0.008 NA   NA
 7006476 7006477 CCV52592_0856 CCV52592_0857   fccA FALSE 0.166 50.000 0.000 NA   NA
 7006477 7006478 CCV52592_0857 CCV52592_0858 fccA   TRUE 0.794 3.000 0.000 NA   NA
 7006478 7006479 CCV52592_0858 CCV52592_0859     TRUE 0.945 -3.000 0.008 1.000   NA
 7006483 7006484 CCV52592_0863 CCV52592_0864     TRUE 0.588 12.000 0.000 NA   NA
 7006485 7006486 CCV52592_0865 CCV52592_0866 fabZ lpxA TRUE 0.961 14.000 0.264 1.000 N NA
 7006486 7006487 CCV52592_0866 CCV52592_0867 lpxA clpX TRUE 0.982 0.000 0.027 1.000 N NA
 7006487 7006488 CCV52592_0867 CCV52592_0868 clpX   TRUE 0.973 10.000 0.034 1.000 N NA
 7006488 7006489 CCV52592_0868 CCV52592_0869   mreC TRUE 0.980 -10.000 0.689 1.000 N NA
 7006489 7006490 CCV52592_0869 CCV52592_0870 mreC carB TRUE 0.974 0.000 0.016 1.000 N NA
 7006490 7006491 CCV52592_0870 CCV52592_0871 carB   FALSE 0.157 58.000 0.000 NA   NA
 7006492 7006493 CCV52592_0873 CCV52592_0874     TRUE 0.959 -13.000 0.059 NA N NA
 7006494 7006495 CCV52592_0875 CCV52592_0876   glnQ FALSE 0.026 369.000 0.000 1.000 N NA
 7006495 7006496 CCV52592_0876 CCV52592_0877 glnQ   TRUE 0.901 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7006497 7006498 CCV52592_2141 CCV52592_0878     FALSE 0.015 314.000 0.000 NA   NA
 7006498 7006499 CCV52592_0878 CCV52592_0879   pmi TRUE 0.974 -7.000 0.117 1.000   NA
 7006500 7006501 CCV52592_0880 CCV52592_0881     TRUE 0.697 -15.000 0.000 1.000   NA
 7006501 7006502 CCV52592_0881 CCV52592_0882     TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7006502 7006503 CCV52592_0882 CCV52592_0883     FALSE 0.174 45.000 0.000 NA   NA
 7006503 7006504 CCV52592_0883 CCV52592_0884     TRUE 0.601 -16.000 0.000 NA   NA
 7006504 7006505 CCV52592_0884 CCV52592_0885     TRUE 0.683 22.000 0.011 NA   NA
 7006505 7006506 CCV52592_0885 CCV52592_0886     FALSE 0.126 80.000 0.000 NA   NA
 7006507 7006508 CCV52592_0887 CCV52592_0888     TRUE 0.984 -3.000 0.043 0.044   NA
 7006508 7006509 CCV52592_0888 CCV52592_0889     TRUE 0.960 -3.000 0.016 1.000   NA
 7006510 7006511 CCV52592_0890 CCV52592_0891     TRUE 0.994 0.000 0.500 1.000 Y NA
 7006511 7006512 CCV52592_0891 CCV52592_0892     TRUE 0.982 -16.000 0.792 1.000 Y NA
 7006513 7006514 CCV52592_0893 CCV52592_0894     FALSE 0.008 474.000 0.000 NA   NA
 7006515 7006516 CCV52592_0895 CCV52592_0896     TRUE 0.605 63.000 0.043 NA   NA
 7006516 7006517 CCV52592_0896 CCV52592_0898   carA TRUE 0.975 0.000 0.041 NA   NA
 7006519 7006520 CCV52592_0899 CCV52592_0900     TRUE 0.898 -7.000 0.007 NA   NA
 7006520 7006521 CCV52592_0900 CCV52592_0901     TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7006521 7006522 CCV52592_0901 CCV52592_0902   ccoN FALSE 0.077 114.000 0.000 NA   NA
 7006522 7006523 CCV52592_0902 CCV52592_0903 ccoN ccoO TRUE 0.993 0.000 0.283 0.003 N NA
 7006523 7006524 CCV52592_0903 CCV52592_0904 ccoO   TRUE 0.990 10.000 0.738 0.003 N NA
 7006524 7006525 CCV52592_0904 CCV52592_0905   ccoP TRUE 0.993 0.000 0.286 0.003 N NA
 7006525 7006526 CCV52592_0905 CCV52592_0906 ccoP   TRUE 0.985 0.000 0.579 NA   NA
 7006526 7006527 CCV52592_0906 CCV52592_0907     TRUE 0.597 101.000 0.526 NA   NA
 7006527 7006528 CCV52592_0907 CCV52592_0908     TRUE 0.972 -7.000 0.250 NA   NA
 7006528 7006529 CCV52592_0908 CCV52592_0909     FALSE 0.029 270.000 0.000 1.000   NA
 7006529 7006530 CCV52592_0909 CCV52592_0910     TRUE 0.994 -3.000 0.173 0.044 Y NA
 7006530 7006531 CCV52592_0910 CCV52592_0911   rplM TRUE 0.474 81.000 0.009 1.000 N NA
 7006531 7006532 CCV52592_0911 CCV52592_0912 rplM rpsI TRUE 0.994 3.000 0.231 0.026 Y NA
 7006532 7006533 CCV52592_0912 CCV52592_0913 rpsI   FALSE 0.355 170.000 0.024 1.000 N NA
 7006533 7006534 CCV52592_0913 CCV52592_0914     TRUE 0.659 70.000 0.068 1.000   NA
 7006536 7006537 CCV52592_0916 CCV52592_0917 nifJ   FALSE 0.394 19.000 0.000 NA   NA
 7006537 7006538 CCV52592_0917 CCV52592_0918     FALSE 0.055 145.000 0.000 NA   NA
 7006538 7006539 CCV52592_0918 CCV52592_0919   fccA FALSE 0.011 374.000 0.000 NA   NA
 7006539 7006540 CCV52592_0919 CCV52592_0920 fccA ifcA FALSE 0.064 133.000 0.000 NA   NA
 7006540 7006541 CCV52592_0920 CCV52592_0377 ifcA   TRUE 0.978 4.000 0.094 NA   NA
 7006541 7006542 CCV52592_0377 CCV52592_0376     TRUE 0.952 12.000 0.391 NA   NA
 7006542 7006543 CCV52592_0376 CCV52592_1321   nikA FALSE 0.078 202.000 0.000 1.000 N NA
 7006543 7006544 CCV52592_1321 CCV52592_1322 nikA   TRUE 0.995 -3.000 0.833 0.038 Y NA
 7006544 7006545 CCV52592_1322 CCV52592_1323   nikC TRUE 0.995 -3.000 0.629 0.038 Y NA
 7006545 7006546 CCV52592_1323 CCV52592_1324 nikC   TRUE 0.662 -19.000 0.000 1.000   NA
 7006547 7006548 CCV52592_2142 CCV52592_1816     FALSE 0.128 75.000 0.000 NA   NA
 7006548 7006549 CCV52592_1816 CCV52592_1815   pipD TRUE 0.994 3.000 0.103 0.002 Y NA
 7006549 7006550 CCV52592_1815 CCV52592_1814 pipD petA TRUE 0.991 10.000 0.093 0.002 Y NA
 7006551 7006552 CCV52592_1813 CCV52592_1812     FALSE 0.043 176.000 0.000 NA   NA
 7006552 7006553 CCV52592_1812 CCV52592_1811     FALSE 0.200 35.000 0.000 NA   NA
 7006553 7006554 CCV52592_1811 CCV52592_1810     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7006555 7006556 CCV52592_1809 CCV52592_1808     TRUE 0.930 -3.000 0.000 NA Y NA
 7006556 7006557 CCV52592_1808 CCV52592_1807     TRUE 0.694 42.000 0.062 NA   NA
 7006558 7006559 CCV52592_1806 CCV52592_1804     TRUE 0.880 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 7006561 7006562 CCV52592_1803 CCV52592_1802     TRUE 0.664 88.000 0.667 NA   NA
 7006562 7006563 CCV52592_1802 CCV52592_1801     TRUE 0.508 -45.000 0.000 NA   NA
 7006564 7006565 CCV52592_1800 CCV52592_1799     FALSE 0.331 23.000 0.000 NA   NA
 7006567 7006568 CCV52592_1797 CCV52592_1795   fumC FALSE 0.060 200.000 0.000 NA N NA
 7006568 7006569 CCV52592_1795 CCV52592_1794 fumC   FALSE 0.200 100.000 0.000 1.000 N NA
 7006569 7006570 CCV52592_1794 CCV52592_1793   gidA TRUE 0.463 26.000 0.000 1.000 N NA
 7006571 7006572 CCV52592_1792 CCV52592_1791   ylxH TRUE 0.992 2.000 0.857 NA Y NA
 7006572 7006573 CCV52592_1791 CCV52592_1790 ylxH   TRUE 0.988 10.000 0.176 1.000 Y NA
 7006573 7006574 CCV52592_1790 CCV52592_1039   hyfE TRUE 0.975 -16.000 0.064 1.000 Y NA
 7006574 7006575 CCV52592_1039 CCV52592_1038 hyfE   TRUE 0.995 3.000 0.864 0.014 Y NA
 7006575 7006576 CCV52592_1038 CCV52592_1635     TRUE 0.993 3.000 0.048 0.014 Y NA
 7006576 7006577 CCV52592_1635 CCV52592_1636     TRUE 0.992 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 7006577 7006578 CCV52592_1636 CCV52592_1637     TRUE 0.992 -3.000 0.133 1.000 Y NA
 7006578 7006579 CCV52592_1637 CCV52592_1638     TRUE 0.792 30.000 0.188 NA   NA
 7006579 7006580 CCV52592_1638 CCV52592_1639     TRUE 0.984 0.000 0.360 NA   NA
 7006580 7006581 CCV52592_1639 CCV52592_1640     FALSE 0.348 168.000 0.022 1.000 N NA
 7006582 7006583 CCV52592_1641 CCV52592_1642     TRUE 0.530 116.000 0.061 NA N NA
 7006584 7006585 CCV52592_1643 CCV52592_1645     TRUE 0.927 14.000 0.083 NA   NA
 7006589 7006590 CCV52592_1648 CCV52592_1649     TRUE 0.978 -3.000 0.092 NA   NA
 7006590 7006591 CCV52592_1649 CCV52592_1057     FALSE 0.126 79.000 0.000 NA   NA
 7006593 7006594 CCV52592_1055 CCV52592_1054     TRUE 0.974 -3.000 0.048 NA   NA
 7006596 7006597 CCV52592_1052 CCV52592_1051     TRUE 0.967 -3.000 0.027 NA   NA
 7006597 7006598 CCV52592_1051 CCV52592_1050     TRUE 0.993 0.000 1.000 0.052 N NA
 7006598 7006599 CCV52592_1050 CCV52592_1049     TRUE 0.985 -19.000 1.000 0.052 Y NA
 7006599 7006600 CCV52592_1049 CCV52592_1047     TRUE 0.988 -3.000 0.217 1.000 N NA
 7006601 7006602 CCV52592_2143 CCV52592_1046   murD FALSE 0.075 117.000 0.000 NA   NA
 7006602 7006603 CCV52592_1046 CCV52592_1045 murD mraY TRUE 0.864 97.000 0.647 0.007 Y NA
 7006604 7006605 CCV52592_1044 CCV52592_1043 gpmI fabG FALSE 0.242 206.000 0.018 1.000 N NA
 7006607 7006608 CCV52592_1041 CCV52592_1911   fabF FALSE 0.133 69.000 0.000 NA   NA
 7006608 7006609 CCV52592_1911 CCV52592_1910 fabF accA TRUE 0.808 2.000 0.000 NA   NA
 7006609 7006610 CCV52592_1910 CCV52592_1908 accA ribE FALSE 0.209 98.000 0.000 1.000 N NA
 7006610 7006611 CCV52592_1908 CCV52592_1906 ribE   TRUE 0.946 0.000 0.011 NA   NA
 7006611 7006612 CCV52592_1906 CCV52592_1905     TRUE 0.467 28.000 0.003 NA   NA
 7006612 7006613 CCV52592_1905 CCV52592_2144     FALSE 0.130 73.000 0.000 NA   NA
 7006613 7006614 CCV52592_2144 CCV52592_2145     FALSE 0.191 39.000 0.000 NA   NA
 7006614 7006615 CCV52592_2145 CCV52592_1262   rpsB FALSE 0.156 92.000 0.000 1.000   NA
 7006615 7006616 CCV52592_1262 CCV52592_1261 rpsB tsf TRUE 0.994 0.000 0.748 1.000 Y NA
 7006616 7006617 CCV52592_1261 CCV52592_1259 tsf   TRUE 0.977 1.000 0.019 1.000 N NA
 7006619 7006620 CCV52592_1258 CCV52592_1257 fliR   TRUE 0.572 60.000 0.026 NA   NA
 7006620 7006621 CCV52592_1257 CCV52592_1256   gmk TRUE 0.815 1.000 0.000 NA   NA
 7006621 7006622 CCV52592_1256 CCV52592_1255 gmk   FALSE 0.306 55.000 0.000 1.000 N NA
 7006622 7006623 CCV52592_1255 CCV52592_1254   argS TRUE 0.947 10.000 0.011 1.000 N NA
 7006623 7006624 CCV52592_1254 CCV52592_1253 argS   TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006624 7006625 CCV52592_1253 CCV52592_1252     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7006625 7006626 CCV52592_1252 CCV52592_1251     FALSE 0.120 88.000 0.000 NA   NA
 7006628 7006629 CCV52592_1249 CCV52592_1248 gap pgk TRUE 0.990 2.000 0.020 0.005 Y NA
 7006629 7006630 CCV52592_1248 CCV52592_1247 pgk tpiA TRUE 0.986 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 7006632 7006633 CCV52592_1245 CCV52592_1244     FALSE 0.055 241.000 0.000 1.000 N NA
 7006633 7006634 CCV52592_1244 CCV52592_1243     FALSE 0.278 33.000 0.000 1.000   NA
 7006635 7006636 CCV52592_1242 CCV52592_1241   expD TRUE 0.954 -25.000 0.074 1.000 N NA
 7006636 7006637 CCV52592_1241 CCV52592_1240 expD exbB TRUE 0.988 -13.000 0.815 0.052 Y NA
 7006638 7006639 CCV52592_1239 CCV52592_1238     FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 7006640 7006641 CCV52592_1237 CCV52592_1236 rfaF   TRUE 0.987 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 7006642 7006643 CCV52592_1235 CCV52592_1234     TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7006644 7006645 CCV52592_1233 CCV52592_1232     TRUE 0.984 -3.000 0.056 1.000 N NA
 7006645 7006646 CCV52592_1232 CCV52592_1231     TRUE 0.987 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 7006646 7006647 CCV52592_1231 CCV52592_1230     TRUE 0.988 -3.000 0.050 NA Y NA
 7006647 7006648 CCV52592_1230 CCV52592_1229     TRUE 0.984 -6.000 0.050 NA Y NA
 7006648 7006649 CCV52592_1229 CCV52592_1228   rfaC TRUE 0.988 -7.000 0.231 1.000 Y NA
 7006650 7006651 CCV52592_1227 CCV52592_1226     TRUE 0.739 48.000 0.034 1.000 N NA
 7006651 7006652 CCV52592_1226 CCV52592_1225     TRUE 0.657 68.000 0.026 1.000 N NA
 7006652 7006653 CCV52592_1225 CCV52592_1224   galE TRUE 0.974 2.000 0.017 1.000 N NA
 7006653 7006654 CCV52592_1224 CCV52592_1223 galE   TRUE 0.972 -18.000 0.052 1.000 Y NA
 7006654 7006655 CCV52592_1223 CCV52592_1222     TRUE 0.971 -3.000 0.034 NA   NA
 7006655 7006656 CCV52592_1222 CCV52592_1221     TRUE 0.942 -3.000 0.012 NA   NA
 7006656 7006657 CCV52592_1221 CCV52592_1220     TRUE 0.810 15.000 0.008 1.000   NA
 7006657 7006658 CCV52592_1220 CCV52592_1219     TRUE 0.864 1.000 0.000 1.000   NA
 7006658 7006659 CCV52592_1219 CCV52592_1218     TRUE 0.911 1.000 0.000 1.000 N NA
 7006659 7006660 CCV52592_1218 CCV52592_1217     TRUE 0.978 4.000 0.091 NA   NA
 7006660 7006661 CCV52592_1217 CCV52592_1216     TRUE 0.980 -3.000 0.200 NA   NA
 7006661 7006662 CCV52592_1216 CCV52592_1215     TRUE 0.995 -3.000 0.600 0.017 Y NA
 7006662 7006663 CCV52592_1215 CCV52592_1214     TRUE 0.994 -3.000 0.167 0.017 Y NA
 7006663 7006664 CCV52592_1214 CCV52592_1213     TRUE 0.972 -10.000 0.375 1.000   NA
 7006664 7006665 CCV52592_1213 CCV52592_1212     TRUE 0.979 2.000 0.045 1.000   NA
 7006665 7006666 CCV52592_1212 CCV52592_1211     TRUE 0.985 -7.000 0.128 NA Y NA
 7006666 7006667 CCV52592_1211 CCV52592_1210     TRUE 0.860 -13.000 0.008 NA   NA
 7006667 7006668 CCV52592_1210 CCV52592_1209     TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7006668 7006669 CCV52592_1209 CCV52592_1208     FALSE 0.037 194.000 0.000 NA   NA
 7006669 7006670 CCV52592_1208 CCV52592_1207     TRUE 0.763 58.000 0.238 NA N NA
 7006670 7006671 CCV52592_1207 CCV52592_1206     TRUE 0.976 11.000 0.600 1.000 N NA
 7006671 7006672 CCV52592_1206 CCV52592_0005   purB TRUE 0.953 4.000 0.004 1.000 N NA
 7006672 7006673 CCV52592_0005 CCV52592_1204 purB   TRUE 0.853 6.000 0.000 1.000   NA
 7006673 7006674 CCV52592_1204 CCV52592_1203     FALSE 0.161 90.000 0.000 1.000   NA
 7006674 7006675 CCV52592_1203 CCV52592_1202     TRUE 0.992 1.000 0.133 1.000 Y NA
 7006675 7006676 CCV52592_1202 CCV52592_1201     TRUE 0.980 3.000 0.242 NA   NA
 7006676 7006677 CCV52592_1201 CCV52592_1200   hisH TRUE 0.981 -3.000 0.273 NA   NA
 7006677 7006678 CCV52592_1200 CCV52592_1199 hisH hisA TRUE 0.995 0.000 0.091 0.006 Y NA
 7006678 7006679 CCV52592_1199 CCV52592_1198 hisA   TRUE 0.983 9.000 0.062 1.000 N NA
 7006679 7006680 CCV52592_1198 CCV52592_1197   prmA TRUE 0.989 0.000 0.146 1.000 N NA
 7006680 7006681 CCV52592_1197 CCV52592_1196 prmA ftsH TRUE 0.989 1.000 0.217 1.000 N NA
 7006681 7006682 CCV52592_1196 CCV52592_1195 ftsH psd TRUE 0.983 3.000 0.043 1.000 N NA
 7006682 7006683 CCV52592_1195 CCV52592_1194 psd   TRUE 0.993 4.000 0.466 1.000 Y NA
 7006683 7006684 CCV52592_1194 CCV52592_1193   leuA TRUE 0.539 134.000 0.073 1.000 N NA
 7006684 7006685 CCV52592_1193 CCV52592_1192 leuA   FALSE 0.147 127.000 0.000 1.000 N NA
 7006685 7006686 CCV52592_1192 CCV52592_1191   motB TRUE 0.991 7.000 0.119 1.000 Y NA
 7006687 7006688 CCV52592_1190 CCV52592_1189 relA serS TRUE 0.965 0.000 0.016 1.000   NA
 7006688 7006689 CCV52592_1189 CCV52592_1188 serS trpS TRUE 0.981 9.000 0.010 0.054 Y NA
 7006689 7006690 CCV52592_1188 CCV52592_1187 trpS aroK TRUE 0.607 114.000 0.033 0.100 N NA
 7006690 7006691 CCV52592_1187 CCV52592_1186 aroK engA TRUE 0.849 -19.000 0.007 1.000   NA
 7006692 7006693 CCV52592_1185 CCV52592_1184   kdsA TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006693 7006694 CCV52592_1184 CCV52592_1183 kdsA   TRUE 0.919 -10.000 0.005 1.000 N NA
 7006694 7006695 CCV52592_1183 CCV52592_1182     TRUE 0.995 -3.000 0.600 0.061 Y NA
 7006695 7006696 CCV52592_1182 CCV52592_1181   ribH FALSE 0.112 240.000 0.003 1.000 N NA
 7006696 7006697 CCV52592_1181 CCV52592_1180 ribH nusB TRUE 0.984 2.000 0.045 1.000 N NA
 7006697 7006698 CCV52592_1180 CCV52592_1179 nusB pyrF TRUE 0.978 -3.000 0.023 1.000 N NA
 7006698 7006699 CCV52592_1179 CCV52592_1178 pyrF   TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7006699 7006700 CCV52592_1178 CCV52592_2146     FALSE 0.092 103.000 0.000 NA   NA
 7006700 7006701 CCV52592_2146 CCV52592_1176     FALSE 0.048 158.000 0.000 NA   NA
 7006701 7006702 CCV52592_1176 CCV52592_1175     TRUE 0.941 21.000 0.088 1.000 Y NA
 7006702 7006703 CCV52592_1175 CCV52592_1174   cdsA TRUE 0.986 -3.000 0.595 1.000   NA
 7006703 7006704 CCV52592_1174 CCV52592_1173 cdsA   FALSE 0.013 344.000 0.000 NA   NA
 7006704 7006705 CCV52592_1173 CCV52592_1172     FALSE 0.388 168.000 0.285 NA   NA
 7006705 7006706 CCV52592_1172 CCV52592_1171     TRUE 0.959 -6.000 0.027 NA   NA
 7006706 7006707 CCV52592_1171 CCV52592_1170     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006707 7006708 CCV52592_1170 CCV52592_1169     TRUE 0.523 -34.000 0.000 NA   NA
 7006708 7006709 CCV52592_1169 CCV52592_1168     FALSE 0.271 26.000 0.000 NA   NA
 7006709 7006710 CCV52592_1168 CCV52592_1166     TRUE 0.634 29.000 0.018 NA   NA
 7006710 7006711 CCV52592_1166 CCV52592_1165     TRUE 0.991 -3.000 0.514 NA Y NA
 7006711 7006712 CCV52592_1165 CCV52592_1164     TRUE 0.987 -7.000 0.397 NA Y NA
 7006712 7006713 CCV52592_1164 CCV52592_1163     TRUE 0.991 -6.000 0.486 1.000 Y NA
 7006713 7006714 CCV52592_1163 CCV52592_1162     TRUE 0.693 29.000 0.024 NA   NA
 7006714 7006715 CCV52592_1162 CCV52592_1161     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 7006715 7006716 CCV52592_1161 CCV52592_1160     TRUE 0.968 -3.000 0.028 NA   NA
 7006716 7006717 CCV52592_1160 CCV52592_0967     TRUE 0.968 -10.000 0.636 NA   NA
 7006717 7006718 CCV52592_0967 CCV52592_0968     TRUE 0.935 -16.000 0.028 1.000   NA
 7006718 7006719 CCV52592_0968 CCV52592_0969     TRUE 0.979 3.000 0.019 0.003   NA
 7006719 7006720 CCV52592_0969 CCV52592_0970     TRUE 0.950 -19.000 0.422 NA   NA
 7006720 7006721 CCV52592_0970 CCV52592_0971     TRUE 0.983 -3.000 0.758 NA   NA
 7006721 7006722 CCV52592_0971 CCV52592_0972     TRUE 0.980 1.000 0.094 NA   NA
 7006722 7006723 CCV52592_0972 CCV52592_0973     TRUE 0.949 -16.000 0.167 NA   NA
 7006723 7006724 CCV52592_0973 CCV52592_0974     TRUE 0.943 -25.000 0.110 1.000   NA
 7006724 7006725 CCV52592_0974 CCV52592_0976     TRUE 0.980 -3.000 0.146 NA   NA
 7006727 7006728 CCV52592_0977 CCV52592_0978 ileS gatA TRUE 0.522 100.000 0.008 1.000 Y NA
 7006728 7006729 CCV52592_0978 CCV52592_0979 gatA guaB TRUE 0.981 3.000 0.032 1.000 N NA
 7006729 7006730 CCV52592_0979 CCV52592_0980 guaB metX TRUE 0.973 0.000 0.015 1.000 N NA
 7006730 7006731 CCV52592_0980 CCV52592_0981 metX   TRUE 0.963 3.000 0.019 1.000   NA
 7006731 7006732 CCV52592_0981 CCV52592_0982     TRUE 0.964 -7.000 0.032 1.000   NA
 7006732 7006733 CCV52592_0982 CCV52592_0983     TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000   NA
 7006733 7006734 CCV52592_0983 CCV52592_0984     TRUE 0.558 -22.000 0.000 NA   NA
 7006734 7006735 CCV52592_0984 CCV52592_0985   murC TRUE 0.500 15.000 0.000 NA   NA
 7006735 7006736 CCV52592_0985 CCV52592_0986 murC   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7006736 7006737 CCV52592_0986 CCV52592_0987     TRUE 0.754 -6.000 0.000 NA   NA
 7006737 7006738 CCV52592_0987 CCV52592_0988     TRUE 0.980 4.000 0.217 NA   NA
 7006738 7006739 CCV52592_0988 CCV52592_0989     FALSE 0.127 78.000 0.000 NA   NA
 7006739 7006740 CCV52592_0989 CCV52592_0990   dapE TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7006740 7006741 CCV52592_0990 CCV52592_0992 dapE   FALSE 0.077 115.000 0.000 NA   NA
 7006742 7006743 CCV52592_0991 CCV52592_0993 hisG   TRUE 0.978 -3.000 0.023 1.000 N NA
 7006743 7006744 CCV52592_0993 CCV52592_0994     TRUE 0.634 -13.000 0.000 NA   NA
 7006744 7006745 CCV52592_0994 CCV52592_0995     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7006745 7006746 CCV52592_0995 CCV52592_0996     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7006747 7006748 CCV52592_0997 CCV52592_0998 gatC   TRUE 0.964 4.000 0.010 1.000 N NA
 7006748 7006749 CCV52592_0998 CCV52592_0999   cvpA TRUE 0.953 2.000 0.010 1.000   NA
 7006749 7006750 CCV52592_0999 CCV52592_2147 cvpA   TRUE 0.971 -3.000 0.023 1.000   NA
 7006750 7006751 CCV52592_2147 CCV52592_1349   lysS TRUE 0.979 2.000 0.022 1.000 N NA
 7006751 7006752 CCV52592_1349 CCV52592_1350 lysS glyA TRUE 0.983 -3.000 0.044 1.000 N NA
 7006752 7006753 CCV52592_1350 CCV52592_1351 glyA   TRUE 0.983 0.000 0.271 NA   NA
 7006753 7006754 CCV52592_1351 CCV52592_1352     TRUE 0.973 10.000 0.387 NA   NA
 7006754 7006755 CCV52592_1352 CCV52592_1353   aroE TRUE 0.964 0.000 0.020 NA   NA
 7006757 7006758 CCV52592_1355 CCV52592_1356   pyk TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006759 7006760 CCV52592_1357 CCV52592_1358   recR TRUE 0.858 2.000 0.000 1.000   NA
 7006760 7006761 CCV52592_1358 CCV52592_1359 recR   TRUE 0.965 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7006761 7006762 CCV52592_1359 CCV52592_1360     TRUE 0.993 -3.000 0.448 1.000 Y NA
 7006763 7006764 CCV52592_1361 CCV52592_0933   dcd TRUE 0.589 -18.000 0.000 NA   NA
 7006765 7006766 CCV52592_0934 CCV52592_0935     TRUE 0.815 1.000 0.000 NA   NA
 7006766 7006767 CCV52592_0935 CCV52592_0936   uvrC TRUE 0.819 -13.000 0.002 NA   NA
 7006767 7006768 CCV52592_0936 CCV52592_0937 uvrC   TRUE 0.918 -10.000 0.018 NA   NA
 7006769 7006770 CCV52592_0938 CCV52592_0939     TRUE 0.665 86.000 0.600 NA   NA
 7006770 7006771 CCV52592_0939 CCV52592_0940   guaA TRUE 0.931 10.000 0.004 1.000 N NA
 7006771 7006772 CCV52592_0940 CCV52592_0941 guaA   TRUE 0.509 24.000 0.000 1.000 N NA
 7006772 7006773 CCV52592_0941 CCV52592_0942     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006773 7006774 CCV52592_0942 CCV52592_0943     FALSE 0.166 50.000 0.000 NA   NA
 7006774 7006775 CCV52592_0943 CCV52592_0944     FALSE 0.034 204.000 0.000 NA   NA
 7006775 7006776 CCV52592_0944 CCV52592_0945     FALSE 0.023 257.000 0.000 NA   NA
 7006776 7006777 CCV52592_0945 CCV52592_0946     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006777 7006778 CCV52592_0946 CCV52592_0947     FALSE 0.417 25.000 0.000 NA N NA
 7006778 7006779 CCV52592_0947 CCV52592_0948   hemD TRUE 0.953 -7.000 0.013 1.000 N NA
 7006779 7006780 CCV52592_0948 CCV52592_0949 hemD purD FALSE 0.060 233.000 0.000 1.000 N NA
 7006780 7006781 CCV52592_0949 CCV52592_0950 purD   TRUE 0.953 -3.000 0.017 NA   NA
 7006781 7006782 CCV52592_0950 CCV52592_1336     TRUE 0.962 -10.000 0.149 NA   NA
 7006782 7006783 CCV52592_1336 CCV52592_0952     TRUE 0.985 0.000 0.165 1.000   NA
 7006783 7006784 CCV52592_0952 CCV52592_0953     TRUE 0.952 -10.000 0.028 1.000   NA
 7006784 7006785 CCV52592_0953 CCV52592_0954     TRUE 0.724 18.000 0.005 1.000   NA
 7006788 7006789 CCV52592_2149 CCV52592_0957     FALSE 0.205 34.000 0.000 NA   NA
 7006790 7006791 CCV52592_0958 CCV52592_0959 modA   TRUE 0.991 1.000 0.222 0.003   NA
 7006791 7006792 CCV52592_0959 CCV52592_0960     TRUE 0.992 0.000 1.000 0.003   NA
 7006792 7006793 CCV52592_0960 CCV52592_0961     TRUE 0.957 10.000 0.038 NA   NA
 7006793 7006794 CCV52592_0961 CCV52592_0962     TRUE 0.992 2.000 0.827 NA Y NA
 7006796 7006797 CCV52592_0964 CCV52592_0965   pckA FALSE 0.182 292.000 0.016 1.000 Y NA
 7006797 7006798 CCV52592_0965 CCV52592_1632 pckA   TRUE 0.781 -25.000 0.005 NA   NA
 7006798 7006799 CCV52592_1632 CCV52592_1033     FALSE 0.059 140.000 0.000 NA   NA
 7006799 7006800 CCV52592_1033 CCV52592_1034     TRUE 0.813 -12.000 0.000 1.000 N NA
 7006801 7006802 CCV52592_1035 CCV52592_1036 dctA   TRUE 0.953 11.000 0.022 1.000 N NA
 7006802 7006803 CCV52592_1036 CCV52592_1037     TRUE 0.732 18.000 0.010 NA   NA
 7006804 7006805 CCV52592_2150 CCV52592_0532     TRUE 0.977 -3.000 0.040 1.000   NA
 7006805 7006806 CCV52592_0532 CCV52592_0531     TRUE 0.989 0.000 0.067 0.004   NA
 7006806 7006807 CCV52592_0531 CCV52592_0530     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7006808 7006809 CCV52592_0529 CCV52592_0528     FALSE 0.128 76.000 0.000 NA   NA
 7006809 7006810 CCV52592_0528 CCV52592_0527     FALSE 0.183 41.000 0.000 NA   NA
 7006812 7006813 CCV52592_0525 CCV52592_0524     TRUE 0.794 3.000 0.000 NA   NA
 7006814 7006815 CCV52592_0523 CCV52592_0522   argH FALSE 0.082 141.000 0.000 1.000   NA
 7006815 7006816 CCV52592_0522 CCV52592_0521 argH   FALSE 0.015 308.000 0.000 NA   NA
 7006816 7006817 CCV52592_0521 CCV52592_0520   gntT FALSE 0.028 227.000 0.000 NA   NA
 7006819 7006820 CCV52592_0518 CCV52592_0517 pheS pheT TRUE 0.996 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 7006820 7006821 CCV52592_0517 CCV52592_0516 pheT aroA TRUE 0.981 -3.000 0.028 1.000 N NA
 7006821 7006822 CCV52592_0516 CCV52592_0515 aroA ispH TRUE 0.966 -10.000 0.032 1.000 N NA
 7006822 7006823 CCV52592_0515 CCV52592_0514 ispH rpsA TRUE 0.732 79.000 0.118 1.000 N NA
 7006823 7006824 CCV52592_0514 CCV52592_0513 rpsA   TRUE 0.879 22.000 0.343 NA   NA
 7006824 7006825 CCV52592_0513 CCV52592_0512   serA TRUE 0.966 -3.000 0.025 NA   NA
 7006825 7006826 CCV52592_0512 CCV52592_0511 serA efp TRUE 0.679 26.000 0.007 1.000 N NA
 7006826 7006827 CCV52592_0511 CCV52592_0510 efp   FALSE 0.400 34.000 0.002 NA   NA
 7006827 7006828 CCV52592_0510 CCV52592_0509     FALSE 0.012 359.000 0.000 NA   NA
 7006828 7006829 CCV52592_0509 CCV52592_0508   pncB FALSE 0.020 272.000 0.000 NA   NA
 7006829 7006830 CCV52592_0508 CCV52592_0507 pncB   TRUE 0.829 -22.000 0.006 1.000   NA
 7006830 7006831 CCV52592_0507 CCV52592_0506   dnaE TRUE 0.521 44.000 0.002 0.052   NA
 7006831 7006832 CCV52592_0506 CCV52592_0505 dnaE   FALSE 0.392 24.000 0.000 1.000   NA
 7006832 7006833 CCV52592_0505 CCV52592_0504     TRUE 0.975 9.000 0.100 NA   NA
 7006833 7006834 CCV52592_0504 CCV52592_0503     FALSE 0.309 24.000 0.000 NA   NA
 7006835 7006836 CCV52592_0502 CCV52592_0501 lemA   TRUE 0.901 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7006836 7006837 CCV52592_0501 CCV52592_0500     TRUE 0.949 -7.000 0.019 1.000   NA
 7006838 7006839 CCV52592_0499 CCV52592_0498 tlpB tlpB TRUE 0.699 -9.000 0.000 NA   NA
 7006840 7006841 CCV52592_0497 CCV52592_0496 thiE thiD TRUE 0.988 -3.000 0.016 0.007 Y NA
 7006841 7006842 CCV52592_0496 CCV52592_0495 thiD tcmP FALSE 0.390 32.000 0.000 1.000 N NA
 7006842 7006843 CCV52592_0495 CCV52592_0494 tcmP gltL TRUE 0.967 16.000 0.385 1.000 Y NA
 7006843 7006844 CCV52592_0494 CCV52592_0493 gltL   TRUE 0.987 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 7006844 7006845 CCV52592_0493 CCV52592_0492     FALSE 0.461 16.000 0.000 NA   NA
 7006849 7006850 CCV52592_0488 CCV52592_0486     FALSE 0.026 236.000 0.000 NA   NA
 7006850 7006851 CCV52592_0486 CCV52592_0485     TRUE 0.968 -7.000 0.050 1.000   NA
 7006851 7006852 CCV52592_0485 CCV52592_0484   tyrS TRUE 0.980 0.000 0.043 1.000   NA
 7006852 7006853 CCV52592_0484 CCV52592_0483 tyrS   TRUE 0.927 16.000 0.045 1.000 N NA
 7006853 7006854 CCV52592_0483 CCV52592_0482   rpoZ TRUE 0.975 -13.000 0.039 1.000 Y NA
 7006854 7006855 CCV52592_0482 CCV52592_0481 rpoZ pyrH TRUE 0.886 21.000 0.033 1.000 N NA
 7006855 7006856 CCV52592_0481 CCV52592_0480 pyrH   TRUE 0.554 51.000 0.009 1.000 N NA
 7006856 7006857 CCV52592_0480 CCV52592_0479     TRUE 0.973 -3.000 0.045 NA   NA
 7006857 7006858 CCV52592_0479 CCV52592_0478     TRUE 0.960 -13.000 0.431 NA   NA
 7006858 7006859 CCV52592_0478 CCV52592_0477     TRUE 0.601 -16.000 0.000 NA   NA
 7006859 7006860 CCV52592_0477 CCV52592_0476     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7006860 7006861 CCV52592_0476 CCV52592_0475     TRUE 0.802 5.000 0.000 NA   NA
 7006861 7006862 CCV52592_0475 CCV52592_0474     FALSE 0.148 62.000 0.000 NA   NA
 7006863 7006864 CCV52592_0473 CCV52592_0472 mrdB   FALSE 0.029 225.000 0.000 NA   NA
 7006865 7006866 CCV52592_2151 CCV52592_0470   ppa FALSE 0.127 78.000 0.000 NA   NA
 7006866 7006867 CCV52592_0470 CCV52592_0469 ppa   TRUE 0.785 13.000 0.004 NA   NA
 7006868 7006869 CCV52592_0468 CCV52592_0467     TRUE 0.809 15.000 0.000 1.000 Y NA
 7006870 7006871 CCV52592_0466 CCV52592_0465 adk aspS FALSE 0.157 58.000 0.000 NA   NA
 7006872 7006873 CCV52592_0464 CCV52592_0463 pnk   TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7006873 7006874 CCV52592_0463 CCV52592_0462   kdtA FALSE 0.121 87.000 0.000 NA   NA
 7006874 7006875 CCV52592_0462 CCV52592_0460 kdtA   TRUE 0.961 -3.000 0.013 NA N NA
 7006875 7006876 CCV52592_0460 CCV52592_0459     TRUE 0.613 72.000 0.028 NA N NA
 7006876 7006877 CCV52592_0459 CCV52592_0458     TRUE 0.949 17.000 0.115 NA Y NA
 7006877 7006878 CCV52592_0458 CCV52592_0457   hisB TRUE 0.975 2.000 0.022 NA N NA
 7006878 7006879 CCV52592_0457 CCV52592_0456 hisB   TRUE 0.963 -3.000 0.018 1.000   NA
 7006879 7006880 CCV52592_0456 CCV52592_0455     TRUE 0.971 -9.000 0.617 NA   NA
 7006880 7006881 CCV52592_0455 CCV52592_0454   yhbN TRUE 0.944 -24.000 0.459 NA   NA
 7006881 7006882 CCV52592_0454 CCV52592_0453 yhbN engB TRUE 0.972 -3.000 0.041 NA   NA
 7006882 7006883 CCV52592_0453 CCV52592_0452 engB   TRUE 0.971 -3.000 0.023 1.000   NA
 7006883 7006884 CCV52592_0452 CCV52592_0451     TRUE 0.885 -33.000 0.023 NA   NA
 7006884 7006885 CCV52592_0451 CCV52592_0450   mrdA TRUE 0.973 -3.000 0.043 NA   NA
 7006887 7006888 CCV52592_0448 CCV52592_0447   hcp FALSE 0.017 603.000 0.000 0.051   NA
 7006889 7006890 CCV52592_0446 CCV52592_0445   metG TRUE 0.979 2.000 0.046 1.000   NA
 7006890 7006891 CCV52592_0445 CCV52592_0444 metG   TRUE 0.833 18.000 0.024 NA   NA
 7006891 7006892 CCV52592_0444 CCV52592_0443   fbp TRUE 0.985 0.000 0.778 NA   NA
 7006892 7006893 CCV52592_0443 CCV52592_0442 fbp mobB TRUE 0.867 -36.000 0.008 1.000 N NA
 7006893 7006894 CCV52592_0442 CCV52592_0441 mobB flgB FALSE 0.028 227.000 0.000 NA   NA
 7006894 7006895 CCV52592_0441 CCV52592_0440 flgB   FALSE 0.014 336.000 0.000 NA   NA
 7006895 7006896 CCV52592_0440 CCV52592_0439     TRUE 0.932 -22.000 0.080 NA   NA
 7006896 7006897 CCV52592_0439 CCV52592_0438   gltX TRUE 0.978 -3.000 0.088 NA   NA
 7006898 7006899 CCV52592_0437 CCV52592_0436 mscL   TRUE 0.504 61.000 0.007 1.000 N NA
 7006899 7006900 CCV52592_0436 CCV52592_0435     FALSE 0.120 119.000 0.000 NA N NA
 7006900 7006901 CCV52592_0435 CCV52592_0434     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7006901 7006902 CCV52592_0434 CCV52592_1132     FALSE 0.145 97.000 0.000 1.000   NA
 7006902 7006903 CCV52592_1132 CCV52592_1320   psd TRUE 0.982 5.000 0.089 1.000   NA
 7006904 7006905 CCV52592_1319 CCV52592_1318   ychF FALSE 0.016 370.000 0.000 1.000   NA
 7006905 7006906 CCV52592_1318 CCV52592_1317 ychF   TRUE 0.987 0.000 0.026 0.025 N NA
 7006906 7006907 CCV52592_1317 CCV52592_1316     TRUE 0.943 -22.000 0.250 NA   NA
 7006907 7006908 CCV52592_1316 CCV52592_1315   apt TRUE 0.535 68.000 0.026 NA   NA
 7006908 7006909 CCV52592_1315 CCV52592_1314 apt secF TRUE 0.856 17.000 0.028 NA   NA
 7006909 7006910 CCV52592_1314 CCV52592_1313 secF rpiB TRUE 0.978 -3.000 0.103 NA   NA
 7006910 7006911 CCV52592_1313 CCV52592_2152 rpiB   FALSE 0.141 65.000 0.000 NA   NA
 7006911 7006912 CCV52592_2152 CCV52592_0804     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006916 7006917 CCV52592_0801 CCV52592_0800   lepB TRUE 0.967 -13.000 0.055 0.023   NA
 7006917 7006918 CCV52592_0800 CCV52592_0799 lepB   TRUE 0.986 3.000 0.117 1.000 N NA
 7006919 7006920 CCV52592_0798 CCV52592_0797   hemL TRUE 0.984 -3.000 0.212 1.000   NA
 7006920 7006921 CCV52592_0797 CCV52592_1326 hemL   TRUE 0.794 -7.000 0.000 1.000   NA
 7006921 7006922 CCV52592_1326 CCV52592_1327     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006922 7006923 CCV52592_1327 CCV52592_1328     TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7006923 7006924 CCV52592_1328 CCV52592_1329     TRUE 0.965 11.000 0.227 1.000   NA
 7006924 7006925 CCV52592_1329 CCV52592_1330     TRUE 0.984 0.000 0.104 1.000   NA
 7006925 7006926 CCV52592_1330 CCV52592_1331     TRUE 0.584 91.000 0.042 1.000   NA
 7006926 7006927 CCV52592_1331 CCV52592_1332     TRUE 0.616 139.000 0.500 0.012   NA
 7006927 7006928 CCV52592_1332 CCV52592_1333   cheR TRUE 0.970 -10.000 0.231 1.000   NA
 7006929 7006930 CCV52592_1334 CCV52592_1627     FALSE 0.100 99.000 0.000 NA   NA
 7006930 7006931 CCV52592_1627 CCV52592_1626     TRUE 0.978 1.000 0.059 NA   NA
 7006931 7006932 CCV52592_1626 CCV52592_1624     FALSE 0.009 410.000 0.000 NA   NA
 7006933 7006934 CCV52592_1623 CCV52592_1622     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006936 7006937 CCV52592_1620 CCV52592_1619     FALSE 0.009 421.000 0.000 NA   NA
 7006937 7006938 CCV52592_1619 CCV52592_1618     TRUE 0.984 1.000 0.130 1.000   NA
 7006938 7006939 CCV52592_1618 CCV52592_1617     TRUE 0.965 -10.000 0.084 1.000   NA
 7006939 7006940 CCV52592_1617 CCV52592_1616     FALSE 0.080 111.000 0.000 NA   NA
 7006941 7006942 CCV52592_1615 CCV52592_1614     TRUE 0.994 0.000 0.500 1.000 Y NA
 7006942 7006943 CCV52592_1614 CCV52592_1613     FALSE 0.011 373.000 0.000 NA   NA
 7006943 7006944 CCV52592_1613 CCV52592_1612     TRUE 0.815 1.000 0.000 NA   NA
 7006944 7006945 CCV52592_1612 CCV52592_1611     TRUE 0.966 -3.000 0.000 0.005 Y NA
 7006945 7006946 CCV52592_1611 CCV52592_1610     TRUE 0.562 30.000 0.000 1.000 Y NA
 7006946 7006947 CCV52592_1610 CCV52592_1609     FALSE 0.141 65.000 0.000 NA   NA
 7006950 7006951 CCV52592_1606 CCV52592_1605     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006951 7006952 CCV52592_1605 CCV52592_1604     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7006952 7006953 CCV52592_1604 CCV52592_1603   proC FALSE 0.148 62.000 0.000 NA   NA
 7006953 7006954 CCV52592_1603 CCV52592_1602 proC   TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000   NA
 7006955 7006956 CCV52592_1601 CCV52592_1600     FALSE 0.161 54.000 0.000 NA   NA
 7006958 7006959 CCV52592_1598 CCV52592_1597     FALSE 0.174 45.000 0.000 NA   NA
 7006959 7006960 CCV52592_1597 CCV52592_1596     TRUE 0.555 82.000 0.040 NA   NA
 7006960 7006961 CCV52592_1596 CCV52592_1595     TRUE 0.984 0.000 0.500 NA   NA
 7006961 7006962 CCV52592_1595 CCV52592_1594     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7006962 7006963 CCV52592_1594 CCV52592_1593     TRUE 0.977 -6.000 0.500 NA   NA
 7006963 7006964 CCV52592_1593 CCV52592_1592     TRUE 0.703 58.000 0.222 NA   NA
 7006964 7006965 CCV52592_1592 CCV52592_1591     FALSE 0.187 40.000 0.000 NA   NA
 7006966 7006967 CCV52592_1590 CCV52592_1589   lon TRUE 0.972 9.000 0.062 NA   NA
 7006967 7006968 CCV52592_1589 CCV52592_1588 lon   FALSE 0.042 225.000 0.000 1.000   NA
 7006969 7006970 CCV52592_1587 CCV52592_1586 rpsR   TRUE 0.942 14.000 0.034 1.000 N NA
 7006970 7006971 CCV52592_1586 CCV52592_1585   rpsF TRUE 0.941 14.000 0.033 1.000 N NA
 7006971 7006972 CCV52592_1585 CCV52592_1584 rpsF   TRUE 0.598 75.000 0.020 1.000 N NA
 7006972 7006973 CCV52592_1584 CCV52592_1583     TRUE 0.982 0.000 0.024 1.000 N NA
 7006973 7006974 CCV52592_1583 CCV52592_1582     TRUE 0.984 -3.000 0.122 NA N NA
 7006975 7006976 CCV52592_1581 CCV52592_1580 ilvC   TRUE 0.957 5.000 0.013 1.000   NA
 7006976 7006977 CCV52592_1580 CCV52592_1579   dprA TRUE 0.969 -3.000 0.022 1.000   NA
 7006977 7006978 CCV52592_1579 CCV52592_1578 dprA   TRUE 0.987 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 7006979 7006980 CCV52592_1577 CCV52592_1576   queA TRUE 0.917 -3.000 0.004 NA   NA
 7006980 7006981 CCV52592_1576 CCV52592_1575 queA tatC TRUE 0.953 -13.000 0.036 NA N NA
 7006981 7006982 CCV52592_1575 CCV52592_1574 tatC   TRUE 0.992 0.000 0.535 NA Y NA
 7006982 7006983 CCV52592_1574 CCV52592_1573     TRUE 0.525 66.000 0.011 1.000 N NA
 7006983 7006984 CCV52592_1573 CCV52592_1572     FALSE 0.016 301.000 0.000 NA   NA
 7006985 7006986 CCV52592_1571 CCV52592_1570     TRUE 0.986 0.000 0.051 1.000 N NA
 7006986 7006987 CCV52592_1570 CCV52592_1569     TRUE 0.977 0.000 0.050 NA   NA
 7006987 7006988 CCV52592_1569 CCV52592_1568     TRUE 0.977 1.000 0.053 NA   NA
 7006988 7006989 CCV52592_1568 CCV52592_1567     TRUE 0.979 -3.000 0.054 1.000   NA
 7006989 7006990 CCV52592_1567 CCV52592_1566     TRUE 0.699 -9.000 0.000 NA   NA
 7006990 7006991 CCV52592_1566 CCV52592_1565   ligA FALSE 0.037 193.000 0.000 NA   NA
 7006991 7006992 CCV52592_1565 CCV52592_1564 ligA rrmJ TRUE 0.942 -10.000 0.014 1.000 N NA
 7006992 7006993 CCV52592_1564 CCV52592_1563 rrmJ ribF TRUE 0.934 -34.000 0.029 1.000 N NA
 7006993 7006994 CCV52592_1563 CCV52592_1562 ribF   TRUE 0.990 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 7006994 7006995 CCV52592_1562 CCV52592_1561     FALSE 0.054 146.000 0.000 NA   NA
 7006996 7006997 CCV52592_1560 CCV52592_1559     FALSE 0.053 343.000 0.000 1.000 Y NA
 7006997 7006998 CCV52592_1559 CCV52592_1557     FALSE 0.084 108.000 0.000 NA   NA
 7006998 7006999 CCV52592_1557 CCV52592_1556     FALSE 0.106 97.000 0.000 NA   NA
 7006999 7007000 CCV52592_1556 CCV52592_2154     FALSE 0.067 129.000 0.000 NA   NA
 7007000 7007001 CCV52592_2154 CCV52592_1555   rpsO TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000   NA
 7007002 7007003 CCV52592_1554 CCV52592_1553   flhA TRUE 0.981 3.000 0.053 NA N NA
 7007003 7007004 CCV52592_1553 CCV52592_1552 flhA   TRUE 0.930 14.000 0.106 NA   NA
 7007004 7007005 CCV52592_1552 CCV52592_1550     TRUE 0.980 -3.000 0.154 NA   NA
 7007005 7007006 CCV52592_1550 CCV52592_2156   htrA FALSE 0.433 17.000 0.000 NA   NA
 7007006 7007007 CCV52592_2156 CCV52592_0155 htrA pyrB TRUE 0.590 15.000 0.000 1.000   NA
 7007007 7007008 CCV52592_0155 CCV52592_0154 pyrB   TRUE 0.993 3.000 0.452 1.000 Y NA
 7007009 7007010 CCV52592_0153 CCV52592_0152     TRUE 0.815 1.000 0.000 NA   NA
 7007011 7007012 CCV52592_0151 CCV52592_0150   grpE TRUE 0.979 -3.000 0.038 NA N NA
 7007012 7007013 CCV52592_0150 CCV52592_0149 grpE   TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7007013 7007014 CCV52592_0149 CCV52592_0148   dnaK TRUE 0.652 -12.000 0.000 NA   NA
 7007015 7007016 CCV52592_0147 CCV52592_0146     TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7007017 7007018 CCV52592_0145 CCV52592_0144   ubiA FALSE 0.019 282.000 0.000 NA   NA
 7007018 7007019 CCV52592_0144 CCV52592_0143 ubiA   FALSE 0.137 67.000 0.000 NA   NA
 7007019 7007020 CCV52592_0143 CCV52592_0142     FALSE 0.013 356.000 0.000 NA   NA
 7007020 7007021 CCV52592_0142 CCV52592_0141     FALSE 0.461 16.000 0.000 NA   NA
 7007024 7007025 CCV52592_0138 CCV52592_0137     FALSE 0.122 86.000 0.000 NA   NA
 7007025 7007026 CCV52592_0137 CCV52592_0136     TRUE 0.990 -7.000 0.600 1.000 Y NA
 7007026 7007027 CCV52592_0136 CCV52592_0135     FALSE 0.255 27.000 0.000 NA   NA
 7007027 7007028 CCV52592_0135 CCV52592_0134     TRUE 0.503 -49.000 0.000 NA   NA
 7007028 7007029 CCV52592_0134 CCV52592_0133     FALSE 0.027 233.000 0.000 NA   NA
 7007029 7007030 CCV52592_0133 CCV52592_0132     FALSE 0.131 72.000 0.000 NA   NA
 7007030 7007031 CCV52592_0132 CCV52592_0131   kdsB FALSE 0.341 82.000 0.009 NA   NA
 7007031 7007032 CCV52592_0131 CCV52592_0130 kdsB thrC TRUE 0.972 -3.000 0.017 1.000 N NA
 7007032 7007033 CCV52592_0130 CCV52592_0129 thrC   TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007033 7007034 CCV52592_0129 CCV52592_0128   argB TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007034 7007035 CCV52592_0128 CCV52592_0127 argB lpxK TRUE 0.612 43.000 0.012 1.000 N NA
 7007035 7007036 CCV52592_0127 CCV52592_0126 lpxK   TRUE 0.980 -7.000 0.024 1.000 Y NA
 7007036 7007037 CCV52592_0126 CCV52592_0125   nadE TRUE 0.895 12.000 0.008 1.000 N NA
 7007039 7007040 CCV52592_0123 CCV52592_0122     FALSE 0.065 132.000 0.000 NA   NA
 7007040 7007041 CCV52592_0122 CCV52592_0121     TRUE 0.978 9.000 0.053 NA N NA
 7007041 7007042 CCV52592_0121 CCV52592_0120     TRUE 0.959 1.000 0.018 NA   NA
 7007043 7007044 CCV52592_0119 CCV52592_0118     TRUE 0.965 -3.000 0.023 NA   NA
 7007044 7007045 CCV52592_0118 CCV52592_0117     TRUE 0.972 -7.000 0.273 NA   NA
 7007045 7007046 CCV52592_0117 CCV52592_0116     TRUE 0.978 10.000 0.077 1.000 N NA
 7007048 7007049 CCV52592_0114 CCV52592_0113   fbaA TRUE 0.915 17.000 0.036 1.000 N NA
 7007049 7007050 CCV52592_0113 CCV52592_0112 fbaA   TRUE 0.973 4.000 0.027 1.000   NA
 7007050 7007051 CCV52592_0112 CCV52592_0111     TRUE 0.961 -13.000 0.133 1.000   NA
 7007051 7007052 CCV52592_0111 CCV52592_0110     TRUE 0.965 -16.000 0.093 1.000 N NA
 7007052 7007053 CCV52592_0110 CCV52592_0109   hisD TRUE 0.984 -3.000 0.020 1.000 Y NA
 7007053 7007054 CCV52592_0109 CCV52592_0107 hisD   FALSE 0.430 58.000 0.007 1.000   NA
 7007055 7007056 CCV52592_0108 CCV52592_0106     FALSE 0.007 638.000 0.000 NA   NA
 7007057 7007058 CCV52592_0105 CCV52592_0104   flgG TRUE 0.986 12.000 0.377 0.007 Y NA
 7007058 7007059 CCV52592_0104 CCV52592_0103 flgG   TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7007059 7007060 CCV52592_0103 CCV52592_0102     FALSE 0.255 27.000 0.000 NA   NA
 7007060 7007061 CCV52592_0102 CCV52592_0101     TRUE 0.992 -3.000 0.915 NA Y NA
 7007061 7007062 CCV52592_0101 CCV52592_1362   ansB TRUE 0.645 85.000 0.020 NA Y NA
 7007062 7007063 CCV52592_1362 CCV52592_1363 ansB   FALSE 0.177 156.000 0.000 1.000 Y NA
 7007063 7007064 CCV52592_1363 CCV52592_1364   algI TRUE 0.747 53.000 0.019 1.000 Y NA
 7007064 7007065 CCV52592_1364 CCV52592_1365 algI leuB TRUE 0.994 9.000 0.089 0.002 Y NA
 7007065 7007066 CCV52592_1365 CCV52592_1366 leuB   TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000   NA
 7007066 7007067 CCV52592_1366 CCV52592_1367     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007067 7007068 CCV52592_1367 CCV52592_1368     TRUE 0.937 -34.000 0.325 NA   NA
 7007070 7007071 CCV52592_1370 CCV52592_1371 purU   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007071 7007072 CCV52592_1371 CCV52592_1372     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007072 7007073 CCV52592_1372 CCV52592_1373     TRUE 0.979 4.000 0.133 NA   NA
 7007073 7007074 CCV52592_1373 CCV52592_1374   glyS TRUE 0.915 -3.000 0.003 NA   NA
 7007075 7007076 CCV52592_1375 CCV52592_1376 modD   TRUE 0.953 -3.000 0.017 NA   NA
 7007076 7007077 CCV52592_1376 CCV52592_1377     TRUE 0.933 -10.000 0.022 NA   NA
 7007077 7007078 CCV52592_1377 CCV52592_1378     TRUE 0.958 -16.000 0.176 1.000   NA
 7007078 7007079 CCV52592_1378 CCV52592_1379     TRUE 0.986 0.000 0.250 1.000   NA
 7007079 7007080 CCV52592_1379 CCV52592_1380     TRUE 0.974 10.000 1.000 NA   NA
 7007080 7007081 CCV52592_1380 CCV52592_1381     TRUE 0.845 26.000 0.800 NA   NA
 7007081 7007082 CCV52592_1381 CCV52592_1382     TRUE 0.972 -7.000 0.250 NA   NA
 7007082 7007083 CCV52592_1382 CCV52592_1383     TRUE 0.560 105.000 0.250 NA   NA
 7007086 7007087 CCV52592_1386 CCV52592_1387   astC TRUE 0.957 10.000 0.037 NA   NA
 7007087 7007088 CCV52592_1387 CCV52592_1389 astC   TRUE 0.905 -10.000 0.014 NA   NA
 7007090 7007091 CCV52592_1630 CCV52592_1391 fliL acpS TRUE 0.983 -3.000 0.047 1.000 N NA
 7007091 7007092 CCV52592_1391 CCV52592_1393 acpS   FALSE 0.032 216.000 0.000 NA   NA
 7007093 7007094 CCV52592_1392 CCV52592_1394 radA   TRUE 0.634 -13.000 0.000 NA   NA
 7007094 7007095 CCV52592_1394 CCV52592_1395   ftsY TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7007095 7007096 CCV52592_1395 CCV52592_1396 ftsY   TRUE 0.959 0.000 0.005 1.000 N NA
 7007097 7007098 CCV52592_1397 CCV52592_1398     TRUE 0.930 -34.000 0.059 1.000   NA
 7007098 7007099 CCV52592_1398 CCV52592_1399     TRUE 0.755 15.000 0.006 NA   NA
 7007099 7007100 CCV52592_1399 CCV52592_1400     TRUE 0.977 9.000 0.156 NA   NA
 7007100 7007101 CCV52592_1400 CCV52592_1401     TRUE 0.978 -3.000 0.094 NA   NA
 7007101 7007102 CCV52592_1401 CCV52592_r01     FALSE 0.009 428.000 0.000 NA   NA
 7007102 7007103 CCV52592_r01 CCV52592_2157     FALSE 0.018 285.000 0.000 NA   NA
 7007103 7007104 CCV52592_2157 CCV52592_2158     FALSE 0.017 289.000 0.000 NA   NA
 7007104 7007105 CCV52592_2158 CCV52592_r02     FALSE 0.010 384.000 0.000 NA   NA
 7007105 7007106 CCV52592_r02 CCV52592_2159   rrf FALSE 0.009 437.000 0.000 NA   NA
 7007106 7007107 CCV52592_2159 CCV52592_1407 rrf   FALSE 0.026 236.000 0.000 NA   NA
 7007107 7007108 CCV52592_1407 CCV52592_1408   fixO FALSE 0.011 566.000 0.000 1.000   NA
 7007108 7007109 CCV52592_1408 CCV52592_1409 fixO   FALSE 0.200 100.000 0.000 1.000 N NA
 7007109 7007110 CCV52592_1409 CCV52592_1410     FALSE 0.252 78.000 0.000 0.097   NA
 7007110 7007111 CCV52592_1410 CCV52592_1411     FALSE 0.112 93.000 0.000 NA   NA
 7007112 7007113 CCV52592_1412 CCV52592_1413     TRUE 0.513 -39.000 0.000 NA   NA
 7007114 7007115 CCV52592_1414 CCV52592_1415     FALSE 0.016 769.000 0.000 1.000 N NA
 7007117 7007118 CCV52592_1417 CCV52592_1418     TRUE 0.882 11.000 0.012 NA   NA
 7007118 7007119 CCV52592_1418 CCV52592_1419     TRUE 0.753 28.000 0.047 NA   NA
 7007119 7007120 CCV52592_1419 CCV52592_1420   trmA TRUE 0.983 1.000 0.056 NA N NA
 7007120 7007121 CCV52592_1420 CCV52592_1421 trmA   TRUE 0.930 -3.000 0.008 NA   NA
 7007121 7007122 CCV52592_1421 CCV52592_1422   ilvA TRUE 0.924 -16.000 0.030 NA   NA
 7007122 7007123 CCV52592_1422 CCV52592_1423 ilvA   FALSE 0.069 127.000 0.000 NA   NA
 7007123 7007124 CCV52592_1423 CCV52592_1424     FALSE 0.047 164.000 0.000 NA   NA
 7007124 7007125 CCV52592_1424 CCV52592_1425     FALSE 0.039 189.000 0.000 NA   NA
 7007126 7007127 CCV52592_1426 CCV52592_1263 truA   TRUE 0.982 0.000 0.059 1.000   NA
 7007127 7007128 CCV52592_1263 CCV52592_1264     TRUE 0.966 -7.000 0.039 1.000   NA
 7007128 7007129 CCV52592_1264 CCV52592_1265   uppS TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007129 7007130 CCV52592_1265 CCV52592_1266 uppS   TRUE 0.808 2.000 0.000 NA   NA
 7007130 7007131 CCV52592_1266 CCV52592_1267   coaBC TRUE 0.966 -3.000 0.024 NA   NA
 7007131 7007132 CCV52592_1267 CCV52592_1268 coaBC glmU TRUE 0.936 -13.000 0.016 1.000 N NA
 7007133 7007134 CCV52592_1269 CCV52592_1270     TRUE 0.859 48.000 0.135 1.000 Y NA
 7007134 7007135 CCV52592_1270 CCV52592_1271   fliP TRUE 0.987 3.000 0.028 1.000 Y NA
 7007135 7007136 CCV52592_1271 CCV52592_1272 fliP   TRUE 0.978 0.000 0.008 1.000 Y NA
 7007136 7007137 CCV52592_1272 CCV52592_1273     TRUE 0.991 -3.000 0.069 1.000 Y NA
 7007137 7007138 CCV52592_1273 CCV52592_1274     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007138 7007139 CCV52592_1274 CCV52592_1275     TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7007139 7007140 CCV52592_1275 CCV52592_1276     TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000   NA
 7007140 7007141 CCV52592_1276 CCV52592_1277     FALSE 0.087 106.000 0.000 NA   NA
 11416773 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 49.000 0.000 NA   NA
 11559136 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 49.000 0.000 NA   NA
 11701528 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 49.000 0.000 NA   NA
 11416774 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 79.000 0.000 NA   NA
 11559137 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 79.000 0.000 NA   NA
 11701529 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 79.000 0.000 NA   NA
 11416775 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 116.000 0.000 NA   NA
 11559138 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 116.000 0.000 NA   NA
 11701530 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 116.000 0.000 NA   NA
 11416776 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 146.000 0.000 NA   NA
 11559139 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 146.000 0.000 NA   NA
 11701531 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 146.000 0.000 NA   NA
 11416777 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 182.000 0.000 NA   NA
 11559140 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 182.000 0.000 NA   NA
 11701532 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 182.000 0.000 NA   NA
 11416778 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 212.000 0.000 NA   NA
 11559141 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 212.000 0.000 NA   NA
 11701533 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 212.000 0.000 NA   NA
 11416779 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 249.000 0.000 NA   NA
 11559142 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 249.000 0.000 NA   NA
 11701534 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 249.000 0.000 NA   NA
 11416780 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 279.000 0.000 NA   NA
 11559143 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 279.000 0.000 NA   NA
 11701535 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 279.000 0.000 NA   NA
 11416781 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 315.000 0.000 NA   NA
 11559144 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 315.000 0.000 NA   NA
 11701536 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 315.000 0.000 NA   NA
 11416782 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 345.000 0.000 NA   NA
 11559145 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 345.000 0.000 NA   NA
 11701537 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 345.000 0.000 NA   NA
 11416783 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 381.000 0.000 NA   NA
 11559146 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 381.000 0.000 NA   NA
 11701538 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 381.000 0.000 NA   NA
 11416784 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 411.000 0.000 NA   NA
 11559147 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 411.000 0.000 NA   NA
 11701539 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 411.000 0.000 NA   NA
 11416785 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 447.000 0.000 NA   NA
 11559148 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 447.000 0.000 NA   NA
 11701540 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 447.000 0.000 NA   NA
 11416786 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 477.000 0.000 NA   NA
 11559149 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 477.000 0.000 NA   NA
 11701541 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 477.000 0.000 NA   NA
 11416787 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 514.000 0.000 NA   NA
 11559150 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 514.000 0.000 NA   NA
 11701542 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 514.000 0.000 NA   NA
 11416788 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 544.000 0.000 NA   NA
 11559151 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 544.000 0.000 NA   NA
 11701543 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 544.000 0.000 NA   NA
 11416789 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 580.000 0.000 NA   NA
 11559152 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 580.000 0.000 NA   NA
 11701544 7007141   CCV52592_1277     FALSE NA 580.000 0.000 NA   NA
 7007142 7007143 CCV52592_1278 CCV52592_1279     TRUE 0.654 92.000 0.043 1.000 N NA
 7007143 7007144 CCV52592_1279 CCV52592_1280     TRUE 0.990 -7.000 0.846 1.000 Y NA
 7007144 7007145 CCV52592_1280 CCV52592_1281     TRUE 0.983 0.000 0.273 NA   NA
 7007145 7007146 CCV52592_1281 CCV52592_1282     TRUE 0.565 65.000 0.029 NA   NA
 7007146 7007147 CCV52592_1282 CCV52592_2160     FALSE 0.087 106.000 0.000 NA   NA
 7007147 7007148 CCV52592_2160 CCV52592_1285     FALSE 0.008 505.000 0.000 NA   NA
 7007149 7007150 CCV52592_2161 CCV52592_1286     FALSE 0.010 404.000 0.000 NA   NA
 7007151 7007152 CCV52592_1287 CCV52592_1288 cas cas TRUE 0.990 9.000 0.600 NA Y NA
 7007152 7007153 CCV52592_1288 CCV52592_1289 cas   TRUE 0.990 0.000 0.081 NA Y NA
 7007153 7007154 CCV52592_1289 CCV52592_1290     TRUE 0.978 0.000 0.054 NA   NA
 7007154 7007155 CCV52592_1290 CCV52592_1291     TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7007155 7007156 CCV52592_1291 CCV52592_1292   csh TRUE 0.464 106.000 0.044 NA   NA
 7007156 7007157 CCV52592_1292 CCV52592_1293 csh   TRUE 0.973 -3.000 0.044 NA   NA
 7007157 7007158 CCV52592_1293 CCV52592_1294     FALSE 0.032 212.000 0.000 NA   NA
 7007159 7007160 CCV52592_1295 CCV52592_1296     TRUE 0.513 129.000 0.145 1.000   NA
 7007160 7007161 CCV52592_1296 CCV52592_2162     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 7007161 7007162 CCV52592_2162 CCV52592_2163     FALSE 0.364 21.000 0.000 NA   NA
 7007163 7007164 CCV52592_1299 CCV52592_1300     FALSE 0.020 273.000 0.000 NA   NA
 7007164 7007165 CCV52592_1300 CCV52592_1301     FALSE 0.433 17.000 0.000 NA   NA
 7007167 7007168 CCV52592_1303 CCV52592_1304     TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7007171 7007172 CCV52592_1307 CCV52592_1308     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7007172 7007173 CCV52592_1308 CCV52592_1309     FALSE 0.162 53.000 0.000 NA   NA
 7007173 7007174 CCV52592_1309 CCV52592_2164     FALSE 0.009 416.000 0.000 NA   NA
 7007176 7007177 CCV52592_0380 CCV52592_0381     FALSE 0.178 44.000 0.000 NA   NA
 7007177 7007178 CCV52592_0381 CCV52592_0382     FALSE 0.123 84.000 0.000 NA   NA
 7007178 7007179 CCV52592_0382 CCV52592_0383     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 7007179 7007180 CCV52592_0383 CCV52592_0384     TRUE 0.980 -3.000 0.148 NA   NA
 7007180 7007181 CCV52592_0384 CCV52592_0385     FALSE 0.131 72.000 0.000 NA   NA
 7007182 7007183 CCV52592_0386 CCV52592_0387     FALSE 0.060 138.000 0.000 NA   NA
 7007183 7007184 CCV52592_0387 CCV52592_0388     FALSE 0.041 181.000 0.000 NA   NA
 7007185 7007186 CCV52592_0389 CCV52592_0390     FALSE 0.019 370.000 0.000 NA N NA
 7007186 7007187 CCV52592_0390 CCV52592_0391     FALSE 0.324 122.000 0.000 0.044 Y NA
 7007187 7007188 CCV52592_0391 CCV52592_0392     TRUE 0.947 10.000 0.000 0.006 Y NA
 7007188 7007189 CCV52592_0392 CCV52592_0393     FALSE 0.235 163.000 0.000 0.044 Y NA
 7007189 7007190 CCV52592_0393 CCV52592_0394     TRUE 0.961 -3.000 0.000 0.044 Y NA
 7007190 7007191 CCV52592_0394 CCV52592_0395     FALSE 0.092 179.000 0.000 1.000 N NA
 7007191 7007192 CCV52592_0395 CCV52592_0397     FALSE 0.094 310.000 0.000 0.011 Y NA
 7007193 7007194 CCV52592_1134 CCV52592_1135   rseP TRUE 0.961 -3.000 0.021 NA   NA
 7007194 7007195 CCV52592_1135 CCV52592_1136 rseP pgsA TRUE 0.984 4.000 0.023 0.051 N NA
 7007195 7007196 CCV52592_1136 CCV52592_1137 pgsA   TRUE 0.982 -3.000 0.017 1.000 Y NA
 7007196 7007197 CCV52592_1137 CCV52592_1138   dapA TRUE 0.989 0.000 0.238 1.000 N NA
 7007197 7007198 CCV52592_1138 CCV52592_1139 dapA   TRUE 0.983 3.000 0.217 1.000   NA
 7007198 7007199 CCV52592_1139 CCV52592_1140   pyrD TRUE 0.953 11.000 0.048 1.000   NA
 7007199 7007200 CCV52592_1140 CCV52592_1141 pyrD   TRUE 0.633 52.000 0.017 1.000 N NA
 7007200 7007201 CCV52592_1141 CCV52592_1142   cysS TRUE 0.942 -15.000 0.013 0.083 N NA
 7007201 7007202 CCV52592_1142 CCV52592_1143 cysS mviN TRUE 0.941 -13.000 0.027 1.000   NA
 7007202 7007203 CCV52592_1143 CCV52592_1144 mviN   FALSE 0.217 54.000 0.000 1.000   NA
 7007203 7007204 CCV52592_1144 CCV52592_1145     FALSE 0.040 390.000 0.000 1.000 Y NA
 7007204 7007205 CCV52592_1145 CCV52592_1146     FALSE 0.443 198.000 0.286 1.000 N NA
 7007205 7007206 CCV52592_1146 CCV52592_1147     TRUE 0.985 10.000 0.429 0.005   NA
 7007207 7007208 CCV52592_1148 CCV52592_1149     FALSE 0.038 192.000 0.000 NA   NA
 7007208 7007209 CCV52592_1149 CCV52592_1150     FALSE 0.058 142.000 0.000 NA   NA
 7007209 7007210 CCV52592_1150 CCV52592_1151   ruvA TRUE 0.869 19.000 0.062 NA   NA
 7007210 7007211 CCV52592_1151 CCV52592_1152 ruvA ddl TRUE 0.926 12.000 0.009 0.083 N NA
 7007211 7007212 CCV52592_1152 CCV52592_1153 ddl   FALSE 0.436 78.000 0.018 NA   NA
 7007212 7007213 CCV52592_1153 CCV52592_1155     TRUE 0.952 -10.000 0.052 NA   NA
 7007213 7007214 CCV52592_1155 CCV52592_1156     TRUE 0.979 -3.000 0.129 NA   NA
 7007214 7007215 CCV52592_1156 CCV52592_1157     TRUE 0.866 0.000 0.000 1.000   NA
 7007216 7007217 CCV52592_1158 CCV52592_1159 ackA   TRUE 0.991 2.000 0.080 1.000 Y NA
 7007218 7007219 CCV52592_1427 CCV52592_1428 flgH ilvB FALSE 0.158 117.000 0.000 1.000 N NA
 7007219 7007220 CCV52592_1428 CCV52592_1429 ilvB ilvH TRUE 0.995 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 7007220 7007221 CCV52592_1429 CCV52592_1430 ilvH lpxD TRUE 0.985 2.000 0.052 1.000 N NA
 7007222 7007223 CCV52592_1431 CCV52592_1432   tgt TRUE 0.983 10.000 0.444 1.000 N NA
 7007224 7007225 CCV52592_1433 CCV52592_1434     TRUE 0.992 -3.000 0.912 NA Y NA
 7007225 7007226 CCV52592_1434 CCV52592_1435     TRUE 0.993 1.000 0.912 NA Y NA
 7007226 7007227 CCV52592_1435 CCV52592_1436     TRUE 0.979 -3.000 0.120 NA   NA
 7007227 7007228 CCV52592_1436 CCV52592_1437     FALSE 0.396 65.000 0.011 NA   NA
 7007228 7007229 CCV52592_1437 CCV52592_1438   aroB TRUE 0.664 50.000 0.031 1.000   NA
 7007229 7007230 CCV52592_1438 CCV52592_1066 aroB   TRUE 0.983 -3.000 0.041 1.000 N NA
 7007230 7007231 CCV52592_1066 CCV52592_1067     TRUE 0.985 -3.000 0.063 1.000 N NA
 7007231 7007232 CCV52592_1067 CCV52592_1068     TRUE 0.959 -19.000 0.067 1.000 N NA
 7007232 7007233 CCV52592_1068 CCV52592_1069     TRUE 0.971 -3.000 0.017 1.000 N NA
 7007234 7007235 CCV52592_1070 CCV52592_1071     TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7007235 7007236 CCV52592_1071 CCV52592_1072     FALSE 0.309 34.000 0.000 NA N NA
 7007236 7007237 CCV52592_1072 CCV52592_1073     FALSE 0.152 151.000 0.000 NA Y NA
 7007237 7007238 CCV52592_1073 CCV52592_1074     FALSE 0.075 249.000 0.000 NA Y NA
 7007238 7007239 CCV52592_1074 CCV52592_1075     TRUE 0.994 0.000 0.511 1.000 Y NA
 7007239 7007240 CCV52592_1075 CCV52592_1076   valS FALSE 0.254 184.000 0.007 0.083 N NA
 7007240 7007241 CCV52592_1076 CCV52592_1077 valS   FALSE 0.161 148.000 0.003 1.000   NA
 7007241 7007242 CCV52592_1077 CCV52592_1078   ppi TRUE 0.982 2.000 0.067 1.000   NA
 7007243 7007244 CCV52592_1079 CCV52592_1080     FALSE 0.031 217.000 0.000 NA   NA
 7007245 7007246 CCV52592_1081 CCV52592_1082     FALSE 0.376 20.000 0.000 NA   NA
 7007247 7007248 CCV52592_1083 CCV52592_1084 acpP   TRUE 0.522 72.000 0.012 1.000 N NA
 7007248 7007249 CCV52592_1084 CCV52592_1085     TRUE 0.991 -3.000 0.258 0.090 N NA
 7007249 7007250 CCV52592_1085 CCV52592_1086     TRUE 0.988 2.000 0.152 1.000 N NA
 7007250 7007251 CCV52592_1086 CCV52592_1087     FALSE 0.125 82.000 0.000 NA   NA
 7007252 7007253 CCV52592_1088 CCV52592_1089     TRUE 0.973 -3.000 0.027 1.000   NA
 7007253 7007254 CCV52592_1089 CCV52592_1090     TRUE 0.973 -3.000 0.027 1.000   NA
 7007254 7007255 CCV52592_1090 CCV52592_1091     TRUE 0.971 2.000 0.029 NA   NA
 7007256 7007257 CCV52592_1092 CCV52592_1093 murA   TRUE 0.980 2.000 0.024 1.000 N NA
 7007257 7007258 CCV52592_1093 CCV52592_2165     FALSE 0.178 44.000 0.000 NA   NA
 7007258 7007259 CCV52592_2165 CCV52592_1095   flgA FALSE 0.138 66.000 0.000 NA   NA
 7007259 7007260 CCV52592_1095 CCV52592_1096 flgA   TRUE 0.985 -3.000 0.191 NA N NA
 7007260 7007261 CCV52592_1096 CCV52592_1097   coaD TRUE 0.988 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 7007261 7007262 CCV52592_1097 CCV52592_1098 coaD tmk TRUE 0.983 2.000 0.034 1.000 N NA
 7007262 7007263 CCV52592_1098 CCV52592_1099 tmk hisS FALSE 0.106 97.000 0.000 NA   NA
 7007263 7007264 CCV52592_1099 CCV52592_1100 hisS speA TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7007264 7007265 CCV52592_1100 CCV52592_1864 speA yjgM FALSE 0.081 110.000 0.000 NA   NA
 7007265 7007266 CCV52592_1864 CCV52592_1865 yjgM thiS TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7007266 7007267 CCV52592_1865 CCV52592_1866 thiS thiF TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007267 7007268 CCV52592_1866 CCV52592_1867 thiF thiG FALSE 0.025 238.000 0.000 NA   NA
 7007268 7007269 CCV52592_1867 CCV52592_1868 thiG thiH TRUE 0.995 -3.000 0.277 0.006 Y NA
 7007269 7007270 CCV52592_1868 CCV52592_1869 thiH   TRUE 0.992 -7.000 0.128 0.006 Y NA
 7007270 7007271 CCV52592_1869 CCV52592_1870     TRUE 0.535 -28.000 0.000 NA   NA
 7007272 7007273 CCV52592_1871 CCV52592_1872     TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7007273 7007274 CCV52592_1872 CCV52592_1873     TRUE 0.995 -3.000 0.279 0.005 Y NA
 7007274 7007275 CCV52592_1873 CCV52592_1875     FALSE 0.020 271.000 0.000 NA   NA
 7007275 7007276 CCV52592_1875 CCV52592_1876     FALSE 0.032 216.000 0.000 NA   NA
 7007276 7007277 CCV52592_1876 CCV52592_1877   oorC TRUE 0.844 44.000 0.056 1.000 Y NA
 7007277 7007278 CCV52592_1877 CCV52592_1878 oorC oorB TRUE 0.995 -3.000 0.324 0.002 Y NA
 7007278 7007279 CCV52592_1878 CCV52592_1879 oorB oorA TRUE 0.992 -10.000 0.771 0.002 Y NA
 7007279 7007280 CCV52592_1879 CCV52592_1880 oorA oorD TRUE 0.986 -19.000 0.316 0.002 Y NA
 7007280 7007281 CCV52592_1880 CCV52592_1881 oorD sucD TRUE 0.986 10.000 0.097 1.000 Y NA
 7007281 7007282 CCV52592_1881 CCV52592_1882 sucD   TRUE 0.995 -3.000 0.169 0.002 Y NA
 7007282 7007283 CCV52592_1882 CCV52592_1883     TRUE 0.986 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 7007283 7007284 CCV52592_1883 CCV52592_1884     TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7007284 7007285 CCV52592_1884 CCV52592_1886     FALSE 0.043 176.000 0.000 NA   NA
 7007286 7007287 CCV52592_1887 CCV52592_1888     FALSE 0.461 16.000 0.000 NA   NA
 7007288 7007289 CCV52592_1889 CCV52592_1890 hypA hypE TRUE 0.866 0.000 0.000 1.000   NA
 7007289 7007290 CCV52592_1890 CCV52592_1891 hypE hypD TRUE 0.964 11.000 0.019 1.000 Y NA
 7007290 7007291 CCV52592_1891 CCV52592_1892 hypD hypC TRUE 0.977 -13.000 0.123 NA Y NA
 7007291 7007292 CCV52592_1892 CCV52592_1893 hypC hypB TRUE 0.992 0.000 0.463 NA Y NA
 7007292 7007293 CCV52592_1893 CCV52592_1894 hypB   FALSE 0.458 88.000 0.021 NA   NA
 7007293 7007294 CCV52592_1894 CCV52592_1895     TRUE 0.968 -10.000 0.589 NA   NA
 7007294 7007295 CCV52592_1895 CCV52592_1896   nhaA TRUE 0.634 -13.000 0.000 NA   NA
 7007295 7007296 CCV52592_1896 CCV52592_1897 nhaA   TRUE 0.664 16.000 0.000 1.000 N NA
 7007296 7007297 CCV52592_1897 CCV52592_1898   hypF TRUE 0.593 59.000 0.015 1.000 N NA
 7007297 7007298 CCV52592_1898 CCV52592_1899 hypF   TRUE 0.931 -16.000 0.043 NA   NA
 7007298 7007299 CCV52592_1899 CCV52592_1900     TRUE 0.982 -3.000 0.488 NA   NA
 7007299 7007300 CCV52592_1900 CCV52592_1901   cybH TRUE 0.992 4.000 0.277 1.000 Y NA
 7007300 7007301 CCV52592_1901 CCV52592_1902 cybH   TRUE 0.988 11.000 0.270 0.043 Y NA
 7007301 7007302 CCV52592_1902 CCV52592_1903     TRUE 0.991 11.000 0.951 0.002 Y NA
 7007302 7007303 CCV52592_1903 CCV52592_1904     FALSE 0.010 796.000 0.000 1.000   NA
 7007304 7007305 CCV52592_2006 CCV52592_2005   purC TRUE 0.964 11.000 0.045 1.000 N NA
 7007305 7007306 CCV52592_2005 CCV52592_2004 purC purS TRUE 0.992 9.000 0.460 1.000 Y NA
 7007306 7007307 CCV52592_2004 CCV52592_2003 purS purQ TRUE 0.996 -3.000 0.656 0.002 Y NA
 7007307 7007308 CCV52592_2003 CCV52592_2002 purQ   TRUE 0.754 -6.000 0.000 NA   NA
 7007308 7007309 CCV52592_2002 CCV52592_2001     TRUE 0.576 -19.000 0.000 NA   NA
 7007310 7007311 CCV52592_2000 CCV52592_1999     TRUE 0.786 23.000 0.000 0.002 Y NA
 7007311 7007312 CCV52592_1999 CCV52592_1998     TRUE 0.958 -10.000 0.083 NA   NA
 7007313 7007314 CCV52592_1997 CCV52592_1996     FALSE 0.015 382.000 0.000 1.000   NA
 7007314 7007315 CCV52592_1996 CCV52592_1995     TRUE 0.918 -3.000 0.000 0.006   NA
 7007315 7007316 CCV52592_1995 CCV52592_1994     FALSE 0.117 108.000 0.000 1.000   NA
 7007317 7007318 CCV52592_2166 CCV52592_1992   murI TRUE 0.802 5.000 0.000 NA   NA
 7007319 7007320 CCV52592_1991 CCV52592_1990     TRUE 0.683 58.000 0.024 1.000 N NA
 7007320 7007321 CCV52592_1990 CCV52592_1988   murG TRUE 0.987 -3.000 0.115 1.000 N NA
 7007322 7007323 CCV52592_1989 CCV52592_2167     FALSE 0.135 68.000 0.000 NA   NA
 7007327 7007328 CCV52592_1983 CCV52592_1982 rpoN   TRUE 0.977 4.000 0.044 1.000   NA
 7007328 7007329 CCV52592_1982 CCV52592_1981     TRUE 0.849 -10.000 0.003 NA   NA
 7007329 7007330 CCV52592_1981 CCV52592_1980     TRUE 0.916 -3.000 0.003 NA   NA
 7007330 7007331 CCV52592_1980 CCV52592_1979     FALSE 0.015 310.000 0.000 NA   NA
 7007331 7007332 CCV52592_1979 CCV52592_1978     TRUE 0.754 -6.000 0.000 NA   NA
 7007332 7007333 CCV52592_1978 CCV52592_1977     FALSE 0.367 45.000 0.000 0.012   NA
 7007334 7007335 CCV52592_1976 CCV52592_1975 argG rplI FALSE 0.458 90.000 0.009 1.000 N NA
 7007335 7007336 CCV52592_1975 CCV52592_1974 rplI hslV TRUE 0.984 1.000 0.034 1.000 N NA
 7007336 7007337 CCV52592_1974 CCV52592_1973 hslV hslU TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007337 7007338 CCV52592_1973 CCV52592_1972 hslU era TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007338 7007339 CCV52592_1972 CCV52592_1971 era   TRUE 0.593 59.000 0.029 NA   NA
 7007339 7007340 CCV52592_1971 CCV52592_1970     TRUE 0.981 -3.000 0.308 NA   NA
 7007340 7007341 CCV52592_1970 CCV52592_1969     TRUE 0.984 0.000 0.385 NA   NA
 7007341 7007342 CCV52592_1969 CCV52592_1968     TRUE 0.952 -22.000 0.250 1.000   NA
 7007342 7007343 CCV52592_1968 CCV52592_1967     TRUE 0.784 44.000 0.458 1.000   NA
 7007343 7007344 CCV52592_1967 CCV52592_1966     TRUE 0.794 -7.000 0.000 1.000   NA
 7007344 7007345 CCV52592_1966 CCV52592_1965     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007345 7007346 CCV52592_1965 CCV52592_1964     TRUE 0.982 0.000 0.188 NA   NA
 7007346 7007347 CCV52592_1964 CCV52592_1963     TRUE 0.993 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 7007347 7007348 CCV52592_1963 CCV52592_1962     TRUE 0.763 46.000 0.231 1.000   NA
 7007348 7007349 CCV52592_1962 CCV52592_1961     TRUE 0.991 2.000 0.667 0.011   NA
 7007350 7007351 CCV52592_1960 CCV52592_1959     FALSE 0.364 21.000 0.000 NA   NA
 7007351 7007352 CCV52592_1959 CCV52592_1958     FALSE 0.429 59.000 0.007 1.000   NA
 7007353 7007354 CCV52592_1957 CCV52592_1956     FALSE 0.102 136.000 0.000 NA N NA
 7007354 7007355 CCV52592_1956 CCV52592_1954     TRUE 0.802 5.000 0.000 NA   NA
 7007356 7007357 CCV52592_1955 CCV52592_1953 ybbB   TRUE 0.944 -13.000 0.030 1.000   NA
 7007357 7007358 CCV52592_1953 CCV52592_1952   trpC TRUE 0.979 3.000 0.026 1.000 N NA
 7007358 7007359 CCV52592_1952 CCV52592_1951 trpC   TRUE 0.978 -3.000 0.044 1.000   NA
 7007359 7007360 CCV52592_1951 CCV52592_1950     TRUE 0.940 -24.000 0.228 NA   NA
 7007360 7007361 CCV52592_1950 CCV52592_1949   murF TRUE 0.976 -3.000 0.064 NA   NA
 7007361 7007362 CCV52592_1949 CCV52592_1948 murF   TRUE 0.951 -3.000 0.016 NA   NA
 7007362 7007363 CCV52592_1948 CCV52592_1947     TRUE 0.968 4.000 0.028 NA   NA
 7007365 7007366 CCV52592_1945 CCV52592_2168     FALSE 0.171 47.000 0.000 NA   NA
 7007367 7007368 CCV52592_1944 CCV52592_0796 rarD rarD TRUE 0.956 -3.000 0.006 0.088   NA
 7007368 7007369 CCV52592_0796 CCV52592_0795 rarD rarD TRUE 0.978 -3.000 0.023 0.088   NA
 7007369 7007370 CCV52592_0795 CCV52592_0794 rarD   TRUE 0.941 -3.000 0.011 NA   NA
 7007371 7007372 CCV52592_0793 CCV52592_0792   gpsA TRUE 0.977 -3.000 0.011 0.006 N NA
 7007372 7007373 CCV52592_0792 CCV52592_0791 gpsA gatB TRUE 0.684 29.000 0.011 1.000 N NA
 7007373 7007374 CCV52592_0791 CCV52592_0790 gatB atpB FALSE 0.364 98.000 0.003 1.000 N NA
 7007374 7007375 CCV52592_0790 CCV52592_0789 atpB   FALSE 0.330 105.000 0.011 1.000   NA
 7007375 7007376 CCV52592_0789 CCV52592_0788   sodC FALSE 0.010 771.000 0.000 1.000   NA
 7007376 7007377 CCV52592_0788 CCV52592_0787 sodC   TRUE 0.516 55.000 0.014 1.000   NA
 7007377 7007378 CCV52592_0787 CCV52592_0786   flgK TRUE 0.983 0.000 0.084 1.000   NA
 7007378 7007379 CCV52592_0786 CCV52592_0785 flgK   TRUE 0.991 3.000 0.558 0.003   NA
 7007379 7007380 CCV52592_0785 CCV52592_0784     TRUE 0.960 16.000 0.677 0.003   NA
 7007380 7007381 CCV52592_0784 CCV52592_0783     TRUE 0.722 58.000 0.469 NA   NA
 7007381 7007382 CCV52592_0783 CCV52592_0782   flgI TRUE 0.985 0.000 0.569 NA   NA
 7007382 7007383 CCV52592_0782 CCV52592_0781 flgI   FALSE 0.119 253.000 0.012 NA N NA
 7007383 7007384 CCV52592_0781 CCV52592_0780     TRUE 0.970 -3.000 0.032 NA   NA
 7007385 7007386 CCV52592_0779 CCV52592_0778     TRUE 0.990 2.000 0.092 NA Y NA
 7007386 7007387 CCV52592_0778 CCV52592_0777   fliS TRUE 0.988 12.000 0.608 0.003 Y NA
 7007387 7007388 CCV52592_0777 CCV52592_0775 fliS   TRUE 0.959 -7.000 0.038 NA   NA
 7007389 7007390 CCV52592_2169 CCV52592_0774   truD FALSE 0.028 231.000 0.000 NA   NA
 7007390 7007391 CCV52592_0774 CCV52592_0773 truD thiL TRUE 0.912 -22.000 0.022 1.000   NA
 7007393 7007394 CCV52592_0771 CCV52592_0770     TRUE 0.798 7.000 0.000 NA   NA
 7007396 7007397 CCV52592_0768 CCV52592_0767   hemC TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007397 7007398 CCV52592_0767 CCV52592_0766 hemC   TRUE 0.955 -3.000 0.013 1.000   NA
 7007398 7007399 CCV52592_0766 CCV52592_0765   proS TRUE 0.961 -6.000 0.022 1.000   NA
 7007399 7007400 CCV52592_0765 CCV52592_0764 proS hemA TRUE 0.977 -10.000 0.040 0.043 N NA
 7007400 7007401 CCV52592_0764 CCV52592_0763 hemA   TRUE 0.991 0.000 0.051 1.000 Y NA
 7007401 7007402 CCV52592_0763 CCV52592_0762     TRUE 0.911 13.000 0.030 NA   NA
 7007402 7007403 CCV52592_0762 CCV52592_0761     TRUE 0.974 -7.000 0.514 NA   NA
 7007403 7007404 CCV52592_0761 CCV52592_0760     TRUE 0.650 69.000 0.143 NA   NA
 7007404 7007405 CCV52592_0760 CCV52592_0759     TRUE 0.982 -3.000 0.364 NA   NA
 7007407 7007408 CCV52592_0757 CCV52592_2170   yvfE FALSE 0.022 259.000 0.000 NA   NA
 7007408 7007409 CCV52592_2170 CCV52592_0810 yvfE   TRUE 0.962 -10.000 0.143 NA   NA
 7007409 7007410 CCV52592_0810 CCV52592_0808     TRUE 0.994 0.000 0.824 1.000 Y NA
 7007413 7007414 CCV52592_0805 CCV52592_1862     TRUE 0.989 5.000 0.282 1.000 N NA
 7007414 7007415 CCV52592_1862 CCV52592_1861     TRUE 0.981 5.000 0.028 1.000 N NA
 7007416 7007417 CCV52592_1860 CCV52592_1859   secA TRUE 0.656 132.000 0.201 0.087 N NA
 7007419 7007420 CCV52592_1857 CCV52592_1856     TRUE 0.984 1.000 0.529 NA   NA
 7007420 7007421 CCV52592_1856 CCV52592_1855     TRUE 0.979 4.000 0.120 NA   NA
 7007421 7007422 CCV52592_1855 CCV52592_1854     TRUE 0.966 -3.000 0.024 NA   NA
 7007422 7007423 CCV52592_1854 CCV52592_1853     TRUE 0.909 -7.000 0.010 NA   NA
 7007423 7007424 CCV52592_1853 CCV52592_1852     TRUE 0.936 -3.000 0.010 NA   NA
 7007424 7007425 CCV52592_1852 CCV52592_1851     TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7007427 7007428 CCV52592_1850 CCV52592_1848     TRUE 0.959 -9.000 0.061 NA   NA
 7007428 7007429 CCV52592_1848 CCV52592_1847   mraW TRUE 0.973 0.000 0.031 NA   NA
 7007430 7007431 CCV52592_1846 CCV52592_1845     FALSE 0.389 136.000 0.029 1.000   NA
 7007431 7007432 CCV52592_1845 CCV52592_1844   ftsA TRUE 0.984 6.000 0.184 1.000   NA
 7007432 7007433 CCV52592_1844 CCV52592_1843 ftsA ftsZ TRUE 0.967 15.000 0.114 1.000 Y NA
 7007433 7007434 CCV52592_1843 CCV52592_2171 ftsZ   FALSE 0.128 75.000 0.000 NA   NA
 7007435 7007436 CCV52592_1842 CCV52592_1841     TRUE 0.968 -10.000 0.667 NA   NA
 7007436 7007437 CCV52592_1841 CCV52592_1840     TRUE 0.980 9.000 0.500 NA   NA
 7007437 7007438 CCV52592_1840 CCV52592_1839     FALSE 0.123 85.000 0.000 NA   NA
 7007438 7007439 CCV52592_1839 CCV52592_1838   purH FALSE 0.222 145.000 0.002 1.000 N NA
 7007439 7007440 CCV52592_1838 CCV52592_1837 purH   FALSE 0.437 81.000 0.005 1.000 N NA
 7007440 7007441 CCV52592_1837 CCV52592_1836     TRUE 0.925 -6.000 0.011 NA   NA
 7007441 7007442 CCV52592_1836 CCV52592_1835   purL FALSE 0.414 18.000 0.000 NA   NA
 7007442 7007443 CCV52592_1835 CCV52592_1834 purL   FALSE 0.028 228.000 0.000 NA   NA
 7007443 7007444 CCV52592_1834 CCV52592_1833   trmE TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7007444 7007445 CCV52592_1833 CCV52592_1832 trmE   TRUE 0.927 -19.000 0.049 NA   NA
 7007445 7007446 CCV52592_1832 CCV52592_1831     TRUE 0.979 0.000 0.061 NA   NA
 7007446 7007447 CCV52592_1831 CCV52592_1830     TRUE 0.982 3.000 0.461 NA   NA
 7007447 7007448 CCV52592_1830 CCV52592_1829     TRUE 0.982 -3.000 0.540 NA   NA
 7007449 7007450 CCV52592_1828 CCV52592_1827     FALSE 0.058 180.000 0.000 1.000   NA
 7007450 7007451 CCV52592_1827 CCV52592_1826     TRUE 0.982 -3.000 0.323 NA   NA
 7007452 7007453 CCV52592_1825 CCV52592_1824     TRUE 0.967 -7.000 0.083 NA   NA
 7007453 7007454 CCV52592_1824 CCV52592_1823     TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7007454 7007455 CCV52592_1823 CCV52592_1822     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007455 7007456 CCV52592_1822 CCV52592_1821     TRUE 0.970 -3.000 0.033 NA   NA
 7007456 7007457 CCV52592_1821 CCV52592_1820     TRUE 0.973 -10.000 0.068 1.000 N NA
 7007457 7007458 CCV52592_1820 CCV52592_1819     TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7007458 7007459 CCV52592_1819 CCV52592_1818     TRUE 0.798 7.000 0.000 NA   NA
 7007460 7007461 CCV52592_1817 CCV52592_2172     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007462 7007463 CCV52592_0075 CCV52592_0076     FALSE 0.211 33.000 0.000 NA   NA
 7007463 7007464 CCV52592_0076 CCV52592_0077     TRUE 0.815 1.000 0.000 NA   NA
 7007465 7007466 CCV52592_0078 CCV52592_0079     TRUE 0.980 1.000 0.085 NA   NA
 7007466 7007467 CCV52592_0079 CCV52592_0080     FALSE 0.125 82.000 0.000 NA   NA
 7007468 7007469 CCV52592_0081 CCV52592_0082     TRUE 0.554 94.000 0.057 NA   NA
 7007469 7007470 CCV52592_0082 CCV52592_0083     FALSE 0.011 371.000 0.000 NA   NA
 7007472 7007473 CCV52592_0084 CCV52592_0085 dfp   TRUE 0.975 3.000 0.025 NA N NA
 7007473 7007474 CCV52592_0085 CCV52592_0086     TRUE 0.954 -3.000 0.018 NA   NA
 7007475 7007476 CCV52592_0286 CCV52592_0287     TRUE 0.570 98.000 0.024 1.000 N NA
 7007476 7007477 CCV52592_0287 CCV52592_0288     TRUE 0.989 -13.000 0.841 0.010 Y NA
 7007477 7007478 CCV52592_0288 CCV52592_0289     TRUE 0.989 10.000 0.773 1.000 Y NA
 7007478 7007479 CCV52592_0289 CCV52592_0290   acrB TRUE 0.775 106.000 0.671 1.000 Y NA
 7007482 7007483 CCV52592_0293 CCV52592_0294     TRUE 0.988 -3.000 0.034 1.000 Y NA
 7007483 7007484 CCV52592_0294 CCV52592_0295     TRUE 0.547 61.000 0.000 0.013 Y NA
 7007484 7007485 CCV52592_0295 CCV52592_0296     TRUE 0.889 -25.000 0.000 0.013 Y NA
 7007485 7007486 CCV52592_0296 CCV52592_0297     TRUE 0.948 -7.000 0.000 0.013 Y NA
 7007486 7007487 CCV52592_0297 CCV52592_0298     FALSE 0.174 45.000 0.000 NA   NA
 7007487 7007488 CCV52592_0298 CCV52592_0299   metW TRUE 0.794 3.000 0.000 NA   NA
 7007488 7007489 CCV52592_0299 CCV52592_0300 metW   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007489 7007490 CCV52592_0300 CCV52592_0301     FALSE 0.291 25.000 0.000 NA   NA
 7007490 7007491 CCV52592_0301 CCV52592_0302     TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7007491 7007492 CCV52592_0302 CCV52592_0303     TRUE 0.858 2.000 0.000 1.000   NA
 7007492 7007493 CCV52592_0303 CCV52592_0304   rfbB TRUE 0.942 3.000 0.000 1.000 Y NA
 7007493 7007494 CCV52592_0304 CCV52592_0305 rfbB rfbA FALSE 0.052 550.000 0.000 0.003 Y NA
 7007494 7007495 CCV52592_0305 CCV52592_0306 rfbA   FALSE 0.382 33.000 0.000 1.000 N NA
 7007495 7007496 CCV52592_0306 CCV52592_0308   groEL FALSE 0.309 119.000 0.007 1.000 N NA
 7007496 7007497 CCV52592_0308 CCV52592_0309 groEL groES TRUE 0.729 24.000 0.000 0.079 Y NA
 7007498 7007499 CCV52592_0310 CCV52592_0311     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007499 7007500 CCV52592_0311 CCV52592_0312     FALSE 0.172 46.000 0.000 NA   NA
 7007500 7007501 CCV52592_0312 CCV52592_0313     TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7007501 7007502 CCV52592_0313 CCV52592_0314     TRUE 0.642 11.000 0.000 NA   NA
 7007502 7007503 CCV52592_0314 CCV52592_0315     TRUE 0.797 4.000 0.000 NA   NA
 7007503 7007504 CCV52592_0315 CCV52592_0316     FALSE 0.054 146.000 0.000 NA   NA
 7007506 7007507 CCV52592_0318 CCV52592_0319     TRUE 0.985 0.000 0.714 NA   NA
 7007507 7007508 CCV52592_0319 CCV52592_0320     TRUE 0.981 -3.000 0.316 NA   NA
 7007508 7007509 CCV52592_0320 CCV52592_0321   priA TRUE 0.959 3.000 0.016 1.000   NA
 7007509 7007510 CCV52592_0321 CCV52592_0322 priA ispG FALSE 0.040 540.000 0.006 1.000 N NA
 7007510 7007511 CCV52592_0322 CCV52592_0323 ispG   FALSE 0.204 61.000 0.000 1.000   NA
 7007511 7007512 CCV52592_0323 CCV52592_0324   dnaB FALSE 0.394 19.000 0.000 NA   NA
 7007512 7007513 CCV52592_0324 CCV52592_0325 dnaB   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007514 7007515 CCV52592_0326 CCV52592_0327     TRUE 0.848 3.000 0.000 1.000   NA
 7007515 7007516 CCV52592_0327 CCV52592_0328     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007516 7007517 CCV52592_0328 CCV52592_2174     FALSE 0.166 50.000 0.000 NA   NA
 7007517 7007518 CCV52592_2174 CCV52592_2175     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007519 7007520 CCV52592_0732 CCV52592_0731   mgtE TRUE 0.936 15.000 0.042 1.000 N NA
 7007520 7007521 CCV52592_0731 CCV52592_0730 mgtE   TRUE 0.944 -15.000 0.036 1.000   NA
 7007521 7007522 CCV52592_0730 CCV52592_0729     FALSE 0.052 148.000 0.000 NA   NA
 7007522 7007523 CCV52592_0729 CCV52592_0728     FALSE 0.291 25.000 0.000 NA   NA
 7007523 7007524 CCV52592_0728 CCV52592_0727   ppk FALSE 0.028 227.000 0.000 NA   NA
 7007525 7007526 CCV52592_0726 CCV52592_0725 nikD rpe TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007526 7007527 CCV52592_0725 CCV52592_0724 rpe   TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7007527 7007528 CCV52592_0724 CCV52592_0723     TRUE 0.982 -3.000 0.333 NA   NA
 7007529 7007530 CCV52592_0722 CCV52592_0721 rpmB   FALSE 0.414 145.000 0.025 1.000 N NA
 7007530 7007531 CCV52592_0721 CCV52592_0720   argJ TRUE 0.962 -7.000 0.019 1.000 N NA
 7007531 7007532 CCV52592_0720 CCV52592_0719 argJ   TRUE 0.465 56.000 0.015 NA   NA
 7007533 7007534 CCV52592_0718 CCV52592_0717 cysE cysK TRUE 0.995 6.000 0.101 0.001 Y NA
 7007534 7007535 CCV52592_0717 CCV52592_0716 cysK   TRUE 0.896 13.000 0.010 1.000 N NA
 7007535 7007536 CCV52592_0716 CCV52592_0715     TRUE 0.955 -3.000 0.018 NA   NA
 7007536 7007537 CCV52592_0715 CCV52592_0714   mfd TRUE 0.925 -3.000 0.006 NA   NA
 7007537 7007538 CCV52592_0714 CCV52592_0713 mfd   TRUE 0.918 -19.000 0.007 0.078 N NA
 7007538 7007539 CCV52592_0713 CCV52592_0712     TRUE 0.959 13.000 0.104 1.000 N NA
 7007539 7007540 CCV52592_0712 CCV52592_0711     TRUE 0.950 -19.000 0.455 NA   NA
 7007540 7007541 CCV52592_0711 CCV52592_0710   leuS TRUE 0.970 4.000 0.031 NA   NA
 7007541 7007542 CCV52592_0710 CCV52592_0709 leuS   TRUE 0.955 9.000 0.021 NA   NA
 7007542 7007543 CCV52592_0709 CCV52592_0708   secF TRUE 0.974 10.000 0.667 NA   NA
 7007543 7007544 CCV52592_0708 CCV52592_0707 secF secD TRUE 0.995 3.000 0.436 0.001 Y NA
 7007544 7007545 CCV52592_0707 CCV52592_0706 secD yajC TRUE 0.988 8.000 0.068 NA Y NA
 7007547 7007548 CCV52592_0704 CCV52592_0703   metK TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007549 7007550 CCV52592_0702 CCV52592_0701     TRUE 0.706 90.000 0.023 1.000 Y NA
 7007550 7007551 CCV52592_0701 CCV52592_0700     TRUE 0.979 -3.000 0.115 NA   NA
 7007551 7007552 CCV52592_0700 CCV52592_0699     TRUE 0.566 62.000 0.026 NA   NA
 7007552 7007553 CCV52592_0699 CCV52592_0698   truB TRUE 0.983 -3.000 0.046 1.000 N NA
 7007553 7007554 CCV52592_0698 CCV52592_0697 truB csrA TRUE 0.985 -6.000 0.046 0.019 N NA
 7007554 7007555 CCV52592_0697 CCV52592_0696 csrA ispE TRUE 0.982 -3.000 0.036 1.000 N NA
 7007555 7007556 CCV52592_0696 CCV52592_0695 ispE smpB TRUE 0.981 -3.000 0.028 1.000 N NA
 7007556 7007557 CCV52592_0695 CCV52592_0694 smpB   TRUE 0.892 11.000 0.009 1.000   NA
 7007557 7007558 CCV52592_0694 CCV52592_0693   flgB FALSE 0.404 63.000 0.007 1.000   NA
 7007558 7007559 CCV52592_0693 CCV52592_0692 flgB flgC TRUE 0.992 9.000 0.804 1.000 Y NA
 7007559 7007560 CCV52592_0692 CCV52592_0691 flgC fliE TRUE 0.995 -3.000 0.271 0.005 Y NA
 7007560 7007561 CCV52592_0691 CCV52592_0690 fliE   TRUE 0.988 7.000 0.303 1.000 N NA
 7007562 7007563 CCV52592_0689 CCV52592_0688 ompR hemH FALSE 0.187 40.000 0.000 NA   NA
 7007563 7007564 CCV52592_0688 CCV52592_0687 hemH   TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007565 7007566 CCV52592_0686 CCV52592_0685 alaS   TRUE 0.931 -7.000 0.011 1.000   NA
 7007566 7007567 CCV52592_0685 CCV52592_0684     TRUE 0.972 0.000 0.028 NA   NA
 7007567 7007568 CCV52592_0684 CCV52592_0683     TRUE 0.975 -3.000 0.026 NA N NA
 7007568 7007569 CCV52592_0683 CCV52592_0682     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7007570 7007571 CCV52592_0681 CCV52592_0680   rplS FALSE 0.138 144.000 0.003 NA   NA
 7007571 7007572 CCV52592_0680 CCV52592_0679 rplS trmD TRUE 0.987 -10.000 0.567 1.000 Y NA
 7007572 7007573 CCV52592_0679 CCV52592_0678 trmD rimM TRUE 0.993 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 7007573 7007574 CCV52592_0678 CCV52592_0677 rimM   TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7007574 7007575 CCV52592_0677 CCV52592_0676   rpsP TRUE 0.802 5.000 0.000 NA   NA
 7007575 7007576 CCV52592_0676 CCV52592_0675 rpsP ffh TRUE 0.696 101.000 0.361 1.000 N NA
 7007576 7007577 CCV52592_0675 CCV52592_0674 ffh   TRUE 0.555 65.000 0.013 1.000 N NA
 7007577 7007578 CCV52592_0674 CCV52592_0673     TRUE 0.981 -7.000 0.133 1.000 N NA
 7007578 7007579 CCV52592_0673 CCV52592_0672     TRUE 0.980 9.000 0.122 1.000   NA
 7007579 7007580 CCV52592_0672 CCV52592_0285     TRUE 0.940 14.000 0.342 NA   NA
 7007580 7007581 CCV52592_0285 CCV52592_0284   glyQ TRUE 0.972 7.000 0.041 NA   NA
 7007581 7007582 CCV52592_0284 CCV52592_0283 glyQ   TRUE 0.701 16.000 0.003 NA   NA
 7007582 7007583 CCV52592_0283 CCV52592_0282     TRUE 0.967 6.000 0.026 NA   NA
 7007583 7007584 CCV52592_0282 CCV52592_0281   purE TRUE 0.936 10.000 0.019 NA   NA
 7007584 7007585 CCV52592_0281 CCV52592_0280 purE   TRUE 0.973 -3.000 0.018 1.000 N NA
 7007585 7007586 CCV52592_0280 CCV52592_0279     TRUE 0.977 -3.000 0.068 NA   NA
 7007586 7007587 CCV52592_0279 CCV52592_0278     FALSE 0.131 72.000 0.000 NA   NA
 7007588 7007589 CCV52592_0277 CCV52592_0276   glnA TRUE 0.653 89.000 0.017 1.000 Y NA
 7007589 7007590 CCV52592_0276 CCV52592_0275 glnA   FALSE 0.055 241.000 0.000 1.000 N NA
 7007592 7007593 CCV52592_0273 CCV52592_0272     FALSE 0.021 267.000 0.000 NA   NA
 7007593 7007594 CCV52592_0272 CCV52592_0271     FALSE 0.074 118.000 0.000 NA   NA
 7007594 7007595 CCV52592_0271 CCV52592_0270     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7007596 7007597 CCV52592_0269 CCV52592_0268     TRUE 0.965 -10.000 0.054 NA N NA
 7007598 7007599 CCV52592_0267 CCV52592_0266     TRUE 0.975 -7.000 0.713 NA   NA
 7007600 7007601 CCV52592_0265 CCV52592_0264     FALSE 0.123 85.000 0.000 NA   NA
 7007604 7007605 CCV52592_0261 CCV52592_0260   miaB TRUE 0.663 39.000 0.033 NA   NA
 7007605 7007606 CCV52592_0260 CCV52592_0259 miaB   TRUE 0.915 -19.000 0.029 NA   NA
 7007606 7007607 CCV52592_0259 CCV52592_0258     TRUE 0.974 -3.000 0.051 NA   NA
 7007607 7007608 CCV52592_0258 CCV52592_0257     TRUE 0.648 62.000 0.069 NA   NA
 7007608 7007609 CCV52592_0257 CCV52592_0256     TRUE 0.983 -3.000 1.000 NA   NA
 7007609 7007610 CCV52592_0256 CCV52592_0254     TRUE 0.974 -7.000 0.448 NA   NA
 7007611 7007612 CCV52592_0255 CCV52592_0253     TRUE 0.946 11.000 0.019 1.000 N NA
 7007612 7007613 CCV52592_0253 CCV52592_0252   panC TRUE 0.963 2.000 0.008 1.000 N NA
 7007616 7007617 CCV52592_0249 CCV52592_0248     TRUE 0.977 9.000 0.143 NA   NA
 7007617 7007618 CCV52592_0248 CCV52592_0247     TRUE 0.975 10.000 0.200 1.000   NA
 7007618 7007619 CCV52592_0247 CCV52592_0246     TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7007620 7007621 CCV52592_0245 CCV52592_0244 gmhA   TRUE 0.964 -13.000 0.050 1.000 N NA
 7007621 7007622 CCV52592_0244 CCV52592_0243   rfaD TRUE 0.987 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 7007622 7007623 CCV52592_0243 CCV52592_0242 rfaD   TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007625 7007626 CCV52592_2176 CCV52592_2177     TRUE 0.802 5.000 0.000 NA   NA
 7007626 7007627 CCV52592_2177 CCV52592_2178     FALSE 0.163 52.000 0.000 NA   NA
 7007627 7007628 CCV52592_2178 CCV52592_2179     TRUE 0.798 7.000 0.000 NA   NA
 7007628 7007629 CCV52592_2179 CCV52592_2180     FALSE 0.394 19.000 0.000 NA   NA
 7007629 7007630 CCV52592_2180 CCV52592_2181     TRUE 0.500 15.000 0.000 NA   NA
 7007630 7007631 CCV52592_2181 CCV52592_2182     TRUE 0.794 3.000 0.000 NA   NA
 7007631 7007632 CCV52592_2182 CCV52592_2183     TRUE 0.798 7.000 0.000 NA   NA
 7007632 7007633 CCV52592_2183 CCV52592_2184     FALSE 0.394 19.000 0.000 NA   NA
 7007633 7007634 CCV52592_2184 CCV52592_2185     TRUE 0.500 15.000 0.000 NA   NA
 7007634 7007635 CCV52592_2185 CCV52592_0230     FALSE 0.023 252.000 0.000 NA   NA
 7007635 7007636 CCV52592_0230 CCV52592_2186   rrf FALSE 0.026 236.000 0.000 NA   NA
 7007636 7007637 CCV52592_2186 CCV52592_r03 rrf   FALSE 0.009 437.000 0.000 NA   NA
 7007637 7007638 CCV52592_r03 CCV52592_2187     FALSE 0.010 384.000 0.000 NA   NA
 7007638 7007639 CCV52592_2187 CCV52592_2188     FALSE 0.017 289.000 0.000 NA   NA
 7007639 7007640 CCV52592_2188 CCV52592_r04     FALSE 0.018 285.000 0.000 NA   NA
 7007640 7007641 CCV52592_r04 CCV52592_0224     FALSE 0.008 476.000 0.000 NA   NA
 7007641 7007642 CCV52592_0224 CCV52592_0223     TRUE 0.981 6.000 0.237 NA   NA
 7007642 7007643 CCV52592_0223 CCV52592_0222     TRUE 0.915 10.000 0.012 NA   NA
 7007643 7007644 CCV52592_0222 CCV52592_0221     TRUE 0.967 10.000 0.048 1.000   NA
 7007644 7007645 CCV52592_0221 CCV52592_0220     TRUE 0.979 -3.000 0.053 1.000   NA
 7007646 7007647 CCV52592_0219 CCV52592_0218   glmS TRUE 0.989 5.000 0.312 1.000 N NA
 7007647 7007648 CCV52592_0218 CCV52592_0217 glmS   TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7007651 7007652 CCV52592_0214 CCV52592_0213     TRUE 0.955 10.000 0.033 NA   NA
 7007655 7007656 CCV52592_0210 CCV52592_0209     FALSE 0.177 73.000 0.000 1.000   NA
 7007656 7007657 CCV52592_0209 CCV52592_0208     FALSE 0.349 26.000 0.000 1.000   NA
 7007657 7007658 CCV52592_0208 CCV52592_0207     TRUE 0.765 -22.000 0.000 0.022   NA
 7007658 7007659 CCV52592_0207 CCV52592_0206     TRUE 0.523 17.000 0.000 1.000   NA
 7007659 7007660 CCV52592_0206 CCV52592_0205     FALSE 0.169 48.000 0.000 NA   NA
 7007661 7007662 CCV52592_0204 CCV52592_0203 mrp thiC TRUE 0.676 -10.000 0.000 NA   NA
 7007663 7007664 CCV52592_0202 CCV52592_0201 ispDF czcD TRUE 0.967 0.000 0.010 1.000 N NA
 7007664 7007665 CCV52592_0201 CCV52592_0200 czcD   TRUE 0.930 -22.000 0.021 1.000 N NA
 7007665 7007666 CCV52592_0200 CCV52592_0199   pgpA TRUE 0.982 9.000 0.052 1.000 N NA
 7007667 7007668 CCV52592_0198 CCV52592_0197     TRUE 0.798 7.000 0.000 NA   NA
 7007668 7007669 CCV52592_0197 CCV52592_0196     TRUE 0.791 32.000 0.100 1.000   NA
 7007669 7007670 CCV52592_0196 CCV52592_0195     TRUE 0.596 97.000 0.188 NA   NA
 7007670 7007671 CCV52592_0195 CCV52592_0194     FALSE 0.016 293.000 0.000 NA   NA
 7007671 7007672 CCV52592_0194 CCV52592_0193     FALSE 0.403 145.000 0.108 NA   NA
 7007672 7007673 CCV52592_0193 CCV52592_0192     TRUE 0.642 11.000 0.000 NA   NA
 7007673 7007674 CCV52592_0192 CCV52592_0191     TRUE 0.510 -43.000 0.000 NA   NA
 7007674 7007675 CCV52592_0191 CCV52592_2189     FALSE 0.008 502.000 0.000 NA   NA
 7007677 7007678 CCV52592_0189 CCV52592_0187 fusA rpsG TRUE 0.978 13.000 0.579 1.000 Y NA
 7007678 7007679 CCV52592_0187 CCV52592_0186 rpsG rpsL TRUE 0.890 76.000 0.620 0.004 Y NA
 7007679 7007680 CCV52592_0186 CCV52592_0185 rpsL iadA FALSE 0.165 112.000 0.000 1.000 N NA
 7007680 7007681 CCV52592_0185 CCV52592_0184 iadA nhaC TRUE 0.986 0.000 0.050 1.000 N NA
 7007681 7007682 CCV52592_0184 CCV52592_0183 nhaC   TRUE 0.496 125.000 0.250 NA   NA
 7007682 7007683 CCV52592_0183 CCV52592_0182   rpoC FALSE 0.122 86.000 0.000 NA   NA
 7007683 7007684 CCV52592_0182 CCV52592_0180 rpoC rplL FALSE 0.014 334.000 0.000 NA   NA
 7007684 7007685 CCV52592_0180 CCV52592_0179 rplL rplJ TRUE 0.968 21.000 0.884 0.019 Y NA
 7007685 7007686 CCV52592_0179 CCV52592_0178 rplJ rplA TRUE 0.821 105.000 0.302 0.024 Y NA
 7007686 7007687 CCV52592_0178 CCV52592_0177 rplA rplK TRUE 0.899 62.000 0.838 0.024 Y NA
 7007687 7007688 CCV52592_0177 CCV52592_0176 rplK nusG TRUE 0.971 12.000 0.681 1.000 N NA
 7007688 7007689 CCV52592_0176 CCV52592_0175 nusG secE TRUE 0.962 12.000 0.843 1.000   NA
 7007689 7007690 CCV52592_0175 CCV52592_2190 secE   TRUE 0.537 14.000 0.000 NA   NA
 7007690 7007691 CCV52592_2190 CCV52592_0173   tuf FALSE 0.029 225.000 0.000 NA   NA
 7007691 7007692 CCV52592_0173 CCV52592_2191 tuf   FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 7007692 7007693 CCV52592_2191 CCV52592_2192     FALSE 0.069 128.000 0.000 NA   NA
 7007693 7007694 CCV52592_2192 CCV52592_2193     TRUE 0.793 8.000 0.000 NA   NA
 7007694 7007695 CCV52592_2193 CCV52592_2194     FALSE 0.161 54.000 0.000 NA   NA
 7007697 7007698 CCV52592_0168 CCV52592_0166     TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7007698 7007699 CCV52592_0166 CCV52592_0165     FALSE 0.461 16.000 0.000 NA   NA
 7007699 7007700 CCV52592_0165 CCV52592_0164     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007700 7007701 CCV52592_0164 CCV52592_0163     TRUE 0.992 3.000 0.447 0.046 N NA
 7007701 7007702 CCV52592_0163 CCV52592_0162   nfo TRUE 0.988 4.000 0.234 1.000 N NA
 7007702 7007703 CCV52592_0162 CCV52592_0161 nfo   TRUE 0.980 -3.000 0.152 NA   NA
 7007703 7007704 CCV52592_0161 CCV52592_0160   fadD TRUE 0.979 9.000 0.333 NA   NA
 7007704 7007705 CCV52592_0160 CCV52592_0159 fadD hemN TRUE 0.554 108.000 0.032 1.000 N NA
 7007705 7007706 CCV52592_0159 CCV52592_0158 hemN   TRUE 0.974 -7.000 0.419 NA   NA
 7007706 7007707 CCV52592_0158 CCV52592_0157   argF TRUE 0.927 -13.000 0.025 NA   NA
 7007707 7007708 CCV52592_0157 CCV52592_1348 argF hemB TRUE 0.787 26.000 0.020 1.000 N NA
 7007709 7007710 CCV52592_1346 CCV52592_1345 ribA gidB TRUE 0.958 -7.000 0.017 1.000 N NA
 7007710 7007711 CCV52592_1345 CCV52592_1344 gidB   TRUE 0.908 -7.000 0.009 NA   NA
 7007711 7007712 CCV52592_1344 CCV52592_1343     TRUE 0.969 -9.000 0.281 NA   NA
 7007712 7007713 CCV52592_1343 CCV52592_1342     TRUE 0.870 -13.000 0.010 NA   NA
 7007713 7007714 CCV52592_1342 CCV52592_1340     FALSE 0.036 196.000 0.000 NA   NA
 7007715 7007716 CCV52592_1341 CCV52592_1339     FALSE 0.414 18.000 0.000 NA   NA
 7007716 7007717 CCV52592_1339 CCV52592_1338   alr FALSE 0.200 62.000 0.000 1.000   NA
 7007717 7007718 CCV52592_1338 CCV52592_2195 alr   TRUE 0.969 -7.000 0.119 NA   NA
 7007718 7007719 CCV52592_2195 CCV52592_0922     TRUE 0.974 3.000 0.052 NA   NA
 7007720 7007721 CCV52592_0923 CCV52592_0924 terC   TRUE 0.972 0.000 0.028 NA   NA
 7007721 7007722 CCV52592_0924 CCV52592_1941     TRUE 0.951 11.000 0.077 NA   NA
 7007722 7007723 CCV52592_1941 CCV52592_1940     FALSE 0.195 38.000 0.000 NA   NA
 7007723 7007724 CCV52592_1940 CCV52592_1939     FALSE 0.241 59.000 0.000 NA N NA
 7007725 7007726 CCV52592_1938 CCV52592_1937     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007726 7007727 CCV52592_1937 CCV52592_1935     FALSE 0.187 40.000 0.000 NA   NA
 7007727 7007728 CCV52592_1935 CCV52592_1934     FALSE 0.071 124.000 0.000 NA   NA
 7007728 7007729 CCV52592_1934 CCV52592_1933     TRUE 0.975 -3.000 0.056 NA   NA
 7007729 7007730 CCV52592_1933 CCV52592_1932     TRUE 0.971 -3.000 0.035 NA   NA
 7007730 7007731 CCV52592_1932 CCV52592_1931   napB TRUE 0.980 -3.000 0.174 NA   NA
 7007731 7007732 CCV52592_1931 CCV52592_1930 napB   TRUE 0.991 -3.000 0.385 NA Y NA
 7007732 7007733 CCV52592_1930 CCV52592_1929   napG TRUE 0.991 0.000 0.795 0.039   NA
 7007733 7007734 CCV52592_1929 CCV52592_1928 napG napA TRUE 0.988 3.000 0.270 0.039   NA
 7007736 7007737 CCV52592_2196 CCV52592_1924 ssrA   FALSE 0.195 38.000 0.000 NA   NA
 7007738 7007739 CCV52592_1923 CCV52592_1922 panB ruvB FALSE 0.167 303.000 0.027 1.000 N NA
 7007739 7007740 CCV52592_1922 CCV52592_1921 ruvB   TRUE 0.923 -10.000 0.019 NA   NA
 7007740 7007741 CCV52592_1921 CCV52592_1920     TRUE 0.616 23.000 0.007 NA   NA
 7007741 7007742 CCV52592_1920 CCV52592_1919     TRUE 0.909 -6.000 0.007 NA   NA
 7007743 7007744 CCV52592_1918 CCV52592_1917     TRUE 0.982 -16.000 0.857 1.000 Y NA
 7007744 7007745 CCV52592_1917 CCV52592_1916     TRUE 0.987 4.000 0.833 NA N NA
 7007745 7007746 CCV52592_1916 CCV52592_1915     TRUE 0.981 -7.000 1.000 NA N NA
 7007746 7007747 CCV52592_1915 CCV52592_1914     TRUE 0.982 11.000 0.667 NA Y NA
 7007749 7007750 CCV52592_1912 CCV52592_2124 yitK   TRUE 0.479 143.000 0.195 1.000   NA
 7007750 7007751 CCV52592_2124 CCV52592_2125     FALSE 0.022 259.000 0.000 NA   NA
 7007751 7007752 CCV52592_2125 CCV52592_2198     FALSE 0.349 22.000 0.000 NA   NA
 7007752 7007753 CCV52592_2198 CCV52592_2199     FALSE 0.013 348.000 0.000 NA   NA
 7007753 7007754 CCV52592_2199 CCV52592_2200   pgi TRUE 0.715 16.000 0.005 NA   NA
 7007754 7007755 CCV52592_2200 CCV52592_2201 pgi galU TRUE 0.952 -13.000 0.023 1.000 N NA
 7007756 7007757 CCV52592_2202 CCV52592_2203   lgt FALSE 0.387 40.000 0.003 NA   NA
 7007757 7007758 CCV52592_2203 CCV52592_2204 lgt   FALSE 0.430 83.000 0.005 1.000 N NA
 7007758 7007759 CCV52592_2204 CCV52592_2205     TRUE 0.943 23.000 0.034 0.005 Y NA
 7007759 7007760 CCV52592_2205 CCV52592_2206   frdB TRUE 0.992 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 7007762 7007763 CCV52592_2208 CCV52592_2209     TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7007763 7007764 CCV52592_2209 CCV52592_2210     TRUE 0.523 17.000 0.000 1.000   NA
 7007764 7007765 CCV52592_2210 CCV52592_2211   rpsO FALSE 0.255 27.000 0.000 NA   NA
 7007766 7007767 CCV52592_2212 CCV52592_2213     FALSE 0.072 122.000 0.000 NA   NA
 7007769 7007770 CCV52592_2215 CCV52592_2216     TRUE 0.976 3.000 0.065 NA   NA
 7007770 7007771 CCV52592_2216 CCV52592_2217     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007771 7007772 CCV52592_2217 CCV52592_2218     TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007772 7007773 CCV52592_2218 CCV52592_2219     TRUE 0.728 14.000 0.000 1.000 N NA
 7007773 7007774 CCV52592_2219 CCV52592_0932     TRUE 0.903 7.000 0.000 0.080   NA
 7007775 7007776 CCV52592_0931 CCV52592_0930     FALSE 0.068 221.000 0.000 1.000 N NA
 7007776 7007777 CCV52592_0930 CCV52592_0929     FALSE 0.102 98.000 0.000 NA   NA
 7007777 7007778 CCV52592_0929 CCV52592_0928   holB FALSE 0.066 131.000 0.000 NA   NA
 7007778 7007779 CCV52592_0928 CCV52592_0927 holB   FALSE 0.035 203.000 0.000 NA   NA
 7007780 7007781 CCV52592_0926 CCV52592_2220     TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7007782 7007783 CCV52592_0371 CCV52592_0372     TRUE 0.517 31.000 0.000 0.032 N NA
 7007784 7007785 CCV52592_1061 CCV52592_2008     TRUE 0.993 2.000 0.045 0.032 Y NA
 7007785 7007786 CCV52592_2008 CCV52592_1475     TRUE 0.994 9.000 0.564 0.032 Y NA
 7007786 7007787 CCV52592_1475 CCV52592_1474     FALSE 0.092 103.000 0.000 NA   NA
 7007787 7007788 CCV52592_1474 CCV52592_2221     FALSE 0.007 835.000 0.000 NA   NA
 7007788 7007789 CCV52592_2221 CCV52592_1472     FALSE 0.125 82.000 0.000 NA   NA
 7007789 7007790 CCV52592_1472 CCV52592_1471   dprA TRUE 0.903 6.000 0.000 1.000 N NA
 7007790 7007791 CCV52592_1471 CCV52592_1470 dprA hemE TRUE 0.806 11.000 0.000 1.000 N NA
 7007791 7007792 CCV52592_1470 CCV52592_1469 hemE   FALSE 0.276 118.000 0.016 NA   NA
 7007793 7007794 CCV52592_1468 CCV52592_1467     TRUE 0.505 -48.000 0.000 NA   NA
 7007794 7007795 CCV52592_1467 CCV52592_1466     FALSE 0.117 90.000 0.000 NA   NA
 7007795 7007796 CCV52592_1466 CCV52592_1465     TRUE 0.513 -39.000 0.000 NA   NA
 7007796 7007797 CCV52592_1465 CCV52592_1464     FALSE 0.084 108.000 0.000 NA   NA
 7007798 7007799 CCV52592_1463 CCV52592_1462 asd   TRUE 0.979 -3.000 0.025 1.000 N NA
 7007799 7007800 CCV52592_1462 CCV52592_1461     TRUE 0.980 -3.000 0.205 NA   NA
 7007800 7007801 CCV52592_1461 CCV52592_1460     TRUE 0.937 15.000 0.900 NA   NA
 7007801 7007802 CCV52592_1460 CCV52592_1459   gyrA FALSE 0.059 284.000 0.008 NA   NA
 7007802 7007803 CCV52592_1459 CCV52592_1458 gyrA   FALSE 0.089 252.000 0.007 1.000   NA
 7007803 7007804 CCV52592_1458 CCV52592_1457     TRUE 0.980 0.000 0.091 NA   NA
 7007804 7007805 CCV52592_1457 CCV52592_1456     TRUE 0.972 10.000 0.333 NA   NA
 7007805 7007806 CCV52592_1456 CCV52592_1455     TRUE 0.963 -6.000 0.036 NA   NA
 7007806 7007807 CCV52592_1455 CCV52592_1454   lepA TRUE 0.488 31.000 0.002 1.000   NA
 7007807 7007808 CCV52592_1454 CCV52592_1453 lepA   FALSE 0.054 146.000 0.000 NA   NA
 7007812 7007813 CCV52592_1450 CCV52592_1449     FALSE 0.195 38.000 0.000 NA   NA
 7007814 7007815 CCV52592_1448 CCV52592_1447     FALSE 0.112 93.000 0.000 NA   NA
 7007816 7007817 CCV52592_1446 CCV52592_1445 prs   FALSE 0.151 61.000 0.000 NA   NA
 7007819 7007820 CCV52592_1443 CCV52592_1442   mnmA FALSE 0.134 100.000 0.000 1.000   NA
 7007820 7007821 CCV52592_1442 CCV52592_1441 mnmA   FALSE 0.456 51.000 0.012 NA   NA
 7007821 7007822 CCV52592_1441 CCV52592_1440   fecB TRUE 0.977 8.000 0.085 NA   NA
 7007822 7007823 CCV52592_1440 CCV52592_1439 fecB fliM TRUE 0.990 -10.000 0.142 0.002 Y NA
 7007823 7007824 CCV52592_1439 CCV52592_0370 fliM fliA TRUE 0.988 0.000 0.118 1.000 N NA
 7007824 7007825 CCV52592_0370 CCV52592_0369 fliA   TRUE 0.930 -28.000 0.112 NA   NA
 7007825 7007826 CCV52592_0369 CCV52592_0368     TRUE 0.940 13.000 0.159 NA   NA
 7007826 7007827 CCV52592_0368 CCV52592_0367   flhF TRUE 0.983 -7.000 0.382 1.000 N NA
 7007827 7007828 CCV52592_0367 CCV52592_0366 flhF folK TRUE 0.973 10.000 0.035 1.000 N NA
 7007828 7007829 CCV52592_0366 CCV52592_0365 folK   TRUE 0.982 -3.000 0.033 1.000 N NA
 7007829 7007830 CCV52592_0365 CCV52592_0364   aroQ TRUE 0.992 -3.000 0.168 1.000 Y NA
 7007830 7007831 CCV52592_0364 CCV52592_0363 aroQ   TRUE 0.614 -15.000 0.000 NA   NA
 7007832 7007833 CCV52592_0362 CCV52592_0361   sppA TRUE 0.963 -12.000 0.035 1.000 N NA
 7007833 7007834 CCV52592_0361 CCV52592_0360 sppA   FALSE 0.075 117.000 0.000 NA   NA
 7007835 7007836 CCV52592_0359 CCV52592_0358 ribD fhs TRUE 0.463 26.000 0.000 1.000 N NA
 7007836 7007837 CCV52592_0358 CCV52592_0357 fhs   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007837 7007838 CCV52592_0357 CCV52592_0356   rbfA TRUE 0.957 -7.000 0.033 NA   NA
 7007838 7007839 CCV52592_0356 CCV52592_0355 rbfA infB TRUE 0.993 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 7007839 7007840 CCV52592_0355 CCV52592_1105 infB   TRUE 0.634 -13.000 0.000 NA   NA
 7007840 7007841 CCV52592_1105 CCV52592_1104   thrB FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 7007841 7007842 CCV52592_1104 CCV52592_1102 thrB   TRUE 0.776 9.000 0.000 NA   NA
 7007842 7007843 CCV52592_1102 CCV52592_1101   lpxC TRUE 0.625 66.000 0.035 1.000   NA
 7007843 7007844 CCV52592_1101 CCV52592_2224 lpxC   TRUE 0.758 60.000 0.022 1.000 Y NA
 7007844 7007845 CCV52592_2224 CCV52592_2225     TRUE 0.580 59.000 0.013 1.000 N NA
 7007846 7007847 CCV52592_1757 CCV52592_1756 yaeT accD FALSE 0.255 136.000 0.004 1.000 N NA
 7007847 7007848 CCV52592_1756 CCV52592_1755 accD   TRUE 0.972 5.000 0.035 NA   NA
 7007848 7007849 CCV52592_1755 CCV52592_1754     TRUE 0.954 10.000 0.029 NA   NA
 7007849 7007850 CCV52592_1754 CCV52592_1753     TRUE 0.962 11.000 0.523 NA   NA
 7007850 7007851 CCV52592_1753 CCV52592_1752     TRUE 0.961 -3.000 0.021 NA   NA
 7007851 7007852 CCV52592_1752 CCV52592_1751   yciA TRUE 0.700 16.000 0.003 NA   NA
 7007853 7007854 CCV52592_1750 CCV52592_1749     FALSE 0.309 24.000 0.000 NA   NA
 7007854 7007855 CCV52592_1749 CCV52592_1748   mtnN TRUE 0.979 -3.000 0.042 NA N NA
 7007855 7007856 CCV52592_1748 CCV52592_1747 mtnN fabD TRUE 0.982 -3.000 0.037 1.000 N NA
 7007856 7007857 CCV52592_1747 CCV52592_1746 fabD   TRUE 0.951 10.000 0.013 1.000 N NA
 7007857 7007858 CCV52592_1746 CCV52592_1745     TRUE 0.753 61.000 0.543 1.000   NA
 7007858 7007859 CCV52592_1745 CCV52592_1744     TRUE 0.986 7.000 0.794 1.000   NA
 7007859 7007860 CCV52592_1744 CCV52592_1743   tolB TRUE 0.769 55.000 0.702 1.000   NA
 7007860 7007861 CCV52592_1743 CCV52592_1742 tolB   TRUE 0.872 22.000 0.213 NA   NA
 7007861 7007862 CCV52592_1742 CCV52592_1741     TRUE 0.665 77.000 0.343 NA   NA
 7007862 7007863 CCV52592_1741 CCV52592_1740     TRUE 0.991 1.000 0.944 0.037   NA
 7007863 7007864 CCV52592_1740 CCV52592_1739   atpC FALSE 0.321 175.000 0.036 1.000   NA
 7007864 7007865 CCV52592_1739 CCV52592_1738 atpC atpD TRUE 0.961 24.000 0.837 0.005 Y NA
 7007865 7007866 CCV52592_1738 CCV52592_1737 atpD atpG TRUE 0.987 12.000 0.724 0.005 Y NA
 7007866 7007867 CCV52592_1737 CCV52592_1736 atpG atpA TRUE 0.993 10.000 0.846 0.005 Y NA
 7007867 7007868 CCV52592_1736 CCV52592_1735 atpA atpH TRUE 0.982 15.000 0.864 0.005 Y NA
 7007868 7007869 CCV52592_1735 CCV52592_1734 atpH serB TRUE 0.995 0.000 0.132 0.005 Y NA
 7007869 7007870 CCV52592_1734 CCV52592_1733 serB   TRUE 0.991 10.000 0.110 0.005 Y NA
 7007870 7007871 CCV52592_1733 CCV52592_1732     TRUE 0.627 97.000 0.037 1.000 N NA
 7007871 7007872 CCV52592_1732 CCV52592_1731     TRUE 0.934 20.000 0.827 1.000 N NA
 7007872 7007873 CCV52592_1731 CCV52592_1730     TRUE 0.983 -3.000 0.040 1.000 N NA
 7007873 7007874 CCV52592_1730 CCV52592_1729   fmt TRUE 0.672 67.000 0.029 1.000 N NA
 7007874 7007875 CCV52592_1729 CCV52592_1728 fmt   FALSE 0.349 22.000 0.000 NA   NA
 7007875 7007876 CCV52592_1728 CCV52592_1727     FALSE 0.021 264.000 0.000 NA   NA
 7007876 7007877 CCV52592_1727 CCV52592_1726   obgE TRUE 0.904 3.000 0.000 0.044   NA
 7007877 7007878 CCV52592_1726 CCV52592_1725 obgE rpmA TRUE 0.637 100.000 0.335 1.000   NA
 7007878 7007879 CCV52592_1725 CCV52592_1724 rpmA rplU TRUE 0.989 11.000 0.667 0.018 Y NA
 7007880 7007881 CCV52592_1723 CCV52592_1722 fliH   TRUE 0.952 11.000 0.019 0.008   NA
 7007883 7007884 CCV52592_1720 CCV52592_1719     TRUE 0.977 3.000 0.087 NA   NA
 7007884 7007885 CCV52592_1719 CCV52592_1718     TRUE 0.923 -28.000 0.066 NA   NA
 7007885 7007886 CCV52592_1718 CCV52592_1717     TRUE 0.984 -3.000 0.210 1.000   NA
 7007886 7007887 CCV52592_1717 CCV52592_1716     FALSE 0.088 135.000 0.000 1.000   NA
 7007887 7007888 CCV52592_1716 CCV52592_1715     TRUE 0.994 -7.000 0.667 0.001 Y NA
 7007888 7007889 CCV52592_1715 CCV52592_1714     FALSE 0.080 111.000 0.000 NA   NA
 7007889 7007890 CCV52592_1714 CCV52592_1713     FALSE 0.008 510.000 0.000 NA   NA
 7007890 7007891 CCV52592_1713 CCV52592_1711     FALSE 0.224 31.000 0.000 NA   NA
 7007892 7007893 CCV52592_1710 CCV52592_1709     TRUE 0.767 68.000 0.267 1.000 N NA
 7007900 7007901 CCV52592_1702 CCV52592_1701 ndk   TRUE 0.906 14.000 0.033 NA   NA
 7007901 7007902 CCV52592_1701 CCV52592_1700   plsX FALSE 0.098 187.000 0.003 NA   NA
 7007902 7007903 CCV52592_1700 CCV52592_1699 plsX   TRUE 0.994 4.000 0.058 0.005 Y NA
 7007903 7007904 CCV52592_1699 CCV52592_1698     FALSE 0.107 154.000 0.000 1.000 N NA
 7007904 7007905 CCV52592_1698 CCV52592_1697     FALSE 0.222 108.000 0.006 NA   NA
 7007905 7007906 CCV52592_1697 CCV52592_1696     TRUE 0.966 10.000 0.089 NA   NA
 7007906 7007907 CCV52592_1696 CCV52592_1695     FALSE 0.451 63.000 0.016 NA   NA
 7007907 7007908 CCV52592_1695 CCV52592_1694   folB TRUE 0.977 -3.000 0.040 1.000   NA
 7007908 7007909 CCV52592_1694 CCV52592_1693 folB   TRUE 0.681 77.000 0.043 1.000 N NA
 7007909 7007910 CCV52592_1693 CCV52592_1692     TRUE 0.852 63.000 0.375 1.000 Y NA
 7007910 7007911 CCV52592_1692 CCV52592_1691     TRUE 0.984 9.000 0.086 1.000 N NA
 7007912 7007913 CCV52592_1690 CCV52592_1689   fliN TRUE 0.982 -3.000 0.531 NA   NA
 7007913 7007914 CCV52592_1689 CCV52592_1688 fliN   TRUE 0.983 -3.000 0.625 NA   NA
 7007914 7007915 CCV52592_1688 CCV52592_1687   trpA FALSE 0.433 78.000 0.017 NA   NA
 7007915 7007916 CCV52592_1687 CCV52592_1686 trpA trpB TRUE 0.993 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 7007916 7007917 CCV52592_1686 CCV52592_1685 trpB trpF TRUE 0.996 0.000 0.375 0.002 Y NA
 7007917 7007918 CCV52592_1685 CCV52592_1684 trpF   TRUE 0.990 3.000 0.052 1.000 Y NA
 7007918 7007919 CCV52592_1684 CCV52592_1683     FALSE 0.197 399.000 0.019 0.001 Y NA
 7007921 7007922 CCV52592_1681 CCV52592_1680     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7007924 7007925 CCV52592_1678 CCV52592_1677     TRUE 0.850 -3.000 0.000 1.000   NA
 7007925 7007926 CCV52592_1677 CCV52592_1676   serC TRUE 0.907 2.000 0.000 1.000 N NA
 7007926 7007927 CCV52592_1676 CCV52592_1675 serC xseA TRUE 0.904 12.000 0.010 1.000 N NA
 7007927 7007928 CCV52592_1675 CCV52592_1674 xseA ubiE TRUE 0.671 35.000 0.016 1.000 N NA
 7007928 7007929 CCV52592_1674 CCV52592_1673 ubiE   TRUE 0.745 16.000 0.008 NA   NA
 7007929 7007930 CCV52592_1673 CCV52592_1672     FALSE 0.190 232.000 0.033 NA   NA
 7007930 7007931 CCV52592_1672 CCV52592_1671   dxs TRUE 0.580 66.000 0.017 1.000 N NA
 7007931 7007932 CCV52592_1671 CCV52592_1670 dxs   TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7007932 7007933 CCV52592_1670 CCV52592_1669   fliG TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007933 7007934 CCV52592_1669 CCV52592_1668 fliG fliF TRUE 0.996 0.000 0.477 0.009 Y NA
 7007934 7007935 CCV52592_1668 CCV52592_1667 fliF hisC TRUE 0.986 5.000 0.084 1.000 N NA
 7007935 7007936 CCV52592_1667 CCV52592_1666 hisC   TRUE 0.989 0.000 0.028 1.000 Y NA
 7007936 7007937 CCV52592_1666 CCV52592_1665   lysA TRUE 0.977 9.000 0.013 1.000 Y NA
 7007937 7007938 CCV52592_1665 CCV52592_1664 lysA   TRUE 0.583 57.000 0.021 1.000   NA
 7007938 7007939 CCV52592_1664 CCV52592_1663   pth TRUE 0.975 -3.000 0.031 1.000   NA
 7007939 7007940 CCV52592_1663 CCV52592_1662 pth   TRUE 0.989 11.000 0.496 0.028 Y NA
 7007940 7007941 CCV52592_1662 CCV52592_1661     TRUE 0.557 66.000 0.014 1.000 N NA
 7007941 7007942 CCV52592_1661 CCV52592_1660   tal TRUE 0.988 -3.000 0.273 1.000 N NA
 7007942 7007943 CCV52592_1660 CCV52592_1659 tal serB TRUE 0.981 5.000 0.029 1.000 N NA
 7007943 7007944 CCV52592_1659 CCV52592_1658 serB   TRUE 0.954 10.000 0.015 1.000 N NA
 7007944 7007945 CCV52592_1658 CCV52592_1657     TRUE 0.991 10.000 0.137 0.009 Y NA
 7007945 7007946 CCV52592_1657 CCV52592_1656     TRUE 0.991 10.000 0.147 0.009 Y NA
 7007946 7007947 CCV52592_1656 CCV52592_1655     TRUE 0.979 0.000 0.065 NA   NA
 7007947 7007948 CCV52592_1655 CCV52592_1654   argC TRUE 0.957 9.000 0.021 NA   NA
 7007948 7007949 CCV52592_1654 CCV52592_1653 argC greA TRUE 0.967 2.000 0.011 1.000 N NA
 7007949 7007950 CCV52592_1653 CCV52592_1652 greA lpxB TRUE 0.983 4.000 0.042 1.000 N NA
 7007950 7007951 CCV52592_1652 CCV52592_1651 lpxB   TRUE 0.866 0.000 0.000 1.000   NA
 7007952 7007953 CCV52592_1650 CCV52592_0001 surE   TRUE 0.979 -3.000 0.051 1.000   NA
 7007954 7007955 CCV52592_0002 CCV52592_0003     FALSE 0.197 210.000 0.000 0.004 Y NA
 7007957 7007958 CCV52592_1786 CCV52592_1785     TRUE 0.970 -7.000 0.147 NA   NA
 7007958 7007959 CCV52592_1785 CCV52592_1784   purA TRUE 0.948 -3.000 0.014 NA   NA
 7007959 7007960 CCV52592_1784 CCV52592_1783 purA hisZ TRUE 0.952 15.000 0.161 1.000 N NA
 7007960 7007961 CCV52592_1783 CCV52592_1782 hisZ   TRUE 0.937 -7.000 0.006 1.000 N NA
 7007961 7007962 CCV52592_1782 CCV52592_1781   selD FALSE 0.124 83.000 0.000 NA   NA
 7007962 7007963 CCV52592_1781 CCV52592_1780 selD   FALSE 0.041 180.000 0.000 NA   NA
 7007963 7007964 CCV52592_1780 CCV52592_1779     FALSE 0.388 137.000 0.031 1.000   NA
 7007964 7007965 CCV52592_1779 CCV52592_2226     TRUE 0.728 -7.000 0.000 NA   NA
 7007965 7007966 CCV52592_2226 CCV52592_1778     FALSE 0.034 206.000 0.000 NA   NA
 7007966 7007967 CCV52592_1778 CCV52592_0396   nspC FALSE 0.233 166.000 0.008 1.000 N NA
 7007968 7007969 CCV52592_0398 CCV52592_0399   moaE TRUE 0.808 2.000 0.000 NA   NA
 7007969 7007970 CCV52592_0399 CCV52592_0400 moaE   FALSE 0.007 572.000 0.000 NA   NA
 7007970 7007971 CCV52592_0400 CCV52592_0401     TRUE 0.774 52.000 0.750 1.000   NA
 7007973 7007974 CCV52592_0404 CCV52592_0405     TRUE 0.474 65.000 0.013 1.000   NA
 7007974 7007975 CCV52592_0405 CCV52592_0407   rimI TRUE 0.972 8.000 0.026 1.000   NA
 7007977 7007978 CCV52592_2227 CCV52592_0408     FALSE 0.233 30.000 0.000 NA   NA
 7007978 7007979 CCV52592_0408 CCV52592_2228     FALSE 0.030 222.000 0.000 NA   NA
 7007980 7007981 CCV52592_0409 CCV52592_0410     TRUE 0.919 -3.000 0.004 NA   NA
 7007982 7007983 CCV52592_0411 CCV52592_0412     TRUE 0.523 -34.000 0.000 NA   NA
 7007983 7007984 CCV52592_0412 CCV52592_0413     FALSE 0.090 133.000 0.000 1.000   NA
 7007987 7007988 CCV52592_0416 CCV52592_0417     TRUE 0.531 -31.000 0.000 NA   NA
 7007989 7007990 CCV52592_0419 CCV52592_0420     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7007991 7007992 CCV52592_0421 CCV52592_0422     TRUE 0.987 -7.000 0.500 NA Y NA
 7007992 7007993 CCV52592_0422 CCV52592_0423     TRUE 0.993 4.000 0.625 1.000 Y NA
 7007993 7007994 CCV52592_0423 CCV52592_0424     TRUE 0.992 -3.000 0.643 NA Y NA
 7007994 7007995 CCV52592_0424 CCV52592_0425     FALSE 0.316 165.000 0.012 NA Y NA
 7007995 7007996 CCV52592_0425 CCV52592_0426     FALSE 0.014 336.000 0.000 NA   NA
 7007996 7007997 CCV52592_0426 CCV52592_0427     TRUE 0.970 10.000 0.188 NA   NA
 7007997 7007998 CCV52592_0427 CCV52592_0428     TRUE 0.971 -3.000 0.023 1.000   NA
 7007998 7007999 CCV52592_0428 CCV52592_0429   nuoL TRUE 0.988 2.000 0.175 1.000 N NA
 7007999 7008000 CCV52592_0429 CCV52592_0430 nuoL   TRUE 0.982 -13.000 0.878 0.077 N NA
 7008000 7008001 CCV52592_0430 CCV52592_0431     TRUE 0.983 -3.000 0.625 NA   NA
 7008001 7008002 CCV52592_0431 CCV52592_0432   proP TRUE 0.705 62.000 0.386 NA   NA
 7008002 7008003 CCV52592_0432 CCV52592_0433 proP   TRUE 0.939 21.000 0.238 NA Y NA
 7008003 7008004 CCV52592_0433 CCV52592_0533     FALSE 0.304 151.000 0.016 1.000 N NA
 7008004 7008005 CCV52592_0533 CCV52592_0534     TRUE 0.980 11.000 0.444 0.001   NA
 7008005 7008006 CCV52592_0534 CCV52592_0535     FALSE 0.168 49.000 0.000 NA   NA
 7008006 7008007 CCV52592_0535 CCV52592_0536     TRUE 0.720 10.000 0.000 NA   NA
 7008007 7008008 CCV52592_0536 CCV52592_0537     FALSE 0.182 287.000 0.200 NA   NA
 7008008 7008009 CCV52592_0537 CCV52592_0539     TRUE 0.971 -7.000 0.200 NA   NA
 7008010 7008011 CCV52592_0540 CCV52592_0541 selA selB TRUE 0.993 -3.000 0.569 0.001 N NA
 7008011 7008012 CCV52592_0541 CCV52592_0542 selB   TRUE 0.630 62.000 0.031 1.000   NA
 7008013 7008014 CCV52592_0543 CCV52592_0544     FALSE 0.461 16.000 0.000 NA   NA
 7008014 7008015 CCV52592_0544 CCV52592_0545     FALSE 0.112 93.000 0.000 NA   NA
 7008015 7008016 CCV52592_0545 CCV52592_0546   upp FALSE 0.009 437.000 0.000 NA   NA
 7008016 7008017 CCV52592_0546 CCV52592_0547 upp   TRUE 0.965 1.000 0.008 1.000 N NA
 7008017 7008018 CCV52592_0547 CCV52592_0548   gltX TRUE 0.977 -3.000 0.021 1.000 N NA
 7008020 7008021 CCV52592_0550 CCV52592_0551 accC accB TRUE 0.817 0.000 0.000 NA   NA
 7008021 7008022 CCV52592_0551 CCV52592_0552 accB modB FALSE 0.141 65.000 0.000 NA   NA
 7008022 7008023 CCV52592_0552 CCV52592_0553 modB modA TRUE 0.936 34.000 0.629 0.002 Y NA
 7008023 7008024 CCV52592_0553 CCV52592_0554 modA   FALSE 0.271 110.000 0.000 1.000 Y NA
 7008024 7008025 CCV52592_0554 CCV52592_0555     TRUE 0.971 -3.000 0.034 NA   NA
 7008025 7008026 CCV52592_0555 CCV52592_0556     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7008026 7008027 CCV52592_0556 CCV52592_0557     TRUE 0.957 -6.000 0.025 NA   NA
 7008027 7008028 CCV52592_0557 CCV52592_0558     TRUE 0.992 1.000 0.388 NA Y NA
 7008029 7008030 CCV52592_0559 CCV52592_0560 dcd   FALSE 0.098 279.000 0.014 1.000   NA
 7008030 7008031 CCV52592_0560 CCV52592_0561     TRUE 0.986 -3.000 0.678 1.000   NA
 7008031 7008032 CCV52592_0561 CCV52592_0562     TRUE 0.866 53.000 0.296 1.000 Y NA
 7008032 7008033 CCV52592_0562 CCV52592_0563     TRUE 0.983 -10.000 0.355 NA Y NA
 7008033 7008034 CCV52592_0563 CCV52592_0564     TRUE 0.963 -15.000 0.137 NA N NA
 7008034 7008035 CCV52592_0564 CCV52592_0565     TRUE 0.984 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7008035 7008036 CCV52592_0565 CCV52592_0566     TRUE 0.859 12.000 0.012 NA   NA
 7008037 7008038 CCV52592_0567 CCV52592_0568     TRUE 0.537 14.000 0.000 NA   NA
 7008038 7008039 CCV52592_0568 CCV52592_0569     FALSE 0.110 95.000 0.000 NA   NA
 7008039 7008040 CCV52592_0569 CCV52592_0570     TRUE 0.880 23.000 1.000 NA   NA
 7008041 7008042 CCV52592_0571 CCV52592_0572 topA   TRUE 0.952 1.000 0.009 1.000   NA
 7008042 7008043 CCV52592_0572 CCV52592_0574     FALSE 0.115 225.000 0.008 1.000   NA
 7008043 7008044 CCV52592_0574 CCV52592_0575     FALSE 0.140 284.000 0.017 1.000 N NA
 7008044 7008045 CCV52592_0575 CCV52592_0576   gltA TRUE 0.974 4.000 0.019 1.000 N NA
 7008045 7008046 CCV52592_0576 CCV52592_0577 gltA   TRUE 0.916 15.000 0.022 1.000 N NA
 7008047 7008048 CCV52592_0578 CCV52592_0579     FALSE 0.078 145.000 0.000 1.000   NA
 7008048 7008049 CCV52592_0579 CCV52592_0580     FALSE 0.249 40.000 0.000 1.000   NA
 7008049 7008050 CCV52592_0580 CCV52592_0581   modB FALSE 0.048 264.000 0.000 1.000 N NA
 7008050 7008051 CCV52592_0581 CCV52592_0582 modB   TRUE 0.868 51.000 0.286 1.000 Y NA
 7008051 7008052 CCV52592_0582 CCV52592_0583     TRUE 0.966 -7.000 0.013 0.070 N NA
 7008052 7008053 CCV52592_0583 CCV52592_0584   modA TRUE 0.946 -3.000 0.000 0.002 N NA
 7008053 7008054 CCV52592_0584 CCV52592_0585 modA   TRUE 0.931 1.000 0.000 0.002   NA
 7008055 7008056 CCV52592_0586 CCV52592_0587   ttg2D TRUE 0.987 3.000 0.684 NA N NA
 7008056 7008057 CCV52592_0587 CCV52592_0588 ttg2D   TRUE 0.981 4.000 0.263 NA   NA
 7008058 7008059 CCV52592_0589 CCV52592_0590   hgpB FALSE 0.012 358.000 0.000 NA   NA
 7008059 7008060 CCV52592_0590 CCV52592_0591 hgpB   FALSE 0.056 185.000 0.000 1.000   NA
 7008060 7008061 CCV52592_0591 CCV52592_0592     TRUE 0.944 -3.000 0.008 1.000   NA
 7008061 7008062 CCV52592_0592 CCV52592_0593     TRUE 0.938 7.000 0.006 1.000   NA
 7008062 7008063 CCV52592_0593 CCV52592_0594   dxr TRUE 0.899 -13.000 0.004 1.000 N NA
 7008063 7008064 CCV52592_0594 CCV52592_0595 dxr cdsA TRUE 0.990 -6.000 0.372 1.000 Y NA
 7008064 7008065 CCV52592_0595 CCV52592_0596 cdsA   FALSE 0.394 19.000 0.000 NA   NA
 7008065 7008066 CCV52592_0596 CCV52592_0597     FALSE 0.008 473.000 0.000 NA   NA
 7008066 7008067 CCV52592_0597 CCV52592_0598     TRUE 0.914 11.000 0.020 NA   NA
 7008067 7008068 CCV52592_0598 CCV52592_0599     FALSE 0.132 70.000 0.000 NA   NA
 7008070 7008071 CCV52592_0601 CCV52592_0602     TRUE 0.993 4.000 0.500 1.000 Y NA
 7008071 7008072 CCV52592_0602 CCV52592_0603     TRUE 0.990 -7.000 0.571 1.000 Y NA
 7008072 7008073 CCV52592_0603 CCV52592_0604     TRUE 0.730 92.000 0.032 1.000 Y NA
 7008073 7008074 CCV52592_0604 CCV52592_0605   moeB FALSE 0.060 137.000 0.000 NA   NA
 7008074 7008075 CCV52592_0605 CCV52592_0606 moeB   TRUE 0.982 -3.000 0.357 NA   NA
 7008076 7008077 CCV52592_0607 CCV52592_0608   leuC FALSE 0.027 367.000 0.000 1.000 N NA
 7008077 7008078 CCV52592_0608 CCV52592_0609 leuC   FALSE 0.096 171.000 0.000 1.000 N NA
 7008078 7008079 CCV52592_0609 CCV52592_0610     TRUE 0.901 -3.000 0.000 1.000 N NA
 7008079 7008080 CCV52592_0610 CCV52592_0611     FALSE 0.078 252.000 0.000 0.076 N NA
 7008080 7008081 CCV52592_0611 CCV52592_0612     TRUE 0.991 -3.000 0.081 1.000 Y NA
 7008082 7008083 CCV52592_0613 CCV52592_0614     TRUE 0.983 6.000 0.788 NA   NA
 7008083 7008084 CCV52592_0614 CCV52592_0615   eno TRUE 0.977 -3.000 0.080 NA   NA
 7008084 7008085 CCV52592_0615 CCV52592_0616 eno recA TRUE 0.982 -3.000 0.033 1.000 N NA
 7008085 7008086 CCV52592_0616 CCV52592_0617 recA   FALSE 0.258 90.000 0.002 NA   NA
 7008086 7008087 CCV52592_0617 CCV52592_0618   murB TRUE 0.910 9.000 0.005 NA   NA
 7008087 7008088 CCV52592_0618 CCV52592_0619 murB fliQ TRUE 0.985 -3.000 0.066 1.000 N NA
 7008088 7008089 CCV52592_0619 CCV52592_0620 fliQ   TRUE 0.983 0.000 0.068 1.000   NA
 7008089 7008090 CCV52592_0620 CCV52592_0621     FALSE 0.089 219.000 0.000 0.002   NA
 7008090 7008091 CCV52592_0621 CCV52592_0623     FALSE 0.024 288.000 0.000 1.000   NA
 7008091 7008092 CCV52592_0623 CCV52592_0624     FALSE 0.082 141.000 0.000 1.000   NA
 7008092 7008093 CCV52592_0624 CCV52592_2229   rrf FALSE 0.026 236.000 0.000 NA   NA
 7008093 7008094 CCV52592_2229 CCV52592_r05 rrf   FALSE 0.009 437.000 0.000 NA   NA
 7008094 7008095 CCV52592_r05 CCV52592_2230     FALSE 0.010 384.000 0.000 NA   NA
 7008095 7008096 CCV52592_2230 CCV52592_2231     FALSE 0.017 289.000 0.000 NA   NA
 7008096 7008097 CCV52592_2231 CCV52592_r06     FALSE 0.018 285.000 0.000 NA   NA
 7008097 7008098 CCV52592_r06 CCV52592_0630     FALSE 0.008 516.000 0.000 NA   NA
 7008098 7008099 CCV52592_0630 CCV52592_0631     TRUE 0.642 11.000 0.000 NA   NA
 7008100 7008101 CCV52592_0632 CCV52592_0633     FALSE 0.039 186.000 0.000 NA   NA
 7008101 7008102 CCV52592_0633 CCV52592_0634     FALSE 0.044 171.000 0.000 NA   NA
 7008102 7008103 CCV52592_0634 CCV52592_0635   hypE FALSE 0.082 109.000 0.000 NA   NA
 7008103 7008104 CCV52592_0635 CCV52592_0636 hypE   FALSE 0.331 23.000 0.000 NA   NA
 7008105 7008106 CCV52592_0637 CCV52592_0638     FALSE 0.291 25.000 0.000 NA   NA
 7008106 7008107 CCV52592_0638 CCV52592_0639     TRUE 0.798 -3.000 0.000 NA   NA
 7008109 7008110 CCV52592_0640 CCV52592_0642     FALSE 0.246 57.000 0.000 NA N NA
 7008110 7008111 CCV52592_0642 CCV52592_0643     FALSE 0.117 90.000 0.000 NA   NA
 7008111 7008112 CCV52592_0643 CCV52592_0644     FALSE 0.394 19.000 0.000