MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter concisus 13826

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 7004084 7004085 CCC13826_1853 CCC13826_1852 dnaA   TRUE 0.855 8.000 0.000 NA   NA
 7004085 7004086 CCC13826_1852 CCC13826_1851   dnaN TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004086 7004087 CCC13826_1851 CCC13826_1850 dnaN gyrB TRUE 0.939 18.000 0.114 1.000 Y NA
 7004087 7004088 CCC13826_1850 CCC13826_1849 gyrB   TRUE 0.651 19.000 0.006 1.000   NA
 7004088 7004089 CCC13826_1849 CCC13826_1848     TRUE 0.924 0.000 0.013 NA   NA
 7004092 7004093 CCC13826_1846 CCC13826_1845     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7004093 7004094 CCC13826_1845 CCC13826_1844   purM FALSE 0.164 68.000 0.000 NA   NA
 7004098 7004099 CCC13826_1840 CCC13826_1839 rplT rpmI TRUE 0.712 99.000 0.928 0.029 Y NA
 7004102 7004103 CCC13826_1837 CCC13826_1836 amyH metE FALSE 0.042 161.000 0.000 NA   NA
 7004103 7004104 CCC13826_1836 CCC13826_1835 metE   TRUE 0.386 26.000 0.000 NA   NA
 7004104 7004105 CCC13826_1835 CCC13826_1834     TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 7004106 7004107 CCC13826_1833 CCC13826_1832     TRUE 0.870 -9.000 0.000 NA   NA
 7004107 7004108 CCC13826_1832 CCC13826_1831     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004108 7004109 CCC13826_1831 CCC13826_1830     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004110 7004111 CCC13826_2208 CCC13826_1828     FALSE 0.022 243.000 0.000 NA   NA
 7004112 7004113 CCC13826_1827 CCC13826_1826 azlD   FALSE 0.119 89.000 0.000 NA   NA
 7004113 7004114 CCC13826_1826 CCC13826_1825     FALSE 0.258 41.000 0.000 NA   NA
 7004114 7004115 CCC13826_1825 CCC13826_1824     TRUE 0.901 3.000 0.002 1.000   NA
 7004120 7004121 CCC13826_1819 CCC13826_1818 thrS infC TRUE 0.927 18.000 0.060 1.000 Y NA
 7004124 7004125 CCC13826_1815 CCC13826_1814     FALSE 0.039 170.000 0.000 NA   NA
 7004127 7004128 CCC13826_1812 CCC13826_1811     FALSE 0.071 117.000 0.000 NA   NA
 7004128 7004129 CCC13826_1811 CCC13826_1810     TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7004129 7004130 CCC13826_1810 CCC13826_1809     TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7004130 7004131 CCC13826_1809 CCC13826_1808   lspA TRUE 0.941 -10.000 0.015 NA   NA
 7004131 7004132 CCC13826_1808 CCC13826_1807 lspA glmM TRUE 0.981 -7.000 0.042 1.000 N NA
 7004133 7004134 CCC13826_1806 CCC13826_1805 rpsT prfA TRUE 0.935 15.000 0.029 1.000 Y NA
 7004134 7004135 CCC13826_1805 CCC13826_1804 prfA   FALSE 0.020 312.000 0.000 1.000 N NA
 7004135 7004136 CCC13826_1804 CCC13826_1803     FALSE 0.016 362.000 0.000 1.000 N NA
 7004137 7004138 CCC13826_1802 CCC13826_1801     TRUE 0.875 -9.000 0.000 1.000   NA
 7004141 7004142 CCC13826_1798 CCC13826_1796     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004146 7004147 CCC13826_1793 CCC13826_1792     TRUE 0.978 3.000 0.174 1.000   NA
 7004147 7004148 CCC13826_1792 CCC13826_1791   pcrA TRUE 0.974 -3.000 0.025 1.000   NA
 7004148 7004149 CCC13826_1791 CCC13826_1789 pcrA pepF TRUE 0.989 10.000 0.616 1.000 Y NA
 7004150 7004151 CCC13826_1790 CCC13826_1788     FALSE 0.040 167.000 0.000 NA   NA
 7004151 7004152 CCC13826_1788 CCC13826_1787     TRUE 0.619 15.000 0.000 NA   NA
 7004152 7004153 CCC13826_1787 CCC13826_1786   purN TRUE 0.956 -7.000 0.009 1.000 N NA
 7004153 7004154 CCC13826_1786 CCC13826_1785 purN   TRUE 0.932 -18.000 0.014 NA N NA
 7004154 7004155 CCC13826_1785 CCC13826_1784     TRUE 0.920 2.000 0.006 NA N NA
 7004155 7004156 CCC13826_1784 CCC13826_1783   def TRUE 0.986 -3.000 0.054 1.000 N NA
 7004156 7004157 CCC13826_1783 CCC13826_1782 def   TRUE 0.974 2.000 0.076 1.000 N NA
 7004157 7004158 CCC13826_1782 CCC13826_1781   clpP TRUE 0.940 9.000 0.009 1.000 N NA
 7004158 7004159 CCC13826_1781 CCC13826_1780 clpP tig TRUE 0.989 0.000 0.351 1.000 Y NA
 7004160 7004161 CCC13826_1779 CCC13826_1778   folE TRUE 0.814 -16.000 0.000 NA   NA
 7004161 7004162 CCC13826_1778 CCC13826_1777 folE fliI TRUE 0.992 -3.000 0.378 0.056 N NA
 7004163 7004164 CCC13826_1776 CCC13826_1775     TRUE 0.990 -3.000 0.714 NA   NA
 7004164 7004165 CCC13826_1775 CCC13826_1774   cysK TRUE 0.578 16.000 0.000 NA   NA
 7004165 7004166 CCC13826_1774 CCC13826_1773 cysK cysE TRUE 0.980 0.000 0.139 1.000 N NA
 7004166 7004167 CCC13826_1773 CCC13826_1772 cysE   TRUE 0.988 9.000 0.111 1.000 Y NA
 7004167 7004168 CCC13826_1772 CCC13826_1104     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004168 7004169 CCC13826_1104 CCC13826_1105     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004171 7004172 CCC13826_1107 CCC13826_1108     TRUE 0.989 -7.000 0.308 1.000 N NA
 7004173 7004174 CCC13826_1109 CCC13826_1110     FALSE 0.063 126.000 0.000 NA   NA
 7004174 7004175 CCC13826_1110 CCC13826_2210     FALSE 0.040 167.000 0.000 NA   NA
 7004175 7004176 CCC13826_2210 CCC13826_2211     TRUE 0.848 9.000 0.000 NA   NA
 7004176 7004177 CCC13826_2211 CCC13826_2212     TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 7004177 7004178 CCC13826_2212 CCC13826_2213     TRUE 0.619 15.000 0.000 NA   NA
 7004178 7004179 CCC13826_2213 CCC13826_2214     TRUE 0.696 13.000 0.000 NA   NA
 7004179 7004180 CCC13826_2214 CCC13826_1116     FALSE 0.219 46.000 0.000 NA   NA
 7004180 7004181 CCC13826_1116 CCC13826_1117     FALSE 0.007 565.000 0.000 NA   NA
 7004182 7004183 CCC13826_2215 CCC13826_1118     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 7004183 7004184 CCC13826_1118 CCC13826_1119     FALSE 0.009 431.000 0.000 NA   NA
 7004184 7004185 CCC13826_1119 CCC13826_1120     TRUE 0.500 21.000 0.000 0.050   NA
 7004185 7004186 CCC13826_1120 CCC13826_1121     FALSE 0.040 167.000 0.000 NA   NA
 7004186 7004187 CCC13826_1121 CCC13826_1122   flgD TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 7004187 7004188 CCC13826_1122 CCC13826_1123 flgD hydD TRUE 0.979 9.000 0.184 NA   NA
 7004190 7004191 CCC13826_1125 CCC13826_1126 hydB hydA FALSE 0.015 295.000 0.000 NA   NA
 7004191 7004192 CCC13826_1126 CCC13826_1127 hydA   FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 7004192 7004193 CCC13826_1127 CCC13826_1128     TRUE 0.887 -22.000 0.011 NA   NA
 7004193 7004194 CCC13826_1128 CCC13826_1129     TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 7004194 7004195 CCC13826_1129 CCC13826_1130   xerC TRUE 0.985 -10.000 0.740 NA   NA
 7004195 7004196 CCC13826_1130 CCC13826_1131 xerC   TRUE 0.979 -15.000 0.625 NA   NA
 7004196 7004197 CCC13826_1131 CCC13826_1132     FALSE 0.305 45.000 0.000 1.000 N NA
 7004198 7004199 CCC13826_1133 CCC13826_1134   murF TRUE 0.974 -13.000 0.059 NA N NA
 7004199 7004200 CCC13826_1134 CCC13826_1135 murF   TRUE 0.420 24.000 0.000 NA   NA
 7004201 7004202 CCC13826_1136 CCC13826_1137   purF TRUE 0.941 -3.000 0.003 NA   NA
 7004202 7004203 CCC13826_1137 CCC13826_1138 purF dapB FALSE 0.079 271.000 0.022 1.000 N NA
 7004203 7004204 CCC13826_1138 CCC13826_1139 dapB   FALSE 0.027 217.000 0.000 NA   NA
 7004204 7004205 CCC13826_1139 CCC13826_1140   trxB FALSE 0.026 219.000 0.000 NA   NA
 7004205 7004206 CCC13826_1140 CCC13826_1141 trxB   TRUE 0.885 10.000 0.004 NA   NA
 7004206 7004207 CCC13826_1141 CCC13826_1142   trx TRUE 0.940 0.000 0.020 NA   NA
 7004207 7004208 CCC13826_1142 CCC13826_1143 trx   TRUE 0.477 74.000 0.027 1.000 N NA
 7004208 7004209 CCC13826_1143 CCC13826_1144     TRUE 0.916 2.000 0.004 1.000 N NA
 7004209 7004210 CCC13826_1144 CCC13826_1145     TRUE 0.983 -3.000 0.018 1.000 Y NA
 7004210 7004211 CCC13826_1145 CCC13826_1146     TRUE 0.969 10.000 0.098 NA   NA
 7004211 7004212 CCC13826_1146 CCC13826_1147   pgsA TRUE 0.990 -6.000 0.882 NA   NA
 7004212 7004213 CCC13826_1147 CCC13826_1148 pgsA   TRUE 0.973 -7.000 0.033 NA   NA
 7004213 7004214 CCC13826_1148 CCC13826_1149     FALSE 0.323 101.000 0.031 1.000   NA
 7004214 7004215 CCC13826_1149 CCC13826_1150   rpmE TRUE 0.966 4.000 0.031 1.000   NA
 7004215 7004216 CCC13826_1150 CCC13826_1151 rpmE   FALSE 0.354 82.000 0.023 NA   NA
 7004216 7004217 CCC13826_1151 CCC13826_1152     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7004217 7004218 CCC13826_1152 CCC13826_1153     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004218 7004219 CCC13826_1153 CCC13826_1154     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004219 7004220 CCC13826_1154 CCC13826_1155     TRUE 0.980 0.000 0.139 1.000 N NA
 7004220 7004221 CCC13826_1155 CCC13826_1156   moaA TRUE 0.966 0.000 0.028 0.029 N NA
 7004221 7004222 CCC13826_1156 CCC13826_1157 moaA   FALSE 0.236 135.000 0.042 NA   NA
 7004222 7004223 CCC13826_1157 CCC13826_1158     TRUE 0.978 10.000 0.476 NA   NA
 7004223 7004224 CCC13826_1158 CCC13826_1159   ubiA TRUE 0.985 -3.000 0.100 NA   NA
 7004225 7004226 CCC13826_1160 CCC13826_1161   miaA TRUE 0.959 3.000 0.021 1.000 N NA
 7004227 7004228 CCC13826_1162 CCC13826_1163 ilvH nifS TRUE 0.901 17.000 0.056 1.000 N NA
 7004229 7004230 CCC13826_1164 CCC13826_1165     FALSE 0.129 83.000 0.000 NA   NA
 7004230 7004231 CCC13826_1165 CCC13826_1166     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004231 7004232 CCC13826_1166 CCC13826_1167     FALSE 0.092 103.000 0.000 NA   NA
 7004232 7004233 CCC13826_1167 CCC13826_1168     TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7004233 7004234 CCC13826_1168 CCC13826_1169     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004234 7004235 CCC13826_1169 CCC13826_1170     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004235 7004236 CCC13826_1170 CCC13826_1171     TRUE 0.400 25.000 0.000 NA   NA
 7004236 7004237 CCC13826_1171 CCC13826_1172   trxB TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7004237 7004238 CCC13826_1172 CCC13826_1173 trxB dhs TRUE 0.493 19.000 0.000 NA   NA
 7004238 7004239 CCC13826_1173 CCC13826_1174 dhs   TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7004239 7004240 CCC13826_1174 CCC13826_1175     TRUE 0.493 19.000 0.000 NA   NA
 7004240 7004241 CCC13826_1175 CCC13826_1176     FALSE 0.103 97.000 0.000 NA   NA
 7004241 7004242 CCC13826_1176 CCC13826_1177     FALSE 0.073 116.000 0.000 NA   NA
 7004242 7004243 CCC13826_1177 CCC13826_1178     TRUE 0.792 38.000 0.462 NA   NA
 7004243 7004244 CCC13826_1178 CCC13826_1179     TRUE 0.971 10.000 0.122 NA   NA
 7004244 7004245 CCC13826_1179 CCC13826_1180     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7004245 7004246 CCC13826_1180 CCC13826_1181     TRUE 0.421 81.000 0.034 NA   NA
 7004246 7004247 CCC13826_1181 CCC13826_1182     TRUE 0.983 3.000 0.821 NA   NA
 7004247 7004248 CCC13826_1182 CCC13826_1183     TRUE 0.973 9.000 0.075 NA   NA
 7004248 7004249 CCC13826_1183 CCC13826_1184   vasA TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004249 7004250 CCC13826_1184 CCC13826_1185 vasA   TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004250 7004251 CCC13826_1185 CCC13826_1186     FALSE 0.139 78.000 0.000 NA   NA
 7004251 7004252 CCC13826_1186 CCC13826_1187     TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7004252 7004253 CCC13826_1187 CCC13826_1188     FALSE 0.173 65.000 0.000 NA   NA
 7004253 7004254 CCC13826_1188 CCC13826_1189     FALSE 0.081 110.000 0.000 NA   NA
 7004254 7004255 CCC13826_1189 CCC13826_1190     FALSE 0.171 66.000 0.000 NA   NA
 7004255 7004256 CCC13826_1190 CCC13826_1191     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004256 7004257 CCC13826_1191 CCC13826_1192     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 7004257 7004258 CCC13826_1192 CCC13826_1193     FALSE 0.177 63.000 0.000 NA   NA
 7004258 7004259 CCC13826_1193 CCC13826_1194     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004259 7004260 CCC13826_1194 CCC13826_1195     FALSE 0.007 494.000 0.000 NA   NA
 7004260 7004261 CCC13826_1195 CCC13826_1196     TRUE 0.493 19.000 0.000 NA   NA
 7004261 7004262 CCC13826_1196 CCC13826_1197     FALSE 0.009 486.000 0.000 0.004   NA
 7004262 7004263 CCC13826_1197 CCC13826_1198     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004263 7004264 CCC13826_1198 CCC13826_1636   nhaC FALSE 0.037 174.000 0.000 NA   NA
 7004265 7004266 CCC13826_1637 CCC13826_1638     TRUE 0.450 22.000 0.000 NA   NA
 7004266 7004267 CCC13826_1638 CCC13826_1639     TRUE 0.986 -10.000 0.241 0.028 N NA
 7004267 7004268 CCC13826_1639 CCC13826_1640     TRUE 0.980 11.000 0.945 1.000 N NA
 7004268 7004269 CCC13826_1640 CCC13826_1641     FALSE 0.102 302.000 0.145 1.000   NA
 7004269 7004270 CCC13826_1641 CCC13826_1642   ccoG TRUE 0.852 31.000 0.818 1.000   NA
 7004271 7004272 CCC13826_1643 CCC13826_1644     FALSE 0.028 207.000 0.000 NA   NA
 7004272 7004273 CCC13826_1644 CCC13826_1645     FALSE 0.265 40.000 0.000 NA   NA
 7004273 7004274 CCC13826_1645 CCC13826_1646     TRUE 0.987 -3.000 0.161 NA   NA
 7004274 7004275 CCC13826_1646 CCC13826_1647     TRUE 0.983 3.000 0.763 NA   NA
 7004275 7004276 CCC13826_1647 CCC13826_1648     TRUE 0.981 3.000 0.118 1.000 N NA
 7004276 7004277 CCC13826_1648 CCC13826_1649     TRUE 0.955 4.000 0.021 NA   NA
 7004277 7004278 CCC13826_1649 CCC13826_1650     FALSE 0.014 304.000 0.000 NA   NA
 7004278 7004279 CCC13826_1650 CCC13826_1652     FALSE 0.173 65.000 0.000 NA   NA
 7004279 7004280 CCC13826_1652 CCC13826_1653     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7004280 7004281 CCC13826_1653 CCC13826_1654     FALSE 0.034 187.000 0.000 NA   NA
 7004281 7004282 CCC13826_1654 CCC13826_1655     TRUE 0.882 0.000 0.000 1.000 N NA
 7004282 7004283 CCC13826_1655 CCC13826_1656     FALSE 0.373 108.000 0.041 1.000 N NA
 7004283 7004284 CCC13826_1656 CCC13826_1657     TRUE 0.989 -18.000 0.571 0.004 Y NA
 7004284 7004285 CCC13826_1657 CCC13826_1658     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004285 7004286 CCC13826_1658 CCC13826_1660     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004286 7004287 CCC13826_1660 CCC13826_1661     TRUE 0.989 -3.000 0.464 NA   NA
 7004287 7004288 CCC13826_1661 CCC13826_1662     TRUE 0.990 -3.000 0.444 0.011   NA
 7004288 7004289 CCC13826_1662 CCC13826_1663     TRUE 0.990 -7.000 0.065 0.011 Y NA
 7004289 7004290 CCC13826_1663 CCC13826_1664     TRUE 0.991 9.000 0.500 0.011 Y NA
 7004290 7004291 CCC13826_1664 CCC13826_1665     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7004291 7004292 CCC13826_1665 CCC13826_1667     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7004292 7004293 CCC13826_1667 CCC13826_1668     TRUE 0.984 0.000 0.056 0.004 Y NA
 7004293 7004294 CCC13826_1668 CCC13826_1669   fdhD TRUE 0.995 -3.000 0.389 0.004 Y NA
 7004294 7004295 CCC13826_1669 CCC13826_1670 fdhD   TRUE 0.979 -16.000 0.586 1.000   NA
 7004295 7004296 CCC13826_1670 CCC13826_2216     FALSE 0.006 854.000 0.000 NA   NA
 7004296 7004297 CCC13826_2216 CCC13826_2217     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7004297 7004298 CCC13826_2217 CCC13826_2218     TRUE 0.619 15.000 0.000 NA   NA
 7004298 7004299 CCC13826_2218 CCC13826_2219     TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7004299 7004300 CCC13826_2219 CCC13826_2220     FALSE 0.073 116.000 0.000 NA   NA
 7004300 7004301 CCC13826_2220 CCC13826_2221     TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 7004301 7004302 CCC13826_2221 CCC13826_1677     FALSE 0.027 210.000 0.000 NA   NA
 7004302 7004303 CCC13826_1677 CCC13826_1678     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004305 7004306 CCC13826_0608 CCC13826_2335     TRUE 0.825 10.000 0.000 1.000   NA
 7004306 7004307 CCC13826_2335 CCC13826_1683     FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 7004307 7004308 CCC13826_1683 CCC13826_1684     FALSE 0.051 141.000 0.000 NA   NA
 7004308 7004309 CCC13826_1684 CCC13826_1685     TRUE 0.756 -30.000 0.000 NA   NA
 7004309 7004310 CCC13826_1685 CCC13826_1687     FALSE 0.020 251.000 0.000 NA   NA
 7004310 7004311 CCC13826_1687 CCC13826_1688     TRUE 0.848 9.000 0.000 NA   NA
 7004311 7004312 CCC13826_1688 CCC13826_1689     TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 7004312 7004313 CCC13826_1689 CCC13826_1690     FALSE 0.012 330.000 0.000 NA   NA
 7004313 7004314 CCC13826_1690 CCC13826_1691     FALSE 0.009 422.000 0.000 NA   NA
 7004314 7004315 CCC13826_1691 CCC13826_1692     FALSE 0.138 81.000 0.000 1.000   NA
 7004315 7004316 CCC13826_1692 CCC13826_1952     FALSE 0.007 499.000 0.000 NA   NA
 7004316 7004317 CCC13826_1952 CCC13826_2222     FALSE 0.012 335.000 0.000 NA   NA
 7004317 7004318 CCC13826_2222 CCC13826_1951     FALSE 0.033 189.000 0.000 NA   NA
 7004318 7004319 CCC13826_1951 CCC13826_1950     FALSE 0.005 922.000 0.000 NA   NA
 7004319 7004320 CCC13826_1950 CCC13826_2223     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 7004320 7004321 CCC13826_2223 CCC13826_1949   nrtD FALSE 0.008 432.000 0.000 NA   NA
 7004321 7004322 CCC13826_1949 CCC13826_1948 nrtD   FALSE 0.016 282.000 0.000 NA   NA
 7004322 7004323 CCC13826_1948 CCC13826_1947     FALSE 0.060 130.000 0.000 NA   NA
 7004323 7004324 CCC13826_1947 CCC13826_1946     TRUE 0.696 13.000 0.000 NA   NA
 7004324 7004325 CCC13826_1946 CCC13826_1945     FALSE 0.273 39.000 0.000 NA   NA
 7004325 7004326 CCC13826_1945 CCC13826_1944     FALSE 0.171 66.000 0.000 NA   NA
 7004326 7004327 CCC13826_1944 CCC13826_1943     FALSE 0.009 403.000 0.000 NA   NA
 7004327 7004328 CCC13826_1943 CCC13826_1942     FALSE 0.295 36.000 0.000 NA   NA
 7004328 7004329 CCC13826_1942 CCC13826_1941     FALSE 0.009 400.000 0.000 NA   NA
 7004329 7004330 CCC13826_1941 CCC13826_1940     TRUE 0.863 6.000 0.000 1.000   NA
 7004330 7004331 CCC13826_1940 CCC13826_1939     FALSE 0.202 50.000 0.000 NA   NA
 7004331 7004332 CCC13826_1939 CCC13826_1938     FALSE 0.145 75.000 0.000 NA   NA
 7004332 7004333 CCC13826_1938 CCC13826_1937     FALSE 0.011 352.000 0.000 NA   NA
 7004333 7004334 CCC13826_1937 CCC13826_1936     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004338 7004339 CCC13826_1932 CCC13826_1931     FALSE 0.053 138.000 0.000 NA   NA
 7004339 7004340 CCC13826_1931 CCC13826_1930     TRUE 0.977 4.000 0.094 NA   NA
 7004340 7004341 CCC13826_1930 CCC13826_1929     TRUE 0.965 12.000 0.391 1.000   NA
 7004342 7004343 CCC13826_1928 CCC13826_1927     TRUE 0.984 0.000 0.069 1.000 Y NA
 7004343 7004344 CCC13826_1927 CCC13826_1926     TRUE 0.938 24.000 0.594 0.027 Y NA
 7004344 7004345 CCC13826_1926 CCC13826_1925     TRUE 0.978 10.000 0.032 0.012 Y NA
 7004345 7004346 CCC13826_1925 CCC13826_1924     TRUE 0.978 10.000 0.032 0.012 Y NA
 7004346 7004347 CCC13826_1924 CCC13826_1923     FALSE 0.072 145.000 0.000 1.000 N NA
 7004348 7004349 CCC13826_1922 CCC13826_1921   petA FALSE 0.025 364.000 0.003 1.000 N NA
 7004349 7004350 CCC13826_1921 CCC13826_1920 petA   TRUE 0.981 11.000 0.093 0.002 Y NA
 7004350 7004351 CCC13826_1920 CCC13826_1919     TRUE 0.988 3.000 0.103 0.002 Y NA
 7004351 7004352 CCC13826_1919 CCC13826_2224     FALSE 0.006 871.000 0.000 NA   NA
 7004352 7004353 CCC13826_2224 CCC13826_1918     TRUE 0.733 -49.000 0.000 NA   NA
 7004354 7004355 CCC13826_1917 CCC13826_1916     FALSE 0.227 45.000 0.000 NA   NA
 7004356 7004357 CCC13826_1915 CCC13826_1914     TRUE 0.990 2.000 0.857 NA Y NA
 7004357 7004358 CCC13826_1914 CCC13826_1913   yyaQ TRUE 0.986 10.000 0.176 1.000 Y NA
 7004358 7004359 CCC13826_1913 CCC13826_1912 yyaQ hyfE TRUE 0.982 2.000 0.064 1.000 Y NA
 7004359 7004360 CCC13826_1912 CCC13826_1911 hyfE   TRUE 0.992 3.000 0.864 0.011 Y NA
 7004360 7004361 CCC13826_1911 CCC13826_0711   tag TRUE 0.991 -3.000 0.048 0.011 Y NA
 7004361 7004362 CCC13826_0711 CCC13826_0712 tag   TRUE 0.993 -3.000 0.133 NA Y NA
 7004362 7004363 CCC13826_0712 CCC13826_0713     TRUE 0.993 -3.000 0.133 NA Y NA
 7004363 7004364 CCC13826_0713 CCC13826_0714     TRUE 0.987 -3.000 0.188 NA   NA
 7004364 7004365 CCC13826_0714 CCC13826_0715     TRUE 0.979 0.000 0.360 NA   NA
 7004365 7004366 CCC13826_0715 CCC13826_0716     FALSE 0.147 184.000 0.022 1.000 N NA
 7004366 7004367 CCC13826_0716 CCC13826_0717     FALSE 0.021 249.000 0.000 1.000   NA
 7004367 7004368 CCC13826_0717 CCC13826_0718     TRUE 0.570 50.000 0.043 NA   NA
 7004368 7004369 CCC13826_0718 CCC13826_0719   carA TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004369 7004370 CCC13826_0719 CCC13826_0720 carA   TRUE 0.438 23.000 0.000 NA   NA
 7004370 7004371 CCC13826_0720 CCC13826_0721     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7004371 7004372 CCC13826_0721 CCC13826_0722     TRUE 0.954 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 7004372 7004373 CCC13826_0722 CCC13826_0723   ccoN FALSE 0.110 93.000 0.000 NA   NA
 7004373 7004374 CCC13826_0723 CCC13826_0724 ccoN ccoO TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004374 7004375 CCC13826_0724 CCC13826_0725 ccoO   TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7004375 7004376 CCC13826_0725 CCC13826_0726   ccoP TRUE 0.985 -12.000 0.286 0.001 N NA
 7004376 7004377 CCC13826_0726 CCC13826_0727 ccoP   TRUE 0.981 0.000 0.579 NA   NA
 7004377 7004378 CCC13826_0727 CCC13826_0728     TRUE 0.698 56.000 0.526 NA   NA
 7004378 7004379 CCC13826_0728 CCC13826_0730     TRUE 0.985 -7.000 0.250 NA   NA
 7004380 7004381 CCC13826_0729 CCC13826_0731     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 7004381 7004382 CCC13826_0731 CCC13826_0732   nhaA FALSE 0.288 37.000 0.000 NA   NA
 7004383 7004384 CCC13826_0733 CCC13826_0734 pcm   FALSE 0.171 66.000 0.000 NA   NA
 7004384 7004385 CCC13826_0734 CCC13826_0735     TRUE 0.741 -43.000 0.000 NA   NA
 7004385 7004386 CCC13826_0735 CCC13826_0736   nrdB TRUE 0.993 -3.000 0.117 0.049 Y NA
 7004386 7004387 CCC13826_0736 CCC13826_0737 nrdB rplM FALSE 0.298 81.000 0.009 1.000 N NA
 7004387 7004388 CCC13826_0737 CCC13826_0738 rplM rpsI TRUE 0.990 3.000 0.231 0.026 Y NA
 7004388 7004389 CCC13826_0738 CCC13826_0739 rpsI   FALSE 0.185 156.000 0.024 1.000 N NA
 7004389 7004390 CCC13826_0739 CCC13826_0740     TRUE 0.532 73.000 0.068 1.000   NA
 7004390 7004391 CCC13826_0740 CCC13826_0741     FALSE 0.014 308.000 0.000 1.000   NA
 7004391 7004392 CCC13826_0741 CCC13826_0742     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004393 7004394 CCC13826_0743 CCC13826_0744     TRUE 0.942 -3.000 0.004 NA   NA
 7004397 7004398 CCC13826_0747 CCC13826_0749 lys1   FALSE 0.006 751.000 0.000 NA   NA
 7004398 7004399 CCC13826_0749 CCC13826_0751     FALSE 0.133 81.000 0.000 NA   NA
 7004400 7004401 CCC13826_0752 CCC13826_0753     FALSE 0.053 138.000 0.000 NA   NA
 7004401 7004402 CCC13826_0753 CCC13826_0754     TRUE 0.987 -7.000 0.412 NA   NA
 7004403 7004404 CCC13826_0755 CCC13826_0756 selA selB TRUE 0.992 -3.000 0.569 0.001 N NA
 7004404 7004405 CCC13826_0756 CCC13826_0757 selB   TRUE 0.778 -22.000 0.000 NA   NA
 7004405 7004406 CCC13826_0757 CCC13826_0758   tpx TRUE 0.745 -40.000 0.000 NA   NA
 7004406 7004407 CCC13826_0758 CCC13826_0759 tpx   FALSE 0.016 281.000 0.000 NA   NA
 7004407 7004408 CCC13826_0759 CCC13826_0760     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7004408 7004409 CCC13826_0760 CCC13826_0761     FALSE 0.207 49.000 0.000 NA   NA
 7004409 7004410 CCC13826_0761 CCC13826_0762     TRUE 0.973 11.000 0.444 0.005   NA
 7004410 7004411 CCC13826_0762 CCC13826_0763   sodB FALSE 0.045 316.000 0.016 1.000 N NA
 7004411 7004412 CCC13826_0763 CCC13826_0764 sodB   TRUE 0.936 21.000 0.238 NA Y NA
 7004412 7004413 CCC13826_0764 CCC13826_0765     TRUE 0.696 52.000 0.386 NA   NA
 7004413 7004414 CCC13826_0765 CCC13826_0766     TRUE 0.990 -3.000 0.625 NA   NA
 7004414 7004415 CCC13826_0766 CCC13826_0767     TRUE 0.987 -13.000 0.878 0.092 N NA
 7004415 7004416 CCC13826_0767 CCC13826_0768     TRUE 0.980 2.000 0.175 1.000 N NA
 7004416 7004417 CCC13826_0768 CCC13826_0769     TRUE 0.959 -10.000 0.023 1.000   NA
 7004417 7004418 CCC13826_0769 CCC13826_0770     TRUE 0.974 10.000 0.188 NA   NA
 7004418 7004419 CCC13826_0770 CCC13826_0771   cynT FALSE 0.327 32.000 0.000 NA   NA
 7004420 7004421 CCC13826_0772 CCC13826_0773   serS TRUE 0.935 0.000 0.016 1.000   NA
 7004421 7004422 CCC13826_0773 CCC13826_0774 serS secG TRUE 0.570 22.000 0.003 NA   NA
 7004422 7004423 CCC13826_0774 CCC13826_0775 secG trpS TRUE 0.927 9.000 0.011 NA   NA
 7004423 7004424 CCC13826_0775 CCC13826_0776 trpS aroK FALSE 0.038 708.000 0.033 1.000 N NA
 7004424 7004425 CCC13826_0776 CCC13826_0777 aroK engA TRUE 0.887 -19.000 0.007 1.000   NA
 7004426 7004427 CCC13826_0778 CCC13826_0779   kdsA TRUE 0.875 11.000 0.007 1.000   NA
 7004427 7004428 CCC13826_0779 CCC13826_0780 kdsA   FALSE 0.125 86.000 0.000 NA   NA
 7004428 7004429 CCC13826_0780 CCC13826_0781     TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 7004429 7004430 CCC13826_0781 CCC13826_0782     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004430 7004431 CCC13826_0782 CCC13826_0783   ribH TRUE 0.385 47.000 0.003 1.000 N NA
 7004431 7004432 CCC13826_0783 CCC13826_0784 ribH nusB TRUE 0.970 2.000 0.045 1.000 N NA
 7004432 7004433 CCC13826_0784 CCC13826_0785 nusB pyrF TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004433 7004434 CCC13826_0785 CCC13826_0786 pyrF   FALSE 0.022 238.000 0.000 NA   NA
 7004434 7004435 CCC13826_0786 CCC13826_0788   rplW FALSE 0.022 237.000 0.000 NA   NA
 7004436 7004437 CCC13826_0787 CCC13826_0789 rplB   TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7004437 7004438 CCC13826_0789 CCC13826_0790     FALSE 0.041 166.000 0.000 NA   NA
 7004438 7004439 CCC13826_0790 CCC13826_0791   aroC FALSE 0.029 201.000 0.000 NA   NA
 7004439 7004440 CCC13826_0791 CCC13826_0792 aroC rnc TRUE 0.848 9.000 0.000 NA   NA
 7004440 7004441 CCC13826_0792 CCC13826_0793 rnc rnhA TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004441 7004442 CCC13826_0793 CCC13826_0794 rnhA soj TRUE 0.778 -22.000 0.000 NA   NA
 7004443 7004444 CCC13826_0795 CCC13826_0796 dnaG thiD FALSE 0.099 99.000 0.000 NA   NA
 7004444 7004445 CCC13826_0796 CCC13826_0797 thiD   TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7004445 7004446 CCC13826_0797 CCC13826_0798     TRUE 0.973 -3.000 0.022 0.027   NA
 7004446 7004447 CCC13826_0798 CCC13826_0799   fliA TRUE 0.619 15.000 0.000 NA   NA
 7004447 7004448 CCC13826_0799 CCC13826_0800 fliA pepT TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7004448 7004449 CCC13826_0800 CCC13826_0801 pepT ylxH FALSE 0.293 75.000 0.003 0.049 N NA
 7004449 7004450 CCC13826_0801 CCC13826_0802 ylxH   FALSE 0.089 104.000 0.000 NA   NA
 7004450 7004451 CCC13826_0802 CCC13826_0803     FALSE 0.009 399.000 0.000 NA   NA
 7004451 7004452 CCC13826_0803 CCC13826_0804   pepQ FALSE 0.006 787.000 0.000 1.000   NA
 7004452 7004453 CCC13826_0804 CCC13826_0805 pepQ   FALSE 0.056 138.000 0.000 1.000   NA
 7004453 7004454 CCC13826_0805 CCC13826_0806     FALSE 0.009 419.000 0.000 NA   NA
 7004454 7004455 CCC13826_0806 CCC13826_0807     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004456 7004457 CCC13826_0165 CCC13826_0810     FALSE 0.058 132.000 0.000 NA   NA
 7004457 7004458 CCC13826_0810 CCC13826_0811     FALSE 0.242 43.000 0.000 NA   NA
 7004458 7004459 CCC13826_0811 CCC13826_0812     FALSE 0.126 85.000 0.000 NA   NA
 7004459 7004460 CCC13826_0812 CCC13826_0813   panB FALSE 0.181 61.000 0.000 NA   NA
 7004460 7004461 CCC13826_0813 CCC13826_0814 panB   TRUE 0.784 11.000 0.000 1.000   NA
 7004461 7004462 CCC13826_0814 CCC13826_0815     TRUE 0.619 15.000 0.000 NA   NA
 7004465 7004466 CCC13826_0818 CCC13826_0819     TRUE 0.915 -3.000 0.000 0.048   NA
 7004466 7004467 CCC13826_0819 CCC13826_0820     TRUE 0.977 10.000 0.029 0.002 Y NA
 7004467 7004468 CCC13826_0820 CCC13826_0821     FALSE 0.188 56.000 0.000 NA   NA
 7004468 7004469 CCC13826_0821 CCC13826_0822     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004469 7004470 CCC13826_0822 CCC13826_0824     TRUE 0.637 74.000 0.552 NA   NA
 7004472 7004473 CCC13826_0825 CCC13826_0826   aspA TRUE 0.695 54.000 0.034 1.000 Y NA
 7004473 7004474 CCC13826_0826 CCC13826_0827 aspA   TRUE 0.619 15.000 0.000 NA   NA
 7004476 7004477 CCC13826_0945 CCC13826_0946     FALSE 0.192 53.000 0.000 NA   NA
 7004477 7004478 CCC13826_0946 CCC13826_0947   atoS FALSE 0.044 153.000 0.000 NA   NA
 7004478 7004479 CCC13826_0947 CCC13826_0949 atoS   TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 7004480 7004481 CCC13826_0948 CCC13826_0950   thiD FALSE 0.155 72.000 0.000 NA   NA
 7004482 7004483 CCC13826_0951 CCC13826_0952     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 7004483 7004484 CCC13826_0952 CCC13826_0953     FALSE 0.010 393.000 0.000 NA   NA
 7004484 7004485 CCC13826_0953 CCC13826_0954     FALSE 0.050 142.000 0.000 NA   NA
 7004485 7004486 CCC13826_0954 CCC13826_0955     FALSE 0.006 761.000 0.000 NA   NA
 7004487 7004488 CCC13826_2225 CCC13826_0957     FALSE 0.071 117.000 0.000 NA   NA
 7004490 7004491 CCC13826_0959 CCC13826_0960     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7004491 7004492 CCC13826_0960 CCC13826_0961     FALSE 0.087 105.000 0.000 NA   NA
 7004492 7004493 CCC13826_0961 CCC13826_0962     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7004493 7004494 CCC13826_0962 CCC13826_0963     FALSE 0.074 115.000 0.000 NA   NA
 7004497 7004498 CCC13826_2226 CCC13826_0966     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7004498 7004499 CCC13826_0966 CCC13826_0967   putP TRUE 0.994 -3.000 0.448 1.000 Y NA
 7004499 7004500 CCC13826_0967 CCC13826_0968 putP recR TRUE 0.967 -3.000 0.011 1.000 N NA
 7004500 7004501 CCC13826_0968 CCC13826_0969 recR   FALSE 0.179 84.000 0.000 1.000 N NA
 7004501 7004502 CCC13826_0969 CCC13826_0970   trpF TRUE 0.983 -13.000 0.052 1.000 Y NA
 7004502 7004503 CCC13826_0970 CCC13826_0972 trpF trpB TRUE 0.992 -10.000 0.375 0.002 Y NA
 7004503 7004504 CCC13826_0972 CCC13826_0973 trpB trpA TRUE 0.993 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 7004504 7004505 CCC13826_0973 CCC13826_0974 trpA   FALSE 0.317 78.000 0.017 NA   NA
 7004505 7004506 CCC13826_0974 CCC13826_0975   fliN TRUE 0.990 -3.000 0.625 NA   NA
 7004506 7004507 CCC13826_0975 CCC13826_0976 fliN   TRUE 0.990 -3.000 0.531 NA   NA
 7004508 7004509 CCC13826_0977 CCC13826_0978   frdC FALSE 0.007 817.000 0.000 0.007   NA
 7004509 7004510 CCC13826_0978 CCC13826_0979 frdC   TRUE 0.982 4.000 0.086 1.000 N NA
 7004510 7004511 CCC13826_0979 CCC13826_0980     TRUE 0.885 36.000 0.375 1.000 Y NA
 7004511 7004512 CCC13826_0980 CCC13826_0981   folB TRUE 0.526 77.000 0.043 1.000 N NA
 7004512 7004513 CCC13826_0981 CCC13826_0982 folB   TRUE 0.980 -3.000 0.040 1.000   NA
 7004513 7004514 CCC13826_0982 CCC13826_0983     TRUE 0.379 60.000 0.016 NA   NA
 7004514 7004515 CCC13826_0983 CCC13826_0984     TRUE 0.974 9.000 0.089 NA   NA
 7004515 7004516 CCC13826_0984 CCC13826_0985     FALSE 0.118 123.000 0.006 NA   NA
 7004516 7004517 CCC13826_0985 CCC13826_0986     FALSE 0.044 198.000 0.000 1.000 N NA
 7004517 7004518 CCC13826_0986 CCC13826_0987   plsX TRUE 0.962 4.000 0.003 0.008 Y NA
 7004518 7004519 CCC13826_0987 CCC13826_0988 plsX rpmF TRUE 0.987 4.000 0.418 1.000 N NA
 7004519 7004520 CCC13826_0988 CCC13826_0989 rpmF   TRUE 0.927 12.000 0.032 NA   NA
 7004520 7004521 CCC13826_0989 CCC13826_0990   ndk TRUE 0.883 15.000 0.033 NA   NA
 7004521 7004522 CCC13826_0990 CCC13826_0991 ndk   FALSE 0.213 103.000 0.015 1.000   NA
 7004523 7004524 CCC13826_0992 CCC13826_0993 uvrA   FALSE 0.295 46.000 0.000 1.000 N NA
 7004524 7004525 CCC13826_0993 CCC13826_0994     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004525 7004526 CCC13826_0994 CCC13826_0995     TRUE 0.983 4.000 0.333 NA   NA
 7004527 7004528 CCC13826_0996 CCC13826_0997 rpmA rplU TRUE 0.984 12.000 0.667 0.024 Y NA
 7004528 7004529 CCC13826_0997 CCC13826_0998 rplU   FALSE 0.083 108.000 0.000 NA   NA
 7004532 7004533 CCC13826_1001 CCC13826_1002     TRUE 0.973 3.000 0.087 NA   NA
 7004533 7004534 CCC13826_1002 CCC13826_1003     TRUE 0.951 -28.000 0.066 NA   NA
 7004534 7004535 CCC13826_1003 CCC13826_1004     TRUE 0.988 -3.000 0.210 1.000   NA
 7004535 7004536 CCC13826_1004 CCC13826_1005     FALSE 0.087 105.000 0.000 NA   NA
 7004536 7004537 CCC13826_1005 CCC13826_1006     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7004537 7004538 CCC13826_1006 CCC13826_1007     TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.002 Y NA
 7004539 7004540 CCC13826_1008 CCC13826_1009 wlaD ansB TRUE 0.668 73.000 0.267 1.000 N NA
 7004543 7004544 CCC13826_0349 CCC13826_0348   tviB TRUE 0.420 24.000 0.000 NA   NA
 7004544 7004545 CCC13826_0348 CCC13826_0347 tviB fmt TRUE 0.559 17.000 0.000 1.000   NA
 7004545 7004546 CCC13826_0347 CCC13826_0361 fmt thiD TRUE 0.643 17.000 0.000 1.000 N NA
 7004546 7004547 CCC13826_0361 CCC13826_0360 thiD   TRUE 0.973 2.000 0.024 1.000 Y NA
 7004547 7004548 CCC13826_0360 CCC13826_0359     TRUE 0.984 -3.000 0.040 1.000 N NA
 7004548 7004549 CCC13826_0359 CCC13826_0358     TRUE 0.950 16.000 0.827 1.000 N NA
 7004549 7004550 CCC13826_0358 CCC13826_0912     TRUE 0.430 96.000 0.037 1.000 N NA
 7004550 7004551 CCC13826_0912 CCC13826_0913     TRUE 0.985 10.000 0.110 0.007 Y NA
 7004551 7004552 CCC13826_0913 CCC13826_0914   atpH TRUE 0.988 0.000 0.132 0.007 Y NA
 7004552 7004553 CCC13826_0914 CCC13826_0915 atpH atpA TRUE 0.974 15.000 0.864 0.007 Y NA
 7004553 7004554 CCC13826_0915 CCC13826_0916 atpA atpG TRUE 0.990 10.000 0.846 0.007 Y NA
 7004554 7004555 CCC13826_0916 CCC13826_0917 atpG atpD TRUE 0.984 12.000 0.724 0.007 Y NA
 7004555 7004556 CCC13826_0917 CCC13826_0918 atpD atpC TRUE 0.956 19.000 0.837 0.007 Y NA
 7004556 7004557 CCC13826_0918 CCC13826_0919 atpC   FALSE 0.273 118.000 0.036 1.000   NA
 7004557 7004558 CCC13826_0919 CCC13826_0920     TRUE 0.982 1.000 0.944 0.038   NA
 7004558 7004559 CCC13826_0920 CCC13826_0921     TRUE 0.977 2.000 0.343 NA   NA
 7004559 7004560 CCC13826_0921 CCC13826_0922   tolB TRUE 0.848 25.000 0.213 NA   NA
 7004560 7004561 CCC13826_0922 CCC13826_0923 tolB   TRUE 0.737 65.000 0.702 1.000 N NA
 7004561 7004562 CCC13826_0923 CCC13826_0924   rfaF TRUE 0.956 14.000 0.794 1.000   NA
 7004562 7004563 CCC13826_0924 CCC13826_0925 rfaF   TRUE 0.692 62.000 0.543 1.000   NA
 7004563 7004564 CCC13826_0925 CCC13826_0926   fabD TRUE 0.936 10.000 0.013 1.000 N NA
 7004564 7004565 CCC13826_0926 CCC13826_0927 fabD mtnN TRUE 0.984 -3.000 0.037 1.000 N NA
 7004565 7004566 CCC13826_0927 CCC13826_0928 mtnN   TRUE 0.984 -3.000 0.042 1.000 N NA
 7004566 7004567 CCC13826_0928 CCC13826_0929     FALSE 0.058 136.000 0.000 1.000   NA
 7004567 7004568 CCC13826_0929 CCC13826_0930     FALSE 0.167 70.000 0.000 1.000   NA
 7004568 7004569 CCC13826_0930 CCC13826_0931     FALSE 0.151 73.000 0.000 NA   NA
 7004569 7004570 CCC13826_0931 CCC13826_0932     TRUE 0.696 13.000 0.000 NA   NA
 7004572 7004573 CCC13826_0934 CCC13826_0936     TRUE 0.420 24.000 0.000 NA   NA
 7004574 7004575 CCC13826_0935 CCC13826_0937     TRUE 0.886 1.000 0.003 NA   NA
 7004575 7004576 CCC13826_0937 CCC13826_0938     TRUE 0.969 -3.000 0.021 NA   NA
 7004576 7004577 CCC13826_0938 CCC13826_0939     TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7004577 7004578 CCC13826_0939 CCC13826_0940     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7004578 7004579 CCC13826_0940 CCC13826_0941   accD TRUE 0.963 3.000 0.035 NA   NA
 7004579 7004580 CCC13826_0941 CCC13826_0942 accD yaeT FALSE 0.056 229.000 0.004 1.000 N NA
 7004581 7004582 CCC13826_0943 CCC13826_1296   tyrS TRUE 0.420 62.000 0.013 1.000 N NA
 7004582 7004583 CCC13826_1296 CCC13826_1297 tyrS lpxC TRUE 0.622 61.000 0.022 1.000 Y NA
 7004583 7004584 CCC13826_1297 CCC13826_1492 lpxC   TRUE 0.623 42.000 0.035 1.000   NA
 7004584 7004585 CCC13826_1492 CCC13826_1493   thrB TRUE 0.963 9.000 0.032 1.000   NA
 7004585 7004586 CCC13826_1493 CCC13826_1494 thrB   TRUE 0.812 22.000 0.044 NA   NA
 7004586 7004587 CCC13826_1494 CCC13826_1495   infB TRUE 0.976 -13.000 0.171 NA   NA
 7004587 7004588 CCC13826_1495 CCC13826_1496 infB rbfA TRUE 0.995 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 7004588 7004589 CCC13826_1496 CCC13826_1497 rbfA   TRUE 0.973 -7.000 0.033 NA   NA
 7004589 7004590 CCC13826_1497 CCC13826_1498   fhs TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7004590 7004591 CCC13826_1498 CCC13826_1500 fhs ribD FALSE 0.195 52.000 0.000 NA   NA
 7004592 7004593 CCC13826_1499 CCC13826_2227     FALSE 0.183 60.000 0.000 NA   NA
 7004593 7004594 CCC13826_2227 CCC13826_1502     FALSE 0.202 50.000 0.000 NA   NA
 7004595 7004596 CCC13826_1503 CCC13826_1504 ftsW_   TRUE 0.979 0.000 0.222 0.003   NA
 7004596 7004597 CCC13826_1504 CCC13826_1505     TRUE 0.984 0.000 1.000 0.003   NA
 7004597 7004598 CCC13826_1505 CCC13826_1506     TRUE 0.975 -7.000 0.038 1.000   NA
 7004598 7004599 CCC13826_1506 CCC13826_1507     TRUE 0.991 0.000 0.827 1.000 Y NA
 7004599 7004600 CCC13826_1507 CCC13826_1508     FALSE 0.324 122.000 0.042 1.000 N NA
 7004600 7004601 CCC13826_1508 CCC13826_1509   pckA TRUE 0.377 103.000 0.016 1.000 Y NA
 7004602 7004603 CCC13826_1510 CCC13826_1511     FALSE 0.030 200.000 0.000 NA   NA
 7004603 7004604 CCC13826_1511 CCC13826_1512     FALSE 0.148 165.000 0.019 1.000 N NA
 7004604 7004605 CCC13826_1512 CCC13826_1513     TRUE 0.931 12.000 0.022 1.000 N NA
 7004605 7004606 CCC13826_1513 CCC13826_1514     TRUE 0.859 12.000 0.010 NA   NA
 7004607 7004608 CCC13826_1515 CCC13826_1516     TRUE 0.980 -3.000 0.040 1.000   NA
 7004608 7004609 CCC13826_1516 CCC13826_1517     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7004609 7004610 CCC13826_1517 CCC13826_1518     TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7004612 7004613 CCC13826_1520 CCC13826_1521 argH   FALSE 0.223 47.000 0.000 1.000   NA
 7004614 7004615 CCC13826_1522 CCC13826_1523     TRUE 0.965 2.000 0.059 NA   NA
 7004615 7004616 CCC13826_1523 CCC13826_1524     FALSE 0.207 49.000 0.000 NA   NA
 7004617 7004618 CCC13826_1525 CCC13826_1526     TRUE 0.994 -3.000 0.313 NA Y NA
 7004620 7004621 CCC13826_1528 CCC13826_1529     TRUE 0.973 1.000 0.130 1.000   NA
 7004621 7004622 CCC13826_1529 CCC13826_1530     TRUE 0.976 -10.000 0.084 1.000   NA
 7004623 7004624 CCC13826_1531 CCC13826_1532     FALSE 0.078 111.000 0.000 NA   NA
 7004624 7004625 CCC13826_1532 CCC13826_1533     TRUE 0.990 0.000 0.500 1.000 Y NA
 7004625 7004626 CCC13826_1533 CCC13826_1534   wbpB TRUE 0.943 4.000 0.000 1.000 Y NA
 7004627 7004628 CCC13826_1535 CCC13826_1536     FALSE 0.155 72.000 0.000 NA   NA
 7004633 7004634 CCC13826_1541 CCC13826_1542   metG TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7004634 7004635 CCC13826_1542 CCC13826_1543 metG   TRUE 0.578 16.000 0.000 NA   NA
 7004635 7004636 CCC13826_1543 CCC13826_1544   fbp TRUE 0.982 0.000 0.778 NA   NA
 7004636 7004637 CCC13826_1544 CCC13826_1545 fbp mobB TRUE 0.932 0.000 0.008 1.000 N NA
 7004637 7004638 CCC13826_1545 CCC13826_1546 mobB   FALSE 0.010 522.000 0.000 NA N NA
 7004638 7004639 CCC13826_1546 CCC13826_1547   ribC TRUE 0.958 -22.000 0.080 NA   NA
 7004639 7004640 CCC13826_1547 CCC13826_1548 ribC gltX TRUE 0.975 9.000 0.088 1.000   NA
 7004641 7004642 CCC13826_1549 CCC13826_1550 mscL   FALSE 0.224 99.000 0.007 1.000 N NA
 7004642 7004643 CCC13826_1550 CCC13826_1551     FALSE 0.098 121.000 0.000 1.000 N NA
 7004643 7004644 CCC13826_1551 CCC13826_1552   fabF TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7004644 7004645 CCC13826_1552 CCC13826_1553 fabF acpP FALSE 0.025 222.000 0.000 NA   NA
 7004645 7004646 CCC13826_1553 CCC13826_1554 acpP psd TRUE 0.970 2.000 0.089 1.000   NA
 7004647 7004648 CCC13826_1555 CCC13826_1556 guaA   TRUE 0.893 11.000 0.004 1.000 N NA
 7004648 7004649 CCC13826_1556 CCC13826_1557     TRUE 0.454 114.000 0.600 NA   NA
 7004650 7004651 CCC13826_1558 CCC13826_1559   uvrC TRUE 0.963 -6.000 0.018 NA   NA
 7004651 7004652 CCC13826_1559 CCC13826_1560 uvrC   TRUE 0.937 -3.000 0.002 NA   NA
 7004652 7004653 CCC13826_1560 CCC13826_1561     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 7004655 7004656 CCC13826_1563 CCC13826_1564 pheS pheT TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004656 7004657 CCC13826_1564 CCC13826_1565 pheT aroA TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004657 7004658 CCC13826_1565 CCC13826_1566 aroA ispH TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 7004658 7004659 CCC13826_1566 CCC13826_1567 ispH rpsA TRUE 0.590 81.000 0.118 1.000 N NA
 7004659 7004660 CCC13826_1567 CCC13826_1568 rpsA   TRUE 0.982 6.000 0.343 NA   NA
 7004660 7004661 CCC13826_1568 CCC13826_1569   serA TRUE 0.973 -3.000 0.025 NA   NA
 7004661 7004662 CCC13826_1569 CCC13826_1570 serA efp TRUE 0.681 22.000 0.007 1.000 N NA
 7004662 7004663 CCC13826_1570 CCC13826_1571 efp   TRUE 0.400 25.000 0.000 NA   NA
 7004666 7004667 CCC13826_1574 CCC13826_1575   surE TRUE 0.972 -10.000 0.051 1.000   NA
 7004668 7004669 CCC13826_1576 CCC13826_1577 lpxB greA TRUE 0.976 4.000 0.042 1.000 N NA
 7004669 7004670 CCC13826_1577 CCC13826_1578 greA   FALSE 0.343 64.000 0.012 1.000   NA
 7004670 7004671 CCC13826_1578 CCC13826_1579     TRUE 0.969 0.000 0.065 1.000   NA
 7004671 7004672 CCC13826_1579 CCC13826_1580     TRUE 0.989 9.000 0.147 0.011 Y NA
 7004672 7004673 CCC13826_1580 CCC13826_1581     TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7004673 7004674 CCC13826_1581 CCC13826_1582   serB TRUE 0.848 9.000 0.000 NA   NA
 7004674 7004675 CCC13826_1582 CCC13826_1583 serB tal TRUE 0.971 5.000 0.029 1.000 N NA
 7004675 7004676 CCC13826_1583 CCC13826_1584 tal   TRUE 0.810 39.000 0.273 1.000 N NA
 7004676 7004677 CCC13826_1584 CCC13826_1585     TRUE 0.401 68.000 0.014 1.000 N NA
 7004677 7004678 CCC13826_1585 CCC13826_1586     TRUE 0.756 81.000 0.496 0.038 Y NA
 7004678 7004679 CCC13826_1586 CCC13826_1587     TRUE 0.977 -3.000 0.031 1.000   NA
 7004679 7004680 CCC13826_1587 CCC13826_1588   lysA TRUE 0.437 56.000 0.021 1.000   NA
 7004680 7004681 CCC13826_1588 CCC13826_1589 lysA   TRUE 0.959 -16.000 0.013 1.000 Y NA
 7004681 7004682 CCC13826_1589 CCC13826_1590   hisC TRUE 0.977 0.000 0.028 1.000 Y NA
 7004682 7004683 CCC13826_1590 CCC13826_1591 hisC fliF TRUE 0.981 5.000 0.084 1.000 N NA
 7004683 7004684 CCC13826_1591 CCC13826_1592 fliF fliG TRUE 0.990 0.000 0.477 0.010 Y NA
 7004684 7004685 CCC13826_1592 CCC13826_1593 fliG fliH TRUE 0.994 -3.000 0.308 NA Y NA
 7004685 7004686 CCC13826_1593 CCC13826_1594 fliH dxs TRUE 0.982 -7.000 0.052 NA N NA
 7004686 7004687 CCC13826_1594 CCC13826_1595 dxs rho FALSE 0.155 72.000 0.000 NA   NA
 7004687 7004688 CCC13826_1595 CCC13826_1596 rho fhaB FALSE 0.048 146.000 0.000 NA   NA
 7004688 7004689 CCC13826_1596 CCC13826_1597 fhaB   TRUE 0.662 14.000 0.000 NA   NA
 7004689 7004690 CCC13826_1597 CCC13826_1599   serC TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7004690 7004691 CCC13826_1599 CCC13826_1600 serC   TRUE 0.840 0.000 0.000 1.000   NA
 7004693 7004694 CCC13826_1602 CCC13826_1603     FALSE 0.026 221.000 0.000 NA   NA
 7004694 7004695 CCC13826_1603 CCC13826_1604     FALSE 0.012 348.000 0.000 NA   NA
 7004696 7004697 CCC13826_1605 CCC13826_1606     TRUE 0.963 0.000 0.026 1.000 N NA
 7004697 7004698 CCC13826_1606 CCC13826_1607     TRUE 0.971 -19.000 0.250 NA   NA
 7004698 7004699 CCC13826_1607 CCC13826_1608   apt TRUE 0.948 2.000 0.026 NA   NA
 7004699 7004700 CCC13826_1608 CCC13826_1609 apt   TRUE 0.785 21.000 0.028 NA   NA
 7004700 7004701 CCC13826_1609 CCC13826_2228   rpiB TRUE 0.985 -3.000 0.103 NA   NA
 7004703 7004704 CCC13826_0830 CCC13826_0831   lepB TRUE 0.970 -13.000 0.055 0.026   NA
 7004704 7004705 CCC13826_0831 CCC13826_0832 lepB   TRUE 0.964 12.000 0.117 1.000 N NA
 7004706 7004707 CCC13826_0833 CCC13826_0834   hemL TRUE 0.988 -3.000 0.212 1.000   NA
 7004707 7004708 CCC13826_0834 CCC13826_0835 hemL   TRUE 0.980 0.000 0.462 NA   NA
 7004708 7004709 CCC13826_0835 CCC13826_0836     TRUE 0.972 -19.000 0.269 NA   NA
 7004709 7004710 CCC13826_0836 CCC13826_0837     TRUE 0.982 -10.000 0.318 NA   NA
 7004710 7004711 CCC13826_0837 CCC13826_0838     TRUE 0.982 4.000 0.227 1.000   NA
 7004711 7004712 CCC13826_0838 CCC13826_0839     TRUE 0.973 0.000 0.104 1.000   NA
 7004712 7004713 CCC13826_0839 CCC13826_0840     TRUE 0.526 67.000 0.042 0.085   NA
 7004713 7004714 CCC13826_0840 CCC13826_0841   cheB TRUE 0.824 35.000 0.500 0.012   NA
 7004714 7004715 CCC13826_0841 CCC13826_0842 cheB fhaC TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 7004715 7004716 CCC13826_0842 CCC13826_0843 fhaC   FALSE 0.119 89.000 0.000 NA   NA
 7004716 7004717 CCC13826_0843 CCC13826_0844     FALSE 0.227 45.000 0.000 NA   NA
 7004717 7004718 CCC13826_0844 CCC13826_0845     TRUE 0.769 -24.000 0.000 NA   NA
 7004718 7004719 CCC13826_0845 CCC13826_0846     TRUE 0.950 13.000 0.205 NA   NA
 7004719 7004720 CCC13826_0846 CCC13826_0847   asd FALSE 0.158 71.000 0.000 NA   NA
 7004721 7004722 CCC13826_0848 CCC13826_0849     FALSE 0.094 102.000 0.000 NA   NA
 7004725 7004726 CCC13826_0852 CCC13826_0853     TRUE 0.786 -22.000 0.000 1.000   NA
 7004726 7004727 CCC13826_0853 CCC13826_0854     TRUE 0.373 27.000 0.000 NA   NA
 7004727 7004728 CCC13826_0854 CCC13826_0855   lepA FALSE 0.116 90.000 0.000 NA   NA
 7004728 7004729 CCC13826_0855 CCC13826_0856 lepA   FALSE 0.185 59.000 0.000 NA   NA
 7004729 7004730 CCC13826_0856 CCC13826_0857     FALSE 0.045 152.000 0.000 NA   NA
 7004730 7004731 CCC13826_0857 CCC13826_0858     TRUE 0.977 -6.000 0.036 NA   NA
 7004731 7004732 CCC13826_0858 CCC13826_0859     TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7004732 7004733 CCC13826_0859 CCC13826_0860     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004733 7004734 CCC13826_0860 CCC13826_0861   glnQ FALSE 0.073 116.000 0.000 NA   NA
 7004735 7004736 CCC13826_0862 CCC13826_0863     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004736 7004737 CCC13826_0863 CCC13826_0864     TRUE 0.979 -3.000 0.035 NA   NA
 7004737 7004738 CCC13826_0864 CCC13826_0865   napB TRUE 0.976 0.000 0.174 NA   NA
 7004738 7004739 CCC13826_0865 CCC13826_0866 napB   TRUE 0.994 -3.000 0.385 NA Y NA
 7004739 7004740 CCC13826_0866 CCC13826_0867   napG TRUE 0.991 -3.000 0.795 0.042   NA
 7004740 7004741 CCC13826_0867 CCC13826_0868 napG napA TRUE 0.981 3.000 0.270 0.042   NA
 7004741 7004742 CCC13826_0868 CCC13826_0869 napA glnQ FALSE 0.008 957.000 0.000 1.000 N NA
 7004742 7004743 CCC13826_0869 CCC13826_0870 glnQ   FALSE 0.073 118.000 0.000 1.000   NA
 7004743 7004744 CCC13826_0870 CCC13826_0871     TRUE 0.967 10.000 0.077 NA   NA
 7004744 7004745 CCC13826_0871 CCC13826_0872   algC TRUE 0.954 0.000 0.028 NA   NA
 7004746 7004747 CCC13826_0873 CCC13826_0874     TRUE 0.969 3.000 0.052 NA   NA
 7004747 7004748 CCC13826_0874 CCC13826_0875   alr TRUE 0.983 -7.000 0.119 NA   NA
 7004748 7004749 CCC13826_0875 CCC13826_0877 alr   FALSE 0.008 432.000 0.000 NA   NA
 7004750 7004751 CCC13826_0878 CCC13826_0879 phzF   FALSE 0.019 257.000 0.000 NA   NA
 7004751 7004752 CCC13826_0879 CCC13826_0880     TRUE 0.924 9.000 0.010 NA   NA
 7004752 7004753 CCC13826_0880 CCC13826_0881     TRUE 0.988 -3.000 0.281 NA   NA
 7004753 7004754 CCC13826_0881 CCC13826_0882     TRUE 0.952 -3.000 0.009 NA   NA
 7004754 7004755 CCC13826_0882 CCC13826_0883   ribA TRUE 0.949 0.000 0.017 1.000 N NA
 7004756 7004757 CCC13826_0884 CCC13826_0885 hemB argF TRUE 0.951 2.000 0.020 1.000 N NA
 7004757 7004758 CCC13826_0885 CCC13826_0886 argF   TRUE 0.974 -3.000 0.025 1.000   NA
 7004758 7004759 CCC13826_0886 CCC13826_0887   hemN TRUE 0.987 -7.000 0.419 1.000   NA
 7004759 7004760 CCC13826_0887 CCC13826_0888 hemN   FALSE 0.326 114.000 0.032 1.000 N NA
 7004760 7004761 CCC13826_0888 CCC13826_0889     TRUE 0.890 21.000 0.333 NA   NA
 7004761 7004762 CCC13826_0889 CCC13826_0890     TRUE 0.987 -3.000 0.152 NA   NA
 7004762 7004763 CCC13826_0890 CCC13826_0891     TRUE 0.985 4.000 0.234 1.000 N NA
 7004763 7004764 CCC13826_0891 CCC13826_0892   acrB TRUE 0.986 3.000 0.447 0.046 N NA
 7004764 7004765 CCC13826_0892 CCC13826_0893 acrB mtrC TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004765 7004766 CCC13826_0893 CCC13826_0894 mtrC   TRUE 0.517 18.000 0.000 NA   NA
 7004766 7004767 CCC13826_0894 CCC13826_0895     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7004769 7004770 CCC13826_2230 CCC13826_2231     FALSE 0.192 53.000 0.000 NA   NA
 7004770 7004771 CCC13826_2231 CCC13826_2232     TRUE 0.855 8.000 0.000 NA   NA
 7004771 7004772 CCC13826_2232 CCC13826_2233     FALSE 0.065 125.000 0.000 NA   NA
 7004772 7004773 CCC13826_2233 CCC13826_0166   tuf FALSE 0.151 73.000 0.000 NA   NA
 7004773 7004774 CCC13826_0166 CCC13826_2234 tuf   FALSE 0.023 231.000 0.000 NA   NA
 7004774 7004775 CCC13826_2234 CCC13826_0168   secE TRUE 0.547 17.000 0.000 NA   NA
 7004775 7004776 CCC13826_0168 CCC13826_0169 secE nusG TRUE 0.948 15.000 0.843 1.000   NA
 7004776 7004777 CCC13826_0169 CCC13826_0170 nusG rplK TRUE 0.979 11.000 0.681 1.000 N NA
 7004777 7004778 CCC13826_0170 CCC13826_0171 rplK rplA TRUE 0.833 60.000 0.838 0.031 Y NA
 7004778 7004779 CCC13826_0171 CCC13826_0172 rplA rplJ TRUE 0.646 104.000 0.302 0.031 Y NA
 7004779 7004780 CCC13826_0172 CCC13826_0173 rplJ rplL TRUE 0.927 29.000 0.884 0.023 Y NA
 7004780 7004781 CCC13826_0173 CCC13826_0174 rplL rpoB FALSE 0.070 118.000 0.000 NA   NA
 7004781 7004782 CCC13826_0174 CCC13826_0175 rpoB rpoC TRUE 0.835 -13.000 0.000 NA   NA
 7004782 7004783 CCC13826_0175 CCC13826_0176 rpoC   FALSE 0.087 134.000 0.002 NA   NA
 7004783 7004784 CCC13826_0176 CCC13826_0177   nhaC FALSE 0.347 133.000 0.250 NA   NA
 7004784 7004785 CCC13826_0177 CCC13826_0178 nhaC iadA TRUE 0.985 -3.000 0.050 1.000 N NA
 7004785 7004786 CCC13826_0178 CCC13826_0179 iadA rpsL FALSE 0.133 81.000 0.000 NA   NA
 7004786 7004787 CCC13826_0179 CCC13826_0180 rpsL rpsG FALSE 0.137 79.000 0.000 NA   NA
 7004787 7004788 CCC13826_0180 CCC13826_0181 rpsG fusA TRUE 0.696 13.000 0.000 NA   NA
 7004788 7004789 CCC13826_0181 CCC13826_2235 fusA   FALSE 0.139 78.000 0.000 NA   NA
 7004789 7004790 CCC13826_2235 CCC13826_2236     FALSE 0.025 222.000 0.000 NA   NA
 7004790 7004791 CCC13826_2236 CCC13826_1456   nuoN FALSE 0.044 153.000 0.000 NA   NA
 7004791 7004792 CCC13826_1456 CCC13826_1457 nuoN   FALSE 0.128 84.000 0.000 NA   NA
 7004792 7004793 CCC13826_1457 CCC13826_1458     FALSE 0.330 125.000 0.108 NA   NA
 7004793 7004794 CCC13826_1458 CCC13826_1459     FALSE 0.018 268.000 0.000 NA   NA
 7004794 7004795 CCC13826_1459 CCC13826_1460     TRUE 0.505 93.000 0.188 NA   NA
 7004795 7004796 CCC13826_1460 CCC13826_1461     TRUE 0.717 46.000 0.100 1.000 N NA
 7004796 7004797 CCC13826_1461 CCC13826_1462     TRUE 0.978 1.000 0.400 NA   NA
 7004797 7004798 CCC13826_1462 CCC13826_1463     FALSE 0.137 79.000 0.000 NA   NA
 7004799 7004800 CCC13826_1464 CCC13826_1465 pgpA   TRUE 0.976 9.000 0.052 1.000 N NA
 7004800 7004801 CCC13826_1465 CCC13826_1466     TRUE 0.941 -22.000 0.021 1.000 N NA
 7004801 7004802 CCC13826_1466 CCC13826_1467   ispDF TRUE 0.965 -3.000 0.010 1.000 N NA
 7004803 7004804 CCC13826_1468 CCC13826_1469 thiC fixN TRUE 0.974 -6.000 0.021 1.000 N NA
 7004804 7004805 CCC13826_1469 CCC13826_1470 fixN fixO FALSE 0.247 61.000 0.000 1.000 N NA
 7004805 7004806 CCC13826_1470 CCC13826_1471 fixO   TRUE 0.979 10.000 0.569 NA   NA
 7004806 7004807 CCC13826_1471 CCC13826_1472   fixP FALSE 0.089 104.000 0.000 NA   NA
 7004807 7004808 CCC13826_1472 CCC13826_1473 fixP   FALSE 0.043 157.000 0.000 NA   NA
 7004810 7004811 CCC13826_1475 CCC13826_1476     TRUE 0.929 12.000 0.033 NA   NA
 7004812 7004813 CCC13826_1477 CCC13826_1478     FALSE 0.227 45.000 0.000 NA   NA
 7004813 7004814 CCC13826_1478 CCC13826_1479     FALSE 0.009 413.000 0.000 NA   NA
 7004814 7004815 CCC13826_1479 CCC13826_1480     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7004815 7004816 CCC13826_1480 CCC13826_1481     FALSE 0.145 129.000 0.000 NA Y NA
 7004816 7004817 CCC13826_1481 CCC13826_1482     TRUE 0.986 4.000 0.312 1.000 N NA
 7004818 7004819 CCC13826_1483 CCC13826_1484     TRUE 0.943 12.000 0.053 1.000   NA
 7004819 7004820 CCC13826_1484 CCC13826_1485   cadF TRUE 0.928 13.000 0.048 1.000   NA
 7004820 7004821 CCC13826_1485 CCC13826_1486 cadF   TRUE 0.913 10.000 0.012 NA   NA
 7004821 7004822 CCC13826_1486 CCC13826_1487     TRUE 0.982 4.000 0.237 NA   NA
 7004822 7004823 CCC13826_1487 CCC13826_2336   rrs FALSE 0.009 400.000 0.000 NA   NA
 7004823 7004824 CCC13826_2336 CCC13826_2237 rrs   FALSE 0.046 148.000 0.000 NA   NA
 7004824 7004825 CCC13826_2237 CCC13826_2238     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7004825 7004826 CCC13826_2238 CCC13826_2337   rrl FALSE 0.008 437.000 0.000 NA   NA
 7004826 7004827 CCC13826_2337 CCC13826_2239 rrl rrf FALSE 0.048 146.000 0.000 NA   NA
 7004827 7004828 CCC13826_2239 CCC13826_0702 rrf   FALSE 0.008 435.000 0.000 NA   NA
 7004829 7004830 CCC13826_0703 CCC13826_0701     FALSE 0.198 51.000 0.000 NA   NA
 7004832 7004833 CCC13826_0699 CCC13826_0698 truA   TRUE 0.968 0.000 0.059 1.000   NA
 7004833 7004834 CCC13826_0698 CCC13826_0697     TRUE 0.976 -7.000 0.039 1.000   NA
 7004834 7004835 CCC13826_0697 CCC13826_0695   uppS TRUE 0.957 8.000 0.017 1.000 N NA
 7004835 7004836 CCC13826_0695 CCC13826_0694 uppS proP TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7004836 7004837 CCC13826_0694 CCC13826_0692 proP glmU TRUE 0.835 -13.000 0.000 NA   NA
 7004838 7004839 CCC13826_0691 CCC13826_0690     TRUE 0.526 120.000 0.135 1.000 Y NA
 7004839 7004840 CCC13826_0690 CCC13826_0689   fliP TRUE 0.979 3.000 0.028 1.000 Y NA
 7004840 7004841 CCC13826_0689 CCC13826_0688 fliP   TRUE 0.958 0.000 0.008 1.000 Y NA
 7004841 7004842 CCC13826_0688 CCC13826_0687   selB TRUE 0.987 -3.000 0.069 1.000 N NA
 7004842 7004843 CCC13826_0687 CCC13826_0686 selB   TRUE 0.995 -3.000 0.844 1.000 Y NA
 7004843 7004844 CCC13826_0686 CCC13826_0685     TRUE 0.908 -3.000 0.000 1.000   NA
 7004844 7004845 CCC13826_0685 CCC13826_0684     TRUE 0.908 -3.000 0.000 1.000   NA
 7004846 7004847 CCC13826_0683 CCC13826_0682     FALSE 0.192 53.000 0.000 NA   NA
 7004847 7004848 CCC13826_0682 CCC13826_0681   dnaB TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7004848 7004849 CCC13826_0681 CCC13826_0680 dnaB ispG TRUE 0.948 5.000 0.011 1.000 N NA
 7004849 7004850 CCC13826_0680 CCC13826_0679 ispG   FALSE 0.144 76.000 0.000 NA   NA
 7004850 7004851 CCC13826_0679 CCC13826_0678   priA FALSE 0.010 397.000 0.000 NA   NA
 7004851 7004852 CCC13826_0678 CCC13826_0677 priA   TRUE 0.898 0.000 0.003 1.000   NA
 7004852 7004853 CCC13826_0677 CCC13826_0676     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004853 7004854 CCC13826_0676 CCC13826_0675     TRUE 0.884 24.000 0.714 NA   NA
 7004856 7004857 CCC13826_0673 CCC13826_2241     FALSE 0.012 341.000 0.000 NA   NA
 7004858 7004859 CCC13826_0672 CCC13826_0671     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004860 7004861 CCC13826_0670 CCC13826_0669     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7004862 7004863 CCC13826_0668 CCC13826_0667 groES groEL TRUE 0.953 18.000 0.356 0.094 Y NA
 7004863 7004864 CCC13826_0667 CCC13826_0666 groEL   FALSE 0.140 131.000 0.007 1.000 N NA
 7004865 7004866 CCC13826_0665 CCC13826_0664     FALSE 0.015 298.000 0.000 1.000   NA
 7004866 7004867 CCC13826_0664 CCC13826_0663     TRUE 0.723 91.000 0.671 1.000 Y NA
 7004867 7004868 CCC13826_0663 CCC13826_0662   sugE TRUE 0.990 2.000 0.773 1.000 Y NA
 7004868 7004869 CCC13826_0662 CCC13826_0661 sugE   TRUE 0.991 -13.000 0.841 0.009 Y NA
 7004870 7004871 CCC13826_0660 CCC13826_0659     TRUE 0.965 -3.000 0.018 NA   NA
 7004871 7004872 CCC13826_0659 CCC13826_0658     TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7004872 7004873 CCC13826_0658 CCC13826_0657     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7004874 7004875 CCC13826_0656 CCC13826_0655     FALSE 0.125 86.000 0.000 NA   NA
 7004877 7004878 CCC13826_0653 CCC13826_0652     FALSE 0.034 185.000 0.000 NA   NA
 7004878 7004879 CCC13826_0652 CCC13826_0651     FALSE 0.019 259.000 0.000 NA   NA
 7004883 7004884 CCC13826_0647 CCC13826_0646     FALSE 0.158 71.000 0.000 NA   NA
 7004884 7004885 CCC13826_0646 CCC13826_0645   dcuC TRUE 0.957 -24.000 0.085 NA   NA
 7004886 7004887 CCC13826_0644 CCC13826_0643     TRUE 0.891 2.000 0.005 NA   NA
 7004887 7004888 CCC13826_0643 CCC13826_0642     FALSE 0.142 77.000 0.000 NA   NA
 7004888 7004889 CCC13826_0642 CCC13826_0641     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004889 7004890 CCC13826_0641 CCC13826_1610     FALSE 0.062 127.000 0.000 NA   NA
 7004890 7004891 CCC13826_1610 CCC13826_1611     FALSE 0.011 368.000 0.000 1.000   NA
 7004891 7004892 CCC13826_1611 CCC13826_1612     TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7004892 7004893 CCC13826_1612 CCC13826_1613     TRUE 0.848 9.000 0.000 NA   NA
 7004893 7004894 CCC13826_1613 CCC13826_1614     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 7004894 7004895 CCC13826_1614 CCC13826_1615     TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7004895 7004896 CCC13826_1615 CCC13826_1616     TRUE 0.814 -16.000 0.000 NA   NA
 7004896 7004897 CCC13826_1616 CCC13826_1617     TRUE 0.981 -7.000 0.083 NA   NA
 7004897 7004898 CCC13826_1617 CCC13826_1618     TRUE 0.468 21.000 0.000 NA   NA
 7004899 7004900 CCC13826_1619 CCC13826_1620     TRUE 0.989 -3.000 0.323 NA   NA
 7004901 7004902 CCC13826_2243 CCC13826_1621 rpmH   TRUE 0.382 138.000 0.787 1.000   NA
 7004902 7004903 CCC13826_1621 CCC13826_1622     TRUE 0.990 -3.000 0.540 NA   NA
 7004903 7004904 CCC13826_1622 CCC13826_1623     TRUE 0.979 1.000 0.461 NA   NA
 7004904 7004905 CCC13826_1623 CCC13826_1624     TRUE 0.968 0.000 0.061 NA   NA
 7004905 7004906 CCC13826_1624 CCC13826_1625   trmE TRUE 0.981 -3.000 0.049 NA   NA
 7004906 7004907 CCC13826_1625 CCC13826_1626 trmE   FALSE 0.258 42.000 0.000 1.000   NA
 7004907 7004908 CCC13826_1626 CCC13826_1627     FALSE 0.145 75.000 0.000 NA   NA
 7004908 7004909 CCC13826_1627 CCC13826_1628   purL FALSE 0.186 57.000 0.000 NA   NA
 7004909 7004910 CCC13826_1628 CCC13826_1629 purL   TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7004910 7004911 CCC13826_1629 CCC13826_1630     TRUE 0.911 2.000 0.011 NA   NA
 7004911 7004912 CCC13826_1630 CCC13826_1631     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7004912 7004913 CCC13826_1631 CCC13826_1632   purH FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 7004913 7004914 CCC13826_1632 CCC13826_1633 purH   FALSE 0.271 77.000 0.002 1.000 N NA
 7004914 7004915 CCC13826_1633 CCC13826_1634     FALSE 0.148 74.000 0.000 NA   NA
 7004915 7004916 CCC13826_1634 CCC13826_1635     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7004916 7004917 CCC13826_1635 CCC13826_1375     TRUE 0.984 6.000 0.667 NA   NA
 7004918 7004919 CCC13826_1374 CCC13826_1086 ftsZ ftsA TRUE 0.959 15.000 0.114 1.000 Y NA
 7004919 7004920 CCC13826_1086 CCC13826_1085 ftsA   TRUE 0.981 6.000 0.184 1.000   NA
 7004920 7004921 CCC13826_1085 CCC13826_1084     FALSE 0.197 140.000 0.029 1.000   NA
 7004922 7004923 CCC13826_1083 CCC13826_1082 mraW   TRUE 0.960 3.000 0.031 NA   NA
 7004923 7004924 CCC13826_1082 CCC13826_1080     TRUE 0.976 -9.000 0.061 NA   NA
 7004926 7004927 CCC13826_1079 CCC13826_1078     TRUE 0.952 -3.000 0.010 NA   NA
 7004927 7004928 CCC13826_1078 CCC13826_1077     TRUE 0.942 -7.000 0.010 NA   NA
 7004928 7004929 CCC13826_1077 CCC13826_1076     TRUE 0.974 -3.000 0.024 1.000   NA
 7004929 7004930 CCC13826_1076 CCC13826_1075     TRUE 0.973 1.000 0.120 1.000   NA
 7004930 7004931 CCC13826_1075 CCC13826_1074     TRUE 0.990 -3.000 0.529 NA   NA
 7004933 7004934 CCC13826_1072 CCC13826_1071 secA   TRUE 0.729 52.000 0.201 0.080 N NA
 7004935 7004936 CCC13826_1070 CCC13826_1069 ywnB   FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 7004936 7004937 CCC13826_1069 CCC13826_1068     TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7004937 7004938 CCC13826_1068 CCC13826_1067     FALSE 0.183 80.000 0.000 NA N NA
 7004938 7004939 CCC13826_1067 CCC13826_1066   czcD TRUE 0.971 4.000 0.028 1.000 N NA
 7004939 7004940 CCC13826_1066 CCC13826_1065 czcD   TRUE 0.986 4.000 0.282 1.000 N NA
 7004941 7004942 CCC13826_1064 CCC13826_1063     TRUE 0.565 98.000 0.294 1.000 N NA
 7004942 7004943 CCC13826_1063 CCC13826_1062     TRUE 0.991 0.000 0.824 1.000 Y NA
 7004943 7004944 CCC13826_1062 CCC13826_1061     TRUE 0.801 31.000 0.143 NA   NA
 7004948 7004949 CCC13826_1057 CCC13826_1056     TRUE 0.989 -3.000 0.364 NA   NA
 7004949 7004950 CCC13826_1056 CCC13826_1055     TRUE 0.668 49.000 0.143 NA   NA
 7004950 7004951 CCC13826_1055 CCC13826_1053     TRUE 0.903 20.000 0.514 NA   NA
 7004951 7004952 CCC13826_1053 CCC13826_1052     TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7004952 7004953 CCC13826_1052 CCC13826_1051   hemA TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004953 7004954 CCC13826_1051 CCC13826_1050 hemA proS TRUE 0.977 -10.000 0.040 0.043 N NA
 7004954 7004955 CCC13826_1050 CCC13826_1049 proS   TRUE 0.971 -3.000 0.022 1.000   NA
 7004955 7004956 CCC13826_1049 CCC13826_1048   hemC TRUE 0.932 9.000 0.013 1.000   NA
 7004956 7004957 CCC13826_1048 CCC13826_1047 hemC   TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7004960 7004961 CCC13826_1044 CCC13826_1043     FALSE 0.010 387.000 0.000 NA   NA
 7004962 7004963 CCC13826_1042 CCC13826_1041   truD TRUE 0.928 -22.000 0.022 1.000   NA
 7004964 7004965 CCC13826_1040 CCC13826_1039     FALSE 0.011 459.000 0.000 1.000 N NA
 7004966 7004967 CCC13826_1038 CCC13826_2244     FALSE 0.013 317.000 0.000 NA   NA
 7004968 7004969 CCC13826_1037 CCC13826_1036   fliS TRUE 0.975 -7.000 0.038 NA   NA
 7004969 7004970 CCC13826_1036 CCC13826_1035 fliS   TRUE 0.755 85.000 0.608 0.004 Y NA
 7004970 7004971 CCC13826_1035 CCC13826_1034   flaG TRUE 0.986 3.000 0.092 NA Y NA
 7004972 7004973 CCC13826_1033 CCC13826_1032     TRUE 0.977 -3.000 0.032 NA   NA
 7004973 7004974 CCC13826_1032 CCC13826_1031   flgI TRUE 0.408 57.000 0.012 NA N NA
 7004974 7004975 CCC13826_1031 CCC13826_1030 flgI   TRUE 0.981 0.000 0.569 NA   NA
 7004975 7004976 CCC13826_1030 CCC13826_1029     TRUE 0.648 71.000 0.469 NA   NA
 7004976 7004977 CCC13826_1029 CCC13826_1028     TRUE 0.933 17.000 0.677 0.004   NA
 7004977 7004978 CCC13826_1028 CCC13826_0708   flgK TRUE 0.986 4.000 0.558 0.004   NA
 7004978 7004979 CCC13826_0708 CCC13826_0709 flgK   TRUE 0.985 -3.000 0.084 1.000   NA
 7004979 7004980 CCC13826_0709 CCC13826_0161   sodC FALSE 0.344 67.000 0.014 1.000   NA
 7004980 7004981 CCC13826_0161 CCC13826_0160 sodC   FALSE 0.052 145.000 0.000 1.000   NA
 7004981 7004982 CCC13826_0160 CCC13826_0159   atpB FALSE 0.324 66.000 0.011 1.000   NA
 7004983 7004984 CCC13826_0158 CCC13826_0157     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004985 7004986 CCC13826_0156 CCC13826_0155     TRUE 0.696 13.000 0.000 NA   NA
 7004986 7004987 CCC13826_0155 CCC13826_0154     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004988 7004989 CCC13826_0153 CCC13826_0152   rarD TRUE 0.947 -7.000 0.011 NA   NA
 7004989 7004990 CCC13826_0152 CCC13826_0151 rarD rarD TRUE 0.413 41.000 0.006 0.078   NA
 7004991 7004992 CCC13826_0150 CCC13826_0149     TRUE 0.519 24.000 0.000 1.000 N NA
 7004992 7004993 CCC13826_0149 CCC13826_0148     TRUE 0.980 -3.000 0.028 NA N NA
 7004993 7004994 CCC13826_0148 CCC13826_0147     TRUE 0.963 -3.000 0.016 NA   NA
 7004994 7004995 CCC13826_0147 CCC13826_0146     TRUE 0.983 -3.000 0.064 NA   NA
 7004995 7004996 CCC13826_0146 CCC13826_0145     TRUE 0.969 -21.000 0.228 NA   NA
 7004996 7004997 CCC13826_0145 CCC13826_0144   trpC TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7004997 7004998 CCC13826_0144 CCC13826_0143 trpC   TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7004998 7004999 CCC13826_0143 CCC13826_0142   ybbB TRUE 0.958 -13.000 0.030 1.000   NA
 7004999 7005000 CCC13826_0142 CCC13826_0141 ybbB   FALSE 0.025 226.000 0.000 NA   NA
 7005000 7005001 CCC13826_0141 CCC13826_0140   ilvB FALSE 0.116 90.000 0.000 NA   NA
 7005001 7005002 CCC13826_0140 CCC13826_0139 ilvB ilvH TRUE 0.994 -3.000 0.249 0.002 Y NA
 7005002 7005003 CCC13826_0139 CCC13826_0138 ilvH lpxD TRUE 0.974 0.000 0.052 1.000 N NA
 7005004 7005005 CCC13826_0137 CCC13826_0136 atpD atpC FALSE 0.033 193.000 0.000 1.000   NA
 7005005 7005006 CCC13826_0136 CCC13826_0135 atpC   TRUE 0.982 -13.000 0.846 NA   NA
 7005006 7005007 CCC13826_0135 CCC13826_0134   purQ TRUE 0.978 -6.000 0.038 NA   NA
 7005007 7005008 CCC13826_0134 CCC13826_0133 purQ purS TRUE 0.995 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 7005008 7005009 CCC13826_0133 CCC13826_0132 purS purC TRUE 0.991 9.000 0.460 1.000 Y NA
 7005009 7005010 CCC13826_0132 CCC13826_0131 purC omp TRUE 0.893 17.000 0.045 1.000 N NA
 7005012 7005013 CCC13826_0094 CCC13826_0093 slyD tgt TRUE 0.984 -10.000 0.444 1.000   NA
 7005014 7005015 CCC13826_0092 CCC13826_0091     TRUE 0.995 -3.000 0.912 1.000 Y NA
 7005015 7005016 CCC13826_0091 CCC13826_0090     TRUE 0.990 1.000 0.912 NA Y NA
 7005016 7005017 CCC13826_0090 CCC13826_0089     TRUE 0.986 -3.000 0.120 NA   NA
 7005017 7005018 CCC13826_0089 CCC13826_0088     FALSE 0.179 104.000 0.011 NA   NA
 7005018 7005019 CCC13826_0088 CCC13826_0087   aroB TRUE 0.966 4.000 0.031 1.000   NA
 7005019 7005020 CCC13826_0087 CCC13826_0086 aroB   TRUE 0.984 -3.000 0.041 1.000 N NA
 7005020 7005021 CCC13826_0086 CCC13826_0085     TRUE 0.975 0.000 0.063 1.000 N NA
 7005021 7005022 CCC13826_0085 CCC13826_1351     TRUE 0.959 -37.000 0.067 1.000 N NA
 7005022 7005023 CCC13826_1351 CCC13826_1350     TRUE 0.880 14.000 0.017 1.000 N NA
 7005023 7005024 CCC13826_1350 CCC13826_1349   nifR TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7005024 7005025 CCC13826_1349 CCC13826_1348 nifR   FALSE 0.005 924.000 0.000 NA   NA
 7005026 7005027 CCC13826_1347 CCC13826_1346     FALSE 0.189 136.000 0.026 NA   NA
 7005027 7005028 CCC13826_1346 CCC13826_1345   rpmB TRUE 0.800 23.000 0.025 1.000 N NA
 7005029 7005030 CCC13826_1344 CCC13826_1343   tyrA TRUE 0.989 -3.000 0.333 NA   NA
 7005030 7005031 CCC13826_1343 CCC13826_1342 tyrA rpe TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7005031 7005032 CCC13826_1342 CCC13826_1341 rpe   TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005034 7005035 CCC13826_1339 CCC13826_1338     TRUE 0.769 -24.000 0.000 NA   NA
 7005036 7005037 CCC13826_1337 CCC13826_1336     TRUE 0.970 10.000 0.097 1.000   NA
 7005037 7005038 CCC13826_1336 CCC13826_1335     TRUE 0.982 4.000 0.159 0.001   NA
 7005038 7005039 CCC13826_1335 CCC13826_1334   ppk FALSE 0.020 258.000 0.000 1.000   NA
 7005039 7005040 CCC13826_1334 CCC13826_1333 ppk   FALSE 0.035 188.000 0.000 1.000   NA
 7005040 7005041 CCC13826_1333 CCC13826_1332   mgtE TRUE 0.959 -15.000 0.036 1.000   NA
 7005041 7005042 CCC13826_1332 CCC13826_1331 mgtE   TRUE 0.968 10.000 0.042 1.000 N NA
 7005043 7005044 CCC13826_1330 CCC13826_1329   moeA TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7005045 7005046 CCC13826_1328 CCC13826_1327     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 7005046 7005047 CCC13826_1327 CCC13826_1326     FALSE 0.065 127.000 0.000 1.000   NA
 7005047 7005048 CCC13826_1326 CCC13826_1325     FALSE 0.312 127.000 0.043 1.000 N NA
 7005048 7005049 CCC13826_1325 CCC13826_1324     TRUE 0.994 -7.000 0.846 1.000 Y NA
 7005049 7005050 CCC13826_1324 CCC13826_1323   pyk TRUE 0.976 10.000 0.273 1.000   NA
 7005050 7005051 CCC13826_1323 CCC13826_1322 pyk   TRUE 0.482 64.000 0.029 1.000   NA
 7005051 7005052 CCC13826_1322 CCC13826_0026   ompR FALSE 0.107 95.000 0.000 NA   NA
 7005052 7005053 CCC13826_0026 CCC13826_0025 ompR   FALSE 0.007 555.000 0.000 NA   NA
 7005053 7005054 CCC13826_0025 CCC13826_0024     TRUE 0.987 -7.000 0.400 NA   NA
 7005054 7005055 CCC13826_0024 CCC13826_0023     FALSE 0.139 78.000 0.000 NA   NA
 7005055 7005056 CCC13826_0023 CCC13826_2245     FALSE 0.005 1167.000 0.000 NA   NA
 7005056 7005057 CCC13826_2245 CCC13826_0021     FALSE 0.160 70.000 0.000 NA   NA
 7005057 7005058 CCC13826_0021 CCC13826_2246     FALSE 0.066 124.000 0.000 NA   NA
 7005061 7005062 CCC13826_1302 CCC13826_1303     FALSE 0.302 35.000 0.000 NA   NA
 7005062 7005063 CCC13826_1303 CCC13826_2247     FALSE 0.007 667.000 0.000 NA   NA
 7005063 7005064 CCC13826_2247 CCC13826_1200     FALSE 0.027 214.000 0.000 NA   NA
 7005064 7005065 CCC13826_1200 CCC13826_1201     TRUE 0.987 -3.000 0.172 NA   NA
 7005066 7005067 CCC13826_1202 CCC13826_1203     FALSE 0.083 108.000 0.000 NA   NA
 7005067 7005068 CCC13826_1203 CCC13826_1204     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005069 7005070 CCC13826_1205 CCC13826_1206     FALSE 0.107 95.000 0.000 NA   NA
 7005070 7005071 CCC13826_1206 CCC13826_2248     FALSE 0.017 277.000 0.000 NA   NA
 7005071 7005072 CCC13826_2248 CCC13826_2249   ahpC TRUE 0.662 14.000 0.000 NA   NA
 7005072 7005073 CCC13826_2249 CCC13826_1208 ahpC   FALSE 0.006 736.000 0.000 NA   NA
 7005073 7005074 CCC13826_1208 CCC13826_1209   plsX TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7005074 7005075 CCC13826_1209 CCC13826_1210 plsX   TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7005075 7005076 CCC13826_1210 CCC13826_1211     TRUE 0.954 -49.000 0.133 NA   NA
 7005076 7005077 CCC13826_1211 CCC13826_1212     FALSE 0.025 229.000 0.000 1.000   NA
 7005077 7005078 CCC13826_1212 CCC13826_1213     TRUE 0.861 8.000 0.000 1.000   NA
 7005079 7005080 CCC13826_2250 CCC13826_2251     TRUE 0.373 27.000 0.000 NA   NA
 7005080 7005081 CCC13826_2251 CCC13826_1216     FALSE 0.031 193.000 0.000 NA   NA
 7005081 7005082 CCC13826_1216 CCC13826_1217   walN FALSE 0.319 52.000 0.007 NA   NA
 7005083 7005084 CCC13826_1218 CCC13826_1219   argG FALSE 0.052 183.000 0.000 1.000 N NA
 7005084 7005085 CCC13826_1219 CCC13826_1220 argG rplI TRUE 0.671 24.000 0.009 1.000 N NA
 7005085 7005086 CCC13826_1220 CCC13826_1221 rplI rplU TRUE 0.966 1.000 0.034 1.000 N NA
 7005086 7005087 CCC13826_1221 CCC13826_1222 rplU hslU TRUE 0.991 9.000 0.752 1.000 Y NA
 7005087 7005088 CCC13826_1222 CCC13826_1223 hslU era TRUE 0.983 -3.000 0.051 0.088   NA
 7005088 7005089 CCC13826_1223 CCC13826_1224 era dcuA TRUE 0.489 61.000 0.029 NA   NA
 7005089 7005090 CCC13826_1224 CCC13826_1225 dcuA   TRUE 0.988 -3.000 0.308 NA   NA
 7005090 7005091 CCC13826_1225 CCC13826_1226     TRUE 0.977 0.000 0.231 NA   NA
 7005091 7005092 CCC13826_1226 CCC13826_1227     TRUE 0.963 -22.000 0.125 NA   NA
 7005092 7005093 CCC13826_1227 CCC13826_1228     TRUE 0.987 -7.000 0.458 1.000   NA
 7005093 7005094 CCC13826_1228 CCC13826_1229     TRUE 0.891 -7.000 0.000 1.000   NA
 7005094 7005095 CCC13826_1229 CCC13826_1230     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005095 7005096 CCC13826_1230 CCC13826_1231     TRUE 0.976 0.000 0.188 NA   NA
 7005096 7005097 CCC13826_1231 CCC13826_1232     TRUE 0.995 -3.000 0.812 1.000 Y NA
 7005097 7005098 CCC13826_1232 CCC13826_1233     TRUE 0.835 28.000 0.231 1.000   NA
 7005098 7005099 CCC13826_1233 CCC13826_1234     TRUE 0.981 2.000 0.667 0.011   NA
 7005099 7005100 CCC13826_1234 CCC13826_1235   polA FALSE 0.035 183.000 0.000 NA   NA
 7005100 7005101 CCC13826_1235 CCC13826_1236 polA   TRUE 0.898 -6.000 0.000 NA   NA
 7005101 7005102 CCC13826_1236 CCC13826_1237   hemE FALSE 0.309 34.000 0.000 NA   NA
 7005102 7005103 CCC13826_1237 CCC13826_1238 hemE   TRUE 0.918 0.000 0.011 NA   NA
 7005103 7005104 CCC13826_1238 CCC13826_1239     TRUE 0.975 -7.000 0.039 NA   NA
 7005104 7005105 CCC13826_1239 CCC13826_1240   rpoN TRUE 0.962 1.000 0.044 1.000   NA
 7005108 7005109 CCC13826_1242 CCC13826_1244 murG   TRUE 0.989 -3.000 0.115 1.000 N NA
 7005111 7005112 CCC13826_1246 CCC13826_1247     FALSE 0.043 158.000 0.000 NA   NA
 7005112 7005113 CCC13826_1247 CCC13826_1248     FALSE 0.142 77.000 0.000 NA   NA
 7005113 7005114 CCC13826_1248 CCC13826_1249     FALSE 0.019 259.000 0.000 NA   NA
 7005114 7005115 CCC13826_1249 CCC13826_1250     TRUE 0.990 0.000 0.511 1.000 Y NA
 7005115 7005116 CCC13826_1250 CCC13826_1251     TRUE 0.604 33.000 0.020 1.000   NA
 7005116 7005117 CCC13826_1251 CCC13826_1252   valS FALSE 0.081 142.000 0.002 1.000   NA
 7005119 7005120 CCC13826_1253 CCC13826_1254     TRUE 0.966 2.000 0.067 NA   NA
 7005121 7005122 CCC13826_1255 CCC13826_1256     TRUE 0.425 54.000 0.012 1.000 N NA
 7005122 7005123 CCC13826_1256 CCC13826_1257     TRUE 0.982 1.000 0.258 0.076 N NA
 7005123 7005124 CCC13826_1257 CCC13826_1258     TRUE 0.979 2.000 0.152 1.000 N NA
 7005124 7005125 CCC13826_1258 CCC13826_1259   fliS TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 7005125 7005126 CCC13826_1259 CCC13826_1260 fliS   FALSE 0.007 533.000 0.000 NA   NA
 7005127 7005128 CCC13826_1261 CCC13826_1262     TRUE 0.974 -3.000 0.027 NA   NA
 7005128 7005129 CCC13826_1262 CCC13826_1263     TRUE 0.954 -13.000 0.027 1.000   NA
 7005129 7005130 CCC13826_1263 CCC13826_1264     TRUE 0.949 -16.000 0.029 NA   NA
 7005131 7005132 CCC13826_1265 CCC13826_1266 murA   TRUE 0.964 3.000 0.024 1.000 N NA
 7005132 7005133 CCC13826_1266 CCC13826_2253     FALSE 0.198 51.000 0.000 NA   NA
 7005133 7005134 CCC13826_2253 CCC13826_1268   flgA FALSE 0.171 66.000 0.000 NA   NA
 7005134 7005135 CCC13826_1268 CCC13826_1269 flgA   TRUE 0.990 -3.000 0.191 NA N NA
 7005135 7005136 CCC13826_1269 CCC13826_1270   coaD TRUE 0.989 -3.000 0.032 1.000 Y NA
 7005136 7005137 CCC13826_1270 CCC13826_1271 coaD tmk TRUE 0.966 2.000 0.034 1.000 N NA
 7005137 7005138 CCC13826_1271 CCC13826_1272 tmk hisS TRUE 0.695 30.000 0.018 0.087 N NA
 7005138 7005139 CCC13826_1272 CCC13826_1273 hisS speA TRUE 0.976 -3.000 0.021 1.000 N NA
 7005139 7005140 CCC13826_1273 CCC13826_1274 speA   TRUE 0.924 12.000 0.006 1.000 Y NA
 7005140 7005141 CCC13826_1274 CCC13826_1275   thiS TRUE 0.882 0.000 0.000 1.000 N NA
 7005141 7005142 CCC13826_1275 CCC13826_1276 thiS thiF TRUE 0.991 8.000 0.346 1.000 Y NA
 7005142 7005143 CCC13826_1276 CCC13826_1277 thiF thiG TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7005143 7005144 CCC13826_1277 CCC13826_1278 thiG thiH TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005144 7005145 CCC13826_1278 CCC13826_1279 thiH   TRUE 0.992 -7.000 0.128 0.005 Y NA
 7005146 7005147 CCC13826_1280 CCC13826_1281     FALSE 0.013 320.000 0.000 NA   NA
 7005147 7005148 CCC13826_1281 CCC13826_1282     TRUE 0.988 3.000 0.175 NA Y NA
 7005148 7005149 CCC13826_1282 CCC13826_1283     TRUE 0.988 10.000 0.279 0.006 Y NA
 7005151 7005152 CCC13826_1285 CCC13826_1286     TRUE 0.963 12.000 0.031 1.000 Y NA
 7005152 7005153 CCC13826_1286 CCC13826_1287   ompR TRUE 0.990 -3.000 0.046 1.000 Y NA
 7005153 7005154 CCC13826_1287 CCC13826_1288 ompR htrA TRUE 0.988 -7.000 0.667 1.000   NA
 7005154 7005155 CCC13826_1288 CCC13826_1289 htrA   TRUE 0.577 91.000 0.667 1.000   NA
 7005155 7005156 CCC13826_1289 CCC13826_1291   hspR FALSE 0.028 208.000 0.000 NA   NA
 7005156 7005157 CCC13826_1291 CCC13826_1292 hspR oorC FALSE 0.258 41.000 0.000 NA   NA
 7005157 7005158 CCC13826_1292 CCC13826_1293 oorC oorB TRUE 0.995 -3.000 0.324 0.002 Y NA
 7005158 7005159 CCC13826_1293 CCC13826_1294 oorB oorA TRUE 0.993 -10.000 0.771 0.002 Y NA
 7005159 7005160 CCC13826_1294 CCC13826_1295 oorA oorD TRUE 0.994 -3.000 0.316 0.002 Y NA
 7005160 7005161 CCC13826_1295 CCC13826_2254 oorD   TRUE 0.962 9.000 0.007 1.000 Y NA
 7005161 7005162 CCC13826_2254 CCC13826_1088     TRUE 0.980 4.000 0.025 1.000 Y NA
 7005162 7005163 CCC13826_1088 CCC13826_1089     TRUE 0.392 52.000 0.016 NA   NA
 7005165 7005166 CCC13826_1091 CCC13826_1092   hypA FALSE 0.031 193.000 0.000 NA   NA
 7005166 7005167 CCC13826_1092 CCC13826_1093 hypA hypE TRUE 0.971 0.000 0.080 1.000   NA
 7005167 7005168 CCC13826_1093 CCC13826_1094 hypE hypD TRUE 0.973 9.000 0.019 1.000 Y NA
 7005168 7005169 CCC13826_1094 CCC13826_1095 hypD hypC TRUE 0.986 0.000 0.123 NA Y NA
 7005169 7005170 CCC13826_1095 CCC13826_1096 hypC hypB TRUE 0.989 0.000 0.463 NA Y NA
 7005170 7005171 CCC13826_1096 CCC13826_1097 hypB   FALSE 0.187 125.000 0.021 NA   NA
 7005171 7005172 CCC13826_1097 CCC13826_1098     TRUE 0.990 -3.000 0.589 NA   NA
 7005174 7005175 CCC13826_0355 CCC13826_0356   hypF TRUE 0.496 46.000 0.015 1.000 N NA
 7005175 7005176 CCC13826_0356 CCC13826_0097 hypF   TRUE 0.958 -16.000 0.043 NA   NA
 7005176 7005177 CCC13826_0097 CCC13826_0098     TRUE 0.989 -3.000 0.488 NA   NA
 7005177 7005178 CCC13826_0098 CCC13826_0099   cybH TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005178 7005179 CCC13826_0099 CCC13826_0100 cybH pabC TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7005179 7005180 CCC13826_0100 CCC13826_0101 pabC   TRUE 0.990 10.000 0.951 0.002 Y NA
 7005180 7005181 CCC13826_0101 CCC13826_0102   flgH FALSE 0.023 282.000 0.000 1.000 N NA
 7005182 7005183 CCC13826_0103 CCC13826_0104   ackA TRUE 0.984 2.000 0.080 1.000 Y NA
 7005183 7005184 CCC13826_0104 CCC13826_0105 ackA hypD TRUE 0.890 3.000 0.000 1.000 N NA
 7005184 7005185 CCC13826_0105 CCC13826_0106 hypD   FALSE 0.215 47.000 0.000 NA   NA
 7005186 7005187 CCC13826_0108 CCC13826_0109     TRUE 0.908 -3.000 0.000 1.000   NA
 7005187 7005188 CCC13826_0109 CCC13826_0110     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005188 7005189 CCC13826_0110 CCC13826_0111     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 7005189 7005190 CCC13826_0111 CCC13826_0112     FALSE 0.173 65.000 0.000 NA   NA
 7005190 7005191 CCC13826_0112 CCC13826_0113   ruvA TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7005191 7005192 CCC13826_0113 CCC13826_0114 ruvA   TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005193 7005194 CCC13826_0115 CCC13826_0116 mviN cysS TRUE 0.835 -13.000 0.000 NA   NA
 7005194 7005195 CCC13826_0116 CCC13826_0117 cysS   TRUE 0.964 -7.000 0.013 0.086 N NA
 7005195 7005196 CCC13826_0117 CCC13826_0118   pyrD TRUE 0.473 54.000 0.017 1.000 N NA
 7005196 7005197 CCC13826_0118 CCC13826_0119 pyrD   TRUE 0.941 12.000 0.048 1.000   NA
 7005197 7005198 CCC13826_0119 CCC13826_0120   dapA TRUE 0.979 3.000 0.217 1.000   NA
 7005198 7005199 CCC13826_0120 CCC13826_0121 dapA   TRUE 0.982 0.000 0.238 1.000 N NA
 7005199 7005200 CCC13826_0121 CCC13826_0122   pgsA TRUE 0.956 -22.000 0.017 1.000 Y NA
 7005200 7005201 CCC13826_0122 CCC13826_0123 pgsA   TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7005201 7005202 CCC13826_0123 CCC13826_0124   rseP TRUE 0.450 22.000 0.000 NA   NA
 7005202 7005203 CCC13826_0124 CCC13826_0125 rseP   TRUE 0.969 -3.000 0.021 NA   NA
 7005203 7005204 CCC13826_0125 CCC13826_0126     FALSE 0.078 111.000 0.000 NA   NA
 7005204 7005205 CCC13826_0126 CCC13826_0127     FALSE 0.086 106.000 0.000 NA   NA
 7005205 7005206 CCC13826_0127 CCC13826_0128     FALSE 0.198 51.000 0.000 NA   NA
 7005207 7005208 CCC13826_2256 CCC13826_2338 rrf rrl FALSE 0.048 146.000 0.000 NA   NA
 7005208 7005209 CCC13826_2338 CCC13826_2257 rrl   FALSE 0.012 329.000 0.000 NA   NA
 7005209 7005210 CCC13826_2257 CCC13826_2258     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7005210 7005211 CCC13826_2258 CCC13826_2339   rrs FALSE 0.046 148.000 0.000 NA   NA
 7005211 7005212 CCC13826_2339 CCC13826_1306 rrs   FALSE 0.020 255.000 0.000 NA   NA
 7005212 7005213 CCC13826_1306 CCC13826_1307   yihK TRUE 0.985 -3.000 0.094 NA   NA
 7005213 7005214 CCC13826_1307 CCC13826_1309 yihK   FALSE 0.015 603.000 0.010 1.000   NA
 7005214 7005215 CCC13826_1309 CCC13826_1310     TRUE 0.946 -43.000 0.059 1.000   NA
 7005216 7005217 CCC13826_1311 CCC13826_1312   ftsY TRUE 0.924 0.000 0.005 1.000 N NA
 7005217 7005218 CCC13826_1312 CCC13826_1313 ftsY nrfG TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7005218 7005219 CCC13826_1313 CCC13826_1314 nrfG radA TRUE 0.765 -25.000 0.000 NA   NA
 7005219 7005220 CCC13826_1314 CCC13826_1315 radA   TRUE 0.662 14.000 0.000 NA   NA
 7005221 7005222 CCC13826_1316 CCC13826_1317     FALSE 0.019 259.000 0.000 NA   NA
 7005222 7005223 CCC13826_1317 CCC13826_1318     FALSE 0.155 72.000 0.000 NA   NA
 7005223 7005224 CCC13826_1318 CCC13826_1319   acpS FALSE 0.083 108.000 0.000 NA   NA
 7005224 7005225 CCC13826_1319 CCC13826_1320 acpS fliL TRUE 0.985 -3.000 0.047 1.000 N NA
 7005227 7005228 CCC13826_1377 CCC13826_1380     TRUE 0.908 -3.000 0.000 1.000   NA
 7005231 7005232 CCC13826_1383 CCC13826_1384     TRUE 0.470 103.000 0.250 NA   NA
 7005232 7005233 CCC13826_1384 CCC13826_1385     TRUE 0.985 -7.000 0.250 NA   NA
 7005233 7005234 CCC13826_1385 CCC13826_1386     TRUE 0.988 -7.000 0.800 NA   NA
 7005234 7005235 CCC13826_1386 CCC13826_1387     TRUE 0.980 10.000 1.000 NA   NA
 7005235 7005236 CCC13826_1387 CCC13826_1388     TRUE 0.978 0.000 0.250 NA   NA
 7005236 7005237 CCC13826_1388 CCC13826_1389     TRUE 0.973 -16.000 0.176 NA   NA
 7005237 7005238 CCC13826_1389 CCC13826_1390     TRUE 0.866 18.000 0.033 1.000 N NA
 7005238 7005239 CCC13826_1390 CCC13826_1391     TRUE 0.960 11.000 0.100 NA   NA
 7005239 7005240 CCC13826_1391 CCC13826_1392   modD TRUE 0.929 2.000 0.017 NA   NA
 7005240 7005241 CCC13826_1392 CCC13826_1393 modD   FALSE 0.007 525.000 0.000 NA   NA
 7005242 7005243 CCC13826_1394 CCC13826_1395     FALSE 0.019 323.000 0.000 1.000 N NA
 7005243 7005244 CCC13826_1395 CCC13826_1396     FALSE 0.060 245.000 0.000 0.002 Y NA
 7005246 7005247 CCC13826_1398 CCC13826_1399   ubiA FALSE 0.105 98.000 0.000 1.000   NA
 7005247 7005248 CCC13826_1399 CCC13826_1400 ubiA   TRUE 0.696 13.000 0.000 NA   NA
 7005248 7005249 CCC13826_1400 CCC13826_1401     TRUE 0.420 24.000 0.000 NA   NA
 7005249 7005250 CCC13826_1401 CCC13826_1402     FALSE 0.186 57.000 0.000 NA   NA
 7005250 7005251 CCC13826_1402 CCC13826_1403   ilvA FALSE 0.115 93.000 0.000 1.000   NA
 7005251 7005252 CCC13826_1403 CCC13826_1404 ilvA trmA TRUE 0.675 22.000 0.006 1.000 N NA
 7005252 7005253 CCC13826_1404 CCC13826_1405 trmA   TRUE 0.975 3.000 0.056 NA N NA
 7005253 7005254 CCC13826_1405 CCC13826_1406     TRUE 0.961 10.000 0.047 NA   NA
 7005254 7005255 CCC13826_1406 CCC13826_1407     TRUE 0.928 9.000 0.012 NA   NA
 7005255 7005256 CCC13826_1407 CCC13826_1408   acnB FALSE 0.288 37.000 0.000 NA   NA
 7005258 7005259 CCC13826_1410 CCC13826_1411     TRUE 0.973 11.000 0.034 0.001 Y NA
 7005259 7005260 CCC13826_1411 CCC13826_1412   hsdM TRUE 0.990 -3.000 0.039 0.039 Y NA
 7005260 7005261 CCC13826_1412 CCC13826_1413 hsdM   TRUE 0.838 11.000 0.000 1.000 N NA
 7005261 7005262 CCC13826_1413 CCC13826_2259     FALSE 0.007 556.000 0.000 NA   NA
 7005262 7005263 CCC13826_2259 CCC13826_2260     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7005263 7005264 CCC13826_2260 CCC13826_2261     TRUE 0.547 17.000 0.000 NA   NA
 7005264 7005265 CCC13826_2261 CCC13826_2262     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7005265 7005266 CCC13826_2262 CCC13826_2263     FALSE 0.101 98.000 0.000 NA   NA
 7005267 7005268 CCC13826_1418 CCC13826_1419     FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 7005268 7005269 CCC13826_1419 CCC13826_1420   csh TRUE 0.948 11.000 0.044 NA   NA
 7005269 7005270 CCC13826_1420 CCC13826_1421 csh cas TRUE 0.952 2.000 0.029 NA   NA
 7005270 7005271 CCC13826_1421 CCC13826_1422 cas cas TRUE 0.958 -22.000 0.077 NA   NA
 7005271 7005272 CCC13826_1422 CCC13826_1423 cas cas TRUE 0.967 0.000 0.054 NA   NA
 7005272 7005273 CCC13826_1423 CCC13826_1424 cas cas TRUE 0.986 9.000 0.081 NA Y NA
 7005273 7005274 CCC13826_1424 CCC13826_1425 cas cas TRUE 0.989 10.000 0.600 NA Y NA
 7005274 7005275 CCC13826_1425 CCC13826_2264 cas   FALSE 0.036 177.000 0.000 NA   NA
 7005276 7005277 CCC13826_1426 CCC13826_1427     TRUE 0.987 -3.000 0.172 NA   NA
 7005277 7005278 CCC13826_1427 CCC13826_1428     FALSE 0.010 382.000 0.000 NA   NA
 7005278 7005279 CCC13826_1428 CCC13826_1429   rplS FALSE 0.057 137.000 0.000 1.000   NA
 7005279 7005280 CCC13826_1429 CCC13826_1430 rplS trmD TRUE 0.991 9.000 0.567 1.000 Y NA
 7005280 7005281 CCC13826_1430 CCC13826_1431 trmD rimM TRUE 0.995 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 7005281 7005282 CCC13826_1431 CCC13826_1432 rimM   TRUE 0.987 -7.000 0.324 1.000   NA
 7005282 7005283 CCC13826_1432 CCC13826_1433   rpsP TRUE 0.980 0.000 0.385 1.000   NA
 7005283 7005284 CCC13826_1433 CCC13826_1434 rpsP ffh TRUE 0.991 -3.000 0.361 1.000 N NA
 7005284 7005285 CCC13826_1434 CCC13826_1435 ffh   TRUE 0.418 63.000 0.013 1.000 N NA
 7005285 7005286 CCC13826_1435 CCC13826_1436     TRUE 0.989 -3.000 0.133 1.000 N NA
 7005286 7005287 CCC13826_1436 CCC13826_1437     TRUE 0.976 9.000 0.122 NA   NA
 7005287 7005288 CCC13826_1437 CCC13826_1438     TRUE 0.908 18.000 0.342 NA   NA
 7005288 7005289 CCC13826_1438 CCC13826_1439   glyQ TRUE 0.968 7.000 0.041 NA   NA
 7005289 7005290 CCC13826_1439 CCC13826_1440 glyQ   TRUE 0.852 11.000 0.003 NA   NA
 7005290 7005291 CCC13826_1440 CCC13826_1441     TRUE 0.960 4.000 0.026 NA   NA
 7005291 7005292 CCC13826_1441 CCC13826_1442   purE TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7005292 7005293 CCC13826_1442 CCC13826_1443 purE   TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005293 7005294 CCC13826_1443 CCC13826_1444     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005295 7005296 CCC13826_1445 CCC13826_1446   glnA TRUE 0.457 88.000 0.017 1.000 Y NA
 7005297 7005298 CCC13826_1447 CCC13826_1448     FALSE 0.081 110.000 0.000 NA   NA
 7005300 7005301 CCC13826_1450 CCC13826_1451     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005302 7005303 CCC13826_1452 CCC13826_1453     TRUE 0.954 12.000 0.054 NA N NA
 7005305 7005306 CCC13826_0605 CCC13826_0604 rho   FALSE 0.038 171.000 0.000 NA   NA
 7005309 7005310 CCC13826_0600 CCC13826_0599   nusA TRUE 0.882 0.000 0.000 1.000 N NA
 7005311 7005312 CCC13826_0598 CCC13826_0597   miaB TRUE 0.959 0.000 0.033 NA   NA
 7005312 7005313 CCC13826_0597 CCC13826_0596 miaB era TRUE 0.944 -19.000 0.029 NA   NA
 7005313 7005314 CCC13826_0596 CCC13826_0595 era   TRUE 0.972 -10.000 0.051 NA   NA
 7005314 7005315 CCC13826_0595 CCC13826_0594     TRUE 0.580 61.000 0.069 NA   NA
 7005315 7005316 CCC13826_0594 CCC13826_0593     TRUE 0.991 -3.000 1.000 NA   NA
 7005316 7005317 CCC13826_0593 CCC13826_0592     TRUE 0.987 -7.000 0.448 NA   NA
 7005317 7005318 CCC13826_0592 CCC13826_0590     FALSE 0.185 59.000 0.000 NA   NA
 7005319 7005320 CCC13826_0591 CCC13826_0589     TRUE 0.696 13.000 0.000 NA   NA
 7005320 7005321 CCC13826_0589 CCC13826_0588     TRUE 0.967 11.000 0.200 1.000   NA
 7005321 7005322 CCC13826_0588 CCC13826_0587     TRUE 0.986 -3.000 0.143 NA   NA
 7005322 7005323 CCC13826_0587 CCC13826_0586     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 7005326 7005327 CCC13826_0583 CCC13826_0582 panC   TRUE 0.937 3.000 0.008 1.000 N NA
 7005327 7005328 CCC13826_0582 CCC13826_0581     TRUE 0.975 -3.000 0.019 1.000 N NA
 7005328 7005329 CCC13826_0581 CCC13826_0580     FALSE 0.017 277.000 0.000 NA   NA
 7005330 7005331 CCC13826_0579 CCC13826_0578   gmhA TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 7005331 7005332 CCC13826_0578 CCC13826_0577 gmhA   TRUE 0.970 -25.000 0.142 1.000 N NA
 7005332 7005333 CCC13826_0577 CCC13826_0576   rfaD TRUE 0.991 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 7005333 7005334 CCC13826_0576 CCC13826_0575 rfaD   TRUE 0.988 -3.000 0.093 1.000 N NA
 7005336 7005337 CCC13826_0083 CCC13826_0082   cysE FALSE 0.327 32.000 0.000 NA   NA
 7005337 7005338 CCC13826_0082 CCC13826_0081 cysE cysK TRUE 0.989 5.000 0.101 0.001 Y NA
 7005338 7005339 CCC13826_0081 CCC13826_0080 cysK   FALSE 0.264 94.000 0.010 1.000 N NA
 7005339 7005340 CCC13826_0080 CCC13826_0079   metN TRUE 0.967 -3.000 0.018 1.000   NA
 7005340 7005341 CCC13826_0079 CCC13826_0078 metN mfd TRUE 0.948 -3.000 0.006 1.000   NA
 7005341 7005342 CCC13826_0078 CCC13826_0077 mfd   TRUE 0.918 -19.000 0.007 0.083 N NA
 7005342 7005343 CCC13826_0077 CCC13826_0076     TRUE 0.988 -3.000 0.104 1.000 N NA
 7005343 7005344 CCC13826_0076 CCC13826_0075     TRUE 0.974 -19.000 0.455 NA   NA
 7005344 7005345 CCC13826_0075 CCC13826_0074   leuS TRUE 0.965 4.000 0.031 NA   NA
 7005345 7005346 CCC13826_0074 CCC13826_0073 leuS   TRUE 0.948 9.000 0.021 NA   NA
 7005346 7005347 CCC13826_0073 CCC13826_0072   secF TRUE 0.979 10.000 0.667 NA   NA
 7005347 7005348 CCC13826_0072 CCC13826_0071 secF secD TRUE 0.991 3.000 0.436 0.001 Y NA
 7005348 7005349 CCC13826_0071 CCC13826_0070 secD yajC TRUE 0.765 48.000 0.068 NA Y NA
 7005352 7005353 CCC13826_0067 CCC13826_0066     TRUE 0.517 88.000 0.023 1.000 Y NA
 7005353 7005354 CCC13826_0066 CCC13826_0065     TRUE 0.971 2.000 0.115 NA   NA
 7005354 7005355 CCC13826_0065 CCC13826_0064     TRUE 0.491 52.000 0.026 NA   NA
 7005355 7005356 CCC13826_0064 CCC13826_0063   truB TRUE 0.985 -3.000 0.046 1.000 N NA
 7005356 7005357 CCC13826_0063 CCC13826_0062 truB csrA TRUE 0.985 -6.000 0.046 0.021 N NA
 7005357 7005358 CCC13826_0062 CCC13826_0061 csrA ispE TRUE 0.984 -3.000 0.036 1.000 N NA
 7005358 7005359 CCC13826_0061 CCC13826_0060 ispE smpB TRUE 0.939 12.000 0.028 1.000 N NA
 7005359 7005360 CCC13826_0060 CCC13826_0059 smpB   TRUE 0.923 9.000 0.009 1.000   NA
 7005360 7005361 CCC13826_0059 CCC13826_0058   flgB FALSE 0.297 63.000 0.007 1.000   NA
 7005361 7005362 CCC13826_0058 CCC13826_0057 flgB flgC TRUE 0.992 9.000 0.804 1.000 Y NA
 7005362 7005363 CCC13826_0057 CCC13826_0056 flgC fliE TRUE 0.989 0.000 0.271 0.004 Y NA
 7005363 7005364 CCC13826_0056 CCC13826_0055 fliE   TRUE 0.985 9.000 0.303 1.000 N NA
 7005365 7005366 CCC13826_0054 CCC13826_0053   hemH FALSE 0.313 48.000 0.004 NA   NA
 7005366 7005367 CCC13826_0053 CCC13826_0052 hemH   TRUE 0.904 0.000 0.005 1.000   NA
 7005368 7005369 CCC13826_0051 CCC13826_0050 alaS   TRUE 0.955 -3.000 0.011 NA   NA
 7005369 7005370 CCC13826_0050 CCC13826_0049     TRUE 0.954 0.000 0.028 NA   NA
 7005370 7005371 CCC13826_0049 CCC13826_0048     TRUE 0.979 -3.000 0.026 NA N NA
 7005371 7005372 CCC13826_0048 CCC13826_0047     TRUE 0.848 9.000 0.000 NA   NA
 7005372 7005373 CCC13826_0047 CCC13826_0046     FALSE 0.151 73.000 0.000 NA   NA
 7005373 7005374 CCC13826_0046 CCC13826_0045     FALSE 0.198 54.000 0.000 1.000   NA
 7005374 7005375 CCC13826_0045 CCC13826_0044     TRUE 0.822 -15.000 0.000 NA   NA
 7005376 7005377 CCC13826_0043 CCC13826_0042 glyS   TRUE 0.940 -3.000 0.003 NA   NA
 7005377 7005378 CCC13826_0042 CCC13826_0041     TRUE 0.973 1.000 0.133 NA   NA
 7005378 7005379 CCC13826_0041 CCC13826_0040     TRUE 0.951 -3.000 0.009 NA   NA
 7005379 7005380 CCC13826_0040 CCC13826_0039     FALSE 0.332 75.000 0.000 0.003 Y NA
 7005380 7005381 CCC13826_0039 CCC13826_0038     TRUE 0.964 -40.000 0.325 NA   NA
 7005381 7005382 CCC13826_0038 CCC13826_0037     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005382 7005383 CCC13826_0037 CCC13826_0036   leuB TRUE 0.908 -3.000 0.000 1.000   NA
 7005383 7005384 CCC13826_0036 CCC13826_0035 leuB   TRUE 0.985 10.000 0.089 0.002 Y NA
 7005384 7005385 CCC13826_0035 CCC13826_0034     FALSE 0.016 280.000 0.000 NA   NA
 7005385 7005386 CCC13826_0034 CCC13826_0033     FALSE 0.087 105.000 0.000 NA   NA
 7005386 7005387 CCC13826_0033 CCC13826_0032     TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7005389 7005390 CCC13826_0030 CCC13826_0029     FALSE 0.128 84.000 0.000 NA   NA
 7005390 7005391 CCC13826_0029 CCC13826_0028     FALSE 0.337 116.000 0.020 NA Y NA
 7005391 7005392 CCC13826_0028 CCC13826_0027     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005393 7005394 CCC13826_2180 CCC13826_2181     TRUE 0.839 10.000 0.000 0.014   NA
 7005394 7005395 CCC13826_2181 CCC13826_2182     FALSE 0.137 79.000 0.000 NA   NA
 7005396 7005397 CCC13826_2183 CCC13826_2184   flgG TRUE 0.857 6.000 0.000 NA   NA
 7005397 7005398 CCC13826_2184 CCC13826_2185 flgG   TRUE 0.964 16.000 0.377 0.005 Y NA
 7005400 7005401 CCC13826_2187 CCC13826_2188   hisD TRUE 0.900 10.000 0.007 1.000   NA
 7005401 7005402 CCC13826_2188 CCC13826_2073 hisD   TRUE 0.985 -3.000 0.020 1.000 Y NA
 7005402 7005403 CCC13826_2073 CCC13826_2072     TRUE 0.986 -7.000 0.093 1.000 N NA
 7005403 7005404 CCC13826_2072 CCC13826_2071     TRUE 0.987 -3.000 0.133 1.000   NA
 7005404 7005405 CCC13826_2071 CCC13826_2070   fbaA TRUE 0.962 5.000 0.027 1.000   NA
 7005405 7005406 CCC13826_2070 CCC13826_2069 fbaA   TRUE 0.896 16.000 0.036 1.000 N NA
 7005408 7005409 CCC13826_2067 CCC13826_2066     TRUE 0.517 18.000 0.000 NA   NA
 7005409 7005410 CCC13826_2066 CCC13826_2065     TRUE 0.986 -7.000 0.273 NA   NA
 7005410 7005411 CCC13826_2065 CCC13826_2064     TRUE 0.972 -3.000 0.023 NA   NA
 7005412 7005413 CCC13826_2063 CCC13826_2062     TRUE 0.931 2.000 0.018 NA   NA
 7005413 7005414 CCC13826_2062 CCC13826_2061     TRUE 0.935 9.000 0.015 NA   NA
 7005414 7005415 CCC13826_2061 CCC13826_2060     FALSE 0.031 197.000 0.000 NA   NA
 7005415 7005416 CCC13826_2060 CCC13826_2059   rbn FALSE 0.075 114.000 0.000 NA   NA
 7005416 7005417 CCC13826_2059 CCC13826_2057 rbn   TRUE 0.738 -45.000 0.000 NA   NA
 7005420 7005421 CCC13826_2055 CCC13826_2054     FALSE 0.015 294.000 0.000 NA   NA
 7005421 7005422 CCC13826_2054 CCC13826_2053   kdsB TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005422 7005423 CCC13826_2053 CCC13826_2052 kdsB thrC TRUE 0.973 -3.000 0.017 1.000 N NA
 7005423 7005424 CCC13826_2052 CCC13826_2051 thrC   TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005424 7005425 CCC13826_2051 CCC13826_2050   lpxK FALSE 0.198 51.000 0.000 NA   NA
 7005425 7005426 CCC13826_2050 CCC13826_2049 lpxK   TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7005426 7005427 CCC13826_2049 CCC13826_2048   nadE TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7005429 7005430 CCC13826_2046 CCC13826_2045 dnaK grpE TRUE 0.820 32.000 0.029 0.009 Y NA
 7005430 7005431 CCC13826_2045 CCC13826_2044 grpE   TRUE 0.983 -3.000 0.038 NA N NA
 7005432 7005433 CCC13826_2043 CCC13826_2042     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7005433 7005434 CCC13826_2042 CCC13826_2041     FALSE 0.022 241.000 0.000 NA   NA
 7005435 7005436 CCC13826_2040 CCC13826_2039   pyrB TRUE 0.990 3.000 0.452 1.000 Y NA
 7005436 7005437 CCC13826_2039 CCC13826_2038 pyrB mog TRUE 0.528 18.000 0.000 1.000   NA
 7005437 7005438 CCC13826_2038 CCC13826_2037 mog ftsH TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7005438 7005439 CCC13826_2037 CCC13826_2036 ftsH   TRUE 0.987 -3.000 0.154 NA   NA
 7005439 7005440 CCC13826_2036 CCC13826_2035   flhA TRUE 0.970 10.000 0.106 NA   NA
 7005440 7005441 CCC13826_2035 CCC13826_2034 flhA   TRUE 0.975 3.000 0.053 NA N NA
 7005442 7005443 CCC13826_2033 CCC13826_2032 rpsO   FALSE 0.012 361.000 0.000 1.000   NA
 7005443 7005444 CCC13826_2032 CCC13826_2031     FALSE 0.108 97.000 0.000 1.000   NA
 7005445 7005446 CCC13826_2030 CCC13826_2029     TRUE 0.468 21.000 0.000 NA   NA
 7005446 7005447 CCC13826_2029 CCC13826_2028     TRUE 0.696 13.000 0.000 NA   NA
 7005447 7005448 CCC13826_2028 CCC13826_2027     TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7005448 7005449 CCC13826_2027 CCC13826_2026     FALSE 0.114 91.000 0.000 NA   NA
 7005449 7005450 CCC13826_2026 CCC13826_2025   ribF TRUE 0.986 -3.000 0.051 1.000 N NA
 7005450 7005451 CCC13826_2025 CCC13826_2024 ribF rrmJ TRUE 0.943 -34.000 0.029 1.000 N NA
 7005451 7005452 CCC13826_2024 CCC13826_2023 rrmJ ligA TRUE 0.954 -10.000 0.014 1.000 N NA
 7005452 7005453 CCC13826_2023 CCC13826_2022 ligA   FALSE 0.249 42.000 0.000 NA   NA
 7005453 7005454 CCC13826_2022 CCC13826_2021     TRUE 0.420 24.000 0.000 NA   NA
 7005454 7005455 CCC13826_2021 CCC13826_2020     TRUE 0.982 -3.000 0.054 1.000   NA
 7005455 7005456 CCC13826_2020 CCC13826_2019     TRUE 0.964 1.000 0.053 NA   NA
 7005456 7005457 CCC13826_2019 CCC13826_2018     TRUE 0.965 0.000 0.050 NA   NA
 7005457 7005458 CCC13826_2018 CCC13826_2017     TRUE 0.973 0.000 0.051 1.000 N NA
 7005458 7005459 CCC13826_2017 CCC13826_2016     FALSE 0.176 64.000 0.000 NA   NA
 7005459 7005460 CCC13826_2016 CCC13826_2015     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7005461 7005462 CCC13826_2013 CCC13826_2011 ftsZ   FALSE 0.188 56.000 0.000 NA   NA
 7005464 7005465 CCC13826_2010 CCC13826_2009   tatC TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005465 7005466 CCC13826_2009 CCC13826_2008 tatC queA TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7005466 7005467 CCC13826_2008 CCC13826_2006 queA   TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005468 7005469 CCC13826_2007 CCC13826_2005   dprA TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005469 7005470 CCC13826_2005 CCC13826_2004 dprA   TRUE 0.971 -3.000 0.022 1.000   NA
 7005470 7005471 CCC13826_2004 CCC13826_2003   ilvC TRUE 0.941 4.000 0.013 1.000   NA
 7005472 7005473 CCC13826_2002 CCC13826_2001     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7005473 7005474 CCC13826_2001 CCC13826_2000     TRUE 0.989 -3.000 0.122 NA N NA
 7005474 7005475 CCC13826_2000 CCC13826_1999     TRUE 0.975 -7.000 0.024 1.000 N NA
 7005475 7005476 CCC13826_1999 CCC13826_1998   rpsF TRUE 0.407 78.000 0.020 1.000 N NA
 7005476 7005477 CCC13826_1998 CCC13826_1997 rpsF   TRUE 0.922 14.000 0.033 1.000 N NA
 7005477 7005478 CCC13826_1997 CCC13826_1996   rpsR TRUE 0.882 17.000 0.034 1.000 N NA
 7005479 7005480 CCC13826_1995 CCC13826_1994 mrdA   TRUE 0.980 -3.000 0.043 NA   NA
 7005480 7005481 CCC13826_1994 CCC13826_1993   engB TRUE 0.900 2.000 0.007 NA   NA
 7005481 7005482 CCC13826_1993 CCC13826_1992 engB yhbN TRUE 0.980 -3.000 0.041 NA   NA
 7005482 7005483 CCC13826_1992 CCC13826_1991 yhbN   TRUE 0.969 -27.000 0.459 NA   NA
 7005483 7005484 CCC13826_1991 CCC13826_1990     TRUE 0.986 -9.000 0.617 NA   NA
 7005484 7005485 CCC13826_1990 CCC13826_1989   hisB TRUE 0.966 -3.000 0.018 1.000   NA
 7005485 7005486 CCC13826_1989 CCC13826_1988 hisB   TRUE 0.966 4.000 0.022 NA N NA
 7005486 7005487 CCC13826_1988 CCC13826_1987     TRUE 0.986 -13.000 0.115 NA Y NA
 7005487 7005488 CCC13826_1987 CCC13826_1986     TRUE 0.814 -16.000 0.000 NA   NA
 7005488 7005489 CCC13826_1986 CCC13826_1985     TRUE 0.754 -31.000 0.000 NA   NA
 7005489 7005490 CCC13826_1985 CCC13826_1984     TRUE 0.740 21.000 0.013 NA N NA
 7005490 7005491 CCC13826_1984 CCC13826_1983     TRUE 0.571 89.000 0.141 1.000 N NA
 7005491 7005492 CCC13826_1983 CCC13826_1982   pnk TRUE 0.979 8.000 0.066 1.000 N NA
 7005493 7005494 CCC13826_1981 CCC13826_1980 aspS adk FALSE 0.160 184.000 0.025 0.081 N NA
 7005494 7005495 CCC13826_1980 CCC13826_1979 adk   FALSE 0.085 107.000 0.000 NA   NA
 7005495 7005496 CCC13826_1979 CCC13826_1978   ppa FALSE 0.247 70.000 0.004 NA   NA
 7005496 7005497 CCC13826_1978 CCC13826_2266 ppa   FALSE 0.065 125.000 0.000 NA   NA
 7005499 7005500 CCC13826_1974 CCC13826_1973 hsdM   TRUE 0.990 -7.000 0.538 NA N NA
 7005500 7005501 CCC13826_1973 CCC13826_1972     TRUE 0.933 0.000 0.016 1.000   NA
 7005501 7005502 CCC13826_1972 CCC13826_1971     FALSE 0.236 44.000 0.000 NA   NA
 7005503 7005504 CCC13826_1970 CCC13826_1969     TRUE 0.988 -16.000 0.492 1.000 Y NA
 7005504 7005505 CCC13826_1969 CCC13826_1968     FALSE 0.249 42.000 0.000 NA   NA
 7005505 7005506 CCC13826_1968 CCC13826_1967     FALSE 0.227 45.000 0.000 NA   NA
 7005506 7005507 CCC13826_1967 CCC13826_2267     FALSE 0.018 269.000 0.000 NA   NA
 7005507 7005508 CCC13826_2267 CCC13826_1965     FALSE 0.081 110.000 0.000 NA   NA
 7005508 7005509 CCC13826_1965 CCC13826_1964     TRUE 0.434 81.000 0.040 NA   NA
 7005509 7005510 CCC13826_1964 CCC13826_1963     TRUE 0.980 0.000 0.400 NA   NA
 7005510 7005511 CCC13826_1963 CCC13826_1962     TRUE 0.989 -3.000 0.333 NA   NA
 7005511 7005512 CCC13826_1962 CCC13826_1961     TRUE 0.898 -6.000 0.000 NA   NA
 7005512 7005513 CCC13826_1961 CCC13826_1960     FALSE 0.190 54.000 0.000 NA   NA
 7005514 7005515 CCC13826_1959 CCC13826_1958   lon TRUE 0.972 9.000 0.062 1.000   NA
 7005516 7005517 CCC13826_1957 CCC13826_1956     FALSE 0.066 149.000 0.000 1.000 N NA
 7005517 7005518 CCC13826_1956 CCC13826_1012   ffh TRUE 0.964 4.000 0.021 1.000 N NA
 7005518 7005519 CCC13826_1012 CCC13826_1013 ffh hemE TRUE 0.959 -10.000 0.017 1.000 N NA
 7005519 7005520 CCC13826_1013 CCC13826_1014 hemE   FALSE 0.251 93.000 0.016 NA   NA
 7005520 7005521 CCC13826_1014 CCC13826_1015     FALSE 0.010 386.000 0.000 NA   NA
 7005523 7005524 CCC13826_1016 CCC13826_1018 mnmA   TRUE 0.391 47.000 0.012 NA   NA
 7005524 7005525 CCC13826_1018 CCC13826_1019     TRUE 0.971 0.000 0.085 NA   NA
 7005525 7005526 CCC13826_1019 CCC13826_1020   fliM TRUE 0.990 -10.000 0.142 0.002 Y NA
 7005526 7005527 CCC13826_1020 CCC13826_1021 fliM fliA TRUE 0.979 0.000 0.118 1.000 N NA
 7005527 7005528 CCC13826_1021 CCC13826_1022 fliA   TRUE 0.958 -28.000 0.112 NA   NA
 7005528 7005529 CCC13826_1022 CCC13826_0366     TRUE 0.940 14.000 0.159 NA   NA
 7005529 7005530 CCC13826_0366 CCC13826_0367   flhF TRUE 0.989 -7.000 0.382 1.000 N NA
 7005530 7005531 CCC13826_0367 CCC13826_0368 flhF folK TRUE 0.966 10.000 0.035 1.000 N NA
 7005531 7005532 CCC13826_0368 CCC13826_0369 folK dnaX TRUE 0.983 -3.000 0.033 1.000 N NA
 7005532 7005533 CCC13826_0369 CCC13826_0370 dnaX aroQ TRUE 0.993 -3.000 0.168 1.000 Y NA
 7005534 7005535 CCC13826_0371 CCC13826_0373   sppA TRUE 0.972 -12.000 0.035 1.000 N NA
 7005536 7005537 CCC13826_0374 CCC13826_0375 psp thrC TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 7005537 7005538 CCC13826_0375 CCC13826_2269 thrC   FALSE 0.119 89.000 0.000 NA   NA
 7005538 7005539 CCC13826_2269 CCC13826_0377     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 7005541 7005542 CCC13826_0379 CCC13826_0380 dps   TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7005542 7005543 CCC13826_0380 CCC13826_0381     TRUE 0.758 15.000 0.007 NA   NA
 7005545 7005546 CCC13826_0383 CCC13826_0384   ruvB TRUE 0.420 24.000 0.000 NA   NA
 7005546 7005547 CCC13826_0384 CCC13826_0385 ruvB   FALSE 0.287 50.000 0.000 0.080 N NA
 7005547 7005548 CCC13826_0385 CCC13826_0386     TRUE 0.989 -16.000 0.857 1.000 Y NA
 7005548 7005549 CCC13826_0386 CCC13826_0387     TRUE 0.639 91.000 0.833 1.000 N NA
 7005549 7005550 CCC13826_0387 CCC13826_0388     TRUE 0.991 -7.000 1.000 NA N NA
 7005550 7005551 CCC13826_0388 CCC13826_0389     TRUE 0.989 10.000 0.667 NA Y NA
 7005551 7005552 CCC13826_0389 CCC13826_0390     FALSE 0.016 294.000 0.000 1.000   NA
 7005552 7005553 CCC13826_0390 CCC13826_0391     TRUE 0.517 92.000 0.195 1.000   NA
 7005553 7005554 CCC13826_0391 CCC13826_0392   mpr FALSE 0.011 509.000 0.000 1.000 N NA
 7005554 7005555 CCC13826_0392 CCC13826_0393 mpr expD TRUE 0.770 38.000 0.074 0.069 N NA
 7005555 7005556 CCC13826_0393 CCC13826_0394 expD exbB TRUE 0.991 -13.000 0.815 0.030 Y NA
 7005556 7005557 CCC13826_0394 CCC13826_0395 exbB   FALSE 0.038 220.000 0.000 1.000 N NA
 7005557 7005558 CCC13826_0395 CCC13826_0396     TRUE 0.882 0.000 0.000 1.000 N NA
 7005558 7005559 CCC13826_0396 CCC13826_0397     TRUE 0.987 -3.000 0.150 NA   NA
 7005560 7005561 CCC13826_0398 CCC13826_0399 dapD thiD TRUE 0.853 -19.000 0.000 1.000 N NA
 7005561 7005562 CCC13826_0399 CCC13826_0400 thiD thiE TRUE 0.980 -7.000 0.016 0.005 Y NA
 7005562 7005563 CCC13826_0400 CCC13826_0401 thiE   FALSE 0.021 247.000 0.000 NA   NA
 7005565 7005566 CCC13826_0403 CCC13826_0404   glmS TRUE 0.989 -7.000 0.750 0.008   NA
 7005567 7005568 CCC13826_0405 CCC13826_0406     FALSE 0.165 88.000 0.000 NA N NA
 7005569 7005570 CCC13826_0407 CCC13826_0408     FALSE 0.316 33.000 0.000 NA   NA
 7005570 7005571 CCC13826_0408 CCC13826_0409     FALSE 0.198 51.000 0.000 NA   NA
 7005572 7005573 CCC13826_0410 CCC13826_0411     FALSE 0.100 101.000 0.000 1.000   NA
 7005573 7005574 CCC13826_0411 CCC13826_0412     FALSE 0.013 314.000 0.000 NA   NA
 7005574 7005575 CCC13826_0412 CCC13826_0413     FALSE 0.061 129.000 0.000 NA   NA
 7005575 7005576 CCC13826_0413 CCC13826_0414     TRUE 0.981 12.000 0.385 1.000 Y NA
 7005576 7005577 CCC13826_0414 CCC13826_0415     TRUE 0.991 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 7005579 7005580 CCC13826_0417 CCC13826_0418     TRUE 0.950 -3.000 0.008 NA   NA
 7005580 7005581 CCC13826_0418 CCC13826_0419     TRUE 0.902 0.000 0.006 NA   NA
 7005581 7005582 CCC13826_0419 CCC13826_0420   dxr TRUE 0.923 -13.000 0.004 1.000 N NA
 7005582 7005583 CCC13826_0420 CCC13826_0421 dxr cdsA TRUE 0.987 -18.000 0.372 1.000 Y NA
 7005583 7005584 CCC13826_0421 CCC13826_0422 cdsA   FALSE 0.038 176.000 0.000 1.000   NA
 7005586 7005587 CCC13826_0424 CCC13826_0425 frdB   TRUE 0.992 -7.000 0.153 0.005 Y NA
 7005587 7005588 CCC13826_0425 CCC13826_0426     TRUE 0.894 15.000 0.034 0.005   NA
 7005588 7005589 CCC13826_0426 CCC13826_0427   lgt FALSE 0.038 246.000 0.005 1.000   NA
 7005589 7005590 CCC13826_0427 CCC13826_0428 lgt   TRUE 0.411 37.000 0.003 1.000   NA
 7005591 7005592 CCC13826_0429 CCC13826_0430 galU pgi TRUE 0.979 -3.000 0.023 1.000 N NA
 7005592 7005593 CCC13826_0430 CCC13826_0431 pgi   TRUE 0.916 4.000 0.005 NA   NA
 7005593 7005594 CCC13826_0431 CCC13826_0432     FALSE 0.181 61.000 0.000 NA   NA
 7005595 7005596 CCC13826_0433 CCC13826_0434     FALSE 0.265 40.000 0.000 NA   NA
 7005596 7005597 CCC13826_0434 CCC13826_0435     FALSE 0.064 129.000 0.000 1.000   NA
 7005597 7005598 CCC13826_0435 CCC13826_0436   pacS FALSE 0.022 234.000 0.000 NA   NA
 7005598 7005599 CCC13826_0436 CCC13826_0438 pacS leuA FALSE 0.006 713.000 0.000 NA   NA
 7005599 7005600 CCC13826_0438 CCC13826_0439 leuA   FALSE 0.306 141.000 0.073 1.000 N NA
 7005600 7005601 CCC13826_0439 CCC13826_0440   psd TRUE 0.989 2.000 0.466 1.000 Y NA
 7005601 7005602 CCC13826_0440 CCC13826_0441 psd   TRUE 0.973 3.000 0.043 1.000 N NA
 7005602 7005603 CCC13826_0441 CCC13826_0442   prmA TRUE 0.979 -7.000 0.032 1.000 N NA
 7005603 7005604 CCC13826_0442 CCC13826_0443 prmA   TRUE 0.966 0.000 0.029 1.000 N NA
 7005604 7005605 CCC13826_0443 CCC13826_0444   hisA TRUE 0.624 64.000 0.062 1.000 N NA
 7005605 7005606 CCC13826_0444 CCC13826_0445 hisA hisH TRUE 0.986 0.000 0.091 0.005 Y NA
 7005606 7005607 CCC13826_0445 CCC13826_0446 hisH   TRUE 0.989 -3.000 0.273 1.000   NA
 7005607 7005608 CCC13826_0446 CCC13826_0447     TRUE 0.980 3.000 0.242 1.000   NA
 7005608 7005609 CCC13826_0447 CCC13826_0448     TRUE 0.986 1.000 0.133 1.000 Y NA
 7005609 7005610 CCC13826_0448 CCC13826_0449     TRUE 0.394 50.000 0.014 1.000   NA
 7005610 7005611 CCC13826_0449 CCC13826_0450     TRUE 0.923 -13.000 0.012 NA   NA
 7005611 7005612 CCC13826_0450 CCC13826_0451     TRUE 0.991 -7.000 0.128 NA Y NA
 7005612 7005613 CCC13826_0451 CCC13826_0452   fecD TRUE 0.967 3.000 0.045 1.000   NA
 7005613 7005614 CCC13826_0452 CCC13826_0453 fecD fecB TRUE 0.987 -7.000 0.375 1.000   NA
 7005614 7005615 CCC13826_0453 CCC13826_0454 fecB   TRUE 0.994 -3.000 0.167 0.015 Y NA
 7005615 7005616 CCC13826_0454 CCC13826_0455     TRUE 0.995 -3.000 0.600 0.015 Y NA
 7005616 7005617 CCC13826_0455 CCC13826_0456     TRUE 0.993 -3.000 0.200 NA Y NA
 7005617 7005618 CCC13826_0456 CCC13826_0457     TRUE 0.984 1.000 0.091 NA Y NA
 7005618 7005619 CCC13826_0457 CCC13826_0458     TRUE 0.831 1.000 0.000 1.000   NA
 7005619 7005620 CCC13826_0458 CCC13826_0460     TRUE 0.851 0.000 0.000 0.068   NA
 7005620 7005621 CCC13826_0460 CCC13826_0461     TRUE 0.920 9.000 0.008 1.000   NA
 7005621 7005622 CCC13826_0461 CCC13826_0462     TRUE 0.956 -3.000 0.012 NA   NA
 7005622 7005623 CCC13826_0462 CCC13826_0463     TRUE 0.978 -3.000 0.034 NA   NA
 7005623 7005624 CCC13826_0463 CCC13826_0464   galE TRUE 0.985 9.000 0.052 1.000 Y NA
 7005626 7005627 CCC13826_0465 CCC13826_0467     TRUE 0.703 21.000 0.000 1.000 Y NA
 7005627 7005628 CCC13826_0467 CCC13826_0468     TRUE 0.875 1.000 0.000 1.000 N NA
 7005628 7005629 CCC13826_0468 CCC13826_0469     TRUE 0.846 21.000 0.034 1.000 N NA
 7005630 7005631 CCC13826_0470 CCC13826_0471 rfaC   TRUE 0.992 -7.000 0.231 1.000 Y NA
 7005631 7005632 CCC13826_0471 CCC13826_0472     TRUE 0.990 -6.000 0.050 NA Y NA
 7005632 7005633 CCC13826_0472 CCC13826_0473     TRUE 0.990 -3.000 0.050 NA Y NA
 7005633 7005634 CCC13826_0473 CCC13826_0474     TRUE 0.987 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 7005634 7005635 CCC13826_0474 CCC13826_0475     TRUE 0.983 -3.000 0.056 1.000   NA
 7005636 7005637 CCC13826_0476 CCC13826_0477     TRUE 0.990 -3.000 0.222 1.000 N NA
 7005638 7005639 CCC13826_0478 CCC13826_0479   rfaF TRUE 0.987 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 7005641 7005642 CCC13826_0481 CCC13826_0482     FALSE 0.017 274.000 0.000 NA   NA
 7005642 7005643 CCC13826_0482 CCC13826_0484     TRUE 0.918 8.000 0.006 1.000   NA
 7005644 7005645 CCC13826_0483 CCC13826_0485   dnaE TRUE 0.589 16.000 0.000 1.000   NA
 7005647 7005648 CCC13826_0487 CCC13826_0488     TRUE 0.637 19.000 0.005 1.000   NA
 7005648 7005649 CCC13826_0488 CCC13826_0489   serA TRUE 0.963 -10.000 0.028 1.000   NA
 7005649 7005650 CCC13826_0489 CCC13826_0490 serA   TRUE 0.949 13.000 0.165 1.000   NA
 7005650 7005651 CCC13826_0490 CCC13826_0491     TRUE 0.983 -7.000 0.116 NA   NA
 7005651 7005652 CCC13826_0491 CCC13826_0492   purD TRUE 0.959 -3.000 0.013 NA   NA
 7005652 7005653 CCC13826_0492 CCC13826_0493 purD hemD FALSE 0.033 233.000 0.000 1.000 N NA
 7005653 7005654 CCC13826_0493 CCC13826_0494 hemD moeB TRUE 0.962 -7.000 0.013 1.000 N NA
 7005654 7005655 CCC13826_0494 CCC13826_0495 moeB   FALSE 0.082 111.000 0.000 1.000   NA
 7005655 7005656 CCC13826_0495 CCC13826_0496   mnmC FALSE 0.154 74.000 0.000 1.000   NA
 7005656 7005657 CCC13826_0496 CCC13826_0497 mnmC   TRUE 0.975 -3.000 0.020 1.000 N NA
 7005657 7005658 CCC13826_0497 CCC13826_0498     TRUE 0.982 -3.000 0.050 1.000   NA
 7005658 7005659 CCC13826_0498 CCC13826_0499   tyrS TRUE 0.962 1.000 0.043 1.000   NA
 7005659 7005660 CCC13826_0499 CCC13826_0500 tyrS   TRUE 0.969 10.000 0.045 1.000 N NA
 7005660 7005661 CCC13826_0500 CCC13826_0501   rpoZ TRUE 0.981 -13.000 0.039 1.000 Y NA
 7005661 7005662 CCC13826_0501 CCC13826_0502 rpoZ pyrH TRUE 0.853 19.000 0.033 1.000 N NA
 7005662 7005663 CCC13826_0502 CCC13826_0503 pyrH   FALSE 0.326 74.000 0.009 1.000 N NA
 7005663 7005664 CCC13826_0503 CCC13826_0504     TRUE 0.990 -3.000 0.045 1.000 Y NA
 7005664 7005665 CCC13826_0504 CCC13826_0505     TRUE 0.984 -13.000 0.431 1.000 N NA
 7005665 7005666 CCC13826_0505 CCC13826_0506   trmB TRUE 0.960 -16.000 0.044 1.000   NA
 7005666 7005667 CCC13826_0506 CCC13826_0507 trmB   TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005667 7005668 CCC13826_0507 CCC13826_0508   lysA FALSE 0.069 119.000 0.000 NA   NA
 7005668 7005669 CCC13826_0508 CCC13826_0509 lysA   TRUE 0.501 62.000 0.031 1.000   NA
 7005671 7005672 CCC13826_0512 CCC13826_0513   fliG FALSE 0.137 79.000 0.000 NA   NA
 7005672 7005673 CCC13826_0513 CCC13826_0514 fliG tpiA FALSE 0.259 169.000 0.071 0.025 N NA
 7005673 7005674 CCC13826_0514 CCC13826_0515 tpiA pgk TRUE 0.979 4.000 0.022 1.000 Y NA
 7005674 7005675 CCC13826_0515 CCC13826_0516 pgk gap TRUE 0.897 17.000 0.020 0.004 Y NA
 7005679 7005680 CCC13826_0520 CCC13826_0521     TRUE 0.992 -7.000 0.146 1.000 Y NA
 7005680 7005681 CCC13826_0521 CCC13826_0522     TRUE 0.983 2.000 0.077 1.000 Y NA
 7005681 7005682 CCC13826_0522 CCC13826_0523   trpE TRUE 0.814 15.000 0.000 1.000 Y NA
 7005682 7005683 CCC13826_0523 CCC13826_0524 trpE asnB TRUE 0.852 18.000 0.028 1.000 N NA
 7005683 7005684 CCC13826_0524 CCC13826_0525 asnB   FALSE 0.214 49.000 0.000 1.000   NA
 7005684 7005685 CCC13826_0525 CCC13826_0526   gtp FALSE 0.008 441.000 0.000 1.000   NA
 7005685 7005686 CCC13826_0526 CCC13826_0528 gtp   FALSE 0.007 635.000 0.000 1.000   NA
 7005686 7005687 CCC13826_0528 CCC13826_0529     TRUE 0.968 10.000 0.079 1.000   NA
 7005687 7005688 CCC13826_0529 CCC13826_0530     TRUE 0.916 -3.000 0.000 0.015   NA
 7005688 7005689 CCC13826_0530 CCC13826_0531     TRUE 0.835 -13.000 0.000 NA   NA
 7005689 7005690 CCC13826_0531 CCC13826_0532     FALSE 0.025 223.000 0.000 NA   NA
 7005690 7005691 CCC13826_0532 CCC13826_0533     TRUE 0.908 -3.000 0.000 1.000   NA
 7005691 7005692 CCC13826_0533 CCC13826_0534     TRUE 0.864 -10.000 0.000 1.000   NA
 7005692 7005693 CCC13826_0534 CCC13826_0535     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005693 7005694 CCC13826_0535 CCC13826_0536   asnB TRUE 0.619 15.000 0.000 NA   NA
 7005694 7005695 CCC13826_0536 CCC13826_0537 asnB   TRUE 0.980 2.000 0.178 1.000 N NA
 7005695 7005696 CCC13826_0537 CCC13826_0538     TRUE 0.748 -37.000 0.000 NA   NA
 7005696 7005697 CCC13826_0538 CCC13826_0539     FALSE 0.089 104.000 0.000 NA   NA
 7005697 7005698 CCC13826_0539 CCC13826_0540     TRUE 0.841 14.000 0.000 1.000 Y NA
 7005698 7005699 CCC13826_0540 CCC13826_0541     TRUE 0.978 4.000 0.048 1.000 N NA
 7005699 7005700 CCC13826_0541 CCC13826_0542     TRUE 0.974 0.000 0.114 1.000   NA
 7005700 7005701 CCC13826_0542 CCC13826_0543   argS FALSE 0.326 33.000 0.000 1.000   NA
 7005701 7005702 CCC13826_0543 CCC13826_0544 argS   TRUE 0.931 10.000 0.011 1.000 N NA
 7005702 7005703 CCC13826_0544 CCC13826_0545   gmk FALSE 0.265 52.000 0.000 1.000 N NA
 7005703 7005704 CCC13826_0545 CCC13826_0546 gmk   TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7005704 7005705 CCC13826_0546 CCC13826_0547   fliR FALSE 0.186 57.000 0.000 NA   NA
 7005705 7005706 CCC13826_0547 CCC13826_0548 fliR mda TRUE 0.430 91.000 0.032 1.000 N NA
 7005706 7005707 CCC13826_0548 CCC13826_0550 mda tsf TRUE 0.953 0.000 0.019 1.000 N NA
 7005707 7005708 CCC13826_0550 CCC13826_0551 tsf rpsB TRUE 0.957 18.000 0.748 1.000 Y NA
 7005708 7005709 CCC13826_0551 CCC13826_0552 rpsB iadA FALSE 0.047 191.000 0.000 1.000 N NA
 7005709 7005710 CCC13826_0552 CCC13826_0553 iadA   TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7005710 7005711 CCC13826_0553 CCC13826_0554     TRUE 0.908 -10.000 0.003 NA   NA
 7005711 7005712 CCC13826_0554 CCC13826_0555   ribE TRUE 0.884 11.000 0.011 NA   NA
 7005714 7005715 CCC13826_0556 CCC13826_0558     TRUE 0.696 13.000 0.000 NA   NA
 7005715 7005716 CCC13826_0558 CCC13826_0559   accA FALSE 0.029 203.000 0.000 NA   NA
 7005716 7005717 CCC13826_0559 CCC13826_0560 accA fabF TRUE 0.981 2.000 0.046 1.000 Y NA
 7005717 7005718 CCC13826_0560 CCC13826_0561 fabF acpP TRUE 0.842 35.000 0.066 1.000 Y NA
 7005718 7005719 CCC13826_0561 CCC13826_0562 acpP fabG TRUE 0.727 87.000 0.321 0.006 Y NA
 7005719 7005720 CCC13826_0562 CCC13826_0563 fabG gpmI TRUE 0.613 37.000 0.018 1.000 N NA
 7005721 7005722 CCC13826_0564 CCC13826_0565 mraY   TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7005722 7005723 CCC13826_0565 CCC13826_0566   murD TRUE 0.907 5.000 0.002 NA   NA
 7005723 7005724 CCC13826_0566 CCC13826_0567 murD   FALSE 0.037 172.000 0.000 NA   NA
 7005724 7005725 CCC13826_0567 CCC13826_0568     FALSE 0.164 68.000 0.000 NA   NA
 7005725 7005726 CCC13826_0568 CCC13826_2270     FALSE 0.065 125.000 0.000 NA   NA
 7005726 7005727 CCC13826_2270 CCC13826_2271     FALSE 0.361 29.000 0.000 NA   NA
 7005728 7005729 CCC13826_0638 CCC13826_2272     TRUE 0.851 0.000 0.000 0.036   NA
 7005729 7005730 CCC13826_2272 CCC13826_2273     TRUE 0.619 15.000 0.000 NA   NA
 7005730 7005731 CCC13826_2273 CCC13826_2274     FALSE 0.023 232.000 0.000 NA   NA
 7005731 7005732 CCC13826_2274 CCC13826_1101     FALSE 0.258 41.000 0.000 NA   NA
 7005733 7005734 CCC13826_1102 CCC13826_2275     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7005735 7005736 CCC13826_2082 CCC13826_1099     FALSE 0.010 375.000 0.000 NA   NA
 7005736 7005737 CCC13826_1099 CCC13826_1100     FALSE 0.207 49.000 0.000 NA   NA
 7005737 7005738 CCC13826_1100 CCC13826_2276     TRUE 0.700 44.000 0.133 NA   NA
 7005738 7005739 CCC13826_2276 CCC13826_2277     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7005739 7005740 CCC13826_2277 CCC13826_0183     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005743 7005744 CCC13826_0164 CCC13826_2078     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7005745 7005746 CCC13826_2077 CCC13826_0020     FALSE 0.020 249.000 0.000 NA   NA
 7005746 7005747 CCC13826_0020 CCC13826_0019     FALSE 0.207 49.000 0.000 NA   NA
 7005747 7005748 CCC13826_0019 CCC13826_2075     TRUE 0.700 44.000 0.133 NA   NA
 7005748 7005749 CCC13826_2075 CCC13826_2074     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7005749 7005750 CCC13826_2074 CCC13826_1299     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005753 7005754 CCC13826_0185 CCC13826_0186     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7005755 7005756 CCC13826_0706 CCC13826_0188     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005756 7005757 CCC13826_0188 CCC13826_0189     TRUE 0.619 15.000 0.000 NA   NA
 7005757 7005758 CCC13826_0189 CCC13826_0190     FALSE 0.023 232.000 0.000 NA   NA
 7005758 7005759 CCC13826_0190 CCC13826_0191     TRUE 0.954 -49.000 0.133 NA   NA
 7005759 7005760 CCC13826_0191 CCC13826_0192     TRUE 0.972 2.000 0.133 NA   NA
 7005760 7005761 CCC13826_0192 CCC13826_0193     FALSE 0.099 99.000 0.000 NA   NA
 7005761 7005762 CCC13826_0193 CCC13826_0194     TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7005762 7005763 CCC13826_0194 CCC13826_0196     FALSE 0.009 414.000 0.000 NA   NA
 7005763 7005764 CCC13826_0196 CCC13826_0197     FALSE 0.108 94.000 0.000 NA   NA
 7005765 7005766 CCC13826_0198 CCC13826_0199     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005767 7005768 CCC13826_0200 CCC13826_0201     TRUE 0.408 49.000 0.015 1.000   NA
 7005768 7005769 CCC13826_0201 CCC13826_0202     FALSE 0.018 262.000 0.000 NA   NA
 7005770 7005771 CCC13826_0203 CCC13826_0204     TRUE 0.983 10.000 0.389 0.019 N NA
 7005771 7005772 CCC13826_0204 CCC13826_0205     FALSE 0.022 246.000 0.000 1.000   NA
 7005772 7005773 CCC13826_0205 CCC13826_0206     TRUE 0.859 -10.000 0.000 NA   NA
 7005773 7005774 CCC13826_0206 CCC13826_0207     FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 7005774 7005775 CCC13826_0207 CCC13826_0208   ttdA FALSE 0.207 49.000 0.000 NA   NA
 7005775 7005776 CCC13826_0208 CCC13826_0209 ttdA lemA TRUE 0.829 2.000 0.000 1.000   NA
 7005776 7005777 CCC13826_0209 CCC13826_0210 lemA   FALSE 0.342 31.000 0.000 NA   NA
 7005777 7005778 CCC13826_0210 CCC13826_0211   fdhD FALSE 0.219 46.000 0.000 NA   NA
 7005778 7005779 CCC13826_0211 CCC13826_0212 fdhD   TRUE 0.985 -7.000 0.172 1.000   NA
 7005779 7005780 CCC13826_0212 CCC13826_0213     TRUE 0.802 26.000 0.077 NA   NA
 7005780 7005781 CCC13826_0213 CCC13826_0214     FALSE 0.129 83.000 0.000 NA   NA
 7005782 7005783 CCC13826_0215 CCC13826_0216   hisG FALSE 0.095 101.000 0.000 NA   NA
 7005783 7005784 CCC13826_0216 CCC13826_0217 hisG   TRUE 0.979 -3.000 0.023 1.000 N NA
 7005784 7005785 CCC13826_0217 CCC13826_0218     TRUE 0.942 -13.000 0.021 NA   NA
 7005785 7005786 CCC13826_0218 CCC13826_0219     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005786 7005787 CCC13826_0219 CCC13826_0220     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005788 7005789 CCC13826_0221 CCC13826_0222 gatC   TRUE 0.861 4.000 0.000 NA   NA
 7005789 7005790 CCC13826_0222 CCC13826_0223   cvpA TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005790 7005791 CCC13826_0223 CCC13826_0224 cvpA   TRUE 0.973 -3.000 0.023 1.000   NA
 7005791 7005792 CCC13826_0224 CCC13826_0225   lysS TRUE 0.955 2.000 0.022 1.000 N NA
 7005792 7005793 CCC13826_0225 CCC13826_0226 lysS glyA TRUE 0.985 -3.000 0.044 1.000 N NA
 7005793 7005794 CCC13826_0226 CCC13826_0227 glyA   TRUE 0.978 0.000 0.271 NA   NA
 7005794 7005795 CCC13826_0227 CCC13826_0228     TRUE 0.977 10.000 0.387 NA   NA
 7005795 7005796 CCC13826_0228 CCC13826_0229   aroE TRUE 0.968 -3.000 0.020 NA   NA
 7005796 7005797 CCC13826_0229 CCC13826_0230 aroE   FALSE 0.020 252.000 0.000 NA   NA
 7005798 7005799 CCC13826_0231 CCC13826_0232     FALSE 0.028 207.000 0.000 NA   NA
 7005799 7005800 CCC13826_0232 CCC13826_0233     TRUE 0.993 -3.000 0.167 1.000 Y NA
 7005800 7005801 CCC13826_0233 CCC13826_0234     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005801 7005802 CCC13826_0234 CCC13826_0235     FALSE 0.103 97.000 0.000 NA   NA
 7005804 7005805 CCC13826_0237 CCC13826_0238     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005805 7005806 CCC13826_0238 CCC13826_0239     TRUE 0.989 -3.000 0.329 NA   NA
 7005806 7005807 CCC13826_0239 CCC13826_0240   upp TRUE 0.825 10.000 0.000 1.000   NA
 7005807 7005808 CCC13826_0240 CCC13826_0241 upp tktA FALSE 0.267 90.000 0.008 1.000 N NA
 7005808 7005809 CCC13826_0241 CCC13826_0242 tktA gltX TRUE 0.977 -3.000 0.021 1.000 N NA
 7005811 7005812 CCC13826_0244 CCC13826_0245     TRUE 0.824 1.000 0.000 NA   NA
 7005812 7005813 CCC13826_0245 CCC13826_0246   dapE FALSE 0.142 77.000 0.000 NA   NA
 7005813 7005814 CCC13826_0246 CCC13826_0247 dapE   TRUE 0.882 0.000 0.000 1.000 N NA
 7005814 7005815 CCC13826_0247 CCC13826_0248     TRUE 0.391 97.000 0.029 1.000 N NA
 7005815 7005816 CCC13826_0248 CCC13826_0249     TRUE 0.988 -3.000 0.217 NA   NA
 7005816 7005817 CCC13826_0249 CCC13826_0250     TRUE 0.898 -6.000 0.000 NA   NA
 7005817 7005818 CCC13826_0250 CCC13826_0251   murC TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005819 7005820 CCC13826_0252 CCC13826_0253     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005820 7005821 CCC13826_0253 CCC13826_0254     TRUE 0.754 -31.000 0.000 NA   NA
 7005821 7005822 CCC13826_0254 CCC13826_0256   rplQ FALSE 0.005 1505.000 0.000 NA   NA
 7005822 7005823 CCC13826_0256 CCC13826_0257 rplQ   TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7005823 7005824 CCC13826_0257 CCC13826_0258     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005824 7005825 CCC13826_0258 CCC13826_2280     FALSE 0.008 461.000 0.000 NA   NA
 7005825 7005826 CCC13826_2280 CCC13826_0260     FALSE 0.027 213.000 0.000 NA   NA
 7005826 7005827 CCC13826_0260 CCC13826_0261     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005827 7005828 CCC13826_0261 CCC13826_0262     FALSE 0.236 44.000 0.000 NA   NA
 7005828 7005829 CCC13826_0262 CCC13826_0263     FALSE 0.006 873.000 0.000 NA   NA
 7005829 7005830 CCC13826_0263 CCC13826_0264     TRUE 0.973 11.000 0.750 NA   NA
 7005830 7005831 CCC13826_0264 CCC13826_0265     TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005831 7005832 CCC13826_0265 CCC13826_0266     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 7005832 7005833 CCC13826_0266 CCC13826_0267     TRUE 0.985 -7.000 0.250 NA   NA
 7005833 7005834 CCC13826_0267 CCC13826_0268     TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 7005837 7005838 CCC13826_0270 CCC13826_0272     FALSE 0.064 153.000 0.000 1.000 N NA
 7005838 7005839 CCC13826_0272 CCC13826_0273   rplN TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005839 7005840 CCC13826_0273 CCC13826_0274 rplN rpsQ TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7005840 7005841 CCC13826_0274 CCC13826_0275 rpsQ metX TRUE 0.950 4.000 0.019 1.000   NA
 7005841 7005842 CCC13826_0275 CCC13826_0276 metX guaB TRUE 0.946 0.000 0.015 1.000 N NA
 7005842 7005843 CCC13826_0276 CCC13826_0277 guaB   TRUE 0.859 5.000 0.000 NA   NA
 7005843 7005844 CCC13826_0277 CCC13826_0278   ileS FALSE 0.097 100.000 0.000 NA   NA
 7005845 7005846 CCC13826_0279 CCC13826_0280 fadD   FALSE 0.116 90.000 0.000 NA   NA
 7005846 7005847 CCC13826_0280 CCC13826_0281     TRUE 0.898 -6.000 0.000 NA   NA
 7005848 7005849 CCC13826_0282 CCC13826_0283     TRUE 0.990 -3.000 0.732 NA   NA
 7005849 7005850 CCC13826_0283 CCC13826_0284     TRUE 0.990 -3.000 0.532 1.000   NA
 7005850 7005851 CCC13826_0284 CCC13826_2177     TRUE 0.982 -9.000 0.167 NA   NA
 7005851 7005852 CCC13826_2177 CCC13826_2176     TRUE 0.985 -3.000 0.094 NA   NA
 7005852 7005853 CCC13826_2176 CCC13826_2175     TRUE 0.985 -10.000 0.758 1.000   NA
 7005853 7005854 CCC13826_2175 CCC13826_2174     TRUE 0.984 -10.000 0.422 1.000   NA
 7005854 7005855 CCC13826_2174 CCC13826_2173     TRUE 0.949 3.000 0.019 0.002   NA
 7005855 7005856 CCC13826_2173 CCC13826_2172     TRUE 0.950 -16.000 0.028 1.000   NA
 7005856 7005857 CCC13826_2172 CCC13826_2171     TRUE 0.984 -10.000 0.636 NA   NA
 7005857 7005858 CCC13826_2171 CCC13826_2170     TRUE 0.954 0.000 0.028 NA   NA
 7005858 7005859 CCC13826_2170 CCC13826_2169   terC TRUE 0.706 13.000 0.000 1.000   NA
 7005859 7005860 CCC13826_2169 CCC13826_2168 terC   TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005860 7005861 CCC13826_2168 CCC13826_2167     TRUE 0.886 -7.000 0.000 NA   NA
 7005861 7005862 CCC13826_2167 CCC13826_2166   norM TRUE 0.994 -3.000 0.514 NA Y NA
 7005862 7005863 CCC13826_2166 CCC13826_2165 norM   TRUE 0.973 -13.000 0.110 NA   NA
 7005863 7005864 CCC13826_2165 CCC13826_2164     TRUE 0.386 26.000 0.000 NA   NA
 7005864 7005865 CCC13826_2164 CCC13826_2163     TRUE 0.796 -19.000 0.000 NA   NA
 7005865 7005866 CCC13826_2163 CCC13826_2162     FALSE 0.036 177.000 0.000 NA   NA
 7005866 7005867 CCC13826_2162 CCC13826_2161     FALSE 0.053 138.000 0.000 NA   NA
 7005867 7005868 CCC13826_2161 CCC13826_2160     FALSE 0.016 279.000 0.000 NA   NA
 7005868 7005869 CCC13826_2160 CCC13826_2159     TRUE 0.978 0.000 0.257 NA   NA
 7005869 7005870 CCC13826_2159 CCC13826_2158     FALSE 0.081 110.000 0.000 NA   NA
 7005870 7005871 CCC13826_2158 CCC13826_2157     FALSE 0.015 294.000 0.000 NA   NA
 7005871 7005872 CCC13826_2157 CCC13826_2156     TRUE 0.962 1.000 0.048 NA   NA
 7005874 7005875 CCC13826_2154 CCC13826_2153     TRUE 0.985 -3.000 0.092 NA   NA
 7005879 7005880 CCC13826_2149 CCC13826_2148   lspA TRUE 0.981 -7.000 0.083 1.000   NA
 7005881 7005882 CCC13826_2146 CCC13826_2145     FALSE 0.262 150.000 0.061 NA N NA
 7005883 7005884 CCC13826_2144 CCC13826_2143   moaE TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7005884 7005885 CCC13826_2143 CCC13826_2142 moaE   TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7005886 7005887 CCC13826_2141 CCC13826_2140 nspC gdhA TRUE 0.825 10.000 0.000 1.000   NA
 7005889 7005890 CCC13826_2138 CCC13826_2136     FALSE 0.196 147.000 0.023 1.000 N NA
 7005890 7005891 CCC13826_2136 CCC13826_2135   selD FALSE 0.139 273.000 0.104 1.000 N NA
 7005891 7005892 CCC13826_2135 CCC13826_2134 selD   FALSE 0.172 113.000 0.005 1.000 N NA
 7005892 7005893 CCC13826_2134 CCC13826_2133     FALSE 0.170 88.000 0.000 1.000 N NA
 7005893 7005894 CCC13826_2133 CCC13826_2132   hisZ TRUE 0.952 -7.000 0.006 1.000 N NA
 7005894 7005895 CCC13826_2132 CCC13826_2131 hisZ purA TRUE 0.982 3.000 0.161 1.000 N NA
 7005895 7005896 CCC13826_2131 CCC13826_2130 purA   TRUE 0.960 -3.000 0.014 NA   NA
 7005896 7005897 CCC13826_2130 CCC13826_2129     TRUE 0.975 0.000 0.147 NA   NA
 7005897 7005898 CCC13826_2129 CCC13826_2128     FALSE 0.119 89.000 0.000 NA   NA
 7005899 7005900 CCC13826_2127 CCC13826_2126 carB   TRUE 0.949 0.000 0.016 1.000 N NA
 7005900 7005901 CCC13826_2126 CCC13826_2125     TRUE 0.894 26.000 0.689 1.000 N NA
 7005901 7005902 CCC13826_2125 CCC13826_2124   clpX TRUE 0.967 10.000 0.034 0.074 N NA
 7005902 7005903 CCC13826_2124 CCC13826_2123 clpX lpxA TRUE 0.834 0.000 0.000 NA   NA
 7005903 7005904 CCC13826_2123 CCC13826_2122 lpxA fabZ TRUE 0.400 25.000 0.000 NA   NA
 7005904 7005905 CCC13826_2122 CCC13826_2121 fabZ   FALSE 0.078 111.000 0.000 NA   NA
 7005905 7005906 CCC13826_2121 CCC13826_2120     TRUE 0.373 27.000 0.000 NA   NA
 7005906 7005907 CCC13826_2120 CCC13826_2119     TRUE 0.993 -3.000 0.111 0.014 Y NA
 7005907 7005908 CCC13826_2119 CCC13826_2118     TRUE 0.994 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 7005908 7005909 CCC13826_2118 CCC13826_2117   pepD TRUE 0.995 -3.000 0.647 0.019 Y NA
 7005909 7005910 CCC13826_2117 CCC13826_2116 pepD   TRUE 0.978 13.000 0.412 0.019 Y NA
 7005913 7005914 CCC13826_2113 CCC13826_2112     TRUE 0.941 -3.000 0.002 1.000   NA
 7005914 7005915 CCC13826_2112 CCC13826_2111     TRUE 0.854 9.000 0.000 1.000   NA
 7005915 7005916 CCC13826_2111 CCC13826_2110     TRUE 0.384 27.000 0.000 1.000   NA
 7005916 7005917 CCC13826_2110 CCC13826_2109   ilvE FALSE 0.178 101.000 0.008 1.000   NA
 7005917 7005918 CCC13826_2109 CCC13826_2108 ilvE   TRUE 0.915 17.000 0.098 1.000 N NA
 7005918 7005919 CCC13826_2108 CCC13826_2107     TRUE 0.961 3.000 0.022 1.000 N NA
 7005919 7005920 CCC13826_2107 CCC13826_2106     TRUE 0.929 -10.000 0.010 NA   NA
 7005920 7005921 CCC13826_2106 CCC13826_2105     TRUE 0.987 -9.000 0.867 NA   NA
 7005922 7005923 CCC13826_2104 CCC13826_2103 accC accB TRUE 0.985 0.000 0.071 0.002 Y NA
 7005923 7005924 CCC13826_2103 CCC13826_2102 accB modB FALSE 0.175 86.000 0.000 1.000 N NA
 7005924 7005925 CCC13826_2102 CCC13826_2101 modB modA TRUE 0.992 9.000 0.629 0.002 Y NA
 7005926 7005927 CCC13826_2100 CCC13826_2099   tlpA TRUE 0.848 9.000 0.000 NA   NA
 7005927 7005928 CCC13826_2099 CCC13826_2098 tlpA   FALSE 0.188 56.000 0.000 NA   NA
 7005928 7005929 CCC13826_2098 CCC13826_2097   fliQ TRUE 0.970 0.000 0.068 1.000   NA
 7005929 7005930 CCC13826_2097 CCC13826_2096 fliQ murB TRUE 0.987 -3.000 0.066 1.000 N NA
 7005930 7005931 CCC13826_2096 CCC13826_2095 murB   TRUE 0.907 9.000 0.005 NA   NA
 7005931 7005932 CCC13826_2095 CCC13826_2094   recA FALSE 0.255 63.000 0.002 NA   NA
 7005932 7005933 CCC13826_2094 CCC13826_2093 recA eno TRUE 0.968 0.000 0.033 1.000 N NA
 7005933 7005934 CCC13826_2093 CCC13826_2092 eno   TRUE 0.984 -3.000 0.080 NA   NA
 7005934 7005935 CCC13826_2092 CCC13826_2091     TRUE 0.985 6.000 0.788 NA   NA
 7005935 7005936 CCC13826_2091 CCC13826_2090     FALSE 0.167 67.000 0.000 NA   NA
 7005937 7005938 CCC13826_2089 CCC13826_2088     TRUE 0.977 14.000 1.000 1.000 Y NA
 7005938 7005939 CCC13826_2088 CCC13826_2189     FALSE 0.033 188.000 0.000 NA   NA
 7005939 7005940 CCC13826_2189 CCC13826_2190     TRUE 0.904 -3.000 0.000 NA   NA
 7005940 7005941 CCC13826_2190 CCC13826_2191     FALSE 0.066 124.000 0.000 NA   NA
 7005941 7005942 CCC13826_2191 CCC13826_2192     TRUE 0.918 -7.000 0.000 NA N NA
 7005944 7005945 CCC13826_2194 CCC13826_2195 leuC   FALSE 0.012 348.000 0.000 NA   NA
 7005946 7005947 CCC13826_2196 CCC13826_2197     FALSE 0.155 72.000 0.000 NA   NA
 7005947 7005948 CCC13826_2197 CCC13826_2198     TRUE 0.945 3.000 0.020 NA   NA
 7005948 7005949 CCC13826_2198 CCC13826_2199     FALSE 0.015 289.000 0.000 NA   NA
 7005950 7005951 CCC13826_2200 CCC13826_2201   ttg2D TRUE 0.978 0.000 0.263 NA   NA
 7005951 7005952 CCC13826_2201 CCC13826_2202 ttg2D   TRUE 0.986 3.000 0.684 NA N NA
 7005953 7005954 CCC13826_2203 CCC13826_2204   modA TRUE 0.933 1.000 0.015 0.002   NA
 7005954 7005955 CCC13826_2204 CCC13826_2205 modA   TRUE 0.954 -3.000 0.010 1.000   NA
 7005955 7005956 CCC13826_2205 CCC13826_2281     TRUE 0.936 3.000 0.013 0.074   NA
 7005956 7005957 CCC13826_2281 CCC13826_2282   modB TRUE 0.989 0.000 0.286 1.000 Y NA
 7005957 7005958 CCC13826_2282 CCC13826_2283 modB   TRUE 0.376 37.000 0.000 1.000 N NA
 7005958 7005959 CCC13826_2283 CCC13826_2284     TRUE 0.870 10.000 0.000 1.000 N NA
 7005959 7005960 CCC13826_2284 CCC13826_2285     TRUE 0.822 2.000 0.000 NA   NA
 7005961 7005962 CCC13826_2286 CCC13826_2287   gltA TRUE 0.978 -3.000 0.022 1.000 N NA
 7005962 7005963 CCC13826_2287 CCC13826_2288 gltA   TRUE 0.956 3.000 0.019 1.000 N NA
 7005964 7005965 CCC13826_2289 CCC13826_2290     TRUE 0.761 -27.000 0.000 NA   NA
 7005965 7005966 CCC13826_2290 CCC13826_2291     TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7005967 7005968 CCC13826_2292 CCC13826_2293 crcB   TRUE 0.882 0.000 0.000 1.000 N NA
 7005970 7005971 CCC13826_2295 CCC13826_2296   topA FALSE 0.183 60.000 0.000 NA   NA
 7005973 7005974 CCC13826_2298 CCC13826_2299     TRUE 0.980 -13.000 0.131 1.000 N NA
 7005974 7005975 CCC13826_2299 CCC13826_2300     TRUE 0.984 -7.000 0.144 1.000   NA
 7005975 7005976 CCC13826_2300 CCC13826_2301     TRUE 0.931 14.000 0.088 1.000   NA
 7005976 7005977 CCC13826_2301 CCC13826_2302     TRUE 0.993 -3.000 0.131 1.000 Y NA
 7005977 7005978 CCC13826_2302 CCC13826_2303     TRUE 0.995 -3.000 0.549 1.000 Y NA
 7005978 7005979 CCC13826_2303 CCC13826_2304     TRUE 0.861 25.000 0.292 1.000   NA
 7005979 7005980 CCC13826_2304 CCC13826_2305     TRUE 0.979 3.000 0.185 1.000   NA
 7005980 7005981 CCC13826_2305 CCC13826_2306     TRUE 0.835 -13.000 0.000 NA   NA
 7005981 7005982 CCC13826_2306 CCC13826_2307     TRUE 0.844 3.000 0.000 NA   NA
 7005982 7005983 CCC13826_2307 CCC13826_2308   dcd FALSE 0.031 197.000 0.000 NA   NA
 7005984 7005985 CCC13826_2309 CCC13826_2310   hyfB TRUE 0.468 21.000 0.000 NA   NA
 7005985 7005986 CCC13826_2310 CCC13826_2311 hyfB   FALSE 0.018 269.000 0.000 NA   NA
 7005988 7005989 CCC13826_2313 CCC13826_2314     TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7005989 7005990 CCC13826_2314 CCC13826_2315     TRUE 0.843 23.000 0.095 NA   NA
 7005990 7005991 CCC13826_2315 CCC13826_2316   fbcH TRUE 0.983 12.000 0.667 1.000 Y NA
 7005991 7005992 CCC13826_2316 CCC13826_2317 fbcH fbcF TRUE 0.975 11.000 0.667 0.032   NA
 7005992 7005993 CCC13826_2317 CCC13826_2318 fbcF   TRUE 0.981 4.000 0.222 NA   NA
 7005994 7005995 CCC13826_2319 CCC13826_2320   rrf FALSE 0.008 435.000 0.000 NA   NA
 7005995 7005996 CCC13826_2320 CCC13826_2341 rrf rrl FALSE 0.048 146.000 0.000 NA   NA
 7005996 7005997 CCC13826_2341 CCC13826_2321 rrl   FALSE 0.012 329.000 0.000 NA   NA
 7005997 7005998 CCC13826_2321 CCC13826_2322     TRUE 0.739 12.000 0.000 NA   NA
 7005998 7005999 CCC13826_2322 CCC13826_2342   rrs FALSE 0.046 148.000 0.000 NA   NA
 7005999 7006000 CCC13826_2342 CCC13826_1696 rrs yckK FALSE 0.010 391.000 0.000 NA   NA
 7006000 7006001 CCC13826_1696 CCC13826_1697 yckK   FALSE 0.123 87.000 0.000 NA   NA
 7006003 7006004 CCC13826_1698 CCC13826_1700     FALSE 0.242 43.000 0.000 NA   NA
 7006004 7006005 CCC13826_1700 CCC13826_1701     TRUE 0.988 10.000 0.262 0.001 Y NA
 7006006 7006007 CCC13826_1702 CCC13826_1703     TRUE 0.776 11.000 0.000 NA   NA
 7006007 7006008 CCC13826_1703 CCC13826_1704     TRUE 0.818 10.000 0.000 NA   NA
 7006012 7006013 CCC13826_1709 CCC13826_1710     FALSE 0.016 282.000 0.000 NA   NA
 7006013 7006014 CCC13826_1710 CCC13826_1711     FALSE 0.327 32.000 0.000 NA   NA
 7006014 7006015 CCC13826_1711 CCC13826_1712     TRUE 0.890 3.000 0.000 1.000 N NA
 7006015 7006016 CCC13826_1712 CCC13826_2323     FALSE 0.242 43.000 0.000 NA   NA
 7006016 7006017 CCC13826_2323 CCC13826_1715     FALSE 0.354 30.0