MicrobesOnline Operon Predictions for Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5511956 5511957 PXO_03483 PXO_03482 dnaA dnaN TRUE 0.732 278.000 0.328 1.000 Y NA
 5511957 5511958 PXO_03482 PXO_03481 dnaN   FALSE 0.119 1262.000 0.318 1.000 Y NA
 5511958 5511959 PXO_03481 PXO_03480   gyrB TRUE 0.946 116.000 0.249 0.004 Y NA
 5511959 5511960 PXO_03480 PXO_03479 gyrB   FALSE 0.343 68.000 0.002 NA   NA
 5511960 5511961 PXO_03479 PXO_03478   ste24p FALSE 0.506 187.000 0.032 NA   NA
 5511961 5511962 PXO_03478 PXO_03477 ste24p   FALSE 0.332 277.000 0.063 1.000   NA
 5511962 5511963 PXO_03477 PXO_03476     FALSE 0.402 271.000 0.095 1.000 N NA
 5511963 5511964 PXO_03476 PXO_03475     TRUE 0.942 85.000 0.600 0.014 N NA
 5511964 5511965 PXO_03475 PXO_03474     TRUE 0.966 80.000 0.600 0.046 Y NA
 5511965 5511966 PXO_03474 PXO_03473     TRUE 0.975 37.000 0.857 0.035 Y NA
 5511967 5511968 PXO_03472 PXO_03471 pdxJ   TRUE 0.750 11.000 0.009 NA   NA
 5511968 5511969 PXO_03471 PXO_03470     TRUE 0.896 96.000 0.417 NA   NA
 5511969 5511970 PXO_03470 PXO_03469   fbp FALSE 0.008 647.000 0.000 1.000 N NA
 5511970 5511971 PXO_03469 PXO_03468 fbp   FALSE 0.088 272.000 0.000 1.000 N NA
 5511972 5511973 PXO_03467 PXO_03466     TRUE 0.822 211.000 0.500 NA   NA
 5511974 5511975 PXO_03465 PXO_03464     FALSE 0.009 511.000 0.000 NA   NA
 5511975 5511976 PXO_03464 PXO_03463     FALSE 0.189 48.000 0.000 NA N NA
 5511976 5511977 PXO_03463 PXO_03462     TRUE 0.663 147.000 0.036 1.000   NA
 5511977 5511978 PXO_03462 PXO_03461     FALSE 0.015 436.000 0.000 NA   NA
 5511978 5511979 PXO_03461 PXO_03459     FALSE 0.094 241.000 0.000 NA   NA
 5511981 5511982 PXO_03457 PXO_03456     FALSE 0.256 130.000 0.000 NA   NA
 5511982 5511983 PXO_03456 PXO_03455     FALSE 0.156 196.000 0.000 NA   NA
 5511984 5511985 PXO_03454 PXO_03452     FALSE 0.003 1325.000 0.000 NA   NA
 5511985 5511986 PXO_03452 PXO_03450     FALSE 0.243 -34.000 0.000 NA   NA
 5511987 5511988 PXO_03449 PXO_03448     FALSE 0.105 231.000 0.000 NA   NA
 5511988 5511989 PXO_03448 PXO_03447   lasA FALSE 0.461 154.000 0.009 NA   NA
 5511989 5511990 PXO_03447 PXO_03446 lasA   FALSE 0.309 -22.000 0.000 NA   NA
 5511992 5511993 PXO_03444 PXO_03443     TRUE 0.745 1.000 0.000 NA   NA
 5511993 5511994 PXO_03443 PXO_03442     FALSE 0.006 647.000 0.000 NA   NA
 5511994 5511995 PXO_03442 PXO_03441     FALSE 0.202 68.000 0.000 NA   NA
 5511995 5511996 PXO_03441 PXO_03440   atsE FALSE 0.316 21.000 0.000 NA   NA
 5511996 5511997 PXO_03440 PXO_03439 atsE   FALSE 0.238 92.000 0.000 NA   NA
 5511997 5511998 PXO_03439 PXO_03438   mutT FALSE 0.202 170.000 0.000 NA   NA
 5511999 5512000 PXO_03437 PXO_03436     FALSE 0.012 463.000 0.000 NA   NA
 5512000 5512001 PXO_03436 PXO_03435     TRUE 0.571 -27.000 0.000 0.002   NA
 5512001 5512002 PXO_03435 PXO_03434     TRUE 0.791 78.000 0.194 NA   NA
 5512003 5512004 PXO_03433 PXO_03432     TRUE 0.618 141.000 0.000 NA Y NA
 5512005 5512006 PXO_03431 PXO_03430     TRUE 0.909 53.000 0.667 NA   NA
 5512006 5512007 PXO_03430 PXO_03429     FALSE 0.238 92.000 0.000 NA   NA
 5512009 5512010 PXO_03427 PXO_03426     FALSE 0.148 201.000 0.000 NA   NA
 5512011 5512012 PXO_05414 PXO_03425     FALSE 0.127 215.000 0.000 NA   NA
 5512013 5512014 PXO_03424 PXO_03423     TRUE 0.822 117.000 0.192 NA   NA
 5512014 5512015 PXO_03423 PXO_03422     TRUE 0.991 4.000 0.857 NA   NA
 5512015 5512016 PXO_03422 PXO_03421     TRUE 0.947 87.000 1.000 NA   NA
 5512017 5512018 PXO_03420 PXO_03419 hpaF   FALSE 0.007 572.000 0.000 NA   NA
 5512018 5512019 PXO_03419 PXO_03418     FALSE 0.137 209.000 0.000 NA   NA
 5512019 5512020 PXO_03418 PXO_03417   hrpF FALSE 0.226 34.000 0.000 NA   NA
 5512021 5512022 PXO_03416 PXO_03415   isXo8 TRUE 0.642 6.000 0.000 NA   NA
 5512022 5512023 PXO_03415 PXO_03414 isXo8 hpa3 FALSE 0.100 235.000 0.000 NA   NA
 5512023 5512024 PXO_03414 PXO_03413 hpa3 xopF1 FALSE 0.055 279.000 0.000 NA   NA
 5512025 5512026 PXO_03412 PXO_03411 hpaB hrpE FALSE 0.031 334.000 0.000 NA   NA
 5512026 5512027 PXO_03411 PXO_03410 hrpE hrpD6 TRUE 0.909 204.000 1.000 NA   NA
 5512027 5512028 PXO_03410 PXO_03409 hrpD6   TRUE 0.968 10.000 0.400 NA   NA
 5512028 5512029 PXO_03409 PXO_03408   hpaA TRUE 0.854 177.000 0.400 NA   NA
 5512029 5512030 PXO_03408 PXO_03407 hpaA hrcS TRUE 0.977 -3.000 0.133 NA   NA
 5512030 5512031 PXO_03407 PXO_03406 hrcS epaP TRUE 0.925 62.000 0.267 0.012 Y NA
 5512031 5512032 PXO_03406 PXO_03405 epaP hrpD1 TRUE 0.950 -13.000 0.182 1.000 Y NA
 5512034 5512035 PXO_03403 PXO_03402 hrcV hrcU TRUE 0.954 45.000 0.500 0.012 Y NA
 5512036 5512037 PXO_03401 PXO_03400     TRUE 0.916 34.000 0.600 NA   NA
 5512037 5512038 PXO_03400 PXO_03399     TRUE 0.956 23.000 0.833 NA   NA
 5512038 5512039 PXO_03399 PXO_03398     TRUE 0.927 65.000 0.833 NA   NA
 5512039 5512040 PXO_03398 PXO_03397     TRUE 0.924 -15.000 0.312 NA   NA
 5512040 5512041 PXO_03397 PXO_03396     TRUE 0.970 -10.000 0.312 NA Y NA
 5512041 5512042 PXO_03396 PXO_03395     TRUE 0.981 -7.000 0.800 NA   NA
 5512044 5512045 PXO_03394 PXO_03393 epaR hrpA1 TRUE 0.977 125.000 1.000 1.000 Y NA
 5512046 5512047 PXO_03392 PXO_05803 hpa1   FALSE 0.021 380.000 0.000 NA   NA
 5512051 5512052 PXO_05417 PXO_03388     FALSE 0.004 925.000 0.000 NA   NA
 5512052 5512053 PXO_03388 PXO_03387     FALSE 0.214 37.000 0.000 NA   NA
 5512053 5512054 PXO_03387 PXO_03386     TRUE 0.775 0.000 0.000 NA   NA
 5512054 5512055 PXO_03386 PXO_03385     FALSE 0.242 144.000 0.000 NA   NA
 5512058 5512059 PXO_05418 PXO_03382     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512064 5512065 PXO_03378 PXO_05419     FALSE 0.255 133.000 0.000 NA   NA
 5512066 5512067 PXO_03376 PXO_03375   glgB TRUE 0.951 45.000 0.600 1.000 Y NA
 5512067 5512068 PXO_03375 PXO_03374 glgB treZ TRUE 0.973 99.000 0.600 0.003 Y NA
 5512068 5512069 PXO_03374 PXO_03373 treZ malQ TRUE 0.874 54.000 0.093 0.010 Y NA
 5512069 5512070 PXO_03373 PXO_03372 malQ treY TRUE 0.993 -3.000 0.141 0.010 Y NA
 5512070 5512071 PXO_03372 PXO_05420 treY   TRUE 0.606 32.000 0.031 NA   NA
 5512071 5512072 PXO_05420 PXO_03371   glgX TRUE 0.882 115.000 0.333 NA   NA
 5512072 5512073 PXO_03371 PXO_03370 glgX   TRUE 0.769 -31.000 0.016 NA Y NA
 5512074 5512075 PXO_03369 PXO_03368     FALSE 0.007 761.000 0.000 1.000   NA
 5512078 5512079 PXO_03366 PXO_03365     FALSE 0.340 -19.000 0.000 NA   NA
 5512079 5512080 PXO_03365 PXO_03364     FALSE 0.004 923.000 0.000 NA   NA
 5512082 5512083 PXO_03362 PXO_03361   virK FALSE 0.027 349.000 0.000 NA   NA
 5512083 5512084 PXO_03361 PXO_03360 virK   FALSE 0.058 275.000 0.000 NA   NA
 5512085 5512086 PXO_03359 PXO_03358     FALSE 0.223 80.000 0.000 NA   NA
 5512087 5512088 PXO_03357 PXO_03356     FALSE 0.012 466.000 0.000 NA   NA
 5512088 5512089 PXO_03356 PXO_03355     FALSE 0.185 -58.000 0.000 NA   NA
 5512090 5512091 PXO_03354 PXO_03353     FALSE 0.446 -10.000 0.000 NA   NA
 5512091 5512092 PXO_03353 PXO_03352     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5512093 5512094 PXO_03351 PXO_03350     FALSE 0.199 -43.000 0.000 NA   NA
 5512094 5512095 PXO_03350 PXO_03349     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5512096 5512097 PXO_03348 PXO_03346     FALSE 0.005 701.000 0.000 NA   NA
 5512097 5512098 PXO_03346 PXO_05804     FALSE 0.013 452.000 0.000 NA   NA
 5512098 5512099 PXO_05804 PXO_03345     FALSE 0.226 82.000 0.000 NA   NA
 5512100 5512101 PXO_05422 PXO_03344     FALSE 0.007 588.000 0.000 NA   NA
 5512101 5512102 PXO_03344 PXO_05423     FALSE 0.015 418.000 0.000 NA   NA
 5512102 5512103 PXO_05423 PXO_03343     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512103 5512104 PXO_03343 PXO_03342     FALSE 0.072 256.000 0.000 NA N NA
 5512104 5512105 PXO_03342 PXO_03341     TRUE 0.975 13.000 0.839 NA N NA
 5512105 5512106 PXO_03341 PXO_03340     TRUE 0.947 28.000 0.820 NA N NA
 5512107 5512108 PXO_03339 PXO_03338     FALSE 0.102 233.000 0.000 NA   NA
 5512108 5512109 PXO_03338 PXO_03337     FALSE 0.181 180.000 0.000 NA   NA
 5512109 5512110 PXO_03337 PXO_03336     FALSE 0.013 453.000 0.000 NA   NA
 5512110 5512111 PXO_03336 PXO_03335     FALSE 0.193 54.000 0.000 NA   NA
 5512111 5512112 PXO_03335 PXO_03334     FALSE 0.200 67.000 0.000 NA   NA
 5512113 5512114 PXO_03333 PXO_03332     TRUE 0.933 3.000 0.010 0.025   NA
 5512115 5512116 PXO_03331 PXO_03330     FALSE 0.254 136.000 0.000 NA   NA
 5512116 5512117 PXO_03330 PXO_03329     FALSE 0.200 171.000 0.000 NA   NA
 5512117 5512118 PXO_03329 PXO_03328     TRUE 0.575 9.000 0.000 NA   NA
 5512119 5512120 PXO_03327 PXO_03326     TRUE 0.977 11.000 0.600 1.000   NA
 5512122 5512123 PXO_03324 PXO_03323     FALSE 0.048 295.000 0.000 NA   NA
 5512123 5512124 PXO_03323 PXO_03322     FALSE 0.027 351.000 0.000 NA   NA
 5512128 5512129 PXO_03319 PXO_03318     TRUE 0.798 195.000 0.032 0.001 Y NA
 5512129 5512130 PXO_03318 PXO_03317     FALSE 0.101 234.000 0.000 NA   NA
 5512130 5512131 PXO_03317 PXO_03316     FALSE 0.250 139.000 0.000 NA   NA
 5512131 5512132 PXO_03316 PXO_03314     FALSE 0.257 124.000 0.000 NA   NA
 5512134 5512135 PXO_05425 PXO_05426     FALSE 0.368 -16.000 0.000 NA   NA
 5512135 5512136 PXO_05426 PXO_05427     FALSE 0.359 -18.000 0.000 NA   NA
 5512137 5512138 PXO_05428 PXO_03678     FALSE 0.412 -12.000 0.000 NA   NA
 5512138 5512139 PXO_03678 PXO_03677     FALSE 0.194 47.000 0.000 NA   NA
 5512139 5512140 PXO_03677 PXO_03676     FALSE 0.055 279.000 0.000 NA   NA
 5512140 5512141 PXO_03676 PXO_03675     TRUE 0.563 28.000 0.000 0.001   NA
 5512141 5512142 PXO_03675 PXO_03674     FALSE 0.027 395.000 0.000 1.000   NA
 5512146 5512147 PXO_03671 PXO_03670     FALSE 0.412 -12.000 0.000 NA   NA
 5512147 5512148 PXO_03670 PXO_03669   glgB FALSE 0.145 204.000 0.000 NA   NA
 5512148 5512149 PXO_03669 PXO_03668 glgB   TRUE 0.940 12.000 0.027 0.010 Y NA
 5512149 5512150 PXO_03668 PXO_03667     TRUE 0.926 42.000 0.544 0.010   NA
 5512153 5512154 PXO_03665 PXO_03664     FALSE 0.238 32.000 0.000 NA   NA
 5512154 5512155 PXO_03664 PXO_03663     FALSE 0.430 13.000 0.000 NA   NA
 5512155 5512156 PXO_03663 PXO_03662     FALSE 0.003 1196.000 0.000 NA   NA
 5512156 5512157 PXO_03662 PXO_03661     FALSE 0.228 83.000 0.000 NA   NA
 5512157 5512158 PXO_03661 PXO_03660     FALSE 0.194 55.000 0.000 NA   NA
 5512158 5512159 PXO_03660 PXO_03659     FALSE 0.205 40.000 0.000 NA   NA
 5512160 5512161 PXO_03658 PXO_03657     FALSE 0.219 81.000 0.000 NA N NA
 5512161 5512162 PXO_03657 PXO_03656     TRUE 0.816 17.000 0.074 NA   NA
 5512163 5512164 PXO_03655 PXO_03654     FALSE 0.009 613.000 0.000 1.000   NA
 5512164 5512165 PXO_03654 PXO_03653     FALSE 0.009 512.000 0.000 NA   NA
 5512165 5512166 PXO_03653 PXO_03652     FALSE 0.006 655.000 0.000 NA   NA
 5512166 5512167 PXO_03652 PXO_03651     FALSE 0.160 193.000 0.000 NA   NA
 5512168 5512169 PXO_03650 PXO_03649     TRUE 0.545 10.000 0.000 NA   NA
 5512172 5512173 PXO_03646 PXO_03645     FALSE 0.293 -24.000 0.000 NA   NA
 5512173 5512174 PXO_03645 PXO_03644     FALSE 0.017 405.000 0.000 NA   NA
 5512174 5512175 PXO_03644 PXO_03643     FALSE 0.199 66.000 0.000 NA   NA
 5512175 5512176 PXO_03643 PXO_03642     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512176 5512177 PXO_03642 PXO_03641     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512177 5512178 PXO_03641 PXO_03639     FALSE 0.187 177.000 0.000 NA   NA
 5512178 5512179 PXO_03639 PXO_03638     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512179 5512180 PXO_03638 PXO_03637     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512181 5512182 PXO_03636 PXO_03635 gidA   FALSE 0.007 574.000 0.000 NA   NA
 5512183 5512184 PXO_03634 PXO_03633     TRUE 0.778 -15.000 0.042 NA   NA
 5512184 5512185 PXO_03633 PXO_03632     FALSE 0.494 43.000 0.019 NA   NA
 5512186 5512187 PXO_03631 PXO_03630   bioC FALSE 0.118 249.000 0.000 1.000 N NA
 5512187 5512188 PXO_03630 PXO_03629 bioC   TRUE 0.684 64.000 0.006 1.000 Y NA
 5512188 5512189 PXO_03629 PXO_03628   bioH TRUE 0.592 51.000 0.033 1.000   NA
 5512189 5512190 PXO_03628 PXO_03627 bioH   TRUE 0.701 98.000 0.065 NA   NA
 5512191 5512192 PXO_03626 PXO_03625     FALSE 0.004 848.000 0.000 NA   NA
 5512192 5512193 PXO_03625 PXO_03624     TRUE 0.605 63.000 0.050 NA   NA
 5512194 5512195 PXO_03623 PXO_03622   tdk FALSE 0.033 452.000 0.000 0.092 N NA
 5512195 5512196 PXO_03622 PXO_03621 tdk   FALSE 0.257 123.000 0.000 NA   NA
 5512197 5512198 PXO_03620 PXO_03619     FALSE 0.061 272.000 0.000 NA   NA
 5512198 5512199 PXO_03619 PXO_03618     FALSE 0.252 100.000 0.000 NA   NA
 5512199 5512200 PXO_03618 PXO_05433     FALSE 0.013 452.000 0.000 NA   NA
 5512201 5512202 PXO_03617 PXO_03616     FALSE 0.250 30.000 0.000 NA   NA
 5512203 5512204 PXO_03615 PXO_03614   pyrF TRUE 0.933 -3.000 0.008 1.000   NA
 5512205 5512206 PXO_03613 PXO_03612     TRUE 0.928 110.000 0.600 NA   NA
 5512206 5512207 PXO_03612 PXO_03611     FALSE 0.134 299.000 0.000 0.005   NA
 5512207 5512208 PXO_03611 PXO_03609     TRUE 0.925 165.000 0.667 1.000   NA
 5512209 5512210 PXO_03608 PXO_03607     TRUE 0.953 0.000 0.043 NA   NA
 5512210 5512211 PXO_03607 PXO_03606     FALSE 0.446 200.000 0.017 1.000 N NA
 5512211 5512212 PXO_03606 PXO_03605     FALSE 0.453 37.000 0.000 0.012   NA
 5512214 5512215 PXO_03603 PXO_03602     FALSE 0.193 49.000 0.000 NA   NA
 5512215 5512216 PXO_03602 PXO_03601     TRUE 0.573 -6.000 0.000 NA   NA
 5512216 5512217 PXO_03601 PXO_03600     FALSE 0.005 735.000 0.000 NA   NA
 5512217 5512218 PXO_03600 PXO_03599     FALSE 0.007 584.000 0.000 NA   NA
 5512218 5512219 PXO_03599 PXO_03598     FALSE 0.205 40.000 0.000 NA   NA
 5512220 5512221 PXO_03597 PXO_03596     FALSE 0.006 628.000 0.000 NA   NA
 5512221 5512222 PXO_03596 PXO_03595     FALSE 0.009 508.000 0.000 NA   NA
 5512222 5512223 PXO_03595 PXO_03594     FALSE 0.167 189.000 0.000 NA   NA
 5512224 5512225 PXO_03593 PXO_03592     TRUE 0.853 47.000 0.333 1.000   NA
 5512225 5512226 PXO_03592 PXO_03591     TRUE 0.922 4.000 0.026 1.000   NA
 5512226 5512227 PXO_03591 PXO_03590     TRUE 0.979 0.000 0.171 1.000 N NA
 5512229 5512230 PXO_03588 PXO_03587     TRUE 0.990 -3.000 0.354 NA   NA
 5512231 5512232 PXO_03586 PXO_03585 hipA   TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512232 5512233 PXO_03585 PXO_03584     FALSE 0.322 143.000 0.000 1.000 N NA
 5512234 5512235 PXO_03583 PXO_03582     FALSE 0.248 97.000 0.000 NA   NA
 5512235 5512236 PXO_03582 PXO_03581     FALSE 0.070 262.000 0.000 NA   NA
 5512236 5512237 PXO_03581 PXO_03580     FALSE 0.039 353.000 0.000 1.000   NA
 5512237 5512238 PXO_03580 PXO_03579     TRUE 0.829 16.000 0.079 NA N NA
 5512238 5512239 PXO_03579 PXO_03578   yceI TRUE 0.688 76.000 0.083 NA   NA
 5512239 5512240 PXO_03578 PXO_03577 yceI   TRUE 0.826 21.000 0.128 NA   NA
 5512240 5512241 PXO_03577 PXO_03576   ydiI FALSE 0.400 264.000 0.107 NA N NA
 5512241 5512242 PXO_03576 PXO_03575 ydiI   FALSE 0.452 192.000 0.023 NA N NA
 5512242 5512243 PXO_03575 PXO_03574     FALSE 0.511 60.000 0.023 NA   NA
 5512243 5512244 PXO_03574 PXO_03573     FALSE 0.086 414.000 0.042 NA   NA
 5512244 5512245 PXO_03573 PXO_03572     TRUE 0.598 195.000 0.083 NA   NA
 5512245 5512246 PXO_03572 PXO_03571     FALSE 0.010 493.000 0.000 NA   NA
 5512250 5512251 PXO_03568 PXO_03567 glnA   FALSE 0.277 272.000 0.000 1.000 Y NA
 5512251 5512252 PXO_03567 PXO_03566   amt TRUE 0.751 23.000 0.048 1.000 N NA
 5512252 5512253 PXO_03566 PXO_03565 amt   FALSE 0.075 289.000 0.000 1.000 N NA
 5512253 5512254 PXO_03565 PXO_03564   ntrC TRUE 0.972 26.000 0.587 0.092 Y NA
 5512254 5512255 PXO_03564 PXO_03563 ntrC sodC FALSE 0.030 499.000 0.007 1.000 N NA
 5512255 5512256 PXO_03563 PXO_03561 sodC sodC TRUE 0.959 92.000 0.375 0.002 Y NA
 5512257 5512258 PXO_03562 PXO_03560     FALSE 0.430 13.000 0.000 NA   NA
 5512258 5512259 PXO_03560 PXO_03559     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5512259 5512260 PXO_03559 PXO_03558     TRUE 0.894 59.000 0.571 NA   NA
 5512260 5512261 PXO_03558 PXO_03557     TRUE 0.911 69.000 0.649 NA   NA
 5512262 5512263 PXO_03556 PXO_03554     FALSE 0.211 163.000 0.000 NA   NA
 5512264 5512265 PXO_03553 PXO_05436     FALSE 0.133 211.000 0.000 NA   NA
 5512266 5512267 PXO_05437 PXO_03906 recC   TRUE 0.998 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 5512267 5512268 PXO_03906 PXO_03905   recD TRUE 0.963 188.000 0.688 0.001 Y NA
 5512268 5512269 PXO_03905 PXO_03904 recD   FALSE 0.245 95.000 0.000 NA   NA
 5512269 5512270 PXO_03904 PXO_03903   higA TRUE 0.872 18.000 0.174 NA   NA
 5512270 5512271 PXO_03903 PXO_05806 higA   FALSE 0.006 662.000 0.000 NA   NA
 5512271 5512272 PXO_05806 PXO_03901     FALSE 0.039 316.000 0.000 NA   NA
 5512274 5512275 PXO_03898 PXO_03897     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 5512275 5512276 PXO_03897 PXO_03896     FALSE 0.516 -7.000 0.000 NA   NA
 5512277 5512278 PXO_03894 PXO_03892     FALSE 0.073 257.000 0.000 NA   NA
 5512282 5512283 PXO_03888 PXO_03887 ohr   TRUE 0.761 102.000 0.086 1.000 N NA
 5512284 5512285 PXO_03886 PXO_03885     FALSE 0.482 -9.000 0.000 NA   NA
 5512285 5512286 PXO_03885 PXO_03883     FALSE 0.516 -7.000 0.000 NA   NA
 5512287 5512288 PXO_03884 PXO_03882     TRUE 0.604 91.000 0.000 NA Y NA
 5512291 5512292 PXO_03879 PXO_03878   desA3 TRUE 0.981 10.000 0.615 1.000 N NA
 5512293 5512294 PXO_03877 PXO_03876     TRUE 0.566 -6.000 0.000 NA N NA
 5512294 5512295 PXO_03876 PXO_05439     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5512295 5512296 PXO_05439 PXO_03875     FALSE 0.198 43.000 0.000 NA   NA
 5512297 5512298 PXO_03874 PXO_03873     FALSE 0.226 82.000 0.000 NA   NA
 5512299 5512300 PXO_03870 PXO_03869     FALSE 0.005 739.000 0.000 NA   NA
 5512300 5512301 PXO_03869 PXO_03868     TRUE 0.906 32.000 0.455 1.000   NA
 5512301 5512302 PXO_03868 PXO_03867     TRUE 0.802 42.000 0.136 0.032 N NA
 5512303 5512304 PXO_03865 PXO_03864     TRUE 0.818 43.000 0.286 NA   NA
 5512304 5512305 PXO_03864 PXO_03863     FALSE 0.243 -34.000 0.000 NA   NA
 5512305 5512306 PXO_03863 PXO_03862     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5512306 5512307 PXO_03862 PXO_03861     FALSE 0.163 191.000 0.000 NA   NA
 5512307 5512308 PXO_03861 PXO_03860   uxaC TRUE 0.773 62.000 0.033 1.000 Y NA
 5512308 5512309 PXO_03860 PXO_03859 uxaC   FALSE 0.112 227.000 0.000 NA   NA
 5512309 5512310 PXO_03859 PXO_03858     FALSE 0.007 582.000 0.000 NA   NA
 5512311 5512312 PXO_03857 PXO_03856     TRUE 0.670 319.000 0.364 1.000 Y NA
 5512312 5512313 PXO_03856 PXO_03855     TRUE 0.997 3.000 0.800 0.019 Y NA
 5512313 5512314 PXO_03855 PXO_03854     TRUE 0.948 30.000 0.800 1.000 N NA
 5512314 5512315 PXO_03854 PXO_03853     TRUE 0.983 12.000 1.000 1.000   NA
 5512315 5512316 PXO_03853 PXO_03852     TRUE 0.809 21.000 0.082 1.000   NA
 5512316 5512317 PXO_03852 PXO_03851     FALSE 0.509 11.000 0.000 NA   NA
 5512317 5512318 PXO_03851 PXO_03850     FALSE 0.205 -42.000 0.000 NA   NA
 5512321 5512322 PXO_03847 PXO_03846     FALSE 0.236 91.000 0.000 NA   NA
 5512322 5512323 PXO_03846 PXO_03845   rdgC FALSE 0.436 64.000 0.012 NA N NA
 5512323 5512324 PXO_03845 PXO_03844 rdgC   FALSE 0.058 621.000 0.121 NA   NA
 5512325 5512326 PXO_03843 PXO_03842   hemH TRUE 0.651 119.000 0.037 NA N NA
 5512327 5512328 PXO_03841 PXO_03840     TRUE 0.667 73.000 0.073 NA   NA
 5512328 5512329 PXO_03840 PXO_03839     TRUE 0.652 121.000 0.037 NA   NA
 5512329 5512330 PXO_03839 PXO_03838   tatC TRUE 0.937 -3.000 0.015 NA   NA
 5512331 5512332 PXO_03837 PXO_03836     TRUE 0.636 60.000 0.070 NA   NA
 5512332 5512333 PXO_03836 PXO_03835     FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 5512333 5512334 PXO_03835 PXO_03834     FALSE 0.027 350.000 0.000 NA   NA
 5512339 5512340 PXO_03829 PXO_03828 glyS   TRUE 0.839 0.000 0.000 1.000   NA
 5512343 5512344 PXO_05441 PXO_03825   cvaB FALSE 0.223 155.000 0.000 NA   NA
 5512344 5512345 PXO_03825 PXO_03824 cvaB   FALSE 0.033 328.000 0.000 NA   NA
 5512345 5512346 PXO_03824 PXO_03823     TRUE 0.580 88.000 0.026 NA   NA
 5512350 5512351 PXO_03816 PXO_03815     FALSE 0.433 272.000 0.158 NA   NA
 5512352 5512353 PXO_05810 PXO_03813     FALSE 0.174 -163.000 0.000 NA   NA
 5512353 5512354 PXO_03813 PXO_03812     FALSE 0.372 17.000 0.000 NA   NA
 5512354 5512355 PXO_03812 PXO_03808     FALSE 0.002 1631.000 0.000 NA   NA
 5512355 5512356 PXO_03808 PXO_03807     FALSE 0.198 43.000 0.000 NA   NA
 5512358 5512359 PXO_03805 PXO_03804     TRUE 0.979 11.000 0.316 1.000 Y NA
 5512359 5512360 PXO_03804 PXO_03803     TRUE 0.734 243.000 0.158 1.000 Y NA
 5512360 5512361 PXO_03803 PXO_03802     FALSE 0.536 100.000 0.008 1.000 N NA
 5512362 5512363 PXO_03801 PXO_03800     FALSE 0.250 139.000 0.000 NA   NA
 5512366 5512367 PXO_03797 PXO_03796     FALSE 0.482 -9.000 0.000 NA   NA
 5512368 5512369 PXO_05442 PXO_03795     FALSE 0.250 99.000 0.000 NA   NA
 5512370 5512371 PXO_03794 PXO_03793     FALSE 0.119 221.000 0.000 NA   NA
 5512371 5512372 PXO_03793 PXO_03792     FALSE 0.050 292.000 0.000 NA   NA
 5512372 5512373 PXO_03792 PXO_03791     FALSE 0.207 166.000 0.000 NA   NA
 5512374 5512375 PXO_03790 PXO_03789     TRUE 0.759 -30.000 0.103 NA   NA
 5512375 5512376 PXO_03789 PXO_03788     TRUE 0.647 38.000 0.061 NA   NA
 5512376 5512377 PXO_03788 PXO_03787     TRUE 0.932 -3.000 0.013 NA   NA
 5512377 5512378 PXO_03787 PXO_03786   pucG TRUE 0.962 -3.000 0.036 1.000 N NA
 5512378 5512379 PXO_03786 PXO_03783 pucG   FALSE 0.003 1361.000 0.000 NA N NA
 5512379 5512380 PXO_03783 PXO_03781     FALSE 0.052 478.000 0.000 NA Y NA
 5512380 5512381 PXO_03781 PXO_05443     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5512382 5512383 PXO_03780 PXO_03779     FALSE 0.238 92.000 0.000 NA   NA
 5512383 5512384 PXO_03779 PXO_03778     FALSE 0.307 22.000 0.000 NA   NA
 5512387 5512388 PXO_03775 PXO_03774     TRUE 0.575 9.000 0.000 NA   NA
 5512388 5512389 PXO_03774 PXO_05444     FALSE 0.042 306.000 0.000 NA   NA
 5512389 5512390 PXO_05444 PXO_03773   lysR FALSE 0.293 -24.000 0.000 NA   NA
 5512392 5512393 PXO_03771 PXO_03770     FALSE 0.025 357.000 0.000 NA   NA
 5512394 5512395 PXO_03769 PXO_03768     TRUE 0.584 59.000 0.031 1.000 N NA
 5512395 5512396 PXO_03768 PXO_03767     TRUE 0.624 68.000 0.040 1.000 N NA
 5512396 5512397 PXO_03767 PXO_03766     FALSE 0.094 241.000 0.000 NA   NA
 5512397 5512398 PXO_03766 PXO_03765   purU TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512399 5512400 PXO_03764 PXO_03763   baeS TRUE 0.994 -3.000 0.591 1.000   NA
 5512400 5512401 PXO_03763 PXO_03762 baeS baeS TRUE 0.957 -3.000 0.026 1.000   NA
 5512401 5512402 PXO_03762 PXO_03761 baeS   FALSE 0.472 17.000 0.000 1.000   NA
 5512402 5512403 PXO_03761 PXO_03760     FALSE 0.322 219.000 0.014 NA   NA
 5512403 5512404 PXO_03760 PXO_03759   lysR TRUE 0.923 0.000 0.014 NA   NA
 5512405 5512406 PXO_03758 PXO_03757     TRUE 0.729 143.000 0.088 NA   NA
 5512406 5512407 PXO_03757 PXO_03755     TRUE 0.945 28.000 0.775 NA   NA
 5512407 5512408 PXO_03755 PXO_05445     FALSE 0.205 70.000 0.000 NA   NA
 5512411 5512412 PXO_03753 PXO_03751     FALSE 0.221 -37.000 0.000 NA   NA
 5512416 5512417 PXO_03747 PXO_03746     FALSE 0.005 685.000 0.000 NA   NA
 5512417 5512418 PXO_03746 PXO_03745     TRUE 0.975 6.000 0.333 NA   NA
 5512422 5512423 PXO_05447 PXO_03740     FALSE 0.003 1400.000 0.000 NA   NA
 5512423 5512424 PXO_03740 PXO_03739   pigB FALSE 0.003 1324.000 0.000 NA   NA
 5512424 5512425 PXO_03739 PXO_03738 pigB   TRUE 0.978 -3.000 0.143 NA   NA
 5512426 5512427 PXO_03737 PXO_03736     TRUE 0.680 38.000 0.083 NA   NA
 5512427 5512428 PXO_03736 PXO_03735     TRUE 0.918 54.000 0.750 NA   NA
 5512428 5512429 PXO_03735 PXO_03734     TRUE 0.924 12.000 0.045 NA Y NA
 5512429 5512430 PXO_03734 PXO_03733     TRUE 0.987 -3.000 0.297 NA   NA
 5512430 5512431 PXO_03733 PXO_03732     TRUE 0.748 -76.000 0.196 NA   NA
 5512431 5512432 PXO_03732 PXO_03730     TRUE 0.931 85.000 0.727 NA   NA
 5512432 5512433 PXO_03730 PXO_03729     TRUE 0.887 -13.000 0.171 NA   NA
 5512435 5512436 PXO_03727 PXO_03726     FALSE 0.214 37.000 0.000 NA   NA
 5512437 5512438 PXO_03725 PXO_03724     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512439 5512440 PXO_03723 PXO_05448     FALSE 0.198 43.000 0.000 NA   NA
 5512440 5512441 PXO_05448 PXO_03722     FALSE 0.163 -268.000 0.000 NA   NA
 5512441 5512442 PXO_03722 PXO_03721     FALSE 0.225 81.000 0.000 NA   NA
 5512442 5512443 PXO_03721 PXO_03720     FALSE 0.482 -9.000 0.000 NA   NA
 5512447 5512448 PXO_03716 PXO_03715 rhlB ftsE TRUE 0.568 76.000 0.007 0.089 N NA
 5512448 5512449 PXO_03715 PXO_03714 ftsE   TRUE 0.972 -3.000 0.010 NA Y NA
 5512449 5512450 PXO_03714 PXO_03713     TRUE 0.757 9.000 0.005 NA N NA
 5512450 5512451 PXO_03713 PXO_03712   ung TRUE 0.924 -3.000 0.005 1.000 N NA
 5512451 5512452 PXO_03712 PXO_03711 ung rpoH FALSE 0.278 226.000 0.005 1.000 N NA
 5512453 5512454 PXO_03710 PXO_03709 yghA   TRUE 0.573 50.000 0.040 NA   NA
 5512455 5512456 PXO_03708 PXO_03707     TRUE 0.925 -3.000 0.010 NA   NA
 5512456 5512457 PXO_03707 PXO_03706     FALSE 0.238 92.000 0.000 NA   NA
 5512457 5512458 PXO_03706 PXO_03705     TRUE 0.620 -18.000 0.000 0.024   NA
 5512458 5512459 PXO_03705 PXO_03704   groS FALSE 0.026 398.000 0.000 1.000   NA
 5512459 5512460 PXO_03704 PXO_03703 groS groL TRUE 0.942 137.000 0.269 0.088 Y NA
 5512462 5512463 PXO_03701 PXO_03700     FALSE 0.507 124.000 0.000 0.017   NA
 5512463 5512464 PXO_03700 PXO_03699     FALSE 0.005 1047.000 0.000 1.000   NA
 5512466 5512467 PXO_03697 PXO_03696     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512471 5512472 PXO_03691 PXO_03690     TRUE 0.545 10.000 0.000 NA   NA
 5512473 5512474 PXO_03689 PXO_03688     FALSE 0.506 177.000 0.025 NA   NA
 5512474 5512475 PXO_03688 PXO_03687     FALSE 0.198 43.000 0.000 NA   NA
 5512476 5512477 PXO_03686 PXO_05812     FALSE 0.009 522.000 0.000 NA   NA
 5512477 5512478 PXO_05812 PXO_05450     FALSE 0.430 13.000 0.000 NA   NA
 5512478 5512479 PXO_05450 PXO_03683     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5512479 5512480 PXO_03683 PXO_03681     FALSE 0.003 1391.000 0.000 NA   NA
 5512480 5512481 PXO_03681 PXO_03680     FALSE 0.026 397.000 0.000 1.000   NA
 5512482 5512483 PXO_05451 PXO_03908     FALSE 0.003 1090.000 0.000 NA   NA
 5512484 5512485 PXO_03909 PXO_03910   yceI TRUE 0.616 211.000 0.132 NA   NA
 5512486 5512487 PXO_03911 PXO_03912     FALSE 0.128 214.000 0.000 NA   NA
 5512487 5512488 PXO_03912 PXO_03913     TRUE 0.989 -3.000 0.125 NA Y NA
 5512488 5512489 PXO_03913 PXO_03914     TRUE 0.990 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 5512490 5512491 PXO_03915 PXO_03916     FALSE 0.026 352.000 0.000 NA   NA
 5512491 5512492 PXO_03916 PXO_03917     TRUE 0.929 19.000 0.400 NA   NA
 5512492 5512493 PXO_03917 PXO_03918     FALSE 0.220 157.000 0.000 NA   NA
 5512493 5512494 PXO_03918 PXO_03920   orfB FALSE 0.242 94.000 0.000 NA   NA
 5512495 5512496 PXO_03919 PXO_03921     FALSE 0.257 123.000 0.000 NA   NA
 5512496 5512497 PXO_03921 PXO_03922   pthXo7 FALSE 0.063 270.000 0.000 NA   NA
 5512498 5512499 PXO_05454 PXO_05455     FALSE 0.004 765.000 0.000 NA   NA
 5512499 5512500 PXO_05455 PXO_05456     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512500 5512501 PXO_05456 PXO_03925     FALSE 0.231 -36.000 0.000 NA   NA
 5512501 5512502 PXO_03925 PXO_03926     FALSE 0.256 130.000 0.000 NA   NA
 5512504 5512505 PXO_03928 PXO_03929     TRUE 0.979 -3.000 0.056 0.009   NA
 5512505 5512506 PXO_03929 PXO_03930     FALSE 0.016 485.000 0.000 1.000   NA
 5512506 5512507 PXO_03930 PXO_03931     FALSE 0.002 1932.000 0.000 NA   NA
 5512507 5512508 PXO_03931 PXO_03932     TRUE 0.573 -6.000 0.000 NA   NA
 5512512 5512513 PXO_03936 PXO_03937     TRUE 0.688 -22.000 0.000 NA Y NA
 5512514 5512515 PXO_03938 PXO_03939     FALSE 0.217 76.000 0.000 NA   NA
 5512520 5512521 PXO_03944 PXO_03945     TRUE 0.722 139.000 0.056 1.000 N NA
 5512521 5512522 PXO_03945 PXO_03946   marR FALSE 0.012 531.000 0.000 1.000 N NA
 5512523 5512524 PXO_03947 PXO_03948     FALSE 0.229 151.000 0.000 NA   NA
 5512524 5512525 PXO_03948 PXO_03949     TRUE 0.642 65.000 0.070 NA   NA
 5512525 5512526 PXO_03949 PXO_03950     TRUE 0.783 229.000 0.418 1.000 N NA
 5512527 5512528 PXO_03951 PXO_03952     FALSE 0.103 232.000 0.000 NA   NA
 5512529 5512530 PXO_03953 PXO_03954     TRUE 0.970 -3.000 0.054 1.000   NA
 5512530 5512531 PXO_03954 PXO_03955     TRUE 0.984 2.000 0.100 1.000 Y NA
 5512531 5512532 PXO_03955 PXO_03956     TRUE 0.972 -3.000 0.071 1.000   NA
 5512532 5512533 PXO_03956 PXO_03957     FALSE 0.427 207.000 0.026 NA   NA
 5512533 5512534 PXO_03957 PXO_03958     TRUE 0.725 102.000 0.078 NA   NA
 5512535 5512536 PXO_03959 PXO_03960   yibK FALSE 0.492 27.000 0.007 NA   NA
 5512537 5512538 PXO_03961 PXO_03962     FALSE 0.316 21.000 0.000 NA   NA
 5512538 5512539 PXO_03962 PXO_03963     TRUE 0.784 105.000 0.133 NA   NA
 5512539 5512540 PXO_03963 PXO_03964     FALSE 0.254 102.000 0.000 NA   NA
 5512540 5512541 PXO_03964 PXO_03965     TRUE 0.649 191.000 0.111 NA   NA
 5512541 5512542 PXO_03965 PXO_03966     TRUE 0.982 -15.000 0.556 0.087 Y NA
 5512542 5512543 PXO_03966 PXO_03967     FALSE 0.261 50.000 0.000 1.000 N NA
 5512545 5512546 PXO_03969 PXO_03970   secB TRUE 0.904 4.000 0.015 1.000 N NA
 5512546 5512547 PXO_03970 PXO_03971 secB   TRUE 0.800 110.000 0.158 NA N NA
 5512547 5512548 PXO_03971 PXO_03972     FALSE 0.525 76.000 0.019 NA   NA
 5512548 5512549 PXO_03972 PXO_03973     TRUE 0.558 53.000 0.035 NA   NA
 5512549 5512550 PXO_03973 PXO_05813     FALSE 0.247 96.000 0.000 NA   NA
 5512551 5512552 PXO_03974 PXO_03975     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5512552 5512553 PXO_03975 PXO_03976     FALSE 0.219 77.000 0.000 NA   NA
 5512553 5512554 PXO_03976 PXO_03977     FALSE 0.446 -10.000 0.000 NA   NA
 5512557 5512558 PXO_03980 PXO_03981     TRUE 0.973 134.000 0.963 NA Y NA
 5512558 5512559 PXO_03981 PXO_03982     TRUE 0.834 93.000 0.148 0.100 N NA
 5512559 5512560 PXO_03982 PXO_03983   tnpA FALSE 0.101 260.000 0.000 1.000 N NA
 5512563 5512564 PXO_03986 PXO_03987     FALSE 0.013 450.000 0.000 NA   NA
 5512564 5512565 PXO_03987 PXO_03988     FALSE 0.226 82.000 0.000 NA   NA
 5512568 5512569 PXO_03991 PXO_03992     TRUE 0.621 7.000 0.000 NA   NA
 5512569 5512570 PXO_03992 PXO_03993     FALSE 0.197 65.000 0.000 NA   NA
 5512571 5512572 PXO_03994 PXO_03995     FALSE 0.289 24.000 0.000 NA   NA
 5512572 5512573 PXO_03995 PXO_03996     FALSE 0.356 18.000 0.000 NA   NA
 5512574 5512575 PXO_03997 PXO_03998     TRUE 0.573 -6.000 0.000 NA   NA
 5512575 5512576 PXO_03998 PXO_03999     FALSE 0.193 49.000 0.000 NA   NA
 5512577 5512578 PXO_04000 PXO_04001     TRUE 0.710 3.000 0.000 NA   NA
 5512578 5512579 PXO_04001 PXO_04002     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512579 5512580 PXO_04002 PXO_04003   trpD FALSE 0.492 118.000 0.003 1.000   NA
 5512580 5512581 PXO_04003 PXO_04004 trpD trpC TRUE 0.934 137.000 0.293 1.000 Y NA
 5512581 5512582 PXO_04004 PXO_04005 trpC   TRUE 0.902 -7.000 0.010 NA Y NA
 5512584 5512585 PXO_04007 PXO_04008   sugE TRUE 0.569 160.000 0.019 1.000 N NA
 5512587 5512588 PXO_04010 PXO_04011 rplM rpsI TRUE 0.996 4.000 0.601 0.012 Y NA
 5512589 5512590 PXO_rna0 PXO_rna1     FALSE 0.193 53.000 0.000 NA   NA
 5512591 5512592 PXO_04012 PXO_04013   bfr FALSE 0.009 639.000 0.000 1.000   NA
 5512593 5512594 PXO_04014 PXO_04015     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5512594 5512595 PXO_04015 PXO_04016     TRUE 0.573 -6.000 0.000 NA   NA
 5512595 5512596 PXO_04016 PXO_04017     FALSE 0.252 100.000 0.000 NA   NA
 5512597 5512598 PXO_04018 PXO_04019   coxB TRUE 0.588 44.000 0.042 NA   NA
 5512598 5512599 PXO_04019 PXO_04020 coxB ctaD TRUE 0.973 39.000 0.741 0.001 Y NA
 5512599 5512600 PXO_04020 PXO_04021 ctaD   TRUE 0.608 20.000 0.012 NA   NA
 5512600 5512601 PXO_04021 PXO_04022   ctaG TRUE 0.924 -3.000 0.010 NA   NA
 5512601 5512602 PXO_04022 PXO_04023 ctaG   TRUE 0.906 39.000 0.536 1.000 N NA
 5512604 5512605 PXO_04025 PXO_04026     TRUE 0.941 28.000 0.722 NA   NA
 5512605 5512606 PXO_04026 PXO_04027     TRUE 0.952 11.000 0.255 1.000   NA
 5512606 5512607 PXO_04027 PXO_04028   cyoE TRUE 0.995 -3.000 0.321 1.000 Y NA
 5512608 5512609 PXO_04029 PXO_04030     TRUE 0.653 175.000 0.056 1.000   NA
 5512610 5512611 PXO_04031 PXO_04032     TRUE 0.775 0.000 0.000 NA   NA
 5512611 5512612 PXO_04032 PXO_04033     TRUE 0.602 8.000 0.000 NA   NA
 5512612 5512613 PXO_04033 PXO_04034     TRUE 0.599 150.000 0.000 NA Y NA
 5512614 5512615 PXO_04035 PXO_04036     FALSE 0.223 80.000 0.000 NA   NA
 5512615 5512616 PXO_04036 PXO_04037     FALSE 0.059 274.000 0.000 NA   NA
 5512616 5512617 PXO_04037 PXO_04038     FALSE 0.017 403.000 0.000 NA   NA
 5512618 5512619 PXO_04039 PXO_04040     TRUE 0.960 -16.000 0.667 NA   NA
 5512621 5512622 PXO_04042 PXO_04043   sppA TRUE 0.572 97.000 0.013 1.000 N NA
 5512625 5512626 PXO_04046 PXO_04047     TRUE 0.965 21.000 1.000 NA   NA
 5512626 5512627 PXO_04047 PXO_04048     FALSE 0.357 224.000 0.022 NA   NA
 5512627 5512628 PXO_04048 PXO_04049   topA TRUE 0.761 11.000 0.011 NA N NA
 5512628 5512629 PXO_04049 PXO_04050 topA   FALSE 0.176 183.000 0.000 NA   NA
 5512629 5512630 PXO_04050 PXO_04051     FALSE 0.201 42.000 0.000 NA   NA
 5512630 5512631 PXO_04051 PXO_04052     TRUE 0.599 89.000 0.030 NA   NA
 5512631 5512632 PXO_04052 PXO_04053   dprA TRUE 0.712 43.000 0.124 NA   NA
 5512632 5512633 PXO_04053 PXO_04054 dprA   FALSE 0.259 279.000 0.033 1.000   NA
 5512634 5512635 PXO_04055 PXO_04056 def fmt FALSE 0.353 394.000 0.105 0.019 Y NA
 5512635 5512636 PXO_04056 PXO_04057 fmt sun TRUE 0.993 0.000 0.305 1.000 Y NA
 5512636 5512637 PXO_04057 PXO_04058 sun   FALSE 0.453 51.000 0.008 1.000 N NA
 5512637 5512638 PXO_04058 PXO_04059     TRUE 0.800 165.000 0.053 NA Y NA
 5512641 5512642 PXO_04061 PXO_04063     FALSE 0.197 65.000 0.000 NA   NA
 5512642 5512643 PXO_04063 PXO_04064     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512643 5512644 PXO_04064 PXO_04065     FALSE 0.219 77.000 0.000 NA   NA
 5512647 5512648 PXO_04068 PXO_04069 dtd   FALSE 0.525 109.000 0.006 1.000 N NA
 5512648 5512649 PXO_04069 PXO_04070     FALSE 0.065 268.000 0.000 NA   NA
 5512652 5512653 PXO_04071 PXO_04072     FALSE 0.255 134.000 0.000 NA   NA
 5512653 5512654 PXO_04072 PXO_04073     FALSE 0.463 12.000 0.000 NA   NA
 5512654 5512655 PXO_04073 PXO_05460     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA   NA
 5512655 5512656 PXO_05460 PXO_04074     FALSE 0.240 93.000 0.000 NA   NA
 5512656 5512657 PXO_04074 PXO_04075     FALSE 0.245 31.000 0.000 NA   NA
 5512658 5512659 PXO_04077 PXO_04076     FALSE 0.176 -147.000 0.000 NA   NA
 5512659 5512660 PXO_04076 PXO_04078     FALSE 0.026 354.000 0.000 NA   NA
 5512663 5512664 PXO_04081 PXO_04082     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5512664 5512665 PXO_04082 PXO_04083     FALSE 0.245 31.000 0.000 NA   NA
 5512666 5512667 PXO_04084 PXO_04085     FALSE 0.153 230.000 0.000 1.000   NA
 5512667 5512668 PXO_04085 PXO_04086     TRUE 0.936 20.000 0.500 NA   NA
 5512668 5512669 PXO_04086 PXO_04087     TRUE 0.978 0.000 0.185 NA   NA
 5512669 5512670 PXO_04087 PXO_04088     TRUE 0.698 90.000 0.074 NA   NA
 5512671 5512672 PXO_04089 PXO_04090     TRUE 0.995 -3.000 0.717 NA   NA
 5512672 5512673 PXO_04090 PXO_04091     TRUE 0.994 -3.000 0.679 NA   NA
 5512673 5512674 PXO_04091 PXO_04092     TRUE 0.702 38.000 0.098 NA   NA
 5512676 5512677 PXO_05462 PXO_04094     FALSE 0.137 209.000 0.000 NA   NA
 5512677 5512678 PXO_04094 PXO_04095     TRUE 0.671 34.000 0.062 NA   NA
 5512680 5512681 PXO_04097 PXO_04098 dnaG   FALSE 0.488 90.000 0.006 1.000   NA
 5512682 5512683 PXO_05463 PXO_05464     FALSE 0.430 13.000 0.000 NA   NA
 5512683 5512684 PXO_05464 PXO_04099     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512685 5512686 PXO_04100 PXO_04101   rpsU FALSE 0.451 308.000 0.173 0.019   NA
 5512687 5512688 PXO_04102 PXO_04103   folB TRUE 0.556 88.000 0.014 1.000 N NA
 5512688 5512689 PXO_04103 PXO_04104 folB   FALSE 0.155 228.000 0.000 1.000 N NA
 5512691 5512692 PXO_04106 PXO_04107     FALSE 0.193 49.000 0.000 NA   NA
 5512693 5512694 PXO_04108 PXO_04109     FALSE 0.195 -45.000 0.000 NA   NA
 5512694 5512695 PXO_04109 PXO_04110     FALSE 0.228 83.000 0.000 NA   NA
 5512695 5512696 PXO_04110 PXO_04111     FALSE 0.020 383.000 0.000 NA N NA
 5512698 5512699 PXO_04113 PXO_04114     TRUE 0.841 201.000 0.500 NA   NA
 5512700 5512701 PXO_04115 PXO_04116     FALSE 0.050 292.000 0.000 NA   NA
 5512701 5512702 PXO_04116 PXO_05465     FALSE 0.425 212.000 0.000 NA Y NA
 5512702 5512703 PXO_05465 PXO_04117     FALSE 0.228 84.000 0.000 NA   NA
 5512704 5512705 PXO_04118 PXO_04119     TRUE 0.568 33.000 0.024 NA   NA
 5512706 5512707 PXO_05466 PXO_05467     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5512710 5512711 PXO_04247 PXO_04246     TRUE 0.731 24.000 0.055 NA   NA
 5512712 5512713 PXO_04245 PXO_04244     FALSE 0.318 93.000 0.000 1.000 N NA
 5512713 5512714 PXO_04244 PXO_04243     FALSE 0.042 307.000 0.000 NA   NA
 5512714 5512715 PXO_04243 PXO_04242     FALSE 0.133 211.000 0.000 NA   NA
 5512715 5512716 PXO_04242 PXO_04241     FALSE 0.113 226.000 0.000 NA   NA
 5512716 5512717 PXO_04241 PXO_04240     FALSE 0.090 348.000 0.000 0.002   NA
 5512717 5512718 PXO_04240 PXO_04239     FALSE 0.287 38.000 0.000 1.000   NA
 5512718 5512719 PXO_04239 PXO_04238     TRUE 0.551 132.000 0.015 NA   NA
 5512719 5512720 PXO_04238 PXO_04236     TRUE 0.786 188.000 0.286 NA   NA
 5512720 5512721 PXO_04236 PXO_04235     FALSE 0.023 365.000 0.000 NA   NA
 5512723 5512724 PXO_04233 PXO_04232 hemD   TRUE 0.956 161.000 0.600 1.000 Y NA
 5512724 5512725 PXO_04232 PXO_04231     TRUE 0.994 6.000 0.765 1.000 Y NA
 5512725 5512726 PXO_04231 PXO_04230     FALSE 0.201 42.000 0.000 NA   NA
 5512727 5512728 PXO_04229 PXO_04228     FALSE 0.519 130.000 0.011 NA   NA
 5512729 5512730 PXO_04227 PXO_05469     FALSE 0.233 89.000 0.000 NA   NA
 5512731 5512732 PXO_04226 PXO_04225     TRUE 0.940 2.000 0.042 NA   NA
 5512732 5512733 PXO_04225 PXO_04224     FALSE 0.307 22.000 0.000 NA   NA
 5512733 5512734 PXO_04224 PXO_04223     FALSE 0.238 32.000 0.000 NA   NA
 5512734 5512735 PXO_04223 PXO_04222     TRUE 0.928 80.000 0.458 0.001   NA
 5512735 5512736 PXO_04222 PXO_04221     FALSE 0.205 70.000 0.000 NA   NA
 5512737 5512738 PXO_04220 PXO_04219     FALSE 0.077 443.000 0.000 1.000 Y NA
 5512738 5512739 PXO_04219 PXO_04218     FALSE 0.250 30.000 0.000 NA   NA
 5512741 5512742 PXO_04216 PXO_04215 hppD hmgA FALSE 0.173 365.000 0.077 1.000 N NA
 5512743 5512744 PXO_04214 PXO_04213   phaF TRUE 0.998 -3.000 0.937 1.000 Y NA
 5512744 5512745 PXO_04213 PXO_04212 phaF phaE TRUE 0.998 -3.000 0.937 0.048 Y NA
 5512745 5512746 PXO_04212 PXO_04211 phaE phaD TRUE 0.998 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 5512746 5512747 PXO_04211 PXO_04210 phaD phaC TRUE 0.998 -3.000 0.976 0.006 Y NA
 5512747 5512748 PXO_04210 PXO_04209 phaC   TRUE 0.998 0.000 0.881 0.006 Y NA
 5512750 5512751 PXO_04207 PXO_04206     FALSE 0.245 142.000 0.000 NA   NA
 5512751 5512752 PXO_04206 PXO_04205     TRUE 0.850 7.000 0.000 0.002   NA
 5512752 5512753 PXO_04205 PXO_04204     TRUE 0.930 -3.000 0.000 0.006   NA
 5512753 5512754 PXO_04204 PXO_04203     FALSE 0.015 429.000 0.000 NA   NA
 5512755 5512756 PXO_04202 PXO_04201   tnpA FALSE 0.193 48.000 0.000 NA   NA
 5512758 5512759 PXO_04199 PXO_05470     FALSE 0.257 121.000 0.000 NA   NA
 5512759 5512760 PXO_05470 PXO_04198   rpe FALSE 0.372 17.000 0.000 NA   NA
 5512760 5512761 PXO_04198 PXO_04197 rpe   TRUE 0.968 -3.000 0.050 1.000   NA
 5512761 5512762 PXO_04197 PXO_04196     FALSE 0.144 235.000 0.000 1.000   NA
 5512762 5512763 PXO_04196 PXO_04195   trpE FALSE 0.010 598.000 0.000 1.000 N NA
 5512763 5512764 PXO_04195 PXO_04194 trpE   TRUE 0.723 35.000 0.007 1.000 Y NA
 5512764 5512765 PXO_04194 PXO_04193     FALSE 0.193 49.000 0.000 NA   NA
 5512765 5512766 PXO_04193 PXO_04192     TRUE 0.573 -6.000 0.000 NA   NA
 5512766 5512767 PXO_04192 PXO_04191     FALSE 0.099 237.000 0.000 NA   NA
 5512768 5512769 PXO_04190 PXO_04189     FALSE 0.018 391.000 0.000 NA   NA
 5512769 5512770 PXO_04189 PXO_04186     FALSE 0.002 2517.000 0.000 NA   NA
 5512771 5512772 PXO_04185 PXO_04184     FALSE 0.205 -42.000 0.000 NA   NA
 5512772 5512773 PXO_04184 PXO_04183     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5512778 5512779 PXO_04177 PXO_05814     FALSE 0.088 245.000 0.000 NA   NA
 5512779 5512780 PXO_05814 PXO_04176     FALSE 0.207 39.000 0.000 NA   NA
 5512780 5512781 PXO_04176 PXO_04175     FALSE 0.257 108.000 0.000 NA   NA
 5512781 5512782 PXO_04175 PXO_04174     FALSE 0.257 117.000 0.000 NA   NA
 5512786 5512787 PXO_04170 PXO_04169     FALSE 0.243 143.000 0.000 NA   NA
 5512788 5512789 PXO_04168 PXO_04167     FALSE 0.068 264.000 0.000 NA   NA
 5512790 5512791 PXO_04166 PXO_04165     FALSE 0.025 354.000 0.000 NA N NA
 5512794 5512795 PXO_04162 PXO_04161     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5512795 5512796 PXO_04161 PXO_04160     FALSE 0.048 329.000 0.000 1.000   NA
 5512796 5512797 PXO_04160 PXO_05473     FALSE 0.156 196.000 0.000 NA   NA
 5512797 5512798 PXO_05473 PXO_04159     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5512801 5512802 PXO_04157 PXO_04156     FALSE 0.008 557.000 0.000 NA   NA
 5512804 5512805 PXO_04154 PXO_04153     FALSE 0.031 333.000 0.000 NA   NA
 5512807 5512808 PXO_04152 PXO_04151     FALSE 0.212 162.000 0.000 NA   NA
 5512809 5512810 PXO_04150 PXO_04149     FALSE 0.196 44.000 0.000 NA   NA
 5512810 5512811 PXO_04149 PXO_04148     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5512811 5512812 PXO_04148 PXO_04147     FALSE 0.183 -72.000 0.000 NA   NA
 5512812 5512813 PXO_04147 PXO_04146     FALSE 0.207 39.000 0.000 NA   NA
 5512813 5512814 PXO_04146 PXO_04145     FALSE 0.410 14.000 0.000 NA   NA
 5512817 5512818 PXO_04143 PXO_05476     FALSE 0.005 688.000 0.000 NA   NA
 5512819 5512820 PXO_04141 PXO_04140     TRUE 0.641 152.000 0.046 NA   NA
 5512820 5512821 PXO_04140 PXO_04139     TRUE 0.914 5.000 0.037 NA   NA
 5512821 5512822 PXO_04139 PXO_04138     TRUE 0.977 31.000 0.775 0.025 Y NA
 5512822 5512823 PXO_04138 PXO_04137   hemC TRUE 0.658 31.000 0.032 1.000 N NA
 5512827 5512828 PXO_04133 PXO_04132     TRUE 0.567 68.000 0.034 NA   NA
 5512828 5512829 PXO_04132 PXO_04131     FALSE 0.205 167.000 0.000 NA   NA
 5512829 5512830 PXO_04131 PXO_04130     FALSE 0.222 79.000 0.000 NA   NA
 5512831 5512832 PXO_04129 PXO_04128     FALSE 0.205 40.000 0.000 NA   NA
 5512833 5512834 PXO_04127 PXO_04126     TRUE 0.560 218.000 0.105 NA   NA
 5512834 5512835 PXO_04126 PXO_04125     FALSE 0.194 58.000 0.000 NA   NA
 5512835 5512836 PXO_04125 PXO_04124   dapF FALSE 0.238 32.000 0.000 NA   NA
 5512836 5512837 PXO_04124 PXO_04123 dapF   TRUE 0.897 -12.000 0.175 NA   NA
 5512837 5512838 PXO_04123 PXO_04122   xerC TRUE 0.887 200.000 0.714 NA   NA
 5512840 5512841 PXO_04280 PXO_04279 hslV hslU TRUE 0.960 52.000 0.752 1.000 Y NA
 5512842 5512843 PXO_04278 PXO_04277     FALSE 0.103 366.000 0.031 NA   NA
 5512843 5512844 PXO_04277 PXO_04276     TRUE 0.641 172.000 0.070 NA   NA
 5512846 5512847 PXO_04275 PXO_04274   ubiE FALSE 0.264 173.000 0.000 1.000 N NA
 5512848 5512849 PXO_04271 PXO_04270     FALSE 0.313 150.000 0.000 1.000   NA
 5512849 5512850 PXO_04270 PXO_04269     TRUE 0.671 9.000 0.000 1.000   NA
 5512850 5512851 PXO_04269 PXO_04268   elaA FALSE 0.257 125.000 0.000 NA   NA
 5512851 5512852 PXO_04268 PXO_04267 elaA   TRUE 0.936 -3.000 0.014 NA   NA
 5512852 5512853 PXO_04267 PXO_04266     FALSE 0.463 12.000 0.000 NA   NA
 5512855 5512856 PXO_04262 PXO_04261     TRUE 0.921 173.000 0.689 1.000 N NA
 5512856 5512857 PXO_04261 PXO_04260   mreD TRUE 0.998 -3.000 0.550 0.002 Y NA
 5512857 5512858 PXO_04260 PXO_04259 mreD   TRUE 0.958 4.000 0.013 1.000 Y NA
 5512858 5512859 PXO_04259 PXO_04258   mrdB TRUE 0.943 -3.000 0.013 1.000 N NA
 5512859 5512860 PXO_04258 PXO_04257 mrdB   FALSE 0.038 317.000 0.000 NA   NA
 5512860 5512861 PXO_04257 PXO_04256     FALSE 0.230 86.000 0.000 NA   NA
 5512861 5512862 PXO_04256 PXO_04254     FALSE 0.003 1542.000 0.000 NA   NA
 5512862 5512863 PXO_04254 PXO_04253     FALSE 0.270 27.000 0.000 NA   NA
 5512863 5512864 PXO_04253 PXO_04252   lysM FALSE 0.034 324.000 0.000 NA   NA
 5512864 5512865 PXO_04252 PXO_04251 lysM   FALSE 0.005 678.000 0.000 NA   NA
 5512865 5512866 PXO_04251 PXO_04250     FALSE 0.195 -45.000 0.000 NA   NA
 5512866 5512867 PXO_04250 PXO_04282   mltB FALSE 0.013 452.000 0.000 NA   NA
 5512867 5512868 PXO_04282 PXO_04283 mltB   TRUE 0.994 -3.000 0.298 NA Y NA
 5512870 5512871 PXO_04285 PXO_04286     FALSE 0.053 286.000 0.000 NA   NA
 5512871 5512872 PXO_04286 PXO_04287     FALSE 0.473 127.000 0.007 NA   NA
 5512872 5512873 PXO_04287 PXO_04288   lipB TRUE 0.929 12.000 0.219 NA   NA
 5512873 5512874 PXO_04288 PXO_04289 lipB lipA TRUE 0.940 45.000 0.319 0.001 Y NA
 5512874 5512875 PXO_04289 PXO_04290 lipA   FALSE 0.022 424.000 0.000 1.000 N NA
 5512877 5512878 PXO_04292 PXO_04293     TRUE 0.871 123.000 0.078 1.000 Y NA
 5512878 5512879 PXO_04293 PXO_04294     TRUE 0.646 23.000 0.022 NA   NA
 5512879 5512880 PXO_04294 PXO_04295     FALSE 0.220 157.000 0.000 NA   NA
 5512880 5512881 PXO_04295 PXO_04296     FALSE 0.258 114.000 0.000 NA   NA
 5512881 5512882 PXO_04296 PXO_04297     TRUE 0.683 4.000 0.000 NA   NA
 5512882 5512883 PXO_04297 PXO_04298     FALSE 0.215 75.000 0.000 NA   NA
 5512883 5512884 PXO_04298 PXO_04299     TRUE 0.694 125.000 0.053 NA   NA
 5512884 5512885 PXO_04299 PXO_04300     FALSE 0.378 232.000 0.035 NA   NA
 5512885 5512886 PXO_04300 PXO_04301   gnd TRUE 0.728 21.000 0.042 NA   NA
 5512888 5512889 PXO_04303 PXO_04304     FALSE 0.053 286.000 0.000 NA   NA
 5512889 5512890 PXO_04304 PXO_04305     TRUE 0.989 -3.000 0.093 1.000 Y NA
 5512890 5512891 PXO_04305 PXO_04306     TRUE 0.985 4.000 0.116 0.022 Y NA
 5512891 5512892 PXO_04306 PXO_04307   folK TRUE 0.605 101.000 0.017 1.000 N NA
 5512900 5512901 PXO_04315 PXO_05480     TRUE 0.775 0.000 0.000 NA   NA
 5512901 5512902 PXO_05480 PXO_04316     FALSE 0.203 41.000 0.000 NA   NA
 5512902 5512903 PXO_04316 PXO_04319     FALSE 0.002 2556.000 0.000 NA   NA
 5512903 5512904 PXO_04319 PXO_04320   gntR FALSE 0.071 260.000 0.000 NA   NA
 5512906 5512907 PXO_04321 PXO_04322   lacI TRUE 0.758 41.000 0.140 1.000 N NA
 5512907 5512908 PXO_04322 PXO_04323 lacI   TRUE 0.904 7.000 0.030 1.000 N NA
 5512908 5512909 PXO_04323 PXO_04324   nagA TRUE 0.680 27.000 0.030 1.000 N NA
 5512910 5512911 PXO_04325 PXO_04326   pgaC TRUE 0.969 -3.000 0.077 NA   NA
 5512911 5512912 PXO_04326 PXO_04327 pgaC pgaB TRUE 0.941 2.000 0.043 NA N NA
 5512912 5512913 PXO_04327 PXO_04328 pgaB hmsH TRUE 0.948 26.000 0.696 1.000   NA
 5512918 5512919 PXO_04334 PXO_05484     FALSE 0.002 1749.000 0.000 NA   NA
 5512919 5512920 PXO_05484 PXO_05485     FALSE 0.198 43.000 0.000 NA   NA
 5512920 5512921 PXO_05485 PXO_05486     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5512921 5512922 PXO_05486 PXO_05487     FALSE 0.194 56.000 0.000 NA   NA
 5512923 5512924 PXO_04446 PXO_04445     FALSE 0.266 49.000 0.000 1.000   NA
 5512925 5512926 PXO_05488 PXO_04443     FALSE 0.146 376.000 0.000 0.100 Y NA
 5512927 5512928 PXO_04444 PXO_04442     FALSE 0.268 64.000 0.000 1.000   NA
 5512928 5512929 PXO_04442 PXO_04441     FALSE 0.007 755.000 0.000 1.000   NA
 5512929 5512930 PXO_04441 PXO_04440     FALSE 0.012 461.000 0.000 NA   NA
 5512930 5512931 PXO_04440 PXO_04439     FALSE 0.196 44.000 0.000 NA   NA
 5512932 5512933 PXO_04438 PXO_04437     TRUE 0.670 -6.000 0.000 1.000   NA
 5512934 5512935 PXO_05489 PXO_04436     FALSE 0.523 -27.000 0.000 0.029   NA
 5512935 5512936 PXO_04436 PXO_04435     TRUE 0.620 138.000 0.029 NA   NA
 5512936 5512937 PXO_04435 PXO_04434     TRUE 0.783 20.000 0.074 NA   NA
 5512937 5512938 PXO_04434 PXO_04433     TRUE 0.975 92.000 0.714 0.005 Y NA
 5512938 5512939 PXO_04433 PXO_04432     TRUE 0.926 94.000 0.571 1.000 N NA
 5512940 5512941 PXO_04431 PXO_04430     FALSE 0.018 462.000 0.000 1.000   NA
 5512943 5512944 PXO_04428 PXO_05490     FALSE 0.195 -45.000 0.000 NA   NA
 5512945 5512946 PXO_04427 PXO_04426   envZ TRUE 0.852 5.000 0.000 0.020   NA
 5512950 5512951 PXO_04422 PXO_04421     TRUE 0.991 -3.000 0.154 1.000 Y NA
 5512952 5512953 PXO_04420 PXO_04418     FALSE 0.011 484.000 0.000 NA   NA
 5512955 5512956 PXO_04417 PXO_04416     FALSE 0.197 65.000 0.000 NA   NA
 5512958 5512959 PXO_04414 PXO_05492     FALSE 0.174 -163.000 0.000 NA   NA
 5512959 5512960 PXO_05492 PXO_04413   fghA FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 5512960 5512961 PXO_04413 PXO_04412 fghA   FALSE 0.256 130.000 0.000 NA   NA
 5512961 5512962 PXO_04412 PXO_04410     FALSE 0.218 158.000 0.000 NA   NA
 5512963 5512964 PXO_04411 PXO_04409     FALSE 0.089 244.000 0.000 NA   NA
 5512967 5512968 PXO_04406 PXO_04405   glyA FALSE 0.234 186.000 0.000 1.000 N NA
 5512968 5512969 PXO_04405 PXO_04404 glyA   FALSE 0.410 14.000 0.000 NA   NA
 5512969 5512970 PXO_04404 PXO_04403     FALSE 0.218 36.000 0.000 NA   NA
 5512970 5512971 PXO_04403 PXO_04402     TRUE 0.812 6.000 0.005 NA   NA
 5512971 5512972 PXO_04402 PXO_04401   ribD TRUE 0.924 -3.000 0.005 1.000   NA
 5512974 5512975 PXO_04399 PXO_04398 ribE ribAB TRUE 0.976 -3.000 0.010 1.000 Y NA
 5512975 5512976 PXO_04398 PXO_04397 ribAB ribH TRUE 0.774 314.000 0.417 0.001 Y NA
 5512976 5512977 PXO_04397 PXO_04396 ribH nusB TRUE 0.939 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5512977 5512978 PXO_04396 PXO_04395 nusB thiL TRUE 0.852 98.000 0.225 1.000 N NA
 5512978 5512979 PXO_04395 PXO_04394 thiL   FALSE 0.257 122.000 0.000 NA   NA
 5512979 5512980 PXO_04394 PXO_04393     FALSE 0.245 31.000 0.000 NA   NA
 5512980 5512981 PXO_04393 PXO_04392     FALSE 0.283 39.000 0.000 1.000   NA
 5512981 5512982 PXO_04392 PXO_04390     FALSE 0.047 296.000 0.000 NA   NA
 5512984 5512985 PXO_04389 PXO_04388     FALSE 0.036 321.000 0.000 NA   NA
 5512985 5512986 PXO_04388 PXO_04387   kdpA TRUE 0.821 16.000 0.071 NA   NA
 5512986 5512987 PXO_04387 PXO_04386 kdpA kdpB TRUE 0.967 13.000 0.145 0.001 Y NA
 5512987 5512988 PXO_04386 PXO_04385 kdpB kdpC TRUE 0.996 8.000 0.877 0.001 Y NA
 5512988 5512989 PXO_04385 PXO_04384 kdpC kdpD TRUE 0.632 52.000 0.026 0.094 N NA
 5512989 5512990 PXO_04384 PXO_04383 kdpD   TRUE 0.953 26.000 0.379 1.000 Y NA
 5512991 5512992 PXO_04382 PXO_04381   ybcI TRUE 0.977 -3.000 0.130 NA   NA
 5512992 5512993 PXO_04381 PXO_04380 ybcI   TRUE 0.749 -6.000 0.004 NA   NA
 5512993 5512994 PXO_04380 PXO_04379   lppC TRUE 0.960 5.000 0.172 NA   NA
 5512997 5512998 PXO_04375 PXO_04374 mraZ mraW TRUE 0.961 16.000 0.635 NA   NA
 5512998 5512999 PXO_04374 PXO_04373 mraW ftsL TRUE 0.986 -3.000 0.227 1.000 N NA
 5512999 5513000 PXO_04373 PXO_04372 ftsL ftsI TRUE 0.633 140.000 0.024 1.000 N NA
 5513000 5513001 PXO_04372 PXO_04371 ftsI   TRUE 0.977 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 5513001 5513002 PXO_04371 PXO_04370     TRUE 0.998 -3.000 0.569 0.002 Y NA
 5513002 5513003 PXO_04370 PXO_04369   mraY TRUE 0.980 -10.000 0.309 0.004 Y NA
 5513003 5513004 PXO_04369 PXO_04368 mraY ftsW TRUE 0.963 0.000 0.018 0.004 N NA
 5513004 5513005 PXO_04368 PXO_04367 ftsW murG TRUE 0.914 60.000 0.647 1.000 N NA
 5513005 5513006 PXO_04367 PXO_04366 murG murC TRUE 0.994 -3.000 0.283 1.000 Y NA
 5513006 5513007 PXO_04366 PXO_04365 murC   TRUE 0.994 -3.000 0.153 0.004 Y NA
 5513007 5513008 PXO_04365 PXO_04364   ftsQ TRUE 0.943 125.000 0.372 NA Y NA
 5513008 5513009 PXO_04364 PXO_04363 ftsQ ftsA TRUE 0.990 -3.000 0.389 NA N NA
 5513009 5513010 PXO_04363 PXO_04362 ftsA ftsZ TRUE 0.610 357.000 0.460 1.000 Y NA
 5513010 5513011 PXO_04362 PXO_04361 ftsZ lpxC TRUE 0.569 237.000 0.134 1.000 N NA
 5513013 5513014 PXO_04359 PXO_04358   secA TRUE 0.701 157.000 0.068 1.000 N NA
 5513014 5513015 PXO_04358 PXO_04357 secA   FALSE 0.012 465.000 0.000 NA   NA
 5513015 5513016 PXO_04357 PXO_04356     FALSE 0.181 180.000 0.000 NA   NA
 5513016 5513017 PXO_04356 PXO_05493     FALSE 0.412 -12.000 0.000 NA   NA
 5513018 5513019 PXO_04355 PXO_04354     FALSE 0.165 190.000 0.000 NA   NA
 5513019 5513020 PXO_04354 PXO_04353   metF TRUE 0.745 1.000 0.000 NA   NA
 5513021 5513022 PXO_04350 PXO_04349     FALSE 0.142 237.000 0.000 1.000   NA
 5513028 5513029 PXO_04343 PXO_04342     FALSE 0.489 229.000 0.080 NA   NA
 5513029 5513030 PXO_04342 PXO_04341     FALSE 0.255 133.000 0.000 NA   NA
 5513032 5513033 PXO_04340 PXO_04339     TRUE 0.830 32.000 0.200 1.000   NA
 5513035 5513036 PXO_05496 PXO_04694   ppc TRUE 0.574 218.000 0.089 1.000   NA
 5513036 5513037 PXO_04694 PXO_04693 ppc   TRUE 0.977 -3.000 0.105 1.000   NA
 5513038 5513039 PXO_04692 PXO_04691     FALSE 0.257 122.000 0.000 NA   NA
 5513039 5513040 PXO_04691 PXO_04690     FALSE 0.216 300.000 0.000 1.000 Y NA
 5513041 5513042 PXO_04688 PXO_04687     TRUE 0.868 56.000 0.375 1.000   NA
 5513044 5513045 PXO_04685 PXO_04684     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513046 5513047 PXO_04683 PXO_04682     FALSE 0.490 28.000 0.002 1.000   NA
 5513049 5513050 PXO_04681 PXO_04680     FALSE 0.008 681.000 0.000 1.000   NA
 5513050 5513051 PXO_04680 PXO_04679     TRUE 0.651 134.000 0.027 1.000 N NA
 5513052 5513053 PXO_04678 PXO_04676     FALSE 0.059 274.000 0.000 NA   NA
 5513054 5513055 PXO_04675 PXO_04674     FALSE 0.250 30.000 0.000 NA   NA
 5513056 5513057 PXO_04673 PXO_04672     FALSE 0.073 396.000 0.023 NA   NA
 5513057 5513058 PXO_04672 PXO_04671     FALSE 0.044 634.000 0.077 NA   NA
 5513059 5513060 PXO_04670 PXO_04669     FALSE 0.257 125.000 0.000 NA   NA
 5513060 5513061 PXO_04669 PXO_04668     FALSE 0.243 -34.000 0.000 NA   NA
 5513061 5513062 PXO_04668 PXO_04663     FALSE 0.003 1965.000 0.000 1.000 N NA
 5513062 5513063 PXO_04663 PXO_04662     FALSE 0.300 314.000 0.011 1.000 Y NA
 5513063 5513064 PXO_04662 PXO_04661     TRUE 0.985 6.000 0.535 1.000 N NA
 5513065 5513066 PXO_04660 PXO_04659     TRUE 0.578 92.000 0.016 1.000 N NA
 5513066 5513067 PXO_04659 PXO_04658     TRUE 0.923 197.000 0.500 1.000 Y NA
 5513068 5513069 PXO_04657 PXO_04656     FALSE 0.341 132.000 0.000 1.000   NA
 5513069 5513070 PXO_04656 PXO_04655     FALSE 0.430 52.000 0.000 0.009   NA
 5513071 5513072 PXO_04654 PXO_04653   lemA FALSE 0.457 96.000 0.007 NA   NA
 5513072 5513073 PXO_04653 PXO_04652 lemA   FALSE 0.024 362.000 0.000 NA   NA
 5513073 5513074 PXO_04652 PXO_04651     FALSE 0.463 60.000 0.015 NA   NA
 5513074 5513075 PXO_04651 PXO_04650   lgt FALSE 0.358 55.000 0.005 NA   NA
 5513075 5513076 PXO_04650 PXO_04649 lgt thyA TRUE 0.982 -3.000 0.164 1.000 N NA
 5513076 5513077 PXO_04649 PXO_05498 thyA   FALSE 0.113 226.000 0.000 NA   NA
 5513077 5513078 PXO_05498 PXO_04648   folA TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513079 5513080 PXO_04647 PXO_04646     TRUE 0.855 29.000 0.267 NA   NA
 5513080 5513081 PXO_04646 PXO_04645   ksgA TRUE 0.677 37.000 0.078 NA N NA
 5513081 5513082 PXO_04645 PXO_04644 ksgA pdxA TRUE 0.546 257.000 0.197 1.000 N NA
 5513082 5513083 PXO_04644 PXO_04643 pdxA   TRUE 0.939 24.000 0.561 1.000 N NA
 5513083 5513084 PXO_04643 PXO_04642     TRUE 0.952 -3.000 0.020 1.000 N NA
 5513084 5513085 PXO_04642 PXO_04641     TRUE 0.889 128.000 0.357 NA N NA
 5513085 5513086 PXO_04641 PXO_04640     FALSE 0.464 38.000 0.013 NA   NA
 5513086 5513087 PXO_04640 PXO_04639     TRUE 0.876 4.000 0.013 NA   NA
 5513088 5513089 PXO_04638 PXO_04637 ubiH visC TRUE 0.997 -3.000 0.474 0.001 Y NA
 5513089 5513090 PXO_04637 PXO_04635 visC   FALSE 0.003 963.000 0.000 NA N NA
 5513090 5513091 PXO_04635 PXO_04634     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5513091 5513092 PXO_04634 PXO_04633     FALSE 0.446 -10.000 0.000 NA   NA
 5513094 5513095 PXO_04631 PXO_04630     TRUE 0.607 231.000 0.190 NA   NA
 5513095 5513096 PXO_04630 PXO_04629     TRUE 0.718 81.000 0.095 NA   NA
 5513097 5513098 PXO_04628 PXO_04627     FALSE 0.305 209.000 0.000 0.045 N NA
 5513098 5513099 PXO_04627 PXO_04626     TRUE 0.901 84.000 0.333 0.045 N NA
 5513099 5513100 PXO_04626 PXO_04625     TRUE 0.890 46.000 0.500 1.000 N NA
 5513100 5513101 PXO_04625 PXO_04624     FALSE 0.343 128.000 0.000 1.000   NA
 5513101 5513102 PXO_04624 PXO_04623     FALSE 0.150 200.000 0.000 NA   NA
 5513102 5513103 PXO_04623 PXO_04622     TRUE 0.687 68.000 0.094 NA   NA
 5513105 5513106 PXO_04620 PXO_04619     TRUE 0.577 37.000 0.032 NA   NA
 5513106 5513107 PXO_04619 PXO_04618     TRUE 0.961 0.000 0.065 NA   NA
 5513107 5513108 PXO_04618 PXO_04617     FALSE 0.008 539.000 0.000 NA   NA
 5513109 5513110 PXO_04616 PXO_04615     FALSE 0.257 117.000 0.000 NA   NA
 5513110 5513111 PXO_04615 PXO_04614     FALSE 0.016 416.000 0.000 NA   NA
 5513111 5513112 PXO_04614 PXO_05501     FALSE 0.231 33.000 0.000 NA   NA
 5513112 5513113 PXO_05501 PXO_04613     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5513113 5513114 PXO_04613 PXO_04612     FALSE 0.240 228.000 0.000 0.098   NA
 5513115 5513116 PXO_04611 PXO_04610   glnS FALSE 0.160 193.000 0.000 NA   NA
 5513117 5513118 PXO_04609 PXO_04608     FALSE 0.194 55.000 0.000 NA   NA
 5513118 5513119 PXO_04608 PXO_04607     TRUE 0.923 2.000 0.024 NA   NA
 5513120 5513121 PXO_04606 PXO_04605     TRUE 0.856 -12.000 0.000 0.022 Y NA
 5513121 5513122 PXO_04605 PXO_04604     TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000   NA
 5513123 5513124 PXO_04603 PXO_04602     TRUE 0.725 137.000 0.000 0.097 Y NA
 5513125 5513126 PXO_04601 PXO_04600     FALSE 0.211 163.000 0.000 NA   NA
 5513127 5513128 PXO_04599 PXO_04598   msrA FALSE 0.520 96.000 0.013 NA   NA
 5513129 5513130 PXO_04597 PXO_04596     FALSE 0.130 212.000 0.000 NA   NA
 5513132 5513133 PXO_04594 PXO_04593     FALSE 0.017 403.000 0.000 NA   NA
 5513133 5513134 PXO_04593 PXO_04592     TRUE 0.571 63.000 0.027 1.000   NA
 5513134 5513135 PXO_04592 PXO_04591     FALSE 0.437 211.000 0.008 0.057   NA
 5513135 5513136 PXO_04591 PXO_04590     TRUE 0.677 92.000 0.041 1.000 N NA
 5513136 5513137 PXO_04590 PXO_04589     TRUE 0.930 196.000 0.551 1.000 Y NA
 5513138 5513139 PXO_04588 PXO_04586     FALSE 0.097 238.000 0.000 NA   NA
 5513139 5513140 PXO_04586 PXO_04585     FALSE 0.196 44.000 0.000 NA   NA
 5513140 5513141 PXO_04585 PXO_05504     FALSE 0.194 59.000 0.000 NA   NA
 5513141 5513142 PXO_05504 PXO_04582   pip FALSE 0.242 94.000 0.000 NA   NA
 5513143 5513144 PXO_04581 PXO_04580     TRUE 0.929 -7.000 0.135 1.000   NA
 5513144 5513145 PXO_04580 PXO_04579     TRUE 0.972 -3.000 0.068 1.000   NA
 5513145 5513146 PXO_04579 PXO_04578     TRUE 0.945 -3.000 0.014 1.000 N NA
 5513147 5513148 PXO_04577 PXO_04576     FALSE 0.520 146.000 0.014 NA   NA
 5513148 5513149 PXO_04576 PXO_04575     FALSE 0.254 102.000 0.000 NA   NA
 5513150 5513151 PXO_04574 PXO_04573     TRUE 0.859 198.000 0.556 NA   NA
 5513151 5513152 PXO_04573 PXO_04572     TRUE 0.967 -3.000 0.065 NA   NA
 5513153 5513154 PXO_04571 PXO_04570     TRUE 0.993 -3.000 0.321 0.001   NA
 5513155 5513156 PXO_04569 PXO_04568     FALSE 0.008 543.000 0.000 NA   NA
 5513157 5513158 PXO_04567 PXO_04566   ilvE FALSE 0.499 71.000 0.017 NA   NA
 5513158 5513159 PXO_04566 PXO_04562 ilvE   FALSE 0.004 1746.000 0.000 1.000 N NA
 5513159 5513160 PXO_04562 PXO_05505     FALSE 0.258 113.000 0.000 NA   NA
 5513160 5513161 PXO_05505 PXO_04561     FALSE 0.256 130.000 0.000 NA   NA
 5513162 5513163 PXO_04560 PXO_04559 ybaK   TRUE 0.860 5.000 0.006 1.000   NA
 5513165 5513166 PXO_04557 PXO_04556     TRUE 0.990 3.000 0.657 NA   NA
 5513167 5513168 PXO_04555 PXO_04554     TRUE 0.953 -3.000 0.020 1.000   NA
 5513168 5513169 PXO_04554 PXO_04553     TRUE 0.927 0.000 0.010 1.000 N NA
 5513169 5513170 PXO_04553 PXO_04551     FALSE 0.227 152.000 0.000 NA   NA
 5513171 5513172 PXO_04552 PXO_04550   moaB FALSE 0.486 33.000 0.006 1.000   NA
 5513172 5513173 PXO_04550 PXO_04549 moaB   FALSE 0.017 466.000 0.000 1.000 N NA
 5513173 5513174 PXO_04549 PXO_04548   prfA TRUE 0.920 -3.000 0.004 1.000 N NA
 5513174 5513175 PXO_04548 PXO_04547 prfA hemA TRUE 0.891 -22.000 0.171 0.031 N NA
 5513176 5513177 PXO_04546 PXO_04545   lolB TRUE 0.956 -3.000 0.024 1.000   NA
 5513177 5513178 PXO_04545 PXO_04544 lolB ispE TRUE 0.978 0.000 0.157 1.000 N NA
 5513178 5513179 PXO_04544 PXO_rna3 ispE   TRUE 0.683 4.000 0.000 NA   NA
 5513179 5513180 PXO_rna3 PXO_04542     FALSE 0.257 128.000 0.000 NA   NA
 5513180 5513181 PXO_04542 PXO_04541     TRUE 0.653 206.000 0.122 1.000 N NA
 5513181 5513182 PXO_04541 PXO_04540   pth TRUE 0.951 52.000 0.496 0.018 Y NA
 5513182 5513183 PXO_04540 PXO_04539 pth ychF TRUE 0.891 75.000 0.184 1.000 Y NA
 5513183 5513184 PXO_04539 PXO_rna4 ychF   FALSE 0.225 154.000 0.000 NA   NA
 5513184 5513185 PXO_rna4 PXO_rna5     FALSE 0.250 30.000 0.000 NA   NA
 5513185 5513186 PXO_rna5 PXO_rna6     FALSE 0.222 35.000 0.000 NA   NA
 5513186 5513187 PXO_rna6 PXO_04538   tuf FALSE 0.228 83.000 0.000 NA   NA
 5513187 5513188 PXO_04538 PXO_rna7 tuf   FALSE 0.256 106.000 0.000 NA   NA
 5513188 5513189 PXO_rna7 PXO_04537   secE FALSE 0.234 149.000 0.000 NA   NA
 5513189 5513190 PXO_04537 PXO_04536 secE nusG TRUE 0.976 14.000 0.843 1.000 N NA
 5513190 5513191 PXO_04536 PXO_04534 nusG rplK TRUE 0.896 197.000 0.681 1.000 N NA
 5513191 5513192 PXO_04534 PXO_04533 rplK rplA TRUE 0.997 4.000 0.838 0.015 Y NA
 5513192 5513193 PXO_04533 PXO_04532 rplA   FALSE 0.252 546.000 0.302 1.000 Y NA
 5513193 5513194 PXO_04532 PXO_04531   rplL TRUE 0.965 55.000 0.884 1.000 Y NA
 5513194 5513195 PXO_04531 PXO_04530 rplL rpoB FALSE 0.457 297.000 0.223 1.000   NA
 5513195 5513196 PXO_04530 PXO_04529 rpoB rpoC TRUE 0.962 151.000 0.851 0.001   NA
 5513196 5513197 PXO_04529 PXO_04528 rpoC rpsL TRUE 0.608 219.000 0.122 1.000 N NA
 5513197 5513198 PXO_04528 PXO_04527 rpsL rpsG TRUE 0.989 13.000 0.620 0.002 Y NA
 5513198 5513199 PXO_04527 PXO_04525 rpsG fusA TRUE 0.941 184.000 0.579 1.000 Y NA
 5513199 5513200 PXO_04525 PXO_04524 fusA tuf TRUE 0.960 86.000 0.400 0.001 Y NA
 5513202 5513203 PXO_05506 PXO_04522   rpsJ FALSE 0.009 504.000 0.000 NA   NA
 5513203 5513204 PXO_04522 PXO_04521 rpsJ rplC TRUE 0.937 39.000 0.307 0.015 Y NA
 5513204 5513205 PXO_04521 PXO_04520 rplC rplD TRUE 0.984 13.000 0.486 0.011 Y NA
 5513205 5513206 PXO_04520 PXO_04519 rplD rplW TRUE 0.996 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 5513206 5513207 PXO_04519 PXO_04518 rplW rplB TRUE 0.982 20.000 0.849 1.000 Y NA
 5513207 5513208 PXO_04518 PXO_04517 rplB rpsS TRUE 0.996 7.000 0.820 0.015 Y NA
 5513208 5513209 PXO_04517 PXO_04516 rpsS rplV TRUE 0.990 13.000 0.769 0.015 Y NA
 5513209 5513210 PXO_04516 PXO_04515 rplV rpsC TRUE 0.985 18.000 0.719 0.015 Y NA
 5513210 5513211 PXO_04515 PXO_04514 rpsC rplP TRUE 0.996 6.000 0.828 0.015 Y NA
 5513211 5513212 PXO_04514 PXO_04513 rplP rpmC TRUE 0.998 0.000 0.802 0.011 Y NA
 5513212 5513213 PXO_04513 PXO_04512 rpmC rpsQ TRUE 0.992 12.000 0.828 0.011 Y NA
 5513213 5513214 PXO_04512 PXO_04511 rpsQ rplN TRUE 0.982 24.000 0.791 0.015 Y NA
 5513214 5513215 PXO_04511 PXO_04510 rplN rplX TRUE 0.988 16.000 0.810 0.015 Y NA
 5513215 5513216 PXO_04510 PXO_04509 rplX   TRUE 0.991 12.000 0.758 0.011 Y NA
 5513216 5513217 PXO_04509 PXO_04508     TRUE 0.968 19.000 0.309 0.011 Y NA
 5513217 5513218 PXO_04508 PXO_04507   rpsH TRUE 0.767 278.000 0.295 0.011 Y NA
 5513218 5513219 PXO_04507 PXO_04506 rpsH   TRUE 0.980 112.000 0.808 0.011 Y NA
 5513219 5513220 PXO_04506 PXO_04504   rplR TRUE 0.977 89.000 0.815 0.011 Y NA
 5513220 5513221 PXO_04504 PXO_04503 rplR rpsE TRUE 0.974 159.000 0.814 0.015 Y NA
 5513221 5513222 PXO_04503 PXO_04502 rpsE rpmD TRUE 0.993 -7.000 0.789 0.015 Y NA
 5513222 5513223 PXO_04502 PXO_04501 rpmD rplO TRUE 0.996 5.000 0.653 0.002 Y NA
 5513223 5513224 PXO_04501 PXO_04500 rplO   TRUE 0.987 8.000 0.730 1.000 N NA
 5513224 5513225 PXO_04500 PXO_04499   rpsM FALSE 0.110 333.000 0.011 1.000 N NA
 5513225 5513226 PXO_04499 PXO_04498 rpsM rpsK TRUE 0.993 11.000 0.810 0.011 Y NA
 5513226 5513227 PXO_04498 PXO_04497 rpsK rpsD TRUE 0.982 16.000 0.509 0.015 Y NA
 5513227 5513228 PXO_04497 PXO_04496 rpsD rpoA TRUE 0.900 54.000 0.549 1.000 N NA
 5513228 5513229 PXO_04496 PXO_04495 rpoA rplQ TRUE 0.928 182.000 0.873 1.000 N NA
 5513230 5513231 PXO_04494 PXO_04493     FALSE 0.516 182.000 0.000 NA Y NA
 5513231 5513232 PXO_04493 PXO_05507     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5513233 5513234 PXO_04492 PXO_04491     FALSE 0.201 42.000 0.000 NA   NA
 5513234 5513235 PXO_04491 PXO_04490     FALSE 0.283 39.000 0.000 1.000   NA
 5513235 5513236 PXO_04490 PXO_04489     TRUE 0.573 -6.000 0.000 NA   NA
 5513236 5513237 PXO_04489 PXO_04488     TRUE 0.683 4.000 0.000 NA   NA
 5513238 5513239 PXO_05508 PXO_04487     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513239 5513240 PXO_04487 PXO_04486     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513240 5513241 PXO_04486 PXO_04485     TRUE 0.602 8.000 0.000 NA   NA
 5513241 5513242 PXO_04485 PXO_04484     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513242 5513243 PXO_04484 PXO_04483     FALSE 0.232 88.000 0.000 NA   NA
 5513243 5513244 PXO_04483 PXO_04482   gcvP FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 5513244 5513245 PXO_04482 PXO_04481 gcvP   FALSE 0.005 670.000 0.000 NA   NA
 5513246 5513247 PXO_04479 PXO_04478 raxST raxA FALSE 0.267 62.000 0.000 1.000   NA
 5513247 5513248 PXO_04478 PXO_04477 raxA raxB TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5513248 5513249 PXO_04477 PXO_04474 raxB   FALSE 0.003 1342.000 0.000 NA   NA
 5513250 5513251 PXO_04473 PXO_04472     TRUE 0.717 112.000 0.049 1.000   NA
 5513251 5513252 PXO_04472 PXO_04471     TRUE 0.769 69.000 0.152 1.000   NA
 5513252 5513253 PXO_04471 PXO_04470     TRUE 0.749 79.000 0.061 0.092   NA
 5513254 5513255 PXO_04469 PXO_04467 raxR raxH TRUE 0.979 23.000 0.833 1.000 Y NA
 5513256 5513257 PXO_04468 PXO_04466     FALSE 0.194 58.000 0.000 NA   NA
 5513257 5513258 PXO_04466 PXO_04465   minE TRUE 0.556 117.000 0.015 NA   NA
 5513258 5513259 PXO_04465 PXO_04464 minE minD TRUE 0.995 3.000 0.618 NA Y NA
 5513259 5513260 PXO_04464 PXO_04463 minD minC TRUE 0.945 36.000 0.466 1.000 Y NA
 5513260 5513261 PXO_04463 PXO_04462 minC   TRUE 0.739 14.000 0.013 1.000   NA
 5513261 5513262 PXO_04462 PXO_04461     FALSE 0.227 152.000 0.000 NA   NA
 5513263 5513264 PXO_04460 PXO_04459     TRUE 0.998 0.000 0.900 0.024 Y NA
 5513264 5513265 PXO_04459 PXO_04458     FALSE 0.027 351.000 0.000 NA   NA
 5513265 5513266 PXO_04458 PXO_04457     FALSE 0.527 97.000 0.013 NA   NA
 5513266 5513267 PXO_04457 PXO_04456     TRUE 0.871 3.000 0.008 NA   NA
 5513268 5513269 PXO_04455 PXO_04454     FALSE 0.342 131.000 0.000 1.000   NA
 5513269 5513270 PXO_04454 PXO_04453     TRUE 0.944 -3.000 0.020 NA   NA
 5513270 5513271 PXO_04453 PXO_04452   spfh TRUE 0.824 10.000 0.018 NA   NA
 5513276 5513277 PXO_05510 PXO_05511     FALSE 0.258 110.000 0.000 NA   NA
 5513277 5513278 PXO_05511 PXO_04695     FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 5513278 5513279 PXO_04695 PXO_04696   imcF TRUE 0.742 61.000 0.167 NA   NA
 5513279 5513280 PXO_04696 PXO_04697 imcF   TRUE 0.995 -3.000 0.750 NA   NA
 5513280 5513281 PXO_04697 PXO_04698     TRUE 0.966 -3.000 0.062 NA   NA
 5513283 5513284 PXO_04700 PXO_04701     FALSE 0.257 125.000 0.000 NA   NA
 5513289 5513290 PXO_04719 PXO_04718     FALSE 0.203 41.000 0.000 NA   NA
 5513295 5513296 PXO_04713 PXO_04712     FALSE 0.231 -36.000 0.000 NA   NA
 5513296 5513297 PXO_04712 PXO_04711     FALSE 0.194 55.000 0.000 NA   NA
 5513297 5513298 PXO_04711 PXO_04710     FALSE 0.010 495.000 0.000 NA   NA
 5513298 5513299 PXO_04710 PXO_04709     FALSE 0.203 41.000 0.000 NA   NA
 5513299 5513300 PXO_04709 PXO_04708     FALSE 0.058 487.000 0.000 1.000 Y NA
 5513302 5513303 PXO_04706 PXO_04705     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513304 5513305 PXO_04704 PXO_04722     TRUE 0.725 137.000 0.000 0.096 Y NA
 5513305 5513306 PXO_04722 PXO_04723     FALSE 0.008 540.000 0.000 NA N NA
 5513306 5513307 PXO_04723 PXO_05514     FALSE 0.002 1875.000 0.000 NA N NA
 5513307 5513308 PXO_05514 PXO_04767     TRUE 0.725 137.000 0.000 0.096 Y NA
 5513309 5513310 PXO_04766 PXO_04765     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513311 5513312 PXO_05818 PXO_04764     FALSE 0.119 220.000 0.000 NA   NA
 5513312 5513313 PXO_04764 PXO_04763     FALSE 0.085 247.000 0.000 NA   NA
 5513313 5513314 PXO_04763 PXO_04762     FALSE 0.004 762.000 0.000 NA   NA
 5513315 5513316 PXO_04761 PXO_04760     FALSE 0.193 54.000 0.000 NA   NA
 5513316 5513317 PXO_04760 PXO_04759     FALSE 0.227 152.000 0.000 NA   NA
 5513317 5513318 PXO_04759 PXO_04758     FALSE 0.200 171.000 0.000 NA   NA
 5513318 5513319 PXO_04758 PXO_04757     TRUE 0.642 6.000 0.000 NA   NA
 5513319 5513320 PXO_04757 PXO_04756     FALSE 0.007 721.000 0.000 1.000   NA
 5513321 5513322 PXO_04755 PXO_04754   cheR TRUE 0.991 -3.000 0.136 1.000 Y NA
 5513322 5513323 PXO_04754 PXO_04753 cheR   TRUE 0.980 5.000 0.136 1.000 Y NA
 5513323 5513324 PXO_04753 PXO_04752     TRUE 0.940 57.000 0.500 1.000 Y NA
 5513324 5513325 PXO_04752 PXO_04751     TRUE 0.994 11.000 1.000 0.010 Y NA
 5513327 5513328 PXO_04748 PXO_04746     FALSE 0.005 700.000 0.000 NA N NA
 5513328 5513329 PXO_04746 PXO_04745   mfd FALSE 0.010 490.000 0.000 NA N NA
 5513329 5513330 PXO_04745 PXO_04744 mfd   FALSE 0.045 403.000 0.002 1.000   NA
 5513330 5513331 PXO_04744 PXO_04743     FALSE 0.016 412.000 0.000 NA   NA
 5513332 5513333 PXO_04742 PXO_04741 creC   FALSE 0.251 128.000 0.000 NA N NA
 5513334 5513335 PXO_04740 PXO_04739     TRUE 0.695 8.000 0.000 1.000   NA
 5513335 5513336 PXO_04739 PXO_05819     FALSE 0.216 159.000 0.000 NA   NA
 5513337 5513338 PXO_04737 PXO_04736     TRUE 0.732 2.000 0.000 NA   NA
 5513338 5513339 PXO_04736 PXO_04735   pliMCI FALSE 0.089 411.000 0.000 1.000 Y NA
 5513339 5513340 PXO_04735 PXO_04734 pliMCI   FALSE 0.350 248.000 0.000 1.000 Y NA
 5513340 5513341 PXO_04734 PXO_04733     FALSE 0.197 65.000 0.000 NA   NA
 5513341 5513342 PXO_04733 PXO_04731   tnpA FALSE 0.516 -7.000 0.000 NA   NA
 5513343 5513344 PXO_04732 PXO_04730     FALSE 0.194 61.000 0.000 NA   NA
 5513345 5513346 PXO_04728 PXO_04727     FALSE 0.194 47.000 0.000 NA   NA
 5513348 5513349 PXO_04824 PXO_04823     TRUE 0.913 118.000 0.437 1.000   NA
 5513349 5513350 PXO_04823 PXO_04820   gltX FALSE 0.005 1186.000 0.000 1.000   NA
 5513350 5513351 PXO_04820 PXO_04819 gltX fur TRUE 0.729 14.000 0.012 1.000 N NA
 5513351 5513352 PXO_04819 PXO_04818 fur   FALSE 0.038 439.000 0.000 0.055   NA
 5513352 5513353 PXO_04818 PXO_04817     FALSE 0.004 805.000 0.000 NA   NA
 5513353 5513354 PXO_04817 PXO_04815     FALSE 0.281 25.000 0.000 NA   NA
 5513357 5513358 PXO_04814 PXO_04813     FALSE 0.236 91.000 0.000 NA   NA
 5513360 5513361 PXO_04811 PXO_04810     TRUE 0.929 132.000 0.556 1.000   NA
 5513363 5513364 PXO_04808 PXO_04807 yjjV   TRUE 0.921 0.000 0.013 NA   NA
 5513365 5513366 PXO_04806 PXO_05519     FALSE 0.218 36.000 0.000 NA   NA
 5513366 5513367 PXO_05519 PXO_04805     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513367 5513368 PXO_04805 PXO_04804     FALSE 0.396 15.000 0.000 NA   NA
 5513368 5513369 PXO_04804 PXO_05820     FALSE 0.011 479.000 0.000 NA   NA
 5513369 5513370 PXO_05820 PXO_05821     FALSE 0.257 124.000 0.000 NA   NA
 5513370 5513371 PXO_05821 PXO_04801     TRUE 0.642 6.000 0.000 NA   NA
 5513371 5513372 PXO_04801 PXO_04800     FALSE 0.430 13.000 0.000 NA   NA
 5513372 5513373 PXO_04800 PXO_04799     FALSE 0.254 135.000 0.000 NA   NA
 5513373 5513374 PXO_04799 PXO_04798   asnB TRUE 0.566 176.000 0.028 1.000 N NA
 5513374 5513375 PXO_04798 PXO_04797 asnB   FALSE 0.463 217.000 0.048 NA   NA
 5513375 5513376 PXO_04797 PXO_04796   dnaB FALSE 0.370 222.000 0.024 NA   NA
 5513376 5513377 PXO_04796 PXO_04795 dnaB   TRUE 0.751 103.000 0.006 1.000 Y NA
 5513377 5513378 PXO_04795 PXO_04794     FALSE 0.110 228.000 0.000 NA   NA
 5513378 5513379 PXO_04794 PXO_04793   ompA TRUE 0.545 10.000 0.000 NA   NA
 5513379 5513380 PXO_04793 PXO_04792 ompA   FALSE 0.258 177.000 0.000 1.000   NA
 5513380 5513381 PXO_04792 PXO_04791     FALSE 0.280 40.000 0.000 1.000   NA
 5513382 5513383 PXO_05520 PXO_04790     FALSE 0.194 62.000 0.000 NA   NA
 5513383 5513384 PXO_04790 PXO_04789     FALSE 0.139 391.000 0.000 0.015 Y NA
 5513384 5513385 PXO_04789 PXO_04788     FALSE 0.410 14.000 0.000 NA   NA
 5513386 5513387 PXO_04787 PXO_04786     TRUE 0.734 300.000 1.000 NA   NA
 5513388 5513389 PXO_04785 PXO_04784     FALSE 0.306 82.000 0.000 1.000   NA
 5513389 5513390 PXO_04784 PXO_04783     FALSE 0.485 178.000 0.013 1.000   NA
 5513392 5513393 PXO_04781 PXO_04780     TRUE 0.994 -3.000 0.275 1.000 Y NA
 5513394 5513395 PXO_04779 PXO_04778     FALSE 0.222 35.000 0.000 NA   NA
 5513395 5513396 PXO_04778 PXO_04777     FALSE 0.222 79.000 0.000 NA   NA
 5513396 5513397 PXO_04777 PXO_04776     FALSE 0.014 445.000 0.000 NA   NA
 5513397 5513398 PXO_04776 PXO_04774     TRUE 0.803 26.000 0.138 NA   NA
 5513399 5513400 PXO_04775 PXO_04773     TRUE 0.907 -3.000 0.005 NA   NA
 5513400 5513401 PXO_04773 PXO_04772     FALSE 0.450 29.000 0.005 NA   NA
 5513401 5513402 PXO_04772 PXO_04771     FALSE 0.250 30.000 0.000 NA   NA
 5513402 5513403 PXO_04771 PXO_04770     FALSE 0.437 54.000 0.000 0.006   NA
 5513404 5513405 PXO_04825 PXO_04826     FALSE 0.169 264.000 0.004 1.000 N NA
 5513405 5513406 PXO_04826 PXO_05522     FALSE 0.463 12.000 0.000 NA   NA
 5513406 5513407 PXO_05522 PXO_04827     FALSE 0.340 19.000 0.000 NA   NA
 5513408 5513409 PXO_04828 PXO_04829 dUF6 dUF72 FALSE 0.017 403.000 0.000 NA   NA
 5513409 5513410 PXO_04829 PXO_04830 dUF72   FALSE 0.257 124.000 0.000 NA   NA
 5513411 5513412 PXO_04831 PXO_04832   rraA FALSE 0.025 359.000 0.000 NA   NA
 5513412 5513413 PXO_04832 PXO_04833 rraA   TRUE 0.803 29.000 0.167 NA N NA
 5513413 5513414 PXO_04833 PXO_04834     FALSE 0.315 147.000 0.000 1.000 N NA
 5513415 5513416 PXO_04835 PXO_04836     TRUE 0.998 -3.000 0.833 1.000 Y NA
 5513417 5513418 PXO_04837 PXO_04838     TRUE 0.856 185.000 0.200 NA Y NA
 5513418 5513419 PXO_04838 PXO_04839     TRUE 0.887 32.000 0.167 NA Y NA
 5513419 5513420 PXO_04839 PXO_04840     TRUE 0.995 -3.000 0.833 NA N NA
 5513420 5513421 PXO_04840 PXO_04841     FALSE 0.199 66.000 0.000 NA   NA
 5513421 5513422 PXO_04841 PXO_04842     FALSE 0.256 132.000 0.000 NA   NA
 5513423 5513424 PXO_04843 PXO_05524     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513424 5513425 PXO_05524 PXO_04844   tnpA FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 5513425 5513426 PXO_04844 PXO_04845 tnpA   FALSE 0.196 44.000 0.000 NA   NA
 5513426 5513427 PXO_04845 PXO_04846     FALSE 0.198 43.000 0.000 NA   NA
 5513428 5513429 PXO_04847 PXO_04848     FALSE 0.097 446.000 0.000 0.094 Y NA
 5513429 5513430 PXO_04848 PXO_04849     FALSE 0.002 1905.000 0.000 NA N NA
 5513432 5513433 PXO_04851 PXO_04852     FALSE 0.217 76.000 0.000 NA   NA
 5513433 5513434 PXO_04852 PXO_04853     FALSE 0.194 63.000 0.000 NA   NA
 5513437 5513438 PXO_04889 PXO_04888 coaE   TRUE 0.887 14.000 0.122 1.000 N NA
 5513438 5513439 PXO_04888 PXO_04887     TRUE 0.990 7.000 0.454 1.000 Y NA
 5513440 5513441 PXO_04886 PXO_04885     FALSE 0.273 66.000 0.000 1.000   NA
 5513441 5513442 PXO_04885 PXO_04884     FALSE 0.024 362.000 0.000 NA   NA
 5513442 5513443 PXO_04884 PXO_04883     FALSE 0.463 12.000 0.000 NA   NA
 5513443 5513444 PXO_04883 PXO_04882   pilB FALSE 0.539 35.000 0.013 1.000   NA
 5513445 5513446 PXO_05527 PXO_05528     FALSE 0.170 187.000 0.000 NA   NA
 5513446 5513447 PXO_05528 PXO_04881     FALSE 0.028 389.000 0.000 1.000   NA
 5513447 5513448 PXO_04881 PXO_05822     FALSE 0.193 175.000 0.000 NA   NA
 5513448 5513449 PXO_05822 PXO_04880     FALSE 0.281 25.000 0.000 NA   NA
 5513450 5513451 PXO_04879 PXO_04878     TRUE 0.983 25.000 0.806 0.001 Y NA
 5513451 5513452 PXO_04878 PXO_05529     FALSE 0.079 252.000 0.000 NA   NA
 5513452 5513453 PXO_05529 PXO_04876     FALSE 0.019 388.000 0.000 NA   NA
 5513453 5513454 PXO_04876 PXO_04875     TRUE 0.642 6.000 0.000 NA   NA
 5513456 5513457 PXO_04873 PXO_04872     TRUE 0.948 8.000 0.168 NA   NA
 5513457 5513458 PXO_04872 PXO_04871     TRUE 0.901 -3.000 0.004 NA   NA
 5513458 5513459 PXO_04871 PXO_04870     TRUE 0.723 -25.000 0.052 NA   NA
 5513460 5513461 PXO_05530 PXO_04869   otsA FALSE 0.194 62.000 0.000 NA   NA
 5513461 5513462 PXO_04869 PXO_04868 otsA   TRUE 0.986 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 5513462 5513463 PXO_04868 PXO_04867   otsB TRUE 0.875 45.000 0.174 1.000 Y NA
 5513463 5513464 PXO_04867 PXO_04866 otsB   FALSE 0.004 883.000 0.000 NA   NA
 5513464 5513465 PXO_04866 PXO_04865     FALSE 0.257 108.000 0.000 NA   NA
 5513468 5513469 PXO_04862 PXO_04861     FALSE 0.227 152.000 0.000 NA   NA
 5513470 5513471 PXO_04860 PXO_04859     FALSE 0.450 53.000 0.014 NA   NA
 5513473 5513474 PXO_04857 PXO_04856     FALSE 0.075 255.000 0.000 NA   NA
 5513474 5513475 PXO_04856 PXO_04855     FALSE 0.217 76.000 0.000 NA   NA
 5513475 5513476 PXO_04855 PXO_05531   tesB FALSE 0.360 228.000 0.026 NA   NA
 5513476 5513477 PXO_05531 PXO_05532 tesB   TRUE 0.763 71.000 0.021 1.000 Y NA
 5513479 5513480 PXO_04892 PXO_04893   uvrA TRUE 0.912 0.000 0.005 1.000   NA
 5513481 5513482 PXO_05533 PXO_05534 rplU rpmA TRUE 0.989 13.000 0.667 0.011 Y NA
 5513482 5513483 PXO_05534 PXO_00015 rpmA cgtA TRUE 0.739 233.000 0.335 1.000   NA
 5513485 5513486 PXO_00013 PXO_00012 mviN ribF FALSE 0.537 253.000 0.169 1.000   NA
 5513486 5513487 PXO_00012 PXO_05535 ribF ileS TRUE 0.819 58.000 0.254 1.000 N NA
 5513487 5513488 PXO_05535 PXO_05536 ileS lspA FALSE 0.344 315.000 0.147 1.000 N NA
 5513488 5513489 PXO_05536 PXO_05537 lspA ispH TRUE 0.868 89.000 0.095 1.000 Y NA
 5513489 5513490 PXO_05537 PXO_rna8 ispH   FALSE 0.219 77.000 0.000 NA   NA
 5513492 5513493 PXO_00009 PXO_00008 cyoA cyoB TRUE 0.996 0.000 0.385 0.006 Y NA
 5513493 5513494 PXO_00008 PXO_00007 cyoB cyoC TRUE 0.996 -3.000 0.385 0.034 Y NA
 5513494 5513495 PXO_00007 PXO_00006 cyoC cyoD TRUE 0.998 0.000 0.917 0.034 Y NA
 5513495 5513496 PXO_00006 PXO_00005 cyoD   TRUE 0.779 167.000 0.167 1.000   NA
 5513496 5513497 PXO_00005 PXO_00004     FALSE 0.114 225.000 0.000 NA   NA
 5513497 5513498 PXO_00004 PXO_00003     FALSE 0.289 24.000 0.000 NA   NA
 5513498 5513499 PXO_00003 PXO_00002     FALSE 0.463 12.000 0.000 NA   NA
 5513499 5513500 PXO_00002 PXO_05538   rhs FALSE 0.340 19.000 0.000 NA   NA
 5513500 5513501 PXO_05538 PXO_00292 rhs   FALSE 0.253 137.000 0.000 NA   NA
 5513501 5513502 PXO_00292 PXO_00291     FALSE 0.254 136.000 0.000 NA   NA
 5513503 5513504 PXO_00290 PXO_00289     FALSE 0.307 22.000 0.000 NA   NA
 5513505 5513506 PXO_00288 PXO_00286     FALSE 0.006 605.000 0.000 NA   NA
 5513506 5513507 PXO_00286 PXO_00285   rhsD FALSE 0.340 19.000 0.000 NA   NA
 5513507 5513508 PXO_00285 PXO_00284 rhsD   FALSE 0.188 52.000 0.000 NA N NA
 5513508 5513509 PXO_00284 PXO_00283   rhsD FALSE 0.003 1060.000 0.000 NA N NA
 5513509 5513510 PXO_00283 PXO_00282 rhsD   FALSE 0.257 116.000 0.000 NA   NA
 5513510 5513511 PXO_00282 PXO_00281     FALSE 0.482 -9.000 0.000 NA   NA
 5513511 5513512 PXO_00281 PXO_00280     FALSE 0.122 365.000 0.000 1.000 Y NA
 5513513 5513514 PXO_00279 PXO_00278     FALSE 0.156 196.000 0.000 NA   NA
 5513514 5513515 PXO_00278 PXO_00277     FALSE 0.032 331.000 0.000 NA   NA
 5513515 5513516 PXO_00277 PXO_00276     FALSE 0.194 56.000 0.000 NA   NA
 5513518 5513519 PXO_00274 PXO_00273     FALSE 0.356 18.000 0.000 NA   NA
 5513519 5513520 PXO_00273 PXO_00272     FALSE 0.007 577.000 0.000 NA   NA
 5513520 5513521 PXO_00272 PXO_00271     TRUE 0.987 -3.000 0.286 NA   NA
 5513521 5513522 PXO_00271 PXO_00270     TRUE 0.974 9.000 0.462 NA   NA
 5513523 5513524 PXO_00269 PXO_00268     FALSE 0.340 -19.000 0.000 NA   NA
 5513526 5513527 PXO_00266 PXO_00265   sciI TRUE 0.954 5.000 0.133 NA   NA
 5513527 5513528 PXO_00265 PXO_00264 sciI   FALSE 0.252 100.000 0.000 NA   NA
 5513528 5513529 PXO_00264 PXO_00263   impE FALSE 0.218 36.000 0.000 NA   NA
 5513529 5513530 PXO_00263 PXO_00262 impE   TRUE 0.933 -12.000 0.311 NA   NA
 5513530 5513531 PXO_00262 PXO_00261   sciC TRUE 0.928 4.000 0.044 NA   NA
 5513531 5513532 PXO_00261 PXO_00260 sciC   FALSE 0.231 -36.000 0.000 NA   NA
 5513532 5513533 PXO_00260 PXO_00259   clpB FALSE 0.231 33.000 0.000 NA   NA
 5513533 5513534 PXO_00259 PXO_00258 clpB   FALSE 0.003 1308.000 0.000 NA   NA
 5513534 5513535 PXO_00258 PXO_00257     FALSE 0.215 75.000 0.000 NA   NA
 5513535 5513536 PXO_00257 PXO_00256     FALSE 0.067 265.000 0.000 NA   NA
 5513536 5513537 PXO_00256 PXO_00254     TRUE 0.575 9.000 0.000 NA   NA
 5513537 5513538 PXO_00254 PXO_00253     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513538 5513539 PXO_00253 PXO_00252   impJ TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513539 5513540 PXO_00252 PXO_00251 impJ ompA TRUE 0.732 2.000 0.000 NA   NA
 5513540 5513541 PXO_00251 PXO_00250 ompA sciS TRUE 0.683 4.000 0.000 NA   NA
 5513541 5513542 PXO_00250 PXO_00249 sciS   TRUE 0.642 6.000 0.000 NA   NA
 5513542 5513543 PXO_00249 PXO_00248     FALSE 0.204 69.000 0.000 NA   NA
 5513543 5513544 PXO_00248 PXO_00247     TRUE 0.960 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5513544 5513545 PXO_00247 PXO_00246     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513546 5513547 PXO_00245 PXO_00244   lysR TRUE 0.575 9.000 0.000 NA   NA
 5513547 5513548 PXO_00244 PXO_00243 lysR   FALSE 0.315 147.000 0.000 1.000 N NA
 5513548 5513549 PXO_00243 PXO_00242     FALSE 0.375 24.000 0.000 1.000 N NA
 5513549 5513550 PXO_00242 PXO_00241   virG TRUE 0.983 -3.000 0.182 1.000 N NA
 5513550 5513551 PXO_00241 PXO_00240 virG   FALSE 0.052 322.000 0.000 1.000   NA
 5513553 5513554 PXO_00239 PXO_00237     TRUE 0.670 -6.000 0.000 1.000   NA
 5513554 5513555 PXO_00237 PXO_00236     FALSE 0.013 451.000 0.000 NA   NA
 5513555 5513556 PXO_00236 PXO_00235     FALSE 0.016 417.000 0.000 NA   NA
 5513556 5513557 PXO_00235 PXO_00234     FALSE 0.020 386.000 0.000 NA   NA
 5513560 5513561 PXO_00231 PXO_00230     TRUE 0.922 57.000 0.706 1.000 N NA
 5513561 5513562 PXO_00230 PXO_00229     FALSE 0.228 83.000 0.000 NA   NA
 5513562 5513563 PXO_00229 PXO_00228     FALSE 0.446 -10.000 0.000 NA   NA
 5513566 5513567 PXO_00224 PXO_00223   talC2A FALSE 0.029 344.000 0.000 NA   NA
 5513567 5513568 PXO_00223 PXO_00221 talC2A   FALSE 0.137 209.000 0.000 NA   NA
 5513568 5513569 PXO_00221 PXO_00220     TRUE 0.987 -6.000 0.500 NA Y NA
 5513569 5513570 PXO_00220 PXO_00219     TRUE 0.998 -3.000 1.000 NA Y NA
 5513570 5513571 PXO_00219 PXO_00218   ccmF TRUE 0.999 -3.000 1.000 0.005 Y NA
 5513571 5513572 PXO_00218 PXO_00217 ccmF   TRUE 0.771 64.000 0.008 0.005 Y NA
 5513572 5513573 PXO_00217 PXO_00216     TRUE 0.990 -3.000 0.344 1.000 N NA
 5513573 5513574 PXO_00216 PXO_00215     TRUE 0.993 -3.000 0.501 1.000 N NA
 5513574 5513575 PXO_00215 PXO_00214     TRUE 0.907 11.000 0.008 1.000 Y NA
 5513575 5513576 PXO_00214 PXO_00213     TRUE 0.995 -3.000 0.833 NA   NA
 5513576 5513577 PXO_00213 PXO_00212     TRUE 0.995 -3.000 0.833 NA   NA
 5513577 5513578 PXO_00212 PXO_00211     TRUE 0.910 64.000 0.667 NA   NA
 5513578 5513579 PXO_00211 PXO_00210     FALSE 0.101 614.000 0.286 NA   NA
 5513579 5513580 PXO_00210 PXO_00209     TRUE 0.908 77.000 0.571 NA   NA
 5513580 5513581 PXO_00209 PXO_00208     TRUE 0.900 84.000 0.500 NA   NA
 5513582 5513583 PXO_00207 PXO_00206     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513583 5513584 PXO_00206 PXO_00205     TRUE 0.972 4.000 0.240 NA   NA
 5513584 5513585 PXO_00205 PXO_00204     TRUE 0.879 -13.000 0.149 NA   NA
 5513585 5513586 PXO_00204 PXO_00203     TRUE 0.969 0.000 0.100 NA   NA
 5513586 5513587 PXO_00203 PXO_00202     TRUE 0.941 -3.000 0.012 1.000   NA
 5513587 5513588 PXO_00202 PXO_00201     TRUE 0.955 -3.000 0.034 NA   NA
 5513588 5513589 PXO_00201 PXO_00200     TRUE 0.573 -42.000 0.034 NA   NA
 5513589 5513590 PXO_00200 PXO_00199     TRUE 0.934 46.000 1.000 NA   NA
 5513590 5513591 PXO_00199 PXO_00198     FALSE 0.079 281.000 0.000 1.000   NA
 5513591 5513592 PXO_00198 PXO_00197     TRUE 0.952 1.000 0.043 1.000 N NA
 5513592 5513593 PXO_00197 PXO_00196     TRUE 0.858 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5513593 5513594 PXO_00196 PXO_00195     FALSE 0.261 53.000 0.000 1.000 N NA
 5513594 5513595 PXO_00195 PXO_00194     TRUE 0.983 -3.000 0.011 0.008 Y NA
 5513596 5513597 PXO_00193 PXO_00191     TRUE 0.824 90.000 0.222 NA   NA
 5513598 5513599 PXO_00190 PXO_00189     FALSE 0.326 94.000 0.000 1.000   NA
 5513600 5513601 PXO_00188 PXO_00187     FALSE 0.008 550.000 0.000 NA   NA
 5513602 5513603 PXO_00186 PXO_00185     FALSE 0.482 61.000 0.011 1.000   NA
 5513604 5513605 PXO_00184 PXO_00183 exoD   TRUE 0.797 35.000 0.200 NA   NA
 5513606 5513607 PXO_00182 PXO_00181     TRUE 0.796 31.000 0.030 NA Y NA
 5513607 5513608 PXO_00181 PXO_00180     FALSE 0.219 77.000 0.000 NA   NA
 5513612 5513613 PXO_00176 PXO_00175     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513613 5513614 PXO_00175 PXO_00174   pyrG FALSE 0.329 175.000 0.002 NA   NA
 5513614 5513615 PXO_00174 PXO_00173 pyrG kdsA TRUE 0.674 204.000 0.138 1.000 N NA
 5513615 5513616 PXO_00173 PXO_00172 kdsA   TRUE 0.546 18.000 0.004 NA   NA
 5513616 5513617 PXO_00172 PXO_00171   eno FALSE 0.428 125.000 0.003 NA   NA
 5513617 5513618 PXO_00171 PXO_00170 eno ftsB TRUE 0.975 4.000 0.241 1.000 N NA
 5513618 5513619 PXO_00170 PXO_00169 ftsB ispD TRUE 0.984 -3.000 0.185 1.000 N NA
 5513619 5513620 PXO_00169 PXO_00168 ispD ispF TRUE 0.943 156.000 0.419 1.000 Y NA
 5513620 5513621 PXO_00168 PXO_00167 ispF truD TRUE 0.878 19.000 0.173 1.000   NA
 5513623 5513624 PXO_00165 PXO_00164 surE pcm TRUE 0.991 -3.000 0.353 1.000   NA
 5513624 5513625 PXO_00164 PXO_00163 pcm   TRUE 0.775 19.000 0.055 NA   NA
 5513625 5513626 PXO_00163 PXO_00162     TRUE 0.782 -21.000 0.074 NA   NA
 5513627 5513628 PXO_00161 PXO_00160     TRUE 0.691 16.000 0.014 NA   NA
 5513629 5513630 PXO_00159 PXO_00158 rrmJ ftsH TRUE 0.630 62.000 0.066 NA N NA
 5513630 5513631 PXO_00158 PXO_00157 ftsH folP TRUE 0.886 99.000 0.325 1.000 N NA
 5513631 5513632 PXO_00157 PXO_00156 folP miaA TRUE 0.926 0.000 0.009 1.000 N NA
 5513632 5513633 PXO_00156 PXO_00155 miaA   TRUE 0.920 147.000 0.531 1.000   NA
 5513633 5513634 PXO_00155 PXO_00154     TRUE 0.751 45.000 0.141 1.000   NA
 5513634 5513635 PXO_00154 PXO_00153     FALSE 0.030 432.000 0.002 NA   NA
 5513637 5513638 PXO_00151 PXO_00150 ubiB lexA TRUE 0.912 89.000 0.500 1.000   NA
 5513638 5513639 PXO_00150 PXO_00149 lexA recA FALSE 0.421 173.000 0.005 1.000 N NA
 5513639 5513640 PXO_00149 PXO_00148 recA recX FALSE 0.489 303.000 0.296 1.000   NA
 5513640 5513641 PXO_00148 PXO_00147 recX alaS TRUE 0.761 102.000 0.085 1.000   NA
 5513641 5513642 PXO_00147 PXO_00146 alaS csrA TRUE 0.614 140.000 0.020 1.000 N NA
 5513642 5513643 PXO_00146 PXO_rna9 csrA   FALSE 0.232 88.000 0.000 NA   NA
 5513643 5513644 PXO_rna9 PXO_00145     FALSE 0.026 352.000 0.000 NA   NA
 5513644 5513645 PXO_00145 PXO_05541     FALSE 0.289 24.000 0.000 NA   NA
 5513645 5513646 PXO_05541 PXO_00144     FALSE 0.019 388.000 0.000 NA   NA
 5513648 5513649 PXO_00143 PXO_00142     FALSE 0.342 131.000 0.000 1.000   NA
 5513649 5513650 PXO_00142 PXO_00141     FALSE 0.089 244.000 0.000 NA   NA
 5513650 5513651 PXO_00141 PXO_00140     FALSE 0.023 365.000 0.000 NA   NA
 5513651 5513652 PXO_00140 PXO_00139     FALSE 0.193 54.000 0.000 NA   NA
 5513652 5513653 PXO_00139 PXO_00138     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513655 5513656 PXO_00136 PXO_00135     TRUE 0.787 45.000 0.222 NA   NA
 5513657 5513658 PXO_rna10 PXO_rna11     FALSE 0.242 94.000 0.000 NA   NA
 5513658 5513659 PXO_rna11 PXO_00134     FALSE 0.203 41.000 0.000 NA   NA
 5513659 5513660 PXO_00134 PXO_00133     FALSE 0.254 136.000 0.000 NA   NA
 5513660 5513661 PXO_00133 PXO_00132   thiD FALSE 0.200 171.000 0.000 NA   NA
 5513661 5513662 PXO_00132 PXO_00131 thiD   TRUE 0.690 85.000 0.074 NA   NA
 5513662 5513663 PXO_00131 PXO_00130   phoH TRUE 0.950 -3.000 0.027 NA   NA
 5513663 5513664 PXO_00130 PXO_00129 phoH   TRUE 0.682 83.000 0.050 1.000 N NA
 5513664 5513665 PXO_00129 PXO_00128     FALSE 0.334 50.000 0.002 NA   NA
 5513665 5513666 PXO_00128 PXO_00127     TRUE 0.778 12.000 0.020 NA   NA
 5513667 5513668 PXO_00126 PXO_00125 dapA   FALSE 0.532 44.000 0.028 NA   NA
 5513671 5513672 PXO_00123 PXO_00122     TRUE 0.986 -3.000 0.053 1.000 Y NA
 5513672 5513673 PXO_00122 PXO_00121     TRUE 0.911 -6.000 0.053 1.000 N NA
 5513673 5513674 PXO_00121 PXO_00120     TRUE 0.988 -3.000 0.192 0.042 N NA
 5513677 5513678 PXO_00115 PXO_00114     TRUE 0.721 86.000 0.094 NA   NA
 5513678 5513679 PXO_00114 PXO_00113     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513679 5513680 PXO_00113 PXO_00112   xylB TRUE 0.959 -3.000 0.029 1.000   NA
 5513680 5513681 PXO_00112 PXO_00110 xylB xylA TRUE 0.835 49.000 0.091 1.000 Y NA
 5513683 5513684 PXO_00108 PXO_00107     FALSE 0.049 294.000 0.000 NA   NA
 5513685 5513686 PXO_00106 PXO_00105     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5513686 5513687 PXO_00105 PXO_00104     TRUE 0.775 0.000 0.000 NA   NA
 5513687 5513688 PXO_00104 PXO_00103     TRUE 0.762 122.000 0.085 1.000 N NA
 5513688 5513689 PXO_00103 PXO_00102     TRUE 0.836 139.000 0.125 0.042 N NA
 5513689 5513690 PXO_00102 PXO_00101     TRUE 0.782 71.000 0.042 NA Y NA
 5513690 5513691 PXO_00101 PXO_00100     TRUE 0.949 -3.000 0.027 NA N NA
 5513692 5513693 PXO_00099 PXO_00098   feoB TRUE 0.984 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 5513693 5513694 PXO_00098 PXO_00097 feoB   TRUE 0.928 2.000 0.028 NA   NA
 5513694 5513695 PXO_00097 PXO_00096     TRUE 0.860 60.000 0.400 NA   NA
 5513695 5513696 PXO_00096 PXO_00095     FALSE 0.262 28.000 0.000 NA   NA
 5513696 5513697 PXO_00095 PXO_00093     FALSE 0.176 183.000 0.000 NA   NA
 5513697 5513698 PXO_00093 PXO_00092     TRUE 0.956 3.000 0.031 0.011   NA
 5513698 5513699 PXO_00092 PXO_05545     FALSE 0.193 53.000 0.000 NA   NA
 5513699 5513700 PXO_05545 PXO_00091     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5513700 5513701 PXO_00091 PXO_00090   dapB FALSE 0.018 458.000 0.000 1.000 N NA
 5513703 5513704 PXO_00088 PXO_00087 carA   TRUE 0.775 0.000 0.000 NA   NA
 5513704 5513705 PXO_00087 PXO_00086   carB TRUE 0.575 9.000 0.000 NA   NA
 5513705 5513706 PXO_00086 PXO_00085 carB   TRUE 0.960 9.000 0.241 1.000 N NA
 5513706 5513707 PXO_00085 PXO_00084   rpfE TRUE 0.644 17.000 0.011 NA   NA
 5513707 5513708 PXO_00084 PXO_00083 rpfE recJ FALSE 0.417 60.000 0.010 NA   NA
 5513710 5513711 PXO_00081 PXO_00080     FALSE 0.177 182.000 0.000 NA   NA
 5513713 5513714 PXO_00073 PXO_00072 rpfD prfB FALSE 0.019 390.000 0.000 NA   NA
 5513714 5513715 PXO_00072 PXO_00071 prfB lysS TRUE 0.859 204.000 0.162 0.029 Y NA
 5513715 5513716 PXO_00071 PXO_00070 lysS rpfG FALSE 0.300 217.000 0.005 1.000 N NA
 5513716 5513717 PXO_00070 PXO_00069 rpfG rpfC TRUE 0.607 386.000 0.450 0.020 Y NA
 5513718 5513719 PXO_00068 PXO_00067 rpfF rpfB TRUE 0.871 177.000 0.108 0.042 Y NA
 5513720 5513721 PXO_00066 PXO_00065     FALSE 0.194 60.000 0.000 NA   NA
 5513723 5513724 PXO_00063 PXO_00062     TRUE 0.981 -3.000 0.177 NA   NA
 5513724 5513725 PXO_00062 PXO_00061   acnB FALSE 0.519 66.000 0.023 NA   NA
 5513725 5513726 PXO_00061 PXO_00060 acnB   FALSE 0.199 66.000 0.000 NA   NA
 5513726 5513727 PXO_00060 PXO_00059     FALSE 0.065 268.000 0.000 NA   NA
 5513728 5513729 PXO_00058 PXO_00057 pdeA   TRUE 0.881 109.000 0.045 0.023 Y NA
 5513729 5513730 PXO_00057 PXO_00056     TRUE 0.994 -3.000 0.267 1.000 Y NA
 5513730 5513731 PXO_00056 PXO_00055     TRUE 0.959 9.000 0.056 1.000 Y NA
 5513731 5513732 PXO_00055 PXO_00054     FALSE 0.310 260.000 0.000 1.000 Y NA
 5513732 5513733 PXO_00054 PXO_00053     TRUE 0.819 85.000 0.222 NA   NA
 5513733 5513734 PXO_00053 PXO_00052     FALSE 0.091 243.000 0.000 NA   NA
 5513736 5513737 PXO_00050 PXO_00049   pilZ TRUE 0.823 136.000 0.200 NA N NA
 5513739 5513740 PXO_00047 PXO_00046     FALSE 0.103 454.000 0.000 0.009 Y NA
 5513740 5513741 PXO_00046 PXO_05546     FALSE 0.194 57.000 0.000 NA   NA
 5513741 5513742 PXO_05546 PXO_00045     FALSE 0.016 408.000 0.000 NA   NA
 5513742 5513743 PXO_00045 PXO_00043     FALSE 0.043 688.000 0.000 0.009 Y NA
 5513743 5513744 PXO_00043 PXO_00041     FALSE 0.041 725.000 0.000 0.009 Y NA
 5513744 5513745 PXO_00041 PXO_00040     FALSE 0.094 241.000 0.000 NA   NA
 5513745 5513746 PXO_00040 PXO_00039     FALSE 0.014 446.000 0.000 NA   NA
 5513746 5513747 PXO_00039 PXO_00038     FALSE 0.255 29.000 0.000 NA   NA
 5513747 5513748 PXO_00038 PXO_00037     TRUE 0.575 9.000 0.000 NA   NA
 5513748 5513749 PXO_00037 PXO_00036     FALSE 0.150 200.000 0.000 NA   NA
 5513751 5513752 PXO_00035 PXO_00033     FALSE 0.057 277.000 0.000 NA   NA
 5513752 5513753 PXO_00033 PXO_00032   cheA FALSE 0.204 168.000 0.000 NA   NA
 5513753 5513754 PXO_00032 PXO_00031 cheA   TRUE 0.881 34.000 0.135 1.000 Y NA
 5513754 5513755 PXO_00031 PXO_00030     TRUE 0.965 12.000 0.514 NA   NA
 5513755 5513756 PXO_00030 PXO_00029     TRUE 0.821 110.000 0.190 NA   NA
 5513756 5513757 PXO_00029 PXO_00028     TRUE 0.958 -3.000 0.028 1.000 N NA
 5513757 5513758 PXO_00028 PXO_00027     TRUE 0.841 116.000 0.199 1.000 N NA
 5513758 5513759 PXO_00027 PXO_00026   motA TRUE 0.984 7.000 0.248 1.000 Y NA
 5513760 5513761 PXO_00025 PXO_05548     FALSE 0.212 162.000 0.000 NA   NA
 5513762 5513763 PXO_00024 PXO_00023     FALSE 0.421 47.000 0.000 0.014   NA
 5513763 5513764 PXO_00023 PXO_00022   sodA FALSE 0.307 152.000 0.000 1.000   NA
 5513764 5513765 PXO_00022 PXO_00021 sodA   FALSE 0.295 76.000 0.000 1.000   NA
 5513765 5513766 PXO_00021 PXO_00020     FALSE 0.316 149.000 0.000 1.000   NA
 5513766 5513767 PXO_00020 PXO_00019     FALSE 0.075 255.000 0.000 NA   NA
 5513769 5513770 PXO_05549 PXO_00296     FALSE 0.285 165.000 0.000 1.000   NA
 5513770 5513771 PXO_00296 PXO_00295     FALSE 0.390 23.000 0.000 1.000   NA
 5513775 5513776 PXO_00510 PXO_00509     FALSE 0.266 54.000 0.000 1.000   NA
 5513777 5513778 PXO_05552 PXO_00508     TRUE 0.573 -6.000 0.000 NA   NA
 5513781 5513782 PXO_00504 PXO_00503     FALSE 0.266 54.000 0.000 1.000   NA
 5513783 5513784 PXO_00502 PXO_00501     TRUE 0.974 9.000 0.462 NA   NA
 5513784 5513785 PXO_00501 PXO_00500     TRUE 0.987 -3.000 0.286 NA   NA
 5513785 5513786 PXO_00500 PXO_00499     FALSE 0.006 631.000 0.000 NA   NA
 5513786 5513787 PXO_00499 PXO_00498     FALSE 0.356 18.000 0.000 NA   NA
 5513787 5513788 PXO_00498 PXO_00497     FALSE 0.006 635.000 0.000 NA   NA
 5513788 5513789 PXO_00497 PXO_00496     TRUE 0.602 8.000 0.000 NA   NA
 5513790 5513791 PXO_05554 PXO_00495   tnpA FALSE 0.195 45.000 0.000 NA   NA
 5513791 5513792 PXO_00495 PXO_05555 tnpA   FALSE 0.214 37.000 0.000 NA   NA
 5513793 5513794 PXO_00492 PXO_00491     FALSE 0.509 11.000 0.000 NA   NA
 5513795 5513796 PXO_00490 PXO_00489     TRUE 0.630 178.000 0.025 0.042 N NA
 5513796 5513797 PXO_00489 PXO_00488     TRUE 0.953 159.000 0.562 1.000 Y NA
 5513797 5513798 PXO_00488 PXO_00487     TRUE 0.992 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 5513800 5513801 PXO_00485 PXO_05556     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5513803 5513804 PXO_00483 PXO_00482     FALSE 0.344 109.000 0.000 1.000   NA
 5513804 5513805 PXO_00482 PXO_00481     TRUE 0.980 13.000 1.000 1.000 N NA
 5513805 5513806 PXO_00481 PXO_00480     TRUE 0.963 15.000 0.571 1.000   NA
 5513806 5513807 PXO_00480 PXO_05557     FALSE 0.254 135.000 0.000 NA   NA
 5513808 5513809 PXO_00479 PXO_00478     FALSE 0.201 42.000 0.000 NA   NA
 5513809 5513810 PXO_00478 PXO_00477     FALSE 0.157 195.000 0.000 NA   NA
 5513811 5513812 PXO_00476 PXO_00475     TRUE 0.888 52.000 0.133 0.020 Y NA
 5513812 5513813 PXO_00475 PXO_00474     FALSE 0.523 142.000 0.013 NA   NA
 5513813 5513814 PXO_00474 PXO_00473     FALSE 0.244 246.000 0.013 NA   NA
 5513817 5513818 PXO_00470 PXO_00469   fdhD FALSE 0.504 31.000 0.011 NA   NA
 5513818 5513819 PXO_00469 PXO_00468 fdhD   TRUE 0.992 -3.000 0.086 0.001 Y NA
 5513819 5513820 PXO_00468 PXO_05824     TRUE 0.886 -10.000 0.114 NA   NA
 5513820 5513821 PXO_05824 PXO_00467     FALSE 0.028 348.000 0.000 NA   NA
 5513822 5513823 PXO_05559 PXO_00466     FALSE 0.194 61.000 0.000 NA   NA
 5513823 5513824 PXO_00466 PXO_00465     TRUE 0.902 137.000 0.375 1.000 N NA
 5513824 5513825 PXO_00465 PXO_00464     TRUE 0.997 0.000 0.750 1.000 Y NA
 5513826 5513827 PXO_05560 PXO_00463     TRUE 0.947 7.000 0.111 1.000   NA
 5513829 5513830 PXO_05825 PXO_00461     FALSE 0.066 267.000 0.000 NA   NA
 5513830 5513831 PXO_00461 PXO_00460     TRUE 0.996 -3.000 0.880 1.000   NA
 5513831 5513832 PXO_00460 PXO_00459   oprN TRUE 0.986 5.000 0.520 1.000   NA
 5513832 5513833 PXO_00459 PXO_00458 oprN   TRUE 0.797 134.000 0.125 1.000 N NA
 5513833 5513834 PXO_00458 PXO_00457     TRUE 0.905 29.000 0.385 1.000   NA
 5513834 5513835 PXO_00457 PXO_00456     TRUE 0.802 85.000 0.094 0.027   NA
 5513838 5513839 PXO_00453 PXO_00452     TRUE 0.846 16.000 0.095 NA   NA
 5513839 5513840 PXO_00452 PXO_00451     TRUE 0.951 -3.000 0.029 NA   NA
 5513840 5513841 PXO_00451 PXO_00450     TRUE 0.588 95.000 0.024 NA   NA
 5513841 5513842 PXO_00450 PXO_00449     TRUE 0.891 0.000 0.005 NA   NA
 5513842 5513843 PXO_00449 PXO_00448     FALSE 0.417 127.000 0.002 NA   NA
 5513843 5513844 PXO_00448 PXO_00447     FALSE 0.016 412.000 0.000 NA   NA
 5513844 5513845 PXO_00447 PXO_00446   miaB FALSE 0.206 424.000 0.220 1.000 N NA
 5513845 5513846 PXO_00446 PXO_00445 miaB   FALSE 0.258 111.000 0.000 NA   NA
 5513846 5513847 PXO_00445 PXO_00444     FALSE 0.214 -40.000 0.000 NA   NA
 5513848 5513849 PXO_00443 PXO_00442     TRUE 0.901 150.000 0.500 NA   NA
 5513849 5513850 PXO_00442 PXO_00441   petA FALSE 0.029 641.000 0.033 NA   NA
 5513850 5513851 PXO_00441 PXO_00440 petA   TRUE 0.994 0.000 0.233 0.001 Y NA
 5513851 5513852 PXO_00440 PXO_00439     TRUE 0.994 8.000 0.630 0.001 Y NA
 5513852 5513853 PXO_00439 PXO_00438   sspA FALSE 0.268 423.000 0.370 NA N NA
 5513853 5513854 PXO_00438 PXO_00437 sspA sspB TRUE 0.936 79.000 0.831 NA   NA
 5513854 5513855 PXO_00437 PXO_05561 sspB   FALSE 0.464 33.000 0.009 NA   NA
 5513855 5513856 PXO_05561 PXO_05562     FALSE 0.194 46.000 0.000 NA   NA
 5513857 5513858 PXO_00435 PXO_00434     FALSE 0.052 289.000 0.000 NA   NA
 5513859 5513860 PXO_00433 PXO_00432     FALSE 0.228 83.000 0.000 NA   NA
 5513860 5513861 PXO_00432 PXO_00431     FALSE 0.070 262.000 0.000 NA   NA
 5513861 5513862 PXO_00431 PXO_00430     FALSE 0.103 232.000 0.000 NA   NA
 5513864 5513865 PXO_00428 PXO_05826     FALSE 0.004 830.000 0.000 NA   NA
 5513865 5513866 PXO_05826 PXO_00427     FALSE 0.007 578.000 0.000 NA   NA
 5513866 5513867 PXO_00427 PXO_00426     FALSE 0.006 602.000 0.000 NA   NA
 5513867 5513868 PXO_00426 PXO_00425     TRUE 0.914 198.000 1.000 NA   NA
 5513868 5513869 PXO_00425 PXO_00424     FALSE 0.042 305.000 0.000 NA   NA
 5513869 5513870 PXO_00424 PXO_00423     FALSE 0.018 391.000 0.000 NA   NA
 5513871 5513872 PXO_rna12 PXO_00422     FALSE 0.240 93.000 0.000 NA   NA
 5513874 5513875 PXO_00420 PXO_00419 rnd   FALSE 0.065 268.000 0.000 NA   NA
 5513876 5513877 PXO_00418 PXO_00417     FALSE 0.010 588.000 0.000 1.000   NA
 5513877 5513878 PXO_00417 PXO_00416     FALSE 0.123 217.000 0.000 NA   NA
 5513879 5513880 PXO_05827 PXO_00415   xseA FALSE 0.258 109.000 0.000 NA   NA
 5513880 5513881 PXO_00415 PXO_00414 xseA   FALSE 0.468 146.000 0.004 1.000 N NA
 5513882 5513883 PXO_00413 PXO_00412 yjeF   TRUE 0.976 -3.000 0.118 NA   NA
 5513883 5513884 PXO_00412 PXO_00411     FALSE 0.453 53.000 0.014 NA   NA
 5513884 5513885 PXO_00411 PXO_00410   mutL TRUE 0.599 138.000 0.016 1.000 N NA
 5513885 5513886 PXO_00410 PXO_00409 mutL   TRUE 0.560 -21.000 0.007 NA   NA
 5513886 5513887 PXO_00409 PXO_00408     TRUE 0.919 34.000 0.625 NA   NA
 5513888 5513889 PXO_00407 PXO_00406 phaR   TRUE 0.614 94.000 0.031 NA   NA
 5513889 5513890 PXO_00406 PXO_00405     TRUE 0.654 88.000 0.014 0.029 N NA
 5513892 5513893 PXO_00403 PXO_00402     FALSE 0.298 224.000 0.007 1.000   NA
 5513893 5513894 PXO_00402 PXO_00401   yaeQ TRUE 0.927 -3.000 0.011 NA   NA
 5513894 5513895 PXO_00401 PXO_00400 yaeQ   FALSE 0.507 119.000 0.010 NA   NA
 5513896 5513897 PXO_00399 PXO_00398     TRUE 0.639 171.000 0.046 1.000 N NA
 5513899 5513900 PXO_00396 PXO_00395   apt FALSE 0.421 98.000 0.004 NA   NA
 5513902 5513903 PXO_00393 PXO_05565     FALSE 0.194 59.000 0.000 NA   NA
 5513904 5513905 PXO_00391 PXO_00390     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 5513910 5513911 PXO_00385 PXO_00384     TRUE 0.982 -3.000 0.200 NA N NA
 5513913 5513914 PXO_00382 PXO_00381 efp   FALSE 0.284 192.000 0.002 NA   NA
 5513914 5513915 PXO_00381 PXO_00380     TRUE 0.856 8.000 0.018 NA   NA
 5513915 5513916 PXO_00380 PXO_00379   ubiG TRUE 0.772 31.000 0.104 1.000 N NA
 5513916 5513917 PXO_00379 PXO_00378 ubiG gph TRUE 0.878 26.000 0.259 1.000   NA
 5513917 5513918 PXO_00378 PXO_00377 gph   TRUE 0.595 29.000 0.022 NA   NA
 5513920 5513921 PXO_00375 PXO_00374     FALSE 0.516 -7.000 0.000 NA   NA
 5513921 5513922 PXO_00374 PXO_00372     FALSE 0.055 279.000 0.000 NA   NA
 5513923 5513924 PXO_00373 PXO_00371     FALSE 0.036 360.000 0.000 1.000   NA
 5513924 5513925 PXO_00371 PXO_00370     FALSE 0.414 37.000 0.000 0.089   NA
 5513925 5513926 PXO_00370 PXO_00369     FALSE 0.074 292.000 0.000 1.000   NA
 5513926 5513927 PXO_00369 PXO_00368     FALSE 0.296 158.000 0.000 1.000   NA
 5513928 5513929 PXO_00367 PXO_00366     FALSE 0.164 224.000 0.000 1.000   NA
 5513934 5513935 PXO_00362 PXO_00361     TRUE 0.946 0.000 0.023 1.000 N NA
 5513936 5513937 PXO_00359 PXO_00358     FALSE 0.296 158.000 0.000 1.000   NA
 5513938 5513939 PXO_00357 PXO_00356   sufE TRUE 0.775 15.000 0.034 NA   NA
 5513939 5513940 PXO_00356 PXO_00355 sufE cysS FALSE 0.023 498.000 0.006 NA   NA
 5513941 5513942 PXO_05567 PXO_00354     FALSE 0.356 18.000 0.000 NA   NA
 5513942 5513943 PXO_00354 PXO_00353     FALSE 0.032 331.000 0.000 NA   NA
 5513943 5513944 PXO_00353 PXO_00352   argG TRUE 0.709 72.000 0.007 1.000 Y NA
 5513944 5513945 PXO_00352 PXO_00351 argG   FALSE 0.190 251.000 0.002 1.000   NA
 5513945 5513946 PXO_00351 PXO_00350     TRUE 0.915 6.000 0.032 1.000   NA
 5513946 5513947 PXO_00350 PXO_00349     TRUE 0.714 40.000 0.009 1.000 Y NA
 5513947 5513948 PXO_00349 PXO_00348     TRUE 0.852 6.000 0.006 1.000 N NA
 5513948 5513949 PXO_00348 PXO_00347   argC FALSE 0.537 -31.000 0.008 1.000 N NA
 5513949 5513950 PXO_00347 PXO_00346 argC   TRUE 0.807 124.000 0.020 1.000 Y NA
 5513950 5513951 PXO_00346 PXO_00345     TRUE 0.902 0.000 0.002 1.000 N NA
 5513951 5513952 PXO_00345 PXO_00344     TRUE 0.949 0.000 0.036 NA   NA
 5513952 5513953 PXO_00344 PXO_00343   proB TRUE 0.855 14.000 0.091 NA   NA
 5513953 5513954 PXO_00343 PXO_00342 proB proA TRUE 0.762 179.000 0.007 0.001 Y NA
 5513954 5513955 PXO_00342 PXO_00338 proA   FALSE 0.033 368.000 0.000 1.000   NA
 5513956 5513957 PXO_00339 PXO_rna13     FALSE 0.229 85.000 0.000 NA   NA
 5513957 5513958 PXO_rna13 PXO_00337     FALSE 0.091 243.000 0.000 NA   NA
 5513958 5513959 PXO_00337 PXO_00336     TRUE 0.950 49.000 0.953 0.032   NA
 5513959 5513960 PXO_00336 PXO_00335     FALSE 0.413 49.000 0.000 0.020   NA
 5513961 5513962 PXO_05568 PXO_00334   cydD FALSE 0.257 119.000 0.000 NA   NA
 5513962 5513963 PXO_00334 PXO_00333 cydD cydC TRUE 0.998 -3.000 0.631 0.003 Y NA
 5513964 5513965 PXO_00332 PXO_00331     TRUE 0.621 7.000 0.000 NA   NA
 5513965 5513966 PXO_00331 PXO_00330     FALSE 0.009 507.000 0.000 NA   NA
 5513967 5513968 PXO_00329 PXO_05569     FALSE 0.226 82.000 0.000 NA   NA
 5513969 5513970 PXO_rna14 PXO_rna15     FALSE 0.193 48.000 0.000 NA   NA
 5513972 5513973 PXO_rna16 PXO_rna17     FALSE 0.193 48.000 0.000 NA   NA
 5513973 5513974 PXO_rna17 PXO_00327     FALSE 0.240 93.000 0.000 NA   NA
 5513974 5513975 PXO_00327 PXO_00326     TRUE 0.994 9.000 0.688 0.005 Y NA
 5513976 5513977 PXO_00325 PXO_00324     FALSE 0.195 64.000 0.000 NA   NA
 5513977 5513978 PXO_00324 PXO_00323     TRUE 0.995 -3.000 0.778 NA   NA
 5513978 5513979 PXO_00323 PXO_00322     TRUE 0.961 22.000 0.481 NA Y NA
 5513979 5513980 PXO_00322 PXO_00321     FALSE 0.193 52.000 0.000 NA   NA
 5513981 5513982 PXO_00320 PXO_00319     FALSE 0.207 39.000 0.000 NA   NA
 5513982 5513983 PXO_00319 PXO_00318   talC4 FALSE 0.246 141.000 0.000 NA   NA
 5513984 5513985 PXO_05570 PXO_05571     FALSE 0.265 -28.000 0.000 NA   NA
 5513987 5513988 PXO_00315 PXO_00314     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5513990 5513991 PXO_00312 PXO_00311   coaD TRUE 0.991 -3.000 0.367 1.000 N NA
 5513991 5513992 PXO_00311 PXO_00310 coaD   FALSE 0.390 59.000 0.007 NA   NA
 5513992 5513993 PXO_00310 PXO_00309     FALSE 0.322 232.000 0.020 NA   NA
 5513993 5513994 PXO_00309 PXO_00307   ggt TRUE 0.969 -3.000 0.076 NA   NA
 5513995 5513996 PXO_00308 PXO_05572     FALSE 0.430 13.000 0.000 NA   NA
 5513996 5513997 PXO_05572 PXO_00306     FALSE 0.235 148.000 0.000 NA   NA
 5513997 5513998 PXO_00306 PXO_05573     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5513998 5513999 PXO_05573 PXO_05828     FALSE 0.430 13.000 0.000 NA   NA
 5513999 5514000 PXO_05828 PXO_00305     FALSE 0.154 197.000 0.000 NA   NA
 5514000 5514001 PXO_00305 PXO_00304   upp FALSE 0.232 150.000 0.000 NA   NA
 5514002 5514003 PXO_00303 PXO_00302     TRUE 0.790 30.000 0.057 0.014   NA
 5514003 5514004 PXO_00302 PXO_00301     TRUE 0.984 -3.000 0.220 NA N NA
 5514006 5514007 PXO_05574 PXO_05575     FALSE 0.074 292.000 0.000 1.000   NA
 5514007 5514008 PXO_05575 PXO_05576     FALSE 0.405 166.000 0.000 0.088   NA
 5514009 5514010 PXO_05577 PXO_05578     FALSE 0.176 183.000 0.000 NA   NA
 5514012 5514013 PXO_00530 PXO_00528     FALSE 0.077 253.000 0.000 NA   NA
 5514014 5514015 PXO_00527 PXO_00526   queA FALSE 0.463 147.000 0.004 1.000 N NA
 5514015 5514016 PXO_00526 PXO_00525 queA tgt TRUE 0.950 70.000 0.360 0.001 Y NA
 5514016 5514017 PXO_00525 PXO_00524 tgt yajC TRUE 0.876 132.000 0.325 NA N NA
 5514019 5514020 PXO_00522 PXO_00521 secD secF TRUE 0.906 95.000 0.084 0.001 Y NA
 5514022 5514023 PXO_00519 PXO_00518     FALSE 0.120 249.000 0.000 1.000   NA
 5514023 5514024 PXO_00518 PXO_00517     FALSE 0.329 95.000 0.000 1.000   NA
 5514025 5514026 PXO_00516 PXO_00515     TRUE 0.618 187.000 0.000 0.088 Y NA
 5514028 5514029 PXO_05580 PXO_00538   rnt TRUE 0.899 8.000 0.000 1.000 Y NA
 5514031 5514032 PXO_00537 PXO_00536   phoU TRUE 0.739 133.000 0.087 NA   NA
 5514034 5514035 PXO_00535 PXO_00541 pstB pstA TRUE 0.976 23.000 0.526 0.002 Y NA
 5514035 5514036 PXO_00541 PXO_00542 pstA pstC TRUE 0.997 0.000 0.537 0.002 Y NA
 5514036 5514037 PXO_00542 PXO_05583 pstC pstS TRUE 0.879 113.000 0.033 0.002 Y NA
 5514037 5514038 PXO_05583 PXO_00789 pstS pstS TRUE 0.932 186.000 0.333 0.002 Y NA
 5514038 5514039 PXO_00789 PXO_00788 pstS   TRUE 0.946 190.000 0.750 NA Y NA
 5514040 5514041 PXO_00787 PXO_05585     FALSE 0.038 318.000 0.000 NA   NA
 5514041 5514042 PXO_05585 PXO_00786     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5514042 5514043 PXO_00786 PXO_00785     FALSE 0.338 127.000 0.000 1.000 N NA
 5514044 5514045 PXO_00782 PXO_00781 nth   TRUE 0.908 -3.000 0.005 NA   NA
 5514045 5514046 PXO_00781 PXO_00780     TRUE 0.745 66.000 0.160 NA   NA
 5514047 5514048 PXO_00779 PXO_00778     TRUE 0.662 113.000 0.028 1.000   NA
 5514048 5514049 PXO_00778 PXO_00777     TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000   NA
 5514049 5514050 PXO_00777 PXO_00776     FALSE 0.233 89.000 0.000 NA   NA
 5514052 5514053 PXO_00774 PXO_00773     TRUE 0.952 -3.000 0.029 NA   NA
 5514053 5514054 PXO_00773 PXO_00772     TRUE 0.588 41.000 0.040 NA   NA
 5514054 5514055 PXO_00772 PXO_05586     FALSE 0.002 1793.000 0.000 NA   NA
 5514055 5514056 PXO_05586 PXO_00768     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5514056 5514057 PXO_00768 PXO_00767     FALSE 0.016 484.000 0.000 1.000 N NA
 5514057 5514058 PXO_00767 PXO_00766     FALSE 0.519 204.000 0.036 1.000   NA
 5514059 5514060 PXO_00765 PXO_00764     FALSE 0.201 42.000 0.000 NA   NA
 5514060 5514061 PXO_00764 PXO_00763     TRUE 0.804 -3.000 0.000 NA   NA
 5514061 5514062 PXO_00763 PXO_00762     TRUE 0.955 -3.000 0.034 NA   NA
 5514062 5514063 PXO_00762 PXO_00761     FALSE 0.257 118.000 0.000 NA   NA
 5514063 5514064 PXO_00761 PXO_00760     FALSE 0.205 70.000 0.000 NA   NA
 5514066 5514067 PXO_00758 PXO_00757 kynU   TRUE 0.623 59.000 0.060 NA   NA
 5514067 5514068 PXO_00757 PXO_00756     FALSE 0.009 523.000 0.000 NA   NA
 5514068 5514069 PXO_00756 PXO_00755     FALSE 0.430 13.000 0.000 NA   NA
 5514069 5514070 PXO_00755 PXO_00754     TRUE 0.571 56.000 0.027 1.000   NA
 5514070 5514071 PXO_00754 PXO_00753   pai2 TRUE 0.597 81.000 0.022 1.000   NA
 5514071 5514072 PXO_00753 PXO_00752 pai2 pai2 TRUE 0.714 13.000 0.000 0.004   NA
 5514072 5514073 PXO_00752 PXO_00751 pai2   TRUE 0.964 2.000 0.116 NA   NA
 5514073 5514074 PXO_00751 PXO_00750     TRUE 0.995 -3.000 0.833 NA   NA
 5514074 5514075 PXO_00750 PXO_00749     TRUE 0.990 -3.000 0.400 NA   NA
 5514075 5514076 PXO_00749 PXO_00748   asnS FALSE 0.411 89.000 0.005 NA   NA
 5514077 5514078 PXO_00747 PXO_00746     FALSE 0.026 355.000 0.000 NA   NA
 5514078 5514079 PXO_00746 PXO_00745   rpsR TRUE 0.981 12.000 0.319 0.010 Y NA
 5514079 5514080 PXO_00745 PXO_00744 rpsR rplI TRUE 0.865 260.000 0.499 0.010 Y NA
 5514080 5514081 PXO_00744 PXO_00743 rplI   FALSE 0.187 210.000 0.000 1.000 N NA
 5514081 5514082 PXO_00743 PXO_00742   zipA TRUE 0.885 57.000 0.115 0.008 Y NA
 5514082 5514083 PXO_00742 PXO_00741 zipA   FALSE 0.243 143.000 0.000 NA   NA
 5514084 5514085 PXO_00740 PXO_00739     FALSE 0.242 94.000 0.000 NA   NA
 5514086 5514087 PXO_00738 PXO_00737     TRUE 0.861 -3.000 0.000 1.000   NA
 5514087 5514088 PXO_00737 PXO_00736     TRUE 0.610 110.000 0.026 NA   NA
 5514088 5514089 PXO_00736 PXO_00735     FALSE 0.338 201.000 0.009 NA   NA
 5514089 5514090 PXO_00735 PXO_00734   gyrA FALSE 0.332 211.000 0.007 1.000 N NA
 5514090 5514091 PXO_00734 PXO_00733 gyrA   FALSE 0.341 133.000 0.000 1.000   NA
 5514091 5514092 PXO_00733 PXO_00732     TRUE 0.670 -6.000 0.000 1.000   NA
 5514093 5514094 PXO_00731 PXO_00730     FALSE 0.256 130.000 0.000 NA   NA
 5514094 5514095 PXO_00730 PXO_00729   hutU FALSE 0.036 360.000 0.000 1.000 N NA
 5514095 5514096 PXO_00729 PXO_00728 hutU hutG TRUE 0.914 17.000 0.061 1.000 Y NA
 5514096 5514097 PXO_00728 PXO_00727 hutG hutH TRUE 0.772 179.000 0.039 1.000 Y NA
 5514097 5514098 PXO_00727 PXO_00726 hutH hutI TRUE 0.932 14.000 0.192 0.028 N NA
 5514099 5514100 PXO_00725 PXO_00724 hutF hutC FALSE 0.122 358.000 0.027 1.000 N NA
 5514101 5514102 PXO_00723 PXO_00722     FALSE 0.051 597.000 0.087 NA   NA
 5514102 5514103 PXO_00722 PXO_00721     TRUE 0.703 162.000 0.095 NA   NA
 5514104 5514105 PXO_00720 PXO_05587     FALSE 0.359 -18.000 0.000 NA   NA
 5514106 5514107 PXO_00719 PXO_00718     FALSE 0.257 117.000 0.000 NA   NA
 5514108 5514109 PXO_00717 PXO_00716 serC   TRUE 0.852 49.000 0.121 1.000 Y NA
 5514109 5514110 PXO_00716 PXO_00715   aroA TRUE 0.834 122.000 0.035 1.000 Y NA
 5514111 5514112 PXO_00714 PXO_00713     TRUE 0.573 -6.000 0.000 NA   NA
 5514112 5514113 PXO_00713 PXO_05588     FALSE 0.193 49.000 0.000 NA   NA
 5514113 5514114 PXO_05588 PXO_00712     FALSE 0.003 1324.000 0.000 NA   NA
 5514115 5514116 PXO_00711 PXO_00710 yapH   FALSE 0.258 110.000 0.000 NA   NA
 5514117 5514118 PXO_00709 PXO_00708     TRUE 0.995 6.000 0.800 1.000 Y NA
 5514118 5514119 PXO_00708 PXO_00707     FALSE 0.390 65.000 0.000 0.082 N NA
 5514119 5514120 PXO_00707 PXO_00706     TRUE 0.864 33.000 0.296 1.000 N NA
 5514120 5514121 PXO_00706 PXO_00705     TRUE 0.975 -7.000 0.519 1.000 N NA
 5514123 5514124 PXO_00703 PXO_00702     FALSE 0.053 321.000 0.000 1.000   NA
 5514126 5514127 PXO_00700 PXO_00699     TRUE 0.573 -6.000 0.000 NA   NA
 5514128 5514129 PXO_00698 PXO_00697     TRUE 0.775 0.000 0.000 NA   NA
 5514129 5514130 PXO_00697 PXO_00696     FALSE 0.022 367.000 0.000 NA   NA
 5514130 5514131 PXO_00696 PXO_00695     TRUE 0.573 65.000 0.026 1.000   NA
 5514131 5514132 PXO_00695 PXO_00694     TRUE 0.545 10.000 0.000 NA   NA
 5514134 5514135 PXO_05829 PXO_00691   folK TRUE 0.974 4.000 0.234 1.000 N NA
 5514135 5514136 PXO_00691 PXO_00690 folK panB TRUE 0.868 36.000 0.117 1.000 Y NA
 5514136 5514137 PXO_00690 PXO_00689 panB panC TRUE 0.997 -3.000 0.395 0.001 Y NA
 5514137 5514138 PXO_00689 PXO_00688 panC panD TRUE 0.940 146.000 0.342 1.000 Y NA
 5514138 5514139 PXO_00688 PXO_00687 panD pgi TRUE 0.939 -3.000 0.011 1.000 N NA
 5514139 5514140 PXO_00687 PXO_00686 pgi   FALSE 0.216 159.000 0.000 NA   NA
 5514140 5514141 PXO_00686 PXO_00685     TRUE 0.974 4.000 0.278 NA   NA
 5514145 5514146 PXO_00680 PXO_00679     TRUE 0.677 44.000 0.071 1.000   NA
 5514148 5514149 PXO_05590 PXO_00677     FALSE 0.135 210.000 0.000 NA   NA
 5514150 5514151 PXO_rna19 PXO_00676     FALSE 0.246 141.000 0.000 NA   NA
 5514154 5514155 PXO_00673 PXO_00672     TRUE 0.976 -3.000 0.091 1.000   NA
 5514157 5514158 PXO_00670 PXO_00669     TRUE 0.812 216.000 0.500 NA   NA
 5514158 5514159 PXO_00669 PXO_00668     TRUE 0.870 67.000 0.429 NA   NA
 5514160 5514161 PXO_00667 PXO_00666     TRUE 0.994 -3.000 0.667 NA   NA
 5514162 5514163 PXO_00664 PXO_00663     FALSE 0.255 103.000 0.000 NA   NA
 5514163 5514164 PXO_00663 PXO_05592     FALSE 0.257 116.000 0.000 NA   NA
 5514164 5514165 PXO_05592 PXO_00662     FALSE 0.326 20.000 0.000 NA   NA
 5514166 5514167 PXO_00661 PXO_00660     TRUE 0.586 25.000 0.000 0.001   NA
 5514168 5514169 PXO_00659 PXO_00658     FALSE 0.309 -22.000 0.000 NA   NA
 5514170 5514171 PXO_00657 PXO_00656     FALSE 0.527 189.000 0.028 1.000 N NA
 5514172 5514173 PXO_00655 PXO_00654     FALSE 0.109 319.000 0.006 1.000 N NA
 5514173 5514174 PXO_00654 PXO_00651     FALSE 0.004 1803.000 0.000 1.000   NA
 5514174 5514175 PXO_00651 PXO_00650     TRUE 0.671 9.000 0.000 1.000   NA
 5514175 5514176 PXO_00650 PXO_05593     FALSE 0.301 156.000 0.000 1.000   NA
 5514179 5514180 PXO_00645 PXO_00644     TRUE 0.775 0.000 0.000 NA   NA
 5514180 5514181 PXO_00644 PXO_05594     FALSE 0.205 -42.000 0.000 NA   NA
 5514185 5514186 PXO_00640 PXO_00639     FALSE 0.205 40.000 0.000 NA   NA
 5514186 5514187 PXO_00639 PXO_00638     FALSE 0.257 119.000 0.000 NA   NA
 5514187 5514188 PXO_00638 PXO_00637     FALSE 0.412 -12.000 0.000 NA   NA
 5514189 5514190 PXO_00636 PXO_00635     TRUE 0.994 -3.000 0.600 1.000   NA
 5514192 5514193 PXO_00633 PXO_00632     TRUE 0.775 0.000 0.000 NA   NA
 5514195 5514196 PXO_00630 PXO_00629     TRUE 0.909 147.000 0.514 NA   NA
 5514196 5514197 PXO_00629 PXO_05830   arsR FALSE 0.273 66.000 0.000 1.000   NA
 5514197 5514198 PXO_05830 PXO_00628 arsR   TRUE 0.799 -3.000 0.000 NA N NA
 5514198 5514199 PXO_00628 PXO_00627     FALSE 0.501 11.000 0.000 NA N NA
 5514199 5514200 PXO_00627 PXO_00626   arsH TRUE 0.978 -3.000 0.139 NA   NA
 5514200 5514201 PXO_00626 PXO_00625 arsH   TRUE 0.776 19.000 0.056 NA   NA
 5514201 5514202 PXO_00625 PXO_00624     FALSE 0.009 638.000 0.000 1.000   NA
 5514202 5514203 PXO_00624 PXO_00623     TRUE 0.644 10.000 0.000 1.000   NA
 5514203 5514204 PXO_00623 PXO_00622     FALSE 0.255 103.000 0.000 NA   NA
 5514204 5514205 PXO_00622 PXO_05831     FALSE 0.005 692.000 0.000 NA   NA
 5514205 5514206 PXO_05831 PXO_05595     FALSE 0.430 13.000 0.000 NA   NA
 5514206 5514207 PXO_05595 PXO_00621     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5514208 5514209 PXO_00620 PXO_00619     FALSE 0.127 215.000 0.000 NA   NA
 5514210 5514211 PXO_rna20 PXO_00618     FALSE 0.198 43.000 0.000 NA   NA
 5514211 5514212 PXO_00618 PXO_00617     FALSE 0.051 291.000 0.000 NA   NA
 5514212 5514213 PXO_00617 PXO_05596     FALSE 0.091 243.000 0.000 NA   NA
 5514213 5514214 PXO_05596 PXO_00615     TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5514215 5514216 PXO_00614 PXO_00613     FALSE 0.195 64.000 0.000 NA   NA
 5514216 5514217 PXO_00613 PXO_00612     FALSE 0.253 137.000 0.000 NA   NA
 5514217 5514218 PXO_00612 PXO_00611   edd TRUE 0.944 56.000 0.523 1.000 Y NA
 5514218 5514219 PXO_00611 PXO_00610 edd pgl TRUE 0.918 103.000 0.202 1.000 Y NA
 5514219 5514220 PXO_00610 PXO_00609 pgl glk TRUE 0.981 -3.000 0.021 1.000 Y NA
 5514220 5514221 PXO_00609 PXO_00608 glk zwf TRUE 0.906 18.000 0.055 1.000 Y NA
 5514221 5514222 PXO_00608 PXO_05597 zwf   FALSE 0.089 244.000 0.000 NA   NA
 5514225 5514226 PXO_00605 PXO_00604   sdhC TRUE 0.551 99.000 0.016 NA   NA
 5514226 5514227 PXO_00604 PXO_00603 sdhC sdhD TRUE 0.996 -3.000 0.291 0.001 Y NA
 5514227 5514228 PXO_00603 PXO_00602 sdhD sdhA TRUE 0.974 35.000 0.705 0.001 Y NA
 5514228 5514229 PXO_00602 PXO_00601 sdhA   TRUE 0.829 4.000 0.004 NA   NA
 5514229 5514230 PXO_00601 PXO_00600     TRUE 0.573 17.000 0.004 NA   NA
 5514230 5514231 PXO_00600 PXO_00599     TRUE 0.798 111.000 0.151 NA   NA
 5514231 5514232 PXO_00599 PXO_00598     FALSE 0.470 56.000 0.016 NA   NA
 5514232 5514233 PXO_00598 PXO_00597     TRUE 0.727 15.000 0.020 NA   NA
 5514233 5514234 PXO_00597 PXO_00596   lolD TRUE 0.970 17.000 0.620 0.034 N NA
 5514234 5514235 PXO_00596 PXO_00594 lolD   TRUE 0.745 1.000 0.000 NA   NA
 5514236 5514237 PXO_00595 PXO_00593     FALSE 0.281 25.000 0.000 NA   NA
 5514237 5514238 PXO_00593 PXO_00592     FALSE 0.220 157.000 0.000 NA   NA
 5514239 5514240 PXO_00591 PXO_00590     TRUE 0.708 29.000 0.045 1.000   NA
 5514240 5514241 PXO_00590 PXO_00589     TRUE 0.996 4.000 0.746 0.034 Y NA
 5514241 5514242 PXO_00589 PXO_00588   msbA TRUE 0.730 57.000 0.120 1.000 N NA
 5514242 5514243 PXO_00588 PXO_00587 msbA lpxK TRUE 0.985 -3.000 0.205 1.000 N NA
 5514245 5514246 PXO_00585 PXO_00584 kdsB   TRUE 0.968 -3.000 0.050 1.000 N NA
 5514246 5514247 PXO_00584 PXO_00583     FALSE 0.510 24.000 0.006 NA   NA
 5514247 5514248 PXO_00583 PXO_00582   uvrC TRUE 0.902 -3.000 0.004 NA   NA
 5514248 5514249 PXO_00582 PXO_00581 uvrC pgsA TRUE 0.984 0.000 0.227 1.000 N NA
 5514249 5514250 PXO_00581 PXO_rna21 pgsA   FALSE 0.214 37.000 0.000 NA   NA
 5514250 5514251 PXO_rna21 PXO_rna22     FALSE 0.204 69.000 0.000 NA   NA
 5514251 5514252 PXO_rna22 PXO_rna23     FALSE 0.228 83.000 0.000 NA   NA
 5514253 5514254 PXO_00580 PXO_00579     FALSE 0.281 167.000 0.000 1.000   NA
 5514255 5514256 PXO_00578 PXO_00577   rhsS FALSE 0.004 900.000 0.000 NA N NA
 5514256 5514257 PXO_00577 PXO_00576 rhsS rhsD TRUE 0.953 -3.000 0.000 NA Y NA
 5514258 5514259 PXO_00575 PXO_00574     TRUE 0.723 22.000 0.000 1.000 Y NA
 5514259 5514260 PXO_00574 PXO_00573     TRUE 0.988 -3.000 0.308 NA   NA
 5514260 5514261 PXO_00573 PXO_00572   pthXo6 FALSE 0.120 219.000 0.000 NA   NA
 5514262 5514263 PXO_05600 PXO_05601     FALSE 0.265 -28.000 0.000 NA   NA
 5514263 5514264 PXO_05601 PXO_00569     FALSE 0.003 938.000 0.000 NA   NA
 5514265 5514266 PXO_00568 PXO_00567   talC5a FALSE 0.064 269.000 0.000 NA   NA
 5514267 5514268 PXO_05602 PXO_05603     FALSE 0.265 -28.000 0.000 NA   NA
 5514270 5514271 PXO_05605 PXO_00564     FALSE 0.048 295.000 0.000 NA   NA
 5514271 5514272 PXO_00564 PXO_00563     TRUE 0.947 105.000 0.750 1.000   NA
 5514272 5514273 PXO_00563 PXO_00562     TRUE 0.683 4.000 0.000 NA   NA
 5514273 5514274 PXO_00562 PXO_00561     FALSE 0.094 241.000 0.000 NA   NA
 5514274 5514275 PXO_00561 PXO_00560     FALSE 0.004 776.000 0.000 NA   NA
 5514275 5514276 PXO_00560 PXO_00558     FALSE 0.037 319.000 0.000 NA   NA
 5514277 5514278 PXO_00557 PXO_00556