MicrobesOnline Operon Predictions for Leptospira biflexa serovar Patoc strain 'Patoc 1 (Ames)'

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

<
 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 5508324 5508325 LBF_0002 LBF_0003 ilvE dnaX-1 TRUE 0.931 7.000 0.005 1.000   NA
 5508325 5508326 LBF_0003 LBF_0004 dnaX-1 dnaA FALSE 0.008 281.000 0.000 1.000   NA
 5508326 5508327 LBF_0004 LBF_0005 dnaA dnaN FALSE 0.234 247.000 0.328 1.000 Y NA
 5508327 5508328 LBF_0005 LBF_0006 dnaN recF TRUE 0.992 0.000 0.318 1.000 Y NA
 5508328 5508329 LBF_0006 LBF_0007 recF   TRUE 0.968 -3.000 0.089 NA   NA
 5508329 5508330 LBF_0007 LBF_0008   gyrB FALSE 0.474 79.000 0.028 NA   NA
 5508330 5508331 LBF_0008 LBF_0009 gyrB gyrA TRUE 0.969 20.000 0.306 0.002 Y NA
 5508331 5508332 LBF_0009 LBF_0010 gyrA   TRUE 0.820 14.000 0.003 1.000 N NA
 5508332 5508333 LBF_0010 LBF_0011     FALSE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 5508335 5508336 LBF_0013 LBF_0014     TRUE 0.658 -19.000 0.000 NA   NA
 5508337 5508338 LBF_0015 LBF_0016 holA   FALSE 0.006 266.000 0.000 NA N NA
 5508339 5508340 LBF_0017 LBF_0018     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508340 5508341 LBF_0018 LBF_0019     TRUE 0.880 12.000 0.006 NA N NA
 5508344 5508345 LBF_0022 LBF_0023 vacB   TRUE 0.923 5.000 0.003 1.000 N NA
 5508345 5508346 LBF_0023 LBF_0024     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508346 5508347 LBF_0024 LBF_0025     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508348 5508349 LBF_0026 LBF_0027 lacA   FALSE 0.369 22.000 0.000 NA   NA
 5508349 5508350 LBF_0027 LBF_0028     TRUE 0.896 11.000 0.005 NA   NA
 5508350 5508351 LBF_0028 LBF_0029   sodA FALSE 0.040 107.000 0.000 1.000 N NA
 5508351 5508352 LBF_0029 LBF_0030 sodA trpE FALSE 0.060 89.000 0.000 1.000 N NA
 5508352 5508353 LBF_0030 LBF_0031 trpE trpG TRUE 0.980 12.000 0.063 0.001 Y NA
 5508354 5508355 LBF_0032 LBF_0033     FALSE 0.653 -25.000 0.000 NA   NA
 5508358 5508359 LBF_0036 LBF_0037     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508359 5508360 LBF_0037 LBF_0038     FALSE 0.652 -28.000 0.000 NA   NA
 5508362 5508363 LBF_0040 LBF_0041 add   FALSE 0.224 40.000 0.000 NA   NA
 5508364 5508365 LBF_0042 LBF_0043     FALSE 0.080 81.000 0.000 NA   NA
 5508365 5508366 LBF_0043 LBF_0044     FALSE 0.340 24.000 0.000 NA   NA
 5508367 5508368 LBF_0045 LBF_0046     FALSE 0.199 44.000 0.000 NA   NA
 5508369 5508370 LBF_0047 LBF_0048     FALSE 0.003 672.000 0.000 1.000 N NA
 5508370 5508371 LBF_0048 LBF_0049   purB FALSE 0.004 447.000 0.000 1.000 N NA
 5508373 5508374 LBF_0051 LBF_0052   caiD-3 FALSE 0.066 95.000 0.000 1.000   NA
 5508374 5508375 LBF_0052 LBF_0053 caiD-3   FALSE 0.033 117.000 0.000 1.000 N NA
 5508375 5508376 LBF_0053 LBF_0054     TRUE 0.898 8.000 0.000 NA Y NA
 5508379 5508380 LBF_0057 LBF_0058   trpG-1 FALSE 0.138 57.000 0.000 1.000 N NA
 5508380 5508381 LBF_0058 LBF_0059 trpG-1   TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5508381 5508382 LBF_0059 LBF_0060     TRUE 0.743 -3.000 0.000 1.000   NA
 5508385 5508386 LBF_0063 LBF_0064   thrA TRUE 0.693 5.000 0.000 1.000 N NA
 5508390 5508391 LBF_0068 LBF_0069     FALSE 0.216 38.000 0.000 1.000 N NA
 5508391 5508392 LBF_0069 LBF_0070     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5508394 5508395 LBF_0072 LBF_0073   galK TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5508397 5508398 LBF_0075 LBF_0076     TRUE 0.968 -3.000 0.642 NA   NA
 5508398 5508399 LBF_0076 LBF_0077     FALSE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 5508399 5508400 LBF_0077 LBF_0078     TRUE 0.928 -13.000 0.000 0.029 Y NA
 5508404 5508405 LBF_0082 LBF_0083   ispA-1 TRUE 0.917 -19.000 0.005 1.000 N NA
 5508405 5508406 LBF_0083 LBF_0084 ispA-1 ndk FALSE 0.144 54.000 0.000 1.000 N NA
 5508406 5508407 LBF_0084 LBF_0085 ndk   FALSE 0.188 43.000 0.000 1.000 N NA
 5508407 5508408 LBF_0085 LBF_0086   coaD FALSE 0.404 18.000 0.000 1.000 N NA
 5508408 5508409 LBF_0086 LBF_0087 coaD argG TRUE 0.941 2.000 0.003 1.000 N NA
 5508410 5508411 LBF_0088 LBF_0089     TRUE 0.663 -16.000 0.000 NA   NA
 5508411 5508412 LBF_0089 LBF_0090     TRUE 0.976 2.000 0.068 NA   NA
 5508413 5508414 LBF_0091 LBF_0092 trmA-2 pyrD TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5508415 5508416 LBF_0093 LBF_0094     TRUE 0.940 -3.000 0.000 0.042 Y NA
 5508417 5508418 LBF_0095 LBF_0096     TRUE 0.705 -10.000 0.000 1.000   NA
 5508418 5508419 LBF_0096 LBF_0097     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508419 5508420 LBF_0097 LBF_0098     TRUE 0.686 -6.000 0.000 NA   NA
 5508423 5508424 LBF_0101 LBF_0102     TRUE 0.954 -7.000 0.886 NA   NA
 5508424 5508425 LBF_0102 LBF_0103     TRUE 0.799 2.000 0.000 1.000   NA
 5508425 5508426 LBF_0103 LBF_0104     TRUE 0.802 1.000 0.000 1.000   NA
 5508426 5508427 LBF_0104 LBF_0105     TRUE 0.755 2.000 0.000 1.000 N NA
 5508427 5508428 LBF_0105 LBF_0106     FALSE 0.623 11.000 0.000 1.000   NA
 5508428 5508429 LBF_0106 LBF_0107     TRUE 0.753 9.000 0.000 0.074   NA
 5508429 5508430 LBF_0107 LBF_0108     TRUE 0.887 12.000 0.000 0.041 Y NA
 5508430 5508431 LBF_0108 LBF_0109     TRUE 0.740 3.000 0.000 1.000 N NA
 5508431 5508432 LBF_0109 LBF_0110     FALSE 0.291 29.000 0.000 NA   NA
 5508433 5508434 LBF_0111 LBF_0112     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508434 5508435 LBF_0112 LBF_0113     FALSE 0.603 -13.000 0.000 NA N NA
 5508435 5508436 LBF_0113 LBF_0114     TRUE 0.799 2.000 0.000 1.000   NA
 5508436 5508437 LBF_0114 LBF_0115     FALSE 0.098 73.000 0.000 NA   NA
 5508437 5508438 LBF_0115 LBF_0116     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508440 5508441 LBF_0118 LBF_0119     FALSE 0.556 12.000 0.000 NA   NA
 5508443 5508444 LBF_0121 LBF_0122 folA   FALSE 0.172 49.000 0.000 NA   NA
 5508445 5508446 LBF_0123 LBF_0124     FALSE 0.005 369.000 0.000 NA   NA
 5508446 5508447 LBF_0124 LBF_0125     TRUE 0.668 -13.000 0.000 NA   NA
 5508449 5508450 LBF_0127 LBF_0128     FALSE 0.024 152.000 0.000 NA   NA
 5508450 5508451 LBF_0128 LBF_0129     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5508455 5508456 LBF_0133 LBF_0134     FALSE 0.451 92.000 0.600 NA   NA
 5508456 5508457 LBF_0134 LBF_0135   motB-2 TRUE 0.965 -3.000 0.750 NA   NA
 5508457 5508458 LBF_0135 LBF_0136 motB-2   FALSE 0.106 71.000 0.000 NA   NA
 5508458 5508459 LBF_0136 LBF_0137     FALSE 0.035 119.000 0.000 NA   NA
 5508460 5508461 LBF_0138 LBF_0139   glpF FALSE 0.036 129.000 0.000 1.000   NA
 5508462 5508463 LBF_0140 LBF_0141 sfcA   FALSE 0.027 142.000 0.000 NA   NA
 5508463 5508464 LBF_0141 LBF_0142     FALSE 0.008 256.000 0.000 NA   NA
 5508465 5508466 LBF_0143 LBF_0144     TRUE 0.975 2.000 0.047 1.000   NA
 5508466 5508467 LBF_0144 LBF_0145     TRUE 0.992 2.000 0.047 0.024 Y NA
 5508467 5508468 LBF_0145 LBF_0146   tolQ TRUE 0.948 23.000 0.044 0.035 Y NA
 5508468 5508469 LBF_0146 LBF_0147 tolQ   FALSE 0.063 86.000 0.000 1.000 N NA
 5508469 5508470 LBF_0147 LBF_0148   trkA TRUE 0.905 8.000 0.000 1.000 Y NA
 5508470 5508471 LBF_0148 LBF_0149 trkA trkG-1 TRUE 0.993 3.000 0.330 0.007 Y NA
 5508471 5508472 LBF_0149 LBF_0150 trkG-1   TRUE 0.959 -3.000 0.026 NA   NA
 5508472 5508473 LBF_0150 LBF_0151     TRUE 0.771 31.000 1.000 NA   NA
 5508474 5508475 LBF_0152 LBF_0153 norM   FALSE 0.500 16.000 0.000 1.000   NA
 5508476 5508477 LBF_0154 LBF_0155     TRUE 0.891 16.000 0.026 NA   NA
 5508477 5508478 LBF_0155 LBF_0156     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508479 5508480 LBF_0157 LBF_0158     FALSE 0.618 10.000 0.000 NA   NA
 5508481 5508482 LBF_0159 LBF_0160     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508484 5508485 LBF_0162 LBF_0163     FALSE 0.172 49.000 0.000 NA   NA
 5508485 5508486 LBF_0163 LBF_0164     FALSE 0.086 79.000 0.000 NA   NA
 5508486 5508487 LBF_0164 LBF_0165     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5508487 5508488 LBF_0165 LBF_0166     FALSE 0.194 45.000 0.000 NA   NA
 5508488 5508489 LBF_0166 LBF_0167   rnd TRUE 0.960 0.000 0.006 1.000   NA
 5508490 5508491 LBF_0168 LBF_0169 purF ptpS TRUE 0.749 0.000 0.000 1.000 N NA
 5508491 5508492 LBF_0169 LBF_0170 ptpS   TRUE 0.971 1.000 0.021 1.000   NA
 5508492 5508493 LBF_0170 LBF_0171     FALSE 0.482 17.000 0.000 1.000   NA
 5508493 5508494 LBF_0171 LBF_0172     FALSE 0.136 62.000 0.000 NA   NA
 5508494 5508495 LBF_0172 LBF_0173     FALSE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 5508495 5508496 LBF_0173 LBF_0174     FALSE 0.015 194.000 0.000 NA   NA
 5508496 5508497 LBF_0174 LBF_0175     FALSE 0.007 289.000 0.000 NA   NA
 5508497 5508498 LBF_0175 LBF_0176   pntB TRUE 0.982 0.000 0.065 0.001   NA
 5508498 5508499 LBF_0176 LBF_0177 pntB   FALSE 0.529 12.000 0.000 1.000 N NA
 5508500 5508501 LBF_0178 LBF_0179     TRUE 0.799 2.000 0.000 1.000   NA
 5508501 5508502 LBF_0179 LBF_0180     TRUE 0.963 -25.000 0.500 1.000   NA
 5508502 5508503 LBF_0180 LBF_0181     TRUE 0.980 0.000 0.286 1.000   NA
 5508503 5508504 LBF_0181 LBF_0182   lysC FALSE 0.560 13.000 0.000 1.000   NA
 5508506 5508507 LBF_0184 LBF_0185     TRUE 0.965 3.000 1.000 NA   NA
 5508507 5508508 LBF_0185 LBF_0186     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508508 5508509 LBF_0186 LBF_0187     TRUE 0.957 -10.000 0.035 1.000   NA
 5508510 5508511 LBF_0188 LBF_0189     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5508511 5508512 LBF_0189 LBF_0190   flbD FALSE 0.306 22.000 0.000 NA N NA
 5508512 5508513 LBF_0190 LBF_0191 flbD motA-1 TRUE 0.990 4.000 0.301 NA Y NA
 5508513 5508514 LBF_0191 LBF_0192 motA-1 motB-1 TRUE 0.983 10.000 0.383 1.000 Y NA
 5508514 5508515 LBF_0192 LBF_0193 motB-1 fliL TRUE 0.991 2.000 0.115 1.000 Y NA
 5508515 5508516 LBF_0193 LBF_0194 fliL kdsB-1 TRUE 0.950 6.000 0.020 1.000 N NA
 5508517 5508518 LBF_0195 LBF_0196     FALSE 0.080 78.000 0.000 1.000 N NA
 5508518 5508519 LBF_0196 LBF_0197     TRUE 0.987 -3.000 0.714 1.000 Y NA
 5508519 5508520 LBF_0197 LBF_0198     TRUE 0.964 7.000 0.351 1.000 N NA
 5508520 5508521 LBF_0198 LBF_0199     FALSE 0.500 24.000 0.000 0.006   NA
 5508522 5508523 LBF_0200 LBF_0201     FALSE 0.096 74.000 0.000 NA   NA
 5508523 5508524 LBF_0201 LBF_0202     FALSE 0.089 78.000 0.000 NA   NA
 5508527 5508528 LBF_0205 LBF_0206     FALSE 0.009 244.000 0.000 NA   NA
 5508528 5508529 LBF_0206 LBF_0207     TRUE 0.668 -13.000 0.000 NA   NA
 5508530 5508531 LBF_0208 LBF_0209     FALSE 0.009 246.000 0.000 NA   NA
 5508532 5508533 LBF_0210 LBF_0211   lig FALSE 0.143 60.000 0.000 NA   NA
 5508533 5508534 LBF_0211 LBF_0212 lig   TRUE 0.946 1.000 0.003 1.000 N NA
 5508535 5508536 LBF_0213 LBF_0214     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508536 5508537 LBF_0214 LBF_0215     FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 5508539 5508540 LBF_0217 LBF_0218     TRUE 0.786 3.000 0.000 1.000   NA
 5508540 5508541 LBF_0218 LBF_0219     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508541 5508542 LBF_0219 LBF_0220     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508544 5508545 LBF_0222 LBF_0223     FALSE 0.172 49.000 0.000 NA   NA
 5508545 5508546 LBF_0223 LBF_0224     FALSE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 5508547 5508548 LBF_0225 LBF_0226     TRUE 0.955 0.000 0.006 NA   NA
 5508548 5508549 LBF_0226 LBF_0227   pth-2 TRUE 0.658 28.000 0.003 1.000 N NA
 5508549 5508550 LBF_0227 LBF_0228 pth-2 rplY TRUE 0.965 20.000 0.496 0.029 Y NA
 5508550 5508551 LBF_0228 LBF_0229 rplY prsA TRUE 0.811 18.000 0.005 1.000 N NA
 5508551 5508552 LBF_0229 LBF_0230 prsA glmU TRUE 0.969 -3.000 0.077 1.000   NA
 5508552 5508553 LBF_0230 LBF_0231 glmU   FALSE 0.299 28.000 0.000 NA   NA
 5508553 5508554 LBF_0231 LBF_0232   ispE TRUE 0.716 5.000 0.000 NA   NA
 5508554 5508555 LBF_0232 LBF_0233 ispE   TRUE 0.722 2.000 0.000 NA N NA
 5508555 5508556 LBF_0233 LBF_0234   fabD TRUE 0.715 0.000 0.000 NA N NA
 5508556 5508557 LBF_0234 LBF_0235 fabD   FALSE 0.036 118.000 0.000 NA   NA
 5508558 5508559 LBF_0236 LBF_0237     FALSE 0.080 81.000 0.000 NA   NA
 5508560 5508561 LBF_0238 LBF_0239     TRUE 0.681 -43.000 0.000 1.000   NA
 5508561 5508562 LBF_0239 LBF_0240     FALSE 0.009 262.000 0.000 1.000   NA
 5508562 5508563 LBF_0240 LBF_0241     FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 5508563 5508564 LBF_0241 LBF_0242     FALSE 0.262 34.000 0.000 NA   NA
 5508565 5508566 LBF_0243 LBF_0244 valS purD TRUE 0.898 -16.000 0.003 1.000 N NA
 5508566 5508567 LBF_0244 LBF_0245 purD   TRUE 0.943 1.000 0.003 NA   NA
 5508567 5508568 LBF_0245 LBF_0246   prfB TRUE 0.702 24.000 0.002 NA   NA
 5508568 5508569 LBF_0246 LBF_0247 prfB   TRUE 0.693 5.000 0.000 1.000 N NA
 5508569 5508570 LBF_0247 LBF_0248     FALSE 0.119 63.000 0.000 1.000 N NA
 5508571 5508572 LBF_0249 LBF_0250   pBP3 TRUE 0.975 1.000 0.058 NA   NA
 5508572 5508573 LBF_0250 LBF_0251 pBP3 lepB-1 TRUE 0.740 3.000 0.000 1.000 N NA
 5508574 5508575 LBF_0252 LBF_0253 thrC   FALSE 0.551 51.000 0.005 NA   NA
 5508575 5508576 LBF_0253 LBF_0254     TRUE 0.957 -3.000 1.000 NA   NA
 5508578 5508579 LBF_0256 LBF_0257     TRUE 0.968 -3.000 0.245 NA N NA
 5508580 5508581 LBF_0258 LBF_0259     FALSE 0.141 65.000 0.000 1.000   NA
 5508582 5508583 LBF_0260 LBF_0261 dnaC folK TRUE 0.693 5.000 0.000 1.000 N NA
 5508583 5508584 LBF_0261 LBF_0262 folK panB TRUE 0.984 -25.000 0.117 1.000 Y NA
 5508585 5508586 LBF_0263 LBF_0264 aroG   TRUE 0.705 3.000 0.000 NA N NA
 5508586 5508587 LBF_0264 LBF_0265     TRUE 0.977 0.000 0.500 NA   NA
 5508587 5508588 LBF_0265 LBF_0266     TRUE 0.691 50.000 0.750 NA   NA
 5508591 5508592 LBF_0269 LBF_0270     TRUE 0.658 -19.000 0.000 NA   NA
 5508592 5508593 LBF_0270 LBF_0271     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 5508593 5508594 LBF_0271 LBF_0272     FALSE 0.148 58.000 0.000 NA   NA
 5508596 5508597 LBF_0274 LBF_0275     FALSE 0.106 62.000 0.000 NA N NA
 5508599 5508600 LBF_0277 LBF_0278     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 5508601 5508602 LBF_0279 LBF_0280     FALSE 0.093 76.000 0.000 NA   NA
 5508602 5508603 LBF_0280 LBF_0281   trmE FALSE 0.078 82.000 0.000 NA   NA
 5508603 5508604 LBF_0281 LBF_0282 trmE   TRUE 0.967 -7.000 0.116 1.000   NA
 5508604 5508605 LBF_0282 LBF_0283   yidC TRUE 0.856 29.000 0.254 1.000   NA
 5508605 5508606 LBF_0283 LBF_3372 yidC   TRUE 0.974 4.000 0.461 NA   NA
 5508607 5508608 LBF_0284 LBF_0285   mltA FALSE 0.277 31.000 0.000 NA   NA
 5508610 5508611 LBF_0287 LBF_0288   gst-6 TRUE 0.663 -16.000 0.000 NA   NA
 5508612 5508613 LBF_0289 LBF_0290 czcD-1   FALSE 0.027 131.000 0.000 1.000 N NA
 5508615 5508616 LBF_0292 LBF_0293     FALSE 0.352 23.000 0.000 NA   NA
 5508616 5508617 LBF_0293 LBF_0294     TRUE 0.674 -10.000 0.000 NA   NA
 5508617 5508618 LBF_0294 LBF_0295     FALSE 0.074 84.000 0.000 NA   NA
 5508618 5508619 LBF_0295 LBF_0296     FALSE 0.652 10.000 0.000 1.000   NA
 5508619 5508620 LBF_0296 LBF_0297   pheT FALSE 0.163 48.000 0.000 1.000 N NA
 5508620 5508621 LBF_0297 LBF_0298 pheT   FALSE 0.188 43.000 0.000 1.000 N NA
 5508621 5508622 LBF_0298 LBF_0299     FALSE 0.649 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5508622 5508623 LBF_0299 LBF_0300   recQ-1 FALSE 0.021 154.000 0.000 1.000 N NA
 5508624 5508625 LBF_0301 LBF_0302     TRUE 0.966 -10.000 0.273 NA   NA
 5508625 5508626 LBF_0302 LBF_0303     FALSE 0.143 60.000 0.000 NA   NA
 5508626 5508627 LBF_0303 LBF_0304     FALSE 0.004 401.000 0.000 NA   NA
 5508627 5508628 LBF_0304 LBF_0305   ftsQ FALSE 0.040 113.000 0.000 NA   NA
 5508628 5508629 LBF_0305 LBF_0306 ftsQ ftsA TRUE 0.976 2.000 0.389 NA N NA
 5508629 5508630 LBF_0306 LBF_0307 ftsA ftsZ TRUE 0.980 11.000 0.460 1.000 Y NA
 5508631 5508632 LBF_0308 LBF_0309     FALSE 0.446 17.000 0.000 NA   NA
 5508632 5508633 LBF_0309 LBF_0310     FALSE 0.251 36.000 0.000 NA   NA
 5508634 5508635 LBF_0311 LBF_0312   nadA FALSE 0.401 20.000 0.000 NA   NA
 5508635 5508636 LBF_0312 LBF_0313 nadA ispF TRUE 0.755 2.000 0.000 1.000 N NA
 5508638 5508639 LBF_0315 LBF_0316     TRUE 0.699 -13.000 0.000 1.000   NA
 5508639 5508640 LBF_0316 LBF_0317     TRUE 0.974 4.000 0.097 1.000   NA
 5508640 5508641 LBF_0317 LBF_0318     TRUE 0.974 -3.000 0.742 0.023   NA
 5508641 5508642 LBF_0318 LBF_0319     TRUE 0.966 -3.000 0.046 1.000   NA
 5508642 5508643 LBF_0319 LBF_0320     TRUE 0.988 -7.000 0.046 0.001 Y NA
 5508643 5508644 LBF_0320 LBF_0321     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 5508645 5508646 LBF_0322 LBF_0323     FALSE 0.498 14.000 0.000 NA   NA
 5508646 5508647 LBF_0323 LBF_0324     FALSE 0.043 115.000 0.000 1.000   NA
 5508647 5508648 LBF_0324 LBF_0325     TRUE 0.942 -64.000 1.000 NA   NA
 5508649 5508650 LBF_0326 LBF_0327 fadD caiD-2 TRUE 0.857 2.000 0.000 0.039   NA
 5508650 5508651 LBF_0327 LBF_0328 caiD-2   TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508651 5508652 LBF_0328 LBF_0329     FALSE 0.026 144.000 0.000 NA   NA
 5508652 5508653 LBF_0329 LBF_0330     TRUE 0.974 4.000 0.144 NA   NA
 5508653 5508654 LBF_0330 LBF_0331   map-1 TRUE 0.802 1.000 0.000 1.000   NA
 5508654 5508655 LBF_0331 LBF_0332 map-1   FALSE 0.022 160.000 0.000 NA   NA
 5508655 5508656 LBF_0332 LBF_0333     FALSE 0.035 119.000 0.000 NA   NA
 5508658 5508659 LBF_0335 LBF_0336     TRUE 0.968 1.000 1.000 NA   NA
 5508659 5508660 LBF_0336 LBF_0337     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5508660 5508661 LBF_0337 LBF_0338     TRUE 0.956 6.000 0.028 NA   NA
 5508661 5508662 LBF_0338 LBF_0339     FALSE 0.517 15.000 0.000 1.000   NA
 5508663 5508664 LBF_0340 LBF_0341 galE lpxA TRUE 0.985 -3.000 0.028 1.000 Y NA
 5508667 5508668 LBF_0344 LBF_0345 paaJ-4   TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5508668 5508669 LBF_0345 LBF_0346     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5508669 5508670 LBF_0346 LBF_0347     TRUE 0.914 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5508670 5508671 LBF_0347 LBF_0348     TRUE 0.940 3.000 0.000 1.000 Y NA
 5508671 5508672 LBF_0348 LBF_0349     TRUE 0.720 9.000 0.000 0.034 N NA
 5508673 5508674 LBF_0350 LBF_0351     FALSE 0.651 -30.000 0.000 NA   NA
 5508674 5508675 LBF_0351 LBF_0352     FALSE 0.242 37.000 0.000 NA   NA
 5508675 5508676 LBF_0352 LBF_0353     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508676 5508677 LBF_0353 LBF_0354   paiB FALSE 0.112 73.000 0.000 1.000   NA
 5508677 5508678 LBF_0354 LBF_0355 paiB   FALSE 0.330 28.000 0.000 1.000   NA
 5508678 5508679 LBF_0355 LBF_0356     TRUE 0.658 -19.000 0.000 NA   NA
 5508679 5508680 LBF_0356 LBF_0357   dinB TRUE 0.663 -16.000 0.000 NA   NA
 5508680 5508681 LBF_0357 LBF_0358 dinB   FALSE 0.083 80.000 0.000 NA   NA
 5508681 5508682 LBF_0358 LBF_0359     FALSE 0.512 72.000 0.041 NA N NA
 5508682 5508683 LBF_0359 LBF_0360     FALSE 0.086 79.000 0.000 NA   NA
 5508683 5508684 LBF_0360 LBF_0361     FALSE 0.025 151.000 0.000 NA   NA
 5508684 5508685 LBF_0361 LBF_0362     FALSE 0.618 10.000 0.000 NA   NA
 5508685 5508686 LBF_0362 LBF_0363     FALSE 0.022 160.000 0.000 NA   NA
 5508686 5508687 LBF_0363 LBF_0364     FALSE 0.291 29.000 0.000 NA   NA
 5508687 5508688 LBF_0364 LBF_0365     FALSE 0.043 108.000 0.000 NA   NA
 5508688 5508689 LBF_0365 LBF_0366     FALSE 0.080 81.000 0.000 NA   NA
 5508689 5508690 LBF_0366 LBF_0367     TRUE 0.970 -3.000 0.133 NA   NA
 5508690 5508691 LBF_0367 LBF_0368     TRUE 0.957 -3.000 0.867 NA N NA
 5508691 5508692 LBF_0368 LBF_0369     TRUE 0.878 23.000 0.406 NA   NA
 5508692 5508693 LBF_0369 LBF_0370     TRUE 0.966 -10.000 0.254 NA   NA
 5508693 5508694 LBF_0370 LBF_0371   nosZ TRUE 0.969 6.000 0.281 NA   NA
 5508694 5508695 LBF_0371 LBF_0372 nosZ   TRUE 0.947 9.000 0.012 0.054   NA
 5508695 5508696 LBF_0372 LBF_0373     FALSE 0.348 26.000 0.000 1.000   NA
 5508698 5508699 LBF_0375 LBF_0376     TRUE 0.852 4.000 0.000 0.002   NA
 5508699 5508700 LBF_0376 LBF_0377     FALSE 0.560 20.000 0.000 0.013   NA
 5508700 5508701 LBF_0377 LBF_0378   fadL FALSE 0.623 11.000 0.000 1.000   NA
 5508701 5508702 LBF_0378 LBF_0379 fadL   FALSE 0.178 48.000 0.000 NA   NA
 5508703 5508704 LBF_0380 LBF_0381     FALSE 0.064 91.000 0.000 NA   NA
 5508706 5508707 LBF_0383 LBF_0384     TRUE 0.986 5.000 0.776 1.000 Y NA
 5508707 5508708 LBF_0384 LBF_0385     FALSE 0.561 75.000 0.311 NA N NA
 5508710 5508711 LBF_0387 LBF_0388     FALSE 0.026 144.000 0.000 NA   NA
 5508714 5508715 LBF_0391 LBF_0392     FALSE 0.148 58.000 0.000 NA   NA
 5508715 5508716 LBF_0392 LBF_0393     FALSE 0.352 23.000 0.000 NA   NA
 5508716 5508717 LBF_0393 LBF_0394   folA-1 TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5508717 5508718 LBF_0394 LBF_0395 folA-1   FALSE 0.024 154.000 0.000 NA   NA
 5508718 5508719 LBF_0395 LBF_0396     FALSE 0.083 80.000 0.000 NA   NA
 5508720 5508721 LBF_0397 LBF_0398     FALSE 0.271 32.000 0.000 NA   NA
 5508721 5508722 LBF_0398 LBF_0399     FALSE 0.017 183.000 0.000 NA   NA
 5508723 5508724 LBF_0400 LBF_0401     FALSE 0.016 186.000 0.000 NA   NA
 5508724 5508725 LBF_0401 LBF_0402     FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 5508725 5508726 LBF_0402 LBF_0403     FALSE 0.194 45.000 0.000 NA   NA
 5508726 5508727 LBF_0403 LBF_0404     FALSE 0.015 195.000 0.000 NA   NA
 5508727 5508728 LBF_0404 LBF_0405     FALSE 0.034 122.000 0.000 NA   NA
 5508729 5508730 LBF_0406 LBF_0407     FALSE 0.006 299.000 0.000 NA   NA
 5508731 5508732 LBF_0408 LBF_0409     FALSE 0.003 628.000 0.000 NA   NA
 5508734 5508735 LBF_0411 LBF_0412     TRUE 0.966 -7.000 0.449 NA   NA
 5508737 5508738 LBF_0414 LBF_0415     FALSE 0.074 84.000 0.000 NA   NA
 5508738 5508739 LBF_0415 LBF_0416   mreB-1 FALSE 0.030 132.000 0.000 NA   NA
 5508740 5508741 LBF_0417 LBF_0418     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5508742 5508743 LBF_0419 LBF_0420     FALSE 0.386 21.000 0.000 NA   NA
 5508743 5508744 LBF_0420 LBF_0421     TRUE 0.962 4.000 1.000 NA   NA
 5508744 5508745 LBF_0421 LBF_0422     FALSE 0.004 417.000 0.000 NA   NA
 5508746 5508747 LBF_0423 LBF_0424     FALSE 0.524 13.000 0.000 NA   NA
 5508747 5508748 LBF_0424 LBF_0425     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508749 5508750 LBF_0426 LBF_0427   mreB FALSE 0.003 954.000 0.000 1.000   NA
 5508751 5508752 LBF_0428 LBF_0429 gppA   TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508752 5508753 LBF_0429 LBF_0430     FALSE 0.029 134.000 0.000 NA   NA
 5508754 5508755 LBF_0431 LBF_0432 pepB bcp TRUE 0.928 -3.000 0.004 1.000 N NA
 5508756 5508757 LBF_0433 LBF_0434     FALSE 0.291 29.000 0.000 NA   NA
 5508758 5508759 LBF_0435 LBF_0436     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5508760 5508761 LBF_0437 LBF_0438 sppA-3   TRUE 0.955 -3.000 0.018 NA   NA
 5508761 5508762 LBF_0438 LBF_0439   surE TRUE 0.965 1.000 0.013 NA   NA
 5508762 5508763 LBF_0439 LBF_0440 surE   TRUE 0.786 3.000 0.000 1.000   NA
 5508763 5508764 LBF_0440 LBF_0441     FALSE 0.143 60.000 0.000 NA   NA
 5508764 5508765 LBF_0441 LBF_0442     FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 5508765 5508766 LBF_0442 LBF_0443     FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 5508766 5508767 LBF_0443 LBF_0444     FALSE 0.003 737.000 0.000 NA   NA
 5508767 5508768 LBF_0444 LBF_0445     FALSE 0.004 453.000 0.000 NA   NA
 5508768 5508769 LBF_0445 LBF_0446     FALSE 0.136 62.000 0.000 NA   NA
 5508769 5508770 LBF_0446 LBF_0447     FALSE 0.046 104.000 0.000 NA   NA
 5508770 5508771 LBF_0447 LBF_0448     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 5508771 5508772 LBF_0448 LBF_0449     FALSE 0.650 -40.000 0.000 NA   NA
 5508775 5508776 LBF_0452 LBF_0453     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508776 5508777 LBF_0453 LBF_0454   xerC-1 FALSE 0.017 184.000 0.000 NA   NA
 5508777 5508778 LBF_0454 LBF_0455 xerC-1 nadB FALSE 0.003 477.000 0.000 1.000 N NA
 5508778 5508779 LBF_0455 LBF_0456 nadB prc-1 FALSE 0.590 52.000 0.013 1.000 N NA
 5508782 5508783 LBF_0459 LBF_0460   miaA TRUE 0.958 -3.000 0.017 1.000   NA
 5508783 5508784 LBF_0460 LBF_0461 miaA   TRUE 0.840 22.000 0.017 1.000   NA
 5508784 5508785 LBF_0461 LBF_0462   manC FALSE 0.181 53.000 0.000 1.000   NA
 5508785 5508786 LBF_0462 LBF_0463 manC   FALSE 0.020 172.000 0.000 NA   NA
 5508786 5508787 LBF_0463 LBF_0464   cheW-1 TRUE 0.874 21.000 0.750 NA   NA
 5508787 5508788 LBF_0464 LBF_0465 cheW-1 phoU FALSE 0.212 34.000 0.000 NA N NA
 5508788 5508789 LBF_0465 LBF_0466 phoU   FALSE 0.004 311.000 0.000 NA N NA
 5508789 5508790 LBF_0466 LBF_0467     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508791 5508792 LBF_0468 LBF_0469     FALSE 0.009 236.000 0.000 NA   NA
 5508794 5508795 LBF_0471 LBF_0472     FALSE 0.008 248.000 0.000 NA   NA
 5508795 5508796 LBF_0472 LBF_0473   capC TRUE 0.966 -3.000 0.733 NA   NA
 5508796 5508797 LBF_0473 LBF_0474 capC capB TRUE 0.975 -7.000 0.545 0.001   NA
 5508799 5508800 LBF_0476 LBF_0477     FALSE 0.178 45.000 0.000 1.000 N NA
 5508800 5508801 LBF_0477 LBF_0478   gpmI FALSE 0.454 15.000 0.000 1.000 N NA
 5508801 5508802 LBF_0478 LBF_0479 gpmI   FALSE 0.251 36.000 0.000 NA   NA
 5508802 5508803 LBF_0479 LBF_0480   btuB TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5508805 5508806 LBF_0482 LBF_0483     TRUE 0.939 -3.000 0.000 0.094 Y NA
 5508807 5508808 LBF_0484 LBF_0485     TRUE 0.971 -3.000 0.429 NA   NA
 5508808 5508809 LBF_0485 LBF_0486     TRUE 0.975 4.000 0.300 NA   NA
 5508809 5508810 LBF_0486 LBF_0487     TRUE 0.972 -3.000 0.300 NA   NA
 5508810 5508811 LBF_0487 LBF_0488     TRUE 0.968 2.000 1.000 NA   NA
 5508811 5508812 LBF_0488 LBF_0489   murC-2 TRUE 0.948 -3.000 0.010 NA   NA
 5508812 5508813 LBF_0489 LBF_0490 murC-2 pheS TRUE 0.917 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5508814 5508815 LBF_0491 LBF_0492     FALSE 0.464 16.000 0.000 NA   NA
 5508815 5508816 LBF_0492 LBF_0493     TRUE 0.969 -3.000 0.600 NA   NA
 5508816 5508817 LBF_0493 LBF_0494     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508818 5508819 LBF_0495 LBF_0496 rpsT   FALSE 0.045 105.000 0.000 NA   NA
 5508819 5508820 LBF_0496 LBF_0497   manB-1 FALSE 0.045 106.000 0.000 NA   NA
 5508820 5508821 LBF_0497 LBF_0498 manB-1 glmS TRUE 0.926 -15.000 0.006 1.000 N NA
 5508821 5508822 LBF_0498 LBF_0499 glmS   TRUE 0.953 4.000 0.006 1.000   NA
 5508822 5508823 LBF_0499 LBF_0500     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5508823 5508824 LBF_0500 LBF_0501     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508824 5508825 LBF_0501 LBF_0502     FALSE 0.178 45.000 0.000 1.000 N NA
 5508827 5508828 LBF_0504 LBF_0505   ruvB TRUE 0.942 2.000 0.003 1.000 N NA
 5508828 5508829 LBF_0505 LBF_0506 ruvB   TRUE 0.912 -19.000 0.003 1.000   NA
 5508830 5508831 LBF_0507 LBF_0508     TRUE 0.963 5.000 0.833 NA   NA
 5508831 5508832 LBF_0508 LBF_0509   sufE FALSE 0.096 74.000 0.000 NA   NA
 5508832 5508833 LBF_0509 LBF_0510 sufE   TRUE 0.663 -16.000 0.000 NA   NA
 5508833 5508834 LBF_0510 LBF_0511     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508835 5508836 LBF_0512 LBF_0513     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508836 5508837 LBF_0513 LBF_0514     TRUE 0.970 1.000 0.026 NA   NA
 5508837 5508838 LBF_0514 LBF_0515     FALSE 0.158 44.000 0.000 NA N NA
 5508838 5508839 LBF_0515 LBF_0516     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 5508839 5508840 LBF_0516 LBF_0517   rsbU-3 TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508840 5508841 LBF_0517 LBF_0518 rsbU-3   TRUE 0.743 -3.000 0.000 1.000   NA
 5508842 5508843 LBF_0519 LBF_0520     TRUE 0.971 2.000 0.025 1.000   NA
 5508844 5508845 LBF_0521 LBF_0522     TRUE 0.966 2.000 0.015 NA   NA
 5508845 5508846 LBF_0522 LBF_0523     TRUE 0.934 10.000 1.000 NA   NA
 5508847 5508848 LBF_0524 LBF_0525     FALSE 0.161 53.000 0.000 NA   NA
 5508848 5508849 LBF_0525 LBF_0526     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508849 5508850 LBF_0526 LBF_0527     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508850 5508851 LBF_0527 LBF_0528     FALSE 0.089 78.000 0.000 NA   NA
 5508851 5508852 LBF_0528 LBF_0529     TRUE 0.967 0.000 1.000 NA   NA
 5508852 5508853 LBF_0529 LBF_0530   truA TRUE 0.937 -28.000 0.013 NA   NA
 5508853 5508854 LBF_0530 LBF_0531 truA   TRUE 0.965 5.000 0.054 NA   NA
 5508855 5508856 LBF_0532 LBF_0533     FALSE 0.055 97.000 0.000 NA   NA
 5508857 5508858 LBF_0534 LBF_0535     TRUE 0.705 -10.000 0.000 1.000   NA
 5508861 5508862 LBF_0538 LBF_0539   accB TRUE 0.813 7.000 0.000 0.001   NA
 5508862 5508863 LBF_0539 LBF_0540 accB   FALSE 0.112 73.000 0.000 1.000   NA
 5508863 5508864 LBF_0540 LBF_0541     FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 5508864 5508865 LBF_0541 LBF_0542     FALSE 0.033 123.000 0.000 NA   NA
 5508866 5508867 LBF_0543 LBF_0544     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 5508867 5508868 LBF_0544 LBF_0546     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508870 5508871 LBF_0548 LBF_0549 thiD   FALSE 0.171 46.000 0.000 1.000 N NA
 5508872 5508873 LBF_0550 LBF_0551     FALSE 0.230 43.000 0.000 1.000   NA
 5508873 5508874 LBF_0551 LBF_0552     FALSE 0.251 36.000 0.000 NA   NA
 5508875 5508876 LBF_0553 LBF_0554     TRUE 0.964 -7.000 0.111 NA   NA
 5508876 5508877 LBF_0554 LBF_0555     TRUE 0.978 2.000 0.136 NA   NA
 5508877 5508878 LBF_0555 LBF_0556   tolC TRUE 0.978 2.000 0.136 NA   NA
 5508878 5508879 LBF_0556 LBF_0557 tolC   FALSE 0.047 103.000 0.000 NA   NA
 5508879 5508880 LBF_0557 LBF_0558     FALSE 0.008 260.000 0.000 NA   NA
 5508880 5508881 LBF_0558 LBF_0559     FALSE 0.042 110.000 0.000 NA   NA
 5508881 5508882 LBF_0559 LBF_0560   ppk TRUE 0.896 11.000 0.006 1.000 N NA
 5508883 5508884 LBF_0561 LBF_0562 fliD   TRUE 0.965 -3.000 0.056 NA   NA
 5508884 5508885 LBF_0562 LBF_0563     FALSE 0.006 307.000 0.000 NA   NA
 5508888 5508889 LBF_0566 LBF_0567 plsC   TRUE 0.979 2.000 0.176 NA   NA
 5508891 5508892 LBF_0569 LBF_0570     FALSE 0.352 23.000 0.000 NA   NA
 5508892 5508893 LBF_0570 LBF_0571     FALSE 0.591 8.000 0.000 NA N NA
 5508893 5508894 LBF_0571 LBF_0572     FALSE 0.049 102.000 0.000 NA   NA
 5508894 5508895 LBF_0572 LBF_0573     FALSE 0.408 32.000 0.000 0.017   NA
 5508896 5508897 LBF_0574 LBF_0575     FALSE 0.246 33.000 0.000 1.000 N NA
 5508898 5508899 LBF_0576 LBF_0577   paaJ-5 TRUE 0.970 5.000 0.125 NA   NA
 5508899 5508900 LBF_0577 LBF_0578 paaJ-5 fadB TRUE 0.831 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5508901 5508902 LBF_0579 LBF_0580     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508903 5508904 LBF_0581 LBF_0582     FALSE 0.277 31.000 0.000 NA   NA
 5508904 5508905 LBF_0582 LBF_0583     FALSE 0.632 8.000 0.000 1.000 N NA
 5508905 5508906 LBF_0583 LBF_0584     TRUE 0.820 30.000 0.048 1.000   NA
 5508907 5508908 LBF_0585 LBF_0586     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508908 5508909 LBF_0586 LBF_0587     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5508909 5508910 LBF_0587 LBF_0588     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 5508910 5508911 LBF_0588 LBF_0589     FALSE 0.155 55.000 0.000 NA   NA
 5508911 5508912 LBF_0589 LBF_0590     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5508912 5508913 LBF_0590 LBF_0591     FALSE 0.118 67.000 0.000 NA   NA
 5508913 5508914 LBF_0591 LBF_0592     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508914 5508915 LBF_0592 LBF_0593     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508915 5508916 LBF_0593 LBF_0594     FALSE 0.095 66.000 0.000 NA N NA
 5508916 5508917 LBF_0594 LBF_0595     FALSE 0.146 53.000 0.000 1.000 N NA
 5508917 5508918 LBF_0595 LBF_0596     FALSE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 5508918 5508919 LBF_0596 LBF_0597     TRUE 0.674 -10.000 0.000 NA   NA
 5508919 5508920 LBF_0597 LBF_0598     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508920 5508921 LBF_0598 LBF_0599     TRUE 0.926 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5508922 5508923 LBF_0600 LBF_0601     TRUE 0.674 -10.000 0.000 NA   NA
 5508923 5508924 LBF_0601 LBF_0602     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5508924 5508925 LBF_0602 LBF_0603     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508925 5508926 LBF_0603 LBF_0604     FALSE 0.183 52.000 0.000 1.000   NA
 5508928 5508929 LBF_0606 LBF_0607     TRUE 0.943 -3.000 0.000 0.016 Y NA
 5508929 5508930 LBF_0607 LBF_0608   splB FALSE 0.130 51.000 0.000 NA N NA
 5508930 5508931 LBF_0608 LBF_0609 splB   TRUE 0.961 -7.000 0.063 NA   NA
 5508932 5508933 LBF_0610 LBF_0611 btuE-2   TRUE 0.936 -16.000 0.011 NA   NA
 5508933 5508934 LBF_0611 LBF_0612   mrcA TRUE 0.878 16.000 0.016 NA   NA
 5508934 5508935 LBF_0612 LBF_0613 mrcA   TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5508935 5508936 LBF_0613 LBF_0614     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5508936 5508937 LBF_0614 LBF_0615     FALSE 0.004 407.000 0.000 NA   NA
 5508937 5508938 LBF_0615 LBF_0616     FALSE 0.004 487.000 0.000 NA   NA
 5508938 5508939 LBF_0616 LBF_0617     TRUE 0.966 -10.000 0.318 NA   NA
 5508940 5508941 LBF_0619 LBF_0620     FALSE 0.524 13.000 0.000 NA   NA
 5508942 5508943 LBF_0621 LBF_0622   tktN FALSE 0.618 10.000 0.000 NA   NA
 5508943 5508944 LBF_0622 LBF_0623 tktN   FALSE 0.172 49.000 0.000 NA   NA
 5508944 5508945 LBF_0623 LBF_0624   ispA-2 TRUE 0.957 4.000 0.013 NA   NA
 5508946 5508947 LBF_0625 LBF_0626     FALSE 0.352 23.000 0.000 NA   NA
 5508948 5508949 LBF_0627 LBF_0628 eriC   TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5508949 5508950 LBF_0628 LBF_0629     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508950 5508951 LBF_0629 LBF_0630     TRUE 0.961 -3.000 0.923 NA   NA
 5508953 5508954 LBF_0632 LBF_0633     FALSE 0.242 37.000 0.000 NA   NA
 5508954 5508955 LBF_0633 LBF_0634     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5508956 5508957 LBF_0635 LBF_0636 lpxD-1   FALSE 0.059 94.000 0.000 NA   NA
 5508957 5508958 LBF_0636 LBF_0637     FALSE 0.078 82.000 0.000 NA   NA
 5508959 5508960 LBF_0638 LBF_0639     TRUE 0.942 -3.000 0.006 NA   NA
 5508961 5508962 LBF_0640 LBF_0641     FALSE 0.112 69.000 0.000 NA   NA
 5508962 5508963 LBF_0641 LBF_0642     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5508963 5508964 LBF_0642 LBF_0643     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 5508966 5508967 LBF_0645 LBF_0646     FALSE 0.271 32.000 0.000 NA   NA
 5508967 5508968 LBF_0646 LBF_0647     TRUE 0.989 4.000 0.088 NA Y NA
 5508968 5508969 LBF_0647 LBF_0648     FALSE 0.080 81.000 0.000 NA   NA
 5508969 5508970 LBF_0648 LBF_0649     TRUE 0.958 -3.000 0.023 NA   NA
 5508970 5508971 LBF_0649 LBF_0650     FALSE 0.009 243.000 0.000 NA   NA
 5508971 5508972 LBF_0650 LBF_0651   polA TRUE 0.668 -13.000 0.000 NA   NA
 5508972 5508973 LBF_0651 LBF_0652 polA   TRUE 0.921 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5508973 5508974 LBF_0652 LBF_0653     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508974 5508975 LBF_0653 LBF_0654   glnS FALSE 0.489 67.000 0.008 NA   NA
 5508975 5508976 LBF_0654 LBF_0655 glnS   TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5508977 5508978 LBF_0656 LBF_0657     TRUE 0.964 7.000 0.021 0.002   NA
 5508978 5508979 LBF_0657 LBF_0658     FALSE 0.080 78.000 0.000 1.000 N NA
 5508980 5508981 LBF_0659 LBF_0660     FALSE 0.524 13.000 0.000 NA   NA
 5508981 5508982 LBF_0660 LBF_0661     FALSE 0.143 60.000 0.000 NA   NA
 5508984 5508985 LBF_0663 LBF_0664     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5508985 5508986 LBF_0664 LBF_0665     TRUE 0.812 -3.000 0.000 0.065   NA
 5508987 5508988 LBF_0666 LBF_0667   dprA FALSE 0.591 12.000 0.000 1.000   NA
 5508991 5508992 LBF_0670 LBF_0671 ldcC   FALSE 0.172 49.000 0.000 NA   NA
 5508992 5508993 LBF_0671 LBF_0672   avtA TRUE 0.956 -3.000 0.019 NA   NA
 5508994 5508995 LBF_0673 LBF_0674     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5508999 5509000 LBF_0678 LBF_0679     TRUE 0.827 -3.000 0.000 0.011   NA
 5509000 5509001 LBF_0679 LBF_0680     FALSE 0.022 163.000 0.000 NA   NA
 5509002 5509003 LBF_0681 LBF_0682     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5509005 5509006 LBF_0684 LBF_0685 paaJ-1 ilvC FALSE 0.136 49.000 0.000 NA N NA
 5509007 5509008 LBF_0686 LBF_0687     TRUE 0.716 5.000 0.000 NA   NA
 5509008 5509009 LBF_0687 LBF_0688     FALSE 0.446 17.000 0.000 NA   NA
 5509009 5509010 LBF_0688 LBF_0689     FALSE 0.143 60.000 0.000 NA   NA
 5509011 5509012 LBF_0690 LBF_0691     FALSE 0.322 29.000 0.000 1.000   NA
 5509012 5509013 LBF_0691 LBF_0692     FALSE 0.250 40.000 0.000 1.000   NA
 5509014 5509015 LBF_0693 LBF_0694     FALSE 0.013 217.000 0.000 1.000   NA
 5509015 5509016 LBF_0694 LBF_0695   coaC TRUE 0.948 1.000 0.003 1.000   NA
 5509016 5509017 LBF_0695 LBF_0696 coaC coaB TRUE 0.954 -3.000 0.016 NA   NA
 5509018 5509019 LBF_0697 LBF_0698     FALSE 0.023 156.000 0.000 NA   NA
 5509021 5509022 LBF_0700 LBF_0701 ccmH ccmF TRUE 0.972 3.000 0.049 NA   NA
 5509022 5509023 LBF_0701 LBF_0702 ccmF ccmE TRUE 0.991 -3.000 0.086 0.002 Y NA
 5509023 5509024 LBF_0702 LBF_0703 ccmE   FALSE 0.235 103.000 0.005 NA   NA
 5509024 5509025 LBF_0703 LBF_0704     FALSE 0.291 29.000 0.000 NA   NA
 5509026 5509027 LBF_0705 LBF_0706   arsB FALSE 0.182 47.000 0.000 NA   NA
 5509027 5509028 LBF_0706 LBF_0707 arsB hutH FALSE 0.306 22.000 0.000 NA N NA
 5509029 5509030 LBF_0708 LBF_0709     FALSE 0.299 28.000 0.000 NA   NA
 5509031 5509032 LBF_0710 LBF_0711 dapA dapB TRUE 0.970 -7.000 0.003 1.000 Y NA
 5509032 5509033 LBF_0711 LBF_0712 dapB   TRUE 0.947 2.000 0.003 NA   NA
 5509033 5509034 LBF_0712 LBF_0713     TRUE 0.944 -3.000 0.007 NA   NA
 5509038 5509039 LBF_0717 LBF_0718 mazE mazF TRUE 0.966 -6.000 0.434 NA   NA
 5509043 5509044 LBF_0722 LBF_0723     FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 5509044 5509045 LBF_0723 LBF_0724   glpA TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509045 5509046 LBF_0724 LBF_0725 glpA   FALSE 0.057 101.000 0.000 1.000   NA
 5509046 5509047 LBF_0725 LBF_0726     TRUE 0.658 -19.000 0.000 NA   NA
 5509048 5509049 LBF_0727 LBF_0728 fliE flgC TRUE 0.707 99.000 0.156 0.004 Y NA
 5509049 5509050 LBF_0728 LBF_0729 flgC flgB TRUE 0.981 11.000 0.804 0.004 Y NA
 5509050 5509051 LBF_0729 LBF_0730 flgB   FALSE 0.019 167.000 0.000 1.000 N NA
 5509051 5509052 LBF_0730 LBF_0731     FALSE 0.573 9.000 0.000 NA N NA
 5509052 5509053 LBF_0731 LBF_0732     FALSE 0.029 114.000 0.000 NA N NA
 5509054 5509055 LBF_0733 LBF_0734     TRUE 0.984 -3.000 0.875 NA Y NA
 5509055 5509056 LBF_0734 LBF_0735     TRUE 0.984 -3.000 0.854 NA Y NA
 5509056 5509057 LBF_0735 LBF_0736     TRUE 0.968 -3.000 0.089 NA   NA
 5509057 5509058 LBF_0736 LBF_0737     FALSE 0.017 181.000 0.000 NA   NA
 5509058 5509059 LBF_0737 LBF_0738     FALSE 0.395 16.000 0.000 NA N NA
 5509059 5509060 LBF_0738 LBF_0739     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5509062 5509063 LBF_0741 LBF_0742     TRUE 0.978 0.000 0.333 NA   NA
 5509063 5509064 LBF_0742 LBF_0743     TRUE 0.830 29.000 0.667 NA   NA
 5509065 5509066 LBF_0744 LBF_0745     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509066 5509067 LBF_0745 LBF_0746     FALSE 0.198 177.000 0.500 NA   NA
 5509067 5509068 LBF_0746 LBF_0747     FALSE 0.586 70.000 0.067 NA   NA
 5509069 5509070 LBF_0748 LBF_0749   sms TRUE 0.950 0.000 0.003 1.000   NA
 5509070 5509071 LBF_0749 LBF_0750 sms   FALSE 0.005 333.000 0.000 NA   NA
 5509071 5509072 LBF_0750 LBF_0751     FALSE 0.421 100.000 0.222 NA   NA
 5509072 5509073 LBF_0751 LBF_0752     FALSE 0.041 111.000 0.000 NA   NA
 5509073 5509074 LBF_0752 LBF_0753     FALSE 0.035 119.000 0.000 NA   NA
 5509076 5509077 LBF_0755 LBF_0756     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509078 5509079 LBF_0757 LBF_0758     FALSE 0.010 233.000 0.000 NA   NA
 5509079 5509080 LBF_0758 LBF_0759     FALSE 0.120 71.000 0.000 1.000   NA
 5509081 5509082 LBF_0760 LBF_0761 maoC   FALSE 0.652 10.000 0.000 1.000   NA
 5509083 5509084 LBF_0762 LBF_0763     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5509085 5509086 LBF_0764 LBF_0765 lepB-2   TRUE 0.951 -3.000 0.012 NA   NA
 5509086 5509087 LBF_0765 LBF_0766     FALSE 0.008 258.000 0.000 NA   NA
 5509088 5509089 LBF_0767 LBF_0768 glnK-1 amtB TRUE 0.672 6.000 0.000 1.000 N NA
 5509090 5509091 LBF_0769 LBF_0770 btuE-1   FALSE 0.643 -13.000 0.000 1.000 N NA
 5509091 5509092 LBF_0770 LBF_0771     FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 5509092 5509093 LBF_0771 LBF_0772   atpB TRUE 0.674 -10.000 0.000 NA   NA
 5509093 5509094 LBF_0772 LBF_0773 atpB atpE TRUE 0.779 49.000 0.628 0.004   NA
 5509094 5509095 LBF_0773 LBF_0774 atpE atpF TRUE 0.983 3.000 0.402 0.004   NA
 5509095 5509096 LBF_0774 LBF_0775 atpF atpH TRUE 0.991 -3.000 0.222 0.004 Y NA
 5509096 5509097 LBF_0775 LBF_0776 atpH atpA TRUE 0.988 -3.000 0.864 0.004 Y NA
 5509097 5509098 LBF_0776 LBF_0777 atpA atpG TRUE 0.978 12.000 0.846 0.004 Y NA
 5509098 5509099 LBF_0777 LBF_0778 atpG atpD TRUE 0.958 22.000 0.724 0.004 Y NA
 5509099 5509100 LBF_0778 LBF_0779 atpD atpC TRUE 0.988 6.000 0.837 0.004 Y NA
 5509100 5509101 LBF_0779 LBF_0780 atpC   FALSE 0.519 48.000 0.003 NA   NA
 5509101 5509102 LBF_0780 LBF_0781     FALSE 0.618 10.000 0.000 NA   NA
 5509102 5509103 LBF_0781 LBF_0782     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5509103 5509104 LBF_0782 LBF_0783     FALSE 0.618 10.000 0.000 NA   NA
 5509104 5509105 LBF_0783 LBF_0784     FALSE 0.340 24.000 0.000 NA   NA
 5509106 5509107 LBF_0785 LBF_0786   carA TRUE 0.716 26.000 0.004 NA   NA
 5509107 5509108 LBF_0786 LBF_0787 carA   FALSE 0.182 47.000 0.000 NA   NA
 5509110 5509111 LBF_0789 LBF_0790 phhB   TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5509111 5509112 LBF_0790 LBF_0791   ung FALSE 0.649 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5509112 5509113 LBF_0791 LBF_0792 ung   TRUE 0.674 -10.000 0.000 NA   NA
 5509115 5509116 LBF_0794 LBF_0795     TRUE 0.962 -3.000 0.034 NA   NA
 5509117 5509118 LBF_0796 LBF_0797 bioD bioA TRUE 0.988 -10.000 0.051 0.001 Y NA
 5509118 5509119 LBF_0797 LBF_0798 bioA bioB TRUE 0.889 58.000 0.176 0.001 Y NA
 5509119 5509120 LBF_0798 LBF_0799 bioB   FALSE 0.130 51.000 0.000 NA N NA
 5509120 5509121 LBF_0799 LBF_3362     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 5509121 5509122 LBF_3362 LBF_0800     TRUE 0.958 -22.000 0.667 NA   NA
 5509122 5509123 LBF_0800 LBF_0801   serB TRUE 0.982 3.000 0.005 1.000 Y NA
 5509124 5509125 LBF_0802 LBF_0803 mutS trpF TRUE 0.914 -16.000 0.004 1.000 N NA
 5509125 5509126 LBF_0803 LBF_0804 trpF   FALSE 0.419 17.000 0.000 1.000 N NA
 5509126 5509127 LBF_0804 LBF_0805   folC FALSE 0.119 63.000 0.000 1.000 N NA
 5509127 5509128 LBF_0805 LBF_0806 folC aroE TRUE 0.702 32.000 0.006 1.000 N NA
 5509130 5509131 LBF_0808 LBF_0809     TRUE 0.934 8.000 0.011 NA   NA
 5509132 5509133 LBF_0810 LBF_0811   rpsA-1 TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509133 5509134 LBF_0811 LBF_0812 rpsA-1 cspR TRUE 0.978 8.000 0.007 0.017 Y NA
 5509134 5509135 LBF_0812 LBF_0813 cspR   FALSE 0.584 49.000 0.007 NA   NA
 5509135 5509136 LBF_0813 LBF_0814   uvrB TRUE 0.910 7.000 0.003 NA   NA
 5509136 5509137 LBF_0814 LBF_0815 uvrB lon FALSE 0.471 14.000 0.000 1.000 N NA
 5509137 5509138 LBF_0815 LBF_0816 lon ponA TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5509142 5509143 LBF_0820 LBF_0821     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509145 5509146 LBF_0823 LBF_0824     FALSE 0.050 101.000 0.000 NA   NA
 5509146 5509147 LBF_0824 LBF_0825     TRUE 0.716 5.000 0.000 NA   NA
 5509147 5509148 LBF_0825 LBF_0826     TRUE 0.655 -22.000 0.000 NA   NA
 5509149 5509150 LBF_0827 LBF_0828     FALSE 0.022 163.000 0.000 NA   NA
 5509150 5509151 LBF_0828 LBF_0829     FALSE 0.219 41.000 0.000 NA   NA
 5509151 5509152 LBF_0829 LBF_0830     FALSE 0.025 146.000 0.000 NA   NA
 5509153 5509154 LBF_0831 LBF_0832     FALSE 0.106 71.000 0.000 NA   NA
 5509154 5509155 LBF_0832 LBF_0833     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5509155 5509156 LBF_0833 LBF_0834     FALSE 0.095 80.000 0.000 1.000   NA
 5509158 5509159 LBF_0836 LBF_0837     TRUE 0.964 -16.000 0.333 NA   NA
 5509159 5509160 LBF_0837 LBF_0838     FALSE 0.110 66.000 0.000 1.000 N NA
 5509160 5509161 LBF_0838 LBF_0839     FALSE 0.020 181.000 0.000 1.000   NA
 5509161 5509162 LBF_0839 LBF_0840     FALSE 0.168 50.000 0.000 NA   NA
 5509162 5509163 LBF_0840 LBF_0841   hisB FALSE 0.009 238.000 0.000 NA   NA
 5509163 5509164 LBF_0841 LBF_0842 hisB hisH-1 TRUE 0.991 -3.000 0.125 0.004 Y NA
 5509164 5509165 LBF_0842 LBF_0843 hisH-1 hisA TRUE 0.993 0.000 0.124 0.004 Y NA
 5509165 5509166 LBF_0843 LBF_0844 hisA   TRUE 0.946 3.000 0.004 1.000 N NA
 5509167 5509168 LBF_0845 LBF_0846 neuB-1 feoB FALSE 0.255 31.000 0.000 1.000 N NA
 5509168 5509169 LBF_0846 LBF_0847 feoB feoA TRUE 0.989 -3.000 0.246 1.000 Y NA
 5509169 5509170 LBF_0847 LBF_0848 feoA   TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509172 5509173 LBF_0850 LBF_0851   lnt-1 FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 5509173 5509174 LBF_0851 LBF_0852 lnt-1   TRUE 0.950 -31.000 0.027 1.000   NA
 5509174 5509175 LBF_0852 LBF_0853     FALSE 0.057 96.000 0.000 NA   NA
 5509176 5509177 LBF_0854 LBF_0855     FALSE 0.277 31.000 0.000 NA   NA
 5509178 5509179 LBF_0856 LBF_0857   glyRS TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5509180 5509181 LBF_0858 LBF_0859     TRUE 0.957 -3.000 1.000 NA   NA
 5509184 5509185 LBF_0862 LBF_0863     TRUE 0.682 -7.000 0.000 NA   NA
 5509186 5509187 LBF_0864 LBF_0865     FALSE 0.632 68.000 0.059 0.049 N NA
 5509187 5509188 LBF_0865 LBF_0866     FALSE 0.009 237.000 0.000 NA   NA
 5509188 5509189 LBF_0866 LBF_0867     FALSE 0.032 128.000 0.000 NA   NA
 5509189 5509190 LBF_0867 LBF_0868   rrf FALSE 0.143 60.000 0.000 NA   NA
 5509190 5509191 LBF_0868 LBF_0869 rrf   FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 5509191 5509192 LBF_0869 LBF_0870     FALSE 0.353 30.000 0.000 0.096 N NA
 5509192 5509193 LBF_0870 LBF_0871     FALSE 0.519 11.000 0.000 NA N NA
 5509193 5509194 LBF_0871 LBF_0872     FALSE 0.242 37.000 0.000 NA   NA
 5509194 5509195 LBF_0872 LBF_0873     FALSE 0.199 64.000 0.000 0.087   NA
 5509195 5509196 LBF_0873 LBF_0874     TRUE 0.887 19.000 0.750 NA   NA
 5509196 5509197 LBF_0874 LBF_0875     TRUE 0.955 8.000 0.750 NA   NA
 5509197 5509198 LBF_0875 LBF_0876   tolB TRUE 0.965 -3.000 0.750 NA   NA
 5509200 5509201 LBF_0878 LBF_0879     TRUE 0.943 5.000 0.008 1.000 N NA
 5509201 5509202 LBF_0879 LBF_0880   murI TRUE 0.947 1.000 0.004 1.000 N NA
 5509202 5509203 LBF_0880 LBF_0881 murI purM TRUE 0.658 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5509204 5509205 LBF_0882 LBF_0883     TRUE 0.927 -13.000 0.000 0.036 Y NA
 5509205 5509206 LBF_0883 LBF_0884     TRUE 0.953 3.000 0.000 0.027 Y NA
 5509206 5509207 LBF_0884 LBF_0885     TRUE 0.860 2.000 0.000 0.027   NA
 5509207 5509208 LBF_0885 LBF_0886     TRUE 0.817 -3.000 0.000 0.027   NA
 5509208 5509209 LBF_0886 LBF_0887     TRUE 0.942 -3.000 0.000 0.018 Y NA
 5509209 5509210 LBF_0887 LBF_0888     TRUE 0.992 4.000 0.167 0.018 Y NA
 5509210 5509211 LBF_0888 LBF_0889     TRUE 0.913 10.000 0.000 0.018 Y NA
 5509211 5509212 LBF_0889 LBF_0890     FALSE 0.058 95.000 0.000 NA   NA
 5509212 5509213 LBF_0890 LBF_0891     TRUE 0.663 -16.000 0.000 NA   NA
 5509214 5509215 LBF_0892 LBF_0893     TRUE 0.957 -3.000 1.000 NA   NA
 5509215 5509216 LBF_0893 LBF_0894     TRUE 0.935 12.000 0.081 1.000 N NA
 5509216 5509217 LBF_0894 LBF_0895     FALSE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 5509217 5509218 LBF_0895 LBF_0896   glgP FALSE 0.161 53.000 0.000 NA   NA
 5509218 5509219 LBF_0896 LBF_0897 glgP   FALSE 0.153 50.000 0.000 1.000 N NA
 5509219 5509220 LBF_0897 LBF_0898     FALSE 0.046 113.000 0.000 1.000   NA
 5509220 5509221 LBF_0898 LBF_0899     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509223 5509224 LBF_0901 LBF_0902     FALSE 0.136 62.000 0.000 NA   NA
 5509224 5509225 LBF_0902 LBF_0903     FALSE 0.612 7.000 0.000 NA N NA
 5509225 5509226 LBF_0903 LBF_0904   ugd FALSE 0.171 46.000 0.000 1.000 N NA
 5509228 5509229 LBF_0906 LBF_0907   lpxK FALSE 0.306 25.000 0.000 1.000 N NA
 5509230 5509231 LBF_0908 LBF_0909     TRUE 0.954 7.000 0.033 NA   NA
 5509232 5509233 LBF_0910 LBF_0911 flhF minD TRUE 0.816 35.000 0.382 1.000 N NA
 5509233 5509234 LBF_0911 LBF_0912 minD   FALSE 0.362 98.000 0.045 1.000 N NA
 5509234 5509235 LBF_0912 LBF_0913     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5509235 5509236 LBF_0913 LBF_0914     FALSE 0.043 108.000 0.000 NA   NA
 5509236 5509237 LBF_0914 LBF_0915     FALSE 0.188 46.000 0.000 NA   NA
 5509237 5509238 LBF_0915 LBF_0916     TRUE 0.904 13.000 0.018 NA   NA
 5509238 5509239 LBF_0916 LBF_0917   gmk TRUE 0.970 -3.000 0.143 NA   NA
 5509240 5509241 LBF_0918 LBF_0919   fliJ TRUE 0.965 0.000 0.016 NA   NA
 5509243 5509244 LBF_0921 LBF_0922 fliI   FALSE 0.045 105.000 0.000 NA   NA
 5509244 5509245 LBF_0922 LBF_0923     FALSE 0.163 52.000 0.000 NA   NA
 5509245 5509246 LBF_0923 LBF_0924     FALSE 0.020 174.000 0.000 NA   NA
 5509246 5509247 LBF_0924 LBF_0925   murA TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5509252 5509253 LBF_0930 LBF_0931     TRUE 0.674 -10.000 0.000 NA   NA
 5509253 5509254 LBF_0931 LBF_0932     FALSE 0.037 117.000 0.000 NA   NA
 5509254 5509255 LBF_0932 LBF_0933     FALSE 0.497 13.000 0.000 1.000 N NA
 5509255 5509256 LBF_0933 LBF_0934     FALSE 0.015 194.000 0.000 NA   NA
 5509256 5509257 LBF_0934 LBF_0935     FALSE 0.131 63.000 0.000 NA   NA
 5509257 5509258 LBF_0935 LBF_0937   clpP-1 TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5509258 5509259 LBF_0937 LBF_0938 clpP-1 clpX TRUE 0.968 16.000 0.352 1.000 Y NA
 5509259 5509260 LBF_0938 LBF_0939 clpX   FALSE 0.590 18.000 0.000 0.012   NA
 5509261 5509262 LBF_0940 LBF_0941   tatC TRUE 0.950 -3.000 0.012 NA   NA
 5509262 5509263 LBF_0941 LBF_0942 tatC tatA TRUE 0.980 10.000 0.093 NA Y NA
 5509266 5509267 LBF_0945 LBF_0946     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509272 5509273 LBF_0951 LBF_0952     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5509273 5509274 LBF_0952 LBF_0953     FALSE 0.213 42.000 0.000 NA   NA
 5509274 5509275 LBF_0953 LBF_0954     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5509276 5509277 LBF_0955 LBF_0956     TRUE 0.979 2.000 0.400 NA   NA
 5509277 5509278 LBF_0956 LBF_0957     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509278 5509279 LBF_0957 LBF_0958     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509279 5509280 LBF_0958 LBF_0959     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5509280 5509281 LBF_0959 LBF_0960     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509281 5509282 LBF_0960 LBF_0961     TRUE 0.920 -3.000 0.000 NA Y NA
 5509282 5509283 LBF_0961 LBF_0962     TRUE 0.929 4.000 0.000 NA Y NA
 5509283 5509284 LBF_0962 LBF_0963     FALSE 0.262 34.000 0.000 NA   NA
 5509284 5509285 LBF_0963 LBF_0964     TRUE 0.674 -10.000 0.000 NA   NA
 5509286 5509287 LBF_0965 LBF_0966     TRUE 0.743 -3.000 0.000 1.000   NA
 5509287 5509288 LBF_0966 LBF_0967     TRUE 0.716 5.000 0.000 NA   NA
 5509289 5509290 LBF_0968 LBF_0969     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509291 5509292 LBF_0970 LBF_0971     FALSE 0.205 43.000 0.000 NA   NA
 5509292 5509293 LBF_0971 LBF_0972     TRUE 0.971 -3.000 0.419 NA   NA
 5509295 5509296 LBF_0974 LBF_0975 glyA lplA TRUE 0.949 -3.000 0.012 1.000 N NA
 5509296 5509297 LBF_0975 LBF_0976 lplA   TRUE 0.743 -3.000 0.000 1.000   NA
 5509298 5509299 LBF_0977 LBF_0978     TRUE 0.969 0.000 1.000 1.000   NA
 5509299 5509300 LBF_0978 LBF_0979     FALSE 0.009 259.000 0.000 1.000   NA
 5509301 5509302 LBF_0980 LBF_0981     FALSE 0.580 62.000 1.000 NA   NA
 5509302 5509303 LBF_0981 LBF_0982   sppA-2 TRUE 0.789 21.000 0.006 NA N NA
 5509306 5509307 LBF_0985 LBF_0986   rpmB FALSE 0.415 19.000 0.000 NA   NA
 5509307 5509308 LBF_0986 LBF_0987 rpmB   TRUE 0.674 27.000 0.003 1.000 N NA
 5509310 5509311 LBF_0989 LBF_0990 ubiA ubiX TRUE 0.988 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 5509313 5509314 LBF_0992 LBF_0993 pyrB   TRUE 0.913 -7.000 0.003 NA   NA
 5509314 5509315 LBF_0993 LBF_0994     TRUE 0.944 -16.000 0.018 NA   NA
 5509315 5509316 LBF_0994 LBF_0995     FALSE 0.161 53.000 0.000 NA   NA
 5509316 5509317 LBF_0995 LBF_0996     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5509317 5509318 LBF_0996 LBF_0997     FALSE 0.172 49.000 0.000 NA   NA
 5509318 5509319 LBF_0997 LBF_0998   rho FALSE 0.031 143.000 0.000 1.000   NA
 5509319 5509320 LBF_0998 LBF_0999 rho rpmE TRUE 0.946 11.000 0.115 1.000 N NA
 5509320 5509321 LBF_0999 LBF_1000 rpmE   FALSE 0.153 50.000 0.000 1.000 N NA
 5509321 5509322 LBF_1000 LBF_1001     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509322 5509323 LBF_1001 LBF_1002     FALSE 0.122 66.000 0.000 NA   NA
 5509323 5509324 LBF_1002 LBF_1003     TRUE 0.959 8.000 0.600 NA   NA
 5509325 5509326 LBF_1004 LBF_1005     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5509326 5509327 LBF_1005 LBF_1006     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509327 5509328 LBF_1006 LBF_1007     TRUE 0.921 16.000 0.213 NA   NA
 5509328 5509329 LBF_1007 LBF_1008     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509329 5509330 LBF_1008 LBF_1009   gltA-1 FALSE 0.157 49.000 0.000 1.000 N NA
 5509330 5509331 LBF_1009 LBF_1010 gltA-1   FALSE 0.488 69.000 0.008 1.000   NA
 5509332 5509333 LBF_1011 LBF_1012     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5509333 5509334 LBF_1012 LBF_1013     FALSE 0.608 69.000 0.600 NA   NA
 5509334 5509335 LBF_1013 LBF_1014   pdxA TRUE 0.968 1.000 0.022 1.000 N NA
 5509335 5509336 LBF_1014 LBF_1015 pdxA   TRUE 0.957 -3.000 0.022 NA   NA
 5509336 5509337 LBF_1015 LBF_1016     FALSE 0.464 16.000 0.000 NA   NA
 5509337 5509338 LBF_1016 LBF_1017     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509339 5509340 LBF_1018 LBF_1019     TRUE 0.655 -22.000 0.000 NA   NA
 5509340 5509341 LBF_1019 LBF_1020     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509341 5509342 LBF_1020 LBF_1021     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509342 5509343 LBF_1021 LBF_1022   sucA FALSE 0.015 203.000 0.000 1.000   NA
 5509343 5509344 LBF_1022 LBF_1023 sucA lpdA-1 TRUE 0.854 35.000 0.005 1.000 Y NA
 5509344 5509345 LBF_1023 LBF_1024 lpdA-1 aceF TRUE 0.985 8.000 0.253 1.000 Y NA
 5509346 5509347 LBF_1025 LBF_1026     FALSE 0.003 632.000 0.000 NA   NA
 5509349 5509350 LBF_1028 LBF_1029     FALSE 0.466 93.000 0.194 NA   NA
 5509350 5509351 LBF_1029 LBF_1030     TRUE 0.970 -3.000 0.483 NA   NA
 5509351 5509352 LBF_1030 LBF_1031     FALSE 0.128 64.000 0.000 NA   NA
 5509353 5509354 LBF_1032 LBF_1033     TRUE 0.799 2.000 0.000 1.000   NA
 5509354 5509355 LBF_1033 LBF_1034     TRUE 0.744 7.000 0.000 0.084 N NA
 5509355 5509356 LBF_1034 LBF_1035   ndh TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5509359 5509360 LBF_1038 LBF_1039     FALSE 0.032 141.000 0.000 1.000   NA
 5509360 5509361 LBF_1039 LBF_1040   rrs-1 FALSE 0.003 678.000 0.000 NA   NA
 5509361 5509362 LBF_1040 LBF_1041 rrs-1   FALSE 0.003 808.000 0.000 NA   NA
 5509362 5509363 LBF_1041 LBF_1042     FALSE 0.459 67.000 0.000 0.035 Y NA
 5509363 5509364 LBF_1042 LBF_1043     FALSE 0.016 672.000 0.000 1.000 Y NA
 5509365 5509366 LBF_1044 LBF_1045     FALSE 0.014 740.000 0.000 1.000 Y NA
 5509366 5509367 LBF_1045 LBF_1046     FALSE 0.168 50.000 0.000 NA   NA
 5509368 5509369 LBF_1047 LBF_1048     FALSE 0.063 92.000 0.000 NA   NA
 5509369 5509370 LBF_1048 LBF_1049     FALSE 0.498 14.000 0.000 NA   NA
 5509371 5509372 LBF_1050 LBF_1051     FALSE 0.055 97.000 0.000 NA   NA
 5509372 5509373 LBF_1051 LBF_1052     FALSE 0.012 209.000 0.000 NA   NA
 5509374 5509375 LBF_1053 LBF_1054     FALSE 0.140 61.000 0.000 NA   NA
 5509375 5509376 LBF_1054 LBF_1055     FALSE 0.034 121.000 0.000 NA   NA
 5509378 5509379 LBF_1057 LBF_1058     FALSE 0.158 54.000 0.000 NA   NA
 5509379 5509380 LBF_1058 LBF_1059     FALSE 0.151 57.000 0.000 NA   NA
 5509380 5509381 LBF_1059 LBF_1060     FALSE 0.064 91.000 0.000 NA   NA
 5509381 5509382 LBF_1060 LBF_1061     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509382 5509383 LBF_1061 LBF_1062     FALSE 0.128 64.000 0.000 NA   NA
 5509383 5509384 LBF_1062 LBF_1063     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 5509385 5509386 LBF_1064 LBF_1065     FALSE 0.556 12.000 0.000 NA   NA
 5509386 5509387 LBF_1065 LBF_1066     FALSE 0.158 54.000 0.000 NA   NA
 5509387 5509388 LBF_1066 LBF_1067   leuA-1 TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5509388 5509389 LBF_1067 LBF_1068 leuA-1   FALSE 0.012 199.000 0.000 1.000 N NA
 5509389 5509390 LBF_1068 LBF_1069     FALSE 0.360 21.000 0.000 1.000 N NA
 5509391 5509392 LBF_1070 LBF_1071     TRUE 0.926 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5509392 5509393 LBF_1071 LBF_1072     TRUE 0.719 4.000 0.000 1.000 N NA
 5509393 5509394 LBF_1072 LBF_1073     FALSE 0.360 21.000 0.000 1.000 N NA
 5509395 5509396 LBF_1074 LBF_1075     TRUE 0.972 0.000 0.039 NA   NA
 5509400 5509401 LBF_1079 LBF_1080 prmA   TRUE 0.740 3.000 0.000 1.000 N NA
 5509401 5509402 LBF_1080 LBF_1081     FALSE 0.250 40.000 0.000 1.000   NA
 5509402 5509403 LBF_1081 LBF_1082     TRUE 0.812 -3.000 0.000 0.061   NA
 5509403 5509404 LBF_1082 LBF_1083     TRUE 0.946 7.000 1.000 1.000 N NA
 5509404 5509405 LBF_1083 LBF_1084     FALSE 0.004 313.000 0.000 NA N NA
 5509405 5509406 LBF_1084 LBF_1085   ksgA FALSE 0.348 19.000 0.000 NA N NA
 5509406 5509407 LBF_1085 LBF_1086 ksgA   TRUE 0.939 -46.000 0.016 NA   NA
 5509407 5509408 LBF_1086 LBF_1087   trpS FALSE 0.205 43.000 0.000 NA   NA
 5509408 5509409 LBF_1087 LBF_1088 trpS   TRUE 0.955 -3.000 0.017 NA   NA
 5509409 5509410 LBF_1088 LBF_1089   lolA-2 TRUE 0.970 -3.000 0.143 NA   NA
 5509410 5509411 LBF_1089 LBF_1090 lolA-2 etfA TRUE 0.858 24.000 0.143 NA N NA
 5509411 5509412 LBF_1090 LBF_1091 etfA eftB TRUE 0.982 11.000 0.060 0.016 Y NA
 5509412 5509413 LBF_1091 LBF_1092 eftB   FALSE 0.587 69.000 0.060 NA   NA
 5509413 5509414 LBF_1092 LBF_1093     FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 5509417 5509418 LBF_1096 LBF_1097 ivd   FALSE 0.085 93.000 0.000 0.047 N NA
 5509418 5509419 LBF_1097 LBF_1098   thrB FALSE 0.236 35.000 0.000 1.000 N NA
 5509420 5509421 LBF_1099 LBF_1100     TRUE 0.965 3.000 1.000 NA   NA
 5509422 5509423 LBF_1101 LBF_1102   mdh TRUE 0.752 30.000 0.014 1.000 N NA
 5509426 5509427 LBF_1106 LBF_1107 hemK   TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5509427 5509428 LBF_1107 LBF_1108     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5509428 5509429 LBF_1108 LBF_1109     TRUE 0.920 -3.000 0.000 NA Y NA
 5509429 5509430 LBF_1109 LBF_1110     FALSE 0.293 26.000 0.000 1.000 N NA
 5509430 5509431 LBF_1110 LBF_1111     TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5509431 5509432 LBF_1111 LBF_1112     FALSE 0.246 102.000 0.006 1.000 N NA
 5509433 5509434 LBF_1113 LBF_1114 trkG-2   FALSE 0.188 46.000 0.000 NA   NA
 5509434 5509435 LBF_1114 LBF_1115     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509435 5509436 LBF_1115 LBF_1116     TRUE 0.740 3.000 0.000 1.000 N NA
 5509436 5509437 LBF_1116 LBF_1117     TRUE 0.894 19.000 0.667 NA   NA
 5509439 5509440 LBF_1119 LBF_1120     FALSE 0.213 42.000 0.000 NA   NA
 5509440 5509441 LBF_1120 LBF_1121   cysK-2 FALSE 0.107 67.000 0.000 1.000 N NA
 5509441 5509442 LBF_1121 LBF_1122 cysK-2 topA FALSE 0.207 96.000 0.002 1.000 N NA
 5509442 5509443 LBF_1122 LBF_1123 topA hemH FALSE 0.649 -10.000 0.000 1.000 N NA
 5509444 5509445 LBF_1124 LBF_1125 hemY hemN TRUE 0.987 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 5509445 5509446 LBF_1125 LBF_1126 hemN hemE TRUE 0.986 -3.000 0.012 0.002 Y NA
 5509446 5509447 LBF_1126 LBF_1127 hemE hemL TRUE 0.934 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5509447 5509448 LBF_1127 LBF_1128 hemL hemB TRUE 0.984 -3.000 0.007 0.002 Y NA
 5509448 5509449 LBF_1128 LBF_1129 hemB hemCD TRUE 0.987 -3.000 0.020 0.002 Y NA
 5509449 5509450 LBF_1129 LBF_1130 hemCD hemA TRUE 0.948 -7.000 0.004 0.002   NA
 5509452 5509453 LBF_1132 LBF_1133     FALSE 0.004 436.000 0.000 NA   NA
 5509455 5509456 LBF_1135 LBF_1136 cysG cysG-1 TRUE 0.990 -3.000 0.077 0.002 Y NA
 5509457 5509458 LBF_1137 LBF_1138 cysJ cysI TRUE 0.987 8.000 0.750 0.001 Y NA
 5509459 5509460 LBF_1139 LBF_1140 cysN cysH-2 TRUE 0.980 0.000 0.744 0.001 N NA
 5509460 5509461 LBF_1140 LBF_1141 cysH-2 cysH-1 TRUE 0.983 7.000 0.046 1.000 Y NA
 5509461 5509462 LBF_1141 LBF_1142 cysH-1   FALSE 0.456 69.000 0.008 1.000 N NA
 5509462 5509463 LBF_1142 LBF_1143     TRUE 0.991 2.000 0.587 1.000 Y NA
 5509463 5509464 LBF_1143 LBF_1144     TRUE 0.970 -3.000 0.935 0.001 N NA
 5509464 5509465 LBF_1144 LBF_1145     TRUE 0.977 1.000 0.026 0.001 N NA
 5509466 5509467 LBF_1146 LBF_1147 fliK flgD FALSE 0.284 30.000 0.000 NA   NA
 5509467 5509468 LBF_1147 LBF_1148 flgD flgE TRUE 0.909 39.000 0.298 NA Y NA
 5509468 5509469 LBF_1148 LBF_1149 flgE   FALSE 0.063 97.000 0.000 1.000   NA
 5509469 5509470 LBF_1149 LBF_1150     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509470 5509471 LBF_1150 LBF_1151     FALSE 0.163 52.000 0.000 NA   NA
 5509471 5509472 LBF_1151 LBF_1152     FALSE 0.115 72.000 0.000 1.000   NA
 5509474 5509475 LBF_1154 LBF_1155   trpC TRUE 0.915 10.000 0.008 1.000 N NA
 5509475 5509476 LBF_1155 LBF_1156 trpC   FALSE 0.054 94.000 0.000 1.000 N NA
 5509478 5509479 LBF_1158 LBF_1159 rrs   FALSE 0.009 247.000 0.000 NA   NA
 5509480 5509481 LBF_1160 LBF_1161   xerD-1 FALSE 0.013 199.000 0.000 NA   NA
 5509481 5509482 LBF_1161 LBF_1162 xerD-1   FALSE 0.098 73.000 0.000 NA   NA
 5509482 5509483 LBF_1162 LBF_1163     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5509483 5509484 LBF_1163 LBF_1164   mauG-1 TRUE 0.984 0.000 0.375 0.011   NA
 5509484 5509485 LBF_1164 LBF_1165 mauG-1   FALSE 0.013 199.000 0.000 NA   NA
 5509485 5509486 LBF_1165 LBF_1166     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5509491 5509492 LBF_1171 LBF_1172     FALSE 0.029 183.000 0.000 0.036   NA
 5509493 5509494 LBF_1173 LBF_1174     FALSE 0.116 88.000 0.000 0.025   NA
 5509496 5509497 LBF_1176 LBF_3363     FALSE 0.648 -126.000 0.000 NA   NA
 5509497 5509498 LBF_3363 LBF_1177     FALSE 0.004 455.000 0.000 NA   NA
 5509501 5509502 LBF_1180 LBF_1181 leuC-1 leuD-1 TRUE 0.992 -3.000 0.309 0.002 Y NA
 5509503 5509504 LBF_1182 LBF_1183     FALSE 0.034 120.000 0.000 NA   NA
 5509504 5509505 LBF_1183 LBF_1184     FALSE 0.023 158.000 0.000 NA   NA
 5509505 5509506 LBF_1184 LBF_1185     FALSE 0.651 -34.000 0.000 NA   NA
 5509507 5509508 LBF_1186 LBF_1187     FALSE 0.556 12.000 0.000 NA   NA
 5509508 5509509 LBF_1187 LBF_1188     TRUE 0.824 27.000 0.800 NA   NA
 5509510 5509511 LBF_1189 LBF_1190 folA-3   FALSE 0.006 294.000 0.000 1.000 N NA
 5509513 5509514 LBF_1192 LBF_1193     FALSE 0.007 271.000 0.000 NA   NA
 5509514 5509515 LBF_1193 LBF_1194     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 5509515 5509516 LBF_1194 LBF_1195     FALSE 0.257 35.000 0.000 NA   NA
 5509516 5509517 LBF_1195 LBF_1196     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5509517 5509518 LBF_1196 LBF_1197     FALSE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 5509519 5509520 LBF_1198 LBF_1199     FALSE 0.004 403.000 0.000 NA   NA
 5509520 5509521 LBF_1199 LBF_1200     FALSE 0.007 269.000 0.000 NA   NA
 5509521 5509522 LBF_1200 LBF_1201     FALSE 0.524 13.000 0.000 NA   NA
 5509522 5509523 LBF_1201 LBF_1202     FALSE 0.480 86.000 0.600 NA   NA
 5509524 5509525 LBF_1203 LBF_1204     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509526 5509527 LBF_1205 LBF_1206   caiA-3 FALSE 0.028 129.000 0.000 1.000 N NA
 5509527 5509528 LBF_1206 LBF_1207 caiA-3   TRUE 0.683 -31.000 0.000 1.000   NA
 5509528 5509529 LBF_1207 LBF_1208     FALSE 0.158 54.000 0.000 NA   NA
 5509529 5509530 LBF_1208 LBF_1209     FALSE 0.415 19.000 0.000 NA   NA
 5509530 5509531 LBF_1209 LBF_1210     TRUE 0.894 16.000 0.887 NA   NA
 5509531 5509532 LBF_1210 LBF_1211     TRUE 0.904 -22.000 0.000 1.000 Y NA
 5509532 5509533 LBF_1211 LBF_1212     TRUE 0.914 -7.000 0.000 1.000 Y NA
 5509533 5509534 LBF_1212 LBF_1213     FALSE 0.632 8.000 0.000 1.000 N NA
 5509536 5509537 LBF_1215 LBF_1216     FALSE 0.215 33.000 0.000 NA N NA
 5509539 5509540 LBF_1218 LBF_1219 imdH   TRUE 0.894 10.000 0.003 NA   NA
 5509540 5509541 LBF_1219 LBF_1220     TRUE 0.907 13.000 0.021 NA   NA
 5509543 5509544 LBF_1222 LBF_1223     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5509544 5509545 LBF_1223 LBF_1224     FALSE 0.524 13.000 0.000 NA   NA
 5509545 5509546 LBF_1224 LBF_1225     FALSE 0.016 188.000 0.000 NA   NA
 5509546 5509547 LBF_1225 LBF_1226     FALSE 0.315 30.000 0.000 1.000   NA
 5509547 5509548 LBF_1226 LBF_1227   carB TRUE 0.808 18.000 0.004 1.000 N NA
 5509549 5509550 LBF_1228 LBF_1230     FALSE 0.330 25.000 0.000 NA   NA
 5509550 5509551 LBF_1230 LBF_1231   gcpE FALSE 0.199 44.000 0.000 NA   NA
 5509552 5509553 LBF_1232 LBF_1233   mutY TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509553 5509554 LBF_1233 LBF_1234 mutY   FALSE 0.307 31.000 0.000 1.000   NA
 5509554 5509555 LBF_1234 LBF_1235     FALSE 0.500 16.000 0.000 1.000   NA
 5509555 5509556 LBF_1235 LBF_1236     FALSE 0.369 22.000 0.000 NA   NA
 5509556 5509557 LBF_1236 LBF_1237   leuA-3 TRUE 0.962 -3.000 0.036 NA   NA
 5509557 5509558 LBF_1237 LBF_1238 leuA-3 pth-1 TRUE 0.919 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5509558 5509559 LBF_1238 LBF_1239 pth-1   FALSE 0.165 51.000 0.000 NA   NA
 5509559 5509560 LBF_1239 LBF_1240     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5509560 5509561 LBF_1240 LBF_1241     TRUE 0.949 2.000 0.003 NA   NA
 5509561 5509562 LBF_1241 LBF_1242   nuoA FALSE 0.033 116.000 0.000 1.000 N NA
 5509562 5509563 LBF_1242 LBF_1243 nuoA nuoB TRUE 0.989 -9.000 0.498 0.003 Y NA
 5509563 5509564 LBF_1243 LBF_1244 nuoB nuoC TRUE 0.991 -3.000 0.125 0.003 Y NA
 5509564 5509565 LBF_1244 LBF_1245 nuoC nuoD TRUE 0.971 17.000 0.096 0.007 Y NA
 5509565 5509566 LBF_1245 LBF_1246 nuoD nuoE TRUE 0.993 0.000 0.097 0.007 Y NA
 5509566 5509567 LBF_1246 LBF_1247 nuoE nuoF TRUE 0.992 2.000 0.061 0.007 Y NA
 5509567 5509568 LBF_1247 LBF_1248 nuoF nuoH TRUE 0.955 16.000 0.008 0.007 Y NA
 5509568 5509569 LBF_1248 LBF_1249 nuoH nuoJ TRUE 0.988 -3.000 0.032 0.007 Y NA
 5509569 5509570 LBF_1249 LBF_1250 nuoJ nuoK TRUE 0.991 -3.000 0.306 0.003 Y NA
 5509570 5509571 LBF_1250 LBF_1251 nuoK nuoL TRUE 0.989 5.000 0.790 0.007 Y NA
 5509571 5509572 LBF_1251 LBF_1252 nuoL   TRUE 0.994 2.000 0.183 0.002 Y NA
 5509572 5509573 LBF_1252 LBF_1253   nuoN TRUE 0.992 4.000 0.126 0.002 Y NA
 5509573 5509574 LBF_1253 LBF_1254 nuoN   FALSE 0.080 86.000 0.000 1.000   NA
 5509575 5509576 LBF_1255 LBF_1256 recJ   TRUE 0.754 21.000 0.004 NA N NA
 5509577 5509578 LBF_1257 LBF_1258     FALSE 0.096 74.000 0.000 NA   NA
 5509578 5509579 LBF_1258 LBF_1259     TRUE 0.758 1.000 0.000 1.000 N NA
 5509579 5509580 LBF_1259 LBF_1260     TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5509580 5509581 LBF_1260 LBF_1261     TRUE 0.987 7.000 0.375 1.000 Y NA
 5509581 5509582 LBF_1261 LBF_1262   lexA TRUE 0.714 51.000 0.167 1.000 N NA
 5509582 5509583 LBF_1262 LBF_1263 lexA   TRUE 0.813 37.000 0.250 NA   NA
 5509583 5509584 LBF_1263 LBF_1264   prc-2 TRUE 0.935 -7.000 0.006 NA   NA
 5509584 5509585 LBF_1264 LBF_1265 prc-2   TRUE 0.972 1.000 0.017 0.030 N NA
 5509585 5509586 LBF_1265 LBF_1266   pssA TRUE 0.920 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5509588 5509589 LBF_1268 LBF_1269   glpK-1 TRUE 0.959 2.000 0.006 1.000   NA
 5509590 5509591 LBF_1270 LBF_1271     TRUE 0.957 -3.000 1.000 NA   NA
 5509591 5509592 LBF_1271 LBF_1272   eutG TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 5509592 5509593 LBF_1272 LBF_1273 eutG   FALSE 0.520 84.000 0.231 NA   NA
 5509593 5509594 LBF_1273 LBF_1274     TRUE 0.759 21.000 0.003 NA   NA
 5509594 5509595 LBF_1274 LBF_1275     TRUE 0.912 -10.000 0.003 NA   NA
 5509597 5509598 LBF_1277 LBF_1278 nadE   FALSE 0.643 -13.000 0.000 1.000 N NA
 5509598 5509599 LBF_1278 LBF_1279     TRUE 0.802 1.000 0.000 1.000   NA
 5509600 5509601 LBF_1280 LBF_1281     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5509601 5509602 LBF_1281 LBF_1282   proC TRUE 0.925 -19.000 0.006 NA   NA
 5509604 5509605 LBF_1284 LBF_1285     TRUE 0.876 23.000 0.143 NA   NA
 5509605 5509606 LBF_1285 LBF_1286     TRUE 0.657 -21.000 0.000 NA   NA
 5509606 5509607 LBF_1286 LBF_1287   trmU TRUE 0.799 2.000 0.000 1.000   NA
 5509607 5509608 LBF_1287 LBF_1288 trmU   TRUE 0.939 -3.000 0.006 1.000 N NA
 5509608 5509609 LBF_1288 LBF_1289     TRUE 0.972 3.000 0.048 NA   NA
 5509609 5509610 LBF_1289 LBF_1290     TRUE 0.977 1.000 0.088 NA   NA
 5509610 5509611 LBF_1290 LBF_1291     FALSE 0.104 77.000 0.000 1.000   NA
 5509611 5509612 LBF_1291 LBF_1292     FALSE 0.556 12.000 0.000 NA   NA
 5509613 5509614 LBF_1293 LBF_1294     TRUE 0.968 1.000 1.000 NA   NA
 5509615 5509616 LBF_1295 LBF_1296     TRUE 0.982 3.000 0.113 0.010   NA
 5509616 5509617 LBF_1296 LBF_1297     TRUE 0.965 0.000 0.013 1.000   NA
 5509617 5509618 LBF_1297 LBF_1298     TRUE 0.953 -3.000 0.012 1.000   NA
 5509618 5509619 LBF_1298 LBF_1299     FALSE 0.484 67.000 0.008 NA   NA
 5509619 5509620 LBF_1299 LBF_1300     FALSE 0.155 55.000 0.000 NA   NA
 5509620 5509621 LBF_1300 LBF_1301     FALSE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 5509622 5509623 LBF_1302 LBF_1303     TRUE 0.716 5.000 0.000 NA   NA
 5509624 5509625 LBF_1304 LBF_1305     FALSE 0.009 245.000 0.000 NA   NA
 5509625 5509626 LBF_1305 LBF_1306   ahpC FALSE 0.279 36.000 0.000 1.000   NA
 5509626 5509627 LBF_1306 LBF_1307 ahpC sufB-1 FALSE 0.614 37.000 0.000 1.000 Y NA
 5509629 5509630 LBF_1309 LBF_1310     FALSE 0.101 69.000 0.000 1.000 N NA
 5509632 5509633 LBF_1312 LBF_1313     TRUE 0.912 -16.000 0.003 NA   NA
 5509633 5509634 LBF_1313 LBF_1314     TRUE 0.969 -3.000 0.091 NA   NA
 5509634 5509635 LBF_1314 LBF_1315     FALSE 0.005 335.000 0.000 NA   NA
 5509635 5509636 LBF_1315 LBF_1316     TRUE 0.872 22.000 0.679 NA   NA
 5509636 5509637 LBF_1316 LBF_1317     TRUE 0.955 20.000 0.550 NA Y NA
 5509637 5509638 LBF_1317 LBF_1318     TRUE 0.975 2.000 0.730 NA   NA
 5509638 5509639 LBF_1318 LBF_1319     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509639 5509640 LBF_1319 LBF_1320     FALSE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 5509640 5509641 LBF_1320 LBF_1321     TRUE 0.941 11.000 0.750 NA   NA
 5509643 5509644 LBF_1323 LBF_1324     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509644 5509645 LBF_1324 LBF_1325     FALSE 0.086 79.000 0.000 NA   NA
 5509646 5509647 LBF_1326 LBF_1327     TRUE 0.697 -15.000 0.000 1.000   NA
 5509647 5509648 LBF_1327 LBF_1328     FALSE 0.010 247.000 0.000 1.000   NA
 5509648 5509649 LBF_1328 LBF_1329   lgt TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5509654 5509655 LBF_1334 LBF_1335 rplM rpsI TRUE 0.993 2.000 0.601 0.015 Y NA
 5509655 5509656 LBF_1335 LBF_1336 rpsI   FALSE 0.076 83.000 0.000 NA   NA
 5509656 5509657 LBF_1336 LBF_1337   alaS FALSE 0.168 50.000 0.000 NA   NA
 5509657 5509658 LBF_1337 LBF_1338 alaS   FALSE 0.616 37.000 0.003 NA   NA
 5509658 5509659 LBF_1338 LBF_1339     FALSE 0.089 78.000 0.000 NA   NA
 5509659 5509660 LBF_1339 LBF_1340   lolA-1 FALSE 0.201 41.000 0.000 1.000 N NA
 5509660 5509661 LBF_1340 LBF_1341 lolA-1   TRUE 0.907 20.000 0.300 1.000   NA
 5509661 5509662 LBF_1341 LBF_1342   miaB-2 TRUE 0.980 0.000 0.300 1.000   NA
 5509662 5509663 LBF_1342 LBF_1343 miaB-2 pgsA-1 TRUE 0.945 0.000 0.003 1.000 N NA
 5509663 5509664 LBF_1343 LBF_1344 pgsA-1 trpD TRUE 0.904 -19.000 0.003 1.000 N NA
 5509664 5509665 LBF_1344 LBF_1345 trpD yajC TRUE 0.666 27.000 0.003 NA N NA
 5509665 5509666 LBF_1345 LBF_1346 yajC   TRUE 0.949 2.000 0.003 NA   NA
 5509666 5509667 LBF_1346 LBF_1347   secD TRUE 0.856 22.000 0.038 NA   NA
 5509667 5509668 LBF_1347 LBF_1348 secD secF TRUE 0.990 -7.000 0.244 0.001 Y NA
 5509668 5509669 LBF_1348 LBF_1349 secF ribD FALSE 0.561 11.000 0.000 1.000 N NA
 5509669 5509670 LBF_1349 LBF_1350 ribD ribC TRUE 0.934 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5509673 5509674 LBF_1353 LBF_1354 pdxH   TRUE 0.658 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5509674 5509675 LBF_1354 LBF_1355     TRUE 0.828 19.000 0.008 1.000 N NA
 5509676 5509677 LBF_1356 LBF_1357   smpB TRUE 0.725 6.000 0.000 1.000   NA
 5509677 5509678 LBF_1357 LBF_1358 smpB   TRUE 0.942 -3.000 0.005 1.000   NA
 5509678 5509679 LBF_1358 LBF_1359     TRUE 0.956 -3.000 0.014 1.000   NA
 5509679 5509680 LBF_1359 LBF_1360     TRUE 0.941 -10.000 0.012 NA   NA
 5509683 5509684 LBF_1363 LBF_1364     FALSE 0.401 20.000 0.000 NA   NA
 5509684 5509685 LBF_1364 LBF_1365   glnA FALSE 0.039 114.000 0.000 NA   NA
 5509687 5509688 LBF_1367 LBF_1368     FALSE 0.172 49.000 0.000 NA   NA
 5509688 5509689 LBF_1368 LBF_1369     TRUE 0.987 -3.000 0.063 1.000 Y NA
 5509690 5509691 LBF_1370 LBF_1371   malQ TRUE 0.889 10.000 0.000 1.000 Y NA
 5509691 5509692 LBF_1371 LBF_1372 malQ   FALSE 0.064 91.000 0.000 NA   NA
 5509695 5509696 LBF_1375 LBF_1376   nlpD FALSE 0.027 141.000 0.000 NA   NA
 5509696 5509697 LBF_1376 LBF_1377 nlpD   TRUE 0.957 20.000 0.214 NA Y NA
 5509697 5509698 LBF_1377 LBF_1378     TRUE 0.841 60.000 0.125 NA Y NA
 5509698 5509699 LBF_1378 LBF_1379     TRUE 0.863 25.000 0.125 NA   NA
 5509700 5509701 LBF_1380 LBF_1381 lysA ispD TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5509702 5509703 LBF_1382 LBF_1383     FALSE 0.270 37.000 0.000 1.000   NA
 5509703 5509704 LBF_1383 LBF_1384     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509705 5509706 LBF_1385 LBF_1386     FALSE 0.003 594.000 0.000 NA   NA
 5509706 5509707 LBF_1386 LBF_1387     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5509707 5509708 LBF_1387 LBF_1388     FALSE 0.072 85.000 0.000 NA   NA
 5509708 5509709 LBF_1388 LBF_1389     FALSE 0.013 204.000 0.000 NA   NA
 5509709 5509710 LBF_1389 LBF_1390     FALSE 0.050 101.000 0.000 NA   NA
 5509710 5509711 LBF_1390 LBF_1391     FALSE 0.471 91.000 0.500 NA   NA
 5509711 5509712 LBF_1391 LBF_1392     FALSE 0.033 124.000 0.000 NA   NA
 5509715 5509716 LBF_1395 LBF_1396     FALSE 0.016 186.000 0.000 NA   NA
 5509716 5509717 LBF_1396 LBF_1397   coaE TRUE 0.921 -3.000 0.003 NA   NA
 5509717 5509718 LBF_1397 LBF_1398 coaE   FALSE 0.087 83.000 0.000 1.000   NA
 5509720 5509721 LBF_1400 LBF_1401     FALSE 0.148 58.000 0.000 NA   NA
 5509722 5509723 LBF_1402 LBF_1403     FALSE 0.008 262.000 0.000 NA   NA
 5509724 5509725 LBF_1405 LBF_1406 rsbU-1   FALSE 0.230 39.000 0.000 NA   NA
 5509727 5509728 LBF_1408 LBF_1409   lipA TRUE 0.947 3.000 0.004 NA   NA
 5509729 5509730 LBF_1410 LBF_1411 rsuA   FALSE 0.151 57.000 0.000 NA   NA
 5509730 5509731 LBF_1411 LBF_1412     FALSE 0.030 131.000 0.000 NA   NA
 5509732 5509733 LBF_1413 LBF_1414 mipB   FALSE 0.575 53.000 0.008 NA   NA
 5509733 5509734 LBF_1414 LBF_1415     TRUE 0.686 44.000 1.000 NA   NA
 5509734 5509735 LBF_1415 LBF_1416   purH TRUE 0.946 0.000 0.003 NA   NA
 5509735 5509736 LBF_1416 LBF_1417 purH purN TRUE 0.989 -3.000 0.225 1.000 Y NA
 5509737 5509738 LBF_1418 LBF_1419 fliS   TRUE 0.919 16.000 0.167 NA   NA
 5509738 5509739 LBF_1419 LBF_1420     TRUE 0.657 -21.000 0.000 NA   NA
 5509740 5509741 LBF_1421 LBF_1422     TRUE 0.977 0.000 0.565 NA   NA
 5509741 5509742 LBF_1422 LBF_1423     TRUE 0.889 22.000 0.308 NA   NA
 5509742 5509743 LBF_1423 LBF_1424     FALSE 0.386 21.000 0.000 NA   NA
 5509743 5509744 LBF_1424 LBF_1425     FALSE 0.021 168.000 0.000 NA   NA
 5509744 5509745 LBF_1425 LBF_1426     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509746 5509747 LBF_1427 LBF_1428 dgt gst-3 FALSE 0.188 38.000 0.000 NA N NA
 5509748 5509749 LBF_1429 LBF_1430   argC TRUE 0.668 -13.000 0.000 NA   NA
 5509750 5509751 LBF_3364 LBF_1431     TRUE 0.658 -19.000 0.000 NA   NA
 5509751 5509752 LBF_1431 LBF_1432     FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 5509755 5509756 LBF_1435 LBF_1436   prc TRUE 0.716 5.000 0.000 NA   NA
 5509757 5509758 LBF_1437 LBF_1438     FALSE 0.004 440.000 0.000 NA   NA
 5509759 5509760 LBF_1439 LBF_1440     FALSE 0.045 105.000 0.000 NA   NA
 5509760 5509761 LBF_1440 LBF_1441     TRUE 0.857 14.000 0.005 NA   NA
 5509761 5509762 LBF_1441 LBF_1442     TRUE 0.983 2.000 0.005 1.000 Y NA
 5509762 5509763 LBF_1442 LBF_1443     TRUE 0.967 5.000 0.086 1.000 N NA
 5509763 5509764 LBF_1443 LBF_1444     TRUE 0.977 0.000 0.500 NA   NA
 5509765 5509766 LBF_1445 LBF_1446     FALSE 0.213 42.000 0.000 NA   NA
 5509768 5509769 LBF_1448 LBF_1449     FALSE 0.306 27.000 0.000 NA   NA
 5509769 5509770 LBF_1449 LBF_1450     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5509771 5509772 LBF_1451 LBF_1452     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5509773 5509774 LBF_1453 LBF_1454     TRUE 0.743 -3.000 0.000 1.000   NA
 5509774 5509775 LBF_1454 LBF_1455     FALSE 0.482 54.000 0.000 1.000 Y NA
 5509777 5509778 LBF_1457 LBF_1458     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 5509778 5509779 LBF_1458 LBF_1459     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5509780 5509781 LBF_1460 LBF_1461     FALSE 0.401 20.000 0.000 NA   NA
 5509782 5509783 LBF_1462 LBF_1463     FALSE 0.556 12.000 0.000 NA   NA
 5509783 5509784 LBF_1463 LBF_1464     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509784 5509785 LBF_1464 LBF_1465     FALSE 0.006 307.000 0.000 NA   NA
 5509785 5509786 LBF_1465 LBF_1466     TRUE 0.950 11.000 0.185 NA   NA
 5509787 5509788 LBF_1467 LBF_1468     TRUE 0.949 0.000 0.004 NA   NA
 5509788 5509789 LBF_1468 LBF_1469     TRUE 0.952 1.000 0.004 NA   NA
 5509790 5509791 LBF_1470 LBF_1471   nusA TRUE 0.716 5.000 0.000 NA   NA
 5509791 5509792 LBF_1471 LBF_1472 nusA infB FALSE 0.437 16.000 0.000 1.000 N NA
 5509792 5509793 LBF_1472 LBF_1473 infB rbfA TRUE 0.980 11.000 0.530 1.000 Y NA
 5509793 5509794 LBF_1473 LBF_1474 rbfA truB TRUE 0.806 69.000 0.111 1.000 Y NA
 5509794 5509795 LBF_1474 LBF_1475 truB rpsO TRUE 0.904 27.000 0.013 1.000 Y NA
 5509795 5509796 LBF_1475 LBF_1476 rpsO pnp TRUE 0.988 6.000 0.335 1.000 Y NA
 5509796 5509797 LBF_1476 LBF_1477 pnp   TRUE 0.783 38.000 0.057 1.000   NA
 5509797 5509798 LBF_1477 LBF_1478   dut TRUE 0.677 54.000 0.045 1.000   NA
 5509798 5509799 LBF_1478 LBF_1479 dut flgG-1 FALSE 0.092 72.000 0.000 1.000 N NA
 5509799 5509800 LBF_1479 LBF_1480 flgG-1 flgA TRUE 0.978 0.000 0.319 NA   NA
 5509800 5509801 LBF_1480 LBF_1481 flgA flgH TRUE 0.972 4.000 0.085 NA   NA
 5509801 5509802 LBF_1481 LBF_1482 flgH flgI TRUE 0.991 5.000 0.235 0.010 Y NA
 5509802 5509803 LBF_1482 LBF_1483 flgI   TRUE 0.790 36.000 0.045 1.000   NA
 5509804 5509805 LBF_1484 LBF_1485     TRUE 0.918 10.000 0.006 1.000   NA
 5509805 5509806 LBF_1485 LBF_1486     TRUE 0.984 0.000 0.333 0.007   NA
 5509806 5509807 LBF_1486 LBF_1487   accC-1 TRUE 0.973 -3.000 0.333 1.000   NA
 5509807 5509808 LBF_1487 LBF_1488 accC-1   TRUE 0.802 1.000 0.000 1.000   NA
 5509810 5509811 LBF_1490 LBF_1491     FALSE 0.019 176.000 0.000 NA   NA
 5509811 5509812 LBF_1491 LBF_1492     FALSE 0.415 25.000 0.000 0.034 N NA
 5509815 5509816 LBF_1495 LBF_1496     TRUE 0.985 -22.000 0.833 0.025 Y NA
 5509817 5509818 LBF_1497 LBF_1498     TRUE 0.660 40.000 0.000 0.009 Y NA
 5509819 5509820 LBF_1499 LBF_1500     FALSE 0.032 141.000 0.000 1.000   NA
 5509825 5509826 LBF_1505 LBF_1506 acoC acoB TRUE 0.984 11.000 0.254 0.057 Y NA
 5509826 5509827 LBF_1506 LBF_1508 acoB acoA TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5509829 5509830 LBF_3368 LBF_1510   fbp FALSE 0.046 104.000 0.000 NA   NA
 5509831 5509832 LBF_1511 LBF_1512   rpsU FALSE 0.067 89.000 0.000 NA   NA
 5509832 5509833 LBF_1512 LBF_1513 rpsU   TRUE 0.843 20.000 0.004 0.023   NA
 5509833 5509834 LBF_1513 LBF_1514   dnaG TRUE 0.938 13.000 0.137 1.000   NA
 5509834 5509835 LBF_1514 LBF_1515 dnaG rpoD TRUE 0.913 17.000 0.299 1.000 N NA
 5509835 5509836 LBF_1515 LBF_1516 rpoD   FALSE 0.352 23.000 0.000 NA   NA
 5509838 5509839 LBF_1518 LBF_1519 tyrS   FALSE 0.398 72.000 0.005 1.000 N NA
 5509840 5509841 LBF_1520 LBF_1521   def FALSE 0.599 48.000 0.012 NA N NA
 5509841 5509842 LBF_1521 LBF_1522 def   FALSE 0.038 115.000 0.000 NA   NA
 5509843 5509844 LBF_1523 LBF_1524     TRUE 0.965 5.000 0.750 NA   NA
 5509844 5509845 LBF_1524 LBF_1525     TRUE 0.926 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5509845 5509846 LBF_1525 LBF_1526   accA FALSE 0.163 48.000 0.000 1.000 N NA
 5509846 5509847 LBF_1526 LBF_1527 accA accC-2 TRUE 0.989 6.000 0.750 0.002 Y NA
 5509848 5509849 LBF_1528 LBF_1529     TRUE 0.989 4.000 0.079 1.000 Y NA
 5509849 5509850 LBF_1529 LBF_1530   cheW-2 TRUE 0.991 1.000 0.079 1.000 Y NA
 5509850 5509851 LBF_1530 LBF_1531 cheW-2   TRUE 0.975 15.000 0.500 0.017 Y NA
 5509851 5509852 LBF_1531 LBF_1532   cheA TRUE 0.993 2.000 0.333 0.017 Y NA
 5509852 5509853 LBF_1532 LBF_1533 cheA   TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5509853 5509854 LBF_1533 LBF_1534   cheY TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5509854 5509855 LBF_1534 LBF_1535 cheY   TRUE 0.982 12.000 0.400 0.025 Y NA
 5509855 5509856 LBF_1535 LBF_1536     FALSE 0.508 49.000 0.000 1.000 Y NA
 5509856 5509857 LBF_1536 LBF_1537   lytB TRUE 0.755 2.000 0.000 1.000 N NA
 5509858 5509859 LBF_1538 LBF_1539 flaB1 ilvA FALSE 0.008 273.000 0.000 1.000   NA
 5509860 5509861 LBF_1540 LBF_1541   metX TRUE 0.970 -3.000 0.509 NA   NA
 5509861 5509862 LBF_1541 LBF_1542 metX metY TRUE 0.977 9.000 0.021 1.000 Y NA
 5509864 5509865 LBF_1544 LBF_1545     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5509865 5509866 LBF_1545 LBF_1546     FALSE 0.401 20.000 0.000 NA   NA
 5509866 5509867 LBF_1546 LBF_1547     FALSE 0.275 123.000 0.750 NA   NA
 5509868 5509869 LBF_1548 LBF_1549 fliN-2   FALSE 0.257 39.000 0.000 1.000   NA
 5509869 5509870 LBF_1549 LBF_1550     FALSE 0.024 155.000 0.000 NA   NA
 5509871 5509872 LBF_1551 LBF_1552     TRUE 0.991 2.000 0.952 0.086 Y NA
 5509872 5509873 LBF_1552 LBF_1553     FALSE 0.614 94.000 0.034 NA Y NA
 5509874 5509875 LBF_1554 LBF_1555   argH TRUE 0.927 -3.000 0.003 NA   NA
 5509875 5509876 LBF_1555 LBF_1556 argH ppiB-2 TRUE 0.932 -3.000 0.003 1.000   NA
 5509876 5509877 LBF_1556 LBF_1557 ppiB-2   TRUE 0.961 -3.000 0.034 NA   NA
 5509877 5509878 LBF_1557 LBF_1558     FALSE 0.083 80.000 0.000 NA   NA
 5509878 5509879 LBF_1558 LBF_1559   fliM TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509879 5509880 LBF_1559 LBF_1560 fliM   FALSE 0.245 41.000 0.000 1.000   NA
 5509881 5509882 LBF_1561 LBF_1562     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509882 5509883 LBF_1562 LBF_1563     TRUE 0.960 1.000 0.008 NA   NA
 5509886 5509887 LBF_1566 LBF_1567     FALSE 0.464 16.000 0.000 NA   NA
 5509889 5509890 LBF_1569 LBF_1570     TRUE 0.937 -13.000 0.011 NA   NA
 5509890 5509891 LBF_1570 LBF_1571   gmhA-1 TRUE 0.947 -10.000 0.019 NA   NA
 5509891 5509892 LBF_1571 LBF_1572 gmhA-1   FALSE 0.643 -13.000 0.000 1.000 N NA
 5509892 5509893 LBF_1572 LBF_1573     FALSE 0.650 -40.000 0.000 NA   NA
 5509893 5509894 LBF_1573 LBF_1574     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5509894 5509895 LBF_1574 LBF_1575   leuC FALSE 0.086 79.000 0.000 NA   NA
 5509895 5509896 LBF_1575 LBF_1576 leuC leuD TRUE 0.994 2.000 0.309 0.001 Y NA
 5509896 5509897 LBF_1576 LBF_1577 leuD   TRUE 0.794 0.000 0.000 1.000   NA
 5509897 5509898 LBF_1577 LBF_1578   cysK-3 TRUE 0.802 1.000 0.000 1.000   NA
 5509900 5509901 LBF_1580 LBF_1581 recN   FALSE 0.352 75.000 0.004 1.000 N NA
 5509901 5509902 LBF_1581 LBF_1582     TRUE 0.978 11.000 0.028 0.027 Y NA
 5509902 5509903 LBF_1582 LBF_1583     TRUE 0.963 4.000 0.028 1.000 N NA
 5509903 5509904 LBF_1583 LBF_1584   uvrD-1 TRUE 0.973 1.000 0.047 1.000 N NA
 5509904 5509905 LBF_1584 LBF_1585 uvrD-1   TRUE 0.894 19.000 0.667 NA   NA
 5509905 5509906 LBF_1585 LBF_1586     TRUE 0.827 23.000 1.000 NA   NA
 5509906 5509907 LBF_1586 LBF_1587     TRUE 0.948 -6.000 1.000 1.000 N NA
 5509909 5509910 LBF_1589 LBF_1590     FALSE 0.026 136.000 0.000 1.000 N NA
 5509910 5509911 LBF_1590 LBF_1591     FALSE 0.068 87.000 0.000 NA   NA
 5509913 5509914 LBF_1593 LBF_1594     TRUE 0.973 -3.000 0.032 0.001   NA
 5509914 5509915 LBF_1594 LBF_1595   pyrG FALSE 0.423 64.000 0.003 1.000   NA
 5509915 5509916 LBF_1595 LBF_1596 pyrG kdsA TRUE 0.977 2.000 0.138 1.000 N NA
 5509916 5509917 LBF_1596 LBF_1597 kdsA   TRUE 0.873 13.000 0.005 NA   NA
 5509917 5509918 LBF_1597 LBF_1598     TRUE 0.956 -3.000 0.020 NA   NA
 5509918 5509919 LBF_1598 LBF_1599     TRUE 0.962 -16.000 0.543 NA   NA
 5509919 5509920 LBF_1599 LBF_1600   rpoN TRUE 0.977 1.000 0.059 1.000   NA
 5509920 5509921 LBF_1600 LBF_1601 rpoN hprK TRUE 0.958 4.000 0.017 1.000 N NA
 5509921 5509922 LBF_1601 LBF_1602 hprK   TRUE 0.948 -25.000 0.036 1.000 N NA
 5509922 5509923 LBF_1602 LBF_1603     TRUE 0.940 -10.000 0.013 1.000 N NA
 5509923 5509924 LBF_1603 LBF_1604     TRUE 0.992 0.000 0.533 0.099 Y NA
 5509924 5509925 LBF_1604 LBF_1605     TRUE 0.963 2.000 0.012 NA   NA
 5509925 5509926 LBF_1605 LBF_1606   priA TRUE 0.949 2.000 0.003 NA   NA
 5509926 5509927 LBF_1606 LBF_1607 priA fmt TRUE 0.944 10.000 0.052 1.000 N NA
 5509927 5509928 LBF_1607 LBF_1608 fmt   TRUE 0.942 -3.000 0.005 1.000   NA
 5509928 5509929 LBF_1608 LBF_1609   rpe TRUE 0.972 2.000 0.026 1.000   NA
 5509929 5509930 LBF_1609 LBF_1610 rpe rpsP TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5509930 5509931 LBF_1610 LBF_1611 rpsP   TRUE 0.965 8.000 0.385 1.000   NA
 5509931 5509932 LBF_1611 LBF_1612   rimM TRUE 0.968 -10.000 0.324 1.000   NA
 5509932 5509933 LBF_1612 LBF_1613 rimM trmD TRUE 0.985 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 5509933 5509934 LBF_1613 LBF_1614 trmD rplS TRUE 0.983 9.000 0.567 1.000 Y NA
 5509934 5509935 LBF_1614 LBF_1615 rplS rnhB TRUE 0.965 -3.000 0.066 1.000 N NA
 5509935 5509936 LBF_1615 LBF_1616 rnhB   FALSE 0.653 -25.000 0.000 NA   NA
 5509936 5509937 LBF_1616 LBF_1617     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5509937 5509938 LBF_1617 LBF_1618     TRUE 0.797 35.000 0.062 NA   NA
 5509938 5509939 LBF_1618 LBF_1619     FALSE 0.114 175.000 0.010 NA N NA
 5509939 5509940 LBF_1619 LBF_1620     FALSE 0.217 103.000 0.004 NA   NA
 5509942 5509943 LBF_1622 LBF_1623     FALSE 0.422 97.000 0.105 NA   NA
 5509943 5509944 LBF_1623 LBF_1624   gspC TRUE 0.775 30.000 0.014 1.000   NA
 5509944 5509945 LBF_1624 LBF_1625 gspC gspD TRUE 0.977 2.000 0.065 1.000   NA
 5509945 5509946 LBF_1625 LBF_1626 gspD gspE TRUE 0.991 -3.000 0.149 0.002 Y NA
 5509946 5509947 LBF_1626 LBF_1627 gspE gspF TRUE 0.991 5.000 0.119 0.002 Y NA
 5509947 5509948 LBF_1627 LBF_1628 gspF gspG TRUE 0.986 6.000 0.599 NA Y NA
 5509948 5509949 LBF_1628 LBF_1629 gspG   TRUE 0.939 -25.000 0.014 NA   NA
 5509949 5509950 LBF_1629 LBF_1630     TRUE 0.944 -22.000 1.000 NA   NA
 5509950 5509951 LBF_1630 LBF_1631     TRUE 0.966 0.000 0.018 NA   NA
 5509951 5509952 LBF_1631 LBF_1632   gspK TRUE 0.941 -37.000 0.018 NA   NA
 5509952 5509953 LBF_1632 LBF_1633 gspK   TRUE 0.972 3.000 0.039 1.000   NA
 5509953 5509954 LBF_1633 LBF_1634     TRUE 0.972 0.000 0.039 NA   NA
 5509954 5509955 LBF_1634 LBF_1635     TRUE 0.968 1.000 1.000 NA   NA
 5509957 5509958 LBF_1637 LBF_1638     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 5509963 5509964 LBF_1643 LBF_1644     FALSE 0.037 117.000 0.000 NA   NA
 5509965 5509966 LBF_1645 LBF_1646   sdhA TRUE 0.927 19.000 0.598 0.001   NA
 5509966 5509967 LBF_1646 LBF_1647 sdhA sdhB TRUE 0.993 0.000 0.470 0.001 Y NA
 5509968 5509969 LBF_1648 LBF_1649     FALSE 0.386 21.000 0.000 NA   NA
 5509969 5509970 LBF_1649 LBF_1650     TRUE 0.696 6.000 0.000 NA   NA
 5509970 5509971 LBF_1650 LBF_1651   lepA FALSE 0.560 13.000 0.000 1.000   NA
 5509972 5509973 LBF_1652 LBF_1653 eno   TRUE 0.970 2.000 0.020 1.000   NA
 5509973 5509974 LBF_1653 LBF_1654   clpP-2 TRUE 0.973 2.000 0.030 1.000   NA
 5509974 5509975 LBF_1654 LBF_1655 clpP-2   TRUE 0.668 -13.000 0.000 NA   NA
 5509975 5509976 LBF_1655 LBF_1656     FALSE 0.213 42.000 0.000 NA   NA
 5509976 5509977 LBF_1656 LBF_1657     TRUE 0.971 -3.000 0.417 NA   NA
 5509977 5509978 LBF_1657 LBF_1658     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5509978 5509979 LBF_1658 LBF_1659     TRUE 0.837 26.000 0.058 NA   NA
 5509980 5509981 LBF_1660 LBF_1661     TRUE 0.948 8.000 0.027 NA   NA
 5509982 5509983 LBF_1662 LBF_1663     TRUE 0.738 37.000 1.000 NA   NA
 5509983 5509984 LBF_1663 LBF_1664     FALSE 0.074 84.000 0.000 NA   NA
 5509984 5509985 LBF_1664 LBF_1665     FALSE 0.061 98.000 0.000 1.000   NA
 5509985 5509986 LBF_1665 LBF_1666     FALSE 0.215 121.000 0.009 1.000   NA
 5509986 5509987 LBF_1666 LBF_1667     TRUE 0.948 -3.000 0.009 NA   NA
 5509988 5509989 LBF_1668 LBF_1669   asnS FALSE 0.162 60.000 0.000 1.000   NA
 5509990 5509991 LBF_1670 LBF_1671 folD   TRUE 0.955 -16.000 0.081 NA N NA
 5509991 5509992 LBF_1671 LBF_1672   cysS TRUE 0.913 -3.000 0.003 NA N NA
 5509992 5509993 LBF_1672 LBF_1673 cysS spoU TRUE 0.984 -18.000 0.088 1.000 Y NA
 5509993 5509994 LBF_1673 LBF_1674 spoU   TRUE 0.668 -13.000 0.000 NA   NA
 5509995 5509996 LBF_1675 LBF_1676   hisF-1 TRUE 0.926 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 5509996 5509997 LBF_1676 LBF_1677 hisF-1   TRUE 0.943 2.000 0.003 1.000 N NA
 5509997 5509998 LBF_1677 LBF_1678   gatC TRUE 0.947 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 5509998 5509999 LBF_1678 LBF_1679 gatC   FALSE 0.550 10.000 0.000 NA N NA
 5509999 5510000 LBF_1679 LBF_1680     TRUE 0.915 14.000 0.051 NA   NA
 5510003 5510004 LBF_1683 LBF_1684 uvrD-2   FALSE 0.194 45.000 0.000 NA   NA
 5510005 5510006 LBF_1685 LBF_1686     TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5510007 5510008 LBF_1687 LBF_1688     FALSE 0.041 111.000 0.000 NA   NA
 5510009 5510010 LBF_1689 LBF_1690     TRUE 0.743 -3.000 0.000 1.000   NA
 5510012 5510013 LBF_1692 LBF_1693     FALSE 0.140 61.000 0.000 NA   NA
 5510013 5510014 LBF_1693 LBF_1694     TRUE 0.978 2.000 0.431 NA   NA
 5510015 5510016 LBF_1695 LBF_1696     TRUE 0.974 0.000 0.750 NA   NA
 5510017 5510018 LBF_1697 LBF_1698 lspA   TRUE 0.854 26.000 0.111 NA   NA
 5510018 5510019 LBF_1698 LBF_1699     TRUE 0.969 -3.000 0.111 NA   NA
 5510020 5510021 LBF_1700 LBF_1701 murF purE FALSE 0.641 31.000 0.003 1.000 N NA
 5510021 5510022 LBF_1701 LBF_1702 purE purK TRUE 0.990 7.000 0.201 0.001 Y NA
 5510023 5510024 LBF_1703 LBF_1704 murC-1 murG TRUE 0.964 14.000 0.036 1.000 Y NA
 5510024 5510025 LBF_1704 LBF_1705 murG ftsW TRUE 0.964 -3.000 0.058 1.000 N NA
 5510025 5510026 LBF_1705 LBF_1706 ftsW mraY TRUE 0.950 0.000 0.003 0.038 N NA
 5510026 5510027 LBF_1706 LBF_1707 mraY murE TRUE 0.974 11.000 0.011 0.005 Y NA
 5510027 5510028 LBF_1707 LBF_1708 murE   TRUE 0.942 -3.000 0.006 NA   NA
 5510028 5510029 LBF_1708 LBF_1709   mraW TRUE 0.925 -3.000 0.003 NA   NA
 5510033 5510034 LBF_1713 LBF_1714   amtB-2 FALSE 0.230 39.000 0.000 NA   NA
 5510034 5510035 LBF_1714 LBF_1715 amtB-2   FALSE 0.561 11.000 0.000 1.000 N NA
 5510035 5510036 LBF_1715 LBF_1716     FALSE 0.019 175.000 0.000 NA   NA
 5510037 5510038 LBF_1717 LBF_1718     FALSE 0.102 72.000 0.000 NA   NA
 5510040 5510041 LBF_1720 LBF_1721 rplU   TRUE 0.991 1.000 0.208 NA Y NA
 5510041 5510042 LBF_1721 LBF_1722   rpmA TRUE 0.990 4.000 0.203 NA Y NA
 5510042 5510043 LBF_1722 LBF_1723 rpmA   FALSE 0.590 77.000 0.335 1.000   NA
 5510043 5510044 LBF_1723 LBF_1724   proB TRUE 0.966 -13.000 0.206 1.000   NA
 5510044 5510045 LBF_1724 LBF_1725 proB proA TRUE 0.993 4.000 0.281 0.001 Y NA
 5510045 5510046 LBF_1725 LBF_1726 proA nadD TRUE 0.978 2.000 0.170 1.000 N NA
 5510046 5510047 LBF_1726 LBF_1727 nadD   TRUE 0.989 -3.000 0.199 1.000 Y NA
 5510047 5510048 LBF_1727 LBF_1728     TRUE 0.970 1.000 0.024 NA   NA
 5510048 5510049 LBF_1728 LBF_1729     TRUE 0.965 2.000 0.014 NA   NA
 5510051 5510052 LBF_1731 LBF_1732     TRUE 0.743 -3.000 0.000 1.000   NA
 5510052 5510053 LBF_1732 LBF_1733   caiD FALSE 0.131 68.000 0.000 1.000   NA
 5510054 5510055 LBF_1734 LBF_1735   pepP FALSE 0.419 17.000 0.000 1.000 N NA
 5510055 5510056 LBF_1735 LBF_1736 pepP   TRUE 0.954 -3.000 0.018 1.000 N NA
 5510056 5510057 LBF_1736 LBF_1737   paaJ-3 TRUE 0.974 0.000 0.075 1.000 N NA
 5510058 5510059 LBF_1738 LBF_1739 bfr   FALSE 0.522 54.000 0.006 NA N NA
 5510059 5510060 LBF_1739 LBF_1740     TRUE 0.943 -3.000 0.006 NA   NA
 5510060 5510061 LBF_1740 LBF_1741     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510062 5510063 LBF_1742 LBF_1743     TRUE 0.971 -3.000 0.200 NA   NA
 5510063 5510064 LBF_1743 LBF_1744   kamA TRUE 0.970 -3.000 0.300 1.000 N NA
 5510065 5510066 LBF_1745 LBF_1746     FALSE 0.257 35.000 0.000 NA   NA
 5510066 5510067 LBF_1746 LBF_1747     FALSE 0.148 58.000 0.000 NA   NA
 5510069 5510070 LBF_1749 LBF_1750     FALSE 0.034 133.000 0.000 1.000   NA
 5510070 5510071 LBF_1750 LBF_1751     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510071 5510072 LBF_1751 LBF_1752   rsbU-7 TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5510074 5510075 LBF_1754 LBF_1755     TRUE 0.776 -19.000 0.000 0.024   NA
 5510080 5510081 LBF_1760 LBF_1761     FALSE 0.424 71.000 0.005 NA   NA
 5510081 5510082 LBF_1761 LBF_1762   miaB-1 TRUE 0.933 -7.000 0.005 1.000   NA
 5510084 5510085 LBF_1764 LBF_1765     TRUE 0.775 2.000 0.000 NA   NA
 5510085 5510086 LBF_1765 LBF_1766     FALSE 0.316 26.000 0.000 NA   NA
 5510088 5510089 LBF_1768 LBF_1769 bacA lipL31 TRUE 0.956 7.000 0.039 NA   NA
 5510089 5510090 LBF_1769 LBF_1770 lipL31 mfd FALSE 0.213 101.000 0.003 NA   NA
 5510090 5510091 LBF_1770 LBF_1771 mfd panC TRUE 0.887 10.000 0.003 1.000 N NA
 5510091 5510092 LBF_1771 LBF_1772 panC hisD TRUE 0.927 -3.000 0.003 1.000 N NA
 5510092 5510093 LBF_1772 LBF_1773 hisD   FALSE 0.199 44.000 0.000 NA   NA
 5510093 5510094 LBF_1773 LBF_1774     TRUE 0.948 -10.000 1.000 NA   NA
 5510094 5510095 LBF_1774 LBF_1775     TRUE 0.944 8.000 1.000 NA   NA
 5510096 5510097 LBF_1776 LBF_1777 xthA   FALSE 0.291 34.000 0.000 1.000   NA
 5510098 5510099 LBF_1778 LBF_1779   mgtE TRUE 0.666 64.000 0.286 NA   NA
 5510100 5510101 LBF_1780 LBF_1781     TRUE 0.668 -13.000 0.000 NA   NA
 5510101 5510102 LBF_1781 LBF_1782   czcD-2 TRUE 0.658 -7.000 0.000 1.000 N NA
 5510103 5510104 LBF_1783 LBF_1784   uvrA TRUE 0.725 6.000 0.000 1.000   NA
 5510106 5510107 LBF_1786 LBF_1787     TRUE 0.963 2.000 0.012 NA   NA
 5510108 5510109 LBF_1788 LBF_1789   ugpQ TRUE 0.716 5.000 0.000 NA   NA
 5510111 5510112 LBF_1791 LBF_1792   leuA-2 FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 5510112 5510113 LBF_1792 LBF_1793 leuA-2 hisC TRUE 0.934 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5510114 5510115 LBF_1794 LBF_1795 ibpA-2 ibpA-1 TRUE 0.983 9.000 0.250 NA Y NA
 5510116 5510117 LBF_1796 LBF_1797 tdcF   TRUE 0.957 -3.000 1.000 NA   NA
 5510118 5510119 LBF_1798 LBF_1799 clpA-2   TRUE 0.969 -3.000 0.596 NA   NA
 5510119 5510120 LBF_1799 LBF_1800     TRUE 0.964 0.000 0.013 NA   NA
 5510120 5510121 LBF_1800 LBF_1801     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5510121 5510122 LBF_1801 LBF_1802   dedA FALSE 0.299 28.000 0.000 NA   NA
 5510123 5510124 LBF_1803 LBF_1804     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5510124 5510125 LBF_1804 LBF_1805   xseA TRUE 0.951 1.000 0.004 NA   NA
 5510125 5510126 LBF_1805 LBF_1806 xseA xseB TRUE 0.990 -10.000 0.412 0.001 Y NA
 5510126 5510127 LBF_1806 LBF_1807 xseB   TRUE 0.719 4.000 0.000 1.000 N NA
 5510129 5510130 LBF_1809 LBF_1810     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510130 5510131 LBF_1810 LBF_1811     TRUE 0.983 9.000 0.333 NA Y NA
 5510131 5510132 LBF_1811 LBF_1812     TRUE 0.924 33.000 0.333 NA Y NA
 5510132 5510133 LBF_1812 LBF_1813   lpxC FALSE 0.014 179.000 0.000 NA N NA
 5510133 5510134 LBF_1813 LBF_1814 lpxC ptsA FALSE 0.468 63.000 0.005 1.000 N NA
 5510135 5510136 LBF_1815 LBF_1816     TRUE 0.666 42.000 0.008 1.000   NA
 5510137 5510138 LBF_1817 LBF_1818 flgL-1   TRUE 0.831 14.000 0.000 1.000 Y NA
 5510142 5510143 LBF_1822 LBF_1823     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510143 5510144 LBF_1823 LBF_1824     FALSE 0.296 33.000 0.000 1.000   NA
 5510145 5510146 LBF_1825 LBF_1826 pepN-1   FALSE 0.238 42.000 0.000 1.000   NA
 5510153 5510154 LBF_1833 LBF_1834     FALSE 0.165 51.000 0.000 NA   NA
 5510156 5510157 LBF_1836 LBF_1837     FALSE 0.112 69.000 0.000 NA   NA
 5510161 5510162 LBF_1841 LBF_1842   lysU TRUE 0.979 2.000 0.333 NA   NA
 5510164 5510165 LBF_1844 LBF_1845     FALSE 0.363 25.000 0.000 1.000   NA
 5510165 5510166 LBF_1845 LBF_1846     FALSE 0.188 46.000 0.000 NA   NA
 5510166 5510167 LBF_1846 LBF_1847     FALSE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 5510167 5510168 LBF_1847 LBF_1848   lpdA-3 FALSE 0.035 114.000 0.000 1.000 N NA
 5510168 5510169 LBF_1848 LBF_1849 lpdA-3   TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510169 5510170 LBF_1849 LBF_1850     TRUE 0.778 1.000 0.000 NA   NA
 5510170 5510171 LBF_1850 LBF_1851     TRUE 0.991 3.000 0.688 0.096 Y NA
 5510171 5510172 LBF_1851 LBF_1852     TRUE 0.929 -16.000 0.011 NA N NA
 5510172 5510173 LBF_1852 LBF_1853   gst-4 FALSE 0.633 6.000 0.000 NA N NA
 5510173 5510174 LBF_1853 LBF_1854 gst-4   TRUE 0.722 2.000 0.000 NA N NA
 5510174 5510175 LBF_1854 LBF_1855     TRUE 0.955 3.000 0.011 NA N NA
 5510175 5510176 LBF_1855 LBF_1856     TRUE 0.991 5.000 0.286 0.005 Y NA
 5510177 5510178 LBF_1857 LBF_1858   gshA TRUE 0.971 2.000 0.036 1.000 N NA
 5510178 5510179 LBF_1858 LBF_1859 gshA ggt TRUE 0.959 4.000 0.018 1.000 N NA
 5510179 5510180 LBF_1859 LBF_1860 ggt   TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510180 5510181 LBF_1860 LBF_1861     TRUE 0.970 -3.000 0.152 NA   NA
 5510181 5510182 LBF_1861 LBF_1862   csdB TRUE 0.932 -16.000 0.013 NA N NA
 5510182 5510183 LBF_1862 LBF_1863 csdB nirD TRUE 0.968 -3.000 0.375 NA N NA
 5510183 5510184 LBF_1863 LBF_1864 nirD sufB-2 TRUE 0.954 0.000 0.005 NA   NA
 5510184 5510185 LBF_1864 LBF_1865 sufB-2   TRUE 0.972 -3.000 0.482 1.000   NA
 5510185 5510186 LBF_1865 LBF_1866     FALSE 0.048 92.000 0.000 NA N NA
 5510186 5510187 LBF_1866 LBF_1867   glgC FALSE 0.027 118.000 0.000 NA N NA
 5510187 5510188 LBF_1867 LBF_1868 glgC   FALSE 0.141 55.000 0.000 1.000 N NA
 5510188 5510189 LBF_1868 LBF_1869   purS TRUE 0.991 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 5510189 5510190 LBF_1869 LBF_1870 purS purC TRUE 0.982 -18.000 0.049 1.000 Y NA
 5510190 5510191 LBF_1870 LBF_1871 purC   TRUE 0.939 -3.000 0.006 1.000 N NA
 5510191 5510192 LBF_1871 LBF_1872     TRUE 0.933 7.000 0.008 1.000 N NA
 5510192 5510193 LBF_1872 LBF_1873     TRUE 0.891 55.000 0.501 0.001 Y NA
 5510193 5510194 LBF_1873 LBF_1874     TRUE 0.962 -16.000 0.196 1.000 N NA
 5510197 5510198 LBF_1877 LBF_1878     TRUE 0.948 -10.000 0.021 NA   NA
 5510199 5510200 LBF_1879 LBF_1880     FALSE 0.219 41.000 0.000 NA   NA
 5510200 5510201 LBF_1880 LBF_1881     FALSE 0.080 81.000 0.000 NA   NA
 5510201 5510202 LBF_1881 LBF_1882     FALSE 0.632 8.000 0.000 1.000 N NA
 5510204 5510205 LBF_1884 LBF_1885   rplQ FALSE 0.046 113.000 0.000 1.000   NA
 5510205 5510206 LBF_1885 LBF_1886 rplQ rpoA TRUE 0.970 2.000 0.873 1.000 N NA
 5510206 5510207 LBF_1886 LBF_1887 rpoA rpsD TRUE 0.849 26.000 0.549 1.000 N NA
 5510207 5510208 LBF_1887 LBF_1888 rpsD rpsK TRUE 0.985 10.000 0.509 0.018 Y NA
 5510208 5510209 LBF_1888 LBF_1889 rpsK rpsM TRUE 0.978 12.000 0.810 0.014 Y NA
 5510209 5510210 LBF_1889 LBF_1890 rpsM rpmJ TRUE 0.974 7.000 0.194 0.014   NA
 5510210 5510211 LBF_1890 LBF_1891 rpmJ infA TRUE 0.956 10.000 0.104 1.000   NA
 5510211 5510212 LBF_1891 LBF_1892 infA adk TRUE 0.914 14.000 0.059 1.000 N NA
 5510212 5510213 LBF_1892 LBF_1893 adk secY TRUE 0.974 4.000 0.241 1.000 N NA
 5510213 5510214 LBF_1893 LBF_1894 secY rplO TRUE 0.958 7.000 0.730 1.000 N NA
 5510214 5510215 LBF_1894 LBF_1895 rplO rpmD TRUE 0.990 5.000 0.653 0.002 Y NA
 5510215 5510216 LBF_1895 LBF_1896 rpmD rpsE TRUE 0.970 15.000 0.789 0.018 Y NA
 5510216 5510217 LBF_1896 LBF_1897 rpsE rplR TRUE 0.992 1.000 0.814 0.018 Y NA
 5510217 5510218 LBF_1897 LBF_1898 rplR rplF TRUE 0.987 7.000 0.815 0.014 Y NA
 5510218 5510219 LBF_1898 LBF_1899 rplF rpsH TRUE 0.970 15.000 0.808 0.014 Y NA
 5510219 5510220 LBF_1899 LBF_1900 rpsH rpsN TRUE 0.970 18.000 0.473 0.014 Y NA
 5510220 5510221 LBF_1900 LBF_1901 rpsN rplE TRUE 0.984 11.000 0.496 0.014 Y NA
 5510221 5510222 LBF_1901 LBF_1902 rplE rplX TRUE 0.991 3.000 0.758 0.014 Y NA
 5510222 5510223 LBF_1902 LBF_1903 rplX rplN TRUE 0.992 2.000 0.810 0.018 Y NA
 5510223 5510224 LBF_1903 LBF_1904 rplN rpsQ TRUE 0.989 -3.000 0.791 0.018 Y NA
 5510224 5510225 LBF_1904 LBF_1905 rpsQ rpmC TRUE 0.976 4.000 0.828 0.014   NA
 5510225 5510226 LBF_1905 LBF_1906 rpmC rplP TRUE 0.973 -3.000 0.802 0.014   NA
 5510226 5510227 LBF_1906 LBF_1907 rplP rpsC TRUE 0.949 23.000 0.828 0.018 Y NA
 5510227 5510228 LBF_1907 LBF_1908 rpsC rplV TRUE 0.991 4.000 0.719 0.018 Y NA
 5510228 5510229 LBF_1908 LBF_1909 rplV rpsS TRUE 0.984 9.000 0.769 0.018 Y NA
 5510229 5510230 LBF_1909 LBF_1910 rpsS rplB TRUE 0.972 14.000 0.820 0.018 Y NA
 5510230 5510231 LBF_1910 LBF_1911 rplB rplW TRUE 0.988 3.000 0.849 1.000 Y NA
 5510231 5510232 LBF_1911 LBF_1912 rplW rplD TRUE 0.989 5.000 0.307 1.000 Y NA
 5510232 5510233 LBF_1912 LBF_1913 rplD rplC TRUE 0.981 12.000 0.544 0.014 Y NA
 5510233 5510234 LBF_1913 LBF_1914 rplC rpsJ TRUE 0.982 12.000 0.467 0.018 Y NA
 5510234 5510235 LBF_1914 LBF_1915 rpsJ tufB TRUE 0.989 5.000 0.318 1.000 Y NA
 5510235 5510236 LBF_1915 LBF_1916 tufB   FALSE 0.589 50.000 0.000 0.001 Y NA
 5510236 5510237 LBF_1916 LBF_1917   rpsG FALSE 0.433 71.000 0.000 0.022 Y NA
 5510237 5510238 LBF_1917 LBF_1918 rpsG rpsL TRUE 0.975 15.000 0.620 0.003 Y NA
 5510238 5510239 LBF_1918 LBF_1919 rpsL rpoC FALSE 0.240 148.000 0.122 1.000 N NA
 5510239 5510240 LBF_1919 LBF_1920 rpoC rpoB TRUE 0.971 15.000 0.851 0.001 Y NA
 5510240 5510241 LBF_1920 LBF_1921 rpoB rplL FALSE 0.301 126.000 0.223 1.000 N NA
 5510241 5510242 LBF_1921 LBF_1922 rplL rplJ TRUE 0.898 36.000 0.884 1.000 Y NA
 5510242 5510243 LBF_1922 LBF_1923 rplJ rplA TRUE 0.975 13.000 0.302 1.000 Y NA
 5510243 5510244 LBF_1923 LBF_1924 rplA rplK TRUE 0.940 26.000 0.838 0.018 Y NA
 5510244 5510245 LBF_1924 LBF_1925 rplK nusG TRUE 0.763 40.000 0.681 1.000 N NA
 5510245 5510246 LBF_1925 LBF_1926 nusG secE TRUE 0.940 10.000 0.843 1.000 N NA
 5510246 5510247 LBF_1926 LBF_1927 secE   FALSE 0.213 42.000 0.000 NA   NA
 5510247 5510248 LBF_1927 LBF_1928     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5510249 5510250 LBF_1929 LBF_1930     FALSE 0.482 74.000 1.000 NA   NA
 5510250 5510251 LBF_1930 LBF_1931     FALSE 0.176 150.000 1.000 1.000 N NA
 5510252 5510253 LBF_1932 LBF_1933   ubiD FALSE 0.345 83.000 0.009 NA N NA
 5510256 5510257 LBF_1936 LBF_1937     TRUE 0.964 6.000 0.667 NA   NA
 5510258 5510259 LBF_1938 LBF_1939     FALSE 0.018 180.000 0.000 NA   NA
 5510259 5510260 LBF_1939 LBF_1940     FALSE 0.052 99.000 0.000 NA   NA
 5510260 5510261 LBF_1940 LBF_1941     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510261 5510262 LBF_1941 LBF_1942     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5510262 5510263 LBF_1942 LBF_1943     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510263 5510264 LBF_1943 LBF_1944     TRUE 0.716 5.000 0.000 NA   NA
 5510264 5510265 LBF_1944 LBF_1945     FALSE 0.352 71.000 0.000 NA Y NA
 5510265 5510266 LBF_1945 LBF_1946   glf TRUE 0.771 55.000 0.008 NA Y NA
 5510266 5510267 LBF_1946 LBF_1947 glf   TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510267 5510268 LBF_1947 LBF_1948     TRUE 0.957 -10.000 0.049 NA   NA
 5510268 5510269 LBF_1948 LBF_1949     TRUE 0.928 -16.000 0.000 0.015 Y NA
 5510269 5510270 LBF_1949 LBF_1950     FALSE 0.011 219.000 0.000 NA   NA
 5510270 5510271 LBF_1950 LBF_1951     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5510271 5510272 LBF_1951 LBF_1952     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510272 5510273 LBF_1952 LBF_1953     FALSE 0.213 42.000 0.000 NA   NA
 5510273 5510274 LBF_1953 LBF_1955     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5510274 5510275 LBF_1955 LBF_1956     FALSE 0.146 59.000 0.000 NA   NA
 5510275 5510276 LBF_1956 LBF_1957     TRUE 0.903 -13.000 0.000 NA Y NA
 5510276 5510277 LBF_1957 LBF_1958     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5510277 5510278 LBF_1958 LBF_1959     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5510278 5510279 LBF_1959 LBF_1960     TRUE 0.951 -7.000 0.024 NA   NA
 5510279 5510280 LBF_1960 LBF_1961     FALSE 0.640 9.000 0.000 NA   NA
 5510280 5510281 LBF_1961 LBF_1962     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510281 5510282 LBF_1962 LBF_1963     FALSE 0.230 39.000 0.000 NA   NA
 5510282 5510283 LBF_1963 LBF_1964     TRUE 0.833 28.000 0.069 NA   NA
 5510283 5510284 LBF_1964 LBF_1965     TRUE 0.940 32.000 0.366 0.095 Y NA
 5510284 5510285 LBF_1965 LBF_1966     FALSE 0.101 78.000 0.000 1.000   NA
 5510285 5510286 LBF_1966 LBF_1967     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510286 5510287 LBF_1967 LBF_1968     FALSE 0.498 14.000 0.000 NA   NA
 5510287 5510288 LBF_1968 LBF_1969     FALSE 0.138 66.000 0.000 1.000   NA
 5510288 5510289 LBF_1969 LBF_1970     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510289 5510290 LBF_1970 LBF_1971     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510290 5510291 LBF_1971 LBF_1972     TRUE 0.978 1.000 0.075 1.000   NA
 5510291 5510292 LBF_1972 LBF_1973     TRUE 0.971 -3.000 0.571 1.000   NA
 5510292 5510293 LBF_1973 LBF_1974   neuB-3 TRUE 0.934 4.000 0.000 1.000 Y NA
 5510293 5510294 LBF_1974 LBF_1975 neuB-3   TRUE 0.954 -3.000 0.019 1.000 N NA
 5510294 5510295 LBF_1975 LBF_1976     TRUE 0.969 6.000 0.333 NA   NA
 5510295 5510296 LBF_1976 LBF_1977     TRUE 0.682 -7.000 0.000 NA   NA
 5510296 5510297 LBF_1977 LBF_1978     FALSE 0.299 28.000 0.000 NA   NA
 5510297 5510298 LBF_1978 LBF_1979     FALSE 0.021 168.000 0.000 NA   NA
 5510298 5510299 LBF_1979 LBF_1980   hemL-1 TRUE 0.961 -3.000 0.056 NA N NA
 5510299 5510300 LBF_1980 LBF_1981 hemL-1   TRUE 0.660 51.000 0.039 1.000 N NA
 5510300 5510301 LBF_1981 LBF_1982     TRUE 0.965 -3.000 0.067 1.000 N NA
 5510301 5510302 LBF_1982 LBF_1983   wecE-1 TRUE 0.966 -3.000 0.072 1.000 N NA
 5510302 5510303 LBF_1983 LBF_1984 wecE-1   TRUE 0.975 3.000 0.678 1.000   NA
 5510303 5510304 LBF_1984 LBF_1985     TRUE 0.713 12.000 0.000 0.003   NA
 5510304 5510305 LBF_1985 LBF_1986   rmlB TRUE 0.658 41.000 0.000 0.003 Y NA
 5510305 5510306 LBF_1986 LBF_1987 rmlB rmlA TRUE 0.960 1.000 0.000 0.004 Y NA
 5510306 5510307 LBF_1987 LBF_1988 rmlA   TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510308 5510309 LBF_1989 LBF_1990     TRUE 0.729 23.000 0.000 1.000 Y NA
 5510309 5510310 LBF_1990 LBF_1991     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510311 5510312 LBF_1992 LBF_1993   fadH-1 FALSE 0.276 28.000 0.000 1.000 N NA
 5510314 5510315 LBF_1995 LBF_1996     FALSE 0.403 22.000 0.000 1.000   NA
 5510316 5510317 LBF_1997 LBF_1998     FALSE 0.235 38.000 0.000 NA   NA
 5510317 5510318 LBF_1998 LBF_1999     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5510318 5510319 LBF_1999 LBF_2000     FALSE 0.008 266.000 0.000 NA   NA
 5510319 5510320 LBF_2000 LBF_2001     FALSE 0.018 179.000 0.000 NA   NA
 5510320 5510321 LBF_2001 LBF_2002     FALSE 0.115 68.000 0.000 NA   NA
 5510321 5510322 LBF_2002 LBF_2003   sucC FALSE 0.030 161.000 0.000 0.094 N NA
 5510322 5510323 LBF_2003 LBF_2004 sucC sucD TRUE 0.978 13.000 0.059 0.001 Y NA
 5510323 5510324 LBF_2004 LBF_2005 sucD   TRUE 0.688 59.000 0.222 1.000 N NA
 5510324 5510325 LBF_2005 LBF_2006     TRUE 0.837 22.000 1.000 NA   NA
 5510325 5510326 LBF_2006 LBF_2007     TRUE 0.914 11.000 0.011 NA   NA
 5510326 5510327 LBF_2007 LBF_2008     TRUE 0.880 14.000 0.011 NA   NA
 5510327 5510328 LBF_2008 LBF_2009   lpxB TRUE 0.961 -31.000 0.173 NA   NA
 5510329 5510330 LBF_2010 LBF_2011     TRUE 0.957 -3.000 1.000 NA   NA
 5510330 5510331 LBF_2011 LBF_2012     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5510331 5510332 LBF_2012 LBF_2013   uvrD-3 TRUE 0.794 0.000 0.000 1.000   NA
 5510332 5510333 LBF_2013 LBF_2014 uvrD-3 gst-5 FALSE 0.086 69.000 0.000 NA N NA
 5510334 5510335 LBF_2015 LBF_2016     FALSE 0.018 191.000 0.000 1.000   NA
 5510335 5510336 LBF_2016 LBF_2017     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 5510336 5510337 LBF_2017 LBF_2018     FALSE 0.136 62.000 0.000 NA   NA
 5510338 5510339 LBF_2019 LBF_2020     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510339 5510340 LBF_2020 LBF_2021     TRUE 0.957 -3.000 1.000 NA   NA
 5510340 5510341 LBF_2021 LBF_2022   uvrC FALSE 0.635 34.000 0.003 NA   NA
 5510342 5510343 LBF_2023 LBF_2024     TRUE 0.785 -7.000 0.000 0.081   NA
 5510345 5510346 LBF_2026 LBF_2027 gapA pgk TRUE 0.988 2.000 0.007 0.003 Y NA
 5510346 5510347 LBF_2027 LBF_2028 pgk tpiA TRUE 0.945 2.000 0.000 1.000 Y NA
 5510347 5510348 LBF_2028 LBF_2029 tpiA secG TRUE 0.875 10.000 0.002 1.000 N NA
 5510348 5510349 LBF_2029 LBF_2030 secG   TRUE 0.904 -40.000 0.003 NA   NA
 5510349 5510350 LBF_2030 LBF_2031     TRUE 0.968 2.000 1.000 NA   NA
 5510350 5510351 LBF_2031 LBF_2032     TRUE 0.987 -3.000 0.026 0.094 Y NA
 5510352 5510353 LBF_2033 LBF_2034     TRUE 0.959 3.000 0.010 NA   NA
 5510353 5510354 LBF_2034 LBF_2035   argS TRUE 0.929 -3.000 0.003 1.000   NA
 5510354 5510355 LBF_2035 LBF_2036 argS   TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510355 5510356 LBF_2036 LBF_2037   recO TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510356 5510357 LBF_2037 LBF_2038 recO   TRUE 0.955 1.000 0.005 NA   NA
 5510357 5510358 LBF_2038 LBF_2039     TRUE 0.971 -3.000 0.182 NA   NA
 5510358 5510359 LBF_2039 LBF_2040   phoH TRUE 0.951 -3.000 0.009 1.000   NA
 5510359 5510360 LBF_2040 LBF_2041 phoH aspS TRUE 0.951 2.000 0.003 0.094 N NA
 5510360 5510361 LBF_2041 LBF_2042 aspS dnaB TRUE 0.861 13.000 0.003 0.094 N NA
 5510361 5510362 LBF_2042 LBF_2043 dnaB rplI TRUE 0.875 22.000 0.100 1.000 N NA
 5510362 5510363 LBF_2043 LBF_2044 rplI rpsR TRUE 0.987 9.000 0.499 0.013 Y NA
 5510363 5510364 LBF_2044 LBF_2045 rpsR ssb FALSE 0.463 73.000 0.016 1.000 N NA
 5510364 5510365 LBF_2045 LBF_2046 ssb rpsF TRUE 0.950 -7.000 0.025 1.000 N NA
 5510367 5510368 LBF_2048 LBF_2049     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5510368 5510369 LBF_2049 LBF_2050     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510370 5510371 LBF_2051 LBF_2052     TRUE 0.945 -22.000 0.023 NA   NA
 5510371 5510372 LBF_2052 LBF_2053     TRUE 0.657 8.000 0.000 NA   NA
 5510372 5510373 LBF_2053 LBF_2054     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510373 5510374 LBF_2054 LBF_2055   rpoE TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510374 5510375 LBF_2055 LBF_2056 rpoE   FALSE 0.415 19.000 0.000 NA   NA
 5510376 5510377 LBF_2057 LBF_2058     FALSE 0.172 49.000 0.000 NA   NA
 5510377 5510378 LBF_2058 LBF_2059     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510378 5510379 LBF_2059 LBF_2060     FALSE 0.588 11.000 0.000 NA   NA
 5510379 5510380 LBF_2060 LBF_2061     TRUE 0.963 4.000 0.023 NA   NA
 5510380 5510381 LBF_2061 LBF_2062     TRUE 0.940 10.000 0.030 NA   NA
 5510383 5510384 LBF_2064 LBF_2065     TRUE 0.740 4.000 0.000 NA   NA
 5510384 5510385 LBF_2065 LBF_2066     FALSE 0.188 46.000 0.000 NA   NA
 5510387 5510388 LBF_2068 LBF_2069   mdaB TRUE 0.961 -7.000 0.778 1.000   NA
 5510390 5510391 LBF_2071 LBF_2072     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5510391 5510392 LBF_2072 LBF_2073     TRUE 0.961 -16.000 0.667 1.000   NA
 5510393 5510394 LBF_2074 LBF_2075     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5510394 5510395 LBF_2075 LBF_2076     FALSE 0.046 104.000 0.000 NA   NA
 5510396 5510397 LBF_2077 LBF_2079 flaB-2 flaB FALSE 0.019 175.000 0.000 NA   NA
 5510397 5510398 LBF_2079 LBF_2080 flaB   FALSE 0.005 331.000 0.000 NA   NA
 5510398 5510399 LBF_2080 LBF_2081   amiA TRUE 0.961 5.000 0.032 NA   NA
 5510399 5510400 LBF_2081 LBF_2082 amiA   TRUE 0.939 -36.000 0.019 1.000 N NA
 5510400 5510401 LBF_2082 LBF_2083   ubiG FALSE 0.615 9.000 0.000 1.000 N NA
 5510401 5510402 LBF_2083 LBF_2084 ubiG   TRUE 0.692 -3.000 0.000 1.000 N NA
 5510402 5510403 LBF_2084 LBF_2085   nusB FALSE 0.615 9.000 0.000 1.000 N NA
 5510403 5510404 LBF_2085 LBF_2086 nusB ribH TRUE 0.970 -3.000 0.347 1.000 N NA
 5510406 5510407 LBF_2088 LBF_2089     FALSE 0.115 68.000 0.000 NA   NA
 5510407 5510408 LBF_2089 LBF_2090     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510409 5510410 LBF_2091 LBF_2093     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5510411 5510412 LBF_2094 LBF_2095     TRUE 0.971 5.000 0.188 NA   NA
 5510412 5510413 LBF_2095 LBF_2096   mutL FALSE 0.127 61.000 0.000 1.000 N NA
 5510413 5510414 LBF_2096 LBF_2097 mutL   FALSE 0.182 44.000 0.000 1.000 N NA
 5510415 5510416 LBF_2098 LBF_2099   purL FALSE 0.623 11.000 0.000 1.000   NA
 5510416 5510417 LBF_2099 LBF_2100 purL   FALSE 0.296 33.000 0.000 1.000   NA
 5510419 5510420 LBF_2102 LBF_2103     FALSE 0.003 738.000 0.000 NA   NA
 5510420 5510421 LBF_2103 LBF_3369     TRUE 0.979 2.000 0.333 NA   NA
 5510421 5510422 LBF_3369 LBF_2104   polB TRUE 0.801 37.000 0.104 NA   NA
 5510422 5510423 LBF_2104 LBF_2105 polB   FALSE 0.004 418.000 0.000 NA   NA
 5510423 5510424 LBF_2105 LBF_2106     FALSE 0.016 186.000 0.000 NA   NA
 5510424 5510425 LBF_2106 LBF_2107     FALSE 0.005 376.000 0.000 NA   NA
 5510425 5510426 LBF_2107 LBF_2108     FALSE 0.096 74.000 0.000 NA   NA
 5510426 5510427 LBF_2108 LBF_2109     FALSE 0.007 276.000 0.000 NA   NA
 5510427 5510428 LBF_2109 LBF_3370     FALSE 0.035 119.000 0.000 NA   NA
 5510428 5510429 LBF_3370 LBF_2110     FALSE 0.006 294.000 0.000 NA   NA
 5510429 5510430 LBF_2110 LBF_2111     FALSE 0.004 498.000 0.000 NA   NA
 5510430 5510431 LBF_2111 LBF_2112     FALSE 0.003 713.000 0.000 NA   NA
 5510431 5510432 LBF_2112 LBF_2113     FALSE 0.010 221.000 0.000 NA   NA
 5510432 5510433 LBF_2113 LBF_2114     FALSE 0.003 677.000 0.000 NA   NA
 5510433 5510434 LBF_2114 LBF_2115     FALSE 0.018 180.000 0.000 NA   NA
 5510434 5510435 LBF_2115 LBF_2116     FALSE 0.011 216.000 0.000 NA   NA
 5510435 5510436 LBF_2116 LBF_2117     FALSE 0.016 189.000 0.000 NA   NA
 5510436 5510437 LBF_2117 LBF_2118     TRUE 0.674 -10.000 0.000 NA   NA
 5510437 5510438 LBF_2118 LBF_2119     FALSE 0.010 224.000 0.000 NA   NA
 5510438 5510439 LBF_2119 LBF_2120     FALSE 0.010 222.000 0.000 NA   NA
 5510439 5510440 LBF_2120 LBF_2121     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5510440 5510441 LBF_2121 LBF_2122     FALSE 0.003 737.000 0.000 NA   NA
 5510441 5510442 LBF_2122 LBF_2123     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510442 5510443 LBF_2123 LBF_2124   ubiE FALSE 0.014 196.000 0.000 NA   NA
 5510443 5510444 LBF_2124 LBF_2125 ubiE   FALSE 0.013 201.000 0.000 NA   NA
 5510444 5510445 LBF_2125 LBF_2126     FALSE 0.011 218.000 0.000 NA   NA
 5510445 5510446 LBF_2126 LBF_2127     FALSE 0.012 207.000 0.000 NA   NA
 5510446 5510447 LBF_2127 LBF_2128     FALSE 0.650 -39.000 0.000 NA   NA
 5510449 5510450 LBF_2130 LBF_2131     FALSE 0.008 258.000 0.000 NA   NA
 5510450 5510451 LBF_2131 LBF_2132     FALSE 0.012 209.000 0.000 NA   NA
 5510451 5510452 LBF_2132 LBF_2133     FALSE 0.020 173.000 0.000 NA   NA
 5510452 5510453 LBF_2133 LBF_2134     FALSE 0.003 912.000 0.000 NA   NA
 5510453 5510454 LBF_2134 LBF_2135     FALSE 0.008 257.000 0.000 NA   NA
 5510454 5510455 LBF_2135 LBF_2136     FALSE 0.004 555.000 0.000 NA   NA
 5510455 5510456 LBF_2136 LBF_2137     FALSE 0.003 735.000 0.000 NA   NA
 5510456 5510457 LBF_2137 LBF_2138     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510457 5510458 LBF_2138 LBF_2139     FALSE 0.011 213.000 0.000 NA   NA
 5510458 5510459 LBF_2139 LBF_2140     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510459 5510460 LBF_2140 LBF_2141     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 5510460 5510461 LBF_2141 LBF_2142     TRUE 0.967 -7.000 0.286 NA   NA
 5510461 5510462 LBF_2142 LBF_2143     FALSE 0.003 689.000 0.000 NA   NA
 5510462 5510463 LBF_2143 LBF_2144     TRUE 0.761 3.000 0.000 NA   NA
 5510463 5510464 LBF_2144 LBF_2145     FALSE 0.014 196.000 0.000 NA   NA
 5510464 5510465 LBF_2145 LBF_2146     FALSE 0.012 205.000 0.000 NA   NA
 5510465 5510466 LBF_2146 LBF_2147     FALSE 0.003 682.000 0.000 NA   NA
 5510466 5510467 LBF_2147 LBF_2148     FALSE 0.005 365.000 0.000 NA   NA
 5510467 5510468 LBF_2148 LBF_2149     FALSE 0.003 1079.000 0.000 NA   NA
 5510468 5510469 LBF_2149 LBF_2150     FALSE 0.003 675.000 0.000 NA   NA
 5510469 5510470 LBF_2150 LBF_2151     FALSE 0.013 200.000 0.000 NA   NA
 5510470 5510471 LBF_2151 LBF_2152     FALSE 0.005 331.000 0.000 NA   NA
 5510471 5510472 LBF_2152 LBF_2153     FALSE 0.011 212.000 0.000 NA   NA
 5510472 5510473 LBF_2153 LBF_2154     FALSE 0.013 201.000 0.000 NA   NA
 5510473 5510474 LBF_2154 LBF_2155     FALSE 0.009 244.000 0.000 NA   NA
 5510474 5510475 LBF_2155 LBF_2156     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510475 5510476 LBF_2156 LBF_2157     FALSE 0.012 208.000 0.000 NA   NA
 5510476 5510477 LBF_2157 LBF_2158     TRUE 0.676 7.000 0.000 NA   NA
 5510477 5510478 LBF_2158 LBF_2159     FALSE 0.007 287.000 0.000 NA   NA
 5510478 5510479 LBF_2159 LBF_2160     FALSE 0.004 390.000 0.000 NA   NA
 5510479 5510480 LBF_2160 LBF_2161     FALSE 0.016 189.000 0.000 NA   NA
 5510480 5510481 LBF_2161 LBF_2162     FALSE 0.012 209.000 0.000 NA   NA
 5510481 5510482 LBF_2162 LBF_2163     TRUE 0.715 -3.000 0.000 NA   NA
 5510482 5510483 LBF_2163 LBF_2164     FALSE 0.005 346.000 0.000 NA   NA
 5510483 5510484 LBF_2164 LBF_2165     FALSE 0.006 306.000 0.000 NA   NA
 5510484 5510485 LBF_2165 LBF_2166     TRUE 0.972 0.000 0.044 NA   NA
 5510485 5510486 LBF_2166 LBF_2167     FALSE 0.010 232.000 0.000 NA   NA
 5510486 5510487 LBF_2167 LBF_2168     FALSE 0.003 997.000 0.000 NA   NA
 5510487 5510488 LBF_2168 LBF_2169     FALSE 0.006 293.000 0.000 NA   NA
 5510488 5510489 LBF_2169 LBF_2170     FALSE 0.498 14.000 0.000 NA   NA
 5510491 5510492 LBF_2172 LBF_2173     FALSE 0.003 2054.000 0.000 NA   NA
 5510492 5510493 LBF_2173 LBF_2174     FALSE 0.006 292.000 0.000 NA   NA
 5510493 5510494 LBF_2174 LBF_2175     TRUE 0.969 -3.000 0.562 NA   NA
 5510494 5510495 LBF_2175 LBF_2176     FALSE 0.010 225.000 0.000 NA   NA
 5510495 5510496 LBF_2176 LBF_2177     FALSE 0.013 203.000 0.000 NA   NA
 5510496 5510497 LBF_2177 LBF_2178     FALSE 0.004 510.000 0.000 NA   NA
 5510497 5510498 LBF_2178 LBF_2179     TRUE 0.979 1.000 0.209 NA   NA
 5510498 5510499 LBF_2179 LBF_2180     FALSE 0.014 196.000 0.000 NA   NA
 5510499 5510500 LBF_2180 LBF_2181     FALSE 0.008 249.000 0.000 NA   NA
 5510500 5510501 LBF_2181 LBF_2182     FALSE 0.007 278.000 0.000 NA   NA
 5510501 5510502 LBF_2182 LBF_2183     TRUE 0.769 0.000 0.000 NA   NA
 5510502 5510503 LBF_2183 LBF_2184     FALSE 0.007 283.000 0.000 NA   NA
 5510503 5510504 LBF_2184 LBF_2185     TRUE 0.978 0.000 0.359 NA   NA
 5510504 5510505 LBF_2185 LBF_2186     FALSE 0.007 271.000 0.000 NA   NA
 5510505 5510506 LBF_2186 LBF_2187     FALSE 0.651 -34.000 0.000 NA   NA
 5510506 5510507 LBF_2187 LBF_2188     FALSE 0.013 211.000 0.000 1.000   NA
 5510507 5510508 LBF_2188 LBF_2189     FALSE 0.004 456.000 0.000 NA   NA
 5510508 5510509 LBF_2189 LBF_2190     FALSE 0.005 318.000 0.000 NA   NA
 5510509 5510510 LBF_2190 LBF_2191     FALSE 0.003 644.000 0.000 NA   NA
 5510510 5510511 LBF_2191 LBF_2192     TRUE 0.940 12.000 0.098 NA   NA
 5510511 5510512 LBF_2192 LBF_2193     FALSE 0.014 198.000 0.000 NA   NA
 5510512 5510513 LBF_2193 LBF_2194     FALSE 0.023 159.000 0.000 NA   NA
 5510513 5510514 LBF_2194 LBF_2195     FALSE 0.007 275.000 0.000 NA   NA
 5510514 5510515 LBF_2195 LBF_2196     TRUE 0.974 1.000 0.045 NA   NA
 5510515 5510516 LBF_2196 LBF_2197     FALSE 0.017 546.000 0.000 1.000 Y