MicrobesOnline Operon Predictions for Leptospira borgpetersenii H-b JB197

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1960741 1960742 LBJ_0002 LBJ_0003 ilvE dnaX-1 TRUE 0.979 7.000 0.005 1.000 N NA
 1960742 1960743 LBJ_0003 LBJ_0004 dnaX-1 dnaA FALSE 0.082 337.000 0.000 1.000 Y NA
 1960743 1960744 LBJ_0004 LBJ_0005 dnaA dnaN FALSE 0.156 1112.000 0.328 1.000 Y NA
 1960744 1960745 LBJ_0005 LBJ_0006 dnaN recF TRUE 0.996 0.000 0.318 1.000 Y NA
 1960745 1960746 LBJ_0006 LBJ_0007 recF   TRUE 0.984 -3.000 0.089 NA   NA
 1960746 1960747 LBJ_0007 LBJ_0008   gyrB TRUE 0.751 66.000 0.028 NA   NA
 1960747 1960748 LBJ_0008 LBJ_0009 gyrB gyrA TRUE 0.995 19.000 0.306 0.002 Y NA
 1960748 1960749 LBJ_0009 LBJ_0010 gyrA   TRUE 0.978 -3.000 0.003 1.000 N NA
 1960749 1482855 LBJ_0010 LBJ_0011     FALSE 0.223 74.000 0.000 NA   NA
 1960751 1960752 LBJ_0013 LBJ_0014     TRUE 0.958 23.000 0.667 NA   NA
 1960755 1960756 LBJ_0017 LBJ_0018     FALSE 0.029 319.000 0.000 1.000 N NA
 1960756 1960757 LBJ_0018 LBJ_0019   fliG-1 TRUE 0.764 66.000 0.005 1.000 N NA
 1960759 1960760 LBJ_0024 LBJ_0025 serS tatD TRUE 0.974 -7.000 0.004 NA N NA
 1960761 1960762 LBJ_0026 LBJ_0027     TRUE 0.995 1.000 0.312 NA Y NA
 1960762 1960763 LBJ_0027 LBJ_0028     TRUE 0.983 -3.000 0.076 NA   NA
 1960764 1960765 LBJ_0029 LBJ_0030     TRUE 0.988 3.000 0.827 1.000 N NA
 1960765 1960766 LBJ_0030 LBJ_0031   gidB TRUE 0.988 -22.000 0.339 1.000 N NA
 1960766 1482874 LBJ_0031 LBJ_0032 gidB   FALSE 0.004 775.000 0.000 NA   NA
 1482874 1960767 LBJ_0032 LBJ_0033   aroD FALSE 0.005 654.000 0.000 NA   NA
 1960767 1960768 LBJ_0033 LBJ_0034 aroD   TRUE 0.987 4.000 0.035 1.000 N NA
 1960768 1960769 LBJ_0034 LBJ_0035     TRUE 0.987 -16.000 0.035 1.000 N NA
 1960769 1960770 LBJ_0035 LBJ_0036     TRUE 0.977 -16.000 1.000 NA   NA
 1960771 1960772 LBJ_0037 LBJ_0038     FALSE 0.109 131.000 0.000 1.000   NA
 1960772 1960773 LBJ_0038 LBJ_0039     TRUE 0.987 -3.000 0.333 1.000   NA
 1960773 1960774 LBJ_0039 LBJ_0040   pntA TRUE 0.745 78.000 0.010 1.000 N NA
 1960775 1960776 LBJ_0041 LBJ_0042   hisS TRUE 0.972 -3.000 0.004 1.000   NA
 1960776 1960777 LBJ_0042 LBJ_0043 hisS   TRUE 0.960 7.000 0.004 NA   NA
 1960777 1960778 LBJ_0043 LBJ_0044     TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 1960779 1960780 LBJ_0045 LBJ_0046 folP   FALSE 0.025 209.000 0.000 NA   NA
 1960780 1960781 LBJ_0046 LBJ_0047     TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 1482890 1960782 LBJ_0049 LBJ_0050     FALSE 0.006 436.000 0.000 NA   NA
 1960782 1960783 LBJ_0050 LBJ_0051     TRUE 0.928 -25.000 0.000 0.036   NA
 1960786 1960787 LBJ_0054 LBJ_0055     TRUE 0.958 -36.000 0.005 NA   NA
 1960788 1960789 LBJ_0056 LBJ_0057   gltP FALSE 0.580 115.000 0.006 0.078 N NA
 1960790 1960791 LBJ_0058 LBJ_0059     TRUE 0.983 -7.000 1.000 1.000   NA
 1960791 1960792 LBJ_0059 LBJ_0060     FALSE 0.014 335.000 0.000 1.000   NA
 1960793 1960794 LBJ_0061 LBJ_0062   dcd FALSE 0.611 74.000 0.007 NA   NA
 1960794 1960795 LBJ_0062 LBJ_0063 dcd   TRUE 0.982 1.000 0.007 1.000 N NA
 1960796 1960797 LBJ_0064 LBJ_0065     FALSE 0.098 115.000 0.000 NA   NA
 1960798 1960799 LBJ_0066 LBJ_0067     FALSE 0.454 111.000 0.014 NA   NA
 1960799 1960800 LBJ_0067 LBJ_0068     TRUE 0.984 -3.000 0.375 NA   NA
 1960804 1960805 LBJ_0072 LBJ_0073 plsC   TRUE 0.931 35.000 0.176 NA   NA
 1960807 1482917 LBJ_0075 LBJ_0076     FALSE 0.164 91.000 0.000 NA   NA
 1482917 1960808 LBJ_0076 LBJ_0077     FALSE 0.006 497.000 0.000 NA   NA
 1482920 1960810 LBJ_0079 LBJ_0080 tRNA-Arg-ACG   TRUE 0.841 4.000 0.000 NA   NA
 1960810 1960811 LBJ_0080 LBJ_0081     TRUE 0.975 -46.000 1.000 NA   NA
 1960811 1482923 LBJ_0081 LBJ_0082   tRNA-Ser-GCT FALSE 0.457 44.000 0.000 NA   NA
 1482923 1482924 LBJ_0082 LBJ_0083 tRNA-Ser-GCT tRNA-Ser-TGA TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 1960812 1960813 LBJ_0084 LBJ_0085 trmA-1   FALSE 0.010 2130.000 0.000 NA N NA
 1960814 1482928 LBJ_0086 LBJ_0087     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 1482928 1960815 LBJ_0087 LBJ_0088   aat FALSE 0.239 71.000 0.000 NA   NA
 1960815 1482930 LBJ_0088 LBJ_0089 aat ligT FALSE 0.543 37.000 0.000 NA   NA
 1482930 1960816 LBJ_0089 LBJ_0090 ligT   FALSE 0.402 49.000 0.000 NA   NA
 1960818 1960819 LBJ_0092 LBJ_0093   prfA TRUE 0.717 65.000 0.002 1.000 N NA
 1960820 1960821 LBJ_0094 LBJ_0095     FALSE 0.017 245.000 0.000 NA   NA
 1960822 1960823 LBJ_0096 LBJ_0097     TRUE 0.977 6.000 0.028 NA   NA
 1960823 1960824 LBJ_0097 LBJ_0098     FALSE 0.010 444.000 0.000 1.000   NA
 1960824 1960825 LBJ_0098 LBJ_0099     TRUE 0.906 -3.000 0.000 1.000   NA
 1960825 1482941 LBJ_0099 LBJ_0100   tRNA-Leu-CAG FALSE 0.004 854.000 0.000 NA   NA
 1960826 1960827 LBJ_0101 LBJ_0102 hisB hisH-1 TRUE 0.997 -3.000 0.125 0.006 Y NA
 1960827 1960828 LBJ_0102 LBJ_0103 hisH-1 hisA TRUE 0.997 -3.000 0.124 0.006 Y NA
 1960828 1960829 LBJ_0103 LBJ_0104 hisA   TRUE 0.634 90.000 0.004 1.000 N NA
 1960829 1960830 LBJ_0104 LBJ_0105     TRUE 0.977 15.000 0.167 NA   NA
 1960830 1960831 LBJ_0105 LBJ_0106     FALSE 0.004 754.000 0.000 NA   NA
 1960832 1960833 LBJ_0107 LBJ_0108     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 1960833 1960834 LBJ_0108 LBJ_0109     TRUE 0.981 10.000 0.400 NA   NA
 1960834 1960835 LBJ_0109 LBJ_0110     TRUE 0.850 52.000 0.600 NA   NA
 1960835 1960836 LBJ_0110 LBJ_0111     FALSE 0.287 64.000 0.000 NA   NA
 1960836 1960837 LBJ_0111 LBJ_0112     FALSE 0.007 1198.000 0.000 1.000   NA
 1960838 1960839 LBJ_0114 LBJ_0115 thiD   FALSE 0.018 467.000 0.000 1.000 N NA
 1960839 1960840 LBJ_0115 LBJ_0116     TRUE 0.765 25.000 0.000 1.000   NA
 1960841 1960842 LBJ_0117 LBJ_0118     TRUE 0.959 -3.000 0.003 NA   NA
 1960842 1960843 LBJ_0118 LBJ_0119     FALSE 0.423 133.000 0.667 NA   NA
 1960843 1960844 LBJ_0119 LBJ_0120     FALSE 0.321 164.000 0.375 NA   NA
 1960844 1960845 LBJ_0120 LBJ_0121     TRUE 0.985 -3.000 0.250 NA   NA
 1960847 1960848 LBJ_0123 LBJ_0124     FALSE 0.086 151.000 0.000 1.000   NA
 1960848 1960849 LBJ_0124 LBJ_0125     FALSE 0.005 533.000 0.000 NA   NA
 1960849 1960850 LBJ_0125 LBJ_0126     FALSE 0.027 202.000 0.000 NA   NA
 1960851 1960852 LBJ_0127 LBJ_0128     TRUE 0.937 19.000 0.003 1.000   NA
 1960853 1960854 LBJ_0129 LBJ_0130     FALSE 0.004 843.000 0.000 NA   NA
 1960855 1960856 LBJ_0131 LBJ_0132     TRUE 0.863 55.000 0.125 1.000   NA
 1960857 1960858 LBJ_0133 LBJ_0134     FALSE 0.287 163.000 1.000 NA   NA
 1960858 1960859 LBJ_0134 LBJ_0135     FALSE 0.004 1121.000 0.000 NA   NA
 1960859 1960860 LBJ_0135 LBJ_0136   aroC FALSE 0.535 67.000 0.002 NA   NA
 1960860 1960861 LBJ_0136 LBJ_0137 aroC nuoG FALSE 0.009 482.000 0.000 1.000   NA
 1960861 1960862 LBJ_0137 LBJ_0138 nuoG nuoI TRUE 0.985 -13.000 0.015 0.010   NA
 1960863 1960864 LBJ_0139 LBJ_0140     FALSE 0.006 491.000 0.000 NA   NA
 1960864 1960865 LBJ_0140 LBJ_0141     TRUE 0.883 12.000 0.000 1.000   NA
 1960866 1960867 LBJ_0142 LBJ_0143     FALSE 0.005 588.000 0.000 NA   NA
 1960867 1482985 LBJ_0143 LBJ_0144     FALSE 0.004 915.000 0.000 NA   NA
 1482985 1960868 LBJ_0144 LBJ_0145   rpmH FALSE 0.019 234.000 0.000 NA   NA
 1960868 1960869 LBJ_0145 LBJ_0146 rpmH   FALSE 0.045 328.000 0.005 NA   NA
 1960869 1960870 LBJ_0146 LBJ_0147   yidC TRUE 0.980 -19.000 0.461 NA   NA
 1960870 1960871 LBJ_0147 LBJ_0148 yidC   TRUE 0.947 32.000 0.254 1.000   NA
 1960871 1960872 LBJ_0148 LBJ_0149   trmE TRUE 0.985 -7.000 0.116 1.000   NA
 1960872 1482991 LBJ_0149 LBJ_0150 trmE   TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1960874 1960875 LBJ_0152 LBJ_0153   fumC FALSE 0.444 91.000 0.003 NA   NA
 1960876 1960877 LBJ_0154 LBJ_0155     FALSE 0.023 218.000 0.000 NA   NA
 1960877 1960878 LBJ_0155 LBJ_0156     TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 1960882 1960883 LBJ_0160 LBJ_0161     TRUE 0.900 37.000 0.011 1.000   NA
 1960883 1960884 LBJ_0161 LBJ_0162   splB TRUE 0.984 -3.000 0.085 NA   NA
 1960884 1960885 LBJ_0162 LBJ_0163 splB   TRUE 0.985 -28.000 0.063 NA N NA
 1960886 1960887 LBJ_0164 LBJ_0165   suhB TRUE 0.961 -3.000 0.003 NA   NA
 1960888 1960889 LBJ_0166 LBJ_0167     TRUE 0.997 -16.000 0.286 0.022 Y NA
 1960889 1960890 LBJ_0167 LBJ_0168     TRUE 0.997 -3.000 0.500 0.022 Y NA
 1960890 1960891 LBJ_0168 LBJ_0169     TRUE 0.983 -3.000 0.750 NA   NA
 1960894 1960895 LBJ_0172 LBJ_0173   rpoE-2 TRUE 0.978 8.000 1.000 NA   NA
 1960895 1960896 LBJ_0173 LBJ_0174 rpoE-2   TRUE 0.975 13.000 1.000 NA   NA
 1960896 1960897 LBJ_0174 LBJ_0175     FALSE 0.006 449.000 0.000 NA   NA
 1960897 1960898 LBJ_0175 LBJ_0176   lig TRUE 0.948 17.000 0.003 1.000   NA
 1960898 1483018 LBJ_0176 LBJ_0177 lig   FALSE 0.026 205.000 0.000 NA   NA
 1483018 1960899 LBJ_0177 LBJ_0178     TRUE 0.745 20.000 0.000 NA   NA
 1960899 1960900 LBJ_0178 LBJ_0179     FALSE 0.004 708.000 0.000 NA   NA
 1960900 1960901 LBJ_0179 LBJ_0180     TRUE 0.984 -3.000 0.188 NA   NA
 1960901 1960902 LBJ_0180 LBJ_0181     FALSE 0.093 117.000 0.000 NA   NA
 1960903 1960904 LBJ_0182 LBJ_0183     TRUE 0.979 0.000 1.000 NA   NA
 1960904 1960905 LBJ_0183 LBJ_0184   argJ TRUE 0.956 -19.000 0.004 NA   NA
 1960905 1960906 LBJ_0184 LBJ_0185 argJ   TRUE 0.768 64.000 0.004 1.000 N NA
 1960906 1960907 LBJ_0185 LBJ_0186     TRUE 0.993 -10.000 0.008 1.000 Y NA
 1960907 1960908 LBJ_0186 LBJ_0187     FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 1960908 1960909 LBJ_0187 LBJ_0188     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 1960909 1960910 LBJ_0188 LBJ_0189     TRUE 0.980 -16.000 0.667 NA   NA
 1960910 1960911 LBJ_0189 LBJ_0190     TRUE 0.984 -3.000 0.375 NA   NA
 1960911 1960912 LBJ_0190 LBJ_0191     TRUE 0.985 -3.000 0.250 NA   NA
 1960912 1960913 LBJ_0191 LBJ_0192     FALSE 0.010 325.000 0.000 NA   NA
 1960913 1960914 LBJ_0192 LBJ_0193   rnd TRUE 0.902 33.000 0.006 1.000   NA
 1960916 1960917 LBJ_0195 LBJ_0196     TRUE 0.971 16.000 1.000 NA   NA
 1960918 1483039 LBJ_0197 LBJ_0198     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1483039 1960919 LBJ_0198 LBJ_0199     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1960919 1960920 LBJ_0199 LBJ_0200     FALSE 0.010 311.000 0.000 NA   NA
 1960920 1960921 LBJ_0200 LBJ_0201     TRUE 0.978 10.000 1.000 NA   NA
 1960921 1960922 LBJ_0201 LBJ_0202     FALSE 0.006 452.000 0.000 NA   NA
 1960922 1960923 LBJ_0202 LBJ_0203     FALSE 0.073 132.000 0.000 NA   NA
 1960924 1960925 LBJ_0204 LBJ_0205   murA TRUE 0.979 -3.000 0.010 1.000   NA
 1960927 1960928 LBJ_0207 LBJ_0208     TRUE 0.936 32.000 0.500 NA   NA
 1960929 1960930 LBJ_0209 LBJ_0210   icdA TRUE 0.685 68.000 0.012 NA   NA
 1960930 1960931 LBJ_0210 LBJ_0211 icdA   FALSE 0.577 82.000 0.008 NA   NA
 1960932 1960933 LBJ_0212 LBJ_0213     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 1960933 1960934 LBJ_0213 LBJ_0214     TRUE 0.958 -3.000 0.003 NA   NA
 1960937 1960938 LBJ_0218 LBJ_0219     TRUE 0.639 84.000 0.019 NA   NA
 1960938 1483061 LBJ_0219 LBJ_0220   tRNA-Thr-CGT FALSE 0.416 48.000 0.000 NA   NA
 1483061 1483062 LBJ_0220 LBJ_0221 tRNA-Thr-CGT   FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   NA
 1483062 1960939 LBJ_0221 LBJ_0222     FALSE 0.005 553.000 0.000 NA   NA
 1960940 1960941 LBJ_0224 LBJ_0225   srmB FALSE 0.355 108.000 0.004 NA   NA
 1960943 1960944 LBJ_0227 LBJ_0228     FALSE 0.004 675.000 0.000 NA   NA
 1960945 1960946 LBJ_0229 LBJ_0230 glpT   FALSE 0.526 131.000 0.023 1.000 N NA
 1960948 1960949 LBJ_0232 LBJ_0233     TRUE 0.977 1.000 0.006 NA N NA
 1960949 1960950 LBJ_0233 LBJ_0234   pheT TRUE 0.657 74.000 0.002 1.000 N NA
 1960950 1960951 LBJ_0234 LBJ_0235 pheT   FALSE 0.021 266.000 0.000 1.000   NA
 1960952 1960953 LBJ_0236 LBJ_0237     FALSE 0.049 161.000 0.000 NA   NA
 1960953 1960954 LBJ_0237 LBJ_0238     FALSE 0.567 106.000 0.667 NA   NA
 1960956 1483082 LBJ_0240 LBJ_0241     FALSE 0.042 169.000 0.000 NA   NA
 1960957 1960958 LBJ_0242 LBJ_0243     TRUE 0.984 -3.000 0.143 NA   NA
 1960958 1960959 LBJ_0243 LBJ_0244     TRUE 0.743 27.000 0.000 1.000   NA
 1960959 1960960 LBJ_0244 LBJ_0245     FALSE 0.051 183.000 0.000 1.000   NA
 1960960 1483087 LBJ_0245 LBJ_0246   apbA FALSE 0.004 776.000 0.000 NA   NA
 1960963 1960964 LBJ_0249 LBJ_0250     FALSE 0.030 192.000 0.000 NA   NA
 1960964 1960965 LBJ_0250 LBJ_0251     TRUE 0.982 3.000 0.429 NA   NA
 1960965 1960966 LBJ_0251 LBJ_0252   pldB-1 FALSE 0.498 117.000 0.600 NA   NA
 1960967 1960968 LBJ_0253 LBJ_0254     TRUE 0.802 16.000 0.000 NA   NA
 1960969 1960970 LBJ_0255 LBJ_0256 caiD-3   FALSE 0.181 136.000 0.000 1.000 N NA
 1960970 1960971 LBJ_0256 LBJ_0257     FALSE 0.010 1432.000 0.000 NA N NA
 1960971 1960972 LBJ_0257 LBJ_0258     FALSE 0.020 340.000 0.000 NA N NA
 1960972 1960973 LBJ_0258 LBJ_0259     FALSE 0.112 274.000 0.000 1.000 Y NA
 1960973 1960974 LBJ_0259 LBJ_0260     FALSE 0.330 70.000 0.000 1.000   NA
 1960975 1960976 LBJ_0261 LBJ_0262     FALSE 0.034 257.000 0.000 NA N NA
 1960976 1960977 LBJ_0262 LBJ_0263   caiA-1 TRUE 0.836 73.000 0.250 1.000 N NA
 1960978 1960979 LBJ_0264 LBJ_0265     TRUE 0.637 29.000 0.000 NA   NA
 1960979 1960980 LBJ_0265 LBJ_0266     FALSE 0.005 621.000 0.000 NA   NA
 1960981 1483109 LBJ_0267 LBJ_0268     FALSE 0.012 292.000 0.000 NA   NA
 1483110 1960982 LBJ_0269 LBJ_0270     FALSE 0.113 109.000 0.000 NA   NA
 1960982 1960983 LBJ_0270 LBJ_0271     TRUE 0.948 28.000 0.400 NA   NA
 1960983 1960984 LBJ_0271 LBJ_0272     TRUE 0.980 -15.000 0.667 NA   NA
 1960986 1960987 LBJ_0274 LBJ_0275     TRUE 0.922 -13.000 0.000 NA N NA
 1960987 1960988 LBJ_0275 LBJ_0276     FALSE 0.008 387.000 0.000 NA   NA
 1960990 1960991 LBJ_0280 LBJ_0281 ispD lysA TRUE 0.986 -22.000 0.024 1.000 N NA
 1960992 1960993 LBJ_0282 LBJ_0283     TRUE 0.982 7.000 0.125 NA   NA
 1960993 1960994 LBJ_0283 LBJ_0284     TRUE 0.839 103.000 0.125 NA Y NA
 1960994 1960995 LBJ_0284 LBJ_0285   nlpD TRUE 0.955 52.000 0.214 NA Y NA
 1960996 1960997 LBJ_0286 LBJ_0287     FALSE 0.558 36.000 0.000 NA   NA
 1960998 1960999 LBJ_0288 LBJ_0289     FALSE 0.018 452.000 0.000 1.000 N NA
 1960999 1961000 LBJ_0289 LBJ_0290     FALSE 0.016 309.000 0.000 1.000   NA
 1961000 1961001 LBJ_0290 LBJ_0291     FALSE 0.007 606.000 0.000 1.000   NA
 1961002 1483134 LBJ_0292 LBJ_0293     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1483134 1483135 LBJ_0293 LBJ_0294     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 1483135 1961003 LBJ_0294 LBJ_0295     FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 1961003 1961004 LBJ_0295 LBJ_0296   recQ-1 FALSE 0.004 751.000 0.000 NA   NA
 1961004 1961005 LBJ_0296 LBJ_0297 recQ-1   FALSE 0.095 183.000 0.000 1.000 N NA
 1961005 1961006 LBJ_0297 LBJ_0298     TRUE 0.969 0.000 0.004 1.000   NA
 1961007 3532766 LBJ_0299 LBJ_0300     FALSE 0.004 955.000 0.000 NA   NA
 3532766 1961008 LBJ_0300 LBJ_0301     TRUE 0.819 -1680.000 0.000 NA   NA
 1961009 1961010 LBJ_0302 LBJ_0303   prrC TRUE 0.981 11.000 0.178 NA   NA
 1961010 1483144 LBJ_0303 LBJ_0304 prrC hsdS TRUE 0.844 2.000 0.000 NA   NA
 1483144 1961011 LBJ_0304 LBJ_0305 hsdS hsdM TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961011 1961012 LBJ_0305 LBJ_0306 hsdM   FALSE 0.018 814.000 0.000 0.095 N NA
 1961012 1961013 LBJ_0306 LBJ_0307     FALSE 0.009 488.000 0.000 1.000   NA
 1961013 1961014 LBJ_0307 LBJ_0308     FALSE 0.371 65.000 0.000 1.000   NA
 1961014 1961015 LBJ_0308 LBJ_0309     FALSE 0.412 142.000 0.429 NA   NA
 1961015 1961016 LBJ_0309 LBJ_0310     FALSE 0.004 931.000 0.000 NA   NA
 1961016 1961017 LBJ_0310 LBJ_0311     TRUE 0.982 2.000 0.333 NA   NA
 1961018 1483153 LBJ_0312 LBJ_0313     TRUE 0.849 0.000 0.000 NA   NA
 1961020 1961021 LBJ_0315 LBJ_0316 ftsQ ftsA TRUE 0.982 2.000 0.389 NA   NA
 1961021 1961022 LBJ_0316 LBJ_0317 ftsA ftsZ TRUE 0.988 26.000 0.460 1.000 Y NA
 1961023 1961024 LBJ_0318 LBJ_0319   lipL41 TRUE 0.936 29.000 1.000 NA   NA
 1961025 1961026 LBJ_0320 LBJ_0321   nadA TRUE 0.964 -3.000 0.004 NA   NA
 1961026 1483162 LBJ_0321 LBJ_0322 nadA   FALSE 0.021 227.000 0.000 NA   NA
 1483162 1961027 LBJ_0322 LBJ_0323   ispF FALSE 0.006 489.000 0.000 NA   NA
 1961028 1483165 LBJ_0324 LBJ_0325     FALSE 0.054 156.000 0.000 NA   NA
 1483165 1961029 LBJ_0325 LBJ_0326     FALSE 0.390 50.000 0.000 NA   NA
 1961029 1961030 LBJ_0326 LBJ_0327     FALSE 0.022 220.000 0.000 NA   NA
 1961031 1961032 LBJ_0328 LBJ_0329     FALSE 0.065 144.000 0.000 NA   NA
 1961032 1961033 LBJ_0329 LBJ_0330   dprA TRUE 0.906 -3.000 0.000 1.000   NA
 1961033 1961034 LBJ_0330 LBJ_0331 dprA   TRUE 0.952 -43.000 0.002 1.000   NA
 1961036 1961037 LBJ_0333 LBJ_0334   flbD TRUE 0.982 5.000 0.014 NA N NA
 1961037 1961038 LBJ_0334 LBJ_0335 flbD motA-1 TRUE 0.995 7.000 0.301 NA Y NA
 1961038 1961039 LBJ_0335 LBJ_0336 motA-1 motB-1 TRUE 0.994 16.000 0.383 1.000 Y NA
 1961039 1961040 LBJ_0336 LBJ_0337 motB-1 fliL TRUE 0.974 42.000 0.115 1.000 Y NA
 1961040 1961041 LBJ_0337 LBJ_0338 fliL kdsB-1 TRUE 0.987 0.000 0.020 1.000 N NA
 1961042 1961043 LBJ_0339 LBJ_0340     FALSE 0.009 357.000 0.000 NA   NA
 1961043 1961044 LBJ_0340 LBJ_0341     FALSE 0.108 111.000 0.000 NA   NA
 1961044 1961045 LBJ_0341 LBJ_0342     FALSE 0.005 1574.000 0.000 NA   NA
 1961045 1483183 LBJ_0342 LBJ_0343   leuA-4 TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1483183 1961046 LBJ_0343 LBJ_0344 leuA-4   FALSE 0.006 442.000 0.000 NA   NA
 1961047 1961048 LBJ_0345 LBJ_0346 dnaC folK TRUE 0.965 -3.000 0.003 1.000   NA
 1961048 1961049 LBJ_0346 LBJ_0347 folK panB TRUE 0.995 -16.000 0.117 1.000 Y NA
 1961049 1961050 LBJ_0347 LBJ_0348 panB aroF TRUE 0.661 74.000 0.002 1.000 N NA
 1961051 1961052 LBJ_0349 LBJ_0350     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961052 1961053 LBJ_0350 LBJ_0351     FALSE 0.021 226.000 0.000 NA   NA
 1961053 1961054 LBJ_0351 LBJ_0352     FALSE 0.233 72.000 0.000 NA   NA
 1961054 1483193 LBJ_0352 LBJ_0353     TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 1961055 1483195 LBJ_0354 LBJ_0355     FALSE 0.004 910.000 0.000 NA   NA
 1961058 1961059 LBJ_0358 LBJ_0359     FALSE 0.004 935.000 0.000 NA   NA
 1961059 1961060 LBJ_0359 LBJ_0360     FALSE 0.010 1051.000 0.000 NA N NA
 1961060 1961061 LBJ_0360 LBJ_0361     TRUE 0.984 -3.000 0.167 NA   NA
 1961061 1961062 LBJ_0361 LBJ_0362     TRUE 0.979 13.000 0.600 NA   NA
 1961062 1483203 LBJ_0362 LBJ_0363     TRUE 0.854 -6.000 0.000 NA   NA
 1483203 1961063 LBJ_0363 LBJ_0364     TRUE 0.819 -1233.000 0.000 NA   NA
 1961064 1483206 LBJ_0365 LBJ_0366 rpsT tRNA-Val-TAC TRUE 0.777 18.000 0.000 NA   NA
 1483206 1961065 LBJ_0366 LBJ_0367 tRNA-Val-TAC manB-1 FALSE 0.514 39.000 0.000 NA   NA
 1961065 1961066 LBJ_0367 LBJ_0368 manB-1 glmS TRUE 0.981 3.000 0.006 1.000 N NA
 1961066 1961067 LBJ_0368 LBJ_0369 glmS   TRUE 0.972 8.000 0.006 1.000   NA
 1961067 1483210 LBJ_0369 LBJ_0370     TRUE 0.788 17.000 0.000 NA   NA
 1483210 1961068 LBJ_0370 LBJ_0371   amtB FALSE 0.004 705.000 0.000 NA   NA
 1961068 1961069 LBJ_0371 LBJ_0372 amtB glnK TRUE 0.955 35.000 0.061 1.000 N NA
 1961070 1961071 LBJ_0373 LBJ_0374 hemK   TRUE 0.656 27.000 0.000 NA   NA
 1483216 1961073 LBJ_0376 LBJ_0377 tRNA-Arg-CCT   TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 1961073 1961074 LBJ_0377 LBJ_0378     TRUE 0.996 0.000 0.250 1.000 Y NA
 1961074 1961075 LBJ_0378 LBJ_0379     TRUE 0.989 10.000 0.150 1.000 N NA
 1961075 1961076 LBJ_0379 LBJ_0380     TRUE 0.979 18.000 0.019 1.000 N NA
 1961076 1961077 LBJ_0380 LBJ_0381     FALSE 0.514 115.000 0.006 1.000 N NA
 1961078 1961079 LBJ_0382 LBJ_0383 trkG-2   FALSE 0.042 263.000 0.000 1.000 N NA
 1961079 1961080 LBJ_0383 LBJ_0384     FALSE 0.029 233.000 0.000 1.000   NA
 1961080 1961081 LBJ_0384 LBJ_0385     FALSE 0.582 103.000 0.667 NA   NA
 1961081 1961082 LBJ_0385 LBJ_0386     FALSE 0.004 669.000 0.000 NA   NA
 1961085 1961086 LBJ_0389 LBJ_0390     FALSE 0.004 860.000 0.000 NA   NA
 1961086 1961087 LBJ_0390 LBJ_0391   coaB FALSE 0.091 118.000 0.000 NA   NA
 1961087 1961088 LBJ_0391 LBJ_0392 coaB coaC TRUE 0.964 17.000 0.016 NA   NA
 1961088 1961089 LBJ_0392 LBJ_0393 coaC   TRUE 0.931 20.000 0.003 1.000   NA
 1961089 1961090 LBJ_0393 LBJ_0394     FALSE 0.031 227.000 0.000 1.000   NA
 1961090 1961091 LBJ_0394 LBJ_0395   gpsA TRUE 0.982 7.000 0.030 1.000   NA
 1961092 1961093 LBJ_0396 LBJ_0397     FALSE 0.502 111.000 1.000 NA   NA
 1961093 1961094 LBJ_0397 LBJ_0398     TRUE 0.981 3.000 0.667 NA   NA
 1961094 1961095 LBJ_0398 LBJ_0399     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 1961095 1961096 LBJ_0399 LBJ_0400     TRUE 0.976 -19.000 0.028 NA   NA
 1961096 1961097 LBJ_0400 LBJ_0401   mazE FALSE 0.004 681.000 0.000 NA   NA
 1961097 1961098 LBJ_0401 LBJ_0402 mazE mazF TRUE 0.983 -6.000 0.434 NA   NA
 1961098 1961099 LBJ_0402 LBJ_0403 mazF thiC FALSE 0.019 428.000 0.000 1.000 N NA
 1961099 1483244 LBJ_0403 LBJ_0404 thiC   FALSE 0.009 343.000 0.000 NA   NA
 1961102 1961103 LBJ_0407 LBJ_0408 galE lpxA TRUE 0.996 -3.000 0.028 1.000 Y NA
 1961104 1961105 LBJ_0410 LBJ_0411 gmd norM FALSE 0.024 362.000 0.000 1.000 N NA
 1961106 1961107 LBJ_0412 LBJ_0413     TRUE 0.794 59.000 1.000 NA   NA
 1961107 1961108 LBJ_0413 LBJ_0414   trkG-1 TRUE 0.978 0.000 0.026 NA   NA
 1961108 1961109 LBJ_0414 LBJ_0415 trkG-1 trkA TRUE 0.996 14.000 0.330 0.005 Y NA
 1961110 1961111 LBJ_0416 LBJ_0417 acyP   TRUE 0.977 -16.000 0.014 1.000   NA
 1961111 1961112 LBJ_0417 LBJ_0418   nudH TRUE 0.669 67.000 0.005 1.000   NA
 1961114 1961115 LBJ_0420 LBJ_0421 ugpQ   FALSE 0.375 153.000 0.222 NA   NA
 1961116 1961117 LBJ_0427 LBJ_0428     FALSE 0.005 542.000 0.000 NA   NA
 1961117 1961118 LBJ_0428 LBJ_0429     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961118 1961119 LBJ_0429 LBJ_0430   pBP3 TRUE 0.974 16.000 0.058 NA   NA
 1961120 1961121 LBJ_0431 LBJ_0432 hrcA grpE TRUE 0.978 14.000 0.007 1.000 N NA
 1961121 1961122 LBJ_0432 LBJ_0433 grpE dnaK TRUE 0.984 35.000 0.018 0.008 Y NA
 1961122 1961123 LBJ_0433 LBJ_0434 dnaK dnaJ FALSE 0.277 448.000 0.196 0.004 Y NA
 1961123 1961124 LBJ_0434 LBJ_0435 dnaJ   FALSE 0.017 300.000 0.000 1.000   NA
 1961124 1961125 LBJ_0435 LBJ_0436     TRUE 0.921 24.000 0.006 NA   NA
 1961125 1961126 LBJ_0436 LBJ_0437     FALSE 0.260 67.000 0.000 NA   NA
 1961126 1483273 LBJ_0437 LBJ_0438     FALSE 0.005 1960.000 0.000 NA   NA
 1483273 1483274 LBJ_0438 LBJ_0439     FALSE 0.574 35.000 0.000 NA   NA
 1483274 1483275 LBJ_0439 LBJ_0440     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961127 1961128 LBJ_0441 LBJ_0442     FALSE 0.005 1450.000 0.000 NA   NA
 1961129 1961130 LBJ_0444 LBJ_0445   lpxD-2 FALSE 0.014 602.000 0.000 1.000 N NA
 1961130 1961131 LBJ_0445 LBJ_0446 lpxD-2   FALSE 0.013 894.000 0.000 1.000 N NA
 1961132 1961133 LBJ_0448 LBJ_0449 ubiE   TRUE 0.868 27.000 0.002 NA   NA
 1961136 1961137 LBJ_0452 LBJ_0453     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 1961137 1961138 LBJ_0453 LBJ_0454     FALSE 0.009 339.000 0.000 NA   NA
 1961138 1961139 LBJ_0454 LBJ_0455     FALSE 0.008 358.000 0.000 NA   NA
 1483291 1483292 LBJ_0456 LBJ_0457     TRUE 0.720 22.000 0.000 NA   NA
 1483292 1961140 LBJ_0457 LBJ_0458   phoU FALSE 0.014 268.000 0.000 NA   NA
 1961140 1961141 LBJ_0458 LBJ_0459 phoU   FALSE 0.007 392.000 0.000 NA   NA
 1961141 1961142 LBJ_0459 LBJ_0460     FALSE 0.004 856.000 0.000 NA   NA
 1961142 1483296 LBJ_0460 LBJ_0461     FALSE 0.005 1648.000 0.000 NA   NA
 1961143 1961144 LBJ_0462 LBJ_0463 lon   TRUE 0.741 72.000 0.006 1.000 N NA
 1961144 1961145 LBJ_0463 LBJ_0464   dps FALSE 0.013 1111.000 0.000 1.000 N NA
 1961148 1483303 LBJ_0467 LBJ_0468     FALSE 0.005 614.000 0.000 NA   NA
 1961152 1961153 LBJ_0472 LBJ_0473     TRUE 0.960 5.000 0.005 NA   NA
 1961155 1961156 LBJ_0475 LBJ_0476 murC-1 murG TRUE 0.982 3.000 0.036 1.000   NA
 1961156 1961157 LBJ_0476 LBJ_0477 murG ftsW TRUE 0.990 -3.000 0.058 1.000 N NA
 1961157 1961158 LBJ_0477 LBJ_0478 ftsW mraY TRUE 0.984 -3.000 0.003 0.042 N NA
 1961158 1961159 LBJ_0478 LBJ_0479 mraY murE TRUE 0.951 58.000 0.011 0.008 Y NA
 1961159 1961160 LBJ_0479 LBJ_0480 murE   TRUE 0.960 -31.000 0.006 NA   NA
 1961160 1961161 LBJ_0480 LBJ_0481   mraW TRUE 0.954 1.000 0.003 NA   NA
 1961164 1961165 LBJ_0484 LBJ_0485     TRUE 0.975 -3.000 0.010 NA   NA
 1961166 1961167 LBJ_0486 LBJ_0487     FALSE 0.031 187.000 0.000 NA   NA
 1961168 1961169 LBJ_0488 LBJ_0489     FALSE 0.004 836.000 0.000 NA   NA
 1961169 1961170 LBJ_0489 LBJ_0490   birA FALSE 0.007 609.000 0.000 1.000   NA
 1961170 1961171 LBJ_0490 LBJ_0491 birA   TRUE 0.989 2.000 0.147 1.000 N NA
 1483329 1961173 LBJ_0494 LBJ_0496     FALSE 0.006 461.000 0.000 NA   NA
 1961173 1961174 LBJ_0496 LBJ_0497     FALSE 0.004 1145.000 0.000 NA   NA
 1961174 1961175 LBJ_0497 LBJ_0498   marR TRUE 0.844 9.000 0.000 NA   NA
 1961175 1961176 LBJ_0498 LBJ_0499 marR   TRUE 0.962 30.000 0.039 1.000 N NA
 1961176 1961177 LBJ_0499 LBJ_0500     TRUE 0.977 12.000 0.039 NA   NA
 1961178 1961179 LBJ_0501 LBJ_0502 nuoA nuoB TRUE 0.988 -9.000 0.000 0.004 Y NA
 1961179 1961180 LBJ_0502 LBJ_0503 nuoB nuoC TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.004 Y NA
 1961180 1961181 LBJ_0503 LBJ_0504 nuoC nuoD TRUE 0.997 5.000 0.096 0.009 Y NA
 1961181 1961182 LBJ_0504 LBJ_0505 nuoD nuoE TRUE 0.997 0.000 0.097 0.009 Y NA
 1961182 1961183 LBJ_0505 LBJ_0506 nuoE nuoF TRUE 0.996 16.000 0.061 0.009 Y NA
 1961183 1961184 LBJ_0506 LBJ_0507 nuoF nuoH TRUE 0.996 -3.000 0.008 0.009 Y NA
 1961184 1961185 LBJ_0507 LBJ_0508 nuoH nuoJ TRUE 0.992 22.000 0.032 0.009 Y NA
 1961185 1961186 LBJ_0508 LBJ_0509 nuoJ nuoK TRUE 0.997 -3.000 0.306 0.004 Y NA
 1961186 1961187 LBJ_0509 LBJ_0510 nuoK nuoL TRUE 0.996 12.000 0.790 0.009 Y NA
 1961187 1961188 LBJ_0510 LBJ_0511 nuoL nuoM TRUE 0.997 2.000 0.183 0.003 Y NA
 1961188 1961189 LBJ_0511 LBJ_0512 nuoM nuoN TRUE 0.997 -3.000 0.126 0.003 Y NA
 1961190 1483348 LBJ_0513 LBJ_0514     FALSE 0.077 129.000 0.000 NA   NA
 1483348 1961191 LBJ_0514 LBJ_0515     FALSE 0.467 43.000 0.000 NA   NA
 1961193 1961194 LBJ_0517 LBJ_0518   rpoE-1 TRUE 0.977 11.000 1.000 NA   NA
 1961195 1483354 LBJ_0519 LBJ_0520     FALSE 0.004 887.000 0.000 NA   NA
 1961198 1961199 LBJ_0523 LBJ_0524   glpK-2 FALSE 0.012 525.000 0.000 NA N NA
 1961199 1961200 LBJ_0524 LBJ_0525 glpK-2   FALSE 0.006 489.000 0.000 NA   NA
 1961200 1961201 LBJ_0525 LBJ_0526     FALSE 0.004 844.000 0.000 NA   NA
 1961201 1961202 LBJ_0526 LBJ_0527   sphB FALSE 0.009 466.000 0.000 1.000   NA
 1961202 1961203 LBJ_0527 LBJ_0528 sphB prfB FALSE 0.007 1001.000 0.000 1.000   NA
 1961203 1961204 LBJ_0528 LBJ_0529 prfB   FALSE 0.568 65.000 0.002 NA   NA
 1961204 1961205 LBJ_0529 LBJ_0530   purD TRUE 0.950 4.000 0.003 NA   NA
 1961205 1961206 LBJ_0530 LBJ_0531 purD valS TRUE 0.975 -10.000 0.003 1.000 N NA
 1961206 1961207 LBJ_0531 LBJ_0532 valS   FALSE 0.013 852.000 0.000 1.000 N NA
 1961207 1961208 LBJ_0532 LBJ_0533     TRUE 0.880 -25.000 0.000 1.000   NA
 1961208 1961209 LBJ_0533 LBJ_0534     FALSE 0.492 50.000 0.000 1.000   NA
 1961209 1961210 LBJ_0534 LBJ_0535     TRUE 0.980 16.000 0.286 1.000   NA
 1961210 1961211 LBJ_0535 LBJ_0536     FALSE 0.318 185.000 0.000 0.012 Y NA
 1961214 1961215 LBJ_0539 LBJ_0540     FALSE 0.171 90.000 0.000 NA   NA
 1961216 1961217 LBJ_0543 LBJ_0544   ruvC TRUE 0.614 100.000 0.277 NA   NA
 1483378 1961218 LBJ_0545 LBJ_0546     FALSE 0.356 54.000 0.000 NA   NA
 1961218 1961219 LBJ_0546 LBJ_0547     FALSE 0.385 146.000 0.667 NA   NA
 1961219 1961220 LBJ_0547 LBJ_0548     FALSE 0.011 400.000 0.000 1.000   NA
 1961220 1961221 LBJ_0548 LBJ_0549     FALSE 0.011 398.000 0.000 1.000   NA
 1961222 1961223 LBJ_0550 LBJ_0551     FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 1961223 1961224 LBJ_0551 LBJ_0552   paaJ-1 TRUE 0.841 44.000 0.011 NA   NA
 1483386 1961225 LBJ_0553 LBJ_0554     FALSE 0.005 564.000 0.000 NA   NA
 1961225 1961226 LBJ_0554 LBJ_0555     FALSE 0.006 432.000 0.000 NA   NA
 1961226 1961227 LBJ_0555 LBJ_0556     TRUE 0.976 -24.000 1.000 NA   NA
 1961227 1961228 LBJ_0556 LBJ_0557   ccmH TRUE 0.849 0.000 0.000 NA   NA
 1961228 1961229 LBJ_0557 LBJ_0558 ccmH ccmF TRUE 0.984 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1961229 1961230 LBJ_0558 LBJ_0559 ccmF ccmE TRUE 0.994 21.000 0.086 0.003 Y NA
 1961230 1961231 LBJ_0559 LBJ_0560 ccmE   FALSE 0.429 100.000 0.005 NA   NA
 1961231 1961232 LBJ_0560 LBJ_0561     FALSE 0.008 365.000 0.000 NA   NA
 1961232 1961233 LBJ_0561 LBJ_0562     TRUE 0.982 9.000 0.400 NA   NA
 1961233 1961234 LBJ_0562 LBJ_0563     TRUE 0.834 57.000 0.400 NA   NA
 1961234 1961235 LBJ_0563 LBJ_0564     FALSE 0.004 741.000 0.000 NA   NA
 1961237 1961238 LBJ_0567 LBJ_0568 caiB   FALSE 0.036 278.000 0.000 1.000 N NA
 1961238 1961239 LBJ_0568 LBJ_0569   mauG-3 FALSE 0.023 534.000 0.000 0.044 N NA
 1961240 1483404 LBJ_0570 LBJ_0571 ompL1   FALSE 0.004 764.000 0.000 NA   NA
 1483404 1483405 LBJ_0571 LBJ_0573   paaJ-2 FALSE 0.005 1278.000 0.000 NA   NA
 1961241 1483407 LBJ_0574 LBJ_0575     FALSE 0.004 1132.000 0.000 NA   NA
 1483407 1961242 LBJ_0575 LBJ_0576     TRUE 0.820 -112.000 0.000 NA   NA
 1961242 1961243 LBJ_0576 LBJ_0577     FALSE 0.004 1160.000 0.000 NA   NA
 1961243 1961244 LBJ_0577 LBJ_0578     FALSE 0.004 1153.000 0.000 NA   NA
 1961244 1961245 LBJ_0578 LBJ_0579     FALSE 0.155 94.000 0.000 NA   NA
 1961245 1961246 LBJ_0579 LBJ_0580     TRUE 0.878 43.000 0.030 NA   NA
 1961248 1961249 LBJ_0582 LBJ_0583     TRUE 0.882 43.000 0.037 NA   NA
 1961249 1961250 LBJ_0583 LBJ_0584     FALSE 0.014 265.000 0.000 NA   NA
 1961250 1483417 LBJ_0584 LBJ_0585     FALSE 0.057 152.000 0.000 NA   NA
 1483417 1483418 LBJ_0585 LBJ_0586     TRUE 0.824 -34.000 0.000 NA   NA
 1483418 1961251 LBJ_0586 LBJ_0587     FALSE 0.008 366.000 0.000 NA   NA
 1961251 1961252 LBJ_0587 LBJ_0588   copZ TRUE 0.844 8.000 0.000 NA   NA
 1961252 1961253 LBJ_0588 LBJ_0589 copZ   TRUE 0.998 -3.000 0.333 0.001 Y NA
 1483422 1961254 LBJ_0590 LBJ_0591 gst-3   FALSE 0.157 93.000 0.000 NA   NA
 1961259 1961260 LBJ_0597 LBJ_0598   ung FALSE 0.022 223.000 0.000 NA   NA
 1961260 1961261 LBJ_0598 LBJ_0599 ung galK FALSE 0.047 223.000 0.000 NA N NA
 1961262 1961263 LBJ_0600 LBJ_0601 pgi   FALSE 0.393 105.000 0.005 NA   NA
 1961263 1961264 LBJ_0601 LBJ_0602     FALSE 0.004 985.000 0.000 NA   NA
 1961265 1961266 LBJ_0603 LBJ_0604     TRUE 0.980 11.000 0.642 NA   NA
 1961266 1961267 LBJ_0604 LBJ_0605     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 1961267 1483438 LBJ_0605 LBJ_0606     FALSE 0.440 46.000 0.000 NA   NA
 1961268 1483440 LBJ_0607 LBJ_0608     FALSE 0.018 242.000 0.000 NA   NA
 1483440 1961269 LBJ_0608 LBJ_0609   ligB FALSE 0.009 348.000 0.000 NA   NA
 1961269 1961270 LBJ_0609 LBJ_0610 ligB   TRUE 0.978 2.000 1.000 NA   NA
 1961270 1961271 LBJ_0610 LBJ_0611     TRUE 0.829 -25.000 0.000 NA   NA
 1961271 1961272 LBJ_0611 LBJ_0612     TRUE 0.844 9.000 0.000 NA   NA
 1961275 1961276 LBJ_0615 LBJ_0616     TRUE 0.731 21.000 0.000 NA   NA
 1961276 1961277 LBJ_0616 LBJ_0617   add FALSE 0.016 255.000 0.000 NA   NA
 1961279 1961280 LBJ_0619 LBJ_0620     TRUE 0.906 -3.000 0.000 1.000   NA
 1961280 1961281 LBJ_0620 LBJ_0621     FALSE 0.007 698.000 0.000 1.000   NA
 1961282 1961283 LBJ_0622 LBJ_0623     FALSE 0.005 555.000 0.000 NA   NA
 1961283 1961284 LBJ_0623 LBJ_0624     TRUE 0.983 -3.000 0.750 NA   NA
 1961284 1483457 LBJ_0624 LBJ_0625     FALSE 0.005 544.000 0.000 NA   NA
 1483457 1961285 LBJ_0625 LBJ_0626     FALSE 0.245 70.000 0.000 NA   NA
 1961286 1961287 LBJ_0627 LBJ_0628     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1961287 1961288 LBJ_0628 LBJ_0629     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA   NA
 1961288 1961289 LBJ_0629 LBJ_0630     TRUE 0.975 42.000 0.400 1.000 Y NA
 1961289 1961290 LBJ_0630 LBJ_0631     FALSE 0.029 233.000 0.000 1.000   NA
 1961290 1961291 LBJ_0631 LBJ_0632     FALSE 0.005 569.000 0.000 NA   NA
 1961291 1961292 LBJ_0632 LBJ_0633     FALSE 0.008 385.000 0.000 NA   NA
 1961292 1961293 LBJ_0633 LBJ_0634   hisI TRUE 0.616 59.000 0.002 NA   NA
 1961293 1483467 LBJ_0634 LBJ_0635 hisI   FALSE 0.023 216.000 0.000 NA   NA
 1961294 1961295 LBJ_0637 LBJ_0638     TRUE 0.982 -10.000 0.500 NA   NA
 1961295 1961296 LBJ_0638 LBJ_0639     TRUE 0.981 -10.000 0.600 NA   NA
 1961296 1961297 LBJ_0639 LBJ_0640   glpF FALSE 0.010 324.000 0.000 NA   NA
 1961298 1961299 LBJ_0641 LBJ_0642 fliD   TRUE 0.967 19.000 0.056 NA   NA
 1961300 1961301 LBJ_0643 LBJ_0644 rsbU-2 rsbU-3 TRUE 0.997 4.000 0.667 0.007 Y NA
 1961301 1961302 LBJ_0644 LBJ_0645 rsbU-3 ribF TRUE 0.654 106.000 0.021 1.000 N NA
 1961305 1961306 LBJ_0648 LBJ_0649     TRUE 0.981 10.000 0.200 NA   NA
 1961306 1961307 LBJ_0649 LBJ_0650   manA TRUE 0.985 6.000 0.200 1.000   NA
 1961307 1961308 LBJ_0650 LBJ_0651 manA   TRUE 0.984 10.000 0.143 1.000   NA
 1961308 1961309 LBJ_0651 LBJ_0652     TRUE 0.979 3.000 0.039 NA   NA
 1961309 1961310 LBJ_0652 LBJ_0653   coaE FALSE 0.009 355.000 0.000 NA   NA
 1961310 1961311 LBJ_0653 LBJ_0654 coaE   TRUE 0.957 -3.000 0.003 NA   NA
 1961311 1961312 LBJ_0654 LBJ_0655     TRUE 0.837 54.000 0.065 NA   NA
 1961312 1961313 LBJ_0655 LBJ_0656     FALSE 0.005 637.000 0.000 NA   NA
 1961313 1961314 LBJ_0656 LBJ_0657   trmA-2 FALSE 0.309 60.000 0.000 NA   NA
 1961315 1961316 LBJ_0658 LBJ_0659 sbcC sbcD TRUE 0.995 2.000 0.025 1.000 Y NA
 1961316 1961317 LBJ_0659 LBJ_0660 sbcD   FALSE 0.011 296.000 0.000 NA   NA
 1961317 1961318 LBJ_0660 LBJ_0661     TRUE 0.716 72.000 1.000 NA   NA
 1961318 1961319 LBJ_0661 LBJ_0662   alkA FALSE 0.004 710.000 0.000 NA   NA
 1961319 1961320 LBJ_0662 LBJ_0663 alkA   TRUE 0.966 20.000 0.006 1.000 N NA
 1961320 1961321 LBJ_0663 LBJ_0664     TRUE 0.916 49.000 0.182 0.031   NA
 1961321 1961322 LBJ_0664 LBJ_0665     FALSE 0.012 283.000 0.000 NA   NA
 1961323 1961324 LBJ_0666 LBJ_0667     FALSE 0.004 1011.000 0.000 NA   NA
 1961324 1961325 LBJ_0667 LBJ_0668     TRUE 0.813 66.000 0.500 1.000   NA
 1961325 1961326 LBJ_0668 LBJ_0669     TRUE 0.970 27.000 0.500 1.000 N NA
 1961326 1961327 LBJ_0669 LBJ_0670     TRUE 0.949 -3.000 0.000 1.000 N NA
 1483505 1961330 LBJ_0673 LBJ_0674 tRNA-Pro-GGG sixA-1 FALSE 0.287 64.000 0.000 NA   NA
 1961331 1961332 LBJ_0675 LBJ_0676     TRUE 0.982 -7.000 0.523 NA   NA
 1961332 1961333 LBJ_0676 LBJ_0677     FALSE 0.171 90.000 0.000 NA   NA
 1961334 1961335 LBJ_0678 LBJ_0679 ksgA   TRUE 0.971 -37.000 0.016 NA   NA
 1961335 1961336 LBJ_0679 LBJ_0680     FALSE 0.011 295.000 0.000 NA   NA
 1961336 1961337 LBJ_0680 LBJ_0681     FALSE 0.189 102.000 0.000 1.000   NA
 1961337 1483514 LBJ_0681 LBJ_0682     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1483514 1961338 LBJ_0682 LBJ_0683   recD FALSE 0.050 159.000 0.000 NA   NA
 1961338 1961339 LBJ_0683 LBJ_0684 recD recB TRUE 0.997 0.000 0.688 0.002 Y NA
 1961339 1961340 LBJ_0684 LBJ_0685 recB recC TRUE 0.997 -3.000 0.542 0.002 Y NA
 1961342 1961343 LBJ_0687 LBJ_0688     FALSE 0.182 211.000 0.056 NA   NA
 1961343 1961344 LBJ_0688 LBJ_0689     FALSE 0.220 193.000 0.067 NA   NA
 1961344 1961345 LBJ_0689 LBJ_0690     TRUE 0.981 -19.000 0.286 NA   NA
 1961347 1961348 LBJ_0692 LBJ_0693     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961349 1961350 LBJ_0694 LBJ_0695     TRUE 0.988 -28.000 0.196 1.000 N NA
 1961350 1961351 LBJ_0695 LBJ_0696     TRUE 0.969 57.000 0.501 0.001 Y NA
 1961351 1961352 LBJ_0696 LBJ_0697     TRUE 0.982 7.000 0.008 1.000 N NA
 1961352 1961353 LBJ_0697 LBJ_0698   purC TRUE 0.983 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1961353 1961354 LBJ_0698 LBJ_0699 purC purS TRUE 0.995 -24.000 0.049 1.000 Y NA
 1961354 1961355 LBJ_0699 LBJ_0700 purS   TRUE 0.997 -3.000 0.656 0.001 Y NA
 1961355 1961356 LBJ_0700 LBJ_0701     FALSE 0.018 242.000 0.000 NA   NA
 1961356 1961357 LBJ_0701 LBJ_0702     TRUE 0.980 4.000 0.667 NA   NA
 1961357 1961358 LBJ_0702 LBJ_0703   flaA-1 FALSE 0.004 710.000 0.000 NA   NA
 1961358 1961359 LBJ_0703 LBJ_0704 flaA-1 flaA-2 TRUE 0.976 24.000 0.348 0.007   NA
 1961359 1961360 LBJ_0704 LBJ_0705 flaA-2 greA FALSE 0.035 217.000 0.000 1.000   NA
 1961360 1961361 LBJ_0705 LBJ_0706 greA   FALSE 0.017 247.000 0.000 NA   NA
 1961361 1961362 LBJ_0706 LBJ_0707     TRUE 0.796 65.000 0.341 NA   NA
 1961362 1483540 LBJ_0707 LBJ_0708     FALSE 0.007 421.000 0.000 NA   NA
 1483540 1961363 LBJ_0708 LBJ_0709     TRUE 0.745 20.000 0.000 NA   NA
 1961363 1961364 LBJ_0709 LBJ_0710     FALSE 0.008 378.000 0.000 NA   NA
 1961365 1961366 LBJ_0711 LBJ_0712     TRUE 0.977 14.000 0.067 NA   NA
 1961368 1961369 LBJ_0714 LBJ_0715     TRUE 0.988 0.000 0.047 0.067   NA
 1961369 1961370 LBJ_0715 LBJ_0716     TRUE 0.988 3.000 0.047 0.019   NA
 1961370 1961371 LBJ_0716 LBJ_0717   tolQ TRUE 0.985 -211.000 0.044 0.027   NA
 1961371 1483550 LBJ_0717 LBJ_0718 tolQ   FALSE 0.005 535.000 0.000 NA   NA
 1483550 1961372 LBJ_0718 LBJ_0719     TRUE 0.637 29.000 0.000 NA   NA
 1961372 1483552 LBJ_0719 LBJ_0720   lipL48 FALSE 0.390 50.000 0.000 NA   NA
 1483552 1961373 LBJ_0720 LBJ_0721 lipL48   FALSE 0.052 157.000 0.000 NA   NA
 1961374 1961375 LBJ_0722 LBJ_0723     TRUE 0.982 2.000 1.000 1.000   NA
 1961376 1961377 LBJ_0724 LBJ_0725     FALSE 0.010 321.000 0.000 NA   NA
 1961377 1961378 LBJ_0725 LBJ_0726     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961378 1961379 LBJ_0726 LBJ_0727   rpmE TRUE 0.796 57.000 0.004 1.000 N NA
 1961379 1961380 LBJ_0727 LBJ_0728 rpmE rho TRUE 0.979 21.000 0.115 1.000 N NA
 1961380 1961381 LBJ_0728 LBJ_0729 rho   FALSE 0.092 146.000 0.000 1.000   NA
 1961382 1961383 LBJ_0730 LBJ_0731   pyrB FALSE 0.024 360.000 0.000 1.000 N NA
 1961383 1961384 LBJ_0731 LBJ_0732 pyrB   TRUE 0.953 7.000 0.003 NA   NA
 1961384 1961385 LBJ_0732 LBJ_0733     TRUE 0.974 -16.000 0.018 NA   NA
 1961386 1483567 LBJ_0734 LBJ_0735   pepD TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961390 1961391 LBJ_0738 LBJ_0739     FALSE 0.245 89.000 0.000 1.000   NA
 1961392 1961393 LBJ_0740 LBJ_0741   gltB FALSE 0.005 611.000 0.000 NA   NA
 1961394 1961395 LBJ_0742 LBJ_0743 colA   FALSE 0.005 2929.000 0.000 NA   NA
 1961395 1961396 LBJ_0743 LBJ_0744     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961396 1961397 LBJ_0744 LBJ_0745     TRUE 0.984 -3.000 0.213 NA   NA
 1961397 1961398 LBJ_0745 LBJ_0746     TRUE 0.969 -43.000 0.014 NA   NA
 1961398 1961399 LBJ_0746 LBJ_0747   gltA-1 TRUE 0.982 9.000 0.250 NA   NA
 1961399 1961400 LBJ_0747 LBJ_0748 gltA-1   FALSE 0.040 474.000 0.008 1.000   NA
 1961401 1483583 LBJ_0749 LBJ_0750     FALSE 0.010 314.000 0.000 NA   NA
 1483583 1961402 LBJ_0750 LBJ_0751     FALSE 0.010 331.000 0.000 NA   NA
 1961402 1961403 LBJ_0751 LBJ_0752     FALSE 0.519 114.000 0.600 NA   NA
 1961403 1961404 LBJ_0752 LBJ_0753   pdxA TRUE 0.860 60.000 0.022 1.000 N NA
 1961404 1961405 LBJ_0753 LBJ_0754 pdxA   TRUE 0.950 23.000 0.022 NA   NA
 1961405 1961406 LBJ_0754 LBJ_0755     TRUE 0.965 20.000 0.667 NA   NA
 1961409 1961410 LBJ_0759 LBJ_0760     FALSE 0.069 219.000 0.000 0.003   NA
 1961410 1961411 LBJ_0760 LBJ_0761   ruvB TRUE 0.976 1.000 0.003 1.000 N NA
 1961411 1961412 LBJ_0761 LBJ_0762 ruvB   TRUE 0.948 -25.000 0.003 NA   NA
 1961412 1961413 LBJ_0762 LBJ_0763     TRUE 0.836 56.000 0.500 NA   NA
 1961413 1961414 LBJ_0763 LBJ_0764     TRUE 0.832 12.000 0.000 NA   NA
 1961415 1961416 LBJ_0765 LBJ_0766     TRUE 0.987 1.000 0.000 0.020 Y NA
 1961416 1961417 LBJ_0766 LBJ_0767     FALSE 0.012 279.000 0.000 NA   NA
 1961417 1961418 LBJ_0767 LBJ_0768     TRUE 0.974 16.000 0.667 NA   NA
 1961419 1961420 LBJ_0769 LBJ_0770     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 1961420 1961421 LBJ_0770 LBJ_0771     TRUE 0.977 5.000 0.026 NA   NA
 1961421 1483605 LBJ_0771 LBJ_0772     FALSE 0.005 606.000 0.000 NA   NA
 1483605 1961422 LBJ_0772 LBJ_0773     TRUE 0.854 -6.000 0.000 NA   NA
 1961422 1961423 LBJ_0773 LBJ_0774   carB TRUE 0.887 42.000 0.004 1.000 N NA
 1961423 1961424 LBJ_0774 LBJ_0775 carB   FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 1961424 10707033 LBJ_0775 LBJ_0776     FALSE 0.017 248.000 0.000 NA   NA
 1483609 1961425 LBJ_0778 LBJ_0780     FALSE 0.004 861.000 0.000 NA   NA
 1961426 1961427 LBJ_0781 LBJ_0782     FALSE 0.005 596.000 0.000 NA   NA
 1961427 1961428 LBJ_0782 LBJ_0783     TRUE 0.970 5.000 0.010 NA   NA
 1961428 1961429 LBJ_0783 LBJ_0784     FALSE 0.006 478.000 0.000 NA   NA
 1961429 1961430 LBJ_0784 LBJ_0785   fliK FALSE 0.007 409.000 0.000 NA   NA
 1961430 1961431 LBJ_0785 LBJ_0786 fliK flgD TRUE 0.963 16.000 0.012 NA   NA
 1961431 1961432 LBJ_0786 LBJ_0787 flgD flgE TRUE 0.923 37.000 0.298 NA   NA
 1961432 1961433 LBJ_0787 LBJ_0788 flgE   FALSE 0.129 162.000 0.000 1.000 N NA
 1961435 1961436 LBJ_0790 LBJ_0791   trpC TRUE 0.982 8.000 0.008 1.000 N NA
 1961436 1961437 LBJ_0791 LBJ_0792 trpC   FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 1961439 1961440 LBJ_0794 LBJ_0795     TRUE 0.863 31.000 0.003 NA   NA
 1961440 1961441 LBJ_0795 LBJ_0796     TRUE 0.979 13.000 0.091 NA   NA
 1961443 1961444 LBJ_0798 LBJ_0799     FALSE 0.014 1284.000 0.000 0.005   NA
 1961444 1961445 LBJ_0799 LBJ_0800     FALSE 0.123 122.000 0.000 1.000   NA
 1961445 1961446 LBJ_0800 LBJ_0801     FALSE 0.007 1281.000 0.000 1.000   NA
 1961446 1961447 LBJ_0801 LBJ_0802     TRUE 0.978 20.000 0.679 0.015   NA
 1961447 1961448 LBJ_0802 LBJ_0803     TRUE 0.986 26.000 0.550 NA Y NA
 1961448 1961449 LBJ_0803 LBJ_0804     TRUE 0.981 0.000 0.730 NA   NA
 1961449 1961450 LBJ_0804 LBJ_0805     FALSE 0.023 215.000 0.000 NA   NA
 1961450 1961451 LBJ_0805 LBJ_0806     TRUE 0.980 6.000 0.067 NA   NA
 1961451 1961452 LBJ_0806 LBJ_0807     TRUE 0.976 14.000 0.750 NA   NA
 1961452 1961453 LBJ_0807 LBJ_0808     FALSE 0.009 334.000 0.000 NA   NA
 1961453 1961454 LBJ_0808 LBJ_0809     FALSE 0.009 347.000 0.000 NA   NA
 1961455 1961456 LBJ_0810 LBJ_0811     TRUE 0.983 -3.000 0.750 NA   NA
 1961457 1483643 LBJ_0812 LBJ_0813     FALSE 0.005 579.000 0.000 NA   NA
 1483643 1483644 LBJ_0813 LBJ_0814     FALSE 0.115 108.000 0.000 NA   NA
 1483644 1961458 LBJ_0814 LBJ_0815     FALSE 0.004 753.000 0.000 NA   NA
 1961458 1483646 LBJ_0815 LBJ_0816     FALSE 0.007 420.000 0.000 NA   NA
 1483646 1483647 LBJ_0816 LBJ_0817     FALSE 0.007 401.000 0.000 NA   NA
 1483647 1483648 LBJ_0817 LBJ_0818     TRUE 0.844 8.000 0.000 NA   NA
 1961461 1961462 LBJ_0821 LBJ_0822 pepB bcp TRUE 0.980 -3.000 0.004 1.000 N NA
 1961463 1961464 LBJ_0823 LBJ_0824     FALSE 0.007 418.000 0.000 NA   NA
 1483655 1961465 LBJ_0825 LBJ_0826     FALSE 0.004 754.000 0.000 NA   NA
 1961465 1961466 LBJ_0826 LBJ_0827     TRUE 0.982 -3.000 0.038 NA   NA
 3532767 1961467 LBJ_0828 LBJ_0829     TRUE 0.819 -1680.000 0.000 NA   NA
 1961468 1961469 LBJ_0831 LBJ_0832     FALSE 0.013 272.000 0.000 NA   NA
 1961472 1961473 LBJ_0836 LBJ_0837     TRUE 0.941 31.000 0.375 NA   NA
 1961473 1961474 LBJ_0837 LBJ_0838   tgt TRUE 0.990 -3.000 0.083 1.000 N NA
 1961474 1961475 LBJ_0838 LBJ_0839 tgt   TRUE 0.839 70.000 0.065 1.000 N NA
 1961475 1961476 LBJ_0839 LBJ_0840   lipL71 TRUE 0.869 48.000 0.065 NA   NA
 1961476 1961477 LBJ_0840 LBJ_0841 lipL71 nadC FALSE 0.004 945.000 0.000 NA   NA
 1961477 1961478 LBJ_0841 LBJ_0842 nadC spoT TRUE 0.977 6.000 0.004 1.000 N NA
 1961478 1961479 LBJ_0842 LBJ_0843 spoT   TRUE 0.987 14.000 0.074 1.000 N NA
 1961479 1961480 LBJ_0843 LBJ_0844     TRUE 0.980 11.000 0.667 NA   NA
 1961480 1961481 LBJ_0844 LBJ_0845   purB FALSE 0.004 745.000 0.000 NA   NA
 1961481 1961482 LBJ_0845 LBJ_0846 purB   TRUE 0.947 1.000 0.002 NA   NA
 1961482 1961483 LBJ_0846 LBJ_0847     FALSE 0.011 297.000 0.000 NA   NA
 1961485 1483679 LBJ_0849 LBJ_0850     FALSE 0.011 306.000 0.000 NA   NA
 1483680 1961486 LBJ_0851 LBJ_0852     FALSE 0.010 331.000 0.000 NA   NA
 1961487 1961488 LBJ_0854 LBJ_0855     TRUE 0.846 -10.000 0.000 NA   NA
 1961489 1483686 LBJ_0856 LBJ_0857     FALSE 0.004 874.000 0.000 NA   NA
 1483691 1961492 LBJ_0862 LBJ_0863     TRUE 0.819 -1627.000 0.000 NA   NA
 1961495 1961496 LBJ_0867 LBJ_0868     TRUE 0.836 39.000 0.005 NA   NA
 1961496 1961497 LBJ_0868 LBJ_0869   miaB-1 TRUE 0.973 -3.000 0.005 1.000   NA
 1961498 1961499 LBJ_0870 LBJ_0871     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA   NA
 1483703 1961501 LBJ_0874 LBJ_0875     FALSE 0.004 853.000 0.000 NA   NA
 1961502 1961503 LBJ_0876 LBJ_0877     FALSE 0.016 307.000 0.000 1.000   NA
 1483713 1961509 LBJ_0884 LBJ_0885     FALSE 0.021 225.000 0.000 NA   NA
 1961510 1961511 LBJ_0886 LBJ_0887     TRUE 0.976 -25.000 1.000 NA   NA
 1961511 1961512 LBJ_0887 LBJ_0888     TRUE 0.989 8.000 0.081 1.000 N NA
 1961512 1961513 LBJ_0888 LBJ_0889     FALSE 0.005 616.000 0.000 NA   NA
 1961515 1961516 LBJ_0891 LBJ_0892     FALSE 0.449 131.000 0.273 NA   NA
 1961516 1961517 LBJ_0892 LBJ_0893     TRUE 0.798 64.000 0.125 NA   NA
 1961517 1961518 LBJ_0893 LBJ_0894     TRUE 0.985 6.000 0.188 1.000   NA
 1961520 1961521 LBJ_0896 LBJ_0897 dapA dapB TRUE 0.991 3.000 0.003 1.000 Y NA
 1961521 1961522 LBJ_0897 LBJ_0898 dapB   TRUE 0.941 16.000 0.003 NA   NA
 1961522 1961523 LBJ_0898 LBJ_0899     TRUE 0.968 0.000 0.007 NA   NA
 1961523 1961524 LBJ_0899 LBJ_0900   acpS TRUE 0.962 -3.000 0.003 NA   NA
 1961524 1961525 LBJ_0900 LBJ_0901 acpS   TRUE 0.963 4.000 0.003 1.000   NA
 1961525 1961526 LBJ_0901 LBJ_0902     TRUE 0.981 9.000 0.095 NA   NA
 1961526 1961527 LBJ_0902 LBJ_0903     TRUE 0.959 23.000 0.095 NA   NA
 1961527 1961528 LBJ_0903 LBJ_0904   rpsB TRUE 0.919 19.000 0.003 NA   NA
 1961528 1961529 LBJ_0904 LBJ_0905 rpsB tsf TRUE 0.980 14.000 0.748 1.000   NA
 1961529 1961530 LBJ_0905 LBJ_0906 tsf pyrH TRUE 0.976 4.000 0.011 1.000   NA
 1961530 1961531 LBJ_0906 LBJ_0907 pyrH frr TRUE 0.986 -10.000 0.015 1.000 N NA
 1961531 1961532 LBJ_0907 LBJ_0908 frr uppS TRUE 0.989 2.000 0.409 1.000 N NA
 1961532 1961533 LBJ_0908 LBJ_0909 uppS cdsA TRUE 0.996 -7.000 0.400 1.000 Y NA
 1961533 1961534 LBJ_0909 LBJ_0910 cdsA dxr TRUE 0.996 7.000 0.372 1.000 Y NA
 1961534 1961535 LBJ_0910 LBJ_0911 dxr   TRUE 0.984 -6.000 0.010 1.000 N NA
 1961535 1961536 LBJ_0911 LBJ_0912   proS TRUE 0.977 5.000 0.004 1.000 N NA
 1961536 1961537 LBJ_0912 LBJ_0913 proS trpB TRUE 0.977 3.000 0.004 1.000 N NA
 1961537 1961538 LBJ_0913 LBJ_0914 trpB trpA TRUE 0.996 -3.000 0.007 0.001 Y NA
 1961540 1961541 LBJ_0916 LBJ_0917   dxs TRUE 0.934 29.000 0.004 1.000 N NA
 1961541 1961542 LBJ_0917 LBJ_0918 dxs   TRUE 0.850 42.000 0.006 1.000   NA
 1961544 1961545 LBJ_0920 LBJ_0921 infC rpmI TRUE 0.984 32.000 0.652 1.000 Y NA
 1961545 1961546 LBJ_0921 LBJ_0922 rpmI rplT TRUE 0.996 0.000 0.928 0.018 Y NA
 1961546 1961547 LBJ_0922 LBJ_0923 rplT   FALSE 0.550 79.000 0.003 1.000   NA
 1961547 1961548 LBJ_0923 LBJ_0924     TRUE 0.836 11.000 0.000 NA   NA
 1961548 1961549 LBJ_0924 LBJ_0925     FALSE 0.495 41.000 0.000 NA   NA
 1961549 1961550 LBJ_0925 LBJ_0926     FALSE 0.016 523.000 0.000 1.000 N NA
 1961550 1961551 LBJ_0926 LBJ_0927     TRUE 0.997 0.000 0.070 0.011 Y NA
 1961551 1961552 LBJ_0927 LBJ_0928   cheB TRUE 0.996 6.000 0.028 0.011 Y NA
 1961552 1961553 LBJ_0928 LBJ_0929 cheB   TRUE 0.996 2.000 0.028 0.017 Y NA
 1961553 1961554 LBJ_0929 LBJ_0930     TRUE 0.941 17.000 0.004 NA   NA
 1961554 1961555 LBJ_0930 LBJ_0931     TRUE 0.984 -3.000 0.570 NA   NA
 1961555 1961556 LBJ_0931 LBJ_0932   pheA TRUE 0.981 -7.000 0.009 NA N NA
 1961556 1961557 LBJ_0932 LBJ_0933 pheA tyrA TRUE 0.996 -3.000 0.057 1.000 Y NA
 1961557 1961558 LBJ_0933 LBJ_0934 tyrA aroA TRUE 0.995 -19.000 0.100 1.000 Y NA
 1961558 1961559 LBJ_0934 LBJ_0935 aroA cmk TRUE 0.990 -7.000 0.209 1.000 N NA
 1961559 1961560 LBJ_0935 LBJ_0936 cmk rpsA-2 TRUE 0.908 53.000 0.281 1.000 N NA
 1961560 1961561 LBJ_0936 LBJ_0937 rpsA-2   TRUE 0.911 26.000 0.003 1.000   NA
 1961561 1961562 LBJ_0937 LBJ_0938   hisG TRUE 0.960 0.000 0.002 1.000   NA
 1961562 1961563 LBJ_0938 LBJ_0939 hisG rpmF FALSE 0.037 274.000 0.000 1.000 N NA
 1961563 1483769 LBJ_0939 LBJ_0940 rpmF plsX TRUE 0.844 9.000 0.000 NA   NA
 1961564 1961565 LBJ_0941 LBJ_0942     TRUE 0.958 3.000 0.004 NA   NA
 1961565 1961566 LBJ_0942 LBJ_0943     TRUE 0.960 -9.000 0.004 NA   NA
 1961567 1961568 LBJ_0944 LBJ_0945   nusA TRUE 0.980 2.000 0.759 NA   NA
 1961568 1961569 LBJ_0945 LBJ_0946 nusA infB TRUE 0.889 69.000 0.342 0.016 N NA
 1961569 1961570 LBJ_0946 LBJ_0947 infB rbfA TRUE 0.995 13.000 0.530 1.000 Y NA
 1961570 1961571 LBJ_0947 LBJ_0948 rbfA truB TRUE 0.982 35.000 0.111 1.000 Y NA
 1961571 1961572 LBJ_0948 LBJ_0949 truB rpsO TRUE 0.946 52.000 0.013 1.000 Y NA
 1961572 1961573 LBJ_0949 LBJ_0950 rpsO pnp TRUE 0.996 -3.000 0.335 1.000 Y NA
 1961573 1961574 LBJ_0950 LBJ_0951 pnp   TRUE 0.972 19.000 0.057 1.000   NA
 1483781 1961575 LBJ_0952 LBJ_0953     TRUE 0.841 4.000 0.000 NA   NA
 1961575 1483783 LBJ_0953 LBJ_0954     FALSE 0.009 356.000 0.000 NA   NA
 1961576 1961577 LBJ_0955 LBJ_0956   radC TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 1961577 1961578 LBJ_0956 LBJ_0957 radC   TRUE 0.987 -6.000 0.050 NA N NA
 1961578 1961579 LBJ_0957 LBJ_0958     TRUE 0.995 -3.000 0.050 NA Y NA
 1961579 1961580 LBJ_0958 LBJ_0959   ugd TRUE 0.963 49.000 0.059 1.000 Y NA
 1961581 1961582 LBJ_0960 LBJ_0961   purK FALSE 0.009 492.000 0.000 1.000   NA
 1961582 1961583 LBJ_0961 LBJ_0962 purK purE TRUE 0.997 -3.000 0.201 0.001 Y NA
 1961583 1961584 LBJ_0962 LBJ_0963 purE murF TRUE 0.816 51.000 0.003 1.000 N NA
 1961585 1961586 LBJ_0964 LBJ_0965     FALSE 0.004 780.000 0.000 NA   NA
 1961586 1961587 LBJ_0965 LBJ_0966     FALSE 0.004 1119.000 0.000 NA   NA
 1961588 1961589 LBJ_0967 LBJ_0968     TRUE 0.974 17.000 0.400 NA   NA
 1961589 1961590 LBJ_0968 LBJ_0969     FALSE 0.004 845.000 0.000 NA   NA
 1961590 1961591 LBJ_0969 LBJ_0970     TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 1961591 1961592 LBJ_0970 LBJ_0971     TRUE 0.977 14.000 0.667 NA   NA
 1961592 1961593 LBJ_0971 LBJ_0972     FALSE 0.004 1156.000 0.000 NA   NA
 1961595 1961596 LBJ_0974 LBJ_0975     FALSE 0.005 596.000 0.000 NA   NA
 1961596 1961597 LBJ_0975 LBJ_0976   kdtA FALSE 0.004 1156.000 0.000 NA   NA
 1961600 1961601 LBJ_0979 LBJ_0980     TRUE 0.844 2.000 0.000 NA   NA
 1961601 1961602 LBJ_0980 LBJ_0981   proC TRUE 0.844 2.000 0.000 NA   NA
 1961603 1961604 LBJ_0983 LBJ_0984     TRUE 0.906 41.000 0.143 NA   NA
 1961604 1961605 LBJ_0984 LBJ_0985     TRUE 0.978 -36.000 0.667 NA   NA
 1961605 1961606 LBJ_0985 LBJ_0986   trmU TRUE 0.968 0.000 0.004 1.000   NA
 1961606 1961607 LBJ_0986 LBJ_0987 trmU   TRUE 0.979 17.000 0.006 0.099 N NA
 1961607 1961608 LBJ_0987 LBJ_0988     FALSE 0.570 103.000 0.048 NA   NA
 1961608 1961609 LBJ_0988 LBJ_0989     TRUE 0.981 9.000 0.088 NA   NA
 1961609 1961610 LBJ_0989 LBJ_0990     TRUE 0.988 -3.000 0.019 1.000 N NA
 1961610 1961611 LBJ_0990 LBJ_0991     TRUE 0.983 -3.000 0.019 1.000   NA
 1961611 1961612 LBJ_0991 LBJ_0992     FALSE 0.004 1166.000 0.000 NA   NA
 1483822 1483823 LBJ_4265 LBJ_0994     FALSE 0.194 83.000 0.000 NA   NA
 1483823 1961613 LBJ_0994 LBJ_0995     TRUE 0.818 -2047.000 0.000 NA   NA
 1483827 1961615 LBJ_0998 LBJ_0999     FALSE 0.039 173.000 0.000 NA   NA
 1961615 1961616 LBJ_0999 LBJ_1000     TRUE 0.985 -16.000 0.000 0.052 Y NA
 1961616 1961617 LBJ_1000 LBJ_1001     TRUE 0.997 -7.000 0.071 0.016 Y NA
 1961617 1961618 LBJ_1001 LBJ_1002     TRUE 0.997 11.000 0.400 0.016 Y NA
 1961618 1961619 LBJ_1002 LBJ_1003     FALSE 0.402 49.000 0.000 NA   NA
 1961619 1961620 LBJ_1003 LBJ_1004     FALSE 0.026 205.000 0.000 NA   NA
 1961621 1483835 LBJ_1005 LBJ_1006   tRNA-Leu-CAA FALSE 0.004 734.000 0.000 NA   NA
 1483835 1961622 LBJ_1006 LBJ_1007 tRNA-Leu-CAA   TRUE 0.709 23.000 0.000 NA   NA
 1961623 1961624 LBJ_1008 LBJ_1009     FALSE 0.006 497.000 0.000 NA   NA
 1961624 1961625 LBJ_1009 LBJ_1010     TRUE 0.978 8.000 0.000 NA Y NA
 1961626 1961627 LBJ_1011 LBJ_1012     TRUE 0.977 -18.000 1.000 NA   NA
 1961627 1961628 LBJ_1012 LBJ_1013     TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 1961629 1961630 LBJ_1014 LBJ_1015   ahpC FALSE 0.014 576.000 0.000 1.000 N NA
 1961630 1961631 LBJ_1015 LBJ_1016 ahpC sufB-1 FALSE 0.182 219.000 0.000 1.000 Y NA
 1961632 1961633 LBJ_1017 LBJ_1018     TRUE 0.962 16.000 0.006 1.000   NA
 1961633 1961634 LBJ_1018 LBJ_1019   bfr TRUE 0.984 -3.000 0.006 1.000 N NA
 1961635 1961636 LBJ_1020 LBJ_1021 paaJ-3   TRUE 0.984 15.000 0.075 NA N NA
 1961636 1961637 LBJ_1021 LBJ_1022   pepP TRUE 0.988 -3.000 0.018 1.000 N NA
 1961637 1483852 LBJ_1022 LBJ_1023 pepP   FALSE 0.004 680.000 0.000 NA   NA
 1961639 1483855 LBJ_1025 LBJ_1026     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1483855 1483856 LBJ_1026 LBJ_1027   lolE-3 TRUE 0.849 0.000 0.000 NA   NA
 1483856 1961640 LBJ_1027 LBJ_1028 lolE-3   TRUE 0.844 2.000 0.000 NA   NA
 1961640 1961641 LBJ_1028 LBJ_1029     FALSE 0.283 139.000 0.004 1.000   NA
 1961642 1961643 LBJ_1030 LBJ_1031     TRUE 0.983 -7.000 0.008 1.000 N NA
 1961644 1961645 LBJ_1032 LBJ_1033   smpB FALSE 0.014 336.000 0.000 1.000   NA
 1961645 1961646 LBJ_1033 LBJ_1034 smpB   TRUE 0.922 26.000 0.005 1.000   NA
 1961646 1961647 LBJ_1034 LBJ_1035     TRUE 0.981 -3.000 0.014 1.000   NA
 1961647 1961648 LBJ_1035 LBJ_1036     TRUE 0.969 -25.000 0.012 NA   NA
 1961648 1961649 LBJ_1036 LBJ_1037     FALSE 0.567 106.000 0.667 NA   NA
 1961652 1483870 LBJ_1040 LBJ_1041   tRNA-Met-CAT-1 TRUE 0.788 17.000 0.000 NA   NA
 1483870 1483871 LBJ_1041 LBJ_1042 tRNA-Met-CAT-1   FALSE 0.305 61.000 0.000 NA   NA
 1961654 10707034 LBJ_1044 LBJ_1046     TRUE 0.671 26.000 0.000 NA   NA
 1961655 1961656 LBJ_1049 LBJ_1050     FALSE 0.065 207.000 0.000 0.046   NA
 1961657 1961658 LBJ_1051 LBJ_1052 fliF fliG-3 TRUE 0.995 0.000 0.008 0.009 Y NA
 1961658 1961659 LBJ_1052 LBJ_1053 fliG-3 fliH TRUE 0.996 4.000 0.014 0.006 Y NA
 1961659 1961660 LBJ_1053 LBJ_1054 fliH fliI FALSE 0.285 426.000 0.379 0.006 Y NA
 1961660 1961661 LBJ_1054 LBJ_1055 fliI fliJ TRUE 0.989 4.000 0.241 0.014   NA
 1961661 1961662 LBJ_1055 LBJ_1056 fliJ   FALSE 0.274 159.000 0.016 NA   NA
 1961662 1961663 LBJ_1056 LBJ_1057     TRUE 0.978 14.000 0.143 NA   NA
 1961663 1483884 LBJ_1057 LBJ_1058     FALSE 0.004 727.000 0.000 NA   NA
 1961665 1961666 LBJ_1060 LBJ_1061     FALSE 0.081 154.000 0.000 1.000   NA
 1961666 1961667 LBJ_1061 LBJ_1062     FALSE 0.005 514.000 0.000 NA   NA
 1961667 1483889 LBJ_1062 LBJ_1063     FALSE 0.005 520.000 0.000 NA   NA
 1483889 1483890 LBJ_1063 LBJ_1064     TRUE 0.848 -9.000 0.000 NA   NA
 1961668 1961669 LBJ_1065 LBJ_1066     TRUE 0.813 15.000 0.000 NA   NA
 1961669 1961670 LBJ_1066 LBJ_1067   neuB-1 TRUE 0.897 -7.000 0.000 1.000   NA
 1961670 1961671 LBJ_1067 LBJ_1068 neuB-1   TRUE 0.996 4.000 0.250 1.000 Y NA
 1961671 1961672 LBJ_1068 LBJ_1069   feoB TRUE 0.975 20.000 0.019 1.000 N NA
 1961672 1961673 LBJ_1069 LBJ_1070 feoB feoA TRUE 0.979 -13.000 0.019 1.000   NA
 1961673 1961674 LBJ_1070 LBJ_1071 feoA   TRUE 0.983 -3.000 0.054 NA   NA
 1961676 1961677 LBJ_1073 LBJ_1074     FALSE 0.018 242.000 0.000 NA   NA
 1961677 1961678 LBJ_1074 LBJ_1075     FALSE 0.045 568.000 0.000 1.000 Y NA
 1961679 1961680 LBJ_1076 LBJ_1077   ilvH TRUE 0.997 -3.000 0.015 0.001 Y NA
 1961681 1961682 LBJ_1078 LBJ_1079     FALSE 0.004 904.000 0.000 NA   NA
 1961682 1961683 LBJ_1079 LBJ_1080     TRUE 0.978 -3.000 0.002 1.000 N NA
 1961684 1483908 LBJ_1081 LBJ_1082   tRNA-Gly-GCC FALSE 0.293 63.000 0.000 NA   NA
 1483908 1961685 LBJ_1082 LBJ_1083 tRNA-Gly-GCC   FALSE 0.495 41.000 0.000 NA   NA
 1961685 1961686 LBJ_1083 LBJ_1084   clpP-1 TRUE 0.996 -3.000 0.351 1.000 Y NA
 1961686 1961687 LBJ_1084 LBJ_1085 clpP-1 clpX TRUE 0.990 23.000 0.352 1.000 Y NA
 1483912 1961688 LBJ_1086 LBJ_1087     FALSE 0.005 547.000 0.000 NA   NA
 1961688 1961689 LBJ_1087 LBJ_1088     FALSE 0.020 228.000 0.000 NA   NA
 1483915 1483916 LBJ_1090 LBJ_1091     FALSE 0.008 371.000 0.000 NA   NA
 1961690 1483918 LBJ_1092 LBJ_1094     FALSE 0.018 244.000 0.000 NA   NA
 1483918 1483919 LBJ_1094 LBJ_1095     FALSE 0.013 275.000 0.000 NA   NA
 1961692 1961693 LBJ_1097 LBJ_1098 cysK-1   FALSE 0.016 508.000 0.000 1.000 N NA
 1961693 1483923 LBJ_1098 LBJ_1099     FALSE 0.004 735.000 0.000 NA   NA
 1483923 1483924 LBJ_1099 LBJ_1100     FALSE 0.079 127.000 0.000 NA   NA
 1961694 1961695 LBJ_1101 LBJ_1102 petE   TRUE 0.914 39.000 0.333 NA   NA
 1961695 1961696 LBJ_1102 LBJ_1103     TRUE 0.973 7.000 0.013 NA   NA
 1961696 1961697 LBJ_1103 LBJ_1104     FALSE 0.278 163.000 0.013 1.000   NA
 1961698 1961699 LBJ_1105 LBJ_1106   ibpA-2 FALSE 0.007 420.000 0.000 NA   NA
 1961699 1961700 LBJ_1106 LBJ_1107 ibpA-2 ibpA-1 TRUE 0.991 20.000 0.250 NA Y NA
 1961700 1961701 LBJ_1107 LBJ_1108 ibpA-1   FALSE 0.007 427.000 0.000 NA   NA
 1961701 1961702 LBJ_1108 LBJ_1109     FALSE 0.004 762.000 0.000 NA   NA
 1961703 1961704 LBJ_1110 LBJ_1111     TRUE 0.983 5.000 0.059 1.000   NA
 1961704 1961705 LBJ_1111 LBJ_1112     FALSE 0.578 59.000 0.000 1.000 N NA
 1961705 1961706 LBJ_1112 LBJ_1113     TRUE 0.922 5.000 0.000 NA N NA
 1961706 1961707 LBJ_1113 LBJ_1114   neuB-2 TRUE 0.994 -3.000 0.015 NA Y NA
 1961707 1961708 LBJ_1114 LBJ_1115 neuB-2   TRUE 0.994 5.000 0.022 1.000 Y NA
 1961708 1483940 LBJ_1115 LBJ_1116     TRUE 0.627 30.000 0.000 NA   NA
 1483940 1961709 LBJ_1116 LBJ_1117     TRUE 0.802 16.000 0.000 NA   NA
 1961709 1961710 LBJ_1117 LBJ_1118     TRUE 0.644 64.000 0.000 0.043 N NA
 1961710 1961711 LBJ_1118 LBJ_1119     TRUE 0.960 3.000 0.000 0.043 N NA
 1961711 1961712 LBJ_1119 LBJ_1120     TRUE 0.816 20.000 0.000 1.000   NA
 1961712 1961713 LBJ_1120 LBJ_1121     TRUE 0.891 -12.000 0.000 1.000   NA
 1961713 1961714 LBJ_1121 LBJ_1122     TRUE 0.982 -3.000 0.043 NA   NA
 1961714 1961715 LBJ_1122 LBJ_1123     TRUE 0.745 20.000 0.000 NA   NA
 1961715 1961716 LBJ_1123 LBJ_1124     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA N NA
 1961716 1961717 LBJ_1124 LBJ_1125     TRUE 0.944 -3.000 0.000 0.033   NA
 1961717 1961718 LBJ_1125 LBJ_1126     TRUE 0.891 9.000 0.000 1.000   NA
 1961718 1961719 LBJ_1126 LBJ_1127     TRUE 0.912 18.000 0.000 0.010   NA
 1961719 1961720 LBJ_1127 LBJ_1128     FALSE 0.006 831.000 0.000 1.000   NA
 1961720 1961721 LBJ_1128 LBJ_1129     TRUE 0.906 -3.000 0.000 1.000   NA
 1961721 1961722 LBJ_1129 LBJ_1130     TRUE 0.849 0.000 0.000 NA   NA
 1961722 1961723 LBJ_1130 LBJ_1131     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961723 1961724 LBJ_1131 LBJ_1132     TRUE 0.961 -10.000 0.000 0.033 N NA
 1961724 1961725 LBJ_1132 LBJ_1133     TRUE 0.934 13.000 0.000 1.000 N NA
 1961725 1483958 LBJ_1133 LBJ_1134     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 1483958 1961726 LBJ_1134 LBJ_1135     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961726 1961727 LBJ_1135 LBJ_1136     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1961727 1961728 LBJ_1136 LBJ_1137     TRUE 0.941 3.000 0.000 1.000 N NA
 1961728 1961729 LBJ_1137 LBJ_1138     FALSE 0.558 36.000 0.000 NA   NA
 1961729 1961730 LBJ_1138 LBJ_1139     TRUE 0.832 12.000 0.000 NA   NA
 1961730 1961731 LBJ_1139 LBJ_1140   nagB TRUE 0.976 6.000 0.019 NA   NA
 1961731 1961732 LBJ_1140 LBJ_1141 nagB   TRUE 0.613 31.000 0.000 NA   NA
 1961732 1961733 LBJ_1141 LBJ_1142   gmhA-2 FALSE 0.245 70.000 0.000 NA   NA
 1961733 1961734 LBJ_1142 LBJ_1143 gmhA-2   TRUE 0.981 2.000 0.000 1.000 Y NA
 1961734 1961735 LBJ_1143 LBJ_1144   kdsB-2 TRUE 0.950 37.000 0.059 1.000 N NA
 1961735 1961736 LBJ_1144 LBJ_1145 kdsB-2   TRUE 0.978 3.000 0.013 1.000   NA
 1961736 1961737 LBJ_1145 LBJ_1146     TRUE 0.977 17.000 0.087 1.000   NA
 1961737 1483971 LBJ_1146 LBJ_1147     FALSE 0.004 707.000 0.000 NA   NA
 1483971 1961738 LBJ_1147 LBJ_1148     FALSE 0.007 402.000 0.000 NA   NA
 1961738 1961739 LBJ_1148 LBJ_1149     FALSE 0.044 165.000 0.000 NA   NA
 1961739 1961740 LBJ_1149 LBJ_1150     FALSE 0.108 111.000 0.000 NA   NA
 1961740 1961741 LBJ_1150 LBJ_1151     FALSE 0.078 128.000 0.000 NA   NA
 1961741 1961742 LBJ_1151 LBJ_1152     FALSE 0.416 48.000 0.000 NA   NA
 1961742 1961743 LBJ_1152 LBJ_1153     TRUE 0.875 51.000 0.095 1.000   NA
 1961743 1961744 LBJ_1153 LBJ_1154     TRUE 0.982 -7.000 0.095 NA   NA
 1961744 1961745 LBJ_1154 LBJ_1155     FALSE 0.504 40.000 0.000 NA   NA
 1961745 1961746 LBJ_1155 LBJ_1156     FALSE 0.440 46.000 0.000 NA   NA
 1961746 1961747 LBJ_1156 LBJ_1157   hisH-2 TRUE 0.990 -3.000 0.379 0.038   NA
 1961747 1961748 LBJ_1157 LBJ_1158 hisH-2 hisF-2 TRUE 0.997 4.000 0.517 0.005 Y NA
 1961748 1961749 LBJ_1158 LBJ_1159 hisF-2   TRUE 0.889 21.000 0.000 1.000 N NA
 1961749 1961750 LBJ_1159 LBJ_1160     TRUE 0.823 58.000 0.000 1.000 Y NA
 1961750 1961751 LBJ_1160 LBJ_1161     TRUE 0.996 -7.000 0.129 1.000 Y NA
 1961751 1961752 LBJ_1161 LBJ_1162     TRUE 0.995 -7.000 0.009 0.018 Y NA
 1961752 1961753 LBJ_1162 LBJ_1163     TRUE 0.817 59.000 0.000 1.000 Y NA
 1961753 1961754 LBJ_1163 LBJ_1164     TRUE 0.986 -7.000 0.271 1.000   NA
 1961754 1961755 LBJ_1164 LBJ_1165     TRUE 0.985 -7.000 0.148 1.000   NA
 1961755 1961756 LBJ_1165 LBJ_1166     TRUE 0.995 10.000 0.125 1.000 Y NA
 1961756 1961757 LBJ_1166 LBJ_1167     TRUE 0.993 -10.000 0.015 NA Y NA
 1961757 1961758 LBJ_1167 LBJ_1168     FALSE 0.482 42.000 0.000 NA   NA
 1483993 10707035 LBJ_1169 LBJ_1170     FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 1961759 1961760 LBJ_1172 LBJ_1173     TRUE 0.981 4.000 0.100 NA   NA
 1961760 1961761 LBJ_1173 LBJ_1174     FALSE 0.005 586.000 0.000 NA   NA
 1961761 1961762 LBJ_1174 LBJ_1175     FALSE 0.004 662.000 0.000 NA   NA
 1961762 1961763 LBJ_1175 LBJ_1176     FALSE 0.005 627.000 0.000 NA   NA
 1961763 1961764 LBJ_1176 LBJ_1177     TRUE 0.980 -3.000 0.024 NA   NA
 1961764 1961765 LBJ_1177 LBJ_1178     FALSE 0.090 285.000 0.000 NA Y NA
 1961765 1961766 LBJ_1178 LBJ_1179     FALSE 0.038 581.000 0.000 NA Y NA
 1961766 1961767 LBJ_1179 LBJ_1180     FALSE 0.004 722.000 0.000 NA   NA
 1961767 1961768 LBJ_1180 LBJ_1181   rmlC FALSE 0.011 298.000 0.000 NA   NA
 1961768 1961769 LBJ_1181 LBJ_1182 rmlC rmlD TRUE 0.995 4.000 0.033 1.000 Y NA
 1961769 1961770 LBJ_1182 LBJ_1183 rmlD rmlB TRUE 0.997 -3.000 0.033 0.006 Y NA
 1961770 1961771 LBJ_1183 LBJ_1184 rmlB rmlA TRUE 0.997 1.000 0.222 0.007 Y NA
 1961771 1961772 LBJ_1184 LBJ_1185 rmlA   FALSE 0.032 185.000 0.000 NA   NA
 1961772 1961773 LBJ_1185 LBJ_1186     TRUE 0.978 5.000 0.038 NA   NA
 1961773 1961774 LBJ_1186 LBJ_1187     FALSE 0.012 285.000 0.000 NA   NA
 1961774 1961775 LBJ_1187 LBJ_1188     TRUE 0.890 40.000 0.025 NA   NA
 1484011 1484012 LBJ_1189 LBJ_1190     FALSE 0.004 875.000 0.000 NA   NA
 1484013 1961776 LBJ_1191 LBJ_1192     FALSE 0.005 1299.000 0.000 NA   NA
 1961776 1961777 LBJ_1192 LBJ_1193   rpsF TRUE 0.666 66.000 0.002 NA N NA
 1961777 1961778 LBJ_1193 LBJ_1194 rpsF ssb TRUE 0.988 -7.000 0.025 1.000 N NA
 1961778 1961779 LBJ_1194 LBJ_1195 ssb rpsR TRUE 0.767 79.000 0.016 1.000 N NA
 1961779 1961780 LBJ_1195 LBJ_1196 rpsR rplI TRUE 0.997 10.000 0.499 0.017 Y NA
 1961780 1961781 LBJ_1196 LBJ_1197 rplI dnaB TRUE 0.985 16.000 0.100 1.000 N NA
 1961781 1961782 LBJ_1197 LBJ_1198 dnaB aspS TRUE 0.982 0.000 0.003 0.095 N NA
 1961782 1961783 LBJ_1198 LBJ_1199 aspS phoH TRUE 0.914 38.000 0.003 0.095 N NA
 1961783 1961784 LBJ_1199 LBJ_1200 phoH   TRUE 0.975 5.000 0.009 1.000   NA
 1961784 1961785 LBJ_1200 LBJ_1201     TRUE 0.806 63.000 0.182 NA   NA
 1961785 1961786 LBJ_1201 LBJ_1202   recO TRUE 0.958 -27.000 0.005 NA   NA
 1961786 1961787 LBJ_1202 LBJ_1203 recO   TRUE 0.946 -16.000 0.002 NA   NA
 1961787 1961788 LBJ_1203 LBJ_1204   argS FALSE 0.008 369.000 0.000 NA   NA
 1961788 1961789 LBJ_1204 LBJ_1205 argS   TRUE 0.963 0.000 0.003 1.000   NA
 1961789 1961790 LBJ_1205 LBJ_1206     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961790 1961791 LBJ_1206 LBJ_1207     FALSE 0.005 596.000 0.000 NA   NA
 1961791 1961792 LBJ_1207 LBJ_1208     TRUE 0.851 -7.000 0.000 NA   NA
 1961792 1961793 LBJ_1208 LBJ_1209     FALSE 0.239 71.000 0.000 NA   NA
 1961793 1484032 LBJ_1209 LBJ_1210     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1484032 1484033 LBJ_1210 LBJ_1211     TRUE 0.763 19.000 0.000 NA   NA
 1484033 1961794 LBJ_1211 LBJ_1212     FALSE 0.005 586.000 0.000 NA   NA
 1961794 1961795 LBJ_1212 LBJ_1213     FALSE 0.233 72.000 0.000 NA   NA
 1961796 1961797 LBJ_1214 LBJ_1215     TRUE 0.996 0.000 0.026 0.095 Y NA
 1961797 1961798 LBJ_1215 LBJ_1216     TRUE 0.977 -18.000 1.000 NA   NA
 1961798 1961799 LBJ_1216 LBJ_1217   secG FALSE 0.556 70.000 0.003 NA   NA
 1961799 1961800 LBJ_1217 LBJ_1218 secG tpiA FALSE 0.112 241.000 0.002 1.000 N NA
 1961800 1961801 LBJ_1218 LBJ_1219 tpiA pgk FALSE 0.156 236.000 0.000 1.000 Y NA
 1961801 1961802 LBJ_1219 LBJ_1220 pgk gapA TRUE 0.995 4.000 0.007 0.004 Y NA
 1961804 1484045 LBJ_1222 LBJ_1223     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1484045 1961805 LBJ_1223 LBJ_1224     FALSE 0.009 348.000 0.000 NA   NA
 1961806 1961807 LBJ_1225 LBJ_1226     FALSE 0.007 398.000 0.000 NA   NA
 1961807 1961808 LBJ_1226 LBJ_1227   cysK-2 FALSE 0.012 287.000 0.000 NA   NA
 1961808 1961809 LBJ_1227 LBJ_1228 cysK-2 topA FALSE 0.370 126.000 0.002 1.000 N NA
 1484051 1484052 LBJ_1229 LBJ_1230     TRUE 0.844 9.000 0.000 NA   NA
 1961810 1961811 LBJ_1231 LBJ_1232     TRUE 0.980 -16.000 0.667 NA   NA
 1961812 1961813 LBJ_1233 LBJ_1234   panD FALSE 0.498 90.000 0.005 NA   NA
 1961813 1961814 LBJ_1234 LBJ_1235 panD   TRUE 0.960 12.000 0.005 NA   NA
 1961815 1961816 LBJ_1236 LBJ_1237 lipB   FALSE 0.200 145.000 0.003 NA   NA
 1961816 1961817 LBJ_1237 LBJ_1238     TRUE 0.981 10.000 0.600 NA   NA
 1961817 1961818 LBJ_1238 LBJ_1239     TRUE 0.964 4.000 0.006 NA   NA
 1961818 1961819 LBJ_1239 LBJ_1240     TRUE 0.970 -3.000 0.006 NA   NA
 1961819 1484063 LBJ_1240 LBJ_1241     TRUE 0.745 20.000 0.000 NA   NA
 1484063 1484064 LBJ_1241 LBJ_1242     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1484064 1484065 LBJ_1242 LBJ_1243     FALSE 0.440 46.000 0.000 NA   NA
 1961822 1961823 LBJ_1246 LBJ_1247     TRUE 0.906 -3.000 0.000 1.000   NA
 1961824 1961825 LBJ_1248 LBJ_1249     TRUE 0.959 24.000 0.039 1.000   NA
 1961825 1961826 LBJ_1249 LBJ_1250     TRUE 0.964 24.000 0.167 1.000   NA
 1961826 1961827 LBJ_1250 LBJ_1251     TRUE 0.995 19.000 0.167 0.011 Y NA
 1961828 1961829 LBJ_1252 LBJ_1253     FALSE 0.037 176.000 0.000 NA   NA
 1961830 1961831 LBJ_1254 LBJ_1255 flaB-1   FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 1961831 1484078 LBJ_1255 LBJ_1256     FALSE 0.482 42.000 0.000 NA   NA
 1484078 1961832 LBJ_1256 LBJ_1257   acrA TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961832 1484080 LBJ_1257 LBJ_1258 acrA   TRUE 0.841 -13.000 0.000 NA   NA
 1961834 1961835 LBJ_1260 LBJ_1261     TRUE 0.971 -24.000 0.008 1.000   NA
 1961835 1961836 LBJ_1261 LBJ_1262     TRUE 0.907 49.000 0.400 NA N NA
 1484085 1484086 LBJ_1263 LBJ_1265     FALSE 0.482 42.000 0.000 NA   NA
 1484087 1484088 LBJ_1266 LBJ_1267     TRUE 0.821 -48.000 0.000 NA   NA
 1484088 1484089 LBJ_1267 LBJ_1269     FALSE 0.009 333.000 0.000 NA   NA
 1484092 1961838 LBJ_1272 LBJ_1273   xseB FALSE 0.004 717.000 0.000 NA   NA
 1961838 1961839 LBJ_1273 LBJ_1274 xseB xseA TRUE 0.997 3.000 0.412 0.001 Y NA
 1961839 1961840 LBJ_1274 LBJ_1275 xseA   TRUE 0.957 7.000 0.004 NA   NA
 1961840 1961841 LBJ_1275 LBJ_1276     TRUE 0.979 7.000 0.043 NA   NA
 1961844 1961845 LBJ_1279 LBJ_1280   leuA-3 TRUE 0.982 -3.000 0.036 NA   NA
 1961845 1961846 LBJ_1280 LBJ_1281 leuA-3 pth-1 TRUE 0.974 -12.000 0.003 1.000 N NA
 1961846 1961847 LBJ_1281 LBJ_1282 pth-1 xerC TRUE 0.907 32.000 0.002 1.000 N NA
 1961847 1961848 LBJ_1282 LBJ_1283 xerC hslV TRUE 0.980 -13.000 0.005 1.000 N NA
 1961848 1961849 LBJ_1283 LBJ_1284 hslV hslU TRUE 0.994 13.000 0.752 1.000 Y NA
 1961849 1961850 LBJ_1284 LBJ_1285 hslU   FALSE 0.032 297.000 0.000 1.000 N NA
 1961852 1961853 LBJ_1287 LBJ_1288     TRUE 0.981 -3.000 0.027 NA   NA
 1961853 1961854 LBJ_1288 LBJ_1289   mrp TRUE 0.981 2.000 0.022 1.000   NA
 1961854 1961855 LBJ_1289 LBJ_1290 mrp   TRUE 0.865 45.000 0.022 NA   NA
 1961856 1961857 LBJ_1291 LBJ_1292 ubiX ubiA TRUE 0.996 -3.000 0.091 1.000 Y NA
 1961858 1961859 LBJ_1293 LBJ_1294     TRUE 0.844 2.000 0.000 NA   NA
 1961859 1961860 LBJ_1294 LBJ_1295     TRUE 0.742 43.000 0.002 NA   NA
 1961860 1961861 LBJ_1295 LBJ_1296   mutY FALSE 0.070 253.000 0.000 0.023 N NA
 1961861 1961862 LBJ_1296 LBJ_1297 mutY ubiD TRUE 0.973 -3.000 0.002 NA N NA
 1961862 1961863 LBJ_1297 LBJ_1298 ubiD   TRUE 0.969 18.000 0.009 NA N NA
 1961864 1961865 LBJ_1299 LBJ_1300     FALSE 0.351 177.000 1.000 1.000 N NA
 1961865 1961866 LBJ_1300 LBJ_1301     TRUE 0.978 -10.000 1.000 NA   NA
 1961867 1961868 LBJ_1302 LBJ_1303 recN   FALSE 0.491 111.000 0.004 1.000 N NA
 1961868 1961869 LBJ_1303 LBJ_1304     TRUE 0.996 3.000 0.028 0.023 Y NA
 1961869 1961870 LBJ_1304 LBJ_1305     TRUE 0.859 62.000 0.028 1.000 N NA
 1961870 1961871 LBJ_1305 LBJ_1306   uvrD-1 TRUE 0.990 -3.000 0.047 1.000 N NA
 1961871 1961872 LBJ_1306 LBJ_1307 uvrD-1   TRUE 0.805 61.000 0.667 NA   NA
 1961872 1961873 LBJ_1307 LBJ_1308     TRUE 0.978 10.000 1.000 NA   NA
 1961873 1961874 LBJ_1308 LBJ_1309     TRUE 0.982 17.000 1.000 1.000 N NA
 1961876 1961877 LBJ_1311 LBJ_1312     FALSE 0.125 163.000 0.000 1.000 N NA
 1961877 1961878 LBJ_1312 LBJ_1313     TRUE 0.623 96.000 0.667 NA   NA
 1961879 1961880 LBJ_1314 LBJ_1315 ptsA lpxC FALSE 0.423 130.000 0.005 1.000 N NA
 1961881 1961882 LBJ_1316 LBJ_1317     TRUE 0.976 14.000 0.049 NA   NA
 1961882 1961883 LBJ_1317 LBJ_1318     TRUE 0.964 21.000 0.400 NA   NA
 1961886 1961887 LBJ_1321 LBJ_1322   lipA TRUE 0.958 -12.000 0.004 NA   NA
 1961888 1961889 LBJ_1323 LBJ_1324 rsuA   TRUE 0.988 -3.000 0.040 NA N NA
 1961889 1961890 LBJ_1324 LBJ_1325     TRUE 0.965 20.000 0.667 NA   NA
 1961891 1961892 LBJ_1326 LBJ_1327 mipB   FALSE 0.031 502.000 0.008 NA   NA
 1961892 1961893 LBJ_1327 LBJ_1328     TRUE 0.929 31.000 1.000 NA   NA
 1961893 1961894 LBJ_1328 LBJ_1329   purH TRUE 0.955 2.000 0.003 NA   NA
 1961894 1961895 LBJ_1329 LBJ_1330 purH purN TRUE 0.996 4.000 0.225 1.000 Y NA
 1961896 1961897 LBJ_1331 LBJ_1332 fliS   TRUE 0.981 4.000 0.167 NA   NA
 1961897 1961898 LBJ_1332 LBJ_1333     TRUE 0.981 -6.000 0.041 NA   NA
 1961899 1961900 LBJ_1334 LBJ_1335   mcrA TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961900 1961901 LBJ_1335 LBJ_1336 mcrA   FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 1484160 1961904 LBJ_1340 LBJ_1341     FALSE 0.004 671.000 0.000 NA   NA
 1961904 1484162 LBJ_1341 LBJ_1342     TRUE 0.820 -112.000 0.000 NA   NA
 1484162 1961905 LBJ_1342 LBJ_1343   argC TRUE 0.842 6.000 0.000 NA   NA
 1961905 1961906 LBJ_1343 LBJ_1344 argC recA FALSE 0.202 127.000 0.000 1.000 N NA
 1961906 1961907 LBJ_1344 LBJ_1345 recA   FALSE 0.022 223.000 0.000 NA   NA
 1961908 1961909 LBJ_1346 LBJ_1347     TRUE 0.776 67.000 0.133 NA   NA
 1961909 1961910 LBJ_1347 LBJ_1348     TRUE 0.735 51.000 0.005 NA   NA
 1961910 1961911 LBJ_1348 LBJ_1349     TRUE 0.984 -3.000 0.114 NA   NA
 1961911 1961912 LBJ_1349 LBJ_1350     FALSE 0.352 149.000 0.038 NA   NA
 1961912 1961913 LBJ_1350 LBJ_1351     TRUE 0.981 8.000 0.027 1.000   NA
 1961913 1961914 LBJ_1351 LBJ_1352     TRUE 0.774 59.000 0.010 1.000   NA
 1961914 1961915 LBJ_1352 LBJ_1353     TRUE 0.982 2.000 0.431 NA   NA
 1961916 1961917 LBJ_1354 LBJ_1355     TRUE 0.941 31.000 0.286 NA   NA
 1961917 1961918 LBJ_1355 LBJ_1356   uvrD-2 TRUE 0.972 6.000 0.012 NA   NA
 1961918 1961919 LBJ_1356 LBJ_1357 uvrD-2 slpA TRUE 0.984 6.000 0.012 1.000 N NA
 1961919 1961920 LBJ_1357 LBJ_1358 slpA   FALSE 0.396 140.000 0.057 NA   NA
 1961920 1484179 LBJ_1358 LBJ_1359     FALSE 0.016 255.000 0.000 NA   NA
 1484179 1961921 LBJ_1359 LBJ_1360   fadH FALSE 0.183 87.000 0.000 NA   NA
 1961925 1961926 LBJ_1364 LBJ_1365 czcD-2   TRUE 0.988 0.000 0.039 1.000 N NA
 1961927 1961928 LBJ_1366 LBJ_1367 mgtE   TRUE 0.699 86.000 0.286 NA   NA
 1961928 1961929 LBJ_1367 LBJ_1368     FALSE 0.004 733.000 0.000 NA   NA
 1961929 1961930 LBJ_1368 LBJ_1369     TRUE 0.981 17.000 0.000 0.011 Y NA
 1961932 1961933 LBJ_1371 LBJ_1372     FALSE 0.025 208.000 0.000 NA   NA
 1961933 1961934 LBJ_1372 LBJ_1373   rpsU FALSE 0.029 194.000 0.000 NA   NA
 1961934 1961935 LBJ_1373 LBJ_1374 rpsU   TRUE 0.792 58.000 0.004 0.027   NA
 1961935 1961936 LBJ_1374 LBJ_1375   dnaG TRUE 0.974 19.000 0.137 1.000   NA
 1961936 1961937 LBJ_1375 LBJ_1376 dnaG rpoD TRUE 0.986 16.000 0.299 1.000 N NA
 1961937 1961938 LBJ_1376 LBJ_1377 rpoD   FALSE 0.014 563.000 0.000 1.000 N NA
 1484198 1961939 LBJ_1378 LBJ_1380   glpA-1 FALSE 0.011 299.000 0.000 NA   NA
 1961940 1961941 LBJ_1381 LBJ_1382 tyrS   TRUE 0.874 46.000 0.005 1.000 N NA
 1961942 1961943 LBJ_1383 LBJ_1384     FALSE 0.025 350.000 0.000 1.000 N NA
 1961943 1961944 LBJ_1384 LBJ_1385     TRUE 0.974 -25.000 0.023 NA   NA
 1961945 1961946 LBJ_1386 LBJ_1387     TRUE 0.937 32.000 0.222 NA   NA
 1961946 1961947 LBJ_1387 LBJ_1388   caiD-2 FALSE 0.432 131.000 0.667 NA   NA
 1961948 1961949 LBJ_1391 LBJ_1392     FALSE 0.410 120.000 0.017 NA   NA
 1961949 1961950 LBJ_1392 LBJ_1393     FALSE 0.030 192.000 0.000 NA   NA
 1961951 1961952 LBJ_1394 LBJ_1395     TRUE 0.974 3.000 0.015 NA   NA
 1961952 1961953 LBJ_1395 LBJ_1396     TRUE 0.978 10.000 1.000 NA   NA
 1961954 1961955 LBJ_1397 LBJ_1398     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1961955 1961956 LBJ_1398 LBJ_1399     FALSE 0.362 53.000 0.000 NA   NA
 1961957 1961958 LBJ_1400 LBJ_1401     TRUE 0.970 -19.000 0.012 NA   NA
 1961960 1961961 LBJ_1403 LBJ_1404 uvrA   TRUE 0.889 27.000 0.002 1.000   NA
 1961961 1961962 LBJ_1404 LBJ_1405     FALSE 0.007 595.000 0.000 1.000   NA
 1961962 1961963 LBJ_1405 LBJ_1406     FALSE 0.012 697.000 0.000 0.015   NA
 1961963 1961964 LBJ_1406 LBJ_1407     FALSE 0.014 269.000 0.000 NA   NA
 1961964 10707036 LBJ_1407 LBJ_1408     TRUE 0.823 -37.000 0.000 NA   NA
 1484227 1961965 LBJ_1410 LBJ_1411     FALSE 0.013 273.000 0.000 NA   NA
 1961965 1961966 LBJ_1411 LBJ_1412     TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 1961966 1961967 LBJ_1412 LBJ_1413     TRUE 0.979 8.000 0.039 NA   NA
 1961967 1961968 LBJ_1413 LBJ_1414   gspK TRUE 0.982 9.000 0.039 1.000   NA
 1961968 1961969 LBJ_1414 LBJ_1415 gspK   TRUE 0.971 -37.000 0.018 NA   NA
 1961969 1961970 LBJ_1415 LBJ_1416     TRUE 0.975 10.000 0.018 NA   NA
 1961970 1961971 LBJ_1416 LBJ_1417     TRUE 0.976 -25.000 1.000 NA   NA
 1961971 1961972 LBJ_1417 LBJ_1418   gspG TRUE 0.948 22.000 0.014 NA   NA
 1961972 1961973 LBJ_1418 LBJ_1419 gspG gspF TRUE 0.993 23.000 0.599 0.003 Y NA
 1961973 1961974 LBJ_1419 LBJ_1420 gspF gspE TRUE 0.997 5.000 0.119 0.003 Y NA
 1961974 1961975 LBJ_1420 LBJ_1421 gspE gspD TRUE 0.997 4.000 0.149 0.003 Y NA
 1961975 1961976 LBJ_1421 LBJ_1422 gspD gspC TRUE 0.995 6.000 0.065 1.000 Y NA
 1961976 1961977 LBJ_1422 LBJ_1423 gspC   TRUE 0.791 60.000 0.014 1.000   NA
 1961977 1961978 LBJ_1423 LBJ_1424     TRUE 0.835 56.000 0.105 NA   NA
 1961979 1961980 LBJ_1426 LBJ_1427     FALSE 0.429 96.000 0.004 NA   NA
 1961980 1961981 LBJ_1427 LBJ_1428     FALSE 0.210 196.000 0.010 NA N NA
 1961981 1961982 LBJ_1428 LBJ_1429     TRUE 0.984 -3.000 0.154 NA   NA
 1961982 1961983 LBJ_1429 LBJ_1430     TRUE 0.982 1.000 0.286 NA   NA
 1961983 1961984 LBJ_1430 LBJ_1431   rnhB FALSE 0.375 96.000 0.002 NA   NA
 1961984 1961985 LBJ_1431 LBJ_1432 rnhB rplS TRUE 0.989 9.000 0.066 1.000 N NA
 1961985 1961986 LBJ_1432 LBJ_1433 rplS trmD TRUE 0.996 -3.000 0.567 1.000 Y NA
 1961986 1961987 LBJ_1433 LBJ_1434 trmD rimM TRUE 0.995 -10.000 0.672 1.000 Y NA
 1961987 1961988 LBJ_1434 LBJ_1435 rimM   TRUE 0.986 -7.000 0.324 1.000   NA
 1961988 1961989 LBJ_1435 LBJ_1436   rpsP TRUE 0.985 0.000 0.385 1.000   NA
 1961989 1961990 LBJ_1436 LBJ_1437 rpsP rpe FALSE 0.058 227.000 0.000 1.000 N NA
 1961990 1961991 LBJ_1437 LBJ_1438 rpe   TRUE 0.984 -3.000 0.026 1.000   NA
 1961991 1961992 LBJ_1438 LBJ_1439   fmt TRUE 0.973 -3.000 0.005 1.000   NA
 1961992 1961993 LBJ_1439 LBJ_1440 fmt priA TRUE 0.988 2.000 0.052 1.000 N NA
 1961993 1961994 LBJ_1440 LBJ_1441 priA   TRUE 0.962 -3.000 0.003 NA   NA
 1961994 1961995 LBJ_1441 LBJ_1442     TRUE 0.973 -7.000 0.012 NA   NA
 1961995 1961996 LBJ_1442 LBJ_1443     TRUE 0.988 7.000 0.533 0.091   NA
 1961996 1961997 LBJ_1443 LBJ_1444   ptsH TRUE 0.974 14.000 0.013 1.000   NA
 1961997 1961998 LBJ_1444 LBJ_1445 ptsH hprK TRUE 0.973 23.000 0.036 1.000 N NA
 1961998 1961999 LBJ_1445 LBJ_1446 hprK rpoN TRUE 0.985 4.000 0.017 1.000 N NA
 1961999 1962000 LBJ_1446 LBJ_1447 rpoN   TRUE 0.986 -3.000 0.059 1.000   NA
 1962000 1962001 LBJ_1447 LBJ_1448     TRUE 0.980 12.000 0.543 NA   NA
 1962001 1962002 LBJ_1448 LBJ_1449     TRUE 0.980 -3.000 0.020 NA   NA
 1962002 1962003 LBJ_1449 LBJ_1450   kdsA TRUE 0.960 12.000 0.005 NA   NA
 1962003 1962004 LBJ_1450 LBJ_1451 kdsA pyrG TRUE 0.991 -3.000 0.138 1.000 N NA
 1962004 1962005 LBJ_1451 LBJ_1452 pyrG   FALSE 0.405 102.000 0.003 1.000   NA
 1962005 1962006 LBJ_1452 LBJ_1453     TRUE 0.988 3.000 0.032 0.001   NA
 1962010 1962011 LBJ_1457 LBJ_1458   map TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 1962011 1962012 LBJ_1458 LBJ_1459 map   TRUE 0.985 7.000 0.429 1.000   NA
 1962012 1962013 LBJ_1459 LBJ_1460     FALSE 0.017 249.000 0.000 NA   NA
 1962014 1962015 LBJ_1461 LBJ_1462     TRUE 0.646 71.000 0.009 NA   NA
 1962015 1962016 LBJ_1462 LBJ_1463   gldA TRUE 0.862 46.000 0.024 NA   NA
 1962016 1962017 LBJ_1463 LBJ_1464 gldA gldF TRUE 0.977 2.000 0.024 NA   NA
 1962017 1962018 LBJ_1464 LBJ_1465 gldF gldG TRUE 0.982 -3.000 0.039 NA   NA
 1962018 1962019 LBJ_1465 LBJ_1466 gldG   TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 1962019 1962020 LBJ_1466 LBJ_1467     FALSE 0.025 208.000 0.000 NA   NA
 1962022 1962023 LBJ_1469 LBJ_1470   cheX TRUE 0.979 0.000 1.000 NA   NA
 1962024 1962025 LBJ_1471 LBJ_1472     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1962026 1962027 LBJ_1473 LBJ_1474   ccoN FALSE 0.013 650.000 0.000 1.000 N NA
 1962027 1962028 LBJ_1474 LBJ_1475 ccoN ccoO TRUE 0.992 -3.000 0.018 0.002 N NA
 1962028 1962029 LBJ_1475 LBJ_1476 ccoO   TRUE 0.836 11.000 0.000 NA   NA
 1962029 1962030 LBJ_1476 LBJ_1477   cccA TRUE 0.978 4.000 1.000 NA   NA
 1962030 1962031 LBJ_1477 LBJ_1478 cccA napH TRUE 0.989 8.000 0.667 0.013   NA
 1962031 1962032 LBJ_1478 LBJ_1479 napH   TRUE 0.975 12.000 0.023 NA   NA
 1962032 1962033 LBJ_1479 LBJ_1480   atzN TRUE 0.974 9.000 0.014 NA   NA
 1962033 1962034 LBJ_1480 LBJ_1481 atzN   TRUE 0.995 -3.000 0.713 NA Y NA
 1962034 1962035 LBJ_1481 LBJ_1482     TRUE 0.982 -10.000 0.266 NA   NA
 1962035 1962036 LBJ_1482 LBJ_1483     FALSE 0.309 60.000 0.000 NA   NA
 1962037 1962038 LBJ_1484 LBJ_1485   rsbW TRUE 0.983 -3.000 0.069 NA   NA
 1962038 1962039 LBJ_1485 LBJ_1486 rsbW xerD FALSE 0.290 154.000 0.003 1.000 N NA
 1962040 1962041 LBJ_1487 LBJ_1488     FALSE 0.253 178.000 0.021 1.000   NA
 1962042 1962043 LBJ_1489 LBJ_1490     TRUE 0.981 -10.000 0.600 NA   NA
 1962045 1962046 LBJ_1492 LBJ_1493     TRUE 0.873 48.000 0.100 NA   NA
 1962049 1962050 LBJ_1496 LBJ_1497     FALSE 0.010 312.000 0.000 NA   NA
 1962050 1962051 LBJ_1497 LBJ_1498     FALSE 0.008 358.000 0.000 NA   NA
 1962052 1962053 LBJ_1499 LBJ_1500     FALSE 0.007 429.000 0.000 NA   NA
 1962053 1962054 LBJ_1500 LBJ_1501     FALSE 0.084 122.000 0.000 NA   NA
 1962054 1962055 LBJ_1501 LBJ_1502     TRUE 0.980 -10.000 0.051 NA   NA
 1962056 1962057 LBJ_1503 LBJ_1504   sdhA TRUE 0.983 19.000 0.598 0.001   NA
 1962057 1962058 LBJ_1504 LBJ_1505 sdhA sdhB TRUE 0.997 0.000 0.470 0.001 Y NA
 1962059 1962060 LBJ_1506 LBJ_1507     FALSE 0.558 36.000 0.000 NA   NA
 1962060 1962061 LBJ_1507 LBJ_1508   lepA FALSE 0.467 43.000 0.000 NA   NA
 1962061 1962062 LBJ_1508 LBJ_1509 lepA   FALSE 0.019 435.000 0.000 1.000 N NA
 1962062 1962063 LBJ_1509 LBJ_1510     TRUE 0.924 8.000 0.000 NA N NA
 1962064 1962065 LBJ_1511 LBJ_1512     TRUE 0.980 5.000 0.667 NA   NA
 1962065 1962066 LBJ_1512 LBJ_1513     TRUE 0.976 12.000 1.000 NA   NA
 1962068 1962069 LBJ_1515 LBJ_1516     FALSE 0.427 47.000 0.000 NA   NA
 1962069 1962070 LBJ_1516 LBJ_1517     TRUE 0.844 8.000 0.000 NA   NA
 1962070 1962071 LBJ_1517 LBJ_1518     FALSE 0.440 46.000 0.000 NA   NA
 1962071 1962072 LBJ_1518 LBJ_1519     FALSE 0.007 415.000 0.000 NA   NA
 1962072 1962073 LBJ_1519 LBJ_1520     FALSE 0.005 1539.000 0.000 NA   NA
 1962073 1962074 LBJ_1520 LBJ_1521     FALSE 0.232 107.000 0.000 NA N NA
 1962074 1962075 LBJ_1521 LBJ_1522     TRUE 0.719 80.000 0.286 NA   NA
 1962075 1962076 LBJ_1522 LBJ_1523   lysU TRUE 0.982 9.000 0.333 NA   NA
 1962077 1962078 LBJ_1524 LBJ_1525     FALSE 0.159 92.000 0.000 NA   NA
 1962078 1962079 LBJ_1525 LBJ_1526   thiE TRUE 0.861 53.000 0.010 1.000 N NA
 1962081 1962082 LBJ_1528 LBJ_1529     TRUE 0.976 10.000 0.021 NA   NA
 1962082 1962083 LBJ_1529 LBJ_1530   imdH TRUE 0.955 2.000 0.003 NA   NA
 1962084 1962085 LBJ_1531 LBJ_1532     FALSE 0.008 362.000 0.000 NA   NA
 1962085 1962086 LBJ_1532 LBJ_1533     FALSE 0.108 111.000 0.000 NA   NA
 1962086 1962087 LBJ_1533 LBJ_1534     TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 1484352 1962088 LBJ_1535 LBJ_1536     FALSE 0.004 881.000 0.000 NA   NA
 1962088 1962089 LBJ_1536 LBJ_1537     TRUE 0.966 -7.000 0.006 NA   NA
 1962089 1962090 LBJ_1537 LBJ_1538   rnhA FALSE 0.427 47.000 0.000 NA   NA
 1962090 1962091 LBJ_1538 LBJ_1539 rnhA   TRUE 0.979 -3.000 0.020 NA   NA
 1962092 1962093 LBJ_1540 LBJ_1541     FALSE 0.018 291.000 0.000 1.000   NA
 1962093 1962094 LBJ_1541 LBJ_1542     TRUE 0.957 30.000 0.025 0.031   NA
 1962094 1962095 LBJ_1542 LBJ_1543     TRUE 0.934 -3.000 0.000 NA N NA
 1962095 1962096 LBJ_1543 LBJ_1544     TRUE 0.963 19.000 0.000 NA Y NA
 1962096 1962097 LBJ_1544 LBJ_1545     FALSE 0.004 1152.000 0.000 NA   NA
 1484363 1962098 LBJ_1546 LBJ_1547     FALSE 0.350 55.000 0.000 NA   NA
 1962098 1962099 LBJ_1547 LBJ_1548     TRUE 0.982 2.000 0.136 NA   NA
 1962099 1962100 LBJ_1548 LBJ_1549   tolC TRUE 0.984 11.000 0.136 1.000   NA
 1962100 1962101 LBJ_1549 LBJ_1550 tolC   FALSE 0.367 151.000 0.667 NA   NA
 1962101 1484368 LBJ_1550 LBJ_1551     FALSE 0.036 177.000 0.000 NA   NA
 1484368 1962102 LBJ_1551 LBJ_1552   secA TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1962102 1962103 LBJ_1552 LBJ_1553 secA guaA-1 FALSE 0.524 125.000 0.015 1.000 N NA
 1962103 1962104 LBJ_1553 LBJ_1554 guaA-1   TRUE 0.986 -3.000 0.091 1.000   NA
 1962104 1962105 LBJ_1554 LBJ_1555     FALSE 0.292 172.000 0.400 NA   NA
 1962105 1962106 LBJ_1555 LBJ_1556     TRUE 0.978 -25.000 0.058 NA   NA
 1962106 1962107 LBJ_1556 LBJ_1557     TRUE 0.979 2.000 0.038 NA   NA
 1962107 1962108 LBJ_1557 LBJ_1558     TRUE 0.958 22.000 0.042 NA   NA
 1962108 1962109 LBJ_1558 LBJ_1559   clpP-2 TRUE 0.969 16.000 0.020 NA   NA
 1962109 1962110 LBJ_1559 LBJ_1560 clpP-2   TRUE 0.970 19.000 0.030 1.000   NA
 1962110 1962111 LBJ_1560 LBJ_1561   eno FALSE 0.484 117.000 0.020 1.000   NA
 1962112 1962113 LBJ_1562 LBJ_1563     TRUE 0.976 16.000 0.182 NA   NA
 1962113 1962114 LBJ_1563 LBJ_1564     FALSE 0.574 107.000 0.182 NA   NA
 1962114 1962115 LBJ_1564 LBJ_1565     TRUE 0.768 38.000 0.000 1.000 N NA
 1962115 1962116 LBJ_1565 LBJ_1566     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 1962116 1962117 LBJ_1566 LBJ_1567     TRUE 0.980 -16.000 0.667 NA   NA
 1962117 1484385 LBJ_1567 LBJ_1568   tRNA-Met-CAT FALSE 0.317 59.000 0.000 NA   NA
 1962119 1962120 LBJ_1570 LBJ_1571     FALSE 0.035 215.000 0.000 1.000   NA
 1962121 1962122 LBJ_1574 LBJ_1575     FALSE 0.108 111.000 0.000 NA   NA
 1962124 1962125 LBJ_1577 LBJ_1578     TRUE 0.717 56.000 0.005 NA   NA
 1962125 1962126 LBJ_1578 LBJ_1579     FALSE 0.483 98.000 0.008 NA   NA
 1962126 1962127 LBJ_1579 LBJ_1580     TRUE 0.694 76.000 0.031 NA   NA
 1962128 1484397 LBJ_1581 LBJ_1582     FALSE 0.119 107.000 0.000 NA   NA
 1484397 1962129 LBJ_1582 LBJ_1583   caiA-2 FALSE 0.027 202.000 0.000 NA   NA
 1962129 1962130 LBJ_1583 LBJ_1584 caiA-2   TRUE 0.983 16.000 1.000 1.000 N NA
 1962130 1962131 LBJ_1584 LBJ_1585   trxA TRUE 0.964 24.000 0.143 1.000   NA
 1962131 1962132 LBJ_1585 LBJ_1586 trxA   TRUE 0.858 51.000 0.143 NA   NA
 1962133 1962134 LBJ_1587 LBJ_1588 tatA tatC TRUE 0.995 -3.000 0.093 NA Y NA
 1962134 1962135 LBJ_1588 LBJ_1589 tatC   TRUE 0.972 2.000 0.012 NA   NA
 1962137 1962138 LBJ_1591 LBJ_1592     FALSE 0.004 999.000 0.000 NA   NA
 1962138 1962139 LBJ_1592 LBJ_1593     FALSE 0.005 646.000 0.000 NA   NA
 1962140 1484410 LBJ_1594 LBJ_1595     FALSE 0.066 141.000 0.000 NA   NA
 1962141 1962142 LBJ_1596 LBJ_1597     TRUE 0.983 16.000 0.429 NA N NA
 1962143 1962144 LBJ_1598 LBJ_1599 katE   TRUE 0.983 -7.000 0.500 NA   NA
 1962145 1962146 LBJ_1600 LBJ_1601 fur flgG-2 FALSE 0.014 621.000 0.000 1.000 N NA
 1484419 1962148 LBJ_1604 LBJ_1605     TRUE 0.813 15.000 0.000 NA   NA
 1962148 1962149 LBJ_1605 LBJ_1606     FALSE 0.016 253.000 0.000 NA   NA
 1962149 1962150 LBJ_1606 LBJ_1607     TRUE 0.844 2.000 0.000 NA   NA
 1962150 1484423 LBJ_1607 LBJ_1608     FALSE 0.029 194.000 0.000 NA   NA
 1484423 1484424 LBJ_1608 LBJ_1609     FALSE 0.005 1574.000 0.000 NA   NA
 1484424 1962151 LBJ_1609 LBJ_1611   clpA-1 FALSE 0.038 174.000 0.000 NA   NA
 1962152 1962153 LBJ_1612 LBJ_1613     FALSE 0.477 110.000 0.009 1.000   NA
 1962153 1962154 LBJ_1613 LBJ_1614     TRUE 0.889 35.000 0.009 NA   NA
 1962155 1962156 LBJ_1615 LBJ_1616 gmk   TRUE 0.984 -3.000 0.143 NA   NA
 1962156 1962157 LBJ_1616 LBJ_1617     TRUE 0.976 0.000 0.018 NA   NA
 1962157 1962158 LBJ_1617 LBJ_1618     TRUE 0.968 19.000 0.667 NA   NA
 1962158 1962159 LBJ_1618 LBJ_1619     TRUE 0.981 8.000 0.087 NA   NA
 1962159 1962160 LBJ_1619 LBJ_1620     TRUE 0.969 26.000 0.050 1.000 N NA
 1962160 1962161 LBJ_1620 LBJ_1621     FALSE 0.264 157.000 0.012 NA   NA
 1962161 1962162 LBJ_1621 LBJ_1622   minD TRUE 0.975 4.000 0.018 NA   NA
 1962162 1962163 LBJ_1622 LBJ_1623 minD flhF TRUE 0.972 26.000 0.382 1.000 N NA
 1962163 1962164 LBJ_1623 LBJ_1624 flhF flhA TRUE 0.961 52.000 0.440 1.000 Y NA
 1962164 1962165 LBJ_1624 LBJ_1625 flhA flhB TRUE 0.997 10.000 0.207 0.005 Y NA
 1962165 1962166 LBJ_1625 LBJ_1626 flhB fliR TRUE 0.996 -3.000 0.218 1.000 Y NA
 1962166 1962167 LBJ_1626 LBJ_1627 fliR fliQ TRUE 0.997 7.000 0.185 0.002 Y NA
 1962167 1962168 LBJ_1627 LBJ_1628 fliQ fliP TRUE 0.997 -3.000 0.049 0.005 Y NA
 1962168 1962169 LBJ_1628 LBJ_1629 fliP fliO TRUE 0.853 44.000 0.008 1.000   NA
 1962169 1962170 LBJ_1629 LBJ_1630 fliO fliN-1 TRUE 0.979 -3.000 0.010 1.000   NA
 1962170 1962171 LBJ_1630 LBJ_1631 fliN-1   FALSE 0.020 232.000 0.000 NA   NA
 1962171 1962172 LBJ_1631 LBJ_1632     FALSE 0.004 809.000 0.000 NA   NA
 1962174 1484449 LBJ_1634 LBJ_1635     FALSE 0.598 32.000 0.000 NA   NA
 1484449 1962175 LBJ_1635 LBJ_1636     TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 1962177 1962178 LBJ_1639 LBJ_1640   maoC FALSE 0.004 681.000 0.000 NA   NA
 1962178 1484455 LBJ_1640 LBJ_1641 maoC   FALSE 0.005 1407.000 0.000 NA   NA
 1484455 1962179 LBJ_1641 LBJ_1642     FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 1962180 1962181 LBJ_1643 LBJ_1644   tktC FALSE 0.456 124.000 0.071 NA   NA
 1962181 1962182 LBJ_1644 LBJ_1645 tktC metK TRUE 0.978 7.000 0.004 1.000 N NA
 1962183 1962184 LBJ_1646 LBJ_1647   lipL32 FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 1962184 1962185 LBJ_1647 LBJ_1648 lipL32 caiA-3 FALSE 0.004 864.000 0.000 NA   NA
 1962186 1962187 LBJ_1649 LBJ_1650   asnS FALSE 0.449 55.000 0.000 1.000   NA
 1962188 1962189 LBJ_1651 LBJ_1652 folD   TRUE 0.983 16.000 0.081 NA N NA
 1962189 1962190 LBJ_1652 LBJ_1653   cysS TRUE 0.974 -3.000 0.003 NA N NA
 1962190 1962191 LBJ_1653 LBJ_1654 cysS spoU TRUE 0.995 -15.000 0.088 1.000 Y NA
 1962191 1962192 LBJ_1654 LBJ_1655 spoU   FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 1962194 1962195 LBJ_1659 LBJ_1660 hisF-1   TRUE 0.979 -3.000 0.003 1.000 N NA
 1962195 1962196 LBJ_1660 LBJ_1661   gatC TRUE 0.997 -3.000 0.643 0.001 Y NA
 1962196 1962197 LBJ_1661 LBJ_1662 gatC   TRUE 0.911 28.000 0.002 NA N NA
 1962197 1962198 LBJ_1662 LBJ_1663     TRUE 0.980 2.000 0.051 NA   NA
 1962198 1962199 LBJ_1663 LBJ_1664   bacA TRUE 0.920 33.000 0.026 NA   NA
 1962199 1962200 LBJ_1664 LBJ_1665 bacA lipL31 TRUE 0.979 7.000 0.039 NA   NA
 1962200 1962201 LBJ_1665 LBJ_1666 lipL31 mfd TRUE 0.734 48.000 0.003 NA   NA
 1962201 1962202 LBJ_1666 LBJ_1667 mfd panC TRUE 0.979 -3.000 0.003 1.000 N NA
 1962202 1962203 LBJ_1667 LBJ_1668 panC hisD TRUE 0.976 6.000 0.003 1.000 N NA
 1962208 1962209 LBJ_1673 LBJ_1674     TRUE 0.764 69.000 0.095 NA   NA
 1962209 1962210 LBJ_1674 LBJ_1675     TRUE 0.978 14.000 0.095 NA   NA
 1962212 1962213 LBJ_1680 LBJ_1681     TRUE 0.981 -16.000 1.000 1.000   NA
 1962213 1962214 LBJ_1681 LBJ_1682     TRUE 0.978 -10.000 1.000 NA   NA
 1962215 1962216 LBJ_1683 LBJ_1684     TRUE 0.841 50.000 0.006 0.087   NA
 1962218 1962219 LBJ_1686 LBJ_1687     FALSE 0.049 160.000 0.000 NA   NA
 1962219 1962220 LBJ_1687 LBJ_1688     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1962220 1962221 LBJ_1688 LBJ_1689     TRUE 0.874 57.000 0.000 0.014 Y NA
 1962221 1962222 LBJ_1689 LBJ_1690     FALSE 0.135 117.000 0.000 1.000   NA
 1962222 1962223 LBJ_1690 LBJ_1691     TRUE 0.982 -3.000 0.015 1.000   NA
 1962223 1962224 LBJ_1691 LBJ_1692     FALSE 0.008 513.000 0.000 1.000   NA
 1962224 1484505 LBJ_1692 LBJ_1693     FALSE 0.155 94.000 0.000 NA   NA
 1962225 1962226 LBJ_1694 LBJ_1695     FALSE 0.005 538.000 0.000 NA   NA
 1962226 1962227 LBJ_1695 LBJ_1696     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 1962228 1962229 LBJ_1697 LBJ_1698   cheW-1 TRUE 0.893 -10.000 0.000 1.000   NA
 1962229 1962230 LBJ_1698 LBJ_1699 cheW-1   TRUE 0.980 8.000 0.750 NA   NA
 1962230 1962231 LBJ_1699 LBJ_1700   manC FALSE 0.021 225.000 0.000 NA   NA
 1962231 1962232 LBJ_1700 LBJ_1701 manC   TRUE 0.981 -3.000 0.032 NA   NA
 1962232 1962233 LBJ_1701 LBJ_1702     TRUE 0.981 0.000 0.667 NA   NA
 1962233 1962234 LBJ_1702 LBJ_1703   miaA TRUE 0.973 16.000 0.017 1.000   NA
 1962234 1962235 LBJ_1703 LBJ_1704 miaA   TRUE 0.976 14.000 0.017 1.000   NA
 1962238 1962239 LBJ_1707 LBJ_1708 prc-1 nadB TRUE 0.984 2.000 0.013 1.000 N NA
 1962240 1962241 LBJ_1709 LBJ_1710     FALSE 0.015 262.000 0.000 NA   NA
 1962241 1962242 LBJ_1710 LBJ_1711     TRUE 0.981 8.000 0.667 NA   NA
 1962242 1962243 LBJ_1711 LBJ_1712   accB FALSE 0.007 921.000 0.000 1.000   NA
 1962243 1962244 LBJ_1712 LBJ_1713 accB   TRUE 0.987 -6.000 0.012 0.001   NA
 1962244 1962245 LBJ_1713 LBJ_1714     TRUE 0.995 -3.000 0.008 0.047 Y NA
 1962245 1962246 LBJ_1714 LBJ_1715     FALSE 0.006 467.000 0.000 NA   NA
 1962247 1962248 LBJ_1716 LBJ_1717   truA TRUE 0.983 -3.000 0.054 NA   NA
 1962248 1962249 LBJ_1717 LBJ_1718 truA   TRUE 0.973 3.000 0.013 NA   NA
 1962249 1962250 LBJ_1718 LBJ_1719     TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 1962251 1962252 LBJ_1720 LBJ_1721     FALSE 0.005 547.000 0.000 NA   NA
 1962252 1962253 LBJ_1721 LBJ_1722     FALSE 0.027 242.000 0.000 1.000   NA
 1962255 1962256 LBJ_1724 LBJ_1725     FALSE 0.006 443.000 0.000 NA   NA
 1962256 1962257 LBJ_1725 LBJ_1726     FALSE 0.009 336.000 0.000 NA   NA
 1962257 1962258 LBJ_1726 LBJ_1727     FALSE 0.136 100.000 0.000 NA   NA
 1962258 1962259 LBJ_1727 LBJ_1728     TRUE 0.974 0.000 0.013 NA   NA
 1962260 1962261 LBJ_1729 LBJ_1730     TRUE 0.948 28.000 0.182 NA   NA
 1962265 1962266 LBJ_1734 LBJ_1735     FALSE 0.043 166.000 0.000 NA   NA
 1962267 1962268 LBJ_1736 LBJ_1737   rodA FALSE 0.015 261.000 0.000 NA   NA
 1962268 1962269 LBJ_1737 LBJ_1738 rodA   TRUE 0.984 -13.000 0.161 1.000   NA
 1962269 1962270 LBJ_1738 LBJ_1739   mreD TRUE 0.984 2.000 0.133 1.000   NA
 1962270 1962271 LBJ_1739 LBJ_1740 mreD mreC TRUE 0.991 -3.000 0.550 0.002   NA
 1962271 1962272 LBJ_1740 LBJ_1741 mreC mreB TRUE 0.827 72.000 0.689 1.000 N NA
 1484555 1962274 LBJ_1743 LBJ_1744     TRUE 0.837 -16.000 0.000 NA   NA
 1962276 1962277 LBJ_1746 LBJ_1747     FALSE 0.010 319.000 0.000 NA   NA
 1962277 1962278 LBJ_1747 LBJ_1748     TRUE 0.980 10.000 0.667 NA   NA
 1962278 1962279 LBJ_1748 LBJ_1749     TRUE 0.841 4.000 0.000 NA   NA
 1962279 1962280 LBJ_1749 LBJ_1750     TRUE 0.802 16.000 0.000 NA   NA
 1962280 1962281 LBJ_1750 LBJ_1751   atpC FALSE 0.476 83.000 0.003 NA   NA
 1962281 1962282 LBJ_1751 LBJ_1752 atpC atpD TRUE 0.997 5.000 0.837 0.004 Y NA
 1962282 1962283 LBJ_1752 LBJ_1753 atpD atpG TRUE 0.991 26.000 0.724 0.004 Y NA
 1962283 1962284 LBJ_1753 LBJ_1754 atpG atpA TRUE 0.996 15.000 0.846 0.004 Y NA
 1962284 1962285 LBJ_1754 LBJ_1755 atpA atpH TRUE 0.997 -10.000 0.864 0.004 Y NA
 1962285 1962286 LBJ_1755 LBJ_1756 atpH atpF TRUE 0.997 5.000 0.222 0.004 Y NA
 1962286 1962287 LBJ_1756 LBJ_1757 atpF atpE TRUE 0.996 4.000 0.013 0.004 Y NA
 1962287 1962288 LBJ_1757 LBJ_1758 atpE atpB TRUE 0.977 42.000 0.015 0.004 Y NA
 1962288 1962289 LBJ_1758 LBJ_1759 atpB   FALSE 0.391 105.000 0.004 NA   NA
 1962289 1484572 LBJ_1759 LBJ_1760     FALSE 0.010 320.000 0.000 NA   NA
 1484572 1962290 LBJ_1760 LBJ_1761     FALSE 0.016 254.000 0.000 NA   NA
 1962290 1962291 LBJ_1761 LBJ_1762     FALSE 0.102 113.000 0.000 NA   NA
 1962291 1962292 LBJ_1762 LBJ_1763     TRUE 0.613 31.000 0.000 NA   NA
 1962292 1962293 LBJ_1763 LBJ_1764   lepB-2 TRUE 0.947 29.000 0.333 NA   NA
 1962294 1962295 LBJ_1765 LBJ_1766     TRUE 0.985 3.000 0.250 1.000   NA
 1962295 1484579 LBJ_1766 LBJ_1767     FALSE 0.223 74.000 0.000 NA   NA
 1484579 1962296 LBJ_1767 LBJ_1768     FALSE 0.005 546.000 0.000 NA   NA
 1962297 1962298 LBJ_1770 LBJ_1771   groES FALSE 0.004 942.000 0.000 NA   NA
 1962298 1962299 LBJ_1771 LBJ_1772 groES groEL TRUE 0.996 14.000 0.028 0.006 Y NA
 1962299 1484585 LBJ_1772 LBJ_1773 groEL   FALSE 0.015 260.000 0.000 NA   NA
 1484587 1962300 LBJ_1775 LBJ_1776     FALSE 0.004 1174.000 0.000 NA   NA
 1962300 1962301 LBJ_1776 LBJ_1777   accC-1 FALSE 0.006 456.000 0.000 NA   NA
 1962301 1962302 LBJ_1777 LBJ_1778 accC-1   TRUE 0.984 -13.000 0.333 1.000   NA
 1962302 1962303 LBJ_1778 LBJ_1779     TRUE 0.988 -24.000 0.333 0.009   NA
 1962303 1484592 LBJ_1779 LBJ_1780     TRUE 0.841 4.000 0.000 NA   NA
 1962304 1962305 LBJ_1781 LBJ_1782   flgI TRUE 0.982 -3.000 0.045 NA   NA
 1962305 1962306 LBJ_1782 LBJ_1783 flgI flgH TRUE 0.997 -3.000 0.235 0.012 Y NA
 1962306 1962307 LBJ_1783 LBJ_1784 flgH flgA TRUE 0.984 -3.000 0.085 NA   NA
 1962307 1962308 LBJ_1784 LBJ_1785 flgA flgG-1 TRUE 0.970 19.000 0.319 NA   NA
 1484598 1962309 LBJ_1786 LBJ_1787     FALSE 0.005 537.000 0.000 NA   NA
 1962309 1962310 LBJ_1787 LBJ_1788     FALSE 0.013 756.000 0.000 0.008   NA
 1962310 1962311 LBJ_1788 LBJ_1789     TRUE 0.984 -19.000 0.357 1.000   NA
 1962313 1962314 LBJ_1791 LBJ_1792     TRUE 0.971 16.000 1.000 NA   NA
 1962314 1484605 LBJ_1792 LBJ_1793     FALSE 0.197 82.000 0.000 NA   NA
 1962315 1962316 LBJ_1794 LBJ_1795     FALSE 0.057 173.000 0.000 1.000   NA
 1962316 1962317 LBJ_1795 LBJ_1796     FALSE 0.014 584.000 0.000 1.000 N NA
 1962318 1484611 LBJ_1800 LBJ_1801 pgsA-2 tRNA-Leu-GAG FALSE 0.356 54.000 0.000 NA   NA
 1484611 1962319 LBJ_1801 LBJ_1802 tRNA-Leu-GAG   FALSE 0.006 469.000 0.000 NA   NA
 1962319 1962320 LBJ_1802 LBJ_1803     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1962322 1962323 LBJ_1805 LBJ_1806     FALSE 0.006 819.000 0.000 1.000   NA
 1962323 1962324 LBJ_1806 LBJ_1807   lytB FALSE 0.139 116.000 0.000 1.000   NA
 1962324 1484618 LBJ_1807 LBJ_1808 lytB   FALSE 0.005 649.000 0.000 NA   NA
 1484618 1484619 LBJ_1808 LBJ_1809     TRUE 0.823 -37.000 0.000 NA   NA
 1484619 1962325 LBJ_1809 LBJ_1810   cheY TRUE 0.802 16.000 0.000 NA   NA
 1962325 1962326 LBJ_1810 LBJ_1811 cheY   TRUE 0.995 8.000 0.667 NA Y NA
 1962326 1484622 LBJ_1811 LBJ_1812   cheA TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 1484622 1962327 LBJ_1812 LBJ_1813 cheA   FALSE 0.416 48.000 0.000 NA   NA
 1962327 1962328 LBJ_1813 LBJ_1814   cheW-2 TRUE 0.997 12.000 0.500 0.009 Y NA
 1962328 1962329 LBJ_1814 LBJ_1815 cheW-2   TRUE 0.996 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 1962329 1962330 LBJ_1815 LBJ_1816     TRUE 0.996 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 1962331 1962332 LBJ_1817 LBJ_1818 accC-2 accA TRUE 0.995 6.000 0.750 1.000 Y NA
 1962332 1962333 LBJ_1818 LBJ_1819 accA   TRUE 0.754 92.000 0.667 1.000 N NA
 1962333 1962334 LBJ_1819 LBJ_1820   rsbU-4 TRUE 0.995 -16.000 0.500 1.000 Y NA
 1962334 1962335 LBJ_1820 LBJ_1821 rsbU-4   TRUE 0.851 50.000 0.750 NA   NA
 1484632 1962336 LBJ_1822 LBJ_1823 tRNA-Ala-GGC def FALSE 0.007 405.000 0.000 NA   NA
 1962336 1484634 LBJ_1823 LBJ_1824 def   TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 1962338 1962339 LBJ_1830 LBJ_1831     FALSE 0.005 1319.000 0.000 NA   NA
 1962339 1962340 LBJ_1831 LBJ_1832     FALSE 0.005 653.000 0.000 NA   NA
 1962340 1484641 LBJ_1832 LBJ_1833     FALSE 0.089 119.000 0.000 NA   NA
 1962342 1484644 LBJ_1837 LBJ_1838     TRUE 0.627 30.000 0.000 NA   NA
 1484644 1962343 LBJ_1838 LBJ_1839     FALSE 0.013 272.000 0.000 NA   NA
 1962343 1962344 LBJ_1839 LBJ_1840     FALSE 0.004 781.000 0.000 NA   NA
 1962344 1484647 LBJ_1840 LBJ_1841     FALSE 0.018 242.000 0.000 NA   NA
 1484647 1962345 LBJ_1841 LBJ_1842     TRUE 0.846 -10.000 0.000 NA   NA
 1962347 1962348 LBJ_1844 LBJ_1845     TRUE 0.984 -3.000 0.419 NA   NA
 1484654 1484655 LBJ_1848 LBJ_1849     FALSE 0.012 293.000 0.000 NA   NA
 1484655 1962351 LBJ_1849 LBJ_1850     FALSE 0.084 122.000 0.000 NA   NA
 1962351 1962352 LBJ_1850 LBJ_1851     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 1962352 1962353 LBJ_1851 LBJ_1852     TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 1962353 1962354 LBJ_1852 LBJ_1853   uvrC TRUE 0.615 62.000 0.003 NA   NA
 1962354 1962355 LBJ_1853 LBJ_1854 uvrC   FALSE 0.118 125.000 0.000 1.000   NA
 1962355 1962356 LBJ_1854 LBJ_1855     TRUE 0.975 6.000 0.018 NA   NA
 1962356 1962357 LBJ_1855 LBJ_1856     TRUE 0.967 6.000 0.002 NA N NA
 1962357 1962358 LBJ_1856 LBJ_1857   rpmB TRUE 0.971 -52.000 0.003 1.000 N NA
 1962360 1962361 LBJ_1859 LBJ_1860     TRUE 0.983 0.000 0.333 NA   NA
 1962362 1962363 LBJ_1861 LBJ_1862 manB-2 argD TRUE 0.991 -3.000 0.167 1.000 N NA
 1962363 1962364 LBJ_1862 LBJ_1863 argD leuB-1 TRUE 0.992 18.000 0.025 1.000 Y NA
 1962364 1962365 LBJ_1863 LBJ_1864 leuB-1   TRUE 0.981 17.000 0.025 1.000 N NA
 1962367 1962368 LBJ_1866 LBJ_1867 trpF mutS TRUE 0.981 -3.000 0.004 1.000 N NA
 1962369 1962370 LBJ_1868 LBJ_1869 serB   TRUE 0.991 12.000 0.005 1.000 Y NA
 1962370 1962371 LBJ_1869 LBJ_1870   bioB FALSE 0.015 555.000 0.000 1.000 N NA
 1962371 1962372 LBJ_1870 LBJ_1871 bioB bioA TRUE 0.991 30.000 0.176 0.001 Y NA
 1962372 1962373 LBJ_1871 LBJ_1872 bioA bioD TRUE 0.997 -3.000 0.051 0.001 Y NA
 1962373 1962374 LBJ_1872 LBJ_1873 bioD bioF TRUE 0.995 0.000 0.020 1.000 Y NA
 1962374 1962375 LBJ_1873 LBJ_1874 bioF mdh TRUE 0.969 20.000 0.009 1.000 N NA
 1962375 1962376 LBJ_1874 LBJ_1875 mdh   TRUE 0.958 27.000 0.014 1.000 N NA
 1962377 1962378 LBJ_1876 LBJ_1877     TRUE 0.978 10.000 1.000 NA   NA
 1962381 1962382 LBJ_1880 LBJ_1881     TRUE 0.978 -12.000 1.000 NA   NA
 1962382 1962383 LBJ_1881 LBJ_1882     TRUE 0.981 4.000 0.500 NA   NA
 1962383 1962384 LBJ_1882 LBJ_1883     TRUE 0.842 66.000 0.029 1.000 N NA
 1962384 1484690 LBJ_1883 LBJ_1884     FALSE 0.032 185.000 0.000 NA   NA
 1962385 1962386 LBJ_1885 LBJ_1886 sppA-2   TRUE 0.892 40.000 0.006 NA N NA
 1962386 1962387 LBJ_1886 LBJ_1887     TRUE 0.861 47.000 1.000 NA   NA
 1962387 1962388 LBJ_1887 LBJ_1888     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA   NA
 1962388 1962389 LBJ_1888 LBJ_1889     TRUE 0.984 -3.000 0.400 NA   NA
 1962389 1962390 LBJ_1889 LBJ_1890     TRUE 0.903 38.000 1.000 NA   NA
 1962391 1962392 LBJ_1891 LBJ_1892 glpK-1   TRUE 0.828 46.000 0.006 1.000   NA
 1962393 1962394 LBJ_1893 LBJ_1894     TRUE 0.841 10.000 0.000 NA   NA
 1962394 1962395 LBJ_1894 LBJ_1895   lpdA-3 TRUE 0.730 57.000 0.004 1.000   NA
 1962395 1962396 LBJ_1895 LBJ_1896 lpdA-3   TRUE 0.975 19.000 0.013 1.000 N NA
 1962396 1962397 LBJ_1896 LBJ_1897     TRUE 0.997 -3.000 0.688 0.084 Y NA
 1962397 1962398 LBJ_1897 LBJ_1898     TRUE 0.976 15.000 0.011 NA N NA
 1962398 1962399 LBJ_1898 LBJ_1899     FALSE 0.592 95.000 0.000 NA Y NA
 1962399 1962400 LBJ_1899 LBJ_1900     TRUE 0.983 -3.000 0.011 NA N NA
 1962400 1962401 LBJ_1900 LBJ_1901     TRUE 0.948 0.000 0.000 0.003   NA
 1962402 1962403 LBJ_1902 LBJ_1903   gshA TRUE 0.988 -12.000 0.036 1.000 N NA
 1962403 1962404 LBJ_1903 LBJ_1904 gshA ggt TRUE 0.988 -3.000 0.018 1.000 N NA
 1962404 1962405 LBJ_1904 LBJ_1905 ggt clpA-2 TRUE 0.957 21.000 0.004 1.000 N NA
 1962405 1962406 LBJ_1905 LBJ_1906 clpA-2   TRUE 0.984 -3.000 0.596 NA   NA
 1962406 1962407 LBJ_1906 LBJ_1907     TRUE 0.977 -3.000 0.013 NA   NA
 1962407 1962408 LBJ_1907 LBJ_1908     TRUE 0.889 34.000 0.008 NA   NA
 1962410 1962411 LBJ_1910 LBJ_1911   cysK-3 TRUE 0.988 -3.000 0.019 1.000 N NA
 1962411 1962412 LBJ_1911 LBJ_1912 cysK-3 leuD TRUE 0.993 16.000 0.023 1.000 Y NA
 1962412 1962413 LBJ_1912 LBJ_1913 leuD leuC TRUE 0.994 23.000 0.309 0.001 Y NA
 1962413 1962414 LBJ_1913 LBJ_1914 leuC   FALSE 0.191 170.000 0.008 NA   NA
 1962414 1962415 LBJ_1914 LBJ_1915     TRUE 0.976 15.000 0.667 NA   NA
 1962415 1962416 LBJ_1915 LBJ_1916   gmhA-1 TRUE 0.983 11.000 0.012 1.000 N NA
 1962416 1962417 LBJ_1916 LBJ_1917 gmhA-1   TRUE 0.976 2.000 0.019 NA   NA
 1962417 1962418 LBJ_1917 LBJ_1918     TRUE 0.971 -10.000 0.011 NA   NA
 1484726 1484727 LBJ_1920 LBJ_1921 tRNA-Leu-TAA tRNA-Cys-GCA FALSE 0.069 138.000 0.000 NA   NA
 1962422 1962423 LBJ_1924 LBJ_1925     TRUE 0.968 7.000 0.008 NA   NA
 1962426 1962427 LBJ_1928 LBJ_1929 fliM   TRUE 0.973 -3.000 0.008 NA   NA
 1962427 1962428 LBJ_1929 LBJ_1930     FALSE 0.326 58.000 0.000 NA   NA
 1962428 1962429 LBJ_1930 LBJ_1931   ppiB-2 TRUE 0.982 -3.000 0.034 NA   NA
 1962429 1962430 LBJ_1931 LBJ_1932 ppiB-2 argH TRUE 0.968 -3.000 0.003 1.000   NA
 1962430 1962431 LBJ_1932 LBJ_1933 argH   TRUE 0.880 27.000 0.003 NA   NA
 1962432 1962433 LBJ_1934 LBJ_1935     TRUE 0.980 31.000 0.034 NA Y NA
 1962433 1962434 LBJ_1935 LBJ_1936     TRUE 0.996 2.000 0.952 0.053 Y NA
 1962434 1962435 LBJ_1936 LBJ_1937     FALSE 0.015 545.000 0.000 1.000 N NA
 1962437 1962438 LBJ_1939 LBJ_1940     FALSE 0.400 137.000 0.750 NA   NA
 1962438 1962439 LBJ_1940 LBJ_1941     TRUE 0.981 7.000 0.667 NA   NA
 1962439 1962440 LBJ_1941 LBJ_1942     TRUE 0.966 16.000 0.014 NA   NA
 1962442 1962443 LBJ_1944 LBJ_1945 metX   TRUE 0.984 -3.000 0.509 NA   NA
 1962445 1962446 LBJ_1947 LBJ_1948     TRUE 0.984 -3.000 0.167 NA   NA
 1962446 1962447 LBJ_1948 LBJ_1949     TRUE 0.995 4.000 0.333 NA Y NA
 1962447 1962448 LBJ_1949 LBJ_1950     TRUE 0.982 32.000 0.333 NA Y NA
 1962448 1962449 LBJ_1950 LBJ_1951     TRUE 0.971 24.000 0.200 NA N NA
 1962450 1962451 LBJ_1952 LBJ_1953     TRUE 0.984 -3.000 0.589 NA   NA
 1962451 1962452 LBJ_1953 LBJ_1954     FALSE 0.021 224.000 0.000 NA   NA
 1962452 1962453 LBJ_1954 LBJ_1955     FALSE 0.014 267.000 0.000 NA   NA
 1962453 1962454 LBJ_1955 LBJ_1956     TRUE 0.980 -3.000 0.023 NA   NA
 1962454 1962455 LBJ_1956 LBJ_1957     TRUE 0.978 2.000 0.030 NA   NA
 1962457 1962458 LBJ_1959 LBJ_1960   flaB-2 FALSE 0.005 1665.000 0.000 NA   NA
 1962458 1962459 LBJ_1960 LBJ_1961 flaB-2 flaB-3 FALSE 0.020 455.000 0.000 0.002   NA
 1962459 1962460 LBJ_1961 LBJ_1962 flaB-3   FALSE 0.004 1019.000 0.000 NA   NA
 1962460 1962461 LBJ_1962 LBJ_1963     TRUE 0.963 18.000 0.019 NA   NA
 1962461 1962462 LBJ_1963 LBJ_1964     FALSE 0.032 185.000 0.000 NA   NA
 1962462 1962463 LBJ_1964 LBJ_1965     TRUE 0.861 98.000 0.776 1.000 Y NA
 1962464 1962465 LBJ_1966 LBJ_1967 acoA acoB TRUE 0.997 0.000 0.456 0.001 Y NA
 1962465 1962466 LBJ_1967 LBJ_1968 acoB   TRUE 0.993 21.000 0.254 0.045 Y NA
 1962466 1962467 LBJ_1968 LBJ_1969   fliG-2 TRUE 0.975 14.000 0.005 1.000 N NA
 1962467 1962468 LBJ_1969 LBJ_1970 fliG-2   FALSE 0.050 184.000 0.000 1.000   NA
 1962469 1484778 LBJ_1971 LBJ_1972     FALSE 0.004 712.000 0.000 NA   NA
 1484778 1962470 LBJ_1972 LBJ_1973     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 10707041 1962471 LBJ_1974 LBJ_1976     FALSE 0.048 162.000 0.000 NA   NA
 1962474 1962475 LBJ_1980 LBJ_1981   pssA FALSE 0.018 450.000 0.000 1.000 N NA
 1962475 1962476 LBJ_1981 LBJ_1982 pssA   TRUE 0.978 -3.000 0.003 1.000 N NA
 1962476 1962477 LBJ_1982 LBJ_1983   prc-2 TRUE 0.989 5.000 0.017 0.028 N NA
 1962477 1962478 LBJ_1983 LBJ_1984 prc-2   TRUE 0.967 -10.000 0.006 NA   NA
 1962478 1962479 LBJ_1984 LBJ_1985   lexA TRUE 0.985 -3.000 0.250 NA   NA
 1962479 1962480 LBJ_1985 LBJ_1986 lexA   FALSE 0.023 526.000 0.000 0.068 N NA
 1962481 1962482 LBJ_1987 LBJ_1988 ruvA   FALSE 0.052 211.000 0.000 NA N NA
 1962482 1962483 LBJ_1988 LBJ_1989   recJ TRUE 0.973 3.000 0.004 NA N NA
 1962485 1962486 LBJ_1991 LBJ_1992   lgt FALSE 0.046 560.000 0.000 1.000 Y NA
 1962488 1484800 LBJ_1994 LBJ_1995   corA FALSE 0.006 494.000 0.000 NA   NA
 1484800 1962489 LBJ_1995 LBJ_1996 corA   FALSE 0.005 1907.000 0.000 NA   NA
 1962489 1484802 LBJ_1996 LBJ_1997     TRUE 0.813 15.000 0.000 NA   NA
 1484802 1962490 LBJ_1997 LBJ_1998     FALSE 0.007 391.000 0.000 NA   NA
 1962492 1962493 LBJ_2001 LBJ_2002     FALSE 0.009 500.000 0.000 1.000   NA
 1962495 1962496 LBJ_2004 LBJ_2005     TRUE 0.980 13.000 0.200 NA   NA
 1962496 1962497 LBJ_2005 LBJ_2006   kamA TRUE 0.990 -7.000 0.300 1.000 N NA
 1962498 1962499 LBJ_2007 LBJ_2008     TRUE 0.880 44.000 0.040 NA   NA
 1962499 1962500 LBJ_2008 LBJ_2009     FALSE 0.091 118.000 0.000 NA   NA
 1962501 1962502 LBJ_2010 LBJ_2011   thiH FALSE 0.133 102.000 0.000 NA   NA
 1962502 1962503 LBJ_2011 LBJ_2012 thiH   FALSE 0.007 768.000 0.000 1.000   NA
 1962503 10707042 LBJ_2012 LBJ_2013     FALSE 0.558 36.000 0.000 NA   NA
 1962505 1962506 LBJ_2016 LBJ_2017     FALSE 0.146 97.000 0.000 NA   NA
 1962506 1484821 LBJ_2017 LBJ_2018     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1962509 1962510 LBJ_2021 LBJ_2022   argF FALSE 0.103 112.000 0.000 NA   NA
 1962510 1962511 LBJ_2022 LBJ_2023 argF citE TRUE 0.688 104.000 0.043 1.000 N NA
 1962512 1962513 LBJ_2024 LBJ_2025     FALSE 0.007 397.000 0.000 NA   NA
 1962515 1484831 LBJ_2027 LBJ_2028     FALSE 0.005 576.000 0.000 NA   NA
 1484831 1484832 LBJ_2028 LBJ_2029     FALSE 0.199 81.000 0.000 NA   NA
 1484832 1962516 LBJ_2029 LBJ_2030     FALSE 0.440 46.000 0.000 NA   NA
 1962516 1962517 LBJ_2030 LBJ_2031     TRUE 0.982 -3.000 0.043 NA   NA
 1484836 1962519 LBJ_2033 LBJ_2034     FALSE 0.004 1093.000 0.000 NA   NA
 1962519 1484838 LBJ_2034 LBJ_2035     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 1484838 1962520 LBJ_2035 LBJ_2036     TRUE 0.682 25.000 0.000 NA   NA
 1962523 1962524 LBJ_2039 LBJ_2040   arsB FALSE 0.012 285.000 0.000 NA   NA
 1962525 1962526 LBJ_2041 LBJ_2042     FALSE 0.260 67.000 0.000 NA   NA
 1962527 1484847 LBJ_2043 LBJ_2044     TRUE 0.763 19.000 0.000 NA   NA
 1484847 1962528 LBJ_2044 LBJ_2045     TRUE 0.851 -7.000 0.000 NA   NA
 1962529 1962530 LBJ_2046 LBJ_2047     FALSE 0.050 233.000 0.000 0.044   NA
 1962530 1962531 LBJ_2047 LBJ_2048     TRUE 0.982 1.000 1.000 1.000   NA
 1962531 1962532 LBJ_2048 LBJ_2049     FALSE 0.004 819.000 0.000 NA   NA
 1962532 1962533 LBJ_2049 LBJ_2050   sseA FALSE 0.005 563.000 0.000 NA   NA
 1962533 1962534 LBJ_2050 LBJ_2051 sseA   FALSE 0.021 394.000 0.000 1.000 N NA
 1962535 1962536 LBJ_2052 LBJ_2053     TRUE 0.979 -7.000 1.000 NA   NA
 1962536 1962537 LBJ_2053 LBJ_2054     TRUE 0.990 -3.000 0.667 0.013   NA
 1962537 1962538 LBJ_2054 LBJ_2055     TRUE 0.911 43.000 0.500 1.000   NA
 1962539 1962540 LBJ_2056 LBJ_2057     TRUE 0.984 -3.000 0.111 NA   NA
 1962540 1962541 LBJ_2057 LBJ_2058     TRUE 0.988 2.000 0.065 0.052   NA
 1962542 1962543 LBJ_2059 LBJ_2060     TRUE 0.980 38.000 0.023 0.044 Y NA
 1962546 1962547 LBJ_2064 LBJ_2065     FALSE 0.004 796.000 0.000 NA   NA
 1484869 1962548 LBJ_2066 LBJ_2067     FALSE 0.005 1219.000 0.000 NA   NA
 1962548 1962549 LBJ_2067 LBJ_2068     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1962550 1962551 LBJ_2069 LBJ_2070     TRUE 0.983 -3.000 0.667 NA   NA
 1962551 1962552 LBJ_2070 LBJ_2071     FALSE 0.238 189.000 0.136 NA   NA
 1962552 1962553 LBJ_2071 LBJ_2072   mauG-4 TRUE 0.877 48.000 0.227 NA   NA
 1962553 1962554 LBJ_2072 LBJ_2073 mauG-4   TRUE 0.979 -28.000 0.429 NA   NA
 1962554 1962555 LBJ_2073 LBJ_2074     TRUE 0.979 0.000 1.000 NA   NA
 1962555 1962556 LBJ_2074 LBJ_2075     FALSE 0.004 781.000 0.000 NA   NA
 1962556 1962557 LBJ_2075 LBJ_2076     FALSE 0.004 946.000 0.000 NA   NA
 1962557 1962558 LBJ_2076 LBJ_2077     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1962558 1962559 LBJ_2077 LBJ_2078     FALSE 0.005 2166.000 0.000 NA   NA
 1962560 1962561 LBJ_2079 LBJ_2080     TRUE 0.720 22.000 0.000 NA   NA
 1962562 1962563 LBJ_2081 LBJ_2082     FALSE 0.012 523.000 0.000 NA N NA
 1962563 1962564 LBJ_2082 LBJ_2083   lolD-1 FALSE 0.015 536.000 0.000 1.000 N NA
 1962564 1484887 LBJ_2083 LBJ_2084 lolD-1 lolE-2 TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 1484887 1962565 LBJ_2084 LBJ_2085 lolE-2   FALSE 0.210 78.000 0.000 NA   NA
 1962565 1962566 LBJ_2085 LBJ_2086     FALSE 0.004 927.000 0.000 NA   NA
 1962567 1962568 LBJ_2087 LBJ_2088     FALSE 0.017 475.000 0.000 1.000 N NA
 1962568 1962569 LBJ_2088 LBJ_2089     TRUE 0.931 -112.000 0.000 1.000 N NA
 1962570 1962571 LBJ_2090 LBJ_2091     TRUE 0.937 -10.000 0.000 0.024   NA
 1962571 1962572 LBJ_2091 LBJ_2092     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1962572 1962573 LBJ_2092 LBJ_2093     TRUE 0.846 -10.000 0.000 NA   NA
 1962573 1484897 LBJ_2093 LBJ_2094     TRUE 0.720 22.000 0.000 NA   NA
 1484897 1962574 LBJ_2094 LBJ_2095     TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 1962574 1962575 LBJ_2095 LBJ_2096     TRUE 0.788 17.000 0.000 NA   NA
 1962575 1484900 LBJ_2096 LBJ_2097     FALSE 0.005 543.000 0.000 NA   NA
 10707043 1962576 LBJ_2098 LBJ_2100     FALSE 0.146 97.000 0.000 NA   NA
 1962576 1962577 LBJ_2100 LBJ_2101   pyrE TRUE 0.971 -7.000 0.009 NA   NA
 1962580 1962581 LBJ_2104 LBJ_2105     TRUE 0.960 -3.000 0.003 NA   NA
 1962581 1962582 LBJ_2105 LBJ_2106     TRUE 0.826 13.000 0.000 NA   NA
 1962582 1962583 LBJ_2106 LBJ_2107   eutG FALSE 0.206 79.000 0.000 NA   NA
 1962584 1962585 LBJ_2108 LBJ_2109   aroB TRUE 0.988 0.000 0.041 1.000 N NA
 1962585 1484911 LBJ_2109 LBJ_2110 aroB   TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1484911 1962586 LBJ_2110 LBJ_2111   rnc FALSE 0.017 249.000 0.000 NA   NA
 1962586 1962587 LBJ_2111 LBJ_2112 rnc acpP TRUE 0.896 55.000 0.068 1.000 N NA
 1962587 1962588 LBJ_2112 LBJ_2113 acpP   FALSE 0.065 632.000 0.000 0.002 Y NA
 1484915 1962589 LBJ_2114 LBJ_2115     FALSE 0.006 488.000 0.000 NA   NA
 1962589 1962590 LBJ_2115 LBJ_2116     TRUE 0.990 -3.000 0.200 0.024   NA
 1962590 1962591 LBJ_2116 LBJ_2117     FALSE 0.013 358.000 0.000 1.000   NA
 1962593 1962594 LBJ_2119 LBJ_2120 carA   TRUE 0.956 4.000 0.004 NA   NA
 1962595 1962596 LBJ_2121 LBJ_2122     FALSE 0.008 378.000 0.000 NA   NA
 1962596 1962597 LBJ_2122 LBJ_2123   sucA FALSE 0.008 531.000 0.000 1.000   NA
 1962597 1962598 LBJ_2123 LBJ_2124 sucA lpdA-1 TRUE 0.985 20.000 0.005 1.000 Y NA
 1962598 1962599 LBJ_2124 LBJ_2125 lpdA-1 aceF TRUE 0.995 14.000 0.253 1.000 Y NA
 1962599 1962600 LBJ_2125 LBJ_2126 aceF   FALSE 0.539 103.000 0.004 1.000 N NA
 1962600 1962601 LBJ_2126 LBJ_2127     TRUE 0.984 -3.000 1.000 1.000   NA
 1962602 1962603 LBJ_2128 LBJ_2129     FALSE 0.164 91.000 0.000 NA   NA
 1962604 1962605 LBJ_2130 LBJ_2131 glyA lplA FALSE 0.248 198.000 0.012 1.000 N NA
 1962605 1962606 LBJ_2131 LBJ_2132 lplA   TRUE 0.665 49.000 0.000 1.000 N NA
 1962606 1962607 LBJ_2132 LBJ_2133     TRUE 0.990 24.000 0.375 1.000 Y NA
 1962607 1962608 LBJ_2133 LBJ_2134     TRUE 0.980 -24.000 0.250 NA   NA
 1962608 1962609 LBJ_2134 LBJ_2135     FALSE 0.024 210.000 0.000 NA   NA
 1962609 1484937 LBJ_2135 LBJ_2136     FALSE 0.012 288.000 0.000 NA   NA
 1484937 1962610 LBJ_2136 LBJ_2137     FALSE 0.084 122.000 0.000 NA   NA
 1962613 1484943 LBJ_2141 LBJ_2142 pdxH   FALSE 0.017 247.000 0.000 NA   NA
 1484943 1962614 LBJ_2142 LBJ_2143     TRUE 0.843 3.000 0.000 NA   NA
 1962614 1484945 LBJ_2143 LBJ_2144     TRUE 0.841 5.000 0.000 NA   NA
 1962616 1962617 LBJ_2146 LBJ_2147     TRUE 0.995 3.000 0.587 1.000 Y NA
 1962617 1962618 LBJ_2147 LBJ_2148     TRUE 0.993 -3.000 0.935 0.001 N NA
 1962618 1962619 LBJ_2148 LBJ_2149     TRUE 0.974 30.000 0.026 0.001 N NA
 1962619 1962620 LBJ_2149 LBJ_2150   ribAB FALSE 0.013 1290.000 0.000 1.000 N NA
 1962620 1962621 LBJ_2150 LBJ_2151 ribAB ribC FALSE 0.152 582.000 0.040 1.000 Y NA
 1962621 1962622 LBJ_2151 LBJ_2152 ribC ribD TRUE 0.990 -15.000 0.002 1.000 Y NA
 1962622 1962623 LBJ_2152 LBJ_2153 ribD secF TRUE 0.989 0.000 0.100 1.000 N NA
 1962623 1962624 LBJ_2153 LBJ_2154 secF secD TRUE 0.997 3.000 0.244 0.001 Y NA
 1962624 1962625 LBJ_2154 LBJ_2155 secD   TRUE 0.978 10.000 0.038 NA   NA
 1962625 1962626 LBJ_2155 LBJ_2156   yajC TRUE 0.962 -3.000 0.003 NA   NA
 1962626 1962627 LBJ_2156 LBJ_2157 yajC trpD TRUE 0.762 56.000 0.003 NA N NA
 1962627 1962628 LBJ_2157 LBJ_2158 trpD pgsA-1 TRUE 0.973 -25.000 0.003 1.000 N NA
 1962628 1962629 LBJ_2158 LBJ_2159 pgsA-1 miaB-2 TRUE 0.980 -3.000 0.003 1.000 N NA
 1962629 1962630 LBJ_2159 LBJ_2160 miaB-2   TRUE 0.985 6.000 0.300 1.000   NA
 1962630 1962631 LBJ_2160 LBJ_2161   lolA-1 TRUE 0.958 27.000 0.300 1.000   NA
 1962633 1962634 LBJ_2163 LBJ_2164     FALSE 0.006 799.000 0.000 1.000   NA
 1962634 1962635 LBJ_2164 LBJ_2165     FALSE 0.008 511.000 0.000 1.000   NA
 1962635 1962636 LBJ_2165 LBJ_2166     TRUE 0.980 -22.000 0.273 NA   NA
 1962636 1962637 LBJ_2166 LBJ_2167     TRUE 0.844 31.000 0.002 NA   NA
 1962637 1962638 LBJ_2167 LBJ_2168     TRUE 0.974 7.000 0.014 NA   NA
 1962641 1962642 LBJ_2171 LBJ_2172     TRUE 0.984 -3.000 0.500 NA   NA
 1962642 1962643 LBJ_2172 LBJ_2173     TRUE 0.990 -3.000 0.086 1.000 N NA
 1962643 1962644 LBJ_2173 LBJ_2174     TRUE 0.993 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 1962644 1962645 LBJ_2174 LBJ_2175     TRUE 0.945 17.000 0.005 NA   NA
 1962645 1484977 LBJ_2175 LBJ_2176     FALSE 0.004 1164.000 0.000 NA   NA
 1962647 1962648 LBJ_2178 LBJ_2179 fabB   TRUE 0.980 11.000 0.667 NA   NA
 1962649 1962650 LBJ_2180 LBJ_2181     FALSE 0.109 172.000 0.000 1.000 N NA
 1962650 1962651 LBJ_2181 LBJ_2182     FALSE 0.024 210.000 0.000 NA   NA
 1962652 1962653 LBJ_2183 LBJ_2184 atoAD fabH TRUE 0.974 34.000 0.015 NA Y NA
 1962653 1962654 LBJ_2184 LBJ_2185 fabH   TRUE 0.941 24.000 0.015 NA   NA
 1962654 1962655 LBJ_2185 LBJ_2186     TRUE 0.918 38.000 0.154 NA   NA
 1962655 1962656 LBJ_2186 LBJ_2187     TRUE 0.981 3.000 0.667 NA   NA
 1962656 1962657 LBJ_2187 LBJ_2188     TRUE 0.682 25.000 0.000 NA   NA
 1484990 1962658 LBJ_2189 LBJ_2190     FALSE 0.007 404.000 0.000 NA   NA
 1962658 1962659 LBJ_2190 LBJ_2191     FALSE 0.035 179.000 0.000 NA   NA
 1962660 1962661 LBJ_2192 LBJ_2193     FALSE 0.016 251.000 0.000 NA   NA
 1962661 1962662 LBJ_2193 LBJ_2194     FALSE 0.010 316.000 0.000 NA   NA
 1962663 1962664 LBJ_2195 LBJ_2196     FALSE 0.005 1366.000 0.000 NA   NA
 1962664 1962665 LBJ_2196 LBJ_2197     FALSE 0.006 509.000 0.000 NA   NA
 1962665 1962666 LBJ_2197 LBJ_2198     FALSE 0.006 508.000 0.000 NA   NA
 1962666 1962667 LBJ_2198 LBJ_2199     FALSE 0.006 504.000 0.000 NA   NA
 1962667 1962668 LBJ_2199 LBJ_2200     TRUE 0.774 24.000 0.000 1.000   NA
 1962668 1485002 LBJ_2200 LBJ_2201     FALSE 0.013 272.000 0.000 NA   NA
 1485002 1485003 LBJ_2201 LBJ_2204     FALSE 0.005 608.000 0.000 NA   NA
 1485003 1962669 LBJ_2204 LBJ_2205   pldB-2 FALSE 0.005 522.000 0.000 NA   NA
 1485005 1962670 LBJ_2206 LBJ_2207     TRUE 0.845 1.000 0.000 NA   NA
 1962670 1962671 LBJ_2207 LBJ_2208     FALSE 0.007 686.000 0.000 1.000   NA
 1962673 1962674 LBJ_2210 LBJ_2211     TRUE 0.985 0.000 0.333 1.000   NA
 1962676 1962677 LBJ_2213 LBJ_2214     FALSE 0.005 634.000 0.000 NA   NA
 1962677 1962678 LBJ_2214 LBJ_2215     FALSE 0.037 175.000 0.000 NA   NA
 1962678 1962679 LBJ_2215 LBJ_2216     TRUE 0.840 56.000 0.286 NA   NA
 1962679 1962680 LBJ_2216 LBJ_2217     FALSE 0.008 553.000 0.000 1.000   NA
 1962683 1962684 LBJ_2220 LBJ_2221     FALSE 0.054 695.000 0.000 0.065 Y NA
 1962684 1962685 LBJ_2221 LBJ_2222     TRUE 0.962 -3.000 0.003 NA   NA
 1962687 1962688 LBJ_2224 LBJ_2225   mutL TRUE 0.943 -31.000 0.002 NA   NA
 1962689 1485026 LBJ_2226 LBJ_2227     FALSE 0.010 325.000 0.000 NA   NA
 1485026 1962690 LBJ_2227 LBJ_2228     TRUE 0.844 7.000 0.000 NA   NA
 1962690 1485028 LBJ_2228 LBJ_2229     TRUE 0.820 14.000 0.000 NA   NA
 1962691 1962692 LBJ_2230 LBJ_2231   prmA TRUE 0.985 5.000 0.014 1.000 N NA
 1962692 1962693 LBJ_2231 LBJ_2232 prmA   TRUE 0.974 9.000 0.014 NA   NA
 1962693 1962694 LBJ_2232 LBJ_2233     TRUE 0.981 -3.000 1.000 NA   NA
 1962695 1962696 LBJ_2234 LBJ_2235 glyRS dut FALSE 0.034 292.000 0.000 1.000 N NA
 1962697 10707044 LBJ_2237 LBJ_2238     FALSE 0.009 337.000 0.000 NA   NA
 1962699 1962700 LBJ_2242 LBJ_2243     FALSE 0.008 367.000 0.000 NA   NA
 1962700 1962701 LBJ_2243 LBJ_2244   btuB TRUE 0.981 2.000 0.667 NA   NA
 1962701 1962702 LBJ_2244 LBJ_2245 btuB   FALSE 0.007 657.000 0.000 1.000   NA
 1962702 1485043 LBJ_2245 LBJ_2246     FALSE 0.006 433.000 0.000 NA   NA
 1485043 1962703 LBJ_2246 LBJ_2247     FALSE 0.040 172.000 0.000 NA   NA
 1962706 1962707 LBJ_2250 LBJ_2251     FALSE 0.031 302.000 0.000 1.000 N NA
 1962707 1962708 LBJ_2251 LBJ_2252     TRUE 0.995 -7.000 0.047 1.000 Y NA
 1962708 1485050 LBJ_2252 LBJ_2253     FALSE 0.050 159.000 0.000 NA   NA
 1962709 1485052 LBJ_2254 LBJ_2255     TRUE 0.863 -3.000 0.000 NA   NA
 1962710 1962711 LBJ_2256 LBJ_2257     FALSE 0.249 88.000 0.000 1.000   NA
 1962711 1962712 LBJ_2257 LBJ_2258     FALSE 0.013 784.000 0.000 1.000 N NA
 1962713 1962714 LBJ_2259 LBJ_2260     FALSE 0.004 1189.000 0.000 NA   NA
 1962714 1962715 LBJ_2260 LBJ_2261     TRUE 0.980 -7.000 0.034 NA   NA
 1962715 1962716 LBJ_2261 LBJ_2262   lspA TRUE 0.986 5.000 0.074 NA N NA
 1962716 1962717 LBJ_2262 LBJ_2263 lspA   TRUE 0.984 -3.000 0.111 NA   NA
 1962717 1962718 LBJ_2263 LBJ_2264     TRUE 0.980 12.000 0.111 NA   NA
 1962720 1962721 LBJ_2266 LBJ_2267     TRUE 0.969 18.000 0.750 NA   NA
 1962722 1962723 LBJ_2268 LBJ_2269     TRUE 0.984 -3.000 0.600 NA   NA
 1962724 1962725 LBJ_2270 LBJ_2271 ileS   TRUE 0.967 8.000 0.004 1.000   NA
 1962725 1962726 LBJ_2271 LBJ_2272   purL TRUE 0.948 18.000 0.004 1.000   NA
 1962727 1962728 LBJ_2273 LBJ_2274 sucC sucD TRUE 0.996 13.000 0.059 0.001 Y NA
 1962728