MicrobesOnline Operon Predictions for Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1955888 1955889 CJJ81176_0027 CJJ81176_0028 dnaA dnaN TRUE 0.687 160.000 0.328 1.000 Y NA
 1955889 1955890 CJJ81176_0028 CJJ81176_0029 dnaN gyrB TRUE 0.767 29.000 0.114 1.000 Y NA
 1955891 1955892 CJJ81176_0030 CJJ81176_0031     TRUE 0.977 3.000 0.027 0.059   NA
 1955893 1955894 CJJ81176_0032 CJJ81176_0033   gltB FALSE 0.210 134.000 0.025 1.000   NA
 1955894 1955895 CJJ81176_0033 CJJ81176_0034 gltB   FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 1955895 1955896 CJJ81176_0034 CJJ81176_0035   gltD TRUE 0.722 11.000 0.000 NA   NA
 1955897 1955898 CJJ81176_0036 CJJ81176_0037 rnhB comEA FALSE 0.371 33.000 0.002 1.000   NA
 1955898 1955899 CJJ81176_0037 CJJ81176_0038 comEA rbr FALSE 0.230 65.000 0.004 1.000   NA
 1955901 1955902 CJJ81176_0040 CJJ81176_0041     TRUE 0.686 -34.000 0.000 NA   NA
 1955902 1955903 CJJ81176_0041 CJJ81176_0042     FALSE 0.157 92.000 0.010 NA   NA
 1955905 1955906 CJJ81176_0044 CJJ81176_0045     TRUE 0.953 12.000 0.667 NA   NA
 1955906 1955907 CJJ81176_0045 CJJ81176_0046     FALSE 0.420 106.000 0.143 NA   NA
 1955907 1955908 CJJ81176_0046 CJJ81176_0047   ccpA-1 TRUE 0.956 14.000 0.800 1.000 N NA
 1955908 1955909 CJJ81176_0047 CJJ81176_0048 ccpA-1   FALSE 0.289 64.000 0.028 1.000 N NA
 1955909 1955910 CJJ81176_0048 CJJ81176_0049     FALSE 0.269 112.000 0.042 1.000 N NA
 1955911 1955912 CJJ81176_0050 CJJ81176_0051 purB-1 nrdA TRUE 0.708 16.000 0.012 1.000 Y NA
 1955913 1955914 CJJ81176_0052 CJJ81176_0053   thyX FALSE 0.168 120.000 0.009 1.000   NA
 1955915 1955916 CJJ81176_0054 CJJ81176_0055 pyrG recJ TRUE 0.678 -13.000 0.026 1.000 N NA
 1955916 1955917 CJJ81176_0055 CJJ81176_0056 recJ ansA FALSE 0.194 86.000 0.004 1.000 N NA
 1955917 1955918 CJJ81176_0056 CJJ81176_1704 ansA rrsA FALSE 0.187 587.000 0.000 NA   NA
 1955918 1955919 CJJ81176_1704 CJJ81176_1705 rrsA   FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 1955919 1955920 CJJ81176_1705 CJJ81176_1706     TRUE 0.821 9.000 0.000 NA   NA
 1955920 1955921 CJJ81176_1706 CJJ81176_1707   rrlA FALSE 0.187 581.000 0.000 NA   NA
 1955923 1955924 CJJ81176_1708 CJJ81176_0063 rrfA   FALSE 0.189 425.000 0.000 NA   NA
 1955924 1955925 CJJ81176_0063 CJJ81176_0064     TRUE 0.587 41.000 0.136 NA   NA
 1955925 1955926 CJJ81176_0064 CJJ81176_0065     FALSE 0.494 44.000 0.091 NA N NA
 1955926 1955927 CJJ81176_0065 CJJ81176_0066     TRUE 0.978 -7.000 0.750 1.000 Y NA
 1955929 1955930 CJJ81176_0068 CJJ81176_0069     TRUE 0.869 0.000 0.000 NA   NA
 1955930 1955931 CJJ81176_0069 CJJ81176_0070     FALSE 0.195 238.000 0.000 NA   NA
 1955931 1955932 CJJ81176_0070 CJJ81176_0071     FALSE 0.221 115.000 0.000 NA   NA
 1955933 1955934 CJJ81176_0072 CJJ81176_0073     TRUE 0.603 -13.000 0.019 NA   NA
 1955936 1955937 CJJ81176_0075 CJJ81176_0076     FALSE 0.420 178.000 0.182 NA   NA
 1955937 1955938 CJJ81176_0076 CJJ81176_0077   typA TRUE 0.792 0.000 0.006 NA   NA
 1955939 1955940 CJJ81176_0078 CJJ81176_0079     TRUE 0.903 20.000 0.500 1.000   NA
 1955940 1955941 CJJ81176_0079 CJJ81176_0080   flgD FALSE 0.371 54.000 0.053 NA   NA
 1955941 1955942 CJJ81176_0080 CJJ81176_0081 flgD flgE-1 TRUE 0.982 4.000 0.341 NA Y NA
 1955943 1955944 CJJ81176_0082 CJJ81176_0083     TRUE 0.702 285.000 0.714 NA   NA
 1955945 1955946 CJJ81176_0084 CJJ81176_0085     FALSE 0.197 223.000 0.000 NA   NA
 1955946 1955947 CJJ81176_0085 CJJ81176_0086     TRUE 0.686 -48.000 0.000 NA   NA
 1955947 1955948 CJJ81176_0086 CJJ81176_0087     TRUE 0.686 -40.000 0.000 NA   NA
 1955948 1955949 CJJ81176_0087 CJJ81176_0088     TRUE 0.996 11.000 1.000 0.008   NA
 1955949 1955950 CJJ81176_0088 CJJ81176_0089     TRUE 0.992 19.000 1.000 0.008   NA
 1955951 1955952 CJJ81176_0090 CJJ81176_0091 trmU   TRUE 0.797 0.000 0.012 NA   NA
 1955952 1955953 CJJ81176_0091 CJJ81176_0092     FALSE 0.537 121.000 0.300 NA   NA
 1955953 1955954 CJJ81176_0092 CJJ81176_0093     TRUE 0.964 14.000 1.000 NA   NA
 1955955 1955956 CJJ81176_0094 CJJ81176_0095     TRUE 0.685 -15.000 0.000 NA   NA
 1955956 1955957 CJJ81176_0095 CJJ81176_0096     TRUE 0.840 6.000 0.000 NA   NA
 1955958 1955959 CJJ81176_0097 CJJ81176_0098 fliY fliM TRUE 0.982 18.000 0.142 0.003 Y NA
 1955959 1955960 CJJ81176_0098 CJJ81176_0099 fliM fliA TRUE 0.940 0.000 0.118 1.000 N NA
 1955960 1955961 CJJ81176_0099 CJJ81176_0100 fliA   TRUE 0.812 -19.000 0.112 NA   NA
 1955961 1955962 CJJ81176_0100 CJJ81176_0101     TRUE 0.770 19.000 0.159 NA   NA
 1955962 1955963 CJJ81176_0101 CJJ81176_0102   flhF TRUE 0.930 -7.000 0.382 1.000 N NA
 1955963 1955964 CJJ81176_0102 CJJ81176_0103 flhF folK TRUE 0.799 10.000 0.035 1.000 N NA
 1955964 1955965 CJJ81176_0103 CJJ81176_0104 folK aroQ TRUE 0.849 3.000 0.009 1.000 N NA
 1955966 1955967 CJJ81176_0105 CJJ81176_0106   sppA TRUE 0.718 -12.000 0.035 1.000 N NA
 1955967 1955968 CJJ81176_0106 CJJ81176_0107 sppA   FALSE 0.170 79.000 0.009 NA   NA
 1955968 1955969 CJJ81176_0107 CJJ81176_1709     TRUE 0.655 13.000 0.000 NA   NA
 1955970 1955971 CJJ81176_0108 CJJ81176_0109     FALSE 0.197 210.000 0.000 NA   NA
 1955971 1955972 CJJ81176_0109 CJJ81176_0110     FALSE 0.234 173.000 0.000 1.000   NA
 1955972 1955973 CJJ81176_0110 CJJ81176_0111     TRUE 0.988 -7.000 0.209 0.002   NA
 1955973 1955974 CJJ81176_0111 CJJ81176_0112     TRUE 0.980 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 1955974 1955975 CJJ81176_0112 CJJ81176_0113   lctP FALSE 0.483 123.000 0.075 1.000 Y NA
 1955975 1955976 CJJ81176_0113 CJJ81176_0114 lctP cdtC FALSE 0.392 172.000 0.125 1.000   NA
 1955976 1955977 CJJ81176_0114 CJJ81176_0115 cdtC cdtB TRUE 0.994 11.000 0.500 0.003   NA
 1955977 1955978 CJJ81176_0115 CJJ81176_0116 cdtB cdtA TRUE 0.994 -3.000 0.421 0.003   NA
 1955979 1955980 CJJ81176_0117 CJJ81176_0118   cydA TRUE 0.991 1.000 0.887 NA   NA
 1955980 1955981 CJJ81176_0118 CJJ81176_0119 cydA cydB TRUE 0.998 0.000 0.962 0.058 Y NA
 1955982 1955983 CJJ81176_0120 CJJ81176_0121   ung FALSE 0.164 120.000 0.011 1.000 N NA
 1955984 1955985 CJJ81176_0122 CJJ81176_0123 aspA dcuA TRUE 0.694 26.000 0.127 1.000   NA
 1955985 1955986 CJJ81176_0123 CJJ81176_0124 dcuA   FALSE 0.229 108.000 0.027 1.000   NA
 1955986 1955987 CJJ81176_0124 CJJ81176_0125     TRUE 0.945 10.000 0.372 NA   NA
 1955987 1955988 CJJ81176_0125 CJJ81176_0126     TRUE 0.878 24.000 0.516 NA   NA
 1955988 1955989 CJJ81176_0126 CJJ81176_0127     FALSE 0.373 82.000 0.087 NA   NA
 1955989 1955990 CJJ81176_0127 CJJ81176_0128     TRUE 0.953 10.000 0.414 NA   NA
 1955990 1955991 CJJ81176_0128 CJJ81176_0129   rplU FALSE 0.129 159.000 0.005 NA   NA
 1955991 1955992 CJJ81176_0129 CJJ81176_0130 rplU rpmA TRUE 0.995 11.000 0.667 0.032 Y NA
 1955992 1955993 CJJ81176_0130 CJJ81176_0131 rpmA   TRUE 0.615 106.000 0.335 1.000   NA
 1955993 1955994 CJJ81176_0131 CJJ81176_0132   proB TRUE 0.636 52.000 0.206 1.000   NA
 1955994 1955995 CJJ81176_0132 CJJ81176_0133 proB fmt FALSE 0.214 74.000 0.014 1.000 N NA
 1955995 1955996 CJJ81176_0133 CJJ81176_0134 fmt   TRUE 0.692 -37.000 0.029 1.000 N NA
 1955996 1955997 CJJ81176_0134 CJJ81176_0135     TRUE 0.784 -3.000 0.040 1.000 N NA
 1955997 1955998 CJJ81176_0135 CJJ81176_0136     TRUE 0.986 6.000 0.827 1.000 N NA
 1955998 1955999 CJJ81176_0136 CJJ81176_0137     FALSE 0.332 61.000 0.037 1.000 N NA
 1955999 1956000 CJJ81176_0137 CJJ81176_0138     TRUE 0.986 11.000 0.110 0.008 Y NA
 1956000 1956001 CJJ81176_0138 CJJ81176_0139   atpH TRUE 0.996 3.000 0.132 0.008 Y NA
 1956001 1956002 CJJ81176_0139 CJJ81176_0140 atpH atpA TRUE 0.996 14.000 0.864 0.008 Y NA
 1956002 1956003 CJJ81176_0140 CJJ81176_0141 atpA atpG TRUE 0.998 9.000 0.846 0.008 Y NA
 1956003 1956004 CJJ81176_0141 CJJ81176_0142 atpG atpD TRUE 0.991 25.000 0.724 0.008 Y NA
 1956004 1956005 CJJ81176_0142 CJJ81176_0143 atpD atpC TRUE 0.999 4.000 0.837 0.008 Y NA
 1956005 1956006 CJJ81176_0143 CJJ81176_0144 atpC   TRUE 0.886 0.000 0.036 1.000 N NA
 1956006 1956007 CJJ81176_0144 CJJ81176_0145     TRUE 0.998 9.000 0.944 0.057 Y NA
 1956007 1956008 CJJ81176_0145 CJJ81176_0146     TRUE 0.975 3.000 0.343 NA   NA
 1956008 1956009 CJJ81176_0146 CJJ81176_0147     TRUE 0.917 10.000 0.213 NA   NA
 1956009 1956010 CJJ81176_0147 CJJ81176_0148     TRUE 0.796 77.000 0.702 1.000 N NA
 1956010 1956011 CJJ81176_0148 CJJ81176_0149     TRUE 0.989 4.000 0.794 1.000   NA
 1956011 1956012 CJJ81176_0149 CJJ81176_0150   slyD TRUE 0.933 15.000 0.543 1.000   NA
 1956012 1956013 CJJ81176_0150 CJJ81176_0151 slyD fabD TRUE 0.828 0.000 0.013 1.000 N NA
 1956013 1956014 CJJ81176_0151 CJJ81176_0152 fabD mtnA TRUE 0.888 0.000 0.037 1.000 N NA
 1956014 1956015 CJJ81176_0152 CJJ81176_0153 mtnA   TRUE 0.755 -3.000 0.042 NA N NA
 1956015 1956016 CJJ81176_0153 CJJ81176_0154     TRUE 0.758 5.000 0.009 NA N NA
 1956016 1956017 CJJ81176_0154 CJJ81176_0155     TRUE 0.791 0.000 0.007 NA   NA
 1956017 1956018 CJJ81176_0155 CJJ81176_0156     TRUE 0.643 -3.000 0.003 NA   NA
 1956018 1956019 CJJ81176_0156 CJJ81176_0157     FALSE 0.245 91.000 0.000 NA   NA
 1956020 1956021 CJJ81176_0158 CJJ81176_0159 dusB   TRUE 0.681 -3.000 0.021 NA   NA
 1956021 1956022 CJJ81176_0159 CJJ81176_0160     TRUE 0.677 116.000 0.523 NA   NA
 1956022 1956023 CJJ81176_0160 CJJ81176_0161     TRUE 0.658 12.000 0.029 NA   NA
 1956023 1956024 CJJ81176_0161 CJJ81176_0162   accD TRUE 0.893 2.000 0.035 NA   NA
 1956024 1956025 CJJ81176_0162 CJJ81176_0163 accD   TRUE 0.777 9.000 0.016 1.000 N NA
 1956025 1956026 CJJ81176_0163 CJJ81176_0164     TRUE 0.822 0.000 0.008 1.000 N NA
 1956027 1956028 CJJ81176_0165 CJJ81176_0166 tyrA   FALSE 0.205 80.000 0.013 1.000 N NA
 1956028 1956029 CJJ81176_0166 CJJ81176_0167   lpxC TRUE 0.926 0.000 0.022 1.000 Y NA
 1956029 1956030 CJJ81176_0167 CJJ81176_0168 lpxC   FALSE 0.383 39.000 0.035 NA N NA
 1956030 1956031 CJJ81176_0168 CJJ81176_0169   thrB TRUE 0.808 9.000 0.032 NA N NA
 1956031 1956032 CJJ81176_0169 CJJ81176_0170 thrB   FALSE 0.507 25.000 0.044 NA N NA
 1956032 1956033 CJJ81176_0170 CJJ81176_0171   infB TRUE 0.855 -13.000 0.171 NA N NA
 1956033 1956034 CJJ81176_0171 CJJ81176_0172 infB rbfA TRUE 0.977 -3.000 0.530 1.000 Y NA
 1956034 1956035 CJJ81176_0172 CJJ81176_0173 rbfA   TRUE 0.679 -10.000 0.033 NA   NA
 1956035 1956036 CJJ81176_0173 CJJ81176_0174     FALSE 0.137 205.000 0.002 NA   NA
 1956036 1956037 CJJ81176_0174 CJJ81176_0175     TRUE 0.986 0.000 0.759 NA   NA
 1956037 1956038 CJJ81176_0175 CJJ81176_0176     TRUE 0.691 -9.000 0.000 NA   NA
 1956039 1956040 CJJ81176_0177 CJJ81176_0178     TRUE 0.973 -7.000 0.616 1.000 Y NA
 1956040 1956041 CJJ81176_0178 CJJ81176_0179     TRUE 0.963 13.000 0.509 1.000 Y NA
 1956042 1956043 CJJ81176_0180 CJJ81176_0181     FALSE 0.247 135.000 0.050 NA   NA
 1956044 1956045 CJJ81176_0182 CJJ81176_0183 trxB trx FALSE 0.388 134.000 0.035 1.000 Y NA
 1956045 1956046 CJJ81176_0183 CJJ81176_0184 trx   FALSE 0.300 57.000 0.027 1.000 N NA
 1956046 1956047 CJJ81176_0184 CJJ81176_0185   hom TRUE 0.835 0.000 0.003 1.000 N NA
 1956047 1956048 CJJ81176_0185 CJJ81176_0186 hom   TRUE 0.915 4.000 0.009 1.000 Y NA
 1956048 1956049 CJJ81176_0186 CJJ81176_0187     TRUE 0.800 12.000 0.098 NA   NA
 1956049 1956050 CJJ81176_0187 CJJ81176_0188     TRUE 0.970 -6.000 0.882 NA   NA
 1956050 1956051 CJJ81176_0188 CJJ81176_0189     TRUE 0.688 -7.000 0.033 NA   NA
 1956051 1956052 CJJ81176_0189 CJJ81176_0190     TRUE 0.654 14.000 0.031 1.000   NA
 1956052 1956053 CJJ81176_0190 CJJ81176_0191   rpmE TRUE 0.899 3.000 0.031 1.000   NA
 1956053 1956054 CJJ81176_0191 CJJ81176_0192 rpmE   FALSE 0.214 79.000 0.023 NA   NA
 1956054 1956055 CJJ81176_0192 CJJ81176_0193     TRUE 0.928 2.000 0.070 NA   NA
 1956055 1956056 CJJ81176_0193 CJJ81176_0194     TRUE 0.965 0.000 0.300 NA   NA
 1956056 1956057 CJJ81176_0194 CJJ81176_0195     TRUE 0.831 0.000 0.011 1.000   NA
 1956057 1956058 CJJ81176_0195 CJJ81176_0196     TRUE 0.887 -3.000 0.139 1.000 N NA
 1956058 1956059 CJJ81176_0196 CJJ81176_0197     TRUE 0.890 3.000 0.028 1.000 N NA
 1956059 1956060 CJJ81176_0197 CJJ81176_0198     TRUE 0.715 13.000 0.042 1.000   NA
 1956060 1956061 CJJ81176_0198 CJJ81176_0199     TRUE 0.951 -3.000 0.476 NA   NA
 1956061 1956062 CJJ81176_0199 CJJ81176_0200     FALSE 0.307 288.000 0.100 NA   NA
 1956067 1956068 CJJ81176_0205 CJJ81176_0206 sodB   FALSE 0.185 69.000 0.004 NA   NA
 1956068 1956069 CJJ81176_0206 CJJ81176_0207     TRUE 0.729 110.000 0.667 NA   NA
 1956070 1956071 CJJ81176_0208 CJJ81176_0209     FALSE 0.495 42.000 0.014 1.000 Y NA
 1956071 1956072 CJJ81176_0209 CJJ81176_0210     TRUE 0.948 -16.000 0.529 1.000 N NA
 1956072 1956073 CJJ81176_0210 CJJ81176_0211     TRUE 0.998 0.000 0.618 0.047 Y NA
 1956073 1956074 CJJ81176_0211 CJJ81176_0212     TRUE 0.854 11.000 0.130 NA   NA
 1956075 1956076 CJJ81176_0213 CJJ81176_0214     FALSE 0.361 171.000 0.103 1.000   NA
 1956077 1956078 CJJ81176_0215 CJJ81176_0216     TRUE 0.714 10.000 0.009 1.000   NA
 1956078 1956079 CJJ81176_0216 CJJ81176_0217     TRUE 0.785 -7.000 0.009 1.000 Y NA
 1956079 1956080 CJJ81176_0217 CJJ81176_0218   purN FALSE 0.207 72.000 0.009 1.000 N NA
 1956080 1956081 CJJ81176_0218 CJJ81176_0219 purN   TRUE 0.567 -9.000 0.014 NA N NA
 1956081 1956082 CJJ81176_0219 CJJ81176_0220     TRUE 0.565 -16.000 0.004 NA   NA
 1956082 1956083 CJJ81176_0220 CJJ81176_0221     TRUE 0.827 2.000 0.007 NA   NA
 1956083 1956084 CJJ81176_0221 CJJ81176_0222   def TRUE 0.814 -3.000 0.054 1.000 N NA
 1956084 1956085 CJJ81176_0222 CJJ81176_0223 def clpP FALSE 0.414 36.000 0.030 1.000 N NA
 1956085 1956086 CJJ81176_0223 CJJ81176_0224 clpP tig TRUE 0.984 0.000 0.351 1.000 Y NA
 1956087 1956088 CJJ81176_0225 CJJ81176_0226 folE fliI TRUE 0.993 0.000 0.378 0.061 N NA
 1956089 1956090 CJJ81176_0227 CJJ81176_0228 purF dapB TRUE 0.882 2.000 0.022 1.000 N NA
 1956090 1956091 CJJ81176_0228 CJJ81176_0229 dapB   FALSE 0.231 63.000 0.003 1.000 N NA
 1956091 1956092 CJJ81176_0229 CJJ81176_0230     TRUE 0.794 0.000 0.005 NA   NA
 1956092 1956093 CJJ81176_0230 CJJ81176_0231     TRUE 0.736 135.000 0.750 NA   NA
 1956093 1956094 CJJ81176_0231 CJJ81176_0232     FALSE 0.364 99.000 0.100 NA   NA
 1956094 1956095 CJJ81176_0232 CJJ81176_0233     TRUE 0.686 -49.000 0.000 NA   NA
 1956095 1956096 CJJ81176_0233 CJJ81176_0234     TRUE 0.685 -22.000 0.000 NA   NA
 1956097 1956098 CJJ81176_0235 CJJ81176_0236     FALSE 0.178 186.000 0.029 NA   NA
 1956098 1956099 CJJ81176_0236 CJJ81176_0237     FALSE 0.290 74.000 0.043 NA   NA
 1956099 1956100 CJJ81176_0237 CJJ81176_0238   thrS FALSE 0.308 131.000 0.063 1.000 N NA
 1956100 1956101 CJJ81176_0238 CJJ81176_0239 thrS infC TRUE 0.899 -3.000 0.060 1.000 Y NA
 1956101 1956102 CJJ81176_0239 CJJ81176_0240 infC   FALSE 0.315 39.000 0.004 1.000 N NA
 1956102 1956103 CJJ81176_0240 CJJ81176_0241     FALSE 0.196 230.000 0.000 NA   NA
 1956103 1956104 CJJ81176_0241 CJJ81176_0242     TRUE 0.810 120.000 1.000 NA   NA
 1956104 1956105 CJJ81176_0242 CJJ81176_0243     TRUE 0.798 164.000 1.000 NA   NA
 1956105 1956106 CJJ81176_0243 CJJ81176_0244     FALSE 0.289 63.000 0.000 NA   NA
 1956106 1956107 CJJ81176_0244 CJJ81176_0245     FALSE 0.205 158.000 0.000 NA   NA
 1956107 1956108 CJJ81176_0245 CJJ81176_0246     TRUE 0.685 -25.000 0.000 NA   NA
 1956108 1956109 CJJ81176_0246 CJJ81176_0247     FALSE 0.187 570.000 0.000 NA   NA
 1956109 1956110 CJJ81176_0247 CJJ81176_0248     TRUE 0.815 114.000 1.000 NA   NA
 1956110 1956111 CJJ81176_0248 CJJ81176_0249   argC FALSE 0.216 81.000 0.003 1.000   NA
 1956111 1956112 CJJ81176_0249 CJJ81176_0250 argC   TRUE 0.796 9.000 0.019 1.000   NA
 1956112 1956113 CJJ81176_0250 CJJ81176_0251   argB TRUE 0.713 10.000 0.006 1.000   NA
 1956113 1956114 CJJ81176_0251 CJJ81176_0252 argB argD TRUE 0.881 10.000 0.030 1.000 Y NA
 1956117 1956118 CJJ81176_0255 CJJ81176_0256   nrdB TRUE 0.752 -10.000 0.048 1.000 N NA
 1956118 1956119 CJJ81176_0256 CJJ81176_0257 nrdB   FALSE 0.546 14.000 0.019 NA   NA
 1956119 1956120 CJJ81176_0257 CJJ81176_0258   pyrE TRUE 0.868 1.000 0.025 NA   NA
 1956120 1956121 CJJ81176_0258 CJJ81176_0259 pyrE frr TRUE 0.886 3.000 0.026 1.000 N NA
 1956121 1956122 CJJ81176_0259 CJJ81176_0260 frr secG FALSE 0.543 16.000 0.017 1.000 N NA
 1956122 1956123 CJJ81176_0260 CJJ81176_0261 secG   FALSE 0.148 104.000 0.007 NA   NA
 1956124 1956125 CJJ81176_0262 CJJ81176_0263 cynT   TRUE 0.846 -3.000 0.105 NA N NA
 1956126 1956127 CJJ81176_0264 CJJ81176_0265     TRUE 0.839 10.000 0.056 1.000 N NA
 1956127 1956128 CJJ81176_0265 CJJ81176_0266     FALSE 0.267 178.000 0.052 1.000 N NA
 1956128 1956129 CJJ81176_0266 CJJ81176_0267     TRUE 0.617 137.000 0.429 NA   NA
 1956129 1956130 CJJ81176_0267 CJJ81176_0268     TRUE 0.607 71.000 0.286 NA   NA
 1956131 1956132 CJJ81176_0269 CJJ81176_0270 rpmI rplT TRUE 0.972 94.000 0.928 0.031 Y NA
 1956133 1956134 CJJ81176_0271 CJJ81176_0272     FALSE 0.189 386.000 0.000 NA   NA
 1956134 1956135 CJJ81176_0272 CJJ81176_0273     FALSE 0.353 117.000 0.105 NA   NA
 1956135 1956136 CJJ81176_0273 CJJ81176_0274     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 1956137 1956138 CJJ81176_0275 CJJ81176_0276     TRUE 0.775 31.000 0.333 NA   NA
 1956139 1956140 CJJ81176_0277 CJJ81176_0278     TRUE 0.974 3.000 0.333 NA   NA
 1956141 1956142 CJJ81176_0279 CJJ81176_0280 moaC   TRUE 0.746 -22.000 0.057 NA   NA
 1956142 1956143 CJJ81176_0280 CJJ81176_0281     TRUE 0.669 14.000 0.047 NA   NA
 1956145 1956146 CJJ81176_0283 CJJ81176_0284   dgkA TRUE 0.888 -3.000 0.136 1.000   NA
 1956146 1956147 CJJ81176_0284 CJJ81176_0285 dgkA   TRUE 0.928 -3.000 0.273 1.000   NA
 1956147 1956148 CJJ81176_0285 CJJ81176_0286   pyrC TRUE 0.616 -10.000 0.009 1.000   NA
 1956149 1956150 CJJ81176_0287 CJJ81176_0288     FALSE 0.540 56.000 0.154 NA   NA
 1956150 1956151 CJJ81176_0288 CJJ81176_0289     FALSE 0.517 80.000 0.154 1.000   NA
 1956153 1956154 CJJ81176_0291 CJJ81176_0292     TRUE 0.982 11.000 0.148 0.055 Y NA
 1956154 1956155 CJJ81176_0292 CJJ81176_0293     FALSE 0.188 481.000 0.000 NA   NA
 1956155 1956156 CJJ81176_0293 CJJ81176_0294     TRUE 0.989 0.000 0.867 NA   NA
 1956156 1956157 CJJ81176_0294 CJJ81176_0295     FALSE 0.530 34.000 0.075 NA   NA
 1956157 1956158 CJJ81176_0295 CJJ81176_0296   ilvE TRUE 0.773 13.000 0.098 NA N NA
 1956159 1956160 CJJ81176_0297 CJJ81176_0298     TRUE 0.680 -3.000 0.008 1.000   NA
 1956160 1956161 CJJ81176_0298 CJJ81176_0299     TRUE 0.792 0.000 0.006 NA   NA
 1956161 1956162 CJJ81176_0299 CJJ81176_0300   fabZ FALSE 0.238 95.000 0.035 NA   NA
 1956162 1956163 CJJ81176_0300 CJJ81176_0301 fabZ lpxA TRUE 0.965 0.000 0.264 1.000 N NA
 1956163 1956164 CJJ81176_0301 CJJ81176_0302 lpxA clpX TRUE 0.693 -7.000 0.027 1.000 N NA
 1956164 1956165 CJJ81176_0302 CJJ81176_0303 clpX mreB TRUE 0.748 11.000 0.034 1.000 N NA
 1956165 1956166 CJJ81176_0303 CJJ81176_0304 mreB   TRUE 0.895 29.000 0.689 1.000 N NA
 1956166 1956167 CJJ81176_0304 CJJ81176_0305   carB FALSE 0.156 261.000 0.016 1.000 N NA
 1956167 1956168 CJJ81176_0305 CJJ81176_0306 carB   TRUE 0.639 -3.000 0.016 NA N NA
 1956169 1956170 CJJ81176_0307 CJJ81176_0308 tal serB TRUE 0.872 0.000 0.029 1.000 N NA
 1956170 1956171 CJJ81176_0308 CJJ81176_0309 serB cheW TRUE 0.832 0.000 0.015 1.000 N NA
 1956171 1956172 CJJ81176_0309 CJJ81176_0310 cheW cheA TRUE 0.993 5.000 0.137 0.014 Y NA
 1956172 1956173 CJJ81176_0310 CJJ81176_0311 cheA cheV TRUE 0.995 4.000 0.147 0.009 Y NA
 1956173 1956174 CJJ81176_0311 CJJ81176_0312 cheV   TRUE 0.773 -7.000 0.065 NA   NA
 1956174 1956175 CJJ81176_0312 CJJ81176_0313   greA FALSE 0.138 133.000 0.012 NA   NA
 1956175 1956176 CJJ81176_0313 CJJ81176_0314 greA lpxB TRUE 0.734 12.000 0.042 1.000 N NA
 1956176 1956177 CJJ81176_0314 CJJ81176_0315 lpxB   FALSE 0.192 97.000 0.003 1.000   NA
 1956177 1956178 CJJ81176_0315 CJJ81176_0316     TRUE 0.604 264.000 0.000 0.046   NA
 1956179 1956180 CJJ81176_0317 CJJ81176_0318 surE   TRUE 0.765 -10.000 0.051 1.000   NA
 1956181 1956182 CJJ81176_0319 CJJ81176_0320 panD panC TRUE 0.964 -3.000 0.342 1.000 Y NA
 1956182 1956183 CJJ81176_0320 CJJ81176_0321 panC panB TRUE 0.996 11.000 0.395 0.001 Y NA
 1956183 1956184 CJJ81176_0321 CJJ81176_0322 panB modC FALSE 0.166 157.000 0.002 1.000 N NA
 1956184 1956185 CJJ81176_0322 CJJ81176_0323 modC modB TRUE 0.965 10.000 0.286 1.000 Y NA
 1956185 1956186 CJJ81176_0323 CJJ81176_0324 modB   TRUE 0.848 -7.000 0.122 1.000 N NA
 1956186 1956187 CJJ81176_0324 CJJ81176_0325   modA FALSE 0.400 93.000 0.098 1.000 N NA
 1956187 1956188 CJJ81176_0325 CJJ81176_0326 modA   FALSE 0.251 54.000 0.008 1.000   NA
 1956188 1956189 CJJ81176_0326 CJJ81176_0327     TRUE 0.812 -3.000 0.065 NA   NA
 1956189 1956190 CJJ81176_0327 CJJ81176_0328   bioF TRUE 0.940 -3.000 0.389 NA   NA
 1956192 1956193 CJJ81176_0330 CJJ81176_0331 bioD   TRUE 0.784 10.000 0.030 1.000 N NA
 1956193 1956194 CJJ81176_0331 CJJ81176_0332     TRUE 0.997 4.000 0.444 0.078 Y NA
 1956195 1956196 CJJ81176_0333 CJJ81176_0334 rplY pth TRUE 0.993 -3.000 0.496 0.049 Y NA
 1956196 1956197 CJJ81176_0334 CJJ81176_0335 pth   TRUE 0.902 2.000 0.031 1.000   NA
 1956197 1956198 CJJ81176_0335 CJJ81176_0336   lysA FALSE 0.338 44.000 0.021 1.000   NA
 1956198 1956199 CJJ81176_0336 CJJ81176_0337 lysA   TRUE 0.862 2.000 0.015 1.000 N NA
 1956199 1956200 CJJ81176_0337 CJJ81176_0338   pheA TRUE 0.657 -12.000 0.021 1.000 N NA
 1956200 1956201 CJJ81176_0338 CJJ81176_0339 pheA hisC TRUE 0.821 -10.000 0.028 1.000 Y NA
 1956201 1956202 CJJ81176_0339 CJJ81176_0340 hisC fliF FALSE 0.479 52.000 0.084 1.000 N NA
 1956202 1956203 CJJ81176_0340 CJJ81176_0341 fliF fliG TRUE 0.998 0.000 0.477 0.013 Y NA
 1956203 1956204 CJJ81176_0341 CJJ81176_0342 fliG   TRUE 0.996 8.000 0.308 0.008 Y NA
 1956204 1956205 CJJ81176_0342 CJJ81176_0343   dxs TRUE 0.770 -7.000 0.052 1.000 N NA
 1956205 1956206 CJJ81176_0343 CJJ81176_0344 dxs   FALSE 0.205 86.000 0.017 1.000 N NA
 1956206 1956207 CJJ81176_0344 CJJ81176_0345     FALSE 0.344 46.000 0.033 NA   NA
 1956207 1956208 CJJ81176_0345 CJJ81176_0346   ubiE TRUE 0.821 3.000 0.008 NA   NA
 1956208 1956209 CJJ81176_0346 CJJ81176_0347 ubiE xseA TRUE 0.689 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1956209 1956210 CJJ81176_0347 CJJ81176_0348 xseA serC TRUE 0.707 10.000 0.010 1.000 N NA
 1956210 1956211 CJJ81176_0348 CJJ81176_0349 serC   TRUE 0.625 -3.000 0.004 NA N NA
 1956212 1956213 CJJ81176_0350 CJJ81176_0351 fabH plsX TRUE 0.980 -7.000 0.058 0.007 Y NA
 1956213 1956214 CJJ81176_0351 CJJ81176_0352 plsX rpmF TRUE 0.973 6.000 0.418 1.000   NA
 1956214 1956215 CJJ81176_0352 CJJ81176_0353 rpmF   FALSE 0.477 24.000 0.032 NA   NA
 1956215 1956216 CJJ81176_0353 CJJ81176_0354   ndk TRUE 0.888 1.000 0.033 NA   NA
 1956216 1956217 CJJ81176_0354 CJJ81176_0355 ndk   FALSE 0.182 113.000 0.015 1.000   NA
 1956218 1956219 CJJ81176_0356 CJJ81176_0357   flhB FALSE 0.163 119.000 0.006 1.000 N NA
 1956220 1956221 CJJ81176_0358 CJJ81176_0359     TRUE 0.972 3.000 0.119 1.000 Y NA
 1956221 1956222 CJJ81176_0359 CJJ81176_0360   polA FALSE 0.512 16.000 0.006 1.000 N NA
 1956223 1956224 CJJ81176_0361 CJJ81176_0362     FALSE 0.252 84.000 0.000 NA   NA
 1956224 1956225 CJJ81176_0362 CJJ81176_0363     FALSE 0.384 40.000 0.000 NA   NA
 1956225 1956226 CJJ81176_0363 CJJ81176_0364     TRUE 0.842 -3.000 0.097 NA   NA
 1956227 1956228 CJJ81176_0365 CJJ81176_0366   uvrA TRUE 0.788 5.000 0.002 NA   NA
 1956228 1956229 CJJ81176_0366 CJJ81176_0367 uvrA   FALSE 0.223 73.000 0.003 1.000   NA
 1956230 1956231 CJJ81176_0368 CJJ81176_0369   trpE FALSE 0.140 165.000 0.016 NA   NA
 1956231 1956232 CJJ81176_0369 CJJ81176_0370 trpE trpD TRUE 0.985 -3.000 0.019 0.001 Y NA
 1956232 1956233 CJJ81176_0370 CJJ81176_0371 trpD trpF TRUE 0.860 -13.000 0.052 1.000 Y NA
 1956233 1956234 CJJ81176_0371 CJJ81176_0372 trpF trpB TRUE 0.996 -3.000 0.375 0.003 Y NA
 1956234 1956235 CJJ81176_0372 CJJ81176_0373 trpB trpA TRUE 0.994 -7.000 0.248 0.001 Y NA
 1956235 1956236 CJJ81176_0373 CJJ81176_0374 trpA   FALSE 0.199 71.000 0.017 NA   NA
 1956236 1956237 CJJ81176_0374 CJJ81176_0375   fliN TRUE 0.983 0.000 0.625 NA   NA
 1956237 1956238 CJJ81176_0375 CJJ81176_0376 fliN   TRUE 0.984 1.000 0.531 NA   NA
 1956239 1956240 CJJ81176_0377 CJJ81176_0378     TRUE 0.989 0.000 0.806 1.000   NA
 1956240 1956241 CJJ81176_0378 CJJ81176_0379     FALSE 0.500 113.000 0.200 1.000   NA
 1956241 1956242 CJJ81176_0379 CJJ81176_0380     FALSE 0.381 79.000 0.067 1.000 N NA
 1956242 1956243 CJJ81176_0380 CJJ81176_0381     TRUE 0.822 -15.000 0.096 1.000   NA
 1956244 1956245 CJJ81176_0382 CJJ81176_0383 ccpA-2 glmM FALSE 0.208 76.000 0.004 1.000 N NA
 1956245 1956246 CJJ81176_0383 CJJ81176_0384 glmM lspA TRUE 0.747 -7.000 0.042 1.000 N NA
 1956246 1956247 CJJ81176_0384 CJJ81176_0385 lspA   TRUE 0.608 -16.000 0.020 NA   NA
 1956250 1956251 CJJ81176_0388 CJJ81176_0389 cmeC cmeB TRUE 0.974 -7.000 0.241 0.046 N NA
 1956251 1956252 CJJ81176_0389 CJJ81176_0390 cmeB cmeA TRUE 0.990 0.000 0.945 1.000 N NA
 1956252 1956253 CJJ81176_0390 CJJ81176_0391 cmeA   FALSE 0.474 95.000 0.145 1.000   NA
 1956253 1956254 CJJ81176_0391 CJJ81176_0392     TRUE 0.967 -13.000 0.818 1.000   NA
 1956257 1956258 CJJ81176_0395 CJJ81176_0396     TRUE 0.974 10.000 0.763 NA   NA
 1956258 1956259 CJJ81176_0396 CJJ81176_0397     TRUE 0.950 3.000 0.118 1.000 N NA
 1956259 1956260 CJJ81176_0397 CJJ81176_0398     TRUE 0.619 -10.000 0.021 NA   NA
 1956260 1956261 CJJ81176_0398 CJJ81176_0399     TRUE 0.730 9.000 0.012 NA   NA
 1956261 1956262 CJJ81176_0399 CJJ81176_0400     TRUE 0.880 11.000 0.176 NA   NA
 1956262 1956263 CJJ81176_0400 CJJ81176_0401     TRUE 0.924 0.000 0.097 NA   NA
 1956264 1956265 CJJ81176_0402 CJJ81176_0403     TRUE 0.997 0.000 0.790 0.054   NA
 1956265 1956266 CJJ81176_0403 CJJ81176_0404   pyrF FALSE 0.261 55.000 0.003 1.000   NA
 1956266 1956267 CJJ81176_0404 CJJ81176_0405 pyrF nusB TRUE 0.726 -3.000 0.023 1.000 N NA
 1956267 1956268 CJJ81176_0405 CJJ81176_0406 nusB ribE TRUE 0.897 0.000 0.045 1.000 N NA
 1956268 1956269 CJJ81176_0406 CJJ81176_0407 ribE kdsA TRUE 0.744 -3.000 0.027 1.000 N NA
 1956269 1956270 CJJ81176_0407 CJJ81176_0408 kdsA   TRUE 0.628 -3.000 0.005 NA   NA
 1956271 1956272 CJJ81176_0409 CJJ81176_0410   aroK TRUE 0.640 -13.000 0.002 1.000   NA
 1956272 1956273 CJJ81176_0410 CJJ81176_0411 aroK trpS TRUE 0.693 -3.000 0.002 1.000 N NA
 1956273 1956274 CJJ81176_0411 CJJ81176_0412 trpS serS TRUE 0.951 11.000 0.010 0.059 Y NA
 1956274 1956275 CJJ81176_0412 CJJ81176_0413 serS   TRUE 0.724 10.000 0.014 1.000   NA
 1956276 1956277 CJJ81176_0414 CJJ81176_0415   pyk FALSE 0.241 98.000 0.037 NA   NA
 1956277 1956278 CJJ81176_0415 CJJ81176_0416 pyk   TRUE 0.919 49.000 0.073 0.001   NA
 1956278 1956279 CJJ81176_0416 CJJ81176_0417     FALSE 0.168 119.000 0.007 1.000   NA
 1956279 1956280 CJJ81176_0417 CJJ81176_0418     TRUE 0.578 -13.000 0.003 NA   NA
 1956280 1956281 CJJ81176_0418 CJJ81176_0419     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1956281 1956282 CJJ81176_0419 CJJ81176_0420     TRUE 0.832 -3.000 0.086 NA   NA
 1956283 1956284 CJJ81176_0421 CJJ81176_0422 gatC   FALSE 0.231 69.000 0.003 1.000   NA
 1956284 1956285 CJJ81176_0422 CJJ81176_0423   fur TRUE 0.888 2.000 0.023 1.000   NA
 1956285 1956286 CJJ81176_0423 CJJ81176_0424 fur lysS TRUE 0.879 1.000 0.022 1.000 N NA
 1956286 1956287 CJJ81176_0424 CJJ81176_0425 lysS glyA TRUE 0.793 -3.000 0.044 1.000 N NA
 1956287 1956288 CJJ81176_0425 CJJ81176_0427 glyA   TRUE 0.918 -3.000 0.271 NA   NA
 1956288 1956289 CJJ81176_0427 CJJ81176_0428     TRUE 0.901 14.000 0.387 NA   NA
 1956289 1956290 CJJ81176_0428 CJJ81176_0429   aroE TRUE 0.676 -3.000 0.020 NA   NA
 1956292 1956293 CJJ81176_0431 CJJ81176_0432 lgt frdC FALSE 0.211 70.000 0.010 1.000 N NA
 1956293 1956294 CJJ81176_0432 CJJ81176_0433 frdC frdA TRUE 0.987 -16.000 0.128 0.004 Y NA
 1956294 1956295 CJJ81176_0433 CJJ81176_0434 frdA frdB TRUE 0.989 -7.000 0.153 0.004 Y NA
 1956295 1956296 CJJ81176_0434 CJJ81176_0435 frdB   FALSE 0.430 28.000 0.022 1.000   NA
 1956296 1956297 CJJ81176_0435 CJJ81176_0436     TRUE 0.949 110.000 0.750 0.012   NA
 1956297 1956298 CJJ81176_0436 CJJ81176_0437     TRUE 0.962 0.000 0.222 1.000   NA
 1956298 1956299 CJJ81176_0437 CJJ81176_0438     FALSE 0.469 136.000 0.182 1.000   NA
 1956299 1956300 CJJ81176_0438 CJJ81176_0439     TRUE 0.998 2.000 0.500 0.001   NA
 1956300 1956301 CJJ81176_0439 CJJ81176_0440     FALSE 0.191 289.000 0.000 NA   NA
 1956303 1956304 CJJ81176_0442 CJJ81176_0443     FALSE 0.195 74.000 0.017 NA   NA
 1956306 1956307 CJJ81176_0445 CJJ81176_0446     FALSE 0.353 46.000 0.000 NA   NA
 1956307 1956308 CJJ81176_0446 CJJ81176_0447     TRUE 0.571 -7.000 0.010 NA   NA
 1956308 1956309 CJJ81176_0447 CJJ81176_0448     TRUE 0.848 76.000 1.000 NA   NA
 1956311 1956312 CJJ81176_0450 CJJ81176_0451     TRUE 0.888 -7.000 0.237 NA   NA
 1956312 1956313 CJJ81176_0451 CJJ81176_1711   rrsB FALSE 0.188 478.000 0.000 NA   NA
 1956313 1956314 CJJ81176_1711 CJJ81176_1712 rrsB   FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 1956314 1956315 CJJ81176_1712 CJJ81176_1713     TRUE 0.821 9.000 0.000 NA   NA
 1956315 1956316 CJJ81176_1713 CJJ81176_1714   rrlB FALSE 0.187 581.000 0.000 NA   NA
 1956319 1956320 CJJ81176_0458 CJJ81176_0459 murD mraY TRUE 0.998 0.000 0.647 0.008 Y NA
 1956321 1956322 CJJ81176_0460 CJJ81176_0461 pgm fabG FALSE 0.231 72.000 0.018 1.000 N NA
 1956322 1956323 CJJ81176_0461 CJJ81176_0462 fabG   TRUE 0.715 10.000 0.005 1.000   NA
 1956323 1956324 CJJ81176_0462 CJJ81176_0463   sdhA FALSE 0.221 337.000 0.000 1.000   NA
 1956324 1956325 CJJ81176_0463 CJJ81176_0464 sdhA sdhB TRUE 0.994 -3.000 0.279 0.004 Y NA
 1956325 1956326 CJJ81176_0464 CJJ81176_0465 sdhB sdhC TRUE 0.996 4.000 0.175 0.004 Y NA
 1956328 1956329 CJJ81176_0467 CJJ81176_0468   acpP FALSE 0.440 19.000 0.003 NA   NA
 1956329 1956330 CJJ81176_0468 CJJ81176_0469 acpP fabF TRUE 0.740 26.000 0.066 1.000 Y NA
 1956330 1956331 CJJ81176_0469 CJJ81176_0470 fabF accA TRUE 0.957 2.000 0.046 1.000 Y NA
 1956331 1956332 CJJ81176_0470 CJJ81176_0471 accA   FALSE 0.273 92.000 0.000 1.000 N NA
 1956332 1956333 CJJ81176_0471 CJJ81176_0472     FALSE 0.399 83.000 0.083 1.000   NA
 1956334 1956335 CJJ81176_0473 CJJ81176_0474     TRUE 0.847 10.000 0.077 NA   NA
 1956335 1956336 CJJ81176_0474 CJJ81176_0475   rpmB FALSE 0.130 183.000 0.004 NA   NA
 1956337 1956338 CJJ81176_0476 CJJ81176_0477 rpe   TRUE 0.928 -3.000 0.279 1.000 N NA
 1956338 1956339 CJJ81176_0477 CJJ81176_0478   thiC FALSE 0.149 183.000 0.007 1.000 N NA
 1956340 1956341 CJJ81176_0479 CJJ81176_0480     TRUE 0.934 -10.000 0.448 NA   NA
 1956341 1956342 CJJ81176_0480 CJJ81176_0481     TRUE 0.978 -3.000 1.000 NA   NA
 1956342 1956343 CJJ81176_0481 CJJ81176_0482     TRUE 0.982 2.000 0.462 NA   NA
 1956343 1956344 CJJ81176_0482 CJJ81176_0483   miaB TRUE 0.658 -37.000 0.029 NA   NA
 1956344 1956345 CJJ81176_0483 CJJ81176_0484 miaB   TRUE 0.740 -3.000 0.033 NA   NA
 1956348 1956349 CJJ81176_0487 CJJ81176_0488     TRUE 0.945 0.000 0.130 1.000   NA
 1956349 1956350 CJJ81176_0488 CJJ81176_0489   recG TRUE 0.812 -10.000 0.084 1.000   NA
 1956352 1956353 CJJ81176_0491 CJJ81176_0492     TRUE 0.617 17.000 0.048 NA N NA
 1956353 1956354 CJJ81176_0492 CJJ81176_0493     TRUE 0.996 -7.000 0.841 0.014 Y NA
 1956354 1956355 CJJ81176_0493 CJJ81176_0494     TRUE 0.994 2.000 0.773 1.000 Y NA
 1956355 1956356 CJJ81176_0494 CJJ81176_1716     FALSE 0.221 115.000 0.000 NA   NA
 1956356 1956357 CJJ81176_1716 CJJ81176_1717     FALSE 0.335 50.000 0.000 NA   NA
 1956357 1956358 CJJ81176_1717 CJJ81176_1718     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 1956358 1956359 CJJ81176_1718 CJJ81176_1719     FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 1956359 1956360 CJJ81176_1719 CJJ81176_0499   tuf FALSE 0.279 69.000 0.000 NA   NA
 1956360 1956361 CJJ81176_0499 CJJ81176_0500 tuf rpmG TRUE 0.646 53.000 0.099 1.000 Y NA
 1956361 1956362 CJJ81176_0500 CJJ81176_1720 rpmG   TRUE 0.655 13.000 0.000 NA   NA
 1956362 1956363 CJJ81176_1720 CJJ81176_0502   secE FALSE 0.554 19.000 0.000 NA   NA
 1956363 1956364 CJJ81176_0502 CJJ81176_0503 secE nusG TRUE 0.980 10.000 0.843 1.000   NA
 1956364 1956365 CJJ81176_0503 CJJ81176_0505 nusG rplK TRUE 0.904 26.000 0.681 1.000 N NA
 1956365 1956366 CJJ81176_0505 CJJ81176_0506 rplK rplA TRUE 0.977 55.000 0.838 0.039 Y NA
 1956366 1956367 CJJ81176_0506 CJJ81176_0507 rplA rplJ TRUE 0.899 152.000 0.302 0.039 Y NA
 1956367 1956368 CJJ81176_0507 CJJ81176_0508 rplJ rplL TRUE 0.992 21.000 0.884 0.029 Y NA
 1956368 1956369 CJJ81176_0508 CJJ81176_0509 rplL rpoB FALSE 0.527 110.000 0.223 1.000   NA
 1956369 1956370 CJJ81176_0509 CJJ81176_0510 rpoB rpoC TRUE 0.997 -7.000 0.851 0.001   NA
 1956370 1956371 CJJ81176_0510 CJJ81176_0511 rpoC rpsL FALSE 0.401 120.000 0.122 1.000 N NA
 1956371 1956372 CJJ81176_0511 CJJ81176_0512 rpsL rpsG TRUE 0.975 70.000 0.620 0.006 Y NA
 1956372 1956373 CJJ81176_0512 CJJ81176_0513 rpsG fusA TRUE 0.966 13.000 0.579 1.000 Y NA
 1956373 1956374 CJJ81176_0513 CJJ81176_1721 fusA   FALSE 0.442 29.000 0.000 NA   NA
 1956374 1956375 CJJ81176_1721 CJJ81176_0515     TRUE 0.574 18.000 0.000 NA   NA
 1956375 1956376 CJJ81176_0515 CJJ81176_0516     TRUE 0.751 6.000 0.006 NA   NA
 1956376 1956377 CJJ81176_0516 CJJ81176_0517     TRUE 0.763 -10.000 0.064 NA   NA
 1956377 1956378 CJJ81176_0517 CJJ81176_0518     TRUE 0.880 12.000 0.228 NA   NA
 1956378 1956379 CJJ81176_0518 CJJ81176_0519   trpC TRUE 0.799 -3.000 0.044 1.000   NA
 1956379 1956380 CJJ81176_0519 CJJ81176_0520 trpC   TRUE 0.769 10.000 0.026 1.000 N NA
 1956380 1956381 CJJ81176_0520 CJJ81176_0521   ybbB TRUE 0.665 -10.000 0.030 NA   NA
 1956383 1956384 CJJ81176_0523 CJJ81176_0524     TRUE 0.893 2.000 0.000 NA   NA
 1956384 1956385 CJJ81176_0524 CJJ81176_0525     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1956385 1956386 CJJ81176_0525 CJJ81176_0526     FALSE 0.434 30.000 0.000 NA   NA
 1956386 1956387 CJJ81176_0526 CJJ81176_0527     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 1956387 1956388 CJJ81176_0527 CJJ81176_0528     FALSE 0.189 386.000 0.000 NA   NA
 1956388 1956389 CJJ81176_0528 CJJ81176_0529     FALSE 0.237 97.000 0.000 NA   NA
 1956389 1956390 CJJ81176_0529 CJJ81176_0530     FALSE 0.193 262.000 0.000 NA   NA
 1956391 1956392 CJJ81176_0531 CJJ81176_0532 hemH   TRUE 0.681 -3.000 0.005 1.000   NA
 1956392 1956393 CJJ81176_0532 CJJ81176_0533     TRUE 0.931 5.000 0.117 1.000   NA
 1956394 1956395 CJJ81176_0534 CJJ81176_0535 alaS   TRUE 0.798 0.000 0.015 NA N NA
 1956395 1956396 CJJ81176_0535 CJJ81176_0536   pbpA TRUE 0.696 -3.000 0.026 NA N NA
 1956397 1956398 CJJ81176_0537 CJJ81176_0538 clpB   FALSE 0.360 112.000 0.108 NA   NA
 1956399 1956400 CJJ81176_0539 CJJ81176_0540 ctpA purC TRUE 0.918 2.000 0.045 1.000 N NA
 1956400 1956401 CJJ81176_0540 CJJ81176_0541 purC purS TRUE 0.982 9.000 0.460 1.000 Y NA
 1956401 1956402 CJJ81176_0541 CJJ81176_0542 purS purQ TRUE 0.999 2.000 0.656 0.002 Y NA
 1956402 1956403 CJJ81176_0542 CJJ81176_0543 purQ   FALSE 0.259 84.000 0.038 NA   NA
 1956403 1956404 CJJ81176_0543 CJJ81176_0544     TRUE 0.965 -19.000 0.846 NA   NA
 1956404 1956405 CJJ81176_0544 CJJ81176_0545     TRUE 0.929 -6.000 0.038 0.099 N NA
 1956405 1956406 CJJ81176_0545 CJJ81176_0546   htpG FALSE 0.207 72.000 0.007 1.000 N NA
 1956406 1956407 CJJ81176_0546 CJJ81176_0547 htpG   TRUE 0.616 -3.000 0.007 NA N NA
 1956407 1956408 CJJ81176_0547 CJJ81176_0548     TRUE 0.974 0.000 0.400 NA   NA
 1956408 1956409 CJJ81176_0548 CJJ81176_0549     TRUE 0.954 4.000 0.200 NA   NA
 1956410 1956411 CJJ81176_0550 CJJ81176_0551   fliE TRUE 0.960 7.000 0.303 1.000 N NA
 1956411 1956412 CJJ81176_0551 CJJ81176_0552 fliE flgC TRUE 0.996 7.000 0.271 0.008 Y NA
 1956412 1956413 CJJ81176_0552 CJJ81176_0553 flgC flgB TRUE 0.987 10.000 0.804 1.000 Y NA
 1956413 1956414 CJJ81176_0553 CJJ81176_0554 flgB   FALSE 0.169 80.000 0.005 NA   NA
 1956415 1956416 CJJ81176_0555 CJJ81176_0556   icd FALSE 0.439 18.000 0.011 NA   NA
 1956416 1956417 CJJ81176_0556 CJJ81176_0557 icd mdh TRUE 0.852 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 1956417 1956418 CJJ81176_0557 CJJ81176_0558 mdh sucC TRUE 0.940 1.000 0.022 1.000 Y NA
 1956418 1956419 CJJ81176_0558 CJJ81176_0559 sucC sucD TRUE 0.995 10.000 0.169 0.001 Y NA
 1956419 1956420 CJJ81176_0559 CJJ81176_0560 sucD oorD TRUE 0.869 14.000 0.097 1.000 Y NA
 1956420 1956421 CJJ81176_0560 CJJ81176_0561 oorD oorA TRUE 0.997 9.000 0.316 0.003 Y NA
 1956421 1956422 CJJ81176_0561 CJJ81176_0562 oorA oorB TRUE 0.999 2.000 0.771 0.003 Y NA
 1956422 1956423 CJJ81176_0562 CJJ81176_0563 oorB oorC TRUE 0.995 -3.000 0.324 0.003 Y NA
 1956423 1956424 CJJ81176_0563 CJJ81176_0564 oorC   FALSE 0.305 139.000 0.083 NA   NA
 1956424 1956425 CJJ81176_0564 CJJ81176_0565     TRUE 0.983 3.000 0.514 NA   NA
 1956425 1956426 CJJ81176_0565 CJJ81176_0566     TRUE 0.605 14.000 0.030 NA   NA
 1956426 1956427 CJJ81176_0566 CJJ81176_0567   hemA TRUE 0.949 0.000 0.051 1.000 Y NA
 1956427 1956428 CJJ81176_0567 CJJ81176_0568 hemA proS TRUE 0.932 -16.000 0.040 0.056 N NA
 1956428 1956429 CJJ81176_0568 CJJ81176_0569 proS   TRUE 0.728 -3.000 0.022 1.000   NA
 1956429 1956430 CJJ81176_0569 CJJ81176_0570   hemC TRUE 0.687 -3.000 0.013 1.000   NA
 1956430 1956431 CJJ81176_0570 CJJ81176_0571 hemC   TRUE 0.797 -3.000 0.009 NA Y NA
 1956431 1956432 CJJ81176_0571 CJJ81176_0572   flaG FALSE 0.141 157.000 0.018 NA N NA
 1956432 1956433 CJJ81176_0572 CJJ81176_0573 flaG fliD TRUE 0.963 3.000 0.092 NA Y NA
 1956433 1956434 CJJ81176_0573 CJJ81176_0574 fliD fliS TRUE 0.996 12.000 0.608 0.005 Y NA
 1956434 1956435 CJJ81176_0574 CJJ81176_0575 fliS   FALSE 0.329 65.000 0.051 NA   NA
 1956435 1956436 CJJ81176_0575 CJJ81176_0576   efp FALSE 0.188 432.000 0.000 NA   NA
 1956436 1956437 CJJ81176_0576 CJJ81176_0577 efp   FALSE 0.145 159.000 0.002 NA   NA
 1956437 1956438 CJJ81176_0577 CJJ81176_0578     TRUE 0.968 -13.000 0.939 NA   NA
 1956438 1956439 CJJ81176_0578 CJJ81176_0579     TRUE 0.915 10.000 0.202 NA   NA
 1956439 1956440 CJJ81176_0579 CJJ81176_0580     FALSE 0.148 115.000 0.014 NA   NA
 1956440 1956441 CJJ81176_0580 CJJ81176_0581     TRUE 0.735 11.000 0.029 1.000   NA
 1956442 1956443 CJJ81176_0582 CJJ81176_0583   proA TRUE 0.639 -3.000 0.003 NA   NA
 1956444 1956445 CJJ81176_0584 CJJ81176_0585     FALSE 0.151 181.000 0.011 1.000 N NA
 1956447 1956448 CJJ81176_0587 CJJ81176_0588 dnaB   FALSE 0.150 105.000 0.012 NA   NA
 1956448 1956449 CJJ81176_0588 CJJ81176_0589     TRUE 0.972 -9.000 1.000 NA   NA
 1956449 1956450 CJJ81176_0589 CJJ81176_0590     FALSE 0.208 142.000 0.000 NA   NA
 1956450 1956451 CJJ81176_0590 CJJ81176_0591     FALSE 0.272 72.000 0.000 NA   NA
 1956451 1956452 CJJ81176_0591 CJJ81176_0592     TRUE 0.869 0.000 0.000 NA   NA
 1956452 1956453 CJJ81176_0592 CJJ81176_0593     TRUE 0.871 4.000 0.000 NA   NA
 1956453 1956454 CJJ81176_0593 CJJ81176_0594     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 1956454 1956455 CJJ81176_0594 CJJ81176_0595     TRUE 0.947 9.000 0.273 NA   NA
 1956455 1956456 CJJ81176_0595 CJJ81176_0596     TRUE 0.686 -43.000 0.000 NA   NA
 1956456 1956457 CJJ81176_0596 CJJ81176_0597     FALSE 0.376 145.000 0.133 NA   NA
 1956458 1956459 CJJ81176_1722 CJJ81176_1723     FALSE 0.409 35.000 0.000 NA   NA
 1956460 1956461 CJJ81176_0600 CJJ81176_0601 ribB   TRUE 0.619 12.000 0.004 1.000   NA
 1956461 1956462 CJJ81176_0601 CJJ81176_0602   ilvB FALSE 0.501 18.000 0.004 1.000   NA
 1956462 1956463 CJJ81176_0602 CJJ81176_0603 ilvB ilvH TRUE 0.995 -3.000 0.249 0.001 Y NA
 1956463 1956464 CJJ81176_0603 CJJ81176_0604 ilvH lpxD TRUE 0.810 -3.000 0.052 1.000 N NA
 1956465 1956466 CJJ81176_0605 CJJ81176_0606 queA tatC TRUE 0.693 -7.000 0.036 NA N NA
 1956466 1956467 CJJ81176_0606 CJJ81176_0607 tatC tatB TRUE 0.990 1.000 0.535 NA Y NA
 1956467 1956468 CJJ81176_0607 CJJ81176_0608 tatB   FALSE 0.231 59.000 0.011 1.000 N NA
 1956469 1956470 CJJ81176_0609 CJJ81176_0610 nidH   TRUE 0.923 2.000 0.051 1.000 N NA
 1956470 1956471 CJJ81176_0610 CJJ81176_0611     TRUE 0.909 1.000 0.050 NA   NA
 1956471 1956472 CJJ81176_0611 CJJ81176_0612     TRUE 0.871 6.000 0.053 NA   NA
 1956472 1956473 CJJ81176_0612 CJJ81176_0613   folP TRUE 0.928 2.000 0.054 1.000   NA
 1956473 1956474 CJJ81176_0613 CJJ81176_0614 folP ligA TRUE 0.851 1.000 0.006 1.000 N NA
 1956474 1956475 CJJ81176_0614 CJJ81176_0615 ligA   FALSE 0.284 38.000 0.003 NA   NA
 1956475 1956476 CJJ81176_0615 CJJ81176_0616   tlyA TRUE 0.630 -3.000 0.005 NA   NA
 1956476 1956477 CJJ81176_0616 CJJ81176_0617 tlyA   TRUE 0.691 -34.000 0.029 1.000 N NA
 1956477 1956478 CJJ81176_0617 CJJ81176_0618     TRUE 0.860 -10.000 0.051 1.000 Y NA
 1956479 1956480 CJJ81176_0619 CJJ81176_0620     TRUE 0.953 -3.000 0.500 NA   NA
 1956480 1956481 CJJ81176_0620 CJJ81176_0621     FALSE 0.217 58.000 0.017 NA   NA
 1956481 1956482 CJJ81176_0621 CJJ81176_0622     TRUE 0.716 11.000 0.033 NA   NA
 1956482 1956483 CJJ81176_0622 CJJ81176_0623   nth TRUE 0.962 -3.000 0.004 0.004 N NA
 1956484 1956485 CJJ81176_0624 CJJ81176_0625   fbaA TRUE 0.886 0.000 0.036 1.000 N NA
 1956485 1956486 CJJ81176_0625 CJJ81176_0626 fbaA   FALSE 0.244 95.000 0.027 1.000   NA
 1956486 1956487 CJJ81176_0626 CJJ81176_0627     TRUE 0.902 -3.000 0.167 1.000   NA
 1956487 1956488 CJJ81176_0627 CJJ81176_0628     TRUE 0.730 -13.000 0.040 1.000 N NA
 1956489 1956490 CJJ81176_0629 CJJ81176_0630     TRUE 0.607 51.000 0.160 1.000   NA
 1956490 1956491 CJJ81176_0630 CJJ81176_0631   dsbD TRUE 0.907 -3.000 0.185 1.000   NA
 1956492 1956493 CJJ81176_0632 CJJ81176_0633     TRUE 0.971 -19.000 1.000 NA   NA
 1956493 1956494 CJJ81176_0633 CJJ81176_0634     TRUE 0.923 9.000 0.154 NA   NA
 1956494 1956495 CJJ81176_0634 CJJ81176_0635     FALSE 0.525 79.000 0.158 1.000   NA
 1956495 1956496 CJJ81176_0635 CJJ81176_0636     TRUE 0.990 0.000 0.258 0.096 N NA
 1956496 1956497 CJJ81176_0636 CJJ81176_0637     TRUE 0.990 2.000 0.152 0.096 N NA
 1956498 1956499 CJJ81176_0638 CJJ81176_0639     TRUE 0.908 -13.000 0.280 1.000   NA
 1956499 1956500 CJJ81176_0639 CJJ81176_0640   algI TRUE 0.966 1.000 0.244 NA   NA
 1956500 1956501 CJJ81176_0640 CJJ81176_0641 algI ftn FALSE 0.397 43.000 0.047 NA N NA
 1956502 1956503 CJJ81176_0642 CJJ81176_0643     TRUE 0.912 10.000 0.079 NA Y NA
 1956503 1956504 CJJ81176_0643 CJJ81176_0644     TRUE 0.997 -3.000 0.485 0.003 Y NA
 1956504 1956505 CJJ81176_0644 CJJ81176_0645   pstB TRUE 0.996 -3.000 0.402 0.003 Y NA
 1956505 1956506 CJJ81176_0645 CJJ81176_0646 pstB   FALSE 0.198 62.000 0.013 NA   NA
 1956506 1956507 CJJ81176_0646 CJJ81176_0647     TRUE 0.971 -30.000 1.000 NA   NA
 1956507 1956508 CJJ81176_0647 CJJ81176_0648     FALSE 0.176 90.000 0.017 NA   NA
 1956508 1956509 CJJ81176_0648 CJJ81176_0649     TRUE 0.785 -24.000 0.085 NA   NA
 1956509 1956510 CJJ81176_0649 CJJ81176_0650     TRUE 0.656 42.000 0.211 NA   NA
 1956510 1956511 CJJ81176_0650 CJJ81176_0651   hypF TRUE 0.591 -19.000 0.018 NA   NA
 1956511 1956512 CJJ81176_0651 CJJ81176_0652 hypF hypB TRUE 0.871 73.000 0.064 0.015 Y NA
 1956512 1956513 CJJ81176_0652 CJJ81176_0653 hypB hypC TRUE 0.986 0.000 0.463 NA Y NA
 1956513 1956514 CJJ81176_0653 CJJ81176_0654 hypC hypD TRUE 0.894 -16.000 0.123 NA Y NA
 1956514 1956515 CJJ81176_0654 CJJ81176_0655 hypD hypE TRUE 0.839 -3.000 0.019 1.000 Y NA
 1956515 1956516 CJJ81176_0655 CJJ81176_0656 hypE hypA TRUE 0.927 0.000 0.080 1.000   NA
 1956517 1956518 CJJ81176_0657 CJJ81176_0658     TRUE 0.669 63.000 0.002 0.043   NA
 1956518 1956519 CJJ81176_0658 CJJ81176_0659     TRUE 0.682 -7.000 0.024 1.000 N NA
 1956520 1956521 CJJ81176_0660 CJJ81176_0661 ilvC   TRUE 0.837 4.000 0.013 1.000   NA
 1956521 1956522 CJJ81176_0661 CJJ81176_0662   dprA TRUE 0.669 -10.000 0.022 1.000   NA
 1956522 1956523 CJJ81176_0662 CJJ81176_0663 dprA   TRUE 0.856 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 1956523 1956524 CJJ81176_0663 CJJ81176_0664     FALSE 0.303 29.000 0.008 NA N NA
 1956525 1956526 CJJ81176_0665 CJJ81176_0666 msrA ppa FALSE 0.298 41.000 0.006 1.000 N NA
 1956526 1956527 CJJ81176_0666 CJJ81176_0667 ppa adk TRUE 0.720 10.000 0.015 1.000 N NA
 1956527 1956528 CJJ81176_0667 CJJ81176_0668 adk aspS TRUE 0.734 -3.000 0.025 1.000 N NA
 1956529 1956530 CJJ81176_0669 CJJ81176_0670   recN TRUE 0.918 0.000 0.066 1.000 N NA
 1956530 1956531 CJJ81176_0670 CJJ81176_0671 recN   FALSE 0.450 103.000 0.141 1.000 N NA
 1956531 1956532 CJJ81176_0671 CJJ81176_0672     TRUE 0.564 -9.000 0.013 NA N NA
 1956532 1956533 CJJ81176_0672 CJJ81176_0673     TRUE 0.844 0.000 0.028 NA N NA
 1956533 1956534 CJJ81176_0673 CJJ81176_0674   rlpA TRUE 0.889 -13.000 0.115 NA Y NA
 1956534 1956535 CJJ81176_0674 CJJ81176_0675 rlpA   TRUE 0.787 6.000 0.020 NA   NA
 1956535 1956536 CJJ81176_0675 CJJ81176_0676     FALSE 0.262 54.000 0.023 NA   NA
 1956536 1956537 CJJ81176_0676 CJJ81176_0677     TRUE 0.567 -18.000 0.013 NA   NA
 1956537 1956538 CJJ81176_0677 CJJ81176_0678     TRUE 0.759 -3.000 0.041 NA   NA
 1956538 1956539 CJJ81176_0678 CJJ81176_0679     TRUE 0.626 -3.000 0.007 NA   NA
 1956539 1956540 CJJ81176_0679 CJJ81176_0680   pbpC TRUE 0.901 1.000 0.043 NA   NA
 1956541 1956542 CJJ81176_0681 CJJ81176_0682     TRUE 0.807 16.000 0.051 1.000 Y NA
 1956542 1956543 CJJ81176_0682 CJJ81176_0683     TRUE 0.976 -27.000 0.062 0.002   NA
 1956543 1956544 CJJ81176_0683 CJJ81176_0684     FALSE 0.265 171.000 0.062 NA   NA
 1956544 1956545 CJJ81176_0684 CJJ81176_0685     FALSE 0.257 228.000 0.062 NA   NA
 1956545 1956546 CJJ81176_0685 CJJ81176_0686     FALSE 0.279 127.000 0.062 NA   NA
 1956546 1956547 CJJ81176_0686 CJJ81176_0687     TRUE 0.955 -7.000 0.667 NA   NA
 1956547 1956548 CJJ81176_0687 CJJ81176_0688   era FALSE 0.285 38.000 0.015 NA   NA
 1956548 1956549 CJJ81176_0688 CJJ81176_0689 era hslU TRUE 0.812 -3.000 0.051 1.000   NA
 1956549 1956550 CJJ81176_0689 CJJ81176_0690 hslU hslV TRUE 0.983 -3.000 0.752 1.000 Y NA
 1956550 1956551 CJJ81176_0690 CJJ81176_0691 hslV rplI TRUE 0.883 0.000 0.034 1.000 N NA
 1956551 1956552 CJJ81176_0691 CJJ81176_0692 rplI argG TRUE 0.571 13.000 0.009 1.000 N NA
 1956553 1956554 CJJ81176_0693 CJJ81176_0694     TRUE 0.631 -3.000 0.011 NA   NA
 1956554 1956555 CJJ81176_0694 CJJ81176_0695     TRUE 0.694 -16.000 0.039 NA   NA
 1956555 1956556 CJJ81176_0695 CJJ81176_0696   rpoN TRUE 0.900 0.000 0.044 1.000   NA
 1956556 1956557 CJJ81176_0696 CJJ81176_0697 rpoN dcuB FALSE 0.230 164.000 0.033 1.000   NA
 1956557 1956558 CJJ81176_0697 CJJ81176_0698 dcuB   FALSE 0.164 142.000 0.022 NA   NA
 1956558 1956559 CJJ81176_0698 CJJ81176_0699     FALSE 0.252 84.000 0.000 NA   NA
 1956559 1956560 CJJ81176_0699 CJJ81176_0700     TRUE 0.995 10.000 0.201 0.002 Y NA
 1956560 1956561 CJJ81176_0700 CJJ81176_0701     TRUE 0.999 2.000 0.877 0.002 Y NA
 1956561 1956562 CJJ81176_0701 CJJ81176_0702     TRUE 0.978 3.000 0.000 0.095 N NA
 1956564 1956565 CJJ81176_0704 CJJ81176_0705     TRUE 0.956 -10.000 0.714 NA   NA
 1956565 1956566 CJJ81176_0705 CJJ81176_0706     TRUE 0.927 -3.000 0.316 NA   NA
 1956566 1956567 CJJ81176_0706 CJJ81176_0707   priA TRUE 0.569 -18.000 0.016 NA N NA
 1956571 1956572 CJJ81176_0711 CJJ81176_0712 pta ackA TRUE 0.809 14.000 0.040 1.000 Y NA
 1956575 1956576 CJJ81176_0715 CJJ81176_0716   mraW TRUE 0.859 0.000 0.031 NA   NA
 1956577 1956578 CJJ81176_0717 CJJ81176_0718   ftsA TRUE 0.964 3.000 0.184 1.000   NA
 1956578 1956579 CJJ81176_0718 CJJ81176_0719 ftsA ftsZ TRUE 0.862 16.000 0.114 1.000 Y NA
 1956579 1956580 CJJ81176_0719 CJJ81176_0720 ftsZ   FALSE 0.168 156.000 0.002 1.000 N NA
 1956580 1956581 CJJ81176_0720 CJJ81176_0721   flgG TRUE 0.979 29.000 0.377 0.008 Y NA
 1956583 1956584 CJJ81176_0723 CJJ81176_0724     TRUE 0.816 -3.000 0.068 NA   NA
 1956584 1956585 CJJ81176_0724 CJJ81176_0725   purE TRUE 0.869 1.000 0.018 1.000 N NA
 1956585 1956586 CJJ81176_0725 CJJ81176_0726 purE   TRUE 0.703 10.000 0.019 NA   NA
 1956586 1956587 CJJ81176_0726 CJJ81176_0727   glyQ TRUE 0.560 12.000 0.011 NA   NA
 1956587 1956588 CJJ81176_0727 CJJ81176_0728 glyQ   TRUE 0.702 -13.000 0.041 NA   NA
 1956588 1956589 CJJ81176_0728 CJJ81176_0729     TRUE 0.943 10.000 0.342 NA   NA
 1956589 1956590 CJJ81176_0729 CJJ81176_0730   waaA TRUE 0.863 -3.000 0.122 NA   NA
 1956590 1956591 CJJ81176_0730 CJJ81176_0731 waaA   TRUE 0.850 -19.000 0.133 1.000 N NA
 1956591 1956592 CJJ81176_0731 CJJ81176_0732   ffh FALSE 0.221 68.000 0.013 1.000 N NA
 1956592 1956593 CJJ81176_0732 CJJ81176_0733 ffh rpsP TRUE 0.686 65.000 0.361 1.000 N NA
 1956593 1956594 CJJ81176_0733 CJJ81176_0734 rpsP   TRUE 0.980 3.000 0.385 1.000   NA
 1956594 1956595 CJJ81176_0734 CJJ81176_0735   rimM TRUE 0.920 -7.000 0.324 1.000   NA
 1956595 1956596 CJJ81176_0735 CJJ81176_0736 rimM trmD TRUE 0.981 -3.000 0.672 1.000 Y NA
 1956596 1956597 CJJ81176_0736 CJJ81176_0737 trmD rplS TRUE 0.974 11.000 0.567 1.000 Y NA
 1956597 1956598 CJJ81176_0737 CJJ81176_0738 rplS   FALSE 0.173 133.000 0.003 1.000   NA
 1956598 1956599 CJJ81176_0738 CJJ81176_0739     FALSE 0.452 24.000 0.018 1.000   NA
 1956599 1956600 CJJ81176_0739 CJJ81176_0740     TRUE 0.683 -3.000 0.014 1.000 N NA
 1956600 1956601 CJJ81176_0740 CJJ81176_0741   dnaE FALSE 0.151 448.000 0.002 1.000 N NA
 1956602 1956603 CJJ81176_0742 CJJ81176_0743   flaC FALSE 0.280 36.000 0.009 NA   NA
 1956603 1956604 CJJ81176_0743 CJJ81176_0744 flaC   TRUE 0.640 39.000 0.172 NA   NA
 1956604 1956605 CJJ81176_0744 CJJ81176_0745     TRUE 0.645 13.000 0.033 NA   NA
 1956605 1956606 CJJ81176_0745 CJJ81176_0746     TRUE 0.835 -3.000 0.068 1.000 N NA
 1956608 1956609 CJJ81176_0748 CJJ81176_0749 mog corA FALSE 0.447 21.000 0.011 1.000 N NA
 1956610 1956611 CJJ81176_0750 CJJ81176_0751     TRUE 0.803 11.000 0.073 NA   NA
 1956611 1956612 CJJ81176_0751 CJJ81176_0752     TRUE 0.907 0.000 0.065 NA   NA
 1956612 1956613 CJJ81176_0752 CJJ81176_0753     TRUE 0.933 -3.000 0.290 1.000   NA
 1956613 1956614 CJJ81176_0753 CJJ81176_0754     TRUE 0.998 1.000 0.774 0.042   NA
 1956614 1956615 CJJ81176_0754 CJJ81176_0755     TRUE 0.996 4.000 0.360 0.042 Y NA
 1956615 1956616 CJJ81176_0755 CJJ81176_0756     TRUE 0.923 -3.000 0.111 1.000 Y NA
 1956618 1956619 CJJ81176_0758 CJJ81176_0759     TRUE 0.943 22.000 1.000 NA   NA
 1956619 1956620 CJJ81176_0759 CJJ81176_0760     TRUE 0.685 12.000 0.000 NA   NA
 1956620 1956621 CJJ81176_0760 CJJ81176_0761     FALSE 0.192 266.000 0.000 NA   NA
 1956621 1956622 CJJ81176_0761 CJJ81176_0762     FALSE 0.282 66.000 0.000 NA   NA
 1956622 1956623 CJJ81176_0762 CJJ81176_0763     FALSE 0.204 160.000 0.000 NA   NA
 1956623 1956624 CJJ81176_0763 CJJ81176_0764     FALSE 0.238 96.000 0.000 NA   NA
 1956624 1956625 CJJ81176_0764 CJJ81176_0765     FALSE 0.554 19.000 0.000 NA   NA
 1956625 1956626 CJJ81176_0765 CJJ81176_1724   rrsC FALSE 0.188 510.000 0.000 NA   NA
 1956626 1956627 CJJ81176_1724 CJJ81176_1725 rrsC   FALSE 0.231 105.000 0.000 NA   NA
 1956627 1956628 CJJ81176_1725 CJJ81176_1726     TRUE 0.821 9.000 0.000 NA   NA
 1956628 1956629 CJJ81176_1726 CJJ81176_1727   rrlC FALSE 0.187 581.000 0.000 NA   NA
 1956631 1956632 CJJ81176_1728 CJJ81176_0772 rrfC   FALSE 0.194 249.000 0.000 NA   NA
 1956632 1956633 CJJ81176_0772 CJJ81176_0773   hrcA FALSE 0.197 217.000 0.000 NA   NA
 1956633 1956634 CJJ81176_0773 CJJ81176_0774 hrcA grpE TRUE 0.746 -3.000 0.038 NA N NA
 1956634 1956635 CJJ81176_0774 CJJ81176_0775 grpE dnaK TRUE 0.934 23.000 0.029 0.010 Y NA
 1956635 1956636 CJJ81176_0775 CJJ81176_0776 dnaK   FALSE 0.173 139.000 0.002 1.000 N NA
 1956636 1956637 CJJ81176_0776 CJJ81176_0777     TRUE 0.976 -3.000 0.060 0.042 Y NA
 1956637 1956638 CJJ81176_0777 CJJ81176_0778     FALSE 0.234 100.000 0.000 NA   NA
 1956638 1956639 CJJ81176_0778 CJJ81176_0779     TRUE 0.601 16.000 0.000 NA   NA
 1956639 1956640 CJJ81176_0779 CJJ81176_0780     TRUE 0.585 17.000 0.000 NA   NA
 1956640 1956641 CJJ81176_0780 CJJ81176_0781     FALSE 0.238 96.000 0.000 NA   NA
 1956641 1956642 CJJ81176_0781 CJJ81176_0782     FALSE 0.305 70.000 0.045 NA   NA
 1956643 1956644 CJJ81176_0783 CJJ81176_0784 aspC cysE FALSE 0.500 172.000 0.102 1.000 Y NA
 1956644 1956645 CJJ81176_0784 CJJ81176_0785 cysE speA TRUE 0.960 1.000 0.055 1.000 Y NA
 1956645 1956646 CJJ81176_0785 CJJ81176_0786 speA hisS TRUE 0.851 0.000 0.021 1.000 N NA
 1956646 1956647 CJJ81176_0786 CJJ81176_0787 hisS tmk TRUE 0.703 -3.000 0.018 1.000 N NA
 1956647 1956648 CJJ81176_0787 CJJ81176_0788 tmk coaD TRUE 0.719 -9.000 0.034 1.000 N NA
 1956648 1956649 CJJ81176_0788 CJJ81176_0789 coaD   TRUE 0.583 40.000 0.032 1.000 Y NA
 1956649 1956650 CJJ81176_0789 CJJ81176_0790     TRUE 0.894 -3.000 0.191 NA N NA
 1956650 1956651 CJJ81176_0790 CJJ81176_0791     FALSE 0.220 84.000 0.028 NA N NA
 1956651 1956652 CJJ81176_0791 CJJ81176_0792     TRUE 0.989 10.000 1.000 NA Y NA
 1956652 1956653 CJJ81176_0792 CJJ81176_0793     TRUE 0.907 49.000 0.800 NA Y NA
 1956653 1956654 CJJ81176_0793 CJJ81176_0794     FALSE 0.537 192.000 0.154 NA Y NA
 1956654 1956655 CJJ81176_0794 CJJ81176_0795     TRUE 0.976 -3.000 0.511 1.000 Y NA
 1956655 1956656 CJJ81176_0795 CJJ81176_0796   valS TRUE 0.798 5.000 0.007 1.000 N NA
 1956656 1956657 CJJ81176_0796 CJJ81176_0797 valS   FALSE 0.370 23.000 0.005 NA   NA
 1956658 1956659 CJJ81176_0798 CJJ81176_0799     FALSE 0.264 41.000 0.012 NA   NA
 1956659 1956660 CJJ81176_0799 CJJ81176_0800   tpx FALSE 0.153 99.000 0.004 NA   NA
 1956660 1956661 CJJ81176_0800 CJJ81176_0801 tpx napA FALSE 0.220 247.000 0.000 1.000 N NA
 1956661 1956662 CJJ81176_0801 CJJ81176_0802 napA napG TRUE 0.960 18.000 0.270 0.049   NA
 1956662 1956663 CJJ81176_0802 CJJ81176_0803 napG napH TRUE 0.998 0.000 0.795 0.023   NA
 1956663 1956664 CJJ81176_0803 CJJ81176_0804 napH napB TRUE 0.983 0.000 0.385 NA Y NA
 1956664 1956665 CJJ81176_0804 CJJ81176_0805 napB napL TRUE 0.928 5.000 0.132 NA   NA
 1956665 1956666 CJJ81176_0805 CJJ81176_0806 napL napD TRUE 0.845 -7.000 0.139 NA   NA
 1956666 1956667 CJJ81176_0806 CJJ81176_0807 napD   TRUE 0.871 10.000 0.111 NA   NA
 1956667 1956668 CJJ81176_0807 CJJ81176_0808     TRUE 0.708 82.000 0.500 NA   NA
 1956668 1956669 CJJ81176_0808 CJJ81176_0809     TRUE 0.872 -3.000 0.133 NA   NA
 1956669 1956670 CJJ81176_0809 CJJ81176_0810     TRUE 0.906 -31.000 0.325 NA   NA
 1956670 1956671 CJJ81176_0810 CJJ81176_0811   purU TRUE 0.830 -3.000 0.064 1.000 N NA
 1956673 1956674 CJJ81176_0813 CJJ81176_0814     TRUE 0.972 4.000 0.333 1.000   NA
 1956674 1956675 CJJ81176_0814 CJJ81176_0815     TRUE 0.561 119.000 0.333 NA   NA
 1956676 1956677 CJJ81176_0816 CJJ81176_0817     TRUE 0.948 1.000 0.129 NA   NA
 1956677 1956678 CJJ81176_0817 CJJ81176_0818     TRUE 0.913 2.000 0.052 NA   NA
 1956678 1956679 CJJ81176_0818 CJJ81176_0819   ddlA FALSE 0.217 60.000 0.018 NA   NA
 1956679 1956680 CJJ81176_0819 CJJ81176_0820 ddlA ruvA TRUE 0.717 10.000 0.014 1.000 N NA
 1956680 1956681 CJJ81176_0820 CJJ81176_0821 ruvA   TRUE 0.617 -24.000 0.004 1.000   NA
 1956682 1956683 CJJ81176_0822 CJJ81176_0823 mviN cysS TRUE 0.870 0.000 0.027 1.000   NA
 1956683 1956684 CJJ81176_0823 CJJ81176_0824 cysS   TRUE 0.625 -7.000 0.013 1.000 N NA
 1956684 1956685 CJJ81176_0824 CJJ81176_0825   pyrD FALSE 0.369 32.000 0.017 1.000 N NA
 1956685 1956686 CJJ81176_0825 CJJ81176_0826 pyrD   TRUE 0.807 -3.000 0.048 1.000   NA
 1956686 1956687 CJJ81176_0826 CJJ81176_0827   dapA TRUE 0.896 -7.000 0.217 1.000   NA
 1956687 1956688 CJJ81176_0827 CJJ81176_0828 dapA   TRUE 0.962 0.000 0.238 1.000 N NA
 1956689 1956690 CJJ81176_0829 CJJ81176_0830     TRUE 0.685 12.000 0.035 NA   NA
 1956691 1956692 CJJ81176_0831 CJJ81176_0832 nadE lpxK TRUE 0.862 4.000 0.024 1.000 N NA
 1956692 1956693 CJJ81176_0832 CJJ81176_0833 lpxK thrC TRUE 0.673 -3.000 0.009 1.000 N NA
 1956693 1956694 CJJ81176_0833 CJJ81176_0834 thrC kdsB TRUE 0.696 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1956694 1956695 CJJ81176_0834 CJJ81176_0835 kdsB   FALSE 0.245 91.000 0.000 NA   NA
 1956695 1956696 CJJ81176_0835 CJJ81176_0836     FALSE 0.410 94.000 0.125 NA   NA
 1956698 1956699 CJJ81176_0838 CJJ81176_0839 glmU coaBC TRUE 0.694 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1956699 1956700 CJJ81176_0839 CJJ81176_0840 coaBC   TRUE 0.863 3.000 0.024 NA   NA
 1956700 1956701 CJJ81176_0840 CJJ81176_0841   uppS TRUE 0.799 4.000 0.012 NA   NA
 1956701 1956702 CJJ81176_0841 CJJ81176_0842 uppS   TRUE 0.696 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1956702 1956703 CJJ81176_0842 CJJ81176_0843     TRUE 0.893 0.000 0.039 1.000   NA
 1956703 1956704 CJJ81176_0843 CJJ81176_0844   truA TRUE 0.825 -3.000 0.059 1.000   NA
 1956705 1956706 CJJ81176_0845 CJJ81176_0846 ilvA   TRUE 0.857 0.000 0.030 NA   NA
 1956708 1956709 CJJ81176_0848 CJJ81176_0849 trmA   TRUE 0.816 -3.000 0.056 1.000 N NA
 1956709 1956710 CJJ81176_0849 CJJ81176_0850     TRUE 0.804 -3.000 0.047 1.000   NA
 1956710 1956711 CJJ81176_0850 CJJ81176_0851     TRUE 0.707 -3.000 0.018 1.000   NA
 1956711 1956712 CJJ81176_0851 CJJ81176_0852   acnB FALSE 0.233 60.000 0.010 1.000   NA
 1956714 1956715 CJJ81176_0854 CJJ81176_0855   metS TRUE 0.904 4.000 0.046 1.000   NA
 1956715 1956716 CJJ81176_0855 CJJ81176_0856 metS   TRUE 0.728 10.000 0.024 NA   NA
 1956716 1956717 CJJ81176_0856 CJJ81176_0857   fbp TRUE 0.907 26.000 0.778 NA   NA
 1956717 1956718 CJJ81176_0857 CJJ81176_0858 fbp mobB TRUE 0.856 2.000 0.005 1.000 N NA
 1956718 1956719 CJJ81176_0858 CJJ81176_0859 mobB   FALSE 0.183 478.000 0.000 NA N NA
 1956719 1956720 CJJ81176_0859 CJJ81176_0860     TRUE 0.828 -3.000 0.080 NA   NA
 1956720 1956721 CJJ81176_0860 CJJ81176_0861   gltX-1 TRUE 0.942 3.000 0.088 1.000   NA
 1956722 1956723 CJJ81176_0862 CJJ81176_0863   psd TRUE 0.856 -3.000 0.089 1.000   NA
 1956724 1956725 CJJ81176_0864 CJJ81176_0865     TRUE 0.779 -3.000 0.000 1.000   NA
 1956725 1956726 CJJ81176_0865 CJJ81176_0866     TRUE 0.735 -7.000 0.000 1.000   NA
 1956726 1956727 CJJ81176_0866 CJJ81176_0867     TRUE 0.904 -22.000 0.318 NA   NA
 1956727 1956728 CJJ81176_0867 CJJ81176_0868     TRUE 0.962 0.000 0.269 NA   NA
 1956728 1956729 CJJ81176_0868 CJJ81176_0869   hemL TRUE 0.653 111.000 0.462 NA   NA
 1956729 1956730 CJJ81176_0869 CJJ81176_0870 hemL   TRUE 0.916 -3.000 0.212 1.000   NA
 1956731 1956732 CJJ81176_0871 CJJ81176_0872 folD lepB TRUE 0.889 10.000 0.117 1.000 N NA
 1956733 1956734 CJJ81176_0873 CJJ81176_0874   murA TRUE 0.730 -3.000 0.024 1.000 N NA
 1956734 1956735 CJJ81176_0874 CJJ81176_0875 murA   FALSE 0.188 66.000 0.004 NA   NA
 1956737 1956738 CJJ81176_0877 CJJ81176_0878 pabA pabB TRUE 0.979 -3.000 0.048 0.015 Y NA
 1956738 1956739 CJJ81176_0878 CJJ81176_0879 pabB   TRUE 0.607 -10.000 0.009 1.000 N NA
 1956740 1956741 CJJ81176_0880 CJJ81176_0881 dsbA dsbB TRUE 0.909 12.000 0.333 NA   NA
 1956741 1956742 CJJ81176_0881 CJJ81176_0882 dsbB   FALSE 0.480 88.000 0.143 1.000   NA
 1956742 1956743 CJJ81176_0882 CJJ81176_0883     TRUE 0.557 56.000 0.143 1.000   NA
 1956744 1956745 CJJ81176_0884 CJJ81176_0885     TRUE 0.781 64.000 0.000 0.013   NA
 1956747 1956748 CJJ81176_0887 CJJ81176_0888     TRUE 0.924 -3.000 0.294 NA   NA
 1956748 1956749 CJJ81176_0888 CJJ81176_0889     TRUE 0.851 -16.000 0.154 NA   NA
 1956749 1956750 CJJ81176_0889 CJJ81176_0890   flhA TRUE 0.912 9.000 0.106 1.000   NA
 1956750 1956751 CJJ81176_0890 CJJ81176_0891 flhA   FALSE 0.525 26.000 0.053 NA N NA
 1956753 1956754 CJJ81176_0893 CJJ81176_0894     FALSE 0.454 110.000 0.145 1.000   NA
 1956755 1956756 CJJ81176_1729 CJJ81176_1730     TRUE 0.722 11.000 0.000 NA   NA
 1956757 1956758 CJJ81176_0897 CJJ81176_0898     TRUE 0.830 4.000 0.007 1.000   NA
 1956758 1956759 CJJ81176_0898 CJJ81176_0899     TRUE 0.941 -6.000 0.231 1.000 Y NA
 1956759 1956760 CJJ81176_0899 CJJ81176_0900   serA TRUE 0.604 -13.000 0.006 1.000 N NA
 1956760 1956761 CJJ81176_0900 CJJ81176_0901 serA   TRUE 0.700 -3.000 0.025 NA   NA
 1956761 1956762 CJJ81176_0901 CJJ81176_0902   rpsA TRUE 0.969 0.000 0.343 NA   NA
 1956762 1956763 CJJ81176_0902 CJJ81176_0903 rpsA ispH FALSE 0.389 132.000 0.118 1.000 N NA
 1956763 1956764 CJJ81176_0903 CJJ81176_0904 ispH aroA TRUE 0.707 -10.000 0.032 1.000 N NA
 1956764 1956765 CJJ81176_0904 CJJ81176_0905 aroA pheT TRUE 0.687 12.000 0.028 1.000 N NA
 1956765 1956766 CJJ81176_0905 CJJ81176_0906 pheT pheS TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.001 Y NA
 1956768 1956769 CJJ81176_0908 CJJ81176_0909 thiJ   TRUE 0.577 -7.000 0.012 NA   NA
 1956770 1956771 CJJ81176_0910 CJJ81176_0911     TRUE 0.898 -7.000 0.096 1.000 Y NA
 1956772 1956773 CJJ81176_0912 CJJ81176_0913     FALSE 0.175 104.000 0.009 1.000 N NA
 1956773 1956774 CJJ81176_0913 CJJ81176_0914   alr TRUE 0.851 3.000 0.005 1.000 N NA
 1956774 1956775 CJJ81176_0914 CJJ81176_0915 alr   TRUE 0.856 1.000 0.021 NA   NA
 1956776 1956777 CJJ81176_0916 CJJ81176_0917     FALSE 0.265 86.000 0.042 NA   NA
 1956777 1956778 CJJ81176_0917 CJJ81176_0918     TRUE 0.912 4.000 0.069 NA   NA
 1956778 1956779 CJJ81176_0918 CJJ81176_0919     TRUE 0.896 -3.000 0.192 NA   NA
 1956780 1956781 CJJ81176_0920 CJJ81176_1731 cysK hup FALSE 0.180 263.000 0.024 1.000 N NA
 1956781 1956782 CJJ81176_1731 CJJ81176_0921 hup ciaB FALSE 0.489 102.000 0.167 1.000   NA
 1956784 1956785 CJJ81176_0923 CJJ81176_0924   cstA TRUE 0.880 -22.000 0.229 NA   NA
 1956785 1956786 CJJ81176_0924 CJJ81176_0925 cstA prsA FALSE 0.159 167.000 0.014 1.000 N NA
 1956786 1956787 CJJ81176_0925 CJJ81176_0926 prsA   FALSE 0.385 108.000 0.029 1.000 Y NA
 1956787 1956788 CJJ81176_0926 CJJ81176_0927     TRUE 0.997 11.000 0.947 0.013 Y NA
 1956788 1956789 CJJ81176_0927 CJJ81176_0928   pebA TRUE 0.997 2.000 0.400 0.040 Y NA
 1956789 1956790 CJJ81176_0928 CJJ81176_0929 pebA pebC TRUE 0.942 22.000 0.594 1.000 Y NA
 1956790 1956791 CJJ81176_0929 CJJ81176_0930 pebC cheR FALSE 0.423 136.000 0.143 1.000 N NA
 1956791 1956792 CJJ81176_0930 CJJ81176_0931 cheR cheB TRUE 0.820 16.000 0.154 1.000   NA
 1956793 1956794 CJJ81176_0932 CJJ81176_1732 rpiB   TRUE 0.926 0.000 0.103 NA   NA
 1956794 1956795 CJJ81176_1732 CJJ81176_0934   apt TRUE 0.715 -3.000 0.028 NA   NA
 1956795 1956796 CJJ81176_0934 CJJ81176_0935 apt   FALSE 0.503 19.000 0.026 NA   NA
 1956796 1956797 CJJ81176_0935 CJJ81176_0936     TRUE 0.914 -3.000 0.250 NA   NA
 1956797 1956798 CJJ81176_0936 CJJ81176_0937     TRUE 0.740 -3.000 0.026 1.000 N NA
 1956799 1956800 CJJ81176_0938 CJJ81176_0939 argH pckA TRUE 0.706 10.000 0.006 1.000 N NA
 1956800 1956801 CJJ81176_0939 CJJ81176_0940 pckA   TRUE 0.763 13.000 0.016 1.000 Y NA
 1956801 1956802 CJJ81176_0940 CJJ81176_0941     TRUE 0.614 33.000 0.100 1.000   NA
 1956802 1956803 CJJ81176_0941 CJJ81176_0942     TRUE 0.992 13.000 0.444 0.002   NA
 1956804 1956805 CJJ81176_0943 CJJ81176_1733 atpE   FALSE 0.398 37.000 0.000 NA   NA
 1956805 1956806 CJJ81176_1733 CJJ81176_0945     FALSE 0.187 603.000 0.000 NA   NA
 1956806 1956807 CJJ81176_0945 CJJ81176_0946     FALSE 0.191 317.000 0.000 NA   NA
 1956807 1956808 CJJ81176_0946 CJJ81176_0947     TRUE 0.945 4.000 0.148 NA   NA
 1956809 1956810 CJJ81176_0948 CJJ81176_0949     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 1956810 1956811 CJJ81176_0949 CJJ81176_0950     TRUE 0.632 14.000 0.000 NA   NA
 1956811 1956812 CJJ81176_0950 CJJ81176_0951     TRUE 0.617 15.000 0.000 NA   NA
 1956812 1956813 CJJ81176_0951 CJJ81176_0952     FALSE 0.340 49.000 0.000 NA   NA
 1956813 1956814 CJJ81176_0952 CJJ81176_0953     FALSE 0.192 284.000 0.000 NA   NA
 1956816 1956817 CJJ81176_0955 CJJ81176_0956 aas   FALSE 0.247 45.000 0.011 NA   NA
 1956817 1956818 CJJ81176_0956 CJJ81176_1734     FALSE 0.281 67.000 0.000 NA   NA
 1956818 1956819 CJJ81176_1734 CJJ81176_1735     FALSE 0.326 52.000 0.000 NA   NA
 1956819 1956820 CJJ81176_1735 CJJ81176_1736     TRUE 0.834 7.000 0.000 NA   NA
 1956820 1956821 CJJ81176_1736 CJJ81176_1737     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 1956821 1956822 CJJ81176_1737 CJJ81176_1738     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 1956822 1956823 CJJ81176_1738 CJJ81176_1739     FALSE 0.326 52.000 0.000 NA   NA
 1956823 1956824 CJJ81176_1739 CJJ81176_1740     TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 1956824 1956825 CJJ81176_1740 CJJ81176_0964     FALSE 0.291 62.000 0.000 NA   NA
 1956825 1956826 CJJ81176_0964 CJJ81176_0965     FALSE 0.431 23.000 0.015 1.000 N NA
 1956826 1956827 CJJ81176_0965 CJJ81176_0966   secA TRUE 0.975 -3.000 0.201 0.089 N NA
 1956829 1956830 CJJ81176_0968 CJJ81176_0969     TRUE 0.963 10.000 0.529 NA   NA
 1956832 1956833 CJJ81176_0971 CJJ81176_0972     TRUE 0.720 -3.000 0.020 1.000   NA
 1956833 1956834 CJJ81176_0972 CJJ81176_0973     TRUE 0.696 -3.000 0.025 NA N NA
 1956834 1956835 CJJ81176_0973 CJJ81176_0974     FALSE 0.197 99.000 0.026 NA N NA
 1956835 1956836 CJJ81176_0974 CJJ81176_0975     TRUE 0.963 10.000 0.556 NA N NA
 1956836 1956837 CJJ81176_0975 CJJ81176_0976   purH FALSE 0.185 99.000 0.003 1.000 N NA
 1956837 1956838 CJJ81176_0976 CJJ81176_0977 purH   TRUE 0.849 3.000 0.005 1.000 N NA
 1956838 1956839 CJJ81176_0977 CJJ81176_0978   purL FALSE 0.162 129.000 0.011 1.000 N NA
 1956839 1956840 CJJ81176_0978 CJJ81176_0979 purL trmE TRUE 0.653 11.000 0.008 1.000   NA
 1956840 1956841 CJJ81176_0979 CJJ81176_0980 trmE   TRUE 0.734 -7.000 0.049 NA   NA
 1956841 1956842 CJJ81176_0980 CJJ81176_0981     TRUE 0.904 4.000 0.061 NA   NA
 1956842 1956843 CJJ81176_0981 CJJ81176_0982     TRUE 0.950 -3.000 0.461 NA   NA
 1956843 1956844 CJJ81176_0982 CJJ81176_0983   rnpA TRUE 0.957 -3.000 0.540 NA   NA
 1956844 1956845 CJJ81176_0983 CJJ81176_0984 rnpA rpmH TRUE 0.974 -3.000 0.787 1.000   NA
 1956846 1956847 CJJ81176_0985 CJJ81176_0986     TRUE 0.649 27.000 0.102 1.000   NA
 1956847 1956848 CJJ81176_0986 CJJ81176_0987     TRUE 0.747 36.000 0.323 NA   NA
 1956850 1956851 CJJ81176_0990 CJJ81176_0991     TRUE 0.893 2.000 0.000 NA   NA
 1956851 1956852 CJJ81176_0991 CJJ81176_0992     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1956852 1956853 CJJ81176_0992 CJJ81176_0993     FALSE 0.434 30.000 0.000 NA   NA
 1956853 1956854 CJJ81176_0993 CJJ81176_1741     FALSE 0.360 45.000 0.000 NA   NA
 1956854 1956855 CJJ81176_1741 CJJ81176_1742     FALSE 0.189 386.000 0.000 NA   NA
 1956855 1956856 CJJ81176_1742 CJJ81176_1743     FALSE 0.237 97.000 0.000 NA   NA
 1956856 1956857 CJJ81176_1743 CJJ81176_1744     FALSE 0.193 262.000 0.000 NA   NA
 1956857 1956858 CJJ81176_1744 CJJ81176_0995     FALSE 0.137 111.000 0.006 NA N NA
 1956858 1956859 CJJ81176_0995 CJJ81176_0996     FALSE 0.317 73.000 0.053 NA N NA
 1956860 1956861 CJJ81176_0997 CJJ81176_0998     TRUE 0.959 9.000 0.375 NA   NA
 1956863 1956864 CJJ81176_1000 CJJ81176_1001 cjaB cjaA TRUE 0.823 40.000 0.049 0.039 N NA
 1956865 1956866 CJJ81176_1002 CJJ81176_1003 jlpA   FALSE 0.156 92.000 0.009 NA   NA
 1956867 1956868 CJJ81176_1004 CJJ81176_1005 hipO   TRUE 0.975 2.000 0.333 NA   NA
 1956868 1956869 CJJ81176_1005 CJJ81176_1006     FALSE 0.195 234.000 0.000 NA   NA
 1956871 1956872 CJJ81176_1008 CJJ81176_1009     TRUE 0.794 -3.000 0.056 NA   NA
 1956872 1956873 CJJ81176_1009 CJJ81176_1010   hemN TRUE 0.997 2.000 0.419 0.022 N NA
 1956873 1956874 CJJ81176_1010 CJJ81176_1011 hemN   TRUE 0.929 -13.000 0.419 NA   NA
 1956874 1956875 CJJ81176_1011 CJJ81176_1012   argF TRUE 0.703 -3.000 0.025 NA   NA
 1956875 1956876 CJJ81176_1012 CJJ81176_1013 argF hemB TRUE 0.712 -3.000 0.020 1.000 N NA
 1956877 1956878 CJJ81176_1014 CJJ81176_1015 ribA gidB TRUE 0.864 1.000 0.017 1.000 N NA
 1956879 1956880 CJJ81176_1016 CJJ81176_1017     FALSE 0.182 95.000 0.020 NA   NA
 1956881 1956882 CJJ81176_1018 CJJ81176_1019   rpoD TRUE 0.802 80.000 0.006 0.009 Y NA
 1956883 1956884 CJJ81176_1020 CJJ81176_1021 sixA   TRUE 0.756 -3.000 0.040 NA   NA
 1956886 1956887 CJJ81176_1023 CJJ81176_1024     TRUE 0.921 4.000 0.067 1.000 N NA
 1956887 1956888 CJJ81176_1024 CJJ81176_1025     TRUE 0.828 -3.000 0.063 1.000 N NA
 1956888 1956889 CJJ81176_1025 CJJ81176_1026   aroB TRUE 0.786 -3.000 0.041 1.000 N NA
 1956889 1956890 CJJ81176_1026 CJJ81176_1027 aroB   FALSE 0.378 46.000 0.031 1.000   NA
 1956891 1956892 CJJ81176_1028 CJJ81176_1029 tgt   TRUE 0.983 2.000 0.444 1.000 N NA
 1956892 1956893 CJJ81176_1029 CJJ81176_1745     FALSE 0.320 53.000 0.000 NA   NA
 1956894 1956895 CJJ81176_1031 CJJ81176_1032     TRUE 0.979 1.000 0.400 NA   NA
 1956895 1956896 CJJ81176_1032 CJJ81176_1033   livF TRUE 0.857 18.000 0.280 1.000 N NA
 1956896 1956897 CJJ81176_1033 CJJ81176_1034 livF livG TRUE 0.991 -16.000 0.381 0.020 Y NA
 1956897 1956898 CJJ81176_1034 CJJ81176_1035 livG livM TRUE 0.946 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1956898 1956899 CJJ81176_1035 CJJ81176_1036 livM livH TRUE 0.998 0.000 0.771 0.039 Y NA
 1956899 1956900 CJJ81176_1036 CJJ81176_1037 livH   TRUE 0.795 19.000 0.085 NA Y NA
 1956900 1956901 CJJ81176_1037 CJJ81176_1038     TRUE 0.965 22.000 1.000 NA Y NA
 1956901 1956902 CJJ81176_1038 CJJ81176_1039     TRUE 0.760 31.000 0.312 NA N NA
 1956902 1956903 CJJ81176_1039 CJJ81176_1040     TRUE 0.943 9.000 0.250 NA   NA
 1956903 1956904 CJJ81176_1040 CJJ81176_1041     FALSE 0.403 52.000 0.062 NA   NA
 1956904 1956905 CJJ81176_1041 CJJ81176_1042   asd TRUE 0.784 9.000 0.025 NA   NA
 1956905 1956906 CJJ81176_1042 CJJ81176_1043 asd   TRUE 0.861 0.000 0.025 1.000 N NA
 1956906 1956907 CJJ81176_1043 CJJ81176_1044     TRUE 0.578 57.000 0.205 NA   NA
 1956907 1956908 CJJ81176_1044 CJJ81176_1045     TRUE 0.800 108.000 0.900 NA   NA
 1956908 1956909 CJJ81176_1045 CJJ81176_1046   gyrA FALSE 0.181 69.000 0.008 NA   NA
 1956909 1956910 CJJ81176_1046 CJJ81176_1047 gyrA ctsW FALSE 0.306 41.000 0.007 1.000   NA
 1956910 1956911 CJJ81176_1047 CJJ81176_1048 ctsW mapA TRUE 0.883 -3.000 0.152 NA   NA
 1956911 1956912 CJJ81176_1048 CJJ81176_1049 mapA lepA FALSE 0.184 77.000 0.003 NA   NA
 1956913 1956914 CJJ81176_1050 CJJ81176_1051     TRUE 0.912 -3.000 0.207 1.000 N NA
 1956914 1956915 CJJ81176_1051 CJJ81176_1052     TRUE 0.994 3.000 0.844 NA Y NA
 1956916 1956917 CJJ81176_1053 CJJ81176_1054     TRUE 0.882 1.000 0.022 1.000   NA
 1956917 1956918 CJJ81176_1054 CJJ81176_1055     TRUE 0.809 0.000 0.016 NA   NA
 1956918 1956919 CJJ81176_1055 CJJ81176_1056   accC-1 TRUE 0.974 4.000 0.400 NA   NA
 1956920 1956921 CJJ81176_1057 CJJ81176_1058   murG TRUE 0.966 -3.000 0.647 1.000 N NA
 1956922 1956923 CJJ81176_1059 CJJ81176_1060     TRUE 0.686 -37.000 0.000 NA   NA
 1956923 1956924 CJJ81176_1060 CJJ81176_1061     TRUE 0.685 -22.000 0.000 NA   NA
 1956924 1956925 CJJ81176_1061 CJJ81176_1062     FALSE 0.252 84.000 0.000 NA   NA
 1956925 1956926 CJJ81176_1062 CJJ81176_1063     TRUE 0.665 63.000 0.357 NA   NA
 1956926 1956927 CJJ81176_1063 CJJ81176_1064     TRUE 0.758 -3.000 0.031 1.000 N NA
 1956927 1956928 CJJ81176_1064 CJJ81176_1065   thiH TRUE 0.987 -10.000 0.128 0.004 Y NA
 1956928 1956929 CJJ81176_1065 CJJ81176_1066 thiH thiG TRUE 0.998 3.000 0.277 0.004 Y NA
 1956929 1956930 CJJ81176_1066 CJJ81176_1067 thiG thiF TRUE 0.986 3.000 0.054 0.031   NA
 1956930 1956931 CJJ81176_1067 CJJ81176_1068 thiF thiS TRUE 0.942 -3.000 0.346 1.000   NA
 1956931 1956932 CJJ81176_1068 CJJ81176_1069 thiS dapE TRUE 0.707 10.000 0.005 1.000 N NA
 1956932 1956933 CJJ81176_1069 CJJ81176_1070 dapE   TRUE 0.922 4.000 0.018 1.000 Y NA
 1956933 1956934 CJJ81176_1070 CJJ81176_1071     TRUE 0.938 -7.000 0.417 1.000 N NA
 1956934 1956935 CJJ81176_1071 CJJ81176_1072   mutS TRUE 0.752 -3.000 0.029 1.000 N NA
 1956935 1956936 CJJ81176_1072 CJJ81176_1073 mutS   TRUE 0.883 -7.000 0.217 NA   NA
 1956936 1956937 CJJ81176_1073 CJJ81176_1074   murC TRUE 0.582 -7.000 0.014 NA   NA
 1956937 1956938 CJJ81176_1074 CJJ81176_1075 murC   FALSE 0.401 67.000 0.002 1.000 Y NA
 1956938 1956939 CJJ81176_1075 CJJ81176_1076     TRUE 0.757 12.000 0.049 1.000   NA
 1956939 1956940 CJJ81176_1076 CJJ81176_1077     TRUE 0.726 -7.000 0.032 1.000   NA
 1956940 1956941 CJJ81176_1077 CJJ81176_1078   guaB TRUE 0.680 -3.000 0.007 1.000   NA
 1956941 1956942 CJJ81176_1078 CJJ81176_1079 guaB gatA TRUE 0.789 10.000 0.032 1.000 N NA
 1956942 1956943 CJJ81176_1079 CJJ81176_1080 gatA ileS FALSE 0.325 101.000 0.008 1.000 Y NA
 1956944 1956945 CJJ81176_1081 CJJ81176_1082     TRUE 0.811 12.000 0.111 NA   NA
 1956945 1956946 CJJ81176_1082 CJJ81176_1083     FALSE 0.479 64.000 0.111 1.000   NA
 1956946 1956947 CJJ81176_1083 CJJ81176_1084     TRUE 0.996 0.000 0.333 0.026 Y NA
 1956947 1956948 CJJ81176_1084 CJJ81176_1085   pgsA FALSE 0.167 125.000 0.003 1.000 N NA
 1956948 1956949 CJJ81176_1085 CJJ81176_1086 pgsA   TRUE 0.935 -3.000 0.023 0.065 N NA
 1956949 1956950 CJJ81176_1086 CJJ81176_1087     TRUE 0.593 -7.000 0.002 NA   NA
 1956950 1956951 CJJ81176_1087 CJJ81176_1088   rpsF FALSE 0.178 87.000 0.002 NA   NA
 1956951 1956952 CJJ81176_1088 CJJ81176_1089 rpsF ssb TRUE 0.838 9.000 0.033 1.000 N NA
 1956952 1956953 CJJ81176_1089 CJJ81176_1090 ssb rpsR TRUE 0.749 11.000 0.034 1.000 N NA
 1956954 1956955 CJJ81176_1091 CJJ81176_1092 lon   TRUE 0.664 17.000 0.062 NA   NA
 1956956 1956957 CJJ81176_1093 CJJ81176_1094   proC TRUE 0.914 0.000 0.075 NA   NA
 1956957 1956958 CJJ81176_1094 CJJ81176_1095 proC ctsT TRUE 0.824 -3.000 0.075 NA   NA
 1956958 1956959 CJJ81176_1095 CJJ81176_1096 ctsT   TRUE 0.971 -3.000 0.800 NA   NA
 1956959 1956960 CJJ81176_1096 CJJ81176_1097     TRUE 0.978 -3.000 1.000 NA   NA
 1956961 1956962 CJJ81176_1098 CJJ81176_1099 hemD thiE TRUE 0.829 -22.000 0.032 1.000 Y NA
 1956962 1956963 CJJ81176_1099 CJJ81176_1100 thiE thiD TRUE 0.984 -10.000 0.079 0.004 Y NA
 1956963 1956964 CJJ81176_1100 CJJ81176_1101 thiD   TRUE 0.689 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1956964 1956965 CJJ81176_1101 CJJ81176_1102     TRUE 0.710 -3.000 0.018 1.000   NA
 1956965 1956966 CJJ81176_1102 CJJ81176_1103   mfd TRUE 0.858 2.000 0.006 1.000   NA
 1956966 1956967 CJJ81176_1103 CJJ81176_1104 mfd   TRUE 0.830 0.000 0.023 NA N NA
 1956967 1956968 CJJ81176_1104 CJJ81176_1105     TRUE 0.916 -63.000 0.178 NA Y NA
 1956968 1956969 CJJ81176_1105 CJJ81176_1106   folC TRUE 0.709 -13.000 0.032 1.000 N NA
 1956969 1956970 CJJ81176_1106 CJJ81176_1107 folC   TRUE 0.829 -22.000 0.104 1.000   NA
 1956970 1956971 CJJ81176_1107 CJJ81176_1108     TRUE 0.933 -16.000 0.455 NA   NA
 1956971 1956972 CJJ81176_1108 CJJ81176_1109   leuS FALSE 0.190 165.000 0.031 NA   NA
 1956972 1956973 CJJ81176_1109 CJJ81176_1110 leuS secF TRUE 0.705 10.000 0.008 1.000 N NA
 1956973 1956974 CJJ81176_1110 CJJ81176_1111 secF secD TRUE 0.998 0.000 0.436 0.002 Y NA
 1956974 1956975 CJJ81176_1111 CJJ81176_1112 secD yajC TRUE 0.868 -7.000 0.068 NA Y NA
 1956978 1956979 CJJ81176_1115 CJJ81176_1116   pyrB TRUE 0.708 10.000 0.005 1.000 N NA
 1956979 1956980 CJJ81176_1116 CJJ81176_1117 pyrB pepF TRUE 0.827 4.000 0.005 1.000 N NA
 1956980 1956981 CJJ81176_1117 CJJ81176_1118 pepF   TRUE 0.828 -6.000 0.115 NA   NA
 1956981 1956982 CJJ81176_1118 CJJ81176_1119     TRUE 0.708 -3.000 0.026 NA   NA
 1956982 1956983 CJJ81176_1119 CJJ81176_1120   truB TRUE 0.797 -3.000 0.046 1.000 N NA
 1956983 1956984 CJJ81176_1120 CJJ81176_1121 truB csrA TRUE 0.956 -6.000 0.046 0.022 N NA
 1956984 1956985 CJJ81176_1121 CJJ81176_1122 csrA ispE TRUE 0.777 -3.000 0.036 1.000 N NA
 1956985 1956986 CJJ81176_1122 CJJ81176_1123 ispE smpB TRUE 0.749 -3.000 0.028 1.000 N NA
 1956986 1956987 CJJ81176_1123 CJJ81176_1124 smpB   TRUE 0.654 11.000 0.009 1.000   NA
 1956987 1956988 CJJ81176_1124 CJJ81176_1125     TRUE 0.837 0.000 0.024 NA   NA
 1956988 1956989 CJJ81176_1125 CJJ81176_1126   clpA TRUE 0.960 -3.000 0.596 NA   NA
 1956989 1956990 CJJ81176_1126 CJJ81176_1127 clpA aat TRUE 0.887 -25.000 0.087 1.000 Y NA
 1956991 1956992 CJJ81176_1128 CJJ81176_1129     TRUE 0.580 82.000 0.286 NA N NA
 1956992 1956993 CJJ81176_1129 CJJ81176_1130   msrB TRUE 0.627 15.000 0.041 NA N NA
 1956995 1956996 CJJ81176_1132 CJJ81176_1133 pssA   TRUE 0.977 10.000 0.466 1.000 Y NA
 1956996 1956997 CJJ81176_1133 CJJ81176_1134   ftsH TRUE 0.790 -3.000 0.043 1.000 N NA
 1956997 1956998 CJJ81176_1134 CJJ81176_1135 ftsH   TRUE 0.961 4.000 0.217 1.000 N NA
 1956998 1956999 CJJ81176_1135 CJJ81176_1136   cheY TRUE 0.740 23.000 0.146 1.000 N NA
 1956999 1957000 CJJ81176_1136 CJJ81176_1137 cheY pglG FALSE 0.324 113.000 0.062 1.000   NA
 1957000 1957001 CJJ81176_1137 CJJ81176_1138 pglG pglF TRUE 0.964 0.000 0.242 1.000   NA
 1957001 1957002 CJJ81176_1138 CJJ81176_1139 pglF pglE TRUE 0.975 2.000 0.133 1.000 Y NA
 1957002 1957003 CJJ81176_1139 CJJ81176_1140 pglE pglD FALSE 0.359 98.000 0.070 1.000   NA
 1957003 1957004 CJJ81176_1140 CJJ81176_1141 pglD pglC TRUE 0.775 -34.000 0.074 NA   NA
 1957004 1957005 CJJ81176_1141 CJJ81176_1142 pglC pglA TRUE 0.903 -7.000 0.128 NA Y NA
 1957005 1957006 CJJ81176_1142 CJJ81176_1143 pglA pglB TRUE 0.824 10.000 0.045 1.000   NA
 1957006 1957007 CJJ81176_1143 CJJ81176_1144 pglB pglJ TRUE 0.975 4.000 0.375 1.000   NA
 1957007 1957008 CJJ81176_1144 CJJ81176_1145 pglJ pglI TRUE 0.924 -12.000 0.208 NA Y NA
 1957008 1957009 CJJ81176_1145 CJJ81176_1146 pglI pglH TRUE 0.937 -7.000 0.267 NA Y NA
 1957009 1957010 CJJ81176_1146 CJJ81176_1147 pglH wlaB TRUE 0.904 -3.000 0.179 1.000 N NA
 1957010 1957011 CJJ81176_1147 CJJ81176_1148 wlaB galE TRUE 0.822 -6.000 0.086 1.000 N NA
 1957011 1957012 CJJ81176_1148 CJJ81176_1149 galE wlaX FALSE 0.450 59.000 0.086 1.000 N NA
 1957013 1957014 CJJ81176_1150 CJJ81176_1151 waaC waaM TRUE 0.937 -10.000 0.231 1.000 Y NA
 1957014 1957015 CJJ81176_1151 CJJ81176_1152 waaM   TRUE 0.890 -3.000 0.050 1.000 Y NA
 1957015 1957016 CJJ81176_1152 CJJ81176_1153     TRUE 0.819 -9.000 0.000 NA Y NA
 1957016 1957017 CJJ81176_1153 CJJ81176_1154     FALSE 0.191 305.000 0.000 NA   NA
 1957018 1957019 CJJ81176_1155 CJJ81176_1156     TRUE 0.831 8.000 0.000 NA   NA
 1957020 1957021 CJJ81176_1157 CJJ81176_1158     TRUE 0.915 1.000 0.056 NA   NA
 1957021 1957022 CJJ81176_1158 CJJ81176_1159     TRUE 0.929 -3.000 0.124 1.000 Y NA
 1957022 1957023 CJJ81176_1159 CJJ81176_1160     TRUE 0.580 -7.000 0.013 NA   NA
 1957023 1957024 CJJ81176_1160 CJJ81176_1161     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957024 1957025 CJJ81176_1161 CJJ81176_1162     FALSE 0.248 123.000 0.000 1.000   NA
 1957028 1957029 CJJ81176_1165 CJJ81176_1166   gmhA-1 TRUE 0.844 0.000 0.019 1.000 N NA
 1957029 1957030 CJJ81176_1166 CJJ81176_1167 gmhA-1 hldE TRUE 0.888 -3.000 0.142 1.000 N NA
 1957030 1957031 CJJ81176_1167 CJJ81176_1168 hldE waaD TRUE 0.981 -7.000 0.096 0.011 Y NA
 1957031 1957032 CJJ81176_1168 CJJ81176_1169 waaD   TRUE 0.943 1.000 0.093 1.000 N NA
 1957034 1957035 CJJ81176_1171 CJJ81176_1172     TRUE 0.980 -3.000 0.713 NA Y NA
 1957036 1957037 CJJ81176_1173 CJJ81176_1174 rho dnaX TRUE 0.826 4.000 0.009 1.000 N NA
 1957038 1957039 CJJ81176_1746 CJJ81176_1176     FALSE 0.289 72.000 0.042 NA   NA
 1957039 1957040 CJJ81176_1176 CJJ81176_1177     TRUE 0.869 0.000 0.000 NA   NA
 1957040 1957041 CJJ81176_1177 CJJ81176_1178     FALSE 0.540 20.000 0.000 NA   NA
 1957041 1957042 CJJ81176_1178 CJJ81176_1179     FALSE 0.333 75.000 0.059 NA   NA
 1957042 1957043 CJJ81176_1179 CJJ81176_1180     FALSE 0.282 70.000 0.037 NA   NA
 1957043 1957044 CJJ81176_1180 CJJ81176_1181     TRUE 0.829 -3.000 0.083 NA   NA
 1957046 1957047 CJJ81176_1183 CJJ81176_1184     FALSE 0.281 80.000 0.043 NA   NA
 1957047 1957048 CJJ81176_1184 CJJ81176_1185     TRUE 0.799 11.000 0.070 NA   NA
 1957048 1957049 CJJ81176_1185 CJJ81176_1186   ppiB FALSE 0.136 164.000 0.015 NA   NA
 1957049 1957050 CJJ81176_1186 CJJ81176_1187 ppiB   TRUE 0.666 10.000 0.010 NA   NA
 1957051 1957052 CJJ81176_1188 CJJ81176_1189     TRUE 0.998 0.000 0.869 0.064 Y NA
 1957053 1957054 CJJ81176_1190 CJJ81176_1191 argS   TRUE 0.606 12.000 0.011 1.000 N NA
 1957054 1957055 CJJ81176_1191 CJJ81176_1192     TRUE 0.854 2.000 0.009 1.000 N NA
 1957055 1957056 CJJ81176_1192 CJJ81176_1193     TRUE 0.655 -3.000 0.002 NA   NA
 1957056 1957057 CJJ81176_1193 CJJ81176_1194   fliR FALSE 0.222 57.000 0.017 NA   NA
 1957057 1957058 CJJ81176_1194 CJJ81176_1195 fliR   TRUE 0.704 -13.000 0.032 1.000 N NA
 1957058 1957059 CJJ81176_1195 CJJ81176_1196   tsf TRUE 0.610 13.000 0.019 1.000 N NA
 1957059 1957060 CJJ81176_1196 CJJ81176_1197 tsf rpsB TRUE 0.992 0.000 0.748 1.000 Y NA
 1957060 1957061 CJJ81176_1197 CJJ81176_1198 rpsB   FALSE 0.171 116.000 0.003 1.000 N NA
 1957061 1957062 CJJ81176_1198 CJJ81176_1199   petC FALSE 0.347 128.000 0.087 1.000 N NA
 1957062 1957063 CJJ81176_1199 CJJ81176_1200 petC petB TRUE 0.991 -3.000 0.103 0.002 Y NA
 1957063 1957064 CJJ81176_1200 CJJ81176_1201 petB petA TRUE 0.997 2.000 0.093 0.002 Y NA
 1957064 1957065 CJJ81176_1201 CJJ81176_1202 petA arsB FALSE 0.380 91.000 0.083 1.000 N NA
 1957065 1957066 CJJ81176_1202 CJJ81176_1203 arsB gidA TRUE 0.858 1.000 0.003 1.000 N NA
 1957066 1957067 CJJ81176_1203 CJJ81176_1204 gidA   FALSE 0.196 88.000 0.004 1.000   NA
 1957067 1957068 CJJ81176_1204 CJJ81176_1205     TRUE 0.986 18.000 0.556 0.008   NA
 1957068 1957069 CJJ81176_1205 CJJ81176_1206     TRUE 0.924 121.000 0.444 0.008   NA
 1957073 1957074 CJJ81176_1210 CJJ81176_1211   gpsA TRUE 0.705 10.000 0.007 1.000 N NA
 1957074 1957075 CJJ81176_1211 CJJ81176_1212 gpsA gatB TRUE 0.824 0.000 0.011 1.000 N NA
 1957076 1957077 CJJ81176_1213 CJJ81176_1214 luxS   TRUE 0.668 312.000 0.000 0.018   NA
 1957077 1957078 CJJ81176_1214 CJJ81176_1215     TRUE 0.721 -7.000 0.043 NA   NA
 1957078 1957079 CJJ81176_1215 CJJ81176_1216   metE FALSE 0.545 12.000 0.006 NA N NA
 1957079 1957080 CJJ81176_1216 CJJ81176_1217 metE metF TRUE 0.989 10.000 0.050 0.002 Y NA
 1957081 1957082 CJJ81176_1218 CJJ81176_1219   atpB FALSE 0.373 42.000 0.000 NA   NA
 1957082 1957083 CJJ81176_1219 CJJ81176_1220 atpB radA FALSE 0.221 69.000 0.003 1.000 N NA
 1957083 1957084 CJJ81176_1220 CJJ81176_1221 radA ftsY TRUE 0.975 0.000 0.015 0.023 N NA
 1957084 1957085 CJJ81176_1221 CJJ81176_1222 ftsY   TRUE 0.834 0.000 0.003 1.000 N NA
 1957085 1957086 CJJ81176_1222 CJJ81176_1747     FALSE 0.484 25.000 0.000 NA   NA
 1957087 1957088 CJJ81176_1223 CJJ81176_1224     TRUE 0.726 9.000 0.010 NA   NA
 1957089 1957090 CJJ81176_1225 CJJ81176_1226 yihY glcD TRUE 0.883 4.000 0.031 1.000   NA
 1957090 1957091 CJJ81176_1226 CJJ81176_1227 glcD   TRUE 0.979 3.000 0.404 NA   NA
 1957093 1957094 CJJ81176_1229 CJJ81176_1230     TRUE 0.829 2.000 0.005 NA   NA
 1957094 1957095 CJJ81176_1230 CJJ81176_1231   ribE TRUE 0.559 -36.000 0.011 NA   NA
 1957095 1957096 CJJ81176_1231 CJJ81176_1232 ribE   TRUE 0.730 9.000 0.004 NA   NA
 1957097 1957098 CJJ81176_1233 CJJ81176_1234 groES groEL TRUE 0.983 22.000 0.356 0.009 Y NA
 1957099 1957100 CJJ81176_1235 CJJ81176_1236     TRUE 0.866 122.000 0.846 1.000 Y NA
 1957101 1957102 CJJ81176_1237 CJJ81176_1238     TRUE 0.743 11.000 0.031 1.000   NA
 1957103 1957104 CJJ81176_1748 CJJ81176_1240     FALSE 0.242 93.000 0.000 NA   NA
 1957104 1957105 CJJ81176_1240 CJJ81176_1241     TRUE 0.894 72.000 0.824 1.000 Y NA
 1957105 1957106 CJJ81176_1241 CJJ81176_1242   htrA TRUE 0.628 76.000 0.294 1.000 N NA
 1957107 1957108 CJJ81176_1243 CJJ81176_1244 dnaJ-1   TRUE 0.870 16.000 0.282 1.000 N NA
 1957108 1957109 CJJ81176_1244 CJJ81176_1245     TRUE 0.836 7.000 0.028 1.000 N NA
 1957109 1957110 CJJ81176_1245 CJJ81176_1246     TRUE 0.926 10.000 0.250 NA   NA
 1957110 1957111 CJJ81176_1246 CJJ81176_1247     TRUE 0.936 -3.000 0.364 NA   NA
 1957111 1957112 CJJ81176_1247 CJJ81176_1248   glyS FALSE 0.244 56.000 0.006 1.000   NA
 1957112 1957113 CJJ81176_1248 CJJ81176_1249 glyS   FALSE 0.190 84.000 0.008 1.000 N NA
 1957113 1957114 CJJ81176_1249 CJJ81176_1250     TRUE 0.633 -3.000 0.012 NA   NA
 1957116 1957117 CJJ81176_1252 CJJ81176_1253 pdxJ pdxA TRUE 0.985 -19.000 0.048 0.001 Y NA
 1957118 1957119 CJJ81176_1254 CJJ81176_1255     FALSE 0.293 61.000 0.000 NA   NA
 1957120 1957121 CJJ81176_1256 CJJ81176_1257     TRUE 0.714 56.000 0.400 NA   NA
 1957121 1957122 CJJ81176_1257 CJJ81176_1258   hemE FALSE 0.131 180.000 0.004 NA   NA
 1957122 1957123 CJJ81176_1258 CJJ81176_1259 hemE   TRUE 0.697 -3.000 0.017 1.000 N NA
 1957124 1957125 CJJ81176_1260 CJJ81176_1261   uvrC TRUE 0.829 2.000 0.005 NA   NA
 1957125 1957126 CJJ81176_1261 CJJ81176_1262 uvrC   TRUE 0.606 -7.000 0.018 NA   NA
 1957127 1957128 CJJ81176_1263 CJJ81176_1264   guaA TRUE 0.817 4.000 0.002 NA   NA
 1957128 1957129 CJJ81176_1264 CJJ81176_1265 guaA   FALSE 0.180 86.000 0.002 NA   NA
 1957129 1957130 CJJ81176_1265 CJJ81176_1266   purD FALSE 0.195 240.000 0.000 NA   NA
 1957130 1957131 CJJ81176_1266 CJJ81176_1267 purD   TRUE 0.655 -3.000 0.017 NA   NA
 1957131 1957132 CJJ81176_1267 CJJ81176_1268     TRUE 0.869 11.000 0.149 NA   NA
 1957132 1957133 CJJ81176_1268 CJJ81176_1269   pnp FALSE 0.210 70.000 0.007 1.000 N NA
 1957133 1957134 CJJ81176_1269 CJJ81176_1270 pnp   TRUE 0.642 -3.000 0.002 NA N NA
 1957134 1957135 CJJ81176_1270 CJJ81176_1271     FALSE 0.197 58.000 0.006 NA   NA
 1957136 1957137 CJJ81176_1272 CJJ81176_1273     TRUE 0.891 18.000 0.429 NA   NA
 1957138 1957139 CJJ81176_1274 CJJ81176_1275   porA FALSE 0.194 252.000 0.000 NA   NA
 1957141 1957142 CJJ81176_1277 CJJ81176_1278 racR racS TRUE 0.840 57.000 0.448 1.000 Y NA
 1957142 1957143 CJJ81176_1278 CJJ81176_1279 racS recR TRUE 0.825 0.000 0.011 1.000 N NA
 1957144 1957145 CJJ81176_1280 CJJ81176_1281 hydD hydC TRUE 0.957 -3.000 0.277 1.000 Y NA
 1957145 1957146 CJJ81176_1281 CJJ81176_1282 hydC hydB TRUE 0.993 -13.000 0.270 0.002 Y NA
 1957146 1957147 CJJ81176_1282 CJJ81176_1283 hydB hydA TRUE 0.999 3.000 0.951 0.002 Y NA
 1957147 1957148 CJJ81176_1283 CJJ81176_1284 hydA   FALSE 0.150 177.000 0.009 1.000 N NA
 1957148 1957149 CJJ81176_1284 CJJ81176_1285     TRUE 0.711 -3.000 0.020 1.000 N NA
 1957149 1957150 CJJ81176_1285 CJJ81176_1286     TRUE 0.887 0.000 0.034 1.000   NA
 1957150 1957151 CJJ81176_1286 CJJ81176_1287   tyrS TRUE 0.690 -3.000 0.003 1.000   NA
 1957151 1957152 CJJ81176_1287 CJJ81176_1288 tyrS   TRUE 0.742 12.000 0.045 1.000 N NA
 1957152 1957153 CJJ81176_1288 CJJ81176_1289   rpoZ TRUE 0.897 8.000 0.018 1.000 Y NA
 1957153 1957154 CJJ81176_1289 CJJ81176_1290 rpoZ pyrH TRUE 0.649 11.000 0.004 1.000 N NA
 1957154 1957155 CJJ81176_1290 CJJ81176_1291 pyrH   FALSE 0.273 52.000 0.002 1.000 N NA
 1957155 1957156 CJJ81176_1291 CJJ81176_1292     TRUE 0.824 -3.000 0.005 1.000 Y NA
 1957156 1957157 CJJ81176_1292 CJJ81176_1293   lolD TRUE 0.890 35.000 0.431 1.000 Y NA
 1957157 1957158 CJJ81176_1293 CJJ81176_1294 lolD trmB FALSE 0.341 70.000 0.044 1.000   NA
 1957158 1957159 CJJ81176_1294 CJJ81176_1295 trmB   TRUE 0.902 0.000 0.060 NA   NA
 1957159 1957160 CJJ81176_1295 CJJ81176_1296     TRUE 0.670 -52.000 0.031 NA   NA
 1957161 1957162 CJJ81176_1297 CJJ81176_1749     FALSE 0.316 54.000 0.000 NA   NA
 1957164 1957165 CJJ81176_1300 CJJ81176_1301     TRUE 0.997 11.000 0.647 0.004 Y NA
 1957166 1957167 CJJ81176_1302 CJJ81176_1303   upp TRUE 0.754 6.000 0.005 NA   NA
 1957167 1957168 CJJ81176_1303 CJJ81176_1304 upp   TRUE 0.672 -3.000 0.008 1.000 N NA
 1957168 1957169 CJJ81176_1304 CJJ81176_1305   gltX-2 TRUE 0.880 2.000 0.021 1.000 N NA
 1957171 1957172 CJJ81176_1307 CJJ81176_1308 accC-2 accB TRUE 0.996 2.000 0.071 0.003 Y NA
 1957173 1957174 CJJ81176_1309 CJJ81176_1310   flmA FALSE 0.282 49.000 0.014 1.000   NA
 1957174 1957175 CJJ81176_1310 CJJ81176_1311 flmA   TRUE 0.989 1.000 0.678 1.000   NA
 1957175 1957176 CJJ81176_1311 CJJ81176_1312     TRUE 0.619 -7.000 0.020 NA   NA
 1957176 1957177 CJJ81176_1312 CJJ81176_1313     TRUE 0.872 11.000 0.154 NA   NA
 1957179 1957180 CJJ81176_1315 CJJ81176_1316     TRUE 0.959 5.000 0.286 NA   NA
 1957180 1957181 CJJ81176_1316 CJJ81176_1317     TRUE 0.697 -7.000 0.000 NA   NA
 1957181 1957182 CJJ81176_1317 CJJ81176_1318     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957182 1957183 CJJ81176_1318 CJJ81176_1319     TRUE 0.887 -10.000 0.250 NA N NA
 1957183 1957184 CJJ81176_1319 CJJ81176_1320     TRUE 0.957 0.000 0.188 1.000   NA
 1957186 1957187 CJJ81176_1322 CJJ81176_1323     TRUE 0.738 140.000 0.093 0.033   NA
 1957189 1957190 CJJ81176_1325 CJJ81176_1326     TRUE 0.950 3.000 0.138 NA   NA
 1957192 1957193 CJJ81176_1328 CJJ81176_1329 neuA   TRUE 0.947 -16.000 0.355 NA Y NA
 1957193 1957194 CJJ81176_1329 CJJ81176_1330     TRUE 0.870 -3.000 0.137 NA N NA
 1957195 1957196 CJJ81176_1331 CJJ81176_1332 hisF-1 hisH-1 TRUE 0.991 1.000 0.011 0.007 Y NA
 1957196 1957197 CJJ81176_1332 CJJ81176_1333 hisH-1   TRUE 0.961 -3.000 0.625 NA N NA
 1957198 1957199 CJJ81176_1334 CJJ81176_1335 neuB   FALSE 0.303 33.000 0.012 NA   NA
 1957199 1957200 CJJ81176_1335 CJJ81176_1336     FALSE 0.532 21.000 0.000 NA   NA
 1957200 1957201 CJJ81176_1336 CJJ81176_1337     TRUE 0.686 -13.000 0.000 NA   NA
 1957202 1957203 CJJ81176_1338 CJJ81176_1339     TRUE 0.984 174.000 1.000 0.002 Y NA
 1957203 1957204 CJJ81176_1339 CJJ81176_1340     TRUE 0.759 83.000 0.667 NA   NA
 1957204 1957205 CJJ81176_1340 CJJ81176_1341     TRUE 0.685 12.000 0.000 NA   NA
 1957205 1957206 CJJ81176_1341 CJJ81176_1342   ctsG TRUE 0.982 0.000 0.600 NA   NA
 1957206 1957207 CJJ81176_1342 CJJ81176_1343 ctsG gcp TRUE 0.857 1.000 0.005 1.000   NA
 1957207 1957208 CJJ81176_1343 CJJ81176_1344 gcp   TRUE 0.626 -3.000 0.008 NA   NA
 1957208 1957209 CJJ81176_1344 CJJ81176_1345   dxr TRUE 0.827 2.000 0.006 NA   NA
 1957209 1957210 CJJ81176_1345 CJJ81176_1346 dxr cdsA TRUE 0.966 -3.000 0.372 1.000 Y NA
 1957210 1957211 CJJ81176_1346 CJJ81176_1347 cdsA   TRUE 0.724 9.000 0.007 NA   NA
 1957211 1957212 CJJ81176_1347 CJJ81176_1348     TRUE 0.876 2.000 0.028 NA   NA
 1957213 1957214 CJJ81176_1349 CJJ81176_1350   pldA TRUE 0.684 -3.000 0.014 1.000 N NA
 1957214 1957215 CJJ81176_1350 CJJ81176_1351 pldA ceuB TRUE 0.592 89.000 0.019 0.083 N NA
 1957215 1957216 CJJ81176_1351 CJJ81176_1352 ceuB ceuC TRUE 0.996 -7.000 0.870 0.037 Y NA
 1957216 1957217 CJJ81176_1352 CJJ81176_1353 ceuC ceuD TRUE 0.986 -3.000 0.870 1.000 Y NA
 1957217 1957218 CJJ81176_1353 CJJ81176_1354 ceuD   TRUE 0.847 13.000 0.055 1.000 Y NA
 1957218 1957219 CJJ81176_1354 CJJ81176_1355     FALSE 0.206 154.000 0.000 NA   NA
 1957219 1957220 CJJ81176_1355 CJJ81176_1356     TRUE 0.891 1.000 0.000 NA   NA
 1957221 1957222 CJJ81176_1751 CJJ81176_1358     FALSE 0.287 64.000 0.000 NA   NA
 1957222 1957223 CJJ81176_1358 CJJ81176_1359   nrfA TRUE 0.576 136.000 0.375 NA   NA
 1957223 1957224 CJJ81176_1359 CJJ81176_1360 nrfA nrfH TRUE 0.965 15.000 0.043 0.001 N NA
 1957226 1957227 CJJ81176_1752 CJJ81176_1363 ssrA   TRUE 0.891 1.000 0.000 NA   NA
 1957228 1957229 CJJ81176_1364 CJJ81176_1365 ruvB   TRUE 0.825 4.000 0.019 NA   NA
 1957230 1957231 CJJ81176_1366 CJJ81176_1367 fumC   FALSE 0.253 56.000 0.003 1.000   NA
 1957231 1957232 CJJ81176_1367 CJJ81176_1368   glmS TRUE 0.913 3.000 0.042 1.000   NA
 1957232 1957233 CJJ81176_1368 CJJ81176_1369 glmS   TRUE 0.965 5.000 0.312 1.000   NA
 1957234 1957235 CJJ81176_1370 CJJ81176_1371     FALSE 0.232 62.000 0.011 1.000   NA
 1957235 1957236 CJJ81176_1371 CJJ81176_1372     FALSE 0.295 47.000 0.016 1.000   NA
 1957236 1957237 CJJ81176_1372 CJJ81176_1373     TRUE 0.709 14.000 0.048 1.000   NA
 1957237 1957238 CJJ81176_1373 CJJ81176_1374     FALSE 0.308 45.000 0.016 1.000   NA
 1957238 1957239 CJJ81176_1374 CJJ81176_1375     TRUE 0.970 10.000 0.684 NA N NA
 1957239 1957240 CJJ81176_1375 CJJ81176_1376     TRUE 0.961 0.000 0.263 NA   NA
 1957244 1957245 CJJ81176_1380 CJJ81176_1381 selA selB TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.001 N NA
 1957245 1957246 CJJ81176_1381 CJJ81176_1382 selB   FALSE 0.353 49.000 0.031 1.000 N NA
 1957246 1957247 CJJ81176_1382 CJJ81176_1383     TRUE 0.902 6.000 0.091 NA   NA
 1957248 1957249 CJJ81176_1384 CJJ81176_1385 fldA   TRUE 0.973 0.000 0.391 NA   NA
 1957249 1957250 CJJ81176_1385 CJJ81176_1386     TRUE 0.935 3.000 0.094 NA   NA
 1957251 1957252 CJJ81176_1387 CJJ81176_1388 katA   FALSE 0.433 57.000 0.091 NA   NA
 1957254 1957255 CJJ81176_1390 CJJ81176_1391     TRUE 0.958 4.000 0.238 NA N NA
 1957255 1957256 CJJ81176_1391 CJJ81176_1392   metC TRUE 0.689 13.000 0.000 1.000 N NA
 1957256 1957257 CJJ81176_1392 CJJ81176_1393 metC purB-2 TRUE 0.800 10.000 0.000 1.000 N NA
 1957257 1957258 CJJ81176_1393 CJJ81176_1394 purB-2   TRUE 0.782 9.000 0.003 1.000   NA
 1957258 1957259 CJJ81176_1394 CJJ81176_1395     FALSE 0.199 193.000 0.000 NA   NA
 1957259 1957260 CJJ81176_1395 CJJ81176_1396     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957260 1957261 CJJ81176_1396 CJJ81176_1397   feoB TRUE 0.954 -25.000 0.019 0.004   NA
 1957262 1957263 CJJ81176_1398 CJJ81176_1399   fabI TRUE 0.930 4.000 0.088 1.000 N NA
 1957263 1957264 CJJ81176_1399 CJJ81176_1400 fabI tpiA TRUE 0.985 4.000 0.071 0.033 N NA
 1957264 1957265 CJJ81176_1400 CJJ81176_1401 tpiA pgk TRUE 0.847 -3.000 0.022 1.000 Y NA
 1957265 1957266 CJJ81176_1401 CJJ81176_1402 pgk gapA TRUE 0.992 3.000 0.020 0.005 Y NA
 1957267 1957268 CJJ81176_1403 CJJ81176_1404 nadD   TRUE 0.731 28.000 0.221 NA   NA
 1957269 1957270 CJJ81176_1405 CJJ81176_1406   algC FALSE 0.233 47.000 0.007 NA   NA
 1957271 1957272 CJJ81176_1407 CJJ81176_1408 fliL acpS TRUE 0.900 0.000 0.047 1.000 N NA
 1957273 1957274 CJJ81176_1409 CJJ81176_1410     TRUE 0.965 -3.000 0.600 1.000   NA
 1957274 1957275 CJJ81176_1410 CJJ81176_1411     TRUE 0.870 -3.000 0.132 NA   NA
 1957275 1957276 CJJ81176_1411 CJJ81176_1412   kpsS FALSE 0.303 72.000 0.046 NA   NA
 1957276 1957277 CJJ81176_1412 CJJ81176_1413 kpsS kpsC TRUE 0.988 -3.000 0.056 0.002 Y NA
 1957277 1957278 CJJ81176_1413 CJJ81176_1414 kpsC   TRUE 0.781 -3.000 0.039 1.000 N NA
 1957278 1957279 CJJ81176_1414 CJJ81176_1415     TRUE 0.729 -10.000 0.039 1.000 N NA
 1957279 1957280 CJJ81176_1415 CJJ81176_1416     TRUE 0.989 2.000 0.679 1.000   NA
 1957280 1957281 CJJ81176_1416 CJJ81176_1417     TRUE 0.959 -9.000 0.667 1.000   NA
 1957281 1957282 CJJ81176_1417 CJJ81176_1418     TRUE 0.870 15.000 0.261 1.000 N NA
 1957282 1957283 CJJ81176_1418 CJJ81176_1419     TRUE 0.949 34.000 0.263 0.009   NA
 1957283 1957284 CJJ81176_1419 CJJ81176_1420     TRUE 0.615 52.000 0.222 NA   NA
 1957284 1957285 CJJ81176_1420 CJJ81176_1421     TRUE 0.685 -28.000 0.000 NA   NA
 1957285 1957286 CJJ81176_1421 CJJ81176_1422     TRUE 0.655 13.000 0.000 NA   NA
 1957286 1957287 CJJ81176_1422 CJJ81176_1423   gmhA-2 TRUE 0.868 -12.000 0.154 1.000 N NA
 1957287 1957288 CJJ81176_1423 CJJ81176_1424 gmhA-2   TRUE 0.865 -12.000 0.148 1.000   NA
 1957288 1957289 CJJ81176_1424 CJJ81176_1425     FALSE 0.346 75.000 0.050 1.000   NA
 1957289 1957290 CJJ81176_1425 CJJ81176_1426   wcbK TRUE 0.968 24.000 0.067 0.002 Y NA
 1957290 1957291 CJJ81176_1426 CJJ81176_1427 wcbK fcl TRUE 0.993 9.000 0.067 0.002 Y NA
 1957291 1957292 CJJ81176_1427 CJJ81176_1428 fcl   TRUE 0.960 10.000 0.500 NA   NA
 1957292 1957293 CJJ81176_1428 CJJ81176_1429     TRUE 0.971 -13.000 1.000 NA   NA
 1957293 1957294 CJJ81176_1429 CJJ81176_1430     TRUE 0.983 3.000 0.500 NA   NA
 1957294 1957295 CJJ81176_1430 CJJ81176_1431     TRUE 0.979 0.000 0.500 NA   NA
 1957295 1957296 CJJ81176_1431 CJJ81176_1432     TRUE 0.978 -3.000 1.000 NA   NA
 1957296 1957297 CJJ81176_1432 CJJ81176_1433     TRUE 0.993 6.000 1.000 NA Y NA
 1957297 1957298 CJJ81176_1433 CJJ81176_1434     TRUE 0.993 6.000 1.000 NA Y NA
 1957298 1957299 CJJ81176_1434 CJJ81176_1435     TRUE 0.960 11.000 0.667 NA   NA
 1957299 1957300 CJJ81176_1435 CJJ81176_1436     TRUE 0.811 -7.000 0.100 NA   NA
 1957300 1957301 CJJ81176_1436 CJJ81176_1437   kpsF TRUE 0.871 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 1957301 1957302 CJJ81176_1437 CJJ81176_1438 kpsF kpsD TRUE 0.909 10.000 0.056 1.000 Y NA
 1957302 1957303 CJJ81176_1438 CJJ81176_1439 kpsD kpsE TRUE 0.995 2.000 0.200 0.082 Y NA
 1957303 1957304 CJJ81176_1439 CJJ81176_1440 kpsE kpsT TRUE 0.980 0.000 0.257 1.000 Y NA
 1957304 1957305 CJJ81176_1440 CJJ81176_1441 kpsT kpsM TRUE 0.988 -3.000 0.306 0.098 Y NA
 1957305 1957306 CJJ81176_1441 CJJ81176_1442 kpsM   FALSE 0.347 72.000 0.048 1.000   NA
 1957307 1957308 CJJ81176_1443 CJJ81176_1444     TRUE 0.588 36.000 0.120 NA   NA
 1957308 1957309 CJJ81176_1444 CJJ81176_1445     TRUE 0.937 2.000 0.092 NA   NA
 1957310 1957311 CJJ81176_1446 CJJ81176_1447 tilS yliG TRUE 0.648 -10.000 0.019 1.000 N NA
 1957313 1957314 CJJ81176_1449 CJJ81176_1450     FALSE 0.121 257.000 0.008 NA   NA
 1957314 1957315 CJJ81176_1450 CJJ81176_1451     TRUE 0.669 -31.000 0.022 1.000   NA
 1957316 1957317 CJJ81176_1452 CJJ81176_1453     TRUE 0.877 -3.000 0.143 NA   NA
 1957317 1957318 CJJ81176_1453 CJJ81176_1454     TRUE 0.712 -10.000 0.043 NA   NA
 1957318 1957319 CJJ81176_1454 CJJ81176_1455   flgI FALSE 0.330 59.000 0.035 1.000 N NA
 1957319 1957320 CJJ81176_1455 CJJ81176_1456 flgI   TRUE 0.981 0.000 0.569 NA   NA
 1957320 1957321 CJJ81176_1456 CJJ81176_1457     TRUE 0.729 63.000 0.469 NA   NA
 1957321 1957322 CJJ81176_1457 CJJ81176_1458     TRUE 0.978 43.000 0.677 0.004   NA
 1957322 1957323 CJJ81176_1458 CJJ81176_1459     TRUE 0.995 10.000 0.558 0.004   NA
 1957323 1957324 CJJ81176_1459 CJJ81176_1460     TRUE 0.734 17.000 0.084 1.000   NA
 1957324 1957325 CJJ81176_1460 CJJ81176_1461     TRUE 0.727 -10.000 0.000 1.000   NA
 1957325 1957326 CJJ81176_1461 CJJ81176_1462     TRUE 0.757 11.000 0.035 1.000   NA
 1957327 1957328 CJJ81176_1463 CJJ81176_1464 ctsF ctsE TRUE 0.946 -3.000 0.200 1.000 Y NA
 1957328 1957329 CJJ81176_1464 CJJ81176_1465 ctsE ctsX TRUE 0.920 -10.000 0.333 1.000   NA
 1957329 1957330 CJJ81176_1465 CJJ81176_1466 ctsX ctsP TRUE 0.986 4.000 0.667 1.000   NA
 1957330 1957331 CJJ81176_1466 CJJ81176_1467 ctsP ctsD TRUE 0.878 -7.000 0.167 1.000   NA
 1957331 1957332 CJJ81176_1467 CJJ81176_1468 ctsD ctsR TRUE 0.855 -22.000 0.167 NA   NA
 1957332 1957333 CJJ81176_1468 CJJ81176_1469 ctsR   FALSE 0.480 24.000 0.032 NA   NA
 1957333 1957334 CJJ81176_1469 CJJ81176_1470     FALSE 0.335 93.000 0.056 1.000   NA
 1957334 1957335 CJJ81176_1470 CJJ81176_1471   cadF TRUE 0.922 0.000 0.068 1.000   NA
 1957335 1957336 CJJ81176_1471 CJJ81176_1472 cadF rpsI FALSE 0.203 126.000 0.024 1.000 N NA
 1957336 1957337 CJJ81176_1472 CJJ81176_1473 rpsI rplM TRUE 0.996 3.000 0.231 0.024 Y NA
 1957337 1957338 CJJ81176_1473 CJJ81176_1474 rplM   FALSE 0.215 66.000 0.009 1.000 N NA
 1957338 1957339 CJJ81176_1474 CJJ81176_1475     TRUE 0.982 -3.000 0.117 0.037 Y NA
 1957339 1957340 CJJ81176_1475 CJJ81176_1476     TRUE 0.837 -3.000 0.091 NA   NA
 1957340 1957341 CJJ81176_1476 CJJ81176_1477     TRUE 0.804 -13.000 0.102 NA   NA
 1957341 1957342 CJJ81176_1477 CJJ81176_1478     TRUE 0.702 95.000 0.526 NA   NA
 1957342 1957343 CJJ81176_1478 CJJ81176_1479   ccoP TRUE 0.982 0.000 0.579 NA   NA
 1957343 1957344 CJJ81176_1479 CJJ81176_1480 ccoP ccoQ TRUE 0.996 0.000 0.286 0.002 N NA
 1957344 1957345 CJJ81176_1480 CJJ81176_1481 ccoQ ccoO TRUE 0.999 2.000 0.738 0.002 N NA
 1957345 1957346 CJJ81176_1481 CJJ81176_1482 ccoO ccoN TRUE 0.987 13.000 0.283 0.002 N NA
 1957346 1957347 CJJ81176_1482 CJJ81176_1483 ccoN   FALSE 0.305 126.000 0.062 1.000 N NA
 1957347 1957348 CJJ81176_1483 CJJ81176_1484     TRUE 0.997 3.000 0.200 0.008 Y NA
 1957348 1957349 CJJ81176_1484 CJJ81176_1485     TRUE 0.631 -3.000 0.011 NA   NA
 1957349 1957350 CJJ81176_1485 CJJ81176_1486   carA TRUE 0.630 -3.000 0.011 NA   NA
 1957350 1957351 CJJ81176_1486 CJJ81176_1487 carA   TRUE 0.876 0.000 0.041 NA   NA
 1957351 1957352 CJJ81176_1487 CJJ81176_1488     FALSE 0.402 93.000 0.120 NA   NA
 1957352 1957353 CJJ81176_1488 CJJ81176_1489     TRUE 0.852 -7.000 0.147 NA   NA
 1957353 1957354 CJJ81176_1489 CJJ81176_1490   purA FALSE 0.138 144.000 0.014 NA   NA
 1957354 1957355 CJJ81176_1490 CJJ81176_1753 purA   FALSE 0.453 28.000 0.000 NA   NA
 1957356 1957357 CJJ81176_1492 CJJ81176_1493     TRUE 0.988 4.000 0.844 NA   NA
 1957358 1957359 CJJ81176_1494 CJJ81176_1495 putP   TRUE 0.784 18.000 0.141 1.000 N NA
 1957359 1957360 CJJ81176_1495 CJJ81176_1496   selD FALSE 0.161 131.000 0.011 1.000 N NA
 1957360 1957361 CJJ81176_1496 CJJ81176_1497 selD   FALSE 0.393 106.000 0.104 1.000 N NA
 1957361 1957362 CJJ81176_1497 CJJ81176_1498     FALSE 0.179 111.000 0.015 1.000 N NA
 1957362 1957363 CJJ81176_1498 CJJ81176_1499     FALSE 0.316 113.000 0.077 NA   NA
 1957363 1957364 CJJ81176_1499 CJJ81176_1500   fdhD TRUE 0.688 29.000 0.172 NA   NA
 1957364 1957365 CJJ81176_1500 CJJ81176_1501 fdhD fdhC TRUE 0.910 167.000 0.138 0.003 Y NA
 1957365 1957366 CJJ81176_1501 CJJ81176_1502 fdhC fdhB TRUE 0.993 -3.000 0.200 0.003 Y NA
 1957366 1957367 CJJ81176_1502 CJJ81176_1503 fdhB fdhA TRUE 0.992 -3.000 0.333 0.003   NA
 1957367 1957368 CJJ81176_1503 CJJ81176_1504 fdhA   TRUE 0.934 22.000 0.000 0.003   NA
 1957368 1957369 CJJ81176_1504 CJJ81176_1505     TRUE 0.960 0.000 0.250 NA   NA
 1957369 1957370 CJJ81176_1505 CJJ81176_1506     TRUE 0.917 -25.000 0.375 NA   NA
 1957370 1957371 CJJ81176_1506 CJJ81176_1507   nspC FALSE 0.221 316.000 0.000 1.000   NA
 1957372 1957373 CJJ81176_1508 CJJ81176_1509     TRUE 0.855 2.000 0.010 1.000 N NA
 1957373 1957374 CJJ81176_1509 CJJ81176_1510     TRUE 0.991 1.000 0.501 1.000 Y NA
 1957374 1957375 CJJ81176_1510 CJJ81176_1511     TRUE 0.990 4.000 0.018 0.005 Y NA
 1957376 1957377 CJJ81176_1512 CJJ81176_1513     TRUE 0.942 -7.000 0.500 NA   NA
 1957377 1957378 CJJ81176_1513 CJJ81176_1514   purM FALSE 0.218 449.000 0.000 1.000   NA
 1957379 1957380 CJJ81176_1515 CJJ81176_1516   dapF TRUE 0.693 -3.000 0.016 1.000 N NA
 1957380 1957381 CJJ81176_1516 CJJ81176_1517 dapF   TRUE 0.614 -25.000 0.010 1.000   NA
 1957382 1957383 CJJ81176_1518 CJJ81176_1519     FALSE 0.263 65.000 0.030 NA   NA
 1957383 1957384 CJJ81176_1519 CJJ81176_1520   pgi FALSE 0.162 130.000 0.011 1.000 N NA
 1957384 1957385 CJJ81176_1520 CJJ81176_1521 pgi galU TRUE 0.684 -6.000 0.023 1.000 N NA
 1957385 1957386 CJJ81176_1521 CJJ81176_1522 galU acs FALSE 0.277 82.000 0.032 1.000 N NA
 1957386 1957387 CJJ81176_1522 CJJ81176_1523 acs   FALSE 0.227 138.000 0.032 1.000 N NA
 1957387 1957388 CJJ81176_1523 CJJ81176_1524     TRUE 0.980 2.000 0.389 1.000 N NA
 1957389 1957390 CJJ81176_1525 CJJ81176_1526     FALSE 0.132 142.000 0.010 NA   NA
 1957390 1957391 CJJ81176_1526 CJJ81176_1527     TRUE 0.839 10.000 0.053 1.000   NA
 1957391 1957392 CJJ81176_1527 CJJ81176_1528     TRUE 0.894 -19.000 0.122 NA Y NA
 1957393 1957394 CJJ81176_1529 CJJ81176_1530     FALSE 0.465 33.000 0.034 1.000   NA
 1957395 1957396 CJJ81176_1531 CJJ81176_1532     TRUE 0.818 -12.000 0.120 NA N NA
 1957397 1957398 CJJ81176_1533 CJJ81176_1534     FALSE 0.227 228.000 0.000 1.000   NA
 1957398 1957399 CJJ81176_1534 CJJ81176_1535     TRUE 0.984 3.000 0.071 0.097 N NA
 1957399 1957400 CJJ81176_1535 CJJ81176_1536     TRUE 0.742 11.000 0.032 1.000 N NA
 1957402 1957403 CJJ81176_1538 CJJ81176_1539     TRUE 0.673 12.000 0.025 1.000 N NA
 1957406 1957407 CJJ81176_1542 CJJ81176_1543     FALSE 0.272 85.000 0.043 NA   NA
 1957407 1957408 CJJ81176_1543 CJJ81176_1544     TRUE 0.583 184.000 0.400 NA   NA
 1957408 1957409 CJJ81176_1544 CJJ81176_1545   arsR TRUE 0.823 10.000 0.057 NA   NA
 1957409 1957410 CJJ81176_1545 CJJ81176_1546 arsR   TRUE 0.631 -9.000 0.023 NA   NA
 1957412 1957413 CJJ81176_1548 CJJ81176_1549     TRUE 0.577 375.000 0.000 0.080   NA
 1957414 1957415 CJJ81176_1550 CJJ81176_1551 pflA nuoN FALSE 0.488 22.000 0.020 1.000   NA
 1957415 1957416 CJJ81176_1551 CJJ81176_1552 nuoN nuoM TRUE 0.979 -10.000 0.024 0.002 Y NA
 1957416 1957417 CJJ81176_1552 CJJ81176_1553 nuoM nuoL TRUE 0.996 2.000 0.056 0.002 Y NA
 1957417 1957418 CJJ81176_1553 CJJ81176_1554 nuoL nuoK TRUE 0.994 2.000 0.056 0.009 Y NA
 1957418 1957419 CJJ81176_1554 CJJ81176_1555 nuoK nuoJ TRUE 0.987 -3.000 0.064 0.004 Y NA
 1957419 1957420 CJJ81176_1555 CJJ81176_1556 nuoJ nuoI TRUE 0.995 -3.000 0.442 0.009 Y NA
 1957420 1957421 CJJ81176_1556 CJJ81176_1557 nuoI nuoH TRUE 0.996 10.000 0.500 0.009 Y NA
 1957421 1957422 CJJ81176_1557 CJJ81176_1558 nuoH nuoG TRUE 0.979 -7.000 0.065 0.009 Y NA
 1957422 1957423 CJJ81176_1558 CJJ81176_1559 nuoG   TRUE 0.992 -3.000 0.444 0.009   NA
 1957423 1957424 CJJ81176_1559 CJJ81176_1560     TRUE 0.992 -3.000 0.464 0.009   NA
 1957424 1957425 CJJ81176_1560 CJJ81176_1561   nuoD TRUE 0.951 84.000 0.650 0.009   NA
 1957425 1957426 CJJ81176_1561 CJJ81176_1562 nuoD nuoC TRUE 0.999 2.000 0.650 0.009 Y NA
 1957426 1957427 CJJ81176_1562 CJJ81176_1563 nuoC nuoB TRUE 0.999 0.000 0.703 0.004 Y NA
 1957427 1957428 CJJ81176_1563 CJJ81176_1564 nuoB nuoA TRUE 0.996 -18.000 0.571 0.004 Y NA
 1957428 1957429 CJJ81176_1564 CJJ81176_1565 nuoA   FALSE 0.265 213.000 0.053 1.000 N NA
 1957429 1957430 CJJ81176_1565 CJJ81176_1566     TRUE 0.971 -7.000 0.039 0.018 Y NA
 1957430 1957431 CJJ81176_1566 CJJ81176_1567     TRUE 0.957 -3.000 0.278 1.000 Y NA
 1957431 1957432 CJJ81176_1567 CJJ81176_1568     TRUE 0.994 -7.000 0.647 0.036 Y NA
 1957432 1957433 CJJ81176_1568 CJJ81176_1569     TRUE 0.997 0.000 0.412 0.036 Y NA
 1957434 1957435 CJJ81176_1570 CJJ81176_1571   dmsB TRUE 0.996 11.000 1.000 0.043 Y NA
 1957435 1957436 CJJ81176_1571 CJJ81176_1572 dmsB   TRUE 0.958 -13.000 0.667 1.000   NA
 1957436 1957437 CJJ81176_1572 CJJ81176_1573     TRUE 0.986 0.000 0.667 1.000   NA
 1957437 1957438 CJJ81176_1573 CJJ81176_1574     FALSE 0.320 67.000 0.000 1.000   NA
 1957439 1957440 CJJ81176_1575 CJJ81176_1576     TRUE 0.766 50.000 0.043 0.060   NA
 1957441 1957442 CJJ81176_1577 CJJ81176_1578   infA FALSE 0.207 88.000 0.002 1.000   NA
 1957442 1957443 CJJ81176_1578 CJJ81176_1754 infA rpmJ FALSE 0.362 172.000 0.104 1.000   NA
 1957443 1957444 CJJ81176_1754 CJJ81176_1579 rpmJ rpsM TRUE 0.993 3.000 0.194 0.024   NA
 1957444 1957445 CJJ81176_1579 CJJ81176_1580 rpsM rpsK TRUE 0.997 10.000 0.810 0.024 Y NA
 1957445 1957446 CJJ81176_1580 CJJ81176_1581 rpsK rpsD TRUE 0.980 28.000 0.509 0.031 Y NA
 1957446 1957447 CJJ81176_1581 CJJ81176_1582 rpsD rpoA TRUE 0.942 13.000 0.549 1.000 N NA
 1957447 1957448 CJJ81176_1582 CJJ81176_1583 rpoA rplQ TRUE 0.990 4.000 0.873 1.000 N NA
 1957448 1957449 CJJ81176_1583 CJJ81176_1584 rplQ hisG FALSE 0.155 173.000 0.004 1.000 N NA
 1957449 1957450 CJJ81176_1584 CJJ81176_1585 hisG hisD TRUE 0.995 8.000 0.171 0.006 Y NA
 1957450 1957451 CJJ81176_1585 CJJ81176_1586 hisD hisB TRUE 0.975 -3.000 0.010 0.006 Y NA
 1957451 1957452 CJJ81176_1586 CJJ81176_1587 hisB hisH-2 TRUE 0.989 -3.000 0.128 0.006 Y NA
 1957452 1957453 CJJ81176_1587 CJJ81176_1588 hisH-2 hisA TRUE 0.992 -3.000 0.210 0.006 Y NA
 1957453 1957454 CJJ81176_1588 CJJ81176_1589 hisA   TRUE 0.562 -15.000 0.004 NA   NA
 1957454 1957455 CJJ81176_1589 CJJ81176_1590   hisF-2 TRUE 0.833 1.000 0.003 NA   NA
 1957455 1957456 CJJ81176_1590 CJJ81176_1591 hisF-2 hisI TRUE 0.998 2.000 0.430 0.006 Y NA
 1957457 1957458 CJJ81176_1592 CJJ81176_1593   mrp FALSE 0.512 26.000 0.036 1.000 N NA
 1957459 1957460 CJJ81176_1594 CJJ81176_1595     TRUE 0.743 -3.000 0.027 1.000 N NA
 1957460 1957461 CJJ81176_1595 CJJ81176_1596     TRUE 0.670 -22.000 0.025 1.000 N NA
 1957461 1957462 CJJ81176_1596 CJJ81176_1597   pgpA TRUE 0.892 5.000 0.052 1.000 N NA
 1957462 1957463 CJJ81176_1597 CJJ81176_1598 pgpA rpsT FALSE 0.205 79.000 0.004 1.000 N NA
 1957463 1957464 CJJ81176_1598 CJJ81176_1599 rpsT prfA TRUE 0.727 19.000 0.029 1.000 Y NA
 1957466 1957467 CJJ81176_1601 CJJ81176_1602 chuA   TRUE 0.985 -25.000 0.250 0.036 Y NA
 1957467 1957468 CJJ81176_1602 CJJ81176_1603     TRUE 0.978 0.000 0.226 1.000 Y NA
 1957468 1957469 CJJ81176_1603 CJJ81176_1604     TRUE 0.903 -3.000 0.065 1.000 Y NA
 1957473 1957474 CJJ81176_1608 CJJ81176_1755     FALSE 0.272 72.000 0.000 NA   NA
 1957474 1957475 CJJ81176_1755 CJJ81176_1756     TRUE 0.775 10.000 0.000 NA   NA
 1957475 1957476 CJJ81176_1756 CJJ81176_1757     FALSE 0.554 19.000 0.000 NA   NA
 1957476 1957477 CJJ81176_1757 CJJ81176_1758     FALSE 0.518 22.000 0.000 NA   NA
 1957477 1957478 CJJ81176_1758 CJJ81176_1613   ribD FALSE 0.198 203.000 0.000 NA   NA
 1957478 1957479 CJJ81176_1613 CJJ81176_1614 ribD   TRUE 0.563 -10.000 0.005 NA   NA
 1957480 1957481 CJJ81176_1615 CJJ81176_1616 sdaA sdaC TRUE 0.884 15.000 0.133 1.000 Y NA
 1957481 1957482 CJJ81176_1616 CJJ81176_1617 sdaC   FALSE 0.194 261.000 0.000 NA   NA
 1957482 1957483 CJJ81176_1617 CJJ81176_1618     TRUE 0.689 65.000 0.400 NA   NA
 1957484 1957485 CJJ81176_1619 CJJ81176_1620 exbB-2 exbD TRUE 0.995 -28.000 0.815 0.042 Y NA
 1957485 1957486 CJJ81176_1620 CJJ81176_1621 exbD   TRUE 0.971 -3.000 0.148 0.080 N NA
 1957487 1957488 CJJ81176_1622 CJJ81176_1623     TRUE 0.983 4.000 0.600 NA   NA
 1957490 1957491 CJJ81176_1625 CJJ81176_1626 aroC rnc TRUE 0.874 0.000 0.030 1.000 N NA
 1957491 1957492 CJJ81176_1626 CJJ81176_1627 rnc rnhA TRUE 0.704 -16.000 0.032 1.000 N NA
 1957492 1957493 CJJ81176_1627 CJJ81176_1628 rnhA   TRUE 0.614 -13.000 0.009 1.000   NA
 1957494 1957495 CJJ81176_1629 CJJ81176_1630 dnaG   FALSE 0.198 82.000 0.011 1.000 N NA
 1957495 1957496 CJJ81176_1630 CJJ81176_1631     TRUE 0.832 -13.000 0.107 1.000   NA
 1957496 1957497 CJJ81176_1631 CJJ81176_1632   murE TRUE 0.775 -16.000 0.057 1.000   NA
 1957497 1957498 CJJ81176_1632 CJJ81176_1633 murE   TRUE 0.796 4.000 0.006 NA   NA
 1957498 1957499 CJJ81176_1633 CJJ81176_1634     FALSE 0.396 21.000 0.010 NA   NA
 1957499 1957500 CJJ81176_1634 CJJ81176_1635   ispA TRUE 0.902 -3.000 0.167 1.000   NA
 1957500 1957501 CJJ81176_1635 CJJ81176_1636 ispA tkt TRUE 0.951 10.000 0.375 1.000 N NA
 1957501 1957502 CJJ81176_1636 CJJ81176_1637 tkt   TRUE 0.949 2.000 0.132 NA N NA
 1957502 1957503 CJJ81176_1637 CJJ81176_1638     TRUE 0.995 1.000 0.912 NA Y NA
 1957503 1957504 CJJ81176_1638 CJJ81176_1639     TRUE 0.994 3.000 0.912 NA Y NA
 1957504 1957505 CJJ81176_1639 CJJ81176_1640     TRUE 0.933 0.000 0.120 NA   NA
 1957505 1957506 CJJ81176_1640 CJJ81176_1641     FALSE 0.272 56.000 0.027 NA   NA
 1957507 1957508 CJJ81176_1642 CJJ81176_1643 map murI TRUE 0.708 10.000 0.005 1.000 N NA
 1957508 1957509 CJJ81176_1643 CJJ81176_1644 murI nlpC TRUE 0.919 2.000 0.005 NA Y NA
 1957509 1957510 CJJ81176_1644 CJJ81176_1645 nlpC nhaA-1 TRUE 0.935 9.000 0.211 NA N NA
 1957510 1957511 CJJ81176_1645 CJJ81176_1646 nhaA-1 nhaA-2 TRUE 0.997 -3.000 0.571 0.003 Y NA
 1957511 1957512 CJJ81176_1646 CJJ81176_1647 nhaA-2   TRUE 0.686 142.000 0.600 NA   NA
 1957513 1957514 CJJ81176_1648 CJJ81176_1649     FALSE 0.190 350.000 0.000 NA   NA
 1957514 1957515 CJJ81176_1649 CJJ81176_1650     TRUE 0.946 -3.000 0.238 NA Y NA
 1957515 1957516 CJJ81176_1650 CJJ81176_1651     TRUE 0.644 83.000 0.386 NA   NA
 1957516 1957517 CJJ81176_1651 CJJ81176_1652     TRUE 0.956 -10.000 0.625 1.000   NA
 1957517 1957518 CJJ81176_1652 CJJ81176_1653     TRUE 0.992 -10.000 0.878 0.080 N NA
 1957518 1957519 CJJ81176_1653 CJJ81176_1654     TRUE 0.954 0.000 0.175 1.000 N NA
 1957519 1957520 CJJ81176_1654 CJJ81176_1655     TRUE 0.848 -3.000 0.078 1.000   NA
 1957520 1957521 CJJ81176_1655 CJJ81176_1656     FALSE 0.384 195.000 0.147 NA   NA
 1957522 1957523 CJJ81176_1657 CJJ81176_1658     FALSE 0.540 91.000 0.250 NA   NA
 1957523 1957524 CJJ81176_1658 CJJ81176_1659     FALSE 0.195 234.000 0.000 NA   NA
 1957524 1957525 CJJ81176_1659 CJJ81176_1759     FALSE 0.192 286.000 0.000 NA   NA
 1957525 1957526 CJJ81176_1759 CJJ81176_1760     TRUE 0.840 6.000 0.000 NA   NA
 1957526 1957527 CJJ81176_1760 CJJ81176_1761     TRUE 0.617 15.000 0.000 NA   NA
 1957527 1957528 CJJ81176_1761 CJJ81176_1762     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 1957528 1957529 CJJ81176_1762 CJJ81176_1763     FALSE 0.484 25.000 0.000 NA   NA
 1957529 1957530 CJJ81176_1763 CJJ81176_1665     FALSE 0.368 43.000 0.000 NA   NA
 1957530 1957531 CJJ81176_1665 CJJ81176_1666     TRUE 0.844 0.000 0.026 NA   NA
 1957531 1957532 CJJ81176_1666 CJJ81176_1667     TRUE 0.961 -10.000 0.788 NA   NA
 1957532 1957533 CJJ81176_1667 CJJ81176_1668   eno FALSE 0.391 66.000 0.080 NA   NA
 1957533 1957534 CJJ81176_1668 CJJ81176_1669 eno recA TRUE 0.883 0.000 0.033 1.000 N NA
 1957535 1957536 CJJ81176_1670 CJJ81176_1671   fliQ TRUE 0.768 12.000 0.068 NA   NA
 1957536 1957537 CJJ81176_1671 CJJ81176_1672 fliQ murB TRUE 0.833 -3.000 0.066 1.000 N NA
 1957538 1957539 CJJ81176_1673 CJJ81176_1674   cysQ FALSE 0.363 46.000 0.039 NA   NA
 1957539 1957540 CJJ81176_1674 CJJ81176_1675 cysQ gltA FALSE 0.237 81.000 0.022 1.000 N NA
 1957540 1957541 CJJ81176_1675 CJJ81176_1676 gltA   FALSE 0.190 115.000 0.019 1.000 N NA
 1957541 1957542 CJJ81176_1676 CJJ81176_1677   bioB TRUE 0.630 -19.000 0.017 1.000 N NA
 1957542 1957543 CJJ81176_1677 CJJ81176_1678 bioB topA TRUE 0.854 2.000 0.009 1.000 N NA
 1957545 1957546 CJJ81176_1680 CJJ81176_1681     TRUE 0.842 -3.000 0.071 1.000   NA
 1957546 1957547 CJJ81176_1681 CJJ81176_1682     TRUE 0.939 -12.000 0.000 0.035   NA
 1957547 1957548 CJJ81176_1682 CJJ81176_1683     TRUE 0.617 15.000 0.000 NA   NA
 1957548 1957549 CJJ81176_1683 CJJ81176_1684     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957549 1957550 CJJ81176_1684 CJJ81176_1685   secY FALSE 0.227 226.000 0.000 1.000   NA
 1957550 1957551 CJJ81176_1685 CJJ81176_1686 secY rplO TRUE 0.987 0.000 0.730 1.000 N NA
 1957551 1957552 CJJ81176_1686 CJJ81176_1687 rplO rpsE TRUE 0.993 5.000 0.148 0.031 Y NA
 1957552 1957553 CJJ81176_1687 CJJ81176_1688 rpsE rplR TRUE 0.995 12.000 0.814 0.031 Y NA
 1957553 1957554 CJJ81176_1688 CJJ81176_1689 rplR rplF TRUE 0.997 10.000 0.815 0.023 Y NA
 1957554 1957555 CJJ81176_1689 CJJ81176_1690 rplF rpsH TRUE 0.974 79.000 0.808 0.023 Y NA
 1957555 1957556 CJJ81176_1690 CJJ81176_1691 rpsH rpsN TRUE 0.995 10.000 0.473 0.023 Y NA
 1957556 1957557 CJJ81176_1691 CJJ81176_1692 rpsN rplE TRUE 0.998 2.000 0.496 0.023 Y NA
 1957557 1957558 CJJ81176_1692 CJJ81176_1693 rplE rplX TRUE 0.998 4.000 0.758 0.023 Y NA
 1957558 1957559 CJJ81176_1693 CJJ81176_1694 rplX rplN TRUE 0.998 0.000 0.810 0.031 Y NA
 1957559 1957560 CJJ81176_1694 CJJ81176_1695 rplN rpsQ TRUE 0.998 0.000 0.791 0.031 Y NA
 1957560 1957561 CJJ81176_1695 CJJ81176_1696 rpsQ rpmC TRUE 0.996 10.000 0.828 0.023   NA
 1957561 1957562 CJJ81176_1696 CJJ81176_1697 rpmC rplP TRUE 0.993 -13.000 0.802 0.023   NA
 1957562 1957563 CJJ81176_1697 CJJ81176_1698 rplP rpsC TRUE 0.999 3.000 0.828 0.031 Y NA
 1957563 1957564 CJJ81176_1698 CJJ81176_1699 rpsC rplV TRUE 0.998 0.000 0.719 0.031 Y NA
 1957564 1957565 CJJ81176_1699 CJJ81176_1700 rplV rpsS TRUE 0.996 11.000 0.769 0.031 Y NA
 1957565 1957566 CJJ81176_1700 CJJ81176_1701 rpsS rplB TRUE 0.999 2.000 0.820 0.031 Y NA
 1957566 1957567 CJJ81176_1701 CJJ81176_1702 rplB rplW TRUE 0.995 2.000 0.849 1.000 Y NA
 1957567 1957568 CJJ81176_1702 CJJ81176_1703 rplW rplD TRUE 0.991 3.000 0.513 1.000 Y NA
 1957568 1957569 CJJ81176_1703 CJJ81176_0001 rplD rplC TRUE 0.993 -3.000 0.361 0.023 Y NA
 1957569 1957570 CJJ81176_0001 CJJ81176_0002 rplC rpsJ TRUE 0.995 10.000 0.467 0.031 Y NA
 1957570 1957571 CJJ81176_0002 CJJ81176_0003 rpsJ   FALSE 0.293 198.000 0.003 1.000 Y NA
 1957571 1957572 CJJ81176_0003 CJJ81176_0004     TRUE 0.624 35.000 0.118 1.000   NA
 1957572 1957573 CJJ81176_0004 CJJ81176_0005   ksgA TRUE 0.692 -25.000 0.028 1.000   NA
 1957574 1957575 CJJ81176_0006 CJJ81176_0007     TRUE 0.851 23.000 0.011 0.028   NA
 1957577 1957578 CJJ81176_1765 CJJ81176_0010     FALSE 0.188 457.000 0.000 NA   NA
 1957578 1957579 CJJ81176_0010 CJJ81176_1766     FALSE 0.209 139.000 0.000 NA   NA
 1957579 1957580 CJJ81176_1766 CJJ81176_1767     TRUE 0.871 4.000 0.000 NA   NA
 1957580 1957581 CJJ81176_1767 CJJ81176_0013     FALSE 0.453 28.000 0.000 NA   NA
 1957582 1957583 CJJ81176_0014 CJJ81176_0015 leuD leuC TRUE 0.999 2.000 0.309 0.001 Y NA
 1957583 1957584 CJJ81176_0015 CJJ81176_0016 leuC leuB TRUE 0.994 -7.000 0.275 0.002 Y NA
 1957584 1957585 CJJ81176_0016 CJJ81176_0017 leuB leuA TRUE 0.992 -3.000 0.126 0.002 Y NA
 1957587 1957588 CJJ81176_0019 CJJ81176_0020     FALSE 0.162 138.000 0.005 1.000   NA
 1957590 1957591 CJJ81176_0022 CJJ81176_0023 metA metX FALSE 0.451 83.000 0.037 1.000 Y NA
 1957591 1957592 CJJ81176_0023 CJJ81176_0024 metX   FALSE 0.195 245.000 0.000 NA   NA
 1957592 1957593 CJJ81176_0024 CJJ81176_0025   flgE TRUE 0.627 26.000 0.103 NA   NA
 1957593 1957594 CJJ81176_0025 CJJ81176_0026 flgE ruvC FALSE 0.160 193.000 0.002 1.000 N NA
 1955836 1955837 CJJ81176_pTet0001 CJJ81176_pTet0002     FALSE 0.202 174.000 0.000 NA   NA
 1955837 1955838 CJJ81176_pTet0002 CJJ81176_pTet0003     TRUE 0.687 -85.000 0.000 NA   NA
 1955838 1955839 CJJ81176_pTet0003 CJJ81176_pTet0004     TRUE 0.802 142.000 1.000 NA   NA
 1955839 1955840 CJJ81176_pTet0004 CJJ81176_pTet0005     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1955840 1955841 CJJ81176_pTet0005 CJJ81176_pTet0006     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1955841 1955842 CJJ81176_pTet0006 CJJ81176_pTet0007     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 1955842 1955843 CJJ81176_pTet0007 CJJ81176_pTet0008     FALSE 0.297 59.000 0.000 NA   NA
 1955843 1955844 CJJ81176_pTet0008 CJJ81176_pTet0009     TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 1955844 1955845 CJJ81176_pTet0009 CJJ81176_pTet0010     FALSE 0.347 47.000 0.000 NA   NA
 1955846 1955847 CJJ81176_pTet0011 CJJ81176_pTet0012     FALSE 0.469 26.000 0.000 NA   NA
 1955847 1955848 CJJ81176_pTet0012 CJJ81176_pTet0013     TRUE 0.869 0.000 0.000 NA   NA
 1955849 1955850 CJJ81176_pTet0014 CJJ81176_pTet0015     TRUE 0.924 29.000 1.000 NA   NA
 1955850 1955851 CJJ81176_pTet0015 CJJ81176_pTet0016     TRUE 0.871 4.000 0.000 NA   NA
 1955851 1955852 CJJ81176_pTet0016 CJJ81176_pTet0017     TRUE 0.561 119.000 0.333 NA   NA
 1955852 1955853 CJJ81176_pTet0017 CJJ81176_pTet0018     FALSE 0.227 108.000 0.000 NA   NA
 1955854 1955855 CJJ81176_pTet0019 CJJ81176_pTet0020     FALSE 0.416 34.000 0.000 NA   NA
 1955856 1955857 CJJ81176_pTet0021 CJJ81176_pTet0022     TRUE 0.884 -7.000 0.222 NA   NA
 1955857 1955858 CJJ81176_pTet0022 CJJ81176_pTet0023     TRUE 0.813 4.000 0.002 NA   NA
 1955859 1955860 CJJ81176_pTet0024 CJJ81176_pTet0025     TRUE 0.911 -3.000 0.200 1.000   NA
 1955860 1955861 CJJ81176_pTet0025 CJJ81176_pTet0026     TRUE 0.926 -9.000 0.400 NA   NA
 1955862 1955863 CJJ81176_pTet0027 CJJ81176_pTet0028     TRUE 0.794 13.000 0.115 NA   NA
 1955863 1955864 CJJ81176_pTet0028 CJJ81176_pTet0029     TRUE 0.841 11.000 0.115 NA   NA
 1955864 1955865 CJJ81176_pTet0029 CJJ81176_pTet0030     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1955865 1955866 CJJ81176_pTet0030 CJJ81176_pTet0031     FALSE 0.416 34.000 0.000 NA   NA
 1955866 1955867 CJJ81176_pTet0031 CJJ81176_pTet0032     TRUE 0.873 16.000 0.333 NA   NA
 1955867 1955868 CJJ81176_pTet0032 CJJ81176_pTet0033     TRUE 0.974 4.000 0.400 NA   NA
 1955868 1955869 CJJ81176_pTet0033 CJJ81176_pTet0034     TRUE 0.837 -3.000 0.091 NA   NA
 1955869 1955870 CJJ81176_pTet0034 CJJ81176_pTet0035     TRUE 0.795 -10.000 0.091 NA   NA
 1955870 1955871 CJJ81176_pTet0035 CJJ81176_pTet0036     TRUE 0.870 -10.000 0.200 NA   NA
 1955871 1955872 CJJ81176_pTet0036 CJJ81176_pTet0037     TRUE 0.976 -3.000 0.600 NA Y NA
 1955872 1955873 CJJ81176_pTet0037 CJJ81176_pTet0038     TRUE 0.955 27.000 1.000 NA Y NA
 1955873 1955874 CJJ81176_pTet0038 CJJ81176_pTet0039     TRUE 0.939 -19.000 0.250 1.000 Y NA
 1955874 1955875 CJJ81176_pTet0039 CJJ81176_pTet0040     TRUE 0.989 1.000 0.429 1.000 Y NA
 1955875 1955876 CJJ81176_pTet0040 CJJ81176_pTet0041     TRUE 0.841 -19.000 0.143 NA   NA
 1955876 1955877 CJJ81176_pTet0041 CJJ81176_pTet0042     TRUE 0.685 12.000 0.000 NA   NA
 1955877 1955878 CJJ81176_pTet0042 CJJ81176_pTet0043     TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 1955878 1955879 CJJ81176_pTet0043 CJJ81176_pTet0044     TRUE 0.797 71.000 0.750 NA   NA
 1955879 1955880 CJJ81176_pTet0044 CJJ81176_pTet0045     FALSE 0.335 264.000 0.120 NA   NA
 1955880 1955881 CJJ81176_pTet0045 CJJ81176_pTet0046     FALSE 0.229 106.000 0.000 NA   NA
 1955881 1955882 CJJ81176_pTet0046 CJJ81176_pTet0047     FALSE 0.554 19.000 0.000 NA   NA
 1955882 1955883 CJJ81176_pTet0047 CJJ81176_pTet0048     FALSE 0.190 359.000 0.000 NA   NA
 1955883 1955884 CJJ81176_pTet0048 CJJ81176_pTet0049     FALSE 0.189 395.000 0.000 NA   NA
 1955884 1955885 CJJ81176_pTet0049 CJJ81176_pTet0050     FALSE 0.200 191.000 0.000 NA   NA
 1957596 1957597 pTet_02 pTet_03     FALSE 0.469 26.000 0.000 NA   NA
 1957597 1957598 pTet_03 pTet_04     TRUE 0.869 0.000 0.000 NA   NA
 1957599 1957600 pTet_05 pTet_06     TRUE 0.924 29.000 1.000 NA   NA
 1957600 1957601 pTet_06 pTet_07     TRUE 0.871 4.000 0.000 NA   NA
 1957601 1957602 pTet_07 pTet_08     TRUE 0.561 119.000 0.333 NA   NA
 1957602 1957603 pTet_08 pTet_09     FALSE 0.227 108.000 0.000 NA   NA
 1957606 1957607 pTet_12 pTet_13     TRUE 0.911 -3.000 0.200 1.000   NA
 1957607 1957608 pTet_13 pTet_14     TRUE 0.641 93.000 0.400 NA   NA
 1957609 1957610 pTet_15 pTet_16     TRUE 0.794 13.000 0.115 NA   NA
 1957610 1957611 pTet_16 pTet_17     TRUE 0.841 11.000 0.115 NA   NA
 1957611 1957612 pTet_17 pTet_18     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957612 1957613 pTet_18 pTet_19     FALSE 0.416 34.000 0.000 NA   NA
 1957613 1957614 pTet_19 pTet_20     TRUE 0.873 16.000 0.333 NA   NA
 1957614 1957615 pTet_20 pTet_21     TRUE 0.974 4.000 0.400 NA   NA
 1957615 1957616 pTet_21 pTet_22     TRUE 0.837 -3.000 0.091 NA   NA
 1957616 1957617 pTet_22 pTet_23     FALSE 0.345 147.000 0.000 NA Y NA
 1957617 1957618 pTet_23 pTet_24     TRUE 0.976 -3.000 0.600 NA Y NA
 1957618 1957619 pTet_24 pTet_25     TRUE 0.993 6.000 1.000 NA Y NA
 1957619 1957620 pTet_25 pTet_26     TRUE 0.939 -19.000 0.250 1.000 Y NA
 1957620 1957621 pTet_26 pTet_27     TRUE 0.989 1.000 0.429 1.000 Y NA
 1957621 1957622 pTet_27 pTet_28     TRUE 0.841 -19.000 0.143 NA   NA
 1957622 1957623 pTet_28 pTet_29     TRUE 0.685 12.000 0.000 NA   NA
 1957623 1957624 pTet_29 pTet_30     TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 1957624 1957625 pTet_30 pTet_31     TRUE 0.797 71.000 0.750 NA   NA
 1957625 1957626 pTet_31 pTet_32     FALSE 0.335 264.000 0.120 NA   NA
 1957626 1957627 pTet_32 pTet_33     FALSE 0.229 106.000 0.000 NA   NA
 1957627 1957628 pTet_33 pTet_34     FALSE 0.187 558.000 0.000 NA   NA
 1957628 1957629 pTet_34 pTet_35     FALSE 0.189 423.000 0.000 NA   NA
 1957629 1957630 pTet_35 pTet_36     FALSE 0.191 297.000 0.000 NA   NA
 1957630 1957631 pTet_36 pTet_37     FALSE 0.199 193.000 0.000 NA   NA
 1957631 1957632 pTet_37 pTet_38     FALSE 0.192 277.000 0.000 NA   NA
 1957632 1957633 pTet_38 pTet_39     TRUE 0.796 174.000 1.000 NA   NA
 1957633 1957634 pTet_39 pTet_40     FALSE 0.206 151.000 0.000 NA   NA
 1957634 1957635 pTet_40 pTet_41     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957635 1957636 pTet_41 pTet_42     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 1957636 1957637 pTet_42 pTet_43     FALSE 0.297 59.000 0.000 NA   NA
 1957637 1957638 pTet_43 pTet_44     TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 1957638 1957595 pTet_44 pTet_01     FALSE 0.347 47.000 0.000 NA   NA
 1957639 1957640 pVir_p01 pVir_p02 virB8 virB9 TRUE 0.994 0.000 1.000 NA Y NA
 1957640 1957641 pVir_p02 pVir_p03 virB9 virB10 TRUE 0.978 -3.000 0.667 NA Y NA
 1957641 1957642 pVir_p03 pVir_p04 virB10 Cjp04 TRUE 0.722 11.000 0.000 NA   NA
 1957642 1957643 pVir_p04 pVir_p05 Cjp04 virB11 TRUE 0.697 -7.000 0.000 NA   NA
 1957643 1957644 pVir_p05 pVir_p06 virB11 virD4 FALSE 0.354 414.000 0.000 1.000 Y NA
 1957644 1957645 pVir_p06 pVir_p07 virD4 Cjp07 FALSE 0.219 119.000 0.000 NA   NA
 1957645 1957646 pVir_p07 pVir_p08 Cjp07 Cjp08 FALSE 0.268 75.000 0.000 NA   NA
 1957646 1957647 pVir_p08 pVir_p09 Cjp08 Cjp09 FALSE 0.192 269.000 0.000 NA   NA
 1957647 1957648 pVir_p09 pVir_p10 Cjp09 Cjp10 TRUE 0.775 10.000 0.000 NA   NA
 1957648 1957649 pVir_p10 pVir_p11 Cjp10 topA TRUE 0.564 22.000 0.000 1.000   NA
 1957649 1957650 pVir_p11 pVir_p12 topA Cjp12 FALSE 0.198 207.000 0.000 NA   NA
 1957650 1957651 pVir_p12 pVir_p13 Cjp12 ssb TRUE 0.601 16.000 0.000 NA   NA
 1957651 1957652 pVir_p13 pVir_p14 ssb Cjp14 FALSE 0.211 136.000 0.000 NA   NA
 1957652 1957653 pVir_p14 pVir_p15 Cjp14 Cjp15 TRUE 0.687 -12.000 0.000 NA   NA
 1957653 1957654 pVir_p15 pVir_p16 Cjp15 Cjp16 TRUE 0.686 -52.000 0.000 NA   NA
 1957654 1957655 pVir_p16 pVir_p17 Cjp16 Cjp17 FALSE 0.484 25.000 0.000 NA   NA
 1957655 1957656 pVir_p17 pVir_p18 Cjp17 Cjp18 TRUE 0.689 -10.000 0.000 NA   NA
 1957656 1957657 pVir_p18 pVir_p19 Cjp18 Cjp19 TRUE 0.821 9.000 0.000 NA   NA
 1957657 1957658 pVir_p19 pVir_p20 Cjp19 Cjp20 TRUE 0.687 -109.000 0.000 NA   NA
 1957658 1957659 pVir_p20 pVir_p21 Cjp20 Cjp21 TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957659 1957660 pVir_p21 pVir_p22 Cjp21 Cjp22 TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957660 1957661 pVir_p22 pVir_p23 Cjp22 Cjp23 TRUE 0.871 4.000 0.000 NA   NA
 1957661 1957662 pVir_p23 pVir_p24 Cjp23 Cjp24 FALSE 0.279 69.000 0.000 NA   NA
 1957662 1957663 pVir_p24 pVir_p25 Cjp24 Cjp25 FALSE 0.208 142.000 0.000 NA   NA
 1957663 1957664 pVir_p25 pVir_p26 Cjp25 Cjp26 FALSE 0.195 244.000 0.000 NA   NA
 1957664 1957665 pVir_p26 pVir_p27 Cjp26 Cjp27 TRUE 0.775 10.000 0.000 NA   NA
 1957667 1957668 pVir_p29 pVir_p30 Cjp29 Cjp30 TRUE 0.923 -3.000 0.286 NA   NA
 1957668 1957669 pVir_p30 pVir_p31 Cjp30 Cjp31 FALSE 0.232 104.000 0.000 NA   NA
 1957669 1957670 pVir_p31 pVir_p32 Cjp31 Cjp32 FALSE 0.430 31.000 0.000 NA   NA
 1957670 1957671 pVir_p32 pVir_p33 Cjp32 Cjp33 TRUE 0.869 0.000 0.000 NA   NA
 1957671 1957672 pVir_p33 pVir_p34 Cjp33 Cjp34 TRUE 0.685 -16.000 0.000 NA   NA
 1957672 1957673 pVir_p34 pVir_p35 Cjp34 Cjp35 FALSE 0.188 475.000 0.000 NA   NA
 1957673 1957674 pVir_p35 pVir_p36 Cjp35 Cjp36 TRUE 0.632 14.000 0.000 NA   NA
 1957674 1957675 pVir_p36 pVir_p37 Cjp36 Cjp37 TRUE 0.775 10.000 0.000 NA   NA
 1957675 1957676 pVir_p37 pVir_p38 Cjp37 Cjp38 FALSE 0.222 114.000 0.000 NA   NA
 1957676 1957677 pVir_p38 pVir_p39 Cjp38 Cjp39 FALSE 0.270 73.000 0.000 NA   NA
 1957677 1957678 pVir_p39 pVir_p40 Cjp39 Cjp40 TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957678 1957679 pVir_p40 pVir_p41 Cjp40 Cjp41 FALSE 0.197 208.000 0.000 NA   NA
 1957679 1957680 pVir_p41 pVir_p42 Cjp41 Cjp42 TRUE 0.685 12.000 0.000 NA   NA
 1957680 1957681 pVir_p42 pVir_p43 Cjp42 Cjp43 FALSE 0.261 80.000 0.000 NA   NA
 1957681 1957682 pVir_p43 pVir_p44 Cjp43 Cjp44 FALSE 0.189 402.000 0.000 NA   NA
 1957682 1957683 pVir_p44 pVir_p45 Cjp44 Cjp45 FALSE 0.398 37.000 0.000 NA   NA
 1957683 1957684 pVir_p45 pVir_p46 Cjp45 Cjp46 FALSE 0.199 197.000 0.000 NA   NA
 1957684 1957685 pVir_p46 pVir_p47 Cjp46 Cjp47 FALSE 0.196 233.000 0.000 NA   NA
 1957685 1957686 pVir_p47 pVir_p48 Cjp47 Cjp48 FALSE 0.194 246.000 0.000 NA   NA
 1957688 1957689 pVir_p50 pVir_p51 Cjp50 Cjp51 FALSE 0.268 75.000 0.000 NA   NA
 1957689 1957690 pVir_p51 pVir_p52 Cjp51 Cjp52 TRUE 0.990 0.000 1.000 NA   NA
 1957690 1957691 pVir_p52 pVir_p53 Cjp52 virB4 TRUE 0.973 10.000 0.750 NA   NA
 1957691 1957692 pVir_p53 pVir_p54 virB4 Cjp54 TRUE 0.869 0.000 0.000 NA   NA
 1957692 1957639 pVir_p54 pVir_p01 Cjp54 virB8 TRUE 0.601 16.000 0.000 NA   NA
 1957693 1957694 pTet_p01 pTet_p02     TRUE 0.730 52.000 0.400 NA   NA
 1957694 1957695 pTet_p02 pTet_p03     FALSE 0.187 550.000 0.000 NA   NA
 1957695 1957696 pTet_p03 pTet_p04     FALSE 0.389 39.000 0.000 NA   NA
 1957696 1957697 pTet_p04 pTet_p05     FALSE 0.199 193.000 0.000 NA   NA
 1957697 1957698 pTet_p05 pTet_p06     FALSE 0.200 186.000 0.000 NA   NA
 1957698 1957699 pTet_p06 pTet_p07     TRUE 0.687 -85.000 0.000 NA   NA
 1957699 1957700 pTet_p07 pTet_p08     TRUE 0.802 142.000 1.000 NA   NA
 1957700 1957701 pTet_p08 pTet_p09     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957701 1957702 pTet_p09 pTet_p10     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957702 1957703 pTet_p10 pTet_p11     TRUE 0.850 5.000 0.000 NA   NA
 1957703 1957704 pTet_p11 pTet_p12     FALSE 0.297 59.000 0.000 NA   NA
 1957704 1957705 pTet_p12 pTet_p13     TRUE 0.889 3.000 0.000 NA   NA
 1957705 1957706 pTet_p13 pTet_p14     FALSE 0.347 47.000 0.000 NA   NA
 1957707 1957708 pTet_p15 pTet_p16     FALSE 0.469 26.000 0.000 NA   NA
 1957708 1957709 pTet_p16 pTet_p17     TRUE 0.869 0.000 0.000 NA   NA
 1957710 1957711 pTet_p18 pTet_p19     TRUE 0.924 29.000 1.000 NA   NA
 1957711 1957712 pTet_p19 pTet_p20     TRUE 0.871 4.000 0.000 NA   NA
 1957712 1957713 pTet_p20 pTet_p21     TRUE 0.561 119.000 0.333 NA   NA
 1957713 1957714 pTet_p21 pTet_p22     FALSE 0.227 108.000 0.000 NA   NA
 1957714 1957715 pTet_p22 pTet_p23     FALSE 0.187 971.000 0.000 NA   NA
 1957715 1957716 pTet_p23 pTet_p24     TRUE 0.884 -7.000 0.222 NA   NA
 1957716 1957717 pTet_p24 pTet_p25     TRUE 0.813 4.000 0.002 NA   NA
 1957718 1957719 pTet_p26 pTet_p27     TRUE 0.911 -3.000 0.200 1.000   NA
 1957719 1957720 pTet_p27 pTet_p28     TRUE 0.926 -9.000 0.400 NA   NA
 1957721 1957722 pTet_p29 pTet_p30     TRUE 0.655 13.000 0.000 NA   NA
 1957722 1957723 pTet_p30 pTet_p31     FALSE 0.198 206.000 0.000 NA   NA
 1957723 1957724 pTet_p31 pTet_p32     TRUE 0.746 -3.000 0.000 NA   NA
 1957724 1957725 pTet_p32 pTet_p33     FALSE 0.416 34.000 0.000 NA   NA
 1957725 1957726 pTet_p33 pTet_p34     TRUE 0.873 16.000 0.333 NA   NA
 1957726 1957727 pTet_p34 pTet_p35     TRUE 0.974 4.000 0.400 NA   NA
 1957727 1957728 pTet_p35 pTet_p36     TRUE 0.961 -3.000 0.600 NA   NA
 1957728 1957729 pTet_p36 pTet_p37     TRUE 0.593 143.000 0.400 NA   NA
 1957729 1957730 pTet_p37 pTet_p38     TRUE 0.870 -10.000 0.200 NA   NA
 1957730 1957731 pTet_p38 pTet_p39     TRUE 0.976 -3.000 0.600 NA Y NA
 1957731 1957732 pTet_p39 pTet_p40     TRUE 0.993 6.000 1.000 NA Y NA
 1957732 1957733 pTet_p40 pTet_p41     TRUE 0.939 -73.000 0.250 1.000 Y NA
 1957733 1957734 pTet_p41 pTet_p42     TRUE 0.989 1.000 0.429 1.000 Y NA
 1957734 1957735 pTet_p42 pTet_p43     TRUE 0.841 -19.000 0.143 NA   NA
 1957735 1957736 pTet_p43 pTet_p44     TRUE 0.685 12.000 0.000 NA   NA
 1957736 1957737 pTet_p44 pTet_p45     FALSE 0.190 337.000 0.000 NA   NA
 1957737 1957738 pTet_p45 pTet_p46     TRUE 0.797 71.000 0.750 NA   NA
 1957738 1957739 pTet_p46 pTet_p47     FALSE 0.335 264.000 0.120 NA   NA
 1957739 1957740 pTet_p47 pTet_p48     FALSE 0.229 106.000 0.000 NA   NA
 1957740 1957741 pTet_p48 pTet_p49     FALSE 0.554 19.000 0.000 NA   NA
 1957741 1957693 pTet_p49 pTet_p01     FALSE 0.190 359.000 0.000 NA   NA
 1957742 1957743 CJJ81176_pVir0001 CJJ81176_pVir0002     TRUE 0.994 0.000 1.000 NA Y NA
 1957743 1957744 CJJ81176_pVir0002 CJJ81176_pVir0003     TRUE 0.978 -3.000 0.667 NA Y NA
 1957744 1957745 CJJ81176_pVir0003 CJJ81176_pVir0004     TRUE 0.722 11.000 0.000 NA   NA
 1957745 1957746 CJJ81176_pVir0004 CJJ81176_pVir0005   trbB TRUE 0.697 -7.000 0.000 NA   NA
 1957746 1957747 CJJ81176_pVir0005 CJJ81176_pVir0006 trbB   TRUE 0.960 10.000 0.500 NA   NA
 1957747 1957748 CJJ81176_pVir0006 CJJ81176_pVir0007     TRUE 0.978 -3.000 1.000 NA   NA
 1957748 1957749 CJJ81176_pVir0007 CJJ81176_pVir0008     FALSE 0.219 119.000 0.000 NA   NA
 1957749 1957750 CJJ81176_pVir0008 CJJ81176_pVir0009     FALSE 0.268 75.000 0.000 NA   NA
 1957750 1957751 CJJ81176_pVir0009 CJJ81176_pVir0010     FALSE 0.207 145.000 0.000 NA   NA
 1957751 1957752 CJJ81176_pVir0010 CJJ81176_pVir0011     TRUE 0.775 10.000 0.000 NA