MicrobesOnline Operon Predictions for Pseudomonas putida F1

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 6982074 6982075 Pput_0001 Pput_0002 dnaA   TRUE 0.943 41.000 0.328 1.000 Y NA
 6982075 6982076 Pput_0002 Pput_0003   recF TRUE 0.976 16.000 0.318 1.000 Y NA
 6982076 6982077 Pput_0003 Pput_0004 recF gyrB TRUE 0.995 5.000 0.249 0.004 Y NA
 6982077 6982078 Pput_0004 Pput_0005 gyrB   FALSE 0.002 837.000 0.000 NA   NA
 6982078 6982079 Pput_0005 Pput_0006     TRUE 0.695 -19.000 0.000 NA   NA
 6982079 6982080 Pput_0006 Pput_0007     TRUE 0.828 -3.000 0.000 1.000   NA
 6982080 6982081 Pput_0007 Pput_0008     FALSE 0.122 76.000 0.000 NA   NA
 6982081 6982082 Pput_0008 Pput_0009     FALSE 0.197 57.000 0.000 NA   NA
 6982082 6982083 Pput_0009 Pput_0010     FALSE 0.005 372.000 0.000 NA   NA
 6982084 6982085 Pput_0011 Pput_0012     TRUE 0.977 -10.000 0.333 NA   NA
 6982085 6982086 Pput_0012 Pput_0013     TRUE 0.989 10.000 0.750 1.000   NA
 6982086 6982087 Pput_0013 Pput_0014     TRUE 0.728 -10.000 0.000 NA   NA
 6982087 6982088 Pput_0014 Pput_0015     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6982088 6982089 Pput_0015 Pput_0016     FALSE 0.073 126.000 0.000 NA   NA
 6982090 6982091 Pput_0017 Pput_0018     TRUE 0.999 0.000 0.800 0.003 Y NA
 6982091 6982092 Pput_0018 Pput_0019     FALSE 0.301 37.000 0.000 NA   NA
 6982092 6982093 Pput_0019 Pput_0020     FALSE 0.405 87.000 0.133 NA   NA
 6982093 6982094 Pput_0020 Pput_0021     TRUE 0.999 -3.000 1.000 1.000 Y NA
 6982094 6982095 Pput_0021 Pput_0022     TRUE 0.983 -3.000 0.333 1.000 N NA
 6982095 6982096 Pput_0022 Pput_0023     TRUE 0.987 -3.000 0.375 NA   NA
 6982096 6982097 Pput_0023 Pput_0024     FALSE 0.019 232.000 0.000 NA   NA
 6982098 6982099 Pput_0025 Pput_0026     TRUE 0.990 -3.000 0.457 NA   NA
 6982099 6982100 Pput_0026 Pput_0027     FALSE 0.385 26.000 0.000 NA   NA
 6982100 6982101 Pput_0027 Pput_0028     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 6982101 6982102 Pput_0028 Pput_0029     FALSE 0.015 266.000 0.000 1.000   NA
 6982102 6982103 Pput_0029 Pput_0030     FALSE 0.037 338.000 0.000 0.003   NA
 6982103 6982104 Pput_0030 Pput_0031     FALSE 0.041 185.000 0.000 NA   NA
 6982105 6982106 Pput_0032 Pput_0033     FALSE 0.005 394.000 0.000 NA   NA
 6982108 6982109 Pput_0035 Pput_0036     FALSE 0.008 311.000 0.000 NA   NA
 6982109 6982110 Pput_0036 Pput_0037     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6982110 6982111 Pput_0037 Pput_0038     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6982113 6982114 Pput_0040 Pput_0041     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 6982116 6982117 Pput_0043 Pput_0044     TRUE 0.988 -3.000 0.000 0.003 Y NA
 6982120 6982121 Pput_0047 Pput_0048     TRUE 0.959 -6.000 0.000 1.000 Y NA
 6982121 6982122 Pput_0048 Pput_0049     TRUE 0.708 -34.000 0.000 1.000   NA
 6982123 6982124 Pput_0050 Pput_0051     FALSE 0.010 211.000 0.000 NA N NA
 6982124 6982125 Pput_0051 Pput_0052     FALSE 0.442 20.000 0.000 NA   NA
 6982125 6982126 Pput_0052 Pput_0053     FALSE 0.065 145.000 0.000 NA   NA
 6982126 6982127 Pput_0053 Pput_0054     FALSE 0.073 128.000 0.000 NA   NA
 6982128 6982129 Pput_0055 Pput_0056     FALSE 0.031 203.000 0.000 NA   NA
 6982129 6982130 Pput_0056 Pput_0057     FALSE 0.055 163.000 0.000 NA   NA
 6982130 6982131 Pput_0057 Pput_0058     TRUE 0.921 25.000 0.421 1.000 N NA
 6982131 6982132 Pput_0058 Pput_0059     TRUE 0.893 69.000 0.368 1.000 Y NA
 6982133 6982134 Pput_0060 Pput_0061     FALSE 0.004 489.000 0.000 1.000   NA
 6982134 6982135 Pput_0061 Pput_0062     FALSE 0.073 118.000 0.000 NA   NA
 6982136 6982137 Pput_0063 Pput_0064     FALSE 0.075 106.000 0.000 NA   NA
 6982137 6982138 Pput_0064 Pput_0065     TRUE 0.572 13.000 0.000 NA   NA
 6982138 6982139 Pput_0065 Pput_0066     FALSE 0.003 691.000 0.000 NA   NA
 6982139 6982140 Pput_0066 Pput_0067     FALSE 0.071 132.000 0.000 NA   NA
 6982141 6982142 Pput_0068 Pput_0069     TRUE 0.812 41.000 0.230 1.000   NA
 6982142 6982143 Pput_0069 Pput_0070     TRUE 0.963 -3.000 0.122 1.000   NA
 6982145 6982146 Pput_0072 Pput_0073     FALSE 0.257 98.000 0.094 1.000 N NA
 6982147 6982148 Pput_0074 Pput_0075     TRUE 0.801 47.000 0.310 1.000 N NA
 6982148 6982149 Pput_0075 Pput_0076   glyS TRUE 0.932 4.000 0.123 1.000 N NA
 6982149 6982150 Pput_0076 Pput_0077 glyS glyQ TRUE 0.999 -3.000 0.651 0.001 Y NA
 6982151 6982152 Pput_0078 Pput_0079     FALSE 0.271 42.000 0.017 1.000 N NA
 6982153 6982154 Pput_0080 Pput_0081   trkA TRUE 0.684 12.000 0.008 1.000   NA
 6982154 6982155 Pput_0081 Pput_0082 trkA   TRUE 0.759 24.000 0.122 1.000 N NA
 6982155 6982156 Pput_0082 Pput_0083   fmt TRUE 0.994 -3.000 0.305 1.000 Y NA
 6982156 6982157 Pput_0083 Pput_0084 fmt def TRUE 0.888 61.000 0.105 0.017 Y NA
 6982158 6982159 Pput_0085 Pput_0086     FALSE 0.275 43.000 0.023 NA N NA
 6982159 6982160 Pput_0086 Pput_0087     FALSE 0.005 380.000 0.000 NA   NA
 6982162 6982163 Pput_0089 Pput_0090   aroE TRUE 0.706 26.000 0.093 1.000 N NA
 6982164 6982165 Pput_0091 Pput_0092     TRUE 0.568 145.000 0.259 0.066 N NA
 6982165 6982166 Pput_0092 Pput_0093     TRUE 0.897 15.000 0.218 1.000 N NA
 6982170 6982171 Pput_0097 Pput_0098 trpA   TRUE 0.989 -3.000 0.000 0.001 Y NA
 6982174 6982175 Pput_0101 Pput_0102     FALSE 0.201 101.000 0.049 NA   NA
 6982177 6982178 Pput_0104 Pput_0105     FALSE 0.211 76.000 0.026 NA   NA
 6982179 6982180 Pput_0106 Pput_0107     FALSE 0.204 56.000 0.000 NA   NA
 6982182 6982183 Pput_0109 Pput_0110     TRUE 0.876 -3.000 0.016 1.000   NA
 6982184 6982185 Pput_0111 Pput_0112     TRUE 0.969 -3.000 0.173 NA   NA
 6982185 6982186 Pput_0112 Pput_0113     FALSE 0.372 125.000 0.173 NA   NA
 6982186 6982187 Pput_0113 Pput_0114     FALSE 0.071 71.000 0.000 1.000 N NA
 6982187 6982188 Pput_0114 Pput_0115     FALSE 0.004 304.000 0.000 1.000 N NA
 6982188 6982189 Pput_0115 Pput_0116     TRUE 0.535 193.000 0.241 1.000 Y NA
 6982190 6982191 Pput_0117 Pput_0118     FALSE 0.073 112.000 0.000 NA   NA
 6982192 6982193 Pput_0119 Pput_0120     TRUE 0.988 44.000 0.741 0.003 Y NA
 6982193 6982194 Pput_0120 Pput_0121     TRUE 0.954 10.000 0.268 1.000 N NA
 6982194 6982195 Pput_0121 Pput_0122     TRUE 0.957 17.000 0.536 1.000 N NA
 6982197 6982198 Pput_0124 Pput_0125     TRUE 0.989 -31.000 0.722 NA   NA
 6982198 6982199 Pput_0125 Pput_0126     TRUE 0.959 10.000 0.255 NA   NA
 6982199 6982200 Pput_0126 Pput_0127     TRUE 0.990 -15.000 0.321 1.000 Y NA
 6982200 6982201 Pput_0127 Pput_0128     TRUE 0.957 -3.000 0.099 1.000   NA
 6982202 6982203 Pput_0129 Pput_0130     TRUE 0.964 65.000 0.867 NA Y NA
 6982203 6982204 Pput_0130 Pput_0131     TRUE 0.996 0.000 0.469 1.000 Y NA
 6982206 6982207 Pput_0133 Pput_0134     FALSE 0.173 127.000 0.037 1.000   NA
 6982207 6982208 Pput_0134 Pput_0135     TRUE 0.997 -7.000 0.755 1.000 Y NA
 6982208 6982209 Pput_0135 Pput_0136     TRUE 0.994 -3.000 0.309 1.000 Y NA
 6982211 6982212 Pput_0138 Pput_0139     TRUE 0.605 70.000 0.204 NA   NA
 6982215 6982216 Pput_0142 Pput_0143     TRUE 0.895 32.000 0.000 0.012 Y NA
 6982216 6982217 Pput_0143 Pput_0144     FALSE 0.030 152.000 0.000 1.000 N NA
 6982217 6982218 Pput_0144 Pput_0145     TRUE 0.904 13.000 0.162 NA   NA
 6982218 6982219 Pput_0145 Pput_0146     TRUE 0.793 28.000 0.147 NA   NA
 6982219 6982220 Pput_0146 Pput_0147     TRUE 0.680 74.000 0.350 1.000 N NA
 6982220 6982221 Pput_0147 Pput_0148     FALSE 0.210 191.000 0.200 NA N NA
 6982222 6982223 Pput_0149 Pput_0150     TRUE 0.996 -3.000 0.455 1.000 Y NA
 6982224 6982225 Pput_0151 Pput_0152     FALSE 0.047 173.000 0.000 NA   NA
 6982225 6982226 Pput_0152 Pput_0153     FALSE 0.265 44.000 0.000 NA   NA
 6982226 6982227 Pput_0153 Pput_0154     TRUE 0.954 3.000 0.140 NA   NA
 6982227 6982228 Pput_0154 Pput_0155   gltP FALSE 0.002 744.000 0.000 NA   NA
 6982228 6982229 Pput_0155 Pput_0156 gltP   FALSE 0.172 148.000 0.047 1.000   NA
 6982230 6982231 Pput_0157 Pput_0158     TRUE 0.974 -3.000 0.201 NA   NA
 6982231 6982232 Pput_0158 Pput_0159     TRUE 0.996 4.000 0.650 NA Y NA
 6982232 6982233 Pput_0159 Pput_0160     TRUE 0.996 -3.000 0.491 NA Y NA
 6982233 6982234 Pput_0160 Pput_0161     FALSE 0.118 202.000 0.075 NA   NA
 6982234 6982235 Pput_0161 Pput_0162     FALSE 0.340 94.000 0.109 NA   NA
 6982235 6982236 Pput_0162 Pput_0163     TRUE 0.947 31.000 0.600 1.000   NA
 6982236 6982237 Pput_0163 Pput_0164     FALSE 0.074 283.000 0.000 1.000 Y NA
 6982237 6982238 Pput_0164 Pput_0165     TRUE 0.569 70.000 0.085 0.081 N NA
 6982240 6982241 Pput_0167 Pput_0168     TRUE 0.989 6.000 0.647 NA   NA
 6982241 6982242 Pput_0168 Pput_0169     TRUE 0.947 37.000 0.727 NA   NA
 6982242 6982243 Pput_0169 Pput_0170     TRUE 0.830 90.000 0.800 NA   NA
 6982243 6982244 Pput_0170 Pput_0171     FALSE 0.008 312.000 0.000 NA   NA
 6982244 6982245 Pput_0171 Pput_0172     FALSE 0.004 434.000 0.000 NA   NA
 6982245 6982246 Pput_0172 Pput_0173     FALSE 0.382 187.000 0.077 1.000 Y NA
 6982246 6982247 Pput_0173 Pput_0174     TRUE 0.985 3.000 0.144 0.001   NA
 6982247 6982248 Pput_0174 Pput_0175     TRUE 0.995 12.000 0.829 0.001   NA
 6982248 6982249 Pput_0175 Pput_0176     FALSE 0.002 420.000 0.000 1.000 N NA
 6982250 6982251 Pput_0177 Pput_0178     TRUE 0.861 14.000 0.143 1.000 N NA
 6982251 6982252 Pput_0178 Pput_R0001     FALSE 0.003 557.000 0.000 NA   NA
 6982252 6982253 Pput_R0001 Pput_R0002     FALSE 0.011 281.000 0.000 NA   NA
 6982253 6982254 Pput_R0002 Pput_R0003     FALSE 0.073 124.000 0.000 NA   NA
 6982254 6982255 Pput_R0003 Pput_R0004     FALSE 0.073 110.000 0.000 NA   NA
 6982256 6982257 Pput_0179 Pput_0180     TRUE 0.670 94.000 0.160 NA Y NA
 6982257 6982258 Pput_0180 Pput_0181     TRUE 0.980 5.000 0.444 NA N NA
 6982258 6982259 Pput_0181 Pput_0182     TRUE 0.610 89.000 0.000 0.059 Y NA
 6982260 6982261 Pput_0183 Pput_0184     TRUE 0.957 11.000 0.273 NA   NA
 6982262 6982263 Pput_0185 Pput_0186     TRUE 0.989 -10.000 0.447 0.081 N NA
 6982264 6982265 Pput_0187 Pput_0188     FALSE 0.010 293.000 0.000 NA   NA
 6982265 6982266 Pput_0188 Pput_0189     FALSE 0.064 146.000 0.000 NA   NA
 6982266 6982267 Pput_0189 Pput_0190     FALSE 0.033 199.000 0.000 NA   NA
 6982267 6982268 Pput_0190 Pput_0191     TRUE 0.963 18.000 0.647 NA N NA
 6982268 6982269 Pput_0191 Pput_0192     TRUE 0.994 7.000 0.553 NA Y NA
 6982269 6982270 Pput_0192 Pput_0193     TRUE 0.992 15.000 0.795 1.000 Y NA
 6982272 6982273 Pput_0195 Pput_0196     FALSE 0.031 208.000 0.000 1.000   NA
 6982273 6982274 Pput_0196 Pput_0197     TRUE 0.990 -3.000 0.444 NA   NA
 6982274 6982275 Pput_0197 Pput_0198     TRUE 0.986 -3.000 0.353 NA   NA
 6982275 6982276 Pput_0198 Pput_0199     TRUE 0.992 -3.000 0.529 NA   NA
 6982276 6982277 Pput_0199 Pput_0200     TRUE 0.994 -3.000 0.800 1.000 N NA
 6982277 6982278 Pput_0200 Pput_0201     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 6982278 6982279 Pput_0201 Pput_0202     FALSE 0.107 81.000 0.000 NA   NA
 6982280 6982281 Pput_0203 Pput_0204     TRUE 0.598 70.000 0.200 NA   NA
 6982284 6982285 Pput_0207 Pput_0208   hemC FALSE 0.109 119.000 0.032 1.000 N NA
 6982285 6982286 Pput_0208 Pput_0209 hemC   TRUE 0.996 -3.000 0.205 0.001 Y NA
 6982286 6982287 Pput_0209 Pput_0210     TRUE 0.966 46.000 0.600 1.000 Y NA
 6982287 6982288 Pput_0210 Pput_0211     TRUE 0.998 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 6982288 6982289 Pput_0211 Pput_0212     FALSE 0.043 223.000 0.042 1.000 N NA
 6982289 6982290 Pput_0212 Pput_0213     FALSE 0.091 232.000 0.133 1.000 N NA
 6982294 6982295 Pput_0217 Pput_0218     TRUE 0.955 0.000 0.108 NA   NA
 6982295 6982296 Pput_0218 Pput_0219     FALSE 0.123 199.000 0.075 NA   NA
 6982297 6982298 Pput_0220 Pput_0221     TRUE 0.994 -3.000 0.330 NA Y NA
 6982299 6982300 Pput_0222 Pput_0223     TRUE 0.876 62.000 0.600 NA   NA
 6982300 6982301 Pput_0223 Pput_0224     FALSE 0.144 70.000 0.000 NA   NA
 6982302 6982303 Pput_0225 Pput_0226     FALSE 0.055 171.000 0.000 1.000   NA
 6982303 6982304 Pput_0226 Pput_R0005     FALSE 0.069 136.000 0.000 NA   NA
 6982305 6982306 Pput_0227 Pput_0228   gabD FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 6982306 6982307 Pput_0228 Pput_0229 gabD   FALSE 0.342 183.000 0.303 1.000 N NA
 6982307 6982308 Pput_0229 Pput_0230     FALSE 0.324 138.000 0.182 1.000 N NA
 6982309 6982310 Pput_0231 Pput_0232     FALSE 0.501 100.000 0.294 1.000 N NA
 6982312 6982313 Pput_0234 Pput_0235     TRUE 0.987 -10.000 0.222 1.000 Y NA
 6982313 6982314 Pput_0235 Pput_0236     TRUE 0.998 2.000 0.800 NA Y NA
 6982314 6982315 Pput_0236 Pput_0237     TRUE 0.976 -7.000 0.346 NA N NA
 6982315 6982316 Pput_0237 Pput_0238     TRUE 0.987 0.000 0.452 NA N NA
 6982316 6982317 Pput_0238 Pput_0239     TRUE 0.908 142.000 0.500 0.006 Y NA
 6982317 6982318 Pput_0239 Pput_0240     FALSE 0.004 318.000 0.000 1.000 N NA
 6982318 6982319 Pput_0240 Pput_0241     TRUE 0.986 3.000 0.150 1.000 Y NA
 6982319 6982320 Pput_0241 Pput_0242     TRUE 0.992 -3.000 0.100 0.083 Y NA
 6982321 6982322 Pput_0243 Pput_0244     FALSE 0.006 271.000 0.000 1.000 N NA
 6982323 6982324 Pput_0245 Pput_0246 tauD   TRUE 0.950 7.000 0.214 1.000 N NA
 6982324 6982325 Pput_0246 Pput_0247   tauB TRUE 0.998 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 6982325 6982326 Pput_0247 Pput_0248 tauB   TRUE 0.938 14.000 0.058 1.000 Y NA
 6982327 6982328 Pput_0249 Pput_0250     FALSE 0.060 166.000 0.000 1.000   NA
 6982328 6982329 Pput_0250 Pput_0251     FALSE 0.050 219.000 0.028 1.000   NA
 6982329 6982330 Pput_0251 Pput_0252     FALSE 0.498 86.000 0.193 1.000   NA
 6982330 6982331 Pput_0252 Pput_0253     TRUE 0.593 60.000 0.176 1.000 N NA
 6982331 6982332 Pput_0253 Pput_0254     TRUE 0.939 11.000 0.226 1.000 N NA
 6982332 6982333 Pput_0254 Pput_0255   ssuB TRUE 0.996 -3.000 0.472 1.000 Y NA
 6982333 6982334 Pput_0255 Pput_0256 ssuB   TRUE 0.771 28.000 0.161 1.000 N NA
 6982335 6982336 Pput_0257 Pput_0258     TRUE 0.656 0.000 0.000 1.000 N NA
 6982336 6982337 Pput_0258 Pput_0259     FALSE 0.102 139.000 0.036 NA N NA
 6982337 6982338 Pput_0259 Pput_0260     TRUE 0.865 0.000 0.036 NA N NA
 6982339 6982340 Pput_0261 Pput_0262 ompR   TRUE 0.994 14.000 0.584 0.036 Y NA
 6982341 6982342 Pput_0263 Pput_0264     TRUE 0.946 -3.000 0.102 1.000 N NA
 6982345 6982346 Pput_0267 Pput_0268 hslO   FALSE 0.088 180.000 0.048 1.000 N NA
 6982346 6982347 Pput_0268 Pput_0269     FALSE 0.011 282.000 0.000 NA   NA
 6982348 6982349 Pput_0270 Pput_0271     FALSE 0.034 197.000 0.000 NA   NA
 6982349 6982350 Pput_0271 Pput_0272     TRUE 0.998 6.000 0.571 0.003 Y NA
 6982353 6982354 Pput_0275 Pput_0276 nudE   TRUE 0.988 -3.000 0.373 1.000   NA
 6982355 6982356 Pput_0277 Pput_0278     TRUE 0.905 0.000 0.035 NA   NA
 6982356 6982357 Pput_0278 Pput_0279     TRUE 0.995 -3.000 0.375 1.000 Y NA
 6982357 6982358 Pput_0279 Pput_0280     TRUE 0.618 43.000 0.111 1.000 N NA
 6982359 6982360 Pput_0281 Pput_0282     FALSE 0.256 195.000 0.214 NA   NA
 6982363 6982364 Pput_0285 Pput_0286     FALSE 0.008 246.000 0.000 1.000 N NA
 6982364 6982365 Pput_0286 Pput_0287     TRUE 0.998 2.000 0.800 1.000 Y NA
 6982368 6982369 Pput_0290 Pput_0291     TRUE 0.814 42.000 0.250 NA   NA
 6982369 6982370 Pput_0291 Pput_0292     FALSE 0.004 421.000 0.000 NA   NA
 6982371 6982372 Pput_0293 Pput_R0006     FALSE 0.010 294.000 0.000 NA   NA
 6982372 6982373 Pput_R0006 Pput_0294     FALSE 0.081 99.000 0.000 NA   NA
 6982374 6982375 Pput_0295 Pput_0296     TRUE 0.705 7.000 0.000 NA   NA
 6982376 6982377 Pput_0297 Pput_0298     FALSE 0.181 112.000 0.046 NA   NA
 6982377 6982378 Pput_0298 Pput_0299     TRUE 0.995 0.000 0.195 0.012 Y NA
 6982378 6982379 Pput_0299 Pput_0300     TRUE 0.911 55.000 0.169 0.083 Y NA
 6982379 6982380 Pput_0300 Pput_0301     TRUE 0.995 12.000 0.824 1.000 Y NA
 6982382 6982383 Pput_0303 Pput_0304     FALSE 0.038 188.000 0.000 NA   NA
 6982383 6982384 Pput_0304 Pput_R0007     FALSE 0.049 171.000 0.000 NA   NA
 6982384 6982385 Pput_R0007 Pput_0305     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6982385 6982386 Pput_0305 Pput_0306     TRUE 0.957 -3.000 0.150 NA N NA
 6982386 6982387 Pput_0306 Pput_0307     TRUE 0.859 -3.000 0.033 NA N NA
 6982388 6982389 Pput_0308 Pput_0309   hisB FALSE 0.020 231.000 0.000 NA   NA
 6982389 6982390 Pput_0309 Pput_0310 hisB hisH TRUE 0.994 1.000 0.111 0.003 Y NA
 6982390 6982391 Pput_0310 Pput_0311 hisH   TRUE 0.934 1.000 0.069 NA   NA
 6982391 6982392 Pput_0311 Pput_0312     FALSE 0.464 28.000 0.016 NA   NA
 6982392 6982393 Pput_0312 Pput_0313     TRUE 0.995 11.000 0.433 0.003 Y NA
 6982394 6982395 Pput_0314 Pput_0315     TRUE 0.998 -3.000 0.844 1.000 Y NA
 6982395 6982396 Pput_0315 Pput_0316     TRUE 0.892 85.000 0.328 0.064 Y NA
 6982397 6982398 Pput_0317 Pput_0318     FALSE 0.002 502.000 0.000 1.000 N NA
 6982401 6982402 Pput_0321 Pput_0322     TRUE 0.973 11.000 0.419 NA   NA
 6982402 6982403 Pput_0322 Pput_0323     TRUE 0.641 171.000 0.608 1.000   NA
 6982403 6982404 Pput_0323 Pput_0324     FALSE 0.255 124.000 0.074 1.000   NA
 6982406 6982407 Pput_0326 Pput_0327     FALSE 0.136 72.000 0.000 NA   NA
 6982407 6982408 Pput_0327 Pput_0328     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 6982409 6982410 Pput_0329 Pput_0330     TRUE 0.884 77.000 0.868 1.000   NA
 6982410 6982411 Pput_0330 Pput_0331     TRUE 0.983 16.000 0.912 1.000   NA
 6982411 6982412 Pput_0331 Pput_0332     TRUE 0.868 179.000 0.574 0.048 Y NA
 6982412 6982413 Pput_0332 Pput_0333     TRUE 0.997 0.000 0.667 1.000 Y NA
 6982413 6982414 Pput_0333 Pput_0334     TRUE 0.997 11.000 0.776 0.019 Y NA
 6982414 6982415 Pput_0334 Pput_0335     FALSE 0.003 601.000 0.000 NA   NA
 6982417 6982418 Pput_0337 Pput_0338     FALSE 0.088 94.000 0.000 NA   NA
 6982420 6982421 Pput_0340 Pput_0341     TRUE 0.866 -3.000 0.017 NA   NA
 6982421 6982422 Pput_0341 Pput_0342     FALSE 0.008 322.000 0.005 NA   NA
 6982424 6982425 Pput_0344 Pput_0345     TRUE 0.979 16.000 0.357 1.000 Y NA
 6982425 6982426 Pput_0345 Pput_0346     TRUE 0.997 15.000 0.824 0.001 Y NA
 6982426 6982427 Pput_0346 Pput_0347     TRUE 0.998 -3.000 0.824 0.001   NA
 6982427 6982428 Pput_0347 Pput_0348     TRUE 0.851 171.000 0.778 0.001   NA
 6982428 6982429 Pput_0348 Pput_0349     TRUE 0.948 12.000 0.303 1.000 N NA
 6982429 6982430 Pput_0349 Pput_0350     FALSE 0.036 302.000 0.103 1.000 N NA
 6982436 6982437 Pput_0356 Pput_0357     FALSE 0.195 148.000 0.085 1.000 N NA
 6982437 6982438 Pput_0357 Pput_0358     TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 6982438 6982439 Pput_0358 Pput_0359     FALSE 0.485 108.000 0.311 NA N NA
 6982440 6982441 Pput_0360 Pput_0361     TRUE 0.953 4.000 0.000 NA Y NA
 6982441 6982442 Pput_0361 Pput_0362     FALSE 0.107 115.000 0.032 1.000 N NA
 6982442 6982443 Pput_0362 Pput_0363     FALSE 0.003 322.000 0.000 1.000 N NA
 6982443 6982444 Pput_0363 Pput_0364   aceE TRUE 0.964 14.000 0.167 1.000 Y NA
 6982445 6982446 Pput_0365 Pput_0366     FALSE 0.016 235.000 0.014 1.000 N NA
 6982446 6982447 Pput_0366 Pput_0367     TRUE 0.996 1.000 0.205 0.001 Y NA
 6982447 6982448 Pput_0367 Pput_0368     TRUE 0.991 0.000 0.217 1.000 Y NA
 6982448 6982449 Pput_0368 Pput_0369     TRUE 0.980 -3.000 0.241 1.000   NA
 6982449 6982450 Pput_0369 Pput_0370     TRUE 0.986 0.000 0.133 0.002   NA
 6982450 6982451 Pput_0370 Pput_0371     TRUE 0.973 -3.000 0.027 0.002   NA
 6982451 6982452 Pput_0371 Pput_0372     TRUE 0.969 0.000 0.019 0.002   NA
 6982453 6982454 Pput_0373 Pput_0374     FALSE 0.152 68.000 0.000 NA   NA
 6982454 6982455 Pput_0374 Pput_0375     TRUE 0.989 -3.000 0.417 NA   NA
 6982455 6982456 Pput_0375 Pput_0376     TRUE 0.797 57.000 0.333 NA   NA
 6982456 6982457 Pput_0376 Pput_0377     TRUE 0.552 254.000 0.600 NA Y NA
 6982457 6982458 Pput_0377 Pput_0378     TRUE 0.996 -3.000 1.000 NA N NA
 6982458 6982459 Pput_0378 Pput_0379     FALSE 0.054 204.000 0.039 1.000 N NA
 6982459 6982460 Pput_0379 Pput_0380     TRUE 0.986 -3.000 0.392 1.000 N NA
 6982464 6982465 Pput_0384 Pput_0385     FALSE 0.250 65.000 0.020 NA   NA
 6982465 6982466 Pput_0385 Pput_0386     FALSE 0.091 159.000 0.019 NA   NA
 6982466 6982467 Pput_0386 Pput_0387     FALSE 0.304 50.000 0.009 1.000   NA
 6982468 6982469 Pput_0388 Pput_0389     TRUE 0.995 2.000 0.168 0.001 Y NA
 6982469 6982470 Pput_0389 Pput_0390     TRUE 0.938 -7.000 0.092 1.000   NA
 6982470 6982471 Pput_0390 Pput_0391     TRUE 0.944 -19.000 0.163 1.000   NA
 6982471 6982472 Pput_0391 Pput_0392   bioD TRUE 0.984 11.000 0.063 0.001 Y NA
 6982472 6982473 Pput_0392 Pput_0393 bioD   FALSE 0.227 212.000 0.244 NA   NA
 6982473 6982474 Pput_0393 Pput_0394     FALSE 0.010 289.000 0.000 NA   NA
 6982474 6982475 Pput_0394 Pput_0395     FALSE 0.072 302.000 0.227 1.000 N NA
 6982475 6982476 Pput_0395 Pput_0396     FALSE 0.432 125.000 0.250 1.000 N NA
 6982478 6982479 Pput_0398 Pput_0399     FALSE 0.101 148.000 0.016 1.000   NA
 6982480 6982481 Pput_0400 Pput_0401     TRUE 0.913 -34.000 0.088 1.000   NA
 6982481 6982482 Pput_0401 Pput_0402     TRUE 0.989 2.000 0.211 0.002   NA
 6982482 6982483 Pput_0402 Pput_0403     TRUE 0.992 -3.000 0.246 0.002   NA
 6982483 6982484 Pput_0403 Pput_0404     TRUE 0.871 163.000 0.825 0.002   NA
 6982484 6982485 Pput_0404 Pput_0405     FALSE 0.048 310.000 0.000 0.002   NA
 6982485 6982486 Pput_0405 Pput_0406     TRUE 0.919 12.000 0.161 1.000   NA
 6982486 6982487 Pput_0406 Pput_0407     TRUE 0.928 15.000 0.258 1.000   NA
 6982487 6982488 Pput_0407 Pput_0408     FALSE 0.043 313.000 0.161 1.000 N NA
 6982491 6982492 Pput_0411 Pput_0412     TRUE 0.829 9.000 0.032 NA   NA
 6982492 6982493 Pput_0412 Pput_0413     TRUE 0.713 -13.000 0.000 NA   NA
 6982494 6982495 Pput_0414 Pput_0415     FALSE 0.016 249.000 0.000 NA   NA
 6982496 6982497 Pput_0416 Pput_0417     FALSE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 6982498 6982499 Pput_0419 Pput_R0008     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 6982499 6982500 Pput_R0008 Pput_0420     FALSE 0.478 17.000 0.000 NA   NA
 6982500 6982501 Pput_0420 Pput_0421     FALSE 0.061 128.000 0.013 1.000 N NA
 6982501 6982502 Pput_0421 Pput_0422   dnaG TRUE 0.679 68.000 0.299 1.000 N NA
 6982502 6982503 Pput_0422 Pput_0423 dnaG rpsU FALSE 0.024 305.000 0.067 1.000 N NA
 6982506 6982507 Pput_0426 Pput_0427     TRUE 0.995 -9.000 0.500 1.000 Y NA
 6982508 6982509 Pput_0428 Pput_0429 cca   FALSE 0.362 56.000 0.032 NA   NA
 6982509 6982510 Pput_0429 Pput_0430     TRUE 0.995 -3.000 0.761 NA   NA
 6982510 6982511 Pput_0430 Pput_0431     TRUE 0.712 156.000 0.683 NA   NA
 6982511 6982512 Pput_0431 Pput_0432   glpE FALSE 0.004 283.000 0.000 NA N NA
 6982512 6982513 Pput_0432 Pput_0433 glpE apaH TRUE 0.757 15.000 0.045 1.000   NA
 6982513 6982514 Pput_0433 Pput_0434 apaH apaG TRUE 0.980 0.000 0.267 NA   NA
 6982514 6982515 Pput_0434 Pput_0435 apaG ksgA FALSE 0.098 198.000 0.078 NA N NA
 6982515 6982516 Pput_0435 Pput_0436 ksgA pdxA TRUE 0.968 -3.000 0.197 1.000 N NA
 6982516 6982517 Pput_0436 Pput_0437 pdxA   TRUE 0.991 -3.000 0.561 1.000 N NA
 6982517 6982518 Pput_0437 Pput_0438     TRUE 0.873 -19.000 0.070 1.000 N NA
 6982519 6982520 Pput_0439 Pput_0440     TRUE 0.993 -3.000 0.642 NA   NA
 6982520 6982521 Pput_0440 Pput_0441     TRUE 0.930 2.000 0.091 1.000 N NA
 6982523 6982524 Pput_0443 Pput_0444     TRUE 0.997 11.000 0.667 0.035 Y NA
 6982524 6982525 Pput_0444 Pput_0445     FALSE 0.040 296.000 0.111 1.000 N NA
 6982525 6982526 Pput_0445 Pput_0446     TRUE 0.968 41.000 0.556 1.000 Y NA
 6982526 6982527 Pput_0446 Pput_0447     TRUE 0.876 61.000 0.108 0.064 Y NA
 6982527 6982528 Pput_0447 Pput_0448     TRUE 0.985 11.000 0.145 0.064 Y NA
 6982528 6982529 Pput_0448 Pput_0449     FALSE 0.042 150.000 0.007 1.000 N NA
 6982529 6982530 Pput_0449 Pput_0450     TRUE 0.962 -3.000 0.120 1.000   NA
 6982530 6982531 Pput_0450 Pput_0451     TRUE 0.650 70.000 0.233 1.000   NA
 6982533 6982534 Pput_0453 Pput_0454   trpD TRUE 0.972 10.000 0.105 1.000 Y NA
 6982534 6982535 Pput_0454 Pput_0455 trpD trpC TRUE 0.994 -3.000 0.293 1.000 Y NA
 6982535 6982536 Pput_0455 Pput_0456 trpC   FALSE 0.054 147.000 0.013 1.000 N NA
 6982539 6982540 Pput_0459 Pput_0460     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6982540 6982541 Pput_0460 Pput_0461     FALSE 0.161 66.000 0.018 1.000 N NA
 6982541 6982542 Pput_0461 Pput_0462     FALSE 0.225 64.000 0.008 1.000   NA
 6982542 6982543 Pput_0462 Pput_0463     FALSE 0.452 68.000 0.000 0.048   NA
 6982543 6982544 Pput_0463 Pput_0464     FALSE 0.503 29.000 0.024 NA   NA
 6982545 6982546 Pput_0465 Pput_0466 argC   FALSE 0.157 100.000 0.031 NA   NA
 6982547 6982548 Pput_0467 Pput_0468 anmK   TRUE 0.949 4.000 0.184 NA N NA
 6982549 6982550 Pput_0469 Pput_R0009     FALSE 0.003 575.000 0.000 NA   NA
 6982550 6982551 Pput_R0009 Pput_R0010     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6982551 6982552 Pput_R0010 Pput_R0011     TRUE 0.705 7.000 0.000 NA   NA
 6982552 6982553 Pput_R0011 Pput_R0012     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 6982553 6982554 Pput_R0012 Pput_R0013     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6982554 6982555 Pput_R0013 Pput_0470     FALSE 0.042 182.000 0.000 NA   NA
 6982555 6982556 Pput_0470 Pput_0471     TRUE 0.935 -10.000 0.147 1.000 N NA
 6982556 6982557 Pput_0471 Pput_0472     TRUE 0.761 8.000 0.012 NA   NA
 6982557 6982558 Pput_0472 Pput_R0014     FALSE 0.060 153.000 0.000 NA   NA
 6982558 6982559 Pput_R0014 Pput_R0015     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6982559 6982560 Pput_R0015 Pput_R0016     FALSE 0.351 30.000 0.000 NA   NA
 6982560 6982561 Pput_R0016 Pput_0473     FALSE 0.113 79.000 0.000 NA   NA
 6982561 6982562 Pput_0473 Pput_R0017     FALSE 0.210 55.000 0.000 NA   NA
 6982562 6982563 Pput_R0017 Pput_0474   secE FALSE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 6982563 6982564 Pput_0474 Pput_0475 secE nusG TRUE 0.989 10.000 0.843 1.000 N NA
 6982564 6982565 Pput_0475 Pput_0476 nusG rplK TRUE 0.730 120.000 0.681 1.000 N NA
 6982565 6982566 Pput_0476 Pput_0477 rplK rplA TRUE 0.999 0.000 0.838 0.014 Y NA
 6982566 6982567 Pput_0477 Pput_0478 rplA rplJ TRUE 0.857 111.000 0.302 0.014 Y NA
 6982567 6982568 Pput_0478 Pput_0479 rplJ rplL TRUE 0.974 77.000 0.884 0.010 Y NA
 6982568 6982569 Pput_0479 Pput_0480 rplL rpoB FALSE 0.200 221.000 0.223 1.000   NA
 6982569 6982570 Pput_0480 Pput_0481 rpoB   TRUE 0.962 65.000 0.851 0.001   NA
 6982570 6982571 Pput_0481 Pput_0482   rpsL FALSE 0.111 212.000 0.122 1.000 N NA
 6982571 6982572 Pput_0482 Pput_0483 rpsL   TRUE 0.940 107.000 0.620 0.002 Y NA
 6982572 6982573 Pput_0483 Pput_0484     TRUE 0.977 31.000 0.579 1.000 Y NA
 6982573 6982574 Pput_0484 Pput_0485     TRUE 0.986 28.000 0.400 0.001 Y NA
 6982574 6982575 Pput_0485 Pput_0486   rpsJ TRUE 0.744 142.000 0.318 1.000 Y NA
 6982575 6982576 Pput_0486 Pput_0487 rpsJ rplC TRUE 0.903 81.000 0.307 0.014 Y NA
 6982576 6982577 Pput_0487 Pput_0488 rplC rplD TRUE 0.994 13.000 0.486 0.010 Y NA
 6982577 6982578 Pput_0488 Pput_0489 rplD rplW TRUE 0.997 -3.000 0.513 1.000 Y NA
 6982578 6982579 Pput_0489 Pput_0490 rplW rplB TRUE 0.993 15.000 0.849 1.000 Y NA
 6982579 6982580 Pput_0490 Pput_0491 rplB rpsS TRUE 0.995 17.000 0.820 0.014 Y NA
 6982580 6982581 Pput_0491 Pput_0492 rpsS rplV TRUE 0.997 12.000 0.769 0.014 Y NA
 6982581 6982582 Pput_0492 Pput_0493 rplV rpsC TRUE 0.996 14.000 0.719 0.014 Y NA
 6982582 6982583 Pput_0493 Pput_0494 rpsC rplP TRUE 0.997 13.000 0.828 0.014 Y NA
 6982583 6982584 Pput_0494 Pput_0495 rplP   TRUE 0.999 0.000 0.802 0.010 Y NA
 6982584 6982585 Pput_0495 Pput_0496   rpsQ TRUE 0.999 3.000 0.828 0.010 Y NA
 6982585 6982586 Pput_0496 Pput_0497 rpsQ rplN TRUE 0.993 24.000 0.791 0.014 Y NA
 6982586 6982587 Pput_0497 Pput_0498 rplN rplX TRUE 0.997 12.000 0.810 0.014 Y NA
 6982587 6982588 Pput_0498 Pput_0499 rplX rplE TRUE 0.994 21.000 0.758 0.010 Y NA
 6982588 6982589 Pput_0499 Pput_0500 rplE rpsN TRUE 0.989 14.000 0.309 0.010 Y NA
 6982589 6982590 Pput_0500 Pput_0501 rpsN rpsH TRUE 0.683 209.000 0.295 0.010 Y NA
 6982590 6982591 Pput_0501 Pput_0502 rpsH rplF TRUE 0.997 13.000 0.808 0.010 Y NA
 6982591 6982592 Pput_0502 Pput_0503 rplF rplR TRUE 0.998 11.000 0.815 0.010 Y NA
 6982592 6982593 Pput_0503 Pput_0504 rplR rpsE TRUE 0.999 4.000 0.814 0.014 Y NA
 6982593 6982594 Pput_0504 Pput_0505 rpsE rpmD TRUE 0.999 3.000 0.789 0.014 Y NA
 6982594 6982595 Pput_0505 Pput_0506 rpmD rplO TRUE 0.998 4.000 0.653 0.002 Y NA
 6982595 6982596 Pput_0506 Pput_0507 rplO secY TRUE 0.993 1.000 0.730 1.000 N NA
 6982596 6982597 Pput_0507 Pput_0508 secY   TRUE 0.792 -22.000 0.036 1.000 N NA
 6982597 6982598 Pput_0508 Pput_0509   rpsM TRUE 0.724 132.000 0.086 0.010 Y NA
 6982598 6982599 Pput_0509 Pput_0510 rpsM   TRUE 0.995 19.000 0.810 0.010 Y NA
 6982599 6982600 Pput_0510 Pput_0511   rpsD TRUE 0.993 16.000 0.509 0.014 Y NA
 6982600 6982601 Pput_0511 Pput_0512 rpsD   TRUE 0.946 23.000 0.549 1.000 N NA
 6982601 6982602 Pput_0512 Pput_0513   rplQ TRUE 0.947 43.000 0.873 1.000 N NA
 6982602 6982603 Pput_0513 Pput_0514 rplQ   FALSE 0.029 173.000 0.004 1.000 N NA
 6982603 6982604 Pput_0514 Pput_0515     FALSE 0.415 164.000 0.052 1.000 Y NA
 6982606 6982607 Pput_0517 Pput_0518     TRUE 0.601 10.000 0.015 NA N NA
 6982609 6982610 Pput_0520 Pput_0521     FALSE 0.454 22.000 0.000 1.000   NA
 6982610 6982611 Pput_0521 Pput_0522     FALSE 0.072 148.000 0.000 1.000   NA
 6982611 6982612 Pput_0522 Pput_0523     TRUE 0.984 13.000 0.400 0.003   NA
 6982612 6982613 Pput_0523 Pput_0524     TRUE 0.987 0.000 0.128 0.001   NA
 6982613 6982614 Pput_0524 Pput_0525     TRUE 0.999 -3.000 0.538 0.001 Y NA
 6982614 6982615 Pput_0525 Pput_0526     TRUE 0.905 5.000 0.091 NA N NA
 6982615 6982616 Pput_0526 Pput_0527     FALSE 0.191 140.000 0.083 NA N NA
 6982616 6982617 Pput_0527 Pput_0528     TRUE 0.996 -3.000 0.569 0.001 N NA
 6982618 6982619 Pput_0529 Pput_0530     TRUE 0.776 64.000 0.095 1.000 Y NA
 6982621 6982622 Pput_0532 Pput_0533     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6982623 6982624 Pput_0535 Pput_0536     TRUE 0.981 -7.000 0.100 1.000 Y NA
 6982627 6982628 Pput_0539 Pput_0540     FALSE 0.212 110.000 0.060 NA   NA
 6982628 6982629 Pput_0540 Pput_0541     FALSE 0.309 106.000 0.114 NA   NA
 6982629 6982630 Pput_0541 Pput_0542     TRUE 0.997 0.000 0.605 NA Y NA
 6982630 6982631 Pput_0542 Pput_0543     TRUE 0.984 1.000 0.336 NA   NA
 6982633 6982634 Pput_0545 Pput_0546     FALSE 0.486 32.000 0.022 1.000   NA
 6982634 6982635 Pput_0546 Pput_0547     TRUE 0.986 4.000 0.462 NA   NA
 6982636 6982637 Pput_0548 Pput_0549 nrdR   TRUE 0.971 3.000 0.277 NA N NA
 6982637 6982638 Pput_0549 Pput_0550     TRUE 0.958 43.000 0.456 1.000 Y NA
 6982638 6982639 Pput_0550 Pput_0551     TRUE 0.919 19.000 0.065 1.000 Y NA
 6982639 6982640 Pput_0551 Pput_0552   ribH TRUE 0.748 92.000 0.049 0.002 Y NA
 6982640 6982641 Pput_0552 Pput_0553 ribH nusB TRUE 0.984 -3.000 0.347 1.000 N NA
 6982641 6982642 Pput_0553 Pput_0554 nusB   TRUE 0.877 19.000 0.225 1.000 N NA
 6982642 6982643 Pput_0554 Pput_0555     TRUE 0.970 -3.000 0.206 1.000 N NA
 6982643 6982644 Pput_0555 Pput_0556     TRUE 0.617 17.000 0.018 1.000   NA
 6982644 6982645 Pput_0556 Pput_0557   ribA FALSE 0.075 182.000 0.020 1.000   NA
 6982645 6982646 Pput_0557 Pput_0558 ribA   TRUE 0.928 -3.000 0.050 NA   NA
 6982646 6982647 Pput_0558 Pput_0559     TRUE 0.937 0.000 0.066 NA   NA
 6982648 6982649 Pput_0560 Pput_0561     FALSE 0.045 348.000 0.009 1.000 Y NA
 6982649 6982650 Pput_0561 Pput_0562     TRUE 0.594 178.000 0.246 1.000 Y NA
 6982650 6982651 Pput_0562 Pput_0563     TRUE 0.964 -3.000 0.177 1.000 N NA
 6982651 6982652 Pput_0563 Pput_0564   ribB FALSE 0.008 249.000 0.000 1.000 N NA
 6982654 6982655 Pput_0566 Pput_0567     FALSE 0.078 101.000 0.000 NA   NA
 6982655 6982656 Pput_0567 Pput_0568     TRUE 0.997 0.000 0.600 1.000 Y NA
 6982658 6982659 Pput_0570 Pput_0571     FALSE 0.072 129.000 0.000 NA   NA
 6982659 6982660 Pput_0571 Pput_0572     FALSE 0.026 212.000 0.000 NA   NA
 6982660 6982661 Pput_0572 Pput_0573     TRUE 0.989 10.000 0.750 1.000   NA
 6982661 6982662 Pput_0573 Pput_0574     FALSE 0.031 322.000 0.000 0.004 N NA
 6982662 6982663 Pput_0574 Pput_0575     FALSE 0.012 277.000 0.000 NA   NA
 6982663 6982664 Pput_0575 Pput_0576     FALSE 0.003 508.000 0.000 NA   NA
 6982664 6982665 Pput_0576 Pput_0577     FALSE 0.019 187.000 0.000 1.000 N NA
 6982665 6982666 Pput_0577 Pput_0578     FALSE 0.144 93.000 0.022 NA   NA
 6982666 6982667 Pput_0578 Pput_0579     TRUE 0.618 21.000 0.030 NA   NA
 6982667 6982668 Pput_0579 Pput_0580     FALSE 0.111 218.000 0.100 NA   NA
 6982668 6982669 Pput_0580 Pput_0581     FALSE 0.196 108.000 0.047 1.000   NA
 6982669 6982670 Pput_0581 Pput_0582     TRUE 0.999 9.000 0.859 0.001 Y NA
 6982670 6982671 Pput_0582 Pput_0583     TRUE 0.946 47.000 0.407 1.000 Y NA
 6982671 6982672 Pput_0583 Pput_0584     FALSE 0.010 228.000 0.000 1.000 N NA
 6982673 6982674 Pput_0585 Pput_0586     FALSE 0.163 67.000 0.020 1.000 N NA
 6982674 6982675 Pput_0586 Pput_0587     TRUE 0.974 -3.000 0.235 1.000 N NA
 6982675 6982676 Pput_0587 Pput_0588     TRUE 0.943 -3.000 0.070 NA   NA
 6982677 6982678 Pput_0589 Pput_0590     TRUE 0.627 28.000 0.043 1.000   NA
 6982678 6982679 Pput_0590 Pput_0591     FALSE 0.078 136.000 0.000 1.000   NA
 6982679 6982680 Pput_0591 Pput_0592     TRUE 0.675 29.000 0.062 1.000   NA
 6982680 6982681 Pput_0592 Pput_0593     TRUE 0.988 -3.000 0.375 1.000   NA
 6982681 6982682 Pput_0593 Pput_0594     TRUE 0.992 34.000 0.804 0.001 Y NA
 6982682 6982683 Pput_0594 Pput_0595     TRUE 0.899 23.000 0.141 0.084   NA
 6982685 6982686 Pput_0597 Pput_0598     TRUE 0.987 18.000 0.275 0.001 Y NA
 6982686 6982687 Pput_0598 Pput_0599     FALSE 0.456 101.000 0.254 1.000 N NA
 6982687 6982688 Pput_0599 Pput_0600   dipZ FALSE 0.033 180.000 0.010 1.000 N NA
 6982688 6982689 Pput_0600 Pput_0601 dipZ   FALSE 0.292 190.000 0.273 1.000 N NA
 6982689 6982690 Pput_0601 Pput_0602     FALSE 0.442 244.000 0.350 1.000 Y NA
 6982691 6982692 Pput_0603 Pput_0604     TRUE 0.943 3.000 0.101 NA   NA
 6982692 6982693 Pput_0604 Pput_0605     FALSE 0.195 57.000 0.017 1.000 N NA
 6982693 6982694 Pput_0605 Pput_0606     FALSE 0.072 151.000 0.023 1.000 N NA
 6982694 6982695 Pput_0606 Pput_0607     FALSE 0.024 171.000 0.000 1.000 N NA
 6982699 6982700 Pput_0611 Pput_0612     FALSE 0.033 93.000 0.000 NA N NA
 6982701 6982702 Pput_0613 Pput_0614     TRUE 0.693 120.000 0.600 1.000 N NA
 6982702 6982703 Pput_0614 Pput_0615     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 6982703 6982704 Pput_0615 Pput_0616     TRUE 0.949 20.000 0.455 NA   NA
 6982704 6982705 Pput_0616 Pput_0617     TRUE 0.764 23.000 0.087 NA   NA
 6982705 6982706 Pput_0617 Pput_0618     TRUE 0.952 -3.000 0.088 NA   NA
 6982706 6982707 Pput_0618 Pput_0619     FALSE 0.237 79.000 0.036 NA   NA
 6982707 6982708 Pput_0619 Pput_0620   fabG TRUE 0.991 3.000 0.263 1.000 Y NA
 6982709 6982710 Pput_0621 Pput_0622     FALSE 0.047 90.000 0.000 1.000 N NA
 6982711 6982712 Pput_0623 Pput_0624     FALSE 0.025 168.000 0.000 1.000 N NA
 6982712 6982713 Pput_0624 Pput_0625     TRUE 0.997 -3.000 0.667 0.004 N NA
 6982713 6982714 Pput_0625 Pput_0626     TRUE 0.879 53.000 0.500 NA   NA
 6982715 6982716 Pput_0627 Pput_0628     FALSE 0.317 108.000 0.161 1.000 N NA
 6982716 6982717 Pput_0628 Pput_0629     FALSE 0.018 241.000 0.000 NA   NA
 6982717 6982718 Pput_0629 Pput_0630     FALSE 0.011 285.000 0.000 NA   NA
 6982719 6982720 Pput_0631 Pput_0632     FALSE 0.133 77.000 0.000 1.000   NA
 6982720 6982721 Pput_0632 Pput_0633     FALSE 0.006 369.000 0.000 1.000   NA
 6982721 6982722 Pput_0633 Pput_0634     TRUE 0.782 10.000 0.019 1.000   NA
 6982722 6982723 Pput_0634 Pput_0635     TRUE 0.675 91.000 0.045 0.091 Y NA
 6982724 6982725 Pput_0636 Pput_0637     TRUE 0.748 74.000 0.455 1.000 N NA
 6982725 6982726 Pput_0637 Pput_R0018     FALSE 0.002 988.000 0.000 NA   NA
 6982726 6982727 Pput_R0018 Pput_R0019     FALSE 0.011 281.000 0.000 NA   NA
 6982727 6982728 Pput_R0019 Pput_R0020     FALSE 0.069 136.000 0.000 NA   NA
 6982728 6982729 Pput_R0020 Pput_0638     FALSE 0.018 240.000 0.000 NA   NA
 6982729 6982730 Pput_0638 Pput_0639     TRUE 0.932 -13.000 0.114 NA   NA
 6982730 6982731 Pput_0639 Pput_0640     TRUE 0.992 -16.000 0.840 NA   NA
 6982733 6982734 Pput_0642 Pput_0643     FALSE 0.396 101.000 0.169 1.000   NA
 6982734 6982735 Pput_0643 Pput_0644   ileS TRUE 0.977 -3.000 0.254 1.000 N NA
 6982735 6982736 Pput_0644 Pput_0645 ileS lspA TRUE 0.941 -7.000 0.147 1.000 N NA
 6982736 6982737 Pput_0645 Pput_0646 lspA   TRUE 0.981 -7.000 0.417 1.000 N NA
 6982737 6982738 Pput_0646 Pput_0647   ispH TRUE 0.970 15.000 0.626 1.000 N NA
 6982740 6982741 Pput_0649 Pput_0650     TRUE 0.993 -3.000 0.615 NA   NA
 6982741 6982742 Pput_0650 Pput_0651     TRUE 0.898 2.000 0.038 NA   NA
 6982742 6982743 Pput_0651 Pput_0652     FALSE 0.395 55.000 0.061 NA N NA
 6982744 6982745 Pput_0653 Pput_0654     TRUE 0.925 2.000 0.083 1.000 N NA
 6982745 6982746 Pput_0654 Pput_0655     TRUE 0.660 114.000 0.188 1.000 Y NA
 6982746 6982747 Pput_0655 Pput_0656     TRUE 0.998 0.000 0.571 0.019 Y NA
 6982747 6982748 Pput_0656 Pput_0657     TRUE 0.997 0.000 0.536 1.000 Y NA
 6982748 6982749 Pput_0657 Pput_0658     TRUE 0.995 2.000 0.246 0.063 Y NA
 6982749 6982750 Pput_0658 Pput_0659     TRUE 0.849 66.000 0.230 NA Y NA
 6982750 6982751 Pput_0659 Pput_0660     FALSE 0.451 91.000 0.222 NA N NA
 6982751 6982752 Pput_0660 Pput_0661     FALSE 0.015 252.000 0.000 NA   NA
 6982752 6982753 Pput_0661 Pput_0662     FALSE 0.125 93.000 0.015 NA   NA
 6982754 6982755 Pput_0663 Pput_0664     TRUE 0.969 -3.000 0.168 NA   NA
 6982755 6982756 Pput_0664 Pput_0665     FALSE 0.077 251.000 0.108 NA   NA
 6982756 6982757 Pput_0665 Pput_R0021     FALSE 0.004 445.000 0.000 NA   NA
 6982757 6982758 Pput_R0021 Pput_R0022     TRUE 0.728 5.000 0.000 NA   NA
 6982758 6982759 Pput_R0022 Pput_R0023     TRUE 0.716 6.000 0.000 NA   NA
 6982759 6982760 Pput_R0023 Pput_R0024     FALSE 0.247 47.000 0.000 NA   NA
 6982760 6982761 Pput_R0024 Pput_R0025     TRUE 0.716 6.000 0.000 NA   NA
 6982762 6982763 Pput_0666 Pput_0667     TRUE 0.811 85.000 0.667 NA   NA
 6982763 6982764 Pput_0667 Pput_0668     FALSE 0.377 133.000 0.182 NA   NA
 6982764 6982765 Pput_0668 Pput_0669     FALSE 0.204 56.000 0.000 NA   NA
 6982767 6982768 Pput_0671 Pput_0672   coaE TRUE 0.911 -3.000 0.033 1.000   NA
 6982768 6982769 Pput_0672 Pput_0673 coaE   TRUE 0.950 0.000 0.122 1.000 N NA
 6982769 6982770 Pput_0673 Pput_0674     TRUE 0.995 3.000 0.454 1.000 Y NA
 6982771 6982772 Pput_0675 Pput_R0026     FALSE 0.136 72.000 0.000 NA   NA
 6982772 6982773 Pput_R0026 Pput_0676     FALSE 0.022 222.000 0.000 NA   NA
 6982773 6982774 Pput_0676 Pput_0677     FALSE 0.002 1344.000 0.000 NA   NA
 6982774 6982775 Pput_0677 Pput_0678     FALSE 0.116 78.000 0.000 NA   NA
 6982775 6982776 Pput_0678 Pput_0679     FALSE 0.073 123.000 0.000 NA   NA
 6982776 6982777 Pput_0679 Pput_0680     FALSE 0.025 216.000 0.000 NA   NA
 6982777 6982778 Pput_0680 Pput_0681     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6982778 6982779 Pput_0681 Pput_0682     FALSE 0.036 191.000 0.000 NA   NA
 6982780 6982781 Pput_0683 Pput_R0027     FALSE 0.082 98.000 0.000 NA   NA
 6982783 6982784 Pput_0685 Pput_0686     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6982785 6982786 Pput_0687 Pput_0688     FALSE 0.073 118.000 0.000 NA   NA
 6982786 6982787 Pput_0688 Pput_0689     FALSE 0.074 108.000 0.000 NA   NA
 6982788 6982789 Pput_0690 Pput_0691     TRUE 0.992 -3.000 0.394 0.062 N NA
 6982790 6982791 Pput_0692 Pput_0693     FALSE 0.284 168.000 0.000 1.000 Y NA
 6982791 6982792 Pput_0693 Pput_0694     FALSE 0.515 143.000 0.077 1.000 Y NA
 6982792 6982793 Pput_0694 Pput_0695     FALSE 0.529 46.000 0.077 1.000 N NA
 6982793 6982794 Pput_0695 Pput_0696     FALSE 0.281 25.000 0.003 1.000 N NA
 6982794 6982795 Pput_0696 Pput_0697     TRUE 0.726 -3.000 0.005 1.000 N NA
 6982795 6982796 Pput_0697 Pput_0698     FALSE 0.098 199.000 0.074 1.000 N NA
 6982796 6982797 Pput_0698 Pput_0699     TRUE 0.853 13.000 0.111 1.000 N NA
 6982797 6982798 Pput_0699 Pput_0700     FALSE 0.244 17.000 0.000 NA N NA
 6982799 6982800 Pput_0701 Pput_0702   glyA FALSE 0.005 289.000 0.000 1.000 N NA
 6982800 6982801 Pput_0702 Pput_0703 glyA   FALSE 0.102 306.000 0.333 1.000 N NA
 6982802 6982803 Pput_0704 Pput_0705     FALSE 0.009 303.000 0.000 NA   NA
 6982803 6982804 Pput_0705 Pput_0706     FALSE 0.025 223.000 0.000 1.000   NA
 6982805 6982806 Pput_0707 Pput_0708     FALSE 0.320 68.000 0.041 NA   NA
 6982806 6982807 Pput_0708 Pput_0709     FALSE 0.166 216.000 0.182 NA   NA
 6982807 6982808 Pput_0709 Pput_0710     FALSE 0.512 72.000 0.149 NA   NA
 6982809 6982810 Pput_0711 Pput_0712     FALSE 0.264 163.000 0.132 NA   NA
 6982810 6982811 Pput_0712 Pput_0713     FALSE 0.146 190.000 0.082 NA   NA
 6982811 6982812 Pput_0713 Pput_0714     FALSE 0.061 218.000 0.041 NA   NA
 6982812 6982813 Pput_0714 Pput_0715     FALSE 0.233 86.000 0.043 NA   NA
 6982814 6982815 Pput_0716 Pput_0717     FALSE 0.117 85.000 0.004 NA   NA
 6982815 6982816 Pput_0717 Pput_0718     FALSE 0.039 160.000 0.007 1.000 N NA
 6982817 6982818 Pput_0719 Pput_0720   rplU TRUE 0.707 -15.000 0.000 NA   NA
 6982818 6982819 Pput_0720 Pput_0721 rplU rpmA TRUE 0.988 39.000 0.667 0.010 Y NA
 6982819 6982820 Pput_0721 Pput_0722 rpmA obgE FALSE 0.400 189.000 0.335 1.000   NA
 6982820 6982821 Pput_0722 Pput_0723 obgE   FALSE 0.517 86.000 0.206 1.000   NA
 6982821 6982822 Pput_0723 Pput_0724     TRUE 0.867 -3.000 0.017 NA   NA
 6982823 6982824 Pput_0725 Pput_0726     TRUE 0.967 33.000 0.950 NA   NA
 6982824 6982825 Pput_0726 Pput_0727     TRUE 0.994 -10.000 0.947 NA   NA
 6982826 6982827 Pput_0728 Pput_0729     TRUE 0.892 -3.000 0.027 NA   NA
 6982827 6982828 Pput_0729 Pput_0730     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 6982831 6982832 Pput_R0028 Pput_0733     FALSE 0.084 96.000 0.000 NA   NA
 6982833 6982834 Pput_0734 Pput_0735     FALSE 0.047 325.000 0.000 NA Y NA
 6982835 6982836 Pput_0736 Pput_0737     FALSE 0.467 -13.000 0.000 NA N NA
 6982837 6982838 Pput_0738 Pput_0739     FALSE 0.300 48.000 0.028 1.000 N NA
 6982838 6982839 Pput_0739 Pput_0740     FALSE 0.080 57.000 0.000 NA N NA
 6982840 6982841 Pput_0741 Pput_0742     FALSE 0.003 580.000 0.000 NA   NA
 6982841 6982842 Pput_0742 Pput_0743     FALSE 0.356 14.000 0.000 1.000 N NA
 6982842 6982843 Pput_0743 Pput_0744     FALSE 0.332 93.000 0.100 NA   NA
 6982844 6982845 Pput_0745 Pput_0746     FALSE 0.084 107.000 0.000 1.000   NA
 6982845 6982846 Pput_0746 Pput_0747     FALSE 0.329 37.000 0.000 1.000   NA
 6982846 6982847 Pput_0747 Pput_0748     FALSE 0.278 42.000 0.000 NA   NA
 6982847 6982848 Pput_0748 Pput_0749     TRUE 0.963 4.000 0.200 NA   NA
 6982848 6982849 Pput_0749 Pput_0750     TRUE 0.977 -3.000 0.260 1.000 N NA
 6982849 6982850 Pput_0750 Pput_0751     TRUE 0.982 -10.000 0.407 NA   NA
 6982851 6982852 Pput_0752 Pput_0753     FALSE 0.128 175.000 0.002 0.077 N NA
 6982852 6982853 Pput_0753 Pput_0754     TRUE 0.941 25.000 0.184 1.000 Y NA
 6982853 6982854 Pput_0754 Pput_0755     TRUE 0.940 80.000 0.496 0.016 Y NA
 6982854 6982855 Pput_0755 Pput_0756     FALSE 0.271 119.000 0.122 1.000 N NA
 6982855 6982856 Pput_0756 Pput_R0029     FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 6982856 6982857 Pput_R0029 Pput_0757   ipk FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6982857 6982858 Pput_0757 Pput_0758 ipk lolB TRUE 0.893 5.000 0.072 1.000 N NA
 6982858 6982859 Pput_0758 Pput_0759 lolB   TRUE 0.893 5.000 0.072 1.000 N NA
 6982860 6982861 Pput_0760 Pput_0761 hemA prfA TRUE 0.983 -3.000 0.171 0.038 N NA
 6982861 6982862 Pput_0761 Pput_0762 prfA   TRUE 0.992 0.000 0.229 1.000 Y NA
 6982862 6982863 Pput_0762 Pput_0763     TRUE 0.903 -6.000 0.068 1.000 N NA
 6982863 6982864 Pput_0763 Pput_0764     TRUE 0.714 -7.000 0.013 1.000 N NA
 6982864 6982865 Pput_0764 Pput_0765     FALSE 0.072 161.000 0.004 1.000   NA
 6982866 6982867 Pput_0766 Pput_0767     FALSE 0.121 81.000 0.000 1.000   NA
 6982867 6982868 Pput_0767 Pput_0768     TRUE 0.732 -9.000 0.017 1.000 N NA
 6982868 6982869 Pput_0768 Pput_0769     TRUE 0.922 -10.000 0.083 NA   NA
 6982869 6982870 Pput_0769 Pput_0770     FALSE 0.115 104.000 0.017 NA   NA
 6982871 6982872 Pput_0771 Pput_0772   hemH TRUE 0.682 14.000 0.020 1.000   NA
 6982873 6982874 Pput_0773 Pput_0774   upp TRUE 0.982 3.000 0.101 1.000 Y NA
 6982875 6982876 Pput_0775 Pput_0776     TRUE 0.886 3.000 0.036 NA   NA
 6982876 6982877 Pput_0776 Pput_0777     TRUE 0.643 52.000 0.138 NA   NA
 6982877 6982878 Pput_0777 Pput_0778     TRUE 0.675 69.000 0.261 NA   NA
 6982884 6982885 Pput_0784 Pput_0785     TRUE 0.986 0.000 0.364 NA   NA
 6982885 6982886 Pput_0785 Pput_0786     TRUE 0.937 16.000 0.320 NA   NA
 6982886 6982887 Pput_0786 Pput_0787     FALSE 0.032 228.000 0.017 NA   NA
 6982888 6982889 Pput_0788 Pput_0789     FALSE 0.013 269.000 0.000 NA   NA
 6982889 6982890 Pput_0789 Pput_0790     FALSE 0.341 55.000 0.042 1.000 N NA
 6982891 6982892 Pput_0791 Pput_0792     FALSE 0.007 332.000 0.000 NA   NA
 6982892 6982893 Pput_0792 Pput_0793     TRUE 0.972 26.000 0.889 NA   NA
 6982893 6982894 Pput_0793 Pput_0794     FALSE 0.113 327.000 0.375 NA   NA
 6982894 6982895 Pput_0794 Pput_0795     FALSE 0.028 160.000 0.000 1.000 N NA
 6982895 6982896 Pput_0795 Pput_0796     TRUE 0.990 -3.000 0.174 1.000 Y NA
 6982896 6982897 Pput_0796 Pput_0797     FALSE 0.233 55.000 0.000 1.000   NA
 6982897 6982898 Pput_0797 Pput_0798     FALSE 0.172 86.000 0.021 1.000   NA
 6982899 6982900 Pput_0799 Pput_0800     TRUE 0.710 32.000 0.094 NA   NA
 6982901 6982902 Pput_0801 Pput_0802     FALSE 0.425 146.000 0.036 1.000 Y NA
 6982904 6982905 Pput_0804 Pput_0805     FALSE 0.022 226.000 0.000 NA   NA
 6982905 6982906 Pput_0805 Pput_0806     FALSE 0.494 16.000 0.000 NA   NA
 6982906 6982907 Pput_0806 Pput_0807     TRUE 0.539 14.000 0.000 NA   NA
 6982911 6982912 Pput_0811 Pput_0812     FALSE 0.236 89.000 0.048 NA   NA
 6982912 6982913 Pput_0812 Pput_0813     TRUE 0.993 -3.000 0.249 1.000 Y NA
 6982914 6982915 Pput_0814 Pput_0815     TRUE 0.725 3.000 0.017 NA N NA
 6982916 6982917 Pput_0816 Pput_0817     TRUE 0.985 1.000 0.101 1.000 Y NA
 6982917 6982918 Pput_0817 Pput_0818     TRUE 0.997 -3.000 0.562 1.000 Y NA
 6982921 6982922 Pput_0821 Pput_0822     FALSE 0.468 201.000 0.500 1.000   NA
 6982922 6982923 Pput_0822 Pput_0823     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6982923 6982924 Pput_0823 Pput_0824     FALSE 0.031 201.000 0.000 NA   NA
 6982924 6982925 Pput_0824 Pput_0825     TRUE 0.974 -3.000 0.200 NA   NA
 6982925 6982926 Pput_0825 Pput_0826     FALSE 0.096 89.000 0.000 NA   NA
 6982926 6982927 Pput_0826 Pput_0827     FALSE 0.014 205.000 0.000 1.000 N NA
 6982927 6982928 Pput_0827 Pput_0828     TRUE 0.924 -3.000 0.000 0.076 N NA
 6982928 6982929 Pput_0828 Pput_0829     TRUE 0.667 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6982929 6982930 Pput_0829 Pput_0830     FALSE 0.171 64.000 0.000 NA   NA
 6982930 6982931 Pput_0830 Pput_0831     FALSE 0.109 80.000 0.000 NA   NA
 6982932 6982933 Pput_0832 Pput_0833     FALSE 0.012 457.000 0.000 0.059 N NA
 6982933 6982934 Pput_0833 Pput_0834     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6982934 6982935 Pput_0834 Pput_0835     FALSE 0.068 138.000 0.000 NA   NA
 6982935 6982936 Pput_0835 Pput_0836     TRUE 0.994 4.000 0.200 0.004 Y NA
 6982936 6982937 Pput_0836 Pput_0837     TRUE 0.995 4.000 0.258 0.004 Y NA
 6982937 6982938 Pput_0837 Pput_0838     TRUE 0.996 0.000 0.273 0.059 Y NA
 6982938 6982939 Pput_0838 Pput_0839     TRUE 0.910 12.000 0.064 0.076 N NA
 6982939 6982940 Pput_0839 Pput_0840     FALSE 0.004 310.000 0.000 1.000 N NA
 6982940 6982941 Pput_0840 Pput_0841     FALSE 0.073 115.000 0.000 NA   NA
 6982941 6982942 Pput_0841 Pput_0842     FALSE 0.056 161.000 0.000 NA   NA
 6982942 6982943 Pput_0842 Pput_0843     FALSE 0.016 246.000 0.000 NA   NA
 6982943 6982944 Pput_0843 Pput_0844     FALSE 0.104 57.000 0.000 1.000 N NA
 6982944 6982945 Pput_0844 Pput_0845     TRUE 0.599 -3.000 0.000 NA N NA
 6982945 6982946 Pput_0845 Pput_0846     FALSE 0.484 77.000 0.000 NA Y NA
 6982946 6982947 Pput_0846 Pput_0847     FALSE 0.152 68.000 0.000 NA   NA
 6982947 6982948 Pput_0847 Pput_0848     FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6982949 6982950 Pput_0849 Pput_0850     TRUE 0.975 0.000 0.214 NA   NA
 6982951 6982952 Pput_0851 Pput_0852     FALSE 0.046 332.000 0.000 1.000 Y NA
 6982952 6982953 Pput_0852 Pput_0853     TRUE 0.992 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 6982955 6982956 Pput_0855 Pput_0856     TRUE 0.987 -3.000 0.357 NA   NA
 6982957 6982958 Pput_0857 Pput_0858     FALSE 0.055 171.000 0.000 1.000   NA
 6982959 6982960 Pput_0859 Pput_0860     FALSE 0.003 561.000 0.000 NA   NA
 6982960 6982961 Pput_0860 Pput_0861     FALSE 0.042 80.000 0.000 NA N NA
 6982963 6982964 Pput_0862 Pput_0863 queA tgt TRUE 0.998 -3.000 0.360 0.001 Y NA
 6982964 6982965 Pput_0863 Pput_0864 tgt yajC TRUE 0.823 43.000 0.325 NA N NA
 6982965 6982966 Pput_0864 Pput_0865 yajC secD TRUE 0.666 64.000 0.031 NA Y NA
 6982966 6982967 Pput_0865 Pput_0866 secD secF TRUE 0.990 11.000 0.171 0.001 Y NA
 6982967 6982968 Pput_0866 Pput_0867 secF   FALSE 0.197 134.000 0.050 1.000   NA
 6982970 6982971 Pput_0869 Pput_0870     TRUE 0.958 4.000 0.208 1.000 N NA
 6982971 6982972 Pput_0870 Pput_0871     FALSE 0.455 123.000 0.271 1.000 N NA
 6982972 6982973 Pput_0871 Pput_0872     TRUE 0.858 46.000 0.424 1.000 N NA
 6982973 6982974 Pput_0872 Pput_0873     TRUE 0.866 47.000 0.448 1.000 N NA
 6982974 6982975 Pput_0873 Pput_0874     TRUE 0.962 29.000 0.359 0.001   NA
 6982975 6982976 Pput_0874 Pput_0875   hscB TRUE 0.983 9.000 0.500 1.000   NA
 6982976 6982977 Pput_0875 Pput_0876 hscB hscA TRUE 0.970 44.000 0.634 1.000 Y NA
 6982977 6982978 Pput_0876 Pput_0877 hscA   TRUE 0.992 4.000 0.794 1.000 N NA
 6982978 6982979 Pput_0877 Pput_0878     TRUE 0.984 11.000 0.625 1.000   NA
 6982979 6982980 Pput_0878 Pput_0879     FALSE 0.154 89.000 0.017 1.000   NA
 6982980 6982981 Pput_0879 Pput_0880     TRUE 0.800 29.000 0.156 1.000   NA
 6982981 6982982 Pput_0880 Pput_0881     TRUE 0.836 15.000 0.086 1.000   NA
 6982982 6982983 Pput_0881 Pput_0882     TRUE 0.976 -3.000 0.204 1.000   NA
 6982983 6982984 Pput_0882 Pput_0883   ispG TRUE 0.970 4.000 0.233 1.000   NA
 6982984 6982985 Pput_0883 Pput_0884 ispG hisS TRUE 0.829 26.000 0.207 1.000 N NA
 6982985 6982986 Pput_0884 Pput_0885 hisS   TRUE 0.834 40.000 0.259 1.000   NA
 6982986 6982987 Pput_0885 Pput_0886     TRUE 0.990 1.000 0.492 1.000   NA
 6982987 6982988 Pput_0886 Pput_0887   engA FALSE 0.425 117.000 0.203 1.000   NA
 6982988 6982989 Pput_0887 Pput_0888 engA   FALSE 0.081 152.000 0.006 1.000   NA
 6982989 6982990 Pput_0888 Pput_0889     TRUE 0.931 -12.000 0.099 1.000   NA
 6982991 6982992 Pput_0890 Pput_0891     FALSE 0.305 254.000 0.068 0.020 Y NA
 6982993 6982994 Pput_0892 Pput_0893     TRUE 0.972 4.000 0.250 1.000   NA
 6982996 6982997 Pput_0895 Pput_0896     TRUE 0.957 21.000 0.625 NA N NA
 6982997 6982998 Pput_0896 Pput_0897     TRUE 0.713 109.000 0.250 NA Y NA
 6982999 6983000 Pput_0898 Pput_0899     TRUE 0.998 -3.000 0.903 1.000 Y NA
 6983000 6983001 Pput_0899 Pput_0900     TRUE 0.990 -3.000 0.313 0.061 N NA
 6983001 6983002 Pput_0900 Pput_0901     TRUE 0.973 14.000 0.403 0.061 N NA
 6983004 6983005 Pput_0903 Pput_0904     TRUE 0.919 53.000 0.714 NA   NA
 6983005 6983006 Pput_0904 Pput_0905     TRUE 0.939 34.000 0.600 NA   NA
 6983006 6983007 Pput_0905 Pput_0906     FALSE 0.086 65.000 0.000 1.000 N NA
 6983007 6983008 Pput_0906 Pput_0907     FALSE 0.003 703.000 0.000 NA   NA
 6983009 6983010 Pput_0908 Pput_0909     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 6983010 6983011 Pput_0909 Pput_0910     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983011 6983012 Pput_0910 Pput_0911     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6983012 6983013 Pput_0911 Pput_0912     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983013 6983014 Pput_0912 Pput_0913     FALSE 0.158 41.000 0.000 1.000 N NA
 6983014 6983015 Pput_0913 Pput_0914     FALSE 0.122 76.000 0.000 NA   NA
 6983015 6983016 Pput_0914 Pput_0915     FALSE 0.086 95.000 0.000 NA   NA
 6983016 6983017 Pput_0915 Pput_0916     TRUE 0.604 3.000 0.000 1.000 N NA
 6983018 6983019 Pput_0917 Pput_0918 dppF   TRUE 0.998 0.000 0.377 0.001 Y NA
 6983019 6983020 Pput_0918 Pput_0919     TRUE 0.993 11.000 0.560 1.000 Y NA
 6983020 6983021 Pput_0919 Pput_0920     TRUE 0.997 11.000 0.779 0.061 Y NA
 6983021 6983022 Pput_0920 Pput_0921     TRUE 0.670 92.000 0.036 0.061 Y NA
 6983022 6983023 Pput_0921 Pput_0922     TRUE 0.899 79.000 0.714 0.079   NA
 6983023 6983024 Pput_0922 Pput_0923     TRUE 0.592 229.000 0.714 0.079   NA
 6983024 6983025 Pput_0923 Pput_0924     FALSE 0.497 148.000 0.000 0.061 Y NA
 6983025 6983026 Pput_0924 Pput_0925     FALSE 0.005 381.000 0.000 NA   NA
 6983027 6983028 Pput_0926 Pput_0927     TRUE 0.998 -3.000 0.682 1.000 Y NA
 6983028 6983029 Pput_0927 Pput_0928     FALSE 0.036 109.000 0.000 1.000 N NA
 6983029 6983030 Pput_0928 Pput_0929     TRUE 0.995 -3.000 0.833 NA   NA
 6983030 6983031 Pput_0929 Pput_0930     TRUE 0.814 45.000 0.273 NA   NA
 6983031 6983032 Pput_0930 Pput_0931     TRUE 0.986 2.000 0.412 NA   NA
 6983032 6983033 Pput_0931 Pput_0932     FALSE 0.348 52.000 0.021 1.000   NA
 6983035 6983036 Pput_0934 Pput_0935     TRUE 0.990 -3.000 0.437 1.000   NA
 6983037 6983038 Pput_0936 Pput_0937     FALSE 0.006 349.000 0.000 NA   NA
 6983041 6983042 Pput_0940 Pput_0941     TRUE 0.951 -10.000 0.000 1.000 Y NA
 6983042 6983043 Pput_0941 Pput_0942     FALSE 0.036 108.000 0.000 1.000 N NA
 6983043 6983044 Pput_0942 Pput_0943     TRUE 0.992 7.000 0.833 1.000   NA
 6983044 6983045 Pput_0943 Pput_0944     TRUE 0.989 0.000 0.455 NA   NA
 6983046 6983047 Pput_0945 Pput_0946     FALSE 0.321 13.000 0.000 NA N NA
 6983047 6983048 Pput_0946 Pput_0947     FALSE 0.024 219.000 0.000 NA   NA
 6983048 6983049 Pput_0947 Pput_0948     TRUE 0.991 3.000 0.620 NA   NA
 6983049 6983050 Pput_0948 Pput_0949     TRUE 0.970 20.000 0.713 NA   NA
 6983050 6983051 Pput_0949 Pput_0950     FALSE 0.073 110.000 0.000 NA   NA
 6983051 6983052 Pput_0950 Pput_0951     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6983052 6983053 Pput_0951 Pput_0952     FALSE 0.066 142.000 0.000 NA   NA
 6983053 6983054 Pput_0952 Pput_0953     FALSE 0.124 160.000 0.057 NA N NA
 6983054 6983055 Pput_0953 Pput_0954     FALSE 0.015 217.000 0.004 1.000 N NA
 6983055 6983056 Pput_0954 Pput_0955     FALSE 0.017 272.000 0.009 1.000   NA
 6983057 6983058 Pput_0956 Pput_0957     FALSE 0.463 50.000 0.066 1.000 N NA
 6983058 6983059 Pput_0957 Pput_0958     TRUE 0.556 74.000 0.192 NA   NA
 6983060 6983061 Pput_0959 Pput_0960     TRUE 0.914 18.000 0.310 1.000 N NA
 6983063 6983064 Pput_0962 Pput_0963     TRUE 0.982 0.000 0.286 NA   NA
 6983065 6983066 Pput_0964 Pput_0965     TRUE 0.695 -19.000 0.000 NA   NA
 6983066 6983067 Pput_0965 Pput_0966     FALSE 0.144 70.000 0.000 NA   NA
 6983067 6983068 Pput_0966 Pput_0967     FALSE 0.494 57.000 0.000 0.076   NA
 6983069 6983070 Pput_0968 Pput_0969     TRUE 0.819 61.000 0.417 NA   NA
 6983070 6983071 Pput_0969 Pput_0970   gatB FALSE 0.092 129.000 0.010 NA   NA
 6983071 6983072 Pput_0970 Pput_0971 gatB gatA TRUE 0.996 12.000 0.492 0.001 Y NA
 6983072 6983073 Pput_0971 Pput_0972 gatA gatC TRUE 0.995 16.000 0.643 0.001 Y NA
 6983074 6983075 Pput_0973 Pput_0974     FALSE 0.432 226.000 0.689 1.000 N NA
 6983075 6983076 Pput_0974 Pput_0975     TRUE 0.999 0.000 0.550 0.002 Y NA
 6983076 6983077 Pput_0975 Pput_0976     TRUE 0.781 33.000 0.206 NA N NA
 6983077 6983078 Pput_0976 Pput_0977     TRUE 0.820 55.000 0.417 NA N NA
 6983078 6983079 Pput_0977 Pput_0978     TRUE 0.594 89.000 0.296 NA   NA
 6983079 6983080 Pput_0978 Pput_0979     TRUE 0.974 9.000 0.358 NA   NA
 6983080 6983081 Pput_0979 Pput_0980     TRUE 0.975 3.000 0.259 NA   NA
 6983083 6983084 Pput_0982 Pput_0983     FALSE 0.022 246.000 0.010 NA   NA
 6983084 6983085 Pput_0983 Pput_0984   fumC TRUE 0.899 -10.000 0.058 NA   NA
 6983085 6983086 Pput_0984 Pput_0985 fumC   FALSE 0.002 377.000 0.000 1.000 N NA
 6983086 6983087 Pput_0985 Pput_0986     TRUE 0.990 12.000 0.464 1.000 Y NA
 6983088 6983089 Pput_0987 Pput_0988     TRUE 0.869 19.000 0.182 NA   NA
 6983089 6983090 Pput_0988 Pput_0989     TRUE 0.964 3.000 0.186 NA   NA
 6983090 6983091 Pput_0989 Pput_0990     TRUE 0.979 13.000 0.728 NA N NA
 6983091 6983092 Pput_0990 Pput_0991     TRUE 0.837 80.000 0.820 NA N NA
 6983092 6983093 Pput_0991 Pput_0992     FALSE 0.261 176.000 0.163 1.000   NA
 6983093 6983094 Pput_0992 Pput_0993     TRUE 0.991 1.000 0.543 NA   NA
 6983094 6983095 Pput_0993 Pput_0994     TRUE 0.983 -13.000 0.459 NA   NA
 6983095 6983096 Pput_0994 Pput_0995     TRUE 0.987 9.000 0.617 NA   NA
 6983096 6983097 Pput_0995 Pput_0996     TRUE 0.978 13.000 0.598 1.000   NA
 6983098 6983099 Pput_0997 Pput_0998     TRUE 0.996 0.000 0.530 NA Y NA
 6983099 6983100 Pput_0998 Pput_0999     TRUE 0.992 0.000 0.562 NA   NA
 6983100 6983101 Pput_0999 Pput_1000     TRUE 0.905 10.000 0.091 NA   NA
 6983101 6983102 Pput_1000 Pput_1001     TRUE 0.937 18.000 0.353 NA   NA
 6983102 6983103 Pput_1001 Pput_1002     FALSE 0.228 118.000 0.067 NA   NA
 6983103 6983104 Pput_1002 Pput_1003     TRUE 0.866 24.000 0.258 NA N NA
 6983104 6983105 Pput_1003 Pput_1004   hisG FALSE 0.320 92.000 0.123 1.000 N NA
 6983105 6983106 Pput_1004 Pput_1005 hisG hisD FALSE 0.437 287.000 0.254 0.003 Y NA
 6983106 6983107 Pput_1005 Pput_1006 hisD   TRUE 0.992 3.000 0.087 0.003 Y NA
 6983109 6983110 Pput_1008 Pput_1009     TRUE 0.918 14.000 0.250 1.000 N NA
 6983110 6983111 Pput_1009 Pput_1010     FALSE 0.185 110.000 0.048 NA   NA
 6983111 6983112 Pput_1010 Pput_1011     TRUE 0.849 -7.000 0.026 NA   NA
 6983115 6983116 Pput_1014 Pput_1015   valS FALSE 0.056 179.000 0.003 1.000   NA
 6983116 6983117 Pput_1015 Pput_1016 valS   FALSE 0.042 199.000 0.009 NA   NA
 6983117 6983118 Pput_1016 Pput_1017     TRUE 0.854 6.000 0.034 NA   NA
 6983118 6983119 Pput_1017 Pput_1018     TRUE 0.864 51.000 0.494 1.000 N NA
 6983120 6983121 Pput_1019 Pput_1020     TRUE 0.995 -7.000 0.631 0.075   NA
 6983122 6983123 Pput_1021 Pput_1022     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6983123 6983124 Pput_1022 Pput_1023     FALSE 0.003 358.000 0.000 1.000 N NA
 6983124 6983125 Pput_1023 Pput_1024     TRUE 0.829 28.000 0.013 1.000 Y NA
 6983125 6983126 Pput_1024 Pput_1025     FALSE 0.384 107.000 0.006 1.000 Y NA
 6983126 6983127 Pput_1025 Pput_1026     TRUE 0.980 12.000 0.249 1.000 Y NA
 6983127 6983128 Pput_1026 Pput_1027     FALSE 0.008 306.000 0.000 NA   NA
 6983128 6983129 Pput_1027 Pput_1028     TRUE 0.981 -7.000 0.367 NA   NA
 6983129 6983130 Pput_1028 Pput_1029     TRUE 0.990 -3.000 0.450 NA   NA
 6983130 6983131 Pput_1029 Pput_1030     TRUE 0.799 17.000 0.080 NA   NA
 6983132 6983133 Pput_1031 Pput_1032     TRUE 0.959 -10.000 0.200 NA   NA
 6983134 6983135 Pput_1033 Pput_1034     FALSE 0.363 128.000 0.000 1.000 Y NA
 6983135 6983136 Pput_1034 Pput_1035     FALSE 0.362 153.000 0.200 NA   NA
 6983136 6983137 Pput_1035 Pput_1036     TRUE 0.586 57.000 0.121 NA   NA
 6983137 6983138 Pput_1036 Pput_1037     TRUE 0.731 186.000 0.483 1.000 Y NA
 6983138 6983139 Pput_1037 Pput_1038     TRUE 0.743 70.000 0.100 1.000 Y NA
 6983139 6983140 Pput_1038 Pput_1039     TRUE 0.959 34.000 0.375 1.000 Y NA
 6983142 6983143 Pput_1041 Pput_1042     TRUE 0.622 55.000 0.132 NA   NA
 6983143 6983144 Pput_1042 Pput_1043     FALSE 0.246 222.000 0.074 NA Y NA
 6983144 6983145 Pput_1043 Pput_1044     TRUE 0.590 126.000 0.122 NA Y NA
 6983145 6983146 Pput_1044 Pput_1045     TRUE 0.849 89.000 1.000 NA N NA
 6983146 6983147 Pput_1045 Pput_1046     FALSE 0.002 375.000 0.000 1.000 N NA
 6983147 6983148 Pput_1046 Pput_1047     FALSE 0.002 379.000 0.000 1.000 N NA
 6983149 6983150 Pput_1048 Pput_1049   glk TRUE 0.978 -3.000 0.033 1.000 Y NA
 6983150 6983151 Pput_1049 Pput_1050 glk   TRUE 0.917 22.000 0.364 1.000 N NA
 6983151 6983152 Pput_1050 Pput_1051     TRUE 0.997 -19.000 0.909 1.000 Y NA
 6983152 6983153 Pput_1051 Pput_1052     FALSE 0.031 216.000 0.026 1.000 N NA
 6983153 6983154 Pput_1052 Pput_1053     FALSE 0.476 108.000 0.043 1.000 Y NA
 6983154 6983155 Pput_1053 Pput_1054     TRUE 0.863 134.000 0.367 0.061 Y NA
 6983155 6983156 Pput_1054 Pput_1055     TRUE 0.998 -7.000 0.816 0.061 Y NA
 6983156 6983157 Pput_1055 Pput_1056     TRUE 0.998 4.000 0.723 0.061 Y NA
 6983157 6983158 Pput_1056 Pput_1057     TRUE 0.813 41.000 0.135 0.061 N NA
 6983158 6983159 Pput_1057 Pput_1058     FALSE 0.079 118.000 0.021 1.000 N NA
 6983161 6983162 Pput_1060 Pput_1061     TRUE 0.982 -13.000 0.163 1.000 Y NA
 6983162 6983163 Pput_1061 Pput_1062     TRUE 0.921 18.000 0.064 1.000 Y NA
 6983163 6983164 Pput_1062 Pput_1063     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 6983164 6983165 Pput_1063 Pput_1064     TRUE 0.728 5.000 0.000 NA   NA
 6983166 6983167 Pput_1065 Pput_1066     FALSE 0.002 468.000 0.000 1.000 N NA
 6983167 6983168 Pput_1066 Pput_1067   xseA TRUE 0.817 4.000 0.032 1.000 N NA
 6983168 6983169 Pput_1067 Pput_1068 xseA   FALSE 0.023 194.000 0.006 1.000 N NA
 6983170 6983171 Pput_1069 Pput_1070     TRUE 0.533 48.000 0.064 NA   NA
 6983171 6983172 Pput_1070 Pput_1071     FALSE 0.119 87.000 0.008 NA   NA
 6983172 6983173 Pput_1071 Pput_1072   guaA TRUE 0.719 79.000 0.190 0.001 N NA
 6983174 6983175 Pput_1073 Pput_1074     TRUE 0.828 -3.000 0.000 1.000   NA
 6983176 6983177 Pput_1075 Pput_1076     TRUE 0.892 0.000 0.045 1.000 N NA
 6983179 6983180 Pput_1078 Pput_1079     TRUE 0.815 4.000 0.016 NA   NA
 6983181 6983182 Pput_1080 Pput_1081     TRUE 0.994 -3.000 0.314 NA Y NA
 6983182 6983183 Pput_1081 Pput_1082     TRUE 0.958 0.000 0.000 0.007   NA
 6983186 6983187 Pput_1085 Pput_1086     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6983187 6983188 Pput_1086 Pput_1087     TRUE 0.745 4.000 0.000 NA   NA
 6983188 6983189 Pput_1087 Pput_1088     TRUE 0.998 0.000 0.776 1.000 Y NA
 6983189 6983190 Pput_1088 Pput_1089     TRUE 0.996 4.000 0.653 1.000 Y NA
 6983190 6983191 Pput_1089 Pput_1090     TRUE 0.994 18.000 0.599 0.003 Y NA
 6983191 6983192 Pput_1090 Pput_1091     TRUE 0.964 3.000 0.029 0.003   NA
 6983192 6983193 Pput_1091 Pput_1092     TRUE 0.968 -3.000 0.015 0.003   NA
 6983193 6983194 Pput_1092 Pput_1093     TRUE 0.992 -3.000 0.569 NA   NA
 6983194 6983195 Pput_1093 Pput_1094     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983195 6983196 Pput_1094 Pput_1095     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983196 6983197 Pput_1095 Pput_1096     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983198 6983199 Pput_1097 Pput_1098     TRUE 0.961 -7.000 0.223 NA N NA
 6983199 6983200 Pput_1098 Pput_1099     FALSE 0.071 90.000 0.014 NA N NA
 6983202 6983203 Pput_1101 Pput_1102     FALSE 0.012 283.000 0.000 1.000   NA
 6983207 6983208 Pput_1106 Pput_1107     TRUE 0.754 24.000 0.085 NA   NA
 6983208 6983209 Pput_1107 Pput_1108     TRUE 0.998 -3.000 0.613 0.097 Y NA
 6983209 6983210 Pput_1108 Pput_1109     TRUE 0.628 69.000 0.129 0.097 N NA
 6983210 6983211 Pput_1109 Pput_1110     TRUE 0.988 -3.000 0.138 1.000 Y NA
 6983211 6983212 Pput_1110 Pput_1111     TRUE 0.999 1.000 0.933 0.011 Y NA
 6983212 6983213 Pput_1111 Pput_1112     TRUE 0.667 146.000 0.083 0.060 Y NA
 6983215 6983216 Pput_1114 Pput_1115 glpD   FALSE 0.009 293.000 0.016 1.000 N NA
 6983216 6983217 Pput_1115 Pput_1116   glpK TRUE 0.912 -3.000 0.055 1.000 N NA
 6983217 6983218 Pput_1116 Pput_1117 glpK   FALSE 0.248 52.000 0.023 1.000 N NA
 6983220 6983221 Pput_1119 Pput_1120     TRUE 0.975 -3.000 0.025 1.000 Y NA
 6983222 6983223 Pput_1121 Pput_1122     TRUE 0.795 -31.000 0.039 1.000 N NA
 6983224 6983225 Pput_1123 Pput_1124     TRUE 0.541 200.000 0.286 NA Y NA
 6983227 6983228 Pput_1126 Pput_1127     TRUE 0.925 -3.000 0.068 1.000 N NA
 6983229 6983230 Pput_1128 Pput_1129     FALSE 0.005 593.000 0.013 1.000   NA
 6983233 6983234 Pput_1132 Pput_1133     FALSE 0.101 105.000 0.012 NA   NA
 6983234 6983235 Pput_1133 Pput_1134     FALSE 0.030 153.000 0.000 1.000 N NA
 6983235 6983236 Pput_1134 Pput_1135     TRUE 0.999 -3.000 0.924 0.058 Y NA
 6983236 6983237 Pput_1135 Pput_1136     TRUE 0.984 -3.000 0.000 0.058 Y NA
 6983237 6983238 Pput_1136 Pput_1137   metG FALSE 0.095 107.000 0.027 1.000 N NA
 6983241 6983242 Pput_1140 Pput_1141 dcd   FALSE 0.120 95.000 0.014 NA   NA
 6983243 6983244 Pput_1142 Pput_1143     TRUE 0.990 -3.000 0.460 1.000   NA
 6983244 6983245 Pput_1143 Pput_1144     FALSE 0.170 68.000 0.000 1.000   NA
 6983245 6983246 Pput_1144 Pput_1145     FALSE 0.082 114.000 0.000 1.000   NA
 6983246 6983247 Pput_1145 Pput_1146     TRUE 0.994 -3.000 0.751 1.000 N NA
 6983247 6983248 Pput_1146 Pput_1147     FALSE 0.082 127.000 0.000 1.000   NA
 6983248 6983249 Pput_1147 Pput_1148     FALSE 0.086 104.000 0.000 1.000   NA
 6983250 6983251 Pput_1149 Pput_1150     TRUE 0.932 -3.000 0.056 NA   NA
 6983251 6983252 Pput_1150 Pput_1151     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983252 6983253 Pput_1151 Pput_1152     TRUE 0.599 -3.000 0.000 NA N NA
 6983254 6983255 Pput_1153 Pput_1154     TRUE 0.942 8.000 0.163 NA   NA
 6983255 6983256 Pput_1154 Pput_1155     TRUE 0.951 -27.000 0.200 NA   NA
 6983256 6983257 Pput_1155 Pput_1156     TRUE 0.985 3.000 0.407 NA   NA
 6983258 6983259 Pput_1157 Pput_1158     TRUE 0.919 90.000 0.400 0.004 Y NA
 6983259 6983260 Pput_1158 Pput_1159     FALSE 0.197 99.000 0.045 NA   NA
 6983262 6983263 Pput_1161 Pput_1162 dinG   FALSE 0.212 80.000 0.029 1.000   NA
 6983263 6983264 Pput_1162 Pput_1163     TRUE 0.978 11.000 0.467 1.000   NA
 6983264 6983265 Pput_1163 Pput_1164     TRUE 0.740 100.000 0.667 1.000 N NA
 6983265 6983266 Pput_1164 Pput_1165     FALSE 0.481 20.000 0.023 1.000 N NA
 6983269 6983270 Pput_1168 Pput_1169     FALSE 0.013 278.000 0.000 1.000   NA
 6983270 6983271 Pput_1169 Pput_1170     FALSE 0.159 80.000 0.017 NA   NA
 6983271 6983272 Pput_1170 Pput_1171     FALSE 0.195 89.000 0.034 NA   NA
 6983272 6983273 Pput_1171 Pput_1172   livG TRUE 0.999 1.000 0.967 0.018 Y NA
 6983273 6983274 Pput_1172 Pput_1173 livG livM TRUE 0.997 -3.000 0.574 1.000 Y NA
 6983274 6983275 Pput_1173 Pput_1174 livM   TRUE 0.998 -3.000 0.574 0.060 Y NA
 6983275 6983276 Pput_1174 Pput_1175     FALSE 0.233 186.000 0.000 1.000 Y NA
 6983277 6983278 Pput_1176 Pput_1177     FALSE 0.035 193.000 0.000 NA   NA
 6983279 6983280 Pput_1178 Pput_1179     FALSE 0.005 277.000 0.000 1.000 N NA
 6983281 6983282 Pput_1180 Pput_1181     FALSE 0.171 64.000 0.000 NA   NA
 6983282 6983283 Pput_1181 Pput_1182     TRUE 0.587 68.000 0.182 NA   NA
 6983283 6983284 Pput_1182 Pput_1183     FALSE 0.370 136.000 0.182 NA   NA
 6983284 6983285 Pput_1183 Pput_1184     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6983285 6983286 Pput_1184 Pput_1185     TRUE 0.953 -13.000 0.185 NA   NA
 6983286 6983287 Pput_1185 Pput_1186     TRUE 0.958 13.000 0.353 NA   NA
 6983287 6983288 Pput_1186 Pput_1187     FALSE 0.022 224.000 0.000 NA   NA
 6983289 6983290 Pput_1188 Pput_1189     TRUE 0.832 52.000 0.000 0.009 Y NA
 6983290 6983291 Pput_1189 Pput_1190     FALSE 0.005 282.000 0.000 1.000 N NA
 6983292 6983293 Pput_R0031 Pput_R0032     FALSE 0.162 66.000 0.000 NA   NA
 6983293 6983294 Pput_R0032 Pput_R0033     TRUE 0.705 7.000 0.000 NA   NA
 6983294 6983295 Pput_R0033 Pput_R0034     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 6983295 6983296 Pput_R0034 Pput_R0035     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6983296 6983297 Pput_R0035 Pput_1191     FALSE 0.003 626.000 0.000 NA   NA
 6983297 6983298 Pput_1191 Pput_1192     FALSE 0.005 438.000 0.000 1.000   NA
 6983298 6983299 Pput_1192 Pput_1193     TRUE 0.824 11.000 0.042 NA   NA
 6983299 6983300 Pput_1193 Pput_1194     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983300 6983301 Pput_1194 Pput_1195     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 6983301 6983302 Pput_1195 Pput_1196     FALSE 0.046 175.000 0.000 NA   NA
 6983302 6983303 Pput_1196 Pput_1197     TRUE 0.917 28.000 0.439 1.000 N NA
 6983303 6983304 Pput_1197 Pput_1198     FALSE 0.251 109.000 0.105 1.000 N NA
 6983305 6983306 Pput_1199 Pput_1200     FALSE 0.395 25.000 0.000 NA   NA
 6983306 6983307 Pput_1200 Pput_1201     FALSE 0.210 55.000 0.000 NA   NA
 6983307 6983308 Pput_1201 Pput_1202     TRUE 0.998 1.000 0.905 NA Y NA
 6983308 6983309 Pput_1202 Pput_1203     TRUE 0.964 67.000 0.947 NA Y NA
 6983309 6983310 Pput_1203 Pput_1204     TRUE 0.898 65.000 0.350 NA Y NA
 6983310 6983311 Pput_1204 Pput_1205     TRUE 0.976 23.000 0.450 NA Y NA
 6983311 6983312 Pput_1205 Pput_1206     FALSE 0.003 558.000 0.000 1.000   NA
 6983313 6983314 Pput_1207 Pput_1208     FALSE 0.343 31.000 0.000 NA   NA
 6983315 6983316 Pput_1209 Pput_1210     FALSE 0.280 1202.000 0.564 0.001 Y NA
 6983317 6983318 Pput_1211 Pput_1212     TRUE 0.992 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 6983319 6983320 Pput_1213 Pput_1214     FALSE 0.186 248.000 0.069 1.000 Y NA
 6983321 6983322 Pput_1215 Pput_1216     FALSE 0.226 195.000 0.180 1.000   NA
 6983322 6983323 Pput_1216 Pput_1217     TRUE 0.998 -3.000 0.940 1.000 Y NA
 6983323 6983324 Pput_1217 Pput_1218     FALSE 0.003 350.000 0.000 1.000 N NA
 6983324 6983325 Pput_1218 Pput_1219     FALSE 0.042 183.000 0.000 NA   NA
 6983326 6983327 Pput_1220 Pput_1221     TRUE 0.818 7.000 0.025 NA   NA
 6983327 6983328 Pput_1221 Pput_1222     FALSE 0.452 50.000 0.043 NA   NA
 6983328 6983329 Pput_1222 Pput_1223     FALSE 0.422 87.000 0.139 1.000   NA
 6983330 6983331 Pput_1224 Pput_1225     FALSE 0.033 198.000 0.000 NA   NA
 6983331 6983332 Pput_1225 Pput_1226     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983332 6983333 Pput_1226 Pput_1227     FALSE 0.210 55.000 0.000 NA   NA
 6983336 6983337 Pput_1230 Pput_1231     TRUE 0.969 0.000 0.176 NA   NA
 6983337 6983338 Pput_1231 Pput_R0036     FALSE 0.014 262.000 0.000 NA   NA
 6983338 6983339 Pput_R0036 Pput_R0037     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6983339 6983340 Pput_R0037 Pput_R0038     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6983342 6983343 Pput_1233 Pput_1234     FALSE 0.522 21.000 0.013 NA   NA
 6983343 6983344 Pput_1234 Pput_1235     FALSE 0.064 161.000 0.000 1.000   NA
 6983345 6983346 Pput_1236 Pput_1237     TRUE 0.892 2.000 0.035 NA   NA
 6983348 6983349 Pput_1239 Pput_1240     FALSE 0.007 387.000 0.014 NA   NA
 6983349 6983350 Pput_1240 Pput_1241     FALSE 0.086 95.000 0.000 NA   NA
 6983350 6983351 Pput_1241 Pput_1242   aspS FALSE 0.139 94.000 0.020 NA   NA
 6983351 6983352 Pput_1242 Pput_1243 aspS   FALSE 0.165 115.000 0.039 NA   NA
 6983352 6983353 Pput_1243 Pput_1244   ruvC FALSE 0.349 186.000 0.277 NA   NA
 6983353 6983354 Pput_1244 Pput_1245 ruvC ruvA TRUE 0.906 110.000 0.451 0.008 Y NA
 6983354 6983355 Pput_1245 Pput_1246 ruvA ruvB TRUE 0.999 -3.000 0.549 0.002 Y NA
 6983355 6983356 Pput_1246 Pput_1247 ruvB   FALSE 0.269 126.000 0.082 1.000   NA
 6983356 6983357 Pput_1247 Pput_1248     TRUE 0.991 3.000 0.593 1.000   NA
 6983357 6983358 Pput_1248 Pput_1249     TRUE 0.993 15.000 0.556 0.077 Y NA
 6983358 6983359 Pput_1249 Pput_1250     TRUE 0.990 0.000 0.460 1.000   NA
 6983359 6983360 Pput_1250 Pput_1251   tolB TRUE 0.934 27.000 0.215 0.007   NA
 6983360 6983361 Pput_1251 Pput_1252 tolB   TRUE 0.881 55.000 0.592 1.000 N NA
 6983361 6983362 Pput_1252 Pput_1253     TRUE 0.970 7.000 0.278 1.000   NA
 6983362 6983363 Pput_1253 Pput_1254     FALSE 0.163 169.000 0.059 1.000   NA
 6983363 6983364 Pput_1254 Pput_1255     TRUE 0.918 18.000 0.270 1.000   NA
 6983364 6983365 Pput_1255 Pput_R0039     FALSE 0.181 61.000 0.000 NA   NA
 6983366 6983367 Pput_1256 Pput_1257     FALSE 0.032 143.000 0.000 1.000 N NA
 6983367 6983368 Pput_1257 Pput_1258     FALSE 0.081 67.000 0.000 1.000 N NA
 6983369 6983370 Pput_1259 Pput_1260     FALSE 0.012 275.000 0.000 NA   NA
 6983371 6983372 Pput_1261 Pput_1262     FALSE 0.016 258.000 0.000 1.000   NA
 6983373 6983374 Pput_1263 Pput_1264     TRUE 0.814 21.000 0.121 NA   NA
 6983375 6983376 Pput_1265 Pput_1266     TRUE 0.857 12.000 0.102 NA N NA
 6983377 6983378 Pput_1267 Pput_1268     TRUE 0.938 16.000 0.088 NA Y NA
 6983378 6983379 Pput_1268 Pput_1269     TRUE 0.866 1.000 0.022 NA   NA
 6983379 6983380 Pput_1269 Pput_1270     FALSE 0.493 31.000 0.021 1.000   NA
 6983380 6983381 Pput_1270 Pput_R0040     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 6983382 6983383 Pput_1271 Pput_1272     FALSE 0.003 654.000 0.000 NA   NA
 6983383 6983384 Pput_1272 Pput_1273     FALSE 0.125 75.000 0.000 NA   NA
 6983385 6983386 Pput_1274 Pput_1275     TRUE 0.685 9.000 0.000 NA   NA
 6983386 6983387 Pput_1275 Pput_1276     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6983389 6983390 Pput_1278 Pput_1279     FALSE 0.007 328.000 0.000 NA   NA
 6983393 6983394 Pput_1282 Pput_1283     TRUE 0.928 3.000 0.097 1.000 N NA
 6983394 6983395 Pput_1283 Pput_1284     FALSE 0.348 152.000 0.091 0.079 N NA
 6983395 6983396 Pput_1284 Pput_1285     TRUE 0.903 47.000 0.215 1.000 Y NA
 6983396 6983397 Pput_1285 Pput_1286     TRUE 0.888 24.000 0.046 1.000 Y NA
 6983401 6983402 Pput_1290 Pput_1291   moaA FALSE 0.433 21.000 0.000 NA   NA
 6983407 6983408 Pput_1296 Pput_1297     FALSE 0.059 178.000 0.006 1.000   NA
 6983408 6983409 Pput_1297 Pput_1298     TRUE 0.945 -3.000 0.073 NA   NA
 6983409 6983410 Pput_1298 Pput_1299     TRUE 0.914 3.000 0.056 NA   NA
 6983412 6983413 Pput_1301 Pput_1302     FALSE 0.472 42.000 0.034 NA   NA
 6983413 6983414 Pput_1302 Pput_1303     TRUE 0.605 12.000 0.000 NA   NA
 6983415 6983416 Pput_1304 Pput_1305     FALSE 0.284 72.000 0.034 1.000   NA
 6983416 6983417 Pput_1305 Pput_1306     FALSE 0.003 608.000 0.000 1.000   NA
 6983418 6983419 Pput_1307 Pput_1308     TRUE 0.754 15.000 0.048 NA   NA
 6983419 6983420 Pput_1308 Pput_1309     TRUE 0.863 10.000 0.053 NA   NA
 6983422 6983423 Pput_1311 Pput_1312     TRUE 0.872 10.000 0.055 1.000   NA
 6983423 6983424 Pput_1312 Pput_1313     TRUE 0.996 0.000 0.909 1.000   NA
 6983424 6983425 Pput_1313 Pput_1314     TRUE 0.998 -3.000 0.909 NA Y NA
 6983426 6983427 Pput_1315 Pput_1316     TRUE 0.962 14.000 0.431 NA   NA
 6983427 6983428 Pput_1316 Pput_1317     FALSE 0.094 188.000 0.041 NA   NA
 6983429 6983430 Pput_1318 Pput_1319     FALSE 0.057 174.000 0.025 1.000 N NA
 6983430 6983431 Pput_1319 Pput_1320     FALSE 0.385 26.000 0.000 NA   NA
 6983431 6983432 Pput_1320 Pput_1321     FALSE 0.073 117.000 0.000 NA   NA
 6983433 6983434 Pput_1322 Pput_1323     TRUE 0.539 14.000 0.000 NA   NA
 6983439 6983440 Pput_1328 Pput_1329     FALSE 0.056 161.000 0.000 NA   NA
 6983440 6983441 Pput_1329 Pput_1330     TRUE 0.904 0.000 0.031 1.000   NA
 6983443 6983444 Pput_1332 Pput_1333     FALSE 0.037 190.000 0.000 NA   NA
 6983444 6983445 Pput_1333 Pput_1334     TRUE 0.698 45.000 0.149 NA   NA
 6983445 6983446 Pput_1334 Pput_1335     TRUE 0.671 22.000 0.045 NA   NA
 6983446 6983447 Pput_1335 Pput_1336     TRUE 0.919 0.000 0.045 NA   NA
 6983448 6983449 Pput_1337 Pput_1338     TRUE 0.842 35.000 0.046 1.000 Y NA
 6983450 6983451 Pput_1339 Pput_1340     FALSE 0.139 320.000 0.000 0.000 Y NA
 6983452 6983453 Pput_1341 Pput_1342     TRUE 0.984 25.000 0.667 1.000 Y NA
 6983453 6983454 Pput_1342 Pput_1343     TRUE 0.621 71.000 0.222 NA   NA
 6983455 6983456 Pput_1344 Pput_1345     FALSE 0.120 124.000 0.036 1.000 N NA
 6983459 6983460 Pput_1348 Pput_1349     TRUE 0.566 63.000 0.171 1.000 N NA
 6983460 6983461 Pput_1349 Pput_1350     TRUE 0.977 -6.000 0.286 NA   NA
 6983461 6983462 Pput_1350 Pput_1351     TRUE 0.869 14.000 0.118 NA   NA
 6983463 6983464 Pput_1352 Pput_1353     TRUE 0.749 97.000 0.600 NA   NA
 6983464 6983465 Pput_1353 Pput_1354     FALSE 0.017 256.000 0.000 1.000   NA
 6983467 6983468 Pput_1356 Pput_1357     FALSE 0.074 108.000 0.000 NA   NA
 6983468 6983469 Pput_1357 Pput_1358     FALSE 0.005 366.000 0.000 NA   NA
 6983470 6983471 Pput_1359 Pput_1360     TRUE 0.953 3.000 0.133 NA   NA
 6983471 6983472 Pput_1360 Pput_1361     TRUE 0.981 2.000 0.309 NA   NA
 6983472 6983473 Pput_1361 Pput_1362     TRUE 0.986 -3.000 0.353 NA   NA
 6983473 6983474 Pput_1362 Pput_1363     FALSE 0.368 28.000 0.000 NA   NA
 6983474 6983475 Pput_1363 Pput_1364     FALSE 0.161 70.000 0.000 1.000   NA
 6983475 6983476 Pput_1364 Pput_1365     TRUE 0.572 54.000 0.087 1.000   NA
 6983476 6983477 Pput_1365 Pput_1366     FALSE 0.341 113.000 0.136 1.000   NA
 6983477 6983478 Pput_1366 Pput_1367     FALSE 0.010 206.000 0.000 NA N NA
 6983478 6983479 Pput_1367 Pput_1368     TRUE 0.967 28.000 0.400 NA Y NA
 6983479 6983480 Pput_1368 Pput_1369     TRUE 0.965 11.000 0.375 1.000 N NA
 6983481 6983482 Pput_1370 Pput_1371     FALSE 0.003 514.000 0.000 NA   NA
 6983482 6983483 Pput_1371 Pput_1372     FALSE 0.004 461.000 0.000 NA   NA
 6983483 6983484 Pput_1372 Pput_1373     FALSE 0.004 459.000 0.000 NA   NA
 6983486 6983487 Pput_1375 Pput_1376     FALSE 0.083 97.000 0.000 NA   NA
 6983491 6983492 Pput_1380 Pput_1381     TRUE 0.975 -22.000 0.364 NA   NA
 6983492 6983493 Pput_1381 Pput_1382     FALSE 0.119 77.000 0.000 NA   NA
 6983493 6983494 Pput_1382 Pput_1383     FALSE 0.075 106.000 0.000 NA   NA
 6983496 6983497 Pput_1385 Pput_1386     FALSE 0.073 125.000 0.000 NA   NA
 6983498 6983499 Pput_1387 Pput_1388     TRUE 0.667 133.000 0.200 1.000 Y NA
 6983500 6983501 Pput_1389 Pput_1390     FALSE 0.392 99.000 0.200 1.000 N NA
 6983501 6983502 Pput_1390 Pput_1391     FALSE 0.298 65.000 0.031 NA   NA
 6983503 6983504 Pput_1392 Pput_1393     FALSE 0.008 312.000 0.000 NA   NA
 6983504 6983505 Pput_1393 Pput_1394     TRUE 0.907 8.000 0.077 NA   NA
 6983506 6983507 Pput_1395 Pput_1396     FALSE 0.231 152.000 0.024 0.053 N NA
 6983510 6983511 Pput_1399 Pput_1400     FALSE 0.137 221.000 0.154 NA   NA
 6983517 6983518 Pput_1406 Pput_1407     TRUE 0.788 59.000 0.333 NA   NA
 6983518 6983519 Pput_1407 Pput_1408     FALSE 0.382 161.000 0.227 NA   NA
 6983519 6983520 Pput_1408 Pput_1409     TRUE 0.572 13.000 0.000 NA   NA
 6983520 6983521 Pput_1409 Pput_1410     FALSE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 6983521 6983522 Pput_1410 Pput_1411     TRUE 0.973 2.000 0.224 NA   NA
 6983523 6983524 Pput_1412 Pput_1413     TRUE 0.967 -22.000 0.281 NA   NA
 6983524 6983525 Pput_1413 Pput_1414     TRUE 0.916 -3.000 0.040 NA   NA
 6983525 6983526 Pput_1414 Pput_1415     TRUE 0.917 -13.000 0.083 NA   NA
 6983526 6983527 Pput_1415 Pput_1416     FALSE 0.091 266.000 0.210 NA N NA
 6983527 6983528 Pput_1416 Pput_1417     FALSE 0.001 638.000 0.000 1.000 N NA
 6983531 6983532 Pput_1420 Pput_1421     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6983532 6983533 Pput_1421 Pput_1422     FALSE 0.058 158.000 0.000 NA   NA
 6983533 6983534 Pput_1422 Pput_1423   phhB FALSE 0.073 109.000 0.000 NA   NA
 6983534 6983535 Pput_1423 Pput_1424 phhB phhA TRUE 0.754 40.000 0.203 1.000 N NA
 6983537 6983538 Pput_1426 Pput_1427     FALSE 0.014 263.000 0.000 NA   NA
 6983539 6983540 Pput_1428 Pput_1429 acsA   FALSE 0.001 537.000 0.000 1.000 N NA
 6983540 6983541 Pput_1429 Pput_1430     TRUE 0.950 89.000 0.714 0.059 Y NA
 6983541 6983542 Pput_1430 Pput_1431     TRUE 0.999 -3.000 0.875 0.011 Y NA
 6983542 6983543 Pput_1431 Pput_1432     TRUE 0.958 23.000 0.250 1.000 Y NA
 6983543 6983544 Pput_1432 Pput_1433     TRUE 0.665 99.000 0.500 1.000 N NA
 6983544 6983545 Pput_1433 Pput_1434   argD FALSE 0.002 373.000 0.000 1.000 N NA
 6983545 6983546 Pput_1434 Pput_1435 argD   TRUE 0.831 148.000 0.533 1.000 Y NA
 6983546 6983547 Pput_1435 Pput_1436     TRUE 0.980 79.000 1.000 0.000 Y NA
 6983547 6983548 Pput_1436 Pput_1437   astD TRUE 0.966 1.000 0.205 1.000 N NA
 6983548 6983549 Pput_1437 Pput_1438 astD   TRUE 0.890 24.000 0.306 1.000 N NA
 6983549 6983550 Pput_1438 Pput_1439     TRUE 0.809 15.000 0.072 NA   NA
 6983550 6983551 Pput_1439 Pput_1440     TRUE 0.990 11.000 0.909 NA   NA
 6983551 6983552 Pput_1440 Pput_1441   alaS FALSE 0.004 316.000 0.000 1.000 N NA
 6983552 6983553 Pput_1441 Pput_1442 alaS   FALSE 0.189 103.000 0.065 1.000 N NA
 6983553 6983554 Pput_1442 Pput_1443     FALSE 0.157 167.000 0.079 1.000 N NA
 6983554 6983555 Pput_1443 Pput_R0041     FALSE 0.133 73.000 0.000 NA   NA
 6983555 6983556 Pput_R0041 Pput_R0042     FALSE 0.074 107.000 0.000 NA   NA
 6983556 6983557 Pput_R0042 Pput_R0043     FALSE 0.133 73.000 0.000 NA   NA
 6983557 6983558 Pput_R0043 Pput_R0044     FALSE 0.125 75.000 0.000 NA   NA
 6983558 6983559 Pput_R0044 Pput_R0045     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6983559 6983560 Pput_R0045 Pput_1444     FALSE 0.005 397.000 0.000 NA   NA
 6983562 6983563 Pput_1446 Pput_R0046     FALSE 0.073 112.000 0.000 NA   NA
 6983564 6983565 Pput_1447 Pput_1448     FALSE 0.008 305.000 0.000 NA   NA
 6983567 6983568 Pput_1450 Pput_1451     TRUE 0.985 3.000 0.143 1.000 Y NA
 6983568 6983569 Pput_1451 Pput_1452     TRUE 0.986 1.000 0.036 0.078 Y NA
 6983569 6983570 Pput_1452 Pput_1453     TRUE 0.998 2.000 0.558 0.078 Y NA
 6983571 6983572 Pput_1454 Pput_1455     FALSE 0.022 175.000 0.000 1.000 N NA
 6983572 6983573 Pput_1455 Pput_1456     TRUE 0.645 133.000 0.462 NA   NA
 6983574 6983575 Pput_1457 Pput_1458     FALSE 0.364 80.000 0.121 1.000 N NA
 6983575 6983576 Pput_1458 Pput_1459     TRUE 0.971 50.000 0.361 0.001 Y NA
 6983576 6983577 Pput_1459 Pput_1460   flgA TRUE 0.725 165.000 0.371 NA Y NA
 6983578 6983579 Pput_1461 Pput_1462     TRUE 0.973 53.000 0.838 1.000 Y NA
 6983579 6983580 Pput_1462 Pput_1463     FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 6983580 6983581 Pput_1463 Pput_1464   flgB FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6983581 6983582 Pput_1464 Pput_1465 flgB flgC TRUE 0.999 3.000 0.800 0.002 Y NA
 6983582 6983583 Pput_1465 Pput_1466 flgC flgD TRUE 0.962 16.000 0.207 NA Y NA
 6983583 6983584 Pput_1466 Pput_1467 flgD   TRUE 0.985 32.000 0.875 NA Y NA
 6983584 6983585 Pput_1467 Pput_1468     FALSE 0.133 73.000 0.000 NA   NA
 6983585 6983586 Pput_1468 Pput_1469   flgF FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6983586 6983587 Pput_1469 Pput_1470 flgF flgG TRUE 0.954 49.000 0.207 0.001 Y NA
 6983587 6983588 Pput_1470 Pput_1471 flgG flgH TRUE 0.988 37.000 0.632 0.005 Y NA
 6983588 6983589 Pput_1471 Pput_1472 flgH flgI TRUE 0.983 13.000 0.128 0.006 Y NA
 6983589 6983590 Pput_1472 Pput_1473 flgI flgJ TRUE 0.994 12.000 0.405 0.006 Y NA
 6983590 6983591 Pput_1473 Pput_1474 flgJ flgK TRUE 0.997 13.000 0.705 0.002 Y NA
 6983591 6983592 Pput_1474 Pput_1475 flgK flgL TRUE 0.975 14.000 0.057 0.001 Y NA
 6983592 6983593 Pput_1475 Pput_1476 flgL   FALSE 0.329 128.000 0.182 NA N NA
 6983593 6983594 Pput_1476 Pput_1477     FALSE 0.217 53.000 0.000 NA   NA
 6983594 6983595 Pput_1477 Pput_1478     FALSE 0.513 15.000 0.000 NA   NA
 6983595 6983596 Pput_1478 Pput_1479     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983596 6983597 Pput_1479 Pput_1480     TRUE 0.997 -3.000 0.624 1.000 Y NA
 6983597 6983598 Pput_1480 Pput_1481     TRUE 0.990 -7.000 0.247 1.000 Y NA
 6983598 6983599 Pput_1481 Pput_1482     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 6983599 6983600 Pput_1482 Pput_1483     FALSE 0.059 155.000 0.000 NA   NA
 6983600 6983601 Pput_1483 Pput_1484     TRUE 0.912 0.000 0.059 1.000 N NA
 6983601 6983602 Pput_1484 Pput_1485     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6983602 6983603 Pput_1485 Pput_1486     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6983603 6983604 Pput_1486 Pput_1487     FALSE 0.140 71.000 0.000 NA   NA
 6983604 6983605 Pput_1487 Pput_1488     FALSE 0.025 215.000 0.000 NA   NA
 6983605 6983606 Pput_1488 Pput_1489     FALSE 0.007 253.000 0.000 1.000 N NA
 6983606 6983607 Pput_1489 Pput_1490     TRUE 0.584 72.000 0.025 NA Y NA
 6983607 6983608 Pput_1490 Pput_1491     TRUE 0.677 82.000 0.117 NA Y NA
 6983608 6983609 Pput_1491 Pput_1492   fliS TRUE 0.811 139.000 0.194 0.002 Y NA
 6983609 6983610 Pput_1492 Pput_1493 fliS   TRUE 0.963 15.000 0.478 NA   NA
 6983610 6983611 Pput_1493 Pput_1494     FALSE 0.147 170.000 0.056 NA   NA
 6983611 6983612 Pput_1494 Pput_1495     TRUE 0.851 141.000 0.377 0.094 Y NA
 6983612 6983613 Pput_1495 Pput_1496     TRUE 0.998 0.000 0.679 0.094 Y NA
 6983613 6983614 Pput_1496 Pput_1497   fliE FALSE 0.411 195.000 0.446 1.000 N NA
 6983614 6983615 Pput_1497 Pput_1498 fliE fliF TRUE 0.997 16.000 0.910 0.005 Y NA
 6983615 6983616 Pput_1498 Pput_1499 fliF fliG TRUE 0.994 -7.000 0.189 0.005 Y NA
 6983616 6983617 Pput_1499 Pput_1500 fliG fliH TRUE 0.700 163.000 0.320 NA Y NA
 6983617 6983618 Pput_1500 Pput_1501 fliH fliI TRUE 0.979 -10.000 0.115 NA Y NA
 6983618 6983619 Pput_1501 Pput_1502 fliI fliJ TRUE 0.972 7.000 0.070 1.000 Y NA
 6983619 6983620 Pput_1502 Pput_1503 fliJ   FALSE 0.008 308.000 0.022 NA N NA
 6983620 6983621 Pput_1503 Pput_1504     TRUE 0.992 9.000 0.429 NA Y NA
 6983621 6983622 Pput_1504 Pput_1505     TRUE 0.882 58.000 0.250 NA Y NA
 6983622 6983623 Pput_1505 Pput_1506     FALSE 0.312 71.000 0.069 NA N NA
 6983623 6983624 Pput_1506 Pput_1507   fliL FALSE 0.263 220.000 0.075 1.000 Y NA
 6983624 6983625 Pput_1507 Pput_1508 fliL fliM TRUE 0.991 10.000 0.171 0.001 Y NA
 6983625 6983626 Pput_1508 Pput_1509 fliM fliN TRUE 0.988 48.000 0.741 0.001 Y NA
 6983626 6983627 Pput_1509 Pput_1510 fliN   TRUE 0.987 13.000 0.443 1.000 Y NA
 6983627 6983628 Pput_1510 Pput_1511   fliP TRUE 0.982 0.000 0.061 1.000 Y NA
 6983628 6983629 Pput_1511 Pput_1512 fliP fliQ TRUE 0.996 22.000 1.000 0.011 Y NA
 6983629 6983630 Pput_1512 Pput_1513 fliQ fliR TRUE 0.999 8.000 1.000 0.001 Y NA
 6983630 6983631 Pput_1513 Pput_1514 fliR flhB TRUE 0.984 3.000 0.129 1.000 Y NA
 6983631 6983632 Pput_1514 Pput_1515 flhB   FALSE 0.322 225.000 0.205 0.011   NA
 6983633 6983634 Pput_1516 Pput_1517     TRUE 0.667 -3.000 0.000 1.000 N NA
 6983634 6983635 Pput_1517 Pput_1518     TRUE 0.754 11.000 0.022 NA   NA
 6983635 6983636 Pput_1518 Pput_1519     FALSE 0.320 34.000 0.000 NA   NA
 6983636 6983637 Pput_1519 Pput_1520     TRUE 0.890 -25.000 0.000 0.030 N NA
 6983640 6983641 Pput_1523 Pput_1524 flhA flhF TRUE 0.973 12.000 0.178 1.000 Y NA
 6983641 6983642 Pput_1524 Pput_1525 flhF   FALSE 0.469 94.000 0.241 1.000 N NA
 6983642 6983643 Pput_1525 Pput_1526   fliA TRUE 0.989 -3.000 0.482 1.000 N NA
 6983643 6983644 Pput_1526 Pput_1527 fliA   FALSE 0.505 96.000 0.283 1.000 N NA
 6983644 6983645 Pput_1527 Pput_1528     TRUE 0.981 22.000 0.516 1.000 Y NA
 6983645 6983646 Pput_1528 Pput_1529     TRUE 0.984 13.000 0.341 1.000 Y NA
 6983646 6983647 Pput_1529 Pput_1530     TRUE 0.965 47.000 0.327 0.012 Y NA
 6983647 6983648 Pput_1530 Pput_1531   motC TRUE 0.988 0.000 0.153 1.000 Y NA
 6983648 6983649 Pput_1531 Pput_1532 motC   TRUE 0.989 4.000 0.248 1.000 Y NA
 6983649 6983650 Pput_1532 Pput_1533     FALSE 0.140 224.000 0.199 1.000 N NA
 6983650 6983651 Pput_1533 Pput_1534     TRUE 0.990 0.000 0.454 1.000   NA
 6983651 6983652 Pput_1534 Pput_1535     TRUE 0.978 42.000 0.886 0.011   NA
 6983652 6983653 Pput_1535 Pput_1536     TRUE 0.993 2.000 0.743 NA   NA
 6983654 6983655 Pput_1537 Pput_1538     FALSE 0.152 68.000 0.000 NA   NA
 6983655 6983656 Pput_1538 Pput_1539     TRUE 0.983 -3.000 0.286 1.000   NA
 6983657 6983658 Pput_1540 Pput_1541     TRUE 0.994 -3.000 0.074 0.002 Y NA
 6983658 6983659 Pput_1541 Pput_1542     TRUE 0.914 47.000 0.051 0.001 Y NA
 6983659 6983660 Pput_1542 Pput_1543     TRUE 0.990 -3.000 0.501 1.000 N NA
 6983660 6983661 Pput_1543 Pput_1544     TRUE 0.984 -3.000 0.344 1.000 N NA
 6983661 6983662 Pput_1544 Pput_1545     TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.002 Y NA
 6983662 6983663 Pput_1545 Pput_1546     TRUE 0.999 -3.000 0.804 0.002 Y NA
 6983663 6983664 Pput_1546 Pput_1547     TRUE 0.991 -3.000 0.196 NA Y NA
 6983664 6983665 Pput_1547 Pput_1548     TRUE 0.995 -7.000 0.522 NA Y NA
 6983665 6983666 Pput_1548 Pput_1549     TRUE 0.981 13.000 0.667 NA   NA
 6983666 6983667 Pput_1549 Pput_1550     FALSE 0.003 617.000 0.000 NA   NA
 6983667 6983668 Pput_1550 Pput_1551     FALSE 0.357 29.000 0.000 NA   NA
 6983668 6983669 Pput_1551 Pput_1552     FALSE 0.245 52.000 0.000 1.000   NA
 6983669 6983670 Pput_1552 Pput_1553     FALSE 0.170 68.000 0.000 1.000   NA
 6983670 6983671 Pput_1553 Pput_1554     FALSE 0.341 35.000 0.000 1.000   NA
 6983671 6983672 Pput_1554 Pput_1555     FALSE 0.019 235.000 0.000 NA   NA
 6983672 6983673 Pput_1555 Pput_1556     FALSE 0.258 45.000 0.000 NA   NA
 6983674 6983675 Pput_1557 Pput_1558     TRUE 0.969 17.000 0.714 NA N NA
 6983675 6983676 Pput_1558 Pput_1559     FALSE 0.002 497.000 0.000 1.000 N NA
 6983677 6983678 Pput_1560 Pput_1561     TRUE 0.778 2.000 0.000 NA   NA
 6983680 6983681 Pput_1563 Pput_1564     FALSE 0.099 87.000 0.000 NA   NA
 6983682 6983683 Pput_1565 Pput_1566     FALSE 0.215 210.000 0.030 1.000 Y NA
 6983683 6983684 Pput_1566 Pput_1567     FALSE 0.326 46.000 0.030 1.000 N NA
 6983684 6983685 Pput_1567 Pput_1568     FALSE 0.075 206.000 0.063 1.000 N NA
 6983685 6983686 Pput_1568 Pput_1569     TRUE 0.989 -3.000 0.148 1.000 Y NA
 6983686 6983687 Pput_1569 Pput_1570     FALSE 0.092 241.000 0.154 1.000 N NA
 6983687 6983688 Pput_1570 Pput_1571     TRUE 0.582 153.000 0.492 1.000 N NA
 6983688 6983689 Pput_1571 Pput_1572     TRUE 0.874 55.000 0.495 1.000   NA
 6983693 6983694 Pput_1576 Pput_1577     FALSE 0.038 353.000 0.000 NA Y NA
 6983694 6983695 Pput_1577 Pput_1578     FALSE 0.333 141.000 0.200 NA N NA
 6983695 6983696 Pput_1578 Pput_1579     FALSE 0.153 230.000 0.192 1.000   NA
 6983696 6983697 Pput_1579 Pput_1580     TRUE 0.911 45.000 0.538 1.000   NA
 6983697 6983698 Pput_1580 Pput_1581     TRUE 0.699 50.000 0.176 NA   NA
 6983698 6983699 Pput_1581 Pput_1582     TRUE 0.953 0.000 0.097 NA   NA
 6983702 6983703 Pput_1585 Pput_1586     FALSE 0.030 150.000 0.000 1.000 N NA
 6983704 6983705 Pput_1587 Pput_1588     TRUE 0.927 11.000 0.203 NA N NA
 6983705 6983706 Pput_1588 Pput_1589     FALSE 0.497 173.000 0.463 NA N NA
 6983706 6983707 Pput_1589 Pput_1590     TRUE 0.996 -7.000 0.269 0.000 Y NA
 6983708 6983709 Pput_1591 Pput_1592     TRUE 0.692 4.000 0.010 1.000 N NA
 6983709 6983710 Pput_1592 Pput_1593   zipA TRUE 0.538 206.000 0.115 0.009 Y NA
 6983710 6983711 Pput_1593 Pput_1594 zipA ligA FALSE 0.075 236.000 0.106 1.000 N NA
 6983711 6983712 Pput_1594 Pput_R0047 ligA ffs FALSE 0.024 218.000 0.000 NA   NA
 6983714 6983715 Pput_1596 Pput_1597     FALSE 0.002 886.000 0.000 NA   NA
 6983717 6983718 Pput_1599 Pput_1600     TRUE 0.806 64.000 0.411 NA   NA
 6983718 6983719 Pput_1600 Pput_1601   recR FALSE 0.241 296.000 0.604 NA   NA
 6983720 6983721 Pput_1602 Pput_1603     FALSE 0.188 56.000 0.016 1.000 N NA
 6983721 6983722 Pput_1603 Pput_1604     FALSE 0.127 187.000 0.084 1.000 N NA
 6983722 6983723 Pput_1604 Pput_1605     FALSE 0.210 106.000 0.051 1.000   NA
 6983723 6983724 Pput_1605 Pput_1606     TRUE 0.600 80.000 0.266 NA   NA
 6983724 6983725 Pput_1606 Pput_1607     TRUE 0.996 -21.000 0.713 NA Y NA
 6983725 6983726 Pput_1607 Pput_1608     FALSE 0.389 137.000 0.197 NA   NA
 6983726 6983727 Pput_1608 Pput_1609     TRUE 0.841 16.000 0.111 NA   NA
 6983727 6983728 Pput_1609 Pput_1610     FALSE 0.066 294.000 0.000 1.000 Y NA
 6983728 6983729 Pput_1610 Pput_1611     TRUE 0.966 -3.000 0.030 0.003 N NA
 6983729 6983730 Pput_1611 Pput_1612     TRUE 0.953 6.000 0.045 0.003 N NA
 6983730 6983731 Pput_1612 Pput_1613     TRUE 0.997 0.000 0.833 0.003 N NA
 6983731 6983732 Pput_1613 Pput_1614     TRUE 0.778 2.000 0.000 NA   NA
 6983732 6983733 Pput_1614 Pput_1615     FALSE 0.008 310.000 0.000 NA   NA
 6983733 6983734 Pput_1615 Pput_1616     TRUE 0.963 -3.000 0.000 0.003   NA
 6983734 6983735 Pput_1616 Pput_1617     TRUE 0.996 6.000 0.800 0.003   NA
 6983735 6983736 Pput_1617 Pput_1618     TRUE 0.985 14.000 0.556 0.003 N NA
 6983738 6983739 Pput_1620 Pput_1621     FALSE 0.296 75.000 0.049 NA   NA
 6983743 6983744 Pput_1625 Pput_1626     FALSE 0.017 244.000 0.000 NA   NA
 6983744 6983745 Pput_1626 Pput_1627   dsbG FALSE 0.002 828.000 0.000 NA   NA
 6983745 6983746 Pput_1627 Pput_1628 dsbG   TRUE 0.961 2.000 0.000 NA Y NA
 6983746 6983747 Pput_1628 Pput_1629     TRUE 0.988 0.000 0.000 0.002 Y NA
 6983748 6983749 Pput_1630 Pput_1631     TRUE 0.992 -7.000 0.167 0.055 Y NA
 6983749 6983750 Pput_1631 Pput_1632     TRUE 0.997 3.000 0.452 0.017 Y NA
 6983750 6983751 Pput_1632 Pput_1633     TRUE 0.916 4.000 0.097 NA N NA
 6983751 6983752 Pput_1633 Pput_1634     TRUE 0.957 -3.000 0.103 NA   NA
 6983753 6983754 Pput_1635 Pput_1636     FALSE 0.410 23.000 0.000 NA   NA
 6983754 6983755 Pput_1636 Pput_1637     FALSE 0.452 19.000 0.000 NA   NA
 6983756 6983757 Pput_1638 Pput_1639     TRUE 0.998 -3.000 0.800 1.000 Y NA
 6983757 6983758 Pput_1639 Pput_1640     FALSE 0.003 327.000 0.000 1.000 N NA
 6983759 6983760 Pput_1641 Pput_1642     FALSE 0.185 65.000 0.000 1.000   NA
 6983760 6983761 Pput_1642 Pput_1643     TRUE 0.958 17.000 0.188 1.000 Y NA
 6983762 6983763 Pput_1644 Pput_1645     FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 6983763 6983764 Pput_1645 Pput_1646     FALSE 0.051 169.000 0.000 NA   NA
 6983764 6983765 Pput_1646 Pput_1647     FALSE 0.133 73.000 0.000 NA   NA
 6983765 6983766 Pput_1647 Pput_1648     FALSE 0.086 95.000 0.000 NA   NA
 6983766 6983767 Pput_1648 Pput_1649     TRUE 0.994 3.000 0.857 NA   NA
 6983769 6983770 Pput_1651 Pput_1652     TRUE 0.992 1.000 0.100 0.017 Y NA
 6983770 6983771 Pput_1652 Pput_1653     FALSE 0.062 76.000 0.000 1.000 N NA
 6983771 6983772 Pput_1653 Pput_1654     TRUE 0.990 10.000 0.818 NA   NA
 6983772 6983773 Pput_1654 Pput_1655     TRUE 0.994 -3.000 0.692 NA   NA
 6983773 6983774 Pput_1655 Pput_1656     TRUE 0.579 85.000 0.308 1.000 N NA
 6983774 6983775 Pput_1656 Pput_1657     TRUE 0.761 65.000 0.333 NA   NA
 6983775 6983776 Pput_1657 Pput_1658     FALSE 0.126 130.000 0.025 NA   NA
 6983776 6983777 Pput_1658 Pput_1659     TRUE 0.564 31.000 0.037 NA   NA
 6983779 6983780 Pput_1661 Pput_1662     TRUE 0.998 -6.000 0.453 0.000 Y NA
 6983780 6983781 Pput_1662 Pput_1663   sdhA TRUE 0.999 4.000 0.705 0.001 Y NA
 6983781 6983782 Pput_1663 Pput_1664 sdhA sdhB TRUE 0.997 12.000 0.604 0.001 Y NA
 6983782 6983783 Pput_1664 Pput_1665 sdhB sucA FALSE 0.186 247.000 0.067 1.000 Y NA
 6983783 6983784 Pput_1665 Pput_1666 sucA   TRUE 0.973 43.000 0.667 1.000 Y NA
 6983784 6983785 Pput_1666 Pput_1667     TRUE 0.761 94.000 0.253 1.000 Y NA
 6983785 6983786 Pput_1667 Pput_1668   sucC FALSE 0.417 172.000 0.069 1.000 Y NA
 6983786 6983787 Pput_1668 Pput_1669 sucC   TRUE 0.999 0.000 0.806 0.000 Y NA
 6983787 6983788 Pput_1669 Pput_1670     FALSE 0.002 404.000 0.000 1.000 N NA
 6983788 6983789 Pput_1670 Pput_1671     FALSE 0.061 236.000 0.060 NA   NA
 6983790 6983791 Pput_1672 Pput_1673     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983792 6983793 Pput_1674 Pput_1675     TRUE 0.988 0.000 0.000 0.002 Y NA
 6983793 6983794 Pput_1675 Pput_1676     TRUE 0.963 13.000 0.000 0.002 Y NA
 6983794 6983795 Pput_1676 Pput_1677     TRUE 0.996 -3.000 0.182 0.002 Y NA
 6983795 6983796 Pput_1677 Pput_1678     FALSE 0.004 309.000 0.000 1.000 N NA
 6983797 6983798 Pput_1679 Pput_1680     FALSE 0.296 38.000 0.000 NA   NA
 6983798 6983799 Pput_1680 Pput_1681     FALSE 0.333 207.000 0.100 1.000 Y NA
 6983799 6983800 Pput_1681 Pput_1682     TRUE 0.702 -16.000 0.000 NA   NA
 6983800 6983801 Pput_1682 Pput_1683     FALSE 0.119 77.000 0.000 NA   NA
 6983801 6983802 Pput_1683 Pput_1684     TRUE 0.981 -3.000 0.314 1.000 N NA
 6983802 6983803 Pput_1684 Pput_1685     TRUE 0.995 1.000 0.943 1.000 N NA
 6983803 6983804 Pput_1685 Pput_1686     FALSE 0.029 206.000 0.000 NA   NA
 6983805 6983806 Pput_1687 Pput_1688     TRUE 0.998 -3.000 0.845 NA Y NA
 6983806 6983807 Pput_1688 Pput_1689     FALSE 0.084 70.000 0.007 NA N NA
 6983807 6983808 Pput_1689 Pput_1690     FALSE 0.128 64.000 0.008 1.000 N NA
 6983811 6983812 Pput_1693 Pput_1694     TRUE 0.989 12.000 0.451 1.000 Y NA
 6983812 6983813 Pput_1694 Pput_1695     FALSE 0.013 208.000 0.000 1.000 N NA
 6983813 6983814 Pput_1695 Pput_1696     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6983814 6983815 Pput_1696 Pput_1697     TRUE 0.989 0.000 0.444 NA   NA
 6983816 6983817 Pput_1698 Pput_1699 gpsA   TRUE 0.844 37.000 0.273 NA   NA
 6983817 6983818 Pput_1699 Pput_1700     TRUE 0.959 -3.000 0.114 NA   NA
 6983818 6983819 Pput_1700 Pput_1701     FALSE 0.062 151.000 0.000 NA   NA
 6983819 6983820 Pput_1701 Pput_1702     FALSE 0.464 18.000 0.000 NA   NA
 6983820 6983821 Pput_1702 Pput_1703     TRUE 0.954 -3.000 0.096 NA   NA
 6983821 6983822 Pput_1703 Pput_1704     FALSE 0.307 110.000 0.118 NA   NA
 6983822 6983823 Pput_1704 Pput_1705     TRUE 0.970 13.000 0.478 NA   NA
 6983823 6983824 Pput_1705 Pput_1706     FALSE 0.018 239.000 0.000 NA   NA
 6983824 6983825 Pput_1706 Pput_1707     TRUE 0.965 10.000 0.071 0.001   NA
 6983825 6983826 Pput_1707 Pput_1708     TRUE 0.985 10.000 0.059 0.001 Y NA
 6983826 6983827 Pput_1708 Pput_1709     TRUE 0.998 11.000 0.877 0.001 Y NA
 6983827 6983828 Pput_1709 Pput_1710     FALSE 0.066 150.000 0.020 1.000 N NA
 6983828 6983829 Pput_1710 Pput_1711     TRUE 0.997 -3.000 0.621 1.000 Y NA
 6983830 6983831 Pput_1712 Pput_1713     FALSE 0.071 71.000 0.000 1.000 N NA
 6983833 6983834 Pput_1715 Pput_1716     TRUE 0.996 2.000 1.000 1.000   NA
 6983834 6983835 Pput_1716 Pput_1717     TRUE 0.998 2.000 1.000 0.058   NA
 6983835 6983836 Pput_1717 Pput_1718     TRUE 0.998 2.000 1.000 0.058   NA
 6983836 6983837 Pput_1718 Pput_1719     TRUE 0.994 -3.000 0.159 0.058 Y NA
 6983837 6983838 Pput_1719 Pput_1720     FALSE 0.148 110.000 0.049 1.000 N NA
 6983838 6983839 Pput_1720 Pput_1721     FALSE 0.484 101.000 0.233 1.000   NA
 6983840 6983841 Pput_1722 Pput_1723   rnhA TRUE 0.585 16.000 0.009 1.000   NA
 6983841 6983842 Pput_1723 Pput_1724 rnhA   TRUE 0.903 51.000 0.248 1.000 Y NA
 6983842 6983843 Pput_1724 Pput_1725     FALSE 0.014 266.000 0.019 1.000 N NA
 6983847 6983848 Pput_1729 Pput_1730     TRUE 0.604 13.000 0.000 1.000   NA
 6983848 6983849 Pput_1730 Pput_1731     TRUE 0.748 -7.000 0.000 NA   NA
 6983852 6983853 Pput_1734 Pput_1735     TRUE 0.997 8.000 0.437 0.001 Y NA
 6983853 6983854 Pput_1735 Pput_1736     TRUE 0.989 41.000 0.713 0.001 Y NA
 6983854 6983855 Pput_1736 Pput_1737     TRUE 0.996 -3.000 0.211 0.004 Y NA
 6983855 6983856 Pput_1737 Pput_1738     TRUE 0.996 4.000 0.269 0.002 Y NA
 6983856 6983857 Pput_1738 Pput_1739     TRUE 0.995 11.000 0.428 0.004 Y NA
 6983857 6983858 Pput_1739 Pput_1740     TRUE 0.994 12.000 0.423 0.004 Y NA
 6983858 6983859 Pput_1740 Pput_1741     TRUE 0.999 -3.000 0.664 0.004 Y NA
 6983859 6983860 Pput_1741 Pput_1742     TRUE 0.799 133.000 0.180 0.004 Y NA
 6983860 6983861 Pput_1742 Pput_1743     TRUE 0.996 -3.000 0.186 0.004 Y NA
 6983861 6983862 Pput_1743 Pput_1744     TRUE 0.997 3.000 0.407 0.004 Y NA
 6983862 6983863 Pput_1744 Pput_1745     TRUE 0.965 80.000 0.691 0.002 Y NA
 6983863 6983864 Pput_1745 Pput_1746     TRUE 0.996 10.000 0.377 0.002 Y NA
 6983864 6983865 Pput_1746 Pput_1747     FALSE 0.006 384.000 0.000 1.000   NA
 6983865 6983866 Pput_1747 Pput_1748     FALSE 0.011 291.000 0.000 1.000   NA
 6983866 6983867 Pput_1748 Pput_1749     FALSE 0.004 491.000 0.000 1.000   NA
 6983868 6983869 Pput_1750 Pput_1751     FALSE 0.215 54.000 0.000 NA   NA
 6983869 6983870 Pput_1751 Pput_1752     FALSE 0.116 84.000 0.000 1.000   NA
 6983871 6983872 Pput_1753 Pput_1754     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6983874 6983875 Pput_1756 Pput_1757     FALSE 0.412 181.000 0.375 1.000 N NA
 6983876 6983877 Pput_1758 Pput_1759     FALSE 0.192 58.000 0.000 NA   NA
 6983877 6983878 Pput_1759 Pput_1760     FALSE 0.098 88.000 0.000 NA   NA
 6983880 6983881 Pput_1762 Pput_1763     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6983881 6983882 Pput_1763 Pput_1764     FALSE 0.083 108.000 0.000 1.000   NA
 6983882 6983883 Pput_1764 Pput_1765     TRUE 0.610 64.000 0.036 0.027   NA
 6983883 6983884 Pput_1765 Pput_1766   uvrC TRUE 0.958 7.000 0.086 0.027 N NA
 6983884 6983885 Pput_1766 Pput_1767 uvrC   TRUE 0.804 34.000 0.227 1.000 N NA
 6983885 6983886 Pput_1767 Pput_R0048     FALSE 0.171 64.000 0.000 NA   NA
 6983889 6983890 Pput_1770 Pput_1771     FALSE 0.004 449.000 0.000 NA   NA
 6983891 6983892 Pput_1772 Pput_1773     TRUE 0.799 57.000 0.000 0.027 Y NA
 6983893 6983894 Pput_1774 Pput_1775     TRUE 0.995 -3.000 0.205 0.076 Y NA
 6983894 6983895 Pput_1775 Pput_1776     TRUE 0.987 4.000 0.189 1.000 Y NA
 6983895 6983896 Pput_1776 Pput_1777     TRUE 0.970 20.000 0.316 1.000 Y NA
 6983897 6983898 Pput_1778 Pput_1779     FALSE 0.073 118.000 0.000 NA   NA
 6983902 6983903 Pput_1783 Pput_1784     TRUE 0.806 155.000 0.544 0.003   NA
 6983903 6983904 Pput_1784 Pput_1785     TRUE 0.994 -3.000 0.115 0.003 Y NA
 6983905 6983906 Pput_1786 Pput_1787     FALSE 0.007 318.000 0.000 NA   NA
 6983906 6983907 Pput_1787 Pput_1788     FALSE 0.073 122.000 0.000 NA   NA
 6983907 6983908 Pput_1788 Pput_1789     TRUE 0.605 135.000 0.417 NA   NA
 6983908 6983909 Pput_1789 Pput_1790     TRUE 0.691 15.000 0.031 NA   NA
 6983909 6983910 Pput_1790 Pput_1791     TRUE 0.995 -3.000 0.141 0.003 Y NA
 6983910 6983911 Pput_1791 Pput_1792     TRUE 0.996 -3.000 0.204 0.003 Y NA
 6983911 6983912 Pput_1792 Pput_1793   glgA TRUE 0.994 15.000 0.917 1.000 Y NA
 6983912 6983913 Pput_1793 Pput_1794 glgA   FALSE 0.003 649.000 0.000 NA   NA
 6983914 6983915 Pput_1795 Pput_1796     TRUE 0.984 -3.000 0.073 1.000 Y NA
 6983915 6983916 Pput_1796 Pput_1797     FALSE 0.363 116.000 0.000 1.000 Y NA
 6983916 6983917 Pput_1797 Pput_1798     FALSE 0.157 67.000 0.000 NA   NA
 6983917 6983918 Pput_1798 Pput_1799     TRUE 0.801 0.000 0.000 NA   NA
 6983919 6983920 Pput_1800 Pput_1801     TRUE 0.978 1.000 0.301 1.000 N NA
 6983920 6983921 Pput_1801 Pput_1802     FALSE 0.135 114.000 0.043 1.000 N NA
 6983922 6983923 Pput_1803 Pput_1804     FALSE 0.473 50.000 0.069 1.000 N NA
 6983924 6983925 Pput_1805 Pput_1806     FALSE 0.110 88.000 0.000 1.000   NA
 6983925 6983926 Pput_1806 Pput_1807   nhaB FALSE 0.031 147.000 0.000 1.000 N NA
 6983927 6983928 Pput_1808 Pput_1809   nudC FALSE 0.344 37.000 0.025 1.000 N NA
 6983929 6983930 Pput_1810 Pput_1811     FALSE 0.064 146.000 0.000 NA   NA
 6983930 6983931 Pput_1811 Pput_1812     FALSE 0.020 230.000 0.000 NA   NA
 6983931 6983932 Pput_1812 Pput_1813     FALSE 0.046 186.000 0.000 1.000   NA
 6983932 6983933 Pput_1813 Pput_1814     FALSE 0.017 193.000 0.000 1.000 N NA
 6983933 6983934 Pput_1814 Pput_1815     FALSE 0.031 209.000 0.000 1.000   NA
 6983934 6983935 Pput_1815 Pput_1816     TRUE 0.956 -7.000 0.167 NA   NA
 6983935 6983936 Pput_1816 Pput_1817     FALSE 0.192 82.000 0.029 NA   NA
 6983936 6983937 Pput_1817 Pput_1818     FALSE 0.275 111.000 0.093 NA   NA
 6983937 6983938 Pput_1818 Pput_1819   mnmA TRUE 0.971 -3.000 0.180 NA   NA
 6983938 6983939 Pput_1819 Pput_1820 mnmA   TRUE 0.568 60.000 0.158 1.000 N NA
 6983939 6983940 Pput_1820 Pput_1821     FALSE 0.043 207.000 0.032 1.000 N NA
 6983943 6983944 Pput_1824 Pput_1825 clpS   TRUE 0.944 31.000 0.596 NA   NA
 6983945 6983946 Pput_1826 Pput_1827 infA   FALSE 0.220 102.000 0.078 1.000 N NA
 6983946 6983947 Pput_1827 Pput_1828   aat TRUE 0.900 57.000 0.285 1.000 Y NA
 6983948 6983949 Pput_1829 Pput_1830   lolA TRUE 0.717 63.000 0.305 1.000 N NA
 6983949 6983950 Pput_1830 Pput_1831 lolA   TRUE 0.890 13.000 0.167 1.000 N NA
 6983950 6983951 Pput_1831 Pput_1832     TRUE 0.830 -3.000 0.027 NA N NA
 6983951 6983952 Pput_1832 Pput_1833     FALSE 0.382 31.000 0.028 NA N NA
 6983952 6983953 Pput_1833 Pput_1834     TRUE 0.848 1.000 0.031 1.000 N NA
 6983954 6983955 Pput_1835 Pput_1836     FALSE 0.167 95.000 0.051 NA N NA
 6983955 6983956 Pput_1836 Pput_1837     TRUE 0.925 -3.000 0.072 NA N NA
 6983956 6983957 Pput_1837 Pput_1838     TRUE 0.994 -3.000 0.317 NA Y NA
 6983957 6983958 Pput_1838 Pput_1839     TRUE 0.998 0.000 0.804 NA Y NA
 6983958 6983959 Pput_1839 Pput_1840     TRUE 0.997 2.000 0.790 NA Y NA
 6983959 6983960 Pput_1840 Pput_1841     FALSE 0.080 57.000 0.000 NA N NA
 6983960 6983961 Pput_1841 Pput_1842     FALSE 0.009 315.000 0.000 1.000   NA
 6983966 6983967 Pput_1846 Pput_1847     TRUE 0.988 4.000 0.541 NA   NA
 6983967 6983968 Pput_1847 Pput_1848     FALSE 0.181 61.000 0.000 NA   NA
 6983968 6983969 Pput_1848 Pput_1849     FALSE 0.369 107.000 0.000 1.000 Y NA
 6983969 6983970 Pput_1849 Pput_1850     FALSE 0.111 328.000 0.000 0.004 Y NA
 6983970 6983971 Pput_1850 Pput_1851     FALSE 0.073 109.000 0.000 NA   NA
 6983973 6983974 Pput_1853 Pput_1854     TRUE 0.554 104.000 0.364 1.000 N NA
 6983974 6983975 Pput_1854 Pput_1855     FALSE 0.442 20.000 0.000 NA   NA
 6983976 6983977 Pput_1856 Pput_1857     FALSE 0.092 91.000 0.000 NA   NA
 6983977 6983978 Pput_1857 Pput_1858     FALSE 0.026 165.000 0.000 1.000 N NA
 6983982 6983983 Pput_1862 Pput_1863     FALSE 0.006 352.000 0.000 NA   NA
 6983983 6983984 Pput_1863 Pput_1864     FALSE 0.004 414.000 0.000 NA   NA
 6983985 6983986 Pput_1865 Pput_1866     TRUE 0.533 157.000 0.438 NA N NA
 6983987 6983988 Pput_1867 Pput_1868     FALSE 0.348 137.000 0.000 1.000 Y NA
 6983988 6983989 Pput_1868 Pput_1869     FALSE 0.022 548.000 0.000 1.000 Y NA
 6983989 6983990 Pput_1869 Pput_1870     FALSE 0.003 368.000 0.000 1.000 N NA
 6983990 6983991 Pput_1870 Pput_1871     TRUE 0.997 9.000 0.487 0.001 Y NA
 6983993 6983994 Pput_1873 Pput_1874     TRUE 0.638 11.000 0.000 NA   NA
 6983994 6983995 Pput_1874 Pput_1875     TRUE 0.967 -3.000 0.000 NA Y NA
 6983995 6983996 Pput_1875 Pput_1876     FALSE 0.486 76.000 0.143 1.000   NA
 6983997 6983998 Pput_1877 Pput_1878     FALSE 0.428 70.000 0.114 1.000 N NA
 6983998 6983999 Pput_1878 Pput_1879     TRUE 0.933 45.000 0.160 0.057 Y NA
 6983999 6984000 Pput_1879 Pput_1880     TRUE 0.915 49.000 0.120 0.057 Y NA
 6984000 6984001 Pput_1880 Pput_1881     TRUE 0.896 62.000 0.158 0.057 Y NA
 6984001 6984002 Pput_1881 Pput_1882     TRUE 0.994 12.000 0.692 1.000 Y NA
 6984002 6984003 Pput_1882 Pput_1883     TRUE 0.997 12.000 0.733 0.017 Y NA
 6984003 6984004 Pput_1883 Pput_1884     FALSE 0.208 29.000 0.000 1.000 N NA
 6984009 6984010 Pput_1889 Pput_1890     TRUE 0.998 -3.000 0.519 0.017 Y NA
 6984010 6984011 Pput_1890 Pput_1891     FALSE 0.018 438.000 0.120 1.000 N NA
 6984011 6984012 Pput_1891 Pput_1892     FALSE 0.498 71.000 0.130 NA   NA
 6984013 6984014 Pput_1893 Pput_1894     TRUE 0.977 -3.000 0.222 NA   NA
 6984014 6984015 Pput_1894 Pput_1895     TRUE 0.981 14.000 0.750 NA   NA
 6984015 6984016 Pput_1895 Pput_1896     TRUE 0.928 16.000 0.065 NA Y NA
 6984016 6984017 Pput_1896 Pput_1897     FALSE 0.403 56.000 0.065 NA N NA
 6984017 6984018 Pput_1897 Pput_1898     FALSE 0.067 139.000 0.000 NA   NA
 6984018 6984019 Pput_1898 Pput_1899     FALSE 0.002 810.000 0.000 NA   NA
 6984022 6984023 Pput_1902 Pput_1903     FALSE 0.030 153.000 0.000 1.000 N NA
 6984023 6984024 Pput_1903 Pput_1904     FALSE 0.073 127.000 0.000 NA   NA
 6984024 6984025 Pput_1904 Pput_1905     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6984025 6984026 Pput_1905 Pput_1906     FALSE 0.210 55.000 0.000 NA   NA
 6984027 6984028 Pput_1907 Pput_1908     FALSE 0.050 170.000 0.000 NA   NA
 6984029 6984030 Pput_1909 Pput_1910     TRUE 0.704 37.000 0.115 NA   NA
 6984030 6984031 Pput_1910 Pput_1911     FALSE 0.041 184.000 0.000 NA   NA
 6984031 6984032 Pput_1911 Pput_1912     TRUE 0.771 57.000 0.344 NA N NA
 6984033 6984034 Pput_1913 Pput_R0050     FALSE 0.059 155.000 0.000 NA   NA
 6984035 6984036 Pput_1914 Pput_1915     TRUE 0.787 1.000 0.000 NA   NA
 6984036 6984037 Pput_1915 Pput_1916     FALSE 0.005 378.000 0.000 NA   NA
 6984037 6984038 Pput_1916 Pput_1917     FALSE 0.023 220.000 0.000 NA   NA
 6984038 6984039 Pput_1917 Pput_1918     FALSE 0.003 675.000 0.000 NA   NA
 6984039 6984040 Pput_1918 Pput_1919     FALSE 0.004 407.000 0.000 NA   NA
 6984040 6984041 Pput_1919 Pput_1920     TRUE 0.988 -25.000 0.667 NA   NA
 6984041 6984042 Pput_1920 Pput_1921     FALSE 0.105 82.000 0.000 NA   NA
 6984042 6984043 Pput_1921 Pput_1922     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984043 6984044 Pput_1922 Pput_1923     TRUE 0.941 -3.000 0.068 NA   NA
 6984045 6984046 Pput_1924 Pput_1925     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6984046 6984047 Pput_1925 Pput_1926     FALSE 0.030 205.000 0.000 NA   NA
 6984047 6984048 Pput_1926 Pput_1927     FALSE 0.003 528.000 0.000 NA   NA
 6984048 6984049 Pput_1927 Pput_1928     FALSE 0.003 725.000 0.000 NA   NA
 6984052 6984053 Pput_1931 Pput_1932     FALSE 0.090 92.000 0.000 NA   NA
 6984055 6984056 Pput_1934 Pput_R0051     FALSE 0.227 51.000 0.000 NA   NA
 6984057 6984058 Pput_1935 Pput_1936     TRUE 0.972 6.000 0.000 0.091 Y NA
 6984058 6984059 Pput_1936 Pput_1937     TRUE 0.918 12.000 0.000 1.000 Y NA
 6984060 6984061 Pput_1938 Pput_1939     FALSE 0.007 254.000 0.000 1.000 N NA
 6984061 6984062 Pput_1939 Pput_1940     FALSE 0.206 58.000 0.021 1.000 N NA
 6984062 6984063 Pput_1940 Pput_1941     TRUE 0.997 2.000 0.308 0.001 Y NA
 6984063 6984064 Pput_1941 Pput_1942     TRUE 0.999 0.000 0.660 0.001 Y NA
 6984064 6984065 Pput_1942 Pput_1943     FALSE 0.193 83.000 0.026 1.000   NA
 6984065 6984066 Pput_1943 Pput_1944     FALSE 0.217 53.000 0.000 NA   NA
 6984066 6984067 Pput_1944 Pput_1945     TRUE 0.941 8.000 0.156 NA   NA
 6984068 6984069 Pput_1946 Pput_1947     FALSE 0.412 78.000 0.100 1.000   NA
 6984069 6984070 Pput_1947 Pput_1948     TRUE 0.998 -3.000 0.371 0.011 Y NA
 6984070 6984071 Pput_1948 Pput_1949     FALSE 0.009 237.000 0.000 1.000 N NA
 6984071 6984072 Pput_1949 Pput_1950     FALSE 0.129 98.000 0.035 1.000 N NA
 6984073 6984074 Pput_1951 Pput_1952     FALSE 0.029 156.000 0.000 1.000 N NA
 6984074 6984075 Pput_1952 Pput_1953     TRUE 0.995 18.000 0.815 0.057 Y NA
 6984075 6984076 Pput_1953 Pput_1954     TRUE 0.998 7.000 0.852 0.057 Y NA
 6984076 6984077 Pput_1954 Pput_1955     TRUE 0.997 -3.000 0.304 0.057 Y NA
 6984077 6984078 Pput_1955 Pput_1956     FALSE 0.003 331.000 0.000 1.000 N NA
 6984081 6984082 Pput_1959 Pput_1960     FALSE 0.377 27.000 0.000 NA   NA
 6984082 6984083 Pput_1960 Pput_1961     FALSE 0.070 135.000 0.000 NA   NA
 6984083 6984084 Pput_1961 Pput_1962     TRUE 0.982 -3.000 0.273 NA   NA
 6984084 6984085 Pput_1962 Pput_1963     TRUE 0.634 58.000 0.000 1.000 Y NA
 6984085 6984086 Pput_1963 Pput_1964     FALSE 0.377 27.000 0.000 NA   NA
 6984087 6984088 Pput_1965 Pput_1966     TRUE 0.997 -3.000 0.512 1.000 Y NA
 6984088 6984089 Pput_1966 Pput_1967     TRUE 0.999 0.000 0.814 0.091 Y NA
 6984089 6984090 Pput_1967 Pput_1968     TRUE 0.996 -3.000 0.484 1.000 Y NA
 6984090 6984091 Pput_1968 Pput_1969     TRUE 0.945 17.000 0.387 NA   NA
 6984091 6984092 Pput_1969 Pput_1970     TRUE 0.987 -3.000 0.360 NA   NA
 6984092 6984093 Pput_1970 Pput_1971     TRUE 0.980 -3.000 0.250 NA   NA
 6984093 6984094 Pput_1971 Pput_1972     TRUE 0.985 -3.000 0.333 NA   NA
 6984094 6984095 Pput_1972 Pput_1973     FALSE 0.044 178.000 0.000 NA   NA
 6984097 6984098 Pput_1975 Pput_1976   pbpG FALSE 0.031 202.000 0.000 NA   NA
 6984098 6984099 Pput_1976 Pput_1977 pbpG   FALSE 0.068 138.000 0.000 NA   NA
 6984102 6984103 Pput_1980 Pput_1981     FALSE 0.003 533.000 0.000 NA   NA
 6984104 6984105 Pput_1982 Pput_1983     FALSE 0.034 195.000 0.000 NA   NA
 6984105 6984106 Pput_1983 Pput_1984     FALSE 0.020 229.000 0.000 NA   NA
 6984106 6984107 Pput_1984 Pput_1985     FALSE 0.081 99.000 0.000 NA   NA
 6984107 6984108 Pput_1985 Pput_1986     TRUE 0.949 12.000 0.050 1.000 Y NA
 6984108 6984109 Pput_1986 Pput_1987     FALSE 0.001 910.000 0.000 1.000 N NA
 6984115 6984116 Pput_1993 Pput_1994     TRUE 0.647 95.000 0.400 NA   NA
 6984118 6984119 Pput_1996 Pput_1997     FALSE 0.082 98.000 0.000 NA   NA
 6984119 6984120 Pput_1997 Pput_1998     FALSE 0.022 225.000 0.000 NA   NA
 6984121 6984122 Pput_1999 Pput_2000     FALSE 0.170 68.000 0.000 1.000   NA
 6984124 6984125 Pput_2002 Pput_2003     TRUE 0.976 -3.000 0.026 1.000 Y NA
 6984125 6984126 Pput_2003 Pput_2004     TRUE 0.989 -3.000 0.416 1.000   NA
 6984126 6984127 Pput_2004 Pput_2005     TRUE 0.983 -6.000 0.353 1.000   NA
 6984127 6984128 Pput_2005 Pput_2006     TRUE 0.976 45.000 0.462 0.025 Y NA
 6984129 6984130 Pput_2007 Pput_2008     TRUE 0.957 13.000 0.400 1.000 N NA
 6984130 6984131 Pput_2008 Pput_2009     TRUE 0.962 14.000 0.154 1.000 Y NA
 6984135 6984136 Pput_2013 Pput_2014     FALSE 0.368 28.000 0.000 NA   NA
 6984136 6984137 Pput_2014 Pput_2015     FALSE 0.067 140.000 0.000 NA   NA
 6984137 6984138 Pput_2015 Pput_2016   glcF TRUE 0.907 -7.000 0.057 NA   NA
 6984138 6984139 Pput_2016 Pput_2017 glcF glcE TRUE 0.983 10.000 0.074 0.042 Y NA
 6984139 6984140 Pput_2017 Pput_2018 glcE   TRUE 0.992 0.000 0.070 0.014 Y NA
 6984145 6984146 Pput_2023 Pput_2024     FALSE 0.255 103.000 0.000 0.070   NA
 6984146 6984147 Pput_2024 Pput_2025     FALSE 0.005 394.000 0.000 1.000   NA
 6984148 6984149 Pput_2026 Pput_2027     TRUE 0.956 13.000 0.128 0.000 N NA
 6984150 6984151 Pput_2028 Pput_2029     TRUE 0.993 0.000 0.680 NA N NA
 6984151 6984152 Pput_2029 Pput_2030     TRUE 0.989 -10.000 0.627 NA   NA
 6984154 6984155 Pput_2032 Pput_2033     TRUE 0.740 74.000 0.125 1.000 Y NA
 6984155 6984156 Pput_2033 Pput_2034     TRUE 0.997 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 6984156 6984157 Pput_2034 Pput_2035     TRUE 0.997 -3.000 0.625 1.000 Y NA
 6984157 6984158 Pput_2035 Pput_2036     FALSE 0.251 197.000 0.250 1.000 N NA
 6984158 6984159 Pput_2036 Pput_2037     FALSE 0.009 239.000 0.000 1.000 N NA
 6984159 6984160 Pput_2037 Pput_2038     TRUE 0.964 34.000 0.429 1.000 Y NA
 6984160 6984161 Pput_2038 Pput_2039     TRUE 0.968 18.000 0.714 1.000 N NA
 6984161 6984162 Pput_2039 Pput_2040     TRUE 0.983 -7.000 0.231 0.029 N NA
 6984162 6984163 Pput_2040 Pput_2041   alr FALSE 0.177 35.000 0.000 1.000 N NA
 6984163 6984164 Pput_2041 Pput_2042 alr   FALSE 0.236 25.000 0.000 1.000 N NA
 6984164 6984165 Pput_2042 Pput_2043     TRUE 0.585 -7.000 0.000 1.000 N NA
 6984165 6984166 Pput_2043 Pput_2044     FALSE 0.324 38.000 0.000 1.000   NA
 6984166 6984167 Pput_2044 Pput_2045     FALSE 0.004 537.000 0.000 1.000   NA
 6984167 6984168 Pput_2045 Pput_2046     TRUE 0.861 35.000 0.333 1.000 N NA
 6984168 6984169 Pput_2046 Pput_2047     TRUE 0.996 -3.000 1.000 1.000 N NA
 6984169 6984170 Pput_2047 Pput_2048     FALSE 0.029 154.000 0.000 1.000 N NA
 6984170 6984171 Pput_2048 Pput_2049     FALSE 0.036 116.000 0.000 1.000 N NA
 6984172 6984173 Pput_2050 Pput_2051     TRUE 0.976 -19.000 0.417 1.000 N NA
 6984173 6984174 Pput_2051 Pput_2052     FALSE 0.008 246.000 0.000 1.000 N NA
 6984175 6984176 Pput_2053 Pput_2054     TRUE 0.893 18.000 0.250 1.000 N NA
 6984176 6984177 Pput_2054 Pput_2055     TRUE 0.823 44.000 0.057 1.000 Y NA
 6984177 6984178 Pput_2055 Pput_2056     FALSE 0.082 118.000 0.000 1.000   NA
 6984178 6984179 Pput_2056 Pput_2057     FALSE 0.064 161.000 0.000 1.000   NA
 6984183 6984184 Pput_2061 Pput_2062     FALSE 0.028 160.000 0.000 1.000 N NA
 6984184 6984185 Pput_2062 Pput_2063     FALSE 0.500 163.000 0.409 1.000 N NA
 6984187 6984188 Pput_2065 Pput_2066 pssA   FALSE 0.036 120.000 0.000 1.000 N NA
 6984189 6984190 Pput_2067 Pput_2068     FALSE 0.025 214.000 0.000 NA   NA
 6984193 6984194 Pput_2071 Pput_2072     FALSE 0.006 271.000 0.000 1.000 N NA
 6984194 6984195 Pput_2072 Pput_2073     TRUE 0.843 29.000 0.250 1.000 N NA
 6984195 6984196 Pput_2073 Pput_2074     FALSE 0.063 162.000 0.000 1.000   NA
 6984197 6984198 Pput_2075 Pput_2076     FALSE 0.002 379.000 0.000 1.000 N NA
 6984199 6984200 Pput_2077 Pput_2078     TRUE 0.806 58.000 0.000 0.009 Y NA
 6984201 6984202 Pput_2079 Pput_2080     FALSE 0.030 152.000 0.000 1.000 N NA
 6984202 6984203 Pput_2080 Pput_2081     TRUE 0.853 3.000 0.039 1.000 N NA
 6984203 6984204 Pput_2081 Pput_2082     FALSE 0.370 89.000 0.105 1.000   NA
 6984204 6984205 Pput_2082 Pput_2083     FALSE 0.120 187.000 0.053 1.000   NA
 6984205 6984206 Pput_2083 Pput_2084     TRUE 0.952 13.000 0.143 0.042   NA
 6984206 6984207 Pput_2084 Pput_2085     TRUE 0.969 -3.000 0.164 1.000   NA
 6984207 6984208 Pput_2085 Pput_2086     TRUE 0.846 69.000 0.582 NA   NA
 6984208 6984209 Pput_2086 Pput_2087     FALSE 0.013 265.000 0.000 NA   NA
 6984209 6984210 Pput_2087 Pput_2088     FALSE 0.107 81.000 0.000 NA   NA
 6984210 6984211 Pput_2088 Pput_2089     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6984213 6984214 Pput_2091 Pput_2092     FALSE 0.009 231.000 0.000 1.000 N NA
 6984214 6984215 Pput_2092 Pput_2093     FALSE 0.497 -58.000 0.000 1.000 N NA
 6984216 6984217 Pput_2094 Pput_2095     FALSE 0.436 99.000 0.200 NA   NA
 6984217 6984218 Pput_2095 Pput_2096     TRUE 0.949 -3.000 0.113 1.000 N NA
 6984218 6984219 Pput_2096 Pput_2097     TRUE 0.984 -13.000 0.189 1.000 Y NA
 6984219 6984220 Pput_2097 Pput_2098     TRUE 0.998 0.000 0.973 1.000 Y NA
 6984221 6984222 Pput_2099 Pput_2100     FALSE 0.137 76.000 0.000 1.000   NA
 6984225 6984226 Pput_2103 Pput_2104     FALSE 0.046 186.000 0.000 1.000   NA
 6984228 6984229 Pput_2106 Pput_2107     TRUE 0.685 9.000 0.000 NA   NA
 6984229 6984230 Pput_2107 Pput_2108     FALSE 0.232 50.000 0.000 NA   NA
 6984230 6984231 Pput_2108 Pput_2109     FALSE 0.169 209.000 0.000 1.000 Y NA
 6984232 6984233 Pput_2110 Pput_2111     TRUE 0.990 19.000 0.500 0.053 Y NA
 6984233 6984234 Pput_2111 Pput_2112     TRUE 0.999 0.000 0.875 0.000 Y NA
 6984236 6984237 Pput_2114 Pput_2115     TRUE 0.764 3.000 0.000 NA   NA
 6984237 6984238 Pput_2115 Pput_2116     TRUE 0.748 -7.000 0.000 NA   NA
 6984238 6984239 Pput_2116 Pput_2117     TRUE 0.809 -3.000 0.000 NA   NA
 6984239 6984240 Pput_2117 Pput_2118     FALSE 0.129 74.000 0.000 NA   NA
 6984240 6984241 Pput_2118 Pput_2119     FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 6984241 6984242 Pput_2119 Pput_2120     TRUE 0.993 2.000 0.673 NA   NA
 6984242 6984243 Pput_2120 Pput_2121     TRUE 0.919 56.000 0.765 NA   NA
 6984243 6984244 Pput_2121 Pput_2122     TRUE 0.996 -3.000 0.862 NA   NA
 6984244 6984245 Pput_2122 Pput_2123     TRUE 0.991 -3.000 0.510 NA   NA
 6984245 6984246 Pput_2123 Pput_2124     TRUE 0.991 -36.000 0.863 NA   NA
 6984246 6984247 Pput_2124 Pput_2125     TRUE 0.988 4.000 0.552 NA   NA
 6984247 6984248 Pput_2125 Pput_2126     TRUE 0.993 -3.000 0.627 NA   NA
 6984248 6984249 Pput_2126 Pput_2127     TRUE 0.977 18.000 0.821 NA   NA
 6984250 6984251 Pput_2128