MicrobesOnline Operon Predictions for Hahella chejuensis KCTC 2396

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 1092095 1092096 HCH_00001 HCH_00002   dnaA TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092096 1092097 HCH_00002 HCH_00003 dnaA dnaN TRUE 0.957 103.000 0.328 1.000 Y NA
 1092097 1092098 HCH_00003 HCH_00004 dnaN   FALSE 0.290 21.000 0.000 NA   NA
 1092098 1092099 HCH_00004 HCH_00005   aarF FALSE 0.270 25.000 0.000 NA   NA
 1092099 1092100 HCH_00005 HCH_00006 aarF   FALSE 0.215 74.000 0.000 NA   NA
 1092100 1092101 HCH_00006 HCH_00007   recF FALSE 0.405 21.000 0.000 NA N NA
 1092101 1092102 HCH_00007 HCH_00008 recF gyrB TRUE 0.977 24.000 0.249 0.005 Y NA
 1092103 1092104 HCH_00009 HCH_00010     FALSE 0.036 314.000 0.000 1.000 N NA
 1092104 1092105 HCH_00010 HCH_00011     TRUE 0.984 -3.000 0.281 0.003   NA
 1092105 1092106 HCH_00011 HCH_00012     TRUE 0.985 -3.000 0.423 1.000   NA
 1092106 1092107 HCH_00012 HCH_00013     TRUE 0.488 571.000 0.462 0.073 Y NA
 1092107 1092108 HCH_00013 HCH_00014     FALSE 0.012 340.000 0.000 NA   NA
 1092110 1092111 HCH_00016 HCH_00017 fumC   TRUE 0.756 20.000 0.058 NA   NA
 1092111 1092112 HCH_00017 HCH_00018     FALSE 0.207 82.000 0.000 NA   NA
 1092112 1092113 HCH_00018 HCH_00019     FALSE 0.421 51.000 0.000 1.000 N NA
 1092113 1092114 HCH_00019 HCH_10039     FALSE 0.016 299.000 0.000 NA   NA
 1092114 1092115 HCH_10039 HCH_00020     FALSE 0.223 61.000 0.000 NA   NA
 1092115 1092116 HCH_00020 HCH_00021   glyS TRUE 0.893 20.000 0.123 1.000 N NA
 1092116 1092117 HCH_00021 HCH_00022 glyS glyQ TRUE 0.997 5.000 0.651 0.001 Y NA
 1092121 1092122 HCH_00025 HCH_00027 trkH trkA TRUE 0.923 34.000 0.065 0.003 Y NA
 1092122 1092123 HCH_00027 HCH_00028 trkA sun TRUE 0.954 2.000 0.122 1.000 N NA
 1092123 1092124 HCH_00028 HCH_00029 sun fmt TRUE 0.991 2.000 0.305 1.000 Y NA
 1092124 1092125 HCH_00029 HCH_00030 fmt def TRUE 0.931 69.000 0.105 0.018 Y NA
 1092126 1092127 HCH_00031 HCH_00032     TRUE 0.677 60.000 0.043 1.000   NA
 1092127 1092128 HCH_00032 HCH_00033     TRUE 0.548 89.000 0.023 NA N NA
 1092128 1092129 HCH_00033 HCH_00036   hemF TRUE 0.858 11.000 0.058 NA N NA
 1092131 1092132 HCH_00037 HCH_00038 aroE motA FALSE 0.301 146.000 0.009 1.000 N NA
 1092132 1092133 HCH_00038 HCH_00039 motA motB TRUE 0.955 -3.000 0.051 1.000 Y NA
 1092133 1092134 HCH_00039 HCH_00040 motB   FALSE 0.205 85.000 0.000 NA   NA
 1092135 1092136 HCH_00041 HCH_00042     FALSE 0.032 231.000 0.000 NA   NA
 1092137 1092138 HCH_00043 HCH_00044 prlC   TRUE 0.904 70.000 0.173 0.022   NA
 1092139 1092140 HCH_00045 HCH_00046     FALSE 0.400 94.000 0.012 NA   NA
 1092141 1092142 HCH_00047 HCH_00048 coxB coxA TRUE 0.993 40.000 0.741 0.002 Y NA
 1092142 1092143 HCH_00048 HCH_00049 coxA coxC TRUE 0.849 57.000 0.011 0.002 Y NA
 1092145 1092146 HCH_00051 HCH_00052     TRUE 0.988 -7.000 0.722 NA   NA
 1092146 1092147 HCH_00052 HCH_00053     TRUE 0.886 95.000 0.255 NA   NA
 1092147 1092148 HCH_00053 HCH_00054   cyoE TRUE 0.991 -3.000 0.321 1.000 Y NA
 1092148 1092149 HCH_00054 HCH_00055 cyoE   FALSE 0.274 119.000 0.000 1.000 N NA
 1092152 1092153 HCH_00058 HCH_00059     FALSE 0.234 42.000 0.000 NA   NA
 1092153 1092154 HCH_00059 HCH_00060     FALSE 0.007 463.000 0.000 NA   NA
 1092155 1092156 HCH_00061 HCH_00062   phrB1 FALSE 0.095 182.000 0.000 1.000   NA
 1092157 1092158 HCH_00063 HCH_00064     FALSE 0.172 104.000 0.000 NA   NA
 1092158 1092159 HCH_00064 HCH_00065     TRUE 0.985 41.000 0.591 1.000 Y NA
 1092162 1092163 HCH_00069 HCH_00070     FALSE 0.188 126.000 0.000 NA N NA
 1092163 1092164 HCH_00070 HCH_00071     FALSE 0.040 256.000 0.000 NA N NA
 1092165 1092166 HCH_00072 HCH_00073 hypE hypD TRUE 0.971 1.000 0.085 1.000 Y NA
 1092166 1092167 HCH_00073 HCH_00074 hypD hypC TRUE 0.998 0.000 0.917 NA Y NA
 1092167 1092168 HCH_00074 HCH_00075 hypC hypF TRUE 0.931 -9.000 0.069 NA Y NA
 1092168 1092169 HCH_00075 HCH_00076 hypF hypB TRUE 0.786 -33.000 0.008 1.000 Y NA
 1092169 1092170 HCH_00076 HCH_00077 hypB   FALSE 0.185 127.000 0.000 NA N NA
 1092170 1092171 HCH_00077 HCH_00078     FALSE 0.223 64.000 0.000 NA   NA
 1092171 1092172 HCH_00078 HCH_00079     TRUE 0.995 3.000 1.000 NA   NA
 1092172 1092173 HCH_00079 HCH_00080     FALSE 0.386 12.000 0.000 NA   NA
 1092173 1092174 HCH_00080 HCH_00081     FALSE 0.259 -28.000 0.000 NA   NA
 1092174 1092175 HCH_00081 HCH_00082     TRUE 0.478 5.000 0.000 NA   NA
 1092175 1092176 HCH_00082 HCH_00083     TRUE 0.521 1.000 0.000 NA   NA
 1092178 1092179 HCH_00085 HCH_00086     TRUE 0.433 112.000 0.000 0.002   NA
 1092179 1092180 HCH_00086 HCH_00087     FALSE 0.259 163.000 0.000 0.002   NA
 1092181 1092182 HCH_00088 HCH_00089     FALSE 0.008 434.000 0.000 NA   NA
 1092182 1092183 HCH_00089 HCH_00090     TRUE 0.992 -3.000 0.741 NA   NA
 1092183 1092184 HCH_00090 HCH_00091     FALSE 0.007 737.000 0.000 NA N NA
 1092186 1092187 HCH_00093 HCH_00094     TRUE 0.478 14.000 0.000 1.000   NA
 1092188 1092189 HCH_00095 HCH_00096     TRUE 0.989 -13.000 1.000 NA   NA
 1092189 1092190 HCH_00096 HCH_00097     FALSE 0.223 66.000 0.000 NA   NA
 1092190 1092191 HCH_00097 HCH_00098   udk FALSE 0.034 226.000 0.000 NA   NA
 1092192 1092193 HCH_00099 HCH_00100     FALSE 0.004 685.000 0.000 NA   NA
 1092193 1092194 HCH_00100 HCH_00101     FALSE 0.185 128.000 0.000 1.000   NA
 1092194 1092195 HCH_00101 HCH_00102     TRUE 0.742 156.000 0.180 0.049   NA
 1092196 1092197 HCH_00103 HCH_00104 hypA   TRUE 0.539 11.000 0.000 1.000   NA
 1092197 1092198 HCH_00104 HCH_00105     TRUE 0.985 19.000 0.441 1.000 Y NA
 1092198 1092199 HCH_00105 HCH_00106     TRUE 0.982 12.000 0.271 1.000 Y NA
 1092199 1092200 HCH_00106 HCH_00107     TRUE 0.985 -3.000 0.298 0.002   NA
 1092200 1092201 HCH_00107 HCH_00108   nuoF TRUE 0.988 -3.000 0.351 0.002   NA
 1092201 1092202 HCH_00108 HCH_00109 nuoF   FALSE 0.194 147.000 0.000 1.000 N NA
 1092202 1092203 HCH_00109 HCH_00110     FALSE 0.222 136.000 0.000 1.000 N NA
 1092204 1092205 HCH_00111 HCH_00112     FALSE 0.020 276.000 0.000 NA   NA
 1092205 1092206 HCH_00112 HCH_00113     TRUE 0.890 101.000 0.286 NA   NA
 1092206 1092207 HCH_00113 HCH_00114     FALSE 0.318 420.000 0.182 1.000 Y NA
 1092209 1092210 HCH_00116 HCH_00117     FALSE 0.191 94.000 0.000 NA   NA
 1092210 1092211 HCH_00117 HCH_00118     FALSE 0.031 237.000 0.000 NA   NA
 1092213 1092214 HCH_00120 HCH_00122     FALSE 0.234 42.000 0.000 NA   NA
 1092214 1092215 HCH_00122 HCH_00123     FALSE 0.261 28.000 0.000 NA   NA
 1092215 1092216 HCH_00123 HCH_00124     FALSE 0.047 275.000 0.000 1.000 N NA
 1092216 1092217 HCH_00124 HCH_00125     FALSE 0.062 178.000 0.000 NA   NA
 1092218 1092219 HCH_00126 HCH_00127     TRUE 0.431 40.000 0.000 1.000 N NA
 1092221 1092222 HCH_00129 HCH_00130   pdxJ TRUE 0.508 20.000 0.000 1.000 N NA
 1092223 1092224 HCH_00132 HCH_00133     FALSE 0.290 21.000 0.000 NA   NA
 1092224 1092225 HCH_00133 HCH_00134     FALSE 0.098 140.000 0.000 NA   NA
 1092227 1092228 HCH_00136 HCH_00137   thiC FALSE 0.012 352.000 0.000 NA   NA
 1092228 1092229 HCH_00137 HCH_00138 thiC thiO TRUE 0.845 5.000 0.022 1.000 N NA
 1092229 1092230 HCH_00138 HCH_00139 thiO thiS TRUE 0.762 -10.000 0.019 1.000 N NA
 1092230 1092231 HCH_00139 HCH_00140 thiS thiG TRUE 0.757 48.000 0.005 1.000 Y NA
 1092231 1092232 HCH_00140 HCH_00141 thiG thiE TRUE 0.918 -7.000 0.005 0.003 Y NA
 1092235 1092236 HCH_00144 HCH_00145     FALSE 0.027 246.000 0.000 NA   NA
 1092236 1092237 HCH_00145 HCH_00146     FALSE 0.074 164.000 0.000 NA   NA
 1092237 1092238 HCH_00146 HCH_00147     FALSE 0.021 268.000 0.000 NA   NA
 1092242 1092243 HCH_00151 HCH_00152     TRUE 0.469 26.000 0.000 1.000 N NA
 1092243 1092244 HCH_00152 HCH_00153     TRUE 0.920 93.000 0.204 0.006 N NA
 1092247 1092248 HCH_00156 HCH_00157     FALSE 0.061 179.000 0.000 NA   NA
 1092248 1092249 HCH_00157 HCH_00158   recQ FALSE 0.096 142.000 0.000 NA   NA
 1092250 1092251 HCH_00159 HCH_00160     TRUE 0.995 0.000 0.542 1.000 Y NA
 1092251 1092252 HCH_00160 HCH_00161     TRUE 0.994 -3.000 0.489 1.000 Y NA
 1092252 1092253 HCH_00161 HCH_00162     TRUE 0.972 63.000 0.521 0.072 N NA
 1092254 1092255 HCH_00163 HCH_00164     FALSE 0.218 72.000 0.000 NA   NA
 1092255 1092256 HCH_00164 HCH_00165     FALSE 0.430 10.000 0.000 NA   NA
 1092257 1092258 HCH_00166 HCH_00167     TRUE 0.752 50.000 0.081 NA   NA
 1092258 1092259 HCH_00167 HCH_00168     FALSE 0.284 202.000 0.068 NA   NA
 1092259 1092260 HCH_00168 HCH_00169     FALSE 0.138 178.000 0.000 1.000 N NA
 1092260 1092261 HCH_00169 HCH_00170     FALSE 0.226 225.000 0.000 1.000 Y NA
 1092261 1092262 HCH_00170 HCH_00171     FALSE 0.053 190.000 0.000 NA   NA
 1092263 1092264 HCH_00172 HCH_00173     FALSE 0.090 147.000 0.000 NA   NA
 1092264 1092265 HCH_00173 HCH_00174     FALSE 0.233 132.000 0.000 1.000 N NA
 1092265 1092266 HCH_00174 HCH_00176     FALSE 0.244 108.000 0.000 1.000   NA
 1092269 1092270 HCH_00179 HCH_00180     FALSE 0.132 120.000 0.000 NA   NA
 1092270 1092271 HCH_00180 HCH_00181     TRUE 0.990 2.000 0.620 NA   NA
 1092271 1092272 HCH_00181 HCH_00182     TRUE 0.987 12.000 0.713 NA   NA
 1092272 1092273 HCH_00182 HCH_00183     TRUE 0.944 90.000 0.436 NA N NA
 1092275 1092276 HCH_00186 HCH_00187     FALSE 0.230 51.000 0.000 NA   NA
 1092276 1092277 HCH_00187 HCH_00188     FALSE 0.172 104.000 0.000 NA   NA
 1092277 1092278 HCH_00188 HCH_00189     FALSE 0.233 44.000 0.000 NA   NA
 1092278 1092279 HCH_00189 HCH_00190     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 1092280 1092281 HCH_00191 HCH_00192     FALSE 0.049 197.000 0.000 NA   NA
 1092281 1092282 HCH_00192 HCH_00193     FALSE 0.113 131.000 0.000 NA   NA
 1092282 1092283 HCH_00193 HCH_00194     TRUE 0.941 40.000 0.375 NA   NA
 1092283 1092284 HCH_00194 HCH_00195     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092284 1092285 HCH_00195 HCH_00196   tehB TRUE 0.928 4.000 0.114 NA   NA
 1092289 1092290 HCH_00200 HCH_00201     FALSE 0.145 114.000 0.000 NA   NA
 1092290 1092291 HCH_00201 HCH_00203     TRUE 0.874 60.000 0.037 0.072 Y NA
 1092291 1092292 HCH_00203 HCH_00204     TRUE 0.997 2.000 0.723 0.072 Y NA
 1092292 1092293 HCH_00204 HCH_00205     TRUE 0.808 55.000 0.021 1.000 Y NA
 1092293 1092294 HCH_00205 HCH_00206     TRUE 0.691 74.000 0.000 1.000 Y NA
 1092294 1092295 HCH_00206 HCH_00207     TRUE 0.431 40.000 0.000 1.000 N NA
 1092295 1092296 HCH_00207 HCH_00208     FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 1092297 1092298 HCH_00209 HCH_00210     FALSE 0.367 29.000 0.000 NA N NA
 1092298 1092299 HCH_00210 HCH_00211     FALSE 0.223 113.000 0.000 NA N NA
 1092300 1092301 HCH_00212 HCH_00213     TRUE 0.830 -7.000 0.057 NA   NA
 1092301 1092302 HCH_00213 HCH_00214     TRUE 0.526 0.000 0.000 NA   NA
 1092304 1092305 HCH_00217 HCH_00218   pepD FALSE 0.411 60.000 0.000 1.000 N NA
 1092306 1092307 HCH_00219 HCH_00220     FALSE 0.038 219.000 0.000 NA   NA
 1092307 1092308 HCH_00220 HCH_00221     FALSE 0.214 -94.000 0.000 NA   NA
 1092308 1092309 HCH_00221 HCH_00222   recD FALSE 0.222 67.000 0.000 NA   NA
 1092309 1092310 HCH_00222 HCH_00223 recD recB TRUE 0.998 -3.000 0.688 0.001 Y NA
 1092310 1092311 HCH_00223 HCH_00224 recB recC TRUE 0.996 -3.000 0.542 0.001 Y NA
 1092312 1092313 HCH_00225 HCH_00226     FALSE 0.012 448.000 0.000 1.000   NA
 1092315 1092316 HCH_00228 HCH_00229     FALSE 0.247 107.000 0.000 1.000   NA
 1092316 1092317 HCH_00229 HCH_00230     FALSE 0.389 24.000 0.000 1.000   NA
 1092317 1092318 HCH_00230 HCH_00231     TRUE 0.668 8.000 0.000 1.000 N NA
 1092318 1092319 HCH_00231 HCH_00232     FALSE 0.039 217.000 0.000 NA   NA
 1092320 1092321 HCH_00233 HCH_00234     FALSE 0.014 323.000 0.000 NA   NA
 1092321 1092322 HCH_00234 HCH_00235     FALSE 0.136 118.000 0.000 NA   NA
 1092322 1092323 HCH_00235 HCH_00236     TRUE 0.991 -6.000 0.671 1.000 N NA
 1092323 1092324 HCH_00236 HCH_00237     TRUE 0.995 -7.000 0.752 1.000 Y NA
 1092325 1092326 HCH_00238 HCH_00239   selD FALSE 0.217 73.000 0.000 NA   NA
 1092326 1092327 HCH_00239 HCH_00240 selD   TRUE 0.967 1.000 0.214 NA   NA
 1092327 1092328 HCH_00240 HCH_00241     FALSE 0.234 43.000 0.000 NA   NA
 1092333 1092334 HCH_00246 HCH_00247     FALSE 0.005 615.000 0.000 NA   NA
 1092336 1092337 HCH_00249 HCH_00252     FALSE 0.048 198.000 0.000 NA   NA
 1092337 1092338 HCH_00252 HCH_00253     FALSE 0.104 320.000 0.000 1.000 Y NA
 1092338 1092339 HCH_00253 HCH_00254     FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1092339 1092340 HCH_00254 HCH_00255     FALSE 0.047 200.000 0.000 NA   NA
 1092340 1092341 HCH_00255 HCH_00256     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 1092343 1092344 HCH_00258 HCH_00259     FALSE 0.138 117.000 0.000 NA   NA
 1092345 1092346 HCH_00260 HCH_00261     FALSE 0.094 143.000 0.000 NA   NA
 1092346 1092347 HCH_00261 HCH_00262     TRUE 0.992 -3.000 0.708 NA   NA
 1092347 1092348 HCH_00262 HCH_00263     TRUE 0.887 -13.000 0.129 NA   NA
 1092348 1092349 HCH_00263 HCH_00264     TRUE 0.989 -13.000 0.955 NA   NA
 1092349 1092350 HCH_00264 HCH_00265     TRUE 0.989 -3.000 0.583 NA   NA
 1092350 1092351 HCH_00265 HCH_00266     TRUE 0.957 -3.000 0.182 NA   NA
 1092351 1092352 HCH_00266 HCH_00267     FALSE 0.218 72.000 0.000 NA   NA
 1092353 1092354 HCH_00268 HCH_00269     FALSE 0.202 88.000 0.000 NA   NA
 1092354 1092355 HCH_00269 HCH_00270     TRUE 0.874 116.000 0.318 NA   NA
 1092355 1092356 HCH_00270 HCH_00271     TRUE 0.919 71.000 0.302 NA   NA
 1092356 1092357 HCH_00271 HCH_00272     FALSE 0.013 335.000 0.000 NA   NA
 1092358 1092359 HCH_00273 HCH_00274     TRUE 0.981 12.000 0.286 NA Y NA
 1092360 1092361 HCH_00275 HCH_00276 gap1   FALSE 0.182 129.000 0.000 1.000   NA
 1092361 1092362 HCH_00276 HCH_00277     FALSE 0.318 73.000 0.000 1.000   NA
 1092362 1092363 HCH_00277 HCH_00278   fkpA FALSE 0.076 230.000 0.000 1.000 N NA
 1092363 1092364 HCH_00278 HCH_00279 fkpA   FALSE 0.120 127.000 0.000 NA   NA
 1092364 1092365 HCH_00279 HCH_00280     FALSE 0.189 95.000 0.000 NA   NA
 1092366 1092367 HCH_00281 HCH_00282     FALSE 0.226 113.000 0.000 1.000   NA
 1092369 1092370 HCH_00284 HCH_00285 trx1 rho FALSE 0.371 203.000 0.087 1.000   NA
 1092370 1092371 HCH_00285 HCH_00286 rho ubiD FALSE 0.406 128.000 0.025 NA N NA
 1092371 1092372 HCH_00286 HCH_00287 ubiD   TRUE 0.918 11.000 0.039 NA Y NA
 1092373 1092374 HCH_00288 HCH_00289 hemY hemX TRUE 0.997 -3.000 0.765 1.000 Y NA
 1092374 1092375 HCH_00289 HCH_00290 hemX   TRUE 0.984 73.000 0.600 1.000 Y NA
 1092375 1092376 HCH_00290 HCH_00291   hemC TRUE 0.978 -16.000 0.205 0.002 Y NA
 1092376 1092377 HCH_00291 HCH_00292 hemC algR TRUE 0.520 121.000 0.032 1.000 N NA
 1092377 1092378 HCH_00292 HCH_00293 algR   TRUE 0.992 41.000 0.775 0.040 Y NA
 1092379 1092380 HCH_00294 HCH_00295 argH   FALSE 0.261 123.000 0.000 1.000 N NA
 1092380 1092381 HCH_00295 HCH_00297   lysA FALSE 0.025 368.000 0.000 1.000 N NA
 1092381 1092382 HCH_00297 HCH_00298 lysA dapF1 TRUE 0.908 13.000 0.006 0.002 Y NA
 1092382 1092383 HCH_00298 HCH_00299 dapF1   TRUE 0.760 121.000 0.175 NA   NA
 1092383 1092384 HCH_00299 HCH_00300   xerC TRUE 0.976 31.000 0.714 NA   NA
 1092384 1092385 HCH_00300 HCH_00301 xerC   FALSE 0.187 97.000 0.000 NA   NA
 1092385 1092386 HCH_00301 HCH_00302     FALSE 0.364 -10.000 0.000 NA   NA
 1092386 1092387 HCH_00302 HCH_00303     FALSE 0.234 223.000 0.000 1.000 Y NA
 1092387 1092388 HCH_00303 HCH_00304     TRUE 0.521 153.000 0.000 0.034 Y NA
 1092390 1092391 HCH_00306 HCH_00307     FALSE 0.235 41.000 0.000 NA   NA
 1092393 1092394 HCH_00309 HCH_00310     TRUE 0.775 176.000 0.375 NA   NA
 1092395 1092396 HCH_00311 HCH_00312     FALSE 0.249 33.000 0.000 NA   NA
 1092396 1092397 HCH_00312 HCH_00313     FALSE 0.221 69.000 0.000 NA   NA
 1092397 1092398 HCH_00313 HCH_00314     FALSE 0.077 159.000 0.000 NA   NA
 1092398 1092399 HCH_00314 HCH_00315     FALSE 0.229 53.000 0.000 NA   NA
 1092401 1092402 HCH_00317 HCH_00318     FALSE 0.386 12.000 0.000 NA   NA
 1092402 1092403 HCH_00318 HCH_00319     FALSE 0.015 480.000 0.000 1.000 N NA
 1092404 1092405 HCH_00320 HCH_00321     FALSE 0.259 -28.000 0.000 NA   NA
 1092409 1092410 HCH_00325 HCH_00326     TRUE 0.882 5.000 0.000 1.000 Y NA
 1092410 1092411 HCH_00326 HCH_00327     FALSE 0.336 49.000 0.000 1.000   NA
 1092411 1092412 HCH_00327 HCH_00328     FALSE 0.050 195.000 0.000 NA   NA
 1092412 1092413 HCH_00328 HCH_00329     FALSE 0.020 276.000 0.000 NA   NA
 1092416 1092417 HCH_00331 HCH_00333     FALSE 0.038 219.000 0.000 NA   NA
 1092417 1092418 HCH_00333 HCH_00334     FALSE 0.233 44.000 0.000 NA   NA
 1092419 1092420 HCH_00335 HCH_00336     TRUE 0.886 -3.000 0.047 1.000   NA
 1092420 1092421 HCH_00336 HCH_00337     TRUE 0.983 -16.000 0.722 NA   NA
 1092421 1092422 HCH_00337 HCH_00338     TRUE 0.676 45.000 0.053 NA   NA
 1092422 1092423 HCH_00338 HCH_00339     TRUE 0.897 -9.000 0.103 1.000   NA
 1092423 1092424 HCH_00339 HCH_00340   cfa TRUE 0.980 -3.000 0.324 1.000   NA
 1092424 1092425 HCH_00340 HCH_00341 cfa   FALSE 0.035 224.000 0.000 NA   NA
 1092425 1092426 HCH_00341 HCH_00342     FALSE 0.082 154.000 0.000 NA   NA
 1092426 1092427 HCH_00342 HCH_00343     FALSE 0.047 200.000 0.000 NA   NA
 1092428 1092429 HCH_00344 HCH_00345   lamB FALSE 0.077 229.000 0.000 1.000 N NA
 1092429 1092430 HCH_00345 HCH_00346 lamB   FALSE 0.031 329.000 0.000 1.000 N NA
 1092431 1092432 HCH_00347 HCH_00348 zwf   TRUE 0.972 -7.000 0.163 1.000 Y NA
 1092432 1092433 HCH_00348 HCH_00349   eda TRUE 0.884 37.000 0.064 1.000 Y NA
 1092434 1092435 HCH_00350 HCH_00351     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092435 1092436 HCH_00351 HCH_00352     TRUE 0.878 49.000 0.172 1.000   NA
 1092438 1092439 HCH_00354 HCH_00355     FALSE 0.025 254.000 0.000 NA   NA
 1092439 1092440 HCH_00355 HCH_00356     FALSE 0.207 83.000 0.000 NA   NA
 1092440 1092441 HCH_00356 HCH_00357     FALSE 0.021 268.000 0.000 NA   NA
 1092442 1092443 HCH_00358 HCH_00359     FALSE 0.324 57.000 0.000 NA N NA
 1092445 1092446 HCH_00361 HCH_00362     FALSE 0.185 98.000 0.000 NA   NA
 1092448 1092449 HCH_00364 HCH_00365     FALSE 0.223 63.000 0.000 NA   NA
 1092449 1092450 HCH_00365 HCH_00366     FALSE 0.316 -16.000 0.000 NA   NA
 1092450 1092451 HCH_00366 HCH_00368     FALSE 0.018 286.000 0.000 NA   NA
 1092452 1092453 HCH_00369 HCH_00370     FALSE 0.217 -78.000 0.000 NA   NA
 1092454 1092455 HCH_00371 HCH_00372     FALSE 0.219 -73.000 0.000 NA   NA
 1092456 1092457 HCH_00373 HCH_00374     TRUE 0.926 -24.000 0.250 NA   NA
 1092457 1092458 HCH_00374 HCH_00375     TRUE 0.989 -3.000 0.588 NA   NA
 1092458 1092459 HCH_00375 HCH_00376     TRUE 0.987 -3.000 0.529 NA   NA
 1092459 1092460 HCH_00376 HCH_00377     TRUE 0.526 0.000 0.000 NA   NA
 1092460 1092461 HCH_00377 HCH_00378     FALSE 0.325 17.000 0.000 NA   NA
 1092461 1092462 HCH_00378 HCH_00379     TRUE 0.803 14.000 0.061 NA   NA
 1092462 1092463 HCH_00379 HCH_00380     TRUE 0.992 -3.000 0.738 NA   NA
 1092463 1092464 HCH_00380 HCH_00381     TRUE 0.992 -3.000 0.738 NA   NA
 1092464 1092465 HCH_00381 HCH_00382     TRUE 0.491 4.000 0.000 NA   NA
 1092465 1092466 HCH_00382 HCH_00383     FALSE 0.058 184.000 0.000 NA   NA
 1092466 1092467 HCH_00383 HCH_00384     TRUE 0.729 -28.000 0.062 NA   NA
 1092467 1092468 HCH_00384 HCH_00385     TRUE 0.491 4.000 0.000 NA   NA
 1092468 1092469 HCH_00385 HCH_00386     TRUE 0.983 -3.000 0.429 NA   NA
 1092469 1092470 HCH_00386 HCH_00387     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092470 1092471 HCH_00387 HCH_00388     TRUE 0.491 4.000 0.000 NA   NA
 1092471 1092472 HCH_00388 HCH_00389     TRUE 0.987 19.000 0.939 NA   NA
 1092472 1092473 HCH_00389 HCH_00390     TRUE 0.994 3.000 0.848 NA   NA
 1092473 1092474 HCH_00390 HCH_00391     TRUE 0.983 -25.000 0.848 NA   NA
 1092474 1092475 HCH_00391 HCH_00392     TRUE 0.992 0.000 0.659 NA   NA
 1092475 1092476 HCH_00392 HCH_00393     TRUE 0.482 100.000 0.000 0.003   NA
 1092476 1092477 HCH_00393 HCH_00394     TRUE 0.620 4.000 0.000 1.000   NA
 1092477 1092478 HCH_00394 HCH_00395     FALSE 0.380 26.000 0.000 1.000   NA
 1092479 1092480 HCH_00396 HCH_00397     TRUE 0.981 15.000 0.636 NA   NA
 1092480 1092481 HCH_00397 HCH_00398     TRUE 0.682 65.000 0.061 NA   NA
 1092482 1092483 HCH_00399 HCH_00400     TRUE 0.432 -6.000 0.000 NA   NA
 1092483 1092484 HCH_00400 HCH_00401     FALSE 0.050 196.000 0.000 NA   NA
 1092484 1092485 HCH_00401 HCH_00402     FALSE 0.223 65.000 0.000 NA   NA
 1092485 1092486 HCH_00402 HCH_00403     FALSE 0.088 148.000 0.000 NA   NA
 1092486 1092487 HCH_00403 HCH_00404     FALSE 0.007 458.000 0.000 NA   NA
 1092488 1092489 HCH_00405 HCH_00406     FALSE 0.213 76.000 0.000 NA   NA
 1092489 1092490 HCH_00406 HCH_00407     FALSE 0.197 91.000 0.000 NA   NA
 1092490 1092491 HCH_00407 HCH_00408     TRUE 0.468 6.000 0.000 NA   NA
 1092492 1092493 HCH_00409 HCH_00410     FALSE 0.226 134.000 0.000 1.000 N NA
 1092494 1092495 HCH_00412 HCH_00413     FALSE 0.205 85.000 0.000 NA   NA
 1092495 1092496 HCH_00413 HCH_00414     FALSE 0.234 43.000 0.000 NA   NA
 1092496 1092497 HCH_00414 HCH_00415     FALSE 0.064 216.000 0.000 1.000   NA
 1092497 1092498 HCH_00415 HCH_00416     TRUE 0.667 161.000 0.077 NA Y NA
 1092498 1092499 HCH_00416 HCH_00417     TRUE 0.997 -3.000 0.827 NA Y NA
 1092499 1092500 HCH_00417 HCH_00418     TRUE 0.958 62.000 0.354 0.055 N NA
 1092500 1092501 HCH_00418 HCH_00419     TRUE 0.987 11.000 0.263 0.039 Y NA
 1092501 1092502 HCH_00419 HCH_00420     FALSE 0.334 48.000 0.000 NA N NA
 1092502 1092503 HCH_00420 HCH_00421     FALSE 0.174 103.000 0.000 NA   NA
 1092503 1092504 HCH_00421 HCH_00422     FALSE 0.209 80.000 0.000 NA   NA
 1092504 1092505 HCH_00422 HCH_00423     FALSE 0.086 150.000 0.000 NA   NA
 1092505 1092506 HCH_00423 HCH_00424     FALSE 0.004 697.000 0.000 NA   NA
 1092506 1092507 HCH_00424 HCH_00425     TRUE 0.490 13.000 0.000 NA N NA
 1092507 1092508 HCH_00425 HCH_00426     FALSE 0.386 12.000 0.000 NA   NA
 1092508 1092509 HCH_00426 HCH_00427     FALSE 0.097 141.000 0.000 NA   NA
 1092509 1092510 HCH_00427 HCH_00428     FALSE 0.233 -43.000 0.000 NA   NA
 1092511 1092512 HCH_00429 HCH_00430     FALSE 0.174 103.000 0.000 NA   NA
 1092512 1092513 HCH_00430 HCH_00431   pyk FALSE 0.016 305.000 0.000 NA   NA
 1092513 1092514 HCH_00431 HCH_00432 pyk gap2 TRUE 0.915 26.000 0.044 0.004 Y NA
 1092515 1092516 HCH_00433 HCH_00434 edd glk TRUE 0.907 -7.000 0.021 1.000 Y NA
 1092516 1092517 HCH_00434 HCH_00435 glk   TRUE 0.783 0.000 0.008 1.000   NA
 1092518 1092519 HCH_00436 HCH_00437     FALSE 0.326 -15.000 0.000 NA   NA
 1092519 1092520 HCH_00437 HCH_00438     FALSE 0.109 133.000 0.000 NA   NA
 1092520 1092521 HCH_00438 HCH_00439     FALSE 0.044 205.000 0.000 NA   NA
 1092522 1092523 HCH_00440 HCH_00441     TRUE 0.841 141.000 0.120 0.070 Y NA
 1092523 1092524 HCH_00441 HCH_00442     TRUE 0.997 11.000 0.814 0.070 Y NA
 1092524 1092525 HCH_00442 HCH_00443     FALSE 0.078 157.000 0.000 NA   NA
 1092525 1092526 HCH_00443 HCH_00444     FALSE 0.024 258.000 0.000 NA   NA
 1092527 1092528 HCH_00445 HCH_00446     FALSE 0.222 68.000 0.000 NA   NA
 1092531 1092532 HCH_00449 HCH_00450     TRUE 0.932 76.000 0.184 NA Y NA
 1092532 1092533 HCH_00450 HCH_00451     TRUE 0.982 30.000 0.524 NA Y NA
 1092534 1092535 HCH_00452 HCH_00453     TRUE 0.815 100.000 0.167 NA   NA
 1092536 1092537 HCH_00454 HCH_00455     TRUE 0.987 29.000 0.595 1.000 Y NA
 1092537 1092538 HCH_00455 HCH_00456     TRUE 0.851 -16.000 0.000 0.018 Y NA
 1092538 1092539 HCH_00456 HCH_00457     TRUE 0.789 46.000 0.000 0.018 Y NA
 1092539 1092540 HCH_00457 HCH_00458     TRUE 0.748 93.000 0.000 0.018 Y NA
 1092540 1092541 HCH_00458 HCH_00459     TRUE 0.932 0.000 0.000 0.018 Y NA
 1092541 1092542 HCH_00459 HCH_00460     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092542 1092543 HCH_00460 HCH_00461     FALSE 0.352 14.000 0.000 NA   NA
 1092543 1092544 HCH_00461 HCH_00462     TRUE 0.979 2.000 0.133 1.000 Y NA
 1092544 1092545 HCH_00462 HCH_00463     TRUE 0.963 51.000 0.267 1.000 Y NA
 1092546 1092547 HCH_00464 HCH_00465     TRUE 0.607 5.000 0.000 1.000   NA
 1092549 1092550 HCH_00467 HCH_00468     FALSE 0.004 662.000 0.000 NA   NA
 1092550 1092551 HCH_00468 HCH_00469     FALSE 0.223 59.000 0.000 NA   NA
 1092551 1092552 HCH_00469 HCH_00470     FALSE 0.201 89.000 0.000 NA   NA
 1092552 1092553 HCH_00470 HCH_00471     FALSE 0.004 748.000 0.000 NA   NA
 1092553 1092554 HCH_00471 HCH_00473     FALSE 0.006 517.000 0.000 NA   NA
 1092556 1092557 HCH_00475 HCH_00476     FALSE 0.232 48.000 0.000 NA   NA
 1092558 1092559 HCH_00477 HCH_00478     FALSE 0.317 18.000 0.000 NA   NA
 1092560 1092561 HCH_00479 HCH_00480     TRUE 0.923 34.000 0.111 1.000 Y NA
 1092561 1092562 HCH_00480 HCH_00481   malT FALSE 0.106 200.000 0.000 1.000 N NA
 1092566 1092567 HCH_00486 HCH_00487     FALSE 0.071 167.000 0.000 NA   NA
 1092568 1092569 HCH_00489 HCH_00490     FALSE 0.196 146.000 0.000 1.000 N NA
 1092570 1092571 HCH_00491 HCH_00492     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092571 1092572 HCH_00492 HCH_00493     FALSE 0.366 13.000 0.000 NA   NA
 1092572 1092573 HCH_00493 HCH_00494     FALSE 0.217 73.000 0.000 NA   NA
 1092573 1092574 HCH_00494 HCH_00495   panE1 FALSE 0.281 117.000 0.000 1.000 N NA
 1092578 1092579 HCH_00498 HCH_00500     TRUE 0.432 151.000 0.000 1.000 Y NA
 1092582 1092583 HCH_00503 HCH_00504     FALSE 0.188 96.000 0.000 NA   NA
 1092585 1092586 HCH_00506 HCH_00507     FALSE 0.060 180.000 0.000 NA   NA
 1092586 1092587 HCH_00507 HCH_00508     TRUE 0.605 12.000 0.000 1.000 N NA
 1092587 1092588 HCH_00508 HCH_00509     TRUE 0.723 131.000 0.128 1.000 N NA
 1092588 1092589 HCH_00509 HCH_00510     TRUE 0.958 1.000 0.132 1.000 N NA
 1092591 1092592 HCH_00513 HCH_00514     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 1092592 1092593 HCH_00514 HCH_00515     FALSE 0.005 544.000 0.000 NA   NA
 1092595 1092596 HCH_00518 HCH_00519     FALSE 0.040 214.000 0.000 NA   NA
 1092596 1092597 HCH_00519 HCH_00521     FALSE 0.236 -40.000 0.000 NA   NA
 1092600 1092601 HCH_00523 HCH_00524     TRUE 0.988 4.000 0.512 1.000   NA
 1092602 1092603 HCH_00525 HCH_00526     FALSE 0.158 109.000 0.000 NA   NA
 1092603 1092604 HCH_00526 HCH_00527   folE TRUE 0.816 36.000 0.080 1.000 N NA
 1092605 1092606 HCH_00528 HCH_00529     FALSE 0.225 56.000 0.000 NA   NA
 1092610 1092611 HCH_00533 HCH_00534     FALSE 0.111 132.000 0.000 NA   NA
 1092611 1092612 HCH_00534 HCH_00535     FALSE 0.153 170.000 0.000 1.000 N NA
 1092612 1092613 HCH_00535 HCH_00536     TRUE 0.995 -7.000 0.755 1.000 Y NA
 1092613 1092614 HCH_00536 HCH_00537     TRUE 0.990 -3.000 0.309 1.000 Y NA
 1092616 1092617 HCH_00539 HCH_00540     TRUE 0.930 137.000 0.517 0.017   NA
 1092617 1092618 HCH_00540 HCH_00541     TRUE 0.989 5.000 0.217 0.018 Y NA
 1092618 1092619 HCH_00541 HCH_00542     TRUE 0.978 12.000 0.217 1.000 Y NA
 1092619 1092620 HCH_00542 HCH_00543     TRUE 0.957 65.000 0.241 1.000 Y NA
 1092620 1092621 HCH_00543 HCH_00544     TRUE 0.992 78.000 0.795 0.017 Y NA
 1092621 1092622 HCH_00544 HCH_00545     TRUE 0.974 19.000 0.266 1.000 Y NA
 1092622 1092623 HCH_00545 HCH_00546     TRUE 0.974 60.000 0.296 0.033 Y NA
 1092624 1092625 HCH_00547 HCH_00548 gshB   TRUE 0.808 73.000 0.089 1.000 N NA
 1092625 1092626 HCH_00548 HCH_00550     TRUE 0.685 95.000 0.064 NA N NA
 1092626 1092627 HCH_00550 HCH_00551     TRUE 0.922 44.000 0.263 NA N NA
 1092627 1092628 HCH_00551 HCH_00552     TRUE 0.889 -16.000 0.109 1.000 N NA
 1092628 1092629 HCH_00552 HCH_00553   pyrB TRUE 0.958 60.000 0.247 1.000 Y NA
 1092629 1092630 HCH_00553 HCH_00554 pyrB   TRUE 0.993 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 1092630 1092631 HCH_00554 HCH_00555     FALSE 0.313 76.000 0.000 1.000   NA
 1092633 1092634 HCH_00557 HCH_00558     FALSE 0.264 27.000 0.000 NA   NA
 1092634 1092635 HCH_00558 HCH_00559     FALSE 0.223 64.000 0.000 NA   NA
 1092635 1092636 HCH_00559 HCH_00560     FALSE 0.202 88.000 0.000 NA   NA
 1092637 1092638 HCH_00561 HCH_00562 pckA   FALSE 0.236 231.000 0.048 1.000 N NA
 1092638 1092639 HCH_00562 HCH_00563     TRUE 0.882 31.000 0.140 1.000 N NA
 1092639 1092640 HCH_00563 HCH_00564     TRUE 0.823 14.000 0.056 1.000   NA
 1092642 1092643 HCH_00566 HCH_00567   mutM1 FALSE 0.114 204.000 0.012 NA   NA
 1092644 1092645 HCH_00568 HCH_00570     FALSE 0.087 149.000 0.000 NA   NA
 1092647 1092648 HCH_00572 HCH_00573 ftsY   TRUE 0.848 45.000 0.117 1.000 N NA
 1092648 1092649 HCH_00573 HCH_00574     TRUE 0.835 34.000 0.035 NA Y NA
 1092649 1092650 HCH_00574 HCH_00575   rpoH FALSE 0.198 241.000 0.054 NA N NA
 1092650 1092651 HCH_00575 HCH_00576 rpoH   TRUE 0.487 88.000 0.005 1.000 N NA
 1092651 1092652 HCH_00576 HCH_00577   gip TRUE 0.624 -7.000 0.000 1.000 N NA
 1092652 1092653 HCH_00577 HCH_00578 gip   FALSE 0.226 134.000 0.000 1.000 N NA
 1092653 1092654 HCH_00578 HCH_00579     FALSE 0.404 72.000 0.000 1.000 N NA
 1092654 1092655 HCH_00579 HCH_00580     TRUE 0.992 -34.000 0.733 0.039 Y NA
 1092656 1092657 HCH_00581 HCH_00582     FALSE 0.106 135.000 0.000 NA   NA
 1092657 1092658 HCH_00582 HCH_00583     FALSE 0.058 184.000 0.000 NA   NA
 1092659 1092660 HCH_00584 HCH_00585   greB FALSE 0.256 30.000 0.000 NA   NA
 1092660 1092661 HCH_00585 HCH_00586 greB   FALSE 0.261 28.000 0.000 NA   NA
 1092661 1092662 HCH_00586 HCH_00587     FALSE 0.166 106.000 0.000 NA   NA
 1092663 1092664 HCH_00588 HCH_00589     FALSE 0.081 196.000 0.000 1.000   NA
 1092665 1092666 HCH_00590 HCH_00591     FALSE 0.028 242.000 0.000 NA   NA
 1092666 1092667 HCH_00591 HCH_00592     FALSE 0.235 41.000 0.000 NA   NA
 1092668 1092669 HCH_00593 HCH_00594     FALSE 0.004 677.000 0.000 NA   NA
 1092669 1092670 HCH_00594 HCH_00595     FALSE 0.004 2279.000 0.000 NA   NA
 1092671 1092672 HCH_00596 HCH_00597     FALSE 0.408 21.000 0.000 1.000   NA
 1092672 1092673 HCH_00597 HCH_00598     TRUE 0.633 3.000 0.000 1.000   NA
 1092673 1092674 HCH_00598 HCH_00599     FALSE 0.279 97.000 0.000 1.000   NA
 1092674 1092675 HCH_00599 HCH_00600     FALSE 0.068 171.000 0.000 NA   NA
 1092675 1092676 HCH_00600 HCH_00602     FALSE 0.134 119.000 0.000 NA   NA
 1092677 1092678 HCH_00601 HCH_00603     TRUE 0.913 71.000 0.286 NA   NA
 1092679 1092680 HCH_00604 HCH_00605     FALSE 0.050 195.000 0.000 NA   NA
 1092680 1092681 HCH_00605 HCH_00606     FALSE 0.022 264.000 0.000 NA   NA
 1092681 1092682 HCH_00606 HCH_00607     FALSE 0.297 20.000 0.000 NA   NA
 1092682 1092683 HCH_00607 HCH_00608     FALSE 0.103 137.000 0.000 NA   NA
 1092683 1092684 HCH_00608 HCH_00609     FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1092684 1092685 HCH_00609 HCH_00610     FALSE 0.218 72.000 0.000 NA   NA
 1092685 1092686 HCH_00610 HCH_00611     FALSE 0.306 19.000 0.000 NA   NA
 1092687 1092688 HCH_00612 HCH_00614     FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1092688 1092689 HCH_00614 HCH_00615     FALSE 0.221 69.000 0.000 NA   NA
 1092689 1092690 HCH_00615 HCH_00616     FALSE 0.251 32.000 0.000 NA   NA
 1092690 1092691 HCH_00616 HCH_00617     FALSE 0.006 483.000 0.000 NA   NA
 1092691 1092692 HCH_00617 HCH_00618     FALSE 0.244 36.000 0.000 NA   NA
 1092694 1092695 HCH_00620 HCH_00621     FALSE 0.010 374.000 0.000 NA   NA
 1092695 1092696 HCH_00621 HCH_00622     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092696 1092697 HCH_00622 HCH_00623     FALSE 0.027 353.000 0.000 1.000 N NA
 1092697 1092698 HCH_00623 HCH_00624     FALSE 0.049 270.000 0.000 1.000 N NA
 1092699 1092700 HCH_00625 HCH_00626     FALSE 0.141 116.000 0.000 NA   NA
 1092700 1092701 HCH_00626 HCH_00627     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092701 1092702 HCH_00627 HCH_00628     FALSE 0.299 -19.000 0.000 NA   NA
 1092703 1092704 HCH_00629 HCH_00631     TRUE 0.950 -13.000 0.286 NA   NA
 1092704 1092705 HCH_00631 HCH_00632     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092707 1092708 HCH_00634 HCH_00635     FALSE 0.023 262.000 0.000 NA   NA
 1092708 1092709 HCH_00635 HCH_00636     FALSE 0.004 699.000 0.000 NA   NA
 1092711 1092712 HCH_00638 HCH_00639 mmsB   TRUE 0.987 67.000 0.687 1.000 Y NA
 1092712 1092713 HCH_00639 HCH_00640     TRUE 0.992 28.000 0.627 0.002 Y NA
 1092713 1092714 HCH_00640 HCH_00641     TRUE 0.989 0.000 0.242 1.000 Y NA
 1092714 1092715 HCH_00641 HCH_00642   mmsA1 TRUE 0.604 39.000 0.013 1.000 N NA
 1092715 1092716 HCH_00642 HCH_00643 mmsA1   FALSE 0.008 414.000 0.000 NA   NA
 1092717 1092718 HCH_00644 HCH_00645     FALSE 0.126 124.000 0.000 NA   NA
 1092720 1092721 HCH_00647 HCH_00648     FALSE 0.097 208.000 0.000 1.000 N NA
 1092721 1092722 HCH_00648 HCH_00649     FALSE 0.021 271.000 0.000 NA   NA
 1092722 1092723 HCH_00649 HCH_00650     TRUE 0.460 7.000 0.000 NA   NA
 1092725 1092726 HCH_00652 HCH_00653   thiI FALSE 0.058 183.000 0.000 NA   NA
 1092727 1092728 HCH_00654 HCH_00655     FALSE 0.153 111.000 0.000 NA   NA
 1092729 1092730 HCH_00656 HCH_00657     TRUE 0.955 18.000 0.336 NA   NA
 1092730 1092731 HCH_00657 HCH_00658     TRUE 0.988 20.000 0.605 NA Y NA
 1092731 1092732 HCH_00658 HCH_00659     FALSE 0.169 105.000 0.000 NA   NA
 1092733 1092734 HCH_00660 HCH_00661     FALSE 0.068 209.000 0.000 1.000   NA
 1092734 1092735 HCH_00661 HCH_00662     TRUE 0.545 39.000 0.000 0.011   NA
 1092736 1092737 HCH_00664 HCH_00665     FALSE 0.100 139.000 0.000 NA   NA
 1092737 1092738 HCH_00665 HCH_00666     TRUE 0.491 4.000 0.000 NA   NA
 1092739 1092740 HCH_00667 HCH_00668     FALSE 0.212 -103.000 0.000 NA   NA
 1092741 1092742 HCH_00669 HCH_00670     FALSE 0.211 78.000 0.000 NA   NA
 1092742 1092743 HCH_00670 HCH_00671     FALSE 0.223 60.000 0.000 NA   NA
 1092743 1092744 HCH_00671 HCH_00672     FALSE 0.183 99.000 0.000 NA   NA
 1092744 1092745 HCH_00672 HCH_00673     TRUE 0.873 3.000 0.000 NA Y NA
 1092745 1092746 HCH_00673 HCH_00674     TRUE 0.659 63.000 0.000 NA Y NA
 1092746 1092747 HCH_00674 HCH_00675     FALSE 0.020 344.000 0.000 1.000   NA
 1092747 1092748 HCH_00675 HCH_00676     FALSE 0.063 177.000 0.000 NA   NA
 1092748 1092749 HCH_00676 HCH_00677     FALSE 0.338 -13.000 0.000 NA   NA
 1092749 1092750 HCH_00677 HCH_00678     FALSE 0.338 -13.000 0.000 NA   NA
 1092750 1092751 HCH_00678 HCH_00679     FALSE 0.338 -13.000 0.000 NA   NA
 1092751 1092752 HCH_00679 HCH_00680     FALSE 0.246 -33.000 0.000 NA   NA
 1092754 1092755 HCH_00682 HCH_00683     TRUE 0.960 86.000 0.600 NA   NA
 1092755 1092756 HCH_00683 HCH_00684     FALSE 0.086 150.000 0.000 NA   NA
 1092757 1092758 HCH_00685 HCH_00686     FALSE 0.237 40.000 0.000 NA   NA
 1092758 1092759 HCH_00686 HCH_00688     TRUE 0.444 9.000 0.000 NA   NA
 1092761 1092762 HCH_00690 HCH_00691     FALSE 0.261 28.000 0.000 NA   NA
 1092762 1092763 HCH_00691 HCH_00692   cydB TRUE 0.526 0.000 0.000 NA   NA
 1092763 1092764 HCH_00692 HCH_00693 cydB cydA TRUE 0.942 12.000 0.041 0.046 Y NA
 1092764 1092765 HCH_00693 HCH_00694 cydA   FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1092766 1092767 HCH_00695 HCH_00696     TRUE 0.892 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1092770 1092771 HCH_00699 HCH_00700     TRUE 0.995 -3.000 0.420 0.003 Y NA
 1092771 1092772 HCH_00700 HCH_00701     TRUE 0.989 18.000 0.554 1.000 Y NA
 1092772 1092773 HCH_00701 HCH_00702     TRUE 0.996 13.000 0.870 0.068 Y NA
 1092773 1092774 HCH_00702 HCH_00703     TRUE 0.957 68.000 0.192 0.068 Y NA
 1092780 1092781 HCH_00710 HCH_00711     FALSE 0.224 57.000 0.000 NA   NA
 1092781 1092782 HCH_00711 HCH_00712     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092782 1092783 HCH_00712 HCH_00713     FALSE 0.208 118.000 0.000 NA N NA
 1092783 1092784 HCH_00713 HCH_00714     TRUE 0.531 -7.000 0.000 NA N NA
 1092787 1092788 HCH_00717 HCH_00718     FALSE 0.246 -33.000 0.000 NA   NA
 1092788 1092789 HCH_00718 HCH_00719     FALSE 0.199 90.000 0.000 NA   NA
 1092789 1092790 HCH_00719 HCH_00720     FALSE 0.317 18.000 0.000 NA   NA
 1092790 1092791 HCH_00720 HCH_00721     FALSE 0.232 47.000 0.000 NA   NA
 1092793 1092794 HCH_00723 HCH_00724     TRUE 0.480 99.000 0.000 0.071 N NA
 1092796 1092797 HCH_00726 HCH_00727     FALSE 0.272 -25.000 0.000 NA   NA
 1092798 1092799 HCH_00728 HCH_00729     FALSE 0.018 286.000 0.000 NA   NA
 1092802 1092803 HCH_00732 HCH_00733     FALSE 0.176 102.000 0.000 NA   NA
 1092803 1092804 HCH_00733 HCH_00734     FALSE 0.132 120.000 0.000 NA   NA
 1092807 1092808 HCH_00737 HCH_00738     FALSE 0.158 109.000 0.000 NA   NA
 1092808 1092809 HCH_00738 HCH_00739     FALSE 0.063 177.000 0.000 NA   NA
 1092809 1092810 HCH_00739 HCH_00740     FALSE 0.060 180.000 0.000 NA   NA
 1092813 1092814 HCH_00743 HCH_00744     FALSE 0.151 218.000 0.010 1.000 N NA
 1092815 1092816 HCH_00745 HCH_00746     TRUE 0.712 103.000 0.080 NA N NA
 1092816 1092817 HCH_00746 HCH_00747     TRUE 0.994 2.000 0.524 NA Y NA
 1092818 1092819 HCH_00749 HCH_00750     FALSE 0.078 199.000 0.000 1.000   NA
 1092819 1092820 HCH_00750 HCH_00751     FALSE 0.033 276.000 0.000 1.000   NA
 1092820 1092821 HCH_00751 HCH_00752   pstA TRUE 0.956 67.000 0.489 1.000   NA
 1092821 1092822 HCH_00752 HCH_00753 pstA pstB TRUE 0.988 43.000 0.511 0.001 Y NA
 1092822 1092823 HCH_00753 HCH_00754 pstB phoU TRUE 0.968 39.000 0.330 NA Y NA
 1092823 1092824 HCH_00754 HCH_00755 phoU   FALSE 0.228 54.000 0.000 NA   NA
 1092824 1092825 HCH_00755 HCH_00756     FALSE 0.120 127.000 0.000 NA   NA
 1092825 1092826 HCH_00756 HCH_00757     FALSE 0.008 430.000 0.000 NA   NA
 1092826 1092827 HCH_00757 HCH_00758     FALSE 0.093 184.000 0.000 1.000   NA
 1092828 1092829 HCH_00759 HCH_00760     FALSE 0.264 153.000 0.006 1.000 N NA
 1092829 1092830 HCH_00760 HCH_00761     FALSE 0.346 101.000 0.000 1.000 N NA
 1092830 1092831 HCH_00761 HCH_00762     FALSE 0.234 42.000 0.000 NA   NA
 1092831 1092832 HCH_00762 HCH_00763     FALSE 0.066 173.000 0.000 NA   NA
 1092832 1092833 HCH_00763 HCH_00764     TRUE 0.702 -28.000 0.000 NA Y NA
 1092836 1092837 HCH_00767 HCH_00768     FALSE 0.229 53.000 0.000 NA   NA
 1092837 1092838 HCH_00768 HCH_00769     TRUE 0.431 116.000 0.011 1.000 N NA
 1092839 1092840 HCH_00770 HCH_00771   phoB TRUE 0.983 57.000 0.453 0.038 Y NA
 1092840 1092841 HCH_00771 HCH_00773 phoB ubiA TRUE 0.500 137.000 0.043 1.000 N NA
 1092841 1092842 HCH_00773 HCH_00774 ubiA   TRUE 0.560 50.000 0.000 0.053 N NA
 1092842 1092843 HCH_00774 HCH_00775     FALSE 0.411 62.000 0.000 1.000 N NA
 1092844 1092845 HCH_00776 HCH_00777     TRUE 0.923 51.000 0.208 0.046   NA
 1092846 1092847 HCH_00778 HCH_00779     TRUE 0.485 23.000 0.000 1.000 N NA
 1092847 1092848 HCH_00779 HCH_00780     FALSE 0.060 180.000 0.000 NA   NA
 1092849 1092850 HCH_00781 HCH_00782 tesB   FALSE 0.300 87.000 0.000 1.000   NA
 1092851 1092852 HCH_00783 HCH_00784     FALSE 0.323 197.000 0.048 1.000 N NA
 1092854 1092855 HCH_00786 HCH_00787     FALSE 0.068 171.000 0.000 NA   NA
 1092856 1092857 HCH_00788 HCH_00790     FALSE 0.100 139.000 0.000 NA   NA
 1092857 1092858 HCH_00790 HCH_00791     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1092859 1092860 HCH_00792 HCH_00793     FALSE 0.019 281.000 0.000 NA   NA
 1092861 1092862 HCH_00794 HCH_00795     FALSE 0.332 54.000 0.000 1.000   NA
 1092865 1092866 HCH_00798 HCH_00799   mnhG FALSE 0.254 156.000 0.006 1.000 N NA
 1092866 1092867 HCH_00799 HCH_00800 mnhG mnhF TRUE 0.992 40.000 0.937 1.000 Y NA
 1092867 1092868 HCH_00800 HCH_00801 mnhF mnhE TRUE 0.998 -6.000 0.937 0.053 Y NA
 1092868 1092869 HCH_00801 HCH_00802 mnhE mnhD TRUE 0.998 0.000 0.944 1.000 Y NA
 1092869 1092870 HCH_00802 HCH_00803 mnhD mnhC TRUE 0.999 0.000 0.976 0.001 Y NA
 1092870 1092871 HCH_00803 HCH_00804 mnhC mnhA TRUE 0.998 1.000 0.881 0.001 Y NA
 1092872 1092873 HCH_00805 HCH_00807     FALSE 0.036 267.000 0.000 1.000   NA
 1092873 1092874 HCH_00807 HCH_00808     FALSE 0.130 154.000 0.000 1.000   NA
 1092876 1092877 HCH_00810 HCH_00811 panB1   FALSE 0.269 101.000 0.000 1.000   NA
 1092877 1092878 HCH_00811 HCH_00812   nfi TRUE 0.630 -3.000 0.000 1.000   NA
 1092878 1092879 HCH_00812 HCH_00813 nfi   FALSE 0.087 189.000 0.000 1.000   NA
 1092881 1092882 HCH_00816 HCH_00817     FALSE 0.018 366.000 0.000 1.000   NA
 1092882 1092883 HCH_00817 HCH_00818     FALSE 0.364 -10.000 0.000 NA   NA
 1092883 1092884 HCH_00818 HCH_00819     FALSE 0.221 70.000 0.000 NA   NA
 1092884 1092885 HCH_00819 HCH_00820     FALSE 0.075 163.000 0.000 NA   NA
 1092885 1092886 HCH_00820 HCH_00822     FALSE 0.042 209.000 0.000 NA   NA
 1092887 1092888 HCH_00821 HCH_00823     FALSE 0.352 14.000 0.000 NA   NA
 1092888 1092889 HCH_00823 HCH_00824     FALSE 0.199 90.000 0.000 NA   NA
 1092889 1092890 HCH_00824 HCH_00825     FALSE 0.245 35.000 0.000 NA   NA
 1092893 1092894 HCH_00828 HCH_00829     FALSE 0.109 133.000 0.000 NA   NA
 1092895 1092896 HCH_00830 HCH_00831     FALSE 0.143 147.000 0.000 1.000   NA
 1092896 1092897 HCH_00831 HCH_00832     TRUE 0.808 150.000 0.333 NA   NA
 1092897 1092898 HCH_00832 HCH_00833     FALSE 0.051 193.000 0.000 NA   NA
 1092898 1092899 HCH_00833 HCH_00834     FALSE 0.070 169.000 0.000 NA   NA
 1092899 1092900 HCH_00834 HCH_00835     FALSE 0.010 385.000 0.000 NA   NA
 1092901 1092902 HCH_00836 HCH_00837     FALSE 0.082 154.000 0.000 NA   NA
 1092902 1092903 HCH_00837 HCH_00838     FALSE 0.008 414.000 0.000 NA   NA
 1092903 1092904 HCH_00838 HCH_00839     FALSE 0.387 -25.000 0.000 1.000   NA
 1092904 1092905 HCH_00839 HCH_00840     FALSE 0.377 27.000 0.000 1.000   NA
 1092905 1092906 HCH_00840 HCH_00842     FALSE 0.083 153.000 0.000 NA   NA
 1092907 1092908 HCH_00841 HCH_00843     TRUE 0.913 71.000 0.286 NA   NA
 1092913 1092914 HCH_00848 HCH_00849     FALSE 0.058 397.000 0.000 NA Y NA
 1092914 1092915 HCH_00849 HCH_00850   betB TRUE 0.988 -3.000 0.459 1.000 N NA
 1092915 1092916 HCH_00850 HCH_00851 betB betA TRUE 0.990 10.000 0.634 1.000 N NA
 1092916 1092917 HCH_00851 HCH_00852 betA   TRUE 0.890 68.000 0.078 1.000 Y NA
 1092917 1092918 HCH_00852 HCH_00853     TRUE 0.987 13.000 0.328 0.067 Y NA
 1092918 1092919 HCH_00853 HCH_00854     TRUE 0.991 46.000 0.844 1.000 Y NA
 1092919 1092920 HCH_00854 HCH_00855     FALSE 0.094 143.000 0.000 NA   NA
 1092921 1092922 HCH_00856 HCH_00857     FALSE 0.038 220.000 0.000 NA   NA
 1092923 1092924 HCH_00858 HCH_00860     FALSE 0.043 206.000 0.000 NA   NA
 1092924 1092925 HCH_00860 HCH_00861     FALSE 0.364 -10.000 0.000 NA   NA
 1092925 1092926 HCH_00861 HCH_00862     TRUE 0.883 12.000 0.000 0.032 Y NA
 1092928 1092929 HCH_00864 HCH_00865     TRUE 0.902 -10.000 0.135 NA   NA
 1092929 1092930 HCH_00865 HCH_00866     TRUE 0.895 -3.000 0.068 NA   NA
 1092932 1092933 HCH_00868 HCH_00870     FALSE 0.249 33.000 0.000 NA   NA
 1092936 1092937 HCH_00872 HCH_00873   lpdA1 FALSE 0.083 252.000 0.000 0.039   NA
 1092938 1092939 HCH_00874 HCH_00875     FALSE 0.232 47.000 0.000 NA   NA
 1092939 1092940 HCH_00875 HCH_00876     FALSE 0.007 459.000 0.000 NA   NA
 1092940 1092941 HCH_00876 HCH_00877     FALSE 0.023 261.000 0.000 NA   NA
 1092941 1092942 HCH_00877 HCH_00878     FALSE 0.169 133.000 0.000 NA N NA
 1092942 1092943 HCH_00878 HCH_00879     TRUE 0.974 0.000 0.254 NA   NA
 1092944 1092945 HCH_00880 HCH_00881     FALSE 0.055 186.000 0.000 NA   NA
 1092945 1092946 HCH_00881 HCH_00882     FALSE 0.015 317.000 0.000 NA   NA
 1092946 1092947 HCH_00882 HCH_00883     TRUE 0.953 -9.000 0.254 NA   NA
 1092947 1092948 HCH_00883 HCH_00884     FALSE 0.430 10.000 0.000 NA   NA
 1092951 1092952 HCH_00887 HCH_00888     TRUE 0.994 12.000 0.611 0.067 Y NA
 1092952 1092953 HCH_00888 HCH_00889     TRUE 0.998 -3.000 0.842 0.009 Y NA
 1092953 1092954 HCH_00889 HCH_00890     TRUE 0.993 -3.000 0.431 1.000 Y NA
 1092954 1092955 HCH_00890 HCH_00891     FALSE 0.143 115.000 0.000 NA   NA
 1092955 1092956 HCH_00891 HCH_00892     TRUE 0.468 6.000 0.000 NA   NA
 1092956 1092957 HCH_00892 HCH_00893     TRUE 0.945 -21.000 0.286 1.000   NA
 1092957 1092958 HCH_00893 HCH_00894     FALSE 0.218 72.000 0.000 NA   NA
 1092960 1092961 HCH_00897 HCH_00898 sbcD sbcC TRUE 0.995 -3.000 0.669 0.001 N NA
 1092962 1092963 HCH_00899 HCH_00900     FALSE 0.077 160.000 0.000 NA   NA
 1092964 1092965 HCH_00901 HCH_00902     TRUE 0.460 7.000 0.000 NA   NA
 1092966 1092967 HCH_00903 HCH_00904     FALSE 0.211 78.000 0.000 NA   NA
 1092968 1092969 HCH_00905 HCH_00906     FALSE 0.266 -27.000 0.000 NA   NA
 1092972 1092973 HCH_00909 HCH_00910     FALSE 0.326 65.000 0.000 1.000   NA
 1092973 1092974 HCH_00910 HCH_00912     FALSE 0.044 518.000 0.000 1.000 Y NA
 1092974 1092975 HCH_00912 HCH_00913     FALSE 0.180 129.000 0.000 NA N NA
 1092976 1092977 HCH_00914 HCH_00916     FALSE 0.352 14.000 0.000 NA   NA
 1092978 1092979 HCH_00915 HCH_00917 atpG1 atpA1 TRUE 0.995 4.000 0.455 0.005 Y NA
 1092979 1092980 HCH_00917 HCH_00918 atpA1 atpF1 TRUE 0.995 14.000 0.697 0.005 Y NA
 1092980 1092981 HCH_00918 HCH_00919 atpF1 atpE1 TRUE 0.993 28.000 0.727 0.005 Y NA
 1092981 1092982 HCH_00919 HCH_00920 atpE1 atpB1 TRUE 0.998 0.000 0.818 0.005 Y NA
 1092982 1092983 HCH_00920 HCH_00921 atpB1   TRUE 0.856 32.000 0.151 NA   NA
 1092983 1092984 HCH_00921 HCH_00922   atpC1 TRUE 0.710 30.000 0.057 NA   NA
 1092984 1092985 HCH_00922 HCH_00923 atpC1 atpD1 TRUE 0.988 -3.000 0.375 0.005   NA
 1092986 1092987 HCH_00924 HCH_00925     TRUE 0.989 -7.000 0.387 1.000 Y NA
 1092988 1092989 HCH_00926 HCH_00927     FALSE 0.011 359.000 0.000 NA   NA
 1092989 1092990 HCH_00927 HCH_00928     FALSE 0.011 366.000 0.000 NA   NA
 1092990 1092991 HCH_00928 HCH_00929     TRUE 0.516 2.000 0.000 NA   NA
 1092993 1092994 HCH_00931 HCH_00932     FALSE 0.225 -58.000 0.000 NA   NA
 1092995 1092996 HCH_00933 HCH_00934     TRUE 0.941 61.000 0.409 NA   NA
 1092996 1092997 HCH_00934 HCH_00935     FALSE 0.029 240.000 0.000 NA   NA
 1092997 1092998 HCH_00935 HCH_00937     FALSE 0.201 89.000 0.000 NA   NA
 1092998 1092999 HCH_00937 HCH_00938     FALSE 0.027 249.000 0.000 NA   NA
 1092999 1093000 HCH_00938 HCH_00939     FALSE 0.115 130.000 0.000 NA   NA
 1093000 1093001 HCH_00939 HCH_00941     FALSE 0.028 243.000 0.000 NA   NA
 1093002 1093003 HCH_00942 HCH_00943     FALSE 0.248 34.000 0.000 NA   NA
 1093003 1093004 HCH_00943 HCH_00944     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1093004 1093005 HCH_00944 HCH_00945     FALSE 0.225 56.000 0.000 NA   NA
 1093006 1093007 HCH_00946 HCH_00947     TRUE 0.957 0.000 0.043 1.000 Y NA
 1093007 1093008 HCH_00947 HCH_00948     FALSE 0.052 265.000 0.000 1.000 N NA
 1093010 1093011 HCH_00950 HCH_00951     FALSE 0.409 11.000 0.000 NA   NA
 1093012 1093013 HCH_00952 HCH_00953 maiA   TRUE 0.989 -3.000 0.495 1.000 N NA
 1093013 1093014 HCH_00953 HCH_00954   hmgA TRUE 0.959 24.000 0.195 1.000 Y NA
 1093014 1093015 HCH_00954 HCH_00955 hmgA hppD TRUE 0.928 -7.000 0.119 1.000 N NA
 1093015 1093016 HCH_00955 HCH_00956 hppD phhA FALSE 0.305 193.000 0.000 1.000 Y NA
 1093016 1093017 HCH_00956 HCH_00957 phhA   FALSE 0.048 240.000 0.000 1.000   NA
 1093020 1093021 HCH_00960 HCH_00961 btuB   FALSE 0.251 32.000 0.000 NA   NA
 1093021 1093022 HCH_00961 HCH_00962   cobQ FALSE 0.239 39.000 0.000 NA   NA
 1093022 1093023 HCH_00962 HCH_00963 cobQ cobU TRUE 0.967 -3.000 0.079 1.000 Y NA
 1093023 1093024 HCH_00963 HCH_00964 cobU cobT TRUE 0.879 115.000 0.138 1.000 Y NA
 1093024 1093025 HCH_00964 HCH_00965 cobT cobS TRUE 0.971 18.000 0.164 0.007 Y NA
 1093025 1093026 HCH_00965 HCH_00966 cobS   TRUE 0.889 -15.000 0.102 1.000 N NA
 1093029 1093030 HCH_00968 HCH_00970     FALSE 0.248 34.000 0.000 NA   NA
 1093034 1093035 HCH_00975 HCH_00976     FALSE 0.126 124.000 0.000 NA   NA
 1093035 1093036 HCH_00976 HCH_00977     FALSE 0.223 62.000 0.000 NA   NA
 1093037 1093038 HCH_00978 HCH_00979     FALSE 0.266 26.000 0.000 NA   NA
 1093038 1093039 HCH_00979 HCH_00980     FALSE 0.209 176.000 0.024 NA   NA
 1093039 1093040 HCH_00980 HCH_00981     TRUE 0.991 4.000 0.667 NA   NA
 1093040 1093041 HCH_00981 HCH_00982     TRUE 0.991 8.000 0.734 NA   NA
 1093041 1093042 HCH_00982 HCH_00983     TRUE 0.558 -25.000 0.018 NA   NA
 1093042 1093043 HCH_00983 HCH_00984     TRUE 0.994 2.000 0.805 NA   NA
 1093044 1093045 HCH_00985 HCH_00987     TRUE 0.453 118.000 0.036 NA   NA
 1093045 1093046 HCH_00987 HCH_00988     TRUE 0.988 18.000 0.911 NA   NA
 1093047 1093048 HCH_00989 HCH_00991     TRUE 0.966 74.000 0.644 NA   NA
 1093048 1093049 HCH_00991 HCH_00992     TRUE 0.968 89.000 0.711 NA   NA
 1093052 1093053 HCH_00995 HCH_00996     FALSE 0.136 118.000 0.000 NA   NA
 1093053 1093054 HCH_00996 HCH_00997     FALSE 0.091 228.000 0.013 NA   NA
 1093054 1093055 HCH_00997 HCH_00998     FALSE 0.266 26.000 0.000 NA   NA
 1093055 1093056 HCH_00998 HCH_00999     FALSE 0.093 212.000 0.000 1.000 N NA
 1093057 1093058 HCH_01000 HCH_01001     FALSE 0.020 273.000 0.000 NA   NA
 1093058 1093059 HCH_01001 HCH_01002     FALSE 0.022 265.000 0.000 NA   NA
 1093061 1093062 HCH_01004 HCH_01005     TRUE 0.721 29.000 0.033 1.000 N NA
 1093062 1093063 HCH_01005 HCH_01006     FALSE 0.245 35.000 0.000 NA   NA
 1093066 1093067 HCH_01009 HCH_01010   coaD TRUE 0.690 113.000 0.088 1.000   NA
 1093067 1093068 HCH_01010 HCH_01011 coaD   FALSE 0.170 190.000 0.005 1.000 N NA
 1093069 1093070 HCH_01012 HCH_01013     FALSE 0.204 86.000 0.000 NA   NA
 1093072 1093073 HCH_01015 HCH_01016     FALSE 0.059 223.000 0.000 1.000   NA
 1093073 1093074 HCH_01016 HCH_01017     FALSE 0.156 110.000 0.000 NA   NA
 1093075 1093076 HCH_01018 HCH_01019 rpmG rpmB TRUE 0.989 12.000 0.332 0.010 Y NA
 1093076 1093077 HCH_01019 HCH_01020 rpmB   FALSE 0.090 217.000 0.000 1.000 N NA
 1093078 1093079 HCH_01021 HCH_01022 coaBC dut TRUE 0.941 17.000 0.201 1.000 N NA
 1093079 1093080 HCH_01022 HCH_01025 dut   TRUE 0.442 149.000 0.039 1.000 N NA
 1093080 1093081 HCH_01025 HCH_01027   argB TRUE 0.716 69.000 0.044 1.000 N NA
 1093081 1093082 HCH_01027 HCH_01028 argB   FALSE 0.111 132.000 0.000 NA   NA
 1093082 1093083 HCH_01028 HCH_01029   argE FALSE 0.224 57.000 0.000 NA   NA
 1093083 1093084 HCH_01029 HCH_01030 argE argA TRUE 0.793 160.000 0.087 0.002 Y NA
 1093087 1093088 HCH_01033 HCH_01034 ntrC   TRUE 0.995 -3.000 0.587 1.000 Y NA
 1093088 1093089 HCH_01034 HCH_01035     FALSE 0.074 252.000 0.014 NA   NA
 1093089 1093090 HCH_01035 HCH_01036   glnA FALSE 0.313 109.000 0.009 NA   NA
 1093091 1093092 HCH_01037 HCH_01038   pip FALSE 0.367 100.000 0.003 1.000   NA
 1093092 1093093 HCH_01038 HCH_01039 pip dtd TRUE 0.655 94.000 0.026 0.038   NA
 1093095 1093096 HCH_01041 HCH_01042     FALSE 0.229 112.000 0.000 1.000   NA
 1093096 1093097 HCH_01042 HCH_01043     FALSE 0.274 24.000 0.000 NA   NA
 1093097 1093098 HCH_01043 HCH_01044   glnE FALSE 0.181 100.000 0.000 NA   NA
 1093098 1093099 HCH_01044 HCH_01045 glnE ilvE1 TRUE 0.754 98.000 0.078 1.000 N NA
 1093099 1093100 HCH_01045 HCH_01046 ilvE1 rfaF TRUE 0.709 36.000 0.034 1.000 N NA
 1093100 1093101 HCH_01046 HCH_01047 rfaF rfaC TRUE 0.985 -7.000 0.205 0.001 Y NA
 1093101 1093102 HCH_01047 HCH_01048 rfaC   TRUE 0.918 -3.000 0.014 NA Y NA
 1093102 1093103 HCH_01048 HCH_01049     TRUE 0.775 -13.000 0.000 NA Y NA
 1093103 1093104 HCH_01049 HCH_01050     TRUE 0.688 111.000 0.000 0.024 Y NA
 1093104 1093105 HCH_01050 HCH_01051     TRUE 0.757 18.000 0.000 NA Y NA
 1093105 1093106 HCH_01051 HCH_01052     TRUE 0.821 -7.000 0.000 NA Y NA
 1093106 1093107 HCH_01052 HCH_01053     FALSE 0.242 37.000 0.000 NA   NA
 1093107 1093108 HCH_01053 HCH_01055     FALSE 0.366 13.000 0.000 NA   NA
 1093109 1093110 HCH_01054 HCH_01056 rfaQ   TRUE 0.892 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1093110 1093111 HCH_01056 HCH_01058     TRUE 0.803 16.000 0.000 1.000 Y NA
 1093113 1093114 HCH_01060 HCH_01061     TRUE 0.503 87.000 0.006 1.000 N NA
 1093114 1093115 HCH_01061 HCH_01062   rpiA FALSE 0.082 224.000 0.000 1.000 N NA
 1093117 1093118 HCH_01064 HCH_01065     FALSE 0.064 325.000 0.034 NA   NA
 1093118 1093119 HCH_01065 HCH_01066     TRUE 0.883 0.000 0.053 NA   NA
 1093119 1093120 HCH_01066 HCH_01067     FALSE 0.223 60.000 0.000 NA   NA
 1093121 1093122 HCH_01068 HCH_01069     FALSE 0.242 -36.000 0.000 NA   NA
 1093122 1093123 HCH_01069 HCH_01070     TRUE 0.933 37.000 0.329 NA   NA
 1093123 1093124 HCH_01070 HCH_01071   ubiH TRUE 0.987 0.000 0.396 1.000 N NA
 1093124 1093125 HCH_01071 HCH_01072 ubiH ubiF TRUE 0.934 42.000 0.083 0.001 Y NA
 1093126 1093127 HCH_01073 HCH_01074   tatC TRUE 0.785 23.000 0.076 NA   NA
 1093127 1093128 HCH_01074 HCH_01075 tatC tatB TRUE 0.990 2.000 0.314 NA Y NA
 1093128 1093129 HCH_01075 HCH_01076 tatB tatA TRUE 0.868 25.000 0.010 0.008 Y NA
 1093129 1093130 HCH_01076 HCH_01078 tatA hisE FALSE 0.389 82.000 0.000 1.000 N NA
 1093130 1093131 HCH_01078 HCH_01079 hisE hisI1 TRUE 0.936 103.000 0.152 0.003 Y NA
 1093131 1093132 HCH_01079 HCH_01080 hisI1 ubiB TRUE 0.557 67.000 0.018 1.000   NA
 1093132 1093133 HCH_01080 HCH_01081 ubiB   TRUE 0.985 -3.000 0.432 1.000   NA
 1093133 1093134 HCH_01081 HCH_01082   ubiE TRUE 0.955 2.000 0.145 1.000   NA
 1093136 1093137 HCH_01084 HCH_01085     FALSE 0.265 239.000 0.097 NA   NA
 1093138 1093139 HCH_01086 HCH_01087     FALSE 0.141 116.000 0.000 NA   NA
 1093139 1093140 HCH_01087 HCH_01088   upp FALSE 0.029 240.000 0.000 NA   NA
 1093141 1093142 HCH_01089 HCH_01090     FALSE 0.174 132.000 0.000 1.000   NA
 1093142 1093143 HCH_01090 HCH_01091     TRUE 0.761 71.000 0.077 1.000   NA
 1093143 1093144 HCH_01091 HCH_01092   allA TRUE 0.905 41.000 0.087 1.000 Y NA
 1093144 1093145 HCH_01092 HCH_01093 allA   TRUE 0.963 2.000 0.176 1.000   NA
 1093145 1093146 HCH_01093 HCH_01094     TRUE 0.979 -3.000 0.350 NA   NA
 1093146 1093147 HCH_01094 HCH_01095   alc TRUE 0.970 -3.000 0.250 NA   NA
 1093147 1093148 HCH_01095 HCH_01096 alc allB TRUE 0.875 65.000 0.066 1.000 Y NA
 1093148 1093149 HCH_01096 HCH_01097 allB xdhC TRUE 0.885 -3.000 0.047 NA N NA
 1093149 1093150 HCH_01097 HCH_01098 xdhC xdhB TRUE 0.986 4.000 0.463 NA N NA
 1093150 1093151 HCH_01098 HCH_01099 xdhB xdhA TRUE 0.989 -7.000 0.269 0.000 Y NA
 1093151 1093152 HCH_01099 HCH_01100 xdhA   FALSE 0.040 214.000 0.000 NA   NA
 1093153 1093154 HCH_01101 HCH_01102     TRUE 0.968 51.000 0.590 1.000   NA
 1093154 1093155 HCH_01102 HCH_01103     TRUE 0.941 13.000 0.154 0.065   NA
 1093155 1093156 HCH_01103 HCH_01105     TRUE 0.831 102.000 0.167 1.000   NA
 1093156 1093157 HCH_01105 HCH_01106     FALSE 0.299 88.000 0.000 1.000   NA
 1093157 1093158 HCH_01106 HCH_01108     TRUE 0.693 117.000 0.081 1.000 N NA
 1093158 1093159 HCH_01108 HCH_01109     FALSE 0.153 111.000 0.000 NA   NA
 1093161 1093162 HCH_01111 HCH_01112     FALSE 0.100 139.000 0.000 NA   NA
 1093164 1093165 HCH_01114 HCH_01115     FALSE 0.018 285.000 0.000 NA   NA
 1093165 1093166 HCH_01115 HCH_01116   argS FALSE 0.040 213.000 0.000 NA   NA
 1093168 1093169 HCH_01118 HCH_01119     FALSE 0.223 59.000 0.000 NA   NA
 1093169 1093170 HCH_01119 HCH_01120     FALSE 0.018 290.000 0.000 NA   NA
 1093170 1093171 HCH_01120 HCH_01121     FALSE 0.025 316.000 0.000 1.000   NA
 1093174 1093175 HCH_01124 HCH_01125     FALSE 0.071 168.000 0.000 NA   NA
 1093176 1093177 HCH_01126 HCH_01127     FALSE 0.052 191.000 0.000 NA   NA
 1093177 1093178 HCH_01127 HCH_01128     TRUE 0.832 58.000 0.014 0.065 Y NA
 1093178 1093179 HCH_01128 HCH_01129     TRUE 0.993 43.000 0.870 0.065 Y NA
 1093179 1093180 HCH_01129 HCH_01130     TRUE 0.993 11.000 0.554 1.000 Y NA
 1093180 1093181 HCH_01130 HCH_01131     TRUE 0.945 56.000 0.123 0.003 Y NA
 1093181 1093182 HCH_01131 HCH_01132     FALSE 0.425 45.000 0.000 1.000 N NA
 1093184 1093185 HCH_01134 HCH_01135     FALSE 0.008 564.000 0.000 1.000   NA
 1093185 1093186 HCH_01135 HCH_01137     TRUE 0.598 30.000 0.000 0.002   NA
 1093186 1093187 HCH_01137 HCH_01138     FALSE 0.039 260.000 0.000 1.000   NA
 1093187 1093188 HCH_01138 HCH_01139     TRUE 0.967 -3.000 0.230 NA   NA
 1093190 1093191 HCH_01141 HCH_01142     FALSE 0.207 83.000 0.000 NA   NA
 1093192 1093193 HCH_01143 HCH_01144     TRUE 0.526 0.000 0.000 NA   NA
 1093193 1093194 HCH_01144 HCH_01145     FALSE 0.081 155.000 0.000 NA   NA
 1093195 1093196 HCH_01146 HCH_01147     FALSE 0.326 59.000 0.000 1.000   NA
 1093196 1093197 HCH_01147 HCH_01148     TRUE 0.805 2.000 0.013 1.000   NA
 1093197 1093198 HCH_01148 HCH_01149     FALSE 0.189 95.000 0.000 NA   NA
 1093198 1093199 HCH_01149 HCH_01150     FALSE 0.201 89.000 0.000 NA   NA
 1093200 1093201 HCH_01151 HCH_01152     TRUE 0.460 7.000 0.000 NA   NA
 1093201 1093202 HCH_01152 HCH_01153     FALSE 0.085 151.000 0.000 NA   NA
 1093202 1093203 HCH_01153 HCH_01154     FALSE 0.071 168.000 0.000 NA   NA
 1093203 1093204 HCH_01154 HCH_01155     TRUE 0.526 0.000 0.000 NA   NA
 1093204 1093205 HCH_01155 HCH_01156     FALSE 0.364 -10.000 0.000 NA   NA
 1093205 1093206 HCH_01156 HCH_01157   mmsA2 FALSE 0.006 510.000 0.000 NA   NA
 1093206 1093207 HCH_01157 HCH_01158 mmsA2   TRUE 0.666 111.000 0.064 1.000 N NA
 1093207 1093208 HCH_01158 HCH_01159   iolD TRUE 0.842 32.000 0.095 1.000 N NA
 1093208 1093209 HCH_01159 HCH_01160 iolD   FALSE 0.146 242.000 0.021 1.000 N NA
 1093214 1093215 HCH_01165 HCH_01166     FALSE 0.090 147.000 0.000 NA   NA
 1093215 1093216 HCH_01166 HCH_01167     TRUE 0.677 40.000 0.000 NA Y NA
 1093216 1093217 HCH_01167 HCH_01169     TRUE 0.886 33.000 0.061 1.000 Y NA
 1093218 1093219 HCH_01170 HCH_01171     FALSE 0.343 15.000 0.000 NA   NA
 1093219 1093220 HCH_01171 HCH_01172     FALSE 0.073 165.000 0.000 NA   NA
 1093226 1093227 HCH_01178 HCH_01179 istB1 istA1 TRUE 0.837 12.000 0.000 1.000 Y NA
 1093228 1093229 HCH_01180 HCH_01181     FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 1093229 1093230 HCH_01181 HCH_01182     TRUE 0.913 71.000 0.286 NA   NA
 1093230 1093231 HCH_01182 HCH_01183     FALSE 0.176 102.000 0.000 NA   NA
 1093231 1093232 HCH_01183 HCH_01185     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 1093232 1093233 HCH_01185 HCH_01186     TRUE 0.947 -6.000 0.169 1.000   NA
 1093233 1093234 HCH_01186 HCH_01187     FALSE 0.100 139.000 0.000 NA   NA
 1093235 1093236 HCH_01188 HCH_01189   gloA1 TRUE 0.985 14.000 0.667 1.000   NA
 1093238 1093239 HCH_01191 HCH_01192     FALSE 0.214 116.000 0.000 NA N NA
 1093240 1093241 HCH_01193 HCH_01195     FALSE 0.208 81.000 0.000 NA   NA
 1093243 1093244 HCH_01196 HCH_01199     FALSE 0.015 399.000 0.000 1.000   NA
 1093244 1093245 HCH_01199 HCH_01200     FALSE 0.409 11.000 0.000 NA   NA
 1093246 1093247 HCH_01201 HCH_01202     FALSE 0.206 -249.000 0.000 NA   NA
 1093247 1093248 HCH_01202 HCH_01203     FALSE 0.007 447.000 0.000 NA   NA
 1093250 1093251 HCH_01205 HCH_01206     FALSE 0.082 154.000 0.000 NA   NA
 1093256 1093257 HCH_01211 HCH_01212     TRUE 0.911 10.000 0.079 1.000 N NA
 1093257 1093258 HCH_01212 HCH_01213     TRUE 0.972 4.000 0.216 1.000 N NA
 1093259 1093260 HCH_01214 HCH_01215   smpB FALSE 0.079 200.000 0.002 NA   NA
 1093261 1093262 HCH_01216 HCH_01217     TRUE 0.566 -19.000 0.014 NA   NA
 1093262 1093263 HCH_01217 HCH_01218     TRUE 0.740 78.000 0.086 NA   NA
 1093267 1093268 HCH_01223 HCH_01224 grpE dnaK TRUE 0.795 131.000 0.049 0.006 Y NA
 1093268 1093269 HCH_01224 HCH_01225 dnaK dnaJ TRUE 0.958 104.000 0.236 0.003 Y NA
 1093269 1093270 HCH_01225 HCH_01226 dnaJ dapB TRUE 0.611 110.000 0.041 1.000 N NA
 1093270 1093271 HCH_01226 HCH_01227 dapB carA FALSE 0.253 281.000 0.034 1.000 Y NA
 1093271 1093272 HCH_01227 HCH_01228 carA carB TRUE 0.963 120.000 0.345 0.000 Y NA
 1093272 1093273 HCH_01228 HCH_01229 carB greA TRUE 0.976 -3.000 0.241 1.000 N NA
 1093275 1093276 HCH_01231 HCH_01232 ftsJ ftsH TRUE 0.478 149.000 0.066 NA N NA
 1093276 1093277 HCH_01232 HCH_01233 ftsH folP TRUE 0.929 94.000 0.325 1.000 N NA
 1093277 1093278 HCH_01233 HCH_01234 folP glmM TRUE 0.974 7.000 0.260 1.000 N NA
 1093278 1093279 HCH_01234 HCH_01235 glmM tpiA TRUE 0.865 102.000 0.082 1.000 Y NA
 1093279 1093280 HCH_01235 HCH_01236 tpiA secG TRUE 0.954 11.000 0.184 1.000 N NA
 1093280 1093281 HCH_01236 HCH_10040 secG   TRUE 0.453 8.000 0.000 NA   NA
 1093281 1093282 HCH_10040 HCH_01237     FALSE 0.093 144.000 0.000 NA   NA
 1093282 1093283 HCH_01237 HCH_01238   nusA TRUE 0.983 19.000 0.759 NA   NA
 1093283 1093284 HCH_01238 HCH_01239 nusA infB TRUE 0.956 25.000 0.342 1.000 N NA
 1093284 1093285 HCH_01239 HCH_01240 infB rbfA TRUE 0.982 57.000 0.530 1.000 Y NA
 1093285 1093286 HCH_01240 HCH_01241 rbfA truB TRUE 0.982 15.000 0.318 1.000 Y NA
 1093286 1093287 HCH_01241 HCH_01243 truB rpsO TRUE 0.951 62.000 0.211 1.000 Y NA
 1093287 1093288 HCH_01243 HCH_01244 rpsO pnp TRUE 0.606 323.000 0.335 1.000 Y NA
 1093290 1093291 HCH_01246 HCH_01247     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 1093291 1093292 HCH_01247 HCH_01249     TRUE 0.951 85.000 0.519 NA   NA
 1093293 1093294 HCH_01250 HCH_01251     TRUE 0.998 0.000 0.967 0.021 Y NA
 1093294 1093295 HCH_01251 HCH_01252     TRUE 0.995 5.000 0.574 1.000 Y NA
 1093295 1093296 HCH_01252 HCH_01254     TRUE 0.997 0.000 0.574 0.064 Y NA
 1093296 1093297 HCH_01254 HCH_01255     TRUE 0.596 111.000 0.000 1.000 Y NA
 1093297 1093298 HCH_01255 HCH_01256   lon1 FALSE 0.016 463.000 0.000 1.000 N NA
 1093298 1093299 HCH_01256 HCH_01257 lon1   FALSE 0.073 165.000 0.000 NA   NA
 1093300 1093301 HCH_01258 HCH_01259     TRUE 0.478 31.000 0.011 NA   NA
 1093301 1093302 HCH_01259 HCH_01260     FALSE 0.209 80.000 0.000 NA   NA
 1093303 1093304 HCH_01261 HCH_01262     TRUE 0.997 2.000 0.812 NA Y NA
 1093304 1093305 HCH_01262 HCH_01263     TRUE 0.995 3.000 0.591 NA Y NA
 1093305 1093306 HCH_01263 HCH_01264     TRUE 0.992 -3.000 0.636 1.000 N NA
 1093308 1093309 HCH_01266 HCH_01268     TRUE 0.952 -7.000 0.203 1.000   NA
 1093309 1093310 HCH_01268 HCH_01269     TRUE 0.991 -7.000 0.639 0.001   NA
 1093310 1093311 HCH_01269 HCH_01270     TRUE 0.996 -3.000 0.657 1.000 Y NA
 1093312 1093313 HCH_01271 HCH_01272   aceE FALSE 0.183 152.000 0.000 1.000 N NA
 1093313 1093314 HCH_01272 HCH_01273 aceE aceF TRUE 0.963 16.000 0.167 1.000 Y NA
 1093314 1093315 HCH_01273 HCH_01274 aceF   FALSE 0.023 321.000 0.000 1.000   NA
 1093316 1093317 HCH_01275 HCH_01276     FALSE 0.098 140.000 0.000 NA   NA
 1093319 1093320 HCH_01278 HCH_01279     FALSE 0.094 143.000 0.000 NA   NA
 1093320 1093321 HCH_01279 HCH_01280     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1093328 1093329 HCH_01287 HCH_01288     FALSE 0.169 105.000 0.000 NA   NA
 1093332 1093333 HCH_01291 HCH_01293     FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1093334 1093335 HCH_01294 HCH_01295     TRUE 0.689 134.000 0.019 0.064 Y NA
 1093335 1093336 HCH_01295 HCH_01296     TRUE 0.998 8.000 0.918 0.064 Y NA
 1093336 1093337 HCH_01296 HCH_01297     TRUE 0.969 19.000 0.173 0.064 Y NA
 1093337 1093338 HCH_01297 HCH_01298     TRUE 0.977 -7.000 0.200 1.000 Y NA
 1093338 1093339 HCH_01298 HCH_01299     TRUE 0.832 17.000 0.057 1.000 N NA
 1093344 1093345 HCH_01303 HCH_01305     FALSE 0.020 275.000 0.000 NA   NA
 1093346 1093347 HCH_01306 HCH_01307     FALSE 0.299 -19.000 0.000 NA   NA
 1093348 1093349 HCH_01308 HCH_01309     FALSE 0.153 111.000 0.000 NA   NA
 1093350 1093351 HCH_01310 HCH_01311     FALSE 0.120 127.000 0.000 NA   NA
 1093351 1093352 HCH_01311 HCH_01312     FALSE 0.169 105.000 0.000 NA   NA
 1093353 1093354 HCH_01313 HCH_01314 trx2   FALSE 0.229 133.000 0.000 1.000 N NA
 1093355 1093356 HCH_10005 HCH_01315     FALSE 0.032 234.000 0.000 NA   NA
 1093361 1093362 HCH_01320 HCH_01321     FALSE 0.244 108.000 0.000 1.000   NA
 1093362 1093363 HCH_01321 HCH_01322     FALSE 0.006 482.000 0.000 NA   NA
 1093364 1093365 HCH_01324 HCH_01323     FALSE 0.205 -322.000 0.000 NA   NA
 1093369 1093370 HCH_01328 HCH_01329     FALSE 0.010 500.000 0.000 1.000   NA
 1093370 1093371 HCH_01329 HCH_01331     FALSE 0.333 16.000 0.000 NA   NA
 1093371 1093372 HCH_01331 HCH_01332     FALSE 0.004 745.000 0.000 NA   NA
 1093372 1093373 HCH_01332 HCH_01333     TRUE 0.913 71.000 0.286 NA   NA
 1093373 1093374 HCH_01333 HCH_01334     FALSE 0.012 341.000 0.000 NA   NA
 1093374 1093375 HCH_01334 HCH_01335     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 1093376 1093377 HCH_01336 HCH_01337     FALSE 0.204 -345.000 0.000 NA   NA
 1093379 1093380 HCH_10041 HCH_01339     FALSE 0.224 58.000 0.000 NA   NA
 1093380 1093381 HCH_01339 HCH_01340   mutY TRUE 0.848 75.000 0.150 NA N NA
 1093382 1093383 HCH_01341 HCH_01342   hisB FALSE 0.237 116.000 0.004 NA   NA
 1093383 1093384 HCH_01342 HCH_01345 hisB hisH1 TRUE 0.883 125.000 0.111 0.003 Y NA
 1093384 1093385 HCH_01345 HCH_01346 hisH1 hisA TRUE 0.943 54.000 0.120 0.003 Y NA
 1093385 1093386 HCH_01346 HCH_01347 hisA hisF TRUE 0.983 63.000 0.433 0.003 Y NA
 1093386 1093387 HCH_01347 HCH_01348 hisF   FALSE 0.071 167.000 0.000 NA   NA
 1093388 1093389 HCH_01349 HCH_01350     TRUE 0.898 66.000 0.210 1.000   NA
 1093389 1093390 HCH_01350 HCH_01351     TRUE 0.973 23.000 0.408 0.034 N NA
 1093390 1093391 HCH_01351 HCH_01352   gpmI TRUE 0.580 198.000 0.170 1.000 N NA
 1093392 1093393 HCH_01353 HCH_01355   grxC TRUE 0.874 44.000 0.166 NA N NA
 1093395 1093396 HCH_01356 HCH_01357 secB   FALSE 0.063 248.000 0.000 1.000 N NA
 1093397 1093398 HCH_01358 HCH_01359     FALSE 0.236 -40.000 0.000 NA   NA
 1093399 1093400 HCH_01361 HCH_01362     TRUE 0.988 28.000 0.630 1.000 Y NA
 1093400 1093401 HCH_01362 HCH_01363     TRUE 0.987 103.000 0.695 0.064 Y NA
 1093401 1093402 HCH_01363 HCH_01364     FALSE 0.266 26.000 0.000 NA   NA
 1093403 1093404 HCH_01365 HCH_01366   cca FALSE 0.172 157.000 0.000 1.000 N NA
 1093405 1093406 HCH_01367 HCH_01368     TRUE 0.911 18.000 0.182 NA   NA
 1093407 1093408 HCH_01369 HCH_01371 hmp   TRUE 0.708 81.000 0.063 NA N NA
 1093408 1093409 HCH_01371 HCH_01372     TRUE 0.980 11.000 0.500 NA   NA
 1093410 1093411 HCH_01373 HCH_01374     FALSE 0.122 126.000 0.000 NA   NA
 1093411 1093412 HCH_01374 HCH_01375     FALSE 0.202 88.000 0.000 NA   NA
 1093412 1093413 HCH_01375 HCH_01376     FALSE 0.016 304.000 0.000 NA   NA
 1093414 1093415 HCH_01377 HCH_01378     FALSE 0.006 471.000 0.000 NA   NA
 1093415 1093416 HCH_01378 HCH_01379     FALSE 0.021 268.000 0.000 NA   NA
 1093416 1093417 HCH_01379 HCH_01380     FALSE 0.082 154.000 0.000 NA   NA
 1093417 1093418 HCH_01380 HCH_01381     FALSE 0.366 13.000 0.000 NA   NA
 1093420 1093421 HCH_01383 HCH_01384     FALSE 0.195 124.000 0.000 1.000   NA
 1093421 1093422 HCH_01384 HCH_01385     FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1093423 1093424 HCH_01386 HCH_01387     FALSE 0.297 20.000 0.000 NA   NA
 1093425 1093426 HCH_01388 HCH_01389 ribB   FALSE 0.019 281.000 0.000 NA   NA
 1093427 1093428 HCH_01390 HCH_01391     TRUE 0.990 -28.000 0.682 1.000 Y NA
 1093429 1093430 HCH_01392 HCH_01393     TRUE 0.852 -3.000 0.031 NA N NA
 1093430 1093431 HCH_01393 HCH_01394     FALSE 0.399 75.000 0.000 1.000 N NA
 1093431 1093432 HCH_01394 HCH_01395     TRUE 0.988 48.000 0.706 1.000 Y NA
 1093432 1093433 HCH_01395 HCH_01396     TRUE 0.986 55.000 0.650 1.000 Y NA
 1093433 1093434 HCH_01396 HCH_01397     TRUE 0.859 -13.000 0.100 NA   NA
 1093436 1093437 HCH_01399 HCH_01400     FALSE 0.044 203.000 0.000 NA   NA
 1093437 1093438 HCH_01400 HCH_01401     TRUE 0.755 -3.000 0.014 NA   NA
 1093438 1093439 HCH_01401 HCH_01402     TRUE 0.460 7.000 0.000 NA   NA
 1093440 1093441 HCH_01403 HCH_01404     FALSE 0.161 108.000 0.000 NA   NA
 1093441 1093442 HCH_01404 HCH_01405     FALSE 0.174 103.000 0.000 NA   NA
 1093443 1093444 HCH_01406 HCH_01407     FALSE 0.084 152.000 0.000 NA   NA
 1093444 1093445 HCH_01407 HCH_01408     FALSE 0.225 56.000 0.000 NA   NA
 1093445 1093446 HCH_01408 HCH_01409     TRUE 0.906 65.000 0.259 NA   NA
 1093446 1093447 HCH_01409 HCH_01411     TRUE 0.964 6.000 0.235 NA   NA
 1093447 1093448 HCH_01411 HCH_01412   csdB TRUE 0.931 14.000 0.200 NA   NA
 1093448 1093449 HCH_01412 HCH_01413 csdB sufD TRUE 0.898 -3.000 0.041 1.000 N NA
 1093449 1093450 HCH_01413 HCH_01414 sufD sufC TRUE 0.990 12.000 0.482 1.000 Y NA
 1093453 1093454 HCH_01417 HCH_01419     FALSE 0.012 352.000 0.000 NA   NA
 1093457 1093458 HCH_01421 HCH_01422 slpA   FALSE 0.312 77.000 0.000 1.000   NA
 1093458 1093459 HCH_01422 HCH_01423     TRUE 0.969 36.000 0.619 NA   NA
 1093459 1093460 HCH_01423 HCH_01424     TRUE 0.886 -54.000 0.209 NA   NA
 1093460 1093461 HCH_01424 HCH_01425     TRUE 0.972 -7.000 0.333 1.000   NA
 1093461 1093462 HCH_01425 HCH_01427     FALSE 0.117 165.000 0.000 1.000   NA
 1093462 1093463 HCH_01427 HCH_01428     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1093463 1093464 HCH_01428 HCH_01429     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1093465 1093466 HCH_01430 HCH_01431     FALSE 0.223 60.000 0.000 NA   NA
 1093466 1093467 HCH_01431 HCH_01432     FALSE 0.306 19.000 0.000 NA   NA
 1093467 1093468 HCH_01432 HCH_01433     FALSE 0.034 227.000 0.000 NA   NA
 1093468 1093469 HCH_01433 HCH_01434     TRUE 0.943 60.000 0.429 NA   NA
 1093470 1093471 HCH_01435 HCH_01436     TRUE 0.997 0.000 0.714 1.000 Y NA
 1093472 1093473 HCH_01437 HCH_01438     FALSE 0.054 188.000 0.000 NA   NA
 1093478 1093479 HCH_01443 HCH_01444     FALSE 0.019 278.000 0.000 NA   NA
 1093480 1093481 HCH_01446 HCH_01447 adhC   FALSE 0.427 19.000 0.000 1.000   NA
 1093481 1093482 HCH_01447 HCH_01448     FALSE 0.340 43.000 0.000 1.000   NA
 1093486 1093487 HCH_01452 HCH_01453     FALSE 0.006 524.000 0.000 NA   NA
 1093487 1093488 HCH_01453 HCH_01454     FALSE 0.316 -16.000 0.000 NA   NA
 1093488 1093489 HCH_01454 HCH_01455     FALSE 0.004 752.000 0.000 NA   NA
 1093489 1093490 HCH_01455 HCH_01456     FALSE 0.005 537.000 0.000 NA   NA
 1093490 1093491 HCH_01456 HCH_01457     FALSE 0.118 128.000 0.000 NA   NA
 1093491 1093492 HCH_01457 HCH_01459     FALSE 0.004 899.000 0.000 NA   NA
 1093493 1093494 HCH_01460 HCH_01461     FALSE 0.221 -70.000 0.000 NA   NA
 1093497 1093498 HCH_01465 HCH_01466     TRUE 0.995 -3.000 0.909 NA N NA
 1093499 1093500 HCH_01467 HCH_01468     TRUE 0.533 -28.000 0.000 0.063   NA
 1093500 1093501 HCH_01468 HCH_01469     FALSE 0.292 114.000 0.000 1.000 N NA
 1093501 1093502 HCH_01469 HCH_01470     FALSE 0.113 131.000 0.000 NA   NA
 1093503 1093504 HCH_01471 HCH_01472     TRUE 0.961 169.000 0.783 1.000 Y NA
 1093504 1093505 HCH_01472 HCH_01473     TRUE 0.997 10.000 0.905 1.000 Y NA
 1093505 1093506 HCH_01473 HCH_01474     TRUE 0.997 11.000 0.909 0.063 Y NA
 1093509 1093510 HCH_01477 HCH_01478     FALSE 0.031 236.000 0.000 NA   NA
 1093510 1093511 HCH_01478 HCH_01479     FALSE 0.248 34.000 0.000 NA   NA
 1093511 1093512 HCH_01479 HCH_01480     TRUE 0.989 -7.000 0.761 NA   NA
 1093512 1093513 HCH_01480 HCH_01481     TRUE 0.984 15.000 0.683 NA   NA
 1093513 1093514 HCH_01481 HCH_01482     FALSE 0.031 603.000 0.000 NA Y NA
 1093516 1093517 HCH_01484 HCH_01485     FALSE 0.073 165.000 0.000 NA   NA
 1093517 1093518 HCH_01485 HCH_01486     FALSE 0.174 103.000 0.000 NA   NA
 1093520 1093521 HCH_01487 HCH_01489     FALSE 0.209 80.000 0.000 NA   NA
 1093521 1093522 HCH_01489 HCH_01490     FALSE 0.008 415.000 0.000 NA   NA
 1093522 1093523 HCH_01490 HCH_01491     TRUE 0.486 111.000 0.027 NA N NA
 1093525 1093526 HCH_01493 HCH_01494     FALSE 0.206 -249.000 0.000 NA   NA
 1093528 1093529 HCH_01496 HCH_01497     TRUE 0.990 -3.000 0.330 NA Y NA
 1093530 1093531 HCH_01498 HCH_01499     FALSE 0.005 538.000 0.000 NA   NA
 1093533 1093534 HCH_01501 HCH_01502     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1093535 1093536 HCH_01503 HCH_01504 add   TRUE 0.465 98.000 0.013 1.000   NA
 1093537 1093538 HCH_01505 HCH_01506     FALSE 0.207 -247.000 0.000 NA   NA
 1093539 1093540 HCH_01507 HCH_01508     TRUE 0.852 10.000 0.046 1.000   NA
 1093540 1093541 HCH_01508 HCH_01509   gabT TRUE 0.966 62.000 0.572 1.000   NA
 1093541 1093542 HCH_01509 HCH_01510 gabT   TRUE 0.961 143.000 0.793 0.000   NA
 1093542 1093543 HCH_01510 HCH_01511     FALSE 0.009 529.000 0.000 1.000   NA
 1093548 1093549 HCH_01516 HCH_01517 deoA prsA TRUE 0.993 0.000 0.412 1.000 Y NA
 1093555 1093556 HCH_01523 HCH_01524   rbn FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1093557 1093558 HCH_01525 HCH_01526     FALSE 0.048 198.000 0.000 NA   NA
 1093558 1093559 HCH_01526 HCH_01527     FALSE 0.150 112.000 0.000 NA   NA
 1093559 1093560 HCH_01527 HCH_01528     FALSE 0.026 365.000 0.009 NA   NA
 1093560 1093561 HCH_01528 HCH_01529   bioA TRUE 0.857 3.000 0.041 NA   NA
 1093561 1093562 HCH_01529 HCH_01530 bioA   FALSE 0.369 93.000 0.000 1.000 N NA
 1093562 1093563 HCH_01530 HCH_01531   metF FALSE 0.077 228.000 0.000 1.000 N NA
 1093563 1093564 HCH_01531 HCH_01532 metF ahcY TRUE 0.743 77.000 0.061 1.000 N NA
 1093564 1093565 HCH_01532 HCH_01533 ahcY metK TRUE 0.917 106.000 0.114 0.001 Y NA
 1093565 1093566 HCH_01533 HCH_01534 metK   TRUE 0.785 18.000 0.036 1.000 N NA
 1093567 1093568 HCH_01535 HCH_01536 tkt edp TRUE 0.967 34.000 0.285 1.000 Y NA
 1093568 1093569 HCH_01536 HCH_01537 edp pgk TRUE 0.890 104.000 0.070 0.003 Y NA
 1093569 1093570 HCH_01537 HCH_01538 pgk fba TRUE 0.761 122.000 0.019 0.003 Y NA
 1093570 1093571 HCH_01538 HCH_01539 fba pldB FALSE 0.059 255.000 0.000 1.000 N NA
 1093571 1093572 HCH_01539 HCH_01540 pldB   TRUE 0.839 -3.000 0.015 1.000 N NA
 1093572 1093573 HCH_01540 HCH_01541     FALSE 0.057 257.000 0.000 1.000 N NA
 1093574 1093575 HCH_01542 HCH_01543     FALSE 0.124 125.000 0.000 NA   NA
 1093576 1093577 HCH_01544 HCH_01546     FALSE 0.052 191.000 0.000 NA   NA
 1093579 1093580 HCH_01548 HCH_01549     FALSE 0.253 31.000 0.000 NA   NA
 1093580 1093581 HCH_01549 HCH_01550     FALSE 0.143 115.000 0.000 NA   NA
 1093582 1093583 HCH_01551 HCH_01552     FALSE 0.080 156.000 0.000 NA   NA
 1093584 1093585 HCH_01553 HCH_01554     FALSE 0.223 62.000 0.000 NA   NA
 1093587 1093588 HCH_01556 HCH_01557   polB TRUE 0.468 6.000 0.000 NA   NA
 1093589 1093590 HCH_01558 HCH_01559     FALSE 0.067 172.000 0.000 NA   NA
 1093590 1093591 HCH_01559 HCH_01560     FALSE 0.430 10.000 0.000 NA   NA
 1093591 1093592 HCH_01560 HCH_01561     FALSE 0.281 96.000 0.000 1.000   NA
 1093593 1093594 HCH_01562 HCH_01563     FALSE 0.061 251.000 0.000 1.000 N NA
 1093594 1093595 HCH_01563 HCH_01564     FALSE 0.279 23.000 0.000 NA   NA
 1093597 1093598 HCH_01566 HCH_01567     FALSE 0.009 410.000 0.000 NA   NA
 1093598 1093599 HCH_01567 HCH_01568     FALSE 0.004 779.000 0.000 NA   NA
 1093605 1093606 HCH_01574 HCH_01575     FALSE 0.038 262.000 0.000 1.000   NA
 1093608 1093609 HCH_01577 HCH_01579     FALSE 0.016 306.000 0.000 NA   NA
 1093613 1093614 HCH_10042 HCH_10043     FALSE 0.145 114.000 0.000 NA   NA
 1093614 1093615 HCH_10043 HCH_10044     FALSE 0.231 49.000 0.000 NA   NA
 1093615 1093616 HCH_10044 HCH_10045     FALSE 0.014 318.000 0.000 NA   NA
 1093619 1093620 HCH_01583 HCH_01584     TRUE 0.993 9.000 1.000 NA   NA
 1093620 1093621 HCH_01584 HCH_01585     TRUE 0.992 11.000 1.000 NA   NA
 1093621 1093622 HCH_01585 HCH_01586     TRUE 0.973 55.000 0.667 1.000   NA
 1093623 1093624 HCH_01588 HCH_01587     FALSE 0.205 -255.000 0.000 NA   NA
 1093624 1093625 HCH_01587 HCH_01589   coxS FALSE 0.004 2247.000 0.000 NA   NA
 1093625 1093626 HCH_01589 HCH_01590 coxS coxL TRUE 0.913 10.000 0.000 0.001 Y NA
 1093626 1093627 HCH_01590 HCH_01591 coxL coxI TRUE 0.639 2.000 0.000 NA N NA
 1093629 1093630 HCH_01593 HCH_01594   htpG1 FALSE 0.164 163.000 0.000 1.000 N NA
 1093630 1093631 HCH_01594 HCH_01595 htpG1   TRUE 0.993 3.000 0.727 1.000   NA
 1093632 1093633 HCH_01596 HCH_01597     FALSE 0.211 78.000 0.000 NA   NA
 1093633 1093634 HCH_01597 HCH_01598     FALSE 0.059 182.000 0.000 NA   NA
 1093634 1093635 HCH_01598 HCH_01599     TRUE 0.909 23.000 0.206 NA   NA
 1093636 1093637 HCH_01600 HCH_01601     FALSE 0.266 -27.000 0.000 NA   NA
 1093637 1093638 HCH_01601 HCH_01602     FALSE 0.217 73.000 0.000 NA   NA
 1093641 1093642 HCH_01605 HCH_01606     TRUE 0.444 9.000 0.000 NA   NA
 1093642 1093643 HCH_01606 HCH_01607     FALSE 0.205 85.000 0.000 NA   NA
 1093643 1093644 HCH_01607 HCH_01608   potG FALSE 0.279 23.000 0.000 NA   NA
 1093646 1093647 HCH_01610 HCH_01611 thiQ thiP TRUE 0.624 -7.000 0.000 1.000 N NA
 1093647 1093648 HCH_01611 HCH_01612 thiP thiB TRUE 0.982 54.000 0.697 0.075 N NA
 1093648 1093649 HCH_01612 HCH_01613 thiB   FALSE 0.048 198.000 0.000 NA   NA
 1093650 1093651 HCH_01614 HCH_01615     FALSE 0.169 105.000 0.000 NA   NA
 1093651 1093652 HCH_01615 HCH_01616     FALSE 0.040 213.000 0.000 NA   NA
 1093652 1093653 HCH_01616 HCH_01617     FALSE 0.409 11.000 0.000 NA   NA
 1093654 1093655 HCH_01618 HCH_01619     TRUE 0.942 -34.000 0.158 1.000 Y NA
 1093658 1093659 HCH_01623 HCH_01624     FALSE 0.188 96.000 0.000 NA   NA
 1093661 1093662 HCH_01626 HCH_01627     FALSE 0.343 132.000 0.000 0.064 N NA
 1093662 1093663 HCH_01627 HCH_01628     FALSE 0.019 283.000 0.000 NA   NA
 1093663 1093664 HCH_01628 HCH_01629     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1093664 1093665 HCH_01629 HCH_01630     FALSE 0.063 176.000 0.000 NA   NA
 1093665 1093666 HCH_01630 HCH_01631     FALSE 0.176 102.000 0.000 NA   NA
 1093667 1093668 HCH_01632 HCH_01633 tdh kbl TRUE 0.990 3.000 0.547 1.000 N NA
 1093668 1093669 HCH_01633 HCH_01634 kbl   TRUE 0.485 185.000 0.095 1.000 N NA
 1093669 1093670 HCH_01634 HCH_01635     TRUE 0.627 -3.000 0.000 NA N NA
 1093670 1093671 HCH_01635 HCH_01636     TRUE 0.531 -7.000 0.000 NA N NA
 1093671 1093672 HCH_01636 HCH_01637     TRUE 0.991 -127.000 1.000 1.000 Y NA
 1093673 1093674 HCH_01639 HCH_01640     TRUE 0.887 6.000 0.071 NA   NA
 1093674 1093675 HCH_01640 HCH_01641     TRUE 0.908 0.000 0.071 NA   NA
 1093678 1093679 HCH_01645 HCH_01646   serA FALSE 0.037 310.000 0.000 1.000 N NA
 1093680 1093681 HCH_01647 HCH_01648     TRUE 0.798 37.000 0.071 1.000 N NA
 1093681 1093682 HCH_01648 HCH_01649     FALSE 0.056 259.000 0.000 1.000 N NA
 1093683 1093684 HCH_01650 HCH_01651     FALSE 0.030 288.000 0.000 1.000   NA
 1093685 1093686 HCH_01652 HCH_01653   glcB FALSE 0.008 430.000 0.000 NA   NA
 1093688 1093689 HCH_01655 HCH_01656 asnB1   TRUE 0.961 84.000 0.514 1.000 N NA
 1093689 1093690 HCH_01656 HCH_01657     TRUE 0.981 11.000 0.471 NA N NA
 1093691 1093692 HCH_01658 HCH_01659     FALSE 0.056 258.000 0.000 1.000 N NA
 1093693 1093694 HCH_01660 HCH_01662     FALSE 0.105 136.000 0.000 NA   NA
 1093694 1093695 HCH_01662 HCH_01663     TRUE 0.987 106.000 0.902 1.000 Y NA
 1093695 1093696 HCH_01663 HCH_01664     FALSE 0.077 160.000 0.000 NA   NA
 1093696 1093697 HCH_01664 HCH_01665     FALSE 0.064 175.000 0.000 NA   NA
 1093697 1093698 HCH_01665 HCH_01666     FALSE 0.070 169.000 0.000 NA   NA
 1093698 1093699 HCH_01666 HCH_01667   sfp FALSE 0.026 251.000 0.000 NA   NA
 1093699 1093700 HCH_01667 HCH_01668 sfp   TRUE 0.479 24.000 0.000 1.000 N NA
 1093705 1093706 HCH_01673 HCH_01674     FALSE 0.029 291.000 0.000 1.000   NA
 1093706 1093707 HCH_01674 HCH_01675     FALSE 0.235 41.000 0.000 NA   NA
 1093707 1093708 HCH_01675 HCH_01676     FALSE 0.274 24.000 0.000 NA   NA
 1093708 1093709 HCH_01676 HCH_01677     TRUE 0.491 4.000 0.000 NA   NA
 1093709 1093710 HCH_01677 HCH_01678     FALSE 0.223 59.000 0.000 NA   NA
 1093710 1093711 HCH_01678 HCH_01681     TRUE 0.439 18.000 0.000 1.000   NA
 1093712 1093713 HCH_01682 HCH_01683     FALSE 0.343 15.000 0.000 NA   NA
 1093719 1093720 HCH_01692 HCH_01693     FALSE 0.010 783.000 0.000 1.000 N NA
 1093724 1093725 HCH_10047 HCH_10048     TRUE 0.468 6.000 0.000 NA   NA
 1093725 1093726 HCH_10048 HCH_10049     FALSE 0.270 25.000 0.000 NA   NA
 1093727 1093728 HCH_01697 HCH_01698     TRUE 0.526 0.000 0.000 NA   NA
 1093728 1093729 HCH_01698 HCH_01699     FALSE 0.245 35.000 0.000 NA   NA
 1093729 1093730 HCH_01699 HCH_01700     FALSE 0.290 181.000 0.048 NA   NA
 1093730 1093731 HCH_01700 HCH_01701     TRUE 0.579 8.000 0.000 NA N NA
 1093732 1093733 HCH_01702 HCH_01703     FALSE 0.261 28.000 0.000 NA   NA
 1093733 1093734 HCH_01703 HCH_10001   hisI2 FALSE 0.365 94.000 0.000 1.000 N NA
 1093734 1093735 HCH_10001 HCH_01704 hisI2   TRUE 0.713 3.000 0.000 1.000 N NA
 1093735 1093736 HCH_01704 HCH_01706     FALSE 0.332 54.000 0.000 1.000   NA
 1093736 1093737 HCH_01706 HCH_01707   dksA TRUE 0.821 -3.000 0.020 1.000   NA
 1093737 1093738 HCH_01707 HCH_01708 dksA   FALSE 0.093 213.000 0.000 1.000 N NA
 1093740 1093741 HCH_01709 HCH_01710 rnr1 spoU TRUE 0.865 106.000 0.147 0.014 N NA
 1093741 1093742 HCH_01710 HCH_01711 spoU rpsF TRUE 0.651 127.000 0.017 1.000 Y NA
 1093742 1093743 HCH_01711 HCH_01712 rpsF rpsR TRUE 0.985 18.000 0.319 0.010 Y NA
 1093743 1093744 HCH_01712 HCH_01713 rpsR rplI TRUE 0.970 123.000 0.499 0.010 Y NA
 1093744 1093745 HCH_01713 HCH_01714 rplI dnaB TRUE 0.581 141.000 0.074 1.000 N NA
 1093745 1093746 HCH_01714 HCH_01715 dnaB alr TRUE 0.865 0.000 0.020 1.000 N NA
 1093746 1093747 HCH_01715 HCH_01716 alr   TRUE 0.577 191.000 0.067 1.000 Y NA
 1093748 1093749 HCH_01717 HCH_01718   hemN1 FALSE 0.144 145.000 0.000 NA N NA
 1093751 1093752 HCH_01720 HCH_01721     FALSE 0.417 186.000 0.000 0.026 Y NA
 1093752 1093753 HCH_01721 HCH_10051     FALSE 0.032 232.000 0.000 NA   NA
 1093753 1093754 HCH_10051 HCH_01722     FALSE 0.223 66.000 0.000 NA   NA
 1093754 1093755 HCH_01722 HCH_01723   pth TRUE 0.629 242.000 0.184 1.000 Y NA
 1093755 1093756 HCH_01723 HCH_01725 pth rplY TRUE 0.995 7.000 0.496 0.015 Y NA
 1093756 1093757 HCH_01725 HCH_01726 rplY prs TRUE 0.663 146.000 0.122 1.000 N NA
 1093757 1093758 HCH_01726 HCH_10052 prs   FALSE 0.223 65.000 0.000 NA   NA
 1093758 1093759 HCH_10052 HCH_01727   ispE FALSE 0.264 27.000 0.000 NA   NA
 1093759 1093760 HCH_01727 HCH_01728 ispE lolB TRUE 0.788 52.000 0.072 1.000 N NA
 1093760 1093761 HCH_01728 HCH_01729 lolB   TRUE 0.762 86.000 0.072 1.000 N NA
 1093761 1093762 HCH_01729 HCH_01730     FALSE 0.021 270.000 0.000 NA   NA
 1093763 1093764 HCH_01731 HCH_01733 hemA prfA TRUE 0.907 79.000 0.171 0.036 N NA
 1093764 1093765 HCH_01733 HCH_01734 prfA hemK TRUE 0.966 23.000 0.229 1.000 Y NA
 1093765 1093766 HCH_01734 HCH_01736 hemK moeB TRUE 0.802 30.000 0.068 1.000 N NA
 1093769 1093770 HCH_01737 HCH_01739     FALSE 0.052 264.000 0.000 1.000 N NA
 1093772 1093773 HCH_01741 HCH_01742   minE FALSE 0.011 361.000 0.000 NA   NA
 1093773 1093774 HCH_01742 HCH_01743 minE minD TRUE 0.995 -3.000 0.618 NA Y NA
 1093774 1093775 HCH_01743 HCH_01744 minD minC TRUE 0.976 87.000 0.466 1.000 Y NA
 1093775 1093776 HCH_01744 HCH_01745 minC   FALSE 0.088 188.000 0.000 1.000   NA
 1093776 1093777 HCH_01745 HCH_01746     TRUE 0.844 -40.000 0.125 1.000   NA
 1093778 1093779 HCH_01747 HCH_01749   phaC FALSE 0.298 87.000 0.000 NA N NA
 1093779 1093780 HCH_01749 HCH_01750 phaC   FALSE 0.076 161.000 0.000 NA   NA
 1093780 1093781 HCH_01750 HCH_01751     FALSE 0.013 326.000 0.000 NA   NA
 1093783 1093784 HCH_01753 HCH_01755     TRUE 0.772 106.000 0.105 1.000 N NA
 1093785 1093786 HCH_01754 HCH_01756     TRUE 0.927 33.000 0.286 NA   NA
 1093787 1093788 HCH_01757 HCH_01758     TRUE 0.783 19.000 0.000 1.000 Y NA
 1093789 1093790 HCH_01759 HCH_01760     TRUE 0.962 28.000 0.500 NA   NA
 1093790 1093791 HCH_01760 HCH_01761     FALSE 0.005 566.000 0.000 NA   NA
 1093791 1093792 HCH_01761 HCH_01762   argF1 TRUE 0.942 2.000 0.025 1.000 Y NA
 1093792 1093793 HCH_01762 HCH_01763 argF1 argD TRUE 0.870 92.000 0.074 1.000 Y NA
 1093795 1093796 HCH_01765 HCH_01766     FALSE 0.191 94.000 0.000 NA   NA
 1093796 1093797 HCH_01766 HCH_01767     FALSE 0.027 249.000 0.000 NA   NA
 1093797 1093798 HCH_01767 HCH_01768     FALSE 0.143 173.000 0.008 NA   NA
 1093798 1093799 HCH_01768 HCH_01769     TRUE 0.827 154.000 0.349 1.000   NA
 1093800 1093801 HCH_01771 HCH_01772 ffh rpsP TRUE 0.972 14.000 0.361 1.000 N NA
 1093801 1093802 HCH_01772 HCH_01773 rpsP rimM TRUE 0.984 22.000 0.342 0.010 Y NA
 1093802 1093803 HCH_01773 HCH_01774 rimM trmD TRUE 0.990 -25.000 0.672 1.000 Y NA
 1093803 1093804 HCH_01774 HCH_01775 trmD rplS TRUE 0.986 30.000 0.567 1.000 Y NA
 1093804 1093805 HCH_01775 HCH_01776 rplS xerD FALSE 0.342 146.000 0.015 1.000 N NA
 1093805 1093806 HCH_01776 HCH_01777 xerD dsbC FALSE 0.383 148.000 0.026 1.000 N NA
 1093806 1093807 HCH_01777 HCH_01778 dsbC   FALSE 0.014 508.000 0.000 1.000 N NA
 1093807 1093808 HCH_01778 HCH_01779   thrA TRUE 0.950 53.000 0.202 1.000 Y NA
 1093808 1093809 HCH_01779 HCH_01780 thrA thrC TRUE 0.892 105.000 0.125 1.000 Y NA
 1093809 1093810 HCH_01780 HCH_01781 thrC recJ FALSE 0.193 186.000 0.007 1.000 N NA
 1093810 1093811 HCH_01781 HCH_01782 recJ prfB FALSE 0.087 318.000 0.028 1.000 N NA
 1093811 1093812 HCH_01782 HCH_01783 prfB lysS TRUE 0.950 72.000 0.162 0.036 Y NA
 1093812 1093813 HCH_01783 HCH_01784 lysS ung TRUE 0.560 43.000 0.008 1.000 N NA
 1093814 1093815 HCH_01785 HCH_01786     FALSE 0.330 147.000 0.034 NA   NA
 1093815 1093816 HCH_01786 HCH_01787     FALSE 0.333 16.000 0.000 NA   NA
 1093816 1093817 HCH_01787 HCH_01788     FALSE 0.283 -22.000 0.000 NA   NA
 1093817 1093818 HCH_01788 HCH_01789   nadB FALSE 0.312 114.000 0.011 NA   NA
 1093819 1093820 HCH_01790 HCH_01791 algU mucA TRUE 0.954 119.000 0.705 NA N NA
 1093820 1093821 HCH_01791 HCH_01792 mucA mucB TRUE 0.997 4.000 0.856 NA Y NA
 1093821 1093822 HCH_01792 HCH_01793 mucB mucC TRUE 0.995 -3.000 0.609 NA Y NA
 1093822 1093823 HCH_01793 HCH_01795 mucC mucD TRUE 0.735 151.000 0.206 NA N NA
 1093823 1093824 HCH_01795 HCH_01797 mucD lepA FALSE 0.212 202.000 0.020 1.000 N NA
 1093824 1093825 HCH_01797 HCH_01798 lepA lepB TRUE 0.901 49.000 0.187 1.000 N NA
 1093825 1093826 HCH_01798 HCH_01799 lepB   TRUE 0.804 83.000 0.133 NA   NA
 1093826 1093827 HCH_01799 HCH_01800   rnc TRUE 0.831 -3.000 0.033 NA   NA
 1093827 1093828 HCH_01800 HCH_01801 rnc era TRUE 0.960 -3.000 0.127 0.052   NA
 1093828 1093829 HCH_01801 HCH_01803 era recO TRUE 0.874 18.000 0.109 1.000   NA
 1093831 1093832 HCH_01805 HCH_01806 cysM rumA TRUE 0.615 108.000 0.039 1.000 N NA
 1093832 1093833 HCH_01806 HCH_01807 rumA relA TRUE 0.735 45.000 0.047 1.000 N NA
 1093833 1093834 HCH_01807 HCH_01808 relA   TRUE 0.875 0.000 0.035 1.000   NA
 1093836 1093837 HCH_01811 HCH_01812 ppc   FALSE 0.242 155.000 0.011 NA N NA
 1093837 1093838 HCH_01812 HCH_01814     FALSE 0.027 300.000 0.000 NA N NA
 1093838 1093839 HCH_01814 HCH_01815     TRUE 0.608 72.000 0.019 1.000 N NA
 1093839 1093840 HCH_01815 HCH_01816     FALSE 0.378 128.000 0.010 1.000 N NA
 1093840 1093841 HCH_01816 HCH_01817     FALSE 0.081 155.000 0.000 NA   NA
 1093841 1093842 HCH_01817 HCH_01818     FALSE 0.231 49.000 0.000 NA   NA
 1093842 1093843 HCH_01818 HCH_01819     FALSE 0.008 420.000 0.000 NA   NA
 1093843 1093844 HCH_01819 HCH_01820     FALSE 0.183 99.000 0.000 NA   NA
 1093844 1093845 HCH_01820 HCH_01821     TRUE 0.970 69.000 0.676 NA   NA
 1093846 1093847 HCH_01822 HCH_01823   putP FALSE 0.162 137.000 0.000 1.000   NA
 1093847 1093848 HCH_01823 HCH_01824 putP putA TRUE 0.721 88.000 0.057 1.000 N NA
 1093848 1093849 HCH_01824 HCH_01825 putA   FALSE 0.065 245.000 0.000 1.000 N NA
 1093849 1093850 HCH_01825 HCH_01826     FALSE 0.306 -18.000 0.000 NA   NA
 1093851 1093852 HCH_01827 HCH_01828     FALSE 0.040 214.000 0.000 NA   NA
 1093853 1093854 HCH_01829 HCH_01830     TRUE 0.928 52.000 0.256 1.000 N NA
 1093854 1093855 HCH_01830 HCH_01831     TRUE 0.993 21.000 0.667 0.003 Y NA
 1093855 1093856 HCH_01831 HCH_01832     TRUE 0.995 4.000 0.543 1.000 Y NA
 1093856 1093857 HCH_01832 HCH_01833     TRUE 0.995 24.000 1.000 0.061 Y NA
 1093857 1093858 HCH_01833 HCH_01834     TRUE 0.981 139.000 0.848 0.061 Y NA
 1093858 1093859 HCH_01834 HCH_01835     FALSE 0.006 475.000 0.000 NA   NA
 1093862 1093863 HCH_01839 HCH_01840   gmhA1 FALSE 0.240 38.000 0.000 NA   NA
 1093864 1093865 HCH_01841 HCH_01842 aspA   FALSE 0.326 64.000 0.000 1.000   NA
 1093865 1093866 HCH_01842 HCH_01843     FALSE 0.279 23.000 0.000 NA   NA
 1093867 1093868 HCH_01844 HCH_01845     TRUE 0.953 -3.000 0.148 1.000   NA
 1093868 1093869 HCH_01845 HCH_01846     TRUE 0.974 0.000 0.231 1.000   NA
 1093870 1093871 HCH_01847 HCH_01848     FALSE 0.207 82.000 0.000 NA   NA
 1093871 1093872 HCH_01848 HCH_01849     TRUE 0.954 34.000 0.200 1.000 Y NA
 1093872 1093873 HCH_01849 HCH_01850     FALSE 0.050 195.000 0.000 NA   NA
 1093873 1093874 HCH_01850 HCH_01851     FALSE 0.082 154.000 0.000 NA   NA
 1093875 1093876 HCH_01852 HCH_01854     FALSE 0.136 118.000 0.000 NA   NA
 1093877 1093878 HCH_01853 HCH_01855     TRUE 0.486 90.000 0.023 NA   NA
 1093878 1093879 HCH_01855 HCH_01857     TRUE 0.974 29.000 0.657 NA   NA
 1093879 1093880 HCH_01857 HCH_01858   arsC TRUE 0.879 30.000 0.112 0.042   NA
 1093880 1093881 HCH_01858 HCH_01859 arsC   FALSE 0.244 36.000 0.000 NA   NA
 1093882 1093883 HCH_01860 HCH_01861   dnaE1 FALSE 0.336 126.000 0.005 1.000 N NA
 1093883 1093884 HCH_01861 HCH_01862 dnaE1 accA TRUE 0.801 104.000 0.122 1.000 N NA
 1093884 1093885 HCH_01862 HCH_01863 accA   TRUE 0.902 -16.000 0.123 1.000 N NA
 1093887 1093888 HCH_01865 HCH_01866 pyrG kdsA TRUE 0.694 143.000 0.138 1.000 N NA
 1093888 1093889 HCH_01866 HCH_01867 kdsA eno TRUE 0.714 133.000 0.125 1.000 N NA
 1093889 1093890 HCH_01867 HCH_10053 eno   FALSE 0.007 442.000 0.000 NA   NA
 1093890 1093891 HCH_10053 HCH_10054     FALSE 0.145 114.000 0.000 NA   NA
 1093891 1093892 HCH_10054 HCH_10055     FALSE 0.231 49.000 0.000 NA   NA
 1093892 1093893 HCH_10055 HCH_10056     FALSE 0.014 318.000 0.000 NA   NA
 1093895 1093896 HCH_10057 HCH_01868     FALSE 0.012 341.000 0.000 NA   NA
 1093896 1093897 HCH_01868 HCH_01869   ispD TRUE 0.894 70.000 0.185 1.000 N NA
 1093897 1093898 HCH_01869 HCH_01870 ispD ispF TRUE 0.993 -3.000 0.419 1.000 Y NA
 1093898 1093899 HCH_01870 HCH_01871 ispF   TRUE 0.963 2.000 0.173 1.000   NA
 1093899 1093900 HCH_01871 HCH_01872   surE TRUE 0.867 109.000 0.235 1.000   NA
 1093900 1093901 HCH_01872 HCH_01874 surE pcm TRUE 0.954 24.000 0.353 1.000   NA
 1093901 1093902 HCH_01874 HCH_01875 pcm   TRUE 0.869 2.000 0.046 NA   NA
 1093902 1093903 HCH_01875 HCH_01876     FALSE 0.194 224.000 0.051 NA   NA
 1093903 1093904 HCH_01876 HCH_01877   rpoS TRUE 0.737 71.000 0.054 1.000 N NA
 1093904 1093905 HCH_01877 HCH_01878 rpoS   FALSE 0.068 259.000 0.014 NA   NA
 1093905 1093906 HCH_01878 HCH_01879     FALSE 0.005 552.000 0.000 NA   NA
 1093906 1093907 HCH_01879 HCH_01880     FALSE 0.034 270.000 0.000 1.000   NA
 1093908 1093909 HCH_01881 HCH_01882     FALSE 0.035 224.000 0.000 NA   NA
 1093909 1093910 HCH_01882 HCH_01883     FALSE 0.088 148.000 0.000 NA   NA
 1093910 1093911 HCH_01883 HCH_01884     FALSE 0.147 113.000 0.000 NA   NA
 1093913 1093914 HCH_01886 HCH_01887   nth FALSE 0.231 49.000 0.000 NA   NA
 1093914 1093915 HCH_01887 HCH_01888 nth rnfE TRUE 0.841 45.000 0.109 1.000 N NA
 1093915 1093916 HCH_01888 HCH_01889 rnfE rnfG TRUE 0.993 58.000 0.908 0.041 Y NA
 1093916 1093917 HCH_01889 HCH_01891 rnfG rnfD TRUE 0.998 10.000 0.924 0.041 Y NA
 1093917 1093918 HCH_01891 HCH_01892 rnfD rnfC TRUE 0.919 4.000 0.000 0.041 Y NA
 1093918 1093919 HCH_01892 HCH_01893 rnfC rnfB TRUE 0.852 18.000 0.000 0.015 Y NA
 1093919 1093920 HCH_01893 HCH_01895 rnfB rnfA TRUE 0.993 14.000 0.564 0.041 Y NA
 1093922 1093923 HCH_01897 HCH_01898 metG   FALSE 0.161 108.000 0.000 NA   NA
 1093924 1093925 HCH_01899 HCH_01900   dcd FALSE 0.292 263.000 0.112 1.000 N NA
 1093925 1093926 HCH_01900 HCH_01901 dcd   FALSE 0.369 93.000 0.000 1.000 N NA
 1093926 1093927 HCH_01901 HCH_01902     FALSE 0.212 77.000 0.000 NA   NA
 1093927 1093928 HCH_01902 HCH_01903   avtA FALSE 0.255 183.000 0.038 NA   NA
 1093929 1093930 HCH_01904 HCH_01905   purN TRUE 0.694 58.000 0.065 NA   NA
 1093930 1093931 HCH_01905 HCH_01906 purN purM TRUE 0.991 3.000 0.230 0.001 Y NA
 1093932 1093933 HCH_01907 HCH_01908     FALSE 0.261 174.000 0.034 NA   NA
 1093933 1093934 HCH_01908 HCH_01909     TRUE 0.704 37.000 0.045 NA N NA
 1093934 1093935 HCH_01909 HCH_01910     TRUE 0.503 100.000 0.020 NA N NA
 1093935 1093936 HCH_01910 HCH_01911     TRUE 0.606 60.000 0.036 NA   NA
 1093937 1093938 HCH_01912 HCH_01913     FALSE 0.224 57.000 0.000 NA   NA
 1093938 1093939 HCH_01913 HCH_01914   ligT FALSE 0.326 60.000 0.000 1.000   NA
 1093939 1093940 HCH_01914 HCH_01915 ligT   FALSE 0.366 13.000 0.000 NA   NA
 1093940 1093941 HCH_01915 HCH_01916     FALSE 0.266 26.000 0.000 NA   NA
 1093941 1093942 HCH_01916 HCH_01917   nadC FALSE 0.112 197.000 0.000 1.000 N NA
 1093942 1093943 HCH_01917 HCH_01918 nadC   TRUE 0.717 11.000 0.011 1.000   NA
 1093944 1093945 HCH_01919 HCH_01921     FALSE 0.297 178.000 0.048 NA   NA
 1093945 1093946 HCH_01921 HCH_01922     TRUE 0.987 5.000 0.249 1.000 Y NA
 1093949 1093950 HCH_01926 HCH_01927   panE2 TRUE 0.520 30.000 0.008 1.000   NA
 1093950 1093951 HCH_01927 HCH_01928 panE2 valS TRUE 0.509 49.000 0.003 1.000 N NA
 1093951 1093952 HCH_01928 HCH_01929 valS   FALSE 0.026 251.000 0.000 NA   NA
 1093952 1093953 HCH_01929 HCH_01930   holC FALSE 0.087 149.000 0.000 NA   NA
 1093953 1093954 HCH_01930 HCH_01931 holC   TRUE 0.953 95.000 0.494 1.000 N NA
 1093955 1093956 HCH_01932 HCH_01933     TRUE 0.468 6.000 0.000 NA   NA
 1093956 1093957 HCH_01933 HCH_01934     TRUE 0.987 -13.000 0.631 0.048   NA
 1093957 1093958 HCH_01934 HCH_01935     FALSE 0.071 205.000 0.000 1.000   NA
 1093960 1093961 HCH_01937 HCH_01939     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 1093963 1093964 HCH_01940 HCH_01941     FALSE 0.211 78.000 0.000 NA   NA
 1093970 1093971 HCH_01947 HCH_01948 aruC aruF TRUE 0.700 63.000 0.000 1.000 Y NA
 1093971 1093972 HCH_01948 HCH_01949 aruF aruG TRUE 0.994 64.000 0.833 0.000 Y NA
 1093972 1093973 HCH_01949 HCH_01950 aruG aruD TRUE 0.954 -3.000 0.128 1.000 N NA
 1093973 1093974 HCH_01950 HCH_01951 aruD astB TRUE 0.939 55.000 0.306 1.000 N NA
 1093974 1093975 HCH_01951 HCH_01952 astB   FALSE 0.127 185.000 0.000 1.000 N NA
 1093975 1093976 HCH_01952 HCH_01953     TRUE 0.911 -6.000 0.016 1.000 Y NA
 1093976 1093977 HCH_01953 HCH_01954     FALSE 0.415 81.000 0.011 NA   NA
 1093977 1093978 HCH_01954 HCH_01955     FALSE 0.016 299.000 0.000 NA   NA
 1093978 1093979 HCH_01955 HCH_01956   pbpC TRUE 0.993 -3.000 0.711 1.000   NA
 1093979 1093980 HCH_01956 HCH_01957 pbpC   FALSE 0.084 192.000 0.000 1.000   NA
 1093980 1093981 HCH_01957 HCH_01958     FALSE 0.316 74.000 0.000 1.000   NA
 1093982 1093983 HCH_01959 HCH_01960     FALSE 0.250 -31.000 0.000 NA   NA
 1093984 1093985 HCH_01961 HCH_01962     TRUE 0.938 -3.000 0.107 1.000   NA
 1093985 1093986 HCH_01962 HCH_01963     TRUE 0.812 2.000 0.000 0.005   NA
 1093986 1093987 HCH_01963 HCH_01964     FALSE 0.364 31.000 0.000 1.000   NA
 1093987 1093988 HCH_01964 HCH_01966     FALSE 0.085 151.000 0.000 NA   NA
 1093990 1093991 HCH_01967 HCH_01968     FALSE 0.233 45.000 0.000 NA   NA
 1093991 1093992 HCH_01968 HCH_01969     FALSE 0.036 223.000 0.000 NA   NA
 1093992 1093993 HCH_01969 HCH_01970     FALSE 0.290 21.000 0.000 NA   NA
 1093993 1093994 HCH_01970 HCH_01971     TRUE 0.491 4.000 0.000 NA   NA
 1093996 1093997 HCH_01973 HCH_01974     FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1093997 1093998 HCH_01974 HCH_01975     FALSE 0.101 138.000 0.000 NA   NA
 1093998 1093999 HCH_01975 HCH_01976     FALSE 0.004 751.000 0.000 NA   NA
 1094004 1094005 HCH_01981 HCH_01982     TRUE 0.926 -13.000 0.154 1.000 N NA
 1094005 1094006 HCH_01982 HCH_01983     FALSE 0.221 69.000 0.000 NA   NA
 1094007 1094008 HCH_01984 HCH_01985     FALSE 0.005 527.000 0.000 NA   NA
 1094008 1094009 HCH_01985 HCH_01986     TRUE 0.932 6.000 0.131 NA   NA
 1094010 1094011 HCH_01987 HCH_10007     TRUE 0.478 5.000 0.000 NA   NA
 1094011 1094012 HCH_10007 HCH_01988     TRUE 0.980 -7.000 0.500 NA   NA
 1094013 1094014 HCH_01989 HCH_01990     FALSE 0.196 92.000 0.000 NA   NA
 1094014 1094015 HCH_01990 HCH_01992     FALSE 0.187 97.000 0.000 NA   NA
 1094017 1094018 HCH_01993 HCH_01994     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1094018 1094019 HCH_01994 HCH_01995     FALSE 0.297 20.000 0.000 NA   NA
 1094019 1094020 HCH_01995 HCH_01996     FALSE 0.053 189.000 0.000 NA   NA
 1094020 1094021 HCH_01996 HCH_01997     TRUE 0.969 77.000 0.700 NA   NA
 1094021 1094022 HCH_01997 HCH_01998     FALSE 0.015 312.000 0.000 NA   NA
 1094022 1094023 HCH_01998 HCH_01999     FALSE 0.240 -37.000 0.000 NA   NA
 1094025 1094026 HCH_02001 HCH_02002     TRUE 0.941 -3.000 0.095 1.000 N NA
 1094026 1094027 HCH_02002 HCH_02003     FALSE 0.073 165.000 0.000 NA   NA
 1094028 1094029 HCH_02004 HCH_02005     TRUE 0.536 103.000 0.029 1.000   NA
 1094029 1094030 HCH_02005 HCH_02006   uvrD FALSE 0.333 136.000 0.000 0.050 N NA
 1094031 1094032 HCH_02007 HCH_02008     FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1094032 1094033 HCH_02008 HCH_02009     TRUE 0.444 9.000 0.000 NA   NA
 1094036 1094037 HCH_02012 HCH_02013   mutM2 FALSE 0.098 140.000 0.000 NA   NA
 1094038 1094039 HCH_02014 HCH_02015     TRUE 0.802 33.000 0.000 0.026 Y NA
 1094039 1094040 HCH_02015 HCH_02016     FALSE 0.036 267.000 0.000 1.000   NA
 1094040 1094041 HCH_02016 HCH_02017     FALSE 0.017 293.000 0.000 NA   NA
 1094041 1094042 HCH_02017 HCH_02018     FALSE 0.210 79.000 0.000 NA   NA
 1094044 1094045 HCH_02020 HCH_02021     FALSE 0.115 130.000 0.000 NA   NA
 1094047 1094048 HCH_02023 HCH_02024     FALSE 0.297 20.000 0.000 NA   NA
 1094050 1094051 HCH_02026 HCH_02027     FALSE 0.017 294.000 0.000 NA   NA
 1094051 1094052 HCH_02027 HCH_02028     TRUE 0.905 190.000 0.500 1.000 Y NA
 1094052 1094053 HCH_02028 HCH_02029     TRUE 0.973 64.000 0.300 0.063 Y NA
 1094053 1094054 HCH_02029 HCH_02030     TRUE 0.994 5.000 0.400 0.005 Y NA
 1094054 1094055 HCH_02030 HCH_02031     TRUE 0.982 20.000 0.286 0.005 Y NA
 1094055 1094056 HCH_02031 HCH_02032     FALSE 0.389 82.000 0.000 1.000 N NA
 1094056 1094057 HCH_02032 HCH_02033   azlC FALSE 0.326 56.000 0.000 NA N NA
 1094057 1094058 HCH_02033 HCH_02035 azlC   TRUE 0.516 2.000 0.000 NA   NA
 1094060 1094061 HCH_02036 HCH_02037     FALSE 0.124 125.000 0.000 NA   NA
 1094061 1094062 HCH_02037 HCH_02038     FALSE 0.022 265.000 0.000 NA   NA
 1094062 1094063 HCH_02038 HCH_02039     FALSE 0.218 72.000 0.000 NA   NA
 1094064 1094065 HCH_02040 HCH_02042 cdsA   FALSE 0.205 85.000 0.000 NA   NA
 1094065 1094066 HCH_02042 HCH_02044     TRUE 0.989 117.000 0.911 0.005 Y NA
 1094066 1094067 HCH_02044 HCH_02045     TRUE 0.468 6.000 0.000 NA   NA
 1094068 1094069 HCH_02047 HCH_02048 tag   FALSE 0.421 51.000 0.000 1.000 N NA
 1094069 1094070 HCH_02048 HCH_02049     TRUE 0.574 9.000 0.000 1.000   NA
 1094070 1094071 HCH_02049 HCH_02050     FALSE 0.078 157.000 0.000 NA   NA
 1094072 1094073 HCH_02051 HCH_02052     TRUE 0.989 -3.000 0.500 1.000 N NA
 1094075 1094076 HCH_02054 HCH_02055     FALSE 0.213 139.000 0.000 1.000 N NA
 1094076 1094077 HCH_02055 HCH_02056     FALSE 0.010 375.000 0.000 NA   NA
 1094080 1094081 HCH_02059 HCH_02060     FALSE 0.008 423.000 0.000 NA   NA
 1094081 1094082 HCH_02060 HCH_02061   rluA1 FALSE 0.074 164.000 0.000 NA   NA
 1094086 1094087 HCH_02065 HCH_02066     FALSE 0.250 -31.000 0.000 NA   NA
 1094087 1094088 HCH_02066 HCH_02067     TRUE 0.798 159.000 0.348 NA   NA
 1094094 1094095 HCH_02073 HCH_02074     FALSE 0.333 16.000 0.000 NA   NA
 1094095 1094096 HCH_02074 HCH_02075     FALSE 0.014 322.000 0.000 NA   NA
 1094096 1094097 HCH_02075 HCH_02076     FALSE 0.266 26.000 0.000 NA   NA
 1094097 1094098 HCH_02076 HCH_02077     FALSE 0.042 208.000 0.000 NA   NA
 1094099 1094100 HCH_02078 HCH_02079     FALSE 0.174 103.000 0.000 NA   NA
 1094101 1094102 HCH_02080 HCH_02081     FALSE 0.014 320.000 0.000 NA   NA
 1094104 1094105 HCH_02083 HCH_02084     FALSE 0.223 66.000 0.000 NA   NA
 1094105 1094106 HCH_02084 HCH_02086     FALSE 0.012 338.000 0.000 NA   NA
 1094106 1094107 HCH_02086 HCH_02087     TRUE 0.526 0.000 0.000 NA   NA
 1094107 1094108 HCH_02087 HCH_02088     FALSE 0.251 32.000 0.000 NA   NA
 1094110 1094111 HCH_02090 HCH_02091     FALSE 0.065 174.000 0.000 NA   NA
 1094115 1094116 HCH_02095 HCH_02096     FALSE 0.194 93.000 0.000 NA   NA
 1094116 1094117 HCH_02096 HCH_02097     FALSE 0.008 419.000 0.000 NA   NA
 1094117 1094118 HCH_02097 HCH_02098     FALSE 0.044 205.000 0.000 NA   NA
 1094118 1094119 HCH_02098 HCH_02100     FALSE 0.016 302.000 0.000 NA   NA
 1094120 1094121 HCH_02101 HCH_02102     FALSE 0.023 263.000 0.000 NA   NA
 1094121 1094122 HCH_02102 HCH_02103     TRUE 0.534 70.000 0.000 0.005   NA
 1094122 1094123 HCH_02103 HCH_02104     FALSE 0.006 499.000 0.000 NA   NA
 1094123 1094124 HCH_02104 HCH_02105     FALSE 0.083 153.000 0.000 NA   NA
 1094125 1094126 HCH_02106 HCH_02107     FALSE 0.259 -28.000 0.000 NA   NA
 1094126 1094127 HCH_02107 HCH_02108     FALSE 0.038 220.000 0.000 NA   NA
 1094127 1094128 HCH_02108 HCH_02109     FALSE 0.064 175.000 0.000 NA   NA
 1094128 1094129 HCH_02109 HCH_02110     TRUE 0.549 16.000 0.000 1.000 N NA
 1094129 1094130 HCH_02110 HCH_02111   gltX FALSE 0.243 129.000 0.000 1.000 N NA
 1094130 1094131 HCH_02111 HCH_10058 gltX   FALSE 0.222 68.000 0.000 NA   NA
 1094131 1094132 HCH_10058 HCH_10059     TRUE 0.444 9.000 0.000 NA   NA
 1094134 1094135 HCH_02113 HCH_02114     FALSE 0.004 1002.000 0.000 NA   NA
 1094136 1094137 HCH_02115 HCH_02116     FALSE 0.030 239.000 0.000 NA   NA
 1094137 1094138 HCH_02116 HCH_02117     TRUE 0.968 64.000 0.600 1.000   NA
 1094141 1094142 HCH_02120 HCH_02121 mgsA   FALSE 0.073 203.000 0.000 1.000   NA
 1094144 1094145 HCH_02123 HCH_02124 ppsA   TRUE 0.525 116.000 0.000 NA Y NA
 1094145 1094146 HCH_02124 HCH_02125   menG FALSE 0.288 92.000 0.000 NA N NA
 1094147 1094148 HCH_02126 HCH_02127     FALSE 0.006 502.000 0.000 NA   NA
 1094148 1094149 HCH_02127 HCH_02128     FALSE 0.037 335.000 0.014 NA   NA
 1094149 1094150 HCH_02128 HCH_02129     FALSE 0.279 174.000 0.038 NA   NA
 1094150 1094151 HCH_02129 HCH_02130   ispZ TRUE 0.897 48.000 0.224 NA   NA
 1094152 1094153 HCH_02131 HCH_02132     TRUE 0.539 11.000 0.000 1.000   NA
 1094154 1094155 HCH_02133 HCH_02134     FALSE 0.261 28.000 0.000 NA   NA
 1094155 1094156 HCH_02134 HCH_02135   rne FALSE 0.229 52.000 0.000 NA   NA
 1094157 1094158 HCH_02136 HCH_02137 rluC   TRUE 0.972 13.000 0.389 1.000   NA
 1094158 1094159 HCH_02137 HCH_02138     TRUE 0.842 61.000 0.134 1.000   NA
 1094161 1094162 HCH_02140 HCH_02141     FALSE 0.226 55.000 0.000 NA   NA
 1094162 1094163 HCH_02141 HCH_10002   rpmF TRUE 0.965 49.000 0.599 NA   NA
 1094163 1094164 HCH_10002 HCH_02142 rpmF plsX TRUE 0.472 342.000 0.418 1.000 N NA
 1094164 1094165 HCH_02142 HCH_02143 plsX fabD TRUE 0.935 73.000 0.106 0.003 Y NA
 1094165 1094166 HCH_02143 HCH_02144 fabD fabG TRUE 0.993 11.000 0.432 0.003 Y NA
 1094166 1094167 HCH_02144 HCH_02145 fabG acpP TRUE 0.962 114.000 0.321 0.003 Y NA
 1094167 1094168 HCH_02145 HCH_02146 acpP pabC TRUE 0.481 99.000 0.008 1.000 N NA
 1094168 1094169 HCH_02146 HCH_02147 pabC   TRUE 0.964 2.000 0.204 NA   NA
 1094169 1094170 HCH_02147 HCH_02148   tmk TRUE 0.884 64.000 0.209 NA   NA
 1094173 1094174 HCH_02151 HCH_02152 lpxH ppiB TRUE 0.971 4.000 0.237 1.000   NA
 1094175 1094176 HCH_02153 HCH_02154 glnS cysS TRUE 0.873 54.000 0.032 0.035 Y NA
 1094178 1094179 HCH_02156 HCH_10060     FALSE 0.145 114.000 0.000 NA   NA
 1094179 1094180 HCH_10060 HCH_10061     FALSE 0.223 61.000 0.000 NA   NA
 1094180 1094181 HCH_10061 HCH_10062     FALSE 0.237 40.000 0.000 NA   NA
 1094181 1094182 HCH_10062 HCH_10063     FALSE 0.221 69.000 0.000 NA   NA
 1094182 1094183 HCH_10063 HCH_02157   tig FALSE 0.132 120.000 0.000 NA   NA
 1094183 1094184 HCH_02157 HCH_02158 tig clpP1 TRUE 0.956 109.000 0.351 1.000 Y NA
 1094184 1094185 HCH_02158 HCH_02160 clpP1 clpX TRUE 0.969 78.000 0.352 1.000 Y NA
 1094185 1094186 HCH_02160 HCH_02161 clpX   FALSE 0.242 37.000 0.000 NA   NA
 1094186 1094187 HCH_02161 HCH_02162   lon2 FALSE 0.223 59.000 0.000 NA   NA
 1094187 1094188 HCH_02162 HCH_02163 lon2   FALSE 0.170 199.000 0.008 1.000 N NA
 1094188 1094189 HCH_02163 HCH_10064     FALSE 0.234 43.000 0.000 NA   NA
 1094189 1094190 HCH_10064 HCH_02164     FALSE 0.208 81.000 0.000 NA   NA
 1094190 1094191 HCH_02164 HCH_02165     FALSE 0.023 321.000 0.000 1.000   NA
 1094191 1094192 HCH_02165 HCH_02166     TRUE 0.933 64.000 0.357 NA   NA
 1094192 1094193 HCH_02166 HCH_02167     TRUE 0.967 31.000 0.571 NA   NA
 1094193 1094194 HCH_02167 HCH_02168     TRUE 0.979 3.000 0.308 1.000   NA
 1094195 1094196 HCH_02169 HCH_02170     TRUE 0.913 -3.000 0.069 1.000   NA
 1094199 1094200 HCH_02174 HCH_02175     FALSE 0.232 48.000 0.000 NA   NA
 1094200 1094201 HCH_02175 HCH_02176     FALSE 0.156 110.000 0.000 NA   NA
 1094201 1094202 HCH_02176 HCH_02177     FALSE 0.032 231.000 0.000 NA   NA
 1094202 1094203 HCH_02177 HCH_02178     TRUE 0.908 76.000 0.218 1.000 N NA
 1094203 1094204 HCH_02178 HCH_02179     FALSE 0.205 142.000 0.000 1.000 N NA
 1094204 1094205 HCH_02179 HCH_02180     FALSE 0.061 179.000 0.000 NA   NA
 1094205 1094206 HCH_02180 HCH_02181     FALSE 0.010 376.000 0.000 NA   NA
 1094206 1094207 HCH_02181 HCH_02182     FALSE 0.074 164.000 0.000 NA   NA
 1094208 1094209 HCH_02183 HCH_02184   prc FALSE 0.189 173.000 0.008 1.000   NA
 1094209 1094210 HCH_02184 HCH_02185 prc fadB FALSE 0.018 437.000 0.000 1.000 N NA
 1094210 1094211 HCH_02185 HCH_02186 fadB   TRUE 0.985 47.000 0.600 1.000 Y NA
 1094220 1094221 HCH_02196 HCH_02197     TRUE 0.907 7.000 0.078 1.000   NA
 1094221 1094222 HCH_02197 HCH_02198     TRUE 0.867 7.000 0.062 NA   NA
 1094222 1094223 HCH_02198 HCH_02199   purT TRUE 0.861 32.000 0.154 NA   NA
 1094223 1094224 HCH_02199 HCH_10065 purT   FALSE 0.008 419.000 0.000 NA   NA
 1094224 1094225 HCH_10065 HCH_10066     FALSE 0.145 114.000 0.000 NA   NA
 1094225 1094226 HCH_10066 HCH_10067     FALSE 0.231 49.000 0.000 NA   NA
 1094226 1094227 HCH_10067 HCH_10068     FALSE 0.014 318.000 0.000 NA   NA
 1094230 1094231 HCH_02200 HCH_02201 dnaE2   TRUE 0.989 16.000 0.864 1.000   NA
 1094231 1094232 HCH_02201 HCH_02202     TRUE 0.603 131.000 0.100 NA   NA
 1094236 1094237 HCH_02206 HCH_02207 potD   TRUE 0.942 -3.000 0.010 0.059 Y NA
 1094237 1094238 HCH_02207 HCH_02208     TRUE 0.982 -16.000 0.286 0.059 Y NA
 1094238 1094239 HCH_02208 HCH_02209     TRUE 0.997 2.000 0.789 1.000 Y NA
 1094241 1094242 HCH_02211 HCH_02212     TRUE 0.994 61.000 0.948 0.005 Y NA
 1094244 1094245 HCH_02214 HCH_02215     FALSE 0.264 27.000 0.000 NA   NA
 1094245 1094246 HCH_02215 HCH_02216     FALSE 0.259 -28.000 0.000 NA   NA
 1094246 1094247 HCH_02216 HCH_02217     TRUE 0.588 28.000 0.000 0.097 N NA
 1094248 1094249 HCH_02219 HCH_02220     TRUE 0.712 0.000 0.007 NA   NA
 1094250 1094251 HCH_02221 HCH_02222     FALSE 0.222 68.000 0.000 NA   NA
 1094252 1094253 HCH_02223 HCH_02224   rsmC TRUE 0.630 -3.000 0.000 1.000   NA
 1094253 1094254 HCH_02224 HCH_02226 rsmC rluA2 TRUE 0.806 -13.000 0.000 1.000 Y NA
 1094258 1094259 HCH_02229 HCH_10008     FALSE 0.030 339.000 0.000 1.000 N NA
 1094259 1094260 HCH_10008 HCH_02231     TRUE 0.966 -10.000 0.155 1.000 Y NA
 1094260 1094261 HCH_02231 HCH_02233     FALSE 0.038 587.000 0.000 1.000 Y NA
 1094261 1094262 HCH_02233 HCH_02234     TRUE 0.892 -3.000 0.000 1.000 Y NA
 1094262 1094263 HCH_02234 HCH_02235     TRUE 0.649 74.000 0.000 NA Y NA
 1094263 1094264 HCH_02235 HCH_02236     FALSE 0.244 36.000 0.000 NA   NA
 1094265 1094266 HCH_02237 HCH_02238     TRUE 0.977 -3.000 0.315 NA   NA
 1094269 1094270 HCH_02241 HCH_02242     TRUE 0.444 9.000 0.000 NA   NA
 1094270 1094271 HCH_02242 HCH_02243   msrA FALSE 0.214 75.000 0.000 NA   NA
 1094271 1094272 HCH_02243 HCH_02245 msrA   FALSE 0.242 37.000 0.000 NA   NA
 1094273 1094274 HCH_02244 HCH_02246     FALSE 0.256 30.000 0.000 NA   NA
 1094275 1094276 HCH_02247 HCH_02248     FALSE 0.014 319.000 0.000 NA   NA
 1094276 1094277 HCH_02248 HCH_02249     FALSE 0.253 31.000 0.000 NA   NA
 1094277 1094278 HCH_02249 HCH_02250     FALSE 0.366 13.000 0.000 NA   NA
 1094280 1094281 HCH_02252 HCH_02253     FALSE 0.213 76.000 0.000 NA   NA
 1094285 1094286 HCH_02257 HCH_02258     FALSE 0.030 239.000 0.000 NA   NA
 1094288 1094289 HCH_02260 HCH_02261     TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1094289 1094290 HCH_02261 HCH_02262     FALSE 0.156 110.000 0.000 NA   NA
 1094290 1094291 HCH_02262 HCH_02263     FALSE 0.007 461.000 0.000 NA   NA
 1094294 1094295 HCH_02266 HCH_02267 hemN2   TRUE 0.683 77.000 0.051 1.000   NA
 1094295 1094296 HCH_02267 HCH_02268   ccoS TRUE 0.959 -7.000 0.266 NA   NA
 1094296 1094297 HCH_02268 HCH_02269 ccoS   TRUE 0.995 10.000 0.713 NA Y NA
 1094297 1094298 HCH_02269 HCH_02271     TRUE 0.943 -7.000 0.197 NA   NA
 1094298 1094299 HCH_02271 HCH_02272     TRUE 0.931 0.000 0.101 NA   NA
 1094299 1094300 HCH_02272 HCH_02273   ccoP TRUE 0.692 111.000 0.000 0.015 Y NA
 1094300 1094301 HCH_02273 HCH_02274 ccoP ccoQ TRUE 0.943 -7.000 0.111 0.001   NA
 1094301 1094302 HCH_02274 HCH_02275 ccoQ ccoO TRUE 0.962 6.000 0.133 0.001   NA
 1094302 1094303 HCH_02275 HCH_02276 ccoO ccoN TRUE 0.954 20.000 0.200 0.001 N NA
 1094304 1094305 HCH_02277 HCH_02278     FALSE 0.217 73.000 0.000 NA   NA
 1094308 1094309 HCH_02281 HCH_02282   dsbD TRUE 0.486 45.000 0.000 0.097   NA
 1094311 1094312 HCH_02283 HCH_02286 mcrC mcrB TRUE 0.993 0.000 0.759 NA   NA
 1094312 1094313 HCH_02286 HCH_02288 mcrB   FALSE 0.270 25.000 0.000 NA   NA
 1094314 1094315 HCH_02289 HCH_02290     FALSE 0.242 37.000 0.000 NA   NA
 1094315 1094316 HCH_02290 HCH_02291   rhlB FALSE 0.191 94.000 0.000 NA   NA
 1094316 1094317 HCH_02291 HCH_02292 rhlB   TRUE 0.704 31.000 0.031 1.000 N NA
 1094319 1094320 HCH_02294 HCH_02295     FALSE 0.244 36.000 0.000 NA   NA
 1094321 1094322 HCH_02296 HCH_02297     FALSE 0.027 249.000 0.000 NA   NA
 1094322 1094323 HCH_02297 HCH_02298     FALSE 0.071 168.000 0.000 NA   NA
 1094325 1094326 HCH_02300 HCH_02301     TRUE 0.590 73.000 0.036 NA   NA
 1094327 1094328 HCH_02302 HCH_02303     TRUE 0.676 30.000 0.024 1.000 N NA
 1094328 1094329 HCH_02303 HCH_02304     FALSE 0.353 157.000 0.026 1.000 N NA
 1094329 1094330 HCH_02304 HCH_02305     TRUE 0.985 -3.000 0.364 1.000 N NA
 1094331 1094332 HCH_02306 HCH_02307     FALSE 0.181 100.000 0.000 NA   NA
 1094332 1094333 HCH_02307 HCH_02308   sixA1 FALSE 0.127 123.000 0.000 NA   NA
 1094334 1094335 HCH_02309 HCH_02310     TRUE 0.748 241.000 0.586 1.000   NA
 1094335 1094336 HCH_02310 HCH_02311     TRUE 0.967 0.000 0.184 1.000   NA
 1094336 1094337 HCH_02311 HCH_02312     TRUE 0.994 -3.000 0.720 0.058   NA
 1094337 1094338 HCH_02312 HCH_02313     FALSE 0.307 81.000 0.000 1.000   NA
 1094338 1094339 HCH_02313 HCH_02314     TRUE 0.616 4.000 0.000 NA N NA
 1094339 1094340 HCH_02314 HCH_02315     FALSE 0.092 316.000 0.000 NA Y NA
 1094343 1094344 HCH_02318 HCH_02319     FALSE 0.238 -39.000 0.000 NA   NA
 1094345 1094346 HCH_02320 HCH_02321     FALSE 0.306 19.000 0.000 NA   NA
 1094346 1094347 HCH_02321 HCH_02322     FALSE 0.209 80.000 0.000 NA   NA
 1094350 1094351 HCH_02325 HCH_02326     FALSE 0.264 27.000 0.000 NA   NA
 1094351 1094352 HCH_02326 HCH_02327     FALSE 0.366 13.000 0.000 NA   NA
 1094354 1094355 HCH_02329 HCH_02330     TRUE 0.795 -13.000 0.061 NA   NA
 1094355 1094356 HCH_02330 HCH_02331   purB TRUE 0.784 8.000 0.029 NA   NA
 1094356 1094357 HCH_02331 HCH_02332 purB   TRUE 0.851 16.000 0.093 NA   NA
 1094357 1094358 HCH_02332 HCH_02333   trmU TRUE 0.922 14.000 0.180 NA   NA
 1094358 1094359 HCH_02333 HCH_02334 trmU mutT TRUE 0.755 133.000 0.158 1.000 N NA
 1094359 1094360 HCH_02334 HCH_02335 mutT rsuA TRUE 0.919 23.000 0.182 1.000 N NA
 1094363 1094364 HCH_02338 HCH_02339 clpS   TRUE 0.976 19.000 0.596 NA   NA
 1094367 1094368 HCH_02342 HCH_02343   aat TRUE 0.989 3.000 0.285 1.000 Y NA
 1094368 1094369 HCH_02343 HCH_02344 aat trxB1 TRUE 0.805 105.000 0.046 1.000 Y NA
 1094369 1094370 HCH_02344 HCH_02345 trxB1 moxR FALSE 0.141 184.000 0.004 1.000   NA
 1094370 1094371 HCH_02345 HCH_02346 moxR   FALSE 0.171 133.000 0.000 1.000   NA
 1094371 1094372 HCH_02346 HCH_02347     TRUE 0.526 0.000 0.000 NA   NA
 1094372 1094373 HCH_02347 HCH_02348     TRUE 0.822 39.000 0.123 NA   NA
 1094373 1094374 HCH_02348 HCH_02349     TRUE 0.870 133.000 0.407 NA   NA
 1094375 1094376 HCH_02350 HCH_02351     TRUE 0.988 -7.000 0.620 1.000 N NA
 1094377 1094378 HCH_02352 HCH_02353 tal1   TRUE 0.747 28.000 0.039 1.000 N NA
 1094378 1094379 HCH_02353 HCH_02354     FALSE 0.018 289.000 0.000 NA   NA
 1094379 1094380 HCH_02354 HCH_02355     TRUE 0.905 87.000 0.286 NA   NA
 1094381 1094382 HCH_02357 HCH_02358     FALSE 0.009 403.000 0.000 NA   NA
 1094382 1094383 HCH_02358 HCH_02360     FALSE 0.223 63.000 0.000 NA   NA
 1094383 1094384 HCH_02360 HCH_02361     TRUE 0.444 9.000 0.000 NA   NA
 1094385 1094386 HCH_02362 HCH_02363     FALSE 0.253 31.000 0.000 NA   NA
 1094390 1094391 HCH_02368 HCH_02369     FALSE 0.019 278.000 0.000 NA   NA
 1094392 1094393 HCH_02370 HCH_02371     FALSE 0.134 119.000 0.000 NA   NA
 1094393 1094394 HCH_02371 HCH_02372     FALSE 0.022 267.000 0.000 NA   NA
 1094394 1094395 HCH_02372 HCH_02373   clpP2 FALSE 0.118 128.000 0.000 NA   NA
 1094395 1094396 HCH_02373 HCH_02374 clpP2   FALSE 0.006 486.000 0.000 NA   NA
 1094397 1094398 HCH_02375 HCH_02376 comEA   FALSE 0.258 29.000 0.000 NA   NA
 1094399 1094400 HCH_02377 HCH_02378     FALSE 0.035 225.000 0.000 NA   NA
 1094400 1094401 HCH_02378 HCH_02380     FALSE 0.221 69.000 0.000 NA   NA
 1094401 1094402 HCH_02380 HCH_02381     TRUE 0.927 124.000 0.219 0.096 Y NA
 1094402 1094403 HCH_02381 HCH_02383   asnB2 FALSE 0.321 107.000 0.000 1.000 N NA
 1094403 1094404 HCH_02383 HCH_02385 asnB2   FALSE 0.418 -19.000 0.000 1.000   NA
 1094404 1094405 HCH_02385 HCH_02386     TRUE 0.478 5.000 0.000 NA   NA
 1094405 1094406 HCH_02386 HCH_02387     TRUE 0.526 0.000 0.000 NA   NA
 1094406 1094407 HCH_02387 HCH_02388     FALSE 0.357 34.000 0.000 1.000   NA
 1094407 1094408 HCH_02388 HCH_02390     TRUE 0.505 3.000 0.000 NA   NA
 1094408 1094409 HCH_02390 HCH_02393     FALSE 0.409 11.000 0.000 NA   NA
 1094409 1094410 HCH_02393 HCH_02394     TRUE 0.794 -10.000 0.000 NA Y NA
 1094410 1094411 HCH_02394 HCH_02395     FALSE 0.405 -7.000 0.000 NA   NA
 1094411 1094412 HCH_02395 HCH_02396     FALSE 0.041 255.000 0.000 1.000   NA
 1094412 1094413 HCH_02396 HCH_02398   asnB3 FALSE 0.411 61.000 0.000 1.000 N NA
 1094413 1094414 HCH_02398 HCH_02399 asnB3 asnB4 TRUE 0.882 52.000 0.028 0.001 Y NA
 1094414 1094415 HCH_02399 HCH_02400 asnB4   TRUE 0.862 13.000 0.061 1.000 N NA
 1094415 1094416 HCH_02400 HCH_02401     FALSE 0.077 374.000 0.000 1.000 Y NA
 1094416 1094417 HCH_02401 HCH_02402     TRUE 0.590 112.000 0.000 1.000 Y NA
 1094417 1094418 HCH_02402 HCH_02403   fabH FALSE 0.084 223.000 0.000 1.000 N NA
 1094418 1094419 HCH_02403 HCH_02404 fabH rfe FALSE 0.166 162.000 0.000 1.000 N NA
 1094419 1094420 HCH_02404 HCH_02405 rfe   FALSE 0.074 380.000 0.000 1.000 Y NA
 1094420 1094421 HCH_02405 HCH_02406   rfbB TRUE 0.643 127.000 0.000 0.004 Y NA
 1094421 1094422 HCH_02406 HCH_02408 rfbB rfbA TRUE 0.774 84.000 0.000 0.004 Y NA
 1094422 1094423 HCH_02408 HCH_02409 rfbA rfbC TRUE 0.987 12.000 0.375 1.000 Y NA
 1094423 1094424 HCH_02409 HCH_02410 rfbC rfbD TRUE 0.901 0.000 0.000 1.000 Y NA
 1094424 1094425 HCH_02410 HCH_02411 rfbD   FALSE 0.111 132.000 0.000 NA   NA
 1094425 1094426 HCH_02411 HCH_02412     FALSE 0.270 25.000 0.000 NA   NA
 1094428 1094429 HCH_02415 HCH_02416 pilZ tatD TRUE 0.765 88.000 0.089 NA N NA
 1094429 1094430 HCH_02416 HCH_02417 tatD   TRUE 0.444 9.000 0.000 NA   NA
 1094430 1094431 HCH_02417 HCH_02418     TRUE 0.828 29.000 0.118 NA   NA
 1094431 1094432 HCH_02418 HCH_02419     TRUE 0.559 35.000 0.024 NA   NA
 1094432 1094433 HCH_02419 HCH_02420     TRUE 0.529 54.000 0.013 1.000   NA
 1094433 1094434 HCH_02420 HCH_02421   aroC TRUE 0.808 49.000 0.081 1.000 N NA
 1094434 1094435 HCH_02421 HCH_02422 aroC   FALSE 0.180 237.000 0.055 NA   NA
 1094435 1094436 HCH_02422 HCH_02424     FALSE 0.010 384.000 0.000 NA   NA
 1094436 1094437 HCH_02424 HCH_02425     TRUE 0.731 135.000 0.187 NA   NA
 1094439 1094440 HCH_02427 HCH_02428   leuC FALSE 0.297 20.000 0.000 NA   NA
 1094440 1094441 HCH_02428 HCH_02429 leuC leuD TRUE 0.993 12.000 0.463 0.000 Y NA
 1094441 1094442 HCH_02429 HCH_02430 leuD leuB TRUE 0.956 59.000 0.159 0.001 Y NA
 1094442 1094443 HCH_02430 HCH_02431 leuB asd TRUE 0.942 106.000 0.196 0.034 Y NA
 1094443 1094444 HCH_02431 HCH_02433 asd   FALSE 0.022 544.000 0.010 1.000 N NA
 1094444 1094445 HCH_02433 HCH_02434   truA TRUE 0.697 48.000 0.035 1.000 N NA
 1094445 1094446 HCH_02434 HCH_02435 truA trpF TRUE 0.746 128.000 0.139 1.000 N NA
 1094446 1094447 HCH_02435 HCH_02436 trpF trpB1 TRUE 0.985 -28.000 0.375 0.001 Y NA
 1094447 1094448 HCH_02436 HCH_02437 trpB1 trpA1 TRUE 0.990 13.000 0.344 0.001 Y NA
 1094448 1094449 HCH_02437 HCH_02438 trpA1 accD TRUE 0.941 21.000 0.232 1.000 N NA
 1094449 1094450 HCH_02438 HCH_02439 accD folC TRUE 0.953 46.000 0.383 1.000 N NA
 1094450 1094451 HCH_02439 HCH_02440 folC dedD TRUE 0.880 78.000 0.216 NA   NA
 1094451 1094452 HCH_02440 HCH_02441 dedD   TRUE 0.752 99.000 0.116 NA   NA
 1094452 1094453 HCH_02441 HCH_02442   purF TRUE 0.922 45.000 0.262 1.000   NA
 1094453 1094454 HCH_02442 HCH_02443 purF metZ TRUE 0.532 202.000 0.153 1.000 N NA
 1094454 1094455 HCH_02443 HCH_02444 metZ   TRUE 0.503 -3.000 0.000 NA   NA
 1094455 1094456 HCH_02444 HCH_02445   ftsK FALSE 0.100 139.000 0.000 NA   NA
 1094456 1094457 HCH_02445 HCH_02446 ftsK lolA TRUE 0.979 6.000 0.305 1.000 N NA
 1094457 1094458 HCH_02446 HCH_02447 lolA   TRUE 0.964 -3.000 0.167 1.000 N NA
 1094458 1094459 HCH_02447 HCH_02448   crcB TRUE 0.696 28.000 0.027 1.000 N NA
 1094459 1094460 HCH_02448 HCH_02449 crcB serS TRUE 0.712 24.000 0.028 1.000 N NA
 1094460 1094461 HCH_02449 HCH_02450 serS cysG TRUE 0.850 9.000 0.031 1.000 N NA
 1094462 1094463 HCH_02451 HCH_02452   modC FALSE 0.219 115.000 0.000 1.000   NA
 1094463 1094464 HCH_02452 HCH_02453 modC modB TRUE 0.993 -3.000 0.308 0.001 Y NA
 1094464 1094465 HCH_02453 HCH_02454 modB modA TRUE 0.991 63.000 0.660 0.001 Y NA
 1094468 1094469 HCH_02457 HCH_02458     FALSE 0.172 239.000 0.000 NA Y NA
 1094469 1094470 HCH_02458 HCH_02459     FALSE 0.137 279.000 0.000 1.000 Y NA
 1094471 1094472 HCH_02460 HCH_02461     FALSE 0.006 518.000 0.000 NA   NA
 1094472 1094473 HCH_02461 HCH_02462     FALSE 0.297 20.000 0.000 NA   NA
 1094474 1094475 HCH_02463 HCH_02464     FALSE 0.245 35.000 0.000 NA   NA
 1094475 1094476 HCH_02464 HCH_02465     TRUE 0.817 113.000 0.121 0.002   NA
 1094478 1094479 HCH_02467 HCH_02469     FALSE 0.133 264.000 0.000 NA Y NA
 1094479 1094480 HCH_02469 HCH_02470     TRUE 0.949 -7.000 0.074 1.000 Y NA
 1094480 1094481 HCH_02470 HCH_02471     TRUE 0.953 69.000 0.407 1.000 N NA
 1094481 1094482 HCH_02471 HCH_02472     TRUE 0.605 12.000 0.000 1.000 N NA
 1094482 1094483 HCH_02472 HCH_02473   tal2 TRUE 0.882 5.000 0.000 1.000 Y NA
 1094483 1094484 HCH_02473 HCH_02474 tal2   FALSE 0.317 18.000 0.000 NA   NA
 1094485 1094486 HCH_02475 HCH_02476     TRUE 0.984 9.000 0.538 NA   NA
 1094486 1094487 HCH_02476 HCH_02477     FALSE 0.122 126.000 0.000 NA   NA
 1094487 1094488 HCH_02477 HCH_02479     FALSE 0.022 539.000 0.000 0.002   NA
 1094489 1094490 HCH_02480 HCH_02482     FALSE 0.010 718.000 0.000 1.000 N NA
 1094492 1094493 HCH_02485 HCH_02486     FALSE 0.109 133.000 0.000 NA   NA
 1094493 1094494 HCH_02486 HCH_02487     FALSE 0.006 487.000 0.000 NA   NA
 1094496 1094497 HCH_02488 HCH_02490     FALSE 0.430 10.000 0.000 NA   NA
 1094498 1094499 HCH_02489 HCH_02491     TRUE 0.827 15.000 0.074