MicrobesOnline Operon Predictions for Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025

For each pair of adjacent genes on the same strand, we report whether they are predicted to be in the same operon, and the two most important features. Small plasmids and, in draft genomes, small scaffolds, are excluded.

Also see:

Column Description
Gene1 VIMSS id of 1st gene in pair
SysName1 Systematic name of 1st gene in pair
Name1 Ordinary name of 1st gene in pair
Gene2 VIMSS id of 2nd gene in pair
SysName2 Systematic name of 2nd gene in pair
Name2 Ordinary name of 2nd gene in pair
bOp Whether the pair is predicted to lie in the same operon or not
pOp Estimated probability that the pair is in the same operon. Values near 1 or 0 are confident predictions of being in the same operon or not, while values near 0.5 are low-confidence predictions.
Sep Distance between the two genes, in base pairs
MOGScore Conservation, ranging from 0 (not conserved) to 1 (100% conserved)
GOScore Smallest shared GO category, as a fraction of the genome, or missing if one of the genes is not characterized
COGSim Whether the genes share a COG category or not
ExprSim Correlation of expression patterns (not available for most genomes)

 Gene1 Gene2 SysName1 SysName2 Name1 Name2 bOp pOp Sep MOGScore GOScore COGSim ExprSim
 3504983 3504984 Rsph17025_0001 Rsph17025_0002 rpsT dnaA FALSE 0.001 513.000 0.000 1.000 N NA
 3504984 3504985 Rsph17025_0002 Rsph17025_0003 dnaA   TRUE 0.840 117.000 0.328 1.000 Y NA
 3504985 3504986 Rsph17025_0003 Rsph17025_0004   recF TRUE 0.915 68.000 0.318 0.099 Y NA
 3504986 3504987 Rsph17025_0004 Rsph17025_0005 recF   TRUE 0.731 -3.000 0.010 NA   NA
 3504987 3504988 Rsph17025_0005 Rsph17025_0006   gyrB FALSE 0.148 91.000 0.002 NA   NA
 3504988 3504989 Rsph17025_0006 Rsph17025_0007 gyrB   FALSE 0.117 103.000 0.000 NA   NA
 3504991 3504992 Rsph17025_0009 Rsph17025_0010     TRUE 0.809 79.000 0.140 1.000 Y NA
 3504992 3504993 Rsph17025_0010 Rsph17025_0011     FALSE 0.403 43.000 0.027 1.000   NA
 3504993 3504994 Rsph17025_0011 Rsph17025_0012     TRUE 0.671 83.000 0.214 1.000   NA
 3504995 3504996 Rsph17025_0013 Rsph17025_0014     TRUE 0.979 -3.000 0.473 1.000   NA
 3504998 3504999 Rsph17025_0016 Rsph17025_0017     TRUE 0.923 0.000 0.048 NA   NA
 3504999 3505000 Rsph17025_0017 Rsph17025_0018     FALSE 0.442 58.000 0.054 NA   NA
 3505001 3505002 Rsph17025_0019 Rsph17025_0020     FALSE 0.395 68.000 0.053 NA   NA
 3505002 3505003 Rsph17025_0020 Rsph17025_0021   mepA TRUE 0.949 0.000 0.079 NA   NA
 3505003 3505004 Rsph17025_0021 Rsph17025_0022 mepA   TRUE 0.882 -27.000 0.175 NA   NA
 3505004 3505005 Rsph17025_0022 Rsph17025_0023     FALSE 0.524 82.000 0.105 NA   NA
 3505005 3505006 Rsph17025_0023 Rsph17025_0024     FALSE 0.007 279.000 0.005 NA   NA
 3505007 3505008 Rsph17025_0025 Rsph17025_0026     TRUE 0.919 2.000 0.053 1.000 N NA
 3505009 3505010 Rsph17025_0027 Rsph17025_0028     TRUE 0.963 -3.000 0.300 1.000 N NA
 3505012 3505013 Rsph17025_0030 Rsph17025_0031     FALSE 0.578 130.000 0.040 0.064 Y NA
 3505013 3505014 Rsph17025_0031 Rsph17025_0032     FALSE 0.440 49.000 0.055 1.000 N NA
 3505014 3505015 Rsph17025_0032 Rsph17025_0033     TRUE 0.849 -3.000 0.041 1.000   NA
 3505015 3505016 Rsph17025_0033 Rsph17025_0034     FALSE 0.144 114.000 0.005 1.000   NA
 3505016 3505017 Rsph17025_0034 Rsph17025_0035     TRUE 0.741 5.000 0.000 NA   NA
 3505019 3505020 Rsph17025_0037 Rsph17025_0038     FALSE 0.613 72.000 0.159 NA   NA
 3505020 3505021 Rsph17025_0038 Rsph17025_0039     TRUE 0.988 0.000 0.408 NA   NA
 3505022 3505023 Rsph17025_0040 Rsph17025_0041     FALSE 0.531 15.000 0.002 NA   NA
 3505023 3505024 Rsph17025_0041 Rsph17025_0042     FALSE 0.150 126.000 0.018 NA   NA
 3505025 3505026 Rsph17025_0043 Rsph17025_0044     FALSE 0.005 275.000 0.000 NA   NA
 3505028 3505029 Rsph17025_0046 Rsph17025_0047 dapD   FALSE 0.193 87.000 0.009 NA   NA
 3505029 3505030 Rsph17025_0047 Rsph17025_0048     FALSE 0.299 57.000 0.020 NA   NA
 3505030 3505031 Rsph17025_0048 Rsph17025_0049     TRUE 0.815 -3.000 0.028 1.000   NA
 3505031 3505032 Rsph17025_0049 Rsph17025_0050     FALSE 0.280 46.000 0.005 1.000   NA
 3505032 3505033 Rsph17025_0050 Rsph17025_0051     FALSE 0.020 185.000 0.003 1.000 N NA
 3505033 3505034 Rsph17025_0051 Rsph17025_0052     FALSE 0.079 128.000 0.000 NA   NA
 3505037 3505038 Rsph17025_0055 Rsph17025_0056     FALSE 0.144 70.000 0.000 NA   NA
 3505039 3505040 Rsph17025_0057 Rsph17025_0058     FALSE 0.193 89.000 0.010 NA   NA
 3505040 3505041 Rsph17025_0058 Rsph17025_0059     TRUE 0.930 13.000 0.198 NA   NA
 3505041 3505042 Rsph17025_0059 Rsph17025_0060     TRUE 0.979 0.000 0.046 1.000 Y NA
 3505043 3505044 Rsph17025_0061 Rsph17025_0062     TRUE 0.953 -3.000 0.235 1.000 N NA
 3505044 3505045 Rsph17025_0062 Rsph17025_0063     TRUE 0.947 12.000 0.233 NA   NA
 3505046 3505047 Rsph17025_0064 Rsph17025_0065     FALSE 0.446 37.000 0.027 1.000   NA
 3505048 3505049 Rsph17025_0066 Rsph17025_0067     TRUE 0.665 89.000 0.048 1.000 Y NA
 3505049 3505050 Rsph17025_0067 Rsph17025_0068     FALSE 0.011 226.000 0.000 NA   NA
 3505050 3505051 Rsph17025_0068 Rsph17025_0069     TRUE 0.980 -3.000 0.540 NA   NA
 3505051 3505052 Rsph17025_0069 Rsph17025_0070     TRUE 0.962 22.000 0.787 1.000   NA
 3505053 3505054 Rsph17025_0071 Rsph17025_0072     TRUE 0.985 0.000 0.320 1.000   NA
 3505054 3505055 Rsph17025_0072 Rsph17025_0073     TRUE 0.754 57.000 0.287 1.000 N NA
 3505056 3505057 Rsph17025_0074 Rsph17025_0075     FALSE 0.046 153.000 0.000 NA   NA
 3505057 3505058 Rsph17025_0075 Rsph17025_0076     FALSE 0.178 55.000 0.000 NA   NA
 3505058 3505059 Rsph17025_0076 Rsph17025_0077   kgd TRUE 0.997 3.000 0.667 1.000 Y NA
 3505059 3505060 Rsph17025_0077 Rsph17025_0078 kgd   TRUE 0.810 56.000 0.092 1.000 Y NA
 3505060 3505061 Rsph17025_0078 Rsph17025_0079   sucC TRUE 0.995 5.000 0.256 0.001 Y NA
 3505061 3505062 Rsph17025_0079 Rsph17025_0080 sucC   FALSE 0.185 230.000 0.113 1.000 Y NA
 3505063 3505064 Rsph17025_0081 Rsph17025_0082     FALSE 0.304 87.000 0.032 1.000   NA
 3505064 3505065 Rsph17025_0082 Rsph17025_0083     TRUE 0.964 9.000 0.223 NA   NA
 3505065 3505066 Rsph17025_0083 Rsph17025_0084     TRUE 0.959 -3.000 0.243 NA   NA
 3505066 3505067 Rsph17025_0084 Rsph17025_0085     TRUE 0.986 1.000 0.347 NA   NA
 3505067 3505068 Rsph17025_0085 Rsph17025_0086     FALSE 0.008 216.000 0.000 1.000 N NA
 3505068 3505069 Rsph17025_0086 Rsph17025_0087     TRUE 0.990 12.000 0.291 0.001 Y NA
 3505069 3505070 Rsph17025_0087 Rsph17025_0088   sdhA TRUE 0.996 11.000 0.705 0.001 Y NA
 3505070 3505071 Rsph17025_0088 Rsph17025_0089 sdhA   TRUE 0.882 0.000 0.022 NA   NA
 3505071 3505072 Rsph17025_0089 Rsph17025_0090     TRUE 0.980 4.000 0.267 NA   NA
 3505072 3505073 Rsph17025_0090 Rsph17025_0091   sdhB FALSE 0.518 19.000 0.009 NA   NA
 3505074 3505075 Rsph17025_0092 Rsph17025_0093     FALSE 0.418 94.000 0.074 NA   NA
 3505075 3505076 Rsph17025_0093 Rsph17025_0094     FALSE 0.613 33.000 0.065 NA   NA
 3505077 3505078 Rsph17025_0095 Rsph17025_R0001     FALSE 0.093 119.000 0.000 NA   NA
 3505079 3505080 Rsph17025_0096 Rsph17025_0097     FALSE 0.002 390.000 0.000 NA   NA
 3505082 3505083 Rsph17025_0099 Rsph17025_0100     TRUE 0.954 -22.000 0.500 NA   NA
 3505083 3505084 Rsph17025_0100 Rsph17025_0101     TRUE 0.966 -16.000 0.667 NA   NA
 3505084 3505085 Rsph17025_0101 Rsph17025_0102     TRUE 0.695 8.000 0.000 NA   NA
 3505085 3505086 Rsph17025_0102 Rsph17025_0103     TRUE 0.790 60.000 0.333 NA   NA
 3505086 3505087 Rsph17025_0103 Rsph17025_0104     FALSE 0.450 17.000 0.000 NA   NA
 3505087 3505088 Rsph17025_0104 Rsph17025_0105     FALSE 0.001 456.000 0.000 NA   NA
 3505088 3505089 Rsph17025_0105 Rsph17025_0106     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505089 3505090 Rsph17025_0106 Rsph17025_0107     FALSE 0.013 216.000 0.000 NA   NA
 3505090 3505091 Rsph17025_0107 Rsph17025_0108     TRUE 0.971 -7.000 0.667 NA   NA
 3505091 3505092 Rsph17025_0108 Rsph17025_0109     TRUE 0.954 22.000 0.667 NA   NA
 3505092 3505093 Rsph17025_0109 Rsph17025_0110     TRUE 0.981 10.000 0.500 NA   NA
 3505093 3505094 Rsph17025_0110 Rsph17025_0111     FALSE 0.001 493.000 0.000 NA   NA
 3505094 3505095 Rsph17025_0111 Rsph17025_0112     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3505095 3505096 Rsph17025_0112 Rsph17025_0113     FALSE 0.047 152.000 0.000 NA   NA
 3505096 3505097 Rsph17025_0113 Rsph17025_0114     FALSE 0.002 351.000 0.000 NA   NA
 3505097 3505098 Rsph17025_0114 Rsph17025_0115     TRUE 0.962 -3.000 0.148 0.007   NA
 3505099 3505100 Rsph17025_0116 Rsph17025_0117     TRUE 0.957 -10.000 0.553 NA N NA
 3505102 3505103 Rsph17025_0119 Rsph17025_0120     FALSE 0.416 28.000 0.020 1.000 N NA
 3505104 3505105 Rsph17025_0121 Rsph17025_0122     TRUE 0.946 -28.000 0.481 1.000 N NA
 3505105 3505106 Rsph17025_0122 Rsph17025_0123   smpB FALSE 0.146 93.000 0.010 1.000 N NA
 3505106 3505107 Rsph17025_0123 Rsph17025_0124 smpB   FALSE 0.220 130.000 0.058 1.000 N NA
 3505108 3505109 Rsph17025_0125 Rsph17025_0126     FALSE 0.063 140.000 0.000 NA   NA
 3505109 3505110 Rsph17025_0126 Rsph17025_0127     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505112 3505113 Rsph17025_0129 Rsph17025_0130     FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 3505113 3505114 Rsph17025_0130 Rsph17025_0131     FALSE 0.445 -13.000 0.000 NA   NA
 3505116 3505117 Rsph17025_0133 Rsph17025_0134     FALSE 0.459 -10.000 0.000 NA   NA
 3505117 3505118 Rsph17025_0134 Rsph17025_0135     FALSE 0.124 95.000 0.000 NA   NA
 3505118 3505119 Rsph17025_0135 Rsph17025_0136     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505119 3505120 Rsph17025_0136 Rsph17025_0137     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505120 3505121 Rsph17025_0137 Rsph17025_0138     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3505121 3505122 Rsph17025_0138 Rsph17025_0139     TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 3505122 3505123 Rsph17025_0139 Rsph17025_0140     FALSE 0.007 248.000 0.000 NA   NA
 3505125 3505126 Rsph17025_0142 Rsph17025_0143     TRUE 0.806 -3.000 0.028 NA   NA
 3505126 3505127 Rsph17025_0143 Rsph17025_0144     FALSE 0.014 179.000 0.000 NA N NA
 3505127 3505128 Rsph17025_0144 Rsph17025_0145     FALSE 0.001 498.000 0.000 1.000   NA
 3505128 3505129 Rsph17025_0145 Rsph17025_0146     FALSE 0.407 112.000 0.091 NA   NA
 3505131 3505132 Rsph17025_0148 Rsph17025_0149     TRUE 0.998 0.000 0.536 0.001 Y NA
 3505132 3505133 Rsph17025_0149 Rsph17025_0150     TRUE 0.995 -3.000 0.519 0.001 Y NA
 3505133 3505134 Rsph17025_0150 Rsph17025_0151     TRUE 0.981 4.000 0.023 0.024 Y NA
 3505134 3505135 Rsph17025_0151 Rsph17025_0152     FALSE 0.171 58.000 0.000 NA   NA
 3505136 3505137 Rsph17025_0153 Rsph17025_0154     FALSE 0.334 33.000 0.003 1.000   NA
 3505137 3505138 Rsph17025_0154 Rsph17025_0155     FALSE 0.219 52.000 0.003 NA   NA
 3505138 3505139 Rsph17025_0155 Rsph17025_0156     TRUE 0.984 0.000 0.307 NA   NA
 3505139 3505140 Rsph17025_0156 Rsph17025_0157     FALSE 0.258 39.000 0.002 NA   NA
 3505141 3505142 Rsph17025_0158 Rsph17025_0159   leuD TRUE 0.928 64.000 0.269 0.001 Y NA
 3505142 3505143 Rsph17025_0159 Rsph17025_0160 leuD   FALSE 0.007 249.000 0.000 NA   NA
 3505143 3505144 Rsph17025_0160 Rsph17025_0161     FALSE 0.214 42.000 0.000 NA   NA
 3505144 3505145 Rsph17025_0161 Rsph17025_0162     FALSE 0.079 128.000 0.000 NA   NA
 3505145 3505146 Rsph17025_0162 Rsph17025_0163     TRUE 0.846 116.000 0.345 NA Y NA
 3505146 3505147 Rsph17025_0163 Rsph17025_R0002     FALSE 0.161 62.000 0.000 NA   NA
 3505148 3505149 Rsph17025_0164 Rsph17025_0165     FALSE 0.459 -10.000 0.000 NA   NA
 3505149 3505150 Rsph17025_0165 Rsph17025_0166     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505150 3505151 Rsph17025_0166 Rsph17025_0167     TRUE 0.837 36.000 0.286 NA   NA
 3505151 3505152 Rsph17025_0167 Rsph17025_0168     FALSE 0.034 168.000 0.000 NA   NA
 3505153 3505154 Rsph17025_0169 Rsph17025_0170     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 3505154 3505155 Rsph17025_0170 Rsph17025_0171     TRUE 0.939 69.000 0.667 NA Y NA
 3505156 3505157 Rsph17025_0172 Rsph17025_0173     FALSE 0.522 86.000 0.000 NA Y NA
 3505157 3505158 Rsph17025_0173 Rsph17025_0174     TRUE 0.813 21.000 0.000 NA Y NA
 3505159 3505160 Rsph17025_0175 Rsph17025_0176     FALSE 0.003 343.000 0.000 1.000   NA
 3505160 3505161 Rsph17025_0176 Rsph17025_0177     FALSE 0.115 77.000 0.002 1.000 N NA
 3505161 3505162 Rsph17025_0177 Rsph17025_0178     TRUE 0.984 -3.000 0.222 1.000 Y NA
 3505162 3505163 Rsph17025_0178 Rsph17025_0179     TRUE 0.987 -3.000 0.176 0.006 Y NA
 3505163 3505164 Rsph17025_0179 Rsph17025_0180     FALSE 0.452 39.000 0.047 1.000 N NA
 3505164 3505165 Rsph17025_0180 Rsph17025_0181   rpsP FALSE 0.458 41.000 0.050 1.000 N NA
 3505165 3505166 Rsph17025_0181 Rsph17025_0182 rpsP   TRUE 0.913 98.000 0.342 0.015 Y NA
 3505166 3505167 Rsph17025_0182 Rsph17025_0183     FALSE 0.144 96.000 0.002 NA   NA
 3505167 3505168 Rsph17025_0183 Rsph17025_0184     FALSE 0.195 58.000 0.002 NA   NA
 3505168 3505169 Rsph17025_0184 Rsph17025_0185   rplS TRUE 0.951 49.000 0.567 1.000 Y NA
 3505169 3505170 Rsph17025_0185 Rsph17025_0186 rplS rpmE TRUE 0.951 13.000 0.027 0.015 Y NA
 3505170 3505171 Rsph17025_0186 Rsph17025_0187 rpmE   FALSE 0.006 259.000 0.006 NA N NA
 3505173 3505174 Rsph17025_0189 Rsph17025_0190     TRUE 0.973 4.000 0.195 NA   NA
 3505174 3505175 Rsph17025_0190 Rsph17025_0191     TRUE 0.924 52.000 0.628 0.004   NA
 3505175 3505176 Rsph17025_0191 Rsph17025_0192     TRUE 0.811 70.000 0.278 0.004   NA
 3505176 3505177 Rsph17025_0192 Rsph17025_0193     TRUE 0.998 6.000 0.863 0.004 Y NA
 3505178 3505179 Rsph17025_0194 Rsph17025_0195     FALSE 0.208 104.000 0.029 1.000 N NA
 3505179 3505180 Rsph17025_0195 Rsph17025_0196     FALSE 0.306 115.000 0.070 1.000 N NA
 3505181 3505182 Rsph17025_0197 Rsph17025_0198     TRUE 0.765 -3.000 0.030 NA N NA
 3505182 3505183 Rsph17025_0198 Rsph17025_0199     FALSE 0.220 162.000 0.000 NA Y NA
 3505184 3505185 Rsph17025_0200 Rsph17025_0201     FALSE 0.318 48.000 0.017 NA   NA
 3505185 3505186 Rsph17025_0201 Rsph17025_0202     FALSE 0.004 291.000 0.000 NA   NA
 3505187 3505188 Rsph17025_0203 Rsph17025_0204     TRUE 0.985 -3.000 0.697 NA   NA
 3505188 3505189 Rsph17025_0204 Rsph17025_0205     TRUE 0.994 0.000 0.816 NA   NA
 3505189 3505190 Rsph17025_0205 Rsph17025_0206     TRUE 0.988 -3.000 0.876 NA   NA
 3505192 3505193 Rsph17025_0208 Rsph17025_0209     TRUE 0.918 65.000 0.266 0.012 Y NA
 3505193 3505194 Rsph17025_0209 Rsph17025_0210     TRUE 0.983 13.000 0.227 0.052 Y NA
 3505194 3505195 Rsph17025_0210 Rsph17025_0211     FALSE 0.130 51.000 0.000 1.000 N NA
 3505195 3505196 Rsph17025_0211 Rsph17025_0212     FALSE 0.022 158.000 0.000 NA N NA
 3505197 3505198 Rsph17025_0213 Rsph17025_0214     FALSE 0.050 130.000 0.000 1.000 N NA
 3505198 3505199 Rsph17025_0214 Rsph17025_0215     TRUE 0.731 53.000 0.213 NA   NA
 3505199 3505200 Rsph17025_0215 Rsph17025_0216     TRUE 0.802 -3.000 0.027 NA   NA
 3505201 3505202 Rsph17025_0217 Rsph17025_0218 ubiA   FALSE 0.466 68.000 0.054 0.063 N NA
 3505202 3505203 Rsph17025_0218 Rsph17025_0219     TRUE 0.910 52.000 0.800 NA   NA
 3505204 3505205 Rsph17025_0220 Rsph17025_0221     TRUE 0.660 -3.000 0.000 1.000   NA
 3505205 3505206 Rsph17025_0221 Rsph17025_0222     FALSE 0.255 154.000 0.108 1.000   NA
 3505206 3505207 Rsph17025_0222 Rsph17025_0223   pyrB TRUE 0.991 -3.000 0.452 1.000 Y NA
 3505211 3505212 Rsph17025_0227 Rsph17025_0228     TRUE 0.997 6.000 0.937 1.000 Y NA
 3505212 3505213 Rsph17025_0228 Rsph17025_0229     TRUE 0.997 -3.000 0.937 0.063 Y NA
 3505213 3505214 Rsph17025_0229 Rsph17025_0230     TRUE 0.996 -3.000 0.944 1.000 Y NA
 3505214 3505215 Rsph17025_0230 Rsph17025_0231     TRUE 0.997 -3.000 0.976 0.013 Y NA
 3505215 3505216 Rsph17025_0231 Rsph17025_0232     TRUE 0.998 0.000 0.881 0.013 Y NA
 3505216 3505217 Rsph17025_0232 Rsph17025_0233     FALSE 0.114 128.000 0.017 1.000 N NA
 3505218 3505219 Rsph17025_0234 Rsph17025_0235     TRUE 0.931 96.000 0.676 NA Y NA
 3505219 3505220 Rsph17025_0235 Rsph17025_0236     TRUE 0.994 0.000 0.797 1.000   NA
 3505220 3505221 Rsph17025_0236 Rsph17025_0237   frcK TRUE 0.775 -3.000 0.016 1.000   NA
 3505224 3505225 Rsph17025_0240 Rsph17025_0241     FALSE 0.051 150.000 0.000 NA   NA
 3505225 3505226 Rsph17025_0241 Rsph17025_0242     TRUE 0.998 2.000 0.882 NA Y NA
 3505226 3505227 Rsph17025_0242 Rsph17025_0243     TRUE 0.805 85.000 0.151 NA Y NA
 3505228 3505229 Rsph17025_0244 Rsph17025_0245     TRUE 0.996 -3.000 0.759 0.023 Y NA
 3505230 3505231 Rsph17025_0246 Rsph17025_0247     TRUE 0.995 -3.000 0.525 0.007 Y NA
 3505231 3505232 Rsph17025_0247 Rsph17025_0248     TRUE 0.990 -13.000 0.857 1.000 Y NA
 3505232 3505233 Rsph17025_0248 Rsph17025_0249     TRUE 0.996 -3.000 0.894 1.000 Y NA
 3505234 3505235 Rsph17025_0250 Rsph17025_0251     TRUE 0.992 0.000 0.696 NA N NA
 3505235 3505236 Rsph17025_0251 Rsph17025_0252     FALSE 0.435 152.000 0.280 NA   NA
 3505236 3505237 Rsph17025_0252 Rsph17025_0253     TRUE 0.673 12.000 0.008 NA   NA
 3505237 3505238 Rsph17025_0253 Rsph17025_0254     FALSE 0.505 -7.000 0.008 1.000 N NA
 3505239 3505240 Rsph17025_0255 Rsph17025_0256     FALSE 0.042 162.000 0.008 1.000 N NA
 3505242 3505243 Rsph17025_0258 Rsph17025_0259     TRUE 0.922 -3.000 0.107 NA   NA
 3505243 3505244 Rsph17025_0259 Rsph17025_0260     TRUE 0.945 -3.000 0.170 NA   NA
 3505245 3505246 Rsph17025_0261 Rsph17025_0262     FALSE 0.002 375.000 0.000 NA   NA
 3505246 3505247 Rsph17025_0262 Rsph17025_0263     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505247 3505248 Rsph17025_0263 Rsph17025_0264     TRUE 0.945 -3.000 0.000 0.084 Y NA
 3505248 3505249 Rsph17025_0264 Rsph17025_0265     TRUE 0.997 -3.000 0.808 0.010 Y NA
 3505249 3505250 Rsph17025_0265 Rsph17025_0266     TRUE 0.823 106.000 0.130 0.010 Y NA
 3505250 3505251 Rsph17025_0266 Rsph17025_0267     TRUE 0.994 0.000 0.310 1.000 Y NA
 3505251 3505252 Rsph17025_0267 Rsph17025_0268     TRUE 0.997 3.000 0.672 1.000 Y NA
 3505252 3505253 Rsph17025_0268 Rsph17025_0269     TRUE 0.881 -3.000 0.059 1.000   NA
 3505253 3505254 Rsph17025_0269 Rsph17025_0270     FALSE 0.360 48.000 0.025 NA   NA
 3505255 3505256 Rsph17025_0271 Rsph17025_0272     TRUE 0.970 -3.000 0.333 NA   NA
 3505256 3505257 Rsph17025_0272 Rsph17025_0273     FALSE 0.142 75.000 0.000 NA   NA
 3505257 3505258 Rsph17025_0273 Rsph17025_0274     FALSE 0.101 162.000 0.018 0.073 N NA
 3505259 3505260 Rsph17025_0275 Rsph17025_0276   deoA TRUE 0.993 2.000 0.242 1.000 Y NA
 3505260 3505261 Rsph17025_0276 Rsph17025_0277 deoA   TRUE 0.994 0.000 0.875 1.000 N NA
 3505261 3505262 Rsph17025_0277 Rsph17025_0278     TRUE 0.966 -3.000 0.325 1.000 N NA
 3505262 3505263 Rsph17025_0278 Rsph17025_0279     TRUE 0.913 -7.000 0.030 1.000 Y NA
 3505263 3505264 Rsph17025_0279 Rsph17025_0280     FALSE 0.275 66.000 0.021 NA   NA
 3505265 3505266 Rsph17025_0281 Rsph17025_0282     TRUE 0.786 84.000 0.407 NA   NA
 3505268 3505269 Rsph17025_0284 Rsph17025_0285     FALSE 0.071 110.000 0.000 1.000 N NA
 3505270 3505271 Rsph17025_0286 Rsph17025_0287     FALSE 0.085 91.000 0.000 1.000 N NA
 3505271 3505272 Rsph17025_0287 Rsph17025_0288     FALSE 0.461 76.000 0.091 1.000 N NA
 3505272 3505273 Rsph17025_0288 Rsph17025_0289     TRUE 0.984 -3.000 0.214 1.000 Y NA
 3505273 3505274 Rsph17025_0289 Rsph17025_0290     FALSE 0.015 210.000 0.000 NA   NA
 3505274 3505275 Rsph17025_0290 Rsph17025_0291     TRUE 0.789 110.000 0.588 NA   NA
 3505275 3505276 Rsph17025_0291 Rsph17025_0292     TRUE 0.976 -3.000 0.433 NA   NA
 3505278 3505279 Rsph17025_0294 Rsph17025_0295     TRUE 0.760 -3.000 0.026 1.000 N NA
 3505280 3505281 Rsph17025_0296 Rsph17025_0297     TRUE 0.938 22.000 0.467 1.000   NA
 3505281 3505282 Rsph17025_0297 Rsph17025_0298     TRUE 0.975 15.000 0.733 1.000   NA
 3505282 3505283 Rsph17025_0298 Rsph17025_0299     TRUE 0.785 39.000 0.115 0.010   NA
 3505283 3505284 Rsph17025_0299 Rsph17025_0300     TRUE 0.933 7.000 0.081 1.000   NA
 3505284 3505285 Rsph17025_0300 Rsph17025_0301     TRUE 0.998 5.000 0.838 0.008 Y NA
 3505285 3505286 Rsph17025_0301 Rsph17025_0302     TRUE 0.997 8.000 0.968 1.000 Y NA
 3505286 3505287 Rsph17025_0302 Rsph17025_0303     TRUE 0.987 21.000 0.833 1.000 Y NA
 3505287 3505288 Rsph17025_0303 Rsph17025_0304     FALSE 0.088 220.000 0.149 1.000 N NA
 3505288 3505289 Rsph17025_0304 Rsph17025_0305     TRUE 0.988 4.000 0.511 1.000 N NA
 3505289 3505290 Rsph17025_0305 Rsph17025_0306     FALSE 0.020 193.000 0.000 NA   NA
 3505291 3505292 Rsph17025_0307 Rsph17025_0308     FALSE 0.035 167.000 0.000 NA   NA
 3505292 3505293 Rsph17025_0308 Rsph17025_0309     FALSE 0.142 73.000 0.000 NA   NA
 3505293 3505294 Rsph17025_0309 Rsph17025_0310     FALSE 0.002 415.000 0.000 NA   NA
 3505294 3505295 Rsph17025_0310 Rsph17025_0311     FALSE 0.012 218.000 0.000 NA   NA
 3505295 3505296 Rsph17025_0311 Rsph17025_0312     TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 3505296 3505297 Rsph17025_0312 Rsph17025_0313     FALSE 0.091 120.000 0.000 NA   NA
 3505298 3505299 Rsph17025_0314 Rsph17025_0315     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505300 3505301 Rsph17025_0316 Rsph17025_0317     TRUE 0.722 6.000 0.000 NA   NA
 3505301 3505302 Rsph17025_0317 Rsph17025_R0003     FALSE 0.056 146.000 0.000 NA   NA
 3505304 3505305 Rsph17025_0320 Rsph17025_0321     FALSE 0.002 407.000 0.000 NA   NA
 3505305 3505306 Rsph17025_0321 Rsph17025_0322     FALSE 0.303 86.000 0.031 1.000   NA
 3505307 3505308 Rsph17025_0323 Rsph17025_0324   pyrE FALSE 0.012 269.000 0.031 1.000 N NA
 3505308 3505309 Rsph17025_0324 Rsph17025_0325 pyrE   TRUE 0.820 43.000 0.072 1.000 Y NA
 3505310 3505311 Rsph17025_0326 Rsph17025_0327     FALSE 0.037 164.000 0.000 NA   NA
 3505311 3505312 Rsph17025_0327 Rsph17025_0328     TRUE 0.815 105.000 0.645 NA   NA
 3505312 3505313 Rsph17025_0328 Rsph17025_0329     FALSE 0.130 142.000 0.026 NA   NA
 3505313 3505314 Rsph17025_0329 Rsph17025_0330     FALSE 0.007 250.000 0.000 NA   NA
 3505314 3505315 Rsph17025_0330 Rsph17025_0331     FALSE 0.071 89.000 0.000 NA N NA
 3505315 3505316 Rsph17025_0331 Rsph17025_0332     TRUE 0.980 0.000 0.289 NA N NA
 3505319 3505320 Rsph17025_0335 Rsph17025_0336     TRUE 0.620 63.000 0.144 NA   NA
 3505320 3505321 Rsph17025_0336 Rsph17025_0337     TRUE 0.935 -3.000 0.139 NA   NA
 3505321 3505322 Rsph17025_0337 Rsph17025_0338     TRUE 0.745 -10.000 0.059 1.000 N NA
 3505322 3505323 Rsph17025_0338 Rsph17025_0339     TRUE 0.973 19.000 0.919 NA   NA
 3505323 3505324 Rsph17025_0339 Rsph17025_0340     TRUE 0.964 -3.000 0.282 NA   NA
 3505326 3505327 Rsph17025_0342 Rsph17025_0343     FALSE 0.007 256.000 0.005 1.000 N NA
 3505327 3505328 Rsph17025_0343 Rsph17025_0344     FALSE 0.376 69.000 0.049 NA   NA
 3505328 3505329 Rsph17025_0344 Rsph17025_0345     FALSE 0.573 121.000 0.240 NA   NA
 3505330 3505331 Rsph17025_0346 Rsph17025_0347     TRUE 0.770 0.000 0.004 1.000 N NA
 3505333 3505334 Rsph17025_0349 Rsph17025_0350 trpA   FALSE 0.007 228.000 0.000 1.000 N NA
 3505334 3505335 Rsph17025_0350 Rsph17025_0351     FALSE 0.064 138.000 0.005 1.000 N NA
 3505335 3505336 Rsph17025_0351 Rsph17025_0352     TRUE 0.852 147.000 0.496 0.024 Y NA
 3505341 3505342 Rsph17025_0357 Rsph17025_0358     TRUE 0.884 30.000 0.333 NA   NA
 3505342 3505343 Rsph17025_0358 Rsph17025_0359     FALSE 0.002 360.000 0.000 NA   NA
 3505343 3505344 Rsph17025_0359 Rsph17025_0360     FALSE 0.007 260.000 0.000 1.000   NA
 3505344 3505345 Rsph17025_0360 Rsph17025_0361   carB FALSE 0.027 183.000 0.000 1.000   NA
 3505346 3505347 Rsph17025_0362 Rsph17025_0363     TRUE 0.903 -57.000 0.219 1.000   NA
 3505347 3505348 Rsph17025_0363 Rsph17025_0364     FALSE 0.221 40.000 0.000 NA   NA
 3505348 3505349 Rsph17025_0364 Rsph17025_0365   aspS FALSE 0.030 181.000 0.002 NA   NA
 3505349 3505350 Rsph17025_0365 Rsph17025_0366 aspS   TRUE 0.966 4.000 0.007 1.000 Y NA
 3505352 3505353 Rsph17025_0368 Rsph17025_0369     TRUE 0.945 -3.000 0.172 NA   NA
 3505354 3505355 Rsph17025_0370 Rsph17025_0371     TRUE 0.882 -3.000 0.075 1.000 N NA
 3505356 3505357 Rsph17025_0372 Rsph17025_0373     TRUE 0.994 1.000 0.200 0.061 Y NA
 3505357 3505358 Rsph17025_0373 Rsph17025_0374     TRUE 0.995 -3.000 0.667 0.061 Y NA
 3505358 3505359 Rsph17025_0374 Rsph17025_0375     TRUE 0.910 122.000 0.714 1.000 Y NA
 3505359 3505360 Rsph17025_0375 Rsph17025_0376     TRUE 0.998 0.000 0.875 0.033 Y NA
 3505360 3505361 Rsph17025_0376 Rsph17025_0377     TRUE 0.982 -3.000 0.188 1.000 Y NA
 3505364 3505365 Rsph17025_0380 Rsph17025_0381     FALSE 0.279 106.000 0.037 1.000   NA
 3505367 3505368 Rsph17025_0383 Rsph17025_0384     FALSE 0.161 88.000 0.003 NA   NA
 3505369 3505370 Rsph17025_0385 Rsph17025_0386     FALSE 0.135 99.000 0.000 1.000   NA
 3505370 3505371 Rsph17025_0386 Rsph17025_0387     TRUE 0.803 19.000 0.028 0.002   NA
 3505371 3505372 Rsph17025_0387 Rsph17025_0388     TRUE 0.992 -3.000 0.825 0.002   NA
 3505372 3505373 Rsph17025_0388 Rsph17025_0389     TRUE 0.985 -3.000 0.404 0.002   NA
 3505373 3505374 Rsph17025_0389 Rsph17025_0390     TRUE 0.992 0.000 0.361 0.002   NA
 3505375 3505376 Rsph17025_0391 Rsph17025_0392     TRUE 0.710 10.000 0.017 NA N NA
 3505376 3505377 Rsph17025_0392 Rsph17025_0393     TRUE 0.933 -3.000 0.133 NA   NA
 3505377 3505378 Rsph17025_0393 Rsph17025_0394     FALSE 0.003 334.000 0.000 NA   NA
 3505378 3505379 Rsph17025_0394 Rsph17025_0395     TRUE 0.951 1.000 0.080 NA   NA
 3505379 3505380 Rsph17025_0395 Rsph17025_0396     TRUE 0.614 32.000 0.073 1.000 N NA
 3505380 3505381 Rsph17025_0396 Rsph17025_0397     FALSE 0.522 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3505381 3505382 Rsph17025_0397 Rsph17025_0398     TRUE 0.680 131.000 0.149 1.000 Y NA
 3505382 3505383 Rsph17025_0398 Rsph17025_0399     TRUE 0.631 60.000 0.134 1.000   NA
 3505383 3505384 Rsph17025_0399 Rsph17025_0400     TRUE 0.973 -3.000 0.362 1.000   NA
 3505385 3505386 Rsph17025_0401 Rsph17025_0402     FALSE 0.249 134.000 0.076 1.000 N NA
 3505386 3505387 Rsph17025_0402 Rsph17025_0403     TRUE 0.965 -7.000 0.620 1.000 N NA
 3505387 3505388 Rsph17025_0403 Rsph17025_0404     FALSE 0.232 59.000 0.005 1.000   NA
 3505388 3505389 Rsph17025_0404 Rsph17025_0405     FALSE 0.232 63.000 0.007 1.000   NA
 3505389 3505390 Rsph17025_0405 Rsph17025_0406     FALSE 0.027 157.000 0.000 1.000 N NA
 3505392 3505393 Rsph17025_0408 Rsph17025_0409     FALSE 0.009 242.000 0.000 1.000   NA
 3505393 3505394 Rsph17025_0409 Rsph17025_0410     TRUE 0.767 4.000 0.000 NA   NA
 3505394 3505395 Rsph17025_0410 Rsph17025_0411     FALSE 0.190 51.000 0.000 NA   NA
 3505397 3505398 Rsph17025_0413 Rsph17025_0414     TRUE 0.866 -3.000 0.053 NA   NA
 3505398 3505399 Rsph17025_0414 Rsph17025_0415     FALSE 0.376 94.000 0.061 NA   NA
 3505401 3505402 Rsph17025_0417 Rsph17025_0418     TRUE 0.847 2.000 0.009 NA   NA
 3505404 3505405 Rsph17025_0420 Rsph17025_0421     TRUE 0.987 4.000 0.051 0.002 Y NA
 3505405 3505406 Rsph17025_0421 Rsph17025_0422     TRUE 0.968 -3.000 0.347 1.000 N NA
 3505406 3505407 Rsph17025_0422 Rsph17025_0423     FALSE 0.014 245.000 0.015 NA   NA
 3505407 3505408 Rsph17025_0423 Rsph17025_0424     FALSE 0.018 202.000 0.000 NA   NA
 3505408 3505409 Rsph17025_0424 Rsph17025_0425     FALSE 0.003 335.000 0.000 NA   NA
 3505411 3505412 Rsph17025_0427 Rsph17025_R0004     FALSE 0.183 53.000 0.000 NA   NA
 3505412 3505413 Rsph17025_R0004 Rsph17025_0428     FALSE 0.017 203.000 0.000 NA   NA
 3505416 3505417 Rsph17025_0431 Rsph17025_0432     TRUE 0.939 69.000 0.667 NA Y NA
 3505417 3505418 Rsph17025_0432 Rsph17025_0433     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 3505419 3505420 Rsph17025_0434 Rsph17025_0435     FALSE 0.459 -10.000 0.000 NA   NA
 3505420 3505421 Rsph17025_0435 Rsph17025_0436     FALSE 0.002 409.000 0.000 NA   NA
 3505421 3505422 Rsph17025_0436 Rsph17025_0437     FALSE 0.001 463.000 0.000 NA   NA
 3505422 3505423 Rsph17025_0437 Rsph17025_0438     FALSE 0.159 63.000 0.000 NA   NA
 3505423 3505424 Rsph17025_0438 Rsph17025_0439     FALSE 0.161 62.000 0.000 NA   NA
 3505424 3505425 Rsph17025_0439 Rsph17025_0440     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505425 3505426 Rsph17025_0440 Rsph17025_0441     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3505426 3505427 Rsph17025_0441 Rsph17025_0442     TRUE 0.660 -3.000 0.000 1.000   NA
 3505427 3505428 Rsph17025_0442 Rsph17025_0443     TRUE 0.660 -3.000 0.000 1.000   NA
 3505428 3505429 Rsph17025_0443 Rsph17025_0444     TRUE 0.956 -3.000 0.222 NA   NA
 3505429 3505430 Rsph17025_0444 Rsph17025_0445     FALSE 0.123 97.000 0.000 NA   NA
 3505430 3505431 Rsph17025_0445 Rsph17025_0446     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505431 3505432 Rsph17025_0446 Rsph17025_0447     FALSE 0.102 113.000 0.000 NA   NA
 3505432 3505433 Rsph17025_0447 Rsph17025_0448     FALSE 0.509 14.000 0.000 NA   NA
 3505433 3505434 Rsph17025_0448 Rsph17025_0449     TRUE 0.897 -10.000 0.176 NA   NA
 3505434 3505435 Rsph17025_0449 Rsph17025_0450     TRUE 0.928 -3.000 0.118 NA   NA
 3505438 3505439 Rsph17025_0453 Rsph17025_0454     FALSE 0.112 88.000 0.003 1.000 N NA
 3505440 3505441 Rsph17025_0455 Rsph17025_0456   secD TRUE 0.939 18.000 0.099 NA Y NA
 3505441 3505442 Rsph17025_0456 Rsph17025_0457 secD secF TRUE 0.992 10.000 0.244 0.001 Y NA
 3505442 3505443 Rsph17025_0457 Rsph17025_0458 secF   FALSE 0.125 164.000 0.052 NA   NA
 3505443 3505444 Rsph17025_0458 Rsph17025_0459     FALSE 0.447 94.000 0.085 NA   NA
 3505444 3505445 Rsph17025_0459 Rsph17025_0460     TRUE 0.995 -3.000 0.503 0.003 Y NA
 3505445 3505446 Rsph17025_0460 Rsph17025_0461     TRUE 0.967 49.000 0.501 0.001 Y NA
 3505446 3505447 Rsph17025_0461 Rsph17025_0462     TRUE 0.980 -3.000 0.501 1.000   NA
 3505447 3505448 Rsph17025_0462 Rsph17025_0463     TRUE 0.872 -7.000 0.108 1.000   NA
 3505453 3505454 Rsph17025_0468 Rsph17025_0469     TRUE 0.906 -3.000 0.081 1.000   NA
 3505454 3505455 Rsph17025_0469 Rsph17025_0470     TRUE 0.717 -16.000 0.059 NA N NA
 3505456 3505457 Rsph17025_0471 Rsph17025_0472     TRUE 0.945 -3.000 0.165 1.000   NA
 3505457 3505458 Rsph17025_0472 Rsph17025_0473     FALSE 0.428 59.000 0.064 1.000 N NA
 3505459 3505460 Rsph17025_0474 Rsph17025_0475     FALSE 0.003 440.000 0.000 0.093   NA
 3505461 3505462 Rsph17025_0476 Rsph17025_0477     FALSE 0.207 44.000 0.000 NA   NA
 3505462 3505463 Rsph17025_0477 Rsph17025_0478     FALSE 0.015 211.000 0.000 NA   NA
 3505464 3505465 Rsph17025_0479 Rsph17025_R0005     FALSE 0.002 433.000 0.000 NA   NA
 3505465 3505466 Rsph17025_R0005 Rsph17025_0480     FALSE 0.150 67.000 0.000 NA   NA
 3505466 3505467 Rsph17025_0480 Rsph17025_0481     TRUE 0.866 -3.000 0.069 NA N NA
 3505468 3505469 Rsph17025_0482 Rsph17025_0483 rpoH2   TRUE 0.909 -3.000 0.090 NA   NA
 3505469 3505470 Rsph17025_0483 Rsph17025_0484     FALSE 0.196 100.000 0.014 NA   NA
 3505470 3505471 Rsph17025_0484 Rsph17025_0485     FALSE 0.078 103.000 0.000 1.000 N NA
 3505473 3505474 Rsph17025_0487 Rsph17025_0488 lysK   FALSE 0.021 170.000 0.000 1.000 N NA
 3505476 3505477 Rsph17025_0490 Rsph17025_0491     TRUE 0.688 -3.000 0.004 NA   NA
 3505481 3505482 Rsph17025_0495 Rsph17025_0496     FALSE 0.006 237.000 0.000 1.000 N NA
 3505482 3505483 Rsph17025_0496 Rsph17025_0497     FALSE 0.023 167.000 0.000 1.000 N NA
 3505484 3505485 Rsph17025_0498 Rsph17025_0499   ileS FALSE 0.243 36.000 0.000 NA   NA
 3505485 3505486 Rsph17025_0499 Rsph17025_0500 ileS   FALSE 0.030 188.000 0.005 NA   NA
 3505486 3505487 Rsph17025_0500 Rsph17025_0501     TRUE 0.893 62.000 0.791 NA   NA
 3505489 3505490 Rsph17025_0503 Rsph17025_0504     TRUE 0.903 4.000 0.047 1.000 N NA
 3505490 3505491 Rsph17025_0504 Rsph17025_0505     TRUE 0.963 2.000 0.114 NA   NA
 3505491 3505492 Rsph17025_0505 Rsph17025_0506     TRUE 0.976 12.000 0.567 NA   NA
 3505492 3505493 Rsph17025_0506 Rsph17025_0507     FALSE 0.523 60.000 0.079 1.000   NA
 3505493 3505494 Rsph17025_0507 Rsph17025_0508     TRUE 0.978 16.000 0.916 NA   NA
 3505494 3505495 Rsph17025_0508 Rsph17025_0509     FALSE 0.427 68.000 0.063 NA   NA
 3505495 3505496 Rsph17025_0509 Rsph17025_0510     TRUE 0.968 4.000 0.179 1.000 N NA
 3505496 3505497 Rsph17025_0510 Rsph17025_0511     FALSE 0.002 353.000 0.000 1.000 N NA
 3505498 3505499 Rsph17025_0512 Rsph17025_0513     FALSE 0.116 58.000 0.000 1.000 N NA
 3505499 3505500 Rsph17025_0513 Rsph17025_0514     FALSE 0.098 69.000 0.000 1.000 N NA
 3505500 3505501 Rsph17025_0514 Rsph17025_0515     FALSE 0.205 76.000 0.019 1.000 N NA
 3505503 3505504 Rsph17025_0517 Rsph17025_0518     FALSE 0.035 198.000 0.016 NA   NA
 3505505 3505506 Rsph17025_0519 Rsph17025_0520     TRUE 0.992 2.000 0.604 NA   NA
 3505506 3505507 Rsph17025_0520 Rsph17025_0521     TRUE 0.965 13.000 0.411 NA   NA
 3505507 3505508 Rsph17025_0521 Rsph17025_R0006   ffs FALSE 0.018 200.000 0.000 NA   NA
 3505509 3505510 Rsph17025_0522 Rsph17025_0523     TRUE 0.674 34.000 0.091 NA   NA
 3505512 3505513 Rsph17025_0525 Rsph17025_0526     FALSE 0.196 182.000 0.188 1.000 N NA
 3505513 3505514 Rsph17025_0526 Rsph17025_0527     TRUE 0.979 16.000 0.711 0.060   NA
 3505514 3505515 Rsph17025_0527 Rsph17025_0528     TRUE 0.996 2.000 0.882 0.060   NA
 3505515 3505516 Rsph17025_0528 Rsph17025_0529     TRUE 0.986 -3.000 0.744 1.000   NA
 3505516 3505517 Rsph17025_0529 Rsph17025_0530     TRUE 0.905 7.000 0.051 1.000   NA
 3505521 3505522 Rsph17025_0534 Rsph17025_0535     TRUE 0.987 12.000 0.714 0.004 N NA
 3505522 3505523 Rsph17025_0535 Rsph17025_0536     TRUE 0.983 12.000 0.571 0.004 N NA
 3505523 3505524 Rsph17025_0536 Rsph17025_0537     TRUE 0.976 -3.000 0.290 0.004 N NA
 3505524 3505525 Rsph17025_0537 Rsph17025_0538     FALSE 0.318 232.000 0.203 0.022 Y NA
 3505525 3505526 Rsph17025_0538 Rsph17025_0539     TRUE 0.989 2.000 0.506 NA N NA
 3505526 3505527 Rsph17025_0539 Rsph17025_0540     TRUE 0.991 4.000 0.206 NA Y NA
 3505527 3505528 Rsph17025_0540 Rsph17025_0541     TRUE 0.997 0.000 0.713 NA Y NA
 3505529 3505530 Rsph17025_0542 Rsph17025_0543     FALSE 0.061 178.000 0.022 1.000   NA
 3505531 3505532 Rsph17025_0544 Rsph17025_0545     TRUE 0.784 17.000 0.066 NA   NA
 3505532 3505533 Rsph17025_0545 Rsph17025_0546     TRUE 0.880 13.000 0.109 1.000 N NA
 3505536 3505537 Rsph17025_0549 Rsph17025_0550     FALSE 0.145 97.000 0.002 NA   NA
 3505538 3505539 Rsph17025_0551 Rsph17025_0552 hemC   FALSE 0.015 210.000 0.000 NA   NA
 3505540 3505541 Rsph17025_0553 Rsph17025_0554     TRUE 0.894 -3.000 0.069 1.000   NA
 3505541 3505542 Rsph17025_0554 Rsph17025_0555     TRUE 0.967 0.000 0.139 NA   NA
 3505542 3505543 Rsph17025_0555 Rsph17025_0556     TRUE 0.945 12.000 0.046 NA Y NA
 3505543 3505544 Rsph17025_0556 Rsph17025_0557     FALSE 0.018 200.000 0.000 NA   NA
 3505545 3505546 Rsph17025_0558 Rsph17025_0559     TRUE 0.705 136.000 0.593 1.000   NA
 3505546 3505547 Rsph17025_0559 Rsph17025_0560     TRUE 0.993 4.000 0.220 0.076 Y NA
 3505547 3505548 Rsph17025_0560 Rsph17025_0561     TRUE 0.970 11.000 0.366 NA   NA
 3505548 3505549 Rsph17025_0561 Rsph17025_0562   tolB FALSE 0.455 68.000 0.070 NA   NA
 3505549 3505550 Rsph17025_0562 Rsph17025_0563 tolB   TRUE 0.819 85.000 0.592 1.000 N NA
 3505550 3505551 Rsph17025_0563 Rsph17025_0564     TRUE 0.971 5.000 0.199 1.000   NA
 3505551 3505552 Rsph17025_0564 Rsph17025_0565     TRUE 0.954 0.000 0.085 1.000   NA
 3505552 3505553 Rsph17025_0565 Rsph17025_0566     FALSE 0.558 79.000 0.145 1.000 N NA
 3505553 3505554 Rsph17025_0566 Rsph17025_0567     FALSE 0.587 -97.000 0.015 1.000   NA
 3505554 3505555 Rsph17025_0567 Rsph17025_0568     FALSE 0.575 12.000 0.000 NA   NA
 3505555 3505556 Rsph17025_0568 Rsph17025_0569     FALSE 0.283 81.000 0.028 NA   NA
 3505556 3505557 Rsph17025_0569 Rsph17025_0570     FALSE 0.369 75.000 0.059 1.000 N NA
 3505557 3505558 Rsph17025_0570 Rsph17025_0571     TRUE 0.858 -3.000 0.059 1.000 N NA
 3505558 3505559 Rsph17025_0571 Rsph17025_0572     FALSE 0.168 137.000 0.036 NA   NA
 3505560 3505561 Rsph17025_0573 Rsph17025_0574     TRUE 0.921 28.000 0.460 1.000   NA
 3505562 3505563 Rsph17025_0575 Rsph17025_0576     FALSE 0.270 104.000 0.031 1.000   NA
 3505563 3505564 Rsph17025_0576 Rsph17025_0577     FALSE 0.307 76.000 0.032 NA   NA
 3505564 3505565 Rsph17025_0577 Rsph17025_0578     FALSE 0.074 158.000 0.016 NA   NA
 3505565 3505566 Rsph17025_0578 Rsph17025_0579     TRUE 0.654 62.000 0.167 NA   NA
 3505566 3505567 Rsph17025_0579 Rsph17025_0580     TRUE 0.980 5.000 0.071 1.000 Y NA
 3505567 3505568 Rsph17025_0580 Rsph17025_0581     TRUE 0.859 11.000 0.067 1.000 N NA
 3505568 3505569 Rsph17025_0581 Rsph17025_0582     TRUE 0.836 -3.000 0.039 NA   NA
 3505569 3505570 Rsph17025_0582 Rsph17025_0583     FALSE 0.006 269.000 0.000 NA   NA
 3505570 3505571 Rsph17025_0583 Rsph17025_0584     TRUE 0.986 -3.000 0.146 0.004 Y NA
 3505571 3505572 Rsph17025_0584 Rsph17025_0585     TRUE 0.984 -3.000 0.109 0.004 Y NA
 3505572 3505573 Rsph17025_0585 Rsph17025_0586     TRUE 0.711 -3.000 0.020 NA N NA
 3505573 3505574 Rsph17025_0586 Rsph17025_0587     TRUE 0.971 0.000 0.020 NA Y NA
 3505574 3505575 Rsph17025_0587 Rsph17025_0588     TRUE 0.995 -3.000 0.741 1.000 Y NA
 3505576 3505577 Rsph17025_0589 Rsph17025_R0007     FALSE 0.002 410.000 0.000 NA   NA
 3505578 3505579 Rsph17025_0590 Rsph17025_0591     TRUE 0.827 11.000 0.039 NA   NA
 3505579 3505580 Rsph17025_0591 Rsph17025_0592     TRUE 0.967 0.000 0.138 NA   NA
 3505580 3505581 Rsph17025_0592 Rsph17025_0593   hisD FALSE 0.061 229.000 0.096 NA   NA
 3505581 3505582 Rsph17025_0593 Rsph17025_0594 hisD   TRUE 0.969 4.000 0.157 NA   NA
 3505582 3505583 Rsph17025_0594 Rsph17025_0595     TRUE 0.993 3.000 0.768 NA   NA
 3505583 3505584 Rsph17025_0595 Rsph17025_0596     TRUE 0.877 -10.000 0.140 NA   NA
 3505584 3505585 Rsph17025_0596 Rsph17025_0597     TRUE 0.972 -3.000 0.364 NA   NA
 3505585 3505586 Rsph17025_0597 Rsph17025_0598     TRUE 0.929 24.000 0.437 1.000   NA
 3505586 3505587 Rsph17025_0598 Rsph17025_0599   infA FALSE 0.512 132.000 0.228 1.000   NA
 3505587 3505588 Rsph17025_0599 Rsph17025_0600 infA   TRUE 0.974 1.000 0.207 NA N NA
 3505588 3505589 Rsph17025_0600 Rsph17025_0601     TRUE 0.921 -3.000 0.133 NA N NA
 3505589 3505590 Rsph17025_0601 Rsph17025_0602     TRUE 0.941 -3.000 0.154 NA   NA
 3505590 3505591 Rsph17025_0602 Rsph17025_R0008     FALSE 0.129 89.000 0.000 NA   NA
 3505592 3505593 Rsph17025_0603 Rsph17025_0604     FALSE 0.064 139.000 0.000 NA   NA
 3505596 3505597 Rsph17025_0607 Rsph17025_0608     FALSE 0.509 14.000 0.000 NA   NA
 3505599 3505600 Rsph17025_0610 Rsph17025_0611     TRUE 0.982 -3.000 0.195 1.000 Y NA
 3505600 3505601 Rsph17025_0611 Rsph17025_0612     TRUE 0.993 -3.000 0.562 1.000 Y NA
 3505603 3505604 Rsph17025_0614 Rsph17025_0615     FALSE 0.486 71.000 0.064 0.061 N NA
 3505604 3505605 Rsph17025_0615 Rsph17025_0616     TRUE 0.937 2.000 0.059 NA   NA
 3505605 3505606 Rsph17025_0616 Rsph17025_0617     TRUE 0.903 -3.000 0.083 NA   NA
 3505606 3505607 Rsph17025_0617 Rsph17025_0618     TRUE 0.927 26.000 0.536 1.000 N NA
 3505607 3505608 Rsph17025_0618 Rsph17025_0619     FALSE 0.430 110.000 0.096 NA   NA
 3505608 3505609 Rsph17025_0619 Rsph17025_0620     TRUE 0.863 9.000 0.040 NA   NA
 3505609 3505610 Rsph17025_0620 Rsph17025_0621     TRUE 0.934 -3.000 0.129 1.000   NA
 3505610 3505611 Rsph17025_0621 Rsph17025_0622     TRUE 0.993 0.000 0.674 1.000   NA
 3505611 3505612 Rsph17025_0622 Rsph17025_0623     FALSE 0.179 144.000 0.049 NA   NA
 3505612 3505613 Rsph17025_0623 Rsph17025_0624     FALSE 0.590 38.000 0.070 NA   NA
 3505614 3505615 Rsph17025_0625 Rsph17025_0626     TRUE 0.980 5.000 0.026 0.004 Y NA
 3505615 3505616 Rsph17025_0626 Rsph17025_0627     FALSE 0.119 127.000 0.005 1.000   NA
 3505617 3505618 Rsph17025_0628 Rsph17025_0629     TRUE 0.751 53.000 0.237 NA   NA
 3505619 3505620 Rsph17025_0630 Rsph17025_0631     TRUE 0.880 12.000 0.082 NA   NA
 3505620 3505621 Rsph17025_0631 Rsph17025_0632     FALSE 0.166 112.000 0.013 NA   NA
 3505624 3505625 Rsph17025_0635 Rsph17025_0636     FALSE 0.072 108.000 0.000 1.000 N NA
 3505625 3505626 Rsph17025_0636 Rsph17025_0637     TRUE 0.669 25.000 0.069 1.000 N NA
 3505626 3505627 Rsph17025_0637 Rsph17025_0638     FALSE 0.022 192.000 0.007 1.000 N NA
 3505627 3505628 Rsph17025_0638 Rsph17025_0639     FALSE 0.403 93.000 0.065 1.000   NA
 3505628 3505629 Rsph17025_0639 Rsph17025_0640     FALSE 0.013 225.000 0.000 1.000   NA
 3505631 3505632 Rsph17025_0642 Rsph17025_0643 glyQ   TRUE 0.841 -3.000 0.041 NA   NA
 3505632 3505633 Rsph17025_0643 Rsph17025_0644     TRUE 0.895 0.000 0.028 NA   NA
 3505633 3505634 Rsph17025_0644 Rsph17025_0645     FALSE 0.174 119.000 0.030 1.000 N NA
 3505634 3505635 Rsph17025_0645 Rsph17025_0646     FALSE 0.332 206.000 0.630 1.000 N NA
 3505635 3505636 Rsph17025_0646 Rsph17025_0647     TRUE 0.868 68.000 0.750 1.000 N NA
 3505636 3505637 Rsph17025_0647 Rsph17025_0648     TRUE 0.752 46.000 0.036 1.000 Y NA
 3505637 3505638 Rsph17025_0648 Rsph17025_0649     TRUE 0.957 -3.000 0.260 1.000 N NA
 3505638 3505639 Rsph17025_0649 Rsph17025_0650     FALSE 0.149 94.000 0.003 NA   NA
 3505641 3505642 Rsph17025_0652 Rsph17025_0653     TRUE 0.997 -3.000 0.964 0.026 Y NA
 3505642 3505643 Rsph17025_0653 Rsph17025_0654     FALSE 0.214 153.000 0.098 1.000 N NA
 3505644 3505645 Rsph17025_0655 Rsph17025_0656     FALSE 0.323 52.000 0.021 NA   NA
 3505645 3505646 Rsph17025_0656 Rsph17025_0657     FALSE 0.194 82.000 0.007 NA   NA
 3505648 3505649 Rsph17025_0659 Rsph17025_0660     FALSE 0.065 169.000 0.020 NA   NA
 3505649 3505650 Rsph17025_0660 Rsph17025_0661     FALSE 0.013 216.000 0.000 NA   NA
 3505652 3505653 Rsph17025_0663 Rsph17025_0664     FALSE 0.608 23.000 0.036 NA   NA
 3505653 3505654 Rsph17025_0664 Rsph17025_0665   lipB FALSE 0.003 316.000 0.003 1.000 N NA
 3505655 3505656 Rsph17025_R0009 Rsph17025_0666     FALSE 0.004 290.000 0.000 NA   NA
 3505656 3505657 Rsph17025_0666 Rsph17025_0667     TRUE 0.787 72.000 0.108 1.000 Y NA
 3505657 3505658 Rsph17025_0667 Rsph17025_0668     TRUE 0.813 50.000 0.048 0.059 Y NA
 3505658 3505659 Rsph17025_0668 Rsph17025_0669     TRUE 0.927 78.000 0.386 0.059 Y NA
 3505659 3505660 Rsph17025_0669 Rsph17025_0670   rpmG FALSE 0.022 180.000 0.002 1.000 N NA
 3505661 3505662 Rsph17025_0671 Rsph17025_0672     FALSE 0.405 133.000 0.149 NA   NA
 3505665 3505666 Rsph17025_0675 Rsph17025_0676     TRUE 0.688 90.000 0.294 1.000 N NA
 3505669 3505670 Rsph17025_0679 Rsph17025_0680     FALSE 0.001 565.000 0.000 NA   NA
 3505671 3505672 Rsph17025_0681 Rsph17025_0682     FALSE 0.001 810.000 0.000 NA   NA
 3505672 3505673 Rsph17025_0682 Rsph17025_0683     TRUE 0.991 4.000 0.635 NA   NA
 3505673 3505674 Rsph17025_0683 Rsph17025_0684     TRUE 0.954 1.000 0.089 NA   NA
 3505674 3505675 Rsph17025_0684 Rsph17025_0685     TRUE 0.968 -3.000 0.315 NA   NA
 3505675 3505676 Rsph17025_0685 Rsph17025_0686   murE TRUE 0.936 18.000 0.091 1.000 Y NA
 3505676 3505677 Rsph17025_0686 Rsph17025_0687 murE   TRUE 0.949 91.000 0.569 0.002 Y NA
 3505677 3505678 Rsph17025_0687 Rsph17025_0688     TRUE 0.996 1.000 0.309 0.004 Y NA
 3505678 3505679 Rsph17025_0688 Rsph17025_0689     FALSE 0.031 180.000 0.002 NA   NA
 3505679 3505680 Rsph17025_0689 Rsph17025_0690     FALSE 0.113 105.000 0.000 NA   NA
 3505680 3505681 Rsph17025_0690 Rsph17025_0691     TRUE 0.696 -3.000 0.002 1.000   NA
 3505681 3505682 Rsph17025_0691 Rsph17025_0692     FALSE 0.108 116.000 0.000 1.000   NA
 3505682 3505683 Rsph17025_0692 Rsph17025_0693   murG TRUE 0.915 2.000 0.050 1.000 N NA
 3505683 3505684 Rsph17025_0693 Rsph17025_0694 murG murC TRUE 0.953 -3.000 0.036 1.000 Y NA
 3505684 3505685 Rsph17025_0694 Rsph17025_0695 murC   TRUE 0.677 11.000 0.004 NA   NA
 3505685 3505686 Rsph17025_0695 Rsph17025_0696     TRUE 0.714 -3.000 0.007 NA   NA
 3505686 3505687 Rsph17025_0696 Rsph17025_0697     TRUE 0.920 39.000 0.135 0.004 Y NA
 3505687 3505688 Rsph17025_0697 Rsph17025_0698     TRUE 0.978 -12.000 0.372 NA Y NA
 3505688 3505689 Rsph17025_0698 Rsph17025_0699     TRUE 0.923 -3.000 0.137 NA N NA
 3505689 3505690 Rsph17025_0699 Rsph17025_0700     FALSE 0.384 180.000 0.114 1.000 Y NA
 3505690 3505691 Rsph17025_0700 Rsph17025_0701   lpxC FALSE 0.308 145.000 0.134 1.000 N NA
 3505691 3505692 Rsph17025_0701 Rsph17025_0702 lpxC   FALSE 0.333 115.000 0.064 1.000   NA
 3505692 3505693 Rsph17025_0702 Rsph17025_0703     TRUE 0.775 28.000 0.117 1.000   NA
 3505694 3505695 Rsph17025_0704 Rsph17025_0705     TRUE 0.932 -3.000 0.130 NA   NA
 3505695 3505696 Rsph17025_0705 Rsph17025_0706     FALSE 0.211 137.000 0.053 NA   NA
 3505696 3505697 Rsph17025_0706 Rsph17025_0707     FALSE 0.288 204.000 0.436 NA   NA
 3505699 3505700 Rsph17025_0709 Rsph17025_0710     FALSE 0.211 187.000 0.205 NA   NA
 3505701 3505702 Rsph17025_0711 Rsph17025_0712     TRUE 0.984 15.000 0.460 1.000 Y NA
 3505702 3505703 Rsph17025_0712 Rsph17025_0713     TRUE 0.822 173.000 0.656 0.001 Y NA
 3505703 3505704 Rsph17025_0713 Rsph17025_0714     TRUE 0.819 -3.000 0.043 1.000 N NA
 3505704 3505705 Rsph17025_0714 Rsph17025_0715     TRUE 0.996 10.000 0.964 1.000 Y NA
 3505705 3505706 Rsph17025_0715 Rsph17025_0716     FALSE 0.001 482.000 0.000 1.000 N NA
 3505709 3505710 Rsph17025_0719 Rsph17025_0720     TRUE 0.976 -3.000 0.425 NA   NA
 3505710 3505711 Rsph17025_0720 Rsph17025_0721   fumC TRUE 0.905 0.000 0.033 NA   NA
 3505711 3505712 Rsph17025_0721 Rsph17025_0722 fumC   FALSE 0.116 169.000 0.054 NA   NA
 3505712 3505713 Rsph17025_0722 Rsph17025_0723     FALSE 0.199 102.000 0.016 NA   NA
 3505715 3505716 Rsph17025_0725 Rsph17025_0726     TRUE 0.983 -13.000 0.864 0.012   NA
 3505716 3505717 Rsph17025_0726 Rsph17025_0727     FALSE 0.001 1030.000 0.000 NA   NA
 3505717 3505718 Rsph17025_0727 Rsph17025_0728     FALSE 0.001 669.000 0.000 NA   NA
 3505719 3505720 Rsph17025_0729 Rsph17025_0730     FALSE 0.010 312.000 0.000 0.041   NA
 3505720 3505721 Rsph17025_0730 Rsph17025_0731     TRUE 0.985 -3.000 0.521 0.091   NA
 3505721 3505722 Rsph17025_0731 Rsph17025_0732     FALSE 0.003 315.000 0.000 NA   NA
 3505722 3505723 Rsph17025_0732 Rsph17025_0733     FALSE 0.142 79.000 0.000 NA   NA
 3505723 3505724 Rsph17025_0733 Rsph17025_0734     FALSE 0.142 76.000 0.000 NA   NA
 3505724 3505725 Rsph17025_0734 Rsph17025_0735     FALSE 0.231 38.000 0.000 NA   NA
 3505725 3505726 Rsph17025_0735 Rsph17025_0736     FALSE 0.005 280.000 0.000 NA   NA
 3505726 3505727 Rsph17025_0736 Rsph17025_0737     FALSE 0.120 100.000 0.000 NA   NA
 3505728 3505729 Rsph17025_0738 Rsph17025_0739     FALSE 0.136 85.000 0.000 NA   NA
 3505729 3505730 Rsph17025_0739 Rsph17025_0740     TRUE 0.891 1.000 0.000 0.091   NA
 3505730 3505731 Rsph17025_0740 Rsph17025_0741     TRUE 0.981 -3.000 0.400 0.091   NA
 3505731 3505732 Rsph17025_0741 Rsph17025_0742     FALSE 0.006 276.000 0.000 1.000   NA
 3505732 3505733 Rsph17025_0742 Rsph17025_0743     TRUE 0.807 -3.000 0.029 NA   NA
 3505733 3505734 Rsph17025_0743 Rsph17025_0744     FALSE 0.002 420.000 0.000 NA   NA
 3505734 3505735 Rsph17025_0744 Rsph17025_0745     TRUE 0.741 5.000 0.000 NA   NA
 3505735 3505736 Rsph17025_0745 Rsph17025_0746     TRUE 0.764 -3.000 0.017 NA   NA
 3505736 3505737 Rsph17025_0746 Rsph17025_0747     FALSE 0.171 58.000 0.000 NA   NA
 3505737 3505738 Rsph17025_0747 Rsph17025_0748     FALSE 0.066 233.000 0.000 1.000 Y NA
 3505738 3505739 Rsph17025_0748 Rsph17025_0749     TRUE 0.976 -3.000 0.118 1.000 Y NA
 3505739 3505740 Rsph17025_0749 Rsph17025_0750     TRUE 0.899 -10.000 0.000 0.059 Y NA
 3505740 3505741 Rsph17025_0750 Rsph17025_0751     TRUE 0.655 66.000 0.000 0.059 Y NA
 3505741 3505742 Rsph17025_0751 Rsph17025_0752     FALSE 0.297 20.000 0.000 1.000 N NA
 3505744 3505745 Rsph17025_0754 Rsph17025_0755     TRUE 0.910 -25.000 0.242 NA   NA
 3505745 3505746 Rsph17025_0755 Rsph17025_0756     FALSE 0.570 55.000 0.094 NA   NA
 3505746 3505747 Rsph17025_0756 Rsph17025_0757     TRUE 0.927 26.000 0.562 NA N NA
 3505748 3505749 Rsph17025_0758 Rsph17025_0759     FALSE 0.565 45.000 0.074 NA   NA
 3505749 3505750 Rsph17025_0759 Rsph17025_0760     FALSE 0.117 103.000 0.000 NA   NA
 3505751 3505752 Rsph17025_0761 Rsph17025_0762     TRUE 0.994 -3.000 0.728 1.000 Y NA
 3505752 3505753 Rsph17025_0762 Rsph17025_0763     TRUE 0.897 46.000 0.209 1.000 Y NA
 3505754 3505755 Rsph17025_0764 Rsph17025_0765     TRUE 0.960 11.000 0.028 0.058 Y NA
 3505755 3505756 Rsph17025_0765 Rsph17025_0766     TRUE 0.996 0.000 0.472 1.000 Y NA
 3505756 3505757 Rsph17025_0766 Rsph17025_0767     FALSE 0.016 183.000 0.000 1.000 N NA
 3505757 3505758 Rsph17025_0767 Rsph17025_0768     TRUE 0.988 -3.000 0.306 1.000 Y NA
 3505758 3505759 Rsph17025_0768 Rsph17025_0769     TRUE 0.991 0.000 0.548 1.000   NA
 3505760 3505761 Rsph17025_0770 Rsph17025_0771     FALSE 0.231 38.000 0.000 NA   NA
 3505761 3505762 Rsph17025_0771 Rsph17025_0772     FALSE 0.021 199.000 0.000 1.000   NA
 3505762 3505763 Rsph17025_0772 Rsph17025_0773     TRUE 0.998 0.000 0.800 0.004 Y NA
 3505763 3505764 Rsph17025_0773 Rsph17025_0774     TRUE 0.991 2.000 0.364 0.004 N NA
 3505764 3505765 Rsph17025_0774 Rsph17025_0775     FALSE 0.556 51.000 0.075 1.000   NA
 3505766 3505767 Rsph17025_0776 Rsph17025_0777     FALSE 0.087 89.000 0.000 1.000 N NA
 3505767 3505768 Rsph17025_0777 Rsph17025_0778     TRUE 0.994 13.000 0.795 0.058 Y NA
 3505768 3505769 Rsph17025_0778 Rsph17025_0779     TRUE 0.990 9.000 0.318 1.000 Y NA
 3505770 3505771 Rsph17025_0780 Rsph17025_0781     FALSE 0.373 -7.000 0.000 1.000 N NA
 3505771 3505772 Rsph17025_0781 Rsph17025_0782     TRUE 0.833 -3.000 0.049 1.000 N NA
 3505772 3505773 Rsph17025_0782 Rsph17025_0783     FALSE 0.087 65.000 0.000 NA N NA
 3505773 3505774 Rsph17025_0783 Rsph17025_0784     TRUE 0.867 34.000 0.091 NA Y NA
 3505774 3505775 Rsph17025_0784 Rsph17025_0785     TRUE 0.991 -10.000 0.914 1.000 Y NA
 3505776 3505777 Rsph17025_0786 Rsph17025_0787     FALSE 0.327 15.000 0.000 NA N NA
 3505777 3505778 Rsph17025_0787 Rsph17025_0788     FALSE 0.117 103.000 0.000 NA   NA
 3505779 3505780 Rsph17025_0789 Rsph17025_0790     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505780 3505781 Rsph17025_0790 Rsph17025_0791     TRUE 0.767 4.000 0.000 NA   NA
 3505781 3505782 Rsph17025_0791 Rsph17025_0792     TRUE 0.954 11.000 0.045 1.000 Y NA
 3505782 3505783 Rsph17025_0792 Rsph17025_0793     TRUE 0.996 4.000 0.935 0.002 N NA
 3505783 3505784 Rsph17025_0793 Rsph17025_0794     TRUE 0.928 2.000 0.010 0.003 N NA
 3505784 3505785 Rsph17025_0794 Rsph17025_0795     FALSE 0.156 65.000 0.000 NA   NA
 3505786 3505787 Rsph17025_0796 Rsph17025_0797     FALSE 0.008 240.000 0.000 NA   NA
 3505787 3505788 Rsph17025_0797 Rsph17025_0798     FALSE 0.153 66.000 0.000 NA   NA
 3505788 3505789 Rsph17025_0798 Rsph17025_0799     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505789 3505790 Rsph17025_0799 Rsph17025_0800     FALSE 0.168 59.000 0.000 NA   NA
 3505790 3505791 Rsph17025_0800 Rsph17025_0801     FALSE 0.011 226.000 0.000 NA   NA
 3505793 3505794 Rsph17025_0803 Rsph17025_0804     FALSE 0.344 154.000 0.000 0.040 Y NA
 3505795 3505796 Rsph17025_0805 Rsph17025_0806     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505796 3505797 Rsph17025_0806 Rsph17025_0807     TRUE 0.961 -3.000 0.256 NA   NA
 3505797 3505798 Rsph17025_0807 Rsph17025_0808     FALSE 0.001 615.000 0.000 NA   NA
 3505798 3505799 Rsph17025_0808 Rsph17025_0809     FALSE 0.002 450.000 0.000 NA   NA
 3505801 3505802 Rsph17025_0811 Rsph17025_0812     FALSE 0.003 340.000 0.000 NA   NA
 3505803 3505804 Rsph17025_0814 Rsph17025_0815     FALSE 0.048 182.000 0.029 1.000 N NA
 3505804 3505805 Rsph17025_0815 Rsph17025_0816     FALSE 0.432 38.000 0.041 1.000 N NA
 3505805 3505806 Rsph17025_0816 Rsph17025_0817     TRUE 0.926 24.000 0.435 NA   NA
 3505806 3505807 Rsph17025_0817 Rsph17025_0818     TRUE 0.933 -3.000 0.132 NA   NA
 3505807 3505808 Rsph17025_0818 Rsph17025_0819     FALSE 0.423 123.000 0.114 1.000   NA
 3505808 3505809 Rsph17025_0819 Rsph17025_0820     TRUE 0.946 5.000 0.114 NA N NA
 3505809 3505810 Rsph17025_0820 Rsph17025_0821     TRUE 0.971 0.000 0.159 NA   NA
 3505811 3505812 Rsph17025_0822 Rsph17025_0823     TRUE 0.867 0.000 0.013 1.000   NA
 3505812 3505813 Rsph17025_0823 Rsph17025_0824     FALSE 0.011 306.000 0.000 0.017   NA
 3505814 3505815 Rsph17025_0825 Rsph17025_R0010     FALSE 0.181 54.000 0.000 NA   NA
 3505819 3505820 Rsph17025_0829 Rsph17025_0830     FALSE 0.142 78.000 0.000 NA   NA
 3505820 3505821 Rsph17025_0830 Rsph17025_0831     FALSE 0.028 177.000 0.000 NA   NA
 3505822 3505823 Rsph17025_R0011 Rsph17025_0832     FALSE 0.143 71.000 0.000 NA   NA
 3505823 3505824 Rsph17025_0832 Rsph17025_0833   glpX TRUE 0.848 -3.000 0.055 1.000 N NA
 3505824 3505825 Rsph17025_0833 Rsph17025_0834 glpX   FALSE 0.549 62.000 0.112 1.000 N NA
 3505827 3505828 Rsph17025_0836 Rsph17025_0837     TRUE 0.924 -3.000 0.111 NA   NA
 3505828 3505829 Rsph17025_0837 Rsph17025_0838     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 3505830 3505831 Rsph17025_0839 Rsph17025_0840   dnaG FALSE 0.036 156.000 0.002 1.000 N NA
 3505831 3505832 Rsph17025_0840 Rsph17025_0841 dnaG   FALSE 0.494 142.000 0.299 1.000 N NA
 3505832 3505833 Rsph17025_0841 Rsph17025_0842     TRUE 0.642 12.000 0.004 NA   NA
 3505833 3505834 Rsph17025_0842 Rsph17025_0843     FALSE 0.006 271.000 0.000 NA   NA
 3505834 3505835 Rsph17025_0843 Rsph17025_0844     TRUE 0.926 15.000 0.277 NA N NA
 3505837 3505838 Rsph17025_0846 Rsph17025_0847     TRUE 0.981 0.000 0.295 1.000 N NA
 3505838 3505839 Rsph17025_0847 Rsph17025_0848     FALSE 0.293 38.000 0.005 NA   NA
 3505839 3505840 Rsph17025_0848 Rsph17025_0849     FALSE 0.201 66.000 0.006 NA   NA
 3505841 3505842 Rsph17025_0850 Rsph17025_0851     FALSE 0.001 497.000 0.000 1.000 N NA
 3505845 3505846 Rsph17025_0854 Rsph17025_0855     FALSE 0.242 126.000 0.049 NA   NA
 3505846 3505847 Rsph17025_0855 Rsph17025_0856     FALSE 0.155 127.000 0.021 NA   NA
 3505848 3505849 Rsph17025_0857 Rsph17025_0858     FALSE 0.112 106.000 0.000 NA   NA
 3505849 3505850 Rsph17025_0858 Rsph17025_0859     FALSE 0.007 258.000 0.000 NA   NA
 3505850 3505851 Rsph17025_0859 Rsph17025_0860     FALSE 0.032 172.000 0.000 NA   NA
 3505853 3505854 Rsph17025_0862 Rsph17025_0863     FALSE 0.190 58.000 0.000 1.000   NA
 3505854 3505855 Rsph17025_0863 Rsph17025_0864     TRUE 0.994 -3.000 0.706 1.000 Y NA
 3505855 3505856 Rsph17025_0864 Rsph17025_0865     TRUE 0.979 5.000 0.329 1.000 N NA
 3505856 3505857 Rsph17025_0865 Rsph17025_0866     TRUE 0.732 61.000 0.278 1.000 N NA
 3505857 3505858 Rsph17025_0866 Rsph17025_0867     TRUE 0.995 5.000 0.481 1.000 Y NA
 3505858 3505859 Rsph17025_0867 Rsph17025_0868     TRUE 0.997 -3.000 1.000 0.058 Y NA
 3505859 3505860 Rsph17025_0868 Rsph17025_0869     TRUE 0.974 41.000 0.724 0.058 Y NA
 3505860 3505861 Rsph17025_0869 Rsph17025_0870     TRUE 0.971 38.000 0.774 1.000 Y NA
 3505861 3505862 Rsph17025_0870 Rsph17025_0871     FALSE 0.543 136.000 0.290 NA   NA
 3505862 3505863 Rsph17025_0871 Rsph17025_0872     FALSE 0.561 20.000 0.017 NA   NA
 3505863 3505864 Rsph17025_0872 Rsph17025_0873     FALSE 0.047 162.000 0.003 NA   NA
 3505864 3505865 Rsph17025_0873 Rsph17025_0874   secG FALSE 0.159 163.000 0.083 1.000 N NA
 3505866 3505867 Rsph17025_0875 Rsph17025_0876     FALSE 0.364 53.000 0.030 NA   NA
 3505868 3505869 Rsph17025_0877 Rsph17025_0878     FALSE 0.011 233.000 0.000 1.000   NA
 3505871 3505872 Rsph17025_0880 Rsph17025_0881     FALSE 0.089 128.000 0.000 1.000   NA
 3505872 3505873 Rsph17025_0881 Rsph17025_0882     FALSE 0.365 118.000 0.083 NA   NA
 3505874 3505875 Rsph17025_0883 Rsph17025_0884     TRUE 0.866 3.000 0.026 1.000 N NA
 3505875 3505876 Rsph17025_0884 Rsph17025_0885     FALSE 0.313 57.000 0.032 1.000 N NA
 3505876 3505877 Rsph17025_0885 Rsph17025_0886     TRUE 0.999 0.000 0.947 0.008 Y NA
 3505877 3505878 Rsph17025_0886 Rsph17025_0887     TRUE 0.632 146.000 0.084 0.008 Y NA
 3505882 3505883 Rsph17025_0890 Rsph17025_0891     TRUE 0.637 -7.000 0.017 NA   NA
 3505884 3505885 Rsph17025_0892 Rsph17025_0893     TRUE 0.678 60.000 0.216 NA N NA
 3505885 3505886 Rsph17025_0893 Rsph17025_0894     FALSE 0.349 116.000 0.093 NA N NA
 3505886 3505887 Rsph17025_0894 Rsph17025_0895     FALSE 0.001 439.000 0.000 1.000 N NA
 3505888 3505889 Rsph17025_0896 Rsph17025_0897     FALSE 0.041 157.000 0.005 1.000 N NA
 3505889 3505890 Rsph17025_0897 Rsph17025_0898   argC FALSE 0.476 25.000 0.025 1.000 N NA
 3505890 3505891 Rsph17025_0898 Rsph17025_0899 argC   FALSE 0.522 25.000 0.032 1.000 N NA
 3505891 3505892 Rsph17025_0899 Rsph17025_0900     FALSE 0.086 174.000 0.036 1.000   NA
 3505892 3505893 Rsph17025_0900 Rsph17025_0901     TRUE 0.898 30.000 0.389 NA   NA
 3505893 3505894 Rsph17025_0901 Rsph17025_0902     FALSE 0.164 75.000 0.002 NA   NA
 3505894 3505895 Rsph17025_0902 Rsph17025_0903     FALSE 0.275 71.000 0.025 NA   NA
 3505895 3505896 Rsph17025_0903 Rsph17025_0904     TRUE 0.906 -3.000 0.085 NA   NA
 3505896 3505897 Rsph17025_0904 Rsph17025_0905     TRUE 0.843 -13.000 0.103 NA   NA
 3505897 3505898 Rsph17025_0905 Rsph17025_0906     TRUE 0.991 0.000 0.570 NA   NA
 3505898 3505899 Rsph17025_0906 Rsph17025_0907     FALSE 0.003 335.000 0.000 NA   NA
 3505900 3505901 Rsph17025_0908 Rsph17025_0909     FALSE 0.162 69.000 0.000 1.000   NA
 3505902 3505903 Rsph17025_0910 Rsph17025_R0013     FALSE 0.107 109.000 0.000 NA   NA
 3505903 3505904 Rsph17025_R0013 Rsph17025_0911     FALSE 0.001 561.000 0.000 NA   NA
 3505904 3505905 Rsph17025_0911 Rsph17025_0912     FALSE 0.030 174.000 0.000 NA   NA
 3505906 3505907 Rsph17025_0913 Rsph17025_0914     FALSE 0.002 365.000 0.000 NA   NA
 3505907 3505908 Rsph17025_0914 Rsph17025_0915     FALSE 0.161 62.000 0.000 NA   NA
 3505908 3505909 Rsph17025_0915 Rsph17025_0916     TRUE 0.939 69.000 0.667 NA Y NA
 3505909 3505910 Rsph17025_0916 Rsph17025_0917     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 3505910 3505911 Rsph17025_0917 Rsph17025_0918     FALSE 0.344 24.000 0.000 NA   NA
 3505912 3505913 Rsph17025_0919 Rsph17025_0920     FALSE 0.005 272.000 0.000 NA   NA
 3505914 3505915 Rsph17025_0921 Rsph17025_0922     TRUE 0.948 2.000 0.075 NA   NA
 3505915 3505916 Rsph17025_0922 Rsph17025_0923     TRUE 0.996 -3.000 0.775 0.057 Y NA
 3505916 3505917 Rsph17025_0923 Rsph17025_0924     TRUE 0.991 4.000 0.190 1.000 Y NA
 3505917 3505918 Rsph17025_0924 Rsph17025_0925     TRUE 0.950 78.000 0.582 0.031 Y NA
 3505918 3505919 Rsph17025_0925 Rsph17025_0926     TRUE 0.807 129.000 0.333 NA Y NA
 3505919 3505920 Rsph17025_0926 Rsph17025_0927     FALSE 0.004 247.000 0.000 NA N NA
 3505921 3505922 Rsph17025_0928 Rsph17025_0929 anmK   FALSE 0.004 290.000 0.000 NA   NA
 3505923 3505924 Rsph17025_0930 Rsph17025_0931     FALSE 0.398 37.000 0.018 1.000   NA
 3505924 3505925 Rsph17025_0931 Rsph17025_0932     FALSE 0.304 92.000 0.035 1.000   NA
 3505926 3505927 Rsph17025_0933 Rsph17025_0934     FALSE 0.003 349.000 0.000 1.000   NA
 3505927 3505928 Rsph17025_0934 Rsph17025_0935     FALSE 0.005 298.000 0.000 1.000   NA
 3505928 3505929 Rsph17025_0935 Rsph17025_0936     FALSE 0.316 27.000 0.000 NA   NA
 3505930 3505931 Rsph17025_0937 Rsph17025_0938     FALSE 0.186 52.000 0.000 NA   NA
 3505931 3505932 Rsph17025_0938 Rsph17025_0939     FALSE 0.002 412.000 0.000 NA   NA
 3505933 3505934 Rsph17025_0940 Rsph17025_0941     FALSE 0.006 268.000 0.000 NA   NA
 3505934 3505935 Rsph17025_0941 Rsph17025_0942     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505938 3505939 Rsph17025_0945 Rsph17025_0946     TRUE 0.750 40.000 0.182 NA   NA
 3505939 3505940 Rsph17025_0946 Rsph17025_0947     FALSE 0.410 57.000 0.045 NA   NA
 3505940 3505941 Rsph17025_0947 Rsph17025_0948     TRUE 0.986 17.000 0.461 0.057 Y NA
 3505941 3505942 Rsph17025_0948 Rsph17025_0949     TRUE 0.990 -3.000 0.774 0.057   NA
 3505942 3505943 Rsph17025_0949 Rsph17025_0950     FALSE 0.580 147.000 0.301 0.057   NA
 3505944 3505945 Rsph17025_0951 Rsph17025_0952     TRUE 0.982 -3.000 0.591 1.000   NA
 3505945 3505946 Rsph17025_0952 Rsph17025_0953     TRUE 0.977 -10.000 0.864 1.000   NA
 3505946 3505947 Rsph17025_0953 Rsph17025_0954     TRUE 0.992 -3.000 0.976 0.057   NA
 3505947 3505948 Rsph17025_0954 Rsph17025_0955     TRUE 0.970 0.000 0.151 1.000   NA
 3505948 3505949 Rsph17025_0955 Rsph17025_0956     FALSE 0.035 190.000 0.012 NA   NA
 3505949 3505950 Rsph17025_0956 Rsph17025_0957     FALSE 0.091 128.000 0.002 NA   NA
 3505950 3505951 Rsph17025_0957 Rsph17025_0958     FALSE 0.178 71.000 0.002 1.000   NA
 3505951 3505952 Rsph17025_0958 Rsph17025_0959     TRUE 0.978 -3.000 0.446 1.000   NA
 3505954 3505955 Rsph17025_0961 Rsph17025_0962     TRUE 0.953 33.000 1.000 NA   NA
 3505955 3505956 Rsph17025_0962 Rsph17025_0963     TRUE 0.995 0.000 1.000 NA   NA
 3505956 3505957 Rsph17025_0963 Rsph17025_0964     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 3505957 3505958 Rsph17025_0964 Rsph17025_0965     TRUE 0.979 -15.000 1.000 1.000   NA
 3505959 3505960 Rsph17025_0966 Rsph17025_0967     FALSE 0.146 136.000 0.041 NA N NA
 3505963 3505964 Rsph17025_0970 Rsph17025_0971     TRUE 0.987 14.000 0.794 0.002   NA
 3505964 3505965 Rsph17025_0971 Rsph17025_0972     TRUE 0.988 -3.000 0.529 0.002   NA
 3505965 3505966 Rsph17025_0972 Rsph17025_0973     TRUE 0.993 5.000 0.590 0.002   NA
 3505966 3505967 Rsph17025_0973 Rsph17025_0974     TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 3505967 3505968 Rsph17025_0974 Rsph17025_0975     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3505968 3505969 Rsph17025_0975 Rsph17025_0976     TRUE 0.824 -3.000 0.034 NA   NA
 3505969 3505970 Rsph17025_0976 Rsph17025_0977     FALSE 0.313 75.000 0.034 NA   NA
 3505971 3505972 Rsph17025_0978 Rsph17025_0979     FALSE 0.002 387.000 0.000 NA   NA
 3505972 3505973 Rsph17025_0979 Rsph17025_0980     FALSE 0.203 194.000 0.222 NA   NA
 3505973 3505974 Rsph17025_0980 Rsph17025_0981     TRUE 0.988 16.000 1.000 0.003   NA
 3505974 3505975 Rsph17025_0981 Rsph17025_0982     FALSE 0.002 438.000 0.000 1.000   NA
 3505975 3505976 Rsph17025_0982 Rsph17025_0983     TRUE 0.959 8.000 0.176 NA   NA
 3505977 3505978 Rsph17025_0984 Rsph17025_0985   ureA TRUE 0.987 11.000 0.664 0.003 N NA
 3505978 3505979 Rsph17025_0985 Rsph17025_0986 ureA ureB TRUE 0.969 51.000 0.595 0.001 Y NA
 3505979 3505980 Rsph17025_0986 Rsph17025_0987 ureB   FALSE 0.441 25.000 0.010 NA   NA
 3505980 3505981 Rsph17025_0987 Rsph17025_0988   ureC FALSE 0.004 334.000 0.006 NA   NA
 3505983 3505984 Rsph17025_0990 Rsph17025_0991 ureE   TRUE 0.993 -3.000 0.330 0.003 Y NA
 3505984 3505985 Rsph17025_0991 Rsph17025_0992     TRUE 0.991 -3.000 0.283 0.003 Y NA
 3505985 3505986 Rsph17025_0992 Rsph17025_0993     FALSE 0.004 300.000 0.010 NA N NA
 3505986 3505987 Rsph17025_0993 Rsph17025_0994     TRUE 0.804 85.000 0.150 NA Y NA
 3505987 3505988 Rsph17025_0994 Rsph17025_0995     TRUE 0.917 34.000 0.121 0.057 Y NA
 3505988 3505989 Rsph17025_0995 Rsph17025_0996     TRUE 0.988 -3.000 0.823 1.000   NA
 3505989 3505990 Rsph17025_0996 Rsph17025_0997     TRUE 0.995 2.000 0.731 0.031   NA
 3505991 3505992 Rsph17025_0998 Rsph17025_0999     FALSE 0.003 328.000 0.000 NA   NA
 3505992 3505993 Rsph17025_0999 Rsph17025_1000     TRUE 0.802 62.000 0.375 NA   NA
 3505993 3505994 Rsph17025_1000 Rsph17025_1001     TRUE 0.972 -3.000 0.361 NA   NA
 3505994 3505995 Rsph17025_1001 Rsph17025_1002     TRUE 0.937 22.000 0.481 NA   NA
 3505995 3505996 Rsph17025_1002 Rsph17025_1003     TRUE 0.840 65.000 0.515 NA   NA
 3505996 3505997 Rsph17025_1003 Rsph17025_1004     TRUE 0.840 119.000 0.912 NA   NA
 3505997 3505998 Rsph17025_1004 Rsph17025_1005     TRUE 0.938 19.000 0.382 NA   NA
 3505998 3505999 Rsph17025_1005 Rsph17025_1006     TRUE 0.924 -3.000 0.111 NA   NA
 3505999 3506000 Rsph17025_1006 Rsph17025_1007   chlL TRUE 0.853 44.000 0.274 0.004 N NA
 3506000 3506001 Rsph17025_1007 Rsph17025_1008 chlL bchH TRUE 0.834 66.000 0.344 0.004 N NA
 3506001 3506002 Rsph17025_1008 Rsph17025_1009 bchH   TRUE 0.950 -10.000 0.278 0.004 N NA
 3506002 3506003 Rsph17025_1009 Rsph17025_1010     TRUE 0.957 71.000 0.591 0.001 Y NA
 3506003 3506004 Rsph17025_1010 Rsph17025_1011     TRUE 0.981 -3.000 0.311 0.001   NA
 3506005 3506006 Rsph17025_1012 Rsph17025_1013     TRUE 0.863 38.000 0.357 1.000   NA
 3506006 3506007 Rsph17025_1013 Rsph17025_1014     FALSE 0.147 147.000 0.035 1.000   NA
 3506007 3506008 Rsph17025_1014 Rsph17025_1015     TRUE 0.981 7.000 0.368 1.000   NA
 3506008 3506009 Rsph17025_1015 Rsph17025_1016     FALSE 0.589 74.000 0.060 0.002   NA
 3506009 3506010 Rsph17025_1016 Rsph17025_1017     TRUE 0.988 -3.000 0.640 0.058   NA
 3506010 3506011 Rsph17025_1017 Rsph17025_1018     TRUE 0.985 3.000 0.314 1.000   NA
 3506011 3506012 Rsph17025_1018 Rsph17025_1019     TRUE 0.727 -9.000 0.050 1.000 N NA
 3506013 3506014 Rsph17025_1020 Rsph17025_1021   bchD TRUE 0.966 3.000 0.152 1.000 N NA
 3506014 3506015 Rsph17025_1021 Rsph17025_1022 bchD bchI TRUE 0.956 60.000 0.465 0.001 Y NA
 3506015 3506016 Rsph17025_1022 Rsph17025_1023 bchI   TRUE 0.958 5.000 0.131 NA   NA
 3506017 3506018 Rsph17025_1024 Rsph17025_1025     TRUE 0.966 -3.000 0.332 1.000 N NA
 3506018 3506019 Rsph17025_1025 Rsph17025_1026     FALSE 0.548 30.000 0.050 1.000 N NA
 3506020 3506021 Rsph17025_1027 Rsph17025_1028     TRUE 0.859 5.000 0.018 1.000   NA
 3506021 3506022 Rsph17025_1028 Rsph17025_1029     TRUE 0.949 -3.000 0.179 1.000   NA
 3506022 3506023 Rsph17025_1029 Rsph17025_1030     TRUE 0.902 29.000 0.391 NA   NA
 3506028 3506029 Rsph17025_1035 Rsph17025_1036     FALSE 0.505 49.000 0.057 1.000   NA
 3506029 3506030 Rsph17025_1036 Rsph17025_1037     FALSE 0.405 34.000 0.029 1.000 N NA
 3506030 3506031 Rsph17025_1037 Rsph17025_1038     TRUE 0.982 11.000 0.212 1.000 Y NA
 3506032 3506033 Rsph17025_1039 Rsph17025_1040     FALSE 0.001 616.000 0.000 NA   NA
 3506035 3506036 Rsph17025_1042 Rsph17025_1043     TRUE 0.996 4.000 0.364 0.014 Y NA
 3506036 3506037 Rsph17025_1043 Rsph17025_1044     FALSE 0.003 339.000 0.006 1.000 N NA
 3506038 3506039 Rsph17025_1045 Rsph17025_1046     FALSE 0.000 670.000 0.000 NA N NA
 3506040 3506041 Rsph17025_1047 Rsph17025_1048     FALSE 0.121 87.000 0.004 1.000 N NA
 3506041 3506042 Rsph17025_1048 Rsph17025_1049     TRUE 0.661 28.000 0.076 1.000 N NA
 3506042 3506043 Rsph17025_1049 Rsph17025_1050     TRUE 0.844 10.000 0.048 1.000 N NA
 3506043 3506044 Rsph17025_1050 Rsph17025_1051     TRUE 0.974 2.000 0.207 1.000 N NA
 3506045 3506046 Rsph17025_1052 Rsph17025_1053     FALSE 0.229 116.000 0.046 1.000 N NA
 3506046 3506047 Rsph17025_1053 Rsph17025_1054     TRUE 0.889 21.000 0.226 NA   NA
 3506050 3506051 Rsph17025_1057 Rsph17025_1058     TRUE 0.688 129.000 0.333 0.058   NA
 3506055 3506056 Rsph17025_1061 Rsph17025_1062     FALSE 0.352 131.000 0.100 1.000   NA
 3506056 3506057 Rsph17025_1062 Rsph17025_1063     FALSE 0.527 84.000 0.101 1.000   NA
 3506057 3506058 Rsph17025_1063 Rsph17025_1064     TRUE 0.819 19.000 0.094 1.000   NA
 3506058 3506059 Rsph17025_1064 Rsph17025_1065     FALSE 0.219 67.000 0.010 NA   NA
 3506059 3506060 Rsph17025_1065 Rsph17025_1066     TRUE 0.941 2.000 0.065 NA   NA
 3506060 3506061 Rsph17025_1066 Rsph17025_1067     TRUE 0.981 -3.000 0.178 1.000 Y NA
 3506061 3506062 Rsph17025_1067 Rsph17025_1068     TRUE 0.884 -3.000 0.077 1.000 N NA
 3506063 3506064 Rsph17025_1069 Rsph17025_1070   acpP TRUE 0.682 178.000 0.321 0.004 Y NA
 3506064 3506065 Rsph17025_1070 Rsph17025_1071 acpP   FALSE 0.032 443.000 0.106 1.000 Y NA
 3506065 3506066 Rsph17025_1071 Rsph17025_1072     TRUE 0.967 0.000 0.134 NA   NA
 3506066 3506067 Rsph17025_1072 Rsph17025_1073     FALSE 0.203 75.000 0.009 NA   NA
 3506067 3506068 Rsph17025_1073 Rsph17025_1074     TRUE 0.885 47.000 0.571 NA   NA
 3506068 3506069 Rsph17025_1074 Rsph17025_1075     TRUE 0.671 89.000 0.242 NA   NA
 3506069 3506070 Rsph17025_1075 Rsph17025_1076     TRUE 0.980 2.000 0.242 NA   NA
 3506070 3506071 Rsph17025_1076 Rsph17025_1077     TRUE 0.991 5.000 0.688 NA   NA
 3506071 3506072 Rsph17025_1077 Rsph17025_1078     TRUE 0.849 66.000 0.578 NA   NA
 3506072 3506073 Rsph17025_1078 Rsph17025_1079     TRUE 0.825 90.000 0.600 NA   NA
 3506073 3506074 Rsph17025_1079 Rsph17025_1080     TRUE 0.981 0.000 0.267 NA   NA
 3506074 3506075 Rsph17025_1080 Rsph17025_1081     TRUE 0.966 -3.000 0.291 NA   NA
 3506075 3506076 Rsph17025_1081 Rsph17025_1082     TRUE 0.853 34.000 0.299 NA   NA
 3506076 3506077 Rsph17025_1082 Rsph17025_1083     TRUE 0.991 0.000 0.577 NA   NA
 3506077 3506078 Rsph17025_1083 Rsph17025_1084     TRUE 0.991 2.000 0.578 NA   NA
 3506078 3506079 Rsph17025_1084 Rsph17025_1085     TRUE 0.974 -10.000 0.800 NA   NA
 3506079 3506080 Rsph17025_1085 Rsph17025_1086     TRUE 0.986 10.000 0.678 NA   NA
 3506080 3506081 Rsph17025_1086 Rsph17025_1087     TRUE 0.989 0.000 0.475 NA   NA
 3506081 3506082 Rsph17025_1087 Rsph17025_1088     TRUE 0.989 -3.000 0.929 NA   NA
 3506082 3506083 Rsph17025_1088 Rsph17025_1089     TRUE 0.994 0.000 0.871 NA   NA
 3506083 3506084 Rsph17025_1089 Rsph17025_1090     TRUE 0.973 4.000 0.194 NA   NA
 3506084 3506085 Rsph17025_1090 Rsph17025_1091     TRUE 0.820 -7.000 0.071 NA   NA
 3506086 3506087 Rsph17025_1092 Rsph17025_1093     TRUE 0.985 11.000 0.254 1.000 Y NA
 3506087 3506088 Rsph17025_1093 Rsph17025_1094     TRUE 0.992 13.000 0.456 0.001 Y NA
 3506088 3506089 Rsph17025_1094 Rsph17025_1095     FALSE 0.080 212.000 0.104 1.000 N NA
 3506089 3506090 Rsph17025_1095 Rsph17025_1096     FALSE 0.028 174.000 0.004 1.000 N NA
 3506090 3506091 Rsph17025_1096 Rsph17025_1097   pgk FALSE 0.521 102.000 0.004 1.000 Y NA
 3506092 3506093 Rsph17025_1098 Rsph17025_1099     TRUE 0.990 -10.000 0.551 0.002 Y NA
 3506097 3506098 Rsph17025_1103 Rsph17025_1104     TRUE 0.982 3.000 0.276 NA   NA
 3506098 3506099 Rsph17025_1104 Rsph17025_1105     TRUE 0.814 -3.000 0.027 1.000   NA
 3506099 3506100 Rsph17025_1105 Rsph17025_1106     FALSE 0.048 157.000 0.000 1.000   NA
 3506101 3506102 Rsph17025_1107 Rsph17025_1108     FALSE 0.085 92.000 0.000 1.000 N NA
 3506102 3506103 Rsph17025_1108 Rsph17025_1109   mazG FALSE 0.229 75.000 0.011 1.000   NA
 3506104 3506105 Rsph17025_1110 Rsph17025_1111     FALSE 0.302 150.000 0.124 1.000   NA
 3506105 3506106 Rsph17025_1111 Rsph17025_1112     TRUE 0.899 -3.000 0.078 NA   NA
 3506106 3506107 Rsph17025_1112 Rsph17025_1113     FALSE 0.055 161.000 0.006 NA   NA
 3506107 3506108 Rsph17025_1113 Rsph17025_1114     TRUE 0.985 -3.000 0.229 1.000 Y NA
 3506108 3506109 Rsph17025_1114 Rsph17025_1115     FALSE 0.012 270.000 0.021 NA   NA
 3506110 3506111 Rsph17025_1116 Rsph17025_1117 ksgA pdxA TRUE 0.621 78.000 0.197 1.000 N NA
 3506111 3506112 Rsph17025_1117 Rsph17025_1118 pdxA   TRUE 0.739 -3.000 0.022 1.000 N NA
 3506112 3506113 Rsph17025_1118 Rsph17025_1119     FALSE 0.549 104.000 0.181 1.000 N NA
 3506113 3506114 Rsph17025_1119 Rsph17025_1120     TRUE 0.971 0.000 0.153 1.000   NA
 3506114 3506115 Rsph17025_1120 Rsph17025_1121     TRUE 0.987 -3.000 0.631 0.058   NA
 3506116 3506117 Rsph17025_1122 Rsph17025_1123     FALSE 0.448 139.000 0.230 1.000 N NA
 3506118 3506119 Rsph17025_1124 Rsph17025_1125     FALSE 0.573 93.000 0.156 NA   NA
 3506119 3506120 Rsph17025_1125 Rsph17025_1126     TRUE 0.957 4.000 0.102 NA   NA
 3506123 3506124 Rsph17025_1129 Rsph17025_1130     TRUE 0.848 35.000 0.200 0.004 N NA
 3506126 3506127 Rsph17025_1132 Rsph17025_1133     TRUE 0.974 13.000 0.189 1.000 Y NA
 3506127 3506128 Rsph17025_1133 Rsph17025_1134   glgC TRUE 0.902 76.000 0.205 0.001 Y NA
 3506128 3506129 Rsph17025_1134 Rsph17025_1135 glgC   TRUE 0.708 109.000 0.094 1.000 Y NA
 3506129 3506130 Rsph17025_1135 Rsph17025_1136     TRUE 0.995 -3.000 0.750 1.000 Y NA
 3506130 3506131 Rsph17025_1136 Rsph17025_1137     TRUE 0.940 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 3506131 3506132 Rsph17025_1137 Rsph17025_1138     FALSE 0.017 180.000 0.000 1.000 N NA
 3506132 3506133 Rsph17025_1138 Rsph17025_1139     TRUE 0.860 111.000 0.923 NA   NA
 3506133 3506134 Rsph17025_1139 Rsph17025_1140     TRUE 0.940 -3.000 0.154 NA   NA
 3506134 3506135 Rsph17025_1140 Rsph17025_1141     FALSE 0.514 107.000 0.143 NA   NA
 3506135 3506136 Rsph17025_1141 Rsph17025_1142     TRUE 0.657 29.000 0.068 NA   NA
 3506136 3506137 Rsph17025_1142 Rsph17025_1143     TRUE 0.980 30.000 0.512 0.001 Y NA
 3506137 3506138 Rsph17025_1143 Rsph17025_1144     TRUE 0.995 11.000 0.525 0.001 Y NA
 3506139 3506140 Rsph17025_1145 Rsph17025_1146     TRUE 0.976 19.000 0.385 1.000 Y NA
 3506141 3506142 Rsph17025_1147 Rsph17025_1148     TRUE 0.876 149.000 0.670 0.056 Y NA
 3506142 3506143 Rsph17025_1148 Rsph17025_1149     TRUE 0.998 0.000 0.693 0.056 Y NA
 3506143 3506144 Rsph17025_1149 Rsph17025_1150     TRUE 0.916 31.000 0.097 0.056 Y NA
 3506144 3506145 Rsph17025_1150 Rsph17025_1151     FALSE 0.001 370.000 0.000 1.000 N NA
 3506145 3506146 Rsph17025_1151 Rsph17025_1152     FALSE 0.083 123.000 0.004 1.000 N NA
 3506148 3506149 Rsph17025_1154 Rsph17025_1155     TRUE 0.993 8.000 1.000 0.097 N NA
 3506149 3506150 Rsph17025_1155 Rsph17025_1156     FALSE 0.061 132.000 0.003 1.000 N NA
 3506150 3506151 Rsph17025_1156 Rsph17025_1157     FALSE 0.129 95.000 0.007 1.000 N NA
 3506151 3506152 Rsph17025_1157 Rsph17025_1158     FALSE 0.003 286.000 0.000 1.000 N NA
 3506152 3506153 Rsph17025_1158 Rsph17025_1159     FALSE 0.008 220.000 0.000 1.000 N NA
 3506153 3506154 Rsph17025_1159 Rsph17025_1160     TRUE 0.950 -3.000 0.029 1.000 Y NA
 3506154 3506155 Rsph17025_1160 Rsph17025_1161     FALSE 0.023 184.000 0.000 NA   NA
 3506158 3506159 Rsph17025_1164 Rsph17025_1165     TRUE 0.695 -15.000 0.033 1.000   NA
 3506159 3506160 Rsph17025_1165 Rsph17025_1166     TRUE 0.763 4.000 0.005 1.000 N NA
 3506163 3506164 Rsph17025_1169 Rsph17025_1170     TRUE 0.996 -3.000 0.963 NA Y NA
 3506164 3506165 Rsph17025_1170 Rsph17025_1171     TRUE 0.883 65.000 0.833 NA N NA
 3506166 3506167 Rsph17025_1172 Rsph17025_1173 ilvH   TRUE 0.876 83.000 0.146 0.001 Y NA
 3506167 3506168 Rsph17025_1173 Rsph17025_1174     FALSE 0.002 304.000 0.000 1.000 N NA
 3506168 3506169 Rsph17025_1174 Rsph17025_1175     FALSE 0.006 230.000 0.000 1.000 N NA
 3506169 3506170 Rsph17025_1175 Rsph17025_1176     FALSE 0.512 103.000 0.128 NA   NA
 3506170 3506171 Rsph17025_1176 Rsph17025_1177     TRUE 0.693 76.000 0.240 NA   NA
 3506172 3506173 Rsph17025_1178 Rsph17025_1179     TRUE 0.769 -13.000 0.060 NA   NA
 3506174 3506175 Rsph17025_1180 Rsph17025_1181     FALSE 0.334 258.000 0.523 1.000 Y NA
 3506175 3506176 Rsph17025_1181 Rsph17025_1182     FALSE 0.038 163.000 0.000 NA   NA
 3506177 3506178 Rsph17025_1183 Rsph17025_1184     TRUE 0.935 -3.000 0.138 NA   NA
 3506179 3506180 Rsph17025_1185 Rsph17025_1186     FALSE 0.119 110.000 0.000 1.000   NA
 3506180 3506181 Rsph17025_1186 Rsph17025_1187     FALSE 0.018 202.000 0.000 NA   NA
 3506181 3506182 Rsph17025_1187 Rsph17025_1188     FALSE 0.497 23.000 0.015 NA   NA
 3506182 3506183 Rsph17025_1188 Rsph17025_1189     TRUE 0.942 -3.000 0.160 NA   NA
 3506183 3506184 Rsph17025_1189 Rsph17025_1190     TRUE 0.987 0.000 0.400 NA   NA
 3506184 3506185 Rsph17025_1190 Rsph17025_1191     FALSE 0.592 24.000 0.030 1.000   NA
 3506186 3506187 Rsph17025_1192 Rsph17025_1193     FALSE 0.496 98.000 0.131 1.000 N NA
 3506188 3506189 Rsph17025_1194 Rsph17025_1195     FALSE 0.207 75.000 0.023 NA N NA
 3506189 3506190 Rsph17025_1195 Rsph17025_1196     FALSE 0.329 73.000 0.038 NA   NA
 3506191 3506192 Rsph17025_1197 Rsph17025_1198     FALSE 0.176 106.000 0.009 1.000   NA
 3506193 3506194 Rsph17025_1199 Rsph17025_1200     TRUE 0.942 -3.000 0.015 1.000 Y NA
 3506194 3506195 Rsph17025_1200 Rsph17025_1201     FALSE 0.087 158.000 0.034 1.000 N NA
 3506195 3506196 Rsph17025_1201 Rsph17025_1202     TRUE 0.873 59.000 0.640 NA   NA
 3506196 3506197 Rsph17025_1202 Rsph17025_1203     FALSE 0.542 13.000 0.000 NA   NA
 3506197 3506198 Rsph17025_1203 Rsph17025_1204     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506198 3506199 Rsph17025_1204 Rsph17025_1205     TRUE 0.981 38.000 0.922 0.056 Y NA
 3506199 3506200 Rsph17025_1205 Rsph17025_1206     TRUE 0.998 0.000 0.847 0.056 Y NA
 3506200 3506201 Rsph17025_1206 Rsph17025_1207     TRUE 0.997 11.000 0.865 0.004 Y NA
 3506201 3506202 Rsph17025_1207 Rsph17025_1208   glpD FALSE 0.402 122.000 0.125 1.000 N NA
 3506202 3506203 Rsph17025_1208 Rsph17025_1209 glpD   FALSE 0.053 148.000 0.000 NA   NA
 3506205 3506206 Rsph17025_1211 Rsph17025_1212     FALSE 0.046 153.000 0.000 NA   NA
 3506206 3506207 Rsph17025_1212 Rsph17025_1213     FALSE 0.002 421.000 0.000 NA   NA
 3506207 3506208 Rsph17025_1213 Rsph17025_1214     TRUE 0.870 65.000 0.667 NA   NA
 3506208 3506209 Rsph17025_1214 Rsph17025_1215     FALSE 0.001 801.000 0.000 NA   NA
 3506211 3506212 Rsph17025_1217 Rsph17025_1218     TRUE 0.907 -3.000 0.087 NA   NA
 3506212 3506213 Rsph17025_1218 Rsph17025_1219     FALSE 0.001 648.000 0.000 NA   NA
 3506214 3506215 Rsph17025_1220 Rsph17025_1221     FALSE 0.002 308.000 0.000 1.000 N NA
 3506216 3506217 Rsph17025_1222 Rsph17025_1223 xerC   TRUE 0.912 -3.000 0.093 NA   NA
 3506217 3506218 Rsph17025_1223 Rsph17025_1224     TRUE 0.853 23.000 0.183 NA   NA
 3506219 3506220 Rsph17025_1225 Rsph17025_1226     FALSE 0.056 125.000 0.000 1.000 N NA
 3506220 3506221 Rsph17025_1226 Rsph17025_1227     FALSE 0.175 64.000 0.009 1.000 N NA
 3506221 3506222 Rsph17025_1227 Rsph17025_1228     FALSE 0.224 117.000 0.034 NA   NA
 3506224 3506225 Rsph17025_1230 Rsph17025_1231 ruvC ruvA TRUE 0.994 -3.000 0.451 0.011 Y NA
 3506225 3506226 Rsph17025_1231 Rsph17025_1232 ruvA   FALSE 0.117 88.000 0.003 1.000 N NA
 3506226 3506227 Rsph17025_1232 Rsph17025_1233   ruvB FALSE 0.126 74.000 0.003 1.000 N NA
 3506230 3506231 Rsph17025_1236 Rsph17025_1237     TRUE 0.871 13.000 0.099 1.000 N NA
 3506231 3506232 Rsph17025_1237 Rsph17025_1238     TRUE 0.909 18.000 0.231 NA   NA
 3506233 3506234 Rsph17025_1239 Rsph17025_1240     FALSE 0.002 292.000 0.000 NA N NA
 3506234 3506235 Rsph17025_1240 Rsph17025_1241     FALSE 0.151 195.000 0.071 0.005   NA
 3506235 3506236 Rsph17025_1241 Rsph17025_1242     FALSE 0.074 138.000 0.000 1.000   NA
 3506236 3506237 Rsph17025_1242 Rsph17025_1243     FALSE 0.514 -7.000 0.000 1.000   NA
 3506237 3506238 Rsph17025_1243 Rsph17025_1244     TRUE 0.982 -3.000 0.354 0.005   NA
 3506238 3506239 Rsph17025_1244 Rsph17025_1245     TRUE 0.972 5.000 0.215 NA   NA
 3506239 3506240 Rsph17025_1245 Rsph17025_1246   nifH FALSE 0.002 412.000 0.000 NA   NA
 3506240 3506241 Rsph17025_1246 Rsph17025_1247 nifH   FALSE 0.514 62.000 0.039 0.003 N NA
 3506241 3506242 Rsph17025_1247 Rsph17025_1248     TRUE 0.965 100.000 0.902 0.003 Y NA
 3506242 3506243 Rsph17025_1248 Rsph17025_1249     TRUE 0.917 107.000 0.380 0.003 Y NA
 3506243 3506244 Rsph17025_1249 Rsph17025_1250     TRUE 0.997 0.000 0.475 0.002 Y NA
 3506244 3506245 Rsph17025_1250 Rsph17025_1251     TRUE 0.976 -28.000 0.663 0.005   NA
 3506245 3506246 Rsph17025_1251 Rsph17025_1252     TRUE 0.937 0.000 0.062 NA   NA
 3506246 3506247 Rsph17025_1252 Rsph17025_1253     FALSE 0.142 79.000 0.000 NA   NA
 3506247 3506248 Rsph17025_1253 Rsph17025_1254     TRUE 0.774 -19.000 0.062 1.000   NA
 3506248 3506249 Rsph17025_1254 Rsph17025_1255     FALSE 0.177 168.000 0.094 NA   NA
 3506249 3506250 Rsph17025_1255 Rsph17025_1256     TRUE 0.843 10.000 0.037 NA   NA
 3506250 3506251 Rsph17025_1256 Rsph17025_1257     TRUE 0.858 0.000 0.023 1.000 N NA
 3506251 3506252 Rsph17025_1257 Rsph17025_1258     TRUE 0.993 0.000 0.250 1.000 Y NA
 3506252 3506253 Rsph17025_1258 Rsph17025_1259   nifW TRUE 0.960 12.000 0.300 1.000   NA
 3506253 3506254 Rsph17025_1259 Rsph17025_1260 nifW   FALSE 0.278 79.000 0.022 1.000   NA
 3506255 3506256 Rsph17025_1261 Rsph17025_1262     TRUE 0.891 11.000 0.077 NA   NA
 3506257 3506258 Rsph17025_1263 Rsph17025_1264     FALSE 0.015 210.000 0.000 NA   NA
 3506260 3506261 Rsph17025_1266 Rsph17025_R0015     FALSE 0.004 290.000 0.000 NA   NA
 3506261 3506262 Rsph17025_R0015 Rsph17025_1267     FALSE 0.001 734.000 0.000 NA   NA
 3506262 3506263 Rsph17025_1267 Rsph17025_1268     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506263 3506264 Rsph17025_1268 Rsph17025_1269     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506264 3506265 Rsph17025_1269 Rsph17025_1270     FALSE 0.575 12.000 0.000 NA   NA
 3506266 3506267 Rsph17025_1271 Rsph17025_1272     FALSE 0.001 1451.000 0.000 NA   NA
 3506268 3506269 Rsph17025_1273 Rsph17025_1274     FALSE 0.575 12.000 0.000 NA   NA
 3506269 3506270 Rsph17025_1274 Rsph17025_1275     FALSE 0.003 332.000 0.000 NA   NA
 3506270 3506271 Rsph17025_1275 Rsph17025_1276     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506271 3506272 Rsph17025_1276 Rsph17025_1277     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506272 3506273 Rsph17025_1277 Rsph17025_1278     TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 3506273 3506274 Rsph17025_1278 Rsph17025_1279     TRUE 0.986 -3.000 0.600 0.086   NA
 3506274 3506275 Rsph17025_1279 Rsph17025_1280     FALSE 0.227 45.000 0.000 1.000   NA
 3506275 3506276 Rsph17025_1280 Rsph17025_1281     TRUE 0.972 3.000 0.167 NA   NA
 3506276 3506277 Rsph17025_1281 Rsph17025_1282     TRUE 0.967 -3.000 0.308 NA   NA
 3506277 3506278 Rsph17025_1282 Rsph17025_1283     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506278 3506279 Rsph17025_1283 Rsph17025_1284     FALSE 0.025 181.000 0.000 NA   NA
 3506281 3506282 Rsph17025_1286 Rsph17025_1287     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506282 3506283 Rsph17025_1287 Rsph17025_1288     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506283 3506284 Rsph17025_1288 Rsph17025_1289     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506286 3506287 Rsph17025_1291 Rsph17025_1292     FALSE 0.542 13.000 0.000 NA   NA
 3506287 3506288 Rsph17025_1292 Rsph17025_1293     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506288 3506289 Rsph17025_1293 Rsph17025_1294     TRUE 0.960 -3.000 0.250 NA   NA
 3506289 3506290 Rsph17025_1294 Rsph17025_1295     TRUE 0.982 2.000 0.273 NA   NA
 3506290 3506291 Rsph17025_1295 Rsph17025_1296     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506291 3506292 Rsph17025_1296 Rsph17025_1297     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506292 3506293 Rsph17025_1297 Rsph17025_1298     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506293 3506294 Rsph17025_1298 Rsph17025_1299     TRUE 0.783 2.000 0.000 NA   NA
 3506294 3506295 Rsph17025_1299 Rsph17025_1300     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 3506295 3506296 Rsph17025_1300 Rsph17025_1301     TRUE 0.979 -3.000 0.500 NA   NA
 3506296 3506297 Rsph17025_1301 Rsph17025_1302     FALSE 0.424 114.000 0.095 1.000   NA
 3506297 3506298 Rsph17025_1302 Rsph17025_1303     TRUE 0.982 0.000 0.276 NA   NA
 3506298 3506299 Rsph17025_1303 Rsph17025_1304     TRUE 0.949 12.000 0.241 NA   NA
 3506299 3506300 Rsph17025_1304 Rsph17025_1305     TRUE 0.968 10.000 0.286 NA   NA
 3506300 3506301 Rsph17025_1305 Rsph17025_1306     FALSE 0.115 104.000 0.000 NA   NA
 3506301 3506302 Rsph17025_1306 Rsph17025_1307     TRUE 0.972 0.000 0.167 NA   NA
 3506302 3506303 Rsph17025_1307 Rsph17025_1308     FALSE 0.060 142.000 0.000 NA   NA
 3506303 3506304 Rsph17025_1308 Rsph17025_1309     TRUE 0.963 20.000 0.714 NA   NA
 3506304 3506305 Rsph17025_1309 Rsph17025_1310     TRUE 0.627 66.000 0.156 NA   NA
 3506305 3506306 Rsph17025_1310 Rsph17025_1311     TRUE 0.913 -3.000 0.094 NA   NA
 3506306 3506307 Rsph17025_1311 Rsph17025_1312     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506307 3506308 Rsph17025_1312 Rsph17025_1313     TRUE 0.979 5.000 0.286 NA   NA
 3506308 3506309 Rsph17025_1313 Rsph17025_1314     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506309 3506310 Rsph17025_1314 Rsph17025_1315     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506310 3506311 Rsph17025_1315 Rsph17025_1316     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506311 3506312 Rsph17025_1316 Rsph17025_1317     FALSE 0.190 51.000 0.000 NA   NA
 3506312 3506313 Rsph17025_1317 Rsph17025_1318     TRUE 0.674 9.000 0.000 NA   NA
 3506313 3506314 Rsph17025_1318 Rsph17025_1319     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506314 3506315 Rsph17025_1319 Rsph17025_1320     TRUE 0.743 68.000 0.294 NA   NA
 3506315 3506316 Rsph17025_1320 Rsph17025_1321     FALSE 0.005 289.000 0.000 NA   NA
 3506316 3506317 Rsph17025_1321 Rsph17025_1322     FALSE 0.005 273.000 0.000 NA   NA
 3506317 3506318 Rsph17025_1322 Rsph17025_1323     TRUE 0.885 28.000 0.308 NA   NA
 3506318 3506319 Rsph17025_1323 Rsph17025_1324     TRUE 0.945 -3.000 0.163 1.000   NA
 3506319 3506320 Rsph17025_1324 Rsph17025_1325     TRUE 0.930 -3.000 0.117 1.000   NA
 3506320 3506321 Rsph17025_1325 Rsph17025_R0016     FALSE 0.002 359.000 0.000 NA   NA
 3506324 3506325 Rsph17025_1328 Rsph17025_1329     FALSE 0.004 310.000 0.000 NA   NA
 3506325 3506326 Rsph17025_1329 Rsph17025_1330     FALSE 0.014 213.000 0.000 NA   NA
 3506327 3506328 Rsph17025_1331 Rsph17025_1332     TRUE 0.974 -7.000 0.143 0.004 Y NA
 3506328 3506329 Rsph17025_1332 Rsph17025_1333     TRUE 0.986 -16.000 0.667 NA Y NA
 3506329 3506330 Rsph17025_1333 Rsph17025_1334     TRUE 0.975 4.000 0.238 NA N NA
 3506330 3506331 Rsph17025_1334 Rsph17025_1335     FALSE 0.001 606.000 0.000 1.000 N NA
 3506331 3506332 Rsph17025_1335 Rsph17025_1336     TRUE 0.988 -3.000 0.318 1.000 Y NA
 3506332 3506333 Rsph17025_1336 Rsph17025_1337     TRUE 0.987 -3.000 0.287 1.000 Y NA
 3506333 3506334 Rsph17025_1337 Rsph17025_1338     FALSE 0.081 188.000 0.056 NA   NA
 3506335 3506336 Rsph17025_1339 Rsph17025_1340     TRUE 0.945 -3.000 0.172 NA   NA
 3506337 3506338 Rsph17025_1341 Rsph17025_1342     TRUE 0.989 -3.000 0.341 1.000 Y NA
 3506338 3506339 Rsph17025_1342 Rsph17025_1343     TRUE 0.990 -3.000 0.273 0.018 Y NA
 3506340 3506341 Rsph17025_1344 Rsph17025_1345     TRUE 0.810 82.000 0.145 1.000 Y NA
 3506344 3506345 Rsph17025_R0017 Rsph17025_1349   tig FALSE 0.334 25.000 0.000 NA   NA
 3506346 3506347 Rsph17025_1350 Rsph17025_1351 rplI rpsR TRUE 0.994 11.000 0.499 0.013 Y NA
 3506347 3506348 Rsph17025_1351 Rsph17025_1352 rpsR rpsF TRUE 0.978 21.000 0.319 0.013 Y NA
 3506349 3506350 Rsph17025_1353 Rsph17025_1354     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506350 3506351 Rsph17025_1354 Rsph17025_1355     FALSE 0.001 477.000 0.000 NA   NA
 3506351 3506352 Rsph17025_1355 Rsph17025_1356     TRUE 0.748 85.000 0.333 NA   NA
 3506352 3506353 Rsph17025_1356 Rsph17025_1357     TRUE 0.968 -10.000 0.667 NA   NA
 3506353 3506354 Rsph17025_1357 Rsph17025_1358     TRUE 0.986 0.000 0.364 NA   NA
 3506354 3506355 Rsph17025_1358 Rsph17025_1359     TRUE 0.992 0.000 0.636 NA   NA
 3506355 3506356 Rsph17025_1359 Rsph17025_1360     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506356 3506357 Rsph17025_1360 Rsph17025_1361     FALSE 0.542 13.000 0.000 NA   NA
 3506357 3506358 Rsph17025_1361 Rsph17025_1362     TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   NA
 3506358 3506359 Rsph17025_1362 Rsph17025_1363     TRUE 0.990 0.000 0.500 NA   NA
 3506359 3506360 Rsph17025_1363 Rsph17025_1364     TRUE 0.992 5.000 0.750 NA   NA
 3506360 3506361 Rsph17025_1364 Rsph17025_1365     TRUE 0.981 10.000 0.500 NA   NA
 3506361 3506362 Rsph17025_1365 Rsph17025_1366     TRUE 0.979 0.000 0.238 NA   NA
 3506362 3506363 Rsph17025_1366 Rsph17025_1367     TRUE 0.970 -3.000 0.333 NA   NA
 3506363 3506364 Rsph17025_1367 Rsph17025_1368     TRUE 0.994 0.000 0.818 NA   NA
 3506364 3506365 Rsph17025_1368 Rsph17025_1369     TRUE 0.988 0.000 0.444 NA   NA
 3506365 3506366 Rsph17025_1369 Rsph17025_1370     TRUE 0.977 -3.000 0.444 NA   NA
 3506366 3506367 Rsph17025_1370 Rsph17025_1371     TRUE 0.981 10.000 0.500 NA   NA
 3506367 3506368 Rsph17025_1371 Rsph17025_1372     TRUE 0.979 4.000 0.250 NA   NA
 3506370 3506371 Rsph17025_1374 Rsph17025_1375     FALSE 0.006 264.000 0.000 NA   NA
 3506371 3506372 Rsph17025_1375 Rsph17025_R0018     FALSE 0.129 89.000 0.000 NA   NA
 3506375 3506376 Rsph17025_1378 Rsph17025_1379     TRUE 0.985 28.000 0.769 0.054 Y NA
 3506376 3506377 Rsph17025_1379 Rsph17025_1380     TRUE 0.994 -7.000 0.909 0.054 Y NA
 3506377 3506378 Rsph17025_1380 Rsph17025_1381     TRUE 0.913 63.000 0.364 1.000 Y NA
 3506379 3506380 Rsph17025_1382 Rsph17025_1383     TRUE 0.790 29.000 0.172 1.000 N NA
 3506380 3506381 Rsph17025_1383 Rsph17025_1384     TRUE 0.995 -3.000 0.786 1.000 Y NA
 3506381 3506382 Rsph17025_1384 Rsph17025_1385     TRUE 0.995 -3.000 0.769 1.000 Y NA
 3506382 3506383 Rsph17025_1385 Rsph17025_1386     TRUE 0.968 -3.000 0.308 1.000   NA
 3506387 3506388 Rsph17025_1390 Rsph17025_1391     TRUE 0.761 51.000 0.229 1.000   NA
 3506388 3506389 Rsph17025_1391 Rsph17025_1392     FALSE 0.573 70.000 0.121 1.000   NA
 3506391 3506392 Rsph17025_1394 Rsph17025_1395     TRUE 0.963 8.000 0.030 1.000 Y NA
 3506392 3506393 Rsph17025_1395 Rsph17025_1396     FALSE 0.016 205.000 0.000 NA   NA
 3506393 3506394 Rsph17025_1396 Rsph17025_1397     TRUE 0.960 20.000 0.667 NA   NA
 3506394 3506395 Rsph17025_1397 Rsph17025_1398     FALSE 0.161 124.000 0.016 1.000   NA
 3506398 3506399 Rsph17025_1401 Rsph17025_1402     FALSE 0.002 428.000 0.000 NA   NA
 3506399 3506400 Rsph17025_1402 Rsph17025_1403     TRUE 0.960 -3.000 0.250 NA   NA
 3506400 3506401 Rsph17025_1403 Rsph17025_1404     TRUE 0.977 -3.000 0.444 NA   NA
 3506401 3506402 Rsph17025_1404 Rsph17025_1405     TRUE 0.979 0.000 0.222 1.000   NA
 3506402 3506403 Rsph17025_1405 Rsph17025_1406     TRUE 0.925 -7.000 0.222 1.000   NA
 3506404 3506405 Rsph17025_1407 Rsph17025_1408     TRUE 0.870 -3.000 0.056 NA   NA
 3506405 3506406 Rsph17025_1408 Rsph17025_1409     FALSE 0.466 16.000 0.000 NA   NA
 3506406 3506407 Rsph17025_1409 Rsph17025_1410     FALSE 0.101 114.000 0.000 NA   NA
 3506407 3506408 Rsph17025_1410 Rsph17025_1411     TRUE 0.967 0.000 0.158 1.000 N NA
 3506408 3506409 Rsph17025_1411 Rsph17025_1412     TRUE 0.962 20.000 0.689 NA   NA
 3506409 3506410 Rsph17025_1412 Rsph17025_1413     FALSE 0.003 336.000 0.000 NA   NA
 3506410 3506411 Rsph17025_1413 Rsph17025_R0019     FALSE 0.001 540.000 0.000 NA   NA
 3506413 3506414 Rsph17025_1415 Rsph17025_1416     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 3506414 3506415 Rsph17025_1416 Rsph17025_1417     TRUE 0.950 24.000 0.667 NA   NA
 3506415 3506416 Rsph17025_1417 Rsph17025_1418     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 3506416 3506417 Rsph17025_1418 Rsph17025_1419     TRUE 0.939 69.000 0.667 NA Y NA
 3506417 3506418 Rsph17025_1419 Rsph17025_1420     FALSE 0.243 36.000 0.000 NA   NA
 3506419 3506420 Rsph17025_1421 Rsph17025_1422     FALSE 0.001 633.000 0.000 1.000   NA
 3506421 3506422 Rsph17025_1423 Rsph17025_1424     FALSE 0.001 1096.000 0.000 NA   NA
 3506422 3506423 Rsph17025_1424 Rsph17025_1425     FALSE 0.001 521.000 0.000 NA   NA
 3506423 3506424 Rsph17025_1425 Rsph17025_1426     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 3506424 3506425 Rsph17025_1426 Rsph17025_1427     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506425 3506426 Rsph17025_1427 Rsph17025_1428     FALSE 0.001 528.000 0.000 NA   NA
 3506432 3506433 Rsph17025_1434 Rsph17025_1435     FALSE 0.194 49.000 0.000 NA   NA
 3506433 3506434 Rsph17025_1435 Rsph17025_1436     FALSE 0.145 69.000 0.000 NA   NA
 3506434 3506435 Rsph17025_1436 Rsph17025_1437     TRUE 0.824 -3.000 0.000 0.038   NA
 3506437 3506438 Rsph17025_1439 Rsph17025_1440     FALSE 0.363 22.000 0.000 NA   NA
 3506441 3506442 Rsph17025_1443 Rsph17025_1444     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506442 3506443 Rsph17025_1444 Rsph17025_1445     TRUE 0.805 -3.000 0.024 1.000   NA
 3506443 3506444 Rsph17025_1445 Rsph17025_1446     TRUE 0.983 -3.000 0.627 NA   NA
 3506445 3506446 Rsph17025_1447 Rsph17025_1448     FALSE 0.053 144.000 0.004 1.000 N NA
 3506446 3506447 Rsph17025_1448 Rsph17025_1449   clpX TRUE 0.832 125.000 0.352 1.000 Y NA
 3506447 3506448 Rsph17025_1449 Rsph17025_1450 clpX   FALSE 0.093 126.000 0.009 1.000 N NA
 3506448 3506449 Rsph17025_1450 Rsph17025_1451     TRUE 0.975 0.000 0.199 NA   NA
 3506449 3506450 Rsph17025_1451 Rsph17025_1452     TRUE 0.922 -3.000 0.108 NA   NA
 3506451 3506452 Rsph17025_1453 Rsph17025_1454 aat   TRUE 0.808 20.000 0.114 1.000 N NA
 3506452 3506453 Rsph17025_1454 Rsph17025_1455     TRUE 0.990 8.000 0.153 0.001 Y NA
 3506454 3506455 Rsph17025_1456 Rsph17025_1457     FALSE 0.263 64.000 0.017 NA   NA
 3506455 3506456 Rsph17025_1457 Rsph17025_1458     FALSE 0.208 73.000 0.010 NA   NA
 3506457 3506458 Rsph17025_1459 Rsph17025_1460     FALSE 0.430 166.000 0.042 0.004 Y NA
 3506459 3506460 Rsph17025_1461 Rsph17025_1462     FALSE 0.393 127.000 0.137 1.000 N NA
 3506460 3506461 Rsph17025_1462 Rsph17025_1463     TRUE 0.965 0.000 0.149 1.000 N NA
 3506461 3506462 Rsph17025_1463 Rsph17025_1464     TRUE 0.994 10.000 0.661 1.000 Y NA
 3506462 3506463 Rsph17025_1464 Rsph17025_1465     TRUE 0.996 -3.000 0.855 0.054 Y NA
 3506463 3506464 Rsph17025_1465 Rsph17025_1466     TRUE 0.977 29.000 0.539 0.054 Y NA
 3506464 3506465 Rsph17025_1466 Rsph17025_1467     FALSE 0.046 134.000 0.000 1.000 N NA
 3506467 3506468 Rsph17025_1469 Rsph17025_1470     TRUE 0.985 10.000 0.143 0.064 Y NA
 3506468 3506469 Rsph17025_1470 Rsph17025_1471     FALSE 0.225 120.000 0.033 1.000   NA
 3506469 3506470 Rsph17025_1471 Rsph17025_1472     TRUE 0.664 128.000 0.397 1.000   NA
 3506470 3506471 Rsph17025_1472 Rsph17025_1473     TRUE 0.976 -3.000 0.429 NA   NA
 3506471 3506472 Rsph17025_1473 Rsph17025_1474     TRUE 0.988 0.000 0.406 NA   NA
 3506472 3506473 Rsph17025_1474 Rsph17025_1475     TRUE 0.754 71.000 0.328 NA   NA
 3506475 3506476 Rsph17025_1477 Rsph17025_1478     FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 3506478 3506479 Rsph17025_1480 Rsph17025_1481     FALSE 0.260 174.000 0.200 NA   NA
 3506479 3506480 Rsph17025_1481 Rsph17025_R0020     FALSE 0.089 122.000 0.000 NA   NA
 3506481 3506482 Rsph17025_1482 Rsph17025_1483     TRUE 0.911 -3.000 0.091 NA   NA
 3506482 3506483 Rsph17025_1483 Rsph17025_1484     TRUE 0.935 -3.000 0.006 1.000 Y NA
 3506483 3506484 Rsph17025_1484 Rsph17025_1485     TRUE 0.865 119.000 0.419 1.000 Y NA
 3506485 3506486 Rsph17025_1486 Rsph17025_1487     TRUE 0.902 -3.000 0.094 1.000 N NA
 3506486 3506487 Rsph17025_1487 Rsph17025_1488     TRUE 0.995 0.000 0.297 0.073 Y NA
 3506487 3506488 Rsph17025_1488 Rsph17025_1489     TRUE 0.856 100.000 0.205 0.073 Y NA
 3506488 3506489 Rsph17025_1489 Rsph17025_1490     TRUE 0.994 -3.000 0.533 0.073 Y NA
 3506489 3506490 Rsph17025_1490 Rsph17025_1491   trkA FALSE 0.515 55.000 0.085 1.000 N NA
 3506490 3506491 Rsph17025_1491 Rsph17025_1492 trkA   TRUE 0.991 2.000 0.089 0.003 Y NA
 3506491 3506492 Rsph17025_1492 Rsph17025_1493   hfq FALSE 0.389 158.000 0.252 1.000   NA
 3506492 3506493 Rsph17025_1493 Rsph17025_1494 hfq   TRUE 0.965 2.000 0.115 1.000   NA
 3506496 3506497 Rsph17025_1497 Rsph17025_1498     FALSE 0.156 140.000 0.033 NA   NA
 3506498 3506499 Rsph17025_1499 Rsph17025_1500     FALSE 0.289 68.000 0.026 NA   NA
 3506500 3506501 Rsph17025_1501 Rsph17025_1502     TRUE 0.930 -3.000 0.147 1.000 N NA
 3506502 3506503 Rsph17025_1503 Rsph17025_1504     TRUE 0.894 -3.000 0.087 1.000 N NA
 3506503 3506504 Rsph17025_1504 Rsph17025_1505     TRUE 0.882 11.000 0.087 NA N NA
 3506507 3506508 Rsph17025_1508 Rsph17025_1509     TRUE 0.920 -3.000 0.131 NA N NA
 3506509 3506510 Rsph17025_1510 Rsph17025_1511 rpsB tsf TRUE 0.946 81.000 0.748 1.000 Y NA
 3506511 3506512 Rsph17025_1512 Rsph17025_1513     FALSE 0.025 187.000 0.000 1.000   NA
 3506513 3506514 Rsph17025_R0021 Rsph17025_R0022     FALSE 0.128 90.000 0.000 NA   NA
 3506515 3506516 Rsph17025_1514 Rsph17025_1515     FALSE 0.589 -3.000 0.005 NA N NA
 3506517 3506518 Rsph17025_1516 Rsph17025_1517     TRUE 0.954 -3.000 0.211 NA   NA
 3506518 3506519 Rsph17025_1517 Rsph17025_1518   cobN TRUE 0.976 4.000 0.204 1.000   NA
 3506519 3506520 Rsph17025_1518 Rsph17025_1519 cobN cobH TRUE 0.896 0.000 0.025 1.000   NA
 3506520 3506521 Rsph17025_1519 Rsph17025_1520 cobH   TRUE 0.983 0.000 0.024 0.010 Y NA
 3506521 3506522 Rsph17025_1520 Rsph17025_1521     TRUE 0.975 -3.000 0.056 0.010 Y NA
 3506524 3506525 Rsph17025_1523 Rsph17025_1524     TRUE 0.960 -3.000 0.139 0.010   NA
 3506525 3506526 Rsph17025_1524 Rsph17025_1525     TRUE 0.983 -3.000 0.397 0.010   NA
 3506526 3506527 Rsph17025_1525 Rsph17025_1526     TRUE 0.936 -3.000 0.007 1.000 Y NA
 3506527 3506528 Rsph17025_1526 Rsph17025_1527     TRUE 0.784 74.000 0.106 1.000 Y NA
 3506529 3506530 Rsph17025_1528 Rsph17025_1529     TRUE 0.978 -3.000 0.147 1.000 Y NA
 3506531 3506532 Rsph17025_1530 Rsph17025_1531     TRUE 0.910 0.000 0.038 NA   NA
 3506532 3506533 Rsph17025_1531 Rsph17025_1532     FALSE 0.051 176.000 0.025 1.000 N NA
 3506538 3506539 Rsph17025_1537 Rsph17025_1538     FALSE 0.077 104.000 0.000 1.000 N NA
 3506539 3506540 Rsph17025_1538 Rsph17025_1539     TRUE 0.947 -3.000 0.000 0.064 Y NA
 3506540 3506541 Rsph17025_1539 Rsph17025_1540     FALSE 0.522 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3506541 3506542 Rsph17025_1540 Rsph17025_1541     FALSE 0.522 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3506542 3506543 Rsph17025_1541 Rsph17025_1542     FALSE 0.205 30.000 0.000 1.000 N NA
 3506543 3506544 Rsph17025_1542 Rsph17025_1543     TRUE 0.865 23.000 0.000 0.013 Y NA
 3506544 3506545 Rsph17025_1543 Rsph17025_1544     FALSE 0.578 65.000 0.000 1.000 Y NA
 3506545 3506546 Rsph17025_1544 Rsph17025_1545     TRUE 0.961 3.000 0.000 NA Y NA
 3506546 3506547 Rsph17025_1545 Rsph17025_1546     FALSE 0.469 -3.000 0.000 NA N NA
 3506547 3506548 Rsph17025_1546 Rsph17025_1547     FALSE 0.522 -3.000 0.000 1.000 N NA
 3506548 3506549 Rsph17025_1547 Rsph17025_1548     TRUE 0.750 -3.000 0.000 0.062 N NA
 3506549 3506550 Rsph17025_1548 Rsph17025_1549     FALSE 0.049 121.000 0.000 NA N NA
 3506550 3506551 Rsph17025_1549 Rsph17025_1550     TRUE 0.884 27.000 0.333 NA N NA
 3506552 3506553 Rsph17025_1551 Rsph17025_1552     FALSE 0.165 68.000 0.000 1.000   NA
 3506554 3506555 Rsph17025_1553 Rsph17025_1554     FALSE 0.011 226.000 0.000 NA   NA
 3506555 3506556 Rsph17025_1554 Rsph17025_1555     TRUE 0.947 -3.000 0.000 0.064 Y NA
 3506558 3506559 Rsph17025_1557 Rsph17025_1558     FALSE 0.003 281.000 0.000 1.000 N NA
 3506559 3506560 Rsph17025_1558 Rsph17025_1559     FALSE 0.394 55.000 0.050 1.000 N NA
 3506560 3506561 Rsph17025_1559 Rsph17025_1560     TRUE 0.722 6.000 0.000 NA   NA
 3506561 3506562 Rsph17025_1560 Rsph17025_1561     TRUE 0.651 10.000 0.000 NA   NA
 3506563 3506564 Rsph17025_1562 Rsph17025_1563     TRUE 0.777 -3.000 0.016 1.000   NA
 3506565 3506566 Rsph17025_1564 Rsph17025_1565     TRUE 0.870 33.000 0.383 NA N NA
 3506566 3506567 Rsph17025_1565 Rsph17025_1566     TRUE 0.897 29.000 0.365 NA   NA
 3506567 3506568 Rsph17025_1566 Rsph17025_1567     TRUE 0.990 8.000 0.805 NA   NA
 3506569 3506570 Rsph17025_1568 Rsph17025_1569     TRUE 0.985 -3.000 0.751 1.000 N NA
 3506570 3506571 Rsph17025_1569 Rsph17025_1570     FALSE 0.144 132.000 0.032 1.000 N NA
 3506571 3506572 Rsph17025_1570 Rsph17025_1571     FALSE 0.191 88.000 0.006 1.000   NA
 3506573 3506574 Rsph17025_1572 Rsph17025_1573     FALSE 0.097 163.000 0.046 1.000 N NA
 3506575 3506576 Rsph17025_1574 Rsph17025_1575     FALSE 0.601 52.000 0.100 NA   NA
 3506579 3506580 Rsph17025_1578 Rsph17025_1579     TRUE 0.991 0.000 0.182 1.000 Y NA
 3506580 3506581 Rsph17025_1579 Rsph17025_1580     FALSE 0.110 165.000 0.045 NA   NA
 3506581 3506582 Rsph17025_1580 Rsph17025_1581     FALSE 0.035 190.000 0.012 NA   NA
 3506582 3506583 Rsph17025_1581 Rsph17025_1582   pntA TRUE 0.996 11.000 0.745 0.001 Y NA
 3506583 3506584 Rsph17025_1582 Rsph17025_1583 pntA   FALSE 0.231 137.000 0.071 1.000 N NA
 3506585 3506586 Rsph17025_1584 Rsph17025_1585     FALSE 0.005 278.000 0.000 NA   NA
 3506586 3506587 Rsph17025_1585 Rsph17025_1586     FALSE 0.127 92.000 0.000 NA   NA
 3506588 3506589 Rsph17025_1587 Rsph17025_1588     TRUE 0.768 90.000 0.400 NA   NA
 3506589 3506590 Rsph17025_1588 Rsph17025_1589     FALSE 0.404 76.000 0.059 NA   NA
 3506595 3506596 Rsph17025_1594 Rsph17025_1595     FALSE 0.012 217.000 0.000 NA   NA
 3506596 3506597 Rsph17025_1595 Rsph17025_1596     FALSE 0.253 151.000 0.100 NA   NA
 3506601 3506602 Rsph17025_1600 Rsph17025_1601     TRUE 0.932 31.000 0.689 1.000 N NA
 3506602 3506603 Rsph17025_1601 Rsph17025_1602     TRUE 0.720 -7.000 0.034 NA   NA
 3506603 3506604 Rsph17025_1602 Rsph17025_1603     TRUE 0.971 -3.000 0.351 NA   NA
 3506604 3506605 Rsph17025_1603 Rsph17025_1604     TRUE 0.925 8.000 0.094 1.000 N NA
 3506607 3506608 Rsph17025_1606 Rsph17025_1607     TRUE 0.964 4.000 0.162 NA N NA
 3506608 3506609 Rsph17025_1607 Rsph17025_1608     TRUE 0.998 0.000 0.865 NA Y NA
 3506609 3506610 Rsph17025_1608 Rsph17025_1609     TRUE 0.965 58.000 0.938 NA Y NA
 3506610 3506611 Rsph17025_1609 Rsph17025_1610     TRUE 0.744 60.000 0.289 1.000 N NA
 3506611 3506612 Rsph17025_1610 Rsph17025_1611     TRUE 0.950 14.000 0.361 1.000 N NA
 3506612 3506613 Rsph17025_1611 Rsph17025_1612     TRUE 0.996 -3.000 0.706 0.045 Y NA
 3506613 3506614 Rsph17025_1612 Rsph17025_1613     TRUE 0.745 18.000 0.029 0.045 N NA
 3506615 3506616 Rsph17025_1614 Rsph17025_1615     TRUE 0.739 88.000 0.333 NA   NA
 3506616 3506617 Rsph17025_1615 Rsph17025_1616     FALSE 0.159 71.000 0.000 1.000   NA
 3506617 3506618 Rsph17025_1616 Rsph17025_1617     TRUE 0.660 -3.000 0.000 1.000   NA
 3506618 3506619 Rsph17025_1617 Rsph17025_1618     TRUE 0.789 4.000 0.000 1.000   NA
 3506620 3506621 Rsph17025_1619 Rsph17025_1620     FALSE 0.378 81.000 0.052 NA   NA
 3506621 3506622 Rsph17025_1620 Rsph17025_1621     TRUE 0.987 -3.000 0.800 NA   NA
 3506622 3506623 Rsph17025_1621 Rsph17025_1622     FALSE 0.393 37.000 0.021 NA   NA
 3506623 3506624 Rsph17025_1622 Rsph17025_1623     FALSE 0.464 29.000 0.021 NA   NA
 3506625 3506626 Rsph17025_1624 Rsph17025_1625     TRUE 0.660 -3.000 0.000 1.000   NA
 3506628 3506629 Rsph17025_1627 Rsph17025_1628     TRUE 0.767 24.000 0.095 NA   NA
 3506629 3506630 Rsph17025_1628 Rsph17025_1629     FALSE 0.098 115.000 0.000 NA   NA
 3506630 3506631 Rsph17025_1629 Rsph17025_1630     TRUE 0.659 138.000 0.500 NA   NA
 3506631 3506632 Rsph17025_1630 Rsph17025_1631     TRUE 0.978 29.000 0.750 1.000 Y NA
 3506632 3506633 Rsph17025_1631 Rsph17025_1632     TRUE 0.920 85.000 0.500 1.000 Y NA
 3506633 3506634 Rsph17025_1632 Rsph17025_1633     TRUE 0.908 -3.000 0.069 0.092 N NA
 3506634 3506635 Rsph17025_1633 Rsph17025_1634     TRUE 0.929 4.000 0.069 1.000 N NA
 3506635 3506636 Rsph17025_1634 Rsph17025_1635     TRUE 0.957 -15.000 0.083 0.009 Y NA
 3506636 3506637 Rsph17025_1635 Rsph17025_1636     TRUE 0.985 0.000 0.083 1.000 Y NA
 3506637 3506638 Rsph17025_1636 Rsph17025_1637     TRUE 0.962 -3.000 0.250 1.000   NA
 3506638 3506639 Rsph17025_1637 Rsph17025_1638     FALSE 0.247 186.000 0.250 NA   NA
 3506640 3506641 Rsph17025_1639 Rsph17025_1640     FALSE 0.541 14.000 0.000 1.000   NA
 3506641 3506642 Rsph17025_1640 Rsph17025_1641     TRUE 0.928 20.000 0.040 0.009 Y NA
 3506642 3506643 Rsph17025_1641 Rsph17025_1642     TRUE 0.995 2.000 0.220 0.009 Y NA
 3506643 3506644 Rsph17025_1642 Rsph17025_1643     TRUE 0.996 4.000 0.320 0.005 Y NA
 3506644 3506645 Rsph17025_1643 Rsph17025_1644     TRUE 0.940 -3.000 0.012 1.000 Y NA
 3506645 3506646 Rsph17025_1644 Rsph17025_1645     TRUE 0.971 2.000 0.154 NA   NA
 3506646 3506647 Rsph17025_1645 Rsph17025_1646     FALSE 0.143 71.000 0.000 NA   NA
 3506647 3506648 Rsph17025_1646 Rsph17025_1647     TRUE 0.963 11.000 0.286 1.000   NA
 3506648 3506649 Rsph17025_1647 Rsph17025_1648     TRUE 0.982 4.000 0.016 0.001 Y NA
 3506649 3506650 Rsph17025_1648 Rsph17025_1649     FALSE 0.591 43.000 0.020 0.001   NA
 3506650 3506651 Rsph17025_1649 Rsph17025_1650     TRUE 0.806 77.000 0.443 1.000   NA
 3506651 3506652 Rsph17025_1650 Rsph17025_1651   fliP TRUE 0.820 -3.000 0.029 1.000   NA
 3506652 3506653 Rsph17025_1651 Rsph17025_1652 fliP   TRUE 0.994 0.000 0.177 0.007 Y NA
 3506653 3506654 Rsph17025_1652 Rsph17025_1653     TRUE 0.995 0.000 0.215 0.002 Y NA
 3506654 3506655 Rsph17025_1653 Rsph17025_1654     TRUE 0.948 -13.000 0.111 1.000 Y NA
 3506655 3506656 Rsph17025_1654 Rsph17025_1655     TRUE 0.859 70.000 0.667 NA   NA
 3506656 3506657 Rsph17025_1655 Rsph17025_1656     TRUE 0.993 7.000 1.000 NA   NA
 3506658 3506659 Rsph17025_1657 Rsph17025_1658     FALSE 0.334 194.000 0.500 1.000 N NA
 3506661 3506662 Rsph17025_1660 Rsph17025_1661     FALSE 0.430 146.000 0.222 NA   NA
 3506662 3506663 Rsph17025_1661 Rsph17025_1662     TRUE 0.941 18.000 0.375 NA   NA
 3506663 3506664 Rsph17025_1662 Rsph17025_1663     TRUE 0.995 8.000 0.357 0.001 Y NA
 3506664 3506665 Rsph17025_1663 Rsph17025_1664     TRUE 0.740 96.000 0.217 0.009   NA
 3506665 3506666 Rsph17025_1664 Rsph17025_1665   flgI TRUE 0.978 0.000 0.117 0.010   NA
 3506666 3506667 Rsph17025_1665 Rsph17025_1666 flgI   TRUE 0.986 -3.000 0.149 0.010 Y NA
 3506667 3506668 Rsph17025_1666 Rsph17025_1667     TRUE 0.993 8.000 0.260 0.009 Y NA
 3506668 3506669 Rsph17025_1667 Rsph17025_1668     TRUE 0.869 54.000 0.174 1.000 Y NA
 3506669 3506670 Rsph17025_1668 Rsph17025_1669     TRUE 0.994 9.000 0.594 1.000 Y NA
 3506670 3506671 Rsph17025_1669 Rsph17025_1670     TRUE 0.983 26.000 0.875 NA Y NA
 3506671 3506672 Rsph17025_1670 Rsph17025_1671     TRUE 0.991 2.000 0.174 NA Y NA
 3506672 3506673 Rsph17025_1671 Rsph17025_1672     TRUE 0.995 0.000 0.222 0.005 Y NA
 3506675 3506676 Rsph17025_1674 Rsph17025_1675     TRUE 0.660 -3.000 0.000 1.000   NA
 3506677 3506678 Rsph17025_1676 Rsph17025_1677     FALSE 0.186 52.000 0.000 NA   NA
 3506680 3506681 Rsph17025_1679 Rsph17025_1680     TRUE 0.660 -3.000 0.000 1.000   NA
 3506681 3506682 Rsph17025_1680 Rsph17025_1681     FALSE 0.595 108.000 0.236 1.000 N NA
 3506682 3506683 Rsph17025_1681 Rsph17025_1682     TRUE 0.900 95.000 0.306 0.053 Y NA
 3506683 3506684 Rsph17025_1682 Rsph17025_1683     TRUE 0.998 2.000 0.918 0.053 Y NA
 3506684 3506685 Rsph17025_1683 Rsph17025_1684     TRUE 0.994 8.000 0.373 0.053 Y NA
 3506685 3506686 Rsph17025_1684 Rsph17025_1685     TRUE 0.759 143.000 0.326 1.000 Y NA
 3506686 3506687 Rsph17025_1685 Rsph17025_1686     FALSE 0.005 240.000 0.000 1.000 N NA
 3506688 3506689 Rsph17025_1687 Rsph17025_1688     TRUE 0.991 -3.000 0.465 NA Y NA
 3506690 3506691 Rsph17025_1689 Rsph17025_1690     TRUE 0.993 -3.000 0.377 0.005 Y NA
 3506691 3506692 Rsph17025_1690 Rsph17025_1691     TRUE 0.996 -3.000 0.691 0.005 Y NA
 3506692 3506693 Rsph17025_1691 Rsph17025_1692     TRUE 0.994 -3.000 0.407 0.009 Y NA
 3506693 3506694 Rsph17025_1692 Rsph17025_1693     TRUE 0.990 -3.000 0.236 0.009 Y NA
 3506694 3506695 Rsph17025_1693 Rsph17025_1694     TRUE 0.988 -3.000 0.184 0.011 Y NA
 3506695 3506696 Rsph17025_1694 Rsph17025_1695     TRUE 0.887 146.000 0.664 0.011 Y NA
 3506696 3506697 Rsph17025_1695 Rsph17025_1696     TRUE 0.994 -3.000 0.423 0.011 Y NA
 3506697 3506698 Rsph17025_1696 Rsph17025_1697     TRUE 0.994 -3.000 0.428 0.011 Y NA
 3506698 3506699 Rsph17025_1697 Rsph17025_1698     TRUE 0.991 -3.000 0.269 0.005 Y NA
 3506699 3506700 Rsph17025_1698 Rsph17025_1699     TRUE 0.982 2.000 0.016 0.011 Y NA
 3506700 3506701 Rsph17025_1699 Rsph17025_1700     TRUE 0.948 -21.000 0.057 0.003 Y NA
 3506701 3506702 Rsph17025_1700 Rsph17025_1701     TRUE 0.997 0.000 0.437 0.003 Y NA
 3506702 3506703 Rsph17025_1701 Rsph17025_1702     FALSE 0.167 80.000 0.011 1.000 N NA
 3506703 3506704 Rsph17025_1702 Rsph17025_1703     TRUE 0.782 -3.000 0.022 NA   NA
 3506705 3506706 Rsph17025_1704 Rsph17025_1705     TRUE 0.997 -3.000 0.792 0.003 Y NA
 3506706 3506707 Rsph17025_1705 Rsph17025_1706     FALSE 0.285 48.000 0.000 0.092 N NA
 3506707 3506708 Rsph17025_1706 Rsph17025_1707     FALSE 0.025 181.000 0.000 NA   NA
 3506709 3506710 Rsph17025_1708 Rsph17025_1709     TRUE 0.886 107.000 0.286 0.023 Y NA
 3506710 3506711 Rsph17025_1709 Rsph17025_1710     FALSE 0.369 175.000 0.385 1.000 N NA
 3506711 3506712 Rsph17025_1710 Rsph17025_1711     FALSE 0.507 114.000 0.154 NA   NA
 3506712 3506713 Rsph17025_1711 Rsph17025_1712   mdoG FALSE 0.003 339.000 0.000 NA   NA
 3506713 3506714 Rsph17025_1712 Rsph17025_1713 mdoG   FALSE 0.009 204.000 0.000 NA N NA
 3506714 3506715 Rsph17025_1713 Rsph17025_1714     TRUE 0.946 -7.000 0.333 NA   NA
 3506715 3506716 Rsph17025_1714 Rsph17025_R0023     FALSE 0.431 18.000 0.000 NA   NA
 3506717 3506718 Rsph17025_1715 Rsph17025_1716     FALSE 0.307 28.000 0.000 NA   NA
 3506718 3506719 Rsph17025_1716 Rsph17025_1717     FALSE 0.150 115.000 0.011 NA   NA
 3506719 3506720 Rsph17025_1717 Rsph17025_1718     TRUE 0.931 3.000 0.054 NA   NA
 3506720 3506721 Rsph17025_1718 Rsph17025_1719     TRUE 0.993 4.000 0.294 NA Y NA
 3506721 3506722 Rsph17025_1719 Rsph17025_1720     TRUE 0.991 0.000 0.206 NA Y NA
 3506724 3506725 Rsph17025_1721 Rsph17025_1722     FALSE 0.271 152.000 0.118 NA   NA
 3506725 3506726 Rsph17025_1722 Rsph17025_1723     TRUE 0.928 -3.000 0.118 NA   NA
 3506726 3506727 Rsph17025_1723 Rsph17025_1724     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506727 3506728 Rsph17025_1724 Rsph17025_1725     TRUE 0.905 -3.000 0.083 NA   NA
 3506728 3506729 Rsph17025_1725 Rsph17025_1726     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506729 3506730 Rsph17025_1726 Rsph17025_1727     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 3506730 3506731 Rsph17025_1727 Rsph17025_1728     FALSE 0.011 225.000 0.000 NA   NA
 3506731 3506732 Rsph17025_1728 Rsph17025_1729     FALSE 0.482 -7.000 0.000 NA   NA
 3506732 3506733 Rsph17025_1729 Rsph17025_1730     FALSE 0.036 165.000 0.000 NA   NA
 3506733 3506734 Rsph17025_1730 Rsph17025_1731     FALSE 0.445 -13.000 0.000 NA   NA
 3506734 3506735 Rsph17025_1731 Rsph17025_1732     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506735 3506736 Rsph17025_1732 Rsph17025_1733     TRUE 0.741 5.000 0.000 NA   NA
 3506736 3506737 Rsph17025_1733 Rsph17025_1734     FALSE 0.002 374.000 0.000 NA   NA
 3506737 3506738 Rsph17025_1734 Rsph17025_1735     FALSE 0.214 42.000 0.000 NA   NA
 3506738 3506739 Rsph17025_1735 Rsph17025_1736     FALSE 0.009 233.000 0.000 NA   NA
 3506739 3506740 Rsph17025_1736 Rsph17025_1737     FALSE 0.014 213.000 0.000 NA   NA
 3506742 3506743 Rsph17025_1739 Rsph17025_1740     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506744 3506745 Rsph17025_1741 Rsph17025_1742     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506745 3506746 Rsph17025_1742 Rsph17025_1743     FALSE 0.004 313.000 0.000 NA   NA
 3506746 3506747 Rsph17025_1743 Rsph17025_1744     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506747 3506748 Rsph17025_1744 Rsph17025_1745     FALSE 0.574 -10.000 0.010 NA   NA
 3506748 3506749 Rsph17025_1745 Rsph17025_1746     FALSE 0.012 220.000 0.000 NA   NA
 3506749 3506750 Rsph17025_1746 Rsph17025_1747     TRUE 0.906 18.000 0.222 NA   NA
 3506750 3506751 Rsph17025_1747 Rsph17025_1748     FALSE 0.174 57.000 0.000 NA   NA
 3506751 3506752 Rsph17025_1748 Rsph17025_1749     FALSE 0.140 94.000 0.000 1.000   NA
 3506752 3506753 Rsph17025_1749 Rsph17025_1750     TRUE 0.974 0.000 0.182 NA   NA
 3506753 3506754 Rsph17025_1750 Rsph17025_1751     TRUE 0.985 3.000 0.333 NA   NA
 3506754 3506755 Rsph17025_1751 Rsph17025_1752     TRUE 0.954 12.000 0.273 NA   NA
 3506755 3506756 Rsph17025_1752 Rsph17025_1753     TRUE 0.940 3.000 0.067 NA   NA
 3506756 3506757 Rsph17025_1753 Rsph17025_1754     FALSE 0.534 68.000 0.100 NA   NA
 3506757 3506758 Rsph17025_1754 Rsph17025_1755     FALSE 0.013 215.000 0.000 NA   NA
 3506758 3506759 Rsph17025_1755 Rsph17025_1756     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506759 3506760 Rsph17025_1756 Rsph17025_1757     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506760 3506761 Rsph17025_1757 Rsph17025_1758     FALSE 0.060 142.000 0.000 NA   NA
 3506761 3506762 Rsph17025_1758 Rsph17025_1759     FALSE 0.531 66.000 0.095 NA   NA
 3506762 3506763 Rsph17025_1759 Rsph17025_1760     FALSE 0.002 434.000 0.000 NA   NA
 3506763 3506764 Rsph17025_1760 Rsph17025_1761     FALSE 0.001 602.000 0.000 NA   NA
 3506764 3506765 Rsph17025_1761 Rsph17025_1762     TRUE 0.778 0.000 0.000 NA   NA
 3506765 3506766 Rsph17025_1762 Rsph17025_1763     TRUE 0.990 -3.000 1.000 NA   NA
 3506766 3506767 Rsph17025_1763 Rsph17025_1764     FALSE 0.006 265.000 0.000 NA   NA
 3506767 3506768 Rsph17025_1764 Rsph17025_1765     FALSE 0.003 343.000 0.000 1.000   NA
 3506768 3506769 Rsph17025_1765 Rsph17025_1766     TRUE 0.916 13.000 0.154 NA   NA
 3506769 3506770 Rsph17025_1766 Rsph17025_1767     FALSE 0.045 154.000 0.000 NA   NA
 3506773 3506774 Rsph17025_1770 Rsph17025_1771     TRUE 0.978 -3.000 0.519 1.000 N NA
 3506774 3506775 Rsph17025_1771 Rsph17025_1772     FALSE 0.006 262.000 0.000 NA   NA
 3506775 3506776 Rsph17025_1772 Rsph17025_1773     TRUE 0.843 -3.000 0.042 NA   NA
 3506776 3506777 Rsph17025_1773 Rsph17025_1774     TRUE 0.946 11.000 0.197 NA   NA
 3506779 3506780 Rsph17025_1776 Rsph17025_1777 pgi   TRUE 0.963 12.000 0.089 1.000 Y NA
 3506780 3506781 Rsph17025_1777 Rsph17025_1778     TRUE 0.868 35.000 0.092 1.000 Y NA
 3506781 3506782 Rsph17025_1778 Rsph17025_1779     FALSE 0.550 79.000 0.000 1.000 Y NA
 3506782 3506783 Rsph17025_1779 Rsph17025_1780     TRUE 0.985 -3.000 0.141 0.005 Y NA
 3506783 3506784 Rsph17025_1780 Rsph17025_1781     TRUE 0.987 -3.000 0.167 0.005 Y NA
 3506784 3506785 Rsph17025_1781 Rsph17025_1782     TRUE 0.968 -3.000 0.027 0.004 Y NA
 3506785 3506786 Rsph17025_1782 Rsph17025_1783     TRUE 0.985 -3.000 0.121 0.004 Y NA
 3506786 3506787 Rsph17025_1783 Rsph17025_1784     TRUE 0.966 -3.000 0.022 0.005 Y NA
 3506787 3506788 Rsph17025_1784 Rsph17025_1785     TRUE 0.988 -3.000 0.544 0.005   NA
 3506788 3506789 Rsph17025_1785 Rsph17025_1786     FALSE 0.093 119.000 0.000 NA   NA
 3506790 3506791 Rsph17025_1787 Rsph17025_1788     TRUE 0.683 89.000 0.056 1.000 Y NA
 3506791 3506792 Rsph17025_1788 Rsph17025_1789     TRUE 0.914 94.000 1.000 0.090   NA
 3506792 3506793 Rsph17025_1789 Rsph17025_1790     FALSE 0.005 383.000 0.000 0.090   NA
 3506793 3506794 Rsph17025_1790 Rsph17025_1791     TRUE 0.715 59.000 0.040 1.000 Y NA
 3506794 3506795 Rsph17025_1791 Rsph17025_1792     TRUE 0.838 -3.000 0.040 NA   NA
 3506795 3506796 Rsph17025_1792 Rsph17025_1793     TRUE 0.955 -25.000 0.525 NA   NA
 3506796 3506797 Rsph17025_1793 Rsph17025_1794     TRUE 0.996 8.000 0.711 1.000 Y NA
 3506797 3506798 Rsph17025_1794 Rsph17025_1795     TRUE 0.994 2.000 0.178 0.008 Y NA
 3506798 3506799 Rsph17025_1795 Rsph17025_1796     TRUE 0.976 -3.000 0.125 1.000 Y NA
 3506799 3506800 Rsph17025_1796 Rsph17025_1797     TRUE 0.966 11.000 0.078 1.000 Y NA
 3506800 3506801 Rsph17025_1797 Rsph17025_1798     TRUE 0.933 -3.000 0.133 NA   NA
 3506804 3506805 Rsph17025_1801 Rsph17025_1802     TRUE 0.749 -1.000 0.000 NA   NA
 3506805 3506806 Rsph17025_1802 Rsph17025_1803     FALSE 0.142 75.000 0.000 NA   NA
 3506806 3506807 Rsph17025_1803 Rsph17025_1804     FALSE 0.236 114.000 0.000 0.036   NA
 3506808 3506809 Rsph17025_1805 Rsph17025_R0025     FALSE 0.002 354.000 0.000 NA   NA
 3506811 3506812 Rsph17025_1807 Rsph17025_1808     TRUE 0.984 -3.000 0.667 NA   NA
 3506812 3506813 Rsph17025_1808 Rsph17025_1809     TRUE 0.939 69.000 0.667 NA Y NA
 3506814 3506815 Rsph17025_1810 Rsph17025_1811     TRUE 0.898 13.000 0.000 1.000 Y NA
 3506816 3506817 Rsph17025_1812 Rsph17025_1813     FALSE 0.004 313.000 0.000 NA   NA
 3506817 3506818 Rsph17025_1813 Rsph17025_1814     FALSE 0.171 58.000 0.000 NA   NA
 3506818 3506819 Rsph17025_1814 Rsph17025_1815     FALSE 0.017 260.000 0.000 0.036   NA
 3506820 3506821 Rsph17025_1816 Rsph17025_1817     FALSE 0.509 14.000 0.000 NA   NA
 3506821 3506822 Rsph17025_1817 Rsph17025_1818     FALSE 0.005 284.000 0.000 NA   NA
 3506822 3506823 Rsph17025_1818 Rsph17025_1819     TRUE 0.886 -3.000 0.068 NA   NA
 3506823 3506824 Rsph17025_1819 Rsph17025_1820     FALSE 0.129 89.000 0.000 NA   NA
 3506824 3506825 Rsph17025_1820 Rsph17025_1821     FALSE 0.186 52.000 0.000 NA   NA
 3506825 3506826 Rsph17025_1821 Rsph17025_1822     FALSE 0.006 268.000 0.000 NA   NA
 3506826 3506827 Rsph17025_1822 Rsph17025_1823     FALSE 0.013 215.000 0.000 NA   NA
 3506828 3506829 Rsph17025_1824 Rsph17025_1825     TRUE 0.970 5.000 0.200 NA   NA
 3506829 3506830 Rsph17025_1825 Rsph17025_1826     FALSE 0.003 330.000 0.000 NA   NA
 3506830 3506831 Rsph17025_1826 Rsph17025_1827     TRUE 0.796 -3.000 0.000 0.081   NA
 3506833 3506834 Rsph17025_1829 Rsph17025_1830     FALSE 0.031 173.000 0.000 NA   NA
 3506834 3506835 Rsph17025_1830 Rsph17025_1831     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506835 3506836 Rsph17025_1831 Rsph17025_1832     FALSE 0.098 212.000 0.000 1.000 Y NA
 3506836 3506837 Rsph17025_1832 Rsph17025_1833     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506837 3506838 Rsph17025_1833 Rsph17025_1834     FALSE 0.142 76.000 0.000 NA   NA
 3506838 3506839 Rsph17025_1834 Rsph17025_1835     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506842 3506843 Rsph17025_1838 Rsph17025_1839     FALSE 0.007 255.000 0.000 NA   NA
 3506843 3506844 Rsph17025_1839 Rsph17025_1840     FALSE 0.001 852.000 0.000 NA   NA
 3506844 3506845 Rsph17025_1840 Rsph17025_1841     FALSE 0.412 19.000 0.000 NA   NA
 3506845 3506846 Rsph17025_1841 Rsph17025_1842     FALSE 0.039 161.000 0.000 NA   NA
 3506846 3506847 Rsph17025_1842 Rsph17025_1843     FALSE 0.028 177.000 0.000 NA   NA
 3506849 3506850 Rsph17025_1845 Rsph17025_1846 uvrA   FALSE 0.123 110.000 0.010 1.000 N NA
 3506850 3506851 Rsph17025_1846 Rsph17025_1847     FALSE 0.179 92.000 0.017 1.000 N NA
 3506851 3506852 Rsph17025_1847 Rsph17025_1848     FALSE 0.404 102.000 0.070 1.000   NA
 3506852 3506853 Rsph17025_1848 Rsph17025_1849     FALSE 0.095 151.000 0.017 1.000   NA
 3506853 3506854 Rsph17025_1849 Rsph17025_1850     FALSE 0.138 80.000 0.005 1.000 N NA
 3506854 3506855 Rsph17025_1850 Rsph17025_1851     FALSE 0.234 92.000 0.021 NA   NA
 3506856 3506857 Rsph17025_1852 Rsph17025_1853     FALSE 0.004 295.000 0.002 1.000 N NA
 3506857 3506858 Rsph17025_1853 Rsph17025_1854     TRUE 0.952 -10.000 0.484 NA N NA
 3506859 3506860 Rsph17025_1855 Rsph17025_1856     FALSE 0.097 134.000 0.006 NA   NA
 3506860 3506861 Rsph17025_1856 Rsph17025_1857     FALSE 0.272 92.000 0.041 1.000 N NA
 3506861 3506862 Rsph17025_1857 Rsph17025_1858     TRUE 0.897 91.000 0.396 1.000 Y NA
 3506862 3506863 Rsph17025_1858 Rsph17025_1859     FALSE 0.502 50.000 0.072 1.000 N NA
 3506865 3506866 Rsph17025_1861 Rsph17025_1862 ispG   FALSE 0.521 130.000 0.233 NA   NA
 3506866 3506867 Rsph17025_1862 Rsph17025_1863     FALSE 0.311 113.000 0.057 NA   NA
 3506867 3506868 Rsph17025_1863 Rsph17025_1864     FALSE 0.279 134.000 0.077 NA   NA
 3506869 3506870 Rsph17025_1865 Rsph17025_1866     TRUE 0.817 -3.000 0.043 1.000 N NA
 3506871 3506872 Rsph17025_R0026 Rsph17025_R0027     FALSE 0.249 35.000 0.000 NA   NA
 3506874 3506875 Rsph17025_1868 Rsph17025_1869     FALSE 0.555 135.000 0.290 1.000   NA
 3506879 3506880 Rsph17025_1873 Rsph17025_1874     TRUE 0.985 -7.000 0.778 0.001   NA
 3506880 3506881 Rsph17025_1874 Rsph17025_1875     TRUE 0.993 -3.000 0.889 0.001   NA
 3506881 3506882 Rsph17025_1875 Rsph17025_1876     FALSE 0.611 40.000 0.083 NA   NA
 3506882 3506883 Rsph17025_1876 Rsph17025_1877     FALSE 0.477 80.000 0.083 NA   NA
 3506884 3506885 Rsph17025_1878 Rsph17025_1879     TRUE 0.797 -3.000 0.035 1.000 N NA
 3506885 3506886 Rsph17025_1879 Rsph17025_1880     FALSE 0.003 319.000 0.000 NA   NA
 3506887 3506888 Rsph17025_1881 Rsph17025_1882     FALSE 0.587 -3.000 0.005 NA N NA
 3506888 3506889 Rsph17025_1882 Rsph17025_1883     TRUE 0.680 14.000 0.033 NA N NA
 3506890 3506891 Rsph17025_1884 Rsph17025_1885     FALSE 0.269 71.000 0.023 NA   NA
 3506891 3506892 Rsph17025_1885 Rsph17025_1886   mtnA FALSE 0.157 94.000 0.004 NA   NA
 3506893 3506894 Rsph17025_1887 Rsph17025_1888     FALSE 0.013 215.000 0.000 NA   NA
 3506894 3506895 Rsph17025_1888 Rsph17025_1889     FALSE 0.071 133.000 0.000 NA   NA
 3506896 3506897 Rsph17025_1890 Rsph17025_1891     TRUE 0.805 -13.000 0.077 NA   NA
 3506897 3506898 Rsph17025_1891 Rsph17025_1892     TRUE 0.979 0.000 0.231 NA   NA
 3506899 3506900 Rsph17025_1893 Rsph17025_1894     FALSE 0.142 73.000 0.000 NA   NA
 3506901 3506902 Rsph17025_1895 Rsph17025_1896     FALSE 0.063 170.000 0.019 NA   NA
 3506902 3506903 Rsph17025_1896 Rsph17025_1897     FALSE 0.469 33.000 0.029 NA   NA
 3506903 3506904 Rsph17025_1897 Rsph17025_1898     FALSE 0.145 145.000 0.034 NA   NA
 3506905 3506906 Rsph17025_1899 Rsph17025_1900 tdh   TRUE 0.989 0.000 0.547 1.000 N NA
 3506906 3506907 Rsph17025_1900 Rsph17025_1901     FALSE 0.258 47.000 0.006 NA   NA
 3506907 3506908 Rsph17025_1901 Rsph17025_1902     FALSE 0.100 131.000 0.006 NA   NA
 3506908 3506909 Rsph17025_1902 Rsph17025_1903     FALSE 0.033 169.000 0.000 NA   NA
 3506909 3506910 Rsph17025_1903 Rsph17025_1904     TRUE 0.639 96.000 0.213 1.000   NA
 3506915 3506916 Rsph17025_1909 Rsph17025_1910   rpmF FALSE 0.490 175.000 0.599 NA   NA
 3506916 3506917 Rsph17025_1910 Rsph17025_1911 rpmF   TRUE 0.782 69.000 0.418 1.000 N NA
 3506917 3506918 Rsph17025_1911 Rsph17025_1912     TRUE 0.986 17.000 0.380 0.004 Y NA
 3506918 3506919 Rsph17025_1912 Rsph17025_1913     FALSE 0.609 90.000 0.207 1.000 N NA
 3506919 3506920 Rsph17025_1913 Rsph17025_1914     TRUE 0.709 7.000 0.005 1.000 N NA
 3506920 3506921 Rsph17025_1914 Rsph17025_R0028     FALSE 0.140 82.000 0.000 NA   NA
 3506921 3506922 Rsph17025_R0028 Rsph17025_1915     FALSE 0.164 61.000 0.000 NA   NA
 3506922 3506923 Rsph17025_1915 Rsph17025_1916     FALSE 0.024 190.000 0.000 1.000   NA
 3506923 3506924 Rsph17025_1916 Rsph17025_1917     FALSE 0.569 67.000 0.111 1.000   NA
 3506924 3506925 Rsph17025_1917 Rsph17025_1918     TRUE 0.770 11.000 0.022 NA   NA
 3506925 3506926 Rsph17025_1918 Rsph17025_1919     FALSE 0.027 179.000 0.000 NA   NA
 3506926 3506927 Rsph17025_1919 Rsph17025_1920     TRUE 0.814 58.000 0.107 NA Y NA
 3506927 3506928 Rsph17025_1920 Rsph17025_1921     TRUE 0.995 -3.000 0.485 0.001 Y NA
 3506928 3506929 Rsph17025_1921 Rsph17025_1922     TRUE 0.993 12.000 0.402 0.001 Y NA
 3506929 3506930 Rsph17025_1922 Rsph17025_1923     TRUE 0.973 14.000 0.222 NA Y NA
 3506930 3506931 Rsph17025_1923 Rsph17025_1924     TRUE 0.949 0.000 0.096 NA N NA
 3506931 3506932 Rsph17025_1924 Rsph17025_1925     FALSE 0.132 86.000 0.005 1.000 N NA
 3506932 3506933 Rsph17025_1925 Rsph17025_1926     TRUE 0.957 19.000 0.200 NA Y NA
 3506933 3506934 Rsph17025_1926 Rsph17025_1927     TRUE 0.969 -3.000 0.087 NA Y NA
 3506935 3506936 Rsph17025_1928 Rsph17025_1929     TRUE 0.982 -3.000 0.600 NA   NA
 3506936 3506937 Rsph17025_1929 Rsph17025_1930     TRUE 0.947 11.000 0.200 NA   NA
 3506937 3506938 Rsph17025_1930 Rsph17025_1931     TRUE 0.934 -10.000 0.294 NA   NA
 3506938 3506939 Rsph17025_1931 Rsph17025_1932     TRUE 0.968 11.000 0.333 NA   NA
 3506939 3506940 Rsph17025_1932 Rsph17025_1933     FALSE 0.207 157.000 0.091 NA   NA
 3506942 3506943 Rsph17025_1935 Rsph17025_1936     TRUE 0.961 11.000 0.281 NA   NA
 3506943 3506944 Rsph17025_1936 Rsph17025_1937     TRUE 0.993 -3.000 0.635 1.000 Y NA
 3506944 3506945 Rsph17025_1937 Rsph17025_1938     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506945 3506946 Rsph17025_1938 Rsph17025_1939     FALSE 0.466 16.000 0.000 NA   NA
 3506946 3506947 Rsph17025_1939 Rsph17025_1940     TRUE 0.716 25.000 0.074 NA   NA
 3506947 3506948 Rsph17025_1940 Rsph17025_1941     TRUE 0.956 25.000 0.793 NA   NA
 3506948 3506949 Rsph17025_1941 Rsph17025_1942     FALSE 0.595 29.000 0.049 NA   NA
 3506949 3506950 Rsph17025_1942 Rsph17025_1943     TRUE 0.979 -3.000 0.488 NA   NA
 3506950 3506951 Rsph17025_1943 Rsph17025_1944     TRUE 0.977 -3.000 0.419 1.000   NA
 3506951 3506952 Rsph17025_1944 Rsph17025_1945     TRUE 0.685 151.000 0.571 0.059   NA
 3506952 3506953 Rsph17025_1945 Rsph17025_1946     FALSE 0.026 212.000 0.000 0.059 N NA
 3506953 3506954 Rsph17025_1946 Rsph17025_1947     TRUE 0.820 127.000 0.333 1.000 Y NA
 3506954 3506955 Rsph17025_1947 Rsph17025_1948     FALSE 0.021 200.000 0.000 1.000   NA
 3506957 3506958 Rsph17025_1950 Rsph17025_1951     TRUE 0.653 157.000 0.286 NA Y NA
 3506958 3506959 Rsph17025_1951 Rsph17025_1952     FALSE 0.245 125.000 0.065 NA N NA
 3506960 3506961 Rsph17025_1953 Rsph17025_1954     FALSE 0.125 135.000 0.014 1.000   NA
 3506961 3506962 Rsph17025_1954 Rsph17025_1955     TRUE 0.986 1.000 0.086 1.000 Y NA
 3506962 3506963 Rsph17025_1955 Rsph17025_1956     TRUE 0.987 -15.000 0.696 1.000 Y NA
 3506963 3506964 Rsph17025_1956 Rsph17025_1957     FALSE 0.023 324.000 0.000 1.000 Y NA
 3506964 3506965 Rsph17025_1957 Rsph17025_1958     TRUE 0.696 24.000 0.065 NA   NA
 3506965 3506966 Rsph17025_1958 Rsph17025_1959     TRUE 0.936 -3.000 0.143 NA   NA
 3506966 3506967 Rsph17025_1959 Rsph17025_1960     TRUE 0.936 -3.000 0.143 NA   NA
 3506967 3506968 Rsph17025_1960 Rsph17025_1961     TRUE 0.900 -3.000 0.080 NA   NA
 3506968 3506969 Rsph17025_1961 Rsph17025_1962     FALSE 0.032 172.000 0.000 NA   NA
 3506970 3506971 Rsph17025_1963 Rsph17025_1964     TRUE 0.899 -3.000 0.073 1.000   NA
 3506971 3506972 Rsph17025_1964 Rsph17025_1965     TRUE 0.989 -3.000 0.875 1.000   NA
 3506972 3506973 Rsph17025_1965 Rsph17025_1966     TRUE 0.631 -3.000 0.000 NA   NA
 3506973 3506974 Rsph17025_1966 Rsph17025_1967     FALSE 0.613 11.000 0.000 NA   NA
 3506974 3506975 Rsph17025_1967 Rsph17025_1968     TRUE 0.832 86.000 0.600 NA   NA
 3506976 3506977 Rsph17025_1969 Rsph17025_1970     TRUE 0.965 -3.000 0.286 NA   NA
 3506979 3506980 Rsph17025_1972 Rsph17025_1973     TRUE 0.889 17.000 0.200 NA N NA
 3506981 3506982 Rsph17025_1974 Rsph17025_1975     TRUE 0.934 78.000 0.611 1.000 Y NA
 3506982 3506983 Rsph17025_1975 Rsph17025_1976     FALSE 0.004 297.000 0.000 NA   NA
 3506984 3506985 Rsph17025_1977 Rsph17025_1978     TRUE 0.940 -3.000 0.147 1.000   NA
 3506985 3506986 Rsph17025_1978 Rsph17025_1979     FALSE 0.226 128.000 0.057 1.000 N NA
 3506987 3506988 Rsph17025_1980 Rsph17025_1981     TRUE 0.899 -3.000 0.078 NA   NA
 3506988 3506989 Rsph17025_1981 Rsph17025_1982     TRUE 0.992 -3.000 0.535 NA Y NA
 3506989 3506990 Rsph17025_1982 Rsph17025_1983     TRUE 0.981 11.000 0.353 0.005   NA
 3506990 3506991 Rsph17025_1983 Rsph17025_1984     FALSE 0.102 227.000 0.176 1.000   NA
 3506991 3506992 Rsph17025_1984 Rsph17025_1985     FALSE 0.425 89.000 0.088 1.000 N NA
 3506993 3506994 Rsph17025_1986 Rsph17025_1987     FALSE 0.049 253.000 0.000 1.000 Y NA
 3506995 3506996 Rsph17025_1988 Rsph17025_1989     TRUE 0.904 -3.000 0.080 1.000   NA
 3506996 3506997 Rsph17025_1989 Rsph17025_1990     TRUE 0.870 11.000 0.071 1.000 N NA
 3506997 3506998 Rsph17025_1990 Rsph17025_1991     TRUE 0.941 -10.000 0.372 1.000 N NA
 3506998 3506999 Rsph17025_1991 Rsph17025_1992     TRUE 0.994 11.000 0.453 0.003 Y NA
 3506999 3507000 Rsph17025_1992 Rsph17025_1993     TRUE 0.996 0.000 0.251 0.003 Y NA
 3507000 3507001 Rsph17025_1993 Rsph17025_1994     FALSE 0.548 217.000 0.451 0.011 Y NA
 3507001 3507002 Rsph17025_1994 Rsph17025_1995     TRUE 0.808 162.000 0.484 0.005 Y NA
 3507002 3507003 Rsph17025_1995 Rsph17025_1996     TRUE 0.889 -3.000 0.066 1.000   NA
 3507003 3507004 Rsph17025_1996 Rsph17025_1997     TRUE 0.859 -3.000 0.046 1.000   NA
 3507004 3507005 Rsph17025_1997 Rsph17025_1998     TRUE 0.997 2.000 0.500 0.011 Y NA
 3507005 3507006 Rsph17025_1998 Rsph17025_1999     TRUE 0.650 28.000 0.060 NA   NA
 3507006 3507007 Rsph17025_1999 Rsph17025_2000     TRUE 0.939 4.000 0.069 NA   NA
 3507007 3507008 Rsph17025_2000 Rsph17025_2001     TRUE 0.935 78.000 0.395 0.011 Y NA
 3507008 3507009 Rsph17025_2001 Rsph17025_2002     TRUE 0.861 11.000 0.056 NA   NA
 3507009 3507010 Rsph17025_2002 Rsph17025_2003     TRUE 0.856 0.000 0.012 NA   NA
 3507010 3507011 Rsph17025_2003 Rsph17025_2004     TRUE 0.996 0.000 0.355 0.009 Y NA
 3507011 3507012 Rsph17025_2004 Rsph17025_2005     TRUE 0.994 11.000 0.483 0.011 Y NA
 3507012 3507013 Rsph17025_2005 Rsph17025_2006     TRUE 0.990 11.000 0.262 0.005 Y NA
 3507013 3507014 Rsph17025_2006 Rsph17025_2007     TRUE 0.994 -3.000 0.396 0.005 Y NA
 3507014 3507015 Rsph17025_2007 Rsph17025_2008     FALSE 0.052 167.000 0.018 1.000 N NA
 3507015 3507016 Rsph17025_2008 Rsph17025_2009     TRUE 0.957 12.000 0.218 0.033 N NA
 3507016 3507017 Rsph17025_2009 Rsph17025_2010     TRUE 0.937 -7.000 0.229 0.061 N NA
 3507017 3507018 Rsph17025_2010 Rsph17025_2011     TRUE 0.862 99.000 0.158 0.002 Y NA
 3507023 3507024 Rsph17025_2016 Rsph17025_2017     TRUE 0.985 0.000 0.083 1.000 Y NA
 3507026 3507027 Rsph17025_2019 Rsph17025_2020     TRUE 0.637 -10.000 0.017 1.000   NA
 3507030 3507031 Rsph17025_2023 Rsph17025_2024     TRUE 0.660 161.000 0.852 NA   NA
 3507031 3507032 Rsph17025_2024 Rsph17025_2025     TRUE 0.630 46.000 0.121 1.000 N NA
 3507034 3507035 Rsph17025_2027 Rsph17025_2028     FALSE 0.416 172.000 0.385 NA   NA
 3507035 3507036 Rsph17025_2028 Rsph17025_2029     TRUE 0.905 13.000 0.132 NA   NA
 3507036 3507037 Rsph17025_2029 Rsph17025_2030     TRUE 0.987 -7.000 0.895 0.003   NA
 3507037 3507038 Rsph17025_2030 Rsph17025_2031     TRUE 0.874 124.000 0.829 0.003   NA
 3507038 3507039 Rsph17025_2031 Rsph17025_2032     TRUE 0.989 14.000 0.946 0.003   NA
 3507039 3507040 Rsph17025_2032 Rsph17025_2033     TRUE 0.725 97.000 0.324 1.000   NA
 3507040 3507041 Rsph17025_2033 Rsph17025_2034     TRUE 0.975 -3.000 0.231 0.002   NA
 3507041 3507042 Rsph17025_2034 Rsph17025_2035     TRUE 0.998 0.000 0.632 0.002 Y NA
 3507042 3507043 Rsph17025_2035 Rsph17025_2036     TRUE 0.867 76.000 0.491 0.002 N NA
 3507043 3507044 Rsph17025_2036 Rsph17025_2037     TRUE 0.992 -3.000 0.882 0.002 N NA
 3507044 3507045 Rsph17025_2037 Rsph17025_2038     FALSE 0.612 155.000 0.627 1.000   NA
 3507045 3507046 Rsph17025_2038 Rsph17025_2039     TRUE 0.871 50.000 0.500 1.000   NA
 3507047 3507048 Rsph17025_2040 Rsph17025_2041     TRUE 0.879 66.000 0.434 0.002   NA
 3507049 3507050 Rsph17025_2042 Rsph17025_2043     FALSE 0.113 114.000 0.000 1.000   NA
 3507051 3507052 Rsph17025_2044 Rsph17025_2045     TRUE 0.869 87.000 0.875 NA N NA
 3507052 3507053 Rsph17025_2045 Rsph17025_2046     TRUE 0.982 10.000 0.625 NA N NA
 3507053 3507054 Rsph17025_2046 Rsph17025_2047     FALSE 0.405 56.000 0.054 1.000 N NA
 3507054 3507055 Rsph17025_2047 Rsph17025_2048     TRUE 0.966 -3.000 0.071 NA Y NA
 3507055 3507056 Rsph17025_2048 Rsph17025_2049     TRUE 0.988 -3.000 1.000 NA N NA
 3507056 3507057 Rsph17025_2049 Rsph17025_2050     TRUE 0.959 15.000 0.500 1.000 N NA
 3507057 3507058 Rsph17025_2050 Rsph17025_2051     TRUE 0.916 -3.000 0.114 1.000 N NA
 3507058 3507059 Rsph17025_2051 Rsph17025_2052     TRUE 0.898 -3.000 0.091 1.000 N NA
 3507059 3507060 Rsph17025_2052 Rsph17025_2053     TRUE 0.966 4.000 0.167 1.000 N NA
 3507060 3507061 Rsph17025_2053 Rsph17025_2054     TRUE 0.748 21.000 0.083 1.000 N NA
 3507062 3507063 Rsph17025_2055 Rsph17025_2056     TRUE 0.637 95.000 0.043 NA Y NA
 3507063 3507064 Rsph17025_2056 Rsph17025_2057     TRUE 0.869 17.000 0.160 NA N NA
 3507064 3507065 Rsph17025_2057 Rsph17025_2058     TRUE 0.619 84.000 0.200 1.000 N NA
 3507065 3507066 Rsph17025_2058 Rsph17025_2059     TRUE 0.712 46.000 0.200 NA N NA
 3507066 3507067 Rsph17025_2059 Rsph17025_2060     TRUE 0.968 -3.000 0.364 NA N NA
 3507068 3507069 Rsph17025_2061 Rsph17025_2062     FALSE 0.002 326.000 0.000 1.000 N NA
 3507069 3507070 Rsph17025_2062 Rsph17025_2063     TRUE 0.824 70.000 0.156 1.000 Y NA
 3507070 3507071 Rsph17025_2063 Rsph17025_2064     TRUE 0.988 5.000 0.156 1.000 Y NA
 3507071 3507072 Rsph17025_2064 Rsph17025_2065     TRUE 0.997 4.000 0.455 0.009 Y NA
 3507072 3507073 Rsph17025_2065 Rsph17025_2066     TRUE 0.906 38.000 0.571 1.000   NA
 3507073 3507074 Rsph17025_2066 Rsph17025_2067     TRUE 0.919 13.000 0.154 1.000   NA
 3507074 3507075 Rsph17025_2067 Rsph17025_2068     TRUE 0.951 -3.000 0.231 NA N NA
 3507075 3507076 Rsph17025_2068 Rsph17025_2069     TRUE 0.988 -3.000 1.000 NA N NA
 3507076 3507077 Rsph17025_2069 Rsph17025_2070     TRUE 0.966 -3.000 0.286 1.000   NA
 3507077 3507078 Rsph17025_2070 Rsph17025_R0029     FALSE 0.140 82.000 0.000 NA   NA
 3507078 3507079 Rsph17025_R0029 Rsph17025_2071     FALSE 0.010 230.000 0.000 NA   NA
 3507079 3507080 Rsph17025_2071 Rsph17025_2072     FALSE 0.121 129.000 0.021 1.000 N NA
 3507080 3507081 Rsph17025_2072 Rsph17025_2073     TRUE 0.689 -3.000 0.013 1.000 N NA
 3507081 3507082 Rsph17025_2073 Rsph17025_2074     TRUE 0.777 -3.000 0.030 1.000 N NA
 3507084 3507085 Rsph17025_2076 Rsph17025_2077     TRUE 0.887 -3.000 0.069 NA   NA
 3507085 3507086 Rsph17025_2077 Rsph17025_2078     FALSE 0.018 202.000 0.000 NA   NA
 3507087 3507088 Rsph17025_2079 Rsph17025_2080     FALSE 0.005 289.000 0.000 NA   NA
 3507088 3507089 Rsph17025_2080